MicrobesOnline Operon Predictions for Clostridiales genomosp. BVAB3 str. UPII9-5

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 10464387 10464388 HMPREF0868_0002 HMPREF0868_0003   speD FALSE 0.202 150.000 0.000 NA   NA
 10464388 10464389 HMPREF0868_0003 HMPREF0868_0004 speD   TRUE 0.987 42.000 0.091 1.000 Y NA
 10464389 10464390 HMPREF0868_0004 HMPREF0868_0005     FALSE 0.423 30.000 0.000 NA   NA
 10464392 10464393 HMPREF0868_0007 HMPREF0868_0008 speE speB TRUE 0.982 82.000 0.077 1.000 Y NA
 10464393 10464394 HMPREF0868_0008 HMPREF0868_0009 speB lYS TRUE 0.978 113.000 0.045 1.000 Y NA
 10464394 10464395 HMPREF0868_0009 HMPREF0868_0010 lYS nspC TRUE 0.995 153.000 0.444 1.000 Y NA
 10464395 10464396 HMPREF0868_0010 HMPREF0868_0011 nspC   FALSE 0.032 462.000 0.000 NA   NA
 10464397 10464398 HMPREF0868_0012 HMPREF0868_0013 iolB   TRUE 0.726 108.000 0.000 1.000 Y NA
 10464398 10464399 HMPREF0868_0013 HMPREF0868_0014     TRUE 0.997 -7.000 0.097 0.002 Y NA
 10464399 10464400 HMPREF0868_0014 HMPREF0868_0015   pgk TRUE 0.911 19.000 0.000 1.000 Y NA
 10464400 10464401 HMPREF0868_0015 HMPREF0868_0016 pgk   TRUE 0.994 -9.000 0.023 0.012 Y NA
 10464401 10464402 HMPREF0868_0016 HMPREF0868_0017     FALSE 0.258 131.000 0.000 NA   NA
 10464402 10464403 HMPREF0868_0017 HMPREF0868_0018     FALSE 0.267 77.000 0.000 NA   NA
 10464403 10464404 HMPREF0868_0018 HMPREF0868_0019     TRUE 0.479 91.000 0.000 1.000 N NA
 10464404 10464405 HMPREF0868_0019 HMPREF0868_0020     TRUE 0.922 54.000 0.042 1.000   NA
 10464405 10464406 HMPREF0868_0020 HMPREF0868_0021     TRUE 0.919 114.000 0.042 0.002   NA
 10464406 10464407 HMPREF0868_0021 HMPREF0868_0022     TRUE 0.696 -15.000 0.000 NA   NA
 10464407 10464408 HMPREF0868_0022 HMPREF0868_0023     TRUE 0.439 29.000 0.000 NA   NA
 10464408 10464409 HMPREF0868_0023 HMPREF0868_0024     FALSE 0.262 130.000 0.000 NA   NA
 10464410 10464411 HMPREF0868_0025 HMPREF0868_0026     TRUE 0.977 170.000 0.136 NA Y NA
 10464411 10464412 HMPREF0868_0026 HMPREF0868_0027     TRUE 0.997 -7.000 0.068 1.000 Y NA
 10464412 10464413 HMPREF0868_0027 HMPREF0868_0028     FALSE 0.136 287.000 0.000 1.000 N NA
 10464414 10464415 HMPREF0868_0029 HMPREF0868_0030     FALSE 0.029 522.000 0.000 NA   NA
 10464416 10464417 HMPREF0868_0031 HMPREF0868_0032     FALSE 0.229 206.000 0.000 1.000 N NA
 10464417 10464418 HMPREF0868_0032 HMPREF0868_0033     TRUE 0.878 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10464418 10464419 HMPREF0868_0033 HMPREF0868_0034     TRUE 0.766 10.000 0.000 NA   NA
 10464419 10464420 HMPREF0868_0034 HMPREF0868_0035     FALSE 0.040 371.000 0.000 NA   NA
 10464420 10464421 HMPREF0868_0035 HMPREF0868_0036     TRUE 0.632 18.000 0.000 NA   NA
 10464423 10464424 HMPREF0868_0038 HMPREF0868_0039     FALSE 0.191 52.000 0.000 0.063   NA
 10464425 10464426 HMPREF0868_0040 HMPREF0868_0041     TRUE 0.733 13.000 0.000 NA   NA
 10464426 10464427 HMPREF0868_0041 HMPREF0868_0042     TRUE 0.462 27.000 0.000 NA   NA
 10464427 10464428 HMPREF0868_0042 HMPREF0868_0043     TRUE 0.750 -3.000 0.000 NA   NA
 10464428 10464429 HMPREF0868_0043 HMPREF0868_0044     TRUE 0.776 7.000 0.000 NA   NA
 10464429 10464430 HMPREF0868_0044 HMPREF0868_0045     FALSE 0.260 62.000 0.000 NA   NA
 10464430 10464431 HMPREF0868_0045 HMPREF0868_0046     FALSE 0.272 83.000 0.000 NA   NA
 10464431 10464432 HMPREF0868_0046 HMPREF0868_0047     TRUE 0.933 102.000 0.040 NA   NA
 10464434 10464435 HMPREF0868_0049 HMPREF0868_0050     FALSE 0.029 532.000 0.000 NA   NA
 10464435 10464436 HMPREF0868_0050 HMPREF0868_0051   secG FALSE 0.300 44.000 0.000 NA   NA
 10464436 10464437 HMPREF0868_0051 HMPREF0868_0052 secG   FALSE 0.260 62.000 0.000 NA   NA
 10464440 10464441 HMPREF0868_0055 HMPREF0868_0056     TRUE 0.862 93.000 0.006 NA   NA
 10464441 10464442 HMPREF0868_0056 HMPREF0868_0057     FALSE 0.193 154.000 0.000 NA   NA
 10464445 10464446 HMPREF0868_0060 HMPREF0868_0061     TRUE 0.497 25.000 0.000 NA   NA
 10464446 10464447 HMPREF0868_0061 HMPREF0868_0062     TRUE 0.780 5.000 0.000 NA   NA
 10464447 10464448 HMPREF0868_0062 HMPREF0868_0063     FALSE 0.262 60.000 0.000 NA   NA
 10464448 10464449 HMPREF0868_0063 HMPREF0868_0064     TRUE 0.654 17.000 0.000 NA   NA
 10464449 10464450 HMPREF0868_0064 HMPREF0868_0065     FALSE 0.266 55.000 0.000 NA   NA
 10464450 10464451 HMPREF0868_0065 HMPREF0868_0066     TRUE 0.782 4.000 0.000 NA   NA
 10464451 10464452 HMPREF0868_0066 HMPREF0868_0067     TRUE 0.729 -7.000 0.000 NA   NA
 10464452 10464453 HMPREF0868_0067 HMPREF0868_0068     FALSE 0.262 60.000 0.000 NA   NA
 10464453 10464454 HMPREF0868_0068 HMPREF0868_0069     FALSE 0.263 109.000 0.000 1.000   NA
 10464454 10464455 HMPREF0868_0069 HMPREF0868_0070     TRUE 0.931 -10.000 0.000 0.047 Y NA
 10464455 10464456 HMPREF0868_0070 HMPREF0868_0071     FALSE 0.219 360.000 0.000 1.000 Y NA
 10464458 10464459 HMPREF0868_0072 HMPREF0868_0074     FALSE 0.317 42.000 0.000 NA   NA
 10464459 10464460 HMPREF0868_0074 HMPREF0868_0075     FALSE 0.237 77.000 0.000 1.000   NA
 10464460 10464461 HMPREF0868_0075 HMPREF0868_0076     TRUE 1.000 -3.000 0.732 1.000 Y NA
 10464461 10464462 HMPREF0868_0076 HMPREF0868_0077   pstB TRUE 0.883 162.000 0.016 1.000 N NA
 10464462 10464463 HMPREF0868_0077 HMPREF0868_0078 pstB pstA TRUE 1.000 2.000 0.428 0.004 Y NA
 10464463 10464464 HMPREF0868_0078 HMPREF0868_0079 pstA pstC TRUE 0.995 35.000 0.219 0.004 Y NA
 10464464 10464465 HMPREF0868_0079 HMPREF0868_0080 pstC pstS TRUE 0.994 17.000 0.033 1.000 Y NA
 10464467 10464468 HMPREF0868_0082 HMPREF0868_0083     TRUE 0.480 26.000 0.000 NA   NA
 10464468 10464469 HMPREF0868_0083 HMPREF0868_0084     FALSE 0.055 317.000 0.000 NA   NA
 10464469 10464470 HMPREF0868_0084 HMPREF0868_0085     FALSE 0.026 690.000 0.000 NA   NA
 10464470 10464471 HMPREF0868_0085 HMPREF0868_0086     FALSE 0.259 63.000 0.000 NA   NA
 10464472 10464473 HMPREF0868_0087 HMPREF0868_0088 soj   TRUE 0.994 122.000 0.827 1.000 N NA
 10464474 10464475 HMPREF0868_0089 HMPREF0868_0090 gyrB   TRUE 0.932 43.000 0.034 NA   NA
 10464475 10464476 HMPREF0868_0090 HMPREF0868_0091     TRUE 0.980 22.000 0.047 NA   NA
 10464476 10464477 HMPREF0868_0091 HMPREF0868_0092   dnaN TRUE 0.995 64.000 0.318 1.000 Y NA
 10464477 10464478 HMPREF0868_0092 HMPREF0868_0093 dnaN dnaA TRUE 0.983 243.000 0.328 1.000 Y NA
 10464478 10464479 HMPREF0868_0093 HMPREF0868_0094 dnaA   FALSE 0.235 139.000 0.000 NA   NA
 10464482 10464483 HMPREF0868_0097 HMPREF0868_0098     FALSE 0.167 166.000 0.000 NA   NA
 10464483 10464484 HMPREF0868_0098 HMPREF0868_0099     TRUE 0.999 -3.000 0.393 0.002 Y NA
 10464486 10464487 HMPREF0868_0101 HMPREF0868_0102     FALSE 0.324 166.000 0.000 1.000 N NA
 10464487 10464488 HMPREF0868_0102 HMPREF0868_0103   hflX TRUE 0.666 -13.000 0.000 1.000   NA
 10464488 10464489 HMPREF0868_0103 HMPREF0868_0104 hflX   TRUE 0.531 22.000 0.000 1.000   NA
 10464489 10464490 HMPREF0868_0104 HMPREF0868_0105     TRUE 0.750 -3.000 0.000 NA   NA
 10464493 10464494 HMPREF0868_0108 HMPREF0868_0109 trkA   TRUE 0.668 92.000 0.000 0.006 Y NA
 10464497 10464498 HMPREF0868_0112 HMPREF0868_0113   rumA FALSE 0.086 220.000 0.000 1.000   NA
 10464498 10464499 HMPREF0868_0113 HMPREF0868_0114 rumA   FALSE 0.292 115.000 0.000 NA   NA
 10464499 10464500 HMPREF0868_0114 HMPREF0868_0115     TRUE 0.549 23.000 0.000 NA   NA
 10464500 10464501 HMPREF0868_0115 HMPREF0868_0116     FALSE 0.026 704.000 0.000 NA   NA
 10464503 10464504 HMPREF0868_0118 HMPREF0868_0119     FALSE 0.276 88.000 0.000 NA   NA
 10464504 10464505 HMPREF0868_0119 HMPREF0868_0120     FALSE 0.032 460.000 0.000 NA   NA
 10464505 10464506 HMPREF0868_0120 HMPREF0868_0121     FALSE 0.125 195.000 0.000 NA   NA
 10464506 10464507 HMPREF0868_0121 HMPREF0868_0122     FALSE 0.258 131.000 0.000 NA   NA
 10464507 10464508 HMPREF0868_0122 HMPREF0868_0123     FALSE 0.086 244.000 0.000 NA   NA
 10464508 10464509 HMPREF0868_0123 HMPREF0868_0124     FALSE 0.141 180.000 0.000 NA   NA
 10464509 10464510 HMPREF0868_0124 HMPREF0868_0125     FALSE 0.256 65.000 0.000 NA   NA
 10464510 10464511 HMPREF0868_0125 HMPREF0868_0126     FALSE 0.026 658.000 0.000 NA   NA
 10464511 10464512 HMPREF0868_0126 HMPREF0868_0127     FALSE 0.027 611.000 0.000 NA   NA
 10464512 10464513 HMPREF0868_0127 HMPREF0868_0128     FALSE 0.294 101.000 0.000 NA   NA
 10464513 10464514 HMPREF0868_0128 HMPREF0868_0129     FALSE 0.172 164.000 0.000 NA   NA
 10464514 10464515 HMPREF0868_0129 HMPREF0868_0130     FALSE 0.289 98.000 0.000 NA   NA
 10464515 10464516 HMPREF0868_0130 HMPREF0868_0131     FALSE 0.285 121.000 0.000 NA   NA
 10464516 10464517 HMPREF0868_0131 HMPREF0868_0132     TRUE 0.676 -28.000 0.000 NA   NA
 10464517 10464518 HMPREF0868_0132 HMPREF0868_0133     TRUE 0.770 9.000 0.000 NA   NA
 10464518 10464519 HMPREF0868_0133 HMPREF0868_0134     FALSE 0.024 755.000 0.000 NA   NA
 10464519 10464520 HMPREF0868_0134 HMPREF0868_0135     TRUE 0.729 -7.000 0.000 NA   NA
 10464521 10464522 HMPREF0868_0136 HMPREF0868_0137     FALSE 0.057 310.000 0.000 NA   NA
 10464525 10464526 HMPREF0868_0140 HMPREF0868_0141     TRUE 0.993 104.000 0.333 1.000 N NA
 10464526 10464527 HMPREF0868_0141 HMPREF0868_0142     TRUE 0.999 -7.000 0.667 0.018 Y NA
 10464527 10464528 HMPREF0868_0142 HMPREF0868_0143     TRUE 0.999 3.000 0.600 1.000   NA
 10464528 10464529 HMPREF0868_0143 HMPREF0868_0144     TRUE 0.998 -10.000 0.500 1.000   NA
 10464529 10464530 HMPREF0868_0144 HMPREF0868_0145     TRUE 0.999 11.000 0.500 NA   NA
 10464530 10464531 HMPREF0868_0145 HMPREF0868_0146     FALSE 0.048 338.000 0.000 NA   NA
 10464531 10464532 HMPREF0868_0146 HMPREF0868_0147     FALSE 0.144 178.000 0.000 NA   NA
 10464532 10464533 HMPREF0868_0147 HMPREF0868_0148     FALSE 0.049 337.000 0.000 NA   NA
 10464533 10464534 HMPREF0868_0148 HMPREF0868_0149     FALSE 0.297 104.000 0.000 NA   NA
 10464534 10464535 HMPREF0868_0149 HMPREF0868_0150     FALSE 0.098 222.000 0.000 NA   NA
 10464535 10464536 HMPREF0868_0150 HMPREF0868_0151     FALSE 0.297 107.000 0.000 NA   NA
 10464536 10464537 HMPREF0868_0151 HMPREF0868_0152     FALSE 0.050 334.000 0.000 NA   NA
 10464537 10464538 HMPREF0868_0152 HMPREF0868_0153     FALSE 0.108 208.000 0.000 NA   NA
 10464538 10464539 HMPREF0868_0153 HMPREF0868_0154     TRUE 0.458 74.000 0.000 1.000 N NA
 10464539 10464540 HMPREF0868_0154 HMPREF0868_0155     TRUE 0.999 -7.000 1.000 0.018 Y NA
 10464540 10464541 HMPREF0868_0155 HMPREF0868_0156     FALSE 0.029 507.000 0.000 NA   NA
 10464541 10464542 HMPREF0868_0156 HMPREF0868_0157     TRUE 0.523 24.000 0.000 NA   NA
 10464542 10464543 HMPREF0868_0157 HMPREF0868_0158     FALSE 0.045 347.000 0.000 NA   NA
 10464543 10464544 HMPREF0868_0158 HMPREF0868_0159     TRUE 0.997 2.000 0.156 NA   NA
 10464544 10464545 HMPREF0868_0159 HMPREF0868_0160     FALSE 0.055 317.000 0.000 NA   NA
 10464547 10464548 HMPREF0868_0162 HMPREF0868_0163     TRUE 0.998 -7.000 1.000 NA   NA
 10464550 10464551 HMPREF0868_0165 HMPREF0868_0166     TRUE 0.763 0.000 0.000 NA   NA
 10464551 10464552 HMPREF0868_0166 HMPREF0868_0167     TRUE 0.763 0.000 0.000 NA   NA
 10464552 10464553 HMPREF0868_0167 HMPREF0868_0168     TRUE 0.763 0.000 0.000 NA   NA
 10464553 10464554 HMPREF0868_0168 HMPREF0868_0169     TRUE 0.995 -7.000 0.143 NA   NA
 10464554 10464555 HMPREF0868_0169 HMPREF0868_0170     FALSE 0.045 346.000 0.000 NA   NA
 10464555 10464556 HMPREF0868_0170 HMPREF0868_0171     FALSE 0.267 77.000 0.000 NA   NA
 10464557 10464558 HMPREF0868_0172 HMPREF0868_0173     TRUE 0.998 14.000 0.286 NA   NA
 10464558 10464559 HMPREF0868_0173 HMPREF0868_0174   bcrA TRUE 0.997 -3.000 0.222 NA   NA
 10464560 10464561 HMPREF0868_0175 HMPREF0868_0176     TRUE 1.000 7.000 0.357 1.000 Y NA
 10464561 10464562 HMPREF0868_0176 HMPREF0868_0177     FALSE 0.028 542.000 0.000 NA   NA
 10464562 10464563 HMPREF0868_0177 HMPREF0868_0178     FALSE 0.293 114.000 0.000 NA   NA
 10464563 10464564 HMPREF0868_0178 HMPREF0868_0179     FALSE 0.104 198.000 0.000 1.000   NA
 10464564 10464565 HMPREF0868_0179 HMPREF0868_0180   pulA FALSE 0.266 106.000 0.000 1.000   NA
 10464565 10464566 HMPREF0868_0180 HMPREF0868_0181 pulA   FALSE 0.184 421.000 0.000 1.000 Y NA
 10464566 10464567 HMPREF0868_0181 HMPREF0868_0182     TRUE 0.659 67.000 0.000 0.061 Y NA
 10464567 10464568 HMPREF0868_0182 HMPREF0868_0183     TRUE 0.944 -3.000 0.000 0.061 Y NA
 10464568 10464569 HMPREF0868_0183 HMPREF0868_0184     FALSE 0.271 52.000 0.000 NA   NA
 10464569 10464570 HMPREF0868_0184 HMPREF0868_0185     FALSE 0.275 51.000 0.000 NA   NA
 10464572 10464573 HMPREF0868_0187 HMPREF0868_0188     TRUE 0.523 24.000 0.000 NA   NA
 10464575 10464576 HMPREF0868_0190 HMPREF0868_0191     FALSE 0.021 740.000 0.000 1.000   NA
 10464576 10464577 HMPREF0868_0191 HMPREF0868_0192     FALSE 0.326 36.000 0.000 1.000   NA
 10464577 10464578 HMPREF0868_0192 HMPREF0868_0193     FALSE 0.044 349.000 0.000 NA   NA
 10464580 10464581 HMPREF0868_0195 HMPREF0868_0196 rpoB rpoC TRUE 0.998 27.000 0.851 0.002 Y NA
 10464581 10464582 HMPREF0868_0196 HMPREF0868_0197 rpoC   FALSE 0.089 215.000 0.000 1.000   NA
 10464582 10464583 HMPREF0868_0197 HMPREF0868_0198     FALSE 0.192 155.000 0.000 NA   NA
 10464583 10464584 HMPREF0868_0198 HMPREF0868_0199     TRUE 0.759 11.000 0.000 NA   NA
 10464584 10464585 HMPREF0868_0199 HMPREF0868_0200     TRUE 0.998 -7.000 0.375 NA   NA
 10464585 10464586 HMPREF0868_0200 HMPREF0868_0201     TRUE 0.768 1.000 0.000 NA   NA
 10464587 10464588 HMPREF0868_0202 HMPREF0868_0203     FALSE 0.294 110.000 0.000 NA   NA
 10464590 10464591 HMPREF0868_0205 HMPREF0868_0206     TRUE 0.763 0.000 0.000 NA   NA
 10464591 10464592 HMPREF0868_0206 HMPREF0868_0207     FALSE 0.168 63.000 0.000 0.033   NA
 10464592 10464593 HMPREF0868_0207 HMPREF0868_0208     TRUE 0.998 -13.000 1.000 0.020   NA
 10464593 10464594 HMPREF0868_0208 HMPREF0868_0209     TRUE 0.614 32.000 0.000 1.000 N NA
 10464594 10464595 HMPREF0868_0209 HMPREF0868_0210     TRUE 0.907 18.000 0.000 0.085 Y NA
 10464595 10464596 HMPREF0868_0210 HMPREF0868_0211     TRUE 0.996 15.000 0.035 1.000 Y NA
 10464596 10464597 HMPREF0868_0211 HMPREF0868_0212     TRUE 0.950 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 10464601 10464602 HMPREF0868_0215 HMPREF0868_0217     FALSE 0.209 148.000 0.000 NA   NA
 10464602 10464603 HMPREF0868_0217 HMPREF0868_0218     FALSE 0.080 420.000 0.000 1.000 N NA
 10464604 10464605 HMPREF0868_0219 HMPREF0868_0220     TRUE 0.775 21.000 0.000 1.000 N NA
 10464605 10464606 HMPREF0868_0220 HMPREF0868_0221     TRUE 0.999 -13.000 0.444 0.060 Y NA
 10464606 10464607 HMPREF0868_0221 HMPREF0868_0222     TRUE 0.805 30.000 0.000 0.060 Y NA
 10464607 10464608 HMPREF0868_0222 HMPREF0868_0223     TRUE 0.953 0.000 0.000 1.000 Y NA
 10464608 10464609 HMPREF0868_0223 HMPREF0868_0224     TRUE 0.591 21.000 0.000 NA   NA
 10464609 10464610 HMPREF0868_0224 HMPREF0868_0225     TRUE 0.773 8.000 0.000 NA   NA
 10464611 10464612 HMPREF0868_0226 HMPREF0868_0227     FALSE 0.160 168.000 0.000 NA   NA
 10464615 10464616 HMPREF0868_0230 HMPREF0868_0231     FALSE 0.042 364.000 0.000 NA   NA
 10464616 10464617 HMPREF0868_0231 HMPREF0868_0232     TRUE 0.523 24.000 0.000 NA   NA
 10464617 10464618 HMPREF0868_0232 HMPREF0868_0233     FALSE 0.028 583.000 0.000 NA   NA
 10464618 10464619 HMPREF0868_0233 HMPREF0868_0234     TRUE 0.990 162.000 0.238 NA Y NA
 10464619 10464620 HMPREF0868_0234 HMPREF0868_0235     TRUE 0.989 82.000 0.386 NA   NA
 10464620 10464621 HMPREF0868_0235 HMPREF0868_0236     TRUE 0.999 2.000 0.625 NA   NA
 10464621 10464622 HMPREF0868_0236 HMPREF0868_0237     TRUE 0.999 7.000 0.878 0.099 N NA
 10464622 10464623 HMPREF0868_0237 HMPREF0868_0238     TRUE 0.982 83.000 0.175 1.000 N NA
 10464623 10464624 HMPREF0868_0238 HMPREF0868_0239     TRUE 0.490 410.000 0.028 1.000   NA
 10464624 10464625 HMPREF0868_0239 HMPREF0868_0240     TRUE 0.987 113.000 0.300 NA   NA
 10464625 10464626 HMPREF0868_0240 HMPREF0868_0241     TRUE 0.979 108.000 0.192 NA   NA
 10464626 10464627 HMPREF0868_0241 HMPREF0868_0242     TRUE 1.000 0.000 0.615 1.000 Y NA
 10464627 10464628 HMPREF0868_0242 HMPREF0868_0243     TRUE 0.804 18.000 0.000 1.000 N NA
 10464629 10464630 HMPREF0868_0244 HMPREF0868_0245     FALSE 0.053 319.000 0.000 NA   NA
 10464631 10464632 HMPREF0868_0246 HMPREF0868_0247   nusA TRUE 0.990 57.000 0.759 NA   NA
 10464632 10464633 HMPREF0868_0247 HMPREF0868_0248 nusA   TRUE 0.994 -16.000 0.075 NA N NA
 10464633 10464634 HMPREF0868_0248 HMPREF0868_0249   infB TRUE 0.974 252.000 0.223 NA Y NA
 10464634 10464635 HMPREF0868_0249 HMPREF0868_0250 infB rbfA TRUE 1.000 2.000 0.530 1.000 Y NA
 10464635 10464636 HMPREF0868_0250 HMPREF0868_0251 rbfA   TRUE 0.995 -25.000 0.173 1.000   NA
 10464636 10464637 HMPREF0868_0251 HMPREF0868_0252   truB TRUE 0.952 85.000 0.094 1.000   NA
 10464637 10464638 HMPREF0868_0252 HMPREF0868_0253 truB ribF TRUE 0.652 -19.000 0.000 1.000   NA
 10464638 10464639 HMPREF0868_0253 HMPREF0868_0254 ribF   TRUE 0.998 -18.000 0.872 0.010   NA
 10464639 10464640 HMPREF0868_0254 HMPREF0868_0255   lgt TRUE 0.994 8.000 0.079 1.000   NA
 10464640 10464641 HMPREF0868_0255 HMPREF0868_0256 lgt   TRUE 0.761 23.000 0.000 NA N NA
 10464643 10464644 HMPREF0868_0258 HMPREF0868_0259     FALSE 0.023 880.000 0.000 NA   NA
 10464644 10464645 HMPREF0868_0259 HMPREF0868_0260     TRUE 0.768 1.000 0.000 NA   NA
 10464645 10464646 HMPREF0868_0260 HMPREF0868_0261     FALSE 0.228 140.000 0.000 NA   NA
 10464646 10464647 HMPREF0868_0261 HMPREF0868_0262     TRUE 0.983 113.000 0.231 NA   NA
 10464647 10464648 HMPREF0868_0262 HMPREF0868_0263     FALSE 0.105 214.000 0.000 NA   NA
 10464648 10464649 HMPREF0868_0263 HMPREF0868_0264     FALSE 0.241 52.000 0.000 1.000   NA
 10464649 10464650 HMPREF0868_0264 HMPREF0868_0265     TRUE 0.989 71.000 0.500 1.000   NA
 10464650 10464651 HMPREF0868_0265 HMPREF0868_0266     TRUE 0.696 -7.000 0.000 1.000   NA
 10464651 10464652 HMPREF0868_0266 HMPREF0868_0267     TRUE 0.681 2.000 0.000 0.059   NA
 10464652 10464653 HMPREF0868_0267 HMPREF0868_0268     TRUE 0.749 12.000 0.000 NA   NA
 10464653 10464654 HMPREF0868_0268 HMPREF0868_0269     TRUE 0.701 131.000 0.000 NA Y NA
 10464656 10464657 HMPREF0868_0271 HMPREF0868_0272     TRUE 0.607 20.000 0.000 NA   NA
 10464657 10464658 HMPREF0868_0272 HMPREF0868_0273     FALSE 0.285 299.000 0.000 1.000 Y NA
 10464658 10464659 HMPREF0868_0273 HMPREF0868_0274     TRUE 0.614 32.000 0.000 1.000 N NA
 10464659 10464660 HMPREF0868_0274 HMPREF0868_0275   nhaC TRUE 0.999 -3.000 0.269 1.000 N NA
 10464660 10464661 HMPREF0868_0275 HMPREF0868_0276 nhaC xylA TRUE 0.939 35.000 0.007 1.000 N NA
 10464661 10464662 HMPREF0868_0276 HMPREF0868_0277 xylA xylB TRUE 0.722 116.000 0.000 1.000 Y NA
 10464663 10464664 HMPREF0868_0278 HMPREF0868_0279     TRUE 0.993 -3.000 0.078 1.000   NA
 10464664 10464665 HMPREF0868_0279 HMPREF0868_0280   trmB TRUE 0.997 14.000 0.235 NA   NA
 10464665 10464666 HMPREF0868_0280 HMPREF0868_0281 trmB   FALSE 0.105 358.000 0.000 NA N NA
 10464666 10464667 HMPREF0868_0281 HMPREF0868_0282     TRUE 0.750 -3.000 0.000 NA   NA
 10464668 10464669 HMPREF0868_0283 HMPREF0868_0284     FALSE 0.053 319.000 0.000 NA   NA
 10464669 10464670 HMPREF0868_0284 HMPREF0868_0285     TRUE 0.944 172.000 0.167 NA   NA
 10464670 10464671 HMPREF0868_0285 HMPREF0868_0286     TRUE 0.689 5.000 0.000 0.059   NA
 10464671 10464672 HMPREF0868_0286 HMPREF0868_0287     FALSE 0.202 119.000 0.000 0.059   NA
 10464672 10464673 HMPREF0868_0287 HMPREF0868_0288     TRUE 0.999 -3.000 0.286 1.000 N NA
 10464673 10464674 HMPREF0868_0288 HMPREF0868_0289     TRUE 0.987 58.000 0.429 0.011   NA
 10464674 10464675 HMPREF0868_0289 HMPREF0868_0290     FALSE 0.362 36.000 0.000 NA   NA
 10464676 10464677 HMPREF0868_0291 HMPREF0868_0292     TRUE 0.654 17.000 0.000 NA   NA
 10464678 10464679 HMPREF0868_0293 HMPREF0868_0294     FALSE 0.293 113.000 0.000 NA   NA
 10464679 10464680 HMPREF0868_0294 HMPREF0868_0295     FALSE 0.215 146.000 0.000 NA   NA
 10464680 10464681 HMPREF0868_0295 HMPREF0868_0296     FALSE 0.046 341.000 0.000 NA   NA
 10464681 10464682 HMPREF0868_0296 HMPREF0868_0297     FALSE 0.288 119.000 0.000 NA   NA
 10464682 10464683 HMPREF0868_0297 HMPREF0868_0298     FALSE 0.131 187.000 0.000 NA   NA
 10464683 10464684 HMPREF0868_0298 HMPREF0868_0299     FALSE 0.066 262.000 0.000 1.000   NA
 10464684 10464685 HMPREF0868_0299 HMPREF0868_0300     TRUE 0.993 121.000 0.833 0.059 N NA
 10464685 10464686 HMPREF0868_0300 HMPREF0868_0301     TRUE 0.999 -13.000 0.833 0.059 N NA
 10464687 10464688 HMPREF0868_0302 HMPREF0868_0303     TRUE 0.999 4.000 1.000 NA   NA
 10464688 10464689 HMPREF0868_0303 HMPREF0868_0304     TRUE 0.995 5.000 0.087 NA   NA
 10464689 10464690 HMPREF0868_0304 HMPREF0868_0305     TRUE 0.962 82.000 0.130 NA   NA
 10464690 10464691 HMPREF0868_0305 HMPREF0868_0306     FALSE 0.298 105.000 0.000 NA   NA
 10464692 10464693 HMPREF0868_0307 HMPREF0868_0308     TRUE 0.992 38.000 0.500 0.011   NA
 10464693 10464694 HMPREF0868_0308 HMPREF0868_0309     FALSE 0.059 217.000 0.000 0.026   NA
 10464694 10464695 HMPREF0868_0309 HMPREF0868_0310     FALSE 0.054 318.000 0.000 NA   NA
 10464695 10464696 HMPREF0868_0310 HMPREF0868_0311     TRUE 0.749 12.000 0.000 NA   NA
 10464696 10464697 HMPREF0868_0311 HMPREF0868_0312     TRUE 0.926 -10.000 0.000 0.002 Y NA
 10464697 10464698 HMPREF0868_0312 HMPREF0868_0313     TRUE 0.725 45.000 0.000 1.000 Y NA
 10464698 10464699 HMPREF0868_0313 HMPREF0868_0314     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.058 Y NA
 10464699 10464700 HMPREF0868_0314 HMPREF0868_0315     TRUE 1.000 2.000 0.600 0.058 Y NA
 10464700 10464701 HMPREF0868_0315 HMPREF0868_0316     TRUE 0.999 5.000 0.600 1.000   NA
 10464701 10464702 HMPREF0868_0316 HMPREF0868_0317     TRUE 0.780 3.000 0.000 NA   NA
 10464702 10464703 HMPREF0868_0317 HMPREF0868_0318     TRUE 0.780 3.000 0.000 NA   NA
 10464703 10464704 HMPREF0868_0318 HMPREF0868_0319     TRUE 0.952 5.000 0.000 0.058 Y NA
 10464704 10464705 HMPREF0868_0319 HMPREF0868_0320     TRUE 0.928 204.000 0.051 0.058 Y NA
 10464705 10464706 HMPREF0868_0320 HMPREF0868_0321     TRUE 0.570 22.000 0.000 NA   NA
 10464706 10464707 HMPREF0868_0321 HMPREF0868_0322     FALSE 0.122 196.000 0.000 NA   NA
 10464707 10464708 HMPREF0868_0322 HMPREF0868_0324     TRUE 0.696 15.000 0.000 NA   NA
 10464709 10464710 HMPREF0868_0323 HMPREF0868_0325   mgtA FALSE 0.051 332.000 0.000 NA   NA
 10464713 10464714 HMPREF0868_0328 HMPREF0868_0329     FALSE 0.277 90.000 0.000 NA   NA
 10464714 10464715 HMPREF0868_0329 HMPREF0868_0330     FALSE 0.037 399.000 0.000 NA   NA
 10464715 10464716 HMPREF0868_0330 HMPREF0868_0331     FALSE 0.269 80.000 0.000 NA   NA
 10464717 10464718 HMPREF0868_0332 HMPREF0868_0333     FALSE 0.183 160.000 0.000 NA   NA
 10464719 10464720 HMPREF0868_0334 HMPREF0868_0335   mraW FALSE 0.288 96.000 0.000 NA   NA
 10464720 10464721 HMPREF0868_0335 HMPREF0868_0336 mraW   FALSE 0.271 82.000 0.000 NA   NA
 10464721 10464722 HMPREF0868_0336 HMPREF0868_0337     TRUE 0.711 -10.000 0.000 NA   NA
 10464722 10464723 HMPREF0868_0337 HMPREF0868_0338   murF FALSE 0.262 113.000 0.000 1.000   NA
 10464723 10464724 HMPREF0868_0338 HMPREF0868_0339 murF mraY TRUE 0.643 132.000 0.000 0.010 Y NA
 10464724 10464725 HMPREF0868_0339 HMPREF0868_0340 mraY   TRUE 0.791 17.000 0.000 0.057 N NA
 10464725 10464726 HMPREF0868_0340 HMPREF0868_0341   murG TRUE 0.989 9.000 0.008 1.000 N NA
 10464726 10464727 HMPREF0868_0341 HMPREF0868_0343 murG ftsQ TRUE 0.959 7.000 0.000 NA Y NA
 10464729 10464730 HMPREF0868_0344 HMPREF0868_0345 ftsZ nrdR TRUE 0.923 60.000 0.013 NA N NA
 10464730 10464731 HMPREF0868_0345 HMPREF0868_0346 nrdR   FALSE 0.363 261.000 0.000 NA Y NA
 10464731 10464732 HMPREF0868_0346 HMPREF0868_0347     TRUE 0.997 75.000 0.653 1.000 Y NA
 10464732 10464733 HMPREF0868_0347 HMPREF0868_0348   nth TRUE 0.652 29.000 0.000 1.000 N NA
 10464733 10464734 HMPREF0868_0348 HMPREF0868_0349 nth recG TRUE 0.853 26.000 0.000 1.000 Y NA
 10464734 10464735 HMPREF0868_0349 HMPREF0868_0350 recG   TRUE 0.956 2.000 0.000 1.000 Y NA
 10464735 10464736 HMPREF0868_0350 HMPREF0868_0351   coaD TRUE 0.993 10.000 0.031 1.000 N NA
 10464736 10464737 HMPREF0868_0351 HMPREF0868_0352 coaD   TRUE 0.980 -7.000 0.008 NA   NA
 10464737 10464738 HMPREF0868_0352 HMPREF0868_0353     TRUE 0.696 15.000 0.000 NA   NA
 10464738 10464739 HMPREF0868_0353 HMPREF0868_0354     TRUE 0.976 20.000 0.027 NA   NA
 10464742 10464743 HMPREF0868_0357 HMPREF0868_0358     FALSE 0.259 63.000 0.000 NA   NA
 10464743 10464744 HMPREF0868_0358 HMPREF0868_0359     FALSE 0.242 137.000 0.000 NA   NA
 10464745 10464746 HMPREF0868_0360 HMPREF0868_0361 argF arcC TRUE 0.996 62.000 0.400 1.000 Y NA
 10464746 10464747 HMPREF0868_0361 HMPREF0868_0362 arcC agcS TRUE 0.726 109.000 0.000 1.000 Y NA
 10464747 10464748 HMPREF0868_0362 HMPREF0868_0363 agcS   FALSE 0.293 114.000 0.000 NA   NA
 10464748 10464749 HMPREF0868_0363 HMPREF0868_0364     FALSE 0.292 115.000 0.000 NA   NA
 10464749 10464750 HMPREF0868_0364 HMPREF0868_0365     TRUE 0.696 -15.000 0.000 NA   NA
 10464750 10464751 HMPREF0868_0365 HMPREF0868_0366     FALSE 0.307 43.000 0.000 NA   NA
 10464752 10464753 HMPREF0868_0367 HMPREF0868_0368 sufB   TRUE 0.974 70.000 0.152 0.003 N NA
 10464753 10464754 HMPREF0868_0368 HMPREF0868_0369     TRUE 0.998 -16.000 0.292 1.000 N NA
 10464754 10464755 HMPREF0868_0369 HMPREF0868_0370     TRUE 0.999 0.000 0.606 1.000 N NA
 10464755 10464756 HMPREF0868_0370 HMPREF0868_0371   sufC TRUE 0.998 15.000 0.139 1.000 Y NA
 10464757 10464758 HMPREF0868_0372 HMPREF0868_0373     TRUE 0.717 -9.000 0.000 NA   NA
 10464759 10464760 HMPREF0868_0374 HMPREF0868_0375     FALSE 0.190 78.000 0.000 0.094   NA
 10464761 10464762 HMPREF0868_0376 HMPREF0868_0377     TRUE 0.993 118.000 0.500 0.057 N NA
 10464762 10464763 HMPREF0868_0377 HMPREF0868_0378     TRUE 0.457 109.000 0.000 0.057 N NA
 10464763 10464764 HMPREF0868_0378 HMPREF0868_0379     TRUE 0.430 86.000 0.000 0.057 N NA
 10464764 10464765 HMPREF0868_0379 HMPREF0868_0380     FALSE 0.274 87.000 0.000 NA   NA
 10464765 10464766 HMPREF0868_0380 HMPREF0868_0381     FALSE 0.256 68.000 0.000 NA   NA
 10464766 10464767 HMPREF0868_0381 HMPREF0868_0382     TRUE 0.759 11.000 0.000 NA   NA
 10464771 10464772 HMPREF0868_0386 HMPREF0868_0387     FALSE 0.307 43.000 0.000 NA   NA
 10464774 10464775 HMPREF0868_0389 HMPREF0868_0390     FALSE 0.188 157.000 0.000 NA   NA
 10464777 10464778 HMPREF0868_0392 HMPREF0868_0393     TRUE 0.462 27.000 0.000 NA   NA
 10464779 10464780 HMPREF0868_0394 HMPREF0868_0395 pyrI pyrB TRUE 0.999 -7.000 0.197 0.002 Y NA
 10464780 10464781 HMPREF0868_0395 HMPREF0868_0396 pyrB   FALSE 0.235 139.000 0.000 NA   NA
 10464781 10464782 HMPREF0868_0396 HMPREF0868_0397     FALSE 0.100 218.000 0.000 NA   NA
 10464782 10464783 HMPREF0868_0397 HMPREF0868_0398     FALSE 0.267 128.000 0.000 NA   NA
 10464790 10464791 HMPREF0868_0405 HMPREF0868_0406   dtd FALSE 0.257 64.000 0.000 NA   NA
 10464791 10464792 HMPREF0868_0406 HMPREF0868_0407 dtd pth TRUE 0.955 9.000 0.000 1.000 Y NA
 10464792 10464793 HMPREF0868_0407 HMPREF0868_0408 pth mfd TRUE 0.982 40.000 0.137 1.000 N NA
 10464793 10464794 HMPREF0868_0408 HMPREF0868_0409 mfd   FALSE 0.189 241.000 0.000 1.000 N NA
 10464794 10464795 HMPREF0868_0409 HMPREF0868_0410     FALSE 0.341 245.000 0.000 0.057 Y NA
 10464795 10464796 HMPREF0868_0410 HMPREF0868_0411     TRUE 0.952 5.000 0.000 0.057 Y NA
 10464796 10464797 HMPREF0868_0411 HMPREF0868_0412     TRUE 0.928 16.000 0.000 1.000 Y NA
 10464797 10464798 HMPREF0868_0412 HMPREF0868_0413     TRUE 0.999 -7.000 0.667 0.007 Y NA
 10464798 10464799 HMPREF0868_0413 HMPREF0868_0414     FALSE 0.240 138.000 0.000 NA   NA
 10464799 10464800 HMPREF0868_0414 HMPREF0868_0415     FALSE 0.274 87.000 0.000 NA   NA
 10464800 10464801 HMPREF0868_0415 HMPREF0868_0416     FALSE 0.391 236.000 0.000 1.000 Y NA
 10464801 10464802 HMPREF0868_0416 HMPREF0868_0417     FALSE 0.178 150.000 0.000 1.000   NA
 10464804 10464805 HMPREF0868_0419 HMPREF0868_0420     FALSE 0.050 302.000 0.000 1.000   NA
 10464805 10464806 HMPREF0868_0420 HMPREF0868_0421     FALSE 0.256 70.000 0.000 NA   NA
 10464806 10464807 HMPREF0868_0421 HMPREF0868_0422     FALSE 0.381 34.000 0.000 NA   NA
 10464807 10464808 HMPREF0868_0422 HMPREF0868_0423     FALSE 0.262 60.000 0.000 NA   NA
 10464808 10464809 HMPREF0868_0423 HMPREF0868_0424     FALSE 0.297 107.000 0.000 NA   NA
 10464809 10464810 HMPREF0868_0424 HMPREF0868_0425     FALSE 0.257 71.000 0.000 NA   NA
 10464810 10464811 HMPREF0868_0425 HMPREF0868_0426     TRUE 0.941 84.000 0.062 NA   NA
 10464811 10464812 HMPREF0868_0426 HMPREF0868_0427     FALSE 0.274 87.000 0.000 NA   NA
 10464815 10464816 HMPREF0868_0430 HMPREF0868_0432     FALSE 0.030 485.000 0.000 NA   NA
 10464817 10464818 HMPREF0868_0433 HMPREF0868_0434     FALSE 0.423 139.000 0.000 1.000 N NA
 10464818 10464819 HMPREF0868_0434 HMPREF0868_0435     FALSE 0.294 45.000 0.000 NA   NA
 10464820 10464821 HMPREF0868_0436 HMPREF0868_0437   ahpC FALSE 0.069 273.000 0.000 NA   NA
 10464821 10464822 HMPREF0868_0437 HMPREF0868_0438 ahpC   FALSE 0.288 96.000 0.000 NA   NA
 10464822 10464823 HMPREF0868_0438 HMPREF0868_0439     TRUE 0.999 4.000 1.000 NA   NA
 10464823 10464824 HMPREF0868_0439 HMPREF0868_0440     FALSE 0.276 88.000 0.000 NA   NA
 10464824 10464825 HMPREF0868_0440 HMPREF0868_0441     FALSE 0.262 60.000 0.000 NA   NA
 10464828 10464829 HMPREF0868_0444 HMPREF0868_0445     FALSE 0.066 280.000 0.000 NA   NA
 10464829 10464830 HMPREF0868_0445 HMPREF0868_0446     TRUE 0.632 18.000 0.000 NA   NA
 10464830 10464831 HMPREF0868_0446 HMPREF0868_0447   proS FALSE 0.169 270.000 0.000 NA N NA
 10464831 10464832 HMPREF0868_0447 HMPREF0868_0448 proS   FALSE 0.047 339.000 0.000 NA   NA
 10464833 10464834 HMPREF0868_0449 HMPREF0868_0450     TRUE 0.995 48.000 0.333 0.010 Y NA
 10464835 10464836 HMPREF0868_0451 HMPREF0868_0452     FALSE 0.267 128.000 0.000 NA   NA
 10464836 10464837 HMPREF0868_0452 HMPREF0868_0453   rpmF TRUE 0.995 30.000 0.599 NA   NA
 10464837 10464838 HMPREF0868_0453 HMPREF0868_0454 rpmF   TRUE 0.763 0.000 0.000 NA   NA
 10464838 10464839 HMPREF0868_0454 HMPREF0868_0455   engA TRUE 0.671 -46.000 0.000 NA   NA
 10464839 10464840 HMPREF0868_0455 HMPREF0868_0456 engA typA FALSE 0.178 116.000 0.000 0.013   NA
 10464840 10464841 HMPREF0868_0456 HMPREF0868_0457 typA   TRUE 0.849 51.000 0.004 NA   NA
 10464841 10464842 HMPREF0868_0457 HMPREF0868_0458     TRUE 0.986 13.000 0.025 NA   NA
 10464843 10464844 HMPREF0868_0459 HMPREF0868_0460     FALSE 0.180 161.000 0.000 NA   NA
 10464845 10464846 HMPREF0868_0461 HMPREF0868_0462     FALSE 0.317 42.000 0.000 NA   NA
 10464846 10464847 HMPREF0868_0462 HMPREF0868_0463     TRUE 0.911 101.000 0.022 NA   NA
 10464847 10464848 HMPREF0868_0463 HMPREF0868_0464     FALSE 0.297 107.000 0.000 NA   NA
 10464850 10464851 HMPREF0868_0466 HMPREF0868_0467     FALSE 0.337 39.000 0.000 NA   NA
 10464851 10464852 HMPREF0868_0467 HMPREF0868_0468     FALSE 0.409 31.000 0.000 NA   NA
 10464852 10464853 HMPREF0868_0468 HMPREF0868_0469     FALSE 0.106 213.000 0.000 NA   NA
 10464853 10464854 HMPREF0868_0469 HMPREF0868_0470     TRUE 0.998 -22.000 0.681 NA   NA
 10464854 10464855 HMPREF0868_0470 HMPREF0868_0471     TRUE 0.999 3.000 0.848 1.000   NA
 10464855 10464856 HMPREF0868_0471 HMPREF0868_0472   clpC FALSE 0.215 215.000 0.000 1.000 N NA
 10464856 10464857 HMPREF0868_0472 HMPREF0868_0473 clpC   FALSE 0.423 30.000 0.000 NA   NA
 10464858 10464859 HMPREF0868_0474 HMPREF0868_0475     TRUE 0.549 23.000 0.000 NA   NA
 10464859 10464860 HMPREF0868_0475 HMPREF0868_0476     FALSE 0.221 143.000 0.000 NA   NA
 10464861 10464862 HMPREF0868_0477 HMPREF0868_0478     TRUE 0.525 42.000 0.000 1.000 N NA
 10464862 10464863 HMPREF0868_0478 HMPREF0868_0479     FALSE 0.272 84.000 0.000 NA   NA
 10464864 10464865 HMPREF0868_0480 HMPREF0868_0481     TRUE 0.718 12.000 0.000 1.000   NA
 10464866 10464867 HMPREF0868_0482 HMPREF0868_0484   murE FALSE 0.257 71.000 0.000 NA   NA
 10464868 10464869 HMPREF0868_0483 HMPREF0868_0485     FALSE 0.297 107.000 0.000 NA   NA
 10464870 10464871 HMPREF0868_0486 HMPREF0868_0487   raiA FALSE 0.318 174.000 0.000 NA N NA
 10464871 10464872 HMPREF0868_0487 HMPREF0868_0488 raiA   FALSE 0.047 339.000 0.000 NA   NA
 10464872 10464873 HMPREF0868_0488 HMPREF0868_0489     FALSE 0.203 46.000 0.000 0.059   NA
 10464873 10464874 HMPREF0868_0489 HMPREF0868_0491     TRUE 0.991 -10.000 0.086 0.059   NA
 10464876 10464877 HMPREF0868_0492 HMPREF0868_0493     TRUE 0.995 13.000 0.086 0.059 N NA
 10464877 10464878 HMPREF0868_0493 HMPREF0868_0494   hsdR TRUE 0.974 94.000 0.052 0.004 Y NA
 10464878 10464879 HMPREF0868_0494 HMPREF0868_0495 hsdR   FALSE 0.244 182.000 0.000 0.059 N NA
 10464879 10464880 HMPREF0868_0495 HMPREF0868_0496     TRUE 0.531 22.000 0.000 1.000   NA
 10464880 10464881 HMPREF0868_0496 HMPREF0868_0497     TRUE 0.666 -13.000 0.000 1.000   NA
 10464881 10464882 HMPREF0868_0497 HMPREF0868_0498   folC TRUE 0.751 3.000 0.000 1.000   NA
 10464882 10464883 HMPREF0868_0498 HMPREF0868_0499 folC   FALSE 0.176 249.000 0.000 1.000 N NA
 10464885 10464886 HMPREF0868_0501 HMPREF0868_0502   thiD FALSE 0.423 30.000 0.000 NA   NA
 10464887 10464888 HMPREF0868_0503 HMPREF0868_0504   nagA TRUE 0.558 166.000 0.000 1.000 Y NA
 10464888 10464889 HMPREF0868_0504 HMPREF0868_0505 nagA   TRUE 0.868 13.000 0.000 1.000 N NA
 10464889 10464890 HMPREF0868_0505 HMPREF0868_0506     TRUE 0.980 143.000 0.200 1.000 N NA
 10464890 10464891 HMPREF0868_0506 HMPREF0868_0507     TRUE 1.000 10.000 1.000 0.055 Y NA
 10464891 10464892 HMPREF0868_0507 HMPREF0868_0508     TRUE 0.990 134.000 0.200 0.055 Y NA
 10464892 10464893 HMPREF0868_0508 HMPREF0868_0509     TRUE 0.980 164.000 0.250 1.000 N NA
 10464893 10464894 HMPREF0868_0509 HMPREF0868_0510     FALSE 0.362 155.000 0.000 1.000 N NA
 10464895 10464896 HMPREF0868_0511 HMPREF0868_0512     TRUE 0.774 2.000 0.000 NA   NA
 10464896 10464897 HMPREF0868_0512 HMPREF0868_0513     FALSE 0.293 114.000 0.000 NA   NA
 10464897 10464898 HMPREF0868_0513 HMPREF0868_0514     FALSE 0.281 123.000 0.000 NA   NA
 10464898 10464899 HMPREF0868_0514 HMPREF0868_0515     TRUE 0.774 2.000 0.000 NA   NA
 10464899 10464900 HMPREF0868_0515 HMPREF0868_0516     FALSE 0.144 178.000 0.000 NA   NA
 10464900 10464901 HMPREF0868_0516 HMPREF0868_0518     FALSE 0.029 515.000 0.000 NA   NA
 10464903 10464904 HMPREF0868_0519 HMPREF0868_0520     FALSE 0.269 79.000 0.000 NA   NA
 10464904 10464905 HMPREF0868_0520 HMPREF0868_0521     FALSE 0.266 55.000 0.000 NA   NA
 10464905 10464906 HMPREF0868_0521 HMPREF0868_0522     FALSE 0.291 117.000 0.000 NA   NA
 10464906 10464907 HMPREF0868_0522 HMPREF0868_0523     FALSE 0.328 40.000 0.000 NA   NA
 10464907 10464908 HMPREF0868_0523 HMPREF0868_0524     FALSE 0.370 35.000 0.000 NA   NA
 10464908 10464909 HMPREF0868_0524 HMPREF0868_0525     FALSE 0.277 50.000 0.000 NA   NA
 10464909 10464910 HMPREF0868_0525 HMPREF0868_0526     FALSE 0.291 117.000 0.000 NA   NA
 10464910 10464911 HMPREF0868_0526 HMPREF0868_0527     FALSE 0.262 60.000 0.000 NA   NA
 10464911 10464912 HMPREF0868_0527 HMPREF0868_0528     TRUE 0.673 -34.000 0.000 NA   NA
 10464912 10464913 HMPREF0868_0528 HMPREF0868_0529     FALSE 0.096 224.000 0.000 NA   NA
 10464913 10464914 HMPREF0868_0529 HMPREF0868_0530     FALSE 0.079 258.000 0.000 NA   NA
 10464914 10464915 HMPREF0868_0530 HMPREF0868_0531   nrdD FALSE 0.049 729.000 0.000 0.052 N NA
 10464915 10464916 HMPREF0868_0531 HMPREF0868_0532 nrdD nrdG TRUE 0.998 -28.000 0.240 1.000 N NA
 10464916 10464917 HMPREF0868_0532 HMPREF0868_0533 nrdG   FALSE 0.070 480.000 0.000 1.000 N NA
 10464918 10464919 HMPREF0868_0534 HMPREF0868_0535     FALSE 0.272 83.000 0.000 NA   NA
 10464919 10464920 HMPREF0868_0535 HMPREF0868_0536   thrS FALSE 0.263 75.000 0.000 NA   NA
 10464920 10464921 HMPREF0868_0536 HMPREF0868_0538 thrS adh FALSE 0.114 331.000 0.000 1.000 N NA
 10464921 10464922 HMPREF0868_0538 HMPREF0868_0539 adh   FALSE 0.259 73.000 0.000 NA   NA
 10464922 10464923 HMPREF0868_0539 HMPREF0868_0540     FALSE 0.172 164.000 0.000 NA   NA
 10464923 10464924 HMPREF0868_0540 HMPREF0868_0541     TRUE 0.496 100.000 0.000 1.000 N NA
 10464927 10464928 HMPREF0868_0544 HMPREF0868_0545     FALSE 0.187 158.000 0.000 NA   NA
 10464928 10464929 HMPREF0868_0545 HMPREF0868_0546     FALSE 0.023 948.000 0.000 NA   NA
 10464929 10464930 HMPREF0868_0546 HMPREF0868_0547     TRUE 0.729 -7.000 0.000 NA   NA
 10464930 10464931 HMPREF0868_0547 HMPREF0868_0548     TRUE 0.701 -13.000 0.000 NA   NA
 10464931 10464932 HMPREF0868_0548 HMPREF0868_0549     FALSE 0.261 74.000 0.000 NA   NA
 10464932 10464933 HMPREF0868_0549 HMPREF0868_0550     FALSE 0.272 84.000 0.000 NA   NA
 10464933 10464934 HMPREF0868_0550 HMPREF0868_0551     FALSE 0.297 104.000 0.000 NA   NA
 10464934 10464935 HMPREF0868_0551 HMPREF0868_0552     FALSE 0.278 91.000 0.000 NA   NA
 10464935 10464936 HMPREF0868_0552 HMPREF0868_0553     TRUE 0.768 1.000 0.000 NA   NA
 10464936 10464937 HMPREF0868_0553 HMPREF0868_0554     TRUE 0.983 -16.000 0.027 NA   NA
 10464937 10464938 HMPREF0868_0554 HMPREF0868_0555     TRUE 0.701 -13.000 0.000 NA   NA
 10464939 10464940 HMPREF0868_0556 HMPREF0868_0557     FALSE 0.283 94.000 0.000 NA   NA
 10464941 10464942 HMPREF0868_0558 HMPREF0868_0559   glgP TRUE 0.486 76.000 0.000 NA N NA
 10464942 10464943 HMPREF0868_0559 HMPREF0868_0560 glgP   FALSE 0.050 334.000 0.000 NA   NA
 10464943 10464944 HMPREF0868_0560 HMPREF0868_0561     FALSE 0.300 44.000 0.000 NA   NA
 10464944 10464945 HMPREF0868_0561 HMPREF0868_0562     TRUE 0.998 1.000 0.231 NA   NA
 10464947 10464948 HMPREF0868_0564 HMPREF0868_0565     TRUE 0.770 9.000 0.000 NA   NA
 10464948 10464949 HMPREF0868_0565 HMPREF0868_0566     FALSE 0.027 619.000 0.000 NA   NA
 10464949 10464950 HMPREF0868_0566 HMPREF0868_0567     TRUE 0.836 26.000 0.000 0.053 Y NA
 10464950 10464951 HMPREF0868_0567 HMPREF0868_0568     TRUE 0.922 -24.000 0.000 0.053 Y NA
 10464951 10464952 HMPREF0868_0568 HMPREF0868_0569     TRUE 0.677 -10.000 0.000 1.000   NA
 10464952 10464953 HMPREF0868_0569 HMPREF0868_0570     TRUE 0.707 -6.000 0.000 1.000   NA
 10464953 10464954 HMPREF0868_0570 HMPREF0868_0571     TRUE 0.997 4.000 0.149 0.015 N NA
 10464955 10464956 HMPREF0868_0572 HMPREF0868_0573     FALSE 0.084 246.000 0.000 NA   NA
 10464957 10464958 HMPREF0868_0574 HMPREF0868_0575 pepD   TRUE 0.755 40.000 0.000 1.000 Y NA
 10464958 10464959 HMPREF0868_0575 HMPREF0868_0576   nagB TRUE 0.452 70.000 0.000 1.000 N NA
 10464961 10464962 HMPREF0868_0578 HMPREF0868_0579 sdaAB sdaAA TRUE 0.999 5.000 0.268 0.002 Y NA
 10464962 10464963 HMPREF0868_0579 HMPREF0868_0580 sdaAA   TRUE 0.458 74.000 0.000 1.000 N NA
 10464963 10464964 HMPREF0868_0580 HMPREF0868_0581     FALSE 0.034 424.000 0.000 NA   NA
 10464964 10464965 HMPREF0868_0581 HMPREF0868_0582     FALSE 0.292 100.000 0.000 NA   NA
 10464965 10464966 HMPREF0868_0582 HMPREF0868_0583     TRUE 0.523 24.000 0.000 NA   NA
 10464966 10464967 HMPREF0868_0583 HMPREF0868_0584     FALSE 0.094 234.000 0.000 NA   NA
 10464967 10464968 HMPREF0868_0584 HMPREF0868_0585   hgdC FALSE 0.087 243.000 0.000 NA   NA
 10464968 10464969 HMPREF0868_0585 HMPREF0868_0586 hgdC fldB TRUE 0.993 93.000 0.875 1.000 N NA
 10464969 10464970 HMPREF0868_0586 HMPREF0868_0587 fldB   TRUE 1.000 3.000 0.500 NA Y NA
 10464970 10464971 HMPREF0868_0587 HMPREF0868_0588     TRUE 0.527 105.000 0.000 NA N NA
 10464971 10464972 HMPREF0868_0588 HMPREF0868_0589     TRUE 0.950 12.000 0.000 1.000 Y NA
 10464972 10464973 HMPREF0868_0589 HMPREF0868_0590   etfB TRUE 0.999 9.000 0.800 0.029 N NA
 10464973 10464974 HMPREF0868_0590 HMPREF0868_0591 etfB etfA TRUE 0.999 17.000 0.400 0.009 Y NA
 10464974 10464975 HMPREF0868_0591 HMPREF0868_0592 etfA fldA TRUE 0.853 26.000 0.000 1.000 Y NA
 10464975 10464976 HMPREF0868_0592 HMPREF0868_0593 fldA   FALSE 0.206 149.000 0.000 NA   NA
 10464976 10464977 HMPREF0868_0593 HMPREF0868_0594     FALSE 0.025 746.000 0.000 NA   NA
 10464977 10464978 HMPREF0868_0594 HMPREF0868_0595     TRUE 0.523 24.000 0.000 NA   NA
 10464978 10464979 HMPREF0868_0595 HMPREF0868_0596   glpK FALSE 0.035 418.000 0.000 NA   NA
 10464979 10464980 HMPREF0868_0596 HMPREF0868_0597 glpK   FALSE 0.122 196.000 0.000 NA   NA
 10464980 10464981 HMPREF0868_0597 HMPREF0868_0598     FALSE 0.242 137.000 0.000 NA   NA
 10464983 10464984 HMPREF0868_0600 HMPREF0868_0602   mgtE FALSE 0.263 75.000 0.000 NA   NA
 10464985 10464986 HMPREF0868_0601 HMPREF0868_0603   trkA TRUE 0.989 48.000 0.163 0.005 Y NA
 10464986 10464987 HMPREF0868_0603 HMPREF0868_0604 trkA   FALSE 0.267 128.000 0.000 NA   NA
 10464988 10464989 HMPREF0868_0605 HMPREF0868_0606     FALSE 0.042 361.000 0.000 NA   NA
 10464989 10464990 HMPREF0868_0606 HMPREF0868_0607     TRUE 0.991 10.000 0.017 1.000 N NA
 10464991 10464992 HMPREF0868_0608 HMPREF0868_0609     TRUE 0.687 -19.000 0.000 NA   NA
 10464993 10464994 HMPREF0868_0610 HMPREF0868_0611 tpiA   FALSE 0.370 35.000 0.000 NA   NA
 10464994 10464995 HMPREF0868_0611 HMPREF0868_0612     FALSE 0.267 77.000 0.000 NA   NA
 10464995 10464996 HMPREF0868_0612 HMPREF0868_0613   nifJ FALSE 0.269 79.000 0.000 NA   NA
 10464996 10464997 HMPREF0868_0613 HMPREF0868_0614 nifJ   FALSE 0.260 62.000 0.000 NA   NA
 10464997 10464998 HMPREF0868_0614 HMPREF0868_0615     FALSE 0.262 60.000 0.000 NA   NA
 10464998 10464999 HMPREF0868_0615 HMPREF0868_0616     TRUE 0.591 21.000 0.000 NA   NA
 10464999 10465000 HMPREF0868_0616 HMPREF0868_0617   acpS TRUE 0.878 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10465000 10465001 HMPREF0868_0617 HMPREF0868_0618 acpS   TRUE 0.461 57.000 0.000 1.000 N NA
 10465001 10465002 HMPREF0868_0618 HMPREF0868_0619   uvrB TRUE 0.889 9.000 0.000 1.000 N NA
 10465002 10465003 HMPREF0868_0619 HMPREF0868_0620 uvrB   TRUE 0.465 54.000 0.000 1.000 N NA
 10465003 10465004 HMPREF0868_0620 HMPREF0868_0621   dnaE TRUE 0.831 16.000 0.000 1.000 N NA
 10465005 10465006 HMPREF0868_0622 HMPREF0868_0623     FALSE 0.296 108.000 0.000 NA   NA
 10465007 10465008 HMPREF0868_0624 HMPREF0868_0625   trpS FALSE 0.286 120.000 0.000 NA   NA
 10465008 10465009 HMPREF0868_0625 HMPREF0868_0626 trpS rnhA TRUE 0.804 18.000 0.000 1.000 N NA
 10465009 10465010 HMPREF0868_0626 HMPREF0868_0627 rnhA   TRUE 0.953 47.000 0.006 1.000 Y NA
 10465010 10465011 HMPREF0868_0627 HMPREF0868_0628     TRUE 0.885 0.000 0.000 1.000 N NA
 10465011 10465012 HMPREF0868_0628 HMPREF0868_0629     TRUE 0.471 82.000 0.000 1.000 N NA
 10465012 10465013 HMPREF0868_0629 HMPREF0868_0630     TRUE 0.661 -15.000 0.000 1.000   NA
 10465013 10465014 HMPREF0868_0630 HMPREF0868_0631     TRUE 0.981 11.000 0.007 1.000   NA
 10465014 10465015 HMPREF0868_0631 HMPREF0868_0632   recA TRUE 0.819 134.000 0.004 1.000   NA
 10465015 10465016 HMPREF0868_0632 HMPREF0868_0633 recA recX TRUE 0.998 0.000 0.296 1.000   NA
 10465016 10465017 HMPREF0868_0633 HMPREF0868_0634 recX rimO TRUE 0.983 -3.000 0.012 1.000   NA
 10465017 10465018 HMPREF0868_0634 HMPREF0868_0635 rimO pgsA TRUE 0.995 17.000 0.132 1.000 N NA
 10465018 10465019 HMPREF0868_0635 HMPREF0868_0636 pgsA   TRUE 0.760 22.000 0.000 1.000 N NA
 10465019 10465020 HMPREF0868_0636 HMPREF0868_0637   acpP TRUE 0.466 128.000 0.000 1.000 N NA
 10465020 10465021 HMPREF0868_0637 HMPREF0868_0638 acpP   FALSE 0.337 163.000 0.000 1.000 N NA
 10465021 10465022 HMPREF0868_0638 HMPREF0868_0639     TRUE 0.993 99.000 0.222 0.052 Y NA
 10465022 10465023 HMPREF0868_0639 HMPREF0868_0640     TRUE 0.820 15.000 0.000 0.052 N NA
 10465023 10465024 HMPREF0868_0640 HMPREF0868_0641     TRUE 0.883 11.000 0.000 1.000 N NA
 10465024 10465025 HMPREF0868_0641 HMPREF0868_0642     TRUE 0.998 -7.000 0.109 0.006 Y NA
 10465025 10465026 HMPREF0868_0642 HMPREF0868_0643     TRUE 0.729 -7.000 0.000 NA   NA
 10465026 10465027 HMPREF0868_0643 HMPREF0868_0644   rnc TRUE 0.632 18.000 0.000 NA   NA
 10465027 10465028 HMPREF0868_0644 HMPREF0868_0645 rnc smc TRUE 0.996 -9.000 0.120 1.000 N NA
 10465028 10465029 HMPREF0868_0645 HMPREF0868_0646 smc ftsY TRUE 0.979 87.000 0.165 0.020 N NA
 10465029 10465030 HMPREF0868_0646 HMPREF0868_0647 ftsY   TRUE 0.467 53.000 0.000 1.000 N NA
 10465030 10465031 HMPREF0868_0647 HMPREF0868_0648     TRUE 0.706 -12.000 0.000 NA   NA
 10465031 10465032 HMPREF0868_0648 HMPREF0868_0649   valS TRUE 0.847 44.000 0.002 NA   NA
 10465032 10465033 HMPREF0868_0649 HMPREF0868_0650 valS coaBC TRUE 0.451 66.000 0.000 1.000 N NA
 10465033 10465034 HMPREF0868_0650 HMPREF0868_0651 coaBC cdd FALSE 0.158 268.000 0.000 1.000 N NA
 10465034 10465035 HMPREF0868_0651 HMPREF0868_0652 cdd   TRUE 0.921 31.000 0.008 1.000   NA
 10465035 10465036 HMPREF0868_0652 HMPREF0868_0653     TRUE 0.998 -10.000 0.438 1.000   NA
 10465036 10465037 HMPREF0868_0653 HMPREF0868_0654     TRUE 0.999 2.000 0.720 0.052   NA
 10465037 10465038 HMPREF0868_0654 HMPREF0868_0655   pyn TRUE 0.898 107.000 0.014 1.000   NA
 10465038 10465039 HMPREF0868_0655 HMPREF0868_0656 pyn deoC TRUE 0.957 70.000 0.013 1.000 Y NA
 10465039 10465040 HMPREF0868_0656 HMPREF0868_0657 deoC   TRUE 0.989 56.000 0.500 1.000   NA
 10465040 10465041 HMPREF0868_0657 HMPREF0868_0658   add TRUE 0.837 150.000 0.013 1.000   NA
 10465041 10465042 HMPREF0868_0658 HMPREF0868_0659 add   TRUE 0.988 -10.000 0.013 1.000 N NA
 10465042 10465043 HMPREF0868_0659 HMPREF0868_0660     TRUE 0.995 29.000 0.267 1.000 N NA
 10465045 10465046 HMPREF0868_0662 HMPREF0868_0663     FALSE 0.353 159.000 0.000 1.000 N NA
 10465048 10465049 HMPREF0868_0665 HMPREF0868_0666   ligA TRUE 0.750 -3.000 0.000 NA   NA
 10465049 10465050 HMPREF0868_0666 HMPREF0868_0667 ligA dsdA FALSE 0.074 455.000 0.000 1.000 N NA
 10465050 10465051 HMPREF0868_0667 HMPREF0868_0668 dsdA   TRUE 0.970 42.000 0.019 1.000 Y NA
 10465051 10465052 HMPREF0868_0668 HMPREF0868_0669     FALSE 0.176 249.000 0.000 1.000 N NA
 10465052 10465053 HMPREF0868_0669 HMPREF0868_0670     TRUE 0.662 15.000 0.000 1.000   NA
 10465053 10465054 HMPREF0868_0670 HMPREF0868_0671     TRUE 0.741 9.000 0.000 1.000   NA
 10465054 10465055 HMPREF0868_0671 HMPREF0868_0672     FALSE 0.266 187.000 0.000 1.000 N NA
 10465055 10465056 HMPREF0868_0672 HMPREF0868_0673     TRUE 0.995 24.000 0.350 0.056   NA
 10465058 10465059 HMPREF0868_0675 HMPREF0868_0676     FALSE 0.275 126.000 0.000 NA   NA
 10465059 10465060 HMPREF0868_0676 HMPREF0868_0677     FALSE 0.060 272.000 0.000 1.000   NA
 10465060 10465061 HMPREF0868_0677 HMPREF0868_0678   arcA FALSE 0.165 263.000 0.000 1.000 N NA
 10465061 10465062 HMPREF0868_0678 HMPREF0868_0679 arcA   TRUE 0.675 -30.000 0.000 NA   NA
 10465064 10465065 HMPREF0868_0681 HMPREF0868_0682     TRUE 0.886 114.000 0.009 NA   NA
 10465065 10465066 HMPREF0868_0682 HMPREF0868_0683     TRUE 0.983 -7.000 0.013 NA   NA
 10465066 10465067 HMPREF0868_0683 HMPREF0868_0684     TRUE 0.692 204.000 0.008 NA   NA
 10465067 10465068 HMPREF0868_0684 HMPREF0868_0685     TRUE 0.750 -3.000 0.000 NA   NA
 10465068 10465069 HMPREF0868_0685 HMPREF0868_0686     TRUE 0.671 8.000 0.000 0.050   NA
 10465069 10465070 HMPREF0868_0686 HMPREF0868_0687     FALSE 0.135 288.000 0.000 1.000 N NA
 10465070 10465071 HMPREF0868_0687 HMPREF0868_0688   rplU FALSE 0.391 147.000 0.000 1.000 N NA
 10465071 10465072 HMPREF0868_0688 HMPREF0868_0689 rplU   TRUE 0.998 22.000 0.208 NA Y NA
 10465072 10465073 HMPREF0868_0689 HMPREF0868_0690   rpmA TRUE 0.998 20.000 0.203 NA Y NA
 10465073 10465074 HMPREF0868_0690 HMPREF0868_0691 rpmA cgtA TRUE 0.986 133.000 0.335 1.000   NA
 10465074 10465075 HMPREF0868_0691 HMPREF0868_0692 cgtA   TRUE 0.930 82.000 0.046 NA   NA
 10465075 10465076 HMPREF0868_0692 HMPREF0868_0693     FALSE 0.085 424.000 0.000 NA N NA
 10465076 10465077 HMPREF0868_0693 HMPREF0868_0694     FALSE 0.409 31.000 0.000 NA   NA
 10465077 10465078 HMPREF0868_0694 HMPREF0868_0695     FALSE 0.108 208.000 0.000 NA   NA
 10465079 10465080 HMPREF0868_0696 HMPREF0868_0697   mscL FALSE 0.283 94.000 0.000 NA   NA
 10465080 10465081 HMPREF0868_0697 HMPREF0868_0698 mscL   TRUE 0.858 14.000 0.000 1.000 N NA
 10465081 10465082 HMPREF0868_0698 HMPREF0868_0699     FALSE 0.259 63.000 0.000 NA   NA
 10465082 10465083 HMPREF0868_0699 HMPREF0868_0700   hup FALSE 0.289 118.000 0.000 NA   NA
 10465083 10465084 HMPREF0868_0700 HMPREF0868_0701 hup   FALSE 0.294 111.000 0.000 NA   NA
 10465084 10465085 HMPREF0868_0701 HMPREF0868_0702     FALSE 0.261 61.000 0.000 NA   NA
 10465085 10465086 HMPREF0868_0702 HMPREF0868_0703     FALSE 0.262 130.000 0.000 NA   NA
 10465086 10465087 HMPREF0868_0703 HMPREF0868_0704   mutM FALSE 0.154 172.000 0.000 NA   NA
 10465087 10465088 HMPREF0868_0704 HMPREF0868_0705 mutM   FALSE 0.249 49.000 0.000 1.000   NA
 10465089 10465090 HMPREF0868_0706 HMPREF0868_0707     FALSE 0.033 452.000 0.000 NA   NA
 10465090 10465091 HMPREF0868_0707 HMPREF0868_0708     TRUE 0.885 0.000 0.000 1.000 N NA
 10465091 10465092 HMPREF0868_0708 HMPREF0868_0709   upp FALSE 0.198 234.000 0.000 1.000 N NA
 10465093 10465094 HMPREF0868_0710 HMPREF0868_0711     TRUE 0.774 2.000 0.000 NA   NA
 10465095 10465096 HMPREF0868_0712 HMPREF0868_0713     FALSE 0.294 111.000 0.000 NA   NA
 10465096 10465097 HMPREF0868_0713 HMPREF0868_0714     TRUE 0.750 -3.000 0.000 NA   NA
 10465097 10465098 HMPREF0868_0714 HMPREF0868_0715     TRUE 0.962 43.000 0.053 1.000 N NA
 10465098 10465099 HMPREF0868_0715 HMPREF0868_0716     TRUE 0.999 -10.000 0.592 1.000 N NA
 10465099 10465100 HMPREF0868_0716 HMPREF0868_0717   pyrF TRUE 0.987 63.000 0.154 0.002 Y NA
 10465100 10465101 HMPREF0868_0717 HMPREF0868_0718 pyrF pyrE TRUE 0.988 123.000 0.133 1.000 Y NA
 10465102 10465103 HMPREF0868_0719 HMPREF0868_0720     FALSE 0.145 280.000 0.000 1.000 N NA
 10465103 10465104 HMPREF0868_0720 HMPREF0868_0721   radA TRUE 0.984 13.000 0.004 1.000 N NA
 10465104 10465105 HMPREF0868_0721 HMPREF0868_0722 radA xth TRUE 0.489 39.000 0.000 0.017 N NA
 10465106 10465107 HMPREF0868_0723 HMPREF0868_0724   hisS FALSE 0.287 47.000 0.000 NA   NA
 10465107 10465108 HMPREF0868_0724 HMPREF0868_0725 hisS aspS TRUE 0.965 84.000 0.028 0.045 Y NA
 10465108 10465109 HMPREF0868_0725 HMPREF0868_0726 aspS lepB TRUE 0.878 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10465109 10465110 HMPREF0868_0726 HMPREF0868_0727 lepB lepB TRUE 0.506 166.000 0.000 0.002 Y NA
 10465110 10465111 HMPREF0868_0727 HMPREF0868_0728 lepB lepA TRUE 0.878 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10465111 10465112 HMPREF0868_0728 HMPREF0868_0729 lepA   TRUE 0.885 0.000 0.000 1.000 N NA
 10465112 10465113 HMPREF0868_0729 HMPREF0868_0730     TRUE 0.865 -7.000 0.000 1.000 N NA
 10465113 10465114 HMPREF0868_0730 HMPREF0868_0731   ispF TRUE 0.888 1.000 0.000 1.000 N NA
 10465115 10465116 HMPREF0868_0732 HMPREF0868_0733     FALSE 0.263 75.000 0.000 NA   NA
 10465116 10465117 HMPREF0868_0733 HMPREF0868_0734     TRUE 0.523 24.000 0.000 NA   NA
 10465118 10465119 HMPREF0868_0735 HMPREF0868_0736 thiS   TRUE 0.509 23.000 0.000 1.000   NA
 10465119 10465120 HMPREF0868_0736 HMPREF0868_0737   thiG TRUE 0.944 22.000 0.003 1.000   NA
 10465120 10465121 HMPREF0868_0737 HMPREF0868_0738 thiG thiH TRUE 0.999 11.000 0.277 0.008 Y NA
 10465121 10465122 HMPREF0868_0738 HMPREF0868_0740 thiH metK FALSE 0.285 299.000 0.000 1.000 Y NA
 10465122 10465123 HMPREF0868_0740 HMPREF0868_0741 metK   TRUE 0.705 186.000 0.007 1.000   NA
 10465125 10465126 HMPREF0868_0743 HMPREF0868_0744 cysS   TRUE 0.696 -7.000 0.000 1.000   NA
 10465126 10465127 HMPREF0868_0744 HMPREF0868_0745     FALSE 0.147 62.000 0.000 0.006   NA
 10465127 10465128 HMPREF0868_0745 HMPREF0868_0746     FALSE 0.180 161.000 0.000 NA   NA
 10465129 10465130 HMPREF0868_0748 HMPREF0868_0749     FALSE 0.271 52.000 0.000 NA   NA
 10465131 10465132 HMPREF0868_0750 HMPREF0868_0751     FALSE 0.040 371.000 0.000 NA   NA
 10465132 10465133 HMPREF0868_0751 HMPREF0868_0752     TRUE 0.485 188.000 0.000 1.000 Y NA
 10465133 10465134 HMPREF0868_0752 HMPREF0868_0753     TRUE 0.485 122.000 0.000 1.000 N NA
 10465134 10465135 HMPREF0868_0753 HMPREF0868_0754     TRUE 0.895 4.000 0.000 1.000 N NA
 10465135 10465136 HMPREF0868_0754 HMPREF0868_0755     TRUE 0.939 -3.000 0.000 0.002 Y NA
 10465136 10465137 HMPREF0868_0755 HMPREF0868_0756     FALSE 0.392 33.000 0.000 NA   NA
 10465137 10465138 HMPREF0868_0756 HMPREF0868_0757   pyk FALSE 0.298 106.000 0.000 NA   NA
 10465139 10465140 HMPREF0868_0758 HMPREF0868_0759 pssA psd TRUE 1.000 4.000 0.466 1.000 Y NA
 10465141 10465142 HMPREF0868_0760 HMPREF0868_0761     FALSE 0.272 127.000 0.000 NA   NA
 10465142 10465143 HMPREF0868_0761 HMPREF0868_0762     FALSE 0.151 174.000 0.000 NA   NA
 10465143 10465144 HMPREF0868_0762 HMPREF0868_0763     FALSE 0.280 49.000 0.000 NA   NA
 10465144 10465145 HMPREF0868_0763 HMPREF0868_0764     TRUE 0.999 -3.000 0.895 0.015 Y NA
 10465146 10465147 HMPREF0868_0765 HMPREF0868_0766 glnS gltX TRUE 0.995 2.000 0.014 0.002 Y NA
 10465150 10465151 HMPREF0868_0769 HMPREF0868_0770 dnaJ   TRUE 0.739 -6.000 0.000 NA   NA
 10465151 10465152 HMPREF0868_0770 HMPREF0868_0771     FALSE 0.156 171.000 0.000 NA   NA
 10465152 10465153 HMPREF0868_0771 HMPREF0868_0772   nfeD TRUE 0.696 15.000 0.000 NA   NA
 10465153 10465154 HMPREF0868_0772 HMPREF0868_0773 nfeD   TRUE 0.995 76.000 0.259 NA Y NA
 10465154 10465155 HMPREF0868_0773 HMPREF0868_0774     FALSE 0.256 68.000 0.000 NA   NA
 10465155 10465156 HMPREF0868_0774 HMPREF0868_0775     TRUE 0.759 11.000 0.000 NA   NA
 10465156 10465157 HMPREF0868_0775 HMPREF0868_0776     TRUE 0.729 -7.000 0.000 NA   NA
 10465157 10465158 HMPREF0868_0776 HMPREF0868_0777   hrcA TRUE 0.963 115.000 0.062 1.000 N NA
 10465158 10465159 HMPREF0868_0777 HMPREF0868_0778 hrcA grpE TRUE 0.998 -10.000 0.286 1.000 N NA
 10465159 10465160 HMPREF0868_0778 HMPREF0868_0779 grpE dnaK TRUE 0.993 107.000 0.224 0.008 Y NA
 10465160 10465161 HMPREF0868_0779 HMPREF0868_0780 dnaK dnaJ TRUE 0.998 20.000 0.196 0.004 Y NA
 10465161 10465162 HMPREF0868_0780 HMPREF0868_0781 dnaJ prmA TRUE 0.984 36.000 0.133 1.000 N NA
 10465162 10465163 HMPREF0868_0781 HMPREF0868_0782 prmA   FALSE 0.105 214.000 0.000 NA   NA
 10465163 10465164 HMPREF0868_0782 HMPREF0868_0783     FALSE 0.328 40.000 0.000 NA   NA
 10465164 10465165 HMPREF0868_0783 HMPREF0868_0784     FALSE 0.095 231.000 0.000 NA   NA
 10465165 10465166 HMPREF0868_0784 HMPREF0868_0785   glgB FALSE 0.288 119.000 0.000 NA   NA
 10465166 10465167 HMPREF0868_0785 HMPREF0868_0786 glgB glgC TRUE 0.977 48.000 0.062 0.002 Y NA
 10465167 10465168 HMPREF0868_0786 HMPREF0868_0787 glgC glgD TRUE 0.998 16.000 0.185 0.002 Y NA
 10465168 10465169 HMPREF0868_0787 HMPREF0868_0788 glgD glgA TRUE 0.998 15.000 0.163 1.000 Y NA
 10465169 10465170 HMPREF0868_0788 HMPREF0868_0789 glgA argS TRUE 0.442 134.000 0.000 1.000 N NA
 10465170 10465171 HMPREF0868_0789 HMPREF0868_0790 argS   TRUE 0.763 0.000 0.000 NA   NA
 10465171 10465172 HMPREF0868_0790 HMPREF0868_0791     TRUE 0.763 0.000 0.000 NA   NA
 10465172 10465173 HMPREF0868_0791 HMPREF0868_0792   rdgB TRUE 0.842 -49.000 0.000 NA N NA
 10465173 10465174 HMPREF0868_0792 HMPREF0868_0793 rdgB   FALSE 0.156 171.000 0.000 NA   NA
 10465174 10465175 HMPREF0868_0793 HMPREF0868_0794     FALSE 0.317 42.000 0.000 NA   NA
 10465175 10465176 HMPREF0868_0794 HMPREF0868_0795     TRUE 0.999 -3.000 0.894 1.000 N NA
 10465176 10465177 HMPREF0868_0795 HMPREF0868_0796   prfB TRUE 0.987 6.000 0.003 1.000 N NA
 10465177 10465178 HMPREF0868_0796 HMPREF0868_0797 prfB   TRUE 0.822 129.000 0.003 1.000   NA
 10465178 10465179 HMPREF0868_0797 HMPREF0868_0798     TRUE 0.985 2.000 0.011 NA   NA
 10465179 10465180 HMPREF0868_0798 HMPREF0868_0799   nadD TRUE 0.729 -7.000 0.000 NA   NA
 10465180 10465181 HMPREF0868_0799 HMPREF0868_0800 nadD   TRUE 0.951 188.000 0.221 NA   NA
 10465181 10465182 HMPREF0868_0800 HMPREF0868_0801     TRUE 0.820 135.000 0.003 NA   NA
 10465182 10465183 HMPREF0868_0801 HMPREF0868_0802   thyA FALSE 0.261 114.000 0.000 1.000   NA
 10465183 10465184 HMPREF0868_0802 HMPREF0868_0803 thyA folA TRUE 0.906 60.000 0.007 1.000 N NA
 10465184 10465185 HMPREF0868_0803 HMPREF0868_0804 folA   FALSE 0.346 38.000 0.000 NA   NA
 10465186 10465187 HMPREF0868_0805 HMPREF0868_0806     FALSE 0.026 692.000 0.000 NA   NA
 10465187 10465188 HMPREF0868_0806 HMPREF0868_0807     TRUE 0.466 20.000 0.000 0.029   NA
 10465189 10465190 HMPREF0868_0808 HMPREF0868_0809     TRUE 0.435 136.000 0.000 1.000 N NA
 10465190 10465191 HMPREF0868_0809 HMPREF0868_0810     TRUE 0.657 64.000 0.000 0.050 Y NA
 10465191 10465192 HMPREF0868_0810 HMPREF0868_0811     TRUE 0.999 -7.000 0.500 0.050 Y NA
 10465192 10465193 HMPREF0868_0811 HMPREF0868_0812     TRUE 0.956 7.000 0.000 1.000 Y NA
 10465193 10465194 HMPREF0868_0812 HMPREF0868_0813   pgmB FALSE 0.302 39.000 0.000 1.000   NA
 10465194 10465195 HMPREF0868_0813 HMPREF0868_0814 pgmB   FALSE 0.056 281.000 0.000 1.000   NA
 10465195 10465196 HMPREF0868_0814 HMPREF0868_0815     FALSE 0.038 383.000 0.000 NA   NA
 10465196 10465197 HMPREF0868_0815 HMPREF0868_0816     FALSE 0.112 205.000 0.000 NA   NA
 10465197 10465198 HMPREF0868_0816 HMPREF0868_0817     FALSE 0.258 72.000 0.000 NA   NA
 10465198 10465199 HMPREF0868_0817 HMPREF0868_0818     FALSE 0.046 341.000 0.000 NA   NA
 10465199 10465200 HMPREF0868_0818 HMPREF0868_0819   lepB FALSE 0.381 34.000 0.000 NA   NA
 10465200 10465201 HMPREF0868_0819 HMPREF0868_0820 lepB   TRUE 0.979 82.000 0.212 NA   NA
 10465201 10465202 HMPREF0868_0820 HMPREF0868_0821   srtB TRUE 0.990 66.000 0.571 NA   NA
 10465202 10465203 HMPREF0868_0821 HMPREF0868_0822 srtB   TRUE 0.998 -3.000 0.333 NA   NA
 10465207 10465208 HMPREF0868_0826 HMPREF0868_0827 leuB pgi TRUE 0.463 76.000 0.000 1.000 N NA
 10465208 10465209 HMPREF0868_0827 HMPREF0868_0828 pgi   TRUE 0.711 -10.000 0.000 NA   NA
 10465209 10465210 HMPREF0868_0828 HMPREF0868_0829     FALSE 0.362 36.000 0.000 NA   NA
 10465210 10465211 HMPREF0868_0829 HMPREF0868_0830     TRUE 0.868 13.000 0.000 1.000 N NA
 10465211 10465212 HMPREF0868_0830 HMPREF0868_0831     TRUE 0.814 33.000 0.000 NA Y NA
 10465212 10465213 HMPREF0868_0831 HMPREF0868_0832     TRUE 0.502 125.000 0.000 NA N NA
 10465213 10465214 HMPREF0868_0832 HMPREF0868_0833   groS FALSE 0.177 264.000 0.000 NA N NA
 10465214 10465215 HMPREF0868_0833 HMPREF0868_0834 groS groL TRUE 1.000 12.000 0.674 1.000 Y NA
 10465215 10465216 HMPREF0868_0834 HMPREF0868_0835 groL   FALSE 0.189 241.000 0.000 1.000 N NA
 10465216 10465217 HMPREF0868_0835 HMPREF0868_0836     FALSE 0.275 126.000 0.000 NA   NA
 10465217 10465218 HMPREF0868_0836 HMPREF0868_0837     FALSE 0.271 52.000 0.000 NA   NA
 10465218 10465219 HMPREF0868_0837 HMPREF0868_0838     TRUE 0.776 7.000 0.000 NA   NA
 10465219 10465220 HMPREF0868_0838 HMPREF0868_0839     TRUE 0.889 70.000 0.020 NA   NA
 10465220 10465221 HMPREF0868_0839 HMPREF0868_0840     TRUE 0.774 2.000 0.000 NA   NA
 10465221 10465222 HMPREF0868_0840 HMPREF0868_0841     FALSE 0.261 61.000 0.000 NA   NA
 10465223 10465224 HMPREF0868_0842 HMPREF0868_0843     TRUE 0.504 106.000 0.000 1.000 N NA
 10465224 10465225 HMPREF0868_0843 HMPREF0868_0844     TRUE 0.855 -10.000 0.000 1.000 N NA
 10465225 10465226 HMPREF0868_0844 HMPREF0868_0845     TRUE 0.980 56.000 0.069 1.000 Y NA
 10465227 10465228 HMPREF0868_0846 HMPREF0868_0847     TRUE 0.618 19.000 0.000 NA   NA
 10465228 10465229 HMPREF0868_0847 HMPREF0868_0848     FALSE 0.147 177.000 0.000 NA   NA
 10465231 10465232 HMPREF0868_0850 HMPREF0868_0851     TRUE 0.763 0.000 0.000 NA   NA
 10465232 10465233 HMPREF0868_0851 HMPREF0868_0852     TRUE 0.717 -9.000 0.000 NA   NA
 10465233 10465234 HMPREF0868_0852 HMPREF0868_0853   polA TRUE 0.787 20.000 0.000 1.000 N NA
 10465234 10465235 HMPREF0868_0853 HMPREF0868_0854 polA coaE TRUE 0.995 0.000 0.068 1.000 N NA
 10465235 10465236 HMPREF0868_0854 HMPREF0868_0855 coaE   FALSE 0.294 110.000 0.000 NA   NA
 10465237 10465238 HMPREF0868_0856 HMPREF0868_0857 ychF   FALSE 0.277 50.000 0.000 NA   NA
 10465239 10465240 HMPREF0868_0858 HMPREF0868_0859 chlI dprA TRUE 0.831 -37.000 0.000 1.000 N NA
 10465240 10465241 HMPREF0868_0859 HMPREF0868_0860 dprA topA TRUE 0.997 27.000 0.238 1.000 Y NA
 10465241 10465242 HMPREF0868_0860 HMPREF0868_0861 topA trmFO TRUE 0.997 -7.000 0.137 1.000 N NA
 10465242 10465243 HMPREF0868_0861 HMPREF0868_0862 trmFO queA TRUE 0.937 -13.000 0.000 1.000 Y NA
 10465243 10465244 HMPREF0868_0862 HMPREF0868_0863 queA tgt TRUE 0.999 17.000 0.360 0.001 Y NA
 10465244 10465245 HMPREF0868_0863 HMPREF0868_0864 tgt   FALSE 0.290 46.000 0.000 NA   NA
 10465245 10465246 HMPREF0868_0864 HMPREF0868_0865   yajC FALSE 0.296 102.000 0.000 NA   NA
 10465246 10465247 HMPREF0868_0865 HMPREF0868_0866 yajC   FALSE 0.133 186.000 0.000 NA   NA
 10465247 10465248 HMPREF0868_0866 HMPREF0868_0867   dnaG TRUE 0.736 10.000 0.000 1.000   NA
 10465248 10465249 HMPREF0868_0867 HMPREF0868_0868 dnaG rpoD TRUE 0.998 11.000 0.209 1.000 N NA
 10465249 10465250 HMPREF0868_0868 HMPREF0868_0869 rpoD   TRUE 0.998 0.000 0.239 1.000   NA
 10465250 10465251 HMPREF0868_0869 HMPREF0868_0870     FALSE 0.269 53.000 0.000 NA   NA
 10465251 10465252 HMPREF0868_0870 HMPREF0868_0871   rnpB FALSE 0.271 52.000 0.000 NA   NA
 10465254 10465255 HMPREF0868_0873 HMPREF0868_0874 rpsD rpsO TRUE 0.670 82.000 0.000 0.037 Y NA
 10465255 10465256 HMPREF0868_0874 HMPREF0868_0875 rpsO pnp TRUE 0.990 180.000 0.335 1.000 Y NA
 10465256 10465257 HMPREF0868_0875 HMPREF0868_0876 pnp   FALSE 0.264 57.000 0.000 NA   NA
 10465257 10465258 HMPREF0868_0876 HMPREF0868_0877     FALSE 0.206 149.000 0.000 NA   NA
 10465258 10465259 HMPREF0868_0877 HMPREF0868_0878     FALSE 0.261 61.000 0.000 NA   NA
 10465259 10465260 HMPREF0868_0878 HMPREF0868_0879     TRUE 0.999 -3.000 0.796 1.000   NA
 10465260 10465261 HMPREF0868_0879 HMPREF0868_0880     FALSE 0.250 123.000 0.000 1.000   NA
 10465261 10465262 HMPREF0868_0880 HMPREF0868_0881   trmU TRUE 0.888 1.000 0.000 1.000 N NA
 10465262 10465263 HMPREF0868_0881 HMPREF0868_0882 trmU miaB TRUE 0.930 -28.000 0.000 1.000 Y NA
 10465263 10465264 HMPREF0868_0882 HMPREF0868_0883 miaB mutS TRUE 0.994 0.000 0.041 1.000 N NA
 10465264 10465265 HMPREF0868_0883 HMPREF0868_0884 mutS mutL TRUE 0.999 15.000 0.220 0.002 Y NA
 10465265 10465266 HMPREF0868_0884 HMPREF0868_0885 mutL miaA TRUE 0.997 4.000 0.097 1.000 N NA
 10465266 10465267 HMPREF0868_0885 HMPREF0868_0886 miaA   FALSE 0.256 68.000 0.000 NA   NA
 10465270 10465271 HMPREF0868_0889 HMPREF0868_0890     FALSE 0.294 45.000 0.000 NA   NA
 10465271 10465272 HMPREF0868_0890 HMPREF0868_0891   asnS FALSE 0.346 38.000 0.000 NA   NA
 10465272 10465273 HMPREF0868_0891 HMPREF0868_0892 asnS   FALSE 0.235 139.000 0.000 NA   NA
 10465273 10465274 HMPREF0868_0892 HMPREF0868_0893   pflA FALSE 0.256 70.000 0.000 NA   NA
 10465274 10465275 HMPREF0868_0893 HMPREF0868_0894 pflA pflB TRUE 0.982 117.000 0.163 1.000 N NA
 10465275 10465276 HMPREF0868_0894 HMPREF0868_0895 pflB holA TRUE 0.466 128.000 0.000 1.000 N NA
 10465276 10465277 HMPREF0868_0895 HMPREF0868_0896 holA   TRUE 0.957 147.000 0.163 1.000   NA
 10465277 10465278 HMPREF0868_0896 HMPREF0868_0897   ysxC TRUE 0.800 80.000 0.002 0.048   NA
 10465279 10465280 HMPREF0868_0898 HMPREF0868_0899 prs prs TRUE 0.779 31.000 0.000 0.001 Y NA
 10465280 10465281 HMPREF0868_0899 HMPREF0868_0900 prs murC TRUE 0.843 -16.000 0.000 1.000 N NA
 10465282 10465283 HMPREF0868_0901 HMPREF0868_0902 hflB hpt TRUE 0.998 4.000 0.180 1.000 N NA
 10465283 10465284 HMPREF0868_0902 HMPREF0868_0903 hpt tilS TRUE 0.995 -43.000 0.137 0.043 N NA
 10465284 10465285 HMPREF0868_0903 HMPREF0868_0904 tilS dnaB TRUE 0.865 -7.000 0.000 1.000 N NA
 10465285 10465286 HMPREF0868_0904 HMPREF0868_0905 dnaB rplI TRUE 0.991 2.000 0.012 1.000 N NA
 10465286 10465287 HMPREF0868_0905 HMPREF0868_0906 rplI pepF TRUE 0.476 88.000 0.000 1.000 N NA
 10465287 10465288 HMPREF0868_0906 HMPREF0868_0907 pepF   FALSE 0.120 198.000 0.000 NA   NA
 10465288 10465289 HMPREF0868_0907 HMPREF0868_0908     TRUE 0.782 4.000 0.000 NA   NA
 10465289 10465290 HMPREF0868_0908 HMPREF0868_0909     TRUE 0.780 5.000 0.000 NA   NA
 10465292 10465293 HMPREF0868_0911 HMPREF0868_0912     TRUE 0.657 -16.000 0.000 1.000   NA
 10465293 10465294 HMPREF0868_0912 HMPREF0868_0913     TRUE 0.607 20.000 0.000 NA   NA
 10465296 10465297 HMPREF0868_0915 HMPREF0868_0916   ruvB TRUE 0.897 64.000 0.024 NA   NA
 10465297 10465298 HMPREF0868_0916 HMPREF0868_0917 ruvB ruvA TRUE 0.996 52.000 0.549 0.002 Y NA
 10465298 10465299 HMPREF0868_0917 HMPREF0868_0918 ruvA ruvC TRUE 0.996 82.000 0.451 0.009 Y NA
 10465301 10465302 HMPREF0868_0919 HMPREF0868_0921     TRUE 0.780 3.000 0.000 NA   NA
 10465302 10465303 HMPREF0868_0921 HMPREF0868_0922     FALSE 0.261 74.000 0.000 NA   NA
 10465303 10465304 HMPREF0868_0922 HMPREF0868_0923     FALSE 0.297 107.000 0.000 NA   NA
 10465304 10465305 HMPREF0868_0923 HMPREF0868_0924     FALSE 0.275 51.000 0.000 NA   NA
 10465306 10465307 HMPREF0868_0925 HMPREF0868_0926     TRUE 0.729 -7.000 0.000 NA   NA
 10465307 10465308 HMPREF0868_0926 HMPREF0868_0928     FALSE 0.147 177.000 0.000 NA   NA
 10465310 10465311 HMPREF0868_0930 HMPREF0868_0932     TRUE 0.744 8.000 0.000 1.000   NA
 10465312 10465313 HMPREF0868_0931 HMPREF0868_0933   fmt TRUE 0.999 2.000 0.305 1.000 Y NA
 10465313 10465314 HMPREF0868_0933 HMPREF0868_0934 fmt def TRUE 0.967 83.000 0.031 0.043 Y NA
 10465314 10465315 HMPREF0868_0934 HMPREF0868_0935 def priA TRUE 0.963 34.000 0.029 1.000 N NA
 10465315 10465316 HMPREF0868_0935 HMPREF0868_0936 priA polC TRUE 0.743 37.000 0.000 0.010 Y NA
 10465316 10465317 HMPREF0868_0936 HMPREF0868_0937 polC ispG TRUE 0.994 0.000 0.040 1.000 N NA
 10465317 10465318 HMPREF0868_0937 HMPREF0868_0938 ispG   TRUE 0.997 6.000 0.092 1.000 N NA
 10465318 10465319 HMPREF0868_0938 HMPREF0868_0939   dxr TRUE 0.999 -3.000 0.568 1.000 N NA
 10465319 10465320 HMPREF0868_0939 HMPREF0868_0940 dxr cdsA TRUE 0.994 149.000 0.372 1.000 Y NA
 10465320 10465321 HMPREF0868_0940 HMPREF0868_0941 cdsA uppS TRUE 0.999 -25.000 0.400 1.000 Y NA
 10465321 10465322 HMPREF0868_0941 HMPREF0868_0942 uppS frr TRUE 0.999 -3.000 0.409 1.000 N NA
 10465322 10465323 HMPREF0868_0942 HMPREF0868_0943 frr pyrH TRUE 0.993 73.000 0.626 1.000 N NA
 10465323 10465324 HMPREF0868_0943 HMPREF0868_0944 pyrH tsf TRUE 0.988 64.000 0.416 1.000   NA
 10465324 10465325 HMPREF0868_0944 HMPREF0868_0945 tsf rpsB TRUE 0.989 56.000 0.748 1.000   NA
 10465325 10465326 HMPREF0868_0945 HMPREF0868_0946 rpsB   FALSE 0.257 71.000 0.000 NA   NA
 10465328 10465329 HMPREF0868_0948 HMPREF0868_0949     FALSE 0.041 367.000 0.000 NA   NA
 10465329 10465330 HMPREF0868_0949 HMPREF0868_0950     FALSE 0.050 334.000 0.000 NA   NA
 10465330 10465331 HMPREF0868_0950 HMPREF0868_0951     FALSE 0.052 326.000 0.000 NA   NA
 10465331 10465332 HMPREF0868_0951 HMPREF0868_0952   lysS FALSE 0.026 502.000 0.000 1.000   NA
 10465332 10465333 HMPREF0868_0952 HMPREF0868_0953 lysS greA TRUE 0.997 9.000 0.098 1.000 N NA
 10465333 10465334 HMPREF0868_0953 HMPREF0868_0954 greA   TRUE 0.499 112.000 0.000 1.000 N NA
 10465336 10465337 HMPREF0868_0956 HMPREF0868_0957 recO era TRUE 0.701 13.000 0.000 1.000   NA
 10465337 10465338 HMPREF0868_0957 HMPREF0868_0958 era   TRUE 0.638 -31.000 0.000 1.000   NA
 10465338 10465339 HMPREF0868_0958 HMPREF0868_0959     TRUE 0.996 13.000 0.172 1.000   NA
 10465339 10465340 HMPREF0868_0959 HMPREF0868_0960     TRUE 0.878 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10465340 10465341 HMPREF0868_0960 HMPREF0868_0961   lspA TRUE 0.833 -28.000 0.000 1.000 N NA
 10465341 10465342 HMPREF0868_0961 HMPREF0868_0962 lspA   TRUE 0.497 25.000 0.000 NA   NA
 10465342 10465343 HMPREF0868_0962 HMPREF0868_0963     TRUE 0.982 131.000 0.245 NA   NA
 10465345 10465346 HMPREF0868_0965 HMPREF0868_0966   secF FALSE 0.294 101.000 0.000 NA   NA
 10465346 10465347 HMPREF0868_0966 HMPREF0868_0967 secF secD TRUE 0.750 -3.000 0.000 NA   NA
 10465349 10465350 HMPREF0868_0969 HMPREF0868_0970   yqeG FALSE 0.083 229.000 0.000 1.000   NA
 10465352 10465353 HMPREF0868_0972 HMPREF0868_0973     FALSE 0.300 44.000 0.000 NA   NA
 10465353 10465354 HMPREF0868_0973 HMPREF0868_0974     TRUE 0.997 14.000 0.110 0.003 Y NA
 10465355 10465356 HMPREF0868_0975 HMPREF0868_0976     FALSE 0.276 88.000 0.000 NA   NA
 10465356 10465357 HMPREF0868_0976 HMPREF0868_0977     TRUE 0.462 27.000 0.000 NA   NA
 10465357 10465358 HMPREF0868_0977 HMPREF0868_0978   pip FALSE 0.288 119.000 0.000 NA   NA
 10465359 10465360 HMPREF0868_0979 HMPREF0868_0980     FALSE 0.100 202.000 0.000 1.000   NA
 10465360 10465361 HMPREF0868_0980 HMPREF0868_0981     FALSE 0.349 160.000 0.000 1.000 N NA
 10465362 10465363 HMPREF0868_0982 HMPREF0868_0983     TRUE 0.768 1.000 0.000 NA   NA
 10465363 10465364 HMPREF0868_0983 HMPREF0868_0984     TRUE 0.519 116.000 0.000 NA N NA
 10465365 10465366 HMPREF0868_0985 HMPREF0868_0986     TRUE 0.750 -3.000 0.000 NA   NA
 10465366 10465367 HMPREF0868_0986 HMPREF0868_0987     TRUE 0.998 -7.000 0.300 NA   NA
 10465367 10465368 HMPREF0868_0987 HMPREF0868_0988     FALSE 0.154 271.000 0.000 1.000 N NA
 10465368 10465369 HMPREF0868_0988 HMPREF0868_0989     FALSE 0.267 54.000 0.000 NA   NA
 10465369 10465370 HMPREF0868_0989 HMPREF0868_0990     TRUE 0.750 -3.000 0.000 NA   NA
 10465370 10465371 HMPREF0868_0990 HMPREF0868_0991     TRUE 0.997 -7.000 0.061 1.000 Y NA
 10465371 10465372 HMPREF0868_0991 HMPREF0868_0992     TRUE 0.996 -7.000 0.037 0.048 Y NA
 10465372 10465373 HMPREF0868_0992 HMPREF0868_0993     TRUE 0.997 33.000 0.300 0.048 Y NA
 10465373 10465374 HMPREF0868_0993 HMPREF0868_0994     TRUE 0.729 -7.000 0.000 NA   NA
 10465376 10465377 HMPREF0868_0996 HMPREF0868_0997     TRUE 0.776 7.000 0.000 NA   NA
 10465377 10465378 HMPREF0868_0997 HMPREF0868_0998   arsD FALSE 0.235 76.000 0.000 1.000   NA
 10465378 10465379 HMPREF0868_0998 HMPREF0868_0999 arsD   TRUE 0.642 -27.000 0.000 1.000   NA
 10465379 10465380 HMPREF0868_0999 HMPREF0868_1000     FALSE 0.111 190.000 0.000 1.000   NA
 10465380 10465381 HMPREF0868_1000 HMPREF0868_1001   uvrC TRUE 0.683 14.000 0.000 1.000   NA
 10465381 10465382 HMPREF0868_1001 HMPREF0868_1002 uvrC   TRUE 0.980 15.000 0.003 1.000 N NA
 10465382 10465383 HMPREF0868_1002 HMPREF0868_1003     FALSE 0.234 75.000 0.000 1.000   NA
 10465383 10465384 HMPREF0868_1003 HMPREF0868_1004   yeaZ TRUE 0.696 -7.000 0.000 1.000   NA
 10465384 10465385 HMPREF0868_1004 HMPREF0868_1005 yeaZ   TRUE 0.998 4.000 0.217 NA   NA
 10465385 10465386 HMPREF0868_1005 HMPREF0868_1006   rpsI FALSE 0.266 55.000 0.000 NA   NA
 10465386 10465387 HMPREF0868_1006 HMPREF0868_1007 rpsI rplM TRUE 0.999 15.000 0.601 0.026 Y NA
 10465387 10465388 HMPREF0868_1007 HMPREF0868_1008 rplM yfhO FALSE 0.296 102.000 0.000 NA   NA
 10465388 10465389 HMPREF0868_1008 HMPREF0868_1009 yfhO yraL FALSE 0.263 58.000 0.000 NA   NA
 10465389 10465390 HMPREF0868_1009 HMPREF0868_1010 yraL   TRUE 0.980 23.000 0.078 0.007   NA
 10465390 10465391 HMPREF0868_1010 HMPREF0868_1011     TRUE 0.820 140.000 0.006 1.000   NA
 10465391 10465392 HMPREF0868_1011 HMPREF0868_1012     TRUE 0.783 163.000 0.007 NA   NA
 10465392 10465393 HMPREF0868_1012 HMPREF0868_1013     TRUE 0.985 -7.000 0.023 NA   NA
 10465393 10465394 HMPREF0868_1013 HMPREF0868_1014     TRUE 0.770 9.000 0.000 NA   NA
 10465394 10465395 HMPREF0868_1014 HMPREF0868_1015   tmk TRUE 0.979 -3.000 0.006 NA   NA
 10465396 10465397 HMPREF0868_1016 HMPREF0868_1017     TRUE 0.774 2.000 0.000 NA   NA
 10465397 10465398 HMPREF0868_1017 HMPREF0868_1018   srpB FALSE 0.257 64.000 0.000 NA   NA
 10465398 10465399 HMPREF0868_1018 HMPREF0868_1019 srpB dnaX FALSE 0.381 34.000 0.000 NA   NA
 10465399 10465400 HMPREF0868_1019 HMPREF0868_1020 dnaX   TRUE 0.995 2.000 0.100 NA   NA
 10465400 10465401 HMPREF0868_1020 HMPREF0868_1021   recR TRUE 0.999 0.000 0.604 NA   NA
 10465402 10465403 HMPREF0868_1022 HMPREF0868_1023     TRUE 0.989 -10.000 0.053 1.000   NA
 10465403 10465404 HMPREF0868_1023 HMPREF0868_1024     FALSE 0.259 63.000 0.000 NA   NA
 10465404 10465405 HMPREF0868_1024 HMPREF0868_1025     FALSE 0.048 338.000 0.000 NA   NA
 10465405 10465406 HMPREF0868_1025 HMPREF0868_1026     FALSE 0.319 37.000 0.000 1.000   NA
 10465408 10465409 HMPREF0868_1028 HMPREF0868_1029     FALSE 0.323 41.000 0.000 NA   NA
 10465411 10465412 HMPREF0868_1031 HMPREF0868_1032     FALSE 0.294 45.000 0.000 NA   NA
 10465412 10465413 HMPREF0868_1032 HMPREF0868_1033     FALSE 0.277 50.000 0.000 NA   NA
 10465413 10465414 HMPREF0868_1033 HMPREF0868_1034     TRUE 0.780 5.000 0.000 NA   NA
 10465414 10465415 HMPREF0868_1034 HMPREF0868_1035     FALSE 0.283 94.000 0.000 NA   NA
 10465416 10465417 HMPREF0868_1036 HMPREF0868_1037     TRUE 0.663 73.000 0.000 0.067 Y NA
 10465417 10465418 HMPREF0868_1037 HMPREF0868_1038     TRUE 0.999 -16.000 0.640 1.000 Y NA
 10465419 10465420 HMPREF0868_1039 HMPREF0868_1040   rbr FALSE 0.227 207.000 0.000 1.000 N NA
 10465422 10465423 HMPREF0868_1042 HMPREF0868_1043 ispH   TRUE 0.840 -19.000 0.000 1.000 N NA
 10465423 10465424 HMPREF0868_1043 HMPREF0868_1044   cmk TRUE 0.990 -22.000 0.030 1.000 N NA
 10465424 10465425 HMPREF0868_1044 HMPREF0868_1045 cmk scpB TRUE 0.898 9.000 0.000 NA N NA
 10465425 10465426 HMPREF0868_1045 HMPREF0868_1046 scpB   TRUE 0.999 -7.000 0.570 NA   NA
 10465426 10465427 HMPREF0868_1046 HMPREF0868_1047     TRUE 0.994 0.000 0.092 NA   NA
 10465427 10465428 HMPREF0868_1047 HMPREF0868_1048   ileS TRUE 0.981 3.000 0.005 1.000   NA
 10465431 10465432 HMPREF0868_1051 HMPREF0868_1052     FALSE 0.085 222.000 0.000 1.000   NA
 10465432 10465433 HMPREF0868_1052 HMPREF0868_1053     FALSE 0.235 139.000 0.000 NA   NA
 10465434 10465435 HMPREF0868_1054 HMPREF0868_1055     TRUE 0.999 -10.000 0.576 0.014 Y NA
 10465436 10465437 HMPREF0868_1056 HMPREF0868_1057     TRUE 0.729 -7.000 0.000 NA   NA
 10465437 10465438 HMPREF0868_1057 HMPREF0868_1058     FALSE 0.031 478.000 0.000 NA   NA
 10465439 10465440 HMPREF0868_1059 HMPREF0868_1060     FALSE 0.139 181.000 0.000 NA   NA
 10465440 10465441 HMPREF0868_1060 HMPREF0868_1061     TRUE 0.766 10.000 0.000 NA   NA
 10465441 10465442 HMPREF0868_1061 HMPREF0868_1062     FALSE 0.354 37.000 0.000 NA   NA
 10465442 10465443 HMPREF0868_1062 HMPREF0868_1063     FALSE 0.256 65.000 0.000 NA   NA
 10465444 10465445 HMPREF0868_1064 HMPREF0868_1065     FALSE 0.286 95.000 0.000 NA   NA
 10465446 10465447 HMPREF0868_1066 HMPREF0868_1067 guaA   TRUE 0.499 101.000 0.000 1.000 N NA
 10465447 10465448 HMPREF0868_1067 HMPREF0868_1068     FALSE 0.071 271.000 0.000 NA   NA
 10465448 10465449 HMPREF0868_1068 HMPREF0868_1069     FALSE 0.235 139.000 0.000 NA   NA
 10465449 10465450 HMPREF0868_1069 HMPREF0868_1070     FALSE 0.381 34.000 0.000 NA   NA
 10465450 10465451 HMPREF0868_1070 HMPREF0868_1071     FALSE 0.183 160.000 0.000 NA   NA
 10465451 10465452 HMPREF0868_1071 HMPREF0868_1072   lysR FALSE 0.031 471.000 0.000 NA   NA
 10465454 10465455 HMPREF0868_1074 HMPREF0868_1075   guaA FALSE 0.293 113.000 0.000 NA   NA
 10465455 10465456 HMPREF0868_1075 HMPREF0868_1076 guaA   FALSE 0.271 82.000 0.000 NA   NA
 10465456 10465457 HMPREF0868_1076 HMPREF0868_1077     TRUE 0.945 105.000 0.061 NA   NA
 10465457 10465458 HMPREF0868_1077 HMPREF0868_1078     TRUE 0.478 125.000 0.000 1.000 N NA
 10465458 10465459 HMPREF0868_1078 HMPREF0868_1079     TRUE 0.504 105.000 0.000 1.000 N NA
 10465459 10465460 HMPREF0868_1079 HMPREF0868_1080     TRUE 0.998 5.000 0.133 0.006 Y NA
 10465460 10465461 HMPREF0868_1080 HMPREF0868_1081     TRUE 0.999 10.000 0.133 1.000 Y NA
 10465461 10465462 HMPREF0868_1081 HMPREF0868_1082   gsiC TRUE 0.998 11.000 0.115 0.047 Y NA
 10465462 10465463 HMPREF0868_1082 HMPREF0868_1083 gsiC   TRUE 0.992 175.000 0.803 0.047 Y NA
 10465464 10465465 HMPREF0868_1084 HMPREF0868_1085 pbuX xpt TRUE 0.995 -13.000 0.032 1.000 Y NA
 10465465 10465466 HMPREF0868_1085 HMPREF0868_1086 xpt   FALSE 0.148 278.000 0.000 1.000 N NA
 10465467 10465468 HMPREF0868_1087 HMPREF0868_1088     FALSE 0.280 49.000 0.000 NA   NA
 10465468 10465469 HMPREF0868_1088 HMPREF0868_1089     TRUE 0.999 -25.000 0.419 1.000 N NA
 10465469 10465470 HMPREF0868_1089 HMPREF0868_1090     FALSE 0.281 123.000 0.000 NA   NA
 10465470 10465471 HMPREF0868_1090 HMPREF0868_1091   secA FALSE 0.057 310.000 0.000 NA   NA
 10465471 10465472 HMPREF0868_1091 HMPREF0868_1092 secA   FALSE 0.235 139.000 0.000 NA   NA
 10465472 10465473 HMPREF0868_1092 HMPREF0868_1093     TRUE 0.680 -25.000 0.000 NA   NA
 10465473 10465474 HMPREF0868_1093 HMPREF0868_1094     TRUE 0.692 -16.000 0.000 NA   NA
 10465474 10465475 HMPREF0868_1094 HMPREF0868_1095   pheT FALSE 0.072 270.000 0.000 NA   NA
 10465475 10465476 HMPREF0868_1095 HMPREF0868_1096 pheT pheS TRUE 1.000 12.000 0.574 0.001 Y NA
 10465476 10465477 HMPREF0868_1096 HMPREF0868_1098 pheS   FALSE 0.133 293.000 0.000 1.000 N NA
 10465478 10465479 HMPREF0868_1099 HMPREF0868_1101     FALSE 0.224 142.000 0.000 NA   NA
 10465480 10465481 HMPREF0868_1100 HMPREF0868_1102     TRUE 0.684 -22.000 0.000 NA   NA
 10465483 10465484 HMPREF0868_1104 HMPREF0868_1105   thiD TRUE 0.998 2.000 0.164 1.000 N NA
 10465484 10465485 HMPREF0868_1105 HMPREF0868_1107 thiD   FALSE 0.054 285.000 0.000 1.000   NA
 10465486 10465487 HMPREF0868_1108 HMPREF0868_1109     FALSE 0.147 177.000 0.000 NA   NA
 10465487 10465488 HMPREF0868_1109 HMPREF0868_1110     FALSE 0.040 368.000 0.000 NA   NA
 10465488 10465489 HMPREF0868_1110 HMPREF0868_1111     FALSE 0.261 61.000 0.000 NA   NA
 10465490 10465491 HMPREF0868_1112 HMPREF0868_1113     FALSE 0.381 34.000 0.000 NA   NA
 10465491 10465492 HMPREF0868_1113 HMPREF0868_1114     FALSE 0.259 63.000 0.000 NA   NA
 10465492 10465493 HMPREF0868_1114 HMPREF0868_1115     FALSE 0.038 380.000 0.000 NA   NA
 10465493 10465494 HMPREF0868_1115 HMPREF0868_1116     FALSE 0.097 223.000 0.000 NA   NA
 10465494 10465495 HMPREF0868_1116 HMPREF0868_1117     TRUE 0.995 25.000 0.333 NA   NA
 10465495 10465496 HMPREF0868_1117 HMPREF0868_1118   atpC FALSE 0.189 241.000 0.000 1.000 N NA
 10465496 10465497 HMPREF0868_1118 HMPREF0868_1119 atpC atpD TRUE 1.000 10.000 0.837 0.009 Y NA
 10465497 10465498 HMPREF0868_1119 HMPREF0868_1120 atpD atpG TRUE 1.000 0.000 0.724 0.009 Y NA
 10465498 10465499 HMPREF0868_1120 HMPREF0868_1121 atpG atpA TRUE 0.999 -13.000 0.846 0.009 Y NA
 10465499 10465500 HMPREF0868_1121 HMPREF0868_1122 atpA   TRUE 0.991 0.000 0.002 0.009 Y NA
 10465500 10465501 HMPREF0868_1122 HMPREF0868_1123   atpE TRUE 0.999 13.000 0.500 0.009 Y NA
 10465501 10465502 HMPREF0868_1123 HMPREF0868_1124 atpE   TRUE 0.936 74.000 0.005 0.011 Y NA
 10465502 10465503 HMPREF0868_1124 HMPREF0868_1125     TRUE 0.462 27.000 0.000 NA   NA
 10465503 10465504 HMPREF0868_1125 HMPREF0868_1126     TRUE 0.774 2.000 0.000 NA   NA
 10465506 10465507 HMPREF0868_1128 HMPREF0868_1129     TRUE 0.778 6.000 0.000 NA   NA
 10465509 10465510 HMPREF0868_1131 HMPREF0868_1132     FALSE 0.215 215.000 0.000 1.000 N NA
 10465510 10465511 HMPREF0868_1132 HMPREF0868_1133   pfkA TRUE 0.795 19.000 0.000 1.000 N NA
 10465513 10465514 HMPREF0868_1135 HMPREF0868_1136     TRUE 0.933 26.000 0.010 0.001   NA
 10465514 10465515 HMPREF0868_1136 HMPREF0868_1137   dhaL FALSE 0.262 110.000 0.000 1.000   NA
 10465515 10465516 HMPREF0868_1137 HMPREF0868_1138 dhaL dhaK TRUE 0.995 1.000 0.021 0.001 Y NA
 10465516 10465517 HMPREF0868_1138 HMPREF0868_1139 dhaK   TRUE 0.992 9.000 0.021 1.000 N NA
 10465517 10465518 HMPREF0868_1139 HMPREF0868_1140     TRUE 0.998 -7.000 0.095 0.034 Y NA
 10465518 10465519 HMPREF0868_1140 HMPREF0868_1141     TRUE 0.750 -3.000 0.000 NA   NA
 10465519 10465520 HMPREF0868_1141 HMPREF0868_1142     TRUE 0.750 -3.000 0.000 NA   NA
 10465520 10465521 HMPREF0868_1142 HMPREF0868_1143     TRUE 0.999 12.000 0.364 1.000 Y NA
 10465521 10465522 HMPREF0868_1143 HMPREF0868_1144     FALSE 0.033 437.000 0.000 NA   NA
 10465522 10465523 HMPREF0868_1144 HMPREF0868_1145     FALSE 0.295 109.000 0.000 NA   NA
 10465523 10465524 HMPREF0868_1145 HMPREF0868_1146     TRUE 0.663 28.000 0.000 1.000 N NA
 10465524 10465525 HMPREF0868_1146 HMPREF0868_1147   rpe TRUE 0.980 56.000 0.166 1.000 N NA
 10465525 10465526 HMPREF0868_1147 HMPREF0868_1148 rpe rsgA TRUE 0.979 121.000 0.213 1.000   NA
 10465526 10465527 HMPREF0868_1148 HMPREF0868_1149 rsgA   TRUE 0.997 7.000 0.196 1.000   NA
 10465527 10465528 HMPREF0868_1149 HMPREF0868_1150     TRUE 0.916 18.000 0.000 1.000 Y NA
 10465528 10465529 HMPREF0868_1150 HMPREF0868_1151   rlmN TRUE 0.751 3.000 0.000 1.000   NA
 10465529 10465530 HMPREF0868_1151 HMPREF0868_1152 rlmN   FALSE 0.167 166.000 0.000 NA   NA
 10465530 10465531 HMPREF0868_1152 HMPREF0868_1153     FALSE 0.261 74.000 0.000 NA   NA
 10465531 10465532 HMPREF0868_1153 HMPREF0868_1154     TRUE 0.888 1.000 0.000 1.000 N NA
 10465533 10465534 HMPREF0868_1155 HMPREF0868_1156     FALSE 0.399 32.000 0.000 NA   NA
 10465535 10465536 HMPREF0868_1157 HMPREF0868_1158     TRUE 0.958 79.000 0.111 NA   NA
 10465536 10465537 HMPREF0868_1158 HMPREF0868_1159   mtnN FALSE 0.142 281.000 0.000 1.000 N NA
 10465539 10465540 HMPREF0868_1161 HMPREF0868_1162     FALSE 0.150 275.000 0.000 1.000 N NA
 10465540 10465541 HMPREF0868_1162 HMPREF0868_1163     TRUE 0.893 22.000 0.000 1.000 Y NA
 10465541 10465542 HMPREF0868_1163 HMPREF0868_1164     TRUE 0.865 -7.000 0.000 1.000 N NA
 10465542 10465543 HMPREF0868_1164 HMPREF0868_1165   thiI TRUE 0.584 35.000 0.000 1.000 N NA
 10465543 10465544 HMPREF0868_1165 HMPREF0868_1166 thiI   TRUE 0.993 101.000 0.349 1.000 N NA
 10465544 10465545 HMPREF0868_1166 HMPREF0868_1167     TRUE 0.703 25.000 0.000 1.000 N NA
 10465545 10465546 HMPREF0868_1167 HMPREF0868_1168     FALSE 0.313 168.000 0.000 1.000 N NA
 10465546 10465547 HMPREF0868_1168 HMPREF0868_1169   rnhB TRUE 0.998 -6.000 0.111 1.000 Y NA
 10465547 10465548 HMPREF0868_1169 HMPREF0868_1170 rnhB ylqF TRUE 0.970 106.000 0.148 1.000   NA
 10465548 10465549 HMPREF0868_1170 HMPREF0868_1171 ylqF rplS TRUE 0.898 130.000 0.027 1.000   NA
 10465549 10465550 HMPREF0868_1171 HMPREF0868_1172 rplS trmD TRUE 0.997 107.000 0.567 1.000 Y NA
 10465550 10465551 HMPREF0868_1172 HMPREF0868_1173 trmD rimM TRUE 1.000 12.000 0.672 1.000 Y NA
 10465551 10465552 HMPREF0868_1173 HMPREF0868_1174 rimM   TRUE 0.998 8.000 0.324 1.000   NA
 10465552 10465553 HMPREF0868_1174 HMPREF0868_1175   rpsP TRUE 0.998 -3.000 0.385 1.000   NA
 10465553 10465554 HMPREF0868_1175 HMPREF0868_1176 rpsP ffh TRUE 0.994 39.000 0.361 1.000 N NA
 10465554 10465555 HMPREF0868_1176 HMPREF0868_1177 ffh   TRUE 0.903 211.000 0.151 1.000   NA
 10465555 10465556 HMPREF0868_1177 HMPREF0868_1178     FALSE 0.170 62.000 0.000 0.038   NA
 10465557 10465558 HMPREF0868_1179 HMPREF0868_1180     TRUE 0.944 121.000 0.062 NA   NA
 10465559 10465560 HMPREF0868_1181 HMPREF0868_1182     TRUE 0.996 0.000 0.143 1.000   NA
 10465560 10465561 HMPREF0868_1182 HMPREF0868_1183     FALSE 0.057 280.000 0.000 1.000   NA
 10465561 10465562 HMPREF0868_1183 HMPREF0868_1184     FALSE 0.152 173.000 0.000 NA   NA
 10465562 10465563 HMPREF0868_1184 HMPREF0868_1185     FALSE 0.028 589.000 0.000 NA   NA
 10465563 10465564 HMPREF0868_1185 HMPREF0868_1186     FALSE 0.275 126.000 0.000 NA   NA
 10465564 10465565 HMPREF0868_1186 HMPREF0868_1187     FALSE 0.259 73.000 0.000 NA   NA
 10465565 10465566 HMPREF0868_1187 HMPREF0868_1188     TRUE 0.950 12.000 0.000 1.000 Y NA
 10465566 10465567 HMPREF0868_1188 HMPREF0868_1189     TRUE 1.000 0.000 0.800 0.013 Y NA
 10465567 10465568 HMPREF0868_1189 HMPREF0868_1190     TRUE 0.998 2.000 0.300 1.000   NA
 10465568 10465569 HMPREF0868_1190 HMPREF0868_1191     TRUE 0.999 -3.000 0.750 1.000   NA
 10465569 10465570 HMPREF0868_1191 HMPREF0868_1192     TRUE 0.999 -3.000 0.917 NA   NA
 10465573 10465574 HMPREF0868_1195 HMPREF0868_1196     TRUE 0.999 3.000 0.500 NA   NA
 10465575 10465576 HMPREF0868_1197 HMPREF0868_1198     FALSE 0.036 410.000 0.000 NA   NA
 10465580 10465581 HMPREF0868_1202 HMPREF0868_1203     TRUE 0.998 16.000 0.545 NA   NA
 10465581 10465582 HMPREF0868_1203 HMPREF0868_1204     FALSE 0.085 245.000 0.000 NA   NA
 10465582 10465583 HMPREF0868_1204 HMPREF0868_1205     TRUE 0.696 15.000 0.000 NA   NA
 10465583 10465584 HMPREF0868_1205 HMPREF0868_1206     TRUE 0.750 -3.000 0.000 NA   NA
 10465584 10465585 HMPREF0868_1206 HMPREF0868_1207     TRUE 0.780 3.000 0.000 NA   NA
 10465585 10465586 HMPREF0868_1207 HMPREF0868_1208     TRUE 0.750 -3.000 0.000 NA   NA
 10465586 10465587 HMPREF0868_1208 HMPREF0868_1209     TRUE 0.692 -16.000 0.000 NA   NA
 10465587 10465588 HMPREF0868_1209 HMPREF0868_1210   ardA TRUE 0.680 -25.000 0.000 NA   NA
 10465588 10465589 HMPREF0868_1210 HMPREF0868_1211 ardA   FALSE 0.291 117.000 0.000 NA   NA
 10465589 10465590 HMPREF0868_1211 HMPREF0868_1212     FALSE 0.307 43.000 0.000 NA   NA
 10465590 10465591 HMPREF0868_1212 HMPREF0868_1213     FALSE 0.125 178.000 0.000 1.000   NA
 10465591 10465592 HMPREF0868_1213 HMPREF0868_1214     TRUE 0.439 29.000 0.000 NA   NA
 10465592 10465593 HMPREF0868_1214 HMPREF0868_1215     TRUE 0.673 16.000 0.000 NA   NA
 10465593 10465594 HMPREF0868_1215 HMPREF0868_1216     FALSE 0.053 324.000 0.000 NA   NA
 10465594 10465595 HMPREF0868_1216 HMPREF0868_1217     TRUE 0.782 4.000 0.000 NA   NA
 10465595 10465596 HMPREF0868_1217 HMPREF0868_1218     TRUE 0.763 0.000 0.000 NA   NA
 10465596 10465597 HMPREF0868_1218 HMPREF0868_1219     FALSE 0.278 91.000 0.000 NA   NA
 10465597 10465598 HMPREF0868_1219 HMPREF0868_1220     FALSE 0.195 143.000 0.000 1.000   NA
 10465598 10465599 HMPREF0868_1220 HMPREF0868_1221     FALSE 0.024 765.000 0.000 NA   NA
 10465600 10465601 HMPREF0868_1222 HMPREF0868_1223     TRUE 0.999 4.000 0.714 0.049   NA
 10465601 10465602 HMPREF0868_1223 HMPREF0868_1224     TRUE 0.749 12.000 0.000 NA   NA
 10465602 10465603 HMPREF0868_1224 HMPREF0868_1225     TRUE 0.998 13.000 0.353 NA   NA
 10465606 10465607 HMPREF0868_1228 HMPREF0868_1230   recN FALSE 0.179 246.000 0.000 1.000 N NA
 10465607 10465608 HMPREF0868_1230 HMPREF0868_1231 recN   TRUE 0.996 18.000 0.170 1.000 N NA
 10465608 10465609 HMPREF0868_1231 HMPREF0868_1232   dxs TRUE 0.979 -25.000 0.004 1.000 N NA
 10465609 10465610 HMPREF0868_1232 HMPREF0868_1233 dxs   TRUE 0.957 5.000 0.000 1.000 Y NA
 10465610 10465611 HMPREF0868_1233 HMPREF0868_1234   xseB TRUE 0.979 -16.000 0.002 1.000 N NA
 10465611 10465612 HMPREF0868_1234 HMPREF0868_1235 xseB xseA TRUE 0.999 -7.000 0.412 0.001 Y NA
 10465612 10465613 HMPREF0868_1235 HMPREF0868_1236 xseA nusB TRUE 0.994 0.000 0.043 1.000 N NA
 10465613 10465614 HMPREF0868_1236 HMPREF0868_1237 nusB   TRUE 0.995 12.000 0.119 NA   NA
 10465614 10465615 HMPREF0868_1237 HMPREF0868_1238     TRUE 0.990 -3.000 0.036 NA   NA
 10465615 10465616 HMPREF0868_1238 HMPREF0868_1239     TRUE 0.729 -7.000 0.000 NA   NA
 10465616 10465617 HMPREF0868_1239 HMPREF0868_1240   efp TRUE 0.984 9.000 0.009 NA   NA
 10465617 10465618 HMPREF0868_1240 HMPREF0868_1241 efp malQ TRUE 0.451 68.000 0.000 1.000 N NA
 10465618 10465619 HMPREF0868_1241 HMPREF0868_1242 malQ   FALSE 0.256 67.000 0.000 NA   NA
 10465619 10465620 HMPREF0868_1242 HMPREF0868_1243     TRUE 0.780 5.000 0.000 NA   NA
 10465620 10465621 HMPREF0868_1243 HMPREF0868_1244   lon TRUE 0.666 -13.000 0.000 1.000   NA
 10465621 10465622 HMPREF0868_1244 HMPREF0868_1245 lon tuf FALSE 0.349 160.000 0.000 1.000 N NA
 10465622 10465623 HMPREF0868_1245 HMPREF0868_1246 tuf fusA TRUE 0.995 135.000 0.400 0.002 Y NA
 10465623 10465624 HMPREF0868_1246 HMPREF0868_1247 fusA rpsG TRUE 0.999 21.000 0.579 1.000 Y NA
 10465624 10465625 HMPREF0868_1247 HMPREF0868_1248 rpsG rpsL TRUE 0.990 144.000 0.224 0.005 Y NA
 10465625 10465626 HMPREF0868_1248 HMPREF0868_1249 rpsL   FALSE 0.275 51.000 0.000 NA   NA
 10465626 10465627 HMPREF0868_1249 HMPREF0868_1250     TRUE 0.780 5.000 0.000 NA   NA
 10465627 10465628 HMPREF0868_1250 HMPREF0868_1251     FALSE 0.057 307.000 0.000 NA   NA
 10465628 10465629 HMPREF0868_1251 HMPREF0868_1252     TRUE 0.497 25.000 0.000 NA   NA
 10465629 10465630 HMPREF0868_1252 HMPREF0868_1253     TRUE 0.717 -9.000 0.000 NA   NA
 10465631 10465632 HMPREF0868_1254 HMPREF0868_1255     TRUE 0.998 -12.000 0.900 NA   NA
 10465633 10465634 HMPREF0868_1256 HMPREF0868_1257   pepT FALSE 0.272 83.000 0.000 NA   NA
 10465634 10465635 HMPREF0868_1257 HMPREF0868_1258 pepT   TRUE 0.451 65.000 0.000 1.000 N NA
 10465635 10465636 HMPREF0868_1258 HMPREF0868_1259   serS TRUE 0.891 2.000 0.000 1.000 N NA
 10465636 10465637 HMPREF0868_1259 HMPREF0868_1260 serS   TRUE 0.451 65.000 0.000 1.000 N NA
 10465637 10465638 HMPREF0868_1260 HMPREF0868_1261     TRUE 0.782 4.000 0.000 NA   NA
 10465638 10465639 HMPREF0868_1261 HMPREF0868_1262     TRUE 0.992 -7.000 0.076 NA   NA
 10465639 10465640 HMPREF0868_1262 HMPREF0868_1263   murB TRUE 0.977 28.000 0.080 NA   NA
 10465640 10465641 HMPREF0868_1263 HMPREF0868_1264 murB hprK TRUE 0.987 -7.000 0.009 1.000 N NA
 10465641 10465642 HMPREF0868_1264 HMPREF0868_1265 hprK   FALSE 0.267 77.000 0.000 NA   NA
 10465642 10465643 HMPREF0868_1265 HMPREF0868_1266     TRUE 0.707 -11.000 0.000 NA   NA
 10465643 10465644 HMPREF0868_1266 HMPREF0868_1267     FALSE 0.354 37.000 0.000 NA   NA
 10465644 10465645 HMPREF0868_1267 HMPREF0868_1268     TRUE 0.780 5.000 0.000 NA   NA
 10465645 10465646 HMPREF0868_1268 HMPREF0868_1269     TRUE 0.780 5.000 0.000 NA   NA
 10465646 10465647 HMPREF0868_1269 HMPREF0868_1270     FALSE 0.109 207.000 0.000 NA   NA
 10465647 10465648 HMPREF0868_1270 HMPREF0868_1271     FALSE 0.256 65.000 0.000 NA   NA
 10465648 10465649 HMPREF0868_1271 HMPREF0868_1272   rplL FALSE 0.118 199.000 0.000 NA   NA
 10465649 10465650 HMPREF0868_1272 HMPREF0868_1273 rplL rplJ TRUE 0.998 29.000 0.884 0.024 Y NA
 10465650 10465651 HMPREF0868_1273 HMPREF0868_1274 rplJ rplA TRUE 0.992 151.000 0.302 0.034 Y NA
 10465651 10465652 HMPREF0868_1274 HMPREF0868_1275 rplA rplK TRUE 1.000 12.000 0.838 0.034 Y NA
 10465652 10465653 HMPREF0868_1275 HMPREF0868_1276 rplK nusG TRUE 0.993 57.000 0.681 1.000 N NA
 10465653 10465654 HMPREF0868_1276 HMPREF0868_1277 nusG secE TRUE 0.999 -3.000 0.843 1.000 N NA
 10465654 10465655 HMPREF0868_1277 HMPREF0868_1278 secE   FALSE 0.039 372.000 0.000 NA   NA
 10465655 10465656 HMPREF0868_1278 HMPREF0868_1279     TRUE 0.983 -10.000 0.021 NA   NA
 10465656 10465657 HMPREF0868_1279 HMPREF0868_1280   murA TRUE 0.992 7.000 0.058 1.000   NA
 10465657 10465658 HMPREF0868_1280 HMPREF0868_1281 murA   TRUE 0.457 62.000 0.000 1.000 N NA
 10465658 10465659 HMPREF0868_1281 HMPREF0868_1282     TRUE 0.998 10.000 0.094 1.000 Y NA
 10465659 10465660 HMPREF0868_1282 HMPREF0868_1283   rrf FALSE 0.286 95.000 0.000 NA   NA
 10465660 10465661 HMPREF0868_1283 HMPREF0868_1284 rrf rrl FALSE 0.278 91.000 0.000 NA   NA
 10465661 10465662 HMPREF0868_1284 HMPREF0868_1285 rrl   FALSE 0.125 195.000 0.000 NA   NA
 10465662 10465663 HMPREF0868_1285 HMPREF0868_1286   rrs FALSE 0.291 117.000 0.000 NA   NA
 10465665 10465666 HMPREF0868_1289 HMPREF0868_1290 gyrA gidB TRUE 0.503 104.000 0.000 1.000 N NA
 10465666 10465667 HMPREF0868_1290 HMPREF0868_1291 gidB gidA TRUE 0.999 -3.000 0.466 1.000 N NA
 10465667 10465668 HMPREF0868_1291 HMPREF0868_1292 gidA trmE TRUE 0.991 31.000 0.266 1.000   NA
 10465668 10465669 HMPREF0868_1292 HMPREF0868_1293 trmE   TRUE 0.994 -7.000 0.116 1.000   NA
 10465669 10465670 HMPREF0868_1293 HMPREF0868_1294   yidC TRUE 0.996 18.000 0.254 1.000   NA
 10465670 10465671 HMPREF0868_1294 HMPREF0868_1295 yidC   TRUE 0.999 13.000 0.461 NA   NA
 10465671 10465672 HMPREF0868_1295 HMPREF0868_1296   rnpA TRUE 0.999 -3.000 0.540 NA   NA
 10465672 10465673 HMPREF0868_1296 HMPREF0868_1297 rnpA rpmH TRUE 0.989 54.000 0.787 1.000   NA
 10465673 10465674 HMPREF0868_1297 HMPREF0868_1298 rpmH   FALSE 0.227 66.000 0.000 1.000   NA
 10465674 10465675 HMPREF0868_1298 HMPREF0868_1299     TRUE 0.804 18.000 0.000 1.000 N NA
 10465675 10465676 HMPREF0868_1299 HMPREF0868_1300     FALSE 0.074 266.000 0.000 NA   NA
 10465676 10465677 HMPREF0868_1300 HMPREF0868_1301   clpX FALSE 0.139 181.000 0.000 NA   NA
 10465677 10465678 HMPREF0868_1301 HMPREF0868_1302 clpX clpP TRUE 0.993 3.000 0.002 1.000 Y NA
 10465678 10465679 HMPREF0868_1302 HMPREF0868_1303 clpP tig TRUE 0.939 86.000 0.002 1.000 Y NA
 10465679 10465680 HMPREF0868_1303 HMPREF0868_1304 tig smpB TRUE 0.605 152.000 0.000 1.000 Y NA
 10465680 10465681 HMPREF0868_1304 HMPREF0868_1305 smpB   TRUE 0.994 2.000 0.005 1.000 Y NA
 10465681 10465682 HMPREF0868_1305 HMPREF0868_1306   dut TRUE 0.895 4.000 0.000 1.000 N NA
 10465682 10465683 HMPREF0868_1306 HMPREF0868_1307 dut   TRUE 0.490 95.000 0.000 1.000 N NA
 10465683 10465684 HMPREF0868_1307 HMPREF0868_1308     TRUE 0.763 0.000 0.000 NA   NA
 10465684 10465685 HMPREF0868_1308 HMPREF0868_1309     TRUE 0.750 -3.000 0.000 NA   NA
 10465685 10465686 HMPREF0868_1309 HMPREF0868_1310   uvrA TRUE 0.490 120.000 0.000 1.000 N NA
 10465688 10465689 HMPREF0868_1312 HMPREF0868_1313   rplT TRUE 0.968 100.000 0.027 0.026 Y NA
 10465689 10465690 HMPREF0868_1313 HMPREF0868_1314 rplT rpmI TRUE 0.998 31.000 0.928 0.024 Y NA
 10465690 10465691 HMPREF0868_1314 HMPREF0868_1315 rpmI infC TRUE 0.999 23.000 0.652 1.000 Y NA
 10465691 10465692 HMPREF0868_1315 HMPREF0868_1316 infC ackA FALSE 0.169 259.000 0.000 1.000 N NA
 10465692 10465693 HMPREF0868_1316 HMPREF0868_1317 ackA pta TRUE 0.995 101.000 0.284 1.000 Y NA
 10465694 10465695 HMPREF0868_1318 HMPREF0868_1319   tyrS FALSE 0.290 99.000 0.000 NA   NA
 10465696 10465697 HMPREF0868_1320 HMPREF0868_1321   rpsT FALSE 0.294 110.000 0.000 NA   NA
 10465697 10465698 HMPREF0868_1321 HMPREF0868_1322 rpsT   FALSE 0.225 141.000 0.000 NA   NA
 10465698 10465699 HMPREF0868_1322 HMPREF0868_1323     TRUE 0.750 -3.000 0.000 NA   NA
 10465699 10465700 HMPREF0868_1323 HMPREF0868_1324   gltA FALSE 0.071 478.000 0.000 1.000 N NA
 10465700 10465701 HMPREF0868_1324 HMPREF0868_1325 gltA   TRUE 0.993 54.000 0.684 0.024 N NA
 10465702 10465703 HMPREF0868_1328 HMPREF0868_1329     TRUE 0.673 16.000 0.000 NA   NA
 10465704 10465705 HMPREF0868_1330 HMPREF0868_1331     TRUE 0.749 12.000 0.000 NA   NA
 10465705 10465706 HMPREF0868_1331 HMPREF0868_1332   metW TRUE 0.719 -3.000 0.000 1.000   NA
 10465710 10465711 HMPREF0868_1336 HMPREF0868_1337     FALSE 0.232 61.000 0.000 1.000   NA
 10465711 10465712 HMPREF0868_1337 HMPREF0868_1338   recJ TRUE 0.994 5.000 0.033 1.000 N NA
 10465712 10465713 HMPREF0868_1338 HMPREF0868_1339 recJ rpsU FALSE 0.119 182.000 0.000 1.000   NA
 10465713 10465714 HMPREF0868_1339 HMPREF0868_1340 rpsU   FALSE 0.064 267.000 0.000 1.000   NA
 10465714 10465715 HMPREF0868_1340 HMPREF0868_1341     TRUE 0.624 31.000 0.000 1.000 N NA
 10465715 10465716 HMPREF0868_1341 HMPREF0868_1342     FALSE 0.126 194.000 0.000 NA   NA
 10465716 10465717 HMPREF0868_1342 HMPREF0868_1343     TRUE 0.750 -3.000 0.000 NA   NA
 10465717 10465718 HMPREF0868_1343 HMPREF0868_1344   alaS FALSE 0.212 147.000 0.000 NA   NA
 10465718 10465719 HMPREF0868_1344 HMPREF0868_1345 alaS lysM FALSE 0.262 113.000 0.000 1.000   NA
 10465721 10465722 HMPREF0868_1347 HMPREF0868_1348     TRUE 0.998 7.000 0.200 NA   NA
 10465723 10465724 HMPREF0868_1349 HMPREF0868_1350 trxA   FALSE 0.148 61.000 0.000 0.006   NA
 10465724 10465725 HMPREF0868_1350 HMPREF0868_1351     TRUE 0.998 0.000 0.318 1.000   NA
 10465726 10465727 HMPREF0868_1352 HMPREF0868_1353     TRUE 0.763 0.000 0.000 NA   NA
 10465727 10465728 HMPREF0868_1353 HMPREF0868_1354     TRUE 0.729 -7.000 0.000 NA   NA
 10465728 10465729 HMPREF0868_1354 HMPREF0868_1355     FALSE 0.307 43.000 0.000 NA   NA
 10465729 10465730 HMPREF0868_1355 HMPREF0868_1356     FALSE 0.283 122.000 0.000 NA   NA
 10465731 10465732 HMPREF0868_1357 HMPREF0868_1358 prfC   TRUE 0.848 -13.000 0.000 1.000 N NA
 10465732 10465733 HMPREF0868_1358 HMPREF0868_1359     TRUE 0.999 0.000 0.286 1.000 Y NA
 10465733 10465734 HMPREF0868_1359 HMPREF0868_1360     TRUE 0.935 15.000 0.000 1.000 Y NA
 10465734 10465735 HMPREF0868_1360 HMPREF0868_1361     TRUE 0.733 13.000 0.000 NA   NA
 10465735 10465736 HMPREF0868_1361 HMPREF0868_1362     TRUE 0.750 -3.000 0.000 NA   NA
 10465736 10465737 HMPREF0868_1362 HMPREF0868_1363     FALSE 0.066 280.000 0.000 NA   NA
 10465738 10465739 HMPREF0868_1364 HMPREF0868_1365     FALSE 0.273 85.000 0.000 NA   NA
 10465739 10465740 HMPREF0868_1365 HMPREF0868_1366     FALSE 0.279 124.000 0.000 NA   NA
 10465740 10465741 HMPREF0868_1366 HMPREF0868_1367     FALSE 0.033 438.000 0.000 NA   NA
 10465742 10465743 HMPREF0868_1368 HMPREF0868_1369     FALSE 0.280 49.000 0.000 NA   NA
 10465743 10465744 HMPREF0868_1369 HMPREF0868_1370   hsdM FALSE 0.058 306.000 0.000 NA   NA
 10465744 10465745 HMPREF0868_1370 HMPREF0868_1371 hsdM   TRUE 0.984 0.000 0.011 NA   NA
 10465745 10465746 HMPREF0868_1371 HMPREF0868_1372     TRUE 0.750 -3.000 0.000 NA   NA
 10465746 10465747 HMPREF0868_1372 HMPREF0868_1373     FALSE 0.291 117.000 0.000 NA   NA
 10465747 10465748 HMPREF0868_1373 HMPREF0868_1374   hsdR TRUE 0.549 23.000 0.000 NA   NA
 10465749 10465750 HMPREF0868_1375 HMPREF0868_1376     FALSE 0.261 74.000 0.000 NA   NA
 10465750 10465751 HMPREF0868_1376 HMPREF0868_1377     FALSE 0.252 133.000 0.000 NA   NA
 10465751 10465752 HMPREF0868_1377 HMPREF0868_1378     FALSE 0.139 284.000 0.000 1.000 N NA
 10465752 10465753 HMPREF0868_1378 HMPREF0868_1379     TRUE 0.465 54.000 0.000 1.000 N NA
 10465753 10465754 HMPREF0868_1379 HMPREF0868_1380     TRUE 0.999 -10.000 0.276 0.047 Y NA
 10465756 10465757 HMPREF0868_1382 HMPREF0868_1383     TRUE 0.454 72.000 0.000 1.000 N NA
 10465757 10465758 HMPREF0868_1383 HMPREF0868_1384   rpsR FALSE 0.273 183.000 0.000 1.000 N NA
 10465758 10465759 HMPREF0868_1384 HMPREF0868_1385 rpsR   TRUE 0.606 33.000 0.000 1.000 N NA
 10465759 10465760 HMPREF0868_1385 HMPREF0868_1386   rpsF TRUE 0.818 17.000 0.000 1.000 N NA
 10465760 10465761 HMPREF0868_1386 HMPREF0868_1387 rpsF trmB FALSE 0.100 200.000 0.000 1.000   NA
 10465761 10465762 HMPREF0868_1387 HMPREF0868_1388 trmB   FALSE 0.267 77.000 0.000 NA   NA
 10465762 10465763 HMPREF0868_1388 HMPREF0868_1389     FALSE 0.267 77.000 0.000 NA   NA
 10465763 10465764 HMPREF0868_1389 HMPREF0868_1390     FALSE 0.271 82.000 0.000 NA   NA
 10465764 10465765 HMPREF0868_1390 HMPREF0868_1391     FALSE 0.092 236.000 0.000 NA   NA
 10465765 10465766 HMPREF0868_1391 HMPREF0868_1392     TRUE 0.729 -7.000 0.000 NA   NA
 10465766 10465767 HMPREF0868_1392 HMPREF0868_1393     TRUE 0.774 2.000 0.000 NA   NA
 10465767 10465768 HMPREF0868_1393 HMPREF0868_1394     FALSE 0.052 328.000 0.000 NA   NA
 10465768 10465769 HMPREF0868_1394 HMPREF0868_1395     TRUE 0.996 20.000 0.176 NA N NA
 10465769 10465770 HMPREF0868_1395 HMPREF0868_1396   prfA TRUE 0.938 -16.000 0.000 NA Y NA
 10465770 10465771 HMPREF0868_1396 HMPREF0868_1397 prfA   TRUE 0.998 21.000 0.229 1.000 Y NA
 10465771 10465772 HMPREF0868_1397 HMPREF0868_1398     TRUE 0.684 -22.000 0.000 NA   NA
 10465772 10465773 HMPREF0868_1398 HMPREF0868_1399   rpmE TRUE 0.961 85.000 0.115 NA   NA
 10465773 10465774 HMPREF0868_1399 HMPREF0868_1400 rpmE rho TRUE 0.973 127.000 0.115 1.000 N NA
 10465774 10465775 HMPREF0868_1400 HMPREF0868_1401 rho ftsA FALSE 0.241 199.000 0.000 1.000 N NA
 10465776 10465777 HMPREF0868_1402 HMPREF0868_1403 traX leuS FALSE 0.283 94.000 0.000 NA   NA
 10465778 10465779 HMPREF0868_1404 HMPREF0868_1406     FALSE 0.288 119.000 0.000 NA   NA
 10465779 10465780 HMPREF0868_1406 HMPREF0868_1407     TRUE 0.998 -3.000 0.357 1.000   NA
 10465780 10465781 HMPREF0868_1407 HMPREF0868_1408     TRUE 0.999 0.000 1.000 NA   NA
 10465781 10465782 HMPREF0868_1408 HMPREF0868_1409     TRUE 0.992 39.000 0.400 NA   NA
 10465782 10465783 HMPREF0868_1409 HMPREF0868_1410     TRUE 0.920 -22.000 0.000 0.012 Y NA
 10465783 10465784 HMPREF0868_1410 HMPREF0868_1411     TRUE 0.984 121.000 0.176 1.000 N NA
 10465784 10465785 HMPREF0868_1411 HMPREF0868_1412   thiE FALSE 0.055 784.000 0.000 1.000 N NA
 10465785 10465786 HMPREF0868_1412 HMPREF0868_1413 thiE   TRUE 0.995 29.000 0.190 0.007 Y NA
 10465786 10465787 HMPREF0868_1413 HMPREF0868_1414   thiW TRUE 0.988 -22.000 0.059 NA   NA
 10465787 10465788 HMPREF0868_1414 HMPREF0868_1415 thiW   FALSE 0.323 41.000 0.000 NA   NA
 10465788 10465789 HMPREF0868_1415 HMPREF0868_1416     FALSE 0.228 140.000 0.000 NA   NA
 10465789 10465790 HMPREF0868_1416 HMPREF0868_1417     TRUE 0.782 4.000 0.000 NA   NA
 10465790 10465791 HMPREF0868_1417 HMPREF0868_1418     FALSE 0.293 114.000 0.000 NA   NA
 10465791 10465792 HMPREF0868_1418 HMPREF0868_1419     FALSE 0.291 117.000 0.000 NA   NA
 10465792 10465793 HMPREF0868_1419 HMPREF0868_1421     FALSE 0.045 345.000 0.000 NA   NA
 10465795 10465796 HMPREF0868_1423 HMPREF0868_1424     FALSE 0.294 45.000 0.000 NA   NA
 10465798 10465799 HMPREF0868_1426 HMPREF0868_1427     FALSE 0.080 254.000 0.000 NA   NA
 10465799 10465800 HMPREF0868_1427 HMPREF0868_1428     TRUE 0.999 14.000 0.238 0.008 Y NA
 10465800 10465801 HMPREF0868_1428 HMPREF0868_1429     TRUE 1.000 11.000 0.776 0.008 Y NA
 10465801 10465802 HMPREF0868_1429 HMPREF0868_1430     TRUE 0.998 34.000 0.462 0.008 Y NA
 10465802 10465803 HMPREF0868_1430 HMPREF0868_1431     TRUE 0.999 -7.000 0.487 0.008 Y NA
 10465803 10465804 HMPREF0868_1431 HMPREF0868_1432     TRUE 0.999 6.000 0.258 0.010 Y NA
 10465804 10465805 HMPREF0868_1432 HMPREF0868_1433     TRUE 0.999 6.000 0.489 0.010   NA
 10465805 10465806 HMPREF0868_1433 HMPREF0868_1434     TRUE 0.988 92.000 0.848 0.010   NA
 10465806 10465807 HMPREF0868_1434 HMPREF0868_1435     TRUE 0.701 -13.000 0.000 NA   NA
 10465807 10465808 HMPREF0868_1435 HMPREF0868_1436     FALSE 0.296 102.000 0.000 NA   NA
 10465808 10465809 HMPREF0868_1436 HMPREF0868_1437     TRUE 0.523 24.000 0.000 NA   NA
 10465809 10465810 HMPREF0868_1437 HMPREF0868_1438     TRUE 0.989 52.000 0.426 NA   NA
 10465810 10465811 HMPREF0868_1438 HMPREF0868_1439     TRUE 0.839 -21.000 0.000 1.000 N NA
 10465811 10465812 HMPREF0868_1439 HMPREF0868_1440     TRUE 0.467 53.000 0.000 1.000 N NA
 10465812 10465813 HMPREF0868_1440 HMPREF0868_1441     TRUE 0.878 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10465814 10465815 HMPREF0868_1442 HMPREF0868_1443     TRUE 0.990 2.000 0.031 NA   NA
 10465816 10465817 HMPREF0868_1444 HMPREF0868_1445     FALSE 0.091 238.000 0.000 NA   NA
 10465817 10465818 HMPREF0868_1445 HMPREF0868_1446     FALSE 0.212 147.000 0.000 NA   NA
 10465818 10465819 HMPREF0868_1446 HMPREF0868_1447     TRUE 0.992 -3.000 0.059 NA   NA
 10465819 10465820 HMPREF0868_1447 HMPREF0868_1448     TRUE 0.774 2.000 0.000 NA   NA
 10465820 10465821 HMPREF0868_1448 HMPREF0868_1449   rpiA TRUE 0.548 39.000 0.000 1.000 N NA
 10465821 10465822 HMPREF0868_1449 HMPREF0868_1450 rpiA   TRUE 0.538 40.000 0.000 1.000 N NA
 10465822 10465823 HMPREF0868_1450 HMPREF0868_1451     FALSE 0.241 83.000 0.000 1.000   NA
 10465823 10465824 HMPREF0868_1451 HMPREF0868_1452   glmM FALSE 0.241 82.000 0.000 1.000   NA
 10465824 10465825 HMPREF0868_1452 HMPREF0868_1453 glmM   TRUE 0.975 14.000 0.005 NA   NA
 10465825 10465826 HMPREF0868_1453 HMPREF0868_1454     TRUE 0.692 -16.000 0.000 NA   NA
 10465826 10465827 HMPREF0868_1454 HMPREF0868_1455     FALSE 0.283 94.000 0.000 NA   NA
 10465827 10465828 HMPREF0868_1455 HMPREF0868_1456     TRUE 0.591 21.000 0.000 NA   NA
 10465828 10465829 HMPREF0868_1456 HMPREF0868_1457     FALSE 0.081 251.000 0.000 NA   NA
 10465829 10465830 HMPREF0868_1457 HMPREF0868_1458     TRUE 0.995 21.000 0.068 NA Y NA
 10465830 10465831 HMPREF0868_1458 HMPREF0868_1459     TRUE 0.999 -13.000 0.274 1.000 Y NA
 10465832 10465833 HMPREF0868_1460 HMPREF0868_1461 brnQ   FALSE 0.133 293.000 0.000 1.000 N NA
 10465833 10465834 HMPREF0868_1461 HMPREF0868_1462     FALSE 0.125 178.000 0.000 1.000   NA
 10465834 10465835 HMPREF0868_1462 HMPREF0868_1463     FALSE 0.037 353.000 0.000 1.000   NA
 10465838 10465839 HMPREF0868_1466 HMPREF0868_1467     TRUE 0.999 -7.000 0.647 0.043 Y NA
 10465839 10465840 HMPREF0868_1467 HMPREF0868_1468     TRUE 0.944 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 10465840 10465841 HMPREF0868_1468 HMPREF0868_1469     TRUE 0.997 109.000 0.600 1.000 Y NA
 10465841 10465842 HMPREF0868_1469 HMPREF0868_1470     TRUE 0.523 24.000 0.000 NA   NA
 10465842 10465843 HMPREF0868_1470 HMPREF0868_1471     FALSE 0.259 63.000 0.000 NA   NA
 10465843 10465844 HMPREF0868_1471 HMPREF0868_1472     FALSE 0.286 95.000 0.000 NA   NA
 10465844 10465845 HMPREF0868_1472 HMPREF0868_1473   rrf TRUE 0.776 7.000 0.000 NA   NA
 10465845 10465846 HMPREF0868_1473 HMPREF0868_1474 rrf rrl FALSE 0.278 91.000 0.000 NA   NA
 10465846 10465847 HMPREF0868_1474 HMPREF0868_1475 rrl   FALSE 0.112 205.000 0.000 NA   NA
 10465847 10465848 HMPREF0868_1475 HMPREF0868_1476   rrs FALSE 0.289 118.000 0.000 NA   NA
 10465848 10465849 HMPREF0868_1476 HMPREF0868_1478 rrs   FALSE 0.039 374.000 0.000 NA   NA
 10465849 10465850 HMPREF0868_1478 HMPREF0868_1479     TRUE 0.998 -7.000 0.417 0.014   NA
 10465850 10465851 HMPREF0868_1479 HMPREF0868_1480     TRUE 0.998 -7.000 0.476 0.014   NA
 10465851 10465852 HMPREF0868_1480 HMPREF0868_1481   ppdK FALSE 0.234 75.000 0.000 1.000   NA
 10465852 10465853 HMPREF0868_1481 HMPREF0868_1482 ppdK glyS TRUE 0.916 80.000 0.010 1.000 N NA
 10465853 10465854 HMPREF0868_1482 HMPREF0868_1483 glyS rpoZ TRUE 0.988 3.000 0.004 1.000 N NA
 10465854 10465855 HMPREF0868_1483 HMPREF0868_1484 rpoZ gmk TRUE 0.993 62.000 0.471 1.000 N NA
 10465855 10465856 HMPREF0868_1484 HMPREF0868_1485 gmk   TRUE 0.996 3.000 0.143 NA   NA
 10465856 10465857 HMPREF0868_1485 HMPREF0868_1486     TRUE 0.988 29.000 0.189 NA   NA
 10465857 10465858 HMPREF0868_1486 HMPREF0868_1487     FALSE 0.271 82.000 0.000 NA   NA
 10465859 10465860 HMPREF0868_1488 HMPREF0868_1489     TRUE 0.750 -3.000 0.000 NA   NA
 10465861 10465862 HMPREF0868_1490 HMPREF0868_1491     TRUE 0.991 37.000 0.330 NA   NA
 10465862 10465863 HMPREF0868_1491 HMPREF0868_1492     TRUE 0.607 20.000 0.000 NA   NA
 10465863 10465864 HMPREF0868_1492 HMPREF0868_1493   gap TRUE 0.654 17.000 0.000 NA   NA
 10465864 10465865 HMPREF0868_1493 HMPREF0868_1494 gap   FALSE 0.265 56.000 0.000 NA   NA
 10465865 10465866 HMPREF0868_1494 HMPREF0868_1495     FALSE 0.286 95.000 0.000 NA   NA
 10465866 10465867 HMPREF0868_1495 HMPREF0868_1496     TRUE 0.750 -3.000 0.000 NA   NA
 10465867 10465868 HMPREF0868_1496 HMPREF0868_1497     TRUE 0.632 18.000 0.000 NA   NA
 10465868 10465869 HMPREF0868_1497 HMPREF0868_1498     FALSE 0.135 184.000 0.000 NA   NA
 10465869 10465870 HMPREF0868_1498 HMPREF0868_1499     TRUE 0.766 10.000 0.000 NA   NA
 10465870 10465871 HMPREF0868_1499 HMPREF0868_1500     FALSE 0.399 32.000 0.000 NA   NA
 10465871 10465872 HMPREF0868_1500 HMPREF0868_1501     TRUE 0.778 6.000 0.000 NA   NA
 10465872 10465873 HMPREF0868_1501 HMPREF0868_1502     FALSE 0.127 193.000 0.000 NA   NA
 10465873 10465874 HMPREF0868_1502 HMPREF0868_1503   galE FALSE 0.216 145.000 0.000 NA   NA
 10465874 10465875 HMPREF0868_1503 HMPREF0868_1504 galE   TRUE 0.522 45.000 0.000 NA N NA
 10465875 10465876 HMPREF0868_1504 HMPREF0868_1505   metG TRUE 0.998 0.000 0.221 NA N NA
 10465876 10465877 HMPREF0868_1505 HMPREF0868_1506 metG   TRUE 0.462 56.000 0.000 1.000 N NA
 10465877 10465878 HMPREF0868_1506 HMPREF0868_1507     TRUE 0.471 82.000 0.000 1.000 N NA
 10465878 10465879 HMPREF0868_1507 HMPREF0868_1508   truA TRUE 0.831 -33.000 0.000 1.000 N NA
 10465879 10465880 HMPREF0868_1508 HMPREF0868_1509 truA   TRUE 0.992 64.000 0.404 1.000 N NA
 10465880 10465881 HMPREF0868_1509 HMPREF0868_1510     TRUE 0.983 -19.000 0.029 1.000   NA
 10465881 10465882 HMPREF0868_1510 HMPREF0868_1511   rplQ TRUE 0.801 74.000 0.002 1.000   NA
 10465882 10465883 HMPREF0868_1511 HMPREF0868_1512 rplQ rpoA TRUE 0.996 33.000 0.873 1.000 N NA
 10465883 10465884 HMPREF0868_1512 HMPREF0868_1513 rpoA rpsK TRUE 0.991 60.000 0.308 1.000 N NA
 10465884 10465885 HMPREF0868_1513 HMPREF0868_1514 rpsK rpsM TRUE 0.999 14.000 0.810 0.023 Y NA
 10465885 10465886 HMPREF0868_1514 HMPREF0868_1515 rpsM rpmJ TRUE 0.974 113.000 0.194 0.023   NA
 10465886 10465887 HMPREF0868_1515 HMPREF0868_1516 rpmJ infA TRUE 0.974 151.000 0.257 1.000   NA
 10465887 10465888 HMPREF0868_1516 HMPREF0868_1517 infA   TRUE 0.992 -18.000 0.090 NA   NA
 10465888 10465889 HMPREF0868_1517 HMPREF0868_1518   map TRUE 0.782 4.000 0.000 NA   NA
 10465889 10465890 HMPREF0868_1518 HMPREF0868_1519 map   TRUE 0.878 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10465890 10465891 HMPREF0868_1519 HMPREF0868_1520   secY TRUE 0.988 64.000 0.241 1.000 N NA
 10465891 10465892 HMPREF0868_1520 HMPREF0868_1521 secY rplO TRUE 0.999 4.000 0.730 1.000 N NA
 10465892 10465893 HMPREF0868_1521 HMPREF0868_1522 rplO rpmD TRUE 0.999 13.000 0.653 0.004 Y NA
 10465893 10465894 HMPREF0868_1522 HMPREF0868_1523 rpmD rpsE TRUE 1.000 12.000 0.789 0.032 Y NA
 10465894 10465895 HMPREF0868_1523 HMPREF0868_1524 rpsE rplR TRUE 0.999 13.000 0.814 0.032 Y NA
 10465895 10465896 HMPREF0868_1524 HMPREF0868_1525 rplR rplF TRUE 0.999 16.000 0.815 0.023 Y NA
 10465896 10465897 HMPREF0868_1525 HMPREF0868_1526 rplF rpsH TRUE 0.996 52.000 0.808 0.023 Y NA
 10465897 10465898 HMPREF0868_1526 HMPREF0868_1527 rpsH rpsN TRUE 0.999 21.000 0.473 0.023 Y NA
 10465898 10465899 HMPREF0868_1527 HMPREF0868_1528 rpsN   TRUE 0.999 18.000 0.496 0.023 Y NA
 10465899 10465900 HMPREF0868_1528 HMPREF0868_1529   rplX TRUE 1.000 11.000 0.758 0.023 Y NA
 10465900 10465901 HMPREF0868_1529 HMPREF0868_1530 rplX rplN TRUE 1.000 11.000 0.810 0.032 Y NA
 10465901 10465902 HMPREF0868_1530 HMPREF0868_1531 rplN rpsQ TRUE 0.998 30.000 0.791 0.032 Y NA
 10465902 10465903 HMPREF0868_1531 HMPREF0868_1532 rpsQ rpmC TRUE 1.000 12.000 0.828 0.023 Y NA
 10465903 10465904 HMPREF0868_1532 HMPREF0868_1533 rpmC rplP TRUE 1.000 -3.000 0.802 0.023 Y NA
 10465904 10465905 HMPREF0868_1533 HMPREF0868_1534 rplP rpsC TRUE 1.000 0.000 0.828 0.032 Y NA
 10465905 10465906 HMPREF0868_1534 HMPREF0868_1535 rpsC rplV TRUE 1.000 11.000 0.719 0.032 Y NA
 10465906 10465907 HMPREF0868_1535 HMPREF0868_1536 rplV rpsS TRUE 0.999 24.000 0.769 0.032 Y NA
 10465907 10465908 HMPREF0868_1536 HMPREF0868_1537 rpsS rplB TRUE 0.999 15.000 0.820 0.032 Y NA
 10465908 10465909 HMPREF0868_1537 HMPREF0868_1538 rplB rplW TRUE 0.999 26.000 0.849 1.000 Y NA
 10465909 10465910 HMPREF0868_1538 HMPREF0868_1539 rplW rplD TRUE 0.999 0.000 0.307 1.000 Y NA
 10465910 10465911 HMPREF0868_1539 HMPREF0868_1540 rplD rplC TRUE 0.999 22.000 0.544 0.023 Y NA
 10465911 10465912 HMPREF0868_1540 HMPREF0868_1541 rplC rpsJ TRUE 0.996 83.000 0.467 0.032 Y NA
 10465912 10465913 HMPREF0868_1541 HMPREF0868_1542 rpsJ   FALSE 0.056 315.000 0.000 NA   NA
 10465913 10465914 HMPREF0868_1542 HMPREF0868_1543     FALSE 0.273 85.000 0.000 NA   NA
 10465914 10465915 HMPREF0868_1543 HMPREF0868_1544     FALSE 0.091 238.000 0.000 NA   NA
 10465915 10465916 HMPREF0868_1544 HMPREF0868_1545     TRUE 0.996 14.000 0.061 0.023 Y NA
 10465916 10465917 HMPREF0868_1545 HMPREF0868_1546     TRUE 0.998 1.000 0.113 0.023 Y NA
 10465917 10465918 HMPREF0868_1546 HMPREF0868_1547     TRUE 1.000 3.000 0.364 0.023 Y NA
 10465918 10465919 HMPREF0868_1547 HMPREF0868_1548     TRUE 1.000 11.000 0.678 0.023 Y NA
 10465919 10465920 HMPREF0868_1548 HMPREF0868_1549     TRUE 1.000 4.000 0.431 0.023 Y NA
 10465920 10465921 HMPREF0868_1549 HMPREF0868_1550     FALSE 0.027 643.000 0.000 NA   NA
 10465921 10465922 HMPREF0868_1550 HMPREF0868_1551   hslO FALSE 0.036 403.000 0.000 NA   NA
 10465922 10465923 HMPREF0868_1551 HMPREF0868_1552 hslO   TRUE 0.909 151.000 0.063 1.000   NA
 10465923 10465924 HMPREF0868_1552 HMPREF0868_1553     TRUE 0.666 -13.000 0.000 1.000   NA
 10465924 10465925 HMPREF0868_1553 HMPREF0868_1554     FALSE 0.294 162.000 0.000 0.029 N NA
 10465925 10465926 HMPREF0868_1554 HMPREF0868_1555     TRUE 0.705 126.000 0.000 1.000 Y NA
 10465926 10465927 HMPREF0868_1555 HMPREF0868_1556   ftsE TRUE 1.000 9.000 0.431 1.000 Y NA
 10465927 10465928 HMPREF0868_1556 HMPREF0868_1557 ftsE   TRUE 0.734 265.000 0.013 NA N NA
 10465928 10465929 HMPREF0868_1557 HMPREF0868_1558     FALSE 0.290 99.000 0.000 NA   NA
 10465929 10465930 HMPREF0868_1558 HMPREF0868_1559     FALSE 0.260 62.000 0.000 NA   NA
 10465930 10465931 HMPREF0868_1559 HMPREF0868_1560     TRUE 0.692 -16.000 0.000 NA   NA
 10465931 10465932 HMPREF0868_1560 HMPREF0868_1561   alr TRUE 0.739 -6.000 0.000 NA   NA
 10465932 10465933 HMPREF0868_1561 HMPREF0868_1562 alr   TRUE 0.470 133.000 0.000 NA N NA
 10465933 10465934 HMPREF0868_1562 HMPREF0868_1563   asnA TRUE 0.518 99.000 0.000 NA N NA
 10465934 10465935 HMPREF0868_1563 HMPREF0868_1564 asnA   FALSE 0.172 164.000 0.000 NA   NA
 10465935 10465936 HMPREF0868_1564 HMPREF0868_1565     TRUE 0.717 -9.000 0.000 NA   NA
 10465938 10465939 HMPREF0868_1567 HMPREF0868_1568     FALSE 0.294 101.000 0.000 NA   NA
 10465939 10465940 HMPREF0868_1568 HMPREF0868_1569     TRUE 0.991 43.000 0.400 NA   NA
 10465940 10465941 HMPREF0868_1569 HMPREF0868_1570     TRUE 0.774 2.000 0.000 NA   NA
 10465942 10465943 HMPREF0868_1571 HMPREF0868_1572     TRUE 0.997 -3.000 0.182 NA   NA
 10465943 10465944 HMPREF0868_1572 HMPREF0868_1573     FALSE 0.256 69.000 0.000 NA   NA
 10465944 10465945 HMPREF0868_1573 HMPREF0868_1574     FALSE 0.190 156.000 0.000 NA   NA
 10465945 10465946 HMPREF0868_1574 HMPREF0868_1575     TRUE 0.523 24.000 0.000 NA   NA
 10465946 10465947 HMPREF0868_1575 HMPREF0868_1577     TRUE 0.706 -12.000 0.000 NA   NA
 10465948 10465949 HMPREF0868_1576 HMPREF0868_1578     TRUE 0.497 25.000 0.000 NA   NA
 10465949 10465950 HMPREF0868_1578 HMPREF0868_1579     FALSE 0.125 195.000 0.000 NA   NA
 10465951 10465952 HMPREF0868_1580 HMPREF0868_1581     TRUE 0.750 -3.000 0.000 NA   NA
 10465952 10465953 HMPREF0868_1581 HMPREF0868_1582     FALSE 0.381 34.000 0.000 NA   NA
 10465953 10465954 HMPREF0868_1582 HMPREF0868_1583     TRUE 0.766 10.000 0.000 NA   NA
 10465955 10465956 HMPREF0868_1584 HMPREF0868_1585 lysR   TRUE 0.831 16.000 0.000 1.000 N NA
 10465956 10465957 HMPREF0868_1585 HMPREF0868_1586     TRUE 0.976 110.000 0.035 1.000 Y NA
 10465957 10465958 HMPREF0868_1586 HMPREF0868_1587     TRUE 0.999 0.000 0.223 0.041 Y NA
 10465958 10465959 HMPREF0868_1587 HMPREF0868_1588     FALSE 0.296 102.000 0.000 NA   NA
 10465959 10465960 HMPREF0868_1588 HMPREF0868_1589     TRUE 0.859 199.000 0.070 NA   NA
 10465960 10465961 HMPREF0868_1589 HMPREF0868_1590     TRUE 0.949 118.000 0.070 NA   NA
 10465962 10465963 HMPREF0868_1591 HMPREF0868_1592     FALSE 0.267 128.000 0.000 NA   NA
 10465963 10465964 HMPREF0868_1592 HMPREF0868_1593     TRUE 0.998 -3.000 0.308 NA   NA
 10465969 10465970 HMPREF0868_1598 HMPREF0868_1599 pulA   FALSE 0.188 157.000 0.000 NA   NA
 10465970 10465971 HMPREF0868_1599 HMPREF0868_1600     TRUE 0.780 3.000 0.000 NA   NA
 10465971 10465972 HMPREF0868_1600 HMPREF0868_1601     TRUE 0.709 124.000 0.000 1.000 Y NA
 10465972 10465973 HMPREF0868_1601 HMPREF0868_1602     TRUE 0.791 16.000 0.000 0.009 N NA
 10465973 10465974 HMPREF0868_1602 HMPREF0868_1603     FALSE 0.330 169.000 0.000 NA N NA
 10465976 10465977 HMPREF0868_1605 HMPREF0868_1606     TRUE 0.926 47.000 0.034 NA   NA
 10465977 10465978 HMPREF0868_1606 HMPREF0868_1607     TRUE 0.996 -13.000 0.184 NA   NA
 10465978 10465979 HMPREF0868_1607 HMPREF0868_1608     TRUE 0.774 2.000 0.000 NA   NA
 10465980 10465981 HMPREF0868_1609 HMPREF0868_1610     FALSE 0.037 397.000 0.000 NA   NA
 10465981 10465982 HMPREF0868_1610 HMPREF0868_1611     TRUE 0.999 0.000 0.444 NA   NA
 10465983 10465984 HMPREF0868_1612 HMPREF0868_1613     FALSE 0.287 47.000 0.000 NA   NA
 10465984 10465985 HMPREF0868_1613 HMPREF0868_1614     FALSE 0.142 167.000 0.000 1.000   NA
 10465985 10465986 HMPREF0868_1614 HMPREF0868_1615   kbl FALSE 0.318 167.000 0.000 1.000 N NA
 10465986 10465987 HMPREF0868_1615 HMPREF0868_1616 kbl   FALSE 0.248 197.000 0.000 1.000 N NA
 10465987 10465988 HMPREF0868_1616 HMPREF0868_1617     TRUE 0.731 38.000 0.000 0.003 Y NA
 10465988 10465989 HMPREF0868_1617 HMPREF0868_1618     FALSE 0.313 168.000 0.000 1.000 N NA
 10465989 10465990 HMPREF0868_1618 HMPREF0868_1619     FALSE 0.041 366.000 0.000 NA   NA
 10465990 10465991 HMPREF0868_1619 HMPREF0868_1620     FALSE 0.044 350.000 0.000 NA   NA
 10465991 10465992 HMPREF0868_1620 HMPREF0868_1621     FALSE 0.064 282.000 0.000 NA   NA
 10465992 10465993 HMPREF0868_1621 HMPREF0868_1622     FALSE 0.298 105.000 0.000 NA   NA
 10465993 10465994 HMPREF0868_1622 HMPREF0868_1623     FALSE 0.170 165.000 0.000 NA   NA
 10465996 10465997 HMPREF0868_1625 HMPREF0868_1626 gidA   TRUE 0.773 8.000 0.000 NA   NA
 10465999 10466000 HMPREF0868_1628 HMPREF0868_1629     TRUE 0.673 16.000 0.000 NA   NA
 10466000 10466001 HMPREF0868_1629 HMPREF0868_1630     TRUE 0.750 -3.000 0.000 NA   NA
 10466001 10466002 HMPREF0868_1630 HMPREF0868_1631     TRUE 0.558 38.000 0.000 1.000 N NA
 10466002 10466003 HMPREF0868_1631 HMPREF0868_1632     TRUE 1.000 4.000 0.571 1.000 Y NA
 10466003 10466004 HMPREF0868_1632 HMPREF0868_1633     FALSE 0.377 150.000 0.000 1.000 N NA
 10466004 10466005 HMPREF0868_1633 HMPREF0868_1634     FALSE 0.338 167.000 0.000 NA N NA
 10466005 10466006 HMPREF0868_1634 HMPREF0868_1635     FALSE 0.093 396.000 0.000 NA N NA
 10466008 10466009 HMPREF0868_1637 HMPREF0868_1638     FALSE 0.221 143.000 0.000 NA   NA
 10466009 10466010 HMPREF0868_1638 HMPREF0868_1639     FALSE 0.288 119.000 0.000 NA   NA
 10466012 10466013 HMPREF0868_1641 HMPREF0868_1642     FALSE 0.281 93.000 0.000 NA   NA
 10466015 10466016 HMPREF0868_1643 HMPREF0868_1645     FALSE 0.272 127.000 0.000 NA   NA
 10466017 10464387 HMPREF0868_1646 HMPREF0868_0002     FALSE 0.024 770.000 0.000 NA   NA