MicrobesOnline Operon Predictions for Hydrogenobacter thermophilus TK-6

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
10375717	10375718	HTH_0001	HTH_0002	dnaA		FALSE	0.294	22.000	0.000	NA		NA
10375718	10375719	HTH_0002	HTH_0003			TRUE	0.946	2.000	0.056	NA		NA
10375720	10375721	HTH_0004	HTH_t01			TRUE	0.592	7.000	0.000	NA		NA
10375722	10375723	HTH_t02	HTH_0005			FALSE	0.533	12.000	0.000	NA		NA
10375723	10375724	HTH_0005	HTH_0006			TRUE	0.733	0.000	0.000	NA		NA
10375725	10375726	HTH_0007	HTH_0008		amnT1	TRUE	0.800	2.000	0.000	1.000	Y	NA
10375726	10375727	HTH_0008	HTH_0009	amnT1	fabI	TRUE	0.699	-3.000	0.000	1.000	N	NA
10375727	10375728	HTH_0009	HTH_0010	fabI		TRUE	0.951	13.000	0.185	0.062	N	NA
10375728	10375729	HTH_0010	HTH_0011			TRUE	0.960	4.000	0.222	1.000		NA
10375729	10375730	HTH_0011	HTH_0012		mobB	FALSE	0.581	10.000	0.000	1.000		NA
10375730	10375731	HTH_0012	HTH_0013	mobB	manB	FALSE	0.521	3.000	0.000	1.000	N	NA
10375733	10375734	HTH_0014	HTH_0015		hsdR	TRUE	0.967	-10.000	0.114	NA		NA
10375734	10375735	HTH_0015	HTH_0016	hsdR		TRUE	0.671	2.000	0.000	NA		NA
10375735	10375736	HTH_0016	HTH_0017			TRUE	0.763	-7.000	0.000	NA		NA
10375736	10375737	HTH_0017	HTH_0018		hsdS	TRUE	0.778	-3.000	0.000	1.000		NA
10375737	10375738	HTH_0018	HTH_0019	hsdS	hsdM	TRUE	0.990	-7.000	0.135	0.046	Y	NA
10375738	10375739	HTH_0019	HTH_0020	hsdM		TRUE	0.789	3.000	0.000	0.046		NA
10375740	10375741	HTH_0021	HTH_0022		nusA	TRUE	0.992	-6.000	0.759	NA		NA
10375741	10375742	HTH_0022	HTH_0023	nusA	trmA	TRUE	0.944	-3.000	0.004	0.031	N	NA
10375742	10375743	HTH_0023	HTH_0024	trmA	nrdA	FALSE	0.020	223.000	0.000	1.000	N	NA
10375743	10375744	HTH_0024	HTH_0025	nrdA	nrdF	TRUE	0.985	13.000	0.393	0.002	Y	NA
10375745	10375746	HTH_0026	HTH_0027			TRUE	0.696	-24.000	0.000	0.058		NA
10375746	10375747	HTH_0027	HTH_0028			TRUE	0.981	0.000	0.333	1.000		NA
10375747	10375748	HTH_0028	HTH_0029			TRUE	0.988	-3.000	0.600	1.000	N	NA
10375748	10375749	HTH_0029	HTH_0030			TRUE	0.966	-3.000	0.086	1.000	N	NA
10375749	10375750	HTH_0030	HTH_0031			TRUE	0.941	0.000	0.033	1.000	N	NA
10375750	10375751	HTH_0031	HTH_0032			TRUE	0.982	-3.000	0.098	1.000	Y	NA
10375752	10375753	HTH_0033	HTH_0034			FALSE	0.063	57.000	0.000	NA	N	NA
10375753	10375754	HTH_0034	HTH_0035			FALSE	0.359	19.000	0.000	1.000		NA
10375754	10375755	HTH_0035	HTH_0036			FALSE	0.583	9.000	0.000	NA		NA
10375755	10375756	HTH_0036	HTH_0037		proA	FALSE	0.157	28.000	0.000	NA	N	NA
10375759	10375760	HTH_0040	HTH_0041	mutS1		TRUE	0.852	-19.000	0.009	1.000		NA
10375760	10375761	HTH_0041	HTH_0042			TRUE	0.958	-10.000	0.059	1.000		NA
10375761	10375762	HTH_0042	HTH_0043		pheT	FALSE	0.055	193.000	0.002	1.000	N	NA
10375763	10375764	HTH_0044	HTH_0045			TRUE	0.759	3.000	0.000	1.000	Y	NA
10375764	10375765	HTH_0045	HTH_0046			FALSE	0.233	21.000	0.000	1.000	N	NA
10375765	10375766	HTH_0046	HTH_0047			TRUE	0.987	-9.000	0.286	1.000	Y	NA
10375766	10375767	HTH_0047	HTH_0048			TRUE	0.979	2.000	0.214	1.000	Y	NA
10375768	10375769	HTH_0049	HTH_0050	rnhC		FALSE	0.062	76.000	0.000	NA		NA
10375773	10375774	HTH_0054	HTH_0055			FALSE	0.467	-19.000	0.000	1.000	N	NA
10375774	10375775	HTH_0055	HTH_0056			FALSE	0.159	40.000	0.000	1.000		NA
10375775	10375776	HTH_0056	HTH_0057			TRUE	0.724	15.000	0.000	0.003		NA
10375777	10375778	HTH_0058	HTH_0059			FALSE	0.064	73.000	0.000	NA		NA
10375778	10375779	HTH_0059	HTH_0060			FALSE	0.533	12.000	0.000	NA		NA
10375779	10375780	HTH_0060	HTH_0061			TRUE	0.920	0.000	0.008	NA		NA
10375780	10375781	HTH_0061	HTH_0062		bacA	TRUE	0.962	0.000	0.062	1.000		NA
10375781	10375782	HTH_0062	HTH_0063	bacA	ftsW	FALSE	0.580	2.000	0.000	1.000	N	NA
10375782	10375783	HTH_0063	HTH_0064	ftsW	ccmC	FALSE	0.481	14.000	0.000	1.000		NA
10375783	10375784	HTH_0064	HTH_0065	ccmC	aroK	TRUE	0.909	-10.000	0.007	1.000		NA
10375785	10375786	HTH_0066	HTH_0067	ndk		FALSE	0.334	-31.000	0.000	1.000	N	NA
10375786	10375787	HTH_0067	HTH_0068		gcpE	FALSE	0.479	10.000	0.000	1.000	N	NA
10375787	10375788	HTH_0068	HTH_0069	gcpE	nadA	TRUE	0.892	-3.000	0.004	1.000	N	NA
10375788	10375789	HTH_0069	HTH_0070	nadA		FALSE	0.128	46.000	0.000	NA		NA
10375789	10375790	HTH_0070	HTH_0071		phoH	TRUE	0.912	-79.000	0.457	NA		NA
10375791	10375792	HTH_0072	HTH_0073	htpX		TRUE	0.778	-3.000	0.000	1.000		NA
10375797	10375798	HTH_0078	HTH_0079			FALSE	0.472	10.000	0.000	NA	N	NA
10375798	10375799	HTH_0079	HTH_0080			FALSE	0.476	14.000	0.000	NA		NA
10375799	10375800	HTH_0080	HTH_0081		lysA	FALSE	0.050	89.000	0.000	NA		NA
10375800	10375801	HTH_0081	HTH_0082	lysA	pgsA2	FALSE	0.380	14.000	0.000	1.000	N	NA
10375801	10375802	HTH_0082	HTH_0083	pgsA2		TRUE	0.692	-12.000	0.000	NA		NA
10375802	10375803	HTH_0083	HTH_0084			TRUE	0.916	-9.000	0.006	NA		NA
10375803	10375804	HTH_0084	HTH_0085		gmhA	TRUE	0.958	-3.000	0.008	1.000	Y	NA
10375804	10375805	HTH_0085	HTH_0086	gmhA		FALSE	0.360	-28.000	0.000	1.000	N	NA
10375805	10375806	HTH_0086	HTH_0087		glgP1	FALSE	0.502	6.000	0.000	1.000	N	NA
10375806	10375807	HTH_0087	HTH_0088	glgP1	glgP2	TRUE	0.948	-3.000	0.000	0.002	Y	NA
10375810	10375811	HTH_0091	HTH_0092	arsA	hynS	FALSE	0.067	56.000	0.000	1.000	N	NA
10375811	10375812	HTH_0092	HTH_0093	hynS		TRUE	0.984	2.000	0.600	NA		NA
10375812	10375813	HTH_0093	HTH_0094			TRUE	0.945	13.000	0.273	NA		NA
10375813	10375814	HTH_0094	HTH_0095		hynL	TRUE	0.994	-3.000	0.667	1.000	Y	NA
10375815	10375816	HTH_0096	HTH_0097	birA	bioA	TRUE	0.941	-3.000	0.003	1.000	Y	NA
10375818	10375819	HTH_0099	HTH_0100			TRUE	0.954	0.000	0.041	NA		NA
10375819	10375820	HTH_0100	HTH_0101			TRUE	0.987	-3.000	0.051	0.032	Y	NA
10375820	10375821	HTH_0101	HTH_0102			TRUE	0.676	2.000	0.000	1.000		NA
10375821	10375822	HTH_0102	HTH_0103		pgmA	FALSE	0.493	-25.000	0.000	1.000		NA
10375822	10375823	HTH_0103	HTH_0104	pgmA	amnT2	TRUE	0.941	-6.000	0.016	1.000	N	NA
10375825	10375826	HTH_0106	HTH_0107		pgk	FALSE	0.570	-19.000	0.000	1.000		NA
10375826	10375827	HTH_0107	HTH_0108	pgk		TRUE	0.747	14.000	0.004	NA		NA
10375827	10375828	HTH_0108	HTH_0109		trpC	TRUE	0.792	12.000	0.005	NA		NA
10375828	10375829	HTH_0109	HTH_0110	trpC		TRUE	0.651	0.000	0.000	1.000	N	NA
10375829	10375830	HTH_0110	HTH_0111			TRUE	0.957	10.000	0.250	NA		NA
10375830	10375831	HTH_0111	HTH_0112		mrcA	FALSE	0.576	10.000	0.000	NA		NA
10375832	10375833	HTH_0113	HTH_t03	ispE		TRUE	0.741	-9.000	0.000	NA		NA
10375833	10375834	HTH_t03	HTH_0114		prsA	FALSE	0.254	25.000	0.000	NA		NA
10375834	10375835	HTH_0114	HTH_0115	prsA	ctc	TRUE	0.796	19.000	0.056	1.000	N	NA
10375835	10375836	HTH_0115	HTH_0116	ctc	pth	TRUE	0.994	0.000	0.496	0.047	Y	NA
10375837	10375838	HTH_0117	HTH_0118	tktA	nuoG	FALSE	0.507	5.000	0.000	1.000	N	NA
10375839	10375840	HTH_0119	HTH_0120	nuoE	nuoF	TRUE	0.992	-25.000	1.000	0.015	Y	NA
10375840	10375841	HTH_0120	HTH_0121	nuoF		FALSE	0.418	-33.000	0.000	NA		NA
10375841	10375842	HTH_0121	HTH_0122			FALSE	0.062	75.000	0.000	NA		NA
10375842	10375843	HTH_0122	HTH_0123		sam1	FALSE	0.410	13.000	0.000	1.000	N	NA
10375843	10375844	HTH_0123	HTH_0124	sam1		TRUE	0.699	-3.000	0.000	1.000	N	NA
10375844	10375845	HTH_0124	HTH_0125		prmA	TRUE	0.699	-3.000	0.000	1.000	N	NA
10375845	10375846	HTH_0125	HTH_0126	prmA		TRUE	0.937	-3.000	0.014	1.000	N	NA
10375846	10375847	HTH_0126	HTH_0127			TRUE	0.718	-10.000	0.000	NA		NA
10375848	10375849	HTH_0128	HTH_0129			TRUE	0.993	0.000	0.688	1.000	Y	NA
10375849	10375850	HTH_0129	HTH_0130			TRUE	0.876	-19.000	0.028	1.000	N	NA
10375850	10375851	HTH_0130	HTH_0131		dnaJ2	TRUE	0.949	-3.000	0.028	1.000	N	NA
10375852	10375853	HTH_0132	HTH_0133		tehB	FALSE	0.559	11.000	0.000	NA		NA
10375854	10375855	HTH_0134	HTH_0135			TRUE	0.892	-13.000	0.008	NA		NA
10375855	10375856	HTH_0135	HTH_0136		mreC	TRUE	0.901	-3.000	0.003	NA		NA
10375856	10375857	HTH_0136	HTH_0137	mreC	mreB	TRUE	0.951	-3.000	0.030	1.000	N	NA
10375858	10375859	HTH_0138	HTH_0139	spoT		FALSE	0.309	17.000	0.000	1.000	N	NA
10375859	10375860	HTH_0139	HTH_0140			FALSE	0.239	26.000	0.000	NA		NA
10375860	10375861	HTH_0140	HTH_0141		dapB	TRUE	0.918	-3.000	0.004	NA		NA
10375861	10375862	HTH_0141	HTH_0142	dapB		TRUE	0.896	-3.000	0.002	NA		NA
10375863	10375864	HTH_0143	HTH_0144			TRUE	0.984	-19.000	1.000	NA		NA
10375864	10375865	HTH_0144	HTH_0145		nirE	FALSE	0.052	88.000	0.000	1.000		NA
10375865	10375866	HTH_0145	HTH_0146	nirE	nirF	TRUE	0.969	-7.000	0.075	1.000		NA
10375866	10375867	HTH_0146	HTH_0147	nirF	nirJ	TRUE	0.967	-12.000	0.151	1.000		NA
10375867	10375868	HTH_0147	HTH_0148	nirJ		TRUE	0.960	-7.000	0.038	1.000		NA
10375868	10375869	HTH_0148	HTH_0149		nirN	TRUE	0.962	-16.000	0.062	0.033		NA
10375869	10375870	HTH_0149	HTH_0150	nirN	nirS	TRUE	0.988	0.000	0.188	0.003		NA
10375870	10375871	HTH_0150	HTH_0151	nirS		FALSE	0.142	68.000	0.000	0.092		NA
10375871	10375872	HTH_0151	HTH_0152			TRUE	0.767	-16.000	0.000	0.092		NA
10375872	10375873	HTH_0152	HTH_0153		cyoB	TRUE	0.929	0.000	0.000	0.006	Y	NA
10375873	10375874	HTH_0153	HTH_0154	cyoB	cyoA	TRUE	0.990	13.000	0.667	0.007	Y	NA
10375874	10375875	HTH_0154	HTH_0155	cyoA		TRUE	0.981	2.000	0.500	NA		NA
10375877	10375878	HTH_0157	HTH_0158		nosY	TRUE	0.971	2.000	0.250	NA		NA
10375878	10375879	HTH_0158	HTH_0159	nosY	nosF	TRUE	0.956	-15.000	0.133	NA		NA
10375879	10375880	HTH_0159	HTH_0160	nosF	nosD	TRUE	0.992	-3.000	0.867	1.000	N	NA
10375880	10375881	HTH_0160	HTH_0161	nosD	nosL	TRUE	0.978	2.000	0.406	NA		NA
10375881	10375882	HTH_0161	HTH_0162	nosL		TRUE	0.983	-3.000	0.254	NA		NA
10375882	10375883	HTH_0162	HTH_0163		nosZ	TRUE	0.945	13.000	0.281	NA		NA
10375883	10375884	HTH_0163	HTH_0164	nosZ		TRUE	0.701	28.000	0.012	0.092		NA
10375885	10375886	HTH_0165	HTH_0166		lon	TRUE	0.691	12.000	0.000	0.024	N	NA
10375886	10375887	HTH_0166	HTH_0167	lon	rspU	FALSE	0.243	26.000	0.000	1.000		NA
10375887	10375888	HTH_0167	HTH_0168	rspU		FALSE	0.055	85.000	0.000	1.000		NA
10375888	10375889	HTH_0168	HTH_0169			FALSE	0.398	17.000	0.000	NA		NA
10375889	10375890	HTH_0169	HTH_0170			FALSE	0.519	-22.000	0.000	NA		NA
10375892	10375893	HTH_0172	HTH_0173			TRUE	0.899	-3.000	0.002	NA		NA
10375895	10375896	HTH_0175	HTH_0176	atpG1	atpD	TRUE	0.964	29.000	0.724	0.008	Y	NA
10375896	10375897	HTH_0176	HTH_0177	atpD	rph	TRUE	0.864	-3.000	0.002	1.000	N	NA
10375898	10375899	HTH_0178	HTH_0179	hisIE		TRUE	0.603	5.000	0.000	NA		NA
10375899	10375900	HTH_0179	HTH_0180		hslU	TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10375900	10375901	HTH_0180	HTH_0181	hslU		TRUE	0.785	-25.000	0.007	NA		NA
10375903	10375904	HTH_0183	HTH_0184			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10375904	10375905	HTH_0184	HTH_0185		kdpD	TRUE	0.763	-7.000	0.000	NA		NA
10375905	10375906	HTH_0185	HTH_0186	kdpD	kdpC	TRUE	0.949	-13.000	0.017	0.086		NA
10375906	10375907	HTH_0186	HTH_0187	kdpC	kdpB	TRUE	0.995	4.000	0.877	0.002	Y	NA
10375907	10375908	HTH_0187	HTH_0188	kdpB	kdpA	TRUE	0.975	3.000	0.035	0.002	Y	NA
10375908	10375909	HTH_0188	HTH_0189	kdpA		FALSE	0.326	-55.000	0.000	NA		NA
10375911	10375912	HTH_0191	HTH_0192	trpF	aroD	TRUE	0.863	-7.000	0.000	1.000	Y	NA
10375912	10375913	HTH_0192	HTH_0193	aroD	argG	TRUE	0.865	3.000	0.002	1.000	Y	NA
10375914	10375915	HTH_0194	HTH_0195			TRUE	0.671	2.000	0.000	NA		NA
10375915	10375916	HTH_0195	HTH_0196			FALSE	0.303	-97.000	0.000	NA		NA
10375916	10375917	HTH_0196	HTH_0197		gidA	FALSE	0.123	47.000	0.000	NA		NA
10375917	10375918	HTH_0197	HTH_0198	gidA	fdx3	FALSE	0.075	51.000	0.000	1.000	N	NA
10375919	10375920	HTH_t04	HTH_0199		thiC	FALSE	0.354	19.000	0.000	NA		NA
10375921	10375922	HTH_0200	HTH_0201	nlpD	ccsB	FALSE	0.258	25.000	0.000	1.000		NA
10375922	10375923	HTH_0201	HTH_0202	ccsB	fadD	TRUE	0.682	11.000	0.000	0.060	N	NA
10375923	10375924	HTH_0202	HTH_0203	fadD	fcbC	TRUE	0.778	-3.000	0.000	1.000		NA
10375924	10375925	HTH_0203	HTH_0204	fcbC		FALSE	0.564	-19.000	0.000	NA		NA
10375926	10375927	HTH_0205	HTH_0206	ispD		TRUE	0.926	-3.000	0.006	NA		NA
10375928	10375929	HTH_0207	HTH_0208		mraY	TRUE	0.891	2.000	0.007	NA		NA
10375934	10375935	HTH_0213	HTH_0214		aroC	TRUE	0.770	-16.000	0.003	NA	N	NA
10375935	10375936	HTH_0214	HTH_0215	aroC	rpmB	TRUE	0.872	0.000	0.004	1.000	N	NA
10375936	10375937	HTH_0215	HTH_0216	rpmB		FALSE	0.294	22.000	0.000	NA		NA
10375940	10375941	HTH_0219	HTH_0220			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10375942	10375943	HTH_0221	HTH_0222	ffh		FALSE	0.156	40.000	0.000	NA		NA
10375945	10375946	HTH_0224	HTH_0225	trxB1	trxA1	TRUE	0.948	0.000	0.027	1.000		NA
10375946	10375947	HTH_0225	HTH_0226	trxA1		TRUE	0.981	2.000	0.500	1.000		NA
10375951	10375952	HTH_0230	HTH_0231			TRUE	0.966	-3.000	0.011	0.059		NA
10375952	10375953	HTH_0231	HTH_0232			TRUE	0.952	-3.000	0.005	1.000	Y	NA
10375953	10375954	HTH_0232	HTH_0233			TRUE	0.778	-3.000	0.000	1.000		NA
10375954	10375955	HTH_0233	HTH_0234			TRUE	0.947	-10.000	0.032	1.000		NA
10375960	10375961	HTH_0239	HTH_0240	cirA		TRUE	0.838	14.000	0.033	NA	N	NA
10375961	10375962	HTH_0240	HTH_0241		tonB1	FALSE	0.573	2.000	0.000	NA	N	NA
10375963	10375964	HTH_r01	HTH_r02			FALSE	0.171	35.000	0.000	NA		NA
10375964	10375965	HTH_r02	HTH_0242			FALSE	0.297	-1161.000	0.000	NA		NA
10375965	10375966	HTH_0242	HTH_t05			FALSE	0.026	2656.000	0.000	NA		NA
10375966	10375967	HTH_t05	HTH_t06			FALSE	0.328	20.000	0.000	NA		NA
10375967	10375968	HTH_t06	HTH_r03			FALSE	0.073	68.000	0.000	NA		NA
10375968	10375969	HTH_r03	HTH_0243			FALSE	0.034	171.000	0.000	NA		NA
10375970	10375971	HTH_0244	HTH_0245			FALSE	0.032	175.000	0.000	NA		NA
10375971	10375972	HTH_0245	HTH_0246			TRUE	0.843	0.000	0.000	1.000	Y	NA
10375972	10375973	HTH_0246	HTH_0247		rnc	TRUE	0.809	-28.000	0.023	1.000	N	NA
10375974	10375975	HTH_0248	HTH_0249			TRUE	0.832	-73.000	0.100	NA		NA
10375975	10375976	HTH_0249	HTH_0250			TRUE	0.759	3.000	0.000	1.000	Y	NA
10375976	10375977	HTH_0250	HTH_0251		recN	TRUE	0.971	-7.000	0.029	1.000	Y	NA
10375978	10375979	HTH_0252	HTH_0253	atpA		TRUE	0.907	-3.000	0.003	NA		NA
10375979	10375980	HTH_0253	HTH_0254			FALSE	0.083	62.000	0.000	NA		NA
10375980	10375981	HTH_0254	HTH_0255		gspG1	FALSE	0.429	16.000	0.000	1.000		NA
10375981	10375982	HTH_0255	HTH_0256	gspG1		TRUE	0.877	-16.000	0.010	NA		NA
10375982	10375983	HTH_0256	HTH_0257			TRUE	0.927	-40.000	0.400	NA		NA
10375983	10375984	HTH_0257	HTH_0258			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10375984	10375985	HTH_0258	HTH_0259			FALSE	0.583	9.000	0.000	NA		NA
10375985	10375986	HTH_0259	HTH_0260			TRUE	0.950	-7.000	0.019	1.000		NA
10375988	10375989	HTH_t07	HTH_0262		accA	FALSE	0.328	20.000	0.000	NA		NA
10375989	10375990	HTH_0262	HTH_0263	accA		TRUE	0.699	-3.000	0.000	1.000	N	NA
10375991	10375992	HTH_0264	HTH_0265	secA		FALSE	0.046	99.000	0.000	NA		NA
10375993	10375994	HTH_0266	HTH_0267			FALSE	0.368	-43.000	0.000	NA		NA
10375994	10375995	HTH_0267	HTH_0268			FALSE	0.340	-49.000	0.000	NA		NA
10375995	10375996	HTH_0268	HTH_0269			TRUE	0.934	-12.000	0.025	NA		NA
10375996	10375997	HTH_0269	HTH_0270			TRUE	0.763	-7.000	0.000	NA		NA
10375997	10375998	HTH_0270	HTH_0271			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10375998	10375999	HTH_0271	HTH_0272			TRUE	0.763	10.000	0.000	0.035		NA
10375999	10376000	HTH_0272	HTH_0273		pdxJ	FALSE	0.447	25.000	0.000	0.035		NA
10376000	10376001	HTH_0273	HTH_0274	pdxJ		FALSE	0.294	22.000	0.000	NA		NA
10376003	10376004	HTH_0276	HTH_0277			TRUE	0.733	0.000	0.000	NA		NA
10376004	10376005	HTH_0277	HTH_0278			FALSE	0.128	46.000	0.000	NA		NA
10376006	10376007	HTH_t08	HTH_0279			FALSE	0.519	-22.000	0.000	NA		NA
10376007	10376008	HTH_0279	HTH_0280		def1	TRUE	0.984	-3.000	0.300	1.000		NA
10376010	10376011	HTH_0282	HTH_0283		norB	TRUE	0.935	17.000	0.417	NA		NA
10376011	10376012	HTH_0283	HTH_0284	norB	norC	TRUE	0.654	19.000	0.000	0.001		NA
10376013	10376014	HTH_0285	HTH_0286	resB		FALSE	0.380	-40.000	0.000	NA		NA
10376014	10376015	HTH_0286	HTH_0287			FALSE	0.376	18.000	0.000	NA		NA
10376015	10376016	HTH_0287	HTH_0288			TRUE	0.975	1.000	0.069	0.044		NA
10376016	10376017	HTH_0288	HTH_0289			FALSE	0.038	127.000	0.000	NA		NA
10376017	10376018	HTH_0289	HTH_0290			FALSE	0.269	24.000	0.000	NA		NA
10376018	10376019	HTH_0290	HTH_0291			TRUE	0.986	-7.000	0.429	NA		NA
10376019	10376020	HTH_0291	HTH_0292			TRUE	0.692	-12.000	0.000	NA		NA
10376020	10376021	HTH_0292	HTH_0293		valS	FALSE	0.093	57.000	0.000	NA		NA
10376021	10376022	HTH_0293	HTH_0294	valS	rfaD	TRUE	0.778	-3.000	0.000	1.000		NA
10376022	10376023	HTH_0294	HTH_0295	rfaD	argB	TRUE	0.699	-3.000	0.000	1.000	N	NA
10376023	10376024	HTH_0295	HTH_0296	argB		FALSE	0.032	177.000	0.000	NA		NA
10376024	10376025	HTH_0296	HTH_0297			TRUE	0.963	11.000	0.400	NA		NA
10376025	10376026	HTH_0297	HTH_0298		trmD	TRUE	0.883	-3.000	0.003	1.000	N	NA
10376026	10376027	HTH_0298	HTH_0299	trmD		TRUE	0.676	2.000	0.000	1.000		NA
10376027	10376028	HTH_0299	HTH_0300			TRUE	0.778	-3.000	0.000	1.000		NA
10376030	10376031	HTH_0302	HTH_0303	pilT1	pilC1	TRUE	0.973	3.000	0.218	1.000	Y	NA
10376031	10376032	HTH_0303	HTH_0304	pilC1		FALSE	0.122	35.000	0.000	1.000	N	NA
10376033	10376034	HTH_0305	HTH_0306			TRUE	0.976	-3.000	0.195	1.000	N	NA
10376034	10376035	HTH_0306	HTH_0307		stpK	TRUE	0.958	-3.000	0.049	1.000	N	NA
10376035	10376036	HTH_0307	HTH_0308	stpK		FALSE	0.580	2.000	0.000	1.000	N	NA
10376036	10376037	HTH_0308	HTH_0309		dksA2	TRUE	0.931	-3.000	0.011	1.000	N	NA
10376038	10376039	HTH_0310	HTH_0311		ccl	TRUE	0.937	0.000	0.013	1.000		NA
10376039	10376040	HTH_0311	HTH_0312	ccl		TRUE	0.963	0.000	0.067	1.000		NA
10376041	10376042	HTH_0313	HTH_0314	thrA		FALSE	0.403	13.000	0.000	NA	N	NA
10376045	10376046	HTH_0317	HTH_0318	feoA	feoB	TRUE	0.964	-3.000	0.042	1.000		NA
10376047	10376048	HTH_0319	HTH_0320	pilC2		TRUE	0.622	1.000	0.000	1.000	N	NA
10376048	10376049	HTH_0320	HTH_0321			FALSE	0.294	22.000	0.000	NA		NA
10376050	10376051	HTH_0322	HTH_0323			TRUE	0.896	-16.000	0.016	NA		NA
10376054	10376055	HTH_0326	HTH_0327	rbn	kamA	TRUE	0.942	-7.000	0.011	1.000		NA
10376056	10376057	HTH_0328	HTH_0329	hemA		TRUE	0.643	-55.000	0.006	NA		NA
10376057	10376058	HTH_0329	HTH_0330			TRUE	0.968	-3.000	0.059	NA		NA
10376058	10376059	HTH_0330	HTH_0331		murA	TRUE	0.761	-28.000	0.007	NA		NA
10376060	10376061	HTH_0332	HTH_0333		pncA	FALSE	0.086	131.000	0.004	NA	N	NA
10376061	10376062	HTH_0333	HTH_0334	pncA		TRUE	0.821	6.000	0.004	NA		NA
10376063	10376064	HTH_0335	HTH_0336			FALSE	0.426	-31.000	0.000	NA		NA
10376064	10376065	HTH_0336	HTH_0337			FALSE	0.587	8.000	0.000	NA		NA
10376066	10376067	HTH_0338	HTH_0339	hemH	smc	TRUE	0.685	-7.000	0.000	1.000	N	NA
10376067	10376068	HTH_0339	HTH_0340	smc		FALSE	0.489	7.000	0.000	NA	N	NA
10376069	10376070	HTH_0341	HTH_0342			FALSE	0.294	22.000	0.000	NA		NA
10376070	10376071	HTH_0342	HTH_0343			TRUE	0.980	-3.000	0.190	NA		NA
10376071	10376072	HTH_0343	HTH_0344		ribF	TRUE	0.912	-3.000	0.003	NA		NA
10376073	10376074	HTH_0345	HTH_0346			TRUE	0.598	6.000	0.000	NA		NA
10376074	10376075	HTH_0346	HTH_0347			TRUE	0.973	9.000	0.625	1.000	N	NA
10376075	10376076	HTH_0347	HTH_0348			TRUE	0.797	49.000	0.625	NA		NA
10376076	10376077	HTH_0348	HTH_0349			TRUE	0.966	16.000	0.800	NA		NA
10376078	10376079	HTH_0350	HTH_0351			TRUE	0.972	-3.000	0.087	NA		NA
10376080	10376081	HTH_0352	HTH_0353		aspS	FALSE	0.580	2.000	0.000	1.000	N	NA
10376082	10376083	HTH_0354	HTH_0355	hpt	hisD	FALSE	0.479	10.000	0.000	1.000	N	NA
10376083	10376084	HTH_0355	HTH_0356	hisD		TRUE	0.944	-3.000	0.011	NA		NA
10376084	10376085	HTH_0356	HTH_0357			TRUE	0.603	5.000	0.000	NA		NA
10376085	10376086	HTH_0357	HTH_0358			TRUE	0.959	-3.000	0.030	1.000		NA
10376086	10376087	HTH_0358	HTH_0359		acuC1	TRUE	0.975	-3.000	0.107	NA		NA
10376087	10376088	HTH_0359	HTH_0360	acuC1	purD	FALSE	0.479	9.000	0.000	NA	N	NA
10376091	10376092	HTH_0363	HTH_0364			TRUE	0.965	0.000	0.027	1.000	Y	NA
10376093	10376094	HTH_0365	HTH_0366	vacB	nsd	TRUE	0.699	-3.000	0.000	1.000	N	NA
10376094	10376095	HTH_0366	HTH_0367	nsd	dppC	TRUE	0.778	-3.000	0.000	1.000		NA
10376095	10376096	HTH_0367	HTH_0368	dppC		TRUE	0.928	-3.000	0.006	1.000		NA
10376096	10376097	HTH_0368	HTH_0369		ribC	TRUE	0.930	0.000	0.003	1.000	Y	NA
10376097	10376098	HTH_0369	HTH_0370	ribC		FALSE	0.537	18.000	0.002	NA	N	NA
10376099	10376100	HTH_0371	HTH_0372		rplI	FALSE	0.204	53.000	0.003	1.000	N	NA
10376100	10376101	HTH_0372	HTH_0373	rplI	rpsR	TRUE	0.986	12.000	0.499	0.027	Y	NA
10376101	10376102	HTH_0373	HTH_0374	rpsR	ssb	TRUE	0.720	13.000	0.004	1.000	N	NA
10376102	10376103	HTH_0374	HTH_0375	ssb	rpsF	TRUE	0.896	-7.000	0.005	1.000	N	NA
10376104	10376105	HTH_0376	HTH_0377		polA	TRUE	0.924	-3.000	0.009	1.000	N	NA
10376106	10376107	HTH_0378	HTH_0379		zwf	TRUE	0.768	-91.000	0.011	1.000	Y	NA
10376107	10376108	HTH_0379	HTH_0380	zwf	gnd	TRUE	0.983	-7.000	0.130	1.000	Y	NA
10376109	10376110	HTH_0381	HTH_0382			TRUE	0.671	2.000	0.000	NA		NA
10376110	10376111	HTH_0382	HTH_0383			FALSE	0.564	-19.000	0.000	NA		NA
10376112	10376113	HTH_0384	HTH_0385	coxG	coxF	FALSE	0.455	-28.000	0.000	NA		NA
10376113	10376114	HTH_0385	HTH_0386	coxF	coxM	FALSE	0.514	3.000	0.000	NA	N	NA
10376114	10376115	HTH_0386	HTH_0387	coxM	coxL	TRUE	0.978	4.000	0.138	0.086	Y	NA
10376115	10376116	HTH_0387	HTH_0388	coxL	coxS	TRUE	0.967	14.000	0.188	0.086	Y	NA
10376116	10376117	HTH_0388	HTH_0389	coxS		FALSE	0.021	200.000	0.000	1.000	N	NA
10376117	10376118	HTH_0389	HTH_0390			FALSE	0.510	23.000	0.000	0.019		NA
10376118	10376119	HTH_0390	HTH_0391			FALSE	0.195	32.000	0.000	1.000		NA
10376119	10376120	HTH_0391	HTH_0392			FALSE	0.104	87.000	0.000	0.086		NA
10376120	10376121	HTH_0392	HTH_0393			FALSE	0.037	136.000	0.000	NA		NA
10376123	10376124	HTH_0395	HTH_0396			FALSE	0.098	55.000	0.000	NA		NA
10376124	10376125	HTH_0396	HTH_0397			FALSE	0.476	14.000	0.000	NA		NA
10376126	10376127	HTH_0398	HTH_0399		livK	FALSE	0.208	30.000	0.000	NA		NA
10376127	10376128	HTH_0399	HTH_0400	livK	livH	TRUE	0.983	-9.000	0.177	NA	Y	NA
10376128	10376129	HTH_0400	HTH_0401	livH	livM	TRUE	0.994	-7.000	0.359	0.018	Y	NA
10376129	10376130	HTH_0401	HTH_0402	livM	livG	TRUE	0.958	-15.000	0.051	1.000	Y	NA
10376130	10376131	HTH_0402	HTH_0403	livG	livF	TRUE	0.990	-10.000	0.200	0.016	Y	NA
10376131	10376132	HTH_0403	HTH_0404	livF	rlpA1	FALSE	0.032	174.000	0.000	NA		NA
10376133	10376134	HTH_0405	HTH_0406			TRUE	0.805	-28.000	0.011	NA		NA
10376135	10376136	HTH_0407	HTH_0408	nuoI2	nuoJ2	TRUE	0.995	-3.000	0.442	0.023	Y	NA
10376136	10376137	HTH_0408	HTH_0409	nuoJ2	nuoK2	TRUE	0.953	-19.000	0.012	0.013	Y	NA
10376137	10376138	HTH_0409	HTH_0410	nuoK2	nuoL3	TRUE	0.966	2.000	0.011	0.023	Y	NA
10376138	10376139	HTH_0410	HTH_0411	nuoL3	nuoM2	TRUE	0.959	5.000	0.011	0.007	Y	NA
10376139	10376140	HTH_0411	HTH_0412	nuoM2	nuoN2	TRUE	0.995	7.000	1.000	0.007	Y	NA
10376140	10376141	HTH_0412	HTH_0413	nuoN2	nuoA1	TRUE	0.963	4.000	0.022	0.023	Y	NA
10376141	10376142	HTH_0413	HTH_0414	nuoA1	nuoD1	TRUE	0.963	5.000	0.018	0.013	Y	NA
10376142	10376143	HTH_0414	HTH_0415	nuoD1	nuoH2	TRUE	0.938	11.000	0.008	0.023	Y	NA
10376144	10376145	HTH_0416	HTH_0417	hisF	mutL	TRUE	0.738	0.000	0.000	1.000		NA
10376147	10376148	HTH_0419	HTH_0420	purA	hflX	TRUE	0.938	0.000	0.002	0.017		NA
10376148	10376149	HTH_0420	HTH_0421	hflX	hfq2	TRUE	0.921	0.000	0.008	1.000		NA
10376149	10376150	HTH_0421	HTH_0422	hfq2		FALSE	0.083	62.000	0.000	NA		NA
10376150	10376151	HTH_0422	HTH_0423			TRUE	0.976	-7.000	0.143	NA		NA
10376151	10376152	HTH_0423	HTH_0424		argD	FALSE	0.134	44.000	0.000	NA		NA
10376152	10376153	HTH_0424	HTH_0425	argD	nadE	TRUE	0.880	3.000	0.017	1.000	N	NA
10376154	10376155	HTH_0426	HTH_0427			FALSE	0.451	15.000	0.000	NA		NA
10376156	10376157	HTH_0428	HTH_0429	gspE		TRUE	0.641	-15.000	0.000	NA		NA
10376157	10376158	HTH_0429	HTH_0430		gspD	TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10376159	10376160	HTH_0431	HTH_0432	dnaX		TRUE	0.950	-37.000	0.600	NA		NA
10376160	10376161	HTH_0432	HTH_0433			FALSE	0.049	90.000	0.000	NA		NA
10376162	10376163	HTH_0434	HTH_0435	purQ	purS	TRUE	0.997	-3.000	0.656	0.002	Y	NA
10376163	10376164	HTH_0435	HTH_0436	purS		FALSE	0.047	96.000	0.000	NA		NA
10376164	10376165	HTH_0436	HTH_0437			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10376165	10376166	HTH_0437	HTH_0438			FALSE	0.107	51.000	0.000	NA		NA
10376166	10376167	HTH_0438	HTH_0439		rfaE	TRUE	0.664	-25.000	0.003	1.000	N	NA
10376167	10376168	HTH_0439	HTH_0440	rfaE	lysC	TRUE	0.851	-10.000	0.003	1.000	N	NA
10376171	10376172	HTH_0443	HTH_0444			TRUE	0.952	-19.000	0.222	NA		NA
10376172	10376173	HTH_0444	HTH_0445			TRUE	0.945	-7.000	0.015	NA		NA
10376173	10376174	HTH_0445	HTH_0446		cobA1	TRUE	0.953	0.000	0.038	1.000		NA
10376174	10376175	HTH_0446	HTH_0447	cobA1		TRUE	0.775	-30.000	0.015	1.000	N	NA
10376175	10376176	HTH_0447	HTH_0448		lpdA1	FALSE	0.357	15.000	0.000	1.000	N	NA
10376176	10376177	HTH_0448	HTH_0449	lpdA1		TRUE	0.984	-3.000	0.286	1.000		NA
10376178	10376179	HTH_0450	HTH_0451			TRUE	0.985	-3.000	0.361	NA		NA
10376179	10376180	HTH_0451	HTH_0452			TRUE	0.953	-16.000	0.143	1.000		NA
10376180	10376181	HTH_0452	HTH_0453			TRUE	0.975	0.000	0.190	NA		NA
10376181	10376182	HTH_0453	HTH_0454		hoxM	TRUE	0.896	16.000	0.122	NA		NA
10376182	10376183	HTH_0454	HTH_0455	hoxM	hoxL	TRUE	0.990	-3.000	0.347	1.000	Y	NA
10376183	10376184	HTH_0455	HTH_0456	hoxL	hoxS	TRUE	0.971	26.000	0.750	0.005	Y	NA
10376185	10376186	HTH_0457	HTH_0458			TRUE	0.987	5.000	1.000	NA		NA
10376186	10376187	HTH_0458	HTH_0459			FALSE	0.041	116.000	0.000	NA		NA
10376187	10376188	HTH_0459	HTH_0460			TRUE	0.733	0.000	0.000	NA		NA
10376188	10376189	HTH_0460	HTH_0461			TRUE	0.989	-3.000	0.500	NA		NA
10376189	10376190	HTH_0461	HTH_0462		cbiM	TRUE	0.888	12.000	0.031	NA		NA
10376190	10376191	HTH_0462	HTH_0463	cbiM	cbiQ	TRUE	0.923	-10.000	0.010	NA		NA
10376191	10376192	HTH_0463	HTH_0464	cbiQ	cbiO	TRUE	0.963	-7.000	0.045	NA		NA
10376193	10376194	HTH_0465	HTH_0466	def2		TRUE	0.983	-3.000	0.364	1.000	N	NA
10376195	10376196	HTH_0467	HTH_0468			TRUE	0.921	9.000	0.051	NA		NA
10376196	10376197	HTH_0468	HTH_0469		phoU	FALSE	0.081	48.000	0.000	NA	N	NA
10376197	10376198	HTH_0469	HTH_0470	phoU		TRUE	0.941	-3.000	0.018	NA	N	NA
10376199	10376200	HTH_0471	HTH_0472			TRUE	0.993	-3.000	0.800	NA		NA
10376200	10376201	HTH_0472	HTH_0473			FALSE	0.166	36.000	0.000	NA		NA
10376201	10376202	HTH_0473	HTH_0474		fabD	FALSE	0.058	61.000	0.000	NA	N	NA
10376202	10376203	HTH_0474	HTH_0475	fabD		TRUE	0.604	4.000	0.000	NA		NA
10376203	10376204	HTH_0475	HTH_0476		lonB	FALSE	0.118	48.000	0.000	NA		NA
10376204	10376205	HTH_0476	HTH_0477	lonB		TRUE	0.883	2.000	0.006	NA		NA
10376205	10376206	HTH_0477	HTH_0478			FALSE	0.398	17.000	0.000	NA		NA
10376206	10376207	HTH_0478	HTH_0479		yqgF	TRUE	0.964	-3.000	0.043	NA		NA
10376207	10376208	HTH_0479	HTH_0480	yqgF		TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10376208	10376209	HTH_0480	HTH_0481			FALSE	0.183	33.000	0.000	NA		NA
10376209	10376210	HTH_0481	HTH_0482		hisS1	TRUE	0.846	-13.000	0.003	NA		NA
10376211	10376212	HTH_0483	HTH_0484	hemB	miaB2	TRUE	0.699	-3.000	0.000	1.000	N	NA
10376212	10376213	HTH_0484	HTH_0485	miaB2		TRUE	0.759	14.000	0.005	NA		NA
10376214	10376215	HTH_0486	HTH_0487			TRUE	0.869	2.000	0.004	NA		NA
10376216	10376217	HTH_0488	HTH_0489	fabG	topA	FALSE	0.507	4.000	0.000	1.000	N	NA
10376217	10376218	HTH_0489	HTH_0490	topA	draG	FALSE	0.568	-13.000	0.000	NA	N	NA
10376218	10376219	HTH_0490	HTH_0491	draG	hfq1	TRUE	0.974	-10.000	0.200	NA		NA
10376220	10376221	HTH_0492	HTH_0493	fdx7	rep	FALSE	0.051	68.000	0.000	1.000	N	NA
10376221	10376222	HTH_0493	HTH_0494	rep		TRUE	0.687	12.000	0.000	NA	Y	NA
10376223	10376224	HTH_0495	HTH_0496			TRUE	0.938	0.000	0.016	NA		NA
10376225	10376226	HTH_0497	HTH_0498			TRUE	0.993	-9.000	0.635	1.000	Y	NA
10376226	10376227	HTH_0498	HTH_0499			FALSE	0.078	66.000	0.000	1.000		NA
10376227	10376228	HTH_0499	HTH_0500		folC	TRUE	0.778	-3.000	0.000	1.000		NA
10376228	10376229	HTH_0500	HTH_0501	folC	cspC	FALSE	0.113	39.000	0.000	1.000	N	NA
10376230	10376231	HTH_0502	HTH_0503			TRUE	0.991	3.000	0.750	0.008		NA
10376231	10376232	HTH_0503	HTH_0504		tatB	FALSE	0.513	24.000	0.000	0.008		NA
10376232	10376233	HTH_0504	HTH_0505	tatB	tatC	TRUE	0.706	-46.000	0.009	NA		NA
10376233	10376234	HTH_0505	HTH_0506	tatC	nueM	TRUE	0.693	-3.000	0.000	NA	N	NA
10376234	10376235	HTH_0506	HTH_0507	nueM		FALSE	0.115	38.000	0.000	1.000	N	NA
10376235	10376236	HTH_0507	HTH_0508			TRUE	0.617	3.000	0.000	NA		NA
10376237	10376238	HTH_0509	HTH_0510	pgsA1	lnt	TRUE	0.693	-19.000	0.000	0.052	N	NA
10376238	10376239	HTH_0510	HTH_0511	lnt		TRUE	0.958	-3.000	0.027	1.000		NA
10376239	10376240	HTH_0511	HTH_0512			TRUE	0.975	-3.000	0.103	1.000		NA
10376241	10376242	HTH_0513	HTH_t09	himA		FALSE	0.089	60.000	0.000	NA		NA
10376243	10376244	HTH_0514	HTH_0515			FALSE	0.086	61.000	0.000	NA		NA
10376244	10376245	HTH_0515	HTH_0516			TRUE	0.671	2.000	0.000	NA		NA
10376245	10376246	HTH_0516	HTH_0517			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10376246	10376247	HTH_0517	HTH_0518			FALSE	0.506	13.000	0.000	NA		NA
10376247	10376248	HTH_0518	HTH_0519			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10376248	10376249	HTH_0519	HTH_0520			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10376249	10376250	HTH_0520	HTH_0521			FALSE	0.503	-24.000	0.000	NA		NA
10376250	10376251	HTH_0521	HTH_0522			FALSE	0.055	84.000	0.000	NA		NA
10376253	10376254	HTH_0524	HTH_0525			FALSE	0.139	43.000	0.000	NA		NA
10376255	10376256	HTH_0527	HTH_0528			TRUE	0.666	-13.000	0.000	NA		NA
10376256	10376257	HTH_0528	HTH_0529			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10376257	10376258	HTH_0529	HTH_0530			TRUE	0.608	17.000	0.000	0.041		NA
10376258	10376259	HTH_0530	HTH_0531			TRUE	0.864	8.000	0.000	0.014	Y	NA
10376259	10376260	HTH_0531	HTH_0532			FALSE	0.023	172.000	0.000	1.000	N	NA
10376260	10376261	HTH_0532	HTH_0533			FALSE	0.034	159.000	0.000	NA		NA
10376261	10376262	HTH_0533	HTH_0534			FALSE	0.506	13.000	0.000	NA		NA
10376262	10376263	HTH_0534	HTH_0535			TRUE	0.733	0.000	0.000	NA		NA
10376264	10376265	HTH_0536	HTH_0537			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10376265	10376266	HTH_0537	HTH_0538			TRUE	0.763	-7.000	0.000	NA		NA
10376266	10376267	HTH_0538	HTH_0539			FALSE	0.043	112.000	0.000	NA		NA
10376267	10376268	HTH_0539	HTH_0540			FALSE	0.053	86.000	0.000	NA		NA
10376269	10376270	HTH_0541	HTH_0542			FALSE	0.060	78.000	0.000	NA		NA
10376270	10376271	HTH_0542	HTH_0543			TRUE	0.718	-10.000	0.000	NA		NA
10376271	10376272	HTH_0543	HTH_0544			TRUE	0.959	20.000	1.000	NA		NA
10376272	10376273	HTH_0544	HTH_0545			FALSE	0.033	172.000	0.000	NA		NA
10376273	10376274	HTH_0545	HTH_0546			FALSE	0.533	12.000	0.000	NA		NA
10376274	10376275	HTH_0546	HTH_0547			FALSE	0.506	13.000	0.000	NA		NA
10376275	10376276	HTH_0547	HTH_0548			TRUE	0.870	23.000	0.286	NA		NA
10376276	10376277	HTH_0548	HTH_0549			FALSE	0.472	90.000	0.286	NA		NA
10376277	10376278	HTH_0549	HTH_0550			TRUE	0.987	3.000	1.000	NA		NA
10376278	10376279	HTH_0550	HTH_0551			TRUE	0.987	4.000	1.000	NA		NA
10376279	10376280	HTH_0551	HTH_0552			FALSE	0.559	11.000	0.000	NA		NA
10376280	10376281	HTH_0552	HTH_0553			TRUE	0.763	-7.000	0.000	NA		NA
10376281	10376282	HTH_0553	HTH_0554			FALSE	0.559	11.000	0.000	NA		NA
10376282	10376283	HTH_0554	HTH_0555			FALSE	0.559	11.000	0.000	NA		NA
10376283	10376284	HTH_0555	HTH_0556			FALSE	0.559	11.000	0.000	NA		NA
10376284	10376285	HTH_0556	HTH_0557			TRUE	0.604	4.000	0.000	NA		NA
10376285	10376286	HTH_0557	HTH_0558			TRUE	0.617	3.000	0.000	NA		NA
10376286	10376287	HTH_0558	HTH_0559			FALSE	0.398	17.000	0.000	NA		NA
10376287	10376288	HTH_0559	HTH_0560			FALSE	0.476	14.000	0.000	NA		NA
10376288	10376289	HTH_0560	HTH_0561			TRUE	0.692	-12.000	0.000	NA		NA
10376289	10376290	HTH_0561	HTH_0562			FALSE	0.559	11.000	0.000	NA		NA
10376290	10376291	HTH_0562	HTH_0563			FALSE	0.564	-19.000	0.000	NA		NA
10376291	10376292	HTH_0563	HTH_0564			FALSE	0.059	79.000	0.000	NA		NA
10376292	10376293	HTH_0564	HTH_0565			FALSE	0.145	42.000	0.000	NA		NA
10376293	10376294	HTH_0565	HTH_0566			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10376294	10376295	HTH_0566	HTH_0567			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10376295	10376296	HTH_0567	HTH_0568			FALSE	0.052	87.000	0.000	NA		NA
10376298	10376299	HTH_0570	HTH_0571			FALSE	0.533	12.000	0.000	NA		NA
10376299	10376300	HTH_0571	HTH_0572			FALSE	0.201	31.000	0.000	NA		NA
10376300	10376301	HTH_0572	HTH_0573			TRUE	0.984	11.000	1.000	NA		NA
10376301	10376302	HTH_0573	HTH_0574			TRUE	0.993	0.000	1.000	NA		NA
10376303	10376304	HTH_0575	HTH_0576	argC	rpsI	TRUE	0.909	-15.000	0.031	1.000	N	NA
10376304	10376305	HTH_0576	HTH_0577	rpsI	rplM	TRUE	0.987	-3.000	0.051	0.025	Y	NA
10376307	10376308	HTH_0579	HTH_0580	lipA1		TRUE	0.800	2.000	0.000	1.000	Y	NA
10376308	10376309	HTH_0580	HTH_0581			TRUE	0.714	1.000	0.000	1.000		NA
10376309	10376310	HTH_0581	HTH_0582			TRUE	0.936	-22.000	0.167	1.000		NA
10376310	10376311	HTH_0582	HTH_0583			TRUE	0.992	-3.000	0.833	NA	N	NA
10376312	10376313	HTH_0584	HTH_0585		pdxA	TRUE	0.738	0.000	0.000	1.000		NA
10376316	10376317	HTH_0588	HTH_0589		asd	TRUE	0.888	3.000	0.011	NA		NA
10376319	10376320	HTH_0591	HTH_0592			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10376320	10376321	HTH_0592	HTH_0593		prfB	TRUE	0.738	0.000	0.000	1.000		NA
10376322	10376323	HTH_0594	HTH_0595			FALSE	0.151	41.000	0.000	NA		NA
10376323	10376324	HTH_0595	HTH_0596			TRUE	0.741	-9.000	0.000	NA		NA
10376324	10376325	HTH_0596	HTH_0597			FALSE	0.145	42.000	0.000	NA		NA
10376325	10376326	HTH_0597	HTH_0598		glnS	FALSE	0.424	16.000	0.000	NA		NA
10376326	10376327	HTH_0598	HTH_0599	glnS	murG	TRUE	0.699	-3.000	0.000	1.000	N	NA
10376327	10376328	HTH_0599	HTH_0600	murG	galU	FALSE	0.162	59.000	0.000	1.000	Y	NA
10376331	10376332	HTH_0603	HTH_0604		metG'	FALSE	0.072	70.000	0.000	1.000		NA
10376332	10376333	HTH_0604	HTH_0605	metG'		FALSE	0.254	25.000	0.000	NA		NA
10376333	10376334	HTH_0605	HTH_0606			FALSE	0.310	21.000	0.000	NA		NA
10376334	10376335	HTH_0606	HTH_0607		moeA	FALSE	0.357	15.000	0.000	1.000	N	NA
10376335	10376336	HTH_0607	HTH_0608	moeA	metK2	FALSE	0.462	11.000	0.000	1.000	N	NA
10376336	10376337	HTH_0608	HTH_0609	metK2	gcvT	FALSE	0.258	41.000	0.000	1.000	Y	NA
10376342	10376343	HTH_0614	HTH_0615	dnaB		FALSE	0.054	85.000	0.000	NA		NA
10376344	10376345	HTH_0616	HTH_0617	metF		TRUE	0.932	-37.000	0.400	NA		NA
10376345	10376346	HTH_0617	HTH_0618			TRUE	0.709	1.000	0.000	NA		NA
10376347	10376348	HTH_0619	HTH_0620			FALSE	0.476	14.000	0.000	NA		NA
10376348	10376349	HTH_0620	HTH_0621			FALSE	0.036	139.000	0.000	NA		NA
10376351	10376352	HTH_0623	HTH_0624	secG	hemK	FALSE	0.552	-94.000	0.005	1.000	N	NA
10376352	10376353	HTH_0624	HTH_0625	hemK	tlyC	TRUE	0.912	-12.000	0.010	NA		NA
10376353	10376354	HTH_0625	HTH_0626	tlyC	radC	TRUE	0.802	-49.000	0.043	NA		NA
10376354	10376355	HTH_0626	HTH_0627	radC		TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10376355	10376356	HTH_0627	HTH_0628		ackA	TRUE	0.733	0.000	0.000	NA		NA
10376356	10376357	HTH_0628	HTH_0629	ackA	folD	FALSE	0.502	6.000	0.000	1.000	N	NA
10376357	10376358	HTH_0629	HTH_0630	folD		TRUE	0.796	-13.000	0.000	1.000	Y	NA
10376360	10376361	HTH_0632	HTH_0633			FALSE	0.537	-21.000	0.000	NA		NA
10376361	10376362	HTH_0633	HTH_0634			TRUE	0.985	-9.000	0.475	NA		NA
10376362	10376363	HTH_0634	HTH_0635		potE	TRUE	0.653	12.000	0.000	0.075	N	NA
10376363	10376364	HTH_0635	HTH_0636	potE	nuc	TRUE	0.699	-3.000	0.000	1.000	N	NA
10376364	10376365	HTH_0636	HTH_0637	nuc	ilvB	FALSE	0.049	70.000	0.000	1.000	N	NA
10376365	10376366	HTH_0637	HTH_0638	ilvB	ilvH	TRUE	0.968	13.000	0.057	0.001	Y	NA
10376366	10376367	HTH_0638	HTH_0639	ilvH	pepB	TRUE	0.849	-9.000	0.000	1.000	Y	NA
10376367	10376368	HTH_0639	HTH_t10	pepB		TRUE	0.741	-9.000	0.000	NA		NA
10376369	10376370	HTH_0640	HTH_0641	nadC		TRUE	0.671	2.000	0.000	NA		NA
10376371	10376372	HTH_0642	HTH_0643	glgA		TRUE	0.961	-10.000	0.071	1.000		NA
10376373	10376374	HTH_0644	HTH_0645			FALSE	0.583	9.000	0.000	NA		NA
10376374	10376375	HTH_0645	HTH_0646			FALSE	0.239	26.000	0.000	NA		NA
10376376	10376377	HTH_0647	HTH_0648	panC	ribH	TRUE	0.889	-13.000	0.002	1.000	Y	NA
10376377	10376378	HTH_0648	HTH_0649	ribH	nusB	TRUE	0.957	-3.000	0.045	1.000	N	NA
10376379	10376380	HTH_0650	HTH_0651	hisA		TRUE	0.603	5.000	0.000	NA		NA
10376380	10376381	HTH_0651	HTH_0652		rpoE	FALSE	0.487	-25.000	0.000	NA		NA
10376382	10376383	HTH_0653	HTH_0654			FALSE	0.455	-28.000	0.000	NA		NA
10376383	10376384	HTH_0654	HTH_0655			FALSE	0.559	11.000	0.000	NA		NA
10376384	10376385	HTH_0655	HTH_0656			FALSE	0.048	94.000	0.000	NA		NA
10376385	10376386	HTH_0656	HTH_0657			FALSE	0.086	61.000	0.000	NA		NA
10376386	10376387	HTH_0657	HTH_0658			FALSE	0.361	-45.000	0.000	NA		NA
10376387	10376388	HTH_0658	HTH_0659			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10376388	10376389	HTH_0659	HTH_0660			TRUE	0.611	-16.000	0.000	NA		NA
10376389	10376390	HTH_0660	HTH_0661			FALSE	0.328	20.000	0.000	NA		NA
10376390	10376391	HTH_0661	HTH_0662			TRUE	0.954	-3.000	0.022	1.000		NA
10376391	10376392	HTH_0662	HTH_0663		pyrC	FALSE	0.508	-55.000	0.003	1.000	N	NA
10376392	10376393	HTH_0663	HTH_0664	pyrC	tyrA	TRUE	0.873	-7.000	0.003	1.000	N	NA
10376394	10376395	HTH_t11	HTH_0665		oppB	FALSE	0.032	175.000	0.000	NA		NA
10376395	10376396	HTH_0665	HTH_0666	oppB		TRUE	0.962	0.000	0.065	NA		NA
10376397	10376398	HTH_0667	HTH_0668		panD	FALSE	0.115	38.000	0.000	1.000	N	NA
10376398	10376399	HTH_0668	HTH_0669	panD		TRUE	0.943	-10.000	0.004	0.016		NA
10376400	10376401	HTH_0670	HTH_0671			TRUE	0.976	-16.000	0.500	NA		NA
10376401	10376402	HTH_0671	HTH_0672		corA	TRUE	0.957	-9.000	0.043	NA		NA
10376402	10376403	HTH_0672	HTH_0673	corA		FALSE	0.391	23.000	0.000	0.074	N	NA
10376403	10376404	HTH_0673	HTH_0674		maf	FALSE	0.030	105.000	0.000	NA	N	NA
10376404	10376405	HTH_0674	HTH_0675	maf	secD	FALSE	0.403	13.000	0.000	NA	N	NA
10376405	10376406	HTH_0675	HTH_0676	secD	kdtA	FALSE	0.479	10.000	0.000	1.000	N	NA
10376407	10376408	HTH_0677	HTH_0678			FALSE	0.048	94.000	0.000	NA		NA
10376408	10376409	HTH_0678	HTH_0679			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10376409	10376410	HTH_0679	HTH_0680			TRUE	0.718	-10.000	0.000	NA		NA
10376410	10376411	HTH_0680	HTH_0681			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10376413	10376414	HTH_0683	HTH_0684			TRUE	0.948	-7.000	0.031	1.000	N	NA
10376415	10376416	HTH_0685	HTH_0686			TRUE	0.671	2.000	0.000	NA		NA
10376416	10376417	HTH_0686	HTH_0687			TRUE	0.831	-10.000	0.000	NA	Y	NA
10376417	10376418	HTH_0687	HTH_0688			FALSE	0.462	11.000	0.000	1.000	N	NA
10376418	10376419	HTH_0688	HTH_0689			TRUE	0.820	5.000	0.006	1.000	N	NA
10376419	10376420	HTH_0689	HTH_0690		leuD	TRUE	0.921	-7.000	0.009	1.000	N	NA
10376420	10376421	HTH_0690	HTH_0691	leuD	frr	FALSE	0.248	20.000	0.000	1.000	N	NA
10376421	10376422	HTH_0691	HTH_0692	frr	pyrH	TRUE	0.955	15.000	0.626	1.000	N	NA
10376422	10376423	HTH_0692	HTH_0693	pyrH	tsf	TRUE	0.980	0.000	0.416	1.000	N	NA
10376423	10376424	HTH_0693	HTH_0694	tsf	rpsB	TRUE	0.980	14.000	0.748	1.000	Y	NA
10376424	10376425	HTH_0694	HTH_0695	rpsB		FALSE	0.108	85.000	0.003	1.000	N	NA
10376426	10376427	HTH_0696	HTH_0697	ctaA	ctaB	TRUE	0.984	-6.000	0.112	1.000	Y	NA
10376427	10376428	HTH_0697	HTH_0698	ctaB		TRUE	0.891	7.000	0.007	0.049	N	NA
10376430	10376431	HTH_0700	HTH_0701		lipA2	TRUE	0.603	5.000	0.000	NA		NA
10376433	10376434	HTH_0703	HTH_0704			FALSE	0.424	16.000	0.000	NA		NA
10376434	10376435	HTH_0704	HTH_0705		lpxB	TRUE	0.893	1.000	0.005	NA		NA
10376436	10376437	HTH_0706	HTH_0707	rluA		TRUE	0.863	-13.000	0.004	NA		NA
10376437	10376438	HTH_0707	HTH_0708		sbcC	FALSE	0.559	11.000	0.000	NA		NA
10376438	10376439	HTH_0708	HTH_0709	sbcC	sbcD	TRUE	0.985	-19.000	0.669	NA	Y	NA
10376439	10376440	HTH_0709	HTH_0710	sbcD		TRUE	0.940	-3.000	0.010	NA		NA
10376440	10376441	HTH_0710	HTH_0711			TRUE	0.913	-10.000	0.008	NA		NA
10376442	10376443	HTH_0712	HTH_0713	rplN	rplX	TRUE	0.995	2.000	0.810	0.034	Y	NA
10376443	10376444	HTH_0713	HTH_0714	rplX	rplE	TRUE	0.997	-3.000	0.758	0.025	Y	NA
10376444	10376445	HTH_0714	HTH_0715	rplE	rpsN	TRUE	0.986	12.000	0.496	0.025	Y	NA
10376445	10376446	HTH_0715	HTH_0716	rpsN	rpsH	TRUE	0.984	13.000	0.473	0.025	Y	NA
10376446	10376447	HTH_0716	HTH_0717	rpsH	rplF	TRUE	0.993	10.000	0.808	0.025	Y	NA
10376447	10376448	HTH_0717	HTH_0718	rplF	rplR	TRUE	0.992	11.000	0.815	0.025	Y	NA
10376448	10376449	HTH_0718	HTH_0719	rplR	rpsE	TRUE	0.990	13.000	0.814	0.034	Y	NA
10376449	10376450	HTH_0719	HTH_0720	rpsE	rpmD	TRUE	0.993	5.000	0.789	0.034	Y	NA
10376450	10376451	HTH_0720	HTH_0721	rpmD	rplO	TRUE	0.997	-3.000	0.653	0.005	Y	NA
10376451	10376452	HTH_0721	HTH_0722	rplO	secY	TRUE	0.991	-6.000	0.730	1.000	N	NA
10376452	10376453	HTH_0722	HTH_0723	secY		TRUE	0.919	-3.000	0.008	1.000	N	NA
10376453	10376454	HTH_0723	HTH_0724		map	TRUE	0.932	-10.000	0.027	1.000	N	NA
10376454	10376455	HTH_0724	HTH_0725	map	infA	TRUE	0.985	-7.000	0.160	1.000	Y	NA
10376455	10376456	HTH_0725	HTH_0726	infA	rpmJ	TRUE	0.932	15.000	0.257	1.000		NA
10376456	10376457	HTH_0726	HTH_0727	rpmJ	rpsM	TRUE	0.967	12.000	0.194	0.025		NA
10376457	10376458	HTH_0727	HTH_0728	rpsM	rpsK	TRUE	0.992	11.000	0.810	0.025	Y	NA
10376458	10376459	HTH_0728	HTH_0729	rpsK	rpsD	TRUE	0.993	2.000	0.509	0.034	Y	NA
10376459	10376460	HTH_0729	HTH_0730	rpsD	rpoA	TRUE	0.960	13.000	0.549	1.000	N	NA
10376460	10376461	HTH_0730	HTH_0731	rpoA	rplQ	TRUE	0.983	4.000	0.873	1.000	N	NA
10376461	10376462	HTH_0731	HTH_0732	rplQ		TRUE	0.917	-3.000	0.004	1.000		NA
10376462	10376463	HTH_0732	HTH_0733			TRUE	0.892	0.000	0.003	1.000		NA
10376463	10376464	HTH_0733	HTH_0734			TRUE	0.761	-22.000	0.003	NA		NA
10376464	10376465	HTH_0734	HTH_0735			TRUE	0.946	-24.000	0.286	NA		NA
10376465	10376466	HTH_0735	HTH_0736			TRUE	0.977	0.000	0.222	NA		NA
10376467	10376468	HTH_0737	HTH_0738	lepB		TRUE	0.619	-39.000	0.002	1.000		NA
10376470	10376471	HTH_0740	HTH_0741		smtA	TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10376471	10376472	HTH_0741	HTH_0742	smtA	uvrB	TRUE	0.652	13.000	0.002	1.000	N	NA
10376472	10376473	HTH_0742	HTH_t12	uvrB		FALSE	0.027	918.000	0.000	NA		NA
10376474	10376475	HTH_0744	HTH_0745		ksgA	TRUE	0.699	-3.000	0.000	1.000	N	NA
10376475	10376476	HTH_0745	HTH_0746	ksgA	speE	TRUE	0.860	-3.000	0.002	1.000	N	NA
10376476	10376477	HTH_0746	HTH_0747	speE	metG	TRUE	0.699	-3.000	0.000	1.000	N	NA
10376477	10376478	HTH_0747	HTH_0748	metG	glnE	FALSE	0.507	4.000	0.000	1.000	N	NA
10376478	10376479	HTH_0748	HTH_0749	glnE		TRUE	0.693	-3.000	0.000	NA	N	NA
10376479	10376480	HTH_0749	HTH_0750		eif	TRUE	0.653	-9.000	0.000	NA	N	NA
10376481	10376482	HTH_0751	HTH_0752	genX		FALSE	0.490	8.000	0.000	1.000	N	NA
10376482	10376483	HTH_0752	HTH_0753		tpx	FALSE	0.119	36.000	0.000	1.000	N	NA
10376484	10376485	HTH_0754	HTH_0755	alr	acnA	FALSE	0.053	66.000	0.000	1.000	N	NA
10376485	10376486	HTH_0755	HTH_0756	acnA	mdh	TRUE	0.924	5.000	0.012	1.000	Y	NA
10376486	10376487	HTH_0756	HTH_0757	mdh	fumA	TRUE	0.903	-19.000	0.010	1.000	Y	NA
10376487	10376488	HTH_0757	HTH_0758	fumA		FALSE	0.049	92.000	0.000	NA		NA
10376488	10376489	HTH_0758	HTH_0759		infC	FALSE	0.442	28.000	0.003	NA		NA
10376490	10376491	HTH_0760	HTH_0761			TRUE	0.992	-3.000	0.703	NA		NA
10376491	10376492	HTH_0761	HTH_0762			TRUE	0.969	-7.000	0.077	NA		NA
10376493	10376494	HTH_0763	HTH_0764			TRUE	0.733	0.000	0.000	NA		NA
10376494	10376495	HTH_0764	HTH_0765			TRUE	0.598	7.000	0.000	1.000		NA
10376496	10376497	HTH_0766	HTH_0767	lpxD		TRUE	0.962	-3.000	0.010	1.000	Y	NA
10376497	10376498	HTH_0767	HTH_0768		clpX	TRUE	0.665	-22.000	0.002	1.000	N	NA
10376498	10376499	HTH_0768	HTH_0769	clpX	clpP	TRUE	0.907	25.000	0.352	1.000	Y	NA
10376499	10376500	HTH_0769	HTH_0770	clpP	tig	TRUE	0.978	-16.000	0.351	1.000	Y	NA
10376502	10376503	HTH_0772	HTH_0773			TRUE	0.940	-3.000	0.010	NA		NA
10376503	10376504	HTH_0773	HTH_0774		hemE	TRUE	0.875	-3.000	0.002	1.000	N	NA
10376505	10376506	HTH_0775	HTH_0776		gph	TRUE	0.967	-9.000	0.088	NA		NA
10376507	10376508	HTH_0777	HTH_0778			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10376510	10376511	HTH_0780	HTH_0781			TRUE	0.888	-13.000	0.007	NA		NA
10376511	10376512	HTH_0781	HTH_0782			FALSE	0.168	119.000	0.011	1.000		NA
10376512	10376513	HTH_0782	HTH_0783			FALSE	0.107	51.000	0.000	NA		NA
10376513	10376514	HTH_0783	HTH_0784		dnaC	FALSE	0.070	70.000	0.000	NA		NA
10376515	10376516	HTH_0785	HTH_0786	surE	purL	FALSE	0.429	16.000	0.000	1.000		NA
10376516	10376517	HTH_0786	HTH_0787	purL	lspA	TRUE	0.681	-42.000	0.009	1.000	N	NA
10376517	10376518	HTH_0787	HTH_0788	lspA	gatC	FALSE	0.187	25.000	0.000	1.000	N	NA
10376518	10376519	HTH_0788	HTH_0789	gatC	recA	TRUE	0.820	5.000	0.006	1.000	N	NA
10376519	10376520	HTH_0789	HTH_0790	recA	pilT2	TRUE	0.887	-28.000	0.021	0.021	N	NA
10376520	10376521	HTH_0790	HTH_0791	pilT2	cmk	TRUE	0.933	0.000	0.004	0.021	N	NA
10376522	10376523	HTH_0792	HTH_0793			TRUE	0.608	5.000	0.000	1.000		NA
10376524	10376525	HTH_0794	HTH_0795		thiE2	FALSE	0.123	47.000	0.000	NA		NA
10376525	10376526	HTH_0795	HTH_0796	thiE2	exo	TRUE	0.939	-3.000	0.016	1.000	N	NA
10376526	10376527	HTH_0796	HTH_0797	exo		FALSE	0.352	-46.000	0.000	NA		NA
10376527	10376528	HTH_0797	HTH_0798			FALSE	0.183	33.000	0.000	NA		NA
10376528	10376529	HTH_0798	HTH_0799			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10376531	10376532	HTH_0801	HTH_0802	rpmF	plsX	TRUE	0.980	0.000	0.418	1.000	N	NA
10376532	10376533	HTH_0802	HTH_0803	plsX	fabH	TRUE	0.986	0.000	0.058	0.006	Y	NA
10376533	10376534	HTH_0803	HTH_0804	fabH		FALSE	0.377	-27.000	0.000	1.000	N	NA
10376536	10376537	HTH_0806	HTH_0807	sorA	sorB	TRUE	0.945	15.000	0.153	0.078		NA
10376537	10376538	HTH_0807	HTH_0808	sorB		TRUE	0.590	17.000	0.000	0.078		NA
10376538	10376539	HTH_0808	HTH_0809			TRUE	0.603	5.000	0.000	NA		NA
10376540	10376541	HTH_0810	HTH_0811	acrR	deoC	FALSE	0.161	28.000	0.000	1.000	N	NA
10376541	10376542	HTH_0811	HTH_0812	deoC	trxB2	TRUE	0.660	-9.000	0.000	1.000	N	NA
10376542	10376543	HTH_0812	HTH_0813	trxB2	leuA	FALSE	0.462	11.000	0.000	1.000	N	NA
10376543	10376544	HTH_0813	HTH_0814	leuA		FALSE	0.114	49.000	0.000	NA		NA
10376544	10376545	HTH_0814	HTH_0815		soxF2	FALSE	0.576	10.000	0.000	NA		NA
10376545	10376546	HTH_0815	HTH_0816	soxF2		TRUE	0.956	-25.000	0.455	NA		NA
10376546	10376547	HTH_0816	HTH_0817		soxF1	TRUE	0.597	71.000	0.182	NA	Y	NA
10376547	10376548	HTH_0817	HTH_0818	soxF1	thiE1	FALSE	0.032	94.000	0.000	NA	N	NA
10376549	10376550	HTH_t13	HTH_0819		mviN	FALSE	0.583	9.000	0.000	NA		NA
10376551	10376552	HTH_0820	HTH_t14	rpsT		FALSE	0.201	31.000	0.000	NA		NA
10376554	10376555	HTH_0822	HTH_0823		carB1	TRUE	0.871	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
10376555	10376556	HTH_0823	HTH_0824	carB1		FALSE	0.047	71.000	0.000	1.000	N	NA
10376556	10376557	HTH_0824	HTH_0825		mazG	FALSE	0.493	-25.000	0.000	1.000		NA
10376557	10376558	HTH_0825	HTH_0826	mazG		TRUE	0.604	4.000	0.000	NA		NA
10376558	10376559	HTH_0826	HTH_0827		moeB	TRUE	0.604	4.000	0.000	NA		NA
10376561	10376562	HTH_0829	HTH_0830			TRUE	0.985	-3.000	0.333	NA		NA
10376563	10376564	HTH_0831	HTH_0832	gpsA	gyrA	FALSE	0.199	24.000	0.000	1.000	N	NA
10376566	10376567	HTH_0834	HTH_0835	dinG		FALSE	0.462	11.000	0.000	1.000	N	NA
10376568	10376569	HTH_0836	HTH_0837	icd	cfa	FALSE	0.020	267.000	0.000	1.000	N	NA
10376571	10376572	HTH_0839	HTH_0840	nfo		TRUE	0.903	-12.000	0.008	1.000		NA
10376572	10376573	HTH_0840	HTH_0841		ileS	FALSE	0.506	24.000	0.003	1.000		NA
10376573	10376574	HTH_0841	HTH_0842	ileS	rpsQ	TRUE	0.827	1.000	0.000	1.000	Y	NA
10376574	10376575	HTH_0842	HTH_0843	rpsQ	rpmC	TRUE	0.996	-3.000	0.828	0.024		NA
10376575	10376576	HTH_0843	HTH_0844	rpmC	rplP	TRUE	0.996	-3.000	0.802	0.024		NA
10376576	10376577	HTH_0844	HTH_0845	rplP	rpsC	TRUE	0.994	4.000	0.828	0.033	Y	NA
10376577	10376578	HTH_0845	HTH_0846	rpsC	rplV	TRUE	0.995	1.000	0.719	0.033	Y	NA
10376578	10376579	HTH_0846	HTH_0847	rplV	rpsS	TRUE	0.992	10.000	0.769	0.033	Y	NA
10376579	10376580	HTH_0847	HTH_0848	rpsS	rplB	TRUE	0.997	-3.000	0.820	0.033	Y	NA
10376580	10376581	HTH_0848	HTH_0849	rplB	rplW	TRUE	0.988	11.000	0.849	1.000	Y	NA
10376581	10376582	HTH_0849	HTH_0850	rplW	rplD	TRUE	0.993	-3.000	0.513	1.000	Y	NA
10376582	10376583	HTH_0850	HTH_0851	rplD	rplC	TRUE	0.994	-3.000	0.361	0.024	Y	NA
10376583	10376584	HTH_0851	HTH_0852	rplC	rpsJ	TRUE	0.990	3.000	0.467	0.033	Y	NA
10376584	10376585	HTH_0852	HTH_0853	rpsJ	tufA1	TRUE	0.969	12.000	0.318	1.000	Y	NA
10376585	10376586	HTH_0853	HTH_0854	tufA1	fusA	TRUE	0.966	22.000	0.400	0.002	Y	NA
10376586	10376587	HTH_0854	HTH_0855	fusA	rpsG	TRUE	0.974	14.000	0.579	1.000	Y	NA
10376587	10376588	HTH_0855	HTH_0856	rpsG	rpsL	TRUE	0.992	0.000	0.224	0.005	Y	NA
10376588	10376589	HTH_0856	HTH_0857	rpsL	rpoC	TRUE	0.608	30.000	0.035	1.000	N	NA
10376589	10376590	HTH_0857	HTH_0858	rpoC	rpoB	TRUE	0.997	-3.000	0.851	0.001		NA
10376590	10376591	HTH_0858	HTH_0859	rpoB	rplL	FALSE	0.382	134.000	0.223	1.000		NA
10376591	10376592	HTH_0859	HTH_0860	rplL	rplJ	TRUE	0.982	15.000	0.884	1.000	Y	NA
10376592	10376593	HTH_0860	HTH_0861	rplJ	rplA	TRUE	0.971	11.000	0.302	1.000	Y	NA
10376593	10376594	HTH_0861	HTH_0862	rplA	rplK	TRUE	0.994	6.000	0.838	0.033	Y	NA
10376594	10376595	HTH_0862	HTH_0863	rplK	nusG	TRUE	0.975	10.000	0.681	1.000	N	NA
10376595	10376596	HTH_0863	HTH_0864	nusG	secE	TRUE	0.990	0.000	0.843	1.000	N	NA
10376596	10376597	HTH_0864	HTH_t15	secE		FALSE	0.451	15.000	0.000	NA		NA
10376597	10376598	HTH_t15	HTH_0865		rpmG	TRUE	0.733	0.000	0.000	NA		NA
10376598	10376599	HTH_0865	HTH_0866	rpmG	tufA2	TRUE	0.949	12.000	0.099	1.000	Y	NA
10376599	10376600	HTH_0866	HTH_t16	tufA2		FALSE	0.376	18.000	0.000	NA		NA
10376603	10376604	HTH_0868	HTH_0869	rpiB		TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10376605	10376606	HTH_0870	HTH_0871		gltS	TRUE	0.763	-7.000	0.000	NA		NA
10376606	10376607	HTH_0871	HTH_0872	gltS		FALSE	0.035	152.000	0.000	NA		NA
10376607	10376608	HTH_0872	HTH_0873		pyrF	FALSE	0.559	11.000	0.000	NA		NA
10376608	10376609	HTH_0873	HTH_0874	pyrF	hisH	TRUE	0.878	-7.000	0.003	1.000	N	NA
10376609	10376610	HTH_0874	HTH_0875	hisH	ccdA	TRUE	0.944	1.000	0.055	1.000	N	NA
10376610	10376611	HTH_0875	HTH_0876	ccdA		TRUE	0.676	2.000	0.000	1.000		NA
10376613	10376614	HTH_0877	HTH_0878			TRUE	0.718	-10.000	0.000	NA		NA
10376614	10376615	HTH_0878	HTH_0879			FALSE	0.028	306.000	0.000	NA		NA
10376615	10376616	HTH_0879	HTH_0880			FALSE	0.104	52.000	0.000	NA		NA
10376616	10376617	HTH_0880	HTH_0881			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10376617	10376618	HTH_0881	HTH_0882			FALSE	0.559	11.000	0.000	NA		NA
10376618	10376619	HTH_0882	HTH_0883			TRUE	0.966	-10.000	0.111	NA		NA
10376619	10376620	HTH_0883	HTH_0884			TRUE	0.993	0.000	1.000	NA		NA
10376620	10376621	HTH_0884	HTH_0885			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10376621	10376622	HTH_0885	HTH_0886			TRUE	0.733	0.000	0.000	NA		NA
10376622	10376623	HTH_0886	HTH_0887			FALSE	0.111	50.000	0.000	NA		NA
10376623	10376624	HTH_0887	HTH_0888			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10376624	10376625	HTH_0888	HTH_0889			TRUE	0.709	1.000	0.000	NA		NA
10376625	10376626	HTH_0889	HTH_0890			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10376626	10376627	HTH_0890	HTH_0891			TRUE	0.603	5.000	0.000	NA		NA
10376627	10376628	HTH_0891	HTH_0892			TRUE	0.666	-13.000	0.000	NA		NA
10376628	10376629	HTH_0892	HTH_0893			FALSE	0.089	60.000	0.000	NA		NA
10376629	10376630	HTH_0893	HTH_0894			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10376630	10376631	HTH_0894	HTH_0895			TRUE	0.733	0.000	0.000	NA		NA
10376631	10376632	HTH_0895	HTH_0896			FALSE	0.082	63.000	0.000	NA		NA
10376632	10376633	HTH_0896	HTH_0897			FALSE	0.533	12.000	0.000	NA		NA
10376634	10376635	HTH_0898	HTH_0899			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10376635	10376636	HTH_0899	HTH_0900			TRUE	0.603	5.000	0.000	NA		NA
10376636	10376637	HTH_0900	HTH_0901			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10376637	10376638	HTH_0901	HTH_0902			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10376638	10376639	HTH_0902	HTH_0903			TRUE	0.671	2.000	0.000	NA		NA
10376639	10376640	HTH_0903	HTH_0904			TRUE	0.604	4.000	0.000	NA		NA
10376640	10376641	HTH_0904	HTH_0905			FALSE	0.359	19.000	0.000	1.000		NA
10376641	10376642	HTH_0905	HTH_0906			TRUE	0.778	-3.000	0.000	1.000		NA
10376642	10376643	HTH_0906	HTH_0907			TRUE	0.592	7.000	0.000	NA		NA
10376643	10376644	HTH_0907	HTH_0908			TRUE	0.994	-3.000	1.000	NA		NA
10376644	10376645	HTH_0908	HTH_0909			FALSE	0.519	-22.000	0.000	NA		NA
10376645	10376646	HTH_0909	HTH_0910			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10376648	10376649	HTH_0912	HTH_0913			TRUE	0.733	0.000	0.000	NA		NA
10376649	10376650	HTH_0913	HTH_0914			FALSE	0.151	41.000	0.000	NA		NA
10376650	10376651	HTH_0914	HTH_0915			TRUE	0.617	3.000	0.000	NA		NA
10376651	10376652	HTH_0915	HTH_0916			FALSE	0.559	11.000	0.000	NA		NA
10376652	10376653	HTH_0916	HTH_0917			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10376653	10376654	HTH_0917	HTH_0918			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10376654	10376655	HTH_0918	HTH_0919			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10376655	10376656	HTH_0919	HTH_0920			TRUE	0.709	1.000	0.000	NA		NA
10376656	10376657	HTH_0920	HTH_0921			FALSE	0.476	14.000	0.000	NA		NA
10376657	10376658	HTH_0921	HTH_0922			TRUE	0.733	0.000	0.000	NA		NA
10376658	10376659	HTH_0922	HTH_0923			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10376659	10376660	HTH_0923	HTH_0924			FALSE	0.426	-31.000	0.000	NA		NA
10376660	10376661	HTH_0924	HTH_0925			TRUE	0.692	-12.000	0.000	NA		NA
10376661	10376662	HTH_0925	HTH_0926			FALSE	0.317	-61.000	0.000	NA		NA
10376662	10376663	HTH_0926	HTH_0927			FALSE	0.028	426.000	0.000	NA		NA
10376663	10376664	HTH_0927	HTH_0928			FALSE	0.051	89.000	0.000	1.000		NA
10376664	10376665	HTH_0928	HTH_0929			TRUE	0.756	13.000	0.000	0.005		NA
10376665	10376666	HTH_0929	HTH_0930			TRUE	0.991	13.000	1.000	0.002		NA
10376666	10376667	HTH_0930	HTH_0931			TRUE	0.994	3.000	0.667	0.002	Y	NA
10376667	10376668	HTH_0931	HTH_0932		sodC	TRUE	0.897	6.000	0.035	1.000	N	NA
10376668	10376669	HTH_0932	HTH_0933	sodC	fdhE	TRUE	0.952	-3.000	0.035	NA	N	NA
10376669	10376670	HTH_0933	HTH_0934	fdhE	gcvH1	TRUE	0.975	-3.000	0.174	NA	N	NA
10376670	10376671	HTH_0934	HTH_t19	gcvH1		TRUE	0.733	0.000	0.000	NA		NA
10376671	10376672	HTH_t19	HTH_0935			FALSE	0.057	81.000	0.000	NA		NA
10376672	10376673	HTH_0935	HTH_0936			TRUE	0.974	13.000	0.727	NA		NA
10376674	10376675	HTH_0937	HTH_0938			TRUE	0.843	0.000	0.000	1.000	Y	NA
10376675	10376676	HTH_0938	HTH_0939			TRUE	0.651	0.000	0.000	1.000	N	NA
10376676	10376677	HTH_0939	HTH_0940			TRUE	0.694	13.000	0.000	0.070		NA
10376677	10376678	HTH_0940	HTH_0941			TRUE	0.973	-3.000	0.091	1.000		NA
10376678	10376679	HTH_0941	HTH_0942			FALSE	0.058	81.000	0.000	1.000		NA
10376679	10376680	HTH_0942	HTH_0943			FALSE	0.310	21.000	0.000	NA		NA
10376680	10376681	HTH_0943	HTH_0944		coxA3	FALSE	0.139	43.000	0.000	NA		NA
10376681	10376682	HTH_0944	HTH_0945	coxA3	coxB3	TRUE	0.996	0.000	0.667	0.006	Y	NA
10376682	10376683	HTH_0945	HTH_0946	coxB3		TRUE	0.992	3.000	1.000	0.074		NA
10376683	10376684	HTH_0946	HTH_0947		coxC3	TRUE	0.996	-3.000	1.000	0.074		NA
10376684	10376685	HTH_0947	HTH_0948	coxC3		TRUE	0.661	99.000	1.000	1.000	N	NA
10376686	10376687	HTH_0949	HTH_0950		cysG	FALSE	0.580	2.000	0.000	1.000	N	NA
10376687	10376688	HTH_0950	HTH_0951	cysG	cysK	FALSE	0.479	10.000	0.000	1.000	N	NA
10376688	10376689	HTH_0951	HTH_0952	cysK	gltD	FALSE	0.400	25.000	0.000	1.000	Y	NA
10376689	10376690	HTH_0952	HTH_0953	gltD		TRUE	0.967	-3.000	0.056	NA		NA
10376690	10376691	HTH_0953	HTH_0954			TRUE	0.971	-3.000	0.075	NA		NA
10376691	10376692	HTH_0954	HTH_0955		mraW	TRUE	0.843	0.000	0.000	1.000	Y	NA
10376692	10376693	HTH_0955	HTH_0956	mraW		TRUE	0.916	-3.000	0.004	NA		NA
10376694	10376695	HTH_0957	HTH_0958	atpG2	tyrS	TRUE	0.699	-3.000	0.000	1.000	N	NA
10376696	10376697	HTH_t20	HTH_0959			FALSE	0.533	12.000	0.000	NA		NA
10376697	10376698	HTH_0959	HTH_0960			FALSE	0.486	9.000	0.000	1.000	N	NA
10376698	10376699	HTH_0960	HTH_0961			TRUE	0.977	-7.000	0.235	1.000	N	NA
10376700	10376701	HTH_0962	HTH_t21			FALSE	0.221	28.000	0.000	NA		NA
10376701	10376702	HTH_t21	HTH_0963			FALSE	0.058	80.000	0.000	NA		NA
10376704	10376705	HTH_0965	HTH_0966		soxF3	FALSE	0.077	115.000	0.000	NA	Y	NA
10376707	10376708	HTH_0968	HTH_0969		era	TRUE	0.661	16.000	0.000	0.020		NA
10376708	10376709	HTH_0969	HTH_0970	era		TRUE	0.733	0.000	0.000	NA		NA
10376709	10376710	HTH_0970	HTH_0971			FALSE	0.098	55.000	0.000	NA		NA
10376710	10376711	HTH_0971	HTH_0972			FALSE	0.537	-21.000	0.000	NA		NA
10376711	10376712	HTH_0972	HTH_0973			FALSE	0.559	11.000	0.000	NA		NA
10376712	10376713	HTH_0973	HTH_0974		atpH	TRUE	0.831	2.000	0.002	NA		NA
10376713	10376714	HTH_0974	HTH_0975	atpH	atpF2	TRUE	0.992	-3.000	0.132	0.006	Y	NA
10376714	10376715	HTH_0975	HTH_0976	atpF2	atpF1	TRUE	0.996	-3.000	0.569	0.006	Y	NA
10376715	10376716	HTH_0976	HTH_0977	atpF1		FALSE	0.161	28.000	0.000	1.000	N	NA
10376717	10376718	HTH_0978	HTH_0979	eno		TRUE	0.938	-49.000	0.600	1.000		NA
10376718	10376719	HTH_0979	HTH_0980		ribD1	TRUE	0.617	-16.000	0.000	1.000		NA
10376719	10376720	HTH_0980	HTH_0981	ribD1	fmt	TRUE	0.861	-3.000	0.002	1.000	N	NA
10376720	10376721	HTH_0981	HTH_0982	fmt		FALSE	0.376	18.000	0.000	NA		NA
10376721	10376722	HTH_0982	HTH_t22			FALSE	0.123	47.000	0.000	NA		NA
10376722	10376723	HTH_t22	HTH_t23			FALSE	0.506	13.000	0.000	NA		NA
10376723	10376724	HTH_t23	HTH_t24			TRUE	0.604	4.000	0.000	NA		NA
10376724	10376725	HTH_t24	HTH_0983		frdB	FALSE	0.221	28.000	0.000	NA		NA
10376725	10376726	HTH_0983	HTH_0984	frdB		FALSE	0.093	57.000	0.000	NA		NA
10376727	10376728	HTH_0985	HTH_0986	tldD		TRUE	0.603	5.000	0.000	NA		NA
10376729	10376730	HTH_0987	HTH_0988	rimM	cyc	FALSE	0.049	70.000	0.000	1.000	N	NA
10376731	10376732	HTH_0989	HTH_0990			FALSE	0.376	18.000	0.000	NA		NA
10376732	10376733	HTH_0990	HTH_0991			FALSE	0.258	25.000	0.000	1.000		NA
10376733	10376734	HTH_0991	HTH_0992			TRUE	0.778	-3.000	0.000	1.000		NA
10376734	10376735	HTH_0992	HTH_0993			TRUE	0.841	0.000	0.000	NA	Y	NA
10376738	10376739	HTH_0996	HTH_0997		rpoZ	FALSE	0.533	12.000	0.000	NA		NA
10376739	10376740	HTH_0997	HTH_0998	rpoZ		FALSE	0.516	-16.000	0.000	1.000	N	NA
10376741	10376742	HTH_0999	HTH_1000			FALSE	0.328	20.000	0.000	NA		NA
10376742	10376743	HTH_1000	HTH_1001		crcB	TRUE	0.951	-3.000	0.017	NA		NA
10376743	10376744	HTH_1001	HTH_1002	crcB		TRUE	0.947	-9.000	0.023	NA		NA
10376745	10376746	HTH_1003	HTH_1004	hypB	hupS2	TRUE	0.943	-3.000	0.021	1.000	N	NA
10376746	10376747	HTH_1004	HTH_1005	hupS2	hupL2	TRUE	0.997	-10.000	1.000	0.005	Y	NA
10376747	10376748	HTH_1005	HTH_1006	hupL2	hypE	FALSE	0.436	12.000	0.000	1.000	N	NA
10376748	10376749	HTH_1006	HTH_1007	hypE	hypA	TRUE	0.953	2.000	0.080	1.000		NA
10376749	10376750	HTH_1007	HTH_1008	hypA	hypF	TRUE	0.936	-10.000	0.018	1.000		NA
10376751	10376752	HTH_1009	HTH_1010	hupH	hupG	TRUE	0.969	-9.000	0.103	NA		NA
10376752	10376753	HTH_1010	HTH_1011	hupG	hupD	TRUE	0.892	-28.000	0.077	1.000		NA
10376753	10376754	HTH_1011	HTH_1012	hupD	hupC	TRUE	0.993	0.000	0.667	1.000	Y	NA
10376754	10376755	HTH_1012	HTH_1013	hupC	hupL1	TRUE	0.961	14.000	0.111	0.073	Y	NA
10376755	10376756	HTH_1013	HTH_1014	hupL1	hupS1	TRUE	0.993	3.000	0.611	0.004	Y	NA
10376757	10376758	HTH_1015	HTH_t25	gapA		TRUE	0.604	4.000	0.000	NA		NA
10376759	10376760	HTH_t26	HTH_1016			TRUE	0.603	5.000	0.000	NA		NA
10376760	10376761	HTH_1016	HTH_1017		rpsA	TRUE	0.829	2.000	0.003	1.000	N	NA
10376761	10376762	HTH_1017	HTH_1018	rpsA		FALSE	0.164	37.000	0.000	NA		NA
10376762	10376763	HTH_1018	HTH_1019			FALSE	0.029	224.000	0.000	NA		NA
10376764	10376765	HTH_1020	HTH_1021			FALSE	0.070	70.000	0.000	NA		NA
10376765	10376766	HTH_1021	HTH_1022			TRUE	0.827	1.000	0.000	1.000	Y	NA
10376766	10376767	HTH_1022	HTH_1023			TRUE	0.945	-13.000	0.091	1.000	N	NA
10376767	10376768	HTH_1023	HTH_1024			TRUE	0.877	-7.000	0.000	0.069		NA
10376768	10376769	HTH_1024	HTH_1025			TRUE	0.767	-7.000	0.000	1.000		NA
10376769	10376770	HTH_1025	HTH_1026			TRUE	0.617	3.000	0.000	NA		NA
10376770	10376771	HTH_1026	HTH_1027			FALSE	0.559	11.000	0.000	NA		NA
10376771	10376772	HTH_1027	HTH_1028			TRUE	0.598	6.000	0.000	NA		NA
10376772	10376773	HTH_1028	HTH_1029			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10376774	10376775	HTH_1030	HTH_1031			FALSE	0.066	72.000	0.000	NA		NA
10376776	10376777	HTH_1032	HTH_1033			FALSE	0.040	122.000	0.000	NA		NA
10376777	10376778	HTH_1033	HTH_1034			FALSE	0.044	106.000	0.000	NA		NA
10376781	10376782	HTH_1037	HTH_1038	priA		TRUE	0.917	-3.000	0.008	NA	N	NA
10376782	10376783	HTH_1038	HTH_1039			TRUE	0.917	2.000	0.015	NA		NA
10376783	10376784	HTH_1039	HTH_1040			TRUE	0.993	-6.000	0.804	NA		NA
10376784	10376785	HTH_1040	HTH_1041			TRUE	0.987	2.000	0.790	NA		NA
10376785	10376786	HTH_1041	HTH_1042		sirA1	TRUE	0.959	-3.000	0.029	NA		NA
10376786	10376787	HTH_1042	HTH_1043	sirA1	pilB	TRUE	0.725	27.000	0.095	1.000	N	NA
10376787	10376788	HTH_1043	HTH_1044	pilB	panB	TRUE	0.893	-7.000	0.004	1.000	N	NA
10376788	10376789	HTH_1044	HTH_1045	panB		TRUE	0.892	-7.000	0.002	NA		NA
10376789	10376790	HTH_1045	HTH_1046		leuS	TRUE	0.813	-16.000	0.003	NA		NA
10376790	10376791	HTH_1046	HTH_1047	leuS	dnaK	FALSE	0.099	43.000	0.000	1.000	N	NA
10376791	10376792	HTH_1047	HTH_1048	dnaK		FALSE	0.038	84.000	0.000	1.000	N	NA
10376794	10376795	HTH_1050	HTH_1051		gspG2	FALSE	0.507	4.000	0.000	1.000	N	NA
10376796	10376797	HTH_1052	HTH_1053	cysS	trpS	TRUE	0.887	-3.000	0.000	0.053		NA
10376797	10376798	HTH_1053	HTH_1054	trpS		TRUE	0.958	-3.000	0.026	1.000		NA
10376798	10376799	HTH_1054	HTH_1055			FALSE	0.036	141.000	0.000	1.000		NA
10376799	10376800	HTH_1055	HTH_1056			FALSE	0.532	34.000	0.000	0.002	Y	NA
10376801	10376802	HTH_1057	HTH_1058			TRUE	0.974	-3.000	0.097	1.000		NA
10376802	10376803	HTH_1058	HTH_1059			FALSE	0.509	-16.000	0.000	NA	N	NA
10376803	10376804	HTH_1059	HTH_1060			FALSE	0.514	3.000	0.000	NA	N	NA
10376804	10376805	HTH_1060	HTH_1061			TRUE	0.945	3.000	0.032	1.000	Y	NA
10376805	10376806	HTH_1061	HTH_1062			TRUE	0.996	-3.000	0.429	0.001	Y	NA
10376806	10376807	HTH_1062	HTH_1063			TRUE	0.967	12.000	0.286	1.000	Y	NA
10376808	10376809	HTH_1064	HTH_1065		trpB2	FALSE	0.352	-46.000	0.000	NA		NA
10376811	10376812	HTH_t27	HTH_1067		minC	FALSE	0.328	20.000	0.000	NA		NA
10376812	10376813	HTH_1067	HTH_1068	minC	minD	TRUE	0.988	-3.000	0.466	1.000		NA
10376813	10376814	HTH_1068	HTH_1069	minD	minE	TRUE	0.985	4.000	0.618	NA	Y	NA
10376814	10376815	HTH_1069	HTH_1070	minE		TRUE	0.903	-3.000	0.005	NA	N	NA
10376816	10376817	HTH_1071	HTH_1072		rfaG	TRUE	0.972	-3.000	0.083	1.000		NA
10376817	10376818	HTH_1072	HTH_1073	rfaG		TRUE	0.897	-22.000	0.045	1.000		NA
10376818	10376819	HTH_1073	HTH_1074			TRUE	0.900	-57.000	0.068	0.007		NA
10376821	10376822	HTH_1076	HTH_1077			FALSE	0.575	27.000	0.010	NA		NA
10376822	10376823	HTH_1077	HTH_1078		atpC	TRUE	0.840	-19.000	0.007	1.000		NA
10376823	10376824	HTH_1078	HTH_1079	atpC		FALSE	0.039	123.000	0.000	NA		NA
10376825	10376826	HTH_1080	HTH_1081		metE	FALSE	0.436	12.000	0.000	1.000	N	NA
10376826	10376827	HTH_1081	HTH_1082	metE		TRUE	0.622	1.000	0.000	1.000	N	NA
10376828	10376829	HTH_1083	HTH_1084			TRUE	0.969	5.000	0.400	NA		NA
10376831	10376832	HTH_1086	HTH_1087		folE	TRUE	0.945	-3.000	0.011	NA		NA
10376836	10376837	HTH_1091	HTH_1092		korB	TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10376837	10376838	HTH_1092	HTH_1093	korB	korA	TRUE	0.982	14.000	0.316	0.001	Y	NA
10376839	10376840	HTH_1094	HTH_1095	forD	forA	TRUE	0.938	19.000	0.545	1.000		NA
10376840	10376841	HTH_1095	HTH_1096	forA	forB	TRUE	0.977	23.000	0.750	0.004	Y	NA
10376841	10376842	HTH_1096	HTH_1097	forB	forG	TRUE	0.996	-3.000	0.500	0.004	Y	NA
10376842	10376843	HTH_1097	HTH_1098	forG	forE	TRUE	0.990	17.000	1.000	0.004	Y	NA
10376843	10376844	HTH_1098	HTH_1099	forE	forF	TRUE	0.981	2.000	0.500	NA		NA
10376844	10376845	HTH_1099	HTH_1100	forF	cobW	TRUE	0.966	4.000	0.333	NA		NA
10376845	10376846	HTH_1100	HTH_1101	cobW	nuoL2	FALSE	0.506	13.000	0.000	NA		NA
10376846	10376847	HTH_1101	HTH_1102	nuoL2		TRUE	0.911	12.000	0.061	NA		NA
10376847	10376848	HTH_1102	HTH_1103		glnB4	TRUE	0.984	-3.000	0.288	NA		NA
10376851	10376852	HTH_1105	HTH_1106			TRUE	0.713	11.000	0.000	1.000	Y	NA
10376852	10376853	HTH_1106	HTH_1107			FALSE	0.559	11.000	0.000	NA		NA
10376853	10376854	HTH_1107	HTH_1108		cobA2	TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10376854	10376855	HTH_1108	HTH_1109	cobA2	hemD2	TRUE	0.969	-7.000	0.024	1.000	Y	NA
10376855	10376856	HTH_1109	HTH_1110	hemD2	nasB	TRUE	0.871	-16.000	0.013	1.000	N	NA
10376856	10376857	HTH_1110	HTH_1111	nasB	nasA	TRUE	0.909	2.000	0.022	NA	N	NA
10376857	10376858	HTH_1111	HTH_1112	nasA	cynS	FALSE	0.537	18.000	0.000	NA	Y	NA
10376858	10376859	HTH_1112	HTH_1113	cynS	glnB5	TRUE	0.902	2.000	0.016	1.000	N	NA
10376859	10376860	HTH_1113	HTH_1114	glnB5	glnB6	TRUE	0.994	-3.000	0.200	0.004	Y	NA
10376860	10376861	HTH_1114	HTH_1115	glnB6	hmp	TRUE	0.930	13.000	0.222	1.000	N	NA
10376862	10376863	HTH_1116	HTH_1117	nirB		FALSE	0.058	80.000	0.000	NA		NA
10376863	10376864	HTH_1117	HTH_1118			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10376864	10376865	HTH_1118	HTH_1119		glnB1	FALSE	0.030	235.000	0.000	1.000		NA
10376865	10376866	HTH_1119	HTH_1120	glnB1	glnB2	TRUE	0.997	-3.000	0.667	0.004	Y	NA
10376866	10376867	HTH_1120	HTH_1121	glnB2	nifT	TRUE	0.869	11.000	0.025	1.000	N	NA
10376867	10376868	HTH_1121	HTH_1122	nifT		FALSE	0.506	13.000	0.000	NA		NA
10376868	10376869	HTH_1122	HTH_1123		fdx4	TRUE	0.671	2.000	0.000	NA		NA
10376869	10376870	HTH_1123	HTH_1124	fdx4	nifW	TRUE	0.933	-12.000	0.022	1.000		NA
10376870	10376871	HTH_1124	HTH_1125	nifW	nifZ	TRUE	0.975	-16.000	0.133	0.005		NA
10376871	10376872	HTH_1125	HTH_1126	nifZ		TRUE	0.882	-25.000	0.043	1.000		NA
10376873	10376874	HTH_1127	HTH_1128	fdx6	fdx5	TRUE	0.899	-3.000	0.000	0.023		NA
10376874	10376875	HTH_1128	HTH_1129	fdx5		TRUE	0.971	-3.000	0.080	NA		NA
10376875	10376876	HTH_1129	HTH_1130			FALSE	0.077	66.000	0.000	NA		NA
10376876	10376877	HTH_1130	HTH_1131		nifS1	TRUE	0.963	-3.000	0.011	1.000	Y	NA
10376877	10376878	HTH_1131	HTH_1132	nifS1	aor	TRUE	0.910	-10.000	0.011	1.000	N	NA
10376878	10376879	HTH_1132	HTH_1133	aor		TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10376879	10376880	HTH_1133	HTH_1134			TRUE	0.617	3.000	0.000	NA		NA
10376881	10376882	HTH_1135	HTH_1136	nifA	nifH	FALSE	0.023	171.000	0.000	1.000	N	NA
10376882	10376883	HTH_1136	HTH_1137	nifH		FALSE	0.533	12.000	0.000	NA		NA
10376883	10376884	HTH_1137	HTH_1138			FALSE	0.398	17.000	0.000	NA		NA
10376884	10376885	HTH_1138	HTH_1139			TRUE	0.603	5.000	0.000	NA		NA
10376885	10376886	HTH_1139	HTH_1140			TRUE	0.777	-6.000	0.000	NA		NA
10376886	10376887	HTH_1140	HTH_1141			TRUE	0.954	0.000	0.039	NA		NA
10376887	10376888	HTH_1141	HTH_1142		nifE	TRUE	0.843	11.000	0.013	1.000	N	NA
10376888	10376889	HTH_1142	HTH_1143	nifE	nifN	TRUE	0.980	-12.000	0.025	0.002	Y	NA
10376889	10376890	HTH_1143	HTH_1144	nifN	nifX	TRUE	0.981	-3.000	0.037	0.005		NA
10376891	10376892	HTH_1145	HTH_1146			FALSE	0.472	-27.000	0.000	NA		NA
10376893	10376894	HTH_1147	HTH_1148			FALSE	0.332	-54.000	0.000	NA		NA
10376894	10376895	HTH_1148	HTH_1149			FALSE	0.239	26.000	0.000	NA		NA
10376896	10376897	HTH_1150	HTH_1151	hyfF	hyfE	TRUE	0.995	-3.000	0.864	NA	Y	NA
10376897	10376898	HTH_1151	HTH_1152	hyfE	hyfC	TRUE	0.923	32.000	0.679	NA	Y	NA
10376898	10376899	HTH_1152	HTH_1153	hyfC	hyfB	TRUE	0.979	-3.000	0.058	1.000	Y	NA
10376900	10376901	HTH_1154	HTH_1155	hycE	hycC	TRUE	0.990	12.000	0.631	0.011	Y	NA
10376904	10376905	HTH_1157	HTH_1158	nifS2	mrp	TRUE	0.955	4.000	0.267	1.000	N	NA
10376907	10376908	HTH_1160	HTH_1161	speC	queC1	FALSE	0.258	25.000	0.000	1.000		NA
10376908	10376909	HTH_1161	HTH_t30	queC1		FALSE	0.559	11.000	0.000	NA		NA
10376909	10376910	HTH_t30	HTH_1162			FALSE	0.279	23.000	0.000	NA		NA
10376910	10376911	HTH_1162	HTH_1163			TRUE	0.923	5.000	0.044	NA		NA
10376912	10376913	HTH_1164	HTH_1165		purM	TRUE	0.898	-7.000	0.005	1.000	N	NA
10376913	10376914	HTH_1165	HTH_1166	purM		TRUE	0.745	-16.000	0.002	1.000	N	NA
10376914	10376915	HTH_1166	HTH_1167			TRUE	0.956	0.000	0.070	1.000	N	NA
10376915	10376916	HTH_1167	HTH_1168		moaC	TRUE	0.735	8.000	0.000	1.000	Y	NA
10376916	10376917	HTH_1168	HTH_1169	moaC		TRUE	0.685	-7.000	0.000	1.000	N	NA
10376918	10376919	HTH_1170	HTH_1171			TRUE	0.738	0.000	0.000	1.000		NA
10376921	10376922	HTH_1173	HTH_1174			TRUE	0.709	1.000	0.000	NA		NA
10376922	10376923	HTH_1174	HTH_1175		dut	TRUE	0.671	2.000	0.000	NA		NA
10376923	10376924	HTH_1175	HTH_t31	dut		FALSE	0.559	11.000	0.000	NA		NA
10376924	10376925	HTH_t31	HTH_1176		pnp	FALSE	0.368	-43.000	0.000	NA		NA
10376925	10376926	HTH_1176	HTH_1177	pnp	rpsO	TRUE	0.990	-3.000	0.335	1.000	Y	NA
10376926	10376927	HTH_1177	HTH_1178	rpsO		FALSE	0.191	32.000	0.000	NA		NA
10376928	10376929	HTH_1179	HTH_1180			TRUE	0.673	48.000	0.333	NA	N	NA
10376929	10376930	HTH_1180	HTH_1181			TRUE	0.966	-3.000	0.050	1.000		NA
10376931	10376932	HTH_1182	HTH_1183			TRUE	0.862	2.000	0.004	NA		NA
10376932	10376933	HTH_1183	HTH_1184		moaA	FALSE	0.030	199.000	0.000	NA		NA
10376933	10376934	HTH_1184	HTH_1185	moaA	moaE	TRUE	0.977	-3.000	0.006	0.005	Y	NA
10376935	10376936	HTH_1186	HTH_1187			FALSE	0.086	61.000	0.000	NA		NA
10376936	10376937	HTH_1187	HTH_1188			FALSE	0.171	35.000	0.000	NA		NA
10376938	10376939	HTH_1189	HTH_1190			TRUE	0.974	-3.000	0.100	1.000		NA
10376940	10376941	HTH_1191	HTH_1192			TRUE	0.963	-3.000	0.042	NA		NA
10376942	10376943	HTH_1193	HTH_1194	gidB		TRUE	0.896	-3.000	0.002	1.000		NA
10376945	10376946	HTH_1196	HTH_1197	lgt		FALSE	0.221	28.000	0.000	NA		NA
10376946	10376947	HTH_1197	HTH_1198		murE	TRUE	0.880	-13.000	0.006	NA		NA
10376947	10376948	HTH_1198	HTH_1199	murE		TRUE	0.693	-3.000	0.000	NA	N	NA
10376948	10376949	HTH_1199	HTH_1200		argF	TRUE	0.724	10.000	0.000	NA	Y	NA
10376950	10376951	HTH_1201	HTH_1202		rimI	TRUE	0.863	-16.000	0.007	NA		NA
10376952	10376953	HTH_1203	HTH_1204	ispA		FALSE	0.533	12.000	0.000	NA		NA
10376953	10376954	HTH_1204	HTH_1205		uvrC	TRUE	0.901	-7.000	0.003	NA		NA
10376956	10376957	HTH_1207	HTH_1208			FALSE	0.300	-141.000	0.000	NA		NA
10376957	10376958	HTH_1208	HTH_1209		lpdA2	FALSE	0.174	35.000	0.000	1.000		NA
10376958	10376959	HTH_1209	HTH_1210	lpdA2		TRUE	0.956	-3.000	0.024	NA		NA
10376959	10376960	HTH_1210	HTH_1211			FALSE	0.031	187.000	0.000	NA		NA
10376961	10376962	HTH_1212	HTH_1213	pqqC1	pqqE	TRUE	0.982	-7.000	0.038	0.002		NA
10376962	10376963	HTH_1213	HTH_1214	pqqE	pqqC2	TRUE	0.983	-3.000	0.038	0.002		NA
10376963	10376964	HTH_1214	HTH_1215	pqqC2	pqqB	TRUE	0.945	22.000	0.825	1.000		NA
10376964	10376965	HTH_1215	HTH_1216	pqqB		TRUE	0.598	6.000	0.000	NA		NA
10376966	10376967	HTH_1217	HTH_1218	pqqD	rpmI	TRUE	0.778	-3.000	0.000	1.000		NA
10376968	10376969	HTH_1219	HTH_1220			TRUE	0.981	2.000	0.500	NA		NA
10376970	10376971	HTH_1221	HTH_1222			TRUE	0.623	50.000	0.164	NA		NA
10376971	10376972	HTH_1222	HTH_1223			FALSE	0.058	80.000	0.000	NA		NA
10376978	10376979	HTH_1229	HTH_1230			FALSE	0.396	-37.000	0.000	NA		NA
10376980	10376981	HTH_1231	HTH_1232	dapA		TRUE	0.671	2.000	0.000	NA		NA
10376981	10376982	HTH_1232	HTH_1233		rusA	TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10376983	10376984	HTH_1234	HTH_1235		acyP	TRUE	0.781	-31.000	0.020	1.000	N	NA
10376984	10376985	HTH_1235	HTH_1236	acyP		FALSE	0.376	18.000	0.000	NA		NA
10376986	10376987	HTH_1237	HTH_1238	lytB		FALSE	0.308	-37.000	0.000	1.000	N	NA
10376987	10376988	HTH_1238	HTH_1239			FALSE	0.093	58.000	0.000	1.000		NA
10376988	10376989	HTH_1239	HTH_1240			TRUE	0.603	5.000	0.000	NA		NA
10376989	10376990	HTH_1240	HTH_1241			FALSE	0.424	16.000	0.000	NA		NA
10376991	10376992	HTH_1242	HTH_1243			FALSE	0.086	61.000	0.000	NA		NA
10376992	10376993	HTH_1243	HTH_1244		cas2	FALSE	0.018	2612.000	0.000	1.000	N	NA
10376993	10376994	HTH_1244	HTH_1245	cas2	cas1	TRUE	0.974	1.000	0.087	NA	Y	NA
10376994	10376995	HTH_1245	HTH_1246	cas1	cas4	TRUE	0.993	-3.000	0.579	NA	Y	NA
10376995	10376996	HTH_1246	HTH_1247	cas4	cas3	TRUE	0.977	-10.000	0.258	NA		NA
10376996	10376997	HTH_1247	HTH_1248	cas3	cas5	TRUE	0.946	-45.000	0.629	NA		NA
10376997	10376998	HTH_1248	HTH_1249	cas5	csh2	TRUE	0.977	7.000	0.603	NA		NA
10376998	10376999	HTH_1249	HTH_1250	csh2	csh1	TRUE	0.972	-16.000	0.441	NA		NA
10376999	10377000	HTH_1250	HTH_1251	csh1	cas6	TRUE	0.949	-16.000	0.129	NA		NA
10377004	10377005	HTH_1255	HTH_1256	ftsI	carA	TRUE	0.802	-13.000	0.002	1.000	N	NA
10377005	10377006	HTH_1256	HTH_t32	carA		FALSE	0.506	13.000	0.000	NA		NA
10377006	10377007	HTH_t32	HTH_t33			FALSE	0.506	13.000	0.000	NA		NA
10377007	10377008	HTH_t33	HTH_1257			FALSE	0.328	20.000	0.000	NA		NA
10377008	10377009	HTH_1257	HTH_1258		rpoN	TRUE	0.914	-3.000	0.007	1.000	N	NA
10377009	10377010	HTH_1258	HTH_1259	rpoN		FALSE	0.424	16.000	0.000	NA		NA
10377010	10377011	HTH_1259	HTH_1260			FALSE	0.426	-31.000	0.000	NA		NA
10377011	10377012	HTH_1260	HTH_1261		hemN1	TRUE	0.963	-3.000	0.065	1.000	N	NA
10377013	10377014	HTH_1262	HTH_1263	grpE		TRUE	0.905	5.000	0.023	1.000		NA
10377014	10377015	HTH_1263	HTH_1264			TRUE	0.778	-3.000	0.000	1.000		NA
10377017	10377018	HTH_1266	HTH_1267	hemC		TRUE	0.867	-12.000	0.003	NA		NA
10377018	10377019	HTH_1267	HTH_1268		amiC	TRUE	0.882	-28.000	0.061	NA		NA
10377020	10377021	HTH_1269	HTH_1270		infB	TRUE	0.668	-36.000	0.006	1.000	N	NA
10377021	10377022	HTH_1270	HTH_1271	infB		FALSE	0.479	10.000	0.000	1.000	N	NA
10377022	10377023	HTH_1271	HTH_1272		bioB	TRUE	0.939	-3.000	0.003	1.000	Y	NA
10377023	10377024	HTH_1272	HTH_1273	bioB		FALSE	0.328	20.000	0.000	NA		NA
10377024	10377025	HTH_1273	HTH_1274			TRUE	0.617	3.000	0.000	NA		NA
10377025	10377026	HTH_1274	HTH_1275		uspA2	TRUE	0.836	2.000	0.002	1.000		NA
10377026	10377027	HTH_1275	HTH_1276	uspA2	gyrB	TRUE	0.897	-7.000	0.005	1.000	N	NA
10377027	10377028	HTH_1276	HTH_t34	gyrB		FALSE	0.398	17.000	0.000	NA		NA
10377028	10377029	HTH_t34	HTH_1277			FALSE	0.151	41.000	0.000	NA		NA
10377029	10377030	HTH_1277	HTH_1278			FALSE	0.123	47.000	0.000	NA		NA
10377030	10377031	HTH_1278	HTH_1279			FALSE	0.451	15.000	0.000	NA		NA
10377031	10377032	HTH_1279	HTH_1280			TRUE	0.962	-19.000	0.364	NA		NA
10377032	10377033	HTH_1280	HTH_1281			TRUE	0.985	0.000	0.043	0.005	Y	NA
10377034	10377035	HTH_1282	HTH_1283	hslV		TRUE	0.709	1.000	0.000	NA		NA
10377035	10377036	HTH_1283	HTH_1284		rodA	TRUE	0.718	-10.000	0.000	NA		NA
10377036	10377037	HTH_1284	HTH_1285	rodA	hemN2	TRUE	0.901	-3.000	0.005	1.000	N	NA
10377037	10377038	HTH_1285	HTH_1286	hemN2		FALSE	0.254	-52.000	0.000	1.000	N	NA
10377038	10377039	HTH_1286	HTH_1287		gcvH2	TRUE	0.937	-7.000	0.018	1.000	N	NA
10377040	10377041	HTH_1288	HTH_1289	selA	selB	TRUE	0.994	-3.000	0.569	0.001	N	NA
10377041	10377042	HTH_1289	HTH_1290	selB	pncB	FALSE	0.502	6.000	0.000	1.000	N	NA
10377042	10377043	HTH_1290	HTH_1291	pncB		TRUE	0.592	8.000	0.000	1.000		NA
10377044	10377045	HTH_1292	HTH_1293	murC	recJ	TRUE	0.699	-3.000	0.000	1.000	N	NA
10377045	10377046	HTH_1293	HTH_1294	recJ		TRUE	0.871	-13.000	0.005	NA		NA
10377048	10377049	HTH_1296	HTH_1297	thrS		TRUE	0.778	-3.000	0.000	1.000		NA
10377049	10377050	HTH_1297	HTH_1298		plsC	FALSE	0.543	-21.000	0.000	1.000		NA
10377050	10377051	HTH_1298	HTH_1299	plsC	tgt	FALSE	0.175	26.000	0.000	1.000	N	NA
10377051	10377052	HTH_1299	HTH_1300	tgt		FALSE	0.559	11.000	0.000	NA		NA
10377052	10377053	HTH_1300	HTH_1301			FALSE	0.066	72.000	0.000	NA		NA
10377053	10377054	HTH_1301	HTH_1302			TRUE	0.934	-3.000	0.012	1.000	N	NA
10377054	10377055	HTH_1302	HTH_1303		sirA2	TRUE	0.966	-3.000	0.011	0.008	N	NA
10377055	10377056	HTH_1303	HTH_1304	sirA2		TRUE	0.977	-3.000	0.138	NA		NA
10377056	10377057	HTH_1304	HTH_1305			TRUE	0.953	3.000	0.138	NA		NA
10377057	10377058	HTH_1305	HTH_1306		aroE	TRUE	0.963	-3.000	0.062	1.000	N	NA
10377058	10377059	HTH_1306	HTH_1307	aroE		TRUE	0.598	6.000	0.000	NA		NA
10377061	10377062	HTH_1309	HTH_1310	lepA	recG	FALSE	0.479	10.000	0.000	1.000	N	NA
10377063	10377064	HTH_1311	HTH_1312			TRUE	0.674	32.000	0.057	NA		NA
10377064	10377065	HTH_1312	HTH_1313			TRUE	0.946	-3.000	0.012	1.000		NA
10377066	10377067	HTH_1314	HTH_1315	guaA		TRUE	0.609	4.000	0.000	1.000		NA
10377067	10377068	HTH_1315	HTH_1316		rlpA2	TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10377069	10377070	HTH_1317	HTH_1318		modB	TRUE	0.989	-3.000	0.286	1.000	Y	NA
10377070	10377071	HTH_1318	HTH_1319	modB		TRUE	0.974	-7.000	0.122	1.000		NA
10377071	10377072	HTH_1319	HTH_1320		modA	TRUE	0.968	0.000	0.098	1.000		NA
10377072	10377073	HTH_1320	HTH_1321	modA		FALSE	0.530	22.000	0.000	0.001	N	NA
10377073	10377074	HTH_1321	HTH_1322			FALSE	0.357	15.000	0.000	1.000	N	NA
10377075	10377076	HTH_1323	HTH_1324			FALSE	0.040	120.000	0.000	NA		NA
10377077	10377078	HTH_1325	HTH_1326	merA	merP	TRUE	0.981	11.000	0.500	0.010	N	NA
10377078	10377079	HTH_1326	HTH_1327	merP		TRUE	0.603	5.000	0.000	NA		NA
10377079	10377080	HTH_1327	HTH_1328			TRUE	0.604	4.000	0.000	NA		NA
10377081	10377082	HTH_1329	HTH_1330	mobA		TRUE	0.626	-10.000	0.000	NA	N	NA
10377082	10377083	HTH_1330	HTH_1331			FALSE	0.263	-46.000	0.000	NA	N	NA
10377084	10377085	HTH_1332	HTH_1333	qcrC	qcrB	TRUE	0.987	2.000	0.103	0.002	Y	NA
10377085	10377086	HTH_1333	HTH_1334	qcrB	qcrA	TRUE	0.950	13.000	0.013	0.002	Y	NA
10377086	10377087	HTH_1334	HTH_1335	qcrA		FALSE	0.018	447.000	0.000	NA	N	NA
10377087	10377088	HTH_1335	HTH_1336			FALSE	0.313	32.000	0.000	NA	Y	NA
10377089	10377090	HTH_1337	HTH_1338			TRUE	0.733	0.000	0.000	NA		NA
10377090	10377091	HTH_1338	HTH_1339		sqr	FALSE	0.035	149.000	0.000	NA		NA
10377092	10377093	HTH_1340	HTH_1341	mutS2		FALSE	0.559	11.000	0.000	NA		NA
10377093	10377094	HTH_1341	HTH_1342			FALSE	0.061	77.000	0.000	NA		NA
10377094	10377095	HTH_1342	HTH_1343			TRUE	0.911	-36.000	0.200	NA		NA
10377095	10377096	HTH_1343	HTH_1344			TRUE	0.925	-13.000	0.022	1.000		NA
10377097	10377098	HTH_1345	HTH_1346			TRUE	0.950	-3.000	0.015	1.000		NA
10377098	10377099	HTH_1346	HTH_1347			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10377099	10377100	HTH_1347	HTH_1348			TRUE	0.718	-10.000	0.000	NA		NA
10377100	10377101	HTH_1348	HTH_1349			FALSE	0.107	41.000	0.000	1.000	N	NA
10377101	10377102	HTH_1349	HTH_1350			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10377102	10377103	HTH_1350	HTH_1351		dsbC	FALSE	0.100	54.000	0.000	NA		NA
10377103	10377104	HTH_1351	HTH_1352	dsbC	bioF	TRUE	0.925	4.000	0.077	1.000	N	NA
10377106	10377107	HTH_1354	HTH_1355			TRUE	0.978	-3.000	0.143	NA		NA
10377107	10377108	HTH_1355	HTH_1356		dxs	TRUE	0.619	21.000	0.006	NA		NA
10377110	10377111	HTH_1358	HTH_1359			TRUE	0.666	-13.000	0.000	NA		NA
10377111	10377112	HTH_1359	HTH_1360		dnaG	FALSE	0.145	42.000	0.000	NA		NA
10377112	10377113	HTH_1360	HTH_1361	dnaG	citA	FALSE	0.290	18.000	0.000	1.000	N	NA
10377113	10377114	HTH_1361	HTH_1362	citA		TRUE	0.853	5.000	0.006	NA		NA
10377114	10377115	HTH_1362	HTH_1363		prc1	TRUE	0.936	-3.000	0.009	NA		NA
10377115	10377116	HTH_1363	HTH_1364	prc1	gcp	TRUE	0.969	-3.000	0.017	0.016	N	NA
10377118	10377119	HTH_1366	HTH_1367		thrC2	TRUE	0.604	4.000	0.000	NA		NA
10377119	10377120	HTH_1367	HTH_1368	thrC2	sua5	TRUE	0.693	-3.000	0.000	NA	N	NA
10377122	10377123	HTH_1370	HTH_t35			FALSE	0.294	22.000	0.000	NA		NA
10377124	10377125	HTH_1371	HTH_1372			TRUE	0.610	45.000	0.091	NA		NA
10377126	10377127	HTH_1373	HTH_1374	atpB	atpE	TRUE	0.892	32.000	0.119	0.005	Y	NA
10377127	10377128	HTH_1374	HTH_1375	atpE	rpmH	TRUE	0.839	11.000	0.008	1.000		NA
10377128	10377129	HTH_1375	HTH_1376	rpmH		TRUE	0.925	-3.000	0.005	NA		NA
10377129	10377130	HTH_1376	HTH_1377		oxaA	TRUE	0.985	0.000	0.461	NA		NA
10377131	10377132	HTH_1378	HTH_1379	selD		FALSE	0.036	140.000	0.000	NA		NA
10377133	10377134	HTH_1380	HTH_1381			FALSE	0.061	77.000	0.000	NA		NA
10377134	10377135	HTH_1381	HTH_1382		moaD2	TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10377135	10377136	HTH_1382	HTH_1383	moaD2		TRUE	0.916	-7.000	0.008	1.000	N	NA
10377137	10377138	HTH_1384	HTH_1385			FALSE	0.377	44.000	0.007	NA		NA
10377138	10377139	HTH_1385	HTH_1386			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10377139	10377140	HTH_1386	HTH_1387			FALSE	0.254	25.000	0.000	NA		NA
10377140	10377141	HTH_1387	HTH_1388		acuC2	TRUE	0.813	20.000	0.059	NA		NA
10377142	10377143	HTH_1389	HTH_1390			FALSE	0.506	13.000	0.000	NA		NA
10377143	10377144	HTH_1390	HTH_1391			FALSE	0.151	41.000	0.000	NA		NA
10377145	10377146	HTH_1392	HTH_1393	cfiA	cfiB	TRUE	0.936	24.000	0.444	0.003	N	NA
10377146	10377147	HTH_1393	HTH_1394	cfiB		TRUE	0.681	18.000	0.009	1.000	N	NA
10377147	10377148	HTH_1394	HTH_1395			FALSE	0.044	73.000	0.000	1.000	N	NA
10377149	10377150	HTH_1396	HTH_1397		pheA	FALSE	0.198	65.000	0.003	NA		NA
10377151	10377152	HTH_1398	HTH_1399			TRUE	0.753	-28.000	0.006	NA		NA
10377152	10377153	HTH_1399	HTH_1400		mscS	FALSE	0.088	86.000	0.000	0.057	N	NA
10377155	10377156	HTH_1402	HTH_1403			TRUE	0.993	-3.000	0.604	1.000	Y	NA
10377156	10377157	HTH_1403	HTH_1404			TRUE	0.979	13.000	0.887	NA		NA
10377157	10377158	HTH_1404	HTH_1405			FALSE	0.450	55.000	0.040	NA		NA
10377158	10377159	HTH_1405	HTH_1406		trmH	TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10377159	10377160	HTH_1406	HTH_1407	trmH	trmU	TRUE	0.871	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
10377160	10377161	HTH_1407	HTH_1408	trmU		TRUE	0.959	12.000	0.400	NA		NA
10377162	10377163	HTH_1409	HTH_1410		ftsY	FALSE	0.299	22.000	0.000	1.000		NA
10377163	10377164	HTH_1410	HTH_1411	ftsY	nuoA2	FALSE	0.580	2.000	0.000	1.000	N	NA
10377164	10377165	HTH_1411	HTH_1412	nuoA2	nuoB	FALSE	0.564	72.000	0.022	0.009	Y	NA
10377165	10377166	HTH_1412	HTH_1413	nuoB	nuoD2	TRUE	0.995	4.000	1.000	0.009	Y	NA
10377166	10377167	HTH_1413	HTH_1414	nuoD2		TRUE	0.709	1.000	0.000	NA		NA
10377167	10377168	HTH_1414	HTH_1415			TRUE	0.979	-3.000	0.167	NA		NA
10377169	10377170	HTH_1416	HTH_1417	queC2		TRUE	0.965	-13.000	0.182	NA		NA
10377171	10377172	HTH_1418	HTH_1419	thrC1		TRUE	0.949	-3.000	0.014	1.000		NA
10377173	10377174	HTH_1420	HTH_1421	purK	frdA	TRUE	0.921	0.000	0.013	1.000	N	NA
10377174	10377175	HTH_1421	HTH_1422	frdA		FALSE	0.139	43.000	0.000	NA		NA
10377175	10377176	HTH_1422	HTH_1423		purB	TRUE	0.777	-6.000	0.000	NA		NA
10377176	10377177	HTH_1423	HTH_1424	purB		FALSE	0.111	50.000	0.000	NA		NA
10377179	10377180	HTH_1426	HTH_1427	kdsA	glyQ	TRUE	0.888	-3.000	0.003	1.000	N	NA
10377181	10377182	HTH_1428	HTH_1429	cafA		TRUE	0.890	4.000	0.013	1.000		NA
10377182	10377183	HTH_1429	HTH_1430			TRUE	0.940	-3.000	0.010	NA		NA
10377183	10377184	HTH_1430	HTH_1431			TRUE	0.897	-3.000	0.002	NA		NA
10377184	10377185	HTH_1431	HTH_1432		mglA2	TRUE	0.975	4.000	0.500	1.000		NA
10377185	10377186	HTH_1432	HTH_1433	mglA2		TRUE	0.990	2.000	1.000	NA		NA
10377186	10377187	HTH_1433	HTH_1434			FALSE	0.564	-19.000	0.000	NA		NA
10377187	10377188	HTH_1434	HTH_1435			TRUE	0.833	-10.000	0.000	1.000	Y	NA
10377188	10377189	HTH_1435	HTH_1436			TRUE	0.671	2.000	0.000	NA		NA
10377189	10377190	HTH_1436	HTH_1437			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10377190	10377191	HTH_1437	HTH_1438			FALSE	0.269	24.000	0.000	NA		NA
10377191	10377192	HTH_1438	HTH_1439		fur1	FALSE	0.104	52.000	0.000	NA		NA
10377192	10377193	HTH_1439	HTH_1440	fur1		TRUE	0.798	-21.000	0.008	1.000	N	NA
10377194	10377195	HTH_1441	HTH_1442			TRUE	0.965	-45.000	1.000	NA		NA
10377195	10377196	HTH_1442	HTH_1443			TRUE	0.994	-3.000	1.000	NA		NA
10377196	10377197	HTH_1443	HTH_1444			TRUE	0.604	4.000	0.000	NA		NA
10377197	10377198	HTH_1444	HTH_1445			TRUE	0.641	-15.000	0.000	NA		NA
10377198	10377199	HTH_1445	HTH_1446			TRUE	0.981	3.000	0.667	NA		NA
10377199	10377200	HTH_1446	HTH_1447			FALSE	0.079	65.000	0.000	NA		NA
10377200	10377201	HTH_1447	HTH_1448		rnhB	FALSE	0.047	96.000	0.000	NA		NA
10377201	10377202	HTH_1448	HTH_1449	rnhB	rplS	TRUE	0.964	-3.000	0.066	1.000	N	NA
10377202	10377203	HTH_1449	HTH_1450	rplS		FALSE	0.231	27.000	0.000	NA		NA
10377204	10377205	HTH_1451	HTH_1452	gatA	pycA	FALSE	0.357	15.000	0.000	1.000	N	NA
10377205	10377206	HTH_1452	HTH_1453	pycA		TRUE	0.980	-3.000	0.286	1.000	N	NA
10377206	10377207	HTH_1453	HTH_1454			TRUE	0.778	-3.000	0.000	1.000		NA
10377209	10377210	HTH_1456	HTH_1457			TRUE	0.781	-24.000	0.005	1.000		NA
10377210	10377211	HTH_1457	HTH_1458			TRUE	0.617	-16.000	0.000	1.000		NA
10377211	10377212	HTH_1458	HTH_1459			TRUE	0.617	3.000	0.000	NA		NA
10377212	10377213	HTH_1459	HTH_1460		uvrA	FALSE	0.476	14.000	0.000	NA		NA
10377214	10377215	HTH_1461	HTH_1462			TRUE	0.617	3.000	0.000	NA		NA
10377215	10377216	HTH_1462	HTH_1463			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10377217	10377218	HTH_1464	HTH_1465		lpxK	TRUE	0.718	-10.000	0.000	NA		NA
10377218	10377219	HTH_1465	HTH_t36	lpxK		FALSE	0.396	-37.000	0.000	NA		NA
10377219	10377220	HTH_t36	HTH_1466		lig	FALSE	0.576	10.000	0.000	NA		NA
10377221	10377222	HTH_t37	HTH_1467			FALSE	0.128	46.000	0.000	NA		NA
10377222	10377223	HTH_1467	HTH_1468		rpoD	TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10377223	10377224	HTH_1468	HTH_1469	rpoD	nfnB	FALSE	0.055	65.000	0.000	1.000	N	NA
10377224	10377225	HTH_1469	HTH_1470	nfnB		TRUE	0.671	-13.000	0.000	1.000		NA
10377227	10377228	HTH_1472	HTH_1473		thrB	TRUE	0.625	-37.000	0.004	1.000	N	NA
10377228	10377229	HTH_1473	HTH_1474	thrB		FALSE	0.576	10.000	0.000	NA		NA
10377230	10377231	HTH_1475	HTH_1476	apbE	coxC1	FALSE	0.026	124.000	0.000	1.000	N	NA
10377231	10377232	HTH_1476	HTH_1477	coxC1		TRUE	0.992	4.000	1.000	0.060		NA
10377232	10377233	HTH_1477	HTH_1478		coxB1	TRUE	0.996	-3.000	1.000	0.060		NA
10377233	10377234	HTH_1478	HTH_1479	coxB1	coxA1	TRUE	0.973	19.000	0.500	0.021	Y	NA
10377234	10377235	HTH_1479	HTH_1480	coxA1		TRUE	0.992	0.000	0.500	0.021		NA
10377235	10377236	HTH_1480	HTH_1481			TRUE	0.622	3.000	0.000	1.000		NA
10377236	10377237	HTH_1481	HTH_1482			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10377237	10377238	HTH_1482	HTH_1483			TRUE	0.986	0.000	0.500	NA		NA
10377238	10377239	HTH_1483	HTH_1484			FALSE	0.529	113.000	0.500	NA		NA
10377239	10377240	HTH_1484	HTH_1485		coxB2	TRUE	0.943	5.000	0.100	NA		NA
10377240	10377241	HTH_1485	HTH_1486	coxB2	coxA2	TRUE	0.991	-3.000	0.200	0.004		NA
10377241	10377242	HTH_1486	HTH_1487	coxA2		TRUE	0.989	2.000	0.571	0.060		NA
10377242	10377243	HTH_1487	HTH_t38			FALSE	0.376	18.000	0.000	NA		NA
10377243	10377244	HTH_t38	HTH_1488		trpD	FALSE	0.576	10.000	0.000	NA		NA
10377244	10377245	HTH_1488	HTH_1489	trpD		TRUE	0.910	-3.000	0.003	NA		NA
10377245	10377246	HTH_1489	HTH_1490			TRUE	0.716	19.000	0.010	NA		NA
10377248	10377249	HTH_1492	HTH_1493	purN		FALSE	0.151	30.000	0.000	1.000	N	NA
10377249	10377250	HTH_1493	HTH_1494			TRUE	0.993	-13.000	0.456	0.001	Y	NA
10377250	10377251	HTH_1494	HTH_1495			TRUE	0.975	-10.000	0.019	0.039	Y	NA
10377251	10377252	HTH_1495	HTH_1496			TRUE	0.969	1.000	0.051	1.000	Y	NA
10377252	10377253	HTH_1496	HTH_1497			FALSE	0.248	20.000	0.000	1.000	N	NA
10377253	10377254	HTH_1497	HTH_1498		uspA1	TRUE	0.669	17.000	0.006	1.000	N	NA
10377254	10377255	HTH_1498	HTH_1499	uspA1		TRUE	0.699	-3.000	0.000	1.000	N	NA
10377255	10377256	HTH_1499	HTH_1500			TRUE	0.738	0.000	0.000	1.000		NA
10377256	10377257	HTH_1500	HTH_1501			FALSE	0.069	71.000	0.000	1.000		NA
10377259	10377260	HTH_1503	HTH_1504			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10377260	10377261	HTH_1504	HTH_1505			TRUE	0.871	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
10377261	10377262	HTH_1505	HTH_1506			FALSE	0.100	54.000	0.000	NA		NA
10377262	10377263	HTH_1506	HTH_1507			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10377263	10377264	HTH_1507	HTH_1508			TRUE	0.987	-3.000	0.200	1.000	Y	NA
10377264	10377265	HTH_1508	HTH_1509			TRUE	0.982	-3.000	0.333	1.000	N	NA
10377265	10377266	HTH_1509	HTH_1510		sulP	TRUE	0.930	-3.000	0.000	0.037	Y	NA
10377267	10377268	HTH_1511	HTH_1512	nadD	frdD	TRUE	0.763	-7.000	0.000	NA		NA
10377268	10377269	HTH_1512	HTH_1513	frdD		FALSE	0.171	35.000	0.000	NA		NA
10377270	10377271	HTH_1514	HTH_1515	trxA2	soxY	TRUE	0.617	78.000	0.500	NA		NA
10377271	10377272	HTH_1515	HTH_1516	soxY	soxZ	TRUE	0.900	32.000	0.778	NA		NA
10377272	10377273	HTH_1516	HTH_1517	soxZ	soxA1	TRUE	0.932	16.000	0.333	NA		NA
10377273	10377274	HTH_1517	HTH_1518	soxA1	soxA2	FALSE	0.528	22.000	0.000	0.019		NA
10377274	10377275	HTH_1518	HTH_1519	soxA2	soxX	TRUE	0.709	14.000	0.000	0.019		NA
10377275	10377276	HTH_1519	HTH_1520	soxX	soxB	TRUE	0.921	15.000	0.188	1.000		NA
10377276	10377277	HTH_1520	HTH_1521	soxB		TRUE	0.982	-3.000	0.250	NA		NA
10377277	10377278	HTH_1521	HTH_1522		soxH	TRUE	0.617	3.000	0.000	NA		NA
10377278	10377279	HTH_1522	HTH_1523	soxH		FALSE	0.359	19.000	0.000	1.000		NA
10377279	10377280	HTH_1523	HTH_1524			TRUE	0.911	-3.000	0.003	NA		NA
10377281	10377282	HTH_1525	HTH_1526		leuB	TRUE	0.890	-18.000	0.019	NA		NA
10377282	10377283	HTH_1526	HTH_1527	leuB		TRUE	0.667	13.000	0.000	1.000	Y	NA
10377283	10377284	HTH_1527	HTH_1528		hisC	FALSE	0.064	58.000	0.000	1.000	N	NA
10377284	10377285	HTH_1528	HTH_1529	hisC		TRUE	0.926	-3.000	0.006	NA		NA
10377287	10377288	HTH_1531	HTH_1532	recR		TRUE	0.718	-10.000	0.000	NA		NA
10377288	10377289	HTH_1532	HTH_1533			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10377290	10377291	HTH_1534	HTH_1535		gcvH5	TRUE	0.963	11.000	0.400	NA		NA
10377291	10377292	HTH_1535	HTH_1536	gcvH5	gcvP	TRUE	0.938	0.000	0.005	1.000	Y	NA
10377292	10377293	HTH_1536	HTH_1537	gcvP		FALSE	0.138	32.000	0.000	1.000	N	NA
10377293	10377294	HTH_1537	HTH_1538		neuB	TRUE	0.896	-19.000	0.050	1.000	N	NA
10377294	10377295	HTH_1538	HTH_1539	neuB		TRUE	0.778	-3.000	0.000	1.000		NA
10377295	10377296	HTH_1539	HTH_1540			TRUE	0.982	-16.000	0.678	1.000		NA
10377296	10377297	HTH_1540	HTH_1541			TRUE	0.962	-7.000	0.072	1.000	N	NA
10377297	10377298	HTH_1541	HTH_1542		clpB	FALSE	0.067	56.000	0.000	1.000	N	NA
10377299	10377300	HTH_1543	HTH_1544	engA		TRUE	0.598	7.000	0.000	1.000		NA
10377300	10377301	HTH_1544	HTH_1545			TRUE	0.918	-10.000	0.015	1.000	N	NA
10377301	10377302	HTH_1545	HTH_1546		trxA3	TRUE	0.945	-3.000	0.011	1.000		NA
10377302	10377303	HTH_1546	HTH_1547	trxA3		FALSE	0.204	31.000	0.000	1.000		NA
10377303	10377304	HTH_1547	HTH_1548			FALSE	0.052	67.000	0.000	1.000	N	NA
10377305	10377306	HTH_1549	HTH_1550		nuoH1	FALSE	0.021	195.000	0.000	1.000	N	NA
10377307	10377308	HTH_1551	HTH_1552	porG	porB	TRUE	0.997	-3.000	0.667	0.003	Y	NA
10377308	10377309	HTH_1552	HTH_1553	porB	porA	TRUE	0.995	-10.000	0.500	0.003	Y	NA
10377309	10377310	HTH_1553	HTH_1554	porA	porD	TRUE	0.675	67.000	0.500	1.000		NA
10377310	10377311	HTH_1554	HTH_1555	porD	porE	TRUE	0.908	23.000	0.500	NA		NA
10377313	10377314	HTH_1557	HTH_1558			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10377314	10377315	HTH_1558	HTH_1559			FALSE	0.265	19.000	0.000	NA	N	NA
10377315	10377316	HTH_1559	HTH_1560			TRUE	0.949	0.000	0.050	1.000	N	NA
10377316	10377317	HTH_1560	HTH_1561			TRUE	0.652	43.000	0.113	1.000		NA
10377317	10377318	HTH_1561	HTH_1562			TRUE	0.980	4.000	0.656	NA		NA
10377319	10377320	HTH_1563	HTH_1564	thiS	thiG	TRUE	0.825	30.000	0.130	1.000	Y	NA
10377320	10377321	HTH_1564	HTH_1565	thiG	hemG	TRUE	0.976	-3.000	0.005	0.004	Y	NA
10377321	10377322	HTH_1565	HTH_1566	hemG	talC	FALSE	0.233	21.000	0.000	1.000	N	NA
10377323	10377324	HTH_1567	HTH_1568			TRUE	0.885	2.000	0.006	NA		NA
10377324	10377325	HTH_1568	HTH_1569			TRUE	0.863	2.000	0.004	NA		NA
10377325	10377326	HTH_1569	HTH_1570			TRUE	0.985	-12.000	0.600	NA		NA
10377326	10377327	HTH_1570	HTH_1571		galE	TRUE	0.948	8.000	0.143	NA		NA
10377327	10377328	HTH_1571	HTH_1572	galE	clpC	FALSE	0.132	33.000	0.000	1.000	N	NA
10377329	10377330	HTH_1573	HTH_1574			FALSE	0.221	28.000	0.000	NA		NA
10377330	10377331	HTH_1574	HTH_1575			TRUE	0.940	-3.000	0.000	0.011	Y	NA
10377331	10377332	HTH_1575	HTH_1576			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10377333	10377334	HTH_1577	HTH_1578			FALSE	0.410	-36.000	0.000	NA		NA
10377334	10377335	HTH_1578	HTH_1579			FALSE	0.095	44.000	0.000	1.000	N	NA
10377335	10377336	HTH_1579	HTH_1580			TRUE	0.982	-3.000	0.231	1.000		NA
10377337	10377338	HTH_1581	HTH_1582	proC		TRUE	0.738	-27.000	0.004	NA		NA
10377338	10377339	HTH_1582	HTH_1583			FALSE	0.030	203.000	0.000	NA		NA
10377339	10377340	HTH_1583	HTH_1584		glnB3	FALSE	0.029	113.000	0.000	1.000	N	NA
10377340	10377341	HTH_1584	HTH_1585	glnB3	glnA	TRUE	0.713	24.000	0.009	1.000	Y	NA
10377341	10377342	HTH_1585	HTH_1586	glnA	amtB	FALSE	0.287	49.000	0.007	1.000	N	NA
10377342	10377343	HTH_1586	HTH_1587	amtB		TRUE	0.978	15.000	0.600	0.020		NA
10377343	10377344	HTH_1587	HTH_1588			TRUE	0.911	4.000	0.027	1.000		NA
10377344	10377345	HTH_1588	HTH_1589			TRUE	0.699	-3.000	0.000	1.000	N	NA
10377345	10377346	HTH_1589	HTH_1590			FALSE	0.164	37.000	0.000	NA		NA
10377346	10377347	HTH_1590	HTH_t39			FALSE	0.576	10.000	0.000	NA		NA
10377347	10377348	HTH_t39	HTH_1591			FALSE	0.576	10.000	0.000	NA		NA
10377348	10377349	HTH_1591	HTH_1592		hisS2	TRUE	0.666	-13.000	0.000	NA		NA
10377350	10377351	HTH_1593	HTH_1594	metK1	serS	FALSE	0.542	16.000	0.000	0.085	N	NA
10377352	10377353	HTH_1595	HTH_1596			FALSE	0.147	30.000	0.000	NA	N	NA
10377353	10377354	HTH_1596	HTH_1597			FALSE	0.559	11.000	0.000	NA		NA
10377356	10377357	HTH_1599	HTH_1600			FALSE	0.328	20.000	0.000	NA		NA
10377357	10377358	HTH_1600	HTH_1601		thiL	TRUE	0.906	-3.000	0.003	NA		NA
10377358	10377359	HTH_1601	HTH_1602	thiL		FALSE	0.479	10.000	0.000	1.000	N	NA
10377359	10377360	HTH_1602	HTH_1603		lplA	FALSE	0.050	69.000	0.000	1.000	N	NA
10377361	10377362	HTH_1604	HTH_1605			TRUE	0.777	-6.000	0.000	NA		NA
10377362	10377363	HTH_1605	HTH_1606			FALSE	0.533	12.000	0.000	NA		NA
10377364	10377365	HTH_1607	HTH_1608	pmbA		TRUE	0.882	3.000	0.010	NA		NA
10377365	10377366	HTH_1608	HTH_1609			TRUE	0.993	-3.000	0.800	NA		NA
10377367	10377368	HTH_1610	HTH_1611	ddpA	dxr	TRUE	0.699	-3.000	0.000	1.000	N	NA
10377368	10377369	HTH_1611	HTH_1612	dxr		TRUE	0.875	-3.000	0.002	1.000	N	NA
10377369	10377370	HTH_1612	HTH_1613		ppa	TRUE	0.922	-3.000	0.009	1.000	N	NA
10377373	10377374	HTH_1616	HTH_1617			TRUE	0.983	-9.000	0.111	0.029		NA
10377374	10377375	HTH_1617	HTH_1618			FALSE	0.564	11.000	0.000	1.000		NA
10377375	10377376	HTH_1618	HTH_1619			TRUE	0.981	-3.000	0.037	0.005		NA
10377377	10377378	HTH_1620	HTH_1621	cooA	purH	FALSE	0.270	19.000	0.000	1.000	N	NA
10377378	10377379	HTH_1621	HTH_1622	purH	yajC	TRUE	0.693	-3.000	0.000	NA	N	NA
10377380	10377381	HTH_1623	HTH_1624	accD		TRUE	0.843	-13.000	0.003	NA		NA
10377381	10377382	HTH_1624	HTH_1625			TRUE	0.896	-7.000	0.003	NA		NA
10377383	10377384	HTH_1626	HTH_1627	rpmA	rplU	TRUE	0.995	2.000	0.667	0.018	Y	NA
10377385	10377386	HTH_1628	HTH_1629			FALSE	0.131	45.000	0.000	NA		NA
10377386	10377387	HTH_1629	HTH_1630		ilvC	FALSE	0.346	34.000	0.002	NA		NA
10377387	10377388	HTH_1630	HTH_1631	ilvC		TRUE	0.921	-3.000	0.008	1.000	N	NA
10377388	10377389	HTH_1631	HTH_1632		ribD2	TRUE	0.990	-7.000	0.700	1.000	N	NA
10377390	10377391	HTH_1633	HTH_1634			FALSE	0.564	-19.000	0.000	NA		NA
10377391	10377392	HTH_1634	HTH_1635			FALSE	0.519	-22.000	0.000	NA		NA
10377393	10377394	HTH_1636	HTH_1637			TRUE	0.733	0.000	0.000	NA		NA
10377396	10377397	HTH_1639	HTH_1640	rfbA	rfbB	TRUE	0.992	0.000	0.385	0.085	Y	NA
10377397	10377398	HTH_1640	HTH_1641	rfbB	secF	TRUE	0.699	-3.000	0.000	1.000	N	NA
10377398	10377399	HTH_1641	HTH_1642	secF		FALSE	0.258	25.000	0.000	1.000		NA
10377399	10377400	HTH_1642	HTH_1643		glyS	TRUE	0.738	0.000	0.000	1.000		NA
10377400	10377401	HTH_1643	HTH_1644	glyS	ppsA	TRUE	0.893	3.000	0.006	0.085	N	NA
10377401	10377402	HTH_1644	HTH_1645	ppsA		TRUE	0.990	-3.000	0.571	NA		NA
10377402	10377403	HTH_1645	HTH_1646			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10377403	10377404	HTH_1646	HTH_1647			TRUE	0.611	-16.000	0.000	NA		NA
10377404	10377405	HTH_1647	HTH_1648			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10377405	10377406	HTH_1648	HTH_1649			TRUE	0.977	-3.000	0.133	NA		NA
10377406	10377407	HTH_1649	HTH_1650			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10377408	10377409	HTH_1651	HTH_1652			TRUE	0.989	-6.000	0.500	1.000		NA
10377409	10377410	HTH_1652	HTH_1653			TRUE	0.956	-3.000	0.043	1.000	N	NA
10377410	10377411	HTH_1653	HTH_1654			TRUE	0.887	-13.000	0.007	NA		NA
10377411	10377412	HTH_1654	HTH_1655			TRUE	0.941	-3.000	0.010	NA		NA
10377412	10377413	HTH_1655	HTH_1656			TRUE	0.963	-3.000	0.041	NA		NA
10377413	10377414	HTH_1656	HTH_1657			TRUE	0.989	-3.000	0.500	NA		NA
10377414	10377415	HTH_1657	HTH_1658			TRUE	0.985	-3.000	0.333	NA		NA
10377415	10377416	HTH_1658	HTH_1659			TRUE	0.820	47.000	0.429	NA	Y	NA
10377416	10377417	HTH_1659	HTH_1660			FALSE	0.050	89.000	0.000	NA		NA
10377417	10377418	HTH_1660	HTH_1661			TRUE	0.709	1.000	0.000	NA		NA
10377418	10377419	HTH_1661	HTH_1662			TRUE	0.709	1.000	0.000	NA		NA
10377421	10377422	HTH_1664	HTH_1665			TRUE	0.927	-7.000	0.007	NA		NA
10377422	10377423	HTH_1665	HTH_1666		folP	TRUE	0.960	-13.000	0.133	NA		NA
10377423	10377424	HTH_1666	HTH_1667	folP		FALSE	0.345	-48.000	0.000	NA		NA
10377425	10377426	HTH_1668	HTH_1669			FALSE	0.207	56.000	0.000	0.029		NA
10377426	10377427	HTH_1669	HTH_1670			TRUE	0.956	4.000	0.026	0.003		NA
10377427	10377428	HTH_1670	HTH_1671			FALSE	0.424	16.000	0.000	NA		NA
10377428	10377429	HTH_1671	HTH_1672		tmk	FALSE	0.033	173.000	0.000	NA		NA
10377429	10377430	HTH_1672	HTH_1673	tmk		FALSE	0.490	8.000	0.000	1.000	N	NA
10377430	10377431	HTH_1673	HTH_1674		pgi	FALSE	0.521	3.000	0.000	1.000	N	NA
10377431	10377432	HTH_1674	HTH_1675	pgi	terC	TRUE	0.900	-3.000	0.005	1.000	N	NA
10377433	10377434	HTH_1676	HTH_1677	tonB2		TRUE	0.826	0.000	0.000	0.054	N	NA
10377434	10377435	HTH_1677	HTH_1678			TRUE	0.985	-10.000	0.065	0.020	Y	NA
10377435	10377436	HTH_1678	HTH_1679			TRUE	0.671	2.000	0.000	NA		NA
10377437	10377438	HTH_1680	HTH_1681	fdsG	fdsB	TRUE	0.994	7.000	0.870	0.009	Y	NA
10377438	10377439	HTH_1681	HTH_1682	fdsB	fdsA	TRUE	0.964	12.000	0.466	1.000		NA
10377439	10377440	HTH_1682	HTH_1683	fdsA	fdsD	TRUE	0.979	3.000	0.175	0.004		NA
10377440	10377441	HTH_1683	HTH_1684	fdsD	fdsC	TRUE	0.831	-16.000	0.000	0.004		NA
10377441	10377442	HTH_1684	HTH_1685	fdsC	rplT	FALSE	0.019	268.000	0.000	1.000	N	NA
10377442	10377443	HTH_1685	HTH_1686	rplT	pheS	TRUE	0.987	-3.000	0.202	1.000	Y	NA
10377444	10377445	HTH_1687	HTH_1688			TRUE	0.733	0.000	0.000	NA		NA
10377445	10377446	HTH_1688	HTH_1689			FALSE	0.493	-25.000	0.000	1.000		NA
10377446	10377447	HTH_1689	HTH_1690			TRUE	0.977	-19.000	0.667	NA		NA
10377447	10377448	HTH_1690	HTH_1691			FALSE	0.145	42.000	0.000	NA		NA
10377448	10377449	HTH_1691	HTH_1692		czcA	TRUE	0.942	-16.000	0.091	NA		NA
10377449	10377450	HTH_1692	HTH_1693	czcA	czcB	TRUE	0.975	-3.000	0.182	1.000	N	NA
10377450	10377451	HTH_1693	HTH_1694	czcB	czcC	TRUE	0.995	-10.000	1.000	1.000	Y	NA
10377452	10377453	HTH_1695	HTH_1696			FALSE	0.310	21.000	0.000	NA		NA
10377456	10377457	HTH_1699	HTH_t40			FALSE	0.208	30.000	0.000	NA		NA
10377457	10377458	HTH_t40	HTH_1700			TRUE	0.709	1.000	0.000	NA		NA
10377458	10377459	HTH_1700	HTH_1701		rpsP	TRUE	0.948	14.000	0.385	1.000		NA
10377459	10377460	HTH_1701	HTH_1702	rpsP		FALSE	0.083	48.000	0.000	1.000	N	NA
10377460	10377461	HTH_1702	HTH_1703		trpA	FALSE	0.075	51.000	0.000	1.000	N	NA
10377461	10377462	HTH_1703	HTH_1704	trpA		TRUE	0.729	-30.000	0.009	1.000	N	NA
10377462	10377463	HTH_1704	HTH_1705		accB	TRUE	0.772	4.000	0.003	1.000	N	NA
10377463	10377464	HTH_1705	HTH_1706	accB	efp	TRUE	0.964	0.000	0.120	1.000	N	NA
10377465	10377466	HTH_1707	HTH_1708			FALSE	0.139	43.000	0.000	NA		NA
10377466	10377467	HTH_1708	HTH_1709		pstS	FALSE	0.512	13.000	0.000	1.000		NA
10377467	10377468	HTH_1709	HTH_1710	pstS	pstC	TRUE	0.971	13.000	0.086	0.002	Y	NA
10377468	10377469	HTH_1710	HTH_1711	pstC	pstA	TRUE	0.997	-3.000	0.537	0.002	Y	NA
10377469	10377470	HTH_1711	HTH_1712	pstA	pstB	TRUE	0.993	3.000	0.526	0.002	Y	NA
10377470	10377471	HTH_1712	HTH_t41	pstB		FALSE	0.398	17.000	0.000	NA		NA
10377471	10377472	HTH_t41	HTH_1713			FALSE	0.506	13.000	0.000	NA		NA
10377473	10377474	HTH_1714	HTH_1715			TRUE	0.956	2.000	0.095	NA		NA
10377474	10377475	HTH_1715	HTH_1716		narH	TRUE	0.963	14.000	0.583	NA		NA
10377475	10377476	HTH_1716	HTH_1717	narH	narG	TRUE	0.974	12.000	0.083	0.002	Y	NA
10377476	10377477	HTH_1717	HTH_1718	narG		FALSE	0.019	298.000	0.000	1.000	N	NA
10377477	10377478	HTH_1718	HTH_1719			TRUE	0.966	0.000	0.133	1.000	N	NA
10377478	10377479	HTH_1719	HTH_1720			TRUE	0.997	-3.000	0.714	0.054	Y	NA
10377479	10377480	HTH_1720	HTH_1721			TRUE	0.800	2.000	0.000	1.000	Y	NA
10377481	10377482	HTH_1722	HTH_1723	glmS		TRUE	0.592	7.000	0.000	NA		NA
10377482	10377483	HTH_1723	HTH_1724			TRUE	0.641	-15.000	0.000	NA		NA
10377483	10377484	HTH_1724	HTH_1725			TRUE	0.763	-7.000	0.000	NA		NA
10377485	10377486	HTH_1726	HTH_1727			TRUE	0.975	2.000	0.449	NA	N	NA
10377486	10377487	HTH_1727	HTH_1728			TRUE	0.991	-3.000	0.422	1.000	Y	NA
10377487	10377488	HTH_1728	HTH_1729			FALSE	0.118	48.000	0.000	NA		NA
10377488	10377489	HTH_1729	HTH_1730		murF	TRUE	0.916	2.000	0.014	NA		NA
10377491	10377492	HTH_1732	HTH_1733			FALSE	0.042	114.000	0.000	NA		NA
10377492	10377493	HTH_1733	HTH_1734			TRUE	0.709	1.000	0.000	NA		NA
10377493	10377494	HTH_1734	HTH_t42			FALSE	0.063	74.000	0.000	NA		NA
10377494	10377495	HTH_t42	HTH_1735		dfp	FALSE	0.559	11.000	0.000	NA		NA
10377495	10377496	HTH_1735	HTH_1736	dfp		TRUE	0.778	-3.000	0.000	1.000		NA
10377498	10377499	HTH_1738	HTH_1739	pflA		TRUE	0.974	0.000	0.178	NA		NA
10377499	10377500	HTH_1739	HTH_1740		sreC	FALSE	0.533	12.000	0.000	NA		NA
10377500	10377501	HTH_1740	HTH_1741	sreC	sreB	TRUE	0.978	3.000	0.548	NA		NA
10377501	10377502	HTH_1741	HTH_1742	sreB		FALSE	0.506	13.000	0.000	NA		NA
10377502	10377503	HTH_1742	HTH_1743			FALSE	0.102	53.000	0.000	NA		NA
10377503	10377504	HTH_1743	HTH_1744			TRUE	0.709	1.000	0.000	NA		NA
10377504	10377505	HTH_1744	HTH_1745			TRUE	0.858	1.000	0.000	0.028		NA
10377505	10377506	HTH_1745	HTH_1746		sreA	TRUE	0.778	-3.000	0.000	1.000		NA
10377506	10377507	HTH_1746	HTH_1747	sreA		FALSE	0.169	102.000	0.000	0.020	Y	NA
10377507	10377508	HTH_1747	HTH_1748			TRUE	0.951	-13.000	0.121	1.000	N	NA
10377508	10377509	HTH_1748	HTH_1749			TRUE	0.727	-40.000	0.009	NA		NA
10377509	10377510	HTH_1749	HTH_1750			TRUE	0.918	-3.000	0.004	NA		NA
10377510	10377511	HTH_1750	HTH_1751			TRUE	0.763	-7.000	0.000	NA		NA
10377512	10377513	HTH_1752	HTH_1753			TRUE	0.896	-10.000	0.005	1.000		NA
10377513	10377514	HTH_1753	HTH_1754			TRUE	0.873	-22.000	0.024	1.000		NA
10377515	10377516	HTH_1755	HTH_1756			TRUE	0.983	-3.000	0.286	NA		NA
10377516	10377517	HTH_1756	HTH_1757			TRUE	0.963	5.000	0.286	NA		NA
10377517	10377518	HTH_1757	HTH_1758			TRUE	0.916	13.000	0.095	NA		NA
10377518	10377519	HTH_1758	HTH_1759		mdaB	FALSE	0.043	111.000	0.000	NA		NA
10377519	10377520	HTH_1759	HTH_1760	mdaB		FALSE	0.460	-28.000	0.000	1.000		NA
10377520	10377521	HTH_1760	HTH_1761			TRUE	0.733	0.000	0.000	NA		NA
10377521	10377522	HTH_1761	HTH_1762			TRUE	0.604	4.000	0.000	NA		NA
10377522	10377523	HTH_1762	HTH_1763			FALSE	0.451	15.000	0.000	NA		NA
10377523	10377524	HTH_1763	HTH_1764			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10377526	10377527	HTH_1766	HTH_1767			TRUE	0.890	-42.000	0.250	1.000	N	NA
10377527	10377528	HTH_1767	HTH_1768			TRUE	0.717	34.000	0.188	1.000	N	NA
10377529	10377530	HTH_1769	HTH_1770			TRUE	0.963	-3.000	0.041	NA		NA
10377531	10377532	HTH_1771	HTH_1772	purC		FALSE	0.107	41.000	0.000	1.000	N	NA
10377532	10377533	HTH_1772	HTH_1773			FALSE	0.027	116.000	0.000	NA	N	NA
10377533	10377534	HTH_1773	HTH_1774		bioW	FALSE	0.055	64.000	0.000	NA	N	NA
10377534	10377535	HTH_1774	HTH_1775	bioW		FALSE	0.410	13.000	0.000	1.000	N	NA
10377536	10377537	HTH_1776	HTH_1777	dapF		FALSE	0.090	46.000	0.000	1.000	N	NA
10377537	10377538	HTH_1777	HTH_1778			TRUE	0.957	3.000	0.273	NA	N	NA
10377538	10377539	HTH_1778	HTH_1779			TRUE	0.671	2.000	0.000	NA		NA
10377539	10377540	HTH_1779	HTH_1780			TRUE	0.763	-7.000	0.000	NA		NA
10377540	10377541	HTH_1780	HTH_1781		arsB	TRUE	0.604	4.000	0.000	NA		NA
10377541	10377542	HTH_1781	HTH_1782	arsB		TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10377542	10377543	HTH_1782	HTH_1783			FALSE	0.035	143.000	0.000	NA		NA
10377543	10377544	HTH_1783	HTH_1784			TRUE	0.955	13.000	0.400	NA		NA
10377545	10377546	HTH_1785	HTH_1786	ppx		TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10377546	10377547	HTH_1786	HTH_1787		nuoN1	TRUE	0.984	-3.000	0.286	1.000		NA
10377547	10377548	HTH_1787	HTH_1788	nuoN1	nuoM1	TRUE	0.996	3.000	1.000	0.005	Y	NA
10377548	10377549	HTH_1788	HTH_1789	nuoM1	nuoL1	TRUE	0.960	5.000	0.011	0.005	Y	NA
10377549	10377550	HTH_1789	HTH_1790	nuoL1	nuoK1	TRUE	0.968	2.000	0.011	0.015	Y	NA
10377550	10377551	HTH_1790	HTH_1791	nuoK1	nuoJ1	TRUE	0.982	-3.000	0.012	0.008	Y	NA
10377551	10377552	HTH_1791	HTH_1792	nuoJ1	nuoI1	TRUE	0.993	-12.000	0.442	0.015	Y	NA
10377553	10377554	HTH_1793	HTH_1794	groS	groL	TRUE	0.905	25.000	0.125	0.082	Y	NA
10377555	10377556	HTH_1795	HTH_1796	cdsA	uppS	TRUE	0.927	-16.000	0.013	1.000	Y	NA
10377556	10377557	HTH_1796	HTH_1797	uppS		TRUE	0.778	-3.000	0.000	1.000		NA
10377558	10377559	HTH_1798	HTH_1799		murB	FALSE	0.115	38.000	0.000	1.000	N	NA
10377559	10377560	HTH_1799	HTH_1800	murB	ddlA	TRUE	0.965	-34.000	0.135	0.004	Y	NA
10377560	10377561	HTH_1800	HTH_1801	ddlA		TRUE	0.850	3.000	0.005	NA		NA
10377561	10377562	HTH_1801	HTH_1802		ftsA	TRUE	0.979	3.000	0.600	NA		NA
10377562	10377563	HTH_1802	HTH_1803	ftsA	ftsZ	TRUE	0.869	11.000	0.004	1.000	Y	NA
10377563	10377564	HTH_1803	HTH_1804	ftsZ		TRUE	0.895	-3.000	0.002	NA		NA
10377564	10377565	HTH_1804	HTH_1805			FALSE	0.134	44.000	0.000	NA		NA
10377565	10377566	HTH_1805	HTH_1806			TRUE	0.989	-3.000	0.312	1.000	Y	NA
10377566	10377567	HTH_1806	HTH_1807			TRUE	0.611	-16.000	0.000	NA		NA
10377567	10377568	HTH_1807	HTH_1808			FALSE	0.317	-61.000	0.000	NA		NA
10377568	10377569	HTH_1808	HTH_1809			TRUE	0.982	-3.000	0.222	NA		NA
10377569	10377570	HTH_1809	HTH_1810			TRUE	0.982	-3.000	0.222	NA		NA
10377570	10377571	HTH_1810	HTH_1811			FALSE	0.025	134.000	0.000	NA	N	NA
10377571	10377572	HTH_1811	HTH_1812			TRUE	0.991	-3.000	0.158	0.035	Y	NA
10377572	10377573	HTH_1812	HTH_1813		hypC	FALSE	0.055	64.000	0.000	NA	N	NA
10377573	10377574	HTH_1813	HTH_1814	hypC	hypD	TRUE	0.962	-13.000	0.055	NA	Y	NA
10377574	10377575	HTH_1814	HTH_1815	hypD	hypX	TRUE	0.957	-3.000	0.044	1.000	N	NA
10377577	10377578	HTH_1817	HTH_1818		cstA	TRUE	0.956	-3.000	0.043	1.000	N	NA
10377578	10377579	HTH_1818	HTH_1819	cstA	hisG	TRUE	0.699	-3.000	0.000	1.000	N	NA
10377580	10377581	HTH_1820	HTH_1821		holB	TRUE	0.733	0.000	0.000	NA		NA
10377583	10377584	HTH_t43	HTH_1823			FALSE	0.451	15.000	0.000	NA		NA
10377584	10377585	HTH_1823	HTH_1824		pulK	TRUE	0.671	2.000	0.000	NA		NA
10377585	10377586	HTH_1824	HTH_1825	pulK		TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10377586	10377587	HTH_1825	HTH_1826			TRUE	0.917	-3.000	0.004	NA		NA
10377587	10377588	HTH_1826	HTH_1827		pulE	TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10377588	10377589	HTH_1827	HTH_1828	pulE		FALSE	0.507	5.000	0.000	1.000	N	NA
10377589	10377590	HTH_1828	HTH_1829			TRUE	0.775	-3.000	0.000	NA		NA
10377590	10377591	HTH_1829	HTH_1830		mglA1	FALSE	0.519	-22.000	0.000	NA		NA
10377591	10377592	HTH_1830	HTH_1831	mglA1	mglB	TRUE	0.981	2.000	0.500	NA		NA
10377592	10377593	HTH_1831	HTH_1832	mglB	glyA	FALSE	0.178	34.000	0.000	NA		NA
10377594	10377595	HTH_1833	HTH_1834	argH		TRUE	0.676	2.000	0.000	1.000		NA
10377596	10377597	HTH_1835	HTH_1836		hisB	FALSE	0.243	20.000	0.000	NA	N	NA
10377597	10377598	HTH_1836	HTH_1837	hisB	holA	TRUE	0.790	-13.000	0.002	1.000	N	NA
10377598	10377599	HTH_1837	HTH_1838	holA	rho	TRUE	0.838	0.000	0.002	1.000	N	NA
10377599	10377600	HTH_1838	HTH_1839	rho	trmE	TRUE	0.767	16.000	0.009	1.000		NA
10377600	10377601	HTH_1839	HTH_1840	trmE	amnT3	FALSE	0.109	51.000	0.000	1.000		NA
10377601	10377602	HTH_1840	HTH_1841	amnT3	dksA1	TRUE	0.942	-7.000	0.022	1.000	N	NA
10377603	10377604	HTH_1842	HTH_1843	hemD1		TRUE	0.827	9.000	0.008	1.000	N	NA
10377606	10377607	HTH_1845	HTH_1846	ahpC	trxB3	TRUE	0.766	31.000	0.056	1.000	Y	NA
10377608	10377609	HTH_1847	HTH_1848			FALSE	0.424	16.000	0.000	NA		NA
10377612	10377613	HTH_1851	HTH_1852	adh	alaS	FALSE	0.581	10.000	0.000	1.000		NA
10377613	10377614	HTH_1852	HTH_1853	alaS	rpmE	TRUE	0.868	3.000	0.002	1.000	Y	NA
10377614	10377615	HTH_1853	HTH_1854	rpmE	prfA	TRUE	0.979	0.000	0.110	1.000	Y	NA
10377616	10377617	HTH_1855	HTH_1856	truB	rpoS	TRUE	0.909	0.000	0.010	1.000	N	NA
10377617	10377618	HTH_1856	HTH_1857	rpoS	htrA	TRUE	0.942	5.000	0.152	1.000	N	NA
10377618	10377619	HTH_1857	HTH_1858	htrA	bioC	TRUE	0.935	-3.000	0.008	1.000		NA
10377619	10377620	HTH_1858	HTH_1859	bioC	bioH	TRUE	0.897	-37.000	0.163	NA		NA
10377620	10377621	HTH_1859	HTH_1860	bioH		TRUE	0.763	-7.000	0.000	NA		NA
10377621	10377622	HTH_1860	HTH_1861			FALSE	0.169	27.000	0.000	1.000	N	NA
10377622	10377623	HTH_1861	HTH_1862			FALSE	0.588	9.000	0.000	1.000		NA
10377623	10377624	HTH_1862	HTH_1863		frdE	FALSE	0.543	-21.000	0.000	1.000		NA
10377624	10377625	HTH_1863	HTH_1864	frdE		TRUE	0.733	0.000	0.000	NA		NA
10377625	10377626	HTH_1864	HTH_1865			FALSE	0.537	-21.000	0.000	NA		NA
10377626	10377627	HTH_1865	HTH_1866		serA	FALSE	0.056	62.000	0.000	NA	N	NA
10377628	10377629	HTH_1867	HTH_1868		dnaE	FALSE	0.429	16.000	0.000	1.000		NA
10377630	10377631	HTH_1869	HTH_1870			TRUE	0.933	0.000	0.012	NA		NA
10377631	10377632	HTH_1870	HTH_1871			TRUE	0.961	-3.000	0.036	NA		NA
10377632	10377633	HTH_1871	HTH_1872			TRUE	0.778	-3.000	0.000	1.000		NA
10377633	10377634	HTH_1872	HTH_1873			TRUE	0.778	-3.000	0.000	1.000		NA
10377634	10377635	HTH_1873	HTH_1874		gcvH4	TRUE	0.974	-9.000	0.158	1.000		NA
10377635	10377636	HTH_1874	HTH_1875	gcvH4		TRUE	0.923	26.000	0.786	NA		NA
10377636	10377637	HTH_1875	HTH_1876			TRUE	0.981	-3.000	0.214	NA		NA
10377637	10377638	HTH_1876	HTH_1877		gcvH3	TRUE	0.976	0.000	0.200	NA		NA
10377638	10377639	HTH_1877	HTH_1878	gcvH3	hdrB1	TRUE	0.921	10.000	0.091	1.000	N	NA
10377639	10377640	HTH_1878	HTH_1879	hdrB1	hdrC1	TRUE	0.994	12.000	0.864	0.002	Y	NA
10377640	10377641	HTH_1879	HTH_1880	hdrC1		TRUE	0.983	4.000	0.760	NA		NA
10377641	10377642	HTH_1880	HTH_1881		hdrA	TRUE	0.990	-3.000	0.600	NA		NA
10377642	10377643	HTH_1881	HTH_1882	hdrA	hdrB2	TRUE	0.918	19.000	0.062	0.002		NA
10377643	10377644	HTH_1882	HTH_1883	hdrB2	hdrC2	TRUE	0.778	49.000	0.050	0.002	Y	NA
10377644	10377645	HTH_1883	HTH_1884	hdrC2		FALSE	0.326	124.000	0.132	NA		NA
10377645	10377646	HTH_1884	HTH_1885			TRUE	0.977	13.000	0.833	NA		NA
10377646	10377647	HTH_1885	HTH_1886		sirA3	TRUE	0.866	14.000	0.034	NA		NA
10377647	10377648	HTH_1886	HTH_1887	sirA3		FALSE	0.044	108.000	0.000	NA		NA
10377650	10377651	HTH_1888	HTH_1889			TRUE	0.733	0.000	0.000	NA		NA
10377651	10377652	HTH_1889	HTH_1890		fdx2	TRUE	0.958	-7.000	0.034	NA		NA
10377652	10377653	HTH_1890	HTH_1891	fdx2	fdx1	TRUE	0.991	-3.000	0.667	NA		NA
10377653	10377654	HTH_1891	HTH_1892	fdx1	sucD	TRUE	0.672	74.000	0.400	NA	Y	NA
10377654	10377655	HTH_1892	HTH_1893	sucD	sucC	TRUE	0.962	12.000	0.025	0.002	Y	NA
10377658	10377659	HTH_1896	HTH_1897		argS	FALSE	0.178	34.000	0.000	NA		NA
10377659	10377660	HTH_1897	HTH_1898	argS		TRUE	0.707	13.000	0.002	NA		NA
10377660	10377661	HTH_1898	HTH_1899			TRUE	0.991	-3.000	0.667	NA		NA
10377661	10377662	HTH_1899	HTH_1900			FALSE	0.357	15.000	0.000	1.000	N	NA
10377663	10377664	HTH_1901	HTH_1902		leuC	TRUE	0.611	-16.000	0.000	NA		NA
10377664	10377665	HTH_1902	HTH_1903	leuC	ftsH	TRUE	0.912	-9.000	0.009	1.000	N	NA
10377665	10377666	HTH_1903	HTH_1904	ftsH	mesJ	TRUE	0.802	32.000	0.145	0.081	N	NA
10377666	10377667	HTH_1904	HTH_1905	mesJ		TRUE	0.603	5.000	0.000	NA		NA
10377667	10377668	HTH_1905	HTH_1906			TRUE	0.671	2.000	0.000	NA		NA
10377669	10377670	HTH_1907	HTH_1908		frdC	TRUE	0.778	-3.000	0.000	1.000		NA
10377670	10377671	HTH_1908	HTH_1909	frdC		TRUE	0.953	-3.000	0.019	NA		NA
10377671	10377672	HTH_1909	HTH_1910		lpxA	TRUE	0.950	-7.000	0.019	NA		NA
10377672	10377673	HTH_1910	HTH_1911	lpxA	glmU	TRUE	0.944	-3.000	0.003	1.000	Y	NA
10377673	10377674	HTH_1911	HTH_1912	glmU		TRUE	0.699	-3.000	0.000	1.000	N	NA
10377674	10377675	HTH_1912	HTH_1913		rbfA	FALSE	0.496	7.000	0.000	1.000	N	NA
10377675	10377676	HTH_1913	HTH_1914	rbfA		TRUE	0.815	-15.000	0.002	1.000		NA
10377676	10377677	HTH_1914	HTH_1915			FALSE	0.436	-30.000	0.000	NA		NA
10377678	10377679	HTH_1916	HTH_1917	murI	accC	FALSE	0.479	10.000	0.000	1.000	N	NA