MicrobesOnline Operon Predictions for Chlamydia trachomatis B/TZ1A828/OT

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 7765714 7765715 CTB_0021 CTB_0031 gatC gatA TRUE 0.995 12.000 0.643 0.005 Y NA
 7765715 7765716 CTB_0031 CTB_0041 gatA gatB TRUE 0.994 2.000 0.492 0.005 Y NA
 7765717 7765718 CTB_0051 CTB_0061     FALSE 0.345 128.000 0.667 NA   NA
 7765722 7765723 CTB_0101 CTB_0111 htrB   FALSE 0.264 131.000 0.222 NA   NA
 7765723 7765724 CTB_0111 CTB_0121     TRUE 0.820 -3.000 0.018 NA   NA
 7765725 7765726 CTB_0131 CTB_0141 cydA cydB TRUE 0.994 12.000 0.622 0.023 Y NA
 7765728 7765729 CTB_0161 CTB_0171     FALSE 0.319 186.000 0.750 NA   NA
 7765732 7765733 CTB_0201 CTB_0211 lepB   FALSE 0.257 186.000 0.333 NA   NA
 7765734 7765735 CTB_0221 CTB_0231 rpmE prfA TRUE 0.530 188.000 0.005 1.000 Y NA
 7765735 7765736 CTB_0231 CTB_0241 prfA   TRUE 0.954 -16.000 0.009 1.000 Y NA
 7765736 7765737 CTB_0241 CTB_0251   ffh TRUE 0.878 -3.000 0.005 1.000 N NA
 7765737 7765738 CTB_0251 CTB_0261 ffh rpsP TRUE 0.933 -9.000 0.361 1.000 N NA
 7765738 7765739 CTB_0261 CTB_0271 rpsP trmD TRUE 0.982 16.000 0.033 1.000 Y NA
 7765739 7765740 CTB_0271 CTB_0281 trmD rplS TRUE 0.978 26.000 0.567 1.000 Y NA
 7765740 7765741 CTB_0281 CTB_0291 rplS rnhB TRUE 0.667 63.000 0.066 1.000 N NA
 7765741 7765742 CTB_0291 CTB_0301 rnhB gmk TRUE 0.832 -9.000 0.003 1.000 N NA
 7765742 7765743 CTB_0301 CTB_0311 gmk   TRUE 0.557 -7.000 0.003 NA   NA
 7765743 7765744 CTB_0311 CTB_0321   metG TRUE 0.796 0.000 0.008 NA   NA
 7765745 7765746 CTB_0331 CTB_0341 recD   FALSE 0.068 248.000 0.000 1.000   NA
 7765748 7765749 CTB_0361 CTB_0362     FALSE 0.032 61.000 0.000 NA   NA
 7765749 10875968 CTB_0362 CTB_t11     FALSE 0.027 65.000 0.000 NA   NA
 10875968 7765750 CTB_t11 CTB_0371     FALSE 0.030 63.000 0.000 NA   NA
 7765750 7765751 CTB_0371 CTB_0381   dcd TRUE 0.822 22.000 0.021 NA   NA
 7765752 7765753 CTB_0391 CTB_0401   ruvB FALSE 0.058 42.000 0.000 NA   NA
 7765753 7765754 CTB_0401 CTB_0411 ruvB   TRUE 0.785 2.000 0.007 NA   NA
 7765755 7765756 CTB_0421 CTB_0431     FALSE 0.382 118.000 0.261 1.000   NA
 7765757 7765758 CTB_0441 CTB_0451 ssb   FALSE 0.349 341.000 0.013 1.000 N NA
 7765758 7765759 CTB_0451 CTB_0452     FALSE 0.264 137.000 0.017 1.000   NA
 7765759 7765760 CTB_0452 CTB_0461     FALSE 0.313 155.000 0.006 0.057   NA
 7765760 7765761 CTB_0461 CTB_0471     FALSE 0.279 95.000 0.007 1.000   NA
 7765761 7765762 CTB_0471 CTB_0481     FALSE 0.246 91.000 0.014 NA   NA
 7765763 7765764 CTB_0491 CTB_0501     FALSE 0.347 104.000 0.400 NA   NA
 7765764 7765765 CTB_0501 CTB_0511   hemN FALSE 0.212 54.000 0.002 NA   NA
 7765765 7765766 CTB_0511 CTB_0521 hemN   TRUE 0.707 -10.000 0.008 NA   NA
 7765767 7765768 CTB_0531 CTB_0541 sucA sucB TRUE 0.989 4.000 0.667 1.000 Y NA
 7765769 7765770 CTB_0551 CTB_0561   gcpE TRUE 0.835 9.000 0.009 NA   NA
 7765770 7765771 CTB_0561 CTB_0571 gcpE   FALSE 0.011 152.000 0.000 NA   NA
 7765771 7765772 CTB_0571 CTB_0581   fer FALSE 0.020 80.000 0.000 NA   NA
 7765772 10875969 CTB_0581 CTB_t22 fer   FALSE 0.065 39.000 0.000 NA   NA
 7765773 7765774 CTB_0591 CTB_0601 flhA fliA FALSE 0.443 108.000 0.025 1.000 N NA
 7765774 7765775 CTB_0601 CTB_0611 fliA tyrS FALSE 0.320 159.000 0.008 1.000 N NA
 7765775 7765776 CTB_0611 CTB_0621 tyrS gnd TRUE 0.942 10.000 0.014 1.000 N NA
 7765777 7765778 CTB_0631 CTB_0641 lepA   FALSE 0.214 186.000 0.002 1.000 N NA
 7765778 7765779 CTB_0641 CTB_0651     FALSE 0.010 351.000 0.000 NA   NA
 7765780 7765781 CTB_0661 CTB_0671     TRUE 0.984 -7.000 0.898 1.000 Y NA
 7765781 7765782 CTB_0671 CTB_0681     TRUE 0.978 1.000 0.012 1.000 Y NA
 7765782 7765783 CTB_0681 CTB_0691     TRUE 0.982 -10.000 0.012 0.006 Y NA
 7765783 7765784 CTB_0691 CTB_0701   dxr TRUE 0.868 27.000 0.008 1.000 N NA
 7765784 7765785 CTB_0701 CTB_0711 dxr   FALSE 0.372 196.000 0.568 1.000   NA
 7765786 7765787 CTB_0721 CTB_0731   recF FALSE 0.105 158.000 0.006 NA   NA
 7765787 7765788 CTB_0731 CTB_0741 recF dnaN TRUE 0.985 0.000 0.318 1.000 Y NA
 7765790 7765791 CTB_0761 CTB_0771 apbE folD TRUE 0.953 -30.000 0.025 1.000 Y NA
 7765791 7765792 CTB_0771 CTB_0781 folD   FALSE 0.144 118.000 0.007 NA   NA
 7765793 7765794 CTB_0791 CTB_0801 ltuB   TRUE 0.771 33.000 0.333 NA   NA
 7765794 7765795 CTB_0801 CTB_0811     TRUE 0.915 10.000 0.333 NA   NA
 7765795 7765796 CTB_0811 CTB_0821     TRUE 0.926 -3.000 1.000 NA   NA
 7765797 7765798 CTB_0831 CTB_0841     FALSE 0.303 170.000 0.038 NA N NA
 7765798 7765799 CTB_0841 CTB_0851   rpmB FALSE 0.195 125.000 0.005 NA N NA
 7765799 7765800 CTB_0851 CTB_0861 rpmB malQ FALSE 0.253 149.000 0.005 1.000 N NA
 7765800 7765801 CTB_0861 CTB_0871 malQ scc1 TRUE 0.948 4.000 0.600 1.000   NA
 7765801 7765802 CTB_0871 CTB_0881 scc1 lcrE TRUE 0.888 38.000 0.240 0.011   NA
 7765802 7765803 CTB_0881 CTB_0891 lcrE lcrD TRUE 0.922 18.000 0.188 1.000   NA
 7765803 7765804 CTB_0891 CTB_0901 lcrD sctU TRUE 0.991 0.000 0.219 0.017 Y NA
 7765806 7765807 CTB_0921 CTB_0931 ribF truB TRUE 0.892 -43.000 0.308 1.000 N NA
 7765807 7765808 CTB_0931 CTB_0941 truB rbfA TRUE 0.942 38.000 0.111 1.000 Y NA
 7765808 7765809 CTB_0941 CTB_0951 rbfA infA TRUE 0.988 7.000 0.530 1.000 Y NA
 7765809 7765810 CTB_0951 CTB_0961 infA nusA TRUE 0.896 -43.000 0.342 1.000 N NA
 7765810 7765811 CTB_0961 CTB_0971 nusA rpsA TRUE 0.453 118.000 0.006 0.056 N NA
 7765812 7765813 CTB_0981 CTB_0991 trxB acpS TRUE 0.934 6.000 0.008 1.000 N NA
 7765815 7765816 CTB_1011 CTB_1021     TRUE 0.713 35.000 0.009 1.000   NA
 7765820 7765821 CTB_1061 CTB_1071     FALSE 0.206 54.000 0.002 NA   NA
 7765822 7765823 CTB_1081 CTB_1091   hsp60_1 FALSE 0.303 128.000 0.400 NA   NA
 7765823 7765824 CTB_1091 CTB_1101 hsp60_1 groES TRUE 0.951 38.000 0.412 1.000 Y NA
 7765824 7765825 CTB_1101 CTB_1111 groES pepF FALSE 0.423 172.000 0.188 1.000 N NA
 7765826 7765827 CTB_1121 CTB_1131 clpB   TRUE 0.811 26.000 0.009 1.000   NA
 7765827 7765828 CTB_1131 CTB_1141   incD FALSE 0.010 186.000 0.000 NA   NA
 7765828 7765829 CTB_1141 CTB_1151 incD incE TRUE 0.517 83.000 1.000 NA   NA
 7765829 7765830 CTB_1151 CTB_1161 incE incF TRUE 0.945 5.000 1.000 NA   NA
 7765830 7765831 CTB_1161 CTB_1171 incF incG TRUE 0.501 87.000 1.000 NA   NA
 7765832 7765833 CTB_1181 CTB_1191 incA   FALSE 0.012 127.000 0.000 NA   NA
 7765834 7765835 CTB_1201 CTB_1211 araD efp TRUE 0.850 -13.000 0.007 1.000 N NA
 7765835 7765836 CTB_1211 CTB_1221 efp accB TRUE 0.956 13.000 0.120 1.000 N NA
 7765836 7765837 CTB_1221 CTB_1231 accB accC TRUE 0.991 4.000 0.011 0.003 Y NA
 7765837 7765838 CTB_1231 CTB_1241 accC rplM FALSE 0.154 223.000 0.000 1.000 N NA
 7765838 7765839 CTB_1241 CTB_1251 rplM rpsI TRUE 0.987 26.000 0.601 0.058 Y NA
 7765840 7765841 CTB_1261 CTB_1271   adk TRUE 0.461 96.000 0.014 1.000 N NA
 7765842 7765843 CTB_1281 CTB_1291     TRUE 0.988 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 7765844 7765845 CTB_1301 CTB_1311     TRUE 0.817 -3.000 0.017 NA   NA
 7765845 7765846 CTB_1311 CTB_1321     FALSE 0.405 78.000 0.017 1.000   NA
 7765847 7765848 CTB_1331 CTB_1341     TRUE 0.542 59.000 0.333 NA   NA
 7765848 7765849 CTB_1341 CTB_1351     FALSE 0.173 90.000 0.007 NA   NA
 7765849 7765850 CTB_1351 CTB_1361     TRUE 0.654 19.000 0.004 NA   NA
 7765850 7765851 CTB_1361 CTB_1371     TRUE 0.806 -22.000 0.012 NA N NA
 7765853 7765854 CTB_1391 CTB_1401     FALSE 0.125 184.000 0.008 NA   NA
 7765854 10875970 CTB_1401 CTB_t31     FALSE 0.024 70.000 0.000 NA   NA
 10875970 7765855 CTB_t31 CTB_1411     FALSE 0.010 258.000 0.000 NA   NA
 7765855 7765856 CTB_1411 CTB_1421     TRUE 0.939 2.000 1.000 NA   NA
 7765856 7765857 CTB_1421 CTB_1431     TRUE 0.936 0.000 1.000 NA   NA
 7765857 7765858 CTB_1431 CTB_1441   pkn1 FALSE 0.198 186.000 0.044 NA   NA
 7765858 7765859 CTB_1441 CTB_1451 pkn1 dnlJ TRUE 0.870 11.000 0.006 1.000   NA
 7765859 7765860 CTB_1451 CTB_1461 dnlJ   FALSE 0.158 98.000 0.006 NA   NA
 7765861 7765862 CTB_1471 CTB_1481 mhpA   FALSE 0.338 200.000 0.857 NA   NA
 7765863 7765864 CTB_1491 CTB_1501 rpmG   TRUE 0.607 36.000 0.006 1.000   NA
 7765864 7765865 CTB_1501 CTB_1511     TRUE 0.988 5.000 0.545 1.000 Y NA
 7765866 7765867 CTB_1521 CTB_1531     FALSE 0.068 186.000 0.000 1.000   NA
 7765867 7765868 CTB_1531 CTB_1541     TRUE 0.722 93.000 0.000 0.023 Y NA
 7765868 7765869 CTB_1541 CTB_1551     TRUE 0.624 514.000 0.000 0.023 Y NA
 7765869 7765870 CTB_1551 CTB_1561     FALSE 0.012 127.000 0.000 NA   NA
 7765870 7765871 CTB_1561 CTB_1571     FALSE 0.010 227.000 0.000 NA   NA
 7765871 7765872 CTB_1571 CTB_1581     FALSE 0.154 -7.000 0.000 NA   NA
 7765872 7765873 CTB_1581 CTB_1591     FALSE 0.011 148.000 0.000 NA   NA
 7765874 7765875 CTB_1601 CTB_1611     FALSE 0.042 53.000 0.000 NA   NA
 7765875 7765876 CTB_1611 CTB_1612     FALSE 0.010 342.000 0.000 NA   NA
 7765876 7765877 CTB_1612 CTB_1613     FALSE 0.010 237.000 0.000 NA   NA
 7765877 7765878 CTB_1613 CTB_1614     FALSE 0.232 4.000 0.000 NA   NA
 7765878 7765879 CTB_1614 CTB_1615     FALSE 0.095 32.000 0.000 NA   NA
 7765879 7765880 CTB_1615 CTB_1616     FALSE 0.077 37.000 0.000 NA   NA
 7765880 7765881 CTB_1616 CTB_1617     FALSE 0.131 -12.000 0.000 NA   NA
 7765881 7765882 CTB_1617 CTB_1621     FALSE 0.241 9.000 0.000 NA   NA
 7765882 7765883 CTB_1621 CTB_1631   trpR FALSE 0.039 56.000 0.000 NA   NA
 7765883 7765884 CTB_1631 CTB_1641 trpR trpB FALSE 0.010 349.000 0.000 NA   NA
 7765884 7765885 CTB_1641 CTB_1651 trpB trpA FALSE 0.154 -7.000 0.000 NA   NA
 7765886 7765887 CTB_1661 CTB_1671     FALSE 0.065 39.000 0.000 NA   NA
 7765887 7765888 CTB_1671 CTB_1672     FALSE 0.026 68.000 0.000 NA   NA
 7765888 7765889 CTB_1672 CTB_1681     FALSE 0.018 87.000 0.000 NA   NA
 7765891 7765892 CTB_1701 CTB_1711 dsbB dsbG TRUE 0.976 -3.000 0.308 NA Y NA
 7765894 7765895 CTB_1731 CTB_1741     FALSE 0.233 144.000 0.111 NA   NA
 7765895 10875971 CTB_1741 CTB_t33     FALSE 0.065 39.000 0.000 NA   NA
 10875971 7765896 CTB_t33 CTB_1751     FALSE 0.010 196.000 0.000 NA   NA
 7765897 7765898 CTB_1761 CTB_1771 kdsB pyrG TRUE 0.866 -24.000 0.018 1.000 N NA
 7765898 7765899 CTB_1771 CTB_1781 pyrG   TRUE 0.842 -13.000 0.006 1.000 N NA
 7765899 7765900 CTB_1781 CTB_1791   zwf FALSE 0.284 117.000 0.004 1.000 N NA
 7765900 7765901 CTB_1791 CTB_1801 zwf devB TRUE 0.970 25.000 0.021 1.000 Y NA
 7765902 7765903 CTB_1811 CTB_1821 dnaX tdk TRUE 0.960 14.000 0.254 1.000 N NA
 7765903 7765904 CTB_1821 CTB_1831 tdk gyrA TRUE 0.917 2.000 0.007 1.000 N NA
 7765904 7765905 CTB_1831 CTB_1841 gyrA gyrB2 TRUE 0.993 15.000 0.306 0.006 Y NA
 7765905 7765906 CTB_1841 CTB_1851 gyrB2   TRUE 0.865 3.000 0.028 NA   NA
 7765906 7765907 CTB_1851 CTB_1861     FALSE 0.011 146.000 0.000 NA   NA
 7765907 7765908 CTB_1861 CTB_1871   tgt FALSE 0.015 104.000 0.000 NA   NA
 7765908 7765909 CTB_1871 CTB_1881 tgt mgtE FALSE 0.261 127.000 0.003 1.000 N NA
 7765909 7765910 CTB_1881 CTB_1891 mgtE   FALSE 0.011 439.000 0.000 NA   NA
 7765911 7765912 CTB_1901 CTB_1911   gcp FALSE 0.118 76.000 0.002 NA   NA
 7765912 7765913 CTB_1911 CTB_1921 gcp oppA3 TRUE 0.783 -36.000 0.006 1.000 N NA
 7765913 7765914 CTB_1921 CTB_1931 oppA3 oppB TRUE 0.802 159.000 0.091 0.023 Y NA
 7765914 7765915 CTB_1931 CTB_1941 oppB oppC TRUE 0.978 32.000 0.273 0.023 Y NA
 7765915 7765916 CTB_1941 CTB_1951 oppC oppD TRUE 0.973 -7.000 0.044 1.000 Y NA
 7765916 7765917 CTB_1951 CTB_1961 oppD oppF TRUE 0.991 15.000 0.044 0.020 Y NA
 7765917 7765918 CTB_1961 CTB_1971 oppF   FALSE 0.010 313.000 0.000 NA   NA
 7765918 7765919 CTB_1971 CTB_1981     TRUE 0.779 30.000 0.217 NA   NA
 7765919 7765920 CTB_1981 CTB_1991   pfkA TRUE 0.942 20.000 0.088 1.000 N NA
 7765920 7765921 CTB_1991 CTB_2001 pfkA   TRUE 0.929 9.000 0.088 1.000   NA
 7765921 7765922 CTB_2001 CTB_2011   pfkA_2 TRUE 0.905 -18.000 0.857 1.000   NA
 10875972 7765923 CTB_t35 CTB_2021   gseA FALSE 0.013 117.000 0.000 NA   NA
 7765923 7765924 CTB_2021 CTB_2031 gseA leuS TRUE 0.883 -3.000 0.006 1.000 N NA
 7765926 7765927 CTB_2051 CTB_2061     TRUE 0.822 19.000 0.012 NA   NA
 7765927 7765928 CTB_2061 CTB_2071   rpiA TRUE 0.726 -10.000 0.011 NA   NA
 7765928 7765929 CTB_2071 CTB_2081 rpiA   FALSE 0.099 95.000 0.003 NA   NA
 7765930 7765931 CTB_2091 CTB_2101 dhnA xasA TRUE 0.974 14.000 1.000 1.000 N NA
 7765931 7765932 CTB_2101 CTB_2111 xasA   TRUE 0.468 94.000 0.250 NA N NA
 7765932 7765933 CTB_2111 CTB_2121   surE FALSE 0.186 131.000 0.015 NA   NA
 7765933 7765934 CTB_2121 CTB_2131 surE ubiA FALSE 0.200 112.000 0.006 1.000   NA
 7765934 7765935 CTB_2131 CTB_2141 ubiA   TRUE 0.977 -3.000 0.029 1.000 Y NA
 7765936 10875973 CTB_2151 CTB_t37     FALSE 0.154 25.000 0.000 NA   NA
 10875973 7765937 CTB_t37 CTB_2161     FALSE 0.010 191.000 0.000 NA   NA
 7765937 7765938 CTB_2161 CTB_2171     FALSE 0.128 27.000 0.000 NA   NA
 7765938 7765939 CTB_2171 CTB_2181     FALSE 0.011 142.000 0.000 NA   NA
 7765939 7765940 CTB_2181 CTB_2191     FALSE 0.011 391.000 0.000 NA   NA
 7765940 7765941 CTB_2191 CTB_2201     FALSE 0.017 91.000 0.000 NA   NA
 7765941 7765942 CTB_2201 CTB_2211     FALSE 0.016 99.000 0.000 NA   NA
 7765942 7765943 CTB_2211 CTB_2221     FALSE 0.397 131.000 1.000 NA   NA
 7765943 7765944 CTB_2221 CTB_2231     FALSE 0.010 271.000 0.000 NA   NA
 7765944 7765945 CTB_2231 CTB_2241     FALSE 0.011 150.000 0.000 NA   NA
 7765946 7765947 CTB_2251 CTB_2261     FALSE 0.328 184.000 0.273 1.000   NA
 7765947 7765948 CTB_2261 CTB_2271   incB FALSE 0.316 105.000 0.273 NA   NA
 7765948 7765949 CTB_2271 CTB_2281 incB incC TRUE 0.550 77.000 1.000 NA   NA
 7765949 7765950 CTB_2281 CTB_2291 incC   TRUE 0.613 58.000 0.667 NA   NA
 7765950 7765951 CTB_2291 CTB_2301     TRUE 0.782 29.000 0.182 NA   NA
 7765952 7765953 CTB_2311 CTB_2321 acpP fabG TRUE 0.733 369.000 0.007 0.014 Y NA
 7765953 7765954 CTB_2321 CTB_2331 fabG fabD TRUE 0.987 -3.000 0.019 0.014 Y NA
 7765954 7765955 CTB_2331 CTB_2341 fabD fabH TRUE 0.988 17.000 0.009 0.014 Y NA
 7765956 7765957 CTB_2351 CTB_2361 recR   FALSE 0.237 375.000 0.003 1.000 N NA
 7765957 7765958 CTB_2361 CTB_2371   ompH TRUE 0.846 69.000 0.175 1.000 Y NA
 7765958 7765959 CTB_2371 CTB_2381 ompH lpxD TRUE 0.959 28.000 0.018 1.000 Y NA
 7765961 7765962 CTB_2401 CTB_2411 pdhA pdhB TRUE 0.990 -7.000 0.456 0.003 Y NA
 7765962 7765963 CTB_2411 CTB_2421 pdhB pdhC TRUE 0.986 5.000 0.254 1.000 Y NA
 7765966 7765967 CTB_2451 CTB_2461 dnaA oxaA TRUE 0.692 77.000 0.714 1.000 N NA
 7765967 7765968 CTB_2461 CTB_2471 oxaA lgt FALSE 0.280 310.000 0.006 1.000 N NA
 7765969 7765970 CTB_2481 CTB_2491     TRUE 0.921 4.000 0.500 NA   NA
 7765972 7765973 CTB_2511 CTB_2521     TRUE 0.862 -10.000 0.545 NA   NA
 7765974 7765975 CTB_2531 CTB_2541     TRUE 0.951 6.000 0.041 1.000 N NA
 7765976 7765977 CTB_2551 CTB_2561   dnaQ TRUE 0.888 9.000 0.050 NA   NA
 7765977 7765978 CTB_2561 CTB_2571 dnaQ   TRUE 0.837 -3.000 0.031 NA   NA
 7765978 7765979 CTB_2571 CTB_2581     TRUE 0.786 -7.000 0.019 NA   NA
 7765980 7765981 CTB_2591 CTB_2601   accA TRUE 0.836 -34.000 0.010 1.000 N NA
 7765981 7765982 CTB_2601 CTB_2611 accA   FALSE 0.150 133.000 0.008 NA   NA
 7765982 7765983 CTB_2611 CTB_2621   ihfA FALSE 0.272 118.000 0.182 NA   NA
 7765983 7765984 CTB_2621 CTB_2631 ihfA amiA FALSE 0.154 220.000 0.000 1.000 N NA
 7765984 7765985 CTB_2631 CTB_2641 amiA murE TRUE 0.941 -85.000 0.014 1.000 Y NA
 7765985 7765986 CTB_2641 CTB_2651 murE pbp TRUE 0.651 323.000 0.022 1.000 Y NA
 7765986 7765987 CTB_2651 CTB_2661 pbp   TRUE 0.803 -13.000 0.135 NA   NA
 7765987 7765988 CTB_2661 CTB_2671   mraW TRUE 0.773 0.000 0.007 NA   NA
 7765989 7765990 CTB_2681 CTB_2691     TRUE 0.911 7.000 0.286 NA   NA
 7765990 7765991 CTB_2691 CTB_2701   dnaA2 FALSE 0.068 243.000 0.000 1.000   NA
 7765991 7765992 CTB_2701 CTB_2711 dnaA2   TRUE 0.614 39.000 0.006 NA N NA
 7765994 7765995 CTB_2731 CTB_2741 nqrB nqrC TRUE 0.993 4.000 0.093 0.003 Y NA
 7765995 7765996 CTB_2741 CTB_2751 nqrC nqrD TRUE 0.984 -10.000 0.034 0.008 Y NA
 7765996 7765997 CTB_2751 CTB_2761 nqrD nqrE TRUE 0.992 6.000 0.034 0.008 Y NA
 7765998 7765999 CTB_2771 CTB_2781 gcsH   TRUE 0.925 20.000 0.857 NA   NA
 7765999 7766000 CTB_2781 CTB_2791     FALSE 0.185 195.000 0.032 NA   NA
 7766000 7766001 CTB_2791 CTB_2801   lplA TRUE 0.949 6.000 0.032 1.000 N NA
 7766005 7766006 CTB_2841 CTB_2851     TRUE 0.526 58.000 0.231 NA   NA
 7766006 7766007 CTB_2851 CTB_2861   ptsN_2 TRUE 0.993 3.000 0.231 0.003 Y NA
 7766007 7766008 CTB_2861 CTB_2871 ptsN_2 dut TRUE 0.926 2.000 0.008 1.000 N NA
 7766008 7766009 CTB_2871 CTB_2881 dut accD TRUE 0.788 37.000 0.008 1.000 N NA
 7766009 7766010 CTB_2881 CTB_2891 accD sodM TRUE 0.517 72.000 0.009 1.000 N NA
 7766010 7766011 CTB_2891 CTB_2901 sodM mrsA FALSE 0.436 132.000 0.067 1.000 N NA
 7766011 7766012 CTB_2901 CTB_2911 mrsA   FALSE 0.186 152.000 0.022 NA   NA
 7766013 7766014 CTB_2921 CTB_2931 rnc radA TRUE 0.850 -16.000 0.007 1.000 N NA
 7766014 7766015 CTB_2931 CTB_2941 radA hemC TRUE 0.691 44.000 0.007 1.000 N NA
 7766015 7766016 CTB_2941 CTB_2951 hemC   FALSE 0.011 393.000 0.000 NA   NA
 7766017 7766018 CTB_2961 CTB_2971 pknD valS TRUE 0.918 15.000 0.006 1.000 N NA
 7766018 7766019 CTB_2971 CTB_2981 valS   FALSE 0.119 127.000 0.006 NA   NA
 7766019 7766020 CTB_2981 CTB_2991   atpK TRUE 0.681 -79.000 0.030 NA   NA
 7766020 7766021 CTB_2991 CTB_3001 atpK atpI TRUE 0.823 63.000 0.848 0.011   NA
 7766021 7766022 CTB_3001 CTB_3011 atpI atpD TRUE 0.993 6.000 0.270 0.011 Y NA
 7766022 7766023 CTB_3011 CTB_3021 atpD atpB TRUE 0.989 -15.000 0.903 0.011 Y NA
 7766023 7766024 CTB_3021 CTB_3031 atpB atpA TRUE 0.994 3.000 0.806 0.011 Y NA
 7766024 7766025 CTB_3031 CTB_3041 atpA   TRUE 0.891 -6.000 0.633 NA   NA
 7766025 7766026 CTB_3041 CTB_3051   atpE FALSE 0.311 167.000 0.667 NA   NA
 7766028 7766029 CTB_3071 CTB_3081   tal TRUE 0.689 45.000 0.667 NA   NA
 7766029 7766030 CTB_3081 CTB_3091 tal rpoC FALSE 0.325 112.000 0.006 1.000 N NA
 7766030 7766031 CTB_3091 CTB_3101 rpoC rpoB TRUE 0.992 25.000 0.851 0.003 Y NA
 7766031 7766032 CTB_3101 CTB_3111 rpoB rplL FALSE 0.437 361.000 0.223 1.000 N NA
 7766032 7766033 CTB_3111 CTB_3121 rplL rplJ TRUE 0.983 32.000 0.884 0.052 Y NA
 7766033 7766034 CTB_3121 CTB_3131 rplJ rplA TRUE 0.988 22.000 0.302 0.071 Y NA
 7766034 7766035 CTB_3131 CTB_3141 rplA rplK TRUE 0.990 23.000 0.838 0.071 Y NA
 7766035 7766036 CTB_3141 CTB_3151 rplK nusG TRUE 0.593 105.000 0.681 1.000 N NA
 7766036 7766037 CTB_3151 CTB_3161 nusG secE TRUE 0.971 4.000 0.843 1.000 N NA
 7766037 10875974 CTB_3161 CTB_t02 secE   FALSE 0.102 31.000 0.000 NA   NA
 10875974 7766038 CTB_t02 CTB_3171   tufA FALSE 0.061 40.000 0.000 NA   NA
 7766038 10875975 CTB_3171 CTB_t03 tufA   FALSE 0.046 47.000 0.000 NA   NA
 10875975 7766039 CTB_t03 CTB_3181   infA2 FALSE 0.010 230.000 0.000 NA   NA
 7766040 7766041 CTB_3191 CTB_3201     TRUE 0.852 -3.000 0.054 NA   NA
 7766042 7766043 CTB_3211 CTB_3221     FALSE 0.010 189.000 0.000 NA   NA
 7766045 7766046 CTB_3241 CTB_3251 tpiS xseA TRUE 0.929 14.000 0.007 1.000 N NA
 7766046 7766047 CTB_3251 CTB_3261 xseA xseB TRUE 0.947 -16.000 0.412 0.003   NA
 7766047 7766048 CTB_3261 CTB_3271 xseB   TRUE 0.800 7.000 0.007 NA   NA
 7766048 7766049 CTB_3271 CTB_3281   dxs TRUE 0.797 -3.000 0.011 NA   NA
 7766049 7766050 CTB_3281 CTB_3291 dxs pykF FALSE 0.325 97.000 0.004 1.000 N NA
 7766050 7766051 CTB_3291 CTB_3301 pykF uvrA TRUE 0.849 23.000 0.002 1.000 N NA
 7766051 7766052 CTB_3301 CTB_3311 uvrA dnaX FALSE 0.441 218.000 0.000 1.000 Y NA
 7766052 7766053 CTB_3311 CTB_3321 dnaX   TRUE 0.869 -7.000 0.411 NA   NA
 7766054 7766055 CTB_3331 CTB_3341 ptsI ptsH TRUE 0.990 0.000 0.026 0.005 Y NA
 7766055 7766056 CTB_3341 CTB_3351 ptsH   FALSE 0.173 137.000 0.013 NA   NA
 7766056 7766057 CTB_3351 CTB_3361     FALSE 0.037 57.000 0.000 NA   NA
 7766059 7766060 CTB_3381 CTB_3391   dnaJ TRUE 0.885 35.000 0.333 1.000 N NA
 7766060 7766061 CTB_3391 CTB_3401 dnaJ rpsU TRUE 0.871 29.000 0.412 1.000   NA
 7766061 7766062 CTB_3401 CTB_3411 rpsU   FALSE 0.169 197.000 0.006 1.000   NA
 7766063 7766064 CTB_3421 CTB_3431 lon   FALSE 0.212 102.000 0.012 NA   NA
 7766064 7766065 CTB_3431 CTB_3441     FALSE 0.010 350.000 0.000 NA   NA
 7766065 7766066 CTB_3441 CTB_3451   xerC FALSE 0.327 62.000 0.004 1.000   NA
 7766066 7766067 CTB_3451 CTB_3461 xerC   TRUE 0.537 54.000 0.010 1.000   NA
 7766067 7766068 CTB_3461 CTB_3471     TRUE 0.640 36.000 0.017 NA   NA
 7766068 7766069 CTB_3471 CTB_3481     TRUE 0.825 -18.000 0.017 NA N NA
 7766069 7766070 CTB_3481 CTB_3491     TRUE 0.924 7.000 0.500 NA   NA
 7766071 7766072 CTB_3501 CTB_3511 secG def FALSE 0.227 156.000 0.002 1.000 N NA
 7766072 7766073 CTB_3511 CTB_3521 def ksgA TRUE 0.446 275.000 0.000 1.000 Y NA
 7766073 7766074 CTB_3521 CTB_3531 ksgA   TRUE 0.827 16.000 0.005 1.000   NA
 7766074 7766075 CTB_3531 CTB_3541     FALSE 0.396 305.000 0.667 1.000   NA
 10875977 7766076 CTB_t05 CTB_3551     FALSE 0.011 155.000 0.000 NA   NA
 7766076 7766077 CTB_3551 CTB_3561     TRUE 0.901 26.000 1.000 NA   NA
 7766078 7766079 CTB_3571 CTB_3581     FALSE 0.010 252.000 0.000 NA   NA
 7766079 7766080 CTB_3581 CTB_3591   dapA FALSE 0.164 162.000 0.014 NA   NA
 7766080 7766081 CTB_3591 CTB_3601 dapA lysC TRUE 0.982 10.000 0.021 1.000 Y NA
 7766081 7766082 CTB_3601 CTB_3611 lysC asd TRUE 0.970 -7.000 0.022 1.000 Y NA
 7766082 7766083 CTB_3611 CTB_3621 asd dapB TRUE 0.983 10.000 0.005 0.066 Y NA
 7766083 7766084 CTB_3621 CTB_3631 dapB   FALSE 0.010 177.000 0.000 NA   NA
 7766085 7766086 CTB_3641 CTB_3651 aroA aroL TRUE 0.922 -58.000 0.006 1.000 Y NA
 7766086 7766087 CTB_3651 CTB_3661 aroL aroC TRUE 0.955 -7.000 0.006 1.000 Y NA
 7766087 7766088 CTB_3661 CTB_3671 aroC aroB TRUE 0.990 -3.000 0.110 0.005 Y NA
 7766088 7766089 CTB_3671 CTB_3681 aroB aroE TRUE 0.974 -19.000 0.007 0.005 Y NA
 7766089 7766090 CTB_3681 CTB_3691 aroE   TRUE 0.646 42.000 0.214 NA   NA
 7766090 7766091 CTB_3691 CTB_3701     FALSE 0.266 141.000 0.300 NA   NA
 7766091 7766092 CTB_3701 CTB_3711     TRUE 0.580 69.000 0.429 1.000   NA
 7766092 7766093 CTB_3711 CTB_3721     FALSE 0.225 16.000 0.000 NA   NA
 7766093 7766094 CTB_3721 CTB_3731     FALSE 0.010 172.000 0.000 NA   NA
 7766095 7766096 CTB_3741 CTB_3751 mdhC ltuA FALSE 0.136 191.000 0.009 NA   NA
 7766096 7766097 CTB_3751 CTB_3761 ltuA pgi FALSE 0.271 115.000 0.133 NA   NA
 7766097 7766098 CTB_3761 CTB_3771 pgi   FALSE 0.160 113.000 0.002 1.000   NA
 7766098 7766099 CTB_3771 CTB_3781   phnP TRUE 0.888 13.000 0.008 1.000   NA
 7766099 7766100 CTB_3781 CTB_3791 phnP artJ TRUE 0.678 29.000 0.005 1.000   NA
 7766100 7766101 CTB_3791 CTB_3801 artJ aroG TRUE 0.847 69.000 0.200 1.000 Y NA
 7766101 7766102 CTB_3801 CTB_3811 aroG   FALSE 0.011 137.000 0.000 NA   NA
 7766104 7766105 CTB_3831 CTB_3841     TRUE 0.687 15.000 0.000 1.000   NA
 7766105 7766106 CTB_3841 CTB_3851     TRUE 0.798 -3.000 0.011 NA   NA
 7766109 7766110 CTB_3881 CTB_3891   dapL FALSE 0.200 108.000 0.012 NA   NA
 7766110 7766111 CTB_3891 CTB_3901 dapL   TRUE 0.882 8.000 0.037 NA   NA
 7766113 7766114 CTB_3921 CTB_3931 proS   TRUE 0.512 69.000 0.007 1.000 N NA
 7766114 7766115 CTB_3931 CTB_3941   grpE TRUE 0.946 -3.000 0.286 1.000 N NA
 7766115 7766116 CTB_3941 CTB_3951 grpE dnaK TRUE 0.987 26.000 0.224 0.010 Y NA
 7766116 7766117 CTB_3951 CTB_3961 dnaK vacB FALSE 0.229 293.000 0.003 1.000 N NA
 7766117 7766118 CTB_3961 CTB_3971 vacB   FALSE 0.010 256.000 0.000 NA   NA
 7766119 7766120 CTB_3981 CTB_3991   sucB TRUE 0.922 32.000 0.857 1.000 N NA
 7766120 7766121 CTB_3991 CTB_4001 sucB gltT TRUE 0.752 246.000 0.714 1.000 Y NA
 7766121 7766122 CTB_4001 CTB_4011 gltT   TRUE 0.921 -3.000 0.013 1.000 N NA
 7766122 7766123 CTB_4011 CTB_4021     FALSE 0.252 166.000 0.006 1.000 N NA
 7766123 7766124 CTB_4021 CTB_4031     TRUE 0.816 -12.000 0.213 NA   NA
 7766124 7766125 CTB_4031 CTB_4041   ribC TRUE 0.725 -3.000 0.006 NA   NA
 7766126 7766127 CTB_4051 CTB_4061   dksA TRUE 0.906 14.000 0.009 NA N NA
 7766127 7766128 CTB_4061 CTB_4071 dksA lspA TRUE 0.950 6.000 0.038 1.000 N NA
 7766128 7766129 CTB_4071 CTB_4081 lspA   TRUE 0.626 102.000 0.038 0.060 N NA
 7766129 7766130 CTB_4081 CTB_4091   pcnB FALSE 0.154 216.000 0.000 1.000 N NA
 7766130 7766131 CTB_4091 CTB_4101 pcnB lpxB TRUE 0.613 61.000 0.010 1.000 N NA
 7766131 7766132 CTB_4101 CTB_4111 lpxB pmpA FALSE 0.176 107.000 0.003 1.000   NA
 7766132 7766133 CTB_4111 CTB_4121 pmpA pmpB TRUE 0.556 139.000 0.400 0.016   NA
 7766133 7766134 CTB_4121 CTB_4131 pmpB pmpC TRUE 0.619 176.000 1.000 0.016   NA
 7766135 7766136 CTB_4141 CTB_4151     TRUE 0.984 -3.000 0.509 1.000 Y NA
 7766136 7766137 CTB_4151 CTB_4161     TRUE 0.979 -9.000 0.616 1.000 Y NA
 7766138 7766139 CTB_4171 CTB_4181   rpmA TRUE 0.479 90.000 0.335 1.000   NA
 7766139 7766140 CTB_4181 CTB_4191 rpmA rplU TRUE 0.983 31.000 0.667 0.049 Y NA
 7766140 10875979 CTB_4191 CTB_t07 rplU   FALSE 0.010 318.000 0.000 NA   NA
 7766141 7766142 CTB_4201 CTB_4211     FALSE 0.178 185.000 0.024 NA   NA
 7766142 7766143 CTB_4211 CTB_4221     TRUE 0.923 17.000 0.667 NA   NA
 7766143 7766144 CTB_4221 CTB_4231     TRUE 0.767 13.000 0.006 NA   NA
 7766144 7766145 CTB_4231 CTB_4241     FALSE 0.260 133.000 0.222 NA   NA
 7766145 7766146 CTB_4241 CTB_4251   rsbV FALSE 0.080 189.000 0.006 NA   NA
 7766146 7766147 CTB_4251 CTB_4261 rsbV   FALSE 0.249 178.000 0.286 NA   NA
 7766147 7766148 CTB_4261 CTB_4271     FALSE 0.145 197.000 0.011 NA   NA
 7766148 7766149 CTB_4271 CTB_4281     TRUE 0.775 -27.000 0.205 NA   NA
 7766149 7766150 CTB_4281 CTB_4291   ubiE TRUE 0.582 -64.000 0.008 NA   NA
 7766151 7766152 CTB_4301 CTB_4311   dapF FALSE 0.321 61.000 0.008 NA   NA
 7766152 7766153 CTB_4311 CTB_4321 dapF clpP TRUE 0.783 -31.000 0.006 1.000 N NA
 7766153 7766154 CTB_4321 CTB_4331 clpP glyA TRUE 0.952 12.000 0.051 1.000 N NA
 7766155 7766156 CTB_4341 CTB_4351   ispF FALSE 0.306 103.000 0.003 1.000 N NA
 7766157 7766158 CTB_4361 CTB_4371   rpsJ TRUE 0.903 17.000 0.006 1.000 N NA
 7766158 7766159 CTB_4371 CTB_4381 rpsJ fusA TRUE 0.977 8.000 0.007 1.000 Y NA
 7766159 7766160 CTB_4381 CTB_4391 fusA rpsG TRUE 0.900 42.000 0.008 1.000 Y NA
 7766160 7766161 CTB_4391 CTB_4401 rpsG rpsL TRUE 0.945 50.000 0.029 0.010 Y NA
 7766162 7766163 CTB_4411 CTB_4421   tsp FALSE 0.267 158.000 0.025 1.000   NA
 7766164 7766165 CTB_4431 CTB_4441 crpA omcB FALSE 0.313 178.000 0.200 1.000   NA
 7766165 7766166 CTB_4441 CTB_4451 omcB omcA TRUE 0.614 147.000 0.600 0.003   NA
 7766168 7766169 CTB_4471 CTB_4481 gltX euo FALSE 0.069 272.000 0.000 1.000   NA
 7766169 7766170 CTB_4481 CTB_4491 euo recJ FALSE 0.072 405.000 0.000 1.000   NA
 7766170 7766171 CTB_4491 CTB_4501 recJ secF FALSE 0.238 117.000 0.007 1.000   NA
 7766171 7766172 CTB_4501 CTB_4511 secF   FALSE 0.011 420.000 0.000 NA   NA
 7766173 7766174 CTB_4521 CTB_4531 uppS cdsA TRUE 0.988 6.000 0.400 1.000 Y NA
 7766174 7766175 CTB_4531 CTB_4541 cdsA cmk TRUE 0.910 -3.000 0.008 1.000 N NA
 7766175 7766176 CTB_4541 CTB_4551 cmk plsC TRUE 0.910 -3.000 0.008 1.000 N NA
 7766176 7766177 CTB_4551 CTB_4561 plsC argS TRUE 0.913 15.000 0.006 1.000 N NA
 7766180 7766181 CTB_4591 CTB_4601     FALSE 0.059 185.000 0.002 NA   NA
 7766181 7766182 CTB_4601 CTB_4611   prfB TRUE 0.967 -3.000 0.006 1.000 Y NA
 7766183 7766184 CTB_4621 CTB_4631     TRUE 0.645 58.000 0.316 1.000   NA
 7766184 7766185 CTB_4631 CTB_4641   ispD TRUE 0.814 -10.000 0.010 1.000   NA
 7766185 7766186 CTB_4641 CTB_4651 ispD truA TRUE 0.928 9.000 0.007 1.000 N NA
 7766188 10875980 CTB_4671 CTB_t08     FALSE 0.012 131.000 0.000 NA   NA
 10875980 7766189 CTB_t08 CTB_4681     FALSE 0.020 81.000 0.000 NA   NA
 7766189 7766190 CTB_4681 CTB_4691   atoS TRUE 0.758 -22.000 0.057 NA   NA
 7766190 7766191 CTB_4691 CTB_4701 atoS atoC TRUE 0.950 43.000 0.019 0.019 Y NA
 7766191 10875981 CTB_4701 CTB_t09 atoC   FALSE 0.026 68.000 0.000 NA   NA
 10875981 7766192 CTB_t09 CTB_4711     FALSE 0.018 86.000 0.000 NA   NA
 7766192 7766193 CTB_4711 CTB_4721   recO TRUE 0.573 -30.000 0.007 NA   NA
 7766194 10875982 CTB_4731 CTB_t10     FALSE 0.012 132.000 0.000 NA   NA
 7766195 7766196 CTB_4741 CTB_4751     TRUE 0.806 6.000 0.007 NA   NA
 7766198 7766199 CTB_4771 CTB_4781 pheT   TRUE 0.715 -3.000 0.006 NA   NA
 7766199 7766200 CTB_4781 CTB_4791     TRUE 0.859 19.000 0.038 NA   NA
 7766201 7766202 CTB_4801 CTB_4811 oppC2 oppB2 TRUE 0.992 2.000 0.400 0.020 Y NA
 7766202 7766203 CTB_4811 CTB_4821 oppB2 oppA4 TRUE 0.958 45.000 0.318 0.020 Y NA
 7766203 7766204 CTB_4821 CTB_4831 oppA4   FALSE 0.165 608.000 0.000 1.000 N NA
 7766204 7766205 CTB_4831 CTB_4841     FALSE 0.320 162.000 0.714 NA   NA
 7766207 7766208 CTB_4861 CTB_4871   hemZ FALSE 0.071 157.000 0.000 1.000   NA
 7766208 7766209 CTB_4871 CTB_4881 hemZ fliY TRUE 0.915 22.000 0.011 1.000 N NA
 7766209 7766210 CTB_4881 CTB_4891 fliY   TRUE 0.608 46.000 0.005 1.000 N NA
 7766210 7766211 CTB_4891 CTB_4901     TRUE 0.847 -3.000 0.008 1.000   NA
 7766211 7766212 CTB_4901 CTB_4911   glgC FALSE 0.422 89.000 0.070 1.000   NA
 7766214 7766215 CTB_4931 CTB_4941 rho   TRUE 0.920 -3.000 0.013 1.000 N NA
 7766215 7766216 CTB_4941 CTB_4951   polA TRUE 0.927 -6.000 0.068 1.000 N NA
 7766216 7766217 CTB_4951 CTB_4961 polA sohB TRUE 0.906 17.000 0.006 1.000 N NA
 7766217 7766218 CTB_4961 CTB_4971 sohB   FALSE 0.351 139.000 0.011 1.000 N NA
 7766218 7766219 CTB_4971 CTB_4981   pgsA FALSE 0.294 212.000 0.000 0.049 N NA
 7766219 10875983 CTB_4981 CTB_t12 pgsA   FALSE 0.010 183.000 0.000 NA   NA
 10875983 7766220 CTB_t12 CTB_4991     FALSE 0.013 125.000 0.000 NA   NA
 7766221 7766222 CTB_5001 CTB_5011 dnaB gidA FALSE 0.158 295.000 0.000 1.000 N NA
 7766222 7766223 CTB_5011 CTB_5021 gidA lplA TRUE 0.870 -10.000 0.008 1.000 N NA
 7766224 7766225 CTB_5031 CTB_5041 ndk ruvA FALSE 0.270 160.000 0.006 1.000 N NA
 7766225 7766226 CTB_5041 CTB_5051 ruvA ruvC TRUE 0.992 20.000 0.451 0.013 Y NA
 7766226 7766227 CTB_5051 CTB_5061 ruvC   FALSE 0.127 108.000 0.006 NA   NA
 7766227 10875984 CTB_5061 CTB_t13     FALSE 0.018 86.000 0.000 NA   NA
 10875984 7766228 CTB_t13 CTB_5071     FALSE 0.013 118.000 0.000 NA   NA
 7766228 7766229 CTB_5071 CTB_5081   gapA TRUE 0.897 11.000 0.128 NA   NA
 7766229 7766230 CTB_5081 CTB_5091 gapA rplQ TRUE 0.643 44.000 0.006 1.000 N NA
 7766230 7766231 CTB_5091 CTB_5101 rplQ rpoA TRUE 0.973 9.000 0.873 1.000 N NA
 7766231 7766232 CTB_5101 CTB_5111 rpoA rpsK TRUE 0.948 21.000 0.308 1.000 N NA
 7766232 7766233 CTB_5111 CTB_5121 rpsK rpsM TRUE 0.992 22.000 0.810 0.047 Y NA
 7766233 7766234 CTB_5121 CTB_5131 rpsM secY TRUE 0.666 56.000 0.011 1.000 N NA
 7766234 7766235 CTB_5131 CTB_5141 secY rplO TRUE 0.955 23.000 0.730 1.000 N NA
 7766235 7766236 CTB_5141 CTB_5151 rplO rpsE TRUE 0.984 -7.000 0.148 0.065 Y NA
 7766236 7766237 CTB_5151 CTB_5161 rpsE rplR TRUE 0.994 15.000 0.814 0.065 Y NA
 7766237 7766238 CTB_5161 CTB_5171 rplR rplF TRUE 0.992 22.000 0.815 0.047 Y NA
 7766238 7766239 CTB_5171 CTB_5181 rplF rpsH TRUE 0.986 28.000 0.808 0.047 Y NA
 7766239 7766240 CTB_5181 CTB_5191 rpsH rplE TRUE 0.989 18.000 0.059 0.047 Y NA
 7766240 7766241 CTB_5191 CTB_5201 rplE rplX TRUE 0.993 2.000 0.758 0.047 Y NA
 7766241 7766242 CTB_5201 CTB_5211 rplX rplN TRUE 0.994 13.000 0.810 0.065 Y NA
 7766242 7766243 CTB_5211 CTB_5221 rplN rpsQ TRUE 0.993 17.000 0.791 0.065 Y NA
 7766243 7766244 CTB_5221 CTB_5231 rpsQ rpmC TRUE 0.990 -7.000 0.828 0.047 Y NA
 7766244 7766245 CTB_5231 CTB_5241 rpmC rplP TRUE 0.993 2.000 0.802 0.047 Y NA
 7766245 7766246 CTB_5241 CTB_5251 rplP rpsC TRUE 0.980 33.000 0.828 0.065 Y NA
 7766246 7766247 CTB_5251 CTB_5261 rpsC rplV TRUE 0.993 10.000 0.719 0.065 Y NA
 7766247 7766248 CTB_5261 CTB_5271 rplV rpsS TRUE 0.992 19.000 0.769 0.065 Y NA
 7766248 7766249 CTB_5271 CTB_5281 rpsS rplB TRUE 0.994 6.000 0.820 0.065 Y NA
 7766249 7766250 CTB_5281 CTB_5291 rplB rplW TRUE 0.984 24.000 0.849 1.000 Y NA
 7766250 7766251 CTB_5291 CTB_5301 rplW rplD TRUE 0.980 16.000 0.013 1.000 Y NA
 7766251 7766252 CTB_5301 CTB_5311 rplD rplC TRUE 0.990 9.000 0.020 0.047 Y NA
 7766252 7766253 CTB_5311 CTB_5321 rplC   FALSE 0.011 435.000 0.000 NA   NA
 7766253 7766254 CTB_5321 CTB_5331   fmt FALSE 0.087 161.000 0.006 NA   NA
 7766254 7766255 CTB_5331 CTB_5341 fmt lpxA TRUE 0.861 -10.000 0.007 1.000 N NA
 7766255 7766256 CTB_5341 CTB_5351 lpxA fabZ TRUE 0.952 12.000 0.048 1.000 N NA
 7766256 7766257 CTB_5351 CTB_5361 fabZ lpxC TRUE 0.919 -3.000 0.012 1.000 N NA
 7766257 7766258 CTB_5361 CTB_5371 lpxC cutE TRUE 0.716 101.000 0.012 1.000 Y NA
 7766258 7766259 CTB_5371 CTB_5381 cutE   TRUE 0.571 64.000 0.072 NA N NA
 7766259 7766260 CTB_5381 CTB_5391   dnaQ2 FALSE 0.344 136.000 0.072 NA N NA
 7766260 7766261 CTB_5391 CTB_5401 dnaQ2   TRUE 0.789 4.000 0.007 NA   NA
 7766261 7766262 CTB_5401 CTB_5411     TRUE 0.672 -21.000 0.010 NA   NA
 10875985 7766263 CTB_t14 CTB_5421   trxA FALSE 0.010 173.000 0.000 NA   NA
 7766264 7766265 CTB_5431 CTB_5441   mip TRUE 0.841 16.000 0.000 1.000 N NA
 7766265 7766266 CTB_5441 CTB_5451 mip aspS FALSE 0.273 137.000 0.006 1.000 N NA
 7766266 7766267 CTB_5451 CTB_5461 aspS hisS TRUE 0.970 -19.000 0.009 0.062 Y NA
 7766268 7766269 CTB_5471 CTB_5481 uhpC dnaE TRUE 0.926 14.000 0.007 1.000 N NA
 7766271 7766272 CTB_5501 CTB_5511     TRUE 0.894 25.000 0.750 NA   NA
 7766272 7766273 CTB_5511 CTB_5521   rsbW TRUE 0.883 -13.000 0.875 NA   NA
 7766275 7766276 CTB_5541 CTB_5551 dacC   FALSE 0.302 134.000 0.455 NA   NA
 7766276 7766277 CTB_5551 CTB_5561     TRUE 0.824 -3.000 0.020 NA   NA
 7766277 7766278 CTB_5561 CTB_5571   brnQ FALSE 0.237 150.000 0.008 NA N NA
 7766278 7766279 CTB_5571 CTB_5581 brnQ   TRUE 0.483 175.000 0.545 1.000 N NA
 7766279 7766280 CTB_5581 CTB_5591     FALSE 0.295 178.000 0.600 NA   NA
 7766280 7766281 CTB_5591 CTB_5601   lpdA FALSE 0.010 209.000 0.000 NA   NA
 7766281 7766282 CTB_5601 CTB_5611 lpdA lipA TRUE 0.913 -3.000 0.009 1.000 N NA
 7766282 7766283 CTB_5611 CTB_5621 lipA sctJ FALSE 0.308 104.000 0.004 1.000 N NA
 7766283 7766284 CTB_5621 CTB_5631 sctJ   TRUE 0.934 1.000 0.875 NA   NA
 7766284 7766285 CTB_5631 CTB_5641   sctL FALSE 0.291 276.000 0.556 NA   NA
 7766285 7766286 CTB_5641 CTB_5651 sctL sctR TRUE 0.990 13.000 0.700 1.000 Y NA
 7766286 7766287 CTB_5651 CTB_5661 sctR sctS TRUE 0.994 12.000 0.700 0.013 Y NA
 7766287 7766288 CTB_5661 CTB_5671 sctS sctT TRUE 0.991 7.000 0.875 1.000 Y NA
 7766289 7766290 CTB_5681 CTB_5691     TRUE 0.489 91.000 1.000 NA   NA
 7766290 7766291 CTB_5691 CTB_5701     TRUE 0.932 6.000 0.667 NA   NA
 7766291 7766292 CTB_5701 CTB_5711     TRUE 0.860 -15.000 0.667 NA   NA
 7766292 7766293 CTB_5711 CTB_5721   gspG TRUE 0.855 -16.000 0.667 NA   NA
 7766293 7766294 CTB_5721 CTB_5731 gspG gspF TRUE 0.813 62.000 0.030 NA Y NA
 7766294 7766295 CTB_5731 CTB_5741 gspF gspE TRUE 0.984 12.000 0.035 1.000 Y NA
 7766295 7766296 CTB_5741 CTB_5751 gspE gspD TRUE 0.973 -16.000 0.467 1.000 Y NA
 7766296 7766297 CTB_5751 CTB_5761 gspD   TRUE 0.911 1.000 0.467 NA   NA
 7766297 7766298 CTB_5761 CTB_5771   pepP FALSE 0.184 128.000 0.014 NA   NA
 7766298 7766299 CTB_5771 CTB_5781 pepP mutL TRUE 0.929 11.000 0.007 1.000 N NA
 7766300 7766301 CTB_5791 CTB_5801 scc2   TRUE 0.905 17.000 0.333 NA   NA
 7766301 7766302 CTB_5801 CTB_5811   copB TRUE 0.810 37.000 0.857 NA   NA
 7766302 7766303 CTB_5811 CTB_5821 copB copD TRUE 0.943 31.000 0.750 0.009   NA
 7766305 7766306 CTB_5841 CTB_5851 thrS minD FALSE 0.394 451.000 0.035 1.000 N NA
 7766306 7766307 CTB_5851 CTB_5861 minD gp6D TRUE 0.941 5.000 0.875 NA   NA
 7766307 7766308 CTB_5861 CTB_5871 gp6D   TRUE 0.834 -34.000 0.750 NA   NA
 7766308 7766309 CTB_5871 CTB_5881   trpS FALSE 0.194 199.000 0.039 NA   NA
 7766309 7766310 CTB_5881 CTB_5891 trpS uvrB TRUE 0.922 25.000 0.006 0.061 N NA
 7766310 7766311 CTB_5891 CTB_5901 uvrB eno FALSE 0.265 162.000 0.006 1.000 N NA
 7766311 7766312 CTB_5901 CTB_5911 eno rbsU FALSE 0.298 127.000 0.006 1.000 N NA
 7766312 7766313 CTB_5911 CTB_5921 rbsU   TRUE 0.460 125.000 0.750 1.000   NA
 7766314 7766315 CTB_5931 CTB_5941   sdhB TRUE 0.714 29.000 0.019 NA   NA
 7766315 7766316 CTB_5941 CTB_5951 sdhB sdhA FALSE 0.021 79.000 0.000 NA   NA
 7766316 7766317 CTB_5951 CTB_5961 sdhA   FALSE 0.186 -3.000 0.000 NA   NA
 7766317 7766318 CTB_5961 CTB_5971     FALSE 0.011 147.000 0.000 NA   NA
 7766318 7766319 CTB_5971 CTB_5981   dsdD FALSE 0.350 85.000 0.008 NA N NA
 7766320 7766321 CTB_5991 CTB_6001 exbB   TRUE 0.991 -3.000 0.583 0.033 Y NA
 7766321 7766322 CTB_6001 CTB_6011     TRUE 0.918 3.000 0.500 NA   NA
 7766322 7766323 CTB_6011 CTB_6021   tolB TRUE 0.925 0.000 0.750 NA   NA
 7766323 7766324 CTB_6021 CTB_6031 tolB pal TRUE 0.944 -3.000 0.750 NA N NA
 7766324 7766325 CTB_6031 CTB_6041 pal   TRUE 0.533 -10.000 0.000 1.000   NA
 7766325 7766326 CTB_6041 CTB_6051     FALSE 0.023 71.000 0.000 NA   NA
 7766327 10875986 CTB_6061 CTB_t15 ahpC   FALSE 0.141 26.000 0.000 NA   NA
 10875986 7766328 CTB_t15 CTB_6071   groEL2 FALSE 0.014 111.000 0.000 NA   NA
 7766328 7766329 CTB_6071 CTB_6081 groEL2   FALSE 0.380 77.000 0.128 NA   NA
 7766331 7766332 CTB_6101 CTB_6111   ung TRUE 0.799 -15.000 0.140 NA   NA
 7766333 7766334 CTB_6121 CTB_6131 uvrD rpoN TRUE 0.941 4.000 0.015 1.000 N NA
 7766335 7766336 CTB_6141 CTB_6151     TRUE 0.853 -3.000 0.055 NA   NA
 7766336 7766337 CTB_6151 CTB_6161   folA TRUE 0.694 -28.000 0.017 NA   NA
 7766337 7766338 CTB_6161 CTB_6171 folA folP TRUE 0.975 -3.000 0.015 1.000 Y NA
 7766338 7766339 CTB_6171 CTB_6181 folP folX TRUE 0.977 -3.000 0.030 1.000 Y NA
 7766339 7766340 CTB_6181 CTB_6191 folX rpoD TRUE 0.938 19.000 0.030 1.000 N NA
 7766340 7766341 CTB_6191 CTB_6201 rpoD   FALSE 0.356 149.000 0.857 NA   NA
 7766342 7766343 CTB_6211 CTB_6221 rpsT   FALSE 0.070 232.000 0.004 NA   NA
 7766346 7766347 CTB_6251 CTB_6261     FALSE 0.010 228.000 0.000 NA   NA
 7766347 7766348 CTB_6261 CTB_6271     FALSE 0.407 108.000 0.833 NA   NA
 7766348 7766349 CTB_6271 CTB_6281   mviN FALSE 0.127 243.000 0.008 NA   NA
 7766353 7766354 CTB_6321 CTB_6331 ispA glmU TRUE 0.613 56.000 0.054 1.000   NA
 7766354 7766355 CTB_6331 CTB_6341 glmU   TRUE 0.675 53.000 0.250 1.000   NA
 7766356 10875987 CTB_6351 CTB_t16     FALSE 0.015 101.000 0.000 NA   NA
 7766359 7766360 CTB_6381 CTB_6391 nqrA   TRUE 0.856 22.000 0.086 NA   NA
 7766362 7766363 CTB_6411 CTB_6421 aspC   TRUE 0.787 -25.000 0.005 1.000 N NA
 7766364 7766365 CTB_6431 CTB_6441 recB recC TRUE 0.994 2.000 0.542 0.005 Y NA
 7766369 7766370 CTB_6481 CTB_6491     TRUE 0.678 -21.000 0.005 1.000   NA
 7766371 7766372 CTB_6501 CTB_6511     TRUE 0.936 0.000 1.000 NA   NA
 7766372 7766373 CTB_6511 CTB_6521     TRUE 0.862 -9.000 0.429 NA   NA
 7766373 7766374 CTB_6521 CTB_6531     TRUE 0.743 3.000 0.006 NA   NA
 7766374 7766375 CTB_6531 CTB_6541   recA FALSE 0.157 261.000 0.000 1.000 N NA
 7766375 7766376 CTB_6541 CTB_6551 recA   FALSE 0.069 286.000 0.000 1.000   NA
 7766376 7766377 CTB_6551 CTB_6561   recD TRUE 0.885 -3.000 0.023 1.000   NA
 7766377 7766378 CTB_6561 CTB_6571 recD   FALSE 0.272 66.000 0.008 NA   NA
 7766379 7766380 CTB_6581 CTB_6591     TRUE 0.834 9.000 0.009 NA   NA
 7766380 7766381 CTB_6591 CTB_6601   kdsA TRUE 0.793 -3.000 0.011 NA   NA
 10875989 7766382 CTB_t18 CTB_6611     FALSE 0.014 106.000 0.000 NA   NA
 7766382 7766383 CTB_6611 CTB_6621     TRUE 0.936 0.000 1.000 NA   NA
 7766383 7766384 CTB_6621 CTB_6631   sfhB FALSE 0.102 82.000 0.002 NA   NA
 7766384 7766385 CTB_6631 CTB_6641 sfhB   FALSE 0.385 100.000 0.004 0.042   NA
 7766386 7766387 CTB_6651 CTB_6661 gyrA2 gyrB TRUE 0.993 15.000 0.110 0.005 Y NA
 7766388 7766389 CTB_6671 CTB_6681 hemA sycE FALSE 0.073 719.000 0.000 1.000   NA
 7766389 7766390 CTB_6681 CTB_6691 sycE   TRUE 0.895 4.000 0.146 NA   NA
 7766390 7766391 CTB_6691 CTB_6701     TRUE 0.606 44.000 0.171 NA   NA
 7766391 7766392 CTB_6701 CTB_6711     TRUE 0.882 27.000 0.857 NA   NA
 7766392 7766393 CTB_6711 CTB_6721     FALSE 0.204 19.000 0.000 NA   NA
 7766393 7766394 CTB_6721 CTB_6731     FALSE 0.195 20.000 0.000 NA   NA
 7766394 7766395 CTB_6731 CTB_6741   sctN TRUE 0.935 2.000 0.857 NA   NA
 7766395 7766396 CTB_6741 CTB_6751 sctN   TRUE 0.915 23.000 0.875 NA   NA
 7766396 7766397 CTB_6751 CTB_6761     TRUE 0.933 4.000 0.750 NA   NA
 7766397 7766398 CTB_6761 CTB_6771   sctQ TRUE 0.928 10.000 0.600 NA   NA
 7766398 7766399 CTB_6771 CTB_6781 sctQ pkn5 TRUE 0.518 135.000 0.583 1.000 N NA
 7766399 7766400 CTB_6781 CTB_6791 pkn5   TRUE 0.943 -3.000 0.208 1.000 N NA
 7766400 10875990 CTB_6791 CTB_t19     FALSE 0.011 135.000 0.000 NA   NA
 7766401 7766402 CTB_6801 CTB_6811 aspC   TRUE 0.919 -10.000 0.848 1.000   NA
 7766402 10875991 CTB_6811 CTB_t20     FALSE 0.016 97.000 0.000 NA   NA
 10875991 7766403 CTB_t20 CTB_6821   rrf FALSE 0.010 193.000 0.000 NA   NA
 7766403 7766404 CTB_6821 CTB_6831 rrf pyrH TRUE 0.956 -3.000 0.626 1.000 N NA
 7766404 7766405 CTB_6831 CTB_6841 pyrH tsf TRUE 0.964 13.000 0.416 1.000 N NA
 7766405 7766406 CTB_6841 CTB_6851 tsf rpsB TRUE 0.986 -3.000 0.748 1.000 Y NA
 7766406 10875992 CTB_6851 CTB_t23 rpsB   FALSE 0.019 83.000 0.000 NA   NA
 10875992 7766407 CTB_t23 CTB_6861   ompA FALSE 0.010 221.000 0.000 NA   NA
 7766408 7766409 CTB_6871 CTB_6881 pbpB   TRUE 0.607 64.000 0.400 1.000   NA
 7766409 7766410 CTB_6881 CTB_6891     FALSE 0.070 343.000 0.000 1.000   NA
 7766410 7766411 CTB_6891 CTB_6901     TRUE 0.987 3.000 0.466 1.000 Y NA
 7766411 7766412 CTB_6901 CTB_6911     TRUE 0.988 4.000 0.482 1.000 Y NA
 7766412 7766413 CTB_6911 CTB_6921   sufS TRUE 0.928 -7.000 0.193 1.000 N NA
 7766413 7766414 CTB_6921 CTB_6931 sufS parB FALSE 0.245 136.000 0.002 1.000 N NA
 7766415 7766416 CTB_6941 CTB_6951 dppF dppD TRUE 0.955 -7.000 0.250 0.003   NA
 7766417 7766418 CTB_6961 CTB_6971     TRUE 0.939 3.000 0.937 NA   NA
 7766418 7766419 CTB_6971 CTB_6981   pgk FALSE 0.171 127.000 0.005 1.000   NA
 7766419 7766420 CTB_6981 CTB_6991 pgk   FALSE 0.010 259.000 0.000 NA   NA
 7766420 7766421 CTB_6991 CTB_7001     TRUE 0.609 51.000 0.333 NA   NA
 7766421 7766422 CTB_7001 CTB_7011     TRUE 0.506 86.000 1.000 NA   NA
 7766423 7766424 CTB_7021 CTB_7031 nth trmE TRUE 0.883 7.000 0.007 1.000   NA
 7766425 7766426 CTB_7041 CTB_7051 psdD   TRUE 0.521 65.000 0.052 1.000   NA
 7766426 7766427 CTB_7051 CTB_7061   secA FALSE 0.242 259.000 0.015 1.000   NA
 7766428 7766429 CTB_7071 CTB_7081   engA FALSE 0.148 77.000 0.005 NA   NA
 7766429 7766430 CTB_7081 CTB_7091 engA pcnB FALSE 0.205 116.000 0.006 1.000   NA
 7766430 7766431 CTB_7091 CTB_7101 pcnB clpX TRUE 0.914 15.000 0.006 1.000 N NA
 7766431 7766432 CTB_7101 CTB_7111 clpX clpP TRUE 0.987 10.000 0.352 1.000 Y NA
 7766432 7766433 CTB_7111 CTB_7121 clpP tig TRUE 0.721 167.000 0.351 1.000 Y NA
 7766433 10875993 CTB_7121 CTB_t24 tig   FALSE 0.083 36.000 0.000 NA   NA
 7766434 7766435 CTB_7131 CTB_7141   mreB TRUE 0.935 5.000 0.009 1.000 N NA
 7766435 7766436 CTB_7141 CTB_7151 mreB pckA TRUE 0.917 -3.000 0.011 1.000 N NA
 7766436 7766437 CTB_7151 CTB_7161 pckA   FALSE 0.227 112.000 0.026 NA   NA
 7766437 7766438 CTB_7161 CTB_7171     TRUE 0.890 27.000 1.000 NA   NA
 7766439 7766440 CTB_7181 CTB_7191 ompB gpdA FALSE 0.381 133.000 0.375 1.000   NA
 7766440 7766441 CTB_7191 CTB_7201 gpdA   TRUE 0.934 -3.000 0.044 1.000 N NA
 7766441 7766442 CTB_7201 CTB_7211     TRUE 0.885 12.000 0.044 NA   NA
 7766442 7766443 CTB_7211 CTB_7221   fliI TRUE 0.875 -7.000 0.500 NA   NA
 7766443 7766444 CTB_7221 CTB_7231 fliI   TRUE 0.502 74.000 0.667 NA   NA
 7766444 7766445 CTB_7231 CTB_7241   fliF TRUE 0.923 5.000 0.500 NA   NA
 7766445 7766446 CTB_7241 CTB_7251 fliF   FALSE 0.330 273.000 0.136 NA N NA
 7766446 7766447 CTB_7251 CTB_7261     TRUE 0.940 -3.000 0.138 1.000 N NA
 7766447 7766448 CTB_7261 CTB_7271   pgmA TRUE 0.850 -45.000 0.021 1.000 N NA
 7766449 7766450 CTB_7281 CTB_7291     FALSE 0.255 119.000 0.080 NA   NA
 7766450 7766451 CTB_7291 CTB_7301   birA TRUE 0.791 27.000 0.061 NA   NA
 7766452 7766453 CTB_7311 CTB_7321     TRUE 0.682 92.000 0.078 0.044 N NA
 7766453 7766454 CTB_7321 CTB_7331     TRUE 0.808 24.000 0.026 NA   NA
 7766454 7766455 CTB_7331 CTB_7341   serS TRUE 0.682 37.000 0.057 NA   NA
 7766456 7766457 CTB_7351 CTB_7361 ribD ribA TRUE 0.803 110.000 0.007 0.005 Y NA
 7766457 7766458 CTB_7361 CTB_7371 ribA ribH TRUE 0.968 -31.000 0.006 0.005 Y NA
 7766460 7766461 CTB_7391 CTB_7401   dagA FALSE 0.325 105.000 0.316 NA   NA
 7766461 7766462 CTB_7401 CTB_7411 dagA   TRUE 0.548 58.000 0.316 NA   NA
 7766463 7766464 CTB_7421 CTB_7431     TRUE 0.878 -3.000 0.016 1.000   NA
 7766464 7766465 CTB_7431 CTB_7441   ftsK TRUE 0.905 4.000 0.016 1.000   NA
 7766465 10875994 CTB_7441 CTB_t25 ftsK   FALSE 0.010 181.000 0.000 NA   NA
 10875995 10875996 CTB_r3 CTB_r1     FALSE 0.013 118.000 0.000 NA   NA
 7766466 7766467 CTB_7451 CTB_7461 dmpP   FALSE 0.223 143.000 0.007 NA N NA
 7766467 7766468 CTB_7461 CTB_7471     FALSE 0.272 105.000 0.007 NA N NA
 7766468 7766469 CTB_7471 CTB_7481   hctA FALSE 0.279 188.000 0.048 1.000   NA
 7766471 7766472 CTB_7501 CTB_7511 hemG hemN TRUE 0.990 -3.000 0.057 0.005 Y NA
 7766472 7766473 CTB_7511 CTB_7521 hemN hemE TRUE 0.976 -27.000 0.012 0.005 Y NA
 7766473 7766474 CTB_7521 CTB_7531 hemE mfd TRUE 0.922 13.000 0.006 1.000 N NA
 7766474 7766475 CTB_7531 CTB_7541 mfd alaS TRUE 0.813 -24.000 0.006 1.000 N NA
 10875997 10875998 CTB_r5 CTB_r4     FALSE 0.011 3299.000 0.000 NA   NA
 10875998 7766476 CTB_r4 CTB_7551   tktB FALSE 0.010 277.000 0.000 NA   NA
 7766479 7766480 CTB_7581 CTB_7591     TRUE 0.547 47.000 0.054 NA   NA
 7766480 7766481 CTB_7591 CTB_7601   groEL FALSE 0.414 81.000 0.027 1.000   NA
 7766481 10875999 CTB_7601 CTB_t26 groEL   FALSE 0.021 79.000 0.000 NA   NA
 7766482 7766483 CTB_7611 CTB_7621 murF mraY TRUE 0.796 146.000 0.018 0.008 Y NA
 7766483 7766484 CTB_7621 CTB_7631 mraY murD TRUE 0.994 12.000 0.647 0.008 Y NA
 7766484 7766485 CTB_7631 CTB_7641 murD nlpD TRUE 0.967 -3.000 0.006 1.000 Y NA
 7766485 7766486 CTB_7641 CTB_7651 nlpD ftsW TRUE 0.951 16.000 0.088 1.000 N NA
 7766486 7766487 CTB_7651 CTB_7661 ftsW murG TRUE 0.850 -91.000 0.037 1.000 N NA
 7766487 7766488 CTB_7661 CTB_7671 murG murC TRUE 0.986 5.000 0.270 1.000 Y NA
 7766489 7766490 CTB_7681 CTB_7691     FALSE 0.074 158.000 0.005 NA   NA
 7766491 7766492 CTB_7701 CTB_7711 rbsV miaA TRUE 0.949 4.000 0.040 1.000 N NA
 7766494 7766495 CTB_7731 CTB_7741     FALSE 0.011 454.000 0.000 NA   NA
 7766495 7766496 CTB_7741 CTB_7751   fabF TRUE 0.813 11.000 0.008 NA   NA
 7766496 7766497 CTB_7751 CTB_7761 fabF   TRUE 0.949 -3.000 0.333 1.000 N NA
 7766501 7766502 CTB_7801 CTB_7811   aas TRUE 0.991 8.000 0.032 0.037 Y NA
 7766502 7766503 CTB_7811 CTB_7821 aas bioF TRUE 0.772 43.000 0.032 1.000 N NA
 7766504 7766505 CTB_7831 CTB_7841 priA   TRUE 0.557 -45.000 0.007 NA   NA
 7766506 7766507 CTB_7851 CTB_7861   lysS FALSE 0.068 232.000 0.000 1.000   NA
 7766510 7766511 CTB_7891 CTB_7901 rnpA rnpA TRUE 0.956 13.000 0.787 1.000   NA
 7766512 7766513 CTB_7911 CTB_7921 rpmJ rpsN TRUE 0.926 24.000 0.013 0.043   NA
 7766514 7766515 CTB_7931 CTB_7941     FALSE 0.013 122.000 0.000 NA   NA
 7766517 7766518 CTB_7961 CTB_7971 uvrC mutS TRUE 0.709 82.000 0.006 1.000 Y NA
 7766519 7766520 CTB_7981 CTB_7991   dnaG FALSE 0.220 2.000 0.000 NA   NA
 7766520 7766521 CTB_7991 CTB_8001 dnaG   FALSE 0.442 85.000 0.625 NA   NA
 7766521 7766522 CTB_8001 CTB_8011     FALSE 0.297 127.000 0.333 NA   NA
 10876000 7766526 CTB_t27 CTB_8051   rplY FALSE 0.010 276.000 0.000 NA   NA
 7766526 7766527 CTB_8051 CTB_8061 rplY pth TRUE 0.992 8.000 0.496 0.068 Y NA
 7766527 7766528 CTB_8061 CTB_8071 pth rpsF TRUE 0.766 138.000 0.029 0.068 Y NA
 7766528 7766529 CTB_8071 CTB_8081 rpsF rpsR TRUE 0.992 17.000 0.319 0.042 Y NA
 7766529 7766530 CTB_8081 CTB_8091 rpsR rplI TRUE 0.991 21.000 0.499 0.042 Y NA
 7766530 7766531 CTB_8091 CTB_8101 rplI ispE TRUE 0.544 64.000 0.007 1.000 N NA
 7766532 7766533 CTB_8111 CTB_8121   ptr FALSE 0.240 179.000 0.250 NA   NA
 7766533 7766534 CTB_8121 CTB_8131 ptr plsB FALSE 0.218 57.000 0.000 1.000   NA
 7766534 7766535 CTB_8131 CTB_8141 plsB cafE TRUE 0.912 13.000 0.019 1.000   NA
 7766536 7766537 CTB_8151 CTB_8161     FALSE 0.091 -51.000 0.000 NA   NA
 7766537 7766538 CTB_8161 CTB_8171   rpmF FALSE 0.241 13.000 0.000 NA   NA
 7766538 7766539 CTB_8171 CTB_8181 rpmF plsX TRUE 0.946 23.000 0.418 1.000 N NA
 7766539 7766540 CTB_8181 CTB_8191 plsX pmpD FALSE 0.143 221.000 0.005 1.000   NA
 7766540 7766541 CTB_8191 CTB_8201 pmpD   FALSE 0.010 244.000 0.000 NA   NA
 7766542 7766543 CTB_8211 CTB_8221     TRUE 0.928 21.000 1.000 NA   NA
 7766544 7766545 CTB_8231 CTB_8241   glmS TRUE 0.948 11.000 0.030 1.000 N NA
 7766545 7766546 CTB_8241 CTB_8251 glmS tyrP FALSE 0.305 103.000 0.003 1.000 N NA
 7766546 7766547 CTB_8251 CTB_8261 tyrP   TRUE 0.884 183.000 1.000 0.003 Y NA
 7766547 7766548 CTB_8261 CTB_8271     TRUE 0.655 42.000 0.250 NA   NA
 7766550 7766551 CTB_8291 CTB_8301 sucC sucD TRUE 0.994 15.000 0.467 0.002 Y NA
 7766551 7766552 CTB_8301 CTB_8311 sucD htrA FALSE 0.425 139.000 0.069 1.000 N NA
 7766552 7766553 CTB_8311 CTB_8321 htrA   FALSE 0.209 200.000 0.000 0.026   NA
 7766554 7766555 CTB_8331 CTB_8341 rmuC pssA TRUE 0.838 4.000 0.011 NA   NA
 7766556 7766557 CTB_8351 CTB_8361 nrdA nrdB TRUE 0.979 38.000 0.564 0.002 Y NA
 7766557 7766558 CTB_8361 CTB_8371 nrdB trmB FALSE 0.202 260.000 0.008 1.000   NA
 7766560 7766561 CTB_8391 CTB_8401 murB nusB FALSE 0.342 133.000 0.008 1.000 N NA
 7766562 7766563 CTB_8411 CTB_8421 infC rpmI TRUE 0.986 20.000 0.652 1.000 Y NA
 7766563 7766564 CTB_8421 CTB_8431 rpmI rplT TRUE 0.994 19.000 0.928 0.042 Y NA
 7766564 7766565 CTB_8431 CTB_8441 rplT pheS TRUE 0.986 7.000 0.202 1.000 Y NA
 7766565 10876002 CTB_8441 CTB_t29 pheS   FALSE 0.220 2.000 0.000 NA   NA
 10876002 7766566 CTB_t29 CTB_8451     FALSE 0.010 225.000 0.000 NA   NA
 7766567 7766568 CTB_8461 CTB_8471     TRUE 0.972 3.000 0.631 0.043   NA
 7766569 7766570 CTB_8481 CTB_8491 tilS ftsH FALSE 0.422 161.000 0.145 1.000 N NA
 7766571 7766572 CTB_8501 CTB_8511 pnp rpsO TRUE 0.969 29.000 0.335 1.000 Y NA
 7766573 7766574 CTB_8521 CTB_8531     TRUE 0.656 32.000 0.013 NA   NA
 7766575 7766576 CTB_8541 CTB_8551     FALSE 0.388 135.000 1.000 NA   NA
 7766576 7766577 CTB_8551 CTB_8561     TRUE 0.941 16.000 1.000 NA   NA
 7766577 7766578 CTB_8561 CTB_8571     TRUE 0.881 28.000 1.000 NA   NA
 7766579 7766580 CTB_8581 CTB_8591     TRUE 0.912 19.000 0.571 NA   NA
 7766581 7766582 CTB_8601 CTB_8611 map   TRUE 0.689 58.000 0.429 NA N NA
 7766582 7766583 CTB_8611 CTB_8621     TRUE 0.975 18.000 0.042 NA Y NA
 7766583 7766584 CTB_8621 CTB_8631     FALSE 0.272 195.000 0.020 NA N NA
 7766586 7766587 CTB_8651 CTB_8671     FALSE 0.010 188.000 0.000 NA   NA
 7766588 7766589 CTB_8681 CTB_8691   cpa FALSE 0.325 114.000 0.400 NA   NA
 7766589 7766590 CTB_8691 CTB_8701 cpa ispH TRUE 0.469 95.000 0.400 1.000   NA
 7766591 7766592 CTB_8711 CTB_8721 copD2 copB2 TRUE 0.946 12.000 1.000 NA   NA
 7766592 7766593 CTB_8721 CTB_8731 copB2 lcrH TRUE 0.878 27.000 0.833 NA   NA
 7766593 7766594 CTB_8731 CTB_8741 lcrH   TRUE 0.826 -78.000 0.833 NA   NA
 7766596 7766597 CTB_8761 CTB_8771   glgB TRUE 0.928 15.000 0.636 NA   NA
 7766598 7766599 CTB_8781 CTB_8791     FALSE 0.266 211.000 0.000 0.002   NA
 7766599 7766600 CTB_8791 CTB_8801   pmpE FALSE 0.393 178.000 0.667 1.000   NA
 7766600 7766601 CTB_8801 CTB_8802 pmpE pmpF TRUE 0.895 3.000 0.000 0.013   NA
 7766602 7766603 CTB_8811 CTB_8821 pmpG pmpH TRUE 0.948 31.000 1.000 0.013   NA
 7766603 7766604 CTB_8821 CTB_8831 pmpH   FALSE 0.011 415.000 0.000 NA   NA