MicrobesOnline Operon Predictions for Lactobacillus crispatus ST1

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 10479938 10479939 LCRIS_00001 LCRIS_00002 dnaA dnaN FALSE 0.272 175.000 0.328 1.000 Y NA
 10479939 10479940 LCRIS_00002 LCRIS_00003 dnaN   FALSE 0.066 217.000 0.103 1.000   NA
 10479940 10479941 LCRIS_00003 LCRIS_00004   recF TRUE 0.922 9.000 0.209 1.000   NA
 10479941 10479942 LCRIS_00004 LCRIS_00005 recF gyrB TRUE 0.994 1.000 0.249 0.007 Y NA
 10479942 10479943 LCRIS_00005 LCRIS_00006 gyrB gyrA TRUE 0.991 10.000 0.306 0.003 Y NA
 10479943 10479944 LCRIS_00006 LCRIS_00007 gyrA rpsF FALSE 0.041 218.000 0.003 1.000 N NA
 10479944 10479945 LCRIS_00007 LCRIS_00008 rpsF ssb TRUE 0.621 50.000 0.006 1.000 N NA
 10479945 10479946 LCRIS_00008 LCRIS_00009 ssb rpsR TRUE 0.750 28.000 0.006 1.000 N NA
 10479948 10479949 LCRIS_00011 LCRIS_00012     FALSE 0.057 141.000 0.000 NA   NA
 10479949 10479950 LCRIS_00012 LCRIS_00013     FALSE 0.018 221.000 0.000 1.000   NA
 10479950 10479951 LCRIS_00013 LCRIS_00014   rplI TRUE 0.904 12.000 0.119 1.000 N NA
 10479951 10479952 LCRIS_00014 LCRIS_00015 rplI dnaB1 TRUE 0.876 20.000 0.100 1.000 N NA
 10479952 10479953 LCRIS_00015 LCRIS_00016 dnaB1 phnD1 FALSE 0.052 168.000 0.000 1.000 N NA
 10479953 10479954 LCRIS_00016 LCRIS_00017 phnD1 degV1 FALSE 0.463 110.000 0.182 NA   NA
 10479954 10479955 LCRIS_00017 LCRIS_00018 degV1 scrK FALSE 0.432 116.000 0.182 NA   NA
 10479955 10479956 LCRIS_00018 LCRIS_00019 scrK   FALSE 0.158 148.000 0.077 NA   NA
 10479956 10479957 LCRIS_00019 LCRIS_00020     FALSE 0.327 51.000 0.000 NA   NA
 10479958 10479959 LCRIS_00021 LCRIS_00022   mgtC FALSE 0.452 98.000 0.103 NA   NA
 10479960 10479961 LCRIS_02037 LCRIS_00023 tRNA-Thr   FALSE 0.023 177.000 0.000 NA   NA
 10479961 10479962 LCRIS_00023 LCRIS_00024     FALSE 0.036 160.000 0.000 NA   NA
 10479962 10479963 LCRIS_00024 LCRIS_00025     FALSE 0.160 99.000 0.000 NA   NA
 10479965 10479966 LCRIS_00026 LCRIS_00028     FALSE 0.165 95.000 0.000 NA   NA
 10479966 10479967 LCRIS_00028 LCRIS_00029     FALSE 0.005 330.000 0.000 NA   NA
 10479968 10479969 LCRIS_00030 LCRIS_00031     FALSE 0.239 66.000 0.000 NA   NA
 10479969 10479970 LCRIS_00031 LCRIS_00032     TRUE 0.980 -40.000 0.000 0.100   NA
 10479970 10479971 LCRIS_00032 LCRIS_00033   oppA1 FALSE 0.004 423.000 0.000 1.000   NA
 10479972 10479973 LCRIS_00034 LCRIS_00035     TRUE 0.953 0.000 0.150 NA   NA
 10479976 10479977 LCRIS_00038 LCRIS_00039     TRUE 0.991 -3.000 0.895 1.000   NA
 10479977 10479978 LCRIS_00039 LCRIS_00040     TRUE 0.956 -3.000 0.105 NA   NA
 10479978 10479979 LCRIS_00040 LCRIS_00041     FALSE 0.007 283.000 0.000 NA   NA
 10479979 10479980 LCRIS_00041 LCRIS_00042     TRUE 0.779 90.000 0.667 1.000   NA
 10479984 10479985 LCRIS_00046 LCRIS_00047     FALSE 0.003 420.000 0.000 NA   NA
 10479985 10479986 LCRIS_00047 LCRIS_00048     FALSE 0.290 57.000 0.000 NA   NA
 10479987 10479988 LCRIS_00049 LCRIS_00050     FALSE 0.097 169.000 0.026 1.000   NA
 10479990 10479991 LCRIS_00052 LCRIS_00053     TRUE 0.878 -40.000 0.000 NA   NA
 10479991 10479992 LCRIS_00053 LCRIS_00054   xthA FALSE 0.003 555.000 0.000 1.000   NA
 10479992 10479993 LCRIS_00054 LCRIS_00055 xthA   FALSE 0.472 74.000 0.005 1.000 N NA
 10479993 10479994 LCRIS_00055 LCRIS_00056     TRUE 0.609 66.000 0.059 1.000 N NA
 10479995 10479996 LCRIS_00057 LCRIS_00058     FALSE 0.016 231.000 0.000 1.000   NA
 10480001 10480002 LCRIS_00062 LCRIS_02038   tRNA-Ile FALSE 0.016 205.000 0.000 NA   NA
 10480002 10480003 LCRIS_02038 LCRIS_02039 tRNA-Ile tRNA-Ala FALSE 0.290 57.000 0.000 NA   NA
 10480003 10480004 LCRIS_02039 LCRIS_02029 tRNA-Ala 23s rRNA FALSE 0.094 123.000 0.000 NA   NA
 10480005 10480006 LCRIS_00063 LCRIS_00064     FALSE 0.002 1421.000 0.000 NA   NA
 10480007 10480008 LCRIS_02025 LCRIS_02040 5s rRNA tRNA-Asn TRUE 0.604 13.000 0.000 NA   NA
 10480008 10480009 LCRIS_02040 LCRIS_00065 tRNA-Asn   FALSE 0.002 519.000 0.000 NA   NA
 10480010 10480011 LCRIS_00066 LCRIS_00067   arbZ TRUE 0.663 93.000 0.333 1.000   NA
 10480011 10480012 LCRIS_00067 LCRIS_00068 arbZ arbY TRUE 0.985 -3.000 0.444 1.000 N NA
 10480012 10480013 LCRIS_00068 LCRIS_00069 arbY   TRUE 0.995 14.000 0.800 0.002 Y NA
 10480013 10480014 LCRIS_00069 LCRIS_00070   arbx TRUE 0.986 18.000 0.118 0.002 Y NA
 10480014 10480015 LCRIS_00070 LCRIS_00071 arbx arbV TRUE 0.907 17.000 0.176 NA N NA
 10480015 10480016 LCRIS_00071 LCRIS_02100 arbV tRNA-Lys FALSE 0.022 180.000 0.000 NA   NA
 10480016 10480017 LCRIS_02100 LCRIS_00072 tRNA-Lys   FALSE 0.069 133.000 0.000 NA   NA
 10480017 10480018 LCRIS_00072 LCRIS_02099   tRNA-Lys FALSE 0.106 119.000 0.000 NA   NA
 10480019 10480020 LCRIS_00073 LCRIS_00074 vicR vicK TRUE 0.943 71.000 0.597 0.066 Y NA
 10480020 10480021 LCRIS_00074 LCRIS_00075 vicK   TRUE 0.989 -19.000 0.575 NA   NA
 10480021 10480022 LCRIS_00075 LCRIS_00076     TRUE 0.981 3.000 0.890 NA   NA
 10480022 10480023 LCRIS_00076 LCRIS_00077     TRUE 0.895 13.000 0.176 NA   NA
 10480023 10480024 LCRIS_00077 LCRIS_00078   htrA FALSE 0.557 62.000 0.030 1.000   NA
 10480024 10480025 LCRIS_00078 LCRIS_00079 htrA ybeA FALSE 0.002 518.000 0.000 NA   NA
 10480025 10480026 LCRIS_00079 LCRIS_00080 ybeA   FALSE 0.002 500.000 0.000 NA   NA
 10480027 10480028 LCRIS_00081 LCRIS_00082 pepI cbiQ1 TRUE 0.877 9.000 0.061 1.000   NA
 10480028 10480029 LCRIS_00082 LCRIS_00083 cbiQ1 cbiO1 TRUE 0.913 5.000 0.122 1.000   NA
 10480031 10480032 LCRIS_00085 LCRIS_00086 htpX lemA TRUE 0.895 19.000 0.222 NA   NA
 10480032 10480033 LCRIS_00086 LCRIS_00087 lemA   FALSE 0.360 97.000 0.023 NA   NA
 10480034 10480035 LCRIS_00088 LCRIS_00089   glpQ1 TRUE 0.579 94.000 0.250 NA   NA
 10480035 10480036 LCRIS_00089 LCRIS_00090 glpQ1   FALSE 0.004 367.000 0.000 NA   NA
 10480036 10480037 LCRIS_00090 LCRIS_00091     TRUE 0.871 -16.000 0.000 NA   NA
 10480037 10480038 LCRIS_00091 LCRIS_00092     FALSE 0.353 47.000 0.000 NA   NA
 10480038 10480039 LCRIS_00092 LCRIS_00093     TRUE 0.850 18.000 0.041 NA N NA
 10480039 10480040 LCRIS_00093 LCRIS_00094     FALSE 0.395 89.000 0.010 1.000   NA
 10480040 10480041 LCRIS_00094 LCRIS_00095     TRUE 0.921 1.000 0.024 1.000   NA
 10480042 10480043 LCRIS_00096 LCRIS_00097     FALSE 0.263 82.000 0.000 1.000   NA
 10480043 10480044 LCRIS_00097 LCRIS_00098     TRUE 0.991 0.000 0.758 1.000 Y NA
 10480044 10480045 LCRIS_00098 LCRIS_00099     FALSE 0.008 333.000 0.000 1.000 N NA
 10480047 10480048 LCRIS_00101 LCRIS_00102   ogt1 TRUE 0.974 -13.000 0.103 1.000 N NA
 10480048 10480049 LCRIS_00102 LCRIS_00103 ogt1 npdA TRUE 0.714 53.000 0.091 1.000 N NA
 10480051 10480052 LCRIS_00105 LCRIS_00106 cls1   TRUE 0.934 20.000 0.500 NA   NA
 10480055 10480056 LCRIS_00109 LCRIS_00110     TRUE 0.904 9.000 0.143 NA N NA
 10480056 10480057 LCRIS_00110 LCRIS_00111     FALSE 0.509 69.000 0.048 NA   NA
 10480057 10480058 LCRIS_00111 LCRIS_00112     FALSE 0.017 197.000 0.000 NA   NA
 10480058 10480059 LCRIS_00112 LCRIS_00113     TRUE 0.613 14.000 0.000 NA   NA
 10480059 10480060 LCRIS_00113 LCRIS_00114     FALSE 0.005 308.000 0.000 NA   NA
 10480060 10480061 LCRIS_00114 LCRIS_00115     TRUE 0.720 3.000 0.000 NA   NA
 10480061 10480062 LCRIS_00115 LCRIS_00116     FALSE 0.522 23.000 0.000 NA   NA
 10480062 10480063 LCRIS_00116 LCRIS_00117     TRUE 0.875 -22.000 0.000 NA   NA
 10480063 10480064 LCRIS_00117 LCRIS_00118     FALSE 0.002 623.000 0.000 NA   NA
 10480064 10480065 LCRIS_00118 LCRIS_00119     FALSE 0.195 84.000 0.000 NA   NA
 10480065 10480066 LCRIS_00119 LCRIS_00120     TRUE 0.798 0.000 0.000 NA   NA
 10480066 10480067 LCRIS_00120 LCRIS_00121     FALSE 0.041 154.000 0.000 NA   NA
 10480067 10480068 LCRIS_00121 LCRIS_00122   prs1 FALSE 0.062 138.000 0.000 NA   NA
 10480068 10480069 LCRIS_00122 LCRIS_00123 prs1   FALSE 0.122 165.000 0.026 1.000 N NA
 10480069 10480070 LCRIS_00123 LCRIS_00124     TRUE 0.828 13.000 0.032 NA   NA
 10480070 10480071 LCRIS_00124 LCRIS_00125   glnP1 FALSE 0.264 127.000 0.077 NA   NA
 10480071 10480072 LCRIS_00125 LCRIS_00126 glnP1 glnQ1 TRUE 0.990 -7.000 0.410 1.000 Y NA
 10480074 10480075 LCRIS_00128 LCRIS_00129 ddl   TRUE 0.735 28.000 0.011 1.000   NA
 10480075 10480076 LCRIS_00129 LCRIS_00130     FALSE 0.455 91.000 0.085 NA   NA
 10480076 10480077 LCRIS_00130 LCRIS_00131     TRUE 0.990 -3.000 0.957 NA   NA
 10480077 10480078 LCRIS_00131 LCRIS_00132     TRUE 0.966 -28.000 0.089 NA   NA
 10480078 10480079 LCRIS_00132 LCRIS_00133     TRUE 0.877 -28.000 0.000 NA   NA
 10480083 10480084 LCRIS_00137 LCRIS_00138     TRUE 0.752 2.000 0.000 NA   NA
 10480084 10480085 LCRIS_00138 LCRIS_00139     FALSE 0.012 222.000 0.000 NA   NA
 10480085 10480086 LCRIS_00139 LCRIS_00140     FALSE 0.336 49.000 0.000 NA   NA
 10480092 10480093 LCRIS_00146 LCRIS_00147 phnD2 phnC TRUE 0.972 31.000 0.115 0.004 Y NA
 10480093 10480094 LCRIS_00147 LCRIS_00148 phnC phnE1 TRUE 0.997 0.000 0.654 0.004 Y NA
 10480094 10480095 LCRIS_00148 LCRIS_00149 phnE1 phnE2 TRUE 0.998 0.000 0.689 0.001 Y NA
 10480097 10480098 LCRIS_00151 LCRIS_00152     TRUE 0.843 57.000 0.600 NA   NA
 10480098 10480099 LCRIS_00152 LCRIS_00153   asnB FALSE 0.361 124.000 0.176 NA   NA
 10480099 10480100 LCRIS_00153 LCRIS_00154 asnB   TRUE 0.890 22.000 0.206 1.000   NA
 10480100 10480101 LCRIS_00154 LCRIS_00155   nrdD FALSE 0.071 174.000 0.010 1.000   NA
 10480101 10480102 LCRIS_00155 LCRIS_00156 nrdD nrdG TRUE 0.971 0.000 0.240 1.000 N NA
 10480102 10480103 LCRIS_00156 LCRIS_00157 nrdG   TRUE 0.643 52.000 0.072 NA   NA
 10480103 10480104 LCRIS_00157 LCRIS_00158     TRUE 0.992 -7.000 1.000 NA   NA
 10480104 10480105 LCRIS_00158 LCRIS_00159     FALSE 0.556 117.000 0.417 NA   NA
 10480105 10480106 LCRIS_00159 LCRIS_00160   pepO1 TRUE 0.678 82.000 0.333 NA   NA
 10480107 10480108 LCRIS_00161 LCRIS_00162 kup1   FALSE 0.012 222.000 0.000 NA   NA
 10480109 10480110 LCRIS_00163 LCRIS_00164     TRUE 0.852 -7.000 0.000 NA   NA
 10480110 10480111 LCRIS_00164 LCRIS_00165     FALSE 0.235 67.000 0.000 NA   NA
 10480112 10480113 LCRIS_00166 LCRIS_00167     TRUE 0.881 23.000 0.250 NA   NA
 10480113 10480114 LCRIS_00167 LCRIS_00168     FALSE 0.142 105.000 0.000 NA   NA
 10480115 10480116 LCRIS_00169 LCRIS_00170     TRUE 0.771 35.000 0.133 NA   NA
 10480116 10480117 LCRIS_00170 LCRIS_00171   slp1 FALSE 0.002 525.000 0.000 NA   NA
 10480117 10480118 LCRIS_00171 LCRIS_00172 slp1   FALSE 0.002 543.000 0.000 NA   NA
 10480119 10480120 LCRIS_00173 LCRIS_00174     FALSE 0.002 542.000 0.000 NA   NA
 10480120 10480121 LCRIS_00174 LCRIS_00175     FALSE 0.014 213.000 0.000 NA   NA
 10480124 10480125 LCRIS_00178 LCRIS_00179     FALSE 0.004 368.000 0.000 NA   NA
 10480125 10480126 LCRIS_00179 LCRIS_00180   cadD FALSE 0.002 602.000 0.000 NA   NA
 10480126 10480127 LCRIS_00180 LCRIS_00181 cadD   FALSE 0.021 182.000 0.000 NA   NA
 10480129 10480130 LCRIS_00183 LCRIS_00184   cwlA TRUE 0.986 20.000 0.500 0.005 N NA
 10480130 10480131 LCRIS_00184 LCRIS_00185 cwlA   FALSE 0.486 89.000 0.031 1.000 N NA
 10480132 10480133 LCRIS_00186 LCRIS_00187 pcp   FALSE 0.510 34.000 0.000 1.000   NA
 10480133 10480134 LCRIS_00187 LCRIS_00188     TRUE 0.956 8.000 0.600 NA   NA
 10480134 10480135 LCRIS_00188 LCRIS_00189     TRUE 0.689 85.000 0.400 NA   NA
 10480136 10480137 LCRIS_00190 LCRIS_00191 gpmA1   FALSE 0.010 278.000 0.000 1.000   NA
 10480137 10480138 LCRIS_00191 LCRIS_00192     TRUE 0.575 106.000 0.333 NA   NA
 10480138 10480139 LCRIS_00192 LCRIS_00193     TRUE 0.934 0.000 0.056 NA   NA
 10480139 10480140 LCRIS_00193 LCRIS_00194     TRUE 0.692 38.000 0.046 NA   NA
 10480140 10480141 LCRIS_00194 LCRIS_00195     TRUE 0.584 102.000 0.300 NA   NA
 10480141 10480142 LCRIS_00195 LCRIS_00196   tyrS FALSE 0.009 254.000 0.000 NA   NA
 10480142 10480143 LCRIS_00196 LCRIS_00197 tyrS   FALSE 0.003 426.000 0.000 NA   NA
 10480143 10480144 LCRIS_00197 LCRIS_02041   tRNA-Thr FALSE 0.106 119.000 0.000 NA   NA
 10480144 10480145 LCRIS_02041 LCRIS_00198 tRNA-Thr pepC1 FALSE 0.408 35.000 0.000 NA   NA
 10480145 10480146 LCRIS_00198 LCRIS_00199 pepC1   TRUE 0.932 0.000 0.020 1.000   NA
 10480146 10480147 LCRIS_00199 LCRIS_00200     FALSE 0.091 168.000 0.015 1.000   NA
 10480147 10480148 LCRIS_00200 LCRIS_00201     FALSE 0.548 189.000 0.600 0.036 Y NA
 10480148 10480149 LCRIS_00201 LCRIS_00202   guaB FALSE 0.077 173.000 0.003 1.000 N NA
 10480149 10480150 LCRIS_00202 LCRIS_00203 guaB oppB1 FALSE 0.085 169.000 0.003 1.000 N NA
 10480150 10480151 LCRIS_00203 LCRIS_00204 oppB1 oppC1 TRUE 0.969 9.000 0.134 0.036   NA
 10480151 10480152 LCRIS_00204 LCRIS_00205 oppC1 oppD1 TRUE 0.932 16.000 0.286 1.000   NA
 10480152 10480153 LCRIS_00205 LCRIS_00206 oppD1 oppF1 TRUE 0.992 21.000 0.619 0.003 Y NA
 10480154 10480155 LCRIS_00207 LCRIS_00208 pepC2 hsp FALSE 0.379 142.000 0.400 NA N NA
 10480156 10480157 LCRIS_00209 LCRIS_00210 greA1   FALSE 0.366 80.000 0.005 NA   NA
 10480158 10480159 LCRIS_02098 LCRIS_00211 tRNA-Gly   TRUE 0.617 10.000 0.000 NA   NA
 10480160 10480161 LCRIS_00212 LCRIS_00213 trpS comEB TRUE 0.844 16.000 0.007 1.000 N NA
 10480161 10480162 LCRIS_00213 LCRIS_00214 comEB   TRUE 0.791 14.000 0.009 NA   NA
 10480162 10480163 LCRIS_00214 LCRIS_00215   mgtA FALSE 0.006 299.000 0.000 NA   NA
 10480163 10480164 LCRIS_00215 LCRIS_00216 mgtA metG FALSE 0.389 99.000 0.006 1.000 N NA
 10480164 10480165 LCRIS_00216 LCRIS_00217 metG tatD TRUE 0.966 0.000 0.221 NA N NA
 10480165 10480166 LCRIS_00217 LCRIS_00218 tatD rnmV TRUE 0.978 -13.000 0.058 NA Y NA
 10480166 10480167 LCRIS_00218 LCRIS_00219 rnmV ksgA TRUE 0.972 -10.000 0.093 1.000 N NA
 10480167 10480168 LCRIS_00219 LCRIS_00220 ksgA   FALSE 0.062 138.000 0.000 NA   NA
 10480168 10480169 LCRIS_00220 LCRIS_00221   veg FALSE 0.091 124.000 0.000 NA   NA
 10480169 10480170 LCRIS_00221 LCRIS_00222 veg purR FALSE 0.328 109.000 0.035 NA   NA
 10480170 10480171 LCRIS_00222 LCRIS_00223 purR glmU TRUE 0.687 47.000 0.021 1.000 N NA
 10480171 10480172 LCRIS_00223 LCRIS_00224 glmU   FALSE 0.079 129.000 0.000 NA   NA
 10480172 10480173 LCRIS_00224 LCRIS_00225     FALSE 0.074 131.000 0.000 NA   NA
 10480173 10480174 LCRIS_00225 LCRIS_00226   prs2 FALSE 0.016 228.000 0.000 1.000   NA
 10480174 10480175 LCRIS_00226 LCRIS_00227 prs2   FALSE 0.039 168.000 0.000 NA N NA
 10480176 10480177 LCRIS_00228 LCRIS_00229     TRUE 0.660 32.000 0.011 NA   NA
 10480178 10480179 LCRIS_00230 LCRIS_00231   rpoE TRUE 0.719 47.000 0.122 NA   NA
 10480179 10480180 LCRIS_00231 LCRIS_00232 rpoE pyrG FALSE 0.354 117.000 0.029 1.000 N NA
 10480180 10480181 LCRIS_00232 LCRIS_00233 pyrG murA FALSE 0.193 135.000 0.007 1.000 N NA
 10480181 10480182 LCRIS_00233 LCRIS_00234 murA   FALSE 0.297 69.000 0.000 1.000   NA
 10480183 10480184 LCRIS_00235 LCRIS_00236 pepDA   TRUE 0.820 87.000 0.750 1.000 N NA
 10480184 10480185 LCRIS_00236 LCRIS_00237   pbuX FALSE 0.306 147.000 0.250 1.000 N NA
 10480185 10480186 LCRIS_00237 LCRIS_00238 pbuX xpt TRUE 0.925 7.000 0.037 1.000 Y NA
 10480186 10480187 LCRIS_00238 LCRIS_00239 xpt   FALSE 0.011 234.000 0.000 NA   NA
 10480187 10480188 LCRIS_00239 LCRIS_00240     FALSE 0.530 22.000 0.000 NA   NA
 10480189 10480190 LCRIS_00241 LCRIS_00242 guaA   FALSE 0.003 498.000 0.000 NA   NA
 10480190 10480191 LCRIS_00242 LCRIS_00243     FALSE 0.031 166.000 0.000 NA   NA
 10480191 10480192 LCRIS_00243 LCRIS_00244     FALSE 0.009 288.000 0.000 1.000   NA
 10480195 10480196 LCRIS_00247 LCRIS_00248     FALSE 0.082 128.000 0.000 NA   NA
 10480198 10480199 LCRIS_00250 LCRIS_00251     FALSE 0.003 497.000 0.000 NA   NA
 10480199 10480200 LCRIS_00251 LCRIS_00252     TRUE 0.833 -3.000 0.000 NA   NA
 10480200 10480201 LCRIS_00252 LCRIS_00253     FALSE 0.453 31.000 0.000 NA   NA
 10480201 10480202 LCRIS_00253 LCRIS_00254   ogt2 FALSE 0.026 270.000 0.000 1.000 Y NA
 10480202 10480203 LCRIS_00254 LCRIS_00255 ogt2   FALSE 0.424 70.000 0.012 NA   NA
 10480204 10480205 LCRIS_00256 LCRIS_00257     FALSE 0.484 27.000 0.000 NA   NA
 10480205 10480206 LCRIS_00257 LCRIS_00258     TRUE 0.703 31.000 0.000 NA Y NA
 10480206 10480207 LCRIS_00258 LCRIS_00259     FALSE 0.440 32.000 0.000 NA   NA
 10480207 10480208 LCRIS_00259 LCRIS_00260     TRUE 0.961 -28.000 0.043 NA   NA
 10480208 10480209 LCRIS_00260 LCRIS_00261     TRUE 0.685 13.000 0.000 1.000   NA
 10480209 10480210 LCRIS_00261 LCRIS_00262     FALSE 0.005 322.000 0.000 NA   NA
 10480210 10480211 LCRIS_00262 LCRIS_00263     TRUE 0.987 -19.000 0.500 NA   NA
 10480211 10480212 LCRIS_00263 LCRIS_00264   glyA FALSE 0.519 59.000 0.019 NA   NA
 10480212 10480213 LCRIS_00264 LCRIS_00265 glyA   FALSE 0.523 104.000 0.019 1.000 Y NA
 10480215 10480216 LCRIS_00267 LCRIS_00268 dexB rpmE FALSE 0.323 110.000 0.004 1.000 N NA
 10480216 10480217 LCRIS_00268 LCRIS_00269 rpmE murF FALSE 0.258 126.000 0.012 1.000 N NA
 10480217 10480218 LCRIS_00269 LCRIS_00270 murF deaD TRUE 0.864 14.000 0.021 1.000 N NA
 10480218 10480219 LCRIS_00270 LCRIS_00271 deaD acpS FALSE 0.507 83.000 0.025 1.000 N NA
 10480219 10480220 LCRIS_00271 LCRIS_00272 acpS alr TRUE 0.913 5.000 0.093 1.000 N NA
 10480221 10480222 LCRIS_00273 LCRIS_00274   ldh1 FALSE 0.105 171.000 0.098 NA   NA
 10480223 10480224 LCRIS_00275 LCRIS_00276 pth mfd TRUE 0.952 2.000 0.137 1.000 N NA
 10480224 10480225 LCRIS_00276 LCRIS_00277 mfd   TRUE 0.869 16.000 0.024 1.000 N NA
 10480225 10480226 LCRIS_00277 LCRIS_00278     FALSE 0.161 98.000 0.000 NA   NA
 10480226 10480227 LCRIS_00278 LCRIS_00279     FALSE 0.059 140.000 0.000 NA   NA
 10480227 10480228 LCRIS_00279 LCRIS_00280     TRUE 0.876 0.000 0.000 1.000 N NA
 10480228 10480229 LCRIS_00280 LCRIS_00281   mesJ TRUE 0.664 39.000 0.002 1.000 N NA
 10480229 10480230 LCRIS_00281 LCRIS_00282 mesJ ftsH FALSE 0.491 95.000 0.051 1.000 N NA
 10480230 10480231 LCRIS_00282 LCRIS_00283 ftsH hslO TRUE 0.772 53.000 0.041 1.000 Y NA
 10480231 10480232 LCRIS_00283 LCRIS_00284 hslO dusB FALSE 0.540 78.000 0.034 1.000 N NA
 10480232 10480233 LCRIS_00284 LCRIS_00285 dusB lysS TRUE 0.919 16.000 0.032 1.000 Y NA
 10480233 10480234 LCRIS_00285 LCRIS_00286 lysS   FALSE 0.004 339.000 0.000 NA   NA
 10480234 10480235 LCRIS_00286 LCRIS_00287     FALSE 0.002 581.000 0.000 NA   NA
 10480235 10480236 LCRIS_00287 LCRIS_02042   tRNA-Gly FALSE 0.065 137.000 0.000 NA   NA
 10480236 10480237 LCRIS_02042 LCRIS_00288 tRNA-Gly   FALSE 0.014 212.000 0.000 NA   NA
 10480237 10480238 LCRIS_00288 LCRIS_02043   tRNA-Gly FALSE 0.150 103.000 0.000 NA   NA
 10480238 10480239 LCRIS_02043 LCRIS_02044 tRNA-Gly tRNA-Gly FALSE 0.125 112.000 0.000 NA   NA
 10480239 10480240 LCRIS_02044 LCRIS_02045 tRNA-Gly tRNA-Pro FALSE 0.393 38.000 0.000 NA   NA
 10480240 10480241 LCRIS_02045 LCRIS_00289 tRNA-Pro   FALSE 0.214 75.000 0.000 NA   NA
 10480241 10480242 LCRIS_00289 LCRIS_00290   clpC FALSE 0.322 105.000 0.009 NA N NA
 10480242 10480243 LCRIS_00290 LCRIS_00291 clpC rpoB FALSE 0.087 222.000 0.000 0.092 N NA
 10480243 10480244 LCRIS_00291 LCRIS_00292 rpoB rpoC TRUE 0.996 16.000 0.851 0.002 Y NA
 10480246 10480247 LCRIS_00294 LCRIS_00295 rpsL rpsG TRUE 0.988 16.000 0.224 0.006 Y NA
 10480247 10480248 LCRIS_00295 LCRIS_00296 rpsG fusA TRUE 0.943 34.000 0.579 1.000 Y NA
 10480248 10480249 LCRIS_00296 LCRIS_00297 fusA rpsJ FALSE 0.030 316.000 0.014 1.000 Y NA
 10480249 10480250 LCRIS_00297 LCRIS_00298 rpsJ rplC TRUE 0.982 24.000 0.467 0.037 Y NA
 10480250 10480251 LCRIS_00298 LCRIS_00299 rplC rplD TRUE 0.990 15.000 0.544 0.028 Y NA
 10480251 10480252 LCRIS_00299 LCRIS_00300 rplD rplW TRUE 0.994 0.000 0.307 0.028 Y NA
 10480252 10480253 LCRIS_00300 LCRIS_00301 rplW rplB TRUE 0.993 16.000 0.849 0.032 Y NA
 10480253 10480254 LCRIS_00301 LCRIS_00302 rplB rpsS TRUE 0.991 19.000 0.820 0.037 Y NA
 10480254 10480255 LCRIS_00302 LCRIS_00303 rpsS rplV TRUE 0.990 20.000 0.769 0.037 Y NA
 10480255 10480256 LCRIS_00303 LCRIS_00304 rplV rpsC TRUE 0.991 14.000 0.719 0.037 Y NA
 10480256 10480257 LCRIS_00304 LCRIS_00305 rpsC rplP TRUE 0.997 0.000 0.828 0.037 Y NA
 10480257 10480258 LCRIS_00305 LCRIS_00306 rplP rpmC TRUE 0.998 -10.000 0.802 0.028 Y NA
 10480258 10480259 LCRIS_00306 LCRIS_00307 rpmC rpsQ TRUE 0.992 19.000 0.828 0.028 Y NA
 10480259 10480260 LCRIS_00307 LCRIS_00308 rpsQ rplN TRUE 0.984 32.000 0.791 0.037 Y NA
 10480260 10480261 LCRIS_00308 LCRIS_00309 rplN rplX TRUE 0.990 20.000 0.810 0.037 Y NA
 10480261 10480262 LCRIS_00309 LCRIS_00310 rplX rplE TRUE 0.993 15.000 0.758 0.028 Y NA
 10480262 10480263 LCRIS_00310 LCRIS_00311 rplE rpsZ TRUE 0.989 13.000 0.496 0.028 Y NA
 10480263 10480264 LCRIS_00311 LCRIS_00312 rpsZ rpsH TRUE 0.983 25.000 0.473 0.028 Y NA
 10480264 10480265 LCRIS_00312 LCRIS_00313 rpsH rplF TRUE 0.989 25.000 0.808 0.028 Y NA
 10480265 10480266 LCRIS_00313 LCRIS_00314 rplF rplR TRUE 0.988 27.000 0.815 0.028 Y NA
 10480266 10480267 LCRIS_00314 LCRIS_00315 rplR rpsE TRUE 0.992 18.000 0.814 0.037 Y NA
 10480267 10480268 LCRIS_00315 LCRIS_00316 rpsE rpmD TRUE 0.991 18.000 0.789 0.037 Y NA
 10480268 10480269 LCRIS_00316 LCRIS_00317 rpmD rplO TRUE 0.990 24.000 0.653 0.005 Y NA
 10480269 10480270 LCRIS_00317 LCRIS_00318 rplO secY TRUE 0.987 0.000 0.730 1.000 N NA
 10480270 10480271 LCRIS_00318 LCRIS_00319 secY adk TRUE 0.932 11.000 0.241 1.000 N NA
 10480271 10480272 LCRIS_00319 LCRIS_00320 adk infA FALSE 0.572 76.000 0.059 1.000 N NA
 10480272 10480273 LCRIS_00320 LCRIS_00321 infA rpsM FALSE 0.528 154.000 0.075 0.032 Y NA
 10480273 10480274 LCRIS_00321 LCRIS_00322 rpsM rpsK TRUE 0.989 25.000 0.810 0.028 Y NA
 10480274 10480275 LCRIS_00322 LCRIS_00323 rpsK rpoA TRUE 0.851 46.000 0.308 1.000 N NA
 10480275 10480276 LCRIS_00323 LCRIS_00324 rpoA rplQ TRUE 0.956 28.000 0.873 1.000 N NA
 10480276 10480277 LCRIS_00324 LCRIS_00325 rplQ cbiO2 FALSE 0.096 184.000 0.074 1.000 N NA
 10480277 10480278 LCRIS_00325 LCRIS_00326 cbiO2 cbiO3 TRUE 0.998 -24.000 0.713 0.029 Y NA
 10480278 10480279 LCRIS_00326 LCRIS_00327 cbiO3 cbiQ2 TRUE 0.955 4.000 0.136 1.000 Y NA
 10480279 10480280 LCRIS_00327 LCRIS_00328 cbiQ2 truA TRUE 0.911 5.000 0.085 1.000 N NA
 10480280 10480281 LCRIS_00328 LCRIS_00329 truA rplM FALSE 0.561 105.000 0.052 1.000 Y NA
 10480281 10480282 LCRIS_00329 LCRIS_00330 rplM rpsI TRUE 0.991 12.000 0.601 0.028 Y NA
 10480282 10480283 LCRIS_00330 LCRIS_00331 rpsI   FALSE 0.010 252.000 0.000 NA   NA
 10480283 10480284 LCRIS_00331 LCRIS_00332     TRUE 0.604 13.000 0.000 NA   NA
 10480284 10480285 LCRIS_00332 LCRIS_00333     FALSE 0.012 222.000 0.000 NA   NA
 10480286 10480287 LCRIS_00334 LCRIS_00335 thiJ   TRUE 0.609 37.000 0.008 NA   NA
 10480288 10480289 LCRIS_00336 LCRIS_00337   gpm1 TRUE 0.856 44.000 0.364 1.000   NA
 10480289 10480290 LCRIS_00337 LCRIS_00338 gpm1   TRUE 0.663 61.000 0.098 1.000 N NA
 10480290 10480291 LCRIS_00338 LCRIS_00339     TRUE 0.621 9.000 0.000 NA   NA
 10480291 10480292 LCRIS_00339 LCRIS_00340   gpmA2 TRUE 0.873 12.000 0.111 NA   NA
 10480292 10480293 LCRIS_00340 LCRIS_00341 gpmA2   FALSE 0.466 111.000 0.148 1.000   NA
 10480294 10480295 LCRIS_00342 LCRIS_00343     TRUE 0.833 -3.000 0.000 NA   NA
 10480295 10480296 LCRIS_00343 LCRIS_00344   pepC3 FALSE 0.059 140.000 0.000 NA   NA
 10480296 10480297 LCRIS_00344 LCRIS_00345 pepC3   FALSE 0.524 68.000 0.061 NA   NA
 10480298 10480299 LCRIS_00346 LCRIS_00347 dut radA TRUE 0.944 0.000 0.028 1.000 N NA
 10480299 10480300 LCRIS_00347 LCRIS_00348 radA gltX FALSE 0.464 78.000 0.005 1.000 N NA
 10480300 10480301 LCRIS_00348 LCRIS_00349 gltX cysS FALSE 0.561 91.000 0.013 1.000 Y NA
 10480301 10480302 LCRIS_00349 LCRIS_00350 cysS   TRUE 0.970 -7.000 0.129 1.000   NA
 10480302 10480303 LCRIS_00350 LCRIS_00351   yjfH TRUE 0.995 -13.000 0.150 0.006   NA
 10480303 10480304 LCRIS_00351 LCRIS_00352 yjfH   FALSE 0.093 134.000 0.000 1.000   NA
 10480304 10480305 LCRIS_00352 LCRIS_00353     FALSE 0.243 64.000 0.000 NA   NA
 10480305 10480306 LCRIS_00353 LCRIS_00354   gntK FALSE 0.558 117.000 0.429 NA   NA
 10480308 10480309 LCRIS_00356 LCRIS_00357 rpmG1 secE TRUE 0.895 10.000 0.080 1.000 N NA
 10480309 10480310 LCRIS_00357 LCRIS_00358 secE nusG TRUE 0.779 109.000 0.843 1.000 N NA
 10480310 10480311 LCRIS_00358 LCRIS_00359 nusG rplK TRUE 0.602 131.000 0.681 1.000 N NA
 10480311 10480312 LCRIS_00359 LCRIS_00360 rplK rplA TRUE 0.958 77.000 0.838 0.037 Y NA
 10480312 10480313 LCRIS_00360 LCRIS_00361 rplA pstS FALSE 0.260 120.000 0.002 1.000 N NA
 10480313 10480314 LCRIS_00361 LCRIS_00362 pstS pstC TRUE 0.953 4.000 0.121 1.000 Y NA
 10480314 10480315 LCRIS_00362 LCRIS_00363 pstC pstA TRUE 0.998 2.000 0.907 0.003 Y NA
 10480315 10480316 LCRIS_00363 LCRIS_00364 pstA pstB1 TRUE 0.993 9.000 0.490 0.003 Y NA
 10480316 10480317 LCRIS_00364 LCRIS_00365 pstB1 pstB2 TRUE 0.997 2.000 0.542 0.001 Y NA
 10480317 10480318 LCRIS_00365 LCRIS_00366 pstB2 phoU TRUE 0.958 18.000 0.413 NA Y NA
 10480319 10480320 LCRIS_00367 LCRIS_00368     TRUE 0.863 -10.000 0.000 NA   NA
 10480321 10480322 LCRIS_00369 LCRIS_00370   rplJ FALSE 0.016 204.000 0.000 NA   NA
 10480322 10480323 LCRIS_00370 LCRIS_00371 rplJ rplL TRUE 0.978 53.000 0.884 0.027 Y NA
 10480323 10480324 LCRIS_00371 LCRIS_00372 rplL   FALSE 0.359 77.000 0.003 NA   NA
 10480324 10480325 LCRIS_00372 LCRIS_00373     TRUE 0.811 6.000 0.010 NA   NA
 10480325 10480326 LCRIS_00373 LCRIS_00374     FALSE 0.177 128.000 0.010 NA   NA
 10480326 10480327 LCRIS_00374 LCRIS_00375     FALSE 0.368 75.000 0.004 NA   NA
 10480327 10480328 LCRIS_00375 LCRIS_00376   dnaX FALSE 0.058 206.000 0.018 1.000 N NA
 10480328 10480329 LCRIS_00376 LCRIS_00377 dnaX   TRUE 0.630 7.000 0.000 NA   NA
 10480329 10480330 LCRIS_00377 LCRIS_00378     TRUE 0.621 9.000 0.000 NA   NA
 10480330 10480331 LCRIS_00378 LCRIS_00379     TRUE 0.616 16.000 0.000 NA   NA
 10480331 10480332 LCRIS_00379 LCRIS_00380   recR TRUE 0.978 1.000 0.604 NA   NA
 10480332 10480333 LCRIS_00380 LCRIS_00381 recR   TRUE 0.937 0.000 0.071 NA   NA
 10480333 10480334 LCRIS_00381 LCRIS_00382   tmk FALSE 0.320 103.000 0.016 NA   NA
 10480334 10480335 LCRIS_00382 LCRIS_00383 tmk   TRUE 0.829 13.000 0.033 NA   NA
 10480335 10480336 LCRIS_00383 LCRIS_00384   holB TRUE 0.930 0.000 0.040 NA   NA
 10480336 10480337 LCRIS_00384 LCRIS_00385 holB   TRUE 0.842 10.000 0.038 NA   NA
 10480337 10480338 LCRIS_00385 LCRIS_00386     TRUE 0.931 0.000 0.043 NA   NA
 10480338 10480339 LCRIS_00386 LCRIS_00387     TRUE 0.899 3.000 0.021 1.000   NA
 10480339 10480340 LCRIS_00387 LCRIS_00388     FALSE 0.557 56.000 0.025 NA   NA
 10480340 10480341 LCRIS_00388 LCRIS_00389     TRUE 0.664 30.000 0.006 NA   NA
 10480341 10480342 LCRIS_00389 LCRIS_00390   rimI TRUE 0.961 -16.000 0.026 1.000   NA
 10480342 10480343 LCRIS_00390 LCRIS_00391 rimI gcp TRUE 0.944 -3.000 0.018 1.000   NA
 10480345 10480346 LCRIS_00393 LCRIS_00394     TRUE 0.638 6.000 0.000 NA   NA
 10480346 10480347 LCRIS_00394 LCRIS_00395     FALSE 0.513 24.000 0.000 NA   NA
 10480350 10480351 LCRIS_00398 LCRIS_00399 scrR scrB TRUE 0.931 16.000 0.222 1.000 N NA
 10480352 10480353 LCRIS_00400 LCRIS_00401 scrA1   FALSE 0.040 156.000 0.000 NA   NA
 10480353 10480354 LCRIS_00401 LCRIS_00402     FALSE 0.361 46.000 0.000 NA   NA
 10480354 10480355 LCRIS_00402 LCRIS_00403   groES FALSE 0.021 182.000 0.000 NA   NA
 10480355 10480356 LCRIS_00403 LCRIS_00404 groES groEL TRUE 0.827 54.000 0.160 1.000 Y NA
 10480356 10480357 LCRIS_00404 LCRIS_00405 groEL mutS1 FALSE 0.027 259.000 0.004 1.000 N NA
 10480357 10480358 LCRIS_00405 LCRIS_00406 mutS1 mutL TRUE 0.995 0.000 0.220 0.003 Y NA
 10480358 10480359 LCRIS_00406 LCRIS_00407 mutL ruvA TRUE 0.961 0.000 0.016 1.000 Y NA
 10480359 10480360 LCRIS_00407 LCRIS_00408 ruvA ruvB TRUE 0.982 40.000 0.549 0.004 Y NA
 10480360 10480361 LCRIS_00408 LCRIS_00409 ruvB yajC TRUE 0.612 60.000 0.063 NA N NA
 10480361 10480362 LCRIS_00409 LCRIS_00410 yajC zwf FALSE 0.324 104.000 0.008 NA N NA
 10480362 10480363 LCRIS_00410 LCRIS_00411 zwf dinB TRUE 0.971 -124.000 0.040 1.000 N NA
 10480363 10480364 LCRIS_00411 LCRIS_00412 dinB   TRUE 0.580 64.000 0.054 1.000   NA
 10480364 10480365 LCRIS_00412 LCRIS_00413     TRUE 0.975 -7.000 0.182 1.000   NA
 10480365 10480366 LCRIS_00413 LCRIS_00414   alaS FALSE 0.147 243.000 0.000 0.016 Y NA
 10480366 10480367 LCRIS_00414 LCRIS_00415 alaS   TRUE 0.608 61.000 0.110 NA   NA
 10480367 10480368 LCRIS_00415 LCRIS_00416   ruvX TRUE 0.953 0.000 0.144 NA   NA
 10480368 10480369 LCRIS_00416 LCRIS_00417 ruvX   TRUE 0.926 2.000 0.094 NA   NA
 10480369 10480370 LCRIS_00417 LCRIS_00418   mutS2 FALSE 0.512 58.000 0.015 NA   NA
 10480370 10480371 LCRIS_00418 LCRIS_00419 mutS2 trxA FALSE 0.475 83.000 0.013 1.000 N NA
 10480372 10480373 LCRIS_00420 LCRIS_00421 mscL   FALSE 0.368 89.000 0.003 1.000   NA
 10480374 10480375 LCRIS_00422 LCRIS_00423 murI rdgB TRUE 0.946 0.000 0.034 1.000 N NA
 10480375 10480376 LCRIS_00423 LCRIS_00424 rdgB   FALSE 0.220 95.000 0.000 1.000   NA
 10480376 10480377 LCRIS_00424 LCRIS_00425     FALSE 0.044 151.000 0.000 NA   NA
 10480379 10480380 LCRIS_00427 LCRIS_00428     TRUE 0.842 18.000 0.063 NA   NA
 10480384 10480385 LCRIS_00432 LCRIS_00433     TRUE 0.853 16.000 0.057 NA   NA
 10480385 10480386 LCRIS_00433 LCRIS_00434     TRUE 0.980 -7.000 0.347 NA   NA
 10480386 10480387 LCRIS_00434 LCRIS_00435     TRUE 0.970 0.000 0.320 NA   NA
 10480387 10480388 LCRIS_00435 LCRIS_00436     TRUE 0.976 -3.000 0.330 NA   NA
 10480389 10480390 LCRIS_00437 LCRIS_00438 dedA trxB1 TRUE 0.859 10.000 0.071 NA   NA
 10480392 10480393 LCRIS_00439 LCRIS_00440     FALSE 0.271 60.000 0.000 NA   NA
 10480394 10480395 LCRIS_00441 LCRIS_02046   tRNA-Ile FALSE 0.016 205.000 0.000 NA   NA
 10480395 10480396 LCRIS_02046 LCRIS_02047 tRNA-Ile tRNA-Ala FALSE 0.290 57.000 0.000 NA   NA
 10480396 10480397 LCRIS_02047 LCRIS_02032 tRNA-Ala 23s rRNA FALSE 0.094 123.000 0.000 NA   NA
 10480399 10480400 LCRIS_00443 LCRIS_02028   5s rRNA FALSE 0.004 340.000 0.000 NA   NA
 10480400 10480401 LCRIS_02028 LCRIS_02048 5s rRNA tRNA-Val TRUE 0.630 7.000 0.000 NA   NA
 10480401 10480402 LCRIS_02048 LCRIS_02049 tRNA-Val tRNA-Lys TRUE 0.654 5.000 0.000 NA   NA
 10480402 10480403 LCRIS_02049 LCRIS_02050 tRNA-Lys tRNA-Leu TRUE 0.613 14.000 0.000 NA   NA
 10480403 10480404 LCRIS_02050 LCRIS_02051 tRNA-Leu tRNA-Thr FALSE 0.503 25.000 0.000 NA   NA
 10480404 10480405 LCRIS_02051 LCRIS_02052 tRNA-Thr tRNA-Gly TRUE 0.613 11.000 0.000 NA   NA
 10480405 10480406 LCRIS_02052 LCRIS_02053 tRNA-Gly tRNA-Leu TRUE 0.605 12.000 0.000 NA   NA
 10480406 10480407 LCRIS_02053 LCRIS_02054 tRNA-Leu tRNA-Arg TRUE 0.621 9.000 0.000 NA   NA
 10480407 10480408 LCRIS_02054 LCRIS_02055 tRNA-Arg tRNA-Pro TRUE 0.638 6.000 0.000 NA   NA
 10480408 10480409 LCRIS_02055 LCRIS_02056 tRNA-Pro tRNA-Met FALSE 0.453 31.000 0.000 NA   NA
 10480409 10480410 LCRIS_02056 LCRIS_02057 tRNA-Met tRNA-Met TRUE 0.613 14.000 0.000 NA   NA
 10480410 10480411 LCRIS_02057 LCRIS_02058 tRNA-Met tRNA-Met FALSE 0.513 24.000 0.000 NA   NA
 10480411 10480412 LCRIS_02058 LCRIS_02059 tRNA-Met tRNA-Asp TRUE 0.679 4.000 0.000 NA   NA
 10480412 10480413 LCRIS_02059 LCRIS_02060 tRNA-Asp tRNA-Phe TRUE 0.630 7.000 0.000 NA   NA
 10480413 10480414 LCRIS_02060 LCRIS_02061 tRNA-Phe tRNA-Gly TRUE 0.573 19.000 0.000 NA   NA
 10480414 10480415 LCRIS_02061 LCRIS_02062 tRNA-Gly tRNA-Ile TRUE 0.630 7.000 0.000 NA   NA
 10480415 10480416 LCRIS_02062 LCRIS_02063 tRNA-Ile tRNA-Ser TRUE 0.720 3.000 0.000 NA   NA
 10480416 10480417 LCRIS_02063 LCRIS_02064 tRNA-Ser tRNA-Glu FALSE 0.002 754.000 0.000 NA   NA
 10480417 10480418 LCRIS_02064 LCRIS_02065 tRNA-Glu tRNA-Ser FALSE 0.408 35.000 0.000 NA   NA
 10480418 10480419 LCRIS_02065 LCRIS_02066 tRNA-Ser tRNA-Met TRUE 0.605 12.000 0.000 NA   NA
 10480419 10480420 LCRIS_02066 LCRIS_02067 tRNA-Met tRNA-Asp TRUE 0.679 4.000 0.000 NA   NA
 10480420 10480421 LCRIS_02067 LCRIS_02068 tRNA-Asp tRNA-Phe TRUE 0.630 7.000 0.000 NA   NA
 10480421 10480422 LCRIS_02068 LCRIS_02069 tRNA-Phe tRNA-Tyr TRUE 0.679 4.000 0.000 NA   NA
 10480422 10480423 LCRIS_02069 LCRIS_02070 tRNA-Tyr tRNA-Trp TRUE 0.654 5.000 0.000 NA   NA
 10480423 10480424 LCRIS_02070 LCRIS_02071 tRNA-Trp tRNA-His TRUE 0.604 13.000 0.000 NA   NA
 10480424 10480425 LCRIS_02071 LCRIS_02072 tRNA-His tRNA-Gln TRUE 0.654 5.000 0.000 NA   NA
 10480425 10480426 LCRIS_02072 LCRIS_02073 tRNA-Gln tRNA-Cys FALSE 0.513 24.000 0.000 NA   NA
 10480426 10480427 LCRIS_02073 LCRIS_02074 tRNA-Cys tRNA-Leu FALSE 0.377 42.000 0.000 NA   NA
 10480427 10480428 LCRIS_02074 LCRIS_00444 tRNA-Leu   FALSE 0.102 120.000 0.000 NA   NA
 10480428 10480429 LCRIS_00444 LCRIS_00445     TRUE 0.995 1.000 0.413 0.010 Y NA
 10480429 10480430 LCRIS_00445 LCRIS_00446     TRUE 0.971 0.000 0.336 NA   NA
 10480430 10480431 LCRIS_00446 LCRIS_00447     FALSE 0.545 75.000 0.109 NA   NA
 10480431 10480432 LCRIS_00447 LCRIS_00448   secG FALSE 0.491 68.000 0.004 1.000 N NA
 10480432 10480433 LCRIS_00448 LCRIS_00449 secG rnr TRUE 0.584 73.000 0.064 1.000 N NA
 10480433 10480434 LCRIS_00449 LCRIS_00450 rnr smpB TRUE 0.971 13.000 0.143 0.031 N NA
 10480434 10480435 LCRIS_00450 LCRIS_02035 smpB 16s rRNA FALSE 0.002 626.000 0.000 NA   NA
 10480436 10480437 LCRIS_00451 LCRIS_00452     TRUE 0.879 -66.000 0.000 NA   NA
 10480437 10480438 LCRIS_00452 LCRIS_00453     FALSE 0.022 181.000 0.000 NA   NA
 10480439 10480440 LCRIS_00454 LCRIS_02031   23s rRNA FALSE 0.007 281.000 0.000 NA   NA
 10480442 10480443 LCRIS_00456 LCRIS_02027   5s rRNA FALSE 0.004 340.000 0.000 NA   NA
 10480443 10480444 LCRIS_02027 LCRIS_02075 5s rRNA tRNA-Asn TRUE 0.604 13.000 0.000 NA   NA
 10480444 10480445 LCRIS_02075 LCRIS_00457 tRNA-Asn manL FALSE 0.006 296.000 0.000 NA   NA
 10480445 10480446 LCRIS_00457 LCRIS_00458 manL manY1 TRUE 0.992 22.000 0.943 0.027 Y NA
 10480446 10480447 LCRIS_00458 LCRIS_00459 manY1 manZ1 TRUE 0.988 29.000 0.812 0.027 Y NA
 10480447 10480448 LCRIS_00459 LCRIS_00460 manZ1 manO TRUE 0.964 4.000 0.583 NA   NA
 10480452 10480453 LCRIS_00464 LCRIS_00465 adhE glmS FALSE 0.052 197.000 0.003 1.000 N NA
 10480453 10480454 LCRIS_00465 LCRIS_00466 glmS mtlR FALSE 0.371 100.000 0.003 1.000 N NA
 10480454 10480455 LCRIS_00466 LCRIS_00467 mtlR mtlA TRUE 0.732 135.000 0.336 0.020 N NA
 10480455 10480456 LCRIS_00467 LCRIS_00468 mtlA mtlF TRUE 0.975 16.000 0.016 0.021 Y NA
 10480456 10480457 LCRIS_00468 LCRIS_00469 mtlF mtlD TRUE 0.947 3.000 0.031 1.000 Y NA
 10480457 10480458 LCRIS_00469 LCRIS_00470 mtlD   FALSE 0.035 161.000 0.000 NA   NA
 10480458 10480459 LCRIS_00470 LCRIS_00471     FALSE 0.003 464.000 0.000 NA   NA
 10480461 10480462 LCRIS_00473 LCRIS_00474     TRUE 0.877 -3.000 0.000 1.000   NA
 10480464 10480465 LCRIS_00476 LCRIS_00477     TRUE 0.929 5.000 0.258 NA   NA
 10480465 10480466 LCRIS_00477 LCRIS_00478   lhr TRUE 0.950 10.000 0.515 NA   NA
 10480466 10480467 LCRIS_00478 LCRIS_00479 lhr   TRUE 0.615 46.000 0.021 NA   NA
 10480467 10480468 LCRIS_00479 LCRIS_00480     FALSE 0.089 125.000 0.000 NA   NA
 10480468 10480469 LCRIS_00480 LCRIS_02076   tRNA-Thr FALSE 0.214 75.000 0.000 NA   NA
 10480475 10480476 LCRIS_00486 LCRIS_00487 pphA   FALSE 0.004 470.000 0.000 1.000   NA
 10480476 10480477 LCRIS_00487 LCRIS_00488     TRUE 0.844 5.000 0.000 NA Y NA
 10480477 10480478 LCRIS_00488 LCRIS_00489   celB1 FALSE 0.018 194.000 0.000 NA   NA
 10480478 10480479 LCRIS_00489 LCRIS_00490 celB1   TRUE 0.877 -28.000 0.000 NA   NA
 10480479 10480480 LCRIS_00490 LCRIS_00491     FALSE 0.004 368.000 0.000 NA   NA
 10480480 10480481 LCRIS_00491 LCRIS_00492     FALSE 0.363 162.000 0.750 NA   NA
 10480481 10480482 LCRIS_00492 LCRIS_00493   gpmB TRUE 0.908 42.000 0.750 NA   NA
 10480482 10480483 LCRIS_00493 LCRIS_00494 gpmB pgm1 TRUE 0.987 2.000 0.750 NA Y NA
 10480483 10480484 LCRIS_00494 LCRIS_00495 pgm1   TRUE 0.831 69.000 0.667 1.000   NA
 10480484 10480485 LCRIS_00495 LCRIS_00496   glpQ2 TRUE 0.786 47.000 0.182 1.000   NA
 10480485 10480486 LCRIS_00496 LCRIS_00497 glpQ2 lacI FALSE 0.567 34.000 0.000 1.000 N NA
 10480486 10480487 LCRIS_00497 LCRIS_00498 lacI   FALSE 0.164 197.000 0.364 1.000 N NA
 10480487 10480488 LCRIS_00498 LCRIS_00499     TRUE 0.991 21.000 0.917 0.033 Y NA
 10480488 10480489 LCRIS_00499 LCRIS_00500     TRUE 0.998 -7.000 0.917 0.033 Y NA
 10480489 10480490 LCRIS_00500 LCRIS_00501   sacA TRUE 0.982 0.000 0.273 1.000 Y NA
 10480490 10480491 LCRIS_00501 LCRIS_00502 sacA msmK1 TRUE 0.955 15.000 0.250 1.000 Y NA
 10480491 10480492 LCRIS_00502 LCRIS_00503 msmK1 gtfA1 TRUE 0.738 122.000 0.667 1.000 Y NA
 10480492 10480493 LCRIS_00503 LCRIS_02077 gtfA1 tRNA-Gln FALSE 0.025 174.000 0.000 NA   NA
 10480493 10480494 LCRIS_02077 LCRIS_00504 tRNA-Gln tyrB FALSE 0.072 132.000 0.000 NA   NA
 10480495 10480496 LCRIS_00505 LCRIS_00506   rpiA1 TRUE 0.955 -13.000 0.015 1.000   NA
 10480497 10480498 LCRIS_00507 LCRIS_00508   slpX FALSE 0.007 329.000 0.000 1.000   NA
 10480498 10480499 LCRIS_00508 LCRIS_00509 slpX   FALSE 0.052 145.000 0.000 NA   NA
 10480499 10480500 LCRIS_00509 LCRIS_00510     TRUE 0.604 13.000 0.000 NA   NA
 10480500 10480501 LCRIS_00510 LCRIS_00511   npr FALSE 0.008 260.000 0.000 NA   NA
 10480501 10480502 LCRIS_00511 LCRIS_02078 npr tRNA-Tyr FALSE 0.094 123.000 0.000 NA   NA
 10480502 10480503 LCRIS_02078 LCRIS_02079 tRNA-Tyr tRNA-Gln FALSE 0.408 35.000 0.000 NA   NA
 10480505 10480506 LCRIS_00513 LCRIS_00514     FALSE 0.023 177.000 0.000 NA   NA
 10480506 10480507 LCRIS_00514 LCRIS_00515   gntR1 FALSE 0.459 88.000 0.075 NA   NA
 10480509 10480510 LCRIS_00517 LCRIS_00518 tagA   TRUE 0.982 11.000 0.083 0.010 Y NA
 10480510 10480511 LCRIS_00518 LCRIS_00519   pncB FALSE 0.497 87.000 0.032 1.000 N NA
 10480511 10480512 LCRIS_00519 LCRIS_00520 pncB nadE TRUE 0.996 -3.000 0.194 0.003 Y NA
 10480512 10480513 LCRIS_00520 LCRIS_00521 nadE   FALSE 0.067 187.000 0.013 1.000 N NA
 10480513 10480514 LCRIS_00521 LCRIS_00522     TRUE 0.756 90.000 0.050 0.091 N NA
 10480514 10480515 LCRIS_00522 LCRIS_00523     TRUE 0.978 2.000 0.100 0.091   NA
 10480515 10480516 LCRIS_00523 LCRIS_00524     TRUE 0.970 3.000 0.571 NA   NA
 10480516 10480517 LCRIS_00524 LCRIS_00525   sprL FALSE 0.491 60.000 0.014 NA   NA
 10480517 10480518 LCRIS_00525 LCRIS_02080 sprL tRNA-Leu FALSE 0.210 77.000 0.000 NA   NA
 10480518 10480519 LCRIS_02080 LCRIS_00526 tRNA-Leu   FALSE 0.187 86.000 0.000 NA   NA
 10480519 10480520 LCRIS_00526 LCRIS_00527   pcrA FALSE 0.464 86.000 0.015 1.000 N NA
 10480520 10480521 LCRIS_00527 LCRIS_00528 pcrA ligA TRUE 0.957 35.000 0.103 0.021 Y NA
 10480521 10480522 LCRIS_00528 LCRIS_00529 ligA   TRUE 0.825 13.000 0.030 NA   NA
 10480522 10480523 LCRIS_00529 LCRIS_00530   gatC TRUE 0.807 12.000 0.017 NA   NA
 10480523 10480524 LCRIS_00530 LCRIS_00531 gatC gatA TRUE 0.998 0.000 0.643 0.002 Y NA
 10480524 10480525 LCRIS_00531 LCRIS_00532 gatA gatB TRUE 0.994 5.000 0.492 0.002 Y NA
 10480525 10480526 LCRIS_00532 LCRIS_00533 gatB dagK TRUE 0.819 25.000 0.034 1.000 N NA
 10480528 10480529 LCRIS_00535 LCRIS_00536     FALSE 0.003 447.000 0.000 NA   NA
 10480529 10480530 LCRIS_00536 LCRIS_00537     TRUE 0.992 -13.000 0.821 NA N NA
 10480530 10480531 LCRIS_00537 LCRIS_00538   rutR TRUE 0.968 -3.000 0.160 NA N NA
 10480531 10480532 LCRIS_00538 LCRIS_00539 rutR tnpR FALSE 0.186 117.000 0.000 1.000 N NA
 10480532 10480533 LCRIS_00539 LCRIS_00540 tnpR   FALSE 0.218 73.000 0.000 NA   NA
 10480534 10480535 LCRIS_00541 LCRIS_00542     FALSE 0.005 363.000 0.000 1.000   NA
 10480537 10480538 LCRIS_00544 LCRIS_00545     TRUE 0.852 -7.000 0.000 NA   NA
 10480539 10480540 LCRIS_00546 LCRIS_00547     TRUE 0.986 -16.000 0.200 NA Y NA
 10480540 10480541 LCRIS_00547 LCRIS_00548     FALSE 0.011 232.000 0.000 NA   NA
 10480542 10480543 LCRIS_00549 LCRIS_00550     FALSE 0.225 70.000 0.000 NA   NA
 10480543 10480544 LCRIS_00550 LCRIS_00551   nhaC FALSE 0.191 85.000 0.000 NA   NA
 10480545 10480546 LCRIS_00552 LCRIS_00553 pbp1 rumA1 FALSE 0.303 84.000 0.000 1.000 N NA
 10480546 10480547 LCRIS_00553 LCRIS_00554 rumA1   TRUE 0.785 3.000 0.000 1.000   NA
 10480547 10480548 LCRIS_00554 LCRIS_02081   tRNA-Ser FALSE 0.173 91.000 0.000 NA   NA
 10480548 10480549 LCRIS_02081 LCRIS_02082 tRNA-Ser tRNA-Asp TRUE 0.654 5.000 0.000 NA   NA
 10480549 10480550 LCRIS_02082 LCRIS_00555 tRNA-Asp   TRUE 0.876 -24.000 0.000 NA   NA
 10480550 10480551 LCRIS_00555 LCRIS_02083   tRNA-His TRUE 0.879 -106.000 0.000 NA   NA
 10480551 10480552 LCRIS_02083 LCRIS_02084 tRNA-His tRNA-Val TRUE 0.654 5.000 0.000 NA   NA
 10480552 10480553 LCRIS_02084 LCRIS_00556 tRNA-Val   FALSE 0.221 71.000 0.000 NA   NA
 10480555 10480556 LCRIS_00558 LCRIS_00559 mycA1   FALSE 0.004 360.000 0.000 NA   NA
 10480556 10480557 LCRIS_00559 LCRIS_00560     FALSE 0.046 164.000 0.000 1.000   NA
 10480557 10480558 LCRIS_00560 LCRIS_00561     FALSE 0.203 81.000 0.000 NA   NA
 10480559 10480560 LCRIS_00562 LCRIS_00563   uraA FALSE 0.034 187.000 0.000 1.000 N NA
 10480560 10480561 LCRIS_00563 LCRIS_00564 uraA pyrR1 TRUE 0.939 12.000 0.140 1.000 Y NA
 10480563 10480564 LCRIS_00566 LCRIS_00567 mdtG1   TRUE 0.852 -7.000 0.000 NA   NA
 10480564 10480565 LCRIS_00567 LCRIS_00568     FALSE 0.137 107.000 0.000 NA   NA
 10480565 10480566 LCRIS_00568 LCRIS_00569     FALSE 0.032 165.000 0.000 NA   NA
 10480567 10480568 LCRIS_00570 LCRIS_00571     FALSE 0.330 94.000 0.010 NA   NA
 10480568 10480569 LCRIS_00571 LCRIS_00572     FALSE 0.239 88.000 0.000 1.000   NA
 10480569 10480570 LCRIS_00572 LCRIS_00573     FALSE 0.165 95.000 0.000 NA   NA
 10480571 10480572 LCRIS_00574 LCRIS_00575     FALSE 0.174 227.000 0.000 0.013 Y NA
 10480575 10480576 LCRIS_00578 LCRIS_00579     TRUE 0.973 -13.000 0.120 1.000   NA
 10480576 10480577 LCRIS_00579 LCRIS_00580     TRUE 0.997 1.000 0.720 0.015 Y NA
 10480577 10480578 LCRIS_00580 LCRIS_00581     FALSE 0.073 181.000 0.053 NA   NA
 10480578 10480579 LCRIS_00581 LCRIS_00582     FALSE 0.134 108.000 0.000 NA   NA
 10480581 10480582 LCRIS_00584 LCRIS_00585 glnQ2 glnH2 TRUE 0.930 12.000 0.093 1.000 Y NA
 10480582 10480583 LCRIS_00585 LCRIS_00586 glnH2 glnM TRUE 0.989 0.000 0.067 0.054 Y NA
 10480583 10480584 LCRIS_00586 LCRIS_00587 glnM glnP2 TRUE 0.995 18.000 0.947 0.011 Y NA
 10480584 10480585 LCRIS_00587 LCRIS_00588 glnP2   FALSE 0.212 76.000 0.000 NA   NA
 10480585 10480586 LCRIS_00588 LCRIS_00589     FALSE 0.184 87.000 0.000 NA   NA
 10480586 10480587 LCRIS_00589 LCRIS_00590     TRUE 0.935 -3.000 0.000 NA Y NA
 10480591 10480592 LCRIS_00594 LCRIS_00595   rbsK FALSE 0.486 90.000 0.065 1.000   NA
 10480592 10480593 LCRIS_00595 LCRIS_00596 rbsK rpiA2 TRUE 0.958 0.000 0.008 1.000 Y NA
 10480593 10480594 LCRIS_00596 LCRIS_00597 rpiA2 kup2 FALSE 0.171 139.000 0.005 1.000 N NA
 10480594 10480595 LCRIS_00597 LCRIS_00598 kup2 iunH1 TRUE 0.641 82.000 0.158 1.000 N NA
 10480595 10480596 LCRIS_00598 LCRIS_00599 iunH1   TRUE 0.973 0.000 0.263 1.000 N NA
 10480597 10480598 LCRIS_00600 LCRIS_00601     FALSE 0.098 122.000 0.000 NA   NA
 10480598 10480599 LCRIS_00601 LCRIS_00602     TRUE 0.871 6.000 0.073 NA   NA
 10480600 10480601 LCRIS_00603 LCRIS_00604 xfp   FALSE 0.546 68.000 0.038 1.000   NA
 10480603 10480604 LCRIS_00606 LCRIS_00607 malX glvR TRUE 0.622 62.000 0.055 1.000 N NA
 10480604 10480605 LCRIS_00607 LCRIS_00608 glvR   TRUE 0.986 -13.000 0.444 NA   NA
 10480605 10480606 LCRIS_00608 LCRIS_00609   crr1 TRUE 0.945 21.000 0.667 NA   NA
 10480606 10480607 LCRIS_00609 LCRIS_00610 crr1   FALSE 0.540 119.000 0.429 NA   NA
 10480607 10480608 LCRIS_00610 LCRIS_00611     TRUE 0.761 72.000 0.500 NA   NA
 10480608 10480609 LCRIS_00611 LCRIS_00612     FALSE 0.488 103.000 0.118 1.000   NA
 10480609 10480610 LCRIS_00612 LCRIS_00613   hpt1 TRUE 0.613 107.000 0.353 1.000   NA
 10480610 10480611 LCRIS_00613 LCRIS_00614 hpt1 frdA1 FALSE 0.045 173.000 0.000 1.000 N NA
 10480612 10480613 LCRIS_00615 LCRIS_00616     FALSE 0.158 100.000 0.000 NA   NA
 10480613 10480614 LCRIS_00616 LCRIS_00617     TRUE 0.875 -22.000 0.000 NA   NA
 10480617 10480618 LCRIS_00620 LCRIS_00621     TRUE 0.915 3.000 0.026 1.000 N NA
 10480618 10480619 LCRIS_00621 LCRIS_00622   celB2 TRUE 0.959 -3.000 0.043 1.000 N NA
 10480619 10480620 LCRIS_00622 LCRIS_02085 celB2 tRNA-Arg FALSE 0.331 50.000 0.000 NA   NA
 10480623 10480624 LCRIS_00625 LCRIS_00626     TRUE 0.965 -7.000 0.086 1.000   NA
 10480625 10480626 LCRIS_00627 LCRIS_00628 map   TRUE 0.944 9.000 0.373 1.000   NA
 10480626 10480627 LCRIS_00628 LCRIS_00629   galU TRUE 0.649 61.000 0.111 1.000   NA
 10480627 10480628 LCRIS_00629 LCRIS_00630 galU atoB FALSE 0.411 111.000 0.047 1.000 N NA
 10480628 10480629 LCRIS_00630 LCRIS_00631 atoB mvaA TRUE 0.978 -3.000 0.098 1.000 Y NA
 10480629 10480630 LCRIS_00631 LCRIS_00632 mvaA pksG TRUE 0.978 0.000 0.183 1.000 Y NA
 10480634 10480635 LCRIS_00636 LCRIS_00637 recX   TRUE 0.792 9.000 0.007 NA   NA
 10480637 10480638 LCRIS_00639 LCRIS_00640 tlyC prfC TRUE 0.912 0.000 0.015 NA   NA
 10480638 10480639 LCRIS_00640 LCRIS_00641 prfC   TRUE 0.699 15.000 0.000 1.000   NA
 10480639 10480640 LCRIS_00641 LCRIS_00642     TRUE 0.750 102.000 0.667 1.000   NA
 10480640 10480641 LCRIS_00642 LCRIS_00643     FALSE 0.091 124.000 0.000 NA   NA
 10480641 10480642 LCRIS_00643 LCRIS_00644     FALSE 0.195 84.000 0.000 NA   NA
 10480642 10480643 LCRIS_00644 LCRIS_00645     FALSE 0.165 95.000 0.000 NA   NA
 10480643 10480644 LCRIS_00645 LCRIS_00646     FALSE 0.125 112.000 0.000 NA   NA
 10480644 10480645 LCRIS_00646 LCRIS_00647     TRUE 0.605 12.000 0.000 NA   NA
 10480646 10480647 LCRIS_00648 LCRIS_00649   clpE1 FALSE 0.206 146.000 0.141 NA   NA
 10480648 10480649 LCRIS_00650 LCRIS_00651   ptsH FALSE 0.319 113.000 0.039 NA   NA
 10480649 10480650 LCRIS_00651 LCRIS_00652 ptsH ptsI TRUE 0.994 0.000 0.240 0.020 Y NA
 10480650 10480651 LCRIS_00652 LCRIS_00653 ptsI arsC FALSE 0.021 224.000 0.000 1.000 N NA
 10480651 10480652 LCRIS_00653 LCRIS_00654 arsC mecA FALSE 0.416 105.000 0.067 NA N NA
 10480652 10480653 LCRIS_00654 LCRIS_00655 mecA coiA FALSE 0.531 72.000 0.089 NA   NA
 10480654 10480655 LCRIS_00656 LCRIS_00657     FALSE 0.365 87.000 0.013 NA   NA
 10480656 10480657 LCRIS_00658 LCRIS_00659   ppnK TRUE 0.989 -3.000 0.725 1.000   NA
 10480657 10480658 LCRIS_00659 LCRIS_00660 ppnK rluD1 TRUE 0.966 -7.000 0.060 1.000 N NA
 10480658 10480659 LCRIS_00660 LCRIS_00661 rluD1 mycA2 FALSE 0.524 106.000 0.250 NA   NA
 10480660 10480661 LCRIS_00662 LCRIS_00663   pgl FALSE 0.030 259.000 0.050 NA   NA
 10480662 10480663 LCRIS_00664 LCRIS_00665 srlB   TRUE 0.925 17.000 0.324 NA   NA
 10480663 10480664 LCRIS_00665 LCRIS_00666   cspR FALSE 0.475 63.000 0.018 NA   NA
 10480664 10480665 LCRIS_00666 LCRIS_00667 cspR   TRUE 0.924 0.000 0.011 1.000   NA
 10480665 10480666 LCRIS_00667 LCRIS_00668   ftsK TRUE 0.862 13.000 0.042 1.000   NA
 10480666 10480667 LCRIS_00668 LCRIS_00669 ftsK   TRUE 0.966 -13.000 0.058 1.000   NA
 10480667 10480668 LCRIS_00669 LCRIS_00670     TRUE 0.998 -3.000 0.872 0.004   NA
 10480668 10480669 LCRIS_00670 LCRIS_00671   fabG TRUE 0.944 14.000 0.397 1.000   NA
 10480669 10480670 LCRIS_00671 LCRIS_00672 fabG   TRUE 0.685 68.000 0.213 1.000   NA
 10480670 10480671 LCRIS_00672 LCRIS_00673   pgsA TRUE 0.870 18.000 0.077 1.000   NA
 10480673 10480674 LCRIS_00674 LCRIS_00676 recA ymdA FALSE 0.309 116.000 0.018 1.000   NA
 10480674 10480675 LCRIS_00676 LCRIS_00677 ymdA rfe FALSE 0.346 105.000 0.014 1.000   NA
 10480677 10480678 LCRIS_00679 LCRIS_00680 comFA comFC TRUE 0.960 -3.000 0.130 NA   NA
 10480678 10480679 LCRIS_00680 LCRIS_00681 comFC yfiA FALSE 0.498 81.000 0.080 NA   NA
 10480679 10480680 LCRIS_00681 LCRIS_00682 yfiA secA FALSE 0.187 142.000 0.041 NA N NA
 10480680 10480681 LCRIS_00682 LCRIS_00683 secA prfB FALSE 0.092 183.000 0.052 1.000 N NA
 10480681 10480682 LCRIS_00683 LCRIS_00684 prfB   TRUE 0.621 9.000 0.000 NA   NA
 10480682 10480683 LCRIS_00684 LCRIS_00685   ptsK TRUE 0.620 15.000 0.000 NA   NA
 10480683 10480684 LCRIS_00685 LCRIS_00686 ptsK lgt TRUE 0.988 -7.000 0.494 1.000 N NA
 10480684 10480685 LCRIS_00686 LCRIS_00687 lgt gpsA TRUE 0.759 41.000 0.067 1.000 N NA
 10480685 10480686 LCRIS_00687 LCRIS_00688 gpsA trxB2 FALSE 0.510 82.000 0.025 1.000 N NA
 10480686 10480687 LCRIS_00688 LCRIS_00689 trxB2 pgm2 FALSE 0.123 167.000 0.033 1.000 N NA
 10480687 10480688 LCRIS_00689 LCRIS_00690 pgm2 uvrB FALSE 0.369 103.000 0.006 1.000 N NA
 10480688 10480689 LCRIS_00690 LCRIS_00691 uvrB uvrA1 TRUE 0.997 -10.000 0.154 0.002 Y NA
 10480689 10480690 LCRIS_00691 LCRIS_00692 uvrA1   FALSE 0.391 73.000 0.007 NA   NA
 10480690 10480691 LCRIS_00692 LCRIS_00693     FALSE 0.441 94.000 0.081 NA   NA
 10480691 10480692 LCRIS_00693 LCRIS_00694     TRUE 0.908 11.000 0.214 NA   NA
 10480692 10480693 LCRIS_00694 LCRIS_00695   whiA TRUE 0.984 -7.000 0.470 NA   NA
 10480695 10480696 LCRIS_00697 LCRIS_00698   ybbL FALSE 0.132 109.000 0.000 NA   NA
 10480696 10480697 LCRIS_00698 LCRIS_00699 ybbL ybbM TRUE 0.960 -3.000 0.127 NA   NA
 10480698 10480699 LCRIS_00700 LCRIS_00701     TRUE 0.959 1.000 0.273 NA   NA
 10480700 10480701 LCRIS_00702 LCRIS_00703     FALSE 0.195 84.000 0.000 NA   NA
 10480705 10480706 LCRIS_00706 LCRIS_00707 cggR gapA TRUE 0.729 53.000 0.109 1.000 N NA
 10480706 10480707 LCRIS_00707 LCRIS_00708 gapA pgk TRUE 0.792 115.000 0.013 0.006 Y NA
 10480707 10480708 LCRIS_00708 LCRIS_00709 pgk tpiA TRUE 0.911 25.000 0.141 1.000 Y NA
 10480709 10480710 LCRIS_00710 LCRIS_00711     TRUE 0.859 20.000 0.136 NA   NA
 10480711 10480712 LCRIS_00712 LCRIS_00713 ung pta TRUE 0.897 11.000 0.092 1.000 N NA
 10480712 10480713 LCRIS_00713 LCRIS_00714 pta   TRUE 0.920 0.000 0.023 NA   NA
 10480715 10480716 LCRIS_00716 LCRIS_00717 murB potA TRUE 0.589 67.000 0.041 1.000 N NA
 10480716 10480717 LCRIS_00717 LCRIS_00718 potA potB TRUE 0.996 -10.000 0.928 1.000 Y NA
 10480717 10480718 LCRIS_00718 LCRIS_00719 potB potC TRUE 0.997 -3.000 0.492 0.031 Y NA
 10480718 10480719 LCRIS_00719 LCRIS_00720 potC potD TRUE 0.995 -3.000 0.253 0.031 Y NA
 10480719 10480720 LCRIS_00720 LCRIS_00721 potD   TRUE 0.630 39.000 0.016 NA   NA
 10480720 10480721 LCRIS_00721 LCRIS_00722   ybbR TRUE 0.983 -3.000 0.502 NA   NA
 10480721 10480722 LCRIS_00722 LCRIS_00723 ybbR glmM TRUE 0.850 23.000 0.150 NA   NA
 10480722 10480723 LCRIS_00723 LCRIS_00724 glmM   FALSE 0.340 101.000 0.005 1.000   NA
 10480723 10480724 LCRIS_00724 LCRIS_00725   copY FALSE 0.541 31.000 0.000 1.000   NA
 10480724 10480725 LCRIS_00725 LCRIS_00726 copY   TRUE 0.620 15.000 0.000 NA   NA
 10480725 10480726 LCRIS_00726 LCRIS_00727   ptpA TRUE 0.897 0.000 0.005 NA   NA
 10480728 10480729 LCRIS_00729 LCRIS_00730 bglG1 bglF1 FALSE 0.461 128.000 0.333 1.000   NA
 10480729 10480730 LCRIS_00730 LCRIS_00731 bglF1 bglA1 TRUE 0.899 42.000 0.300 1.000 Y NA
 10480730 10480731 LCRIS_00731 LCRIS_00732 bglA1   FALSE 0.162 172.000 0.200 1.000   NA
 10480733 10480734 LCRIS_00734 LCRIS_00735 rpsN   TRUE 0.926 -22.000 0.000 1.000 N NA
 10480734 10480735 LCRIS_00735 LCRIS_00736     FALSE 0.220 72.000 0.000 NA   NA
 10480735 10480736 LCRIS_00736 LCRIS_00737     FALSE 0.375 85.000 0.013 NA   NA
 10480736 10480737 LCRIS_00737 LCRIS_00738   comGA FALSE 0.042 198.000 0.014 NA   NA
 10480737 10480738 LCRIS_00738 LCRIS_00739 comGA comGB TRUE 0.994 -31.000 0.639 NA Y NA
 10480738 10480739 LCRIS_00739 LCRIS_00740 comGB comGC TRUE 0.917 60.000 0.861 NA Y NA
 10480739 10480740 LCRIS_00740 LCRIS_00741 comGC comGD TRUE 0.959 -13.000 0.050 NA   NA
 10480740 10480741 LCRIS_00741 LCRIS_00742 comGD   TRUE 0.979 -3.000 0.400 NA   NA
 10480741 10480742 LCRIS_00742 LCRIS_00743     TRUE 0.961 8.000 0.667 NA   NA
 10480742 10480743 LCRIS_00743 LCRIS_00744     TRUE 0.877 -28.000 0.000 NA   NA
 10480743 10480744 LCRIS_00744 LCRIS_00745     FALSE 0.279 59.000 0.000 NA   NA
 10480744 10480745 LCRIS_00745 LCRIS_00746   ackA1 TRUE 0.711 44.000 0.026 1.000 N NA
 10480745 10480746 LCRIS_00746 LCRIS_00747 ackA1   FALSE 0.002 808.000 0.000 NA   NA
 10480746 10480747 LCRIS_00747 LCRIS_00748   patB TRUE 0.937 9.000 0.386 NA   NA
 10480747 10480748 LCRIS_00748 LCRIS_00749 patB manA FALSE 0.563 93.000 0.125 1.000 N NA
 10480748 10480749 LCRIS_00749 LCRIS_00750 manA   TRUE 0.757 36.000 0.120 NA   NA
 10480749 10480750 LCRIS_00750 LCRIS_00751     TRUE 0.917 3.000 0.103 NA   NA
 10480750 10480751 LCRIS_00751 LCRIS_00752     TRUE 0.989 0.000 0.586 1.000 Y NA
 10480753 10480754 LCRIS_00754 LCRIS_00755   pgi FALSE 0.395 88.000 0.011 NA N NA
 10480754 10480755 LCRIS_00755 LCRIS_00756 pgi   FALSE 0.245 119.000 0.005 1.000   NA
 10480755 10480756 LCRIS_00756 LCRIS_00757     TRUE 0.879 -45.000 0.000 NA   NA
 10480758 10480759 LCRIS_02086 LCRIS_02087 tRNA-Glu tRNA-Gln TRUE 0.638 6.000 0.000 NA   NA
 10480761 10480762 LCRIS_00760 LCRIS_00761 tdk prfA TRUE 0.884 17.000 0.062 1.000 N NA
 10480762 10480763 LCRIS_00761 LCRIS_00762 prfA hemK TRUE 0.993 -7.000 0.084 0.047 Y NA
 10480763 10480764 LCRIS_00762 LCRIS_00763 hemK sua TRUE 0.949 6.000 0.204 NA Y NA
 10480764 10480765 LCRIS_00763 LCRIS_00764 sua upp FALSE 0.429 85.000 0.017 NA N NA
 10480765 10480766 LCRIS_00764 LCRIS_00765 upp atpB FALSE 0.260 123.000 0.007 1.000 N NA
 10480766 10480767 LCRIS_00765 LCRIS_00766 atpB atpE TRUE 0.990 21.000 0.557 0.005 Y NA
 10480767 10480768 LCRIS_00766 LCRIS_00767 atpE atpF TRUE 0.940 57.000 0.077 0.004 Y NA
 10480768 10480769 LCRIS_00767 LCRIS_00768 atpF atpH TRUE 0.995 0.000 0.222 0.004 Y NA
 10480769 10480770 LCRIS_00768 LCRIS_00769 atpH atpA TRUE 0.996 6.000 0.864 0.004 Y NA
 10480770 10480771 LCRIS_00769 LCRIS_00770 atpA atpG TRUE 0.995 11.000 0.846 0.004 Y NA
 10480771 10480772 LCRIS_00770 LCRIS_00771 atpG atpD TRUE 0.992 23.000 0.724 0.004 Y NA
 10480772 10480773 LCRIS_00771 LCRIS_00772 atpD atpC TRUE 0.995 12.000 0.837 0.004 Y NA
 10480773 10480774 LCRIS_00772 LCRIS_00773 atpC   FALSE 0.505 67.000 0.039 NA   NA
 10480774 10480775 LCRIS_00773 LCRIS_00774   mreB1 FALSE 0.465 84.000 0.055 NA   NA
 10480775 10480776 LCRIS_00774 LCRIS_00775 mreB1   TRUE 0.802 14.000 0.013 NA   NA
 10480776 10480777 LCRIS_00775 LCRIS_00776     TRUE 0.818 9.000 0.018 NA   NA
 10480777 10480778 LCRIS_00776 LCRIS_00777   rodA TRUE 0.889 22.000 0.270 NA   NA
 10480779 10480780 LCRIS_00778 LCRIS_00779     TRUE 0.684 61.000 0.208 NA   NA
 10480780 10480781 LCRIS_00779 LCRIS_00780   ycaJ FALSE 0.005 311.000 0.000 NA   NA
 10480781 10480782 LCRIS_00780 LCRIS_00781 ycaJ yueI TRUE 0.945 1.000 0.153 NA   NA
 10480782 10480783 LCRIS_00781 LCRIS_00782 yueI rpsD FALSE 0.323 92.000 0.007 NA   NA
 10480784 10480785 LCRIS_00783 LCRIS_00784 ezrA nifS TRUE 0.637 88.000 0.201 1.000 N NA
 10480785 10480786 LCRIS_00784 LCRIS_00785 nifS thiI TRUE 0.978 0.000 0.349 1.000 N NA
 10480786 10480787 LCRIS_00785 LCRIS_00786 thiI rsuA1 TRUE 0.656 47.000 0.009 1.000 N NA
 10480787 10480788 LCRIS_00786 LCRIS_00787 rsuA1   FALSE 0.077 142.000 0.000 1.000   NA
 10480788 10480789 LCRIS_00787 LCRIS_00788     TRUE 0.981 -3.000 0.000 0.019   NA
 10480789 10480790 LCRIS_00788 LCRIS_00789     FALSE 0.160 99.000 0.000 NA   NA
 10480790 10480791 LCRIS_00789 LCRIS_00790     FALSE 0.006 294.000 0.000 NA   NA
 10480791 10480792 LCRIS_00790 LCRIS_00791     FALSE 0.191 85.000 0.000 NA   NA
 10480792 10480793 LCRIS_00791 LCRIS_00792     FALSE 0.006 293.000 0.000 NA   NA
 10480793 10480794 LCRIS_00792 LCRIS_00793     FALSE 0.077 130.000 0.000 NA   NA
 10480795 10480796 LCRIS_00794 LCRIS_00795     FALSE 0.243 64.000 0.000 NA   NA
 10480797 10480798 LCRIS_00796 LCRIS_00797     FALSE 0.005 326.000 0.000 NA   NA
 10480798 10480799 LCRIS_00797 LCRIS_00798     TRUE 0.573 19.000 0.000 NA   NA
 10480799 10480800 LCRIS_00798 LCRIS_00799     FALSE 0.042 153.000 0.000 NA   NA
 10480800 10480801 LCRIS_00799 LCRIS_00800     TRUE 0.573 19.000 0.000 NA   NA
 10480801 10480802 LCRIS_00800 LCRIS_00801   rsuA2 FALSE 0.052 145.000 0.000 NA   NA
 10480802 10480803 LCRIS_00801 LCRIS_00802 rsuA2   FALSE 0.156 101.000 0.000 NA   NA
 10480803 10480804 LCRIS_00802 LCRIS_00803     FALSE 0.020 185.000 0.000 NA   NA
 10480804 10480805 LCRIS_00803 LCRIS_00804     TRUE 0.932 0.000 0.045 NA   NA
 10480805 10480806 LCRIS_00804 LCRIS_00805     FALSE 0.046 148.000 0.000 NA   NA
 10480806 10480807 LCRIS_00805 LCRIS_00806     TRUE 0.833 -3.000 0.000 NA   NA
 10480807 10480808 LCRIS_00806 LCRIS_00807     FALSE 0.422 34.000 0.000 NA   NA
 10480808 10480809 LCRIS_00807 LCRIS_00808     FALSE 0.016 206.000 0.000 NA   NA
 10480809 10480810 LCRIS_00808 LCRIS_00809     FALSE 0.170 93.000 0.000 NA   NA
 10480812 10480813 LCRIS_00811 LCRIS_00812     TRUE 0.798 0.000 0.000 NA   NA
 10480813 10480814 LCRIS_00812 LCRIS_00813   valS FALSE 0.007 312.000 0.000 1.000   NA
 10480814 10480815 LCRIS_00813 LCRIS_00814 valS folC TRUE 0.916 1.000 0.006 1.000 N NA
 10480815 10480816 LCRIS_00814 LCRIS_00815 folC   TRUE 0.987 -22.000 0.400 1.000   NA
 10480816 10480817 LCRIS_00815 LCRIS_00816   radC TRUE 0.765 36.000 0.093 1.000   NA
 10480817 10480818 LCRIS_00816 LCRIS_00817 radC mreB2 TRUE 0.595 86.000 0.130 1.000 N NA
 10480818 10480819 LCRIS_00817 LCRIS_00818 mreB2 mreC TRUE 0.699 46.000 0.024 1.000 N NA
 10480819 10480820 LCRIS_00818 LCRIS_00819 mreC mreD TRUE 0.996 0.000 0.550 0.004   NA
 10480820 10480821 LCRIS_00819 LCRIS_00820 mreD   FALSE 0.008 261.000 0.000 NA   NA
 10480821 10480822 LCRIS_00820 LCRIS_00821   mraZ FALSE 0.063 171.000 0.008 NA   NA
 10480822 10480823 LCRIS_00821 LCRIS_00822 mraZ mraW TRUE 0.961 6.000 0.635 NA   NA
 10480823 10480824 LCRIS_00822 LCRIS_00823 mraW ftsL TRUE 0.893 14.000 0.077 1.000 N NA
 10480824 10480825 LCRIS_00823 LCRIS_00824 ftsL pbpB TRUE 0.778 78.000 0.456 1.000 N NA
 10480825 10480826 LCRIS_00824 LCRIS_00825 pbpB mraY TRUE 0.926 7.000 0.038 1.000 Y NA
 10480826 10480827 LCRIS_00825 LCRIS_00826 mraY murD TRUE 0.994 8.000 0.647 0.006 Y NA
 10480827 10480828 LCRIS_00826 LCRIS_00827 murD murG TRUE 0.960 2.000 0.060 1.000 Y NA
 10480828 10480829 LCRIS_00827 LCRIS_00828 murG ftsQ TRUE 0.915 17.000 0.072 NA Y NA
 10480829 10480830 LCRIS_00828 LCRIS_00829 ftsQ ftsA TRUE 0.770 63.000 0.389 NA N NA
 10480830 10480831 LCRIS_00829 LCRIS_00830 ftsA ftsZ TRUE 0.969 15.000 0.460 1.000 Y NA
 10480831 10480832 LCRIS_00830 LCRIS_00831 ftsZ sepF TRUE 0.803 18.000 0.020 NA   NA
 10480832 10480833 LCRIS_00831 LCRIS_00832 sepF yggT TRUE 0.973 0.000 0.370 NA   NA
 10480833 10480834 LCRIS_00832 LCRIS_00833 yggT   TRUE 0.972 0.000 0.287 1.000   NA
 10480834 10480835 LCRIS_00833 LCRIS_00834   divIVA TRUE 0.990 -24.000 0.579 1.000   NA
 10480835 10480836 LCRIS_00834 LCRIS_00835 divIVA ileS FALSE 0.041 228.000 0.012 1.000 N NA
 10480836 10480837 LCRIS_00835 LCRIS_00836 ileS cspA TRUE 0.938 0.000 0.016 1.000 N NA
 10480837 10480838 LCRIS_00836 LCRIS_00837 cspA nudF TRUE 0.868 16.000 0.023 1.000 N NA
 10480838 10480839 LCRIS_00837 LCRIS_00838 nudF   TRUE 0.720 3.000 0.000 NA   NA
 10480839 10480840 LCRIS_00838 LCRIS_00839   mtnN TRUE 0.573 19.000 0.000 NA   NA
 10480840 10480841 LCRIS_00839 LCRIS_00840 mtnN iscS TRUE 0.917 3.000 0.030 1.000 N NA
 10480841 10480842 LCRIS_00840 LCRIS_00841 iscS   TRUE 0.742 48.000 0.166 NA   NA
 10480842 10480843 LCRIS_00841 LCRIS_00842   mnmA TRUE 0.826 8.000 0.021 NA   NA
 10480843 10480844 LCRIS_00842 LCRIS_00843 mnmA gpm2 FALSE 0.436 93.000 0.015 1.000 N NA
 10480844 10480845 LCRIS_00843 LCRIS_00844 gpm2   TRUE 0.964 0.000 0.183 1.000   NA
 10480845 10480846 LCRIS_00844 LCRIS_00845   recD TRUE 0.980 -7.000 0.281 1.000   NA
 10480846 10480847 LCRIS_00845 LCRIS_00846 recD   FALSE 0.054 182.000 0.017 NA   NA
 10480848 10480849 LCRIS_00847 LCRIS_00848     TRUE 0.694 47.000 0.045 1.000   NA
 10480849 10480850 LCRIS_00848 LCRIS_00849     TRUE 0.955 7.000 0.576 NA   NA
 10480850 10480851 LCRIS_00849 LCRIS_00850     FALSE 0.091 124.000 0.000 NA   NA
 10480851 10480852 LCRIS_00850 LCRIS_00851   def2 FALSE 0.373 43.000 0.000 NA   NA
 10480853 10480854 LCRIS_00852 LCRIS_00853 typA ftsW FALSE 0.403 100.000 0.011 1.000 N NA
 10480854 10480855 LCRIS_00853 LCRIS_00854 ftsW   TRUE 0.963 -3.000 0.152 NA   NA
 10480855 10480856 LCRIS_00854 LCRIS_00855   rsmD TRUE 0.946 -3.000 0.048 NA   NA
 10480856 10480857 LCRIS_00855 LCRIS_00856 rsmD coaD TRUE 0.967 3.000 0.367 1.000 N NA
 10480857 10480858 LCRIS_00856 LCRIS_00857 coaD   TRUE 0.966 -7.000 0.052 1.000 N NA
 10480858 10480859 LCRIS_00857 LCRIS_00858   comEA FALSE 0.546 76.000 0.035 1.000 N NA
 10480859 10480860 LCRIS_00858 LCRIS_00859 comEA comEC TRUE 0.976 -31.000 0.130 1.000   NA
 10480860 10480861 LCRIS_00859 LCRIS_00860 comEC holA TRUE 0.970 -3.000 0.163 1.000   NA
 10480863 10480864 LCRIS_00862 LCRIS_00863 rpsO   FALSE 0.105 158.000 0.008 1.000   NA
 10480864 10480865 LCRIS_00863 LCRIS_00864     TRUE 0.905 3.000 0.065 NA   NA
 10480865 10480866 LCRIS_00864 LCRIS_00865   tufA FALSE 0.040 189.000 0.005 NA   NA
 10480866 10480867 LCRIS_00865 LCRIS_00866 tufA tig FALSE 0.156 146.000 0.011 1.000 N NA
 10480867 10480868 LCRIS_00866 LCRIS_00867 tig clpX TRUE 0.764 129.000 0.033 0.002 Y NA
 10480868 10480869 LCRIS_00867 LCRIS_00868 clpX engB TRUE 0.963 -10.000 0.043 1.000   NA
 10480869 10480870 LCRIS_00868 LCRIS_00869 engB   FALSE 0.088 126.000 0.000 NA   NA
 10480870 10480871 LCRIS_00869 LCRIS_00870     FALSE 0.085 127.000 0.000 NA   NA
 10480871 10480872 LCRIS_00870 LCRIS_00871     FALSE 0.484 27.000 0.000 NA   NA
 10480873 10480874 LCRIS_00872 LCRIS_00873 dapF lysC1 TRUE 0.907 9.000 0.011 1.000 Y NA
 10480875 10480876 LCRIS_00874 LCRIS_00875 lysA dapD TRUE 0.911 15.000 0.016 1.000 Y NA
 10480876 10480877 LCRIS_00875 LCRIS_00876 dapD   TRUE 0.969 2.000 0.372 1.000   NA
 10480877 10480878 LCRIS_00876 LCRIS_00877   dapA TRUE 0.936 2.000 0.092 1.000   NA
 10480878 10480879 LCRIS_00877 LCRIS_00878 dapA dapB TRUE 0.915 7.000 0.017 1.000 Y NA
 10480879 10480880 LCRIS_00878 LCRIS_00879 dapB patA1 TRUE 0.893 12.000 0.004 1.000 Y NA
 10480880 10480881 LCRIS_00879 LCRIS_00880 patA1 asd TRUE 0.970 0.000 0.077 1.000 Y NA
 10480881 10480882 LCRIS_00880 LCRIS_00881 asd   FALSE 0.145 163.000 0.058 1.000 N NA
 10480884 10480885 LCRIS_00883 LCRIS_00884     TRUE 0.923 10.000 0.286 NA   NA
 10480887 10480888 LCRIS_00886 LCRIS_00887     FALSE 0.316 116.000 0.048 NA   NA
 10480889 10480890 LCRIS_00888 LCRIS_00889 bglA2   FALSE 0.478 87.000 0.023 1.000 N NA
 10480891 10480892 LCRIS_00890 LCRIS_00891 celA1 celC1 TRUE 0.969 41.000 0.286 0.015 Y NA
 10480892 10480893 LCRIS_00891 LCRIS_00892 celC1   FALSE 0.459 96.000 0.105 NA   NA
 10480893 10480894 LCRIS_00892 LCRIS_00893   celB3 FALSE 0.330 173.000 0.842 NA   NA
 10480895 10480896 LCRIS_00894 LCRIS_00895   bglA3 TRUE 0.686 103.000 0.571 NA   NA
 10480896 10480897 LCRIS_00895 LCRIS_00896 bglA3 ydhQ TRUE 0.920 10.000 0.158 1.000 N NA
 10480897 10480898 LCRIS_00896 LCRIS_00897 ydhQ   FALSE 0.320 122.000 0.105 NA   NA
 10480898 10480899 LCRIS_00897 LCRIS_00898   celB4 TRUE 0.927 19.000 0.400 NA   NA
 10480899 10480900 LCRIS_00898 LCRIS_00899 celB4 bglA4 TRUE 0.983 0.000 0.294 1.000 Y NA
 10480900 10480901 LCRIS_00899 LCRIS_00900 bglA4 glk FALSE 0.240 171.000 0.176 1.000 Y NA
 10480902 10480903 LCRIS_00901 LCRIS_00902     FALSE 0.519 107.000 0.250 NA   NA
 10480906 10480907 LCRIS_00905 LCRIS_00906   cbh FALSE 0.559 104.000 0.222 1.000   NA
 10480907 10480908 LCRIS_00906 LCRIS_02096 cbh tRNA-Ser FALSE 0.085 127.000 0.000 NA   NA
 10480909 10480910 LCRIS_00907 LCRIS_00908   dps FALSE 0.082 128.000 0.000 NA   NA
 10480910 10480911 LCRIS_00908 LCRIS_00909 dps   FALSE 0.170 93.000 0.000 NA   NA
 10480911 10480912 LCRIS_00909 LCRIS_00910     TRUE 0.878 -34.000 0.000 NA   NA
 10480912 10480913 LCRIS_00910 LCRIS_00911     TRUE 0.613 14.000 0.000 NA   NA
 10480913 10480914 LCRIS_00911 LCRIS_00912     FALSE 0.006 290.000 0.000 NA   NA
 10480914 10480915 LCRIS_00912 LCRIS_00913     FALSE 0.036 160.000 0.000 NA   NA
 10480917 10480918 LCRIS_00915 LCRIS_00916     FALSE 0.004 344.000 0.000 NA   NA
 10480918 10480919 LCRIS_00916 LCRIS_00917     TRUE 0.863 -10.000 0.000 NA   NA
 10480919 10480920 LCRIS_00917 LCRIS_00918     FALSE 0.004 332.000 0.000 NA   NA
 10480920 10480921 LCRIS_00918 LCRIS_00919     TRUE 0.699 15.000 0.000 1.000   NA
 10480921 10480922 LCRIS_00919 LCRIS_00920     FALSE 0.011 233.000 0.000 NA   NA
 10480922 10480923 LCRIS_00920 LCRIS_00921     FALSE 0.049 146.000 0.000 NA   NA
 10480923 10480924 LCRIS_00921 LCRIS_00922     FALSE 0.057 141.000 0.000 NA   NA
 10480924 10480925 LCRIS_00922 LCRIS_00923     TRUE 0.840 0.000 0.000 NA N NA
 10480925 10480926 LCRIS_00923 LCRIS_00924     FALSE 0.005 367.000 0.000 1.000   NA
 10480926 10480927 LCRIS_00924 LCRIS_00925     FALSE 0.503 25.000 0.000 NA   NA
 10480927 10480928 LCRIS_00925 LCRIS_00926     FALSE 0.002 570.000 0.000 NA   NA
 10480929 10480930 LCRIS_00927 LCRIS_00928 ribH ribA TRUE 0.982 15.000 0.010 0.002 Y NA
 10480930 10480931 LCRIS_00928 LCRIS_00929 ribA ribE TRUE 0.947 2.000 0.011 1.000 Y NA
 10480931 10480932 LCRIS_00929 LCRIS_00930 ribE ribD TRUE 0.991 -7.000 0.456 1.000 Y NA
 10480933 10480934 LCRIS_00931 LCRIS_00932     FALSE 0.043 152.000 0.000 NA   NA
 10480935 10480936 LCRIS_00933 LCRIS_00934     TRUE 0.704 62.000 0.267 NA   NA
 10480936 10480937 LCRIS_00934 LCRIS_00935     FALSE 0.038 159.000 0.000 NA   NA
 10480938 10480939 LCRIS_00936 LCRIS_00937     FALSE 0.008 260.000 0.000 NA   NA
 10480941 10480942 LCRIS_00939 LCRIS_00940     TRUE 0.869 -13.000 0.000 NA   NA
 10480942 10480943 LCRIS_00940 LCRIS_00941   brnQ FALSE 0.006 386.000 0.000 1.000 N NA
 10480943 10480944 LCRIS_00941 LCRIS_00942 brnQ   FALSE 0.113 117.000 0.000 NA   NA
 10480948 10480949 LCRIS_00946 LCRIS_00947     FALSE 0.168 94.000 0.000 NA   NA
 10480949 10480950 LCRIS_00947 LCRIS_00948     FALSE 0.176 90.000 0.000 NA   NA
 10480950 10480951 LCRIS_00948 LCRIS_00949     TRUE 0.894 2.000 0.019 NA   NA
 10480951 10480952 LCRIS_00949 LCRIS_00950     FALSE 0.003 440.000 0.000 NA   NA
 10480952 10480953 LCRIS_00950 LCRIS_00951     FALSE 0.012 222.000 0.000 NA   NA
 10480953 10480954 LCRIS_00951 LCRIS_00952     TRUE 0.998 -3.000 0.750 0.004 N NA
 10480954 10480955 LCRIS_00952 LCRIS_00953     FALSE 0.396 130.000 0.000 0.066 N NA
 10480955 10480956 LCRIS_00953 LCRIS_00954   thyA FALSE 0.101 162.000 0.004 1.000 N NA
 10480956 10480957 LCRIS_00954 LCRIS_00955 thyA folA TRUE 0.940 10.000 0.295 1.000 N NA
 10480957 10480958 LCRIS_00955 LCRIS_00956 folA   FALSE 0.421 90.000 0.007 1.000 N NA
 10480960 10480961 LCRIS_00958 LCRIS_00959 metQ1 metN TRUE 0.913 13.000 0.062 NA Y NA
 10480961 10480962 LCRIS_00959 LCRIS_00960 metN metI TRUE 0.995 -7.000 0.938 1.000 Y NA
 10480962 10480963 LCRIS_00960 LCRIS_00961 metI fumC FALSE 0.208 131.000 0.005 1.000 N NA
 10480963 10480964 LCRIS_00961 LCRIS_00962 fumC frdA2 TRUE 0.907 13.000 0.017 1.000 Y NA
 10480964 10480965 LCRIS_00962 LCRIS_00963 frdA2 ldh2 FALSE 0.117 197.000 0.048 1.000 Y NA
 10480965 10480966 LCRIS_00963 LCRIS_00964 ldh2 pepC4 FALSE 0.345 138.000 0.200 1.000 N NA
 10480966 10480967 LCRIS_00964 LCRIS_00965 pepC4 hxlA FALSE 0.013 252.000 0.000 NA N NA
 10480967 10480968 LCRIS_00965 LCRIS_00966 hxlA   TRUE 0.670 17.000 0.000 NA N NA
 10480968 10480969 LCRIS_00966 LCRIS_00967     TRUE 0.573 82.000 0.115 1.000   NA
 10480969 10480970 LCRIS_00967 LCRIS_00968   citC FALSE 0.505 81.000 0.038 1.000   NA
 10480970 10480971 LCRIS_00968 LCRIS_00969 citC citD TRUE 0.988 -10.000 0.231 1.000 Y NA
 10480971 10480972 LCRIS_00969 LCRIS_00970 citD citE TRUE 0.994 1.000 0.284 0.002 N NA
 10480972 10480973 LCRIS_00970 LCRIS_00971 citE citF TRUE 0.996 -10.000 0.119 0.001 N NA
 10480973 10480974 LCRIS_00971 LCRIS_00972 citF   FALSE 0.004 336.000 0.000 NA   NA
 10480974 10480975 LCRIS_00972 LCRIS_00973     FALSE 0.464 30.000 0.000 NA   NA
 10480976 10480977 LCRIS_00974 LCRIS_00975 cbiQ3 cbiO4 TRUE 0.987 -7.000 0.530 1.000   NA
 10480977 10480978 LCRIS_00975 LCRIS_00976 cbiO4   TRUE 0.955 4.000 0.435 NA   NA
 10480980 10480981 LCRIS_00978 LCRIS_00979   citR TRUE 0.642 48.000 0.043 NA   NA
 10480984 10480985 LCRIS_00982 LCRIS_00983 prmA   FALSE 0.472 56.000 0.003 NA   NA
 10480985 10480986 LCRIS_00983 LCRIS_00984   relA TRUE 0.823 15.000 0.021 NA   NA
 10480986 10480987 LCRIS_00984 LCRIS_00985 relA dtd TRUE 0.967 0.000 0.177 1.000 N NA
 10480987 10480988 LCRIS_00985 LCRIS_00986 dtd hisS FALSE 0.090 296.000 0.003 0.045 Y NA
 10480988 10480989 LCRIS_00986 LCRIS_00987 hisS aspS TRUE 0.982 6.000 0.161 0.045 Y NA
 10480990 10480991 LCRIS_00988 LCRIS_00989 patA2   FALSE 0.106 119.000 0.000 NA   NA
 10480992 10480993 LCRIS_00990 LCRIS_00991 coaBC   FALSE 0.003 515.000 0.000 1.000   NA
 10480993 10480994 LCRIS_00991 LCRIS_00992     FALSE 0.419 49.000 0.000 1.000   NA
 10480994 10480995 LCRIS_00992 LCRIS_00993     TRUE 0.693 67.000 0.000 0.049   NA
 10480996 10480997 LCRIS_00994 LCRIS_00995     FALSE 0.395 98.000 0.042 NA   NA
 10480998 10480999 LCRIS_00996 LCRIS_00997 uvrC obg FALSE 0.459 79.000 0.016 1.000   NA
 10480999 10481000 LCRIS_00997 LCRIS_00998 obg   TRUE 0.829 16.000 0.010 1.000   NA
 10481000 10481001 LCRIS_00998 LCRIS_00999     FALSE 0.033 177.000 0.000 1.000   NA
 10481001 10481002 LCRIS_00999 LCRIS_01000   elaC TRUE 0.673 18.000 0.000 1.000   NA
 10481002 10481003 LCRIS_01000 LCRIS_01001 elaC   TRUE 0.958 -3.000 0.074 1.000   NA
 10481003 10481004 LCRIS_01001 LCRIS_01002     TRUE 0.856 7.000 0.048 NA   NA
 10481004 10481005 LCRIS_01002 LCRIS_01003   rpmF FALSE 0.276 103.000 0.004 NA   NA
 10481005 10481006 LCRIS_01003 LCRIS_01004 rpmF   FALSE 0.549 60.000 0.005 1.000 N NA
 10481008 10481009 LCRIS_01006 LCRIS_01007 dnaE pfk FALSE 0.149 168.000 0.098 1.000 N NA
 10481009 10481010 LCRIS_01007 LCRIS_01008 pfk pyk TRUE 0.975 34.000 0.261 0.006 Y NA
 10481010 10481011 LCRIS_01008 LCRIS_01009 pyk   FALSE 0.225 127.000 0.031 NA   NA
 10481011 10481012 LCRIS_01009 LCRIS_01010   xerD TRUE 0.951 -13.000 0.024 NA   NA
 10481012 10481013 LCRIS_01010 LCRIS_01011 xerD ribT TRUE 0.803 9.000 0.011 NA   NA
 10481013 10481014 LCRIS_01011 LCRIS_01012 ribT scpA TRUE 0.945 -13.000 0.014 NA   NA
 10481014 10481015 LCRIS_01012 LCRIS_01013 scpA scpB TRUE 0.987 -10.000 0.570 NA   NA
 10481015 10481016 LCRIS_01013 LCRIS_01014 scpB rluB TRUE 0.939 4.000 0.224 NA N NA
 10481016 10481017 LCRIS_01014 LCRIS_01015 rluB   FALSE 0.013 218.000 0.000 NA   NA
 10481017 10481018 LCRIS_01015 LCRIS_01016     FALSE 0.154 102.000 0.000 NA   NA
 10481018 10481019 LCRIS_01016 LCRIS_01017   cmk FALSE 0.560 52.000 0.004 1.000   NA
 10481019 10481020 LCRIS_01017 LCRIS_01018 cmk rpsA FALSE 0.571 73.000 0.047 1.000 N NA
 10481020 10481021 LCRIS_01018 LCRIS_01019 rpsA engA FALSE 0.527 70.000 0.032 1.000   NA
 10481021 10481022 LCRIS_01019 LCRIS_01020 engA hupB1 FALSE 0.103 159.000 0.008 1.000   NA
 10481022 10481023 LCRIS_01020 LCRIS_01021 hupB1   FALSE 0.530 81.000 0.063 1.000   NA
 10481024 10481025 LCRIS_01022 LCRIS_01023 cls2   FALSE 0.061 161.000 0.000 1.000 N NA
 10481027 10481028 LCRIS_01025 LCRIS_01026     TRUE 0.679 4.000 0.000 NA   NA
 10481029 10481030 LCRIS_01027 LCRIS_01028     TRUE 0.891 12.000 0.154 NA   NA
 10481030 10481031 LCRIS_01028 LCRIS_01029     TRUE 0.958 -7.000 0.080 NA   NA
 10481031 10481032 LCRIS_01029 LCRIS_01030   glsA FALSE 0.085 127.000 0.000 NA   NA
 10481032 10481033 LCRIS_01030 LCRIS_01031 glsA   FALSE 0.158 100.000 0.000 NA   NA
 10481033 10481034 LCRIS_01031 LCRIS_01032     FALSE 0.009 257.000 0.000 NA   NA
 10481034 10481035 LCRIS_01032 LCRIS_01033     TRUE 0.823 40.000 0.286 NA   NA
 10481035 10481036 LCRIS_01033 LCRIS_01034     FALSE 0.005 330.000 0.000 NA   NA
 10481036 10481037 LCRIS_01034 LCRIS_01035     FALSE 0.013 219.000 0.000 NA   NA
 10481037 10481038 LCRIS_01035 LCRIS_01036   cofE FALSE 0.168 94.000 0.000 NA   NA
 10481038 10481039 LCRIS_01036 LCRIS_01037 cofE   FALSE 0.493 26.000 0.000 NA   NA
 10481039 10481040 LCRIS_01037 LCRIS_01038     FALSE 0.350 103.000 0.011 1.000   NA
 10481040 10481041 LCRIS_01038 LCRIS_01039     TRUE 0.961 32.000 0.026 0.006 Y NA
 10481042 10481043 LCRIS_01040 LCRIS_01041     FALSE 0.009 286.000 0.000 1.000   NA
 10481043 10481044 LCRIS_01041 LCRIS_01042     TRUE 0.917 25.000 0.000 0.012   NA
 10481044 10481045 LCRIS_01042 LCRIS_01043     TRUE 0.901 31.000 0.000 0.012   NA
 10481050 10481051 LCRIS_01048 LCRIS_01049     TRUE 0.906 3.000 0.068 NA   NA
 10481051 10481052 LCRIS_01049 LCRIS_01050     FALSE 0.336 49.000 0.000 NA   NA
 10481052 10481053 LCRIS_01050 LCRIS_01051     TRUE 0.991 -55.000 0.000 0.002   NA
 10481053 10481054 LCRIS_01051 LCRIS_01052     TRUE 0.752 70.000 0.007 0.065   NA
 10481054 10481055 LCRIS_01052 LCRIS_01053   rnhB TRUE 0.968 -3.000 0.148 1.000   NA
 10481055 10481056 LCRIS_01053 LCRIS_01054 rnhB smf TRUE 0.709 62.000 0.037 1.000 Y NA
 10481056 10481057 LCRIS_01054 LCRIS_01055 smf topA TRUE 0.787 70.000 0.238 1.000 Y NA
 10481057 10481058 LCRIS_01055 LCRIS_01056 topA trmFO TRUE 0.878 23.000 0.137 1.000 N NA
 10481058 10481059 LCRIS_01056 LCRIS_01057 trmFO xerC TRUE 0.958 0.000 0.105 1.000 N NA
 10481059 10481060 LCRIS_01057 LCRIS_01058 xerC   TRUE 0.988 -40.000 0.000 0.007   NA
 10481060 10481061 LCRIS_01058 LCRIS_01059   hslV TRUE 0.884 9.000 0.080 1.000   NA
 10481061 10481062 LCRIS_01059 LCRIS_01060 hslV hslU TRUE 0.978 12.000 0.752 1.000 Y NA
 10481062 10481063 LCRIS_01060 LCRIS_01061 hslU   FALSE 0.130 160.000 0.020 1.000 N NA
 10481063 10481064 LCRIS_01061 LCRIS_01062     FALSE 0.333 61.000 0.000 1.000   NA
 10481064 10481065 LCRIS_01062 LCRIS_01063     TRUE 0.980 -3.000 0.000 0.022   NA
 10481065 10481066 LCRIS_01063 LCRIS_01064     FALSE 0.006 288.000 0.000 NA   NA
 10481068 10481069 LCRIS_01066 LCRIS_01067 crcB1 crcB2 TRUE 0.993 -3.000 0.160 0.081 Y NA
 10481069 10481070 LCRIS_01067 LCRIS_01068 crcB2   TRUE 0.638 20.000 0.000 1.000   NA
 10481070 10481071 LCRIS_01068 LCRIS_01069     TRUE 0.962 -6.000 0.080 1.000   NA
 10481075 10481076 LCRIS_01073 LCRIS_01074 speC   TRUE 0.971 11.000 0.018 0.005 N NA
 10481076 10481077 LCRIS_01074 LCRIS_01075   recQ FALSE 0.169 120.000 0.000 1.000 N NA
 10481077 10481078 LCRIS_01075 LCRIS_01076 recQ   FALSE 0.451 81.000 0.014 1.000   NA
 10481078 10481079 LCRIS_01076 LCRIS_01077   uvrA2 FALSE 0.004 411.000 0.000 1.000   NA
 10481079 10481080 LCRIS_01077 LCRIS_01078 uvrA2 mmuM FALSE 0.059 162.000 0.000 1.000 N NA
 10481080 10481081 LCRIS_01078 LCRIS_01079 mmuM   TRUE 0.833 -3.000 0.000 NA   NA
 10481083 10481084 LCRIS_01081 LCRIS_01082   maa3 TRUE 0.685 17.000 0.000 1.000   NA
 10481084 10481085 LCRIS_01082 LCRIS_01083 maa3 pbpX FALSE 0.103 182.000 0.118 1.000   NA
 10481085 10481086 LCRIS_01083 LCRIS_01084 pbpX   TRUE 0.603 48.000 0.024 NA   NA
 10481087 10481088 LCRIS_01085 LCRIS_01086     FALSE 0.343 48.000 0.000 NA   NA
 10481089 10481090 LCRIS_01087 LCRIS_01088   pdxK FALSE 0.343 48.000 0.000 NA   NA
 10481090 10481091 LCRIS_01088 LCRIS_01089 pdxK   FALSE 0.548 53.000 0.016 NA   NA
 10481091 10481092 LCRIS_01089 LCRIS_01090     TRUE 0.928 3.000 0.142 NA   NA
 10481092 10481093 LCRIS_01090 LCRIS_01091     FALSE 0.501 75.000 0.064 NA   NA
 10481093 10481094 LCRIS_01091 LCRIS_01092     FALSE 0.003 446.000 0.000 NA   NA
 10481094 10481095 LCRIS_01092 LCRIS_01093   pepT1 TRUE 0.685 13.000 0.000 1.000   NA
 10481096 10481097 LCRIS_01094 LCRIS_01095     TRUE 0.943 14.000 0.000 0.018   NA
 10481098 10481099 LCRIS_01096 LCRIS_01097 spxA treC FALSE 0.024 218.000 0.000 1.000 N NA
 10481099 10481100 LCRIS_01097 LCRIS_01098 treC   FALSE 0.023 178.000 0.000 NA   NA
 10481102 10481103 LCRIS_01100 LCRIS_01101     FALSE 0.195 104.000 0.000 1.000   NA
 10481103 10481104 LCRIS_01101 LCRIS_01102     FALSE 0.002 566.000 0.000 NA   NA
 10481104 10481105 LCRIS_01102 LCRIS_01103     FALSE 0.052 145.000 0.000 NA   NA
 10481105 10481106 LCRIS_01103 LCRIS_01104   hsdR FALSE 0.084 139.000 0.000 1.000   NA
 10481106 10481107 LCRIS_01104 LCRIS_01105 hsdR   FALSE 0.217 96.000 0.000 1.000   NA
 10481107 10481108 LCRIS_01105 LCRIS_01106   hsdM FALSE 0.292 70.000 0.000 1.000   NA
 10481108 10481109 LCRIS_01106 LCRIS_01107 hsdM hsdS1 TRUE 0.978 -10.000 0.000 0.076   NA
 10481109 10481110 LCRIS_01107 LCRIS_01108 hsdS1 hsdS2 TRUE 0.951 11.000 0.000 0.005   NA
 10481110 10481111 LCRIS_01108 LCRIS_01109 hsdS2   FALSE 0.099 132.000 0.000 1.000   NA
 10481111 10481112 LCRIS_01109 LCRIS_01110     TRUE 0.613 11.000 0.000 NA   NA
 10481112 10481113 LCRIS_01110 LCRIS_01111     FALSE 0.422 34.000 0.000 NA   NA
 10481115 10481116 LCRIS_01113 LCRIS_01114     FALSE 0.259 61.000 0.000 NA   NA
 10481116 10481117 LCRIS_01114 LCRIS_01115     FALSE 0.212 76.000 0.000 NA   NA
 10481117 10481118 LCRIS_01115 LCRIS_01116     FALSE 0.041 154.000 0.000 NA   NA
 10481118 10481119 LCRIS_01116 LCRIS_01117     FALSE 0.067 134.000 0.000 NA   NA
 10481119 10481120 LCRIS_01117 LCRIS_01118     FALSE 0.212 76.000 0.000 NA   NA
 10481122 10481123 LCRIS_01120 LCRIS_01121     TRUE 0.752 2.000 0.000 NA   NA
 10481123 10481124 LCRIS_01121 LCRIS_01122     FALSE 0.381 41.000 0.000 NA   NA
 10481124 10481125 LCRIS_01122 LCRIS_01123     FALSE 0.004 341.000 0.000 NA   NA
 10481125 10481126 LCRIS_01123 LCRIS_01124   psd TRUE 0.626 8.000 0.000 NA   NA
 10481126 10481127 LCRIS_01124 LCRIS_01125 psd   FALSE 0.065 137.000 0.000 NA   NA
 10481127 10481128 LCRIS_01125 LCRIS_01126     TRUE 0.798 0.000 0.000 NA   NA
 10481128 10481129 LCRIS_01126 LCRIS_01127   fhs TRUE 0.814 72.000 0.000 0.001   NA
 10481129 10481130 LCRIS_01127 LCRIS_01128 fhs lspA TRUE 0.884 6.000 0.030 1.000 N NA
 10481130 10481131 LCRIS_01128 LCRIS_01129 lspA rluD2 TRUE 0.969 -7.000 0.082 1.000 N NA
 10481131 10481132 LCRIS_01129 LCRIS_01130 rluD2 carA1 TRUE 0.869 5.000 0.010 1.000 N NA
 10481132 10481133 LCRIS_01130 LCRIS_01131 carA1 carB1 TRUE 0.984 5.000 0.007 0.002 Y NA
 10481135 10481136 LCRIS_01133 LCRIS_01134   degV2 TRUE 0.656 70.000 0.235 NA   NA
 10481136 10481137 LCRIS_01134 LCRIS_01135 degV2   FALSE 0.004 336.000 0.000 NA   NA
 10481137 10481138 LCRIS_01135 LCRIS_01136     TRUE 0.958 -18.000 0.039 NA   NA
 10481141 10481142 LCRIS_01139 LCRIS_01140     FALSE 0.211 150.000 0.182 NA   NA
 10481146 10481147 LCRIS_01144 LCRIS_01145 ppiB ppaC FALSE 0.450 86.000 0.010 1.000 N NA
 10481147 10481148 LCRIS_01145 LCRIS_01146 ppaC   TRUE 0.787 30.000 0.028 1.000 N NA
 10481148 10481149 LCRIS_01146 LCRIS_01147   parC FALSE 0.192 148.000 0.053 1.000 N NA
 10481149 10481150 LCRIS_01147 LCRIS_01148 parC parE TRUE 0.992 19.000 0.552 0.002 Y NA
 10481154 10481155 LCRIS_01152 LCRIS_01153     FALSE 0.025 174.000 0.000 NA   NA
 10481155 10481156 LCRIS_01153 LCRIS_01154     TRUE 0.605 12.000 0.000 NA   NA
 10481156 10481157 LCRIS_01154 LCRIS_01155     FALSE 0.353 47.000 0.000 NA   NA
 10481157 10481158 LCRIS_01155 LCRIS_01156     FALSE 0.493 26.000 0.000 NA   NA
 10481158 10481159 LCRIS_01156 LCRIS_01157     FALSE 0.161 98.000 0.000 NA   NA
 10481160 10481161 LCRIS_01158 LCRIS_01159     FALSE 0.003 421.000 0.000 NA   NA
 10481162 10481163 LCRIS_01160 LCRIS_01161     FALSE 0.331 50.000 0.000 NA   NA
 10481163 10481164 LCRIS_01161 LCRIS_01162   ycbY TRUE 0.857 4.000 0.006 1.000   NA
 10481164 10481165 LCRIS_01162 LCRIS_01163 ycbY   FALSE 0.003 461.000 0.000 NA   NA
 10481165 10481166 LCRIS_01163 LCRIS_01164     TRUE 0.718 94.000 0.579 NA   NA
 10481167 10481168 LCRIS_01165 LCRIS_01166 recU mrcA TRUE 0.960 3.000 0.319 1.000   NA
 10481169 10481170 LCRIS_01167 LCRIS_01168 nth dnaD TRUE 0.948 3.000 0.075 NA Y NA
 10481170 10481171 LCRIS_01168 LCRIS_01169 dnaD asnS TRUE 0.657 79.000 0.234 NA N NA
 10481171 10481172 LCRIS_01169 LCRIS_01170 asnS   TRUE 0.609 54.000 0.051 NA   NA
 10481172 10481173 LCRIS_01170 LCRIS_01171   dinG TRUE 0.951 3.000 0.296 NA   NA
 10481173 10481174 LCRIS_01171 LCRIS_01172 dinG   TRUE 0.971 16.000 0.040 0.075 Y NA
 10481174 10481175 LCRIS_01172 LCRIS_01173     TRUE 0.969 3.000 0.276 NA Y NA
 10481176 10481177 LCRIS_01174 LCRIS_01175 mvaK1   TRUE 0.621 9.000 0.000 NA   NA
 10481177 10481178 LCRIS_01175 LCRIS_01176   mvaD TRUE 0.798 0.000 0.000 NA   NA
 10481178 10481179 LCRIS_01176 LCRIS_01177 mvaD mvaK2 TRUE 0.972 43.000 0.312 0.006 Y NA
 10481179 10481180 LCRIS_01177 LCRIS_01178 mvaK2 idi TRUE 0.965 12.000 0.097 0.044 N NA
 10481181 10481182 LCRIS_01179 LCRIS_01180     TRUE 0.621 9.000 0.000 NA   NA
 10481182 10481183 LCRIS_01180 LCRIS_01181     TRUE 0.833 -3.000 0.000 NA   NA
 10481183 10481184 LCRIS_01181 LCRIS_01182     TRUE 0.980 -19.000 0.273 NA   NA
 10481184 10481185 LCRIS_01182 LCRIS_01183     TRUE 0.802 53.000 0.364 NA   NA
 10481186 10481187 LCRIS_01184 LCRIS_01185 lepB1   TRUE 0.739 71.000 0.429 NA   NA
 10481188 10481189 LCRIS_01186 LCRIS_01187     TRUE 0.962 21.000 1.000 NA   NA
 10481189 10481190 LCRIS_01187 LCRIS_01188     TRUE 0.972 10.000 1.000 NA   NA
 10481190 10481191 LCRIS_01188 LCRIS_01189     TRUE 0.964 0.000 0.250 NA   NA
 10481191 10481192 LCRIS_01189 LCRIS_01190   gntR2 TRUE 0.987 -7.000 0.478 1.000 N NA
 10481192 10481193 LCRIS_01190 LCRIS_01191 gntR2 pepT2 FALSE 0.010 307.000 0.000 1.000 N NA
 10481193 10481194 LCRIS_01191 LCRIS_01192 pepT2   TRUE 0.826 19.000 0.051 NA   NA
 10481194 10481195 LCRIS_01192 LCRIS_01193     TRUE 0.973 -3.000 0.283 NA   NA
 10481196 10481197 LCRIS_01194 LCRIS_01195     TRUE 0.946 0.000 0.111 NA   NA
 10481198 10481199 LCRIS_01196 LCRIS_01197 rpoD dnaG TRUE 0.928 16.000 0.209 1.000 N NA
 10481199 10481200 LCRIS_01197 LCRIS_01198 dnaG glyS TRUE 0.769 30.000 0.017 1.000 N NA
 10481200 10481201 LCRIS_01198 LCRIS_01199 glyS glyQ TRUE 0.999 -7.000 0.651 0.001 Y NA
 10481201 10481202 LCRIS_01199 LCRIS_01200 glyQ recO FALSE 0.037 260.000 0.036 1.000 N NA
 10481202 10481203 LCRIS_01200 LCRIS_01201 recO era FALSE 0.009 1285.000 0.108 1.000   NA
 10481203 10481204 LCRIS_01201 LCRIS_01202 era   TRUE 0.908 1.000 0.026 NA   NA
 10481204 10481205 LCRIS_01202 LCRIS_01203   phoH TRUE 0.964 3.000 0.457 NA   NA
 10481205 10481206 LCRIS_01203 LCRIS_01204 phoH   TRUE 0.782 26.000 0.027 1.000   NA
 10481206 10481207 LCRIS_01204 LCRIS_01205   rpsU FALSE 0.422 161.000 0.150 0.035   NA
 10481209 10481210 LCRIS_01207 LCRIS_01208 cas1 cas2 TRUE 0.969 -3.000 0.036 NA Y NA
 10481210 10481211 LCRIS_01208 LCRIS_01209 cas2   TRUE 0.961 5.000 0.589 NA   NA
 10481211 10481212 LCRIS_01209 LCRIS_01210     TRUE 0.943 10.000 0.444 NA   NA
 10481212 10481213 LCRIS_01210 LCRIS_01211   casE TRUE 0.982 -19.000 0.318 NA   NA
 10481213 10481214 LCRIS_01211 LCRIS_01212 casE   TRUE 0.850 28.000 0.216 NA   NA
 10481214 10481215 LCRIS_01212 LCRIS_01213     TRUE 0.905 11.000 0.198 NA   NA
 10481215 10481216 LCRIS_01213 LCRIS_01214   cas3 FALSE 0.062 196.000 0.063 NA   NA
 10481216 10481217 LCRIS_01214 LCRIS_01215 cas3   FALSE 0.298 56.000 0.000 NA   NA
 10481218 10481219 LCRIS_01216 LCRIS_01217     FALSE 0.006 302.000 0.000 NA   NA
 10481220 10481221 LCRIS_01218 LCRIS_01219 fnr   TRUE 0.947 20.000 0.583 1.000   NA
 10481221 10481222 LCRIS_01219 LCRIS_01220     TRUE 0.980 0.000 0.478 1.000   NA
 10481222 10481223 LCRIS_01220 LCRIS_01221   cadA TRUE 0.956 83.000 0.500 0.003 Y NA
 10481223 10481224 LCRIS_01221 LCRIS_01222 cadA   FALSE 0.002 647.000 0.000 NA   NA
 11463872 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5311.000 0.000 NA   NA
 11606235 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5311.000 0.000 NA   NA
 11748627 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5311.000 0.000 NA   NA
 11463873 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5340.000 0.000 NA   NA
 11606236 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5340.000 0.000 NA   NA
 11748628 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5340.000 0.000 NA   NA
 11463874 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5373.000 0.000 NA   NA
 11606237 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5373.000 0.000 NA   NA
 11748629 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5373.000 0.000 NA   NA
 11463875 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5401.000 0.000 NA   NA
 11606238 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5401.000 0.000 NA   NA
 11748630 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5401.000 0.000 NA   NA
 11463876 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5434.000 0.000 NA   NA
 11606239 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5434.000 0.000 NA   NA
 11748631 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5434.000 0.000 NA   NA
 11463877 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5462.000 0.000 NA   NA
 11606240 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5462.000 0.000 NA   NA
 11748632 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5462.000 0.000 NA   NA
 11463878 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5495.000 0.000 NA   NA
 11606241 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5495.000 0.000 NA   NA
 11748633 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5495.000 0.000 NA   NA
 11463879 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5523.000 0.000 NA   NA
 11606242 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5523.000 0.000 NA   NA
 11748634 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5523.000 0.000 NA   NA
 11463880 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5556.000 0.000 NA   NA
 11606243 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5556.000 0.000 NA   NA
 11748635 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5556.000 0.000 NA   NA
 11463881 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5584.000 0.000 NA   NA
 11606244 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5584.000 0.000 NA   NA
 11748636 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5584.000 0.000 NA   NA
 11463882 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5617.000 0.000 NA   NA
 11606245 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5617.000 0.000 NA   NA
 11748637 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5617.000 0.000 NA   NA
 11463883 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5645.000 0.000 NA   NA
 11606246 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5645.000 0.000 NA   NA
 11748638 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5645.000 0.000 NA   NA
 11463884 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5679.000 0.000 NA   NA
 11606247 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5679.000 0.000 NA   NA
 11748639 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5679.000 0.000 NA   NA
 11463885 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5707.000 0.000 NA   NA
 11606248 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5707.000 0.000 NA   NA
 11748640 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5707.000 0.000 NA   NA
 11463886 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5740.000 0.000 NA   NA
 11606249 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5740.000 0.000 NA   NA
 11748641 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5740.000 0.000 NA   NA
 10481225 10481226 LCRIS_01223 LCRIS_01224     FALSE 0.002 722.000 0.000 NA   NA
 11463887 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5768.000 0.000 NA   NA
 11606250 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5768.000 0.000 NA   NA
 11748642 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5768.000 0.000 NA   NA
 11463888 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5801.000 0.000 NA   NA
 11606251 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5801.000 0.000 NA   NA
 11748643 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5801.000 0.000 NA   NA
 11463889 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5829.000 0.000 NA   NA
 11606252 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5829.000 0.000 NA   NA
 11748644 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5829.000 0.000 NA   NA
 11463890 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5862.000 0.000 NA   NA
 11606253 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5862.000 0.000 NA   NA
 11748645 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5862.000 0.000 NA   NA
 11463891 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5890.000 0.000 NA   NA
 11606254 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5890.000 0.000 NA   NA
 11748646 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5890.000 0.000 NA   NA
 11463892 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5923.000 0.000 NA   NA
 11606255 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5923.000 0.000 NA   NA
 11748647 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5923.000 0.000 NA   NA
 11463893 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5951.000 0.000 NA   NA
 11606256 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5951.000 0.000 NA   NA
 11748648 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5951.000 0.000 NA   NA
 11463894 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5984.000 0.000 NA   NA
 11606257 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5984.000 0.000 NA   NA
 11748649 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 5984.000 0.000 NA   NA
 11463895 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 6012.000 0.000 NA   NA
 11606258 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 6012.000 0.000 NA   NA
 11748650 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 6012.000 0.000 NA   NA
 11463896 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 6045.000 0.000 NA   NA
 11606259 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 6045.000 0.000 NA   NA
 11748651 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 6045.000 0.000 NA   NA
 11463897 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 6073.000 0.000 NA   NA
 11606260 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 6073.000 0.000 NA   NA
 11748652 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 6073.000 0.000 NA   NA
 11463898 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 6106.000 0.000 NA   NA
 11606261 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 6106.000 0.000 NA   NA
 11748653 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 6106.000 0.000 NA   NA
 11463899 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 6134.000 0.000 NA   NA
 11606262 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 6134.000 0.000 NA   NA
 11748654 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 6134.000 0.000 NA   NA
 11463900 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 6167.000 0.000 NA   NA
 11606263 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 6167.000 0.000 NA   NA
 11748655 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 6167.000 0.000 NA   NA
 11463901 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 6195.000 0.000 NA   NA
 11606264 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 6195.000 0.000 NA   NA
 11748656 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 6195.000 0.000 NA   NA
 11463902 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 6228.000 0.000 NA   NA
 11606265 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 6228.000 0.000 NA   NA
 11748657 10481219   LCRIS_01217     FALSE NA 6228.000 0.000 NA   NA
 10481227 10481228 LCRIS_01225 LCRIS_01226 msrA   FALSE 0.516 117.000 0.333 NA   NA
 10481228 10481229 LCRIS_01226 LCRIS_01227     TRUE 0.852 -7.000 0.000 NA   NA
 10481233 10481234 LCRIS_01231 LCRIS_01232 thrB hom TRUE 0.917 17.000 0.036 1.000 Y NA
 10481235 10481236 LCRIS_01233 LCRIS_01234 thrC lysC2 TRUE 0.871 20.000 0.005 1.000 Y NA
 10481239 10481240 LCRIS_01237 LCRIS_01238     FALSE 0.041 154.000 0.000 NA   NA
 10481240 10481241 LCRIS_01238 LCRIS_01239     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.003 Y NA
 10481241 10481242 LCRIS_01239 LCRIS_01240     FALSE 0.025 174.000 0.000 NA   NA
 10481242 10481243 LCRIS_01240 LCRIS_01241     FALSE 0.002 571.000 0.000 NA   NA
 10481243 10481244 LCRIS_01241 LCRIS_01242     FALSE 0.163 96.000 0.000 NA   NA
 10481244 10481245 LCRIS_01242 LCRIS_01243     FALSE 0.173 91.000 0.000 NA   NA
 10481245 10481246 LCRIS_01243 LCRIS_01244     TRUE 0.863 -10.000 0.000 NA   NA
 10481246 10481247 LCRIS_01244 LCRIS_01245     TRUE 0.948 16.000 0.500 NA   NA
 10481247 10481248 LCRIS_01245 LCRIS_01246   citX FALSE 0.332 116.000 0.031 1.000   NA
 10481248 10481249 LCRIS_01246 LCRIS_01247 citX arcC TRUE 0.740 14.000 0.000 1.000 N NA
 10481249 10481250 LCRIS_01247 LCRIS_01248 arcC   TRUE 0.962 9.000 0.000 0.001   NA
 10481250 10481251 LCRIS_01248 LCRIS_01249   argF TRUE 0.917 33.000 0.000 0.002   NA
 10481251 10481252 LCRIS_01249 LCRIS_01250 argF arcA TRUE 0.898 11.000 0.125 1.000   NA
 10481252 10481253 LCRIS_01250 LCRIS_01251 arcA   FALSE 0.216 74.000 0.000 NA   NA
 10481253 10481254 LCRIS_01251 LCRIS_01252     TRUE 0.863 -10.000 0.000 NA   NA
 10481256 10481257 LCRIS_01254 LCRIS_01255     FALSE 0.180 88.000 0.000 NA   NA
 10481257 10481258 LCRIS_01255 LCRIS_01256     FALSE 0.513 24.000 0.000 NA   NA
 10481260 10481261 LCRIS_01258 LCRIS_01259 merA   TRUE 0.981 -3.000 0.000 0.018   NA
 10481261 10481262 LCRIS_01259 LCRIS_01260   apt FALSE 0.005 453.000 0.000 1.000 N NA
 10481262 10481263 LCRIS_01260 LCRIS_01261 apt recJ FALSE 0.512 105.000 0.128 1.000 N NA
 10481263 10481264 LCRIS_01261 LCRIS_01262 recJ srtA FALSE 0.232 121.000 0.006 NA N NA
 10481264 10481265 LCRIS_01262 LCRIS_01263 srtA lepA TRUE 0.712 48.000 0.006 NA Y NA
 10481267 10481268 LCRIS_01265 LCRIS_01266 dnaJ dnaK TRUE 0.929 83.000 0.196 0.003 Y NA
 10481268 10481269 LCRIS_01266 LCRIS_01267 dnaK grpE TRUE 0.979 17.000 0.026 0.007 Y NA
 10481269 10481270 LCRIS_01267 LCRIS_01268 grpE hrcA TRUE 0.881 13.000 0.051 1.000 N NA
 10481270 10481271 LCRIS_01268 LCRIS_01269 hrcA ribF FALSE 0.188 138.000 0.009 1.000 N NA
 10481271 10481272 LCRIS_01269 LCRIS_01270 ribF truB TRUE 0.908 26.000 0.308 1.000 N NA
 10481272 10481273 LCRIS_01270 LCRIS_01271 truB rbfA TRUE 0.797 56.000 0.111 1.000 Y NA
 10481273 10481274 LCRIS_01271 LCRIS_01272 rbfA infB TRUE 0.963 20.000 0.530 1.000 Y NA
 10481274 10481275 LCRIS_01272 LCRIS_01273 infB   TRUE 0.954 5.000 0.223 NA Y NA
 10481275 10481276 LCRIS_01273 LCRIS_01274     TRUE 0.965 3.000 0.408 NA N NA
 10481276 10481277 LCRIS_01274 LCRIS_01275   nusA TRUE 0.956 10.000 0.323 NA Y NA
 10481277 10481278 LCRIS_01275 LCRIS_01276 nusA   TRUE 0.954 20.000 0.759 NA   NA
 10481278 10481279 LCRIS_01276 LCRIS_01277   polC FALSE 0.347 111.000 0.059 NA   NA
 10481279 10481280 LCRIS_01277 LCRIS_01278 polC proS TRUE 0.967 6.000 0.070 0.038 N NA
 10481280 10481281 LCRIS_01278 LCRIS_01279 proS   TRUE 0.835 28.000 0.095 1.000 N NA
 10481281 10481282 LCRIS_01279 LCRIS_01280   cdsA TRUE 0.876 13.000 0.040 1.000 N NA
 10481282 10481283 LCRIS_01280 LCRIS_01281 cdsA uppS TRUE 0.710 78.000 0.113 1.000 Y NA
 10481283 10481284 LCRIS_01281 LCRIS_01282 uppS frr TRUE 0.969 3.000 0.409 1.000 N NA
 10481284 10481285 LCRIS_01282 LCRIS_01283 frr pyrH TRUE 0.985 0.000 0.626 1.000 N NA
 10481285 10481286 LCRIS_01283 LCRIS_01284 pyrH tsf FALSE 0.404 145.000 0.416 1.000 N NA
 10481286 10481287 LCRIS_01284 LCRIS_01285 tsf rpsB TRUE 0.954 34.000 0.748 1.000 Y NA
 10481287 10481288 LCRIS_01285 LCRIS_01286 rpsB   FALSE 0.087 164.000 0.006 1.000   NA
 10481289 10481290 LCRIS_01287 LCRIS_01288 plsC cfa FALSE 0.385 113.000 0.034 1.000 N NA
 10481291 10481292 LCRIS_01289 LCRIS_01290 pepO2 mdlB FALSE 0.446 93.000 0.018 1.000 N NA
 10481292 10481293 LCRIS_01290 LCRIS_01291 mdlB mdlA TRUE 0.999 -7.000 0.911 0.011 Y NA
 10481293 10481294 LCRIS_01291 LCRIS_01292 mdlA   TRUE 0.615 81.000 0.214 NA   NA
 10481294 10481295 LCRIS_01292 LCRIS_01293     TRUE 0.596 70.000 0.145 NA   NA
 10481297 10481298 LCRIS_01295 LCRIS_01296   dpo TRUE 0.960 -7.000 0.024 1.000 N NA
 10481298 10481299 LCRIS_01296 LCRIS_01297 dpo   FALSE 0.004 350.000 0.000 NA   NA
 10481299 10481300 LCRIS_01297 LCRIS_01298   rplS FALSE 0.125 112.000 0.000 NA   NA
 10481300 10481301 LCRIS_01298 LCRIS_01299 rplS trmD TRUE 0.752 114.000 0.567 1.000 Y NA
 10481301 10481302 LCRIS_01299 LCRIS_01300 trmD rimM TRUE 0.994 -10.000 0.672 1.000 Y NA
 10481302 10481303 LCRIS_01300 LCRIS_01301 rimM rpsP TRUE 0.944 67.000 0.342 0.019 Y NA
 10481303 10481304 LCRIS_01301 LCRIS_01302 rpsP ffh TRUE 0.712 88.000 0.361 1.000 N NA
 10481304 10481305 LCRIS_01302 LCRIS_01303 ffh   TRUE 0.928 4.000 0.151 1.000   NA
 10481307 10481308 LCRIS_01305 LCRIS_01306     TRUE 0.948 15.000 0.417 1.000   NA
 10481308 10481309 LCRIS_01306 LCRIS_01307   pepD1 FALSE 0.004 547.000 0.000 1.000 N NA
 10481309 10481310 LCRIS_01307 LCRIS_01308 pepD1 ftsY TRUE 0.650 45.000 0.005 1.000 N NA
 10481310 10481311 LCRIS_01308 LCRIS_01309 ftsY smc TRUE 0.990 1.000 0.165 0.013 N NA
 10481311 10481312 LCRIS_01309 LCRIS_01310 smc rnc TRUE 0.905 13.000 0.120 1.000 N NA
 10481312 10481313 LCRIS_01310 LCRIS_01311 rnc oppA2 FALSE 0.224 106.000 0.000 1.000 N NA
 10481313 10481314 LCRIS_01311 LCRIS_01312 oppA2 oppC2 FALSE 0.072 314.000 0.000 0.025 Y NA
 10481314 10481315 LCRIS_01312 LCRIS_01313 oppC2 oppB2 TRUE 0.993 14.000 0.727 0.025 Y NA
 10481315 10481316 LCRIS_01313 LCRIS_01314 oppB2 oppF2 TRUE 0.991 0.000 0.727 1.000 Y NA
 10481316 10481317 LCRIS_01314 LCRIS_01315 oppF2 oppD2 TRUE 0.995 4.000 0.477 0.002 Y NA
 10481317 10481318 LCRIS_01315 LCRIS_01316 oppD2 acpP FALSE 0.372 119.000 0.062 1.000 N NA
 10481318 10481319 LCRIS_01316 LCRIS_01317 acpP plsX TRUE 0.968 31.000 0.029 0.002 Y NA
 10481319 10481320 LCRIS_01317 LCRIS_01318 plsX recG TRUE 0.846 20.000 0.033 1.000 N NA
 10481320 10481321 LCRIS_01318 LCRIS_01319 recG   TRUE 0.921 3.000 0.074 1.000   NA
 10481321 10481322 LCRIS_01319 LCRIS_01320     TRUE 0.932 22.000 0.567 NA   NA
 10481323 10481324 LCRIS_01321 LCRIS_01322 rpmB   FALSE 0.010 248.000 0.000 NA   NA
 10481324 10481325 LCRIS_01322 LCRIS_01323     FALSE 0.464 30.000 0.000 NA   NA
 10481326 10481327 LCRIS_01324 LCRIS_01325   thiN FALSE 0.026 227.000 0.005 NA   NA
 10481327 10481328 LCRIS_01325 LCRIS_01326 thiN rpe1 TRUE 0.944 0.000 0.028 1.000 N NA
 10481328 10481329 LCRIS_01326 LCRIS_01327 rpe1 rsgA TRUE 0.837 13.000 0.018 1.000   NA
 10481329 10481330 LCRIS_01327 LCRIS_01328 rsgA prkC TRUE 0.958 1.000 0.196 1.000   NA
 10481330 10481331 LCRIS_01328 LCRIS_01329 prkC   TRUE 0.994 -10.000 0.704 1.000 Y NA
 10481331 10481332 LCRIS_01329 LCRIS_01330   sun TRUE 0.908 5.000 0.074 1.000 N NA
 10481332 10481333 LCRIS_01330 LCRIS_01331 sun fmt TRUE 0.990 -13.000 0.305 1.000 Y NA
 10481333 10481334 LCRIS_01331 LCRIS_01332 fmt priA TRUE 0.881 13.000 0.052 1.000 N NA
 10481334 10481335 LCRIS_01332 LCRIS_01333 priA rpoZ TRUE 0.873 51.000 0.032 0.064 N NA
 10481335 10481336 LCRIS_01333 LCRIS_01334 rpoZ gmk1 TRUE 0.960 6.000 0.471 1.000 N NA
 10481336 10481337 LCRIS_01334 LCRIS_01335 gmk1   FALSE 0.247 108.000 0.003 NA   NA
 10481337 10481338 LCRIS_01335 LCRIS_01336   recN TRUE 0.925 -7.000 0.004 NA   NA
 10481338 10481339 LCRIS_01336 LCRIS_01337 recN tlyA TRUE 0.860 11.000 0.017 1.000 N NA
 10481339 10481340 LCRIS_01337 LCRIS_01338 tlyA ispA TRUE 0.942 1.000 0.058 1.000 N NA
 10481340 10481341 LCRIS_01338 LCRIS_01339 ispA xseB TRUE 0.936 3.000 0.100 1.000 N NA
 10481341 10481342 LCRIS_01339 LCRIS_01340 xseB xseA TRUE 0.998 -19.000 0.412 0.001 Y NA
 10481342 10481343 LCRIS_01340 LCRIS_01341 xseA folD TRUE 0.969 -13.000 0.045 1.000 N NA
 10481343 10481344 LCRIS_01341 LCRIS_01342 folD nusB TRUE 0.685 57.000 0.082 1.000 N NA
 10481344 10481345 LCRIS_01342 LCRIS_01343 nusB   TRUE 0.965 0.000 0.265 NA   NA
 10481345 10481346 LCRIS_01343 LCRIS_01344   efp1 TRUE 0.808 19.000 0.031 NA   NA
 10481346 10481347 LCRIS_01344 LCRIS_01345 efp1 pepP1 TRUE 0.646 81.000 0.160 1.000 N NA
 10481347 10481348 LCRIS_01345 LCRIS_01346 pepP1 rpmA FALSE 0.320 117.000 0.013 1.000 N NA
 10481348 10481349 LCRIS_01346 LCRIS_01347 rpmA rplU TRUE 0.992 19.000 0.667 0.019 Y NA
 10481349 10481350 LCRIS_01347 LCRIS_01348 rplU   FALSE 0.076 159.000 0.002 NA   NA
 10481350 10481351 LCRIS_01348 LCRIS_01349     FALSE 0.550 84.000 0.143 NA   NA
 10481351 10481352 LCRIS_01349 LCRIS_01350     FALSE 0.039 158.000 0.000 NA   NA
 10481352 10481353 LCRIS_01350 LCRIS_01351     FALSE 0.062 138.000 0.000 NA   NA
 10481353 10481354 LCRIS_01351 LCRIS_01352     TRUE 0.626 49.000 0.038 NA   NA
 10481354 10481355 LCRIS_01352 LCRIS_01353     TRUE 0.889 4.000 0.071 NA   NA
 10481355 10481356 LCRIS_01353 LCRIS_01354     FALSE 0.130 130.000 0.000 1.000 N NA
 10481356 10481357 LCRIS_01354 LCRIS_02095   tRNA-Arg FALSE 0.008 263.000 0.000 NA   NA
 10481358 10481359 LCRIS_01355 LCRIS_01356     TRUE 0.852 13.000 0.015 1.000 N NA
 10481360 10481361 LCRIS_01357 LCRIS_01358     TRUE 0.998 0.000 1.000 0.003 Y NA
 10481361 10481362 LCRIS_01358 LCRIS_01359     FALSE 0.006 334.000 0.000 1.000   NA
 10481362 10481363 LCRIS_01359 LCRIS_01360     FALSE 0.271 60.000 0.000 NA   NA
 10481363 10481364 LCRIS_01360 LCRIS_01361     FALSE 0.098 122.000 0.000 NA   NA
 10481364 10481365 LCRIS_01361 LCRIS_01362     FALSE 0.094 123.000 0.000 NA   NA
 10481366 10481367 LCRIS_01363 LCRIS_01364   pepXP TRUE 0.847 95.000 0.054 0.001   NA
 10481368 10481369 LCRIS_01365 LCRIS_01366 msrB   TRUE 0.859 16.000 0.071 NA   NA
 10481369 10481370 LCRIS_01366 LCRIS_01367     TRUE 0.610 126.000 0.750 NA   NA
 10481370 10481371 LCRIS_01367 LCRIS_01368   lctP1 FALSE 0.089 145.000 0.000 1.000 N NA
 10481371 10481372 LCRIS_01368 LCRIS_01369 lctP1 carB2 FALSE 0.014 264.000 0.000 1.000 N NA
 10481372 10481373 LCRIS_01369 LCRIS_01370 carB2 carA2 TRUE 0.996 -7.000 0.117 0.002 Y NA
 10481373 10481374 LCRIS_01370 LCRIS_01371 carA2 pyrC TRUE 0.977 0.000 0.155 1.000 Y NA
 10481374 10481375 LCRIS_01371 LCRIS_01372 pyrC pyrB TRUE 0.987 0.000 0.452 1.000 Y NA
 10481375 10481376 LCRIS_01372 LCRIS_01373 pyrB pyrR2 FALSE 0.440 141.000 0.247 1.000 Y NA
 10481376 10481377 LCRIS_01373 LCRIS_01374 pyrR2 pyrD FALSE 0.148 169.000 0.010 1.000 Y NA
 10481378 10481379 LCRIS_01375 LCRIS_01376 pyrF pyrE TRUE 0.968 2.000 0.133 1.000 Y NA
 10481379 10481380 LCRIS_01376 LCRIS_01377 pyrE   FALSE 0.082 140.000 0.000 1.000   NA
 10481380 10481381 LCRIS_01377 LCRIS_01378     FALSE 0.011 271.000 0.000 1.000   NA
 10481383 10481384 LCRIS_01380 LCRIS_01381 sdaB sdaA TRUE 0.988 15.000 0.324 0.001   NA
 10481384 10481385 LCRIS_01381 LCRIS_01382 sdaA   TRUE 0.868 9.000 0.088 NA   NA
 10481386 10481387 LCRIS_01383 LCRIS_01384 dapE1 dapE2 TRUE 0.988 -10.000 0.000 0.004   NA
 10481387 10481388 LCRIS_01384 LCRIS_01385 dapE2   FALSE 0.015 208.000 0.000 NA   NA
 10481388 10481389 LCRIS_01385 LCRIS_01386     TRUE 0.833 -3.000 0.000 NA   NA
 10481389 10481390 LCRIS_01386 LCRIS_01387     FALSE 0.389 39.000 0.000 NA   NA
 10481390 10481391 LCRIS_01387 LCRIS_01388   lctO FALSE 0.005 352.000 0.000 1.000   NA
 10481393 10481394 LCRIS_01390 LCRIS_01391     FALSE 0.070 155.000 0.000 1.000 N NA
 10481394 10481395 LCRIS_01391 LCRIS_01392     FALSE 0.007 279.000 0.000 NA   NA
 10481395 10481396 LCRIS_01392 LCRIS_01393     FALSE 0.029 169.000 0.000 NA   NA
 10481396 10481397 LCRIS_01393 LCRIS_01394     FALSE 0.165 95.000 0.000 NA   NA
 10481397 10481398 LCRIS_01394 LCRIS_01395     FALSE 0.049 146.000 0.000 NA   NA
 10481398 10481399 LCRIS_01395 LCRIS_01396     FALSE 0.322 52.000 0.000 NA   NA
 10481399 10481400 LCRIS_01396 LCRIS_01397     TRUE 0.751 4.000 0.000 1.000   NA
 10481400 10481401 LCRIS_01397 LCRIS_01398     TRUE 0.872 10.000 0.100 NA   NA
 10481401 10481402 LCRIS_01398 LCRIS_01399     TRUE 0.692 48.000 0.067 NA N NA
 10481402 10481403 LCRIS_01399 LCRIS_01400     TRUE 0.614 133.000 0.533 1.000 Y NA
 10481403 10481404 LCRIS_01400 LCRIS_01401     TRUE 0.971 7.000 0.800 1.000   NA
 10481404 10481405 LCRIS_01401 LCRIS_01402   gtfA2 FALSE 0.038 172.000 0.000 1.000   NA
 10481405 10481406 LCRIS_01402 LCRIS_01403 gtfA2 galA1 TRUE 0.994 12.000 1.000 0.024 Y NA
 10481406 10481407 LCRIS_01403 LCRIS_01404 galA1 msmK2 TRUE 0.977 10.000 0.667 1.000 Y NA
 10481407 10481408 LCRIS_01404 LCRIS_01405 msmK2 msmG TRUE 0.962 27.000 0.050 0.024 Y NA
 10481408 10481409 LCRIS_01405 LCRIS_01406 msmG msmF TRUE 0.994 15.000 0.925 0.024 Y NA
 10481409 10481410 LCRIS_01406 LCRIS_01407 msmF msmE TRUE 0.985 13.000 0.275 0.024 Y NA
 10481412 10481413 LCRIS_01409 LCRIS_01410   galM FALSE 0.069 133.000 0.000 NA   NA
 10481413 10481414 LCRIS_01410 LCRIS_01411 galM galT FALSE 0.442 123.000 0.048 1.000 Y NA
 10481414 10481415 LCRIS_01411 LCRIS_01412 galT galK TRUE 0.982 19.000 0.063 0.002 Y NA
 10481415 10481416 LCRIS_01412 LCRIS_01413 galK lacZ FALSE 0.012 368.000 0.000 1.000 Y NA
 10481416 10481417 LCRIS_01413 LCRIS_01414 lacZ   TRUE 0.965 11.000 0.400 1.000 Y NA
 10481417 10481418 LCRIS_01414 LCRIS_01415   lacR FALSE 0.206 193.000 0.500 1.000 N NA
 10481419 10481420 LCRIS_01416 LCRIS_01417 lacL lacM TRUE 0.996 -16.000 0.435 0.024   NA
 10481420 10481421 LCRIS_01417 LCRIS_01418 lacM galE FALSE 0.542 103.000 0.182 1.000   NA
 10481422 10481423 LCRIS_01419 LCRIS_01420     TRUE 0.983 -3.000 0.500 NA   NA
 10481427 10481428 LCRIS_01424 LCRIS_01425 malY pepP2 TRUE 0.904 8.000 0.007 1.000 Y NA
 10481428 10481429 LCRIS_01425 LCRIS_01426 pepP2   TRUE 0.852 -7.000 0.000 NA   NA
 10481429 10481430 LCRIS_01426 LCRIS_01427   lacE FALSE 0.522 23.000 0.000 NA   NA
 10481430 10481431 LCRIS_01427 LCRIS_01428 lacE celA2 TRUE 0.997 3.000 1.000 0.012 Y NA
 10481431 10481432 LCRIS_01428 LCRIS_01429 celA2 celC2 TRUE 0.994 19.000 1.000 0.012 Y NA
 10481432 10481433 LCRIS_01429 LCRIS_01430 celC2 ypdE TRUE 0.984 15.000 1.000 1.000 Y NA
 10481433 10481434 LCRIS_01430 LCRIS_01431 ypdE licR TRUE 0.985 3.000 1.000 1.000 N NA
 10481434 10481435 LCRIS_01431 LCRIS_01432 licR   FALSE 0.287 87.000 0.000 1.000 N NA
 10481435 10481436 LCRIS_01432 LCRIS_01433     TRUE 0.872 37.000 0.000 0.018   NA
 10481436 10481437 LCRIS_01433 LCRIS_01434     TRUE 0.933 19.000 0.000 0.018   NA
 10481439 10481440 LCRIS_01436 LCRIS_01437 manX1 manZ2 TRUE 0.964 15.000 0.000 0.020 Y NA
 10481440 10481441 LCRIS_01437 LCRIS_01438 manZ2 manY2 TRUE 0.996 -22.000 0.172 0.020 Y NA
 10481441 10481442 LCRIS_01438 LCRIS_01439 manY2 manX2 TRUE 0.993 17.000 0.800 0.020 Y NA
 10481442 10481443 LCRIS_01439 LCRIS_01440 manX2   TRUE 0.740 11.000 0.000 1.000 N NA
 10481443 10481444 LCRIS_01440 LCRIS_01441     TRUE 0.690 20.000 0.000 1.000 N NA
 10481444 10481445 LCRIS_01441 LCRIS_01442     FALSE 0.032 189.000 0.000 1.000 N NA
 10481445 10481446 LCRIS_01442 LCRIS_01443   malE1 FALSE 0.201 113.000 0.000 1.000 N NA
 10481446 10481447 LCRIS_01443 LCRIS_01444 malE1   TRUE 0.791 4.000 0.000 1.000 N NA
 10481447 10481448 LCRIS_01444 LCRIS_01445     TRUE 0.883 11.000 0.044 1.000 N NA
 10481449 10481450 LCRIS_01446 LCRIS_01447 umuC   TRUE 0.992 -7.000 1.000 NA   NA
 10481450 10481451 LCRIS_01447 LCRIS_01448     FALSE 0.010 242.000 0.000 NA   NA
 10481452 10481453 LCRIS_01449 LCRIS_01450     FALSE 0.418 145.000 0.600 NA   NA
 10481453 10481454 LCRIS_01450 LCRIS_01451   glnA FALSE 0.006 290.000 0.000 NA   NA
 10481454 10481455 LCRIS_01451 LCRIS_01452 glnA   FALSE 0.063 188.000 0.009 1.000 N NA
 10481455 10481456 LCRIS_01452 LCRIS_01453   miaA TRUE 0.967 -7.000 0.065 1.000 N NA
 10481456 10481457 LCRIS_01453 LCRIS_01454 miaA   FALSE 0.428 78.000 0.009 NA N NA
 10481457 10481458 LCRIS_01454 LCRIS_01455     FALSE 0.556 59.000 0.035 NA   NA
 10481458 10481459 LCRIS_01455 LCRIS_01456     TRUE 0.972 0.000 0.347 NA   NA
 10481459 10481460 LCRIS_01456 LCRIS_01457     TRUE 0.742 34.000 0.037 1.000   NA
 10481460 10481461 LCRIS_01457 LCRIS_01458   rpmG2 TRUE 0.843 22.000 0.045 1.000 N NA
 10481461 10481462 LCRIS_01458 LCRIS_01459 rpmG2 pbp2 FALSE 0.549 67.000 0.019 1.000 N NA
 10481463 10481464 LCRIS_01460 LCRIS_01461     TRUE 0.576 63.000 0.095 NA   NA
 10481464 10481465 LCRIS_01461 LCRIS_01462     FALSE 0.008 268.000 0.000 NA   NA
 10481465 10481466 LCRIS_01462 LCRIS_01463     TRUE 0.720 3.000 0.000 NA   NA
 10481466 10481467 LCRIS_01463 LCRIS_01464   hupB2 FALSE 0.002 759.000 0.000 NA   NA
 10481468 10481469 LCRIS_01465 LCRIS_01466 fepC   TRUE 0.993 -7.000 0.657 1.000 Y NA
 10481469 10481470 LCRIS_01466 LCRIS_01467     TRUE 0.984 6.000 0.877 1.000 Y NA
 10481470 10481471 LCRIS_01467 LCRIS_01468     TRUE 0.950 -3.000 0.073 NA   NA
 10481471 10481472 LCRIS_01468 LCRIS_01469     TRUE 0.935 0.000 0.061 NA   NA
 10481472 10481473 LCRIS_01469 LCRIS_01470     FALSE 0.117 116.000 0.000 NA   NA
 10481477 10481478 LCRIS_01474 LCRIS_01475     TRUE 0.991 -7.000 0.889 NA   NA
 10481478 10481479 LCRIS_01475 LCRIS_01476     TRUE 0.978 -3.000 0.375 NA   NA
 10481479 10481480 LCRIS_01476 LCRIS_01477     FALSE 0.019 219.000 0.000 1.000   NA
 10481480 10481481 LCRIS_01477 LCRIS_01478   oppA3 TRUE 0.740 11.000 0.000 1.000 N NA
 10481481 10481482 LCRIS_01478 LCRIS_01479 oppA3   FALSE 0.005 397.000 0.000 1.000   NA
 10481483 10481484 LCRIS_01480 LCRIS_01481 sufI   TRUE 0.604 13.000 0.000 NA   NA
 10481484 10481485 LCRIS_01481 LCRIS_01482   metQ2 FALSE 0.003 372.000 0.000 NA   NA
 10481486 10481487 LCRIS_01483 LCRIS_01484 ldh3 greA2 FALSE 0.554 62.000 0.014 1.000 N NA
 10481487 10481488 LCRIS_01484 LCRIS_01485 greA2 pheT FALSE 0.454 79.000 0.004 1.000 N NA
 10481488 10481489 LCRIS_01485 LCRIS_01486 pheT pheS TRUE 0.996 4.000 0.574 0.001 Y NA
 10481489 10481490 LCRIS_01486 LCRIS_01487 pheS   FALSE 0.012 284.000 0.000 1.000 N NA
 10481490 10481491 LCRIS_01487 LCRIS_01488   gltL TRUE 0.979 7.000 0.671 1.000 Y NA
 10481491 10481492 LCRIS_01488 LCRIS_01489 gltL glnP3 TRUE 0.980 10.000 0.773 1.000 Y NA
 10481492 10481493 LCRIS_01489 LCRIS_01490 glnP3 glnP4 TRUE 0.999 -19.000 0.841 0.008 Y NA
 10481493 10481494 LCRIS_01490 LCRIS_01491 glnP4   FALSE 0.008 301.000 0.000 NA N NA
 10481494 10481495 LCRIS_01491 LCRIS_01492   spoU FALSE 0.338 108.000 0.020 NA N NA
 10481496 10481497 LCRIS_01493 LCRIS_01494 acyP yidC TRUE 0.700 44.000 0.020 1.000 N NA
 10481497 10481498 LCRIS_01494 LCRIS_01495 yidC   TRUE 0.660 47.000 0.051 NA   NA
 10481499 10481500 LCRIS_01496 LCRIS_01497     FALSE 0.229 69.000 0.000 NA   NA
 10481500 10481501 LCRIS_01497 LCRIS_01498     FALSE 0.137 107.000 0.000 NA   NA
 10481501 10481502 LCRIS_01498 LCRIS_01499     FALSE 0.006 302.000 0.000 NA   NA
 10481502 10481503 LCRIS_01499 LCRIS_01500     TRUE 0.992 -22.000 0.438 1.000 Y NA
 10481503 10481504 LCRIS_01500 LCRIS_01501     FALSE 0.071 169.000 0.014 NA   NA
 10481504 10481505 LCRIS_01501 LCRIS_01502     TRUE 0.906 3.000 0.070 NA   NA
 10481505 10481506 LCRIS_01502 LCRIS_01503     TRUE 0.829 4.000 0.007 NA   NA
 10481506 10481507 LCRIS_01503 LCRIS_01504     TRUE 0.873 19.000 0.149 NA   NA
 10481507 10481508 LCRIS_01504 LCRIS_01505   nadD TRUE 0.988 -19.000 0.199 1.000 Y NA
 10481508 10481509 LCRIS_01505 LCRIS_01506 nadD   TRUE 0.828 11.000 0.010 1.000   NA
 10481509 10481510 LCRIS_01506 LCRIS_01507     TRUE 0.986 -7.000 0.555 NA   NA
 10481512 10481513 LCRIS_01509 LCRIS_01510 galA2 scrA2 TRUE 0.849 10.000 0.000 1.000 Y NA
 10481513 10481514 LCRIS_01510 LCRIS_01511 scrA2   TRUE 0.591 18.000 0.000 NA   NA
 10481514 10481515 LCRIS_01511 LCRIS_01512     TRUE 0.752 2.000 0.000 NA   NA
 10481516 10481517 LCRIS_01513 LCRIS_01514     TRUE 0.930 6.000 0.000 0.042   NA
 10481518 10481519 LCRIS_01515 LCRIS_01516 rplT rpmI TRUE 0.985 45.000 0.928 0.019 Y NA
 10481519 10481520 LCRIS_01516 LCRIS_01517 rpmI infC TRUE 0.966 22.000 0.652 1.000 Y NA
 10481520 10481521 LCRIS_01517 LCRIS_01518 infC   FALSE 0.012 261.000 0.000 1.000   NA
 10481521 10481522 LCRIS_01518 LCRIS_01519     FALSE 0.440 32.000 0.000 NA   NA
 10481522 10481523 LCRIS_01519 LCRIS_01520     TRUE 0.983 0.000 0.667 NA   NA
 10481523 10481524 LCRIS_01520 LCRIS_01521     TRUE 0.900 3.000 0.048 NA   NA
 10481524 10481525 LCRIS_01521 LCRIS_01522     TRUE 0.969 -3.000 0.214 NA   NA
 10481525 10481526 LCRIS_01522 LCRIS_01523     FALSE 0.033 164.000 0.000 NA   NA
 10481526 10481527 LCRIS_01523 LCRIS_01524     FALSE 0.015 207.000 0.000 NA   NA
 10481527 10481528 LCRIS_01524 LCRIS_01525   thrS FALSE 0.077 130.000 0.000 NA   NA
 10481528 10481529 LCRIS_01525 LCRIS_01526 thrS dnaI FALSE 0.012 285.000 0.000 1.000 N NA
 10481529 10481530 LCRIS_01526 LCRIS_01527 dnaI dnaB2 TRUE 0.972 20.000 0.817 NA Y NA
 10481530 10481531 LCRIS_01527 LCRIS_01528 dnaB2 nrdR TRUE 0.928 3.000 0.109 NA N NA
 10481531 10481532 LCRIS_01528 LCRIS_01529 nrdR coaE TRUE 0.898 3.000 0.024 NA N NA
 10481532 10481533 LCRIS_01529 LCRIS_01530 coaE fpg TRUE 0.953 0.000 0.066 1.000 N NA
 10481533 10481534 LCRIS_01530 LCRIS_01531 fpg polA TRUE 0.936 9.000 0.101 1.000 Y NA
 10481534 10481535 LCRIS_01531 LCRIS_01532 polA   FALSE 0.027 207.000 0.000 1.000 N NA
 10481535 10481536 LCRIS_01532 LCRIS_01533     TRUE 0.889 21.000 0.200 NA N NA
 10481536 10481537 LCRIS_01533 LCRIS_01534     TRUE 0.609 114.000 0.500 NA   NA
 10481538 10481539 LCRIS_01535 LCRIS_01536     FALSE 0.150 103.000 0.000 NA   NA
 10481539 10481540 LCRIS_01536 LCRIS_01537     TRUE 0.766 1.000 0.000 NA   NA
 10481540 10481541 LCRIS_01537 LCRIS_01538     FALSE 0.121 114.000 0.000 NA   NA
 10481541 10481542 LCRIS_01538 LCRIS_01539     FALSE 0.134 108.000 0.000 NA   NA
 10481543 10481544 LCRIS_01540 LCRIS_01541 murC   FALSE 0.019 288.000 0.008 1.000   NA
 10481544 10481545 LCRIS_01541 LCRIS_01542   trx TRUE 0.847 20.000 0.068 1.000   NA
 10481545 10481546 LCRIS_01542 LCRIS_01543 trx   FALSE 0.292 70.000 0.000 1.000   NA
 10481546 10481547 LCRIS_01543 LCRIS_01544     TRUE 0.725 118.000 1.000 NA   NA
 10481547 10481548 LCRIS_01544 LCRIS_01545   trmB FALSE 0.054 143.000 0.000 NA   NA
 10481548 10481549 LCRIS_01545 LCRIS_01546 trmB   TRUE 0.828 10.000 0.026 NA   NA
 10481549 10481550 LCRIS_01546 LCRIS_01547   ecsA TRUE 0.967 -13.000 0.073 NA N NA
 10481551 10481552 LCRIS_01548 LCRIS_01549 hit   TRUE 0.823 10.000 0.023 NA   NA
 10481552 10481553 LCRIS_01549 LCRIS_01550   prsA TRUE 0.609 119.000 0.600 NA   NA
 10481554 10481555 LCRIS_01551 LCRIS_01552   eda FALSE 0.016 257.000 0.000 1.000 N NA
 10481555 10481556 LCRIS_01552 LCRIS_01553 eda   FALSE 0.180 108.000 0.000 1.000   NA
 10481556 10481557 LCRIS_01553 LCRIS_01554   cbf FALSE 0.015 235.000 0.000 1.000   NA
 10481557 10481558 LCRIS_01554 LCRIS_01555 cbf   TRUE 0.959 -7.000 0.039 1.000   NA
 10481558 10481559 LCRIS_01555 LCRIS_01556     TRUE 0.990 -19.000 0.312 1.000 Y NA
 10481559 10481560 LCRIS_01556 LCRIS_01557     TRUE 0.871 9.000 0.093 NA   NA
 10481560 10481561 LCRIS_01557 LCRIS_01558   pbp3 TRUE 0.894 17.000 0.168 NA   NA
 10481563 10481564 LCRIS_01560 LCRIS_01561 ppsA   TRUE 0.842 17.000 0.000 1.000 Y NA
 10481568 10481569 LCRIS_01565 LCRIS_01566   citG FALSE 0.531 90.000 0.154 NA   NA
 10481569 10481570 LCRIS_01566 LCRIS_01567 citG   TRUE 0.693 11.000 0.000 1.000   NA
 10481570 10481571 LCRIS_01567 LCRIS_01568     TRUE 0.812 2.000 0.000 1.000   NA
 10481571 10481572 LCRIS_01568 LCRIS_01569   mdcD TRUE 0.966 -12.000 0.062 1.000   NA
 10481572 10481573 LCRIS_01569 LCRIS_01570 mdcD mdcC TRUE 0.983 -10.000 0.400 NA   NA
 10481573 10481574 LCRIS_01570 LCRIS_01571 mdcC mdcA TRUE 0.830 19.000 0.061 NA   NA
 10481574 10481575 LCRIS_01571 LCRIS_01572 mdcA fabD TRUE 0.980 0.000 0.020 0.039   NA
 10481576 10481577 LCRIS_01573 LCRIS_01574     FALSE 0.252 85.000 0.000 1.000   NA
 10481580 10481581 LCRIS_01577 LCRIS_01578     FALSE 0.553 20.000 0.000 NA   NA
 10481582 10481583 LCRIS_01579 LCRIS_01580 nagZ   FALSE 0.125 124.000 0.000 1.000   NA
 10481583 10481584 LCRIS_01580 LCRIS_01581     TRUE 0.797 90.000 0.049 0.020   NA
 10481585 10481586 LCRIS_01582 LCRIS_01583     FALSE 0.530 22.000 0.000 NA   NA
 10481588 10481589 LCRIS_01585 LCRIS_01586 rpiA3 rpe2 TRUE 0.630 51.000 0.000 1.000 Y NA
 10481589 10481590 LCRIS_01586 LCRIS_01587 rpe2   FALSE 0.265 159.000 0.000 0.024   NA
 10481590 10481591 LCRIS_01587 LCRIS_01588     TRUE 0.859 52.000 0.500 1.000   NA
 10481591 10481592 LCRIS_01588 LCRIS_01589   bglF2 TRUE 0.920 12.000 0.182 1.000 N NA
 10481592 10481593 LCRIS_01589 LCRIS_01590 bglF2 bglG2 TRUE 0.980 -7.000 0.273 1.000   NA
 10481593 10481594 LCRIS_01590 LCRIS_01591 bglG2   FALSE 0.113 186.000 0.167 1.000   NA
 10481594 10481595 LCRIS_01591 LCRIS_01592     TRUE 0.828 27.000 0.105 1.000   NA
 10481595 10481596 LCRIS_01592 LCRIS_01593     FALSE 0.460 111.000 0.105 1.000 N NA
 10481597 10481598 LCRIS_01594 LCRIS_01595     FALSE 0.098 122.000 0.000 NA   NA
 10481600 10481601 LCRIS_01597 LCRIS_01598     FALSE 0.003 489.000 0.000 NA   NA
 10481602 10481603 LCRIS_01599 LCRIS_01600   celB6 TRUE 0.849 0.000 0.000 1.000   NA
 10481605 10481606 LCRIS_01602 LCRIS_01603     TRUE 0.573 19.000 0.000 NA   NA
 10481606 10481607 LCRIS_01603 LCRIS_01604     TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA N NA
 10481607 10481608 LCRIS_01604 LCRIS_01605     TRUE 0.679 4.000 0.000 NA   NA
 10481608 10481609 LCRIS_01605 LCRIS_01606     TRUE 0.605 12.000 0.000 NA   NA
 10481609 10481610 LCRIS_01606 LCRIS_01607     TRUE 0.833 -3.000 0.000 NA   NA
 10481612 10481613 LCRIS_01609 LCRIS_01610     FALSE 0.422 34.000 0.000 NA   NA
 10481613 10481614 LCRIS_01610 LCRIS_01611     FALSE 0.110 118.000 0.000 NA   NA
 10481614 10481615 LCRIS_01611 LCRIS_01612     FALSE 0.062 138.000 0.000 NA   NA
 10481615 10481616 LCRIS_01612 LCRIS_01613     FALSE 0.187 86.000 0.000 NA   NA
 10481616 10481617 LCRIS_01613 LCRIS_01614     FALSE 0.422 34.000 0.000 NA   NA
 10481617 10481618 LCRIS_01614 LCRIS_01615     FALSE 0.012 222.000 0.000 NA   NA
 10481618 10481619 LCRIS_01615 LCRIS_01616     TRUE 0.812 2.000 0.000 1.000   NA
 10481619 10481620 LCRIS_01616 LCRIS_01617     FALSE 0.002 635.000 0.000 NA   NA
 10481620 10481621 LCRIS_01617 LCRIS_01618     FALSE 0.016 199.000 0.000 NA   NA
 10481621 10481622 LCRIS_01618 LCRIS_01619     FALSE 0.221 71.000 0.000 NA   NA
 10481622 10481623 LCRIS_01619 LCRIS_01620     TRUE 0.976 3.000 0.000 0.001   NA
 10481623 10481624 LCRIS_01620 LCRIS_01621     FALSE 0.010 279.000 0.000 1.000   NA
 10481624 10481625 LCRIS_01621 LCRIS_01622   fbaA FALSE 0.519 64.000 0.018 1.000   NA
 10481625 10481626 LCRIS_01622 LCRIS_01623 fbaA argS FALSE 0.407 111.000 0.042 1.000 N NA
 10481626 10481627 LCRIS_01623 LCRIS_01624 argS   FALSE 0.004 364.000 0.000 NA   NA
 10481627 10481628 LCRIS_01624 LCRIS_01625     FALSE 0.010 344.000 0.013 NA   NA
 10481628 10481629 LCRIS_01625 LCRIS_01626   dacA TRUE 0.904 3.000 0.032 NA N NA
 10481630 10481631 LCRIS_02088 LCRIS_01627 tRNA-Leu   FALSE 0.066 135.000 0.000 NA   NA
 10481632 10481633 LCRIS_01628 LCRIS_01629   leuS FALSE 0.361 94.000 0.006 1.000   NA
 10481635 10481636 LCRIS_01631 LCRIS_01632     FALSE 0.259 61.000 0.000 NA   NA
 10481636 10481637 LCRIS_01632 LCRIS_01633   ndh FALSE 0.021 182.000 0.000 NA   NA
 10481637 10481638 LCRIS_01633 LCRIS_01634 ndh menA TRUE 0.936 15.000 0.261 1.000 N NA
 10481640 10481641 LCRIS_01636 LCRIS_01637 ubiE   TRUE 0.743 10.000 0.000 1.000 N NA
 10481641 10481642 LCRIS_01637 LCRIS_01638     TRUE 0.705 90.000 0.000 0.011   NA
 10481642 10481643 LCRIS_01638 LCRIS_01639     TRUE 0.994 -10.000 0.168 0.011   NA
 10481643 10481644 LCRIS_01639 LCRIS_01640   cydB TRUE 0.969 0.000 0.061 1.000 Y NA
 10481644 10481645 LCRIS_01640 LCRIS_01641 cydB cydA TRUE 0.997 2.000 0.950 0.012 Y NA
 10481645 10481646 LCRIS_01641 LCRIS_01642 cydA   FALSE 0.008 327.000 0.000 1.000 N NA
 10481646 10481647 LCRIS_01642 LCRIS_01643     TRUE 0.673 18.000 0.000 1.000   NA
 10481647 10481648 LCRIS_01643 LCRIS_01644   murQ TRUE 0.616 60.000 0.057 1.000   NA
 10481648 10481649 LCRIS_01644 LCRIS_01645 murQ scrA3 TRUE 0.865 24.000 0.150 1.000   NA
 10481649 10481650 LCRIS_01645 LCRIS_01646 scrA3   FALSE 0.032 228.000 0.000 NA Y NA
 10481650 10481651 LCRIS_01646 LCRIS_01647   metK TRUE 0.820 24.000 0.069 NA N NA
 10481651 10481652 LCRIS_01647 LCRIS_02094 metK tRNA-Val FALSE 0.039 158.000 0.000 NA   NA
 10481652 10481653 LCRIS_02094 LCRIS_02093 tRNA-Val tRNA-Glu TRUE 0.720 3.000 0.000 NA   NA
 10481653 10481654 LCRIS_02093 LCRIS_01648 tRNA-Glu   FALSE 0.043 152.000 0.000 NA   NA
 10481654 10481655 LCRIS_01648 LCRIS_02092   tRNA-Ser FALSE 0.178 89.000 0.000 NA   NA
 10481655 10481656 LCRIS_02092 LCRIS_02091 tRNA-Ser tRNA-Asn TRUE 0.613 11.000 0.000 NA   NA
 10481656 10481657 LCRIS_02091 LCRIS_02026 tRNA-Asn 5s rRNA TRUE 0.604 13.000 0.000 NA   NA
 10481657 10481658 LCRIS_02026 LCRIS_02030 5s rRNA 23s rRNA FALSE 0.218 73.000 0.000 NA   NA
 10481659 10481660 LCRIS_01649 LCRIS_01650     FALSE 0.002 1421.000 0.000 NA   NA
 10481661 10481662 LCRIS_02034 LCRIS_01651 16s rRNA   TRUE 0.880 -421.000 0.000 NA   NA
 10481663 10481664 LCRIS_01652 LCRIS_01653     FALSE 0.271 60.000 0.000 NA   NA
 10481665 10481666 LCRIS_01654 LCRIS_01655   serS FALSE 0.022 205.000 0.000 1.000   NA
 10481666 10481667 LCRIS_01655 LCRIS_01656 serS   FALSE 0.038 231.000 0.000 1.000 Y NA
 10481667 10481668 LCRIS_01656 LCRIS_01657     TRUE 0.937 0.000 0.067 NA   NA
 10481669 10481670 LCRIS_01658 LCRIS_01659     TRUE 0.961 3.000 0.333 1.000   NA
 10481672 10481673 LCRIS_01661 LCRIS_01662 gabD   FALSE 0.013 275.000 0.000 1.000 N NA
 10481674 10481675 LCRIS_01663 LCRIS_01664     FALSE 0.549 114.000 0.364 NA   NA
 10481675 10481676 LCRIS_01664 LCRIS_01665     TRUE 0.958 5.000 0.455 1.000   NA
 10481676 10481677 LCRIS_01665 LCRIS_01666   penP FALSE 0.458 133.000 0.500 NA   NA
 10481677 10481678 LCRIS_01666 LCRIS_01667 penP   TRUE 0.943 16.000 0.444 NA   NA
 10481678 10481679 LCRIS_01667 LCRIS_01668     FALSE 0.525 119.000 0.333 NA N NA
 10481679 10481680 LCRIS_01668 LCRIS_01669     TRUE 0.606 54.000 0.048 NA   NA
 10481680 10481681 LCRIS_01669 LCRIS_01670     TRUE 0.974 -16.000 0.127 1.000   NA
 10481681 10481682 LCRIS_01670 LCRIS_01671     TRUE 0.990 4.000 0.296 0.023 Y NA
 10481682 10481683 LCRIS_01671 LCRIS_01672     TRUE 0.995 0.000 0.611 0.023 N NA
 10481683 10481684 LCRIS_01672 LCRIS_01673     FALSE 0.031 257.000 0.000 1.000 Y NA
 10481684 10481685 LCRIS_01673 LCRIS_01674     TRUE 0.827 57.000 0.444 1.000   NA
 10481685 10481686 LCRIS_01674 LCRIS_01675   dnaQ2 TRUE 0.948 10.000 0.000 0.011   NA
 10481686 10481687 LCRIS_01675 LCRIS_01676 dnaQ2   TRUE 0.616 16.000 0.000 NA   NA
 10481687 10481688 LCRIS_01676 LCRIS_01677     TRUE 0.918 2.000 0.062 NA   NA
 10481688 10481689 LCRIS_01677 LCRIS_01678     TRUE 0.949 0.000 0.125 NA   NA
 10481689 10481690 LCRIS_01678 LCRIS_01679   pnuC FALSE 0.402 104.000 0.083 NA   NA
 10481690 10481691 LCRIS_01679 LCRIS_01680 pnuC bglA6 FALSE 0.018 239.000 0.000 1.000 N NA
 10481691 10481692 LCRIS_01680 LCRIS_01681 bglA6 bglF3 TRUE 0.947 11.000 0.182 1.000 Y NA
 10481692 10481693 LCRIS_01681 LCRIS_01682 bglF3 bglG3 TRUE 0.982 -3.000 0.409 1.000   NA
 10481695 10481696 LCRIS_01684 LCRIS_01685     FALSE 0.140 152.000 0.057 NA   NA
 10481697 10481698 LCRIS_01686 LCRIS_01687 pip   TRUE 0.665 58.000 0.100 1.000   NA
 10481698 10481699 LCRIS_01687 LCRIS_01688     TRUE 0.992 -13.000 0.450 1.000 Y NA
 10481699 10481700 LCRIS_01688 LCRIS_01689     FALSE 0.424 119.000 0.154 1.000   NA
 10481700 10481701 LCRIS_01689 LCRIS_01690     TRUE 0.954 18.000 0.000 0.002   NA
 10481702 10481703 LCRIS_01691 LCRIS_01692     TRUE 0.929 0.000 0.017 1.000   NA
 10481703 10481704 LCRIS_01692 LCRIS_01693     FALSE 0.273 91.000 0.000 1.000 N NA
 10481705 10481706 LCRIS_01694 LCRIS_01695     FALSE 0.189 127.000 0.012 NA   NA
 10481707 10481708 LCRIS_01696 LCRIS_01697 efp2 coaA TRUE 0.613 118.000 0.006 0.036 N NA
 10481710 10481711 LCRIS_01699 LCRIS_01700     TRUE 0.908 2.000 0.015 1.000   NA
 10481711 10481712 LCRIS_01700 LCRIS_01701     TRUE 0.958 4.000 0.154 1.000 Y NA
 10481712 10481713 LCRIS_01701 LCRIS_01702     TRUE 0.940 14.000 0.130 1.000 Y NA
 10481713 10481714 LCRIS_01702 LCRIS_01703   uvrD FALSE 0.004 434.000 0.000 1.000   NA
 10481715 10481716 LCRIS_01704 LCRIS_01705   gpm3 TRUE 0.720 61.000 0.174 1.000 N NA
 10481718 10481719 LCRIS_01707 LCRIS_01708     FALSE 0.075 180.000 0.054 NA   NA
 10481720 10481721 LCRIS_01709 LCRIS_01710 manX3   FALSE 0.298 56.000 0.000 NA   NA
 10481721 10481722 LCRIS_01710 LCRIS_01711   ansA FALSE 0.006 287.000 0.000 NA   NA
 10481722 10481723 LCRIS_01711 LCRIS_01712 ansA   TRUE 0.848 12.000 0.012 1.000 N NA
 10481723 10481724 LCRIS_01712 LCRIS_01713   glvA TRUE 0.718 132.000 0.286 0.023 N NA
 10481725 10481726 LCRIS_01714 LCRIS_01715     FALSE 0.003 457.000 0.000 NA   NA
 10481727 10481728 LCRIS_01716 LCRIS_01717 hpt2   FALSE 0.015 239.000 0.000 1.000   NA
 10481728 10481729 LCRIS_01717 LCRIS_01718     TRUE 0.591 18.000 0.000 NA   NA
 10481729 10481730 LCRIS_01718 LCRIS_01719     FALSE 0.010 238.000 0.000 NA   NA
 10481730 10481731 LCRIS_01719 LCRIS_01720     FALSE 0.214 75.000 0.000 NA   NA
 10481733 10481734 LCRIS_01722 LCRIS_01723     FALSE 0.007 316.000 0.000 1.000   NA
 10481735 10481736 LCRIS_01724 LCRIS_01725     TRUE 0.720 84.000 0.000 0.015   NA
 10481736 10481737 LCRIS_01725 LCRIS_01726     FALSE 0.214 75.000 0.000 NA   NA
 10481738 10481739 LCRIS_01727 LCRIS_01728     TRUE 0.871 -16.000 0.000 NA   NA
 10481740 10481741 LCRIS_01729 LCRIS_01730     TRUE 0.613 11.000 0.000 NA   NA
 10481741 10481742 LCRIS_01730 LCRIS_01731     FALSE 0.206 79.000 0.000 NA   NA
 10481743 10481744 LCRIS_01732 LCRIS_01733   rfbD FALSE 0.014 264.000 0.000 1.000 N NA
 10481744 10481745 LCRIS_01733 LCRIS_01734 rfbD rfbC TRUE 0.931 21.000 0.188 1.000 Y NA
 10481745 10481746 LCRIS_01734 LCRIS_01735 rfbC rfbA TRUE 0.894 26.000 0.094 1.000 Y NA
 10481746 10481747 LCRIS_01735 LCRIS_01736 rfbA rfbB TRUE 0.994 3.000 0.241 0.002 Y NA
 10481747 10481748 LCRIS_01736 LCRIS_01737 rfbB   FALSE 0.283 88.000 0.000 1.000 N NA
 10481748 10481749 LCRIS_01737 LCRIS_01738     FALSE 0.158 100.000 0.000 NA   NA
 10481749 10481750 LCRIS_01738 LCRIS_01739     TRUE 0.974 0.000 0.400 NA   NA
 10481750 10481751 LCRIS_01739 LCRIS_01740     FALSE 0.005 325.000 0.000 NA   NA
 10481751 10481752 LCRIS_01740 LCRIS_01741   sacB FALSE 0.003 376.000 0.000 NA   NA
 10481752 10481753 LCRIS_01741 LCRIS_01742 sacB   FALSE 0.009 257.000 0.000 NA   NA
 10481753 10481754 LCRIS_01742 LCRIS_01743     FALSE 0.035 161.000 0.000 NA   NA
 10481754 10481755 LCRIS_01743 LCRIS_01744     FALSE 0.106 119.000 0.000 NA   NA
 10481756 10481757 LCRIS_01745 LCRIS_01746     FALSE 0.003 445.000 0.000 NA   NA
 10481757 10481758 LCRIS_01746 LCRIS_01747     FALSE 0.030 442.000 0.000 0.015   NA
 10481759 10481760 LCRIS_01748 LCRIS_01749     TRUE 0.605 12.000 0.000 NA   NA
 10481760 10481761 LCRIS_01749 LCRIS_01750     FALSE 0.002 1051.000 0.000 NA   NA
 10481761 10481762 LCRIS_01750 LCRIS_01751     FALSE 0.259 61.000 0.000 NA   NA
 10481762 10481763 LCRIS_01751 LCRIS_01752   glf TRUE 0.865 8.000 0.032 1.000   NA
 10481763 10481764 LCRIS_01752 LCRIS_01753 glf   TRUE 0.866 3.000 0.012 NA   NA
 10481764 10481765 LCRIS_01753 LCRIS_01754     TRUE 0.873 -19.000 0.000 NA   NA
 10481765 10481766 LCRIS_01754 LCRIS_01755     FALSE 0.553 20.000 0.000 NA   NA
 10481766 10481767 LCRIS_01755 LCRIS_01756     TRUE 0.605 12.000 0.000 NA   NA
 10481767 10481768 LCRIS_01756 LCRIS_01757     FALSE 0.475 28.000 0.000 NA   NA
 10481768 10481769 LCRIS_01757 LCRIS_01758     FALSE 0.513 24.000 0.000 NA   NA
 10481769 10481770 LCRIS_01758 LCRIS_01759     FALSE 0.541 103.000 0.054 NA Y NA
 10481770 10481771 LCRIS_01759 LCRIS_01760     TRUE 0.955 0.000 0.080 1.000 N NA
 10481771 10481772 LCRIS_01760 LCRIS_01761     TRUE 0.965 15.000 0.615 1.000 N NA
 10481772 10481773 LCRIS_01761 LCRIS_01762   epsA TRUE 0.914 18.000 0.231 NA N NA
 10481773 10481774 LCRIS_01762 LCRIS_01763 epsA   FALSE 0.295 66.000 0.000 NA N NA
 10481774 10481775 LCRIS_01763 LCRIS_01764   yoeB FALSE 0.009 255.000 0.000 NA   NA
 10481775 10481776 LCRIS_01764 LCRIS_01765 yoeB   TRUE 0.798 0.000 0.000 NA   NA
 10481777 10481778 LCRIS_01766 LCRIS_01767 hflX   FALSE 0.326 86.000 0.002 NA   NA
 10481779 10481780 LCRIS_01768 LCRIS_01769     FALSE 0.004 332.000 0.000 NA   NA
 10481780 10481781 LCRIS_01769 LCRIS_01770     FALSE 0.489 170.000 1.000 NA Y NA
 10481781 10481782 LCRIS_01770 LCRIS_01771     FALSE 0.022 270.000 0.000 NA Y NA
 10481782 10481783 LCRIS_01771 LCRIS_01772   gmk2 FALSE 0.063 173.000 0.003 NA N NA
 10481784 10481785 LCRIS_01773 LCRIS_01774     TRUE 0.618 86.000 0.263 NA   NA
 10481786 10481787 LCRIS_01775 LCRIS_01776     FALSE 0.018 189.000 0.000 NA   NA
 10481788 10481789 LCRIS_01777 LCRIS_01778 nrdI nrdF TRUE 0.949 3.000 0.083 NA Y NA
 10481792 10481793 LCRIS_01781 LCRIS_01782     TRUE 0.952 3.000 0.300 NA   NA
 10481793 10481794 LCRIS_01782 LCRIS_01783     TRUE 0.878 11.000 0.116 NA   NA
 10481794 10481795 LCRIS_01783 LCRIS_01784     TRUE 0.856 18.000 0.093 NA   NA
 10481796 10481797 LCRIS_01785 LCRIS_01786     FALSE 0.005 315.000 0.000 NA   NA
 10481798 10481799 LCRIS_01787 LCRIS_01788     FALSE 0.241 65.000 0.000 NA   NA
 10481800 10481801 LCRIS_01789 LCRIS_01790 pepF   FALSE 0.216 74.000 0.000 NA   NA
 10481801 10481802 LCRIS_01790 LCRIS_01791     FALSE 0.045 149.000 0.000 NA   NA
 10481802 10481803 LCRIS_01791 LCRIS_01792     TRUE 0.679 4.000 0.000 NA   NA
 10481804 10481805 LCRIS_01793 LCRIS_01794     FALSE 0.208 78.000 0.000 NA   NA
 10481805 10481806 LCRIS_01794 LCRIS_01795     TRUE 0.616 16.000 0.000 NA   NA
 10481806 10481807 LCRIS_01795 LCRIS_01796     TRUE 0.833 -3.000 0.000 NA   NA
 10481808 10481809 LCRIS_01797 LCRIS_01798     FALSE 0.010 249.000 0.000 NA   NA
 10481809 10481810 LCRIS_01798 LCRIS_01799   luxS TRUE 0.576 59.000 0.010 1.000 N NA
 10481811 10481812 LCRIS_01800 LCRIS_01801 lctP2   FALSE 0.016 257.000 0.000 1.000 N NA
 10481812 10481813 LCRIS_01801 LCRIS_01802     TRUE 0.994 0.000 0.379 0.096 Y NA
 10481813 10481814 LCRIS_01802 LCRIS_01803     TRUE 0.867 27.000 0.029 1.000 Y NA
 10481814 10481815 LCRIS_01803 LCRIS_01804     FALSE 0.017 253.000 0.000 1.000 N NA
 10481815 10481816 LCRIS_01804 LCRIS_01805   fruA FALSE 0.035 185.000 0.000 1.000 N NA
 10481816 10481817 LCRIS_01805 LCRIS_01806 fruA fruK TRUE 0.974 21.000 0.816 1.000 Y NA
 10481817 10481818 LCRIS_01806 LCRIS_01807 fruK fruR TRUE 0.988 2.000 0.721 1.000 Y NA
 10481818 10481819 LCRIS_01807 LCRIS_01808 fruR   FALSE 0.007 308.000 0.000 NA N NA
 10481819 10481820 LCRIS_01808 LCRIS_01809     TRUE 0.852 -7.000 0.000 NA   NA
 10481820 10481821 LCRIS_01809 LCRIS_01810     FALSE 0.373 43.000 0.000 NA   NA
 10481821 10481822 LCRIS_01810 LCRIS_01811     FALSE 0.003 416.000 0.000 NA   NA
 10481822 10481823 LCRIS_01811 LCRIS_01812     TRUE 0.964 20.000 1.000 NA   NA
 10481823 10481824 LCRIS_01812 LCRIS_01813     TRUE 0.940 34.000 1.000 NA   NA
 10481824 10481825 LCRIS_01813 LCRIS_01814     FALSE 0.176 133.000 0.022 NA   NA
 10481825 10481826 LCRIS_01814 LCRIS_01815     TRUE 0.824 15.000 0.022 NA   NA
 10481826 10481827 LCRIS_01815 LCRIS_01816     TRUE 0.654 5.000 0.000 NA   NA
 10481827 10481828 LCRIS_01816 LCRIS_01817     FALSE 0.014 213.000 0.000 NA   NA
 10481828 10481829 LCRIS_01817 LCRIS_01818     FALSE 0.007 282.000 0.000 NA   NA
 10481829 10481830 LCRIS_01818 LCRIS_01819     FALSE 0.003 401.000 0.000 NA   NA
 10481830 10481831 LCRIS_01819 LCRIS_01820     FALSE 0.002 520.000 0.000 NA   NA
 10481831 10481832 LCRIS_01820 LCRIS_01821     TRUE 0.605 12.000 0.000 NA   NA
 10481832 10481833 LCRIS_01821 LCRIS_01822     FALSE 0.025 174.000 0.000 NA   NA
 10481833 10481834 LCRIS_01822 LCRIS_01823     FALSE 0.513 24.000 0.000 NA   NA
 10481834 10481835 LCRIS_01823 LCRIS_01824     TRUE 0.993 -7.000 0.667 1.000 Y NA
 10481835 10481836 LCRIS_01824 LCRIS_01825     FALSE 0.006 294.000 0.000 NA   NA
 10481836 10481837 LCRIS_01825 LCRIS_01826     FALSE 0.040 156.000 0.000 NA   NA
 10481837 10481838 LCRIS_01826 LCRIS_01827     FALSE 0.077 130.000 0.000 NA   NA
 10481838 10481839 LCRIS_01827 LCRIS_01828     FALSE 0.003 370.000 0.000 NA   NA
 10481839 10481840 LCRIS_01828 LCRIS_01829     FALSE 0.072 132.000 0.000 NA   NA
 10481840 10481841 LCRIS_01829 LCRIS_01830   malZ FALSE 0.032 165.000 0.000 NA   NA
 10481841 10481842 LCRIS_01830 LCRIS_01831 malZ glcD FALSE 0.082 147.000 0.000 1.000 N NA
 10481842 10481843 LCRIS_01831 LCRIS_01832 glcD   FALSE 0.015 208.000 0.000 NA   NA
 10481843 10481844 LCRIS_01832 LCRIS_01833     TRUE 0.620 15.000 0.000 NA   NA
 10481844 10481845 LCRIS_01833 LCRIS_01834     FALSE 0.212 76.000 0.000 NA   NA
 10481845 10481846 LCRIS_01834 LCRIS_01835     FALSE 0.408 149.000 0.667 NA   NA
 10481846 10481847 LCRIS_01835 LCRIS_01836   racD FALSE 0.055 142.000 0.000 NA   NA
 10481847 10481848 LCRIS_01836 LCRIS_01837 racD murE2 TRUE 0.931 10.000 0.085 1.000 Y NA
 10481848 10481849 LCRIS_01837 LCRIS_01838 murE2   TRUE 0.884 53.000 0.107 0.095 N NA
 10481849 10481850 LCRIS_01838 LCRIS_01839     TRUE 0.998 2.000 0.932 0.004 Y NA
 10481850 10481851 LCRIS_01839 LCRIS_01840     FALSE 0.010 272.000 0.000 1.000   NA
 10481851 10481852 LCRIS_01840 LCRIS_01841   crr2 TRUE 0.916 12.000 0.000 0.063   NA
 10481852 10481853 LCRIS_01841 LCRIS_01842 crr2 bglA7 TRUE 0.933 0.000 0.000 1.000 Y NA
 10481853 10481854 LCRIS_01842 LCRIS_01843 bglA7 ascF TRUE 0.849 16.000 0.000 1.000 Y NA
 10481854 10481855 LCRIS_01843 LCRIS_01844 ascF bglG4 TRUE 0.696 16.000 0.000 1.000   NA
 10481855 10481856 LCRIS_01844 LCRIS_01845 bglG4   FALSE 0.021 207.000 0.000 1.000   NA
 10481856 10481857 LCRIS_01845 LCRIS_01846     TRUE 0.983 10.000 0.084 0.010 Y NA
 10481857 10481858 LCRIS_01846 LCRIS_01847     FALSE 0.149 147.000 0.048 NA   NA
 10481858 10481859 LCRIS_01847 LCRIS_01848   ychF TRUE 0.825 9.000 0.022 NA   NA
 10481859 10481860 LCRIS_01848 LCRIS_01849 ychF   TRUE 0.619 54.000 0.064 NA   NA
 10481860 10481861 LCRIS_01849 LCRIS_01850   parB1 TRUE 0.950 -7.000 0.039 NA   NA
 10481861 10481862 LCRIS_01850 LCRIS_01851 parB1 parA TRUE 0.994 -22.000 0.827 1.000 N NA
 10481862 10481863 LCRIS_01851 LCRIS_01852 parA parB2 TRUE 0.873 19.000 0.069 1.000 N NA
 10481863 10481864 LCRIS_01852 LCRIS_01853 parB2 gidB TRUE 0.888 18.000 0.089 1.000 N NA
 10481866 10481867 LCRIS_01855 LCRIS_01856   apbE FALSE 0.098 122.000 0.000 NA   NA
 10481867 10481868 LCRIS_01856 LCRIS_01857 apbE   TRUE 0.956 3.000 0.231 1.000 N NA
 10481868 10481869 LCRIS_01857 LCRIS_01858     TRUE 0.660 92.000 0.400 NA   NA
 10481869 10481870 LCRIS_01858 LCRIS_01859     TRUE 0.956 14.000 0.625 NA   NA
 10481870 10481871 LCRIS_01859 LCRIS_01860     FALSE 0.042 153.000 0.000 NA   NA
 10481871 10481872 LCRIS_01860 LCRIS_01861     FALSE 0.074 131.000 0.000 NA   NA
 10481874 10481875 LCRIS_01863 LCRIS_01864     FALSE 0.007 284.000 0.000 NA   NA
 10481875 10481876 LCRIS_01864 LCRIS_01865     TRUE 0.703 31.000 0.000 NA Y NA
 10481876 10481877 LCRIS_01865 LCRIS_01866     FALSE 0.210 77.000 0.000 NA   NA
 10481877 10481878 LCRIS_01866 LCRIS_01867     TRUE 0.833 -3.000 0.000 NA   NA
 10481878 10481879 LCRIS_01867 LCRIS_01868     TRUE 0.812 2.000 0.000 1.000   NA
 10481879 10481880 LCRIS_01868 LCRIS_01869     TRUE 0.953 3.000 0.250 1.000   NA
 10481880 10481881 LCRIS_01869 LCRIS_01870   gpm4 FALSE 0.563 120.000 0.429 1.000   NA
 10481886 10481887 LCRIS_01875 LCRIS_01876     FALSE 0.172 92.000 0.000 NA   NA
 10481887 10481888 LCRIS_01876 LCRIS_01877     FALSE 0.023 178.000 0.000 NA   NA
 10481889 10481890 LCRIS_01878 LCRIS_01879     TRUE 0.975 3.000 0.714 NA   NA
 10481890 10481891 LCRIS_01879 LCRIS_01880     FALSE 0.057 141.000 0.000 NA   NA
 10481891 10481892 LCRIS_01880 LCRIS_01881     FALSE 0.098 122.000 0.000 NA   NA
 10481892 10481893 LCRIS_01881 LCRIS_01882   pepN FALSE 0.026 271.000 0.000 1.000 Y NA
 10481897 10481898 LCRIS_01886 LCRIS_01887     FALSE 0.020 184.000 0.000 NA   NA
 10481898 10481899 LCRIS_01887 LCRIS_01888     TRUE 0.982 -3.000 0.000 0.014   NA
 10481899 10481900 LCRIS_01888 LCRIS_01889     FALSE 0.153 117.000 0.000 1.000   NA
 10481900 10481901 LCRIS_01889 LCRIS_01890   malG FALSE 0.175 110.000 0.000 1.000   NA
 10481901 10481902 LCRIS_01890 LCRIS_01891 malG malF TRUE 0.996 3.000 0.793 0.022 Y NA
 10481902 10481903 LCRIS_01891 LCRIS_01892 malF malE2 TRUE 0.959 75.000 0.690 0.022 Y NA
 10481903 10481904 LCRIS_01892 LCRIS_01893 malE2 malK TRUE 0.841 115.000 0.185 0.022 Y NA
 10481904 10481905 LCRIS_01893 LCRIS_01894 malK pgmB TRUE 0.941 22.000 0.571 1.000   NA
 10481905 10481906 LCRIS_01894 LCRIS_01895 pgmB mapA TRUE 0.993 -7.000 1.000 1.000   NA
 10481906 10481907 LCRIS_01895 LCRIS_01896 mapA nplT FALSE 0.437 172.000 0.057 0.022 Y NA
 10481907 10481908 LCRIS_01896 LCRIS_01897 nplT malL TRUE 0.986 4.000 0.073 0.009 Y NA
 10481908 10481909 LCRIS_01897 LCRIS_01898 malL   FALSE 0.123 113.000 0.000 NA   NA
 10481909 10481910 LCRIS_01898 LCRIS_01899   ackA3 TRUE 0.766 1.000 0.000 NA   NA
 10481910 10481911 LCRIS_01899 LCRIS_01900 ackA3   FALSE 0.508 144.000 0.074 0.031 N NA
 10481911 10481912 LCRIS_01900 LCRIS_01901     TRUE 0.909 8.000 0.111 1.000 N NA
 10481912 10481913 LCRIS_01901 LCRIS_01902     FALSE 0.049 146.000 0.000 NA   NA
 10481913 10481914 LCRIS_01902 LCRIS_01903     TRUE 0.852 -7.000 0.000 NA   NA
 10481914 10481915 LCRIS_01903 LCRIS_01904     TRUE 0.876 -25.000 0.000 NA   NA
 10481915 10481916 LCRIS_01904 LCRIS_01905     FALSE 0.040 156.000 0.000 NA   NA
 10481916 10481917 LCRIS_01905 LCRIS_01906     FALSE 0.020 212.000 0.000 1.000   NA
 10481917 10481918 LCRIS_01906 LCRIS_01907   glpK FALSE 0.450 45.000 0.000 1.000   NA
 10481920 10481921 LCRIS_01909 LCRIS_01910     FALSE 0.433 33.000 0.000 NA   NA
 10481921 10481922 LCRIS_01910 LCRIS_01911     FALSE 0.161 98.000 0.000 NA   NA
 10481922 10481923 LCRIS_01911 LCRIS_01912     FALSE 0.154 102.000 0.000 NA   NA
 10481923 10481924 LCRIS_01912 LCRIS_01913     TRUE 0.900 36.000 0.615 NA   NA
 10481925 10481926 LCRIS_01914 LCRIS_01915     TRUE 0.638 6.000 0.000 NA   NA
 10481926 10481927 LCRIS_01915 LCRIS_01916     FALSE 0.225 70.000 0.000 NA   NA
 10481929 10481930 LCRIS_01918 LCRIS_01919     FALSE 0.100 121.000 0.000 NA   NA
 10481930 10481931 LCRIS_01919 LCRIS_01920     FALSE 0.002 614.000 0.000 NA   NA
 10481932 10481933 LCRIS_01921 LCRIS_01922     TRUE 0.945 78.000 0.667 0.062 Y NA
 10481933 10481934 LCRIS_01922 LCRIS_01923     TRUE 0.780 83.000 0.065 0.062   NA
 10481934 10481935 LCRIS_01923 LCRIS_01924     FALSE 0.538 66.000 0.065 NA   NA
 10481935 10481936 LCRIS_01924 LCRIS_01925     TRUE 0.620 15.000 0.000 NA   NA
 10481937 10481938 LCRIS_01926 LCRIS_01927     FALSE 0.022 180.000 0.000 NA   NA
 10481939 10481940 LCRIS_01928 LCRIS_01929     FALSE 0.142 105.000 0.000 NA   NA
 10481940 10481941 LCRIS_01929 LCRIS_01930     FALSE 0.110 118.000 0.000 NA   NA
 10481941 10481942 LCRIS_01930 LCRIS_01931   purB FALSE 0.014 212.000 0.000 NA   NA
 10481942 10481943 LCRIS_01931 LCRIS_01932 purB purA TRUE 0.939 4.000 0.038 1.000 Y NA
 10481944 10481945 LCRIS_01933 LCRIS_02089 guaC tRNA-Arg FALSE 0.016 199.000 0.000 NA   NA
 10481945 10481946 LCRIS_02089 LCRIS_02090 tRNA-Arg tRNA-Pro TRUE 0.621 9.000 0.000 NA   NA
 10481949 10481950 LCRIS_01936 LCRIS_01937     FALSE 0.003 400.000 0.000 NA   NA
 10481950 10481951 LCRIS_01937 LCRIS_01938     TRUE 0.654 5.000 0.000 NA   NA
 10481951 10481952 LCRIS_01938 LCRIS_01939     TRUE 0.752 2.000 0.000 NA   NA
 10481952 10481953 LCRIS_01939 LCRIS_01940     TRUE 0.766 1.000 0.000 NA   NA
 10481953 10481954 LCRIS_01940 LCRIS_01941     FALSE 0.440 32.000 0.000 NA   NA
 10481954 10481955 LCRIS_01941 LCRIS_01942     TRUE 0.852 -7.000 0.000 NA   NA
 10481955 10481956 LCRIS_01942 LCRIS_01943     TRUE 0.833 -3.000 0.000 NA   NA
 10481956 10481957 LCRIS_01943 LCRIS_01944     FALSE 0.302 55.000 0.000 NA   NA
 10481957 10481958 LCRIS_01944 LCRIS_01945     FALSE 0.002 752.000 0.000 NA   NA
 10481958 10481959 LCRIS_01945 LCRIS_01946     TRUE 0.957 13.000 0.583 1.000   NA
 10481959 10481960 LCRIS_01946 LCRIS_01947     FALSE 0.036 160.000 0.000 NA   NA
 10481960 10481961 LCRIS_01947 LCRIS_01948     TRUE 0.929 2.000 0.105 NA   NA
 10481961 10481962 LCRIS_01948 LCRIS_01949     FALSE 0.011 232.000 0.000 NA   NA
 10481962 10481963 LCRIS_01949 LCRIS_01950     FALSE 0.279 59.000 0.000 NA   NA
 10481963 10481964 LCRIS_01950 LCRIS_01951     FALSE 0.259 61.000 0.000 NA   NA
 10481964 10481965 LCRIS_01951 LCRIS_01952   cycA TRUE 0.940 73.000 0.300 0.009 Y NA
 10481965 10481966 LCRIS_01952 LCRIS_01953 cycA lepB2 FALSE 0.048 162.000 0.000 1.000   NA
 10481966 10481967 LCRIS_01953 LCRIS_01954 lepB2 clpE2 FALSE 0.381 114.000 0.070 1.000   NA
 10481967 10481968 LCRIS_01954 LCRIS_01955 clpE2   FALSE 0.005 331.000 0.000 NA   NA
 10481968 10481969 LCRIS_01955 LCRIS_01956   celB7 TRUE 0.991 -19.000 0.769 NA   NA
 10481970 10481971 LCRIS_01957 LCRIS_01958     TRUE 0.968 10.000 0.438 1.000 Y NA
 10481971 10481972 LCRIS_01958 LCRIS_01959     TRUE 0.666 47.000 0.061 NA   NA
 10481975 10481976 LCRIS_01962 LCRIS_01963     FALSE 0.005 316.000 0.000 NA   NA
 10481976 10481977 LCRIS_01963 LCRIS_01964   dltD TRUE 0.935 0.000 0.062 NA   NA
 10481977 10481978 LCRIS_01964 LCRIS_01965 dltD dltC TRUE 0.982 -7.000 0.409 NA   NA
 10481978 10481979 LCRIS_01965 LCRIS_01966 dltC dltB TRUE 0.856 38.000 0.387 NA   NA
 10481979 10481980 LCRIS_01966 LCRIS_01967 dltB dltA TRUE 0.978 0.000 0.435 NA N NA
 10481980 10481981 LCRIS_01967 LCRIS_01968 dltA   TRUE 0.951 16.000 0.549 NA   NA
 10481981 10481982 LCRIS_01968 LCRIS_01969     FALSE 0.145 149.000 0.055 NA   NA
 10481982 10481983 LCRIS_01969 LCRIS_01970     TRUE 0.923 26.000 0.571 NA   NA
 10481984 10481985 LCRIS_01971 LCRIS_01972     FALSE 0.541 129.000 0.026 0.036   NA
 10481985 10481986 LCRIS_01972 LCRIS_01973     FALSE 0.184 246.000 0.052 0.049 Y NA
 10481987 10481988 LCRIS_01974 LCRIS_01975     FALSE 0.004 347.000 0.000 NA   NA
 10481990 10481991 LCRIS_01977 LCRIS_01978     FALSE 0.011 236.000 0.000 NA   NA
 10481992 10481993 LCRIS_01979 LCRIS_01980     TRUE 0.836 15.000 0.031 NA   NA
 10481993 10481994 LCRIS_01980 LCRIS_01981   ppc FALSE 0.221 107.000 0.000 1.000 N NA
 10481996 10481997 LCRIS_01983 LCRIS_01984 bmpA1 bmpA2 FALSE 0.475 142.000 0.000 0.001   NA
 10481997 10481998 LCRIS_01984 LCRIS_01985 bmpA2   FALSE 0.458 82.000 0.018 1.000   NA
 10481998 10481999 LCRIS_01985 LCRIS_01986     TRUE 0.985 -7.000 0.438 1.000   NA
 10481999 10482000 LCRIS_01986 LCRIS_01987     TRUE 0.996 0.000 0.720 0.022   NA
 10482002 10482003 LCRIS_01989 LCRIS_01990 nagB dgk1 FALSE 0.011 295.000 0.000 1.000 N NA
 10482003 10482004 LCRIS_01990 LCRIS_01991 dgk1 dgk2 TRUE 0.995 18.000 0.833 0.001 Y NA
 10482004 10482005 LCRIS_01991 LCRIS_01992 dgk2   FALSE 0.117 116.000 0.000 NA   NA
 10482008 10482009 LCRIS_01995 LCRIS_01996     FALSE 0.022 180.000 0.000 NA   NA
 10482010 10482011 LCRIS_01997 LCRIS_01998 pbuG2   FALSE 0.031 167.000 0.000 NA   NA
 10482011 10482012 LCRIS_01998 LCRIS_01999     TRUE 0.981 -10.000 0.333 NA   NA
 10482012 10482013 LCRIS_01999 LCRIS_02000     FALSE 0.002 699.000 0.000 NA   NA
 10482013 10482014 LCRIS_02000 LCRIS_02001     FALSE 0.150 103.000 0.000 NA   NA
 10482014 10482015 LCRIS_02001 LCRIS_02002     TRUE 0.679 4.000 0.000 NA   NA
 10482015 10482016 LCRIS_02002 LCRIS_02003     FALSE 0.082 128.000 0.000 NA   NA
 10482018 10482019 LCRIS_02005 LCRIS_02006 pbuG3   FALSE 0.158 100.000 0.000 NA   NA
 10482019 10482020 LCRIS_02006 LCRIS_02007     FALSE 0.154 102.000 0.000 NA   NA
 10482020 10482021 LCRIS_02007 LCRIS_02008     TRUE 0.931 16.000 0.333 NA   NA
 10482021 10482022 LCRIS_02008 LCRIS_02009     TRUE 0.963 13.000 0.778 NA   NA
 10482022 10482023 LCRIS_02009 LCRIS_02010   copA TRUE 0.973 0.000 0.389 NA   NA
 10482025 10482026 LCRIS_02012 LCRIS_02013     FALSE 0.088 126.000 0.000 NA   NA
 10482027 10482028 LCRIS_02014 LCRIS_02015     TRUE 0.822 61.000 0.600 NA   NA
 10482028 10482029 LCRIS_02015 LCRIS_02016     FALSE 0.021 496.000 0.333 NA   NA
 10482029 10482030 LCRIS_02016 LCRIS_02017   gnd FALSE 0.561 101.000 0.152 1.000 N NA
 10482030 10482031 LCRIS_02017 LCRIS_02018 gnd   FALSE 0.026 173.000 0.000 NA   NA
 10482031 10482032 LCRIS_02018 LCRIS_02019   poxL FALSE 0.014 214.000 0.000 NA   NA
 10482032 10482033 LCRIS_02019 LCRIS_02020 poxL mnmG FALSE 0.006 369.000 0.000 1.000 N NA
 10482033 10482034 LCRIS_02020 LCRIS_02021 mnmG mnmE TRUE 0.961 2.000 0.266 1.000   NA
 10482034 10482035 LCRIS_02021 LCRIS_02022 mnmE spoIIIJ TRUE 0.620 111.000 0.009 0.048   NA
 10482035 10482036 LCRIS_02022 LCRIS_02023 spoIIIJ rnpA TRUE 0.937 2.000 0.052 1.000 N NA
 10482036 10482037 LCRIS_02023 LCRIS_02024 rnpA rpmH TRUE 0.901 52.000 0.787 1.000   NA