MicrobesOnline Operon Predictions for Corynebacterium kroppenstedtii DSM 44385

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 7746229 7746230 ckrop_0000 ckrop_0001 dnaA   FALSE 0.258 659.000 0.328 1.000 Y NA
 7746230 7746231 ckrop_0001 ckrop_0002     TRUE 0.937 51.000 0.318 1.000 Y NA
 7746231 7746232 ckrop_0002 ckrop_0003     TRUE 0.975 -7.000 0.099 NA   NA
 7746232 7746233 ckrop_0003 ckrop_0004     FALSE 0.239 177.000 0.022 NA   NA
 7746233 7746234 ckrop_0004 ckrop_0005     FALSE 0.024 396.000 0.000 1.000 N NA
 7746240 7746241 ckrop_0012 ckrop_0013   lldD FALSE 0.053 274.000 0.000 1.000 N NA
 7746241 7746242 ckrop_0013 ckrop_0014 lldD lldT FALSE 0.094 386.000 0.000 1.000 Y NA
 7746244 7746245 ckrop_3000 ckrop_0016     TRUE 0.916 14.000 0.143 NA Y NA
 7746246 7746247 ckrop_0017 ckrop_0018     TRUE 0.861 -7.000 0.000 NA   NA
 7746247 7746248 ckrop_0018 ckrop_0019     FALSE 0.199 106.000 0.000 NA   NA
 7746248 7746249 ckrop_0019 ckrop_0020     TRUE 0.555 3.000 0.000 NA   NA
 7746249 7746250 ckrop_0020 ckrop_t0001     FALSE 0.010 541.000 0.000 NA   NA
 7746250 7746251 ckrop_t0001 ckrop_t0002     FALSE 0.284 42.000 0.000 NA   NA
 7746251 7746252 ckrop_t0002 ckrop_0021     FALSE 0.116 166.000 0.000 NA   NA
 7746252 7746253 ckrop_0021 ckrop_0022     TRUE 0.903 0.000 0.053 NA   NA
 7746254 7746255 ckrop_0023 ckrop_0024     TRUE 0.791 -3.000 0.000 NA   NA
 7746257 7746258 ckrop_0026 ckrop_0027 mvaK1 mvaD TRUE 0.997 -3.000 0.281 0.005 Y NA
 7746258 7746259 ckrop_0027 ckrop_0028 mvaD mvaK2 TRUE 0.987 6.000 0.312 0.005 Y NA
 7746259 7746260 ckrop_0028 ckrop_0029 mvaK2 idi TRUE 0.987 -3.000 0.097 0.005 N NA
 7746260 7746261 ckrop_0029 ckrop_0031 idi mvaA FALSE 0.362 144.000 0.013 1.000 N NA
 7746261 7746262 ckrop_0031 ckrop_0032 mvaA mvaS TRUE 0.981 -3.000 0.047 1.000 Y NA
 7746263 7746264 ckrop_0033 ckrop_0034     FALSE 0.047 244.000 0.000 NA   NA
 7746265 7746266 ckrop_0035 ckrop_0036     TRUE 0.579 120.000 0.080 1.000   NA
 7746266 7746267 ckrop_0036 ckrop_0037     FALSE 0.010 546.000 0.000 NA   NA
 7746267 7746268 ckrop_0037 ckrop_0038     FALSE 0.268 56.000 0.000 NA   NA
 7746268 7746269 ckrop_0038 ckrop_0039     FALSE 0.008 889.000 0.000 NA   NA
 7746270 7746271 ckrop_0040 ckrop_0041     FALSE 0.038 263.000 0.000 NA   NA
 7746272 7746273 ckrop_0042 ckrop_0043 oadA   TRUE 0.722 44.000 0.081 1.000 N NA
 7746273 7746274 ckrop_0043 ckrop_0044     TRUE 0.727 11.000 0.047 NA   NA
 7746274 7746275 ckrop_0044 ckrop_0045     FALSE 0.288 27.000 0.000 NA   NA
 7746275 7746276 ckrop_0045 ckrop_0046     FALSE 0.030 287.000 0.000 NA   NA
 7746276 7746277 ckrop_0046 ckrop_0047     FALSE 0.175 124.000 0.000 NA   NA
 7746277 7746278 ckrop_0047 ckrop_0048   lysX FALSE 0.240 70.000 0.000 NA   NA
 7746278 7746279 ckrop_0048 ckrop_0050 lysX gltB FALSE 0.026 302.000 0.000 NA   NA
 7746279 7746280 ckrop_0050 ckrop_0051 gltB gltD TRUE 0.988 0.000 0.043 0.001 Y NA
 7746281 7746282 ckrop_0052 ckrop_0053     FALSE 0.224 83.000 0.000 NA   NA
 7746283 7746284 ckrop_0054 ckrop_0055     FALSE 0.007 1448.000 0.000 NA   NA
 7746284 7746285 ckrop_0055 ckrop_0056     FALSE 0.034 274.000 0.000 NA   NA
 7746285 7746286 ckrop_0056 ckrop_0057     TRUE 0.560 6.000 0.000 1.000   NA
 7746286 7746287 ckrop_0057 ckrop_0058     FALSE 0.288 27.000 0.000 NA   NA
 7746289 7746290 ckrop_0060 ckrop_0061     FALSE 0.307 22.000 0.000 NA   NA
 7746290 7746291 ckrop_0061 ckrop_0062     TRUE 0.845 0.000 0.016 NA   NA
 7746292 7746293 ckrop_0063 ckrop_0064     FALSE 0.007 1395.000 0.000 NA   NA
 7746296 7746297 ckrop_0067 ckrop_0068     FALSE 0.368 169.000 0.060 NA   NA
 7746297 7746298 ckrop_0068 ckrop_0069     TRUE 0.614 1.000 0.000 NA   NA
 7746298 7746299 ckrop_0069 ckrop_0070     FALSE 0.445 16.000 0.000 1.000 N NA
 7746299 7746300 ckrop_0070 ckrop_0071     FALSE 0.277 50.000 0.000 NA   NA
 7746300 7746301 ckrop_0071 ckrop_0072   bglP FALSE 0.083 190.000 0.000 NA   NA
 7746303 7746304 ckrop_0074 ckrop_0075     FALSE 0.256 64.000 0.000 NA   NA
 7746305 7746306 ckrop_0076 ckrop_0077     FALSE 0.237 72.000 0.000 NA   NA
 7746307 7746308 ckrop_0078 ckrop_0079     TRUE 0.677 0.000 0.000 NA   NA
 7746308 7746309 ckrop_0079 ckrop_0080     TRUE 0.557 159.000 0.150 NA   NA
 7746309 7746310 ckrop_0080 ckrop_0081   glrK FALSE 0.381 47.000 0.000 1.000 N NA
 7746311 7746312 ckrop_0082 ckrop_0083 embC   TRUE 0.886 22.000 0.360 NA   NA
 7746312 7746313 ckrop_0083 ckrop_0084     TRUE 0.745 30.000 0.120 NA   NA
 7746314 7746315 ckrop_0085 ckrop_0086     FALSE 0.383 11.000 0.000 NA   NA
 7746317 7746318 ckrop_r01 ckrop_r02     FALSE 0.014 414.000 0.000 NA   NA
 7746318 7746319 ckrop_r02 ckrop_r03     FALSE 0.222 84.000 0.000 NA   NA
 7746319 7746320 ckrop_r03 ckrop_0088     FALSE 0.123 163.000 0.000 NA   NA
 7746320 7746321 ckrop_0088 ckrop_0089     FALSE 0.028 293.000 0.000 NA   NA
 7746321 7746322 ckrop_0089 ckrop_0090     TRUE 0.929 37.000 0.088 0.045 Y NA
 7746322 7746323 ckrop_0090 ckrop_0091     TRUE 0.999 -7.000 0.811 0.045 Y NA
 7746323 7746324 ckrop_0091 ckrop_0092     TRUE 0.993 -3.000 0.725 1.000   NA
 7746325 7746326 ckrop_0093 ckrop_0094     TRUE 0.997 -3.000 0.769 1.000 Y NA
 7746326 7746327 ckrop_0094 ckrop_0095     FALSE 0.441 9.000 0.000 NA   NA
 7746327 7746328 ckrop_0095 ckrop_0096     FALSE 0.272 53.000 0.000 NA   NA
 7746329 7746330 ckrop_0097 ckrop_0098   uspA1 FALSE 0.100 242.000 0.007 NA N NA
 7746330 7746331 ckrop_0098 ckrop_0099 uspA1 mcbR TRUE 0.575 181.000 0.214 1.000 N NA
 7746332 7746333 ckrop_0100 ckrop_0101     TRUE 0.735 13.000 0.069 NA   NA
 7746335 7746336 ckrop_0103 ckrop_0104     TRUE 0.703 146.000 0.273 NA   NA
 7746336 7746337 ckrop_0104 ckrop_0105     FALSE 0.067 520.000 0.111 NA   NA
 7746341 7746342 ckrop_0109 ckrop_0110     FALSE 0.181 163.000 0.000 1.000 N NA
 7746343 7746344 ckrop_0111 ckrop_0112 ldh   TRUE 0.689 43.000 0.065 1.000   NA
 7746344 7746345 ckrop_0112 ckrop_0113     FALSE 0.361 39.000 0.000 1.000   NA
 7746345 7746346 ckrop_0113 ckrop_0114     TRUE 0.620 100.000 0.100 NA   NA
 7746347 7746348 ckrop_0115 ckrop_0116 lytR1   FALSE 0.383 11.000 0.000 NA   NA
 7746348 7746349 ckrop_0116 ckrop_0117     FALSE 0.051 238.000 0.000 NA   NA
 7746349 7746350 ckrop_0117 ckrop_0118     TRUE 0.891 44.000 0.444 NA   NA
 7746351 7746352 ckrop_0119 ckrop_0120     TRUE 0.626 101.000 0.079 1.000 N NA
 7746352 7746353 ckrop_0120 ckrop_0121     FALSE 0.323 76.000 0.000 1.000 N NA
 7746354 7746355 ckrop_0122 ckrop_0123     TRUE 0.982 4.000 0.132 0.003 Y NA
 7746355 7746356 ckrop_0123 ckrop_0124     TRUE 0.970 4.000 0.574 1.000 N NA
 7746356 7746357 ckrop_0124 ckrop_0125     TRUE 0.982 -3.000 0.250 1.000 N NA
 7746357 7746358 ckrop_0125 ckrop_0126   ppp TRUE 0.940 1.000 0.145 1.000 N NA
 7746358 7746359 ckrop_0126 ckrop_0127 ppp   TRUE 0.933 15.000 0.216 NA Y NA
 7746359 7746360 ckrop_0127 ckrop_0128     FALSE 0.418 310.000 0.629 NA   NA
 7746361 7746362 ckrop_t0003 ckrop_0130     FALSE 0.076 199.000 0.000 NA   NA
 7746365 7746366 ckrop_0134 ckrop_0135 eutC eutB TRUE 0.999 -3.000 0.859 0.001 Y NA
 7746366 7746367 ckrop_0135 ckrop_0136 eutB eutP TRUE 0.990 0.000 0.407 1.000 Y NA
 7746367 7746368 ckrop_0136 ckrop_0137 eutP   FALSE 0.009 586.000 0.000 NA   NA
 7746369 7746370 ckrop_0138 ckrop_0139     FALSE 0.208 98.000 0.000 NA   NA
 7746371 7746372 ckrop_0140 ckrop_0141     FALSE 0.280 45.000 0.000 NA   NA
 7746372 7746373 ckrop_0141 ckrop_0142     FALSE 0.249 130.000 0.002 NA   NA
 7746373 7746374 ckrop_0142 ckrop_0143     TRUE 0.867 113.000 0.604 NA   NA
 7746374 7746375 ckrop_0143 ckrop_0144   dnaX FALSE 0.330 164.000 0.031 NA   NA
 7746375 7746376 ckrop_0144 ckrop_0145 dnaX   TRUE 0.626 67.000 0.071 NA   NA
 7746376 7746377 ckrop_0145 ckrop_0146     TRUE 0.650 44.000 0.061 NA   NA
 7746377 7746378 ckrop_0146 ckrop_0147     FALSE 0.275 51.000 0.000 NA   NA
 7746378 7746379 ckrop_0147 ckrop_t0004     FALSE 0.033 277.000 0.000 NA   NA
 7746380 7746381 ckrop_0148 ckrop_0149     TRUE 0.587 2.000 0.000 NA   NA
 7746382 7746383 ckrop_0150 ckrop_0151 dhaM dhaL TRUE 0.969 12.000 0.442 0.003   NA
 7746383 7746384 ckrop_0151 ckrop_0152 dhaL dhaK TRUE 0.967 28.000 0.242 0.003 Y NA
 7746385 7746386 ckrop_0153 ckrop_0154     FALSE 0.022 328.000 0.000 NA   NA
 7746386 7746387 ckrop_0154 ckrop_0155     TRUE 0.630 103.000 0.000 0.005   NA
 7746387 7746388 ckrop_0155 ckrop_0157     FALSE 0.008 828.000 0.000 NA   NA
 7746388 7746389 ckrop_0157 ckrop_0158     FALSE 0.245 68.000 0.000 NA   NA
 7746389 7746390 ckrop_0158 ckrop_0159     FALSE 0.014 420.000 0.000 NA   NA
 7746394 7746395 ckrop_0163 ckrop_0164     FALSE 0.011 499.000 0.000 NA   NA
 7746398 7746399 ckrop_0167 ckrop_0168 gntP gntK TRUE 0.989 0.000 0.353 1.000 Y NA
 7746399 7746400 ckrop_0168 ckrop_0170 gntK   FALSE 0.036 302.000 0.000 1.000   NA
 7746400 7746401 ckrop_0170 ckrop_0171     FALSE 0.364 26.000 0.000 1.000   NA
 7746401 7746402 ckrop_0171 ckrop_0172   cfa1 FALSE 0.306 87.000 0.000 1.000 N NA
 7746402 7746403 ckrop_0172 ckrop_0173 cfa1 cfa2 TRUE 0.887 35.000 0.000 0.002 Y NA
 7746403 7746404 ckrop_0173 ckrop_0174 cfa2   TRUE 0.791 174.000 0.633 1.000 N NA
 7746404 7746405 ckrop_0174 ckrop_0175     TRUE 0.840 -3.000 0.000 1.000   NA
 7746405 7746406 ckrop_0175 ckrop_0176     TRUE 0.996 -10.000 0.796 1.000   NA
 7746406 7746407 ckrop_0176 ckrop_0177     FALSE 0.375 179.000 0.058 1.000 N NA
 7746407 7746408 ckrop_0177 ckrop_0178     FALSE 0.464 11.000 0.000 1.000   NA
 7746410 7746411 ckrop_0180 ckrop_0181     FALSE 0.047 243.000 0.000 NA   NA
 7746412 7746413 ckrop_0182 ckrop_0183     TRUE 0.856 81.000 0.119 1.000 Y NA
 7746415 7746416 ckrop_0185 ckrop_0186     FALSE 0.399 167.000 0.043 1.000 N NA
 7746417 7746418 ckrop_0187 ckrop_0188     FALSE 0.287 41.000 0.000 NA   NA
 7746418 7746419 ckrop_0188 ckrop_0189     FALSE 0.269 55.000 0.000 NA   NA
 7746419 7746420 ckrop_0189 ckrop_0190     TRUE 0.555 3.000 0.000 NA   NA
 7746420 7746421 ckrop_0190 ckrop_0191     FALSE 0.289 38.000 0.000 NA   NA
 7746421 7746422 ckrop_0191 ckrop_0192     FALSE 0.011 492.000 0.000 NA   NA
 7746423 7746424 ckrop_t0005 ckrop_t0006     FALSE 0.086 189.000 0.000 NA   NA
 7746425 7746426 ckrop_0193 ckrop_0194     FALSE 0.045 246.000 0.000 NA   NA
 7746426 7746427 ckrop_0194 ckrop_0195   dccT FALSE 0.016 382.000 0.000 NA   NA
 7746430 7746431 ckrop_0198 ckrop_0199     TRUE 0.668 21.000 0.053 NA   NA
 7746431 7746432 ckrop_0199 ckrop_0200     FALSE 0.080 195.000 0.000 NA   NA
 7746432 7746433 ckrop_0200 ckrop_t0007     FALSE 0.195 109.000 0.000 NA   NA
 7746433 7746434 ckrop_t0007 ckrop_0201     FALSE 0.068 209.000 0.000 NA   NA
 7746434 7746435 ckrop_0201 ckrop_0202     FALSE 0.256 64.000 0.000 NA   NA
 7746435 7746436 ckrop_0202 ckrop_0203     FALSE 0.275 51.000 0.000 NA   NA
 7746439 7746440 ckrop_0206 ckrop_0207     TRUE 0.791 -3.000 0.000 NA   NA
 7746440 7746441 ckrop_0207 ckrop_0208     FALSE 0.017 374.000 0.000 NA   NA
 7746441 7746442 ckrop_0208 ckrop_0209     TRUE 0.587 2.000 0.000 NA   NA
 7746442 7746443 ckrop_0209 ckrop_0210     FALSE 0.311 68.000 0.000 1.000   NA
 7746443 7746444 ckrop_0210 ckrop_0211     FALSE 0.248 112.000 0.000 1.000   NA
 7746444 7746445 ckrop_0211 ckrop_0212     FALSE 0.059 222.000 0.000 NA   NA
 7746445 7746446 ckrop_0212 ckrop_0213     TRUE 0.936 9.000 0.387 NA   NA
 7746448 7746449 ckrop_0215 ckrop_0216   glpK FALSE 0.009 1028.000 0.000 NA N NA
 7746449 7746450 ckrop_0216 ckrop_0217 glpK glpF TRUE 0.583 169.000 0.174 1.000 N NA
 7746450 7746451 ckrop_0217 ckrop_0218 glpF glpD TRUE 0.840 2.000 0.020 1.000 N NA
 7746452 7746453 ckrop_0219 ckrop_0220     TRUE 0.789 9.000 0.000 0.066   NA
 7746453 7746454 ckrop_0220 ckrop_0221     FALSE 0.269 95.000 0.000 1.000   NA
 7746454 7746455 ckrop_0221 ckrop_0222     TRUE 0.755 50.000 0.118 1.000   NA
 7746455 7746456 ckrop_0222 ckrop_0223     TRUE 0.873 103.000 0.588 NA   NA
 7746456 7746457 ckrop_0223 ckrop_0224   galT FALSE 0.451 53.000 0.010 NA   NA
 7746457 7746458 ckrop_0224 ckrop_0225 galT galK TRUE 0.991 0.000 0.370 0.003 N NA
 7746458 7746459 ckrop_0225 ckrop_0226 galK   FALSE 0.388 29.000 0.000 1.000 N NA
 7746461 7746462 ckrop_0229 ckrop_0230 betT gbsA TRUE 0.825 31.000 0.182 1.000 N NA
 7746464 7746465 ckrop_0232 ckrop_0233     FALSE 0.361 36.000 0.000 1.000   NA
 7746465 7746466 ckrop_0233 ckrop_0234     FALSE 0.035 272.000 0.000 NA   NA
 7746466 7746467 ckrop_0234 ckrop_0235     TRUE 0.903 47.000 0.500 NA   NA
 7746467 7746468 ckrop_0235 ckrop_0236     TRUE 0.766 53.000 0.136 1.000   NA
 7746468 7746469 ckrop_0236 ckrop_0238   cmtA FALSE 0.055 260.000 0.000 1.000   NA
 7746469 7746470 ckrop_0238 ckrop_0239 cmtA cmtB FALSE 0.240 261.000 0.000 0.002   NA
 7746470 7746471 ckrop_0239 ckrop_0241 cmtB   TRUE 0.873 114.000 0.643 NA   NA
 7746471 7746472 ckrop_0241 ckrop_0242     TRUE 0.891 25.000 0.409 NA   NA
 7746472 7746473 ckrop_0242 ckrop_0243     FALSE 0.008 695.000 0.000 NA   NA
 7746474 7746475 ckrop_0244 ckrop_0246     FALSE 0.262 61.000 0.000 NA   NA
 7746475 7746476 ckrop_0246 ckrop_0247     TRUE 0.694 120.000 0.184 NA   NA
 7746476 7746477 ckrop_0247 ckrop_0248     TRUE 0.715 20.000 0.080 NA   NA
 7746477 7746478 ckrop_0248 ckrop_0249     TRUE 0.938 -3.000 0.040 NA   NA
 7746479 7746480 ckrop_0250 ckrop_0251     TRUE 0.791 -3.000 0.000 NA   NA
 7746480 7746481 ckrop_0251 ckrop_0252     FALSE 0.316 20.000 0.000 NA   NA
 7746481 7746482 ckrop_0252 ckrop_0253   pck FALSE 0.054 232.000 0.000 NA   NA
 7746482 7746483 ckrop_0253 ckrop_0254 pck   FALSE 0.362 60.000 0.000 1.000 N NA
 7746483 7746484 ckrop_0254 ckrop_0255     TRUE 0.527 81.000 0.023 1.000 N NA
 7746484 7746485 ckrop_0255 ckrop_0256     TRUE 0.516 4.000 0.000 NA   NA
 7746486 7746487 ckrop_0257 ckrop_0258 fadB1 fadA1 TRUE 0.846 99.000 0.130 1.000 Y NA
 7746487 7746488 ckrop_0258 ckrop_0259 fadA1   FALSE 0.065 256.000 0.000 1.000 N NA
 7746488 7746489 ckrop_0259 ckrop_0260     FALSE 0.354 43.000 0.000 1.000   NA
 7746489 7746490 ckrop_0260 ckrop_0261     FALSE 0.086 189.000 0.000 NA   NA
 7746490 7746491 ckrop_0261 ckrop_0262   uspA2 FALSE 0.143 151.000 0.000 NA   NA
 7746492 7746493 ckrop_0263 ckrop_0264     FALSE 0.383 11.000 0.000 NA   NA
 7746493 7746494 ckrop_0264 ckrop_0265     TRUE 0.791 -3.000 0.000 NA   NA
 7746494 7746495 ckrop_0265 ckrop_0267     FALSE 0.268 98.000 0.000 1.000   NA
 7746497 7746498 ckrop_0268 ckrop_0269 dcd   TRUE 0.481 71.000 0.010 1.000 N NA
 7746499 7746500 ckrop_0270 ckrop_0271     FALSE 0.181 196.000 0.015 NA   NA
 7746500 7746501 ckrop_0271 ckrop_0272     FALSE 0.258 63.000 0.000 NA   NA
 7746502 7746503 ckrop_0273 ckrop_0274     FALSE 0.027 300.000 0.000 NA   NA
 7746503 7746504 ckrop_0274 ckrop_0275     FALSE 0.192 112.000 0.000 NA   NA
 7746504 7746505 ckrop_0275 ckrop_0276     FALSE 0.218 87.000 0.000 NA   NA
 7746505 7746506 ckrop_0276 ckrop_0278     FALSE 0.041 257.000 0.000 NA   NA
 7746506 7746507 ckrop_0278 ckrop_0279     TRUE 0.993 -3.000 0.074 0.007 Y NA
 7746507 7746508 ckrop_0279 ckrop_0280     FALSE 0.011 514.000 0.000 NA   NA
 7746508 7746509 ckrop_0280 ckrop_0283     FALSE 0.008 805.000 0.000 NA   NA
 7746509 7746510 ckrop_0283 ckrop_0284   hspR TRUE 0.871 4.000 0.074 1.000 N NA
 7746510 7746511 ckrop_0284 ckrop_0285 hspR   FALSE 0.299 92.000 0.000 1.000 N NA
 7746512 7746513 ckrop_0286 ckrop_0287 pyc   TRUE 0.667 74.000 0.000 1.000 Y NA
 7746513 7746514 ckrop_0287 ckrop_0288     FALSE 0.169 129.000 0.000 NA   NA
 7746514 7746515 ckrop_0288 ckrop_0289     FALSE 0.365 12.000 0.000 NA   NA
 7746515 7746516 ckrop_0289 ckrop_0290     FALSE 0.103 173.000 0.000 NA   NA
 7746517 7746518 ckrop_0291 ckrop_0292     FALSE 0.011 882.000 0.000 1.000   NA
 7746518 7746519 ckrop_0292 ckrop_0293     TRUE 0.677 0.000 0.000 NA   NA
 7746519 7746520 ckrop_0293 ckrop_0294   clpB FALSE 0.007 1064.000 0.000 NA   NA
 7746521 7746522 ckrop_0295 ckrop_0296     TRUE 0.516 4.000 0.000 NA   NA
 7746523 7746524 ckrop_0297 ckrop_0298     FALSE 0.017 498.000 0.000 1.000 N NA
 7746524 7746525 ckrop_0298 ckrop_0299     TRUE 0.921 67.000 0.032 0.001 Y NA
 7746525 7746526 ckrop_0299 ckrop_0300     TRUE 0.913 87.000 0.056 0.002 Y NA
 7746526 7746527 ckrop_0300 ckrop_0301     TRUE 0.598 92.000 0.081 NA   NA
 7746527 7746528 ckrop_0301 ckrop_0302     TRUE 0.544 55.000 0.025 NA   NA
 7746528 7746529 ckrop_0302 ckrop_0303     TRUE 0.971 -7.000 0.050 1.000 N NA
 7746529 7746530 ckrop_0303 ckrop_0304     TRUE 0.628 117.000 0.097 1.000 N NA
 7746531 7746532 ckrop_0305 ckrop_0306     TRUE 0.913 9.000 0.238 1.000   NA
 7746532 7746533 ckrop_0306 ckrop_0307     FALSE 0.147 148.000 0.000 NA   NA
 7746533 7746534 ckrop_0307 ckrop_0308     TRUE 0.982 1.000 0.727 NA   NA
 7746534 7746535 ckrop_0308 ckrop_0309     TRUE 0.898 26.000 0.434 NA N NA
 7746537 7746538 ckrop_0312 ckrop_0313     FALSE 0.289 37.000 0.000 NA   NA
 7746538 7746539 ckrop_0313 ckrop_0314     FALSE 0.015 413.000 0.000 NA   NA
 7746542 7746543 ckrop_0317 ckrop_0319   sigD FALSE 0.046 245.000 0.000 NA   NA
 7746543 7746544 ckrop_0319 ckrop_0320 sigD   TRUE 0.804 169.000 0.714 NA   NA
 7746546 7746547 ckrop_0322 ckrop_0323   guaB2 TRUE 0.676 171.000 0.056 0.002 N NA
 7746547 7746548 ckrop_0323 ckrop_0324 guaB2   TRUE 0.479 68.000 0.009 1.000 N NA
 7746550 7746551 ckrop_0326 ckrop_0327     TRUE 0.961 -3.000 0.107 NA   NA
 7746551 7746552 ckrop_0327 ckrop_0328     TRUE 0.607 53.000 0.036 NA N NA
 7746553 7746554 ckrop_0329 ckrop_0330     TRUE 0.994 0.000 0.674 1.000 Y NA
 7746554 7746555 ckrop_0330 ckrop_0331   metQ TRUE 0.923 0.000 0.000 NA Y NA
 7746557 7746558 ckrop_0334 ckrop_0335     FALSE 0.323 76.000 0.000 1.000 N NA
 7746561 7746562 ckrop_0339 ckrop_0340     TRUE 0.792 116.000 0.333 NA   NA
 7746564 7746565 ckrop_0342 ckrop_0343   cysS TRUE 0.479 41.000 0.002 1.000 N NA
 7746565 7746566 ckrop_0343 ckrop_0344 cysS   TRUE 0.832 83.000 0.088 1.000 Y NA
 7746567 7746568 ckrop_0345 ckrop_0346     TRUE 0.936 33.000 0.291 1.000 Y NA
 7746568 7746569 ckrop_0346 ckrop_0347     TRUE 0.919 10.000 0.078 1.000 Y NA
 7746571 7746572 ckrop_0349 ckrop_0350 otsB   TRUE 0.556 9.000 0.000 1.000 N NA
 7746572 7746573 ckrop_0350 ckrop_0351   otsA TRUE 0.908 -7.000 0.000 1.000 N NA
 7746573 7746574 ckrop_0351 ckrop_0352 otsA   FALSE 0.271 113.000 0.000 1.000 N NA
 7746576 7746577 ckrop_0354 ckrop_0355     TRUE 0.723 102.000 0.186 NA   NA
 7746578 7746579 ckrop_t0009 ckrop_0356     FALSE 0.013 450.000 0.000 NA   NA
 7746581 7746582 ckrop_0358 ckrop_0359     TRUE 0.955 28.000 0.455 1.000 Y NA
 7746582 7746583 ckrop_0359 ckrop_0360     FALSE 0.230 103.000 0.000 NA N NA
 7746585 7746586 ckrop_0362 ckrop_0363 tcsR1 tcsS1 TRUE 0.946 135.000 0.824 1.000 Y NA
 7746588 7746589 ckrop_0365 ckrop_0366   aspB TRUE 0.527 23.000 0.006 1.000 N NA
 7746589 7746590 ckrop_0366 ckrop_0367 aspB   FALSE 0.398 89.000 0.004 1.000 N NA
 7746590 7746591 ckrop_0367 ckrop_0368     FALSE 0.033 276.000 0.000 NA   NA
 7746591 7746592 ckrop_0368 ckrop_0369     FALSE 0.236 73.000 0.000 NA   NA
 7746592 7746593 ckrop_0369 ckrop_0370     TRUE 0.542 106.000 0.035 1.000 N NA
 7746595 7746596 ckrop_0372 ckrop_0373 pcaC   TRUE 0.555 3.000 0.000 NA   NA
 7746596 7746597 ckrop_0373 ckrop_0374     FALSE 0.288 82.000 0.000 1.000   NA
 7746597 7746598 ckrop_0374 ckrop_0375     TRUE 0.533 55.000 0.012 1.000 N NA
 7746598 7746599 ckrop_0375 ckrop_0376   purS FALSE 0.435 85.000 0.008 1.000 N NA
 7746599 7746600 ckrop_0376 ckrop_0377 purS   TRUE 0.997 0.000 0.656 0.002 Y NA
 7746600 7746601 ckrop_0377 ckrop_0378     TRUE 0.991 4.000 0.346 0.002 Y NA
 7746601 7746602 ckrop_0378 ckrop_0379     FALSE 0.230 103.000 0.000 NA N NA
 7746602 7746603 ckrop_0379 ckrop_0380     FALSE 0.070 206.000 0.000 NA   NA
 7746603 7746604 ckrop_0380 ckrop_0381     FALSE 0.066 210.000 0.000 NA   NA
 7746606 7746607 ckrop_0383 ckrop_0384     TRUE 0.527 78.000 0.034 NA   NA
 7746607 7746608 ckrop_0384 ckrop_0385     TRUE 0.744 190.000 0.248 1.000 Y NA
 7746609 7746610 ckrop_0386 ckrop_0387     FALSE 0.078 284.000 0.017 NA   NA
 7746612 7746613 ckrop_0389 ckrop_0390     FALSE 0.185 118.000 0.000 NA   NA
 7746614 7746615 ckrop_0391 ckrop_0392     FALSE 0.148 146.000 0.000 NA   NA
 7746615 7746616 ckrop_0392 ckrop_0393     FALSE 0.231 76.000 0.000 NA   NA
 7746617 7746618 ckrop_0394 ckrop_0395     TRUE 0.732 41.000 0.111 NA   NA
 7746619 7746620 ckrop_0396 ckrop_0397     TRUE 0.666 148.000 0.196 1.000   NA
 7746620 7746621 ckrop_0397 ckrop_0398     FALSE 0.315 177.000 0.033 1.000   NA
 7746621 7746622 ckrop_0398 ckrop_0399     TRUE 0.970 83.000 0.444 0.004 Y NA
 7746622 7746623 ckrop_0399 ckrop_0400     TRUE 0.926 64.000 0.063 0.004 Y NA
 7746623 7746624 ckrop_0400 ckrop_0401     TRUE 0.970 68.000 0.373 0.004 Y NA
 7746624 7746625 ckrop_0401 ckrop_0402   deoD FALSE 0.031 344.000 0.000 1.000 N NA
 7746625 7746626 ckrop_0402 ckrop_0403 deoD   TRUE 0.825 11.000 0.100 1.000 N NA
 7746627 7746628 ckrop_0404 ckrop_0405 phoU   FALSE 0.406 76.000 0.008 NA N NA
 7746629 7746630 ckrop_0406 ckrop_t0010 cat1   FALSE 0.131 158.000 0.000 NA   NA
 7746631 7746632 ckrop_0407 ckrop_0408     TRUE 0.941 107.000 0.667 0.041 N NA
 7746632 7746633 ckrop_0408 ckrop_0409     TRUE 0.999 -3.000 0.918 0.041 Y NA
 7746633 7746634 ckrop_0409 ckrop_0410     TRUE 0.997 -3.000 0.694 1.000 Y NA
 7746636 7746637 ckrop_0411 ckrop_0412   glpQ FALSE 0.012 458.000 0.000 NA   NA
 7746637 7746638 ckrop_0412 ckrop_0413 glpQ glpT TRUE 0.769 0.000 0.000 1.000 N NA
 7746639 7746640 ckrop_t0012 ckrop_0414     FALSE 0.021 334.000 0.000 NA   NA
 7746640 7746641 ckrop_0414 ckrop_0415     TRUE 0.961 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7746641 7746642 ckrop_0415 ckrop_0416     TRUE 0.976 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 7746642 7746643 ckrop_0416 ckrop_t0013     FALSE 0.129 159.000 0.000 NA   NA
 7746643 7746644 ckrop_t0013 ckrop_0417     FALSE 0.007 1090.000 0.000 NA   NA
 7746645 7746646 ckrop_0418 ckrop_0419     TRUE 0.982 41.000 0.483 0.001 Y NA
 7746647 7746648 ckrop_0420 ckrop_0421 echA1   TRUE 0.896 71.000 0.600 NA   NA
 7746648 7746649 ckrop_0421 ckrop_0422   ramA FALSE 0.010 567.000 0.000 NA   NA
 7746651 7746652 ckrop_0425 ckrop_0426     FALSE 0.143 151.000 0.000 NA   NA
 7746652 7746653 ckrop_0426 ckrop_r04     FALSE 0.013 437.000 0.000 NA   NA
 7746653 7746654 ckrop_r04 ckrop_r05     FALSE 0.014 414.000 0.000 NA   NA
 7746654 7746655 ckrop_r05 ckrop_r06     FALSE 0.222 84.000 0.000 NA   NA
 7746658 7746659 ckrop_0429 ckrop_0430     TRUE 0.866 5.000 0.108 NA   NA
 7746659 7746660 ckrop_0430 ckrop_0431     TRUE 0.758 81.000 0.206 NA   NA
 7746660 7746661 ckrop_0431 ckrop_0433     FALSE 0.012 475.000 0.000 NA   NA
 7746663 7746664 ckrop_0435 ckrop_0436     TRUE 0.794 136.000 0.432 NA   NA
 7746664 7746665 ckrop_0436 ckrop_0437     TRUE 0.718 10.000 0.032 NA   NA
 7746665 7746666 ckrop_0437 ckrop_0438     FALSE 0.326 18.000 0.000 NA   NA
 7746667 7746668 ckrop_0439 ckrop_0440     TRUE 0.709 17.000 0.046 1.000   NA
 7746669 7746670 ckrop_0441 ckrop_0442     TRUE 0.771 75.000 0.213 NA   NA
 7746670 7746671 ckrop_0442 ckrop_0443     FALSE 0.242 293.000 0.214 NA   NA
 7746672 7746673 ckrop_0444 ckrop_0445 gltA   TRUE 0.647 153.000 0.182 1.000   NA
 7746673 7746674 ckrop_0445 ckrop_0446     FALSE 0.392 20.000 0.000 1.000   NA
 7746674 7746675 ckrop_0446 ckrop_0447     TRUE 0.791 -3.000 0.000 NA   NA
 7746675 7746676 ckrop_0447 ckrop_0448     FALSE 0.357 13.000 0.000 NA   NA
 7746678 7746679 ckrop_0450 ckrop_0451   echA2 TRUE 0.786 91.000 0.240 1.000   NA
 7746679 7746680 ckrop_0451 ckrop_0452 echA2   TRUE 0.687 124.000 0.034 0.062 N NA
 7746680 7746681 ckrop_0452 ckrop_0453     TRUE 0.512 154.000 0.000 1.000 Y NA
 7746681 7746682 ckrop_0453 ckrop_t0014     FALSE 0.175 124.000 0.000 NA   NA
 7746682 7746683 ckrop_t0014 ckrop_0454     FALSE 0.088 186.000 0.000 NA   NA
 7746684 7746685 ckrop_0455 ckrop_0456     FALSE 0.245 68.000 0.000 NA   NA
 7746686 7746687 ckrop_0457 ckrop_0458   cobF TRUE 0.512 65.000 0.024 NA   NA
 7746688 7746689 ckrop_0459 ckrop_0460   folA FALSE 0.387 42.000 0.000 1.000 N NA
 7746689 7746690 ckrop_0460 ckrop_0461 folA   TRUE 0.949 30.000 0.295 0.001 N NA
 7746690 7746691 ckrop_0461 ckrop_0462   cysQ FALSE 0.470 82.000 0.011 1.000 N NA
 7746692 7746693 ckrop_0464 ckrop_0465     FALSE 0.341 15.000 0.000 NA   NA
 7746694 7746695 ckrop_0466 ckrop_0467     TRUE 0.961 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7746695 7746696 ckrop_0467 ckrop_0468     TRUE 0.981 -3.000 0.000 0.041 Y NA
 7746696 7746697 ckrop_0468 ckrop_0469   pgi FALSE 0.218 145.000 0.000 1.000 N NA
 7746697 7746698 ckrop_0469 ckrop_0470 pgi   FALSE 0.213 149.000 0.000 1.000 N NA
 7746701 7746702 ckrop_0473 ckrop_0474     TRUE 0.969 -13.000 0.044 NA   NA
 7746702 7746703 ckrop_0474 ckrop_0475     TRUE 0.991 -3.000 0.225 1.000 Y NA
 7746703 7746704 ckrop_0475 ckrop_0476   fadA2 FALSE 0.301 137.000 0.002 1.000 N NA
 7746704 7746705 ckrop_0476 ckrop_0477 fadA2 citE FALSE 0.013 715.000 0.000 1.000 N NA
 7746706 7746707 ckrop_0478 ckrop_0479     FALSE 0.132 209.000 0.002 1.000   NA
 7746707 7746708 ckrop_0479 ckrop_0480     TRUE 0.933 12.000 0.024 0.025 Y NA
 7746708 7746709 ckrop_0480 ckrop_0481   rpmG TRUE 0.973 3.000 0.052 0.025 Y NA
 7746709 7746710 ckrop_0481 ckrop_0482 rpmG   TRUE 0.994 0.000 0.332 0.025 Y NA
 7746711 7746712 ckrop_0483 ckrop_0484   rpmF TRUE 0.690 90.000 0.014 0.034   NA
 7746712 7746713 ckrop_0484 ckrop_0485 rpmF   FALSE 0.208 136.000 0.000 1.000   NA
 7746713 7746714 ckrop_0485 ckrop_0486     TRUE 0.549 241.000 0.423 1.000 N NA
 7746714 7746715 ckrop_0486 ckrop_0487     FALSE 0.412 10.000 0.000 NA   NA
 7746716 7746717 ckrop_0488 ckrop_0489     FALSE 0.043 347.000 0.002 1.000 N NA
 7746718 7746719 ckrop_0491 ckrop_0492 galU moeA TRUE 0.605 87.000 0.054 1.000 N NA
 7746719 7746720 ckrop_0492 ckrop_0493 moeA rimJ TRUE 0.922 16.000 0.427 1.000 N NA
 7746720 7746721 ckrop_0493 ckrop_0494 rimJ   TRUE 0.504 183.000 0.183 NA   NA
 7746721 7746722 ckrop_0494 ckrop_0495     FALSE 0.151 144.000 0.000 NA   NA
 7746722 7746723 ckrop_0495 ckrop_0496     FALSE 0.210 94.000 0.000 NA   NA
 7746723 7746724 ckrop_0496 ckrop_0497     FALSE 0.112 168.000 0.000 NA   NA
 7746725 7746726 ckrop_t0015 ckrop_0498     FALSE 0.209 96.000 0.000 NA   NA
 7746728 7746729 ckrop_0500 ckrop_0502     FALSE 0.031 302.000 0.000 NA N NA
 7746729 7746730 ckrop_0502 ckrop_0503     FALSE 0.284 212.000 0.000 NA Y NA
 7746730 7746731 ckrop_0503 ckrop_0504   tcsR5 FALSE 0.185 161.000 0.000 1.000 N NA
 7746731 7746732 ckrop_0504 ckrop_0505 tcsR5 tcsS5 TRUE 0.973 0.000 0.000 0.006 Y NA
 7746733 7746734 ckrop_0506 ckrop_0507     TRUE 0.985 1.000 0.811 1.000   NA
 7746736 7746737 ckrop_0509 ckrop_0510     FALSE 0.204 102.000 0.000 NA   NA
 7746737 7746738 ckrop_0510 ckrop_0512     TRUE 0.802 86.000 0.290 NA   NA
 7746740 7746741 ckrop_0514 ckrop_0515     FALSE 0.419 71.000 0.005 1.000   NA
 7746742 7746743 ckrop_0516 ckrop_0517   pabB FALSE 0.234 100.000 0.000 NA N NA
 7746744 7746745 ckrop_0518 ckrop_0519 metS qor FALSE 0.329 73.000 0.000 1.000 N NA
 7746746 7746747 ckrop_0520 ckrop_0521   pepC2 FALSE 0.360 35.000 0.000 1.000   NA
 7746747 7746748 ckrop_0521 ckrop_0522 pepC2 pepC1 TRUE 0.883 58.000 0.000 0.001 Y NA
 7746749 7746750 ckrop_0523 ckrop_0524 tatD   FALSE 0.075 250.000 0.004 NA   NA
 7746750 7746751 ckrop_0524 ckrop_0525     TRUE 0.642 10.000 0.009 1.000   NA
 7746751 7746752 ckrop_0525 ckrop_0526   ispE FALSE 0.388 31.000 0.000 1.000 N NA
 7746752 7746753 ckrop_0526 ckrop_0527 ispE   FALSE 0.286 83.000 0.000 1.000   NA
 7746753 7746754 ckrop_0527 ckrop_0528     FALSE 0.364 73.000 0.006 NA   NA
 7746754 7746755 ckrop_0528 ckrop_0529     FALSE 0.216 88.000 0.000 NA   NA
 7746755 7746756 ckrop_0529 ckrop_0530     FALSE 0.324 64.000 0.000 1.000   NA
 7746756 7746757 ckrop_0530 ckrop_0531   ppk2A FALSE 0.324 64.000 0.000 1.000   NA
 7746757 7746758 ckrop_0531 ckrop_0533 ppk2A echA3 FALSE 0.417 129.000 0.022 1.000   NA
 7746759 7746760 ckrop_0534 ckrop_0535     FALSE 0.031 343.000 0.000 1.000 N NA
 7746760 7746761 ckrop_0535 ckrop_0536   mmpL TRUE 0.744 0.000 0.000 1.000   NA
 7746767 7746768 ckrop_0543 ckrop_0544     TRUE 0.979 22.000 0.496 0.040 Y NA
 7746768 7746769 ckrop_0544 ckrop_0545   prsA FALSE 0.026 381.000 0.000 1.000 N NA
 7746769 7746770 ckrop_0545 ckrop_0546 prsA glmU TRUE 0.528 97.000 0.026 1.000 N NA
 7746770 7746771 ckrop_0546 ckrop_t0016 glmU   FALSE 0.196 108.000 0.000 NA   NA
 7746772 7746773 ckrop_0547 ckrop_0548     TRUE 0.751 46.000 0.013 0.037   NA
 7746773 7746774 ckrop_0548 ckrop_0549     TRUE 0.700 10.000 0.026 NA   NA
 7746774 7746775 ckrop_0549 ckrop_0550     FALSE 0.429 40.000 0.006 NA   NA
 7746775 7746776 ckrop_0550 ckrop_0551   eno FALSE 0.035 366.000 0.005 NA N NA
 7746776 7746777 ckrop_0551 ckrop_0552 eno ftsB TRUE 0.887 12.000 0.241 1.000   NA
 7746777 7746778 ckrop_0552 ckrop_0553 ftsB ppx2 FALSE 0.445 59.000 0.004 1.000   NA
 7746778 7746779 ckrop_0553 ckrop_t0017 ppx2   FALSE 0.213 91.000 0.000 NA   NA
 7746780 7746781 ckrop_0554 ckrop_0555     FALSE 0.207 99.000 0.000 NA   NA
 7746782 7746783 ckrop_0556 ckrop_0557     FALSE 0.013 455.000 0.000 NA   NA
 7746784 7746785 ckrop_0558 ckrop_0559     FALSE 0.007 1219.000 0.000 NA   NA
 7746785 7746786 ckrop_0559 ckrop_0560     FALSE 0.086 189.000 0.000 NA   NA
 7746788 7746789 ckrop_0562 ckrop_0563 greA   TRUE 0.734 122.000 0.250 NA   NA
 7746790 7746791 ckrop_0564 ckrop_0565     FALSE 0.338 220.000 0.141 NA   NA
 7746791 7746792 ckrop_0565 ckrop_0566   aroF FALSE 0.285 29.000 0.000 NA   NA
 7746792 7746793 ckrop_0566 ckrop_0567 aroF   TRUE 0.527 10.000 0.000 1.000 N NA
 7746795 7746796 ckrop_0569 ckrop_0570     TRUE 0.760 3.000 0.005 1.000 N NA
 7746796 7746797 ckrop_0570 ckrop_0571   fadE1 FALSE 0.014 605.000 0.000 1.000 N NA
 7746797 7746798 ckrop_0571 ckrop_0572 fadE1 echA4 TRUE 0.788 66.000 0.023 1.000 Y NA
 7746800 7746801 ckrop_0574 ckrop_0575     TRUE 0.625 61.000 0.060 NA   NA
 7746802 7746803 ckrop_0576 ckrop_0577     FALSE 0.451 15.000 0.000 1.000 N NA
 7746803 7746804 ckrop_0577 ckrop_0578   fum FALSE 0.203 154.000 0.000 1.000 N NA
 7746804 7746805 ckrop_0578 ckrop_0579 fum pfkB FALSE 0.211 258.000 0.071 1.000 N NA
 7746807 7746808 ckrop_0583 ckrop_0584     FALSE 0.274 119.000 0.002 NA   NA
 7746808 7746809 ckrop_0584 ckrop_0587     FALSE 0.288 27.000 0.000 NA   NA
 7746809 7746810 ckrop_0587 ckrop_0588     TRUE 0.677 0.000 0.000 NA   NA
 7746810 7746811 ckrop_0588 ckrop_0589   metPS FALSE 0.265 59.000 0.000 NA   NA
 7746811 7746812 ckrop_0589 ckrop_0590 metPS metP TRUE 0.955 -3.000 0.087 NA   NA
 7746813 7746814 ckrop_0591 ckrop_0592     TRUE 0.614 1.000 0.000 NA   NA
 7746814 7746815 ckrop_0592 ckrop_0594   alsS FALSE 0.015 390.000 0.000 NA   NA
 7746816 7746817 ckrop_0595 ckrop_0596     FALSE 0.297 75.000 0.000 1.000   NA
 7746818 7746819 ckrop_0597 ckrop_0598     FALSE 0.193 111.000 0.000 NA   NA
 7746819 7746820 ckrop_0598 ckrop_0599     FALSE 0.154 166.000 0.000 1.000   NA
 7746820 7746821 ckrop_0599 ckrop_0600     FALSE 0.284 84.000 0.000 1.000   NA
 7746821 7746822 ckrop_0600 ckrop_0601     FALSE 0.219 112.000 0.000 NA N NA
 7746823 7746824 ckrop_0602 ckrop_0604     FALSE 0.036 271.000 0.000 NA   NA
 7746824 7746825 ckrop_0604 ckrop_0605     FALSE 0.131 158.000 0.000 NA   NA
 7746825 7746826 ckrop_0605 ckrop_0606     FALSE 0.361 40.000 0.000 1.000   NA
 7746829 7746830 ckrop_0610 ckrop_0611     TRUE 0.971 0.000 0.326 NA   NA
 7746830 7746831 ckrop_0611 ckrop_0612     TRUE 0.987 -3.000 0.372 1.000   NA
 7746831 7746832 ckrop_0612 ckrop_0613     FALSE 0.427 14.000 0.000 1.000   NA
 7746839 7746840 ckrop_0620 ckrop_0621   chlD1 FALSE 0.208 98.000 0.000 NA   NA
 7746840 7746841 ckrop_0621 ckrop_0622 chlD1 chlI1 TRUE 0.979 49.000 0.465 0.004 Y NA
 7746841 7746842 ckrop_0622 ckrop_0623 chlI1 chlH TRUE 0.891 21.000 0.000 0.004 Y NA
 7746843 7746844 ckrop_0624 ckrop_0625     FALSE 0.446 124.000 0.025 1.000   NA
 7746844 7746845 ckrop_0625 ckrop_0626     TRUE 0.918 20.000 0.500 NA   NA
 7746845 7746846 ckrop_0626 ckrop_0627     TRUE 0.886 14.000 0.290 NA   NA
 7746846 7746847 ckrop_0627 ckrop_0628     FALSE 0.046 245.000 0.000 NA   NA
 7746847 7746848 ckrop_0628 ckrop_0629     FALSE 0.259 121.000 0.000 1.000 N NA
 7746849 7746850 ckrop_0630 ckrop_0631     FALSE 0.291 26.000 0.000 NA   NA
 7746850 7746851 ckrop_0631 ckrop_0632     TRUE 0.867 67.000 0.113 1.000 Y NA
 7746852 7746853 ckrop_0633 ckrop_0634     TRUE 0.818 17.000 0.166 NA   NA
 7746853 7746854 ckrop_0634 ckrop_0635   folP1 TRUE 0.504 125.000 0.063 NA   NA
 7746854 7746855 ckrop_0635 ckrop_0636 folP1   FALSE 0.286 33.000 0.000 NA   NA
 7746855 7746856 ckrop_0636 ckrop_0637     FALSE 0.371 161.000 0.042 NA   NA
 7746856 7746857 ckrop_0637 ckrop_0638     TRUE 0.637 77.000 0.091 NA   NA
 7746857 7746858 ckrop_0638 ckrop_0639     FALSE 0.025 361.000 0.000 1.000   NA
 7746862 7746863 ckrop_0643 ckrop_0644 sigE cseE FALSE 0.438 118.000 0.028 NA   NA
 7746863 7746864 ckrop_0644 ckrop_0645 cseE tatB FALSE 0.225 82.000 0.000 NA   NA
 7746865 7746866 ckrop_0646 ckrop_0647     TRUE 0.913 13.000 0.389 NA   NA
 7746866 7746867 ckrop_0647 ckrop_0648     TRUE 0.943 22.000 0.806 NA   NA
 7746870 7746871 ckrop_0651 ckrop_0652     TRUE 0.587 2.000 0.000 NA   NA
 7746872 7746873 ckrop_0653 ckrop_0655 sucA   FALSE 0.412 133.000 0.019 1.000 N NA
 7746873 7746874 ckrop_0655 ckrop_0656     TRUE 0.747 21.000 0.105 NA   NA
 7746875 7746876 ckrop_0657 ckrop_0658 glyS   TRUE 0.805 1.000 0.015 NA   NA
 7746878 7746879 ckrop_0661 ckrop_0662   dgt TRUE 0.707 46.000 0.099 NA   NA
 7746882 7746883 ckrop_0665 ckrop_0666     FALSE 0.287 34.000 0.000 NA   NA
 7746884 7746885 ckrop_0667 ckrop_0668     FALSE 0.053 233.000 0.000 NA   NA
 7746887 7746888 ckrop_t0018 ckrop_t0019     FALSE 0.145 149.000 0.000 NA   NA
 7746888 7746889 ckrop_t0019 ckrop_0670     FALSE 0.240 70.000 0.000 NA   NA
 7746889 7746890 ckrop_0670 ckrop_0671     FALSE 0.289 38.000 0.000 NA   NA
 7746890 7746891 ckrop_0671 ckrop_0672     FALSE 0.289 268.000 0.200 NA   NA
 7746892 7746893 ckrop_0673 ckrop_0674   aceE TRUE 0.493 113.000 0.030 1.000   NA
 7746894 7746895 ckrop_0675 ckrop_t0020     FALSE 0.075 201.000 0.000 NA   NA
 7746895 7746896 ckrop_t0020 ckrop_0676     FALSE 0.078 197.000 0.000 NA   NA
 7746896 7746897 ckrop_0676 ckrop_0677     FALSE 0.286 33.000 0.000 NA   NA
 7746897 7746898 ckrop_0677 ckrop_0678   cobD TRUE 0.850 -6.000 0.000 NA   NA
 7746899 7746900 ckrop_0679 ckrop_0680     TRUE 0.681 3.000 0.003 NA   NA
 7746901 7746902 ckrop_0681 ckrop_0682     TRUE 0.695 73.000 0.121 NA   NA
 7746902 7746903 ckrop_0682 ckrop_0683     FALSE 0.425 158.000 0.065 NA   NA
 7746903 7746904 ckrop_0683 ckrop_0684     TRUE 0.913 0.000 0.069 NA   NA
 7746907 7746908 ckrop_0687 ckrop_0688     FALSE 0.357 29.000 0.000 1.000   NA
 7746909 7746910 ckrop_0689 ckrop_0690   glnE TRUE 0.708 37.000 0.065 1.000 N NA
 7746910 7746911 ckrop_0690 ckrop_0691 glnE   FALSE 0.196 145.000 0.000 1.000   NA
 7746913 7746914 ckrop_0693 ckrop_0694 pqo thrC TRUE 0.643 88.000 0.000 1.000 Y NA
 7746917 7746918 ckrop_0697 ckrop_0698     TRUE 0.645 48.000 0.059 NA   NA
 7746918 7746919 ckrop_0698 ckrop_0699     TRUE 0.976 40.000 0.319 0.001 Y NA
 7746919 7746920 ckrop_0699 ckrop_0700   sucB TRUE 0.539 51.000 0.012 1.000 N NA
 7746922 7746923 ckrop_0702 ckrop_0703 cobS cobT TRUE 0.984 0.000 0.039 0.014 Y NA
 7746923 7746924 ckrop_0703 ckrop_0704 cobT cobU TRUE 0.849 51.000 0.060 1.000 Y NA
 7746924 7746925 ckrop_0704 ckrop_0705 cobU   TRUE 0.603 52.000 0.041 NA   NA
 7746928 7746929 ckrop_0708 ckrop_0709     TRUE 0.889 19.000 0.342 NA   NA
 7746931 7746932 ckrop_0711 ckrop_0712   qcrC TRUE 0.935 66.000 0.140 0.027 Y NA
 7746932 7746933 ckrop_0712 ckrop_0713 qcrC qcrA TRUE 0.994 -3.000 0.421 NA Y NA
 7746933 7746934 ckrop_0713 ckrop_0714 qcrA qcrB TRUE 0.996 -3.000 0.660 NA Y NA
 7746936 7746937 ckrop_0716 ckrop_0717     FALSE 0.108 338.000 0.000 NA Y NA
 7746937 7746938 ckrop_0717 ckrop_0718   pimB' TRUE 0.866 30.000 0.097 NA Y NA
 7746938 7746939 ckrop_0718 ckrop_0719 pimB' glk TRUE 0.786 97.000 0.226 1.000 N NA
 7746939 7746940 ckrop_0719 ckrop_0720 glk   TRUE 0.993 -7.000 0.438 1.000 N NA
 7746941 7746942 ckrop_0721 ckrop_0722     TRUE 0.791 -3.000 0.000 NA   NA
 7746942 7746943 ckrop_0722 ckrop_0723     FALSE 0.465 7.000 0.000 NA   NA
 7746944 7746945 ckrop_0724 ckrop_0725     TRUE 0.818 91.000 0.301 1.000   NA
 7746946 7746947 ckrop_0726 ckrop_0727     FALSE 0.204 122.000 0.000 NA N NA
 7746947 7746948 ckrop_0727 ckrop_0729   mptA FALSE 0.013 446.000 0.000 NA   NA
 7746948 7746949 ckrop_0729 ckrop_0730 mptA crtI TRUE 0.946 -3.000 0.057 NA   NA
 7746949 7746950 ckrop_0730 ckrop_0731 crtI   TRUE 0.973 -3.000 0.138 1.000 N NA
 7746953 7746954 ckrop_0735 ckrop_0736     TRUE 0.586 102.000 0.081 NA   NA
 7746954 7746955 ckrop_0736 ckrop_0738     FALSE 0.008 697.000 0.000 NA   NA
 7746955 7746956 ckrop_0738 ckrop_0739     TRUE 0.699 202.000 0.635 NA   NA
 7746956 7746957 ckrop_0739 ckrop_0740     TRUE 0.929 -3.000 0.028 NA   NA
 7746957 7746958 ckrop_0740 ckrop_0741     FALSE 0.341 222.000 0.144 NA   NA
 7746958 7746959 ckrop_0741 ckrop_0742     TRUE 0.924 77.000 0.333 1.000 Y NA
 7746959 7746960 ckrop_0742 ckrop_0743     TRUE 0.975 53.000 0.367 0.002 Y NA
 7746960 7746961 ckrop_0743 ckrop_0744   murX TRUE 0.987 0.000 0.071 0.007 Y NA
 7746961 7746962 ckrop_0744 ckrop_0745 murX   TRUE 0.983 38.000 0.647 0.007 Y NA
 7746962 7746963 ckrop_0745 ckrop_0746     TRUE 0.911 12.000 0.081 0.005 N NA
 7746963 7746964 ckrop_0746 ckrop_0747   murG TRUE 0.769 74.000 0.167 1.000 N NA
 7746964 7746965 ckrop_0747 ckrop_0748 murG   TRUE 0.927 53.000 0.270 1.000 Y NA
 7746965 7746966 ckrop_0748 ckrop_0749     TRUE 0.885 42.000 0.134 NA Y NA
 7746966 7746967 ckrop_0749 ckrop_0750     FALSE 0.222 237.000 0.067 NA N NA
 7746967 7746968 ckrop_0750 ckrop_0751     TRUE 0.729 18.000 0.082 NA   NA
 7746968 7746969 ckrop_0751 ckrop_0752     TRUE 0.552 100.000 0.061 NA   NA
 7746969 7746970 ckrop_0752 ckrop_0753   sepF TRUE 0.710 29.000 0.097 NA   NA
 7746972 7746973 ckrop_0755 ckrop_0756 divIVA   FALSE 0.198 107.000 0.000 NA   NA
 7746975 7746976 ckrop_0758 ckrop_0759     TRUE 0.575 37.000 0.014 1.000 N NA
 7746977 7746978 ckrop_0760 ckrop_0761     FALSE 0.383 11.000 0.000 NA   NA
 7746979 7746980 ckrop_0762 ckrop_0763     TRUE 0.744 20.000 0.073 1.000 N NA
 7746980 7746981 ckrop_0763 ckrop_0764     TRUE 0.928 -7.000 0.009 NA   NA
 7746981 7746982 ckrop_0764 ckrop_0765     FALSE 0.320 152.000 0.020 NA   NA
 7746986 7746987 ckrop_0769 ckrop_0770     FALSE 0.465 7.000 0.000 NA   NA
 7746987 7746988 ckrop_0770 ckrop_0771     FALSE 0.295 25.000 0.000 NA   NA
 7746988 7746989 ckrop_0771 ckrop_0772     TRUE 0.558 10.000 0.005 NA   NA
 7746990 7746991 ckrop_0773 ckrop_0774     FALSE 0.228 78.000 0.000 NA   NA
 7746991 7746992 ckrop_0774 ckrop_0775   treY TRUE 0.500 78.000 0.019 1.000   NA
 7746992 7746993 ckrop_0775 ckrop_0776 treY   FALSE 0.275 51.000 0.000 NA   NA
 7746993 7746994 ckrop_0776 ckrop_0778   fda FALSE 0.082 192.000 0.000 NA   NA
 7746994 7746995 ckrop_0778 ckrop_0779 fda   FALSE 0.018 480.000 0.000 1.000 N NA
 7746995 7746996 ckrop_0779 ckrop_0780     TRUE 0.725 61.000 0.098 1.000 N NA
 7746996 7746997 ckrop_0780 ckrop_0781   bioQ FALSE 0.464 11.000 0.000 1.000   NA
 7746998 7746999 ckrop_0783 ckrop_0784   bioB FALSE 0.193 111.000 0.000 NA   NA
 7746999 7747000 ckrop_0784 ckrop_0785 bioB   TRUE 0.739 10.000 0.041 NA   NA
 7747000 7747001 ckrop_0785 ckrop_0786     TRUE 0.650 39.000 0.056 NA   NA
 7747001 7747002 ckrop_0786 ckrop_0787     FALSE 0.259 62.000 0.000 NA   NA
 7747002 7747003 ckrop_0787 ckrop_0788     TRUE 0.925 85.000 0.112 0.006 Y NA
 7747003 7747004 ckrop_0788 ckrop_0789     TRUE 0.988 6.000 0.341 0.006 Y NA
 7747004 7747005 ckrop_0789 ckrop_0790     TRUE 0.975 3.000 0.046 0.006 Y NA
 7747005 7747006 ckrop_0790 ckrop_0791     TRUE 0.979 43.000 0.491 0.006 Y NA
 7747006 7747007 ckrop_0791 ckrop_0792   impA TRUE 0.826 74.000 0.266 1.000 N NA
 7747007 7747008 ckrop_0792 ckrop_0793 impA trpE FALSE 0.233 134.000 0.000 1.000 N NA
 7747008 7747009 ckrop_0793 ckrop_0794 trpE   TRUE 0.702 209.000 0.690 NA   NA
 7747009 7747010 ckrop_0794 ckrop_0795     TRUE 0.542 113.000 0.070 NA   NA
 7747010 7747011 ckrop_0795 ckrop_0796     TRUE 0.939 49.000 0.070 0.002 Y NA
 7747011 7747012 ckrop_0796 ckrop_0797     TRUE 0.992 0.000 0.153 0.001 Y NA
 7747012 7747013 ckrop_0797 ckrop_0798     TRUE 0.942 -7.000 0.007 1.000 N NA
 7747013 7747014 ckrop_0798 ckrop_0799   pyk TRUE 0.571 153.000 0.111 1.000 N NA
 7747015 7747016 ckrop_0800 ckrop_0801     FALSE 0.175 124.000 0.000 NA   NA
 7747016 7747017 ckrop_0801 ckrop_0802     FALSE 0.058 223.000 0.000 NA   NA
 7747017 7747018 ckrop_0802 ckrop_0803   ureD FALSE 0.188 132.000 0.000 NA N NA
 7747018 7747019 ckrop_0803 ckrop_0804 ureD ureG TRUE 0.867 4.000 0.095 NA   NA
 7747019 7747020 ckrop_0804 ckrop_0805 ureG ureF FALSE 0.210 307.000 0.188 NA   NA
 7747020 7747021 ckrop_0805 ckrop_0806 ureF ureBC TRUE 0.930 29.000 0.200 0.002 N NA
 7747021 7747022 ckrop_0806 ckrop_0807 ureBC   FALSE 0.287 34.000 0.000 NA   NA
 7747022 7747023 ckrop_0807 ckrop_0808   ureA TRUE 0.925 19.000 0.571 NA   NA
 7747023 7747024 ckrop_0808 ckrop_0809 ureA   FALSE 0.230 136.000 0.000 1.000 N NA
 7747025 7747026 ckrop_0812 ckrop_0813     FALSE 0.227 79.000 0.000 NA   NA
 7747026 7747027 ckrop_0813 ckrop_t0021     FALSE 0.094 181.000 0.000 NA   NA
 7747027 7747028 ckrop_t0021 ckrop_0814     FALSE 0.151 144.000 0.000 NA   NA
 7747028 7747029 ckrop_0814 ckrop_0815     FALSE 0.221 110.000 0.000 NA N NA
 7747029 7747030 ckrop_0815 ckrop_0816     FALSE 0.070 291.000 0.005 1.000 N NA
 7747030 7747031 ckrop_0816 ckrop_0817   ptsG FALSE 0.049 280.000 0.000 1.000 N NA
 7747032 7747033 ckrop_0818 ckrop_0819   fabG1 TRUE 0.954 2.000 0.263 1.000   NA
 7747034 7747035 ckrop_0820 ckrop_0821 fadA3   FALSE 0.153 174.000 0.000 1.000 N NA
 7747035 7747036 ckrop_0821 ckrop_0822     TRUE 0.523 99.000 0.026 1.000 N NA
 7747036 7747037 ckrop_0822 ckrop_0823   uspA3 FALSE 0.333 122.000 0.002 1.000 N NA
 7747037 7747038 ckrop_0823 ckrop_0824 uspA3 cmtC FALSE 0.203 138.000 0.000 1.000   NA
 7747039 7747040 ckrop_0825 ckrop_0826     FALSE 0.263 101.000 0.000 1.000   NA
 7747041 7747042 ckrop_0827 ckrop_0828     FALSE 0.264 119.000 0.000 1.000 N NA
 7747042 7747043 ckrop_0828 ckrop_0829     TRUE 0.928 62.000 0.087 0.017 Y NA
 7747043 7747044 ckrop_0829 ckrop_0830     FALSE 0.022 420.000 0.000 1.000 N NA
 7747044 7747045 ckrop_0830 ckrop_0831   rpmI TRUE 0.893 172.000 0.652 1.000 Y NA
 7747045 7747046 ckrop_0831 ckrop_0832 rpmI   TRUE 0.987 50.000 0.928 0.023 Y NA
 7747046 7747047 ckrop_0832 ckrop_0833     TRUE 0.567 257.000 0.057 0.025 Y NA
 7747047 7747048 ckrop_0833 ckrop_0834     TRUE 0.816 51.000 0.026 1.000 Y NA
 7747048 7747049 ckrop_0834 ckrop_0835   pheT TRUE 0.983 55.000 0.574 0.001 Y NA
 7747049 7747050 ckrop_0835 ckrop_0836 pheT   TRUE 0.562 42.000 0.014 1.000 N NA
 7747050 7747051 ckrop_0836 ckrop_0837   argJ TRUE 0.944 133.000 0.303 0.003 Y NA
 7747051 7747052 ckrop_0837 ckrop_0838 argJ   TRUE 0.942 120.000 0.239 0.003 Y NA
 7747052 7747053 ckrop_0838 ckrop_0839     TRUE 0.592 204.000 0.105 1.000 Y NA
 7747053 7747054 ckrop_0839 ckrop_0840     TRUE 0.776 131.000 0.091 1.000 Y NA
 7747054 7747055 ckrop_0840 ckrop_0841   argR TRUE 0.728 50.000 0.088 1.000 N NA
 7747055 7747056 ckrop_0841 ckrop_0842 argR   TRUE 0.576 107.000 0.054 1.000 N NA
 7747056 7747057 ckrop_0842 ckrop_0843     TRUE 0.899 105.000 0.278 1.000 Y NA
 7747057 7747058 ckrop_0843 ckrop_0844     FALSE 0.123 199.000 0.003 NA   NA
 7747058 7747059 ckrop_0844 ckrop_0845   tyrS FALSE 0.413 87.000 0.014 NA   NA
 7747061 7747062 ckrop_r07 ckrop_r08     FALSE 0.014 414.000 0.000 NA   NA
 7747062 7747063 ckrop_r08 ckrop_r09     FALSE 0.222 84.000 0.000 NA   NA
 7747063 7747064 ckrop_r09 ckrop_0847     FALSE 0.020 343.000 0.000 NA   NA
 7747064 7747065 ckrop_0847 ckrop_0848     TRUE 0.896 68.000 0.500 1.000   NA
 7747065 7747066 ckrop_0848 ckrop_0849     TRUE 0.871 -9.000 0.000 NA   NA
 7747066 7747067 ckrop_0849 ckrop_0850     TRUE 0.861 -7.000 0.000 NA   NA
 7747067 7747068 ckrop_0850 ckrop_0851     TRUE 0.970 -3.000 0.120 1.000 N NA
 7747068 7747069 ckrop_0851 ckrop_0852     TRUE 0.665 90.000 0.094 1.000 N NA
 7747069 7747070 ckrop_0852 ckrop_0853     TRUE 0.526 121.000 0.049 1.000   NA
 7747070 7747071 ckrop_0853 ckrop_0854     TRUE 0.936 29.000 0.798 NA   NA
 7747071 7747072 ckrop_0854 ckrop_0855   pyrG FALSE 0.118 238.000 0.014 NA   NA
 7747072 7747073 ckrop_0855 ckrop_0856 pyrG   FALSE 0.364 182.000 0.055 1.000 N NA
 7747073 7747074 ckrop_0856 ckrop_0857     TRUE 0.840 62.000 0.063 1.000 Y NA
 7747074 7747075 ckrop_0857 ckrop_0858     FALSE 0.150 287.000 0.058 1.000 N NA
 7747075 7747076 ckrop_0858 ckrop_0859     TRUE 0.949 -3.000 0.065 NA   NA
 7747076 7747077 ckrop_0859 ckrop_0860     TRUE 0.894 68.000 0.570 NA   NA
 7747077 7747078 ckrop_0860 ckrop_0861   bioA FALSE 0.331 25.000 0.000 NA N NA
 7747078 7747079 ckrop_0861 ckrop_0862 bioA bioD TRUE 0.923 68.000 0.053 0.002 Y NA
 7747079 7747080 ckrop_0862 ckrop_0863 bioD   FALSE 0.068 251.000 0.000 1.000 N NA
 7747080 7747081 ckrop_0863 ckrop_0864     FALSE 0.425 97.000 0.011 1.000   NA
 7747082 7747083 ckrop_0865 ckrop_t0022     FALSE 0.206 100.000 0.000 NA   NA
 7747083 7747084 ckrop_t0022 ckrop_0866     FALSE 0.265 59.000 0.000 NA   NA
 7747085 7747086 ckrop_0867 ckrop_0868     TRUE 0.532 114.000 0.038 1.000 N NA
 7747086 7747087 ckrop_0868 ckrop_0869     FALSE 0.088 284.000 0.019 NA N NA
 7747087 7747088 ckrop_0869 ckrop_0870     TRUE 0.969 6.000 0.707 NA N NA
 7747088 7747089 ckrop_0870 ckrop_0871     TRUE 0.721 65.000 0.133 NA   NA
 7747089 7747090 ckrop_0871 ckrop_0872     FALSE 0.072 311.000 0.024 NA   NA
 7747091 7747092 ckrop_0873 ckrop_0874     FALSE 0.412 10.000 0.000 NA   NA
 7747092 7747093 ckrop_0874 ckrop_0875     TRUE 0.820 65.000 0.271 NA   NA
 7747093 7747094 ckrop_0875 ckrop_0876     TRUE 0.984 1.000 0.815 NA   NA
 7747094 7747095 ckrop_0876 ckrop_0877   gnd FALSE 0.242 69.000 0.000 NA   NA
 7747099 7747100 ckrop_0881 ckrop_0882     FALSE 0.138 154.000 0.000 NA   NA
 7747100 7747101 ckrop_0882 ckrop_0883     FALSE 0.177 196.000 0.008 1.000   NA
 7747102 7747103 ckrop_0884 ckrop_0885   trkA TRUE 0.922 116.000 0.447 1.000 Y NA
 7747103 7747104 ckrop_0885 ckrop_0886 trkA sulP TRUE 0.903 2.000 0.000 1.000 Y NA
 7747104 7747105 ckrop_0886 ckrop_0887 sulP   TRUE 0.699 61.000 0.000 1.000 Y NA
 7747106 7747107 ckrop_0888 ckrop_0889     TRUE 0.943 -3.000 0.050 NA   NA
 7747107 7747108 ckrop_0889 ckrop_0890     FALSE 0.158 136.000 0.000 NA   NA
 7747108 7747109 ckrop_0890 ckrop_0891     FALSE 0.031 280.000 0.000 NA   NA
 7747109 7747110 ckrop_0891 ckrop_0892     TRUE 0.677 0.000 0.000 NA   NA
 7747110 7747111 ckrop_0892 ckrop_0893     FALSE 0.476 19.000 0.007 NA   NA
 7747113 7747114 ckrop_0895 ckrop_0896 ppm1 ppm2 TRUE 0.620 23.000 0.034 NA   NA
 7747114 7747115 ckrop_0896 ckrop_0897 ppm2 cobN FALSE 0.337 57.000 0.000 1.000   NA
 7747116 7747117 ckrop_0898 ckrop_0899 cobG cobH TRUE 0.990 -7.000 0.273 1.000 N NA
 7747117 7747118 ckrop_0899 ckrop_0900 cobH cobI TRUE 0.995 -3.000 0.191 0.014 Y NA
 7747118 7747119 ckrop_0900 ckrop_0901 cobI cobJ TRUE 0.995 -3.000 0.138 0.001 Y NA
 7747120 7747121 ckrop_0902 ckrop_0903 cobK cobM TRUE 0.935 36.000 0.076 0.014 Y NA
 7747121 7747122 ckrop_0903 ckrop_0904 cobM cobL TRUE 0.959 10.000 0.065 0.014 Y NA
 7747122 7747123 ckrop_0904 ckrop_0905 cobL   FALSE 0.460 14.000 0.000 1.000 N NA
 7747123 7747124 ckrop_0905 ckrop_0906     TRUE 0.705 16.000 0.035 1.000 N NA
 7747124 7747125 ckrop_0906 ckrop_0907   tatC TRUE 0.706 105.000 0.166 NA N NA
 7747125 7747126 ckrop_0907 ckrop_0908 tatC tatA FALSE 0.314 229.000 0.008 NA Y NA
 7747126 7747127 ckrop_0908 ckrop_0909 tatA   TRUE 0.552 85.000 0.041 NA N NA
 7747127 7747128 ckrop_0909 ckrop_0910   pafA2 TRUE 0.594 19.000 0.024 NA   NA
 7747128 7747129 ckrop_0910 ckrop_0911 pafA2 pup TRUE 0.980 -3.000 0.259 NA   NA
 7747129 7747130 ckrop_0911 ckrop_0912 pup pafA1 TRUE 0.882 118.000 0.706 NA   NA
 7747130 7747131 ckrop_0912 ckrop_0913 pafA1   TRUE 0.993 -10.000 0.416 NA   NA
 7747131 7747132 ckrop_0913 ckrop_0914     TRUE 0.835 48.000 0.215 1.000 N NA
 7747134 7747135 ckrop_0916 ckrop_0917   hisE2 TRUE 0.912 91.000 0.081 0.005 Y NA
 7747135 7747136 ckrop_0917 ckrop_0918 hisE2 hisE1 TRUE 0.945 3.000 0.023 0.001   NA
 7747136 7747137 ckrop_0918 ckrop_0919 hisE1 metH TRUE 0.535 75.000 0.024 1.000   NA
 7747137 7747138 ckrop_0919 ckrop_0920 metH mshC FALSE 0.460 14.000 0.000 1.000 N NA
 7747138 7747139 ckrop_0920 ckrop_0921 mshC uppP TRUE 0.715 35.000 0.071 1.000 N NA
 7747140 7747141 ckrop_0922 ckrop_0923 lppL pyrD TRUE 0.867 3.000 0.055 1.000   NA
 7747142 7747143 ckrop_0924 ckrop_0925 ybhB   FALSE 0.289 40.000 0.000 NA   NA
 7747144 7747145 ckrop_0926 ckrop_t0023     FALSE 0.229 77.000 0.000 NA   NA
 7747146 7747147 ckrop_0927 ckrop_0928   mcmB FALSE 0.310 331.000 0.366 1.000 N NA
 7747147 7747148 ckrop_0928 ckrop_0929 mcmB mcmA TRUE 0.970 24.000 0.220 0.001 Y NA
 7747149 7747150 ckrop_0930 ckrop_0931     TRUE 0.873 14.000 0.257 NA   NA
 7747151 7747152 ckrop_0932 ckrop_0933     TRUE 0.970 4.000 0.259 NA Y NA
 7747152 7747153 ckrop_0933 ckrop_0934     TRUE 0.554 65.000 0.032 NA   NA
 7747155 7747156 ckrop_0936 ckrop_0937     FALSE 0.154 157.000 0.000 NA N NA
 7747157 7747158 ckrop_0938 ckrop_0939 acn acnR TRUE 0.601 31.000 0.021 1.000 N NA
 7747158 7747159 ckrop_0939 ckrop_0940 acnR   FALSE 0.355 145.000 0.012 1.000 N NA
 7747159 7747160 ckrop_0940 ckrop_0941     TRUE 0.935 13.000 0.569 NA   NA
 7747160 7747161 ckrop_0941 ckrop_0942     FALSE 0.242 69.000 0.000 NA   NA
 7747162 7747163 ckrop_0943 ckrop_0944     FALSE 0.227 80.000 0.000 NA   NA
 7747165 7747166 ckrop_0946 ckrop_0947     TRUE 0.614 137.000 0.152 NA   NA
 7747166 7747167 ckrop_0947 ckrop_0948     TRUE 0.982 -3.000 0.249 1.000 N NA
 7747167 7747168 ckrop_0948 ckrop_0950   sufC TRUE 0.639 107.000 0.093 1.000 N NA
 7747168 7747169 ckrop_0950 ckrop_0951 sufC sufD TRUE 0.953 58.000 0.482 1.000 Y NA
 7747169 7747170 ckrop_0951 ckrop_0952 sufD sufB TRUE 0.992 1.000 0.266 0.002 Y NA
 7747170 7747171 ckrop_0952 ckrop_0953 sufB sufR TRUE 0.696 76.000 0.100 1.000 N NA
 7747172 7747173 ckrop_0954 ckrop_0955 mptB   TRUE 0.866 54.000 0.357 NA   NA
 7747173 7747174 ckrop_0955 ckrop_0956     TRUE 0.982 1.000 0.743 NA   NA
 7747174 7747175 ckrop_0956 ckrop_0957     TRUE 0.579 126.000 0.106 NA   NA
 7747177 7747178 ckrop_0959 ckrop_0960 tkt tal TRUE 0.892 48.000 0.135 1.000 Y NA
 7747178 7747179 ckrop_0960 ckrop_0961 tal zwf TRUE 0.772 109.000 0.049 1.000 Y NA
 7747179 7747180 ckrop_0961 ckrop_0962 zwf opcA TRUE 0.954 62.000 0.583 NA Y NA
 7747180 7747181 ckrop_0962 ckrop_0963 opcA pgl TRUE 0.952 34.000 0.463 NA Y NA
 7747183 7747184 ckrop_0965 ckrop_0966     FALSE 0.285 30.000 0.000 NA   NA
 7747185 7747186 ckrop_0967 ckrop_0968 tpi pgk TRUE 0.841 67.000 0.075 1.000 Y NA
 7747186 7747187 ckrop_0968 ckrop_0969 pgk gapA TRUE 0.893 100.000 0.055 0.008 Y NA
 7747187 7747188 ckrop_0969 ckrop_0970 gapA whiA FALSE 0.167 243.000 0.040 NA   NA
 7747188 7747189 ckrop_0970 ckrop_0971 whiA   TRUE 0.970 2.000 0.470 NA   NA
 7747189 7747190 ckrop_0971 ckrop_0972     TRUE 0.818 64.000 0.259 NA   NA
 7747190 7747191 ckrop_0972 ckrop_0973     TRUE 0.763 11.000 0.073 NA   NA
 7747191 7747192 ckrop_0973 ckrop_0974     TRUE 0.692 4.000 0.009 NA   NA
 7747192 7747193 ckrop_0974 ckrop_0975   ribH FALSE 0.318 117.000 0.008 NA   NA
 7747193 7747194 ckrop_0975 ckrop_0976 ribH   TRUE 0.867 100.000 0.012 0.003 Y NA
 7747194 7747195 ckrop_0976 ckrop_0977     TRUE 0.793 26.000 0.011 1.000 Y NA
 7747195 7747196 ckrop_0977 ckrop_0978   ribD TRUE 0.941 75.000 0.456 1.000 Y NA
 7747196 7747197 ckrop_0978 ckrop_0979 ribD rpe TRUE 0.900 0.000 0.028 1.000 N NA
 7747197 7747198 ckrop_0979 ckrop_0980 rpe   TRUE 0.798 10.000 0.056 1.000 N NA
 7747198 7747199 ckrop_0980 ckrop_0981     TRUE 0.993 -3.000 0.305 1.000 Y NA
 7747199 7747200 ckrop_0981 ckrop_0982     TRUE 0.981 0.000 0.031 0.037 Y NA
 7747200 7747201 ckrop_0982 ckrop_0983     TRUE 0.599 136.000 0.130 NA N NA
 7747201 7747202 ckrop_0983 ckrop_0984     TRUE 0.608 81.000 0.068 NA N NA
 7747202 7747203 ckrop_0984 ckrop_0985     TRUE 0.775 113.000 0.059 1.000 Y NA
 7747203 7747204 ckrop_0985 ckrop_0986     TRUE 0.623 164.000 0.192 1.000 N NA
 7747204 7747205 ckrop_0986 ckrop_0987     TRUE 0.990 -3.000 0.471 1.000 N NA
 7747205 7747206 ckrop_0987 ckrop_0988   cihF TRUE 0.632 67.000 0.054 1.000   NA
 7747206 7747207 ckrop_0988 ckrop_0989 cihF   FALSE 0.237 206.000 0.029 1.000   NA
 7747207 7747208 ckrop_0989 ckrop_0990     TRUE 0.854 55.000 0.075 1.000 Y NA
 7747208 7747209 ckrop_0990 ckrop_0991   carA TRUE 0.994 1.000 0.345 0.001 Y NA
 7747209 7747210 ckrop_0991 ckrop_0992 carA   TRUE 0.980 0.000 0.155 1.000 Y NA
 7747210 7747211 ckrop_0992 ckrop_3001   pyrB TRUE 0.987 2.000 0.452 1.000 Y NA
 7747211 7747212 ckrop_3001 ckrop_0993 pyrB pyrR TRUE 0.992 -3.000 0.247 1.000 Y NA
 7747214 7747215 ckrop_0995 ckrop_0996     TRUE 0.789 12.000 0.078 1.000 N NA
 7747215 7747216 ckrop_0996 ckrop_0997     TRUE 0.641 149.000 0.160 1.000 N NA
 7747216 7747217 ckrop_0997 ckrop_0998     TRUE 0.816 40.000 0.023 1.000 Y NA
 7747217 7747218 ckrop_0998 ckrop_0999     TRUE 0.986 0.000 0.052 0.004 Y NA
 7747218 7747219 ckrop_0999 ckrop_1000     TRUE 0.989 -3.000 0.147 1.000 Y NA
 7747219 7747220 ckrop_1000 ckrop_1001     TRUE 0.955 1.000 0.041 1.000 Y NA
 7747220 7747221 ckrop_1001 ckrop_1002     FALSE 0.386 112.000 0.009 1.000   NA
 7747221 7747222 ckrop_1002 ckrop_1004     TRUE 0.738 120.000 0.219 1.000   NA
 7747222 7747223 ckrop_1004 ckrop_1005     TRUE 0.995 -10.000 0.667 NA   NA
 7747223 7747224 ckrop_1005 ckrop_1006     FALSE 0.366 160.000 0.039 NA   NA
 7747224 7747225 ckrop_1006 ckrop_1007     TRUE 0.866 8.000 0.103 1.000 N NA
 7747225 7747226 ckrop_1007 ckrop_1008     FALSE 0.036 314.000 0.000 1.000 N NA
 7747226 7747227 ckrop_1008 ckrop_1009     TRUE 0.990 -3.000 0.229 0.037 N NA
 7747227 7747228 ckrop_1009 ckrop_1010     TRUE 0.991 -7.000 0.083 1.000 Y NA
 7747228 7747229 ckrop_1010 ckrop_1011     TRUE 0.955 3.000 0.085 1.000 Y NA
 7747229 7747230 ckrop_1011 ckrop_1012     FALSE 0.209 151.000 0.000 1.000 N NA
 7747230 7747231 ckrop_1012 ckrop_1013     TRUE 0.534 20.000 0.014 NA   NA
 7747231 7747232 ckrop_1013 ckrop_1014   aspS FALSE 0.364 87.000 0.009 NA   NA
 7747233 7747234 ckrop_1015 ckrop_1016     FALSE 0.249 67.000 0.000 NA   NA
 7747235 7747236 ckrop_1017 ckrop_1018     TRUE 0.580 91.000 0.051 1.000   NA
 7747238 7747239 ckrop_1020 ckrop_1021     TRUE 0.974 3.000 0.600 1.000   NA
 7747241 7747242 ckrop_1023 ckrop_1024     TRUE 0.971 -7.000 0.051 1.000 N NA
 7747242 7747243 ckrop_1024 ckrop_1025   dciAE TRUE 0.852 1.000 0.023 1.000   NA
 7747243 7747244 ckrop_1025 ckrop_1026 dciAE secF FALSE 0.112 345.000 0.083 1.000   NA
 7747244 7747245 ckrop_1026 ckrop_1027 secF secD TRUE 0.995 0.000 0.336 0.001 Y NA
 7747245 7747246 ckrop_1027 ckrop_1028 secD secN FALSE 0.425 236.000 0.062 NA Y NA
 7747246 7747247 ckrop_1028 ckrop_1029 secN   TRUE 0.538 119.000 0.063 NA N NA
 7747247 7747248 ckrop_1029 ckrop_1030     TRUE 0.994 4.000 0.549 0.002 Y NA
 7747248 7747249 ckrop_1030 ckrop_1031     TRUE 0.974 60.000 0.451 0.009 Y NA
 7747249 7747250 ckrop_1031 ckrop_1032     TRUE 0.825 65.000 0.277 NA   NA
 7747250 7747251 ckrop_1032 ckrop_1033   pdxT TRUE 0.488 126.000 0.055 NA   NA
 7747251 7747252 ckrop_1033 ckrop_1034 pdxT pdxS TRUE 0.837 183.000 0.488 NA Y NA
 7747252 7747253 ckrop_1034 ckrop_1035 pdxS   FALSE 0.367 122.000 0.017 NA   NA
 7747253 7747254 ckrop_1035 ckrop_1036   pimA TRUE 0.976 -3.000 0.211 NA   NA
 7747254 7747255 ckrop_1036 ckrop_1037 pimA   TRUE 0.979 16.000 0.831 1.000 Y NA
 7747255 7747256 ckrop_1037 ckrop_1038     TRUE 0.965 10.000 0.737 1.000 N NA
 7747256 7747257 ckrop_1038 ckrop_1039     TRUE 0.869 10.000 0.140 1.000 N NA
 7747257 7747258 ckrop_1039 ckrop_1040     TRUE 0.806 68.000 0.208 1.000 N NA
 7747258 7747259 ckrop_1040 ckrop_1041     FALSE 0.175 242.000 0.036 NA N NA
 7747259 7747260 ckrop_1041 ckrop_1042     TRUE 0.526 224.000 0.369 NA   NA
 7747260 7747261 ckrop_1042 ckrop_1043     FALSE 0.451 99.000 0.024 NA   NA
 7747261 7747262 ckrop_1043 ckrop_t0024     FALSE 0.025 308.000 0.000 NA   NA
 7747263 7747264 ckrop_t0025 ckrop_t0026     FALSE 0.227 80.000 0.000 NA   NA
 7747264 7747265 ckrop_t0026 ckrop_t0027     FALSE 0.267 57.000 0.000 NA   NA
 7747265 7747266 ckrop_t0027 ckrop_t0028     FALSE 0.211 93.000 0.000 NA   NA
 7747266 7747267 ckrop_t0028 ckrop_1044     FALSE 0.235 74.000 0.000 NA   NA
 7747267 7747268 ckrop_1044 ckrop_1046     FALSE 0.414 155.000 0.036 1.000   NA
 7747269 7747270 ckrop_1047 ckrop_1048     TRUE 0.643 128.000 0.158 NA   NA
 7747270 7747271 ckrop_1048 ckrop_1049     TRUE 0.995 -6.000 0.049 0.003 Y NA
 7747272 7747273 ckrop_1050 ckrop_1051     TRUE 0.909 2.000 0.115 NA   NA
 7747274 7747275 ckrop_1052 ckrop_1053     TRUE 0.576 10.000 0.007 NA   NA
 7747275 7747276 ckrop_1053 ckrop_1054     TRUE 0.970 -13.000 0.048 NA   NA
 7747276 7747277 ckrop_1054 ckrop_1055     TRUE 0.516 130.000 0.078 NA   NA
 7747279 7747280 ckrop_1058 ckrop_1059   suhB FALSE 0.223 165.000 0.010 NA   NA
 7747281 7747282 ckrop_1060 ckrop_1061   sigA FALSE 0.170 456.000 0.075 1.000 Y NA
 7747283 7747284 ckrop_1062 ckrop_1063     TRUE 0.976 -3.000 0.198 NA   NA
 7747285 7747286 ckrop_1064 ckrop_1065     TRUE 0.548 168.000 0.174 NA   NA
 7747286 7747287 ckrop_1065 ckrop_1066   dtd TRUE 0.917 -3.000 0.013 1.000   NA
 7747287 7747288 ckrop_1066 ckrop_1067 dtd sigB FALSE 0.043 381.000 0.008 1.000 N NA
 7747288 7747289 ckrop_1067 ckrop_1068 sigB dtxR TRUE 0.828 172.000 0.134 0.033 Y NA
 7747291 7747292 ckrop_1070 ckrop_1071 hmuT hmuU TRUE 0.997 -3.000 0.852 1.000 Y NA
 7747292 7747293 ckrop_1071 ckrop_1072 hmuU hmuV TRUE 0.938 39.000 0.292 1.000 Y NA
 7747297 7747298 ckrop_1076 ckrop_1077 pac   TRUE 0.658 23.000 0.035 1.000   NA
 7747300 7747301 ckrop_1079 ckrop_1080 ahpC ahpD TRUE 0.859 76.000 0.095 0.002   NA
 7747301 7747302 ckrop_1080 ckrop_1081 ahpD   FALSE 0.016 387.000 0.000 NA   NA
 7747302 7747303 ckrop_1081 ckrop_1082     FALSE 0.016 383.000 0.000 NA   NA
 7747303 7747304 ckrop_1082 ckrop_1083     TRUE 0.587 2.000 0.000 NA   NA
 7747304 7747305 ckrop_1083 ckrop_1084     TRUE 0.967 -3.000 0.137 NA   NA
 7747305 7747306 ckrop_1084 ckrop_1085     TRUE 0.964 65.000 0.353 0.036 Y NA
 7747306 7747307 ckrop_1085 ckrop_1086     FALSE 0.320 78.000 0.000 1.000 N NA
 7747308 7747309 ckrop_1087 ckrop_2122 nrdR divS FALSE 0.273 52.000 0.000 NA   NA
 7747312 7747313 ckrop_1090 ckrop_1091 sugR fruK TRUE 0.858 77.000 0.118 1.000 Y NA
 7747313 7747314 ckrop_1091 ckrop_1092 fruK ptsF TRUE 0.991 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 7747314 7747315 ckrop_1092 ckrop_1094 ptsF ptsH TRUE 0.701 284.000 0.273 0.006 Y NA
 7747316 7747317 ckrop_1095 ckrop_1096     FALSE 0.292 155.000 0.009 1.000   NA
 7747317 7747318 ckrop_1096 ckrop_1097     FALSE 0.198 107.000 0.000 NA   NA
 7747318 7747319 ckrop_1097 ckrop_1098   feoB FALSE 0.388 143.000 0.030 NA   NA
 7747321 7747322 ckrop_1100 ckrop_1101     TRUE 0.804 10.000 0.062 1.000 N NA
 7747322 7747323 ckrop_1101 ckrop_1102     TRUE 0.557 15.000 0.013 NA   NA
 7747325 7747326 ckrop_1104 ckrop_1105     TRUE 0.547 51.000 0.024 NA   NA
 7747327 7747328 ckrop_1106 ckrop_1107     TRUE 0.953 16.000 0.328 1.000 Y NA
 7747328 7747329 ckrop_1107 ckrop_1108   gluC FALSE 0.441 9.000 0.000 NA   NA
 7747329 7747330 ckrop_1108 ckrop_1110 gluC   TRUE 0.677 0.000 0.000 NA   NA
 7747331 7747332 ckrop_1111 ckrop_1113     TRUE 0.875 24.000 0.296 1.000   NA
 7747333 7747334 ckrop_1114 ckrop_1115 bioY bioM TRUE 0.937 0.000 0.117 NA   NA
 7747334 7747335 ckrop_1115 ckrop_1116 bioM bioN TRUE 0.987 6.000 0.729 1.000 Y NA
 7747336 7747337 ckrop_1117 ckrop_1118   clgR TRUE 0.704 139.000 0.260 NA   NA
 7747337 7747338 ckrop_1118 ckrop_1119 clgR   TRUE 0.820 25.000 0.208 NA   NA
 7747338 7747339 ckrop_1119 ckrop_1120     TRUE 0.524 42.000 0.018 NA   NA
 7747339 7747340 ckrop_1120 ckrop_1121     TRUE 0.655 85.000 0.005 0.053 N NA
 7747340 7747341 ckrop_1121 ckrop_1122     FALSE 0.093 346.000 0.000 0.053 N NA
 7747341 7747342 ckrop_1122 ckrop_1123     FALSE 0.036 662.000 0.032 1.000   NA
 7747342 7747343 ckrop_1123 ckrop_1124     TRUE 0.983 0.000 0.550 1.000   NA
 7747343 7747344 ckrop_1124 ckrop_1125     TRUE 0.664 39.000 0.037 1.000 N NA
 7747344 7747345 ckrop_1125 ckrop_1126     TRUE 0.822 1.000 0.010 1.000 N NA
 7747346 7747347 ckrop_1127 ckrop_1128     TRUE 0.996 1.000 0.812 0.036 Y NA
 7747347 7747348 ckrop_1128 ckrop_1129     TRUE 0.994 -3.000 0.364 1.000 Y NA
 7747348 7747349 ckrop_1129 ckrop_1130     FALSE 0.341 15.000 0.000 NA   NA
 7747350 7747351 ckrop_1132 ckrop_1133     FALSE 0.120 164.000 0.000 NA   NA
 7747351 7747352 ckrop_1133 ckrop_1135     FALSE 0.350 231.000 0.011 1.000 Y NA
 7747352 7747353 ckrop_1135 ckrop_1136     FALSE 0.361 216.000 0.119 1.000 N NA
 7747355 7747356 ckrop_1138 ckrop_1139     TRUE 0.671 9.000 0.006 1.000 N NA
 7747356 7747357 ckrop_1139 ckrop_1140     TRUE 0.952 -3.000 0.054 1.000   NA
 7747357 7747358 ckrop_1140 ckrop_1141     TRUE 0.987 -10.000 0.173 1.000   NA
 7747358 7747359 ckrop_1141 ckrop_1142     TRUE 0.939 100.000 0.530 1.000 Y NA
 7747359 7747360 ckrop_1142 ckrop_1143     FALSE 0.368 230.000 0.171 NA N NA
 7747360 7747361 ckrop_1143 ckrop_1144     TRUE 0.848 157.000 0.323 NA Y NA
 7747361 7747362 ckrop_1144 ckrop_1145     TRUE 0.892 113.000 0.759 NA   NA
 7747365 7747366 ckrop_1148 ckrop_1149     FALSE 0.267 57.000 0.000 NA   NA
 7747367 7747368 ckrop_1150 ckrop_1151   cobB TRUE 0.840 117.000 0.145 1.000 Y NA
 7747368 7747369 ckrop_1151 ckrop_1152 cobB cobO TRUE 0.996 -6.000 0.114 0.013 Y NA
 7747369 7747370 ckrop_1152 ckrop_1153 cobO chlD2 TRUE 0.657 133.000 0.014 1.000 Y NA
 7747370 7747371 ckrop_1153 ckrop_1154 chlD2 chlI2 TRUE 0.762 203.000 0.081 0.003 Y NA
 7747371 7747372 ckrop_1154 ckrop_1155 chlI2 mqo FALSE 0.381 139.000 0.020 1.000   NA
 7747373 7747374 ckrop_1156 ckrop_1157     FALSE 0.202 123.000 0.000 NA N NA
 7747375 7747376 ckrop_1158 ckrop_1159 cobQ   TRUE 0.601 34.000 0.021 1.000 N NA
 7747376 7747377 ckrop_1159 ckrop_1160     TRUE 0.685 115.000 0.139 1.000 N NA
 7747377 7747378 ckrop_1160 ckrop_1161     TRUE 0.787 67.000 0.024 1.000 Y NA
 7747382 7747383 ckrop_1165 ckrop_1166     TRUE 0.721 34.000 0.076 1.000 N NA
 7747383 7747384 ckrop_1166 ckrop_1167     TRUE 0.893 103.000 0.626 1.000 N NA
 7747384 7747385 ckrop_1167 ckrop_1168     FALSE 0.376 304.000 0.416 1.000 N NA
 7747385 7747386 ckrop_1168 ckrop_1169   rpsB TRUE 0.971 34.000 0.748 1.000 Y NA
 7747388 7747389 ckrop_1171 ckrop_1172     TRUE 0.838 30.000 0.037 1.000 Y NA
 7747389 7747390 ckrop_1172 ckrop_1173     TRUE 0.975 -10.000 0.053 1.000 N NA
 7747390 7747391 ckrop_1173 ckrop_1174     TRUE 0.919 0.000 0.050 1.000 N NA
 7747391 7747392 ckrop_1174 ckrop_1175     FALSE 0.117 276.000 0.036 NA   NA
 7747392 7747393 ckrop_1175 ckrop_1176     TRUE 0.606 72.000 0.067 NA   NA
 7747393 7747394 ckrop_1176 ckrop_1177   lepB1 TRUE 0.715 11.000 0.024 1.000 N NA
 7747394 7747395 ckrop_1177 ckrop_1178 lepB1   FALSE 0.269 95.000 0.000 1.000   NA
 7747395 7747396 ckrop_1178 ckrop_1179   rplS FALSE 0.017 459.000 0.000 1.000   NA
 7747396 7747397 ckrop_1179 ckrop_1180 rplS   FALSE 0.064 292.000 0.003 1.000 N NA
 7747397 7747398 ckrop_1180 ckrop_1181     TRUE 0.620 92.000 0.000 0.024 N NA
 7747398 7747399 ckrop_1181 ckrop_1182     TRUE 0.981 10.000 0.672 1.000 Y NA
 7747399 7747400 ckrop_1182 ckrop_1183     TRUE 0.876 41.000 0.324 1.000   NA
 7747400 7747401 ckrop_1183 ckrop_1184     TRUE 0.852 86.000 0.385 1.000   NA
 7747401 7747402 ckrop_1184 ckrop_1185     FALSE 0.420 274.000 0.361 1.000 N NA
 7747402 7747403 ckrop_1185 ckrop_1186     FALSE 0.254 123.000 0.000 1.000 N NA
 7747403 7747404 ckrop_1186 ckrop_1187   glnD FALSE 0.043 297.000 0.000 1.000 N NA
 7747404 7747405 ckrop_1187 ckrop_1188 glnD   TRUE 0.727 31.000 0.081 1.000 N NA
 7747405 7747406 ckrop_1188 ckrop_1189     TRUE 0.719 95.000 0.143 1.000 N NA
 7747406 7747407 ckrop_1189 ckrop_1190     FALSE 0.013 556.000 0.000 1.000   NA
 7747407 7747408 ckrop_1190 ckrop_1191     FALSE 0.043 280.000 0.000 1.000   NA
 7747408 7747409 ckrop_1191 ckrop_1192     FALSE 0.278 49.000 0.000 NA   NA
 7747409 7747410 ckrop_1192 ckrop_1193     FALSE 0.405 68.000 0.009 NA   NA
 7747410 7747411 ckrop_1193 ckrop_1194     TRUE 0.603 35.000 0.021 1.000 N NA
 7747411 7747412 ckrop_1194 ckrop_1195   glyP FALSE 0.464 82.000 0.011 1.000 N NA
 7747412 7747413 ckrop_1195 ckrop_1196 glyP rnc FALSE 0.259 121.000 0.000 1.000 N NA
 7747413 7747414 ckrop_1196 ckrop_1197 rnc   TRUE 0.953 -7.000 0.026 NA   NA
 7747414 7747415 ckrop_1197 ckrop_1198     FALSE 0.458 110.000 0.029 NA   NA
 7747415 7747416 ckrop_1198 ckrop_1199     FALSE 0.410 104.000 0.014 NA N NA
 7747416 7747417 ckrop_1199 ckrop_1200     FALSE 0.399 104.000 0.007 1.000 N NA
 7747417 7747418 ckrop_1200 ckrop_1201   pca TRUE 0.642 113.000 0.133 NA   NA
 7747418 7747419 ckrop_1201 ckrop_1202 pca   TRUE 0.644 31.000 0.055 NA   NA
 7747419 7747420 ckrop_1202 ckrop_1203     TRUE 0.772 57.000 0.144 1.000   NA
 7747420 7747421 ckrop_1203 ckrop_1204     TRUE 0.939 -3.000 0.029 1.000   NA
 7747421 7747422 ckrop_1204 ckrop_1206     TRUE 0.625 50.000 0.028 1.000 N NA
 7747424 7747425 ckrop_1208 ckrop_1209 ddlA gpsA TRUE 0.773 18.000 0.088 1.000 N NA
 7747427 7747428 ckrop_1210 ckrop_1211     TRUE 0.973 100.000 0.477 0.001 Y NA
 7747430 7747431 ckrop_1213 ckrop_1214 mntH   FALSE 0.126 190.000 0.000 1.000 N NA
 7747433 7747434 ckrop_1216 ckrop_1217     FALSE 0.085 215.000 0.000 1.000   NA
 7747435 7747436 ckrop_1219 ckrop_1220     TRUE 0.951 7.000 0.409 1.000 N NA
 7747438 7747439 ckrop_1222 ckrop_1223     FALSE 0.007 946.000 0.000 NA   NA
 7747439 7747440 ckrop_1223 ckrop_1224     TRUE 0.791 -3.000 0.000 NA   NA
 7747440 7747441 ckrop_1224 ckrop_1225     FALSE 0.279 48.000 0.000 NA   NA
 7747441 7747442 ckrop_1225 ckrop_1226   int8 FALSE 0.221 85.000 0.000 NA   NA
 7747443 7747444 ckrop_t0029 ckrop_t0030     FALSE 0.312 21.000 0.000 NA   NA
 7747444 7747445 ckrop_t0030 ckrop_1227     FALSE 0.112 168.000 0.000 NA   NA
 7747447 7747448 ckrop_1229 ckrop_1230     FALSE 0.474 107.000 0.020 1.000 N NA
 7747448 7747449 ckrop_1230 ckrop_1231     TRUE 0.978 -3.000 0.184 1.000 N NA
 7747451 7747452 ckrop_1233 ckrop_1234     FALSE 0.349 21.000 0.000 NA N NA
 7747452 7747453 ckrop_1234 ckrop_1235     FALSE 0.284 42.000 0.000 NA   NA
 7747453 7747454 ckrop_1235 ckrop_1236     FALSE 0.072 204.000 0.000 NA   NA
 7747454 7747455 ckrop_1236 ckrop_1237     FALSE 0.455 185.000 0.006 1.000 Y NA
 7747455 7747456 ckrop_1237 ckrop_1238     TRUE 0.937 55.000 0.071 0.002 Y NA
 7747456 7747457 ckrop_1238 ckrop_1239   ilvB TRUE 0.991 5.000 0.380 0.002 Y NA
 7747458 7747459 ckrop_1240 ckrop_1241     TRUE 0.791 -3.000 0.000 NA   NA
 7747459 7747460 ckrop_1241 ckrop_1242     FALSE 0.449 51.000 0.009 NA   NA
 7747461 7747462 ckrop_1243 ckrop_1244     FALSE 0.192 112.000 0.000 NA   NA
 7747462 7747463 ckrop_1244 ckrop_1245     FALSE 0.267 57.000 0.000 NA   NA
 7747463 7747464 ckrop_1245 ckrop_1246     FALSE 0.221 85.000 0.000 NA   NA
 7747464 7747465 ckrop_1246 ckrop_1247     FALSE 0.262 61.000 0.000 NA   NA
 7747467 7747468 ckrop_1249 ckrop_1250 pfkA   TRUE 0.784 52.000 0.143 1.000 N NA
 7747468 7747469 ckrop_1250 ckrop_1251     FALSE 0.054 475.000 0.042 1.000   NA
 7747469 7747470 ckrop_1251 ckrop_1252     TRUE 0.573 11.000 0.003 1.000   NA
 7747470 7747471 ckrop_1252 ckrop_1253   gatC TRUE 0.994 4.000 0.643 0.002 Y NA
 7747473 7747474 ckrop_1255 ckrop_1256     FALSE 0.303 89.000 0.000 1.000 N NA
 7747475 7747476 ckrop_1257 ckrop_1258     FALSE 0.301 91.000 0.000 1.000 N NA
 7747477 7747478 ckrop_1259 ckrop_1260     TRUE 0.860 2.000 0.047 NA   NA
 7747478 7747479 ckrop_1260 ckrop_1261   iscS TRUE 0.577 136.000 0.094 1.000 N NA
 7747479 7747480 ckrop_1261 ckrop_1262 iscS   TRUE 0.727 91.000 0.145 1.000 N NA
 7747480 7747481 ckrop_1262 ckrop_1263     TRUE 0.982 91.000 0.877 0.007 Y NA
 7747481 7747482 ckrop_1263 ckrop_1264     FALSE 0.156 262.000 0.056 NA   NA
 7747482 7747483 ckrop_1264 ckrop_1265     TRUE 0.862 3.000 0.070 NA   NA
 7747483 7747484 ckrop_1265 ckrop_1266     TRUE 0.698 127.000 0.180 1.000   NA
 7747485 7747486 ckrop_1267 ckrop_1268     TRUE 0.897 54.000 0.159 0.007   NA
 7747487 7747488 ckrop_1269 ckrop_1270     FALSE 0.315 164.000 0.027 NA   NA
 7747490 7747491 ckrop_1272 ckrop_3003     TRUE 0.603 112.000 0.104 NA   NA
 7747491 7747492 ckrop_3003 ckrop_1273     FALSE 0.285 192.000 0.054 NA   NA
 7747492 7747493 ckrop_1273 ckrop_1274     TRUE 0.991 13.000 0.837 0.005 Y NA
 7747493 7747494 ckrop_1274 ckrop_1275     TRUE 0.994 4.000 0.724 0.005 Y NA
 7747494 7747495 ckrop_1275 ckrop_1276     TRUE 0.988 48.000 0.846 0.005 Y NA
 7747495 7747496 ckrop_1276 ckrop_1277     TRUE 0.987 64.000 0.864 0.005 Y NA
 7747496 7747497 ckrop_1277 ckrop_1278     TRUE 0.970 6.000 0.067 0.005 Y NA
 7747497 7747498 ckrop_1278 ckrop_1279   atpE TRUE 0.927 53.000 0.056 0.005 Y NA
 7747498 7747499 ckrop_1279 ckrop_1280 atpE   TRUE 0.912 79.000 0.062 0.005 Y NA
 7747499 7747500 ckrop_1280 ckrop_1281     FALSE 0.079 269.000 0.011 NA   NA
 7747500 7747501 ckrop_1281 ckrop_1282   rfe FALSE 0.135 312.000 0.105 NA   NA
 7747501 7747502 ckrop_1282 ckrop_1283 rfe   TRUE 0.816 65.000 0.248 NA N NA
 7747502 7747503 ckrop_1283 ckrop_1284   hemK TRUE 0.979 9.000 0.583 NA Y NA
 7747503 7747504 ckrop_1284 ckrop_1285 hemK   TRUE 0.983 -3.000 0.069 1.000 Y NA
 7747504 7747505 ckrop_1285 ckrop_1286     FALSE 0.264 182.000 0.017 1.000 N NA
 7747506 7747507 ckrop_1287 ckrop_1288   fadD1 FALSE 0.019 353.000 0.000 NA   NA
 7747508 7747509 ckrop_1289 ckrop_1290     TRUE 0.955 1.000 0.039 1.000 Y NA
 7747509 7747510 ckrop_1290 ckrop_1291     TRUE 0.553 203.000 0.071 1.000 Y NA
 7747510 7747511 ckrop_1291 ckrop_1292     TRUE 0.830 9.000 0.071 1.000 N NA
 7747512 7747513 ckrop_1293 ckrop_1294     TRUE 0.994 -3.000 0.403 NA Y NA
 7747513 7747514 ckrop_1294 ckrop_1295     TRUE 0.985 3.000 0.387 0.002   NA
 7747514 7747515 ckrop_1295 ckrop_t0031     FALSE 0.138 154.000 0.000 NA   NA
 7747516 7747517 ckrop_1296 ckrop_1297     FALSE 0.212 92.000 0.000 NA   NA
 7747517 7747518 ckrop_1297 ckrop_1298     FALSE 0.153 271.000 0.000 0.052   NA
 7747519 7747520 ckrop_1299 ckrop_1300     FALSE 0.032 279.000 0.000 NA   NA
 7747521 7747522 ckrop_1301 ckrop_1302     FALSE 0.254 83.000 0.000 NA N NA
 7747522 7747523 ckrop_1302 ckrop_1303     TRUE 0.987 0.000 0.312 NA Y NA
 7747523 7747524 ckrop_1303 ckrop_1304     TRUE 0.678 17.000 0.032 1.000   NA
 7747524 7747525 ckrop_1304 ckrop_1305     TRUE 0.988 -7.000 0.236 1.000   NA
 7747526 7747527 ckrop_1307 ckrop_1308 putP   TRUE 0.692 43.000 0.087 NA   NA
 7747527 7747528 ckrop_1308 ckrop_1309     TRUE 0.699 175.000 0.444 NA   NA
 7747529 7747530 ckrop_1310 ckrop_1311     FALSE 0.011 593.000 0.000 NA N NA
 7747532 7747533 ckrop_1313 ckrop_1314     TRUE 0.754 184.000 0.667 NA   NA
 7747535 7747536 ckrop_1316 ckrop_1317     FALSE 0.419 77.000 0.007 1.000   NA
 7747536 7747537 ckrop_1317 ckrop_1318     TRUE 0.621 102.000 0.076 1.000 N NA
 7747537 7747538 ckrop_1318 ckrop_1319     TRUE 0.863 8.000 0.108 1.000   NA
 7747538 7747539 ckrop_1319 ckrop_1320     TRUE 0.637 96.000 0.089 1.000   NA
 7747539 7747540 ckrop_1320 ckrop_1321     TRUE 0.848 18.000 0.222 NA   NA
 7747540 7747541 ckrop_1321 ckrop_1322     TRUE 0.988 -3.000 0.457 NA   NA
 7747541 7747542 ckrop_1322 ckrop_1323     FALSE 0.263 167.000 0.018 NA   NA
 7747542 7747543 ckrop_1323 ckrop_1324   dnaJ2 TRUE 0.803 9.000 0.073 NA   NA
 7747543 7747544 ckrop_1324 ckrop_1325 dnaJ2 hrcA FALSE 0.311 206.000 0.064 1.000 N NA
 7747544 7747545 ckrop_1325 ckrop_1326 hrcA   TRUE 0.653 69.000 0.062 1.000 N NA
 7747545 7747546 ckrop_1326 ckrop_1327     TRUE 0.932 -10.000 0.007 NA   NA
 7747546 7747547 ckrop_1327 ckrop_1328   fadD2 TRUE 0.659 172.000 0.333 NA   NA
 7747550 7747551 ckrop_1332 ckrop_1333   metC FALSE 0.227 252.000 0.000 0.017 N NA
 7747551 7747552 ckrop_1333 ckrop_1334 metC   TRUE 0.723 31.000 0.000 1.000 Y NA
 7747552 7747553 ckrop_1334 ckrop_1335     TRUE 0.995 -3.000 0.177 0.035 Y NA
 7747553 7747554 ckrop_1335 ckrop_1336     TRUE 0.675 41.000 0.000 0.035   NA
 7747554 7747555 ckrop_1336 ckrop_1337     FALSE 0.269 55.000 0.000 NA   NA
 7747556 7747557 ckrop_1338 ckrop_1339 fadB2   FALSE 0.086 189.000 0.000 NA   NA
 7747560 7747561 ckrop_1343 ckrop_1344   rpsT FALSE 0.106 261.000 0.013 1.000   NA
 7747562 7747563 ckrop_1345 ckrop_1346 holA   TRUE 0.971 -3.000 0.163 NA   NA
 7747563 7747564 ckrop_1346 ckrop_1347     FALSE 0.228 78.000 0.000 NA   NA
 7747564 7747565 ckrop_1347 ckrop_1348     FALSE 0.233 75.000 0.000 NA   NA
 7747565 7747566 ckrop_1348 ckrop_1349     FALSE 0.271 54.000 0.000 NA   NA
 7747566 7747567 ckrop_1349 ckrop_1351     FALSE 0.110 169.000 0.000 NA   NA
 7747567 7747568 ckrop_1351 ckrop_1352   gpmB TRUE 0.978 -3.000 0.224 NA   NA
 7747568 7747569 ckrop_1352 ckrop_1353 gpmB   TRUE 0.747 10.000 0.045 NA   NA
 7747569 7747570 ckrop_1353 ckrop_1354     TRUE 0.750 98.000 0.221 NA   NA
 7747570 7747571 ckrop_1354 ckrop_1355   proA TRUE 0.856 14.000 0.170 1.000 N NA
 7747571 7747572 ckrop_1355 ckrop_1356 proA   TRUE 0.960 86.000 0.281 0.002 Y NA
 7747572 7747573 ckrop_1356 ckrop_1357     FALSE 0.400 235.000 0.206 1.000   NA
 7747573 7747574 ckrop_1357 ckrop_1358     TRUE 0.641 57.000 0.000 0.051   NA
 7747574 7747575 ckrop_1358 ckrop_1359     FALSE 0.238 132.000 0.000 1.000 N NA
 7747575 7747576 ckrop_1359 ckrop_1360     TRUE 0.978 75.000 0.667 0.021 Y NA
 7747576 7747577 ckrop_1360 ckrop_1361     TRUE 0.533 254.000 0.027 0.023 Y NA
 7747577 7747578 ckrop_1361 ckrop_1362     FALSE 0.016 542.000 0.000 1.000 N NA
 7747578 7747579 ckrop_1362 ckrop_1363     FALSE 0.274 112.000 0.000 1.000 N NA
 7747579 7747580 ckrop_1363 ckrop_1364     TRUE 0.992 -3.000 0.250 1.000 Y NA
 7747580 7747581 ckrop_1364 ckrop_1365     FALSE 0.036 269.000 0.000 NA   NA
 7747581 7747582 ckrop_1365 ckrop_1366     TRUE 0.928 3.000 0.188 NA   NA
 7747582 7747583 ckrop_1366 ckrop_1367     TRUE 0.795 75.000 0.208 1.000 N NA
 7747583 7747584 ckrop_1367 ckrop_1368   mdh FALSE 0.412 132.000 0.018 1.000 N NA
 7747586 7747587 ckrop_1370 ckrop_1371 clpX   TRUE 0.536 193.000 0.039 1.000 Y NA
 7747587 7747588 ckrop_1371 ckrop_1372     TRUE 0.996 0.000 0.341 0.001 Y NA
 7747588 7747589 ckrop_1372 ckrop_1373   tig TRUE 0.537 175.000 0.018 1.000 Y NA
 7747589 7747590 ckrop_1373 ckrop_t0032 tig   FALSE 0.200 105.000 0.000 NA   NA
 7747590 7747591 ckrop_t0032 ckrop_t0033     FALSE 0.008 687.000 0.000 NA   NA
 7747593 7747594 ckrop_1376 ckrop_1377 rpi   TRUE 0.916 5.000 0.182 1.000   NA
 7747596 7747597 ckrop_1379 ckrop_1380     TRUE 0.914 27.000 0.571 NA   NA
 7747597 7747598 ckrop_1380 ckrop_1381     TRUE 0.549 22.000 0.011 1.000   NA
 7747598 7747599 ckrop_1381 ckrop_1382   dps FALSE 0.010 1346.000 0.000 1.000   NA
 7747599 7747600 ckrop_1382 ckrop_1383 dps   FALSE 0.101 201.000 0.000 1.000   NA
 7747604 7747605 ckrop_1386 ckrop_1387   cdd TRUE 0.945 3.000 0.046 1.000 Y NA
 7747606 7747607 ckrop_1388 ckrop_1389 deoA pmmB FALSE 0.344 67.000 0.000 1.000 N NA
 7747611 7747612 ckrop_1392 ckrop_t0036     FALSE 0.211 93.000 0.000 NA   NA
 7747618 7747619 ckrop_1397 ckrop_1398     TRUE 0.857 25.000 0.286 NA   NA
 7747620 7747621 ckrop_1399 ckrop_1400     FALSE 0.336 133.000 0.006 1.000 N NA
 7747621 7747622 ckrop_1400 ckrop_1401     TRUE 0.584 36.000 0.028 NA   NA
 7747622 7747623 ckrop_1401 ckrop_1402     TRUE 0.522 109.000 0.054 NA   NA
 7747623 7747624 ckrop_1402 ckrop_1403     TRUE 0.901 -3.000 0.013 NA   NA
 7747625 7747626 ckrop_1404 ckrop_1405     TRUE 0.757 19.000 0.080 1.000 N NA
 7747627 7747628 ckrop_1406 ckrop_1407     TRUE 0.628 14.000 0.024 NA   NA
 7747628 7747629 ckrop_1407 ckrop_1408     FALSE 0.174 210.000 0.010 1.000 N NA
 7747629 7747630 ckrop_1408 ckrop_1409     FALSE 0.028 365.000 0.000 1.000 N NA
 7747632 7747633 ckrop_1411 ckrop_1412   nrdI TRUE 0.880 98.000 0.225 NA Y NA
 7747633 7747634 ckrop_1412 ckrop_1413 nrdI nrdH TRUE 0.596 175.000 0.250 NA N NA
 7747634 7747635 ckrop_1413 ckrop_1416 nrdH rpmJ FALSE 0.015 507.000 0.000 1.000   NA
 7747637 7747638 ckrop_1418 ckrop_1419     FALSE 0.237 72.000 0.000 NA   NA
 7747638 7747639 ckrop_1419 ckrop_1420     TRUE 0.996 -16.000 0.667 NA   NA
 7747639 7747640 ckrop_1420 ckrop_1421     TRUE 0.906 52.000 0.556 NA   NA
 7747642 7747643 ckrop_1423 ckrop_1424     TRUE 0.581 62.000 0.038 NA   NA
 7747643 7747644 ckrop_1424 ckrop_1425     FALSE 0.219 112.000 0.000 NA N NA
 7747646 7747647 ckrop_1426 ckrop_1427 pgm   FALSE 0.053 300.000 0.005 NA N NA
 7747647 7747648 ckrop_1427 ckrop_1428     FALSE 0.167 130.000 0.000 NA   NA
 7747649 7747650 ckrop_1429 ckrop_1430 alaP   TRUE 0.857 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7747650 7747651 ckrop_1430 ckrop_1431     FALSE 0.216 88.000 0.000 NA   NA
 7747653 7747654 ckrop_1433 ckrop_1434     TRUE 0.981 1.000 0.667 NA N NA
 7747655 7747656 ckrop_1435 ckrop_1436     FALSE 0.229 77.000 0.000 NA   NA
 7747656 7747657 ckrop_1436 ckrop_1437   intA FALSE 0.008 739.000 0.000 NA   NA
 7747657 7747658 ckrop_1437 ckrop_1438 intA   FALSE 0.010 575.000 0.000 NA   NA
 7747658 7747659 ckrop_1438 ckrop_1439   smpB FALSE 0.318 87.000 0.003 NA   NA
 7747659 7747660 ckrop_1439 ckrop_1440 smpB   TRUE 0.658 44.000 0.038 1.000 N NA
 7747660 7747661 ckrop_1440 ckrop_1441   ftsE TRUE 0.966 12.000 0.431 1.000 Y NA
 7747661 7747662 ckrop_1441 ckrop_1442 ftsE   TRUE 0.637 69.000 0.053 1.000 N NA
 7747665 7747666 ckrop_1445 ckrop_1446     TRUE 0.639 91.000 0.000 1.000 Y NA
 7747666 7747667 ckrop_1446 ckrop_1448     FALSE 0.010 520.000 0.000 NA   NA
 7747667 7747668 ckrop_1448 ckrop_1451     FALSE 0.167 130.000 0.000 NA   NA
 7747668 7747669 ckrop_1451 ckrop_1452     TRUE 0.516 4.000 0.000 NA   NA
 7747669 7747670 ckrop_1452 ckrop_1453     TRUE 0.861 -7.000 0.000 NA   NA
 7747670 7747671 ckrop_1453 ckrop_1456     FALSE 0.401 265.000 0.308 1.000   NA
 7747671 7747672 ckrop_1456 ckrop_1457     TRUE 0.815 83.000 0.094 0.029   NA
 7747674 7747675 ckrop_1459 ckrop_1460     TRUE 0.990 3.000 0.713 1.000 Y NA
 7747675 7747676 ckrop_1460 ckrop_1461     FALSE 0.460 14.000 0.000 1.000 N NA
 7747676 7747677 ckrop_1461 ckrop_1463     FALSE 0.153 139.000 0.000 NA   NA
 7747678 7747679 ckrop_1464 ckrop_t0039 tnpF1   FALSE 0.134 156.000 0.000 NA   NA
 7747679 7747680 ckrop_t0039 ckrop_1465     FALSE 0.218 87.000 0.000 NA   NA
 7747682 7747683 ckrop_1467 ckrop_1468     TRUE 0.960 0.000 0.222 NA   NA
 7747683 7747684 ckrop_1468 ckrop_1469     FALSE 0.012 476.000 0.000 NA   NA
 7747685 7747686 ckrop_1470 ckrop_1471     FALSE 0.271 54.000 0.000 NA   NA
 7747686 7747687 ckrop_1471 ckrop_1472     TRUE 0.743 19.000 0.000 0.023 N NA
 7747689 7747690 ckrop_1474 ckrop_1475     TRUE 0.791 -3.000 0.000 NA   NA
 7747691 7747692 ckrop_1476 ckrop_1477     TRUE 0.645 41.000 0.031 1.000 N NA
 7747692 7747693 ckrop_1477 ckrop_1478     TRUE 0.615 131.000 0.110 1.000 N NA
 7747693 7747694 ckrop_1478 ckrop_1479     TRUE 0.972 95.000 0.493 0.003 Y NA
 7747694 7747695 ckrop_1479 ckrop_1480     TRUE 0.627 84.000 0.091 NA   NA
 7747695 7747696 ckrop_1480 ckrop_1481     TRUE 0.827 37.000 0.225 NA   NA
 7747696 7747697 ckrop_1481 ckrop_1482     TRUE 0.658 83.000 0.108 NA   NA
 7747698 7747699 ckrop_1483 ckrop_1485     FALSE 0.195 109.000 0.000 NA   NA
 7747701 7747702 ckrop_1487 ckrop_1488 whiB1   FALSE 0.059 222.000 0.000 NA   NA
 7747703 7747704 ckrop_1489 ckrop_1490 rshA sigH TRUE 0.901 108.000 0.808 NA   NA
 7747705 7747706 ckrop_1491 ckrop_1492     FALSE 0.358 33.000 0.000 1.000   NA
 7747706 7747707 ckrop_1492 ckrop_1493     TRUE 0.955 -3.000 0.063 1.000   NA
 7747707 7747708 ckrop_1493 ckrop_1494     TRUE 0.971 -10.000 0.000 0.067   NA
 7747708 7747709 ckrop_1494 ckrop_1495     TRUE 0.850 81.000 0.000 0.002 Y NA
 7747710 7747711 ckrop_1496 ckrop_1497     TRUE 0.853 11.000 0.170 NA   NA
 7747711 7747712 ckrop_1497 ckrop_1498     FALSE 0.129 159.000 0.000 NA   NA
 7747714 7747715 ckrop_1500 ckrop_1501 secA   FALSE 0.138 309.000 0.094 NA N NA
 7747715 7747716 ckrop_1501 ckrop_1502     FALSE 0.201 244.000 0.072 NA   NA
 7747716 7747717 ckrop_1502 ckrop_1503     FALSE 0.272 53.000 0.000 NA   NA
 7747717 7747718 ckrop_1503 ckrop_1504   mtrB TRUE 0.677 0.000 0.000 NA   NA
 7747718 7747719 ckrop_1504 ckrop_1505 mtrB mtrA TRUE 0.998 -7.000 0.772 1.000 Y NA
 7747721 7747722 ckrop_1507 ckrop_1508     TRUE 0.663 76.000 0.000 1.000 Y NA
 7747722 7747723 ckrop_1508 ckrop_1509     TRUE 0.961 -3.000 0.076 1.000 N NA
 7747723 7747724 ckrop_1509 ckrop_1510     FALSE 0.216 88.000 0.000 NA   NA
 7747726 7747727 ckrop_1512 ckrop_1513 manA   TRUE 0.713 100.000 0.174 NA   NA
 7747727 7747728 ckrop_1513 ckrop_1514   pmmA TRUE 0.758 12.000 0.080 NA   NA
 7747728 7747729 ckrop_1514 ckrop_1515 pmmA   TRUE 0.886 61.000 0.460 NA   NA
 7747731 7747732 ckrop_1517 ckrop_1518 whiB2   FALSE 0.014 542.000 0.000 1.000   NA
 7747732 7747733 ckrop_1518 ckrop_1519   wbbL FALSE 0.374 211.000 0.151 NA   NA
 7747733 7747734 ckrop_1519 ckrop_1520 wbbL rmlD TRUE 0.881 24.000 0.354 NA   NA
 7747735 7747736 ckrop_1521 ckrop_1522 lytR2   FALSE 0.434 94.000 0.020 NA   NA
 7747737 7747738 ckrop_1523 ckrop_1524     FALSE 0.110 169.000 0.000 NA   NA
 7747738 7747739 ckrop_1524 ckrop_1525     FALSE 0.457 8.000 0.000 NA   NA
 7747739 7747740 ckrop_1525 ckrop_1526     TRUE 0.957 51.000 0.141 0.001 Y NA
 7747740 7747741 ckrop_1526 ckrop_1527     TRUE 0.596 21.000 0.025 NA   NA
 7747741 7747742 ckrop_1527 ckrop_1528     FALSE 0.221 193.000 0.025 NA   NA
 7747743 7747744 ckrop_1529 ckrop_1530 accD accE TRUE 0.905 119.000 0.857 NA   NA
 7747744 7747745 ckrop_1530 ckrop_1531 accE   FALSE 0.455 40.000 0.009 NA   NA
 7747745 7747746 ckrop_1531 ckrop_1532     FALSE 0.170 146.000 0.000 NA N NA
 7747746 7747747 ckrop_1532 ckrop_1533     TRUE 0.991 -3.000 0.615 NA   NA
 7747747 7747748 ckrop_1533 ckrop_1534     TRUE 0.972 -3.000 0.167 NA   NA
 7747748 7747749 ckrop_1534 ckrop_1535     TRUE 0.689 22.000 0.069 NA   NA
 7747749 7747750 ckrop_1535 ckrop_1536     TRUE 0.998 -3.000 0.686 0.004 Y NA
 7747750 7747751 ckrop_1536 ckrop_1537     TRUE 0.953 -3.000 0.057 1.000   NA
 7747751 7747752 ckrop_1537 ckrop_1538     FALSE 0.199 106.000 0.000 NA   NA
 7747752 7747753 ckrop_1538 ckrop_1539     FALSE 0.289 37.000 0.000 NA   NA
 7747755 7747756 ckrop_1541 ckrop_1542   accBC FALSE 0.084 363.000 0.042 1.000 N NA
 7747756 7747757 ckrop_1542 ckrop_1543 accBC   FALSE 0.331 72.000 0.000 1.000 N NA
 7747757 7747758 ckrop_1543 ckrop_1544     FALSE 0.231 76.000 0.000 NA   NA
 7747758 7747759 ckrop_1544 ckrop_1545     FALSE 0.224 83.000 0.000 NA   NA
 7747760 7747761 ckrop_1546 ckrop_1547 lpdA   FALSE 0.075 242.000 0.000 1.000 N NA
 7747762 7747763 ckrop_1548 ckrop_1550     TRUE 0.516 4.000 0.000 NA   NA
 7747763 7747764 ckrop_1550 ckrop_1551     TRUE 0.760 64.000 0.167 NA   NA
 7747765 7747766 ckrop_1552 ckrop_1553     TRUE 0.992 -3.000 0.667 1.000   NA
 7747766 7747767 ckrop_1553 ckrop_1554     TRUE 0.998 -3.000 0.500 0.033 Y NA
 7747767 7747768 ckrop_1554 ckrop_1555     FALSE 0.116 261.000 0.013 1.000 N NA
 7747769 7747770 ckrop_1556 ckrop_1557     FALSE 0.138 154.000 0.000 NA   NA
 7747771 7747772 ckrop_1558 ckrop_1559     TRUE 0.567 92.000 0.045 1.000   NA
 7747772 7747773 ckrop_1559 ckrop_1560   exoA TRUE 0.542 85.000 0.026 1.000 N NA
 7747773 7747774 ckrop_1560 ckrop_1561 exoA   FALSE 0.242 175.000 0.016 NA N NA
 7747775 7747776 ckrop_1562 ckrop_1563     FALSE 0.349 14.000 0.000 NA   NA
 7747778 7747779 ckrop_1565 ckrop_1566   icd FALSE 0.025 383.000 0.000 1.000 N NA
 7747781 7747782 ckrop_1568 ckrop_1569     TRUE 0.915 141.000 0.542 1.000 Y NA
 7747783 7747784 ckrop_1570 ckrop_1571   mntR FALSE 0.018 362.000 0.000 NA   NA
 7747785 7747786 ckrop_1572 ckrop_1573     TRUE 0.995 0.000 0.894 1.000 Y NA
 7747786 7747787 ckrop_1573 ckrop_1574     TRUE 0.997 -3.000 0.857 1.000 Y NA
 7747788 7747789 ckrop_1575 ckrop_1576 glsA   FALSE 0.389 28.000 0.000 1.000 N NA
 7747791 7747792 ckrop_1578 ckrop_1579   folD TRUE 0.978 0.000 0.453 NA   NA
 7747792 7747793 ckrop_1579 ckrop_1580 folD   FALSE 0.123 163.000 0.000 NA   NA
 7747794 7747795 ckrop_1581 ckrop_1582     TRUE 0.516 4.000 0.000 NA   NA
 7747795 7747796 ckrop_1582 ckrop_1583     TRUE 0.964 -3.000 0.118 NA   NA
 7747796 7747797 ckrop_1583 ckrop_1584     TRUE 0.614 1.000 0.000 NA   NA
 7747797 7747798 ckrop_1584 ckrop_1585     FALSE 0.211 93.000 0.000 NA   NA
 7747798 7747799 ckrop_1585 ckrop_1586     FALSE 0.285 30.000 0.000 NA   NA
 7747799 7747800 ckrop_1586 ckrop_1587     TRUE 0.677 0.000 0.000 NA   NA
 7747800 7747801 ckrop_1587 ckrop_1588     FALSE 0.321 19.000 0.000 NA   NA
 7747801 7747802 ckrop_1588 ckrop_1589     FALSE 0.286 32.000 0.000 NA   NA
 7747802 7747803 ckrop_1589 ckrop_1590     TRUE 0.555 3.000 0.000 NA   NA
 7747803 7747804 ckrop_1590 ckrop_3005     TRUE 0.791 -3.000 0.000 NA   NA
 7747804 7747805 ckrop_3005 ckrop_1591     TRUE 0.660 84.000 0.111 NA   NA
 7747805 7747806 ckrop_1591 ckrop_1592     FALSE 0.275 51.000 0.000 NA   NA
 7747806 7747807 ckrop_1592 ckrop_1593     TRUE 0.555 3.000 0.000 NA   NA
 7747808 7747809 ckrop_1594 ckrop_1595     FALSE 0.143 151.000 0.000 NA   NA
 7747810 7747811 ckrop_1596 ckrop_1597     FALSE 0.300 24.000 0.000 NA   NA
 7747811 7747812 ckrop_1597 ckrop_1598     FALSE 0.180 121.000 0.000 NA   NA
 7747812 7747813 ckrop_1598 ckrop_1599     FALSE 0.286 32.000 0.000 NA   NA
 7747813 7747814 ckrop_1599 ckrop_1600     TRUE 0.516 4.000 0.000 NA   NA
 7747814 7747815 ckrop_1600 ckrop_1601     FALSE 0.295 25.000 0.000 NA   NA
 7747815 7747816 ckrop_1601 ckrop_1602     FALSE 0.015 398.000 0.000 NA   NA
 7747816 7747817 ckrop_1602 ckrop_1603     FALSE 0.039 261.000 0.000 NA   NA
 7747817 7747818 ckrop_1603 ckrop_1604     FALSE 0.266 58.000 0.000 NA   NA
 7747818 7747819 ckrop_1604 ckrop_1605     FALSE 0.277 50.000 0.000 NA   NA
 7747819 7747820 ckrop_1605 ckrop_1606     FALSE 0.017 366.000 0.000 NA   NA
 7747820 7747821 ckrop_1606 ckrop_1607     TRUE 0.718 25.000 0.000 0.018   NA
 7747822 7747823 ckrop_1608 ckrop_1609     TRUE 0.970 6.000 0.750 NA   NA
 7747823 7747824 ckrop_1609 ckrop_1610     TRUE 0.952 24.000 1.000 NA   NA
 7747825 7747826 ckrop_1611 ckrop_1612     FALSE 0.262 61.000 0.000 NA   NA
 7747828 7747829 ckrop_1615 ckrop_1616 arsC   FALSE 0.104 185.000 0.000 NA N NA
 7747830 7747831 ckrop_1617 ckrop_1618     FALSE 0.341 15.000 0.000 NA   NA
 7747832 7747833 ckrop_1621 ckrop_1622     TRUE 0.555 3.000 0.000 NA   NA
 7747834 7747835 ckrop_1623 ckrop_1624     FALSE 0.009 636.000 0.000 NA   NA
 7747835 7747836 ckrop_1624 ckrop_1625     FALSE 0.189 114.000 0.000 NA   NA
 7747836 7747837 ckrop_1625 ckrop_1626     TRUE 0.791 -3.000 0.000 NA   NA
 7747837 7747838 ckrop_1626 ckrop_3006     FALSE 0.062 216.000 0.000 NA   NA
 7747838 7747839 ckrop_3006 ckrop_1627     TRUE 0.861 -7.000 0.000 NA   NA
 7747839 7747840 ckrop_1627 ckrop_1628     TRUE 0.861 -7.000 0.000 NA   NA
 7747840 7747841 ckrop_1628 ckrop_1629     TRUE 0.677 0.000 0.000 NA   NA
 7747841 7747842 ckrop_1629 ckrop_1630     TRUE 0.555 3.000 0.000 NA   NA
 7747844 7747845 ckrop_1632 ckrop_1633     FALSE 0.030 288.000 0.000 NA   NA
 7747845 7747846 ckrop_1633 ckrop_1634     FALSE 0.277 50.000 0.000 NA   NA
 7747846 7747847 ckrop_1634 ckrop_1635     TRUE 0.665 51.000 0.000 0.033   NA
 7747848 7747849 ckrop_1636 ckrop_1637     FALSE 0.194 110.000 0.000 NA   NA
 7747849 7747850 ckrop_1637 ckrop_1639     FALSE 0.295 25.000 0.000 NA   NA
 7747850 7747851 ckrop_1639 ckrop_1640   int9 FALSE 0.023 318.000 0.000 NA   NA
 7747852 7747853 ckrop_1641 ckrop_1642 fadE3 fadE4 TRUE 0.970 128.000 0.604 0.002 Y NA
 7747853 7747854 ckrop_1642 ckrop_1644 fadE4   FALSE 0.069 248.000 0.000 1.000 N NA
 7747854 7747855 ckrop_1644 ckrop_1645     TRUE 0.507 59.000 0.009 1.000 N NA
 7747855 7747856 ckrop_1645 ckrop_1646     FALSE 0.412 10.000 0.000 NA   NA
 7747856 7747857 ckrop_1646 ckrop_1647     TRUE 0.937 -3.000 0.037 NA   NA
 7747857 7747858 ckrop_1647 ckrop_1648   folXK TRUE 0.954 -3.000 0.081 NA   NA
 7747858 7747859 ckrop_1648 ckrop_1649 folXK folP2 TRUE 0.994 -7.000 0.018 0.006 Y NA
 7747859 7747860 ckrop_1649 ckrop_1650 folP2   TRUE 0.960 59.000 0.609 1.000 Y NA
 7747860 7747861 ckrop_1650 ckrop_1651   ftsH TRUE 0.964 0.000 0.212 1.000 N NA
 7747861 7747862 ckrop_1651 ckrop_1652 ftsH hpt FALSE 0.435 216.000 0.180 1.000 N NA
 7747862 7747863 ckrop_1652 ckrop_1653 hpt   TRUE 0.837 89.000 0.137 0.042 N NA
 7747863 7747864 ckrop_1653 ckrop_1654     TRUE 0.592 26.000 0.017 1.000 N NA
 7747868 7747869 ckrop_1658 ckrop_1659 ugpC ugpB TRUE 0.937 89.000 0.467 1.000 Y NA
 7747869 7747870 ckrop_1659 ckrop_1660 ugpB ugpE TRUE 0.995 0.000 0.467 0.032 Y NA
 7747870 7747871 ckrop_1660 ckrop_1661 ugpE ugpA TRUE 0.987 6.000 0.389 0.032 Y NA
 7747872 7747873 ckrop_1662 ckrop_1663     FALSE 0.227 80.000 0.000 NA   NA
 7747873 7747874 ckrop_1663 ckrop_1664     FALSE 0.314 254.000 0.176 NA N NA
 7747874 7747875 ckrop_1664 ckrop_1665     TRUE 0.840 -3.000 0.000 1.000   NA
 7747876 7747877 ckrop_1666 ckrop_1667   groEL2 FALSE 0.064 244.000 0.000 1.000   NA
 7747878 7747879 ckrop_1668 ckrop_1669     FALSE 0.129 159.000 0.000 NA   NA
 7747879 7747880 ckrop_1669 ckrop_1670     FALSE 0.162 133.000 0.000 NA   NA
 7747881 7747882 ckrop_1671 ckrop_1672     TRUE 0.559 99.000 0.064 NA   NA
 7747882 7747883 ckrop_1672 ckrop_1673     FALSE 0.156 137.000 0.000 NA   NA
 7747884 7747885 ckrop_1674 ckrop_1675     TRUE 0.911 32.000 0.488 1.000   NA
 7747885 7747886 ckrop_1675 ckrop_1676     TRUE 0.802 11.000 0.088 1.000   NA
 7747886 7747887 ckrop_1676 ckrop_1677     TRUE 0.618 94.000 0.000 0.024 N NA
 7747888 7747889 ckrop_1678 ckrop_1679     TRUE 0.964 0.000 0.250 NA   NA
 7747890 7747891 ckrop_1680 ckrop_1681     TRUE 0.994 -3.000 0.895 NA   NA
 7747891 7747892 ckrop_1681 ckrop_1682     TRUE 0.996 -3.000 0.622 1.000 Y NA
 7747892 7747893 ckrop_1682 ckrop_1683     FALSE 0.431 150.000 0.054 NA   NA
 7747893 7747894 ckrop_1683 ckrop_1685     FALSE 0.098 176.000 0.000 NA   NA
 7747895 7747896 ckrop_1686 ckrop_1687 ack pta TRUE 0.938 22.000 0.271 1.000 Y NA
 7747898 7747899 ckrop_1689 ckrop_1690 cysY   TRUE 0.760 80.000 0.175 1.000   NA
 7747899 7747900 ckrop_1690 ckrop_1691     TRUE 0.996 0.000 0.925 0.001 N NA
 7747900 7747901 ckrop_1691 ckrop_1692     TRUE 0.814 69.000 0.046 1.000 Y NA
 7747901 7747902 ckrop_1692 ckrop_1693     FALSE 0.070 409.000 0.041 1.000 N NA
 7747902 7747903 ckrop_1693 ckrop_1695     FALSE 0.026 348.000 0.000 1.000   NA
 7747903 7747904 ckrop_1695 ckrop_1696   ptsS FALSE 0.013 593.000 0.000 1.000   NA
 7747904 7747905 ckrop_1696 ckrop_1697 ptsS scrB FALSE 0.102 602.000 0.031 1.000 Y NA
 7747906 7747907 ckrop_1699 ckrop_1700     FALSE 0.032 341.000 0.000 1.000 N NA
 7747907 7747908 ckrop_1700 ckrop_1701     TRUE 0.744 0.000 0.000 1.000   NA
 7747908 7747909 ckrop_1701 ckrop_1702     FALSE 0.206 100.000 0.000 NA   NA
 7747911 7747912 ckrop_1704 ckrop_1705     TRUE 0.793 39.000 0.170 NA   NA
 7747912 7747913 ckrop_1705 ckrop_1707   tcsS2 TRUE 0.817 120.000 0.421 NA   NA
 7747913 7747914 ckrop_1707 ckrop_1708 tcsS2 tcsR2 TRUE 0.998 -3.000 0.667 0.005 Y NA
 7747914 7747915 ckrop_1708 ckrop_1709 tcsR2   FALSE 0.088 226.000 0.000 1.000 N NA
 7747915 7747916 ckrop_1709 ckrop_1710     TRUE 0.842 117.000 0.009 0.004 Y NA
 7747917 7747918 ckrop_1711 ckrop_1712     TRUE 0.989 -3.000 0.500 NA   NA
 7747918 7747919 ckrop_1712 ckrop_1713     FALSE 0.279 108.000 0.000 1.000 N NA
 7747919 7747920 ckrop_1713 ckrop_1714     FALSE 0.472 161.000 0.000 0.020 N NA
 7747920 7747921 ckrop_1714 ckrop_1715   thiG TRUE 0.994 -13.000 0.014 0.020 Y NA
 7747921 7747922 ckrop_1715 ckrop_1716 thiG thiS TRUE 0.952 4.000 0.104 1.000 Y NA
 7747922 7747923 ckrop_1716 ckrop_1717 thiS thiO TRUE 0.866 132.000 0.625 1.000 N NA
 7747927 7747928 ckrop_1721 ckrop_1722     FALSE 0.332 60.000 0.000 1.000   NA
 7747928 7747929 ckrop_1722 ckrop_1723     TRUE 0.651 23.000 0.047 NA   NA
 7747929 7747930 ckrop_1723 ckrop_1724     FALSE 0.272 449.000 0.605 NA   NA
 7747930 7747931 ckrop_1724 ckrop_1725   uvrA2 FALSE 0.036 271.000 0.000 NA   NA
 7747934 7747935 ckrop_1728 ckrop_1729     FALSE 0.028 294.000 0.000 NA   NA
 7747935 7747936 ckrop_1729 ckrop_1730   lplA2 FALSE 0.285 31.000 0.000 NA   NA
 7747937 7747938 ckrop_1731 ckrop_1732 acoC acoB TRUE 0.976 11.000 0.295 0.048 Y NA
 7747938 7747939 ckrop_1732 ckrop_1733 acoB acoA TRUE 0.988 40.000 0.804 0.002 Y NA
 7747939 7747940 ckrop_1733 ckrop_1734 acoA   FALSE 0.014 656.000 0.000 1.000 N NA
 7747942 7747943 ckrop_1736 ckrop_1737 groEL   TRUE 0.963 27.000 0.592 1.000 Y NA
 7747943 7747944 ckrop_1737 ckrop_1738     FALSE 0.355 215.000 0.004 1.000 Y NA
 7747944 7747945 ckrop_1738 ckrop_1739     TRUE 0.598 86.000 0.056 1.000   NA
 7747945 7747946 ckrop_1739 ckrop_1740     TRUE 0.682 44.000 0.062 1.000   NA
 7747946 7747947 ckrop_1740 ckrop_1741     TRUE 0.596 11.000 0.003 1.000 N NA
 7747947 7747948 ckrop_1741 ckrop_1742     TRUE 0.567 78.000 0.042 NA N NA
 7747948 7747949 ckrop_1742 ckrop_1743     FALSE 0.324 119.000 0.006 NA N NA
 7747951 7747952 ckrop_1745 ckrop_1746     TRUE 0.791 -3.000 0.000 NA   NA
 7747952 7747953 ckrop_1746 ckrop_1747     TRUE 0.791 -3.000 0.000 NA   NA
 7747953 7747954 ckrop_1747 ckrop_1748   pmmC FALSE 0.056 229.000 0.000 NA   NA
 7747956 7747957 ckrop_1750 ckrop_1751   rplM TRUE 0.996 0.000 0.601 0.020 Y NA
 7747957 7747958 ckrop_1751 ckrop_1752 rplM   FALSE 0.034 329.000 0.000 1.000 N NA
 7747958 7747959 ckrop_1752 ckrop_1753     FALSE 0.289 38.000 0.000 NA   NA
 7747959 7747960 ckrop_1753 ckrop_1754     TRUE 0.949 28.000 1.000 NA   NA
 7747960 7747961 ckrop_1754 ckrop_1755     TRUE 0.999 -10.000 1.000 0.005 Y NA
 7747961 7747962 ckrop_1755 ckrop_1756     FALSE 0.269 55.000 0.000 NA   NA
 7747962 7747963 ckrop_1756 ckrop_1757     TRUE 0.808 62.000 0.238 NA   NA
 7747963 7747964 ckrop_1757 ckrop_1758     TRUE 0.497 220.000 0.310 NA   NA
 7747964 7747965 ckrop_1758 ckrop_1759     TRUE 0.791 -3.000 0.000 NA   NA
 7747965 7747966 ckrop_1759 ckrop_1760     FALSE 0.064 213.000 0.000 NA   NA
 7747967 7747968 ckrop_1761 ckrop_1762     TRUE 0.971 6.000 0.800 NA   NA
 7747970 7747971 ckrop_1764 ckrop_1765     TRUE 0.989 -3.000 0.508 NA   NA
 7747971 7747972 ckrop_1765 ckrop_1766     FALSE 0.225 82.000 0.000 NA   NA
 7747976 7747977 ckrop_1770 ckrop_1771     FALSE 0.038 265.000 0.000 NA   NA
 7747977 7747978 ckrop_1771 ckrop_1772     FALSE 0.124 162.000 0.000 NA   NA
 7747978 7747979 ckrop_1772 ckrop_1773     FALSE 0.279 48.000 0.000 NA   NA
 7747980 7747981 ckrop_1774 ckrop_1775     TRUE 0.901 137.000 0.873 1.000 N NA
 7747981 7747982 ckrop_1775 ckrop_1776     TRUE 0.857 128.000 0.549 1.000 N NA
 7747982 7747983 ckrop_1776 ckrop_1777     TRUE 0.980 21.000 0.509 0.027 Y NA
 7747983 7747984 ckrop_1777 ckrop_1778     TRUE 0.995 4.000 0.810 0.019 Y NA
 7747984 7747985 ckrop_1778 ckrop_1779     TRUE 0.536 276.000 0.075 0.021 Y NA
 7747986 7747987 ckrop_1780 ckrop_1781 bglF bglA TRUE 0.875 76.000 0.150 1.000 Y NA
 7747987 7747988 ckrop_1781 ckrop_1782 bglA licT TRUE 0.703 67.000 0.100 1.000   NA
 7747988 7747989 ckrop_1782 ckrop_1783 licT maa FALSE 0.203 138.000 0.000 1.000   NA
 7747990 7747991 ckrop_1784 ckrop_1785 arcA   FALSE 0.160 171.000 0.000 1.000 N NA
 7747991 7747992 ckrop_1785 ckrop_1786   irp6C FALSE 0.289 102.000 0.000 1.000 N NA
 7747992 7747993 ckrop_1786 ckrop_1787 irp6C irp6B TRUE 0.996 0.000 1.000 1.000 Y NA
 7747993 7747994 ckrop_1787 ckrop_1788 irp6B irp6A TRUE 0.991 4.000 0.857 1.000 Y NA
 7747994 7747995 ckrop_1788 ckrop_1789 irp6A   FALSE 0.029 356.000 0.000 1.000 N NA
 7747995 7747996 ckrop_1789 ckrop_1790     TRUE 0.890 2.000 0.057 1.000 N NA
 7747996 7747997 ckrop_1790 ckrop_1791     TRUE 0.566 278.000 0.730 1.000 N NA
 7747997 7747998 ckrop_1791 ckrop_1792   rpmD TRUE 0.993 7.000 0.653 0.004 Y NA
 7747998 7747999 ckrop_1792 ckrop_1793 rpmD   TRUE 0.994 4.000 0.789 0.027 Y NA
 7747999 7748000 ckrop_1793 ckrop_1794     TRUE 0.985 44.000 0.814 0.027 Y NA
 7748000 7748001 ckrop_1794 ckrop_1795     TRUE 0.997 0.000 0.815 0.019 Y NA
 7748001 7748002 ckrop_1795 ckrop_1796     TRUE 0.988 18.000 0.808 0.019 Y NA
 7748004 7748005 ckrop_1798 ckrop_1799     FALSE 0.410 177.000 0.000 1.000 Y NA
 7748005 7748006 ckrop_1799 ckrop_1800     FALSE 0.224 127.000 0.000 1.000   NA
 7748007 7748008 ckrop_1801 ckrop_1802     FALSE 0.015 393.000 0.000 NA   NA
 7748009 7748010 ckrop_1803 ckrop_1804     FALSE 0.028 292.000 0.000 NA   NA
 7748010 7748011 ckrop_1804 ckrop_1805     FALSE 0.010 949.000 0.000 1.000   NA
 7748011 7748012 ckrop_1805 ckrop_1806     FALSE 0.123 163.000 0.000 NA   NA
 7748012 7748013 ckrop_1806 ckrop_1808     FALSE 0.020 341.000 0.000 NA   NA
 7748013 7748014 ckrop_1808 ckrop_1809     FALSE 0.069 207.000 0.000 NA   NA
 7748014 7748015 ckrop_1809 ckrop_1810     TRUE 0.995 3.000 0.758 0.019 Y NA
 7748015 7748016 ckrop_1810 ckrop_1811     TRUE 0.996 1.000 0.810 0.026 Y NA
 7748016 7748017 ckrop_1811 ckrop_1812     FALSE 0.030 306.000 0.000 NA N NA
 7748017 7748018 ckrop_1812 ckrop_1813     FALSE 0.299 207.000 0.000 NA Y NA
 7748020 7748021 ckrop_1815 ckrop_1816     FALSE 0.073 232.000 0.000 1.000   NA
 7748021 7748022 ckrop_1816 ckrop_1817     TRUE 0.647 86.000 0.000 1.000 Y NA
 7748023 7748024 ckrop_1818 ckrop_1819     TRUE 0.837 9.000 0.000 1.000 Y NA
 7748025 7748026 ckrop_1820 ckrop_1821     TRUE 0.908 -10.000 0.000 1.000   NA
 7748027 7748028 ckrop_1822 ckrop_1823     FALSE 0.107 171.000 0.000 NA   NA
 7748028 7748029 ckrop_1823 ckrop_1824     FALSE 0.022 322.000 0.000 NA   NA
 7748029 7748030 ckrop_1824 ckrop_1825     TRUE 0.861 -7.000 0.000 NA   NA
 7748030 7748031 ckrop_1825 ckrop_1826     FALSE 0.307 22.000 0.000 NA   NA
 7748032 7748033 ckrop_1827 ckrop_1828     FALSE 0.083 232.000 0.000 1.000 N NA
 7748033 7748034 ckrop_1828 ckrop_1829     TRUE 0.997 0.000 0.828 0.019 Y NA
 7748034 7748035 ckrop_1829 ckrop_1830     TRUE 0.997 0.000 0.802 0.019 Y NA
 7748035 7748036 ckrop_1830 ckrop_1831     TRUE 0.995 3.000 0.828 0.026 Y NA
 7748036 7748037 ckrop_1831 ckrop_1832     TRUE 0.997 0.000 0.719 0.026 Y NA
 7748037 7748038 ckrop_1832 ckrop_1833     TRUE 0.994 4.000 0.769 0.026 Y NA
 7748038 7748039 ckrop_1833 ckrop_1834     TRUE 0.988 17.000 0.820 0.026 Y NA
 7748039 7748040 ckrop_1834 ckrop_1835     TRUE 0.977 23.000 0.849 1.000 Y NA
 7748040 7748041 ckrop_1835 ckrop_1836     TRUE 0.996 -3.000 0.513 1.000 Y NA
 7748041 7748042 ckrop_1836 ckrop_1837     TRUE 0.997 -3.000 0.361 0.019 Y NA
 7748042 7748043 ckrop_1837 ckrop_1838   rpsJ TRUE 0.977 27.000 0.467 0.026 Y NA
 7748044 7748045 ckrop_1839 ckrop_1840     FALSE 0.014 422.000 0.000 NA   NA
 7748045 7748046 ckrop_1840 ckrop_1841     FALSE 0.178 122.000 0.000 NA   NA
 7748046 7748047 ckrop_1841 ckrop_1842     FALSE 0.172 127.000 0.000 NA   NA
 7748047 7748048 ckrop_1842 ckrop_1843     TRUE 0.555 3.000 0.000 NA   NA
 7748048 7748049 ckrop_1843 ckrop_1844     TRUE 0.677 0.000 0.000 NA   NA
 7748049 7748050 ckrop_1844 ckrop_1845     TRUE 0.791 -3.000 0.000 NA   NA
 7748050 7748051 ckrop_1845 ckrop_1847     FALSE 0.025 308.000 0.000 NA   NA
 7748052 7748053 ckrop_1848 ckrop_1849     FALSE 0.012 458.000 0.000 NA   NA
 7748053 7748054 ckrop_1849 ckrop_1850     TRUE 0.620 423.000 0.400 0.001 Y NA
 7748054 7748055 ckrop_1850 ckrop_1851     TRUE 0.950 78.000 0.579 1.000 Y NA
 7748055 7748056 ckrop_1851 ckrop_1852     TRUE 0.994 4.000 0.620 0.004 Y NA
 7748056 7748057 ckrop_1852 ckrop_1853     FALSE 0.010 522.000 0.000 NA   NA
 7748057 7748058 ckrop_1853 ckrop_1854     FALSE 0.050 241.000 0.000 NA   NA
 7748058 7748059 ckrop_1854 ckrop_1856   rbsK FALSE 0.027 299.000 0.000 NA   NA
 7748059 7748060 ckrop_1856 ckrop_1857 rbsK   FALSE 0.014 611.000 0.000 1.000 N NA
 7748060 7748061 ckrop_1857 ckrop_1858   rpoB TRUE 0.988 67.000 0.851 0.001 Y NA
 7748061 7748062 ckrop_1858 ckrop_1859 rpoB   FALSE 0.142 472.000 0.223 1.000 N NA
 7748062 7748063 ckrop_1859 ckrop_1860     TRUE 0.984 74.000 0.884 0.019 Y NA
 7748063 7748064 ckrop_1860 ckrop_1861     FALSE 0.023 317.000 0.000 NA   NA
 7748065 7748066 ckrop_1862 ckrop_1863     FALSE 0.034 274.000 0.000 NA   NA
 7748067 7748068 ckrop_1864 ckrop_1865 nanE nanK TRUE 0.969 40.000 0.714 1.000 Y NA
 7748069 7748070 ckrop_1866 ckrop_1869 nagA nagB TRUE 0.782 164.000 0.179 1.000 Y NA
 7748071 7748072 ckrop_1870 ckrop_1871   nanL FALSE 0.042 256.000 0.000 NA   NA
 7748072 7748073 ckrop_1871 ckrop_1872 nanL nanI FALSE 0.220 129.000 0.000 1.000   NA
 7748074 7748075 ckrop_1873 ckrop_1874 nanT   TRUE 0.880 3.000 0.091 NA   NA
 7748078 7748079 ckrop_1878 ckrop_1879     TRUE 0.976 117.000 0.838 0.026 Y NA
 7748079 7748080 ckrop_1879 ckrop_1880     TRUE 0.588 266.000 0.681 1.000 N NA
 7748080 7748081 ckrop_1880 ckrop_1881   secE TRUE 0.862 165.000 0.843 1.000 N NA
 7748081 7748082 ckrop_1881 ckrop_t0040 secE   FALSE 0.240 70.000 0.000 NA   NA
 7748082 7748083 ckrop_t0040 ckrop_t0041     FALSE 0.068 209.000 0.000 NA   NA
 7748083 7748084 ckrop_t0041 ckrop_t0042     FALSE 0.249 67.000 0.000 NA   NA
 7748084 7748085 ckrop_t0042 ckrop_t0043     FALSE 0.057 227.000 0.000 NA   NA
 7748085 7748086 ckrop_t0043 ckrop_1882     FALSE 0.138 154.000 0.000 NA   NA
 7748086 7748087 ckrop_1882 ckrop_1883     FALSE 0.416 197.000 0.006 1.000 Y NA
 7748087 7748088 ckrop_1883 ckrop_1884     TRUE 0.562 29.000 0.013 1.000 N NA
 7748088 7748089 ckrop_1884 ckrop_1885     TRUE 0.794 79.000 0.259 NA   NA
 7748089 7748090 ckrop_1885 ckrop_1886     TRUE 0.546 95.000 0.055 NA   NA
 7748090 7748091 ckrop_1886 ckrop_1887     TRUE 0.537 46.000 0.014 1.000   NA
 7748092 7748093 ckrop_1888 ckrop_1889     FALSE 0.293 99.000 0.000 1.000 N NA
 7748093 7748094 ckrop_1889 ckrop_1890     TRUE 0.985 0.000 0.667 NA   NA
 7748094 7748095 ckrop_1890 ckrop_1891     TRUE 0.784 12.000 0.100 NA   NA
 7748095 7748096 ckrop_1891 ckrop_1892     FALSE 0.022 324.000 0.000 NA   NA
 7748096 7748097 ckrop_1892 ckrop_1893     FALSE 0.240 70.000 0.000 NA   NA
 7748100 7748101 ckrop_1896 ckrop_1897   rmlC FALSE 0.210 95.000 0.000 NA   NA
 7748101 7748102 ckrop_1897 ckrop_1898 rmlC   TRUE 0.712 51.000 0.000 1.000 Y NA
 7748102 7748103 ckrop_1898 ckrop_1899     FALSE 0.389 32.000 0.000 1.000 N NA
 7748103 7748104 ckrop_1899 ckrop_1900     FALSE 0.080 379.000 0.000 0.062 N NA
 7748104 7748105 ckrop_1900 ckrop_1901     TRUE 0.827 105.000 0.131 NA Y NA
 7748105 7748106 ckrop_1901 ckrop_1902     TRUE 0.824 120.000 0.148 NA Y NA
 7748106 7748107 ckrop_1902 ckrop_1903     TRUE 0.991 0.000 0.455 1.000 Y NA
 7748107 7748108 ckrop_1903 ckrop_1904     TRUE 0.617 60.000 0.044 NA N NA
 7748108 7748109 ckrop_1904 ckrop_1905     TRUE 0.916 5.000 0.204 NA N NA
 7748109 7748110 ckrop_1905 ckrop_1906     TRUE 0.505 83.000 0.018 1.000 N NA
 7748110 7748111 ckrop_1906 ckrop_1907     TRUE 0.992 -9.000 0.400 NA   NA
 7748111 7748112 ckrop_1907 ckrop_1908     FALSE 0.211 93.000 0.000 NA   NA
 7748112 7748113 ckrop_1908 ckrop_1909   hemB FALSE 0.233 75.000 0.000 NA   NA
 7748113 7748114 ckrop_1909 ckrop_1910 hemB   TRUE 0.850 36.000 0.048 1.000 Y NA
 7748114 7748115 ckrop_1910 ckrop_1911   hemC TRUE 0.576 150.000 0.003 1.000 Y NA
 7748115 7748116 ckrop_1911 ckrop_1912 hemC   TRUE 0.996 -3.000 0.178 0.002 Y NA
 7748116 7748117 ckrop_1912 ckrop_1915     FALSE 0.013 451.000 0.000 NA   NA
 7748117 7748118 ckrop_1915 ckrop_1916     FALSE 0.196 108.000 0.000 NA   NA
 7748118 7748119 ckrop_1916 ckrop_3007     TRUE 0.606 155.000 0.178 NA   NA
 7748119 7748120 ckrop_3007 ckrop_1917     FALSE 0.040 289.000 0.000 1.000   NA
 7748120 7748121 ckrop_1917 ckrop_1918     FALSE 0.285 29.000 0.000 NA   NA
 7748121 7748122 ckrop_1918 ckrop_1919   ppx1 FALSE 0.224 83.000 0.000 NA   NA
 7748122 7748123 ckrop_1919 ckrop_1920 ppx1   FALSE 0.131 158.000 0.000 NA   NA
 7748124 7748125 ckrop_1921 ckrop_1922     FALSE 0.079 196.000 0.000 NA   NA
 7748126 7748127 ckrop_1923 ckrop_1924 tcsR3 tcsS3 TRUE 0.997 -7.000 0.437 1.000 Y NA
 7748127 7748128 ckrop_1924 ckrop_1925 tcsS3 gpmA TRUE 0.690 139.000 0.196 1.000 N NA
 7748128 7748129 ckrop_1925 ckrop_1926 gpmA   TRUE 0.735 95.000 0.196 NA   NA
 7748129 7748130 ckrop_1926 ckrop_1927     TRUE 0.952 9.000 0.541 NA   NA
 7748134 7748135 ckrop_1931 ckrop_1932     FALSE 0.037 267.000 0.000 NA   NA
 7748135 7748136 ckrop_1932 ckrop_1933     FALSE 0.041 259.000 0.000 NA   NA
 7748136 7748137 ckrop_1933 ckrop_1934     TRUE 0.950 27.000 1.000 NA   NA
 7748137 7748138 ckrop_1934 ckrop_1935     FALSE 0.066 210.000 0.000 NA   NA
 7748138 7748139 ckrop_1935 ckrop_1936     FALSE 0.012 477.000 0.000 NA   NA
 7748139 7748140 ckrop_1936 ckrop_1938   mco FALSE 0.011 486.000 0.000 NA   NA
 7748140 7748141 ckrop_1938 ckrop_1939 mco   TRUE 0.698 72.000 0.125 NA   NA
 7748142 7748143 ckrop_1940 ckrop_1941 tcsR4 tcsS4 TRUE 0.997 -3.000 0.833 1.000 Y NA
 7748143 7748144 ckrop_1941 ckrop_1942 tcsS4   TRUE 0.880 113.000 0.600 1.000 N NA
 7748144 7748145 ckrop_1942 ckrop_1943   copB TRUE 0.976 52.000 0.400 0.003 Y NA
 7748145 7748146 ckrop_1943 ckrop_1944 copB tnpF2 FALSE 0.210 94.000 0.000 NA   NA
 7748146 7748147 ckrop_1944 ckrop_1946 tnpF2   FALSE 0.015 394.000 0.000 NA   NA
 7748148 7748149 ckrop_1947 ckrop_1948     TRUE 0.582 52.000 0.033 NA   NA
 7748149 7748150 ckrop_1948 ckrop_1950     FALSE 0.052 235.000 0.000 NA   NA
 7748150 7748151 ckrop_1950 ckrop_1951   sdhB FALSE 0.307 167.000 0.028 NA   NA
 7748151 7748152 ckrop_1951 ckrop_1952 sdhB sdhA TRUE 0.988 0.000 0.059 0.001 Y NA
 7748152 7748153 ckrop_1952 ckrop_1953 sdhA sdhC TRUE 0.902 16.000 0.060 0.001   NA
 7748153 7748154 ckrop_1953 ckrop_1954 sdhC   FALSE 0.030 324.000 0.000 1.000   NA
 7748154 7748155 ckrop_1954 ckrop_1955     TRUE 0.880 114.000 0.262 0.019   NA
 7748155 7748156 ckrop_1955 ckrop_1956   aceB FALSE 0.451 95.000 0.015 1.000   NA
 7748157 7748158 ckrop_1958 ckrop_1959 aceA ramB FALSE 0.417 119.000 0.016 1.000   NA
 7748158 7748159 ckrop_1959 ckrop_1960 ramB gltT FALSE 0.087 213.000 0.000 1.000   NA
 7748159 7748160 ckrop_1960 ckrop_1961 gltT   FALSE 0.333 71.000 0.000 1.000 N NA
 7748161 7748162 ckrop_1962 ckrop_1963 lipT2 lipT1 TRUE 0.886 52.000 0.000 0.001 Y NA
 7748162 7748163 ckrop_1963 ckrop_1964 lipT1   FALSE 0.007 2083.000 0.000 NA   NA
 7748164 7748165 ckrop_1965 ckrop_1966     TRUE 0.981 17.000 0.889 1.000 Y NA
 7748165 7748166 ckrop_1966 ckrop_1967     TRUE 0.997 -3.000 0.889 1.000 Y NA
 7748166 7748167 ckrop_1967 ckrop_1968     FALSE 0.208 98.000 0.000 NA   NA
 7748170 7748171 ckrop_1971 ckrop_1972     FALSE 0.301 91.000 0.000 1.000 N NA
 7748173 7748174 ckrop_1975 ckrop_t0044     FALSE 0.011 503.000 0.000 NA   NA
 7748174 7748175 ckrop_t0044 ckrop_1976     FALSE 0.195 109.000 0.000 NA   NA
 7748179 7748180 ckrop_1980 ckrop_1981 fadD5   FALSE 0.033 310.000 0.000 1.000   NA
 7748181 7748182 ckrop_1982 ckrop_1983     FALSE 0.051 237.000 0.000 NA   NA
 7748184 7748185 ckrop_1985 ckrop_1986 bgl   FALSE 0.234 121.000 0.000 1.000   NA
 7748186 7748187 ckrop_1987 ckrop_1988     FALSE 0.202 103.000 0.000 NA   NA
 7748187 7748188 ckrop_1988 ckrop_1989   cspA FALSE 0.037 313.000 0.000 1.000 N NA
 7748189 7748190 ckrop_1990 ckrop_1991     FALSE 0.231 76.000 0.000 NA   NA
 7748191 7748192 ckrop_1992 ckrop_1993     FALSE 0.221 85.000 0.000 NA   NA
 7748192 7748193 ckrop_1993 ckrop_1994     FALSE 0.289 39.000 0.000 NA   NA
 7748193 7748194 ckrop_1994 ckrop_1995     FALSE 0.440 201.000 0.176 NA   NA
 7748194 7748195 ckrop_1995 ckrop_1996     TRUE 0.977 -3.000 0.215 NA   NA
 7748195 7748196 ckrop_1996 ckrop_1997     TRUE 0.996 -3.000 0.659 NA Y NA
 7748196 7748197 ckrop_1997 ckrop_1998     FALSE 0.022 322.000 0.000 NA   NA
 7748198 7748199 ckrop_1999 ckrop_2001     TRUE 0.826 130.000 0.494 NA   NA
 7748200 7748201 ckrop_2002 ckrop_2003     TRUE 0.925 11.000 0.367 1.000   NA
 7748201 7748202 ckrop_2003 ckrop_2004     TRUE 0.793 117.000 0.304 1.000   NA
 7748202 7748203 ckrop_2004 ckrop_2005     TRUE 0.888 0.000 0.022 1.000 N NA
 7748205 7748206 ckrop_2009 ckrop_2010     FALSE 0.225 176.000 0.017 NA   NA
 7748206 7748207 ckrop_2010 ckrop_2011     TRUE 0.492 5.000 0.000 NA   NA
 7748207 7748208 ckrop_2011 ckrop_2012   whiB4 TRUE 0.662 100.000 0.132 NA   NA
 7748211 7748212 ckrop_2014 ckrop_t0045     FALSE 0.251 66.000 0.000 NA   NA
 7748213 7748214 ckrop_2015 ckrop_2017     FALSE 0.129 159.000 0.000 NA   NA
 7748214 7748215 ckrop_2017 ckrop_2018     FALSE 0.365 12.000 0.000 NA   NA
 7748216 7748217 ckrop_2019 ckrop_2020     FALSE 0.177 123.000 0.000 NA   NA
 7748217 7748218 ckrop_2020 ckrop_2021     FALSE 0.246 128.000 0.000 1.000 N NA
 7748219 7748220 ckrop_2022 ckrop_2023     FALSE 0.287 41.000 0.000 NA   NA
 7748221 7748222 ckrop_2024 ckrop_2025 mnhB mnhC TRUE 0.999 -3.000 0.941 0.001 Y NA
 7748222 7748223 ckrop_2025 ckrop_2026 mnhC mnhD TRUE 0.998 1.000 0.941 0.001 Y NA
 7748223 7748224 ckrop_2026 ckrop_2027 mnhD mnhE TRUE 0.989 -3.000 0.165 1.000 Y NA
 7748224 7748225 ckrop_2027 ckrop_2028 mnhE mnhF TRUE 0.846 3.000 0.051 NA   NA
 7748225 7748226 ckrop_2028 ckrop_2029 mnhF mnhG TRUE 0.967 -3.000 0.136 NA   NA
 7748226 7748227 ckrop_2029 ckrop_2030 mnhG   FALSE 0.045 248.000 0.000 NA   NA
 7748227 7748228 ckrop_2030 ckrop_2031     FALSE 0.007 1236.000 0.000 NA   NA
 7748229 7748230 ckrop_2032 ckrop_2034     FALSE 0.029 291.000 0.000 NA   NA
 7748230 7748231 ckrop_2034 ckrop_2035     FALSE 0.383 11.000 0.000 NA   NA
 7748231 7748232 ckrop_2035 ckrop_t0046     FALSE 0.007 2632.000 0.000 NA   NA
 7748232 7748233 ckrop_t0046 ckrop_2036     FALSE 0.071 205.000 0.000 NA   NA
 7748233 7748234 ckrop_2036 ckrop_2037     TRUE 0.677 0.000 0.000 NA   NA
 7748234 7748235 ckrop_2037 ckrop_2038     FALSE 0.061 219.000 0.000 NA   NA
 7748238 7748239 ckrop_2041 ckrop_2042     TRUE 0.883 112.000 0.273 NA Y NA
 7748239 7748240 ckrop_2042 ckrop_2043     TRUE 0.826 71.000 0.303 NA   NA
 7748240 7748241 ckrop_2043 ckrop_2044     FALSE 0.018 360.000 0.000 NA   NA
 7748241 7748242 ckrop_2044 ckrop_2045     FALSE 0.273 52.000 0.000 NA   NA
 7748242 7748243 ckrop_2045 ckrop_2046     TRUE 0.955 100.000 0.812 NA Y NA
 7748244 7748245 ckrop_2047 ckrop_2048     TRUE 0.791 -3.000 0.000 NA   NA
 7748245 7748246 ckrop_2048 ckrop_2049     TRUE 0.883 36.000 0.000 0.003 Y NA
 7748248 7748249 ckrop_2051 ckrop_2052     TRUE 0.808 121.000 0.400 NA   NA
 7748249 7748250 ckrop_2052 ckrop_2053     TRUE 0.813 75.000 0.286 NA   NA
 7748251 7748252 ckrop_2054 ckrop_2055     FALSE 0.268 98.000 0.000 1.000   NA
 7748252 7748253 ckrop_2055 ckrop_2057     FALSE 0.020 341.000 0.000 NA   NA
 7748255 7748256 ckrop_2060 ckrop_2061     FALSE 0.017 375.000 0.000 NA   NA
 7748256 7748257 ckrop_2061 ckrop_2062     FALSE 0.259 62.000 0.000 NA   NA
 7748257 7748258 ckrop_2062 ckrop_2064     FALSE 0.178 122.000 0.000 NA   NA
 7748258 7748259 ckrop_2064 ckrop_2065     FALSE 0.227 215.000 0.050 NA   NA
 7748259 7748260 ckrop_2065 ckrop_2066     TRUE 0.786 92.000 0.242 1.000   NA
 7748261 7748262 ckrop_2067 ckrop_2068 pdc   FALSE 0.101 188.000 0.000 NA N NA
 7748262 7748263 ckrop_2068 ckrop_2069     FALSE 0.102 174.000 0.000 NA   NA
 7748263 7748264 ckrop_2069 ckrop_2071   trxA FALSE 0.083 190.000 0.000 NA   NA
 7748264 7748265 ckrop_2071 ckrop_2072 trxA   FALSE 0.087 228.000 0.000 1.000 N NA
 7748265 7748266 ckrop_2072 ckrop_2073     TRUE 0.986 -3.000 0.400 NA   NA
 7748266 7748267 ckrop_2073 ckrop_2074     FALSE 0.009 625.000 0.000 NA   NA
 7748267 7748268 ckrop_2074 ckrop_2076     FALSE 0.326 18.000 0.000 NA   NA
 7748268 7748269 ckrop_2076 ckrop_2077     TRUE 0.997 -3.000 0.452 0.059 Y NA
 7748269 7748270 ckrop_2077 ckrop_2078     TRUE 0.572 8.000 0.000 1.000 N NA
 7748270 7748271 ckrop_2078 ckrop_2079     FALSE 0.034 330.000 0.000 1.000 N NA
 7748271 7748272 ckrop_2079 ckrop_2080     FALSE 0.012 833.000 0.000 1.000 N NA
 7748272 7748273 ckrop_2080 ckrop_2081   ssb TRUE 0.534 29.000 0.009 1.000 N NA
 7748273 7748274 ckrop_2081 ckrop_2082 ssb   FALSE 0.452 80.000 0.009 1.000 N NA
 7748274 7748275 ckrop_2082 ckrop_2084     FALSE 0.149 183.000 0.004 NA   NA
 7748275 7748276 ckrop_2084 ckrop_2085     TRUE 0.969 -3.000 0.143 NA   NA
 7748276 7748277 ckrop_2085 ckrop_2086     TRUE 0.766 41.000 0.143 NA   NA
 7748277 7748278 ckrop_2086 ckrop_2087     TRUE 0.886 6.000 0.150 NA   NA
 7748279 7748280 ckrop_2088 ckrop_2089   uspA4 TRUE 0.953 27.000 0.889 1.000 N NA
 7748280 7748281 ckrop_2089 ckrop_2090 uspA4   TRUE 0.911 31.000 0.556 NA   NA
 7748282 7748283 ckrop_2091 ckrop_2092 lepB2   FALSE 0.400 25.000 0.000 1.000 N NA
 7748284 7748285 ckrop_2093 ckrop_2094     FALSE 0.231 76.000 0.000 NA   NA
 7748285 7748286 ckrop_2094 ckrop_2095     FALSE 0.300 24.000 0.000 NA   NA
 7748286 7748287 ckrop_2095 ckrop_2096     TRUE 0.492 5.000 0.000 NA   NA
 7748288 7748289 ckrop_2097 ckrop_2098     TRUE 0.876 -10.000 0.000 NA   NA
 7748291 7748292 ckrop_2100 ckrop_2101 azlD azlC TRUE 0.997 -3.000 0.915 NA Y NA
 7748292 7748293 ckrop_2101 ckrop_2102 azlC   TRUE 0.524 43.000 0.014 NA N NA
 7748293 7748294 ckrop_2102 ckrop_2103     TRUE 0.916 -3.000 0.017 NA N NA
 7748295 7748296 ckrop_2104 ckrop_2105     TRUE 0.790 134.000 0.411 NA   NA
 7748296 7748297 ckrop_2105 ckrop_2106   sigM TRUE 0.726 155.000 0.306 1.000   NA
 7748297 7748298 ckrop_2106 ckrop_2107 sigM   FALSE 0.103 173.000 0.000 NA   NA
 7748298 7748299 ckrop_2107 ckrop_2108     FALSE 0.441 9.000 0.000 NA   NA
 7748299 7748300 ckrop_2108 ckrop_2109     FALSE 0.181 199.000 0.010 1.000   NA
 7748300 7748301 ckrop_2109 ckrop_2110   cwlM TRUE 0.700 93.000 0.136 1.000   NA
 7748302 7748303 ckrop_2111 ckrop_2112     FALSE 0.088 187.000 0.000 NA   NA
 7748303 7748304 ckrop_2112 ckrop_2113     FALSE 0.040 850.000 0.000 0.031   NA
 7748304 7748305 ckrop_2113 ckrop_2115     FALSE 0.461 355.000 0.827 1.000 N NA
 7748305 7748306 ckrop_2115 ckrop_2116     TRUE 0.786 136.000 0.339 1.000 N NA
 7748306 7748307 ckrop_2116 ckrop_2117     TRUE 0.625 83.000 0.070 1.000   NA
 7748307 7748308 ckrop_2117 ckrop_2118   yidC FALSE 0.045 277.000 0.000 1.000   NA
 7748308 7748309 ckrop_2118 ckrop_2119 yidC   FALSE 0.336 16.000 0.000 NA   NA
 7748309 7748310 ckrop_2119 ckrop_2120   rnpA FALSE 0.011 497.000 0.000 NA   NA
 7748310 7748311 ckrop_2120 ckrop_2121 rnpA rpmH TRUE 0.668 242.000 0.787 1.000   NA