MicrobesOnline Operon Predictions for Bacillus megaterium DSM319

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 10370438 10370439 BMD_0001 BMD_0002 dnaA dnaN TRUE 0.802 188.000 0.328 1.000 Y NA
 10370439 10370440 BMD_0002 BMD_0003 dnaN   FALSE 0.498 101.000 0.103 1.000   NA
 10370440 10370441 BMD_0003 BMD_0004   recF TRUE 0.896 15.000 0.209 1.000   NA
 10370441 10370442 BMD_0004 BMD_0005 recF gyrB TRUE 0.784 241.000 0.249 0.003 Y NA
 10370442 10370443 BMD_0005 BMD_0006 gyrB gyrA TRUE 0.915 127.000 0.306 0.001 Y NA
 10370443 10370444 BMD_0006 BMD_0007 gyrA   FALSE 0.002 272.000 0.000 NA   NA
 10370444 10370445 BMD_0007 BMD_0008     FALSE 0.016 75.000 0.000 NA   NA
 10370445 10370446 BMD_0008 BMD_0009     FALSE 0.046 18.000 0.000 NA   NA
 10370446 10370447 BMD_0009 BMD_0010     FALSE 0.009 111.000 0.000 NA   NA
 10370447 10370448 BMD_0010 BMD_0011     FALSE 0.009 112.000 0.000 NA   NA
 10370450 10370451 BMD_0013 BMD_0014 guaB dacA FALSE 0.181 150.000 0.000 1.000 N NA
 10370451 10370452 BMD_0014 BMD_0015 dacA pdxS FALSE 0.158 191.000 0.000 1.000 N NA
 10370452 10370453 BMD_0015 BMD_0016 pdxS pdxT TRUE 0.973 22.000 0.488 NA Y NA
 10370453 10370454 BMD_0016 BMD_0017 pdxT serS FALSE 0.078 323.000 0.010 NA N NA
 10370454 10370455 BMD_0017 BMD_0018 serS   FALSE 0.009 113.000 0.000 NA   NA
 10370456 10370457 BMD_0019 BMD_0020 dck dgk TRUE 0.994 0.000 0.255 0.001 Y NA
 10370457 10370458 BMD_0020 BMD_0021 dgk yaaH FALSE 0.308 144.000 0.058 1.000   NA
 10370458 10370459 BMD_0021 BMD_0022 yaaH   TRUE 0.739 57.000 0.163 1.000   NA
 10370460 10370461 BMD_0023 BMD_0024 tadA dnaX FALSE 0.018 498.000 0.000 1.000 N NA
 10370461 10370462 BMD_0024 BMD_0025 dnaX   TRUE 0.707 20.000 0.071 NA   NA
 10370462 10370463 BMD_0025 BMD_0026   recR TRUE 0.936 16.000 0.604 NA   NA
 10370463 10370464 BMD_0026 BMD_0027 recR   TRUE 0.733 15.000 0.071 NA   NA
 10370464 10370465 BMD_0027 BMD_0028   bofA TRUE 0.637 117.000 0.417 NA   NA
 10370465 10370466 BMD_0028 BMD_0029 bofA   FALSE 0.002 297.000 0.000 NA   NA
 10370466 10370467 BMD_0029 BMD_0030     FALSE 0.003 234.000 0.000 NA   NA
 10370467 10370468 BMD_0030 BMD_0031     FALSE 0.009 113.000 0.000 NA   NA
 10370468 10370469 BMD_0031 BMD_0032     FALSE 0.069 9.000 0.000 NA   NA
 10370469 10370470 BMD_0032 BMD_0033     FALSE 0.084 4.000 0.000 NA   NA
 10370470 10370471 BMD_0033 BMD_0034     FALSE 0.070 8.000 0.000 NA   NA
 10370471 10370472 BMD_0034 BMD_0035     FALSE 0.056 14.000 0.000 NA   NA
 10370472 10370473 BMD_0035 BMD_0036     FALSE 0.044 24.000 0.000 NA   NA
 10370473 10370474 BMD_0036 BMD_0037     FALSE 0.052 15.000 0.000 NA   NA
 10370474 10370475 BMD_0037 BMD_0038     FALSE 0.068 10.000 0.000 NA   NA
 10370475 10370476 BMD_0038 BMD_0039     FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10370476 10370477 BMD_0039 BMD_0040     FALSE 0.074 6.000 0.000 NA   NA
 10370477 10370478 BMD_0040 BMD_0041     FALSE 0.012 92.000 0.000 NA   NA
 10370478 10370479 BMD_0041 BMD_0042     FALSE 0.003 233.000 0.000 NA   NA
 10370479 10370480 BMD_0042 BMD_0043     FALSE 0.018 65.000 0.000 NA   NA
 10370480 10370481 BMD_0043 BMD_0044   csfB FALSE 0.007 139.000 0.000 NA   NA
 10370481 10370482 BMD_0044 BMD_0045 csfB   FALSE 0.569 153.000 0.400 NA   NA
 10370482 10370483 BMD_0045 BMD_0046   tmk TRUE 0.843 19.000 0.045 1.000 N NA
 10370483 10370484 BMD_0046 BMD_0047 tmk   FALSE 0.394 64.000 0.038 NA   NA
 10370484 10370485 BMD_0047 BMD_0048   holB FALSE 0.450 34.000 0.021 NA   NA
 10370485 10370486 BMD_0048 BMD_0049 holB yaaT TRUE 0.942 5.000 0.372 NA   NA
 10370486 10370487 BMD_0049 BMD_0050 yaaT yabA TRUE 0.851 15.000 0.183 NA   NA
 10370487 10370488 BMD_0050 BMD_0051 yabA   FALSE 0.620 79.000 0.193 NA   NA
 10370488 10370489 BMD_0051 BMD_0052     TRUE 0.977 -13.000 0.209 1.000   NA
 10370489 10370490 BMD_0052 BMD_0053     TRUE 0.949 -22.000 0.041 1.000   NA
 10370492 10370493 BMD_0055 BMD_0056 metG   TRUE 0.760 72.000 0.221 NA N NA
 10370493 10370494 BMD_0056 BMD_0057   rnmV FALSE 0.470 224.000 0.058 NA Y NA
 10370494 10370495 BMD_0057 BMD_0058 rnmV ksgA TRUE 0.968 -6.000 0.093 1.000 N NA
 10370495 10370496 BMD_0058 BMD_0059 ksgA yabG FALSE 0.289 78.000 0.022 NA   NA
 10370496 10370497 BMD_0059 BMD_0060 yabG   FALSE 0.024 49.000 0.000 NA   NA
 10370497 10370498 BMD_0060 BMD_0061   veg FALSE 0.009 112.000 0.000 NA   NA
 10370498 10370499 BMD_0061 BMD_0062 veg sspF FALSE 0.337 195.000 0.163 NA   NA
 10370499 10370500 BMD_0062 BMD_0063 sspF ispE FALSE 0.197 199.000 0.024 1.000   NA
 10370500 10370501 BMD_0063 BMD_0064 ispE purR TRUE 0.726 57.000 0.062 1.000 N NA
 10370501 10370502 BMD_0064 BMD_0065 purR   TRUE 0.906 22.000 0.227 NA N NA
 10370502 10370503 BMD_0065 BMD_0066   spoVG TRUE 0.652 156.000 0.377 NA N NA
 10370503 10370504 BMD_0066 BMD_0067 spoVG gcaD FALSE 0.543 195.000 0.014 1.000 Y NA
 10370504 10370505 BMD_0067 BMD_0068 gcaD prs TRUE 0.862 19.000 0.069 1.000 N NA
 10370505 10370506 BMD_0068 BMD_0069 prs ctc FALSE 0.351 188.000 0.027 1.000 N NA
 10370506 10370507 BMD_0069 BMD_0070 ctc pth TRUE 0.915 140.000 0.496 0.023 Y NA
 10370507 10370508 BMD_0070 BMD_0071 pth   FALSE 0.398 60.000 0.033 NA   NA
 10370508 10370509 BMD_0071 BMD_0072   mfd FALSE 0.358 70.000 0.035 NA   NA
 10370509 10370510 BMD_0072 BMD_0073 mfd   FALSE 0.007 135.000 0.000 NA   NA
 10370510 10370511 BMD_0073 BMD_0074   spoVT FALSE 0.008 117.000 0.000 NA   NA
 10370511 10370512 BMD_0074 BMD_0075 spoVT yabM FALSE 0.239 230.000 0.147 NA   NA
 10370512 10370513 BMD_0075 BMD_0076 yabM   TRUE 0.812 13.000 0.058 1.000   NA
 10370513 10370514 BMD_0076 BMD_0077     TRUE 0.764 21.000 0.054 1.000   NA
 10370514 10370515 BMD_0077 BMD_0078   yabP FALSE 0.423 100.000 0.108 NA   NA
 10370515 10370516 BMD_0078 BMD_0079 yabP   TRUE 0.982 -3.000 0.774 NA   NA
 10370516 10370517 BMD_0079 BMD_0080   divIC TRUE 0.814 5.000 0.074 NA   NA
 10370517 10370518 BMD_0080 BMD_0081 divIC   TRUE 0.701 89.000 0.134 1.000 N NA
 10370519 10370520 BMD_0082 BMD_0083     FALSE 0.066 11.000 0.000 NA   NA
 10370521 10370522 BMD_0084 BMD_0085 spoIIE   FALSE 0.292 72.000 0.019 NA   NA
 10370522 10370523 BMD_0085 BMD_0086     FALSE 0.332 71.000 0.029 NA   NA
 10370523 10370524 BMD_0086 BMD_0087   tilS FALSE 0.337 97.000 0.018 1.000   NA
 10370524 10370525 BMD_0087 BMD_0088 tilS hpt TRUE 0.905 28.000 0.067 0.043 N NA
 10370525 10370526 BMD_0088 BMD_0089 hpt ftsH TRUE 0.727 94.000 0.192 1.000 N NA
 10370526 10370527 BMD_0089 BMD_0090 ftsH coaX FALSE 0.289 218.000 0.029 1.000 N NA
 10370527 10370528 BMD_0090 BMD_0091 coaX hslO TRUE 0.884 13.000 0.060 1.000 N NA
 10370528 10370529 BMD_0091 BMD_0092 hslO cysK FALSE 0.365 202.000 0.053 1.000 N NA
 10370529 10370530 BMD_0092 BMD_0093 cysK pabB TRUE 0.803 98.000 0.107 1.000 Y NA
 10370530 10370531 BMD_0093 BMD_0094 pabB pabA TRUE 0.994 3.000 0.452 0.018 Y NA
 10370531 10370532 BMD_0094 BMD_0095 pabA pabC TRUE 0.988 5.000 0.532 1.000 Y NA
 10370532 10370533 BMD_0095 BMD_0096 pabC folB TRUE 0.858 22.000 0.000 1.000 Y NA
 10370533 10370534 BMD_0096 BMD_0097 folB folK TRUE 0.980 1.000 0.142 1.000 Y NA
 10370534 10370535 BMD_0097 BMD_0098 folK lysS FALSE 0.074 273.000 0.000 1.000 N NA
 10370535 10370536 BMD_0098 BMD_0099 lysS   FALSE 0.002 289.000 0.000 NA   NA
 10370536 10370537 BMD_0099 BMD_0100     FALSE 0.003 233.000 0.000 NA   NA
 10370537 10370538 BMD_0100 BMD_0101     FALSE 0.017 66.000 0.000 NA   NA
 10370538 10370539 BMD_0101 BMD_0102   ctsR FALSE 0.003 235.000 0.000 NA   NA
 10370539 10370540 BMD_0102 BMD_0103 ctsR mcsA TRUE 0.892 42.000 0.681 NA   NA
 10370540 10370541 BMD_0103 BMD_0104 mcsA mcsB TRUE 0.977 4.000 0.848 1.000   NA
 10370541 10370542 BMD_0104 BMD_0105 mcsB clpC TRUE 0.952 21.000 0.425 1.000 N NA
 10370542 10370543 BMD_0105 BMD_0106 clpC radA TRUE 0.812 124.000 0.062 0.013 Y NA
 10370543 10370544 BMD_0106 BMD_0107 radA disA TRUE 0.908 4.000 0.126 1.000   NA
 10370544 10370545 BMD_0107 BMD_0108 disA   FALSE 0.271 148.000 0.088 NA   NA
 10370545 10370546 BMD_0108 BMD_0109   ispD TRUE 0.747 26.000 0.108 NA   NA
 10370546 10370547 BMD_0109 BMD_0110 ispD ispF TRUE 0.993 -3.000 0.419 1.000 Y NA
 10370547 10370548 BMD_0110 BMD_0111 ispF gltX FALSE 0.564 106.000 0.076 1.000 N NA
 10370548 10370549 BMD_0111 BMD_0112 gltX cysE FALSE 0.101 336.000 0.008 1.000 N NA
 10370549 10370550 BMD_0112 BMD_0113 cysE cysS TRUE 0.981 -10.000 0.039 0.043 N NA
 10370550 10370551 BMD_0113 BMD_0114 cysS mrnC TRUE 0.893 8.000 0.129 1.000   NA
 10370551 10370552 BMD_0114 BMD_0115 mrnC rlmB TRUE 0.986 -10.000 0.150 0.003   NA
 10370552 10370553 BMD_0115 BMD_0116 rlmB   TRUE 0.872 3.000 0.109 NA   NA
 10370553 10370554 BMD_0116 BMD_0117   sigH TRUE 0.760 69.000 0.361 NA   NA
 10370554 10370555 BMD_0117 BMD_0118 sigH rpmG TRUE 0.813 82.000 0.282 1.000 N NA
 10370555 10370556 BMD_0118 BMD_0119 rpmG secE TRUE 0.753 54.000 0.080 1.000 N NA
 10370556 10370557 BMD_0119 BMD_0120 secE nusG TRUE 0.776 196.000 0.843 1.000 N NA
 10370557 10370558 BMD_0120 BMD_0121 nusG rplK TRUE 0.775 166.000 0.681 1.000 N NA
 10370558 10370559 BMD_0121 BMD_0122 rplK rplA TRUE 0.955 111.000 0.838 0.018 Y NA
 10370559 10370560 BMD_0122 BMD_0123 rplA rplJ TRUE 0.777 250.000 0.302 0.018 Y NA
 10370560 10370561 BMD_0123 BMD_0124 rplJ rplL TRUE 0.985 45.000 0.884 0.014 Y NA
 10370561 10370562 BMD_0124 BMD_0125 rplL   TRUE 0.712 113.000 0.050 1.000 Y NA
 10370562 10370563 BMD_0125 BMD_0126   rpoB FALSE 0.194 246.000 0.008 1.000 N NA
 10370563 10370564 BMD_0126 BMD_0127 rpoB rpoC TRUE 0.981 63.000 0.851 0.002 Y NA
 10370564 10370565 BMD_0127 BMD_0128 rpoC rplGB FALSE 0.464 132.000 0.065 1.000 N NA
 10370565 10370566 BMD_0128 BMD_0129 rplGB rpsL TRUE 0.917 100.000 0.239 0.018 Y NA
 10370566 10370567 BMD_0129 BMD_0130 rpsL rpsG TRUE 0.964 51.000 0.224 0.002 Y NA
 10370567 10370568 BMD_0130 BMD_0131 rpsG fusA TRUE 0.957 58.000 0.579 1.000 Y NA
 10370568 10370569 BMD_0131 BMD_0132 fusA tuf TRUE 0.936 117.000 0.400 0.001 Y NA
 10370569 10370570 BMD_0132 BMD_0133 tuf rpsJ FALSE 0.532 317.000 0.318 1.000 Y NA
 10370570 10370571 BMD_0133 BMD_0134 rpsJ rplC TRUE 0.977 42.000 0.467 0.018 Y NA
 10370571 10370572 BMD_0134 BMD_0135 rplC rplD TRUE 0.986 29.000 0.544 0.014 Y NA
 10370572 10370573 BMD_0135 BMD_0136 rplD rplW TRUE 0.994 0.000 0.307 0.014 Y NA
 10370573 10370574 BMD_0136 BMD_0137 rplW rplB TRUE 0.989 28.000 0.849 0.018 Y NA
 10370574 10370575 BMD_0137 BMD_0138 rplB rpsS TRUE 0.980 58.000 0.820 0.018 Y NA
 10370575 10370576 BMD_0138 BMD_0139 rpsS rplV TRUE 0.991 20.000 0.769 0.018 Y NA
 10370576 10370577 BMD_0139 BMD_0140 rplV rpsC TRUE 0.995 4.000 0.719 0.018 Y NA
 10370577 10370578 BMD_0140 BMD_0141 rpsC rplP TRUE 0.996 3.000 0.828 0.018 Y NA
 10370578 10370579 BMD_0141 BMD_0142 rplP rpmC TRUE 0.998 -10.000 0.802 0.014 Y NA
 10370579 10370580 BMD_0142 BMD_0143 rpmC rpsQ TRUE 0.990 26.000 0.828 0.014 Y NA
 10370580 10370581 BMD_0143 BMD_0144 rpsQ rplN TRUE 0.981 52.000 0.791 0.018 Y NA
 10370581 10370582 BMD_0144 BMD_0145 rplN rplX TRUE 0.933 50.000 0.071 0.018 Y NA
 10370582 10370583 BMD_0145 BMD_0146 rplX rplE TRUE 0.949 32.000 0.057 0.014 Y NA
 10370583 10370584 BMD_0146 BMD_0147 rplE rpsN TRUE 0.982 34.000 0.496 0.014 Y NA
 10370584 10370585 BMD_0147 BMD_0148 rpsN rpsH TRUE 0.983 31.000 0.473 0.014 Y NA
 10370585 10370586 BMD_0148 BMD_0149 rpsH rplF TRUE 0.988 31.000 0.808 0.014 Y NA
 10370586 10370587 BMD_0149 BMD_0150 rplF rplR TRUE 0.987 33.000 0.815 0.014 Y NA
 10370587 10370588 BMD_0150 BMD_0151 rplR rpsE TRUE 0.991 21.000 0.814 0.018 Y NA
 10370588 10370589 BMD_0151 BMD_0152 rpsE rpmD TRUE 0.992 15.000 0.789 0.018 Y NA
 10370589 10370590 BMD_0152 BMD_0153 rpmD rplO TRUE 0.986 34.000 0.653 0.002 Y NA
 10370590 10370591 BMD_0153 BMD_0154 rplO secY TRUE 0.987 0.000 0.730 1.000 N NA
 10370591 10370592 BMD_0154 BMD_0155 secY adk TRUE 0.824 67.000 0.241 1.000 N NA
 10370592 10370593 BMD_0155 BMD_0156 adk map TRUE 0.909 33.000 0.290 1.000 N NA
 10370593 10370594 BMD_0156 BMD_0157 map infA FALSE 0.600 236.000 0.160 1.000 Y NA
 10370594 10370595 BMD_0157 BMD_0158 infA rpsM TRUE 0.777 176.000 0.075 0.018 Y NA
 10370595 10370596 BMD_0158 BMD_0159 rpsM rpsK TRUE 0.991 24.000 0.810 0.014 Y NA
 10370596 10370597 BMD_0159 BMD_0160 rpsK rpoA TRUE 0.654 181.000 0.308 1.000 N NA
 10370597 10370598 BMD_0160 BMD_0161 rpoA rplQ TRUE 0.946 45.000 0.873 1.000 N NA
 10370598 10370599 BMD_0161 BMD_0162 rplQ cbiO1 FALSE 0.464 139.000 0.074 1.000 N NA
 10370599 10370600 BMD_0162 BMD_0163 cbiO1 cbiO2 TRUE 0.999 -24.000 0.713 0.022 Y NA
 10370600 10370601 BMD_0163 BMD_0164 cbiO2 cbiQ TRUE 0.986 -3.000 0.139 1.000 Y NA
 10370601 10370602 BMD_0164 BMD_0165 cbiQ truA TRUE 0.912 19.000 0.170 1.000 N NA
 10370602 10370603 BMD_0165 BMD_0166 truA rplM TRUE 0.640 157.000 0.052 1.000 Y NA
 10370603 10370604 BMD_0166 BMD_0167 rplM rpsI TRUE 0.989 23.000 0.601 0.014 Y NA
 10370604 10370605 BMD_0167 BMD_0168 rpsI   FALSE 0.196 109.000 0.021 NA   NA
 10370605 10370606 BMD_0168 BMD_0169   cwlD TRUE 0.659 71.000 0.211 NA   NA
 10370606 10370607 BMD_0169 BMD_0170 cwlD mrp TRUE 0.751 91.000 0.211 1.000 N NA
 10370608 10370609 BMD_0171 BMD_0172   gerD FALSE 0.006 188.000 0.000 NA   NA
 10370612 10370613 BMD_0175 BMD_0176     FALSE 0.003 233.000 0.000 NA   NA
 10370613 10370614 BMD_0176 BMD_0177     FALSE 0.023 50.000 0.000 NA   NA
 10370614 10370615 BMD_0177 BMD_0178     FALSE 0.010 104.000 0.000 NA   NA
 10370615 10370616 BMD_0178 BMD_0179     FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10370616 10370617 BMD_0179 BMD_0180     FALSE 0.069 9.000 0.000 NA   NA
 10370617 10370618 BMD_0180 BMD_0181     FALSE 0.070 8.000 0.000 NA   NA
 10370618 10370619 BMD_0181 BMD_0182     FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10370619 10370620 BMD_0182 BMD_0183     FALSE 0.068 10.000 0.000 NA   NA
 10370620 10370621 BMD_0183 BMD_0184     FALSE 0.046 23.000 0.000 NA   NA
 10370621 10370622 BMD_0184 BMD_0185   argI FALSE 0.006 146.000 0.000 NA   NA
 10370624 10370625 BMD_0187 BMD_0188 sigW rsiW TRUE 0.979 15.000 0.583 NA Y NA
 10370625 10370626 BMD_0188 BMD_0189 rsiW   FALSE 0.140 193.000 0.028 NA   NA
 10370626 10370627 BMD_0189 BMD_0190     TRUE 0.982 -7.000 0.502 NA   NA
 10370627 10370628 BMD_0190 BMD_0191   glmM TRUE 0.769 29.000 0.150 NA   NA
 10370628 10370629 BMD_0191 BMD_0192 glmM glmS FALSE 0.064 431.000 0.030 1.000 N NA
 10370629 10370630 BMD_0192 BMD_0193 glmS   FALSE 0.006 172.000 0.000 NA   NA
 10370630 10370631 BMD_0193 BMD_0194     FALSE 0.007 138.000 0.000 NA   NA
 10370631 10370632 BMD_0194 BMD_0195     FALSE 0.006 144.000 0.000 NA   NA
 10370632 10370633 BMD_0195 BMD_0196     FALSE 0.006 161.000 0.000 NA   NA
 10370633 10370634 BMD_0196 BMD_0197     TRUE 0.931 61.000 0.336 0.008 N NA
 10370634 10370635 BMD_0197 BMD_0198     TRUE 0.887 6.000 0.031 1.000 N NA
 10370635 10370636 BMD_0198 BMD_0199     FALSE 0.166 90.000 0.000 NA N NA
 10370638 10370639 BMD_0201 BMD_0202 mscL   FALSE 0.397 196.000 0.000 1.000 Y NA
 10370639 10370640 BMD_0202 BMD_0203     FALSE 0.151 196.000 0.000 1.000 N NA
 10370640 10370641 BMD_0203 BMD_0204   potA TRUE 0.943 21.000 0.326 1.000 N NA
 10370641 10370642 BMD_0204 BMD_0205 potA potB TRUE 0.998 -10.000 0.928 0.041 Y NA
 10370642 10370643 BMD_0205 BMD_0206 potB potC TRUE 0.994 2.000 0.492 0.041 Y NA
 10370643 10370644 BMD_0206 BMD_0207 potC potD TRUE 0.994 -3.000 0.253 0.041 Y NA
 10370644 10370645 BMD_0207 BMD_0208 potD   FALSE 0.026 219.000 0.000 1.000   NA
 10370645 10370646 BMD_0208 BMD_0209     FALSE 0.040 146.000 0.000 1.000   NA
 10370646 10370647 BMD_0209 BMD_0210     TRUE 0.996 -7.000 0.606 1.000 Y NA
 10370648 10370649 BMD_0211 BMD_0212   apbE TRUE 0.980 -16.000 0.118 1.000 N NA
 10370650 10370651 BMD_0213 BMD_0214 ddl   TRUE 0.861 97.000 0.044 0.005 Y NA
 10370651 10370652 BMD_0214 BMD_0215     FALSE 0.286 197.000 0.004 1.000 N NA
 10370652 10370653 BMD_0215 BMD_0216   uvdE TRUE 0.720 95.000 0.013 1.000 Y NA
 10370655 10370656 BMD_0218 BMD_0219 acpS   FALSE 0.603 59.000 0.038 NA N NA
 10370656 10370657 BMD_0219 BMD_0220   alr TRUE 0.776 114.000 0.194 NA Y NA
 10370657 10370658 BMD_0220 BMD_0221 alr ndoAI FALSE 0.446 201.000 0.108 1.000 N NA
 10370658 10370659 BMD_0221 BMD_0222 ndoAI ndoA TRUE 0.960 5.000 0.260 1.000 N NA
 10370659 10370660 BMD_0222 BMD_0223 ndoA rsbR FALSE 0.357 160.000 0.000 NA Y NA
 10370660 10370661 BMD_0223 BMD_0224 rsbR rsbS TRUE 0.899 3.000 0.000 NA Y NA
 10370661 10370662 BMD_0224 BMD_0225 rsbS rsbT TRUE 0.981 4.000 0.320 NA Y NA
 10370662 10370663 BMD_0225 BMD_0226 rsbT rsbU TRUE 0.981 14.000 0.617 NA Y NA
 10370663 10370664 BMD_0226 BMD_0227 rsbU rsbV TRUE 0.948 60.000 0.440 1.000 Y NA
 10370664 10370665 BMD_0227 BMD_0228 rsbV rsbW TRUE 0.995 -3.000 0.714 1.000 Y NA
 10370665 10370666 BMD_0228 BMD_0229 rsbW sigB TRUE 0.996 -34.000 0.838 1.000 N NA
 10370666 10370667 BMD_0229 BMD_0230 sigB rsbX TRUE 0.956 0.000 0.243 1.000   NA
 10370667 10370668 BMD_0230 BMD_0231 rsbX   FALSE 0.408 85.000 0.027 1.000   NA
 10370670 10370671 BMD_0233 BMD_0234     FALSE 0.007 135.000 0.000 NA   NA
 10370671 10370672 BMD_0234 BMD_0235     FALSE 0.084 4.000 0.000 NA   NA
 10370672 10370673 BMD_0235 BMD_0236     FALSE 0.068 10.000 0.000 NA   NA
 10370673 10370674 BMD_0236 BMD_0237     FALSE 0.043 25.000 0.000 NA   NA
 10370674 10370675 BMD_0237 BMD_0238     FALSE 0.036 29.000 0.000 NA   NA
 10370675 10370676 BMD_0238 BMD_0239     FALSE 0.063 12.000 0.000 NA   NA
 10370676 10370677 BMD_0239 BMD_0240     FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10370677 10370678 BMD_0240 BMD_0241     FALSE 0.059 13.000 0.000 NA   NA
 10370678 10370679 BMD_0241 BMD_0242     FALSE 0.046 23.000 0.000 NA   NA
 10370679 10370680 BMD_0242 BMD_0243     FALSE 0.012 91.000 0.000 NA   NA
 10370680 10370681 BMD_0243 BMD_0244     FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10370681 10370682 BMD_0244 BMD_0245     FALSE 0.013 89.000 0.000 NA   NA
 10370682 10370683 BMD_0245 BMD_0246     FALSE 0.003 233.000 0.000 NA   NA
 10370683 10370684 BMD_0246 BMD_0247     FALSE 0.016 71.000 0.000 NA   NA
 10370684 10370685 BMD_0247 BMD_0248     FALSE 0.044 24.000 0.000 NA   NA
 10370685 10370686 BMD_0248 BMD_0249     FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10370686 10370687 BMD_0249 BMD_0250     FALSE 0.004 221.000 0.000 NA   NA
 10370687 10370688 BMD_0250 BMD_0251     TRUE 0.951 -3.000 0.217 NA   NA
 10370688 10370689 BMD_0251 BMD_0252   rimI TRUE 0.858 15.000 0.127 1.000   NA
 10370689 10370690 BMD_0252 BMD_0253 rimI   TRUE 0.961 -15.000 0.090 1.000   NA
 10370692 10370693 BMD_0255 BMD_0256   tatA FALSE 0.126 54.000 0.000 1.000   NA
 10370693 10370694 BMD_0256 BMD_0257 tatA tatC TRUE 0.823 16.000 0.000 NA Y NA
 10370695 10370696 BMD_0258 BMD_0259     TRUE 0.897 -3.000 0.080 NA   NA
 10370697 10370698 BMD_0260 BMD_0261 groES groEL TRUE 0.952 68.000 0.674 1.000 Y NA
 10370698 10370699 BMD_0261 BMD_0262 groEL   FALSE 0.038 159.000 0.000 1.000   NA
 10370699 10370700 BMD_0262 BMD_0263     TRUE 0.956 12.000 0.714 NA   NA
 10370700 10370701 BMD_0263 BMD_0264     TRUE 0.979 -3.000 0.642 NA   NA
 10370701 10370702 BMD_0264 BMD_0265     FALSE 0.117 265.000 0.007 NA N NA
 10370702 10370703 BMD_0265 BMD_0266   pbuG FALSE 0.009 333.000 0.000 1.000   NA
 10370703 10370704 BMD_0266 BMD_0267 pbuG   FALSE 0.001 381.000 0.000 NA   NA
 10370704 10370705 BMD_0267 BMD_0268     FALSE 0.003 233.000 0.000 NA   NA
 10370705 10370706 BMD_0268 BMD_0269     FALSE 0.017 66.000 0.000 NA   NA
 10370706 10370707 BMD_0269 BMD_0270     FALSE 0.006 166.000 0.000 NA   NA
 10370707 10370708 BMD_0270 BMD_0271   purE FALSE 0.002 316.000 0.000 NA   NA
 10370708 10370709 BMD_0271 BMD_0272 purE purK TRUE 0.993 -7.000 0.038 0.001 Y NA
 10370709 10370710 BMD_0272 BMD_0273 purK purB TRUE 0.976 -3.000 0.033 1.000 Y NA
 10370710 10370711 BMD_0273 BMD_0274 purB purC TRUE 0.832 75.000 0.072 1.000 Y NA
 10370711 10370712 BMD_0274 BMD_0275 purC purS TRUE 0.986 8.000 0.460 1.000 Y NA
 10370712 10370713 BMD_0275 BMD_0276 purS purQ TRUE 0.997 -3.000 0.656 0.001 Y NA
 10370713 10370714 BMD_0276 BMD_0277 purQ purL TRUE 0.998 -16.000 0.346 0.001 Y NA
 10370714 10370715 BMD_0277 BMD_0278 purL purF TRUE 0.994 -24.000 0.223 1.000 Y NA
 10370715 10370716 BMD_0278 BMD_0279 purF purM TRUE 0.960 27.000 0.248 1.000 Y NA
 10370716 10370717 BMD_0279 BMD_0280 purM purN TRUE 0.995 -3.000 0.238 0.002 Y NA
 10370717 10370718 BMD_0280 BMD_0281 purN purH TRUE 0.848 104.000 0.225 1.000 Y NA
 10370718 10370719 BMD_0281 BMD_0282 purH purD TRUE 0.971 14.000 0.238 1.000 Y NA
 10370721 10370722 BMD_0284 BMD_0285     FALSE 0.243 148.000 0.025 1.000   NA
 10370724 10370725 BMD_0287 BMD_0288   pcrA TRUE 0.705 29.000 0.049 1.000   NA
 10370725 10370726 BMD_0288 BMD_0289 pcrA ligA TRUE 0.971 21.000 0.103 0.011 Y NA
 10370726 10370727 BMD_0289 BMD_0290 ligA   FALSE 0.536 14.000 0.005 NA   NA
 10370729 10370730 BMD_0292 BMD_0293 gatC gatA TRUE 0.991 17.000 0.643 0.002 Y NA
 10370730 10370731 BMD_0293 BMD_0294 gatA gatB TRUE 0.991 15.000 0.492 0.002 Y NA
 10370731 10370732 BMD_0294 BMD_0295 gatB   FALSE 0.252 235.000 0.034 1.000 N NA
 10370732 10370733 BMD_0295 BMD_0296   rumA TRUE 0.783 96.000 0.299 1.000 N NA
 10370733 10370734 BMD_0296 BMD_0297 rumA   FALSE 0.156 193.000 0.000 1.000 N NA
 10370734 10370735 BMD_0297 BMD_0298     FALSE 0.015 81.000 0.000 NA   NA
 10370735 10370736 BMD_0298 BMD_0299     FALSE 0.004 217.000 0.000 NA   NA
 10370736 10370737 BMD_0299 BMD_0300     FALSE 0.005 196.000 0.000 NA   NA
 10370737 10370738 BMD_0300 BMD_0301     FALSE 0.056 14.000 0.000 NA   NA
 10370738 10370739 BMD_0301 BMD_0302   med FALSE 0.037 173.000 0.000 1.000   NA
 10370739 10370740 BMD_0302 BMD_0303 med kin TRUE 0.827 24.000 0.115 1.000   NA
 10370742 10370743 BMD_0305 BMD_0306     FALSE 0.003 253.000 0.000 NA   NA
 10370743 10370744 BMD_0306 BMD_0307     FALSE 0.108 64.000 0.000 1.000   NA
 10370744 10370745 BMD_0307 BMD_0308     FALSE 0.368 68.000 0.000 1.000 N NA
 10370747 10370748 BMD_0310 BMD_0311   glnQ FALSE 0.004 467.000 0.000 1.000   NA
 10370748 10370749 BMD_0311 BMD_0312 glnQ glnH TRUE 0.975 22.000 0.389 1.000 Y NA
 10370749 10370750 BMD_0312 BMD_0313 glnH glnM TRUE 0.942 78.000 0.280 0.052 Y NA
 10370750 10370751 BMD_0313 BMD_0314 glnM glnP TRUE 0.993 15.000 0.947 0.008 Y NA
 10370751 10370752 BMD_0314 BMD_0315 glnP   FALSE 0.473 224.000 0.000 0.082 Y NA
 10370752 10370753 BMD_0315 BMD_0316     FALSE 0.007 129.000 0.000 NA   NA
 10370754 10370755 BMD_0317 BMD_0318     FALSE 0.309 134.000 0.000 0.004   NA
 10370755 10370756 BMD_0318 BMD_0319   ykoH TRUE 0.842 73.000 0.533 1.000   NA
 10370756 10370757 BMD_0319 BMD_0320 ykoH ykoG TRUE 0.970 4.000 0.100 1.000 Y NA
 10370757 10370758 BMD_0320 BMD_0321 ykoG   TRUE 0.645 82.000 0.000 1.000 Y NA
 10370758 10370759 BMD_0321 BMD_0322     TRUE 0.996 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 10370760 10370761 BMD_0323 BMD_0324     FALSE 0.029 36.000 0.000 NA   NA
 10370761 10370762 BMD_0324 BMD_0325     TRUE 0.978 2.000 1.000 NA   NA
 10370762 10370763 BMD_0325 BMD_0326     FALSE 0.040 146.000 0.000 1.000   NA
 10370763 10370764 BMD_0326 BMD_0327   ohrA FALSE 0.040 153.000 0.000 1.000   NA
 10370764 10370765 BMD_0327 BMD_0328 ohrA   FALSE 0.025 422.000 0.000 1.000 N NA
 10370765 10370766 BMD_0328 BMD_0329     FALSE 0.109 230.000 0.000 1.000 N NA
 10370776 10370777 BMD_0339 BMD_0340 corA malK FALSE 0.178 155.000 0.000 1.000 N NA
 10370777 10370778 BMD_0340 BMD_0341 malK malR TRUE 0.997 -7.000 0.857 1.000 Y NA
 10370778 10370779 BMD_0341 BMD_0342 malR   FALSE 0.040 141.000 0.000 1.000   NA
 10370779 10370780 BMD_0342 BMD_0343     TRUE 0.991 -13.000 1.000 NA   NA
 10370780 10370781 BMD_0343 BMD_0344   kinC FALSE 0.015 81.000 0.000 NA   NA
 10370781 10370782 BMD_0344 BMD_0345 kinC   FALSE 0.036 366.000 0.000 1.000 N NA
 10370782 10370783 BMD_0345 BMD_0346     FALSE 0.003 251.000 0.000 NA   NA
 10370783 10370784 BMD_0346 BMD_0347     FALSE 0.009 110.000 0.000 NA   NA
 10370784 10370785 BMD_0347 BMD_0348     FALSE 0.019 62.000 0.000 NA   NA
 10370785 10370786 BMD_0348 BMD_0349     FALSE 0.001 372.000 0.000 NA   NA
 10370786 10370787 BMD_0349 BMD_0350     FALSE 0.579 94.000 0.211 NA   NA
 10370787 10370788 BMD_0350 BMD_0351     TRUE 0.952 15.000 0.833 NA   NA
 10370788 10370789 BMD_0351 BMD_0352     TRUE 0.948 13.000 0.623 NA   NA
 10370789 10370790 BMD_0352 BMD_0353     TRUE 0.935 -3.000 0.151 NA   NA
 10370790 10370791 BMD_0353 BMD_0354     TRUE 0.980 -22.000 0.286 NA   NA
 10370793 10370794 BMD_0356 BMD_0357     FALSE 0.058 107.000 0.000 1.000   NA
 10370796 10370797 BMD_0359 BMD_0360     FALSE 0.006 164.000 0.000 NA   NA
 10370799 10370800 BMD_0362 BMD_0363   nos FALSE 0.573 100.000 0.000 1.000 Y NA
 10370801 10370802 BMD_0364 BMD_0365   nsrR FALSE 0.012 90.000 0.000 NA   NA
 10370803 10370804 BMD_0366 BMD_0367 hmp   FALSE 0.203 73.000 0.000 NA N NA
 10370804 10370805 BMD_0367 BMD_0368     FALSE 0.224 144.000 0.059 NA   NA
 10370805 10370806 BMD_0368 BMD_0369     FALSE 0.001 360.000 0.000 NA   NA
 10370807 10370808 BMD_0370 BMD_0371 ade   FALSE 0.001 368.000 0.000 NA   NA
 10370809 10370810 BMD_0372 BMD_0373     FALSE 0.363 40.000 0.008 NA   NA
 10370810 10370811 BMD_0373 BMD_0374   yihY TRUE 0.838 15.000 0.159 NA   NA
 10370812 10370813 BMD_0375 BMD_0376 cadA   FALSE 0.004 225.000 0.000 NA   NA
 10370814 10370815 BMD_0377 BMD_0378     TRUE 0.906 16.000 0.139 1.000 N NA
 10370817 10370818 BMD_0380 BMD_0381 padC   FALSE 0.159 190.000 0.000 1.000 N NA
 10370820 10370821 BMD_0383 BMD_0384 cax   FALSE 0.409 179.000 0.212 NA   NA
 10370823 10370824 BMD_0386 BMD_0387     FALSE 0.264 164.000 0.093 NA   NA
 10370824 10370825 BMD_0387 BMD_0388   pdaA TRUE 0.720 95.000 0.185 1.000 N NA
 10370825 10370826 BMD_0388 BMD_0389 pdaA rumA FALSE 0.360 163.000 0.025 1.000 N NA
 10370826 10370827 BMD_0389 BMD_0390 rumA   FALSE 0.003 251.000 0.000 NA   NA
 10370827 10370828 BMD_0390 BMD_0391     FALSE 0.001 439.000 0.000 NA   NA
 10370828 10370829 BMD_0391 BMD_0392   kin FALSE 0.046 333.000 0.000 1.000 N NA
 10370830 10370831 BMD_0393 BMD_0394     TRUE 0.716 103.000 0.500 NA   NA
 10370831 10370832 BMD_0394 BMD_0395     FALSE 0.041 256.000 0.000 NA N NA
 10370832 10370833 BMD_0395 BMD_0396     TRUE 0.746 62.000 0.200 1.000   NA
 10370842 10370843 BMD_0405 BMD_0406   sspE FALSE 0.416 98.000 0.051 1.000   NA
 10370843 10370844 BMD_0406 BMD_0407 sspE   FALSE 0.006 190.000 0.000 NA   NA
 10370844 10370845 BMD_0407 BMD_0408     FALSE 0.188 196.000 0.058 NA   NA
 10370845 10370846 BMD_0408 BMD_0409   ygaD FALSE 0.369 170.000 0.077 NA N NA
 10370847 10370848 BMD_0410 BMD_0411   gsaB FALSE 0.028 550.000 0.102 NA   NA
 10370849 10370850 BMD_0412 BMD_0413 drrA   TRUE 0.982 -7.000 0.488 NA   NA
 10370850 10370851 BMD_0413 BMD_0414     TRUE 0.957 4.000 0.500 NA   NA
 10370851 10370852 BMD_0414 BMD_0415     FALSE 0.552 94.000 0.188 NA   NA
 10370852 10370853 BMD_0415 BMD_0416     FALSE 0.286 70.000 0.015 NA   NA
 10370853 10370854 BMD_0416 BMD_0417   perR FALSE 0.177 255.000 0.005 1.000 N NA
 10370856 10370857 BMD_0419 BMD_0420     FALSE 0.001 351.000 0.000 NA   NA
 10370857 10370858 BMD_0420 BMD_0421     FALSE 0.003 233.000 0.000 NA   NA
 10370858 10370859 BMD_0421 BMD_0422     FALSE 0.009 111.000 0.000 NA   NA
 10370859 10370860 BMD_0422 BMD_0423     FALSE 0.069 9.000 0.000 NA   NA
 10370860 10370861 BMD_0423 BMD_0424     FALSE 0.084 4.000 0.000 NA   NA
 10370861 10370862 BMD_0424 BMD_0425     FALSE 0.046 22.000 0.000 NA   NA
 10370862 10370863 BMD_0425 BMD_0426     FALSE 0.044 24.000 0.000 NA   NA
 10370863 10370864 BMD_0426 BMD_0427     FALSE 0.063 12.000 0.000 NA   NA
 10370864 10370865 BMD_0427 BMD_0428     FALSE 0.084 4.000 0.000 NA   NA
 10370865 10370866 BMD_0428 BMD_0429     FALSE 0.049 16.000 0.000 NA   NA
 10370866 10370867 BMD_0429 BMD_0430     FALSE 0.041 26.000 0.000 NA   NA
 10370867 10370868 BMD_0430 BMD_0431     FALSE 0.066 11.000 0.000 NA   NA
 10370868 10370869 BMD_0431 BMD_0432     FALSE 0.074 6.000 0.000 NA   NA
 10370869 10370870 BMD_0432 BMD_0433     FALSE 0.034 31.000 0.000 NA   NA
 10370870 10370871 BMD_0433 BMD_0434     FALSE 0.036 29.000 0.000 NA   NA
 10370871 10370872 BMD_0434 BMD_0435     FALSE 0.074 6.000 0.000 NA   NA
 10370872 10370873 BMD_0435 BMD_0436     FALSE 0.031 33.000 0.000 NA   NA
 10370873 10370874 BMD_0436 BMD_0437     FALSE 0.052 15.000 0.000 NA   NA
 10370874 10370875 BMD_0437 BMD_0438     FALSE 0.034 31.000 0.000 NA   NA
 10370875 10370876 BMD_0438 BMD_0439     FALSE 0.016 73.000 0.000 NA   NA
 10370878 10370879 BMD_0441 BMD_0442     FALSE 0.616 73.000 0.174 NA   NA
 10370879 10370880 BMD_0442 BMD_0443     FALSE 0.480 80.000 0.097 NA   NA
 10370880 10370881 BMD_0443 BMD_0444     FALSE 0.010 459.000 0.000 NA N NA
 10370881 10370882 BMD_0444 BMD_0445   yhbH FALSE 0.321 325.000 0.683 NA   NA
 10370882 10370883 BMD_0445 BMD_0446 yhbH   FALSE 0.010 105.000 0.000 NA   NA
 10370883 10370884 BMD_0446 BMD_0447     FALSE 0.027 40.000 0.000 NA   NA
 10370884 10370885 BMD_0447 BMD_0448     FALSE 0.013 88.000 0.000 NA   NA
 10370885 10370886 BMD_0448 BMD_0449     FALSE 0.056 227.000 0.000 NA N NA
 10370887 10370888 BMD_0450 BMD_0451 thiC   FALSE 0.002 310.000 0.000 NA   NA
 10370889 10370890 BMD_0452 BMD_0453 uppP   FALSE 0.016 520.000 0.000 1.000 N NA
 10370890 10370891 BMD_0453 BMD_0454   ytvI FALSE 0.004 214.000 0.000 NA   NA
 10370891 10370892 BMD_0454 BMD_0455 ytvI   FALSE 0.006 161.000 0.000 NA   NA
 10370892 10370893 BMD_0455 BMD_0456     FALSE 0.043 25.000 0.000 NA   NA
 10370895 10370896 BMD_0458 BMD_0459     FALSE 0.046 20.000 0.000 NA   NA
 10370896 10370897 BMD_0459 BMD_0460   bioB FALSE 0.181 148.000 0.000 1.000 N NA
 10370897 10370898 BMD_0460 BMD_0461 bioB glpP FALSE 0.094 243.000 0.000 1.000 N NA
 10370898 10370899 BMD_0461 BMD_0462 glpP   FALSE 0.623 21.000 0.000 1.000 N NA
 10370899 10370900 BMD_0462 BMD_0463     TRUE 0.995 -3.000 0.391 0.039 Y NA
 10370900 10370901 BMD_0463 BMD_0464     TRUE 0.997 -3.000 0.848 0.039 Y NA
 10370901 10370902 BMD_0464 BMD_0465     TRUE 0.991 14.000 0.708 0.039 Y NA
 10370902 10370903 BMD_0465 BMD_0466     TRUE 0.676 87.000 0.104 1.000 N NA
 10370903 10370904 BMD_0466 BMD_0467     FALSE 0.001 504.000 0.000 NA   NA
 10370904 10370905 BMD_0467 BMD_0468     TRUE 0.647 94.000 0.292 NA   NA
 10370905 10370906 BMD_0468 BMD_0469     FALSE 0.541 61.000 0.092 NA   NA
 10370906 10370907 BMD_0469 BMD_0470     TRUE 0.917 33.000 0.147 NA Y NA
 10370907 10370908 BMD_0470 BMD_0471     FALSE 0.001 387.000 0.000 NA   NA
 10370908 10370909 BMD_0471 BMD_0472     FALSE 0.003 233.000 0.000 NA   NA
 10370909 10370910 BMD_0472 BMD_0473     FALSE 0.018 65.000 0.000 NA   NA
 10370910 10370911 BMD_0473 BMD_0474     FALSE 0.066 11.000 0.000 NA   NA
 10370911 10370912 BMD_0474 BMD_0475     FALSE 0.006 140.000 0.000 NA   NA
 10370912 10370913 BMD_0475 BMD_0476     FALSE 0.001 346.000 0.000 NA   NA
 10370913 10370914 BMD_0476 BMD_0477   phaZ1 FALSE 0.019 249.000 0.000 1.000   NA
 10370914 10370915 BMD_0477 BMD_0478 phaZ1 yocH FALSE 0.014 279.000 0.000 1.000   NA
 10370915 10370916 BMD_0478 BMD_0479 yocH   FALSE 0.029 209.000 0.000 1.000   NA
 10370916 10370917 BMD_0479 BMD_0480     FALSE 0.004 230.000 0.000 NA   NA
 10370918 10370919 BMD_0481 BMD_0482     FALSE 0.006 161.000 0.000 NA   NA
 10370920 10370921 BMD_0483 BMD_0484   cls FALSE 0.024 478.000 0.000 0.095   NA
 10370921 10370922 BMD_0484 BMD_0485 cls   FALSE 0.006 175.000 0.000 NA   NA
 10370922 10370923 BMD_0485 BMD_0486     FALSE 0.015 76.000 0.000 NA   NA
 10370925 10370926 BMD_0488 BMD_0489     FALSE 0.007 138.000 0.000 NA   NA
 10370928 10370929 BMD_0491 BMD_0492 iolG iolC FALSE 0.088 80.000 0.000 1.000   NA
 10370929 10370930 BMD_0492 BMD_0493 iolC mmsA FALSE 0.312 86.000 0.000 1.000 N NA
 10370930 10370931 BMD_0493 BMD_0494 mmsA iolD FALSE 0.230 113.000 0.000 1.000 N NA
 10370931 10370932 BMD_0494 BMD_0495 iolD   FALSE 0.316 85.000 0.000 1.000 N NA
 10370932 10370933 BMD_0495 BMD_0496     FALSE 0.403 61.000 0.000 1.000 N NA
 10370933 10370934 BMD_0496 BMD_0497   iolB FALSE 0.184 135.000 0.000 1.000 N NA
 10370937 10370938 BMD_0500 BMD_0501     FALSE 0.001 384.000 0.000 NA   NA
 10370939 10370940 BMD_0502 BMD_0503     FALSE 0.001 435.000 0.000 NA   NA
 10370940 10370941 BMD_0503 BMD_0504     FALSE 0.018 65.000 0.000 NA   NA
 10370942 10370943 BMD_0505 BMD_0506     TRUE 0.964 22.000 0.667 1.000 N NA
 10370946 10370947 BMD_0509 BMD_0510     FALSE 0.037 167.000 0.000 1.000   NA
 10370947 10370948 BMD_0510 BMD_0511   ftsZ FALSE 0.007 360.000 0.000 1.000   NA
 10370948 10370949 BMD_0511 BMD_0512 ftsZ   FALSE 0.045 337.000 0.000 1.000 N NA
 10370949 10370950 BMD_0512 BMD_0513     FALSE 0.095 72.000 0.000 1.000   NA
 10370951 10370952 BMD_0514 BMD_0515     FALSE 0.006 142.000 0.000 NA   NA
 10370960 10370961 BMD_0523 BMD_0524 lctP ldh TRUE 0.679 69.000 0.000 1.000 Y NA
 10370962 10370963 BMD_0525 BMD_0526     FALSE 0.181 142.000 0.000 1.000 N NA
 10370965 10370966 BMD_0528 BMD_0529     FALSE 0.001 403.000 0.000 NA   NA
 10370966 10370967 BMD_0529 BMD_0530     FALSE 0.001 369.000 0.000 NA   NA
 10370967 10370968 BMD_0530 BMD_0531     FALSE 0.002 317.000 0.000 NA   NA
 10370968 10370969 BMD_0531 BMD_0532   glpP FALSE 0.272 114.000 0.014 1.000   NA
 10370969 10370970 BMD_0532 BMD_0533 glpP glpF FALSE 0.450 178.000 0.083 1.000 N NA
 10370970 10370971 BMD_0533 BMD_0534 glpF glpK TRUE 0.672 68.000 0.057 1.000 N NA
 10370971 10370972 BMD_0534 BMD_0535 glpK glpD TRUE 0.744 188.000 0.010 0.001 Y NA
 10370972 10370973 BMD_0535 BMD_0536 glpD pgcA FALSE 0.404 165.000 0.049 1.000 N NA
 10370974 10370975 BMD_0537 BMD_0538 bioY   FALSE 0.005 211.000 0.000 NA   NA
 10370975 10370976 BMD_0538 BMD_0539     FALSE 0.009 114.000 0.000 NA   NA
 10370977 10370978 BMD_0540 BMD_0541 spoVR   FALSE 0.008 123.000 0.000 NA   NA
 10370978 10370979 BMD_0541 BMD_0542     FALSE 0.017 67.000 0.000 NA   NA
 10370982 10370983 BMD_0545 BMD_0546 tcyC tcyB TRUE 0.970 31.000 0.481 1.000 Y NA
 10370983 10370984 BMD_0546 BMD_0547 tcyB tcyA TRUE 0.998 -25.000 0.594 0.039 Y NA
 10370985 10370986 BMD_0548 BMD_0549 crcB crcB TRUE 0.976 1.000 0.160 NA Y NA
 10370986 10370987 BMD_0549 BMD_0550 crcB   FALSE 0.024 48.000 0.000 NA   NA
 10370987 10370988 BMD_0550 BMD_0551     FALSE 0.001 386.000 0.000 NA   NA
 10370988 10370989 BMD_0551 BMD_0552   thiO TRUE 0.985 -16.000 0.194 1.000 N NA
 10370989 10370990 BMD_0552 BMD_0553 thiO thiS TRUE 0.977 -3.000 0.239 1.000 N NA
 10370990 10370991 BMD_0553 BMD_0554 thiS thiG TRUE 0.958 6.000 0.054 1.000 Y NA
 10370991 10370992 BMD_0554 BMD_0555 thiG thiF TRUE 0.972 -3.000 0.009 1.000 Y NA
 10370992 10370993 BMD_0555 BMD_0556 thiF thiD TRUE 0.857 23.000 0.000 1.000 Y NA
 10371000 10371001 BMD_0563 BMD_0564 msmX yxkF FALSE 0.527 140.000 0.321 NA   NA
 10371001 10371002 BMD_0564 BMD_0565 yxkF   TRUE 0.644 30.000 0.071 NA   NA
 10371002 10371003 BMD_0565 BMD_0566     FALSE 0.017 67.000 0.000 NA   NA
 10371003 10371004 BMD_0566 BMD_0567     TRUE 0.892 -3.000 0.000 0.038   NA
 10371004 10371005 BMD_0567 BMD_0568     TRUE 0.962 5.000 0.208 0.038   NA
 10371005 10371006 BMD_0568 BMD_0569     TRUE 0.980 -45.000 0.167 1.000   NA
 10371007 10371008 BMD_0570 BMD_0571     FALSE 0.165 181.000 0.036 NA   NA
 10371008 10371009 BMD_0571 BMD_0572     FALSE 0.006 151.000 0.000 NA   NA
 10371009 10371010 BMD_0572 BMD_0573     FALSE 0.007 131.000 0.000 NA   NA
 10371010 10371011 BMD_0573 BMD_0574     FALSE 0.419 116.000 0.000 0.095 N NA
 10371011 10371012 BMD_0574 BMD_0575     TRUE 0.947 6.000 0.000 0.095 Y NA
 10371012 10371013 BMD_0575 BMD_0576     FALSE 0.230 113.000 0.000 1.000 N NA
 10371015 10371016 BMD_0578 BMD_0579 natA natB TRUE 0.978 -7.000 0.382 NA   NA
 10371016 10371017 BMD_0579 BMD_0580 natB   FALSE 0.015 493.000 0.024 NA   NA
 10371017 10371018 BMD_0580 BMD_0581     FALSE 0.502 66.000 0.087 NA   NA
 10371019 10371020 BMD_0582 BMD_0583 prsA   FALSE 0.000 565.000 0.000 NA   NA
 10371022 10371023 BMD_0585 BMD_0586 hpr   FALSE 0.009 114.000 0.000 NA   NA
 10371023 10371024 BMD_0586 BMD_0587     FALSE 0.000 550.000 0.000 NA   NA
 10371024 10371025 BMD_0587 BMD_0588   serC FALSE 0.128 188.000 0.020 NA   NA
 10371026 10371027 BMD_0589 BMD_0590     FALSE 0.046 18.000 0.000 NA   NA
 10371027 10371028 BMD_0590 BMD_0591     FALSE 0.011 304.000 0.000 1.000   NA
 10371030 10371031 BMD_0593 BMD_0594 ecsA ecsB TRUE 0.980 -7.000 0.271 NA N NA
 10371032 10371033 BMD_0595 BMD_0596 ecsC   FALSE 0.397 114.000 0.125 NA   NA
 10371035 10371036 BMD_0598 BMD_0599     FALSE 0.436 84.000 0.083 NA   NA
 10371037 10371038 BMD_0600 BMD_0601   hemE FALSE 0.314 197.000 0.020 1.000 N NA
 10371038 10371039 BMD_0601 BMD_0602 hemE hemH TRUE 0.818 98.000 0.131 1.000 Y NA
 10371039 10371040 BMD_0602 BMD_0603 hemH hemG TRUE 0.668 138.000 0.069 1.000 Y NA
 10371040 10371041 BMD_0603 BMD_0604 hemG   FALSE 0.170 163.000 0.000 1.000 N NA
 10371043 10371044 BMD_0606 BMD_0607   yesM FALSE 0.181 150.000 0.000 1.000 N NA
 10371044 10371045 BMD_0607 BMD_0608 yesM yesN TRUE 0.988 -22.000 0.000 0.024 Y NA
 10371047 10371048 BMD_0610 BMD_0611     TRUE 0.886 16.000 0.200 1.000   NA
 10371048 10371049 BMD_0611 BMD_0612   lcfA FALSE 0.365 170.000 0.000 0.037 N NA
 10371049 10371050 BMD_0612 BMD_0613 lcfA   TRUE 0.871 36.000 0.000 0.094 Y NA
 10371050 10371051 BMD_0613 BMD_0614     FALSE 0.001 427.000 0.000 NA   NA
 10371051 10371052 BMD_0614 BMD_0615     FALSE 0.003 233.000 0.000 NA   NA
 10371052 10371053 BMD_0615 BMD_0616     FALSE 0.023 50.000 0.000 NA   NA
 10371053 10371054 BMD_0616 BMD_0617     FALSE 0.010 104.000 0.000 NA   NA
 10371054 10371055 BMD_0617 BMD_0618     FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10371055 10371056 BMD_0618 BMD_0619     FALSE 0.069 9.000 0.000 NA   NA
 10371056 10371057 BMD_0619 BMD_0620     FALSE 0.070 8.000 0.000 NA   NA
 10371057 10371058 BMD_0620 BMD_0621     FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10371058 10371059 BMD_0621 BMD_0622     FALSE 0.068 10.000 0.000 NA   NA
 10371059 10371060 BMD_0622 BMD_0623     FALSE 0.072 7.000 0.000 NA   NA
 10371060 10371061 BMD_0623 BMD_0624     FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10371061 10371062 BMD_0624 BMD_0625     FALSE 0.074 6.000 0.000 NA   NA
 10371062 10371063 BMD_0625 BMD_0626     FALSE 0.034 31.000 0.000 NA   NA
 10371063 10371064 BMD_0626 BMD_0627     FALSE 0.038 28.000 0.000 NA   NA
 10371064 10371065 BMD_0627 BMD_0628     FALSE 0.041 26.000 0.000 NA   NA
 10371065 10371066 BMD_0628 BMD_0629     FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10371066 10371067 BMD_0629 BMD_0630     FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10371067 10371068 BMD_0630 BMD_0631     FALSE 0.066 11.000 0.000 NA   NA
 10371068 10371069 BMD_0631 BMD_0632     FALSE 0.063 12.000 0.000 NA   NA
 10371069 10371070 BMD_0632 BMD_0633     FALSE 0.072 7.000 0.000 NA   NA
 10371070 10371071 BMD_0633 BMD_0634     FALSE 0.084 4.000 0.000 NA   NA
 10371071 10371072 BMD_0634 BMD_0635     FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10371072 10371073 BMD_0635 BMD_0636     FALSE 0.005 210.000 0.000 NA   NA
 10371073 10371074 BMD_0636 BMD_0637   aceA FALSE 0.028 393.000 0.000 1.000 N NA
 10371076 10371077 BMD_0639 BMD_0640     FALSE 0.156 163.000 0.029 NA   NA
 10371077 10371078 BMD_0640 BMD_0641   fabG FALSE 0.000 581.000 0.000 NA   NA
 10371078 10371079 BMD_0641 BMD_0642 fabG addB FALSE 0.079 264.000 0.000 1.000 N NA
 10371079 10371080 BMD_0642 BMD_0643 addB addA TRUE 0.997 -7.000 0.408 0.002 Y NA
 10371080 10371081 BMD_0643 BMD_0644 addA sbcD TRUE 0.857 54.000 0.041 1.000 Y NA
 10371081 10371082 BMD_0644 BMD_0645 sbcD sbcC TRUE 0.993 -3.000 0.669 NA Y NA
 10371082 10371083 BMD_0645 BMD_0646 sbcC   FALSE 0.052 15.000 0.000 NA   NA
 10371084 10371085 BMD_0647 BMD_0648 gerPF gerPE FALSE 0.020 60.000 0.000 NA   NA
 10371085 10371086 BMD_0648 BMD_0649 gerPE gerPD TRUE 0.898 13.000 0.259 NA   NA
 10371086 10371087 BMD_0649 BMD_0650 gerPD gerPC TRUE 0.959 -3.000 0.269 NA   NA
 10371087 10371088 BMD_0650 BMD_0651 gerPC gerPB TRUE 0.808 90.000 0.769 NA   NA
 10371088 10371089 BMD_0651 BMD_0652 gerPB gerPA TRUE 0.945 25.000 0.889 NA   NA
 10371090 10371091 BMD_0653 BMD_0654     FALSE 0.411 79.000 0.062 NA   NA
 10371093 10371094 BMD_0656 BMD_0657 asnO crtI FALSE 0.151 317.000 0.045 1.000 N NA
 10371094 10371095 BMD_0657 BMD_0658 crtI crtI TRUE 0.993 -3.000 0.229 0.045 Y NA
 10371095 10371096 BMD_0658 BMD_0659 crtI   TRUE 0.929 59.000 0.800 1.000 N NA
 10371096 10371097 BMD_0659 BMD_0660     FALSE 0.024 428.000 0.000 1.000 N NA
 10371097 10371098 BMD_0660 BMD_0661     FALSE 0.344 77.000 0.000 1.000 N NA
 10371098 10371099 BMD_0661 BMD_0662   rocA FALSE 0.036 368.000 0.000 1.000 N NA
 10371099 10371100 BMD_0662 BMD_0663 rocA rocD FALSE 0.612 24.000 0.000 1.000 N NA
 10371100 10371101 BMD_0663 BMD_0664 rocD rocB FALSE 0.557 104.000 0.000 1.000 Y NA
 10371101 10371102 BMD_0664 BMD_0665 rocB rocC TRUE 0.965 24.000 0.250 1.000 Y NA
 10371103 10371104 BMD_0666 BMD_0667 rocR   FALSE 0.060 105.000 0.000 1.000   NA
 10371104 10371105 BMD_0667 BMD_0668     FALSE 0.006 140.000 0.000 NA   NA
 10371107 10371108 BMD_0670 BMD_0671     TRUE 0.683 53.000 0.161 NA   NA
 10371110 10371111 BMD_0673 BMD_0674     FALSE 0.084 4.000 0.000 NA   NA
 10371111 10371112 BMD_0674 BMD_0675     FALSE 0.008 122.000 0.000 NA   NA
 10371115 10371116 BMD_0678 BMD_0679 argC argJ TRUE 0.972 47.000 0.303 0.002 Y NA
 10371116 10371117 BMD_0679 BMD_0680 argJ argB TRUE 0.976 13.000 0.067 0.002 Y NA
 10371117 10371118 BMD_0680 BMD_0681 argB argD TRUE 0.996 -34.000 0.322 1.000 Y NA
 10371118 10371119 BMD_0681 BMD_0682 argD carA TRUE 0.915 71.000 0.286 1.000 Y NA
 10371119 10371120 BMD_0682 BMD_0683 carA carB TRUE 0.998 -7.000 0.714 0.001 Y NA
 10371120 10371121 BMD_0683 BMD_0684 carB argF TRUE 0.975 -3.000 0.027 1.000 Y NA
 10371121 10371122 BMD_0684 BMD_0685 argF   FALSE 0.254 104.000 0.000 1.000 N NA
 10371122 10371123 BMD_0685 BMD_0686     FALSE 0.007 130.000 0.000 NA   NA
 10371123 10371124 BMD_0686 BMD_0687   clpB FALSE 0.153 115.000 0.009 NA   NA
 10371126 10371127 BMD_0689 BMD_0690 galK galT TRUE 0.983 33.000 0.429 0.001 Y NA
 10371128 10371129 BMD_0691 BMD_0692     FALSE 0.005 203.000 0.000 NA   NA
 10371130 10371131 BMD_0693 BMD_0694     FALSE 0.006 182.000 0.000 NA   NA
 10371131 10371132 BMD_0694 BMD_0695     FALSE 0.420 78.000 0.065 NA   NA
 10371132 10371133 BMD_0695 BMD_0696   fabH FALSE 0.001 486.000 0.000 NA   NA
 10371133 10371134 BMD_0696 BMD_0697 fabH fabF TRUE 0.952 40.000 0.076 0.001 Y NA
 10371134 10371135 BMD_0697 BMD_0698 fabF   FALSE 0.415 106.000 0.039 NA N NA
 10371135 10371136 BMD_0698 BMD_0699   appD FALSE 0.056 227.000 0.000 NA N NA
 10371136 10371137 BMD_0699 BMD_0700 appD appF TRUE 0.995 0.000 0.333 0.002 Y NA
 10371137 10371138 BMD_0700 BMD_0701 appF appA TRUE 0.965 44.000 0.600 1.000 Y NA
 10371138 10371139 BMD_0701 BMD_0702 appA appB TRUE 0.953 29.000 0.068 0.038 Y NA
 10371139 10371140 BMD_0702 BMD_0703 appB appC TRUE 0.981 12.000 0.159 0.038 Y NA
 10371140 10371141 BMD_0703 BMD_0704 appC   FALSE 0.002 301.000 0.000 NA   NA
 10371143 10371144 BMD_0706 BMD_0707 oppA oppB TRUE 0.929 98.000 0.318 0.038 Y NA
 10371144 10371145 BMD_0707 BMD_0708 oppB oppC TRUE 0.994 3.000 0.545 0.038 Y NA
 10371145 10371146 BMD_0708 BMD_0709 oppC oppD FALSE 0.052 15.000 0.000 NA   NA
 10371146 10371147 BMD_0709 BMD_0710 oppD oppF FALSE 0.182 -7.000 0.000 NA   NA
 10371149 10371150 BMD_0712 BMD_0713   arcD FALSE 0.156 433.000 0.000 0.013 Y NA
 10371150 10371151 BMD_0713 BMD_0714 arcD spxA FALSE 0.025 419.000 0.000 1.000 N NA
 10371151 10371152 BMD_0714 BMD_0715 spxA   FALSE 0.143 202.000 0.000 1.000 N NA
 10371152 10371153 BMD_0715 BMD_0716   madL FALSE 0.005 196.000 0.000 NA   NA
 10371153 10371154 BMD_0716 BMD_0717 madL madM TRUE 0.985 -3.000 0.945 NA   NA
 10371156 10371157 BMD_0719 BMD_0720 mecA cls FALSE 0.526 215.000 0.314 NA N NA
 10371157 10371158 BMD_0720 BMD_0721 cls coiA FALSE 0.456 120.000 0.189 NA   NA
 10371158 10371159 BMD_0721 BMD_0722 coiA pepF FALSE 0.549 164.000 0.398 NA   NA
 10371160 10371161 BMD_0723 BMD_0724     FALSE 0.002 295.000 0.000 NA   NA
 10371161 10371162 BMD_0724 BMD_0725     TRUE 0.825 27.000 0.138 1.000   NA
 10371162 10371163 BMD_0725 BMD_0726     FALSE 0.055 287.000 0.024 NA   NA
 10371163 10371164 BMD_0726 BMD_0727     TRUE 0.899 5.000 0.188 NA   NA
 10371165 10371166 BMD_0728 BMD_0729     TRUE 0.856 28.000 0.283 NA   NA
 10371166 10371167 BMD_0729 BMD_0730     TRUE 0.904 53.000 0.725 1.000   NA
 10371167 10371168 BMD_0730 BMD_0731     TRUE 0.961 15.000 0.480 1.000 N NA
 10371170 10371171 BMD_0733 BMD_0734 mgtE   TRUE 0.679 160.000 0.094 1.000 Y NA
 10371171 10371172 BMD_0734 BMD_0735     FALSE 0.000 523.000 0.000 NA   NA
 10371172 10371173 BMD_0735 BMD_0736     FALSE 0.015 78.000 0.000 NA   NA
 10371174 10371175 BMD_0737 BMD_0738     FALSE 0.007 139.000 0.000 NA   NA
 10371176 10371177 BMD_0739 BMD_0740     FALSE 0.000 567.000 0.000 NA   NA
 10371177 10371178 BMD_0740 BMD_0741     FALSE 0.007 134.000 0.000 NA   NA
 10371179 10371180 BMD_0742 BMD_0743     FALSE 0.020 472.000 0.000 1.000 N NA
 10371182 10371183 BMD_0745 BMD_0746     FALSE 0.410 90.000 0.083 NA   NA
 10371183 10371184 BMD_0746 BMD_0747     TRUE 0.927 6.000 0.213 1.000   NA
 10371184 10371185 BMD_0747 BMD_0748     TRUE 0.773 83.000 0.287 NA N NA
 10371185 10371186 BMD_0748 BMD_0749     FALSE 0.001 477.000 0.000 NA   NA
 10371188 10371189 BMD_0751 BMD_0752     FALSE 0.037 170.000 0.000 1.000   NA
 10371190 10371191 BMD_0753 BMD_0754 gnd gntK TRUE 0.937 26.000 0.095 1.000 Y NA
 10371191 10371192 BMD_0754 BMD_0755 gntK ncs1 FALSE 0.070 279.000 0.000 1.000 N NA
 10371192 10371193 BMD_0755 BMD_0756 ncs1   FALSE 0.075 271.000 0.000 1.000 N NA
 10371193 10371194 BMD_0756 BMD_0757     FALSE 0.006 154.000 0.000 NA   NA
 10371197 10371198 BMD_0760 BMD_0761     TRUE 0.859 21.000 0.000 1.000 Y NA
 10371199 10371200 BMD_0762 BMD_0763   dbpA FALSE 0.006 169.000 0.000 NA   NA
 10371200 10371201 BMD_0763 BMD_0764 dbpA cutC FALSE 0.381 65.000 0.000 1.000 N NA
 10371203 10371204 BMD_0766 BMD_0767     FALSE 0.002 306.000 0.000 NA   NA
 10371204 10371205 BMD_0767 BMD_0768     TRUE 0.945 5.000 0.289 1.000   NA
 10371205 10371206 BMD_0768 BMD_0769   licR FALSE 0.300 300.000 0.000 0.096 Y NA
 10371206 10371207 BMD_0769 BMD_0770 licR licB TRUE 0.675 160.000 0.106 0.008 N NA
 10371207 10371208 BMD_0770 BMD_0771 licB licC TRUE 0.942 14.000 0.000 0.008 Y NA
 10371208 10371209 BMD_0771 BMD_0772 licC licA TRUE 0.942 14.000 0.000 0.008 Y NA
 10371209 10371210 BMD_0772 BMD_0773 licA licH TRUE 0.983 -3.000 0.100 1.000 Y NA
 10371210 10371211 BMD_0773 BMD_0774 licH lytS FALSE 0.208 122.000 0.000 1.000 N NA
 10371211 10371212 BMD_0774 BMD_0775 lytS lytT TRUE 0.995 2.000 0.538 0.023 Y NA
 10371212 10371213 BMD_0775 BMD_0776 lytT lrgA FALSE 0.455 163.000 0.178 1.000   NA
 10371213 10371214 BMD_0776 BMD_0777 lrgA lrgB TRUE 0.921 34.000 0.869 NA   NA
 10371214 10371215 BMD_0777 BMD_0778 lrgB nasB FALSE 0.005 828.000 0.000 NA N NA
 10371215 10371216 BMD_0778 BMD_0779 nasB nasC TRUE 0.937 20.000 0.138 0.001   NA
 10371220 10371221 BMD_0783 BMD_0784   murF FALSE 0.511 -3.000 0.000 1.000   NA
 10371221 10371222 BMD_0784 BMD_0785 murF aepX TRUE 0.666 14.000 0.000 1.000 N NA
 10371222 10371223 BMD_0785 BMD_0786 aepX aepY TRUE 0.989 -7.000 0.714 1.000   NA
 10371223 10371224 BMD_0786 BMD_0787 aepY   TRUE 0.949 -7.000 0.086 1.000   NA
 10371224 10371225 BMD_0787 BMD_0788     TRUE 0.719 8.000 0.000 1.000 N NA
 10371226 10371227 BMD_0789 BMD_0790 alsD alsS TRUE 0.943 17.000 0.323 1.000 N NA
 10371227 10371228 BMD_0790 BMD_0791 alsS   FALSE 0.000 1262.000 0.000 NA   NA
 10371228 10371229 BMD_0791 BMD_0792     TRUE 0.784 0.000 0.026 NA   NA
 10371229 10371230 BMD_0792 BMD_0793     FALSE 0.013 85.000 0.000 NA   NA
 10371231 10371232 BMD_0794 BMD_0795     FALSE 0.559 58.000 0.094 NA   NA
 10371232 10371233 BMD_0795 BMD_0796   mdcH FALSE 0.005 413.000 0.000 1.000   NA
 10371233 10371234 BMD_0796 BMD_0797 mdcH mdcA TRUE 0.786 38.000 0.047 0.092   NA
 10371234 10371235 BMD_0797 BMD_0798 mdcA mdcB TRUE 0.963 6.000 0.508 1.000   NA
 10371235 10371236 BMD_0798 BMD_0799 mdcB mdcC TRUE 0.934 24.000 0.475 1.000   NA
 10371236 10371237 BMD_0799 BMD_0800 mdcC mdcD TRUE 0.986 -13.000 0.400 1.000   NA
 10371237 10371238 BMD_0800 BMD_0801 mdcD mdcG TRUE 0.949 -12.000 0.062 1.000   NA
 10371239 10371240 BMD_0802 BMD_0803 glnL glnJ TRUE 0.914 5.000 0.000 1.000 Y NA
 10371241 10371242 BMD_0804 BMD_0805 glsA glnT TRUE 0.721 125.000 0.095 1.000 Y NA
 10371243 10371244 BMD_0806 BMD_0807     TRUE 0.971 0.000 0.571 NA   NA
 10371244 10371245 BMD_0807 BMD_0808     FALSE 0.001 379.000 0.000 NA   NA
 10371246 10371247 BMD_0809 BMD_0810     FALSE 0.006 174.000 0.000 NA   NA
 10371247 10371248 BMD_0810 BMD_0811     FALSE 0.006 152.000 0.000 NA   NA
 10371248 10371249 BMD_0811 BMD_0812     FALSE 0.010 462.000 0.000 NA N NA
 10371249 10371250 BMD_0812 BMD_0813     FALSE 0.004 218.000 0.000 NA   NA
 10371250 10371251 BMD_0813 BMD_0814     FALSE 0.001 393.000 0.000 NA   NA
 10371252 10371253 BMD_0815 BMD_0816 yjkA yjkB TRUE 0.862 -3.000 0.047 NA   NA
 10371253 10371254 BMD_0816 BMD_0817 yjkB   FALSE 0.272 98.000 0.000 1.000 N NA
 10371255 10371256 BMD_0818 BMD_0819     TRUE 0.974 1.000 0.727 NA   NA
 10371256 10371257 BMD_0819 BMD_0820   yknY TRUE 0.990 -3.000 0.818 1.000 N NA
 10371257 10371258 BMD_0820 BMD_0821 yknY yknZ TRUE 0.995 -3.000 0.909 NA Y NA
 10371260 10371261 BMD_0823 BMD_0824 folP   FALSE 0.003 252.000 0.000 NA   NA
 10371263 10371264 BMD_0826 BMD_0827     FALSE 0.052 317.000 0.000 1.000 N NA
 10371264 10371265 BMD_0827 BMD_0828   bioY FALSE 0.007 137.000 0.000 NA   NA
 10371265 10371266 BMD_0828 BMD_0829 bioY bioD FALSE 0.515 31.000 0.029 NA   NA
 10371266 10371267 BMD_0829 BMD_0830 bioD bioA TRUE 0.995 -19.000 0.051 0.001 Y NA
 10371270 10371271 BMD_0833 BMD_0834     FALSE 0.181 146.000 0.000 1.000 N NA
 10371272 10371273 BMD_0835 BMD_0836 dctS dctR TRUE 0.990 13.000 1.000 1.000 Y NA
 10371273 10371274 BMD_0836 BMD_0837 dctR glcU FALSE 0.121 220.000 0.000 1.000 N NA
 10371274 10371275 BMD_0837 BMD_0838 glcU gdh FALSE 0.623 18.000 0.000 1.000 N NA
 10371276 10371277 BMD_0839 BMD_0840     TRUE 0.977 -25.000 0.154 1.000   NA
 10371277 10371278 BMD_0840 BMD_0841     TRUE 0.917 13.000 0.333 NA   NA
 10371278 10371279 BMD_0841 BMD_0842     FALSE 0.004 222.000 0.000 NA   NA
 10371279 10371280 BMD_0842 BMD_0843     TRUE 0.984 -10.000 0.500 NA   NA
 10371280 10371281 BMD_0843 BMD_0844     FALSE 0.006 149.000 0.000 NA   NA
 10371283 10371284 BMD_0846 BMD_0847     FALSE 0.003 248.000 0.000 NA   NA
 10371285 10371286 BMD_0848 BMD_0849   ybgG FALSE 0.455 135.000 0.000 1.000 Y NA
 10371286 10371287 BMD_0849 BMD_0850 ybgG   FALSE 0.063 294.000 0.000 1.000 N NA
 10371287 10371288 BMD_0850 BMD_0851     FALSE 0.000 946.000 0.000 NA   NA
 10371288 10371289 BMD_0851 BMD_0852   citM FALSE 0.001 329.000 0.000 NA   NA
 10371289 10371290 BMD_0852 BMD_0853 citM citS FALSE 0.179 154.000 0.000 1.000 N NA
 10371290 10371291 BMD_0853 BMD_0854 citS citT TRUE 0.988 28.000 0.833 0.096 Y NA
 10371291 10371292 BMD_0854 BMD_0855 citT   TRUE 0.942 25.000 0.611 1.000   NA
 10371294 10371295 BMD_0857 BMD_0858     FALSE 0.017 68.000 0.000 NA   NA
 10371296 10371297 BMD_0859 BMD_0860 opuAB opuAA TRUE 0.987 -7.000 0.094 1.000 Y NA
 10371297 10371298 BMD_0860 BMD_0861 opuAA opuAC TRUE 0.911 36.000 0.094 1.000 Y NA
 10371299 10371300 BMD_0862 BMD_0863     FALSE 0.183 136.000 0.000 1.000 N NA
 10371300 10371301 BMD_0863 BMD_0864   rocD TRUE 0.855 26.000 0.081 1.000 N NA
 10371301 10371302 BMD_0864 BMD_0865 rocD speB FALSE 0.489 123.000 0.000 1.000 Y NA
 10371302 10371303 BMD_0865 BMD_0866 speB   FALSE 0.193 300.000 0.000 1.000 Y NA
 10371303 10371304 BMD_0866 BMD_0867     FALSE 0.053 114.000 0.000 1.000   NA
 10371304 10371305 BMD_0867 BMD_0868     FALSE 0.002 308.000 0.000 NA   NA
 10371305 10371306 BMD_0868 BMD_0869     TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA N NA
 10371306 10371307 BMD_0869 BMD_0870     FALSE 0.239 109.000 0.000 1.000 N NA
 10371307 10371308 BMD_0870 BMD_0871     TRUE 0.635 16.000 0.000 1.000 N NA
 10371308 10371309 BMD_0871 BMD_0872   yfmC FALSE 0.043 345.000 0.000 1.000 N NA
 10371309 10371310 BMD_0872 BMD_0873 yfmC yfmD TRUE 0.865 80.000 0.143 1.000 Y NA
 10371310 10371311 BMD_0873 BMD_0874 yfmD yfmE TRUE 0.989 6.000 0.280 0.038 Y NA
 10371312 10371313 BMD_0875 BMD_0876     FALSE 0.046 20.000 0.000 NA   NA
 10371314 10371315 BMD_0877 BMD_0878     FALSE 0.247 106.000 0.000 1.000 N NA
 10371315 10371316 BMD_0878 BMD_0879     FALSE 0.000 554.000 0.000 NA   NA
 10371316 10371317 BMD_0879 BMD_0880   murQ FALSE 0.001 403.000 0.000 NA   NA
 10371317 10371318 BMD_0880 BMD_0881 murQ   TRUE 0.960 13.000 0.240 0.004   NA
 10371318 10371319 BMD_0881 BMD_0882   sacP TRUE 0.626 89.000 0.071 1.000 N NA
 10371319 10371320 BMD_0882 BMD_0883 sacP   TRUE 0.975 -3.000 0.357 1.000   NA
 10371320 10371321 BMD_0883 BMD_0884     FALSE 0.004 436.000 0.000 1.000   NA
 10371321 10371322 BMD_0884 BMD_0885     TRUE 0.898 6.000 0.045 1.000 N NA
 10371322 10371323 BMD_0885 BMD_0886     TRUE 0.977 -7.000 0.145 1.000 N NA
 10371323 10371324 BMD_0886 BMD_0887     TRUE 0.995 -3.000 0.826 1.000 Y NA
 10371324 10371325 BMD_0887 BMD_0888     TRUE 0.991 -3.000 0.135 0.038 Y NA
 10371325 10371326 BMD_0888 BMD_0889     FALSE 0.310 87.000 0.000 1.000 N NA
 10371327 10371328 BMD_0890 BMD_0891   hxlA TRUE 0.704 11.000 0.000 1.000 N NA
 10371328 10371329 BMD_0891 BMD_0892 hxlA   FALSE 0.037 269.000 0.000 NA N NA
 10371330 10371331 BMD_0893 BMD_0894     FALSE 0.047 17.000 0.000 NA   NA
 10371332 10371333 BMD_0895 BMD_0896   feoB TRUE 0.929 16.000 0.517 NA   NA
 10371333 10371334 BMD_0896 BMD_0897 feoB   TRUE 0.991 -3.000 0.308 1.000 Y NA
 10371335 10371336 BMD_0898 BMD_0899     FALSE 0.005 192.000 0.000 NA   NA
 10371336 10371337 BMD_0899 BMD_0900     FALSE 0.011 98.000 0.000 NA   NA
 10371338 10371339 BMD_0901 BMD_0902 rpoN   FALSE 0.279 216.000 0.000 NA Y NA
 10371341 10371342 BMD_0904 BMD_0905   yfiC FALSE 0.008 115.000 0.000 NA   NA
 10371342 10371343 BMD_0905 BMD_0906 yfiC malQ TRUE 0.982 17.000 0.240 0.003 Y NA
 10371345 10371346 BMD_0908 BMD_0909     TRUE 0.912 17.000 0.409 NA   NA
 10371347 10371348 BMD_0910 BMD_0911     FALSE 0.004 215.000 0.000 NA   NA
 10371348 10371349 BMD_0911 BMD_0912     FALSE 0.178 32.000 0.000 1.000   NA
 10371349 10371350 BMD_0912 BMD_0913   dltE FALSE 0.276 122.000 0.000 0.044   NA
 10371351 10371352 BMD_0914 BMD_0915     FALSE 0.110 0.000 0.000 NA   NA
 10371353 10371354 BMD_0916 BMD_0917     FALSE 0.145 43.000 0.000 1.000   NA
 10371354 10371355 BMD_0917 BMD_0918     TRUE 0.870 19.000 0.176 1.000   NA
 10371355 10371356 BMD_0918 BMD_0919     TRUE 0.929 9.000 0.333 NA   NA
 10371356 10371357 BMD_0919 BMD_0920     FALSE 0.006 163.000 0.000 NA   NA
 10371357 10371358 BMD_0920 BMD_0921   rbsR TRUE 0.664 117.000 0.000 0.050 Y NA
 10371358 10371359 BMD_0921 BMD_0922 rbsR rbsK TRUE 0.985 -7.000 0.281 1.000 N NA
 10371359 10371360 BMD_0922 BMD_0923 rbsK rbsD TRUE 0.982 1.000 0.183 1.000 Y NA
 10371360 10371361 BMD_0923 BMD_0924 rbsD rbsA TRUE 0.970 15.000 0.243 1.000 Y NA
 10371361 10371362 BMD_0924 BMD_0925 rbsA rbsC TRUE 0.984 2.000 0.358 0.001   NA
 10371362 10371363 BMD_0925 BMD_0926 rbsC rbsB TRUE 0.961 12.000 0.847 NA   NA
 10371363 10371364 BMD_0926 BMD_0927 rbsB   FALSE 0.001 440.000 0.000 NA   NA
 10371364 10371365 BMD_0927 BMD_0928     FALSE 0.039 156.000 0.000 1.000   NA
 10371365 10371366 BMD_0928 BMD_0929     FALSE 0.010 105.000 0.000 NA   NA
 10371366 10371367 BMD_0929 BMD_0930   araN FALSE 0.008 122.000 0.000 NA   NA
 10371367 10371368 BMD_0930 BMD_0931 araN araP TRUE 0.955 73.000 0.370 0.038 Y NA
 10371368 10371369 BMD_0931 BMD_0932 araP araQ TRUE 0.976 69.000 0.926 0.038 Y NA
 10371369 10371370 BMD_0932 BMD_0933 araQ   TRUE 0.678 52.000 0.000 NA Y NA
 10371372 10371373 BMD_0935 BMD_0936     TRUE 0.794 1.000 0.000 1.000 N NA
 10371373 10371374 BMD_0936 BMD_0937     TRUE 0.895 -10.000 0.000 1.000 N NA
 10371374 10371375 BMD_0937 BMD_0938     FALSE 0.511 -3.000 0.000 1.000   NA
 10371375 10371376 BMD_0938 BMD_0939     TRUE 0.817 11.000 0.000 0.007   NA
 10371376 10371377 BMD_0939 BMD_0940     TRUE 0.913 3.000 0.125 1.000   NA
 10371377 10371378 BMD_0940 BMD_0941     TRUE 0.998 -10.000 0.667 0.015 Y NA
 10371378 10371379 BMD_0941 BMD_0942     FALSE 0.001 454.000 0.000 NA   NA
 10371379 10371380 BMD_0942 BMD_0943     FALSE 0.028 37.000 0.000 NA   NA
 10371380 10371381 BMD_0943 BMD_0944     FALSE 0.059 13.000 0.000 NA   NA
 10371381 10371382 BMD_0944 BMD_0945     FALSE 0.037 361.000 0.000 1.000 N NA
 10371383 10371384 BMD_0946 BMD_0947     FALSE 0.022 54.000 0.000 NA   NA
 10371385 10371386 BMD_0948 BMD_0949     FALSE 0.002 611.000 0.000 1.000   NA
 10371390 10371391 BMD_0953 BMD_0954     FALSE 0.441 52.000 0.000 1.000 N NA
 10371391 10371392 BMD_0954 BMD_0955   aroC TRUE 0.801 67.000 0.019 1.000 Y NA
 10371394 10371395 BMD_0957 BMD_0958 scrA treC TRUE 0.983 16.000 0.650 1.000 Y NA
 10371395 10371396 BMD_0958 BMD_0959 treC treR TRUE 0.818 89.000 0.336 1.000 N NA
 10371396 10371397 BMD_0959 BMD_0960 treR   FALSE 0.039 356.000 0.000 1.000 N NA
 10371397 10371398 BMD_0960 BMD_0961     TRUE 0.998 -10.000 0.596 0.001 Y NA
 10371398 10371399 BMD_0961 BMD_0962     TRUE 0.951 12.000 0.447 1.000   NA
 10371399 10371400 BMD_0962 BMD_0963     TRUE 0.903 10.000 0.158 1.000   NA
 10371404 10371405 BMD_0967 BMD_0968     FALSE 0.010 102.000 0.000 NA   NA
 10371405 10371406 BMD_0968 BMD_0969   bluB FALSE 0.001 465.000 0.000 NA   NA
 10371406 10371407 BMD_0969 BMD_0970 bluB   FALSE 0.006 169.000 0.000 NA   NA
 10371407 10371408 BMD_0970 BMD_0971     FALSE 0.009 109.000 0.000 NA   NA
 10371410 10371411 BMD_0973 BMD_0974     FALSE 0.005 194.000 0.000 NA   NA
 10371411 10371412 BMD_0974 BMD_0975   aroD FALSE 0.000 515.000 0.000 NA   NA
 10371412 10371413 BMD_0975 BMD_0976 aroD   FALSE 0.006 637.000 0.000 NA N NA
 10371413 10371414 BMD_0976 BMD_0977     FALSE 0.124 112.000 0.000 NA N NA
 10371414 10371415 BMD_0977 BMD_0978     TRUE 0.989 0.000 0.500 0.091 N NA
 10371415 10371416 BMD_0978 BMD_0979     FALSE 0.359 152.000 0.000 0.091 N NA
 10371416 10371417 BMD_0979 BMD_0980     FALSE 0.161 92.000 0.000 NA N NA
 10371418 10371419 BMD_0981 BMD_0982 atzF uca TRUE 0.959 15.000 0.437 1.000 N NA
 10371419 10371420 BMD_0982 BMD_0983 uca   TRUE 0.946 17.000 0.835 NA   NA
 10371420 10371421 BMD_0983 BMD_0984     TRUE 0.951 21.000 0.931 NA   NA
 10371421 10371422 BMD_0984 BMD_0985     FALSE 0.002 277.000 0.000 NA   NA
 10371425 10371426 BMD_0988 BMD_0989     FALSE 0.037 172.000 0.000 1.000   NA
 10371426 10371427 BMD_0989 BMD_0990     FALSE 0.018 613.000 0.000 0.044   NA
 10371427 10371428 BMD_0990 BMD_0991     TRUE 0.789 120.000 0.006 0.002 Y NA
 10371428 10371429 BMD_0991 BMD_0992     FALSE 0.004 462.000 0.000 1.000   NA
 10371429 10371430 BMD_0992 BMD_0993     FALSE 0.182 -7.000 0.000 NA   NA
 10371430 10371431 BMD_0993 BMD_0994     FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10371431 10371432 BMD_0994 BMD_0995     FALSE 0.003 531.000 0.000 1.000   NA
 10371432 10371433 BMD_0995 BMD_0996     FALSE 0.114 61.000 0.000 1.000   NA
 10371434 10371435 BMD_0997 BMD_0998 tatA   FALSE 0.423 74.000 0.000 0.076   NA
 10371435 10371436 BMD_0998 BMD_0999     TRUE 0.996 2.000 0.941 0.076 Y NA
 10371436 10371437 BMD_0999 BMD_1000     FALSE 0.471 43.000 0.000 1.000 N NA
 10371437 10371438 BMD_1000 BMD_1001     FALSE 0.013 85.000 0.000 NA   NA
 10371438 10371439 BMD_1001 BMD_1002     FALSE 0.052 15.000 0.000 NA   NA
 10371440 10371441 BMD_1003 BMD_1004 capB capC TRUE 0.798 17.000 0.000 0.001   NA
 10371441 10371442 BMD_1004 BMD_1005 capC capA FALSE 0.149 41.000 0.000 1.000   NA
 10371442 10371443 BMD_1005 BMD_1006 capA   TRUE 0.934 30.000 0.400 1.000 N NA
 10371443 10371444 BMD_1006 BMD_1007     FALSE 0.046 21.000 0.000 NA   NA
 10371444 10371445 BMD_1007 BMD_1008   capD FALSE 0.009 114.000 0.000 NA   NA
 10371447 10371448 BMD_1010 BMD_1011     FALSE 0.001 431.000 0.000 NA   NA
 10371448 10371449 BMD_1011 BMD_1012   had FALSE 0.007 130.000 0.000 NA   NA
 10371450 10371451 BMD_1013 BMD_1014     FALSE 0.006 144.000 0.000 NA   NA
 10371451 10371452 BMD_1014 BMD_1015     FALSE 0.239 19.000 0.000 1.000   NA
 10371453 10371454 BMD_1016 BMD_1017     TRUE 0.652 15.000 0.000 1.000 N NA
 10371454 10371455 BMD_1017 BMD_1018     TRUE 0.969 81.000 0.667 0.008 Y NA
 10371455 10371456 BMD_1018 BMD_1019     TRUE 0.776 56.000 0.296 NA   NA
 10371456 10371457 BMD_1019 BMD_1020     FALSE 0.047 17.000 0.000 NA   NA
 10371457 10371458 BMD_1020 BMD_1021     TRUE 0.627 2.000 0.000 NA N NA
 10371458 10371459 BMD_1021 BMD_1022   licA FALSE 0.436 18.000 0.000 NA N NA
 10371459 10371460 BMD_1022 BMD_1023 licA   FALSE 0.511 -3.000 0.000 1.000   NA
 10371460 10371461 BMD_1023 BMD_1024     FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10371461 10371462 BMD_1024 BMD_1025     FALSE 0.029 36.000 0.000 NA   NA
 10371462 10371463 BMD_1025 BMD_1026   murQ FALSE 0.589 84.000 0.182 NA   NA
 10371463 10371464 BMD_1026 BMD_1027 murQ   FALSE 0.037 169.000 0.000 1.000   NA
 10371464 10371465 BMD_1027 BMD_1028     TRUE 0.852 16.000 0.000 0.008 N NA
 10371465 10371466 BMD_1028 BMD_1029     TRUE 0.979 4.000 0.377 0.008   NA
 10371466 10371467 BMD_1029 BMD_1030     FALSE 0.100 68.000 0.000 1.000   NA
 10371467 10371468 BMD_1030 BMD_1031     FALSE 0.007 133.000 0.000 NA   NA
 10371468 10371469 BMD_1031 BMD_1032   rpiA FALSE 0.014 83.000 0.000 NA   NA
 10371472 10371473 BMD_1035 BMD_1036     FALSE 0.009 107.000 0.000 NA   NA
 10371473 10371474 BMD_1036 BMD_1037     FALSE 0.000 566.000 0.000 NA   NA
 10371475 10371476 BMD_1038 BMD_1039     FALSE 0.031 33.000 0.000 NA   NA
 10371477 10371478 BMD_1040 BMD_1041     FALSE 0.007 130.000 0.000 NA   NA
 10371478 10371479 BMD_1041 BMD_1042     FALSE 0.006 185.000 0.000 NA   NA
 10371479 10371480 BMD_1042 BMD_1043     FALSE 0.006 149.000 0.000 NA   NA
 10371481 10371482 BMD_1044 BMD_1045 gatA   TRUE 0.846 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10371482 10371483 BMD_1045 BMD_1046   galE FALSE 0.147 198.000 0.000 1.000 N NA
 10371483 10371484 BMD_1046 BMD_1047 galE   FALSE 0.004 230.000 0.000 NA   NA
 10371484 10371485 BMD_1047 BMD_1048     FALSE 0.005 206.000 0.000 NA   NA
 10371485 10371486 BMD_1048 BMD_1049     FALSE 0.003 235.000 0.000 NA   NA
 10371486 10371487 BMD_1049 BMD_1050     FALSE 0.004 215.000 0.000 NA   NA
 10371487 10371488 BMD_1050 BMD_1051     FALSE 0.303 204.000 0.000 NA Y NA
 10371490 10371491 BMD_1053 BMD_1054     FALSE 0.394 63.000 0.000 1.000 N NA
 10371493 10371494 BMD_1056 BMD_1057     FALSE 0.139 -3.000 0.000 NA   NA
 10371494 10371495 BMD_1057 BMD_1058     FALSE 0.013 85.000 0.000 NA   NA
 10371497 10371498 BMD_1060 BMD_1061     TRUE 0.991 2.000 0.583 1.000 Y NA
 10371498 10371499 BMD_1061 BMD_1062     FALSE 0.128 215.000 0.000 1.000 N NA
 10371499 10371500 BMD_1062 BMD_1063     FALSE 0.008 116.000 0.000 NA   NA
 10371500 10371501 BMD_1063 BMD_1064     FALSE 0.027 39.000 0.000 NA   NA
 10371501 10371502 BMD_1064 BMD_1065   lytE FALSE 0.001 371.000 0.000 NA   NA
 10371502 10371503 BMD_1065 BMD_1066 lytE lytC FALSE 0.319 197.000 0.000 NA Y NA
 10371503 10371504 BMD_1066 BMD_1067 lytC lytB FALSE 0.125 218.000 0.000 1.000 N NA
 10371504 10371505 BMD_1067 BMD_1068 lytB   FALSE 0.036 183.000 0.000 1.000   NA
 10371505 10371506 BMD_1068 BMD_1069     FALSE 0.001 382.000 0.000 NA   NA
 10371506 10371507 BMD_1069 BMD_1070     FALSE 0.011 95.000 0.000 NA   NA
 10371508 10371509 BMD_1071 BMD_1072   menC FALSE 0.023 432.000 0.000 1.000 N NA
 10371509 10371510 BMD_1072 BMD_1073 menC   TRUE 0.981 -3.000 0.250 0.090   NA
 10371510 10371511 BMD_1073 BMD_1074     FALSE 0.236 23.000 0.000 1.000   NA
 10371512 10371513 BMD_1075 BMD_1076     FALSE 0.350 74.000 0.000 1.000 N NA
 10371513 10371514 BMD_1076 BMD_1077     TRUE 0.701 64.000 0.000 1.000 Y NA
 10371514 10371515 BMD_1077 BMD_1078     FALSE 0.191 131.000 0.000 1.000 N NA
 10371517 10371518 BMD_1080 BMD_1081     FALSE 0.004 224.000 0.000 NA   NA
 10371518 10371519 BMD_1081 BMD_1082     FALSE 0.010 105.000 0.000 NA   NA
 10371519 10371520 BMD_1082 BMD_1083     TRUE 0.904 1.000 0.139 NA   NA
 10371521 10371522 BMD_1084 BMD_1085     FALSE 0.052 15.000 0.000 NA   NA
 10371522 10371523 BMD_1085 BMD_1086     FALSE 0.006 154.000 0.000 NA   NA
 10371524 10371525 BMD_1087 BMD_1088     FALSE 0.002 281.000 0.000 NA   NA
 10371525 10371526 BMD_1088 BMD_1089   folE FALSE 0.418 58.000 0.000 1.000 N NA
 10371526 10371527 BMD_1089 BMD_1090 folE   TRUE 0.851 49.000 0.200 1.000 N NA
 10371529 10371530 BMD_1092 BMD_1093 capB capC TRUE 0.844 12.000 0.000 0.001   NA
 10371530 10371531 BMD_1093 BMD_1094 capC capA FALSE 0.319 10.000 0.000 1.000   NA
 10371531 10371532 BMD_1094 BMD_1095 capA ggt TRUE 0.742 5.000 0.000 1.000 N NA
 10371532 10371533 BMD_1095 BMD_1096 ggt   FALSE 0.231 24.000 0.000 1.000   NA
 10371534 10371535 BMD_1097 BMD_1098   hag FALSE 0.092 324.000 0.000 0.004   NA
 10371535 10371536 BMD_1098 BMD_1099 hag pcp FALSE 0.109 230.000 0.000 1.000 N NA
 10371536 10371537 BMD_1099 BMD_1100 pcp   TRUE 0.899 15.000 0.300 NA   NA
 10371537 10371538 BMD_1100 BMD_1101     TRUE 0.978 1.000 0.939 NA   NA
 10371539 10371540 BMD_1102 BMD_1103     FALSE 0.018 64.000 0.000 NA   NA
 10371542 10371543 BMD_1105 BMD_1106     FALSE 0.016 522.000 0.000 1.000 N NA
 10371544 10371545 BMD_1107 BMD_1108     FALSE 0.001 483.000 0.000 NA   NA
 10371546 10371547 BMD_1109 BMD_1110     FALSE 0.002 1119.000 0.000 1.000   NA
 10371548 10371549 BMD_1111 BMD_1112     FALSE 0.000 1673.000 0.000 NA   NA
 10371550 10371551 BMD_1113 BMD_1114   galU FALSE 0.002 2223.000 0.000 1.000   NA
 10371551 10371552 BMD_1114 BMD_1115 galU   FALSE 0.351 168.000 0.000 NA Y NA
 10371552 10371553 BMD_1115 BMD_1116     FALSE 0.000 789.000 0.000 NA   NA
 10371553 10371554 BMD_1116 BMD_1117     FALSE 0.043 25.000 0.000 NA   NA
 10371554 10371555 BMD_1117 BMD_1118     FALSE 0.008 123.000 0.000 NA   NA
 10371555 10371556 BMD_1118 BMD_1119     FALSE 0.000 601.000 0.000 NA   NA
 10371556 10371557 BMD_1119 BMD_1120     FALSE 0.129 479.000 0.000 0.016 Y NA
 10371557 10371558 BMD_1120 BMD_1121     FALSE 0.145 43.000 0.000 1.000   NA
 10371558 10371559 BMD_1121 BMD_1122     FALSE 0.005 407.000 0.000 1.000   NA
 10371559 10371560 BMD_1122 BMD_1123     FALSE 0.449 149.000 0.000 1.000 Y NA
 10371560 10371561 BMD_1123 BMD_1124     TRUE 0.975 -10.000 0.105 1.000 N NA
 10371561 10371562 BMD_1124 BMD_1125     FALSE 0.051 318.000 0.000 1.000 N NA
 10371562 10371563 BMD_1125 BMD_1126   galU FALSE 0.449 144.000 0.000 1.000 Y NA
 10371565 10371566 BMD_1128 BMD_1129   ywqE FALSE 0.144 227.000 0.018 1.000   NA
 10371566 10371567 BMD_1129 BMD_1130 ywqE   FALSE 0.278 280.000 0.018 NA Y NA
 10371567 10371568 BMD_1130 BMD_1131     FALSE 0.143 101.000 0.000 NA N NA
 10371568 10371569 BMD_1131 BMD_1132   yerD TRUE 0.750 50.000 0.000 1.000 Y NA
 10371571 10371572 BMD_1134 BMD_1135     TRUE 0.880 -3.000 0.061 NA   NA
 10371572 10371573 BMD_1135 BMD_1136     FALSE 0.009 107.000 0.000 NA   NA
 10371573 10371574 BMD_1136 BMD_1137   comK FALSE 0.094 140.000 0.000 NA N NA
 10371576 10371577 BMD_1139 BMD_1140   nasD FALSE 0.003 608.000 0.000 1.000   NA
 10371577 10371578 BMD_1140 BMD_1141 nasD nasE TRUE 0.937 19.000 0.055 0.001 N NA
 10371578 10371579 BMD_1141 BMD_1142 nasE nasF FALSE 0.572 73.000 0.012 1.000 N NA
 10371579 10371580 BMD_1142 BMD_1143 nasF   FALSE 0.602 25.000 0.000 1.000 N NA
 10371580 10371581 BMD_1143 BMD_1144     FALSE 0.010 999.000 0.000 1.000 N NA
 10371581 10371582 BMD_1144 BMD_1145   glcU FALSE 0.121 366.000 0.000 1.000 Y NA
 10371582 10371583 BMD_1145 BMD_1146 glcU   FALSE 0.001 341.000 0.000 NA   NA
 10371583 10371584 BMD_1146 BMD_1147     FALSE 0.001 404.000 0.000 NA   NA
 10371584 10371585 BMD_1147 BMD_1148     FALSE 0.388 3.000 0.000 1.000   NA
 10371585 10371586 BMD_1148 BMD_1149     FALSE 0.055 111.000 0.000 1.000   NA
 10371587 10371588 BMD_1150 BMD_1151     FALSE 0.015 77.000 0.000 NA   NA
 10371591 10371592 BMD_1154 BMD_1155     FALSE 0.006 141.000 0.000 NA   NA
 10371592 10371593 BMD_1155 BMD_1156     FALSE 0.096 2.000 0.000 NA   NA
 10371594 10371595 BMD_1157 BMD_1158     TRUE 0.860 16.000 0.143 1.000   NA
 10371595 10371596 BMD_1158 BMD_1159   nagB TRUE 0.866 58.000 0.286 1.000 N NA
 10371596 10371597 BMD_1159 BMD_1160 nagB nagA TRUE 0.989 3.000 0.139 0.001 Y NA
 10371598 10371599 BMD_1161 BMD_1162 nagE   FALSE 0.012 91.000 0.000 NA   NA
 10371599 10371600 BMD_1162 BMD_1163     FALSE 0.007 130.000 0.000 NA   NA
 10371600 10371601 BMD_1163 BMD_1164     FALSE 0.015 80.000 0.000 NA   NA
 10371603 10371604 BMD_1166 BMD_1167     TRUE 0.894 15.000 0.286 NA   NA
 10371604 10371605 BMD_1167 BMD_1168     FALSE 0.139 -3.000 0.000 NA   NA
 10371605 10371606 BMD_1168 BMD_1169     FALSE 0.139 -3.000 0.000 NA   NA
 10371607 10371608 BMD_1170 BMD_1171     FALSE 0.116 60.000 0.000 1.000   NA
 10371608 10371609 BMD_1171 BMD_1172     FALSE 0.004 228.000 0.000 NA   NA
 10371610 10371611 BMD_1173 BMD_1174     FALSE 0.559 6.000 0.000 NA N NA
 10371614 10371615 BMD_1177 BMD_1178 sipV   FALSE 0.005 205.000 0.000 NA   NA
 10371615 10371616 BMD_1178 BMD_1179     FALSE 0.001 391.000 0.000 NA   NA
 10371619 10371620 BMD_1182 BMD_1183     FALSE 0.005 204.000 0.000 NA   NA
 10371620 10371621 BMD_1183 BMD_1184     FALSE 0.137 48.000 0.000 1.000   NA
 10371621 10371622 BMD_1184 BMD_1185     FALSE 0.003 233.000 0.000 NA   NA
 10371622 10371623 BMD_1185 BMD_1186     FALSE 0.006 166.000 0.000 NA   NA
 10371623 10371624 BMD_1186 BMD_1187     FALSE 0.006 169.000 0.000 NA   NA
 10371625 10371626 BMD_1188 BMD_1189     FALSE 0.006 154.000 0.000 NA   NA
 10371630 10371631 BMD_1193 BMD_1194 pbuO natK FALSE 0.026 220.000 0.000 1.000   NA
 10371631 10371632 BMD_1194 BMD_1195 natK natR TRUE 0.932 18.000 0.429 1.000   NA
 10371633 10371634 BMD_1196 BMD_1197 natA natB TRUE 0.987 2.000 0.448 NA Y NA
 10371634 10371635 BMD_1197 BMD_1198 natB   FALSE 0.001 381.000 0.000 NA   NA
 10371635 10371636 BMD_1198 BMD_1199     FALSE 0.007 138.000 0.000 NA   NA
 10371636 10371637 BMD_1199 BMD_1200     FALSE 0.031 203.000 0.000 1.000   NA
 10371637 10371638 BMD_1200 BMD_1201   msrAB FALSE 0.179 154.000 0.000 1.000 N NA
 10371639 10371640 BMD_1202 BMD_1203     TRUE 0.977 13.000 0.600 0.010   NA
 10371640 10371641 BMD_1203 BMD_1204     TRUE 0.980 15.000 0.867 0.010   NA
 10371642 10371643 BMD_1205 BMD_1206     FALSE 0.011 752.000 0.000 1.000 N NA
 10371643 10371644 BMD_1206 BMD_1207     TRUE 0.633 145.000 0.000 0.015 Y NA
 10371644 10371645 BMD_1207 BMD_1208     FALSE 0.077 268.000 0.000 1.000 N NA
 10371645 10371646 BMD_1208 BMD_1209   sigI FALSE 0.035 371.000 0.000 1.000 N NA
 10371647 10371648 BMD_1210 BMD_1211   phaP FALSE 0.006 144.000 0.000 NA   NA
 10371648 10371649 BMD_1211 BMD_1212 phaP phaQ FALSE 0.463 169.000 0.273 NA   NA
 10371650 10371651 BMD_1213 BMD_1214   phaR FALSE 0.003 234.000 0.000 NA   NA
 10371651 10371652 BMD_1214 BMD_1215 phaR phaB TRUE 0.767 82.000 0.450 NA   NA
 10371652 10371653 BMD_1215 BMD_1216 phaB phaC TRUE 0.940 77.000 0.161 0.001 Y NA
 10371653 10371654 BMD_1216 BMD_1217 phaC ktrD FALSE 0.014 585.000 0.000 1.000 N NA
 10371654 10371655 BMD_1217 BMD_1218 ktrD   FALSE 0.002 288.000 0.000 NA   NA
 10371655 10371656 BMD_1218 BMD_1219     FALSE 0.089 3.000 0.000 NA   NA
 10371658 10371659 BMD_1221 BMD_1222   pncB FALSE 0.181 139.000 0.000 1.000 N NA
 10371659 10371660 BMD_1222 BMD_1223 pncB nadE TRUE 0.967 36.000 0.194 0.004 Y NA
 10371660 10371661 BMD_1223 BMD_1224 nadE   FALSE 0.034 281.000 0.000 NA N NA
 10371661 10371662 BMD_1224 BMD_1225     TRUE 0.983 18.000 0.947 NA Y NA
 10371662 10371663 BMD_1225 BMD_1226     TRUE 0.995 -22.000 0.447 0.001   NA
 10371663 10371664 BMD_1226 BMD_1227   kinE FALSE 0.035 398.000 0.000 0.097   NA
 10371664 10371665 BMD_1227 BMD_1228 kinE ogt TRUE 0.856 19.000 0.061 1.000 N NA
 10371666 10371667 BMD_1229 BMD_1230   mtnA FALSE 0.007 135.000 0.000 NA   NA
 10371667 10371668 BMD_1230 BMD_1231 mtnA mtnK TRUE 0.739 36.000 0.104 1.000   NA
 10371668 10371669 BMD_1231 BMD_1232 mtnK mtnU FALSE 0.006 378.000 0.000 1.000   NA
 10371670 10371671 BMD_1233 BMD_1234 mtnE mtnW FALSE 0.147 318.000 0.043 1.000 N NA
 10371671 10371672 BMD_1234 BMD_1235 mtnW mtnX TRUE 0.992 -3.000 0.304 0.001 N NA
 10371672 10371673 BMD_1235 BMD_1236 mtnX mtnB TRUE 0.846 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10371673 10371674 BMD_1236 BMD_1237 mtnB mtnD FALSE 0.249 16.000 0.000 1.000   NA
 10371674 10371675 BMD_1237 BMD_1238 mtnD rbsB FALSE 0.008 123.000 0.000 NA   NA
 10371675 10371676 BMD_1238 BMD_1239 rbsB rbsA TRUE 0.970 17.000 0.403 NA Y NA
 10371676 10371677 BMD_1239 BMD_1240 rbsA rbsC TRUE 0.996 -3.000 0.952 1.000 Y NA
 10371677 10371678 BMD_1240 BMD_1241 rbsC   FALSE 0.079 87.000 0.000 1.000   NA
 10371678 10371679 BMD_1241 BMD_1242     FALSE 0.001 452.000 0.000 NA   NA
 10371680 10371681 BMD_1243 BMD_1244     FALSE 0.174 158.000 0.000 1.000 N NA
 10371682 10371683 BMD_1245 BMD_1246     FALSE 0.515 168.000 0.129 1.000 N NA
 10371687 10371688 BMD_1250 BMD_1251 nhaC   FALSE 0.020 239.000 0.000 1.000   NA
 10371688 10371689 BMD_1251 BMD_1252     FALSE 0.013 88.000 0.000 NA   NA
 10371691 10371692 BMD_1254 BMD_1255   queC FALSE 0.001 345.000 0.000 NA   NA
 10371692 10371693 BMD_1255 BMD_1256 queC queD TRUE 0.879 0.000 0.041 1.000   NA
 10371693 10371694 BMD_1256 BMD_1257 queD queE TRUE 0.986 -7.000 0.307 1.000 N NA
 10371694 10371695 BMD_1257 BMD_1258 queE queF FALSE 0.502 99.000 0.101 1.000   NA
 10371695 10371696 BMD_1258 BMD_1259 queF   FALSE 0.401 69.000 0.008 1.000   NA
 10371697 10371698 BMD_1260 BMD_1261     FALSE 0.002 317.000 0.000 NA   NA
 10371699 10371700 BMD_1262 BMD_1263     FALSE 0.046 18.000 0.000 NA   NA
 10371700 10371701 BMD_1263 BMD_1264     FALSE 0.450 148.000 0.229 NA   NA
 10371701 10371702 BMD_1264 BMD_1265   sleB FALSE 0.002 313.000 0.000 NA   NA
 10371704 10371705 BMD_1267 BMD_1268     FALSE 0.004 231.000 0.000 NA   NA
 10371705 10371706 BMD_1268 BMD_1269     FALSE 0.023 228.000 0.000 1.000   NA
 10371706 10371707 BMD_1269 BMD_1270     FALSE 0.005 205.000 0.000 NA   NA
 10371707 10371708 BMD_1270 BMD_1271     FALSE 0.024 49.000 0.000 NA   NA
 10371709 10371710 BMD_1272 BMD_1273   metH FALSE 0.007 377.000 0.000 1.000   NA
 10371710 10371711 BMD_1273 BMD_1274 metH yitJ TRUE 0.986 1.000 0.045 0.001 Y NA
 10371712 10371713 BMD_1275 BMD_1276     FALSE 0.002 302.000 0.000 NA   NA
 10371713 10371714 BMD_1276 BMD_1277   ribE FALSE 0.234 -19.000 0.000 NA   NA
 10371714 10371715 BMD_1277 BMD_1278 ribE ribAB TRUE 0.928 17.000 0.040 1.000 Y NA
 10371715 10371716 BMD_1278 BMD_1279 ribAB ribH TRUE 0.871 92.000 0.034 0.002 Y NA
 10371716 10371717 BMD_1279 BMD_1280 ribH   FALSE 0.001 443.000 0.000 NA   NA
 10371717 10371718 BMD_1280 BMD_1281     FALSE 0.007 132.000 0.000 NA   NA
 10371718 10371719 BMD_1281 BMD_1282   ptsG FALSE 0.153 272.000 0.071 1.000   NA
 10371719 10371720 BMD_1282 BMD_1283 ptsG ptsH TRUE 0.965 19.000 0.054 0.007 Y NA
 10371720 10371721 BMD_1283 BMD_1284 ptsH ptsI TRUE 0.990 0.000 0.132 0.008 Y NA
 10371722 10371723 BMD_1285 BMD_1286     TRUE 0.987 -3.000 0.840 1.000   NA
 10371723 10371724 BMD_1286 BMD_1287     FALSE 0.004 484.000 0.000 1.000   NA
 10371728 10371729 BMD_1291 BMD_1292   patA FALSE 0.179 153.000 0.000 1.000 N NA
 10371729 10371730 BMD_1292 BMD_1293 patA   FALSE 0.011 97.000 0.000 NA   NA
 10371730 10371731 BMD_1293 BMD_1294     FALSE 0.005 204.000 0.000 NA   NA
 10371731 10371732 BMD_1294 BMD_1295     FALSE 0.009 114.000 0.000 NA   NA
 10371734 10371735 BMD_1297 BMD_1298     FALSE 0.003 256.000 0.000 NA   NA
 10371736 10371737 BMD_1299 BMD_1300 ppx ppk TRUE 0.781 74.000 0.056 NA Y NA
 10371738 10371739 BMD_1301 BMD_1302     FALSE 0.006 146.000 0.000 NA   NA
 10371740 10371741 BMD_1303 BMD_1304     FALSE 0.426 106.000 0.043 NA N NA
 10371741 10371742 BMD_1304 BMD_1305     FALSE 0.345 156.000 0.139 NA   NA
 10371744 10371745 BMD_1307 BMD_1308     FALSE 0.023 383.000 0.017 NA   NA
 10371745 10371746 BMD_1308 BMD_1309     TRUE 0.631 100.000 0.214 1.000   NA
 10371746 10371747 BMD_1309 BMD_1310   dapH FALSE 0.549 130.000 0.121 1.000 N NA
 10371747 10371748 BMD_1310 BMD_1311 dapH dapL FALSE 0.619 145.000 0.372 1.000   NA
 10371748 10371749 BMD_1311 BMD_1312 dapL   FALSE 0.558 57.000 0.091 NA   NA
 10371751 10371752 BMD_1314 BMD_1315     TRUE 0.830 103.000 0.008 0.002 Y NA
 10371752 10371753 BMD_1315 BMD_1316   gnd FALSE 0.161 188.000 0.000 1.000 N NA
 10371753 10371754 BMD_1316 BMD_1317 gnd yknU FALSE 0.075 271.000 0.000 1.000 N NA
 10371754 10371755 BMD_1317 BMD_1318 yknU yknV TRUE 0.993 16.000 0.938 0.003 Y NA
 10371755 10371756 BMD_1318 BMD_1319 yknV ktrC FALSE 0.409 152.000 0.041 1.000 N NA
 10371757 10371758 BMD_1320 BMD_1321 rnjA   TRUE 0.971 0.000 0.576 NA   NA
 10371760 10371761 BMD_1323 BMD_1324 defB   FALSE 0.006 175.000 0.000 NA   NA
 10371762 10371763 BMD_1325 BMD_1326   pdhA FALSE 0.000 581.000 0.000 NA   NA
 10371763 10371764 BMD_1326 BMD_1327 pdhA pdhB TRUE 0.994 4.000 0.484 0.001 Y NA
 10371764 10371765 BMD_1327 BMD_1328 pdhB pdhC TRUE 0.957 103.000 0.883 0.088 Y NA
 10371765 10371766 BMD_1328 BMD_1329 pdhC pdhD TRUE 0.993 4.000 0.948 1.000 Y NA
 10371766 10371767 BMD_1329 BMD_1330 pdhD   FALSE 0.002 294.000 0.000 NA   NA
 10371771 10371772 BMD_1334 BMD_1335     FALSE 0.016 70.000 0.000 NA   NA
 10371774 10371775 BMD_1337 BMD_1338   suhB FALSE 0.295 196.000 0.132 NA   NA
 10371777 10371778 BMD_1340 BMD_1341 bipA   FALSE 0.165 161.000 0.032 NA   NA
 10371779 10371780 BMD_1342 BMD_1343     TRUE 0.848 2.000 0.077 NA   NA
 10371785 10371786 BMD_1348 BMD_1349   ftsW FALSE 0.511 144.000 0.300 NA   NA
 10371786 10371787 BMD_1349 BMD_1350 ftsW pycA FALSE 0.427 134.000 0.046 1.000 N NA
 10371789 10371790 BMD_1352 BMD_1353 ctaB ctaC TRUE 0.627 138.000 0.084 0.074 N NA
 10371790 10371791 BMD_1353 BMD_1354 ctaC ctaD TRUE 0.987 35.000 0.755 0.002 Y NA
 10371791 10371792 BMD_1354 BMD_1355 ctaD ctaE TRUE 0.997 0.000 0.925 0.002 Y NA
 10371792 10371793 BMD_1355 BMD_1356 ctaE ctaF TRUE 0.996 5.000 0.950 0.002 Y NA
 10371793 10371794 BMD_1356 BMD_1357 ctaF ctaG TRUE 0.947 58.000 0.707 0.002   NA
 10371796 10371797 BMD_1359 BMD_1360     FALSE 0.336 191.000 0.155 NA   NA
 10371797 10371798 BMD_1360 BMD_1361   ypjB FALSE 0.013 85.000 0.000 NA   NA
 10371798 10371799 BMD_1361 BMD_1362 ypjB   FALSE 0.424 65.000 0.050 NA   NA
 10371801 10371802 BMD_1364 BMD_1365   dapB TRUE 0.689 14.000 0.044 NA   NA
 10371802 10371803 BMD_1365 BMD_1366 dapB mgsA TRUE 0.932 13.000 0.044 0.038 N NA
 10371803 10371804 BMD_1366 BMD_1367 mgsA   TRUE 0.791 11.000 0.081 NA   NA
 10371804 10371805 BMD_1367 BMD_1368     TRUE 0.930 1.000 0.210 NA   NA
 10371805 10371806 BMD_1368 BMD_1369   cca TRUE 0.900 16.000 0.126 1.000 N NA
 10371806 10371807 BMD_1369 BMD_1370 cca birA TRUE 0.981 -15.000 0.134 1.000 N NA
 10371807 10371808 BMD_1370 BMD_1371 birA panB FALSE 0.330 273.000 0.002 1.000 Y NA
 10371808 10371809 BMD_1371 BMD_1372 panB panC TRUE 0.995 2.000 0.395 0.001 Y NA
 10371809 10371810 BMD_1372 BMD_1373 panC panD TRUE 0.988 1.000 0.342 1.000 Y NA
 10371810 10371811 BMD_1373 BMD_1374 panD   FALSE 0.362 203.000 0.053 1.000 N NA
 10371811 10371812 BMD_1374 BMD_1375     FALSE 0.357 89.000 0.056 NA   NA
 10371812 10371813 BMD_1375 BMD_1376     FALSE 0.006 189.000 0.000 NA   NA
 10371813 10371814 BMD_1376 BMD_1377     FALSE 0.304 12.000 0.000 1.000   NA
 10371814 10371815 BMD_1377 BMD_1378   aspB TRUE 0.624 134.000 0.367 1.000   NA
 10371815 10371816 BMD_1378 BMD_1379 aspB asnS FALSE 0.476 158.000 0.094 1.000 N NA
 10371816 10371817 BMD_1379 BMD_1380 asnS   FALSE 0.219 337.000 0.234 NA N NA
 10371817 10371818 BMD_1380 BMD_1381   nth FALSE 0.617 141.000 0.075 NA Y NA
 10371818 10371819 BMD_1381 BMD_1382 nth   TRUE 0.901 -13.000 0.034 NA   NA
 10371820 10371821 BMD_1383 BMD_1384 ponA recU FALSE 0.571 64.000 0.062 1.000   NA
 10371822 10371823 BMD_1385 BMD_1386     FALSE 0.002 290.000 0.000 NA   NA
 10371823 10371824 BMD_1386 BMD_1387     FALSE 0.025 46.000 0.000 NA   NA
 10371825 10371826 BMD_1388 BMD_1389     FALSE 0.508 127.000 0.263 NA   NA
 10371828 10371829 BMD_1391 BMD_1392     FALSE 0.006 146.000 0.000 NA   NA
 11490342 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4529.000 0.000 NA   NA
 11632705 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4529.000 0.000 NA   NA
 11775097 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4529.000 0.000 NA   NA
 11490343 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4558.000 0.000 NA   NA
 11632706 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4558.000 0.000 NA   NA
 11775098 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4558.000 0.000 NA   NA
 11490344 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4601.000 0.000 NA   NA
 11632707 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4601.000 0.000 NA   NA
 11775099 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4601.000 0.000 NA   NA
 11490345 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4630.000 0.000 NA   NA
 11632708 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4630.000 0.000 NA   NA
 11775100 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4630.000 0.000 NA   NA
 11490346 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4673.000 0.000 NA   NA
 11632709 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4673.000 0.000 NA   NA
 11775101 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4673.000 0.000 NA   NA
 11490347 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4702.000 0.000 NA   NA
 11632710 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4702.000 0.000 NA   NA
 11775102 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4702.000 0.000 NA   NA
 11490348 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4721.000 0.000 NA   NA
 11632711 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4721.000 0.000 NA   NA
 11775103 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4721.000 0.000 NA   NA
 11490349 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4750.000 0.000 NA   NA
 11632712 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4750.000 0.000 NA   NA
 11775104 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4750.000 0.000 NA   NA
 11490350 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4781.000 0.000 NA   NA
 11632713 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4781.000 0.000 NA   NA
 11775105 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4781.000 0.000 NA   NA
 11490351 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4810.000 0.000 NA   NA
 11632714 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4810.000 0.000 NA   NA
 11775106 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4810.000 0.000 NA   NA
 11490352 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4841.000 0.000 NA   NA
 11632715 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4841.000 0.000 NA   NA
 11775107 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4841.000 0.000 NA   NA
 10371830 10371831 BMD_1393 BMD_1394 cotH cotB FALSE 0.007 131.000 0.000 NA   NA
 10371831 10371832 BMD_1394 BMD_1395 cotB   FALSE 0.018 65.000 0.000 NA   NA
 10371832 10371833 BMD_1395 BMD_1396   metB FALSE 0.001 357.000 0.000 NA   NA
 10371833 10371834 BMD_1396 BMD_1397 metB metC TRUE 0.998 -16.000 0.600 0.006 Y NA
 10371835 10371836 BMD_1398 BMD_1399     FALSE 0.019 63.000 0.000 NA   NA
 10371836 10371837 BMD_1399 BMD_1400     FALSE 0.014 83.000 0.000 NA   NA
 10371837 10371838 BMD_1400 BMD_1401   opuE FALSE 0.034 31.000 0.000 NA   NA
 10371838 10371839 BMD_1401 BMD_1402 opuE   FALSE 0.002 293.000 0.000 NA   NA
 10371840 10371841 BMD_1403 BMD_1404   cspA FALSE 0.002 288.000 0.000 NA   NA
 10371841 10371842 BMD_1404 BMD_1405 cspA   FALSE 0.010 105.000 0.000 NA   NA
 10371843 10371844 BMD_1406 BMD_1407     FALSE 0.006 151.000 0.000 NA   NA
 10371844 10371845 BMD_1407 BMD_1408     FALSE 0.006 150.000 0.000 NA   NA
 10371846 10371847 BMD_1409 BMD_1410     TRUE 0.787 5.000 0.015 1.000   NA
 10371847 10371848 BMD_1410 BMD_1411   cotD FALSE 0.001 347.000 0.000 NA   NA
 10371848 10371849 BMD_1411 BMD_1412 cotD   FALSE 0.018 65.000 0.000 NA   NA
 10371849 10371850 BMD_1412 BMD_1413     FALSE 0.249 -25.000 0.000 NA   NA
 10371850 10371851 BMD_1413 BMD_1414   gpsB FALSE 0.200 -10.000 0.000 NA   NA
 10371851 10371852 BMD_1414 BMD_1415 gpsB liaI FALSE 0.000 717.000 0.000 NA   NA
 10371852 10371853 BMD_1415 BMD_1416 liaI liaH TRUE 0.881 37.000 0.514 NA   NA
 10371853 10371854 BMD_1416 BMD_1417 liaH liaF FALSE 0.436 136.000 0.210 NA   NA
 10371854 10371855 BMD_1417 BMD_1418 liaF liaS TRUE 0.980 -3.000 0.679 NA   NA
 10371855 10371856 BMD_1418 BMD_1419 liaS liaR TRUE 0.998 -7.000 0.853 0.022 Y NA
 10371856 10371857 BMD_1419 BMD_1420 liaR malL FALSE 0.187 133.000 0.000 1.000 N NA
 10371857 10371858 BMD_1420 BMD_1421 malL   FALSE 0.081 260.000 0.000 1.000 N NA
 10371860 10371861 BMD_1423 BMD_1424     FALSE 0.023 52.000 0.000 NA   NA
 10371862 10371863 BMD_1425 BMD_1426     TRUE 0.990 15.000 0.600 0.035 Y NA
 10371863 10371864 BMD_1426 BMD_1427     TRUE 0.993 -16.000 0.053 0.035 Y NA
 10371864 10371865 BMD_1427 BMD_1428   msmX TRUE 0.878 37.000 0.000 0.035 Y NA
 10371866 10371867 BMD_1429 BMD_1430     FALSE 0.004 224.000 0.000 NA   NA
 10371867 10371868 BMD_1430 BMD_1431     FALSE 0.560 125.000 0.118 1.000 N NA
 10371868 10371869 BMD_1431 BMD_1432   xpt FALSE 0.129 303.000 0.009 1.000 N NA
 10371869 10371870 BMD_1432 BMD_1433 xpt   TRUE 0.968 2.000 0.056 1.000 Y NA
 10371874 10371875 BMD_1437 BMD_1438     FALSE 0.116 225.000 0.000 1.000 N NA
 10371875 10371876 BMD_1438 BMD_1439     TRUE 0.940 6.000 0.279 1.000   NA
 10371876 10371877 BMD_1439 BMD_1440     FALSE 0.051 375.000 0.029 1.000   NA
 10371877 10371878 BMD_1440 BMD_1441     TRUE 0.698 6.000 0.026 NA   NA
 10371878 10371879 BMD_1441 BMD_1442     FALSE 0.139 -3.000 0.000 NA   NA
 10371879 10371880 BMD_1442 BMD_1443     FALSE 0.010 106.000 0.000 NA   NA
 10371880 10371881 BMD_1443 BMD_1444     FALSE 0.007 131.000 0.000 NA   NA
 10371881 10371882 BMD_1444 BMD_1445     FALSE 0.324 62.000 0.017 NA   NA
 10371884 10371885 BMD_1447 BMD_1448 rnhA   TRUE 0.918 30.000 0.680 NA   NA
 10371885 10371886 BMD_1448 BMD_1449     TRUE 0.849 57.000 0.542 NA   NA
 10371888 10371889 BMD_1451 BMD_1452     FALSE 0.002 303.000 0.000 NA   NA
 10371889 10371890 BMD_1452 BMD_1453     FALSE 0.037 169.000 0.000 1.000   NA
 10371892 10371893 BMD_1455 BMD_1456   dppA FALSE 0.006 141.000 0.000 NA   NA
 10371893 10371894 BMD_1456 BMD_1457 dppA dppB TRUE 0.977 15.000 0.500 NA Y NA
 10371894 10371895 BMD_1457 BMD_1458 dppB dppC TRUE 0.996 2.000 0.909 0.035 Y NA
 10371895 10371896 BMD_1458 BMD_1459 dppC dppD FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10371896 10371897 BMD_1459 BMD_1460 dppD dppE FALSE 0.044 24.000 0.000 NA   NA
 10371897 10371898 BMD_1460 BMD_1461 dppE   TRUE 0.776 89.000 0.333 NA N NA
 10371898 10371899 BMD_1461 BMD_1462     TRUE 0.804 29.000 0.095 NA N NA
 10371899 10371900 BMD_1462 BMD_1463   ykfD TRUE 0.951 13.000 0.400 NA N NA
 10371900 10371901 BMD_1463 BMD_1464 ykfD   TRUE 0.982 -3.000 0.333 1.000 N NA
 10371901 10371902 BMD_1464 BMD_1465     FALSE 0.001 342.000 0.000 NA   NA
 10371902 10371903 BMD_1465 BMD_1466     FALSE 0.009 110.000 0.000 NA   NA
 10371903 10371904 BMD_1466 BMD_1467     FALSE 0.310 87.000 0.000 1.000 N NA
 10371905 10371906 BMD_1468 BMD_1469     FALSE 0.013 89.000 0.000 NA   NA
 10371907 10371908 BMD_1470 BMD_1471     FALSE 0.001 338.000 0.000 NA   NA
 10371909 10371910 BMD_1472 BMD_1473 desR desK TRUE 0.998 -3.000 1.000 0.021 Y NA
 10371910 10371911 BMD_1473 BMD_1474 desK des TRUE 0.705 123.000 0.294 1.000 N NA
 10371912 10371913 BMD_1475 BMD_1476     FALSE 0.006 157.000 0.000 NA   NA
 10371913 10371914 BMD_1476 BMD_1477   cls FALSE 0.003 258.000 0.000 NA   NA
 10371914 10371915 BMD_1477 BMD_1478 cls   FALSE 0.029 36.000 0.000 NA   NA
 10371915 10371916 BMD_1478 BMD_1479     FALSE 0.013 85.000 0.000 NA   NA
 10371916 10371917 BMD_1479 BMD_1480     FALSE 0.004 218.000 0.000 NA   NA
 10371917 10371918 BMD_1480 BMD_1481     FALSE 0.013 288.000 0.000 1.000   NA
 10371918 10371919 BMD_1481 BMD_1482   galU FALSE 0.459 47.000 0.000 1.000 N NA
 10371919 10371920 BMD_1482 BMD_1483 galU   FALSE 0.254 104.000 0.000 1.000 N NA
 10371922 10371923 BMD_1485 BMD_1486     FALSE 0.006 154.000 0.000 NA   NA
 10371923 10371924 BMD_1486 BMD_1487     FALSE 0.040 155.000 0.000 1.000   NA
 10371924 10371925 BMD_1487 BMD_1488   selA TRUE 0.993 -22.000 0.750 1.000   NA
 10371925 10371926 BMD_1488 BMD_1489 selA   TRUE 0.970 2.000 0.679 NA   NA
 10371926 10371927 BMD_1489 BMD_1490     TRUE 0.850 29.000 0.283 NA   NA
 10371927 10371928 BMD_1490 BMD_1491     TRUE 0.959 12.000 0.333 1.000 N NA
 10371928 10371929 BMD_1491 BMD_1492     FALSE 0.339 79.000 0.000 1.000 N NA
 10371929 10371930 BMD_1492 BMD_1493     FALSE 0.081 85.000 0.000 1.000   NA
 10371930 10371931 BMD_1493 BMD_1494     FALSE 0.046 19.000 0.000 NA   NA
 10371931 10371932 BMD_1494 BMD_1495     FALSE 0.003 252.000 0.000 NA   NA
 10371932 10371933 BMD_1495 BMD_1496     FALSE 0.006 141.000 0.000 NA   NA
 10371933 10371934 BMD_1496 BMD_1497     FALSE 0.181 143.000 0.000 1.000 N NA
 10371934 10371935 BMD_1497 BMD_1498     FALSE 0.143 202.000 0.000 1.000 N NA
 10371935 10371936 BMD_1498 BMD_1499   bsn TRUE 0.974 -3.000 0.200 1.000 N NA
 10371938 10371939 BMD_1501 BMD_1502     FALSE 0.168 34.000 0.000 1.000   NA
 10371939 10371940 BMD_1502 BMD_1503     FALSE 0.398 62.000 0.000 1.000 N NA
 10371940 10371941 BMD_1503 BMD_1504     FALSE 0.141 46.000 0.000 1.000   NA
 10371944 10371945 BMD_1507 BMD_1508 fhuG fhuB TRUE 0.997 -3.000 0.857 0.035 Y NA
 10371945 10371946 BMD_1508 BMD_1509 fhuB fhuD TRUE 0.931 82.000 0.487 1.000 Y NA
 10371946 10371947 BMD_1509 BMD_1510 fhuD fhuC TRUE 0.990 1.000 0.455 1.000 Y NA
 10371948 10371949 BMD_1511 BMD_1512   megL FALSE 0.175 157.000 0.000 1.000 N NA
 10371949 10371950 BMD_1512 BMD_1513 megL   FALSE 0.131 213.000 0.000 1.000 N NA
 10371950 10371951 BMD_1513 BMD_1514     FALSE 0.050 118.000 0.000 1.000   NA
 10371951 10371952 BMD_1514 BMD_1515     FALSE 0.006 143.000 0.000 NA   NA
 10371952 10371953 BMD_1515 BMD_1516     FALSE 0.023 51.000 0.000 NA   NA
 10371955 10371956 BMD_1518 BMD_1519   hxlA FALSE 0.073 202.000 0.000 NA N NA
 10371956 10371957 BMD_1519 BMD_1520 hxlA   FALSE 0.038 360.000 0.000 1.000 N NA
 10371957 10371958 BMD_1520 BMD_1521     TRUE 0.813 31.000 0.000 1.000 Y NA
 10371958 10371959 BMD_1521 BMD_1522     TRUE 0.796 67.000 0.185 1.000 N NA
 10371959 10371960 BMD_1522 BMD_1523   opuAA FALSE 0.333 81.000 0.000 1.000 N NA
 10371960 10371961 BMD_1523 BMD_1524 opuAA opuAB TRUE 0.994 3.000 0.600 0.095 Y NA
 10371961 10371962 BMD_1524 BMD_1525 opuAB opuAC TRUE 0.970 22.000 0.111 0.035 Y NA
 10371962 10371963 BMD_1525 BMD_1526 opuAC pyk FALSE 0.194 130.000 0.000 1.000 N NA
 10371963 10371964 BMD_1526 BMD_1527 pyk   FALSE 0.018 496.000 0.000 1.000 N NA
 10371964 10371965 BMD_1527 BMD_1528     TRUE 0.958 19.000 0.169 1.000 Y NA
 10371966 10371967 BMD_1529 BMD_1530     FALSE 0.163 184.000 0.000 1.000 N NA
 10371968 10371969 BMD_1531 BMD_1532     FALSE 0.167 172.000 0.000 1.000 N NA
 10371969 10371970 BMD_1532 BMD_1533     FALSE 0.158 37.000 0.000 1.000   NA
 10371970 10371971 BMD_1533 BMD_1534   ggt FALSE 0.022 231.000 0.000 1.000   NA
 10371973 10371974 BMD_1536 BMD_1537 sacB sacC TRUE 0.665 98.000 0.250 1.000   NA
 10371974 10371975 BMD_1537 BMD_1538 sacC   FALSE 0.242 108.000 0.000 1.000 N NA
 10371975 10371976 BMD_1538 BMD_1539     FALSE 0.059 302.000 0.000 1.000 N NA
 10371976 10371977 BMD_1539 BMD_1540     FALSE 0.019 479.000 0.000 1.000 N NA
 10371977 10371978 BMD_1540 BMD_1541     TRUE 0.856 38.000 0.165 1.000 N NA
 10371978 10371979 BMD_1541 BMD_1542     FALSE 0.004 212.000 0.000 NA   NA
 10371979 10371980 BMD_1542 BMD_1543     FALSE 0.001 354.000 0.000 NA   NA
 10371980 10371981 BMD_1543 BMD_1544     FALSE 0.003 261.000 0.000 NA   NA
 10371981 10371982 BMD_1544 BMD_1545     FALSE 0.005 205.000 0.000 NA   NA
 10371982 10371983 BMD_1545 BMD_1546     FALSE 0.027 483.000 0.000 0.041   NA
 10371983 10371984 BMD_1546 BMD_1547     FALSE 0.040 152.000 0.000 1.000   NA
 10371984 10371985 BMD_1547 BMD_1548     FALSE 0.261 -37.000 0.000 NA   NA
 10371987 10371988 BMD_1550 BMD_1551     TRUE 0.863 128.000 0.167 0.014 Y NA
 10371988 10371989 BMD_1551 BMD_1552     FALSE 0.016 71.000 0.000 NA   NA
 10371990 10371991 BMD_1553 BMD_1554     FALSE 0.004 228.000 0.000 NA   NA
 10371992 10371993 BMD_1555 BMD_1556     FALSE 0.001 429.000 0.000 NA   NA
 10371997 10371998 BMD_1560 BMD_1561     FALSE 0.006 155.000 0.000 NA   NA
 10371998 10371999 BMD_1561 BMD_1562     FALSE 0.006 158.000 0.000 NA   NA
 10372000 10372001 BMD_1563 BMD_1564 sspA fruR FALSE 0.074 91.000 0.000 1.000   NA
 10372002 10372003 BMD_1565 BMD_1566   cscA TRUE 0.847 13.000 0.094 1.000   NA
 10372003 10372004 BMD_1566 BMD_1567 cscA   FALSE 0.002 274.000 0.000 NA   NA
 10372004 10372005 BMD_1567 BMD_1568   sacB FALSE 0.001 477.000 0.000 NA   NA
 10372005 10372006 BMD_1568 BMD_1569 sacB levR FALSE 0.008 354.000 0.000 1.000   NA
 10372006 10372007 BMD_1569 BMD_1570 levR levD FALSE 0.150 318.000 0.000 0.008 N NA
 10372007 10372008 BMD_1570 BMD_1571 levD levE TRUE 0.997 -3.000 0.750 0.007 Y NA
 10372008 10372009 BMD_1571 BMD_1572 levE levF TRUE 0.994 13.000 1.000 0.007 Y NA
 10372009 10372010 BMD_1572 BMD_1573 levF levG TRUE 0.975 27.000 0.190 0.007 Y NA
 10372010 10372011 BMD_1573 BMD_1574 levG sacC FALSE 0.612 87.000 0.143 1.000   NA
 10372012 10372013 BMD_1575 BMD_1576     TRUE 0.973 28.000 0.182 0.007 Y NA
 10372013 10372014 BMD_1576 BMD_1577     TRUE 0.978 38.000 0.455 0.035 Y NA
 10372015 10372016 BMD_1578 BMD_1579 met metN TRUE 0.986 13.000 0.880 NA Y NA
 10372016 10372017 BMD_1579 BMD_1580 metN met TRUE 0.993 1.000 0.846 1.000 Y NA
 10372018 10372019 BMD_1581 BMD_1582     FALSE 0.113 119.000 0.000 NA N NA
 10372019 10372020 BMD_1582 BMD_1583     FALSE 0.284 47.000 0.000 NA N NA
 10372021 10372022 BMD_1584 BMD_1585 metQ metN TRUE 0.661 57.000 0.000 NA Y NA
 10372022 10372023 BMD_1585 BMD_1586 metN   TRUE 0.997 -61.000 0.487 1.000 Y NA
 10372025 10372026 BMD_1588 BMD_1589     FALSE 0.434 22.000 0.000 NA N NA
 10372026 10372027 BMD_1589 BMD_1590   map FALSE 0.011 432.000 0.000 NA N NA
 10372027 10372028 BMD_1590 BMD_1591 map   FALSE 0.004 212.000 0.000 NA   NA
 10372028 10372029 BMD_1591 BMD_1592     FALSE 0.000 611.000 0.000 NA   NA
 10372031 10372032 BMD_1594 BMD_1595     FALSE 0.028 38.000 0.000 NA   NA
 10372032 10372033 BMD_1595 BMD_1596   hutH FALSE 0.008 355.000 0.000 1.000   NA
 10372033 10372034 BMD_1596 BMD_1597 hutH hutU TRUE 0.972 51.000 0.315 0.001 Y NA
 10372034 10372035 BMD_1597 BMD_1598 hutU hutI TRUE 0.889 17.000 0.110 1.000 N NA
 10372035 10372036 BMD_1598 BMD_1599 hutI hutG TRUE 0.965 -25.000 0.013 1.000 N NA
 10372037 10372038 BMD_1600 BMD_1601     FALSE 0.486 39.000 0.000 1.000 N NA
 10372039 10372040 BMD_1602 BMD_1603   iadA FALSE 0.018 64.000 0.000 NA   NA
 10372040 10372041 BMD_1603 BMD_1604 iadA   FALSE 0.527 93.000 0.025 1.000 N NA
 10372041 10372042 BMD_1604 BMD_1605     FALSE 0.121 220.000 0.000 1.000 N NA
 10372042 10372043 BMD_1605 BMD_1606     FALSE 0.011 425.000 0.000 NA N NA
 10372043 10372044 BMD_1606 BMD_1607     FALSE 0.006 181.000 0.000 NA   NA
 10372046 10372047 BMD_1609 BMD_1610     FALSE 0.022 54.000 0.000 NA   NA
 10372047 10372048 BMD_1610 BMD_1611     FALSE 0.006 145.000 0.000 NA   NA
 10372050 10372051 BMD_1613 BMD_1614     TRUE 0.828 20.000 0.109 1.000   NA
 10372055 10372056 BMD_1618 BMD_1619     FALSE 0.006 161.000 0.000 NA   NA
 10372056 10372057 BMD_1619 BMD_1620     FALSE 0.000 806.000 0.000 NA   NA
 10372057 10372058 BMD_1620 BMD_1621     FALSE 0.001 380.000 0.000 NA   NA
 10372058 10372059 BMD_1621 BMD_1622     FALSE 0.002 972.000 0.000 1.000   NA
 10372059 10372060 BMD_1622 BMD_1623     FALSE 0.002 305.000 0.000 NA   NA
 10372062 10372063 BMD_1625 BMD_1626 lytF   FALSE 0.006 146.000 0.000 NA   NA
 10372064 10372065 BMD_1627 BMD_1628     FALSE 0.002 266.000 0.000 NA   NA
 10372068 10372069 BMD_1631 BMD_1632     FALSE 0.063 12.000 0.000 NA   NA
 10372071 10372072 BMD_1634 BMD_1635     FALSE 0.169 166.000 0.000 1.000 N NA
 10372072 10372073 BMD_1635 BMD_1636     FALSE 0.003 250.000 0.000 NA   NA
 10372074 10372075 BMD_1637 BMD_1638     FALSE 0.003 233.000 0.000 NA   NA
 10372076 10372077 BMD_1639 BMD_1640     FALSE 0.002 283.000 0.000 NA   NA
 10372078 10372079 BMD_1641 BMD_1642 ykoH ykoG TRUE 0.975 -22.000 0.000 1.000 Y NA
 10372079 10372080 BMD_1642 BMD_1643 ykoG   FALSE 0.071 93.000 0.000 1.000   NA
 10372081 10372082 BMD_1644 BMD_1645 ugtP   TRUE 0.961 2.000 0.043 0.018 N NA
 10372082 10372083 BMD_1645 BMD_1646     FALSE 0.003 248.000 0.000 NA   NA
 10372083 10372084 BMD_1646 BMD_1647     FALSE 0.015 76.000 0.000 NA   NA
 10372084 10372085 BMD_1647 BMD_1648     FALSE 0.041 26.000 0.000 NA   NA
 10372086 10372087 BMD_1649 BMD_1650     TRUE 0.749 20.000 0.000 0.009   NA
 10372087 10372088 BMD_1650 BMD_1651     FALSE 0.295 133.000 0.000 0.009   NA
 10372088 10372089 BMD_1651 BMD_1652   cax FALSE 0.026 476.000 0.000 0.071   NA
 10372090 10372091 BMD_1653 BMD_1654     TRUE 0.692 149.000 0.333 1.000 N NA
 10372091 10372092 BMD_1654 BMD_1655   mmsA TRUE 0.789 36.000 0.000 1.000 Y NA
 10372092 10372093 BMD_1655 BMD_1656 mmsA   FALSE 0.033 379.000 0.000 1.000 N NA
 10372093 10372094 BMD_1656 BMD_1657   hisD FALSE 0.068 284.000 0.000 1.000 N NA
 10372094 10372095 BMD_1657 BMD_1658 hisD   FALSE 0.345 218.000 0.000 1.000 Y NA
 10372095 10372096 BMD_1658 BMD_1659     FALSE 0.491 38.000 0.000 1.000 N NA
 10372096 10372097 BMD_1659 BMD_1660     TRUE 0.953 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 10372100 10372101 BMD_1663 BMD_1664     FALSE 0.000 546.000 0.000 NA   NA
 10372102 10372103 BMD_1665 BMD_1666     FALSE 0.043 345.000 0.000 1.000 N NA
 10372103 10372104 BMD_1666 BMD_1667     FALSE 0.000 689.000 0.000 NA   NA
 10372104 10372105 BMD_1667 BMD_1668   cotF TRUE 0.765 18.000 0.105 NA   NA
 10372105 10372106 BMD_1668 BMD_1669 cotF   FALSE 0.003 258.000 0.000 NA   NA
 10372106 10372107 BMD_1669 BMD_1670     FALSE 0.000 727.000 0.000 NA   NA
 10372113 10372114 BMD_1676 BMD_1677     FALSE 0.004 215.000 0.000 NA   NA
 10372115 10372116 BMD_1678 BMD_1679 qacC qacC TRUE 0.967 0.000 0.000 0.071 Y NA
 10372118 10372119 BMD_1681 BMD_1682   cspA FALSE 0.000 883.000 0.000 NA   NA
 10372121 10372122 BMD_1684 BMD_1685     FALSE 0.113 352.000 0.179 NA   NA
 10372123 10372124 BMD_1686 BMD_1687     FALSE 0.003 253.000 0.000 NA   NA
 10372127 10372128 BMD_1690 BMD_1691   sspH FALSE 0.008 117.000 0.000 NA   NA
 10372129 10372130 BMD_1692 BMD_1693     FALSE 0.019 62.000 0.000 NA   NA
 10372130 10372131 BMD_1693 BMD_1694   dapA FALSE 0.000 565.000 0.000 NA   NA
 10372132 10372133 BMD_1695 BMD_1696     FALSE 0.439 66.000 0.000 0.094   NA
 10372138 10372139 BMD_1701 BMD_1702   nikA FALSE 0.015 552.000 0.000 1.000 N NA
 10372139 10372140 BMD_1702 BMD_1703 nikA nikB TRUE 0.991 17.000 0.833 0.045 Y NA
 10372140 10372141 BMD_1703 BMD_1704 nikB nikC TRUE 0.995 -3.000 0.200 0.001 Y NA
 10372141 10372142 BMD_1704 BMD_1705 nikC nikD TRUE 0.989 17.000 0.429 0.001 Y NA
 10372142 10372143 BMD_1705 BMD_1706 nikD nikE TRUE 0.967 33.000 0.129 0.001 Y NA
 10372143 10372144 BMD_1706 BMD_1707 nikE   FALSE 0.449 102.000 0.006 1.000 N NA
 10372144 10372145 BMD_1707 BMD_1708     FALSE 0.000 581.000 0.000 NA   NA
 10372145 10372146 BMD_1708 BMD_1709     FALSE 0.000 533.000 0.000 NA   NA
 10372146 10372147 BMD_1709 BMD_1710     FALSE 0.244 118.000 0.049 NA   NA
 10372147 10372148 BMD_1710 BMD_1711     FALSE 0.001 506.000 0.000 NA   NA
 10372148 10372149 BMD_1711 BMD_1712     FALSE 0.008 116.000 0.000 NA   NA
 10372149 10372150 BMD_1712 BMD_1713     FALSE 0.001 365.000 0.000 NA   NA
 10372150 10372151 BMD_1713 BMD_1714     FALSE 0.008 120.000 0.000 NA   NA
 10372152 10372153 BMD_1715 BMD_1716     FALSE 0.001 478.000 0.000 NA   NA
 10372154 10372155 BMD_1717 BMD_1718     FALSE 0.004 230.000 0.000 NA   NA
 10372155 10372156 BMD_1718 BMD_1719     FALSE 0.024 227.000 0.000 1.000   NA
 10372158 10372159 BMD_1721 BMD_1722     FALSE 0.304 12.000 0.000 1.000   NA
 10372159 10372160 BMD_1722 BMD_1723     FALSE 0.001 372.000 0.000 NA   NA
 10372163 10372164 BMD_1726 BMD_1727 recA1 arsC FALSE 0.018 492.000 0.000 1.000 N NA
 10372164 10372165 BMD_1727 BMD_1728 arsC arsB FALSE 0.043 25.000 0.000 NA   NA
 10372165 10372166 BMD_1728 BMD_1729 arsB   FALSE 0.046 19.000 0.000 NA   NA
 10372167 10372168 BMD_1730 BMD_1731 cspC   FALSE 0.002 276.000 0.000 NA   NA
 10372168 10372169 BMD_1731 BMD_1732     FALSE 0.003 256.000 0.000 NA   NA
 10372169 10372170 BMD_1732 BMD_1733     FALSE 0.008 115.000 0.000 NA   NA
 10372170 10372171 BMD_1733 BMD_1734     FALSE 0.002 318.000 0.000 NA   NA
 10372171 10372172 BMD_1734 BMD_1735     FALSE 0.039 27.000 0.000 NA   NA
 10372172 10372173 BMD_1735 BMD_1736     FALSE 0.001 500.000 0.000 NA   NA
 10372173 10372174 BMD_1736 BMD_1737     FALSE 0.006 176.000 0.000 NA   NA
 10372176 10372177 BMD_1739 BMD_1740     FALSE 0.264 -39.000 0.000 NA   NA
 10372180 10372181 BMD_1743 BMD_1744     TRUE 0.822 101.000 0.462 1.000 N NA
 10372184 10372185 BMD_1747 BMD_1748 gerKA gerKC TRUE 0.996 -10.000 0.889 0.009   NA
 10372185 10372186 BMD_1748 BMD_1749 gerKC gerKB TRUE 0.978 22.000 0.900 0.009   NA
 10372186 10372187 BMD_1749 BMD_1750 gerKB   FALSE 0.222 208.000 0.000 0.009   NA
 10372187 10372188 BMD_1750 BMD_1751     FALSE 0.216 212.000 0.000 0.009   NA
 10372188 10372189 BMD_1751 BMD_1752     FALSE 0.001 485.000 0.000 NA   NA
 10372189 10372190 BMD_1752 BMD_1753     FALSE 0.000 887.000 0.000 NA   NA
 10372191 10372192 BMD_1754 BMD_1755     FALSE 0.000 683.000 0.000 NA   NA
 10372193 10372194 BMD_1756 BMD_1757 gerUC   FALSE 0.010 316.000 0.000 1.000   NA
 10372195 10372196 BMD_1758 BMD_1759   psiE FALSE 0.002 685.000 0.000 1.000   NA
 10372196 10372197 BMD_1759 BMD_1760 psiE   FALSE 0.000 712.000 0.000 NA   NA
 10372198 10372199 BMD_1761 BMD_1762   rsbR FALSE 0.013 89.000 0.000 NA   NA
 10372200 10372201 BMD_1763 BMD_1764 ykoH ykoG TRUE 0.975 -22.000 0.000 1.000 Y NA
 10372201 10372202 BMD_1764 BMD_1765 ykoG   FALSE 0.118 59.000 0.000 1.000   NA
 10372203 10372204 BMD_1766 BMD_1767     FALSE 0.000 520.000 0.000 NA   NA
 10372206 10372207 BMD_1769 BMD_1770   hutH FALSE 0.060 312.000 0.044 NA   NA
 10372207 10372208 BMD_1770 BMD_1771 hutH hutU TRUE 0.862 218.000 0.315 0.001 Y NA
 10372208 10372209 BMD_1771 BMD_1772 hutU hutI TRUE 0.888 20.000 0.110 1.000 N NA
 10372209 10372210 BMD_1772 BMD_1773 hutI hutG TRUE 0.965 -25.000 0.013 1.000 N NA
 10372210 10372211 BMD_1773 BMD_1774 hutG   FALSE 0.131 107.000 0.000 NA N NA
 10372211 10372212 BMD_1774 BMD_1775     FALSE 0.000 753.000 0.000 NA   NA
 10372212 10372213 BMD_1775 BMD_1776     FALSE 0.001 384.000 0.000 NA   NA
 10372213 10372214 BMD_1776 BMD_1777     FALSE 0.002 1890.000 0.000 1.000   NA
 10372214 10372215 BMD_1777 BMD_1778   aspA TRUE 0.875 36.000 0.200 1.000 N NA
 10372216 10372217 BMD_1779 BMD_1780 cotF   FALSE 0.047 17.000 0.000 NA   NA
 10372217 10372218 BMD_1780 BMD_1781     FALSE 0.014 84.000 0.000 NA   NA
 10372219 10372220 BMD_1782 BMD_1783 ysnF   FALSE 0.001 332.000 0.000 NA   NA
 10372220 10372221 BMD_1783 BMD_1784     FALSE 0.001 389.000 0.000 NA   NA
 10372221 10372222 BMD_1784 BMD_1785     FALSE 0.289 82.000 0.024 NA   NA
 10372222 10372223 BMD_1785 BMD_1786     FALSE 0.004 229.000 0.000 NA   NA
 10372225 10372226 BMD_1788 BMD_1789     FALSE 0.000 1847.000 0.000 NA   NA
 10372227 10372228 BMD_1790 BMD_1791     FALSE 0.013 86.000 0.000 NA   NA
 10372229 10372230 BMD_1792 BMD_1793     FALSE 0.003 238.000 0.000 NA   NA
 10372231 10372232 BMD_1794 BMD_1795     FALSE 0.000 768.000 0.000 NA   NA
 10372232 10372233 BMD_1795 BMD_1796     FALSE 0.005 198.000 0.000 NA   NA
 10372234 10372235 BMD_1797 BMD_1798     FALSE 0.000 558.000 0.000 NA   NA
 10372237 10372238 BMD_1800 BMD_1801     FALSE 0.015 78.000 0.000 NA   NA
 10372238 10372239 BMD_1801 BMD_1802     FALSE 0.006 144.000 0.000 NA   NA
 10372241 10372242 BMD_1804 BMD_1805     FALSE 0.000 523.000 0.000 NA   NA
 10372244 10372245 BMD_1807 BMD_1808     FALSE 0.006 154.000 0.000 NA   NA
 10372246 10372247 BMD_1809 BMD_1810     TRUE 0.949 16.000 0.841 NA   NA
 10372247 10372248 BMD_1810 BMD_1811     FALSE 0.007 127.000 0.000 NA   NA
 10372248 10372249 BMD_1811 BMD_1812     FALSE 0.004 223.000 0.000 NA   NA
 10372249 10372250 BMD_1812 BMD_1813     TRUE 0.959 11.000 0.750 NA   NA
 10372251 10372252 BMD_1814 BMD_1815     FALSE 0.001 328.000 0.000 NA   NA
 10372252 10372253 BMD_1815 BMD_1816     FALSE 0.046 19.000 0.000 NA   NA
 10372253 10372254 BMD_1816 BMD_1817     FALSE 0.139 -3.000 0.000 NA   NA
 10372254 10372255 BMD_1817 BMD_1818     FALSE 0.253 -28.000 0.000 NA   NA
 10372256 10372257 BMD_1819 BMD_1820     FALSE 0.002 285.000 0.000 NA   NA
 10372258 10372259 BMD_1821 BMD_1822     FALSE 0.046 23.000 0.000 NA   NA
 10372262 10372263 BMD_1825 BMD_1826 brnQ   FALSE 0.003 493.000 0.000 1.000   NA
 10372264 10372265 BMD_1827 BMD_1828     FALSE 0.056 14.000 0.000 NA   NA
 10372265 10372266 BMD_1828 BMD_1829     FALSE 0.007 133.000 0.000 NA   NA
 10372266 10372267 BMD_1829 BMD_1830     FALSE 0.000 1012.000 0.000 NA   NA
 10372269 10372270 BMD_1832 BMD_1833     TRUE 0.962 60.000 0.333 0.034 Y NA
 10372270 10372271 BMD_1833 BMD_1834     TRUE 0.985 16.000 0.333 0.034 Y NA
 10372271 10372272 BMD_1834 BMD_1835     TRUE 0.995 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 10372272 10372273 BMD_1835 BMD_1836     TRUE 0.998 -7.000 1.000 0.002 Y NA
 10372273 10372274 BMD_1836 BMD_1837     FALSE 0.003 232.000 0.000 NA   NA
 10372274 10372275 BMD_1837 BMD_1838     FALSE 0.009 112.000 0.000 NA   NA
 10372275 10372276 BMD_1838 BMD_1839     FALSE 0.006 176.000 0.000 NA   NA
 10372276 10372277 BMD_1839 BMD_1840     FALSE 0.000 657.000 0.000 NA   NA
 10372277 10372278 BMD_1840 BMD_1841   phaZ3 FALSE 0.019 473.000 0.000 1.000 N NA
 10372278 10372279 BMD_1841 BMD_1842 phaZ3   FALSE 0.000 618.000 0.000 NA   NA
 10372283 10372284 BMD_1846 BMD_1847   tal FALSE 0.020 61.000 0.000 NA   NA
 10372286 10372287 BMD_1849 BMD_1850   mro FALSE 0.006 190.000 0.000 NA   NA
 10372288 10372289 BMD_1851 BMD_1852     FALSE 0.017 66.000 0.000 NA   NA
 10372290 10372291 BMD_1853 BMD_1854     FALSE 0.028 37.000 0.000 NA   NA
 10372295 10372296 BMD_1858 BMD_1859 xylA xylB TRUE 0.876 59.000 0.091 1.000 Y NA
 10372296 10372297 BMD_1859 BMD_1860 xylB xylT FALSE 0.012 302.000 0.000 1.000   NA
 10372297 10372298 BMD_1860 BMD_1861 xylT cyoA FALSE 0.015 747.000 0.000 0.069   NA
 10372298 10372299 BMD_1861 BMD_1862 cyoA cyoB TRUE 0.967 2.000 0.000 0.007 Y NA
 10372299 10372300 BMD_1862 BMD_1863 cyoB cyoC TRUE 0.963 2.000 0.000 0.040 Y NA
 10372300 10372301 BMD_1863 BMD_1864 cyoC cyoD TRUE 0.995 1.000 0.667 0.040 Y NA
 10372301 10372302 BMD_1864 BMD_1865 cyoD   FALSE 0.181 145.000 0.000 1.000 N NA
 10372302 10372303 BMD_1865 BMD_1866     FALSE 0.041 351.000 0.000 1.000 N NA
 10372305 10372306 BMD_1868 BMD_1869     FALSE 0.028 37.000 0.000 NA   NA
 10372306 10372307 BMD_1869 BMD_1870     FALSE 0.003 256.000 0.000 NA   NA
 10372309 10372310 BMD_1872 BMD_1873 acoA acoB TRUE 0.992 19.000 0.804 0.001 Y NA
 10372310 10372311 BMD_1873 BMD_1874 acoB acoC TRUE 0.979 26.000 0.295 0.082 Y NA
 10372311 10372312 BMD_1874 BMD_1875 acoC acoL TRUE 0.972 16.000 0.294 1.000 Y NA
 10372312 10372313 BMD_1875 BMD_1876 acoL acoR FALSE 0.414 265.000 0.259 1.000 N NA
 10372313 10372314 BMD_1876 BMD_1877 acoR bdhA FALSE 0.427 55.000 0.000 1.000 N NA
 10372314 10372315 BMD_1877 BMD_1878 bdhA   FALSE 0.083 426.000 0.000 1.000 Y NA
 10372315 10372316 BMD_1878 BMD_1879     FALSE 0.104 233.000 0.000 1.000 N NA
 10372316 10372317 BMD_1879 BMD_1880     FALSE 0.016 72.000 0.000 NA   NA
 10372318 10372319 BMD_1881 BMD_1882     FALSE 0.000 898.000 0.000 NA   NA
 10372321 10372322 BMD_1884 BMD_1885 yueF tatA FALSE 0.009 110.000 0.000 NA   NA
 10372323 10372324 BMD_1886 BMD_1887     TRUE 0.631 85.000 0.000 1.000 Y NA
 10372324 10372325 BMD_1887 BMD_1888     FALSE 0.008 118.000 0.000 NA   NA
 10372325 10372326 BMD_1888 BMD_1889     FALSE 0.003 243.000 0.000 NA   NA
 10372326 10372327 BMD_1889 BMD_1890     FALSE 0.001 388.000 0.000 NA   NA
 10372327 10372328 BMD_1890 BMD_1891     FALSE 0.004 227.000 0.000 NA   NA
 10372328 10372329 BMD_1891 BMD_1892     FALSE 0.108 381.000 0.000 1.000 Y NA
 10372329 10372330 BMD_1892 BMD_1893     TRUE 0.990 2.000 0.500 1.000 Y NA
 10372330 10372331 BMD_1893 BMD_1894     FALSE 0.009 114.000 0.000 NA   NA
 10372331 10372332 BMD_1894 BMD_1895   copZ TRUE 0.686 15.000 0.048 NA   NA
 10372332 10372333 BMD_1895 BMD_1896 copZ copA TRUE 0.906 86.000 0.077 0.001 Y NA
 10372335 10372336 BMD_1898 BMD_1899     FALSE 0.001 330.000 0.000 NA   NA
 10372336 10372337 BMD_1899 BMD_1900     FALSE 0.002 291.000 0.000 NA   NA
 10372337 10372338 BMD_1900 BMD_1901     FALSE 0.016 75.000 0.000 NA   NA
 10372340 10372341 BMD_1903 BMD_1904     TRUE 0.985 -3.000 0.957 NA   NA
 10372341 10372342 BMD_1904 BMD_1905     FALSE 0.000 587.000 0.000 NA   NA
 10372342 10372343 BMD_1905 BMD_1906   arsB TRUE 0.635 16.000 0.000 1.000 N NA
 10372343 10372344 BMD_1906 BMD_1907 arsB   FALSE 0.077 266.000 0.000 1.000 N NA
 10372344 10372345 BMD_1907 BMD_1908     FALSE 0.121 114.000 0.000 NA N NA
 10372349 10372350 BMD_1912 BMD_1913   zwf FALSE 0.153 39.000 0.000 1.000   NA
 10372352 10372353 BMD_1915 BMD_1916 ycsA   FALSE 0.023 326.000 0.000 NA N NA
 10372355 10372356 BMD_1918 BMD_1919   ribD TRUE 0.980 -3.000 0.000 0.002 Y NA
 10372356 10372357 BMD_1919 BMD_1920 ribD   FALSE 0.005 396.000 0.000 1.000   NA
 10372357 10372358 BMD_1920 BMD_1921     FALSE 0.006 151.000 0.000 NA   NA
 10372359 10372360 BMD_1922 BMD_1923     TRUE 0.782 13.000 0.087 NA   NA
 10372361 10372362 BMD_1924 BMD_1925     FALSE 0.017 66.000 0.000 NA   NA
 10372362 10372363 BMD_1925 BMD_1926     FALSE 0.001 376.000 0.000 NA   NA
 10372363 10372364 BMD_1926 BMD_1927     FALSE 0.459 137.000 0.235 NA   NA
 10372366 10372367 BMD_1929 BMD_1930   ply FALSE 0.047 123.000 0.000 1.000   NA
 10372368 10372369 BMD_1931 BMD_1932     FALSE 0.001 465.000 0.000 NA   NA
 10372370 10372371 BMD_1933 BMD_1934     FALSE 0.015 76.000 0.000 NA   NA
 10372375 10372376 BMD_1938 BMD_1939 fhs   FALSE 0.302 274.000 0.355 NA   NA
 10372376 10372377 BMD_1939 BMD_1940     FALSE 0.593 62.000 0.122 NA   NA
 10372377 10372378 BMD_1940 BMD_1941     FALSE 0.271 125.000 0.026 1.000   NA
 10372378 10372379 BMD_1941 BMD_1942   yfmR TRUE 0.941 -19.000 0.031 1.000   NA
 10372379 10372380 BMD_1942 BMD_1943 yfmR   FALSE 0.108 64.000 0.000 1.000   NA
 10372382 10372383 BMD_1945 BMD_1946     FALSE 0.271 132.000 0.081 NA   NA
 10372383 10372384 BMD_1946 BMD_1947     FALSE 0.001 354.000 0.000 NA   NA
 10372384 10372385 BMD_1947 BMD_1948     FALSE 0.006 189.000 0.000 NA   NA
 10372385 10372386 BMD_1948 BMD_1949     FALSE 0.018 483.000 0.000 1.000 N NA
 10372386 10372387 BMD_1949 BMD_1950     FALSE 0.013 89.000 0.000 NA   NA
 10372387 10372388 BMD_1950 BMD_1951   cbiB FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10372388 10372389 BMD_1951 BMD_1952 cbiB cobD TRUE 0.992 -25.000 0.112 0.006 N NA
 10372389 10372390 BMD_1952 BMD_1953 cobD cobU TRUE 0.941 -3.000 0.031 1.000 N NA
 10372390 10372391 BMD_1953 BMD_1954 cobU cobS TRUE 0.982 -3.000 0.092 1.000 Y NA
 10372391 10372392 BMD_1954 BMD_1955 cobS cobC TRUE 0.972 -42.000 0.028 1.000 N NA
 10372392 10372393 BMD_1955 BMD_1956 cobC   TRUE 0.992 -48.000 0.434 NA N NA
 10372393 10372394 BMD_1956 BMD_1957     TRUE 0.924 -3.000 0.123 NA   NA
 10372394 10372395 BMD_1957 BMD_1958   rarD FALSE 0.041 135.000 0.000 1.000   NA
 10372399 10372400 BMD_1962 BMD_1963 panE   FALSE 0.445 0.000 0.000 1.000   NA
 10372402 10372403 BMD_1965 BMD_1966     FALSE 0.024 47.000 0.000 NA   NA
 10372403 10372404 BMD_1966 BMD_1967     TRUE 0.932 24.000 0.644 NA   NA
 10372404 10372405 BMD_1967 BMD_1968   proI FALSE 0.084 4.000 0.000 NA   NA
 10372407 10372408 BMD_1970 BMD_1971     TRUE 0.966 -3.000 0.333 NA   NA
 10372410 10372411 BMD_1973 BMD_1974   abrB FALSE 0.001 357.000 0.000 NA   NA
 10372415 10372416 BMD_1978 BMD_1979     TRUE 0.936 -3.000 0.154 NA   NA
 10372418 10372419 BMD_1981 BMD_1982     FALSE 0.006 167.000 0.000 NA   NA
 10372419 10372420 BMD_1982 BMD_1983     TRUE 0.896 25.000 0.373 NA   NA
 10372421 10372422 BMD_1984 BMD_1985     FALSE 0.046 22.000 0.000 NA   NA
 10372423 10372424 BMD_1986 BMD_1987     FALSE 0.102 1.000 0.000 NA   NA
 10372425 10372426 BMD_1988 BMD_1989 cvrA ywaD FALSE 0.037 165.000 0.000 1.000   NA
 10372427 10372428 BMD_1990 BMD_1991 kinC   FALSE 0.010 105.000 0.000 NA   NA
 10372428 10372429 BMD_1991 BMD_1992     FALSE 0.001 333.000 0.000 NA   NA
 10372429 10372430 BMD_1992 BMD_1993   pulA FALSE 0.088 80.000 0.000 1.000   NA
 10372430 10372431 BMD_1993 BMD_1994 pulA   FALSE 0.196 129.000 0.000 1.000 N NA
 10372431 10372432 BMD_1994 BMD_1995     FALSE 0.153 195.000 0.000 1.000 N NA
 10372432 10372433 BMD_1995 BMD_1996     FALSE 0.008 120.000 0.000 NA   NA
 10372435 10372436 BMD_1998 BMD_1999 motA motB TRUE 0.993 -7.000 0.257 1.000 Y NA
 10372438 10372439 BMD_2001 BMD_2002     FALSE 0.046 20.000 0.000 NA   NA
 10372443 10372444 BMD_2006 BMD_2007     FALSE 0.062 297.000 0.000 1.000 N NA
 10372444 10372445 BMD_2007 BMD_2008   prsA FALSE 0.592 26.000 0.000 1.000 N NA
 10372445 10372446 BMD_2008 BMD_2009 prsA   FALSE 0.036 365.000 0.000 1.000 N NA
 10372446 10372447 BMD_2009 BMD_2010     TRUE 0.994 -10.000 0.304 1.000 Y NA
 10372447 10372448 BMD_2010 BMD_2011   allB FALSE 0.031 382.000 0.000 1.000 N NA
 10372448 10372449 BMD_2011 BMD_2012 allB dtpT FALSE 0.017 508.000 0.000 1.000 N NA
 10372451 10372452 BMD_2014 BMD_2015     FALSE 0.449 144.000 0.000 1.000 Y NA
 10372453 10372454 BMD_2016 BMD_2017     FALSE 0.005 207.000 0.000 NA   NA
 10372455 10372456 BMD_2018 BMD_2019     FALSE 0.066 11.000 0.000 NA   NA
 10372456 10372457 BMD_2019 BMD_2020     TRUE 0.776 27.000 0.087 1.000   NA
 10372457 10372458 BMD_2020 BMD_2021   tcyK FALSE 0.361 70.000 0.000 1.000 N NA
 10372458 10372459 BMD_2021 BMD_2022 tcyK tcyL TRUE 0.917 75.000 0.125 0.033 Y NA
 10372459 10372460 BMD_2022 BMD_2023 tcyL tcyM TRUE 0.986 28.000 0.476 0.006 Y NA
 10372460 10372461 BMD_2023 BMD_2024 tcyM tcyN TRUE 0.993 -3.000 0.405 1.000 Y NA
 10372461 10372462 BMD_2024 BMD_2025 tcyN   FALSE 0.037 166.000 0.000 1.000   NA
 10372462 10372463 BMD_2025 BMD_2026     FALSE 0.096 2.000 0.000 NA   NA
 10372463 10372464 BMD_2026 BMD_2027     FALSE 0.007 136.000 0.000 NA   NA
 10372464 10372465 BMD_2027 BMD_2028   cwlM FALSE 0.011 97.000 0.000 NA   NA
 10372465 10372466 BMD_2028 BMD_2029 cwlM   FALSE 0.010 106.000 0.000 NA   NA
 10372468 10372469 BMD_2031 BMD_2032     FALSE 0.039 156.000 0.000 1.000   NA
 10372470 10372471 BMD_2033 BMD_2034     FALSE 0.014 84.000 0.000 NA   NA
 10372474 10372475 BMD_2037 BMD_2038     FALSE 0.006 143.000 0.000 NA   NA
 10372475 10372476 BMD_2038 BMD_2039     TRUE 0.989 -13.000 0.714 NA   NA
 10372480 10372481 BMD_2043 BMD_2044     FALSE 0.011 97.000 0.000 NA   NA
 10372481 10372482 BMD_2044 BMD_2045     FALSE 0.020 60.000 0.000 NA   NA
 10372482 10372483 BMD_2045 BMD_2046     FALSE 0.006 148.000 0.000 NA   NA
 10372483 10372484 BMD_2046 BMD_2047     FALSE 0.003 242.000 0.000 NA   NA
 10372485 10372486 BMD_2048 BMD_2049     FALSE 0.007 130.000 0.000 NA   NA
 10372486 10372487 BMD_2049 BMD_2050     FALSE 0.006 142.000 0.000 NA   NA
 10372488 10372489 BMD_2051 BMD_2052   sspH FALSE 0.015 78.000 0.000 NA   NA
 10372490 10372491 BMD_2053 BMD_2054   gltC FALSE 0.006 161.000 0.000 NA   NA
 10372492 10372493 BMD_2055 BMD_2056 gltA gltB TRUE 0.983 17.000 0.222 0.001 Y NA
 10372494 10372495 BMD_2057 BMD_2058     FALSE 0.070 8.000 0.000 NA   NA
 10372496 10372497 BMD_2059 BMD_2060     FALSE 0.003 249.000 0.000 NA   NA
 10372497 10372498 BMD_2060 BMD_2061     FALSE 0.001 344.000 0.000 NA   NA
 10372498 10372499 BMD_2061 BMD_2062     FALSE 0.000 607.000 0.000 NA   NA
 10372499 10372500 BMD_2062 BMD_2063     FALSE 0.212 172.000 0.000 0.080   NA
 10372502 10372503 BMD_2065 BMD_2066     TRUE 0.993 -30.000 0.727 1.000   NA
 10372503 10372504 BMD_2066 BMD_2067   rsbR FALSE 0.038 264.000 0.000 NA N NA
 10372505 10372506 BMD_2068 BMD_2069     FALSE 0.017 69.000 0.000 NA   NA
 10372507 10372508 BMD_2070 BMD_2071     TRUE 0.926 14.000 0.300 1.000   NA
 10372508 10372509 BMD_2071 BMD_2072     TRUE 0.968 -7.000 0.176 1.000   NA
 10372509 10372510 BMD_2072 BMD_2073   gtaB TRUE 0.953 -3.000 0.154 1.000   NA
 10372510 10372511 BMD_2073 BMD_2074 gtaB   FALSE 0.181 145.000 0.000 1.000 N NA
 10372511 10372512 BMD_2074 BMD_2075     TRUE 0.930 2.000 0.000 1.000 Y NA
 10372512 10372513 BMD_2075 BMD_2076     FALSE 0.001 373.000 0.000 NA   NA
 10372513 10372514 BMD_2076 BMD_2077     FALSE 0.001 348.000 0.000 NA   NA
 10372514 10372515 BMD_2077 BMD_2078     FALSE 0.003 253.000 0.000 NA   NA
 10372515 10372516 BMD_2078 BMD_2079   cysT TRUE 0.824 95.000 0.112 0.001 N NA
 10372516 10372517 BMD_2079 BMD_2080 cysT cysW TRUE 0.990 13.000 0.935 0.000 N NA
 10372517 10372518 BMD_2080 BMD_2081 cysW cysA TRUE 0.981 20.000 0.587 1.000 Y NA
 10372518 10372519 BMD_2081 BMD_2082 cysA   FALSE 0.232 112.000 0.000 1.000 N NA
 10372521 10372522 BMD_2084 BMD_2085     FALSE 0.008 123.000 0.000 NA   NA
 10372522 10372523 BMD_2085 BMD_2086     FALSE 0.001 382.000 0.000 NA   NA
 10372523 10372524 BMD_2086 BMD_2087   pfkB TRUE 0.995 -3.000 0.721 1.000 Y NA
 10372524 10372525 BMD_2087 BMD_2088 pfkB fruA TRUE 0.988 13.000 0.816 1.000 Y NA
 10372525 10372526 BMD_2088 BMD_2089 fruA yclM FALSE 0.151 196.000 0.000 1.000 N NA
 10372526 10372527 BMD_2089 BMD_2090 yclM   FALSE 0.008 117.000 0.000 NA   NA
 10372527 10372528 BMD_2090 BMD_2091   sodC FALSE 0.006 189.000 0.000 NA   NA
 10372528 10372529 BMD_2091 BMD_2092 sodC   FALSE 0.219 117.000 0.000 1.000 N NA
 10372531 10372532 BMD_2094 BMD_2095     TRUE 0.737 13.000 0.016 1.000   NA
 10372532 10372533 BMD_2095 BMD_2096     TRUE 0.666 14.000 0.000 1.000 N NA
 10372535 10372536 BMD_2098 BMD_2099     FALSE 0.002 303.000 0.000 NA   NA
 10372536 10372537 BMD_2099 BMD_2100     FALSE 0.006 177.000 0.000 NA   NA
 10372539 10372540 BMD_2102 BMD_2103     FALSE 0.166 90.000 0.000 NA N NA
 10372540 10372541 BMD_2103 BMD_2104     TRUE 0.783 33.000 0.200 NA   NA
 10372541 10372542 BMD_2104 BMD_2105     FALSE 0.596 203.000 0.217 0.039   NA
 10372542 10372543 BMD_2105 BMD_2106     TRUE 0.882 2.000 0.111 NA   NA
 10372545 10372546 BMD_2108 BMD_2109     FALSE 0.004 227.000 0.000 NA   NA
 10372546 10372547 BMD_2109 BMD_2110     TRUE 0.829 35.000 0.018 0.001   NA
 10372549 10372550 BMD_2112 BMD_2113     FALSE 0.011 314.000 0.000 1.000   NA
 10372550 10372551 BMD_2113 BMD_2114     TRUE 0.654 97.000 0.116 1.000 N NA
 10372551 10372552 BMD_2114 BMD_2115   thiM FALSE 0.034 376.000 0.000 1.000 N NA
 10372552 10372553 BMD_2115 BMD_2116 thiM thiE TRUE 0.973 14.000 0.061 0.004 Y NA
 10372554 10372555 BMD_2117 BMD_2118     FALSE 0.001 439.000 0.000 NA   NA
 10372557 10372558 BMD_2120 BMD_2121     FALSE 0.139 -3.000 0.000 NA   NA
 10372559 10372560 BMD_2122 BMD_2123     FALSE 0.007 132.000 0.000 NA   NA
 10372560 10372561 BMD_2123 BMD_2124     TRUE 0.959 12.000 0.822 NA   NA
 10372561 10372562 BMD_2124 BMD_2125     FALSE 0.147 99.000 0.000 NA N NA
 10372564 10372565 BMD_2127 BMD_2128     FALSE 0.006 147.000 0.000 NA   NA
 10372565 10372566 BMD_2128 BMD_2129     FALSE 0.270 -49.000 0.000 NA   NA
 10372566 10372567 BMD_2129 BMD_2130     FALSE 0.018 65.000 0.000 NA   NA
 10372567 10372568 BMD_2130 BMD_2131   ylmA FALSE 0.622 19.000 0.000 1.000 N NA
 10372569 10372570 BMD_2132 BMD_2133     FALSE 0.010 102.000 0.000 NA   NA
 10372570 10372571 BMD_2133 BMD_2134     FALSE 0.047 332.000 0.000 1.000 N NA
 10372572 10372573 BMD_2135 BMD_2136     FALSE 0.063 12.000 0.000 NA   NA
 10372573 10372574 BMD_2136 BMD_2137     FALSE 0.007 126.000 0.000 NA   NA
 10372575 10372576 BMD_2138 BMD_2139     FALSE 0.006 141.000 0.000 NA   NA
 10372576 10372577 BMD_2139 BMD_2140     FALSE 0.006 165.000 0.000 NA   NA
 10372580 10372581 BMD_2143 BMD_2144     FALSE 0.108 381.000 0.000 1.000 Y NA
 10372581 10372582 BMD_2144 BMD_2145   yrkP TRUE 0.696 12.000 0.000 1.000 N NA
 10372582 10372583 BMD_2145 BMD_2146 yrkP yrkQ TRUE 0.993 -3.000 0.462 1.000 Y NA
 10372585 10372586 BMD_2148 BMD_2149     FALSE 0.017 68.000 0.000 NA   NA
 10372586 10372587 BMD_2149 BMD_2150     FALSE 0.008 116.000 0.000 NA   NA
 10372587 10372588 BMD_2150 BMD_2151     FALSE 0.001 439.000 0.000 NA   NA
 10372592 10372593 BMD_2155 BMD_2156     FALSE 0.030 204.000 0.000 1.000   NA
 10372595 10372596 BMD_2158 BMD_2159     FALSE 0.004 222.000 0.000 NA   NA
 10372596 10372597 BMD_2159 BMD_2160     TRUE 0.644 72.000 0.047 1.000 N NA
 10372597 10372598 BMD_2160 BMD_2161     TRUE 0.890 24.000 0.125 1.000 N NA
 10372598 10372599 BMD_2161 BMD_2162   nadD TRUE 0.959 16.000 0.005 0.003 Y NA
 10372599 10372600 BMD_2162 BMD_2163 nadD nadE TRUE 0.936 35.000 0.016 0.003 Y NA
 10372600 10372601 BMD_2163 BMD_2164 nadE   FALSE 0.164 182.000 0.000 1.000 N NA
 10372601 10372602 BMD_2164 BMD_2165     FALSE 0.011 741.000 0.000 1.000 N NA
 10372603 10372604 BMD_2166 BMD_2167     FALSE 0.326 83.000 0.000 1.000 N NA
 10372605 10372606 BMD_2168 BMD_2169     FALSE 0.100 131.000 0.000 NA N NA
 10372606 10372607 BMD_2169 BMD_2170     FALSE 0.020 61.000 0.000 NA   NA
 10372607 10372608 BMD_2170 BMD_2171     FALSE 0.038 28.000 0.000 NA   NA
 10372608 10372609 BMD_2171 BMD_2172     FALSE 0.381 65.000 0.000 1.000 N NA
 10372611 10372612 BMD_2174 BMD_2175 gerBA gerBB TRUE 0.848 4.000 0.000 0.009   NA
 10372612 10372613 BMD_2175 BMD_2176 gerBB gerBC FALSE 0.228 -16.000 0.000 NA   NA
 10372615 10372616 BMD_2178 BMD_2179 ydbJ ydbK TRUE 0.781 20.000 0.118 NA   NA
 10372616 10372617 BMD_2179 BMD_2180 ydbK   FALSE 0.002 293.000 0.000 NA   NA
 10372619 10372620 BMD_2182 BMD_2183     FALSE 0.012 92.000 0.000 NA   NA
 10372620 10372621 BMD_2183 BMD_2184   splB FALSE 0.009 109.000 0.000 NA   NA
 10372621 10372622 BMD_2184 BMD_2185 splB   FALSE 0.006 154.000 0.000 NA   NA
 10372622 10372623 BMD_2185 BMD_2186     FALSE 0.011 100.000 0.000 NA   NA
 10372623 10372624 BMD_2186 BMD_2187     FALSE 0.006 176.000 0.000 NA   NA
 10372624 10372625 BMD_2187 BMD_2188     FALSE 0.030 34.000 0.000 NA   NA
 10372625 10372626 BMD_2188 BMD_2189   topB FALSE 0.007 128.000 0.000 NA   NA
 10372626 10372627 BMD_2189 BMD_2190 topB   FALSE 0.004 223.000 0.000 NA   NA
 10372627 10372628 BMD_2190 BMD_2191     FALSE 0.002 278.000 0.000 NA   NA
 10372630 10372631 BMD_2193 BMD_2194     FALSE 0.005 210.000 0.000 NA   NA
 10372631 10372632 BMD_2194 BMD_2195     FALSE 0.017 502.000 0.000 1.000 N NA
 10372632 10372633 BMD_2195 BMD_2196     FALSE 0.004 222.000 0.000 NA   NA
 10372633 10372634 BMD_2196 BMD_2197     FALSE 0.039 27.000 0.000 NA   NA
 10372634 10372635 BMD_2197 BMD_2198     FALSE 0.046 20.000 0.000 NA   NA
 10372635 10372636 BMD_2198 BMD_2199     FALSE 0.004 215.000 0.000 NA   NA
 10372638 10372639 BMD_2201 BMD_2202     FALSE 0.006 189.000 0.000 NA   NA
 10372641 10372642 BMD_2204 BMD_2205     FALSE 0.001 391.000 0.000 NA   NA
 10372643 10372644 BMD_2206 BMD_2207     FALSE 0.018 65.000 0.000 NA   NA
 10372644 10372645 BMD_2207 BMD_2208     FALSE 0.000 649.000 0.000 NA   NA
 10372645 10372646 BMD_2208 BMD_2209     FALSE 0.002 289.000 0.000 NA   NA
 10372646 10372647 BMD_2209 BMD_2210     FALSE 0.015 81.000 0.000 NA   NA
 10372648 10372649 BMD_2211 BMD_2212   recQ FALSE 0.006 187.000 0.000 NA   NA
 10372649 10372650 BMD_2212 BMD_2213 recQ   FALSE 0.479 109.000 0.000 0.032 N NA
 10372650 10372651 BMD_2213 BMD_2214   speB FALSE 0.125 218.000 0.000 1.000 N NA
 10372651 10372652 BMD_2214 BMD_2215 speB   TRUE 0.722 83.000 0.133 1.000 N NA
 10372652 10372653 BMD_2215 BMD_2216     TRUE 0.937 21.000 0.286 1.000 N NA
 10372653 10372654 BMD_2216 BMD_2217     FALSE 0.097 240.000 0.000 1.000 N NA
 10372654 10372655 BMD_2217 BMD_2218     FALSE 0.006 144.000 0.000 NA   NA
 10372655 10372656 BMD_2218 BMD_2219   menA FALSE 0.001 334.000 0.000 NA   NA
 10372658 10372659 BMD_2221 BMD_2222     FALSE 0.018 65.000 0.000 NA   NA
 10372659 10372660 BMD_2222 BMD_2223     FALSE 0.003 234.000 0.000 NA   NA
 10372662 10372663 BMD_2225 BMD_2226     TRUE 0.989 -7.000 0.419 1.000 N NA
 10372663 10372664 BMD_2226 BMD_2227     TRUE 0.977 -25.000 0.231 NA   NA
 10372664 10372665 BMD_2227 BMD_2228     FALSE 0.047 17.000 0.000 NA   NA
 10372667 10372668 BMD_2230 BMD_2231   ohrB FALSE 0.175 157.000 0.000 1.000 N NA
 10372670 10372671 BMD_2233 BMD_2234     FALSE 0.015 78.000 0.000 NA   NA
 10372671 10372672 BMD_2234 BMD_2235     FALSE 0.013 86.000 0.000 NA   NA
 10372672 10372673 BMD_2235 BMD_2236     FALSE 0.006 167.000 0.000 NA   NA
 10372673 10372674 BMD_2236 BMD_2237     FALSE 0.089 3.000 0.000 NA   NA
 10372676 10372677 BMD_2239 BMD_2240     FALSE 0.110 63.000 0.000 1.000   NA
 10372677 10372678 BMD_2240 BMD_2241     FALSE 0.139 -3.000 0.000 NA   NA
 10372680 10372681 BMD_2243 BMD_2244 proH proJ TRUE 0.859 88.000 0.009 0.003 Y NA
 10372681 10372682 BMD_2244 BMD_2245 proJ proA TRUE 0.915 115.000 0.281 0.003 Y NA
 10372682 10372683 BMD_2245 BMD_2246 proA   FALSE 0.001 358.000 0.000 NA   NA
 10372683 10372684 BMD_2246 BMD_2247     FALSE 0.027 39.000 0.000 NA   NA
 10372686 10372687 BMD_2249 BMD_2250     TRUE 0.988 -12.000 0.722 NA   NA
 10372689 10372690 BMD_2252 BMD_2253   sspC FALSE 0.045 128.000 0.000 1.000   NA
 10372690 10372691 BMD_2253 BMD_2254 sspC   FALSE 0.035 189.000 0.000 1.000   NA
 10372693 10372694 BMD_2256 BMD_2257     FALSE 0.007 370.000 0.000 1.000   NA
 10372695 10372696 BMD_2258 BMD_2259     FALSE 0.200 -10.000 0.000 NA   NA
 10372696 10372697 BMD_2259 BMD_2260     FALSE 0.001 371.000 0.000 NA   NA
 10372698 10372699 BMD_2261 BMD_2262     FALSE 0.000 1256.000 0.000 NA   NA
 10372699 10372700 BMD_2262 BMD_2263     FALSE 0.000 916.000 0.000 NA   NA
 10372700 10372701 BMD_2263 BMD_2264     FALSE 0.006 149.000 0.000 NA   NA
 10372702 10372703 BMD_2265 BMD_2266     FALSE 0.070 8.000 0.000 NA   NA
 10372704 10372705 BMD_2267 BMD_2268 maa   FALSE 0.003 248.000 0.000 NA   NA
 10372707 10372708 BMD_2270 BMD_2271     FALSE 0.002 287.000 0.000 NA   NA
 10372708 10372709 BMD_2271 BMD_2272     TRUE 0.968 0.000 0.500 NA   NA
 10372709 10372710 BMD_2272 BMD_2273     FALSE 0.004 227.000 0.000 NA   NA
 10372711 10372712 BMD_2274 BMD_2275     FALSE 0.020 59.000 0.000 NA   NA
 10372713 10372714 BMD_2276 BMD_2277     FALSE 0.014 82.000 0.000 NA   NA
 10372714 10372715 BMD_2277 BMD_2278   inhA FALSE 0.001 383.000 0.000 NA   NA
 10372715 10372716 BMD_2278 BMD_2279 inhA fumC FALSE 0.024 225.000 0.000 1.000   NA
 10372716 10372717 BMD_2279 BMD_2280 fumC   FALSE 0.006 181.000 0.000 NA   NA
 10372717 10372718 BMD_2280 BMD_2281     FALSE 0.039 27.000 0.000 NA   NA
 10372718 10372719 BMD_2281 BMD_2282     FALSE 0.019 62.000 0.000 NA   NA
 10372719 10372720 BMD_2282 BMD_2283   kin FALSE 0.007 136.000 0.000 NA   NA
 10372720 10372721 BMD_2283 BMD_2284 kin   FALSE 0.012 90.000 0.000 NA   NA
 10372721 10372722 BMD_2284 BMD_2285   nprM FALSE 0.000 908.000 0.000 NA   NA
 10372722 10372723 BMD_2285 BMD_2286 nprM   FALSE 0.011 308.000 0.000 1.000   NA
 10372723 10372724 BMD_2286 BMD_2287   talC FALSE 0.015 274.000 0.000 1.000   NA
 10372724 10372725 BMD_2287 BMD_2288 talC   FALSE 0.001 502.000 0.000 NA   NA
 10372726 10372727 BMD_2289 BMD_2290   sspL FALSE 0.002 302.000 0.000 NA   NA
 10372727 10372728 BMD_2290 BMD_2291 sspL   FALSE 0.006 172.000 0.000 NA   NA
 10372729 10372730 BMD_2292 BMD_2293 citS citT TRUE 0.996 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 10372730 10372731 BMD_2293 BMD_2294 citT citM FALSE 0.147 198.000 0.000 1.000 N NA
 10372733 10372734 BMD_2296 BMD_2297     TRUE 0.623 20.000 0.000 1.000 N NA
 10372734 10372735 BMD_2297 BMD_2298     FALSE 0.153 195.000 0.000 1.000 N NA
 10372735 10372736 BMD_2298 BMD_2299     FALSE 0.003 245.000 0.000 NA   NA
 10372736 10372737 BMD_2299 BMD_2300     FALSE 0.006 182.000 0.000 NA   NA
 10372737 10372738 BMD_2300 BMD_2301     FALSE 0.006 157.000 0.000 NA   NA
 10372738 10372739 BMD_2301 BMD_2302     TRUE 0.905 19.000 0.380 NA   NA
 10372739 10372740 BMD_2302 BMD_2303     FALSE 0.006 180.000 0.000 NA   NA
 10372741 10372742 BMD_2304 BMD_2305     FALSE 0.007 137.000 0.000 NA   NA
 10372742 10372743 BMD_2305 BMD_2306     FALSE 0.006 151.000 0.000 NA   NA
 10372743 10372744 BMD_2306 BMD_2307     FALSE 0.007 139.000 0.000 NA   NA
 10372744 10372745 BMD_2307 BMD_2308   lysA FALSE 0.436 53.000 0.000 1.000 N NA
 10372745 10372746 BMD_2308 BMD_2309 lysA   FALSE 0.001 396.000 0.000 NA   NA
 10372746 10372747 BMD_2309 BMD_2310     FALSE 0.273 -94.000 0.000 NA   NA
 10372748 10372749 BMD_2311 BMD_2312 yurR   FALSE 0.016 74.000 0.000 NA   NA
 10372749 10372750 BMD_2312 BMD_2313   kinA FALSE 0.006 162.000 0.000 NA   NA
 10372750 10372751 BMD_2313 BMD_2314 kinA   FALSE 0.013 87.000 0.000 NA   NA
 10372751 10372752 BMD_2314 BMD_2315     FALSE 0.006 152.000 0.000 NA   NA
 10372752 10372753 BMD_2315 BMD_2316     TRUE 0.996 -22.000 0.346 1.000 Y NA
 10372753 10372754 BMD_2316 BMD_2317     TRUE 0.981 20.000 0.300 0.078 Y NA
 10372754 10372755 BMD_2317 BMD_2318     FALSE 0.294 91.000 0.000 1.000 N NA
 10372755 10372756 BMD_2318 BMD_2319     FALSE 0.322 84.000 0.000 1.000 N NA
 10372756 10372757 BMD_2319 BMD_2320     TRUE 0.940 0.000 0.000 1.000 Y NA
 10372757 10372758 BMD_2320 BMD_2321     TRUE 0.633 15.000 0.031 NA   NA
 10372758 10372759 BMD_2321 BMD_2322     TRUE 0.664 26.000 0.062 NA   NA
 10372759 10372760 BMD_2322 BMD_2323     TRUE 0.892 -3.000 0.073 NA   NA
 10372760 10372761 BMD_2323 BMD_2324     TRUE 0.969 -12.000 0.059 1.000 N NA
 10372761 10372762 BMD_2324 BMD_2325     TRUE 0.983 12.000 0.429 1.000 Y NA
 10372762 10372763 BMD_2325 BMD_2326     TRUE 0.974 30.000 0.571 1.000 Y NA
 10372763 10372764 BMD_2326 BMD_2327     TRUE 0.913 15.000 0.143 1.000 N NA
 10372764 10372765 BMD_2327 BMD_2328     FALSE 0.154 194.000 0.000 1.000 N NA
 10372765 10372766 BMD_2328 BMD_2329   fer FALSE 0.491 38.000 0.000 1.000 N NA
 10372766 10372767 BMD_2329 BMD_2330 fer   FALSE 0.004 215.000 0.000 NA   NA
 10372767 10372768 BMD_2330 BMD_2331   scoA FALSE 0.006 179.000 0.000 NA   NA
 10372768 10372769 BMD_2331 BMD_2332 scoA scoB TRUE 0.972 2.000 0.000 0.001 Y NA
 10372769 10372770 BMD_2332 BMD_2333 scoB   TRUE 0.940 0.000 0.000 1.000 Y NA
 10372770 10372771 BMD_2333 BMD_2334     TRUE 0.899 -12.000 0.000 1.000 N NA
 10372771 10372772 BMD_2334 BMD_2335     TRUE 0.972 -16.000 0.000 0.004 N NA
 10372772 10372773 BMD_2335 BMD_2336     FALSE 0.560 29.000 0.000 1.000 N NA
 10372773 10372774 BMD_2336 BMD_2337     FALSE 0.035 30.000 0.000 NA   NA
 10372774 10372775 BMD_2337 BMD_2338     FALSE 0.209 -12.000 0.000 NA   NA
 10372775 10372776 BMD_2338 BMD_2339   kamA FALSE 0.546 43.000 0.000 0.078   NA
 10372776 10372777 BMD_2339 BMD_2340 kamA   TRUE 0.880 3.000 0.124 NA   NA
 10372777 10372778 BMD_2340 BMD_2341     FALSE 0.010 102.000 0.000 NA   NA
 10372778 10372779 BMD_2341 BMD_2342     FALSE 0.020 242.000 0.000 1.000   NA
 10372779 10372780 BMD_2342 BMD_2343     FALSE 0.017 68.000 0.000 NA   NA
 10372780 10372781 BMD_2343 BMD_2344     FALSE 0.027 40.000 0.000 NA   NA
 10372781 10372782 BMD_2344 BMD_2345     FALSE 0.202 191.000 0.000 0.078   NA
 10372782 10372783 BMD_2345 BMD_2346     FALSE 0.085 180.000 0.000 NA N NA
 10372783 10372784 BMD_2346 BMD_2347     FALSE 0.004 230.000 0.000 NA   NA
 10372784 10372785 BMD_2347 BMD_2348   ydeQ FALSE 0.009 331.000 0.000 1.000   NA
 10372785 10372786 BMD_2348 BMD_2349 ydeQ   FALSE 0.011 312.000 0.000 1.000   NA
 10372786 10372787 BMD_2349 BMD_2350     FALSE 0.249 16.000 0.000 1.000   NA
 10372787 10372788 BMD_2350 BMD_2351     FALSE 0.173 33.000 0.000 1.000   NA
 10372788 10372789 BMD_2351 BMD_2352     FALSE 0.038 28.000 0.000 NA   NA
 10372789 10372790 BMD_2352 BMD_2353     FALSE 0.566 16.000 0.019 NA   NA
 10372791 10372792 BMD_2354 BMD_2355     FALSE 0.284 94.000 0.000 1.000 N NA
 10372793 10372794 BMD_2356 BMD_2357 sleB   FALSE 0.006 174.000 0.000 NA   NA
 10372794 10372795 BMD_2357 BMD_2358     FALSE 0.006 165.000 0.000 NA   NA
 10372795 10372796 BMD_2358 BMD_2359   thrS FALSE 0.002 937.000 0.000 1.000   NA
 10372796 10372797 BMD_2359 BMD_2360 thrS   TRUE 0.978 -13.000 0.021 0.001   NA
 10372801 10372802 BMD_2364 BMD_2365     TRUE 0.955 -3.000 0.160 1.000   NA
 10372802 10372803 BMD_2365 BMD_2366     FALSE 0.016 263.000 0.000 1.000   NA
 10372803 10372804 BMD_2366 BMD_2367   yurJ FALSE 0.012 302.000 0.000 1.000   NA
 10372804 10372805 BMD_2367 BMD_2368 yurJ frlB FALSE 0.336 80.000 0.000 1.000 N NA
 10372805 10372806 BMD_2368 BMD_2369 frlB yurO TRUE 0.676 119.000 0.231 1.000 N NA
 10372806 10372807 BMD_2369 BMD_2370 yurO yurN TRUE 0.990 16.000 0.688 0.032 Y NA
 10372807 10372808 BMD_2370 BMD_2371 yurN yurM TRUE 0.996 0.000 0.688 0.032 Y NA
 10372808 10372809 BMD_2371 BMD_2372 yurM yurL TRUE 0.966 16.000 0.308 NA Y NA
 10372811 10372812 BMD_2374 BMD_2375     FALSE 0.006 189.000 0.000 NA   NA
 10372812 10372813 BMD_2375 BMD_2376     TRUE 0.960 1.000 0.413 NA   NA
 10372813 10372814 BMD_2376 BMD_2377     FALSE 0.036 186.000 0.000 1.000   NA
 10372816 10372817 BMD_2379 BMD_2380     FALSE 0.005 203.000 0.000 NA   NA
 10372817 10372818 BMD_2380 BMD_2381     FALSE 0.004 225.000 0.000 NA   NA
 10372818 10372819 BMD_2381 BMD_2382   hpaB FALSE 0.040 140.000 0.000 1.000   NA
 10372819 10372820 BMD_2382 BMD_2383 hpaB   FALSE 0.145 149.000 0.021 NA   NA
 10372820 10372821 BMD_2383 BMD_2384     FALSE 0.017 66.000 0.000 NA   NA
 10372823 10372824 BMD_2386 BMD_2387     FALSE 0.007 135.000 0.000 NA   NA
 10372825 10372826 BMD_2388 BMD_2389     FALSE 0.006 152.000 0.000 NA   NA
 10372826 10372827 BMD_2389 BMD_2390     FALSE 0.026 43.000 0.000 NA   NA
 10372828 10372829 BMD_2391 BMD_2392     FALSE 0.252 -27.000 0.000 NA   NA
 10372829 10372830 BMD_2392 BMD_2393     FALSE 0.000 518.000 0.000 NA   NA
 10372832 10372833 BMD_2395 BMD_2396     FALSE 0.000 531.000 0.000 NA   NA
 10372833 10372834 BMD_2396 BMD_2397     FALSE 0.006 173.000 0.000 NA   NA
 10372836 10372837 BMD_2399 BMD_2400     FALSE 0.006 176.000 0.000 NA   NA
 10372838 10372839 BMD_2401 BMD_2402     FALSE 0.009 107.000 0.000 NA   NA
 10372840 10372841 BMD_2403 BMD_2404 lyc   FALSE 0.006 176.000 0.000 NA   NA
 10372845 10372846 BMD_2408 BMD_2409     FALSE 0.007 139.000 0.000 NA   NA
 10372846 10372847 BMD_2409 BMD_2410     FALSE 0.018 65.000 0.000 NA   NA
 10372847 10372848 BMD_2410 BMD_2411     FALSE 0.001 397.000 0.000 NA   NA
 10372850 10372851 BMD_2413 BMD_2414 rocG   FALSE 0.242 235.000 0.000 0.038 N NA
 10372851 10372852 BMD_2414 BMD_2415     FALSE 0.001 380.000 0.000 NA   NA
 10372854 10372855 BMD_2417 BMD_2418     FALSE 0.044 24.000 0.000 NA   NA
 10372855 10372856 BMD_2418 BMD_2419     FALSE 0.063 12.000 0.000 NA   NA
 10372858 10372859 BMD_2421 BMD_2422     FALSE 0.001 347.000 0.000 NA   NA
 10372859 10372860 BMD_2422 BMD_2423     FALSE 0.001 430.000 0.000 NA   NA
 10372860 10372861 BMD_2423 BMD_2424     FALSE 0.007 130.000 0.000 NA   NA
 10372861 10372862 BMD_2424 BMD_2425     FALSE 0.001 433.000 0.000 NA   NA
 10372862 10372863 BMD_2425 BMD_2426     FALSE 0.007 134.000 0.000 NA   NA
 10372863 10372864 BMD_2426 BMD_2427     FALSE 0.007 134.000 0.000 NA   NA
 10372864 10372865 BMD_2427 BMD_2428     FALSE 0.049 16.000 0.000 NA   NA
 10372865 10372866 BMD_2428 BMD_2429     FALSE 0.010 101.000 0.000 NA   NA
 10372866 10372867 BMD_2429 BMD_2430   fabZ FALSE 0.622 19.000 0.000 1.000 N NA
 10372867 10372868 BMD_2430 BMD_2431 fabZ   FALSE 0.002 287.000 0.000 NA   NA
 10372868 10372869 BMD_2431 BMD_2432     FALSE 0.006 177.000 0.000 NA   NA
 10372874 10372875 BMD_2437 BMD_2438     FALSE 0.006 156.000 0.000 NA   NA
 10372875 10372876 BMD_2438 BMD_2439     FALSE 0.439 240.000 0.500 NA   NA
 10372877 10372878 BMD_2440 BMD_2441     FALSE 0.011 99.000 0.000 NA   NA
 10372879 10372880 BMD_2442 BMD_2443     FALSE 0.001 367.000 0.000 NA   NA
 10372880 10372881 BMD_2443 BMD_2444     FALSE 0.003 237.000 0.000 NA   NA
 10372883 10372884 BMD_2446 BMD_2447     FALSE 0.007 132.000 0.000 NA   NA
 10372884 10372885 BMD_2447 BMD_2448     FALSE 0.008 117.000 0.000 NA   NA
 10372885 10372886 BMD_2448 BMD_2449     FALSE 0.029 36.000 0.000 NA   NA
 10372886 10372887 BMD_2449 BMD_2450   fnt FALSE 0.004 218.000 0.000 NA   NA
 10372887 10372888 BMD_2450 BMD_2451 fnt   FALSE 0.006 189.000 0.000 NA   NA
 10372888 10372889 BMD_2451 BMD_2452     FALSE 0.001 395.000 0.000 NA   NA
 10372889 10372890 BMD_2452 BMD_2453     FALSE 0.001 412.000 0.000 NA   NA
 10372890 10372891 BMD_2453 BMD_2454     TRUE 0.870 -3.000 0.052 NA   NA
 10372891 10372892 BMD_2454 BMD_2455     FALSE 0.049 468.000 0.000 0.086 N NA
 10372892 10372893 BMD_2455 BMD_2456     FALSE 0.005 404.000 0.000 1.000   NA
 10372894 10372895 BMD_2457 BMD_2458     FALSE 0.006 150.000 0.000 NA   NA
 10372896 10372897 BMD_2459 BMD_2460   cwlO FALSE 0.212 69.000 0.000 NA N NA
 10372897 10372898 BMD_2460 BMD_2461 cwlO hemD FALSE 0.006 590.000 0.000 NA N NA
 10372898 10372899 BMD_2461 BMD_2462 hemD   FALSE 0.571 28.000 0.000 1.000 N NA
 10372899 10372900 BMD_2462 BMD_2463   accC FALSE 0.080 261.000 0.000 1.000 N NA
 10372900 10372901 BMD_2463 BMD_2464 accC accB TRUE 0.964 29.000 0.086 0.002 Y NA
 10372901 10372902 BMD_2464 BMD_2465 accB   FALSE 0.618 23.000 0.000 1.000 N NA
 10372902 10372903 BMD_2465 BMD_2466     TRUE 0.997 -3.000 0.596 0.001 Y NA
 10372903 10372904 BMD_2466 BMD_2467     FALSE 0.609 18.000 0.032 NA   NA
 10372904 10372905 BMD_2467 BMD_2468     FALSE 0.555 53.000 0.082 NA   NA
 10372905 10372906 BMD_2468 BMD_2469     TRUE 0.816 31.000 0.158 1.000   NA
 10372907 10372908 BMD_2470 BMD_2471     FALSE 0.024 424.000 0.000 1.000 N NA
 10372908 10372909 BMD_2471 BMD_2472     FALSE 0.381 65.000 0.000 1.000 N NA
 10372910 10372911 BMD_2473 BMD_2474     FALSE 0.198 194.000 0.000 0.077   NA
 10372912 10372913 BMD_2475 BMD_2476   rsbR FALSE 0.000 649.000 0.000 NA   NA
 10372914 10372915 BMD_2477 BMD_2478     FALSE 0.001 476.000 0.000 NA   NA
 10372915 10372916 BMD_2478 BMD_2479     FALSE 0.016 73.000 0.000 NA   NA
 10372916 10372917 BMD_2479 BMD_2480     FALSE 0.000 845.000 0.000 NA   NA
 10372917 10372918 BMD_2480 BMD_2481     FALSE 0.000 703.000 0.000 NA   NA
 10372918 10372919 BMD_2481 BMD_2482     TRUE 0.945 -73.000 0.000 0.077   NA
 10372920 10372921 BMD_2483 BMD_2484 bioY   TRUE 0.670 8.000 0.022 NA   NA
 10372922 10372923 BMD_2485 BMD_2486     FALSE 0.623 18.000 0.000 1.000 N NA
 10372923 10372924 BMD_2486 BMD_2487     FALSE 0.097 133.000 0.000 NA N NA
 10372924 10372925 BMD_2487 BMD_2488     TRUE 0.917 0.000 0.150 NA   NA
 10372925 10372926 BMD_2488 BMD_2489   yhcZ FALSE 0.475 140.000 0.179 1.000   NA
 10372926 10372927 BMD_2489 BMD_2490 yhcZ yhcY TRUE 0.989 16.000 0.536 0.019 Y NA
 10372928 10372929 BMD_2491 BMD_2492     FALSE 0.011 97.000 0.000 NA   NA
 10372936 10372937 BMD_2499 BMD_2500 ppaC   FALSE 0.003 256.000 0.000 NA   NA
 10372937 10372938 BMD_2500 BMD_2501     FALSE 0.009 107.000 0.000 NA   NA
 10372938 10372939 BMD_2501 BMD_2502   ilvK FALSE 0.000 594.000 0.000 NA   NA
 10372939 10372940 BMD_2502 BMD_2503 ilvK   FALSE 0.004 220.000 0.000 NA   NA
 10372940 10372941 BMD_2503 BMD_2504     FALSE 0.046 21.000 0.000 NA   NA
 10372942 10372943 BMD_2505 BMD_2506 pucK pucL FALSE 0.290 13.000 0.000 1.000   NA
 10372943 10372944 BMD_2506 BMD_2507 pucL pucM FALSE 0.511 -3.000 0.000 1.000   NA
 10372946 10372947 BMD_2509 BMD_2510     FALSE 0.001 506.000 0.000 NA   NA
 10372947 10372948 BMD_2510 BMD_2511   mntH FALSE 0.006 157.000 0.000 NA   NA
 10372949 10372950 BMD_2512 BMD_2513     FALSE 0.000 655.000 0.000 NA   NA
 10372952 10372953 BMD_2515 BMD_2516     FALSE 0.006 142.000 0.000 NA   NA
 10372953 10372954 BMD_2516 BMD_2517     FALSE 0.000 842.000 0.000 NA   NA
 10372954 10372955 BMD_2517 BMD_2518     FALSE 0.024 48.000 0.000 NA   NA
 10372955 10372956 BMD_2518 BMD_2519   eat FALSE 0.006 141.000 0.000 NA   NA
 10372956 10372957 BMD_2519 BMD_2520 eat eutC FALSE 0.046 22.000 0.000 NA   NA
 10372957 10372958 BMD_2520 BMD_2521 eutC eutB TRUE 0.972 15.000 0.048 0.001 Y NA
 10372958 10372959 BMD_2521 BMD_2522 eutB   TRUE 0.984 27.000 1.000 1.000 Y NA
 10372959 10372960 BMD_2522 BMD_2523     FALSE 0.006 157.000 0.000 NA   NA
 10372960 10372961 BMD_2523 BMD_2524     TRUE 0.900 -49.000 0.016 NA   NA
 10372963 10372964 BMD_2526 BMD_2527     FALSE 0.010 104.000 0.000 NA   NA
 10372964 10372965 BMD_2527 BMD_2528     FALSE 0.523 91.000 0.000 0.076 N NA
 10372965 10372966 BMD_2528 BMD_2529     FALSE 0.290 13.000 0.000 1.000   NA
 10372966 10372967 BMD_2529 BMD_2530     FALSE 0.259 -34.000 0.000 NA   NA
 10372969 10372970 BMD_2532 BMD_2533   parC FALSE 0.029 211.000 0.000 1.000   NA
 10372970 10372971 BMD_2533 BMD_2534 parC parE TRUE 0.989 -3.000 0.019 0.001 Y NA
 10372971 10372972 BMD_2534 BMD_2535 parE   FALSE 0.042 334.000 0.030 NA   NA
 10372973 10372974 BMD_2536 BMD_2537 plsY   FALSE 0.010 101.000 0.000 NA   NA
 10372974 10372975 BMD_2537 BMD_2538     FALSE 0.006 159.000 0.000 NA   NA
 10372976 10372977 BMD_2539 BMD_2540     FALSE 0.089 79.000 0.000 1.000   NA
 10372977 10372978 BMD_2540 BMD_2541   tlp FALSE 0.009 113.000 0.000 NA   NA
 10372980 10372981 BMD_2543 BMD_2544 sspN   TRUE 0.896 45.000 0.773 NA   NA
 10372981 10372982 BMD_2544 BMD_2545     FALSE 0.260 214.000 0.130 NA   NA
 10372982 10372983 BMD_2545 BMD_2546   acnA FALSE 0.290 196.000 0.004 1.000 N NA
 10372984 10372985 BMD_2547 BMD_2548 sspO sspP FALSE 0.397 212.000 0.192 1.000   NA
 10372985 10372986 BMD_2548 BMD_2549 sspP   FALSE 0.573 153.000 0.407 NA   NA
 10372986 10372987 BMD_2549 BMD_2550     FALSE 0.006 151.000 0.000 NA   NA
 10372988 10372989 BMD_2551 BMD_2552     FALSE 0.006 187.000 0.000 NA   NA
 10372989 10372990 BMD_2552 BMD_2553     TRUE 0.937 23.000 0.684 NA   NA
 10372990 10372991 BMD_2553 BMD_2554     FALSE 0.002 296.000 0.000 NA   NA
 10372991 10372992 BMD_2554 BMD_2555     FALSE 0.074 6.000 0.000 NA   NA
 10372992 10372993 BMD_2555 BMD_2556   pucE FALSE 0.016 72.000 0.000 NA   NA
 10372993 10372994 BMD_2556 BMD_2557 pucE pucC TRUE 0.996 2.000 0.667 0.001 Y NA
 10372994 10372995 BMD_2557 BMD_2558 pucC pucD TRUE 0.999 -19.000 0.800 0.001 Y NA
 10372995 10372996 BMD_2558 BMD_2559 pucD pucB FALSE 0.046 19.000 0.000 NA   NA
 10372996 10372997 BMD_2559 BMD_2560 pucB pucA FALSE 0.026 42.000 0.000 NA   NA
 10372998 10372999 BMD_2561 BMD_2562     FALSE 0.059 13.000 0.000 NA   NA
 10373001 10373002 BMD_2564 BMD_2565 cotP   FALSE 0.400 148.000 0.182 NA   NA
 10373002 10373003 BMD_2565 BMD_2566     FALSE 0.012 93.000 0.000 NA   NA
 10373003 10373004 BMD_2566 BMD_2567     FALSE 0.015 81.000 0.000 NA   NA
 10373004 10373005 BMD_2567 BMD_2568     TRUE 0.897 -3.000 0.080 NA   NA
 10373006 10373007 BMD_2569 BMD_2570     FALSE 0.017 68.000 0.000 NA   NA
 10373007 10373008 BMD_2570 BMD_2571     TRUE 0.867 17.000 0.247 NA   NA
 10373009 10373010 BMD_2572 BMD_2573 pssA   FALSE 0.009 484.000 0.000 NA N NA
 10373010 10373011 BMD_2573 BMD_2574     FALSE 0.526 105.000 0.100 NA N NA
 10373012 10373013 BMD_2575 BMD_2576     FALSE 0.014 83.000 0.000 NA   NA
 10373013 10373014 BMD_2576 BMD_2577     FALSE 0.522 28.000 0.024 NA   NA
 10373014 10373015 BMD_2577 BMD_2578     FALSE 0.460 90.000 0.107 NA   NA
 10373015 10373016 BMD_2578 BMD_2579     FALSE 0.007 130.000 0.000 NA   NA
 10373016 10373017 BMD_2579 BMD_2580     FALSE 0.002 284.000 0.000 NA   NA
 10373019 10373020 BMD_2582 BMD_2583     TRUE 0.988 -30.000 0.205 1.000 N NA
 10373020 10373021 BMD_2583 BMD_2584     FALSE 0.006 155.000 0.000 NA   NA
 10373022 10373023 BMD_2585 BMD_2586     TRUE 0.918 17.000 0.017 1.000 Y NA
 10373024 10373025 BMD_2587 BMD_2588     TRUE 0.989 -22.000 0.050 1.000 Y NA
 10373027 10373028 BMD_2590 BMD_2591     FALSE 0.006 156.000 0.000 NA   NA
 10373029 10373030 BMD_2592 BMD_2593   spoIIP FALSE 0.006 160.000 0.000 NA   NA
 10373031 10373032 BMD_2594 BMD_2595 btuR cbiY TRUE 0.726 32.000 0.007 1.000 N NA
 10373032 10373033 BMD_2595 BMD_2596 cbiY cysG FALSE 0.623 21.000 0.000 1.000 N NA
 10373033 10373034 BMD_2596 BMD_2597 cysG cbiA TRUE 0.953 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 10373034 10373035 BMD_2597 BMD_2598 cbiA cbiG TRUE 0.968 14.000 0.032 0.006 Y NA
 10373035 10373036 BMD_2598 BMD_2599 cbiG cbiF TRUE 0.993 3.000 0.397 0.006 Y NA
 10373036 10373037 BMD_2599 BMD_2600 cbiF cbiL TRUE 0.995 -3.000 0.291 0.006 Y NA
 10373037 10373038 BMD_2600 BMD_2601 cbiL cbiET TRUE 0.987 3.000 0.128 0.006 Y NA
 10373038 10373039 BMD_2601 BMD_2602 cbiET cbiD TRUE 0.995 -10.000 0.107 0.006 Y NA
 10373039 10373040 BMD_2602 BMD_2603 cbiD cbiC TRUE 0.985 4.000 0.102 0.006 Y NA
 10373040 10373041 BMD_2603 BMD_2604 cbiC cbiJ TRUE 0.975 6.000 0.026 0.006 Y NA
 10373041 10373042 BMD_2604 BMD_2605 cbiJ cbiX TRUE 0.959 -3.000 0.026 0.006   NA
 10373042 10373043 BMD_2605 BMD_2606 cbiX cbiH TRUE 0.874 19.000 0.025 0.006   NA
 10373043 10373044 BMD_2606 BMD_2607 cbiH cbiW TRUE 0.911 14.000 0.008 0.037 N NA
 10373044 10373045 BMD_2607 BMD_2608 cbiW   FALSE 0.000 725.000 0.000 NA   NA
 10373045 10373046 BMD_2608 BMD_2609     FALSE 0.001 351.000 0.000 NA   NA
 10373046 10373047 BMD_2609 BMD_2610     FALSE 0.237 110.000 0.000 1.000 N NA
 10373049 10373050 BMD_2612 BMD_2613     FALSE 0.052 15.000 0.000 NA   NA
 10373050 10373051 BMD_2613 BMD_2614     FALSE 0.006 187.000 0.000 NA   NA
 10373051 10373052 BMD_2614 BMD_2615   amt FALSE 0.007 134.000 0.000 NA   NA
 10373052 10373053 BMD_2615 BMD_2616 amt   TRUE 0.949 -3.000 0.028 0.085   NA
 10373054 10373055 BMD_2617 BMD_2618   ndh TRUE 0.837 34.000 0.310 NA   NA
 10373056 10373057 BMD_2619 BMD_2620     TRUE 0.927 13.000 0.286 1.000   NA
 10373057 10373058 BMD_2620 BMD_2621     FALSE 0.020 239.000 0.000 1.000   NA
 10373058 10373059 BMD_2621 BMD_2622     TRUE 0.746 23.000 0.097 NA   NA
 10373061 10373062 BMD_2624 BMD_2625     TRUE 0.824 22.000 0.167 NA   NA
 10373062 10373063 BMD_2625 BMD_2626   ubiD TRUE 0.879 17.000 0.278 NA   NA
 10373063 10373064 BMD_2626 BMD_2627 ubiD   TRUE 0.976 3.000 0.200 NA Y NA
 10373066 10373067 BMD_2629 BMD_2630     FALSE 0.000 708.000 0.000 NA   NA
 10373067 10373068 BMD_2630 BMD_2631     FALSE 0.011 100.000 0.000 NA   NA
 10373068 10373069 BMD_2631 BMD_2632     FALSE 0.013 89.000 0.000 NA   NA
 10373071 10373072 BMD_2634 BMD_2635   glcD TRUE 0.992 -3.000 0.342 1.000 Y NA
 10373072 10373073 BMD_2635 BMD_2636 glcD   FALSE 0.598 130.000 0.247 NA N NA
 10373073 10373074 BMD_2636 BMD_2637     FALSE 0.016 72.000 0.000 NA   NA
 10373074 10373075 BMD_2637 BMD_2638     FALSE 0.008 121.000 0.000 NA   NA
 10373075 10373076 BMD_2638 BMD_2639     FALSE 0.001 434.000 0.000 NA   NA
 10373076 10373077 BMD_2639 BMD_2640     FALSE 0.183 137.000 0.000 1.000 N NA
 10373077 10373078 BMD_2640 BMD_2641   yfiN FALSE 0.272 247.000 0.000 1.000 Y NA
 10373078 10373079 BMD_2641 BMD_2642 yfiN yfiM TRUE 0.982 2.000 0.280 NA Y NA
 10373079 10373080 BMD_2642 BMD_2643 yfiM yfiL TRUE 0.889 20.000 0.176 NA N NA
 10373080 10373081 BMD_2643 BMD_2644 yfiL yfiJ TRUE 0.904 102.000 0.667 0.082 N NA
 10373081 10373082 BMD_2644 BMD_2645 yfiJ yfiK TRUE 0.995 5.000 0.857 0.019 Y NA
 10373082 10373083 BMD_2645 BMD_2646 yfiK   FALSE 0.006 168.000 0.000 NA   NA
 10373083 10373084 BMD_2646 BMD_2647     FALSE 0.002 300.000 0.000 NA   NA
 10373085 10373086 BMD_2648 BMD_2649     FALSE 0.006 155.000 0.000 NA   NA
 10373087 10373088 BMD_2650 BMD_2651     FALSE 0.007 132.000 0.000 NA   NA
 10373090 10373091 BMD_2653 BMD_2654     TRUE 0.850 15.000 0.182 NA   NA
 10373091 10373092 BMD_2654 BMD_2655     FALSE 0.007 134.000 0.000 NA   NA
 10373092 10373093 BMD_2655 BMD_2656     FALSE 0.011 95.000 0.000 NA   NA
 10373095 10373096 BMD_2658 BMD_2659     FALSE 0.290 13.000 0.000 1.000   NA
 10373097 10373098 BMD_2660 BMD_2661     FALSE 0.147 42.000 0.000 1.000   NA
 10373099 10373100 BMD_2662 BMD_2663     FALSE 0.022 54.000 0.000 NA   NA
 10373100 10373101 BMD_2663 BMD_2664     FALSE 0.003 255.000 0.000 NA   NA
 10373101 10373102 BMD_2664 BMD_2665     FALSE 0.006 158.000 0.000 NA   NA
 10373102 10373103 BMD_2665 BMD_2666     FALSE 0.194 -9.000 0.000 NA   NA
 10373103 10373104 BMD_2666 BMD_2667     FALSE 0.000 701.000 0.000 NA   NA
 10373104 10373105 BMD_2667 BMD_2668     TRUE 0.980 -3.000 0.667 NA   NA
 10373105 10373106 BMD_2668 BMD_2669     FALSE 0.002 324.000 0.000 NA   NA
 10373106 10373107 BMD_2669 BMD_2670     FALSE 0.102 1.000 0.000 NA   NA
 10373107 10373108 BMD_2670 BMD_2671     FALSE 0.046 19.000 0.000 NA   NA
 10373108 10373109 BMD_2671 BMD_2672     FALSE 0.139 -3.000 0.000 NA   NA
 10373109 10373110 BMD_2672 BMD_2673     FALSE 0.011 96.000 0.000 NA   NA
 10373110 10373111 BMD_2673 BMD_2674     FALSE 0.013 89.000 0.000 NA   NA
 10373111 10373112 BMD_2674 BMD_2675     FALSE 0.224 154.000 0.000 0.084   NA
 10373112 10373113 BMD_2675 BMD_2676     TRUE 0.899 30.000 0.500 NA   NA
 10373113 10373114 BMD_2676 BMD_2677     TRUE 0.664 194.000 0.500 NA N NA
 10373114 10373115 BMD_2677 BMD_2678   xth FALSE 0.432 118.000 0.000 0.041 N NA
 10373117 10373118 BMD_2680 BMD_2681     TRUE 0.775 14.000 0.091 NA   NA
 10373118 10373119 BMD_2681 BMD_2682     TRUE 0.911 -3.000 0.049 1.000   NA
 10373119 10373120 BMD_2682 BMD_2683     FALSE 0.034 278.000 0.000 NA N NA
 10373120 10373121 BMD_2683 BMD_2684     TRUE 0.941 19.000 0.727 NA   NA
 10373121 10373122 BMD_2684 BMD_2685     FALSE 0.011 95.000 0.000 NA   NA
 10373122 10373123 BMD_2685 BMD_2686     TRUE 0.984 36.000 0.571 0.003 Y NA
 10373123 10373124 BMD_2686 BMD_2687     TRUE 0.985 25.000 0.364 0.003 Y NA
 10373124 10373125 BMD_2687 BMD_2688   yfkN FALSE 0.067 287.000 0.000 1.000 N NA
 10373125 10373126 BMD_2688 BMD_2689 yfkN   FALSE 0.000 628.000 0.000 NA   NA
 10373126 10373127 BMD_2689 BMD_2690     FALSE 0.102 1.000 0.000 NA   NA
 10373127 10373128 BMD_2690 BMD_2691     FALSE 0.021 56.000 0.000 NA   NA
 10373128 10373129 BMD_2691 BMD_2692     TRUE 0.987 -7.000 0.791 NA   NA
 10373129 10373130 BMD_2692 BMD_2693     TRUE 0.975 14.000 0.850 1.000 N NA
 10373130 10373131 BMD_2693 BMD_2694     FALSE 0.612 24.000 0.000 1.000 N NA
 10373133 10373134 BMD_2696 BMD_2697     FALSE 0.191 301.000 0.000 1.000 Y NA
 10373138 10373139 BMD_2701 BMD_2702     FALSE 0.006 144.000 0.000 NA   NA
 10373141 10373142 BMD_2704 BMD_2705     FALSE 0.125 218.000 0.000 1.000 N NA
 10373142 10373143 BMD_2705 BMD_2706     FALSE 0.501 119.000 0.000 1.000 Y NA
 10373143 10373144 BMD_2706 BMD_2707     TRUE 0.653 133.000 0.588 NA   NA
 10373146 10373147 BMD_2709 BMD_2710     FALSE 0.009 343.000 0.000 1.000   NA
 10373147 10373148 BMD_2710 BMD_2711     FALSE 0.003 550.000 0.000 1.000   NA
 10373148 10373149 BMD_2711 BMD_2712     FALSE 0.006 140.000 0.000 NA   NA
 10373151 10373152 BMD_2714 BMD_2715     FALSE 0.019 63.000 0.000 NA   NA
 10373152 10373153 BMD_2715 BMD_2716     FALSE 0.013 85.000 0.000 NA   NA
 10373155 10373156 BMD_2718 BMD_2719 ileS   FALSE 0.016 518.000 0.000 1.000 N NA
 10373158 10373159 BMD_2721 BMD_2722     FALSE 0.006 384.000 0.000 1.000   NA
 10373159 10373160 BMD_2722 BMD_2723     FALSE 0.010 103.000 0.000 NA   NA
 10373160 10373161 BMD_2723 BMD_2724     FALSE 0.000 737.000 0.000 NA   NA
 10373161 10373162 BMD_2724 BMD_2725     FALSE 0.084 4.000 0.000 NA   NA
 10373162 10373163 BMD_2725 BMD_2726     FALSE 0.000 605.000 0.000 NA   NA
 10373163 10373164 BMD_2726 BMD_2727     FALSE 0.013 86.000 0.000 NA   NA
 10373164 10373165 BMD_2727 BMD_2728     FALSE 0.006 176.000 0.000 NA   NA
 10373165 10373166 BMD_2728 BMD_2729     FALSE 0.027 40.000 0.000 NA   NA
 10373168 10373169 BMD_2731 BMD_2732 mqo   FALSE 0.000 1537.000 0.000 NA   NA
 10373169 10373170 BMD_2732 BMD_2733     FALSE 0.074 6.000 0.000 NA   NA
 10373170 10373171 BMD_2733 BMD_2734     FALSE 0.013 89.000 0.000 NA   NA
 10373173 10373174 BMD_2736 BMD_2737 expZ melA FALSE 0.007 371.000 0.000 1.000   NA
 10373174 10373175 BMD_2737 BMD_2738 melA amyC TRUE 0.957 27.000 0.217 1.000 Y NA
 10373175 10373176 BMD_2738 BMD_2739 amyC amyD TRUE 0.996 0.000 0.588 0.031 Y NA
 10373176 10373177 BMD_2739 BMD_2740 amyD msmE TRUE 0.965 90.000 0.818 0.031 Y NA
 10373177 10373178 BMD_2740 BMD_2741 msmE   FALSE 0.385 311.000 0.364 1.000 N NA
 10373179 10373180 BMD_2742 BMD_2743     FALSE 0.016 74.000 0.000 NA   NA
 10373181 10373182 BMD_2744 BMD_2745     FALSE 0.015 77.000 0.000 NA   NA
 10373182 10373183 BMD_2745 BMD_2746     FALSE 0.006 170.000 0.000 NA   NA
 10373183 10373184 BMD_2746 BMD_2747     FALSE 0.003 256.000 0.000 NA   NA
 10373184 10373185 BMD_2747 BMD_2748     TRUE 0.942 23.000 0.091 1.000 Y NA
 10373185 10373186 BMD_2748 BMD_2749     TRUE 0.638 127.000 0.290 NA N NA
 10373188 10373189 BMD_2751 BMD_2752     FALSE 0.006 161.000 0.000 NA   NA
 10373189 10373190 BMD_2752 BMD_2753     FALSE 0.003 256.000 0.000 NA   NA
 10373190 10373191 BMD_2753 BMD_2754     FALSE 0.000 1167.000 0.000 NA   NA
 10373191 10373192 BMD_2754 BMD_2755     FALSE 0.001 431.000 0.000 NA   NA
 10373192 10373193 BMD_2755 BMD_2756     FALSE 0.025 46.000 0.000 NA   NA
 10373194 10373195 BMD_2757 BMD_2758     FALSE 0.001 417.000 0.000 NA   NA
 10373196 10373197 BMD_2759 BMD_2760     FALSE 0.023 50.000 0.000 NA   NA
 10373197 10373198 BMD_2760 BMD_2761     FALSE 0.001 400.000 0.000 NA   NA
 10373198 10373199 BMD_2761 BMD_2762     FALSE 0.200 -10.000 0.000 NA   NA
 10373199 10373200 BMD_2762 BMD_2763     FALSE 0.050 359.000 0.000 0.083   NA
 10373200 10373201 BMD_2763 BMD_2764     FALSE 0.001 402.000 0.000 NA   NA
 10373202 10373203 BMD_2765 BMD_2766     FALSE 0.009 109.000 0.000 NA   NA
 10373203 10373204 BMD_2766 BMD_2767     FALSE 0.000 829.000 0.000 NA   NA
 10373205 10373206 BMD_2768 BMD_2769     FALSE 0.003 238.000 0.000 NA   NA
 10373206 10373207 BMD_2769 BMD_2770     FALSE 0.022 54.000 0.000 NA   NA
 10373207 10373208 BMD_2770 BMD_2771     TRUE 0.975 3.000 0.400 1.000 N NA
 10373208 10373209 BMD_2771 BMD_2772     TRUE 0.963 2.000 0.211 1.000 N NA
 10373209 10373210 BMD_2772 BMD_2773     FALSE 0.511 -3.000 0.000 1.000   NA
 10373210 10373211 BMD_2773 BMD_2774     FALSE 0.168 34.000 0.000 1.000   NA
 10373211 10373212 BMD_2774 BMD_2775     FALSE 0.329 82.000 0.000 1.000 N NA
 10373212 10373213 BMD_2775 BMD_2776     FALSE 0.001 377.000 0.000 NA   NA
 10373213 10373214 BMD_2776 BMD_2777     FALSE 0.000 788.000 0.000 NA   NA
 10373216 10373217 BMD_2779 BMD_2780     FALSE 0.004 226.000 0.000 NA   NA
 10373217 10373218 BMD_2780 BMD_2781   abrB FALSE 0.010 106.000 0.000 NA   NA
 10373219 10373220 BMD_2782 BMD_2783   brnQ FALSE 0.051 561.000 0.000 1.000 Y NA
 10373220 10373221 BMD_2783 BMD_2784 brnQ   FALSE 0.075 272.000 0.000 1.000 N NA
 10373222 10373223 BMD_2785 BMD_2786     TRUE 0.948 -16.000 0.000 0.008   NA
 10373223 10373224 BMD_2786 BMD_2787     FALSE 0.000 646.000 0.000 NA   NA
 10373224 10373225 BMD_2787 BMD_2788     FALSE 0.000 2006.000 0.000 NA   NA
 10373225 10373226 BMD_2788 BMD_2789     FALSE 0.002 299.000 0.000 NA   NA
 10373227 10373228 BMD_2790 BMD_2791   cspC FALSE 0.000 833.000 0.000 NA   NA
 10373233 10373234 BMD_2796 BMD_2797     FALSE 0.002 320.000 0.000 NA   NA
 10373234 10373235 BMD_2797 BMD_2798     TRUE 0.685 17.000 0.016 1.000   NA
 10373235 10373236 BMD_2798 BMD_2799     FALSE 0.004 215.000 0.000 NA   NA
 10373236 10373237 BMD_2799 BMD_2800     FALSE 0.001 365.000 0.000 NA   NA
 10373237 10373238 BMD_2800 BMD_2801     TRUE 0.759 24.000 0.030 NA N NA
 10373240 10373241 BMD_2803 BMD_2804     FALSE 0.009 331.000 0.000 1.000   NA
 10373241 10373242 BMD_2804 BMD_2805     FALSE 0.006 183.000 0.000 NA   NA
 10373242 10373243 BMD_2805 BMD_2806   tcyJ FALSE 0.006 152.000 0.000 NA   NA
 10373245 10373246 BMD_2808 BMD_2809     FALSE 0.015 79.000 0.000 NA   NA
 10373246 10373247 BMD_2809 BMD_2810     FALSE 0.009 110.000 0.000 NA   NA
 10373247 10373248 BMD_2810 BMD_2811     FALSE 0.001 354.000 0.000 NA   NA
 10373248 10373249 BMD_2811 BMD_2812     FALSE 0.246 148.000 0.000 0.040   NA
 10373249 10373250 BMD_2812 BMD_2813   cdd TRUE 0.859 20.000 0.000 1.000 Y NA
 10373250 10373251 BMD_2813 BMD_2814 cdd deoC TRUE 0.819 60.000 0.013 1.000 Y NA
 10373251 10373252 BMD_2814 BMD_2815 deoC   TRUE 0.947 22.000 0.106 1.000 Y NA
 10373252 10373253 BMD_2815 BMD_2816     FALSE 0.006 183.000 0.000 NA   NA
 10373253 10373254 BMD_2816 BMD_2817     FALSE 0.006 188.000 0.000 NA   NA
 10373254 10373255 BMD_2817 BMD_2818     FALSE 0.042 133.000 0.000 1.000   NA
 10373255 10373256 BMD_2818 BMD_2819     FALSE 0.024 225.000 0.000 1.000   NA
 10373256 10373257 BMD_2819 BMD_2820     FALSE 0.168 34.000 0.000 1.000   NA
 10373257 10373258 BMD_2820 BMD_2821     FALSE 0.002 313.000 0.000 NA   NA
 10373258 10373259 BMD_2821 BMD_2822     FALSE 0.002 307.000 0.000 NA   NA
 10373261 10373262 BMD_2824 BMD_2825     TRUE 0.954 -10.000 0.138 NA   NA
 10373266 10373267 BMD_2829 BMD_2830     TRUE 0.807 71.000 0.000 0.030 Y NA
 10373267 10373268 BMD_2830 BMD_2831     TRUE 0.997 0.000 1.000 0.030 Y NA
 10373270 10373271 BMD_2833 BMD_2834     FALSE 0.045 128.000 0.000 1.000   NA
 10373271 10373272 BMD_2834 BMD_2835     FALSE 0.010 104.000 0.000 NA   NA
 10373272 10373273 BMD_2835 BMD_2836     FALSE 0.010 101.000 0.000 NA   NA
 10373273 10373274 BMD_2836 BMD_2837   capA FALSE 0.012 92.000 0.000 NA   NA
 10373274 10373275 BMD_2837 BMD_2838 capA   FALSE 0.002 302.000 0.000 NA   NA
 10373275 10373276 BMD_2838 BMD_2839     FALSE 0.006 173.000 0.000 NA   NA
 10373278 10373279 BMD_2841 BMD_2842     FALSE 0.316 85.000 0.000 1.000 N NA
 10373280 10373281 BMD_2843 BMD_2844     FALSE 0.006 168.000 0.000 NA   NA
 10373282 10373283 BMD_2845 BMD_2846     FALSE 0.139 -3.000 0.000 NA   NA
 10373284 10373285 BMD_2847 BMD_2848     FALSE 0.025 44.000 0.000 NA   NA
 10373288 10373289 BMD_2851 BMD_2852   kduD FALSE 0.019 63.000 0.000 NA   NA
 10373289 10373290 BMD_2852 BMD_2853 kduD   TRUE 0.846 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10373290 10373291 BMD_2853 BMD_2854   gntR FALSE 0.336 80.000 0.000 1.000 N NA
 10373301 10373302 BMD_2864 BMD_2865     TRUE 0.950 10.000 0.000 0.016 Y NA
 10373302 10373303 BMD_2865 BMD_2866     TRUE 0.909 6.000 0.000 1.000 Y NA
 10373303 10373304 BMD_2866 BMD_2867     TRUE 0.997 -3.000 0.647 0.030 Y NA
 10373304 10373305 BMD_2867 BMD_2868     TRUE 0.961 3.000 0.000 0.030 Y NA
 10373305 10373306 BMD_2868 BMD_2869     FALSE 0.003 246.000 0.000 NA   NA
 10373306 10373307 BMD_2869 BMD_2870     FALSE 0.002 313.000 0.000 NA   NA
 10373307 10373308 BMD_2870 BMD_2871     FALSE 0.005 199.000 0.000 NA   NA
 10373308 10373309 BMD_2871 BMD_2872     FALSE 0.032 198.000 0.000 1.000   NA
 10373311 10373312 BMD_2874 BMD_2875     FALSE 0.005 421.000 0.000 1.000   NA
 10373312 10373313 BMD_2875 BMD_2876   mqo FALSE 0.019 247.000 0.000 1.000   NA
 10373313 10373314 BMD_2876 BMD_2877 mqo   FALSE 0.008 121.000 0.000 NA   NA
 10373314 10373315 BMD_2877 BMD_2878     FALSE 0.000 570.000 0.000 NA   NA
 10373319 10373320 BMD_2882 BMD_2883     FALSE 0.007 128.000 0.000 NA   NA
 10373320 10373321 BMD_2883 BMD_2884     FALSE 0.016 73.000 0.000 NA   NA
 10373322 10373323 BMD_2885 BMD_2886     FALSE 0.015 81.000 0.000 NA   NA
 10373324 10373325 BMD_2887 BMD_2888 pepS   FALSE 0.181 144.000 0.000 1.000 N NA
 10373325 10373326 BMD_2888 BMD_2889     TRUE 0.658 52.000 0.012 1.000 N NA
 10373326 10373327 BMD_2889 BMD_2890   glcB FALSE 0.430 108.000 0.008 1.000 N NA
 10373327 10373328 BMD_2890 BMD_2891 glcB   FALSE 0.582 172.000 0.022 1.000 Y NA
 10373328 10373329 BMD_2891 BMD_2892     TRUE 0.993 -16.000 0.039 0.036 Y NA
 10373329 10373330 BMD_2892 BMD_2893     TRUE 0.986 1.000 0.096 0.036 Y NA
 10373332 10373333 BMD_2895 BMD_2896     FALSE 0.008 116.000 0.000 NA   NA
 10373334 10373335 BMD_2897 BMD_2898     FALSE 0.009 109.000 0.000 NA   NA
 10373336 10373337 BMD_2899 BMD_2900 yxlG yxlF TRUE 0.977 -3.000 0.569 NA   NA
 10373337 10373338 BMD_2900 BMD_2901 yxlF   TRUE 0.797 13.000 0.098 NA   NA
 10373338 10373339 BMD_2901 BMD_2902     FALSE 0.102 1.000 0.000 NA   NA
 10373339 10373340 BMD_2902 BMD_2903     TRUE 0.944 0.000 0.250 NA   NA
 10373340 10373341 BMD_2903 BMD_2904     TRUE 0.952 -12.000 0.125 NA   NA
 10373343 10373344 BMD_2906 BMD_2907     FALSE 0.001 398.000 0.000 NA   NA
 10373344 10373345 BMD_2907 BMD_2908     FALSE 0.009 110.000 0.000 NA   NA
 10373345 10373346 BMD_2908 BMD_2909     FALSE 0.007 128.000 0.000 NA   NA
 10373346 10373347 BMD_2909 BMD_2910     FALSE 0.002 278.000 0.000 NA   NA
 10373347 10373348 BMD_2910 BMD_2911     FALSE 0.015 80.000 0.000 NA   NA
 10373348 10373349 BMD_2911 BMD_2912     FALSE 0.048 122.000 0.000 1.000   NA
 10373349 10373350 BMD_2912 BMD_2913   rsbR FALSE 0.061 220.000 0.000 NA N NA
 10373351 10373352 BMD_2914 BMD_2915 spe   FALSE 0.081 85.000 0.000 1.000   NA
 10373353 10373354 BMD_2916 BMD_2917     FALSE 0.008 116.000 0.000 NA   NA
 10373354 10373355 BMD_2917 BMD_2918     FALSE 0.006 162.000 0.000 NA   NA
 10373355 10373356 BMD_2918 BMD_2919     FALSE 0.264 -39.000 0.000 NA   NA
 10373356 10373357 BMD_2919 BMD_2920   phoR FALSE 0.041 26.000 0.000 NA   NA
 10373357 10373358 BMD_2920 BMD_2921 phoR phoP TRUE 0.991 -3.000 0.286 1.000 Y NA
 10373358 10373359 BMD_2921 BMD_2922 phoP   FALSE 0.189 132.000 0.000 1.000 N NA
 10373359 10373360 BMD_2922 BMD_2923     FALSE 0.031 33.000 0.000 NA   NA
 10373362 10373363 BMD_2925 BMD_2926 odhB odhA TRUE 0.983 17.000 0.667 1.000 Y NA
 10373363 10373364 BMD_2926 BMD_2927 odhA   FALSE 0.018 364.000 0.000 NA N NA
 10373364 10373365 BMD_2927 BMD_2928     TRUE 0.858 30.000 0.182 NA N NA
 10373365 10373366 BMD_2928 BMD_2929     FALSE 0.181 141.000 0.000 1.000 N NA
 10373366 10373367 BMD_2929 BMD_2930     FALSE 0.205 123.000 0.000 1.000 N NA
 10373369 10373370 BMD_2932 BMD_2933     FALSE 0.002 327.000 0.000 NA   NA
 10373370 10373371 BMD_2933 BMD_2934     FALSE 0.012 92.000 0.000 NA   NA
 10373373 10373374 BMD_2936 BMD_2937     FALSE 0.004 218.000 0.000 NA   NA
 10373374 10373375 BMD_2937 BMD_2938     FALSE 0.002 301.000 0.000 NA   NA
 10373375 10373376 BMD_2938 BMD_2939     TRUE 0.997 -3.000 0.773 0.016 Y NA
 10373376 10373377 BMD_2939 BMD_2940     TRUE 0.985 13.000 0.581 1.000 Y NA
 10373377 10373378 BMD_2940 BMD_2941     TRUE 0.948 100.000 0.508 0.030 Y NA
 10373378 10373379 BMD_2941 BMD_2942     TRUE 0.802 82.000 0.049 1.000 Y NA
 10373379 10373380 BMD_2942 BMD_2943     FALSE 0.068 476.000 0.000 1.000 Y NA
 10373380 10373381 BMD_2943 BMD_2944   amt TRUE 0.652 15.000 0.000 1.000 N NA
 10373381 10373382 BMD_2944 BMD_2945 amt   FALSE 0.007 124.000 0.000 NA   NA
 10373382 10373383 BMD_2945 BMD_2946     FALSE 0.234 -19.000 0.000 NA   NA
 10373383 10373384 BMD_2946 BMD_2947     FALSE 0.004 217.000 0.000 NA   NA
 10373384 10373385 BMD_2947 BMD_2948     FALSE 0.613 108.000 0.318 NA   NA
 10373385 10373386 BMD_2948 BMD_2949     FALSE 0.000 731.000 0.000 NA   NA
 10373388 10373389 BMD_2951 BMD_2952     FALSE 0.049 16.000 0.000 NA   NA
 10373389 10373390 BMD_2952 BMD_2953     FALSE 0.261 -37.000 0.000 NA   NA
 10373390 10373391 BMD_2953 BMD_2954     FALSE 0.063 12.000 0.000 NA   NA
 10373392 10373393 BMD_2955 BMD_2956     FALSE 0.006 184.000 0.000 NA   NA
 10373393 10373394 BMD_2956 BMD_2957     FALSE 0.006 144.000 0.000 NA   NA
 10373394 10373395 BMD_2957 BMD_2958     TRUE 0.795 108.000 1.000 NA   NA
 10373395 10373396 BMD_2958 BMD_2959   gerT FALSE 0.023 52.000 0.000 NA   NA
 10373396 10373397 BMD_2959 BMD_2960 gerT   FALSE 0.583 90.000 0.200 NA   NA
 10373397 10373398 BMD_2960 BMD_2961     FALSE 0.006 183.000 0.000 NA   NA
 10373399 10373400 BMD_2962 BMD_2963     TRUE 0.992 -3.000 0.373 1.000 Y NA
 10373400 10373401 BMD_2963 BMD_2964   cbiP FALSE 0.137 206.000 0.000 1.000 N NA
 10373403 10373404 BMD_2966 BMD_2967     FALSE 0.005 423.000 0.000 1.000   NA
 10373404 10373405 BMD_2967 BMD_2968     FALSE 0.112 270.000 0.000 0.035   NA
 10373405 10373406 BMD_2968 BMD_2969     FALSE 0.046 22.000 0.000 NA   NA
 10373406 10373407 BMD_2969 BMD_2970     FALSE 0.002 313.000 0.000 NA   NA
 10373407 10373408 BMD_2970 BMD_2971   hxlA TRUE 0.808 0.000 0.000 1.000 N NA
 10373408 10373409 BMD_2971 BMD_2972 hxlA   FALSE 0.257 103.000 0.000 1.000 N NA
 10373409 10373410 BMD_2972 BMD_2973     TRUE 0.853 102.000 0.667 1.000 N NA
 10373410 10373411 BMD_2973 BMD_2974     TRUE 0.951 27.000 0.250 NA Y NA
 10373411 10373412 BMD_2974 BMD_2975     TRUE 0.979 3.000 0.250 NA Y NA
 10373412 10373413 BMD_2975 BMD_2976     TRUE 0.970 -3.000 0.035 NA Y NA
 10373413 10373414 BMD_2976 BMD_2977     FALSE 0.006 157.000 0.000 NA   NA
 10373414 10373415 BMD_2977 BMD_2978     FALSE 0.006 142.000 0.000 NA   NA
 10373415 10373416 BMD_2978 BMD_2979     TRUE 0.960 -3.000 0.149 NA N NA
 10373416 10373417 BMD_2979 BMD_2980     TRUE 0.976 -3.000 0.315 NA N NA
 10373417 10373418 BMD_2980 BMD_2981     TRUE 0.919 -3.000 0.111 NA   NA
 10373418 10373419 BMD_2981 BMD_2982     FALSE 0.003 236.000 0.000 NA   NA
 10373421 10373422 BMD_2984 BMD_2985   ureD FALSE 0.046 19.000 0.000 NA   NA
 10373422 10373423 BMD_2985 BMD_2986 ureD ureG TRUE 0.996 -3.000 0.337 0.002 Y NA
 10373423 10373424 BMD_2986 BMD_2987 ureG ureF TRUE 0.980 39.000 0.439 0.002 Y NA
 10373424 10373425 BMD_2987 BMD_2988 ureF ureE TRUE 0.998 -7.000 0.460 0.002 Y NA
 10373425 10373426 BMD_2988 BMD_2989 ureE ureC TRUE 0.952 11.000 0.038 0.001 N NA
 10373426 10373427 BMD_2989 BMD_2990 ureC ureB TRUE 0.988 2.000 0.089 0.001 Y NA
 10373427 10373428 BMD_2990 BMD_2991 ureB ureA TRUE 0.989 15.000 0.356 0.001 Y NA
 10373428 10373429 BMD_2991 BMD_2992 ureA   FALSE 0.446 154.000 0.000 1.000 Y NA
 10373431 10373432 BMD_2994 BMD_2995     FALSE 0.008 356.000 0.000 1.000   NA
 10373432 10373433 BMD_2995 BMD_2996     FALSE 0.287 93.000 0.000 1.000 N NA
 10373433 10373434 BMD_2996 BMD_2997     TRUE 0.985 -3.000 0.714 1.000   NA
 10373434 10373435 BMD_2997 BMD_2998     TRUE 0.954 16.000 0.714 1.000   NA
 10373435 10373436 BMD_2998 BMD_2999     FALSE 0.002 291.000 0.000 NA   NA
 10373438 10373439 BMD_3001 BMD_3002 spoVB   FALSE 0.083 294.000 0.000 0.081   NA
 10373442 10373443 BMD_3005 BMD_3006     FALSE 0.011 98.000 0.000 NA   NA
 10373446 10373447 BMD_3009 BMD_3010   copC FALSE 0.241 17.000 0.000 1.000   NA
 10373449 10373450 BMD_3012 BMD_3013     FALSE 0.005 204.000 0.000 NA   NA
 10373450 10373451 BMD_3013 BMD_3014     FALSE 0.003 232.000 0.000 NA   NA
 10373451 10373452 BMD_3014 BMD_3015     FALSE 0.011 95.000 0.000 NA   NA
 10373453 10373454 BMD_3016 BMD_3017     TRUE 0.943 -6.000 0.000 0.001   NA
 10373456 10373457 BMD_3019 BMD_3020     FALSE 0.000 676.000 0.000 NA   NA
 10373458 10373459 BMD_3021 BMD_3022 spo0M   FALSE 0.000 651.000 0.000 NA   NA
 10373459 10373460 BMD_3022 BMD_3023     FALSE 0.004 228.000 0.000 NA   NA
 10373460 10373461 BMD_3023 BMD_3024   phaZ FALSE 0.256 -30.000 0.000 NA   NA
 10373463 10373464 BMD_3026 BMD_3027   aroE FALSE 0.006 142.000 0.000 NA   NA
 10373464 10373465 BMD_3027 BMD_3028 aroE tyrA TRUE 0.941 16.000 0.069 1.000 Y NA
 10373465 10373466 BMD_3028 BMD_3029 tyrA aroF TRUE 0.914 21.000 0.010 1.000 Y NA
 10373466 10373467 BMD_3029 BMD_3030 aroF   FALSE 0.445 257.000 0.000 0.002 Y NA
 10373467 10373468 BMD_3030 BMD_3031     FALSE 0.002 810.000 0.000 1.000   NA
 10373468 10373469 BMD_3031 BMD_3032     FALSE 0.116 60.000 0.000 1.000   NA
 10373469 10373470 BMD_3032 BMD_3033     TRUE 0.997 -3.000 0.435 0.000 Y NA
 10373470 10373471 BMD_3033 BMD_3034   ggt TRUE 0.872 25.000 0.100 1.000 N NA
 10373471 10373472 BMD_3034 BMD_3035 ggt   TRUE 0.765 44.000 0.000 1.000 Y NA
 10373472 10373473 BMD_3035 BMD_3036     TRUE 0.942 13.000 0.036 1.000 Y NA
 10373475 10373476 BMD_3038 BMD_3039   lytF FALSE 0.007 124.000 0.000 NA   NA
 10373478 10373479 BMD_3041 BMD_3042     FALSE 0.003 256.000 0.000 NA   NA
 10373481 10373482 BMD_3044 BMD_3045     FALSE 0.001 355.000 0.000 NA   NA
 10373482 10373483 BMD_3045 BMD_3046     TRUE 0.877 15.000 0.235 NA   NA
 10373483 10373484 BMD_3046 BMD_3047     TRUE 0.976 0.000 0.765 NA   NA
 10373484 10373485 BMD_3047 BMD_3048     TRUE 0.980 0.000 0.933 NA   NA
 10373485 10373486 BMD_3048 BMD_3049     FALSE 0.008 116.000 0.000 NA   NA
 10373486 10373487 BMD_3049 BMD_3050     FALSE 0.001 434.000 0.000 NA   NA
 10373487 10373488 BMD_3050 BMD_3051     FALSE 0.018 250.000 0.000 1.000   NA
 10373488 10373489 BMD_3051 BMD_3052   sipT FALSE 0.294 91.000 0.000 1.000 N NA
 10373489 10373490 BMD_3052 BMD_3053 sipT   FALSE 0.111 255.000 0.000 0.081   NA
 10373490 10373491 BMD_3053 BMD_3054   murG FALSE 0.083 84.000 0.000 1.000   NA
 10373494 10373495 BMD_3057 BMD_3058     TRUE 0.880 30.000 0.108 0.035   NA
 10373495 10373496 BMD_3058 BMD_3059     FALSE 0.012 93.000 0.000 NA   NA
 10373496 10373497 BMD_3059 BMD_3060     FALSE 0.008 116.000 0.000 NA   NA
 10373501 10373502 BMD_3064 BMD_3065     FALSE 0.008 121.000 0.000 NA   NA
 10373502 10373503 BMD_3065 BMD_3066     FALSE 0.005 194.000 0.000 NA   NA
 10373507 10373508 BMD_3070 BMD_3071     FALSE 0.017 67.000 0.000 NA   NA
 10373509 10373510 BMD_3072 BMD_3073     FALSE 0.006 186.000 0.000 NA   NA
 10373515 10373516 BMD_3078 BMD_3079     FALSE 0.009 109.000 0.000 NA   NA
 10373519 10373520 BMD_3082 BMD_3083     FALSE 0.216 -13.000 0.000 NA   NA
 10373520 10373521 BMD_3083 BMD_3084     FALSE 0.001 355.000 0.000 NA   NA
 10373522 10373523 BMD_3085 BMD_3086 pfyP   FALSE 0.225 239.000 0.000 NA Y NA
 10373524 10373525 BMD_3087 BMD_3088     FALSE 0.007 139.000 0.000 NA   NA
 10373525 10373526 BMD_3088 BMD_3089     FALSE 0.006 143.000 0.000 NA   NA
 10373527 10373528 BMD_3090 BMD_3091     FALSE 0.006 159.000 0.000 NA   NA
 10373531 10373532 BMD_3094 BMD_3095     FALSE 0.006 162.000 0.000 NA   NA
 10373532 10373533 BMD_3095 BMD_3096   clpP FALSE 0.059 13.000 0.000 NA   NA
 10373533 10373534 BMD_3096 BMD_3097 clpP   TRUE 0.883 -7.000 0.000 1.000 N NA
 10373536 10373537 BMD_3099 BMD_3100 ansB ansA TRUE 0.924 21.000 0.031 1.000 Y NA
 10373539 10373540 BMD_3102 BMD_3103     FALSE 0.006 148.000 0.000 NA   NA
 10373540 10373541 BMD_3103 BMD_3104     FALSE 0.002 287.000 0.000 NA   NA
 10373542 10373543 BMD_3105 BMD_3106     FALSE 0.547 71.000 0.118 NA   NA
 10373543 10373544 BMD_3106 BMD_3107     TRUE 0.962 13.000 0.941 NA   NA
 10373544 10373545 BMD_3107 BMD_3108     FALSE 0.006 152.000 0.000 NA   NA
 10373545 10373546 BMD_3108 BMD_3109     FALSE 0.001 393.000 0.000 NA   NA
 10373547 10373548 BMD_3110 BMD_3111     FALSE 0.011 100.000 0.000 NA   NA
 10373548 10373549 BMD_3111 BMD_3112     FALSE 0.004 223.000 0.000 NA   NA
 10373549 10373550 BMD_3112 BMD_3113     TRUE 0.952 -3.000 0.222 NA   NA
 10373552 10373553 BMD_3115 BMD_3116     FALSE 0.076 270.000 0.000 1.000 N NA
 10373554 10373555 BMD_3117 BMD_3118     FALSE 0.003 237.000 0.000 NA   NA
 10373558 10373559 BMD_3121 BMD_3122 cysI   TRUE 0.993 22.000 0.791 0.000 Y NA
 10373560 10373561 BMD_3123 BMD_3124     FALSE 0.041 26.000 0.000 NA   NA
 10373562 10373563 BMD_3125 BMD_3126     TRUE 0.945 23.000 0.351 1.000 N NA
 10373565 10373566 BMD_3128 BMD_3129     FALSE 0.025 45.000 0.000 NA   NA
 10373566 10373567 BMD_3129 BMD_3130     FALSE 0.026 43.000 0.000 NA   NA
 10373567 10373568 BMD_3130 BMD_3131     FALSE 0.013 85.000 0.000 NA   NA
 10373569 10373570 BMD_3132 BMD_3133     FALSE 0.049 16.000 0.000 NA   NA
 10373570 10373571 BMD_3133 BMD_3134     FALSE 0.554 61.000 0.000 0.008   NA
 10373575 10373576 BMD_3138 BMD_3139     FALSE 0.006 157.000 0.000 NA   NA
 10373577 10373578 BMD_3140 BMD_3141     FALSE 0.046 246.000 0.000 NA N NA
 10373578 10373579 BMD_3141 BMD_3142     FALSE 0.007 125.000 0.000 NA   NA
 10373579 10373580 BMD_3142 BMD_3143     FALSE 0.027 40.000 0.000 NA   NA
 10373582 10373583 BMD_3145 BMD_3146   hutI FALSE 0.015 76.000 0.000 NA   NA
 10373585 10373586 BMD_3148 BMD_3149     FALSE 0.097 134.000 0.000 NA N NA
 10373586 10373587 BMD_3149 BMD_3150     FALSE 0.010 102.000 0.000 NA   NA
 10373588 10373589 BMD_3151 BMD_3152     FALSE 0.096 2.000 0.000 NA   NA
 10373590 10373591 BMD_3153 BMD_3154 qoxD qoxC TRUE 0.993 4.000 0.959 1.000 Y NA
 10373591 10373592 BMD_3154 BMD_3155 qoxC qoxB TRUE 0.997 0.000 0.957 0.035 Y NA
 10373592 10373593 BMD_3155 BMD_3156 qoxB qoxA TRUE 0.965 47.000 0.234 0.006 Y NA
 10373593 10373594 BMD_3156 BMD_3157 qoxA   FALSE 0.000 567.000 0.000 NA   NA
 10373594 10373595 BMD_3157 BMD_3158     FALSE 0.002 309.000 0.000 NA   NA
 10373598 10373599 BMD_3161 BMD_3162     FALSE 0.024 49.000 0.000 NA   NA
 10373599 10373600 BMD_3162 BMD_3163     FALSE 0.002 300.000 0.000 NA   NA
 10373600 10373601 BMD_3163 BMD_3164   cadA FALSE 0.531 32.000 0.000 1.000 N NA
 10373601 10373602 BMD_3164 BMD_3165 cadA   TRUE 0.652 59.000 0.000 0.071 N NA
 10373602 10373603 BMD_3165 BMD_3166     FALSE 0.013 85.000 0.000 NA   NA
 10373603 10373604 BMD_3166 BMD_3167     FALSE 0.004 219.000 0.000 NA   NA
 10373605 10373606 BMD_3168 BMD_3169 cwlC   FALSE 0.021 448.000 0.000 1.000 N NA
 10373606 10373607 BMD_3169 BMD_3170     TRUE 0.668 125.000 0.000 0.012 Y NA
 10373607 10373608 BMD_3170 BMD_3171     FALSE 0.003 248.000 0.000 NA   NA
 10373608 10373609 BMD_3171 BMD_3172     FALSE 0.046 20.000 0.000 NA   NA
 10373610 10373611 BMD_3173 BMD_3174     FALSE 0.001 344.000 0.000 NA   NA
 10373611 10373612 BMD_3174 BMD_3175     TRUE 0.966 2.000 0.571 NA   NA
 10373618 10373619 BMD_3181 BMD_3182     FALSE 0.003 243.000 0.000 NA   NA
 10373620 10373621 BMD_3183 BMD_3184     FALSE 0.011 99.000 0.000 NA   NA
 10373623 10373624 BMD_3186 BMD_3187     TRUE 0.978 -7.000 0.383 NA   NA
 10373624 10373625 BMD_3187 BMD_3188     FALSE 0.006 186.000 0.000 NA   NA
 10373625 10373626 BMD_3188 BMD_3189   bdbC FALSE 0.000 777.000 0.000 NA   NA
 10373626 10373627 BMD_3189 BMD_3190 bdbC bdbD TRUE 0.994 0.000 0.308 0.004 Y NA
 10373627 10373628 BMD_3190 BMD_3191 bdbD   FALSE 0.471 38.000 0.031 NA   NA
 10373628 10373629 BMD_3191 BMD_3192     TRUE 0.925 4.000 0.250 NA   NA
 10373629 10373630 BMD_3192 BMD_3193     FALSE 0.013 85.000 0.000 NA   NA
 10373630 10373631 BMD_3193 BMD_3194     TRUE 0.747 56.000 0.250 NA   NA
 10373631 10373632 BMD_3194 BMD_3195     TRUE 0.810 16.000 0.139 NA   NA
 10373634 10373635 BMD_3197 BMD_3198     FALSE 0.006 158.000 0.000 NA   NA
 10373638 10373639 BMD_3201 BMD_3202     TRUE 0.846 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10373640 10373641 BMD_3203 BMD_3204 prfC cspB FALSE 0.094 243.000 0.000 1.000 N NA
 10373642 10373643 BMD_3205 BMD_3206     FALSE 0.023 52.000 0.000 NA   NA
 10373645 10373646 BMD_3208 BMD_3209     FALSE 0.046 23.000 0.000 NA   NA
 10373646 10373647 BMD_3209 BMD_3210     FALSE 0.002 276.000 0.000 NA   NA
 10373650 10373651 BMD_3213 BMD_3214     FALSE 0.010 104.000 0.000 NA   NA
 10373651 10373652 BMD_3214 BMD_3215     FALSE 0.006 186.000 0.000 NA   NA
 10373652 10373653 BMD_3215 BMD_3216   yclQ FALSE 0.081 431.000 0.000 1.000 Y NA
 10373653 10373654 BMD_3216 BMD_3217 yclQ yclP TRUE 0.959 24.000 0.196 1.000 Y NA
 10373654 10373655 BMD_3217 BMD_3218 yclP yclO TRUE 0.996 -6.000 0.870 1.000 Y NA
 10373655 10373656 BMD_3218 BMD_3219 yclO yclN TRUE 0.998 -7.000 0.870 0.029 Y NA
 10373656 10373657 BMD_3219 BMD_3220 yclN sleB FALSE 0.027 399.000 0.000 1.000 N NA
 10373659 10373660 BMD_3222 BMD_3223     FALSE 0.002 326.000 0.000 NA   NA
 10373660 10373661 BMD_3223 BMD_3224   sipS FALSE 0.013 292.000 0.000 1.000   NA
 10373661 10373662 BMD_3224 BMD_3225 sipS   FALSE 0.014 84.000 0.000 NA   NA
 10373662 10373663 BMD_3225 BMD_3226     FALSE 0.002 318.000 0.000 NA   NA
 10373664 10373665 BMD_3227 BMD_3228     FALSE 0.008 115.000 0.000 NA   NA
 10373666 10373667 BMD_3229 BMD_3230   phnW FALSE 0.402 145.000 0.037 1.000 N NA
 10373667 10373668 BMD_3230 BMD_3231 phnW phnX TRUE 0.955 15.000 0.315 0.071   NA
 10373668 10373669 BMD_3231 BMD_3232 phnX mutS FALSE 0.007 363.000 0.000 1.000   NA
 10373669 10373670 BMD_3232 BMD_3233 mutS   FALSE 0.001 453.000 0.000 NA   NA
 10373670 10373671 BMD_3233 BMD_3234     TRUE 0.967 -3.000 0.338 NA   NA
 10373676 10373677 BMD_3239 BMD_3240     FALSE 0.043 25.000 0.000 NA   NA
 10373678 10373679 BMD_3241 BMD_3242     FALSE 0.012 93.000 0.000 NA   NA
 10373680 10373681 BMD_3243 BMD_3244     FALSE 0.006 146.000 0.000 NA   NA
 10373682 10373683 BMD_3245 BMD_3246 cwlJ   FALSE 0.043 132.000 0.000 1.000   NA
 10373685 10373686 BMD_3248 BMD_3249     FALSE 0.582 27.000 0.000 1.000 N NA
 10373688 10373689 BMD_3251 BMD_3252 cotJC cotJB TRUE 0.915 22.000 0.438 NA   NA
 10373689 10373690 BMD_3252 BMD_3253 cotJB cotJA TRUE 0.976 -3.000 0.516 NA   NA
 10373692 10373693 BMD_3255 BMD_3256     FALSE 0.571 28.000 0.000 1.000 N NA
 10373694 10373695 BMD_3257 BMD_3258     TRUE 0.999 -31.000 0.833 0.018 Y NA
 10373695 10373696 BMD_3258 BMD_3259     FALSE 0.043 132.000 0.000 1.000   NA
 10373696 10373697 BMD_3259 BMD_3260     FALSE 0.005 204.000 0.000 NA   NA
 10373697 10373698 BMD_3260 BMD_3261   nucA FALSE 0.006 141.000 0.000 NA   NA
 10373698 10373699 BMD_3261 BMD_3262 nucA   FALSE 0.006 164.000 0.000 NA   NA
 10373700 10373701 BMD_3263 BMD_3264     FALSE 0.002 274.000 0.000 NA   NA
 10373701 10373702 BMD_3264 BMD_3265   tal FALSE 0.015 78.000 0.000 NA   NA
 10373702 10373703 BMD_3265 BMD_3266 tal gnd TRUE 0.921 50.000 0.182 1.000 Y NA
 10373703 10373704 BMD_3266 BMD_3267 gnd tkt TRUE 0.969 39.000 0.636 1.000 Y NA
 10373704 10373705 BMD_3267 BMD_3268 tkt zwf TRUE 0.825 29.000 0.000 1.000 Y NA
 10373705 10373706 BMD_3268 BMD_3269 zwf   FALSE 0.001 441.000 0.000 NA   NA
 10373706 10373707 BMD_3269 BMD_3270     FALSE 0.006 169.000 0.000 NA   NA
 10373709 10373710 BMD_3272 BMD_3273     FALSE 0.016 263.000 0.000 1.000   NA
 10373710 10373711 BMD_3273 BMD_3274     TRUE 0.988 0.000 0.852 1.000 N NA
 10373711 10373712 BMD_3274 BMD_3275     TRUE 0.907 73.000 0.367 0.079 N NA
 10373712 10373713 BMD_3275 BMD_3276     TRUE 0.995 -3.000 0.833 1.000 Y NA
 10373713 10373714 BMD_3276 BMD_3277     FALSE 0.037 164.000 0.000 1.000   NA
 10373714 10373715 BMD_3277 BMD_3278     FALSE 0.052 15.000 0.000 NA   NA
 10373717 10373718 BMD_3280 BMD_3281 kin   FALSE 0.333 81.000 0.000 1.000 N NA
 10373718 10373719 BMD_3281 BMD_3282   puuB FALSE 0.339 79.000 0.000 1.000 N NA
 10373719 10373720 BMD_3282 BMD_3283 puuB   FALSE 0.001 458.000 0.000 NA   NA
 10373722 10373723 BMD_3285 BMD_3286     FALSE 0.239 21.000 0.000 1.000   NA
 10373726 10373727 BMD_3289 BMD_3290     FALSE 0.253 -28.000 0.000 NA   NA
 10373730 10373731 BMD_3293 BMD_3294 gvpU gvpT FALSE 0.044 24.000 0.000 NA   NA
 10373731 10373732 BMD_3294 BMD_3295 gvpT gvpJ FALSE 0.028 37.000 0.000 NA   NA
 10373732 10373733 BMD_3295 BMD_3296 gvpJ gvpK FALSE 0.238 22.000 0.000 1.000   NA
 10373733 10373734 BMD_3296 BMD_3297 gvpK gvpS TRUE 0.995 -46.000 1.000 1.000   NA
 10373734 10373735 BMD_3297 BMD_3298 gvpS gvpL TRUE 0.962 18.000 1.000 1.000   NA
 10373735 10373736 BMD_3298 BMD_3299 gvpL gvpG TRUE 0.883 1.000 0.105 NA   NA
 10373736 10373737 BMD_3299 BMD_3300 gvpG gvpF TRUE 0.876 2.000 0.105 NA   NA
 10373737 10373738 BMD_3300 BMD_3301 gvpF gvpN TRUE 0.918 15.000 0.054 0.001   NA
 10373738 10373739 BMD_3301 BMD_3302 gvpN gvpR TRUE 0.884 29.000 0.054 0.001   NA
 10373739 10373740 BMD_3302 BMD_3303 gvpR gvpB TRUE 0.832 76.000 0.500 1.000   NA
 10373740 10373741 BMD_3303 BMD_3304 gvpB gvpQ TRUE 0.953 20.000 1.000 NA   NA
 10373741 10373742 BMD_3304 BMD_3305 gvpQ gvpP TRUE 0.947 26.000 1.000 NA   NA
 10373742 10373743 BMD_3305 BMD_3306 gvpP gvpA TRUE 0.892 61.000 1.000 NA   NA
 10373743 10373744 BMD_3306 BMD_3307 gvpA   FALSE 0.001 443.000 0.000 NA   NA
 10373744 10373745 BMD_3307 BMD_3308     FALSE 0.009 109.000 0.000 NA   NA
 10373747 10373748 BMD_3310 BMD_3311   gltP FALSE 0.005 199.000 0.000 NA   NA
 10373748 10373749 BMD_3311 BMD_3312 gltP phnA FALSE 0.143 202.000 0.000 1.000 N NA
 10373749 10373750 BMD_3312 BMD_3313 phnA   FALSE 0.012 91.000 0.000 NA   NA
 10373750 10373751 BMD_3313 BMD_3314     FALSE 0.031 33.000 0.000 NA   NA
 10373753 10373754 BMD_3316 BMD_3317     FALSE 0.027 39.000 0.000 NA   NA
 10373754 10373755 BMD_3317 BMD_3318   ggt FALSE 0.002 299.000 0.000 NA   NA
 10373757 10373758 BMD_3320 BMD_3321     TRUE 0.969 0.000 0.000 0.034 Y NA
 10373759 10373760 BMD_3322 BMD_3323     TRUE 0.979 23.000 0.223 0.029 Y NA
 10373760 10373761 BMD_3323 BMD_3324     TRUE 0.949 64.000 0.536 1.000 Y NA
 10373761 10373762 BMD_3324 BMD_3325   tauD TRUE 0.885 14.000 0.071 1.000 N NA
 10373762 10373763 BMD_3325 BMD_3326 tauD   FALSE 0.531 32.000 0.000 1.000 N NA
 10373766 10373767 BMD_3329 BMD_3330     FALSE 0.005 201.000 0.000 NA   NA
 10373768 10373769 BMD_3331 BMD_3332     FALSE 0.471 43.000 0.000 1.000 N NA
 10373771 10373772 BMD_3334 BMD_3335 bceR bceS TRUE 0.997 -7.000 0.958 1.000 Y NA
 10373772 10373773 BMD_3335 BMD_3336 bceS bceA TRUE 0.889 101.000 0.500 0.077 N NA
 10373773 10373774 BMD_3336 BMD_3337 bceA bceB TRUE 0.991 -10.000 0.824 1.000   NA
 10373775 10373776 BMD_3338 BMD_3339     FALSE 0.130 108.000 0.000 NA N NA
 10373776 10373777 BMD_3339 BMD_3340     TRUE 0.730 6.000 0.000 1.000 N NA
 10373779 10373780 BMD_3342 BMD_3343     TRUE 0.726 71.000 0.214 1.000   NA
 10373780 10373781 BMD_3343 BMD_3344     TRUE 0.887 25.000 0.241 1.000   NA
 10373781 10373782 BMD_3344 BMD_3345     TRUE 0.794 63.000 0.286 1.000   NA
 10373782 10373783 BMD_3345 BMD_3346     TRUE 0.913 55.000 0.175 1.000 Y NA
 10373783 10373784 BMD_3346 BMD_3347     TRUE 0.970 23.000 0.410 NA Y NA
 10373784 10373785 BMD_3347 BMD_3348     TRUE 0.833 28.000 0.231 NA   NA
 10373785 10373786 BMD_3348 BMD_3349     TRUE 0.625 47.000 0.105 NA   NA
 10373786 10373787 BMD_3349 BMD_3350     FALSE 0.542 93.000 0.174 NA   NA
 10373787 10373788 BMD_3350 BMD_3351     TRUE 0.952 -10.000 0.130 NA   NA
 10373788 10373789 BMD_3351 BMD_3352     FALSE 0.001 333.000 0.000 NA   NA
 10373789 10373790 BMD_3352 BMD_3353   fabI FALSE 0.002 311.000 0.000 NA   NA
 10373790 10373791 BMD_3353 BMD_3354 fabI   FALSE 0.191 131.000 0.000 1.000 N NA
 10373793 10373794 BMD_3356 BMD_3357     FALSE 0.044 24.000 0.000 NA   NA
 10373794 10373795 BMD_3357 BMD_3358     FALSE 0.006 161.000 0.000 NA   NA
 10373797 10373798 BMD_3360 BMD_3361     FALSE 0.006 188.000 0.000 NA   NA
 10373798 10373799 BMD_3361 BMD_3362     FALSE 0.003 248.000 0.000 NA   NA
 10373799 10373800 BMD_3362 BMD_3363   penP FALSE 0.011 99.000 0.000 NA   NA
 10373800 10373801 BMD_3363 BMD_3364 penP   FALSE 0.037 172.000 0.000 1.000   NA
 10373805 10373806 BMD_3368 BMD_3369     FALSE 0.001 357.000 0.000 NA   NA
 10373807 10373808 BMD_3370 BMD_3371     FALSE 0.002 612.000 0.000 1.000   NA
 10373809 10373810 BMD_3372 BMD_3373     FALSE 0.007 131.000 0.000 NA   NA
 10373810 10373811 BMD_3373 BMD_3374     FALSE 0.006 146.000 0.000 NA   NA
 10373812 10373813 BMD_3375 BMD_3376     TRUE 0.701 64.000 0.000 1.000 Y NA
 10373814 10373815 BMD_3377 BMD_3378     FALSE 0.001 395.000 0.000 NA   NA
 10373815 10373816 BMD_3378 BMD_3379     TRUE 0.822 0.000 0.042 NA   NA
 10373816 10373817 BMD_3379 BMD_3380     FALSE 0.003 257.000 0.000 NA   NA
 10373817 10373818 BMD_3380 BMD_3381     FALSE 0.007 128.000 0.000 NA   NA
 10373818 10373819 BMD_3381 BMD_3382     FALSE 0.000 557.000 0.000 NA   NA
 10373820 10373821 BMD_3383 BMD_3384     FALSE 0.355 31.000 0.000 NA N NA
 10373821 10373822 BMD_3384 BMD_3385     FALSE 0.131 486.000 0.000 0.007 Y NA
 10373824 10373825 BMD_3387 BMD_3388     FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10373825 10373826 BMD_3388 BMD_3389     FALSE 0.006 178.000 0.000 NA   NA
 10373826 10373827 BMD_3389 BMD_3390     FALSE 0.003 233.000 0.000 NA   NA
 10373828 10373829 BMD_3391 BMD_3392   paiB FALSE 0.067 212.000 0.000 NA N NA
 10373829 10373830 BMD_3392 BMD_3393 paiB   FALSE 0.002 274.000 0.000 NA   NA
 10373832 10373833 BMD_3395 BMD_3396 phaZ2   FALSE 0.005 208.000 0.000 NA   NA
 10373833 10373834 BMD_3396 BMD_3397     FALSE 0.012 90.000 0.000 NA   NA
 10373835 10373836 BMD_3398 BMD_3399     FALSE 0.096 2.000 0.000 NA   NA
 10373837 10373838 BMD_3400 BMD_3401 fbp   FALSE 0.000 766.000 0.000 NA   NA
 10373840 10373841 BMD_3403 BMD_3404   cspC FALSE 0.002 311.000 0.000 NA   NA
 10373841 10373842 BMD_3404 BMD_3405 cspC   FALSE 0.013 291.000 0.000 1.000   NA
 10373842 10373843 BMD_3405 BMD_3406   thrC FALSE 0.002 909.000 0.000 1.000   NA
 10373844 10373845 BMD_3407 BMD_3408     FALSE 0.023 51.000 0.000 NA   NA
 10373845 10373846 BMD_3408 BMD_3409     FALSE 0.003 249.000 0.000 NA   NA
 10373846 10373847 BMD_3409 BMD_3410     FALSE 0.431 54.000 0.000 1.000 N NA
 10373848 10373849 BMD_3411 BMD_3412     FALSE 0.028 38.000 0.000 NA   NA
 10373849 10373850 BMD_3412 BMD_3413     FALSE 0.007 125.000 0.000 NA   NA
 10373851 10373852 BMD_3414 BMD_3415     FALSE 0.004 221.000 0.000 NA   NA
 10373853 10373854 BMD_3416 BMD_3417     FALSE 0.020 470.000 0.000 1.000 N NA
 10373854 10373855 BMD_3417 BMD_3418     FALSE 0.501 119.000 0.000 1.000 Y NA
 10373855 10373856 BMD_3418 BMD_3419     FALSE 0.010 103.000 0.000 NA   NA
 10373856 10373857 BMD_3419 BMD_3420     TRUE 0.657 58.000 0.154 NA   NA
 10373857 10373858 BMD_3420 BMD_3421     TRUE 0.861 -19.000 0.007 NA   NA
 10373858 10373859 BMD_3421 BMD_3422     TRUE 0.796 48.000 0.210 1.000   NA
 10373859 10373860 BMD_3422 BMD_3423     FALSE 0.538 37.000 0.008 1.000   NA
 10373860 10373861 BMD_3423 BMD_3424     TRUE 0.970 -16.000 0.200 NA   NA
 10373861 10373862 BMD_3424 BMD_3425   uxaC FALSE 0.016 71.000 0.000 NA   NA
 10373864 10373865 BMD_3427 BMD_3428     FALSE 0.001 454.000 0.000 NA   NA
 10373865 10373866 BMD_3428 BMD_3429     FALSE 0.003 238.000 0.000 NA   NA
 10373866 10373867 BMD_3429 BMD_3430     TRUE 0.923 13.000 0.371 NA   NA
 10373872 10373873 BMD_3435 BMD_3436     FALSE 0.052 15.000 0.000 NA   NA
 10373874 10373875 BMD_3437 BMD_3438     FALSE 0.009 110.000 0.000 NA   NA
 10373875 10373876 BMD_3438 BMD_3439     FALSE 0.006 141.000 0.000 NA   NA
 10373878 10373879 BMD_3441 BMD_3442     FALSE 0.018 254.000 0.000 1.000   NA
 10373879 10373880 BMD_3442 BMD_3443     TRUE 0.998 -12.000 0.500 0.017 Y NA
 10373880 10373881 BMD_3443 BMD_3444     TRUE 0.903 8.000 0.222 NA   NA
 10373881 10373882 BMD_3444 BMD_3445     TRUE 0.950 14.000 0.714 NA   NA
 10373882 10373883 BMD_3445 BMD_3446     TRUE 0.979 -3.000 0.625 NA   NA
 10373883 10373884 BMD_3446 BMD_3447     FALSE 0.018 64.000 0.000 NA   NA
 10373884 10373885 BMD_3447 BMD_3448     FALSE 0.021 58.000 0.000 NA   NA
 10373886 10373887 BMD_3449 BMD_3450     FALSE 0.035 30.000 0.000 NA   NA
 10373887 10373888 BMD_3450 BMD_3451     TRUE 0.925 11.000 0.333 NA   NA
 10373889 10373890 BMD_3452 BMD_3453     FALSE 0.035 191.000 0.000 1.000   NA
 10373892 10373893 BMD_3455 BMD_3456     FALSE 0.018 65.000 0.000 NA   NA
 10373893 10373894 BMD_3456 BMD_3457     FALSE 0.046 246.000 0.000 NA N NA
 10373894 10373895 BMD_3457 BMD_3458     FALSE 0.008 120.000 0.000 NA   NA
 10373895 10373896 BMD_3458 BMD_3459     FALSE 0.008 123.000 0.000 NA   NA
 10373896 10373897 BMD_3459 BMD_3460   iolH FALSE 0.086 253.000 0.000 1.000 N NA
 10373897 10373898 BMD_3460 BMD_3461 iolH iolG FALSE 0.083 84.000 0.000 1.000   NA
 10373898 10373899 BMD_3461 BMD_3462 iolG   FALSE 0.090 78.000 0.000 1.000   NA
 10373899 10373900 BMD_3462 BMD_3463   mmsA FALSE 0.230 113.000 0.000 1.000 N NA
 10373900 10373901 BMD_3463 BMD_3464 mmsA iolC FALSE 0.622 19.000 0.000 1.000 N NA
 10373901 10373902 BMD_3464 BMD_3465 iolC iolB TRUE 0.866 16.000 0.000 1.000 Y NA
 10373902 10373903 BMD_3465 BMD_3466 iolB iolD FALSE 0.492 95.000 0.013 1.000 N NA
 10373903 10373904 BMD_3466 BMD_3467 iolD iolR FALSE 0.013 599.000 0.000 1.000 N NA
 10373904 10373905 BMD_3467 BMD_3468 iolR fba FALSE 0.109 380.000 0.000 1.000 Y NA
 10373905 10373906 BMD_3468 BMD_3469 fba iolI TRUE 0.963 17.000 0.294 NA Y NA
 10373906 10373907 BMD_3469 BMD_3470 iolI iolT TRUE 0.812 23.000 0.000 NA Y NA
 10373907 10373908 BMD_3470 BMD_3471 iolT   TRUE 0.859 21.000 0.000 1.000 Y NA
 10373909 10373910 BMD_3472 BMD_3473 crh   FALSE 0.039 156.000 0.000 1.000   NA
 10373911 10373912 BMD_3474 BMD_3475     FALSE 0.003 250.000 0.000 NA   NA
 10373912 10373913 BMD_3475 BMD_3476     FALSE 0.002 266.000 0.000 NA   NA
 10373914 10373915 BMD_3477 BMD_3478     FALSE 0.003 236.000 0.000 NA   NA
 10373916 10373917 BMD_3479 BMD_3480     FALSE 0.049 16.000 0.000 NA   NA
 10373917 10373918 BMD_3480 BMD_3481   rsbR FALSE 0.001 381.000 0.000 NA   NA
 10373920 10373921 BMD_3483 BMD_3484     FALSE 0.001 377.000 0.000 NA   NA
 10373921 10373922 BMD_3484 BMD_3485     FALSE 0.002 313.000 0.000 NA   NA
 10373922 10373923 BMD_3485 BMD_3486     FALSE 0.005 210.000 0.000 NA   NA
 10373924 10373925 BMD_3487 BMD_3488     FALSE 0.007 134.000 0.000 NA   NA
 10373925 10373926 BMD_3488 BMD_3489     FALSE 0.044 24.000 0.000 NA   NA
 10373929 10373930 BMD_3492 BMD_3493     FALSE 0.032 32.000 0.000 NA   NA
 10373931 10373932 BMD_3494 BMD_3495     FALSE 0.014 84.000 0.000 NA   NA
 10373935 10373936 BMD_3498 BMD_3499     FALSE 0.001 483.000 0.000 NA   NA
 10373936 10373937 BMD_3499 BMD_3500     FALSE 0.006 157.000 0.000 NA   NA
 10373937 10373938 BMD_3500 BMD_3501     FALSE 0.388 3.000 0.000 1.000   NA
 10373938 10373939 BMD_3501 BMD_3502     FALSE 0.015 80.000 0.000 NA   NA
 10373940 10373941 BMD_3503 BMD_3504     FALSE 0.007 130.000 0.000 NA   NA
 10373942 10373943 BMD_3505 BMD_3506     TRUE 0.719 8.000 0.000 1.000 N NA
 10373943 10373944 BMD_3506 BMD_3507     TRUE 0.793 23.000 0.000 0.001   NA
 10373944 10373945 BMD_3507 BMD_3508     FALSE 0.022 231.000 0.000 1.000   NA
 10373945 10373946 BMD_3508 BMD_3509     FALSE 0.002 285.000 0.000 NA   NA
 10373946 10373947 BMD_3509 BMD_3510     FALSE 0.010 105.000 0.000 NA   NA
 10373947 10373948 BMD_3510 BMD_3511     FALSE 0.030 34.000 0.000 NA   NA
 10373949 10373950 BMD_3512 BMD_3513   yoaK FALSE 0.016 74.000 0.000 NA   NA
 10373951 10373952 BMD_3514 BMD_3515     FALSE 0.022 53.000 0.000 NA   NA
 10373954 10373955 BMD_3517 BMD_3518     FALSE 0.063 12.000 0.000 NA   NA
 10373956 10373957 BMD_3519 BMD_3520     FALSE 0.005 192.000 0.000 NA   NA
 10373957 10373958 BMD_3520 BMD_3521     FALSE 0.006 167.000 0.000 NA   NA
 10373959 10373960 BMD_3522 BMD_3523     FALSE 0.032 32.000 0.000 NA   NA
 10373960 10373961 BMD_3523 BMD_3524     FALSE 0.006 162.000 0.000 NA   NA
 10373961 10373962 BMD_3524 BMD_3525     FALSE 0.005 396.000 0.000 1.000   NA
 10373962 10373963 BMD_3525 BMD_3526     FALSE 0.040 145.000 0.000 1.000   NA
 10373963 10373964 BMD_3526 BMD_3527   metE FALSE 0.040 143.000 0.000 1.000   NA
 10373964 10373965 BMD_3527 BMD_3528 metE   FALSE 0.000 609.000 0.000 NA   NA
 10373965 10373966 BMD_3528 BMD_3529   araE FALSE 0.000 523.000 0.000 NA   NA
 10373966 10373967 BMD_3529 BMD_3530 araE araA TRUE 0.632 151.000 0.040 1.000 Y NA
 10373967 10373968 BMD_3530 BMD_3531 araA araD TRUE 0.902 30.000 0.034 1.000 Y NA
 10373968 10373969 BMD_3531 BMD_3532 araD   TRUE 0.985 -6.000 0.074 1.000 Y NA
 10373971 10373972 BMD_3534 BMD_3535     FALSE 0.008 117.000 0.000 NA   NA
 10373972 10373973 BMD_3535 BMD_3536     FALSE 0.005 198.000 0.000 NA   NA
 10373973 10373974 BMD_3536 BMD_3537     TRUE 0.996 -22.000 0.556 0.002   NA
 10373974 10373975 BMD_3537 BMD_3538     TRUE 0.976 -7.000 0.250 1.000   NA
 10373979 10373980 BMD_3542 BMD_3543     FALSE 0.005 205.000 0.000 NA   NA
 10373982 10373983 BMD_3545 BMD_3546     FALSE 0.046 20.000 0.000 NA   NA
 10373986 10373987 BMD_3549 BMD_3550     FALSE 0.000 548.000 0.000 NA   NA
 10373990 10373991 BMD_3553 BMD_3554     FALSE 0.030 34.000 0.000 NA   NA
 10373991 10373992 BMD_3554 BMD_3555     FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10373992 10373993 BMD_3555 BMD_3556     FALSE 0.068 10.000 0.000 NA   NA
 10373993 10373994 BMD_3556 BMD_3557     FALSE 0.066 11.000 0.000 NA   NA
 10373994 10373995 BMD_3557 BMD_3558     FALSE 0.046 19.000 0.000 NA   NA
 10373995 10373996 BMD_3558 BMD_3559     FALSE 0.049 16.000 0.000 NA   NA
 10373996 10373997 BMD_3559 BMD_3560   sspH FALSE 0.001 513.000 0.000 NA   NA
 10373997 10373998 BMD_3560 BMD_3561 sspH   FALSE 0.000 526.000 0.000 NA   NA
 10374003 10374004 BMD_3566 BMD_3567 kynU   TRUE 0.746 118.000 0.103 1.000 Y NA
 10374004 10374005 BMD_3567 BMD_3568   kynA TRUE 0.868 40.000 0.025 1.000 Y NA
 10374005 10374006 BMD_3568 BMD_3569 kynA kynB TRUE 0.811 33.000 0.165 1.000   NA
 10374007 10374008 BMD_3570 BMD_3571     TRUE 0.809 79.000 0.429 1.000   NA
 10374008 10374009 BMD_3571 BMD_3572   dmpG TRUE 0.976 3.000 0.429 1.000 N NA
 10374009 10374010 BMD_3572 BMD_3573 dmpG mhpF TRUE 0.987 -10.000 0.292 1.000 N NA
 10374010 10374011 BMD_3573 BMD_3574 mhpF   TRUE 0.979 24.000 0.542 1.000 Y NA
 10374011 10374012 BMD_3574 BMD_3575     TRUE 0.955 25.000 0.250 0.069 N NA
 10374012 10374013 BMD_3575 BMD_3576     TRUE 0.972 -3.000 0.250 NA N NA
 10374013 10374014 BMD_3576 BMD_3577     TRUE 0.991 -37.000 0.714 NA   NA
 10374014 10374015 BMD_3577 BMD_3578   nbaC TRUE 0.972 -15.000 0.031 0.069   NA
 10374015 10374016 BMD_3578 BMD_3579 nbaC   FALSE 0.356 88.000 0.012 1.000   NA
 10374016 10374017 BMD_3579 BMD_3580     FALSE 0.479 56.000 0.012 1.000   NA
 10374017 10374018 BMD_3580 BMD_3581   hpaB FALSE 0.356 88.000 0.012 1.000   NA
 10374019 10374020 BMD_3582 BMD_3583     TRUE 0.956 97.000 0.667 0.037 Y NA
 10374023 10374024 BMD_3586 BMD_3587   gph TRUE 0.954 16.000 0.130 1.000 Y NA
 10374024 10374025 BMD_3587 BMD_3588 gph gutB FALSE 0.431 193.000 0.083 1.000 N NA
 10374029 10374030 BMD_3592 BMD_3593     FALSE 0.046 124.000 0.000 1.000   NA
 10374030 10374031 BMD_3593 BMD_3594     FALSE 0.001 337.000 0.000 NA   NA
 10374031 10374032 BMD_3594 BMD_3595     FALSE 0.028 38.000 0.000 NA   NA
 10374032 10374033 BMD_3595 BMD_3596     FALSE 0.006 140.000 0.000 NA   NA
 10374033 10374034 BMD_3596 BMD_3597     FALSE 0.006 171.000 0.000 NA   NA
 10374036 10374037 BMD_3599 BMD_3600     FALSE 0.003 255.000 0.000 NA   NA
 10374039 10374040 BMD_3602 BMD_3603     FALSE 0.000 825.000 0.000 NA   NA
 10374042 10374043 BMD_3605 BMD_3606 yqhS   TRUE 0.799 27.000 0.167 NA   NA
 10374043 10374044 BMD_3606 BMD_3607   panE TRUE 0.642 21.000 0.042 NA   NA
 10374044 10374045 BMD_3607 BMD_3608 panE   TRUE 0.792 23.000 0.008 1.000 N NA
 10374045 10374046 BMD_3608 BMD_3609     TRUE 0.937 45.000 0.091 0.068 Y NA
 10374046 10374047 BMD_3609 BMD_3610     FALSE 0.388 64.000 0.000 1.000 N NA
 10374047 10374048 BMD_3610 BMD_3611     FALSE 0.022 442.000 0.000 1.000 N NA
 10374048 10374049 BMD_3611 BMD_3612     FALSE 0.015 548.000 0.000 1.000 N NA
 10374049 10374050 BMD_3612 BMD_3613     TRUE 0.923 27.000 0.276 1.000 N NA
 10374050 10374051 BMD_3613 BMD_3614     FALSE 0.026 404.000 0.000 1.000 N NA
 10374051 10374052 BMD_3614 BMD_3615     FALSE 0.000 605.000 0.000 NA   NA
 10374052 10374053 BMD_3615 BMD_3616     FALSE 0.000 515.000 0.000 NA   NA
 10374055 10374056 BMD_3618 BMD_3619     FALSE 0.000 1639.000 0.000 NA   NA
 10374056 10374057 BMD_3619 BMD_3620     FALSE 0.101 130.000 0.000 NA N NA
 10374057 10374058 BMD_3620 BMD_3621     TRUE 0.965 -39.000 0.125 NA   NA
 10374058 10374059 BMD_3621 BMD_3622     FALSE 0.235 183.000 0.000 0.033   NA
 10374059 10374060 BMD_3622 BMD_3623     TRUE 0.646 132.000 0.400 1.000   NA
 10374060 10374061 BMD_3623 BMD_3624     FALSE 0.040 354.000 0.000 1.000 N NA
 10374061 10374062 BMD_3624 BMD_3625     FALSE 0.560 193.000 0.000 0.071 Y NA
 10374062 10374063 BMD_3625 BMD_3626     TRUE 0.990 -121.000 0.000 0.011 Y NA
 10374063 10374064 BMD_3626 BMD_3627     FALSE 0.001 332.000 0.000 NA   NA
 10374065 10374066 BMD_3628 BMD_3629     TRUE 0.930 17.000 0.571 NA   NA
 10374066 10374067 BMD_3629 BMD_3630     TRUE 0.953 19.000 0.600 NA N NA
 10374067 10374068 BMD_3630 BMD_3631     TRUE 0.844 18.000 0.200 NA   NA
 10374068 10374069 BMD_3631 BMD_3632     TRUE 0.928 13.000 0.400 NA   NA
 10374070 10374071 BMD_3633 BMD_3634   rsbR FALSE 0.027 39.000 0.000 NA   NA
 10374071 10374072 BMD_3634 BMD_3635 rsbR   FALSE 0.046 22.000 0.000 NA   NA
 10374076 10374077 BMD_3639 BMD_3640     TRUE 0.974 3.000 0.647 1.000   NA
 10374079 10374080 BMD_3642 BMD_3643     FALSE 0.046 21.000 0.000 NA   NA
 10374080 10374081 BMD_3643 BMD_3644     FALSE 0.002 324.000 0.000 NA   NA
 10374081 10374082 BMD_3644 BMD_3645     FALSE 0.234 -19.000 0.000 NA   NA
 10374082 10374083 BMD_3645 BMD_3646     FALSE 0.003 251.000 0.000 NA   NA
 10374084 10374085 BMD_3647 BMD_3648     FALSE 0.002 304.000 0.000 NA   NA
 10374086 10374087 BMD_3649 BMD_3650   ltrA FALSE 0.028 37.000 0.000 NA   NA
 10374087 10374088 BMD_3650 BMD_3651 ltrA   FALSE 0.003 249.000 0.000 NA   NA
 10374088 10374089 BMD_3651 BMD_3652     FALSE 0.381 175.000 0.118 1.000   NA
 10374089 10374090 BMD_3652 BMD_3653     FALSE 0.039 156.000 0.000 1.000   NA
 10374090 10374091 BMD_3653 BMD_3654     FALSE 0.006 142.000 0.000 NA   NA
 10374091 10374092 BMD_3654 BMD_3655     FALSE 0.001 348.000 0.000 NA   NA
 10374092 10374093 BMD_3655 BMD_3656   mdh FALSE 0.002 319.000 0.000 NA   NA
 10374093 10374094 BMD_3656 BMD_3657 mdh   TRUE 0.829 36.000 0.007 NA Y NA
 10374094 10374095 BMD_3657 BMD_3658   eutN TRUE 0.990 -7.000 0.231 NA Y NA
 10374095 10374096 BMD_3658 BMD_3659 eutN   FALSE 0.139 -3.000 0.000 NA   NA
 10374096 10374097 BMD_3659 BMD_3660     FALSE 0.139 -3.000 0.000 NA   NA
 10374097 10374098 BMD_3660 BMD_3661   eutM FALSE 0.041 26.000 0.000 NA   NA
 10374098 10374099 BMD_3661 BMD_3662 eutM eutE TRUE 0.924 17.000 0.500 NA   NA
 10374099 10374100 BMD_3662 BMD_3663 eutE eutL TRUE 0.810 35.000 0.085 1.000 N NA
 10374100 10374101 BMD_3663 BMD_3664 eutL eutC TRUE 0.950 13.000 0.064 1.000 Y NA
 10374101 10374102 BMD_3664 BMD_3665 eutC eutB TRUE 0.995 13.000 1.000 0.001 Y NA
 10374102 10374103 BMD_3665 BMD_3666 eutB eutA TRUE 0.983 18.000 1.000 NA Y NA
 10374103 10374104 BMD_3666 BMD_3667 eutA eutP FALSE 0.313 199.000 0.000 NA Y NA
 10374104 10374105 BMD_3667 BMD_3668 eutP eutS TRUE 0.970 25.000 0.333 1.000 Y NA
 10374105 10374106 BMD_3668 BMD_3669 eutS eutH TRUE 0.944 42.000 0.273 1.000 Y NA
 10374106 10374107 BMD_3669 BMD_3670 eutH   FALSE 0.405 215.000 0.103 1.000 N NA
 10374107 10374108 BMD_3670 BMD_3671     TRUE 0.987 -7.000 0.091 1.000 Y NA
 10374110 10374111 BMD_3673 BMD_3674     TRUE 0.938 11.000 0.429 NA   NA
 10374111 10374112 BMD_3674 BMD_3675     TRUE 0.870 12.000 0.173 NA   NA
 10374113 10374114 BMD_3676 BMD_3677     TRUE 0.893 15.000 0.098 1.000 N NA
 10374114 10374115 BMD_3677 BMD_3678   yvaD TRUE 0.874 5.000 0.137 NA   NA
 10374115 10374116 BMD_3678 BMD_3679 yvaD   FALSE 0.006 152.000 0.000 NA   NA
 10374117 10374118 BMD_3680 BMD_3681     TRUE 0.799 21.000 0.050 NA N NA
 10374119 10374120 BMD_3682 BMD_3683     FALSE 0.012 724.000 0.000 1.000 N NA
 10374121 10374122 BMD_3684 BMD_3685     FALSE 0.003 253.000 0.000 NA   NA
 10374124 10374125 BMD_3687 BMD_3688     FALSE 0.096 135.000 0.000 NA N NA
 10374125 10374126 BMD_3688 BMD_3689     FALSE 0.000 533.000 0.000 NA   NA
 10374129 10374130 BMD_3692 BMD_3693   bioF FALSE 0.002 310.000 0.000 NA   NA
 10374130 10374131 BMD_3693 BMD_3694 bioF bioH TRUE 0.947 -3.000 0.128 1.000   NA
 10374131 10374132 BMD_3694 BMD_3695 bioH bioC TRUE 0.967 -7.000 0.163 1.000   NA
 10374133 10374134 BMD_3696 BMD_3697   murQ TRUE 0.633 33.000 0.031 1.000   NA
 10374134 10374135 BMD_3697 BMD_3698 murQ   FALSE 0.001 448.000 0.000 NA   NA
 10374137 10374138 BMD_3700 BMD_3701     FALSE 0.468 106.000 0.000 0.068 N NA
 10374140 10374141 BMD_3703 BMD_3704     FALSE 0.006 172.000 0.000 NA   NA
 10374147 10374148 BMD_3710 BMD_3711     FALSE 0.000 538.000 0.000 NA   NA
 10374149 10374150 BMD_3712 BMD_3713     FALSE 0.030 34.000 0.000 NA   NA
 10374151 10374152 BMD_3714 BMD_3715     FALSE 0.040 154.000 0.000 1.000   NA
 10374156 10374157 BMD_3719 BMD_3720     FALSE 0.000 852.000 0.000 NA   NA
 10374161 10374162 BMD_3724 BMD_3725     FALSE 0.005 198.000 0.000 NA   NA
 10374162 10374163 BMD_3725 BMD_3726     FALSE 0.011 96.000 0.000 NA   NA
 10374165 10374166 BMD_3728 BMD_3729     FALSE 0.004 222.000 0.000 NA   NA
 10374168 10374169 BMD_3731 BMD_3732     FALSE 0.046 20.000 0.000 NA   NA
 10374171 10374172 BMD_3734 BMD_3735     FALSE 0.002 311.000 0.000 NA   NA
 10374172 10374173 BMD_3735 BMD_3736     FALSE 0.200 -10.000 0.000 NA   NA
 10374173 10374174 BMD_3736 BMD_3737     TRUE 0.988 -13.000 0.667 NA   NA
 10374174 10374175 BMD_3737 BMD_3738     FALSE 0.004 215.000 0.000 NA   NA
 10374175 10374176 BMD_3738 BMD_3739     FALSE 0.002 293.000 0.000 NA   NA
 10374177 10374178 BMD_3740 BMD_3741     FALSE 0.002 265.000 0.000 NA   NA
 10374178 10374179 BMD_3741 BMD_3742     FALSE 0.003 240.000 0.000 NA   NA
 10374184 10374185 BMD_3747 BMD_3748     FALSE 0.003 262.000 0.000 NA   NA
 10374185 10374186 BMD_3748 BMD_3749     FALSE 0.000 1122.000 0.000 NA   NA
 10374186 10374187 BMD_3749 BMD_3750     FALSE 0.007 131.000 0.000 NA   NA
 10374187 10374188 BMD_3750 BMD_3751     FALSE 0.004 221.000 0.000 NA   NA
 10374188 10374189 BMD_3751 BMD_3752     FALSE 0.007 134.000 0.000 NA   NA
 10374190 10374191 BMD_3753 BMD_3754     FALSE 0.026 43.000 0.000 NA   NA
 10374191 10374192 BMD_3754 BMD_3755   sspA FALSE 0.001 343.000 0.000 NA   NA
 10374192 10374193 BMD_3755 BMD_3756 sspA   FALSE 0.014 84.000 0.000 NA   NA
 10374194 10374195 BMD_3757 BMD_3758     FALSE 0.010 319.000 0.000 1.000   NA
 10374195 10374196 BMD_3758 BMD_3759     FALSE 0.604 184.000 0.000 0.015 Y NA
 10374196 10374197 BMD_3759 BMD_3760     FALSE 0.098 239.000 0.000 1.000 N NA
 10374199 10374200 BMD_3762 BMD_3763     FALSE 0.015 81.000 0.000 NA   NA
 10374200 10374201 BMD_3763 BMD_3764     FALSE 0.001 409.000 0.000 NA   NA
 10374201 10374202 BMD_3764 BMD_3765     FALSE 0.001 456.000 0.000 NA   NA
 10374202 10374203 BMD_3765 BMD_3766     FALSE 0.046 22.000 0.000 NA   NA
 10374204 10374205 BMD_3767 BMD_3768     FALSE 0.001 333.000 0.000 NA   NA
 10374205 10374206 BMD_3768 BMD_3769     FALSE 0.000 1115.000 0.000 NA   NA
 10374206 10374207 BMD_3769 BMD_3770     FALSE 0.006 190.000 0.000 NA   NA
 10374207 10374208 BMD_3770 BMD_3771     TRUE 0.945 5.000 0.400 NA   NA
 10374211 10374212 BMD_3774 BMD_3775     FALSE 0.000 1106.000 0.000 NA   NA
 10374212 10374213 BMD_3775 BMD_3776     FALSE 0.003 252.000 0.000 NA   NA
 10374213 10374214 BMD_3776 BMD_3777     FALSE 0.001 385.000 0.000 NA   NA
 10374215 10374216 BMD_3778 BMD_3779     FALSE 0.001 510.000 0.000 NA   NA
 10374217 10374218 BMD_3780 BMD_3781     FALSE 0.001 435.000 0.000 NA   NA
 10374219 10374220 BMD_3782 BMD_3783 moaC moaB TRUE 0.980 13.000 0.109 0.002 Y NA
 10374221 10374222 BMD_3784 BMD_3785     FALSE 0.002 327.000 0.000 NA   NA
 10374222 10374223 BMD_3785 BMD_3786   ytgP FALSE 0.056 14.000 0.000 NA   NA
 10374225 10374226 BMD_3788 BMD_3789     FALSE 0.139 -3.000 0.000 NA   NA
 10374226 10374227 BMD_3789 BMD_3790     FALSE 0.011 95.000 0.000 NA   NA
 10374228 10374229 BMD_3791 BMD_3792     FALSE 0.290 298.000 0.167 1.000 N NA
 10374229 10374230 BMD_3792 BMD_3793     FALSE 0.009 110.000 0.000 NA   NA
 10374231 10374232 BMD_3794 BMD_3795     FALSE 0.006 149.000 0.000 NA   NA
 10374234 10374235 BMD_3797 BMD_3798   clpP FALSE 0.006 145.000 0.000 NA   NA
 10374235 10374236 BMD_3798 BMD_3799 clpP   TRUE 0.952 30.000 0.647 1.000 N NA
 10374238 10374239 BMD_3801 BMD_3802     FALSE 0.085 179.000 0.000 NA N NA
 10374239 10374240 BMD_3802 BMD_3803     TRUE 0.978 -31.000 0.071 1.000 N NA
 10374242 10374243 BMD_3805 BMD_3806 sigH   FALSE 0.001 386.000 0.000 NA   NA
 10374243 10374244 BMD_3806 BMD_3807     FALSE 0.014 84.000 0.000 NA   NA
 10374246 10374247 BMD_3809 BMD_3810     FALSE 0.016 71.000 0.000 NA   NA
 10374247 10374248 BMD_3810 BMD_3811     FALSE 0.001 337.000 0.000 NA   NA
 10374248 10374249 BMD_3811 BMD_3812     TRUE 0.881 41.000 0.000 0.009 Y NA
 10374250 10374251 BMD_3813 BMD_3814 putC putB FALSE 0.353 73.000 0.000 1.000 N NA
 10374251 10374252 BMD_3814 BMD_3815 putB   FALSE 0.006 173.000 0.000 NA   NA
 10374257 10374258 BMD_3820 BMD_3821     FALSE 0.014 83.000 0.000 NA   NA
 10374258 10374259 BMD_3821 BMD_3822     FALSE 0.033 379.000 0.000 1.000 N NA
 10374259 10374260 BMD_3822 BMD_3823     FALSE 0.139 -3.000 0.000 NA   NA
 10374260 10374261 BMD_3823 BMD_3824     TRUE 0.950 -42.000 0.077 NA   NA
 10374262 10374263 BMD_3825 BMD_3826 ftnA   FALSE 0.001 369.000 0.000 NA   NA
 10374263 10374264 BMD_3826 BMD_3827     FALSE 0.001 469.000 0.000 NA   NA
 10374269 10374270 BMD_3832 BMD_3833     FALSE 0.089 3.000 0.000 NA   NA
 10374270 10374271 BMD_3833 BMD_3834     FALSE 0.006 386.000 0.000 1.000   NA
 10374272 10374273 BMD_3835 BMD_3836     FALSE 0.007 125.000 0.000 NA   NA
 10374274 10374275 BMD_3837 BMD_3838     FALSE 0.228 -16.000 0.000 NA   NA
 10374275 10374276 BMD_3838 BMD_3839     FALSE 0.039 27.000 0.000 NA   NA
 10374276 10374277 BMD_3839 BMD_3840     FALSE 0.018 65.000 0.000 NA   NA
 10374277 10374278 BMD_3840 BMD_3841     FALSE 0.001 443.000 0.000 NA   NA
 10374278 10374279 BMD_3841 BMD_3842     FALSE 0.022 54.000 0.000 NA   NA
 10374281 10374282 BMD_3844 BMD_3845     FALSE 0.004 227.000 0.000 NA   NA
 10374283 10374284 BMD_3846 BMD_3847     FALSE 0.074 6.000 0.000 NA   NA
 10374284 10374285 BMD_3847 BMD_3848     FALSE 0.246 -24.000 0.000 NA   NA
 10374287 10374288 BMD_3850 BMD_3851     FALSE 0.013 87.000 0.000 NA   NA
 10374291 10374292 BMD_3854 BMD_3855     FALSE 0.002 295.000 0.000 NA   NA
 10374292 10374293 BMD_3855 BMD_3856     FALSE 0.006 173.000 0.000 NA   NA
 10374295 10374296 BMD_3858 BMD_3859     FALSE 0.045 128.000 0.000 1.000   NA
 10374296 10374297 BMD_3859 BMD_3860     TRUE 0.640 -13.000 0.000 1.000   NA
 10374297 10374298 BMD_3860 BMD_3861     FALSE 0.139 -3.000 0.000 NA   NA
 10374298 10374299 BMD_3861 BMD_3862     FALSE 0.013 88.000 0.000 NA   NA
 10374299 10374300 BMD_3862 BMD_3863     TRUE 0.994 2.000 0.958 1.000 Y NA
 10374302 10374303 BMD_3865 BMD_3866     FALSE 0.006 157.000 0.000 NA   NA
 10374304 10374305 BMD_3867 BMD_3868 nucB nin FALSE 0.029 36.000 0.000 NA   NA
 10374306 10374307 BMD_3869 BMD_3870     FALSE 0.003 510.000 0.000 1.000   NA
 10374308 10374309 BMD_3871 BMD_3872     FALSE 0.049 16.000 0.000 NA   NA
 10374309 10374310 BMD_3872 BMD_3873     FALSE 0.374 114.000 0.109 NA   NA
 10374311 10374312 BMD_3874 BMD_3875     FALSE 0.037 170.000 0.000 1.000   NA
 10374312 10374313 BMD_3875 BMD_3876     FALSE 0.006 156.000 0.000 NA   NA
 10374313 10374314 BMD_3876 BMD_3877     FALSE 0.025 45.000 0.000 NA   NA
 10374314 10374315 BMD_3877 BMD_3878     TRUE 0.983 -7.000 0.533 NA   NA
 10374315 10374316 BMD_3878 BMD_3879     TRUE 0.967 3.000 0.667 NA   NA
 10374316 10374317 BMD_3879 BMD_3880     TRUE 0.939 19.000 0.692 NA   NA
 10374317 10374318 BMD_3880 BMD_3881     FALSE 0.003 260.000 0.000 NA   NA
 10374320 10374321 BMD_3883 BMD_3884 hpr   FALSE 0.005 197.000 0.000 NA   NA
 10374321 10374322 BMD_3884 BMD_3885     TRUE 0.938 -3.000 0.160 NA   NA
 10374325 10374326 BMD_3888 BMD_3889     FALSE 0.004 220.000 0.000 NA   NA
 10374327 10374328 BMD_3890 BMD_3891   argI FALSE 0.305 232.000 0.000 1.000 Y NA
 10374328 10374329 BMD_3891 BMD_3892 argI ggt FALSE 0.077 437.000 0.000 1.000 Y NA
 10374329 10374330 BMD_3892 BMD_3893 ggt   FALSE 0.005 411.000 0.000 1.000   NA
 10374330 10374331 BMD_3893 BMD_3894   ktrB FALSE 0.002 853.000 0.000 1.000   NA
 10374331 10374332 BMD_3894 BMD_3895 ktrB ktrA TRUE 0.964 4.000 0.000 0.003 Y NA
 10374332 10374333 BMD_3895 BMD_3896 ktrA   FALSE 0.001 385.000 0.000 NA   NA
 10374335 10374336 BMD_3898 BMD_3899     FALSE 0.511 -3.000 0.000 1.000   NA
 10374337 10374338 BMD_3900 BMD_3901 cssR cssS TRUE 0.996 -3.000 0.889 1.000 Y NA
 10374340 10374341 BMD_3903 BMD_3904     FALSE 0.199 76.000 0.000 NA N NA
 10374341 10374342 BMD_3904 BMD_3905     FALSE 0.139 -3.000 0.000 NA   NA
 10374343 10374344 BMD_3906 BMD_3907   pepQ FALSE 0.004 224.000 0.000 NA   NA
 10374344 10374345 BMD_3907 BMD_3908 pepQ   FALSE 0.015 76.000 0.000 NA   NA
 10374346 10374347 BMD_3909 BMD_3910     FALSE 0.004 215.000 0.000 NA   NA
 10374348 10374349 BMD_3911 BMD_3912     FALSE 0.006 141.000 0.000 NA   NA
 10374349 10374350 BMD_3912 BMD_3913     FALSE 0.046 19.000 0.000 NA   NA
 10374350 10374351 BMD_3913 BMD_3914   opu FALSE 0.006 143.000 0.000 NA   NA
 10374351 10374352 BMD_3914 BMD_3915 opu opu TRUE 0.979 0.000 0.382 1.000 N NA
 10374352 10374353 BMD_3915 BMD_3916 opu   FALSE 0.003 256.000 0.000 NA   NA
 10374358 10374359 BMD_3921 BMD_3922     FALSE 0.021 234.000 0.000 1.000   NA
 10374360 10374361 BMD_3923 BMD_3924     FALSE 0.016 71.000 0.000 NA   NA
 10374362 10374363 BMD_3925 BMD_3926     FALSE 0.007 124.000 0.000 NA   NA
 10374366 10374367 BMD_3929 BMD_3930     FALSE 0.172 88.000 0.000 NA N NA
 10374367 10374368 BMD_3930 BMD_3931     FALSE 0.012 407.000 0.000 NA N NA
 10374368 10374369 BMD_3931 BMD_3932     TRUE 0.674 53.000 0.000 NA Y NA
 10374369 10374370 BMD_3932 BMD_3933     FALSE 0.180 152.000 0.000 1.000 N NA
 10374370 10374371 BMD_3933 BMD_3934     FALSE 0.005 196.000 0.000 NA   NA
 10374371 10374372 BMD_3934 BMD_3935     FALSE 0.009 112.000 0.000 NA   NA
 10374374 10374375 BMD_3937 BMD_3938     FALSE 0.001 434.000 0.000 NA   NA
 10374375 10374376 BMD_3938 BMD_3939     FALSE 0.048 121.000 0.000 1.000   NA
 10374376 10374377 BMD_3939 BMD_3940     FALSE 0.511 -3.000 0.000 1.000   NA
 10374379 10374380 BMD_3942 BMD_3943     FALSE 0.100 68.000 0.000 1.000   NA
 10374380 10374381 BMD_3943 BMD_3944     FALSE 0.009 339.000 0.000 1.000   NA
 10374382 10374383 BMD_3945 BMD_3946     FALSE 0.025 44.000 0.000 NA   NA
 10374384 10374385 BMD_3947 BMD_3948     FALSE 0.036 29.000 0.000 NA   NA
 10374387 10374388 BMD_3950 BMD_3951   proY FALSE 0.047 123.000 0.000 1.000   NA
 10374388 10374389 BMD_3951 BMD_3952 proY   FALSE 0.000 554.000 0.000 NA   NA
 10374391 10374392 BMD_3954 BMD_3955     FALSE 0.014 82.000 0.000 NA   NA
 10374392 10374393 BMD_3955 BMD_3956     FALSE 0.009 108.000 0.000 NA   NA
 10374393 10374394 BMD_3956 BMD_3957     TRUE 0.666 13.000 0.031 NA   NA
 10374394 10374395 BMD_3957 BMD_3958     FALSE 0.028 38.000 0.000 NA   NA
 10374399 10374400 BMD_3962 BMD_3963     FALSE 0.005 205.000 0.000 NA   NA
 10374400 10374401 BMD_3963 BMD_3964     FALSE 0.224 25.000 0.000 1.000   NA
 10374401 10374402 BMD_3964 BMD_3965     FALSE 0.511 -3.000 0.000 1.000   NA
 10374403 10374404 BMD_3966 BMD_3967     FALSE 0.343 278.000 0.000 0.074 Y NA
 10374405 10374406 BMD_3968 BMD_3969     FALSE 0.006 158.000 0.000 NA   NA
 10374408 10374409 BMD_3971 BMD_3972     FALSE 0.018 252.000 0.000 1.000   NA
 10374409 10374410 BMD_3972 BMD_3973     FALSE 0.000 712.000 0.000 NA   NA
 10374410 10374411 BMD_3973 BMD_3974     FALSE 0.006 184.000 0.000 NA   NA
 10374411 10374412 BMD_3974 BMD_3975     TRUE 0.681 13.000 0.000 1.000 N NA
 10374415 10374416 BMD_3978 BMD_3979 lytF   FALSE 0.006 140.000 0.000 NA   NA
 10374417 10374418 BMD_3980 BMD_3981     FALSE 0.084 4.000 0.000 NA   NA
 10374418 10374419 BMD_3981 BMD_3982     FALSE 0.000 560.000 0.000 NA   NA
 10374420 10374421 BMD_3983 BMD_3984 gerAA gerAB TRUE 0.958 22.000 0.333 0.007   NA
 10374421 10374422 BMD_3984 BMD_3985 gerAB gerAC TRUE 0.994 -3.000 1.000 0.007   NA
 10374425 10374426 BMD_3988 BMD_3989     TRUE 0.981 0.000 1.000 NA   NA
 10374426 10374427 BMD_3989 BMD_3990     TRUE 0.846 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10374427 10374428 BMD_3990 BMD_3991     FALSE 0.010 106.000 0.000 NA   NA
 10374428 10374429 BMD_3991 BMD_3992     FALSE 0.004 225.000 0.000 NA   NA
 10374430 10374431 BMD_3993 BMD_3994     TRUE 0.868 -3.000 0.050 NA   NA
 10374431 10374432 BMD_3994 BMD_3995     FALSE 0.102 129.000 0.000 NA N NA
 10374433 10374434 BMD_3996 BMD_3997     TRUE 0.925 2.000 0.208 NA   NA
 10374434 10374435 BMD_3997 BMD_3998     FALSE 0.210 121.000 0.000 1.000 N NA
 10374435 10374436 BMD_3998 BMD_3999     FALSE 0.029 36.000 0.000 NA   NA
 10374436 10374437 BMD_3999 BMD_4000   oxaA FALSE 0.010 102.000 0.000 NA   NA
 10374437 10374438 BMD_4000 BMD_4001 oxaA   FALSE 0.046 22.000 0.000 NA   NA
 10374438 10374439 BMD_4001 BMD_4002     FALSE 0.004 212.000 0.000 NA   NA
 10374439 10374440 BMD_4002 BMD_4003   sacT FALSE 0.314 179.000 0.075 1.000   NA
 10374440 10374441 BMD_4003 BMD_4004 sacT ptbA TRUE 0.692 38.000 0.077 1.000   NA
 10374441 10374442 BMD_4004 BMD_4005 ptbA azoR FALSE 0.084 256.000 0.000 1.000 N NA
 10374442 10374443 BMD_4005 BMD_4006 azoR   FALSE 0.006 141.000 0.000 NA   NA
 10374443 10374444 BMD_4006 BMD_4007     FALSE 0.006 161.000 0.000 NA   NA
 10374446 10374447 BMD_4009 BMD_4010   deoD FALSE 0.128 215.000 0.000 1.000 N NA
 10374449 10374450 BMD_4012 BMD_4013     FALSE 0.003 247.000 0.000 NA   NA
 10374450 10374451 BMD_4013 BMD_4014     FALSE 0.022 54.000 0.000 NA   NA
 10374451 10374452 BMD_4014 BMD_4015   spo0M FALSE 0.019 63.000 0.000 NA   NA
 10374452 10374453 BMD_4015 BMD_4016 spo0M prkC TRUE 0.973 -13.000 0.237 NA   NA
 10374453 10374454 BMD_4016 BMD_4017 prkC   FALSE 0.139 -3.000 0.000 NA   NA
 10374456 10374457 BMD_4019 BMD_4020     FALSE 0.002 266.000 0.000 NA   NA
 10374457 10374458 BMD_4020 BMD_4021     FALSE 0.222 203.000 0.091 NA   NA
 10374459 10374460 BMD_4022 BMD_4023   dat FALSE 0.208 122.000 0.000 1.000 N NA
 10374461 10374462 BMD_4024 BMD_4025     FALSE 0.056 14.000 0.000 NA   NA
 10374462 10374463 BMD_4025 BMD_4026     TRUE 0.846 68.000 0.245 0.066   NA
 10374463 10374464 BMD_4026 BMD_4027   argE TRUE 0.779 26.000 0.084 1.000   NA
 10374464 10374465 BMD_4027 BMD_4028 argE   TRUE 0.960 14.000 0.419 1.000 N NA
 10374465 10374466 BMD_4028 BMD_4029     TRUE 0.999 -21.000 0.760 0.001 Y NA
 10374466 10374467 BMD_4029 BMD_4030     TRUE 0.986 1.000 0.792 1.000 N NA
 10374467 10374468 BMD_4030 BMD_4031     FALSE 0.239 109.000 0.000 1.000 N NA
 10374468 10374469 BMD_4031 BMD_4032     FALSE 0.000 570.000 0.000 NA   NA
 10374469 10374470 BMD_4032 BMD_4033   kin FALSE 0.004 219.000 0.000 NA   NA
 10374470 10374471 BMD_4033 BMD_4034 kin   FALSE 0.001 431.000 0.000 NA   NA
 10374471 10374472 BMD_4034 BMD_4035     FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10374474 10374475 BMD_4037 BMD_4038     TRUE 0.957 13.000 0.828 NA   NA
 10374475 10374476 BMD_4038 BMD_4039     FALSE 0.193 237.000 0.068 1.000   NA
 10374476 10374477 BMD_4039 BMD_4040   kin FALSE 0.224 25.000 0.000 1.000   NA
 10374477 10374478 BMD_4040 BMD_4041 kin   FALSE 0.006 151.000 0.000 NA   NA
 10374478 10374479 BMD_4041 BMD_4042     FALSE 0.618 170.000 0.577 NA   NA
 10374479 10374480 BMD_4042 BMD_4043   ilvA FALSE 0.198 162.000 0.050 NA   NA
 10374480 10374481 BMD_4043 BMD_4044 ilvA dfrA FALSE 0.011 728.000 0.000 1.000 N NA
 10374481 10374482 BMD_4044 BMD_4045 dfrA thyA TRUE 0.981 -3.000 0.295 1.000 N NA
 10374482 10374483 BMD_4045 BMD_4046 thyA purU FALSE 0.087 418.000 0.000 1.000 Y NA
 10374483 10374484 BMD_4046 BMD_4047 purU   FALSE 0.139 -3.000 0.000 NA   NA
 10374484 10374485 BMD_4047 BMD_4048     FALSE 0.007 132.000 0.000 NA   NA
 10374485 10374486 BMD_4048 BMD_4049     TRUE 0.857 -3.000 0.042 NA   NA
 10374486 10374487 BMD_4049 BMD_4050     TRUE 0.852 4.000 0.100 NA   NA
 10374487 10374488 BMD_4050 BMD_4051     TRUE 0.991 -21.000 0.500 NA N NA
 10374488 10374489 BMD_4051 BMD_4052     TRUE 0.980 -3.000 0.279 1.000 N NA
 10374489 10374490 BMD_4052 BMD_4053     TRUE 0.989 -22.000 0.279 1.000 N NA
 10374490 10374491 BMD_4053 BMD_4054     TRUE 0.992 2.000 0.289 0.014 Y NA
 10374491 10374492 BMD_4054 BMD_4055     FALSE 0.003 263.000 0.000 NA   NA
 10374492 10374493 BMD_4055 BMD_4056     FALSE 0.003 252.000 0.000 NA   NA
 10374494 10374495 BMD_4057 BMD_4058   kin FALSE 0.097 240.000 0.000 1.000 N NA
 10374496 10374497 BMD_4059 BMD_4060     FALSE 0.008 117.000 0.000 NA   NA
 10374497 10374498 BMD_4060 BMD_4061     FALSE 0.001 403.000 0.000 NA   NA
 10374498 10374499 BMD_4061 BMD_4062     FALSE 0.531 32.000 0.000 1.000 N NA
 10374499 10374500 BMD_4062 BMD_4063   gabT TRUE 0.723 149.000 0.409 1.000 N NA
 10374502 10374503 BMD_4065 BMD_4066     FALSE 0.010 106.000 0.000 NA   NA
 10374503 10374504 BMD_4066 BMD_4067     FALSE 0.002 301.000 0.000 NA   NA
 10374506 10374507 BMD_4069 BMD_4070 yheH yheI TRUE 0.999 -10.000 0.911 0.002 Y NA
 10374507 10374508 BMD_4070 BMD_4071 yheI   TRUE 0.663 91.000 0.214 1.000   NA
 10374508 10374509 BMD_4071 BMD_4072     FALSE 0.575 91.000 0.197 NA   NA
 10374509 10374510 BMD_4072 BMD_4073   tkt FALSE 0.593 150.000 0.440 NA   NA
 10374510 10374511 BMD_4073 BMD_4074 tkt   FALSE 0.395 168.000 0.196 NA   NA
 10374511 10374512 BMD_4074 BMD_4075   yneB TRUE 0.703 70.000 0.264 NA   NA
 10374512 10374513 BMD_4075 BMD_4076 yneB yneA TRUE 0.826 24.000 0.113 1.000   NA
 10374514 10374515 BMD_4077 BMD_4078 lexA   FALSE 0.004 212.000 0.000 NA   NA
 10374515 10374516 BMD_4078 BMD_4079     FALSE 0.004 217.000 0.000 NA   NA
 10374516 10374517 BMD_4079 BMD_4080     FALSE 0.021 57.000 0.000 NA   NA
 10374517 10374518 BMD_4080 BMD_4081     TRUE 0.933 -3.000 0.091 1.000   NA
 10374519 10374520 BMD_4082 BMD_4083     FALSE 0.451 110.000 0.000 0.073 N NA
 10374520 10374521 BMD_4083 BMD_4084   cwlM FALSE 0.017 502.000 0.000 1.000 N NA
 10374521 10374522 BMD_4084 BMD_4085 cwlM   FALSE 0.002 275.000 0.000 NA   NA
 10374522 10374523 BMD_4085 BMD_4086   glnA FALSE 0.001 332.000 0.000 NA   NA
 10374523 10374524 BMD_4086 BMD_4087 glnA glnR TRUE 0.863 84.000 0.481 1.000 N NA
 10374524 10374525 BMD_4087 BMD_4088 glnR   FALSE 0.505 191.000 0.138 1.000 N NA
 10374525 10374526 BMD_4088 BMD_4089   hflX TRUE 0.830 12.000 0.065 1.000   NA
 10374528 10374529 BMD_4091 BMD_4092 spoVK hfq FALSE 0.206 209.000 0.037 1.000   NA
 10374529 10374530 BMD_4092 BMD_4093 hfq miaA TRUE 0.826 33.000 0.192 1.000   NA
 10374530 10374531 BMD_4093 BMD_4094 miaA mutL TRUE 0.742 101.000 0.097 0.071 N NA
 10374531 10374532 BMD_4094 BMD_4095 mutL mutS TRUE 0.983 19.000 0.220 0.001 Y NA
 10374532 10374533 BMD_4095 BMD_4096 mutS   FALSE 0.170 164.000 0.000 1.000 N NA
 10374533 10374534 BMD_4096 BMD_4097   cotE FALSE 0.006 178.000 0.000 NA   NA
 10374534 10374535 BMD_4097 BMD_4098 cotE   FALSE 0.306 226.000 0.209 NA   NA
 10374535 10374536 BMD_4098 BMD_4099   miaB TRUE 0.795 2.000 0.041 NA   NA
 10374536 10374537 BMD_4099 BMD_4100 miaB   FALSE 0.033 556.000 0.004 1.000 N NA
 10374537 10374538 BMD_4100 BMD_4101     TRUE 0.998 -13.000 0.437 0.000 Y NA
 10374538 10374539 BMD_4101 BMD_4102     FALSE 0.096 379.000 0.041 1.000 N NA
 10374539 10374540 BMD_4102 BMD_4103   spoVS TRUE 0.675 76.000 0.247 NA   NA
 10374540 10374541 BMD_4103 BMD_4104 spoVS   FALSE 0.245 224.000 0.139 NA   NA
 10374541 10374542 BMD_4104 BMD_4105     TRUE 0.657 82.000 0.245 NA   NA
 10374542 10374543 BMD_4105 BMD_4106   recA2 FALSE 0.092 278.000 0.018 1.000   NA
 10374543 10374544 BMD_4106 BMD_4107 recA2 cinA FALSE 0.291 200.000 0.083 1.000   NA
 10374544 10374545 BMD_4107 BMD_4108 cinA pgsA TRUE 0.859 17.000 0.151 1.000   NA
 10374545 10374546 BMD_4108 BMD_4109 pgsA   FALSE 0.340 145.000 0.077 1.000   NA
 10374546 10374547 BMD_4109 BMD_4110     TRUE 0.923 22.000 0.371 1.000   NA
 10374547 10374548 BMD_4110 BMD_4111     FALSE 0.469 214.000 0.388 NA   NA
 10374548 10374549 BMD_4111 BMD_4112   fabG TRUE 0.779 66.000 0.386 NA   NA
 10374549 10374550 BMD_4112 BMD_4113 fabG   TRUE 0.831 64.000 0.397 1.000   NA
 10374550 10374551 BMD_4113 BMD_4114     TRUE 0.997 -22.000 0.872 0.003   NA
 10374551 10374552 BMD_4114 BMD_4115   yufQ FALSE 0.172 259.000 0.077 1.000   NA
 10374552 10374553 BMD_4115 BMD_4116 yufQ yufP TRUE 0.992 -3.000 0.720 0.027   NA
 10374553 10374554 BMD_4116 BMD_4117 yufP yufO TRUE 0.979 -3.000 0.438 1.000   NA
 10374554 10374555 BMD_4117 BMD_4118 yufO yufN FALSE 0.049 120.000 0.000 1.000   NA
 10374555 10374556 BMD_4118 BMD_4119 yufN   FALSE 0.042 134.000 0.000 1.000   NA
 10374556 10374557 BMD_4119 BMD_4120   ftsK FALSE 0.164 358.000 0.115 1.000 N NA
 10374557 10374558 BMD_4120 BMD_4121 ftsK   FALSE 0.213 139.000 0.052 NA   NA
 10374558 10374559 BMD_4121 BMD_4122   tepA TRUE 0.927 -3.000 0.129 NA   NA
 10374559 10374560 BMD_4122 BMD_4123 tepA   TRUE 0.640 106.000 0.257 1.000   NA
 10374560 10374561 BMD_4123 BMD_4124   dapA FALSE 0.033 196.000 0.000 1.000   NA
 10374561 10374562 BMD_4124 BMD_4125 dapA dapG TRUE 0.662 76.000 0.000 1.000 Y NA
 10374562 10374563 BMD_4125 BMD_4126 dapG asd TRUE 0.892 40.000 0.065 1.000 Y NA
 10374563 10374564 BMD_4126 BMD_4127 asd dpaB FALSE 0.212 192.000 0.025 1.000   NA
 10374564 10374565 BMD_4127 BMD_4128 dpaB dpaA TRUE 0.973 0.000 0.450 1.000   NA
 10374565 10374566 BMD_4128 BMD_4129 dpaA ymxH FALSE 0.440 201.000 0.292 NA   NA
 10374566 10374567 BMD_4129 BMD_4130 ymxH mlpA FALSE 0.416 99.000 0.104 NA   NA
 10374567 10374568 BMD_4130 BMD_4131 mlpA ylxY TRUE 0.804 29.000 0.127 1.000   NA
 10374568 10374569 BMD_4131 BMD_4132 ylxY pnp FALSE 0.420 143.000 0.048 1.000 N NA
 10374569 10374570 BMD_4132 BMD_4133 pnp rpsO TRUE 0.815 169.000 0.335 1.000 Y NA
 10374570 10374571 BMD_4133 BMD_4134 rpsO ribC FALSE 0.526 150.000 0.119 1.000 N NA
 10374571 10374572 BMD_4134 BMD_4135 ribC truB TRUE 0.924 29.000 0.308 1.000 N NA
 10374572 10374573 BMD_4135 BMD_4136 truB rbfA TRUE 0.818 93.000 0.111 1.000 Y NA
 10374573 10374574 BMD_4136 BMD_4137 rbfA   TRUE 0.797 15.000 0.113 NA   NA
 10374574 10374575 BMD_4137 BMD_4138   infB TRUE 0.913 -3.000 0.102 NA   NA
 10374575 10374576 BMD_4138 BMD_4139 infB rplGA TRUE 0.964 20.000 0.223 1.000 Y NA
 10374576 10374577 BMD_4139 BMD_4140 rplGA   TRUE 0.975 0.000 0.408 NA N NA
 10374577 10374578 BMD_4140 BMD_4141   nusA TRUE 0.971 14.000 0.323 NA Y NA
 10374578 10374579 BMD_4141 BMD_4142 nusA   TRUE 0.904 38.000 0.759 NA   NA
 10374579 10374580 BMD_4142 BMD_4143   polC FALSE 0.047 365.000 0.059 NA   NA
 10374580 10374581 BMD_4143 BMD_4144 polC proS TRUE 0.677 119.000 0.070 0.028 N NA
 10374581 10374582 BMD_4144 BMD_4145 proS rseP FALSE 0.588 106.000 0.095 1.000 N NA
 10374582 10374583 BMD_4145 BMD_4146 rseP dxr TRUE 0.764 152.000 0.568 1.000 N NA
 10374583 10374584 BMD_4146 BMD_4147 dxr cdsA TRUE 0.903 36.000 0.071 1.000 Y NA
 10374584 10374585 BMD_4147 BMD_4148 cdsA uppS TRUE 0.949 19.000 0.113 1.000 Y NA
 10374585 10374586 BMD_4148 BMD_4149 uppS frr TRUE 0.728 135.000 0.409 1.000 N NA
 10374586 10374587 BMD_4149 BMD_4150 frr pyrH TRUE 0.883 3.000 0.003 1.000 N NA
 10374587 10374588 BMD_4150 BMD_4151 pyrH tsf FALSE 0.344 77.000 0.000 1.000 N NA
 10374588 10374589 BMD_4151 BMD_4152 tsf rpsB TRUE 0.920 108.000 0.748 1.000 Y NA
 10374589 10374590 BMD_4152 BMD_4153 rpsB   FALSE 0.122 159.000 0.012 NA   NA
 10374590 10374591 BMD_4153 BMD_4154   sigD FALSE 0.592 16.000 0.025 NA   NA
 10374591 10374592 BMD_4154 BMD_4155 sigD cheD TRUE 0.804 50.000 0.120 1.000 N NA
 10374592 10374593 BMD_4155 BMD_4156 cheD cheW TRUE 0.748 51.000 0.000 1.000 Y NA
 10374593 10374594 BMD_4156 BMD_4157 cheW cheA TRUE 0.971 31.000 0.184 0.003 Y NA
 10374594 10374595 BMD_4157 BMD_4158 cheA cheB TRUE 0.989 15.000 0.390 0.003 Y NA
 10374595 10374596 BMD_4158 BMD_4159 cheB   TRUE 0.935 10.000 0.153 1.000 N NA
 10374596 10374597 BMD_4159 BMD_4160   flhF TRUE 0.988 -7.000 0.382 1.000 N NA
 10374597 10374598 BMD_4160 BMD_4161 flhF flhA TRUE 0.991 0.000 0.440 1.000 Y NA
 10374598 10374599 BMD_4161 BMD_4162 flhA flhB TRUE 0.974 31.000 0.203 0.002 Y NA
 10374599 10374600 BMD_4162 BMD_4163 flhB fliR TRUE 0.992 3.000 0.750 1.000 Y NA
 10374600 10374601 BMD_4163 BMD_4164 fliR fliQ TRUE 0.996 3.000 0.817 0.001 Y NA
 10374601 10374602 BMD_4164 BMD_4165 fliQ fliP TRUE 0.987 11.000 0.206 0.002 Y NA
 10374602 10374603 BMD_4165 BMD_4166 fliP fliZ TRUE 0.994 -7.000 0.386 1.000 Y NA
 10374603 10374604 BMD_4166 BMD_4167 fliZ cheY TRUE 0.743 64.000 0.101 1.000 N NA
 10374604 10374605 BMD_4167 BMD_4168 cheY fliN TRUE 0.921 21.000 0.203 1.000 N NA
 10374605 10374606 BMD_4168 BMD_4169 fliN fliM TRUE 0.999 -37.000 0.508 0.001 Y NA
 10374606 10374607 BMD_4169 BMD_4170 fliM fliL TRUE 0.987 21.000 0.323 0.001 Y NA
 10374607 10374608 BMD_4170 BMD_4171 fliL flbD TRUE 0.969 4.000 0.149 NA Y NA
 10374608 10374609 BMD_4171 BMD_4172 flbD flgE TRUE 0.891 36.000 0.098 NA Y NA
 10374609 10374610 BMD_4172 BMD_4173 flgE flgD TRUE 0.907 26.000 0.058 NA Y NA
 10374610 10374611 BMD_4173 BMD_4174 flgD flik TRUE 0.868 10.000 0.000 NA Y NA
 10374611 10374612 BMD_4174 BMD_4175 flik   FALSE 0.239 18.000 0.000 1.000   NA
 10374612 10374613 BMD_4175 BMD_4176   fliJ TRUE 0.866 10.000 0.095 1.000   NA
 10374613 10374614 BMD_4176 BMD_4177 fliJ fliI TRUE 0.983 3.000 0.241 1.000 Y NA
 10374614 10374615 BMD_4177 BMD_4178 fliI fliH TRUE 0.991 -25.000 0.152 NA Y NA
 10374615 10374616 BMD_4178 BMD_4179 fliH fliG TRUE 0.986 -25.000 0.048 NA Y NA
 10374616 10374617 BMD_4179 BMD_4180 fliG fliF TRUE 0.992 12.000 0.477 0.003 Y NA
 10374617 10374618 BMD_4180 BMD_4181 fliF fliE TRUE 0.957 50.000 0.164 0.003 Y NA
 10374618 10374619 BMD_4181 BMD_4182 fliE flgC TRUE 0.983 13.000 0.156 0.002 Y NA
 10374619 10374620 BMD_4182 BMD_4183 flgC flgB TRUE 0.996 3.000 0.804 0.002 Y NA
 10374620 10374621 BMD_4183 BMD_4184 flgB codY FALSE 0.062 443.000 0.037 1.000 N NA
 10374621 10374622 BMD_4184 BMD_4185 codY hslU TRUE 0.872 29.000 0.131 1.000 N NA
 10374622 10374623 BMD_4185 BMD_4186 hslU hslV TRUE 0.984 17.000 0.752 1.000 Y NA
 10374623 10374624 BMD_4186 BMD_4187 hslV xerC TRUE 0.902 15.000 0.113 1.000 N NA
 10374624 10374625 BMD_4187 BMD_4188 xerC trmFO TRUE 0.737 66.000 0.105 1.000 N NA
 10374625 10374626 BMD_4188 BMD_4189 trmFO topA FALSE 0.464 206.000 0.137 1.000 N NA
 10374626 10374627 BMD_4189 BMD_4190 topA dprA TRUE 0.785 155.000 0.238 1.000 Y NA
 10374627 10374628 BMD_4190 BMD_4191 dprA sucD TRUE 0.659 64.000 0.037 1.000 N NA
 10374628 10374629 BMD_4191 BMD_4192 sucD sucC TRUE 0.981 19.000 0.173 0.000 Y NA
 10374629 10374630 BMD_4192 BMD_4193 sucC rnhB FALSE 0.084 370.000 0.015 1.000 N NA
 10374630 10374631 BMD_4193 BMD_4194 rnhB rbgA FALSE 0.537 107.000 0.148 1.000   NA
 10374631 10374632 BMD_4194 BMD_4195 rbgA sipM TRUE 0.753 22.000 0.049 1.000   NA
 10374632 10374633 BMD_4195 BMD_4196 sipM rplS FALSE 0.340 182.000 0.020 1.000 N NA
 10374633 10374634 BMD_4196 BMD_4197 rplS trmD TRUE 0.861 162.000 0.567 1.000 Y NA
 10374634 10374635 BMD_4197 BMD_4198 trmD rimM TRUE 0.993 0.000 0.672 1.000 Y NA
 10374635 10374636 BMD_4198 BMD_4199 rimM   TRUE 0.698 13.000 0.041 NA   NA
 10374636 10374637 BMD_4199 BMD_4200     FALSE 0.228 152.000 0.061 NA   NA
 10374637 10374638 BMD_4200 BMD_4201   rpsP TRUE 0.946 12.000 0.385 1.000   NA
 10374638 10374639 BMD_4201 BMD_4202 rpsP ffh TRUE 0.705 137.000 0.361 1.000 N NA
 10374639 10374640 BMD_4202 BMD_4203 ffh   TRUE 0.702 13.000 0.002 1.000   NA
 10374640 10374641 BMD_4203 BMD_4204   ftsY FALSE 0.020 240.000 0.000 1.000   NA
 10374641 10374642 BMD_4204 BMD_4205 ftsY smc TRUE 0.948 26.000 0.165 0.008 N NA
 10374642 10374643 BMD_4205 BMD_4206 smc rnc TRUE 0.724 78.000 0.120 1.000 N NA
 10374643 10374644 BMD_4206 BMD_4207 rnc acpP FALSE 0.474 130.000 0.068 1.000 N NA
 10374644 10374645 BMD_4207 BMD_4208 acpP fabG TRUE 0.825 139.000 0.100 0.003 Y NA
 10374645 10374646 BMD_4208 BMD_4209 fabG fabD TRUE 0.989 2.000 0.149 0.003 Y NA
 10374646 10374647 BMD_4209 BMD_4210 fabD plsX TRUE 0.986 4.000 0.106 0.003 Y NA
 10374647 10374648 BMD_4210 BMD_4211 plsX   TRUE 0.777 21.000 0.035 NA N NA
 10374648 10374649 BMD_4211 BMD_4212   recG FALSE 0.094 502.000 0.225 NA N NA
 10374649 10374650 BMD_4212 BMD_4213 recG sdaAA TRUE 0.985 -7.000 0.265 1.000 N NA
 10374650 10374651 BMD_4213 BMD_4214 sdaAA sdaAB TRUE 0.936 101.000 0.265 0.000 Y NA
 10374651 10374652 BMD_4214 BMD_4215 sdaAB   FALSE 0.067 211.000 0.000 NA N NA
 10374652 10374653 BMD_4215 BMD_4216     FALSE 0.005 197.000 0.000 NA   NA
 10374653 10374654 BMD_4216 BMD_4217     TRUE 0.929 17.000 0.567 NA   NA
 10374656 10374657 BMD_4219 BMD_4220 thiN rpe TRUE 0.634 117.000 0.166 1.000 N NA
 10374657 10374658 BMD_4220 BMD_4221 rpe rsgA TRUE 0.940 3.000 0.213 1.000   NA
 10374658 10374659 BMD_4221 BMD_4222 rsgA prkC TRUE 0.898 14.000 0.196 1.000   NA
 10374659 10374660 BMD_4222 BMD_4223 prkC prpC TRUE 0.952 69.000 0.704 1.000 Y NA
 10374660 10374661 BMD_4223 BMD_4224 prpC   TRUE 0.890 5.000 0.105 1.000   NA
 10374661 10374662 BMD_4224 BMD_4225   rsmB TRUE 0.918 3.000 0.135 1.000   NA
 10374662 10374663 BMD_4225 BMD_4226 rsmB fmt TRUE 0.993 -7.000 0.305 1.000 Y NA
 10374663 10374664 BMD_4226 BMD_4227 fmt def TRUE 0.971 11.000 0.031 0.015 Y NA
 10374664 10374665 BMD_4227 BMD_4228 def priA FALSE 0.614 71.000 0.029 1.000 N NA
 10374665 10374666 BMD_4228 BMD_4229 priA coaBC TRUE 0.961 -3.000 0.099 1.000 N NA
 10374666 10374667 BMD_4229 BMD_4230 coaBC rpoZ FALSE 0.570 181.000 0.192 1.000 N NA
 10374667 10374668 BMD_4230 BMD_4231 rpoZ gmk TRUE 0.978 3.000 0.471 1.000 N NA
 10374668 10374669 BMD_4231 BMD_4232 gmk   TRUE 0.835 14.000 0.143 NA   NA
 10374669 10374670 BMD_4232 BMD_4233     TRUE 0.727 47.000 0.189 NA   NA
 10374670 10374671 BMD_4233 BMD_4234     FALSE 0.180 154.000 0.037 NA   NA
 10374673 10374674 BMD_4236 BMD_4237 pyrE pyrF TRUE 0.985 -3.000 0.133 1.000 Y NA
 10374674 10374675 BMD_4237 BMD_4238 pyrF pyrD TRUE 0.997 -28.000 0.154 0.002 Y NA
 10374675 10374676 BMD_4238 BMD_4239 pyrD pyrK TRUE 0.988 -3.000 0.592 1.000 N NA
 10374676 10374677 BMD_4239 BMD_4240 pyrK pyrAB TRUE 0.969 -3.000 0.147 1.000 N NA
 10374677 10374678 BMD_4240 BMD_4241 pyrAB pyrAA TRUE 0.991 0.000 0.117 0.001 Y NA
 10374678 10374679 BMD_4241 BMD_4242 pyrAA pyrC TRUE 0.992 -15.000 0.155 1.000 Y NA
 10374679 10374680 BMD_4242 BMD_4243 pyrC pyrB TRUE 0.997 -37.000 0.452 1.000 Y NA
 10374680 10374681 BMD_4243 BMD_4244 pyrB pyrP TRUE 0.662 149.000 0.064 1.000 Y NA
 10374681 10374682 BMD_4244 BMD_4245 pyrP pyrR TRUE 0.727 157.000 0.140 1.000 Y NA
 10374682 10374683 BMD_4245 BMD_4246 pyrR rluD FALSE 0.383 191.000 0.048 1.000 N NA
 10374683 10374684 BMD_4246 BMD_4247 rluD lspA TRUE 0.936 -3.000 0.022 1.000 N NA
 10374684 10374685 BMD_4247 BMD_4248 lspA   TRUE 0.656 81.000 0.160 1.000   NA
 10374685 10374686 BMD_4248 BMD_4249   ileS FALSE 0.411 171.000 0.005 0.011   NA
 10374686 10374687 BMD_4249 BMD_4250 ileS divIVA FALSE 0.060 363.000 0.012 NA N NA
 10374687 10374688 BMD_4250 BMD_4251 divIVA   TRUE 0.788 85.000 0.579 NA   NA
 10374688 10374689 BMD_4251 BMD_4252     TRUE 0.729 52.000 0.138 1.000   NA
 10374689 10374690 BMD_4252 BMD_4253   sepF TRUE 0.894 4.000 0.158 NA   NA
 10374690 10374691 BMD_4253 BMD_4254 sepF   TRUE 0.842 17.000 0.194 NA   NA
 10374691 10374692 BMD_4254 BMD_4255     TRUE 0.774 8.000 0.061 NA   NA
 10374692 10374693 BMD_4255 BMD_4256     FALSE 0.358 75.000 0.039 NA   NA
 10374693 10374694 BMD_4256 BMD_4257   sigG FALSE 0.157 349.000 0.276 NA   NA
 10374694 10374695 BMD_4257 BMD_4258 sigG sigE TRUE 0.930 149.000 0.602 0.005 Y NA
 10374695 10374696 BMD_4258 BMD_4259 sigE spoIIGA TRUE 0.942 31.000 0.856 1.000   NA
 10374696 10374697 BMD_4259 BMD_4260 spoIIGA ftsZ FALSE 0.100 277.000 0.024 1.000   NA
 10374697 10374698 BMD_4260 BMD_4261 ftsZ ftsA TRUE 0.960 42.000 0.460 1.000 Y NA
 10374698 10374699 BMD_4261 BMD_4262 ftsA divIB FALSE 0.180 426.000 0.389 NA N NA
 10374699 10374700 BMD_4262 BMD_4263 divIB murB FALSE 0.607 154.000 0.070 NA Y NA
 10374700 10374701 BMD_4263 BMD_4264 murB spoVE FALSE 0.052 541.000 0.000 0.003 N NA
 10374701 10374702 BMD_4264 BMD_4265 spoVE murD TRUE 0.659 137.000 0.067 0.003 N NA
 10374702 10374703 BMD_4265 BMD_4266 murD mraY TRUE 0.996 1.000 0.647 0.003 Y NA
 10374703 10374704 BMD_4266 BMD_4267 mraY murE TRUE 0.908 62.000 0.025 0.003 Y NA
 10374704 10374705 BMD_4267 BMD_4268 murE spoVD TRUE 0.702 203.000 0.181 1.000 Y NA
 10374705 10374706 BMD_4268 BMD_4269 spoVD pbpB TRUE 0.943 70.000 0.157 0.001 Y NA
 10374706 10374707 BMD_4269 BMD_4270 pbpB ftsL TRUE 0.963 6.000 0.316 1.000 N NA
 10374707 10374708 BMD_4270 BMD_4271 ftsL mraW TRUE 0.807 34.000 0.077 1.000 N NA
 10374708 10374709 BMD_4271 BMD_4272 mraW   FALSE 0.026 334.000 0.003 NA   NA
 10374709 10374710 BMD_4272 BMD_4273     FALSE 0.012 91.000 0.000 NA   NA
 10374710 10374711 BMD_4273 BMD_4274   panE FALSE 0.096 2.000 0.000 NA   NA
 10374711 10374712 BMD_4274 BMD_4275 panE pccB FALSE 0.338 159.000 0.011 1.000 N NA
 10374712 10374713 BMD_4275 BMD_4276 pccB   TRUE 0.793 20.000 0.130 NA   NA
 10374713 10374714 BMD_4276 BMD_4277     TRUE 0.928 -3.000 0.132 NA   NA
 10374716 10374717 BMD_4279 BMD_4280     FALSE 0.357 179.000 0.103 1.000   NA
 10374717 10374718 BMD_4280 BMD_4281   rpmF FALSE 0.329 168.000 0.010 1.000 N NA
 10374718 10374719 BMD_4281 BMD_4282 rpmF   TRUE 0.832 66.000 0.599 NA   NA
 10374721 10374722 BMD_4284 BMD_4285     TRUE 0.813 20.000 0.095 1.000   NA
 10374724 10374725 BMD_4287 BMD_4288 coaD   TRUE 0.896 36.000 0.367 NA N NA
 10374727 10374728 BMD_4290 BMD_4291     FALSE 0.170 398.000 0.500 NA   NA
 10374728 10374729 BMD_4291 BMD_4292     FALSE 0.010 101.000 0.000 NA   NA
 10374729 10374730 BMD_4292 BMD_4293     FALSE 0.011 100.000 0.000 NA   NA
 10374730 10374731 BMD_4293 BMD_4294     TRUE 0.967 6.000 0.852 NA   NA
 10374731 10374732 BMD_4294 BMD_4295     FALSE 0.014 83.000 0.000 NA   NA
 10374732 10374733 BMD_4295 BMD_4296   qcrC FALSE 0.242 137.000 0.069 NA   NA
 10374733 10374734 BMD_4296 BMD_4297 qcrC qcrB TRUE 0.634 111.000 0.095 0.031   NA
 10374734 10374735 BMD_4297 BMD_4298 qcrB qcrA TRUE 0.980 4.000 0.447 0.031   NA
 10374735 10374736 BMD_4298 BMD_4299 qcrA   FALSE 0.552 205.000 0.540 NA   NA
 10374736 10374737 BMD_4299 BMD_4300     TRUE 0.945 13.000 0.583 NA   NA
 10374737 10374738 BMD_4300 BMD_4301     TRUE 0.680 98.000 0.375 NA   NA
 10374738 10374739 BMD_4301 BMD_4302   aroE FALSE 0.088 260.000 0.002 1.000   NA
 10374739 10374740 BMD_4302 BMD_4303 aroE tyrA TRUE 0.937 22.000 0.069 1.000 Y NA
 10374740 10374741 BMD_4303 BMD_4304 tyrA hisC TRUE 0.839 73.000 0.080 1.000 Y NA
 10374741 10374742 BMD_4304 BMD_4305 hisC trpA TRUE 0.951 5.000 0.017 1.000 Y NA
 10374742 10374743 BMD_4305 BMD_4306 trpA trpB TRUE 0.997 -13.000 0.248 0.001 Y NA
 10374743 10374744 BMD_4306 BMD_4307 trpB trpF TRUE 0.996 -3.000 0.375 0.001 Y NA
 10374744 10374745 BMD_4307 BMD_4308 trpF trpC TRUE 0.998 -37.000 0.264 0.001 Y NA
 10374745 10374746 BMD_4308 BMD_4309 trpC trpD TRUE 0.993 -10.000 0.216 1.000 Y NA
 10374746 10374747 BMD_4309 BMD_4310 trpD trpE TRUE 0.994 -13.000 0.032 0.000 Y NA
 10374747 10374748 BMD_4310 BMD_4311 trpE aroB FALSE 0.213 284.000 0.000 1.000 Y NA
 10374748 10374749 BMD_4311 BMD_4312 aroB aroF TRUE 0.990 0.000 0.110 0.002 Y NA
 10374749 10374750 BMD_4312 BMD_4313 aroF cheR FALSE 0.366 135.000 0.017 1.000 N NA
 10374750 10374751 BMD_4313 BMD_4314 cheR ndk FALSE 0.294 211.000 0.023 1.000 N NA
 10374751 10374752 BMD_4314 BMD_4315 ndk hepT FALSE 0.497 116.000 0.054 1.000 N NA
 10374752 10374753 BMD_4315 BMD_4316 hepT menH TRUE 0.930 82.000 0.476 1.000 Y NA
 10374753 10374754 BMD_4316 BMD_4317 menH hepS TRUE 0.971 5.000 0.708 1.000   NA
 10374754 10374755 BMD_4317 BMD_4318 hepS mtrB FALSE 0.281 279.000 0.245 1.000   NA
 10374755 10374756 BMD_4318 BMD_4319 mtrB folE TRUE 0.827 26.000 0.130 1.000   NA
 10374756 10374757 BMD_4319 BMD_4320 folE hbs FALSE 0.566 149.000 0.154 1.000 N NA
 10374757 10374758 BMD_4320 BMD_4321 hbs spoIVA FALSE 0.001 374.000 0.000 NA   NA
 10374758 10374759 BMD_4321 BMD_4322 spoIVA   FALSE 0.163 230.000 0.081 NA   NA
 10374759 10374760 BMD_4322 BMD_4323     TRUE 0.937 25.000 0.771 NA   NA
 10374760 10374761 BMD_4323 BMD_4324   gpsA FALSE 0.041 317.000 0.021 NA   NA
 10374761 10374762 BMD_4324 BMD_4325 gpsA engA TRUE 0.781 18.000 0.068 1.000   NA
 10374762 10374763 BMD_4325 BMD_4326 engA   FALSE 0.035 298.000 0.003 NA   NA
 10374765 10374766 BMD_4328 BMD_4329   fni FALSE 0.085 177.000 0.000 NA N NA
 10374766 10374767 BMD_4329 BMD_4330 fni rpsA TRUE 0.857 17.000 0.061 1.000 N NA
 10374767 10374768 BMD_4330 BMD_4331 rpsA plsC FALSE 0.474 163.000 0.095 1.000 N NA
 10374768 10374769 BMD_4331 BMD_4332 plsC cmk TRUE 0.945 -3.000 0.041 1.000 N NA
 10374769 10374770 BMD_4332 BMD_4333 cmk   FALSE 0.128 163.000 0.016 NA   NA
 10374770 10374771 BMD_4333 BMD_4334     FALSE 0.519 70.000 0.103 NA   NA
 10374771 10374772 BMD_4334 BMD_4335   ypeB FALSE 0.232 257.000 0.205 NA   NA
 10374772 10374773 BMD_4335 BMD_4336 ypeB sleB TRUE 0.929 18.000 0.408 1.000   NA
 10374773 10374774 BMD_4336 BMD_4337 sleB   FALSE 0.375 146.000 0.157 NA   NA
 10374776 10374777 BMD_4339 BMD_4340   gudB FALSE 0.508 125.000 0.083 1.000 N NA
 10374777 10374778 BMD_4340 BMD_4341 gudB mecB FALSE 0.207 343.000 0.222 NA N NA
 10374778 10374779 BMD_4341 BMD_4342 mecB   FALSE 0.607 128.000 0.417 NA   NA
 10374779 10374780 BMD_4342 BMD_4343     TRUE 0.728 108.000 0.433 1.000   NA
 10374780 10374781 BMD_4343 BMD_4344     FALSE 0.046 21.000 0.000 NA   NA
 10374781 10374782 BMD_4344 BMD_4345     FALSE 0.022 55.000 0.000 NA   NA
 10374782 10374783 BMD_4345 BMD_4346     FALSE 0.012 93.000 0.000 NA   NA
 10374783 10374784 BMD_4346 BMD_4347   recQ TRUE 0.982 -60.000 0.270 NA   NA
 10374784 10374785 BMD_4347 BMD_4348 recQ   TRUE 0.922 24.000 0.508 NA   NA
 10374789 10374790 BMD_4352 BMD_4353   resE FALSE 0.037 170.000 0.000 1.000   NA
 10374790 10374791 BMD_4353 BMD_4354 resE resD TRUE 0.995 0.000 0.511 0.067 Y NA
 10374791 10374792 BMD_4354 BMD_4355 resD resC FALSE 0.216 350.000 0.178 1.000 N NA
 10374792 10374793 BMD_4355 BMD_4356 resC resB TRUE 0.971 12.000 0.278 NA Y NA
 10374793 10374794 BMD_4356 BMD_4357 resB resA TRUE 0.972 13.000 0.306 NA Y NA
 10374794 10374795 BMD_4357 BMD_4358 resA rluB FALSE 0.394 198.000 0.069 1.000 N NA
 10374795 10374796 BMD_4358 BMD_4359 rluB spmB FALSE 0.486 87.000 0.063 1.000   NA
 10374796 10374797 BMD_4359 BMD_4360 spmB spmA TRUE 0.993 -3.000 0.655 0.001   NA
 10374797 10374798 BMD_4360 BMD_4361 spmA dacB TRUE 0.976 -7.000 0.252 1.000   NA
 10374798 10374799 BMD_4361 BMD_4362 dacB scpB FALSE 0.330 119.000 0.021 NA N NA
 10374799 10374800 BMD_4362 BMD_4363 scpB scpA TRUE 0.977 -3.000 0.570 NA   NA
 10374801 10374802 BMD_4364 BMD_4365     FALSE 0.007 133.000 0.000 NA   NA
 10374803 10374804 BMD_4366 BMD_4367 ribT ppiB FALSE 0.019 245.000 0.000 1.000   NA
 10374806 10374807 BMD_4369 BMD_4370 lysA spoVAF FALSE 0.221 140.000 0.015 1.000   NA
 10374807 10374808 BMD_4370 BMD_4371 spoVAF spoVAEA TRUE 0.985 -7.000 0.650 NA   NA
 10374808 10374809 BMD_4371 BMD_4372 spoVAEA spoVAEB TRUE 0.940 7.000 0.400 NA   NA
 10374809 10374810 BMD_4372 BMD_4373 spoVAEB spoVAD TRUE 0.989 -12.000 0.808 NA   NA
 10374810 10374811 BMD_4373 BMD_4374 spoVAD spoVAC TRUE 0.944 14.000 0.615 NA   NA
 10374811 10374812 BMD_4374 BMD_4375 spoVAC spoVAB TRUE 0.872 19.000 0.260 NA   NA
 10374812 10374813 BMD_4375 BMD_4376 spoVAB spoVAA TRUE 0.991 -13.000 0.923 NA   NA
 10374813 10374814 BMD_4376 BMD_4377 spoVAA sigF FALSE 0.368 163.000 0.165 NA   NA
 10374814 10374815 BMD_4377 BMD_4378 sigF spoIIAB TRUE 0.977 13.000 0.842 1.000 N NA
 10374815 10374816 BMD_4378 BMD_4379 spoIIAB spoIIAA TRUE 0.997 0.000 0.669 0.002 Y NA
 10374816 10374817 BMD_4379 BMD_4380 spoIIAA dacF TRUE 0.750 103.000 0.276 1.000 N NA
 10374817 10374818 BMD_4380 BMD_4381 dacF pupG FALSE 0.506 117.000 0.063 1.000 N NA
 10374818 10374819 BMD_4381 BMD_4382 pupG drm TRUE 0.963 17.000 0.609 1.000 N NA
 10374819 10374820 BMD_4382 BMD_4383 drm xerD FALSE 0.595 198.000 0.267 1.000 N NA
 10374820 10374821 BMD_4383 BMD_4384 xerD   TRUE 0.948 7.000 0.476 NA   NA
 10374821 10374822 BMD_4384 BMD_4385   fur FALSE 0.448 194.000 0.284 NA   NA
 10374822 10374823 BMD_4385 BMD_4386 fur spoIIM FALSE 0.615 113.000 0.341 NA   NA
 10374823 10374824 BMD_4386 BMD_4387 spoIIM   FALSE 0.015 535.000 0.033 NA   NA
 10374825 10374826 BMD_4388 BMD_4389     FALSE 0.357 102.000 0.080 NA   NA
 10374827 10374828 BMD_4390 BMD_4391   scoB FALSE 0.018 65.000 0.000 NA   NA
 10374828 10374829 BMD_4391 BMD_4392 scoB scoA TRUE 0.987 21.000 0.352 0.001 Y NA
 10374829 10374830 BMD_4392 BMD_4393 scoA   FALSE 0.478 236.000 0.049 1.000 Y NA
 10374831 10374832 BMD_4394 BMD_4395     FALSE 0.098 69.000 0.000 1.000   NA
 10374835 10374836 BMD_4398 BMD_4399     TRUE 0.870 24.000 0.188 1.000   NA
 10374837 10374838 BMD_4400 BMD_4401 proI   FALSE 0.537 138.000 0.128 1.000 N NA
 10374839 10374840 BMD_4402 BMD_4403 rnz   FALSE 0.098 69.000 0.000 1.000   NA
 10374840 10374841 BMD_4403 BMD_4404   mmsA FALSE 0.284 94.000 0.000 1.000 N NA
 10374841 10374842 BMD_4404 BMD_4405 mmsA   FALSE 0.556 208.000 0.333 NA N NA
 10374842 10374843 BMD_4405 BMD_4406     FALSE 0.006 140.000 0.000 NA   NA
 10374843 10374844 BMD_4406 BMD_4407     FALSE 0.001 394.000 0.000 NA   NA
 10374844 10374845 BMD_4407 BMD_4408   hydA FALSE 0.470 34.000 0.025 NA   NA
 10374845 10374846 BMD_4408 BMD_4409 hydA   TRUE 0.859 20.000 0.000 1.000 Y NA
 10374846 10374847 BMD_4409 BMD_4410     FALSE 0.621 22.000 0.000 1.000 N NA
 10374847 10374848 BMD_4410 BMD_4411     FALSE 0.323 226.000 0.000 1.000 Y NA
 10374848 10374849 BMD_4411 BMD_4412     TRUE 0.850 26.000 0.074 1.000 N NA
 10374849 10374850 BMD_4412 BMD_4413   mce TRUE 0.973 -7.000 0.108 1.000 N NA
 10374850 10374851 BMD_4413 BMD_4414 mce   FALSE 0.002 322.000 0.000 NA   NA
 10374851 10374852 BMD_4414 BMD_4415     FALSE 0.452 162.000 0.250 NA   NA
 10374852 10374853 BMD_4415 BMD_4416   artM FALSE 0.300 160.000 0.110 NA   NA
 10374853 10374854 BMD_4416 BMD_4417 artM artQ TRUE 0.996 -7.000 0.640 1.000 Y NA
 10374854 10374855 BMD_4417 BMD_4418 artQ artP TRUE 0.974 20.000 0.154 0.034 Y NA
 10374855 10374856 BMD_4418 BMD_4419 artP   FALSE 0.002 277.000 0.000 NA   NA
 10374856 10374857 BMD_4419 BMD_4420     FALSE 0.128 194.000 0.023 NA   NA
 10374857 10374858 BMD_4420 BMD_4421   mutB TRUE 0.947 17.000 0.366 1.000 N NA
 10374858 10374859 BMD_4421 BMD_4422 mutB mutA TRUE 0.996 -7.000 0.220 0.001 Y NA
 10374859 10374860 BMD_4422 BMD_4423 mutA bkdB FALSE 0.335 261.000 0.032 0.064 N NA
 10374860 10374861 BMD_4423 BMD_4424 bkdB bkdAB TRUE 0.991 16.000 0.882 0.064 Y NA
 10374861 10374862 BMD_4424 BMD_4425 bkdAB bkdAA TRUE 0.995 13.000 0.897 0.000 Y NA
 10374862 10374863 BMD_4425 BMD_4426 bkdAA lpdV TRUE 0.976 21.000 0.414 1.000 Y NA
 10374863 10374864 BMD_4426 BMD_4427 lpdV buk TRUE 0.969 29.000 0.172 0.028 Y NA
 10374864 10374865 BMD_4427 BMD_4428 buk bcd TRUE 0.849 91.000 0.490 1.000 N NA
 10374865 10374866 BMD_4428 BMD_4429 bcd ptb TRUE 0.963 13.000 0.431 1.000 N NA
 10374866 10374867 BMD_4429 BMD_4430 ptb bkdR FALSE 0.522 240.000 0.333 1.000 N NA
 10374870 10374871 BMD_4433 BMD_4434     FALSE 0.002 313.000 0.000 NA   NA
 10374872 10374873 BMD_4435 BMD_4436   spo0A FALSE 0.003 234.000 0.000 NA   NA
 10374873 10374874 BMD_4436 BMD_4437 spo0A spoIVB FALSE 0.588 228.000 0.393 1.000 N NA
 10374874 10374875 BMD_4437 BMD_4438 spoIVB recN FALSE 0.440 183.000 0.079 1.000 N NA
 10374875 10374876 BMD_4438 BMD_4439 recN argR TRUE 0.854 17.000 0.056 1.000 N NA
 10374876 10374877 BMD_4439 BMD_4440 argR   FALSE 0.431 162.000 0.064 1.000 N NA
 10374877 10374878 BMD_4440 BMD_4441   dxs TRUE 0.973 -3.000 0.189 1.000 N NA
 10374878 10374879 BMD_4441 BMD_4442 dxs ispA FALSE 0.244 341.000 0.024 1.000 Y NA
 10374879 10374880 BMD_4442 BMD_4443 ispA xseB TRUE 0.949 0.000 0.100 1.000 N NA
 10374880 10374881 BMD_4443 BMD_4444 xseB xseA TRUE 0.994 4.000 0.412 0.000 Y NA
 10374881 10374882 BMD_4444 BMD_4445 xseA nusB FALSE 0.532 85.000 0.012 1.000 N NA
 10374882 10374883 BMD_4445 BMD_4446 nusB   FALSE 0.099 222.000 0.023 NA   NA
 10374883 10374884 BMD_4446 BMD_4447   accC TRUE 0.874 30.000 0.373 NA   NA
 10374884 10374885 BMD_4447 BMD_4448 accC accB TRUE 0.979 13.000 0.086 0.001 Y NA
 10374885 10374886 BMD_4448 BMD_4449 accB spoIIIAH FALSE 0.031 353.000 0.020 NA   NA
 10374886 10374887 BMD_4449 BMD_4450 spoIIIAH spoIIIAG TRUE 0.937 14.000 0.509 NA   NA
 10374887 10374888 BMD_4450 BMD_4451 spoIIIAG spoIIIAF TRUE 0.984 -3.000 0.907 NA   NA
 10374888 10374889 BMD_4451 BMD_4452 spoIIIAF spoIIIAE TRUE 0.969 6.000 0.918 NA   NA
 10374889 10374890 BMD_4452 BMD_4453 spoIIIAE spoIIIAD TRUE 0.943 25.000 0.864 NA   NA
 10374890 10374891 BMD_4453 BMD_4454 spoIIIAD spoIIIAC TRUE 0.949 21.000 0.895 NA   NA
 10374891 10374892 BMD_4454 BMD_4455 spoIIIAC spoIIIAB TRUE 0.950 20.000 0.926 NA   NA
 10374892 10374893 BMD_4455 BMD_4456 spoIIIAB spoIIIAA TRUE 0.956 7.000 0.604 NA   NA
 10374893 10374894 BMD_4456 BMD_4457 spoIIIAA   FALSE 0.609 66.000 0.148 NA   NA
 10374894 10374895 BMD_4457 BMD_4458   efp FALSE 0.121 139.000 0.009 NA   NA
 10374895 10374896 BMD_4458 BMD_4459 efp   TRUE 0.909 20.000 0.160 1.000 N NA
 10374896 10374897 BMD_4459 BMD_4460   yqhS TRUE 0.980 2.000 0.168 1.000 Y NA
 10374897 10374898 BMD_4460 BMD_4461 yqhS   FALSE 0.228 122.000 0.044 NA   NA
 10374899 10374900 BMD_4462 BMD_4463     TRUE 0.672 49.000 0.140 NA   NA
 10374901 10374902 BMD_4464 BMD_4465   mntR FALSE 0.485 103.000 0.101 1.000   NA
 10374902 10374903 BMD_4465 BMD_4466 mntR   FALSE 0.002 285.000 0.000 NA   NA
 10374903 10374904 BMD_4466 BMD_4467     FALSE 0.002 312.000 0.000 NA   NA
 10374906 10374907 BMD_4469 BMD_4470 gcvPB gcvPA TRUE 0.997 -7.000 0.316 0.000 Y NA
 10374907 10374908 BMD_4470 BMD_4471 gcvPA gcvT TRUE 0.974 21.000 0.092 0.001 Y NA
 10374909 10374910 BMD_4472 BMD_4473     FALSE 0.216 -13.000 0.000 NA   NA
 10374911 10374912 BMD_4474 BMD_4475   comGG FALSE 0.025 44.000 0.000 NA   NA
 10374912 10374913 BMD_4475 BMD_4476 comGG comGF TRUE 0.944 -16.000 0.089 NA   NA
 10374913 10374914 BMD_4476 BMD_4477 comGF comGE TRUE 0.917 -3.000 0.107 NA   NA
 10374914 10374915 BMD_4477 BMD_4478 comGE comGD TRUE 0.953 -16.000 0.109 NA   NA
 10374915 10374916 BMD_4478 BMD_4479 comGD comGC TRUE 0.979 -13.000 0.320 NA   NA
 10374916 10374917 BMD_4479 BMD_4480 comGC comGB TRUE 0.994 15.000 0.861 0.001 Y NA
 10374917 10374918 BMD_4480 BMD_4481 comGB comGA TRUE 0.996 -9.000 0.639 1.000 Y NA
 10374918 10374919 BMD_4481 BMD_4482 comGA spxA FALSE 0.181 270.000 0.023 1.000 N NA
 10374923 10374924 BMD_4486 BMD_4487   glk FALSE 0.479 112.000 0.036 1.000 N NA
 10374924 10374925 BMD_4487 BMD_4488 glk   TRUE 0.960 3.000 0.496 NA   NA
 10374925 10374926 BMD_4488 BMD_4489   glpG FALSE 0.515 182.000 0.347 NA   NA
 10374926 10374927 BMD_4489 BMD_4490 glpG   FALSE 0.007 136.000 0.000 NA   NA
 10374927 10374928 BMD_4490 BMD_4491     FALSE 0.023 52.000 0.000 NA   NA
 10374928 10374929 BMD_4491 BMD_4492     TRUE 0.860 -13.000 0.012 NA   NA
 10374929 10374930 BMD_4492 BMD_4493   rpmG TRUE 0.731 48.000 0.045 1.000 N NA
 10374930 10374931 BMD_4493 BMD_4494 rpmG   FALSE 0.199 243.000 0.009 1.000 N NA
 10374931 10374932 BMD_4494 BMD_4495     TRUE 0.975 -3.000 0.044 0.011 N NA
 10374932 10374933 BMD_4495 BMD_4496     TRUE 0.945 -7.000 0.127 NA   NA
 10374933 10374934 BMD_4496 BMD_4497   phoU FALSE 0.239 194.000 0.091 NA   NA
 10374934 10374935 BMD_4497 BMD_4498 phoU pstB TRUE 0.936 23.000 0.118 NA Y NA
 10374935 10374936 BMD_4498 BMD_4499 pstB   FALSE 0.001 354.000 0.000 NA   NA
 10374936 10374937 BMD_4499 BMD_4500   pbpA FALSE 0.007 131.000 0.000 NA   NA
 10374937 10374938 BMD_4500 BMD_4501 pbpA   FALSE 0.038 162.000 0.000 1.000   NA
 10374938 10374939 BMD_4501 BMD_4502   sodA FALSE 0.565 130.000 0.255 1.000   NA
 10374939 10374940 BMD_4502 BMD_4503 sodA   FALSE 0.005 198.000 0.000 NA   NA
 10374940 10374941 BMD_4503 BMD_4504     FALSE 0.063 12.000 0.000 NA   NA
 10374941 10374942 BMD_4504 BMD_4505     FALSE 0.084 4.000 0.000 NA   NA
 10374942 10374943 BMD_4505 BMD_4506     FALSE 0.026 41.000 0.000 NA   NA
 10374943 10374944 BMD_4506 BMD_4507     FALSE 0.096 2.000 0.000 NA   NA
 10374944 10374945 BMD_4507 BMD_4508     FALSE 0.019 63.000 0.000 NA   NA
 10374945 10374946 BMD_4508 BMD_4509     FALSE 0.009 109.000 0.000 NA   NA
 10374949 10374950 BMD_4512 BMD_4513   ispG FALSE 0.149 143.000 0.022 NA   NA
 10374953 10374954 BMD_4516 BMD_4517 zur   TRUE 0.993 -3.000 0.480 1.000 Y NA
 10374954 10374955 BMD_4517 BMD_4518     TRUE 0.995 -3.000 0.389 0.069 Y NA
 10374957 10374958 BMD_4520 BMD_4521 nfo   TRUE 0.932 29.000 0.104 1.000 Y NA
 10374959 10374960 BMD_4522 BMD_4523   ispH FALSE 0.477 129.000 0.231 NA   NA
 10374961 10374962 BMD_4524 BMD_4525     TRUE 0.930 -3.000 0.138 NA   NA
 10374962 10374963 BMD_4525 BMD_4526   cccA FALSE 0.152 169.000 0.028 NA   NA
 10374963 10374964 BMD_4526 BMD_4527 cccA   FALSE 0.556 132.000 0.012 0.031 N NA
 10374964 10374965 BMD_4527 BMD_4528   sigA FALSE 0.031 384.000 0.000 1.000 N NA
 10374965 10374966 BMD_4528 BMD_4529 sigA dnaG TRUE 0.811 66.000 0.209 1.000 N NA
 10374966 10374967 BMD_4529 BMD_4530 dnaG   FALSE 0.468 42.000 0.033 NA   NA
 10374967 10374968 BMD_4530 BMD_4531     FALSE 0.001 417.000 0.000 NA   NA
 10374968 10374969 BMD_4531 BMD_4532   ccpN TRUE 0.900 34.000 0.621 NA   NA
 10374969 10374970 BMD_4532 BMD_4533 ccpN recO FALSE 0.103 256.000 0.013 1.000   NA
 10374970 10374971 BMD_4533 BMD_4534 recO era FALSE 0.129 327.000 0.108 1.000   NA
 10374971 10374972 BMD_4534 BMD_4535 era cdd TRUE 0.952 -7.000 0.098 1.000   NA
 10374972 10374973 BMD_4535 BMD_4536 cdd dgkA TRUE 0.725 92.000 0.179 1.000 N NA
 10374973 10374974 BMD_4536 BMD_4537 dgkA   FALSE 0.528 80.000 0.123 NA   NA
 10374974 10374975 BMD_4537 BMD_4538     TRUE 0.944 -3.000 0.182 NA   NA
 10374975 10374976 BMD_4538 BMD_4539   phoH FALSE 0.498 127.000 0.172 1.000   NA
 10374976 10374977 BMD_4539 BMD_4540 phoH yqfD TRUE 0.867 4.000 0.114 NA   NA
 10374977 10374978 BMD_4540 BMD_4541 yqfD yqfC TRUE 0.947 17.000 0.851 NA   NA
 10374978 10374979 BMD_4541 BMD_4542 yqfC   FALSE 0.603 60.000 0.121 NA   NA
 10374979 10374980 BMD_4542 BMD_4543     TRUE 0.791 32.000 0.203 NA   NA
 10374980 10374981 BMD_4543 BMD_4544     TRUE 0.968 0.000 0.367 1.000   NA
 10374981 10374982 BMD_4544 BMD_4545     FALSE 0.236 179.000 0.031 1.000   NA
 10374982 10374983 BMD_4545 BMD_4546   rpsU TRUE 0.931 16.000 0.150 0.014   NA
 10374983 10374984 BMD_4546 BMD_4547 rpsU rimO FALSE 0.144 226.000 0.016 1.000   NA
 10374984 10374985 BMD_4547 BMD_4548 rimO rsmE TRUE 0.883 6.000 0.163 NA   NA
 10374985 10374986 BMD_4548 BMD_4549 rsmE prmA TRUE 0.859 20.000 0.227 NA   NA
 10374986 10374987 BMD_4549 BMD_4550 prmA dnaJ FALSE 0.596 118.000 0.133 1.000 N NA
 10374987 10374988 BMD_4550 BMD_4551 dnaJ dnaK TRUE 0.785 236.000 0.196 0.001 Y NA
 10374988 10374989 BMD_4551 BMD_4552 dnaK grpE TRUE 0.974 31.000 0.224 0.004 Y NA
 10374989 10374990 BMD_4552 BMD_4553 grpE hrcA TRUE 0.746 106.000 0.286 1.000 N NA
 10374990 10374991 BMD_4553 BMD_4554 hrcA hemN TRUE 0.625 92.000 0.082 1.000 N NA
 10374991 10374992 BMD_4554 BMD_4555 hemN lepA FALSE 0.370 176.000 0.032 1.000 N NA
 10374992 10374993 BMD_4555 BMD_4556 lepA   FALSE 0.128 129.000 0.008 NA   NA
 10374993 10374994 BMD_4556 BMD_4557   gpr TRUE 0.659 85.000 0.265 NA   NA
 10374998 10374999 BMD_4561 BMD_4562 comEC comEB FALSE 0.531 69.000 0.055 1.000   NA
 10374999 10375000 BMD_4562 BMD_4563 comEB comEA TRUE 0.624 97.000 0.095 1.000 N NA
 10375002 10375003 BMD_4565 BMD_4566     TRUE 0.901 -3.000 0.085 NA   NA
 10375003 10375004 BMD_4566 BMD_4567     TRUE 0.951 -7.000 0.149 NA   NA
 10375004 10375005 BMD_4567 BMD_4568   nadD TRUE 0.995 -46.000 0.199 1.000 Y NA
 10375005 10375006 BMD_4568 BMD_4569 nadD   TRUE 0.747 61.000 0.150 NA N NA
 10375006 10375007 BMD_4569 BMD_4570   aroD TRUE 0.836 19.000 0.089 NA N NA
 10375007 10375008 BMD_4570 BMD_4571 aroD   TRUE 0.920 20.000 0.336 1.000   NA
 10375008 10375009 BMD_4571 BMD_4572   yqeG TRUE 0.969 4.000 0.555 1.000   NA
 10375015 10375016 BMD_4578 BMD_4579     FALSE 0.001 391.000 0.000 NA   NA
 10375016 10375017 BMD_4579 BMD_4580   mccB FALSE 0.402 82.000 0.063 NA   NA
 10375017 10375018 BMD_4580 BMD_4581 mccB mccA TRUE 0.996 2.000 0.690 0.014 Y NA
 10375018 10375019 BMD_4581 BMD_4582 mccA mtnN FALSE 0.421 143.000 0.048 1.000 N NA
 10375019 10375020 BMD_4582 BMD_4583 mtnN   FALSE 0.239 18.000 0.000 1.000   NA
 10375022 10375023 BMD_4585 BMD_4586   pbpI FALSE 0.480 118.000 0.203 NA   NA
 10375023 10375024 BMD_4586 BMD_4587 pbpI   FALSE 0.208 122.000 0.000 1.000 N NA
 10375024 10375025 BMD_4587 BMD_4588   greA FALSE 0.200 126.000 0.000 1.000 N NA
 10375025 10375026 BMD_4588 BMD_4589 greA udk FALSE 0.379 219.000 0.095 1.000 N NA
 10375026 10375027 BMD_4589 BMD_4590 udk   TRUE 0.920 8.000 0.100 1.000 N NA
 10375027 10375028 BMD_4590 BMD_4591     TRUE 0.855 149.000 0.156 0.003 Y NA
 10375028 10375029 BMD_4591 BMD_4592     TRUE 0.950 -3.000 0.142 1.000   NA
 10375029 10375030 BMD_4592 BMD_4593     FALSE 0.420 182.000 0.154 1.000   NA
 10375030 10375031 BMD_4593 BMD_4594     FALSE 0.065 413.000 0.151 NA   NA
 10375031 10375032 BMD_4594 BMD_4595     TRUE 0.655 155.000 0.651 NA   NA
 10375032 10375033 BMD_4595 BMD_4596     TRUE 0.967 1.000 0.537 NA   NA
 10375033 10375034 BMD_4596 BMD_4597   alaS FALSE 0.487 85.000 0.110 NA   NA
 10375034 10375035 BMD_4597 BMD_4598 alaS   FALSE 0.006 191.000 0.000 NA   NA
 10375035 10375036 BMD_4598 BMD_4599     FALSE 0.020 61.000 0.000 NA   NA
 10375036 10375037 BMD_4599 BMD_4600     FALSE 0.009 114.000 0.000 NA   NA
 10375037 10375038 BMD_4600 BMD_4601     FALSE 0.041 26.000 0.000 NA   NA
 10375038 10375039 BMD_4601 BMD_4602     FALSE 0.307 142.000 0.107 NA   NA
 10375039 10375040 BMD_4602 BMD_4603     TRUE 0.930 25.000 0.281 1.000 N NA
 10375040 10375041 BMD_4603 BMD_4604   trmU FALSE 0.392 158.000 0.038 1.000 N NA
 10375041 10375042 BMD_4604 BMD_4605 trmU iscS FALSE 0.555 107.000 0.072 1.000 N NA
 10375042 10375043 BMD_4605 BMD_4606 iscS cymR TRUE 0.894 24.000 0.201 NA N NA
 10375045 10375046 BMD_4608 BMD_4609 pstA pstC TRUE 0.998 -3.000 0.907 0.001 Y NA
 10375046 10375047 BMD_4609 BMD_4610 pstC pstS TRUE 0.796 125.000 0.206 1.000 Y NA
 10375047 10375048 BMD_4610 BMD_4611 pstS   FALSE 0.025 422.000 0.000 1.000 N NA
 10375048 10375049 BMD_4611 BMD_4612   aspS FALSE 0.046 463.000 0.008 1.000 N NA
 10375049 10375050 BMD_4612 BMD_4613 aspS hisS TRUE 0.983 10.000 0.161 0.027 Y NA
 10375050 10375051 BMD_4613 BMD_4614 hisS   FALSE 0.001 389.000 0.000 NA   NA
 10375053 10375054 BMD_4616 BMD_4617 dtd relA TRUE 0.918 16.000 0.177 1.000 N NA
 10375054 10375055 BMD_4617 BMD_4618 relA apt FALSE 0.422 186.000 0.068 1.000 N NA
 10375055 10375056 BMD_4618 BMD_4619 apt recJ TRUE 0.901 16.000 0.128 1.000 N NA
 10375056 10375057 BMD_4619 BMD_4620 recJ secDF FALSE 0.341 141.000 0.007 1.000 N NA
 10375057 10375058 BMD_4620 BMD_4621 secDF comN FALSE 0.406 138.000 0.185 NA   NA
 10375062 10375063 BMD_4625 BMD_4626 yajC tgt TRUE 0.810 73.000 0.325 NA N NA
 10375063 10375064 BMD_4626 BMD_4627 tgt queA TRUE 0.988 24.000 0.360 0.000 Y NA
 10375064 10375065 BMD_4627 BMD_4628 queA   FALSE 0.620 24.000 0.039 NA   NA
 10375065 10375066 BMD_4628 BMD_4629   ruvB TRUE 0.852 -3.000 0.040 NA   NA
 10375066 10375067 BMD_4629 BMD_4630 ruvB ruvA TRUE 0.991 17.000 0.549 0.001 Y NA
 10375067 10375068 BMD_4630 BMD_4631 ruvA bofC FALSE 0.008 637.000 0.010 NA   NA
 10375070 10375071 BMD_4633 BMD_4634 coxA   FALSE 0.520 95.000 0.160 NA   NA
 10375071 10375072 BMD_4634 BMD_4635   safA TRUE 0.779 83.000 0.500 NA   NA
 10375072 10375073 BMD_4635 BMD_4636 safA nadA FALSE 0.027 215.000 0.000 1.000   NA
 10375073 10375074 BMD_4636 BMD_4637 nadA nadC TRUE 0.997 -43.000 0.198 0.003 Y NA
 10375074 10375075 BMD_4637 BMD_4638 nadC nadB TRUE 0.933 37.000 0.014 0.003 Y NA
 10375076 10375077 BMD_4639 BMD_4640 nifS nadR TRUE 0.900 16.000 0.243 1.000   NA
 10375078 10375079 BMD_4641 BMD_4642 pheA pheB TRUE 0.884 29.000 0.054 0.001   NA
 10375079 10375080 BMD_4642 BMD_4643 pheB obg FALSE 0.601 34.000 0.024 1.000   NA
 10375080 10375081 BMD_4643 BMD_4644 obg spo0B FALSE 0.377 52.000 0.021 NA   NA
 10375081 10375082 BMD_4644 BMD_4645 spo0B rpmA FALSE 0.121 172.000 0.013 NA   NA
 10375082 10375083 BMD_4645 BMD_4646 rpmA   TRUE 0.953 17.000 0.203 NA Y NA
 10375083 10375084 BMD_4646 BMD_4647   rplU TRUE 0.968 10.000 0.208 NA Y NA
 10375084 10375085 BMD_4647 BMD_4648 rplU   FALSE 0.619 165.000 0.000 0.012 Y NA
 10375085 10375086 BMD_4648 BMD_4649   spoIVFB FALSE 0.083 84.000 0.000 1.000   NA
 10375086 10375087 BMD_4649 BMD_4650 spoIVFB spoIVFA TRUE 0.964 -7.000 0.219 NA   NA
 10375087 10375088 BMD_4650 BMD_4651 spoIVFA minD FALSE 0.260 121.000 0.060 NA   NA
 10375088 10375089 BMD_4651 BMD_4652 minD minC TRUE 0.987 3.000 0.368 1.000 Y NA
 10375089 10375090 BMD_4652 BMD_4653 minC mreD FALSE 0.569 117.000 0.106 1.000 N NA
 10375090 10375091 BMD_4653 BMD_4654 mreD mreC TRUE 0.996 0.000 0.550 0.001 Y NA
 10375091 10375092 BMD_4654 BMD_4655 mreC mreB TRUE 0.966 20.000 0.689 1.000 N NA
 10375092 10375093 BMD_4655 BMD_4656 mreB radC FALSE 0.109 230.000 0.000 1.000 N NA
 10375093 10375094 BMD_4656 BMD_4657 radC maf FALSE 0.449 16.000 0.000 NA N NA
 10375094 10375095 BMD_4657 BMD_4658 maf spoIIB FALSE 0.189 111.000 0.020 NA   NA
 10375095 10375096 BMD_4658 BMD_4659 spoIIB comC FALSE 0.149 119.000 0.011 NA   NA
 10375096 10375097 BMD_4659 BMD_4660 comC   FALSE 0.139 -3.000 0.000 NA   NA
 10375097 10375098 BMD_4660 BMD_4661     FALSE 0.006 186.000 0.000 NA   NA
 10375098 10375099 BMD_4661 BMD_4662   folC FALSE 0.006 157.000 0.000 NA   NA
 10375099 10375100 BMD_4662 BMD_4663 folC valS TRUE 0.698 97.000 0.041 0.069 N NA
 10375102 10375103 BMD_4665 BMD_4666 ysxE spoVID TRUE 0.791 78.000 0.500 NA   NA
 10375103 10375104 BMD_4666 BMD_4667 spoVID hemL FALSE 0.570 148.000 0.288 1.000   NA
 10375104 10375105 BMD_4667 BMD_4668 hemL hemB TRUE 0.978 17.000 0.126 0.001 Y NA
 10375105 10375106 BMD_4668 BMD_4669 hemB hemD TRUE 0.970 18.000 0.061 0.001 Y NA
 10375106 10375107 BMD_4669 BMD_4670 hemD hemC TRUE 0.986 0.000 0.028 0.001 Y NA
 10375107 10375108 BMD_4670 BMD_4671 hemC hemX TRUE 0.861 14.000 0.040 1.000 N NA
 10375108 10375109 BMD_4671 BMD_4672 hemX hemA TRUE 0.967 15.000 0.613 1.000 N NA
 10375111 10375112 BMD_4674 BMD_4675   lonA TRUE 0.916 -3.000 0.055 1.000   NA
 10375112 10375113 BMD_4675 BMD_4676 lonA lonB TRUE 0.828 260.000 0.435 0.001 Y NA
 10375113 10375114 BMD_4676 BMD_4677 lonB clpX TRUE 0.799 153.000 0.042 0.001 Y NA
 10375114 10375115 BMD_4677 BMD_4678 clpX tig FALSE 0.329 385.000 0.033 0.003 Y NA
 10375115 10375116 BMD_4678 BMD_4679 tig   FALSE 0.142 222.000 0.011 1.000   NA
 10375116 10375117 BMD_4679 BMD_4680   leuD FALSE 0.510 102.000 0.111 1.000   NA
 10375117 10375118 BMD_4680 BMD_4681 leuD leuC TRUE 0.979 15.000 0.103 0.000 Y NA
 10375118 10375119 BMD_4681 BMD_4682 leuC leuB TRUE 0.937 59.000 0.076 0.001 Y NA
 10375119 10375120 BMD_4682 BMD_4683 leuB leuA TRUE 0.966 20.000 0.033 0.001 Y NA
 10375120 10375121 BMD_4683 BMD_4684 leuA ilvC TRUE 0.990 -13.000 0.103 1.000 Y NA
 10375121 10375122 BMD_4684 BMD_4685 ilvC ilvH TRUE 0.942 65.000 0.130 0.001 Y NA
 10375122 10375123 BMD_4685 BMD_4686 ilvH ilvB TRUE 0.995 -3.000 0.249 0.001 Y NA
 10375123 10375124 BMD_4686 BMD_4687 ilvB   FALSE 0.000 654.000 0.000 NA   NA
 10375124 10375125 BMD_4687 BMD_4688     FALSE 0.007 126.000 0.000 NA   NA
 10375125 10375126 BMD_4688 BMD_4689   rdgB TRUE 0.742 16.000 0.085 NA   NA
 10375126 10375127 BMD_4689 BMD_4690 rdgB rph TRUE 0.954 10.000 0.262 1.000 N NA
 10375127 10375128 BMD_4690 BMD_4691 rph gerM FALSE 0.193 135.000 0.040 NA   NA
 10375128 10375129 BMD_4691 BMD_4692 gerM racE FALSE 0.202 114.000 0.026 NA   NA
 10375129 10375130 BMD_4692 BMD_4693 racE   TRUE 0.866 11.000 0.024 1.000 N NA
 10375130 10375131 BMD_4693 BMD_4694     FALSE 0.004 212.000 0.000 NA   NA
 10375131 10375132 BMD_4694 BMD_4695   pit FALSE 0.009 114.000 0.000 NA   NA
 10375132 10375133 BMD_4695 BMD_4696 pit   TRUE 0.934 16.000 0.100 NA Y NA
 10375133 10375134 BMD_4696 BMD_4697   pbpC FALSE 0.010 457.000 0.000 NA N NA
 10375136 10375137 BMD_4699 BMD_4700 ssuD ssuE TRUE 0.900 -3.000 0.036 1.000   NA
 10375137 10375138 BMD_4700 BMD_4701 ssuE ssuC FALSE 0.448 70.000 0.024 1.000   NA
 10375138 10375139 BMD_4701 BMD_4702 ssuC ssuA TRUE 0.988 11.000 0.312 0.026 Y NA
 10375139 10375140 BMD_4702 BMD_4703 ssuA ssuB TRUE 0.975 34.000 0.750 1.000 Y NA
 10375140 10375141 BMD_4703 BMD_4704 ssuB   FALSE 0.452 137.000 0.000 1.000 Y NA
 10375141 10375142 BMD_4704 BMD_4705     TRUE 0.934 1.000 0.000 1.000 Y NA
 10375142 10375143 BMD_4705 BMD_4706     FALSE 0.006 149.000 0.000 NA   NA
 10375143 10375144 BMD_4706 BMD_4707   gerE FALSE 0.005 205.000 0.000 NA   NA
 10375144 10375145 BMD_4707 BMD_4708 gerE   FALSE 0.533 174.000 0.275 1.000   NA
 10375145 10375146 BMD_4708 BMD_4709   sdhB FALSE 0.589 64.000 0.072 1.000   NA
 10375146 10375147 BMD_4709 BMD_4710 sdhB sdhA TRUE 0.991 4.000 0.231 0.001 Y NA
 10375147 10375148 BMD_4710 BMD_4711 sdhA sdhC TRUE 0.975 30.000 0.184 0.001 Y NA
 10375150 10375151 BMD_4713 BMD_4714 lysC uvrC FALSE 0.069 385.000 0.009 1.000 N NA
 10375151 10375152 BMD_4714 BMD_4715 uvrC trx FALSE 0.156 225.000 0.023 1.000   NA
 10375152 10375153 BMD_4715 BMD_4716 trx etfA FALSE 0.122 409.000 0.055 0.005   NA
 10375153 10375154 BMD_4716 BMD_4717 etfA etfB TRUE 0.979 34.000 0.373 0.005 Y NA
 10375154 10375155 BMD_4717 BMD_4718 etfB fadB TRUE 0.934 19.000 0.275 1.000 N NA
 10375155 10375156 BMD_4718 BMD_4719 fadB fadR TRUE 0.824 80.000 0.294 1.000 N NA
 10375156 10375157 BMD_4719 BMD_4720 fadR lcfA TRUE 0.778 113.000 0.406 1.000 N NA
 10375159 10375160 BMD_4722 BMD_4723   mutS FALSE 0.215 182.000 0.065 NA   NA
 10375160 10375161 BMD_4723 BMD_4724 mutS polX TRUE 0.949 20.000 0.114 1.000 Y NA
 10375161 10375162 BMD_4724 BMD_4725 polX   FALSE 0.268 199.000 0.066 1.000   NA
 10375162 10375163 BMD_4725 BMD_4726   zapA TRUE 0.813 9.000 0.091 NA   NA
 10375165 10375166 BMD_4728 BMD_4729 pheT pheS TRUE 0.993 14.000 0.574 0.000 Y NA
 10375166 10375167 BMD_4729 BMD_4730 pheS   FALSE 0.225 339.000 0.006 1.000 Y NA
 10375169 10375170 BMD_4732 BMD_4733     TRUE 0.780 78.000 0.463 NA   NA
 10375172 10375173 BMD_4735 BMD_4736   rplT FALSE 0.319 61.000 0.014 NA   NA
 10375173 10375174 BMD_4736 BMD_4737 rplT rpmI TRUE 0.986 40.000 0.928 0.009 Y NA
 10375174 10375175 BMD_4737 BMD_4738 rpmI infC TRUE 0.982 22.000 0.652 1.000 Y NA
 10375175 10375176 BMD_4738 BMD_4739 infC thrS FALSE 0.124 364.000 0.000 1.000 Y NA
 10375176 10375177 BMD_4739 BMD_4740 thrS ytxC FALSE 0.001 375.000 0.000 NA   NA
 10375177 10375178 BMD_4740 BMD_4741 ytxC dnaI FALSE 0.305 97.000 0.048 NA   NA
 10375178 10375179 BMD_4741 BMD_4742 dnaI dnaB TRUE 0.971 33.000 0.817 NA Y NA
 10375179 10375180 BMD_4742 BMD_4743 dnaB nrdR TRUE 0.661 73.000 0.109 NA N NA
 10375180 10375181 BMD_4743 BMD_4744 nrdR   FALSE 0.071 244.000 0.019 NA   NA
 10375181 10375182 BMD_4744 BMD_4745   speH FALSE 0.464 94.000 0.119 NA   NA
 10375182 10375183 BMD_4745 BMD_4746 speH gap FALSE 0.024 423.000 0.000 1.000 N NA
 10375183 10375184 BMD_4746 BMD_4747 gap coaE FALSE 0.268 219.000 0.020 1.000 N NA
 10375184 10375185 BMD_4747 BMD_4748 coaE ytaF FALSE 0.615 24.000 0.038 NA   NA
 10375185 10375186 BMD_4748 BMD_4749 ytaF mutM FALSE 0.449 61.000 0.050 NA   NA
 10375186 10375187 BMD_4749 BMD_4750 mutM polA TRUE 0.945 22.000 0.101 1.000 Y NA
 10375187 10375188 BMD_4750 BMD_4751 polA phoR FALSE 0.103 329.000 0.004 1.000 N NA
 10375188 10375189 BMD_4751 BMD_4752 phoR phoP TRUE 0.997 -7.000 0.384 0.066 Y NA
 10375189 10375190 BMD_4752 BMD_4753 phoP   FALSE 0.447 179.000 0.082 1.000 N NA
 10375190 10375191 BMD_4753 BMD_4754   mdh FALSE 0.388 131.000 0.022 1.000 N NA
 10375191 10375192 BMD_4754 BMD_4755 mdh icd TRUE 0.935 29.000 0.115 1.000 Y NA
 10375192 10375193 BMD_4755 BMD_4756 icd citZ TRUE 0.860 82.000 0.140 1.000 Y NA
 10375193 10375194 BMD_4756 BMD_4757 citZ   FALSE 0.039 361.000 0.039 NA   NA
 10375196 10375197 BMD_4759 BMD_4760   pyk TRUE 0.851 11.000 0.082 1.000   NA
 10375197 10375198 BMD_4760 BMD_4761 pyk accA FALSE 0.019 480.000 0.000 1.000 N NA
 10375198 10375199 BMD_4761 BMD_4762 accA accD TRUE 0.996 -6.000 0.234 0.001 Y NA
 10375199 10375200 BMD_4762 BMD_4763 accD   FALSE 0.269 228.000 0.032 1.000 N NA
 10375200 10375201 BMD_4763 BMD_4764     TRUE 0.892 68.000 0.514 1.000 N NA
 10375201 10375202 BMD_4764 BMD_4765   dnaE FALSE 0.468 201.000 0.127 1.000 N NA
 10375203 10375204 BMD_4766 BMD_4767     TRUE 0.975 -3.000 0.481 NA   NA
 10375207 10375208 BMD_4770 BMD_4771     FALSE 0.518 82.000 0.120 NA   NA
 10375208 10375209 BMD_4771 BMD_4772     FALSE 0.027 347.000 0.009 NA   NA
 10375209 10375210 BMD_4772 BMD_4773   ald FALSE 0.055 111.000 0.000 1.000   NA
 10375210 10375211 BMD_4773 BMD_4774 ald   FALSE 0.006 151.000 0.000 NA   NA
 10375211 10375212 BMD_4774 BMD_4775   argH FALSE 0.006 164.000 0.000 NA   NA
 10375212 10375213 BMD_4775 BMD_4776 argH argG TRUE 0.990 -3.000 0.278 1.000 Y NA
 10375215 10375216 BMD_4778 BMD_4779   ackA FALSE 0.139 232.000 0.062 NA   NA
 10375216 10375217 BMD_4779 BMD_4780 ackA   FALSE 0.564 197.000 0.217 1.000 N NA
 10375217 10375218 BMD_4780 BMD_4781   tpx FALSE 0.482 148.000 0.089 1.000 N NA
 10375218 10375219 BMD_4781 BMD_4782 tpx ytfJ FALSE 0.137 177.000 0.022 NA   NA
 10375219 10375220 BMD_4782 BMD_4783 ytfJ   TRUE 0.932 14.000 0.467 NA   NA
 10375220 10375221 BMD_4783 BMD_4784     FALSE 0.165 201.000 0.049 NA   NA
 10375221 10375222 BMD_4784 BMD_4785   sppA TRUE 0.800 11.000 0.087 NA   NA
 10375224 10375225 BMD_4787 BMD_4788   sspA FALSE 0.046 124.000 0.000 1.000   NA
 10375225 10375226 BMD_4788 BMD_4789 sspA thiI FALSE 0.077 89.000 0.000 1.000   NA
 10375226 10375227 BMD_4789 BMD_4790 thiI iscS TRUE 0.965 7.000 0.349 1.000 N NA
 10375227 10375228 BMD_4790 BMD_4791 iscS ezrA FALSE 0.361 272.000 0.201 1.000 N NA
 10375234 10375235 BMD_4797 BMD_4798 tyrS acsA FALSE 0.029 388.000 0.000 1.000 N NA
 10375236 10375237 BMD_4799 BMD_4800 acuA acuB TRUE 0.886 31.000 0.446 NA   NA
 10375237 10375238 BMD_4800 BMD_4801 acuB acuC TRUE 0.973 0.000 0.271 1.000 N NA
 10375239 10375240 BMD_4802 BMD_4803     TRUE 0.958 35.000 0.350 1.000 Y NA
 10375240 10375241 BMD_4803 BMD_4804   ccpA TRUE 0.756 54.000 0.083 1.000 N NA
 10375241 10375242 BMD_4804 BMD_4805 ccpA aroA FALSE 0.036 559.000 0.017 1.000 N NA
 10375242 10375243 BMD_4805 BMD_4806 aroA   FALSE 0.001 328.000 0.000 NA   NA
 10375243 10375244 BMD_4806 BMD_4807     FALSE 0.136 214.000 0.040 NA   NA
 10375244 10375245 BMD_4807 BMD_4808     TRUE 0.846 28.000 0.259 NA   NA
 10375247 10375248 BMD_4810 BMD_4811 murC   FALSE 0.098 186.000 0.003 NA   NA
 10375248 10375249 BMD_4811 BMD_4812   ftsK FALSE 0.001 340.000 0.000 NA   NA
 10375249 10375250 BMD_4812 BMD_4813 ftsK   FALSE 0.078 430.000 0.143 1.000   NA
 10375250 10375251 BMD_4813 BMD_4814     TRUE 0.962 3.000 0.511 NA   NA
 10375251 10375252 BMD_4814 BMD_4815     TRUE 0.799 73.000 0.500 NA   NA
 10375252 10375253 BMD_4815 BMD_4816     FALSE 0.227 154.000 0.062 NA   NA
 10375253 10375254 BMD_4816 BMD_4817     FALSE 0.536 59.000 0.084 NA   NA
 10375256 10375257 BMD_4819 BMD_4820   trmB FALSE 0.618 76.000 0.117 1.000   NA
 10375259 10375260 BMD_4822 BMD_4823   amyX FALSE 0.351 192.000 0.078 NA N NA
 10375260 10375261 BMD_4823 BMD_4824 amyX   FALSE 0.530 93.000 0.162 NA   NA
 10375261 10375262 BMD_4824 BMD_4825     FALSE 0.451 136.000 0.224 NA   NA
 10375266 10375267 BMD_4829 BMD_4830     FALSE 0.123 56.000 0.000 1.000   NA
 10375269 10375270 BMD_4832 BMD_4833     FALSE 0.029 519.000 0.097 NA   NA
 10375270 10375271 BMD_4833 BMD_4834   leuS FALSE 0.142 240.000 0.006 NA N NA
 10375271 10375272 BMD_4834 BMD_4835 leuS   FALSE 0.000 527.000 0.000 NA   NA
 10375272 10375273 BMD_4835 BMD_4836     FALSE 0.018 65.000 0.000 NA   NA
 10375273 10375274 BMD_4836 BMD_4837     FALSE 0.006 157.000 0.000 NA   NA
 10375274 10375275 BMD_4837 BMD_4838     FALSE 0.221 159.000 0.062 NA   NA
 10375275 10375276 BMD_4838 BMD_4839     TRUE 0.945 13.000 0.583 NA   NA
 10375277 10375278 BMD_4840 BMD_4841     TRUE 0.889 -3.000 0.025 1.000   NA
 10375279 10375280 BMD_4842 BMD_4843     TRUE 0.855 32.000 0.333 NA   NA
 10375281 10375282 BMD_4844 BMD_4845     FALSE 0.179 192.000 0.008 1.000   NA
 10375282 10375283 BMD_4845 BMD_4846     TRUE 0.915 19.000 0.318 1.000   NA
 10375286 10375287 BMD_4849 BMD_4850     TRUE 0.710 55.000 0.200 NA   NA
 10375288 10375289 BMD_4851 BMD_4852 ytlA ytlC TRUE 0.995 -7.000 0.528 1.000 Y NA
 10375289 10375290 BMD_4852 BMD_4853 ytlC ytlD TRUE 0.954 80.000 0.876 1.000 Y NA
 10375291 10375292 BMD_4854 BMD_4855 ytkD   FALSE 0.606 105.000 0.292 NA   NA
 10375292 10375293 BMD_4855 BMD_4856     TRUE 0.696 75.000 0.273 NA   NA
 10375293 10375294 BMD_4856 BMD_4857   dps TRUE 0.675 80.000 0.259 NA   NA
 10375294 10375295 BMD_4857 BMD_4858 dps luxS FALSE 0.170 164.000 0.000 1.000 N NA
 10375298 10375299 BMD_4861 BMD_4862     FALSE 0.609 84.000 0.200 NA   NA
 10375301 10375302 BMD_4864 BMD_4865 ythA ythB TRUE 0.992 16.000 0.880 0.030 Y NA
 10375303 10375304 BMD_4866 BMD_4867 fldA   FALSE 0.049 16.000 0.000 NA   NA
 10375304 10375305 BMD_4867 BMD_4868     FALSE 0.016 70.000 0.000 NA   NA
 10375306 10375307 BMD_4869 BMD_4870     TRUE 0.629 67.000 0.167 NA   NA
 10375308 10375309 BMD_4871 BMD_4872 nrdF nrdE TRUE 0.976 17.000 0.101 0.000 Y NA
 10375309 10375310 BMD_4872 BMD_4873 nrdE menC FALSE 0.013 599.000 0.000 1.000 N NA
 10375310 10375311 BMD_4873 BMD_4874 menC menE TRUE 0.898 4.000 0.029 1.000 N NA
 10375311 10375312 BMD_4874 BMD_4875 menE menB TRUE 0.884 83.000 0.193 0.001 N NA
 10375312 10375313 BMD_4875 BMD_4876 menB   TRUE 0.906 17.000 0.280 1.000   NA
 10375313 10375314 BMD_4876 BMD_4877   menD TRUE 0.956 4.000 0.355 1.000   NA
 10375314 10375315 BMD_4877 BMD_4878 menD menF TRUE 0.992 -13.000 0.142 1.000 Y NA
 10375316 10375317 BMD_4879 BMD_4880     FALSE 0.216 95.000 0.015 NA   NA
 10375318 10375319 BMD_4881 BMD_4882 glgP glgA TRUE 0.976 14.000 0.314 1.000 Y NA
 10375319 10375320 BMD_4882 BMD_4883 glgA glgD TRUE 0.994 -3.000 0.630 1.000 Y NA
 10375320 10375321 BMD_4883 BMD_4884 glgD glgC TRUE 0.983 23.000 0.210 0.000 Y NA
 10375321 10375322 BMD_4884 BMD_4885 glgC glgB TRUE 0.998 -100.000 0.296 0.001 Y NA
 10375322 10375323 BMD_4885 BMD_4886 glgB   FALSE 0.002 294.000 0.000 NA   NA
 10375323 10375324 BMD_4886 BMD_4887     FALSE 0.046 21.000 0.000 NA   NA
 10375324 10375325 BMD_4887 BMD_4888     FALSE 0.084 4.000 0.000 NA   NA
 10375325 10375326 BMD_4888 BMD_4889     FALSE 0.084 4.000 0.000 NA   NA
 10375326 10375327 BMD_4889 BMD_4890     FALSE 0.074 6.000 0.000 NA   NA
 10375327 10375328 BMD_4890 BMD_4891     FALSE 0.063 12.000 0.000 NA   NA
 10375328 10375329 BMD_4891 BMD_4892     FALSE 0.066 11.000 0.000 NA   NA
 10375329 10375330 BMD_4892 BMD_4893     FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10375330 10375331 BMD_4893 BMD_4894     FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10375331 10375332 BMD_4894 BMD_4895     FALSE 0.041 26.000 0.000 NA   NA
 10375332 10375333 BMD_4895 BMD_4896     FALSE 0.038 28.000 0.000 NA   NA
 10375333 10375334 BMD_4896 BMD_4897     FALSE 0.034 31.000 0.000 NA   NA
 10375334 10375335 BMD_4897 BMD_4898     FALSE 0.074 6.000 0.000 NA   NA
 10375335 10375336 BMD_4898 BMD_4899     FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10375336 10375337 BMD_4899 BMD_4900     FALSE 0.068 10.000 0.000 NA   NA
 10375337 10375338 BMD_4900 BMD_4901     FALSE 0.052 15.000 0.000 NA   NA
 10375338 10375339 BMD_4901 BMD_4902     FALSE 0.044 24.000 0.000 NA   NA
 10375339 10375340 BMD_4902 BMD_4903     FALSE 0.056 14.000 0.000 NA   NA
 10375340 10375341 BMD_4903 BMD_4904     FALSE 0.069 9.000 0.000 NA   NA
 10375341 10375342 BMD_4904 BMD_4905     FALSE 0.039 27.000 0.000 NA   NA
 10375342 10375343 BMD_4905 BMD_4906     FALSE 0.069 9.000 0.000 NA   NA
 10375343 10375344 BMD_4906 BMD_4907     FALSE 0.009 111.000 0.000 NA   NA
 10375344 10375345 BMD_4907 BMD_4908     FALSE 0.003 233.000 0.000 NA   NA
 10375346 10375347 BMD_4909 BMD_4910     FALSE 0.003 240.000 0.000 NA   NA
 10375347 10375348 BMD_4910 BMD_4911   sapB FALSE 0.049 120.000 0.000 1.000   NA
 10375349 10375350 BMD_4912 BMD_4913 sirC sirB TRUE 0.986 -19.000 0.333 1.000   NA
 10375350 10375351 BMD_4913 BMD_4914 sirB sirA TRUE 0.944 14.000 0.438 1.000   NA
 10375351 10375352 BMD_4914 BMD_4915 sirA cysC FALSE 0.578 92.000 0.049 1.000 N NA
 10375352 10375353 BMD_4915 BMD_4916 cysC sat TRUE 0.981 13.000 0.101 0.001 Y NA
 10375353 10375354 BMD_4916 BMD_4917 sat cysP TRUE 0.842 53.000 0.021 1.000 Y NA
 10375354 10375355 BMD_4917 BMD_4918 cysP cysH TRUE 0.801 20.000 0.011 1.000 N NA
 10375356 10375357 BMD_4919 BMD_4920     FALSE 0.011 98.000 0.000 NA   NA
 10375357 10375358 BMD_4920 BMD_4921     FALSE 0.017 68.000 0.000 NA   NA
 10375359 10375360 BMD_4922 BMD_4923   pgi FALSE 0.029 379.000 0.027 NA   NA
 10375361 10375362 BMD_4924 BMD_4925 mrpA mrpB TRUE 0.980 -3.000 0.122 NA Y NA
 10375362 10375363 BMD_4925 BMD_4926 mrpB mrpC TRUE 0.986 0.000 0.317 NA Y NA
 10375363 10375364 BMD_4926 BMD_4927 mrpC mrpD TRUE 0.997 -10.000 0.289 0.001 Y NA
 10375364 10375365 BMD_4927 BMD_4928 mrpD mrpE TRUE 0.974 7.000 0.184 1.000 Y NA
 10375365 10375366 BMD_4928 BMD_4929 mrpE mrpF TRUE 0.964 1.000 0.000 0.052 Y NA
 10375366 10375367 BMD_4929 BMD_4930 mrpF mrpG TRUE 0.994 -16.000 0.220 1.000 Y NA
 10375370 10375371 BMD_4933 BMD_4934   yugH FALSE 0.319 208.000 0.033 1.000 N NA
 10375371 10375372 BMD_4934 BMD_4935 yugH   TRUE 0.989 0.000 0.894 1.000 N NA
 10375373 10375374 BMD_4936 BMD_4937   patB FALSE 0.037 167.000 0.000 1.000   NA
 10375375 10375376 BMD_4938 BMD_4939 sodC   FALSE 0.489 104.000 0.163 NA   NA
 10375378 10375379 BMD_4941 BMD_4942 kapD   FALSE 0.001 349.000 0.000 NA   NA
 10375380 10375381 BMD_4943 BMD_4944     FALSE 0.006 174.000 0.000 NA   NA
 10375381 10375382 BMD_4944 BMD_4945     FALSE 0.008 117.000 0.000 NA   NA
 10375383 10375384 BMD_4946 BMD_4947   pepA FALSE 0.084 268.000 0.042 NA   NA
 10375386 10375387 BMD_4949 BMD_4950     FALSE 0.309 82.000 0.030 NA   NA
 10375387 10375388 BMD_4950 BMD_4951   yumB FALSE 0.335 123.000 0.104 NA   NA
 10375390 10375391 BMD_4953 BMD_4954     FALSE 0.006 150.000 0.000 NA   NA
 10375391 10375392 BMD_4954 BMD_4955   dapF FALSE 0.288 76.000 0.020 NA   NA
 10375392 10375393 BMD_4955 BMD_4956 dapF   FALSE 0.033 303.000 0.002 NA   NA
 10375397 10375398 BMD_4960 BMD_4961 thrB thrC TRUE 0.991 -6.000 0.221 1.000 Y NA
 10375398 10375399 BMD_4961 BMD_4962 thrC hom TRUE 0.979 -3.000 0.052 1.000 Y NA
 10375399 10375400 BMD_4962 BMD_4963 hom gyaR FALSE 0.358 241.000 0.129 1.000 N NA
 10375400 10375401 BMD_4963 BMD_4964 gyaR cotS FALSE 0.616 118.000 0.385 NA   NA
 10375403 10375404 BMD_4966 BMD_4967 yutF   TRUE 0.666 77.000 0.237 NA   NA
 10375410 10375411 BMD_4973 BMD_4974 yunB   FALSE 0.605 90.000 0.221 NA   NA
 10375411 10375412 BMD_4974 BMD_4975     FALSE 0.007 132.000 0.000 NA   NA
 10375412 10375413 BMD_4975 BMD_4976   sufB FALSE 0.165 103.000 0.004 NA   NA
 10375413 10375414 BMD_4976 BMD_4977 sufB iscU TRUE 0.923 46.000 0.152 0.001 N NA
 10375414 10375415 BMD_4977 BMD_4978 iscU sufS TRUE 0.987 -10.000 0.292 1.000 N NA
 10375415 10375416 BMD_4978 BMD_4979 sufS sufD TRUE 0.985 0.000 0.606 1.000 N NA
 10375416 10375417 BMD_4979 BMD_4980 sufD sufC TRUE 0.954 18.000 0.139 1.000 Y NA
 10375417 10375418 BMD_4980 BMD_4981 sufC   FALSE 0.020 240.000 0.000 1.000   NA
 10375418 10375419 BMD_4981 BMD_4982   metQ FALSE 0.304 105.000 0.059 NA   NA
 10375419 10375420 BMD_4982 BMD_4983 metQ metP TRUE 0.941 18.000 0.138 NA Y NA
 10375420 10375421 BMD_4983 BMD_4984 metP metN TRUE 0.996 -7.000 0.642 1.000 Y NA
 10375421 10375422 BMD_4984 BMD_4985 metN   FALSE 0.005 420.000 0.000 1.000   NA
 10375422 10375423 BMD_4985 BMD_4986   yusF TRUE 0.941 15.000 0.443 1.000   NA
 10375423 10375424 BMD_4986 BMD_4987 yusF   FALSE 0.399 182.000 0.205 NA   NA
 10375424 10375425 BMD_4987 BMD_4988   gcvH TRUE 0.673 80.000 0.255 NA   NA
 10375425 10375426 BMD_4988 BMD_4989 gcvH   FALSE 0.584 136.000 0.170 1.000 N NA
 10375426 10375427 BMD_4989 BMD_4990   fadE TRUE 0.671 117.000 0.060 0.030 N NA
 10375427 10375428 BMD_4990 BMD_4991 fadE fadA TRUE 0.948 24.000 0.124 1.000 Y NA
 10375428 10375429 BMD_4991 BMD_4992 fadA fadN TRUE 0.985 13.000 0.588 1.000 Y NA
 10375431 10375432 BMD_4994 BMD_4995 fadM   FALSE 0.006 178.000 0.000 NA   NA
 10375432 10375433 BMD_4995 BMD_4996     TRUE 0.965 -7.000 0.222 NA   NA
 10375433 10375434 BMD_4996 BMD_4997   yusV TRUE 0.978 -10.000 0.333 NA   NA
 10375434 10375435 BMD_4997 BMD_4998 yusV yfhA TRUE 0.962 27.000 0.273 1.000 Y NA
 10375435 10375436 BMD_4998 BMD_4999 yfhA yfiZ TRUE 0.994 -3.000 0.273 0.025 Y NA
 10375437 10375438 BMD_5000 BMD_5001 yfiY   FALSE 0.009 112.000 0.000 NA   NA
 10375442 10375443 BMD_5005 BMD_5006   yceI FALSE 0.194 130.000 0.000 1.000 N NA
 10375444 10375445 BMD_5007 BMD_5008     FALSE 0.041 137.000 0.000 1.000   NA
 10375445 10375446 BMD_5008 BMD_5009     FALSE 0.039 158.000 0.000 1.000   NA
 10375446 10375447 BMD_5009 BMD_5010     TRUE 0.759 20.000 0.000 0.006   NA
 10375447 10375448 BMD_5010 BMD_5011     FALSE 0.040 147.000 0.000 1.000   NA
 10375448 10375449 BMD_5011 BMD_5012     TRUE 0.975 -22.000 0.000 1.000 Y NA
 10375449 10375450 BMD_5012 BMD_5013   ykoN FALSE 0.173 159.000 0.000 1.000 N NA
 10375451 10375452 BMD_5014 BMD_5015   ydgJ FALSE 0.007 375.000 0.000 1.000   NA
 10375452 10375453 BMD_5015 BMD_5016 ydgJ ydgI TRUE 0.964 28.000 0.882 1.000 N NA
 10375454 10375455 BMD_5017 BMD_5018 moaD moaE TRUE 0.995 3.000 0.501 0.002 Y NA
 10375455 10375456 BMD_5018 BMD_5019 moaE mobB TRUE 0.989 -3.000 0.040 0.002 Y NA
 10375456 10375457 BMD_5019 BMD_5020 mobB moeA TRUE 0.994 -12.000 0.075 0.002 Y NA
 10375457 10375458 BMD_5020 BMD_5021 moeA moeB TRUE 0.986 18.000 0.900 1.000 Y NA
 10375460 10375461 BMD_5023 BMD_5024 moaA fdhD TRUE 0.908 47.000 0.400 1.000 N NA
 10375461 10375462 BMD_5024 BMD_5025 fdhD   TRUE 0.931 16.000 0.545 NA   NA
 10375463 10375464 BMD_5026 BMD_5027 fdhA   TRUE 0.964 12.000 0.929 NA   NA
 10375464 10375465 BMD_5027 BMD_5028   modA FALSE 0.007 126.000 0.000 NA   NA
 10375465 10375466 BMD_5028 BMD_5029 modA modB TRUE 0.993 8.000 0.430 0.000 Y NA
 10375467 10375468 BMD_5030 BMD_5031 smpB rnr TRUE 0.715 152.000 0.143 0.011 N NA
 10375468 10375469 BMD_5031 BMD_5032 rnr   TRUE 0.659 39.000 0.060 1.000   NA
 10375469 10375470 BMD_5032 BMD_5033   secG FALSE 0.116 268.000 0.032 1.000   NA
 10375470 10375471 BMD_5033 BMD_5034 secG eno FALSE 0.313 210.000 0.032 1.000 N NA
 10375471 10375472 BMD_5034 BMD_5035 eno gpmI TRUE 0.949 25.000 0.136 1.000 Y NA
 10375472 10375473 BMD_5035 BMD_5036 gpmI tpiA TRUE 0.981 0.000 0.138 1.000 Y NA
 10375473 10375474 BMD_5036 BMD_5037 tpiA pgk TRUE 0.715 176.000 0.141 1.000 Y NA
 10375474 10375475 BMD_5037 BMD_5038 pgk gap FALSE 0.518 310.000 0.063 0.003 Y NA
 10375475 10375476 BMD_5038 BMD_5039 gap cggR TRUE 0.901 46.000 0.348 1.000 N NA
 10375476 10375477 BMD_5039 BMD_5040 cggR   FALSE 0.152 134.000 0.022 NA   NA
 10375477 10375478 BMD_5040 BMD_5041   sigL TRUE 0.644 13.000 0.025 NA   NA
 10375478 10375479 BMD_5041 BMD_5042 sigL   FALSE 0.002 287.000 0.000 NA   NA
 10375479 10375480 BMD_5042 BMD_5043     FALSE 0.005 202.000 0.000 NA   NA
 10375482 10375483 BMD_5045 BMD_5046 crh   TRUE 0.706 29.000 0.101 NA   NA
 10375483 10375484 BMD_5046 BMD_5047     TRUE 0.879 34.000 0.470 NA   NA
 10375484 10375485 BMD_5047 BMD_5048     TRUE 0.951 -3.000 0.214 NA   NA
 10375485 10375486 BMD_5048 BMD_5049   yvcI TRUE 0.790 42.000 0.263 NA   NA
 10375486 10375487 BMD_5049 BMD_5050 yvcI trxB FALSE 0.057 304.000 0.000 1.000 N NA
 10375487 10375488 BMD_5050 BMD_5051 trxB   FALSE 0.558 112.000 0.183 1.000   NA
 10375488 10375489 BMD_5051 BMD_5052   hisI FALSE 0.185 182.000 0.007 1.000   NA
 10375489 10375490 BMD_5052 BMD_5053 hisI hisF TRUE 0.996 -3.000 0.430 0.003 Y NA
 10375490 10375491 BMD_5053 BMD_5054 hisF hisA TRUE 0.995 0.000 0.433 0.003 Y NA
 10375491 10375492 BMD_5054 BMD_5055 hisA hisH TRUE 0.995 -13.000 0.124 0.003 Y NA
 10375492 10375493 BMD_5055 BMD_5056 hisH hisB TRUE 0.989 1.000 0.125 0.003 Y NA
 10375493 10375494 BMD_5056 BMD_5057 hisB hisD TRUE 0.918 76.000 0.096 0.003 Y NA
 10375494 10375495 BMD_5057 BMD_5058 hisD hisG TRUE 0.984 16.000 0.254 0.003 Y NA
 10375495 10375496 BMD_5058 BMD_5059 hisG hisZ TRUE 0.993 0.000 0.239 0.003 Y NA
 10375496 10375497 BMD_5059 BMD_5060 hisZ   FALSE 0.195 184.000 0.012 1.000   NA
 10375497 10375498 BMD_5060 BMD_5061   ppaX TRUE 0.978 -3.000 0.417 1.000   NA
 10375498 10375499 BMD_5061 BMD_5062 ppaX lgt TRUE 0.728 61.000 0.169 1.000   NA
 10375499 10375500 BMD_5062 BMD_5063 lgt hprK TRUE 0.957 17.000 0.494 1.000 N NA
 10375500 10375501 BMD_5063 BMD_5064 hprK   FALSE 0.401 189.000 0.215 NA   NA
 10375501 10375502 BMD_5064 BMD_5065     TRUE 0.913 3.000 0.190 NA   NA
 10375502 10375503 BMD_5065 BMD_5066     TRUE 0.803 42.000 0.286 NA   NA
 10375503 10375504 BMD_5066 BMD_5067     TRUE 0.746 39.000 0.188 NA   NA
 10375504 10375505 BMD_5067 BMD_5068   uvrA FALSE 0.203 88.000 0.005 NA   NA
 10375505 10375506 BMD_5068 BMD_5069 uvrA uvrB TRUE 0.987 7.000 0.154 0.001 Y NA
 10375508 10375509 BMD_5071 BMD_5072   csbA FALSE 0.002 314.000 0.000 NA   NA
 10375509 10375510 BMD_5072 BMD_5073 csbA minJ TRUE 0.712 27.000 0.094 NA   NA
 10375510 10375511 BMD_5073 BMD_5074 minJ ctpB TRUE 0.685 163.000 0.224 0.005   NA
 10375511 10375512 BMD_5074 BMD_5075 ctpB   FALSE 0.571 174.000 0.040 0.020 N NA
 10375512 10375513 BMD_5075 BMD_5076   ftsX FALSE 0.539 204.000 0.026 1.000 Y NA
 10375513 10375514 BMD_5076 BMD_5077 ftsX ftsE TRUE 0.995 -10.000 0.431 1.000 Y NA
 10375516 10375517 BMD_5079 BMD_5080 cccB tatCD FALSE 0.106 125.000 0.000 NA N NA
 10375517 10375518 BMD_5080 BMD_5081 tatCD tatAD TRUE 0.944 60.000 0.571 NA Y NA
 10375518 10375519 BMD_5081 BMD_5082 tatAD phoD TRUE 0.946 27.000 0.444 1.000 N NA
 10375519 10375520 BMD_5082 BMD_5083 phoD prfB FALSE 0.071 278.000 0.000 1.000 N NA
 10375520 10375521 BMD_5083 BMD_5084 prfB secA FALSE 0.326 218.000 0.052 1.000 N NA
 10375523 10375524 BMD_5086 BMD_5087   fliT FALSE 0.006 190.000 0.000 NA   NA
 10375524 10375525 BMD_5087 BMD_5088 fliT fliS TRUE 0.907 3.000 0.174 NA   NA
 10375525 10375526 BMD_5088 BMD_5089 fliS fliD TRUE 0.988 17.000 0.370 0.001 Y NA
 10375526 10375527 BMD_5089 BMD_5090 fliD   FALSE 0.005 203.000 0.000 NA   NA
 10375530 10375531 BMD_5093 BMD_5094 gbsA gbsB TRUE 0.974 22.000 0.364 1.000 Y NA
 10375532 10375533 BMD_5095 BMD_5096 gbsR csrA FALSE 0.055 229.000 0.000 NA N NA
 10375533 10375534 BMD_5096 BMD_5097 csrA fliW TRUE 0.915 25.000 0.489 NA   NA
 10375534 10375535 BMD_5097 BMD_5098 fliW flgL FALSE 0.254 82.000 0.014 NA   NA
 10375535 10375536 BMD_5098 BMD_5099 flgL flgK TRUE 0.978 3.000 0.257 0.001   NA
 10375536 10375537 BMD_5099 BMD_5100 flgK   TRUE 0.953 19.000 0.233 0.001   NA
 10375537 10375538 BMD_5100 BMD_5101   flgM TRUE 0.970 16.000 0.421 0.001   NA
 10375538 10375539 BMD_5101 BMD_5102 flgM   FALSE 0.412 160.000 0.204 NA   NA
 10375539 10375540 BMD_5102 BMD_5103   comFC FALSE 0.427 62.000 0.045 NA   NA
 10375540 10375541 BMD_5103 BMD_5104 comFC comFA FALSE 0.378 192.000 0.130 1.000   NA
 10375541 10375542 BMD_5104 BMD_5105 comFA degV FALSE 0.566 98.000 0.214 NA   NA
 10375542 10375543 BMD_5105 BMD_5106 degV   FALSE 0.182 107.000 0.014 NA   NA
 10375543 10375544 BMD_5106 BMD_5107   fliS FALSE 0.006 144.000 0.000 NA   NA
 10375544 10375545 BMD_5107 BMD_5108 fliS degU FALSE 0.024 423.000 0.000 1.000 N NA
 10375545 10375546 BMD_5108 BMD_5109 degU degS TRUE 0.964 78.000 0.519 0.015 Y NA
 10375547 10375548 BMD_5110 BMD_5111     FALSE 0.101 196.000 0.009 NA   NA
 10375550 10375551 BMD_5113 BMD_5114     TRUE 0.919 21.000 0.464 NA   NA
 10375552 10375553 BMD_5115 BMD_5116 tagA   TRUE 0.801 67.000 0.019 1.000 Y NA
 10375553 10375554 BMD_5116 BMD_5117   galU FALSE 0.278 243.000 0.000 1.000 Y NA
 10375555 10375556 BMD_5118 BMD_5119     FALSE 0.589 -7.000 0.000 1.000   NA
 10375556 10375557 BMD_5119 BMD_5120   lytF FALSE 0.062 298.000 0.000 1.000 N NA
 10375560 10375561 BMD_5123 BMD_5124 fabZ flhP FALSE 0.522 84.000 0.004 1.000 N NA
 10375561 10375562 BMD_5124 BMD_5125 flhP flhO TRUE 0.982 24.000 0.248 0.002 Y NA
 10375562 10375563 BMD_5125 BMD_5126 flhO mbl TRUE 0.656 115.000 0.186 1.000 N NA
 10375563 10375564 BMD_5126 BMD_5127 mbl spoIIID FALSE 0.463 187.000 0.284 NA   NA
 10375564 10375565 BMD_5127 BMD_5128 spoIIID spoIIQ FALSE 0.002 276.000 0.000 NA   NA
 10375565 10375566 BMD_5128 BMD_5129 spoIIQ spoIID FALSE 0.526 163.000 0.135 1.000 N NA
 10375566 10375567 BMD_5129 BMD_5130 spoIID murA FALSE 0.619 163.000 0.243 1.000 N NA
 10375567 10375568 BMD_5130 BMD_5131 murA   TRUE 0.859 32.000 0.346 NA   NA
 10375568 10375569 BMD_5131 BMD_5132     FALSE 0.434 161.000 0.228 NA   NA
 10375569 10375570 BMD_5132 BMD_5133   atpC FALSE 0.075 275.000 0.039 NA   NA
 10375570 10375571 BMD_5133 BMD_5134 atpC atpD TRUE 0.991 27.000 0.837 0.002 Y NA
 10375571 10375572 BMD_5134 BMD_5135 atpD atpG TRUE 0.986 37.000 0.724 0.002 Y NA
 10375572 10375573 BMD_5135 BMD_5136 atpG atpA TRUE 0.963 106.000 0.846 0.002 Y NA
 10375573 10375574 BMD_5136 BMD_5137 atpA atpH TRUE 0.993 16.000 0.864 0.002 Y NA
 10375574 10375575 BMD_5137 BMD_5138 atpH atpF TRUE 0.995 -3.000 0.222 0.002 Y NA
 10375575 10375576 BMD_5138 BMD_5139 atpF atpE TRUE 0.855 103.000 0.402 0.002   NA
 10375576 10375577 BMD_5139 BMD_5140 atpE atpB TRUE 0.808 91.000 0.189 0.002   NA
 10375577 10375578 BMD_5140 BMD_5141 atpB atpI TRUE 0.961 19.000 0.330 0.002   NA
 10375578 10375579 BMD_5141 BMD_5142 atpI   TRUE 0.890 7.000 0.187 NA   NA
 10375579 10375580 BMD_5142 BMD_5143   vpr FALSE 0.002 298.000 0.000 NA   NA
 10375580 10375581 BMD_5143 BMD_5144 vpr mnaA FALSE 0.100 68.000 0.000 1.000   NA
 10375581 10375582 BMD_5144 BMD_5145 mnaA upp FALSE 0.618 23.000 0.000 1.000 N NA
 10375582 10375583 BMD_5145 BMD_5146 upp glyA FALSE 0.337 214.000 0.051 1.000 N NA
 10375583 10375584 BMD_5146 BMD_5147 glyA   FALSE 0.412 118.000 0.145 NA   NA
 10375584 10375585 BMD_5147 BMD_5148   rpiB TRUE 0.869 15.000 0.218 NA   NA
 10375585 10375586 BMD_5148 BMD_5149 rpiB   TRUE 0.659 81.000 0.072 1.000 N NA
 10375586 10375587 BMD_5149 BMD_5150     FALSE 0.282 230.000 0.196 NA   NA
 10375587 10375588 BMD_5150 BMD_5151     TRUE 0.684 68.000 0.230 NA   NA
 10375588 10375589 BMD_5151 BMD_5152     FALSE 0.426 193.000 0.133 NA N NA
 10375589 10375590 BMD_5152 BMD_5153   spoIIR FALSE 0.555 86.000 0.158 NA   NA
 10375590 10375591 BMD_5153 BMD_5154 spoIIR hemK FALSE 0.440 122.000 0.178 NA   NA
 10375591 10375592 BMD_5154 BMD_5155 hemK prfA TRUE 0.976 0.000 0.084 1.000 Y NA
 10375592 10375593 BMD_5155 BMD_5156 prfA tdk FALSE 0.306 230.000 0.062 1.000 N NA
 10375593 10375594 BMD_5156 BMD_5157 tdk rpmE FALSE 0.387 193.000 0.052 1.000 N NA
 10375594 10375595 BMD_5157 BMD_5158 rpmE rho FALSE 0.516 155.000 0.115 1.000 N NA
 10375595 10375596 BMD_5158 BMD_5159 rho murAB FALSE 0.041 526.000 0.022 1.000 N NA
 10375596 10375597 BMD_5159 BMD_5160 murAB tal FALSE 0.344 208.000 0.049 1.000 N NA
 10375597 10375598 BMD_5160 BMD_5161 tal fba TRUE 0.660 138.000 0.061 1.000 Y NA
 10375598 10375599 BMD_5161 BMD_5162 fba spo0F FALSE 0.116 225.000 0.000 1.000 N NA
 10375601 10375602 BMD_5164 BMD_5165 pyrG rpoE FALSE 0.131 321.000 0.029 1.000 N NA
 10375602 10375603 BMD_5165 BMD_5166 rpoE   FALSE 0.102 353.000 0.023 1.000 N NA
 10375603 10375604 BMD_5166 BMD_5167     TRUE 0.969 -3.000 0.146 1.000 N NA
 10375604 10375605 BMD_5167 BMD_5168   acdA TRUE 0.943 28.000 0.432 1.000 N NA
 10375605 10375606 BMD_5168 BMD_5169 acdA mmgC TRUE 0.988 12.000 0.270 0.002 Y NA
 10375606 10375607 BMD_5169 BMD_5170 mmgC mmgB TRUE 0.960 13.000 0.110 1.000 Y NA
 10375607 10375608 BMD_5170 BMD_5171 mmgB mmgA TRUE 0.952 16.000 0.118 1.000 Y NA
 10375608 10375609 BMD_5171 BMD_5172 mmgA fadF TRUE 0.703 105.000 0.205 1.000 N NA
 10375610 10375611 BMD_5173 BMD_5174 clsB uvdE TRUE 0.957 25.000 0.545 1.000 N NA
 10375612 10375613 BMD_5175 BMD_5176 argS   TRUE 0.896 -3.000 0.079 NA   NA
 10375613 10375614 BMD_5176 BMD_5177   speB FALSE 0.118 179.000 0.013 NA   NA
 10375614 10375615 BMD_5177 BMD_5178 speB speE TRUE 0.869 76.000 0.141 1.000 Y NA
 10375617 10375618 BMD_5180 BMD_5181     TRUE 0.647 20.000 0.044 NA   NA
 10375620 10375621 BMD_5183 BMD_5184   ywfO TRUE 0.698 24.000 0.071 NA   NA
 10375621 10375622 BMD_5184 BMD_5185 ywfO   FALSE 0.158 194.000 0.039 NA   NA
 10375623 10375624 BMD_5186 BMD_5187 rsfA   FALSE 0.270 129.000 0.075 NA   NA
 10375626 10375627 BMD_5189 BMD_5190   cwlJ FALSE 0.137 180.000 0.023 NA   NA
 10375627 10375628 BMD_5190 BMD_5191 cwlJ gerQ TRUE 0.930 27.000 0.722 NA   NA
 10375629 10375630 BMD_5192 BMD_5193     TRUE 0.655 16.000 0.042 NA   NA
 10375630 10375631 BMD_5193 BMD_5194   ung FALSE 0.274 104.000 0.044 NA   NA
 10375632 10375633 BMD_5195 BMD_5196   zwf FALSE 0.002 306.000 0.000 NA   NA
 10375635 10375636 BMD_5198 BMD_5199   ald FALSE 0.503 253.000 0.360 1.000 N NA
 10375639 10375640 BMD_5202 BMD_5203   pgmB FALSE 0.382 89.000 0.000 0.061   NA
 10375641 10375642 BMD_5204 BMD_5205     TRUE 0.960 5.000 0.610 NA   NA
 10375642 10375643 BMD_5205 BMD_5206     FALSE 0.002 292.000 0.000 NA   NA
 10375643 10375644 BMD_5206 BMD_5207     TRUE 0.936 -3.000 0.000 NA Y NA
 10375644 10375645 BMD_5207 BMD_5208     FALSE 0.089 3.000 0.000 NA   NA
 10375645 10375646 BMD_5208 BMD_5209     FALSE 0.110 0.000 0.000 NA   NA
 10375646 10375647 BMD_5209 BMD_5210     TRUE 0.989 -7.000 0.333 0.068   NA
 10375647 10375648 BMD_5210 BMD_5211   mviN FALSE 0.183 31.000 0.000 1.000   NA
 10375648 10375649 BMD_5211 BMD_5212 mviN   FALSE 0.041 26.000 0.000 NA   NA
 10375650 10375651 BMD_5213 BMD_5214   cydC FALSE 0.258 227.000 0.000 0.051 N NA
 10375651 10375652 BMD_5214 BMD_5215 cydC cydD TRUE 0.994 -3.000 0.168 0.002 Y NA
 10375652 10375653 BMD_5215 BMD_5216 cydD cydB TRUE 0.961 15.000 0.151 1.000 Y NA
 10375653 10375654 BMD_5216 BMD_5217 cydB cydA TRUE 0.986 -13.000 0.000 0.029 Y NA
 10375654 10375655 BMD_5217 BMD_5218 cydA   FALSE 0.002 302.000 0.000 NA   NA
 10375655 10375656 BMD_5218 BMD_5219     TRUE 0.950 15.000 0.800 NA   NA
 10375656 10375657 BMD_5219 BMD_5220     FALSE 0.006 145.000 0.000 NA   NA
 10375657 10375658 BMD_5220 BMD_5221     FALSE 0.011 96.000 0.000 NA   NA
 10375660 10375661 BMD_5223 BMD_5224 proA proB TRUE 0.995 -3.000 0.281 0.002 Y NA
 10375662 10375663 BMD_5225 BMD_5226 cstA katA FALSE 0.072 276.000 0.000 1.000 N NA
 10375664 10375665 BMD_5227 BMD_5228     TRUE 0.995 -22.000 0.261 1.000 Y NA
 10375667 10375668 BMD_5230 BMD_5231     FALSE 0.014 280.000 0.000 1.000   NA
 10375668 10375669 BMD_5231 BMD_5232     FALSE 0.036 186.000 0.000 1.000   NA
 10375670 10375671 BMD_5233 BMD_5234     TRUE 0.992 -3.000 0.385 1.000 Y NA
 10375673 10375674 BMD_5236 BMD_5237     FALSE 0.001 410.000 0.000 NA   NA
 10375675 10375676 BMD_5238 BMD_5239     FALSE 0.287 84.000 0.025 NA   NA
 10375676 10375677 BMD_5239 BMD_5240   htrA TRUE 0.784 74.000 0.452 NA   NA
 10375677 10375678 BMD_5240 BMD_5241 htrA   FALSE 0.595 58.000 0.060 1.000   NA
 10375678 10375679 BMD_5241 BMD_5242     TRUE 0.830 19.000 0.176 NA   NA
 10375679 10375680 BMD_5242 BMD_5243   walH TRUE 0.991 -13.000 0.890 NA   NA
 10375680 10375681 BMD_5243 BMD_5244 walH walK TRUE 0.985 -9.000 0.575 NA   NA
 10375681 10375682 BMD_5244 BMD_5245 walK walR TRUE 0.993 7.000 0.597 0.015 Y NA
 10375682 10375683 BMD_5245 BMD_5246 walR   FALSE 0.003 260.000 0.000 NA   NA
 10375683 10375684 BMD_5246 BMD_5247     FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10375684 10375685 BMD_5247 BMD_5248     FALSE 0.029 36.000 0.000 NA   NA
 10375685 10375686 BMD_5248 BMD_5249     FALSE 0.049 16.000 0.000 NA   NA
 10375686 10375687 BMD_5249 BMD_5250   purA FALSE 0.006 169.000 0.000 NA   NA
 10375687 10375688 BMD_5250 BMD_5251 purA dnaC FALSE 0.331 188.000 0.018 1.000 N NA
 10375688 10375689 BMD_5251 BMD_5252 dnaC rplI FALSE 0.513 116.000 0.064 1.000 N NA
 10375689 10375690 BMD_5252 BMD_5253 rplI   TRUE 0.935 -3.000 0.020 1.000 N NA
 10375690 10375691 BMD_5253 BMD_5254     TRUE 0.677 37.000 0.116 NA   NA
 10375691 10375692 BMD_5254 BMD_5255   rpsR FALSE 0.242 139.000 0.069 NA   NA
 10375692 10375693 BMD_5255 BMD_5256 rpsR ssbA FALSE 0.599 67.000 0.015 1.000 N NA
 10375693 10375694 BMD_5256 BMD_5257 ssbA rpsF TRUE 0.675 49.000 0.015 1.000 N NA
 10375694 10375695 BMD_5257 BMD_5258 rpsF engD FALSE 0.579 190.000 0.029 1.000 Y NA
 10375695 10375696 BMD_5258 BMD_5259 engD   FALSE 0.219 169.000 0.064 NA   NA
 10375696 10375697 BMD_5259 BMD_5260     TRUE 0.845 15.000 0.171 NA   NA
 10375697 10375698 BMD_5260 BMD_5261     FALSE 0.338 68.000 0.027 NA   NA
 10375700 10375701 BMD_5263 BMD_5264 spo0J soj TRUE 0.995 -28.000 0.827 1.000 N NA
 10375701 10375702 BMD_5264 BMD_5265 soj noc FALSE 0.508 118.000 0.069 1.000 N NA
 10375702 10375703 BMD_5265 BMD_5266 noc gidB FALSE 0.486 136.000 0.089 1.000 N NA
 10375703 10375704 BMD_5266 BMD_5267 gidB gidA TRUE 0.938 31.000 0.466 1.000 N NA
 10375704 10375705 BMD_5267 BMD_5268 gidA trmE TRUE 0.900 23.000 0.266 1.000   NA
 10375705 10375706 BMD_5268 BMD_5269 trmE jag FALSE 0.154 306.000 0.116 1.000   NA
 10375706 10375707 BMD_5269 BMD_5270 jag oxaA TRUE 0.925 -3.000 0.071 1.000   NA
 10375707 10375708 BMD_5270 BMD_5271 oxaA rnpA FALSE 0.439 116.000 0.025 1.000 N NA
 10375708 10375709 BMD_5271 BMD_5272 rnpA rpmH TRUE 0.795 111.000 0.787 1.000   NA