MicrobesOnline Operon Predictions for Yersinia pestis Z176003

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
10386470	10386471	YPZ3_0001	YPZ3_0002		asnC	TRUE	0.564	93.000	0.165	1.000	N	NA
10386473	10386474	YPZ3_0004	YPZ3_0005			TRUE	0.991	4.000	0.443	NA		NA
10386475	10386476	YPZ3_0006	YPZ3_0007	kup		FALSE	0.010	205.000	0.010	1.000	N	NA
10386476	10386477	YPZ3_0007	YPZ3_0008		rbsK	TRUE	0.880	51.000	0.010	1.000	Y	NA
10386478	10386479	YPZ3_0009	YPZ3_0010			TRUE	0.590	128.000	0.133	1.000		NA
10386480	10386481	YPZ3_r1	YPZ3_t1			FALSE	0.281	181.000	0.000	NA		NA
10386481	10386482	YPZ3_t1	YPZ3_r2			FALSE	0.149	253.000	0.000	NA		NA
10386482	10386483	YPZ3_r2	YPZ3_r3			FALSE	0.425	110.000	0.000	NA		NA
10386483	10386484	YPZ3_r3	YPZ3_0011		y1062	FALSE	0.017	503.000	0.000	NA		NA
10386485	10386486	YPZ3_0012	YPZ3_0013	mobB		TRUE	0.997	-27.000	0.064	0.003	Y	NA
10386487	10386488	YPZ3_0014	YPZ3_0015		dsbA	TRUE	0.891	28.000	0.111	NA		NA
10386488	10386489	YPZ3_0015	YPZ3_0016	dsbA	polA	FALSE	0.015	492.000	0.000	1.000		NA
10386489	10386490	YPZ3_0016	YPZ3_0017	polA		FALSE	0.274	358.000	0.000	0.088	Y	NA
10386492	10386493	YPZ3_0019	YPZ3_0020		hemN	TRUE	0.441	183.000	0.107	NA		NA
10386494	10386495	YPZ3_0021	YPZ3_0022	ntrC	ntrB	TRUE	0.998	8.000	0.587	0.084	Y	NA
10386495	10386496	YPZ3_0022	YPZ3_0023	ntrB	glnA	FALSE	0.042	253.000	0.053	1.000	N	NA
10386497	10386498	YPZ3_0024	YPZ3_0025	bipA		FALSE	0.045	322.000	0.007	1.000		NA
10386498	10386499	YPZ3_0025	YPZ3_0026		rbn	TRUE	0.718	37.000	0.031	1.000		NA
10386499	10386500	YPZ3_0026	YPZ3_0027	rbn		TRUE	0.922	7.000	0.069	1.000		NA
10386501	10386502	YPZ3_0028	YPZ3_0029			TRUE	0.982	0.000	0.000	1.000	Y	NA
10386504	10386505	YPZ3_0031	YPZ3_0032			TRUE	0.743	148.000	0.257	NA		NA
10386507	10386508	YPZ3_0034	YPZ3_0035	recG		TRUE	0.858	1.000	0.076	1.000	N	NA
10386508	10386509	YPZ3_0035	YPZ3_0036		spoT	TRUE	0.665	39.000	0.095	1.000	N	NA
10386509	10386510	YPZ3_0036	YPZ3_0037	spoT	gmk	FALSE	0.006	350.000	0.000	1.000	N	NA
10386512	10386513	YPZ3_0039	YPZ3_0040			FALSE	0.032	403.000	0.000	NA		NA
10386514	10386515	YPZ3_0041	YPZ3_0042	rph	pyrE	FALSE	0.261	167.000	0.108	1.000	N	NA
10386516	10386517	YPZ3_0043	YPZ3_0044		dut	FALSE	0.349	167.000	0.060	1.000		NA
10386517	10386518	YPZ3_0044	YPZ3_0045	dut	dfp	TRUE	0.976	-19.000	0.201	1.000	N	NA
10386519	10386520	YPZ3_0046	YPZ3_0047	radC	mutM	FALSE	0.023	761.000	0.000	1.000	Y	NA
10386521	10386522	YPZ3_0048	YPZ3_0049	coaD	kdtX	TRUE	0.655	-3.000	0.023	NA	N	NA
10386522	10386523	YPZ3_0049	YPZ3_0050	kdtX	kdtA	TRUE	0.986	1.000	0.083	NA	Y	NA
10386523	10386524	YPZ3_0050	YPZ3_0051	kdtA	rfaC	FALSE	0.089	420.000	0.028	1.000	Y	NA
10386524	10386525	YPZ3_0051	YPZ3_0052	rfaC	rfaF	TRUE	0.998	0.000	0.205	0.001	Y	NA
10386525	10386526	YPZ3_0052	YPZ3_0053	rfaF	rfaD	TRUE	0.964	31.000	0.146	1.000	Y	NA
10386527	10386528	YPZ3_0054	YPZ3_0055	kbl	tdh	TRUE	0.986	10.000	0.547	1.000	N	NA
10386529	10386530	YPZ3_0056	YPZ3_0057			TRUE	0.987	-3.000	0.000	0.004		NA
10386530	10386531	YPZ3_0057	YPZ3_0058			TRUE	0.878	24.000	0.088	1.000		NA
10386531	10386532	YPZ3_0058	YPZ3_0059			TRUE	0.925	10.000	0.170	1.000	N	NA
10386533	10386534	YPZ3_0060	YPZ3_0061		secB	FALSE	0.034	455.000	0.158	NA	N	NA
10386534	10386535	YPZ3_0061	YPZ3_0062	secB	gpsA	TRUE	0.967	0.000	0.206	1.000	N	NA
10386535	10386536	YPZ3_0062	YPZ3_0063	gpsA	cysE	TRUE	0.474	263.000	0.429	1.000	N	NA
10386539	10386540	YPZ3_0066	YPZ3_0067	cpxA	cpxR	TRUE	0.999	-3.000	0.791	1.000	Y	NA
10386541	10386542	YPZ3_0068	YPZ3_0069	cpxP		FALSE	0.008	678.000	0.000	NA		NA
10386542	10386543	YPZ3_0069	YPZ3_0070		fieF	FALSE	0.013	562.000	0.000	NA		NA
10386543	10386544	YPZ3_0070	YPZ3_0071	fieF	pfkA	FALSE	0.036	218.000	0.040	1.000	N	NA
10386544	10386545	YPZ3_0071	YPZ3_0072	pfkA	sbp1	FALSE	0.052	221.000	0.049	1.000	N	NA
10386546	10386547	YPZ3_0073	YPZ3_0074			FALSE	0.230	322.000	0.000	NA	Y	NA
10386547	10386548	YPZ3_0074	YPZ3_0075			FALSE	0.164	66.000	0.000	1.000	N	NA
10386548	10386549	YPZ3_0075	YPZ3_0076			TRUE	0.993	-3.000	0.353	NA		NA
10386551	10386552	YPZ3_0078	YPZ3_0079			FALSE	0.340	180.000	0.058	NA		NA
10386554	10386555	YPZ3_0081	YPZ3_0082	fpr	glpX	FALSE	0.304	155.000	0.117	1.000	N	NA
10386555	10386556	YPZ3_0082	YPZ3_0083	glpX	glpK	FALSE	0.014	192.000	0.025	1.000	N	NA
10386556	10386557	YPZ3_0083	YPZ3_0084	glpK	glpF	FALSE	0.013	177.000	0.013	1.000	N	NA
10386557	10386558	YPZ3_0084	YPZ3_0085	glpF		FALSE	0.001	1075.000	0.000	1.000	N	NA
10386558	10386559	YPZ3_0085	YPZ3_0086			FALSE	0.008	334.000	0.000	1.000	N	NA
10386559	10386560	YPZ3_0086	YPZ3_0087			TRUE	0.996	-7.000	0.250	1.000	Y	NA
10386562	10386563	YPZ3_0089	YPZ3_0090		menA	TRUE	0.747	193.000	0.158	NA	Y	NA
10386563	10386564	YPZ3_0090	YPZ3_0091	menA	hslU	FALSE	0.048	236.000	0.051	1.000	N	NA
10386564	10386565	YPZ3_0091	YPZ3_0092	hslU	hslV	TRUE	0.988	71.000	0.752	1.000	Y	NA
10386565	10386566	YPZ3_0092	YPZ3_0093	hslV	ftsN	TRUE	0.465	100.000	0.122	NA	N	NA
10386566	10386567	YPZ3_0093	YPZ3_0094	ftsN	cytR	TRUE	0.824	66.000	0.245	NA	N	NA
10386567	10386568	YPZ3_0094	YPZ3_0095	cytR	priA	FALSE	0.002	353.000	0.013	1.000	N	NA
10386568	10386569	YPZ3_0095	YPZ3_0096	priA		FALSE	0.005	1001.000	0.000	NA		NA
10386569	10386570	YPZ3_0096	YPZ3_0097		metJ	FALSE	0.053	349.000	0.000	NA		NA
10386571	10386572	YPZ3_0098	YPZ3_0099		metL	TRUE	0.909	173.000	0.428	1.000	Y	NA
10386572	10386573	YPZ3_0099	YPZ3_0100	metL	metF	FALSE	0.415	233.000	0.017	1.000	Y	NA
10386574	10386575	YPZ3_0101	YPZ3_0102			TRUE	0.948	54.000	0.167	1.000	Y	NA
10386575	10386576	YPZ3_0102	YPZ3_0103		glpR	FALSE	0.169	64.000	0.000	1.000	N	NA
10386576	10386577	YPZ3_0103	YPZ3_0104	glpR		TRUE	0.917	35.000	0.190	1.000		NA
10386577	10386578	YPZ3_0104	YPZ3_0105			TRUE	0.924	75.000	0.405	1.000		NA
10386578	10386579	YPZ3_0105	YPZ3_0106		malT	FALSE	0.005	375.000	0.000	1.000	N	NA
10386580	10386581	YPZ3_0107	YPZ3_0108			TRUE	0.986	-18.000	0.000	0.023		NA
10386581	10386582	YPZ3_0108	YPZ3_0109		malQ	TRUE	0.992	13.000	0.137	0.023	Y	NA
10386583	10386584	YPZ3_0110	YPZ3_0111			TRUE	0.704	60.000	0.066	1.000		NA
10386586	10386587	YPZ3_0113	YPZ3_0114	feoB		FALSE	0.001	843.000	0.000	1.000	N	NA
10386588	10386589	YPZ3_0115	YPZ3_0116	greB	ompR	TRUE	0.843	136.000	0.067	0.083	Y	NA
10386589	10386590	YPZ3_0116	YPZ3_0117	ompR	envZ	TRUE	0.999	-3.000	0.584	1.000	Y	NA
10386591	10386592	YPZ3_0118	YPZ3_0119	pckA	hslO	FALSE	0.064	197.000	0.048	1.000	N	NA
10386592	10386593	YPZ3_0119	YPZ3_0120	hslO	hslR	FALSE	0.351	163.000	0.140	1.000	N	NA
10386593	10386594	YPZ3_0120	YPZ3_0121	hslR		TRUE	0.813	29.000	0.056	1.000		NA
10386594	10386595	YPZ3_0121	YPZ3_0122			TRUE	0.538	144.000	0.122	1.000		NA
10386598	10386599	YPZ3_0125	YPZ3_0126			TRUE	0.998	0.000	0.870	NA		NA
10386599	10386600	YPZ3_0126	YPZ3_0127			TRUE	0.639	149.000	0.174	NA		NA
10386602	10386603	YPZ3_0129	YPZ3_0130		aroK	FALSE	0.271	349.000	0.319	1.000		NA
10386603	10386604	YPZ3_0130	YPZ3_0131	aroK	aroB	TRUE	0.954	57.000	0.208	1.000	Y	NA
10386604	10386605	YPZ3_0131	YPZ3_0132	aroB		FALSE	0.125	254.000	0.022	NA		NA
10386605	10386606	YPZ3_0132	YPZ3_0133		dam	TRUE	0.842	84.000	0.234	NA		NA
10386606	10386607	YPZ3_0133	YPZ3_0134	dam	rpe	FALSE	0.022	303.000	0.053	1.000	N	NA
10386607	10386608	YPZ3_0134	YPZ3_0135	rpe	gph	TRUE	0.955	-7.000	0.050	1.000		NA
10386608	10386609	YPZ3_0135	YPZ3_0136	gph	trpS	TRUE	0.961	2.000	0.118	1.000		NA
10386610	10386611	YPZ3_0137	YPZ3_0138	cysG	nirC	FALSE	0.268	88.000	0.065	1.000	N	NA
10386611	10386612	YPZ3_0138	YPZ3_0139	nirC	nirD	TRUE	0.816	203.000	0.283	1.000	Y	NA
10386612	10386613	YPZ3_0139	YPZ3_0140	nirD	nirB	TRUE	0.999	-3.000	0.829	0.001	N	NA
10386617	10386618	YPZ3_0144	YPZ3_0145			FALSE	0.353	249.000	0.267	1.000	N	NA
10386619	10386620	YPZ3_0146	YPZ3_0147	ppiA		FALSE	0.060	326.000	0.000	1.000		NA
10386620	10386621	YPZ3_0147	YPZ3_0148		pabA	FALSE	0.110	243.000	0.007	1.000		NA
10386621	10386622	YPZ3_0148	YPZ3_0149	pabA		TRUE	0.753	133.000	0.088	1.000	Y	NA
10386623	10386624	YPZ3_0150	YPZ3_0151		crp	TRUE	0.692	86.000	0.111	NA		NA
10386625	10386626	YPZ3_0152	YPZ3_0153			FALSE	0.436	105.000	0.000	NA		NA
10386627	10386628	YPZ3_0154	YPZ3_0155	prk		FALSE	0.038	382.000	0.000	NA		NA
10386629	10386630	YPZ3_0156	YPZ3_0157		tauA	FALSE	0.035	203.000	0.000	1.000	N	NA
10386630	10386631	YPZ3_0157	YPZ3_0158	tauA	tauB	TRUE	0.966	9.000	0.023	1.000	Y	NA
10386631	10386632	YPZ3_0158	YPZ3_0159	tauB	tauC	TRUE	0.999	-3.000	0.728	1.000	Y	NA
10386632	10386633	YPZ3_0159	YPZ3_0160	tauC	tauD	TRUE	0.975	-3.000	0.214	1.000	N	NA
10386634	10386635	YPZ3_0161	YPZ3_0162			TRUE	0.528	93.000	0.053	NA		NA
10386635	10386636	YPZ3_0162	YPZ3_0163			FALSE	0.323	135.000	0.020	NA		NA
10386636	10386637	YPZ3_0163	YPZ3_0164			TRUE	0.985	-33.000	0.029	0.027		NA
10386638	10386639	YPZ3_0165	YPZ3_0166		kefB	TRUE	0.997	4.000	0.927	1.000		NA
10386639	10386640	YPZ3_0166	YPZ3_0167	kefB	slyD	FALSE	0.008	332.000	0.000	1.000	N	NA
10386640	10386641	YPZ3_0167	YPZ3_0168	slyD	fkpA	FALSE	0.070	754.000	0.000	0.003	Y	NA
10386641	10386642	YPZ3_0168	YPZ3_0169	fkpA		TRUE	0.538	254.000	0.310	NA		NA
10386642	10386643	YPZ3_0169	YPZ3_0170			TRUE	0.985	0.000	0.220	NA		NA
10386643	10386644	YPZ3_0170	YPZ3_0171			TRUE	0.999	0.000	0.790	NA	Y	NA
10386644	10386645	YPZ3_0171	YPZ3_0172		rpsl	FALSE	0.005	445.000	0.000	NA	N	NA
10386645	10386646	YPZ3_0172	YPZ3_0173	rpsl	rpsG	TRUE	0.990	97.000	0.620	0.003	Y	NA
10386646	10386647	YPZ3_0173	YPZ3_0174	rpsG	fusA	TRUE	0.971	94.000	0.579	1.000	Y	NA
10386647	10386648	YPZ3_0174	YPZ3_0175	fusA	tuf	TRUE	0.943	73.000	0.005	0.001	Y	NA
10386648	10386649	YPZ3_0175	YPZ3_0176	tuf		FALSE	0.058	152.000	0.000	1.000	N	NA
10386649	10386650	YPZ3_0176	YPZ3_0177		bfr	FALSE	0.003	461.000	0.000	1.000	N	NA
10386650	10386651	YPZ3_0177	YPZ3_0178	bfr	rpsJ	FALSE	0.004	414.000	0.000	1.000	N	NA
10386651	10386652	YPZ3_0178	YPZ3_0179	rpsJ	rplC	TRUE	0.992	33.000	0.307	0.014	Y	NA
10386652	10386653	YPZ3_0179	YPZ3_0180	rplC	rplD	TRUE	0.997	17.000	0.486	0.010	Y	NA
10386653	10386654	YPZ3_0180	YPZ3_0181	rplD	rplW	TRUE	0.999	-3.000	0.513	0.010	Y	NA
10386654	10386655	YPZ3_0181	YPZ3_0182	rplW	rplB	TRUE	0.999	17.000	0.849	0.014	Y	NA
10386655	10840160	YPZ3_0182	YPZ3_0182a	rplB		TRUE	0.999	15.000	0.820	0.014	Y	NA
10840160	10386656	YPZ3_0182a	YPZ3_0183		rplV	TRUE	0.999	15.000	0.769	0.014	Y	NA
10386656	10386657	YPZ3_0183	YPZ3_0184	rplV	rpsC	TRUE	0.998	18.000	0.719	0.014	Y	NA
10386657	10386658	YPZ3_0184	YPZ3_0185	rpsC	rplP	TRUE	0.999	13.000	0.828	0.014	Y	NA
10386658	10840161	YPZ3_0185	YPZ3_0185a	rplP		TRUE	1.000	0.000	0.802	0.010	Y	NA
10840161	10386659	YPZ3_0185a	YPZ3_0186		rplN	FALSE	0.201	435.000	0.000	0.014	Y	NA
10386659	10386660	YPZ3_0186	YPZ3_0187	rplN	rplX	TRUE	0.999	11.000	0.810	0.014	Y	NA
10386660	10386661	YPZ3_0187	YPZ3_0188	rplX	rplE	TRUE	0.999	15.000	0.758	0.010	Y	NA
10386661	10386662	YPZ3_0188	YPZ3_0189	rplE	rpsN	TRUE	0.998	14.000	0.496	0.010	Y	NA
10386662	10386663	YPZ3_0189	YPZ3_0190	rpsN	rpsH	TRUE	0.995	34.000	0.473	0.010	Y	NA
10386663	10386664	YPZ3_0190	YPZ3_0191	rpsH	rplF	TRUE	0.999	15.000	0.808	0.010	Y	NA
10386664	10386665	YPZ3_0191	YPZ3_0192	rplF	rplR	TRUE	0.999	10.000	0.815	0.010	Y	NA
10386665	10386666	YPZ3_0192	YPZ3_0193	rplR	rpsE	TRUE	0.999	15.000	0.814	0.014	Y	NA
10386666	10386667	YPZ3_0193	YPZ3_0194	rpsE	rplO	TRUE	0.872	186.000	0.148	0.014	Y	NA
10386667	10386668	YPZ3_0194	YPZ3_0195	rplO	secY	TRUE	0.992	8.000	0.730	1.000	N	NA
10386668	10386669	YPZ3_0195	YPZ3_0196	secY	rpsM	FALSE	0.003	298.000	0.011	1.000	N	NA
10386669	10386670	YPZ3_0196	YPZ3_0197	rpsM	rpsK	TRUE	0.999	17.000	0.810	0.010	Y	NA
10386670	10386671	YPZ3_0197	YPZ3_0198	rpsK	rpsD	TRUE	0.996	31.000	0.509	0.014	Y	NA
10386671	10386672	YPZ3_0198	YPZ3_0199	rpsD	rpoA	TRUE	0.973	26.000	0.549	1.000	N	NA
10386672	10386673	YPZ3_0199	YPZ3_0200	rpoA	rplQ	TRUE	0.984	41.000	0.873	1.000	N	NA
10386673	10386674	YPZ3_0200	YPZ3_0201	rplQ	zntR	FALSE	0.001	438.000	0.005	1.000	N	NA
10386675	10386676	YPZ3_0202	YPZ3_0203	mscL	trkA	FALSE	0.018	139.000	0.007	1.000	N	NA
10386676	10386677	YPZ3_0203	YPZ3_0204	trkA		FALSE	0.064	56.000	0.007	1.000	N	NA
10386677	10386678	YPZ3_0204	YPZ3_0205		fmt	TRUE	0.941	88.000	0.305	1.000	Y	NA
10386678	10386679	YPZ3_0205	YPZ3_0206	fmt	def	TRUE	0.979	25.000	0.058	0.017	Y	NA
10386680	10386681	YPZ3_0207	YPZ3_0208		smg	TRUE	0.980	-28.000	0.124	NA		NA
10386681	10386682	YPZ3_0208	YPZ3_0209	smg		TRUE	0.858	101.000	0.331	NA		NA
10386682	10386683	YPZ3_0209	YPZ3_0210			TRUE	0.939	2.000	0.137	NA	N	NA
10386683	10386684	YPZ3_0210	YPZ3_0211		aroE	TRUE	0.851	9.000	0.087	NA	N	NA
10386685	10386686	YPZ3_0212	YPZ3_0213			TRUE	0.840	16.000	0.000	1.000		NA
10386686	10386687	YPZ3_0213	YPZ3_0214			TRUE	0.982	0.000	0.000	1.000	Y	NA
10386689	10386690	YPZ3_0216	YPZ3_0217	actP		TRUE	0.998	-3.000	0.733	NA		NA
10386690	10386691	YPZ3_0217	YPZ3_0218		acs	TRUE	0.849	57.000	0.147	NA		NA
10386693	10386694	YPZ3_0220	YPZ3_0221			TRUE	0.999	13.000	0.688	0.012	Y	NA
10386695	10386696	YPZ3_0222	YPZ3_0223			TRUE	0.986	2.000	0.268	NA		NA
10386696	10386697	YPZ3_0223	YPZ3_0224			FALSE	0.029	414.000	0.000	NA		NA
10386697	10386698	YPZ3_0224	YPZ3_0225			FALSE	0.001	816.000	0.000	1.000	N	NA
10386698	10386699	YPZ3_0225	YPZ3_0226			TRUE	0.919	175.000	0.786	NA		NA
10386699	10386700	YPZ3_0226	YPZ3_0227			TRUE	0.977	39.000	0.538	NA		NA
10386700	10386701	YPZ3_0227	YPZ3_0228			TRUE	0.953	-7.000	0.000	NA		NA
10386701	10386702	YPZ3_0228	YPZ3_0229			TRUE	1.000	-13.000	0.647	0.009	Y	NA
10386702	10386703	YPZ3_0229	YPZ3_0230			TRUE	0.984	-3.000	0.176	NA		NA
10386703	10386704	YPZ3_0230	YPZ3_0231			TRUE	0.999	-19.000	1.000	NA		NA
10386704	10386705	YPZ3_0231	YPZ3_0232			TRUE	0.990	-22.000	0.231	NA		NA
10386705	10386706	YPZ3_0232	YPZ3_0233			TRUE	0.828	127.000	0.154	1.000	Y	NA
10386706	10386707	YPZ3_0233	YPZ3_0234			TRUE	0.458	292.000	0.000	0.080	Y	NA
10386707	10386708	YPZ3_0234	YPZ3_0235			TRUE	0.999	-10.000	0.406	0.080	Y	NA
10386708	10386709	YPZ3_0235	YPZ3_0236			FALSE	0.041	383.000	0.045	NA		NA
10386711	10386712	YPZ3_0238	YPZ3_0239		metC	TRUE	0.917	46.000	0.043	NA	Y	NA
10386713	10386714	YPZ3_0240	YPZ3_0241	hmuV	hmuU	TRUE	0.996	-7.000	0.220	1.000	Y	NA
10386714	10386715	YPZ3_0241	YPZ3_0242	hmuU	hmuT	TRUE	0.999	-3.000	0.852	1.000	Y	NA
10386715	10386716	YPZ3_0242	YPZ3_0243	hmuT	hmuS	TRUE	0.997	-3.000	0.384	1.000	Y	NA
10386716	10386717	YPZ3_0243	YPZ3_0244	hmuS	hmuR	TRUE	0.751	119.000	0.064	1.000	Y	NA
10386717	10386718	YPZ3_0244	YPZ3_0245	hmuR		FALSE	0.004	415.000	0.000	1.000	N	NA
10386718	10386719	YPZ3_0245	YPZ3_0246			TRUE	0.468	34.000	0.054	1.000	N	NA
10386719	10386720	YPZ3_0246	YPZ3_0247			TRUE	0.791	33.000	0.135	1.000	N	NA
10386720	10386721	YPZ3_0247	YPZ3_0248			FALSE	0.007	341.000	0.000	1.000	N	NA
10386721	10386722	YPZ3_0248	YPZ3_0249			FALSE	0.073	315.000	0.000	NA		NA
10386722	10386723	YPZ3_0249	YPZ3_0250			FALSE	0.033	397.000	0.000	NA		NA
10386723	10386724	YPZ3_0250	YPZ3_0251			TRUE	0.993	0.000	0.420	NA		NA
10386724	10386725	YPZ3_0251	YPZ3_0252			TRUE	0.993	-7.000	0.296	NA		NA
10386725	10386726	YPZ3_0252	YPZ3_0253			TRUE	0.980	-7.000	0.126	NA		NA
10386726	10386727	YPZ3_0253	YPZ3_0254			TRUE	0.967	12.000	0.217	1.000		NA
10386728	10386729	YPZ3_0255	YPZ3_0256	terZ	terA	TRUE	0.986	0.000	0.054	0.004		NA
10386729	10386730	YPZ3_0256	YPZ3_0257	terA	terB	TRUE	0.929	33.000	0.200	NA		NA
10386730	10386731	YPZ3_0257	YPZ3_0258	terB	terC	TRUE	0.950	22.000	0.000	NA	Y	NA
10386731	10386732	YPZ3_0258	YPZ3_0259	terC	terD	FALSE	0.169	64.000	0.000	1.000	N	NA
10386732	10386733	YPZ3_0259	YPZ3_0260	terD	terE	TRUE	0.942	184.000	0.310	0.004	Y	NA
10386733	10386734	YPZ3_0260	YPZ3_0261	terE		FALSE	0.007	713.000	0.000	NA		NA
10386734	10386735	YPZ3_0261	YPZ3_0262			FALSE	0.152	251.000	0.000	NA		NA
10386735	10386736	YPZ3_0262	YPZ3_0263			TRUE	0.982	72.000	0.571	NA	Y	NA
10386736	10386737	YPZ3_0263	YPZ3_0264			FALSE	0.003	1458.000	0.000	NA		NA
10386737	10386738	YPZ3_0264	YPZ3_0265			FALSE	0.004	1009.000	0.000	1.000		NA
10386740	10386741	YPZ3_0267	YPZ3_0268	ubiC	ubiA	TRUE	0.859	166.000	0.248	NA	Y	NA
10386743	10386744	YPZ3_0270	YPZ3_0271	dgkA	lexA	FALSE	0.422	125.000	0.141	1.000	N	NA
10386748	10386749	YPZ3_0275	YPZ3_0276	dnaB	alr	TRUE	0.768	97.000	0.317	1.000	N	NA
10386749	10386750	YPZ3_0276	YPZ3_0277	alr	tyrB	FALSE	0.378	186.000	0.181	1.000	N	NA
10386750	10386751	YPZ3_0277	YPZ3_0278	tyrB		FALSE	0.016	527.000	0.000	NA		NA
10386754	10386755	YPZ3_0281	YPZ3_0282			TRUE	0.901	14.000	0.063	NA		NA
10386755	10386756	YPZ3_0282	YPZ3_0283		rhaD	TRUE	0.782	67.000	0.041	0.007	N	NA
10386756	10386757	YPZ3_0283	YPZ3_0284	rhaD	rhaA	TRUE	0.989	13.000	0.247	1.000	Y	NA
10386757	10386758	YPZ3_0284	YPZ3_0285	rhaA	rhaB	TRUE	0.997	-3.000	0.387	1.000	Y	NA
10386759	10386760	YPZ3_0286	YPZ3_0287	rhaS	rhaR	TRUE	0.988	133.000	0.800	0.031	Y	NA
10386761	10386762	YPZ3_0288	YPZ3_0289	rhaT		FALSE	0.005	856.000	0.000	1.000		NA
10386763	10386764	YPZ3_0290	YPZ3_0291			FALSE	0.008	634.000	0.000	1.000		NA
10386764	10386765	YPZ3_0291	YPZ3_0292			TRUE	0.928	-3.000	0.100	1.000	N	NA
10386765	10386766	YPZ3_0292	YPZ3_0293			TRUE	0.979	3.000	0.100	0.086		NA
10386766	10386767	YPZ3_0293	YPZ3_0294			TRUE	0.998	0.000	1.000	NA		NA
10386767	10386768	YPZ3_0294	YPZ3_0295			TRUE	0.998	5.000	1.000	NA		NA
10386768	10386769	YPZ3_0295	YPZ3_0296			FALSE	0.034	394.000	0.000	NA		NA
10386769	10386770	YPZ3_0296	YPZ3_0297			FALSE	0.039	378.000	0.000	NA		NA
10386770	10386771	YPZ3_0297	YPZ3_0298			TRUE	0.948	-3.000	0.000	NA		NA
10386771	10386772	YPZ3_0298	YPZ3_0299			TRUE	0.864	15.000	0.000	NA		NA
10386772	10386773	YPZ3_0299	YPZ3_0300			FALSE	0.008	669.000	0.000	NA		NA
10386773	10386774	YPZ3_0300	YPZ3_0301			TRUE	0.597	144.000	0.143	NA		NA
10386774	10386775	YPZ3_0301	YPZ3_0302			TRUE	0.551	79.000	0.000	NA		NA
10386775	10386776	YPZ3_0302	YPZ3_0303			FALSE	0.361	137.000	0.000	NA		NA
10386776	10386777	YPZ3_0303	YPZ3_0304			TRUE	0.948	-3.000	0.000	NA		NA
10386777	10386778	YPZ3_0304	YPZ3_0305			TRUE	0.884	11.000	0.000	NA		NA
10386778	10386779	YPZ3_0305	YPZ3_0306			TRUE	0.999	-21.000	1.000	NA		NA
10386779	10386780	YPZ3_0306	YPZ3_0307			TRUE	0.998	3.000	1.000	NA		NA
10386780	10386781	YPZ3_0307	YPZ3_0308			TRUE	0.980	-3.000	0.143	NA		NA
10386781	10386782	YPZ3_0308	YPZ3_0309			TRUE	0.955	-16.000	0.000	NA		NA
10386782	10386783	YPZ3_0309	YPZ3_0310			TRUE	0.953	-7.000	0.000	NA		NA
10386783	10386784	YPZ3_0310	YPZ3_0311			TRUE	0.530	83.000	0.000	NA		NA
10386784	10386785	YPZ3_0311	YPZ3_0312			FALSE	0.178	235.000	0.000	NA		NA
10386785	10386786	YPZ3_0312	YPZ3_0313			FALSE	0.078	311.000	0.000	NA		NA
10386786	10386787	YPZ3_0313	YPZ3_0314			TRUE	0.880	12.000	0.000	NA		NA
10386787	10386788	YPZ3_0314	YPZ3_0315			TRUE	0.948	-3.000	0.000	NA		NA
10386788	10386789	YPZ3_0315	YPZ3_0316			TRUE	0.974	-3.000	0.105	NA		NA
10386789	10386790	YPZ3_0316	YPZ3_0317			TRUE	0.991	-7.000	0.263	NA		NA
10386790	10386791	YPZ3_0317	YPZ3_0318			TRUE	0.989	25.000	0.667	NA		NA
10386791	10386792	YPZ3_0318	YPZ3_0319			TRUE	0.990	0.000	0.312	NA		NA
10386792	10386793	YPZ3_0319	YPZ3_0320			FALSE	0.004	1291.000	0.000	NA		NA
10386793	10386794	YPZ3_0320	YPZ3_0321			FALSE	0.278	183.000	0.000	NA		NA
10386794	10386795	YPZ3_0321	YPZ3_0322			TRUE	0.973	2.000	0.154	NA		NA
10386795	10386796	YPZ3_0322	YPZ3_0323			TRUE	0.993	11.000	0.611	NA		NA
10386796	10386797	YPZ3_0323	YPZ3_0324			FALSE	0.036	385.000	0.000	NA		NA
10386799	10386800	YPZ3_0326	YPZ3_0327			TRUE	0.857	16.000	0.000	NA		NA
10386800	10386801	YPZ3_0327	YPZ3_0328			FALSE	0.004	1196.000	0.000	NA		NA
10386801	10386802	YPZ3_0328	YPZ3_0329			FALSE	0.015	533.000	0.000	NA		NA
10386802	10386803	YPZ3_0329	YPZ3_0330			TRUE	0.490	91.000	0.000	NA		NA
10386803	10386804	YPZ3_0330	YPZ3_0331			FALSE	0.409	117.000	0.000	NA		NA
10386804	10386805	YPZ3_0331	YPZ3_0332			TRUE	0.499	89.000	0.000	NA		NA
10386805	10386806	YPZ3_0332	YPZ3_0333			TRUE	0.858	75.000	0.222	NA		NA
10386806	10386807	YPZ3_0333	YPZ3_0334			FALSE	0.008	671.000	0.000	NA		NA
10386807	10386808	YPZ3_0334	YPZ3_0335			FALSE	0.016	508.000	0.000	NA		NA
10386808	10386809	YPZ3_0335	YPZ3_0336			TRUE	0.999	-7.000	1.000	NA		NA
10386809	10386810	YPZ3_0336	YPZ3_0337			TRUE	0.995	25.000	0.667	NA	Y	NA
10386810	10386811	YPZ3_0337	YPZ3_0338			FALSE	0.001	1193.000	0.000	NA	N	NA
10386811	10386812	YPZ3_0338	YPZ3_0339			TRUE	0.570	69.000	0.000	1.000		NA
10386812	10386813	YPZ3_0339	YPZ3_0340			FALSE	0.029	398.000	0.000	1.000		NA
10386813	10386814	YPZ3_0340	YPZ3_0341			TRUE	0.953	-6.000	0.000	NA		NA
10386814	10386815	YPZ3_0341	YPZ3_0342			TRUE	0.970	68.000	0.667	NA		NA
10386816	10386817	YPZ3_t2	YPZ3_0343			FALSE	0.351	145.000	0.000	NA		NA
10386818	10386819	YPZ3_0344	YPZ3_0345		hydN	TRUE	0.971	23.000	0.222	0.010	N	NA
10386819	10386820	YPZ3_0345	YPZ3_0346	hydN	fdhF	TRUE	0.980	23.000	0.231	0.039		NA
10386821	10386822	YPZ3_0347	YPZ3_0348	dsbD		TRUE	0.928	-24.000	0.092	1.000	N	NA
10386822	10386823	YPZ3_0348	YPZ3_0349		dcuA	FALSE	0.188	185.000	0.007	1.000		NA
10386823	10386824	YPZ3_0349	YPZ3_0350	dcuA	aspA	FALSE	0.330	120.000	0.023	1.000		NA
10386825	10386826	YPZ3_0351	YPZ3_0352		groEL	FALSE	0.011	595.000	0.000	NA		NA
10386826	10386827	YPZ3_0352	YPZ3_0353	groEL		FALSE	0.010	624.000	0.000	NA		NA
10386829	10386830	YPZ3_0355	YPZ3_0356	efp	sugE	FALSE	0.090	100.000	0.000	1.000	N	NA
10386831	10386832	YPZ3_0357	YPZ3_0358	frdD	frdC	TRUE	0.999	17.000	0.787	0.002	Y	NA
10386832	10386833	YPZ3_0358	YPZ3_0359	frdC	frdB	TRUE	0.998	17.000	0.454	0.002	Y	NA
10386833	10386834	YPZ3_0359	YPZ3_0360	frdB	frdA	TRUE	0.999	-7.000	0.470	0.002	Y	NA
10386836	10386837	YPZ3_0362	YPZ3_0363		psd	TRUE	0.797	42.000	0.148	NA	N	NA
10386837	10386838	YPZ3_0363	YPZ3_0364	psd		FALSE	0.110	325.000	0.095	1.000		NA
10386839	10386840	YPZ3_0365	YPZ3_t3	orn		FALSE	0.013	558.000	0.000	NA		NA
10386842	10386843	YPZ3_0367	YPZ3_0368			TRUE	0.945	11.000	0.118	NA		NA
10386843	10386844	YPZ3_0368	YPZ3_0369			TRUE	0.537	140.000	0.109	NA		NA
10386844	10386845	YPZ3_0369	YPZ3_0370		mutL	TRUE	0.785	16.000	0.092	1.000	N	NA
10386845	10386846	YPZ3_0370	YPZ3_0371	mutL	miaA	TRUE	0.973	-7.000	0.188	1.000	N	NA
10386846	10386847	YPZ3_0371	YPZ3_0372	miaA	ymr	TRUE	0.903	116.000	0.531	1.000		NA
10386847	10386848	YPZ3_0372	YPZ3_0373	ymr	hflX	TRUE	0.673	99.000	0.141	1.000		NA
10386848	10386849	YPZ3_0373	YPZ3_0374	hflX	hflK	TRUE	0.596	241.000	0.184	0.078		NA
10386849	10386850	YPZ3_0374	YPZ3_0375	hflK	hflC	TRUE	1.000	4.000	0.947	0.014	Y	NA
10386850	10386851	YPZ3_0375	YPZ3_0376	hflC	purA	FALSE	0.001	472.000	0.019	1.000	N	NA
10386851	10386852	YPZ3_0376	YPZ3_0377	purA		FALSE	0.003	330.000	0.010	NA	N	NA
10386852	10386853	YPZ3_0377	YPZ3_0378		rnr	TRUE	0.452	241.000	0.038	NA	Y	NA
10386853	10386854	YPZ3_0378	YPZ3_0379	rnr		TRUE	0.740	119.000	0.147	0.018	N	NA
10386854	10386855	YPZ3_0379	YPZ3_0380		aidB	FALSE	0.001	408.000	0.005	1.000	N	NA
10386856	10386857	YPZ3_0381	YPZ3_0382			FALSE	0.059	340.000	0.000	NA		NA
10386857	10386858	YPZ3_0382	YPZ3_0383			TRUE	0.982	0.000	0.000	1.000	Y	NA
10386859	10386860	YPZ3_0384	YPZ3_0385			TRUE	0.999	-3.000	0.759	NA	Y	NA
10386860	10386861	YPZ3_0385	YPZ3_0386			FALSE	0.001	1024.000	0.000	NA	N	NA
10386861	10386862	YPZ3_0386	YPZ3_0387			TRUE	0.708	50.000	0.000	NA		NA
10386862	10386863	YPZ3_0387	YPZ3_0388			TRUE	0.955	-28.000	0.000	NA		NA
10386863	10386864	YPZ3_0388	YPZ3_0389			FALSE	0.004	1272.000	0.000	NA		NA
10386864	10386865	YPZ3_0389	YPZ3_0390			TRUE	0.964	-3.000	0.068	NA		NA
10386866	10386867	YPZ3_0391	YPZ3_0392			TRUE	0.993	11.000	0.637	NA		NA
10386868	10386869	YPZ3_0393	YPZ3_0394			TRUE	0.914	2.000	0.000	1.000		NA
10386870	10386871	YPZ3_0395	YPZ3_0396			TRUE	0.908	93.000	0.000	0.007	Y	NA
10386871	10386872	YPZ3_0396	YPZ3_0397			TRUE	0.769	341.000	0.400	0.008	Y	NA
10386874	10386875	YPZ3_0399	YPZ3_0400			FALSE	0.009	655.000	0.000	NA		NA
10386875	10386876	YPZ3_0400	YPZ3_0401			TRUE	0.907	56.000	0.062	NA	Y	NA
10386876	10386877	YPZ3_0401	YPZ3_0402			TRUE	0.993	59.000	0.844	NA	Y	NA
10386877	10386878	YPZ3_0402	YPZ3_0403			TRUE	1.000	-3.000	0.788	0.067	Y	NA
10386878	10386879	YPZ3_0403	YPZ3_0404			TRUE	0.999	-6.000	0.818	1.000	Y	NA
10386879	10386880	YPZ3_0404	YPZ3_0405			FALSE	0.425	110.000	0.000	NA		NA
10386881	10386882	YPZ3_0406	YPZ3_0407			TRUE	0.448	171.000	0.200	1.000	N	NA
10386882	10386883	YPZ3_0407	YPZ3_0408			FALSE	0.007	346.000	0.000	1.000	N	NA
10386883	10386884	YPZ3_0408	YPZ3_0409			TRUE	0.941	48.000	0.105	NA	Y	NA
10386884	10386885	YPZ3_0409	YPZ3_0410			FALSE	0.015	1200.000	0.000	NA	Y	NA
10386885	10386886	YPZ3_0410	YPZ3_0411			TRUE	0.965	0.000	0.185	NA	N	NA
10386886	10386887	YPZ3_0411	YPZ3_0412			FALSE	0.001	1496.000	0.000	NA	N	NA
10386890	10386891	YPZ3_t4	YPZ3_0415		rsmC	FALSE	0.140	257.000	0.000	NA		NA
10386892	10386893	YPZ3_0416	YPZ3_0417	holD	rimI	TRUE	0.732	77.000	0.121	1.000		NA
10386893	10386894	YPZ3_0417	YPZ3_0418	rimI	prfC	FALSE	0.235	179.000	0.026	1.000		NA
10386894	10386895	YPZ3_0418	YPZ3_0419	prfC	osmY	FALSE	0.067	327.000	0.000	NA		NA
10386895	10386896	YPZ3_0419	YPZ3_0420	osmY		FALSE	0.031	405.000	0.000	NA		NA
10386896	10386897	YPZ3_0420	YPZ3_0421			TRUE	0.885	16.000	0.057	NA		NA
10386897	10386898	YPZ3_0421	YPZ3_0422			FALSE	0.002	535.000	0.027	NA	N	NA
10386898	10386899	YPZ3_0422	YPZ3_0423		deoC	FALSE	0.043	576.000	0.000	1.000	Y	NA
10386899	10386900	YPZ3_0423	YPZ3_0424	deoC		TRUE	0.752	28.000	0.028	1.000		NA
10386900	10386901	YPZ3_0424	YPZ3_0425			TRUE	0.998	-3.000	0.385	0.001		NA
10386901	10386902	YPZ3_0425	YPZ3_0426		deoB	FALSE	0.371	132.000	0.047	1.000		NA
10386902	10386903	YPZ3_0426	YPZ3_0427	deoB	deoD	TRUE	0.782	125.000	0.414	1.000	N	NA
10386905	10386906	YPZ3_0429	YPZ3_0430	serB	radA	FALSE	0.036	88.000	0.024	1.000	N	NA
10386906	10386907	YPZ3_0430	YPZ3_0431	radA	nadR	FALSE	0.016	159.000	0.021	1.000	N	NA
10386907	10386908	YPZ3_0431	YPZ3_0432	nadR		FALSE	0.305	157.000	0.000	1.000		NA
10386909	10386910	YPZ3_0433	YPZ3_0434			TRUE	0.976	0.000	0.007	0.026		NA
10386910	10386911	YPZ3_0434	YPZ3_0435			FALSE	0.190	183.000	0.005	1.000		NA
10386911	10386912	YPZ3_0435	YPZ3_0436			TRUE	0.955	15.000	0.290	1.000	N	NA
10386912	10386913	YPZ3_0436	YPZ3_0437			TRUE	0.990	-3.000	0.259	NA		NA
10386913	10386914	YPZ3_0437	YPZ3_0438			FALSE	0.041	375.000	0.000	NA		NA
10386915	10386916	YPZ3_0439	YPZ3_0440			FALSE	0.240	236.000	0.167	1.000	N	NA
10386922	10386923	YPZ3_0446	YPZ3_0447	thrA	thrB	TRUE	0.987	3.000	0.133	1.000	Y	NA
10386923	10386924	YPZ3_0447	YPZ3_0448	thrB	thrC	TRUE	0.992	4.000	0.233	1.000	Y	NA
10386926	10386927	YPZ3_0450	YPZ3_0451	talB	mogA	FALSE	0.018	288.000	0.042	1.000	N	NA
10386927	10386928	YPZ3_0451	YPZ3_0452	mogA		FALSE	0.077	128.000	0.039	1.000	N	NA
10386929	10386930	YPZ3_0453	YPZ3_0454			FALSE	0.102	289.000	0.000	NA		NA
10386931	10386932	YPZ3_0455	YPZ3_0456	dnaK	dnaJ	TRUE	0.961	112.000	0.236	0.003	Y	NA
10386932	10386933	YPZ3_0456	YPZ3_0457	dnaJ	nhaA	FALSE	0.007	243.000	0.022	1.000	N	NA
10386933	10386934	YPZ3_0457	YPZ3_0458	nhaA	nhaR	TRUE	0.671	130.000	0.292	1.000	N	NA
10386934	10386935	YPZ3_0458	YPZ3_0459	nhaR		FALSE	0.005	860.000	0.000	1.000		NA
10386935	10386936	YPZ3_0459	YPZ3_0460			TRUE	0.926	47.000	0.014	0.001		NA
10386936	10386937	YPZ3_0460	YPZ3_0461		ileS	TRUE	0.946	32.000	0.254	1.000		NA
10386937	10386938	YPZ3_0461	YPZ3_0462	ileS	lspA	TRUE	0.730	0.000	0.045	1.000	N	NA
10386938	10386939	YPZ3_0462	YPZ3_0463	lspA	slpA	TRUE	0.964	-7.000	0.154	1.000	N	NA
10386939	10386940	YPZ3_0463	YPZ3_0464	slpA	lytB	TRUE	0.996	-19.000	0.626	1.000	N	NA
10386940	10386941	YPZ3_0464	YPZ3_0465	lytB		FALSE	0.008	331.000	0.000	1.000	N	NA
10386941	10386942	YPZ3_0465	YPZ3_0466		dapB	FALSE	0.003	453.000	0.000	1.000	N	NA
10386942	10386943	YPZ3_0466	YPZ3_0467	dapB	carA	FALSE	0.068	473.000	0.034	1.000	Y	NA
10386943	10386944	YPZ3_0467	YPZ3_0468	carA	carB	TRUE	0.997	16.000	0.345	0.001	Y	NA
10386946	10386947	YPZ3_0470	YPZ3_0471			TRUE	0.998	-3.000	0.704	NA		NA
10386947	10386948	YPZ3_0471	YPZ3_0472		folA	TRUE	0.514	150.000	0.104	NA		NA
10386948	10386949	YPZ3_0472	YPZ3_0473	folA		FALSE	0.054	161.000	0.000	1.000	N	NA
10386949	10386950	YPZ3_0473	YPZ3_0474			FALSE	0.005	883.000	0.000	NA		NA
10386951	10386952	YPZ3_0475	YPZ3_0476	apaH	apaG	TRUE	0.949	17.000	0.267	NA	N	NA
10386952	10386953	YPZ3_0476	YPZ3_0477	apaG	ksgA	TRUE	0.797	14.000	0.078	NA	N	NA
10386953	10386954	YPZ3_0477	YPZ3_0478	ksgA	pdxA	TRUE	0.974	-7.000	0.197	1.000	N	NA
10386954	10386955	YPZ3_0478	YPZ3_0479	pdxA	surA	TRUE	0.995	-16.000	0.561	1.000	N	NA
10386955	10386956	YPZ3_0479	YPZ3_0480	surA	imp	TRUE	0.722	68.000	0.182	1.000	N	NA
10386958	10386959	YPZ3_0482	YPZ3_0483	rluA		FALSE	0.004	1223.000	0.000	NA		NA
10386960	10386961	YPZ3_0484	YPZ3_0485			TRUE	0.997	11.000	1.000	NA		NA
10386961	10386962	YPZ3_0485	YPZ3_0486			TRUE	0.995	9.000	0.700	NA		NA
10386962	10386963	YPZ3_0486	YPZ3_0487			TRUE	0.858	163.000	0.500	NA		NA
10386963	10386964	YPZ3_0487	YPZ3_0488			TRUE	0.970	74.000	0.714	NA		NA
10386964	10386965	YPZ3_0488	YPZ3_0489			TRUE	0.980	33.000	0.533	NA		NA
10386965	10386966	YPZ3_0489	YPZ3_0490			TRUE	0.962	62.000	0.533	NA		NA
10386966	10386967	YPZ3_0490	YPZ3_0491			TRUE	0.981	18.000	0.400	NA		NA
10386967	10386968	YPZ3_0491	YPZ3_0492			TRUE	0.439	104.000	0.000	NA		NA
10386968	10386969	YPZ3_0492	YPZ3_0493			TRUE	0.875	13.000	0.000	NA		NA
10386969	10386970	YPZ3_0493	YPZ3_0494			TRUE	0.813	25.000	0.000	NA		NA
10386970	10386971	YPZ3_0494	YPZ3_0495			TRUE	0.804	26.000	0.000	NA		NA
10386971	10386972	YPZ3_0495	YPZ3_0496			TRUE	0.953	-7.000	0.000	NA		NA
10386972	10386973	YPZ3_0496	YPZ3_0497			FALSE	0.038	382.000	0.000	NA		NA
10386973	10386974	YPZ3_0497	YPZ3_0498			FALSE	0.401	120.000	0.000	NA		NA
10386974	10386975	YPZ3_0498	YPZ3_0499			TRUE	0.948	-3.000	0.000	NA		NA
10386975	10386976	YPZ3_0499	YPZ3_0500			TRUE	0.970	62.000	0.615	NA		NA
10386976	10386977	YPZ3_0500	YPZ3_0501			TRUE	0.995	22.000	1.000	NA		NA
10386978	10386979	YPZ3_0502	YPZ3_0503			FALSE	0.200	461.000	0.098	0.084	Y	NA
10386981	10386982	YPZ3_0505	YPZ3_0506		cysU	TRUE	0.997	-13.000	0.522	0.020	N	NA
10386982	10386983	YPZ3_0506	YPZ3_0507	cysU		TRUE	0.998	-24.000	0.697	0.085	N	NA
10386983	10386984	YPZ3_0507	YPZ3_0508			FALSE	0.012	886.000	0.014	0.085		NA
10386986	10386987	YPZ3_0510	YPZ3_0511			TRUE	0.982	0.000	0.000	1.000	Y	NA
10386987	10386988	YPZ3_0511	YPZ3_0512		leuD	FALSE	0.001	580.000	0.000	1.000	N	NA
10386988	10386989	YPZ3_0512	YPZ3_0513	leuD	leuC	TRUE	0.997	15.000	0.309	0.001	Y	NA
10386989	10386990	YPZ3_0513	YPZ3_0514	leuC		TRUE	0.998	2.000	0.275	0.001	Y	NA
10386990	10386991	YPZ3_0514	YPZ3_0515		leuA	TRUE	0.996	3.000	0.126	0.001	Y	NA
10386991	10386992	YPZ3_0515	YPZ3_0516	leuA		FALSE	0.060	147.000	0.000	1.000	N	NA
10386993	10386994	YPZ3_0517	YPZ3_0518	leuO		FALSE	0.003	576.000	0.050	1.000	N	NA
10386994	10386995	YPZ3_0518	YPZ3_0519			FALSE	0.002	484.000	0.000	1.000	N	NA
10386995	10386996	YPZ3_0519	YPZ3_0520		ilvH	TRUE	0.998	3.000	0.371	0.002	Y	NA
10386996	10386997	YPZ3_0520	YPZ3_0521	ilvH		FALSE	0.060	148.000	0.000	1.000	N	NA
10386997	10386998	YPZ3_0521	YPZ3_0522		fruR	FALSE	0.002	505.000	0.000	1.000	N	NA
10387000	10387001	YPZ3_0524	YPZ3_0525		mraW	TRUE	0.995	3.000	0.635	NA		NA
10387001	10387002	YPZ3_0525	YPZ3_0526	mraW	ftsL	TRUE	0.978	-3.000	0.227	1.000	N	NA
10387002	10387003	YPZ3_0526	YPZ3_0527	ftsL	ftsI	TRUE	0.612	66.000	0.124	1.000	N	NA
10387003	10387004	YPZ3_0527	YPZ3_0528	ftsI	murE	TRUE	0.989	-13.000	0.059	1.000	Y	NA
10387004	10387005	YPZ3_0528	YPZ3_0529	murE	murF	TRUE	0.999	-3.000	0.569	0.002	Y	NA
10387005	10387006	YPZ3_0529	YPZ3_0530	murF	mraY	TRUE	0.999	-6.000	0.309	0.005	Y	NA
10387006	10387007	YPZ3_0530	YPZ3_0531	mraY	murD	TRUE	0.999	3.000	0.647	0.005	Y	NA
10387007	10387008	YPZ3_0531	YPZ3_0532	murD	ftsW	TRUE	0.994	0.000	0.297	0.003	N	NA
10387008	10387009	YPZ3_0532	YPZ3_0533	ftsW	murG	TRUE	0.995	-3.000	0.647	1.000	N	NA
10387009	10387010	YPZ3_0533	YPZ3_0534	murG		TRUE	0.914	111.000	0.283	1.000	Y	NA
10387010	10387011	YPZ3_0534	YPZ3_0535		ddl	TRUE	0.998	-7.000	0.153	0.005	Y	NA
10387011	10387012	YPZ3_0535	YPZ3_0536	ddl	ftsQ	TRUE	0.996	2.000	0.372	NA	Y	NA
10387012	10387013	YPZ3_0536	YPZ3_0537	ftsQ		TRUE	0.836	93.000	0.389	NA	N	NA
10387013	10387014	YPZ3_0537	YPZ3_0538		ftsZ	TRUE	0.973	73.000	0.460	1.000	Y	NA
10387014	10387015	YPZ3_0538	YPZ3_0539	ftsZ	lpxC	TRUE	0.541	85.000	0.134	1.000	N	NA
10387017	10387018	YPZ3_0541	YPZ3_0542		secA	TRUE	0.613	78.000	0.065	1.000		NA
10387018	10387019	YPZ3_0542	YPZ3_0543	secA		FALSE	0.003	295.000	0.003	1.000	N	NA
10387020	10387021	YPZ3_0544	YPZ3_0545			TRUE	0.982	0.000	0.000	1.000	Y	NA
10387021	10387022	YPZ3_0545	YPZ3_0546			FALSE	0.112	279.000	0.000	NA		NA
10387022	10387023	YPZ3_0546	YPZ3_0547			FALSE	0.012	585.000	0.000	NA		NA
10387023	10387024	YPZ3_0547	YPZ3_0548			TRUE	0.976	3.000	0.185	NA		NA
10387024	10387025	YPZ3_0548	YPZ3_0549			TRUE	0.899	155.000	0.609	NA		NA
10387025	10387026	YPZ3_0549	YPZ3_0550			TRUE	0.841	226.000	0.684	NA		NA
10387026	10387027	YPZ3_0550	YPZ3_0551			TRUE	0.976	-3.000	0.118	NA		NA
10387027	10387028	YPZ3_0551	YPZ3_0552			FALSE	0.113	278.000	0.000	NA		NA
10387028	10387029	YPZ3_0552	YPZ3_0553		exuR	FALSE	0.241	201.000	0.000	NA		NA
10387029	10387030	YPZ3_0553	YPZ3_0554	exuR	exuT	TRUE	0.482	263.000	0.433	1.000	N	NA
10387031	10387032	YPZ3_0555	YPZ3_0556	uxaC	uxaB	TRUE	0.642	199.000	0.095	1.000	Y	NA
10387032	10387033	YPZ3_0556	YPZ3_0557	uxaB	uxaA	TRUE	0.981	11.000	0.126	1.000	Y	NA
10387033	10387034	YPZ3_0557	YPZ3_0558	uxaA		TRUE	0.558	153.000	0.126	NA		NA
10387035	10387036	YPZ3_0559	YPZ3_0560		sstT	FALSE	0.059	150.000	0.000	1.000	N	NA
10387036	10387037	YPZ3_0560	YPZ3_0561	sstT		FALSE	0.010	586.000	0.000	1.000		NA
10387037	10387038	YPZ3_0561	YPZ3_0562			FALSE	0.315	203.000	0.072	NA		NA
10387038	10387039	YPZ3_0562	YPZ3_0563			FALSE	0.174	239.000	0.000	NA		NA
10387041	10387042	YPZ3_0565	YPZ3_0566	fadH		FALSE	0.194	213.000	0.000	1.000		NA
10387042	10387043	YPZ3_0566	YPZ3_0567			FALSE	0.030	391.000	0.000	1.000		NA
10387043	10387044	YPZ3_0567	YPZ3_0568			TRUE	0.974	32.000	0.452	1.000		NA
10387044	10387045	YPZ3_0568	YPZ3_0569			TRUE	0.983	56.000	0.789	NA		NA
10387045	10387046	YPZ3_0569	YPZ3_0570			TRUE	0.954	102.000	0.750	NA		NA
10387046	10387047	YPZ3_0570	YPZ3_0571		terX	TRUE	0.934	23.000	0.164	NA		NA
10387047	10387048	YPZ3_0571	YPZ3_0572	terX	terY	TRUE	0.929	33.000	0.200	NA		NA
10387049	10387050	YPZ3_0573	YPZ3_0574			TRUE	0.915	45.000	0.000	NA	Y	NA
10387050	10387051	YPZ3_0574	YPZ3_0575			FALSE	0.004	1268.000	0.000	NA		NA
10387052	10387053	YPZ3_0576	YPZ3_0577	yapF		TRUE	0.653	60.000	0.000	NA		NA
10387053	10387054	YPZ3_0577	YPZ3_0578			TRUE	0.955	-31.000	0.000	NA		NA
10387054	10387055	YPZ3_0578	YPZ3_0579			FALSE	0.389	102.000	0.016	NA		NA
10387056	10387057	YPZ3_0580	YPZ3_0581			TRUE	0.649	149.000	0.030	1.000	Y	NA
10387057	10387058	YPZ3_0581	YPZ3_0582			FALSE	0.249	109.000	0.073	1.000	N	NA
10387058	10387059	YPZ3_0582	YPZ3_0583			FALSE	0.239	149.000	0.089	1.000	N	NA
10387059	10387060	YPZ3_0583	YPZ3_0584			TRUE	0.996	54.000	0.733	0.066	Y	NA
10387060	10387061	YPZ3_0584	YPZ3_0585			TRUE	0.994	0.000	0.105	0.066	Y	NA
10387061	10387062	YPZ3_0585	YPZ3_0586			TRUE	0.994	-3.000	0.375	NA		NA
10387062	10387063	YPZ3_0586	YPZ3_0587			TRUE	0.954	51.000	0.375	NA		NA
10387064	10387065	YPZ3_0588	YPZ3_0589			TRUE	0.919	170.000	0.750	NA		NA
10387065	10387066	YPZ3_0589	YPZ3_0590			TRUE	0.999	-16.000	0.889	NA		NA
10387067	10387068	YPZ3_0591	YPZ3_0592			FALSE	0.246	276.000	0.222	NA	N	NA
10387068	10387069	YPZ3_0592	YPZ3_0593			TRUE	0.875	13.000	0.000	NA		NA
10387069	10387070	YPZ3_0593	YPZ3_0594			FALSE	0.368	134.000	0.000	NA		NA
10387070	10387071	YPZ3_0594	YPZ3_0595			TRUE	0.857	16.000	0.000	NA		NA
10387071	10387072	YPZ3_0595	YPZ3_0596			FALSE	0.318	285.000	0.000	NA	Y	NA
10387073	10387074	YPZ3_0597	YPZ3_0598			FALSE	0.136	260.000	0.000	NA		NA
10387075	10387076	YPZ3_0599	YPZ3_0600			FALSE	0.003	2036.000	0.000	NA		NA
10387076	10387077	YPZ3_0600	YPZ3_0601			TRUE	0.895	9.000	0.000	NA		NA
10387077	10387078	YPZ3_0601	YPZ3_0602			TRUE	0.799	27.000	0.000	NA		NA
10387078	10387079	YPZ3_0602	YPZ3_0603			FALSE	0.106	285.000	0.000	NA		NA
10387080	10387081	YPZ3_t5	YPZ3_0604			FALSE	0.249	196.000	0.000	NA		NA
10387081	10387082	YPZ3_0604	YPZ3_0605			TRUE	0.637	158.000	0.299	1.000	N	NA
10387085	10387086	YPZ3_0608	YPZ3_0609	folB	uppP	FALSE	0.122	274.000	0.128	1.000	N	NA
10387087	10387088	YPZ3_0610	YPZ3_0611	cca		FALSE	0.298	160.000	0.106	NA	N	NA
10387089	10387090	YPZ3_0612	YPZ3_0613		glnE	FALSE	0.318	171.000	0.053	1.000		NA
10387090	10387091	YPZ3_0613	YPZ3_0614	glnE	rfaE	FALSE	0.233	135.000	0.083	1.000	N	NA
10387091	10387092	YPZ3_0614	YPZ3_0615	rfaE	asoB	FALSE	0.093	37.000	0.012	1.000	N	NA
10387092	10387093	YPZ3_0615	YPZ3_0616	asoB	ribB	FALSE	0.000	1175.000	0.000	1.000	N	NA
10387093	10387094	YPZ3_0616	YPZ3_0617	ribB		FALSE	0.022	459.000	0.048	1.000		NA
10387095	10387096	YPZ3_0618	YPZ3_0619			TRUE	0.994	10.000	0.632	NA		NA
10387096	10387097	YPZ3_0619	YPZ3_0620			TRUE	0.530	301.000	0.480	NA		NA
10387098	10387099	YPZ3_0621	YPZ3_0622			TRUE	0.973	34.000	0.443	NA		NA
10387099	10387100	YPZ3_0622	YPZ3_0623		icc	TRUE	0.924	82.000	0.433	NA		NA
10387100	10387101	YPZ3_0623	YPZ3_0624	icc		TRUE	0.993	0.000	0.427	NA		NA
10387101	10387102	YPZ3_0624	YPZ3_0625		parE	TRUE	0.776	102.000	0.217	NA		NA
10387102	10387103	YPZ3_0625	YPZ3_0626	parE		FALSE	0.254	4.000	0.022	1.000	N	NA
10387105	10387106	YPZ3_0628	YPZ3_0629	parC		FALSE	0.005	427.000	0.043	1.000	N	NA
10387106	10387107	YPZ3_0629	YPZ3_0630		sufI	FALSE	0.344	179.000	0.154	1.000	N	NA
10387107	10387108	YPZ3_0630	YPZ3_0631	sufI		FALSE	0.061	308.000	0.025	1.000		NA
10387108	10387109	YPZ3_0631	YPZ3_0632			TRUE	0.934	-3.000	0.012	NA		NA
10387110	10387111	YPZ3_0633	YPZ3_0634			FALSE	0.024	419.000	0.000	1.000		NA
10387113	10387114	YPZ3_0636	YPZ3_0637		metC	TRUE	0.592	193.000	0.212	NA		NA
10387115	10387116	YPZ3_0638	YPZ3_0639			TRUE	0.999	4.000	0.810	0.084	Y	NA
10387117	10387118	YPZ3_0640	YPZ3_0641			TRUE	0.982	25.000	0.500	NA		NA
10387118	10387119	YPZ3_0641	YPZ3_0642			TRUE	0.955	-16.000	0.000	NA		NA
10387119	10387120	YPZ3_0642	YPZ3_0643			TRUE	0.983	0.000	0.000	NA	Y	NA
10387120	10387121	YPZ3_0643	YPZ3_0644			TRUE	0.997	-16.000	0.273	NA	Y	NA
10387121	10387122	YPZ3_0644	YPZ3_0645			TRUE	0.999	-3.000	0.909	NA	Y	NA
10387122	10387123	YPZ3_0645	YPZ3_0646			TRUE	0.999	-3.000	0.800	NA	Y	NA
10387123	10387124	YPZ3_0646	YPZ3_0647			TRUE	0.992	54.000	0.727	NA	Y	NA
10387124	10387125	YPZ3_0647	YPZ3_0648			FALSE	0.258	298.000	0.182	NA		NA
10387125	10387126	YPZ3_0648	YPZ3_0649			TRUE	0.864	15.000	0.000	NA		NA
10387126	10387127	YPZ3_0649	YPZ3_0650			TRUE	0.999	-3.000	0.889	NA		NA
10387127	10387128	YPZ3_0650	YPZ3_0651			TRUE	0.913	52.000	0.222	NA		NA
10387129	10387130	YPZ3_0652	YPZ3_0653			TRUE	0.738	202.000	0.000	0.033	Y	NA
10387130	10387131	YPZ3_0653	YPZ3_0654			FALSE	0.006	353.000	0.000	1.000	N	NA
10387131	10387132	YPZ3_0654	YPZ3_0655			TRUE	0.952	18.000	0.000	1.000	Y	NA
10387132	10387133	YPZ3_0655	YPZ3_0656			TRUE	0.940	25.000	0.000	1.000	Y	NA
10387136	10387137	YPZ3_0659	YPZ3_0660			TRUE	0.969	8.000	0.000	0.014		NA
10387137	10387138	YPZ3_0660	YPZ3_0661		flhB	TRUE	0.997	-10.000	0.333	0.014		NA
10387138	10387139	YPZ3_0661	YPZ3_0662	flhB	fliR	TRUE	0.999	0.000	1.000	1.000	Y	NA
10387139	10387140	YPZ3_0662	YPZ3_0663	fliR	fliP	FALSE	0.325	275.000	0.000	1.000	Y	NA
10387140	10387141	YPZ3_0663	YPZ3_0664	fliP	fliN	TRUE	0.997	-3.000	0.368	1.000	Y	NA
10387141	10387142	YPZ3_0664	YPZ3_0665	fliN		TRUE	0.980	-7.000	0.123	NA		NA
10387143	10387144	YPZ3_0666	YPZ3_0667		fliE	TRUE	0.982	17.000	0.576	1.000	N	NA
10387144	10387145	YPZ3_0667	YPZ3_0668	fliE	fliF	TRUE	0.999	10.000	1.000	0.012	Y	NA
10387145	10387146	YPZ3_0668	YPZ3_0669	fliF		TRUE	1.000	-28.000	0.970	0.012	Y	NA
10387146	10387147	YPZ3_0669	YPZ3_0670		fliH	TRUE	0.999	2.000	0.789	NA	Y	NA
10387147	10387148	YPZ3_0670	YPZ3_0671	fliH	fliI	TRUE	0.999	-7.000	0.816	NA	Y	NA
10387148	10387149	YPZ3_0671	YPZ3_0672	fliI		TRUE	0.898	4.000	0.035	1.000		NA
10387150	10387151	YPZ3_0673	YPZ3_0674			FALSE	0.013	502.000	0.014	NA		NA
10387152	10387153	YPZ3_0675	YPZ3_0676	flgB	flgC	TRUE	1.000	3.000	0.972	0.007	Y	NA
10387153	10387154	YPZ3_0676	YPZ3_0677	flgC	flgD	TRUE	0.999	3.000	0.914	NA	Y	NA
10387154	10387155	YPZ3_0677	YPZ3_0678	flgD	flgE	TRUE	0.995	55.000	0.970	NA	Y	NA
10387157	10387158	YPZ3_0680	YPZ3_0681		flgG	TRUE	0.993	68.000	0.971	1.000	Y	NA
10387158	10387159	YPZ3_0681	YPZ3_0682	flgG	flgH	TRUE	0.998	35.000	0.941	0.012	Y	NA
10387159	10387160	YPZ3_0682	YPZ3_0683	flgH	flgI	TRUE	0.988	170.000	0.912	0.014	Y	NA
10387160	10387161	YPZ3_0683	YPZ3_0684	flgI	flgK	FALSE	0.042	594.000	0.000	0.008		NA
10387161	10387162	YPZ3_0684	YPZ3_0685	flgK	flgL	TRUE	0.994	29.000	0.576	0.002		NA
10387162	10387163	YPZ3_0685	YPZ3_0686	flgL		TRUE	0.993	12.000	0.667	NA		NA
10387164	10387165	YPZ3_0687	YPZ3_0688			TRUE	0.998	-19.000	0.714	NA		NA
10387166	10387167	YPZ3_0689	YPZ3_0690	flaA1	flaA2	FALSE	0.170	515.000	0.000	0.002	Y	NA
10387167	10387168	YPZ3_0690	YPZ3_0691	flaA2	flaA3	TRUE	0.605	283.000	0.000	0.002	Y	NA
10387168	10387169	YPZ3_0691	YPZ3_0692	flaA3	fliD	TRUE	0.482	220.000	0.000	1.000	Y	NA
10387169	10387170	YPZ3_0692	YPZ3_0693	fliD	fliS	TRUE	0.999	10.000	0.865	0.004	Y	NA
10387170	10387171	YPZ3_0693	YPZ3_0694	fliS		TRUE	0.938	2.000	0.054	NA		NA
10387171	10387172	YPZ3_0694	YPZ3_0695			TRUE	0.943	2.000	0.062	NA		NA
10387172	10387173	YPZ3_0695	YPZ3_0696			TRUE	0.948	39.000	0.296	1.000		NA
10387173	10387174	YPZ3_0696	YPZ3_0697		fliA	TRUE	0.985	6.000	0.333	1.000		NA
10387174	10387175	YPZ3_0697	YPZ3_0698	fliA	motA	TRUE	0.978	16.000	0.500	1.000	N	NA
10387175	10387176	YPZ3_0698	YPZ3_0699	motA	motB	TRUE	0.999	0.000	0.846	1.000	Y	NA
10387176	10387177	YPZ3_0699	YPZ3_0700	motB		FALSE	0.022	460.000	0.000	NA		NA
10387177	10387178	YPZ3_0700	YPZ3_0701			TRUE	0.948	-3.000	0.000	NA		NA
10387178	10387179	YPZ3_0701	YPZ3_0702			FALSE	0.003	2129.000	0.000	NA		NA
10387179	10387180	YPZ3_0702	YPZ3_0703			TRUE	0.948	54.000	0.167	1.000	Y	NA
10387182	10387183	YPZ3_0705	YPZ3_0706			TRUE	0.993	13.000	0.842	1.000	N	NA
10387185	10387186	YPZ3_0708	YPZ3_0709		yapH	FALSE	0.005	854.000	0.000	NA		NA
10387187	10387188	YPZ3_0710	YPZ3_0711			FALSE	0.038	596.000	0.000	0.013		NA
10387188	10387189	YPZ3_0711	YPZ3_0712			TRUE	0.512	208.000	0.000	0.013		NA
10387190	10387191	YPZ3_0713	YPZ3_0714			TRUE	0.468	78.000	0.089	NA	N	NA
10387191	10387192	YPZ3_0714	YPZ3_0715			FALSE	0.004	388.000	0.000	1.000	N	NA
10387192	10387193	YPZ3_0715	YPZ3_0716			FALSE	0.059	151.000	0.000	1.000	N	NA
10387193	10387194	YPZ3_0716	YPZ3_0717			TRUE	0.985	-3.000	0.000	0.014		NA
10387194	10387195	YPZ3_0717	YPZ3_0718			TRUE	0.854	14.000	0.000	1.000		NA
10387195	10387196	YPZ3_0718	YPZ3_0719			TRUE	0.982	0.000	0.000	1.000	Y	NA
10387196	10387197	YPZ3_0719	YPZ3_0720		irp2	FALSE	0.033	208.000	0.000	1.000	N	NA
10387197	10387198	YPZ3_0720	YPZ3_0721	irp2		TRUE	0.979	8.000	0.000	0.001		NA
10387198	10387199	YPZ3_0721	YPZ3_0722			TRUE	0.974	13.000	0.000	0.001		NA
10387199	10387200	YPZ3_0722	YPZ3_0723			TRUE	0.948	-3.000	0.000	NA		NA
10387200	10387201	YPZ3_0723	YPZ3_0724			TRUE	0.948	-3.000	0.000	NA		NA
10387201	10387202	YPZ3_0724	YPZ3_0725			TRUE	0.990	-7.000	0.074	1.000	Y	NA
10387202	10387203	YPZ3_0725	YPZ3_0726			TRUE	0.954	-10.000	0.000	NA		NA
10387203	10387204	YPZ3_0726	YPZ3_0727			TRUE	0.936	0.000	0.000	NA		NA
10387204	10387205	YPZ3_0727	YPZ3_0728			TRUE	0.995	-7.000	0.000	0.007	Y	NA
10387206	10387207	YPZ3_0729	YPZ3_0730			FALSE	0.025	436.000	0.000	NA		NA
10387208	10387209	YPZ3_0731	YPZ3_0732	gntP		FALSE	0.004	1226.000	0.000	NA		NA
10387209	10387210	YPZ3_0732	YPZ3_0733			FALSE	0.409	117.000	0.000	NA		NA
10387210	10387211	YPZ3_0733	YPZ3_0734			FALSE	0.083	656.000	0.000	0.010	Y	NA
10387211	10387212	YPZ3_0734	YPZ3_0735			FALSE	0.011	586.000	0.000	NA		NA
10387212	10387213	YPZ3_0735	YPZ3_0736			TRUE	0.804	26.000	0.000	NA		NA
10387213	10387214	YPZ3_0736	YPZ3_0737			TRUE	0.870	14.000	0.000	NA		NA
10387214	10387215	YPZ3_0737	YPZ3_0738			FALSE	0.004	1061.000	0.000	NA		NA
10387216	10387217	YPZ3_0739	YPZ3_0740		cytR	FALSE	0.014	282.000	0.000	1.000	N	NA
10387217	10387218	YPZ3_0740	YPZ3_0741	cytR		FALSE	0.000	1347.000	0.000	1.000	N	NA
10387218	10387219	YPZ3_0741	YPZ3_0742			TRUE	0.948	54.000	0.167	1.000	Y	NA
10387221	10387222	YPZ3_0744	YPZ3_0745	iutA	iucD	TRUE	0.499	72.000	0.100	1.000	N	NA
10387222	10387223	YPZ3_0745	YPZ3_0746	iucD	iucC	TRUE	0.998	-3.000	0.417	1.000	Y	NA
10387223	10387224	YPZ3_0746	YPZ3_0747	iucC	iucB	TRUE	0.989	-3.000	0.250	1.000		NA
10387224	10387225	YPZ3_0747	YPZ3_0748	iucB	iucA2	TRUE	0.997	-16.000	0.609	1.000		NA
10387225	10387226	YPZ3_0748	YPZ3_0749	iucA2	iucA1	TRUE	0.833	93.000	0.000	0.001		NA
10387228	10387229	YPZ3_0751	YPZ3_0752			FALSE	0.035	377.000	0.000	1.000		NA
10387232	10387233	YPZ3_0755	YPZ3_0756			FALSE	0.003	3122.000	0.000	NA		NA
10387233	10387234	YPZ3_0756	YPZ3_0757			TRUE	0.714	49.000	0.000	NA		NA
10387234	10387235	YPZ3_0757	YPZ3_0758			FALSE	0.409	117.000	0.000	NA		NA
10387235	10387236	YPZ3_0758	YPZ3_0759			TRUE	0.998	-3.000	0.750	NA		NA
10387236	10387237	YPZ3_0759	YPZ3_0760			TRUE	0.936	0.000	0.000	NA		NA
10387237	10387238	YPZ3_0760	YPZ3_0761			TRUE	0.911	4.000	0.000	NA		NA
10387238	10387239	YPZ3_0761	YPZ3_0762			FALSE	0.058	388.000	0.083	NA		NA
10387239	10387240	YPZ3_0762	YPZ3_0763			TRUE	0.964	3.000	0.125	NA		NA
10387240	10387241	YPZ3_0763	YPZ3_0764			TRUE	0.983	16.000	0.400	NA		NA
10387241	10387242	YPZ3_0764	YPZ3_0765			TRUE	0.954	-13.000	0.000	NA		NA
10387242	10387243	YPZ3_0765	YPZ3_0766		insB	FALSE	0.025	437.000	0.000	NA		NA
10387243	10387244	YPZ3_0766	YPZ3_0767	insB		FALSE	0.010	608.000	0.000	NA		NA
10387246	10387247	YPZ3_0768	YPZ3_0769	speC		FALSE	0.003	556.000	0.000	NA	N	NA
10387247	10387248	YPZ3_0769	YPZ3_0770		mglA	TRUE	0.990	46.000	0.545	NA	Y	NA
10387248	10387249	YPZ3_0770	YPZ3_0771	mglA		TRUE	0.995	33.000	0.727	1.000	Y	NA
10387250	10387251	YPZ3_0772	YPZ3_0773			TRUE	0.842	104.000	0.128	1.000	Y	NA
10387251	10387252	YPZ3_0773	YPZ3_0774			FALSE	0.018	300.000	0.000	NA	N	NA
10387252	10387253	YPZ3_0774	YPZ3_0775			FALSE	0.002	633.000	0.000	NA	N	NA
10387254	10387255	YPZ3_0776	YPZ3_0777			TRUE	0.963	0.000	0.092	NA		NA
10387255	10387256	YPZ3_0777	YPZ3_0778			TRUE	0.631	111.000	0.123	NA		NA
10387256	10387257	YPZ3_0778	YPZ3_0779			TRUE	0.486	112.000	0.059	NA		NA
10387257	10387258	YPZ3_0779	YPZ3_0780			FALSE	0.007	703.000	0.000	NA		NA
10387259	10387260	YPZ3_0781	YPZ3_0782			TRUE	0.978	-7.000	0.218	1.000	N	NA
10387260	10387261	YPZ3_0782	YPZ3_0783			TRUE	0.791	22.000	0.016	NA		NA
10387261	10387262	YPZ3_0783	YPZ3_0784			TRUE	0.972	-15.000	0.081	NA		NA
10387262	10387263	YPZ3_0784	YPZ3_0785		proC	FALSE	0.203	288.000	0.117	NA		NA
10387263	10387264	YPZ3_0785	YPZ3_0786	proC		TRUE	0.583	133.000	0.125	NA		NA
10387266	10387267	YPZ3_0788	YPZ3_0789			TRUE	0.945	4.000	0.095	1.000		NA
10387267	10387268	YPZ3_0789	YPZ3_0790			FALSE	0.194	180.000	0.004	1.000		NA
10387268	10387269	YPZ3_0790	YPZ3_0791			TRUE	0.979	0.000	0.263	NA	N	NA
10387269	10387270	YPZ3_0791	YPZ3_0792		gshB	FALSE	0.417	116.000	0.120	NA	N	NA
10387270	10387271	YPZ3_0792	YPZ3_0793	gshB		TRUE	0.932	26.000	0.173	NA		NA
10387271	10387272	YPZ3_0793	YPZ3_0794		endA	FALSE	0.410	252.000	0.201	NA		NA
10387272	10387273	YPZ3_0794	YPZ3_0795	endA	sprT	TRUE	0.777	98.000	0.210	NA		NA
10387273	10387274	YPZ3_0795	YPZ3_0796	sprT	metK	FALSE	0.338	142.000	0.030	NA		NA
10387275	10387276	YPZ3_0797	YPZ3_0798	speA		FALSE	0.016	160.000	0.006	NA	N	NA
10387278	10387279	YPZ3_0800	YPZ3_0801	tktA		FALSE	0.019	257.000	0.000	1.000	N	NA
10387279	10387280	YPZ3_0801	YPZ3_0802		epd	FALSE	0.007	341.000	0.000	1.000	N	NA
10387280	10387281	YPZ3_0802	YPZ3_0803	epd	pgk	TRUE	0.915	103.000	0.070	0.006	Y	NA
10387281	10387282	YPZ3_0803	YPZ3_0804	pgk	fbaA	TRUE	0.893	120.000	0.056	0.006	Y	NA
10387282	10387283	YPZ3_0804	YPZ3_0805	fbaA		FALSE	0.005	438.000	0.038	NA	N	NA
10387283	10387284	YPZ3_0805	YPZ3_0806			FALSE	0.150	263.000	0.049	NA		NA
10387284	10387285	YPZ3_0806	YPZ3_0807			FALSE	0.361	190.000	0.075	NA		NA
10387287	10387288	YPZ3_0809	YPZ3_0810	rpiA	serA	FALSE	0.006	307.000	0.029	1.000	N	NA
10387289	10387290	YPZ3_0811	YPZ3_0812			FALSE	0.044	364.000	0.034	NA		NA
10387291	10387292	YPZ3_0813	YPZ3_0814		pepP	TRUE	0.605	88.000	0.073	NA		NA
10387292	10387293	YPZ3_0814	YPZ3_0815	pepP	ubiH	FALSE	0.233	69.000	0.047	1.000	N	NA
10387293	10387294	YPZ3_0815	YPZ3_0816	ubiH	visC	TRUE	0.973	173.000	0.474	0.001	Y	NA
10387294	10387295	YPZ3_0816	YPZ3_0817	visC	gcvT	FALSE	0.000	721.000	0.004	1.000	N	NA
10387295	10387296	YPZ3_0817	YPZ3_0818	gcvT	gcsH	TRUE	0.988	69.000	0.317	0.001	Y	NA
10387296	10387297	YPZ3_0818	YPZ3_0819	gcsH	gcvP	TRUE	0.778	212.000	0.249	1.000	Y	NA
10387297	10387298	YPZ3_0819	YPZ3_0820	gcvP		FALSE	0.039	378.000	0.000	NA		NA
10387298	10387299	YPZ3_0820	YPZ3_0821			FALSE	0.004	1210.000	0.000	NA		NA
10387299	10387300	YPZ3_0821	YPZ3_0822			TRUE	0.439	104.000	0.000	NA		NA
10387300	10387301	YPZ3_0822	YPZ3_0823			FALSE	0.238	202.000	0.000	NA		NA
10387301	10387302	YPZ3_0823	YPZ3_0824			FALSE	0.138	258.000	0.000	NA		NA
10387304	10387305	YPZ3_0826	YPZ3_0827			TRUE	0.945	0.000	0.051	NA		NA
10387305	10387306	YPZ3_0827	YPZ3_0828		creC	TRUE	0.996	25.000	0.776	1.000	Y	NA
10387306	10387307	YPZ3_0828	YPZ3_0829	creC		TRUE	0.727	121.000	0.311	NA	N	NA
10387309	10387310	YPZ3_0831	YPZ3_0832	xerD	dsbC	TRUE	0.639	31.000	0.079	1.000	N	NA
10387310	10387311	YPZ3_0832	YPZ3_0833	dsbC	recJ	TRUE	0.823	7.000	0.082	1.000	N	NA
10387311	10387312	YPZ3_0833	YPZ3_0834	recJ	prfB	FALSE	0.003	345.000	0.028	1.000	N	NA
10387312	10387313	YPZ3_0834	YPZ3_0835	prfB	lysS	TRUE	0.993	10.000	0.162	0.048	Y	NA
10387313	10387314	YPZ3_0835	YPZ3_t7	lysS		FALSE	0.256	194.000	0.000	NA		NA
10387314	10387315	YPZ3_t7	YPZ3_0836		int	FALSE	0.314	166.000	0.000	NA		NA
10387315	10387316	YPZ3_0836	YPZ3_0837	int		FALSE	0.003	1188.000	0.000	1.000		NA
10387316	10387317	YPZ3_0837	YPZ3_0838			FALSE	0.069	460.000	0.000	0.029		NA
10387320	10387321	YPZ3_0841	YPZ3_0842			FALSE	0.143	255.000	0.000	NA		NA
10387322	10387323	YPZ3_0843	YPZ3_0844			FALSE	0.015	507.000	0.000	1.000		NA
10387323	10387324	YPZ3_0844	YPZ3_0845			FALSE	0.003	1508.000	0.000	NA		NA
10387324	10387325	YPZ3_0845	YPZ3_0846			TRUE	0.995	-30.000	0.429	NA		NA
10387325	10387326	YPZ3_0846	YPZ3_0847			FALSE	0.010	605.000	0.000	NA		NA
10387326	10387327	YPZ3_0847	YPZ3_0848			FALSE	0.209	217.000	0.000	NA		NA
10387328	10387329	YPZ3_0849	YPZ3_0850			TRUE	0.953	0.000	0.065	NA		NA
10387329	10387330	YPZ3_0850	YPZ3_0851			FALSE	0.027	424.000	0.000	NA		NA
10387330	10387331	YPZ3_0851	YPZ3_0852			FALSE	0.040	376.000	0.000	NA		NA
10387331	10387332	YPZ3_0852	YPZ3_0853			FALSE	0.006	779.000	0.000	NA		NA
10387332	10387333	YPZ3_0853	YPZ3_0854			FALSE	0.229	435.000	0.217	NA	Y	NA
10387333	10387334	YPZ3_0854	YPZ3_0855			TRUE	0.933	72.000	0.200	1.000	Y	NA
10387334	10387335	YPZ3_0855	YPZ3_0856			FALSE	0.048	549.000	0.000	1.000	Y	NA
10387336	10387337	YPZ3_0857	YPZ3_0858			TRUE	0.970	160.000	0.815	1.000	Y	NA
10387337	10387338	YPZ3_0858	YPZ3_0859			TRUE	0.999	12.000	0.885	0.064	Y	NA
10387338	10387339	YPZ3_0859	YPZ3_0860			TRUE	0.994	5.000	0.308	1.000	Y	NA
10387339	10387340	YPZ3_0860	YPZ3_0861		bgaB	TRUE	0.984	51.000	0.190	0.004	Y	NA
10387340	10387341	YPZ3_0861	YPZ3_0862	bgaB		TRUE	0.841	112.000	0.143	1.000	Y	NA
10387344	10387345	YPZ3_0865	YPZ3_0866			TRUE	0.911	151.000	0.341	NA	Y	NA
10387347	10387348	YPZ3_0868	YPZ3_0869		agaY	TRUE	0.927	24.000	0.148	NA		NA
10387348	10387349	YPZ3_0869	YPZ3_0870	agaY		TRUE	0.805	109.000	0.261	NA		NA
10387349	10387350	YPZ3_0870	YPZ3_0871			TRUE	0.942	123.000	0.727	NA		NA
10387350	10387351	YPZ3_0871	YPZ3_0872			TRUE	0.988	21.000	0.615	1.000		NA
10387351	10387352	YPZ3_0872	YPZ3_0873			FALSE	0.399	244.000	0.000	0.020		NA
10387352	10387353	YPZ3_0873	YPZ3_0874		kduD2	TRUE	0.985	16.000	0.462	1.000		NA
10387353	10387354	YPZ3_0874	YPZ3_0875	kduD2		FALSE	0.038	196.000	0.000	1.000	N	NA
10387354	10387355	YPZ3_0875	YPZ3_0876			TRUE	0.985	3.000	0.104	1.000	Y	NA
10387355	10387356	YPZ3_0876	YPZ3_0877			TRUE	0.994	86.000	0.833	0.009	Y	NA
10387356	10387357	YPZ3_0877	YPZ3_0878			TRUE	1.000	-10.000	0.917	0.009	Y	NA
10387357	10387358	YPZ3_0878	YPZ3_0879		manX	TRUE	0.998	47.000	0.909	0.009	Y	NA
10387358	10387359	YPZ3_0879	YPZ3_0880	manX		TRUE	0.873	18.000	0.150	1.000	N	NA
10387359	10387360	YPZ3_0880	YPZ3_0881		agaZ	TRUE	0.979	-3.000	0.240	1.000	N	NA
10387360	10387361	YPZ3_0881	YPZ3_0882	agaZ		TRUE	0.981	50.000	0.400	1.000	Y	NA
10387364	10387365	YPZ3_0885	YPZ3_0886			TRUE	0.982	0.000	0.000	1.000	Y	NA
10387366	10387367	YPZ3_0887	YPZ3_0888			TRUE	0.886	109.000	0.444	1.000		NA
10387367	10387368	YPZ3_0888	YPZ3_0889			TRUE	0.802	115.000	0.286	1.000		NA
10387369	10387370	YPZ3_0890	YPZ3_0891			FALSE	0.007	743.000	0.000	NA		NA
10387370	10387371	YPZ3_0891	YPZ3_0892			TRUE	0.900	170.000	0.667	NA		NA
10387371	10387372	YPZ3_0892	YPZ3_0893			TRUE	0.961	81.000	0.667	NA		NA
10387372	10387373	YPZ3_0893	YPZ3_0894			TRUE	0.995	-3.000	0.012	0.002	Y	NA
10387373	10387374	YPZ3_0894	YPZ3_0895		hofF	TRUE	0.986	142.000	0.653	0.002	Y	NA
10387374	10387375	YPZ3_0895	YPZ3_0896	hofF		TRUE	0.998	20.000	0.599	0.002	Y	NA
10387375	10387376	YPZ3_0896	YPZ3_0897		gspJ	FALSE	0.016	1123.000	0.000	NA	Y	NA
10387376	10387377	YPZ3_0897	YPZ3_0898	gspJ		TRUE	0.977	69.000	0.461	NA	Y	NA
10387377	10387378	YPZ3_0898	YPZ3_0899			TRUE	0.999	-16.000	0.537	0.074	Y	NA
10387378	10387379	YPZ3_0899	YPZ3_0900			FALSE	0.062	487.000	0.000	1.000	Y	NA
10387381	10387382	YPZ3_0902	YPZ3_0903			FALSE	0.002	553.000	0.000	1.000	N	NA
10387383	10387384	YPZ3_0904	YPZ3_0905			TRUE	0.664	113.000	0.157	1.000		NA
10387385	10387386	YPZ3_0906	YPZ3_0907			FALSE	0.009	369.000	0.000	NA	N	NA
10387390	10387391	YPZ3_0911	YPZ3_0912	bisC	aas	FALSE	0.003	449.000	0.000	1.000	N	NA
10387391	10387392	YPZ3_0912	YPZ3_0913	aas		TRUE	0.977	-3.000	0.124	NA		NA
10387393	10387394	YPZ3_0914	YPZ3_0915	tas	mutH	FALSE	0.001	389.000	0.015	1.000	N	NA
10387395	10387396	YPZ3_0916	YPZ3_0917			FALSE	0.149	19.000	0.012	1.000	N	NA
10387396	10387397	YPZ3_0917	YPZ3_0918		lgt	FALSE	0.006	251.000	0.003	1.000	N	NA
10387397	10387398	YPZ3_0918	YPZ3_0919	lgt	thyA	TRUE	0.926	7.000	0.164	1.000	N	NA
10387398	10387399	YPZ3_0919	YPZ3_0920	thyA		FALSE	0.001	719.000	0.000	1.000	N	NA
10387399	10387400	YPZ3_0920	YPZ3_0921			TRUE	0.986	-10.000	0.000	0.020		NA
10387400	10387401	YPZ3_0921	YPZ3_0922			TRUE	0.996	0.000	0.667	1.000		NA
10387401	10387402	YPZ3_0922	YPZ3_0923			FALSE	0.042	235.000	0.000	NA	N	NA
10387402	10387403	YPZ3_0923	YPZ3_0924			TRUE	0.994	-3.000	0.373	NA		NA
10387403	10387404	YPZ3_0924	YPZ3_0925			TRUE	0.980	33.000	0.538	NA		NA
10387404	10387405	YPZ3_0925	YPZ3_0926		recC	FALSE	0.249	135.000	0.076	NA	N	NA
10387405	10387406	YPZ3_0926	YPZ3_0927	recC	ptrA	FALSE	0.413	82.000	0.092	1.000	N	NA
10387406	10387407	YPZ3_0927	YPZ3_0928	ptrA		FALSE	0.196	180.000	0.092	1.000	N	NA
10387407	10387408	YPZ3_0928	YPZ3_0929			TRUE	1.000	0.000	0.688	0.001	Y	NA
10387411	10387412	YPZ3_t8	YPZ3_t9			FALSE	0.393	124.000	0.000	NA		NA
10387413	10387414	YPZ3_0932	YPZ3_0933			FALSE	0.018	143.000	0.021	1.000	N	NA
10387415	10387416	YPZ3_0934	YPZ3_0935			TRUE	0.824	138.000	0.122	0.002		NA
10387417	10387418	YPZ3_0936	YPZ3_0937	gcvA		FALSE	0.428	166.000	0.081	NA		NA
10387418	10387419	YPZ3_0937	YPZ3_0938			TRUE	0.983	-7.000	0.144	NA		NA
10387420	10387421	YPZ3_0939	YPZ3_0940	xni		FALSE	0.351	260.000	0.178	NA		NA
10387421	10387422	YPZ3_0940	YPZ3_0941			TRUE	0.451	153.000	0.079	NA		NA
10387423	10387424	YPZ3_0942	YPZ3_0943	syd		FALSE	0.009	639.000	0.000	NA		NA
10387424	10387425	YPZ3_0943	YPZ3_0944			FALSE	0.146	254.000	0.000	NA		NA
10387425	10387426	YPZ3_0944	YPZ3_0945			TRUE	0.995	0.000	0.518	NA		NA
10387426	10387427	YPZ3_0945	YPZ3_0946			TRUE	0.887	28.000	0.209	1.000	N	NA
10387428	10387429	YPZ3_0947	YPZ3_0948		dapD	FALSE	0.391	124.000	0.035	NA		NA
10387429	10387430	YPZ3_0948	YPZ3_0949	dapD		FALSE	0.219	175.000	0.097	1.000	N	NA
10387430	10387431	YPZ3_0949	YPZ3_0950		ampM	TRUE	0.832	60.000	0.243	1.000	N	NA
10387432	10387433	YPZ3_0951	YPZ3_0952		tsf	TRUE	0.972	128.000	0.748	1.000	Y	NA
10387433	10387434	YPZ3_0952	YPZ3_0953	tsf	pyrH	TRUE	0.617	209.000	0.416	1.000	N	NA
10387434	10387435	YPZ3_0953	YPZ3_0954	pyrH	frr	TRUE	0.862	136.000	0.626	1.000	N	NA
10387435	10387436	YPZ3_0954	YPZ3_0955	frr	dxr	FALSE	0.022	214.000	0.032	1.000	N	NA
10387436	10387437	YPZ3_0955	YPZ3_0956	dxr		FALSE	0.275	290.000	0.025	1.000	Y	NA
10387437	10387438	YPZ3_0956	YPZ3_0957			TRUE	0.984	43.000	0.400	1.000	Y	NA
10387438	10387439	YPZ3_0957	YPZ3_0958			TRUE	0.652	29.000	0.080	1.000	N	NA
10387439	10387440	YPZ3_0958	YPZ3_0959			TRUE	0.969	37.000	0.204	1.000	Y	NA
10387440	10387441	YPZ3_0959	YPZ3_0960		ompH	TRUE	0.905	158.000	0.354	1.000	Y	NA
10387441	10387442	YPZ3_0960	YPZ3_0961	ompH	lpxD	TRUE	0.999	4.000	0.814	1.000	Y	NA
10387442	10387443	YPZ3_0961	YPZ3_0962	lpxD	fabZ	TRUE	0.895	158.000	0.796	1.000	N	NA
10387443	10387444	YPZ3_0962	YPZ3_0963	fabZ	lpxA	TRUE	0.995	4.000	0.850	1.000	N	NA
10387444	10387445	YPZ3_0963	YPZ3_0964	lpxA	lpxB	TRUE	0.994	4.000	0.289	1.000	Y	NA
10387445	10387446	YPZ3_0964	YPZ3_0965	lpxB	rnhB	TRUE	0.970	-3.000	0.186	1.000	N	NA
10387446	10387447	YPZ3_0965	YPZ3_0966	rnhB	dnaE	TRUE	0.775	130.000	0.104	1.000	Y	NA
10387447	10387448	YPZ3_0966	YPZ3_0967	dnaE	accA	TRUE	0.868	13.000	0.122	1.000	N	NA
10387448	10387449	YPZ3_0967	YPZ3_0968	accA		FALSE	0.012	184.000	0.008	1.000	N	NA
10387449	10387450	YPZ3_0968	YPZ3_0969			FALSE	0.287	2.000	0.015	1.000	N	NA
10387450	10387451	YPZ3_0969	YPZ3_0970			FALSE	0.007	237.000	0.005	1.000	N	NA
10387451	10387452	YPZ3_0970	YPZ3_0971			FALSE	0.004	954.000	0.000	1.000		NA
10387452	10387453	YPZ3_0971	YPZ3_0972			TRUE	0.947	-21.000	0.034	1.000		NA
10387453	10387454	YPZ3_0972	YPZ3_0973			TRUE	0.488	85.000	0.027	NA		NA
10387455	10387456	YPZ3_0974	YPZ3_0975	proS		TRUE	0.474	104.000	0.048	NA		NA
10387456	10387457	YPZ3_0975	YPZ3_0976		rcsF	TRUE	0.989	-3.000	0.247	NA		NA
10387457	10387458	YPZ3_0976	YPZ3_0977	rcsF		TRUE	0.898	118.000	0.500	NA		NA
10387458	10387459	YPZ3_0977	YPZ3_0978			TRUE	0.976	64.000	0.411	NA	Y	NA
10387459	10387460	YPZ3_0978	YPZ3_0979		abc	TRUE	0.990	47.000	0.584	1.000	Y	NA
10387461	10387462	YPZ3_0980	YPZ3_r4			FALSE	0.021	469.000	0.000	NA		NA
10387462	10387463	YPZ3_r4	YPZ3_t10			FALSE	0.281	181.000	0.000	NA		NA
10387463	10387464	YPZ3_t10	YPZ3_r5			FALSE	0.149	253.000	0.000	NA		NA
10387464	10387465	YPZ3_r5	YPZ3_r6			FALSE	0.425	110.000	0.000	NA		NA
10387465	10387466	YPZ3_r6	YPZ3_t11			FALSE	0.384	126.000	0.000	NA		NA
10387466	10387467	YPZ3_t11	YPZ3_0981			FALSE	0.046	359.000	0.000	NA		NA
10387467	10387468	YPZ3_0981	YPZ3_0982			TRUE	0.695	53.000	0.000	NA		NA
10387468	10387469	YPZ3_0982	YPZ3_0983			FALSE	0.038	382.000	0.000	NA		NA
10387470	10387471	YPZ3_0984	YPZ3_0985	mltD	gloB	TRUE	0.666	168.000	0.233	1.000		NA
10387474	10387475	YPZ3_0988	YPZ3_t12	dnaQ		FALSE	0.417	113.000	0.000	NA		NA
10387476	10387477	YPZ3_0989	YPZ3_0990			FALSE	0.001	659.000	0.000	1.000	N	NA
10387477	10387478	YPZ3_0990	YPZ3_0991			TRUE	0.982	0.000	0.000	1.000	Y	NA
10387480	10387481	YPZ3_0993	YPZ3_0994			TRUE	0.948	-3.000	0.000	NA		NA
10387481	10387482	YPZ3_0994	YPZ3_0995			FALSE	0.005	932.000	0.000	NA		NA
10387482	10387483	YPZ3_0995	YPZ3_0996			FALSE	0.004	1197.000	0.000	NA		NA
10387483	10387484	YPZ3_0996	YPZ3_0997			TRUE	0.926	51.000	0.250	NA		NA
10387484	10387485	YPZ3_0997	YPZ3_0998			TRUE	0.551	79.000	0.000	NA		NA
10387485	10387486	YPZ3_0998	YPZ3_0999			TRUE	0.653	224.000	0.000	0.079	Y	NA
10387486	10387487	YPZ3_0999	YPZ3_1000		smpB	FALSE	0.001	584.000	0.000	1.000	N	NA
10387489	10387490	YPZ3_1002	YPZ3_1003			FALSE	0.133	114.000	0.049	1.000	N	NA
10387490	10387491	YPZ3_1003	YPZ3_1004		ppnK	TRUE	0.610	87.000	0.170	1.000	N	NA
10387494	10387495	YPZ3_1007	YPZ3_1008	sdhD	sdhA	TRUE	0.999	1.000	0.705	0.002	Y	NA
10387495	10387496	YPZ3_1008	YPZ3_1009	sdhA	sdhB	TRUE	0.996	50.000	0.604	0.002	Y	NA
10387496	10387497	YPZ3_1009	YPZ3_1010	sdhB	sucA	FALSE	0.188	356.000	0.067	1.000	Y	NA
10387497	10387498	YPZ3_1010	YPZ3_1011	sucA	sucB	TRUE	0.994	30.000	0.667	1.000	Y	NA
10387498	10387499	YPZ3_1011	YPZ3_1012	sucB	sucC	TRUE	0.836	113.000	0.136	1.000	Y	NA
10387499	10387500	YPZ3_1012	YPZ3_1013	sucC	sucD	TRUE	1.000	0.000	0.806	0.001	Y	NA
10387500	10387501	YPZ3_1013	YPZ3_1014	sucD	cydA	FALSE	0.022	767.000	0.000	1.000	Y	NA
10387501	10387502	YPZ3_1014	YPZ3_1015	cydA	cydB	TRUE	0.996	15.000	0.348	0.036	Y	NA
10387502	10387503	YPZ3_1015	YPZ3_1016	cydB	tolQ	FALSE	0.001	957.000	0.000	1.000	N	NA
10387503	10387504	YPZ3_1016	YPZ3_1017	tolQ	tolR	TRUE	0.998	13.000	0.556	0.081	Y	NA
10387504	10387505	YPZ3_1017	YPZ3_1018	tolR	tolA	FALSE	0.408	112.000	0.114	NA	N	NA
10387505	10387506	YPZ3_1018	YPZ3_1019	tolA	tolB	FALSE	0.176	120.000	0.051	NA	N	NA
10387506	10387507	YPZ3_1019	YPZ3_1020	tolB	pal	TRUE	0.959	51.000	0.592	1.000	N	NA
10387507	10387508	YPZ3_1020	YPZ3_1021	pal		TRUE	0.928	10.000	0.088	1.000		NA
10387508	10387509	YPZ3_1021	YPZ3_t13			FALSE	0.263	191.000	0.000	NA		NA
10387509	10387510	YPZ3_t13	YPZ3_t14			TRUE	0.795	28.000	0.000	NA		NA
10387510	10387511	YPZ3_t14	YPZ3_r7			TRUE	0.792	29.000	0.000	NA		NA
10387511	10387512	YPZ3_r7	YPZ3_1022		nadA	FALSE	0.043	369.000	0.000	NA		NA
10387512	10387513	YPZ3_1022	YPZ3_1023	nadA	pnuC	TRUE	0.687	122.000	0.023	1.000	Y	NA
10387516	10387517	YPZ3_1026	YPZ3_1027			TRUE	0.982	0.000	0.000	1.000	Y	NA
10387517	10387518	YPZ3_1027	YPZ3_1028		gpmA	FALSE	0.005	366.000	0.000	1.000	N	NA
10387518	10387519	YPZ3_1028	YPZ3_1029	gpmA	psiF	FALSE	0.054	347.000	0.000	NA		NA
10387519	10387520	YPZ3_1029	YPZ3_1030	psiF		FALSE	0.097	293.000	0.000	NA		NA
10387520	10387521	YPZ3_1030	YPZ3_1031		galK	TRUE	0.891	167.000	0.083	0.001	Y	NA
10387521	10387522	YPZ3_1031	YPZ3_1032	galK	galT	TRUE	0.997	-3.000	0.370	0.001	N	NA
10387522	10387523	YPZ3_1032	YPZ3_1033	galT	galE	TRUE	0.966	10.000	0.053	0.001	N	NA
10387523	10387524	YPZ3_1033	YPZ3_1034	galE		FALSE	0.046	360.000	0.000	NA		NA
10387524	10387525	YPZ3_1034	YPZ3_1035		modF	FALSE	0.164	217.000	0.009	NA		NA
10387525	10387526	YPZ3_1035	YPZ3_1036	modF	modE	FALSE	0.366	110.000	0.028	1.000		NA
10387527	10387528	YPZ3_1037	YPZ3_1038	modA	modB	TRUE	0.999	0.000	0.627	0.001	Y	NA
10387528	10387529	YPZ3_1038	YPZ3_1039	modB	modC	TRUE	1.000	-6.000	0.537	0.001	Y	NA
10387533	10387534	YPZ3_1043	YPZ3_1044	bioB	bioF	TRUE	0.997	0.000	0.168	0.003	Y	NA
10387534	10387535	YPZ3_1044	YPZ3_1045	bioF	bioC	TRUE	0.998	-16.000	0.133	0.003	Y	NA
10387535	10387536	YPZ3_1045	YPZ3_1046	bioC	bioD	TRUE	0.996	-7.000	0.054	0.003	Y	NA
10387540	10387541	YPZ3_1050	YPZ3_1051	moaA	moaC	TRUE	0.906	101.000	0.039	0.003	Y	NA
10387541	10387542	YPZ3_1051	YPZ3_1052	moaC		TRUE	0.682	245.000	0.025	0.003	Y	NA
10387542	10387543	YPZ3_1052	YPZ3_1053			FALSE	0.323	144.000	0.025	NA		NA
10387543	10387544	YPZ3_1053	YPZ3_1054			FALSE	0.274	184.000	0.000	NA		NA
10387545	10387546	YPZ3_1055	YPZ3_1056	betA	betB	TRUE	0.981	23.000	0.634	1.000	N	NA
10387546	10387547	YPZ3_1056	YPZ3_1057	betB	betI	TRUE	0.928	58.000	0.459	1.000	N	NA
10387548	10387549	YPZ3_1058	YPZ3_1059			FALSE	0.016	271.000	0.000	1.000	N	NA
10387551	10387552	YPZ3_1061	YPZ3_1062	xapA		TRUE	0.521	139.000	0.111	1.000		NA
10387552	10387553	YPZ3_1062	YPZ3_1063		tnp	TRUE	0.948	-10.000	0.000	1.000		NA
10387553	10387554	YPZ3_1063	YPZ3_1064	tnp		FALSE	0.385	113.000	0.000	1.000		NA
10387556	10387557	YPZ3_1066	YPZ3_1067		hydG	TRUE	0.995	-13.000	0.000	0.013	Y	NA
10387557	10387558	YPZ3_1067	YPZ3_1068	hydG	nemA1	FALSE	0.007	348.000	0.000	1.000	N	NA
10387561	10387562	YPZ3_1071	YPZ3_1072			TRUE	0.995	13.000	0.609	0.007	N	NA
10387562	10387563	YPZ3_1072	YPZ3_1073		ccmA2	TRUE	0.993	5.000	0.547	1.000		NA
10387563	10387564	YPZ3_1073	YPZ3_1074	ccmA2	acrA4	TRUE	0.989	14.000	0.545	1.000		NA
10387564	10387565	YPZ3_1074	YPZ3_1075	acrA4	acrR3	TRUE	0.855	52.000	0.236	1.000	N	NA
10387566	10387567	YPZ3_1076	YPZ3_1077			FALSE	0.003	1581.000	0.000	NA		NA
10387567	10387568	YPZ3_1077	YPZ3_1078			FALSE	0.010	607.000	0.000	NA		NA
10387568	10387569	YPZ3_1078	YPZ3_1079			TRUE	0.755	92.000	0.000	0.031		NA
10387569	10387570	YPZ3_1079	YPZ3_1080		rhlE	TRUE	0.914	2.000	0.000	1.000		NA
10387570	10387571	YPZ3_1080	YPZ3_1081	rhlE		TRUE	0.639	160.000	0.000	1.000	Y	NA
10387571	10387572	YPZ3_1081	YPZ3_1082			FALSE	0.029	415.000	0.000	NA		NA
10387572	10387573	YPZ3_1082	YPZ3_1083			FALSE	0.096	294.000	0.000	NA		NA
10387573	10387574	YPZ3_1083	YPZ3_1084		pbpG	FALSE	0.001	592.000	0.000	1.000	N	NA
10387578	10387579	YPZ3_1088	YPZ3_1089			FALSE	0.009	641.000	0.000	NA		NA
10387579	10387580	YPZ3_1089	YPZ3_1090			TRUE	0.997	37.000	0.589	0.002	Y	NA
10387580	10387581	YPZ3_1090	YPZ3_1091			TRUE	0.989	103.000	0.568	0.001	Y	NA
10387581	10387582	YPZ3_1091	YPZ3_1092			TRUE	0.999	3.000	0.491	0.001	Y	NA
10387582	10387583	YPZ3_1092	YPZ3_1093			FALSE	0.160	246.000	0.000	NA		NA
10387583	10387584	YPZ3_1093	YPZ3_1094			FALSE	0.025	435.000	0.000	NA		NA
10387584	10387585	YPZ3_1094	YPZ3_1095			TRUE	0.966	124.000	0.654	1.000	Y	NA
10387585	10387586	YPZ3_1095	YPZ3_1096			TRUE	0.999	0.000	0.758	0.063	Y	NA
10387586	10387587	YPZ3_1096	YPZ3_1097			TRUE	0.998	-3.000	0.823	1.000		NA
10387587	10387588	YPZ3_1097	YPZ3_1098		livF	TRUE	0.995	31.000	0.731	0.024		NA
10387588	10387589	YPZ3_1098	YPZ3_1099	livF		FALSE	0.413	115.000	0.000	NA		NA
10387589	10387590	YPZ3_1099	YPZ3_1100			TRUE	0.819	24.000	0.000	NA		NA
10387592	10387593	YPZ3_1102	YPZ3_1103	yehZ1		TRUE	0.652	145.000	0.028	0.012		NA
10387593	10387594	YPZ3_1103	YPZ3_1104			TRUE	0.668	261.000	0.521	1.000		NA
10387594	10387595	YPZ3_1104	YPZ3_1105			TRUE	0.998	-3.000	0.489	1.000	Y	NA
10387595	10387596	YPZ3_1105	YPZ3_1106			TRUE	0.998	-3.000	0.542	1.000	Y	NA
10387596	10387597	YPZ3_1106	YPZ3_1107			FALSE	0.051	541.000	0.000	1.000	Y	NA
10387597	10387598	YPZ3_1107	YPZ3_1108			TRUE	0.956	70.000	0.286	1.000	Y	NA
10387599	10387600	YPZ3_1109	YPZ3_1110		ompC2	FALSE	0.030	412.000	0.000	NA		NA
10387606	10387607	YPZ3_1116	YPZ3_1117	eco	nrdB	FALSE	0.093	296.000	0.000	NA		NA
10387607	10387608	YPZ3_1117	YPZ3_1118	nrdB	nrdA	TRUE	0.993	163.000	1.000	0.001	Y	NA
10387608	10387609	YPZ3_1118	YPZ3_1119	nrdA	ubiG	FALSE	0.002	494.000	0.000	1.000	N	NA
10387610	10387611	YPZ3_1120	YPZ3_1121	gyrA		FALSE	0.004	281.000	0.013	1.000	N	NA
10387612	10387613	YPZ3_1122	YPZ3_1123	rcsB		TRUE	0.994	3.000	0.558	1.000		NA
10387613	10387614	YPZ3_1123	YPZ3_1124			TRUE	0.751	168.000	0.070	0.001		NA
10387614	10387615	YPZ3_1124	YPZ3_1125			FALSE	0.379	99.000	0.093	NA	N	NA
10387616	10387617	YPZ3_1126	YPZ3_1127	ompC		FALSE	0.059	151.000	0.000	1.000	N	NA
10387617	10387618	YPZ3_1127	YPZ3_t15			FALSE	0.026	434.000	0.000	NA		NA
10387618	10387619	YPZ3_t15	YPZ3_t16			TRUE	0.904	6.000	0.000	NA		NA
10387620	10387621	YPZ3_1128	YPZ3_1129			FALSE	0.023	287.000	0.000	NA	N	NA
10387623	10387624	YPZ3_1131	YPZ3_1132	tsr2	pla2	FALSE	0.003	422.000	0.000	1.000	N	NA
10387624	10387625	YPZ3_1132	YPZ3_1133	pla2		FALSE	0.001	620.000	0.000	1.000	N	NA
10387626	10387627	YPZ3_1134	YPZ3_1135			FALSE	0.220	211.000	0.000	NA		NA
10387627	10387628	YPZ3_1135	YPZ3_1136			TRUE	0.952	-3.000	0.044	NA		NA
10387628	10387629	YPZ3_1136	YPZ3_1137			TRUE	0.782	83.000	0.015	1.000	Y	NA
10387629	10387630	YPZ3_1137	YPZ3_1138			TRUE	0.998	-24.000	0.400	1.000	Y	NA
10387630	10387631	YPZ3_1138	YPZ3_1139			FALSE	0.005	967.000	0.000	NA		NA
10387631	10387632	YPZ3_1139	YPZ3_1140			FALSE	0.249	196.000	0.000	NA		NA
10387632	10387633	YPZ3_1140	YPZ3_1141			TRUE	0.995	22.000	1.000	NA		NA
10387633	10387634	YPZ3_1141	YPZ3_1142			FALSE	0.027	422.000	0.000	NA		NA
10387634	10387635	YPZ3_1142	YPZ3_1143			FALSE	0.182	267.000	0.074	NA		NA
10387635	10387636	YPZ3_1143	YPZ3_1144			TRUE	0.966	-3.000	0.074	NA		NA
10387636	10387637	YPZ3_1144	YPZ3_1145			TRUE	0.996	16.000	1.000	NA		NA
10387637	10387638	YPZ3_1145	YPZ3_1146			TRUE	0.999	-3.000	1.000	NA		NA
10387638	10387639	YPZ3_1146	YPZ3_1147			TRUE	0.998	4.000	1.000	NA		NA
10387639	10387640	YPZ3_1147	YPZ3_1148			TRUE	0.687	254.000	0.500	NA		NA
10387640	10387641	YPZ3_1148	YPZ3_1149		stf	TRUE	0.463	97.000	0.000	NA		NA
10387641	10387642	YPZ3_1149	YPZ3_1150	stf		FALSE	0.090	298.000	0.000	NA		NA
10387642	10387643	YPZ3_1150	YPZ3_1151		bglA	FALSE	0.161	291.000	0.000	0.021	N	NA
10387644	10387645	YPZ3_1152	YPZ3_1153			FALSE	0.007	700.000	0.000	NA		NA
10387645	10387646	YPZ3_1153	YPZ3_1154			TRUE	0.875	13.000	0.000	NA		NA
10387646	10387647	YPZ3_1154	YPZ3_1155			FALSE	0.048	357.000	0.000	NA		NA
10387647	10387648	YPZ3_1155	YPZ3_t17			TRUE	0.708	50.000	0.000	NA		NA
10387648	10387649	YPZ3_t17	YPZ3_1156			FALSE	0.436	105.000	0.000	NA		NA
10387650	10387651	YPZ3_1157	YPZ3_1158			FALSE	0.345	150.000	0.000	NA		NA
10387653	10387654	YPZ3_1160	YPZ3_1161	rsuA	bcr	TRUE	0.451	119.000	0.145	1.000	N	NA
10387654	10387655	YPZ3_1161	YPZ3_1162	bcr		FALSE	0.005	967.000	0.000	NA		NA
10387656	10387657	YPZ3_1163	YPZ3_1164			TRUE	0.997	2.000	0.758	1.000		NA
10387657	10387658	YPZ3_1164	YPZ3_1165			TRUE	0.999	0.000	0.833	0.062		NA
10387658	10387659	YPZ3_1165	YPZ3_1166			TRUE	0.998	10.000	0.848	0.062		NA
10387659	10387660	YPZ3_1166	YPZ3_1167		rtn1	TRUE	0.864	82.000	0.394	NA	N	NA
10387660	10387661	YPZ3_1167	YPZ3_1168	rtn1	spr	FALSE	0.018	696.000	0.219	NA	N	NA
10387661	10387662	YPZ3_1168	YPZ3_1169	spr		FALSE	0.024	442.000	0.000	NA		NA
10387662	10387663	YPZ3_1169	YPZ3_1170			TRUE	0.918	59.000	0.275	NA		NA
10387667	10387668	YPZ3_1174	YPZ3_1175	efp2	mtr	TRUE	0.695	62.000	0.153	1.000	N	NA
10387668	10387669	YPZ3_1175	YPZ3_1176	mtr		FALSE	0.001	698.000	0.000	1.000	N	NA
10387669	10387670	YPZ3_1176	YPZ3_1177			TRUE	0.478	11.000	0.000	1.000	N	NA
10387670	10387671	YPZ3_1177	YPZ3_1178			TRUE	0.953	12.000	0.017	0.048		NA
10387672	10387673	YPZ3_1179	YPZ3_1180			TRUE	0.788	4.000	0.065	1.000	N	NA
10387673	10387674	YPZ3_1180	YPZ3_1181		rpiA	TRUE	0.949	20.000	0.000	1.000	Y	NA
10387674	10387675	YPZ3_1181	YPZ3_1182	rpiA		TRUE	0.717	124.000	0.000	NA	Y	NA
10387675	10387676	YPZ3_1182	YPZ3_1183			TRUE	0.941	109.000	0.375	NA	Y	NA
10387676	10387677	YPZ3_1183	YPZ3_1184			TRUE	0.985	36.000	0.375	1.000	Y	NA
10387679	10387680	YPZ3_1186	YPZ3_1187	fruB	fruK	TRUE	0.991	-3.000	0.112	1.000	Y	NA
10387680	10387681	YPZ3_1187	YPZ3_1188	fruK	fruA	TRUE	0.996	15.000	0.562	1.000	Y	NA
10387681	10387682	YPZ3_1188	YPZ3_1189	fruA	psaE	FALSE	0.009	325.000	0.000	1.000	N	NA
10387682	10387683	YPZ3_1189	YPZ3_1190	psaE		TRUE	0.993	36.000	1.000	NA		NA
10387683	10387684	YPZ3_1190	YPZ3_1191		psaA	FALSE	0.014	545.000	0.000	NA		NA
10387684	10387685	YPZ3_1191	YPZ3_1192	psaA	psaB	TRUE	0.853	127.000	0.400	NA		NA
10387685	10387686	YPZ3_1192	YPZ3_1193	psaB		TRUE	0.800	84.000	0.000	1.000	Y	NA
10387687	10387688	YPZ3_1194	YPZ3_1195	nfo		FALSE	0.328	164.000	0.040	NA		NA
10387689	10387690	YPZ3_1196	YPZ3_1197		lysP	FALSE	0.268	258.000	0.222	1.000	N	NA
10387690	10387691	YPZ3_1197	YPZ3_1198	lysP		FALSE	0.014	286.000	0.000	1.000	N	NA
10387691	10387692	YPZ3_1198	YPZ3_1199			TRUE	0.699	216.000	0.175	1.000	Y	NA
10387692	10387693	YPZ3_1199	YPZ3_1200			TRUE	0.999	-3.000	0.833	1.000	Y	NA
10387693	10387694	YPZ3_1200	YPZ3_1201			FALSE	0.365	260.000	0.000	1.000	Y	NA
10387695	10387696	YPZ3_1202	YPZ3_1203			FALSE	0.126	154.000	0.056	1.000	N	NA
10387697	10387698	YPZ3_1204	YPZ3_1205			FALSE	0.437	228.000	0.174	NA		NA
10387698	10387699	YPZ3_1205	YPZ3_1206			TRUE	0.997	-3.000	0.323	NA	Y	NA
10387699	10387700	YPZ3_1206	YPZ3_1207			TRUE	0.990	-3.000	0.096	1.000	Y	NA
10387700	10387701	YPZ3_1207	YPZ3_1208			FALSE	0.008	338.000	0.000	1.000	N	NA
10387702	10387703	YPZ3_1209	YPZ3_1210		deoR	FALSE	0.000	1181.000	0.000	1.000	N	NA
10387703	10387704	YPZ3_1210	YPZ3_1211	deoR		FALSE	0.016	230.000	0.030	1.000	N	NA
10387704	10387705	YPZ3_1211	YPZ3_1212			FALSE	0.123	258.000	0.000	1.000		NA
10387705	10387706	YPZ3_1212	YPZ3_1213			TRUE	0.641	91.000	0.106	1.000		NA
10387706	10387707	YPZ3_1213	YPZ3_1214			FALSE	0.017	477.000	0.000	1.000		NA
10387708	10387709	YPZ3_1215	YPZ3_1216		potF	FALSE	0.016	518.000	0.000	NA		NA
10387709	10387710	YPZ3_1216	YPZ3_1217	potF	potG	TRUE	0.954	171.000	0.679	1.000	Y	NA
10387710	10387711	YPZ3_1217	YPZ3_1218	potG	potH	TRUE	0.997	25.000	0.857	1.000	Y	NA
10387711	10387712	YPZ3_1218	YPZ3_1219	potH	potI	TRUE	0.999	-3.000	0.528	0.062	Y	NA
10387712	10387713	YPZ3_1219	YPZ3_1220	potI		TRUE	0.781	125.000	0.264	NA		NA
10387713	10387714	YPZ3_1220	YPZ3_1221			TRUE	0.712	84.000	0.119	NA		NA
10387716	10387717	YPZ3_1223	YPZ3_1224			FALSE	0.006	412.000	0.000	NA	N	NA
10387717	10387718	YPZ3_1224	YPZ3_1225			FALSE	0.162	233.000	0.000	1.000		NA
10387718	10387719	YPZ3_1225	YPZ3_1226		btuC1	TRUE	0.984	-39.000	0.000	0.062		NA
10387719	10387720	YPZ3_1226	YPZ3_1227	btuC1		TRUE	0.942	-3.000	0.000	1.000		NA
10387720	10387721	YPZ3_1227	YPZ3_1228			TRUE	0.948	-12.000	0.000	1.000		NA
10387721	10387722	YPZ3_1228	YPZ3_1229			TRUE	0.993	-7.000	0.312	NA		NA
10387722	10387723	YPZ3_1229	YPZ3_1230			TRUE	0.978	-3.000	0.125	NA		NA
10387724	10387725	YPZ3_1231	YPZ3_1232	artM	artQ	TRUE	0.999	0.000	0.714	0.019	Y	NA
10387725	10387726	YPZ3_1232	YPZ3_1233	artQ	artI	TRUE	0.995	12.000	0.260	0.079	Y	NA
10387726	10387727	YPZ3_1233	YPZ3_1234	artI	artP	TRUE	0.988	21.000	0.323	1.000	Y	NA
10387727	10387728	YPZ3_1234	YPZ3_1235	artP		FALSE	0.417	244.000	0.000	1.000	Y	NA
10387728	10387729	YPZ3_1235	YPZ3_1236			FALSE	0.261	170.000	0.018	NA		NA
10387729	10387730	YPZ3_1236	YPZ3_1237			TRUE	0.730	97.000	0.167	NA		NA
10387730	10387731	YPZ3_1237	YPZ3_1238			TRUE	0.888	100.000	0.022	0.009	Y	NA
10387731	10387732	YPZ3_1238	YPZ3_1239		ltaA	TRUE	0.892	-3.000	0.074	1.000	N	NA
10387732	10387733	YPZ3_1239	YPZ3_1240	ltaA	poxB	FALSE	0.163	349.000	0.031	1.000	Y	NA
10387733	10387734	YPZ3_1240	YPZ3_1241	poxB	hcr	FALSE	0.018	144.000	0.017	1.000	N	NA
10387734	10387735	YPZ3_1241	YPZ3_1242	hcr	hcp	TRUE	0.905	114.000	0.085	0.011	Y	NA
10387735	10387736	YPZ3_1242	YPZ3_1243	hcp		FALSE	0.221	202.000	0.028	NA		NA
10387739	10387740	YPZ3_1246	YPZ3_1247	acrA5		TRUE	0.996	0.000	0.789	1.000	N	NA
10387740	10387741	YPZ3_1247	YPZ3_1248		clpS	FALSE	0.005	905.000	0.000	NA		NA
10387741	10387742	YPZ3_1248	YPZ3_1249	clpS	clpA	TRUE	0.986	26.000	0.596	NA		NA
10387742	10387743	YPZ3_1249	YPZ3_1250	clpA		FALSE	0.024	242.000	0.000	1.000	N	NA
10387744	10387745	YPZ3_1251	YPZ3_1252		cydC	TRUE	0.509	219.000	0.049	1.000	Y	NA
10387745	10387746	YPZ3_1252	YPZ3_1253	cydC		TRUE	0.999	3.000	0.631	0.007	Y	NA
10387746	10387747	YPZ3_1253	YPZ3_1254		trxB	FALSE	0.068	483.000	0.049	1.000	Y	NA
10387748	10387749	YPZ3_1255	YPZ3_1256	lrp	ftsK	TRUE	0.745	123.000	0.345	1.000	N	NA
10387749	10387750	YPZ3_1256	YPZ3_1257	ftsK	lolA	TRUE	0.557	193.000	0.305	1.000	N	NA
10387750	10387751	YPZ3_1257	YPZ3_1258	lolA	rarA	TRUE	0.882	20.000	0.167	1.000	N	NA
10387751	10387752	YPZ3_1258	YPZ3_1259	rarA	serS	FALSE	0.090	242.000	0.078	1.000	N	NA
10387752	10387753	YPZ3_1259	YPZ3_1260	serS		FALSE	0.032	255.000	0.000	NA	N	NA
10387756	10387757	YPZ3_1263	YPZ3_1264	pflB	focA	TRUE	0.760	56.000	0.172	1.000	N	NA
10387757	10387758	YPZ3_1264	YPZ3_1265	focA		FALSE	0.007	697.000	0.000	NA		NA
10387759	10387760	YPZ3_1266	YPZ3_1267	ansB		FALSE	0.109	269.000	0.000	1.000		NA
10387760	10387761	YPZ3_1267	YPZ3_1268			TRUE	0.832	21.000	0.000	NA		NA
10387761	10387762	YPZ3_1268	YPZ3_1269			FALSE	0.032	403.000	0.000	NA		NA
10387762	10387763	YPZ3_1269	YPZ3_1270		aroA	TRUE	0.625	163.000	0.033	1.000	Y	NA
10387763	10387764	YPZ3_1270	YPZ3_1271	aroA	cmk	FALSE	0.143	313.000	0.209	1.000	N	NA
10387764	10387765	YPZ3_1271	YPZ3_1272	cmk	rpsA	TRUE	0.571	174.000	0.281	1.000	N	NA
10387765	10387766	YPZ3_1272	YPZ3_1273	rpsA		FALSE	0.004	892.000	0.000	1.000		NA
10387766	10387767	YPZ3_1273	YPZ3_1274		msbA	TRUE	0.922	36.000	0.075	0.072		NA
10387767	10387768	YPZ3_1274	YPZ3_1275	msbA	lpxK	TRUE	0.973	-3.000	0.205	1.000	N	NA
10387770	10387771	YPZ3_1277	YPZ3_1278	kdsB		FALSE	0.039	363.000	0.023	NA		NA
10387771	10387772	YPZ3_1278	YPZ3_1279		smtA	FALSE	0.006	773.000	0.000	NA		NA
10387772	10387773	YPZ3_1279	YPZ3_1280	smtA	mukF	TRUE	0.988	-3.000	0.325	NA	N	NA
10387773	10387774	YPZ3_1280	YPZ3_1281	mukF		TRUE	0.995	-19.000	0.196	NA	Y	NA
10387774	10387775	YPZ3_1281	YPZ3_1282		mukB	TRUE	1.000	-3.000	0.786	0.002	Y	NA
10387775	10387776	YPZ3_1282	YPZ3_1283	mukB		FALSE	0.376	165.000	0.000	0.078	N	NA
10387776	10387777	YPZ3_1283	YPZ3_1284			FALSE	0.023	431.000	0.000	1.000		NA
10387777	10387778	YPZ3_1284	YPZ3_1285			TRUE	0.675	224.000	0.372	NA		NA
10387778	10387779	YPZ3_1285	YPZ3_1286			TRUE	0.764	61.000	0.089	NA		NA
10387780	10387781	YPZ3_1287	YPZ3_1288	aspC		FALSE	0.019	257.000	0.000	1.000	N	NA
10387781	10387782	YPZ3_1288	YPZ3_1289		asnS	FALSE	0.012	298.000	0.000	1.000	N	NA
10387782	10387783	YPZ3_1289	YPZ3_1290	asnS	pncB	FALSE	0.002	499.000	0.034	1.000	N	NA
10387784	10387785	YPZ3_1291	YPZ3_1292	pepN	pyrD	FALSE	0.000	654.000	0.014	1.000	N	NA
10387785	10387786	YPZ3_1292	YPZ3_1293	pyrD		FALSE	0.386	183.000	0.081	NA		NA
10387788	10387789	YPZ3_1295	YPZ3_1296		uup	TRUE	0.918	6.000	0.061	1.000		NA
10387789	10387790	YPZ3_1296	YPZ3_1297	uup	pqiA	FALSE	0.429	129.000	0.054	NA		NA
10387790	10387791	YPZ3_1297	YPZ3_1298	pqiA	pqiB	TRUE	0.998	-13.000	0.819	NA		NA
10387791	10387792	YPZ3_1298	YPZ3_1299	pqiB		TRUE	0.996	-3.000	0.531	NA		NA
10387792	10387793	YPZ3_1299	YPZ3_1300			FALSE	0.012	584.000	0.000	NA		NA
10387794	10387795	YPZ3_1301	YPZ3_1302	fabF		FALSE	0.417	16.000	0.000	1.000	N	NA
10387795	10387796	YPZ3_1302	YPZ3_1303			TRUE	0.982	0.000	0.000	1.000	Y	NA
10387796	10387797	YPZ3_1303	YPZ3_1304			TRUE	0.854	14.000	0.000	1.000		NA
10387797	10387798	YPZ3_1304	YPZ3_1305		fabA	FALSE	0.006	700.000	0.000	1.000		NA
10387798	10387799	YPZ3_1305	YPZ3_1306	fabA		TRUE	0.836	69.000	0.290	1.000	N	NA
10387801	10387802	YPZ3_1308	YPZ3_1309		ompA	FALSE	0.062	139.000	0.000	1.000	N	NA
10387802	10387803	YPZ3_1309	YPZ3_1310	ompA	sulA	FALSE	0.006	358.000	0.000	1.000	N	NA
10387805	10387806	YPZ3_1312	YPZ3_1313			TRUE	0.869	30.000	0.090	NA		NA
10387808	10387809	YPZ3_1315	YPZ3_1316	mgsA		FALSE	0.335	179.000	0.055	NA		NA
10387811	10387812	YPZ3_1318	YPZ3_1319			TRUE	0.771	61.000	0.094	NA		NA
10387812	10387813	YPZ3_1319	YPZ3_1320			FALSE	0.024	424.000	0.000	1.000		NA
10387814	10387815	YPZ3_t18	YPZ3_1321			FALSE	0.004	1077.000	0.000	NA		NA
10387815	10387816	YPZ3_1321	YPZ3_1322			FALSE	0.086	300.000	0.000	NA		NA
10387817	10387818	YPZ3_1323	YPZ3_1324			TRUE	0.472	154.000	0.000	0.020	N	NA
10387819	10387820	YPZ3_1325	YPZ3_1326	fabZ		TRUE	0.991	-10.000	0.083	NA	Y	NA
10387820	10387821	YPZ3_1326	YPZ3_1327			TRUE	0.981	2.000	0.056	1.000	Y	NA
10387821	10387822	YPZ3_1327	YPZ3_1328			TRUE	0.991	16.000	0.333	1.000	Y	NA
10387822	10387823	YPZ3_1328	YPZ3_1329			TRUE	0.992	-7.000	0.120	1.000	Y	NA
10387823	10387824	YPZ3_1329	YPZ3_1330			TRUE	0.995	2.000	0.120	0.020	Y	NA
10387824	10387825	YPZ3_1330	YPZ3_1331			TRUE	0.991	3.000	0.051	0.047	Y	NA
10387825	10387826	YPZ3_1331	YPZ3_1332			FALSE	0.253	195.000	0.000	NA		NA
10387826	10387827	YPZ3_1332	YPZ3_1333			FALSE	0.036	385.000	0.000	NA		NA
10387827	10387828	YPZ3_1333	YPZ3_1334			FALSE	0.005	989.000	0.000	NA		NA
10387828	10387829	YPZ3_1334	YPZ3_1335			TRUE	0.714	49.000	0.000	NA		NA
10387829	10387830	YPZ3_1335	YPZ3_1336			FALSE	0.409	117.000	0.000	NA		NA
10387830	10387831	YPZ3_1336	YPZ3_1337			TRUE	0.998	-3.000	0.750	NA		NA
10387831	10387832	YPZ3_1337	YPZ3_1338			TRUE	0.936	0.000	0.000	NA		NA
10387832	10387833	YPZ3_1338	YPZ3_1339			TRUE	0.911	4.000	0.000	NA		NA
10387833	10387834	YPZ3_1339	YPZ3_1340		clpB3	FALSE	0.046	418.000	0.083	NA		NA
10387834	10387835	YPZ3_1340	YPZ3_1341	clpB3		TRUE	0.978	-3.000	0.125	NA		NA
10387835	10387836	YPZ3_1341	YPZ3_1342			TRUE	0.864	15.000	0.000	NA		NA
10387836	10387837	YPZ3_1342	YPZ3_1343			FALSE	0.003	2093.000	0.000	NA		NA
10387837	10387838	YPZ3_1343	YPZ3_1344			TRUE	0.857	16.000	0.000	NA		NA
10387838	10387839	YPZ3_1344	YPZ3_1345			TRUE	0.948	-3.000	0.000	NA		NA
10387839	10387840	YPZ3_1345	YPZ3_1346			FALSE	0.026	430.000	0.000	NA		NA
10387842	10387843	YPZ3_1348	YPZ3_1349			TRUE	0.997	-3.000	0.625	NA		NA
10387843	10387844	YPZ3_1349	YPZ3_1350			TRUE	0.864	44.000	0.120	NA		NA
10387844	10387845	YPZ3_1350	YPZ3_1351			TRUE	0.850	18.000	0.040	NA		NA
10387845	10387846	YPZ3_1351	YPZ3_1352			TRUE	0.975	15.000	0.286	NA		NA
10387846	10387847	YPZ3_1352	YPZ3_1353			FALSE	0.201	221.000	0.000	NA		NA
10387847	10387848	YPZ3_1353	YPZ3_1354			TRUE	0.998	-36.000	0.750	NA		NA
10387848	10387849	YPZ3_1354	YPZ3_1355			TRUE	0.998	-25.000	0.750	NA		NA
10387849	10387850	YPZ3_1355	YPZ3_1356			TRUE	0.936	0.000	0.000	NA		NA
10387850	10387851	YPZ3_1356	YPZ3_1357			TRUE	0.813	25.000	0.000	NA		NA
10387853	10387854	YPZ3_1359	YPZ3_1360			FALSE	0.189	228.000	0.000	NA		NA
10387855	10387856	YPZ3_1361	YPZ3_1362			FALSE	0.064	136.000	0.000	1.000	N	NA
10387856	10387857	YPZ3_1362	YPZ3_1363		moeA	TRUE	0.998	2.000	0.323	0.003	Y	NA
10387857	10387858	YPZ3_1363	YPZ3_1364	moeA		FALSE	0.013	535.000	0.000	1.000		NA
10387858	10387859	YPZ3_1364	YPZ3_1365			TRUE	0.931	10.000	0.094	1.000		NA
10387859	10387860	YPZ3_1365	YPZ3_1366			TRUE	0.884	2.000	0.094	1.000	N	NA
10387860	10387861	YPZ3_1366	YPZ3_1367			TRUE	0.994	2.000	0.500	NA		NA
10387861	10387862	YPZ3_1367	YPZ3_1368			FALSE	0.011	595.000	0.000	NA		NA
10387862	10387863	YPZ3_1368	YPZ3_1369		adhC	TRUE	0.964	21.000	0.273	1.000		NA
10387863	10387864	YPZ3_1369	YPZ3_1370	adhC		TRUE	0.603	274.000	0.636	1.000	N	NA
10387865	10387866	YPZ3_1371	YPZ3_1372		folE	TRUE	0.665	184.000	0.250	NA		NA
10387866	10387867	YPZ3_1372	YPZ3_1373	folE		TRUE	0.981	55.000	0.719	NA		NA
10387867	10387868	YPZ3_1373	YPZ3_1374			FALSE	0.006	748.000	0.000	NA		NA
10387868	10387869	YPZ3_1374	YPZ3_1375		mglA	TRUE	0.755	230.000	0.250	NA	Y	NA
10387869	10387870	YPZ3_1375	YPZ3_1376	mglA	mglC	TRUE	0.998	21.000	0.905	1.000	Y	NA
10387871	10387872	YPZ3_1377	YPZ3_1378		sfcA	FALSE	0.121	281.000	0.045	NA		NA
10387872	10387873	YPZ3_1378	YPZ3_1379	sfcA	cdd	FALSE	0.002	356.000	0.022	1.000	N	NA
10387873	10387874	YPZ3_1379	YPZ3_1380	cdd		FALSE	0.129	326.000	0.198	NA	N	NA
10387874	10387875	YPZ3_1380	YPZ3_1381			TRUE	0.993	-3.000	0.340	NA		NA
10387875	10387876	YPZ3_1381	YPZ3_1382			FALSE	0.144	242.000	0.021	NA		NA
10387876	10387877	YPZ3_1382	YPZ3_1383			FALSE	0.062	333.000	0.000	NA		NA
10387877	10387878	YPZ3_1383	YPZ3_1384			TRUE	0.949	18.000	0.177	NA		NA
10387879	10387880	YPZ3_1385	YPZ3_1386			FALSE	0.311	167.000	0.000	NA		NA
10387882	10387883	YPZ3_1388	YPZ3_1389		udk	FALSE	0.079	245.000	0.073	1.000	N	NA
10387883	10387884	YPZ3_1389	YPZ3_1390	udk	dcd	TRUE	0.812	105.000	0.098	1.000	Y	NA
10387884	10387885	YPZ3_1390	YPZ3_1391	dcd		FALSE	0.104	205.000	0.057	NA	N	NA
10387887	10387888	YPZ3_1393	YPZ3_1394			FALSE	0.341	152.000	0.000	NA		NA
10387888	10387889	YPZ3_1394	YPZ3_1395		alcA	TRUE	0.975	35.000	0.667	1.000	N	NA
10387889	10387890	YPZ3_1395	YPZ3_1396	alcA		TRUE	0.744	0.000	0.000	NA	N	NA
10387890	10387891	YPZ3_1396	YPZ3_1397			TRUE	0.786	-3.000	0.000	NA	N	NA
10387892	10387893	YPZ3_1398	YPZ3_1399	fepC		TRUE	0.993	27.000	0.583	1.000	Y	NA
10387893	10387894	YPZ3_1399	YPZ3_1400			TRUE	1.000	-13.000	0.818	0.061	Y	NA
10387894	10387895	YPZ3_1400	YPZ3_1401			TRUE	0.998	-3.000	0.455	1.000	Y	NA
10387895	10387896	YPZ3_1401	YPZ3_1402		ysuR	TRUE	0.950	90.000	0.364	1.000	Y	NA
10387896	10387897	YPZ3_1402	YPZ3_1403	ysuR		TRUE	0.841	213.000	0.455	0.003	N	NA
10387898	10387899	YPZ3_1404	YPZ3_1405	galU	galF	TRUE	0.959	84.000	0.111	0.001	Y	NA
10387899	10387900	YPZ3_1405	YPZ3_1406	galF	gnd	FALSE	0.004	386.000	0.000	1.000	N	NA
10387901	10387902	YPZ3_1407	YPZ3_1408	hisI	hisF	TRUE	0.999	-6.000	0.430	0.003	Y	NA
10387902	10387903	YPZ3_1408	YPZ3_1409	hisF	hisA	TRUE	0.999	-18.000	0.433	0.003	Y	NA
10387903	10387904	YPZ3_1409	YPZ3_1410	hisA	hisH	TRUE	0.996	6.000	0.210	0.003	Y	NA
10387904	10387905	YPZ3_1410	YPZ3_1411	hisH	hisB	TRUE	0.997	0.000	0.128	0.003	Y	NA
10387905	10387906	YPZ3_1411	YPZ3_1412	hisB	hisC	TRUE	0.999	-3.000	0.341	0.003	Y	NA
10387906	10387907	YPZ3_1412	YPZ3_1413	hisC	hisD	TRUE	0.998	3.000	0.294	0.003	Y	NA
10387907	10387908	YPZ3_1413	YPZ3_1414	hisD	hisG	TRUE	0.996	4.000	0.171	0.003	Y	NA
10387910	10387911	YPZ3_1416	YPZ3_1417			FALSE	0.123	269.000	0.000	NA		NA
10387911	10387912	YPZ3_1417	YPZ3_1418			TRUE	0.999	-3.000	0.952	1.000		NA
10387912	10387913	YPZ3_1418	YPZ3_1419			TRUE	0.989	-42.000	0.000	0.006		NA
10387914	10387915	YPZ3_1420	YPZ3_1421			FALSE	0.003	460.000	0.000	1.000	N	NA
10387917	10387918	YPZ3_1423	YPZ3_1424			FALSE	0.026	434.000	0.000	NA		NA
10387918	10387919	YPZ3_1424	YPZ3_1425			FALSE	0.042	371.000	0.000	NA		NA
10387923	10387924	YPZ3_1429	YPZ3_1430			TRUE	0.990	48.000	0.333	0.046	Y	NA
10387924	10387925	YPZ3_1430	YPZ3_1431			TRUE	0.969	32.000	0.290	0.019	N	NA
10387925	10387926	YPZ3_1431	YPZ3_1432		lldD	FALSE	0.012	297.000	0.000	1.000	N	NA
10387929	10387930	YPZ3_1435	YPZ3_1436			TRUE	0.781	36.000	0.136	1.000	N	NA
10387931	10387932	YPZ3_1437	YPZ3_1438			TRUE	0.495	90.000	0.000	NA		NA
10387933	10387934	YPZ3_t19	YPZ3_1439			FALSE	0.023	446.000	0.000	NA		NA
10387934	10387935	YPZ3_1439	YPZ3_1440			FALSE	0.019	258.000	0.000	1.000	N	NA
10387935	10387936	YPZ3_1440	YPZ3_1441			TRUE	0.998	20.000	0.905	NA	Y	NA
10387936	10387937	YPZ3_1441	YPZ3_1442			TRUE	0.983	124.000	0.947	NA	Y	NA
10387939	10387940	YPZ3_1444	YPZ3_1445			TRUE	0.526	78.000	0.000	1.000		NA
10387944	10387945	YPZ3_1449	YPZ3_1450		yfeD	FALSE	0.015	305.000	0.033	NA	N	NA
10387945	10387946	YPZ3_1450	YPZ3_1451	yfeD	yfeC	TRUE	0.999	-3.000	0.525	0.007	Y	NA
10387946	10387947	YPZ3_1451	YPZ3_1452	yfeC	yfeB	TRUE	0.999	0.000	0.857	1.000	Y	NA
10387947	10387948	YPZ3_1452	YPZ3_1453	yfeB		TRUE	0.999	-3.000	0.894	1.000	Y	NA
10387951	10387952	YPZ3_1456	YPZ3_1457	thrS	infC	TRUE	0.733	205.000	0.186	1.000	Y	NA
10387952	10387953	YPZ3_1457	YPZ3_1458	infC	rplT	FALSE	0.195	332.000	0.000	1.000	Y	NA
10387953	10387954	YPZ3_1458	YPZ3_1459	rplT	pheS	FALSE	0.147	499.000	0.202	1.000	Y	NA
10387954	10387955	YPZ3_1459	YPZ3_1460	pheS	pheT	TRUE	0.999	14.000	0.574	0.001	Y	NA
10387955	10387956	YPZ3_1460	YPZ3_1461	pheT		FALSE	0.009	635.000	0.000	NA		NA
10387956	10387957	YPZ3_1461	YPZ3_1462		btuC2	FALSE	0.317	173.000	0.044	NA		NA
10387957	10387958	YPZ3_1462	YPZ3_1463	btuC2	btuE	TRUE	0.442	70.000	0.084	1.000	N	NA
10387958	10387959	YPZ3_1463	YPZ3_1464	btuE		FALSE	0.341	25.000	0.036	1.000	N	NA
10387959	10387960	YPZ3_1464	YPZ3_1465			FALSE	0.054	350.000	0.129	1.000	N	NA
10387960	10387961	YPZ3_1465	YPZ3_1466		pmrF	TRUE	0.998	-13.000	0.378	NA	Y	NA
10387961	10387962	YPZ3_1466	YPZ3_1467	pmrF		TRUE	0.995	-3.000	0.220	NA	Y	NA
10387962	10387963	YPZ3_1467	YPZ3_1468			TRUE	0.998	-3.000	0.447	1.000	Y	NA
10387963	10387964	YPZ3_1468	YPZ3_1469			TRUE	0.858	-3.000	0.061	1.000	N	NA
10387964	10387965	YPZ3_1469	YPZ3_1470			TRUE	0.988	-3.000	0.227	1.000		NA
10387965	10387966	YPZ3_1470	YPZ3_1471			TRUE	0.997	-3.000	0.613	NA		NA
10387966	10387967	YPZ3_1471	YPZ3_1472		nlpC	FALSE	0.199	313.000	0.161	NA		NA
10387967	10387968	YPZ3_1472	YPZ3_1473	nlpC	lplA	FALSE	0.311	125.000	0.091	NA	N	NA
10387968	10387969	YPZ3_1473	YPZ3_1474	lplA		TRUE	0.552	64.000	0.006	NA		NA
10387969	10387970	YPZ3_1474	YPZ3_1475			TRUE	0.767	25.000	0.011	NA		NA
10387971	10387972	YPZ3_1476	YPZ3_1477	aroH		TRUE	0.586	157.000	0.165	1.000		NA
10387975	10387976	YPZ3_1480	YPZ3_1481			FALSE	0.438	122.000	0.129	NA	N	NA
10387976	10387977	YPZ3_1481	YPZ3_1482		sufA	FALSE	0.011	595.000	0.000	NA		NA
10387977	10387978	YPZ3_1482	YPZ3_1483	sufA		TRUE	0.469	99.000	0.041	NA		NA
10387978	10387979	YPZ3_1483	YPZ3_1484			TRUE	0.908	186.000	0.466	1.000	Y	NA
10387979	10387980	YPZ3_1484	YPZ3_1485			TRUE	0.998	-25.000	0.482	1.000	Y	NA
10387980	10387981	YPZ3_1485	YPZ3_1486			TRUE	0.971	-3.000	0.193	1.000	N	NA
10387981	10387982	YPZ3_1486	YPZ3_1487			TRUE	0.779	89.000	0.183	NA		NA
10387982	10387983	YPZ3_1487	YPZ3_1488			FALSE	0.215	271.000	0.103	NA		NA
10387984	10387985	YPZ3_1489	YPZ3_1490			TRUE	0.982	0.000	0.000	1.000	Y	NA
10387985	10387986	YPZ3_1490	YPZ3_1491			FALSE	0.042	582.000	0.000	1.000	Y	NA
10387986	10387987	YPZ3_1491	YPZ3_1492		pykF	FALSE	0.001	697.000	0.000	1.000	N	NA
10387987	10387988	YPZ3_1492	YPZ3_t20	pykF		FALSE	0.012	576.000	0.000	NA		NA
10387988	10387989	YPZ3_t20	YPZ3_t21			TRUE	0.653	60.000	0.000	NA		NA
10387989	10387990	YPZ3_t21	YPZ3_1493			FALSE	0.166	243.000	0.000	NA		NA
10387992	10387993	YPZ3_1495	YPZ3_1496	cfa		FALSE	0.002	480.000	0.000	1.000	N	NA
10387995	10387996	YPZ3_1498	YPZ3_1499	purR	sodB	FALSE	0.002	527.000	0.000	1.000	N	NA
10387996	10387997	YPZ3_1499	YPZ3_1500	sodB		FALSE	0.001	378.000	0.015	1.000	N	NA
10387999	10388000	YPZ3_1502	YPZ3_1503		gloA	TRUE	0.577	79.000	0.136	1.000	N	NA
10388002	10388003	YPZ3_1505	YPZ3_1506			TRUE	0.825	88.000	0.362	1.000	N	NA
10388003	10388004	YPZ3_1506	YPZ3_1507			FALSE	0.358	223.000	0.128	1.000		NA
10388005	10388006	YPZ3_1508	YPZ3_1509		slyA	FALSE	0.005	798.000	0.000	1.000		NA
10388008	10388009	YPZ3_1511	YPZ3_1512			TRUE	0.674	55.000	0.034	NA		NA
10388009	10388010	YPZ3_1512	YPZ3_1513		pdxH	TRUE	0.481	91.000	0.034	NA		NA
10388010	10388011	YPZ3_1513	YPZ3_1514	pdxH	tyrS	FALSE	0.092	182.000	0.054	1.000	N	NA
10388011	10388012	YPZ3_1514	YPZ3_1515	tyrS		FALSE	0.035	227.000	0.041	1.000	N	NA
10388013	10388014	YPZ3_1516	YPZ3_1517	gst		FALSE	0.006	754.000	0.000	NA		NA
10388014	10388015	YPZ3_1517	YPZ3_1518			FALSE	0.143	255.000	0.000	NA		NA
10388015	10388016	YPZ3_1518	YPZ3_1519			FALSE	0.008	682.000	0.000	NA		NA
10388016	10388017	YPZ3_1519	YPZ3_1520		sapF	FALSE	0.035	390.000	0.000	NA		NA
10388017	10388018	YPZ3_1520	YPZ3_1521	sapF	sapD	TRUE	0.999	0.000	0.684	0.023	Y	NA
10388018	10388019	YPZ3_1521	YPZ3_1522	sapD	sapC	TRUE	0.999	0.000	0.667	1.000	Y	NA
10388019	10388020	YPZ3_1522	YPZ3_1523	sapC	sapB	TRUE	0.998	-13.000	0.284	0.060	Y	NA
10388020	10388021	YPZ3_1523	YPZ3_1524	sapB	sapA	TRUE	0.992	-3.000	0.264	0.060	N	NA
10388024	10388025	YPZ3_1527	YPZ3_1528	pspA	pspC	FALSE	0.125	389.000	0.000	NA	Y	NA
10388025	10388026	YPZ3_1528	YPZ3_1529	pspC		FALSE	0.242	308.000	0.190	NA		NA
10388026	10388027	YPZ3_1529	YPZ3_1530			TRUE	0.998	-3.000	0.791	NA		NA
10388028	10388029	YPZ3_1531	YPZ3_1532			TRUE	0.918	83.000	0.412	NA		NA
10388031	10388032	YPZ3_1534	YPZ3_1535		tpx	FALSE	0.036	202.000	0.000	1.000	N	NA
10388035	10388036	YPZ3_1538	YPZ3_1539	mppA		FALSE	0.009	213.000	0.019	1.000	N	NA
10388037	10388038	YPZ3_1540	YPZ3_1541			FALSE	0.010	312.000	0.000	1.000	N	NA
10388038	10388039	YPZ3_1541	YPZ3_1542			FALSE	0.017	307.000	0.000	NA	N	NA
10388039	10388040	YPZ3_1542	YPZ3_1543		nifJ	FALSE	0.026	275.000	0.000	NA	N	NA
10388044	10388045	YPZ3_1547	YPZ3_1548	hslJ	ldhA	FALSE	0.144	70.000	0.024	NA	N	NA
10388046	10388047	YPZ3_1549	YPZ3_1550			FALSE	0.241	201.000	0.000	NA		NA
10388051	10388052	YPZ3_1554	YPZ3_1555	hrpA		FALSE	0.001	665.000	0.000	1.000	N	NA
10388054	10388055	YPZ3_1557	YPZ3_1558			TRUE	0.989	26.000	0.676	NA		NA
10388056	10388057	YPZ3_1559	YPZ3_1560			TRUE	0.864	15.000	0.000	NA		NA
10388059	10388060	YPZ3_1562	YPZ3_1563			TRUE	0.764	94.000	0.300	1.000	N	NA
10388060	10388061	YPZ3_1563	YPZ3_1564		rstA	TRUE	0.957	49.000	0.181	1.000	Y	NA
10388063	10388064	YPZ3_1566	YPZ3_1567			FALSE	0.274	270.000	0.143	NA		NA
10388065	10388066	YPZ3_1568	YPZ3_1569	pntA		TRUE	0.985	184.000	0.745	0.001	Y	NA
10388067	10388068	YPZ3_1570	YPZ3_1571		fnr	TRUE	0.959	135.000	0.619	1.000	Y	NA
10388068	10388069	YPZ3_1571	YPZ3_1572	fnr	ogt	FALSE	0.152	73.000	0.038	1.000	N	NA
10388070	10388071	YPZ3_1573	YPZ3_1574	phoA		FALSE	0.014	546.000	0.000	NA		NA
10388071	10388072	YPZ3_1574	YPZ3_1575			TRUE	0.936	0.000	0.000	NA		NA
10388072	10388073	YPZ3_1575	YPZ3_1576			FALSE	0.362	131.000	0.033	NA		NA
10388074	10388075	YPZ3_1577	YPZ3_1578	ilvN		TRUE	0.998	2.000	0.649	0.002		NA
10388077	10388078	YPZ3_1580	YPZ3_1581			TRUE	0.993	-3.000	0.333	NA		NA
10388078	10388079	YPZ3_1581	YPZ3_1582			TRUE	0.735	44.000	0.000	NA		NA
10388079	10388080	YPZ3_1582	YPZ3_1583			TRUE	0.954	5.000	0.111	NA		NA
10388081	10388082	YPZ3_1584	YPZ3_1585	amn		FALSE	0.010	610.000	0.000	NA		NA
10388082	10388083	YPZ3_1585	YPZ3_1586			FALSE	0.352	144.000	0.000	NA		NA
10388083	10388084	YPZ3_1586	YPZ3_1587			TRUE	0.631	64.000	0.000	NA		NA
10388084	10388085	YPZ3_1587	YPZ3_1588			FALSE	0.001	600.000	0.000	1.000	N	NA
10388086	10388087	YPZ3_1589	YPZ3_1590	bioD	mlc	TRUE	0.612	224.000	0.455	1.000	N	NA
10388087	10388088	YPZ3_1590	YPZ3_1591	mlc		TRUE	0.860	214.000	0.408	1.000	Y	NA
10388089	10388090	YPZ3_1592	YPZ3_1593		tus	FALSE	0.040	346.000	0.018	1.000		NA
10388092	10388093	YPZ3_1595	YPZ3_1596	manA		TRUE	0.851	240.000	0.778	NA		NA
10388094	10388095	YPZ3_1597	YPZ3_1598			FALSE	0.227	206.000	0.000	NA		NA
10388095	10388096	YPZ3_1598	YPZ3_1599			FALSE	0.256	194.000	0.000	NA		NA
10388096	10388097	YPZ3_1599	YPZ3_1600		araC	TRUE	0.769	128.000	0.276	1.000		NA
10388097	10388098	YPZ3_1600	YPZ3_1601	araC	araH	FALSE	0.315	221.000	0.196	1.000	N	NA
10388098	10388099	YPZ3_1601	YPZ3_1602	araH	araG	TRUE	0.997	18.000	0.451	0.006	Y	NA
10388099	10388100	YPZ3_1602	YPZ3_1603	araG	araF	TRUE	0.994	98.000	0.917	0.006	Y	NA
10388101	10388102	YPZ3_1604	YPZ3_1605	araB	araA	FALSE	0.175	84.000	0.046	1.000	N	NA
10388103	10388104	YPZ3_1606	YPZ3_1607			TRUE	0.994	2.000	0.255	0.010		NA
10388104	10388105	YPZ3_1607	YPZ3_1608			TRUE	0.982	0.000	0.000	0.010		NA
10388105	10388106	YPZ3_1608	YPZ3_1609			TRUE	0.449	299.000	0.170	1.000	Y	NA
10388107	10388108	YPZ3_1610	YPZ3_1611			TRUE	0.632	128.000	0.148	NA		NA
10388108	10388109	YPZ3_1611	YPZ3_1612			TRUE	0.999	0.000	0.564	0.034	Y	NA
10388109	10388110	YPZ3_1612	YPZ3_1613		tolA	TRUE	0.994	50.000	0.537	0.034	Y	NA
10388112	10388113	YPZ3_1615	YPZ3_1616			TRUE	0.999	10.000	0.924	0.034	Y	NA
10388113	10388114	YPZ3_1616	YPZ3_1617			TRUE	1.000	-3.000	0.908	0.034	Y	NA
10388114	10388115	YPZ3_1617	YPZ3_1618		nth	TRUE	0.936	-3.000	0.109	1.000	N	NA
10388116	10388117	YPZ3_1619	YPZ3_1620			TRUE	0.949	38.000	0.103	NA	Y	NA
10388118	10388119	YPZ3_1621	YPZ3_1622	rnb	cstA	FALSE	0.006	350.000	0.000	1.000	N	NA
10388119	10388120	YPZ3_1622	YPZ3_1623	cstA		TRUE	0.982	-7.000	0.143	NA		NA
10388121	10388122	YPZ3_1624	YPZ3_1625		araD	FALSE	0.049	548.000	0.000	1.000	Y	NA
10388122	10388123	YPZ3_1625	YPZ3_1626	araD		FALSE	0.001	825.000	0.000	1.000	N	NA
10388123	10388124	YPZ3_1626	YPZ3_1627		pyrF	TRUE	0.732	0.000	0.045	1.000	N	NA
10388124	10388125	YPZ3_1627	YPZ3_1628	pyrF		FALSE	0.005	891.000	0.125	1.000	N	NA
10388125	10388126	YPZ3_1628	YPZ3_1629			TRUE	0.993	7.000	0.576	NA		NA
10388126	10388127	YPZ3_1629	YPZ3_1630		pgpB	TRUE	0.546	169.000	0.143	NA		NA
10388129	10388130	YPZ3_1632	YPZ3_1633	acnA		FALSE	0.034	391.000	0.000	NA		NA
10388130	10388131	YPZ3_1633	YPZ3_1634		cysB	FALSE	0.061	336.000	0.000	NA		NA
10388131	10388132	YPZ3_1634	YPZ3_1635	cysB	topA	FALSE	0.001	397.000	0.008	1.000	N	NA
10388132	10388133	YPZ3_1635	YPZ3_1636	topA	sohB	FALSE	0.000	789.000	0.006	1.000	N	NA
10388134	10388135	YPZ3_1637	YPZ3_1638		btuR	TRUE	0.561	17.000	0.050	1.000	N	NA
10388136	10388137	YPZ3_1639	YPZ3_1640			FALSE	0.230	347.000	0.075	NA	Y	NA
10388137	10388138	YPZ3_1640	YPZ3_1641			TRUE	0.971	17.000	0.281	NA		NA
10388139	10388140	YPZ3_1642	YPZ3_1643	trpE	trpG	TRUE	1.000	0.000	0.703	0.001	Y	NA
10388140	10388141	YPZ3_1643	YPZ3_1644	trpG		TRUE	0.970	15.000	0.083	1.000	Y	NA
10388141	10388142	YPZ3_1644	YPZ3_1645		trpC	TRUE	0.994	4.000	0.293	1.000	Y	NA
10388142	10388143	YPZ3_1645	YPZ3_1646	trpC	trpB	TRUE	0.948	157.000	0.221	0.001	Y	NA
10388143	10388144	YPZ3_1646	YPZ3_1647	trpB	trpA	TRUE	1.000	0.000	0.947	0.001	Y	NA
10388144	10388145	YPZ3_1647	YPZ3_1648	trpA		FALSE	0.046	343.000	0.018	NA		NA
10388148	10388149	YPZ3_1651	YPZ3_1652			TRUE	0.779	32.000	0.000	NA		NA
10388150	10388151	YPZ3_1653	YPZ3_1654	ispZ		TRUE	0.657	80.000	0.167	NA	N	NA
10388151	10388152	YPZ3_1654	YPZ3_1655			FALSE	0.097	148.000	0.000	NA	N	NA
10388153	10388154	YPZ3_1656	YPZ3_1657	tonB	ail	FALSE	0.012	1665.000	0.000	1.000	Y	NA
10388155	10388156	YPZ3_1658	YPZ3_1659	cls		TRUE	0.687	165.000	0.231	NA		NA
10388157	10388158	YPZ3_1660	YPZ3_1661	oppF	oppD	TRUE	0.999	-3.000	0.420	0.002	Y	NA
10388158	10388159	YPZ3_1661	YPZ3_1662	oppD	oppC	TRUE	0.996	12.000	0.554	1.000	Y	NA
10388159	10388160	YPZ3_1662	YPZ3_1663	oppC	oppB	TRUE	0.999	19.000	0.870	0.059	Y	NA
10388160	10388161	YPZ3_1663	YPZ3_1664	oppB	oppA	TRUE	0.943	87.000	0.151	0.059	Y	NA
10388161	10388162	YPZ3_1664	YPZ3_1665	oppA		FALSE	0.001	898.000	0.000	NA	N	NA
10388163	10388164	YPZ3_1666	YPZ3_1667	adhE		FALSE	0.002	540.000	0.000	1.000	N	NA
10388164	10388165	YPZ3_1667	YPZ3_1668			TRUE	0.982	0.000	0.000	1.000	Y	NA
10388168	10388169	YPZ3_1671	YPZ3_1672			FALSE	0.010	307.000	0.000	1.000	N	NA
10388170	10388171	YPZ3_1673	YPZ3_1674			TRUE	0.810	84.000	0.200	NA		NA
10388175	10388176	YPZ3_1677	YPZ3_1678	xthA	nudG	FALSE	0.196	98.000	0.056	1.000	N	NA
10388177	10388178	YPZ3_1679	YPZ3_1680	topB	selD	FALSE	0.213	62.000	0.041	1.000	N	NA
10388178	10388179	YPZ3_1680	YPZ3_1681	selD		FALSE	0.022	225.000	0.033	1.000	N	NA
10388180	10388181	YPZ3_1682	YPZ3_1683	sppA	ansA	FALSE	0.364	117.000	0.113	1.000	N	NA
10388181	10388182	YPZ3_1683	YPZ3_1684	ansA	pncA	TRUE	0.475	15.000	0.040	1.000	N	NA
10388183	10388184	YPZ3_1685	YPZ3_1686			TRUE	0.989	-22.000	0.216	NA		NA
10388185	10388186	YPZ3_1687	YPZ3_1688			FALSE	0.387	314.000	0.154	1.000	Y	NA
10388188	10388189	YPZ3_1690	YPZ3_1691			TRUE	0.882	195.000	0.683	NA		NA
10388189	10388190	YPZ3_1691	YPZ3_1692			FALSE	0.357	108.000	0.007	NA		NA
10388192	10388193	YPZ3_1694	YPZ3_1695			FALSE	0.128	265.000	0.000	NA		NA
10388197	10388198	YPZ3_1699	YPZ3_1700	nhaB		TRUE	0.785	221.000	0.723	1.000	N	NA
10388200	10388201	YPZ3_1702	YPZ3_1703			TRUE	0.824	17.000	0.019	NA		NA
10388201	10388202	YPZ3_1703	YPZ3_1704			TRUE	0.894	4.000	0.019	NA		NA
10388202	10388203	YPZ3_1704	YPZ3_1705			FALSE	0.083	305.000	0.000	NA		NA
10388204	10388205	YPZ3_1706	YPZ3_1707			TRUE	0.884	11.000	0.000	NA		NA
10388205	10388206	YPZ3_1707	YPZ3_1708			TRUE	0.850	17.000	0.000	NA		NA
10388206	10388207	YPZ3_1708	YPZ3_1709			TRUE	0.991	0.000	0.333	NA		NA
10388207	10388208	YPZ3_1709	YPZ3_1710			FALSE	0.012	572.000	0.000	NA		NA
10388208	10388209	YPZ3_1710	YPZ3_1711			FALSE	0.004	1064.000	0.000	NA		NA
10388209	10388210	YPZ3_1711	YPZ3_1712			FALSE	0.005	875.000	0.000	NA		NA
10388210	10388211	YPZ3_1712	YPZ3_1713			FALSE	0.135	261.000	0.000	NA		NA
10388211	10388212	YPZ3_1713	YPZ3_1714			TRUE	0.996	3.000	0.714	NA		NA
10388212	10388213	YPZ3_1714	YPZ3_1715			FALSE	0.399	121.000	0.000	NA		NA
10388213	10388214	YPZ3_1715	YPZ3_1716			FALSE	0.146	254.000	0.000	NA		NA
10388214	10388215	YPZ3_1716	YPZ3_1717			TRUE	0.962	3.000	0.120	NA		NA
10388215	10388216	YPZ3_1717	YPZ3_1718			FALSE	0.079	309.000	0.000	NA		NA
10388216	10388217	YPZ3_1718	YPZ3_1719			TRUE	0.937	13.000	0.111	NA		NA
10388217	10388218	YPZ3_1719	YPZ3_1720			TRUE	0.939	66.000	0.400	NA		NA
10388218	10388219	YPZ3_1720	YPZ3_1721			TRUE	0.992	-3.000	0.294	NA		NA
10388219	10388220	YPZ3_1721	YPZ3_1722			TRUE	0.983	2.000	0.235	NA		NA
10388220	10388221	YPZ3_1722	YPZ3_1723			TRUE	0.571	253.000	0.333	NA		NA
10388221	10388222	YPZ3_1723	YPZ3_1724			TRUE	0.921	48.000	0.222	NA		NA
10388222	10388223	YPZ3_1724	YPZ3_1725			TRUE	0.997	14.000	1.000	NA		NA
10388223	10388224	YPZ3_1725	YPZ3_1726			TRUE	0.967	122.000	1.000	NA		NA
10388224	10388225	YPZ3_1726	YPZ3_1727			TRUE	0.927	1.000	0.000	NA		NA
10388225	10388226	YPZ3_1727	YPZ3_1728			TRUE	0.841	19.000	0.000	NA		NA
10388226	10388227	YPZ3_1728	YPZ3_1729			TRUE	0.936	0.000	0.000	NA		NA
10388227	10388228	YPZ3_1729	YPZ3_1730			TRUE	0.907	5.000	0.000	NA		NA
10388228	10388229	YPZ3_1730	YPZ3_1731			TRUE	0.720	48.000	0.000	NA		NA
10388229	10388230	YPZ3_1731	YPZ3_1732			FALSE	0.153	250.000	0.000	NA		NA
10388230	10388231	YPZ3_1732	YPZ3_1733			TRUE	0.987	31.000	0.667	NA		NA
10388231	10388232	YPZ3_1733	YPZ3_1734			FALSE	0.022	457.000	0.000	NA		NA
10388232	10388233	YPZ3_1734	YPZ3_1735		rzpR	FALSE	0.012	546.000	0.000	1.000		NA
10388233	10388234	YPZ3_1735	YPZ3_1736	rzpR		TRUE	0.949	-15.000	0.000	1.000		NA
10388234	10388235	YPZ3_1736	YPZ3_1737			FALSE	0.003	1379.000	0.000	NA		NA
10388235	10388236	YPZ3_1737	YPZ3_1738			FALSE	0.008	661.000	0.000	NA		NA
10388236	10388237	YPZ3_1738	YPZ3_1739			TRUE	0.577	74.000	0.000	NA		NA
10388239	10388240	YPZ3_1741	YPZ3_1742			TRUE	0.982	0.000	0.000	1.000	Y	NA
10388242	10388243	YPZ3_1744	YPZ3_1745			TRUE	0.580	103.000	0.088	NA		NA
10388243	10388244	YPZ3_1745	YPZ3_1746			FALSE	0.285	71.000	0.046	NA	N	NA
10388245	10388246	YPZ3_1747	YPZ3_1748	minC	minD	TRUE	0.991	25.000	0.466	1.000	Y	NA
10388247	10388248	YPZ3_1749	YPZ3_1750	rnd	fadD	FALSE	0.292	160.000	0.115	1.000	N	NA
10388248	10388249	YPZ3_1750	YPZ3_1751	fadD		FALSE	0.014	643.000	0.169	1.000	N	NA
10388249	10388250	YPZ3_1751	YPZ3_1752			FALSE	0.020	137.000	0.024	1.000	N	NA
10388250	10388251	YPZ3_1752	YPZ3_1753			FALSE	0.423	72.000	0.082	1.000	N	NA
10388253	10388254	YPZ3_1755	YPZ3_1756			TRUE	1.000	-13.000	0.869	0.068	Y	NA
10388254	10388255	YPZ3_1756	YPZ3_1757		eda	FALSE	0.001	715.000	0.000	1.000	N	NA
10388255	10388256	YPZ3_1757	YPZ3_1758	eda	zwf	FALSE	0.421	242.000	0.034	1.000	Y	NA
10388257	10388258	YPZ3_1759	YPZ3_1760		pykA	FALSE	0.008	330.000	0.000	1.000	N	NA
10388259	10388260	YPZ3_1761	YPZ3_1762	msbB		FALSE	0.338	267.000	0.299	1.000	N	NA
10388260	10388261	YPZ3_1762	YPZ3_1763		znuA	TRUE	0.451	105.000	0.131	1.000	N	NA
10388262	10388263	YPZ3_1764	YPZ3_1765	znuC	znuB	TRUE	0.999	-3.000	0.755	1.000	Y	NA
10388264	10388265	YPZ3_1766	YPZ3_1767	ruvB	ruvA	TRUE	0.979	162.000	0.549	0.002	Y	NA
10388265	10388266	YPZ3_1767	YPZ3_1768	ruvA	ruvC	TRUE	0.874	283.000	0.451	0.018	Y	NA
10388266	10388267	YPZ3_1768	YPZ3_1769	ruvC		TRUE	0.627	209.000	0.277	NA		NA
10388267	10388268	YPZ3_1769	YPZ3_1770		ntpA	TRUE	0.659	58.000	0.035	NA		NA
10388268	10388269	YPZ3_1770	YPZ3_1771	ntpA	aspS	TRUE	0.770	0.000	0.050	1.000	N	NA
10388270	10388271	YPZ3_1772	YPZ3_1773			TRUE	0.492	180.000	0.126	NA		NA
10388271	10388272	YPZ3_1773	YPZ3_1774			FALSE	0.385	191.000	0.089	NA		NA
10388272	10388273	YPZ3_1774	YPZ3_1775			TRUE	0.992	-3.000	0.315	NA		NA
10388274	10388275	YPZ3_1776	YPZ3_1777	cutC		FALSE	0.222	232.000	0.057	NA		NA
10388277	10388278	YPZ3_1779	YPZ3_1780		fhaC1	TRUE	0.982	150.000	1.000	NA	Y	NA
10388278	10388279	YPZ3_1780	YPZ3_1781	fhaC1	mviN	FALSE	0.019	480.000	0.000	NA		NA
10388279	10388280	YPZ3_1781	YPZ3_1782	mviN		FALSE	0.095	267.000	0.022	1.000		NA
10388280	10388281	YPZ3_1782	YPZ3_1783		rimJ	TRUE	0.884	8.000	0.000	1.000		NA
10388282	10388283	YPZ3_1784	YPZ3_1785			FALSE	0.117	395.000	0.196	NA		NA
10388284	10388285	YPZ3_1786	YPZ3_1787			TRUE	0.967	37.000	0.417	1.000		NA
10388287	10388288	YPZ3_1788	YPZ3_1789			TRUE	0.972	14.000	0.375	NA	N	NA
10388291	10388292	YPZ3_1792	YPZ3_1793			TRUE	0.999	-3.000	0.400	0.058	Y	NA
10388292	10388293	YPZ3_1793	YPZ3_1794			TRUE	0.999	-3.000	0.440	0.058	Y	NA
10388293	10388294	YPZ3_1794	YPZ3_1795			TRUE	0.992	20.000	0.480	0.058		NA
10388294	10388295	YPZ3_1795	YPZ3_1796			FALSE	0.076	301.000	0.000	1.000		NA
10388295	10388296	YPZ3_1796	YPZ3_t24			FALSE	0.355	142.000	0.000	NA		NA
10388296	10388297	YPZ3_t24	YPZ3_1797		sUL1	FALSE	0.006	836.000	0.000	NA		NA
10388298	10388299	YPZ3_1798	YPZ3_1799	kdsA		TRUE	0.585	96.000	0.089	1.000		NA
10388299	10388300	YPZ3_1799	YPZ3_1800			TRUE	0.986	-3.000	0.195	NA		NA
10388300	10388301	YPZ3_1800	YPZ3_1801			TRUE	0.782	64.000	0.109	NA		NA
10388301	10388302	YPZ3_1801	YPZ3_1802		prfA	TRUE	0.997	0.000	0.229	0.044	Y	NA
10388302	10388303	YPZ3_1802	YPZ3_1803	prfA	hemA	TRUE	0.939	33.000	0.171	0.044	N	NA
10388304	10388305	YPZ3_1804	YPZ3_1805	lolB		TRUE	0.678	68.000	0.157	1.000	N	NA
10388305	10388306	YPZ3_1805	YPZ3_1806		prsA	FALSE	0.015	341.000	0.053	1.000	N	NA
10388306	10388307	YPZ3_1806	YPZ3_1807	prsA	pth	FALSE	0.000	806.000	0.011	1.000	N	NA
10388307	10388308	YPZ3_1807	YPZ3_1808	pth		TRUE	0.810	164.000	0.184	1.000	Y	NA
10388308	10388309	YPZ3_1808	YPZ3_1809			FALSE	0.005	773.000	0.000	1.000		NA
10388310	10388311	YPZ3_1810	YPZ3_1811			TRUE	0.613	8.000	0.034	NA	N	NA
10388311	10388312	YPZ3_1811	YPZ3_1812			TRUE	0.978	-3.000	0.125	NA		NA
10388314	10388315	YPZ3_1814	YPZ3_1815			TRUE	0.942	15.000	0.133	NA		NA
10388315	10388316	YPZ3_1815	YPZ3_1816			FALSE	0.263	191.000	0.000	NA		NA
10388317	10388318	YPZ3_1817	YPZ3_1818	copR		TRUE	0.999	12.000	0.793	0.001	Y	NA
10388318	10388319	YPZ3_1818	YPZ3_1819			FALSE	0.102	277.000	0.000	1.000		NA
10388319	10388320	YPZ3_1819	YPZ3_1820			TRUE	0.851	55.000	0.154	1.000		NA
10388320	10388321	YPZ3_1820	YPZ3_1821			FALSE	0.215	213.000	0.000	NA		NA
10388321	10388322	YPZ3_1821	YPZ3_1822			FALSE	0.006	791.000	0.000	NA		NA
10388322	10388323	YPZ3_1822	YPZ3_1823			TRUE	0.904	6.000	0.000	NA		NA
10388323	10388324	YPZ3_1823	YPZ3_1824			TRUE	0.954	-13.000	0.000	NA		NA
10388324	10388325	YPZ3_1824	YPZ3_1825			FALSE	0.058	341.000	0.000	NA		NA
10388325	10388326	YPZ3_1825	YPZ3_1826			TRUE	0.710	105.000	0.000	0.045		NA
10388327	10388328	YPZ3_1827	YPZ3_1828			FALSE	0.141	247.000	0.000	1.000		NA
10388331	10388332	YPZ3_1831	YPZ3_1832			FALSE	0.304	170.000	0.000	NA		NA
10388333	10388334	YPZ3_1833	YPZ3_1834			TRUE	0.983	-3.000	0.167	NA		NA
10388334	10388335	YPZ3_1834	YPZ3_1835			TRUE	0.948	-3.000	0.000	NA		NA
10388335	10388336	YPZ3_1835	YPZ3_1836			TRUE	0.927	0.000	0.000	1.000		NA
10388336	10388337	YPZ3_1836	YPZ3_1837			FALSE	0.171	134.000	0.054	NA	N	NA
10388337	10388338	YPZ3_1837	YPZ3_1838			TRUE	0.996	-3.000	0.550	NA		NA
10388338	10388339	YPZ3_1838	YPZ3_1839			TRUE	0.668	98.000	0.133	1.000		NA
10388339	10388340	YPZ3_1839	YPZ3_1840			TRUE	0.963	14.000	0.200	NA		NA
10388340	10388341	YPZ3_1840	YPZ3_1841			TRUE	0.445	137.000	0.067	NA		NA
10388343	10388344	YPZ3_1843	YPZ3_1844			TRUE	0.954	0.000	0.067	NA		NA
10388345	10388346	YPZ3_1845	YPZ3_1846	hutC	hutI	FALSE	0.010	204.000	0.010	1.000	N	NA
10388346	10388347	YPZ3_1846	YPZ3_1847	hutI	hutG	TRUE	0.586	-3.000	0.031	1.000	N	NA
10388348	10388349	YPZ3_1848	YPZ3_1849			TRUE	0.982	0.000	0.000	1.000	Y	NA
10388349	10388350	YPZ3_1849	YPZ3_1850			FALSE	0.000	1140.000	0.000	1.000	N	NA
10388350	10388351	YPZ3_1850	YPZ3_1851			TRUE	0.940	25.000	0.000	1.000	Y	NA
10388351	10388352	YPZ3_1851	YPZ3_1852			TRUE	0.994	-7.000	0.000	0.058	Y	NA
10388352	10388353	YPZ3_1852	YPZ3_1853			TRUE	0.930	67.000	0.000	0.058	Y	NA
10388353	10388354	YPZ3_1853	YPZ3_1854			TRUE	0.766	30.000	0.000	1.000		NA
10388354	10388355	YPZ3_1854	YPZ3_1855			FALSE	0.007	668.000	0.000	1.000		NA
10388356	10388357	YPZ3_1856	YPZ3_1857			TRUE	0.880	12.000	0.000	NA		NA
10388358	10388359	YPZ3_1858	YPZ3_1859			TRUE	0.980	0.000	0.000	0.029		NA
10388359	10388360	YPZ3_1859	YPZ3_1860			TRUE	0.692	48.000	0.000	1.000		NA
10388361	10388362	YPZ3_1861	YPZ3_1862			FALSE	0.008	675.000	0.000	NA		NA
10388362	10388363	YPZ3_1862	YPZ3_1863			TRUE	0.905	183.000	0.521	0.073		NA
10388363	10388364	YPZ3_1863	YPZ3_1864			FALSE	0.203	220.000	0.000	NA		NA
10388365	10388366	YPZ3_t25	YPZ3_t26			TRUE	0.884	11.000	0.000	NA		NA
10388366	10388367	YPZ3_t26	YPZ3_t27			TRUE	0.695	53.000	0.000	NA		NA
10388367	10388368	YPZ3_t27	YPZ3_1865		pgsA	FALSE	0.351	145.000	0.000	NA		NA
10388368	10388369	YPZ3_1865	YPZ3_1866	pgsA	uvrC	TRUE	0.821	59.000	0.227	1.000	N	NA
10388369	10388370	YPZ3_1866	YPZ3_1867	uvrC	uvrY	TRUE	0.836	59.000	0.086	0.026	N	NA
10388372	10388373	YPZ3_1869	YPZ3_t28			FALSE	0.008	687.000	0.000	NA		NA
10388377	10388378	YPZ3_1873	YPZ3_1874			TRUE	0.994	11.000	0.378	NA	Y	NA
10388378	10388379	YPZ3_1874	YPZ3_1875			TRUE	0.987	30.000	0.356	NA	Y	NA
10388379	10388380	YPZ3_1875	YPZ3_1876		putP	FALSE	0.013	333.000	0.000	NA	N	NA
10388381	10388382	YPZ3_1877	YPZ3_1878	putA		FALSE	0.006	833.000	0.000	NA		NA
10388383	10388384	YPZ3_1879	YPZ3_1880			TRUE	0.988	3.000	0.150	1.000	Y	NA
10388384	10388385	YPZ3_1880	YPZ3_1881		fliY	TRUE	0.994	0.000	0.100	0.074	Y	NA
10388385	10388386	YPZ3_1881	YPZ3_1882	fliY		TRUE	0.946	124.000	0.469	1.000	Y	NA
10388386	10388387	YPZ3_1882	YPZ3_1883		fliZ	FALSE	0.158	262.000	0.062	1.000		NA
10388387	10388388	YPZ3_1883	YPZ3_1884	fliZ	fliA	FALSE	0.322	222.000	0.108	1.000		NA
10388388	10388389	YPZ3_1884	YPZ3_1885	fliA	fliC	FALSE	0.007	347.000	0.000	1.000	N	NA
10388390	10388391	YPZ3_1886	YPZ3_1887	fliD		TRUE	0.984	68.000	0.284	0.004	Y	NA
10388391	10388392	YPZ3_1887	YPZ3_1888			FALSE	0.001	674.000	0.000	1.000	N	NA
10388392	10388393	YPZ3_1888	YPZ3_1889			FALSE	0.043	354.000	0.000	1.000		NA
10388393	10388394	YPZ3_1889	YPZ3_1890			TRUE	0.673	149.000	0.200	NA		NA
10388394	10388395	YPZ3_1890	YPZ3_1891			FALSE	0.258	161.000	0.006	NA		NA
10388397	10388398	YPZ3_1893	YPZ3_1894	fliF	fliG	TRUE	0.998	-3.000	0.220	0.011	Y	NA
10388398	10388399	YPZ3_1894	YPZ3_1895	fliG	fliH	TRUE	0.995	-7.000	0.007	0.006	Y	NA
10388399	10388400	YPZ3_1895	YPZ3_1896	fliH	fliI	TRUE	0.992	-37.000	0.115	1.000	Y	NA
10388400	10388401	YPZ3_1896	YPZ3_1897	fliI	fliJ	TRUE	0.797	100.000	0.073	1.000	Y	NA
10388401	10388402	YPZ3_1897	YPZ3_1898	fliJ	fliK	TRUE	0.999	-3.000	0.317	0.011	Y	NA
10388402	10388403	YPZ3_1898	YPZ3_1899	fliK		TRUE	0.727	174.000	0.119	1.000	Y	NA
10388403	10388404	YPZ3_1899	YPZ3_1900		fliM	TRUE	1.000	6.000	0.957	0.002	Y	NA
10388404	10388405	YPZ3_1900	YPZ3_1901	fliM		TRUE	0.985	39.000	0.137	0.002	Y	NA
10388405	10388406	YPZ3_1901	YPZ3_1902		fliO	TRUE	0.997	0.000	0.443	1.000	Y	NA
10388406	10388407	YPZ3_1902	YPZ3_1903	fliO	fliP	TRUE	0.995	-3.000	0.203	1.000	Y	NA
10388407	10388408	YPZ3_1903	YPZ3_1904	fliP	fliR	FALSE	0.128	379.000	0.000	1.000	Y	NA
10388408	10388409	YPZ3_1904	YPZ3_1905	fliR		FALSE	0.023	434.000	0.000	1.000		NA
10388410	10388411	YPZ3_1906	YPZ3_1907			TRUE	0.907	49.000	0.000	NA	Y	NA
10388411	10388412	YPZ3_1907	YPZ3_1908			TRUE	0.994	3.000	0.286	1.000	Y	NA
10388412	10388413	YPZ3_1908	YPZ3_1909			TRUE	0.866	66.000	0.000	NA	Y	NA
10388413	10388414	YPZ3_1909	YPZ3_1910			TRUE	0.997	43.000	1.000	NA	Y	NA
10388414	10388415	YPZ3_1910	YPZ3_1911			FALSE	0.343	130.000	0.000	1.000		NA
10388417	10388418	YPZ3_1913	YPZ3_1914	flgL	flgK	TRUE	0.927	139.000	0.142	0.002	Y	NA
10388418	10388419	YPZ3_1914	YPZ3_1915	flgK	flgJ	FALSE	0.415	871.000	0.705	0.004	Y	NA
10388419	10388420	YPZ3_1915	YPZ3_1916	flgJ	flgI	TRUE	0.994	0.000	0.048	0.013	Y	NA
10388420	10388421	YPZ3_1916	YPZ3_1917	flgI	flgH	TRUE	0.988	15.000	0.085	0.013	Y	NA
10388421	10388422	YPZ3_1917	YPZ3_1918	flgH	flgG	TRUE	0.882	144.000	0.268	1.000	Y	NA
10388422	10388423	YPZ3_1918	YPZ3_1919	flgG	flgF	TRUE	0.998	-19.000	0.420	1.000	Y	NA
10388423	10388424	YPZ3_1919	YPZ3_1920	flgF	flgE	TRUE	0.987	22.000	0.095	0.007	Y	NA
10388424	10388425	YPZ3_1920	YPZ3_1921	flgE	flgD	TRUE	0.550	202.000	0.000	NA	Y	NA
10388425	10388426	YPZ3_1921	YPZ3_1922	flgD	flgC	TRUE	0.984	15.000	0.186	NA	Y	NA
10388426	10388427	YPZ3_1922	YPZ3_1923	flgC	flgB	TRUE	0.999	6.000	0.824	0.006	Y	NA
10388428	10388429	YPZ3_1924	YPZ3_1925	flgA	flgM	TRUE	0.906	151.000	0.330	NA	Y	NA
10388429	10388430	YPZ3_1925	YPZ3_1926	flgM	flgN	TRUE	0.996	19.000	0.361	0.003	Y	NA
10388431	10388432	YPZ3_1927	YPZ3_1928			TRUE	0.495	90.000	0.000	NA		NA
10388432	10388433	YPZ3_1928	YPZ3_1929		flhE	FALSE	0.003	1607.000	0.000	1.000		NA
10388433	10388434	YPZ3_1929	YPZ3_1930	flhE	flhA	TRUE	0.986	0.000	0.053	0.003		NA
10388434	10388435	YPZ3_1930	YPZ3_1931	flhA	flhB	TRUE	0.998	0.000	0.287	0.012	Y	NA
10388436	10388437	YPZ3_1932	YPZ3_1933			TRUE	0.998	-6.000	0.800	NA		NA
10388438	10388439	YPZ3_1934	YPZ3_1935			TRUE	0.952	97.000	0.704	NA		NA
10388439	10388440	YPZ3_1935	YPZ3_1936			TRUE	0.995	3.000	0.613	1.000		NA
10388440	10388441	YPZ3_1936	YPZ3_1937		ftnA	FALSE	0.027	397.000	0.029	1.000		NA
10388441	10388442	YPZ3_1937	YPZ3_1938	ftnA	pip	FALSE	0.007	691.000	0.000	1.000		NA
10388442	10388443	YPZ3_1938	YPZ3_1939	pip	ptrB	FALSE	0.022	722.000	0.000	0.020		NA
10388443	10388444	YPZ3_1939	YPZ3_1940	ptrB		FALSE	0.079	310.000	0.000	NA		NA
10388444	10388445	YPZ3_1940	YPZ3_1941			TRUE	0.521	92.000	0.048	NA		NA
10388445	10388446	YPZ3_1941	YPZ3_1942			TRUE	0.782	40.000	0.053	NA		NA
10388446	10388447	YPZ3_1942	YPZ3_1943		dbpA	FALSE	0.414	94.000	0.014	NA		NA
10388448	10388449	YPZ3_1944	YPZ3_1945	purT		FALSE	0.002	548.000	0.000	1.000	N	NA
10388449	10388450	YPZ3_1945	YPZ3_1946			TRUE	0.974	-3.000	0.116	1.000		NA
10388450	10388451	YPZ3_1946	YPZ3_1947			FALSE	0.061	708.000	0.409	1.000		NA
10388452	10388453	YPZ3_1948	YPZ3_1949	hpaC	hpaB	TRUE	0.987	21.000	0.226	0.001		NA
10388453	10388454	YPZ3_1949	YPZ3_1950	hpaB	hpaX	FALSE	0.158	68.000	0.000	1.000	N	NA
10388454	10388455	YPZ3_1950	YPZ3_1951	hpaX	hpaI	TRUE	0.973	26.000	0.175	1.000	Y	NA
10388455	10388456	YPZ3_1951	YPZ3_1952	hpaI	hpaH	TRUE	0.979	11.000	0.439	1.000	N	NA
10388456	10388457	YPZ3_1952	YPZ3_1953	hpaH	hpaF	TRUE	0.985	-6.000	0.282	1.000	N	NA
10388457	10388458	YPZ3_1953	YPZ3_1954	hpaF	hpaD	TRUE	0.968	25.000	0.330	1.000		NA
10388458	10388459	YPZ3_1954	YPZ3_1955	hpaD	hpaE	TRUE	0.848	119.000	0.378	1.000		NA
10388459	10388460	YPZ3_1955	YPZ3_1956	hpaE		TRUE	0.997	-3.000	0.510	0.044	N	NA
10388460	10388461	YPZ3_1956	YPZ3_1957			TRUE	1.000	-3.000	0.618	0.001	Y	NA
10388464	10388465	YPZ3_1960	YPZ3_1961	manX	manY	TRUE	0.924	92.000	0.064	0.006	Y	NA
10388465	10388466	YPZ3_1961	YPZ3_1962	manY		TRUE	0.991	151.000	0.939	0.006	Y	NA
10388466	10388467	YPZ3_1962	YPZ3_1963			TRUE	0.895	200.000	0.755	NA		NA
10388467	10388468	YPZ3_1963	YPZ3_1964			FALSE	0.027	429.000	0.000	NA		NA
10388472	10388473	YPZ3_1968	YPZ3_1969			FALSE	0.003	1461.000	0.000	NA		NA
10388475	10388476	YPZ3_1971	YPZ3_1972			FALSE	0.001	902.000	0.000	1.000	N	NA
10388476	10388477	YPZ3_1972	YPZ3_1973			FALSE	0.026	103.000	0.021	1.000	N	NA
10388477	10388478	YPZ3_1973	YPZ3_1974			FALSE	0.005	911.000	0.000	NA		NA
10388478	10388479	YPZ3_1974	YPZ3_t29			FALSE	0.289	178.000	0.000	NA		NA
10388480	10388481	YPZ3_1975	YPZ3_1976			TRUE	0.982	0.000	0.000	1.000	Y	NA
10388481	10388482	YPZ3_1976	YPZ3_1977			TRUE	0.915	14.000	0.000	0.046	N	NA
10388482	10388483	YPZ3_1977	YPZ3_1978			FALSE	0.002	475.000	0.000	1.000	N	NA
10388483	10388484	YPZ3_1978	YPZ3_1979		kdgF	TRUE	0.720	48.000	0.000	NA		NA
10388485	10388486	YPZ3_1980	YPZ3_1981	kduI	kduD1	TRUE	0.631	92.000	0.192	1.000	N	NA
10388486	10388487	YPZ3_1981	YPZ3_1982	kduD1	pelW	FALSE	0.054	336.000	0.000	1.000		NA
10388487	10388488	YPZ3_1982	YPZ3_1983	pelW		TRUE	0.658	161.000	0.217	1.000		NA
10388488	10388489	YPZ3_1983	YPZ3_1984			TRUE	1.000	-7.000	0.917	0.057	Y	NA
10388489	10388490	YPZ3_1984	YPZ3_1985			TRUE	0.990	14.000	0.131	0.057	Y	NA
10388490	10388491	YPZ3_1985	YPZ3_1986			TRUE	0.987	16.000	0.101	0.057	Y	NA
10388491	10388492	YPZ3_1986	YPZ3_1987			FALSE	0.226	298.000	0.000	0.057		NA
10388492	10388493	YPZ3_1987	YPZ3_1988			FALSE	0.019	480.000	0.000	NA		NA
10388493	10388494	YPZ3_1988	YPZ3_1989			FALSE	0.374	204.000	0.102	NA		NA
10388495	10388496	YPZ3_1990	YPZ3_1991		kdgR	FALSE	0.004	385.000	0.000	1.000	N	NA
10388496	10388497	YPZ3_1991	YPZ3_1992	kdgR	ogl	FALSE	0.102	187.000	0.059	1.000	N	NA
10388499	10388500	YPZ3_1994	YPZ3_1995			TRUE	0.993	-3.000	0.167	1.000	Y	NA
10388500	10388501	YPZ3_1995	YPZ3_1996			TRUE	0.993	-3.000	0.167	1.000	Y	NA
10388501	10388502	YPZ3_1996	YPZ3_1997			TRUE	0.985	82.000	0.750	1.000	Y	NA
10388502	10388503	YPZ3_1997	YPZ3_1998			TRUE	0.951	195.000	0.750	1.000	Y	NA
10388503	10388504	YPZ3_1998	YPZ3_1999			FALSE	0.001	658.000	0.000	1.000	N	NA
10388504	10388505	YPZ3_1999	YPZ3_2000			FALSE	0.035	474.000	0.042	0.020	N	NA
10388505	10388506	YPZ3_2000	YPZ3_2001			TRUE	0.952	20.000	0.304	NA	N	NA
10388506	10388507	YPZ3_2001	YPZ3_2002			TRUE	0.825	96.000	0.081	NA	Y	NA
10388508	10388509	YPZ3_2003	YPZ3_2004			TRUE	0.999	-31.000	0.840	NA		NA
10388509	10388510	YPZ3_2004	YPZ3_2005			FALSE	0.019	479.000	0.000	NA		NA
10388510	10388511	YPZ3_2005	YPZ3_2006			TRUE	0.911	45.000	0.192	NA		NA
10388511	10388512	YPZ3_2006	YPZ3_2007			FALSE	0.010	609.000	0.000	NA		NA
10388512	10388513	YPZ3_2007	YPZ3_2008			TRUE	0.973	171.000	0.879	NA	Y	NA
10388513	10388514	YPZ3_2008	YPZ3_2009			TRUE	0.907	206.000	0.848	NA		NA
10388516	10388517	YPZ3_2011	YPZ3_2012			TRUE	0.982	0.000	0.000	1.000	Y	NA
10388520	10388521	YPZ3_2015	YPZ3_2016			TRUE	0.452	100.000	0.000	NA		NA
10388521	10388522	YPZ3_2016	YPZ3_2017			TRUE	0.823	23.000	0.000	NA		NA
10388522	10388523	YPZ3_2017	YPZ3_2018			FALSE	0.002	474.000	0.000	1.000	N	NA
10388523	10388524	YPZ3_2018	YPZ3_2019		cheZ	FALSE	0.001	571.000	0.000	1.000	N	NA
10388524	10388525	YPZ3_2019	YPZ3_2020	cheZ	cheY	TRUE	0.993	10.000	0.333	1.000	Y	NA
10388525	10388526	YPZ3_2020	YPZ3_2021	cheY	cheB	TRUE	0.967	101.000	0.286	0.010	Y	NA
10388526	10388527	YPZ3_2021	YPZ3_2022	cheB	cheR	TRUE	0.987	0.000	0.087	1.000	Y	NA
10388527	10388528	YPZ3_2022	YPZ3_2023	cheR	tap	TRUE	0.688	227.000	0.188	1.000	Y	NA
10388528	10388529	YPZ3_2023	YPZ3_2024	tap	cheD	TRUE	0.963	184.000	0.429	0.002	Y	NA
10388529	10388530	YPZ3_2024	YPZ3_2025	cheD		FALSE	0.172	241.000	0.000	NA		NA
10388530	10388531	YPZ3_2025	YPZ3_2026			TRUE	0.602	69.000	0.000	NA		NA
10388531	10388532	YPZ3_2026	YPZ3_2027			FALSE	0.015	528.000	0.000	NA		NA
10388532	10388533	YPZ3_2027	YPZ3_2028			FALSE	0.019	475.000	0.000	NA		NA
10388534	10388535	YPZ3_2029	YPZ3_2030			TRUE	0.991	-3.000	0.400	NA	N	NA
10388535	10388536	YPZ3_2030	YPZ3_2031			TRUE	0.976	13.000	0.400	NA	N	NA
10388537	10388538	YPZ3_2032	YPZ3_2033	cheW		TRUE	0.969	163.000	0.447	0.004	Y	NA
10388538	10388539	YPZ3_2033	YPZ3_2034		motB	TRUE	0.998	17.000	0.913	1.000	Y	NA
10388539	10388540	YPZ3_2034	YPZ3_2035	motB	motA	TRUE	0.998	-3.000	0.429	1.000	Y	NA
10388540	10388541	YPZ3_2035	YPZ3_2036	motA		TRUE	0.733	205.000	0.408	1.000		NA
10388541	10388542	YPZ3_2036	YPZ3_2037		mgtB	FALSE	0.003	1543.000	0.000	1.000		NA
10388542	10388543	YPZ3_2037	YPZ3_2038	mgtB		FALSE	0.044	401.000	0.065	NA		NA
10388544	10388545	YPZ3_2039	YPZ3_2040			TRUE	0.999	-46.000	0.667	0.008		NA
10388545	10388546	YPZ3_2040	YPZ3_2041		lacZ	FALSE	0.003	1372.000	0.000	1.000		NA
10388546	10388547	YPZ3_2041	YPZ3_2042	lacZ		FALSE	0.004	408.000	0.000	1.000	N	NA
10388547	10388548	YPZ3_2042	YPZ3_2043			FALSE	0.109	283.000	0.000	NA		NA
10388548	10388549	YPZ3_2043	YPZ3_2044			FALSE	0.017	506.000	0.000	NA		NA
10388549	10388550	YPZ3_2044	YPZ3_2045			TRUE	0.513	92.000	0.045	NA		NA
10388551	10388552	YPZ3_2046	YPZ3_2047			FALSE	0.015	532.000	0.000	NA		NA
10388553	10388554	YPZ3_2048	YPZ3_2049			FALSE	0.001	920.000	0.000	1.000	N	NA
10388554	10388555	YPZ3_2049	YPZ3_2050			FALSE	0.012	656.000	0.000	0.068	N	NA
10388557	10388558	YPZ3_2052	YPZ3_2053			TRUE	0.972	-7.000	0.182	1.000	N	NA
10388558	10388559	YPZ3_2053	YPZ3_2054			FALSE	0.333	187.000	0.158	1.000	N	NA
10388559	10388560	YPZ3_2054	YPZ3_2055			TRUE	0.872	58.000	0.180	NA		NA
10388560	10388561	YPZ3_2055	YPZ3_2056		purB	TRUE	0.769	61.000	0.093	NA		NA
10388561	10388562	YPZ3_2056	YPZ3_2057	purB		FALSE	0.177	188.000	0.002	1.000		NA
10388562	10388563	YPZ3_2057	YPZ3_2058		phoP	FALSE	0.198	211.000	0.000	1.000		NA
10388563	10388564	YPZ3_2058	YPZ3_2059	phoP	phoQ	TRUE	0.995	54.000	0.940	1.000	Y	NA
10388564	10388565	YPZ3_2059	YPZ3_2060	phoQ		TRUE	0.915	84.000	0.408	NA		NA
10388566	10388567	YPZ3_2061	YPZ3_2062			FALSE	0.002	330.000	0.019	1.000	N	NA
10388567	10388568	YPZ3_2062	YPZ3_2063			TRUE	0.686	194.000	0.119	1.000	Y	NA
10388568	10388569	YPZ3_2063	YPZ3_2064			TRUE	0.925	19.000	0.225	1.000	N	NA
10388569	10388570	YPZ3_2064	YPZ3_2065			TRUE	0.977	0.000	0.125	0.073	N	NA
10388570	10388571	YPZ3_2065	YPZ3_2066			TRUE	0.988	-7.000	0.175	0.073	N	NA
10388573	10388574	YPZ3_2068	YPZ3_2069			FALSE	0.057	330.000	0.000	1.000		NA
10388574	10388575	YPZ3_2069	YPZ3_2070			TRUE	0.468	96.000	0.000	NA		NA
10388575	10388576	YPZ3_2070	YPZ3_2071			TRUE	0.897	8.000	0.000	NA		NA
10388576	10388577	YPZ3_2071	YPZ3_2072			FALSE	0.007	742.000	0.000	NA		NA
10388577	10388578	YPZ3_2072	YPZ3_2073			FALSE	0.052	375.000	0.057	NA		NA
10388578	10388579	YPZ3_2073	YPZ3_2074		nagZ	TRUE	0.520	128.000	0.091	NA		NA
10388579	10388580	YPZ3_2074	YPZ3_2075	nagZ	cotS	FALSE	0.328	80.000	0.069	1.000	N	NA
10388580	10388581	YPZ3_2075	YPZ3_2076	cotS		TRUE	0.993	-19.000	0.310	NA		NA
10388581	10388582	YPZ3_2076	YPZ3_2077			TRUE	0.975	41.000	0.516	NA		NA
10388582	10388583	YPZ3_2077	YPZ3_2078			TRUE	0.795	35.000	0.051	NA		NA
10388583	10388584	YPZ3_2078	YPZ3_2079			FALSE	0.014	174.000	0.003	1.000	N	NA
10388584	10388585	YPZ3_2079	YPZ3_2080			FALSE	0.002	473.000	0.000	1.000	N	NA
10388585	10388586	YPZ3_2080	YPZ3_2081		ptsG	FALSE	0.062	139.000	0.000	1.000	N	NA
10388586	10388587	YPZ3_2081	YPZ3_2082	ptsG		FALSE	0.003	306.000	0.004	NA	N	NA
10388587	10388588	YPZ3_2082	YPZ3_2083		holB	TRUE	0.976	15.000	0.110	NA	Y	NA
10388588	10388589	YPZ3_2083	YPZ3_2084	holB	tmk	TRUE	0.968	0.000	0.211	1.000	N	NA
10388589	10388590	YPZ3_2084	YPZ3_2085	tmk		TRUE	0.997	-10.000	0.209	0.001		NA
10388590	10388591	YPZ3_2085	YPZ3_2086			TRUE	0.476	223.000	0.204	1.000		NA
10388591	10388592	YPZ3_2086	YPZ3_2087			FALSE	0.004	416.000	0.000	1.000	N	NA
10388592	10388593	YPZ3_2087	YPZ3_2088			FALSE	0.060	149.000	0.000	1.000	N	NA
10388593	10388594	YPZ3_2088	YPZ3_2089		fabG	FALSE	0.055	521.000	0.000	1.000	Y	NA
10388594	10388595	YPZ3_2089	YPZ3_2090	fabG	fabD	TRUE	0.998	14.000	0.432	0.003	Y	NA
10388595	10388596	YPZ3_2090	YPZ3_2091	fabD	fabH	TRUE	0.988	38.000	0.182	0.003	Y	NA
10388596	10388597	YPZ3_2091	YPZ3_2092	fabH		TRUE	0.998	7.000	0.380	0.003	Y	NA
10388597	10388598	YPZ3_2092	YPZ3_2093			FALSE	0.128	274.000	0.044	NA		NA
10388600	10388601	YPZ3_2095	YPZ3_2096			FALSE	0.050	169.000	0.000	1.000	N	NA
10388602	10388603	YPZ3_2097	YPZ3_2098			FALSE	0.095	96.000	0.000	1.000	N	NA
10388603	10388604	YPZ3_2098	YPZ3_2099		pyrC	FALSE	0.001	799.000	0.000	1.000	N	NA
10388606	10388607	YPZ3_2101	YPZ3_2102	solA		FALSE	0.017	267.000	0.000	1.000	N	NA
10388608	10388609	YPZ3_2103	YPZ3_2104			FALSE	0.336	149.000	0.033	NA		NA
10388609	10388610	YPZ3_2104	YPZ3_2105			FALSE	0.004	1051.000	0.000	NA		NA
10388612	10388613	YPZ3_2107	YPZ3_2108	ypeR		FALSE	0.133	487.000	0.000	0.053	Y	NA
10388614	10388615	YPZ3_2109	YPZ3_2110			TRUE	0.938	47.000	0.286	1.000		NA
10388615	10388616	YPZ3_2110	YPZ3_2111			TRUE	0.994	11.000	0.714	1.000		NA
10388617	10388618	YPZ3_2112	YPZ3_2113			TRUE	0.989	11.000	0.468	NA		NA
10388618	10388619	YPZ3_2113	YPZ3_2114			TRUE	0.993	18.000	0.787	NA		NA
10388619	10388620	YPZ3_2114	YPZ3_2115			TRUE	0.999	-3.000	0.895	NA		NA
10388620	10388621	YPZ3_2115	YPZ3_2116			FALSE	0.306	408.000	0.528	NA		NA
10388621	10388622	YPZ3_2116	YPZ3_2117			TRUE	0.998	-3.000	0.707	NA		NA
11483851	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	360.000	0.000	NA		NA
11626214	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	360.000	0.000	NA		NA
11768606	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	360.000	0.000	NA		NA
11483852	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	388.000	0.000	NA		NA
11626215	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	388.000	0.000	NA		NA
11768607	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	388.000	0.000	NA		NA
11483853	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	420.000	0.000	NA		NA
11626216	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	420.000	0.000	NA		NA
11768608	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	420.000	0.000	NA		NA
11483854	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	448.000	0.000	NA		NA
11626217	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	448.000	0.000	NA		NA
11768609	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	448.000	0.000	NA		NA
11483855	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	480.000	0.000	NA		NA
11626218	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	480.000	0.000	NA		NA
11768610	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	480.000	0.000	NA		NA
11483856	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	508.000	0.000	NA		NA
11626219	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	508.000	0.000	NA		NA
11768611	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	508.000	0.000	NA		NA
11483857	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	540.000	0.000	NA		NA
11626220	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	540.000	0.000	NA		NA
11768612	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	540.000	0.000	NA		NA
11483858	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	568.000	0.000	NA		NA
11626221	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	568.000	0.000	NA		NA
11768613	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	568.000	0.000	NA		NA
11483859	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	600.000	0.000	NA		NA
11626222	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	600.000	0.000	NA		NA
11768614	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	600.000	0.000	NA		NA
11483860	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	628.000	0.000	NA		NA
11626223	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	628.000	0.000	NA		NA
11768615	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	628.000	0.000	NA		NA
11483861	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	660.000	0.000	NA		NA
11626224	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	660.000	0.000	NA		NA
11768616	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	660.000	0.000	NA		NA
11483862	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	688.000	0.000	NA		NA
11626225	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	688.000	0.000	NA		NA
11768617	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	688.000	0.000	NA		NA
11483863	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	720.000	0.000	NA		NA
11626226	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	720.000	0.000	NA		NA
11768618	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	720.000	0.000	NA		NA
11483864	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	748.000	0.000	NA		NA
11626227	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	748.000	0.000	NA		NA
11768619	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	748.000	0.000	NA		NA
11483865	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	780.000	0.000	NA		NA
11626228	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	780.000	0.000	NA		NA
11768620	10388622		YPZ3_2117			FALSE	NA	780.000	0.000	NA		NA
10388624	10388625	YPZ3_2119	YPZ3_2120			TRUE	0.750	39.000	0.000	NA		NA
10388625	10388626	YPZ3_2120	YPZ3_2121			FALSE	0.396	123.000	0.000	NA		NA
10388626	10388627	YPZ3_2121	YPZ3_2122			TRUE	0.788	30.000	0.000	NA		NA
10388627	10388628	YPZ3_2122	YPZ3_2123			TRUE	0.678	147.000	0.000	NA	Y	NA
10388628	10388629	YPZ3_2123	YPZ3_2124			TRUE	0.999	1.000	0.711	0.056	Y	NA
10388629	10388630	YPZ3_2124	YPZ3_2125			TRUE	0.988	109.000	0.733	0.056	Y	NA
10388631	10388632	YPZ3_2126	YPZ3_2127		manB	FALSE	0.405	17.000	0.000	1.000	N	NA
10388632	10388633	YPZ3_2127	YPZ3_2128	manB	mtlK	TRUE	0.750	100.000	0.000	1.000	Y	NA
10388634	10388635	YPZ3_2129	YPZ3_2130			FALSE	0.051	351.000	0.000	NA		NA
10388635	10388636	YPZ3_2130	YPZ3_2131			FALSE	0.004	1283.000	0.000	NA		NA
10388636	10388637	YPZ3_2131	YPZ3_2132			FALSE	0.004	1160.000	0.000	NA		NA
10388637	10388638	YPZ3_2132	YPZ3_2133			TRUE	0.924	2.000	0.000	NA		NA
10388638	10388639	YPZ3_2133	YPZ3_2134			TRUE	0.537	201.000	0.000	1.000	Y	NA
10388639	10388640	YPZ3_2134	YPZ3_2135			FALSE	0.001	653.000	0.000	1.000	N	NA
10388640	10388641	YPZ3_2135	YPZ3_2136			TRUE	0.548	111.000	0.000	0.032	N	NA
10388641	10388642	YPZ3_2136	YPZ3_2137			TRUE	0.498	117.000	0.167	1.000	N	NA
10388642	10388643	YPZ3_2137	YPZ3_2138			FALSE	0.040	617.000	0.333	1.000	N	NA
10388644	10388645	YPZ3_2139	YPZ3_2140			TRUE	0.617	247.000	0.000	0.052	Y	NA
10388646	10388647	YPZ3_2141	YPZ3_2142	rbsC	rbsA	TRUE	0.997	-3.000	0.111	0.005	Y	NA
10388647	10388648	YPZ3_2142	YPZ3_2143	rbsA	rbsB	TRUE	0.954	40.000	0.125	NA	Y	NA
10388648	10388649	YPZ3_2143	YPZ3_2144	rbsB		FALSE	0.315	175.000	0.125	NA	N	NA
10388649	10388650	YPZ3_2144	YPZ3_2145			FALSE	0.007	742.000	0.000	NA		NA
10388650	10388651	YPZ3_2145	YPZ3_2146			FALSE	0.249	196.000	0.000	NA		NA
10388651	10388652	YPZ3_2146	YPZ3_2147			FALSE	0.175	238.000	0.000	NA		NA
10388652	10388653	YPZ3_2147	YPZ3_2148		ompX	FALSE	0.009	316.000	0.000	1.000	N	NA
10388654	10388655	YPZ3_2149	YPZ3_2150			TRUE	0.804	16.000	0.016	1.000		NA
10388655	10388656	YPZ3_2150	YPZ3_2151		tam	TRUE	0.937	23.000	0.000	0.043		NA
10388656	10388657	YPZ3_2151	YPZ3_2152	tam	dps	FALSE	0.125	257.000	0.000	1.000		NA
10388657	10388658	YPZ3_2152	YPZ3_2153	dps		FALSE	0.064	320.000	0.000	1.000		NA
10388658	10388659	YPZ3_2153	YPZ3_2154		glnH	FALSE	0.011	570.000	0.000	1.000		NA
10388659	10388660	YPZ3_2154	YPZ3_2155	glnH	glnP	TRUE	0.974	35.000	0.103	0.071	Y	NA
10388660	10388661	YPZ3_2155	YPZ3_2156	glnP	glnQ	TRUE	0.987	-3.000	0.051	1.000	Y	NA
10388663	10388664	YPZ3_2158	YPZ3_2159			TRUE	0.982	0.000	0.000	1.000	Y	NA
10388664	10388665	YPZ3_2159	YPZ3_2160			TRUE	0.440	95.000	0.000	1.000		NA
10388665	10388666	YPZ3_2160	YPZ3_2161			TRUE	0.986	95.000	1.000	0.065		NA
10388666	10388667	YPZ3_2161	YPZ3_t30			FALSE	0.409	117.000	0.000	NA		NA
10388667	10388668	YPZ3_t30	YPZ3_2162			FALSE	0.076	313.000	0.000	NA		NA
10388668	10388669	YPZ3_2162	YPZ3_2163			TRUE	0.682	193.000	0.286	NA		NA
10388669	10388670	YPZ3_2163	YPZ3_2164		dppA	FALSE	0.002	669.000	0.000	NA	N	NA
10388670	10388671	YPZ3_2164	YPZ3_2165	dppA		TRUE	0.501	307.000	0.087	0.056	Y	NA
10388671	10388672	YPZ3_2165	YPZ3_2166		dppC	TRUE	0.993	82.000	0.779	0.056	Y	NA
10388672	10388673	YPZ3_2166	YPZ3_2167	dppC	dppD	TRUE	0.996	14.000	0.560	1.000	Y	NA
10388673	10388674	YPZ3_2167	YPZ3_2168	dppD	dppF	TRUE	0.999	-3.000	0.500	0.001	Y	NA
10388674	10388675	YPZ3_2168	YPZ3_2169	dppF		FALSE	0.009	319.000	0.000	1.000	N	NA
10388675	10388676	YPZ3_2169	YPZ3_2170			FALSE	0.010	314.000	0.000	1.000	N	NA
10388676	10388677	YPZ3_2170	YPZ3_2171			FALSE	0.024	640.000	0.000	0.099		NA
10388677	10388678	YPZ3_2171	YPZ3_2172		pelY	TRUE	0.483	246.000	0.250	1.000		NA
10388678	10388679	YPZ3_2172	YPZ3_2173	pelY		TRUE	0.756	125.000	0.250	1.000		NA
10388679	10388680	YPZ3_2173	YPZ3_2174		dctA	FALSE	0.020	455.000	0.000	1.000		NA
10388680	10388681	YPZ3_2174	YPZ3_2175	dctA		FALSE	0.068	365.000	0.088	1.000		NA
10388683	10388684	YPZ3_2177	YPZ3_2178			FALSE	0.018	305.000	0.000	NA	N	NA
10388685	10388686	YPZ3_2179	YPZ3_2180	cdh		TRUE	0.895	4.000	0.033	1.000		NA
10388687	10388688	YPZ3_2181	YPZ3_2182	yapE		FALSE	0.289	178.000	0.000	NA		NA
10388688	10388689	YPZ3_2182	YPZ3_2183			TRUE	0.924	2.000	0.000	NA		NA
10388689	10388690	YPZ3_2183	YPZ3_2184			TRUE	0.611	68.000	0.000	NA		NA
10388691	10388692	YPZ3_2185	YPZ3_2186	glxK		TRUE	0.992	11.000	0.295	1.000	Y	NA
10388692	10388693	YPZ3_2186	YPZ3_2187			TRUE	0.595	178.000	0.290	NA	N	NA
10388693	10388694	YPZ3_2187	YPZ3_2188		gor	FALSE	0.066	192.000	0.000	NA	N	NA
10388694	10388695	YPZ3_2188	YPZ3_2189	gor		TRUE	0.472	156.000	0.100	1.000		NA
10388696	10388697	YPZ3_2190	YPZ3_2191	opdA		TRUE	0.952	4.000	0.098	NA		NA
10388698	10388699	YPZ3_2192	YPZ3_2193		gdhA	FALSE	0.022	248.000	0.000	1.000	N	NA
10388699	10388700	YPZ3_2193	YPZ3_2194	gdhA	uspA	FALSE	0.022	247.000	0.000	1.000	N	NA
10388702	10388703	YPZ3_2196	YPZ3_2197			FALSE	0.031	215.000	0.000	1.000	N	NA
10388706	10388707	YPZ3_2200	YPZ3_2201			TRUE	0.947	-7.000	0.000	1.000		NA
10388707	10388708	YPZ3_2201	YPZ3_2202			TRUE	0.947	31.000	0.238	NA		NA
10388708	10388709	YPZ3_2202	YPZ3_2203			TRUE	0.712	75.000	0.095	NA		NA
10388709	10388710	YPZ3_2203	YPZ3_2204			TRUE	0.921	26.000	0.149	NA		NA
10388710	10388711	YPZ3_2204	YPZ3_2205			TRUE	0.987	10.000	0.180	NA	Y	NA
10388713	10388714	YPZ3_2207	YPZ3_2208		gntR	TRUE	0.518	129.000	0.091	NA		NA
10388716	10388717	YPZ3_2210	YPZ3_2211			FALSE	0.006	801.000	0.000	NA		NA
10388719	10388720	YPZ3_2213	YPZ3_2214	asd		FALSE	0.003	3335.000	0.000	1.000		NA
10388722	10388723	YPZ3_2216	YPZ3_2217		glgX	TRUE	0.995	2.000	0.069	0.002	Y	NA
10388723	10388724	YPZ3_2217	YPZ3_2218	glgX	glgC	TRUE	0.989	10.000	0.228	1.000	Y	NA
10388724	10388725	YPZ3_2218	YPZ3_2219	glgC	glgA	TRUE	0.962	68.000	0.307	1.000	Y	NA
10388725	10388726	YPZ3_2219	YPZ3_2220	glgA		TRUE	0.856	153.000	0.228	1.000	Y	NA
10388729	10388730	YPZ3_2223	YPZ3_2224			TRUE	0.874	54.000	0.167	NA		NA
10388731	10388732	YPZ3_2225	YPZ3_2226			TRUE	0.982	0.000	0.000	1.000	Y	NA
10388733	10388734	YPZ3_2227	YPZ3_2228			FALSE	0.004	930.000	0.000	1.000		NA
10388734	10388735	YPZ3_2228	YPZ3_2229		menE	FALSE	0.164	66.000	0.000	1.000	N	NA
10388735	10388736	YPZ3_2229	YPZ3_2230	menE	menC	TRUE	0.996	-12.000	0.283	0.001	N	NA
10388736	10388737	YPZ3_2230	YPZ3_2231	menC	menB	TRUE	0.998	0.000	0.171	0.001	Y	NA
10388737	10388738	YPZ3_2231	YPZ3_2232	menB		TRUE	0.975	14.000	0.280	NA		NA
10388738	10388739	YPZ3_2232	YPZ3_2233		menD	TRUE	0.993	-3.000	0.355	NA		NA
10388739	10388740	YPZ3_2233	YPZ3_2234	menD	menF	TRUE	0.770	228.000	0.281	1.000	Y	NA
10388740	10388741	YPZ3_2234	YPZ3_2235	menF		FALSE	0.015	528.000	0.000	NA		NA
10388741	10388742	YPZ3_2235	YPZ3_2236		elaB	FALSE	0.013	555.000	0.000	NA		NA
10388742	10388743	YPZ3_2236	YPZ3_2237	elaB	edd	FALSE	0.005	926.000	0.000	NA		NA
10388743	10388744	YPZ3_2237	YPZ3_2238	edd		TRUE	0.857	10.000	0.008	NA		NA
10388744	10388745	YPZ3_2238	YPZ3_2239			TRUE	0.789	30.000	0.036	NA		NA
10388745	10388746	YPZ3_2239	YPZ3_2240			FALSE	0.157	546.000	0.667	NA	N	NA
10388746	10388747	YPZ3_2240	YPZ3_2241			FALSE	0.003	466.000	0.000	1.000	N	NA
10388748	10388749	YPZ3_2242	YPZ3_2243		idnO	FALSE	0.006	759.000	0.000	1.000		NA
10388749	10388750	YPZ3_2243	YPZ3_2244	idnO	idnK	TRUE	0.619	49.000	0.095	1.000	N	NA
10388750	10388751	YPZ3_2244	YPZ3_2245	idnK		TRUE	0.882	78.000	0.095	NA	Y	NA
10388752	10388753	YPZ3_2246	YPZ3_2247		nuoN	FALSE	0.140	236.000	0.011	NA		NA
10388753	10388754	YPZ3_2247	YPZ3_2248	nuoN	nuoM	TRUE	0.999	7.000	0.437	0.001	Y	NA
10388754	10388755	YPZ3_2248	YPZ3_2249	nuoM	nuoL	TRUE	0.998	40.000	0.713	0.001	Y	NA
10388755	10388756	YPZ3_2249	YPZ3_2250	nuoL	nuoK	TRUE	0.998	-3.000	0.211	0.004	Y	NA
10388756	10388757	YPZ3_2250	YPZ3_2251	nuoK	nuoJ	TRUE	0.999	-3.000	0.269	0.002	Y	NA
10388757	10388758	YPZ3_2251	YPZ3_2252	nuoJ	nuoI	TRUE	0.998	13.000	0.428	0.004	Y	NA
10388758	10388759	YPZ3_2252	YPZ3_2253	nuoI	nuoH	TRUE	0.997	15.000	0.423	0.004	Y	NA
10388759	10388760	YPZ3_2253	YPZ3_2254	nuoH	nuoG	TRUE	1.000	-3.000	0.664	0.004	Y	NA
10388760	10388761	YPZ3_2254	YPZ3_2255	nuoG	nuoF	TRUE	0.962	87.000	0.180	0.004	Y	NA
10388761	10388762	YPZ3_2255	YPZ3_2256	nuoF	nuoE	TRUE	0.998	-3.000	0.186	0.004	Y	NA
10388762	10388763	YPZ3_2256	YPZ3_2257	nuoE	nuoD	TRUE	0.998	3.000	0.407	0.004	Y	NA
10388763	10388764	YPZ3_2257	YPZ3_2258	nuoD	nuoB	TRUE	0.987	141.000	0.691	0.002	Y	NA
10388764	10388765	YPZ3_2258	YPZ3_2259	nuoB	nuoA	TRUE	0.980	102.000	0.377	0.002	Y	NA
10388765	10388766	YPZ3_2259	YPZ3_2260	nuoA	lrhA	FALSE	0.001	684.000	0.000	1.000	N	NA
10388767	10388768	YPZ3_2261	YPZ3_2262	aat		TRUE	0.488	151.000	0.104	1.000		NA
10388769	10388770	YPZ3_2263	YPZ3_2264			FALSE	0.350	232.000	0.136	1.000		NA
10388770	10388771	YPZ3_2264	YPZ3_2265			TRUE	0.800	165.000	0.375	NA		NA
10388771	10388772	YPZ3_2265	YPZ3_2266			FALSE	0.258	316.000	0.221	NA		NA
10388773	10388774	YPZ3_2267	YPZ3_2268	ackA	pta	TRUE	0.634	378.000	0.634	1.000	Y	NA
10388777	10388778	YPZ3_2271	YPZ3_2272			TRUE	0.743	34.000	0.000	1.000		NA
10388778	10388779	YPZ3_2272	YPZ3_2273			TRUE	0.714	57.000	0.065	1.000		NA
10388779	10388780	YPZ3_2273	YPZ3_2274			FALSE	0.031	407.000	0.000	NA		NA
10388780	10388781	YPZ3_2274	YPZ3_2275			FALSE	0.010	634.000	0.000	NA		NA
10388782	10388783	YPZ3_2276	YPZ3_2277			TRUE	0.806	14.000	0.093	1.000	N	NA
10388783	10388784	YPZ3_2277	YPZ3_2278			FALSE	0.085	294.000	0.000	1.000		NA
10388784	10388785	YPZ3_2278	YPZ3_2279			TRUE	0.991	-33.000	0.000	0.001		NA
10388785	10388786	YPZ3_2279	YPZ3_2280			TRUE	0.889	126.000	0.500	NA		NA
10388786	10388787	YPZ3_2280	YPZ3_2281		rbsA	TRUE	0.992	49.000	0.667	NA	Y	NA
10388787	10388788	YPZ3_2281	YPZ3_2282	rbsA		TRUE	0.995	12.000	0.444	1.000	Y	NA
10388788	10388789	YPZ3_2282	YPZ3_2283			TRUE	0.934	24.000	0.176	1.000		NA
10388789	10388790	YPZ3_2283	YPZ3_2284		rbsK2	TRUE	0.439	125.000	0.064	1.000		NA
10388790	10388791	YPZ3_2284	YPZ3_2285	rbsK2		TRUE	0.970	15.000	0.086	1.000	Y	NA
10388791	10388792	YPZ3_2285	YPZ3_2286			TRUE	0.987	10.000	0.199	1.000	Y	NA
10388797	10388798	YPZ3_2291	YPZ3_2292		ccrB	FALSE	0.004	1018.000	0.000	NA		NA
10388798	10388799	YPZ3_2292	YPZ3_2293	ccrB	lipA	FALSE	0.000	1005.000	0.004	1.000	N	NA
10388799	10388800	YPZ3_2293	YPZ3_2294	lipA		TRUE	0.950	193.000	0.319	0.001	Y	NA
10388800	10388801	YPZ3_2294	YPZ3_2295		dacA	FALSE	0.001	676.000	0.000	1.000	N	NA
10388801	10388802	YPZ3_2295	YPZ3_2296	dacA		TRUE	0.487	403.000	0.475	NA	Y	NA
10388802	10388803	YPZ3_2296	YPZ3_2297		rodA	FALSE	0.346	44.000	0.035	NA	N	NA
10388803	10388804	YPZ3_2297	YPZ3_2298	rodA	pbpA	FALSE	0.068	185.000	0.046	1.000	N	NA
10388804	10388805	YPZ3_2298	YPZ3_2299	pbpA		TRUE	0.517	82.000	0.031	NA		NA
10388805	10388806	YPZ3_2299	YPZ3_2300			TRUE	0.986	4.000	0.307	NA		NA
10388806	10388807	YPZ3_2300	YPZ3_2301		nadD	FALSE	0.186	224.000	0.032	NA		NA
10388807	10388808	YPZ3_2301	YPZ3_2302	nadD	holA	TRUE	0.792	-10.000	0.045	1.000	N	NA
10388808	10388809	YPZ3_2302	YPZ3_2303	holA	rlpB	TRUE	0.974	-3.000	0.199	NA	N	NA
10388809	10388810	YPZ3_2303	YPZ3_2304	rlpB	leuS	TRUE	0.921	15.000	0.182	NA	N	NA
10388812	10388813	YPZ3_2306	YPZ3_2307		gltK	TRUE	0.997	0.000	0.379	1.000	Y	NA
10388813	10388814	YPZ3_2307	YPZ3_2308	gltK		TRUE	1.000	0.000	0.933	0.016	Y	NA
10388814	10388815	YPZ3_2308	YPZ3_2309		glnH	TRUE	0.872	174.000	0.150	0.055	Y	NA
10388815	10388816	YPZ3_2309	YPZ3_2310	glnH	cutE	FALSE	0.001	765.000	0.000	1.000	N	NA
10388816	10388817	YPZ3_2310	YPZ3_2311	cutE		TRUE	0.987	8.000	0.557	1.000	N	NA
10388817	10388818	YPZ3_2311	YPZ3_2312			TRUE	0.659	118.000	0.150	NA		NA
10388818	10388819	YPZ3_2312	YPZ3_2313			TRUE	0.995	-3.000	0.457	NA		NA
10388819	10388820	YPZ3_2313	YPZ3_2314			FALSE	0.136	327.000	0.220	1.000	N	NA
10388822	10388823	YPZ3_t31	YPZ3_t32			TRUE	0.904	6.000	0.000	NA		NA
10388823	10388824	YPZ3_t32	YPZ3_t33			TRUE	0.773	33.000	0.000	NA		NA
10388824	10388825	YPZ3_t33	YPZ3_t34			TRUE	0.788	30.000	0.000	NA		NA
10388825	10388826	YPZ3_t34	YPZ3_t35			TRUE	0.897	8.000	0.000	NA		NA
10388826	10388827	YPZ3_t35	YPZ3_2316		asnB	FALSE	0.022	458.000	0.000	NA		NA
10388827	10388828	YPZ3_2316	YPZ3_2317	asnB	nagD	FALSE	0.006	355.000	0.000	1.000	N	NA
10388828	10388829	YPZ3_2317	YPZ3_2318	nagD	nagC	TRUE	0.866	73.000	0.070	1.000	Y	NA
10388829	10388830	YPZ3_2318	YPZ3_2319	nagC	nagA	TRUE	0.995	17.000	0.571	1.000	Y	NA
10388830	10388831	YPZ3_2319	YPZ3_2320	nagA	nagB	TRUE	0.998	20.000	0.557	0.001	Y	NA
10388832	10388833	YPZ3_2321	YPZ3_2322			FALSE	0.031	214.000	0.000	1.000	N	NA
10388833	10388834	YPZ3_2322	YPZ3_2323		glnS	FALSE	0.036	202.000	0.000	1.000	N	NA
10388834	10388835	YPZ3_2323	YPZ3_2324	glnS		FALSE	0.006	706.000	0.000	1.000		NA
10388835	10388836	YPZ3_2324	YPZ3_2325			FALSE	0.058	328.000	0.000	1.000		NA
10388836	10388837	YPZ3_2325	YPZ3_2326			TRUE	0.959	-22.000	0.054	1.000		NA
10388838	10388839	YPZ3_2327	YPZ3_2328	fur	fldA	FALSE	0.057	367.000	0.156	1.000	N	NA
10388839	10388840	YPZ3_2328	YPZ3_2329	fldA		FALSE	0.001	1036.000	0.000	NA	N	NA
10388840	10388841	YPZ3_2329	YPZ3_2330			FALSE	0.003	1705.000	0.000	NA		NA
10388841	10388842	YPZ3_2330	YPZ3_2331			TRUE	0.840	16.000	0.000	1.000		NA
10388842	10388843	YPZ3_2331	YPZ3_2332			TRUE	0.982	0.000	0.000	1.000	Y	NA
10388845	10388846	YPZ3_2334	YPZ3_2335	proX	proW	TRUE	0.996	48.000	0.695	0.055	Y	NA
10388846	10388847	YPZ3_2335	YPZ3_2336	proW	proV	TRUE	0.999	-7.000	0.630	0.097	Y	NA
10388847	10388848	YPZ3_2336	YPZ3_2337	proV	nrdF	FALSE	0.001	676.000	0.000	1.000	N	NA
10388848	10388849	YPZ3_2337	YPZ3_2338	nrdF	nrdE	TRUE	0.960	107.000	0.190	0.001	Y	NA
10388849	10388850	YPZ3_2338	YPZ3_2339	nrdE	nrdI	TRUE	0.996	-18.000	0.216	NA	Y	NA
10388851	10388852	YPZ3_2340	YPZ3_2341	asr		FALSE	0.019	478.000	0.000	NA		NA
10388853	10388854	YPZ3_2342	YPZ3_2343			TRUE	0.592	165.000	0.167	NA		NA
10388855	10388856	YPZ3_2344	YPZ3_2345	yntA	dppB3	TRUE	1.000	0.000	1.000	0.055	Y	NA
10388856	10388857	YPZ3_2345	YPZ3_2346	dppB3		TRUE	1.000	-3.000	1.000	0.055	Y	NA
10388857	10388858	YPZ3_2346	YPZ3_2347			TRUE	0.998	0.000	1.000	1.000		NA
10388858	10388859	YPZ3_2347	YPZ3_2348			TRUE	0.998	-7.000	0.500	0.021		NA
10388859	10388860	YPZ3_2348	YPZ3_2349		ureA	FALSE	0.014	1199.000	0.000	1.000	Y	NA
10388860	10388861	YPZ3_2349	YPZ3_2350	ureA	ureB	TRUE	0.997	11.000	0.267	0.001	Y	NA
10388861	10388862	YPZ3_2350	YPZ3_2351	ureB	ureC	TRUE	0.978	90.000	0.267	0.001	Y	NA
10388862	10388863	YPZ3_2351	YPZ3_2352	ureC	ureE	FALSE	0.286	296.000	0.067	0.001	N	NA
10388863	10388864	YPZ3_2352	YPZ3_2353	ureE	ureF	TRUE	0.997	22.000	0.460	0.002	Y	NA
10388864	10388865	YPZ3_2353	YPZ3_2354	ureF	ureG	TRUE	0.902	127.000	0.064	0.002	Y	NA
10388865	10388866	YPZ3_2354	YPZ3_2355	ureG		TRUE	0.997	-3.000	0.095	0.002	Y	NA
10388866	10388867	YPZ3_2355	YPZ3_2356			FALSE	0.026	325.000	0.065	1.000	N	NA
10388867	10388868	YPZ3_2356	YPZ3_2357			TRUE	0.558	149.000	0.095	0.063	N	NA
10388871	10388872	YPZ3_2360	YPZ3_2361	ccrB		TRUE	0.993	16.000	0.233	0.097	Y	NA
10388873	10388874	YPZ3_2362	YPZ3_2363	celA	celB	TRUE	0.996	11.000	0.250	0.006	Y	NA
10388874	10388875	YPZ3_2363	YPZ3_2364	celB	celC	TRUE	0.988	167.000	0.833	0.006	Y	NA
10388875	10388876	YPZ3_2364	YPZ3_2365	celC		TRUE	0.973	49.000	0.727	1.000	N	NA
10388876	10388877	YPZ3_2365	YPZ3_2366			TRUE	0.907	52.000	0.222	1.000		NA
10388877	10388878	YPZ3_2366	YPZ3_2367		seqA	FALSE	0.004	1158.000	0.000	1.000		NA
10388878	10388879	YPZ3_2367	YPZ3_2368	seqA	pgm	TRUE	0.639	73.000	0.151	1.000	N	NA
10388880	10388881	YPZ3_2369	YPZ3_2370		kdpE	TRUE	0.673	95.000	0.129	1.000		NA
10388881	10388882	YPZ3_2370	YPZ3_2371	kdpE	kdpD	TRUE	0.694	293.000	0.385	1.000	Y	NA
10388882	10388883	YPZ3_2371	YPZ3_2372	kdpD	kdpC	TRUE	0.949	10.000	0.100	0.097	N	NA
10388883	10388884	YPZ3_2372	YPZ3_2373	kdpC		TRUE	0.985	212.000	0.877	0.001	Y	NA
10388884	10388885	YPZ3_2373	YPZ3_2374		kdpA	TRUE	0.915	199.000	0.201	0.001	Y	NA
10388886	10388887	YPZ3_2375	YPZ3_2376		phrB	FALSE	0.329	130.000	0.019	NA		NA
10388887	10388888	YPZ3_2376	YPZ3_2377	phrB		FALSE	0.407	-9.000	0.008	1.000	N	NA
10388888	10388889	YPZ3_2377	YPZ3_2378			FALSE	0.300	140.000	0.013	NA		NA
10388889	10388890	YPZ3_2378	YPZ3_2379			FALSE	0.010	658.000	0.050	NA		NA
10388890	10388891	YPZ3_2379	YPZ3_2380			TRUE	0.944	105.000	0.379	NA	Y	NA
10388891	10388892	YPZ3_2380	YPZ3_2381			TRUE	0.668	160.000	0.211	NA		NA
10388892	10388893	YPZ3_2381	YPZ3_2382			TRUE	0.779	85.000	0.173	NA		NA
10388893	10388894	YPZ3_2382	YPZ3_2383			TRUE	0.999	-3.000	0.939	NA		NA
10388894	10388895	YPZ3_2383	YPZ3_2384		pcp	TRUE	0.982	10.000	0.300	NA		NA
10388897	10388898	YPZ3_2386	YPZ3_2387		yplA	FALSE	0.261	179.000	0.000	1.000		NA
10388898	10388899	YPZ3_2387	YPZ3_2388	yplA	yplB	TRUE	0.916	78.000	0.375	NA		NA
10388903	10388904	YPZ3_2392	YPZ3_2393	rpoE	rseA	TRUE	0.984	26.000	0.705	NA	N	NA
10388904	10388905	YPZ3_2393	YPZ3_2394	rseA	rseB	TRUE	0.999	0.000	0.856	NA	Y	NA
10388905	10388906	YPZ3_2394	YPZ3_2395	rseB	rseC	TRUE	0.999	-3.000	0.609	NA	Y	NA
10388908	10388909	YPZ3_2397	YPZ3_2398	lepA	lepB	TRUE	0.965	10.000	0.187	1.000		NA
10388909	10388910	YPZ3_2398	YPZ3_2399	lepB		FALSE	0.055	418.000	0.117	1.000		NA
10388910	10388911	YPZ3_2399	YPZ3_2400		era	TRUE	0.991	-3.000	0.127	0.044		NA
10388911	10388912	YPZ3_2400	YPZ3_2401	era	recO	TRUE	0.939	10.000	0.109	1.000		NA
10388912	10388913	YPZ3_2401	YPZ3_2402	recO		TRUE	0.854	127.000	0.000	0.017	Y	NA
10388913	10388914	YPZ3_2402	YPZ3_2403			TRUE	0.982	0.000	0.000	1.000	Y	NA
10388914	10388915	YPZ3_2403	YPZ3_2404		pdxJ	FALSE	0.041	190.000	0.000	1.000	N	NA
10388915	10388916	YPZ3_2404	YPZ3_2405	pdxJ	acpS	TRUE	0.983	0.000	0.326	1.000	N	NA
10388916	10388917	YPZ3_2405	YPZ3_2406	acpS		FALSE	0.059	151.000	0.000	1.000	N	NA
10388919	10388920	YPZ3_2408	YPZ3_2409		yfhB	TRUE	0.572	246.000	0.316	NA		NA
10388920	10388921	YPZ3_2409	YPZ3_2410	yfhB		FALSE	0.380	71.000	0.062	NA	N	NA
10388924	10388925	YPZ3_2413	YPZ3_2414			FALSE	0.023	452.000	0.000	NA		NA
10388926	10388927	YPZ3_2415	YPZ3_2416			FALSE	0.026	230.000	0.000	1.000	N	NA
10388927	10388928	YPZ3_2416	YPZ3_2417			TRUE	0.771	76.000	0.132	NA		NA
10388928	10388929	YPZ3_2417	YPZ3_2418			TRUE	0.982	-37.000	0.130	NA		NA
10388929	10388930	YPZ3_2418	YPZ3_2419		nadE	FALSE	0.147	160.000	0.065	1.000	N	NA
10388930	10388931	YPZ3_2419	YPZ3_2420	nadE	glnB	TRUE	0.890	15.000	0.151	1.000	N	NA
10388932	10388933	YPZ3_2421	YPZ3_2422			TRUE	0.955	-34.000	0.000	NA		NA
10388933	10388934	YPZ3_2422	YPZ3_2423		hmp	FALSE	0.016	509.000	0.000	NA		NA
10388935	10388936	YPZ3_2424	YPZ3_2425	glyA	ail	FALSE	0.003	453.000	0.000	1.000	N	NA
10388936	10388937	YPZ3_2425	YPZ3_2426	ail	hcaT	FALSE	0.044	352.000	0.000	1.000		NA
10388939	10388940	YPZ3_2428	YPZ3_2429			TRUE	0.983	-9.000	0.150	NA		NA
10388941	10388942	YPZ3_2430	YPZ3_2431			FALSE	0.058	153.000	0.000	1.000	N	NA
10388943	10388944	YPZ3_2432	YPZ3_2433			FALSE	0.335	156.000	0.126	1.000	N	NA
10388944	10388945	YPZ3_2433	YPZ3_2434			TRUE	0.928	54.000	0.424	1.000	N	NA
10388945	10388946	YPZ3_2434	YPZ3_2435		nifU	TRUE	0.958	31.000	0.448	1.000	N	NA
10388946	10388947	YPZ3_2435	YPZ3_2436	nifU	hscB	FALSE	0.000	704.000	0.010	1.000	N	NA
10388947	10388948	YPZ3_2436	YPZ3_2437	hscB	hscA	TRUE	0.894	243.000	0.634	1.000	Y	NA
10388948	10388949	YPZ3_2437	YPZ3_2438	hscA	fdx	TRUE	0.995	3.000	0.794	1.000	N	NA
10388949	10388950	YPZ3_2438	YPZ3_2439	fdx	pepB	FALSE	0.001	370.000	0.010	1.000	N	NA
10388950	10388951	YPZ3_2439	YPZ3_2440	pepB		TRUE	0.868	79.000	0.253	NA		NA
10388952	10388953	YPZ3_2441	YPZ3_2442			TRUE	0.949	-34.000	0.000	1.000		NA
10388953	10388954	YPZ3_2442	YPZ3_2443		yapA	FALSE	0.049	558.000	0.000	0.008		NA
10388955	10388956	YPZ3_2444	YPZ3_2445		ndk	FALSE	0.067	327.000	0.000	NA		NA
10388956	10388957	YPZ3_2445	YPZ3_2446	ndk		FALSE	0.298	262.000	0.156	1.000		NA
10388957	10388958	YPZ3_2446	YPZ3_2447			FALSE	0.395	154.000	0.067	1.000		NA
10388958	10388959	YPZ3_2447	YPZ3_2448			TRUE	0.982	-10.000	0.153	1.000		NA
10388959	10388960	YPZ3_2448	YPZ3_2449		aarC	TRUE	0.888	62.000	0.233	1.000		NA
10388960	10388961	YPZ3_2449	YPZ3_2450	aarC	hisS	FALSE	0.363	209.000	0.207	1.000	N	NA
10388961	10388962	YPZ3_2450	YPZ3_2451	hisS		TRUE	0.971	14.000	0.259	1.000		NA
10388962	10388963	YPZ3_2451	YPZ3_2452			TRUE	0.988	12.000	0.492	1.000		NA
10388963	10388964	YPZ3_2452	YPZ3_2453			TRUE	0.662	148.000	0.203	1.000		NA
10388964	10388965	YPZ3_2453	YPZ3_2454			FALSE	0.116	347.000	0.003	0.063		NA
10388967	10388968	YPZ3_2456	YPZ3_2457	guaB	guaA	TRUE	0.841	180.000	0.190	0.001		NA
10388968	10388969	YPZ3_2457	YPZ3_2458	guaA		FALSE	0.009	324.000	0.000	1.000	N	NA
10388970	10388971	YPZ3_2459	YPZ3_2460			TRUE	0.819	24.000	0.000	NA		NA
10388971	10388972	YPZ3_2460	YPZ3_2461			FALSE	0.005	980.000	0.000	NA		NA
10388972	10388973	YPZ3_2461	YPZ3_2462			TRUE	0.948	-3.000	0.000	NA		NA
10388979	10388980	YPZ3_2468	YPZ3_2469			FALSE	0.001	636.000	0.000	1.000	N	NA
10388980	10388981	YPZ3_2469	YPZ3_2470			FALSE	0.038	350.000	0.008	NA		NA
10388981	10388982	YPZ3_2470	YPZ3_2471		baeR	FALSE	0.433	137.000	0.062	NA		NA
10388982	10388983	YPZ3_2471	YPZ3_2472	baeR		TRUE	0.825	279.000	0.591	1.000	Y	NA
10388983	10388984	YPZ3_2472	YPZ3_2473		yegB	TRUE	0.898	31.000	0.139	1.000		NA
10388984	10388985	YPZ3_2473	YPZ3_2474	yegB		TRUE	0.971	34.000	0.438	1.000		NA
10388985	10388986	YPZ3_2474	YPZ3_2475			TRUE	0.991	-3.000	0.094	NA	Y	NA
10388986	10388987	YPZ3_2475	YPZ3_2476			TRUE	0.998	0.000	1.000	NA	N	NA
10388987	10388988	YPZ3_2476	YPZ3_2477			FALSE	0.006	364.000	0.000	1.000	N	NA
10388988	10388989	YPZ3_2477	YPZ3_2478			FALSE	0.123	383.000	0.000	1.000	Y	NA
10388990	10388991	YPZ3_2479	YPZ3_2480	goaG		TRUE	0.893	53.000	0.000	1.000	Y	NA
10388991	10388992	YPZ3_2480	YPZ3_2481			TRUE	0.957	47.000	0.000	0.054	Y	NA
10388992	10388993	YPZ3_2481	YPZ3_2482			TRUE	0.950	62.000	0.072	0.054	Y	NA
10388994	10388995	YPZ3_2483	YPZ3_2484		mgtE	FALSE	0.100	140.000	0.000	NA	N	NA
10388995	10388996	YPZ3_2484	YPZ3_2485	mgtE	ppx	FALSE	0.120	376.000	0.018	1.000	Y	NA
10388996	10388997	YPZ3_2485	YPZ3_2486	ppx	ppk	TRUE	0.995	11.000	0.486	1.000	Y	NA
10388998	10388999	YPZ3_2487	YPZ3_2488		pstA	TRUE	0.997	0.000	0.489	0.096		NA
10388999	10389000	YPZ3_2488	YPZ3_2489	pstA	pstb	TRUE	0.997	28.000	0.511	0.002	Y	NA
10389000	10389001	YPZ3_2489	YPZ3_2490	pstb		FALSE	0.189	228.000	0.000	NA		NA
10389001	10389002	YPZ3_2490	YPZ3_2491			TRUE	0.509	87.000	0.000	NA		NA
10389003	10389004	YPZ3_2492	YPZ3_2493	speG	purN	FALSE	0.008	229.000	0.017	1.000	N	NA
10389004	10389005	YPZ3_2493	YPZ3_2494	purN	purI	TRUE	0.961	115.000	0.230	0.002	Y	NA
10389006	10389007	YPZ3_2495	YPZ3_2496	upp		FALSE	0.070	125.000	0.000	1.000	N	NA
10389011	10389012	YPZ3_2499	YPZ3_2500			TRUE	0.996	-7.000	0.179	0.002		NA
10389012	10389013	YPZ3_2500	YPZ3_2501			TRUE	0.974	10.000	0.238	1.000		NA
10389013	10389014	YPZ3_2501	YPZ3_2502			TRUE	0.988	-3.000	0.054	NA	Y	NA
10389014	10389015	YPZ3_2502	YPZ3_2503			TRUE	0.898	137.000	0.285	NA	Y	NA
10389015	10389016	YPZ3_2503	YPZ3_2504			TRUE	0.966	-18.000	0.063	NA		NA
10389016	10389017	YPZ3_2504	YPZ3_2505			TRUE	0.463	97.000	0.000	NA		NA
10389018	10389019	YPZ3_2506	YPZ3_2507			TRUE	0.982	0.000	0.000	1.000	Y	NA
10389021	10389022	YPZ3_2509	YPZ3_2510			TRUE	0.976	26.000	0.438	1.000		NA
10389024	10389025	YPZ3_2512	YPZ3_2513	bglB		FALSE	0.329	159.000	0.000	NA		NA
10389025	10389026	YPZ3_2513	YPZ3_2514			TRUE	0.967	-7.000	0.068	NA		NA
10389027	10389028	YPZ3_2515	YPZ3_2516			TRUE	0.551	79.000	0.000	NA		NA
10389029	10389030	YPZ3_2517	YPZ3_2518		yapC	FALSE	0.015	535.000	0.000	NA		NA
10389032	10389033	YPZ3_2520	YPZ3_2521			FALSE	0.004	1131.000	0.000	NA		NA
10389033	10389034	YPZ3_2521	YPZ3_2522			FALSE	0.305	157.000	0.000	1.000		NA
10389036	10389037	YPZ3_2524	YPZ3_2525			TRUE	0.659	222.000	0.143	0.009		NA
10389037	10389038	YPZ3_2525	YPZ3_2526		rtn2	FALSE	0.266	188.000	0.000	NA		NA
10389040	10389041	YPZ3_2528	YPZ3_2529	hisP	hisM	TRUE	0.997	14.000	0.643	1.000	Y	NA
10389041	10389042	YPZ3_2529	YPZ3_2530	hisM	hisQ	TRUE	1.000	-3.000	0.900	0.016	Y	NA
10389042	10389043	YPZ3_2530	YPZ3_2531	hisQ	hisJ	TRUE	0.991	103.000	0.833	0.054	Y	NA
10389043	10389044	YPZ3_2531	YPZ3_2532	hisJ	ubiX	FALSE	0.004	399.000	0.000	1.000	N	NA
10389044	10389045	YPZ3_2532	YPZ3_2533	ubiX	purF	FALSE	0.051	247.000	0.056	1.000	N	NA
10389045	10389046	YPZ3_2533	YPZ3_2534	purF	cvpA	TRUE	0.973	13.000	0.262	1.000		NA
10389046	10389047	YPZ3_2534	YPZ3_2535	cvpA	dedD	FALSE	0.154	312.000	0.116	NA		NA
10389047	10389048	YPZ3_2535	YPZ3_2536	dedD	folC	TRUE	0.740	120.000	0.216	NA		NA
10389048	10389049	YPZ3_2536	YPZ3_2537	folC	accD	TRUE	0.480	249.000	0.383	1.000	N	NA
10389049	10389050	YPZ3_2537	YPZ3_2538	accD	dedA	FALSE	0.157	231.000	0.020	NA		NA
10389050	10389051	YPZ3_2538	YPZ3_2539	dedA	truA	FALSE	0.336	157.000	0.038	NA		NA
10389051	10389052	YPZ3_2539	YPZ3_2540	truA		TRUE	0.678	0.000	0.040	1.000	N	NA
10389052	10389053	YPZ3_2540	YPZ3_2541		pdxB	TRUE	0.868	170.000	0.097	0.009	Y	NA
10389053	10389054	YPZ3_2541	YPZ3_2542	pdxB		FALSE	0.310	47.000	0.043	1.000	N	NA
10389055	10389056	YPZ3_2543	YPZ3_2544		flk	FALSE	0.210	285.000	0.118	NA		NA
10389061	10389062	YPZ3_2549	YPZ3_2550			TRUE	0.705	100.000	0.153	NA		NA
10389062	10389063	YPZ3_2550	YPZ3_2551		mepA	TRUE	0.966	4.000	0.160	1.000		NA
10389063	10389064	YPZ3_2551	YPZ3_2552	mepA	aroC	FALSE	0.268	6.000	0.025	1.000	N	NA
10389064	10389065	YPZ3_2552	YPZ3_2553	aroC		FALSE	0.397	77.000	0.081	1.000	N	NA
10389067	10389068	YPZ3_2555	YPZ3_2556	sixA	faoA	FALSE	0.002	569.000	0.000	1.000	N	NA
10389068	10389069	YPZ3_2556	YPZ3_2557	faoA		TRUE	0.997	0.000	0.430	1.000	Y	NA
10389071	10389072	YPZ3_2559	YPZ3_2560	vacJ		TRUE	0.892	36.000	0.239	1.000	N	NA
10389072	10389073	YPZ3_2560	YPZ3_2561		ccmH	TRUE	0.999	0.000	0.727	NA	Y	NA
10389073	10389074	YPZ3_2561	YPZ3_2562	ccmH	ccmG	TRUE	0.999	-3.000	0.578	NA	Y	NA
10389074	10389075	YPZ3_2562	YPZ3_2563	ccmG	ccmF	TRUE	1.000	-3.000	0.804	0.002	Y	NA
10389075	10389076	YPZ3_2563	YPZ3_2564	ccmF	ccmE	TRUE	0.998	-3.000	0.211	0.002	Y	NA
10389076	10389077	YPZ3_2564	YPZ3_2565	ccmE	ccmD	TRUE	0.988	-3.000	0.344	1.000	N	NA
10389077	10389078	YPZ3_2565	YPZ3_2566	ccmD	ccmC	TRUE	0.993	-3.000	0.501	1.000	N	NA
10389078	10389079	YPZ3_2566	YPZ3_2567	ccmC	ccmB	TRUE	0.994	63.000	0.501	0.001	Y	NA
10389079	10389080	YPZ3_2567	YPZ3_2568	ccmB	ccmA	TRUE	0.999	-30.000	0.503	0.002	Y	NA
10389080	10389081	YPZ3_2568	YPZ3_2569	ccmA		FALSE	0.024	445.000	0.000	NA		NA
10389081	10389082	YPZ3_2569	YPZ3_t37			FALSE	0.143	255.000	0.000	NA		NA
10389083	10389084	YPZ3_2570	YPZ3_2571	lemA		TRUE	0.937	5.000	0.074	NA		NA
10389084	10389085	YPZ3_2571	YPZ3_2572			FALSE	0.040	376.000	0.000	NA		NA
10389086	10389087	YPZ3_2573	YPZ3_2574			TRUE	0.813	25.000	0.000	NA		NA
10389087	10389088	YPZ3_2574	YPZ3_2575			TRUE	0.974	97.000	1.000	NA		NA
10389088	10389089	YPZ3_2575	YPZ3_2576			TRUE	0.994	20.000	0.833	NA		NA
10389089	10389090	YPZ3_2576	YPZ3_2577			FALSE	0.046	359.000	0.000	NA		NA
10389090	10389091	YPZ3_2577	YPZ3_2578			FALSE	0.067	327.000	0.000	NA		NA
10389091	10389092	YPZ3_2578	YPZ3_2579			TRUE	0.895	9.000	0.000	NA		NA
10389092	10389093	YPZ3_2579	YPZ3_2580			FALSE	0.087	292.000	0.000	1.000		NA
10389093	10389094	YPZ3_2580	YPZ3_2581			TRUE	0.982	0.000	0.000	1.000	Y	NA
10389094	10389095	YPZ3_2581	YPZ3_2582			TRUE	0.870	14.000	0.000	NA		NA
10389095	10389096	YPZ3_2582	YPZ3_2583			TRUE	0.924	60.000	0.294	NA		NA
10389096	10389097	YPZ3_2583	YPZ3_2584			TRUE	0.997	4.000	0.833	NA		NA
10389097	10389098	YPZ3_2584	YPZ3_2585			TRUE	0.505	274.000	0.333	NA		NA
10389098	10389099	YPZ3_2585	YPZ3_2586			TRUE	0.484	326.000	0.500	NA		NA
10389099	10389100	YPZ3_2586	YPZ3_2587			TRUE	0.992	24.000	0.800	NA		NA
10389100	10389101	YPZ3_2587	YPZ3_2588			TRUE	0.941	105.000	0.667	NA		NA
10389101	10389102	YPZ3_2588	YPZ3_2589			TRUE	0.998	-15.000	0.833	1.000		NA
10389104	10389105	YPZ3_2591	YPZ3_2592			TRUE	0.799	299.000	1.000	1.000		NA
10389105	10389106	YPZ3_2592	YPZ3_2593			TRUE	0.980	157.000	1.000	1.000	Y	NA
10389106	10389107	YPZ3_2593	YPZ3_2594		clpB	TRUE	0.894	201.000	1.000	1.000	N	NA
10389108	10389109	YPZ3_2595	YPZ3_2596			TRUE	0.998	0.000	0.833	NA		NA
10389109	10389110	YPZ3_2596	YPZ3_2597			TRUE	0.973	99.000	1.000	NA		NA
10389110	10389111	YPZ3_2597	YPZ3_2598			TRUE	0.944	115.000	0.714	NA		NA
10389111	10389112	YPZ3_2598	YPZ3_2599			TRUE	0.986	40.000	0.714	NA		NA
10389112	10389113	YPZ3_2599	YPZ3_2600			TRUE	0.997	-3.000	0.600	NA		NA
10389113	10389114	YPZ3_2600	YPZ3_2601			TRUE	0.992	1.000	0.400	NA		NA
10389114	10389115	YPZ3_2601	YPZ3_2602			TRUE	0.980	84.000	1.000	NA		NA
10389116	10389117	YPZ3_2603	YPZ3_2604			FALSE	0.001	1255.000	0.000	NA	N	NA
10389118	10389119	YPZ3_2605	YPZ3_2606	sfuA	sfuB	TRUE	0.996	56.000	0.824	0.053	Y	NA
10389119	10389120	YPZ3_2606	YPZ3_2607	sfuB	sfuC	TRUE	0.993	-3.000	0.275	0.053	N	NA
10389121	10389122	YPZ3_2608	YPZ3_2609			FALSE	0.004	1176.000	0.000	NA		NA
10389123	10389124	YPZ3_2610	YPZ3_2611	dmsA	dmsB	TRUE	0.998	12.000	0.500	0.031	Y	NA
10389124	10389125	YPZ3_2611	YPZ3_2612	dmsB	dmsC	TRUE	0.996	2.000	0.667	1.000		NA
10389125	10389126	YPZ3_2612	YPZ3_2613	dmsC		FALSE	0.028	404.000	0.000	1.000		NA
10389126	10389127	YPZ3_2613	YPZ3_2614			TRUE	0.993	-3.000	0.333	NA		NA
10389128	10389129	YPZ3_2615	YPZ3_2616			TRUE	0.998	-3.000	0.740	NA		NA
10389129	10389130	YPZ3_2616	YPZ3_2617			TRUE	0.986	27.000	0.625	NA		NA
10389132	10389133	YPZ3_2619	YPZ3_2620			FALSE	0.005	264.000	0.009	1.000	N	NA
10389135	10389136	YPZ3_2622	YPZ3_2623	glk		FALSE	0.308	181.000	0.048	NA		NA
10389137	10389138	YPZ3_2624	YPZ3_2625			FALSE	0.115	136.000	0.050	1.000	N	NA
10389138	10389139	YPZ3_2625	YPZ3_2626			FALSE	0.391	171.000	0.071	NA		NA
10389142	10389143	YPZ3_t38	YPZ3_t39			FALSE	0.244	200.000	0.000	NA		NA
10389143	10389144	YPZ3_t39	YPZ3_t40			TRUE	0.732	45.000	0.000	NA		NA
10389144	10389145	YPZ3_t40	YPZ3_t41			TRUE	0.756	37.000	0.000	NA		NA
10389146	10389147	YPZ3_2629	YPZ3_2630	gltX		FALSE	0.062	142.000	0.000	1.000	N	NA
10389147	10389148	YPZ3_2630	YPZ3_t42			FALSE	0.100	291.000	0.000	NA		NA
10389148	10389149	YPZ3_t42	YPZ3_t43			TRUE	0.558	78.000	0.000	NA		NA
10389149	10389150	YPZ3_t43	YPZ3_2631			FALSE	0.253	195.000	0.000	NA		NA
10389150	10389151	YPZ3_2631	YPZ3_2632			FALSE	0.344	132.000	0.027	NA		NA
10389152	10389153	YPZ3_2633	YPZ3_2634			FALSE	0.019	133.000	0.013	1.000	N	NA
10389154	10389155	YPZ3_2635	YPZ3_2636		cysK	TRUE	0.764	157.000	0.122	1.000	Y	NA
10389155	10389156	YPZ3_2636	YPZ3_2637	cysK	ptsI	FALSE	0.001	805.000	0.000	1.000	N	NA
10389156	10389157	YPZ3_2637	YPZ3_2638	ptsI	crr	TRUE	0.965	49.000	0.038	0.006	Y	NA
10389158	10389159	YPZ3_2639	YPZ3_2640			FALSE	0.030	219.000	0.000	1.000	N	NA
10389159	10389160	YPZ3_2640	YPZ3_2641			TRUE	0.978	26.000	0.216	1.000	Y	NA
10389161	10389162	YPZ3_2642	YPZ3_2643			TRUE	0.992	4.000	0.439	0.094	N	NA
10389163	10389164	YPZ3_2644	YPZ3_2645			TRUE	0.623	60.000	0.000	1.000		NA
10389164	10389165	YPZ3_2645	YPZ3_2646			FALSE	0.189	337.000	0.000	1.000	Y	NA
10389165	10389166	YPZ3_2646	YPZ3_2647			FALSE	0.410	246.000	0.000	1.000	Y	NA
10389167	10389168	YPZ3_2648	YPZ3_2649			FALSE	0.181	233.000	0.000	NA		NA
10389168	10389169	YPZ3_2649	YPZ3_2650			TRUE	0.985	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
10389170	10389171	YPZ3_2651	YPZ3_2652		cysM	FALSE	0.162	245.000	0.000	NA		NA
10389171	10389172	YPZ3_2652	YPZ3_2653	cysM	cysA	FALSE	0.084	171.000	0.049	1.000	N	NA
10389172	10389173	YPZ3_2653	YPZ3_2654	cysA	cysW	TRUE	0.995	-10.000	0.180	1.000	Y	NA
10389173	10389174	YPZ3_2654	YPZ3_2655	cysW	cysT	TRUE	0.998	0.000	0.583	0.001	N	NA
10389174	10389175	YPZ3_2655	YPZ3_2656	cysT	cysP	TRUE	0.997	0.000	0.479	0.002	N	NA
10389175	10389176	YPZ3_2656	YPZ3_2657	cysP		FALSE	0.009	315.000	0.000	1.000	N	NA
10389176	10389177	YPZ3_2657	YPZ3_2658			FALSE	0.001	605.000	0.000	1.000	N	NA
10389177	10389178	YPZ3_2658	YPZ3_2659			FALSE	0.345	189.000	0.154	NA	N	NA
10389178	10389179	YPZ3_2659	YPZ3_2660			TRUE	0.905	82.000	0.154	NA	Y	NA
10389180	10389181	YPZ3_2661	YPZ3_2662			TRUE	0.695	53.000	0.000	NA		NA
10389181	10389182	YPZ3_2662	YPZ3_2663			FALSE	0.108	284.000	0.000	NA		NA
10389182	10389183	YPZ3_2663	YPZ3_2664			TRUE	0.494	63.000	0.087	1.000	N	NA
10389184	10389185	YPZ3_2665	YPZ3_2666			TRUE	0.755	178.000	0.333	NA		NA
10389186	10389187	YPZ3_2667	YPZ3_2668			FALSE	0.018	487.000	0.000	NA		NA
10389188	10389189	YPZ3_2669	YPZ3_2670			FALSE	0.020	473.000	0.000	NA		NA
10389190	10389191	YPZ3_2671	YPZ3_2672	hemF		TRUE	0.921	0.000	0.016	NA		NA
10389192	10389193	YPZ3_2673	YPZ3_2674			TRUE	0.449	196.000	0.047	0.005	N	NA
10389193	10389194	YPZ3_2674	YPZ3_2675		napC	FALSE	0.136	184.000	0.070	1.000	N	NA
10389194	10389195	YPZ3_2675	YPZ3_2676	napC	napB	TRUE	0.992	25.000	0.490	1.000	Y	NA
10389195	10389196	YPZ3_2676	YPZ3_2677	napB	napA	TRUE	0.874	152.000	0.031	0.001	Y	NA
10389196	10389197	YPZ3_2677	YPZ3_2678	napA	napF	FALSE	0.364	253.000	0.000	0.030		NA
10389198	10389199	YPZ3_2679	YPZ3_2680	narP		FALSE	0.001	706.000	0.034	1.000	N	NA
10389199	10389200	YPZ3_2680	YPZ3_2681			FALSE	0.184	231.000	0.000	NA		NA
10389200	10389201	YPZ3_2681	YPZ3_2682			FALSE	0.102	289.000	0.000	NA		NA
10389202	10389203	YPZ3_2683	YPZ3_2684			TRUE	0.969	58.000	0.600	1.000		NA
10389203	10389204	YPZ3_2684	YPZ3_2685			FALSE	0.002	547.000	0.000	1.000	N	NA
10389204	10389205	YPZ3_2685	YPZ3_2686			TRUE	0.998	-7.000	0.585	0.053	N	NA
10389205	10389206	YPZ3_2686	YPZ3_2687			TRUE	0.989	95.000	0.688	0.053	Y	NA
10389207	10389208	YPZ3_2688	YPZ3_2689			FALSE	0.229	160.000	0.006	1.000		NA
10389208	10389209	YPZ3_2689	YPZ3_2690		dapE	TRUE	0.977	2.000	0.292	1.000	N	NA
10389209	10389210	YPZ3_2690	YPZ3_2691	dapE		TRUE	0.988	-3.000	0.163	0.019	N	NA
10389211	10389212	YPZ3_2692	YPZ3_2693			TRUE	0.959	2.000	0.100	NA		NA
10389212	10389213	YPZ3_2693	YPZ3_2694			FALSE	0.424	94.000	0.018	NA		NA
10389213	10389214	YPZ3_2694	YPZ3_2695		purC	FALSE	0.155	219.000	0.004	NA		NA
10389214	10389215	YPZ3_2695	YPZ3_2696	purC		FALSE	0.060	148.000	0.000	1.000	N	NA
10389215	10389216	YPZ3_2696	YPZ3_2697		dapX	FALSE	0.114	124.000	0.000	NA	N	NA
10389216	10389217	YPZ3_2697	YPZ3_2698	dapX	dapA	TRUE	0.954	18.000	0.032	NA	Y	NA
10389218	10389219	YPZ3_2699	YPZ3_2700			TRUE	0.889	3.000	0.102	1.000	N	NA
10389220	10389221	YPZ3_2701	YPZ3_2702			FALSE	0.011	600.000	0.000	NA		NA
10389222	10389223	YPZ3_2703	YPZ3_2704			TRUE	0.795	107.000	0.259	1.000		NA
10389224	10389225	YPZ3_2705	YPZ3_2706			TRUE	0.618	176.000	0.000	NA	Y	NA
10389225	10389226	YPZ3_2706	YPZ3_2707		cysS	FALSE	0.012	296.000	0.000	1.000	N	NA
10389227	10389228	YPZ3_2708	YPZ3_2709	ppiB		TRUE	0.972	11.000	0.237	1.000		NA
10389228	10389229	YPZ3_2709	YPZ3_2710		purE	FALSE	0.066	296.000	0.016	1.000		NA
10389229	10389230	YPZ3_2710	YPZ3_2711	purE	purK	TRUE	0.998	-3.000	0.136	0.001	Y	NA
10389231	10389232	YPZ3_2712	YPZ3_2713			TRUE	0.998	-3.000	0.535	1.000	Y	NA
10389233	10389234	YPZ3_2714	YPZ3_2715			FALSE	0.048	387.000	0.072	1.000		NA
10389234	10389235	YPZ3_2715	YPZ3_2716			TRUE	0.728	77.000	0.118	1.000		NA
10389235	10389236	YPZ3_2716	YPZ3_2717			TRUE	0.622	195.000	0.075	1.000	Y	NA
10389236	10389237	YPZ3_2717	YPZ3_2718			TRUE	0.995	3.000	0.313	NA	Y	NA
10389239	10389240	YPZ3_2720	YPZ3_2721			FALSE	0.013	521.000	0.018	NA		NA
10389240	10389241	YPZ3_2721	YPZ3_2722			FALSE	0.111	264.000	0.022	NA		NA
10389242	10389243	YPZ3_2723	YPZ3_2724			TRUE	0.991	-6.000	0.039	0.001		NA
10389244	10389245	YPZ3_2725	YPZ3_2726	rosA	rosB	TRUE	0.460	235.000	0.000	NA	Y	NA
10389246	10389247	YPZ3_2727	YPZ3_2728			FALSE	0.026	276.000	0.000	NA	N	NA
10389247	10389248	YPZ3_2728	YPZ3_2729		manB	FALSE	0.011	348.000	0.000	NA	N	NA
10389248	10389249	YPZ3_2729	YPZ3_2730	manB	wbyL	TRUE	0.746	5.000	0.049	NA	N	NA
10389249	10389250	YPZ3_2730	YPZ3_2731	wbyL		TRUE	0.983	3.000	0.073	NA	Y	NA
10389250	10389251	YPZ3_2731	YPZ3_2732		wcaG	TRUE	0.542	194.000	0.028	1.000	Y	NA
10389251	10389252	YPZ3_2732	YPZ3_2733	wcaG		TRUE	0.974	6.000	0.000	0.008		NA
10389252	10389253	YPZ3_2733	YPZ3_2734			TRUE	0.976	11.000	0.000	0.001		NA
10389253	10389254	YPZ3_2734	YPZ3_2735		wbyK	TRUE	0.840	16.000	0.000	1.000		NA
10389254	10389255	YPZ3_2735	YPZ3_2736	wbyK		FALSE	0.154	249.000	0.000	NA		NA
10389255	10389256	YPZ3_2736	YPZ3_2737		wbyJ	FALSE	0.071	322.000	0.000	NA		NA
10389256	10389257	YPZ3_2737	YPZ3_2738	wbyJ		FALSE	0.038	380.000	0.000	NA		NA
10389257	10389258	YPZ3_2738	YPZ3_2739		wzx	TRUE	0.884	11.000	0.000	NA		NA
10389258	10389259	YPZ3_2739	YPZ3_2740	wzx	wbyH	TRUE	0.577	74.000	0.000	NA		NA
10389259	10389260	YPZ3_2740	YPZ3_2741	wbyH	prt	TRUE	0.718	1.000	0.000	NA	N	NA
10389260	10389261	YPZ3_2741	YPZ3_2742	prt	ddhC	TRUE	0.919	37.000	0.000	1.000	Y	NA
10389261	10389262	YPZ3_2742	YPZ3_2743	ddhC		TRUE	0.986	18.000	0.247	1.000	Y	NA
10389262	10389263	YPZ3_2743	YPZ3_2744		ddhA	TRUE	0.974	180.000	0.624	0.011	Y	NA
10389263	10389264	YPZ3_2744	YPZ3_2745	ddhA	ddhD	FALSE	0.278	38.000	0.038	1.000	N	NA
10389264	10389265	YPZ3_2745	YPZ3_2746	ddhD	hemH	FALSE	0.001	598.000	0.000	1.000	N	NA
10389265	10389266	YPZ3_2746	YPZ3_2747	hemH	adk	FALSE	0.031	90.000	0.008	1.000	N	NA
10389266	10389267	YPZ3_2747	YPZ3_2748	adk	htpG	FALSE	0.224	227.000	0.035	0.099	N	NA
10389267	10389268	YPZ3_2748	YPZ3_2749	htpG		FALSE	0.021	192.000	0.028	1.000	N	NA
10389268	10389269	YPZ3_2749	YPZ3_2750			TRUE	0.985	30.000	0.604	NA		NA
10389269	10389270	YPZ3_2750	YPZ3_2751		dnaX	TRUE	0.953	56.000	0.411	NA		NA
10389270	10389271	YPZ3_2751	YPZ3_2752	dnaX	apt	FALSE	0.005	656.000	0.088	1.000	N	NA
10389273	10389274	YPZ3_2754	YPZ3_2755	kefA		FALSE	0.035	296.000	0.054	NA	N	NA
10389274	10389275	YPZ3_2755	YPZ3_2756		acrR	TRUE	0.799	13.000	0.075	NA	N	NA
10389276	10389277	YPZ3_2757	YPZ3_2758	acrA	acrB	TRUE	0.977	17.000	0.500	1.000	N	NA
10389277	10389278	YPZ3_2758	YPZ3_2759	acrB		FALSE	0.003	1479.000	0.000	NA		NA
10389278	10389279	YPZ3_2759	YPZ3_2760			TRUE	0.822	159.000	0.400	NA		NA
10389279	10389280	YPZ3_2760	YPZ3_2761			FALSE	0.004	1140.000	0.000	NA		NA
10389283	10389284	YPZ3_2764	YPZ3_2765	amt	glnK	TRUE	0.806	37.000	0.156	1.000	N	NA
10389284	10389285	YPZ3_2765	YPZ3_2766	glnK	mdlB	FALSE	0.002	410.000	0.028	1.000	N	NA
10389285	10389286	YPZ3_2766	YPZ3_2767	mdlB	mdlA	TRUE	1.000	-7.000	0.911	0.006	Y	NA
10389286	10389287	YPZ3_2767	YPZ3_2768	mdlA		TRUE	0.565	102.000	0.179	1.000	N	NA
10389290	10389291	YPZ3_2771	YPZ3_2772			FALSE	0.095	265.000	0.019	1.000		NA
10389292	10389293	YPZ3_2773	YPZ3_2774			FALSE	0.043	354.000	0.000	1.000		NA
10389293	10389294	YPZ3_2774	YPZ3_2775		ppiD	FALSE	0.062	140.000	0.000	1.000	N	NA
10389294	10389295	YPZ3_2775	YPZ3_2776	ppiD	lon	FALSE	0.019	791.000	0.015	1.000	Y	NA
10389295	10389296	YPZ3_2776	YPZ3_2777	lon	clpX	TRUE	0.864	195.000	0.201	0.099	Y	NA
10389296	10389297	YPZ3_2777	YPZ3_2778	clpX	clpP	TRUE	0.848	206.000	0.352	1.000	Y	NA
10389297	10389298	YPZ3_2778	YPZ3_2779	clpP	tig	FALSE	0.294	462.000	0.351	1.000	Y	NA
10389298	10389299	YPZ3_2779	YPZ3_2780	tig	bolA	FALSE	0.006	417.000	0.000	NA	N	NA
10389300	10389301	YPZ3_2781	YPZ3_2782		ampG	TRUE	0.677	118.000	0.256	NA	N	NA
10389301	10389302	YPZ3_2782	YPZ3_2783	ampG		FALSE	0.098	292.000	0.000	NA		NA
10389302	10389303	YPZ3_2783	YPZ3_2784		cyoA	FALSE	0.043	370.000	0.000	NA		NA
10389303	10389304	YPZ3_2784	YPZ3_2785	cyoA	cyoB	TRUE	0.996	5.000	0.204	0.003	Y	NA
10389304	10389305	YPZ3_2785	YPZ3_2786	cyoB		TRUE	0.976	185.000	0.697	0.030	Y	NA
10389305	10389306	YPZ3_2786	YPZ3_2787		cyoD	TRUE	0.999	0.000	0.485	0.030	Y	NA
10389306	10389307	YPZ3_2787	YPZ3_2788	cyoD		TRUE	0.951	14.000	0.118	0.061	N	NA
10389307	10389308	YPZ3_2788	YPZ3_2789			FALSE	0.006	556.000	0.061	NA	N	NA
10389310	10389311	YPZ3_2791	YPZ3_2792		thiJ	TRUE	0.984	-37.000	0.155	NA		NA
10389313	10389314	YPZ3_2794	YPZ3_2795	ispA	dxs	TRUE	0.686	156.000	0.060	1.000	Y	NA
10389315	10389316	YPZ3_2796	YPZ3_2797		pgpA	FALSE	0.053	163.000	0.000	1.000	N	NA
10389316	10389317	YPZ3_2797	YPZ3_2798	pgpA		TRUE	0.976	-7.000	0.206	1.000	N	NA
10389317	10389318	YPZ3_2798	YPZ3_2799		nusB	FALSE	0.120	346.000	0.225	1.000	N	NA
10389318	10389319	YPZ3_2799	YPZ3_2800	nusB	ribH	TRUE	0.957	21.000	0.347	1.000	N	NA
10389319	10389320	YPZ3_2800	YPZ3_2801	ribH	ribD	TRUE	0.877	136.000	0.034	0.002	Y	NA
10389320	10389321	YPZ3_2801	YPZ3_2802	ribD		TRUE	0.641	150.000	0.277	NA	N	NA
10389321	10389322	YPZ3_2802	YPZ3_2803			TRUE	0.591	71.000	0.000	NA		NA
10389322	10389323	YPZ3_2803	YPZ3_2804			TRUE	0.773	33.000	0.000	NA		NA
10389323	10389324	YPZ3_2804	YPZ3_2805			FALSE	0.090	298.000	0.000	NA		NA
10389324	10389325	YPZ3_2805	YPZ3_2806		secF	FALSE	0.057	156.000	0.000	1.000	N	NA
10389325	10389326	YPZ3_2806	YPZ3_2807	secF		TRUE	0.996	11.000	0.206	0.001	Y	NA
10389326	10389327	YPZ3_2807	YPZ3_2808		yajC	TRUE	0.884	61.000	0.045	NA	Y	NA
10389327	10389328	YPZ3_2808	YPZ3_2809	yajC	tgt	TRUE	0.756	112.000	0.325	NA	N	NA
10389328	10389329	YPZ3_2809	YPZ3_2810	tgt	queA	TRUE	0.983	93.000	0.360	0.001	Y	NA
10389330	10389331	YPZ3_2811	YPZ3_2812		ahpC	FALSE	0.060	299.000	0.014	1.000		NA
10389331	10389332	YPZ3_2812	YPZ3_2813	ahpC		FALSE	0.053	164.000	0.000	1.000	N	NA
10389332	10389333	YPZ3_2813	YPZ3_2814		ggt	FALSE	0.001	679.000	0.000	1.000	N	NA
10389334	10389335	YPZ3_2815	YPZ3_2816		malZ	FALSE	0.292	155.000	0.031	1.000		NA
10389335	10389336	YPZ3_2816	YPZ3_2817	malZ	proY	FALSE	0.012	561.000	0.123	1.000	N	NA
10389336	10389337	YPZ3_2817	YPZ3_2818	proY	brnQ	TRUE	0.972	76.000	0.261	0.061	Y	NA
10389337	10389338	YPZ3_2818	YPZ3_2819	brnQ		FALSE	0.002	474.000	0.000	1.000	N	NA
10389338	10389339	YPZ3_2819	YPZ3_2820		phoR	FALSE	0.299	208.000	0.168	1.000	N	NA
10389339	10389340	YPZ3_2820	YPZ3_2821	phoR	phoB	TRUE	0.995	25.000	0.453	0.063	Y	NA
10389341	10389342	YPZ3_2822	YPZ3_2823	sbcD		TRUE	0.999	-3.000	0.669	1.000	Y	NA
10389345	10389346	YPZ3_2826	YPZ3_2827	aroL		FALSE	0.022	247.000	0.000	1.000	N	NA
10389346	10389347	YPZ3_2827	YPZ3_2828			FALSE	0.006	730.000	0.000	1.000		NA
10389347	10389348	YPZ3_2828	YPZ3_2829			FALSE	0.007	698.000	0.000	NA		NA
10389348	10389349	YPZ3_2829	YPZ3_2830		proA	FALSE	0.014	328.000	0.000	NA	N	NA
10389349	10389350	YPZ3_2830	YPZ3_2831	proA	proB	TRUE	0.991	10.000	0.026	0.001	Y	NA
10389350	10389351	YPZ3_2831	YPZ3_2832	proB	crl	TRUE	0.694	177.000	0.262	NA		NA
10389351	10389352	YPZ3_2832	YPZ3_2833	crl		TRUE	0.779	60.000	0.095	NA		NA
10389352	10389353	YPZ3_2833	YPZ3_2834		gpt	TRUE	0.584	127.000	0.120	NA		NA
10389359	10389360	YPZ3_2840	YPZ3_2841		nqrF	TRUE	0.925	68.000	0.519	1.000	N	NA
10389360	10389361	YPZ3_2841	YPZ3_2842	nqrF	nqrE	TRUE	0.998	16.000	0.551	0.002	Y	NA
10389361	10389362	YPZ3_2842	YPZ3_2843	nqrE	nqrD	TRUE	0.996	7.000	0.188	0.002	Y	NA
10389362	10389363	YPZ3_2843	YPZ3_2844	nqrD	nqrC	TRUE	0.999	-7.000	0.312	0.002	Y	NA
10389363	10389364	YPZ3_2844	YPZ3_2845	nqrC	nqrB	TRUE	1.000	-10.000	0.603	0.002	Y	NA
10389364	10389365	YPZ3_2845	YPZ3_2846	nqrB	nqrA	TRUE	1.000	4.000	0.854	0.002	Y	NA
10389367	10389368	YPZ3_2848	YPZ3_2849		gmhA	TRUE	0.572	203.000	0.229	1.000		NA
10389370	10389371	YPZ3_2851	YPZ3_2852		hmwC	TRUE	0.924	2.000	0.000	NA		NA
10389371	10389372	YPZ3_2852	YPZ3_2853	hmwC	hmwA	TRUE	0.548	155.000	0.125	NA		NA
10389372	10389373	YPZ3_2853	YPZ3_2854	hmwA	hxuB	TRUE	0.913	41.000	0.188	NA		NA
10389373	10389374	YPZ3_2854	YPZ3_2855	hxuB		FALSE	0.001	1089.000	0.000	NA	N	NA
10389374	10389375	YPZ3_2855	YPZ3_2856			TRUE	0.965	0.000	0.108	1.000		NA
10389376	10389377	YPZ3_2857	YPZ3_2858			TRUE	0.982	0.000	0.000	1.000	Y	NA
10389378	10389379	YPZ3_2859	YPZ3_2860			TRUE	0.936	32.000	0.054	1.000	Y	NA
10389379	10389380	YPZ3_2860	YPZ3_2861			TRUE	0.999	-19.000	0.532	1.000	Y	NA
10389380	10389381	YPZ3_2861	YPZ3_2862			TRUE	0.999	-3.000	0.433	0.016	Y	NA
10389381	10389382	YPZ3_2862	YPZ3_2863			TRUE	0.999	13.000	0.765	0.052	Y	NA
10389382	10389383	YPZ3_2863	YPZ3_2864			FALSE	0.008	328.000	0.000	1.000	N	NA
10389384	10389385	YPZ3_2865	YPZ3_2866			TRUE	0.891	56.000	0.203	NA		NA
10389385	10389386	YPZ3_2866	YPZ3_2867			FALSE	0.189	228.000	0.000	NA		NA
10389386	10389387	YPZ3_2867	YPZ3_2868			FALSE	0.167	160.000	0.060	NA	N	NA
10389387	10389388	YPZ3_2868	YPZ3_2869			TRUE	0.999	-3.000	0.915	NA		NA
10389388	10389389	YPZ3_2869	YPZ3_2870		emrR	FALSE	0.374	172.000	0.065	NA		NA
10389389	10389390	YPZ3_2870	YPZ3_2871	emrR	emrA	FALSE	0.028	384.000	0.107	1.000	N	NA
10389390	10389391	YPZ3_2871	YPZ3_2872	emrA	emrB	TRUE	0.985	39.000	0.875	1.000	N	NA
10389393	10389394	YPZ3_2874	YPZ3_2875	trxC		FALSE	0.423	170.000	0.084	NA		NA
10389394	10389395	YPZ3_2875	YPZ3_2876			TRUE	0.927	43.000	0.222	NA		NA
10389395	10389396	YPZ3_2876	YPZ3_2877			TRUE	0.575	176.000	0.121	0.040	N	NA
10389396	10389397	YPZ3_2877	YPZ3_2878			TRUE	0.759	62.000	0.089	NA		NA
10389398	10389399	YPZ3_r8	YPZ3_r9			FALSE	0.425	110.000	0.000	NA		NA
10389399	10389400	YPZ3_r9	YPZ3_t44			FALSE	0.149	253.000	0.000	NA		NA
10389400	10389401	YPZ3_t44	YPZ3_r10			FALSE	0.281	181.000	0.000	NA		NA
10389401	10389402	YPZ3_r10	YPZ3_2880			FALSE	0.014	544.000	0.000	NA		NA
10389402	10389403	YPZ3_2880	YPZ3_2881			TRUE	0.552	130.000	0.108	NA		NA
10389403	10389404	YPZ3_2881	YPZ3_2882		rluD	TRUE	0.975	2.000	0.168	NA		NA
10389405	10389406	YPZ3_2883	YPZ3_2884			FALSE	0.035	355.000	0.004	NA		NA
10389408	10389409	YPZ3_2886	YPZ3_2887			TRUE	0.444	14.000	0.000	1.000	N	NA
10389409	10389410	YPZ3_2887	YPZ3_2888			TRUE	0.982	0.000	0.000	1.000	Y	NA
10389410	10389411	YPZ3_2888	YPZ3_2889			TRUE	0.840	16.000	0.000	1.000		NA
10389412	10389413	YPZ3_2890	YPZ3_2891	tyrA	aroF	TRUE	0.959	13.000	0.023	1.000	Y	NA
10389414	10389415	YPZ3_2892	YPZ3_2893			FALSE	0.015	492.000	0.000	1.000		NA
10389415	10389416	YPZ3_2893	YPZ3_2894			TRUE	0.888	69.000	0.033	0.001		NA
10389416	10389417	YPZ3_2894	YPZ3_2895			FALSE	0.010	607.000	0.000	NA		NA
10389418	10389419	YPZ3_2896	YPZ3_2897		rplS	FALSE	0.054	161.000	0.000	1.000	N	NA
10389419	10389420	YPZ3_2897	YPZ3_2898	rplS		TRUE	0.977	81.000	0.567	1.000	Y	NA
10389420	10389421	YPZ3_2898	YPZ3_2899		rimM	TRUE	0.927	216.000	0.672	1.000	Y	NA
10389421	10389422	YPZ3_2899	YPZ3_2900	rimM	ffh	FALSE	0.002	498.000	0.000	1.000	N	NA
10389423	10389424	YPZ3_2901	YPZ3_2902			TRUE	0.925	69.000	0.349	NA		NA
10389425	10389426	YPZ3_2903	YPZ3_2904		luxS	FALSE	0.058	153.000	0.000	1.000	N	NA
10389426	10389427	YPZ3_2904	YPZ3_2905	luxS	gshA	FALSE	0.199	168.000	0.087	1.000	N	NA
10389427	10389428	YPZ3_2905	YPZ3_2906	gshA		TRUE	0.805	44.000	0.071	NA		NA
10389428	10389429	YPZ3_2906	YPZ3_2907			TRUE	0.626	81.000	0.067	NA		NA
10389429	10389430	YPZ3_2907	YPZ3_t45			FALSE	0.011	595.000	0.000	NA		NA
10389430	10389431	YPZ3_t45	YPZ3_t46			TRUE	0.547	80.000	0.000	NA		NA
10389431	10389432	YPZ3_t46	YPZ3_t47			TRUE	0.664	58.000	0.000	NA		NA
10389432	10389433	YPZ3_t47	YPZ3_t48			TRUE	0.895	9.000	0.000	NA		NA
10389433	10389434	YPZ3_t48	YPZ3_2908		alaS	FALSE	0.006	798.000	0.000	NA		NA
10389434	10389435	YPZ3_2908	YPZ3_2909	alaS	recX	FALSE	0.271	224.000	0.085	1.000		NA
10389435	10389436	YPZ3_2909	YPZ3_2910	recX	recA	TRUE	0.773	138.000	0.296	1.000		NA
10389436	10389437	YPZ3_2910	YPZ3_2911	recA		TRUE	0.536	115.000	0.082	NA		NA
10389438	10389439	YPZ3_2912	YPZ3_2913			FALSE	0.156	248.000	0.000	NA		NA
10389440	10389441	YPZ3_2914	YPZ3_2915			TRUE	0.835	21.000	0.127	1.000	N	NA
10389441	10389442	YPZ3_2915	YPZ3_2916			TRUE	0.991	3.000	0.596	1.000	N	NA
10389442	10389443	YPZ3_2916	YPZ3_2917			TRUE	1.000	-7.000	0.860	0.001	Y	NA
10389443	10389444	YPZ3_2917	YPZ3_2918			TRUE	0.446	256.000	0.075	1.000	Y	NA
10389444	10389445	YPZ3_2918	YPZ3_2919			TRUE	0.999	-3.000	0.793	1.000	Y	NA
10389445	10389446	YPZ3_2919	YPZ3_2920			TRUE	0.989	0.000	0.292	NA		NA
10389446	10389447	YPZ3_2920	YPZ3_2921			TRUE	0.846	93.000	0.280	NA		NA
10389448	10389449	YPZ3_2922	YPZ3_2923	katY	cybC	TRUE	0.547	158.000	0.000	0.003	N	NA
10389450	10389451	YPZ3_2924	YPZ3_2925		dmsC	TRUE	0.542	146.000	0.125	1.000		NA
10389451	10389452	YPZ3_2925	YPZ3_2926	dmsC	dmsB	TRUE	0.993	2.000	0.500	1.000		NA
10389452	10389453	YPZ3_2926	YPZ3_2927	dmsB	dmsA	TRUE	0.990	12.000	0.103	0.030	Y	NA
10389453	10389454	YPZ3_2927	YPZ3_2928	dmsA	araD	FALSE	0.003	463.000	0.000	1.000	N	NA
10389455	10389456	YPZ3_2929	YPZ3_2930			TRUE	0.958	62.000	0.235	NA	Y	NA
10389456	10389457	YPZ3_2930	YPZ3_2931			FALSE	0.061	200.000	0.000	NA	N	NA
10389457	10389458	YPZ3_2931	YPZ3_2932			FALSE	0.059	151.000	0.000	1.000	N	NA
10389458	10389459	YPZ3_2932	YPZ3_2933			TRUE	0.999	-7.000	0.941	1.000	Y	NA
10389459	10389460	YPZ3_2933	YPZ3_2934			TRUE	0.999	13.000	0.938	0.052	Y	NA
10389460	10389461	YPZ3_2934	YPZ3_2935		sgbU	TRUE	0.790	206.000	0.250	1.000	Y	NA
10389461	10389462	YPZ3_2935	YPZ3_2936	sgbU	sgbK	TRUE	0.999	11.000	1.000	0.018	Y	NA
10389462	10389463	YPZ3_2936	YPZ3_2937	sgbK	fumA	FALSE	0.004	398.000	0.000	1.000	N	NA
10389463	10389464	YPZ3_2937	YPZ3_2938	fumA	map	FALSE	0.003	431.000	0.000	1.000	N	NA
10389465	10389466	YPZ3_2939	YPZ3_2940			FALSE	0.026	433.000	0.000	NA		NA
10389466	10389467	YPZ3_2940	YPZ3_2941			TRUE	0.919	46.000	0.000	0.004		NA
10389468	10389469	YPZ3_2942	YPZ3_2943			FALSE	0.147	71.000	0.000	1.000	N	NA
10389469	10389470	YPZ3_2943	YPZ3_2944		arsR	FALSE	0.000	1348.000	0.000	1.000	N	NA
10389470	10389471	YPZ3_2944	YPZ3_2945	arsR	arsB	FALSE	0.113	85.000	0.000	1.000	N	NA
10389471	10389472	YPZ3_2945	YPZ3_2946	arsB		FALSE	0.012	555.000	0.000	1.000		NA
10389472	10389473	YPZ3_2946	YPZ3_2947			TRUE	0.989	-19.000	0.000	0.004		NA
10389474	10389475	YPZ3_2948	YPZ3_2949			TRUE	0.997	7.000	0.211	0.001	Y	NA
10389475	10389476	YPZ3_2949	YPZ3_2950			TRUE	0.816	0.000	0.058	1.000	N	NA
10389476	10389477	YPZ3_2950	YPZ3_2951			TRUE	0.755	64.000	0.000	0.017	N	NA
10389478	10389479	YPZ3_2952	YPZ3_2953	rpiB		FALSE	0.001	890.000	0.000	1.000	N	NA
10389480	10389481	YPZ3_2954	YPZ3_2955	rpoS	nlpD	TRUE	0.712	55.000	0.142	1.000	N	NA
10389481	10389482	YPZ3_2955	YPZ3_2956	nlpD	pcm	FALSE	0.045	122.000	0.030	1.000	N	NA
10389482	10389483	YPZ3_2956	YPZ3_2957	pcm		TRUE	0.994	-6.000	0.353	1.000		NA
10389483	10389484	YPZ3_2957	YPZ3_2958			TRUE	0.989	-7.000	0.235	1.000		NA
10389484	10389485	YPZ3_2958	YPZ3_2959		ispF	TRUE	0.959	11.000	0.173	1.000		NA
10389485	10389486	YPZ3_2959	YPZ3_2960	ispF	ispD	TRUE	0.929	139.000	0.419	1.000	Y	NA
10389486	10389487	YPZ3_2960	YPZ3_2961	ispD	ftsB	TRUE	0.946	4.000	0.185	1.000	N	NA
10389487	10389488	YPZ3_2961	YPZ3_2962	ftsB		FALSE	0.068	314.000	0.028	NA		NA
10389488	10389489	YPZ3_2962	YPZ3_2963		cysC	TRUE	0.576	191.000	0.198	NA		NA
10389489	10389490	YPZ3_2963	YPZ3_2964	cysC	cysN	TRUE	0.996	2.000	0.340	1.000	Y	NA
10389490	10389491	YPZ3_2964	YPZ3_2965	cysN	cysD	TRUE	0.996	12.000	0.574	0.001	N	NA
10389491	10389492	YPZ3_2965	YPZ3_2966	cysD	cysG	TRUE	0.994	11.000	0.417	1.000	Y	NA
10389494	10389495	YPZ3_2968	YPZ3_2969		cysI	TRUE	0.974	-3.000	0.116	1.000		NA
10389495	10389496	YPZ3_2969	YPZ3_2970	cysI	cysJ	TRUE	1.000	0.000	0.791	0.001	Y	NA
10389498	10389499	YPZ3_2972	YPZ3_2973		sodC	FALSE	0.025	104.000	0.004	1.000	N	NA
10389499	10389500	YPZ3_2973	YPZ3_2974	sodC	eno	FALSE	0.006	363.000	0.000	1.000	N	NA
10389500	10389501	YPZ3_2974	YPZ3_2975	eno	pyrG	FALSE	0.318	81.000	0.068	1.000	N	NA
10389501	10389502	YPZ3_2975	YPZ3_2976	pyrG		FALSE	0.174	212.000	0.025	1.000		NA
10389502	10389503	YPZ3_2976	YPZ3_2977		relA	FALSE	0.222	202.000	0.040	1.000		NA
10389505	10389506	YPZ3_2979	YPZ3_2980	gsrA	dgt	FALSE	0.190	198.000	0.101	1.000	N	NA
10389507	10389508	YPZ3_2981	YPZ3_2982	mtn		TRUE	0.865	0.000	0.073	1.000	N	NA
10389508	10389509	YPZ3_2982	YPZ3_2983			TRUE	0.984	0.000	0.213	NA		NA
10389510	10389511	YPZ3_2984	YPZ3_2985		eriC1	FALSE	0.349	136.000	0.031	NA		NA
10389513	10389514	YPZ3_2987	YPZ3_2988	fhuB	fhuD	TRUE	0.998	-3.000	0.500	1.000	Y	NA
10389514	10389515	YPZ3_2988	YPZ3_2989	fhuD	fhuC	TRUE	0.689	177.000	0.094	1.000	Y	NA
10389515	10389516	YPZ3_2989	YPZ3_2990	fhuC	mrcB	FALSE	0.009	322.000	0.000	1.000	N	NA
10389516	10389517	YPZ3_2990	YPZ3_2991	mrcB	hrpB	TRUE	0.783	109.000	0.158	0.011	N	NA
10389518	10389519	YPZ3_2992	YPZ3_2993	ligT		TRUE	0.958	-10.000	0.045	NA		NA
10389519	10389520	YPZ3_2993	YPZ3_2994			FALSE	0.304	263.000	0.151	NA		NA
10389520	10389521	YPZ3_2994	YPZ3_2995			TRUE	0.701	91.000	0.231	1.000	N	NA
10389521	10389522	YPZ3_2995	YPZ3_2996		pcnB	TRUE	0.586	242.000	0.131	1.000	Y	NA
10389522	10389523	YPZ3_2996	YPZ3_2997	pcnB	folK	TRUE	0.956	8.000	0.234	1.000	N	NA
10389523	10389524	YPZ3_2997	YPZ3_2998	folK	panB	TRUE	0.466	269.000	0.117	1.000	Y	NA
10389524	10389525	YPZ3_2998	YPZ3_2999	panB	panC	TRUE	0.986	88.000	0.395	0.001	Y	NA
10389525	10389526	YPZ3_2999	YPZ3_3000	panC	panD	FALSE	0.366	411.000	0.342	1.000	Y	NA
10389527	10389528	YPZ3_3001	YPZ3_3002			FALSE	0.001	574.000	0.000	1.000	N	NA
10389528	10389529	YPZ3_3002	YPZ3_3003			TRUE	0.999	-3.000	0.688	0.098	Y	NA
10389531	10389532	YPZ3_3005	YPZ3_3006	hpt		FALSE	0.007	241.000	0.010	1.000	N	NA
10389533	10389534	YPZ3_3007	YPZ3_3008		speE	TRUE	0.850	117.000	0.354	NA		NA
10389534	10389535	YPZ3_3008	YPZ3_3009	speE	speD	TRUE	0.910	78.000	0.162	1.000	Y	NA
10389535	10389536	YPZ3_3009	YPZ3_3010	speD		FALSE	0.021	438.000	0.000	1.000		NA
10389537	10389538	YPZ3_3011	YPZ3_3012		acnB	FALSE	0.122	299.000	0.068	NA		NA
10389538	10389539	YPZ3_3012	YPZ3_3013	acnB		FALSE	0.002	570.000	0.000	1.000	N	NA
10389539	10389540	YPZ3_3013	YPZ3_3014		lpdA	FALSE	0.040	192.000	0.000	1.000	N	NA
10389540	10389541	YPZ3_3014	YPZ3_3015	lpdA	aceF	TRUE	0.708	303.000	0.463	1.000	Y	NA
10389541	10389542	YPZ3_3015	YPZ3_3016	aceF	aceE	TRUE	0.987	14.000	0.220	1.000	Y	NA
10389542	10389543	YPZ3_3016	YPZ3_3017	aceE		TRUE	0.509	196.000	0.276	1.000	N	NA
10389545	10389546	YPZ3_3019	YPZ3_3020	ampE	ampD	TRUE	0.585	290.000	0.249	1.000	Y	NA
10389547	10389548	YPZ3_3021	YPZ3_3022	nadC	ppdD	FALSE	0.018	203.000	0.015	NA	N	NA
10389548	10389549	YPZ3_3022	YPZ3_3023	ppdD	hofB	TRUE	0.983	68.000	0.556	NA	Y	NA
10389549	10389550	YPZ3_3023	YPZ3_3024	hofB		TRUE	0.985	60.000	0.571	1.000	Y	NA
10389552	10389553	YPZ3_3026	YPZ3_3027	coaE		TRUE	0.975	-3.000	0.110	NA		NA
10389555	10389556	YPZ3_3029	YPZ3_3030			TRUE	0.982	0.000	0.000	1.000	Y	NA
10389557	10389558	YPZ3_3031	YPZ3_3032			TRUE	0.953	-7.000	0.000	NA		NA
10389558	10389559	YPZ3_3032	YPZ3_3033		intB	FALSE	0.338	154.000	0.000	NA		NA
10389559	10389560	YPZ3_3033	YPZ3_t49	intB		FALSE	0.246	199.000	0.000	NA		NA
10389560	10389561	YPZ3_t49	YPZ3_3034			FALSE	0.436	105.000	0.000	NA		NA
10389561	10389562	YPZ3_3034	YPZ3_3035			TRUE	0.998	0.000	0.631	0.060		NA
10389563	10389564	YPZ3_3036	YPZ3_3037	pepA	holC	TRUE	0.789	151.000	0.494	1.000	N	NA
10389564	10389565	YPZ3_3037	YPZ3_3038	holC	valS	TRUE	0.805	13.000	0.089	1.000	N	NA
10389565	10389566	YPZ3_3038	YPZ3_3039	valS		TRUE	0.628	143.000	0.008	1.000	Y	NA
10389570	10389571	YPZ3_3043	YPZ3_3044			TRUE	0.948	-3.000	0.000	NA		NA
10389571	10389572	YPZ3_3044	YPZ3_3045			TRUE	0.892	96.000	0.400	NA		NA
10389572	10389573	YPZ3_3045	YPZ3_3046			TRUE	0.996	19.000	0.441	0.052	Y	NA
10389573	10389574	YPZ3_3046	YPZ3_3047			TRUE	0.997	-7.000	0.324	1.000	Y	NA
10389574	10389575	YPZ3_3047	YPZ3_3048			TRUE	0.999	-13.000	0.550	0.020	Y	NA
10389575	10389576	YPZ3_3048	YPZ3_3049		nrdD	FALSE	0.003	434.000	0.000	1.000	N	NA
10389576	10389577	YPZ3_3049	YPZ3_3050	nrdD		FALSE	0.438	327.000	0.464	1.000		NA
10389577	10389578	YPZ3_3050	YPZ3_3051		phnF	FALSE	0.058	328.000	0.000	1.000		NA
10389578	10389579	YPZ3_3051	YPZ3_3052	phnF	phnG	TRUE	0.994	1.000	0.691	1.000	N	NA
10389579	10389580	YPZ3_3052	YPZ3_3053	phnG	phnH	TRUE	1.000	0.000	0.967	0.002	Y	NA
10389580	10389581	YPZ3_3053	YPZ3_3054	phnH	phnI	TRUE	1.000	0.000	0.960	0.002	Y	NA
10389581	10389582	YPZ3_3054	YPZ3_3055	phnI	phnJ	TRUE	0.999	-7.000	0.880	1.000	Y	NA
10389582	10389583	YPZ3_3055	YPZ3_3056	phnJ	phnK	TRUE	0.999	0.000	0.883	1.000	Y	NA
10389583	10389584	YPZ3_3056	YPZ3_3057	phnK	phnL	TRUE	0.855	389.000	0.859	0.020	Y	NA
10389584	10389585	YPZ3_3057	YPZ3_3058	phnL	phnM	TRUE	0.997	-3.000	0.320	1.000	Y	NA
10389585	10389586	YPZ3_3058	YPZ3_3059	phnM	phnN	TRUE	0.995	0.000	0.235	NA	Y	NA
10389586	10389587	YPZ3_3059	YPZ3_3060	phnN	phnP	TRUE	0.989	-9.000	0.214	NA		NA
10389588	10389589	YPZ3_3061	YPZ3_3062			FALSE	0.370	152.000	0.056	1.000		NA
10389589	10389590	YPZ3_3062	YPZ3_3063			FALSE	0.408	99.000	0.032	1.000		NA
10389590	10389591	YPZ3_3063	YPZ3_3064			TRUE	0.972	15.000	0.273	1.000		NA
10389591	10389592	YPZ3_3064	YPZ3_3065			TRUE	0.997	12.000	0.364	0.052	Y	NA
10389592	10389593	YPZ3_3065	YPZ3_3066			TRUE	0.998	19.000	0.611	0.052	Y	NA
10389593	10389594	YPZ3_3066	YPZ3_3067			TRUE	0.999	8.000	0.611	0.052	Y	NA
10389595	10389596	YPZ3_3068	YPZ3_3069			TRUE	0.993	24.000	0.400	0.001		NA
10389597	10389598	YPZ3_3070	YPZ3_3071			TRUE	0.992	-6.000	0.295	1.000		NA
10389599	10389600	YPZ3_3072	YPZ3_3073			TRUE	0.999	12.000	0.948	0.003	Y	NA
10389601	10389602	YPZ3_3074	YPZ3_3075			TRUE	0.992	2.000	0.367	0.052	N	NA
10389602	10389603	YPZ3_3075	YPZ3_3076			TRUE	0.918	4.000	0.133	1.000	N	NA
10389605	10389606	YPZ3_3078	YPZ3_3079		deaD	FALSE	0.009	628.000	0.000	1.000		NA
10389606	10389607	YPZ3_3079	YPZ3_3080	deaD	nlpI	FALSE	0.281	187.000	0.053	1.000		NA
10389607	10389608	YPZ3_3080	YPZ3_3081	nlpI	pnp	TRUE	0.459	125.000	0.071	1.000		NA
10389608	10389609	YPZ3_3081	YPZ3_3082	pnp		FALSE	0.017	267.000	0.000	1.000	N	NA
10389609	10389610	YPZ3_3082	YPZ3_3083			TRUE	0.948	54.000	0.167	1.000	Y	NA
10389611	10389612	YPZ3_3084	YPZ3_3085			TRUE	0.999	-36.000	0.863	NA		NA
10389612	10389613	YPZ3_3085	YPZ3_3086			TRUE	0.893	126.000	0.510	NA		NA
10389613	10389614	YPZ3_3086	YPZ3_3087			TRUE	0.998	0.000	0.862	NA		NA
10389614	10389615	YPZ3_3087	YPZ3_3088			TRUE	0.997	3.000	0.765	NA		NA
10389615	10389616	YPZ3_3088	YPZ3_3089			TRUE	0.997	0.000	0.673	NA		NA
10389616	10389617	YPZ3_3089	YPZ3_3090		clpB2	TRUE	0.989	11.000	0.471	NA		NA
10389617	10389618	YPZ3_3090	YPZ3_3091	clpB2		TRUE	0.943	-3.000	0.039	1.000		NA
10389618	10389619	YPZ3_3091	YPZ3_3092			TRUE	0.957	-3.000	0.053	NA		NA
10389619	10389620	YPZ3_3092	YPZ3_3093			TRUE	0.995	6.000	0.711	NA		NA
10389620	10389621	YPZ3_3093	YPZ3_3094			TRUE	0.989	32.000	0.750	NA		NA
10389621	10389622	YPZ3_3094	YPZ3_3095			TRUE	0.814	125.000	0.312	NA		NA
10389622	10389623	YPZ3_3095	YPZ3_3096			TRUE	0.948	-3.000	0.000	NA		NA
10389623	10389624	YPZ3_3096	YPZ3_3097			TRUE	0.828	22.000	0.000	NA		NA
10389624	10389625	YPZ3_3097	YPZ3_3098			TRUE	0.904	6.000	0.000	NA		NA
10389625	10389626	YPZ3_3098	YPZ3_3099			TRUE	0.982	-7.000	0.143	NA		NA
10389626	10389627	YPZ3_3099	YPZ3_3100			TRUE	0.795	28.000	0.000	NA		NA
10389627	10389628	YPZ3_3100	YPZ3_3101			TRUE	0.991	2.000	0.400	NA		NA
10389630	10389631	YPZ3_3103	YPZ3_3104	vgrG6		TRUE	0.918	3.000	0.000	NA		NA
10389631	10389632	YPZ3_3104	YPZ3_3105			TRUE	0.732	45.000	0.000	NA		NA
10389632	10389633	YPZ3_3105	YPZ3_3106			TRUE	0.895	9.000	0.000	NA		NA
10389634	10389635	YPZ3_3107	YPZ3_3108			TRUE	0.995	-3.000	0.455	NA		NA
10389637	10389638	YPZ3_3110	YPZ3_3111			TRUE	0.972	6.000	0.000	1.000	Y	NA
10389638	10389639	YPZ3_3111	YPZ3_3112			FALSE	0.056	157.000	0.000	1.000	N	NA
10389640	10389641	YPZ3_3113	YPZ3_3114	ssuE	ssuA	TRUE	0.950	15.000	0.169	1.000		NA
10389641	10389642	YPZ3_3114	YPZ3_3115	ssuA	ssuD	TRUE	0.958	19.000	0.341	1.000	N	NA
10389642	10389643	YPZ3_3115	YPZ3_3116	ssuD	ssuC	TRUE	0.952	9.000	0.226	1.000	N	NA
10389643	10389644	YPZ3_3116	YPZ3_3117	ssuC	tauB	TRUE	0.998	-3.000	0.472	1.000	Y	NA
10389644	10389645	YPZ3_3117	YPZ3_3118	tauB		FALSE	0.003	1276.000	0.000	1.000		NA
10389645	10389646	YPZ3_3118	YPZ3_3119			FALSE	0.047	349.000	0.000	1.000		NA
10389647	10389648	YPZ3_3120	YPZ3_3121			FALSE	0.341	152.000	0.000	NA		NA
10389649	10389650	YPZ3_3122	YPZ3_3123			TRUE	0.944	204.000	0.714	NA	Y	NA
10389650	10389651	YPZ3_3123	YPZ3_3124			TRUE	0.999	-7.000	0.667	1.000	Y	NA
10389651	10389652	YPZ3_3124	YPZ3_3125			TRUE	0.999	2.000	0.900	0.052	Y	NA
10389652	10389653	YPZ3_3125	YPZ3_3126			TRUE	0.899	19.000	0.184	1.000	N	NA
10389653	10389654	YPZ3_3126	YPZ3_3127			TRUE	0.983	-3.000	0.102	0.017	N	NA
10389660	10389661	YPZ3_3133	YPZ3_3134			TRUE	0.595	65.000	0.000	1.000		NA
10389661	10389662	YPZ3_3134	YPZ3_3135			FALSE	0.434	175.000	0.105	1.000		NA
10389662	10389663	YPZ3_3135	YPZ3_3136			TRUE	0.486	154.000	0.105	1.000		NA
10389663	10389664	YPZ3_3136	YPZ3_3137			TRUE	0.462	90.000	0.000	1.000		NA
10389664	10389665	YPZ3_3137	YPZ3_3138			TRUE	0.622	66.000	0.000	NA		NA
10389666	10389667	YPZ3_3139	YPZ3_3140		prmA	FALSE	0.042	589.000	0.042	1.000	Y	NA
10389667	10389668	YPZ3_3140	YPZ3_3141	prmA	panF	FALSE	0.071	157.000	0.041	1.000	N	NA
10389668	10389669	YPZ3_3141	YPZ3_3142	panF	accC	FALSE	0.000	1590.000	0.000	1.000	N	NA
10389669	10389670	YPZ3_3142	YPZ3_3143	accC	accB	TRUE	0.997	12.000	0.275	0.001	Y	NA
10389670	10389671	YPZ3_3143	YPZ3_3144	accB	aroQ	TRUE	0.581	158.000	0.254	1.000	N	NA
10389671	10389672	YPZ3_3144	YPZ3_3145	aroQ		FALSE	0.086	263.000	0.006	1.000		NA
10389672	10389673	YPZ3_3145	YPZ3_3146			TRUE	0.999	0.000	0.790	0.030		NA
10389673	10389674	YPZ3_3146	YPZ3_3147			FALSE	0.224	223.000	0.059	1.000		NA
10389675	10389676	YPZ3_3148	YPZ3_3149		mreB	FALSE	0.008	337.000	0.000	1.000	N	NA
10389676	10389677	YPZ3_3149	YPZ3_3150	mreB	mreC	TRUE	0.802	204.000	0.689	1.000	N	NA
10389677	10389678	YPZ3_3150	YPZ3_3151	mreC	mreD	TRUE	0.999	-3.000	0.550	0.002	Y	NA
10389678	10389679	YPZ3_3151	YPZ3_3152	mreD	maf	TRUE	0.935	14.000	0.206	NA	N	NA
10389679	10389680	YPZ3_3152	YPZ3_3153	maf	cafA	TRUE	0.992	-10.000	0.417	NA	N	NA
10389680	10389681	YPZ3_3153	YPZ3_3154	cafA		TRUE	0.821	115.000	0.296	NA		NA
10389681	10389682	YPZ3_3154	YPZ3_3155			TRUE	0.994	-3.000	0.358	NA		NA
10389682	10389683	YPZ3_3155	YPZ3_3156		tldD	TRUE	0.975	12.000	0.259	NA		NA
10389684	10389685	YPZ3_3157	YPZ3_3158		tccC1	TRUE	0.940	25.000	0.000	1.000	Y	NA
10389685	10389686	YPZ3_3158	YPZ3_3159	tccC1		TRUE	0.933	201.000	1.000	NA		NA
10389686	10389687	YPZ3_3159	YPZ3_3160			TRUE	0.995	-12.000	0.400	NA		NA
10389687	10389688	YPZ3_3160	YPZ3_3161			TRUE	0.875	13.000	0.000	NA		NA
10389688	10389689	YPZ3_3161	YPZ3_3162			FALSE	0.368	134.000	0.000	NA		NA
10389689	10389690	YPZ3_3162	YPZ3_3163			TRUE	0.963	57.000	0.500	NA		NA
10389690	10389691	YPZ3_3163	YPZ3_3164			TRUE	0.602	69.000	0.000	NA		NA
10389691	10389692	YPZ3_3164	YPZ3_3165			TRUE	0.742	41.000	0.000	NA		NA
10389692	10389693	YPZ3_3165	YPZ3_3166			FALSE	0.177	236.000	0.000	NA		NA
10389693	10389694	YPZ3_3166	YPZ3_3167			FALSE	0.305	357.000	0.000	0.048	Y	NA
10389695	10389696	YPZ3_3168	YPZ3_3169			TRUE	0.998	2.000	1.000	NA		NA
10389696	10389697	YPZ3_3169	YPZ3_3170		gabD	FALSE	0.126	267.000	0.000	NA		NA
10389697	10389698	YPZ3_3170	YPZ3_3171	gabD		TRUE	0.999	-3.000	0.667	0.039		NA
10389698	10389699	YPZ3_3171	YPZ3_3172			FALSE	0.229	195.000	0.000	1.000		NA
10389701	10389702	YPZ3_3174	YPZ3_3175	pmbA		FALSE	0.079	285.000	0.005	NA		NA
10389702	10389703	YPZ3_3175	YPZ3_3176			FALSE	0.224	208.000	0.000	NA		NA
10389704	10389705	YPZ3_3177	YPZ3_3178	rnk	treC	FALSE	0.006	353.000	0.000	1.000	N	NA
10389705	10389706	YPZ3_3178	YPZ3_3179	treC		TRUE	0.975	95.000	0.650	1.000	Y	NA
10389706	10389707	YPZ3_3179	YPZ3_3180		treR	FALSE	0.004	411.000	0.000	1.000	N	NA
10389707	10389708	YPZ3_3180	YPZ3_3181	treR		FALSE	0.180	234.000	0.000	NA		NA
10389708	10389709	YPZ3_3181	YPZ3_3182			FALSE	0.088	299.000	0.000	NA		NA
10389709	10389710	YPZ3_3182	YPZ3_3183		pyrI	FALSE	0.266	138.000	0.084	NA	N	NA
10389710	10389711	YPZ3_3183	YPZ3_3184	pyrI	pyrB	TRUE	0.996	12.000	0.197	0.001	Y	NA
10389711	10389712	YPZ3_3184	YPZ3_3185	pyrB		FALSE	0.007	607.000	0.002	NA		NA
10389712	10389713	YPZ3_3185	YPZ3_3186		ptsN	FALSE	0.244	306.000	0.186	NA		NA
10389713	10389714	YPZ3_3186	YPZ3_3187	ptsN	rpoN	FALSE	0.002	417.000	0.029	1.000	N	NA
10389714	10389715	YPZ3_3187	YPZ3_3188	rpoN		TRUE	0.834	62.000	0.163	1.000		NA
10389715	10389716	YPZ3_3188	YPZ3_3189			TRUE	0.993	7.000	0.543	NA		NA
10389716	10389717	YPZ3_3189	YPZ3_3190			TRUE	0.996	-16.000	0.459	NA		NA
10389717	10389718	YPZ3_3190	YPZ3_3191		kdsC	TRUE	0.997	-3.000	0.617	NA		NA
10389718	10389719	YPZ3_3191	YPZ3_3192	kdsC		TRUE	0.648	288.000	0.598	1.000		NA
10389719	10389720	YPZ3_3192	YPZ3_3193			TRUE	0.631	111.000	0.226	1.000	N	NA
10389721	10389722	YPZ3_3194	YPZ3_3195			TRUE	0.898	218.000	0.530	NA	Y	NA
10389722	10389723	YPZ3_3195	YPZ3_3196			TRUE	0.993	5.000	0.562	NA		NA
10389723	10389724	YPZ3_3196	YPZ3_3197			TRUE	0.963	13.000	0.188	NA		NA
10389724	10389725	YPZ3_3197	YPZ3_3198			TRUE	0.956	36.000	0.308	NA		NA
10389725	10389726	YPZ3_3198	YPZ3_3199		murA	FALSE	0.010	555.000	0.011	NA		NA
10389729	10389730	YPZ3_3202	YPZ3_3203			FALSE	0.155	340.000	0.154	NA		NA
10389731	10389732	YPZ3_3204	YPZ3_3205		rplM	FALSE	0.054	314.000	0.003	NA		NA
10389732	10389733	YPZ3_3205	YPZ3_3206	rplM	rpsI	TRUE	0.998	15.000	0.601	0.007	Y	NA
10389733	10389734	YPZ3_3206	YPZ3_3207	rpsI	sspA	FALSE	0.002	374.000	0.014	NA	N	NA
10389734	10389735	YPZ3_3207	YPZ3_3208	sspA	sspB	TRUE	0.994	21.000	0.831	NA		NA
10389736	10389737	YPZ3_3209	YPZ3_3210		gltD	FALSE	0.024	441.000	0.000	NA		NA
10389737	10389738	YPZ3_3210	YPZ3_3211	gltD		TRUE	0.994	10.000	0.096	0.001	Y	NA
10389739	10389740	YPZ3_3212	YPZ3_3213		arcB	FALSE	0.227	264.000	0.113	1.000		NA
10389740	10389741	YPZ3_3213	YPZ3_3214	arcB	elbB	FALSE	0.039	242.000	0.000	NA	N	NA
10389741	10389742	YPZ3_3214	YPZ3_3215	elbB	mtgA	TRUE	0.963	-3.000	0.066	NA		NA
10389743	10389744	YPZ3_3216	YPZ3_3217			TRUE	0.993	11.000	0.613	NA		NA
10389744	10389745	YPZ3_3217	YPZ3_3218			FALSE	0.193	271.000	0.187	1.000	N	NA
10389745	10389746	YPZ3_3218	YPZ3_3219			TRUE	0.783	84.000	0.172	NA		NA
11483875	10389740		YPZ3_3213		arcB	FALSE	NA	7080.000	0.000	NA		NA
11626238	10389740		YPZ3_3213		arcB	FALSE	NA	7080.000	0.000	NA		NA
11768630	10389740		YPZ3_3213		arcB	FALSE	NA	7080.000	0.000	NA		NA
11483876	10389740		YPZ3_3213		arcB	FALSE	NA	7142.000	0.000	NA		NA
11626239	10389740		YPZ3_3213		arcB	FALSE	NA	7142.000	0.000	NA		NA
11768631	10389740		YPZ3_3213		arcB	FALSE	NA	7142.000	0.000	NA		NA
11483877	10389740		YPZ3_3213		arcB	FALSE	NA	7193.000	0.000	NA		NA
11626240	10389740		YPZ3_3213		arcB	FALSE	NA	7193.000	0.000	NA		NA
11768632	10389740		YPZ3_3213		arcB	FALSE	NA	7193.000	0.000	NA		NA
11483878	10389740		YPZ3_3213		arcB	FALSE	NA	7255.000	0.000	NA		NA
11626241	10389740		YPZ3_3213		arcB	FALSE	NA	7255.000	0.000	NA		NA
11768633	10389740		YPZ3_3213		arcB	FALSE	NA	7255.000	0.000	NA		NA
11483879	10389740		YPZ3_3213		arcB	FALSE	NA	7306.000	0.000	NA		NA
11626242	10389740		YPZ3_3213		arcB	FALSE	NA	7306.000	0.000	NA		NA
11768634	10389740		YPZ3_3213		arcB	FALSE	NA	7306.000	0.000	NA		NA
10389750	10389751	YPZ3_3223	YPZ3_3224			TRUE	0.544	16.000	0.000	NA	N	NA
10389751	10389752	YPZ3_3224	YPZ3_3225			TRUE	0.982	0.000	0.000	1.000	Y	NA
10389753	10389754	YPZ3_3226	YPZ3_3227		rpsF	FALSE	0.027	367.000	0.005	1.000		NA
10389754	10389755	YPZ3_3227	YPZ3_3228	rpsF	rplI	FALSE	0.104	598.000	0.000	0.007	Y	NA
10389755	10389756	YPZ3_3228	YPZ3_3229	rplI		FALSE	0.061	145.000	0.000	1.000	N	NA
10389757	10389758	YPZ3_3230	YPZ3_3231			FALSE	0.384	140.000	0.047	NA		NA
10389760	10389761	YPZ3_3233	YPZ3_3234		cpdB	FALSE	0.070	155.000	0.030	NA	N	NA
10389763	10389764	YPZ3_3236	YPZ3_3237			FALSE	0.009	656.000	0.000	NA		NA
10389764	10389765	YPZ3_3237	YPZ3_3238		msrA	FALSE	0.119	278.000	0.042	NA		NA
10389766	10389767	YPZ3_3239	YPZ3_3240			TRUE	0.997	-3.000	0.575	NA		NA
10389767	10389768	YPZ3_3240	YPZ3_3241			TRUE	0.863	57.000	0.167	NA		NA
10389769	10389770	YPZ3_3242	YPZ3_3243	ppa	fbp	FALSE	0.051	200.000	0.043	1.000	N	NA
10389773	10389774	YPZ3_3246	YPZ3_3247	mdh		FALSE	0.004	893.000	0.000	1.000		NA
10389776	10389777	YPZ3_3249	YPZ3_3250	rplU		FALSE	0.039	365.000	0.000	1.000		NA
10389777	10389778	YPZ3_3250	YPZ3_3251			TRUE	0.895	1.000	0.015	1.000		NA
10389779	10389780	YPZ3_3252	YPZ3_3253	basS	basR	TRUE	0.997	-3.000	0.381	1.000	Y	NA
10389780	10389781	YPZ3_3253	YPZ3_3254	basR	dacB	TRUE	0.871	6.000	0.101	1.000	N	NA
10389782	10389783	YPZ3_3255	YPZ3_3256		ftsJ	FALSE	0.000	556.000	0.009	1.000	N	NA
10389783	10389784	YPZ3_3256	YPZ3_3257	ftsJ		FALSE	0.363	168.000	0.152	1.000	N	NA
10389784	10389785	YPZ3_3257	YPZ3_3258		folP	TRUE	0.729	120.000	0.325	1.000	N	NA
10389785	10389786	YPZ3_3258	YPZ3_3259	folP	mrsA	TRUE	0.959	10.000	0.260	1.000	N	NA
10389786	10389787	YPZ3_3259	YPZ3_t50	mrsA		FALSE	0.009	651.000	0.000	NA		NA
10389787	10389788	YPZ3_t50	YPZ3_t51			TRUE	0.647	61.000	0.000	NA		NA
10389788	10389789	YPZ3_t51	YPZ3_3260			FALSE	0.210	216.000	0.000	NA		NA
10389789	10389790	YPZ3_3260	YPZ3_3261		nusA	TRUE	0.992	22.000	0.759	NA		NA
10389790	10389791	YPZ3_3261	YPZ3_3262	nusA	infB	TRUE	0.950	25.000	0.342	1.000	N	NA
10389791	10389792	YPZ3_3262	YPZ3_3263	infB	rbfA	TRUE	0.981	66.000	0.530	1.000	Y	NA
10389792	10389793	YPZ3_3263	YPZ3_3264	rbfA	truB	TRUE	0.996	0.000	0.318	1.000	Y	NA
10389793	10389794	YPZ3_3264	YPZ3_3265	truB		FALSE	0.002	478.000	0.000	1.000	N	NA
10389794	10389795	YPZ3_3265	YPZ3_3266			TRUE	0.948	54.000	0.167	1.000	Y	NA
10389796	10389797	YPZ3_3267	YPZ3_3268			TRUE	0.994	7.000	0.627	NA		NA
10389797	10389798	YPZ3_3268	YPZ3_3269			TRUE	0.980	68.000	0.821	NA		NA
10389800	10389801	YPZ3_3271	YPZ3_3272		lamB	FALSE	0.154	241.000	0.000	1.000		NA
10389801	10389802	YPZ3_3272	YPZ3_3273	lamB	malK	TRUE	0.920	71.000	0.000	0.065	Y	NA
10389803	10389804	YPZ3_3274	YPZ3_3275	malE	malF	TRUE	0.614	187.000	0.060	1.000	Y	NA
10389804	10389805	YPZ3_3275	YPZ3_3276	malF	malG	TRUE	0.999	14.000	0.814	0.051	Y	NA
10389806	10389807	YPZ3_3277	YPZ3_3278		pgi	FALSE	0.280	135.000	0.015	1.000		NA
10389808	10389809	YPZ3_3279	YPZ3_3280	lysC		FALSE	0.018	481.000	0.000	NA		NA
10389809	10389810	YPZ3_3280	YPZ3_3281			TRUE	0.955	-34.000	0.000	NA		NA
10389810	10389811	YPZ3_3281	YPZ3_3282			TRUE	0.962	70.000	0.600	NA		NA
10389813	10389814	YPZ3_3284	YPZ3_3285			TRUE	0.955	-15.000	0.000	NA		NA
10389815	10389816	YPZ3_3286	YPZ3_3287	aceK	aceA	FALSE	0.336	256.000	0.273	1.000	N	NA
10389816	10389817	YPZ3_3287	YPZ3_3288	aceA	aceB	TRUE	0.943	47.000	0.118	1.000	Y	NA
10389817	10389818	YPZ3_3288	YPZ3_3289	aceB	metA	FALSE	0.003	421.000	0.000	1.000	N	NA
10389818	10389819	YPZ3_3289	YPZ3_r11	metA		FALSE	0.007	740.000	0.000	NA		NA
10389819	10389820	YPZ3_r11	YPZ3_t52			TRUE	0.742	41.000	0.000	NA		NA
10389820	10389821	YPZ3_t52	YPZ3_r12			TRUE	0.857	16.000	0.000	NA		NA
10389821	10389822	YPZ3_r12	YPZ3_r13			FALSE	0.425	110.000	0.000	NA		NA
10389822	10389823	YPZ3_r13	YPZ3_t53			FALSE	0.205	219.000	0.000	NA		NA
10389823	10389824	YPZ3_t53	YPZ3_t54			TRUE	0.699	52.000	0.000	NA		NA
10389824	10389825	YPZ3_t54	YPZ3_r14			FALSE	0.350	147.000	0.000	NA		NA
10389826	10389827	YPZ3_3290	YPZ3_3291	purH	purD	TRUE	0.958	60.000	0.238	1.000	Y	NA
10389828	10389829	YPZ3_3292	YPZ3_3293			FALSE	0.016	508.000	0.000	NA		NA
10389829	10389830	YPZ3_3293	YPZ3_3294			TRUE	0.472	150.000	0.086	NA		NA
10389830	10389831	YPZ3_3294	YPZ3_3295		hemE	FALSE	0.181	30.000	0.028	1.000	N	NA
10389831	10389832	YPZ3_3295	YPZ3_3296	hemE		FALSE	0.404	119.000	0.000	NA		NA
10389832	10389833	YPZ3_3296	YPZ3_3297		nudC	TRUE	0.480	93.000	0.000	NA		NA
10389834	10389835	YPZ3_3298	YPZ3_3299	rsd	thiC	FALSE	0.005	376.000	0.000	1.000	N	NA
10389835	10389836	YPZ3_3299	YPZ3_3300	thiC		TRUE	0.997	-13.000	0.063	0.002	Y	NA
10389836	10389837	YPZ3_3300	YPZ3_3301		thiF	TRUE	0.996	-10.000	0.242	1.000	Y	NA
10389837	10389838	YPZ3_3301	YPZ3_3302	thiF		TRUE	0.690	214.000	0.005	0.016	Y	NA
10389838	10389839	YPZ3_3302	YPZ3_3303		thiH	TRUE	0.999	-7.000	0.277	0.002	Y	NA
10389839	10389840	YPZ3_3303	YPZ3_3304	thiH		FALSE	0.005	381.000	0.000	1.000	N	NA
10389841	10389842	YPZ3_3305	YPZ3_3306	rpoC	rpoB	TRUE	0.984	129.000	0.851	0.001		NA
10389842	10389843	YPZ3_3306	YPZ3_3307	rpoB	rplL	FALSE	0.204	343.000	0.223	1.000		NA
10389843	10389844	YPZ3_3307	YPZ3_3308	rplL	rplJ	TRUE	0.997	67.000	0.884	0.007	Y	NA
10389844	10389845	YPZ3_3308	YPZ3_3309	rplJ	rplA	TRUE	0.642	365.000	0.302	0.010	Y	NA
10389845	10389846	YPZ3_3309	YPZ3_3310	rplA	rplK	TRUE	0.999	4.000	0.838	0.010	Y	NA
10389846	10389847	YPZ3_3310	YPZ3_3311	rplK	nusG	TRUE	0.823	191.000	0.681	1.000	N	NA
10389847	10389848	YPZ3_3311	YPZ3_3312	nusG	secE	TRUE	0.996	2.000	0.843	1.000	N	NA
10389848	10389849	YPZ3_3312	YPZ3_3313	secE	tuf	FALSE	0.006	251.000	0.009	1.000	N	NA
10389849	10389850	YPZ3_3313	YPZ3_t55	tuf		FALSE	0.429	109.000	0.000	NA		NA
10389850	10389851	YPZ3_t55	YPZ3_t56			TRUE	0.900	7.000	0.000	NA		NA
10389851	10389852	YPZ3_t56	YPZ3_t57			FALSE	0.345	150.000	0.000	NA		NA
10389852	10389853	YPZ3_t57	YPZ3_t58			TRUE	0.841	19.000	0.000	NA		NA
10389853	10389854	YPZ3_t58	YPZ3_3314			FALSE	0.021	464.000	0.000	NA		NA
10389854	10389855	YPZ3_3314	YPZ3_3315			TRUE	0.982	0.000	0.000	1.000	Y	NA
10389856	10389857	YPZ3_3316	YPZ3_3317		coaA	FALSE	0.198	211.000	0.000	1.000		NA
10389858	10389859	YPZ3_3318	YPZ3_3319	birA	murB	TRUE	0.974	-3.000	0.211	1.000	N	NA
10389859	10389860	YPZ3_3319	YPZ3_r15	murB		FALSE	0.021	464.000	0.000	NA		NA
10389860	10389861	YPZ3_r15	YPZ3_r16			FALSE	0.425	110.000	0.000	NA		NA
10389861	10389862	YPZ3_r16	YPZ3_t59			FALSE	0.205	219.000	0.000	NA		NA
10389862	10389863	YPZ3_t59	YPZ3_t60			TRUE	0.699	52.000	0.000	NA		NA
10389863	10389864	YPZ3_t60	YPZ3_r17			FALSE	0.350	147.000	0.000	NA		NA
10389864	10389865	YPZ3_r17	YPZ3_3320		trkH	FALSE	0.004	1070.000	0.000	NA		NA
10389865	10389866	YPZ3_3320	YPZ3_3321	trkH		TRUE	0.646	40.000	0.007	1.000		NA
10389866	10389867	YPZ3_3321	YPZ3_3322			TRUE	0.549	73.000	0.000	1.000		NA
10389867	10389868	YPZ3_3322	YPZ3_3323		pepQ	FALSE	0.018	263.000	0.000	1.000	N	NA
10389869	10389870	YPZ3_3324	YPZ3_3325	fadB	fadA	TRUE	0.997	12.000	0.607	1.000	Y	NA
10389871	10389872	YPZ3_3326	YPZ3_3327	fadI		TRUE	0.923	55.000	0.090	NA	Y	NA
10389874	10389875	YPZ3_3329	YPZ3_3330	hemB		TRUE	0.856	15.000	0.031	NA		NA
10389875	10389876	YPZ3_3330	YPZ3_3331			TRUE	0.750	39.000	0.000	NA		NA
10389876	10389877	YPZ3_3331	YPZ3_3332			TRUE	0.982	0.000	0.000	1.000	Y	NA
10389877	10389878	YPZ3_3332	YPZ3_3333			TRUE	0.940	27.000	0.000	NA	Y	NA
10389878	10389879	YPZ3_3333	YPZ3_3334		tatC	TRUE	0.684	56.000	0.121	NA	N	NA
10389879	10389880	YPZ3_3334	YPZ3_3335	tatC	tatB	TRUE	0.995	3.000	0.333	NA	Y	NA
10389880	10389881	YPZ3_3335	YPZ3_3336	tatB	aarF	FALSE	0.020	450.000	0.000	1.000		NA
10389881	10389882	YPZ3_3336	YPZ3_3337	aarF		TRUE	0.993	0.000	0.432	1.000		NA
10389882	10389883	YPZ3_3337	YPZ3_3338		ubiE	TRUE	0.944	14.000	0.145	1.000		NA
10389883	10389884	YPZ3_3338	YPZ3_3339	ubiE		TRUE	0.518	92.000	0.047	NA		NA
10389884	10389885	YPZ3_3339	YPZ3_3340			FALSE	0.408	208.000	0.125	NA		NA
10389885	10389886	YPZ3_3340	YPZ3_3341			FALSE	0.125	272.000	0.041	NA		NA
10389886	10389887	YPZ3_3341	YPZ3_3342			FALSE	0.147	364.000	0.000	1.000	Y	NA
10389887	10389888	YPZ3_3342	YPZ3_3343		udp	FALSE	0.043	127.000	0.030	1.000	N	NA
10389892	10389893	YPZ3_3347	YPZ3_3348		ugpQ	FALSE	0.376	101.000	0.023	1.000		NA
10389893	10389894	YPZ3_3348	YPZ3_3349	ugpQ	ugpC	FALSE	0.395	-3.000	0.024	1.000	N	NA
10389894	10389895	YPZ3_3349	YPZ3_3350	ugpC	ugpE	TRUE	0.996	7.000	0.272	0.050	Y	NA
10389895	10389896	YPZ3_3350	YPZ3_3351	ugpE	ugpA	TRUE	0.998	-3.000	0.306	0.050	Y	NA
10389896	10389897	YPZ3_3351	YPZ3_3352	ugpA	ugpB	TRUE	0.927	298.000	0.793	0.050	Y	NA
10389898	10389899	YPZ3_3353	YPZ3_3354			FALSE	0.126	267.000	0.000	NA		NA
10389899	10389900	YPZ3_3354	YPZ3_3355			TRUE	0.971	18.000	0.286	NA		NA
10389900	10389901	YPZ3_3355	YPZ3_3356			TRUE	0.997	-28.000	0.600	NA		NA
10389901	10389902	YPZ3_3356	YPZ3_3357			TRUE	0.968	62.000	0.600	NA		NA
10389902	10389903	YPZ3_3357	YPZ3_3358			TRUE	0.948	176.000	1.000	NA		NA
10389904	10389905	YPZ3_3359	YPZ3_3360		livF	FALSE	0.189	228.000	0.000	NA		NA
10389905	10389906	YPZ3_3360	YPZ3_3361	livF	livG	TRUE	0.998	45.000	0.967	0.019	Y	NA
10389906	10389907	YPZ3_3361	YPZ3_3362	livG	livM	TRUE	0.998	-3.000	0.574	1.000	Y	NA
10389907	10389908	YPZ3_3362	YPZ3_3363	livM	livH	TRUE	0.999	-3.000	0.574	0.050	Y	NA
10389908	10389909	YPZ3_3363	YPZ3_3364	livH	livK	TRUE	0.808	181.000	0.217	1.000	Y	NA
10389911	10389912	YPZ3_3366	YPZ3_3367		rpoH	FALSE	0.053	163.000	0.000	1.000	N	NA
10389912	10389913	YPZ3_3367	YPZ3_3368	rpoH	ftsX	FALSE	0.020	311.000	0.051	1.000	N	NA
10389913	10389914	YPZ3_3368	YPZ3_3369	ftsX	ftsE	TRUE	0.993	-10.000	0.121	1.000	Y	NA
10389914	10389915	YPZ3_3369	YPZ3_3370	ftsE	ftsY	TRUE	0.961	6.000	0.117	0.094	N	NA
10389917	10389918	YPZ3_3372	YPZ3_3373			FALSE	0.266	212.000	0.058	NA		NA
10389919	10389920	YPZ3_3374	YPZ3_3375			FALSE	0.304	414.000	0.325	0.058		NA
10389922	10389923	YPZ3_3377	YPZ3_3378			TRUE	0.455	130.000	0.066	NA		NA
10389924	10389925	YPZ3_3379	YPZ3_3380	glpC	glpB	TRUE	0.948	126.000	0.547	0.001	N	NA
10389925	10389926	YPZ3_3380	YPZ3_3381	glpB	glpA	TRUE	0.999	-10.000	0.650	0.001	N	NA
10389928	10389929	YPZ3_3383	YPZ3_3384			FALSE	0.102	277.000	0.000	1.000		NA
10389929	10389930	YPZ3_3384	YPZ3_3385		pldB	TRUE	0.977	35.000	0.524	1.000		NA
10389932	10389933	YPZ3_3387	YPZ3_3388	rhtC	recQ	FALSE	0.113	107.000	0.043	1.000	N	NA
10389933	10389934	YPZ3_3388	YPZ3_3389	recQ	pldA	FALSE	0.271	78.000	0.057	1.000	N	NA
10389935	10389936	YPZ3_3390	YPZ3_3391			TRUE	0.666	87.000	0.099	NA		NA
10389937	10389938	YPZ3_3392	YPZ3_3393	corA		FALSE	0.008	649.000	0.000	1.000		NA
10389938	10389939	YPZ3_3393	YPZ3_3394			TRUE	0.814	26.000	0.042	NA		NA
10389941	10389942	YPZ3_3396	YPZ3_3397	uvrD		TRUE	0.648	102.000	0.128	1.000		NA
10389942	10389943	YPZ3_3397	YPZ3_3398		xerC	TRUE	0.991	0.000	0.367	1.000		NA
10389943	10389944	YPZ3_3398	YPZ3_3399	xerC		TRUE	0.998	-3.000	0.714	NA		NA
10389944	10389945	YPZ3_3399	YPZ3_3400		dapF	TRUE	0.849	65.000	0.175	NA		NA
10389948	10389949	YPZ3_3403	YPZ3_3404	hemC	hemD	TRUE	0.998	-3.000	0.205	0.001	Y	NA
10389949	10389950	YPZ3_3404	YPZ3_3405	hemD	hemX	TRUE	0.993	31.000	0.600	1.000	Y	NA
10389950	10389951	YPZ3_3405	YPZ3_3406	hemX	hemY	TRUE	0.988	3.000	0.144	1.000	Y	NA
10389952	10389953	YPZ3_3407	YPZ3_t61			FALSE	0.006	816.000	0.000	NA		NA
10389953	10389954	YPZ3_t61	YPZ3_t62			TRUE	0.568	76.000	0.000	NA		NA
10389954	10389955	YPZ3_t62	YPZ3_t63			TRUE	0.850	17.000	0.000	NA		NA
10389955	10389956	YPZ3_t63	YPZ3_t64			TRUE	0.523	84.000	0.000	NA		NA
10389956	10389957	YPZ3_t64	YPZ3_3408		proY	FALSE	0.347	149.000	0.000	NA		NA
10389957	10389958	YPZ3_3408	YPZ3_3409	proY	wecG	FALSE	0.002	524.000	0.000	1.000	N	NA
10389958	10389959	YPZ3_3409	YPZ3_3410	wecG	wecF	TRUE	0.950	9.000	0.126	1.000		NA
10389959	10389960	YPZ3_3410	YPZ3_3411	wecF		TRUE	0.997	-3.000	0.684	1.000		NA
10389960	10389961	YPZ3_3411	YPZ3_3412		wzxE	TRUE	0.987	23.000	0.605	1.000		NA
10389961	10389962	YPZ3_3412	YPZ3_3413	wzxE	rffA	TRUE	0.980	2.000	0.218	1.000		NA
10389962	10389963	YPZ3_3413	YPZ3_3414	rffA	wecD	TRUE	0.983	2.000	0.248	1.000		NA
10389963	10389964	YPZ3_3414	YPZ3_3415	wecD	rffH	TRUE	0.982	-22.000	0.145	1.000		NA
10389964	10389965	YPZ3_3415	YPZ3_3416	rffH	rffG	TRUE	0.940	295.000	0.739	0.003	Y	NA
10389965	10389966	YPZ3_3416	YPZ3_3417	rffG	rffD	TRUE	0.996	-3.000	0.273	1.000	Y	NA
10389966	10389967	YPZ3_3417	YPZ3_3418	rffD	rffE	TRUE	0.997	-3.000	0.348	1.000	Y	NA
10389967	10389968	YPZ3_3418	YPZ3_3419	rffE		TRUE	0.942	281.000	0.677	0.003	Y	NA
10389968	10389969	YPZ3_3419	YPZ3_3420		rfe	TRUE	0.995	78.000	0.735	0.003	Y	NA
10389969	10389970	YPZ3_3420	YPZ3_3421	rfe	rho	FALSE	0.002	535.000	0.000	1.000	N	NA
10389970	10389971	YPZ3_3421	YPZ3_3422	rho	trxA	FALSE	0.010	480.000	0.087	1.000	N	NA
10389972	10389973	YPZ3_3423	YPZ3_3424	rhlB		FALSE	0.101	473.000	0.406	1.000	N	NA
10389975	10389976	YPZ3_3426	YPZ3_3427			FALSE	0.094	97.000	0.000	1.000	N	NA
10389976	10389977	YPZ3_3427	YPZ3_3428			FALSE	0.001	810.000	0.000	1.000	N	NA
10389977	10389978	YPZ3_3428	YPZ3_3429			TRUE	0.994	64.000	1.000	1.000	Y	NA
10389978	10389979	YPZ3_3429	YPZ3_3430			TRUE	0.991	28.000	0.500	1.000	Y	NA
10389979	10389980	YPZ3_3430	YPZ3_3431			TRUE	0.986	17.000	0.500	1.000		NA
10389980	10389981	YPZ3_3431	YPZ3_3432			TRUE	0.990	50.000	1.000	1.000		NA
10389982	10389983	YPZ3_3433	YPZ3_3434		ilvC	FALSE	0.010	589.000	0.000	1.000		NA
10389984	10389985	YPZ3_3435	YPZ3_3436	ilvY		FALSE	0.004	1160.000	0.000	NA		NA
10389985	10389986	YPZ3_3436	YPZ3_3437			TRUE	0.998	-16.000	0.667	NA		NA
10389986	10389987	YPZ3_3437	YPZ3_3438			TRUE	0.660	59.000	0.000	NA		NA
10389988	10389989	YPZ3_3439	YPZ3_3440	ilvA	ilvD	TRUE	0.982	6.000	0.106	1.000	Y	NA
10389989	10389990	YPZ3_3440	YPZ3_3441	ilvD	ilvE	FALSE	0.290	311.000	0.075	1.000	Y	NA
10389990	10389991	YPZ3_3441	YPZ3_3442	ilvE	ilvG	FALSE	0.320	277.000	0.000	1.000	Y	NA
10389995	10389996	YPZ3_3446	YPZ3_3447			TRUE	1.000	0.000	0.865	0.050	Y	NA
10389996	10389997	YPZ3_3447	YPZ3_3448			TRUE	0.990	33.000	0.506	1.000	Y	NA
10389997	10389998	YPZ3_3448	YPZ3_3449			TRUE	0.986	86.000	0.804	NA	Y	NA
10389998	10389999	YPZ3_3449	YPZ3_t65			FALSE	0.005	979.000	0.000	NA		NA
10389999	10390000	YPZ3_t65	YPZ3_t66			TRUE	0.895	9.000	0.000	NA		NA
10390000	10390001	YPZ3_t66	YPZ3_r18			FALSE	0.384	126.000	0.000	NA		NA
10390001	10390002	YPZ3_r18	YPZ3_r19			FALSE	0.425	110.000	0.000	NA		NA
10390002	10390003	YPZ3_r19	YPZ3_t67			FALSE	0.149	253.000	0.000	NA		NA
10390003	10390004	YPZ3_t67	YPZ3_r20			FALSE	0.281	181.000	0.000	NA		NA
10390004	10390005	YPZ3_r20	YPZ3_3450		murI	FALSE	0.018	484.000	0.000	NA		NA
10390005	10390006	YPZ3_3450	YPZ3_3451	murI		FALSE	0.041	86.000	0.025	1.000	N	NA
10390008	10390009	YPZ3_3453	YPZ3_3454			TRUE	0.989	13.000	0.508	NA		NA
10390012	10390013	YPZ3_3457	YPZ3_3458			TRUE	0.867	95.000	0.204	0.003	N	NA
10390014	10390015	YPZ3_3459	YPZ3_3460			TRUE	0.982	65.000	0.667	0.007	N	NA
10390015	10390016	YPZ3_3460	YPZ3_3461			TRUE	0.993	76.000	1.000	0.007		NA
10390016	10390017	YPZ3_3461	YPZ3_3462			FALSE	0.314	166.000	0.000	NA		NA
10390017	10390018	YPZ3_3462	YPZ3_3463			FALSE	0.199	222.000	0.000	NA		NA
10390018	10390019	YPZ3_3463	YPZ3_3464		argH	FALSE	0.001	599.000	0.000	1.000	N	NA
10390019	10390020	YPZ3_3464	YPZ3_3465	argH	argB	TRUE	0.591	167.000	0.017	1.000	Y	NA
10390020	10390021	YPZ3_3465	YPZ3_3466	argB	argC	TRUE	0.892	166.000	0.097	0.002	Y	NA
10390022	10390023	YPZ3_3467	YPZ3_3468		ppc	FALSE	0.011	374.000	0.053	1.000	N	NA
10390023	10390024	YPZ3_3468	YPZ3_3469	ppc		FALSE	0.001	743.000	0.000	1.000	N	NA
10390024	10390025	YPZ3_3469	YPZ3_3470			TRUE	0.948	54.000	0.167	1.000	Y	NA
10390025	10390026	YPZ3_3470	YPZ3_3471		mdfA	FALSE	0.003	542.000	0.000	NA	N	NA
10390026	10390027	YPZ3_3471	YPZ3_3472	mdfA		FALSE	0.007	743.000	0.000	NA		NA
10390030	10390031	YPZ3_3475	YPZ3_3476	selB	selA	TRUE	0.998	-3.000	0.569	0.001	N	NA
10390031	10390032	YPZ3_3476	YPZ3_3477	selA	fdhE	FALSE	0.193	184.000	0.083	NA	N	NA
10390032	10390033	YPZ3_3477	YPZ3_3478	fdhE	fdoI	TRUE	0.964	0.000	0.182	NA	N	NA
10390033	10390034	YPZ3_3478	YPZ3_3479	fdoI	fdoH	TRUE	1.000	-3.000	0.944	0.001	Y	NA
10390034	10390035	YPZ3_3479	YPZ3_3480	fdoH		TRUE	0.999	13.000	0.833	0.001		NA
10390035	10390036	YPZ3_3480	YPZ3_3481			TRUE	0.955	49.000	0.125	0.002		NA
10390037	10390038	YPZ3_3482	YPZ3_3483		sodA	FALSE	0.002	436.000	0.029	1.000	N	NA
10390038	10390039	YPZ3_3483	YPZ3_3484	sodA	tar	FALSE	0.007	344.000	0.000	1.000	N	NA
10390039	10390040	YPZ3_3484	YPZ3_3485	tar		FALSE	0.265	190.000	0.000	NA		NA
10390040	10390041	YPZ3_3485	YPZ3_3486			FALSE	0.013	556.000	0.000	NA		NA
10390042	10390043	YPZ3_3487	YPZ3_3488		mtlR	FALSE	0.205	249.000	0.067	NA		NA
10390043	10390044	YPZ3_3488	YPZ3_3489	mtlR	mtlD	FALSE	0.433	207.000	0.230	NA	N	NA
10390044	10390045	YPZ3_3489	YPZ3_3490	mtlD	mtlA	TRUE	0.895	137.000	0.292	1.000	Y	NA
10390045	10390046	YPZ3_3490	YPZ3_3491	mtlA		FALSE	0.009	650.000	0.000	NA		NA
10390046	10390047	YPZ3_3491	YPZ3_3492		glyS	FALSE	0.014	473.000	0.003	NA		NA
10390047	10390048	YPZ3_3492	YPZ3_3493	glyS	glyQ	TRUE	0.999	10.000	0.651	0.001	Y	NA
10390049	10390050	YPZ3_3494	YPZ3_3495	tag		TRUE	0.936	-3.000	0.028	1.000		NA
10390050	10390051	YPZ3_3495	YPZ3_3496			FALSE	0.041	358.000	0.000	1.000		NA
10390053	10390054	YPZ3_3498	YPZ3_3499		malS	FALSE	0.013	289.000	0.000	1.000	N	NA
10390054	10390055	YPZ3_3499	YPZ3_3500	malS		FALSE	0.029	415.000	0.000	NA		NA
10390055	10390056	YPZ3_3500	YPZ3_3501			FALSE	0.016	512.000	0.000	NA		NA
10390057	10390058	YPZ3_3502	YPZ3_3503		ibpB	FALSE	0.060	373.000	0.069	NA		NA
10390058	10390059	YPZ3_3503	YPZ3_3504	ibpB	ibpA	FALSE	0.429	281.000	0.099	NA	Y	NA
10390061	10390062	YPZ3_3506	YPZ3_3507			TRUE	0.963	-10.000	0.054	NA		NA
10390063	10390064	YPZ3_3508	YPZ3_3509			TRUE	0.997	-6.000	0.316	1.000	Y	NA
10390064	10390065	YPZ3_3509	YPZ3_3510			FALSE	0.208	54.000	0.000	1.000	N	NA
10390065	10390066	YPZ3_3510	YPZ3_3511			TRUE	0.948	54.000	0.167	1.000	Y	NA
10390067	10390068	YPZ3_3512	YPZ3_3513		gyrB	FALSE	0.361	216.000	0.003	0.093		NA
10390068	10390069	YPZ3_3513	YPZ3_3514	gyrB	recF	TRUE	0.995	20.000	0.249	0.003	Y	NA
10390069	10390070	YPZ3_3514	YPZ3_3515	recF	dnaN	TRUE	0.876	173.000	0.318	1.000	Y	NA
10390070	10390071	YPZ3_3515	YPZ3_3516	dnaN	dnaA	TRUE	0.994	5.000	0.328	1.000	Y	NA
10390072	10390073	YPZ3_3517	YPZ3_3518		thdF	TRUE	0.835	143.000	0.221	0.058		NA
10390073	10390074	YPZ3_3518	YPZ3_3519	thdF		FALSE	0.206	186.000	0.003	NA		NA
10390075	10390076	YPZ3_3520	YPZ3_3521			FALSE	0.014	545.000	0.000	NA		NA
10390078	10390079	YPZ3_3523	YPZ3_3524			TRUE	0.998	2.000	0.282	0.015	Y	NA
10390079	10390080	YPZ3_3524	YPZ3_3525			TRUE	0.917	183.000	0.263	0.050	Y	NA
10390080	10390081	YPZ3_3525	YPZ3_3526			FALSE	0.048	220.000	0.000	NA	N	NA
10390081	10390082	YPZ3_3526	YPZ3_3527		phoU	FALSE	0.013	335.000	0.000	NA	N	NA
10390082	10390083	YPZ3_3527	YPZ3_3528	phoU	pstB	TRUE	0.947	88.000	0.317	NA	Y	NA
10390083	10390084	YPZ3_3528	YPZ3_3529	pstB	pstA	TRUE	0.991	81.000	0.526	0.002	Y	NA
10390084	10390085	YPZ3_3529	YPZ3_3530	pstA	pstC	TRUE	0.999	2.000	0.537	0.002	Y	NA
10390085	10390086	YPZ3_3530	YPZ3_3531	pstC	pstS	TRUE	0.842	229.000	0.145	0.002	Y	NA
10390086	10390087	YPZ3_3531	YPZ3_3532	pstS	glmS	FALSE	0.002	483.000	0.000	1.000	N	NA
10390087	10390088	YPZ3_3532	YPZ3_3533	glmS		TRUE	0.572	201.000	0.055	1.000	Y	NA
10390088	10390089	YPZ3_3533	YPZ3_3534		atpC	FALSE	0.003	708.000	0.067	1.000	N	NA
10390089	10390090	YPZ3_3534	YPZ3_3535	atpC		TRUE	0.999	22.000	0.837	0.003	Y	NA
10390090	10390091	YPZ3_3535	YPZ3_3536		atpG	TRUE	0.980	195.000	0.724	0.003	Y	NA
10390091	10390092	YPZ3_3536	YPZ3_3537	atpG	atpA	TRUE	0.997	62.000	0.846	0.003	Y	NA
10390092	10390093	YPZ3_3537	YPZ3_3538	atpA	atpH	TRUE	0.999	15.000	0.864	0.003	Y	NA
10390093	10390094	YPZ3_3538	YPZ3_3539	atpH	atpF	TRUE	0.995	15.000	0.242	0.003	Y	NA
10390094	10390095	YPZ3_3539	YPZ3_3540	atpF	atpB	FALSE	0.386	351.000	0.000	0.003	Y	NA
10390095	10390096	YPZ3_3540	YPZ3_3541	atpB	atpI	TRUE	0.920	106.000	0.291	1.000	Y	NA
10390096	10390097	YPZ3_3541	YPZ3_3542	atpI	gidB	FALSE	0.000	667.000	0.005	1.000	N	NA
10390097	10390098	YPZ3_3542	YPZ3_3543	gidB	gidA	TRUE	0.783	146.000	0.466	1.000	N	NA
10390098	10386470	YPZ3_3543	YPZ3_0001	gidA		FALSE	0.005	381.000	0.000	1.000	N	NA
10386330	10386331	YPZ3_pCD0003	YPZ3_pCD0004	yopE		FALSE	0.003	1509.000	0.000	NA		NA
10386332	10386333	YPZ3_pCD0005	YPZ3_pCD0006		sopA	TRUE	0.990	-3.000	0.400	1.000	N	NA
10386333	10386334	YPZ3_pCD0006	YPZ3_pCD0007	sopA		FALSE	0.004	1106.000	0.000	1.000		NA
10386334	10386335	YPZ3_pCD0007	YPZ3_pCD0008			TRUE	0.973	33.000	0.250	0.062		NA
10386335	10386336	YPZ3_pCD0008	YPZ3_pCD0009			FALSE	0.400	107.000	0.000	1.000		NA
10386336	10386337	YPZ3_pCD0009	YPZ3_pCD0010		yopQ	FALSE	0.010	610.000	0.000	NA		NA
10386338	10386339	YPZ3_pCD0011	YPZ3_pCD0012	yopT	sycT	TRUE	0.998	0.000	0.500	0.007		NA
10386344	10386345	YPZ3_pCD0017	YPZ3_pCD0018	yopD	yopB	TRUE	0.987	19.000	0.526	NA		NA
10386345	10386346	YPZ3_pCD0018	YPZ3_pCD0019	yopB	sycD	TRUE	0.904	149.000	0.632	1.000		NA
10386346	10386347	YPZ3_pCD0019	YPZ3_pCD0020	sycD	lcrV	TRUE	0.970	13.000	0.235	1.000		NA
10386347	10386348	YPZ3_pCD0020	YPZ3_pCD0021	lcrV	lcrR	FALSE	0.063	331.000	0.000	NA		NA
10386348	10386349	YPZ3_pCD0021	YPZ3_pCD0022	lcrR	yscV	TRUE	0.991	-3.000	0.281	NA		NA
10386349	10386350	YPZ3_pCD0022	YPZ3_pCD0023	yscV	yscY	TRUE	0.962	-13.000	0.062	1.000		NA
10386350	10386351	YPZ3_pCD0023	YPZ3_pCD0024	yscY	yscX	TRUE	0.948	-3.000	0.000	NA		NA
10386351	10386352	YPZ3_pCD0024	YPZ3_pCD0025	yscX	sycN	TRUE	0.948	-3.000	0.000	NA		NA
10386352	10386353	YPZ3_pCD0025	YPZ3_pCD0026	sycN	lcrE	FALSE	0.419	246.000	0.208	1.000		NA
10386354	10386355	YPZ3_pCD0027	YPZ3_pCD0028	yscN	yscO	TRUE	0.992	-3.000	0.300	NA		NA
10386355	10386356	YPZ3_pCD0028	YPZ3_pCD0029	yscO	yscP	TRUE	0.976	0.000	0.150	NA		NA
10386356	10386357	YPZ3_pCD0029	YPZ3_pCD0030	yscP	yscQ	TRUE	0.993	3.000	0.235	0.009		NA
10386357	10386358	YPZ3_pCD0030	YPZ3_pCD0031	yscQ	yscR	TRUE	0.998	-3.000	0.529	1.000	Y	NA
10386358	10386359	YPZ3_pCD0031	YPZ3_pCD0032	yscR	yscT	TRUE	0.551	265.000	0.000	0.057	Y	NA
10386359	10386360	YPZ3_pCD0032	YPZ3_pCD0033	yscT	yscU	TRUE	0.999	0.000	0.548	0.057	Y	NA
10386360	10386361	YPZ3_pCD0033	YPZ3_pCD0034	yscU	virG	FALSE	0.012	576.000	0.000	NA		NA
10386361	10386362	YPZ3_pCD0034	YPZ3_pCD0035	virG	virF	TRUE	0.654	124.000	0.154	NA		NA
10386362	10386363	YPZ3_pCD0035	YPZ3_pCD0036	virF	yscB	FALSE	0.028	403.000	0.000	1.000		NA
10386363	10386364	YPZ3_pCD0036	YPZ3_pCD0037	yscB	yscC	TRUE	0.998	-9.000	0.750	1.000		NA
10386366	10386367	YPZ3_pCD0039	YPZ3_pCD0040	yscD	yscG	FALSE	0.021	463.000	0.000	NA		NA
10386367	10386368	YPZ3_pCD0040	YPZ3_pCD0041	yscG	yopR	TRUE	0.999	-3.000	0.900	0.007		NA
10386368	10386369	YPZ3_pCD0041	YPZ3_pCD0042	yopR	lcrO	TRUE	0.996	1.000	0.333	0.007		NA
10386369	10386370	YPZ3_pCD0042	YPZ3_pCD0043	lcrO	ylpB	TRUE	0.994	7.000	0.333	0.011		NA
10386370	10386371	YPZ3_pCD0043	YPZ3_pCD0044	ylpB	yscK	TRUE	0.998	0.000	0.800	1.000		NA
10386371	10386372	YPZ3_pCD0044	YPZ3_pCD0045	yscK	yscL	TRUE	0.998	-21.000	0.727	1.000		NA
10386372	10386373	YPZ3_pCD0045	YPZ3_pCD0046	yscL	lcrQ	FALSE	0.174	225.000	0.000	1.000		NA
10386373	10386374	YPZ3_pCD0046	YPZ3_pCD0047	lcrQ		FALSE	0.005	850.000	0.000	1.000		NA
10386374	10386375	YPZ3_pCD0047	YPZ3_pCD0048			TRUE	0.986	-3.000	0.000	0.010		NA
10386378	10386379	YPZ3_pCD0051	YPZ3_pCD0052	yopJ	ypkA	FALSE	0.034	396.000	0.000	NA		NA
10386379	10386380	YPZ3_pCD0052	YPZ3_pCD0053	ypkA		TRUE	0.982	8.000	0.308	1.000		NA
10386380	10386381	YPZ3_pCD0053	YPZ3_pCD0054		repA1	FALSE	0.003	2158.000	0.000	1.000		NA
10386381	10386382	YPZ3_pCD0054	YPZ3_pCD0055	repA1		FALSE	0.003	1366.000	0.000	1.000		NA
10386382	10386383	YPZ3_pCD0055	YPZ3_pCD0056			TRUE	0.943	33.000	0.250	1.000		NA
10386383	10386384	YPZ3_pCD0056	YPZ3_pCD0057			FALSE	0.299	172.000	0.000	NA		NA
10386384	10386385	YPZ3_pCD0057	YPZ3_pCD0058			FALSE	0.008	664.000	0.000	NA		NA
10386388	10386389	YPZ3_pCD0061	YPZ3_pCD0062	tnpR		TRUE	0.841	19.000	0.000	NA		NA
10386389	10386390	YPZ3_pCD0062	YPZ3_pCD0063			FALSE	0.358	139.000	0.000	NA		NA
10386390	10386391	YPZ3_pCD0063	YPZ3_pCD0064			FALSE	0.024	444.000	0.000	NA		NA
10386392	10386393	YPZ3_pCD0065	YPZ3_pCD0066	sycH		FALSE	0.050	343.000	0.000	1.000		NA
10386393	10386327	YPZ3_pCD0066	YPZ3_pCD0067			TRUE	0.998	0.000	1.000	1.000		NA
10386394	10386395	YPZ3_pMT0001	YPZ3_pMT0002			TRUE	0.982	0.000	0.000	1.000	Y	NA
10386396	10386397	YPZ3_pMT0003	YPZ3_pMT0004			FALSE	0.085	302.000	0.000	NA		NA
10386397	10386398	YPZ3_pMT0004	YPZ3_pMT0005			TRUE	0.542	81.000	0.000	NA		NA
10386398	10386399	YPZ3_pMT0005	YPZ3_pMT0006			TRUE	0.918	3.000	0.000	NA		NA
10386399	10386400	YPZ3_pMT0006	YPZ3_pMT0007			TRUE	0.973	22.000	0.333	NA		NA
10386400	10386401	YPZ3_pMT0007	YPZ3_pMT0008			TRUE	0.998	-12.000	0.800	NA		NA
10386401	10386402	YPZ3_pMT0008	YPZ3_pMT0009			TRUE	0.996	-7.000	0.444	NA		NA
10386402	10386403	YPZ3_pMT0009	YPZ3_pMT0010			TRUE	0.495	90.000	0.000	NA		NA
10386403	10386404	YPZ3_pMT0010	YPZ3_pMT0011			TRUE	0.740	42.000	0.000	NA		NA
10386404	10386405	YPZ3_pMT0011	YPZ3_pMT0012			FALSE	0.047	358.000	0.000	NA		NA
10386405	10386406	YPZ3_pMT0012	YPZ3_pMT0013			TRUE	0.653	60.000	0.000	NA		NA
10386406	10386407	YPZ3_pMT0013	YPZ3_pMT0014			TRUE	0.911	75.000	0.333	NA		NA
10386407	10386408	YPZ3_pMT0014	YPZ3_pMT0015			TRUE	0.996	2.000	0.667	NA		NA
10386408	10386409	YPZ3_pMT0015	YPZ3_pMT0016			TRUE	0.998	-9.000	0.667	NA		NA
10386409	10386410	YPZ3_pMT0016	YPZ3_pMT0017			TRUE	0.946	98.000	0.667	NA		NA
10386410	10386411	YPZ3_pMT0017	YPZ3_pMT0018			TRUE	0.998	0.000	1.000	NA		NA
10386411	10386412	YPZ3_pMT0018	YPZ3_pMT0019			TRUE	0.983	44.000	0.667	NA		NA
10386412	10386413	YPZ3_pMT0019	YPZ3_pMT0020			TRUE	0.723	75.000	0.100	NA		NA
10386413	10386414	YPZ3_pMT0020	YPZ3_pMT0021			TRUE	0.886	27.000	0.100	NA		NA
10386414	10386415	YPZ3_pMT0021	YPZ3_pMT0022			TRUE	0.961	23.000	0.250	NA		NA
10386415	10386416	YPZ3_pMT0022	YPZ3_pMT0023			TRUE	0.966	34.000	0.375	NA		NA
10386416	10386417	YPZ3_pMT0023	YPZ3_pMT0024			TRUE	0.995	3.000	0.667	1.000		NA
10386417	10386418	YPZ3_pMT0024	YPZ3_pMT0025			FALSE	0.020	472.000	0.000	NA		NA
10386418	10386419	YPZ3_pMT0025	YPZ3_pMT0026			FALSE	0.164	244.000	0.000	NA		NA
10386419	10386420	YPZ3_pMT0026	YPZ3_pMT0027			TRUE	0.960	-3.000	0.068	1.000		NA
10386420	10386421	YPZ3_pMT0027	YPZ3_pMT0028			TRUE	0.997	0.000	0.222	0.062	Y	NA
10386422	10386423	YPZ3_pMT0029	YPZ3_pMT0030			FALSE	0.058	341.000	0.000	NA		NA
10386423	10386424	YPZ3_pMT0030	YPZ3_pMT0031			TRUE	0.964	5.000	0.143	NA		NA
10386424	10386425	YPZ3_pMT0031	YPZ3_pMT0032			FALSE	0.070	323.000	0.000	NA		NA
10386426	10386427	YPZ3_pMT0033	YPZ3_pMT0034			FALSE	0.008	687.000	0.000	NA		NA
10386427	10386428	YPZ3_pMT0034	YPZ3_pMT0035			FALSE	0.090	290.000	0.000	1.000		NA
10386428	10386429	YPZ3_pMT0035	YPZ3_pMT0036			TRUE	0.831	13.000	0.002	NA		NA
10386429	10386430	YPZ3_pMT0036	YPZ3_pMT0037			TRUE	0.995	-10.000	0.400	NA		NA
10386430	10386431	YPZ3_pMT0037	YPZ3_pMT0038			FALSE	0.166	230.000	0.000	1.000		NA
10386435	10386436	YPZ3_pMT0042	YPZ3_pMT0043			FALSE	0.013	560.000	0.000	NA		NA
10386436	10386437	YPZ3_pMT0043	YPZ3_pMT0044			TRUE	0.998	-16.000	0.667	NA		NA
10386437	10386438	YPZ3_pMT0044	YPZ3_pMT0045			TRUE	0.913	154.000	0.667	NA		NA
10386438	10386439	YPZ3_pMT0045	YPZ3_pMT0046			FALSE	0.012	295.000	0.000	1.000	N	NA
10386439	10386440	YPZ3_pMT0046	YPZ3_pMT0047			TRUE	0.532	269.000	0.000	0.062	Y	NA
10386440	10386441	YPZ3_pMT0047	YPZ3_pMT0048			TRUE	0.637	61.000	0.033	NA		NA
10386441	10386442	YPZ3_pMT0048	YPZ3_pMT0049			TRUE	0.967	120.000	1.000	NA		NA
10386444	10386445	YPZ3_pMT0051	YPZ3_pMT0052			TRUE	0.936	-3.000	0.016	NA		NA
10386445	10386446	YPZ3_pMT0052	YPZ3_pMT0053		cobS	FALSE	0.210	181.000	0.016	1.000		NA
10386446	10386447	YPZ3_pMT0053	YPZ3_pMT0054	cobS	cobT	TRUE	0.947	97.000	0.667	NA		NA
10386449	10386450	YPZ3_pMT0056	YPZ3_pMT0057			FALSE	0.007	703.000	0.000	NA		NA
10386450	10386451	YPZ3_pMT0057	YPZ3_pMT0058		caf1A	TRUE	0.981	81.000	1.000	NA		NA
10386451	10386452	YPZ3_pMT0058	YPZ3_pMT0059	caf1A	caf1M	TRUE	0.971	112.000	0.667	1.000	Y	NA
10386453	10386454	YPZ3_pMT0060	YPZ3_pMT0061			FALSE	0.072	349.000	0.000	0.062	N	NA
10386454	10386455	YPZ3_pMT0061	YPZ3_pMT0062			FALSE	0.163	469.000	0.000	0.024	Y	NA
10386458	10386459	YPZ3_pMT0065	YPZ3_pMT0066			TRUE	0.815	78.000	0.000	0.016		NA
10386459	10386460	YPZ3_pMT0066	YPZ3_pMT0067			FALSE	0.004	1037.000	0.000	NA		NA
10386460	10386461	YPZ3_pMT0067	YPZ3_pMT0068			TRUE	0.799	27.000	0.000	NA		NA
10386462	10386463	YPZ3_pMT0069	YPZ3_pMT0070	parA	parB	TRUE	0.996	-3.000	0.667	1.000	N	NA
10386463	10386464	YPZ3_pMT0070	YPZ3_pMT0071	parB		FALSE	0.034	379.000	0.000	1.000		NA
10386464	10386465	YPZ3_pMT0071	YPZ3_pMT0072			FALSE	0.005	863.000	0.000	1.000		NA
10386465	10386466	YPZ3_pMT0072	YPZ3_pMT0073			FALSE	0.182	232.000	0.000	NA		NA
10386466	10386467	YPZ3_pMT0073	YPZ3_pMT0074			TRUE	0.979	54.000	0.667	NA		NA
10386467	10386468	YPZ3_pMT0074	YPZ3_pMT0075			FALSE	0.033	399.000	0.000	NA		NA
10386468	10386469	YPZ3_pMT0075	YPZ3_pMT0076			FALSE	0.005	1016.000	0.000	NA		NA
10386469	10386394	YPZ3_pMT0076	YPZ3_pMT0001			FALSE	0.072	124.000	0.000	1.000	N	NA
10390099	10390100	YPZ3_pPCP0001	YPZ3_pPCP0002			TRUE	0.982	0.000	0.000	1.000	Y	NA
10390100	10390101	YPZ3_pPCP0002	YPZ3_pPCP0003			FALSE	0.003	1598.000	0.000	NA		NA
10390101	10390102	YPZ3_pPCP0003	YPZ3_pPCP0004		pim	FALSE	0.012	585.000	0.000	NA		NA
10390104	10390105	YPZ3_pPCP0006	YPZ3_pPCP0007		pla	FALSE	0.166	243.000	0.000	NA		NA