MicrobesOnline Operon Predictions for Staphylococcus aureus subsp. aureus ED98

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
10448709	10448710	SAAV_0001	SAAV_0002	dnaA	dnaN	FALSE	0.438	278.000	0.328	1.000	Y	NA
10448710	10448711	SAAV_0002	SAAV_0003	dnaN		FALSE	0.083	381.000	0.103	1.000		NA
10448711	10448712	SAAV_0003	SAAV_0004		recF	TRUE	0.964	-3.000	0.209	1.000		NA
10448712	10448713	SAAV_0004	SAAV_0005	recF	gyrB	TRUE	0.984	10.000	0.249	0.006	Y	NA
10448713	10448714	SAAV_0005	SAAV_0006	gyrB	gyrA	TRUE	0.971	37.000	0.306	0.002	Y	NA
10448716	10448717	SAAV_0008	SAAV_0010	hutH	serS	FALSE	0.096	379.000	0.000	0.060	N	NA
10448717	10448718	SAAV_0010	SAAV_0011	serS		FALSE	0.021	651.000	0.000	NA	N	NA
10448718	10448719	SAAV_0011	SAAV_0012			TRUE	0.966	-3.000	0.338	NA		NA
10448719	10448720	SAAV_0012	SAAV_0014			FALSE	0.025	363.000	0.000	NA		NA
10448720	10448721	SAAV_0014	SAAV_0015			FALSE	0.044	308.000	0.011	NA		NA
10448721	10448722	SAAV_0015	SAAV_0016			TRUE	0.779	15.000	0.039	NA		NA
10448722	10448723	SAAV_0016	SAAV_0017		rplI	TRUE	0.928	-3.000	0.008	1.000	N	NA
10448723	10448724	SAAV_0017	SAAV_0018	rplI	dnaB	TRUE	0.773	32.000	0.064	1.000	N	NA
10448724	10448725	SAAV_0018	SAAV_0019	dnaB	purA	FALSE	0.090	278.000	0.018	1.000	N	NA
10448725	10448726	SAAV_0019	SAAV_0020	purA		FALSE	0.021	429.000	0.000	NA		NA
10448726	10448727	SAAV_0020	SAAV_0021			TRUE	0.630	8.000	0.000	NA		NA
10448727	10448728	SAAV_0021	SAAV_0022		yycF	FALSE	0.017	617.000	0.000	NA		NA
10448728	10448729	SAAV_0022	SAAV_0023	yycF	yycG	TRUE	0.989	13.000	0.597	0.014	Y	NA
10448729	10448730	SAAV_0023	SAAV_0024	yycG	yycH	TRUE	0.981	-7.000	0.575	NA		NA
10448730	10448731	SAAV_0024	SAAV_0025	yycH	yycI	TRUE	0.970	1.000	0.890	NA		NA
10448731	10448732	SAAV_0025	SAAV_0026	yycI	yycJ	FALSE	0.080	389.000	0.176	NA		NA
10448732	10448733	SAAV_0026	SAAV_0027	yycJ		FALSE	0.071	227.000	0.000	1.000		NA
10448735	10448736	SAAV_0029	SAAV_0030			FALSE	0.110	147.000	0.000	NA		NA
10448737	10448738	SAAV_0031	SAAV_0032			FALSE	0.034	434.000	0.000	1.000		NA
10448738	10448739	SAAV_0032	SAAV_0033			TRUE	0.792	0.000	0.000	NA		NA
10448740	10448741	SAAV_0034	SAAV_0035			TRUE	0.620	31.000	0.000	1.000		NA
10448741	10448742	SAAV_0035	SAAV_0036			TRUE	0.743	19.000	0.000	1.000		NA
10448744	10448745	SAAV_0038	SAAV_0039			FALSE	0.357	49.000	0.000	NA		NA
10448745	10448746	SAAV_0039	SAAV_0040			FALSE	0.050	208.000	0.000	NA		NA
10448746	10448747	SAAV_0040	SAAV_0041			FALSE	0.038	267.000	0.000	NA		NA
10448747	10448748	SAAV_0041	SAAV_0042			FALSE	0.313	57.000	0.000	NA		NA
10448748	10448749	SAAV_0042	SAAV_0043		plc	FALSE	0.050	206.000	0.000	NA		NA
10448749	10448750	SAAV_0043	SAAV_0044	plc		FALSE	0.045	221.000	0.000	NA		NA
10448750	10448751	SAAV_0044	SAAV_0045			FALSE	0.343	52.000	0.000	NA		NA
10448751	10448752	SAAV_0045	SAAV_0046			FALSE	0.255	68.000	0.000	NA		NA
10448753	10448754	SAAV_0047	SAAV_0048			TRUE	0.976	-34.000	0.000	0.068		NA
10448754	10448755	SAAV_0048	SAAV_0049			FALSE	0.165	112.000	0.000	NA		NA
10448755	10448756	SAAV_0049	SAAV_0050			FALSE	0.357	49.000	0.000	NA		NA
10448756	10448757	SAAV_0050	SAAV_0051			TRUE	0.633	7.000	0.000	NA		NA
10448757	10448758	SAAV_0051	SAAV_0052			TRUE	0.893	-10.000	0.000	NA		NA
10448758	10448759	SAAV_0052	SAAV_0053			TRUE	0.659	16.000	0.000	NA		NA
10448759	10448760	SAAV_0053	SAAV_0054			TRUE	0.626	13.000	0.000	NA		NA
10448760	10448761	SAAV_0054	SAAV_0055			FALSE	0.306	58.000	0.000	NA		NA
10448763	10448764	SAAV_0057	SAAV_0058			FALSE	0.453	35.000	0.000	NA		NA
10448764	10448765	SAAV_0058	SAAV_0059			TRUE	0.640	6.000	0.000	NA		NA
10448765	10448766	SAAV_0059	SAAV_0060			TRUE	0.656	5.000	0.000	NA		NA
10448766	10448767	SAAV_0060	SAAV_0061			FALSE	0.192	91.000	0.000	NA		NA
10448767	10448768	SAAV_0061	SAAV_0062			FALSE	0.067	180.000	0.000	NA		NA
10448768	10448769	SAAV_0062	SAAV_0063			TRUE	0.681	4.000	0.000	NA		NA
10448769	10448770	SAAV_0063	SAAV_0064			FALSE	0.413	39.000	0.000	NA		NA
10448770	10448771	SAAV_0064	SAAV_0065			FALSE	0.096	157.000	0.000	NA		NA
10448772	10448773	SAAV_0066	SAAV_0067			FALSE	0.197	89.000	0.000	NA		NA
10448773	10448774	SAAV_0067	SAAV_0068			FALSE	0.260	67.000	0.000	NA		NA
10448774	10448775	SAAV_0068	SAAV_0069			FALSE	0.123	136.000	0.000	NA		NA
10448775	10448776	SAAV_0069	SAAV_0070			FALSE	0.159	151.000	0.000	1.000		NA
10448776	10448777	SAAV_0070	SAAV_0071			TRUE	0.740	2.000	0.000	NA		NA
10448778	10448779	SAAV_0072	SAAV_0073			FALSE	0.029	325.000	0.000	NA		NA
10448779	10448780	SAAV_0073	SAAV_0074			FALSE	0.075	174.000	0.000	NA		NA
10448781	10448782	SAAV_0075	SAAV_0076			FALSE	0.059	190.000	0.000	NA		NA
10448782	10448783	SAAV_0076	SAAV_0077			FALSE	0.038	262.000	0.000	NA		NA
10448784	10448785	SAAV_0078	SAAV_0080	spa	sarS	FALSE	0.017	577.000	0.000	NA		NA
10448785	10448786	SAAV_0080	SAAV_0081	sarS	sirC	FALSE	0.039	369.000	0.000	1.000		NA
10448786	10448787	SAAV_0081	SAAV_0082	sirC	sirB	TRUE	0.991	-3.000	0.091	0.037	Y	NA
10448787	10448788	SAAV_0082	SAAV_0083	sirB	sirA	TRUE	0.964	16.000	0.111	1.000	Y	NA
10448789	10448790	SAAV_0084	SAAV_0085			TRUE	0.973	9.000	0.333	1.000	Y	NA
10448790	10448791	SAAV_0085	SAAV_0086			TRUE	0.897	21.000	0.171	1.000	N	NA
10448791	10448792	SAAV_0086	SAAV_0087			TRUE	0.974	-7.000	0.171	1.000	N	NA
10448792	10448793	SAAV_0087	SAAV_0088			TRUE	0.983	-10.000	0.278	1.000	N	NA
10448793	10448794	SAAV_0088	SAAV_0089			TRUE	0.998	-91.000	0.172	0.001	Y	NA
10448794	10448795	SAAV_0089	SAAV_0090			TRUE	0.988	-25.000	0.355	1.000	N	NA
10448795	10448796	SAAV_0090	SAAV_0091			TRUE	0.955	0.000	0.185	1.000	N	NA
10448796	10448797	SAAV_0091	SAAV_0092			TRUE	0.871	4.000	0.037	1.000	N	NA
10448797	10448798	SAAV_0092	SAAV_0093			FALSE	0.054	196.000	0.000	NA		NA
10448798	10448799	SAAV_0093	SAAV_0094			FALSE	0.048	212.000	0.000	NA		NA
10448799	10448800	SAAV_0094	SAAV_0095			FALSE	0.113	144.000	0.000	NA		NA
10448800	10448801	SAAV_0095	SAAV_0096			FALSE	0.215	79.000	0.000	NA		NA
10448801	10448802	SAAV_0096	SAAV_0097			TRUE	0.986	-37.000	0.000	NA	Y	NA
10448802	10448803	SAAV_0097	SAAV_0098			FALSE	0.250	210.000	0.000	NA	Y	NA
10448803	10448804	SAAV_0098	SAAV_0099			TRUE	0.907	-19.000	0.000	NA		NA
10448804	10448805	SAAV_0099	SAAV_0100			TRUE	0.893	-10.000	0.000	NA		NA
10448805	10448806	SAAV_0100	SAAV_0101		sodA1	FALSE	0.060	268.000	0.000	1.000		NA
10448806	10448807	SAAV_0101	SAAV_0102	sodA1		FALSE	0.039	368.000	0.000	1.000		NA
10448809	10448810	SAAV_0104	SAAV_0105	deoD1		TRUE	0.879	7.000	0.100	1.000	N	NA
10448810	10448811	SAAV_0105	SAAV_0106		deoC1	FALSE	0.410	81.000	0.013	1.000	N	NA
10448811	10448812	SAAV_0106	SAAV_0107	deoC1	deoB	TRUE	0.838	28.000	0.000	0.059	N	NA
10448813	10448814	SAAV_0108	SAAV_0109			TRUE	0.997	-3.000	0.689	0.002	Y	NA
10448814	10448815	SAAV_0109	SAAV_0110			TRUE	0.994	2.000	0.654	0.002	Y	NA
10448815	10448816	SAAV_0110	SAAV_0111			TRUE	0.723	195.000	0.308	0.002	Y	NA
10448817	10448818	SAAV_0112	SAAV_0113			TRUE	0.585	51.000	0.091	NA		NA
10448818	10448819	SAAV_0113	SAAV_0114			FALSE	0.096	157.000	0.000	NA		NA
10448819	10448820	SAAV_0114	SAAV_0115			TRUE	0.869	6.000	0.182	NA		NA
10448820	10448821	SAAV_0115	SAAV_0116			FALSE	0.045	385.000	0.000	1.000	N	NA
10448821	10448822	SAAV_0116	SAAV_0117		cap5A	FALSE	0.052	343.000	0.000	1.000	N	NA
10448822	10448823	SAAV_0117	SAAV_0118	cap5A	cap5B	TRUE	0.794	16.000	0.000	1.000	N	NA
10448823	10448824	SAAV_0118	SAAV_0119	cap5B	cap5C	TRUE	0.831	3.000	0.000	1.000	N	NA
10448824	10448825	SAAV_0119	SAAV_0120	cap5C	cap5D	TRUE	0.981	20.000	0.667	1.000	Y	NA
10448825	10448826	SAAV_0120	SAAV_0121	cap5D	cap5E	TRUE	0.991	-10.000	1.000	1.000		NA
10448826	10448827	SAAV_0121	SAAV_0122	cap5E	cap5F	TRUE	0.795	13.000	0.019	1.000		NA
10448827	10448828	SAAV_0122	SAAV_0123	cap5F	cap5G	TRUE	0.991	4.000	0.477	0.004	Y	NA
10448828	10448829	SAAV_0123	SAAV_0124	cap5G	cap5H	TRUE	0.833	3.000	0.005	1.000		NA
10448829	10448830	SAAV_0124	SAAV_0125	cap5H	cap5I	TRUE	0.791	5.000	0.002	1.000		NA
10448830	10448831	SAAV_0125	SAAV_0126	cap5I	cap5J	TRUE	0.917	14.000	0.000	NA	Y	NA
10448831	10448832	SAAV_0126	SAAV_0127	cap5J	cap5K	TRUE	0.874	-7.000	0.000	NA		NA
10448832	10448833	SAAV_0127	SAAV_0128	cap5K	cap5L	TRUE	0.761	1.000	0.000	NA		NA
10448833	10448834	SAAV_0128	SAAV_0129	cap5L	cap5M	TRUE	0.930	11.000	0.015	NA	Y	NA
10448834	10448835	SAAV_0129	SAAV_0130	cap5M	cap5N	TRUE	0.985	0.000	0.297	NA	Y	NA
10448835	10448836	SAAV_0130	SAAV_0131	cap5N	cap5O	TRUE	0.823	54.000	0.009	1.000	Y	NA
10448836	10448837	SAAV_0131	SAAV_0132	cap5O	cap5P	TRUE	0.793	77.000	0.105	1.000	Y	NA
10448838	10448839	SAAV_0133	SAAV_0134			TRUE	0.633	7.000	0.000	NA		NA
10448840	10448841	SAAV_0135	SAAV_0136	aldA1		FALSE	0.033	647.000	0.000	1.000	N	NA
10448843	10448844	SAAV_0138	SAAV_0139			FALSE	0.027	342.000	0.000	NA		NA
10448844	10448845	SAAV_0139	SAAV_0140			TRUE	0.953	14.000	0.130	NA	Y	NA
10448845	10448846	SAAV_0140	SAAV_0141			TRUE	0.992	-3.000	0.652	NA	Y	NA
10448846	10448847	SAAV_0141	SAAV_0142			TRUE	0.836	13.000	0.032	1.000	N	NA
10448847	10448848	SAAV_0142	SAAV_0143			FALSE	0.033	289.000	0.000	NA		NA
10448848	10448849	SAAV_0143	SAAV_0145			FALSE	0.227	75.000	0.000	NA		NA
10448849	10448850	SAAV_0145	SAAV_0146			FALSE	0.023	386.000	0.000	NA		NA
10448850	10448851	SAAV_0146	SAAV_0147			FALSE	0.043	429.000	0.049	NA		NA
10448851	10448852	SAAV_0147	SAAV_0148			TRUE	0.928	13.000	0.333	1.000	N	NA
10448853	10448854	SAAV_0149	SAAV_0150		argB	FALSE	0.040	255.000	0.000	NA		NA
10448854	10448855	SAAV_0150	SAAV_0151	argB	argJ	TRUE	0.975	16.000	0.008	0.003	Y	NA
10448855	10448856	SAAV_0151	SAAV_0152	argJ	argC	TRUE	0.986	12.000	0.303	0.003	Y	NA
10448856	10448857	SAAV_0152	SAAV_0153	argC	rocD1	TRUE	0.865	39.000	0.004	1.000	Y	NA
10448857	10448858	SAAV_0153	SAAV_0154	rocD1	brnQ1	FALSE	0.250	259.000	0.000	1.000	Y	NA
10448858	10448859	SAAV_0154	SAAV_0155	brnQ1	entB	FALSE	0.067	279.000	0.000	1.000	N	NA
10448859	10448860	SAAV_0155	SAAV_0156	entB	ipdC	FALSE	0.238	127.000	0.000	1.000	N	NA
10448863	10448864	SAAV_0159	SAAV_0160		murQ	TRUE	0.955	0.000	0.234	1.000		NA
10448864	10448865	SAAV_0160	SAAV_0161	murQ		TRUE	0.908	12.000	0.250	1.000		NA
10448865	10448866	SAAV_0161	SAAV_0162			TRUE	0.912	3.000	0.100	1.000	N	NA
10448866	10448867	SAAV_0162	SAAV_0163			FALSE	0.032	688.000	0.000	1.000	N	NA
10448869	10448870	SAAV_0165	SAAV_0166			FALSE	0.021	674.000	0.000	NA	N	NA
10448870	10448871	SAAV_0166	SAAV_0167			FALSE	0.050	207.000	0.000	NA		NA
10448871	10448872	SAAV_0167	SAAV_0168			FALSE	0.243	71.000	0.000	NA		NA
10448872	10448873	SAAV_0168	SAAV_0169			FALSE	0.255	68.000	0.000	NA		NA
10448873	10448874	SAAV_0169	SAAV_0170			TRUE	0.630	12.000	0.000	NA		NA
10448876	10448877	SAAV_0172	SAAV_0173			TRUE	0.990	6.000	0.833	0.037	Y	NA
10448877	10448878	SAAV_0173	SAAV_0174			TRUE	0.974	17.000	0.833	0.037		NA
10448878	10448879	SAAV_0174	SAAV_0175		ggt	TRUE	0.543	38.000	0.000	1.000		NA
10448880	10448881	SAAV_0176	SAAV_0177		acpD	FALSE	0.061	189.000	0.000	NA		NA
10448882	10448883	SAAV_0178	SAAV_0179			FALSE	0.038	384.000	0.000	1.000		NA
10448883	10448884	SAAV_0179	SAAV_0180			TRUE	0.932	13.000	0.000	1.000	Y	NA
10448884	10448885	SAAV_0180	SAAV_0181			TRUE	0.988	3.000	0.800	1.000	Y	NA
10448885	10448886	SAAV_0181	SAAV_0182			TRUE	0.994	2.000	0.909	0.037	Y	NA
10448886	10448887	SAAV_0182	SAAV_0183			FALSE	0.332	74.000	0.000	1.000		NA
10448887	10448888	SAAV_0183	SAAV_0184			TRUE	0.856	25.000	0.000	0.021		NA
10448888	10448889	SAAV_0184	SAAV_0185			TRUE	0.579	55.000	0.111	NA		NA
10448892	10448893	SAAV_0188	SAAV_0189			TRUE	0.986	-7.000	0.167	0.014		NA
10448893	10448894	SAAV_0189	SAAV_0190			TRUE	0.965	-3.000	0.167	1.000	N	NA
10448895	10448896	SAAV_0191	SAAV_0192	pflB	pflA	TRUE	0.874	23.000	0.135	1.000	N	NA
10448896	10448897	SAAV_0192	SAAV_0193	pflA		FALSE	0.057	322.000	0.000	1.000	N	NA
10448900	10448901	SAAV_0196	SAAV_0197			TRUE	0.962	30.000	0.588	NA	Y	NA
10448901	10448902	SAAV_0197	SAAV_0198			FALSE	0.387	186.000	0.012	1.000	Y	NA
10448902	10448903	SAAV_0198	SAAV_0199			TRUE	0.693	112.000	0.046	1.000	Y	NA
10448903	10448904	SAAV_0199	SAAV_0200			TRUE	0.960	26.000	0.046	0.066	Y	NA
10448906	10448907	SAAV_0202	SAAV_0203			FALSE	0.054	198.000	0.000	NA		NA
10448907	10448908	SAAV_0203	SAAV_0204			FALSE	0.096	157.000	0.000	NA		NA
10448908	10448909	SAAV_0204	SAAV_0205			TRUE	0.915	26.000	0.667	NA		NA
10448911	10448912	SAAV_0207	SAAV_0208			TRUE	0.558	27.000	0.000	NA		NA
10448913	10448914	SAAV_0209	SAAV_0210			FALSE	0.035	338.000	0.000	NA	N	NA
10448914	10448915	SAAV_0210	SAAV_0211			TRUE	0.993	-15.000	0.308	0.014	N	NA
10448915	10448916	SAAV_0211	SAAV_0212			TRUE	0.977	23.000	0.148	0.011	Y	NA
10448918	10448919	SAAV_0214	SAAV_0215			TRUE	0.887	18.000	0.103	1.000	N	NA
10448919	10448920	SAAV_0215	SAAV_0216			TRUE	0.887	2.000	0.103	NA		NA
10448920	10448921	SAAV_0216	SAAV_0217			TRUE	0.587	24.000	0.000	NA		NA
10448921	10448922	SAAV_0217	SAAV_0219		ispD	FALSE	0.018	528.000	0.000	NA		NA
10448922	10448923	SAAV_0219	SAAV_0220	ispD		TRUE	0.982	-7.000	0.367	1.000	N	NA
10448923	10448924	SAAV_0220	SAAV_0221			TRUE	0.885	22.000	0.148	1.000	N	NA
10448924	10448925	SAAV_0221	SAAV_0222			FALSE	0.279	428.000	0.000	0.003	Y	NA
10448925	10448926	SAAV_0222	SAAV_0223		ispD_1	FALSE	0.069	276.000	0.000	1.000	N	NA
10448926	10448927	SAAV_0223	SAAV_0224	ispD_1		TRUE	0.982	-7.000	0.367	1.000	N	NA
10448927	10448928	SAAV_0224	SAAV_0225			TRUE	0.885	22.000	0.148	1.000	N	NA
10448928	10448929	SAAV_0225	SAAV_0226			TRUE	0.703	36.000	0.125	NA		NA
10448929	10448930	SAAV_0226	SAAV_0227		scdA	FALSE	0.113	144.000	0.000	NA		NA
10448930	10448931	SAAV_0227	SAAV_0228	scdA	lytS	FALSE	0.050	260.000	0.000	NA	N	NA
10448931	10448932	SAAV_0228	SAAV_0229	lytS	lytR	TRUE	0.992	3.000	0.538	0.014	Y	NA
10448932	10448933	SAAV_0229	SAAV_0230	lytR	lrgA	TRUE	0.486	113.000	0.178	1.000		NA
10448933	10448934	SAAV_0230	SAAV_0231	lrgA	lrgB	TRUE	0.988	-7.000	0.869	1.000		NA
10448936	10448937	SAAV_0233	SAAV_0234		bglA	TRUE	0.940	16.000	0.000	1.000	Y	NA
10448938	10448939	SAAV_0235	SAAV_0236		rbsK	FALSE	0.077	251.000	0.000	1.000	N	NA
10448939	10448940	SAAV_0236	SAAV_0237	rbsK		TRUE	0.926	28.000	0.030	1.000	Y	NA
10448940	10448941	SAAV_0237	SAAV_0238			TRUE	0.979	15.000	0.045	0.002	Y	NA
10448941	10448942	SAAV_0238	SAAV_0239			FALSE	0.083	232.000	0.000	1.000	N	NA
10448943	10448944	SAAV_0240	SAAV_0241			FALSE	0.353	50.000	0.000	NA		NA
10448946	10448947	SAAV_0243	SAAV_0244		lytM	FALSE	0.047	326.000	0.000	1.000		NA
10448948	10448949	SAAV_0245	SAAV_0246			TRUE	0.941	14.000	0.833	NA		NA
10448949	10448950	SAAV_0246	SAAV_0247			TRUE	0.974	-3.000	0.571	NA		NA
10448950	10448951	SAAV_0247	SAAV_0248			TRUE	0.662	72.000	0.429	NA		NA
10448951	10448952	SAAV_0248	SAAV_0249			FALSE	0.028	331.000	0.000	NA		NA
10448953	10448954	SAAV_0250	SAAV_0251			FALSE	0.337	83.000	0.041	NA		NA
10448954	10448955	SAAV_0251	SAAV_0252			TRUE	0.949	0.000	0.286	NA		NA
10448955	10448956	SAAV_0252	SAAV_0253			TRUE	0.979	-28.000	0.237	NA		NA
10448956	10448957	SAAV_0253	SAAV_0254			TRUE	0.940	13.000	0.833	NA		NA
10448957	10448958	SAAV_0254	SAAV_0255		yukA	TRUE	0.923	22.000	0.623	NA		NA
10448958	10448959	SAAV_0255	SAAV_0256	yukA		TRUE	0.516	30.000	0.000	NA		NA
10448959	10448960	SAAV_0256	SAAV_0257			TRUE	0.659	16.000	0.000	NA		NA
10448960	10448961	SAAV_0257	SAAV_0258			TRUE	0.792	0.000	0.000	NA		NA
10448961	10448962	SAAV_0258	SAAV_0259			TRUE	0.792	0.000	0.000	NA		NA
10448962	10448963	SAAV_0259	SAAV_0260			TRUE	0.629	10.000	0.000	NA		NA
10448963	10448964	SAAV_0260	SAAV_0261			FALSE	0.243	71.000	0.000	NA		NA
10448964	10448965	SAAV_0261	SAAV_0262			FALSE	0.052	203.000	0.000	NA		NA
10448965	10448966	SAAV_0262	SAAV_0263			FALSE	0.111	146.000	0.000	NA		NA
10448966	10448967	SAAV_0263	SAAV_0264			FALSE	0.124	135.000	0.000	NA		NA
10448967	10448968	SAAV_0264	SAAV_0265			FALSE	0.128	132.000	0.000	NA		NA
10448968	10448969	SAAV_0265	SAAV_0266			TRUE	0.610	71.000	0.286	NA		NA
10448969	10448970	SAAV_0266	SAAV_0267			TRUE	0.892	11.000	0.286	NA		NA
10448970	10448971	SAAV_0267	SAAV_0268			TRUE	0.730	49.000	0.286	NA		NA
10448971	10448972	SAAV_0268	SAAV_0269			TRUE	0.892	11.000	0.286	NA		NA
10448972	10448973	SAAV_0269	SAAV_0270			FALSE	0.017	625.000	0.000	NA		NA
10448973	10448974	SAAV_0270	SAAV_0271			FALSE	0.106	150.000	0.000	NA		NA
10448975	10448976	SAAV_0272	SAAV_0273		brnQ2	FALSE	0.081	237.000	0.000	1.000	N	NA
10448977	10448978	SAAV_0274	SAAV_0275			FALSE	0.065	249.000	0.000	1.000		NA
10448978	10448979	SAAV_0275	SAAV_0276			TRUE	0.928	13.000	0.333	1.000	N	NA
10448979	10448980	SAAV_0276	SAAV_0277		pfoR	FALSE	0.063	208.000	0.000	NA	N	NA
10448980	10448981	SAAV_0277	SAAV_0278	pfoR		FALSE	0.151	343.000	0.000	NA	Y	NA
10448981	10448982	SAAV_0278	SAAV_0279			TRUE	0.969	-25.000	0.085	NA	N	NA
10448982	10448983	SAAV_0279	SAAV_0280			TRUE	0.743	11.000	0.008	NA	N	NA
10448984	10448985	SAAV_0281	SAAV_0282		nanA	TRUE	0.908	40.000	0.130	1.000	Y	NA
10448991	10448992	SAAV_0288	SAAV_0289			TRUE	0.570	73.000	0.000	0.064	N	NA
10448993	10448994	SAAV_0290	SAAV_0291			FALSE	0.161	114.000	0.000	NA		NA
10448994	10448995	SAAV_0291	SAAV_0292			TRUE	0.657	94.000	0.571	NA	N	NA
10448995	10448996	SAAV_0292	SAAV_0293			TRUE	0.899	1.000	0.107	NA		NA
10448996	10448997	SAAV_0293	SAAV_0294			TRUE	0.976	-10.000	0.286	NA		NA
10448997	10448998	SAAV_0294	SAAV_0295			TRUE	0.985	-22.000	0.250	1.000	N	NA
10448998	10448999	SAAV_0295	SAAV_0296			FALSE	0.058	316.000	0.000	1.000	N	NA
10449000	10449001	SAAV_0297	SAAV_0298	ulaA		TRUE	0.950	15.000	0.182	0.016		NA
10449001	10449002	SAAV_0298	SAAV_0299			TRUE	0.983	2.000	0.026	0.011	Y	NA
10449002	10449003	SAAV_0299	SAAV_0300			TRUE	0.957	5.000	0.182	0.014	N	NA
10449004	10449005	SAAV_0301	SAAV_0302			TRUE	0.719	107.000	0.800	1.000	N	NA
10449005	10449006	SAAV_0302	SAAV_0303			FALSE	0.176	104.000	0.000	NA		NA
10449008	10449009	SAAV_0305	SAAV_0306			TRUE	0.631	14.000	0.000	NA		NA
10449009	10449010	SAAV_0306	SAAV_0307			TRUE	0.888	14.000	0.259	NA		NA
10449012	10449013	SAAV_0309	SAAV_0310			TRUE	0.626	13.000	0.000	NA		NA
10449013	10449014	SAAV_0310	SAAV_0311			FALSE	0.048	267.000	0.000	NA	N	NA
10449014	10449015	SAAV_0311	SAAV_0312			TRUE	0.993	-3.000	0.812	NA	Y	NA
10449015	10449016	SAAV_0312	SAAV_0313			TRUE	0.991	-19.000	0.119	NA	Y	NA
10449017	10449018	SAAV_0314	SAAV_0315			TRUE	0.789	113.000	0.393	NA	Y	NA
10449018	10449019	SAAV_0315	SAAV_0316			FALSE	0.170	109.000	0.000	NA		NA
10449020	10449021	SAAV_0317	SAAV_0318			TRUE	0.967	-3.000	0.362	NA		NA
10449021	10449022	SAAV_0318	SAAV_0319			TRUE	0.816	25.000	0.143	NA		NA
10449022	10449023	SAAV_0319	SAAV_0320			TRUE	0.957	0.000	0.371	NA		NA
10449026	10449027	SAAV_0323	SAAV_0324		metE	TRUE	0.476	43.000	0.011	NA		NA
10449027	10449028	SAAV_0324	SAAV_0325	metE		TRUE	0.982	-3.000	0.030	1.000	Y	NA
10449028	10449029	SAAV_0325	SAAV_0326			TRUE	0.994	-31.000	0.162	1.000	Y	NA
10449029	10449030	SAAV_0326	SAAV_0327			TRUE	0.996	-3.000	0.600	0.006	Y	NA
10449031	10449032	SAAV_0328	SAAV_0329			FALSE	0.215	154.000	0.007	1.000	N	NA
10449032	10449033	SAAV_0329	SAAV_0330			TRUE	0.795	30.000	0.171	NA		NA
10449033	10449034	SAAV_0330	SAAV_0331			TRUE	0.799	12.000	0.064	NA		NA
10449036	10449037	SAAV_0333	SAAV_0334	rpsF	ssb2	TRUE	0.798	21.000	0.007	1.000	N	NA
10449037	10449038	SAAV_0334	SAAV_0335	ssb2	rpsR	TRUE	0.562	52.000	0.007	1.000	N	NA
10449039	10449040	SAAV_0336	SAAV_0337			FALSE	0.021	422.000	0.000	NA		NA
10449041	10449042	SAAV_0338	SAAV_0339			FALSE	0.024	369.000	0.000	NA		NA
10449042	10449043	SAAV_0339	SAAV_0340			FALSE	0.049	211.000	0.000	NA		NA
10449045	10449046	SAAV_0342	SAAV_0343			FALSE	0.034	426.000	0.000	1.000		NA
10449047	10449048	SAAV_0344	SAAV_0345			FALSE	0.037	270.000	0.000	NA		NA
10449048	10449049	SAAV_0345	SAAV_0346			FALSE	0.236	73.000	0.000	NA		NA
10449049	10449050	SAAV_0346	SAAV_0347		ahpF	FALSE	0.067	180.000	0.000	NA		NA
10449050	10449051	SAAV_0347	SAAV_0348	ahpF	ahpC	TRUE	0.981	16.000	0.551	1.000	Y	NA
10449053	10449054	SAAV_0350	SAAV_0351			FALSE	0.016	978.000	0.000	NA		NA
10449054	10449055	SAAV_0351	SAAV_0352			TRUE	0.635	118.000	0.857	NA		NA
10449055	10449056	SAAV_0352	SAAV_0353			TRUE	0.556	143.000	0.857	NA		NA
10449057	10449058	SAAV_0355	SAAV_0356	xpt	pbuX	TRUE	0.976	0.000	0.037	1.000	Y	NA
10449058	10449059	SAAV_0356	SAAV_0357	pbuX	guaB	TRUE	0.903	38.000	1.000	1.000		NA
10449059	10449060	SAAV_0357	SAAV_0358	guaB	guaA	TRUE	0.908	25.000	0.007	0.001		NA
10449061	10449062	SAAV_0359	SAAV_0360			FALSE	0.023	392.000	0.000	NA		NA
10449062	10449063	SAAV_0360	SAAV_0361			FALSE	0.079	399.000	0.000	0.063		NA
10449063	10449064	SAAV_0361	SAAV_0362			FALSE	0.039	261.000	0.000	NA		NA
10449064	10449065	SAAV_0362	SAAV_0363			FALSE	0.018	532.000	0.000	NA		NA
10449065	10449066	SAAV_0363	SAAV_0364			TRUE	0.637	19.000	0.000	NA		NA
10449067	10449068	SAAV_0365	SAAV_0366			FALSE	0.134	286.000	0.000	0.019		NA
10449068	10449069	SAAV_0366	SAAV_0367			FALSE	0.131	291.000	0.000	0.019		NA
10449069	10449070	SAAV_0367	SAAV_0368			FALSE	0.101	364.000	0.000	0.019		NA
10449070	10449071	SAAV_0368	SAAV_0369			FALSE	0.101	364.000	0.000	0.019		NA
10449071	10449072	SAAV_0369	SAAV_0370			FALSE	0.084	446.000	0.000	0.019		NA
10449072	10449073	SAAV_0370	SAAV_0371			FALSE	0.111	339.000	0.000	0.019		NA
10449073	10449074	SAAV_0371	SAAV_0372			FALSE	0.098	377.000	0.000	0.019		NA
10449074	10449075	SAAV_0372	SAAV_0373			FALSE	0.101	366.000	0.000	0.019		NA
10449075	10449076	SAAV_0373	SAAV_0374		hsdM1	FALSE	0.061	264.000	0.000	1.000		NA
10449076	10449077	SAAV_0374	SAAV_0375	hsdM1	hsdS1	TRUE	0.993	-7.000	0.083	0.063	Y	NA
10449077	10449078	SAAV_0375	SAAV_0376	hsdS1		FALSE	0.038	383.000	0.000	1.000		NA
10449078	10449079	SAAV_0376	SAAV_0377			TRUE	0.717	22.000	0.000	1.000		NA
10449081	10449082	SAAV_0379	SAAV_0380			TRUE	0.497	31.000	0.000	NA		NA
10449082	10449083	SAAV_0380	SAAV_0381			FALSE	0.377	45.000	0.000	NA		NA
10449083	10449084	SAAV_0381	SAAV_0382			FALSE	0.377	45.000	0.000	NA		NA
10449084	10449085	SAAV_0382	SAAV_0383			FALSE	0.291	61.000	0.000	NA		NA
10449085	10449086	SAAV_0383	SAAV_0384			TRUE	0.637	19.000	0.000	NA		NA
10449086	10449087	SAAV_0384	SAAV_0385			FALSE	0.313	57.000	0.000	NA		NA
10449087	10449088	SAAV_0385	SAAV_0386			FALSE	0.343	52.000	0.000	NA		NA
10449088	10449089	SAAV_0386	SAAV_0387			TRUE	0.637	19.000	0.000	NA		NA
10449089	10449090	SAAV_0387	SAAV_0388			FALSE	0.040	257.000	0.000	NA		NA
10449090	10449091	SAAV_0388	SAAV_0389			TRUE	0.893	-10.000	0.000	NA		NA
10449091	10449092	SAAV_0389	SAAV_0391			TRUE	0.837	-3.000	0.000	NA		NA
10449092	10449093	SAAV_0391	SAAV_0392			TRUE	0.637	19.000	0.000	NA		NA
10449095	10449096	SAAV_0394	SAAV_0395		nuoF	FALSE	0.015	1588.000	0.000	NA		NA
10449096	10449097	SAAV_0395	SAAV_0396	nuoF		TRUE	0.895	13.000	0.303	NA		NA
10449097	10449098	SAAV_0396	SAAV_0397			FALSE	0.193	162.000	0.076	NA		NA
10449100	10449101	SAAV_0399	SAAV_0400			TRUE	0.821	37.000	0.273	1.000		NA
10449101	10449102	SAAV_0400	SAAV_0401			FALSE	0.039	372.000	0.000	1.000		NA
10449102	10449103	SAAV_0401	SAAV_0402			FALSE	0.106	217.000	0.024	1.000		NA
10449103	10449104	SAAV_0402	SAAV_0403			TRUE	0.997	-7.000	0.690	0.019	Y	NA
10449104	10449105	SAAV_0403	SAAV_0404			FALSE	0.062	295.000	0.000	1.000	N	NA
10449105	10449106	SAAV_0404	SAAV_0405			TRUE	0.982	4.000	0.487	1.000	Y	NA
10449106	10449107	SAAV_0405	SAAV_0406			TRUE	0.830	37.000	0.000	NA	Y	NA
10449107	10449108	SAAV_0406	SAAV_0407			FALSE	0.028	332.000	0.000	NA		NA
10449110	10449111	SAAV_0409	SAAV_0410			TRUE	0.974	-10.000	0.150	1.000		NA
10449112	10449113	SAAV_0411	SAAV_0412			TRUE	0.981	-3.000	0.957	NA		NA
10449113	10449114	SAAV_0412	SAAV_0413			FALSE	0.325	121.000	0.106	NA		NA
10449115	10449116	SAAV_0414	SAAV_0415	gltB	gltD	TRUE	0.986	18.000	0.222	0.002	Y	NA
10449116	10449117	SAAV_0415	SAAV_0416	gltD		FALSE	0.037	269.000	0.000	NA		NA
10449117	10449118	SAAV_0416	SAAV_0417			FALSE	0.020	469.000	0.000	NA		NA
10449118	10449119	SAAV_0417	SAAV_0418			TRUE	0.918	64.000	0.650	1.000	Y	NA
10449119	10449120	SAAV_0418	SAAV_0419			TRUE	0.914	25.000	0.336	1.000	N	NA
10449120	10449121	SAAV_0419	SAAV_0420		srpB	FALSE	0.067	180.000	0.000	NA		NA
10449121	10449122	SAAV_0420	SAAV_0421	srpB		FALSE	0.025	363.000	0.000	NA		NA
10449122	10449123	SAAV_0421	SAAV_0422		dnaX	TRUE	0.552	69.000	0.103	1.000		NA
10449123	10449124	SAAV_0422	SAAV_0423	dnaX		FALSE	0.369	90.000	0.071	NA		NA
10449124	10449125	SAAV_0423	SAAV_0424		recR	TRUE	0.930	7.000	0.604	NA		NA
10449125	10449126	SAAV_0424	SAAV_0425	recR		FALSE	0.016	860.000	0.000	NA		NA
10449126	10449127	SAAV_0425	SAAV_0425a			FALSE	0.025	365.000	0.000	NA		NA
10449127	10449128	SAAV_0425a	SAAV_0426			FALSE	0.088	162.000	0.000	NA		NA
10449128	10449129	SAAV_0426	SAAV_0427			FALSE	0.016	903.000	0.000	NA		NA
10449129	10449130	SAAV_0427	SAAV_0428		tmk	TRUE	0.879	2.000	0.010	1.000	N	NA
10449130	10449131	SAAV_0428	SAAV_0429	tmk		TRUE	0.695	28.000	0.038	NA		NA
10449131	10449132	SAAV_0429	SAAV_0430			FALSE	0.074	214.000	0.021	NA		NA
10449132	10449133	SAAV_0430	SAAV_0431			TRUE	0.949	1.000	0.372	NA		NA
10449133	10449134	SAAV_0431	SAAV_0432			TRUE	0.878	17.000	0.183	NA		NA
10449134	10449135	SAAV_0432	SAAV_0433			FALSE	0.127	274.000	0.193	NA		NA
10449135	10449136	SAAV_0433	SAAV_0434			TRUE	0.973	-7.000	0.209	1.000		NA
10449136	10449137	SAAV_0434	SAAV_0435			TRUE	0.888	2.000	0.041	1.000		NA
10449139	10449140	SAAV_0437	SAAV_0438	metS		TRUE	0.824	31.000	0.221	NA	N	NA
10449140	10449141	SAAV_0438	SAAV_0439			FALSE	0.467	167.000	0.058	NA	Y	NA
10449141	10449142	SAAV_0439	SAAV_0440		ksgA	TRUE	0.874	11.000	0.093	1.000	N	NA
10449142	10449143	SAAV_0440	SAAV_0441	ksgA		FALSE	0.291	100.000	0.035	NA		NA
10449143	10449144	SAAV_0441	SAAV_0442		ipk	FALSE	0.060	311.000	0.046	NA		NA
10449144	10449145	SAAV_0442	SAAV_0443	ipk	purR	TRUE	0.862	14.000	0.062	1.000	N	NA
10449145	10449146	SAAV_0443	SAAV_0444	purR		TRUE	0.903	17.000	0.227	NA	N	NA
10449146	10449147	SAAV_0444	SAAV_0445		spoVG	TRUE	0.528	72.000	0.131	NA	N	NA
10449147	10449148	SAAV_0445	SAAV_0446	spoVG	glmU	FALSE	0.187	365.000	0.003	1.000	Y	NA
10449148	10449149	SAAV_0446	SAAV_0447	glmU	prsA	FALSE	0.318	147.000	0.069	1.000	N	NA
10449149	10449150	SAAV_0447	SAAV_0448	prsA	rplY	FALSE	0.257	150.000	0.027	1.000	N	NA
10449150	10449151	SAAV_0448	SAAV_0449	rplY	pth	TRUE	0.570	311.000	0.496	0.035	Y	NA
10449151	10449152	SAAV_0449	SAAV_0450	pth	mfd	TRUE	0.948	0.000	0.137	1.000	N	NA
10449152	10449153	SAAV_0450	SAAV_0451	mfd		TRUE	0.956	-10.000	0.033	1.000		NA
10449153	10449154	SAAV_0451	SAAV_0452			TRUE	0.923	0.000	0.058	1.000		NA
10449154	10449155	SAAV_0452	SAAV_0453			TRUE	0.940	-3.000	0.054	1.000		NA
10449155	10449156	SAAV_0453	SAAV_0454			TRUE	0.865	18.000	0.053	1.000	N	NA
10449156	10449157	SAAV_0454	SAAV_0455			TRUE	0.498	105.000	0.134	1.000	N	NA
10449157	10449158	SAAV_0455	SAAV_0456			FALSE	0.177	180.000	0.031	1.000	N	NA
10449158	10449159	SAAV_0456	SAAV_0457		hpt	TRUE	0.931	5.000	0.067	0.055	N	NA
10449159	10449160	SAAV_0457	SAAV_0458	hpt		FALSE	0.189	257.000	0.192	1.000	N	NA
10449160	10449161	SAAV_0458	SAAV_0459		hslO	FALSE	0.338	228.000	0.041	1.000	Y	NA
10449161	10449162	SAAV_0459	SAAV_0460	hslO	cysK	FALSE	0.206	179.000	0.053	1.000	N	NA
10449162	10449163	SAAV_0460	SAAV_0461	cysK	folP	FALSE	0.105	216.000	0.005	1.000	N	NA
10449163	10449164	SAAV_0461	SAAV_0462	folP	folB	TRUE	0.990	-22.000	0.024	1.000	Y	NA
10449164	10449165	SAAV_0462	SAAV_0463	folB	folK	TRUE	0.987	-3.000	0.142	1.000	Y	NA
10449165	10449166	SAAV_0463	SAAV_0464	folK		FALSE	0.023	394.000	0.000	NA		NA
10449166	10449167	SAAV_0464	SAAV_0465		lysS	FALSE	0.336	53.000	0.000	NA		NA
10449167	10449168	SAAV_0465	SAAV_0485a	lysS		FALSE	0.018	558.000	0.000	NA		NA
10449168	10449169	SAAV_0485a	SAAV_0466			TRUE	0.626	13.000	0.000	NA		NA
10449169	10449170	SAAV_0466	SAAV_0467			TRUE	0.658	17.000	0.000	NA		NA
10449170	10449171	SAAV_0467	SAAV_0468			TRUE	0.640	6.000	0.000	NA		NA
10449171	10449172	SAAV_0468	SAAV_0469			TRUE	0.516	30.000	0.000	NA		NA
10449172	10449173	SAAV_0469	SAAV_0470			TRUE	0.633	7.000	0.000	NA		NA
10449173	10449174	SAAV_0470	SAAV_0471			TRUE	0.656	5.000	0.000	NA		NA
10449174	10449175	SAAV_0471	SAAV_0472			TRUE	0.618	21.000	0.000	NA		NA
10449175	10449176	SAAV_0472	SAAV_0473			TRUE	0.626	20.000	0.000	NA		NA
10449176	10449177	SAAV_0473	SAAV_0474			FALSE	0.150	120.000	0.000	NA		NA
10449177	10449178	SAAV_0474	SAAV_0475			FALSE	0.190	92.000	0.000	NA		NA
10449178	10449179	SAAV_0475	SAAV_0476			FALSE	0.083	167.000	0.000	NA		NA
10449179	10449180	SAAV_0476	SAAV_0477			FALSE	0.088	162.000	0.000	NA		NA
10449180	10449181	SAAV_0477	SAAV_0478			FALSE	0.091	161.000	0.000	NA		NA
10449183	10449184	SAAV_0480	SAAV_0481			TRUE	0.978	4.000	0.488	NA	Y	NA
10449186	10449187	SAAV_0483	SAAV_0484	ctsR		TRUE	0.936	19.000	0.681	NA		NA
10449187	10449188	SAAV_0484	SAAV_0485			TRUE	0.990	-10.000	0.848	1.000		NA
10449188	10449189	SAAV_0485	SAAV_0486			TRUE	0.937	14.000	0.425	1.000	N	NA
10449189	10449190	SAAV_0486	SAAV_0487		radA	FALSE	0.311	485.000	0.062	0.013	Y	NA
10449190	10449191	SAAV_0487	SAAV_0488	radA		TRUE	0.751	25.000	0.056	NA		NA
10449191	10449192	SAAV_0488	SAAV_0489		gltX	FALSE	0.028	557.000	0.021	NA		NA
10449192	10449193	SAAV_0489	SAAV_0490	gltX	cysE	FALSE	0.051	429.000	0.008	1.000	N	NA
10449193	10449194	SAAV_0490	SAAV_0491	cysE	cysS	TRUE	0.983	-16.000	0.039	0.054	N	NA
10449194	10449195	SAAV_0491	SAAV_0492	cysS		TRUE	0.966	-7.000	0.129	1.000		NA
10449195	10449196	SAAV_0492	SAAV_0493			TRUE	0.946	8.000	0.150	0.004		NA
10449196	10449197	SAAV_0493	SAAV_0494			TRUE	0.915	0.000	0.109	NA		NA
10449197	10449198	SAAV_0494	SAAV_0495			FALSE	0.333	81.000	0.036	NA		NA
10449198	10449199	SAAV_0495	SAAV_0496		rpmG	FALSE	0.373	115.000	0.037	1.000	N	NA
10449199	10449200	SAAV_0496	SAAV_0497	rpmG	secE	TRUE	0.649	56.000	0.080	1.000	N	NA
10449200	10449201	SAAV_0497	SAAV_0498	secE	nusG	TRUE	0.956	13.000	0.843	1.000	N	NA
10449201	10449202	SAAV_0498	SAAV_0499	nusG	rplK	FALSE	0.443	181.000	0.681	1.000	N	NA
10449202	10449203	SAAV_0499	SAAV_0500	rplK	rplA	TRUE	0.744	208.000	0.838	0.030	Y	NA
10449203	10449204	SAAV_0500	SAAV_0502	rplA	rplJ	TRUE	0.567	272.000	0.302	0.030	Y	NA
10449204	10449205	SAAV_0502	SAAV_0503	rplJ	rplL	TRUE	0.974	43.000	0.884	0.022	Y	NA
10449205	10449206	SAAV_0503	SAAV_0504	rplL		TRUE	0.474	175.000	0.050	1.000	Y	NA
10449206	10449207	SAAV_0504	SAAV_0505		rpoB	FALSE	0.109	215.000	0.008	1.000	N	NA
10449207	10449208	SAAV_0505	SAAV_0506	rpoB	rpoC	TRUE	0.908	137.000	0.851	0.002	Y	NA
10449208	10449209	SAAV_0506	SAAV_0507	rpoC		FALSE	0.274	137.000	0.065	NA	N	NA
10449209	10449210	SAAV_0507	SAAV_0508		rpsL	TRUE	0.774	98.000	0.239	NA	Y	NA
10449210	10449211	SAAV_0508	SAAV_0509	rpsL	rpsG	TRUE	0.928	66.000	0.224	0.004	Y	NA
10449211	10449212	SAAV_0509	SAAV_0510	rpsG	fusA	TRUE	0.823	123.000	0.579	1.000	Y	NA
10449212	10449213	SAAV_0510	SAAV_0511	fusA	tuf	TRUE	0.720	217.000	0.400	0.001	Y	NA
10449215	10449216	SAAV_0513	SAAV_0514			FALSE	0.037	270.000	0.000	NA		NA
10449216	10449217	SAAV_0514	SAAV_0515			FALSE	0.093	159.000	0.000	NA		NA
10449217	10449218	SAAV_0515	SAAV_0516			FALSE	0.090	214.000	0.000	1.000	N	NA
10449218	10449219	SAAV_0516	SAAV_0517		ilvE	FALSE	0.054	336.000	0.000	1.000	N	NA
10449219	10449220	SAAV_0517	SAAV_0518	ilvE		FALSE	0.065	250.000	0.000	1.000		NA
10449221	10449222	SAAV_0519	SAAV_0520			TRUE	0.996	-7.000	0.255	0.002	Y	NA
10449223	10449224	SAAV_0521	SAAV_0522			FALSE	0.397	147.000	0.013	0.020		NA
10449224	10449225	SAAV_0522	SAAV_0523			TRUE	0.844	22.000	0.159	NA		NA
10449225	10449226	SAAV_0523	SAAV_0524		sdrC	FALSE	0.021	430.000	0.000	NA		NA
10449226	10449227	SAAV_0524	SAAV_0525	sdrC	sdrD	FALSE	0.115	367.000	0.000	0.004		NA
10449227	10449228	SAAV_0525	SAAV_0526	sdrD	sdrE	FALSE	0.107	394.000	0.000	0.004		NA
10449228	10449229	SAAV_0526	SAAV_0527	sdrE		FALSE	0.221	121.000	0.000	1.000		NA
10449230	10449231	SAAV_0528	SAAV_0529			FALSE	0.055	282.000	0.000	1.000		NA
10449231	10449232	SAAV_0529	SAAV_0530			TRUE	0.742	13.000	0.026	NA		NA
10449232	10449233	SAAV_0530	SAAV_0531			TRUE	0.932	14.000	0.644	NA		NA
10449234	10449235	SAAV_0532	SAAV_0533	nagB	hxlA	TRUE	0.890	77.000	0.600	1.000	Y	NA
10449235	10449236	SAAV_0533	SAAV_0534	hxlA		TRUE	0.970	2.000	0.667	1.000	N	NA
10449236	10449237	SAAV_0534	SAAV_0535			FALSE	0.243	113.000	0.000	1.000		NA
10449237	10449238	SAAV_0535	SAAV_0536		proP	FALSE	0.030	502.000	0.000	1.000		NA
10449238	10449239	SAAV_0536	SAAV_0537	proP		FALSE	0.029	544.000	0.000	1.000		NA
10449239	10449240	SAAV_0537	SAAV_0538		atoB	TRUE	0.988	2.000	0.576	1.000	Y	NA
10449240	10449241	SAAV_0538	SAAV_0539	atoB		TRUE	0.966	-25.000	0.101	NA		NA
10449241	10449242	SAAV_0539	SAAV_0540			TRUE	0.944	3.000	0.500	NA		NA
10449243	10449244	SAAV_0541	SAAV_0542		thiD1	FALSE	0.018	507.000	0.000	NA		NA
10449245	10449246	SAAV_0543	SAAV_0544	ung		TRUE	0.966	1.000	0.800	NA		NA
10449246	10449247	SAAV_0544	SAAV_0545			FALSE	0.194	133.000	0.024	NA		NA
10449247	10449248	SAAV_0545	SAAV_0546			FALSE	0.217	121.000	0.021	NA		NA
10449249	10449250	SAAV_0547	SAAV_0548			TRUE	0.946	13.000	1.000	NA		NA
10449250	10449251	SAAV_0548	SAAV_0549			FALSE	0.018	549.000	0.000	NA		NA
10449252	10449253	SAAV_0550	SAAV_0551	eutD		TRUE	0.918	3.000	0.123	1.000	N	NA
10449253	10449254	SAAV_0551	SAAV_0552		mvk	FALSE	0.034	587.000	0.000	1.000	N	NA
10449254	10449255	SAAV_0552	SAAV_0553	mvk	mvaD	TRUE	0.987	5.000	0.281	0.004	Y	NA
10449255	10449256	SAAV_0553	SAAV_0554	mvaD		TRUE	0.986	13.000	0.312	0.004	Y	NA
10449256	10449257	SAAV_0554	SAAV_0555			FALSE	0.119	177.000	0.030	NA		NA
10449258	10449259	SAAV_0556	SAAV_0558			TRUE	0.901	-13.000	0.000	NA		NA
10449260	10449261	SAAV_0559	SAAV_0560			FALSE	0.020	466.000	0.000	NA		NA
10449261	10449262	SAAV_0560	SAAV_0561			TRUE	0.681	4.000	0.000	NA		NA
10449262	10449263	SAAV_0561	SAAV_0562			FALSE	0.151	119.000	0.000	NA		NA
10449263	10449264	SAAV_0562	SAAV_0563			FALSE	0.117	140.000	0.000	NA		NA
10449264	10449265	SAAV_0563	SAAV_0564			FALSE	0.020	448.000	0.000	NA		NA
10449265	10449266	SAAV_0564	SAAV_0565			FALSE	0.048	446.000	0.071	NA		NA
10449266	10449267	SAAV_0565	SAAV_0566			FALSE	0.160	168.000	0.051	NA		NA
10449267	10449268	SAAV_0566	SAAV_0567			TRUE	0.628	40.000	0.025	1.000		NA
10449268	10449269	SAAV_0567	SAAV_0568			TRUE	0.521	43.000	0.028	NA		NA
10449269	10449270	SAAV_0568	SAAV_0569		adhP	FALSE	0.019	499.000	0.000	NA		NA
10449270	10449271	SAAV_0569	SAAV_0570	adhP		FALSE	0.036	276.000	0.000	NA		NA
10449271	10449272	SAAV_0570	SAAV_0571		argS	TRUE	0.928	-3.000	0.079	NA		NA
10449272	10449273	SAAV_0571	SAAV_0572	argS		FALSE	0.084	270.000	0.004	1.000	N	NA
10449273	10449274	SAAV_0572	SAAV_0573			FALSE	0.058	312.000	0.000	1.000	N	NA
10449274	10449275	SAAV_0573	SAAV_0574			TRUE	0.577	149.000	0.046	1.000	Y	NA
10449275	10449276	SAAV_0574	SAAV_0575			TRUE	0.787	55.000	0.412	1.000		NA
10449276	10449277	SAAV_0575	SAAV_0576			TRUE	0.986	-16.000	0.412	1.000		NA
10449277	10449278	SAAV_0576	SAAV_0577			TRUE	0.505	136.000	0.556	NA		NA
10449278	10449279	SAAV_0577	SAAV_0578			FALSE	0.418	162.000	0.571	NA		NA
10449279	10449280	SAAV_0578	SAAV_0579			FALSE	0.300	169.000	0.286	NA		NA
10449281	10449282	SAAV_0580	SAAV_0581	sarA		FALSE	0.108	148.000	0.000	NA		NA
10449282	10449283	SAAV_0581	SAAV_0582			FALSE	0.016	681.000	0.000	NA		NA
10449283	10449284	SAAV_0582	SAAV_0583			FALSE	0.044	231.000	0.000	NA		NA
10449284	10449285	SAAV_0583	SAAV_0584			TRUE	0.892	17.000	0.233	NA		NA
10449286	10449287	SAAV_0585	SAAV_0586			TRUE	0.954	19.000	0.857	1.000		NA
10449287	10449288	SAAV_0586	SAAV_0587			TRUE	0.995	-13.000	0.636	NA	Y	NA
10449288	10449289	SAAV_0587	SAAV_0588			TRUE	0.992	-3.000	0.636	NA	Y	NA
10449289	10449290	SAAV_0588	SAAV_0589			TRUE	0.998	-10.000	1.000	0.004	Y	NA
10449290	10449291	SAAV_0589	SAAV_0590			TRUE	0.988	1.000	0.500	1.000	Y	NA
10449291	10449292	SAAV_0590	SAAV_0591			TRUE	0.995	-3.000	0.429	0.065	Y	NA
10449292	10449293	SAAV_0591	SAAV_0592			TRUE	0.995	-25.000	0.273	1.000	Y	NA
10449293	10449294	SAAV_0592	SAAV_0593			FALSE	0.186	340.000	0.000	1.000	Y	NA
10449295	10449296	SAAV_0594	SAAV_0595			TRUE	0.988	-3.000	0.154	1.000	Y	NA
10449296	10449297	SAAV_0595	SAAV_0596			TRUE	0.992	-6.000	0.286	1.000	Y	NA
10449302	10449303	SAAV_0601	SAAV_0602		tagB	TRUE	0.839	99.000	0.138	0.085	Y	NA
10449303	10449304	SAAV_0602	SAAV_0603	tagB	tagX	TRUE	0.837	-3.000	0.000	NA		NA
10449304	10449305	SAAV_0603	SAAV_0604	tagX	tagD	FALSE	0.281	63.000	0.000	NA		NA
10449307	10449308	SAAV_0606	SAAV_0607	abcA		FALSE	0.106	357.000	0.000	0.042	N	NA
10449308	10449309	SAAV_0607	SAAV_0608			FALSE	0.018	525.000	0.000	NA		NA
10449309	10449310	SAAV_0608	SAAV_0609			FALSE	0.034	282.000	0.000	NA		NA
10449310	10449311	SAAV_0609	SAAV_0610			TRUE	0.929	36.000	0.179	1.000	Y	NA
10449311	10449312	SAAV_0610	SAAV_0611			TRUE	0.997	-3.000	0.857	0.034	Y	NA
10449312	10449313	SAAV_0611	SAAV_0612			FALSE	0.081	237.000	0.000	1.000	N	NA
10449313	10449314	SAAV_0612	SAAV_0613			TRUE	0.967	42.000	0.316	0.002	Y	NA
10449314	10449315	SAAV_0613	SAAV_0614			TRUE	0.969	-7.000	0.155	1.000		NA
10449315	10449316	SAAV_0614	SAAV_0615			TRUE	0.701	62.000	0.385	NA		NA
10449316	10449317	SAAV_0615	SAAV_0616			FALSE	0.020	457.000	0.000	NA		NA
10449317	10449318	SAAV_0616	SAAV_0617			FALSE	0.264	151.000	0.135	NA		NA
10449318	10449319	SAAV_0617	SAAV_0618			FALSE	0.029	329.000	0.000	NA		NA
10449321	10449322	SAAV_0620	SAAV_0621			TRUE	0.899	16.000	0.208	NA	N	NA
10449322	10449323	SAAV_0621	SAAV_0622			TRUE	0.996	-7.000	0.958	1.000	Y	NA
10449323	10449324	SAAV_0622	SAAV_0623			FALSE	0.453	144.000	0.250	1.000	N	NA
10449324	10449325	SAAV_0623	SAAV_0624			TRUE	0.989	-10.000	0.714	1.000		NA
10449325	10449326	SAAV_0624	SAAV_0625			FALSE	0.016	725.000	0.000	NA		NA
10449326	10449327	SAAV_0625	SAAV_0626			TRUE	0.944	16.000	0.033	NA	Y	NA
10449329	10449330	SAAV_0628	SAAV_0629			FALSE	0.016	697.000	0.000	NA		NA
10449330	10449331	SAAV_0629	SAAV_0630		sarX	TRUE	0.729	80.000	0.875	NA		NA
10449331	10449332	SAAV_0630	SAAV_0631	sarX		FALSE	0.075	190.000	0.002	NA		NA
10449332	10449333	SAAV_0631	SAAV_0632			TRUE	0.843	0.000	0.009	NA		NA
10449333	10449334	SAAV_0632	SAAV_0633			FALSE	0.190	92.000	0.000	NA		NA
10449334	10449335	SAAV_0633	SAAV_0634			FALSE	0.111	145.000	0.000	NA		NA
10449335	10449336	SAAV_0634	SAAV_0635			FALSE	0.350	116.000	0.114	NA		NA
10449336	10449337	SAAV_0635	SAAV_0636			FALSE	0.370	132.000	0.159	NA	N	NA
10449337	10449338	SAAV_0636	SAAV_0637			TRUE	0.905	-3.000	0.034	NA		NA
10449340	10449341	SAAV_0639	SAAV_0640			FALSE	0.260	67.000	0.000	NA		NA
10449341	10449342	SAAV_0640	SAAV_0641			FALSE	0.397	138.000	0.286	NA		NA
10449342	10449343	SAAV_0641	SAAV_0642			FALSE	0.350	80.000	0.043	NA		NA
10449344	10449345	SAAV_0643	SAAV_0644			TRUE	0.815	2.000	0.017	NA		NA
10449345	10449346	SAAV_0644	SAAV_0645			TRUE	0.771	3.000	0.007	NA		NA
10449346	10449347	SAAV_0645	SAAV_0646		uppP	FALSE	0.076	172.000	0.000	NA		NA
10449348	10449349	SAAV_0647	SAAV_0648			TRUE	0.994	-3.000	0.222	0.005	Y	NA
10449351	10449352	SAAV_0650	SAAV_0651			FALSE	0.241	103.000	0.012	NA		NA
10449352	10449353	SAAV_0651	SAAV_0652			TRUE	0.550	35.000	0.012	NA		NA
10449353	10449354	SAAV_0652	SAAV_0653			FALSE	0.034	283.000	0.000	NA		NA
10449354	10449355	SAAV_0653	SAAV_0654			FALSE	0.389	86.000	0.010	1.000	N	NA
10449356	10449357	SAAV_0655	SAAV_0656			FALSE	0.063	183.000	0.000	NA		NA
10449358	10449359	SAAV_0657	SAAV_0658	norA		FALSE	0.033	293.000	0.000	NA		NA
10449359	10449360	SAAV_0658	SAAV_0659			FALSE	0.103	174.000	0.010	NA		NA
10449360	10449361	SAAV_0659	SAAV_0660			FALSE	0.157	250.000	0.004	0.054		NA
10449361	10449362	SAAV_0660	SAAV_0661		fruK	TRUE	0.984	-3.000	0.063	1.000	Y	NA
10449362	10449363	SAAV_0661	SAAV_0662	fruK		TRUE	0.985	6.000	0.889	1.000	Y	NA
10449363	10449364	SAAV_0662	SAAV_0663		nagA	FALSE	0.206	308.000	0.000	1.000	Y	NA
10449364	10449365	SAAV_0663	SAAV_0664	nagA		FALSE	0.072	221.000	0.000	1.000		NA
10449365	10449366	SAAV_0664	SAAV_0665			FALSE	0.148	222.000	0.100	1.000		NA
10449366	10449367	SAAV_0665	SAAV_0666			FALSE	0.285	132.000	0.100	NA		NA
10449368	10449369	SAAV_0667	SAAV_0668	saeS	saeR	TRUE	0.990	0.000	0.500	1.000	Y	NA
10449369	10449370	SAAV_0668	SAAV_0669	saeR		TRUE	0.979	-25.000	0.250	NA		NA
10449370	10449371	SAAV_0669	SAAV_0670			FALSE	0.027	343.000	0.000	NA		NA
10449371	10449372	SAAV_0670	SAAV_0671			FALSE	0.035	280.000	0.000	NA		NA
10449372	10449373	SAAV_0671	SAAV_0672			FALSE	0.359	99.000	0.080	NA		NA
10449373	10449374	SAAV_0672	SAAV_0673			TRUE	0.940	4.000	0.307	1.000	N	NA
10449374	10449375	SAAV_0673	SAAV_0674			TRUE	0.888	2.000	0.041	1.000		NA
10449376	10449377	SAAV_0675	SAAV_0676	pabA		TRUE	0.995	-16.000	0.027	0.017	Y	NA
10449377	10449378	SAAV_0676	SAAV_0677			TRUE	0.985	0.000	0.219	1.000	Y	NA
10449378	10449379	SAAV_0677	SAAV_0678			FALSE	0.175	360.000	0.000	1.000	Y	NA
10449379	10449380	SAAV_0678	SAAV_0679			TRUE	0.992	-16.000	0.194	NA	Y	NA
10449380	10449381	SAAV_0679	SAAV_0680			FALSE	0.025	474.000	0.000	NA	N	NA
10449381	10449382	SAAV_0680	SAAV_0681			FALSE	0.058	276.000	0.000	1.000		NA
10449382	10449383	SAAV_0681	SAAV_0682		recQ1	TRUE	0.804	12.000	0.022	1.000		NA
10449383	10449384	SAAV_0682	SAAV_0683	recQ1		FALSE	0.122	222.000	0.029	1.000	N	NA
10449384	10449385	SAAV_0683	SAAV_0684			TRUE	0.983	-7.000	0.382	1.000	N	NA
10449385	10449386	SAAV_0684	SAAV_0685		hisC	FALSE	0.114	240.000	0.027	1.000	N	NA
10449386	10449387	SAAV_0685	SAAV_0686	hisC		FALSE	0.072	339.000	0.102	NA		NA
10449388	10449389	SAAV_0687	SAAV_0688			FALSE	0.121	270.000	0.057	1.000	N	NA
10449389	10449390	SAAV_0688	SAAV_0689			FALSE	0.043	343.000	0.000	1.000		NA
10449390	10449391	SAAV_0689	SAAV_0690			TRUE	0.773	20.000	0.005	1.000		NA
10449392	10449393	SAAV_0691	SAAV_0692		nrdI	FALSE	0.106	150.000	0.000	NA		NA
10449393	10449394	SAAV_0692	SAAV_0693	nrdI	nrdE	TRUE	0.996	-37.000	0.533	NA	Y	NA
10449394	10449395	SAAV_0693	SAAV_0694	nrdE	nrdF	TRUE	0.934	118.000	0.875	0.001	Y	NA
10449395	10449396	SAAV_0694	SAAV_0695	nrdF		FALSE	0.047	375.000	0.000	1.000	N	NA
10449396	10449397	SAAV_0695	SAAV_0696			TRUE	0.998	-13.000	0.870	0.033	Y	NA
10449397	10449398	SAAV_0696	SAAV_0697			TRUE	0.995	-3.000	0.870	1.000	Y	NA
10449398	10449399	SAAV_0697	SAAV_0698			TRUE	0.652	119.000	0.031	1.000	Y	NA
10449400	10449401	SAAV_0699	SAAV_0700		murB	TRUE	0.804	18.000	0.014	1.000		NA
10449401	10449402	SAAV_0700	SAAV_0701	murB		FALSE	0.191	127.000	0.014	NA		NA
10449403	10449404	SAAV_0702	SAAV_0703			FALSE	0.211	154.000	0.069	NA		NA
10449404	10449405	SAAV_0703	SAAV_0704			FALSE	0.021	424.000	0.000	NA		NA
10449406	10449407	SAAV_0705	SAAV_0706	pepT		TRUE	0.839	14.000	0.127	NA		NA
10449407	10449408	SAAV_0706	SAAV_0707			TRUE	0.948	18.000	0.875	NA		NA
10449408	10449409	SAAV_0707	SAAV_0708			FALSE	0.119	196.000	0.067	NA		NA
10449412	10449413	SAAV_0711	SAAV_0712			FALSE	0.071	508.000	0.214	NA		NA
10449413	10449414	SAAV_0712	SAAV_0713			TRUE	0.966	-7.000	0.130	1.000		NA
10449414	10449415	SAAV_0713	SAAV_0714			TRUE	0.508	61.000	0.080	NA		NA
10449415	10449416	SAAV_0714	SAAV_0715		secA	FALSE	0.049	414.000	0.041	NA	N	NA
10449416	10449417	SAAV_0715	SAAV_0716	secA		FALSE	0.393	42.000	0.000	NA		NA
10449417	10449418	SAAV_0716	SAAV_0717		prfB	FALSE	0.034	284.000	0.000	NA		NA
10449418	10449419	SAAV_0717	SAAV_0718	prfB		FALSE	0.035	409.000	0.000	1.000		NA
10449419	10449420	SAAV_0718	SAAV_0719			FALSE	0.148	174.000	0.010	1.000		NA
10449420	10449421	SAAV_0719	SAAV_0720			TRUE	0.931	-3.000	0.093	NA		NA
10449421	10449422	SAAV_0720	SAAV_0721		uvrB	FALSE	0.050	269.000	0.007	NA		NA
10449422	10449423	SAAV_0721	SAAV_0722	uvrB	uvrA	TRUE	0.983	8.000	0.154	0.002	Y	NA
10449423	10449424	SAAV_0722	SAAV_0723	uvrA	hprK	FALSE	0.038	664.000	0.002	1.000	N	NA
10449424	10449425	SAAV_0723	SAAV_0724	hprK	lgt	TRUE	0.943	6.000	0.494	1.000	N	NA
10449425	10449426	SAAV_0724	SAAV_0725	lgt		TRUE	0.830	8.000	0.045	1.000		NA
10449426	10449427	SAAV_0725	SAAV_0726			TRUE	0.890	8.000	0.169	1.000		NA
10449427	10449428	SAAV_0726	SAAV_0727		trxB	TRUE	0.635	67.000	0.183	1.000		NA
10449430	10449431	SAAV_0729	SAAV_0730			TRUE	0.955	-3.000	0.214	NA		NA
10449431	10449432	SAAV_0730	SAAV_0731			TRUE	0.567	111.000	0.470	NA		NA
10449438	10449439	SAAV_0737	SAAV_0738	gapR	gapA1	TRUE	0.662	53.000	0.076	1.000	N	NA
10449439	10449440	SAAV_0738	SAAV_0739	gapA1	pgk	TRUE	0.714	139.000	0.006	0.006	Y	NA
10449440	10449441	SAAV_0739	SAAV_0740	pgk	tpiA	TRUE	0.714	122.000	0.141	1.000	Y	NA
10449441	10449442	SAAV_0740	SAAV_0741	tpiA	pgm	TRUE	0.973	3.000	0.138	1.000	Y	NA
10449442	10449443	SAAV_0741	SAAV_0742	pgm	eno	TRUE	0.691	130.000	0.136	1.000	Y	NA
10449443	10449444	SAAV_0742	SAAV_0743	eno		FALSE	0.036	339.000	0.005	NA		NA
10449444	10449445	SAAV_0743	SAAV_0744		secG	FALSE	0.325	67.000	0.007	NA		NA
10449445	10449446	SAAV_0744	SAAV_0745	secG	est	FALSE	0.326	116.000	0.032	1.000		NA
10449446	10449447	SAAV_0745	SAAV_0746	est		TRUE	0.731	34.000	0.060	1.000		NA
10449447	10449448	SAAV_0746	SAAV_0747		smpB	TRUE	0.937	22.000	0.143	0.023	N	NA
10449448	10449449	SAAV_0747	SAAV_0749	smpB		FALSE	0.192	91.000	0.000	NA		NA
10449449	10449450	SAAV_0749	SAAV_0750			FALSE	0.029	323.000	0.000	NA		NA
10449451	10449452	SAAV_0751	SAAV_0752			TRUE	0.659	16.000	0.000	NA		NA
10449452	10449453	SAAV_0752	SAAV_0753			FALSE	0.058	192.000	0.000	NA		NA
10449454	10449455	SAAV_0754	SAAV_0755			FALSE	0.336	53.000	0.000	NA		NA
10449455	10449456	SAAV_0755	SAAV_0756			FALSE	0.118	139.000	0.000	NA		NA
10449456	10449457	SAAV_0756	SAAV_0757		clfA	FALSE	0.060	269.000	0.000	1.000		NA
10449457	10449458	SAAV_0757	SAAV_0758	clfA		FALSE	0.045	221.000	0.000	NA		NA
10449458	10449459	SAAV_0758	SAAV_0759		empbp	FALSE	0.026	353.000	0.000	NA		NA
10449459	10449460	SAAV_0759	SAAV_0760	empbp		FALSE	0.028	335.000	0.000	NA		NA
10449460	10449461	SAAV_0760	SAAV_0761		nuc	FALSE	0.027	341.000	0.000	NA		NA
10449461	10449462	SAAV_0761	SAAV_0762	nuc		FALSE	0.050	357.000	0.000	1.000	N	NA
10449463	10449464	SAAV_0763	SAAV_0764			TRUE	0.766	62.000	0.667	NA		NA
10449464	10449465	SAAV_0764	SAAV_0765			FALSE	0.199	88.000	0.000	NA		NA
10449465	10449466	SAAV_0765	SAAV_0766			FALSE	0.294	188.000	0.444	NA		NA
10449466	10449467	SAAV_0766	SAAV_0767			TRUE	0.858	29.000	0.333	NA		NA
10449467	10449468	SAAV_0767	SAAV_0768			FALSE	0.031	305.000	0.000	NA		NA
10449472	10449473	SAAV_0772	SAAV_0773			FALSE	0.340	155.000	0.167	1.000		NA
10449473	10449474	SAAV_0773	SAAV_0774			FALSE	0.036	399.000	0.000	1.000		NA
10449475	10449476	SAAV_0775	SAAV_0776	aroD		FALSE	0.422	83.000	0.022	1.000	N	NA
10449478	10449479	SAAV_0778	SAAV_0779			FALSE	0.017	602.000	0.000	NA		NA
10449479	10449480	SAAV_0779	SAAV_0780			TRUE	0.740	2.000	0.000	NA		NA
10449480	10449481	SAAV_0780	SAAV_0781			FALSE	0.016	794.000	0.000	NA		NA
10449481	10449482	SAAV_0781	SAAV_0782			TRUE	0.978	-7.000	0.443	NA		NA
10449482	10449483	SAAV_0782	SAAV_0784			FALSE	0.040	250.000	0.000	NA		NA
10449483	10449484	SAAV_0784	SAAV_0785			TRUE	0.995	-7.000	0.642	1.000	Y	NA
10449484	10449485	SAAV_0785	SAAV_0786			TRUE	0.951	18.000	0.085	NA	Y	NA
10449486	10449487	SAAV_0787	SAAV_0788			TRUE	0.738	14.000	0.000	1.000		NA
10449487	10449488	SAAV_0788	SAAV_0789			TRUE	0.675	27.000	0.000	1.000		NA
10449489	10449490	SAAV_0790	SAAV_0791			TRUE	0.761	1.000	0.000	NA		NA
10449490	10449491	SAAV_0791	SAAV_0792			TRUE	0.630	12.000	0.000	NA		NA
10449491	10449492	SAAV_0792	SAAV_0793			TRUE	0.874	-7.000	0.000	NA		NA
10449492	10449493	SAAV_0793	SAAV_0794			TRUE	0.740	2.000	0.000	NA		NA
10449493	10449494	SAAV_0794	SAAV_0795			TRUE	0.761	1.000	0.000	NA		NA
10449494	10449495	SAAV_0795	SAAV_0796			FALSE	0.275	64.000	0.000	NA		NA
10449495	10449496	SAAV_0796	SAAV_0797			TRUE	0.631	14.000	0.000	NA		NA
10449496	10449497	SAAV_0797	SAAV_0798			FALSE	0.028	330.000	0.000	NA		NA
10449497	10449498	SAAV_0798	SAAV_0799			TRUE	0.837	-3.000	0.000	NA		NA
10449498	10449499	SAAV_0799	SAAV_0800			FALSE	0.026	347.000	0.000	NA		NA
10449499	10449500	SAAV_0800	SAAV_0801			TRUE	0.630	12.000	0.000	NA		NA
10449500	10449501	SAAV_0801	SAAV_0802			TRUE	0.647	18.000	0.000	NA		NA
10449501	10449502	SAAV_0802	SAAV_0803			FALSE	0.350	51.000	0.000	NA		NA
10449502	10449503	SAAV_0803	SAAV_0804			TRUE	0.711	3.000	0.000	NA		NA
10449503	10449504	SAAV_0804	SAAV_0805			TRUE	0.894	-3.000	0.000	1.000		NA
10449505	10449506	SAAV_0806	SAAV_0807			FALSE	0.155	117.000	0.000	NA		NA
10449506	10449507	SAAV_0807	SAAV_0808			TRUE	0.740	2.000	0.000	NA		NA
10449508	10449509	SAAV_0809	SAAV_0810			FALSE	0.072	175.000	0.000	NA		NA
10449509	10449510	SAAV_0810	SAAV_0811			FALSE	0.017	600.000	0.000	NA		NA
10449512	10449513	SAAV_0813	SAAV_0814		sufD	TRUE	0.770	98.000	0.139	1.000	Y	NA
10449513	10449514	SAAV_0814	SAAV_0815	sufD		TRUE	0.668	115.000	0.606	1.000	N	NA
10449514	10449515	SAAV_0815	SAAV_0816			TRUE	0.983	-10.000	0.292	1.000	N	NA
10449515	10449516	SAAV_0816	SAAV_0817		sufB	TRUE	0.595	151.000	0.152	0.002	N	NA
10449517	10449518	SAAV_0818	SAAV_0819			TRUE	0.612	61.000	0.000	0.058		NA
10449518	10449519	SAAV_0819	SAAV_0820			TRUE	0.544	131.000	0.146	0.058		NA
10449519	10449520	SAAV_0820	SAAV_0821			FALSE	0.197	89.000	0.000	NA		NA
10449520	10449521	SAAV_0821	SAAV_0822			TRUE	0.630	12.000	0.000	NA		NA
10449522	10449523	SAAV_0823	SAAV_0824			TRUE	0.626	13.000	0.000	NA		NA
10449523	10449524	SAAV_0824	SAAV_0825			TRUE	0.648	15.000	0.000	NA		NA
10449526	10449527	SAAV_0827	SAAV_0828			FALSE	0.400	41.000	0.000	NA		NA
10449529	10449530	SAAV_0830	SAAV_0831			FALSE	0.041	248.000	0.000	NA		NA
10449530	10449531	SAAV_0831	SAAV_0832			TRUE	0.630	8.000	0.000	NA		NA
10449531	10449532	SAAV_0832	SAAV_0833			TRUE	0.874	-7.000	0.000	NA		NA
10449532	10449533	SAAV_0833	SAAV_0834			TRUE	0.792	0.000	0.000	NA		NA
10449533	10449534	SAAV_0834	SAAV_0835		ssb1	TRUE	0.792	0.000	0.000	NA		NA
10449534	10449535	SAAV_0835	SAAV_0836	ssb1		FALSE	0.016	685.000	0.000	NA		NA
10449537	10449538	SAAV_0838	SAAV_0839			TRUE	0.629	10.000	0.000	NA		NA
10449538	10449539	SAAV_0839	SAAV_0840			TRUE	0.967	-6.000	0.286	NA		NA
10449539	10449540	SAAV_0840	SAAV_0841			FALSE	0.041	244.000	0.000	NA		NA
10449540	10449541	SAAV_0841	SAAV_0842			FALSE	0.195	90.000	0.000	NA		NA
10449541	10449542	SAAV_0842	SAAV_0843			TRUE	0.761	1.000	0.000	NA		NA
10449542	10449543	SAAV_0843	SAAV_0844			FALSE	0.039	261.000	0.000	NA		NA
10449543	10449544	SAAV_0844	SAAV_0845			TRUE	0.874	-7.000	0.000	NA		NA
10449544	10449545	SAAV_0845	SAAV_0846			FALSE	0.430	37.000	0.000	NA		NA
10449545	10449546	SAAV_0846	SAAV_0847			TRUE	0.837	-3.000	0.000	NA		NA
10449546	10449547	SAAV_0847	SAAV_0848			TRUE	0.837	-3.000	0.000	NA		NA
10449547	10449548	SAAV_0848	SAAV_0849			FALSE	0.031	305.000	0.000	NA		NA
10449548	10449549	SAAV_0849	SAAV_0850			TRUE	0.837	-3.000	0.000	NA		NA
10449549	10449550	SAAV_0850	SAAV_0851			TRUE	0.596	23.000	0.000	NA		NA
10449550	10449551	SAAV_0851	SAAV_0852			FALSE	0.159	115.000	0.000	NA		NA
10449551	10449552	SAAV_0852	SAAV_0853			TRUE	0.633	7.000	0.000	NA		NA
10449552	10449553	SAAV_0853	SAAV_0854			FALSE	0.167	128.000	0.000	NA	N	NA
10449553	10449554	SAAV_0854	SAAV_0855			TRUE	0.916	0.000	0.111	NA		NA
10449554	10449555	SAAV_0855	SAAV_0856			TRUE	0.631	14.000	0.000	NA		NA
10449555	10449556	SAAV_0856	SAAV_0857			FALSE	0.267	66.000	0.000	NA		NA
10449556	10449557	SAAV_0857	SAAV_0858			TRUE	0.979	-7.000	0.500	NA		NA
10449557	10449558	SAAV_0858	SAAV_0859			TRUE	0.495	88.000	0.200	NA		NA
10449558	10449559	SAAV_0859	SAAV_0860			FALSE	0.442	36.000	0.000	NA		NA
10449559	10449560	SAAV_0860	SAAV_0861			TRUE	0.629	9.000	0.000	NA		NA
10449560	10449561	SAAV_0861	SAAV_0862			FALSE	0.029	322.000	0.000	NA		NA
10449561	10449562	SAAV_0862	SAAV_0863			TRUE	0.837	-3.000	0.000	NA		NA
10449562	10449563	SAAV_0863	SAAV_0864			TRUE	0.761	1.000	0.000	NA		NA
10449563	10449564	SAAV_0864	SAAV_0865			FALSE	0.271	65.000	0.000	NA		NA
10449564	10449565	SAAV_0865	SAAV_0866			FALSE	0.298	60.000	0.000	NA		NA
10449565	10449566	SAAV_0866	SAAV_0867			FALSE	0.319	56.000	0.000	NA		NA
10449566	10449567	SAAV_0867	SAAV_0868			TRUE	0.792	0.000	0.000	NA		NA
10449567	10449568	SAAV_0868	SAAV_0869			TRUE	0.853	16.000	0.125	NA		NA
10449568	10449569	SAAV_0869	SAAV_0870			TRUE	0.874	-7.000	0.000	NA		NA
10449569	10449570	SAAV_0870	SAAV_0871			FALSE	0.372	46.000	0.000	NA		NA
10449570	10449571	SAAV_0871	SAAV_0872			FALSE	0.319	56.000	0.000	NA		NA
10449571	10449572	SAAV_0872	SAAV_0873			FALSE	0.018	530.000	0.000	NA		NA
10449572	10449573	SAAV_0873	SAAV_0874			TRUE	0.988	-13.000	0.750	NA		NA
10449575	10449576	SAAV_0876	SAAV_0877			FALSE	0.243	71.000	0.000	NA		NA
10449576	10449577	SAAV_0877	SAAV_0878			TRUE	0.901	-13.000	0.000	NA		NA
10449579	10449580	SAAV_0880	SAAV_0881			TRUE	0.815	14.000	0.085	NA		NA
10449580	10449581	SAAV_0881	SAAV_0882			FALSE	0.056	385.000	0.079	NA		NA
10449581	10449582	SAAV_0882	SAAV_0883			TRUE	0.895	13.000	0.303	NA		NA
10449582	10449583	SAAV_0883	SAAV_0884			TRUE	0.890	27.000	0.299	1.000		NA
10449583	10449584	SAAV_0884	SAAV_0885		lipA	FALSE	0.398	84.000	0.012	1.000	N	NA
10449584	10449585	SAAV_0885	SAAV_0886	lipA		FALSE	0.196	130.000	0.021	NA		NA
10449587	10449588	SAAV_0888	SAAV_0889			TRUE	0.943	0.000	0.237	NA		NA
10449588	10449589	SAAV_0889	SAAV_0890			TRUE	0.606	108.000	0.082	0.056	N	NA
10449589	10449590	SAAV_0890	SAAV_0891			FALSE	0.040	257.000	0.000	NA		NA
10449590	10449591	SAAV_0891	SAAV_0892			FALSE	0.362	48.000	0.000	NA		NA
10449591	10449592	SAAV_0892	SAAV_0893		dltA	TRUE	0.933	16.000	0.549	NA		NA
10449592	10449593	SAAV_0893	SAAV_0894	dltA	dltB	TRUE	0.973	-3.000	0.435	NA	N	NA
10449593	10449594	SAAV_0894	SAAV_0895	dltB	dltC	TRUE	0.915	18.000	0.387	NA		NA
10449594	10449595	SAAV_0895	SAAV_0896	dltC	dltD	TRUE	0.923	-3.000	0.064	NA		NA
10449599	10449600	SAAV_0900	SAAV_0901			TRUE	0.711	13.000	0.012	NA		NA
10449600	10449601	SAAV_0901	SAAV_0902			FALSE	0.020	454.000	0.000	NA		NA
10449601	10449602	SAAV_0902	SAAV_0903			FALSE	0.383	131.000	0.097	1.000	N	NA
10449602	10449603	SAAV_0903	SAAV_0904			FALSE	0.037	411.000	0.025	NA		NA
10449603	10449604	SAAV_0904	SAAV_0905			TRUE	0.790	19.000	0.052	NA		NA
10449605	10449606	SAAV_0906	SAAV_0907		mnhG	FALSE	0.212	249.000	0.364	NA	N	NA
10449606	10449607	SAAV_0907	SAAV_0908	mnhG	mnhF	TRUE	0.995	-22.000	0.244	1.000	Y	NA
10449607	10449608	SAAV_0908	SAAV_0909	mnhF	mnhE	TRUE	0.995	0.000	0.829	0.060	Y	NA
10449608	10449609	SAAV_0909	SAAV_0910	mnhE	mnhD	TRUE	0.995	2.000	0.842	0.005	Y	NA
10449609	10449610	SAAV_0910	SAAV_0911	mnhD	mnhC	TRUE	0.996	-7.000	0.211	0.003	Y	NA
10449610	10449611	SAAV_0911	SAAV_0912	mnhC	mnhB	TRUE	0.959	12.000	0.195	NA	Y	NA
10449611	10449612	SAAV_0912	SAAV_0913	mnhB	mnhA	TRUE	0.993	-7.000	0.439	NA	Y	NA
10449612	10449613	SAAV_0913	SAAV_0914	mnhA	kapB	FALSE	0.375	131.000	0.206	NA		NA
10449614	10449615	SAAV_0915	SAAV_0916			FALSE	0.087	415.000	0.110	1.000	N	NA
10449615	10449616	SAAV_0916	SAAV_0917			FALSE	0.070	362.000	0.027	1.000	N	NA
10449616	10449617	SAAV_0917	SAAV_0918		rocD	FALSE	0.060	308.000	0.000	1.000	N	NA
10449617	10449618	SAAV_0918	SAAV_0919	rocD	gluD	TRUE	0.669	109.000	0.019	1.000	Y	NA
10449619	10449620	SAAV_0920	SAAV_0921		argH	FALSE	0.094	242.000	0.003	1.000	N	NA
10449620	10449621	SAAV_0921	SAAV_0922	argH	argG	TRUE	0.994	-10.000	0.278	1.000	Y	NA
10449622	10449623	SAAV_0923	SAAV_0924	pgi		FALSE	0.038	325.000	0.005	NA		NA
10449623	10449624	SAAV_0924	SAAV_0925		lepB	TRUE	0.847	5.000	0.115	NA		NA
10449624	10449625	SAAV_0925	SAAV_0926	lepB	spsB	TRUE	0.987	16.000	0.184	0.001	Y	NA
10449625	10449626	SAAV_0926	SAAV_0927	spsB	rexB	FALSE	0.266	160.000	0.057	1.000	N	NA
10449626	10449627	SAAV_0927	SAAV_0928	rexB	rexA	TRUE	0.991	4.000	0.408	0.002	Y	NA
10449627	10449628	SAAV_0928	SAAV_0929	rexA		FALSE	0.262	166.000	0.075	1.000	N	NA
10449628	10449629	SAAV_0929	SAAV_0930			FALSE	0.049	329.000	0.028	NA		NA
10449630	10449631	SAAV_0931	SAAV_0932			TRUE	0.715	52.000	0.171	1.000		NA
10449632	10449633	SAAV_0933	SAAV_0934			FALSE	0.018	548.000	0.000	NA		NA
10449633	10449634	SAAV_0934	SAAV_0935		clpB	FALSE	0.099	203.000	0.000	1.000	N	NA
10449636	10449637	SAAV_0937	SAAV_0939			TRUE	0.905	-16.000	0.000	NA		NA
10449637	10449638	SAAV_0939	SAAV_0940			TRUE	0.874	-7.000	0.000	NA		NA
10449638	10449639	SAAV_0940	SAAV_0941			TRUE	0.910	-22.000	0.000	NA		NA
10449639	10449640	SAAV_0941	SAAV_0942			FALSE	0.030	311.000	0.000	NA		NA
10449642	10449643	SAAV_0944	SAAV_0945	fabH	fabF	TRUE	0.933	12.000	0.000	1.000	Y	NA
10449645	10449646	SAAV_0947	SAAV_0948	oppB	oppC	TRUE	0.988	0.000	0.062	0.031	Y	NA
10449646	10449647	SAAV_0948	SAAV_0949	oppC	oppD	TRUE	0.985	16.000	0.857	1.000	Y	NA
10449647	10449648	SAAV_0949	SAAV_0950	oppD	oppF	TRUE	0.996	-10.000	0.111	0.002	Y	NA
10449648	10449649	SAAV_0950	SAAV_0951	oppF		TRUE	0.957	19.000	0.074	1.000	Y	NA
10449649	10449650	SAAV_0951	SAAV_0952			FALSE	0.422	212.000	0.000	0.031	Y	NA
10449650	10449651	SAAV_0952	SAAV_0953			TRUE	0.814	51.000	0.000	1.000	Y	NA
10449651	10449652	SAAV_0953	SAAV_0954			TRUE	0.992	3.000	0.333	0.001	Y	NA
10449652	10449653	SAAV_0954	SAAV_0955			TRUE	0.987	-7.000	0.045	1.000	Y	NA
10449653	10449654	SAAV_0955	SAAV_0956			TRUE	0.978	12.000	0.159	0.031	Y	NA
10449657	10449658	SAAV_0959	SAAV_0960			TRUE	0.985	-31.000	0.400	NA		NA
10449659	10449660	SAAV_0961	SAAV_0962			FALSE	0.317	121.000	0.098	NA		NA
10449660	10449661	SAAV_0962	SAAV_0963		pepF	TRUE	0.583	48.000	0.075	NA		NA
10449662	10449663	SAAV_0964	SAAV_0965			TRUE	0.823	23.000	0.138	NA		NA
10449663	10449664	SAAV_0965	SAAV_0966			FALSE	0.407	104.000	0.063	1.000		NA
10449665	10449666	SAAV_0967	SAAV_0968		relA1	TRUE	0.902	17.000	0.283	NA		NA
10449666	10449667	SAAV_0968	SAAV_0969	relA1	ppnK	TRUE	0.954	17.000	0.725	1.000		NA
10449667	10449668	SAAV_0969	SAAV_0970	ppnK		TRUE	0.979	-3.000	0.480	1.000	N	NA
10449668	10449669	SAAV_0970	SAAV_0971		mgtE	TRUE	0.895	21.000	0.163	1.000	N	NA
10449669	10449670	SAAV_0971	SAAV_0972	mgtE		TRUE	0.957	10.000	0.094	1.000	Y	NA
10449670	10449671	SAAV_0972	SAAV_0973		fabI	FALSE	0.089	278.000	0.016	1.000	N	NA
10449673	10449674	SAAV_0975	SAAV_0976			FALSE	0.139	145.000	0.000	NA	N	NA
10449674	10449675	SAAV_0976	SAAV_0977			FALSE	0.248	194.000	0.287	NA	N	NA
10449676	10449677	SAAV_0978	SAAV_0979		ypfP	TRUE	0.981	-22.000	0.239	NA	N	NA
10449678	10449679	SAAV_0980	SAAV_0981			TRUE	0.925	-10.000	0.012	NA		NA
10449679	10449680	SAAV_0981	SAAV_0982			TRUE	0.843	0.000	0.009	NA		NA
10449680	10449681	SAAV_0982	SAAV_0984			FALSE	0.062	302.000	0.000	1.000	N	NA
10449681	10449682	SAAV_0984	SAAV_0985			FALSE	0.166	219.000	0.095	1.000	N	NA
10449682	10449683	SAAV_0985	SAAV_0986			TRUE	0.889	17.000	0.096	1.000	N	NA
10449683	10449684	SAAV_0986	SAAV_0987			FALSE	0.335	139.000	0.068	1.000	N	NA
10449685	10449686	SAAV_0988	SAAV_0989			TRUE	0.740	2.000	0.000	NA		NA
10449686	10449687	SAAV_0989	SAAV_0990			FALSE	0.116	142.000	0.000	NA		NA
10449690	10449691	SAAV_0993	SAAV_0994			TRUE	0.869	15.000	0.167	NA		NA
10449691	10449692	SAAV_0994	SAAV_0995			FALSE	0.015	1343.000	0.000	NA		NA
10449692	10449693	SAAV_0995	SAAV_0996			TRUE	0.711	3.000	0.000	NA		NA
10449693	10449694	SAAV_0996	SAAV_0997			TRUE	0.973	-3.000	0.500	NA		NA
10449699	10449700	SAAV_1002	SAAV_1003			FALSE	0.275	64.000	0.000	NA		NA
10449703	10449704	SAAV_1006	SAAV_1007		menD	TRUE	0.993	-13.000	0.142	1.000	Y	NA
10449704	10449705	SAAV_1007	SAAV_1008	menD		TRUE	0.981	-13.000	0.355	NA		NA
10449705	10449706	SAAV_1008	SAAV_1009		menB	TRUE	0.971	-7.000	0.280	NA		NA
10449707	10449708	SAAV_1010	SAAV_1011	sspC	sspB1	TRUE	0.543	38.000	0.000	1.000		NA
10449708	10449709	SAAV_1011	SAAV_1012	sspB1	sspA	FALSE	0.208	82.000	0.000	NA		NA
10449709	10449710	SAAV_1012	SAAV_1014	sspA		FALSE	0.018	528.000	0.000	NA		NA
10449710	10449711	SAAV_1014	SAAV_1015			FALSE	0.229	196.000	0.158	1.000	N	NA
10449713	10449714	SAAV_1017	SAAV_1018	atl		FALSE	0.071	228.000	0.000	1.000		NA
10449714	10449715	SAAV_1018	SAAV_1019			FALSE	0.383	155.000	0.364	NA		NA
10449715	10449716	SAAV_1019	SAAV_1020			TRUE	0.836	48.000	0.800	NA		NA
10449718	10449719	SAAV_1022	SAAV_1023	qoxD	qoxC	TRUE	0.984	9.000	0.959	1.000	Y	NA
10449719	10449720	SAAV_1023	SAAV_1024	qoxC	qoxA	TRUE	0.998	-10.000	0.957	0.025	Y	NA
10449720	10449721	SAAV_1024	SAAV_1025	qoxA	qoxB	TRUE	0.995	0.000	0.489	0.003	Y	NA
10449723	10449724	SAAV_1027	SAAV_1028		folD	FALSE	0.016	864.000	0.000	NA		NA
10449725	10449726	SAAV_1029	SAAV_1030	purE	purK	TRUE	0.995	-13.000	0.008	0.001	Y	NA
10449726	10449727	SAAV_1030	SAAV_1031	purK	purC	TRUE	0.954	4.000	0.015	1.000	Y	NA
10449727	10449728	SAAV_1031	SAAV_1032	purC	purS	TRUE	0.990	0.000	0.460	1.000	Y	NA
10449728	10449729	SAAV_1032	SAAV_1033	purS	purQ	TRUE	0.995	2.000	0.656	0.001	Y	NA
10449729	10449730	SAAV_1033	SAAV_1034	purQ	purL	TRUE	0.997	-7.000	0.346	0.001	Y	NA
10449730	10449731	SAAV_1034	SAAV_1035	purL	purF	TRUE	0.994	-21.000	0.223	1.000	Y	NA
10449731	10449732	SAAV_1035	SAAV_1036	purF	purM	TRUE	0.992	-7.000	0.248	1.000	Y	NA
10449732	10449733	SAAV_1036	SAAV_1037	purM	purN	TRUE	0.989	3.000	0.238	0.003	Y	NA
10449733	10449734	SAAV_1037	SAAV_1038	purN	purH	TRUE	0.971	15.000	0.225	1.000	Y	NA
10449734	10449735	SAAV_1038	SAAV_1039	purH	purD	TRUE	0.966	22.000	0.238	1.000	Y	NA
10449736	10449737	SAAV_1040	SAAV_1041			TRUE	0.983	-7.000	0.469	1.000		NA
10449737	10449738	SAAV_1041	SAAV_1042			TRUE	0.891	15.000	0.241	NA		NA
10449738	10449739	SAAV_1042	SAAV_1044			FALSE	0.016	836.000	0.000	NA		NA
10449740	10449741	SAAV_1045	SAAV_1046			FALSE	0.044	425.000	0.050	NA		NA
10449741	10449742	SAAV_1046	SAAV_1047			TRUE	0.572	54.000	0.100	NA		NA
10449742	10449743	SAAV_1047	SAAV_1048		ptsH	FALSE	0.187	154.000	0.047	NA		NA
10449743	10449744	SAAV_1048	SAAV_1049	ptsH	ptsI	TRUE	0.982	3.000	0.054	0.013	Y	NA
10449746	10449747	SAAV_1051	SAAV_1052	cydA	cydB	TRUE	0.996	-3.000	0.778	0.025	Y	NA
10449747	10449748	SAAV_1052	SAAV_1053	cydB		FALSE	0.434	133.000	0.163	1.000	N	NA
10449749	10449750	SAAV_1054	SAAV_1055			TRUE	0.966	0.000	0.576	NA		NA
10449750	10449751	SAAV_1055	SAAV_1056		def	FALSE	0.032	482.000	0.025	NA		NA
10449752	10449753	SAAV_1057	SAAV_1058		pdhA	FALSE	0.147	171.000	0.046	NA		NA
10449753	10449754	SAAV_1058	SAAV_1059	pdhA	pdhB	TRUE	0.992	4.000	0.484	0.001	Y	NA
10449754	10449755	SAAV_1059	SAAV_1060	pdhB		TRUE	0.931	91.000	0.883	0.055	Y	NA
10449755	10449756	SAAV_1060	SAAV_1061		pdhD	TRUE	0.987	4.000	0.948	1.000	Y	NA
10449756	10449757	SAAV_1061	SAAV_1062	pdhD		FALSE	0.193	168.000	0.096	NA		NA
10449757	10449758	SAAV_1062	SAAV_1063			FALSE	0.191	144.000	0.034	NA		NA
10449758	10449759	SAAV_1063	SAAV_1064			TRUE	0.926	13.000	0.326	1.000	N	NA
10449759	10449760	SAAV_1064	SAAV_1065			TRUE	0.998	-7.000	0.928	0.031	Y	NA
10449760	10449761	SAAV_1065	SAAV_1066			TRUE	0.987	6.000	0.492	0.031	Y	NA
10449761	10449762	SAAV_1066	SAAV_1067			TRUE	0.992	0.000	0.253	0.031	Y	NA
10449762	10449763	SAAV_1067	SAAV_1068			FALSE	0.440	74.000	0.089	NA		NA
10449766	10449767	SAAV_1071	SAAV_1072			FALSE	0.115	184.000	0.041	NA		NA
10449771	10449772	SAAV_1076	SAAV_1077			TRUE	0.913	2.000	0.173	NA		NA
10449773	10449774	SAAV_1078	SAAV_1079			FALSE	0.030	314.000	0.000	NA		NA
10449774	10449775	SAAV_1079	SAAV_1080		pyc	FALSE	0.034	554.000	0.000	1.000	N	NA
10449777	10449778	SAAV_1082	SAAV_1083	ctaB		TRUE	0.701	25.000	0.027	NA		NA
10449778	10449779	SAAV_1083	SAAV_1084			FALSE	0.048	212.000	0.000	NA		NA
10449779	10449780	SAAV_1084	SAAV_1085			TRUE	0.916	-88.000	0.000	NA		NA
10449780	10449781	SAAV_1085	SAAV_1086			TRUE	0.907	16.000	0.301	NA		NA
10449785	10449786	SAAV_1090	SAAV_1091		coaD	TRUE	0.958	2.000	0.367	1.000	N	NA
10449788	10449789	SAAV_1093	SAAV_1094		rpmF	TRUE	0.673	80.000	0.599	NA		NA
10449790	10449791	SAAV_1095	SAAV_1096	isdB	isdA	TRUE	0.480	203.000	0.000	0.006	Y	NA
10449792	10449793	SAAV_1097	SAAV_1098	isdC	isdD	TRUE	0.792	0.000	0.000	NA		NA
10449793	10449794	SAAV_1098	SAAV_1099	isdD	isdE	TRUE	0.837	-3.000	0.000	NA		NA
10449794	10449795	SAAV_1099	SAAV_1100	isdE	isdF	TRUE	0.984	10.000	0.877	1.000	Y	NA
10449795	10449796	SAAV_1100	SAAV_1101	isdF	srtB	FALSE	0.286	62.000	0.000	NA		NA
10449796	10449797	SAAV_1101	SAAV_1102	srtB		TRUE	0.797	19.000	0.058	NA		NA
10449797	10449798	SAAV_1102	SAAV_1103			FALSE	0.038	384.000	0.000	1.000		NA
10449798	10449799	SAAV_1103	SAAV_1105		pheS	FALSE	0.182	380.000	0.006	1.000	Y	NA
10449799	10449800	SAAV_1105	SAAV_1106	pheS	pheT	TRUE	0.996	0.000	0.574	0.001	Y	NA
10449802	10449803	SAAV_1108	SAAV_1109			TRUE	0.893	1.000	0.091	NA		NA
10449803	10449804	SAAV_1109	SAAV_1110			TRUE	0.501	73.000	0.066	1.000		NA
10449804	10449805	SAAV_1110	SAAV_1111			TRUE	0.959	10.000	0.114	1.000	Y	NA
10449805	10449806	SAAV_1111	SAAV_1112		trxA	FALSE	0.158	173.000	0.018	1.000		NA
10449808	10449809	SAAV_1114	SAAV_1115	uvrC	sdhC	FALSE	0.056	324.000	0.000	1.000	N	NA
10449809	10449810	SAAV_1115	SAAV_1116	sdhC	sdhA	TRUE	0.952	52.000	0.184	0.001	Y	NA
10449810	10449811	SAAV_1116	SAAV_1117	sdhA	sdhB	TRUE	0.994	0.000	0.231	0.001	Y	NA
10449811	10449812	SAAV_1117	SAAV_1118	sdhB	murI	FALSE	0.096	236.000	0.002	1.000	N	NA
10449812	10449813	SAAV_1118	SAAV_1119	murI		TRUE	0.840	12.000	0.034	1.000	N	NA
10449813	10449814	SAAV_1119	SAAV_1120			TRUE	0.947	-7.000	0.085	NA		NA
10449814	10449815	SAAV_1120	SAAV_1121			FALSE	0.098	155.000	0.000	NA		NA
10449815	10449816	SAAV_1121	SAAV_1122			FALSE	0.056	194.000	0.000	NA		NA
10449816	10449817	SAAV_1122	SAAV_1123			FALSE	0.078	171.000	0.000	NA		NA
10449819	10449820	SAAV_1125	SAAV_1126		efb	FALSE	0.039	260.000	0.000	NA		NA
10449820	10449821	SAAV_1126	SAAV_1127	efb		FALSE	0.106	150.000	0.000	NA		NA
10449821	10449822	SAAV_1127	SAAV_1128			FALSE	0.025	362.000	0.000	NA		NA
10449826	10449827	SAAV_1132	SAAV_1133			TRUE	0.905	-16.000	0.000	NA		NA
10449828	10449829	SAAV_1134	SAAV_1135			TRUE	0.490	108.000	0.000	0.016		NA
10449829	10449830	SAAV_1135	SAAV_1136			TRUE	0.516	95.000	0.000	0.016		NA
10449831	10449832	SAAV_1137	SAAV_1138	arcB1	arcC1	TRUE	0.982	23.000	1.000	1.000	Y	NA
10449832	10449833	SAAV_1138	SAAV_1139	arcC1		FALSE	0.076	172.000	0.000	NA		NA
10449833	10449834	SAAV_1139	SAAV_1140			FALSE	0.031	307.000	0.000	NA		NA
10449838	10449839	SAAV_1144	SAAV_1145			TRUE	0.884	57.000	0.500	0.016		NA
10449839	10449840	SAAV_1145	SAAV_1146			FALSE	0.210	124.000	0.000	1.000		NA
10449842	10449843	SAAV_1148	SAAV_1149		mraZ	FALSE	0.177	144.000	0.025	NA		NA
10449843	10449844	SAAV_1149	SAAV_1150	mraZ	mraW	TRUE	0.938	16.000	0.635	NA		NA
10449844	10449845	SAAV_1150	SAAV_1151	mraW		TRUE	0.869	14.000	0.077	1.000	N	NA
10449845	10449846	SAAV_1151	SAAV_1152		pbp1	TRUE	0.989	-19.000	0.456	1.000	N	NA
10449846	10449847	SAAV_1152	SAAV_1153	pbp1	mraY	FALSE	0.270	292.000	0.038	1.000	Y	NA
10449847	10449848	SAAV_1153	SAAV_1154	mraY	murD	TRUE	0.994	2.000	0.647	0.007	Y	NA
10449848	10449849	SAAV_1154	SAAV_1155	murD	divIB	TRUE	0.936	16.000	0.008	NA	Y	NA
10449849	10449850	SAAV_1155	SAAV_1156	divIB	ftsA	TRUE	0.581	106.000	0.389	NA	N	NA
10449850	10449851	SAAV_1156	SAAV_1157	ftsA	ftsZ	TRUE	0.957	33.000	0.460	1.000	Y	NA
10449851	10449852	SAAV_1157	SAAV_1158	ftsZ		FALSE	0.093	260.000	0.082	NA		NA
10449852	10449853	SAAV_1158	SAAV_1159			TRUE	0.807	18.000	0.061	NA		NA
10449853	10449854	SAAV_1159	SAAV_1160			TRUE	0.873	6.000	0.194	NA		NA
10449854	10449855	SAAV_1160	SAAV_1161		ylmG	TRUE	0.908	12.000	0.370	NA		NA
10449855	10449856	SAAV_1161	SAAV_1162	ylmG		TRUE	0.621	83.000	0.287	1.000		NA
10449856	10449857	SAAV_1162	SAAV_1163			TRUE	0.915	24.000	0.579	NA		NA
10449857	10449858	SAAV_1163	SAAV_1165		ileS	FALSE	0.079	221.000	0.012	NA	N	NA
10449858	10449859	SAAV_1165	SAAV_1166	ileS		FALSE	0.033	291.000	0.000	NA		NA
10449859	10449860	SAAV_1166	SAAV_1167		lspA	FALSE	0.067	824.000	0.250	NA		NA
10449860	10449861	SAAV_1167	SAAV_1168	lspA		TRUE	0.904	0.000	0.008	1.000	N	NA
10449861	10449862	SAAV_1168	SAAV_1169		pyrR	FALSE	0.071	400.000	0.048	1.000	N	NA
10449862	10449863	SAAV_1169	SAAV_1170	pyrR	uraA	FALSE	0.418	218.000	0.140	1.000	Y	NA
10449863	10449864	SAAV_1170	SAAV_1171	uraA	pyrB	TRUE	0.936	28.000	0.064	1.000	Y	NA
10449864	10449865	SAAV_1171	SAAV_1172	pyrB	pyrC	TRUE	0.978	18.000	0.452	1.000	Y	NA
10449865	10449866	SAAV_1172	SAAV_1173	pyrC	carA	TRUE	0.978	2.000	0.155	1.000	Y	NA
10449866	10449867	SAAV_1173	SAAV_1174	carA	carB	TRUE	0.996	-7.000	0.117	0.001	Y	NA
10449867	10449868	SAAV_1174	SAAV_1175	carB	pyrF	TRUE	0.665	110.000	0.018	1.000	Y	NA
10449868	10449869	SAAV_1175	SAAV_1176	pyrF	pyrE	TRUE	0.972	0.000	0.006	1.000	Y	NA
10449869	10449870	SAAV_1176	SAAV_1177	pyrE		TRUE	0.516	30.000	0.000	NA		NA
10449870	10449871	SAAV_1177	SAAV_1178			FALSE	0.021	437.000	0.000	NA		NA
10449872	10449873	SAAV_1179	SAAV_1180			FALSE	0.223	76.000	0.000	NA		NA
10449874	10449875	SAAV_1181	SAAV_1182	gmk	rpoZ	TRUE	0.972	0.000	0.471	1.000	N	NA
10449875	10449876	SAAV_1182	SAAV_1183	rpoZ	coaBC	FALSE	0.217	216.000	0.192	1.000	N	NA
10449876	10449877	SAAV_1183	SAAV_1184	coaBC	priA	TRUE	0.941	0.000	0.099	1.000	N	NA
10449877	10449878	SAAV_1184	SAAV_1185	priA		FALSE	0.019	506.000	0.000	NA		NA
10449880	10449881	SAAV_1187	SAAV_1188	def2	fmt	TRUE	0.992	-7.000	0.031	0.030	Y	NA
10449881	10449882	SAAV_1188	SAAV_1189	fmt	sun	TRUE	0.991	-3.000	0.305	1.000	Y	NA
10449882	10449883	SAAV_1189	SAAV_1190	sun		TRUE	0.911	3.000	0.135	1.000		NA
10449883	10449884	SAAV_1190	SAAV_1191			TRUE	0.866	7.000	0.105	1.000		NA
10449884	10449885	SAAV_1191	SAAV_1192			TRUE	0.994	-3.000	0.704	1.000	Y	NA
10449885	10449886	SAAV_1192	SAAV_1193			FALSE	0.190	228.000	0.196	1.000		NA
10449886	10449887	SAAV_1193	SAAV_1194		rpe	TRUE	0.877	1.000	0.013	1.000		NA
10449887	10449888	SAAV_1194	SAAV_1195	rpe		TRUE	0.824	7.000	0.019	1.000	N	NA
10449890	10449891	SAAV_1197	SAAV_1198			TRUE	0.931	15.000	0.567	NA		NA
10449891	10449892	SAAV_1198	SAAV_1199		recG	FALSE	0.175	190.000	0.074	1.000		NA
10449892	10449893	SAAV_1199	SAAV_1200	recG		FALSE	0.138	203.000	0.078	NA	N	NA
10449893	10449894	SAAV_1200	SAAV_1201		plsX	TRUE	0.785	5.000	0.020	NA	N	NA
10449894	10449895	SAAV_1201	SAAV_1202	plsX	fabD	TRUE	0.995	-7.000	0.106	0.005	Y	NA
10449895	10449896	SAAV_1202	SAAV_1203	fabD	fabG1	TRUE	0.995	-7.000	0.149	0.005	Y	NA
10449898	10449899	SAAV_1205	SAAV_1206	acpP	rnc	FALSE	0.412	116.000	0.068	1.000	N	NA
10449899	10449900	SAAV_1206	SAAV_1207	rnc		FALSE	0.357	147.000	0.120	1.000	N	NA
10449900	10449901	SAAV_1207	SAAV_1208			TRUE	0.977	0.000	0.165	0.011	N	NA
10449901	10449902	SAAV_1208	SAAV_1209			TRUE	0.969	-13.000	0.081	1.000		NA
10449902	10449903	SAAV_1209	SAAV_1210		ffh	TRUE	0.855	26.000	0.151	1.000		NA
10449903	10449904	SAAV_1210	SAAV_1211	ffh	rpsP	FALSE	0.144	435.000	0.361	1.000	N	NA
10449904	10449905	SAAV_1211	SAAV_1212	rpsP	rimM	TRUE	0.717	188.000	0.342	0.019	Y	NA
10449905	10449906	SAAV_1212	SAAV_1213	rimM	trmD	TRUE	0.991	0.000	0.672	1.000	Y	NA
10449906	10449907	SAAV_1213	SAAV_1215	trmD	rplS	TRUE	0.855	103.000	0.567	1.000	Y	NA
10449909	10449910	SAAV_1217	SAAV_1218	rbgA	rnhB	TRUE	0.977	-16.000	0.148	1.000		NA
10449910	10449911	SAAV_1218	SAAV_1219	rnhB	sucC	FALSE	0.352	109.000	0.015	1.000	N	NA
10449911	10449912	SAAV_1219	SAAV_1220	sucC	sucD	TRUE	0.983	22.000	0.173	0.001	Y	NA
10449912	10449913	SAAV_1220	SAAV_1221	sucD	lytN	FALSE	0.110	227.000	0.034	1.000		NA
10449913	10449914	SAAV_1221	SAAV_1222	lytN	eprH	TRUE	0.911	28.000	0.500	1.000		NA
10449914	10449915	SAAV_1222	SAAV_1223	eprH		FALSE	0.060	305.000	0.000	1.000	N	NA
10449915	10449916	SAAV_1223	SAAV_1224		topA	TRUE	0.569	180.000	0.238	1.000	Y	NA
10449916	10449917	SAAV_1224	SAAV_1225	topA	gid	FALSE	0.339	156.000	0.137	1.000	N	NA
10449917	10449918	SAAV_1225	SAAV_1226	gid	xerC	FALSE	0.086	418.000	0.105	1.000	N	NA
10449918	10449919	SAAV_1226	SAAV_1227	xerC	hslV	TRUE	0.958	-3.000	0.113	1.000	N	NA
10449919	10449920	SAAV_1227	SAAV_1228	hslV	hslU	TRUE	0.921	66.000	0.752	1.000	Y	NA
10449920	10449921	SAAV_1228	SAAV_1229	hslU	codY	TRUE	0.864	25.000	0.131	1.000	N	NA
10449921	10449922	SAAV_1229	SAAV_1230	codY	rpsB	FALSE	0.061	347.000	0.006	1.000	N	NA
10449922	10449923	SAAV_1230	SAAV_1231	rpsB		FALSE	0.464	34.000	0.000	NA		NA
10449923	10449924	SAAV_1231	SAAV_1232		tsf	FALSE	0.453	35.000	0.000	NA		NA
10449924	10449925	SAAV_1232	SAAV_1233	tsf	pyrH	TRUE	0.541	137.000	0.416	1.000	N	NA
10449925	10449926	SAAV_1233	SAAV_1234	pyrH	frr	TRUE	0.950	19.000	0.626	1.000	N	NA
10449926	10449927	SAAV_1234	SAAV_1235	frr	uppS	FALSE	0.174	373.000	0.409	1.000	N	NA
10449927	10449928	SAAV_1235	SAAV_1236	uppS	cdsA	TRUE	0.960	7.000	0.113	1.000	Y	NA
10449928	10449929	SAAV_1236	SAAV_1237	cdsA		FALSE	0.139	212.000	0.040	1.000	N	NA
10449929	10449930	SAAV_1237	SAAV_1238		proS	TRUE	0.874	20.000	0.095	1.000	N	NA
10449930	10449931	SAAV_1238	SAAV_1239	proS	polC	FALSE	0.226	264.000	0.070	0.047	N	NA
10449931	10449932	SAAV_1239	SAAV_1240	polC		FALSE	0.072	290.000	0.059	NA		NA
10449932	10449933	SAAV_1240	SAAV_1241		nusA	TRUE	0.934	21.000	0.759	NA		NA
10449933	10449934	SAAV_1241	SAAV_1242	nusA		TRUE	0.966	21.000	0.323	NA	Y	NA
10449934	10449935	SAAV_1242	SAAV_1243			TRUE	0.972	-3.000	0.408	NA	N	NA
10449935	10449936	SAAV_1243	SAAV_1244		infB	TRUE	0.972	5.000	0.223	1.000	Y	NA
10449936	10449937	SAAV_1244	SAAV_1245	infB	rbfA	FALSE	0.388	386.000	0.530	1.000	Y	NA
10449937	10449938	SAAV_1245	SAAV_1246	rbfA	truB	TRUE	0.549	169.000	0.111	1.000	Y	NA
10449938	10449939	SAAV_1246	SAAV_1247	truB	ribF	TRUE	0.931	15.000	0.308	1.000	N	NA
10449939	10449940	SAAV_1247	SAAV_1248	ribF	rpsO	FALSE	0.459	115.000	0.119	1.000	N	NA
10449940	10449941	SAAV_1248	SAAV_1249	rpsO	pnp	FALSE	0.352	369.000	0.335	1.000	Y	NA
10449941	10449942	SAAV_1249	SAAV_1250	pnp		FALSE	0.045	338.000	0.000	1.000		NA
10449942	10449943	SAAV_1250	SAAV_1251			FALSE	0.059	383.000	0.031	1.000		NA
10449943	10449944	SAAV_1251	SAAV_1252			TRUE	0.895	5.000	0.115	1.000	N	NA
10449944	10449945	SAAV_1252	SAAV_1253			TRUE	0.781	31.000	0.093	1.000		NA
10449945	10449946	SAAV_1253	SAAV_1254			TRUE	0.989	0.000	0.872	0.005		NA
10449946	10449947	SAAV_1254	SAAV_1255			TRUE	0.966	0.000	0.397	1.000		NA
10449947	10449948	SAAV_1255	SAAV_1256			TRUE	0.610	105.000	0.114	0.053		NA
10449948	10449949	SAAV_1256	SAAV_1257			TRUE	0.891	19.000	0.163	1.000		NA
10449949	10449950	SAAV_1257	SAAV_1258		pgsA	TRUE	0.648	34.000	0.009	1.000		NA
10449950	10449951	SAAV_1258	SAAV_1259	pgsA		FALSE	0.173	224.000	0.151	1.000		NA
10449951	10449952	SAAV_1259	SAAV_1260		recA	FALSE	0.244	165.000	0.083	1.000		NA
10449952	10449953	SAAV_1260	SAAV_1261	recA		FALSE	0.058	354.000	0.018	1.000		NA
10449955	10449956	SAAV_1263	SAAV_1264			FALSE	0.238	140.000	0.021	1.000		NA
10449956	10449957	SAAV_1264	SAAV_1265			TRUE	0.994	1.000	0.437	0.001	Y	NA
10449957	10449958	SAAV_1265	SAAV_1266			FALSE	0.188	94.000	0.000	NA		NA
10449958	10449959	SAAV_1266	SAAV_1267		miaB	FALSE	0.155	134.000	0.002	NA		NA
10449959	10449960	SAAV_1267	SAAV_1268	miaB		TRUE	0.862	1.000	0.041	NA		NA
10449960	10449961	SAAV_1268	SAAV_1269			TRUE	0.768	27.000	0.091	NA		NA
10449961	10449962	SAAV_1269	SAAV_1270		hexA	FALSE	0.041	303.000	0.003	NA		NA
10449962	10449963	SAAV_1270	SAAV_1271	hexA	mutL	TRUE	0.985	13.000	0.220	0.002	Y	NA
10449963	10449964	SAAV_1271	SAAV_1272	mutL	glpP	TRUE	0.834	15.000	0.020	1.000	N	NA
10449964	10449965	SAAV_1272	SAAV_1273	glpP	glpF	FALSE	0.072	475.000	0.083	1.000	N	NA
10449965	10449966	SAAV_1273	SAAV_1274	glpF	glpK	FALSE	0.354	129.000	0.057	1.000	N	NA
10449966	10449967	SAAV_1274	SAAV_1275	glpK	glpD	TRUE	0.710	158.000	0.013	0.001	Y	NA
10449967	10449968	SAAV_1275	SAAV_1276	glpD		FALSE	0.259	150.000	0.029	1.000	N	NA
10449968	10449969	SAAV_1276	SAAV_1277		miaA	TRUE	0.840	18.000	0.025	1.000	N	NA
10449969	10449970	SAAV_1277	SAAV_1278	miaA		TRUE	0.807	15.000	0.016	1.000		NA
10449972	10449973	SAAV_1280	SAAV_1281			TRUE	0.850	19.000	0.065	1.000		NA
10449973	10449974	SAAV_1281	SAAV_1282		glnR	FALSE	0.127	243.000	0.046	1.000	N	NA
10449974	10449975	SAAV_1282	SAAV_1283	glnR	femC	TRUE	0.881	19.000	0.103	1.000	N	NA
10449975	10449976	SAAV_1283	SAAV_1284	femC		FALSE	0.031	493.000	0.000	1.000		NA
10449976	10449977	SAAV_1284	SAAV_1285			FALSE	0.060	700.000	0.000	0.053		NA
10449977	10449978	SAAV_1285	SAAV_1286			FALSE	0.032	294.000	0.000	NA		NA
10449978	10449979	SAAV_1286	SAAV_1287			FALSE	0.016	700.000	0.000	NA		NA
10449979	10449980	SAAV_1287	SAAV_1288			FALSE	0.021	424.000	0.000	NA		NA
10449980	10449981	SAAV_1288	SAAV_1289			FALSE	0.018	511.000	0.000	NA		NA
10449981	10449982	SAAV_1289	SAAV_1290			TRUE	0.916	-45.000	0.000	NA		NA
10449982	10449983	SAAV_1290	SAAV_1291			TRUE	0.647	18.000	0.000	NA		NA
10449983	10449984	SAAV_1291	SAAV_1292			FALSE	0.372	46.000	0.000	NA		NA
10449984	10449985	SAAV_1292	SAAV_1293			FALSE	0.159	115.000	0.000	NA		NA
10449985	10449986	SAAV_1293	SAAV_1294			FALSE	0.267	66.000	0.000	NA		NA
10449988	10449989	SAAV_1296	SAAV_1297			TRUE	0.772	57.000	0.571	NA		NA
10449989	10449990	SAAV_1297	SAAV_1298			FALSE	0.217	175.000	0.057	1.000	N	NA
10449990	10449991	SAAV_1298	SAAV_1299			TRUE	0.987	-31.000	0.136	0.098		NA
10449991	10449992	SAAV_1299	SAAV_1300			TRUE	0.968	4.000	0.500	0.098		NA
10449992	10449993	SAAV_1300	SAAV_1301			TRUE	0.997	-3.000	0.857	0.011	Y	NA
10449999	10450000	SAAV_1307	SAAV_1308			FALSE	0.217	78.000	0.000	NA		NA
10450000	10450001	SAAV_1308	SAAV_1309		thrC	TRUE	0.947	6.000	0.021	1.000	Y	NA
10450001	10450002	SAAV_1309	SAAV_1310	thrC	thrB	TRUE	0.981	2.000	0.221	1.000	Y	NA
10450002	10450003	SAAV_1310	SAAV_1311	thrB		TRUE	0.664	58.000	0.013	0.098		NA
10450004	10450005	SAAV_1312	SAAV_1313			FALSE	0.282	218.000	0.667	NA		NA
10450006	10450007	SAAV_1314	SAAV_1315	kataA	rpmG	FALSE	0.365	91.000	0.006	1.000	N	NA
10450007	10450008	SAAV_1315	SAAV_1316	rpmG	rpsN	FALSE	0.302	454.000	0.052	0.019	Y	NA
10450008	10450009	SAAV_1316	SAAV_1317	rpsN	guaC	FALSE	0.220	157.000	0.015	1.000	N	NA
10450013	10450014	SAAV_1321	SAAV_1322			FALSE	0.351	137.000	0.200	NA		NA
10450014	10450015	SAAV_1322	SAAV_1323		tkt	FALSE	0.431	121.000	0.240	NA		NA
10450015	10450016	SAAV_1323	SAAV_1324	tkt		FALSE	0.057	278.000	0.000	1.000		NA
10450016	10450017	SAAV_1324	SAAV_1325			FALSE	0.112	179.000	0.026	NA		NA
10450017	10450018	SAAV_1325	SAAV_1326		sbcD	FALSE	0.221	124.000	0.010	NA	N	NA
10450018	10450019	SAAV_1326	SAAV_1327	sbcD	sbcC	TRUE	0.982	4.000	0.669	NA	Y	NA
10450023	10450024	SAAV_1331	SAAV_1332	acnA		FALSE	0.139	180.000	0.015	1.000		NA
10450025	10450026	SAAV_1333	SAAV_1334			FALSE	0.033	376.000	0.008	NA		NA
10450027	10450028	SAAV_1335	SAAV_1336	parE	parC	TRUE	0.995	0.000	0.552	0.002	Y	NA
10450028	10450029	SAAV_1336	SAAV_1337	parC		FALSE	0.077	250.000	0.000	1.000	N	NA
10450029	10450030	SAAV_1337	SAAV_1338			FALSE	0.070	500.000	0.119	1.000		NA
10450030	10450031	SAAV_1338	SAAV_1339			FALSE	0.135	195.000	0.095	NA		NA
10450031	10450032	SAAV_1339	SAAV_1340		fmtC	FALSE	0.029	481.000	0.018	NA		NA
10450038	10450039	SAAV_1346	SAAV_1349		trpE	FALSE	0.037	492.000	0.000	1.000	N	NA
10450039	10450040	SAAV_1349	SAAV_1350	trpE	trpG	TRUE	0.992	-3.000	0.021	0.001	Y	NA
10450040	10450041	SAAV_1350	SAAV_1351	trpG	trpD	TRUE	0.942	6.000	0.006	1.000	Y	NA
10450041	10450042	SAAV_1351	SAAV_1352	trpD	trpC	TRUE	0.981	2.000	0.216	1.000	Y	NA
10450042	10450043	SAAV_1352	SAAV_1353	trpC	trpF	TRUE	0.995	-3.000	0.264	0.002	Y	NA
10450043	10450044	SAAV_1353	SAAV_1354	trpF	trpB	TRUE	0.997	-7.000	0.375	0.002	Y	NA
10450044	10450045	SAAV_1354	SAAV_1355	trpB	trpA	TRUE	0.997	-7.000	0.248	0.001	Y	NA
10450045	10450046	SAAV_1355	SAAV_1356	trpA	femA	FALSE	0.057	322.000	0.000	1.000	N	NA
10450046	10450047	SAAV_1356	SAAV_1357	femA		TRUE	0.992	19.000	1.000	0.007	Y	NA
10450047	10450048	SAAV_1357	SAAV_1358			FALSE	0.033	289.000	0.000	NA		NA
10450048	10450049	SAAV_1358	SAAV_1359			FALSE	0.044	230.000	0.000	NA		NA
10450050	10450051	SAAV_1360	SAAV_1361			FALSE	0.210	124.000	0.000	1.000		NA
10450051	10450052	SAAV_1361	SAAV_1362			TRUE	0.993	-7.000	0.059	0.023	Y	NA
10450052	10450053	SAAV_1362	SAAV_1363			TRUE	0.995	-13.000	0.353	1.000	Y	NA
10450053	10450054	SAAV_1363	SAAV_1364			TRUE	0.997	-7.000	0.647	0.029	Y	NA
10450054	10450055	SAAV_1364	SAAV_1365			FALSE	0.108	304.000	0.182	NA		NA
10450057	10450058	SAAV_1367	SAAV_1368			TRUE	0.959	7.000	0.182	NA	Y	NA
10450058	10450059	SAAV_1368	SAAV_1369			TRUE	0.948	47.000	0.125	0.002	Y	NA
10450059	10450060	SAAV_1369	SAAV_1370			TRUE	0.994	2.000	0.485	0.002	Y	NA
10450060	10450061	SAAV_1370	SAAV_1371			FALSE	0.440	191.000	0.077	1.000	Y	NA
10450064	10450065	SAAV_1374	SAAV_1376		lysC	FALSE	0.025	1062.000	0.000	1.000		NA
10450065	10450066	SAAV_1376	SAAV_1377	lysC	asd	TRUE	0.843	64.000	0.119	1.000	Y	NA
10450066	10450067	SAAV_1377	SAAV_1378	asd	dapA	TRUE	0.965	2.000	0.015	1.000	Y	NA
10450067	10450068	SAAV_1378	SAAV_1379	dapA	dapB	TRUE	0.925	27.000	0.014	1.000	Y	NA
10450068	10450069	SAAV_1379	SAAV_1380	dapB	dapD	TRUE	0.932	27.000	0.036	1.000	Y	NA
10450069	10450070	SAAV_1380	SAAV_1381	dapD		TRUE	0.486	143.000	0.372	1.000		NA
10450070	10450071	SAAV_1381	SAAV_1382			TRUE	0.856	5.000	0.058	1.000		NA
10450071	10450072	SAAV_1382	SAAV_1383		lysA	TRUE	0.954	-10.000	0.008	1.000	N	NA
10450075	10450076	SAAV_1386	SAAV_1387			FALSE	0.190	171.000	0.105	NA		NA
10450077	10450078	SAAV_1388	SAAV_1389			TRUE	0.763	25.000	0.067	NA		NA
10450078	10450079	SAAV_1389	SAAV_1390			TRUE	0.842	32.000	0.373	NA		NA
10450080	10450081	SAAV_1391	SAAV_1392	brnQ3		FALSE	0.144	225.000	0.136	NA	N	NA
10450081	10450082	SAAV_1392	SAAV_1393			TRUE	0.940	14.000	0.822	NA		NA
10450082	10450083	SAAV_1393	SAAV_1394			FALSE	0.193	181.000	0.156	NA		NA
10450083	10450084	SAAV_1394	SAAV_1395			TRUE	0.843	29.000	0.280	NA		NA
10450084	10450085	SAAV_1395	SAAV_1396		sucB	FALSE	0.017	580.000	0.000	NA		NA
10450085	10450086	SAAV_1396	SAAV_1397	sucB	sucA	TRUE	0.981	14.000	0.667	1.000	Y	NA
10450086	10450087	SAAV_1397	SAAV_1398	sucA	arlS	FALSE	0.079	284.000	0.006	1.000	N	NA
10450087	10450088	SAAV_1398	SAAV_1399	arlS	arlR	TRUE	0.992	-3.000	0.438	1.000	Y	NA
10450088	10450089	SAAV_1399	SAAV_1400	arlR		FALSE	0.031	788.000	0.000	1.000	N	NA
10450089	10450090	SAAV_1400	SAAV_1401		murG	TRUE	0.837	17.000	0.016	1.000	N	NA
10450090	10450091	SAAV_1401	SAAV_1402	murG		TRUE	0.793	12.000	0.014	1.000		NA
10450091	10450092	SAAV_1402	SAAV_1403			FALSE	0.061	400.000	0.046	1.000		NA
10450092	10450093	SAAV_1403	SAAV_1404			FALSE	0.111	192.000	0.045	NA		NA
10450093	10450094	SAAV_1404	SAAV_1405			TRUE	0.905	0.000	0.080	NA		NA
10450094	10450095	SAAV_1405	SAAV_1406		msrB	TRUE	0.897	12.000	0.154	1.000	N	NA
10450095	10450096	SAAV_1406	SAAV_1407	msrB	msrA	TRUE	0.998	-7.000	0.615	0.002	Y	NA
10450096	10450097	SAAV_1407	SAAV_1408	msrA		FALSE	0.201	86.000	0.000	NA		NA
10450097	10450098	SAAV_1408	SAAV_1409		folA	TRUE	0.648	15.000	0.000	NA		NA
10450098	10450099	SAAV_1409	SAAV_1410	folA	thyA	FALSE	0.285	200.000	0.295	1.000	N	NA
10450099	10450100	SAAV_1410	SAAV_1411	thyA		FALSE	0.028	424.000	0.003	NA		NA
10450100	10450101	SAAV_1411	SAAV_1412			TRUE	0.659	16.000	0.000	NA		NA
10450101	10450102	SAAV_1412	SAAV_1413			TRUE	0.782	38.000	0.000	0.007		NA
10450106	10450107	SAAV_1417	SAAV_1418	ebh	ebhA	FALSE	0.372	46.000	0.000	NA		NA
10450107	10450108	SAAV_1418	SAAV_1419	ebhA	ebhB	TRUE	0.918	40.000	0.000	0.013	Y	NA
10450108	10450109	SAAV_1419	SAAV_1420	ebhB		FALSE	0.022	398.000	0.000	NA		NA
10450109	10450110	SAAV_1420	SAAV_1421			FALSE	0.097	156.000	0.000	NA		NA
10450110	10450111	SAAV_1421	SAAV_1422		ilvA1	TRUE	0.901	31.000	0.006	1.000	Y	NA
10450111	10450112	SAAV_1422	SAAV_1423	ilvA1	ald1	TRUE	0.687	95.000	0.012	1.000	Y	NA
10450112	10450113	SAAV_1423	SAAV_1424	ald1		FALSE	0.037	476.000	0.000	1.000	N	NA
10450113	10450114	SAAV_1424	SAAV_1425			TRUE	0.734	20.000	0.000	1.000		NA
10450116	10450117	SAAV_1427	SAAV_1428			FALSE	0.204	84.000	0.000	NA		NA
10450117	10450118	SAAV_1428	SAAV_1430			FALSE	0.021	434.000	0.000	NA		NA
10450118	10450119	SAAV_1430	SAAV_1431			FALSE	0.178	101.000	0.000	NA		NA
10450119	10450120	SAAV_1431	SAAV_1432			TRUE	0.928	14.000	0.579	NA		NA
10450120	10450121	SAAV_1432	SAAV_1433			TRUE	0.961	-7.000	0.165	NA		NA
10450121	10450122	SAAV_1433	SAAV_1434			FALSE	0.325	55.000	0.000	NA		NA
10450123	10450124	SAAV_1435	SAAV_1436		recU	TRUE	0.907	-19.000	0.000	NA		NA
10450124	10450125	SAAV_1436	SAAV_1437	recU	pbp2	TRUE	0.972	-3.000	0.319	1.000		NA
10450126	10450127	SAAV_1438	SAAV_1439		nth	TRUE	0.728	5.000	0.009	NA		NA
10450127	10450128	SAAV_1439	SAAV_1440	nth		TRUE	0.988	-10.000	0.075	NA	Y	NA
10450128	10450129	SAAV_1440	SAAV_1441		asnC	FALSE	0.126	328.000	0.234	NA	N	NA
10450129	10450130	SAAV_1441	SAAV_1442	asnC		FALSE	0.146	322.000	0.030	0.096	N	NA
10450130	10450131	SAAV_1442	SAAV_1443		birA	TRUE	0.845	24.000	0.074	1.000	N	NA
10450131	10450132	SAAV_1443	SAAV_1444	birA	papS	TRUE	0.963	-13.000	0.023	1.000	N	NA
10450132	10450133	SAAV_1444	SAAV_1445	papS		TRUE	0.897	5.000	0.126	1.000	N	NA
10450133	10450134	SAAV_1445	SAAV_1446			FALSE	0.076	244.000	0.038	NA		NA
10450134	10450135	SAAV_1446	SAAV_1447			FALSE	0.041	336.000	0.013	NA		NA
10450135	10450136	SAAV_1447	SAAV_1448			TRUE	0.556	54.000	0.083	NA		NA
10450136	10450137	SAAV_1448	SAAV_1449			TRUE	0.962	-10.000	0.127	NA		NA
10450137	10450138	SAAV_1449	SAAV_1450			TRUE	0.906	14.000	0.353	NA		NA
10450138	10450139	SAAV_1450	SAAV_1451		aroA	TRUE	0.808	7.000	0.007	1.000	N	NA
10450139	10450140	SAAV_1451	SAAV_1452	aroA	aroB	TRUE	0.952	10.000	0.051	1.000	Y	NA
10450140	10450141	SAAV_1452	SAAV_1453	aroB	aroC	TRUE	0.976	26.000	0.110	0.002	Y	NA
10450141	10450142	SAAV_1453	SAAV_1454	aroC		FALSE	0.023	386.000	0.000	NA		NA
10450142	10450143	SAAV_1454	SAAV_1455			TRUE	0.528	29.000	0.000	NA		NA
10450143	10450144	SAAV_1455	SAAV_1456		ndk	FALSE	0.325	55.000	0.000	NA		NA
10450144	10450145	SAAV_1456	SAAV_1457	ndk		FALSE	0.451	92.000	0.054	1.000	N	NA
10450145	10450146	SAAV_1457	SAAV_1458		ubiE	TRUE	0.950	17.000	0.020	1.000	Y	NA
10450146	10450147	SAAV_1458	SAAV_1459	ubiE		TRUE	0.773	3.000	0.008	NA		NA
10450147	10450148	SAAV_1459	SAAV_1460		hup	FALSE	0.021	431.000	0.000	NA		NA
10450148	10450149	SAAV_1460	SAAV_1461	hup	gpsA	FALSE	0.195	171.000	0.025	1.000	N	NA
10450149	10450150	SAAV_1461	SAAV_1462	gpsA	engA	TRUE	0.863	17.000	0.068	1.000		NA
10450150	10450151	SAAV_1462	SAAV_1463	engA	rpsA	FALSE	0.110	222.000	0.032	1.000		NA
10450151	10450152	SAAV_1463	SAAV_1464	rpsA	cmk	FALSE	0.052	712.000	0.047	1.000	N	NA
10450154	10450155	SAAV_1466	SAAV_1467			FALSE	0.091	161.000	0.000	NA		NA
10450155	10450156	SAAV_1467	SAAV_1468			FALSE	0.138	125.000	0.000	NA		NA
10450156	10450157	SAAV_1468	SAAV_1469		recQ2	FALSE	0.278	153.000	0.079	1.000		NA
10450157	10450158	SAAV_1469	SAAV_1470	recQ2		TRUE	0.983	-10.000	0.508	NA		NA
10450160	10450161	SAAV_1472	SAAV_1474			FALSE	0.022	402.000	0.000	NA		NA
10450163	10450164	SAAV_1476	SAAV_1477			FALSE	0.223	76.000	0.000	NA		NA
10450164	10450165	SAAV_1477	SAAV_1478			FALSE	0.306	58.000	0.000	NA		NA
10450165	10450166	SAAV_1478	SAAV_1479			FALSE	0.195	90.000	0.000	NA		NA
10450166	10450167	SAAV_1479	SAAV_1480			TRUE	0.874	-7.000	0.000	NA		NA
10450167	10450168	SAAV_1480	SAAV_1481		srrB	FALSE	0.032	304.000	0.000	NA		NA
10450168	10450169	SAAV_1481	SAAV_1482	srrB	srrA	TRUE	0.993	-19.000	0.111	1.000	Y	NA
10450169	10450170	SAAV_1482	SAAV_1483	srrA	rluB	FALSE	0.325	133.000	0.046	1.000	N	NA
10450170	10450171	SAAV_1483	SAAV_1484	rluB	scpB	TRUE	0.971	-7.000	0.224	NA	N	NA
10450171	10450172	SAAV_1484	SAAV_1485	scpB	scpA	TRUE	0.981	-7.000	0.570	NA		NA
10450174	10450175	SAAV_1487	SAAV_1488	xerD		TRUE	0.621	49.000	0.029	1.000	N	NA
10450175	10450176	SAAV_1488	SAAV_1489			FALSE	0.371	105.000	0.021	1.000	N	NA
10450178	10450179	SAAV_1491	SAAV_1492			TRUE	0.659	16.000	0.000	NA		NA
10450182	10450183	SAAV_1495	SAAV_1496	zwf		FALSE	0.393	42.000	0.000	NA		NA
10450183	10450184	SAAV_1496	SAAV_1497			TRUE	0.516	30.000	0.000	NA		NA
10450185	10450186	SAAV_1498	SAAV_1499	malA	malR	TRUE	0.949	16.000	0.500	1.000	N	NA
10450186	10450187	SAAV_1499	SAAV_1500	malR		FALSE	0.089	194.000	0.000	1.000		NA
10450187	10450188	SAAV_1500	SAAV_1501			FALSE	0.020	467.000	0.000	NA		NA
10450188	10450189	SAAV_1501	SAAV_1502			FALSE	0.166	316.000	0.000	NA	Y	NA
10450189	10450190	SAAV_1502	SAAV_1503			TRUE	0.514	68.000	0.035	1.000	N	NA
10450192	10450193	SAAV_1505	SAAV_1506			TRUE	0.822	14.000	0.097	NA		NA
10450193	10450194	SAAV_1506	SAAV_1507			FALSE	0.236	73.000	0.000	NA		NA
10450194	10450195	SAAV_1507	SAAV_1508			FALSE	0.067	180.000	0.000	NA		NA
10450195	10450196	SAAV_1508	SAAV_1509			TRUE	0.990	13.000	0.882	0.051	Y	NA
10450196	10450197	SAAV_1509	SAAV_1510			TRUE	0.997	0.000	0.897	0.001	Y	NA
10450197	10450198	SAAV_1510	SAAV_1511		lpdA	TRUE	0.979	16.000	0.414	1.000	Y	NA
10450198	10450199	SAAV_1511	SAAV_1512	lpdA	recN	FALSE	0.215	151.000	0.002	1.000	N	NA
10450199	10450200	SAAV_1512	SAAV_1513	recN	argR	TRUE	0.873	16.000	0.056	1.000	N	NA
10450200	10450201	SAAV_1513	SAAV_1514	argR	ispA	FALSE	0.040	432.000	0.000	1.000	N	NA
10450201	10450202	SAAV_1514	SAAV_1515	ispA	xseB	TRUE	0.977	-22.000	0.100	1.000	N	NA
10450202	10450203	SAAV_1515	SAAV_1516	xseB	xseA	TRUE	0.997	-7.000	0.412	0.001	Y	NA
10450203	10450204	SAAV_1516	SAAV_1517	xseA	nusB	TRUE	0.831	17.000	0.011	1.000	N	NA
10450204	10450205	SAAV_1517	SAAV_1518	nusB		TRUE	0.664	60.000	0.265	NA		NA
10450205	10450206	SAAV_1518	SAAV_1519		accC	TRUE	0.915	15.000	0.373	NA		NA
10450206	10450207	SAAV_1519	SAAV_1520	accC	accB	TRUE	0.980	0.000	0.086	1.000	Y	NA
10450207	10450208	SAAV_1520	SAAV_1521	accB	efp	FALSE	0.081	474.000	0.120	1.000	N	NA
10450208	10450209	SAAV_1521	SAAV_1522	efp		TRUE	0.873	26.000	0.160	1.000	N	NA
10450210	10450211	SAAV_1523	SAAV_1524			TRUE	0.947	14.000	1.000	NA		NA
10450214	10450215	SAAV_1527	SAAV_1528			TRUE	0.997	-7.000	0.316	0.001	Y	NA
10450215	10450216	SAAV_1528	SAAV_1529		gcvT	TRUE	0.981	20.000	0.092	0.001	Y	NA
10450216	10450217	SAAV_1529	SAAV_1531	gcvT	aroK	TRUE	0.505	159.000	0.019	1.000	Y	NA
10450217	10450218	SAAV_1531	SAAV_1532	aroK		FALSE	0.087	233.000	0.029	NA	N	NA
10450218	10450219	SAAV_1532	SAAV_1533			FALSE	0.259	204.000	0.000	NA	Y	NA
10450219	10450220	SAAV_1533	SAAV_1534		comGC	TRUE	0.985	-22.000	0.000	NA	Y	NA
10450220	10450221	SAAV_1534	SAAV_1535	comGC		TRUE	0.980	14.000	0.861	NA	Y	NA
10450221	10450222	SAAV_1535	SAAV_1536			TRUE	0.996	-28.000	0.639	NA	Y	NA
10450222	10450223	SAAV_1536	SAAV_1537			TRUE	0.540	52.000	0.015	1.000		NA
10450223	10450224	SAAV_1537	SAAV_1538			TRUE	0.886	-3.000	0.015	NA		NA
10450224	10450225	SAAV_1538	SAAV_1539		glk	TRUE	0.865	0.000	0.024	NA		NA
10450225	10450226	SAAV_1539	SAAV_1540	glk		TRUE	0.972	-3.000	0.496	NA		NA
10450226	10450227	SAAV_1540	SAAV_1541			TRUE	0.956	-19.000	0.058	NA		NA
10450227	10450228	SAAV_1541	SAAV_1542			TRUE	0.776	12.000	0.006	1.000		NA
10450228	10450229	SAAV_1542	SAAV_1543		rpmG_1	FALSE	0.146	209.000	0.045	1.000	N	NA
10450229	10450230	SAAV_1543	SAAV_1544	rpmG_1	pbp3	FALSE	0.346	113.000	0.019	1.000	N	NA
10450230	10450231	SAAV_1544	SAAV_1545	pbp3	sodA2	FALSE	0.408	121.000	0.085	1.000	N	NA
10450231	10450232	SAAV_1545	SAAV_1546	sodA2		FALSE	0.233	276.000	0.000	1.000	Y	NA
10450232	10450233	SAAV_1546	SAAV_1547			TRUE	0.996	-13.000	0.480	1.000	Y	NA
10450233	10450234	SAAV_1547	SAAV_1548			TRUE	0.939	42.000	0.148	0.095	Y	NA
10450234	10450235	SAAV_1548	SAAV_1549		nfo	FALSE	0.291	126.000	0.012	1.000	N	NA
10450235	10450236	SAAV_1549	SAAV_1550	nfo		TRUE	0.958	10.000	0.104	1.000	Y	NA
10450236	10450237	SAAV_1550	SAAV_1551			FALSE	0.258	114.000	0.032	NA		NA
10450237	10450238	SAAV_1551	SAAV_1552			TRUE	0.922	3.000	0.283	NA		NA
10450238	10450239	SAAV_1552	SAAV_1553		rpoD	FALSE	0.396	131.000	0.239	NA		NA
10450239	10450240	SAAV_1553	SAAV_1554	rpoD	dnaG	FALSE	0.217	224.000	0.209	1.000	N	NA
10450240	10450241	SAAV_1554	SAAV_1555	dnaG		FALSE	0.374	61.000	0.011	NA		NA
10450241	10450242	SAAV_1555	SAAV_1556			TRUE	0.930	11.000	0.621	NA		NA
10450244	10450245	SAAV_1558	SAAV_1559		era	TRUE	0.818	28.000	0.108	1.000		NA
10450245	10450246	SAAV_1559	SAAV_1560	era	cdd	TRUE	0.921	1.000	0.098	1.000		NA
10450246	10450247	SAAV_1560	SAAV_1561	cdd	dgkA	TRUE	0.880	11.000	0.108	1.000	N	NA
10450247	10450248	SAAV_1561	SAAV_1562	dgkA		TRUE	0.770	3.000	0.007	NA		NA
10450248	10450249	SAAV_1562	SAAV_1563			TRUE	0.954	1.000	0.457	NA		NA
10450249	10450250	SAAV_1563	SAAV_1564			FALSE	0.032	304.000	0.000	NA		NA
10450250	10450251	SAAV_1564	SAAV_1565			TRUE	0.808	17.000	0.055	NA		NA
10450251	10450252	SAAV_1565	SAAV_1566			TRUE	0.894	18.000	0.258	NA		NA
10450252	10450253	SAAV_1566	SAAV_1567		rpsU	FALSE	0.064	220.000	0.011	NA		NA
10450253	10450254	SAAV_1567	SAAV_1568	rpsU		FALSE	0.071	293.000	0.016	1.000		NA
10450254	10450255	SAAV_1568	SAAV_1569			TRUE	0.859	7.000	0.163	NA		NA
10450255	10450256	SAAV_1569	SAAV_1570		prmA	TRUE	0.924	2.000	0.227	NA		NA
10450256	10450257	SAAV_1570	SAAV_1571	prmA	dnaJ	TRUE	0.909	4.000	0.133	1.000	N	NA
10450257	10450258	SAAV_1571	SAAV_1572	dnaJ	dnaK	TRUE	0.845	136.000	0.196	0.001	Y	NA
10450258	10450259	SAAV_1572	SAAV_1573	dnaK	grpE	TRUE	0.921	69.000	0.224	0.005	Y	NA
10450259	10450260	SAAV_1573	SAAV_1574	grpE	hrcA	TRUE	0.864	32.000	0.286	1.000	N	NA
10450260	10450261	SAAV_1574	SAAV_1575	hrcA		FALSE	0.462	101.000	0.082	1.000	N	NA
10450261	10450262	SAAV_1575	SAAV_1576		lepA	FALSE	0.051	566.000	0.032	1.000	N	NA
10450264	10450265	SAAV_1578	SAAV_1579	holA		TRUE	0.680	57.000	0.163	1.000		NA
10450265	10450266	SAAV_1579	SAAV_1580			TRUE	0.570	59.000	0.055	1.000		NA
10450266	10450267	SAAV_1580	SAAV_1581		comEA	FALSE	0.408	122.000	0.095	1.000	N	NA
10450267	10450268	SAAV_1581	SAAV_1582	comEA		TRUE	0.593	49.000	0.033	1.000		NA
10450268	10450269	SAAV_1582	SAAV_1583			TRUE	0.864	3.000	0.085	NA		NA
10450269	10450270	SAAV_1583	SAAV_1584			TRUE	0.914	1.000	0.149	NA		NA
10450270	10450271	SAAV_1584	SAAV_1585		nadD	TRUE	0.993	-10.000	0.199	1.000	Y	NA
10450271	10450272	SAAV_1585	SAAV_1586	nadD		TRUE	0.905	3.000	0.150	NA	N	NA
10450272	10450273	SAAV_1586	SAAV_1587		aroE	TRUE	0.866	4.000	0.089	NA	N	NA
10450273	10450274	SAAV_1587	SAAV_1588	aroE		TRUE	0.923	14.000	0.336	1.000		NA
10450274	10450275	SAAV_1588	SAAV_1589			TRUE	0.967	1.000	0.555	1.000		NA
10450275	10450276	SAAV_1589	SAAV_1590		mtn	TRUE	0.796	20.000	0.019	1.000		NA
10450278	10450279	SAAV_1592	SAAV_1593			FALSE	0.358	149.000	0.000	0.016		NA
10450279	10450280	SAAV_1593	SAAV_1594			FALSE	0.016	764.000	0.000	NA		NA
10450280	10450281	SAAV_1594	SAAV_1596			FALSE	0.033	289.000	0.000	NA		NA
10450281	10450282	SAAV_1596	SAAV_1597			TRUE	0.854	13.000	0.084	1.000		NA
10450282	10450283	SAAV_1597	SAAV_1598			TRUE	0.924	0.000	0.062	1.000		NA
10450283	10450284	SAAV_1598	SAAV_1599			TRUE	0.936	14.000	0.031	NA	Y	NA
10450284	10450285	SAAV_1599	SAAV_1600			TRUE	0.952	2.000	0.429	NA	N	NA
10450285	10450286	SAAV_1600	SAAV_1601			TRUE	0.993	-10.000	0.184	1.000	Y	NA
10450286	10450287	SAAV_1601	SAAV_1602		greA	FALSE	0.056	326.000	0.000	1.000	N	NA
10450287	10450288	SAAV_1602	SAAV_1603	greA	udk	TRUE	0.831	28.000	0.095	1.000	N	NA
10450288	10450289	SAAV_1603	SAAV_1604	udk		TRUE	0.941	0.000	0.100	1.000	N	NA
10450289	10450290	SAAV_1604	SAAV_1605			TRUE	0.984	12.000	0.156	0.001	Y	NA
10450290	10450291	SAAV_1605	SAAV_1606			TRUE	0.913	3.000	0.142	1.000		NA
10450291	10450292	SAAV_1606	SAAV_1607			FALSE	0.034	285.000	0.000	NA		NA
10450292	10450293	SAAV_1607	SAAV_1608			TRUE	0.936	15.000	0.651	NA		NA
10450293	10450294	SAAV_1608	SAAV_1609			TRUE	0.938	4.000	0.537	NA		NA
10450294	10450295	SAAV_1609	SAAV_1610		alaS	TRUE	0.526	63.000	0.110	NA		NA
10450295	10450296	SAAV_1610	SAAV_1612	alaS		FALSE	0.052	343.000	0.000	1.000	N	NA
10450296	10450297	SAAV_1612	SAAV_1613			TRUE	0.946	2.000	0.281	1.000		NA
10450297	10450298	SAAV_1613	SAAV_1614		mnmA	FALSE	0.043	695.000	0.038	1.000		NA
10450298	10450299	SAAV_1614	SAAV_1615	mnmA		TRUE	0.924	1.000	0.072	1.000	N	NA
10450301	10450302	SAAV_1617	SAAV_1618			FALSE	0.407	40.000	0.000	NA		NA
10450302	10450303	SAAV_1618	SAAV_1619			FALSE	0.180	100.000	0.000	NA		NA
10450305	10450306	SAAV_1621	SAAV_1622			FALSE	0.057	193.000	0.000	NA		NA
10450306	10450307	SAAV_1622	SAAV_1623		aspS	FALSE	0.217	78.000	0.000	NA		NA
10450307	10450308	SAAV_1623	SAAV_1624	aspS	hisS	TRUE	0.981	16.000	0.161	0.045	Y	NA
10450308	10450309	SAAV_1624	SAAV_1625	hisS		FALSE	0.039	461.000	0.000	1.000	N	NA
10450309	10450310	SAAV_1625	SAAV_1626			TRUE	0.929	-3.000	0.010	1.000	N	NA
10450310	10450311	SAAV_1626	SAAV_1627		relA2	TRUE	0.903	12.000	0.177	1.000	N	NA
10450311	10450312	SAAV_1627	SAAV_1628	relA2	apt	FALSE	0.075	428.000	0.068	1.000	N	NA
10450312	10450313	SAAV_1628	SAAV_1629	apt	recJ	TRUE	0.877	22.000	0.128	1.000	N	NA
10450313	10450314	SAAV_1629	SAAV_1630	recJ		FALSE	0.119	203.000	0.007	1.000	N	NA
10450314	10450315	SAAV_1630	SAAV_1631		yajC	FALSE	0.174	335.000	0.005	NA	Y	NA
10450315	10450316	SAAV_1631	SAAV_1632	yajC	tgt	TRUE	0.912	19.000	0.325	NA	N	NA
10450316	10450317	SAAV_1632	SAAV_1633	tgt	queA	TRUE	0.987	23.000	0.360	0.001	Y	NA
10450317	10450318	SAAV_1633	SAAV_1634	queA	ruvB	TRUE	0.915	2.000	0.069	1.000	N	NA
10450318	10450319	SAAV_1634	SAAV_1635	ruvB	ruvA	TRUE	0.981	32.000	0.549	0.002	Y	NA
10450319	10450320	SAAV_1635	SAAV_1636	ruvA		TRUE	0.784	14.000	0.009	1.000		NA
10450320	10450321	SAAV_1636	SAAV_1637		obgE	TRUE	0.805	10.000	0.024	1.000		NA
10450321	10450322	SAAV_1637	SAAV_1638	obgE	rpmA	FALSE	0.156	354.000	0.335	1.000		NA
10450322	10450323	SAAV_1638	SAAV_1639	rpmA		TRUE	0.960	12.000	0.203	NA	Y	NA
10450323	10450324	SAAV_1639	SAAV_1640		rplU	TRUE	0.962	6.000	0.208	NA	Y	NA
10450324	10450325	SAAV_1640	SAAV_1641	rplU		FALSE	0.100	236.000	0.008	1.000	N	NA
10450325	10450326	SAAV_1641	SAAV_1642		mreC	TRUE	0.995	0.000	0.550	0.003	Y	NA
10450326	10450327	SAAV_1642	SAAV_1643	mreC		FALSE	0.053	199.000	0.000	NA		NA
10450327	10450328	SAAV_1643	SAAV_1644			FALSE	0.232	74.000	0.000	NA		NA
10450328	10450329	SAAV_1644	SAAV_1645			FALSE	0.019	474.000	0.000	NA		NA
10450329	10450330	SAAV_1645	SAAV_1646		radC	FALSE	0.393	68.000	0.037	NA		NA
10450330	10450331	SAAV_1646	SAAV_1647	radC		TRUE	0.911	-3.000	0.000	1.000	N	NA
10450331	10450332	SAAV_1647	SAAV_1648		folC	FALSE	0.071	270.000	0.000	1.000	N	NA
10450332	10450333	SAAV_1648	SAAV_1649	folC	valS	TRUE	0.890	13.000	0.006	0.094	N	NA
10450337	10450338	SAAV_1654	SAAV_1655	hemL1	hemB	TRUE	0.944	48.000	0.126	0.003	Y	NA
10450338	10450339	SAAV_1655	SAAV_1656	hemB	hemD	TRUE	0.983	3.000	0.042	0.003	Y	NA
10450339	10450340	SAAV_1656	SAAV_1657	hemD	hemC	TRUE	0.971	22.000	0.020	0.003	Y	NA
10450340	10450341	SAAV_1657	SAAV_1658	hemC		TRUE	0.674	42.000	0.040	1.000	N	NA
10450341	10450342	SAAV_1658	SAAV_1659		hemA	TRUE	0.943	22.000	0.613	1.000	N	NA
10450342	10450343	SAAV_1659	SAAV_1660	hemA	engB	FALSE	0.102	217.000	0.020	1.000		NA
10450343	10450344	SAAV_1660	SAAV_1661	engB		FALSE	0.157	152.000	0.000	1.000		NA
10450344	10450345	SAAV_1661	SAAV_1662		clpX	FALSE	0.099	203.000	0.000	1.000	N	NA
10450345	10450346	SAAV_1662	SAAV_1663	clpX	tig	TRUE	0.735	151.000	0.033	0.002	Y	NA
10450346	10450347	SAAV_1663	SAAV_1664	tig		FALSE	0.122	163.000	0.012	NA		NA
10450347	10450348	SAAV_1664	SAAV_1665			TRUE	0.872	19.000	0.195	NA		NA
10450348	10450349	SAAV_1665	SAAV_1666		rplT	FALSE	0.209	142.000	0.004	1.000		NA
10450349	10450350	SAAV_1666	SAAV_1667	rplT	rpmI	TRUE	0.973	47.000	0.928	0.018	Y	NA
10450350	10450351	SAAV_1667	SAAV_1668	rpmI	infC	TRUE	0.971	29.000	0.652	1.000	Y	NA
10450351	10450352	SAAV_1668	SAAV_1670	infC		FALSE	0.099	229.000	0.004	1.000	N	NA
10450352	10450353	SAAV_1670	SAAV_1672		thrS	FALSE	0.041	426.000	0.000	1.000	N	NA
10450353	10450354	SAAV_1672	SAAV_1674	thrS	dnaI	FALSE	0.085	413.000	0.000	0.093	N	NA
10450354	10450355	SAAV_1674	SAAV_1675	dnaI		TRUE	0.991	0.000	0.817	NA	Y	NA
10450355	10450356	SAAV_1675	SAAV_1676		nrdR	TRUE	0.912	1.000	0.109	NA	N	NA
10450356	10450357	SAAV_1676	SAAV_1677	nrdR	gapA2	FALSE	0.077	211.000	0.004	NA	N	NA
10450357	10450358	SAAV_1677	SAAV_1678	gapA2	coaE	FALSE	0.192	170.000	0.020	1.000	N	NA
10450358	10450359	SAAV_1678	SAAV_1679	coaE	fpg	TRUE	0.878	16.000	0.066	1.000	N	NA
10450359	10450360	SAAV_1679	SAAV_1680	fpg	polA	TRUE	0.963	16.000	0.101	1.000	Y	NA
10450360	10450361	SAAV_1680	SAAV_1681	polA		FALSE	0.032	294.000	0.000	NA		NA
10450361	10450362	SAAV_1681	SAAV_1682			FALSE	0.019	499.000	0.000	NA		NA
10450362	10450363	SAAV_1682	SAAV_1683		phoP	TRUE	0.988	-3.000	0.159	1.000	Y	NA
10450363	10450364	SAAV_1683	SAAV_1684	phoP	icd	FALSE	0.045	390.000	0.000	1.000	N	NA
10450364	10450365	SAAV_1684	SAAV_1685	icd	gltA	TRUE	0.892	49.000	0.140	1.000	Y	NA
10450367	10450368	SAAV_1687	SAAV_1688	pyk	pfkA	TRUE	0.983	22.000	0.261	0.005	Y	NA
10450368	10450369	SAAV_1688	SAAV_1689	pfkA		FALSE	0.036	401.000	0.000	1.000		NA
10450369	10450370	SAAV_1689	SAAV_1690			FALSE	0.130	131.000	0.000	NA		NA
10450370	10450371	SAAV_1690	SAAV_1691			FALSE	0.167	111.000	0.000	NA		NA
10450371	10450372	SAAV_1691	SAAV_1692			FALSE	0.367	47.000	0.000	NA		NA
10450372	10450373	SAAV_1692	SAAV_1693			TRUE	0.640	6.000	0.000	NA		NA
10450373	10450374	SAAV_1693	SAAV_1694			TRUE	0.893	-10.000	0.000	NA		NA
10450374	10450375	SAAV_1694	SAAV_1695			TRUE	0.596	23.000	0.000	NA		NA
10450375	10450376	SAAV_1695	SAAV_1696			TRUE	0.637	19.000	0.000	NA		NA
10450376	10450377	SAAV_1696	SAAV_1697			TRUE	0.681	4.000	0.000	NA		NA
10450377	10450378	SAAV_1697	SAAV_1698			TRUE	0.656	5.000	0.000	NA		NA
10450378	10450379	SAAV_1698	SAAV_1699			TRUE	0.837	-3.000	0.000	NA		NA
10450379	10450380	SAAV_1699	SAAV_1700			TRUE	0.681	4.000	0.000	NA		NA
10450380	10450381	SAAV_1700	SAAV_1701			TRUE	0.630	12.000	0.000	NA		NA
10450381	10450382	SAAV_1701	SAAV_1702			FALSE	0.453	35.000	0.000	NA		NA
10450382	10450383	SAAV_1702	SAAV_1703			TRUE	0.640	6.000	0.000	NA		NA
10450383	10450384	SAAV_1703	SAAV_1704			TRUE	0.656	5.000	0.000	NA		NA
10450384	10450385	SAAV_1704	SAAV_1705			FALSE	0.091	161.000	0.000	NA		NA
10450385	10450386	SAAV_1705	SAAV_1706			FALSE	0.067	180.000	0.000	NA		NA
10450386	10450387	SAAV_1706	SAAV_1707			TRUE	0.681	4.000	0.000	NA		NA
10450387	10450388	SAAV_1707	SAAV_1708			FALSE	0.407	40.000	0.000	NA		NA
10450388	10450389	SAAV_1708	SAAV_1709		accA	FALSE	0.017	639.000	0.000	NA		NA
10450389	10450390	SAAV_1709	SAAV_1710	accA	accD	TRUE	0.994	0.000	0.234	0.001	Y	NA
10450390	10450391	SAAV_1710	SAAV_1711	accD		FALSE	0.130	195.000	0.010	1.000	N	NA
10450391	10450392	SAAV_1711	SAAV_1712		dnaE	FALSE	0.087	450.000	0.127	1.000	N	NA
10450392	10450393	SAAV_1712	SAAV_1713	dnaE		TRUE	0.881	21.000	0.159	1.000		NA
10450393	10450394	SAAV_1713	SAAV_1714			FALSE	0.108	312.000	0.113	1.000		NA
10450398	10450399	SAAV_1718	SAAV_1719		ald2	FALSE	0.139	124.000	0.000	NA		NA
10450401	10450402	SAAV_1721	SAAV_1722	ackA		TRUE	0.600	88.000	0.217	1.000	N	NA
10450402	10450403	SAAV_1722	SAAV_1723		tpx	FALSE	0.400	123.000	0.089	1.000	N	NA
10450403	10450404	SAAV_1723	SAAV_1724	tpx		FALSE	0.325	98.000	0.009	1.000		NA
10450404	10450405	SAAV_1724	SAAV_1725		thiI	TRUE	0.582	44.000	0.016	1.000		NA
10450405	10450406	SAAV_1725	SAAV_1726	thiI		TRUE	0.968	0.000	0.349	1.000	N	NA
10450409	10450410	SAAV_1729	SAAV_1730		rpsD	FALSE	0.066	244.000	0.005	NA	N	NA
10450412	10450413	SAAV_1732	SAAV_1733			FALSE	0.357	115.000	0.027	1.000	N	NA
10450413	10450414	SAAV_1733	SAAV_1734		serA	TRUE	0.992	-13.000	0.113	1.000	Y	NA
10450415	10450416	SAAV_1735	SAAV_1736			FALSE	0.325	107.000	0.062	NA		NA
10450416	10450417	SAAV_1736	SAAV_1737			FALSE	0.310	128.000	0.025	1.000	N	NA
10450421	10450422	SAAV_1741	SAAV_1742		fhs	FALSE	0.045	333.000	0.000	1.000		NA
10450422	10450423	SAAV_1742	SAAV_1743	fhs	acs	FALSE	0.040	440.000	0.000	1.000	N	NA
10450424	10450425	SAAV_1744	SAAV_1745	acuA	acuC	TRUE	0.821	25.000	0.075	1.000		NA
10450426	10450427	SAAV_1746	SAAV_1747	ccpA		FALSE	0.046	540.000	0.017	1.000	N	NA
10450427	10450428	SAAV_1747	SAAV_1748			FALSE	0.016	694.000	0.000	NA		NA
10450428	10450429	SAAV_1748	SAAV_1749			TRUE	0.559	74.000	0.222	NA		NA
10450429	10450430	SAAV_1749	SAAV_1750		murC	FALSE	0.312	74.000	0.014	NA		NA
10450430	10450431	SAAV_1750	SAAV_1751	murC		TRUE	0.908	24.000	0.017	0.006	N	NA
10450431	10450432	SAAV_1751	SAAV_1752			TRUE	0.875	21.000	0.143	1.000		NA
10450432	10450433	SAAV_1752	SAAV_1753			TRUE	0.888	29.000	0.511	NA		NA
10450433	10450434	SAAV_1753	SAAV_1754			TRUE	0.602	100.000	0.500	NA		NA
10450434	10450435	SAAV_1754	SAAV_1755		pepA1	TRUE	0.596	65.000	0.081	1.000	N	NA
10450437	10450438	SAAV_1757	SAAV_1758		trmB	FALSE	0.072	471.000	0.117	1.000		NA
10450438	10450439	SAAV_1758	SAAV_1759	trmB		TRUE	0.863	15.000	0.154	NA		NA
10450439	10450440	SAAV_1759	SAAV_1760		dat	FALSE	0.022	616.000	0.000	NA	N	NA
10450440	10450441	SAAV_1760	SAAV_1761	dat		TRUE	0.970	4.000	0.143	1.000	Y	NA
10450441	10450442	SAAV_1761	SAAV_1762			FALSE	0.018	558.000	0.000	NA		NA
10450442	10450443	SAAV_1762	SAAV_1763			TRUE	0.892	17.000	0.233	NA		NA
10450443	10450444	SAAV_1763	SAAV_1764			TRUE	0.966	-3.000	0.233	1.000		NA
10450446	10450447	SAAV_1766	SAAV_1767			FALSE	0.037	326.000	0.000	NA	N	NA
10450447	10450448	SAAV_1767	SAAV_1768		leuS	TRUE	0.721	22.000	0.007	NA	N	NA
10450448	10450449	SAAV_1768	SAAV_1770	leuS		FALSE	0.043	288.000	0.000	NA	N	NA
10450450	10450451	SAAV_1771	SAAV_1772			TRUE	0.975	-3.000	0.408	1.000		NA
10450452	10450453	SAAV_1773	SAAV_1774	rot		FALSE	0.019	474.000	0.000	NA		NA
10450453	10450454	SAAV_1774	SAAV_1775			TRUE	0.711	3.000	0.000	NA		NA
10450456	10450457	SAAV_1777	SAAV_1778	ribH	ribBA	TRUE	0.975	13.000	0.022	0.002	Y	NA
10450457	10450458	SAAV_1778	SAAV_1779	ribBA	ribE	TRUE	0.946	11.000	0.026	1.000	Y	NA
10450458	10450459	SAAV_1779	SAAV_1780	ribE	ribD	TRUE	0.977	7.000	0.456	1.000	Y	NA
10450459	10450460	SAAV_1780	SAAV_1782	ribD		FALSE	0.019	493.000	0.000	NA		NA
10450461	10450462	SAAV_1783	SAAV_1784	arsR	arsB	TRUE	0.884	0.000	0.000	1.000	N	NA
10450463	10450464	SAAV_1785	SAAV_1786			FALSE	0.036	276.000	0.000	NA		NA
10450465	10450466	SAAV_1787	SAAV_1788			FALSE	0.069	413.000	0.150	NA		NA
10450470	10450471	SAAV_1792	SAAV_1793		crcB	FALSE	0.123	178.000	0.034	NA		NA
10450471	10450472	SAAV_1793	SAAV_1794	crcB		TRUE	0.990	-3.000	0.069	0.070	Y	NA
10450472	10450473	SAAV_1794	SAAV_1795			FALSE	0.017	648.000	0.000	NA		NA
10450473	10450474	SAAV_1795	SAAV_1796			FALSE	0.020	439.000	0.000	NA		NA
10450475	10450476	SAAV_1797	SAAV_1798			FALSE	0.175	212.000	0.222	NA		NA
10450476	10450477	SAAV_1798	SAAV_1799		metK	FALSE	0.266	122.000	0.054	NA		NA
10450479	10450480	SAAV_1802	SAAV_1803			TRUE	0.903	5.000	0.182	1.000		NA
10450482	10450483	SAAV_1805	SAAV_1806			TRUE	0.850	5.000	0.029	1.000	N	NA
10450483	10450484	SAAV_1806	SAAV_1807			FALSE	0.093	159.000	0.000	NA		NA
10450485	10450486	SAAV_1808	SAAV_1809			FALSE	0.210	81.000	0.000	NA		NA
10450486	10450487	SAAV_1809	SAAV_1810			FALSE	0.227	75.000	0.000	NA		NA
10450487	10450488	SAAV_1810	SAAV_1811			FALSE	0.400	41.000	0.000	NA		NA
10450488	10450489	SAAV_1811	SAAV_1812			FALSE	0.178	101.000	0.000	NA		NA
10450490	10450491	SAAV_1813	SAAV_1814			FALSE	0.058	1031.000	0.000	0.050		NA
10450491	10450492	SAAV_1814	SAAV_1815		hsdS	FALSE	0.075	452.000	0.000	0.050		NA
10450492	10450493	SAAV_1815	SAAV_1816	hsdS	hsdM	TRUE	0.991	-7.000	0.011	0.050	Y	NA
10450493	10450494	SAAV_1816	SAAV_1817	hsdM		FALSE	0.049	361.000	0.000	1.000	N	NA
10450494	10450495	SAAV_1817	SAAV_1818			TRUE	0.781	158.000	0.200	0.004	Y	NA
10450495	10450496	SAAV_1818	SAAV_1819		splC	TRUE	0.854	121.000	0.200	0.004	Y	NA
10450496	10450497	SAAV_1819	SAAV_1820	splC	splB	TRUE	0.937	58.000	0.200	0.004	Y	NA
10450497	10450498	SAAV_1820	SAAV_1821	splB	splA	TRUE	0.845	125.000	0.200	0.004	Y	NA
10450499	10450500	SAAV_1822	SAAV_1823			FALSE	0.106	150.000	0.000	NA		NA
10450502	10450503	SAAV_1825	SAAV_1826			TRUE	0.840	5.000	0.103	NA		NA
10450504	10450505	SAAV_1827	SAAV_1828		lukD	FALSE	0.040	258.000	0.000	NA		NA
10450505	10450506	SAAV_1828	SAAV_1829	lukD	lukE	TRUE	0.937	2.000	0.000	0.004		NA
10450507	10450508	SAAV_1830	SAAV_1831			FALSE	0.015	980.000	0.000	NA		NA
10450508	10450509	SAAV_1831	SAAV_1832			FALSE	0.217	78.000	0.000	NA		NA
10450509	10450510	SAAV_1832	SAAV_1833			TRUE	0.884	21.000	0.276	NA		NA
10450511	10450512	SAAV_1834	SAAV_1835	seg	sen	FALSE	0.142	283.000	0.000	0.015		NA
10450512	10450513	SAAV_1835	SAAV_1836	sen	yent1	FALSE	0.134	297.000	0.000	0.015		NA
10450513	10450514	SAAV_1836	SAAV_1837	yent1	yent2	TRUE	0.980	-25.000	0.000	0.015		NA
10450514	10450515	SAAV_1837	SAAV_1838	yent2	sei	FALSE	0.197	208.000	0.000	0.015		NA
10450515	10450516	SAAV_1838	SAAV_1839	sei	sem	TRUE	0.795	35.000	0.000	0.015		NA
10450516	10450517	SAAV_1839	SAAV_1840	sem	seo	FALSE	0.143	281.000	0.000	0.015		NA
10450517	10450518	SAAV_1840	SAAV_1841	seo		FALSE	0.044	229.000	0.000	NA		NA
10450518	10450519	SAAV_1841	SAAV_1841a			FALSE	0.325	55.000	0.000	NA		NA
10450519	10450520	SAAV_1841a	SAAV_1842			TRUE	0.740	2.000	0.000	NA		NA
10450520	10450521	SAAV_1842	SAAV_1843			TRUE	0.658	17.000	0.000	NA		NA
10450521	10450522	SAAV_1843	SAAV_1844			TRUE	0.631	14.000	0.000	NA		NA
10450522	10450523	SAAV_1844	SAAV_1845			TRUE	0.629	10.000	0.000	NA		NA
10450523	10450524	SAAV_1845	SAAV_1846			TRUE	0.658	17.000	0.000	NA		NA
10450524	10450525	SAAV_1846	SAAV_1847			TRUE	0.637	19.000	0.000	NA		NA
10450525	10450526	SAAV_1847	SAAV_1848			FALSE	0.022	401.000	0.000	NA		NA
10450528	10450529	SAAV_1850	SAAV_1851	hemG	hemH	TRUE	0.946	24.000	0.069	1.000	Y	NA
10450529	10450530	SAAV_1851	SAAV_1852	hemH	hemE	TRUE	0.865	58.000	0.131	1.000	Y	NA
10450530	10450531	SAAV_1852	SAAV_1853	hemE		TRUE	0.893	-10.000	0.000	NA		NA
10450533	10450534	SAAV_1855	SAAV_1856			TRUE	0.954	-7.000	0.083	NA	N	NA
10450535	10450536	SAAV_1857	SAAV_1858			FALSE	0.291	142.000	0.137	NA		NA
10450536	10450537	SAAV_1858	SAAV_1859			FALSE	0.058	735.000	0.190	NA		NA
10450537	10450538	SAAV_1859	SAAV_1860			FALSE	0.051	205.000	0.000	NA		NA
10450539	10450540	SAAV_1861	SAAV_1862	cbf1		TRUE	0.962	-3.000	0.291	NA		NA
10450540	10450541	SAAV_1862	SAAV_1863			TRUE	0.978	-10.000	0.330	NA		NA
10450541	10450542	SAAV_1863	SAAV_1864			FALSE	0.040	928.000	0.093	NA		NA
10450542	10450543	SAAV_1864	SAAV_1865			TRUE	0.635	69.000	0.321	NA		NA
10450543	10450544	SAAV_1865	SAAV_1866			FALSE	0.115	179.000	0.029	NA		NA
10450544	10450545	SAAV_1866	SAAV_1867			FALSE	0.296	356.000	0.000	0.015	Y	NA
10450545	10450546	SAAV_1867	SAAV_1868			TRUE	0.987	22.000	0.536	0.010	Y	NA
10450548	10450549	SAAV_1870	SAAV_1871	fumC		FALSE	0.075	196.000	0.009	NA		NA
10450549	10450550	SAAV_1871	SAAV_1872			FALSE	0.118	548.000	0.571	NA		NA
10450550	10450551	SAAV_1872	SAAV_1873			TRUE	0.689	25.000	0.021	NA		NA
10450551	10450552	SAAV_1873	SAAV_1874			FALSE	0.224	159.000	0.021	1.000	N	NA
10450552	10450553	SAAV_1874	SAAV_1875			TRUE	0.881	5.000	0.077	1.000	N	NA
10450553	10450554	SAAV_1875	SAAV_1876			FALSE	0.315	136.000	0.044	1.000	N	NA
10450554	10450555	SAAV_1876	SAAV_1877			TRUE	0.993	-13.000	0.154	1.000	Y	NA
10450555	10450556	SAAV_1877	SAAV_1878			FALSE	0.123	258.000	0.077	1.000		NA
10450558	10450559	SAAV_1880	SAAV_1881			FALSE	0.413	39.000	0.000	NA		NA
10450559	10450560	SAAV_1881	SAAV_1882			TRUE	0.631	14.000	0.000	NA		NA
10450560	10450561	SAAV_1882	SAAV_1883			TRUE	0.631	14.000	0.000	NA		NA
10450561	10450562	SAAV_1883	SAAV_1884			TRUE	0.659	16.000	0.000	NA		NA
10450562	10450563	SAAV_1884	SAAV_1885			TRUE	0.630	8.000	0.000	NA		NA
10450563	10450564	SAAV_1885	SAAV_1886			TRUE	0.711	3.000	0.000	NA		NA
10450564	10450565	SAAV_1886	SAAV_1887			TRUE	0.630	8.000	0.000	NA		NA
10450565	10450566	SAAV_1887	SAAV_1888			TRUE	0.761	1.000	0.000	NA		NA
10450566	10450567	SAAV_1888	SAAV_1889			TRUE	0.629	11.000	0.000	NA		NA
10450567	10450568	SAAV_1889	SAAV_1890			TRUE	0.656	5.000	0.000	NA		NA
10450568	10450569	SAAV_1890	SAAV_1891			TRUE	0.681	4.000	0.000	NA		NA
10450569	10450570	SAAV_1891	SAAV_1892			TRUE	0.647	18.000	0.000	NA		NA
10450570	10450571	SAAV_1892	SAAV_1893			TRUE	0.647	18.000	0.000	NA		NA
10450571	10450572	SAAV_1893	SAAV_1894			TRUE	0.626	13.000	0.000	NA		NA
10450572	10450573	SAAV_1894	SAAV_1895			FALSE	0.430	37.000	0.000	NA		NA
10450573	10450574	SAAV_1895	SAAV_1896			TRUE	0.640	6.000	0.000	NA		NA
10450574	10450575	SAAV_1896	SAAV_1897			TRUE	0.640	6.000	0.000	NA		NA
10450575	10450576	SAAV_1897	SAAV_1898			TRUE	0.568	26.000	0.000	NA		NA
10450576	10450577	SAAV_1898	SAAV_1899			TRUE	0.618	21.000	0.000	NA		NA
10450577	10450578	SAAV_1899	SAAV_1900			TRUE	0.631	14.000	0.000	NA		NA
10450578	10450579	SAAV_1900	SAAV_1901			TRUE	0.640	6.000	0.000	NA		NA
10450579	10450580	SAAV_1901	SAAV_1902			TRUE	0.658	17.000	0.000	NA		NA
10450580	10450581	SAAV_1902	SAAV_1902a			TRUE	0.629	10.000	0.000	NA		NA
10450581	10450582	SAAV_1902a	SAAV_1903			TRUE	0.681	4.000	0.000	NA		NA
10450582	10450583	SAAV_1903	SAAV_1904			TRUE	0.681	4.000	0.000	NA		NA
10450583	10450584	SAAV_1904	SAAV_1905			TRUE	0.656	5.000	0.000	NA		NA
10450584	10450585	SAAV_1905	SAAV_1906			TRUE	0.659	16.000	0.000	NA		NA
10450585	10450586	SAAV_1906	SAAV_1907			TRUE	0.630	12.000	0.000	NA		NA
10450586	10450587	SAAV_1907	SAAV_1907a			FALSE	0.088	162.000	0.000	NA		NA
10450587	10450588	SAAV_1907a	SAAV_1908			FALSE	0.048	213.000	0.000	NA		NA
10450588	10450589	SAAV_1908	SAAV_1909			TRUE	0.658	17.000	0.000	NA		NA
10450589	10450590	SAAV_1909	SAAV_1910			FALSE	0.197	89.000	0.000	NA		NA
10450590	10450591	SAAV_1910	SAAV_1911			FALSE	0.016	741.000	0.000	NA		NA
10450591	10450592	SAAV_1911	SAAV_1912			TRUE	0.529	97.000	0.146	1.000	N	NA
10450592	10450593	SAAV_1912	SAAV_1913		bcp	TRUE	0.827	6.000	0.017	1.000	N	NA
10450594	10450595	SAAV_1914	SAAV_1915	hemL2		FALSE	0.070	344.000	0.102	NA		NA
10450596	10450597	SAAV_1916	SAAV_1917			FALSE	0.090	291.000	0.077	NA	N	NA
10450597	10450598	SAAV_1917	SAAV_1918		mutY	FALSE	0.055	303.000	0.011	NA	N	NA
10450600	10450601	SAAV_1920	SAAV_1921			TRUE	0.936	9.000	0.727	NA		NA
10450601	10450602	SAAV_1921	SAAV_1922			TRUE	0.875	15.000	0.186	NA		NA
10450602	10450603	SAAV_1922	SAAV_1923		recX	TRUE	0.954	-22.000	0.045	NA		NA
10450603	10450604	SAAV_1923	SAAV_1924	recX		FALSE	0.076	260.000	0.004	1.000		NA
10450604	10450605	SAAV_1924	SAAV_1925			FALSE	0.044	340.000	0.000	1.000		NA
10450605	10450606	SAAV_1925	SAAV_1926			FALSE	0.268	131.000	0.074	NA		NA
10450607	10450608	SAAV_1927	SAAV_1928			FALSE	0.141	123.000	0.000	NA		NA
10450608	10450609	SAAV_1928	SAAV_1929			FALSE	0.103	151.000	0.000	NA		NA
10450609	10450610	SAAV_1929	SAAV_1930			TRUE	0.631	14.000	0.000	NA		NA
10450610	10450611	SAAV_1930	SAAV_1931			FALSE	0.072	175.000	0.000	NA		NA
10450611	10450612	SAAV_1931	SAAV_1932			FALSE	0.291	61.000	0.000	NA		NA
10450612	10450613	SAAV_1932	SAAV_1933			TRUE	0.656	5.000	0.000	NA		NA
10450613	10450614	SAAV_1933	SAAV_1934			TRUE	0.630	12.000	0.000	NA		NA
10450614	10450615	SAAV_1934	SAAV_1935			FALSE	0.453	35.000	0.000	NA		NA
10450615	10450616	SAAV_1935	SAAV_1936			FALSE	0.330	54.000	0.000	NA		NA
10450616	10450617	SAAV_1936	SAAV_1937			TRUE	0.656	5.000	0.000	NA		NA
10450617	10450618	SAAV_1937	SAAV_1938			TRUE	0.893	-10.000	0.000	NA		NA
10450618	10450619	SAAV_1938	SAAV_1939			TRUE	0.633	7.000	0.000	NA		NA
10450619	10450620	SAAV_1939	SAAV_1940			FALSE	0.319	56.000	0.000	NA		NA
10450620	10450621	SAAV_1940	SAAV_1941			FALSE	0.170	109.000	0.000	NA		NA
10450621	10450622	SAAV_1941	SAAV_1942			TRUE	0.575	68.000	0.000	0.048		NA
10450623	10450624	SAAV_1943	SAAV_1944		pepS	TRUE	0.659	90.000	0.545	NA	N	NA
10450624	10450625	SAAV_1944	SAAV_1945	pepS		TRUE	0.836	12.000	0.125	NA		NA
10450626	10450627	SAAV_1946	SAAV_1947			TRUE	0.711	7.000	0.010	NA		NA
10450627	10450628	SAAV_1947	SAAV_1948			FALSE	0.035	278.000	0.000	NA		NA
10450629	10450630	SAAV_1949	SAAV_1950	vraR	vraS	TRUE	0.998	-10.000	0.853	0.010	Y	NA
10450630	10450631	SAAV_1950	SAAV_1951	vraS		TRUE	0.977	-3.000	0.679	NA		NA
10450631	10450632	SAAV_1951	SAAV_1952			TRUE	0.826	15.000	0.086	NA		NA
10450632	10450633	SAAV_1952	SAAV_1953			FALSE	0.094	217.000	0.051	NA		NA
10450635	10450636	SAAV_1955	SAAV_1956			FALSE	0.045	225.000	0.000	NA		NA
10450636	10450637	SAAV_1956	SAAV_1957			TRUE	0.969	2.000	0.796	1.000		NA
10450641	10450642	SAAV_1961	SAAV_1962	dinP		FALSE	0.061	247.000	0.015	NA		NA
10450642	10450643	SAAV_1962	SAAV_1963		rumA	FALSE	0.152	170.000	0.047	NA		NA
10450643	10450644	SAAV_1963	SAAV_1964	rumA		TRUE	0.655	81.000	0.299	1.000	N	NA
10450644	10450645	SAAV_1964	SAAV_1965		gatB	FALSE	0.047	768.000	0.034	1.000	N	NA
10450645	10450646	SAAV_1965	SAAV_1966	gatB	gatA	TRUE	0.990	13.000	0.492	0.001	Y	NA
10450646	10450647	SAAV_1966	SAAV_1967	gatA	gatC	TRUE	0.995	2.000	0.643	0.001	Y	NA
10450649	10450650	SAAV_1969	SAAV_1970	camS	ligA	TRUE	0.748	13.000	0.030	NA		NA
10450650	10450651	SAAV_1970	SAAV_1971	ligA	pcrA	TRUE	0.982	4.000	0.103	0.012	Y	NA
10450651	10450652	SAAV_1971	SAAV_1972	pcrA		TRUE	0.940	-3.000	0.054	1.000		NA
10450652	10450653	SAAV_1972	SAAV_1973			FALSE	0.176	172.000	0.031	1.000		NA
10450653	10450654	SAAV_1973	SAAV_1974		purB	FALSE	0.296	109.000	0.006	1.000		NA
10450655	10450656	SAAV_1975	SAAV_1976	sspB2		TRUE	0.620	31.000	0.000	1.000		NA
10450657	10450658	SAAV_1977	SAAV_1978			TRUE	0.978	-19.000	0.258	NA		NA
10450658	10450659	SAAV_1978	SAAV_1979		nadE	FALSE	0.059	271.000	0.023	NA		NA
10450659	10450660	SAAV_1979	SAAV_1980	nadE		TRUE	0.996	-7.000	0.194	0.001	Y	NA
10450661	10450662	SAAV_1981	SAAV_1982		pheA	TRUE	0.944	20.000	0.022	1.000	Y	NA
10450663	10450664	SAAV_1983	SAAV_1984			FALSE	0.051	205.000	0.000	NA		NA
10450665	10450666	SAAV_1985	SAAV_1986		ppaC	TRUE	0.582	53.000	0.020	1.000	N	NA
10450673	10450674	SAAV_1993	SAAV_1994			TRUE	0.974	-3.000	0.545	NA		NA
10450674	10450675	SAAV_1994	SAAV_1995			TRUE	0.770	60.000	0.636	NA		NA
10450677	10450678	SAAV_1997	SAAV_1998			TRUE	0.967	0.000	0.615	NA		NA
10450678	10450679	SAAV_1998	SAAV_1999			TRUE	0.837	-3.000	0.000	NA		NA
10450679	10450680	SAAV_1999	SAAV_2000			TRUE	0.761	1.000	0.000	NA		NA
10450680	10450681	SAAV_2000	SAAV_2001			TRUE	0.973	-3.000	0.292	1.000	N	NA
10450681	10450682	SAAV_2001	SAAV_2002			FALSE	0.110	258.000	0.125	NA		NA
10450682	10450683	SAAV_2002	SAAV_2003			FALSE	0.190	243.000	0.333	NA		NA
10450685	10450686	SAAV_2005	SAAV_2006	map	map	TRUE	0.648	15.000	0.000	NA		NA
10450688	10450689	SAAV_2008	SAAV_2009			FALSE	0.016	677.000	0.000	NA		NA
10450689	10450690	SAAV_2009	SAAV_2010			FALSE	0.026	345.000	0.000	NA		NA
10450690	10450691	SAAV_2010	SAAV_2011			TRUE	0.629	11.000	0.000	NA		NA
10450691	10450692	SAAV_2011	SAAV_2012			FALSE	0.018	539.000	0.000	NA		NA
10450692	10450693	SAAV_2012	SAAV_2013			FALSE	0.372	46.000	0.000	NA		NA
10450693	10450694	SAAV_2013	SAAV_2014			TRUE	0.874	-7.000	0.000	NA		NA
10450694	10450695	SAAV_2014	SAAV_2015			TRUE	0.792	0.000	0.000	NA		NA
10450695	10450696	SAAV_2015	SAAV_2016			TRUE	0.792	0.000	0.000	NA		NA
10450696	10450697	SAAV_2016	SAAV_2017			TRUE	0.659	16.000	0.000	NA		NA
10450697	10450698	SAAV_2017	SAAV_2018			TRUE	0.792	0.000	0.000	NA		NA
10450698	10450699	SAAV_2018	SAAV_2019			TRUE	0.946	9.000	1.000	NA		NA
10450699	10450700	SAAV_2019	SAAV_2020			TRUE	0.929	0.000	0.154	NA		NA
10450700	10450701	SAAV_2020	SAAV_2021			TRUE	0.631	14.000	0.000	NA		NA
10450701	10450702	SAAV_2021	SAAV_2022			TRUE	0.795	42.000	0.400	NA		NA
10450702	10450703	SAAV_2022	SAAV_2023			TRUE	0.725	58.000	0.400	NA		NA
10450703	10450704	SAAV_2023	SAAV_2024			FALSE	0.444	92.000	0.154	NA		NA
10450704	10450705	SAAV_2024	SAAV_2025			TRUE	0.865	35.000	0.615	NA		NA
10450705	10450706	SAAV_2025	SAAV_2026			TRUE	0.930	1.000	0.222	NA		NA
10450706	10450707	SAAV_2026	SAAV_2027			TRUE	0.959	-3.000	0.250	NA		NA
10450707	10450708	SAAV_2027	SAAV_2028			TRUE	0.630	12.000	0.000	NA		NA
10450708	10450709	SAAV_2028	SAAV_2029			FALSE	0.249	69.000	0.000	NA		NA
10450709	10450710	SAAV_2029	SAAV_2030			TRUE	0.942	12.000	0.846	NA		NA
10450710	10450711	SAAV_2030	SAAV_2031			TRUE	0.989	-16.000	0.846	NA		NA
10450711	10450712	SAAV_2031	SAAV_2032			TRUE	0.941	5.000	0.692	NA		NA
10450712	10450713	SAAV_2032	SAAV_2033			TRUE	0.971	-10.000	0.200	NA		NA
10450713	10450714	SAAV_2033	SAAV_2034			FALSE	0.136	127.000	0.000	NA		NA
10450714	10450715	SAAV_2034	SAAV_2035			FALSE	0.098	155.000	0.000	NA		NA
10450715	10450716	SAAV_2035	SAAV_2036			TRUE	0.543	28.000	0.000	NA		NA
10450716	10450717	SAAV_2036	SAAV_2037			TRUE	0.792	0.000	0.000	NA		NA
10450717	10450718	SAAV_2037	SAAV_2038			TRUE	0.837	-3.000	0.000	NA		NA
10450718	10450719	SAAV_2038	SAAV_2039			FALSE	0.430	37.000	0.000	NA		NA
10450719	10450720	SAAV_2039	SAAV_2040			TRUE	0.874	-7.000	0.000	NA		NA
10450720	10450721	SAAV_2040	SAAV_2041			TRUE	0.893	-10.000	0.000	NA		NA
10450721	10450722	SAAV_2041	SAAV_2042			TRUE	0.648	15.000	0.000	NA		NA
10450722	10450723	SAAV_2042	SAAV_2043			FALSE	0.123	136.000	0.000	NA		NA
10450723	10450724	SAAV_2043	SAAV_2044			TRUE	0.761	1.000	0.000	NA		NA
10450724	10450725	SAAV_2044	SAAV_2045			FALSE	0.020	469.000	0.000	NA		NA
10450725	10450726	SAAV_2045	SAAV_2046			FALSE	0.281	63.000	0.000	NA		NA
10450726	10450727	SAAV_2046	SAAV_2047			TRUE	0.837	-3.000	0.000	NA		NA
10450727	10450728	SAAV_2047	SAAV_2048			TRUE	0.762	22.000	0.047	NA		NA
10450728	10450729	SAAV_2048	SAAV_2049			TRUE	0.626	20.000	0.000	NA		NA
10450729	10450730	SAAV_2049	SAAV_2050			TRUE	0.790	23.000	0.083	NA		NA
10450730	10450731	SAAV_2050	SAAV_2051			TRUE	0.629	11.000	0.000	NA		NA
10450731	10450732	SAAV_2051	SAAV_2052			TRUE	0.626	13.000	0.000	NA		NA
10450732	10450733	SAAV_2052	SAAV_2053			TRUE	0.596	23.000	0.000	NA		NA
10450733	10450734	SAAV_2053	SAAV_2054			TRUE	0.630	8.000	0.000	NA		NA
10450734	10450735	SAAV_2054	SAAV_2055			FALSE	0.182	99.000	0.000	NA		NA
10450735	10450736	SAAV_2055	SAAV_2056			TRUE	0.837	-3.000	0.000	NA		NA
10450736	10450737	SAAV_2056	SAAV_2057			FALSE	0.103	151.000	0.000	NA		NA
10450739	10450740	SAAV_2059	SAAV_2060			TRUE	0.648	15.000	0.000	NA		NA
10450740	10450741	SAAV_2060	SAAV_2061			TRUE	0.626	13.000	0.000	NA		NA
10450742	10450743	SAAV_2062	SAAV_2063			TRUE	0.626	13.000	0.000	NA		NA
10450743	10450744	SAAV_2063	SAAV_2064			TRUE	0.658	17.000	0.000	NA		NA
10450744	10450745	SAAV_2064	SAAV_2065			FALSE	0.249	69.000	0.000	NA		NA
10450745	10450746	SAAV_2065	SAAV_2066			FALSE	0.030	321.000	0.000	NA		NA
10450746	10450747	SAAV_2066	SAAV_2067			FALSE	0.182	99.000	0.000	NA		NA
10450747	10450748	SAAV_2067	SAAV_2068			FALSE	0.027	340.000	0.000	NA		NA
10450748	10450749	SAAV_2068	SAAV_2069			TRUE	0.734	13.000	0.000	1.000		NA
10450749	10450750	SAAV_2069	SAAV_2070			FALSE	0.137	162.000	0.000	1.000		NA
10450750	10450751	SAAV_2070	SAAV_2071		hlb	FALSE	0.428	57.000	0.000	1.000		NA
10450752	10450753	SAAV_2072	SAAV_2073			TRUE	0.889	22.000	0.000	0.004		NA
10450754	10450755	SAAV_2074	SAAV_2075			FALSE	0.045	386.000	0.000	1.000	N	NA
10450756	10450757	SAAV_2076	SAAV_2077	groEL	groES	TRUE	0.931	76.000	0.674	0.086	Y	NA
10450760	10450761	SAAV_2080	SAAV_2081			FALSE	0.098	361.000	0.138	1.000		NA
10450762	10450763	SAAV_2082	SAAV_2083			TRUE	0.917	-169.000	0.000	NA		NA
10450764	10450765	SAAV_2084	SAAV_2085	agrB	agrD	TRUE	0.913	3.000	0.225	NA		NA
10450765	10450766	SAAV_2085	SAAV_2086	agrD	agrC	TRUE	0.828	30.000	0.250	NA		NA
10450766	10450767	SAAV_2086	SAAV_2087	agrC	agrA	TRUE	0.984	19.000	0.875	1.000	Y	NA
10450768	10450769	SAAV_2088	SAAV_2089		cscA	TRUE	0.991	-3.000	0.364	1.000	Y	NA
10450769	10450770	SAAV_2089	SAAV_2090	cscA	scrR	FALSE	0.315	149.000	0.070	1.000	N	NA
10450770	10450771	SAAV_2090	SAAV_2091	scrR		FALSE	0.205	183.000	0.070	1.000	N	NA
10450771	10450772	SAAV_2091	SAAV_2092			FALSE	0.144	208.000	0.040	1.000	N	NA
10450772	10450773	SAAV_2092	SAAV_2093			TRUE	0.723	60.000	0.419	NA		NA
10450773	10450774	SAAV_2093	SAAV_2094			FALSE	0.032	304.000	0.000	NA		NA
10450775	10450776	SAAV_2095	SAAV_2096			FALSE	0.087	361.000	0.000	0.086		NA
10450777	10450778	SAAV_2097	SAAV_2098			TRUE	0.961	-7.000	0.090	1.000		NA
10450778	10450779	SAAV_2098	SAAV_2099			TRUE	0.874	12.000	0.127	1.000		NA
10450779	10450780	SAAV_2099	SAAV_2100			TRUE	0.976	-19.000	0.217	NA		NA
10450781	10450782	SAAV_2101	SAAV_2102	ilvD	ilvB	TRUE	0.973	28.000	0.089	0.001	Y	NA
10450782	10450783	SAAV_2102	SAAV_2103	ilvB		TRUE	0.966	0.000	0.013	0.001		NA
10450783	10450784	SAAV_2103	SAAV_2104		ilvC	FALSE	0.219	137.000	0.006	1.000		NA
10450784	10450785	SAAV_2104	SAAV_2105	ilvC	leuA	TRUE	0.935	30.000	0.103	1.000	Y	NA
10450785	10450786	SAAV_2105	SAAV_2106	leuA	leuB	TRUE	0.982	3.000	0.011	0.002	Y	NA
10450786	10450787	SAAV_2106	SAAV_2107	leuB	leuC	TRUE	0.976	14.000	0.027	0.002	Y	NA
10450787	10450788	SAAV_2107	SAAV_2108	leuC	leuD	TRUE	0.994	1.000	0.477	0.001	Y	NA
10450788	10450789	SAAV_2108	SAAV_2109	leuD	ilvA2	TRUE	0.961	15.000	0.100	1.000	Y	NA
10450790	10450791	SAAV_2110	SAAV_2110a			FALSE	0.088	162.000	0.000	NA		NA
10450791	10450792	SAAV_2110a	SAAV_2111			FALSE	0.019	470.000	0.000	NA		NA
10450792	10450793	SAAV_2111	SAAV_2112			FALSE	0.155	117.000	0.000	NA		NA
10450793	10450794	SAAV_2112	SAAV_2113			TRUE	0.647	18.000	0.000	NA		NA
10450794	10450795	SAAV_2113	SAAV_2114			FALSE	0.017	647.000	0.000	NA		NA
10450795	10450796	SAAV_2114	SAAV_2115			TRUE	0.966	-7.000	0.215	NA		NA
10450798	10450799	SAAV_2117	SAAV_2118	rpoF	rsbW	TRUE	0.993	-25.000	0.838	1.000	N	NA
10450799	10450800	SAAV_2118	SAAV_2119	rsbW	rsbV	TRUE	0.989	2.000	0.714	1.000	Y	NA
10450800	10450801	SAAV_2119	SAAV_2120	rsbV	rsbU	TRUE	0.814	119.000	0.440	1.000	Y	NA
10450801	10450802	SAAV_2120	SAAV_2121	rsbU		FALSE	0.179	350.000	0.000	1.000	Y	NA
10450802	10450803	SAAV_2121	SAAV_2122			TRUE	0.908	-3.000	0.039	NA		NA
10450803	10450804	SAAV_2122	SAAV_2123		alr	FALSE	0.372	85.000	0.065	NA		NA
10450804	10450805	SAAV_2123	SAAV_2124	alr	acpS	TRUE	0.599	66.000	0.093	1.000	N	NA
10450805	10450806	SAAV_2124	SAAV_2125	acpS		TRUE	0.758	4.000	0.012	NA		NA
10450806	10450807	SAAV_2125	SAAV_2126			TRUE	0.968	-16.000	0.137	NA		NA
10450807	10450808	SAAV_2126	SAAV_2127			TRUE	0.964	-7.000	0.196	NA		NA
10450808	10450809	SAAV_2127	SAAV_2128			FALSE	0.187	95.000	0.000	NA		NA
10450809	10450810	SAAV_2128	SAAV_2129		kdpC	TRUE	0.837	-3.000	0.000	NA		NA
10450810	10450811	SAAV_2129	SAAV_2130	kdpC	kdpB	TRUE	0.969	20.000	0.000	0.002	Y	NA
10450811	10450812	SAAV_2130	SAAV_2131	kdpB	kdpA	TRUE	0.971	19.000	0.000	0.002	Y	NA
10450812	10450813	SAAV_2131	SAAV_2132	kdpA	kdpF	TRUE	0.892	24.000	0.000	0.002		NA
10450814	10450815	SAAV_2133	SAAV_2134	kdpD	kdpE	TRUE	0.969	0.000	0.000	1.000	Y	NA
10450816	10450817	SAAV_2135	SAAV_2136		murF	FALSE	0.073	517.000	0.000	0.085	N	NA
10450817	10450818	SAAV_2136	SAAV_2137	murF	ddl	TRUE	0.976	15.000	0.035	0.006	Y	NA
10450820	10450821	SAAV_2139	SAAV_2140			FALSE	0.456	128.000	0.333	NA		NA
10450821	10450822	SAAV_2140	SAAV_2141			TRUE	0.762	12.000	0.036	NA		NA
10450823	10450824	SAAV_2142	SAAV_2143	cls2		TRUE	0.877	28.000	0.036	0.022		NA
10450825	10450826	SAAV_2144	SAAV_2145		thiE	TRUE	0.471	86.000	0.055	1.000	N	NA
10450826	10450827	SAAV_2145	SAAV_2146	thiE	thiM	TRUE	0.986	2.000	0.061	0.003	Y	NA
10450827	10450828	SAAV_2146	SAAV_2147	thiM	thiD2	TRUE	0.995	-16.000	0.032	0.003	Y	NA
10450828	10450829	SAAV_2147	SAAV_2148	thiD2		TRUE	0.985	-7.000	0.478	1.000	N	NA
10450829	10450830	SAAV_2148	SAAV_2150			FALSE	0.180	100.000	0.000	NA		NA
10450830	10450831	SAAV_2150	SAAV_2151			FALSE	0.088	162.000	0.000	NA		NA
10450831	10450832	SAAV_2151	SAAV_2152			FALSE	0.037	389.000	0.000	1.000		NA
10450834	10450835	SAAV_2154	SAAV_2155	fabZ	murAA	TRUE	0.740	34.000	0.044	1.000	N	NA
10450835	10450836	SAAV_2155	SAAV_2156	murAA		TRUE	0.488	111.000	0.279	NA		NA
10450836	10450837	SAAV_2156	SAAV_2157		atpC	FALSE	0.033	562.000	0.039	NA		NA
10450837	10450838	SAAV_2157	SAAV_2158	atpC	atpD	TRUE	0.991	20.000	0.837	0.003	Y	NA
10450838	10450839	SAAV_2158	SAAV_2159	atpD	atpG	TRUE	0.990	22.000	0.724	0.003	Y	NA
10450839	10450840	SAAV_2159	SAAV_2160	atpG	atpA	TRUE	0.985	31.000	0.846	0.003	Y	NA
10450840	10450841	SAAV_2160	SAAV_2161	atpA	atpH	TRUE	0.991	22.000	0.864	0.003	Y	NA
10450841	10450842	SAAV_2161	SAAV_2162	atpH	atpF	TRUE	0.993	0.000	0.222	0.003	Y	NA
10450842	10450843	SAAV_2162	SAAV_2163	atpF	atpE	TRUE	0.490	198.000	0.402	0.003		NA
10450843	10450844	SAAV_2163	SAAV_2164	atpE	atpB	TRUE	0.881	43.000	0.189	0.003		NA
10450844	10450845	SAAV_2164	SAAV_2165	atpB		TRUE	0.916	21.000	0.330	1.000		NA
10450845	10450846	SAAV_2165	SAAV_2166			FALSE	0.188	167.000	0.030	1.000		NA
10450846	10450847	SAAV_2166	SAAV_2167		upp	TRUE	0.781	24.000	0.008	1.000	N	NA
10450847	10450848	SAAV_2167	SAAV_2168	upp	glyA	TRUE	0.804	28.000	0.051	1.000	N	NA
10450848	10450849	SAAV_2168	SAAV_2169	glyA		TRUE	0.805	27.000	0.145	NA		NA
10450849	10450850	SAAV_2169	SAAV_2170			FALSE	0.311	107.000	0.052	NA		NA
10450850	10450851	SAAV_2170	SAAV_2171			TRUE	0.929	-3.000	0.052	NA	N	NA
10450851	10450852	SAAV_2171	SAAV_2172			TRUE	0.722	84.000	0.072	NA	Y	NA
10450852	10450853	SAAV_2172	SAAV_2173		prfA	TRUE	0.992	-13.000	0.084	1.000	Y	NA
10450853	10450854	SAAV_2173	SAAV_2174	prfA	tdk	TRUE	0.921	1.000	0.062	1.000	N	NA
10450854	10450855	SAAV_2174	SAAV_2175	tdk	rpmE2	FALSE	0.073	347.000	0.028	1.000	N	NA
10450855	10450856	SAAV_2175	SAAV_2176	rpmE2	rho	FALSE	0.380	118.000	0.049	1.000	N	NA
10450856	10450857	SAAV_2176	SAAV_2177	rho		FALSE	0.078	247.000	0.000	1.000	N	NA
10450857	10450858	SAAV_2177	SAAV_2178			FALSE	0.166	238.000	0.200	NA	N	NA
10450858	10450859	SAAV_2178	SAAV_2179		murAB	FALSE	0.373	89.000	0.046	NA	N	NA
10450859	10450860	SAAV_2179	SAAV_2180	murAB	fbaA	FALSE	0.038	466.000	0.000	1.000	N	NA
10450862	10450863	SAAV_2182	SAAV_2183	pyrG	rpoE	FALSE	0.078	336.000	0.029	1.000	N	NA
10450863	10450864	SAAV_2183	SAAV_2184	rpoE		FALSE	0.384	112.000	0.060	1.000		NA
10450866	10450867	SAAV_2186	SAAV_2187			FALSE	0.022	399.000	0.000	NA		NA
10450867	10450868	SAAV_2187	SAAV_2188			TRUE	0.938	0.000	0.121	1.000		NA
10450870	10450871	SAAV_2190	SAAV_2191		pdp	TRUE	0.631	14.000	0.000	NA		NA
10450871	10450872	SAAV_2191	SAAV_2192	pdp	deoC2	FALSE	0.271	279.000	0.026	1.000	Y	NA
10450874	10450875	SAAV_2194	SAAV_2195			FALSE	0.074	200.000	0.009	NA		NA
10450875	10450876	SAAV_2195	SAAV_2196			FALSE	0.027	457.000	0.007	NA		NA
10450876	10450877	SAAV_2196	SAAV_2197			FALSE	0.016	672.000	0.000	NA		NA
10450877	10450878	SAAV_2197	SAAV_2198		manA1	TRUE	0.912	31.000	1.000	NA		NA
10450878	10450879	SAAV_2198	SAAV_2199	manA1		FALSE	0.033	436.000	0.000	1.000		NA
10450880	10450881	SAAV_2200	SAAV_2201	czrA		TRUE	0.932	2.000	0.139	1.000	N	NA
10450881	10450882	SAAV_2201	SAAV_2202			FALSE	0.049	210.000	0.000	NA		NA
10450882	10450883	SAAV_2202	SAAV_2203			TRUE	0.916	-51.000	0.000	NA		NA
10450883	10450884	SAAV_2203	SAAV_2204			FALSE	0.015	1054.000	0.000	NA		NA
10450884	10450885	SAAV_2204	SAAV_2205			TRUE	0.874	-7.000	0.000	NA		NA
10450886	10450887	SAAV_2206	SAAV_2207			TRUE	0.629	68.000	0.188	1.000		NA
10450887	10450888	SAAV_2207	SAAV_2208		glmS	FALSE	0.083	232.000	0.000	1.000	N	NA
10450889	10450890	SAAV_2210	SAAV_2211			TRUE	0.930	35.000	0.336	0.010	N	NA
10450890	10450891	SAAV_2211	SAAV_2212			TRUE	0.941	12.000	0.098	0.010	N	NA
10450891	10450892	SAAV_2212	SAAV_2213		mtlD	TRUE	0.979	0.000	0.062	1.000	Y	NA
10450893	10450894	SAAV_2214	SAAV_2215	fmtB	glmM	FALSE	0.068	278.000	0.000	1.000	N	NA
10450894	10450895	SAAV_2215	SAAV_2216	glmM		TRUE	0.810	27.000	0.150	NA		NA
10450895	10450896	SAAV_2216	SAAV_2217			TRUE	0.952	2.000	0.502	NA		NA
10450896	10450897	SAAV_2217	SAAV_2218		rocF	FALSE	0.080	189.000	0.007	NA		NA
10450897	10450898	SAAV_2218	SAAV_2219	rocF		FALSE	0.124	135.000	0.000	NA		NA
10450898	10450899	SAAV_2219	SAAV_2220			TRUE	0.711	3.000	0.000	NA		NA
10450899	10450900	SAAV_2220	SAAV_2221			TRUE	0.630	8.000	0.000	NA		NA
10450900	10450901	SAAV_2221	SAAV_2222			TRUE	0.543	28.000	0.000	NA		NA
10450901	10450902	SAAV_2222	SAAV_2223			TRUE	0.711	3.000	0.000	NA		NA
10450902	10450903	SAAV_2223	SAAV_2224			TRUE	0.761	1.000	0.000	NA		NA
10450903	10450904	SAAV_2224	SAAV_2225			TRUE	0.629	11.000	0.000	NA		NA
10450904	10450905	SAAV_2225	SAAV_2225a			FALSE	0.088	162.000	0.000	NA		NA
10450905	10450906	SAAV_2225a	SAAV_2226			FALSE	0.019	470.000	0.000	NA		NA
10450906	10450907	SAAV_2226	SAAV_2227			FALSE	0.020	456.000	0.000	NA		NA
10450907	10450908	SAAV_2227	SAAV_2228			FALSE	0.361	148.000	0.162	1.000		NA
10450908	10450909	SAAV_2228	SAAV_2229			FALSE	0.172	323.000	0.500	NA		NA
10450909	10450910	SAAV_2229	SAAV_2230			TRUE	0.689	99.000	0.875	NA		NA
10450910	10450911	SAAV_2230	SAAV_2231			FALSE	0.396	177.000	0.162	0.049		NA
10450911	10450912	SAAV_2231	SAAV_2232			TRUE	0.840	19.000	0.051	1.000		NA
10450912	10450913	SAAV_2232	SAAV_2233			TRUE	0.551	44.000	0.044	NA		NA
10450915	10450916	SAAV_2235	SAAV_2236			FALSE	0.068	236.000	0.000	1.000		NA
10450916	10450917	SAAV_2236	SAAV_2237			TRUE	0.994	-3.000	0.280	0.026	Y	NA
10450917	10450918	SAAV_2237	SAAV_2238			TRUE	0.978	12.000	0.500	1.000	Y	NA
10450918	10450919	SAAV_2238	SAAV_2239			FALSE	0.070	392.000	0.105	NA	N	NA
10450919	10450920	SAAV_2239	SAAV_2240			TRUE	0.917	7.000	0.368	NA	N	NA
10450920	10450921	SAAV_2240	SAAV_2241			TRUE	0.983	-13.000	0.429	NA		NA
10450923	10450924	SAAV_2243	SAAV_2244			TRUE	0.500	63.000	0.083	NA		NA
10450924	10450925	SAAV_2244	SAAV_2245			TRUE	0.824	13.000	0.107	NA		NA
10450925	10450926	SAAV_2245	SAAV_2246		opuD2	FALSE	0.334	175.000	0.455	NA		NA
10450926	10450927	SAAV_2246	SAAV_2247	opuD2		FALSE	0.088	308.000	0.032	1.000	N	NA
10450927	10450928	SAAV_2247	SAAV_2248			FALSE	0.264	235.000	0.079	0.013		NA
10450928	10450929	SAAV_2248	SAAV_2249			FALSE	0.066	278.000	0.039	NA		NA
10450929	10450930	SAAV_2249	SAAV_2250		lacG	FALSE	0.038	266.000	0.000	NA		NA
10450930	10450931	SAAV_2250	SAAV_2251	lacG	lacE	TRUE	0.974	18.000	0.300	1.000	Y	NA
10450931	10450932	SAAV_2251	SAAV_2252	lacE	lacF	TRUE	0.995	0.000	0.600	0.008	Y	NA
10450932	10450933	SAAV_2252	SAAV_2253	lacF	lacD	TRUE	0.974	22.000	0.417	1.000	Y	NA
10450933	10450934	SAAV_2253	SAAV_2254	lacD	lacC	TRUE	0.992	4.000	0.556	0.001	Y	NA
10450934	10450935	SAAV_2254	SAAV_2255	lacC	lacB	TRUE	0.981	13.000	0.667	1.000	Y	NA
10450935	10450936	SAAV_2255	SAAV_2256	lacB		TRUE	0.993	16.000	0.750	0.001	Y	NA
10450936	10450937	SAAV_2256	SAAV_2257			FALSE	0.170	367.000	0.000	1.000	Y	NA
10450939	10450940	SAAV_2259	SAAV_2260			FALSE	0.043	233.000	0.000	NA		NA
10450940	10450941	SAAV_2260	SAAV_2261			FALSE	0.349	70.000	0.000	1.000		NA
10450942	10450943	SAAV_2262	SAAV_2263			TRUE	0.837	-3.000	0.000	NA		NA
10450944	10450945	SAAV_2264	SAAV_2265			FALSE	0.078	211.000	0.000	1.000		NA
10450947	10450948	SAAV_2267	SAAV_2268	budA1	budB	TRUE	0.680	37.000	0.022	1.000	N	NA
10450948	10450949	SAAV_2268	SAAV_2269	budB		FALSE	0.030	1250.000	0.000	1.000	N	NA
10450949	10450950	SAAV_2269	SAAV_2270			FALSE	0.041	245.000	0.000	NA		NA
10450950	10450951	SAAV_2270	SAAV_2271			FALSE	0.019	488.000	0.000	NA		NA
10450951	10450952	SAAV_2271	SAAV_2272			FALSE	0.017	650.000	0.000	NA		NA
10450952	10450953	SAAV_2272	SAAV_2273			FALSE	0.039	260.000	0.000	NA		NA
10450953	10450954	SAAV_2273	SAAV_2274			FALSE	0.091	161.000	0.000	NA		NA
10450954	10450955	SAAV_2274	SAAV_2275			FALSE	0.051	204.000	0.000	NA		NA
10450956	10450957	SAAV_2276	SAAV_2277			FALSE	0.034	282.000	0.000	NA		NA
10450958	10450959	SAAV_2278	SAAV_2279	rpsI	rplM	TRUE	0.967	20.000	0.006	0.017	Y	NA
10450959	10450960	SAAV_2279	SAAV_2281	rplM	truA	FALSE	0.340	240.000	0.052	1.000	Y	NA
10450960	10450961	SAAV_2281	SAAV_2282	truA		TRUE	0.911	5.000	0.170	1.000	N	NA
10450961	10450962	SAAV_2282	SAAV_2283		cbiO	TRUE	0.992	-10.000	0.139	1.000	Y	NA
10450962	10450963	SAAV_2283	SAAV_2284	cbiO		TRUE	0.996	-3.000	0.713	0.020	Y	NA
10450963	10450964	SAAV_2284	SAAV_2285		rplQ	FALSE	0.066	538.000	0.074	1.000	N	NA
10450964	10450965	SAAV_2285	SAAV_2286	rplQ	rpoA	TRUE	0.963	17.000	0.873	1.000	N	NA
10450965	10450966	SAAV_2286	SAAV_2287	rpoA	rpsK	TRUE	0.684	75.000	0.308	1.000	N	NA
10450966	10450967	SAAV_2287	SAAV_2288	rpsK	rpsM	TRUE	0.988	24.000	0.810	0.017	Y	NA
10450967	10450968	SAAV_2288	SAAV_2289	rpsM	rpmJ	TRUE	0.939	23.000	0.194	0.017		NA
10450968	10450969	SAAV_2289	SAAV_2290	rpmJ	infA	TRUE	0.845	32.000	0.257	1.000		NA
10450969	10450970	SAAV_2290	SAAV_2291	infA	adk	FALSE	0.179	193.000	0.059	1.000	N	NA
10450970	10450971	SAAV_2291	SAAV_2292	adk	secY	TRUE	0.925	17.000	0.241	1.000	N	NA
10450971	10450972	SAAV_2292	SAAV_2293	secY	rplO	TRUE	0.978	0.000	0.730	1.000	N	NA
10450972	10450973	SAAV_2293	SAAV_2294	rplO	rpmD	TRUE	0.991	17.000	0.653	0.003	Y	NA
10450973	10450974	SAAV_2294	SAAV_2295	rpmD	rpsE	TRUE	0.991	17.000	0.789	0.022	Y	NA
10450974	10450975	SAAV_2295	SAAV_2296	rpsE	rplR	TRUE	0.989	21.000	0.814	0.022	Y	NA
10450975	10450976	SAAV_2296	SAAV_2297	rplR	rplF	TRUE	0.983	31.000	0.815	0.017	Y	NA
10450976	10450977	SAAV_2297	SAAV_2298	rplF	rpsH	TRUE	0.987	25.000	0.808	0.017	Y	NA
10450977	10450978	SAAV_2298	SAAV_2299	rpsH	rpsN_1	TRUE	0.976	32.000	0.473	0.017	Y	NA
10450978	10450979	SAAV_2299	SAAV_2300	rpsN_1	rplE	TRUE	0.971	38.000	0.496	0.017	Y	NA
10450979	10450980	SAAV_2300	SAAV_2301	rplE	rplX	TRUE	0.986	27.000	0.758	0.017	Y	NA
10450980	10450981	SAAV_2301	SAAV_2302	rplX	rplN	TRUE	0.978	36.000	0.810	0.022	Y	NA
10450981	10450982	SAAV_2302	SAAV_2303	rplN	rpsQ	TRUE	0.981	32.000	0.791	0.022	Y	NA
10450982	10450983	SAAV_2303	SAAV_2304	rpsQ	rpmC	TRUE	0.988	24.000	0.828	0.017	Y	NA
10450983	10450984	SAAV_2304	SAAV_2305	rpmC	rplP	TRUE	0.998	-10.000	0.802	0.017	Y	NA
10450984	10450985	SAAV_2305	SAAV_2306	rplP	rpsC	TRUE	0.993	3.000	0.828	0.022	Y	NA
10450985	10450986	SAAV_2306	SAAV_2307	rpsC	rplV	TRUE	0.987	24.000	0.719	0.022	Y	NA
10450986	10450987	SAAV_2307	SAAV_2308	rplV	rpsS	TRUE	0.984	29.000	0.769	0.022	Y	NA
10450987	10450988	SAAV_2308	SAAV_2309	rpsS	rplB	TRUE	0.952	67.000	0.820	0.022	Y	NA
10450988	10450989	SAAV_2309	SAAV_2310	rplB	rplW	TRUE	0.968	33.000	0.849	1.000	Y	NA
10450989	10450990	SAAV_2310	SAAV_2311	rplW	rplD	TRUE	0.988	0.000	0.307	1.000	Y	NA
10450990	10450991	SAAV_2311	SAAV_2312	rplD	rplC	TRUE	0.984	27.000	0.544	0.017	Y	NA
10450991	10450992	SAAV_2312	SAAV_2313	rplC	rpsJ	TRUE	0.981	28.000	0.467	0.022	Y	NA
10450994	10450995	SAAV_2315	SAAV_2316		topB	FALSE	0.381	113.000	0.060	1.000		NA
10450996	10450997	SAAV_2317	SAAV_2318			FALSE	0.142	181.000	0.022	1.000		NA
10450998	10450999	SAAV_2319	SAAV_2320			FALSE	0.026	348.000	0.000	NA		NA
10451000	10451001	SAAV_2321	SAAV_2322			FALSE	0.173	245.000	0.286	NA		NA
10451002	10451003	SAAV_2323	SAAV_2326		femX	FALSE	0.155	117.000	0.000	NA		NA
10451003	10451004	SAAV_2326	SAAV_2327	femX		FALSE	0.017	632.000	0.000	NA		NA
10451005	10451006	SAAV_2328	SAAV_2329			TRUE	0.982	-7.000	0.370	1.000	N	NA
10451007	10451008	SAAV_2330	SAAV_2331	sarV	moaA	FALSE	0.028	577.000	0.000	1.000		NA
10451008	10451009	SAAV_2331	SAAV_2332	moaA	mobA	TRUE	0.973	20.000	0.016	0.003	Y	NA
10451009	10451010	SAAV_2332	SAAV_2333	mobA	moaD	TRUE	0.975	7.000	0.027	0.003	Y	NA
10451010	10451011	SAAV_2333	SAAV_2334	moaD	moaE	TRUE	0.990	6.000	0.501	0.003	Y	NA
10451011	10451012	SAAV_2334	SAAV_2335	moaE	mobB	TRUE	0.976	14.000	0.040	0.003	Y	NA
10451012	10451013	SAAV_2335	SAAV_2336	mobB		TRUE	0.995	-3.000	0.200	0.003	Y	NA
10451015	10451016	SAAV_2338	SAAV_2339	moaB		TRUE	0.909	31.000	0.023	1.000	Y	NA
10451016	10451017	SAAV_2339	SAAV_2340		modC	FALSE	0.165	170.000	0.017	1.000		NA
10451017	10451018	SAAV_2340	SAAV_2341	modC	modB	TRUE	0.887	1.000	0.025	1.000		NA
10451018	10451019	SAAV_2341	SAAV_2342	modB	modA	TRUE	0.989	14.000	0.430	0.001	Y	NA
10451021	10451022	SAAV_2344	SAAV_2345			FALSE	0.341	77.000	0.033	NA		NA
10451022	10451023	SAAV_2345	SAAV_2346			FALSE	0.240	121.000	0.033	NA		NA
10451023	10451024	SAAV_2346	SAAV_2347			FALSE	0.076	398.000	0.059	1.000	N	NA
10451024	10451025	SAAV_2347	SAAV_2348			FALSE	0.156	214.000	0.065	1.000	N	NA
10451025	10451026	SAAV_2348	SAAV_2349			FALSE	0.088	217.000	0.000	1.000	N	NA
10451027	10451028	SAAV_2350	SAAV_2351	ureA	ureB	TRUE	0.983	14.000	0.135	0.001	Y	NA
10451028	10451029	SAAV_2351	SAAV_2352	ureB	ureC	TRUE	0.993	-3.000	0.045	0.001	Y	NA
10451029	10451030	SAAV_2352	SAAV_2353	ureC	ureE	TRUE	0.950	13.000	0.087	0.001	N	NA
10451030	10451031	SAAV_2353	SAAV_2354	ureE	ureF	TRUE	0.997	-7.000	0.460	0.003	Y	NA
10451031	10451032	SAAV_2354	SAAV_2355	ureF	ureG	TRUE	0.988	13.000	0.439	0.003	Y	NA
10451032	10451033	SAAV_2355	SAAV_2356	ureG	ureD	TRUE	0.994	0.000	0.337	0.003	Y	NA
10451034	10451035	SAAV_2357	SAAV_2358	sarR		FALSE	0.021	428.000	0.000	NA		NA
10451035	10451036	SAAV_2358	SAAV_2359		sarY	TRUE	0.724	64.000	0.500	NA		NA
10451036	10451037	SAAV_2359	SAAV_2360	sarY		TRUE	0.949	26.000	0.429	0.030		NA
10451039	10451040	SAAV_2362	SAAV_2363	nhaC		TRUE	0.665	95.000	0.500	1.000		NA
10451041	10451042	SAAV_2364	SAAV_2365			FALSE	0.043	237.000	0.000	NA		NA
10451042	10451043	SAAV_2365	SAAV_2366			FALSE	0.025	361.000	0.000	NA		NA
10451044	10451045	SAAV_2367	SAAV_2368			FALSE	0.123	311.000	0.118	1.000	N	NA
10451045	10451046	SAAV_2368	SAAV_2369			TRUE	0.930	22.000	0.714	NA		NA
10451046	10451047	SAAV_2369	SAAV_2370			FALSE	0.109	291.000	0.167	NA		NA
10451047	10451048	SAAV_2370	SAAV_2371			TRUE	0.973	0.000	0.846	NA		NA
10451048	10451049	SAAV_2371	SAAV_2372			FALSE	0.017	603.000	0.000	NA		NA
10451049	10451050	SAAV_2372	SAAV_2373			FALSE	0.334	133.000	0.125	NA	N	NA
10451053	10451054	SAAV_2376	SAAV_2377			FALSE	0.020	445.000	0.000	NA		NA
10451056	10451057	SAAV_2379	SAAV_2380			TRUE	0.978	-3.000	0.714	NA		NA
10451058	10451059	SAAV_2381	SAAV_2382			TRUE	0.894	11.000	0.294	NA		NA
10451059	10451060	SAAV_2382	SAAV_2383			FALSE	0.420	75.000	0.025	1.000		NA
10451064	10451065	SAAV_2387	SAAV_2388			FALSE	0.184	167.000	0.077	NA		NA
10451067	10451068	SAAV_2391	SAAV_2392			FALSE	0.019	487.000	0.000	NA		NA
10451068	10451069	SAAV_2392	SAAV_2393			FALSE	0.456	111.000	0.137	1.000		NA
10451069	10451070	SAAV_2393	SAAV_2394		hutI	FALSE	0.058	276.000	0.000	1.000		NA
10451070	10451071	SAAV_2394	SAAV_2395	hutI	hutU	TRUE	0.943	0.000	0.110	1.000	N	NA
10451072	10451073	SAAV_2396	SAAV_2397		fosB	FALSE	0.021	662.000	0.000	NA	N	NA
10451078	10451079	SAAV_2402	SAAV_2403		galM	TRUE	0.874	-7.000	0.000	NA		NA
10451079	10451080	SAAV_2403	SAAV_2404	galM		TRUE	0.794	30.000	0.095	1.000		NA
10451080	10451081	SAAV_2404	SAAV_2405			FALSE	0.046	218.000	0.000	NA		NA
10451081	10451082	SAAV_2405	SAAV_2406			TRUE	0.976	-7.000	0.382	NA		NA
10451082	10451083	SAAV_2406	SAAV_2407			FALSE	0.070	231.000	0.000	1.000		NA
10451084	10451085	SAAV_2408	SAAV_2409		gltS	FALSE	0.055	333.000	0.000	1.000	N	NA
10451086	10451087	SAAV_2410	SAAV_2411	fni		TRUE	0.729	31.000	0.018	1.000	N	NA
10451088	10451089	SAAV_2412	SAAV_2413			TRUE	0.982	-3.000	1.000	NA		NA
10451092	10451093	SAAV_2416	SAAV_2417			TRUE	0.908	13.000	0.206	1.000	N	NA
10451095	10451096	SAAV_2419	SAAV_2420	tcaB		FALSE	0.168	110.000	0.000	NA		NA
10451096	10451097	SAAV_2420	SAAV_2421		tcaA	TRUE	0.497	31.000	0.000	NA		NA
10451097	10451098	SAAV_2421	SAAV_2422	tcaA	tcaR	FALSE	0.112	240.000	0.111	NA		NA
10451100	10451101	SAAV_2424	SAAV_2425			TRUE	0.968	0.000	0.364	1.000	N	NA
10451102	10451103	SAAV_2426	SAAV_2427			TRUE	0.996	-7.000	0.833	1.000	Y	NA
10451103	10451104	SAAV_2427	SAAV_2428			FALSE	0.454	163.000	0.039	NA	Y	NA
10451104	10451105	SAAV_2428	SAAV_2429			TRUE	0.968	-3.000	0.392	NA		NA
10451106	10451107	SAAV_2430	SAAV_2431	mqo1		FALSE	0.038	381.000	0.000	1.000		NA
10451109	10451110	SAAV_2433	SAAV_2434			FALSE	0.030	314.000	0.000	NA		NA
10451112	10451113	SAAV_2436	SAAV_2437			TRUE	0.738	36.000	0.091	1.000		NA
10451113	10451114	SAAV_2437	SAAV_2438			TRUE	0.629	11.000	0.000	NA		NA
10451114	10451115	SAAV_2438	SAAV_2439			FALSE	0.175	105.000	0.000	NA		NA
10451115	10451116	SAAV_2439	SAAV_2440			FALSE	0.050	207.000	0.000	NA		NA
10451117	10451118	SAAV_2441	SAAV_2442			TRUE	0.857	46.000	0.556	1.000	N	NA
10451120	10451121	SAAV_2444	SAAV_2445			FALSE	0.015	1488.000	0.000	NA		NA
10451121	10451122	SAAV_2445	SAAV_2446			TRUE	0.535	71.000	0.093	1.000		NA
10451125	10451126	SAAV_2449	SAAV_2450			FALSE	0.236	182.000	0.250	NA		NA
10451127	10451128	SAAV_2451	SAAV_2452	sarZ		FALSE	0.060	216.000	0.000	NA	N	NA
10451130	10451131	SAAV_2454	SAAV_2455			TRUE	0.928	-21.000	0.000	NA	N	NA
10451132	10451133	SAAV_2456	SAAV_2457			TRUE	0.948	74.000	0.800	0.009	Y	NA
10451133	10451134	SAAV_2457	SAAV_2458			TRUE	0.885	24.000	0.333	NA		NA
10451134	10451135	SAAV_2458	SAAV_2459		narI	TRUE	0.813	20.000	0.088	NA		NA
10451135	10451136	SAAV_2459	SAAV_2460	narI	narJ	TRUE	0.996	-7.000	0.206	0.002	Y	NA
10451136	10451137	SAAV_2460	SAAV_2461	narJ	narH	TRUE	0.999	-22.000	0.933	0.002	Y	NA
10451137	10451138	SAAV_2461	SAAV_2462	narH	narG	TRUE	0.998	-10.000	0.429	0.001	Y	NA
10451138	10451139	SAAV_2462	SAAV_2463	narG		FALSE	0.059	309.000	0.000	1.000	N	NA
10451139	10451140	SAAV_2463	SAAV_2464		nirD	TRUE	0.962	-9.000	0.042	1.000	N	NA
10451140	10451141	SAAV_2464	SAAV_2465	nirD	nirB	TRUE	0.961	4.000	0.091	0.001	N	NA
10451141	10451142	SAAV_2465	SAAV_2466	nirB	nirR	TRUE	0.593	66.000	0.125	1.000		NA
10451142	10451143	SAAV_2466	SAAV_2467	nirR		FALSE	0.063	260.000	0.000	1.000		NA
10451143	10451144	SAAV_2467	SAAV_2468			FALSE	0.069	234.000	0.000	1.000		NA
10451144	10451145	SAAV_2468	SAAV_2469			FALSE	0.032	295.000	0.000	NA		NA
10451145	10451146	SAAV_2469	SAAV_2470			TRUE	0.638	84.000	0.500	NA		NA
10451146	10451147	SAAV_2470	SAAV_2471			FALSE	0.230	186.000	0.250	NA		NA
10451147	10451148	SAAV_2471	SAAV_2472			FALSE	0.032	295.000	0.000	NA		NA
10451148	10451149	SAAV_2472	SAAV_2473			TRUE	0.908	0.000	0.087	NA		NA
10451149	10451150	SAAV_2473	SAAV_2474			FALSE	0.047	273.000	0.000	NA	N	NA
10451150	10451151	SAAV_2474	SAAV_2475			TRUE	0.822	19.000	0.092	NA		NA
10451153	10451154	SAAV_2477	SAAV_2478			TRUE	0.992	-3.000	0.481	1.000	Y	NA
10451154	10451155	SAAV_2478	SAAV_2479			TRUE	0.998	-19.000	0.594	0.025	Y	NA
10451155	10451156	SAAV_2479	SAAV_2480			FALSE	0.296	121.000	0.024	1.000		NA
10451158	10451159	SAAV_2482	SAAV_2483	gpm		FALSE	0.056	327.000	0.000	1.000	N	NA
10451160	10451161	SAAV_2484	SAAV_2485		hlgA	FALSE	0.080	536.000	0.000	0.014		NA
10451161	10451162	SAAV_2485	SAAV_2486	hlgA	hlgC	FALSE	0.088	567.000	0.000	0.003		NA
10451162	10451163	SAAV_2486	SAAV_2487	hlgC	hlgB	TRUE	0.940	2.000	0.000	0.003		NA
10451164	10451165	SAAV_2488	SAAV_2489		bioW	TRUE	0.629	11.000	0.000	NA		NA
10451165	10451166	SAAV_2489	SAAV_2490	bioW		TRUE	0.960	11.000	0.118	1.000	Y	NA
10451166	10451167	SAAV_2490	SAAV_2491		bioB	TRUE	0.988	-22.000	0.000	1.000	Y	NA
10451167	10451168	SAAV_2491	SAAV_2492	bioB	bioA	TRUE	0.990	2.000	0.176	0.002	Y	NA
10451168	10451169	SAAV_2492	SAAV_2493	bioA	bioD	TRUE	0.996	-22.000	0.051	0.002	Y	NA
10451169	10451170	SAAV_2493	SAAV_2494	bioD		FALSE	0.079	453.000	0.000	0.082	N	NA
10451170	10451171	SAAV_2494	SAAV_2495			TRUE	0.989	25.000	0.867	0.004	Y	NA
10451171	10451172	SAAV_2495	SAAV_2496			FALSE	0.016	703.000	0.000	NA		NA
10451172	10451173	SAAV_2496	SAAV_2497			FALSE	0.125	134.000	0.000	NA		NA
10451174	10451175	SAAV_2498	SAAV_2499			TRUE	0.717	60.000	0.400	NA		NA
10451175	10451176	SAAV_2499	SAAV_2500		bcr	FALSE	0.250	182.000	0.286	NA		NA
10451180	10451181	SAAV_2504	SAAV_2505			TRUE	0.509	138.000	0.333	1.000	N	NA
10451184	10451185	SAAV_2508	SAAV_2509			FALSE	0.057	322.000	0.000	1.000	N	NA
10451185	10451186	SAAV_2509	SAAV_2510			FALSE	0.224	226.000	0.429	NA		NA
10451186	10451187	SAAV_2510	SAAV_2511			FALSE	0.032	294.000	0.000	NA		NA
10451187	10451188	SAAV_2511	SAAV_2512			TRUE	0.976	0.000	0.190	0.025	N	NA
10451188	10451189	SAAV_2512	SAAV_2513			TRUE	0.955	17.000	0.200	0.025	N	NA
10451189	10451190	SAAV_2513	SAAV_2514			TRUE	0.993	-3.000	0.200	0.062	Y	NA
10451190	10451191	SAAV_2514	SAAV_2515			FALSE	0.018	515.000	0.000	NA		NA
10451191	10451192	SAAV_2515	SAAV_2516			FALSE	0.400	41.000	0.000	NA		NA
10451193	10451194	SAAV_2517	SAAV_2518		pnbA	FALSE	0.090	309.000	0.036	1.000	N	NA
10451195	10451196	SAAV_2519	SAAV_2520			FALSE	0.031	396.000	0.009	NA		NA
10451196	10451197	SAAV_2520	SAAV_2521			TRUE	0.955	-7.000	0.127	NA		NA
10451197	10451198	SAAV_2521	SAAV_2522		pepA2	FALSE	0.065	248.000	0.000	1.000		NA
10451198	10451199	SAAV_2522	SAAV_2523	pepA2		FALSE	0.026	355.000	0.000	NA		NA
10451199	10451200	SAAV_2523	SAAV_2524			TRUE	0.883	0.000	0.043	NA		NA
10451204	10451205	SAAV_2528	SAAV_2529			TRUE	0.888	12.000	0.214	NA	N	NA
10451205	10451206	SAAV_2529	SAAV_2530			TRUE	0.996	-7.000	0.273	0.019	Y	NA
10451206	10451207	SAAV_2530	SAAV_2531			TRUE	0.993	-3.000	0.545	1.000	Y	NA
10451207	10451208	SAAV_2531	SAAV_2532			TRUE	0.997	-3.000	1.000	0.025	Y	NA
10451208	10451209	SAAV_2532	SAAV_2533			TRUE	0.984	13.000	0.353	0.025	Y	NA
10451209	10451210	SAAV_2533	SAAV_2534			FALSE	0.359	143.000	0.235	NA		NA
10451210	10451211	SAAV_2534	SAAV_2535			FALSE	0.213	80.000	0.000	NA		NA
10451211	10451212	SAAV_2535	SAAV_2536			TRUE	0.629	11.000	0.000	NA		NA
10451212	10451213	SAAV_2536	SAAV_2537			FALSE	0.017	565.000	0.000	NA		NA
10451213	10451214	SAAV_2537	SAAV_2538			FALSE	0.265	100.000	0.000	1.000		NA
10451216	10451217	SAAV_2540	SAAV_2541			FALSE	0.020	452.000	0.000	NA		NA
10451217	10451218	SAAV_2541	SAAV_2542			TRUE	0.558	27.000	0.000	NA		NA
10451218	10451219	SAAV_2542	SAAV_2543			FALSE	0.038	267.000	0.000	NA		NA
10451219	10451220	SAAV_2543	SAAV_2544			FALSE	0.040	250.000	0.000	NA		NA
10451222	10451223	SAAV_2546	SAAV_2547			FALSE	0.017	561.000	0.000	NA		NA
10451223	10451224	SAAV_2547	SAAV_2548			FALSE	0.018	536.000	0.000	NA		NA
10451224	10451225	SAAV_2548	SAAV_2549			TRUE	0.953	3.000	0.667	NA		NA
10451225	10451226	SAAV_2549	SAAV_2550			TRUE	0.963	0.000	0.500	NA		NA
10451226	10451227	SAAV_2550	SAAV_2551			TRUE	0.901	-13.000	0.000	NA		NA
10451227	10451228	SAAV_2551	SAAV_2552			FALSE	0.042	241.000	0.000	NA		NA
10451228	10451229	SAAV_2552	SAAV_2553			FALSE	0.161	114.000	0.000	NA		NA
10451229	10451230	SAAV_2553	SAAV_2554			FALSE	0.170	109.000	0.000	NA		NA
10451230	10451231	SAAV_2554	SAAV_2555			FALSE	0.032	304.000	0.000	NA		NA
10451231	10451232	SAAV_2555	SAAV_2556			TRUE	0.991	2.000	0.327	0.014	Y	NA
10451233	10451234	SAAV_2557	SAAV_2558			FALSE	0.336	53.000	0.000	NA		NA
10451234	10451235	SAAV_2558	SAAV_2559			FALSE	0.034	284.000	0.000	NA		NA
10451235	10451236	SAAV_2559	SAAV_2560			FALSE	0.113	144.000	0.000	NA		NA
10451237	10451238	SAAV_2561	SAAV_2562			FALSE	0.023	384.000	0.000	NA		NA
10451238	10451239	SAAV_2562	SAAV_2563		sarT	FALSE	0.031	305.000	0.000	NA		NA
10451241	10451242	SAAV_2565	SAAV_2566	galU	fnbB	FALSE	0.061	266.000	0.000	1.000		NA
10451242	10451243	SAAV_2566	SAAV_2567	fnbB		FALSE	0.044	230.000	0.000	NA		NA
10451243	10451244	SAAV_2567	SAAV_2568		fnbA	FALSE	0.022	398.000	0.000	NA		NA
10451244	10451245	SAAV_2568	SAAV_2569	fnbA		FALSE	0.051	204.000	0.000	NA		NA
10451245	10451246	SAAV_2569	SAAV_2570		gntP	FALSE	0.125	134.000	0.000	NA		NA
10451246	10451247	SAAV_2570	SAAV_2571	gntP	gntK	TRUE	0.850	117.000	0.696	1.000	Y	NA
10451247	10451248	SAAV_2571	SAAV_2572	gntK	gntR	TRUE	0.942	24.000	0.680	1.000	N	NA
10451248	10451249	SAAV_2572	SAAV_2573	gntR		TRUE	0.702	153.000	0.062	0.030	Y	NA
10451249	10451250	SAAV_2573	SAAV_2574			FALSE	0.229	165.000	0.062	1.000		NA
10451250	10451251	SAAV_2574	SAAV_2575			FALSE	0.068	231.000	0.021	NA		NA
10451251	10451252	SAAV_2575	SAAV_2576			FALSE	0.236	139.000	0.062	NA		NA
10451252	10451253	SAAV_2576	SAAV_2577			FALSE	0.019	477.000	0.000	NA		NA
10451254	10451255	SAAV_2578	SAAV_2579			FALSE	0.030	518.000	0.000	1.000		NA
10451255	10451256	SAAV_2579	SAAV_2580			TRUE	0.942	2.000	0.368	NA		NA
10451256	10451257	SAAV_2580	SAAV_2581			FALSE	0.024	373.000	0.000	NA		NA
10451257	10451258	SAAV_2581	SAAV_2582			FALSE	0.027	342.000	0.000	NA		NA
10451259	10451260	SAAV_2583	SAAV_2584			TRUE	0.843	31.000	0.333	NA		NA
10451260	10451261	SAAV_2584	SAAV_2585			TRUE	0.619	78.000	0.312	NA	N	NA
10451262	10451263	SAAV_2586	SAAV_2587			FALSE	0.078	171.000	0.000	NA		NA
10451267	10451268	SAAV_2591	SAAV_2592			TRUE	0.648	15.000	0.000	NA		NA
10451271	10451272	SAAV_2595	SAAV_2596		sdaAA	FALSE	0.115	179.000	0.029	NA		NA
10451272	10451273	SAAV_2596	SAAV_2597	sdaAA	sdaAB	TRUE	0.988	14.000	0.324	0.001	Y	NA
10451273	10451274	SAAV_2597	SAAV_2598	sdaAB		TRUE	0.934	3.000	0.304	NA	N	NA
10451275	10451276	SAAV_2599	SAAV_2600			FALSE	0.092	192.000	0.000	1.000		NA
10451277	10451278	SAAV_2601	SAAV_2602			FALSE	0.221	121.000	0.000	1.000		NA
10451278	10451279	SAAV_2602	SAAV_2603			TRUE	0.573	42.000	0.047	NA		NA
10451279	10451280	SAAV_2603	SAAV_2604			FALSE	0.024	380.000	0.000	NA		NA
10451280	10451281	SAAV_2604	SAAV_2605			FALSE	0.062	301.000	0.000	1.000	N	NA
10451281	10451282	SAAV_2605	SAAV_2606			TRUE	0.794	51.000	0.300	1.000	N	NA
10451282	10451283	SAAV_2606	SAAV_2607			TRUE	0.958	-7.000	0.070	1.000		NA
10451283	10451284	SAAV_2607	SAAV_2608			FALSE	0.076	213.000	0.000	1.000		NA
10451285	10451286	SAAV_2609	SAAV_2610			FALSE	0.023	390.000	0.000	NA		NA
10451291	10451292	SAAV_2615	SAAV_2616			TRUE	0.922	13.000	0.517	NA		NA
10451292	10451293	SAAV_2616	SAAV_2617			TRUE	0.973	12.000	0.308	1.000	Y	NA
10451293	10451294	SAAV_2617	SAAV_2618			FALSE	0.075	216.000	0.000	1.000		NA
10451296	10451297	SAAV_2620	SAAV_2621			FALSE	0.094	190.000	0.000	1.000		NA
10451298	10451299	SAAV_2622	SAAV_2623			FALSE	0.042	240.000	0.000	NA		NA
10451299	10451300	SAAV_2623	SAAV_2624			FALSE	0.422	411.000	0.118	0.001	Y	NA
10451301	10451302	SAAV_2625	SAAV_2626			TRUE	0.861	23.000	0.100	1.000	N	NA
10451302	10451303	SAAV_2626	SAAV_2627		crtN	FALSE	0.041	428.000	0.000	1.000	N	NA
10451303	10451304	SAAV_2627	SAAV_2628	crtN	crtM	TRUE	0.954	12.000	0.800	1.000	N	NA
10451304	10451305	SAAV_2628	SAAV_2629	crtM		TRUE	0.726	37.000	0.160	NA		NA
10451305	10451306	SAAV_2629	SAAV_2630			TRUE	0.892	6.000	0.263	NA		NA
10451306	10451307	SAAV_2630	SAAV_2631			TRUE	0.966	-7.000	0.211	NA		NA
10451307	10451308	SAAV_2631	SAAV_2632			FALSE	0.072	175.000	0.000	NA		NA
10451308	10451309	SAAV_2632	SAAV_2633			FALSE	0.025	361.000	0.000	NA		NA
10451309	10451310	SAAV_2633	SAAV_2634			FALSE	0.030	513.000	0.000	1.000		NA
10451310	10451311	SAAV_2634	SAAV_2635		isaA	FALSE	0.058	276.000	0.000	1.000		NA
10451311	10451312	SAAV_2635	SAAV_2636	isaA		FALSE	0.017	608.000	0.000	NA		NA
10451313	10451314	SAAV_2637	SAAV_2638			FALSE	0.291	61.000	0.000	NA		NA
10451314	10451315	SAAV_2638	SAAV_2639			FALSE	0.041	246.000	0.000	NA		NA
10451315	10451316	SAAV_2639	SAAV_2640			FALSE	0.046	220.000	0.000	NA		NA
10451317	10451318	SAAV_2641	SAAV_2642			TRUE	0.930	17.000	0.500	NA		NA
10451318	10451319	SAAV_2642	SAAV_2643			TRUE	0.827	20.000	0.111	NA		NA
10451320	10451321	SAAV_2644	SAAV_2645			TRUE	0.981	-7.000	0.333	1.000	N	NA
10451321	10451322	SAAV_2645	SAAV_2646			TRUE	0.568	98.000	0.250	1.000		NA
10451322	10451323	SAAV_2646	SAAV_2647			TRUE	0.820	20.000	0.100	NA		NA
10451324	10451325	SAAV_2648	SAAV_2649			FALSE	0.459	97.000	0.182	NA		NA
10451325	10451326	SAAV_2649	SAAV_2650			TRUE	0.925	15.000	0.267	1.000	N	NA
10451326	10451327	SAAV_2650	SAAV_2651			FALSE	0.028	333.000	0.000	NA		NA
10451327	10451328	SAAV_2651	SAAV_2652			TRUE	0.898	-12.000	0.000	NA		NA
10451328	10451329	SAAV_2652	SAAV_2653			TRUE	0.938	15.000	0.667	NA		NA
10451329	10451330	SAAV_2653	SAAV_2654			FALSE	0.027	344.000	0.000	NA		NA
10451331	10451332	SAAV_2655	SAAV_2656	pyrD		FALSE	0.128	155.000	0.006	NA		NA
10451337	10451338	SAAV_2661	SAAV_2662			TRUE	0.659	16.000	0.000	NA		NA
10451338	10451339	SAAV_2662	SAAV_2663		panD	FALSE	0.052	343.000	0.000	1.000	N	NA
10451339	10451340	SAAV_2663	SAAV_2664	panD	panC	TRUE	0.974	14.000	0.342	1.000	Y	NA
10451340	10451341	SAAV_2664	SAAV_2665	panC	panB	TRUE	0.997	-7.000	0.395	0.001	Y	NA
10451343	10451344	SAAV_2667	SAAV_2668	budA2	ldh2	FALSE	0.068	278.000	0.000	1.000	N	NA
10451347	10451348	SAAV_2671	SAAV_2672		fdaB	FALSE	0.141	123.000	0.000	NA		NA
10451351	10451352	SAAV_2675	SAAV_2676			FALSE	0.145	194.000	0.044	1.000		NA
10451352	10451353	SAAV_2676	SAAV_2677			FALSE	0.216	280.000	0.600	NA		NA
10451353	10451354	SAAV_2677	SAAV_2678		betA	FALSE	0.035	278.000	0.000	NA		NA
10451355	10451356	SAAV_2679	SAAV_2680			FALSE	0.197	89.000	0.000	NA		NA
10451357	10451358	SAAV_2681	SAAV_2682	cudT	nrdG	FALSE	0.035	537.000	0.000	1.000	N	NA
10451358	10451359	SAAV_2682	SAAV_2683	nrdG	nrdD	TRUE	0.970	-3.000	0.240	1.000	N	NA
10451359	10451360	SAAV_2683	SAAV_2684	nrdD		FALSE	0.112	190.000	0.000	1.000	N	NA
10451360	10451361	SAAV_2684	SAAV_2685			FALSE	0.029	322.000	0.000	NA		NA
10451361	10451362	SAAV_2685	SAAV_2686			FALSE	0.223	76.000	0.000	NA		NA
10451362	10451363	SAAV_2686	SAAV_2687			FALSE	0.438	63.000	0.000	1.000	N	NA
10451363	10451364	SAAV_2687	SAAV_2688		gpxA2	FALSE	0.044	394.000	0.000	1.000	N	NA
10451364	10451365	SAAV_2688	SAAV_2689	gpxA2		FALSE	0.016	695.000	0.000	NA		NA
10451365	10451366	SAAV_2689	SAAV_2690			FALSE	0.017	616.000	0.000	NA		NA
10451366	10451367	SAAV_2690	SAAV_2691			TRUE	0.984	-3.000	0.855	1.000		NA
10451367	10451368	SAAV_2691	SAAV_2692			TRUE	0.760	108.000	0.492	0.080	N	NA
10451368	10451369	SAAV_2692	SAAV_2693			TRUE	0.982	11.000	0.812	1.000	Y	NA
10451369	10451370	SAAV_2693	SAAV_2694			TRUE	0.733	26.000	0.047	NA		NA
10451372	10451373	SAAV_2696	SAAV_2697			FALSE	0.143	122.000	0.000	NA		NA
10451373	10451374	SAAV_2697	SAAV_2698			FALSE	0.041	245.000	0.000	NA		NA
10451374	10451375	SAAV_2698	SAAV_2699		clfB	FALSE	0.157	116.000	0.000	NA		NA
10451375	10451376	SAAV_2699	SAAV_2700	clfB		FALSE	0.042	350.000	0.000	1.000		NA
10451376	10451377	SAAV_2700	SAAV_2701		arcC2	FALSE	0.307	99.000	0.000	1.000	N	NA
10451377	10451378	SAAV_2701	SAAV_2702	arcC2	arcD	TRUE	0.969	17.000	0.182	1.000	Y	NA
10451378	10451379	SAAV_2702	SAAV_2703	arcD	arcB2	TRUE	0.660	91.000	0.000	1.000	Y	NA
10451379	10451380	SAAV_2703	SAAV_2704	arcB2	arcA	TRUE	0.915	33.000	0.062	1.000	Y	NA
10451380	10451381	SAAV_2704	SAAV_2705	arcA		FALSE	0.051	347.000	0.000	1.000	N	NA
10451381	10451382	SAAV_2705	SAAV_2706		aur	FALSE	0.048	367.000	0.000	1.000	N	NA
10451385	10451386	SAAV_2709	SAAV_2710			FALSE	0.042	240.000	0.000	NA		NA
10451386	10451387	SAAV_2710	SAAV_2711			TRUE	0.739	76.000	0.111	0.009	N	NA
10451387	10451388	SAAV_2711	SAAV_2712		manA2	TRUE	0.960	14.000	0.111	1.000	Y	NA
10451391	10451392	SAAV_2715	SAAV_2716			FALSE	0.167	169.000	0.061	NA		NA
10451392	10451393	SAAV_2716	SAAV_2717			FALSE	0.042	241.000	0.000	NA		NA
10451393	10451394	SAAV_2717	SAAV_2718			TRUE	0.976	-7.000	0.400	NA		NA
10451394	10451395	SAAV_2718	SAAV_2719			TRUE	0.785	18.000	0.000	1.000	N	NA
10451395	10451396	SAAV_2719	SAAV_2720			TRUE	0.893	-10.000	0.000	NA		NA
10451396	10451397	SAAV_2720	SAAV_2721			TRUE	0.910	-22.000	0.000	NA		NA
10451397	10451398	SAAV_2721	SAAV_2722		asp1	TRUE	0.893	-10.000	0.000	NA		NA
10451398	10451399	SAAV_2722	SAAV_2723	asp1	asp1	FALSE	0.132	130.000	0.000	NA		NA
10451399	10451400	SAAV_2723	SAAV_2724	asp1	secY_1	TRUE	0.685	11.000	0.002	NA		NA
10451400	10451401	SAAV_2724	SAAV_2725	secY_1		FALSE	0.397	130.000	0.002	0.060		NA
10451401	10451402	SAAV_2725	SAAV_2726			FALSE	0.026	353.000	0.000	NA		NA
10451402	10451403	SAAV_2726	SAAV_2727			FALSE	0.210	81.000	0.000	NA		NA
10451404	10451405	SAAV_2728	SAAV_2729			FALSE	0.048	212.000	0.000	NA		NA
10451405	10451406	SAAV_2729	SAAV_2730			FALSE	0.100	154.000	0.000	NA		NA
10451407	10451408	SAAV_2731	SAAV_2732			FALSE	0.311	79.000	0.000	1.000		NA
10451408	10451409	SAAV_2732	SAAV_2733			TRUE	0.802	3.000	0.000	1.000		NA
10451409	10451410	SAAV_2733	SAAV_2734		cap1C	FALSE	0.069	235.000	0.000	1.000		NA
10451410	10451411	SAAV_2734	SAAV_2735	cap1C	cap1B	TRUE	0.911	-3.000	0.000	1.000	N	NA
10451411	10451412	SAAV_2735	SAAV_2736	cap1B	cap1A	TRUE	0.895	17.000	0.115	1.000	N	NA
10451412	10451413	SAAV_2736	SAAV_2737	cap1A	icaR	FALSE	0.031	849.000	0.000	1.000	N	NA
10451414	10451415	SAAV_2738	SAAV_2739	icaA	icaD	TRUE	0.988	-36.000	0.625	NA		NA
10451415	10451416	SAAV_2739	SAAV_2740	icaD	icaB	TRUE	0.980	-3.000	0.833	NA		NA
10451416	10451417	SAAV_2740	SAAV_2741	icaB	icaC	TRUE	0.993	-13.000	0.156	1.000	Y	NA
10451418	10451419	SAAV_2742	SAAV_2743			TRUE	0.543	28.000	0.000	NA		NA
10451419	10451420	SAAV_2743	SAAV_2744			FALSE	0.016	721.000	0.000	NA		NA
10451420	10451421	SAAV_2744	SAAV_2745		hisI	FALSE	0.057	193.000	0.000	NA		NA
10451421	10451422	SAAV_2745	SAAV_2746	hisI	hisF	TRUE	0.996	-3.000	0.430	0.003	Y	NA
10451422	10451423	SAAV_2746	SAAV_2747	hisF	hisA	TRUE	0.990	-3.000	0.002	0.003	Y	NA
10451423	10451424	SAAV_2747	SAAV_2748	hisA	hisH	TRUE	0.993	-7.000	0.009	0.003	Y	NA
10451424	10451425	SAAV_2748	SAAV_2749	hisH	hisB	TRUE	0.994	-3.000	0.125	0.003	Y	NA
10451425	10451426	SAAV_2749	SAAV_2750	hisB		TRUE	0.996	-31.000	0.341	1.000	Y	NA
10451426	10451427	SAAV_2750	SAAV_2752		hisD	TRUE	0.948	16.000	0.009	1.000	Y	NA
10451427	10451428	SAAV_2752	SAAV_2753	hisD	hisG	TRUE	0.993	-7.000	0.007	0.003	Y	NA
10451428	10451429	SAAV_2753	SAAV_2754	hisG	hisZ	TRUE	0.889	18.000	0.239	NA		NA
10451429	10451430	SAAV_2754	SAAV_2755	hisZ		FALSE	0.020	451.000	0.000	NA		NA
10451430	10451431	SAAV_2755	SAAV_2756			FALSE	0.153	118.000	0.000	NA		NA
10451431	10451432	SAAV_2756	SAAV_2757			FALSE	0.428	47.000	0.000	NA	N	NA
10451432	10451433	SAAV_2757	SAAV_2758			TRUE	0.979	-3.000	0.530	1.000		NA
10451433	10451434	SAAV_2758	SAAV_2759			TRUE	0.761	53.000	0.435	NA		NA
10451434	10451435	SAAV_2759	SAAV_2760			TRUE	0.726	29.000	0.068	NA		NA
10451438	10451439	SAAV_2763	SAAV_2764		pcp	FALSE	0.144	152.000	0.013	NA		NA
10451441	10451442	SAAV_2766	SAAV_2767			FALSE	0.042	238.000	0.000	NA		NA
10451444	10451445	SAAV_2769	SAAV_2770		nixA	FALSE	0.207	126.000	0.000	1.000		NA
10451445	10451446	SAAV_2770	SAAV_2771	nixA		FALSE	0.080	243.000	0.000	1.000	N	NA
10451448	10451449	SAAV_2773	SAAV_2774			TRUE	0.990	-10.000	0.857	1.000		NA
10451449	10451450	SAAV_2774	SAAV_2775			FALSE	0.190	92.000	0.000	NA		NA
10451450	10451451	SAAV_2775	SAAV_2776			FALSE	0.023	392.000	0.000	NA		NA
10451452	10451453	SAAV_2777	SAAV_2778			FALSE	0.039	260.000	0.000	NA		NA
10451453	10451454	SAAV_2778	SAAV_2779			TRUE	0.689	83.000	0.714	NA		NA
10451454	10451455	SAAV_2779	SAAV_2780			FALSE	0.020	451.000	0.000	NA		NA
10451455	10451456	SAAV_2780	SAAV_2781		gidB	TRUE	0.717	43.000	0.089	1.000	N	NA
10451456	10451457	SAAV_2781	SAAV_2782	gidB	gidA	TRUE	0.972	0.000	0.466	1.000	N	NA
10451457	10451458	SAAV_2782	SAAV_2783	gidA	trmE	FALSE	0.379	160.000	0.266	1.000		NA
10451458	10451459	SAAV_2783	SAAV_2784	trmE	rnpA	FALSE	0.181	157.000	0.007	1.000		NA
10451459	10451460	SAAV_2784	SAAV_2785	rnpA	rpmH	TRUE	0.654	121.000	0.787	1.000		NA
7766610	7766611	SAAV_b3	SAAV_b4			TRUE	0.496	162.000	0.667	1.000		NA
7766611	7766608	SAAV_b4	SAAV_b1			FALSE	0.401	187.000	0.667	1.000		NA
7766612	7766613	SAAV_c01	SAAV_c02			FALSE	0.015	979.000	0.000	NA		NA
7766613	7766614	SAAV_c02	SAAV_c03			FALSE	0.023	392.000	0.000	NA		NA
7766614	7766615	SAAV_c03	SAAV_c04			TRUE	0.874	13.000	0.000	0.029		NA
7766616	7766617	SAAV_c05	SAAV_c06			TRUE	0.469	51.000	0.000	1.000		NA
7766620	7766621	SAAV_c09	SAAV_c10		scpA	TRUE	0.727	21.000	0.000	1.000		NA
7766621	7766622	SAAV_c10	SAAV_c11	scpA		FALSE	0.030	494.000	0.000	1.000		NA
7766622	7766623	SAAV_c11	SAAV_c12			FALSE	0.025	360.000	0.000	NA		NA
7766623	7766624	SAAV_c12	SAAV_c13			TRUE	0.961	1.000	0.600	NA		NA
7766625	7766626	SAAV_c14	SAAV_c15			TRUE	0.479	32.000	0.000	NA		NA
7766626	7766627	SAAV_c15	SAAV_c16			TRUE	0.629	10.000	0.000	NA		NA
7766630	7766631	SAAV_c19	SAAV_c20			FALSE	0.072	175.000	0.000	NA		NA
7766631	7766632	SAAV_c20	SAAV_c21			TRUE	0.977	-3.000	0.667	NA		NA
7766633	7766634	SAAV_c22	SAAV_c23			FALSE	0.163	113.000	0.000	NA		NA