MicrobesOnline Operon Predictions for Pyrococcus horikoshii OT3

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 29972 29973 PH0001 PH0002     FALSE 0.617 12.000 0.038 1.000 N NA
 29973 29974 PH0002 PH0002a   SSS1 TRUE 0.969 -3.000 0.506 1.000 N NA
 29974 29975 PH0002a PH0003 SSS1   TRUE 0.688 52.000 0.272 1.000 N NA
 29975 29976 PH0003 PH0005     FALSE 0.108 68.000 0.044 NA   NA
 29976 1743998 PH0005 PH0005.1n     FALSE 0.011 30.000 0.000 NA   NA
 1743998 29977 PH0005.1n PH0006     FALSE 0.008 41.000 0.000 NA   NA
 29982 29983 PH0011 PH0012     FALSE 0.301 -3.000 0.002 1.000   NA
 29983 29984 PH0012 PH0013     FALSE 0.302 -3.000 0.003 1.000   NA
 29984 29985 PH0013 PH0014     FALSE 0.009 44.000 0.003 NA   NA
 29985 29986 PH0014 PH0015     FALSE 0.009 35.000 0.006 NA   NA
 29986 29987 PH0015 PH0016     FALSE 0.414 -3.000 0.009 1.000   NA
 29987 29988 PH0016 PH0017     FALSE 0.002 407.000 0.000 1.000   NA
 29990 29991 PH0020 PH0021     TRUE 0.707 11.000 0.051 1.000 N NA
 29991 29992 PH0021 PH0022     FALSE 0.020 215.000 0.000 1.000 N NA
 29992 29993 PH0022 PH0023     TRUE 0.984 -21.000 0.368 0.047 Y NA
 29993 29994 PH0023 PH0024     TRUE 0.996 -3.000 0.897 0.047 Y NA
 29994 29995 PH0024 PH0025     TRUE 0.968 37.000 0.674 0.047 Y NA
 29997 29998 PH0026b PH0026a EFB1   TRUE 0.989 1.000 0.511 1.000 Y NA
 29999 1743999 PH0027 PH0027.1n     FALSE 0.300 4.000 0.026 NA   NA
 30000 30001 PH0028 PH0031     TRUE 0.864 -12.000 0.222 1.000   NA
 30001 30002 PH0031 PH0032     FALSE 0.087 16.000 0.000 1.000   NA
 30002 30003 PH0032 PH0034     FALSE 0.212 33.000 0.000 1.000 N NA
 30004 30005 PH0035 PH0036     FALSE 0.000 1925.000 0.000 NA   NA
 30006 30007 PH0037 PH0039     FALSE 0.359 36.000 0.032 1.000 N NA
 30007 30008 PH0039 PH0041a     TRUE 0.739 -24.000 0.003 0.060 N NA
 30008 30009 PH0041a PH0042     FALSE 0.042 -10.000 0.008 NA   NA
 30009 30010 PH0042 PH0043     TRUE 0.825 -3.000 0.163 NA   NA
 30010 30011 PH0043 PH0044     FALSE 0.380 -33.000 0.023 1.000   NA
 30011 30012 PH0044 PH0045     TRUE 0.895 9.000 0.333 1.000   NA
 30012 30013 PH0045 PH0046     TRUE 0.983 4.000 0.167 0.023 Y NA
 30013 30014 PH0046 PH0047     FALSE 0.084 91.000 0.034 1.000   NA
 30016 30017 PH0051 PH0052     FALSE 0.292 37.000 0.018 1.000 N NA
 30017 30018 PH0052 PH0053     TRUE 0.986 6.000 0.720 NA Y NA
 30018 30019 PH0053 PH0054     FALSE 0.038 77.000 0.000 NA N NA
 30021 30022 PH0056 PH0057     TRUE 0.747 -22.000 0.000 0.042 N NA
 30023 30024 PH0058 PH0059     TRUE 0.729 22.000 0.177 1.000 N NA
 30024 1744000 PH0059 PH0059.1n     TRUE 0.733 -16.000 0.140 NA   NA
 1744000 30025 PH0059.1n PH0060     FALSE 0.535 -3.000 0.041 NA   NA
 30026 30027 PH0061 PHS001     FALSE 0.041 73.000 0.028 NA   NA
 30027 30028 PHS001 PH0062     FALSE 0.186 17.000 0.034 NA   NA
 30031 1744001 PH0065 PH0065.1n     TRUE 0.713 -6.000 0.084 NA   NA
 1744001 1744002 PH0065.1n PH0065.2n     FALSE 0.001 182.000 0.000 NA   NA
 30032 1744003 PH0066 PH0066.1n     FALSE 0.003 88.000 0.000 NA   NA
 1744003 1744004 PH0066.1n PH0067     FALSE 0.026 -30.000 0.000 NA   NA
 30038 30039 PH0072 PH0073     FALSE 0.003 90.000 0.007 NA   NA
 30039 30040 PH0073 PH0074     TRUE 0.796 -85.000 0.375 NA   NA
 30044 30045 PH0078 PH0080     FALSE 0.499 -3.000 0.038 NA   NA
 30046 1744005 PH0081 PH0081.1n     FALSE 0.045 5.000 0.000 NA   NA
 30047 30048 PH0082 PH0083     FALSE 0.194 62.000 0.010 1.000 N NA
 30048 30049 PH0083 PH0084     FALSE 0.039 7.000 0.010 NA   NA
 30051 30052 PH0087 PH0088     TRUE 0.971 -3.000 1.000 NA   NA
 30052 30053 PH0088 PH0089     TRUE 0.682 -67.000 0.222 NA   NA
 30053 30054 PH0089 PH0090     TRUE 0.790 -19.000 0.222 NA   NA
 30054 30055 PH0090 PH0092     FALSE 0.143 106.000 0.042 1.000 N NA
 30055 30056 PH0092 PH0093     FALSE 0.055 63.000 0.004 1.000   NA
 30056 30057 PH0093 PH0094     TRUE 0.774 -3.000 0.004 0.042   NA
 30057 30058 PH0094 PH0095     FALSE 0.066 66.000 0.008 1.000   NA
 30058 30059 PH0095 PH0096     FALSE 0.093 44.000 0.008 1.000   NA
 1744006 30060 PH0096.1n PH0097     FALSE 0.026 -30.000 0.000 NA   NA
 30060 1744007 PH0097 PH0097.1n     FALSE 0.002 101.000 0.000 NA   NA
 1744008 1744009 PH0097.2n PH0098     TRUE 0.832 -28.000 0.333 NA   NA
 1744009 30062 PH0098 PH0099     FALSE 0.000 357.000 0.000 NA   NA
 30062 30063 PH0099 PH0101     FALSE 0.428 130.000 0.096 1.000 Y NA
 30066 30067 PH0104 PH0107     TRUE 0.935 -3.000 0.348 1.000   NA
 30068 30069 PH0108 PH0109     FALSE 0.001 379.000 0.019 NA   NA
 30069 30070 PH0109 PH0112     FALSE 0.510 35.000 0.000 NA Y NA
 30070 30071 PH0112 PH0113     TRUE 0.872 7.000 0.003 1.000 Y NA
 30072 30073 PH0114 PH0115     FALSE 0.135 41.000 0.039 NA   NA
 30074 30075 PH0116 PH0117     FALSE 0.586 -43.000 0.107 NA   NA
 30076 30077 PH0119 PH0120     TRUE 0.787 -19.000 0.136 1.000   NA
 30077 30078 PH0120 PH0121     FALSE 0.243 51.000 0.038 1.000   NA
 30078 30079 PH0121 PH0123     TRUE 0.973 -9.000 0.056 0.005 Y NA
 30079 30080 PH0123 PH0124     TRUE 0.953 0.000 0.063 1.000 Y NA
 30080 30081 PH0124 PH0125     FALSE 0.007 773.000 0.000 1.000 N NA
 30082 30083 PH0126 PH0127     TRUE 0.948 10.000 0.925 NA   NA
 30085 30086 PH0129 PH0130     FALSE 0.233 85.000 0.200 NA   NA
 30087 30088 PH0131 PH0132     TRUE 0.996 -3.000 0.530 0.002 Y NA
 30089 30090 PH0134 PH0135     TRUE 0.836 12.000 0.400 NA   NA
 30090 30091 PH0135 PH0136     FALSE 0.253 25.000 0.000 1.000 N NA
 30091 30092 PH0136 PH0137     FALSE 0.001 275.000 0.000 NA   NA
 30092 30093 PH0137 PH0138     FALSE 0.584 10.000 0.077 NA   NA
 30094 30095 PH0140 PH0141     FALSE 0.007 61.000 0.000 NA   NA
 30096 30097 PH0142 PH0143     FALSE 0.007 61.000 0.000 NA   NA
 30098 403128 PH0144 PHtRNA02   tRNA-Gly FALSE 0.009 40.000 0.000 NA   NA
 403128 403127 PHtRNA02 PHtRNA03 tRNA-Gly tRNA-Phe FALSE 0.036 8.000 0.000 NA   NA
 1744010 30099 PH0144.3n PH0146     TRUE 0.930 -45.000 1.000 NA   NA
 30099 30100 PH0146 PH0147     FALSE 0.001 232.000 0.000 NA   NA
 30101 1744011 PH0149 PH0149.1n     TRUE 0.761 -28.000 0.233 NA   NA
 30103 30104 PH0152 PH0153     FALSE 0.608 -3.000 0.051 NA   NA
 30105 30106 PH0154 PH0155     FALSE 0.244 -3.000 0.000 1.000   NA
 30106 30107 PH0155 PH0156     FALSE 0.056 0.000 0.000 NA   NA
 30107 30108 PH0156 PH0157     TRUE 0.812 2.000 0.143 NA   NA
 30109 30110 PH0159 PH0160     FALSE 0.091 15.000 0.000 1.000   NA
 30111 30112 PH0161 PH0162     FALSE 0.001 210.000 0.000 NA   NA
 30112 30113 PH0162 PH0164     TRUE 0.899 3.000 0.327 NA   NA
 30113 30114 PH0164 PH0165     TRUE 0.971 -3.000 0.256 NA Y NA
 30114 1744012 PH0165 PH0166     TRUE 0.981 -10.000 0.547 NA Y NA
 1744012 30116 PH0166 PH0167     TRUE 0.963 -58.000 0.597 NA Y NA
 30116 30117 PH0167 PH0168     TRUE 0.942 -3.000 0.078 NA Y NA
 30117 30118 PH0168 PH0169     FALSE 0.043 -9.000 0.000 NA   NA
 30118 30119 PH0169 PH0170     FALSE 0.028 -28.000 0.000 NA   NA
 30119 30120 PH0170 PH0171     TRUE 0.906 -7.000 0.038 NA Y NA
 11536732 30122   PH0173     FALSE NA 1748.000 0.000 NA   NA
 11679095 30122   PH0173     FALSE NA 1748.000 0.000 NA   NA
 11821487 30122   PH0173     FALSE NA 1748.000 0.000 NA   NA
 11536733 30122   PH0173     FALSE NA 1710.000 0.000 NA   NA
 11679096 30122   PH0173     FALSE NA 1710.000 0.000 NA   NA
 11821488 30122   PH0173     FALSE NA 1710.000 0.000 NA   NA
 11536734 30122   PH0173     FALSE NA 1681.000 0.000 NA   NA
 11679097 30122   PH0173     FALSE NA 1681.000 0.000 NA   NA
 11821489 30122   PH0173     FALSE NA 1681.000 0.000 NA   NA
 11536735 30122   PH0173     FALSE NA 1643.000 0.000 NA   NA
 11679098 30122   PH0173     FALSE NA 1643.000 0.000 NA   NA
 11821490 30122   PH0173     FALSE NA 1643.000 0.000 NA   NA
 11536736 30122   PH0173     FALSE NA 1614.000 0.000 NA   NA
 11679099 30122   PH0173     FALSE NA 1614.000 0.000 NA   NA
 11821491 30122   PH0173     FALSE NA 1614.000 0.000 NA   NA
 11536737 30122   PH0173     FALSE NA 1571.000 0.000 NA   NA
 11679100 30122   PH0173     FALSE NA 1571.000 0.000 NA   NA
 11821492 30122   PH0173     FALSE NA 1571.000 0.000 NA   NA
 11536738 30122   PH0173     FALSE NA 1542.000 0.000 NA   NA
 11679101 30122   PH0173     FALSE NA 1542.000 0.000 NA   NA
 11821493 30122   PH0173     FALSE NA 1542.000 0.000 NA   NA
 11536739 30122   PH0173     FALSE NA 1495.000 0.000 NA   NA
 11679102 30122   PH0173     FALSE NA 1495.000 0.000 NA   NA
 11821494 30122   PH0173     FALSE NA 1495.000 0.000 NA   NA
 11536740 30122   PH0173     FALSE NA 1466.000 0.000 NA   NA
 11679103 30122   PH0173     FALSE NA 1466.000 0.000 NA   NA
 11821495 30122   PH0173     FALSE NA 1466.000 0.000 NA   NA
 11536741 30122   PH0173     FALSE NA 1427.000 0.000 NA   NA
 11679104 30122   PH0173     FALSE NA 1427.000 0.000 NA   NA
 11821496 30122   PH0173     FALSE NA 1427.000 0.000 NA   NA
 11536742 30122   PH0173     FALSE NA 1398.000 0.000 NA   NA
 11679105 30122   PH0173     FALSE NA 1398.000 0.000 NA   NA
 11821497 30122   PH0173     FALSE NA 1398.000 0.000 NA   NA
 11536743 30122   PH0173     FALSE NA 1360.000 0.000 NA   NA
 11679106 30122   PH0173     FALSE NA 1360.000 0.000 NA   NA
 11821498 30122   PH0173     FALSE NA 1360.000 0.000 NA   NA
 11536744 30122   PH0173     FALSE NA 1331.000 0.000 NA   NA
 11679107 30122   PH0173     FALSE NA 1331.000 0.000 NA   NA
 11821499 30122   PH0173     FALSE NA 1331.000 0.000 NA   NA
 11536745 30122   PH0173     FALSE NA 1295.000 0.000 NA   NA
 11679108 30122   PH0173     FALSE NA 1295.000 0.000 NA   NA
 11821500 30122   PH0173     FALSE NA 1295.000 0.000 NA   NA
 11536746 30122   PH0173     FALSE NA 1266.000 0.000 NA   NA
 11679109 30122   PH0173     FALSE NA 1266.000 0.000 NA   NA
 11821501 30122   PH0173     FALSE NA 1266.000 0.000 NA   NA
 11536747 30122   PH0173     FALSE NA 1228.000 0.000 NA   NA
 11679110 30122   PH0173     FALSE NA 1228.000 0.000 NA   NA
 11821502 30122   PH0173     FALSE NA 1228.000 0.000 NA   NA
 11536748 30122   PH0173     FALSE NA 1199.000 0.000 NA   NA
 11679111 30122   PH0173     FALSE NA 1199.000 0.000 NA   NA
 11821503 30122   PH0173     FALSE NA 1199.000 0.000 NA   NA
 11536749 30122   PH0173     FALSE NA 1157.000 0.000 NA   NA
 11679112 30122   PH0173     FALSE NA 1157.000 0.000 NA   NA
 11821504 30122   PH0173     FALSE NA 1157.000 0.000 NA   NA
 11536750 30122   PH0173     FALSE NA 1128.000 0.000 NA   NA
 11679113 30122   PH0173     FALSE NA 1128.000 0.000 NA   NA
 11821505 30122   PH0173     FALSE NA 1128.000 0.000 NA   NA
 11536751 30122   PH0173     FALSE NA 1088.000 0.000 NA   NA
 11679114 30122   PH0173     FALSE NA 1088.000 0.000 NA   NA
 11821506 30122   PH0173     FALSE NA 1088.000 0.000 NA   NA
 11536752 30122   PH0173     FALSE NA 1059.000 0.000 NA   NA
 11679115 30122   PH0173     FALSE NA 1059.000 0.000 NA   NA
 11821507 30122   PH0173     FALSE NA 1059.000 0.000 NA   NA
 11536753 30122   PH0173     FALSE NA 1017.000 0.000 NA   NA
 11679116 30122   PH0173     FALSE NA 1017.000 0.000 NA   NA
 11821508 30122   PH0173     FALSE NA 1017.000 0.000 NA   NA
 11536754 30122   PH0173     FALSE NA 988.000 0.000 NA   NA
 11679117 30122   PH0173     FALSE NA 988.000 0.000 NA   NA
 11821509 30122   PH0173     FALSE NA 988.000 0.000 NA   NA
 11536755 30122   PH0173     FALSE NA 939.000 0.000 NA   NA
 11679118 30122   PH0173     FALSE NA 939.000 0.000 NA   NA
 11821510 30122   PH0173     FALSE NA 939.000 0.000 NA   NA
 11536756 30122   PH0173     FALSE NA 910.000 0.000 NA   NA
 11679119 30122   PH0173     FALSE NA 910.000 0.000 NA   NA
 11821511 30122   PH0173     FALSE NA 910.000 0.000 NA   NA
 11536757 30122   PH0173     FALSE NA 872.000 0.000 NA   NA
 11679120 30122   PH0173     FALSE NA 872.000 0.000 NA   NA
 11821512 30122   PH0173     FALSE NA 872.000 0.000 NA   NA
 11536758 30122   PH0173     FALSE NA 843.000 0.000 NA   NA
 11679121 30122   PH0173     FALSE NA 843.000 0.000 NA   NA
 11821513 30122   PH0173     FALSE NA 843.000 0.000 NA   NA
 11536759 30122   PH0173     FALSE NA 792.000 0.000 NA   NA
 11679122 30122   PH0173     FALSE NA 792.000 0.000 NA   NA
 11821514 30122   PH0173     FALSE NA 792.000 0.000 NA   NA
 11536760 30122   PH0173     FALSE NA 769.000 0.000 NA   NA
 11679123 30122   PH0173     FALSE NA 769.000 0.000 NA   NA
 11821515 30122   PH0173     FALSE NA 769.000 0.000 NA   NA
 11536761 30122   PH0173     FALSE NA 726.000 0.000 NA   NA
 11679124 30122   PH0173     FALSE NA 726.000 0.000 NA   NA
 11821516 30122   PH0173     FALSE NA 726.000 0.000 NA   NA
 11536762 30122   PH0173     FALSE NA 697.000 0.000 NA   NA
 11679125 30122   PH0173     FALSE NA 697.000 0.000 NA   NA
 11821517 30122   PH0173     FALSE NA 697.000 0.000 NA   NA
 11536763 30122   PH0173     FALSE NA 658.000 0.000 NA   NA
 11679126 30122   PH0173     FALSE NA 658.000 0.000 NA   NA
 11821518 30122   PH0173     FALSE NA 658.000 0.000 NA   NA
 11536764 30122   PH0173     FALSE NA 629.000 0.000 NA   NA
 11679127 30122   PH0173     FALSE NA 629.000 0.000 NA   NA
 11821519 30122   PH0173     FALSE NA 629.000 0.000 NA   NA
 11536765 30122   PH0173     FALSE NA 592.000 0.000 NA   NA
 11679128 30122   PH0173     FALSE NA 592.000 0.000 NA   NA
 11821520 30122   PH0173     FALSE NA 592.000 0.000 NA   NA
 11536766 30122   PH0173     FALSE NA 563.000 0.000 NA   NA
 11679129 30122   PH0173     FALSE NA 563.000 0.000 NA   NA
 11821521 30122   PH0173     FALSE NA 563.000 0.000 NA   NA
 11536767 30122   PH0173     FALSE NA 521.000 0.000 NA   NA
 11679130 30122   PH0173     FALSE NA 521.000 0.000 NA   NA
 11821522 30122   PH0173     FALSE NA 521.000 0.000 NA   NA
 11536768 30122   PH0173     FALSE NA 492.000 0.000 NA   NA
 11679131 30122   PH0173     FALSE NA 492.000 0.000 NA   NA
 11821523 30122   PH0173     FALSE NA 492.000 0.000 NA   NA
 11536769 30122   PH0173     FALSE NA 453.000 0.000 NA   NA
 11679132 30122   PH0173     FALSE NA 453.000 0.000 NA   NA
 11821524 30122   PH0173     FALSE NA 453.000 0.000 NA   NA
 11536770 30122   PH0173     FALSE NA 424.000 0.000 NA   NA
 11679133 30122   PH0173     FALSE NA 424.000 0.000 NA   NA
 11821525 30122   PH0173     FALSE NA 424.000 0.000 NA   NA
 11536771 30122   PH0173     FALSE NA 385.000 0.000 NA   NA
 11679134 30122   PH0173     FALSE NA 385.000 0.000 NA   NA
 11821526 30122   PH0173     FALSE NA 385.000 0.000 NA   NA
 11536772 30122   PH0173     FALSE NA 356.000 0.000 NA   NA
 11679135 30122   PH0173     FALSE NA 356.000 0.000 NA   NA
 11821527 30122   PH0173     FALSE NA 356.000 0.000 NA   NA
 11536773 30122   PH0173     FALSE NA 319.000 0.000 NA   NA
 11679136 30122   PH0173     FALSE NA 319.000 0.000 NA   NA
 11821528 30122   PH0173     FALSE NA 319.000 0.000 NA   NA
 11536774 30122   PH0173     FALSE NA 290.000 0.000 NA   NA
 11679137 30122   PH0173     FALSE NA 290.000 0.000 NA   NA
 11821529 30122   PH0173     FALSE NA 290.000 0.000 NA   NA
 11536775 30122   PH0173     FALSE NA 252.000 0.000 NA   NA
 11679138 30122   PH0173     FALSE NA 252.000 0.000 NA   NA
 11821530 30122   PH0173     FALSE NA 252.000 0.000 NA   NA
 11536776 30122   PH0173     FALSE NA 223.000 0.000 NA   NA
 11679139 30122   PH0173     FALSE NA 223.000 0.000 NA   NA
 11821531 30122   PH0173     FALSE NA 223.000 0.000 NA   NA
 11536777 30122   PH0173     FALSE NA 185.000 0.000 NA   NA
 11679140 30122   PH0173     FALSE NA 185.000 0.000 NA   NA
 11821532 30122   PH0173     FALSE NA 185.000 0.000 NA   NA
 11536778 30122   PH0173     FALSE NA 156.000 0.000 NA   NA
 11679141 30122   PH0173     FALSE NA 156.000 0.000 NA   NA
 11821533 30122   PH0173     FALSE NA 156.000 0.000 NA   NA
 11536779 30122   PH0173     FALSE NA 117.000 0.000 NA   NA
 11679142 30122   PH0173     FALSE NA 117.000 0.000 NA   NA
 11821534 30122   PH0173     FALSE NA 117.000 0.000 NA   NA
 11536780 30122   PH0173     FALSE NA 88.000 0.000 NA   NA
 11679143 30122   PH0173     FALSE NA 88.000 0.000 NA   NA
 11821535 30122   PH0173     FALSE NA 88.000 0.000 NA   NA
 11536781 30122   PH0173     FALSE NA 50.000 0.000 NA   NA
 11679144 30122   PH0173     FALSE NA 50.000 0.000 NA   NA
 11821536 30122   PH0173     FALSE NA 50.000 0.000 NA   NA
 11536782 30122   PH0173     FALSE NA 21.000 0.000 NA   NA
 11679145 30122   PH0173     FALSE NA 21.000 0.000 NA   NA
 11821537 30122   PH0173     FALSE NA 21.000 0.000 NA   NA
 30122 1744013 PH0173 PH0173.1n     TRUE 0.948 -9.000 0.086 1.000 Y NA
 1744013 30123 PH0173.1n PH0175     TRUE 0.865 -3.000 0.000 NA Y NA
 30123 30124 PH0175 PH0176     FALSE 0.592 4.000 0.053 NA   NA
 30124 30125 PH0176 PH0177     FALSE 0.054 2.000 0.000 NA   NA
 30127 1744014 PH0180 PH0180.1n     FALSE 0.356 -31.000 0.019 1.000   NA
 1744014 30128 PH0180.1n PH0181     TRUE 0.850 -3.000 0.034 0.050   NA
 30129 30130 PH0182 PH0183     FALSE 0.244 -3.000 0.000 1.000   NA
 30131 30132 PH0184 PH0185     FALSE 0.003 92.000 0.008 NA   NA
 30132 30133 PH0185 PH0186     FALSE 0.375 83.000 0.333 NA   NA
 30133 30134 PH0186 PH0187     TRUE 0.938 13.000 0.333 NA Y NA
 30134 30135 PH0187 PH0188     FALSE 0.532 68.000 0.375 NA   NA
 30135 30136 PH0188 PH0189     TRUE 0.732 -25.000 0.195 NA   NA
 30136 30137 PH0189 PH0190     FALSE 0.277 34.000 0.073 NA   NA
 30137 30138 PH0190 PH0191     TRUE 0.667 -13.000 0.051 1.000   NA
 30140 30141 PH0193 PH0194     FALSE 0.447 70.000 0.000 1.000 Y NA
 30142 1744015 PH0195 PH0196     TRUE 0.962 -52.000 0.085 0.001 Y NA
 30144 30145 PH0197 PH0199     FALSE 0.197 72.000 0.056 1.000   NA
 30146 30147 PH0200 PH0201     FALSE 0.239 59.000 0.045 1.000   NA
 30147 30148 PH0201 PH0203     FALSE 0.279 71.000 0.045 1.000 N NA
 30148 30149 PH0203 PH0204     TRUE 0.987 14.000 0.789 0.037 Y NA
 30149 30150 PH0204 PH0205     TRUE 0.996 0.000 0.775 0.037 Y NA
 30150 30151 PH0205 PH0206     TRUE 0.993 5.000 0.625 0.037 Y NA
 30151 30152 PH0206 PH0207     FALSE 0.125 133.000 0.051 1.000 N NA
 30152 30153 PH0207 PH0208     FALSE 0.022 207.000 0.000 1.000 N NA
 30153 30154 PH0208 PH0209     FALSE 0.040 -12.000 0.000 NA   NA
 30154 30155 PH0209 PH0209a     FALSE 0.054 -3.000 0.000 NA   NA
 30158 30159 PH0212 PH0213     TRUE 0.890 -3.000 0.286 NA   NA
 30161 1744016 PH0216 PHrRNA01     FALSE 0.000 336.000 0.000 NA   NA
 1744016 403083 PHrRNA01 PHtRNA04   tRNA-Ala FALSE 0.007 61.000 0.000 NA   NA
 403083 1744017 PHtRNA04 PHrRNA02 tRNA-Ala   FALSE 0.001 150.000 0.000 NA   NA
 30164 30165 PHS003 PHS004     FALSE 0.015 21.000 0.000 NA   NA
 30165 30166 PHS004 PH0222     FALSE 0.000 443.000 0.000 NA   NA
 30166 30167 PH0222 PH0223     TRUE 0.688 -3.000 0.071 NA   NA
 30168 30169 PH0224 PH0225     FALSE 0.049 4.000 0.013 NA   NA
 30171 30172 PH0227 PH0228     TRUE 0.909 -7.000 0.375 NA   NA
 30172 30173 PH0228 PH0229     TRUE 0.900 7.000 0.046 NA Y NA
 30175 30176 PH0231 PH0232     FALSE 0.388 54.000 0.081 NA N NA
 30176 30177 PH0232 PH0233     TRUE 0.875 0.000 0.081 1.000 N NA
 30177 30178 PH0233 PH0234     TRUE 0.817 -10.000 0.125 1.000   NA
 30179 30180 PH0235 PH0236     TRUE 0.987 -13.000 1.000 0.003   NA
 30181 30182 PH0237 PH0238     TRUE 0.912 -64.000 0.875 NA   NA
 30185 30186 PH0241 PH0242     FALSE 0.003 285.000 0.000 1.000   NA
 30186 30187 PH0242 PH0243     FALSE 0.192 15.000 0.011 1.000   NA
 30187 30188 PH0243 PH0244     FALSE 0.046 70.000 0.005 1.000   NA
 30188 30189 PH0244 PH0245     TRUE 0.892 15.000 0.625 1.000   NA
 30190 30191 PH0246 PH0249     TRUE 0.888 -3.000 0.280 NA   NA
 30191 30192 PH0249 PH0250     FALSE 0.449 51.000 0.200 NA   NA
 30195 30196 PH0253 PH0255     FALSE 0.028 -28.000 0.010 NA   NA
 30196 30197 PH0255 PH0256     FALSE 0.054 -3.000 0.014 NA   NA
 30198 30199 PH0258 PH0259     FALSE 0.014 22.000 0.012 NA   NA
 30201 30202 PH0261 PH0262     TRUE 0.747 -37.000 0.250 NA   NA
 30202 30203 PH0262 PH0263     FALSE 0.001 254.000 0.000 NA   NA
 30203 30204 PH0263 PH0265     FALSE 0.149 63.000 0.000 1.000 N NA
 30204 30205 PH0265 PH0266     FALSE 0.149 29.000 0.014 1.000   NA
 30207 30208 PH0268 PH0270     FALSE 0.098 144.000 0.044 1.000 N NA
 30208 30209 PH0270 PH0271     FALSE 0.281 44.000 0.046 1.000   NA
 30209 1744021 PH0271 PH0271.1n     TRUE 0.761 4.000 0.108 NA   NA
 30210 30211 PH0272 PH0274     TRUE 0.949 -3.000 0.057 1.000 Y NA
 30211 30212 PH0274 PH0275     FALSE 0.535 51.000 0.094 1.000 N NA
 30215 30216 PH0278 PH0279     FALSE 0.001 140.000 0.000 NA   NA
 30216 30217 PH0279 PH0280     FALSE 0.607 2.000 0.028 1.000   NA
 30217 1744022 PH0280 PH0281     FALSE 0.008 194.000 0.000 NA N NA
 30219 30220 PH0282 PH0283     FALSE 0.313 5.000 0.000 NA N NA
 30220 30221 PH0283 PH0284     FALSE 0.619 0.000 0.000 1.000 N NA
 30223 30224 PH0286 PH0287     FALSE 0.244 -3.000 0.000 1.000   NA
 30227 30228 PH0292 PH0293     FALSE 0.001 175.000 0.000 NA   NA
 30228 30229 PH0293 PH0294     FALSE 0.001 154.000 0.000 NA   NA
 30230 30231 PH0295 PH0296     TRUE 0.875 -3.000 0.167 1.000   NA
 30232 30233 PHS005 PH0297     FALSE 0.009 37.000 0.000 NA   NA
 30234 30235 PH0298 PH0300     FALSE 0.004 78.000 0.000 NA   NA
 30238 30239 PH0305 PH0305a     FALSE 0.118 32.000 0.011 1.000   NA
 30241 30242 PH0307 PH0309     FALSE 0.073 96.000 0.003 1.000 N NA
 30245 30246 PH0312 PH0314     FALSE 0.046 134.000 0.002 1.000 N NA
 30248 1744023 PHS006 PH0316.1n     FALSE 0.017 -142.000 0.000 NA   NA
 1744023 30249 PH0316.1n PH0317     FALSE 0.009 49.000 0.000 NA   NA
 30249 1744024 PH0317 PH0317.1n     FALSE 0.000 1381.000 0.000 NA   NA
 1744024 1744025 PH0317.1n PH0317.2n     FALSE 0.054 -3.000 0.000 NA   NA
 1744025 1744026 PH0317.2n PH0317.3n     FALSE 0.007 56.000 0.000 NA   NA
 1744026 30250 PH0317.3n PH0318     FALSE 0.000 610.000 0.000 NA   NA
 30251 1744027 PH0320 PH0321     FALSE 0.003 89.000 0.002 NA   NA
 1744027 30253 PH0321 PH0322     TRUE 0.942 -3.000 0.500 NA   NA
 30254 30255 PH0323 PH0324     FALSE 0.375 2.000 0.007 1.000   NA
 30255 30256 PH0324 PH0325     FALSE 0.253 67.000 0.062 1.000   NA
 30256 30257 PH0325 PH0326     FALSE 0.380 -3.000 0.030 NA   NA
 30257 30258 PH0326 PH0328     FALSE 0.515 -22.000 0.060 NA   NA
 30258 30259 PH0328 PH0329     TRUE 0.948 -3.000 0.556 NA   NA
 30259 30260 PH0329 PH0331     TRUE 0.947 4.000 0.611 NA   NA
 30260 30261 PH0331 PH0332     TRUE 0.826 0.000 0.154 NA   NA
 30261 30262 PH0332 PH0333     FALSE 0.018 15.000 0.005 NA   NA
 30264 30265 PH0335 PH0336     TRUE 0.961 -6.000 0.818 NA   NA
 30265 30266 PH0336 PH0337     FALSE 0.256 37.000 0.071 NA   NA
 30266 30267 PH0337 PH0338     TRUE 0.670 33.000 0.375 NA   NA
 30267 30268 PH0338 PH0340     TRUE 0.902 13.000 0.103 1.000 Y NA
 30268 30269 PH0340 PH0343     TRUE 0.646 -3.000 0.004 1.000 N NA
 30271 30272 PH0345 PH0346     FALSE 0.010 31.000 0.000 NA   NA
 30272 30273 PH0346 PH0347     TRUE 0.642 -3.000 0.057 NA   NA
 30273 30274 PH0347 PH0348     FALSE 0.055 57.000 0.003 1.000   NA
 30275 30276 PH0350 PH0351     FALSE 0.159 71.000 0.035 NA N NA
 30276 30277 PH0351 PH0353     FALSE 0.200 83.000 0.081 1.000   NA
 30277 30278 PH0353 PH0354     TRUE 0.783 0.000 0.106 NA   NA
 30278 30279 PH0354 PH0355     FALSE 0.389 2.000 0.030 NA   NA
 30279 30280 PH0355 PH0356     FALSE 0.495 13.000 0.083 NA   NA
 30281 30282 PH0357 PH0358     FALSE 0.625 2.000 0.054 NA   NA
 30282 1744028 PH0358 PH0358.1n     TRUE 0.779 -6.000 0.125 NA   NA
 1744028 30283 PH0358.1n PH0359     FALSE 0.134 152.000 0.250 NA   NA
 30284 30285 PH0360 PH0361     FALSE 0.012 26.000 0.000 NA   NA
 30285 30286 PH0361 PH0363     FALSE 0.001 249.000 0.000 NA   NA
 30286 30287 PH0363 PH0365     FALSE 0.025 186.000 0.000 1.000 N NA
 30289 30290 PH0367 PH0368     TRUE 0.920 -52.000 0.714 1.000   NA
 30290 30291 PH0368 PH0369     FALSE 0.475 -3.000 0.014 1.000   NA
 30292 30293 PH0370 PH0371     TRUE 0.925 -10.000 0.500 NA   NA
 30294 30295 PH0372 PH0373     TRUE 0.847 -12.000 0.010 NA Y NA
 30295 1744029 PH0373 PH0373.1n     FALSE 0.069 49.000 0.003 1.000   NA
 1744029 30296 PH0373.1n PH0374     TRUE 0.774 2.000 0.062 1.000   NA
 30296 30297 PH0374 PH0375     FALSE 0.557 -18.000 0.062 NA   NA
 30298 30299 PH0376 PH0377     TRUE 0.753 -36.000 0.084 1.000 N NA
 1744030 30300 PH0377.1n PHS007     FALSE 0.046 -7.000 0.000 NA   NA
 30301 30302 PH0378 PH0379     FALSE 0.002 134.000 0.000 NA   NA
 30302 30303 PH0379 PH0380     FALSE 0.018 15.000 0.000 NA   NA
 30304 1744031 PH0381 PH0381.1n     TRUE 0.893 5.000 0.333 NA   NA
 1744031 1744032 PH0381.1n PH0381.2n     FALSE 0.043 -9.000 0.000 NA   NA
 1744032 1744033 PH0381.2n PH0382     FALSE 0.011 30.000 0.000 NA   NA
 30306 30307 PH0383 PH0384     TRUE 0.956 -3.000 0.667 NA   NA
 30307 30308 PH0384 PH0385     TRUE 0.966 -7.000 1.000 NA   NA
 30308 30309 PH0385 PH0387     TRUE 0.956 -3.000 0.667 NA   NA
 30309 30310 PH0387 PH0388     TRUE 0.956 -3.000 0.667 NA   NA
 30311 1744034 PH0389 PH0389.1n     TRUE 0.931 -13.000 0.600 NA   NA
 30313 30314 PH0391 PH0392     FALSE 0.031 -22.000 0.000 NA   NA
 30316 30317 PH0394 PH0395     FALSE 0.039 7.000 0.000 NA   NA
 30317 30318 PH0395 PH0396     FALSE 0.054 -3.000 0.000 NA   NA
 30319 30320 PH0397 PH0398     FALSE 0.006 66.000 0.000 NA   NA
 30320 30321 PH0398 PH0399     FALSE 0.014 22.000 0.000 NA   NA
 30321 30322 PH0399 PH0401     FALSE 0.434 -3.000 0.033 NA   NA
 30322 30323 PH0401 PH0402     FALSE 0.035 9.000 0.000 NA   NA
 30323 30324 PH0402 PH0403     FALSE 0.034 -19.000 0.000 NA   NA
 30324 1744035 PH0403 PH0403.1n     FALSE 0.033 -21.000 0.000 NA   NA
 30325 30326 PH0404 PH0405     FALSE 0.030 -24.000 0.000 NA   NA
 30326 30327 PH0405 PH0406     FALSE 0.027 11.000 0.000 NA   NA
 30328 30329 PH0407 PH0408     FALSE 0.029 -25.000 0.000 NA   NA
 30329 30330 PH0408 PH0409     FALSE 0.539 20.000 0.143 NA   NA
 30330 30331 PH0409 PHS008     FALSE 0.002 112.000 0.000 NA   NA
 30331 1744036 PHS008 PHS008.3n     FALSE 0.000 683.000 0.000 NA   NA
 1744036 30332 PHS008.3n PHS009     FALSE 0.000 294.000 0.000 NA   NA
 30332 30333 PHS009 PHS010     FALSE 0.001 244.000 0.000 NA   NA
 1744038 1744039 PHS010.3n PHS010.5n     FALSE 0.000 341.000 0.000 NA   NA
 1744039 30334 PHS010.5n PHS011     TRUE 0.909 -3.000 0.333 NA   NA
 30335 1744040 PHS012 PHS011.1n     FALSE 0.001 290.000 0.000 NA   NA
 1744040 30336 PHS011.1n PHS013     FALSE 0.010 33.000 0.000 NA   NA
 30336 30337 PHS013 PHS014     FALSE 0.032 10.000 0.000 NA   NA
 30338 1744041 PHS015 PHS014.3n     FALSE 0.004 81.000 0.000 NA   NA
 30344 30345 PH0412 PH0413     FALSE 0.009 48.000 0.000 NA   NA
 30345 30346 PH0413 PH0414     TRUE 0.974 2.000 0.217 1.000 Y NA
 30348 30349 PH0416 PH0417     TRUE 0.969 1.000 0.154 1.000 Y NA
 30349 30350 PH0417 PH0419     FALSE 0.001 154.000 0.000 NA   NA
 30350 1744044 PH0419 PH0419.1n     FALSE 0.004 76.000 0.000 NA   NA
 30352 30353 PH0421 PH0422     FALSE 0.244 -3.000 0.000 1.000   NA
 30353 30354 PH0422 PH0423     TRUE 0.744 -18.000 0.000 0.007   NA
 30354 30355 PH0423 PH0424     FALSE 0.036 8.000 0.000 NA   NA
 30355 30356 PH0424 PH0425     FALSE 0.054 -3.000 0.000 NA   NA
 30356 30357 PH0425 PH0426     FALSE 0.550 6.000 0.000 1.000 N NA
 30359 30360 PH0429 PH0430     FALSE 0.052 3.000 0.000 NA   NA
 1744045 30361 PH0430.1n PH0432     FALSE 0.027 11.000 0.000 NA   NA
 30361 30362 PH0432 PH0433     TRUE 0.645 27.000 0.000 1.000 Y NA
 30363 30364 PH0434 PH0435     TRUE 0.647 -3.000 0.028 NA N NA
 30364 30365 PH0435 PH0436     FALSE 0.023 12.000 0.000 NA   NA
 30365 30366 PH0436 PH0437     FALSE 0.003 264.000 0.000 1.000   NA
 30366 30367 PH0437 PH0438     FALSE 0.038 59.000 0.000 1.000   NA
 30367 30368 PH0438 PH0439     FALSE 0.054 32.000 0.000 1.000   NA
 30368 30369 PH0439 PH0440     FALSE 0.452 3.000 0.013 1.000   NA
 30371 30372 PH0442 PH0443     FALSE 0.154 135.000 0.081 1.000 N NA
 30374 30375 PH0446 PH0447     TRUE 0.653 30.000 0.333 NA   NA
 30375 1744046 PH0447 PH0448     TRUE 0.964 -3.000 0.800 NA   NA
 30380 30381 PH0452 PH0456     FALSE 0.014 140.000 0.000 NA N NA
 30381 30382 PH0456 PH0457     FALSE 0.099 96.000 0.038 NA N NA
 30382 1744047 PH0457 PH0457.1n     FALSE 0.001 272.000 0.000 NA   NA
 1744047 30383 PH0457.1n PH0458     FALSE 0.022 -46.000 0.000 NA   NA
 30383 30384 PH0458 PH0459     FALSE 0.052 33.000 0.000 1.000   NA
 30385 30386 PH0460 PH0461     FALSE 0.548 -82.000 0.068 1.000   NA
 30386 30387 PH0461 PH0462     TRUE 0.801 -3.000 0.080 1.000   NA
 30388 30389 PH0463 PH0464     TRUE 0.748 -3.000 0.088 NA   NA
 30389 30390 PH0464 PHS019     FALSE 0.298 1.000 0.002 1.000   NA
 30390 30391 PHS019 PH0465     FALSE 0.002 558.000 0.000 1.000   NA
 30392 1744048 PH0466 PH0466.1n     FALSE 0.008 53.000 0.000 NA   NA
 30394 30395 PH0468 PH0469     TRUE 0.942 -3.000 0.500 NA   NA
 30396 403125 PHS020 PHtRNA06   tRNA-Gln FALSE 0.000 1331.000 0.000 NA   NA
 30397 30398 PH0470 PH0471     TRUE 0.916 -3.000 0.036 NA Y NA
 1744050 30400 PH0472 PH0473     FALSE 0.626 11.000 0.103 NA   NA
 30404 30405 PH0478 PH0479     TRUE 0.991 4.000 0.308 0.004 Y NA
 30406 30407 PH0480 PH0481     FALSE 0.001 264.000 0.000 NA   NA
 30407 30408 PH0481 PH0482     TRUE 0.991 -7.000 0.833 1.000 Y NA
 30408 30409 PH0482 PH0483     TRUE 0.935 18.000 0.047 0.001 Y NA
 30409 30410 PH0483 PH0484     TRUE 0.986 -37.000 0.390 0.002 Y NA
 30410 30411 PH0484 PH0487     TRUE 0.903 -16.000 0.059 NA Y NA
 30411 30412 PH0487 PH0488     TRUE 0.987 -3.000 0.625 NA Y NA
 30412 30413 PH0488 PH0490     TRUE 0.863 -13.000 0.021 NA Y NA
 30413 30414 PH0490 PH0491     TRUE 0.805 14.000 0.021 1.000 Y NA
 30414 30415 PH0491 PH0493     TRUE 0.759 35.000 0.600 NA   NA
 30415 30416 PH0493 PH0494     TRUE 0.903 14.000 0.833 NA   NA
 30417 30418 PH0495 PH0498     TRUE 0.761 2.000 0.027 1.000 N NA
 30420 1744051 PH0500 PH0500.1n     TRUE 0.959 3.000 0.750 NA   NA
 1744051 30421 PH0500.1n PH0501     TRUE 0.951 -3.000 0.600 NA   NA
 30422 30423 PH0502 PH0503     TRUE 0.960 36.000 0.500 0.034 Y NA
 30423 30424 PH0503 PH0504     TRUE 0.996 4.000 1.000 0.045 Y NA
 30424 30425 PH0504 PH0505     TRUE 0.972 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 30425 30426 PH0505 PH0507     TRUE 0.995 -16.000 0.900 0.005 Y NA
 30426 30427 PH0507 PH0510     TRUE 0.764 7.000 0.044 1.000 N NA
 30427 30428 PH0510 PH0511     TRUE 0.923 -6.000 0.044 0.011 N NA
 1744052 30434 PH0517 PH0518     TRUE 0.696 10.000 0.125 NA   NA
 30434 30435 PH0518 PH0519     TRUE 0.843 11.000 0.278 1.000   NA
 30435 30436 PH0519 PH0520     TRUE 0.740 3.000 0.023 1.000 N NA
 30437 30438 PH0521 PH0522     FALSE 0.008 54.000 0.000 NA   NA
 30438 30439 PH0522 PH0523     FALSE 0.005 72.000 0.000 NA   NA
 30439 30440 PH0523 PH0524     FALSE 0.191 44.000 0.000 1.000 N NA
 30440 30441 PH0524 PH0525     FALSE 0.381 42.000 0.041 1.000 N NA
 30442 30443 PH0527 PHS021     TRUE 0.882 13.000 0.348 1.000 N NA
 30443 30444 PHS021 PH0528     TRUE 0.949 13.000 0.324 1.000 Y NA
 30444 1744053 PH0528 PH0529a     TRUE 0.951 21.000 0.474 1.000 Y NA
 1744053 30446 PH0529a PH0529b     TRUE 0.965 6.000 0.434 0.031   NA
 30447 30448 PH0530 PH0531     FALSE 0.440 47.000 0.100 1.000   NA
 30448 30449 PH0531 PH0532     FALSE 0.186 37.000 0.026 1.000   NA
 30449 30450 PH0532 PH0533     FALSE 0.374 17.000 0.065 NA   NA
 30450 30451 PH0533 PH0534     FALSE 0.616 -46.000 0.136 NA   NA
 30451 30452 PH0534 PH0535     TRUE 0.816 -16.000 0.159 1.000   NA
 30452 30453 PH0535 PH0536     TRUE 0.756 -16.000 0.091 1.000   NA
 30453 30454 PH0536 PH0537     TRUE 0.810 4.000 0.091 1.000   NA
 30456 403084 PH0539 PHtRNA07   tRNA-Gly FALSE 0.003 96.000 0.000 NA   NA
 403084 403085 PHtRNA07 PHtRNA08 tRNA-Gly tRNA-Arg FALSE 0.008 54.000 0.000 NA   NA
 403085 30457 PHtRNA08 PH0540 tRNA-Arg   FALSE 0.009 40.000 0.000 NA   NA
 30461 30462 PH0544 PH0545     FALSE 0.123 2.000 0.017 NA   NA
 30462 30463 PH0545 PH0546     FALSE 0.040 137.000 0.000 1.000 N NA
 30463 30464 PH0546 PH0548     TRUE 0.813 33.000 0.000 0.004 Y NA
 30464 30465 PH0548 PH0549     TRUE 0.987 15.000 0.667 0.004 Y NA
 30465 30466 PH0549 PH0550     TRUE 0.766 57.000 0.000 0.004 Y NA
 30466 30467 PH0550 PH0551     TRUE 0.994 11.000 0.857 0.004 Y NA
 30467 30468 PH0551 PH0552     TRUE 0.980 2.000 0.300 1.000 Y NA
 30468 30469 PH0552 PH0553     TRUE 0.986 4.000 0.500 1.000 Y NA
 1744054 30471 PH0553.1n PH0555     TRUE 0.988 -21.000 0.355 0.004 Y NA
 30471 30472 PH0555 PH0556     TRUE 0.968 15.000 0.622 1.000 Y NA
 30472 30473 PH0556 PH0557     TRUE 0.989 2.000 0.547 1.000 Y NA
 30473 30474 PH0557 PH0559     TRUE 0.989 2.000 0.578 1.000 Y NA
 30474 30475 PH0559 PH0560     TRUE 0.820 4.000 0.184 NA   NA
 30476 1744055 PH0561 PH0562     FALSE 0.049 -6.000 0.000 NA   NA
 1744055 30478 PH0562 PH0563     FALSE 0.043 -9.000 0.000 NA   NA
 30478 1744056 PH0563 PH0564     TRUE 0.784 42.000 0.750 NA   NA
 1744056 30480 PH0564 PH0565     TRUE 0.905 15.000 0.889 NA   NA
 30480 30481 PH0565 PH0566     FALSE 0.428 99.000 0.545 NA   NA
 403086 403087 PHtRNA09 PHtRNA10 tRNA-Gln tRNA-Leu FALSE 0.007 60.000 0.000 NA   NA
 30482 1744057 PH0567 PH0568     FALSE 0.002 495.000 0.000 1.000   NA
 1744057 30484 PH0568 PH0569     FALSE 0.317 79.000 0.250 NA   NA
 30484 30485 PH0569 PH0570     FALSE 0.478 2.000 0.037 NA   NA
 30487 30488 PH0574 PH0575     FALSE 0.528 16.000 0.118 NA   NA
 30488 30489 PH0575 PH0577     TRUE 0.992 -42.000 0.750 0.003 Y NA
 30490 30491 PH0578 PH0579     FALSE 0.134 27.000 0.033 NA   NA
 30491 30492 PH0579 PH0580     FALSE 0.123 58.000 0.041 NA   NA
 30492 1744058 PH0580 PH0580.1n     TRUE 0.733 14.000 0.286 NA   NA
 1744058 30493 PH0580.1n PH0581     TRUE 0.651 -3.000 0.059 NA   NA
 1744059 30494 PH0581.1n PH0582     TRUE 0.972 2.000 0.031 0.007 Y NA
 403088 1744060 PHtRNA11 PH0584.1n tRNA-Ser   FALSE 0.002 132.000 0.000 NA   NA
 1744060 30497 PH0584.1n PH0585     TRUE 0.942 -3.000 0.500 NA   NA
 30499 30500 PH0587 PH0588     TRUE 0.922 -12.000 0.500 NA   NA
 30501 30502 PH0589 PH0590     FALSE 0.044 52.000 0.000 1.000   NA
 30502 30503 PH0590 PH0591     FALSE 0.562 -24.000 0.077 NA   NA
 30504 30505 PH0592 PH0593     FALSE 0.173 -16.000 0.000 1.000   NA
 30505 30506 PH0593 PH0594     TRUE 0.875 29.000 0.214 1.000 Y NA
 30511 30512 PH0599 PH0600     FALSE 0.000 430.000 0.000 NA   NA
 30512 30513 PH0600 PH0601     FALSE 0.322 98.000 0.015 1.000 Y NA
 403089 30514 PHtRNA12 PH0602 tRNA-Glu   FALSE 0.000 312.000 0.000 NA   NA
 30514 30515 PH0602 PH0603     FALSE 0.052 3.000 0.000 NA   NA
 30515 30516 PH0603 PH0604     FALSE 0.003 84.000 0.000 NA   NA
 30516 1744061 PH0604 PH0604.1n     FALSE 0.000 342.000 0.000 NA   NA
 30517 30518 PH0605 PH0606     TRUE 0.642 43.000 0.211 1.000 N NA
 30518 30519 PH0606 PH0610     TRUE 0.938 3.000 0.211 0.095   NA
 30519 30520 PH0610 PH0611     FALSE 0.484 43.000 0.143 1.000   NA
 30520 30521 PH0611 PH0612     TRUE 0.842 31.000 0.286 0.006   NA
 30524 30525 PH0615 PH0617     FALSE 0.006 67.000 0.012 NA   NA
 30526 30527 PH0618 PH0619     TRUE 0.742 7.000 0.131 NA   NA
 30527 1744062 PH0619 PH0619.1n     FALSE 0.053 74.000 0.033 NA   NA
 403090 30528 PHtRNA13 PH0620 tRNA-Lys   FALSE 0.009 47.000 0.000 NA   NA
 30528 30529 PH0620 PH0622     FALSE 0.505 -3.000 0.038 NA   NA
 30530 30531 PH0623 PH0624     FALSE 0.317 59.000 0.118 NA   NA
 30534 30535 PH0627 PH0628     FALSE 0.082 43.000 0.007 1.000   NA
 30535 30536 PH0628 PH0629     FALSE 0.513 -3.000 0.017 1.000   NA
 30537 1744063 PH0630 PH0630.1n     TRUE 0.942 -3.000 0.500 NA   NA
 1744063 30538 PH0630.1n PHS022     FALSE 0.018 -93.000 0.000 NA   NA
 30539 30540 PH0632 PH0633     FALSE 0.132 78.000 0.011 1.000 N NA
 30540 30541 PH0633 PH0634     FALSE 0.258 54.000 0.017 1.000 N NA
 30541 30542 PH0634 PH0635     TRUE 0.776 -6.000 0.037 1.000 N NA
 30542 1744064 PH0635 PH0635.1n     FALSE 0.446 2.000 0.034 NA   NA
 30545 30546 PH0637 PH0640     TRUE 0.969 -3.000 0.937 NA   NA
 30546 30547 PH0640 PH0641     FALSE 0.068 76.000 0.016 1.000   NA
 30548 30549 PH0642 PH0643     FALSE 0.400 -3.000 0.008 1.000   NA
 30550 30551 PH0644 PH0645     FALSE 0.323 37.000 0.091 NA   NA
 30553 30554 PH0648 PH0649     TRUE 0.890 -3.000 0.286 NA   NA
 30554 30555 PH0649 PH0650     TRUE 0.961 -7.000 0.875 NA   NA
 30555 30556 PH0650 PH0653     TRUE 0.962 3.000 0.467 1.000 N NA
 30556 30557 PH0653 PH0654     TRUE 0.989 -3.000 0.200 0.002 Y NA
 30557 30558 PH0654 PH0655     FALSE 0.120 83.000 0.013 1.000 N NA
 30559 30560 PH0657 PH0658     TRUE 0.954 12.000 0.046 0.001 Y NA
 30560 30561 PH0658 PH0660     FALSE 0.021 214.000 0.000 1.000 N NA
 30561 30562 PH0660 PH0661     FALSE 0.487 -88.000 0.022 1.000 N NA
 30562 30563 PH0661 PH0663     FALSE 0.447 -40.000 0.030 NA N NA
 30564 1744066 PH0664 PH0664.1n     TRUE 0.902 -30.000 0.600 NA   NA
 1744066 30565 PH0664.1n PH0665     TRUE 0.943 -22.000 0.875 NA   NA
 30565 30566 PH0665 PH0666     FALSE 0.552 20.000 0.151 NA   NA
 30568 30569 PH0670 PH0671     TRUE 0.724 -3.000 0.047 1.000   NA
 30569 30570 PH0671 PH0672     FALSE 0.102 20.000 0.024 NA   NA
 30570 30571 PH0672 PH0673     FALSE 0.052 3.000 0.014 NA   NA
 30571 1744067 PH0673 PH0673.1n     FALSE 0.480 -18.000 0.050 NA   NA
 1744067 1744068 PH0673.1n PH0674     FALSE 0.054 -3.000 0.000 NA   NA
 1744068 30573 PH0674 PH0675     FALSE 0.175 21.000 0.035 NA   NA
 30573 30574 PH0675 PH0676     TRUE 0.962 2.000 0.756 NA   NA
 30574 30575 PH0676 PH0677     TRUE 0.968 14.000 0.565 1.000 Y NA
 30576 30577 PH0678 PH0679     TRUE 0.984 34.000 1.000 0.004 Y NA
 30577 30578 PH0679 PH0680     TRUE 0.997 2.000 0.889 0.004 Y NA
 30578 30579 PH0680 PH0681     TRUE 0.996 -3.000 0.750 0.004 Y NA
 30579 30580 PH0681 PH0682     TRUE 0.984 22.000 0.667 0.004 Y NA
 30580 30581 PH0682 PH0684     TRUE 0.982 7.000 0.148 0.004 Y NA
 30581 30582 PH0684 PH0685     TRUE 0.985 2.000 0.110 0.004 Y NA
 30582 30583 PH0685 PH0686     FALSE 0.271 31.000 0.037 1.000   NA
 30583 30584 PH0686 PH0687     TRUE 0.882 -19.000 0.308 1.000   NA
 403124 403123 PHtRNA15 PHtRNA16 tRNA-Val tRNA-Ala FALSE 0.020 13.000 0.000 NA   NA
 1744070 30585 PH0687.2n PH0690     TRUE 0.920 -24.000 0.667 NA   NA
 30586 30587 PH0691 PH0692     FALSE 0.001 259.000 0.000 NA   NA
 30589 30590 PH0694 PH0695     FALSE 0.005 295.000 0.000 NA N NA
 30591 1744071 PH0696 PH0696.1n     FALSE 0.046 -7.000 0.000 NA   NA
 1744071 1744072 PH0696.1n PH0696.2n     FALSE 0.005 72.000 0.000 NA   NA
 30592 1744073 PH0697 PH0697.1n     FALSE 0.634 -7.000 0.064 NA   NA
 1744073 30593 PH0697.1n PH0698     FALSE 0.043 6.000 0.002 NA   NA
 30593 30594 PH0698 PH0699     FALSE 0.451 35.000 0.002 0.093 N NA
 30595 30596 PH0700 PH0701     FALSE 0.002 110.000 0.000 NA   NA
 30596 30597 PH0701 PH0702     FALSE 0.031 -22.000 0.000 NA   NA
 30597 30598 PH0702 PH0703     FALSE 0.219 47.000 0.004 1.000 N NA
 30598 30599 PH0703 PH0705     FALSE 0.011 28.000 0.000 NA   NA
 30600 30601 PH0706 PH0707     FALSE 0.013 24.000 0.002 NA   NA
 30601 1744074 PH0707 PH0707.2n     FALSE 0.001 217.000 0.000 NA   NA
 1744074 30602 PH0707.2n PH0708     TRUE 0.919 -31.000 0.750 NA   NA
 30603 30604 PH0709 PH0710     FALSE 0.110 -15.000 0.018 NA   NA
 30604 30605 PH0710 PH0711     FALSE 0.010 33.000 0.012 NA   NA
 1744075 30608 PH0713.1n PH0714     TRUE 0.960 7.000 1.000 NA   NA
 30608 30609 PH0714 PH0715     FALSE 0.010 32.000 0.000 NA   NA
 1744076 30610 PH0714.1n PH0716     FALSE 0.000 1892.000 0.000 NA   NA
 11536783 30600   PH0706     FALSE NA 7340.000 0.000 NA   NA
 11679146 30600   PH0706     FALSE NA 7340.000 0.000 NA   NA
 11821538 30600   PH0706     FALSE NA 7340.000 0.000 NA   NA
 11536784 30600   PH0706     FALSE NA 7370.000 0.000 NA   NA
 11679147 30600   PH0706     FALSE NA 7370.000 0.000 NA   NA
 11821539 30600   PH0706     FALSE NA 7370.000 0.000 NA   NA
 11536785 30600   PH0706     FALSE NA 7409.000 0.000 NA   NA
 11679148 30600   PH0706     FALSE NA 7409.000 0.000 NA   NA
 11821540 30600   PH0706     FALSE NA 7409.000 0.000 NA   NA
 11536786 30600   PH0706     FALSE NA 7439.000 0.000 NA   NA
 11679149 30600   PH0706     FALSE NA 7439.000 0.000 NA   NA
 11821541 30600   PH0706     FALSE NA 7439.000 0.000 NA   NA
 11536787 30600   PH0706     FALSE NA 7477.000 0.000 NA   NA
 11679150 30600   PH0706     FALSE NA 7477.000 0.000 NA   NA
 11821542 30600   PH0706     FALSE NA 7477.000 0.000 NA   NA
 11536788 30600   PH0706     FALSE NA 7507.000 0.000 NA   NA
 11679151 30600   PH0706     FALSE NA 7507.000 0.000 NA   NA
 11821543 30600   PH0706     FALSE NA 7507.000 0.000 NA   NA
 11536789 30600   PH0706     FALSE NA 7545.000 0.000 NA   NA
 11679152 30600   PH0706     FALSE NA 7545.000 0.000 NA   NA
 11821544 30600   PH0706     FALSE NA 7545.000 0.000 NA   NA
 11536790 30600   PH0706     FALSE NA 7575.000 0.000 NA   NA
 11679153 30600   PH0706     FALSE NA 7575.000 0.000 NA   NA
 11821545 30600   PH0706     FALSE NA 7575.000 0.000 NA   NA
 11536791 30600   PH0706     FALSE NA 7612.000 0.000 NA   NA
 11679154 30600   PH0706     FALSE NA 7612.000 0.000 NA   NA
 11821546 30600   PH0706     FALSE NA 7612.000 0.000 NA   NA
 11536792 30600   PH0706     FALSE NA 7642.000 0.000 NA   NA
 11679155 30600   PH0706     FALSE NA 7642.000 0.000 NA   NA
 11821547 30600   PH0706     FALSE NA 7642.000 0.000 NA   NA
 11536793 30600   PH0706     FALSE NA 7679.000 0.000 NA   NA
 11679156 30600   PH0706     FALSE NA 7679.000 0.000 NA   NA
 11821548 30600   PH0706     FALSE NA 7679.000 0.000 NA   NA
 11536794 30600   PH0706     FALSE NA 7709.000 0.000 NA   NA
 11679157 30600   PH0706     FALSE NA 7709.000 0.000 NA   NA
 11821549 30600   PH0706     FALSE NA 7709.000 0.000 NA   NA
 11536795 30600   PH0706     FALSE NA 7746.000 0.000 NA   NA
 11679158 30600   PH0706     FALSE NA 7746.000 0.000 NA   NA
 11821550 30600   PH0706     FALSE NA 7746.000 0.000 NA   NA
 11536796 30600   PH0706     FALSE NA 7776.000 0.000 NA   NA
 11679159 30600   PH0706     FALSE NA 7776.000 0.000 NA   NA
 11821551 30600   PH0706     FALSE NA 7776.000 0.000 NA   NA
 11536797 30600   PH0706     FALSE NA 7813.000 0.000 NA   NA
 11679160 30600   PH0706     FALSE NA 7813.000 0.000 NA   NA
 11821552 30600   PH0706     FALSE NA 7813.000 0.000 NA   NA
 11536798 30600   PH0706     FALSE NA 7843.000 0.000 NA   NA
 11679161 30600   PH0706     FALSE NA 7843.000 0.000 NA   NA
 11821553 30600   PH0706     FALSE NA 7843.000 0.000 NA   NA
 11536799 30600   PH0706     FALSE NA 7880.000 0.000 NA   NA
 11679162 30600   PH0706     FALSE NA 7880.000 0.000 NA   NA
 11821554 30600   PH0706     FALSE NA 7880.000 0.000 NA   NA
 11536800 30600   PH0706     FALSE NA 7910.000 0.000 NA   NA
 11679163 30600   PH0706     FALSE NA 7910.000 0.000 NA   NA
 11821555 30600   PH0706     FALSE NA 7910.000 0.000 NA   NA
 11536801 30600   PH0706     FALSE NA 7947.000 0.000 NA   NA
 11679164 30600   PH0706     FALSE NA 7947.000 0.000 NA   NA
 11821556 30600   PH0706     FALSE NA 7947.000 0.000 NA   NA
 11536802 30600   PH0706     FALSE NA 7977.000 0.000 NA   NA
 11679165 30600   PH0706     FALSE NA 7977.000 0.000 NA   NA
 11821557 30600   PH0706     FALSE NA 7977.000 0.000 NA   NA
 11536803 30600   PH0706     FALSE NA 8015.000 0.000 NA   NA
 11679166 30600   PH0706     FALSE NA 8015.000 0.000 NA   NA
 11821558 30600   PH0706     FALSE NA 8015.000 0.000 NA   NA
 11536804 30600   PH0706     FALSE NA 8045.000 0.000 NA   NA
 11679167 30600   PH0706     FALSE NA 8045.000 0.000 NA   NA
 11821559 30600   PH0706     FALSE NA 8045.000 0.000 NA   NA
 11536805 30600   PH0706     FALSE NA 8083.000 0.000 NA   NA
 11679168 30600   PH0706     FALSE NA 8083.000 0.000 NA   NA
 11821560 30600   PH0706     FALSE NA 8083.000 0.000 NA   NA
 11536806 30600   PH0706     FALSE NA 8113.000 0.000 NA   NA
 11679169 30600   PH0706     FALSE NA 8113.000 0.000 NA   NA
 11821561 30600   PH0706     FALSE NA 8113.000 0.000 NA   NA
 11536807 30600   PH0706     FALSE NA 8149.000 0.000 NA   NA
 11679170 30600   PH0706     FALSE NA 8149.000 0.000 NA   NA
 11821562 30600   PH0706     FALSE NA 8149.000 0.000 NA   NA
 11536808 30600   PH0706     FALSE NA 8179.000 0.000 NA   NA
 11679171 30600   PH0706     FALSE NA 8179.000 0.000 NA   NA
 11821563 30600   PH0706     FALSE NA 8179.000 0.000 NA   NA
 11536809 30600   PH0706     FALSE NA 8217.000 0.000 NA   NA
 11679172 30600   PH0706     FALSE NA 8217.000 0.000 NA   NA
 11821564 30600   PH0706     FALSE NA 8217.000 0.000 NA   NA
 11536810 30600   PH0706     FALSE NA 8247.000 0.000 NA   NA
 11679173 30600   PH0706     FALSE NA 8247.000 0.000 NA   NA
 11821565 30600   PH0706     FALSE NA 8247.000 0.000 NA   NA
 11536811 30600   PH0706     FALSE NA 8285.000 0.000 NA   NA
 11679174 30600   PH0706     FALSE NA 8285.000 0.000 NA   NA
 11821566 30600   PH0706     FALSE NA 8285.000 0.000 NA   NA
 11536812 30600   PH0706     FALSE NA 8315.000 0.000 NA   NA
 11679175 30600   PH0706     FALSE NA 8315.000 0.000 NA   NA
 11821567 30600   PH0706     FALSE NA 8315.000 0.000 NA   NA
 11536813 30600   PH0706     FALSE NA 8357.000 0.000 NA   NA
 11679176 30600   PH0706     FALSE NA 8357.000 0.000 NA   NA
 11821568 30600   PH0706     FALSE NA 8357.000 0.000 NA   NA
 11536814 30600   PH0706     FALSE NA 8387.000 0.000 NA   NA
 11679177 30600   PH0706     FALSE NA 8387.000 0.000 NA   NA
 11821569 30600   PH0706     FALSE NA 8387.000 0.000 NA   NA
 11536815 30600   PH0706     FALSE NA 8423.000 0.000 NA   NA
 11679178 30600   PH0706     FALSE NA 8423.000 0.000 NA   NA
 11821570 30600   PH0706     FALSE NA 8423.000 0.000 NA   NA
 11536816 30600   PH0706     FALSE NA 8453.000 0.000 NA   NA
 11679179 30600   PH0706     FALSE NA 8453.000 0.000 NA   NA
 11821571 30600   PH0706     FALSE NA 8453.000 0.000 NA   NA
 11536817 30600   PH0706     FALSE NA 8491.000 0.000 NA   NA
 11679180 30600   PH0706     FALSE NA 8491.000 0.000 NA   NA
 11821572 30600   PH0706     FALSE NA 8491.000 0.000 NA   NA
 30610 1744077 PH0716 PH0716.1n     TRUE 0.726 -79.000 0.273 NA   NA
 1744077 30611 PH0716.1n PH0718     FALSE 0.031 -22.000 0.000 NA   NA
 30611 1744078 PH0718 PH0718.1n     TRUE 0.804 -7.000 0.050 1.000 N NA
 1744078 30612 PH0718.1n PH0719     FALSE 0.009 34.000 0.000 NA   NA
 30613 30614 PH0720 PH0721     TRUE 0.990 1.000 0.197 0.001 Y NA
 30616 30617 PH0723 PH0724     FALSE 0.056 0.000 0.000 NA   NA
 30617 30618 PH0724 PH0725     TRUE 0.917 1.000 0.012 1.000 Y NA
 30618 30619 PH0725 PH0726     FALSE 0.052 130.000 0.004 1.000 N NA
 30619 30620 PH0726 PH0727     FALSE 0.012 25.000 0.003 NA   NA
 30621 30622 PH0728 PH0729     FALSE 0.021 179.000 0.043 NA   NA
 30623 30624 PH0730 PH0731     FALSE 0.194 -102.000 0.011 1.000   NA
 30624 30625 PH0731 PH0734     TRUE 0.675 -7.000 0.016 1.000 N NA
 30625 30626 PH0734 PH0735     FALSE 0.598 -21.000 0.017 1.000 N NA
 30627 30628 PH0736 PH0737     FALSE 0.108 -12.000 0.018 NA   NA
 30631 30632 PH0742 PH0743     TRUE 0.899 8.000 0.333 1.000   NA
 30632 30633 PH0743 PH0744     TRUE 0.920 -7.000 0.333 1.000   NA
 30635 30636 PH0746 PH0749     TRUE 0.930 -3.000 0.120 0.030   NA
 30636 30637 PH0749 PH0751     TRUE 0.956 -3.000 0.667 NA   NA
 30637 30638 PH0751 PH0752     FALSE 0.008 41.000 0.000 NA   NA
 30639 30640 PH0753 PH0754     TRUE 0.992 10.000 0.677 0.030 Y NA
 30640 30641 PH0754 PH0755     TRUE 0.996 -3.000 0.825 0.040 Y NA
 30641 30642 PH0755 PH0756     TRUE 0.973 0.000 0.053 0.040 Y NA
 30644 30645 PH0758 PH0759     FALSE 0.001 188.000 0.000 NA   NA
 30646 30647 PH0760 PH0762     FALSE 0.020 109.000 0.000 NA N NA
 403092 30648 PHtRNA17 PH0763 tRNA-Arg   FALSE 0.004 74.000 0.000 NA   NA
 30649 30650 PH0764 PH0765     TRUE 0.988 -3.000 0.138 0.002 Y NA
 30650 30651 PH0765 PH0766     TRUE 0.990 1.000 0.636 1.000 Y NA
 30651 1744080 PH0766 PH0766.1n     FALSE 0.215 103.000 0.250 NA   NA
 1744080 30652 PH0766.1n PH0768     TRUE 0.929 -13.000 0.583 NA   NA
 30652 30653 PH0768 PH0769     TRUE 0.804 41.000 0.125 1.000 Y NA
 30653 30654 PH0769 PHS024     TRUE 0.808 21.000 0.286 1.000 N NA
 30655 30656 PH0770 PH0771     FALSE 0.225 47.000 0.059 NA   NA
 30656 1744081 PH0771 PH0771.1n     FALSE 0.617 -3.000 0.029 1.000   NA
 1744081 30657 PH0771.1n PH0772     FALSE 0.341 12.000 0.021 1.000   NA
 30658 30659 PH0773 PH0774     TRUE 0.963 -3.000 0.778 NA   NA
 30659 30660 PH0774 PH0776     TRUE 0.803 7.000 0.205 NA   NA
 30660 30661 PH0776 PH0777     FALSE 0.491 -43.000 0.077 NA   NA
 30664 30665 PH0780 PH0781     FALSE 0.002 100.000 0.000 NA   NA
 30665 30666 PH0781 PH0782     TRUE 0.985 0.000 0.385 1.000 Y NA
 30668 30669 PH0784 PHS025     FALSE 0.009 39.000 0.000 NA   NA
 30669 30670 PHS025 PH0785     FALSE 0.000 297.000 0.000 NA   NA
 30670 30671 PH0785 PH0786     FALSE 0.054 -3.000 0.000 NA   NA
 1744082 1744083 PH0786.1n PH0786.2n     FALSE 0.008 42.000 0.000 NA   NA
 30672 30673 PH0787 PH0788     FALSE 0.079 41.000 0.029 NA   NA
 30673 30674 PH0788 PH0790     FALSE 0.608 20.000 0.029 0.030   NA
 30674 30675 PH0790 PH0791     TRUE 0.935 -16.000 0.082 1.000 Y NA
 30675 30676 PH0791 PH0792     TRUE 0.652 31.000 0.048 0.086 N NA
 30676 30677 PH0792 PH0793     FALSE 0.590 -3.000 0.048 NA   NA
 30677 30678 PH0793 PH0794     FALSE 0.017 25.000 0.015 NA   NA
 30678 30679 PH0794 PH0795     FALSE 0.495 -3.000 0.015 1.000   NA
 30679 1744084 PH0795 PH0795.1n     FALSE 0.628 -3.000 0.055 NA   NA
 1744084 30680 PH0795.1n PH0796     FALSE 0.000 648.000 0.000 NA   NA
 30680 30681 PH0796 PH0797     TRUE 0.936 -15.000 0.667 NA   NA
 30681 30682 PH0797 PH0798     FALSE 0.036 8.000 0.000 NA   NA
 1744085 30684 PH0799 PH0800     FALSE 0.045 196.000 0.050 NA N NA
 30684 30685 PH0800 PH0802     FALSE 0.004 111.000 0.017 NA   NA
 30686 30687 PH0803 PH0804     TRUE 0.934 -3.000 0.130 0.024   NA
 30689 30690 PH0806 PH0807     FALSE 0.006 175.000 0.000 1.000   NA
 30690 30691 PH0807 PH0808     TRUE 0.957 42.000 0.500 0.030 Y NA
 30691 30692 PH0808 PH0809     TRUE 0.989 12.000 0.750 0.040 Y NA
 30692 30693 PH0809 PH0810     TRUE 0.902 1.000 0.000 1.000 Y NA
 30693 30694 PH0810 PH0811     TRUE 0.962 -3.000 0.000 0.004 Y NA
 30694 30695 PH0811 PH0812     FALSE 0.390 12.000 0.000 1.000 N NA
 30695 30696 PH0812 PH0813     TRUE 0.962 -3.000 0.000 0.004 Y NA
 30697 30698 PH0814 PH0815     FALSE 0.011 30.000 0.000 NA   NA
 30698 1744086 PH0815 PH0815.1n     FALSE 0.043 6.000 0.000 NA   NA
 1744086 30699 PH0815.1n PH0816     FALSE 0.006 64.000 0.000 NA   NA
 30699 30700 PH0816 PH0817     FALSE 0.042 -10.000 0.014 NA   NA
 1744087 30701 PH0817.1n PH0818     FALSE 0.019 14.000 0.000 NA   NA
 30703 30704 PH0820 PH0821     TRUE 0.984 -16.000 0.333 0.057 Y NA
 30706 30707 PH0823 PH0824     TRUE 0.820 -40.000 0.188 1.000 N NA
 30708 30709 PH0825 PH0826     FALSE 0.005 70.000 0.005 NA   NA
 30710 30711 PH0827 PH0828     FALSE 0.000 639.000 0.000 NA   NA
 30714 30715 PH0831 PH0832     TRUE 0.925 -10.000 0.500 NA   NA
 30715 30716 PH0832 PH0833     TRUE 0.810 -37.000 0.333 NA   NA
 30716 30717 PH0833 PH0834     FALSE 0.010 344.000 0.000 1.000 N NA
 30718 30719 PH0835 PH0837     FALSE 0.001 958.000 0.000 1.000   NA
 30719 1744089 PH0837 PH0840m     FALSE 0.002 381.000 0.000 1.000   NA
 1744089 1744090 PH0840m PH0837.1n     FALSE 0.017 -353.000 0.000 NA   NA
 30722 30723 PH0843 PH0844     FALSE 0.019 -73.000 0.000 NA   NA
 30727 30728 PH0848 PH0849     TRUE 0.969 2.000 0.912 NA   NA
 30729 30730 PH0850 PH0851     FALSE 0.388 41.000 0.143 NA   NA
 30730 30731 PH0851 PH0852     FALSE 0.044 71.000 0.000 NA N NA
 30731 30732 PH0852 PH0854     FALSE 0.002 687.000 0.000 NA N NA
 30734 30735 PH0856 PH0857     FALSE 0.004 230.000 0.000 1.000   NA
 30735 30736 PH0857 PH0858     FALSE 0.052 386.000 0.000 1.000 Y NA
 30736 30737 PH0858 PH0859     FALSE 0.005 202.000 0.000 1.000   NA
 30739 30740 PH0861 PH0862     FALSE 0.054 -3.000 0.000 NA   NA
 30742 30743 PH0864 PH0865     FALSE 0.000 306.000 0.000 NA   NA
 30744 30745 PH0867 PH0868     FALSE 0.009 36.000 0.000 NA   NA
 30747 1744091 PH0870 PH0870.2n     FALSE 0.000 384.000 0.000 NA   NA
 1744091 30748 PH0870.2n PH0871     FALSE 0.000 297.000 0.000 NA   NA
 30748 1744092 PH0871 PH0871.1n     FALSE 0.005 69.000 0.000 NA   NA
 1744092 30749 PH0871.1n PH0872     FALSE 0.004 79.000 0.000 NA   NA
 30749 30750 PH0872 PH0873     TRUE 0.934 -19.000 0.684 NA   NA
 30751 30752 PH0874 PH0876     FALSE 0.040 57.000 0.000 1.000   NA
 30752 30753 PH0876 PH0878     TRUE 0.981 1.000 0.467 0.039 N NA
 30754 30755 PH0878a PH0879 hypC   TRUE 0.979 1.000 0.363 NA Y NA
 30755 30756 PH0879 PH0880     FALSE 0.002 113.000 0.000 NA   NA
 30758 30759 PH0882 PH0883     TRUE 0.972 -30.000 0.465 1.000 Y NA
 30760 30761 PH0884 PH0885     FALSE 0.009 134.000 0.000 1.000   NA
 30762 30763 PH0886 PH0887     TRUE 0.771 26.000 0.500 NA   NA
 30763 30764 PH0887 PH0888     TRUE 0.836 44.000 1.000 NA   NA
 30764 30765 PH0888 PH0889     TRUE 0.880 4.000 0.286 NA   NA
 30766 30767 PH0890 PH0891     TRUE 0.761 -3.000 0.000 0.039   NA
 30767 30768 PH0891 PH0892     TRUE 0.977 7.000 0.083 0.003 Y NA
 30768 30769 PH0892 PH0893     TRUE 0.878 -61.000 0.000 0.023 Y NA
 30769 30770 PH0893 PH0894     FALSE 0.043 53.000 0.000 1.000   NA
 30770 1744093 PH0894 PH0894.1n     FALSE 0.244 -3.000 0.000 1.000   NA
 30771 30772 PH0896 PH0897     FALSE 0.083 92.000 0.005 1.000 N NA
 30775 30776 PH0900 PH0901     FALSE 0.441 111.000 0.667 NA   NA
 30776 30777 PH0901 PH0902     TRUE 0.951 0.000 0.583 NA   NA
 30777 30778 PH0902 PH0905     FALSE 0.054 -3.000 0.000 NA   NA
 30781 30782 PH0909 PHS027     FALSE 0.310 8.000 0.031 NA   NA
 30782 1744094 PHS027 PHS027.1n     FALSE 0.043 -9.000 0.000 NA   NA
 30783 30784 PHS028 PH0910     FALSE 0.001 175.000 0.000 NA   NA
 30784 30785 PH0910 PH0911     FALSE 0.054 -3.000 0.000 NA   NA
 30785 30786 PH0911 PH0913     TRUE 0.947 -12.000 0.222 0.055 N NA
 30786 30787 PH0913 PH0914     TRUE 0.948 -7.000 0.484 NA N NA
 30787 30788 PH0914 PH0915     FALSE 0.001 176.000 0.000 NA   NA
 30788 30789 PH0915 PH0916     FALSE 0.480 77.000 0.417 NA   NA
 30789 30790 PH0916 PH0917     TRUE 0.948 -3.000 0.556 NA   NA
 30790 30791 PH0917 PH0918     TRUE 0.912 -30.000 0.667 NA   NA
 30791 1744095 PH0918 PH0919     TRUE 0.816 56.000 1.000 NA   NA
 1744095 30793 PH0919 PH0920     TRUE 0.968 12.000 0.600 NA Y NA
 30793 30794 PH0920 PH0921     TRUE 0.942 -3.000 0.500 NA   NA
 30794 30795 PH0921 PH0922     FALSE 0.000 318.000 0.000 NA   NA
 30795 30796 PH0922 PH0923     FALSE 0.003 277.000 0.000 1.000   NA
 30796 30797 PH0923 PH0925     TRUE 0.812 5.000 0.054 1.000 N NA
 30797 30798 PH0925 PH0926     TRUE 0.679 -3.000 0.038 1.000   NA
 30798 30799 PH0926 PH0927     TRUE 0.947 -3.000 0.088 0.001   NA
 403122 1744097 PHtRNA18 PH0928 tRNA-Gly   FALSE 0.009 44.000 0.000 NA   NA
 1744097 30801 PH0928 PH0929     TRUE 0.914 -3.000 0.339 NA   NA
 30801 30802 PH0929 PH0930     TRUE 0.980 3.000 0.331 1.000 Y NA
 30802 30803 PH0930 PH0932     TRUE 0.673 13.000 0.207 NA   NA
 30803 30804 PH0932 PH0934     FALSE 0.346 21.000 0.064 NA   NA
 30804 1744098 PH0934 PHS029     TRUE 0.852 2.000 0.211 NA   NA
 30806 30807 PH0935 PH0936     TRUE 0.958 -16.000 0.800 1.000   NA
 30807 30808 PH0936 PH0937     TRUE 0.822 0.000 0.044 1.000 N NA
 30808 30809 PH0937 PH0938     FALSE 0.086 108.000 0.044 1.000   NA
 30809 30810 PH0938 PH0939     FALSE 0.274 28.000 0.035 1.000   NA
 30810 30811 PH0939 PH0940     FALSE 0.001 207.000 0.000 NA   NA
 30811 1744099 PH0940 PH0940.1n     FALSE 0.013 23.000 0.000 NA   NA
 30812 1744100 PH0941 PH0941a   mnhC TRUE 0.991 -3.000 0.306 0.010 Y NA
 1744100 30814 PH0941a PH0942 mnhC   TRUE 0.751 3.000 0.093 NA   NA
 30814 30815 PH0942 PH0943     FALSE 0.481 -34.000 0.067 NA   NA
 30815 30816 PH0943 PH0944     TRUE 0.919 -19.000 0.092 NA Y NA
 1744101 30818 PH0944.1n PH0946     TRUE 0.964 -24.000 0.104 0.030 Y NA
 30818 30819 PH0946 PH0947     TRUE 0.892 0.000 0.100 1.000 N NA
 30820 30821 PH0948 PH0949     FALSE 0.172 83.000 0.105 NA   NA
 30821 30822 PH0949 PH0950     TRUE 0.805 -19.000 0.158 1.000   NA
 30823 30824 PH0951 PH0952     FALSE 0.223 31.000 0.000 1.000 N NA
 1744102 30828 PH0954.1n PH0958     FALSE 0.032 10.000 0.000 NA   NA
 30828 30829 PH0958 PH0959a     TRUE 0.899 -3.000 0.305 NA   NA
 30829 30830 PH0959a PH0961     TRUE 0.980 7.000 0.519 NA Y NA
 30831 30832 PH0962 PH0963     FALSE 0.474 -31.000 0.030 NA N NA
 30834 30835 PH0968 PH0969     FALSE 0.013 23.000 0.000 NA   NA
 30835 30836 PH0969 PH0970     FALSE 0.001 161.000 0.000 NA   NA
 30836 30837 PH0970 PH0971     FALSE 0.019 -82.000 0.000 NA   NA
 30838 1744103 PH0972 PH0973     FALSE 0.046 -7.000 0.000 NA   NA
 1744103 30840 PH0973 PH0974     FALSE 0.001 153.000 0.000 NA   NA
 30840 1744104 PH0974 PH0974.1n     FALSE 0.009 40.000 0.000 NA   NA
 1744104 30841 PH0974.1n PH0975     FALSE 0.001 280.000 0.000 NA   NA
 30841 1744105 PH0975 PH0975.3n     FALSE 0.000 487.000 0.000 NA   NA
 1744105 30842 PH0975.3n PH0976     FALSE 0.049 4.000 0.000 NA   NA
 30842 30843 PH0976 PH0977     FALSE 0.271 63.000 0.000 0.030   NA
 30844 30845 PH0978 PH0979     FALSE 0.290 31.000 0.012 1.000 N NA
 30847 30848 PH0981 PH0982     TRUE 0.763 62.000 0.026 0.022 Y NA
 30848 30849 PH0982 PH0983     TRUE 0.997 -3.000 0.838 0.005 Y NA
 30849 403093 PH0983 PHtRNA19   tRNA-Leu FALSE 0.009 44.000 0.000 NA   NA
 30851 30852 PH0985 PH0986     FALSE 0.116 12.000 0.000 1.000   NA
 30852 30853 PH0986 PH0987     TRUE 0.865 7.000 0.229 1.000   NA
 30853 30854 PH0987 PH0988     TRUE 0.996 -9.000 0.780 0.001 Y NA
 30854 30855 PH0988 PH0989     FALSE 0.174 32.000 0.042 NA   NA
 30855 30856 PH0989 PH0990     TRUE 0.809 -6.000 0.165 NA   NA
 30856 30857 PH0990 PH0992     FALSE 0.469 -3.000 0.007 NA N NA
 30858 30859 PH0993 PH0995     FALSE 0.048 75.000 0.008 1.000   NA
 30859 30860 PH0995 PH0996     TRUE 0.978 -3.000 1.000 1.000   NA
 30861 30862 PH0997 PH0999     FALSE 0.209 42.000 0.004 1.000 N NA
 30863 30864 PH1000 PH1001     FALSE 0.018 -91.000 0.011 NA   NA
 30865 403094 PH1002 PHtRNA20   tRNA-Tyr FALSE 0.018 -102.000 0.000 NA   NA
 403094 30866 PHtRNA20 PH1003 tRNA-Tyr   FALSE 0.000 953.000 0.000 NA   NA
 30866 30867 PH1003 PH1004     FALSE 0.408 52.000 0.167 NA   NA
 30868 30869 PH1006 PH1008     TRUE 0.718 11.000 0.003 0.082 N NA
 30869 30870 PH1008 PH1009     FALSE 0.100 82.000 0.003 1.000 N NA
 30873 30874 PH1012 PH1013     TRUE 0.922 5.000 0.250 1.000 N NA
 30874 30875 PH1013 PH1014     TRUE 0.881 -7.000 0.119 1.000 N NA
 30877 30878 PH1016 PH1017     FALSE 0.514 -39.000 0.080 NA   NA
 1744107 30880 PH1017.1n PH1019     FALSE 0.522 33.000 0.076 1.000 N NA
 30880 30881 PH1019 PH1020     FALSE 0.058 137.000 0.013 1.000 N NA
 30881 30882 PH1020 PH1022     FALSE 0.556 66.000 0.020 1.000 Y NA
 30883 30884 PH1023 PH1024     FALSE 0.054 2.000 0.000 NA   NA
 30884 30885 PH1024 PH1025     FALSE 0.054 2.000 0.000 NA   NA
 30886 30887 PH1026 PH1028     FALSE 0.594 -3.000 0.026 1.000   NA
 30887 1744109 PH1028 PH1028.2n     FALSE 0.000 324.000 0.000 NA   NA
 1744109 30888 PH1028.2n PH1029     FALSE 0.000 2515.000 0.000 NA   NA
 30889 30890 PH1030 PH1031     FALSE 0.000 1346.000 0.000 NA   NA
 30894 30895 PH1034 PH1035     TRUE 0.876 5.000 0.200 NA N NA
 30895 30896 PH1035 PH1036     TRUE 0.932 4.000 0.267 1.000 N NA
 30896 30897 PH1036 PH1038     TRUE 0.979 5.000 0.136 0.024 Y NA
 30897 30898 PH1038 PH1039     TRUE 0.965 11.000 0.125 0.024 Y NA
 30899 30900 PH1040 PH1041     FALSE 0.001 221.000 0.000 NA   NA
 30901 30902 PH1043 PH1044     FALSE 0.098 14.000 0.000 1.000   NA
 30902 1744110 PH1044 PH1044.1n     FALSE 0.022 -43.000 0.000 NA   NA
 1744110 30903 PH1044.1n PH1045     FALSE 0.001 149.000 0.000 NA   NA
 30903 30904 PH1045 PH1046     FALSE 0.162 -64.000 0.000 NA N NA
 30904 30905 PH1046 PH1047     FALSE 0.009 38.000 0.000 NA   NA
 30905 30906 PH1047 PH1048     FALSE 0.027 11.000 0.000 NA   NA
 30906 30907 PH1048 PH1049     FALSE 0.225 4.000 0.000 1.000   NA
 30907 1744111 PH1049 PH1050     FALSE 0.054 -3.000 0.000 NA   NA
 30913 30914 PH1055 PH1056     FALSE 0.010 32.000 0.000 NA   NA
 30917 30918 PH1059 PH1060     FALSE 0.000 554.000 0.000 NA   NA
 30918 30919 PH1060 PH1061     FALSE 0.118 40.000 0.014 1.000   NA
 30919 30920 PH1061 PH1062     TRUE 0.894 0.000 0.286 NA   NA
 30921 30922 PHS031 PHS031a     FALSE 0.491 83.000 0.500 NA   NA
 30922 30923 PHS031a PH1063     FALSE 0.024 -37.000 0.000 NA   NA
 30924 30925 PH1064 PH1065     FALSE 0.314 69.000 0.000 0.067 N NA
 30925 30926 PH1065 PH1067     FALSE 0.015 130.000 0.004 1.000   NA
 30926 30927 PH1067 PH1069     FALSE 0.272 43.000 0.080 NA   NA
 30928 30929 PH1070 PH1071     FALSE 0.046 66.000 0.026 NA   NA
 30929 30930 PH1071 PH1072     FALSE 0.564 58.000 0.258 1.000   NA
 30930 30931 PH1072 PH1074     FALSE 0.016 262.000 0.000 1.000 N NA
 30935 30936 PH1078 PH1079     FALSE 0.591 25.000 0.154 1.000   NA
 1744113 30937 PH1079.1n PH1080     TRUE 0.951 2.000 0.600 NA   NA
 30937 30938 PH1080 PH1081     FALSE 0.008 55.000 0.000 NA   NA
 30940 30941 PH1083 PH1085     FALSE 0.296 93.000 0.000 1.000 Y NA
 30942 30943 PH1086 PH1087     TRUE 0.982 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 30943 30944 PH1087 PH1088     TRUE 0.912 -3.000 0.009 1.000 Y NA
 30945 30946 PH1089 PH1090     TRUE 0.978 3.000 0.039 0.001 Y NA
 30946 30947 PH1090 PH1091     TRUE 0.910 2.000 0.007 1.000 Y NA
 30947 30948 PH1091 PH1093     TRUE 0.965 -3.000 0.125 1.000 Y NA
 30948 30949 PH1093 PH1095     FALSE 0.006 1080.000 0.000 1.000 N NA
 30951 30952 PH1098 PH1099     FALSE 0.023 12.000 0.000 NA   NA
 30952 30953 PH1099 PH1100     TRUE 0.843 12.000 0.429 NA   NA
 30953 30954 PH1100 PH1101     FALSE 0.036 -16.000 0.000 NA   NA
 30954 30955 PH1101 PH1102     FALSE 0.047 39.000 0.000 1.000   NA
 30955 30956 PH1102 PH1103     FALSE 0.066 122.000 0.012 1.000 N NA
 30956 30957 PH1103 PH1104     FALSE 0.013 24.000 0.000 NA   NA
 30957 30958 PH1104 PH1105     FALSE 0.522 -40.000 0.082 NA   NA
 1744114 30960 PH1105.1n PH1106a   thiS FALSE 0.016 96.000 0.023 NA   NA
 30961 30962 PH1107 PH1108     TRUE 0.890 -3.000 0.286 NA   NA
 30962 30963 PH1108 PH1109     FALSE 0.032 10.000 0.004 NA   NA
 30964 30965 PH1110 PH1112     FALSE 0.002 125.000 0.012 NA   NA
 30965 30966 PH1112 PH1113     FALSE 0.329 3.000 0.028 NA   NA
 30968 30969 PH1115 PH1116     FALSE 0.494 -3.000 0.038 NA   NA
 30969 30970 PH1116 PH1117     FALSE 0.188 43.000 0.000 1.000 N NA
 30971 30972 PH1118 PH1119     FALSE 0.054 2.000 0.000 NA   NA
 30973 30974 PH1120 PH1122     TRUE 0.683 71.000 0.600 1.000   NA
 1744115 30978 PH1126.1n PH1127     FALSE 0.013 99.000 0.021 NA   NA
 30978 1744116 PH1127 PHS032     TRUE 0.935 7.000 0.479 1.000   NA
 30980 30981 PH1128 PH1129     FALSE 0.006 67.000 0.000 NA   NA
 30981 30982 PH1129 PH1130     TRUE 0.652 20.000 0.250 NA   NA
 30982 1744117 PH1130 PH1130.1n     FALSE 0.045 41.000 0.000 1.000   NA
 1744117 30983 PH1130.1n PH1131     FALSE 0.057 30.000 0.000 1.000   NA
 30984 30985 PH1132 PH1134     FALSE 0.163 27.000 0.015 1.000   NA
 30985 1744118 PH1134 PH1135     FALSE 0.159 -28.000 0.023 NA   NA
 30988 30989 PH1137 PH1138     FALSE 0.410 41.000 0.048 1.000 N NA
 30990 30991 PH1139 PH1140     TRUE 0.678 -3.000 0.067 NA   NA
 30991 30992 PH1140 PH1141     FALSE 0.018 -88.000 0.000 NA   NA
 30992 30993 PH1141 PH1142     FALSE 0.008 51.000 0.000 NA   NA
 30995 30996 PH1144 PH1145     TRUE 0.961 -3.000 0.750 NA   NA
 30996 30997 PH1145 PH1146     FALSE 0.009 47.000 0.011 NA   NA
 30998 30999 PH1147 PH1148     FALSE 0.002 100.000 0.000 NA   NA
 31001 31002 PH1150 PH1151     FALSE 0.367 2.000 0.005 1.000   NA
 31002 31003 PH1151 PH1152     FALSE 0.026 -31.000 0.014 NA   NA
 1744119 1744120 PH1152.1n PH1152.2n     FALSE 0.115 175.000 0.250 NA   NA
 31005 31006 PH1155 PH1156   thiE TRUE 0.961 -3.000 0.000 0.005 Y NA
 31006 31007 PH1156 PH1157 thiE   TRUE 0.982 -10.000 0.146 0.005 Y NA
 31009 1744121 PH1159 PH1160     TRUE 0.761 1.000 0.049 NA N NA
 1744121 31011 PH1160 PH1161     TRUE 0.832 -49.000 0.050 NA Y NA
 31013 31014 PH1163 PH1164     FALSE 0.183 41.000 0.028 1.000   NA
 31014 31015 PH1164 PH1166     FALSE 0.071 23.000 0.000 1.000   NA
 31017 31018 PH1168 PH1169     FALSE 0.004 82.000 0.000 NA   NA
 31020 31021 PH1171 PH1172     FALSE 0.001 159.000 0.000 NA   NA
 31022 31023 PH1173 PH1174     FALSE 0.054 -3.000 0.000 NA   NA
 31023 1744122 PH1174 PH1174.1n     FALSE 0.000 298.000 0.000 NA   NA
 1744122 31024 PH1174.1n PH1175     FALSE 0.001 180.000 0.000 NA   NA
 31024 1744123 PH1175 PH1175.2n     FALSE 0.001 173.000 0.000 NA   NA
 1744123 31025 PH1175.2n PH1177     FALSE 0.031 -22.000 0.000 NA   NA
 31025 31026 PH1177 PH1178     FALSE 0.046 -7.000 0.000 NA   NA
 31026 31027 PH1178 PH1179     FALSE 0.000 503.000 0.000 NA   NA
 31028 31029 PH1180 PH1181     FALSE 0.577 22.000 0.200 NA   NA
 31030 31031 PH1182 PH1183     TRUE 0.913 15.000 1.000 NA   NA
 31031 31032 PH1183 PH1184     FALSE 0.001 141.000 0.000 NA   NA
 1744124 31034 PH1185.1n PH1186     FALSE 0.039 7.000 0.000 NA   NA
 31036 31037 PH1188 PH1189     FALSE 0.007 158.000 0.000 1.000   NA
 31037 31038 PH1189 PH1190     FALSE 0.054 -3.000 0.000 NA   NA
 31038 31039 PH1190 PH1191     TRUE 0.815 7.000 0.222 NA   NA
 31039 31040 PH1191 PH1192     TRUE 0.803 12.000 0.333 NA   NA
 31040 1744125 PH1192 PH1192.1n     TRUE 0.971 -3.000 1.000 NA   NA
 1744125 31041 PH1192.1n PH1193     TRUE 0.963 -10.000 1.000 NA   NA
 31041 31042 PH1193 PH1194     TRUE 0.932 12.000 1.000 NA   NA
 31042 31043 PH1194 PH1196     TRUE 0.880 14.000 0.667 NA   NA
 31043 31044 PH1196 PH1198     TRUE 0.847 4.000 0.222 NA   NA
 31044 31045 PH1198 PH1199     TRUE 0.943 4.000 0.556 NA   NA
 31045 1744126 PH1199 PH1199.1n     FALSE 0.001 255.000 0.000 NA   NA
 1744126 31046 PH1199.1n PH1200     FALSE 0.003 89.000 0.000 NA   NA
 31047 31048 PH1201 PH1202     FALSE 0.000 301.000 0.000 NA   NA
 31048 31049 PH1202 PH1204     FALSE 0.003 83.000 0.005 NA   NA
 1744127 31050 PH1204.1n PH1205     FALSE 0.225 4.000 0.000 1.000   NA
 31050 1744128 PH1205 PH1205.1n     TRUE 0.991 2.000 0.667 1.000 Y NA
 31053 31054 PH1209 PH1210     TRUE 0.661 -3.000 0.035 1.000   NA
 1744129 31055 PH1210.1n PH1212     TRUE 0.872 -15.000 0.333 NA   NA
 31055 1744130 PH1212 PH1212.1n     FALSE 0.202 -40.000 0.030 NA   NA
 1744130 31056 PH1212.1n PH1213     TRUE 0.792 -3.000 0.119 NA   NA
 31057 31058 PH1214 PH1215     TRUE 0.860 16.000 0.000 0.022 Y NA
 31058 31059 PH1215 PH1216     TRUE 0.954 -3.000 0.000 0.022 Y NA
 31059 31060 PH1216 PH1217     FALSE 0.046 128.000 0.000 1.000 N NA
 31060 31061 PH1217 PH1218     FALSE 0.086 83.000 0.000 1.000 N NA
 31061 31062 PH1218 PH1219     FALSE 0.628 -3.000 0.002 1.000 N NA
 31063 31064 PH1221 PH1222     FALSE 0.075 89.000 0.000 1.000 N NA
 31066 31067 PH1224 PH1225     FALSE 0.244 -3.000 0.000 1.000   NA
 31067 31068 PH1225 PH1226     TRUE 0.666 -57.000 0.200 NA   NA
 31069 1744131 PH1227 PH1227.1n     TRUE 0.739 42.000 0.600 NA   NA
 1744131 31070 PH1227.1n PH1228     FALSE 0.009 50.000 0.000 NA   NA
 31070 31071 PH1228 PH1229     TRUE 0.931 -3.000 0.333 1.000   NA
 31071 31072 PH1229 PH1230     FALSE 0.589 21.000 0.111 1.000   NA
 31072 31073 PH1230 PH1231     TRUE 0.965 0.000 0.800 NA   NA
 31075 31076 PH1233 PH1234     FALSE 0.054 -3.000 0.006 NA   NA
 31077 31078 PH1235 PH1236     TRUE 0.971 -3.000 0.198 1.000 Y NA
 31078 31079 PH1236 PH1237     TRUE 0.972 7.000 0.302 1.000 Y NA
 31079 31080 PH1237 PH1238     TRUE 0.908 -3.000 0.147 1.000 N NA
 31080 31081 PH1238 PH1239     FALSE 0.486 74.000 0.214 1.000 N NA
 31081 31082 PH1239 PH1240     FALSE 0.071 60.000 0.030 NA   NA
 31082 31083 PH1240 PH1241     FALSE 0.271 10.000 0.030 NA   NA
 31084 31085 PH1242 PH1243     FALSE 0.009 35.000 0.000 NA   NA
 31085 31086 PH1243 PH1244     FALSE 0.054 -3.000 0.000 NA   NA
 31086 1744132 PH1244 PH1244.1n     FALSE 0.001 1670.000 0.000 1.000   NA
 31087 31088 PH1245 PHS033     TRUE 0.920 5.000 0.455 NA   NA
 31088 1744133 PHS033 PHS033.1n     FALSE 0.001 148.000 0.000 NA   NA
 1744133 31089 PHS033.1n PH1246     FALSE 0.019 14.000 0.000 NA   NA
 31089 1744134 PH1246 PH1249     TRUE 0.888 -12.000 0.350 NA   NA
 1744134 31091 PH1249 PH1250     TRUE 0.948 -67.000 0.423 NA Y NA
 31091 31092 PH1250 PH1251     TRUE 0.894 -3.000 0.295 NA   NA
 31092 31093 PH1251 PH1252     FALSE 0.031 236.000 0.083 NA   NA
 31093 31094 PH1252 PH1253     FALSE 0.314 70.000 0.088 NA N NA
 31096 31097 PH1255 PH1256     FALSE 0.610 -7.000 0.005 1.000 N NA
 31097 31098 PH1256 PHS034     FALSE 0.047 45.000 0.000 1.000   NA
 31098 31099 PHS034 PH1257     FALSE 0.047 48.000 0.000 1.000   NA
 31099 31100 PH1257 PH1259     FALSE 0.486 -9.000 0.019 1.000   NA
 31100 31101 PH1259 PH1260     TRUE 0.813 7.000 0.071 1.000 N NA
 31101 31102 PH1260 PH1262     TRUE 0.749 24.000 0.231 1.000 N NA
 31103 1744136 PH1263 PH1263.1n     FALSE 0.001 214.000 0.000 NA   NA
 31105 31106 PHS035 PH1265     TRUE 0.906 4.000 0.168 1.000 N NA
 31106 31107 PH1265 PH1265a   rpl14E TRUE 0.889 1.000 0.095 1.000 N NA
 31107 31108 PH1265a PH1267 rpl14E   FALSE 0.272 46.000 0.015 1.000 N NA
 31108 31109 PH1267 PH1269     FALSE 0.567 -12.000 0.057 NA   NA
 403120 403119 PHtRNA23 PHtRNA24 tRNA-Ile tRNA-Glu FALSE 0.049 4.000 0.000 NA   NA
 31111 31112 PH1271 PH1273     FALSE 0.052 3.000 0.000 NA   NA
 31114 31115 PH1275 PH1277     TRUE 0.988 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 31115 31116 PH1277 PH1278     FALSE 0.194 46.000 0.000 1.000 N NA
 1744138 31120 PH1282.1n PH1283     FALSE 0.344 64.000 0.167 NA   NA
 31120 31121 PH1283 PH1284     TRUE 0.922 7.000 0.292 1.000 N NA
 31121 31122 PH1284 PH1285     TRUE 0.943 -3.000 0.292 1.000 N NA
 31122 31123 PH1285 PH1287     TRUE 0.968 10.000 0.333 0.003 N NA
 31123 31124 PH1287 PH1288     FALSE 0.024 187.000 0.000 1.000 N NA
 31125 31126 PH1290 PH1291     TRUE 0.988 -3.000 1.000 0.028   NA
 31126 31127 PH1291 PH1292     TRUE 0.993 2.000 0.875 1.000 Y NA
 31127 31128 PH1292 PH1294     TRUE 0.992 -3.000 0.778 1.000 Y NA
 31128 31129 PH1294 PHS036     FALSE 0.515 33.000 0.222 NA   NA
 1744141 31131 PH1295.3n PH1297     FALSE 0.522 37.000 0.167 1.000   NA
 31132 31133 PH1298 PH1299     FALSE 0.001 147.000 0.000 NA   NA
 31133 31134 PH1299 PH1300     FALSE 0.003 84.000 0.000 NA   NA
 31134 1744143 PH1300 PH1300.1n     FALSE 0.019 -85.000 0.000 NA   NA
 1744143 31135 PH1300.1n PH1301     FALSE 0.000 543.000 0.000 NA   NA
 31135 31136 PH1301 PH1302     TRUE 0.942 2.000 0.500 NA   NA
 31136 31137 PH1302 PH1303     FALSE 0.006 64.000 0.000 NA   NA
 31138 31139 PH1304 PH1305     TRUE 0.799 5.000 0.000 0.006   NA
 31139 1744144 PH1305 PHrRNA03     FALSE 0.011 27.000 0.000 NA   NA
 1744144 31140 PHrRNA03 PH1306     FALSE 0.003 89.000 0.000 NA   NA
 31144 31145 PH1309 PH1310     FALSE 0.250 49.000 0.038 1.000   NA
 31145 403117 PH1310 PHtRNA26   tRNA-Lys FALSE 0.013 23.000 0.000 NA   NA
 403117 31146 PHtRNA26 PH1311 tRNA-Lys   FALSE 0.006 66.000 0.000 NA   NA
 31147 31148 PHS038 PH1312     TRUE 0.832 7.000 0.250 NA   NA
 31150 31151 PH1314 PH1315     FALSE 0.009 45.000 0.000 NA   NA
 31155 31156 PH1318 PH1319     FALSE 0.449 61.000 0.250 NA   NA
 31157 31158 PH1320 PH1321     FALSE 0.016 17.000 0.012 NA   NA
 403116 403115 PHtRNA27 PHtRNA28 tRNA-Cys tRNA-Ser FALSE 0.019 14.000 0.000 NA   NA
 403115 403114 PHtRNA28 PHtRNA29 tRNA-Ser tRNA-Thr FALSE 0.009 45.000 0.000 NA   NA
 31160 31161 PH1323 PH1325     TRUE 0.925 4.000 0.056 NA Y NA
 31161 1744146 PH1325 PH1325.1n     FALSE 0.010 31.000 0.012 NA   NA
 1744146 31162 PH1325.1n PH1326     FALSE 0.207 -3.000 0.019 NA   NA
 31163 31164 PH1327 PH1328     TRUE 0.809 -3.000 0.082 1.000   NA
 31165 31166 PH1329 PH1333     FALSE 0.251 62.000 0.053 1.000   NA
 31166 31167 PH1333 PH1334     FALSE 0.566 68.000 0.333 1.000   NA
 31167 31168 PH1334 PH1335     TRUE 0.791 13.000 0.267 1.000   NA
 31168 31169 PH1335 PH1337     TRUE 0.931 -10.000 0.533 NA   NA
 31169 31170 PH1337 PH1338     TRUE 0.872 27.000 1.000 NA   NA
 31170 31171 PH1338 PH1339     TRUE 0.966 -7.000 1.000 NA   NA
 31171 1744147 PH1339 PH1340     TRUE 0.961 -7.000 0.875 NA   NA
 1744147 31173 PH1340 PH1341     TRUE 0.956 -3.000 0.667 NA   NA
 31173 31174 PH1341 PH1342     TRUE 0.963 -3.000 0.778 NA   NA
 31174 31175 PH1342 PH1343     TRUE 0.969 0.000 0.889 NA   NA
 31175 31176 PH1343 PH1344     TRUE 0.940 8.000 0.727 NA   NA
 1744148 31177 PH1344.1n PH1345     FALSE 0.031 -22.000 0.000 NA   NA
 31177 31178 PH1345 PH1346     FALSE 0.022 78.000 0.000 1.000   NA
 31178 31179 PH1346 PH1347     TRUE 0.961 8.000 0.019 0.001 Y NA
 31179 31180 PH1347 PH1348     TRUE 0.763 1.000 0.004 0.061   NA
 31182 31183 PH1350 PH1352     TRUE 0.917 -6.000 0.045 0.021 N NA
 31183 31184 PH1352 PH1353     FALSE 0.241 -106.000 0.017 1.000   NA
 31184 31185 PH1353 PH1354     FALSE 0.006 67.000 0.000 NA   NA
 31185 31186 PH1354 PH1355     FALSE 0.551 29.000 0.000 NA Y NA
 31186 1744149 PH1355 PH1355.1n     FALSE 0.006 65.000 0.000 NA   NA
 1744149 31188 PH1355.1n PH1357     FALSE 0.013 24.000 0.000 NA   NA
 31188 1744150 PH1357 PH1358     FALSE 0.009 36.000 0.012 NA   NA
 1744150 31190 PH1358 PH1359     FALSE 0.013 23.000 0.000 NA   NA
 31190 1744151 PH1359 PH1359.1n     TRUE 0.684 -3.000 0.069 NA   NA
 1744151 1744152 PH1359.1n PH1359.2n     TRUE 0.839 3.000 0.200 NA   NA
 1744152 31191 PH1359.2n PH1360     FALSE 0.013 23.000 0.000 NA   NA
 1744153 31192 PH1360.1n PH1361     TRUE 0.971 -3.000 1.000 NA   NA
 31192 31193 PH1361 PH1363     TRUE 0.711 79.000 0.625 1.000 N NA
 31193 31194 PH1363 PH1364     TRUE 0.992 5.000 0.875 0.001 N NA
 31194 31195 PH1364 PH1365     FALSE 0.344 96.000 0.375 NA   NA
 31195 31196 PH1365 PH1366     TRUE 0.852 5.000 0.250 NA   NA
 31196 31197 PH1366 PH1368     TRUE 0.800 -7.000 0.091 1.000   NA
 31197 31198 PH1368 PH1369     TRUE 0.782 2.000 0.109 NA   NA
 31200 1744154 PH1372 PH1372.1n     TRUE 0.642 2.000 0.057 NA   NA
 1744154 31201 PH1372.1n PH1373     FALSE 0.379 44.000 0.133 NA   NA
 31202 31203 PH1374 PH1375     FALSE 0.205 14.000 0.005 NA N NA
 31203 31204 PH1375 PH1376     FALSE 0.049 4.000 0.012 NA   NA
 31204 31205 PH1376 PH1377     FALSE 0.513 39.000 0.250 NA   NA
 31205 31206 PH1377 PH1378     TRUE 0.932 3.000 0.467 NA   NA
 31207 1744155 PH1379 PH1380     FALSE 0.524 51.000 0.261 NA   NA
 1744155 31209 PH1380 PH1381     FALSE 0.009 50.000 0.007 NA   NA
 31210 31211 PH1382 PH1383     TRUE 0.868 -21.000 0.364 NA   NA
 31212 31213 PH1384 PH1385     TRUE 0.984 -7.000 0.466 1.000 Y NA
 31213 31214 PH1385 PH1386     FALSE 0.063 52.000 0.003 1.000   NA
 31215 31216 PH1387 PH1389     TRUE 0.809 -3.000 0.073 NA N NA
 31216 31217 PH1389 PH1390     FALSE 0.641 -3.000 0.027 NA N NA
 31218 31219 PH1391 PH1392     FALSE 0.352 -82.000 0.053 NA   NA
 31219 31220 PH1392 PH1394     FALSE 0.086 175.000 0.182 NA   NA
 31220 31221 PH1394 PH1395     FALSE 0.113 171.000 0.000 0.001   NA
 31221 1744156 PH1395 PH1395.1n     TRUE 0.668 45.000 0.429 NA   NA
 31223 31224 PH1399 PH1400     FALSE 0.267 24.000 0.053 NA   NA
 31224 31225 PH1400 PH1401     FALSE 0.533 10.000 0.061 NA   NA
 31225 31226 PH1401 PH1402     FALSE 0.111 82.000 0.061 NA   NA
 31226 31227 PH1402 PH1404     TRUE 0.710 8.000 0.073 1.000   NA
 31227 31228 PH1404 PH1406     TRUE 0.682 5.000 0.045 1.000   NA
 31228 31229 PH1406 PH1408     FALSE 0.468 11.000 0.003 1.000 N NA
 31229 31230 PH1408 PH1409     FALSE 0.017 251.000 0.000 1.000 N NA
 31230 31231 PH1409 PH1410     TRUE 0.771 118.000 0.308 0.021 Y NA
 31231 31232 PH1410 PH1411     TRUE 0.976 12.000 0.302 0.021 Y NA
 31232 31233 PH1411 PH1412     TRUE 0.970 -16.000 0.302 1.000 Y NA
 31233 31234 PH1412 PH1413     TRUE 0.991 2.000 0.267 0.003 Y NA
 31234 31235 PH1413 PH1414     TRUE 0.732 27.000 0.333 1.000   NA
 31235 31236 PH1414 PH1415     FALSE 0.075 94.000 0.032 1.000   NA
 31237 31238 PH1416 PH1418     TRUE 0.895 7.000 0.375 NA   NA
 31238 31239 PH1418 PH1419     TRUE 0.915 -46.000 0.833 NA   NA
 31239 31240 PH1419 PH1420     TRUE 0.860 -9.000 0.273 NA   NA
 31241 31242 PH1421 PH1422     FALSE 0.021 -55.000 0.000 NA   NA
 31242 1744157 PH1422 PH1422.1n     TRUE 0.894 -7.000 0.333 NA   NA
 31243 31244 PH1423 PH1426     FALSE 0.223 97.000 0.081 1.000 N NA
 31245 31246 PH1427 PH1427a   mnhF TRUE 0.997 -3.000 1.000 0.022 Y NA
 31246 31247 PH1427a PH1428 mnhF   TRUE 0.989 -3.000 0.533 1.000 Y NA
 31247 31248 PH1428 PHS039     TRUE 0.986 -7.000 0.667 NA Y NA
 31248 1744158 PHS039 PHS039.1n     TRUE 0.959 -3.000 0.700 NA   NA
 1744158 31249 PHS039.1n PH1429     TRUE 0.936 -7.000 0.529 NA   NA
 31249 31250 PH1429 PH1430     TRUE 0.977 -12.000 0.471 NA Y NA
 31250 31251 PH1430 PH1431     TRUE 0.997 -3.000 0.889 0.007 Y NA
 31251 31252 PH1431 PH1433     TRUE 0.966 -7.000 1.000 NA   NA
 31252 31253 PH1433 PH1434     TRUE 0.885 5.000 0.320 NA   NA
 31253 31254 PH1434 PH1435     TRUE 0.992 -3.000 0.320 0.003 Y NA
 31254 31255 PH1435 PH1437     TRUE 0.997 -3.000 1.000 0.007 Y NA
 31255 31256 PH1437 PH1439     TRUE 0.997 5.000 1.000 0.007 Y NA
 31256 31257 PH1439 PH1440     TRUE 0.984 -3.000 0.111 0.007 Y NA
 31257 31258 PH1440 PH1441     FALSE 0.169 89.000 0.037 1.000 N NA
 31259 31260 PH1442 PH1443     FALSE 0.046 -7.000 0.000 NA   NA
 31262 31263 PH1446 PH1447     TRUE 0.993 -3.000 0.360 0.007 Y NA
 31263 31264 PH1447 PH1448     TRUE 0.994 2.000 0.447 0.007 Y NA
 31264 31265 PH1448 PH1449     TRUE 0.995 -3.000 0.468 0.003 Y NA
 31265 31266 PH1449 PH1450     TRUE 0.996 2.000 0.667 0.007 Y NA
 31266 31267 PH1450 PH1451     TRUE 0.994 4.000 0.531 0.007 Y NA
 31267 31268 PH1451 PH1452     TRUE 0.989 -3.000 0.162 0.001 Y NA
 31268 31269 PH1452 PH1453     TRUE 0.982 -3.000 0.086 0.007 Y NA
 31269 31270 PH1453 PH1454     TRUE 0.972 -3.000 0.273 NA Y NA
 31270 1744159 PH1454 PH1454.1n     TRUE 0.963 -15.000 0.303 NA Y NA
 1744159 31271 PH1454.1n PH1455     TRUE 0.978 -3.000 0.345 NA Y NA
 31271 1744160 PH1455 PH1455.1n     TRUE 0.980 -3.000 0.310 1.000 Y NA
 1744160 31272 PH1455.1n PH1456     TRUE 0.992 -3.000 0.409 0.022 Y NA
 31272 31273 PH1456 PH1457     FALSE 0.003 83.000 0.000 NA   NA
 31274 1744161 PH1458 PH1458.1n     TRUE 0.951 -3.000 0.175 0.007   NA
 31275 31276 PH1459 PH1461     FALSE 0.056 0.000 0.000 NA   NA
 31277 31278 PH1462 PH1463     FALSE 0.248 41.000 0.012 1.000 N NA
 31278 31279 PH1463 PH1464     TRUE 0.993 -3.000 0.301 0.001 Y NA
 31279 31280 PH1464 PH1465     TRUE 0.696 -3.000 0.013 1.000 N NA
 31280 31281 PH1465 PH1467     FALSE 0.312 -3.000 0.026 NA   NA
 31283 31284 PH1469 PH1470     FALSE 0.049 4.000 0.000 NA   NA
 1744162 31286 PH1471 PH1472     FALSE 0.593 10.000 0.017 1.000 N NA
 31286 31287 PH1472 PH1473     TRUE 0.671 -3.000 0.064 NA   NA
 31287 31288 PH1473 PH1474     TRUE 0.774 5.000 0.136 NA   NA
 403097 31289 PHtRNA30 PH1475 tRNA-Met   FALSE 0.008 43.000 0.000 NA   NA
 31289 31290 PH1475 PH1477     FALSE 0.638 14.000 0.194 NA   NA
 31291 31292 PH1478 PH1479     FALSE 0.160 12.000 0.003 1.000   NA
 31292 31293 PH1479 PH1481     FALSE 0.389 10.000 0.018 1.000   NA
 403113 31295 PHtRNA31 PH1483 tRNA-Ser   FALSE 0.008 43.000 0.000 NA   NA
 31295 31296 PH1483 PH1484     TRUE 0.725 37.000 0.047 1.000 Y NA
 31297 31298 PH1486 PH1487     FALSE 0.001 183.000 0.000 NA   NA
 31298 31299 PH1487 PH1488     FALSE 0.004 80.000 0.000 NA   NA
 403098 403099 PHtRNA32 PHtRNA33 tRNA-Asn tRNA-Met FALSE 0.032 10.000 0.000 NA   NA
 31300 31301 PH1489 PH1490     FALSE 0.408 -34.000 0.000 1.000 N NA
 31303 31304 PH1492 PH1493     FALSE 0.054 -3.000 0.000 NA   NA
 31304 31305 PH1493 PH1494     FALSE 0.025 -34.000 0.000 NA   NA
 31305 31306 PH1494 PH1495     FALSE 0.021 -49.000 0.000 NA   NA
 31306 31307 PH1495 PH1495a     FALSE 0.001 240.000 0.000 NA   NA
 31307 31308 PH1495a PHS040     TRUE 0.995 6.000 0.761 0.019 Y NA
 31308 31309 PHS040 PH1496     TRUE 0.968 48.000 0.602 0.019 Y NA
 31311 1744164 PH1498 PH1498.1n     FALSE 0.342 -31.000 0.018 1.000   NA
 31312 31313 PH1501 PH1502     FALSE 0.048 120.000 0.000 1.000 N NA
 31313 31314 PH1502 PH1503     FALSE 0.442 -3.000 0.034 NA   NA
 31314 31315 PH1503 PH1505     FALSE 0.578 54.000 0.333 NA   NA
 31315 31316 PH1505 PH1506     TRUE 0.874 2.000 0.250 NA   NA
 31316 31317 PH1506 PH1507     FALSE 0.009 49.000 0.000 NA   NA
 31317 31318 PH1507 PH1509     FALSE 0.026 308.000 0.000 0.028   NA
 31318 31319 PH1509 PH1510     FALSE 0.093 92.000 0.038 1.000   NA
 31319 31320 PH1510 PH1511     TRUE 0.955 -3.000 0.077 1.000 Y NA
 31321 31322 PH1512 PH1513     FALSE 0.055 -22.000 0.017 NA   NA
 31322 31323 PH1513 PH1514     TRUE 0.900 -16.000 0.455 NA   NA
 31323 31324 PH1514 PH1515     TRUE 0.812 0.000 0.139 NA   NA
 31325 31326 PH1516 PH1517     FALSE 0.098 94.000 0.014 1.000 N NA
 31327 31328 PHS041 PHS042     TRUE 0.912 12.000 0.439 1.000 N NA
 31329 31330 PH1519 PH1520     FALSE 0.555 57.000 0.250 1.000   NA
 31333 31334 PH1523 PH1524     FALSE 0.000 620.000 0.000 NA   NA
 31334 403112 PH1524 PHtRNA34   tRNA-Leu FALSE 0.020 13.000 0.000 NA   NA
 403112 1744165 PHtRNA34 PH1526 tRNA-Leu   FALSE 0.009 35.000 0.000 NA   NA
 1744165 31336 PH1526 PH1527     TRUE 0.854 -28.000 0.375 NA   NA
 31337 31338 PH1528 PH1529     FALSE 0.209 -87.000 0.035 NA   NA
 31338 31339 PH1529 PH1530     FALSE 0.515 -3.000 0.017 1.000   NA
 31340 31341 PH1531 PH1532     TRUE 0.994 -7.000 0.742 0.059 Y NA
 31341 31342 PH1532 PH1533     FALSE 0.476 50.000 0.217 NA   NA
 31345 31346 PH1536 PH1537     FALSE 0.399 10.000 0.041 NA   NA
 31346 1744166 PH1537 PH1537.1n     FALSE 0.389 -3.000 0.030 NA   NA
 31347 31348 PH1538 PH1539     TRUE 0.663 11.000 0.078 1.000   NA
 31348 31349 PH1539 PH1540     FALSE 0.429 1.000 0.010 1.000   NA
 31349 1744167 PH1540 PH1540.1n     TRUE 0.790 -15.000 0.000 0.003   NA
 1744167 31350 PH1540.1n PH1541     FALSE 0.042 54.000 0.000 1.000   NA
 31350 31351 PH1541 PH1542     TRUE 0.994 -3.000 0.410 0.003 Y NA
 31351 31352 PH1542 PH1543     TRUE 0.843 2.000 0.057 1.000 N NA
 31352 31353 PH1543 PHS043     TRUE 0.790 9.000 0.068 1.000 N NA
 31353 31354 PHS043 PH1544     FALSE 0.604 4.000 0.030 1.000   NA
 31354 31355 PH1544 PH1545     TRUE 0.844 12.000 0.075 0.004   NA
 31355 31356 PH1545 PH1546     TRUE 0.981 4.000 0.086 0.004 Y NA
 31356 31357 PH1546 PHS044     TRUE 0.942 18.000 0.083 0.004 Y NA
 31357 403111 PHS044 PHtRNA35   tRNA-Thr FALSE 0.002 115.000 0.000 NA   NA
 403111 31358 PHtRNA35 PH1547 tRNA-Thr   FALSE 0.008 54.000 0.000 NA   NA
 31358 403110 PH1547 PHtRNA36   tRNA-Pro FALSE 0.007 59.000 0.000 NA   NA
 403110 403109 PHtRNA36 PHtRNA37 tRNA-Pro tRNA-Thr FALSE 0.052 3.000 0.000 NA   NA
 403109 31359 PHtRNA37 PH1548 tRNA-Thr   FALSE 0.005 72.000 0.000 NA   NA
 31359 31360 PH1548 PH1549     TRUE 0.986 -7.000 0.143 0.001 Y NA
 31360 31361 PH1549 PH1551     TRUE 0.980 -25.000 0.266 0.014 Y NA
 31361 31362 PH1551 PH1552     TRUE 0.978 -3.000 0.335 NA Y NA
 31362 31363 PH1552 PH1553     TRUE 0.696 28.000 0.274 NA N NA
 31365 31366 PH1555 PH1556     FALSE 0.003 88.000 0.000 NA   NA
 31367 31368 PH1557 PH1558     TRUE 0.818 2.000 0.150 NA   NA
 31369 31370 PH1559 PH1560     FALSE 0.073 161.000 0.120 NA   NA
 31370 31371 PH1560 PH1562     TRUE 0.942 -3.000 0.500 NA   NA
 31371 31372 PH1562 PH1563     FALSE 0.433 7.000 0.039 NA   NA
 31372 31373 PH1563 PH1564     TRUE 0.645 218.000 0.328 0.001 Y NA
 31373 31374 PH1564 PH1566     TRUE 0.723 10.000 0.086 1.000   NA
 31374 31375 PH1566 PH1567     TRUE 0.893 -27.000 0.387 1.000   NA
 31375 31376 PH1567 PH1568     TRUE 0.825 7.000 0.080 1.000 N NA
 31377 31378 PH1569 PH1570     TRUE 0.970 3.000 1.000 NA   NA
 31378 31379 PH1570 PH1571     TRUE 0.968 -6.000 1.000 NA   NA
 31383 31384 PH1578 PH1579     FALSE 0.127 60.000 0.014 NA N NA
 31385 1744168 PH1580 PH1581   hypA TRUE 0.966 -3.000 0.667 1.000   NA
 31387 31388 PH1582 PH1583     FALSE 0.005 69.000 0.014 NA   NA
 31390 1744169 PH1585 PH1586     TRUE 0.848 -19.000 0.311 NA   NA
 1744169 31392 PH1586 PH1587     FALSE 0.202 39.000 0.054 NA   NA
 31392 31393 PH1587 PH1588     TRUE 0.948 7.000 0.446 1.000 N NA
 31393 31394 PH1588 PH1589     FALSE 0.270 40.000 0.016 1.000 N NA
 31395 31396 PH1590 PH1591     FALSE 0.634 -3.000 0.031 1.000   NA
 31396 31397 PH1591 PH1592     FALSE 0.008 140.000 0.000 1.000   NA
 31397 31398 PH1592 PH1593     FALSE 0.182 106.000 0.062 1.000 N NA
 31398 31399 PH1593 PH1594     FALSE 0.015 276.000 0.000 1.000 N NA
 31399 31400 PH1594 PH1595     TRUE 0.767 -30.000 0.250 NA   NA
 31400 1744170 PH1595 PH1595.1n     TRUE 0.926 -3.000 0.400 NA   NA
 31401 31402 PH1596 PH1598     FALSE 0.609 13.000 0.042 1.000 N NA
 31404 1744171 PH1600 PH1600.1n     TRUE 0.893 -3.000 0.292 NA   NA
 31405 31406 PH1601 PH1602     FALSE 0.247 26.000 0.000 1.000 N NA
 31407 31408 PH1605 PH1606     FALSE 0.034 44.000 0.019 NA   NA
 31408 31409 PH1606 PH1607     FALSE 0.012 26.000 0.008 NA   NA
 31409 31410 PH1607 PH1608     FALSE 0.060 45.000 0.002 1.000   NA
 31415 31416 PH1613 PH1614     FALSE 0.039 7.000 0.000 NA   NA
 31417 31418 PH1615 PH1616     FALSE 0.012 108.000 0.000 1.000   NA
 31419 31420 PH1617 PH1618     TRUE 0.736 123.000 0.538 1.000 Y NA
 31422 31423 PH1620 PH1620a     TRUE 0.909 -3.000 0.333 NA   NA
 31424 31425 PH1621 PH1622     FALSE 0.299 49.000 0.020 1.000 N NA
 31426 31427 PH1623 PH1625     TRUE 0.880 -3.000 0.185 1.000   NA
 31427 31428 PH1625 PH1626     FALSE 0.290 31.000 0.072 NA   NA
 31428 31429 PH1626 PH1627     FALSE 0.013 24.000 0.014 NA   NA
 31429 31430 PH1627 PH1629     FALSE 0.290 23.000 0.003 1.000 N NA
 31430 31431 PH1629 PH1630     TRUE 0.646 4.000 0.008 1.000 N NA
 31431 31432 PH1630 PH1631a     TRUE 0.816 7.000 0.073 1.000 N NA
 31432 403108 PH1631a PHtRNA38   tRNA-Pro FALSE 0.014 22.000 0.000 NA   NA
 403108 31433 PHtRNA38 PH1632 tRNA-Pro   FALSE 0.013 24.000 0.000 NA   NA
 31433 31434 PH1632 PH1633     TRUE 0.910 -103.000 0.536 1.000 N NA
 31434 31435 PH1633 PH1634     TRUE 0.988 11.000 0.515 0.023 Y NA
 31435 31436 PH1634 PH1636     TRUE 0.969 7.000 0.075 0.023 Y NA
 31436 403107 PH1636 PHtRNA39   tRNA-Leu FALSE 0.006 63.000 0.000 NA   NA
 403107 31437 PHtRNA39 PH1637 tRNA-Leu   FALSE 0.043 6.000 0.000 NA   NA
 31437 31438 PH1637 PH1638     FALSE 0.523 27.000 0.058 1.000 N NA
 31438 31439 PH1638 PH1640     TRUE 0.977 -3.000 0.073 0.023 Y NA
 31439 31440 PH1640 PH1641     TRUE 0.989 11.000 0.512 0.014 Y NA
 31440 403106 PH1641 PHtRNA40   tRNA-Ser FALSE 0.011 30.000 0.000 NA   NA
 403106 31441 PHtRNA40 PH1642 tRNA-Ser   FALSE 0.038 -14.000 0.000 NA   NA
 31446 31447 PH1647 PH1648     FALSE 0.291 69.000 0.043 1.000 N NA
 31448 31449 PH1649 PH1650     FALSE 0.000 326.000 0.000 NA   NA
 31449 31450 PH1650 PH1651     TRUE 0.825 -3.000 0.048 1.000 N NA
 31450 31451 PH1651 PH1653     TRUE 0.992 1.000 0.440 0.058 Y NA
 31452 31453 PH1654 PH1655     FALSE 0.198 61.000 0.037 1.000   NA
 31453 31454 PH1655 PH1656     TRUE 0.764 -49.000 0.296 NA   NA
 31454 31455 PH1656 PH1657     TRUE 0.926 -3.000 0.400 NA   NA
 31455 31456 PH1657 PH1658     FALSE 0.497 -21.000 0.055 NA   NA
 31457 31458 PH1659 PH1660     FALSE 0.166 79.000 0.023 1.000 N NA
 31458 31459 PH1660 PH1661     TRUE 0.985 -12.000 0.190 0.002 Y NA
 31459 31460 PH1661 PH1662     TRUE 0.998 -3.000 1.000 0.002 Y NA
 31460 31461 PH1662 PH1663     TRUE 0.985 -3.000 0.091 0.002 Y NA
 31461 31462 PH1663 PH1665     TRUE 0.985 4.000 0.106 0.002 Y NA
 31462 31463 PH1665 PH1666     TRUE 0.997 -3.000 0.889 0.002 Y NA
 31463 1744172 PH1666 PH1666.1n     TRUE 0.985 3.000 0.096 0.002 Y NA
 1744172 31464 PH1666.1n PH1668     FALSE 0.001 161.000 0.000 NA   NA
 31465 1744173 PH1669 PH1669.1n     FALSE 0.036 -16.000 0.003 NA   NA
 31468 31469 PH1673 PH1674     TRUE 0.990 5.000 1.000 NA Y NA
 31469 31470 PH1674 PH1675     FALSE 0.022 116.000 0.031 NA   NA
 31470 31471 PH1675 PH1678     FALSE 0.613 7.000 0.071 NA   NA
 31471 31472 PH1678 PH1679     TRUE 0.710 -7.000 0.087 NA   NA
 31474 31475 PH1681 PH1682     TRUE 0.846 -3.000 0.200 NA   NA
 1744174 31476 PH1682.1n PH1683     FALSE 0.034 51.000 0.019 NA   NA
 31476 31477 PH1683 PH1684     TRUE 0.996 -9.000 0.667 0.001 Y NA
 31477 31478 PH1684 PH1685     FALSE 0.025 -34.000 0.000 NA   NA
 31479 1744175 PH1686 PH1686.1n     FALSE 0.001 177.000 0.000 NA   NA
 1744175 31480 PH1686.1n PH1688     FALSE 0.027 11.000 0.000 NA   NA
 31483 31484 PH1692 PH1693     FALSE 0.009 44.000 0.008 NA   NA
 31484 31485 PH1693 PHS045     FALSE 0.020 13.000 0.011 NA   NA
 31485 31486 PHS045 PH1694     FALSE 0.329 6.000 0.007 1.000   NA
 31486 31487 PH1694 PH1695     FALSE 0.234 32.000 0.003 1.000 N NA
 31487 31488 PH1695 PH1696     TRUE 0.738 5.000 0.062 1.000   NA
 31488 31489 PH1696 PH1697     FALSE 0.609 4.000 0.031 1.000   NA
 31491 31492 PH1699 PH1700     TRUE 0.984 0.000 0.081 0.002 Y NA
 31492 31493 PH1700 PH1701     FALSE 0.318 71.000 0.059 1.000 N NA
 31493 31494 PH1701 PHS046     FALSE 0.396 41.000 0.044 1.000 N NA
 31494 31495 PHS046 PH1702     FALSE 0.007 225.000 0.000 NA N NA
 31495 31496 PH1702 PH1703     FALSE 0.319 -7.000 0.029 NA   NA
 31496 31497 PH1703 PH1704     FALSE 0.065 43.000 0.026 NA   NA
 31498 31499 PH1705 PH1706     FALSE 0.203 77.000 0.032 1.000 N NA
 31499 31500 PH1706 PH1708     FALSE 0.016 91.000 0.021 NA   NA
 31503 31504 PH1711 PH1712     TRUE 0.907 -3.000 0.058 0.020   NA
 31504 31505 PH1712 PH1713     TRUE 0.729 -7.000 0.058 1.000   NA
 31505 31506 PH1713 PH1714     TRUE 0.814 46.000 0.667 1.000   NA
 31506 1744176 PH1714 PH1714.1n     FALSE 0.008 52.000 0.000 NA   NA
 1744176 31507 PH1714.1n PH1715     FALSE 0.160 15.000 0.030 NA   NA
 31507 31508 PH1715 PH1716     TRUE 0.953 -25.000 0.243 1.000 Y NA
 31508 31509 PH1716 PH1718     TRUE 0.923 6.000 0.039 1.000 Y NA
 31509 31510 PH1718 PH1720     TRUE 0.983 -3.000 0.058 0.001 Y NA
 31510 31511 PH1720 PH1721     TRUE 0.848 -3.000 0.060 1.000 N NA
 31511 1744177 PH1721 PH1721.1n     FALSE 0.050 35.000 0.000 1.000   NA
 1744177 31512 PH1721.1n PH1722     FALSE 0.085 17.000 0.000 1.000   NA
 31512 31513 PH1722 PH1724     TRUE 0.980 -12.000 0.087 0.001 Y NA
 31513 31514 PH1724 PH1726     TRUE 0.995 -3.000 0.417 0.001 Y NA
 31514 31515 PH1726 PH1727     TRUE 0.964 -3.000 0.111 1.000 Y NA
 31515 31516 PH1727 PH1729     FALSE 0.004 216.000 0.000 1.000   NA
 31518 403104 PH1731 PHtRNA42   tRNA-Asp FALSE 0.011 28.000 0.000 NA   NA
 403104 1744178 PHtRNA42 PHrRNA04 tRNA-Asp   FALSE 0.023 12.000 0.000 NA   NA
 1744178 31519 PHrRNA04 PH1732     FALSE 0.005 71.000 0.000 NA   NA
 31520 31521 PH1733 PH1734     FALSE 0.149 73.000 0.039 1.000   NA
 31522 31523 PH1735 PH1736     TRUE 0.981 -19.000 0.176 0.003 Y NA
 31523 31524 PH1736 PH1737     FALSE 0.005 71.000 0.000 NA   NA
 31524 31525 PH1737 PH1738     FALSE 0.154 138.000 0.250 NA   NA
 31525 31526 PH1738 PH1739     FALSE 0.222 144.000 0.375 NA   NA
 31528 31529 PH1741 PH1742     FALSE 0.000 780.000 0.000 NA   NA
 31531 31532 PH1744 PH1745a   GAR1 TRUE 0.700 6.000 0.023 1.000 N NA
 31532 31533 PH1745a PH1746 GAR1   FALSE 0.063 26.000 0.000 1.000   NA
 31535 31536 PH1748 PH1749     FALSE 0.302 51.000 0.053 1.000   NA
 31536 31537 PH1749 PH1750     TRUE 0.969 -3.000 0.316 0.009   NA
 31537 1744180 PH1750 PH1750.1n     TRUE 0.919 -3.000 0.368 NA   NA
 1744180 31538 PH1750.1n PH1751     TRUE 0.882 -3.000 0.263 NA   NA
 31539 31540 PH1752 PH1753     TRUE 0.916 -7.000 0.329 1.000   NA
 31540 31541 PH1753 PH1754     FALSE 0.371 78.000 0.110 1.000 N NA
 31541 1744181 PH1754 PH1755   rpl15p FALSE 0.451 34.000 0.051 1.000 N NA
 1744181 31543 PH1755 PH1756 rpl15p   TRUE 0.986 11.000 0.471 0.022 Y NA
 31543 31544 PH1756 PH1757     TRUE 0.984 12.000 0.475 0.022 Y NA
 31544 31545 PH1757 PH1758   rpl18p TRUE 0.977 -3.000 0.072 0.022 Y NA
 31545 31546 PH1758 PH1759 rpl18p   TRUE 0.960 11.000 0.079 0.018 Y NA
 31546 31547 PH1759 PH1761     TRUE 0.991 10.000 0.529 0.018 Y NA
 31547 31548 PH1761 PH1763   rpl6p TRUE 0.987 11.000 0.465 0.018 Y NA
 31548 31549 PH1763 PH1764 rpl6p   TRUE 0.957 11.000 0.068 0.018 Y NA
 31549 31550 PH1764 PHS047     TRUE 0.989 10.000 0.473 0.018 Y NA
 31550 31551 PHS047 PH1765     TRUE 0.992 6.000 0.496 0.018 Y NA
 31551 31552 PH1765 PH1766     TRUE 0.958 11.000 0.073 0.018 Y NA
 31552 31553 PH1766 PH1767     TRUE 0.994 0.000 0.478 0.022 Y NA
 31553 31554 PH1767 PH1768   rpl14p TRUE 0.993 2.000 0.472 0.022 Y NA
 31554 31555 PH1768 PH1770 rpl14p rps17p TRUE 0.993 6.000 0.506 0.018 Y NA
 31555 31556 PH1770 PH1771 rps17p   TRUE 0.985 -6.000 0.468 1.000 Y NA
 31556 31557 PH1771 PH1771a   SUI1 TRUE 0.862 -114.000 0.070 1.000 Y NA
 31557 1744182 PH1771a PHS048 SUI1 rpmC TRUE 0.879 10.000 0.023 1.000 Y NA
 1744182 31559 PHS048 PH1772 rpmC   TRUE 0.968 -13.000 0.074 0.022 Y NA
 31559 31560 PH1772 PH1773     TRUE 0.973 5.000 0.074 0.022 Y NA
 31560 31561 PH1773 PH1774     TRUE 0.983 11.000 0.355 0.022 Y NA
 31561 31562 PH1774 PH1775     TRUE 0.948 11.000 0.051 0.022 Y NA
 31562 31563 PH1775 PHS049     TRUE 0.991 12.000 0.849 0.018 Y NA
 31565 31566 PH1776 PH1777     TRUE 0.993 11.000 0.885 0.018 Y NA
 31566 31567 PH1777 PH1779     TRUE 0.917 2.000 0.359 NA   NA
 31567 31568 PH1779 PH1780     FALSE 0.001 140.000 0.000 NA   NA
 31568 31569 PH1780 PH1781     FALSE 0.002 116.000 0.000 NA   NA
 31569 31570 PH1781 PH1782     FALSE 0.144 55.000 0.044 NA   NA
 31571 31572 PHS051 PH1783     FALSE 0.062 70.000 0.010 1.000   NA
 31574 31575 PH1785 PH1786     FALSE 0.126 -12.000 0.018 NA   NA
 31575 31576 PH1786 PH1787     FALSE 0.036 8.000 0.007 NA   NA
 31577 31578 PH1788 PH1789     TRUE 0.990 -3.000 0.800 0.002   NA
 31579 1744183 PH1792 PH1794     FALSE 0.039 -13.000 0.003 NA   NA
 31581 31582 PH1795 PH1796     FALSE 0.016 19.000 0.000 NA   NA
 31582 31583 PH1796 PH1797     FALSE 0.005 71.000 0.000 NA   NA
 31583 31584 PH1797 PH1798     FALSE 0.460 -28.000 0.056 NA   NA
 31585 31586 PH1801 PH1802     TRUE 0.935 -3.000 0.340 1.000   NA
 31586 31587 PH1802 PH1803     FALSE 0.483 12.000 0.073 NA   NA
 31588 31589 PH1804 PH1805     FALSE 0.193 84.000 0.041 1.000 N NA
 31589 31590 PH1805 PH1806     TRUE 0.775 12.000 0.110 1.000 N NA
 31593 31594 PH1809 PH1810     TRUE 0.706 -3.000 0.077 NA   NA
 31596 31597 PH1812 PH1813     FALSE 0.234 34.000 0.033 1.000   NA
 31597 31598 PH1813 PH1815     TRUE 0.991 0.000 0.667 1.000 Y NA
 31598 31599 PH1815 PH1816     TRUE 0.821 -27.000 0.000 1.000 Y NA
 31599 31600 PH1816 PH1818     TRUE 0.995 2.000 0.667 0.020 Y NA
 31600 1744184 PH1818 PH1818.1n     FALSE 0.039 7.000 0.000 NA   NA
 31601 31602 PH1819 PH1820     TRUE 0.780 -7.000 0.082 1.000   NA
 31602 31603 PH1820 PH1821     TRUE 0.935 -3.000 0.086 0.005   NA
 31604 31605 PH1822 PH1823     TRUE 0.820 -64.000 0.049 NA Y NA
 1744185 31607 PH1824.1n PH1826     TRUE 0.774 -31.000 0.194 1.000   NA
 31607 31608 PH1826 PH1827     FALSE 0.588 6.000 0.033 1.000   NA
 31608 1744186 PH1827 PH1827.1n     FALSE 0.231 -7.000 0.022 NA   NA
 31609 31610 PH1829 PHS052     TRUE 0.828 19.000 0.050 1.000 Y NA
 31611 31612 PH1830 PH1831     FALSE 0.050 65.000 0.027 NA   NA
 31614 31615 PH1833 PH1835     FALSE 0.507 -22.000 0.004 1.000 N NA
 31615 31616 PH1835 PH1836     FALSE 0.191 -12.000 0.000 1.000   NA
 31617 31618 PH1837 PH1838     FALSE 0.054 -3.000 0.000 NA   NA
 31620 31621 PHS053 PH1840     FALSE 0.263 133.000 0.214 1.000 N NA
 31621 31622 PH1840 PH1842     TRUE 0.847 83.000 0.750 NA Y NA
 1744187 31623 PH1842.1n PH1844     TRUE 0.921 -28.000 0.714 NA   NA
 31623 31624 PH1844 PH1845     FALSE 0.552 32.000 0.083 1.000 N NA
 31625 31626 PH1846 PH1848     TRUE 0.795 -13.000 0.000 0.003   NA
 31626 31627 PH1848 PH1849     FALSE 0.547 33.000 0.049 0.057   NA
 31627 31628 PH1849 PH1850     FALSE 0.583 35.000 0.300 NA   NA
 31628 31629 PH1850 PH1852     TRUE 0.932 9.000 0.667 NA   NA
 31629 31630 PH1852 PH1853     TRUE 0.971 2.000 1.000 NA   NA
 31630 31631 PH1853 PH1854     FALSE 0.001 251.000 0.000 NA   NA
 31631 31632 PH1854 PH1855     FALSE 0.003 297.000 0.000 1.000   NA
 31632 31633 PH1855 PH1856     FALSE 0.545 -3.000 0.043 NA   NA
 31635 31636 PH1857 PH1858     TRUE 0.819 -3.000 0.151 NA   NA
 31636 403100 PH1858 PHtRNA43   tRNA-Val FALSE 0.002 118.000 0.000 NA   NA
 31637 31638 PH1859 PH1860     FALSE 0.026 -31.000 0.000 NA   NA
 31640 31641 PH1862 PH1863     FALSE 0.002 115.000 0.000 NA   NA
 31641 31642 PH1863 PH1864     FALSE 0.000 320.000 0.000 NA   NA
 31642 31643 PH1864 PH1865     FALSE 0.009 34.000 0.000 NA   NA
 31646 1744189 PH1868 PH1868.1n     FALSE 0.001 190.000 0.000 NA   NA
 1744189 31647 PH1868.1n PH1869     FALSE 0.000 692.000 0.000 NA   NA
 31647 1744190 PH1869 PH1869.1n     FALSE 0.000 645.000 0.000 NA   NA
 1744190 31648 PH1869.1n PH1870     FALSE 0.001 190.000 0.000 NA   NA
 31648 31649 PH1870 PH1871     TRUE 0.931 5.000 0.500 NA   NA
 31649 31650 PH1871 PH1872     FALSE 0.056 1.000 0.000 NA   NA
 1744191 31651 PH1871.1n PH1873     FALSE 0.461 182.000 0.375 0.015 N NA
 31651 31652 PH1873 PH1874     TRUE 0.857 1.000 0.000 0.026 N NA
 31653 31654 PH1875 PH1876     FALSE 0.502 43.000 0.003 NA Y NA
 31654 31655 PH1876 PH1877     TRUE 0.937 -21.000 0.190 NA Y NA
 31655 1744192 PH1877 PH1878     FALSE 0.047 46.000 0.000 1.000   NA
 31658 31659 PH1881 PH1882     TRUE 0.986 2.000 0.714 0.010   NA
 31660 31661 PH1884 PH1885     TRUE 0.659 28.000 0.036 0.029 N NA
 31661 31662 PH1885 PH1886     TRUE 0.644 -12.000 0.016 1.000 N NA
 31662 403103 PH1886 PHtRNA44   tRNA-His FALSE 0.007 57.000 0.000 NA   NA
 31665 31666 PH1889 PH1891     FALSE 0.106 34.000 0.003 NA N NA
 31668 1744193 PH1893 PH1893.1n     TRUE 0.974 2.000 0.375 0.013   NA
 1744193 31669 PH1893.1n PH1894     TRUE 0.933 -9.000 0.150 0.013   NA
 31669 31670 PH1894 PH1895     FALSE 0.440 47.000 0.100 1.000   NA
 1744194 31671 PH1895.1n PH1896m   MUS81 FALSE 0.008 177.000 0.025 NA   NA
 31671 1744195 PH1896m PH1896m.1n MUS81   TRUE 0.894 -1952.000 0.000 0.002 Y NA
 1744195 31672 PH1896m.1n PH1897     TRUE 0.797 -3.000 0.037 1.000 N NA
 31672 31673 PH1897 PH1898     TRUE 0.923 3.000 0.400 NA   NA
 31673 31674 PH1898 PH1899     FALSE 0.070 58.000 0.030 NA   NA
 31674 31675 PH1899 PH1899a     FALSE 0.044 74.000 0.030 NA   NA
 31675 31676 PH1899a PH1900     TRUE 0.879 -22.000 0.424 NA   NA
 31676 1744196 PH1900 PHS056     FALSE 0.585 43.000 0.142 1.000 N NA
 1744196 31678 PHS056 PHS057     TRUE 0.897 8.000 0.234 1.000 N NA
 31679 31680 PH1901 PH1902     TRUE 0.711 50.000 0.286 1.000 N NA
 31681 31682 PH1903 PH1904     FALSE 0.292 -3.000 0.024 NA   NA
 31683 31684 PH1905 PH1907     FALSE 0.226 66.000 0.021 1.000 N NA
 31684 31685 PH1907 PH1908     FALSE 0.492 41.000 0.080 1.000 N NA
 31685 31686 PH1908 PH1908a     TRUE 0.994 -3.000 0.429 0.004 Y NA
 31686 31687 PH1908a PH1909     TRUE 0.960 0.000 0.695 NA   NA
 31687 31688 PH1909 PH1909a     TRUE 0.895 -10.000 0.362 NA   NA
 31688 31689 PH1909a PH1910a     TRUE 0.989 -22.000 0.487 0.018 Y NA
 31689 31690 PH1910a PH1911     FALSE 0.021 -55.000 0.000 NA   NA
 31690 31691 PH1911 PH1912     TRUE 0.720 12.000 0.227 NA   NA
 31691 31692 PH1912 PH1914     TRUE 0.940 -3.000 0.273 1.000 N NA
 31693 31694 PH1915 PH1916     FALSE 0.261 70.000 0.077 1.000   NA
 31694 31695 PH1916 PH1917     FALSE 0.257 33.000 0.007 1.000 N NA
 31695 31696 PH1917 PH1918     FALSE 0.027 11.000 0.007 NA   NA
 31701 31702 PHS059 PH1922     FALSE 0.129 47.000 0.037 NA   NA
 31702 31703 PH1922 PH1923     TRUE 0.753 -3.000 0.091 NA   NA
 31705 31706 PH1925 PH1927     TRUE 0.949 -3.000 0.583 NA   NA
 31707 31708 PH1928 PH1930     TRUE 0.763 52.000 0.375 1.000 N NA
 31708 31709 PH1930 PH1931     FALSE 0.569 5.000 0.052 NA   NA
 31709 31710 PH1931 PH1932     FALSE 0.482 4.000 0.039 NA   NA
 31710 403102 PH1932 PHtRNA45   tRNA-Arg FALSE 0.003 86.000 0.000 NA   NA
 403102 31711 PHtRNA45 PH1933 tRNA-Arg   FALSE 0.011 27.000 0.000 NA   NA
 1744197 1744198 PH1935 PH1935.1n     TRUE 0.906 -25.000 0.571 NA   NA
 1744198 31714 PH1935.1n PH1936     TRUE 0.950 -16.000 0.875 NA   NA
 31714 31715 PH1936 PH1937     TRUE 0.969 -6.000 0.800 1.000   NA
 31715 31716 PH1937 PH1938     FALSE 0.624 34.000 0.150 1.000 N NA
 31718 31719 PH1939a PH1940   rpl44e TRUE 0.992 4.000 0.436 0.018 Y NA
 31720 31721 PH1941 PH1942     FALSE 0.122 42.000 0.009 NA N NA
 31721 31722 PH1942 PH1943     FALSE 0.243 34.000 0.060 NA   NA
 31723 31724 PH1945 PH1946     FALSE 0.009 50.000 0.000 NA   NA
 31727 31728 PH1949 PH1950     FALSE 0.126 25.000 0.003 NA N NA
 31729 31730 PH1952 PH1953     FALSE 0.223 31.000 0.000 1.000 N NA
 31732 31733 PH1955 PH1955a   purS TRUE 0.996 -6.000 0.656 0.001 Y NA
 31733 31734 PH1955a PH1956 purS   FALSE 0.161 67.000 0.006 1.000 N NA
 31734 1744199 PH1956 PH1956.1n     FALSE 0.429 -46.000 0.060 NA   NA
 1744199 31735 PH1956.1n PH1958     TRUE 0.665 13.000 0.200 NA   NA
 31735 31736 PH1958 PH1959     TRUE 0.994 10.000 0.737 0.003 Y NA
 31736 31737 PH1959 PH1960     TRUE 0.984 2.000 0.370 1.000 Y NA
 31737 31738 PH1960 PH1961     TRUE 0.991 12.000 0.814 0.020 Y NA
 31738 31739 PH1961 PH1962     FALSE 0.116 199.000 0.051 0.020   NA
 31740 31741 PH1963 PH1965     FALSE 0.551 -52.000 0.029 1.000 N NA
 31741 31742 PH1965 PH1966     TRUE 0.818 5.000 0.109 1.000   NA
 31742 31743 PH1966 PH1968     FALSE 0.047 47.000 0.000 1.000   NA
 31744 31745 PH1969 PH1970     FALSE 0.471 -22.000 0.029 1.000   NA
 31745 31746 PH1970 PH1971     TRUE 0.949 -3.000 0.455 1.000   NA
 31746 31747 PH1971 PH1972     FALSE 0.631 52.000 0.019 1.000 Y NA
 31749 31750 PH1974 PH1975     TRUE 0.948 -3.000 0.060 0.003 N NA
 31750 31751 PH1975 PH1976     TRUE 0.980 7.000 0.462 0.003 N NA
 31751 31752 PH1976 PH1977     TRUE 0.994 -3.000 0.462 0.003 Y NA
 31752 31753 PH1977 PH1978     TRUE 0.988 5.000 0.236 0.003 Y NA
 31753 31754 PH1978 PH1980     TRUE 0.906 32.000 0.489 0.003   NA
 31754 31755 PH1980 PH1981     TRUE 0.988 5.000 0.848 0.003   NA
 31755 31756 PH1981 PH1983     TRUE 0.951 2.000 0.132 0.003   NA
 31756 31757 PH1983 PH1984     FALSE 0.042 89.000 0.013 1.000   NA
 31757 31758 PH1984 PH1985     TRUE 0.811 5.000 0.054 1.000 N NA
 31758 31759 PH1985 PH1986     TRUE 0.997 -3.000 0.860 0.001 Y NA
 31760 31761 PH1987 PH1988     FALSE 0.272 -6.000 0.024 NA   NA
 31762 31763 PH1989 PH1991     TRUE 0.881 -3.000 0.257 NA   NA
 31764 31765 PH1992 PH1993     FALSE 0.465 -13.000 0.020 1.000   NA
 31766 31767 PH1994 PH1995     TRUE 0.993 1.000 0.316 0.001 Y NA
 31767 31768 PH1995 PH1996     FALSE 0.059 62.000 0.005 1.000   NA
 31768 403101 PH1996 PHtRNA46   tRNA-Arg FALSE 0.012 25.000 0.000 NA   NA
 31770 31771 PH1998 PH1999 rpl12p   TRUE 0.979 43.000 0.758 0.002 Y NA
 31771 1743997 PH1999 PH2000   rpl1P TRUE 0.974 6.000 0.076 0.018 Y NA
 1743997 29972 PH2000 PH0001 rpl1P   TRUE 0.967 65.000 0.838 0.018 Y NA