MicrobesOnline Operon Predictions for Escherichia coli 55989

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5877972 5877973 EC55989_5066 EC55989_0002 thrL thrA FALSE 0.258 81.000 0.043 1.000   NA
 5877973 5877974 EC55989_0002 EC55989_0003 thrA thrB TRUE 0.991 2.000 0.133 1.000 Y NA
 5877974 5877975 EC55989_0003 EC55989_0004 thrB thrC TRUE 0.994 1.000 0.233 1.000 Y NA
 5877975 5877976 EC55989_0004 EC55989_0005 thrC yaaX FALSE 0.015 214.000 0.003 NA   NA
 5877977 5877978 EC55989_0006 EC55989_0007 yaaA yaaJ FALSE 0.230 70.000 0.028 NA   NA
 5877979 5877980 EC55989_0009 EC55989_0010 talB mogA FALSE 0.094 115.000 0.042 1.000 N NA
 5877981 5877982 EC55989_0011 EC55989_0012 yaaH htpY FALSE 0.072 149.000 0.043 NA   NA
 5877982 5877983 EC55989_0012 EC55989_0013 htpY yaaI TRUE 0.960 26.000 0.500 NA   NA
 5877984 5877985 EC55989_0014 EC55989_misc_RNA_1 dnaK tpke11 TRUE 0.921 1.000 0.000 NA   NA
 5877985 5877986 EC55989_misc_RNA_1 EC55989_0015 tpke11 dnaJ TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5877986 5877987 EC55989_0015 EC55989_misc_RNA_2 dnaJ sokC FALSE 0.012 305.000 0.000 NA   NA
 5877987 5877988 EC55989_misc_RNA_2 EC55989_0016 sokC nhaA FALSE 0.006 483.000 0.000 NA   NA
 5877988 5877989 EC55989_0016 EC55989_0017 nhaA nhaR TRUE 0.663 60.000 0.292 1.000 N NA
 5877990 5877991 EC55989_0018 EC55989_0019     TRUE 0.867 13.000 0.000 NA   NA
 5877991 5877992 EC55989_0019 EC55989_0020     FALSE 0.007 409.000 0.000 NA   NA
 5877992 5877993 EC55989_0020 EC55989_0022   rpsT FALSE 0.004 783.000 0.000 NA   NA
 5877994 5877995 EC55989_0023 EC55989_0024 yaaY ribF TRUE 0.838 8.000 0.019 NA   NA
 5877995 5877996 EC55989_0024 EC55989_0025 ribF ileS TRUE 0.775 43.000 0.254 1.000 N NA
 5877996 5877997 EC55989_0025 EC55989_0026 ileS lspA TRUE 0.872 0.000 0.045 1.000 N NA
 5877997 5877998 EC55989_0026 EC55989_0027 lspA fkpB FALSE 0.348 88.000 0.154 1.000 N NA
 5877998 5877999 EC55989_0027 EC55989_0028 fkpB ispH TRUE 0.992 2.000 0.626 1.000 N NA
 5877999 5878000 EC55989_0028 EC55989_0029 ispH rihC FALSE 0.115 66.000 0.028 NA N NA
 5878000 5878001 EC55989_0029 EC55989_0030 rihC dapB FALSE 0.010 167.000 0.003 NA N NA
 5878001 5878002 EC55989_0030 EC55989_0031 dapB carA FALSE 0.034 456.000 0.034 1.000 Y NA
 5878002 5878003 EC55989_0031 EC55989_0032 carA carB TRUE 0.996 18.000 0.345 0.001 Y NA
 5878006 5878007 EC55989_0035 EC55989_0036 caiE caiD TRUE 0.914 6.000 0.000 1.000   NA
 5878007 5878008 EC55989_0036 EC55989_0037 caiD caiC TRUE 0.716 109.000 0.000 0.022 Y NA
 5878008 5878009 EC55989_0037 EC55989_0038 caiC caiB TRUE 0.662 59.000 0.154 0.022 N NA
 5878009 5878010 EC55989_0038 EC55989_0039 caiB caiA TRUE 0.541 129.000 0.529 1.000 N NA
 5878010 5878011 EC55989_0039 EC55989_0040 caiA caiT TRUE 0.719 31.000 0.118 1.000 N NA
 5878012 5878013 EC55989_0041 EC55989_0042 fixA fixB TRUE 0.993 15.000 0.231 0.014 Y NA
 5878013 5878014 EC55989_0042 EC55989_0043 fixB fixC TRUE 0.887 51.000 0.000 0.054 Y NA
 5878014 5878015 EC55989_0043 EC55989_0044 fixC fixX TRUE 0.994 -3.000 0.167 0.054 Y NA
 5878015 5878016 EC55989_0044 EC55989_0045 fixX yaaU FALSE 0.270 59.000 0.000 1.000 N NA
 5878016 5878017 EC55989_0045 EC55989_0046 yaaU kefF FALSE 0.207 108.000 0.000 1.000   NA
 5878017 5878018 EC55989_0046 EC55989_0047 kefF kefC TRUE 0.981 -7.000 0.560 1.000   NA
 5878018 5878019 EC55989_0047 EC55989_0048 kefC folA FALSE 0.013 192.000 0.012 1.000 N NA
 5878020 5878021 EC55989_0049 EC55989_0050 apaH apaG TRUE 0.963 7.000 0.267 NA N NA
 5878021 5878022 EC55989_0050 EC55989_0051 apaG ksgA TRUE 0.887 3.000 0.078 NA N NA
 5878022 5878023 EC55989_0051 EC55989_0052 ksgA pdxA TRUE 0.957 -3.000 0.197 1.000 N NA
 5878023 5878024 EC55989_0052 EC55989_0053 pdxA surA TRUE 0.991 0.000 0.561 1.000 N NA
 5878024 5878025 EC55989_0053 EC55989_0054 surA imp TRUE 0.580 53.000 0.182 1.000 N NA
 5878027 5878028 EC55989_0056 EC55989_0057 rluA hepA TRUE 0.964 12.000 0.294 1.000 N NA
 5878028 5878029 EC55989_0057 EC55989_0058 hepA polB TRUE 0.471 165.000 0.098 0.091 Y NA
 5878029 5878030 EC55989_0058 EC55989_0059 polB araD FALSE 0.114 75.000 0.018 1.000 N NA
 5878030 5878031 EC55989_0059 EC55989_0060 araD araA FALSE 0.259 169.000 0.017 1.000 Y NA
 5878031 5878032 EC55989_0060 EC55989_0061 araA araB TRUE 0.922 11.000 0.138 1.000 N NA
 5878033 5878034 EC55989_0062 EC55989_0063 araC yabI FALSE 0.431 86.000 0.167 NA   NA
 5878035 5878036 EC55989_0064 EC55989_0065 thiQ thiP TRUE 0.969 -16.000 0.522 0.018 N NA
 5878036 5878037 EC55989_0065 EC55989_0066 thiP tbpA TRUE 0.969 -24.000 0.697 0.074 N NA
 5878037 5878038 EC55989_0066 EC55989_misc_RNA_3 tbpA   TRUE 0.661 31.000 0.000 NA   NA
 5878038 5878039 EC55989_misc_RNA_3 EC55989_0067   sgrR TRUE 0.630 34.000 0.000 NA   NA
 5878040 5878041 EC55989_misc_RNA_4 EC55989_0068 sgrS setA TRUE 0.705 28.000 0.000 NA   NA
 5878042 5878043 EC55989_0069 EC55989_0070 leuD leuC TRUE 0.997 11.000 0.309 0.001 Y NA
 5878043 5878044 EC55989_0070 EC55989_0071 leuC leuB TRUE 0.997 3.000 0.275 0.002 Y NA
 5878044 5878045 EC55989_0071 EC55989_0072 leuB leuA TRUE 0.996 0.000 0.126 0.002 Y NA
 5878045 5878046 EC55989_0072 EC55989_misc_RNA_5 leuA   TRUE 0.508 44.000 0.000 NA   NA
 5878046 5878047 EC55989_misc_RNA_5 EC55989_5067   leuL FALSE 0.376 -100.000 0.000 NA   NA
 5878048 5878049 EC55989_0073 EC55989_0074 leuO ilvI FALSE 0.007 318.000 0.000 1.000 N NA
 5878049 5878050 EC55989_0074 EC55989_0075 ilvI ilvH TRUE 0.998 3.000 0.371 0.002 Y NA
 5878050 5878051 EC55989_0075 EC55989_0076 ilvH fruR FALSE 0.038 180.000 0.063 1.000 N NA
 5878051 5878052 EC55989_0076 EC55989_0077 fruR mraZ FALSE 0.005 602.000 0.000 NA   NA
 5878052 5878053 EC55989_0077 EC55989_0078 mraZ mraW TRUE 0.993 2.000 0.635 NA   NA
 5878053 5878054 EC55989_0078 EC55989_0079 mraW ftsL TRUE 0.965 -3.000 0.227 1.000 N NA
 5878054 5878055 EC55989_0079 EC55989_0080 ftsL ftsI TRUE 0.882 16.000 0.124 1.000 N NA
 5878055 5878056 EC55989_0080 EC55989_0081 ftsI murE TRUE 0.949 -13.000 0.059 1.000 Y NA
 5878056 5878057 EC55989_0081 EC55989_0082 murE murF TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 5878057 5878058 EC55989_0082 EC55989_0083 murF mraY TRUE 0.995 -6.000 0.309 0.004 Y NA
 5878058 5878059 EC55989_0083 EC55989_0084 mraY murD TRUE 0.999 3.000 0.647 0.004 Y NA
 5878059 5878060 EC55989_0084 EC55989_0085 murD ftsW TRUE 0.990 0.000 0.297 0.003 N NA
 5878060 5878061 EC55989_0085 EC55989_0086 ftsW murG TRUE 0.991 -3.000 0.647 1.000 N NA
 5878061 5878062 EC55989_0086 EC55989_0087 murG murC TRUE 0.920 54.000 0.283 1.000 Y NA
 5878062 5878063 EC55989_0087 EC55989_0088 murC ddlB TRUE 0.989 -7.000 0.153 0.004 Y NA
 5878063 5878064 EC55989_0088 EC55989_0089 ddlB ftsQ TRUE 0.996 2.000 0.372 NA Y NA
 5878064 5878065 EC55989_0089 EC55989_0090 ftsQ ftsA TRUE 0.980 -3.000 0.389 NA N NA
 5878065 5878066 EC55989_0090 EC55989_0091 ftsA ftsZ TRUE 0.940 61.000 0.460 1.000 Y NA
 5878066 5878067 EC55989_0091 EC55989_0092 ftsZ lpxC FALSE 0.269 101.000 0.134 1.000 N NA
 5878067 5878068 EC55989_0092 EC55989_0093 lpxC secM FALSE 0.027 231.000 0.000 1.000   NA
 5878068 5878069 EC55989_0093 EC55989_0094 secM secA FALSE 0.397 62.000 0.065 1.000   NA
 5878069 5878070 EC55989_0094 EC55989_0095 secA mutT TRUE 0.503 60.000 0.168 1.000 N NA
 5878071 5878072 EC55989_0096 EC55989_0097 yacF coaE TRUE 0.952 0.000 0.110 NA   NA
 5878074 5878075 EC55989_0099 EC55989_0100 hofC hofB TRUE 0.992 -10.000 0.571 1.000 Y NA
 5878075 5878076 EC55989_0100 EC55989_0101 hofB ppdD TRUE 0.996 10.000 0.556 NA Y NA
 5878076 5878077 EC55989_0101 EC55989_0102 ppdD nadC FALSE 0.007 203.000 0.015 NA N NA
 5878078 5878079 EC55989_0103 EC55989_0104 ampD ampE TRUE 0.994 -3.000 0.249 1.000 Y NA
 5878083 5878084 EC55989_0107 EC55989_0108 aceE aceF TRUE 0.988 15.000 0.220 1.000 Y NA
 5878084 5878085 EC55989_0108 EC55989_0109 aceF lpd FALSE 0.235 325.000 0.463 1.000 Y NA
 5878087 5878088 EC55989_0111 EC55989_0112 acnB yacL FALSE 0.061 176.000 0.068 NA   NA
 5878089 5878090 EC55989_0113 EC55989_0114 speD speE TRUE 0.984 16.000 0.162 1.000 Y NA
 5878090 5878091 EC55989_0114 EC55989_0115 speE yacC TRUE 0.569 106.000 0.354 NA   NA
 5878096 5878097 EC55989_0120 EC55989_0122 yadG yadH TRUE 0.999 -3.000 0.688 0.098 Y NA
 5878097 5878098 EC55989_0122 EC55989_0123 yadH yadI FALSE 0.100 105.000 0.037 1.000 N NA
 5878098 5878099 EC55989_0123 EC55989_0124 yadI yadE TRUE 0.878 64.000 0.222 1.000 Y NA
 5878102 5878103 EC55989_0127 EC55989_0128 panC panB TRUE 0.997 12.000 0.395 0.001 Y NA
 5878103 5878104 EC55989_0128 EC55989_0129 panB   FALSE 0.120 113.000 0.000 1.000 N NA
 5878104 5878105 EC55989_0129 EC55989_0130   yadK TRUE 0.660 53.000 0.000 0.011   NA
 5878105 5878106 EC55989_0130 EC55989_0131 yadK yadL TRUE 0.981 27.000 0.571 0.011   NA
 5878106 5878107 EC55989_0131 EC55989_0132 yadL yadM TRUE 0.992 15.000 0.571 0.011   NA
 5878107 5878108 EC55989_0132 EC55989_0133 yadM htrE TRUE 0.995 17.000 0.571 1.000 Y NA
 5878108 5878109 EC55989_0133 EC55989_0134 htrE ecpD TRUE 0.992 35.000 1.000 1.000 Y NA
 5878109 5878110 EC55989_0134 EC55989_0135 ecpD yadN TRUE 0.884 105.000 0.500 1.000 Y NA
 5878110 5878111 EC55989_0135 EC55989_0136 yadN folK FALSE 0.005 370.000 0.000 1.000 N NA
 5878111 5878112 EC55989_0136 EC55989_0137 folK pcnB TRUE 0.966 -3.000 0.234 1.000 N NA
 5878112 5878113 EC55989_0137 EC55989_0138 pcnB yadB TRUE 0.931 39.000 0.131 1.000 Y NA
 5878113 5878114 EC55989_0138 EC55989_0139 yadB dksA TRUE 0.811 37.000 0.231 1.000 N NA
 5878114 5878115 EC55989_0139 EC55989_0140 dksA sfsA FALSE 0.107 178.000 0.151 NA   NA
 5878115 5878116 EC55989_0140 EC55989_0141 sfsA ligT TRUE 0.832 15.000 0.045 NA   NA
 5878117 5878118 EC55989_0142 EC55989_0143 hrpB mrcB FALSE 0.067 196.000 0.158 1.000 N NA
 5878118 5878119 EC55989_0143 EC55989_0144 mrcB fhuA FALSE 0.018 220.000 0.000 1.000 N NA
 5878119 5878120 EC55989_0144 EC55989_0145 fhuA fhuC TRUE 0.888 51.000 0.156 1.000 Y NA
 5878120 5878121 EC55989_0145 EC55989_0146 fhuC fhuD TRUE 0.986 0.000 0.031 1.000 Y NA
 5878121 5878122 EC55989_0146 EC55989_0147 fhuD fhuB TRUE 0.985 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5878124 5878125 EC55989_0149 EC55989_0151 clcA yadR FALSE 0.194 82.000 0.031 NA   NA
 5878126 5878127 EC55989_0152 EC55989_0153 yadS btuF TRUE 0.814 38.000 0.213 NA   NA
 5878127 5878128 EC55989_0153 EC55989_0154 btuF pfs TRUE 0.793 -7.000 0.073 1.000 N NA
 5878129 5878130 EC55989_0155 EC55989_0156 dgt degP FALSE 0.142 130.000 0.101 1.000 N NA
 5878130 5878131 EC55989_0156 EC55989_0157 degP cdaR FALSE 0.056 155.000 0.080 NA N NA
 5878132 5878133 EC55989_0158 EC55989_0159 yaeH dapD FALSE 0.008 315.000 0.035 NA   NA
 5878133 5878134 EC55989_0159 EC55989_0160 dapD glnD TRUE 0.684 31.000 0.097 1.000 N NA
 5878134 5878135 EC55989_0160 EC55989_0161 glnD map TRUE 0.602 62.000 0.243 1.000 N NA
 5878135 5878136 EC55989_0161 EC55989_0162 map   TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5878137 5878138 EC55989_misc_RNA_7 EC55989_0163 t44 rpsB TRUE 0.723 27.000 0.000 NA   NA
 5878138 5878139 EC55989_0163 EC55989_0164 rpsB tsf TRUE 0.496 258.000 0.748 1.000 Y NA
 5878139 5878140 EC55989_0164 EC55989_0165 tsf pyrH FALSE 0.363 147.000 0.416 1.000 N NA
 5878140 5878141 EC55989_0165 EC55989_0166 pyrH frr FALSE 0.119 292.000 0.626 1.000 N NA
 5878141 5878142 EC55989_0166 EC55989_0167 frr dxr FALSE 0.113 92.000 0.032 1.000 N NA
 5878142 5878143 EC55989_0167 EC55989_0168 dxr ispU FALSE 0.207 186.000 0.025 1.000 Y NA
 5878143 5878144 EC55989_0168 EC55989_0169 ispU cdsA TRUE 0.994 13.000 0.400 1.000 Y NA
 5878144 5878145 EC55989_0169 EC55989_0170 cdsA yaeL TRUE 0.865 12.000 0.080 1.000 N NA
 5878145 5878146 EC55989_0170 EC55989_0171 yaeL yaeT TRUE 0.966 30.000 0.204 1.000 Y NA
 5878146 5878147 EC55989_0171 EC55989_0172 yaeT hlpA TRUE 0.802 122.000 0.354 1.000 Y NA
 5878147 5878148 EC55989_0172 EC55989_0173 hlpA lpxD TRUE 0.998 4.000 0.814 1.000 Y NA
 5878148 5878149 EC55989_0173 EC55989_0174 lpxD fabZ TRUE 0.765 105.000 0.796 1.000 N NA
 5878149 5878150 EC55989_0174 EC55989_0175 fabZ lpxA TRUE 0.994 4.000 0.850 1.000 N NA
 5878150 5878151 EC55989_0175 EC55989_0176 lpxA lpxB TRUE 0.996 0.000 0.289 1.000 Y NA
 5878151 5878152 EC55989_0176 EC55989_0177 lpxB rnhB TRUE 0.956 -3.000 0.186 1.000 N NA
 5878152 5878153 EC55989_0177 EC55989_0178 rnhB dnaE TRUE 0.929 37.000 0.104 1.000 Y NA
 5878153 5878154 EC55989_0178 EC55989_0179 dnaE accA TRUE 0.899 13.000 0.122 1.000 N NA
 5878154 5878155 EC55989_0179 EC55989_0180 accA ldcC FALSE 0.071 99.000 0.010 1.000 N NA
 5878155 5878156 EC55989_0180 EC55989_0181 ldcC yaeR TRUE 0.762 57.000 0.039 NA Y NA
 5878156 5878157 EC55989_0181 EC55989_0182 yaeR tilS FALSE 0.083 65.000 0.015 NA N NA
 5878158 5878159 EC55989_0183 EC55989_0184 rof yaeP TRUE 0.921 -7.000 0.179 NA   NA
 5878160 5878161 EC55989_0185 EC55989_0186 yaeQ yaeJ TRUE 0.901 -3.000 0.034 1.000   NA
 5878161 5878162 EC55989_0186 EC55989_0187 yaeJ nlpE TRUE 0.807 14.000 0.027 NA   NA
 5878162 5878163 EC55989_0187 EC55989_0189 nlpE   FALSE 0.010 250.000 0.000 NA N NA
 5878164 5878165 EC55989_0190 EC55989_0191 yaeF yaeF TRUE 0.493 -69.000 0.000 NA   NA
 5878165 5878166 EC55989_0191 EC55989_0192 yaeF proS TRUE 0.508 44.000 0.000 NA   NA
 5878166 5878167 EC55989_0192 EC55989_0193 proS yaeB FALSE 0.154 112.000 0.048 NA   NA
 5878167 5878168 EC55989_0193 EC55989_0194 yaeB rcsF TRUE 0.973 -3.000 0.247 NA   NA
 5878168 5878169 EC55989_0194 EC55989_0195 rcsF metQ TRUE 0.617 118.000 0.500 NA   NA
 5878169 5878170 EC55989_0195 EC55989_0196 metQ metI TRUE 0.981 40.000 0.411 0.059 Y NA
 5878170 5878171 EC55989_0196 EC55989_0197 metI metN TRUE 0.995 -7.000 0.584 1.000 Y NA
 5878172 5878173 EC55989_0198 EC55989_16S_3 gmhB   FALSE 0.008 364.000 0.000 NA   NA
 5878173 5878174 EC55989_16S_3 EC55989_tRNA1     FALSE 0.306 69.000 0.000 NA   NA
 5878174 5878175 EC55989_tRNA1 EC55989_tRNA2     TRUE 0.523 43.000 0.000 NA   NA
 5878175 5878176 EC55989_tRNA2 EC55989_23S_3     FALSE 0.046 184.000 0.000 NA   NA
 5878176 5878177 EC55989_23S_3 EC55989_5S_4     FALSE 0.218 94.000 0.000 NA   NA
 5878177 5878178 EC55989_5S_4 EC55989_0204     FALSE 0.187 105.000 0.000 NA   NA
 5878178 5878179 EC55989_0204 EC55989_tRNA3     FALSE 0.319 -163.000 0.000 NA   NA
 5878179 5878180 EC55989_tRNA3 EC55989_0205   dkgB FALSE 0.068 162.000 0.000 NA   NA
 5878184 5878185 EC55989_0208 EC55989_0209 yafD yafE FALSE 0.282 78.000 0.066 NA   NA
 5878186 5878187 EC55989_0210 EC55989_0211 mltD gloB TRUE 0.618 72.000 0.233 1.000   NA
 5878190 5878191 EC55989_0214 EC55989_tRNA4 dnaQ   FALSE 0.120 133.000 0.000 NA   NA
 5878191 5878192 EC55989_tRNA4 EC55989_0216   yafT FALSE 0.010 327.000 0.000 NA   NA
 5878192 5878193 EC55989_0216 EC55989_misc_RNA_9 yafT C0067 FALSE 0.009 342.000 0.000 NA   NA
 5878194 5878195 EC55989_0217 EC55989_0218 yafU   TRUE 0.972 29.000 0.750 NA   NA
 5878195 5878196 EC55989_0218 EC55989_0219     TRUE 0.897 24.000 0.182 NA   NA
 5878196 5878197 EC55989_0219 EC55989_0220     TRUE 0.801 -79.000 0.312 NA   NA
 5878197 5878198 EC55989_0220 EC55989_0221     TRUE 0.986 19.000 0.750 NA   NA
 5878198 5878199 EC55989_0221 EC55989_0222     TRUE 0.938 -61.000 0.711 NA   NA
 5878199 5878200 EC55989_0222 EC55989_0223     TRUE 0.887 -3.000 0.039 NA   NA
 5878200 5878201 EC55989_0223 EC55989_0224     TRUE 0.818 -105.000 0.471 NA   NA
 5878201 5878202 EC55989_0224 EC55989_0225     TRUE 0.992 5.000 0.673 NA   NA
 5878202 5878203 EC55989_0225 EC55989_0226     TRUE 0.994 3.000 0.765 NA   NA
 5878203 5878204 EC55989_0226 EC55989_0227     TRUE 0.995 -3.000 0.862 NA   NA
 5878204 5878205 EC55989_0227 EC55989_0228     TRUE 0.989 4.000 0.510 NA   NA
 5878205 5878206 EC55989_0228 EC55989_0229     TRUE 0.958 -42.000 0.863 NA   NA
 5878206 5878207 EC55989_0229 EC55989_0230     TRUE 0.990 4.000 0.552 NA   NA
 5878207 5878208 EC55989_0230 EC55989_0231     TRUE 0.991 7.000 0.627 NA   NA
 5878208 5878209 EC55989_0231 EC55989_0232     FALSE 0.338 51.000 0.030 NA   NA
 5878209 5878210 EC55989_0232 EC55989_0233     TRUE 0.546 35.000 0.034 NA   NA
 5878211 5878212 EC55989_0234 EC55989_0235     FALSE 0.136 127.000 0.000 NA   NA
 5878212 5878213 EC55989_0235 EC55989_0236     FALSE 0.030 210.000 0.000 NA   NA
 5878213 5878214 EC55989_0236 EC55989_0237     FALSE 0.271 76.000 0.000 NA   NA
 5878214 5878215 EC55989_0237 EC55989_0238   rhsE FALSE 0.317 -166.000 0.000 NA   NA
 5878215 5878216 EC55989_0238 EC55989_0239 rhsE ydcD TRUE 0.698 -16.000 0.000 NA   NA
 5878216 5878217 EC55989_0239 EC55989_0240 ydcD yncI FALSE 0.050 181.000 0.000 NA   NA
 5878217 5878218 EC55989_0240 EC55989_0241 yncI yncM TRUE 0.738 44.000 0.000 0.025   NA
 5878218 5878219 EC55989_0241 EC55989_0242 yncM yhhI FALSE 0.030 314.000 0.000 0.025   NA
 5878223 5878224 EC55989_0246 EC55989_0247 lpcA yafJ FALSE 0.116 206.000 0.229 1.000   NA
 5878225 5878226 EC55989_0248 EC55989_0249 yafK yafQ FALSE 0.073 156.000 0.000 NA   NA
 5878226 5878227 EC55989_0249 EC55989_0250 yafQ dinJ TRUE 0.963 3.000 0.167 NA   NA
 5878229 5878230 EC55989_0252 EC55989_0253     TRUE 0.945 -7.000 0.250 NA   NA
 5878230 5878231 EC55989_0253 EC55989_0254   fhiA FALSE 0.247 84.000 0.000 NA   NA
 5878232 5878233 EC55989_0255 EC55989_0256 mbhA dinB FALSE 0.222 71.000 0.000 1.000 N NA
 5878233 5878234 EC55989_0256 EC55989_0257 dinB yafP TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5878236 5878237 EC55989_misc_RNA_10 EC55989_0259 RNAout   FALSE 0.007 386.000 0.000 NA   NA
 5878237 5878238 EC55989_0259 EC55989_0260   prfH TRUE 0.492 111.000 0.303 NA   NA
 5878240 5878241 EC55989_0262 EC55989_0263 gpt frsA FALSE 0.190 92.000 0.040 NA   NA
 5878241 5878242 EC55989_0263 EC55989_0264 frsA crl FALSE 0.333 58.000 0.048 NA   NA
 5878244 5878245 EC55989_0266 EC55989_0267 proB proA TRUE 0.989 12.000 0.026 0.001 Y NA
 5878245 5878246 EC55989_0267 EC55989_tRNA5 proA   FALSE 0.163 115.000 0.000 NA   NA
 5878246 5878247 EC55989_tRNA5 EC55989_0268     FALSE 0.063 167.000 0.000 NA   NA
 5878247 5878248 EC55989_0268 EC55989_0269     FALSE 0.146 123.000 0.000 NA   NA
 5878248 5878249 EC55989_0269 EC55989_0270     FALSE 0.039 195.000 0.000 NA   NA
 5878249 5878250 EC55989_0270 EC55989_0271     TRUE 0.720 79.000 0.087 NA Y NA
 5878250 5878251 EC55989_0271 EC55989_0272     TRUE 0.819 -7.000 0.000 NA   NA
 5878253 5878254 EC55989_0274 EC55989_0275     TRUE 0.819 -7.000 0.000 NA   NA
 5878254 5878255 EC55989_0275 EC55989_0276     TRUE 0.902 5.000 0.000 NA   NA
 5878255 5878256 EC55989_0276 EC55989_0277     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5878256 5878257 EC55989_0277 EC55989_0278     FALSE 0.006 459.000 0.000 NA   NA
 5878257 5878258 EC55989_0278 EC55989_0279     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5878258 5878259 EC55989_0279 EC55989_0280     FALSE 0.113 135.000 0.000 NA   NA
 5878259 5878260 EC55989_0280 EC55989_0281     FALSE 0.324 65.000 0.000 NA   NA
 5878260 5878261 EC55989_0281 EC55989_0283     FALSE 0.006 443.000 0.000 NA   NA
 5878261 5878262 EC55989_0283 EC55989_0284     FALSE 0.250 82.000 0.000 NA   NA
 5878262 5878263 EC55989_0284 EC55989_0285     FALSE 0.005 604.000 0.000 NA   NA
 5878263 5878264 EC55989_0285 EC55989_0286     TRUE 0.977 -7.000 0.519 NA   NA
 5878265 5878266 EC55989_0287 EC55989_0288 yagP yagQ TRUE 0.653 -21.000 0.000 NA   NA
 5878266 5878267 EC55989_0288 EC55989_0289 yagQ yagR TRUE 0.894 10.000 0.111 NA N NA
 5878267 5878268 EC55989_0289 EC55989_0290 yagR yagS TRUE 0.999 -3.000 0.917 0.001 Y NA
 5878268 5878269 EC55989_0290 EC55989_0291 yagS yagT TRUE 0.999 -3.000 0.705 0.052 Y NA
 5878271 5878272 EC55989_0293 EC55989_0294 yagV yagW TRUE 0.938 -31.000 0.571 NA   NA
 5878272 5878273 EC55989_0294 EC55989_0295 yagW yagX TRUE 0.959 -10.000 0.429 NA   NA
 5878273 5878274 EC55989_0295 EC55989_0296 yagX yagY TRUE 0.930 26.000 0.308 NA   NA
 5878274 5878275 EC55989_0296 EC55989_0297 yagY ecpA TRUE 0.783 58.000 0.385 NA   NA
 5878275 5878276 EC55989_0297 EC55989_0298 ecpA ykgK TRUE 0.717 75.000 0.400 NA   NA
 5878280 5878281 EC55989_0303 EC55989_0304 ykgA ykgB FALSE 0.005 557.000 0.000 NA   NA
 5878281 5878282 EC55989_0304 EC55989_0305 ykgB ykgI TRUE 0.857 12.000 0.043 NA   NA
 5878282 5878283 EC55989_0305 EC55989_0306 ykgI ykgC TRUE 0.741 109.000 0.667 NA   NA
 5878284 5878285 EC55989_0307 EC55989_0308 ykgD ykgE FALSE 0.003 527.000 0.000 NA N NA
 5878285 5878286 EC55989_0308 EC55989_0309 ykgE ykgF TRUE 0.992 11.000 0.286 NA Y NA
 5878286 5878287 EC55989_0309 EC55989_0310 ykgF ykgG TRUE 0.980 -7.000 0.286 0.001   NA
 5878288 5878289 EC55989_0311 EC55989_0312   ykgH TRUE 0.614 -25.000 0.000 NA   NA
 5878289 5878290 EC55989_0312 EC55989_0313 ykgH betA FALSE 0.029 213.000 0.000 NA   NA
 5878290 5878291 EC55989_0313 EC55989_0314 betA betB TRUE 0.985 14.000 0.634 1.000 N NA
 5878291 5878292 EC55989_0314 EC55989_0315 betB betI TRUE 0.976 14.000 0.459 1.000 N NA
 5878293 5878294 EC55989_0316 EC55989_0317 betT   FALSE 0.036 507.000 0.000 1.000 Y NA
 5878294 5878295 EC55989_0317 EC55989_0318   yahA FALSE 0.070 142.000 0.000 1.000 N NA
 5878296 5878297 EC55989_0319 EC55989_0320 yahB yahC FALSE 0.226 92.000 0.000 NA   NA
 5878298 5878299 EC55989_0321 EC55989_0322 yahD yahE TRUE 0.946 40.000 0.667 NA   NA
 5878299 5878300 EC55989_0322 EC55989_0323 yahE yahF TRUE 0.959 -10.000 0.429 NA   NA
 5878300 5878301 EC55989_0323 EC55989_0324 yahF yahG TRUE 0.994 0.000 0.714 NA   NA
 5878301 5878302 EC55989_0324 EC55989_0325 yahG yahI FALSE 0.164 143.000 0.125 NA   NA
 5878302 5878303 EC55989_0325 EC55989_0326 yahI yahJ TRUE 0.965 10.000 0.278 1.000 N NA
 5878303 5878304 EC55989_0326 EC55989_0327 yahJ   FALSE 0.015 269.000 0.000 NA   NA
 5878304 5878305 EC55989_0327 EC55989_0328     FALSE 0.019 251.000 0.000 NA   NA
 5878305 5878306 EC55989_0328 EC55989_0329     TRUE 0.984 34.000 0.571 NA Y NA
 5878306 5878307 EC55989_0329 EC55989_0330     TRUE 0.995 -7.000 0.667 1.000 Y NA
 5878307 5878308 EC55989_0330 EC55989_0331     TRUE 0.994 -33.000 1.000 0.058 Y NA
 5878308 5878309 EC55989_0331 EC55989_0332   yahK FALSE 0.273 87.000 0.000 1.000   NA
 5878309 5878310 EC55989_0332 EC55989_0333 yahK yahL FALSE 0.021 243.000 0.000 NA   NA
 5878310 5878311 EC55989_0333 EC55989_tRNA6 yahL   FALSE 0.009 342.000 0.000 NA   NA
 5878311 5878312 EC55989_tRNA6 EC55989_0334   yahM TRUE 0.764 -10.000 0.000 NA   NA
 5878316 5878317 EC55989_0338 EC55989_0339 prpB prpC TRUE 0.883 45.000 0.502 1.000 N NA
 5878317 5878318 EC55989_0339 EC55989_0340 prpC prpD TRUE 0.858 34.000 0.216 1.000   NA
 5878318 5878319 EC55989_0340 EC55989_0341 prpD prpE TRUE 0.811 40.000 0.038 0.001   NA
 5878319 5878320 EC55989_0341 EC55989_0342 prpE   FALSE 0.004 463.000 0.000 1.000 N NA
 5878320 5878321 EC55989_0342 EC55989_0343   codB FALSE 0.011 262.000 0.000 1.000 N NA
 5878321 5878322 EC55989_0343 EC55989_0344 codB codA TRUE 0.981 -10.000 0.250 1.000 Y NA
 5878324 5878325 EC55989_0346 EC55989_0347 cynT cynS TRUE 0.936 31.000 0.075 1.000 Y NA
 5878325 5878326 EC55989_0347 EC55989_0348 cynS cynX TRUE 0.923 33.000 0.000 1.000 Y NA
 5878327 5878328 EC55989_0349 EC55989_0350 lacA lacY TRUE 0.634 66.000 0.222 1.000   NA
 5878328 5878329 EC55989_0350 EC55989_0351 lacY lacZ TRUE 0.751 52.000 0.261 1.000   NA
 5878329 5878330 EC55989_0351 EC55989_0352 lacZ lacI FALSE 0.253 123.000 0.174 1.000 N NA
 5878330 5878331 EC55989_0352 EC55989_0353 lacI mhpR TRUE 0.800 77.000 0.000 0.052 Y NA
 5878332 5878333 EC55989_0354 EC55989_0355 mhpA mhpB TRUE 0.992 2.000 0.333 0.005   NA
 5878333 5878334 EC55989_0355 EC55989_0356 mhpB mhpC TRUE 0.982 3.000 0.300 1.000   NA
 5878334 5878335 EC55989_0356 EC55989_0357 mhpC mhpD TRUE 0.976 10.000 0.300 1.000   NA
 5878335 5878336 EC55989_0357 EC55989_0358 mhpD mhpF TRUE 0.997 -3.000 0.444 1.000 Y NA
 5878336 5878337 EC55989_0358 EC55989_0359 mhpF mhpE TRUE 0.992 -3.000 0.750 1.000 N NA
 5878337 5878338 EC55989_0359 EC55989_0360 mhpE mhpT FALSE 0.356 176.000 0.600 1.000 N NA
 5878338 5878339 EC55989_0360 EC55989_0361 mhpT yaiL FALSE 0.194 102.000 0.000 NA   NA
 5878339 5878340 EC55989_0361 EC55989_0363 yaiL   FALSE 0.019 250.000 0.000 NA   NA
 5878341 5878342 EC55989_0364 EC55989_0365 frmB frmA TRUE 0.618 93.000 0.327 1.000   NA
 5878342 5878343 EC55989_0365 EC55989_0366 frmA frmR TRUE 0.939 35.000 0.531 NA   NA
 5878343 5878344 EC55989_0366 EC55989_0368 frmR yaiO FALSE 0.044 186.000 0.000 NA   NA
 5878344 5878345 EC55989_0368 EC55989_0369 yaiO yaiX TRUE 0.920 2.000 0.000 NA   NA
 5878345 5878346 EC55989_0369 EC55989_0370 yaiX yaiP TRUE 0.602 -151.000 0.214 NA   NA
 5878346 5878347 EC55989_0370 EC55989_0371 yaiP yaiS TRUE 0.962 10.000 0.214 NA   NA
 5878348 5878349 EC55989_0372 EC55989_0373 tauA tauB TRUE 0.977 13.000 0.047 1.000 Y NA
 5878349 5878350 EC55989_0373 EC55989_0374 tauB tauC TRUE 0.998 -3.000 0.728 1.000 Y NA
 5878350 5878351 EC55989_0374 EC55989_0375 tauC tauD TRUE 0.961 -3.000 0.214 1.000 N NA
 5878353 5878354 EC55989_0378 EC55989_0379   yaiV TRUE 0.936 43.000 0.667 NA   NA
 5878356 5878357 EC55989_0381 EC55989_0382   sbmA TRUE 0.814 20.000 0.000 NA   NA
 5878357 5878358 EC55989_0382 EC55989_0383 sbmA yaiW TRUE 0.867 13.000 0.000 NA   NA
 5878362 5878363 EC55989_0387 EC55989_0388   yaiB FALSE 0.049 182.000 0.000 NA   NA
 5878363 5878364 EC55989_0388 EC55989_0389 yaiB phoA TRUE 0.647 32.000 0.000 NA   NA
 5878365 5878366 EC55989_0390 EC55989_0391 insB insA TRUE 0.898 -81.000 0.000 0.030 Y NA
 5878367 5878368 EC55989_0392 EC55989_0393 phoA psiF FALSE 0.153 119.000 0.000 NA   NA
 5878368 5878369 EC55989_0393 EC55989_0394 psiF yaiC TRUE 0.476 102.000 0.250 NA   NA
 5878371 5878372 EC55989_0396 EC55989_0397 yaiI aroL FALSE 0.027 183.000 0.007 NA   NA
 5878372 5878373 EC55989_0397 EC55989_0398 aroL yaiA FALSE 0.392 50.000 0.044 NA   NA
 5878373 5878374 EC55989_0398 EC55989_0399 yaiA aroM FALSE 0.017 258.000 0.000 NA   NA
 5878374 5878375 EC55989_0399 EC55989_0400 aroM yaiE FALSE 0.270 72.000 0.049 NA   NA
 5878375 5878376 EC55989_0400 EC55989_0401 yaiE   FALSE 0.017 261.000 0.000 NA   NA
 5878379 5878380 EC55989_0404 EC55989_0405 araJ sbcC FALSE 0.045 126.000 0.030 NA N NA
 5878380 5878381 EC55989_0405 EC55989_0406 sbcC sbcD TRUE 0.992 -3.000 0.021 0.001 Y NA
 5878382 5878383 EC55989_0407 EC55989_0408 phoB phoR TRUE 0.960 58.000 0.453 0.084 Y NA
 5878385 5878386 EC55989_0410 EC55989_0411 brnQ proY TRUE 0.926 76.000 0.348 0.089 Y NA
 5878386 5878387 EC55989_0411 EC55989_0412 proY malZ FALSE 0.097 156.000 0.123 1.000 N NA
 5878389 5878390 EC55989_0414 EC55989_0415 queA tgt TRUE 0.966 56.000 0.360 0.001 Y NA
 5878390 5878391 EC55989_0415 EC55989_0416 tgt yajC TRUE 0.931 23.000 0.325 NA N NA
 5878391 5878392 EC55989_0416 EC55989_0417 yajC secD TRUE 0.932 28.000 0.045 NA Y NA
 5878392 5878393 EC55989_0417 EC55989_0418 secD secF TRUE 0.995 11.000 0.206 0.001 Y NA
 5878393 5878394 EC55989_0418 EC55989_0419 secF yajD FALSE 0.100 129.000 0.015 1.000   NA
 5878395 5878396 EC55989_0420 EC55989_0421 tsx yajI FALSE 0.012 299.000 0.000 NA   NA
 5878396 5878397 EC55989_0421 EC55989_0422 yajI   TRUE 0.909 4.000 0.000 NA   NA
 5878398 5878399 EC55989_0423 EC55989_0424 nrdR ribD TRUE 0.968 4.000 0.277 NA N NA
 5878399 5878400 EC55989_0424 EC55989_0425 ribD ribE TRUE 0.800 89.000 0.034 0.001 Y NA
 5878400 5878401 EC55989_0425 EC55989_0426 ribE nusB TRUE 0.954 20.000 0.347 1.000 N NA
 5878401 5878402 EC55989_0426 EC55989_0427 nusB thiL TRUE 0.494 78.000 0.225 1.000 N NA
 5878402 5878403 EC55989_0427 EC55989_0428 thiL pgpA TRUE 0.810 -22.000 0.206 1.000 N NA
 5878404 5878405 EC55989_0429 EC55989_0430 yajO dxs FALSE 0.155 55.000 0.009 1.000 N NA
 5878405 5878406 EC55989_0430 EC55989_0431 dxs ispA TRUE 0.955 25.000 0.060 1.000 Y NA
 5878406 5878407 EC55989_0431 EC55989_0432 ispA xseB TRUE 0.849 0.000 0.035 1.000 N NA
 5878409 5878410 EC55989_0435 EC55989_0436 yajL panE TRUE 0.740 -37.000 0.155 NA   NA
 5878414 5878415 EC55989_0440 EC55989_0441     TRUE 0.735 -16.000 0.000 1.000   NA
 5878415 5878416 EC55989_0441 EC55989_0442   cyoE FALSE 0.178 119.000 0.000 1.000   NA
 5878416 5878417 EC55989_0442 EC55989_0443 cyoE cyoD TRUE 0.947 12.000 0.118 0.089 N NA
 5878417 5878418 EC55989_0443 EC55989_0444 cyoD cyoC TRUE 0.998 0.000 0.485 0.051 Y NA
 5878418 5878419 EC55989_0444 EC55989_0445 cyoC cyoB TRUE 0.996 -10.000 0.697 0.051 Y NA
 5878419 5878420 EC55989_0445 EC55989_0446 cyoB cyoA TRUE 0.979 22.000 0.041 0.004 Y NA
 5878420 5878421 EC55989_0446 EC55989_0447 cyoA ampG FALSE 0.006 460.000 0.000 NA   NA
 5878421 5878422 EC55989_0447 EC55989_0448 ampG yajG TRUE 0.799 44.000 0.256 NA   NA
 5878423 5878424 EC55989_0449 EC55989_0450 bolA tig FALSE 0.005 344.000 0.000 NA N NA
 5878424 5878425 EC55989_0450 EC55989_0451 tig clpP FALSE 0.319 246.000 0.351 1.000 Y NA
 5878425 5878426 EC55989_0451 EC55989_0452 clpP clpX TRUE 0.790 126.000 0.352 1.000 Y NA
 5878428 5878429 EC55989_0453 EC55989_0454 lon hupB FALSE 0.021 209.000 0.000 1.000 N NA
 5878429 5878430 EC55989_0454 EC55989_0455 hupB ppiD FALSE 0.029 192.000 0.000 1.000 N NA
 5878430 5878431 EC55989_0455 EC55989_0456 ppiD ybaV FALSE 0.037 151.000 0.033 1.000 N NA
 5878431 5878432 EC55989_0456 EC55989_0457 ybaV ybaW FALSE 0.192 94.000 0.027 1.000   NA
 5878433 5878434 EC55989_0458 EC55989_0459 queC ybaE FALSE 0.273 65.000 0.019 1.000   NA
 5878435 5878436 EC55989_0460 EC55989_0461 cof ybaO FALSE 0.406 -75.000 0.020 1.000   NA
 5878436 5878437 EC55989_0461 EC55989_0462 ybaO mdlA TRUE 0.812 30.000 0.179 1.000 N NA
 5878437 5878438 EC55989_0462 EC55989_0463 mdlA mdlB TRUE 0.998 -7.000 0.911 0.005 Y NA
 5878438 5878439 EC55989_0463 EC55989_0464 mdlB glnK FALSE 0.021 181.000 0.028 1.000 N NA
 5878439 5878440 EC55989_0464 EC55989_0465 glnK amtB TRUE 0.787 30.000 0.156 1.000 N NA
 5878444 5878445 EC55989_misc_RNA_12 EC55989_0469 ffs ybaA FALSE 0.175 110.000 0.000 NA   NA
 5878446 5878447 EC55989_0470 EC55989_0471 ylaB ylaC FALSE 0.066 164.000 0.000 NA   NA
 5878447 5878448 EC55989_0471 EC55989_0472 ylaC maa FALSE 0.255 116.000 0.101 1.000   NA
 5878448 5878449 EC55989_0472 EC55989_0473 maa hha FALSE 0.059 171.000 0.000 NA   NA
 5878449 5878450 EC55989_0473 EC55989_0474 hha ybaJ FALSE 0.295 -220.000 0.000 NA   NA
 5878450 5878451 EC55989_0474 EC55989_0475 ybaJ acrB FALSE 0.005 546.000 0.000 NA   NA
 5878451 5878452 EC55989_0475 EC55989_0476 acrB acrA TRUE 0.959 23.000 0.458 1.000 N NA
 5878453 5878454 EC55989_0477 EC55989_0478 acrR kefA FALSE 0.074 128.000 0.000 NA N NA
 5878455 5878456 EC55989_0479 EC55989_0480 ybaM priC TRUE 0.980 14.000 0.474 NA   NA
 5878457 5878458 EC55989_0481 EC55989_0482 ybaN apt FALSE 0.064 153.000 0.043 NA   NA
 5878458 5878459 EC55989_0482 EC55989_0483 apt dnaX FALSE 0.130 129.000 0.088 1.000 N NA
 5878459 5878460 EC55989_0483 EC55989_0484 dnaX ybaB TRUE 0.820 53.000 0.411 NA   NA
 5878460 5878461 EC55989_0484 EC55989_0485 ybaB recR TRUE 0.993 0.000 0.604 NA   NA
 5878461 5878462 EC55989_0485 EC55989_0486 recR htpG FALSE 0.080 110.000 0.028 1.000 N NA
 5878462 5878463 EC55989_0486 EC55989_0487 htpG adk FALSE 0.062 181.000 0.035 0.094 N NA
 5878463 5878464 EC55989_0487 EC55989_0488 adk hemH FALSE 0.007 236.000 0.013 1.000 N NA
 5878467 5878468 EC55989_0491 EC55989_0492 ybaL fsr FALSE 0.011 238.000 0.000 NA N NA
 5878470 5878471 EC55989_misc_RNA_13 EC55989_0494 rybC ybaK FALSE 0.244 85.000 0.000 NA   NA
 5878476 5878477 EC55989_0498 EC55989_0499 ybaS ybaT TRUE 0.984 3.000 0.028 1.000 Y NA
 5878477 5878478 EC55989_0499 EC55989_0500 ybaT cueR FALSE 0.101 125.000 0.000 1.000 N NA
 5878479 5878480 EC55989_0501 EC55989_0502 ybbJ ybbK TRUE 0.996 0.000 0.313 NA Y NA
 5878481 5878482 EC55989_0503 EC55989_0504 ybbL ybbM TRUE 0.833 -13.000 0.127 NA   NA
 5878483 5878484 EC55989_0505 EC55989_0506 ybbN ybbO TRUE 0.510 61.000 0.118 1.000   NA
 5878484 5878485 EC55989_0506 EC55989_0507 ybbO tesA TRUE 0.819 -10.000 0.072 1.000   NA
 5878486 5878487 EC55989_0508 EC55989_0509 ybbA ybbP TRUE 0.997 -3.000 0.535 NA Y NA
 5878487 5878488 EC55989_0509 EC55989_0510 ybbP rhsD FALSE 0.003 430.000 0.000 NA N NA
 5878488 5878489 EC55989_0510 EC55989_0511 rhsD insA TRUE 0.470 34.000 0.000 NA N NA
 5878489 5878490 EC55989_0511 EC55989_0512 insA insB TRUE 0.898 -81.000 0.000 0.029 Y NA
 5878490 5878491 EC55989_0512 EC55989_0513 insB ybbC FALSE 0.182 107.000 0.000 NA   NA
 5878491 5878492 EC55989_0513 EC55989_0514 ybbC ylbH TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5878492 5878493 EC55989_0514 EC55989_0515 ylbH   TRUE 0.665 -19.000 0.000 NA   NA
 5878494 5878495 EC55989_0516 EC55989_0517     TRUE 0.729 -13.000 0.000 NA   NA
 5878495 5878496 EC55989_0517 EC55989_0518   ybbB FALSE 0.256 80.000 0.000 NA   NA
 5878496 5878497 EC55989_0518 EC55989_0519 ybbB ybbS FALSE 0.202 69.000 0.012 NA   NA
 5878498 5878499 EC55989_0520 EC55989_0521 allA allR TRUE 0.786 78.000 0.625 1.000 N NA
 5878499 5878500 EC55989_0521 EC55989_0522 allR gcl FALSE 0.258 90.000 0.054 1.000   NA
 5878500 5878501 EC55989_0522 EC55989_0523 gcl hyi TRUE 0.893 13.000 0.065 1.000   NA
 5878501 5878502 EC55989_0523 EC55989_0524 hyi glxR FALSE 0.300 100.000 0.154 1.000 N NA
 5878502 5878503 EC55989_0524 EC55989_0525 glxR ybbW FALSE 0.042 169.000 0.000 1.000 N NA
 5878503 5878504 EC55989_0525 EC55989_0526 ybbW allB TRUE 0.857 60.000 0.161 1.000 Y NA
 5878504 5878505 EC55989_0526 EC55989_0527 allB ybbY TRUE 0.867 57.000 0.161 1.000 Y NA
 5878505 5878506 EC55989_0527 EC55989_0528 ybbY glxK TRUE 0.850 22.000 0.133 1.000 N NA
 5878507 5878508 EC55989_0529 EC55989_0530 ylbA allC TRUE 0.887 11.000 0.059 NA   NA
 5878508 5878509 EC55989_0530 EC55989_0531 allC allD TRUE 0.883 22.000 0.174 1.000 N NA
 5878510 5878511 EC55989_0532 EC55989_0533 fdrA ylbE TRUE 0.982 10.000 0.412 NA   NA
 5878511 5878512 EC55989_0533 EC55989_0534 ylbE ylbF TRUE 0.968 11.000 0.265 NA   NA
 5878512 5878513 EC55989_0534 EC55989_0535 ylbF ybcF TRUE 0.984 -3.000 0.375 NA   NA
 5878514 5878515 EC55989_0536 EC55989_0537 purK purE TRUE 0.995 -3.000 0.136 0.001 Y NA
 5878515 5878516 EC55989_0537 EC55989_0538 purE lpxH FALSE 0.123 118.000 0.016 1.000   NA
 5878516 5878517 EC55989_0538 EC55989_0539 lpxH ppiB TRUE 0.978 3.000 0.237 1.000   NA
 5878519 5878520 EC55989_0541 EC55989_0542 ybcI ybcJ FALSE 0.110 108.000 0.011 NA   NA
 5878520 5878521 EC55989_0542 EC55989_0543 ybcJ folD TRUE 0.931 2.000 0.055 1.000   NA
 5878522 5878523 EC55989_0544 EC55989_0545 sfmA sfmC FALSE 0.152 220.000 0.000 1.000 Y NA
 5878523 5878524 EC55989_0545 EC55989_0546 sfmC sfmD TRUE 0.993 31.000 0.875 1.000 Y NA
 5878524 5878525 EC55989_0546 EC55989_0547 sfmD sfmH TRUE 0.987 43.000 0.875 1.000 Y NA
 5878525 5878526 EC55989_0547 EC55989_0548 sfmH sfmF TRUE 0.999 11.000 0.875 0.011 Y NA
 5878529 5878530 EC55989_0550 EC55989_0551   envY TRUE 0.847 -6.000 0.000 NA   NA
 5878530 5878531 EC55989_0551 EC55989_0552 envY ybcH FALSE 0.048 183.000 0.000 NA   NA
 5878531 5878532 EC55989_0552 EC55989_0553 ybcH nfrA TRUE 0.990 1.000 0.500 NA   NA
 5878532 5878533 EC55989_0553 EC55989_0554 nfrA nfrB TRUE 0.875 -13.000 0.159 1.000   NA
 5878533 5878534 EC55989_0554 EC55989_0555 nfrB yhhI FALSE 0.010 269.000 0.000 1.000 N NA
 5878534 5878535 EC55989_0555 EC55989_0556 yhhI   FALSE 0.190 104.000 0.000 NA   NA
 5878535 5878536 EC55989_0556 EC55989_0557     FALSE 0.163 115.000 0.000 NA   NA
 5878536 5878537 EC55989_0557 EC55989_0558     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5878537 5878538 EC55989_0558 EC55989_0559     TRUE 0.814 20.000 0.000 NA   NA
 5878538 5878539 EC55989_0559 EC55989_0560     TRUE 0.900 28.000 0.250 NA   NA
 5878539 5878540 EC55989_0560 EC55989_0561   cusS FALSE 0.004 737.000 0.000 NA   NA
 5878540 5878541 EC55989_0561 EC55989_0562 cusS cusR TRUE 0.993 -22.000 0.600 0.002 Y NA
 5878542 5878543 EC55989_0563 EC55989_0564 cusC cusF TRUE 0.967 24.000 0.500 NA   NA
 5878543 5878544 EC55989_0564 EC55989_0565 cusF cusB TRUE 0.843 16.000 0.000 NA   NA
 5878544 5878545 EC55989_0565 EC55989_0566 cusB cusA TRUE 0.981 12.000 0.500 1.000 N NA
 5878545 5878546 EC55989_0566 EC55989_0567 cusA pheP FALSE 0.277 102.000 0.000 0.088 N NA
 5878547 5878548 EC55989_0568 EC55989_0569 ybdG nfnB FALSE 0.037 108.000 0.012 NA N NA
 5878548 5878549 EC55989_0569 EC55989_0570 nfnB ybdF TRUE 0.709 94.000 0.500 NA   NA
 5878549 5878550 EC55989_0570 EC55989_0571 ybdF ybdJ FALSE 0.324 65.000 0.000 NA   NA
 5878550 5878551 EC55989_0571 EC55989_0572 ybdJ ybdK FALSE 0.318 66.000 0.000 NA   NA
 5878553 5878554 EC55989_0574 EC55989_0575 entD fepA FALSE 0.458 166.000 0.700 1.000 N NA
 5878555 5878556 EC55989_0576 EC55989_0577 fes ybdZ TRUE 0.982 3.000 0.320 NA   NA
 5878556 5878557 EC55989_0577 EC55989_0578 ybdZ entF TRUE 0.926 -3.000 0.080 NA   NA
 5878557 5878558 EC55989_0578 EC55989_0579 entF fepE FALSE 0.019 216.000 0.000 1.000 N NA
 5878559 5878560 EC55989_0580 EC55989_0581 fepC fepG TRUE 0.984 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 5878560 5878561 EC55989_0581 EC55989_0582 fepG fepD TRUE 0.991 -3.000 0.000 0.056 Y NA
 5878564 5878565 EC55989_0585 EC55989_0586 entC entE TRUE 0.997 10.000 0.667 1.000 Y NA
 5878565 5878566 EC55989_0586 EC55989_0587 entE entB TRUE 0.997 14.000 0.667 1.000 Y NA
 5878566 5878567 EC55989_0587 EC55989_0588 entB entA TRUE 0.986 0.000 0.024 1.000 Y NA
 5878567 5878568 EC55989_0588 EC55989_0589 entA ybdB TRUE 0.986 3.000 0.065 NA Y NA
 5878568 5878569 EC55989_0589 EC55989_0590 ybdB cstA FALSE 0.110 181.000 0.222 NA N NA
 5878569 5878570 EC55989_0590 EC55989_0591 cstA ybdD FALSE 0.214 182.000 0.333 NA   NA
 5878573 5878574 EC55989_0594 EC55989_0595 ibrB ibrA TRUE 0.643 -27.000 0.000 1.000   NA
 5878574 5878575 EC55989_0595 EC55989_0596 ibrA ybdO FALSE 0.365 147.000 0.333 1.000   NA
 5878575 5878576 EC55989_0596 EC55989_0597 ybdO dsbG FALSE 0.024 209.000 0.067 1.000 N NA
 5878577 5878578 EC55989_0598 EC55989_0599 ahpC ahpF TRUE 0.918 129.000 0.551 0.001 Y NA
 5878581 5878582 EC55989_0602 EC55989_0603 rnk rna FALSE 0.008 230.000 0.018 1.000 N NA
 5878582 5878583 EC55989_0603 EC55989_0604 rna citT FALSE 0.070 114.000 0.024 1.000 N NA
 5878583 5878584 EC55989_0604 EC55989_0605 citT citG TRUE 0.618 51.000 0.194 1.000 N NA
 5878584 5878585 EC55989_0605 EC55989_0606 citG citX TRUE 0.976 -25.000 0.400 1.000 Y NA
 5878585 5878586 EC55989_0606 EC55989_0607 citX citF TRUE 0.872 4.000 0.000 1.000 N NA
 5878586 5878587 EC55989_0607 EC55989_0608 citF citE TRUE 0.954 11.000 0.000 0.001 N NA
 5878587 5878588 EC55989_0608 EC55989_0609 citE citD TRUE 0.994 -3.000 0.537 0.001 N NA
 5878588 5878589 EC55989_0609 EC55989_0610 citD citC TRUE 0.975 15.000 0.000 1.000 Y NA
 5878590 5878591 EC55989_0611 EC55989_0612 citA citB TRUE 0.906 -31.000 0.000 1.000 Y NA
 5878593 5878594 EC55989_0615 EC55989_0616 crcA cspE FALSE 0.256 175.000 0.333 1.000   NA
 5878596 5878597 EC55989_0618 EC55989_0619 ybeM tatE FALSE 0.320 129.000 0.196 1.000   NA
 5878598 5878599 EC55989_0620 EC55989_0621 lipA ybeF FALSE 0.009 209.000 0.005 1.000 N NA
 5878599 5878600 EC55989_0621 EC55989_0622 ybeF lipB FALSE 0.012 259.000 0.000 1.000 N NA
 5878600 5878601 EC55989_0622 EC55989_0623 lipB ybeD FALSE 0.441 101.000 0.219 NA   NA
 5878601 5878602 EC55989_0623 EC55989_0624 ybeD dacA FALSE 0.212 111.000 0.081 NA   NA
 5878602 5878603 EC55989_0624 EC55989_0625 dacA rlpA TRUE 0.774 139.000 0.475 NA Y NA
 5878603 5878604 EC55989_0625 EC55989_0626 rlpA mrdB TRUE 0.712 11.000 0.035 NA N NA
 5878604 5878605 EC55989_0626 EC55989_0627 mrdB mrdA TRUE 0.861 3.000 0.046 1.000 N NA
 5878605 5878606 EC55989_0627 EC55989_0628 mrdA ybeA TRUE 0.582 31.000 0.031 NA   NA
 5878606 5878607 EC55989_0628 EC55989_0629 ybeA ybeB TRUE 0.979 4.000 0.307 NA   NA
 5878607 5878608 EC55989_0629 EC55989_0630 ybeB phpB FALSE 0.017 261.000 0.000 NA   NA
 5878608 5878609 EC55989_0630 EC55989_0631 phpB nadD TRUE 0.692 24.000 0.057 1.000 N NA
 5878609 5878610 EC55989_0631 EC55989_0632 nadD holA TRUE 0.865 2.000 0.045 1.000 N NA
 5878610 5878611 EC55989_0632 EC55989_0633 holA rlpB TRUE 0.961 0.000 0.199 NA N NA
 5878611 5878612 EC55989_0633 EC55989_0634 rlpB leuS TRUE 0.914 15.000 0.182 NA N NA
 5878615 5878616 EC55989_0637 EC55989_0638 ybeR djlB TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5878618 5878619 EC55989_0640 EC55989_0641 ybeU djlC TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5878620 5878621 EC55989_0642 EC55989_misc_RNA_15 hscC RNAout TRUE 0.786 -9.000 0.000 NA   NA
 5878623 5878624 EC55989_0644 EC55989_0645 hscC rihA FALSE 0.247 84.000 0.000 NA   NA
 5878624 5878625 EC55989_0645 EC55989_0646 rihA gltL FALSE 0.268 118.000 0.195 NA N NA
 5878625 5878626 EC55989_0646 EC55989_0647 gltL gltK TRUE 0.997 0.000 0.379 1.000 Y NA
 5878626 5878627 EC55989_0647 EC55989_0648 gltK gltJ TRUE 0.999 0.000 0.933 0.017 Y NA
 5878627 5878628 EC55989_0648 EC55989_misc_RNA_16 gltJ   TRUE 0.876 12.000 0.000 NA   NA
 5878628 5878629 EC55989_misc_RNA_16 EC55989_0649   gltI TRUE 0.921 1.000 0.000 NA   NA
 5878630 5878631 EC55989_0650 EC55989_0651     TRUE 0.852 15.000 0.000 NA   NA
 5878632 5878633 EC55989_0652 EC55989_0653 lnt ybeX TRUE 0.963 25.000 0.557 1.000 N NA
 5878633 5878634 EC55989_0653 EC55989_0654 ybeX ybeY FALSE 0.392 90.000 0.150 NA   NA
 5878634 5878635 EC55989_0654 EC55989_0655 ybeY ybeZ TRUE 0.987 -3.000 0.457 NA   NA
 5878635 5878636 EC55989_0655 EC55989_0656 ybeZ miaB FALSE 0.342 114.000 0.220 1.000 N NA
 5878638 5878639 EC55989_tRNA94 EC55989_tRNA93     TRUE 0.587 38.000 0.000 NA   NA
 5878639 5878640 EC55989_tRNA93 EC55989_tRNA92     FALSE 0.442 49.000 0.000 NA   NA
 5878640 5878641 EC55989_tRNA92 EC55989_tRNA91     TRUE 0.843 16.000 0.000 NA   NA
 5878641 5878642 EC55989_tRNA91 EC55989_tRNA90     TRUE 0.619 35.000 0.000 NA   NA
 5878642 5878643 EC55989_tRNA90 EC55989_tRNA89     TRUE 0.768 24.000 0.000 NA   NA
 5878643 5878644 EC55989_tRNA89 EC55989_tRNA88     TRUE 0.893 9.000 0.000 NA   NA
 5878644 5878645 EC55989_tRNA88 EC55989_0660   asnB FALSE 0.007 381.000 0.000 NA   NA
 5878645 5878646 EC55989_0660 EC55989_0661 asnB nagD FALSE 0.012 257.000 0.000 1.000 N NA
 5878646 5878647 EC55989_0661 EC55989_0662 nagD nagC TRUE 0.860 48.000 0.070 1.000 Y NA
 5878647 5878648 EC55989_0662 EC55989_0663 nagC nagA TRUE 0.997 9.000 0.571 1.000 Y NA
 5878648 5878649 EC55989_0663 EC55989_0664 nagA nagB TRUE 0.976 60.000 0.557 0.001 Y NA
 5878650 5878651 EC55989_0665 EC55989_0666 nagE glnS FALSE 0.010 203.000 0.006 1.000 N NA
 5878651 5878652 EC55989_0666 EC55989_0667 glnS ybfM FALSE 0.007 446.000 0.000 1.000   NA
 5878652 5878653 EC55989_0667 EC55989_0668 ybfM ybfN FALSE 0.430 50.000 0.000 NA   NA
 5878656 5878657 EC55989_0671 EC55989_0672 fldA ybfE TRUE 0.507 140.000 0.473 1.000   NA
 5878657 5878658 EC55989_0672 EC55989_0673 ybfE ybfF FALSE 0.323 140.000 0.276 NA   NA
 5878659 5878660 EC55989_0674 EC55989_0675 seqA pgm TRUE 0.825 26.000 0.151 1.000 N NA
 5878661 5878662 EC55989_0676 EC55989_0677 potE speF TRUE 0.988 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 5878662 5878663 EC55989_0677 EC55989_0678 speF kdpE FALSE 0.003 690.000 0.000 1.000 N NA
 5878663 5878664 EC55989_0678 EC55989_0679 kdpE kdpD TRUE 0.996 -3.000 0.385 1.000 Y NA
 5878664 5878665 EC55989_0679 EC55989_0680 kdpD kdpC TRUE 0.837 -7.000 0.100 1.000 N NA
 5878665 5878666 EC55989_0680 EC55989_0681 kdpC kdpB TRUE 0.999 9.000 0.877 0.001 Y NA
 5878666 5878667 EC55989_0681 EC55989_0682 kdpB kdpA TRUE 0.990 23.000 0.201 0.001 Y NA
 5878668 5878669 EC55989_0683 EC55989_0684 ybfA rhsC FALSE 0.021 243.000 0.000 NA   NA
 5878669 5878670 EC55989_0684 EC55989_0685 rhsC ybfB TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5878670 5878671 EC55989_0685 EC55989_0686 ybfB ybfO FALSE 0.156 118.000 0.000 NA   NA
 5878671 5878672 EC55989_0686 EC55989_0687 ybfO ybfC TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5878672 5878673 EC55989_0687 EC55989_0688 ybfC yhhI FALSE 0.024 226.000 0.000 NA   NA
 5878673 5878674 EC55989_0688 EC55989_0689 yhhI yhhI FALSE 0.035 201.000 0.000 NA   NA
 5878674 5878675 EC55989_0689 EC55989_0690 yhhI ybgA FALSE 0.087 148.000 0.000 NA   NA
 5878675 5878676 EC55989_0690 EC55989_0691 ybgA phr TRUE 0.859 -3.000 0.019 NA   NA
 5878678 5878679 EC55989_0693 EC55989_0694 ybgI ybgJ TRUE 0.764 23.000 0.050 NA   NA
 5878679 5878680 EC55989_0694 EC55989_0695 ybgJ ybgK TRUE 0.992 -6.000 0.379 NA Y NA
 5878680 5878681 EC55989_0695 EC55989_0696 ybgK ybgL TRUE 0.908 -10.000 0.211 NA   NA
 5878681 5878682 EC55989_0696 EC55989_0697 ybgL nei TRUE 0.599 36.000 0.037 1.000   NA
 5878683 5878684 EC55989_0698 EC55989_0699 abrB ybgO FALSE 0.077 152.000 0.000 NA   NA
 5878684 5878685 EC55989_0699 EC55989_0700 ybgO ybgP TRUE 0.922 -3.000 0.000 1.000   NA
 5878685 5878686 EC55989_0700 EC55989_0701 ybgP ybgQ TRUE 0.961 -9.000 0.000 1.000 Y NA
 5878686 5878687 EC55989_0701 EC55989_0702 ybgQ   TRUE 0.983 9.000 0.000 1.000 Y NA
 5878687 5878688 EC55989_0702 EC55989_0703   gltA FALSE 0.005 390.000 0.000 1.000 N NA
 5878688 5878689 EC55989_0703 EC55989_0704 gltA   FALSE 0.033 206.000 0.000 NA   NA
 5878690 5878691 EC55989_0705 EC55989_0706 sdhC sdhD TRUE 0.997 -6.000 0.453 0.001 Y NA
 5878691 5878692 EC55989_0706 EC55989_0707 sdhD sdhA TRUE 0.999 0.000 0.705 0.002 Y NA
 5878692 5878693 EC55989_0707 EC55989_0708 sdhA sdhB TRUE 0.998 16.000 0.604 0.002 Y NA
 5878693 5878694 EC55989_0708 EC55989_0709 sdhB sucA FALSE 0.210 201.000 0.067 1.000 Y NA
 5878694 5878695 EC55989_0709 EC55989_0710 sucA sucB TRUE 0.996 15.000 0.667 1.000 Y NA
 5878695 5878696 EC55989_0710 EC55989_0711 sucB sucC TRUE 0.739 94.000 0.136 1.000 Y NA
 5878696 5878697 EC55989_0711 EC55989_0712 sucC sucD TRUE 0.999 0.000 0.806 0.001 Y NA
 5878697 5878698 EC55989_0712 EC55989_misc_RNA_17 sucD rybD TRUE 0.921 1.000 0.000 NA   NA
 5878700 5878701 EC55989_0714 EC55989_0715 mngA mngB TRUE 0.967 18.000 0.036 1.000 Y NA
 5878701 5878702 EC55989_0715 EC55989_0716 mngB   TRUE 0.751 25.000 0.000 NA   NA
 5878702 5878703 EC55989_0716 EC55989_0718   cydA FALSE 0.005 595.000 0.000 NA   NA
 5878703 5878704 EC55989_0718 EC55989_0719 cydA cydB TRUE 0.984 16.000 0.000 0.050 Y NA
 5878704 5878705 EC55989_0719 EC55989_0720 cydB ybgE FALSE 0.190 128.000 0.100 NA   NA
 5878705 5878706 EC55989_0720 EC55989_0721 ybgE ybgC FALSE 0.115 150.000 0.095 NA   NA
 5878706 5878707 EC55989_0721 EC55989_0722 ybgC tolQ TRUE 0.992 -3.000 0.593 1.000   NA
 5878707 5878708 EC55989_0722 EC55989_0723 tolQ tolR TRUE 0.998 4.000 0.556 0.069 Y NA
 5878708 5878709 EC55989_0723 EC55989_0724 tolR tolA FALSE 0.338 65.000 0.114 NA N NA
 5878709 5878710 EC55989_0724 EC55989_0725 tolA tolB FALSE 0.059 133.000 0.051 NA N NA
 5878710 5878711 EC55989_0725 EC55989_0726 tolB pal TRUE 0.939 35.000 0.592 1.000 N NA
 5878711 5878712 EC55989_0726 EC55989_0727 pal ybgF TRUE 0.929 10.000 0.088 1.000   NA
 5878712 5878713 EC55989_0727 EC55989_tRNA8 ybgF   FALSE 0.065 165.000 0.000 NA   NA
 5878713 5878714 EC55989_tRNA8 EC55989_tRNA9     TRUE 0.611 36.000 0.000 NA   NA
 5878714 5878715 EC55989_tRNA9 EC55989_tRNA10     TRUE 0.916 3.000 0.000 NA   NA
 5878715 5878716 EC55989_tRNA10 EC55989_tRNA11     FALSE 0.081 150.000 0.000 NA   NA
 5878716 5878717 EC55989_tRNA11 EC55989_tRNA12     TRUE 0.909 4.000 0.000 NA   NA
 5878717 5878718 EC55989_tRNA12 EC55989_tRNA13     FALSE 0.089 147.000 0.000 NA   NA
 5878718 5878719 EC55989_tRNA13 EC55989_tRNA14     TRUE 0.630 34.000 0.000 NA   NA
 5878719 5878720 EC55989_tRNA14 EC55989_0729   nadA FALSE 0.007 405.000 0.000 NA   NA
 5878720 5878721 EC55989_0729 EC55989_0730 nadA pnuC TRUE 0.889 38.000 0.023 1.000 Y NA
 5878722 5878723 EC55989_0731 EC55989_0732 zitB ybgS FALSE 0.167 114.000 0.057 NA   NA
 5878725 5878726 EC55989_0734 EC55989_0735 gpmA galM FALSE 0.155 205.000 0.009 1.000 Y NA
 5878726 5878727 EC55989_0735 EC55989_0736 galM galK TRUE 0.989 -6.000 0.083 0.001 Y NA
 5878727 5878728 EC55989_0736 EC55989_0737 galK galT TRUE 0.991 4.000 0.370 0.001 N NA
 5878728 5878729 EC55989_0737 EC55989_0738 galT galE TRUE 0.955 10.000 0.053 0.001 N NA
 5878729 5878730 EC55989_0738 EC55989_0739 galE modF FALSE 0.014 261.000 0.023 1.000   NA
 5878730 5878731 EC55989_0739 EC55989_0740 modF   TRUE 0.477 -72.000 0.000 NA   NA
 5878731 5878732 EC55989_0740 EC55989_0741   modE TRUE 0.847 -6.000 0.000 NA   NA
 5878733 5878734 EC55989_0742 EC55989_0743 ybhT modA FALSE 0.073 167.000 0.072 NA   NA
 5878734 5878735 EC55989_0743 EC55989_0744 modA modB TRUE 0.999 0.000 0.627 0.001 Y NA
 5878735 5878736 EC55989_0744 EC55989_0745 modB modC TRUE 0.999 3.000 0.537 0.001 Y NA
 5878740 5878741 EC55989_0749 EC55989_0750 insA insB TRUE 0.898 -81.000 0.000 0.029 Y NA
 5878741 5878742 EC55989_0750 EC55989_0751 insB ybhH TRUE 0.639 33.000 0.000 NA   NA
 5878742 5878743 EC55989_0751 EC55989_0752 ybhH ybhI FALSE 0.271 76.000 0.000 NA   NA
 5878743 5878744 EC55989_0752 EC55989_0753 ybhI ybhJ FALSE 0.160 183.000 0.300 1.000 N NA
 5878745 5878746 EC55989_0754 EC55989_0755 ybhC int FALSE 0.228 135.000 0.200 1.000 N NA
 5878748 5878749 EC55989_0758 EC55989_0759     FALSE 0.456 99.000 0.222 NA   NA
 5878749 5878750 EC55989_0759 EC55989_0761     TRUE 0.665 -19.000 0.000 NA   NA
 5878750 5878751 EC55989_0761 EC55989_0762     FALSE 0.077 152.000 0.000 NA   NA
 5878751 5878752 EC55989_0762 EC55989_0763     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5878752 5878753 EC55989_0763 EC55989_0764     TRUE 0.877 6.000 0.040 NA   NA
 5878753 5878754 EC55989_0764 EC55989_0765     FALSE 0.271 76.000 0.000 NA   NA
 5878754 5878755 EC55989_0765 EC55989_0766     FALSE 0.005 514.000 0.000 NA   NA
 5878756 5878757 EC55989_0767 EC55989_0768 cro   FALSE 0.300 70.000 0.000 NA   NA
 5878757 5878758 EC55989_0768 EC55989_0769     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5878758 5878759 EC55989_0769 EC55989_0770     TRUE 0.983 -3.000 0.333 1.000   NA
 5878759 5878760 EC55989_0770 EC55989_0771     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5878760 5878761 EC55989_0771 EC55989_0772   emrE FALSE 0.310 68.000 0.000 NA   NA
 5878761 5878762 EC55989_0772 EC55989_0773 emrE ybcK FALSE 0.012 256.000 0.000 1.000 N NA
 5878762 5878763 EC55989_0773 EC55989_0774 ybcK   TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5878763 5878764 EC55989_0774 EC55989_0775     TRUE 0.509 -61.000 0.000 NA   NA
 5878764 5878765 EC55989_0775 EC55989_0776     FALSE 0.011 319.000 0.000 NA   NA
 5878765 5878766 EC55989_0776 EC55989_0777   ybcN FALSE 0.039 195.000 0.000 NA   NA
 5878766 5878767 EC55989_0777 EC55989_0778 ybcN ninE TRUE 0.964 0.000 0.154 NA   NA
 5878767 5878768 EC55989_0778 EC55989_0779 ninE ybcO TRUE 0.819 -7.000 0.000 NA   NA
 5878768 5878769 EC55989_0779 EC55989_0780 ybcO rusA FALSE 0.124 131.000 0.000 NA   NA
 5878769 5878770 EC55989_0780 EC55989_0781 rusA ybcQ FALSE 0.025 223.000 0.000 NA   NA
 5878772 5878773 EC55989_0783 EC55989_0784 essD ybcS TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5878773 5878774 EC55989_0784 EC55989_0785 ybcS   TRUE 0.750 -15.000 0.000 1.000   NA
 5878774 5878775 EC55989_0785 EC55989_0786     FALSE 0.033 206.000 0.000 NA   NA
 5878776 5878777 EC55989_0787 EC55989_0788   ynfO TRUE 0.540 42.000 0.000 NA   NA
 5878778 5878779 EC55989_0789 EC55989_0790 nohB A TRUE 0.614 -25.000 0.000 NA   NA
 5878779 5878780 EC55989_0790 EC55989_0791 A   TRUE 0.496 45.000 0.000 NA   NA
 5878780 5878781 EC55989_0791 EC55989_0792   W TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5878781 5878782 EC55989_0792 EC55989_0793 W B TRUE 0.946 -3.000 0.100 1.000   NA
 5878782 5878783 EC55989_0793 EC55989_0794 B C FALSE 0.366 -154.000 0.000 1.000   NA
 5878783 5878784 EC55989_0794 EC55989_0795 C D TRUE 0.923 4.000 0.000 1.000   NA
 5878784 5878785 EC55989_0795 EC55989_0796 D E TRUE 0.690 29.000 0.000 NA   NA
 5878785 5878786 EC55989_0796 EC55989_0797 E fI TRUE 0.916 3.000 0.000 NA   NA
 5878786 5878787 EC55989_0797 EC55989_0798 fI fII TRUE 0.876 12.000 0.000 NA   NA
 5878787 5878788 EC55989_0798 EC55989_0799 fII   TRUE 0.876 12.000 0.000 NA   NA
 5878788 5878789 EC55989_0799 EC55989_0800     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5878789 5878790 EC55989_0800 EC55989_0801     TRUE 0.641 -22.000 0.000 NA   NA
 5878790 5878791 EC55989_0801 EC55989_0802     TRUE 0.843 16.000 0.000 NA   NA
 5878791 5878792 EC55989_0802 EC55989_0803     TRUE 0.966 -18.000 0.667 NA   NA
 5878792 5878793 EC55989_0803 EC55989_0804     TRUE 0.819 -7.000 0.000 NA   NA
 5878793 5878794 EC55989_0804 EC55989_0805     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5878794 5878795 EC55989_0805 EC55989_0806     TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5878795 5878796 EC55989_0806 EC55989_0807     TRUE 0.899 6.000 0.000 NA   NA
 5878796 5878797 EC55989_0807 EC55989_0808     FALSE 0.371 -102.000 0.000 NA   NA
 5878797 5878798 EC55989_0808 EC55989_0809     FALSE 0.341 61.000 0.000 NA   NA
 5878798 5878799 EC55989_0809 EC55989_0810     FALSE 0.295 71.000 0.000 NA   NA
 5878799 5878800 EC55989_0810 EC55989_0811     FALSE 0.394 59.000 0.000 1.000   NA
 5878800 5878801 EC55989_0811 EC55989_0812   tfaQ TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5878803 5878804 EC55989_0814 EC55989_0815     FALSE 0.016 265.000 0.000 NA   NA
 5878805 5878806 EC55989_0816 EC55989_0817 ybhB bioA FALSE 0.225 59.000 0.003 NA   NA
 5878807 5878808 EC55989_0818 EC55989_0819 bioB bioF TRUE 0.996 -3.000 0.168 0.002 Y NA
 5878808 5878809 EC55989_0819 EC55989_0820 bioF bioC TRUE 0.981 -13.000 0.133 0.002 Y NA
 5878809 5878810 EC55989_0820 EC55989_0821 bioC bioD TRUE 0.984 -7.000 0.054 0.002 Y NA
 5878810 5878811 EC55989_0821 EC55989_0822 bioD uvrB FALSE 0.008 579.000 0.000 0.091 N NA
 5878813 5878814 EC55989_0824 EC55989_0825 moaA moaB TRUE 0.985 22.000 0.108 0.003 Y NA
 5878814 5878815 EC55989_0825 EC55989_0826 moaB moaC TRUE 0.995 3.000 0.109 0.003 Y NA
 5878815 5878816 EC55989_0826 EC55989_0827 moaC moaD TRUE 0.990 -7.000 0.175 0.003 Y NA
 5878816 5878817 EC55989_0827 EC55989_0828 moaD moaE TRUE 0.999 2.000 0.501 0.003 Y NA
 5878817 5878818 EC55989_0828 EC55989_0829 moaE ybhL FALSE 0.076 137.000 0.025 NA   NA
 5878818 5878819 EC55989_0829 EC55989_0830 ybhL   FALSE 0.073 145.000 0.037 NA   NA
 5878819 5878820 EC55989_0830 EC55989_0831   ybhM FALSE 0.249 70.000 0.037 NA   NA
 5878821 5878822 EC55989_0832 EC55989_0833 ybhN ybhO TRUE 0.934 0.000 0.071 NA   NA
 5878822 5878823 EC55989_0833 EC55989_0834 ybhO ybhP TRUE 0.981 -3.000 0.333 NA   NA
 5878825 5878826 EC55989_0836 EC55989_0837 ybhR ybhS TRUE 0.998 11.000 0.609 0.005 Y NA
 5878826 5878827 EC55989_0837 EC55989_0838 ybhS ybhF TRUE 0.986 -7.000 0.547 0.090   NA
 5878827 5878828 EC55989_0838 EC55989_0839 ybhF ybhG TRUE 0.980 -7.000 0.545 1.000   NA
 5878828 5878829 EC55989_0839 EC55989_0840 ybhG ybiH TRUE 0.973 0.000 0.236 1.000 N NA
 5878832 5878833 EC55989_0843 EC55989_0844 dinG ybiB TRUE 0.556 28.000 0.041 1.000 N NA
 5878833 5878834 EC55989_0844 EC55989_0845 ybiB ybiC FALSE 0.162 141.000 0.000 0.055 N NA
 5878835 5878836 EC55989_0846 EC55989_0847 ybiJ ybiI FALSE 0.011 265.000 0.027 NA   NA
 5878836 5878837 EC55989_0847 EC55989_0848 ybiI ybiX FALSE 0.319 74.000 0.000 1.000   NA
 5878837 5878838 EC55989_0848 EC55989_0849 ybiX fiu TRUE 0.766 42.000 0.171 1.000   NA
 5878838 5878839 EC55989_0849 EC55989_0850 fiu ybiM FALSE 0.016 265.000 0.000 NA   NA
 5878841 5878842 EC55989_0852 EC55989_0853 ybiO glnQ FALSE 0.089 117.000 0.000 NA N NA
 5878842 5878843 EC55989_0853 EC55989_0854 glnQ glnP TRUE 0.984 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 5878843 5878844 EC55989_0854 EC55989_0855 glnP glnH TRUE 0.549 139.000 0.051 0.068 Y NA
 5878844 5878845 EC55989_0855 EC55989_0856 glnH dps FALSE 0.005 404.000 0.000 1.000 N NA
 5878845 5878846 EC55989_0856 EC55989_0857 dps rhtA FALSE 0.010 299.000 0.044 NA   NA
 5878848 5878849 EC55989_0859 EC55989_misc_RNA_18 ybiP rybA FALSE 0.008 355.000 0.000 NA   NA
 5878850 5878851 EC55989_0860 EC55989_0861 mntR ybiR TRUE 0.760 -3.000 0.014 1.000 N NA
 5878853 5878854 EC55989_0863 EC55989_0865 ybiT   FALSE 0.017 279.000 0.000 1.000   NA
 5878855 5878856 EC55989_0866 EC55989_0867 ybiU ybiV FALSE 0.077 152.000 0.000 NA   NA
 5878856 5878857 EC55989_0867 EC55989_0868 ybiV ybiW FALSE 0.107 146.000 0.000 1.000   NA
 5878857 5878858 EC55989_0868 EC55989_0869 ybiW ybiY TRUE 0.987 6.000 0.316 0.003 N NA
 5878860 5878861 EC55989_0871 EC55989_0872 moeB moeA TRUE 0.998 0.000 0.323 0.003 Y NA
 5878862 5878863 EC55989_0873 EC55989_0874 iaaA yliA TRUE 0.888 20.000 0.104 1.000   NA
 5878863 5878864 EC55989_0874 EC55989_0875 yliA yliB TRUE 0.871 20.000 0.083 1.000   NA
 5878864 5878865 EC55989_0875 EC55989_0876 yliB yliC TRUE 0.998 18.000 0.803 0.055 Y NA
 5878865 5878866 EC55989_0876 EC55989_0877 yliC yliD TRUE 0.999 3.000 0.689 0.055 Y NA
 5878866 5878867 EC55989_0877 EC55989_0878 yliD yliE FALSE 0.028 178.000 0.000 NA N NA
 5878867 5878868 EC55989_0878 EC55989_0879 yliE yliF TRUE 0.981 8.000 0.000 NA Y NA
 5878870 5878871 EC55989_0881 EC55989_0882 bssR yliI FALSE 0.155 111.000 0.047 NA   NA
 5878874 5878875 EC55989_0885 EC55989_0886 deoR ybjG TRUE 0.691 58.000 0.235 1.000   NA
 5878877 5878878 EC55989_0888 EC55989_0889 ybjH ybjI FALSE 0.242 86.000 0.000 NA   NA
 5878878 5878879 EC55989_0889 EC55989_0890 ybjI ybjJ TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5878881 5878882 EC55989_misc_RNA_19 EC55989_0892 rybB ybjL FALSE 0.266 77.000 0.000 NA   NA
 5878885 5878886 EC55989_0895 EC55989_0896 ybjC nfsA TRUE 0.842 -16.000 0.159 NA   NA
 5878886 5878887 EC55989_0896 EC55989_0897 nfsA rimK FALSE 0.261 61.000 0.000 1.000 N NA
 5878887 5878888 EC55989_0897 EC55989_0898 rimK ybjN FALSE 0.251 88.000 0.065 NA   NA
 5878888 5878889 EC55989_0898 EC55989_0899 ybjN potF FALSE 0.008 352.000 0.000 NA   NA
 5878889 5878890 EC55989_0899 EC55989_0900 potF potG TRUE 0.933 95.000 0.679 1.000 Y NA
 5878890 5878891 EC55989_0900 EC55989_0901 potG potH TRUE 0.998 10.000 0.857 1.000 Y NA
 5878891 5878892 EC55989_0901 EC55989_0902 potH potI TRUE 0.996 -7.000 0.528 0.055 Y NA
 5878892 5878893 EC55989_0902 EC55989_0903 potI ybjO TRUE 0.679 60.000 0.264 NA   NA
 5878893 5878894 EC55989_0903 EC55989_0904 ybjO rumB TRUE 0.810 41.000 0.226 NA   NA
 5878895 5878896 EC55989_0905 EC55989_0906 artJ artM FALSE 0.171 292.000 0.143 0.068 Y NA
 5878896 5878897 EC55989_0906 EC55989_0907 artM artQ TRUE 0.999 0.000 0.714 0.016 Y NA
 5878897 5878898 EC55989_0907 EC55989_0908 artQ artI TRUE 0.996 7.000 0.260 0.055 Y NA
 5878898 5878899 EC55989_0908 EC55989_0909 artI artP TRUE 0.990 18.000 0.323 1.000 Y NA
 5878899 5878900 EC55989_0909 EC55989_0910 artP ybjP FALSE 0.034 218.000 0.081 NA   NA
 5878901 5878902 EC55989_0911 EC55989_0912 ybjQ ybjR TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5878903 5878904 EC55989_0913 EC55989_0914 ybjS ybjT TRUE 0.728 99.000 0.022 0.008 Y NA
 5878904 5878905 EC55989_0914 EC55989_0915 ybjT ltaE TRUE 0.867 11.000 0.074 1.000 N NA
 5878905 5878906 EC55989_0915 EC55989_0916 ltaE poxB TRUE 0.903 37.000 0.041 1.000 Y NA
 5878906 5878907 EC55989_0916 EC55989_0917 poxB hcr FALSE 0.050 133.000 0.025 1.000 N NA
 5878907 5878908 EC55989_0917 EC55989_0918 hcr hcp TRUE 0.988 12.000 0.000 0.016 Y NA
 5878908 5878909 EC55989_0918 EC55989_0919 hcp ybjE FALSE 0.095 144.000 0.000 NA   NA
 5878909 5878910 EC55989_0919 EC55989_0920 ybjE aqpZ FALSE 0.004 495.000 0.025 NA   NA
 5878913 5878914 EC55989_0923 EC55989_0924 macA macB TRUE 0.993 -3.000 0.789 1.000 N NA
 5878916 5878917 EC55989_0926 EC55989_0927 clpS clpA TRUE 0.956 31.000 0.596 NA   NA
 5878918 5878919 EC55989_tRNA87 EC55989_0929   infA FALSE 0.018 253.000 0.000 NA   NA
 5878919 5878920 EC55989_0929 EC55989_0930 infA aat FALSE 0.005 285.000 0.020 1.000 N NA
 5878920 5878921 EC55989_0930 EC55989_0931 aat cydC TRUE 0.884 42.000 0.049 1.000 Y NA
 5878921 5878922 EC55989_0931 EC55989_0932 cydC cydD TRUE 0.999 1.000 0.631 0.005 Y NA
 5878922 5878923 EC55989_0932 EC55989_0933 cydD trxB TRUE 0.524 123.000 0.049 1.000 Y NA
 5878924 5878925 EC55989_0934 EC55989_0935 lrp ftsK FALSE 0.378 135.000 0.345 1.000 N NA
 5878925 5878926 EC55989_0935 EC55989_0936 ftsK lolA FALSE 0.247 152.000 0.305 1.000 N NA
 5878926 5878927 EC55989_0936 EC55989_0937 lolA ycaJ TRUE 0.936 11.000 0.167 1.000 N NA
 5878927 5878928 EC55989_0937 EC55989_0938 ycaJ serS FALSE 0.360 91.000 0.078 0.090 N NA
 5878928 5878929 EC55989_0938 EC55989_0939 serS dmsA FALSE 0.015 239.000 0.000 1.000 N NA
 5878929 5878930 EC55989_0939 EC55989_0940 dmsA dmsB TRUE 0.993 11.000 0.172 0.049 Y NA
 5878930 5878931 EC55989_0940 EC55989_0941 dmsB dmsC TRUE 0.985 2.000 0.333 1.000   NA
 5878933 5878934 EC55989_0943 EC55989_0944 ycaD ycaM FALSE 0.016 210.000 0.000 NA N NA
 5878937 5878938 EC55989_0947 EC55989_0948 pflA pflB FALSE 0.044 192.000 0.092 1.000 N NA
 5878938 5878939 EC55989_0948 EC55989_0949 pflB focA TRUE 0.743 55.000 0.345 1.000 N NA
 5878939 5878940 EC55989_0949 EC55989_0950 focA ycaO FALSE 0.007 405.000 0.000 NA   NA
 5878941 5878942 EC55989_0951 EC55989_0952 ycaP serC FALSE 0.022 199.000 0.014 NA   NA
 5878942 5878943 EC55989_0952 EC55989_0953 serC aroA TRUE 0.711 71.000 0.033 1.000 Y NA
 5878943 5878944 EC55989_0953 EC55989_0954 aroA ycaL FALSE 0.017 169.000 0.003 1.000 N NA
 5878944 5878945 EC55989_0954 EC55989_0955 ycaL cmk FALSE 0.016 173.000 0.004 1.000 N NA
 5878945 5878946 EC55989_0955 EC55989_0956 cmk rpsA FALSE 0.420 111.000 0.281 1.000 N NA
 5878946 5878947 EC55989_0956 EC55989_0957 rpsA ihfB FALSE 0.217 160.000 0.292 1.000 N NA
 5878947 5878948 EC55989_0957 EC55989_0958 ihfB ycaI FALSE 0.023 207.000 0.003 1.000   NA
 5878948 5878949 EC55989_0958 EC55989_0959 ycaI msbA TRUE 0.802 37.000 0.075 0.084   NA
 5878949 5878950 EC55989_0959 EC55989_0960 msbA lpxK TRUE 0.959 -3.000 0.205 1.000 N NA
 5878950 5878951 EC55989_0960 EC55989_0961 lpxK ycaQ TRUE 0.473 37.000 0.017 NA   NA
 5878951 5878952 EC55989_0961 EC55989_0962 ycaQ ycaR FALSE 0.291 52.000 0.016 NA   NA
 5878952 5878953 EC55989_0962 EC55989_0963 ycaR kdsB TRUE 0.976 -3.000 0.265 NA   NA
 5878953 5878954 EC55989_0963 EC55989_0964 kdsB ycbJ FALSE 0.049 154.000 0.023 NA   NA
 5878955 5878956 EC55989_0965 EC55989_0966 ycbC   FALSE 0.320 -97.000 0.036 NA   NA
 5878957 5878958 EC55989_0967 EC55989_0968 smtA mukF TRUE 0.974 -3.000 0.325 NA N NA
 5878958 5878959 EC55989_0968 EC55989_0969 mukF mukE TRUE 0.979 8.000 0.036 NA Y NA
 5878959 5878960 EC55989_0969 EC55989_0970 mukE mukB TRUE 0.994 0.000 0.000 0.001 Y NA
 5878960 5878961 EC55989_0970 EC55989_0971 mukB ycbB FALSE 0.020 261.000 0.000 1.000   NA
 5878961 5878962 EC55989_0971 EC55989_0972 ycbB ycbK FALSE 0.243 181.000 0.372 NA   NA
 5878962 5878963 EC55989_0972 EC55989_0973 ycbK ycbL TRUE 0.786 27.000 0.089 NA   NA
 5878964 5878965 EC55989_0975 EC55989_0977   aspC FALSE 0.010 279.000 0.000 1.000 N NA
 5878965 5878966 EC55989_0977 EC55989_0978 aspC ompF FALSE 0.022 185.000 0.036 1.000 N NA
 5878966 5878967 EC55989_0978 EC55989_0979 ompF asnS FALSE 0.003 602.000 0.000 1.000 N NA
 5878967 5878968 EC55989_0979 EC55989_0980 asnS pncB FALSE 0.029 169.000 0.034 1.000 N NA
 5878970 5878971 EC55989_0982 EC55989_0983 ssuB ssuC TRUE 0.997 -3.000 0.472 1.000 Y NA
 5878971 5878972 EC55989_0983 EC55989_0984 ssuC ssuD TRUE 0.955 11.000 0.226 1.000 N NA
 5878972 5878973 EC55989_0984 EC55989_0985 ssuD ssuA TRUE 0.979 -3.000 0.341 1.000 N NA
 5878973 5878974 EC55989_0985 EC55989_0986 ssuA ssuE TRUE 0.926 -7.000 0.169 1.000   NA
 5878975 5878976 EC55989_0987 EC55989_0988 ycbQ ycbR TRUE 0.916 83.000 0.500 1.000 Y NA
 5878976 5878977 EC55989_0988 EC55989_0989 ycbR ycbS TRUE 0.993 25.000 0.667 1.000 Y NA
 5878977 5878978 EC55989_0989 EC55989_0990 ycbS ycbT TRUE 0.961 -9.000 0.000 1.000 Y NA
 5878978 5878979 EC55989_0990 EC55989_0991 ycbT ycbU TRUE 0.989 12.000 0.000 0.010 Y NA
 5878979 5878980 EC55989_0991 EC55989_0992 ycbU ycbV TRUE 0.999 8.000 0.667 0.010 Y NA
 5878980 5878981 EC55989_0992 EC55989_0993 ycbV ycbF TRUE 0.993 -7.000 0.500 1.000 Y NA
 5878981 5878982 EC55989_0993 EC55989_0994 ycbF pyrD FALSE 0.124 111.000 0.000 1.000 N NA
 5878982 5878983 EC55989_0994 EC55989_0995 pyrD ycbW FALSE 0.071 174.000 0.081 NA   NA
 5878985 5878986 EC55989_0997 EC55989_0998 ycbY uup TRUE 0.906 11.000 0.061 1.000   NA
 5878986 5878987 EC55989_0998 EC55989_0999 uup pqiA FALSE 0.122 130.000 0.054 NA   NA
 5878987 5878988 EC55989_0999 EC55989_1000 pqiA pqiB TRUE 0.994 5.000 0.819 NA   NA
 5878988 5878989 EC55989_1000 EC55989_1001 pqiB ymbA TRUE 0.985 12.000 0.531 NA   NA
 5878989 5878990 EC55989_1001 EC55989_1002 ymbA rmf FALSE 0.018 256.000 0.000 NA   NA
 5878991 5878992 EC55989_1003 EC55989_1004 fabA ycbZ TRUE 0.617 69.000 0.290 1.000 N NA
 5878998 5878999 EC55989_1009 EC55989_1010 yccS yccF TRUE 0.867 19.000 0.090 NA   NA
 5879001 5879002 EC55989_1012 EC55989_1013 mgsA yccT FALSE 0.206 96.000 0.055 NA   NA
 5879004 5879005 EC55989_1015 EC55989_1016 yccV yccW FALSE 0.451 58.000 0.094 NA   NA
 5879007 5879008 EC55989_1018 EC55989_1019 tusE yccA FALSE 0.374 91.000 0.140 NA   NA
 5879010 5879011 EC55989_1021 EC55989_1022     TRUE 0.641 -22.000 0.000 NA   NA
 5879011 5879012 EC55989_1022 EC55989_1023     TRUE 0.486 -70.000 0.000 NA   NA
 5879012 5879013 EC55989_1023 EC55989_1024     FALSE 0.211 96.000 0.000 NA   NA
 5879013 5879014 EC55989_1024 EC55989_1025     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5879014 5879015 EC55989_1025 EC55989_misc_RNA_21   dicF FALSE 0.300 70.000 0.000 NA   NA
 5879015 5879016 EC55989_misc_RNA_21 EC55989_1026 dicF ydfC FALSE 0.009 341.000 0.000 NA   NA
 5879016 5879017 EC55989_1026 EC55989_1027 ydfC ydfB TRUE 0.677 30.000 0.000 NA   NA
 5879017 5879018 EC55989_1027 EC55989_1028 ydfB ydfA TRUE 0.920 2.000 0.000 NA   NA
 5879018 5879019 EC55989_1028 EC55989_1029 ydfA dicA FALSE 0.032 208.000 0.000 NA   NA
 5879020 5879021 EC55989_1030 EC55989_1031 dicC   TRUE 0.698 -16.000 0.000 NA   NA
 5879021 5879022 EC55989_1031 EC55989_1032     FALSE 0.363 -103.000 0.000 NA   NA
 5879022 5879023 EC55989_1032 EC55989_1033     FALSE 0.300 -211.000 0.000 NA   NA
 5879023 5879024 EC55989_1033 EC55989_1034     TRUE 0.843 16.000 0.000 NA   NA
 5879024 5879025 EC55989_1034 EC55989_1035     TRUE 0.921 1.000 0.000 NA   NA
 5879025 5879026 EC55989_1035 EC55989_1036     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5879026 5879027 EC55989_1036 EC55989_1037     TRUE 0.819 -7.000 0.000 NA   NA
 5879027 5879028 EC55989_1037 EC55989_1038     TRUE 0.819 -7.000 0.000 NA   NA
 5879028 5879029 EC55989_1038 EC55989_1039     FALSE 0.129 129.000 0.000 NA   NA
 5879029 5879030 EC55989_1039 EC55989_1040     TRUE 0.819 -7.000 0.000 NA   NA
 5879030 5879031 EC55989_1040 EC55989_1041     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5879032 5879033 EC55989_1042 EC55989_1043 insB insA TRUE 0.898 -81.000 0.000 0.028 Y NA
 5879034 5879035 EC55989_1044 EC55989_1045 rem ydfU FALSE 0.009 347.000 0.000 NA   NA
 5879035 5879036 EC55989_1045 EC55989_1046 ydfU   TRUE 0.921 1.000 0.000 NA   NA
 5879036 5879037 EC55989_1046 EC55989_1047     TRUE 0.922 -3.000 0.000 1.000   NA
 5879037 5879038 EC55989_1047 EC55989_1048     FALSE 0.103 140.000 0.000 NA   NA
 5879038 5879039 EC55989_1048 EC55989_1049     FALSE 0.080 151.000 0.000 NA   NA
 5879039 5879040 EC55989_1049 EC55989_tRNA15     FALSE 0.430 50.000 0.000 NA   NA
 5879040 5879041 EC55989_tRNA15 EC55989_tRNA16     TRUE 0.894 8.000 0.000 NA   NA
 5879041 5879042 EC55989_tRNA16 EC55989_tRNA17     TRUE 0.859 14.000 0.000 NA   NA
 5879042 5879043 EC55989_tRNA17 EC55989_1050     FALSE 0.006 490.000 0.000 NA   NA
 5879043 5879044 EC55989_1050 EC55989_1051     TRUE 0.496 45.000 0.000 NA   NA
 5879044 5879045 EC55989_1051 EC55989_1052     TRUE 0.902 5.000 0.000 NA   NA
 5879047 5879048 EC55989_1054 EC55989_1055 ydfQ   FALSE 0.263 78.000 0.000 NA   NA
 5879048 5879049 EC55989_1055 EC55989_1056     TRUE 0.665 -19.000 0.000 NA   NA
 5879049 5879050 EC55989_1056 EC55989_1058   rz TRUE 0.843 16.000 0.000 NA   NA
 5879050 5879051 EC55989_1058 EC55989_1059 rz   FALSE 0.006 453.000 0.000 NA   NA
 5879051 5879052 EC55989_1059 EC55989_1060     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5879052 5879053 EC55989_1060 EC55989_1061     TRUE 0.601 -27.000 0.000 NA   NA
 5879053 5879054 EC55989_1061 EC55989_1062     TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5879054 5879055 EC55989_1062 EC55989_1063   clp FALSE 0.341 -202.000 0.000 1.000   NA
 5879055 5879056 EC55989_1063 EC55989_1064 clp   TRUE 0.749 88.000 0.537 NA   NA
 5879056 5879057 EC55989_1064 EC55989_1065     TRUE 0.819 -7.000 0.000 NA   NA
 5879057 5879058 EC55989_1065 EC55989_1066   Z TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5879058 5879059 EC55989_1066 EC55989_1067 Z U TRUE 0.867 13.000 0.000 NA   NA
 5879059 5879060 EC55989_1067 EC55989_1068 U   TRUE 0.894 8.000 0.000 NA   NA
 5879060 5879061 EC55989_1068 EC55989_1069     TRUE 0.822 19.000 0.000 NA   NA
 5879061 5879062 EC55989_1069 EC55989_1070   T TRUE 0.972 27.000 0.667 NA   NA
 5879062 5879063 EC55989_1070 EC55989_1071 T   TRUE 0.665 -19.000 0.000 NA   NA
 5879063 5879064 EC55989_1071 EC55989_1072     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5879064 5879065 EC55989_1072 EC55989_1073     TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5879065 5879066 EC55989_1073 EC55989_1074     TRUE 0.561 -37.000 0.000 NA   NA
 5879066 5879067 EC55989_1074 EC55989_1075     FALSE 0.371 -102.000 0.000 NA   NA
 5879067 5879068 EC55989_1075 EC55989_1076     FALSE 0.341 61.000 0.000 NA   NA
 5879068 5879069 EC55989_1076 EC55989_1077     FALSE 0.310 68.000 0.000 NA   NA
 5879069 5879070 EC55989_1077 EC55989_1078     FALSE 0.091 152.000 0.000 1.000   NA
 5879070 5879071 EC55989_1078 EC55989_1079     FALSE 0.456 -78.000 0.000 NA   NA
 5879073 5879074 EC55989_1080 EC55989_1081 hyaA hyaB TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 5879074 5879075 EC55989_1081 EC55989_1082 hyaB hyaC TRUE 0.994 19.000 0.355 0.048 Y NA
 5879075 5879076 EC55989_1082 EC55989_1083 hyaC hyaD TRUE 0.992 -3.000 0.177 1.000 Y NA
 5879076 5879077 EC55989_1083 EC55989_1084 hyaD hyaE TRUE 0.936 -3.000 0.096 NA   NA
 5879077 5879078 EC55989_1084 EC55989_1085 hyaE hyaF TRUE 0.994 -3.000 0.769 NA   NA
 5879078 5879079 EC55989_1085 EC55989_1086 hyaF appC FALSE 0.121 134.000 0.061 NA   NA
 5879079 5879080 EC55989_1086 EC55989_1087 appC appB TRUE 0.992 12.000 0.158 0.048 Y NA
 5879080 5879081 EC55989_1087 EC55989_1088 appB appA FALSE 0.054 185.000 0.000 1.000   NA
 5879082 5879083 EC55989_1089 EC55989_1090 yccC etp TRUE 0.988 20.000 1.000 1.000 N NA
 5879083 5879084 EC55989_1090 EC55989_1091 etp yccZ TRUE 0.974 -12.000 0.750 1.000 N NA
 5879084 5879085 EC55989_1091 EC55989_1092 yccZ ymcA TRUE 0.478 46.000 0.000 NA   NA
 5879085 5879086 EC55989_1092 EC55989_1093 ymcA ymcB TRUE 0.927 0.000 0.060 NA   NA
 5879086 5879087 EC55989_1093 EC55989_1094 ymcB ymcC TRUE 0.991 -3.000 0.600 NA   NA
 5879087 5879088 EC55989_1094 EC55989_1095 ymcC   FALSE 0.250 82.000 0.000 NA   NA
 5879088 5879089 EC55989_1095 EC55989_1096   ymcD FALSE 0.292 -247.000 0.000 NA   NA
 5879089 5879090 EC55989_1096 EC55989_1097 ymcD cspH FALSE 0.006 442.000 0.000 NA   NA
 5879090 5879091 EC55989_1097 EC55989_1098 cspH insB TRUE 0.466 59.000 0.000 0.081 N NA
 5879091 5879092 EC55989_1098 EC55989_1099 insB insA TRUE 0.898 -81.000 0.000 0.027 Y NA
 5879093 5879094 EC55989_1100 EC55989_1101 cspG gnsA FALSE 0.007 394.000 0.000 NA   NA
 5879095 5879096 EC55989_1102 EC55989_1103 yccM torS FALSE 0.176 72.000 0.000 NA N NA
 5879099 5879100 EC55989_1106 EC55989_1107 torC torA TRUE 0.993 0.000 0.000 0.048 Y NA
 5879100 5879101 EC55989_1107 EC55989_1108 torA torD TRUE 0.967 -3.000 0.077 0.048   NA
 5879102 5879103 EC55989_1109 EC55989_1110 cbpM cbpA TRUE 0.991 0.000 0.512 NA   NA
 5879104 5879105 EC55989_1111 EC55989_1112 yccE agp FALSE 0.013 289.000 0.000 NA   NA
 5879106 5879107 EC55989_1113 EC55989_1114 yccJ wrbA TRUE 0.948 21.000 0.290 NA   NA
 5879108 5879109 EC55989_1115 EC55989_1116   ymdF TRUE 0.498 -67.000 0.000 NA   NA
 5879110 5879111 EC55989_1117 EC55989_1118 rutG rutF TRUE 0.977 21.000 0.533 1.000   NA
 5879111 5879112 EC55989_1118 EC55989_1119 rutF rutE TRUE 0.994 11.000 0.625 0.029   NA
 5879112 5879113 EC55989_1119 EC55989_1120 rutE rutD TRUE 0.969 10.000 0.256 NA   NA
 5879113 5879114 EC55989_1120 EC55989_1121 rutD rutC TRUE 0.981 8.000 0.365 NA   NA
 5879114 5879115 EC55989_1121 EC55989_1122 rutC rutB TRUE 0.976 12.000 0.442 NA N NA
 5879115 5879116 EC55989_1122 EC55989_1123 rutB rutA TRUE 0.991 0.000 0.621 NA N NA
 5879119 5879120 EC55989_1126 EC55989_1127 putP efeU FALSE 0.004 533.000 0.000 1.000 N NA
 5879120 5879121 EC55989_1127 EC55989_1128 efeU efeO TRUE 0.924 58.000 0.356 NA Y NA
 5879121 5879122 EC55989_1128 EC55989_1129 efeO efeB TRUE 0.995 6.000 0.378 NA Y NA
 5879125 5879126 EC55989_1132 EC55989_1133 pgaD pgaC TRUE 0.989 2.000 0.462 NA   NA
 5879126 5879127 EC55989_1133 EC55989_1134 pgaC pgaB TRUE 0.966 -7.000 0.435 1.000 N NA
 5879127 5879128 EC55989_1134 EC55989_1135 pgaB pgaA TRUE 0.992 9.000 0.696 1.000   NA
 5879129 5879130 EC55989_1136 EC55989_1137 insA insB TRUE 0.898 -81.000 0.000 0.027 Y NA
 5879130 5879131 EC55989_1137 EC55989_1138 insB   TRUE 0.664 51.000 0.000 0.023   NA
 5879131 5879132 EC55989_1138 EC55989_1139   ycdT FALSE 0.030 211.000 0.000 NA   NA
 5879132 5879133 EC55989_1139 EC55989_1140 ycdT ycdT TRUE 0.540 -46.000 0.000 NA   NA
 5879134 5879135 EC55989_1141 EC55989_1142 insF insE TRUE 0.959 -3.000 0.000 0.081   NA
 5879136 5879137 EC55989_1143 EC55989_1144   ycdU TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5879139 5879140 EC55989_1146 EC55989_1147 ycdW ycdX TRUE 0.878 55.000 0.169 1.000 Y NA
 5879140 5879141 EC55989_1147 EC55989_1148 ycdX ycdY TRUE 0.962 24.000 0.417 1.000   NA
 5879141 5879142 EC55989_1148 EC55989_1149 ycdY ycdZ FALSE 0.335 102.000 0.145 NA   NA
 5879143 5879144 EC55989_1150 EC55989_1151 csgG csgF TRUE 0.685 27.000 0.043 NA   NA
 5879144 5879145 EC55989_1151 EC55989_1152 csgF csgE TRUE 0.978 25.000 0.723 NA   NA
 5879145 5879146 EC55989_1152 EC55989_1153 csgE csgD TRUE 0.959 5.000 0.176 NA   NA
 5879147 5879148 EC55989_1154 EC55989_1155 csgB csgA TRUE 0.931 41.000 0.333 0.010   NA
 5879148 5879149 EC55989_1155 EC55989_1156 csgA csgC TRUE 0.879 59.000 0.667 NA   NA
 5879149 5879150 EC55989_1156 EC55989_1157 csgC ymdA FALSE 0.023 231.000 0.000 NA   NA
 5879150 5879151 EC55989_1157 EC55989_1158 ymdA ymdB FALSE 0.214 95.000 0.000 NA   NA
 5879151 5879152 EC55989_1158 EC55989_1159 ymdB ymdC TRUE 0.909 2.000 0.046 NA   NA
 5879153 5879154 EC55989_1160 EC55989_1161 mdoC   TRUE 0.496 45.000 0.000 NA   NA
 5879154 5879155 EC55989_1161 EC55989_1162     TRUE 0.909 4.000 0.000 NA   NA
 5879156 5879157 EC55989_1163 EC55989_1164 mdoG mdoH TRUE 0.965 -7.000 0.469 NA N NA
 5879157 5879158 EC55989_1164 EC55989_1165 mdoH yceK FALSE 0.106 173.000 0.135 NA   NA
 5879159 5879160 EC55989_1166 EC55989_1167 msyB mdtG TRUE 0.638 83.000 0.333 NA   NA
 5879160 5879161 EC55989_1167 EC55989_1168 mdtG lpxL TRUE 0.591 172.000 0.857 0.082 N NA
 5879163 5879164 EC55989_1170 EC55989_1171 yceI yceJ TRUE 0.993 4.000 0.676 NA   NA
 5879164 5879165 EC55989_1171 EC55989_1172 yceJ solA FALSE 0.012 422.000 0.000 0.029 N NA
 5879165 5879166 EC55989_1172 EC55989_1173 solA bssS TRUE 0.580 115.000 0.423 NA   NA
 5879166 5879167 EC55989_1173 EC55989_1174 bssS dinI FALSE 0.013 290.000 0.000 NA   NA
 5879167 5879168 EC55989_1174 EC55989_1175 dinI pyrC FALSE 0.218 74.000 0.031 NA   NA
 5879168 5879169 EC55989_1175 EC55989_1176 pyrC yceB FALSE 0.126 106.000 0.022 NA   NA
 5879169 5879170 EC55989_1176 EC55989_1177 yceB grxB FALSE 0.141 134.000 0.078 NA   NA
 5879170 5879171 EC55989_1177 EC55989_1178 grxB mdtH FALSE 0.322 64.000 0.103 NA N NA
 5879172 5879173 EC55989_1179 EC55989_1180 rimJ yceH TRUE 0.929 11.000 0.116 NA   NA
 5879173 5879174 EC55989_1180 EC55989_1181 yceH mviM TRUE 0.947 2.000 0.103 NA   NA
 5879174 5879175 EC55989_1181 EC55989_1182 mviM mviN FALSE 0.146 110.000 0.022 1.000   NA
 5879176 5879177 EC55989_1183 EC55989_1184 flgN flgM TRUE 0.998 5.000 0.361 0.002 Y NA
 5879177 5879178 EC55989_1184 EC55989_1185 flgM flgA TRUE 0.877 76.000 0.330 NA Y NA
 5879179 5879180 EC55989_1186 EC55989_1187 flgB flgC TRUE 0.999 4.000 0.824 0.003 Y NA
 5879180 5879181 EC55989_1187 EC55989_1188 flgC flgD TRUE 0.988 12.000 0.186 NA Y NA
 5879181 5879182 EC55989_1188 EC55989_1189 flgD flgE TRUE 0.962 25.000 0.116 NA Y NA
 5879182 5879183 EC55989_1189 EC55989_1190 flgE flgF TRUE 0.996 20.000 0.476 0.004 Y NA
 5879183 5879184 EC55989_1190 EC55989_1191 flgF flgG TRUE 0.773 172.000 0.420 0.001 Y NA
 5879184 5879185 EC55989_1191 EC55989_1192 flgG flgH TRUE 0.954 53.000 0.268 0.005 Y NA
 5879185 5879186 EC55989_1192 EC55989_1193 flgH flgI TRUE 0.990 12.000 0.073 0.006 Y NA
 5879186 5879187 EC55989_1193 EC55989_1194 flgI flgJ TRUE 0.993 0.000 0.036 0.006 Y NA
 5879187 5879188 EC55989_1194 EC55989_1195 flgJ flgK TRUE 0.979 66.000 0.705 0.002 Y NA
 5879188 5879189 EC55989_1195 EC55989_1196 flgK flgL TRUE 0.994 12.000 0.142 0.001 Y NA
 5879190 5879191 EC55989_1197 EC55989_misc_RNA_22 rne   TRUE 0.751 25.000 0.000 NA   NA
 5879194 5879195 EC55989_misc_RNA_23 EC55989_1200 sraB yceD TRUE 0.600 37.000 0.000 NA   NA
 5879195 5879196 EC55989_1200 EC55989_1201 yceD rpmF TRUE 0.885 52.000 0.599 NA   NA
 5879196 5879197 EC55989_1201 EC55989_1202 rpmF plsX TRUE 0.665 81.000 0.418 1.000 N NA
 5879197 5879198 EC55989_1202 EC55989_1203 plsX fabH TRUE 0.953 68.000 0.380 0.004 Y NA
 5879198 5879199 EC55989_1203 EC55989_1204 fabH fabD TRUE 0.992 16.000 0.182 0.004 Y NA
 5879199 5879200 EC55989_1204 EC55989_1205 fabD fabG TRUE 0.997 13.000 0.432 0.004 Y NA
 5879200 5879201 EC55989_1205 EC55989_1206 fabG acpP TRUE 0.534 211.000 0.321 0.004 Y NA
 5879201 5879202 EC55989_1206 EC55989_1207 acpP fabF TRUE 0.876 88.000 0.346 1.000 Y NA
 5879202 5879203 EC55989_1207 EC55989_1208 fabF pabC FALSE 0.279 120.000 0.187 1.000 N NA
 5879203 5879204 EC55989_1208 EC55989_1209 pabC yceG TRUE 0.970 3.000 0.204 NA   NA
 5879204 5879205 EC55989_1209 EC55989_1210 yceG tmk TRUE 0.906 -10.000 0.209 NA   NA
 5879205 5879206 EC55989_1210 EC55989_1211 tmk holB TRUE 0.960 -3.000 0.211 1.000 N NA
 5879206 5879207 EC55989_1211 EC55989_1212 holB ycfH TRUE 0.984 11.000 0.110 NA Y NA
 5879207 5879208 EC55989_1212 EC55989_1213 ycfH ptsG FALSE 0.002 295.000 0.004 NA N NA
 5879210 5879211 EC55989_1215 EC55989_1216 hinT ycfL TRUE 0.911 3.000 0.051 NA   NA
 5879211 5879212 EC55989_1216 EC55989_1217 ycfL ycfM TRUE 0.983 14.000 0.516 NA   NA
 5879212 5879213 EC55989_1217 EC55989_1218 ycfM ycfN TRUE 0.906 -19.000 0.310 NA   NA
 5879213 5879214 EC55989_1218 EC55989_1219 ycfN nagZ TRUE 0.859 11.000 0.069 1.000 N NA
 5879214 5879215 EC55989_1219 EC55989_1220 nagZ ycfP TRUE 0.834 23.000 0.091 NA   NA
 5879215 5879216 EC55989_1220 EC55989_1221 ycfP ndh FALSE 0.007 408.000 0.057 NA   NA
 5879216 5879217 EC55989_1221 EC55989_1222 ndh ycfJ FALSE 0.042 210.000 0.071 1.000   NA
 5879220 5879221 EC55989_1225 EC55989_1226 ycfS mfd FALSE 0.069 144.000 0.006 1.000   NA
 5879221 5879222 EC55989_1226 EC55989_1227 mfd ycfT FALSE 0.096 128.000 0.003 1.000   NA
 5879223 5879224 EC55989_1228 EC55989_1229 lolC lolD TRUE 0.942 -7.000 0.175 0.065 N NA
 5879224 5879225 EC55989_1229 EC55989_1230 lolD lolE TRUE 0.970 0.000 0.125 0.065 N NA
 5879225 5879226 EC55989_1230 EC55989_1231 lolE ycfX TRUE 0.860 29.000 0.225 1.000 N NA
 5879226 5879227 EC55989_1231 EC55989_1232 ycfX cobB TRUE 0.981 16.000 0.119 1.000 Y NA
 5879228 5879229 EC55989_1233 EC55989_1234 ycfZ   FALSE 0.334 63.000 0.000 NA   NA
 5879229 5879230 EC55989_1234 EC55989_1235   potD FALSE 0.442 49.000 0.000 NA   NA
 5879230 5879231 EC55989_1235 EC55989_1236 potD potC TRUE 0.991 -3.000 0.000 0.053 Y NA
 5879231 5879232 EC55989_1236 EC55989_1237 potC potB TRUE 0.996 -3.000 0.286 0.053 Y NA
 5879232 5879233 EC55989_1237 EC55989_1238 potB potA TRUE 0.997 14.000 0.789 1.000 Y NA
 5879233 5879234 EC55989_1238 EC55989_1239 potA   TRUE 0.653 -21.000 0.000 NA   NA
 5879236 5879237 EC55989_1241 EC55989_1242 ycfD phoQ TRUE 0.718 76.000 0.408 NA   NA
 5879237 5879238 EC55989_1242 EC55989_1243 phoQ phoP TRUE 0.999 0.000 0.940 1.000 Y NA
 5879238 5879239 EC55989_1243 EC55989_1244 phoP purB FALSE 0.020 168.000 0.011 1.000 N NA
 5879239 5879240 EC55989_1244 EC55989_1245 purB hflD TRUE 0.935 4.000 0.093 NA   NA
 5879240 5879241 EC55989_1245 EC55989_1246 hflD trmU TRUE 0.803 36.000 0.180 NA   NA
 5879241 5879242 EC55989_1246 EC55989_1247 trmU ymfB TRUE 0.534 54.000 0.158 1.000 N NA
 5879242 5879243 EC55989_1247 EC55989_1248 ymfB ymfC TRUE 0.945 10.000 0.182 1.000 N NA
 5879245 5879246 EC55989_1250 EC55989_1251 elbA ycgX FALSE 0.004 696.000 0.000 NA   NA
 5879246 5879247 EC55989_1251 EC55989_1252 ycgX ycgE FALSE 0.025 221.000 0.000 NA   NA
 5879247 5879248 EC55989_1252 EC55989_1253 ycgE ycgF FALSE 0.134 205.000 0.333 1.000 N NA
 5879249 5879250 EC55989_1254 EC55989_1255 ycgZ ymgA TRUE 0.523 43.000 0.000 NA   NA
 5879250 5879251 EC55989_1255 EC55989_1256 ymgA ymgB TRUE 0.690 29.000 0.000 NA   NA
 5879251 5879252 EC55989_1256 EC55989_1257 ymgB ymgC FALSE 0.167 113.000 0.000 NA   NA
 5879252 5879253 EC55989_1257 EC55989_1258 ymgC ycgG FALSE 0.010 332.000 0.000 NA   NA
 5879253 5879254 EC55989_1258 EC55989_1259 ycgG ymgF FALSE 0.122 132.000 0.000 NA   NA
 5879254 5879255 EC55989_1259 EC55989_1260 ymgF   FALSE 0.007 400.000 0.000 NA   NA
 5879255 5879256 EC55989_1260 EC55989_1261   insA FALSE 0.032 207.000 0.000 NA   NA
 5879256 5879257 EC55989_1261 EC55989_1262 insA insB TRUE 0.898 -81.000 0.000 0.027 Y NA
 5879257 5879258 EC55989_1262 EC55989_1263 insB   TRUE 0.886 2.000 0.000 1.000 N NA
 5879259 5879260 EC55989_1264 EC55989_1265 ymgD ymgG TRUE 0.890 10.000 0.000 NA   NA
 5879262 5879263 EC55989_1267 EC55989_1268 minE minD TRUE 0.998 4.000 0.618 NA Y NA
 5879263 5879264 EC55989_1268 EC55989_1269 minD minC TRUE 0.990 24.000 0.466 1.000 Y NA
 5879267 5879268 EC55989_1272 EC55989_1273 ycgL ycgM FALSE 0.290 72.000 0.056 NA   NA
 5879268 5879269 EC55989_1273 EC55989_1274 ycgM ycgN FALSE 0.288 92.000 0.088 NA   NA
 5879270 5879271 EC55989_1275 EC55989_1276 hlyE hlyE FALSE 0.151 120.000 0.000 NA   NA
 5879271 5879272 EC55989_1276 EC55989_1277 hlyE   FALSE 0.207 97.000 0.000 NA   NA
 5879273 5879274 EC55989_misc_RNA_24 EC55989_1278 C0299 umuD FALSE 0.346 60.000 0.000 NA   NA
 5879274 5879275 EC55989_1278 EC55989_1279 umuD umuC TRUE 0.892 0.000 0.000 1.000 N NA
 5879276 5879277 EC55989_1280 EC55989_1281 dsbB nhaB TRUE 0.561 146.000 0.723 1.000 N NA
 5879280 5879281 EC55989_1284 EC55989_1285 dadA dadX TRUE 0.939 10.000 0.168 1.000 N NA
 5879282 5879283 EC55989_1287 EC55989_1288 cvrA ldcA FALSE 0.210 95.000 0.103 NA N NA
 5879286 5879287 EC55989_1291 EC55989_1292 ymgE ycgY FALSE 0.052 178.000 0.000 NA   NA
 5879288 5879289 EC55989_1293 EC55989_1294 treA dhaH FALSE 0.013 320.000 0.000 1.000   NA
 5879289 5879290 EC55989_1294 EC55989_1295 dhaH dhaL TRUE 0.938 11.000 0.118 1.000   NA
 5879290 5879291 EC55989_1295 EC55989_1296 dhaL dhaK TRUE 0.996 11.000 0.226 0.001 Y NA
 5879293 5879294 EC55989_1298 EC55989_1299 ycgV ychF FALSE 0.003 769.000 0.000 1.000 N NA
 5879294 5879295 EC55989_1299 EC55989_1300 ychF pth TRUE 0.703 117.000 0.184 1.000 Y NA
 5879297 5879298 EC55989_1302 EC55989_1303 ychM prsA FALSE 0.062 125.000 0.027 1.000 N NA
 5879298 5879299 EC55989_1303 EC55989_1304 prsA ispE FALSE 0.052 151.000 0.053 1.000 N NA
 5879299 5879300 EC55989_1304 EC55989_1305 ispE lolB TRUE 0.955 0.000 0.157 1.000 N NA
 5879301 5879302 EC55989_1306 EC55989_1307 hemA prfA TRUE 0.818 42.000 0.171 0.042 N NA
 5879302 5879303 EC55989_1307 EC55989_1308 prfA prmC TRUE 0.997 0.000 0.229 0.042 Y NA
 5879303 5879304 EC55989_1308 EC55989_1309 prmC ychQ TRUE 0.942 -3.000 0.109 NA   NA
 5879304 5879305 EC55989_1309 EC55989_1310 ychQ ychA TRUE 0.966 4.000 0.195 NA   NA
 5879305 5879306 EC55989_1310 EC55989_1311 ychA kdsA TRUE 0.720 36.000 0.089 1.000   NA
 5879312 5879313 EC55989_1315 EC55989_1316 chaB chaC FALSE 0.199 137.000 0.140 NA   NA
 5879316 5879317 EC55989_1319 EC55989_1320 narL narX TRUE 0.996 -7.000 0.521 0.014 Y NA
 5879318 5879319 EC55989_1321 EC55989_1322 narK narG FALSE 0.004 516.000 0.000 1.000 N NA
 5879319 5879320 EC55989_1322 EC55989_1323 narG narH TRUE 0.998 -3.000 0.471 0.001 Y NA
 5879320 5879321 EC55989_1323 EC55989_1324 narH narJ TRUE 0.999 -3.000 0.588 0.003 Y NA
 5879321 5879322 EC55989_1324 EC55989_1325 narJ narI TRUE 0.999 0.000 0.500 0.003 Y NA
 5879322 5879323 EC55989_1325 EC55989_1326 narI   FALSE 0.051 180.000 0.000 NA   NA
 5879324 5879325 EC55989_misc_RNA_27 EC55989_tRNA84 rtt   TRUE 0.894 8.000 0.000 NA   NA
 5879325 5879326 EC55989_tRNA84 EC55989_tRNA83     TRUE 0.619 35.000 0.000 NA   NA
 5879326 5879327 EC55989_tRNA83 EC55989_1327   purU FALSE 0.070 160.000 0.000 NA   NA
 5879327 5879328 EC55989_1327 EC55989_1328 purU ychJ TRUE 0.685 50.000 0.200 NA   NA
 5879329 5879330 EC55989_1329 EC55989_1330 rssA rssB FALSE 0.239 92.000 0.048 1.000   NA
 5879330 5879331 EC55989_1330 EC55989_1331 rssB galU FALSE 0.096 202.000 0.235 1.000 N NA
 5879334 5879335 EC55989_1334 EC55989_1335     TRUE 0.909 4.000 0.000 NA   NA
 5879335 5879336 EC55989_1335 EC55989_1336   ychG TRUE 0.509 -61.000 0.000 NA   NA
 5879336 5879337 EC55989_1336 EC55989_1337 ychG adhE FALSE 0.143 124.000 0.000 NA   NA
 5879340 5879341 EC55989_1340 EC55989_1341 oppA oppB TRUE 0.844 86.000 0.151 0.052 Y NA
 5879341 5879342 EC55989_1341 EC55989_1342 oppB oppC TRUE 0.998 15.000 0.870 0.052 Y NA
 5879342 5879343 EC55989_1342 EC55989_1343 oppC oppD TRUE 0.996 12.000 0.554 1.000 Y NA
 5879343 5879344 EC55989_1343 EC55989_1344 oppD oppF TRUE 0.998 -3.000 0.420 0.002 Y NA
 5879345 5879346 EC55989_1345 EC55989_1346 yciU cls TRUE 0.850 35.000 0.231 NA   NA
 5879348 5879349 EC55989_1348 EC55989_1349 kch yciI FALSE 0.012 300.000 0.000 NA   NA
 5879351 5879352 EC55989_1351 EC55989_1352 yciA yciB FALSE 0.272 105.000 0.167 NA N NA
 5879352 5879353 EC55989_1352 EC55989_1353 yciB yciC TRUE 0.688 30.000 0.061 NA   NA
 5879355 5879356 EC55989_1355 EC55989_1356     TRUE 0.840 -22.000 0.000 0.011   NA
 5879356 5879357 EC55989_1356 EC55989_1357     FALSE 0.365 65.000 0.000 1.000   NA
 5879357 5879358 EC55989_1357 EC55989_1358   ydfD FALSE 0.222 93.000 0.000 NA   NA
 5879358 5879359 EC55989_1358 EC55989_1359 ydfD   TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5879359 5879360 EC55989_1359 EC55989_misc_RNA_28   dicF FALSE 0.300 70.000 0.000 NA   NA
 5879361 5879362 EC55989_1360 EC55989_1361     TRUE 0.486 -70.000 0.000 NA   NA
 5879363 5879364 EC55989_1362 EC55989_1363     TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5879364 5879365 EC55989_1363 EC55989_1364   dicA TRUE 0.600 37.000 0.000 NA   NA
 5879366 5879367 EC55989_1365 EC55989_1366     TRUE 0.698 -16.000 0.000 NA   NA
 5879367 5879368 EC55989_1366 EC55989_1367     TRUE 0.468 -73.000 0.000 NA   NA
 5879368 5879369 EC55989_1367 EC55989_1368     TRUE 0.555 41.000 0.000 NA   NA
 5879369 5879370 EC55989_1368 EC55989_1369     FALSE 0.018 253.000 0.000 NA   NA
 5879371 5879372 EC55989_1370 EC55989_1371 ymfD   TRUE 0.995 7.000 1.000 NA   NA
 5879372 5879373 EC55989_1371 EC55989_1372     FALSE 0.057 173.000 0.000 NA   NA
 5879374 5879375 EC55989_1373 EC55989_1374 rem ydfU FALSE 0.009 347.000 0.000 NA   NA
 5879375 5879376 EC55989_1374 EC55989_1375 ydfU   TRUE 0.899 6.000 0.000 NA   NA
 5879376 5879377 EC55989_1375 EC55989_1376     FALSE 0.306 -193.000 0.000 NA   NA
 5879377 5879378 EC55989_1376 EC55989_1377   Q TRUE 0.786 -9.000 0.000 NA   NA
 5879378 5879379 EC55989_1377 EC55989_1378 Q   FALSE 0.291 72.000 0.000 NA   NA
 5879379 5879380 EC55989_1378 EC55989_1379     TRUE 0.991 -3.000 0.571 1.000   NA
 5879380 5879381 EC55989_1379 EC55989_1380     FALSE 0.172 111.000 0.000 NA   NA
 5879381 5879382 EC55989_1380 EC55989_tRNA18     FALSE 0.430 50.000 0.000 NA   NA
 5879382 5879383 EC55989_tRNA18 EC55989_tRNA19     FALSE 0.204 98.000 0.000 NA   NA
 5879383 5879384 EC55989_tRNA19 EC55989_1381     FALSE 0.004 977.000 0.000 NA   NA
 5879384 5879385 EC55989_1381 EC55989_1382     FALSE 0.287 73.000 0.000 NA   NA
 5879385 5879386 EC55989_1382 EC55989_1383     TRUE 0.902 5.000 0.000 NA   NA
 5879386 5879387 EC55989_1383 EC55989_1384   ydfQ FALSE 0.372 56.000 0.000 NA   NA
 5879387 5879388 EC55989_1384 EC55989_1385 ydfQ Rz TRUE 0.719 -18.000 0.000 1.000   NA
 5879388 5879389 EC55989_1385 EC55989_1386 Rz   FALSE 0.006 417.000 0.000 NA   NA
 5879391 5879392 EC55989_1388 EC55989_1389     FALSE 0.108 138.000 0.000 NA   NA
 5879392 5879393 EC55989_1389 EC55989_1390     TRUE 0.486 -70.000 0.000 NA   NA
 5879393 5879394 EC55989_1390 EC55989_1391     TRUE 0.698 -16.000 0.000 NA   NA
 5879394 5879395 EC55989_1391 EC55989_1392     TRUE 0.922 -3.000 0.000 1.000   NA
 5879395 5879396 EC55989_1392 EC55989_1393     TRUE 0.888 -10.000 0.150 1.000   NA
 5879396 5879397 EC55989_1393 EC55989_1394     TRUE 0.643 37.000 0.000 1.000   NA
 5879397 5879398 EC55989_1394 EC55989_1395     FALSE 0.360 58.000 0.000 NA   NA
 5879398 5879399 EC55989_1395 EC55989_1396     TRUE 0.909 4.000 0.000 NA   NA
 5879399 5879400 EC55989_1396 EC55989_1397     TRUE 0.819 -7.000 0.000 NA   NA
 5879400 5879401 EC55989_1397 EC55989_1398     TRUE 0.852 15.000 0.000 NA   NA
 5879401 5879402 EC55989_1398 EC55989_1399     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5879402 5879403 EC55989_1399 EC55989_1400     TRUE 0.894 8.000 0.000 NA   NA
 5879403 5879404 EC55989_1400 EC55989_1401     TRUE 0.859 14.000 0.000 NA   NA
 5879404 5879405 EC55989_1401 EC55989_1402     TRUE 0.972 27.000 0.667 NA   NA
 5879405 5879406 EC55989_1402 EC55989_1403     TRUE 0.665 -19.000 0.000 NA   NA
 5879406 5879407 EC55989_1403 EC55989_1405     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5879407 5879408 EC55989_1405 EC55989_1406     TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5879408 5879409 EC55989_1406 EC55989_1407     FALSE 0.289 -250.000 0.000 NA   NA
 5879409 5879410 EC55989_1407 EC55989_1408     TRUE 0.927 -102.000 1.000 NA   NA
 5879410 5879411 EC55989_1408 EC55989_1409     FALSE 0.009 343.000 0.000 NA   NA
 5879411 5879412 EC55989_1409 EC55989_1410     FALSE 0.310 68.000 0.000 NA   NA
 5879412 5879413 EC55989_1410 EC55989_1411     FALSE 0.091 152.000 0.000 1.000   NA
 5879413 5879414 EC55989_1411 EC55989_1412   tfaQ TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5879417 5879418 EC55989_1415 EC55989_1416 yciE yciF TRUE 0.809 46.000 0.115 0.003   NA
 5879418 5879419 EC55989_1416 EC55989_1417 yciF yciG FALSE 0.242 86.000 0.000 NA   NA
 5879419 5879420 EC55989_1417 EC55989_1418 yciG trpA FALSE 0.007 381.000 0.000 NA   NA
 5879420 5879421 EC55989_1418 EC55989_1419 trpA trpB TRUE 0.999 0.000 0.947 0.001 Y NA
 5879421 5879422 EC55989_1419 EC55989_1420 trpB trpC TRUE 0.995 12.000 0.221 0.001 Y NA
 5879422 5879423 EC55989_1420 EC55989_1421 trpC trpD TRUE 0.995 4.000 0.293 1.000 Y NA
 5879423 5879424 EC55989_1421 EC55989_1422 trpD trpE TRUE 0.993 0.000 0.010 0.001 Y NA
 5879424 5879425 EC55989_1422 EC55989_misc_RNA_29 trpE   TRUE 0.792 22.000 0.000 NA   NA
 5879425 5879426 EC55989_misc_RNA_29 EC55989_5068   trpL TRUE 0.631 -23.000 0.000 NA   NA
 5879427 5879428 EC55989_1423 EC55989_1424 yciV yciO TRUE 0.977 -3.000 0.281 NA   NA
 5879428 5879429 EC55989_1424 EC55989_1425 yciO rluB TRUE 0.729 74.000 0.075 NA Y NA
 5879430 5879431 EC55989_1426 EC55989_1427 btuR yciK TRUE 0.857 -3.000 0.050 1.000 N NA
 5879431 5879432 EC55989_1427 EC55989_1428 yciK   TRUE 0.508 44.000 0.000 NA   NA
 5879435 5879436 EC55989_1431 EC55989_1432   topA FALSE 0.084 123.000 0.003 NA   NA
 5879436 5879437 EC55989_1432 EC55989_1433 topA cysB FALSE 0.009 210.000 0.008 1.000 N NA
 5879437 5879438 EC55989_1433 EC55989_1434 cysB   FALSE 0.012 294.000 0.000 NA   NA
 5879438 5879439 EC55989_1434 EC55989_1435     TRUE 0.956 -18.000 0.556 NA   NA
 5879439 5879440 EC55989_1435 EC55989_1436     FALSE 0.110 137.000 0.000 NA   NA
 5879440 5879441 EC55989_1436 EC55989_1437   acnA FALSE 0.389 54.000 0.000 NA   NA
 5879443 5879444 EC55989_1439 EC55989_1440 pgpB yciS FALSE 0.159 149.000 0.143 NA   NA
 5879444 5879445 EC55989_1440 EC55989_1441 yciS yciM TRUE 0.989 7.000 0.576 NA   NA
 5879445 5879446 EC55989_1441 EC55989_1442 yciM pyrF FALSE 0.056 193.000 0.125 1.000 N NA
 5879446 5879447 EC55989_1442 EC55989_1443 pyrF yciH TRUE 0.872 0.000 0.045 1.000 N NA
 5879448 5879449 EC55989_1444 EC55989_1445 osmB deoT FALSE 0.015 269.000 0.000 NA   NA
 5879449 5879450 EC55989_1445 EC55989_1446 deoT   FALSE 0.388 90.000 0.146 NA   NA
 5879450 5879451 EC55989_1446 EC55989_1447   gmr FALSE 0.234 105.000 0.083 NA   NA
 5879451 5879452 EC55989_1447 EC55989_1448 gmr rnb FALSE 0.015 235.000 0.000 1.000 N NA
 5879452 5879453 EC55989_1448 EC55989_1449 rnb yciW FALSE 0.418 68.000 0.105 NA   NA
 5879453 5879454 EC55989_1449 EC55989_1450 yciW fabI FALSE 0.093 145.000 0.057 NA   NA
 5879454 5879455 EC55989_1450 EC55989_1451 fabI ycjD FALSE 0.009 370.000 0.000 1.000   NA
 5879455 5879456 EC55989_1451 EC55989_1452 ycjD sapF FALSE 0.351 68.000 0.000 1.000   NA
 5879456 5879457 EC55989_1452 EC55989_1453 sapF sapD TRUE 0.999 2.000 0.684 0.015 Y NA
 5879457 5879458 EC55989_1453 EC55989_1454 sapD sapC TRUE 0.998 0.000 0.667 1.000 Y NA
 5879458 5879459 EC55989_1454 EC55989_1455 sapC sapB TRUE 0.987 -13.000 0.284 0.051 Y NA
 5879459 5879460 EC55989_1455 EC55989_1456 sapB sapA TRUE 0.983 -3.000 0.264 0.051 N NA
 5879460 5879461 EC55989_1456 EC55989_1457 sapA ymjA FALSE 0.011 312.000 0.000 NA   NA
 5879461 5879462 EC55989_1457 EC55989_1458 ymjA puuP FALSE 0.116 134.000 0.000 NA   NA
 5879462 5879463 EC55989_1458 EC55989_1459 puuP puuA FALSE 0.075 303.000 0.000 1.000 Y NA
 5879464 5879465 EC55989_1460 EC55989_1461 puuD puuR TRUE 0.734 27.000 0.046 1.000   NA
 5879465 5879466 EC55989_1461 EC55989_1462 puuR puuC FALSE 0.007 275.000 0.040 1.000 N NA
 5879466 5879467 EC55989_1462 EC55989_1463 puuC puuB TRUE 0.993 2.000 0.500 0.028 N NA
 5879467 5879468 EC55989_1463 EC55989_1464 puuB puuE TRUE 0.925 38.000 0.100 1.000 Y NA
 5879470 5879471 EC55989_1467 EC55989_1468 pspA pspB TRUE 0.907 54.000 0.739 NA   NA
 5879471 5879472 EC55989_1468 EC55989_1469 pspB pspC TRUE 0.996 0.000 0.913 NA   NA
 5879472 5879473 EC55989_1469 EC55989_1470 pspC pspD TRUE 0.952 9.000 0.167 NA   NA
 5879473 5879474 EC55989_1470 EC55989_1471 pspD pspE FALSE 0.425 75.000 0.133 NA   NA
 5879474 5879475 EC55989_1471 EC55989_1472 pspE ycjM FALSE 0.020 212.000 0.000 1.000 N NA
 5879475 5879476 EC55989_1472 EC55989_1473 ycjM ycjN TRUE 0.993 14.000 0.360 1.000 Y NA
 5879476 5879477 EC55989_1473 EC55989_1474 ycjN ycjO TRUE 0.996 21.000 0.620 0.051 Y NA
 5879477 5879478 EC55989_1474 EC55989_1475 ycjO ycjP TRUE 0.996 -13.000 0.805 0.051 Y NA
 5879478 5879479 EC55989_1475 EC55989_1476 ycjP ycjQ TRUE 0.822 31.000 0.205 1.000 N NA
 5879479 5879480 EC55989_1476 EC55989_1477 ycjQ ycjR TRUE 0.933 18.000 0.261 NA N NA
 5879480 5879481 EC55989_1477 EC55989_1478 ycjR ycjS TRUE 0.890 10.000 0.000 NA   NA
 5879481 5879482 EC55989_1478 EC55989_1479 ycjS ycjS TRUE 0.523 43.000 0.000 NA   NA
 5879482 5879483 EC55989_1479 EC55989_1480 ycjS ycjT TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5879483 5879484 EC55989_1480 EC55989_1481 ycjT ycjU TRUE 0.922 -3.000 0.000 1.000   NA
 5879484 5879485 EC55989_1481 EC55989_1482 ycjU ycjV TRUE 0.917 14.000 0.103 1.000   NA
 5879485 5879486 EC55989_1482 EC55989_1483 ycjV ompG TRUE 0.784 45.000 0.222 1.000   NA
 5879488 5879489 EC55989_1485 EC55989_1486 ycjX ycjF TRUE 0.994 -3.000 0.791 NA   NA
 5879489 5879490 EC55989_1486 EC55989_1487 ycjF tyrR FALSE 0.158 148.000 0.137 NA   NA
 5879493 5879494 EC55989_1490 EC55989_1491 mpaA ymjC TRUE 0.555 41.000 0.000 NA   NA
 5879494 5879495 EC55989_1491 EC55989_1492 ymjC ycjY FALSE 0.295 71.000 0.000 NA   NA
 5879496 5879497 EC55989_1493 EC55989_1494 ycjZ mppA FALSE 0.006 337.000 0.000 1.000 N NA
 5879500 5879501 EC55989_1497 EC55989_1498 uspE fnr TRUE 0.787 152.000 0.619 1.000 Y NA
 5879501 5879502 EC55989_1498 EC55989_1499 fnr ogt FALSE 0.027 195.000 0.000 1.000 N NA
 5879502 5879503 EC55989_1499 EC55989_1500 ogt abgT TRUE 0.799 11.000 0.000 NA N NA
 5879503 5879504 EC55989_1500 EC55989_1501 abgT   TRUE 0.486 -70.000 0.000 NA   NA
 5879504 5879505 EC55989_1501 EC55989_1502   abgB FALSE 0.404 -87.000 0.000 NA   NA
 5879505 5879506 EC55989_1502 EC55989_1503 abgB abgA TRUE 0.984 0.000 0.128 0.002   NA
 5879507 5879508 EC55989_1504 EC55989_misc_RNA_30 abgR isrA TRUE 0.916 3.000 0.000 NA   NA
 5879508 5879509 EC55989_misc_RNA_30 EC55989_1505 isrA ydaL FALSE 0.059 170.000 0.000 NA   NA
 5879511 5879512 EC55989_1507 EC55989_1508 ydaN   FALSE 0.014 275.000 0.000 NA   NA
 5879512 5879513 EC55989_1508 EC55989_misc_RNA_31   C0343 FALSE 0.347 -118.000 0.000 NA   NA
 5879513 5879514 EC55989_misc_RNA_31 EC55989_1509 C0343 dbpA FALSE 0.281 74.000 0.000 NA   NA
 5879515 5879516 EC55989_1510 EC55989_1511 ydaO uspF FALSE 0.029 176.000 0.000 NA N NA
 5879516 5879517 EC55989_1511 EC55989_1512 uspF ompN FALSE 0.071 141.000 0.000 1.000 N NA
 5879521 5879522 EC55989_1515 EC55989_1516 hslJ ldhA FALSE 0.098 111.000 0.000 NA N NA
 5879523 5879524 EC55989_1517 EC55989_1518 ydbH ynbE TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5879524 5879525 EC55989_1518 EC55989_1519 ynbE ydbL TRUE 0.992 8.000 0.726 NA   NA
 5879528 5879529 EC55989_1522 EC55989_1523 tynA maoC FALSE 0.013 248.000 0.000 1.000 N NA
 5879530 5879531 EC55989_1524 EC55989_1525 paaA paaB TRUE 0.993 12.000 0.920 NA   NA
 5879531 5879532 EC55989_1525 EC55989_1526 paaB paaC TRUE 0.994 9.000 0.943 NA   NA
 5879532 5879533 EC55989_1526 EC55989_1527 paaC paaD TRUE 0.991 15.000 0.919 NA   NA
 5879533 5879534 EC55989_1527 EC55989_1528 paaD paaJ TRUE 0.989 8.000 0.571 NA   NA
 5879534 5879535 EC55989_1528 EC55989_1529 paaJ paaF TRUE 0.914 -3.000 0.093 1.000 N NA
 5879535 5879536 EC55989_1529 EC55989_1530 paaF paaG TRUE 0.997 0.000 0.215 0.001 Y NA
 5879536 5879537 EC55989_1530 EC55989_1531 paaG paaH TRUE 0.987 2.000 0.051 1.000 Y NA
 5879537 5879538 EC55989_1531 EC55989_1532 paaH paaI FALSE 0.374 -10.000 0.013 NA N NA
 5879538 5879539 EC55989_1532 EC55989_1533 paaI paaE TRUE 0.866 0.000 0.058 NA N NA
 5879539 5879540 EC55989_1533 EC55989_1534 paaE paaK TRUE 0.906 27.000 0.293 1.000 N NA
 5879540 5879541 EC55989_1534 EC55989_1535 paaK paaX FALSE 0.236 101.000 0.132 NA N NA
 5879541 5879542 EC55989_1535 EC55989_1536 paaX paaY TRUE 0.787 -18.000 0.118 NA   NA
 5879542 5879543 EC55989_1536 EC55989_1537 paaY ydbC FALSE 0.027 230.000 0.000 1.000   NA
 5879543 5879544 EC55989_1537 EC55989_1538 ydbC ydbD FALSE 0.329 64.000 0.000 NA   NA
 5879544 5879545 EC55989_1538 EC55989_1539 ydbD ynbA FALSE 0.059 171.000 0.000 NA   NA
 5879545 5879546 EC55989_1539 EC55989_1540 ynbA ynbB TRUE 0.988 0.000 0.179 0.002   NA
 5879546 5879547 EC55989_1540 EC55989_1541 ynbB ynbC TRUE 0.843 16.000 0.000 NA   NA
 5879547 5879548 EC55989_1541 EC55989_1542 ynbC ynbD TRUE 0.990 14.000 0.285 NA Y NA
 5879550 5879551 EC55989_1544 EC55989_1545 hrpA ydcF FALSE 0.015 272.000 0.000 NA   NA
 5879551 5879552 EC55989_1545 EC55989_1546 ydcF aldA FALSE 0.031 197.000 0.040 NA   NA
 5879558 5879559 EC55989_misc_RNA_34 EC55989_1551 sokB trg FALSE 0.012 299.000 0.000 NA   NA
 5879561 5879562 EC55989_1553 EC55989_1555 ydcJ mdoD FALSE 0.018 255.000 0.000 NA   NA
 5879564 5879565 EC55989_1557 EC55989_1558 ydcH rimL FALSE 0.359 48.000 0.026 NA   NA
 5879567 5879568 EC55989_1560 EC55989_1561 tehA tehB TRUE 0.966 -3.000 0.175 1.000   NA
 5879568 5879569 EC55989_1561 EC55989_1562 tehB ydcL FALSE 0.016 303.000 0.088 NA   NA
 5879570 5879571 EC55989_1563 EC55989_1564     FALSE 0.359 112.000 0.000 0.022   NA
 5879574 5879575 EC55989_1567 EC55989_1568 ydcN ydcP FALSE 0.325 73.000 0.000 1.000   NA
 5879577 5879578 EC55989_1570 EC55989_1571 ydcQ ydcR FALSE 0.295 79.000 0.000 1.000   NA
 5879578 5879579 EC55989_1571 EC55989_1572 ydcR ydcS FALSE 0.122 245.000 0.000 1.000 Y NA
 5879579 5879580 EC55989_1572 EC55989_1573 ydcS ydcT TRUE 0.997 18.000 0.609 0.050 Y NA
 5879580 5879581 EC55989_1573 EC55989_1574 ydcT ydcU TRUE 0.999 1.000 0.643 0.050 Y NA
 5879581 5879582 EC55989_1574 EC55989_1575 ydcU ydcV TRUE 0.997 -10.000 0.821 0.050 Y NA
 5879582 5879583 EC55989_1575 EC55989_1576 ydcV ydcW TRUE 0.907 22.000 0.216 1.000 N NA
 5879583 5879584 EC55989_1576 EC55989_1577 ydcW   FALSE 0.036 210.000 0.000 1.000   NA
 5879584 5879585 EC55989_1577 EC55989_1578   ydcX FALSE 0.005 617.000 0.000 NA   NA
 5879585 5879586 EC55989_1578 EC55989_1579 ydcX ydcY FALSE 0.242 86.000 0.000 NA   NA
 5879587 5879588 EC55989_1580 EC55989_1581 ydcZ yncA TRUE 0.920 -3.000 0.070 NA   NA
 5879589 5879590 EC55989_1582 EC55989_1583 yncB yncC FALSE 0.044 198.000 0.000 1.000   NA
 5879594 5879595 EC55989_1587 EC55989_1588 yncG   FALSE 0.004 1072.000 0.000 NA   NA
 5879595 5879596 EC55989_1588 EC55989_1589   rhsD TRUE 0.629 68.000 0.250 NA   NA
 5879596 5879597 EC55989_1589 EC55989_1590 rhsD   TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5879597 5879598 EC55989_1590 EC55989_1591   yhhI FALSE 0.009 336.000 0.000 NA   NA
 5879598 5879599 EC55989_1591 EC55989_1592 yhhI   TRUE 0.579 -33.000 0.000 NA   NA
 5879602 5879603 EC55989_1595 EC55989_1596 yddE narV FALSE 0.295 79.000 0.000 1.000   NA
 5879603 5879604 EC55989_1596 EC55989_1597 narV narW TRUE 0.998 -3.000 0.429 0.003 Y NA
 5879604 5879605 EC55989_1597 EC55989_1598 narW narY TRUE 0.999 0.000 0.714 0.003 Y NA
 5879605 5879606 EC55989_1598 EC55989_1599 narY narZ TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.001 Y NA
 5879606 5879607 EC55989_1599 EC55989_1601 narZ narU TRUE 0.742 82.000 0.556 1.000 N NA
 5879607 5879608 EC55989_1601 EC55989_1602 narU   FALSE 0.012 324.000 0.000 1.000   NA
 5879608 5879609 EC55989_1602 EC55989_1603   yddL TRUE 0.799 24.000 0.000 1.000   NA
 5879609 5879610 EC55989_1603 EC55989_1604 yddL yddG FALSE 0.039 259.000 0.000 0.094   NA
 5879611 5879612 EC55989_1605 EC55989_1607 fdnG fdnH TRUE 0.997 13.000 0.429 0.002 Y NA
 5879612 5879613 EC55989_1607 EC55989_1608 fdnH fdnI TRUE 0.995 -7.000 0.333 0.002 Y NA
 5879614 5879615 EC55989_1609 EC55989_1610 yddM adhP FALSE 0.345 69.000 0.000 1.000   NA
 5879615 5879616 EC55989_1610 EC55989_1611 adhP sfcA FALSE 0.136 134.000 0.000 1.000   NA
 5879616 5879617 EC55989_1611 EC55989_1612 sfcA bdm FALSE 0.007 396.000 0.000 NA   NA
 5879619 5879620 EC55989_1615 EC55989_1616 ddpF ddpD TRUE 0.992 -7.000 0.219 0.002 Y NA
 5879620 5879621 EC55989_1616 EC55989_1617 ddpD ddpC TRUE 0.995 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 5879621 5879622 EC55989_1617 EC55989_1618 ddpC ddpB TRUE 0.994 -3.000 0.143 0.050 Y NA
 5879622 5879623 EC55989_1618 EC55989_1619 ddpB ddpA TRUE 0.993 2.000 0.091 0.050 Y NA
 5879623 5879624 EC55989_1619 EC55989_1620 ddpA ddpX TRUE 0.865 14.000 0.091 1.000 N NA
 5879624 5879625 EC55989_1620 EC55989_1621 ddpX dos FALSE 0.012 258.000 0.000 1.000 N NA
 5879625 5879626 EC55989_1621 EC55989_1622 dos yddV TRUE 0.982 25.000 0.130 0.004 Y NA
 5879626 5879627 EC55989_1622 EC55989_1623 yddV yddW FALSE 0.009 372.000 0.000 1.000   NA
 5879627 5879628 EC55989_1623 EC55989_1624 yddW gadC FALSE 0.145 131.000 0.000 1.000   NA
 5879628 5879629 EC55989_1624 EC55989_1625 gadC gadB FALSE 0.406 156.000 0.103 1.000 Y NA
 5879629 5879630 EC55989_1625 EC55989_1626 gadB pqqL FALSE 0.010 362.000 0.000 1.000   NA
 5879630 5879631 EC55989_1626 EC55989_1627 pqqL yddB TRUE 0.725 45.000 0.167 1.000   NA
 5879631 5879632 EC55989_1627 EC55989_1628 yddB yddA TRUE 0.776 38.000 0.000 0.063   NA
 5879632 5879633 EC55989_1628 EC55989_1629 yddA ydeM FALSE 0.016 291.000 0.000 1.000   NA
 5879633 5879634 EC55989_1629 EC55989_1630 ydeM ydeN TRUE 0.895 52.000 0.600 1.000   NA
 5879634 5879635 EC55989_1630 EC55989_1631 ydeN ydeO FALSE 0.005 402.000 0.000 1.000 N NA
 5879635 5879636 EC55989_1631 EC55989_1632 ydeO   FALSE 0.276 75.000 0.000 NA   NA
 5879636 5879637 EC55989_1632 EC55989_1633   ydeP FALSE 0.019 248.000 0.000 NA   NA
 5879637 5879638 EC55989_1633 EC55989_1634 ydeP ydeQ FALSE 0.011 334.000 0.000 1.000   NA
 5879638 5879639 EC55989_1634 EC55989_1635 ydeQ ydeR TRUE 0.622 59.000 0.000 0.009   NA
 5879639 5879640 EC55989_1635 EC55989_1636 ydeR ydeS TRUE 0.988 13.000 0.000 0.009 Y NA
 5879640 5879641 EC55989_1636 EC55989_1637 ydeS   TRUE 0.977 14.000 0.000 1.000 Y NA
 5879641 5879642 EC55989_1637 EC55989_1638     TRUE 0.889 42.000 0.000 1.000 Y NA
 5879642 5879643 EC55989_1638 EC55989_1639     FALSE 0.055 352.000 0.000 1.000 Y NA
 5879643 5879644 EC55989_1639 EC55989_1640   yneL FALSE 0.007 408.000 0.000 NA   NA
 5879644 5879645 EC55989_1640 EC55989_1641 yneL hipA FALSE 0.011 318.000 0.000 NA   NA
 5879645 5879646 EC55989_1641 EC55989_1642 hipA hipB TRUE 0.994 0.000 0.675 NA   NA
 5879646 5879647 EC55989_1642 EC55989_1643 hipB   FALSE 0.021 209.000 0.000 1.000 N NA
 5879647 5879648 EC55989_1643 EC55989_1644   lsrK FALSE 0.004 531.000 0.000 1.000 N NA
 5879648 5879649 EC55989_1644 EC55989_1645 lsrK lsrR FALSE 0.192 79.000 0.000 1.000 N NA
 5879650 5879651 EC55989_1646 EC55989_1647 ego lsrC TRUE 0.997 -6.000 0.818 1.000 Y NA
 5879651 5879652 EC55989_1647 EC55989_1648 lsrC lsrD TRUE 0.999 0.000 0.788 0.050 Y NA
 5879652 5879653 EC55989_1648 EC55989_1649 lsrD lsrB TRUE 0.998 12.000 0.844 NA Y NA
 5879653 5879654 EC55989_1649 EC55989_1650 lsrB lsrF TRUE 0.942 27.000 0.000 NA Y NA
 5879654 5879655 EC55989_1650 EC55989_1651 lsrF lsrG TRUE 0.799 24.000 0.000 1.000   NA
 5879655 5879656 EC55989_1651 EC55989_1652 lsrG tam FALSE 0.409 57.000 0.000 1.000   NA
 5879657 5879658 EC55989_1653 EC55989_1654 yneE uxaB FALSE 0.064 207.000 0.143 NA   NA
 5879658 5879659 EC55989_1654 EC55989_1655 uxaB yneF FALSE 0.016 227.000 0.000 1.000 N NA
 5879659 5879660 EC55989_1655 EC55989_1656 yneF yneG FALSE 0.152 139.000 0.098 NA   NA
 5879660 5879661 EC55989_1656 EC55989_1657 yneG yneH TRUE 0.904 0.000 0.037 NA   NA
 5879661 5879662 EC55989_1657 EC55989_1658 yneH yneI FALSE 0.250 64.000 0.000 1.000 N NA
 5879663 5879664 EC55989_1659 EC55989_1660 yneJ yneK FALSE 0.263 78.000 0.000 NA   NA
 5879664 5879665 EC55989_1660 EC55989_1661 yneK yneK TRUE 0.533 -51.000 0.000 NA   NA
 5879665 5879666 EC55989_1661 EC55989_1662 yneK yneK TRUE 0.601 -27.000 0.000 NA   NA
 5879666 5879667 EC55989_1662 EC55989_1663 yneK ydeA FALSE 0.081 150.000 0.000 NA   NA
 5879669 5879670 EC55989_1665 EC55989_1666 marR marA TRUE 0.997 20.000 0.667 0.045 Y NA
 5879670 5879671 EC55989_1666 EC55989_1667 marA marB TRUE 0.647 32.000 0.000 NA   NA
 5879672 5879673 EC55989_1668 EC55989_1669     TRUE 0.969 19.000 0.000 1.000 Y NA
 5879673 5879674 EC55989_1669 EC55989_1670     TRUE 0.942 56.000 0.250 0.013 Y NA
 5879674 5879675 EC55989_1670 EC55989_1671     TRUE 0.979 25.000 0.105 0.012 Y NA
 5879675 5879676 EC55989_1671 EC55989_1672     TRUE 0.973 76.000 0.789 0.012 Y NA
 5879680 5879681 EC55989_1676 EC55989_1677 ydeH ydeI FALSE 0.018 255.000 0.000 NA   NA
 5879684 5879685 EC55989_1680 EC55989_1681 ydfG ydfH FALSE 0.268 89.000 0.000 1.000   NA
 5879685 5879686 EC55989_1681 EC55989_1682 ydfH ydfZ FALSE 0.052 178.000 0.000 NA   NA
 5879687 5879688 EC55989_1683 EC55989_1684 ydfI ydfJ TRUE 0.676 89.000 0.000 1.000 Y NA
 5879689 5879690 EC55989_1686 EC55989_1687 yciG yciF FALSE 0.287 73.000 0.000 NA   NA
 5879690 5879691 EC55989_1687 EC55989_1688 yciF yciE TRUE 0.831 37.000 0.000 0.003   NA
 5879691 5879692 EC55989_1688 EC55989_1689 yciE   TRUE 0.955 19.000 0.115 0.003   NA
 5879693 5879694 EC55989_1690 EC55989_1691 tfaQ   TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5879694 5879695 EC55989_1691 EC55989_1692     FALSE 0.365 65.000 0.000 1.000   NA
 5879695 5879696 EC55989_1692 EC55989_1693     FALSE 0.300 70.000 0.000 NA   NA
 5879696 5879697 EC55989_1693 EC55989_1694     TRUE 0.819 61.000 0.500 NA   NA
 5879697 5879698 EC55989_1694 EC55989_1695     TRUE 0.927 -102.000 1.000 NA   NA
 5879698 5879699 EC55989_1695 EC55989_1696     TRUE 0.899 6.000 0.000 NA   NA
 5879699 5879700 EC55989_1696 EC55989_1697     TRUE 0.890 10.000 0.000 NA   NA
 5879700 5879701 EC55989_1697 EC55989_1698     TRUE 0.988 0.000 0.400 NA   NA
 5879701 5879702 EC55989_1698 EC55989_1699     TRUE 0.879 -58.000 0.400 NA   NA
 5879702 5879703 EC55989_1699 EC55989_1700     TRUE 0.893 9.000 0.000 NA   NA
 5879703 5879704 EC55989_1700 EC55989_1701     TRUE 0.822 19.000 0.000 NA   NA
 5879704 5879705 EC55989_1701 EC55989_1702     TRUE 0.956 -64.000 1.000 NA   NA
 5879705 5879706 EC55989_1702 EC55989_1703     TRUE 0.982 -15.000 1.000 NA   NA
 5879706 5879707 EC55989_1703 EC55989_1704     TRUE 0.876 12.000 0.000 NA   NA
 5879707 5879708 EC55989_1704 EC55989_1705     TRUE 0.908 -7.000 0.152 NA   NA
 5879708 5879709 EC55989_1705 EC55989_1706     TRUE 0.919 42.000 0.537 NA   NA
 5879709 5879710 EC55989_1706 EC55989_1707     FALSE 0.310 -247.000 0.049 1.000   NA
 5879710 5879711 EC55989_1707 EC55989_1708     TRUE 0.924 -72.000 0.667 NA   NA
 5879711 5879712 EC55989_1708 EC55989_1709     TRUE 0.980 -9.000 0.667 NA   NA
 5879712 5879713 EC55989_1709 EC55989_1710     TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5879713 5879714 EC55989_1710 EC55989_1711     FALSE 0.005 553.000 0.000 NA   NA
 5879716 5879717 EC55989_1713 EC55989_1714 rzpD   TRUE 0.920 2.000 0.000 NA   NA
 5879717 5879718 EC55989_1714 EC55989_1715   ydfQ FALSE 0.143 124.000 0.000 NA   NA
 5879718 5879719 EC55989_1715 EC55989_1716 ydfQ   FALSE 0.372 56.000 0.000 NA   NA
 5879719 5879720 EC55989_1716 EC55989_1717   essD TRUE 0.902 5.000 0.000 NA   NA
 5879720 5879721 EC55989_1717 EC55989_1718 essD   FALSE 0.019 252.000 0.000 NA   NA
 5879721 5879722 EC55989_1718 EC55989_1719   tolA FALSE 0.080 151.000 0.000 NA   NA
 5879722 5879723 EC55989_1719 EC55989_1720 tolA   FALSE 0.008 367.000 0.000 NA   NA
 5879723 5879724 EC55989_1720 EC55989_1721     FALSE 0.253 81.000 0.000 NA   NA
 5879724 5879725 EC55989_1721 EC55989_tRNA82     FALSE 0.172 111.000 0.000 NA   NA
 5879727 5879728 EC55989_tRNA81 EC55989_1723     FALSE 0.095 144.000 0.000 NA   NA
 5879728 5879729 EC55989_1723 EC55989_1724     TRUE 0.922 -3.000 0.000 1.000   NA
 5879729 5879730 EC55989_1724 EC55989_1725     FALSE 0.304 -196.000 0.000 NA   NA
 5879730 5879731 EC55989_1725 EC55989_1726   ydfU TRUE 0.899 6.000 0.000 NA   NA
 5879731 5879732 EC55989_1726 EC55989_1727 ydfU rem FALSE 0.009 347.000 0.000 NA   NA
 5879732 5879733 EC55989_1727 EC55989_1728 rem   FALSE 0.005 588.000 0.000 NA   NA
 5879733 5879734 EC55989_1728 EC55989_1729     FALSE 0.442 49.000 0.000 NA   NA
 5879734 5879735 EC55989_1729 EC55989_1730     FALSE 0.028 216.000 0.000 NA   NA
 5879735 5879736 EC55989_1730 EC55989_1731     TRUE 0.555 41.000 0.000 NA   NA
 5879736 5879737 EC55989_1731 EC55989_1732     TRUE 0.468 -73.000 0.000 NA   NA
 5879737 5879738 EC55989_1732 EC55989_1733   dicC TRUE 0.698 -16.000 0.000 NA   NA
 5879739 5879740 EC55989_1734 EC55989_1735 dicA ydfA FALSE 0.060 169.000 0.000 NA   NA
 5879740 5879741 EC55989_1735 EC55989_1736 ydfA   TRUE 0.551 -40.000 0.000 NA   NA
 5879741 5879742 EC55989_1736 EC55989_misc_RNA_35   dicF FALSE 0.017 260.000 0.000 NA   NA
 5879742 5879743 EC55989_misc_RNA_35 EC55989_1737 dicF   FALSE 0.300 70.000 0.000 NA   NA
 5879743 5879744 EC55989_1737 EC55989_1738   ydfD TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5879744 5879745 EC55989_1738 EC55989_1739 ydfD   FALSE 0.218 94.000 0.000 NA   NA
 5879745 5879746 EC55989_1739 EC55989_1740   xis FALSE 0.287 73.000 0.000 NA   NA
 5879746 5879747 EC55989_1740 EC55989_1741 xis intQ TRUE 0.814 20.000 0.000 NA   NA
 5879748 5879749 EC55989_1742 EC55989_1743 ynfP rspB FALSE 0.360 58.000 0.000 NA   NA
 5879749 5879750 EC55989_1743 EC55989_misc_RNA_36 rspB RNAout FALSE 0.211 96.000 0.000 NA   NA
 5879752 5879753 EC55989_1745 EC55989_1746 rspB rspA TRUE 0.742 -12.000 0.000 NA   NA
 5879753 5879754 EC55989_1746 EC55989_1747 rspA ynfA FALSE 0.026 206.000 0.020 1.000   NA
 5879755 5879756 EC55989_1748 EC55989_1749 ynfB speG TRUE 0.613 35.000 0.055 NA   NA
 5879758 5879759 EC55989_1751 EC55989_1752 ynfD ynfE FALSE 0.151 199.000 0.304 NA   NA
 5879759 5879760 EC55989_1752 EC55989_1753 ynfE ynfF TRUE 0.942 61.000 0.231 0.001 Y NA
 5879760 5879761 EC55989_1753 EC55989_1754 ynfF ynfG TRUE 0.998 11.000 0.667 0.044 Y NA
 5879761 5879762 EC55989_1754 EC55989_1755 ynfG ynfH TRUE 0.985 2.000 0.333 1.000   NA
 5879762 5879763 EC55989_1755 EC55989_1756 ynfH dmsD TRUE 0.696 43.000 0.125 1.000   NA
 5879763 5879764 EC55989_1756 EC55989_1757 dmsD clcB FALSE 0.057 195.000 0.079 1.000   NA
 5879765 5879766 EC55989_1758 EC55989_1759 ynfK dgsA TRUE 0.494 125.000 0.455 NA N NA
 5879766 5879767 EC55989_1759 EC55989_1760 dgsA ynfL TRUE 0.759 135.000 0.408 NA Y NA
 5879768 5879769 EC55989_1761 EC55989_1762 ynfM asr FALSE 0.006 424.000 0.000 NA   NA
 5879769 5879770 EC55989_1762 EC55989_1763 asr ydgD FALSE 0.014 276.000 0.000 NA   NA
 5879771 5879772 EC55989_1764 EC55989_1765 mdtI mdtJ TRUE 0.996 -13.000 0.869 0.077 Y NA
 5879774 5879775 EC55989_1767 EC55989_1768 pntB pntA TRUE 0.999 11.000 0.745 0.001 Y NA
 5879776 5879777 EC55989_1769 EC55989_1770 ydgH ydgI FALSE 0.087 186.000 0.143 NA   NA
 5879777 5879778 EC55989_1770 EC55989_1771 ydgI folM TRUE 0.700 37.000 0.140 1.000 N NA
 5879780 5879781 EC55989_1774 EC55989_1775 rstA rstB TRUE 0.992 4.000 0.181 1.000 Y NA
 5879781 5879782 EC55989_1775 EC55989_1776 rstB tus TRUE 0.546 76.000 0.200 1.000   NA
 5879783 5879784 EC55989_1777 EC55989_1778 fumC fumA TRUE 0.614 143.000 0.000 0.001 Y NA
 5879785 5879786 EC55989_1779 EC55989_1780 manA ydgA TRUE 0.796 101.000 0.778 NA   NA
 5879787 5879788 EC55989_1781 EC55989_1782 uidC uidB TRUE 0.903 39.000 0.375 1.000   NA
 5879788 5879789 EC55989_1782 EC55989_1783 uidB uidA TRUE 0.994 -3.000 0.235 1.000 Y NA
 5879789 5879790 EC55989_1783 EC55989_1784 uidA uidR FALSE 0.005 389.000 0.000 1.000 N NA
 5879790 5879791 EC55989_1784 EC55989_1786 uidR hdhA FALSE 0.016 229.000 0.000 1.000 N NA
 5879791 5879792 EC55989_1786 EC55989_1787 hdhA malI FALSE 0.121 112.000 0.000 1.000 N NA
 5879793 5879794 EC55989_1788 EC55989_1789 malX malY TRUE 0.985 10.000 0.531 1.000 N NA
 5879794 5879795 EC55989_1789 EC55989_1790 malY add FALSE 0.257 104.000 0.132 1.000 N NA
 5879797 5879798 EC55989_1792 EC55989_1793 blr ydgT FALSE 0.015 273.000 0.000 NA   NA
 5879798 5879799 EC55989_1793 EC55989_1794 ydgT ydgK FALSE 0.359 86.000 0.120 NA   NA
 5879799 5879800 EC55989_1794 EC55989_1795 ydgK rsxA FALSE 0.437 77.000 0.148 NA   NA
 5879800 5879801 EC55989_1795 EC55989_1796 rsxA rsxB TRUE 0.999 0.000 0.564 0.044 Y NA
 5879801 5879802 EC55989_1796 EC55989_1797 rsxB rsxC TRUE 0.996 -7.000 0.537 0.044 Y NA
 5879802 5879803 EC55989_1797 EC55989_1798 rsxC rsxD TRUE 0.999 1.000 0.814 0.044 Y NA
 5879803 5879804 EC55989_1798 EC55989_1799 rsxD rsxG TRUE 0.999 4.000 0.924 0.044 Y NA
 5879804 5879805 EC55989_1799 EC55989_1800 rsxG rsxE TRUE 0.999 4.000 0.908 0.044 Y NA
 5879805 5879806 EC55989_1800 EC55989_1801 rsxE nth TRUE 0.937 0.000 0.109 1.000 N NA
 5879806 5879807 EC55989_1801 EC55989_1802 nth ydgR FALSE 0.003 611.000 0.000 1.000 N NA
 5879807 5879808 EC55989_1802 EC55989_1803 ydgR gst TRUE 0.514 106.000 0.344 1.000 N NA
 5879809 5879810 EC55989_1804 EC55989_1805 pdxY tyrS FALSE 0.223 59.000 0.041 1.000 N NA
 5879810 5879811 EC55989_1805 EC55989_1806 tyrS pdxH FALSE 0.087 129.000 0.054 1.000 N NA
 5879811 5879812 EC55989_1806 EC55989_1807 pdxH ydhA FALSE 0.286 59.000 0.034 NA   NA
 5879812 5879813 EC55989_1807 EC55989_1808 ydhA anmK FALSE 0.160 98.000 0.034 NA   NA
 5879816 5879817 EC55989_1811 EC55989_1812 ydhI ydhJ TRUE 0.987 3.000 0.412 NA   NA
 5879817 5879818 EC55989_1812 EC55989_1813 ydhJ ydhK TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5879819 5879820 EC55989_1814 EC55989_1815 sodC ydhF FALSE 0.235 81.000 0.033 1.000   NA
 5879820 5879821 EC55989_1815 EC55989_1816 ydhF ydhL FALSE 0.407 49.000 0.045 NA   NA
 5879822 5879823 EC55989_1817 EC55989_1818 ydhM nemA TRUE 0.883 37.000 0.362 1.000 N NA
 5879823 5879824 EC55989_1818 EC55989_1819 nemA gloA FALSE 0.187 81.000 0.057 1.000 N NA
 5879824 5879825 EC55989_1819 EC55989_1820 gloA rnt FALSE 0.264 103.000 0.136 1.000 N NA
 5879825 5879826 EC55989_1820 EC55989_1821 rnt lhr FALSE 0.255 93.000 0.000 1.000   NA
 5879828 5879829 EC55989_1823 EC55989_1824 ydhO sodB FALSE 0.047 128.000 0.015 1.000 N NA
 5879833 5879834 EC55989_1828 EC55989_1829 ydhC cfa FALSE 0.009 291.000 0.000 1.000 N NA
 5879838 5879839 EC55989_tRNA20 EC55989_tRNA21     TRUE 0.902 5.000 0.000 NA   NA
 5879839 5879840 EC55989_tRNA21 EC55989_1834   ydhR FALSE 0.179 108.000 0.000 NA   NA
 5879840 5879841 EC55989_1834 EC55989_1835 ydhR ydhS FALSE 0.140 126.000 0.000 NA   NA
 5879842 5879843 EC55989_1836 EC55989_1837 ydhT ydhU TRUE 0.971 4.000 0.222 NA   NA
 5879843 5879844 EC55989_1837 EC55989_1838 ydhU ydhX TRUE 0.996 -3.000 0.444 NA Y NA
 5879844 5879845 EC55989_1838 EC55989_1839 ydhX ydhW TRUE 0.637 64.000 0.235 NA   NA
 5879845 5879846 EC55989_1839 EC55989_1840 ydhW ydhV TRUE 0.987 4.000 0.458 NA   NA
 5879846 5879847 EC55989_1840 EC55989_1841 ydhV ydhY TRUE 0.997 21.000 0.600 0.014 Y NA
 5879847 5879848 EC55989_1841 EC55989_1842 ydhY ydhZ FALSE 0.006 456.000 0.000 NA   NA
 5879849 5879850 EC55989_1843 EC55989_1844 pykF lpp FALSE 0.008 311.000 0.000 1.000 N NA
 5879851 5879852 EC55989_1845 EC55989_1846 ynhG sufE FALSE 0.095 149.000 0.069 NA   NA
 5879852 5879853 EC55989_1846 EC55989_1847 sufE sufS TRUE 0.946 13.000 0.183 NA   NA
 5879853 5879854 EC55989_1847 EC55989_1848 sufS sufD TRUE 0.957 -3.000 0.193 1.000 N NA
 5879854 5879855 EC55989_1848 EC55989_1849 sufD sufC TRUE 0.981 -25.000 0.482 1.000 Y NA
 5879855 5879856 EC55989_1849 EC55989_1850 sufC sufB TRUE 0.996 10.000 0.466 1.000 Y NA
 5879856 5879857 EC55989_1850 EC55989_1851 sufB sufA TRUE 0.872 9.000 0.041 NA   NA
 5879859 5879860 EC55989_1852 EC55989_1853 ydiH ydiI TRUE 0.770 19.000 0.032 NA   NA
 5879860 5879861 EC55989_1853 EC55989_1854 ydiI ydiJ TRUE 0.924 -3.000 0.129 NA N NA
 5879862 5879863 EC55989_1855 EC55989_misc_RNA_38 ydiK rprA FALSE 0.044 186.000 0.000 NA   NA
 5879863 5879864 EC55989_misc_RNA_38 EC55989_1856 rprA ydiL FALSE 0.097 143.000 0.000 NA   NA
 5879864 5879865 EC55989_1856 EC55989_1857 ydiL ydiM FALSE 0.299 100.000 0.095 1.000   NA
 5879865 5879866 EC55989_1857 EC55989_1858 ydiM ydiN FALSE 0.132 227.000 0.000 NA Y NA
 5879866 5879867 EC55989_1858 EC55989_1859 ydiN ydiB TRUE 0.844 12.000 0.082 NA N NA
 5879867 5879868 EC55989_1859 EC55989_1860 ydiB aroD TRUE 0.947 31.000 0.113 1.000 Y NA
 5879868 5879869 EC55989_1860 EC55989_1861 aroD ydiF FALSE 0.035 144.000 0.019 1.000 N NA
 5879869 5879870 EC55989_1861 EC55989_1862 ydiF ydiO TRUE 0.995 14.000 0.500 1.000 Y NA
 5879871 5879872 EC55989_1863 EC55989_1864 ydiP   FALSE 0.192 103.000 0.000 NA   NA
 5879873 5879874 EC55989_1865 EC55989_1866 ydiQ ydiR TRUE 0.998 20.000 1.000 0.012 Y NA
 5879874 5879875 EC55989_1866 EC55989_1867 ydiR ydiS TRUE 0.986 56.000 1.000 0.044 Y NA
 5879875 5879876 EC55989_1867 EC55989_1868 ydiS ydiT TRUE 0.998 -3.000 0.400 0.044 Y NA
 5879876 5879877 EC55989_1868 EC55989_1869 ydiT ydiD TRUE 0.909 3.000 0.080 1.000 N NA
 5879879 5879880 EC55989_1871 EC55989_1872 ydiA aroH FALSE 0.170 157.000 0.165 1.000   NA
 5879880 5879881 EC55989_1872 EC55989_1873 aroH ydiE FALSE 0.064 132.000 0.054 NA N NA
 5879882 5879883 EC55989_1874 EC55989_1875 ydiU ydiV FALSE 0.264 63.000 0.031 NA   NA
 5879883 5879884 EC55989_1875 EC55989_1876 ydiV nlpC FALSE 0.010 247.000 0.000 NA N NA
 5879884 5879885 EC55989_1876 EC55989_1877 nlpC btuD FALSE 0.157 78.000 0.000 NA N NA
 5879885 5879886 EC55989_1877 EC55989_1878 btuD btuE TRUE 0.892 0.000 0.000 1.000 N NA
 5879886 5879887 EC55989_1878 EC55989_1879 btuE btuC FALSE 0.329 63.000 0.084 1.000 N NA
 5879887 5879888 EC55989_1879 EC55989_1880 btuC ihfA FALSE 0.084 101.000 0.023 1.000 N NA
 5879888 5879889 EC55989_1880 EC55989_1881 ihfA pheT TRUE 0.957 5.000 0.208 1.000 N NA
 5879889 5879890 EC55989_1881 EC55989_1882 pheT pheS TRUE 0.998 15.000 0.574 0.001 Y NA
 5879890 5879891 EC55989_1882 EC55989_5069 pheS pheM FALSE 0.014 283.000 0.000 NA   NA
 5879891 5879892 EC55989_5069 EC55989_1883 pheM rplT FALSE 0.146 123.000 0.000 NA   NA
 5879892 5879893 EC55989_1883 EC55989_1884 rplT rpmI TRUE 0.988 53.000 0.928 0.010 Y NA
 5879893 5879894 EC55989_1884 EC55989_1885 rpmI infC FALSE 0.207 97.000 0.000 NA   NA
 5879894 5879895 EC55989_1885 EC55989_1886 infC thrS FALSE 0.169 112.000 0.000 NA   NA
 5879896 5879897 EC55989_1887 EC55989_1888     TRUE 0.792 22.000 0.000 NA   NA
 5879899 5879900 EC55989_1890 EC55989_1891 pfkB ydiZ FALSE 0.196 101.000 0.000 NA   NA
 5879900 5879901 EC55989_1891 EC55989_1892 ydiZ yniA FALSE 0.184 106.000 0.000 NA   NA
 5879903 5879904 EC55989_1894 EC55989_1895 yniC ydjM FALSE 0.075 163.000 0.068 NA   NA
 5879904 5879905 EC55989_1895 EC55989_1896 ydjM ydjN FALSE 0.174 133.000 0.102 NA   NA
 5879906 5879907 EC55989_1897 EC55989_1898 ydjO ydjO TRUE 0.890 10.000 0.000 NA   NA
 5879907 5879908 EC55989_1898 EC55989_1899 ydjO cedA FALSE 0.014 277.000 0.000 NA   NA
 5879910 5879911 EC55989_1901 EC55989_1902 chbG chbF TRUE 0.989 13.000 0.429 0.018   NA
 5879911 5879912 EC55989_1902 EC55989_1903 chbF chbR TRUE 0.703 105.000 0.625 1.000 N NA
 5879912 5879913 EC55989_1903 EC55989_1904 chbR chbA TRUE 0.991 8.000 0.727 1.000 N NA
 5879913 5879914 EC55989_1904 EC55989_1905 chbA chbC TRUE 0.987 51.000 0.833 0.012 Y NA
 5879914 5879915 EC55989_1905 EC55989_1906 chbC chbB TRUE 0.947 85.000 0.500 0.012 Y NA
 5879915 5879916 EC55989_1906 EC55989_1907 chbB osmE FALSE 0.015 299.000 0.000 1.000   NA
 5879917 5879918 EC55989_1908 EC55989_1909 nadE ydjQ FALSE 0.007 230.000 0.010 1.000 N NA
 5879919 5879920 EC55989_1910 EC55989_1911 ydjR spy FALSE 0.024 203.000 0.028 NA   NA
 5879920 5879921 EC55989_1911 EC55989_1912 spy astE FALSE 0.005 330.000 0.000 NA N NA
 5879921 5879922 EC55989_1912 EC55989_1913 astE astB TRUE 0.978 -7.000 0.126 1.000 Y NA
 5879922 5879923 EC55989_1913 EC55989_1914 astB astD TRUE 0.975 -3.000 0.306 1.000 N NA
 5879923 5879924 EC55989_1914 EC55989_1915 astD astA TRUE 0.953 -3.000 0.179 1.000 N NA
 5879924 5879925 EC55989_1915 EC55989_1916 astA astC TRUE 0.998 -3.000 0.625 1.000 Y NA
 5879926 5879927 EC55989_1917 EC55989_1918 xthA ydjX FALSE 0.038 167.000 0.016 NA   NA
 5879927 5879928 EC55989_1918 EC55989_1919 ydjX ydjY TRUE 0.925 5.000 0.083 NA   NA
 5879928 5879929 EC55989_1919 EC55989_1920 ydjY ydjZ TRUE 0.939 14.000 0.174 NA   NA
 5879929 5879930 EC55989_1920 EC55989_1921 ydjZ ynjA TRUE 0.943 0.000 0.087 NA   NA
 5879930 5879931 EC55989_1921 EC55989_1922 ynjA ynjB TRUE 0.853 10.000 0.032 NA   NA
 5879931 5879932 EC55989_1922 EC55989_1923 ynjB ynjC TRUE 0.990 18.000 0.627 0.049   NA
 5879932 5879933 EC55989_1923 EC55989_1924 ynjC ynjD TRUE 0.993 0.000 0.602 1.000   NA
 5879933 5879934 EC55989_1924 EC55989_1925 ynjD ynjE TRUE 0.467 67.000 0.111 1.000   NA
 5879936 5879937 EC55989_1927 EC55989_1928 nudG gdhA FALSE 0.004 474.000 0.000 1.000 N NA
 5879938 5879939 EC55989_1929 EC55989_1930 ynjI topB FALSE 0.133 128.000 0.000 NA   NA
 5879939 5879940 EC55989_1930 EC55989_1931 topB selD TRUE 0.829 5.000 0.041 1.000 N NA
 5879940 5879941 EC55989_1931 EC55989_1932 selD   TRUE 0.522 -58.000 0.000 NA   NA
 5879941 5879942 EC55989_1932 EC55989_1933   ydjA TRUE 0.736 26.000 0.000 NA   NA
 5879943 5879944 EC55989_1934 EC55989_1935   sppA TRUE 0.529 -57.000 0.000 NA   NA
 5879944 5879945 EC55989_1935 EC55989_1936 sppA ansA FALSE 0.078 167.000 0.113 1.000 N NA
 5879945 5879946 EC55989_1936 EC55989_1937 ansA pncA TRUE 0.795 11.000 0.040 1.000 N NA
 5879947 5879948 EC55989_1938 EC55989_1939 ydjE ydjF TRUE 0.645 117.000 0.125 1.000 Y NA
 5879948 5879949 EC55989_1939 EC55989_1940 ydjF ydjG FALSE 0.294 137.000 0.269 1.000 N NA
 5879949 5879950 EC55989_1940 EC55989_1941 ydjG ydjH TRUE 0.964 10.000 0.269 1.000 N NA
 5879950 5879951 EC55989_1941 EC55989_1942 ydjH ydjI TRUE 0.996 5.000 0.368 1.000 Y NA
 5879951 5879952 EC55989_1942 EC55989_1943 ydjI ydjJ TRUE 0.949 21.000 0.194 0.014 N NA
 5879952 5879953 EC55989_1943 EC55989_1944 ydjJ ydjK FALSE 0.385 82.000 0.167 1.000 N NA
 5879953 5879954 EC55989_1944 EC55989_1945 ydjK ydjL TRUE 0.889 27.000 0.250 1.000 N NA
 5879954 5879955 EC55989_1945 EC55989_1946 ydjL yeaC FALSE 0.008 370.000 0.000 NA   NA
 5879955 5879956 EC55989_1946 EC55989_1947 yeaC msrB TRUE 0.787 42.000 0.216 NA   NA
 5879957 5879958 EC55989_1948 EC55989_1949 gapA yeaD TRUE 0.782 84.000 0.154 1.000 Y NA
 5879959 5879960 EC55989_1950 EC55989_1951 yeaE mipA FALSE 0.252 90.000 0.067 NA   NA
 5879961 5879962 EC55989_1952 EC55989_1953 yeaG yeaH TRUE 0.739 113.000 0.683 NA   NA
 5879962 5879963 EC55989_1953 EC55989_1954 yeaH yeaI FALSE 0.089 147.000 0.000 NA   NA
 5879963 5879964 EC55989_1954 EC55989_1955 yeaI yeaJ FALSE 0.406 181.000 0.000 0.004 Y NA
 5879964 5879965 EC55989_1955 EC55989_1956 yeaJ yeaK TRUE 0.592 43.000 0.083 NA   NA
 5879969 5879970 EC55989_1961 EC55989_1962 yeaN yeaO FALSE 0.252 55.000 0.007 NA   NA
 5879973 5879974 EC55989_1965 EC55989_1966 yeaQ   TRUE 0.876 12.000 0.000 NA   NA
 5879974 5879975 EC55989_1966 EC55989_1967   ydcM TRUE 0.677 30.000 0.000 NA   NA
 5879975 5879976 EC55989_1967 EC55989_1968 ydcM   TRUE 0.641 -22.000 0.000 NA   NA
 5879976 5879977 EC55989_1968 EC55989_1969     FALSE 0.010 331.000 0.000 NA   NA
 5879977 5879978 EC55989_1969 EC55989_1970   yeaR TRUE 0.909 4.000 0.000 NA   NA
 5879978 5879979 EC55989_1970 EC55989_1971 yeaR yeaS FALSE 0.030 173.000 0.000 NA N NA
 5879979 5879980 EC55989_1971 EC55989_1972 yeaS yeaT FALSE 0.097 127.000 0.000 1.000 N NA
 5879981 5879982 EC55989_1973 EC55989_1974 yeaU yeaV FALSE 0.028 416.000 0.333 1.000 N NA
 5879982 5879983 EC55989_1974 EC55989_1975 yeaV yeaW TRUE 0.555 32.000 0.000 1.000 N NA
 5879983 5879984 EC55989_1975 EC55989_1976 yeaW yeaX TRUE 0.488 56.000 0.043 0.044 N NA
 5879985 5879986 EC55989_1977 EC55989_1978 rnd fadD FALSE 0.355 70.000 0.115 1.000 N NA
 5879986 5879987 EC55989_1978 EC55989_1979 fadD yeaY FALSE 0.063 205.000 0.169 1.000 N NA
 5879987 5879988 EC55989_1979 EC55989_1980 yeaY yeaZ FALSE 0.332 40.000 0.024 1.000 N NA
 5879988 5879989 EC55989_1980 EC55989_1981 yeaZ yoaA FALSE 0.348 58.000 0.082 1.000 N NA
 5879990 5879991 EC55989_1982 EC55989_1983 yoaB yoaC FALSE 0.008 363.000 0.000 NA   NA
 5879993 5879994 EC55989_1985 EC55989_1986 pabB yeaB TRUE 0.952 4.000 0.116 1.000   NA
 5879994 5879995 EC55989_1986 EC55989_1987 yeaB sdaA FALSE 0.268 184.000 0.409 1.000   NA
 5879995 5879996 EC55989_1987 EC55989_1988 sdaA adrB FALSE 0.410 131.000 0.389 NA N NA
 5879998 5879999 EC55989_1990 EC55989_1991 manX manY TRUE 0.857 63.000 0.000 0.015 Y NA
 5879999 5880000 EC55989_1991 EC55989_1992 manY manZ TRUE 0.999 4.000 0.939 0.015 Y NA
 5880000 5880001 EC55989_1992 EC55989_1993 manZ yobD TRUE 0.906 55.000 0.755 NA   NA
 5880001 5880002 EC55989_1993 EC55989_1994 yobD   FALSE 0.043 187.000 0.000 NA   NA
 5880002 5880003 EC55989_1994 EC55989_1995   yebN TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5880004 5880005 EC55989_1996 EC55989_1997 rrmA cspC FALSE 0.062 166.000 0.038 1.000   NA
 5880005 5880006 EC55989_1997 EC55989_1998 cspC yobF TRUE 0.953 13.000 0.214 NA   NA
 5880006 5880007 EC55989_1998 EC55989_1999 yobF yebO FALSE 0.005 670.000 0.000 NA   NA
 5880007 5880008 EC55989_1999 EC55989_2000 yebO yobG TRUE 0.769 75.000 0.500 NA   NA
 5880009 5880010 EC55989_2001 EC55989_2002 yobH insA FALSE 0.012 297.000 0.000 NA   NA
 5880010 5880011 EC55989_2002 EC55989_2003 insA insB TRUE 0.898 -81.000 0.000 0.025 Y NA
 5880014 5880015 EC55989_2006 EC55989_2007 htpX prc FALSE 0.069 192.000 0.042 0.020 N NA
 5880015 5880016 EC55989_2007 EC55989_2008 prc proQ TRUE 0.938 20.000 0.304 NA N NA
 5880016 5880017 EC55989_2008 EC55989_2009 proQ yebR TRUE 0.649 97.000 0.081 NA Y NA
 5880018 5880019 EC55989_2010 EC55989_2011 yebS yebT TRUE 0.962 -31.000 0.840 NA   NA
 5880019 5880020 EC55989_2011 EC55989_2012 yebT yebU TRUE 0.707 80.000 0.420 NA   NA
 5880020 5880021 EC55989_2012 EC55989_2013 yebU yebV FALSE 0.246 118.000 0.121 NA   NA
 5880021 5880022 EC55989_2013 EC55989_2014 yebV yebW TRUE 0.960 21.000 0.353 NA   NA
 5880025 5880026 EC55989_misc_RNA_40 EC55989_2016 ryeB   FALSE 0.396 -90.000 0.000 NA   NA
 5880026 5880027 EC55989_2016 EC55989_2017   yebY FALSE 0.244 85.000 0.000 NA   NA
 5880027 5880028 EC55989_2017 EC55989_2018 yebY yebZ TRUE 0.990 13.000 0.704 NA   NA
 5880028 5880029 EC55989_2018 EC55989_2019 yebZ yobA TRUE 0.992 4.000 0.613 1.000   NA
 5880030 5880031 EC55989_2020 EC55989_2021 holE yobB TRUE 0.471 102.000 0.222 1.000   NA
 5880031 5880032 EC55989_2021 EC55989_2022 yobB exoX TRUE 0.969 24.000 0.500 1.000   NA
 5880033 5880034 EC55989_2023 EC55989_2024 ptrB yebE FALSE 0.044 209.000 0.092 NA   NA
 5880034 5880035 EC55989_2024 EC55989_2025 yebE yebF FALSE 0.007 327.000 0.028 NA   NA
 5880035 5880036 EC55989_2025 EC55989_2026 yebF yebG FALSE 0.294 55.000 0.027 NA   NA
 5880038 5880039 EC55989_2028 EC55989_2029 eda edd TRUE 0.981 37.000 0.523 1.000 Y NA
 5880039 5880040 EC55989_2029 EC55989_2030 edd zwf FALSE 0.123 235.000 0.041 1.000 Y NA
 5880041 5880042 EC55989_2032 EC55989_2033 yebK pykA FALSE 0.112 128.000 0.071 1.000 N NA
 5880043 5880044 EC55989_2034 EC55989_2035 lpxM yebA TRUE 0.772 120.000 0.299 1.000 Y NA
 5880044 5880045 EC55989_2035 EC55989_2036 yebA znuA TRUE 0.888 16.000 0.131 1.000 N NA
 5880046 5880047 EC55989_2037 EC55989_2038 znuC znuB TRUE 0.999 -3.000 0.755 0.080 Y NA
 5880048 5880049 EC55989_2039 EC55989_2040 ruvB ruvA TRUE 0.998 9.000 0.549 0.001 Y NA
 5880051 5880052 EC55989_2042 EC55989_2043 ruvC yebC TRUE 0.872 35.000 0.277 NA   NA
 5880052 5880053 EC55989_2043 EC55989_2044 yebC nudB TRUE 0.626 29.000 0.035 NA   NA
 5880053 5880054 EC55989_2044 EC55989_2045 nudB aspS TRUE 0.875 2.000 0.050 1.000 N NA
 5880055 5880056 EC55989_2046 EC55989_2047 yecD yecE TRUE 0.933 -3.000 0.089 NA   NA
 5880056 5880057 EC55989_2047 EC55989_2048 yecE yecN TRUE 0.549 53.000 0.126 NA   NA
 5880057 5880058 EC55989_2048 EC55989_2049 yecN yecO TRUE 0.636 41.000 0.089 NA   NA
 5880058 5880059 EC55989_2049 EC55989_2050 yecO yecP TRUE 0.980 -3.000 0.315 NA   NA
 5880060 5880061 EC55989_2051 EC55989_2052 torZ torY TRUE 0.993 25.000 0.481 0.043 Y NA
 5880061 5880062 EC55989_2052 EC55989_2053 torY cutC FALSE 0.005 388.000 0.000 1.000 N NA
 5880062 5880063 EC55989_2053 EC55989_2054 cutC yecM TRUE 0.859 14.000 0.057 NA   NA
 5880064 5880065 EC55989_2055 EC55989_2056 argS yecT FALSE 0.053 177.000 0.000 NA   NA
 5880066 5880067 EC55989_2057 EC55989_2058 flhE flhA TRUE 0.986 0.000 0.158 0.002   NA
 5880067 5880068 EC55989_2058 EC55989_2059 flhA flhB TRUE 0.993 -7.000 0.287 0.007 Y NA
 5880068 5880069 EC55989_2059 EC55989_2060 flhB cheZ FALSE 0.198 202.000 0.000 1.000 Y NA
 5880069 5880070 EC55989_2060 EC55989_2061 cheZ cheY TRUE 0.981 11.000 0.000 1.000 Y NA
 5880070 5880071 EC55989_2061 EC55989_2062 cheY cheB TRUE 0.986 15.000 0.000 0.010 Y NA
 5880071 5880072 EC55989_2062 EC55989_2063 cheB cheR TRUE 0.984 3.000 0.025 1.000 Y NA
 5880072 5880073 EC55989_2063 EC55989_2064 cheR tap TRUE 0.983 19.000 0.188 1.000 Y NA
 5880073 5880074 EC55989_2064 EC55989_2065 tap tar TRUE 0.967 46.000 0.235 0.001 Y NA
 5880076 5880077 EC55989_2066 EC55989_2067 cheW cheA TRUE 0.995 21.000 0.447 0.003 Y NA
 5880077 5880078 EC55989_2067 EC55989_2068 cheA motB TRUE 0.998 5.000 0.913 1.000 Y NA
 5880078 5880079 EC55989_2068 EC55989_2069 motB motA TRUE 0.996 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 5880079 5880080 EC55989_2069 EC55989_2070 motA flhC TRUE 0.543 127.000 0.408 1.000   NA
 5880080 5880081 EC55989_2070 EC55989_2071 flhC flhD TRUE 0.976 3.000 0.000 0.001   NA
 5880083 5880084 EC55989_2073 EC55989_2074 otsA otsB TRUE 0.963 -25.000 0.068 0.000 Y NA
 5880084 5880085 EC55989_2074 EC55989_2075 otsB araH FALSE 0.287 167.000 0.037 1.000 Y NA
 5880085 5880086 EC55989_2075 EC55989_2076 araH araG TRUE 0.995 12.000 0.451 1.000 Y NA
 5880086 5880087 EC55989_2076 EC55989_2077 araG araF TRUE 0.966 70.000 0.917 NA Y NA
 5880089 5880090 EC55989_2079 EC55989_misc_RNA_42 yecJ isrB FALSE 0.253 81.000 0.000 NA   NA
 5880091 5880092 EC55989_2080 EC55989_2081   yecR FALSE 0.033 206.000 0.000 NA   NA
 5880092 5880093 EC55989_2081 EC55989_2082 yecR ftn FALSE 0.058 172.000 0.000 NA   NA
 5880096 5880097 EC55989_2085 EC55989_2086 yecA int FALSE 0.008 357.000 0.000 NA   NA
 5880097 5880098 EC55989_2086 EC55989_2087 int   TRUE 0.899 6.000 0.000 NA   NA
 5880098 5880099 EC55989_2087 EC55989_2088     TRUE 0.677 30.000 0.000 NA   NA
 5880099 5880100 EC55989_2088 EC55989_2089     TRUE 0.867 16.000 0.074 NA   NA
 5880101 5880102 EC55989_2090 EC55989_2091     TRUE 0.836 17.000 0.000 NA   NA
 5880102 5880103 EC55989_2091 EC55989_2092     FALSE 0.029 212.000 0.000 NA   NA
 5880103 5880104 EC55989_2092 EC55989_2093     TRUE 0.536 -49.000 0.000 NA   NA
 5880104 5880105 EC55989_2093 EC55989_2094     TRUE 0.893 9.000 0.000 NA   NA
 5880105 5880106 EC55989_2094 EC55989_2095     FALSE 0.091 146.000 0.000 NA   NA
 5880106 5880107 EC55989_2095 EC55989_2096     TRUE 0.514 -60.000 0.000 NA   NA
 5880107 5880108 EC55989_2096 EC55989_2097     FALSE 0.099 142.000 0.000 NA   NA
 5880108 5880109 EC55989_2097 EC55989_2098     TRUE 0.896 7.000 0.000 NA   NA
 5880109 5880110 EC55989_2098 EC55989_2099   parM TRUE 0.887 77.000 1.000 NA   NA
 5880110 5880111 EC55989_2099 EC55989_2100 parM   TRUE 0.902 5.000 0.000 NA   NA
 5880111 5880112 EC55989_2100 EC55989_2101     TRUE 0.814 20.000 0.000 NA   NA
 5880112 5880113 EC55989_2101 EC55989_2102     TRUE 0.665 -19.000 0.000 NA   NA
 5880114 5880115 EC55989_2103 EC55989_2104   Q FALSE 0.245 103.000 0.087 NA   NA
 5880115 5880116 EC55989_2104 EC55989_2105 Q P TRUE 0.958 0.000 0.130 NA   NA
 5880117 5880118 EC55989_2106 EC55989_2107 O N TRUE 0.799 24.000 0.000 1.000   NA
 5880118 5880119 EC55989_2107 EC55989_2108 N M TRUE 0.524 46.000 0.000 1.000   NA
 5880119 5880120 EC55989_2108 EC55989_2109 M L TRUE 0.982 32.000 0.667 0.001   NA
 5880120 5880121 EC55989_2109 EC55989_2111 L   TRUE 0.698 -16.000 0.000 NA   NA
 5880121 5880122 EC55989_2111 EC55989_2110   X FALSE 0.298 -216.000 0.000 NA   NA
 5880122 5880123 EC55989_2110 EC55989_2112 X   FALSE 0.010 323.000 0.000 NA   NA
 5880123 5880124 EC55989_2112 EC55989_2113     FALSE 0.334 -147.000 0.000 NA   NA
 5880124 5880125 EC55989_2113 EC55989_2114     FALSE 0.106 139.000 0.000 NA   NA
 5880125 5880126 EC55989_2114 EC55989_2115   R TRUE 0.768 24.000 0.000 NA   NA
 5880126 5880127 EC55989_2115 EC55989_2116 R S TRUE 0.698 -16.000 0.000 NA   NA
 5880127 5880128 EC55989_2116 EC55989_2117 S V TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5880128 5880129 EC55989_2117 EC55989_2118 V W TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5880129 5880130 EC55989_2118 EC55989_2119 W J TRUE 0.993 4.000 0.667 NA   NA
 5880130 5880131 EC55989_2119 EC55989_2120 J I TRUE 0.819 -7.000 0.000 NA   NA
 5880131 5880132 EC55989_2120 EC55989_2121 I   TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5880132 5880133 EC55989_2121 EC55989_2122   tfaQ TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5880134 5880135 EC55989_2123 EC55989_2124     FALSE 0.143 124.000 0.000 NA   NA
 5880135 5880136 EC55989_2124 EC55989_2125     TRUE 0.896 7.000 0.000 NA   NA
 5880136 5880137 EC55989_2125 EC55989_2126     TRUE 0.641 -22.000 0.000 NA   NA
 5880137 5880138 EC55989_2126 EC55989_2127     TRUE 0.477 -72.000 0.000 NA   NA
 5880138 5880139 EC55989_2127 EC55989_2128   fII FALSE 0.372 56.000 0.000 NA   NA
 5880139 5880140 EC55989_2128 EC55989_2129 fII fI TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5880142 5880143 EC55989_2131 EC55989_tRNA80     FALSE 0.006 425.000 0.000 NA   NA
 5880143 5880144 EC55989_tRNA80 EC55989_tRNA79     TRUE 0.867 13.000 0.000 NA   NA
 5880144 5880145 EC55989_tRNA79 EC55989_tRNA78     FALSE 0.381 55.000 0.000 NA   NA
 5880145 5880146 EC55989_tRNA78 EC55989_2132   pgsA FALSE 0.077 152.000 0.000 NA   NA
 5880146 5880147 EC55989_2132 EC55989_2133 pgsA uvrC TRUE 0.617 57.000 0.227 1.000 N NA
 5880147 5880148 EC55989_2133 EC55989_2134 uvrC uvrY TRUE 0.960 -3.000 0.086 0.022 N NA
 5880149 5880150 EC55989_2135 EC55989_2136   yecF TRUE 0.729 -13.000 0.000 NA   NA
 5880151 5880152 EC55989_2137 EC55989_2138 sdiA yecC FALSE 0.019 230.000 0.071 1.000 N NA
 5880152 5880153 EC55989_2138 EC55989_2139 yecC yecS TRUE 0.991 -3.000 0.150 1.000 Y NA
 5880153 5880154 EC55989_2139 EC55989_2140 yecS yedO TRUE 0.974 15.000 0.050 1.000 Y NA
 5880154 5880155 EC55989_2140 EC55989_2141 yedO fliY TRUE 0.876 105.000 0.469 1.000 Y NA
 5880155 5880156 EC55989_2141 EC55989_2142 fliY fliZ TRUE 0.592 88.000 0.280 1.000   NA
 5880156 5880157 EC55989_2142 EC55989_2143 fliZ fliA TRUE 0.632 46.000 0.108 1.000   NA
 5880157 5880158 EC55989_2143 EC55989_2144 fliA   FALSE 0.022 164.000 0.012 1.000 N NA
 5880159 5880160 EC55989_2145 EC55989_2146   fliS TRUE 0.995 16.000 0.284 0.002 Y NA
 5880160 5880161 EC55989_2146 EC55989_2147 fliS fliT TRUE 0.985 0.000 0.324 1.000   NA
 5880161 5880162 EC55989_2147 EC55989_2148 fliT amyA FALSE 0.410 78.000 0.115 1.000   NA
 5880164 5880165 EC55989_2150 EC55989_2151 yedE yedF TRUE 0.994 -3.000 0.844 NA   NA
 5880165 5880166 EC55989_2151 EC55989_2152 yedF yedK FALSE 0.177 109.000 0.000 NA   NA
 5880166 5880167 EC55989_2152 EC55989_2153 yedK   FALSE 0.043 189.000 0.000 NA   NA
 5880168 5880169 EC55989_2154 EC55989_2155 ybcM ybcL TRUE 0.990 10.000 0.625 NA   NA
 5880169 5880170 EC55989_2155 EC55989_2156 ybcL emrE FALSE 0.060 169.000 0.000 NA   NA
 5880170 5880171 EC55989_2156 EC55989_2157 emrE fliE FALSE 0.046 164.000 0.000 1.000 N NA
 5880172 5880173 EC55989_2158 EC55989_2159 fliF fliG TRUE 0.992 -7.000 0.220 0.004 Y NA
 5880173 5880174 EC55989_2159 EC55989_2160 fliG fliH TRUE 0.984 -7.000 0.000 0.003 Y NA
 5880174 5880175 EC55989_2160 EC55989_2161 fliH fliI TRUE 0.988 0.000 0.000 1.000 Y NA
 5880175 5880176 EC55989_2161 EC55989_2162 fliI fliJ TRUE 0.960 19.000 0.006 1.000 Y NA
 5880176 5880177 EC55989_2162 EC55989_2163 fliJ fliK TRUE 0.997 -3.000 0.317 0.004 Y NA
 5880177 5880178 EC55989_2163 EC55989_2164 fliK fliL TRUE 0.683 105.000 0.119 1.000 Y NA
 5880178 5880179 EC55989_2164 EC55989_2165 fliL fliM TRUE 0.999 5.000 0.957 0.001 Y NA
 5880179 5880180 EC55989_2165 EC55989_2166 fliM fliN TRUE 0.995 -3.000 0.137 0.001 Y NA
 5880180 5880181 EC55989_2166 EC55989_2167 fliN fliO TRUE 0.997 3.000 0.443 1.000 Y NA
 5880181 5880182 EC55989_2167 EC55989_2168 fliO fliP TRUE 0.994 0.000 0.203 1.000 Y NA
 5880182 5880183 EC55989_2168 EC55989_2169 fliP fliQ TRUE 0.999 10.000 0.827 0.007 Y NA
 5880183 5880184 EC55989_2169 EC55989_2170 fliQ fliR TRUE 0.991 9.000 0.000 0.002 Y NA
 5880184 5880185 EC55989_2170 EC55989_2171 fliR rcsA FALSE 0.009 290.000 0.000 1.000 N NA
 5880186 5880187 EC55989_2172 EC55989_misc_RNA_43 dsrB dsrB FALSE 0.309 -186.000 0.000 NA   NA
 5880191 5880192 EC55989_2175 EC55989_2176 yedQ yedQ TRUE 0.909 4.000 0.000 NA   NA
 5880192 5880193 EC55989_2176 EC55989_2177 yedQ   FALSE 0.452 -79.000 0.000 NA   NA
 5880193 5880194 EC55989_2177 EC55989_2178   yodC FALSE 0.338 62.000 0.000 NA   NA
 5880194 5880195 EC55989_2178 EC55989_2179 yodC yedI FALSE 0.189 79.000 0.025 NA   NA
 5880197 5880198 EC55989_2181 EC55989_2182 vsr dcm TRUE 0.952 -19.000 0.048 0.072 Y NA
 5880198 5880199 EC55989_2182 EC55989_2183 dcm yedJ FALSE 0.395 67.000 0.074 1.000   NA
 5880199 5880200 EC55989_2183 EC55989_2184 yedJ yedR TRUE 0.580 40.000 0.062 NA   NA
 5880201 5880202 EC55989_misc_RNA_45 EC55989_2185 rseX   FALSE 0.021 242.000 0.000 NA   NA
 5880202 5880203 EC55989_2185 EC55989_2186     TRUE 0.847 -6.000 0.000 NA   NA
 5880203 5880204 EC55989_2186 EC55989_2187   insM FALSE 0.408 52.000 0.000 NA   NA
 5880206 5880207 EC55989_misc_RNA_46 EC55989_2189 RNAC   FALSE 0.005 643.000 0.000 NA   NA
 5880208 5880209 EC55989_2191 EC55989_2192 insB insA TRUE 0.899 -81.000 0.000 0.024 Y NA
 5880211 5880212 EC55989_2194 EC55989_2195 yedV yedW TRUE 0.999 0.000 0.857 0.002 Y NA
 5880213 5880214 EC55989_2196 EC55989_2197 yedX yedY FALSE 0.205 109.000 0.000 1.000   NA
 5880214 5880215 EC55989_2197 EC55989_2198 yedY yedZ TRUE 0.997 1.000 0.790 0.042   NA
 5880215 5880216 EC55989_2198 EC55989_2199 yedZ yodA FALSE 0.021 257.000 0.000 1.000   NA
 5880218 5880219 EC55989_2200 EC55989_tRNA22 yeeI   FALSE 0.196 101.000 0.000 NA   NA
 5880219 5880220 EC55989_tRNA22 EC55989_2201   int FALSE 0.068 162.000 0.000 NA   NA
 5880221 5880222 EC55989_2202 EC55989_2203 irp irp TRUE 0.809 28.000 0.176 NA N NA
 5880222 5880223 EC55989_2203 EC55989_2204 irp irp FALSE 0.391 -130.000 0.130 NA N NA
 5880223 5880224 EC55989_2204 EC55989_2205 irp irp TRUE 0.994 -40.000 0.913 0.004 Y NA
 5880225 5880226 EC55989_2206 EC55989_2207 ybtA irp FALSE 0.039 173.000 0.000 1.000 N NA
 5880226 5880227 EC55989_2207 EC55989_2208 irp irp TRUE 0.853 88.000 0.105 0.001 Y NA
 5880227 5880228 EC55989_2208 EC55989_2209 irp irp TRUE 0.973 -63.000 0.333 0.026 Y NA
 5880228 5880229 EC55989_2209 EC55989_2210 irp irp TRUE 0.996 -3.000 0.406 1.000 Y NA
 5880229 5880230 EC55989_2210 EC55989_2211 irp irp TRUE 0.988 4.000 0.094 1.000 Y NA
 5880230 5880231 EC55989_2211 EC55989_2212 irp fyuA FALSE 0.165 131.000 0.125 1.000 N NA
 5880231 5880232 EC55989_2212 EC55989_2213 fyuA yeeJ FALSE 0.005 672.000 0.000 NA   NA
 5880232 5880233 EC55989_2213 EC55989_2214 yeeJ yeeJ TRUE 0.468 -73.000 0.000 NA   NA
 5880233 5880234 EC55989_2214 EC55989_2215 yeeJ yeeJ TRUE 0.611 36.000 0.000 NA   NA
 5880234 5880235 EC55989_2215 EC55989_2216 yeeJ yeeJ FALSE 0.442 49.000 0.000 NA   NA
 5880237 5880238 EC55989_2218 EC55989_2219 shiA amn FALSE 0.079 102.000 0.021 1.000 N NA
 5880238 5880239 EC55989_2219 EC55989_2220 amn yeeN FALSE 0.009 343.000 0.000 NA   NA
 5880240 5880241 EC55989_tRNA76 EC55989_2221   yeeO FALSE 0.196 101.000 0.000 NA   NA
 5880243 5880244 EC55989_2222 EC55989_2223 cbl nac TRUE 0.847 102.000 0.222 0.050 Y NA
 5880246 5880247 EC55989_2224 EC55989_2225 erfK cobT FALSE 0.220 65.000 0.015 NA   NA
 5880247 5880248 EC55989_2225 EC55989_2226 cobT cobS TRUE 0.989 12.000 0.056 0.003 Y NA
 5880248 5880249 EC55989_2226 EC55989_2227 cobS cobU TRUE 0.985 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5880249 5880250 EC55989_2227 EC55989_2228 cobU   FALSE 0.116 134.000 0.000 NA   NA
 5880250 5880251 EC55989_2228 EC55989_2229     FALSE 0.042 191.000 0.000 NA   NA
 5880252 5880253 EC55989_2231 EC55989_2232     FALSE 0.039 196.000 0.000 NA   NA
 5880253 5880254 EC55989_2232 EC55989_2233     TRUE 0.859 14.000 0.000 NA   NA
 5880254 5880255 EC55989_2233 EC55989_2234     FALSE 0.367 57.000 0.000 NA   NA
 5880255 5880256 EC55989_2234 EC55989_2235     FALSE 0.218 94.000 0.000 NA   NA
 5880256 5880257 EC55989_2235 EC55989_2236     TRUE 0.916 3.000 0.000 NA   NA
 5880258 5880259 EC55989_2237 EC55989_2238 ggt   TRUE 0.786 -9.000 0.000 NA   NA
 5880259 5880260 EC55989_2238 EC55989_2239     TRUE 0.508 44.000 0.000 NA   NA
 5880260 5880261 EC55989_2239 EC55989_2240     FALSE 0.259 79.000 0.000 NA   NA
 5880261 5880262 EC55989_2240 EC55989_2241     FALSE 0.014 284.000 0.000 NA   NA
 5880262 5880263 EC55989_2241 EC55989_2242     FALSE 0.379 -99.000 0.000 NA   NA
 5880263 5880264 EC55989_2242 EC55989_2243     FALSE 0.018 254.000 0.000 NA   NA
 5880265 5880266 EC55989_2244 EC55989_2245     FALSE 0.259 79.000 0.000 NA   NA
 5880266 5880267 EC55989_2245 EC55989_2246     FALSE 0.006 428.000 0.000 NA   NA
 5880268 5880269 EC55989_2247 EC55989_2248     FALSE 0.122 132.000 0.000 NA   NA
 5880269 5880270 EC55989_2248 EC55989_2249     TRUE 0.823 50.000 0.000 NA Y NA
 5880271 5880272 EC55989_2250 EC55989_2251     TRUE 0.496 45.000 0.000 NA   NA
 5880272 5880273 EC55989_2251 EC55989_2252     FALSE 0.322 -156.000 0.000 NA   NA
 5880273 5880274 EC55989_2252 EC55989_2253     FALSE 0.027 218.000 0.000 NA   NA
 5880274 5880275 EC55989_2253 EC55989_2254     TRUE 0.991 -3.000 0.600 NA   NA
 5880275 5880276 EC55989_2254 EC55989_2255     TRUE 0.994 -3.000 0.800 NA   NA
 5880276 5880277 EC55989_2255 EC55989_2256     TRUE 0.705 28.000 0.000 NA   NA
 5880277 5880278 EC55989_2256 EC55989_2257     TRUE 0.843 16.000 0.000 NA   NA
 5880278 5880279 EC55989_2257 EC55989_2258     FALSE 0.025 221.000 0.000 NA   NA
 5880279 5880280 EC55989_2258 EC55989_2259     FALSE 0.250 82.000 0.000 NA   NA
 5880280 5880281 EC55989_2259 EC55989_2260   yeeS TRUE 0.478 46.000 0.000 NA   NA
 5880281 5880282 EC55989_2260 EC55989_2261 yeeS yeeT FALSE 0.334 63.000 0.000 NA   NA
 5880282 5880283 EC55989_2261 EC55989_2262 yeeT yeeU FALSE 0.281 74.000 0.000 NA   NA
 5880283 5880284 EC55989_2262 EC55989_2263 yeeU yeeV FALSE 0.234 89.000 0.000 NA   NA
 5880284 5880285 EC55989_2263 EC55989_2264 yeeV yeeW FALSE 0.182 107.000 0.000 NA   NA
 5880285 5880286 EC55989_2264 EC55989_2265 yeeW yoeF FALSE 0.006 441.000 0.000 NA   NA
 5880287 5880288 EC55989_2266 EC55989_2267 yeeX yeeA FALSE 0.371 106.000 0.180 NA   NA
 5880288 5880289 EC55989_2267 EC55989_2268 yeeA sbmC FALSE 0.054 198.000 0.096 NA   NA
 5880289 5880290 EC55989_2268 EC55989_2269 sbmC dacD FALSE 0.157 119.000 0.110 NA N NA
 5880292 5880293 EC55989_2271 EC55989_2272 yeeD yeeE TRUE 0.977 14.000 0.419 NA   NA
 5880293 5880294 EC55989_2272 EC55989_2273 yeeE yeeF FALSE 0.052 179.000 0.000 NA   NA
 5880294 5880295 EC55989_2273 EC55989_2274 yeeF yeeY FALSE 0.011 267.000 0.000 1.000 N NA
 5880295 5880296 EC55989_2274 EC55989_2275 yeeY yeeZ FALSE 0.229 46.000 0.015 1.000 N NA
 5880296 5880297 EC55989_2275 EC55989_2276 yeeZ yoeB FALSE 0.249 83.000 0.000 NA   NA
 5880297 5880298 EC55989_2276 EC55989_2277 yoeB yefM TRUE 0.984 -3.000 0.366 NA   NA
 5880299 5880300 EC55989_5070 EC55989_misc_RNA_47 hisL   TRUE 0.627 -24.000 0.000 NA   NA
 5880300 5880301 EC55989_misc_RNA_47 EC55989_2278   hisG TRUE 0.466 47.000 0.000 NA   NA
 5880301 5880302 EC55989_2278 EC55989_2279 hisG hisD TRUE 0.995 6.000 0.171 0.002 Y NA
 5880302 5880303 EC55989_2279 EC55989_2280 hisD hisC TRUE 0.997 -3.000 0.294 0.002 Y NA
 5880303 5880304 EC55989_2280 EC55989_2281 hisC hisB TRUE 0.998 0.000 0.341 0.002 Y NA
 5880304 5880305 EC55989_2281 EC55989_2282 hisB hisH TRUE 0.996 0.000 0.128 0.002 Y NA
 5880305 5880306 EC55989_2282 EC55989_2283 hisH hisA TRUE 0.997 0.000 0.210 0.002 Y NA
 5880306 5880307 EC55989_2283 EC55989_2284 hisA hisF TRUE 0.991 -18.000 0.433 0.002 Y NA
 5880307 5880308 EC55989_2284 EC55989_2285 hisF hisI TRUE 0.997 -6.000 0.430 0.002 Y NA
 5880309 5880310 EC55989_2286 EC55989_2287 cld ugd FALSE 0.417 144.000 0.000 1.000 Y NA
 5880310 5880311 EC55989_2287 EC55989_2288 ugd gnd FALSE 0.013 248.000 0.000 1.000 N NA
 5880311 5880312 EC55989_2288 EC55989_2289 gnd   FALSE 0.149 121.000 0.000 NA   NA
 5880312 5880313 EC55989_2289 EC55989_2290     TRUE 0.867 13.000 0.000 NA   NA
 5880313 5880314 EC55989_2290 EC55989_2291     TRUE 0.719 -18.000 0.000 1.000   NA
 5880314 5880315 EC55989_2291 EC55989_2292     FALSE 0.005 1115.000 0.000 1.000   NA
 5880315 5880316 EC55989_2292 EC55989_2293     TRUE 0.509 85.000 0.000 0.004   NA
 5880316 5880317 EC55989_2293 EC55989_2294     TRUE 0.994 -3.000 0.111 0.004 Y NA
 5880317 5880318 EC55989_2294 EC55989_2295     TRUE 0.987 6.000 0.105 1.000 Y NA
 5880318 5880319 EC55989_2295 EC55989_2296     TRUE 0.897 5.000 0.036 1.000   NA
 5880319 5880320 EC55989_2296 EC55989_2297   galF FALSE 0.010 361.000 0.000 1.000   NA
 5880320 5880321 EC55989_2297 EC55989_2298 galF gne FALSE 0.136 243.000 0.074 1.000 Y NA
 5880321 5880322 EC55989_2298 EC55989_2299 gne wcaM FALSE 0.092 158.000 0.083 NA   NA
 5880322 5880323 EC55989_2299 EC55989_2300 wcaM wcaL TRUE 0.972 11.000 0.292 NA   NA
 5880323 5880324 EC55989_2300 EC55989_2301 wcaL wcaK TRUE 0.936 -3.000 0.095 NA   NA
 5880324 5880325 EC55989_2301 EC55989_2302 wcaK wzxC FALSE 0.020 285.000 0.095 NA   NA
 5880325 5880326 EC55989_2302 EC55989_2303 wzxC wcaJ TRUE 0.982 2.000 0.304 NA   NA
 5880326 5880327 EC55989_2303 EC55989_2304 wcaJ cpsG TRUE 0.822 55.000 0.538 NA N NA
 5880327 5880328 EC55989_2304 EC55989_2305 cpsG cpsB FALSE 0.127 369.000 1.000 1.000 N NA
 5880328 5880329 EC55989_2305 EC55989_2306 cpsB wcaI TRUE 0.990 3.000 0.123 1.000 Y NA
 5880329 5880330 EC55989_2306 EC55989_2307 wcaI nudD TRUE 0.924 -3.000 0.108 1.000 N NA
 5880330 5880331 EC55989_2307 EC55989_2308 nudD fcl TRUE 0.987 3.000 0.217 0.000 N NA
 5880331 5880332 EC55989_2308 EC55989_2309 fcl gmd TRUE 0.993 3.000 0.000 0.007 Y NA
 5880332 5880333 EC55989_2309 EC55989_2310 gmd wcaF TRUE 0.678 27.000 0.022 1.000   NA
 5880333 5880334 EC55989_2310 EC55989_2311 wcaF wcaE TRUE 0.870 16.000 0.077 NA   NA
 5880334 5880335 EC55989_2311 EC55989_2312 wcaE wcaD TRUE 0.976 11.000 0.333 NA   NA
 5880335 5880336 EC55989_2312 EC55989_2313 wcaD wcaC TRUE 0.914 -25.000 0.400 NA   NA
 5880336 5880337 EC55989_2313 EC55989_2314 wcaC wcaB TRUE 0.969 -3.000 0.259 1.000 N NA
 5880337 5880338 EC55989_2314 EC55989_2315 wcaB wcaA TRUE 0.969 3.000 0.259 NA N NA
 5880338 5880339 EC55989_2315 EC55989_2316 wcaA wzc FALSE 0.255 178.000 0.000 NA Y NA
 5880339 5880340 EC55989_2316 EC55989_2317 wzc wzb TRUE 0.881 3.000 0.000 1.000 N NA
 5880340 5880341 EC55989_2317 EC55989_2318 wzb wza TRUE 0.969 6.000 0.286 1.000 N NA
 5880343 5880344 EC55989_2320 EC55989_2321 asmA dcd TRUE 0.669 22.000 0.057 NA N NA
 5880344 5880345 EC55989_2321 EC55989_2322 dcd udk TRUE 0.713 92.000 0.098 1.000 Y NA
 5880349 5880350 EC55989_2327 EC55989_2328 yegI yegK TRUE 0.961 -12.000 0.455 1.000   NA
 5880350 5880351 EC55989_2328 EC55989_2329 yegK yegL TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5880352 5880353 EC55989_misc_RNA_48 EC55989_misc_RNA_49 rygC rygD FALSE 0.343 -121.000 0.000 NA   NA
 5880353 5880354 EC55989_misc_RNA_49 EC55989_misc_RNA_50 rygD   FALSE 0.005 516.000 0.000 NA   NA
 5880354 5880355 EC55989_misc_RNA_50 EC55989_2330   mdtA FALSE 0.016 264.000 0.000 NA   NA
 5880355 5880356 EC55989_2330 EC55989_2331 mdtA mdtB TRUE 0.863 0.000 0.000 NA N NA
 5880356 5880357 EC55989_2331 EC55989_2332 mdtB mdtC TRUE 0.987 1.000 0.062 NA Y NA
 5880357 5880358 EC55989_2332 EC55989_2333 mdtC mdtD TRUE 0.986 1.000 0.438 1.000 N NA
 5880358 5880359 EC55989_2333 EC55989_2334 mdtD baeS TRUE 0.939 -3.000 0.139 1.000 N NA
 5880359 5880360 EC55989_2334 EC55989_2335 baeS baeR TRUE 0.998 -3.000 0.591 1.000 Y NA
 5880360 5880361 EC55989_2335 EC55989_2337 baeR yegP FALSE 0.045 191.000 0.062 NA   NA
 5880361 5880362 EC55989_2337 EC55989_2338 yegP   FALSE 0.031 209.000 0.000 NA   NA
 5880362 5880363 EC55989_2338 EC55989_2339     TRUE 0.920 2.000 0.000 NA   NA
 5880363 5880364 EC55989_2339 EC55989_2340   yegQ FALSE 0.192 103.000 0.000 NA   NA
 5880364 5880365 EC55989_2340 EC55989_misc_RNA_51 yegQ ryeE FALSE 0.249 83.000 0.000 NA   NA
 5880366 5880367 EC55989_2341 EC55989_2342   yegR TRUE 0.742 -12.000 0.000 NA   NA
 5880369 5880370 EC55989_2344 EC55989_2345 gatR gatD FALSE 0.145 100.000 0.000 1.000 N NA
 5880370 5880371 EC55989_2345 EC55989_2346 gatD gatC FALSE 0.363 48.000 0.000 1.000 N NA
 5880371 5880372 EC55989_2346 EC55989_2347 gatC gatB TRUE 0.992 4.000 0.000 0.015 Y NA
 5880372 5880373 EC55989_2347 EC55989_2348 gatB gatA TRUE 0.960 31.000 0.000 0.011 Y NA
 5880373 5880374 EC55989_2348 EC55989_2349 gatA gatZ TRUE 0.890 10.000 0.000 NA   NA
 5880374 5880375 EC55989_2349 EC55989_2350 gatZ gatZ TRUE 0.522 -58.000 0.000 NA   NA
 5880375 5880376 EC55989_2350 EC55989_2351 gatZ gatY TRUE 0.690 29.000 0.000 NA   NA
 5880376 5880377 EC55989_2351 EC55989_2352 gatY fbaB FALSE 0.146 310.000 0.000 0.001 Y NA
 5880378 5880379 EC55989_2353 EC55989_2354 yegT yegU TRUE 0.983 -3.000 0.364 NA   NA
 5880379 5880380 EC55989_2354 EC55989_2355 yegU yegV TRUE 0.989 -3.000 0.600 NA N NA
 5880381 5880382 EC55989_2356 EC55989_2357 yegW yegX FALSE 0.319 52.000 0.000 1.000 N NA
 5880382 5880383 EC55989_2357 EC55989_2358 yegX thiD FALSE 0.246 65.000 0.000 1.000 N NA
 5880383 5880384 EC55989_2358 EC55989_2359 thiD thiM TRUE 0.991 -3.000 0.037 0.004 Y NA
 5880384 5880385 EC55989_2359 EC55989_misc_RNA_52 thiM   TRUE 0.619 35.000 0.000 NA   NA
 5880385 5880386 EC55989_misc_RNA_52 EC55989_2360   yohL FALSE 0.226 92.000 0.000 NA   NA
 5880387 5880388 EC55989_2361 EC55989_2362 rncA yohN TRUE 0.577 39.000 0.000 NA   NA
 5880389 5880390 EC55989_2363 EC55989_2364 yehA yehB TRUE 0.866 16.000 0.000 1.000   NA
 5880390 5880391 EC55989_2364 EC55989_2365 yehB yehC TRUE 0.998 16.000 1.000 1.000 Y NA
 5880391 5880392 EC55989_2365 EC55989_2366 yehC yehD TRUE 0.832 81.000 0.222 1.000 Y NA
 5880392 5880393 EC55989_2366 EC55989_2367 yehD yehE FALSE 0.013 293.000 0.000 NA   NA
 5880393 5880394 EC55989_2367 EC55989_2368 yehE mrp FALSE 0.016 263.000 0.000 NA   NA
 5880395 5880396 EC55989_2369 EC55989_2370 metG   FALSE 0.101 141.000 0.000 NA   NA
 5880396 5880397 EC55989_2370 EC55989_2371   insA TRUE 0.690 29.000 0.000 NA   NA
 5880397 5880398 EC55989_2371 EC55989_2372 insA insB TRUE 0.899 -81.000 0.000 0.024 Y NA
 5880399 5880400 EC55989_2373 EC55989_2374 yehS yehT FALSE 0.447 47.000 0.051 NA   NA
 5880400 5880401 EC55989_2374 EC55989_2375 yehT yehU TRUE 0.999 -3.000 0.877 0.013 Y NA
 5880402 5880403 EC55989_2376 EC55989_2377 mlrA yohO FALSE 0.346 60.000 0.000 NA   NA
 5880404 5880405 EC55989_2378 EC55989_2379 yehW yehX TRUE 0.997 5.000 0.542 1.000 Y NA
 5880405 5880406 EC55989_2379 EC55989_2380 yehX yehY TRUE 0.993 -7.000 0.489 1.000 Y NA
 5880406 5880407 EC55989_2380 EC55989_2381 yehY yehZ TRUE 0.991 7.000 0.521 0.046 N NA
 5880407 5880408 EC55989_2381 EC55989_2382 yehZ bglX FALSE 0.033 211.000 0.099 1.000 N NA
 5880410 5880411 EC55989_2384 EC55989_2385 pbpG yohC FALSE 0.110 174.000 0.145 NA   NA
 5880413 5880414 EC55989_2388 EC55989_2389 yohF yohG FALSE 0.441 53.000 0.105 1.000 N NA
 5880414 5880415 EC55989_2389 EC55989_2390 yohG dusC FALSE 0.003 1028.000 0.000 1.000 N NA
 5880416 5880417 EC55989_2391 EC55989_2392 yohJ yohK TRUE 0.984 -3.000 0.340 1.000   NA
 5880417 5880418 EC55989_2392 EC55989_2393 yohK cdd FALSE 0.248 130.000 0.198 1.000 N NA
 5880418 5880419 EC55989_2393 EC55989_2394 cdd sanA FALSE 0.071 150.000 0.045 NA   NA
 5880419 5880420 EC55989_2394 EC55989_2395 sanA yeiS TRUE 0.870 3.000 0.019 NA   NA
 5880420 5880421 EC55989_2395 EC55989_2396 yeiS yeiT FALSE 0.008 319.000 0.036 NA   NA
 5880421 5880422 EC55989_2396 EC55989_2397 yeiT yeiA TRUE 0.721 23.000 0.062 1.000 N NA
 5880423 5880424 EC55989_2398 EC55989_2399 mglC mglA TRUE 0.997 16.000 0.905 1.000 Y NA
 5880424 5880425 EC55989_2399 EC55989_2400 mglA mglB TRUE 0.885 61.000 0.250 NA Y NA
 5880425 5880426 EC55989_2400 EC55989_2401 mglB galS FALSE 0.007 280.000 0.000 NA N NA
 5880428 5880429 EC55989_2403 EC55989_2404 yeiB folE TRUE 0.987 17.000 0.719 NA   NA
 5880430 5880431 EC55989_2405 EC55989_2406   frmC TRUE 0.477 -72.000 0.000 NA   NA
 5880432 5880433 EC55989_2407 EC55989_2408 cirA   TRUE 0.819 -7.000 0.000 NA   NA
 5880433 5880434 EC55989_2408 EC55989_2409   lysP FALSE 0.207 97.000 0.000 NA   NA
 5880434 5880435 EC55989_2409 EC55989_2410 lysP yeiE FALSE 0.023 205.000 0.000 1.000 N NA
 5880436 5880437 EC55989_2411 EC55989_2412 yeiH nfo FALSE 0.241 74.000 0.040 NA   NA
 5880437 5880438 EC55989_2412 EC55989_2413 nfo yeiI TRUE 0.602 4.000 0.004 NA N NA
 5880439 5880440 EC55989_2414 EC55989_2415 yeiJ rihB TRUE 0.604 100.000 0.056 NA Y NA
 5880442 5880443 EC55989_2417 EC55989_2418 yeiM yeiN FALSE 0.127 94.000 0.000 NA N NA
 5880443 5880444 EC55989_2418 EC55989_2419 yeiN yeiC FALSE 0.316 -12.000 0.008 NA N NA
 5880444 5880445 EC55989_2419 EC55989_2420 yeiC fruA FALSE 0.038 424.000 0.000 NA Y NA
 5880445 5880446 EC55989_2420 EC55989_2421 fruA fruK TRUE 0.995 17.000 0.562 1.000 Y NA
 5880446 5880447 EC55989_2421 EC55989_2422 fruK fruB TRUE 0.991 0.000 0.112 1.000 Y NA
 5880450 5880451 EC55989_2425 EC55989_2426   yeiQ FALSE 0.017 223.000 0.000 1.000 N NA
 5880451 5880452 EC55989_2426 EC55989_2427 yeiQ yeiR FALSE 0.305 118.000 0.167 NA   NA
 5880452 5880453 EC55989_2427 EC55989_2428 yeiR yeiU TRUE 0.849 39.000 0.275 NA   NA
 5880453 5880454 EC55989_2428 EC55989_2429 yeiU spr FALSE 0.007 412.000 0.000 NA   NA
 5880454 5880455 EC55989_2429 EC55989_2430 spr rtn FALSE 0.107 181.000 0.219 NA N NA
 5880455 5880456 EC55989_2430 EC55989_2431 rtn yejA TRUE 0.622 82.000 0.394 NA N NA
 5880456 5880457 EC55989_2431 EC55989_2432 yejA yejB TRUE 0.997 1.000 0.848 0.046   NA
 5880457 5880458 EC55989_2432 EC55989_2433 yejB yejE TRUE 0.997 0.000 0.833 0.046   NA
 5880458 5880459 EC55989_2433 EC55989_2434 yejE yejF TRUE 0.995 2.000 0.758 1.000   NA
 5880460 5880461 EC55989_2435 EC55989_2436 yejG bcr FALSE 0.010 333.000 0.000 NA   NA
 5880461 5880462 EC55989_2436 EC55989_2437 bcr rsuA TRUE 0.533 28.000 0.036 1.000 N NA
 5880463 5880464 EC55989_2438 EC55989_2439 yejH rplY FALSE 0.198 125.000 0.024 0.015 N NA
 5880466 5880467 EC55989_2441 EC55989_2442 yejL yejM TRUE 0.779 20.000 0.040 NA   NA
 5880467 5880468 EC55989_2442 EC55989_tRNA25 yejM   FALSE 0.276 75.000 0.000 NA   NA
 5880469 5880470 EC55989_2443 EC55989_2444   yejO TRUE 0.568 -36.000 0.000 NA   NA
 5880470 5880471 EC55989_2444 EC55989_2445 yejO yejO TRUE 0.867 13.000 0.000 NA   NA
 5880473 5880474 EC55989_2447 EC55989_2448 ccmH ccmG TRUE 0.998 -3.000 0.578 1.000 Y NA
 5880474 5880475 EC55989_2448 EC55989_2449 ccmG ccmF TRUE 0.999 -3.000 0.804 0.002 Y NA
 5880475 5880476 EC55989_2449 EC55989_2450 ccmF ccmE TRUE 0.996 -3.000 0.211 0.002 Y NA
 5880476 5880477 EC55989_2450 EC55989_2451 ccmE ccmD TRUE 0.979 -3.000 0.344 1.000 N NA
 5880477 5880478 EC55989_2451 EC55989_2452 ccmD ccmC TRUE 0.987 -3.000 0.501 1.000 N NA
 5880478 5880479 EC55989_2452 EC55989_2453 ccmC ccmB TRUE 0.988 42.000 0.501 0.001 Y NA
 5880479 5880480 EC55989_2453 EC55989_2454 ccmB ccmA TRUE 0.998 -3.000 0.503 0.002 Y NA
 5880480 5880481 EC55989_2454 EC55989_2455 ccmA napC TRUE 0.777 13.000 0.043 1.000 N NA
 5880481 5880482 EC55989_2455 EC55989_2456 napC napB TRUE 0.998 10.000 0.490 0.003 Y NA
 5880482 5880483 EC55989_2456 EC55989_2457 napB napH TRUE 0.997 -3.000 0.316 0.009 Y NA
 5880483 5880484 EC55989_2457 EC55989_2459 napH napG TRUE 0.987 -13.000 0.795 0.041   NA
 5880484 5880485 EC55989_2459 EC55989_2460 napG napA TRUE 0.984 7.000 0.243 0.041   NA
 5880485 5880486 EC55989_2460 EC55989_2461 napA napD TRUE 0.993 -3.000 0.875 NA N NA
 5880486 5880487 EC55989_2461 EC55989_2462 napD napF TRUE 0.907 -10.000 0.209 NA   NA
 5880488 5880489 EC55989_2463 EC55989_2464   eco FALSE 0.087 135.000 0.034 NA   NA
 5880490 5880491 EC55989_2465 EC55989_2466 mqo yojI FALSE 0.032 218.000 0.000 1.000   NA
 5880491 5880492 EC55989_2466 EC55989_2467 yojI alkB FALSE 0.246 76.000 0.076 1.000 N NA
 5880492 5880493 EC55989_2467 EC55989_2468 alkB ada TRUE 0.945 0.000 0.015 0.014 N NA
 5880493 5880494 EC55989_2468 EC55989_2469 ada yojL FALSE 0.119 74.000 0.019 1.000 N NA
 5880494 5880495 EC55989_2469 EC55989_2470 yojL ompC FALSE 0.134 112.000 0.066 1.000 N NA
 5880496 5880497 EC55989_misc_RNA_53 EC55989_2471 micF rcsD FALSE 0.011 312.000 0.000 NA   NA
 5880497 5880498 EC55989_2471 EC55989_2472 rcsD rcsB TRUE 0.995 17.000 0.558 1.000 Y NA
 5880499 5880500 EC55989_2473 EC55989_2474 rcsC yfaP FALSE 0.010 323.000 0.000 NA   NA
 5880500 5880501 EC55989_2474 EC55989_2475 yfaP yfaQ TRUE 0.902 5.000 0.000 NA   NA
 5880501 5880502 EC55989_2475 EC55989_2476 yfaQ   TRUE 0.921 1.000 0.000 NA   NA
 5880502 5880503 EC55989_2476 EC55989_2477   yfaT FALSE 0.432 -81.000 0.000 NA   NA
 5880503 5880504 EC55989_2477 EC55989_2478 yfaT yfaA TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5880504 5880505 EC55989_2478 EC55989_2479 yfaA gyrA FALSE 0.084 149.000 0.000 NA   NA
 5880508 5880509 EC55989_2482 EC55989_2483 nrdA nrdB TRUE 0.819 89.000 0.000 0.001 Y NA
 5880509 5880510 EC55989_2483 EC55989_2484 nrdB yfaE TRUE 0.848 0.000 0.034 1.000 N NA
 5880511 5880512 EC55989_2485 EC55989_2486 inaA   FALSE 0.256 80.000 0.000 NA   NA
 5880514 5880515 EC55989_2488 EC55989_2489 glpQ glpT TRUE 0.981 5.000 0.396 1.000 N NA
 5880516 5880517 EC55989_2490 EC55989_2491 glpA glpB TRUE 0.987 -10.000 0.650 0.001 N NA
 5880517 5880518 EC55989_2491 EC55989_2492 glpB glpC TRUE 0.994 -3.000 0.547 0.001 N NA
 5880518 5880519 EC55989_2492 EC55989_2493 glpC yfaD FALSE 0.040 194.000 0.000 NA   NA
 5880520 5880521 EC55989_2494 EC55989_2495 yfaU yfaY TRUE 0.867 13.000 0.000 NA   NA
 5880521 5880522 EC55989_2495 EC55989_2496 yfaY yfaZ FALSE 0.149 100.000 0.005 1.000   NA
 5880525 5880526 EC55989_2499 EC55989_2500 yfbE yfbF TRUE 0.996 4.000 0.378 NA Y NA
 5880526 5880527 EC55989_2500 EC55989_2501 yfbF yfbG TRUE 0.994 0.000 0.220 NA Y NA
 5880527 5880528 EC55989_2501 EC55989_2502 yfbG yfbH TRUE 0.997 -3.000 0.447 1.000 Y NA
 5880528 5880529 EC55989_2502 EC55989_2504 yfbH arnT TRUE 0.839 0.000 0.031 1.000 N NA
 5880529 5880530 EC55989_2504 EC55989_2505 arnT yfbW TRUE 0.947 -3.000 0.158 1.000 N NA
 5880530 5880531 EC55989_2505 EC55989_2506 yfbW yfbJ TRUE 0.976 0.000 0.226 NA   NA
 5880532 5880533 EC55989_2507 EC55989_2508 pmrD menE FALSE 0.103 110.000 0.005 NA   NA
 5880533 5880534 EC55989_2508 EC55989_2509 menE menC TRUE 0.988 -3.000 0.283 0.001 N NA
 5880534 5880535 EC55989_2509 EC55989_2510 menC menB TRUE 0.997 0.000 0.171 0.001 Y NA
 5880535 5880536 EC55989_2510 EC55989_2511 menB yfbB TRUE 0.960 15.000 0.280 NA   NA
 5880536 5880537 EC55989_2511 EC55989_2512 yfbB menD TRUE 0.983 -3.000 0.355 NA   NA
 5880537 5880538 EC55989_2512 EC55989_2513 menD menF TRUE 0.846 89.000 0.281 1.000 Y NA
 5880538 5880539 EC55989_2513 EC55989_2514 menF elaB FALSE 0.228 79.000 0.043 NA   NA
 5880539 5880540 EC55989_2514 EC55989_2515 elaB elaA FALSE 0.432 55.000 0.077 NA   NA
 5880541 5880542 EC55989_2516 EC55989_2517 elaC elaD FALSE 0.051 188.000 0.000 1.000   NA
 5880542 5880543 EC55989_2517 EC55989_2518 elaD   FALSE 0.005 645.000 0.000 NA   NA
 5880543 5880544 EC55989_2518 EC55989_2519   yfbM FALSE 0.140 126.000 0.000 NA   NA
 5880545 5880546 EC55989_2520 EC55989_2521 nuoN nuoM TRUE 0.998 7.000 0.437 0.002 Y NA
 5880546 5880547 EC55989_2521 EC55989_2522 nuoM nuoL TRUE 0.878 164.000 0.713 0.002 Y NA
 5880547 5880548 EC55989_2522 EC55989_2523 nuoL nuoK TRUE 0.996 -3.000 0.211 0.005 Y NA
 5880548 5880549 EC55989_2523 EC55989_2524 nuoK nuoJ TRUE 0.997 -3.000 0.269 0.003 Y NA
 5880549 5880550 EC55989_2524 EC55989_2525 nuoJ nuoI TRUE 0.997 12.000 0.428 0.005 Y NA
 5880550 5880551 EC55989_2525 EC55989_2526 nuoI nuoH TRUE 0.996 15.000 0.423 0.005 Y NA
 5880551 5880552 EC55989_2526 EC55989_2527 nuoH nuoG TRUE 0.999 -3.000 0.664 0.005 Y NA
 5880552 5880553 EC55989_2527 EC55989_2528 nuoG nuoF TRUE 0.952 47.000 0.180 0.005 Y NA
 5880553 5880554 EC55989_2528 EC55989_2529 nuoF nuoE TRUE 0.996 -3.000 0.186 0.005 Y NA
 5880554 5880555 EC55989_2529 EC55989_2530 nuoE nuoC TRUE 0.998 3.000 0.407 0.005 Y NA
 5880555 5880556 EC55989_2530 EC55989_2531 nuoC nuoB TRUE 0.964 94.000 0.691 0.003 Y NA
 5880556 5880557 EC55989_2531 EC55989_2532 nuoB nuoA TRUE 0.996 16.000 0.377 0.003 Y NA
 5880557 5880558 EC55989_2532 EC55989_2533 nuoA lrhA FALSE 0.003 631.000 0.000 1.000 N NA
 5880559 5880560 EC55989_2534 EC55989_2535 yfbQ yfbR FALSE 0.373 84.000 0.104 1.000   NA
 5880561 5880562 EC55989_2536 EC55989_2537 yfbS yfbT TRUE 0.624 87.000 0.308 1.000   NA
 5880562 5880563 EC55989_2537 EC55989_2538 yfbT yfbU TRUE 0.979 11.000 0.375 NA   NA
 5880563 5880564 EC55989_2538 EC55989_2539 yfbU yfbV TRUE 0.519 83.000 0.221 NA   NA
 5880565 5880566 EC55989_2540 EC55989_2541 ackA pta TRUE 0.839 75.000 0.634 1.000   NA
 5880566 5880567 EC55989_2541 EC55989_2542 pta yfcC FALSE 0.043 190.000 0.000 NA   NA
 5880568 5880569 EC55989_2543 EC55989_2544 yfcD yfcE TRUE 0.736 58.000 0.143 0.009   NA
 5880569 5880570 EC55989_2544 EC55989_2545 yfcE yfcF TRUE 0.487 53.000 0.092 NA   NA
 5880571 5880572 EC55989_2546 EC55989_2547 yfcG folX FALSE 0.153 57.000 0.012 1.000 N NA
 5880572 5880573 EC55989_2547 EC55989_2548 folX yfcH TRUE 0.894 21.000 0.122 1.000   NA
 5880574 5880575 EC55989_2549 EC55989_2550 yfcI hisP FALSE 0.038 197.000 0.000 NA   NA
 5880575 5880576 EC55989_2550 EC55989_2551 hisP hisM TRUE 0.997 8.000 0.643 1.000 Y NA
 5880576 5880577 EC55989_2551 EC55989_2552 hisM hisQ TRUE 0.999 -3.000 0.900 0.014 Y NA
 5880577 5880578 EC55989_2552 EC55989_2553 hisQ hisJ TRUE 0.968 90.000 0.833 0.046 Y NA
 5880578 5880579 EC55989_2553 EC55989_2554 hisJ argT FALSE 0.241 221.000 0.000 0.011 Y NA
 5880579 5880580 EC55989_2554 EC55989_2555 argT ubiX FALSE 0.011 266.000 0.000 1.000 N NA
 5880580 5880581 EC55989_2555 EC55989_2556 ubiX purF FALSE 0.154 95.000 0.056 1.000 N NA
 5880581 5880582 EC55989_2556 EC55989_2557 purF cvpA TRUE 0.869 37.000 0.262 1.000   NA
 5880582 5880583 EC55989_2557 EC55989_2558 cvpA dedD FALSE 0.029 259.000 0.116 NA   NA
 5880583 5880584 EC55989_2558 EC55989_2559 dedD folC TRUE 0.911 -10.000 0.216 NA   NA
 5880584 5880585 EC55989_2559 EC55989_2560 folC accD TRUE 0.698 70.000 0.383 1.000 N NA
 5880585 5880586 EC55989_2560 EC55989_2561 accD dedA FALSE 0.047 156.000 0.020 NA   NA
 5880586 5880587 EC55989_2561 EC55989_2562 dedA truA FALSE 0.206 83.000 0.038 NA   NA
 5880587 5880588 EC55989_2562 EC55989_2563 truA usg TRUE 0.862 0.000 0.040 1.000 N NA
 5880588 5880589 EC55989_2563 EC55989_2564 usg pdxB TRUE 0.879 66.000 0.097 0.008 Y NA
 5880591 5880592 EC55989_2566 EC55989_2567 yfcJ fabB FALSE 0.007 293.000 0.000 NA N NA
 5880594 5880595 EC55989_2569 EC55989_2570 yfcL yfcM TRUE 0.924 34.000 0.425 NA   NA
 5880595 5880596 EC55989_2570 EC55989_2571 yfcM yfcA TRUE 0.964 0.000 0.153 NA   NA
 5880596 5880597 EC55989_2571 EC55989_2572 yfcA mepA TRUE 0.969 0.000 0.160 1.000   NA
 5880597 5880598 EC55989_2572 EC55989_2573 mepA aroC TRUE 0.792 4.000 0.025 1.000 N NA
 5880598 5880599 EC55989_2573 EC55989_2574 aroC prmB TRUE 0.602 35.000 0.081 1.000 N NA
 5880601 5880602 EC55989_2576 EC55989_2577     FALSE 0.024 227.000 0.000 NA   NA
 5880602 5880603 EC55989_2577 EC55989_2578     TRUE 0.729 -13.000 0.000 NA   NA
 5880603 5880604 EC55989_2578 EC55989_2579     TRUE 0.997 -3.000 0.286 0.009 Y NA
 5880604 5880605 EC55989_2579 EC55989_2580     TRUE 0.997 -3.000 0.571 NA Y NA
 5880605 5880606 EC55989_2580 EC55989_2581   yfcS TRUE 0.927 -91.000 0.333 NA Y NA
 5880606 5880607 EC55989_2581 EC55989_2582 yfcS   TRUE 0.997 20.000 1.000 1.000 Y NA
 5880607 5880608 EC55989_2582 EC55989_2583   yfcV TRUE 0.963 82.000 1.000 1.000 Y NA
 5880608 5880609 EC55989_2583 EC55989_2584 yfcV sixA FALSE 0.003 675.000 0.000 1.000 N NA
 5880609 5880610 EC55989_2584 EC55989_2585 sixA yfcX FALSE 0.024 203.000 0.000 1.000 N NA
 5880610 5880611 EC55989_2585 EC55989_2586 yfcX yfcY TRUE 0.997 0.000 0.430 1.000 Y NA
 5880611 5880612 EC55989_2586 EC55989_2587 yfcY yfcZ FALSE 0.053 180.000 0.061 NA   NA
 5880613 5880614 EC55989_2588 EC55989_2589 fadL yfdF FALSE 0.008 366.000 0.000 NA   NA
 5880615 5880616 EC55989_2590 EC55989_2591 vacJ   TRUE 0.736 26.000 0.000 NA   NA
 5880617 5880618 EC55989_2592 EC55989_tRNA26 yfdC   FALSE 0.271 76.000 0.000 NA   NA
 5880618 5880619 EC55989_tRNA26 EC55989_2593   intS FALSE 0.068 162.000 0.000 NA   NA
 5880619 5880620 EC55989_2593 EC55989_2594 intS   FALSE 0.021 209.000 0.000 1.000 N NA
 5880623 5880624 EC55989_2597 EC55989_2598     TRUE 0.660 38.000 0.087 NA   NA
 5880624 5880625 EC55989_2598 EC55989_2599     TRUE 0.815 -10.000 0.087 NA   NA
 5880626 5880627 EC55989_2600 EC55989_2601     FALSE 0.247 84.000 0.000 NA   NA
 5880628 5880629 EC55989_2602 EC55989_2603     FALSE 0.018 255.000 0.000 NA   NA
 5880629 5880630 EC55989_2603 EC55989_2604   gp TRUE 0.714 -15.000 0.000 NA   NA
 5880630 5880631 EC55989_2604 EC55989_2605 gp   TRUE 0.976 11.000 0.333 NA   NA
 5880631 5880632 EC55989_2605 EC55989_2606     TRUE 0.992 3.000 0.600 NA   NA
 5880632 5880633 EC55989_2606 EC55989_2607   GP TRUE 0.994 -3.000 0.750 NA   NA
 5880633 5880634 EC55989_2607 EC55989_2608 GP   TRUE 0.981 0.000 0.286 NA   NA
 5880634 5880635 EC55989_2608 EC55989_2609     TRUE 0.986 9.000 0.500 NA   NA
 5880635 5880636 EC55989_2609 EC55989_2610     TRUE 0.920 -25.000 0.429 NA   NA
 5880636 5880637 EC55989_2610 EC55989_2611   p TRUE 0.620 43.000 0.097 NA   NA
 5880637 5880638 EC55989_2611 EC55989_2612 p   TRUE 0.884 12.000 0.065 NA   NA
 5880638 5880639 EC55989_2612 EC55989_2613     TRUE 0.926 14.000 0.143 NA   NA
 5880639 5880640 EC55989_2613 EC55989_2614     TRUE 0.752 -69.000 0.214 NA   NA
 5880640 5880641 EC55989_2614 EC55989_2615     TRUE 0.961 -3.000 0.174 NA   NA
 5880641 5880642 EC55989_2615 EC55989_2616     FALSE 0.319 80.000 0.087 NA   NA
 5880642 5880643 EC55989_2616 EC55989_2617     FALSE 0.190 104.000 0.000 NA   NA
 5880643 5880644 EC55989_2617 EC55989_2618     FALSE 0.022 234.000 0.000 NA   NA
 5880644 5880645 EC55989_2618 EC55989_2619     FALSE 0.025 222.000 0.000 NA   NA
 5880645 5880646 EC55989_2619 EC55989_2620   ybcS TRUE 0.750 -15.000 0.000 1.000   NA
 5880646 5880647 EC55989_2620 EC55989_2621 ybcS   TRUE 0.641 -22.000 0.000 NA   NA
 5880648 5880649 EC55989_2622 EC55989_2624     FALSE 0.148 122.000 0.000 NA   NA
 5880650 5880651 EC55989_2625 EC55989_2626   rusA FALSE 0.058 182.000 0.000 1.000   NA
 5880651 5880652 EC55989_2626 EC55989_2627 rusA   TRUE 0.992 -3.000 0.667 NA   NA
 5880652 5880653 EC55989_2627 EC55989_2628   roi TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5880653 5880654 EC55989_2628 EC55989_2629 roi ninF TRUE 0.819 -7.000 0.000 NA   NA
 5880654 5880655 EC55989_2629 EC55989_2630 ninF   FALSE 0.054 176.000 0.000 NA   NA
 5880655 5880656 EC55989_2630 EC55989_2631     FALSE 0.036 200.000 0.000 NA   NA
 5880656 5880657 EC55989_2631 EC55989_2632     TRUE 0.829 18.000 0.000 NA   NA
 5880657 5880658 EC55989_2632 EC55989_2633   P FALSE 0.271 76.000 0.000 NA   NA
 5880658 5880659 EC55989_2633 EC55989_2634 P O TRUE 0.905 -25.000 0.364 NA   NA
 5880659 5880660 EC55989_2634 EC55989_2635 O   TRUE 0.959 -13.000 0.500 NA   NA
 5880660 5880661 EC55989_2635 EC55989_2636   C TRUE 0.949 35.000 0.600 NA   NA
 5880661 5880662 EC55989_2636 EC55989_2637 C cro TRUE 0.901 22.000 0.000 0.069   NA
 5880665 5880666 EC55989_2640 EC55989_2641 N   TRUE 0.893 9.000 0.000 NA   NA
 5880666 5880667 EC55989_2641 EC55989_2642     FALSE 0.232 90.000 0.000 NA   NA
 5880667 5880668 EC55989_2642 EC55989_2643     TRUE 0.579 -33.000 0.000 NA   NA
 5880668 5880669 EC55989_2643 EC55989_2644     FALSE 0.390 -91.000 0.000 NA   NA
 5880669 5880670 EC55989_2644 EC55989_2645   erf TRUE 0.595 -19.000 0.034 NA   NA
 5880670 5880671 EC55989_2645 EC55989_2646 erf   FALSE 0.327 -90.000 0.034 NA   NA
 5880671 5880672 EC55989_2646 EC55989_2647   abc TRUE 0.967 24.000 0.500 NA   NA
 5880672 5880673 EC55989_2647 EC55989_2648 abc   TRUE 0.884 11.000 0.000 NA   NA
 5880673 5880674 EC55989_2648 EC55989_2649     FALSE 0.069 161.000 0.000 NA   NA
 5880674 5880675 EC55989_2649 EC55989_2650     FALSE 0.057 173.000 0.000 NA   NA
 5880675 5880676 EC55989_2650 EC55989_2651     TRUE 0.920 2.000 0.000 NA   NA
 5880676 5880677 EC55989_2651 EC55989_2652     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5880677 5880678 EC55989_2652 EC55989_2653   torI FALSE 0.007 408.000 0.000 NA   NA
 5880679 5880680 EC55989_2654 EC55989_2655 cscB cscK FALSE 0.330 72.000 0.000 1.000   NA
 5880683 5880684 EC55989_2658 EC55989_2659 dsdX dsdA TRUE 0.829 18.000 0.000 NA   NA
 5880685 5880686 EC55989_2660 EC55989_2661 emrY emrK TRUE 0.997 0.000 1.000 1.000   NA
 5880687 5880688 EC55989_2662 EC55989_2663 evgA evgS TRUE 0.991 5.000 0.000 0.010 Y NA
 5880689 5880690 EC55989_2664 EC55989_2665 yfdE yfdV FALSE 0.319 74.000 0.000 1.000   NA
 5880690 5880691 EC55989_2665 EC55989_2666 yfdV oxc FALSE 0.340 70.000 0.000 1.000   NA
 5880691 5880692 EC55989_2666 EC55989_2667 oxc frc TRUE 0.490 54.000 0.134 1.000 N NA
 5880692 5880693 EC55989_2667 EC55989_2669 frc yfdX FALSE 0.005 513.000 0.000 NA   NA
 5880695 5880696 EC55989_2672 EC55989_2673 yfdY   FALSE 0.022 234.000 0.000 NA   NA
 5880698 5880699 EC55989_misc_RNA_54 EC55989_2675 tpke70 yfdZ FALSE 0.006 428.000 0.000 NA   NA
 5880700 5880701 EC55989_2676 EC55989_2677 ypdA ypdB TRUE 0.998 15.000 0.744 0.012 Y NA
 5880701 5880702 EC55989_2677 EC55989_2678 ypdB ypdC TRUE 0.985 13.000 0.051 0.066 Y NA
 5880703 5880704 EC55989_2679 EC55989_2680 ypdD ypdE TRUE 0.992 25.000 0.571 1.000 Y NA
 5880704 5880705 EC55989_2680 EC55989_2681 ypdE ypdF TRUE 0.942 0.000 0.009 0.019 N NA
 5880705 5880706 EC55989_2681 EC55989_2682 ypdF ypdG TRUE 0.638 15.000 0.011 1.000 N NA
 5880706 5880707 EC55989_2682 EC55989_2683 ypdG ypdH TRUE 0.998 22.000 0.875 0.011 Y NA
 5880707 5880708 EC55989_2683 EC55989_2684 ypdH glk FALSE 0.181 219.000 0.091 1.000 Y NA
 5880709 5880710 EC55989_2685 EC55989_2686 yfeO ypeC FALSE 0.163 115.000 0.000 NA   NA
 5880713 5880714 EC55989_2689 EC55989_tRNA75 yfeA   FALSE 0.032 208.000 0.000 NA   NA
 5880714 5880715 EC55989_tRNA75 EC55989_tRNA74     TRUE 0.566 40.000 0.000 NA   NA
 5880716 5880717 EC55989_2691 EC55989_2692 yfeC yfeD TRUE 0.973 2.000 0.000 0.005   NA
 5880719 5880720 EC55989_tRNA27 EC55989_tRNA28     TRUE 0.496 45.000 0.000 NA   NA
 5880720 5880721 EC55989_tRNA28 EC55989_tRNA29     TRUE 0.466 47.000 0.000 NA   NA
 5880721 5880722 EC55989_tRNA29 EC55989_tRNA30     TRUE 0.902 5.000 0.000 NA   NA
 5880723 5880724 EC55989_2694 EC55989_2695 xapR xapB FALSE 0.040 252.000 0.130 1.000   NA
 5880724 5880725 EC55989_2695 EC55989_2696 xapB xapA TRUE 0.503 60.000 0.111 1.000   NA
 5880729 5880730 EC55989_2700 EC55989_2701 ypeB ligA TRUE 0.873 2.000 0.017 NA   NA
 5880730 5880731 EC55989_2701 EC55989_2702 ligA zipA FALSE 0.103 71.000 0.002 1.000 N NA
 5880732 5880733 EC55989_2703 EC55989_2704 cysZ cysK FALSE 0.309 185.000 0.122 1.000 Y NA
 5880733 5880734 EC55989_2704 EC55989_2705 cysK ptsH FALSE 0.003 384.000 0.019 1.000 N NA
 5880734 5880735 EC55989_2705 EC55989_2706 ptsH ptsI TRUE 0.923 45.000 0.000 0.012 Y NA
 5880735 5880736 EC55989_2706 EC55989_2707 ptsI crr TRUE 0.938 41.000 0.000 0.012 Y NA
 5880739 5880740 EC55989_2710 EC55989_2711 cysM cysA FALSE 0.072 134.000 0.049 1.000 N NA
 5880740 5880741 EC55989_2711 EC55989_2712 cysA cysW TRUE 0.975 -10.000 0.180 1.000 Y NA
 5880741 5880742 EC55989_2712 EC55989_2713 cysW cysU TRUE 0.996 0.000 0.583 0.000 N NA
 5880742 5880743 EC55989_2713 EC55989_2714 cysU cysP TRUE 0.994 0.000 0.479 0.002 N NA
 5880743 5880744 EC55989_2714 EC55989_2715 cysP ucpA FALSE 0.033 171.000 0.043 1.000 N NA
 5880744 5880745 EC55989_2715 EC55989_2716 ucpA yfeT FALSE 0.091 129.000 0.000 1.000 N NA
 5880746 5880747 EC55989_2717 EC55989_2718 yfeU murP TRUE 0.963 4.000 0.158 1.000   NA
 5880747 5880748 EC55989_2718 EC55989_2719 murP murQ TRUE 0.945 5.000 0.167 1.000 N NA
 5880749 5880750 EC55989_2720 EC55989_2721 yfeX yfeY TRUE 0.588 96.000 0.333 NA   NA
 5880750 5880751 EC55989_2721 EC55989_2722 yfeY yfeZ TRUE 0.603 61.000 0.204 NA   NA
 5880751 5880752 EC55989_2722 EC55989_2723 yfeZ ypeA TRUE 0.736 -13.000 0.059 NA   NA
 5880753 5880754 EC55989_2724 EC55989_2725 amiA hemF TRUE 0.793 4.000 0.025 1.000 N NA
 5880755 5880756 EC55989_2726 EC55989_2727 yfeG yffI TRUE 0.716 46.000 0.250 NA N NA
 5880756 5880757 EC55989_2727 EC55989_2728 yffI eutL TRUE 0.867 13.000 0.106 NA N NA
 5880757 5880758 EC55989_2728 EC55989_2729 eutL eutC TRUE 0.982 10.000 0.000 1.000 Y NA
 5880758 5880759 EC55989_2729 EC55989_2730 eutC eutB TRUE 0.984 21.000 0.000 0.000 Y NA
 5880759 5880760 EC55989_2730 EC55989_2731 eutB eutA TRUE 0.978 12.000 0.000 NA Y NA
 5880760 5880761 EC55989_2731 EC55989_2732 eutA eutH TRUE 0.996 -3.000 0.400 NA Y NA
 5880761 5880762 EC55989_2732 EC55989_2733 eutH eutG FALSE 0.029 317.000 0.222 1.000 N NA
 5880762 5880763 EC55989_2733 EC55989_2734 eutG eutJ TRUE 0.965 -10.000 0.556 1.000 N NA
 5880763 5880764 EC55989_2734 EC55989_2735 eutJ eutE TRUE 0.976 11.000 0.375 1.000 N NA
 5880764 5880765 EC55989_2735 EC55989_2736 eutE cchB TRUE 0.997 12.000 0.667 NA Y NA
 5880765 5880766 EC55989_2736 EC55989_2737 cchB cchA TRUE 0.716 107.000 0.182 NA Y NA
 5880766 5880767 EC55989_2737 EC55989_2738 cchA eutI TRUE 0.974 39.000 0.455 NA Y NA
 5880767 5880768 EC55989_2738 EC55989_2739 eutI eutT TRUE 0.915 -3.000 0.095 1.000 N NA
 5880768 5880769 EC55989_2739 EC55989_2740 eutT eutQ TRUE 0.992 -3.000 0.214 NA Y NA
 5880769 5880770 EC55989_2740 EC55989_2741 eutQ eutP TRUE 0.944 -25.000 0.167 NA Y NA
 5880770 5880771 EC55989_2741 EC55989_2742 eutP ypfE TRUE 0.978 13.000 0.000 1.000 Y NA
 5880771 5880772 EC55989_2742 EC55989_2743 ypfE maeB FALSE 0.010 293.000 0.070 1.000 N NA
 5880773 5880774 EC55989_2744 EC55989_2745 talA tktB TRUE 0.996 20.000 0.739 1.000 Y NA
 5880775 5880776 EC55989_2746 EC55989_2747 ypfG yffH TRUE 0.464 126.000 0.333 NA   NA
 5880776 5880777 EC55989_2747 EC55989_2748 yffH aegA FALSE 0.458 68.000 0.167 1.000 N NA
 5880778 5880779 EC55989_2749 EC55989_2750 narQ acrD FALSE 0.167 164.000 0.133 0.070 N NA
 5880779 5880780 EC55989_2750 EC55989_2751 acrD yffB FALSE 0.004 539.000 0.000 1.000 N NA
 5880780 5880781 EC55989_2751 EC55989_2752 yffB dapE TRUE 0.974 4.000 0.292 1.000 N NA
 5880781 5880782 EC55989_2752 EC55989_2753 dapE ypfN TRUE 0.613 28.000 0.025 NA   NA
 5880783 5880784 EC55989_2754 EC55989_2755 ypfH ypfI FALSE 0.281 74.000 0.000 NA   NA
 5880784 5880785 EC55989_2755 EC55989_2756 ypfI ypfJ TRUE 0.801 15.000 0.029 NA   NA
 5880785 5880786 EC55989_2756 EC55989_2757 ypfJ   FALSE 0.089 147.000 0.000 NA   NA
 5880786 5880787 EC55989_2757 EC55989_2758     TRUE 0.995 0.000 0.727 NA   NA
 5880787 5880788 EC55989_2758 EC55989_2759   purC FALSE 0.161 116.000 0.000 NA   NA
 5880788 5880789 EC55989_2759 EC55989_2760 purC nlpB FALSE 0.006 213.000 0.019 NA N NA
 5880789 5880790 EC55989_2760 EC55989_2761 nlpB dapA TRUE 0.988 17.000 0.267 NA Y NA
 5880791 5880792 EC55989_2762 EC55989_2763 gcvR bcp TRUE 0.933 0.000 0.102 1.000 N NA
 5880792 5880793 EC55989_2763 EC55989_2764 bcp hyfA FALSE 0.013 253.000 0.000 1.000 N NA
 5880793 5880794 EC55989_2764 EC55989_2765 hyfA hyfB TRUE 0.988 0.000 0.000 1.000 Y NA
 5880794 5880795 EC55989_2765 EC55989_2766 hyfB hyfC TRUE 0.764 -10.000 0.000 NA   NA
 5880795 5880796 EC55989_2766 EC55989_2767 hyfC hyfC FALSE 0.381 55.000 0.000 NA   NA
 5880796 5880797 EC55989_2767 EC55989_2768 hyfC hyfD TRUE 0.836 17.000 0.000 NA   NA
 5880797 5880798 EC55989_2768 EC55989_2769 hyfD hyfD TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5880798 5880799 EC55989_2769 EC55989_2770 hyfD hyfE TRUE 0.876 12.000 0.000 NA   NA
 5880799 5880800 EC55989_2770 EC55989_2771 hyfE hyfF TRUE 0.999 5.000 0.864 0.005 Y NA
 5880800 5880801 EC55989_2771 EC55989_2772 hyfF hyfG TRUE 0.937 38.000 0.016 0.005 Y NA
 5880801 5880802 EC55989_2772 EC55989_2773 hyfG hyfH TRUE 0.981 10.000 0.044 1.000 Y NA
 5880802 5880803 EC55989_2773 EC55989_2774 hyfH hyfI TRUE 0.993 -3.000 0.222 1.000 Y NA
 5880803 5880804 EC55989_2774 EC55989_2775 hyfI hyfJ TRUE 0.945 -7.000 0.250 NA   NA
 5880804 5880805 EC55989_2775 EC55989_2776 hyfJ hyfR TRUE 0.677 30.000 0.000 NA   NA
 5880805 5880806 EC55989_2776 EC55989_2777 hyfR focB TRUE 0.721 22.000 0.000 1.000 N NA
 5880808 5880809 EC55989_2779 EC55989_2780 yfgC yfgD TRUE 0.947 21.000 0.259 1.000   NA
 5880810 5880811 EC55989_2781 EC55989_2782 hda uraA FALSE 0.245 50.000 0.048 NA N NA
 5880811 5880812 EC55989_2782 EC55989_2783 uraA upp TRUE 0.734 86.000 0.101 1.000 Y NA
 5880813 5880814 EC55989_2784 EC55989_2785 purM purN TRUE 0.997 0.000 0.230 0.001 Y NA
 5880814 5880815 EC55989_2785 EC55989_2786 purN ppk FALSE 0.020 171.000 0.017 1.000 N NA
 5880815 5880816 EC55989_2786 EC55989_2787 ppk ppx TRUE 0.997 5.000 0.486 1.000 Y NA
 5880817 5880818 EC55989_2788 EC55989_2789 yfgF   FALSE 0.027 217.000 0.000 NA   NA
 5880819 5880820 EC55989_2790 EC55989_2791 yfgH yfgI TRUE 0.957 16.000 0.273 NA   NA
 5880821 5880822 EC55989_2792 EC55989_2793 guaA guaB TRUE 0.925 69.000 0.190 0.000 Y NA
 5880824 5880825 EC55989_2795 EC55989_2796 yfgJ der FALSE 0.197 69.000 0.009 NA   NA
 5880825 5880826 EC55989_2796 EC55989_2797 der yfgL FALSE 0.377 118.000 0.203 1.000   NA
 5880826 5880827 EC55989_2797 EC55989_2798 yfgL yfgM TRUE 0.986 11.000 0.492 1.000   NA
 5880827 5880828 EC55989_2798 EC55989_2799 yfgM hisS TRUE 0.955 18.000 0.259 1.000   NA
 5880828 5880829 EC55989_2799 EC55989_misc_RNA_55 hisS   TRUE 0.814 20.000 0.000 NA   NA
 5880829 5880830 EC55989_misc_RNA_55 EC55989_2800   ispG TRUE 0.921 1.000 0.000 NA   NA
 5880830 5880831 EC55989_2800 EC55989_2801 ispG yfgA TRUE 0.911 27.000 0.233 1.000   NA
 5880831 5880832 EC55989_2801 EC55989_2802 yfgA yfgB FALSE 0.011 285.000 0.020 1.000   NA
 5880832 5880833 EC55989_2802 EC55989_2803 yfgB ndk FALSE 0.184 150.000 0.156 1.000   NA
 5880833 5880834 EC55989_2803 EC55989_2804 ndk pbpC FALSE 0.026 149.000 0.008 1.000 N NA
 5880834 5880835 EC55989_2804 EC55989_2805 pbpC yfhM TRUE 0.995 1.000 0.711 1.000   NA
 5880839 5880840 EC55989_2807 EC55989_2808 sseB pepB FALSE 0.297 142.000 0.253 NA   NA
 5880840 5880841 EC55989_2808 EC55989_2809 pepB yfhJ FALSE 0.133 178.000 0.171 1.000   NA
 5880841 5880842 EC55989_2809 EC55989_2810 yfhJ fdx TRUE 0.989 12.000 0.625 1.000   NA
 5880842 5880843 EC55989_2810 EC55989_2811 fdx hscA TRUE 0.994 2.000 0.794 1.000 N NA
 5880843 5880844 EC55989_2811 EC55989_2812 hscA hscB TRUE 0.996 17.000 0.634 1.000 Y NA
 5880844 5880845 EC55989_2812 EC55989_2813 hscB iscA TRUE 0.719 96.000 0.500 1.000   NA
 5880845 5880846 EC55989_2813 EC55989_2814 iscA iscU TRUE 0.985 17.000 0.359 0.002   NA
 5880846 5880847 EC55989_2814 EC55989_2815 iscU iscS TRUE 0.939 28.000 0.448 1.000 N NA
 5880847 5880848 EC55989_2815 EC55989_2816 iscS iscR TRUE 0.548 112.000 0.424 1.000 N NA
 5880848 5880849 EC55989_2816 EC55989_2817 iscR yfhQ FALSE 0.021 270.000 0.126 1.000 N NA
 5880850 5880851 EC55989_2818 EC55989_2820 suhB yfhR FALSE 0.114 118.000 0.003 1.000   NA
 5880851 5880852 EC55989_2820 EC55989_2821 yfhR csiE FALSE 0.050 191.000 0.000 1.000   NA
 5880853 5880854 EC55989_2822 EC55989_2823 hcaT hcaR FALSE 0.083 160.000 0.000 1.000   NA
 5880855 5880856 EC55989_2824 EC55989_2825 hcaE hcaF TRUE 0.991 -3.000 0.333 0.000 N NA
 5880856 5880857 EC55989_2825 EC55989_2826 hcaF hcaC TRUE 0.905 0.000 0.083 NA N NA
 5880857 5880858 EC55989_2826 EC55989_2827 hcaC hcaB TRUE 0.886 -3.000 0.083 NA N NA
 5880858 5880859 EC55989_2827 EC55989_2828 hcaB hcaD TRUE 0.906 10.000 0.000 1.000   NA
 5880859 5880860 EC55989_2828 EC55989_2829 hcaD yphA FALSE 0.207 97.000 0.000 NA   NA
 5880861 5880862 EC55989_2830 EC55989_2831 yphB yphC TRUE 0.828 12.000 0.000 1.000 N NA
 5880862 5880863 EC55989_2831 EC55989_2832 yphC yphD FALSE 0.241 66.000 0.000 1.000 N NA
 5880863 5880864 EC55989_2832 EC55989_2833 yphD yphE TRUE 0.970 25.000 0.148 1.000 Y NA
 5880864 5880865 EC55989_2833 EC55989_2834 yphE yphF TRUE 0.973 23.000 0.161 NA Y NA
 5880865 5880866 EC55989_2834 EC55989_2835 yphF yphG FALSE 0.207 97.000 0.000 NA   NA
 5880870 5880871 EC55989_2839 EC55989_2840 glnB yfhA FALSE 0.460 61.000 0.146 1.000 N NA
 5880871 5880872 EC55989_2840 EC55989_2841 yfhA yfhG TRUE 0.695 -10.000 0.029 NA   NA
 5880872 5880873 EC55989_2841 EC55989_2842 yfhG yfhK FALSE 0.047 165.000 0.029 NA   NA
 5880873 5880874 EC55989_2842 EC55989_misc_RNA_58 yfhK tke1 FALSE 0.218 94.000 0.000 NA   NA
 5880874 5880875 EC55989_misc_RNA_58 EC55989_2844 tke1 purL FALSE 0.009 334.000 0.000 NA   NA
 5880877 5880878 EC55989_2846 EC55989_2847 tadA yfhB TRUE 0.631 25.000 0.062 NA N NA
 5880879 5880880 EC55989_2848 EC55989_2849 yfhH yfhL FALSE 0.368 56.000 0.056 NA   NA
 5880881 5880882 EC55989_misc_RNA_59 EC55989_2850 ryfB   FALSE 0.312 -183.000 0.000 NA   NA
 5880884 5880885 EC55989_2851 EC55989_2852 acpS pdxJ TRUE 0.981 0.000 0.326 1.000 N NA
 5880885 5880886 EC55989_2852 EC55989_2853 pdxJ recO TRUE 0.929 12.000 0.166 1.000 N NA
 5880886 5880887 EC55989_2853 EC55989_2854 recO era TRUE 0.930 12.000 0.109 1.000   NA
 5880887 5880888 EC55989_2854 EC55989_2855 era rnc TRUE 0.976 -3.000 0.127 0.040   NA
 5880888 5880889 EC55989_2855 EC55989_2857 rnc lepB FALSE 0.029 273.000 0.117 1.000   NA
 5880889 5880890 EC55989_2857 EC55989_2858 lepB lepA TRUE 0.943 16.000 0.187 1.000   NA
 5880890 5880891 EC55989_2858 EC55989_2859 lepA rseC FALSE 0.016 198.000 0.045 NA N NA
 5880891 5880892 EC55989_2859 EC55989_2860 rseC rseB TRUE 0.997 -3.000 0.609 NA Y NA
 5880892 5880893 EC55989_2860 EC55989_2861 rseB rseA TRUE 0.999 0.000 0.856 NA Y NA
 5880893 5880894 EC55989_2861 EC55989_2862 rseA rpoE TRUE 0.953 33.000 0.705 NA N NA
 5880902 5880903 EC55989_2870 EC55989_2871 yfiF   TRUE 0.764 -10.000 0.000 NA   NA
 5880904 5880905 EC55989_2872 EC55989_2873 trxC yfiP FALSE 0.371 69.000 0.084 NA   NA
 5880905 5880906 EC55989_2873 EC55989_2874 yfiP yfiQ TRUE 0.859 32.000 0.222 NA   NA
 5880906 5880907 EC55989_2874 EC55989_2875 yfiQ pssA FALSE 0.359 114.000 0.121 0.045 N NA
 5880907 5880908 EC55989_2875 EC55989_2876 pssA yfiM FALSE 0.269 97.000 0.089 NA   NA
 5880909 5880910 EC55989_2877 EC55989_5S_3 kgtP   FALSE 0.010 324.000 0.000 NA   NA
 5880910 5880911 EC55989_5S_3 EC55989_23S_2     FALSE 0.218 94.000 0.000 NA   NA
 5880911 5880912 EC55989_23S_2 EC55989_tRNA73     FALSE 0.040 194.000 0.000 NA   NA
 5880912 5880913 EC55989_tRNA73 EC55989_16S_2     FALSE 0.058 172.000 0.000 NA   NA
 5880913 5880914 EC55989_16S_2 EC55989_2883   clpB FALSE 0.006 444.000 0.000 NA   NA
 5880914 5880915 EC55989_2883 EC55989_misc_RNA_61 clpB ryfD TRUE 0.641 -22.000 0.000 NA   NA
 5880915 5880916 EC55989_misc_RNA_61 EC55989_2884 ryfD yfiH TRUE 0.894 8.000 0.000 NA   NA
 5880916 5880917 EC55989_2884 EC55989_2885 yfiH rluD TRUE 0.960 -3.000 0.168 NA   NA
 5880918 5880919 EC55989_2886 EC55989_2887 yfiO yfiA FALSE 0.008 271.000 0.004 NA   NA
 5880919 5880920 EC55989_2887 EC55989_5071 yfiA pheL FALSE 0.190 104.000 0.000 NA   NA
 5880920 5880921 EC55989_5071 EC55989_2888 pheL pheA FALSE 0.202 99.000 0.000 NA   NA
 5880922 5880923 EC55989_2889 EC55989_2890 tyrA aroF TRUE 0.981 11.000 0.000 1.000 Y NA
 5880924 5880925 EC55989_2891 EC55989_2892 yfiL yfiR FALSE 0.159 150.000 0.148 NA   NA
 5880925 5880926 EC55989_2892 EC55989_2893 yfiR yfiN TRUE 0.964 -10.000 0.475 NA   NA
 5880926 5880927 EC55989_2893 EC55989_2894 yfiN yfiB TRUE 0.974 16.000 0.475 1.000 N NA
 5880928 5880929 EC55989_2895 EC55989_2896 rplS trmD TRUE 0.979 42.000 0.567 1.000 Y NA
 5880929 5880930 EC55989_2896 EC55989_2897 trmD rimM TRUE 0.990 31.000 0.672 1.000 Y NA
 5880930 5880931 EC55989_2897 EC55989_2898 rimM rpsP TRUE 0.995 19.000 0.342 0.009 Y NA
 5880931 5880932 EC55989_2898 EC55989_2899 rpsP ffh FALSE 0.382 137.000 0.361 1.000 N NA
 5880933 5880934 EC55989_2900 EC55989_2901 ypjD yfjD TRUE 0.545 111.000 0.349 NA   NA
 5880936 5880937 EC55989_2903 EC55989_2904 yfjB recN FALSE 0.382 86.000 0.170 1.000 N NA
 5880937 5880938 EC55989_2904 EC55989_2905 recN smpA FALSE 0.052 149.000 0.049 1.000 N NA
 5880939 5880940 EC55989_2906 EC55989_2907 yfjF yfjG TRUE 0.854 -10.000 0.124 NA   NA
 5880941 5880942 EC55989_2908 EC55989_misc_RNA_62 smpB ssrA FALSE 0.032 208.000 0.000 NA   NA
 5880942 5880943 EC55989_misc_RNA_62 EC55989_2909 ssrA intA FALSE 0.136 127.000 0.000 NA   NA
 5880945 5880946 EC55989_2911 EC55989_2912     TRUE 0.478 46.000 0.000 NA   NA
 5880946 5880947 EC55989_2912 EC55989_2913     FALSE 0.330 -148.000 0.000 NA   NA
 5880948 5880949 EC55989_2914 EC55989_2915     TRUE 0.751 25.000 0.000 NA   NA
 5880950 5880951 EC55989_2916 EC55989_2917     TRUE 0.831 21.000 0.000 1.000   NA
 5880951 5880952 EC55989_2917 EC55989_2918     FALSE 0.151 120.000 0.000 NA   NA
 5880953 5880954 EC55989_2919 EC55989_2920   pinH FALSE 0.030 210.000 0.000 NA   NA
 5880954 5880955 EC55989_2920 EC55989_2921 pinH   FALSE 0.007 385.000 0.000 NA   NA
 5880955 5880956 EC55989_2921 EC55989_2922     FALSE 0.035 201.000 0.000 NA   NA
 5880956 5880957 EC55989_2922 EC55989_2923     FALSE 0.005 515.000 0.000 NA   NA
 5880957 5880958 EC55989_2923 EC55989_tRNA72     FALSE 0.385 -93.000 0.000 NA   NA
 5880959 5880960 EC55989_2924 EC55989_2925     FALSE 0.281 74.000 0.000 NA   NA
 5880960 5880961 EC55989_2925 EC55989_2926   yqaD FALSE 0.106 139.000 0.000 NA   NA
 5880961 5880962 EC55989_2926 EC55989_2927 yqaD ygaT FALSE 0.009 336.000 0.000 NA   NA
 5880962 5880963 EC55989_2927 EC55989_2928 ygaT ygaF TRUE 0.814 20.000 0.000 NA   NA
 5880963 5880964 EC55989_2928 EC55989_2929 ygaF gabD TRUE 0.809 23.000 0.000 1.000   NA
 5880964 5880965 EC55989_2929 EC55989_2930 gabD gabT TRUE 0.959 14.000 0.303 1.000 N NA
 5880965 5880966 EC55989_2930 EC55989_2931 gabT gabP FALSE 0.098 311.000 0.121 1.000 Y NA
 5880966 5880967 EC55989_2931 EC55989_2932 gabP csiR TRUE 0.977 21.000 0.625 1.000 N NA
 5880968 5880969 EC55989_2933 EC55989_2934 ygaU yqaE FALSE 0.218 84.000 0.027 1.000   NA
 5880970 5880971 EC55989_2935 EC55989_2936 ygaV ygaP TRUE 0.863 10.000 0.083 NA N NA
 5880975 5880976 EC55989_2940 EC55989_2941 ygaM nrdH FALSE 0.019 248.000 0.000 NA   NA
 5880976 5880977 EC55989_2941 EC55989_2942 nrdH nrdI TRUE 0.718 -3.000 0.026 NA N NA
 5880977 5880978 EC55989_2942 EC55989_2943 nrdI nrdE TRUE 0.903 -27.000 0.000 NA Y NA
 5880978 5880979 EC55989_2943 EC55989_2944 nrdE nrdF TRUE 0.992 10.000 0.000 0.001 Y NA
 5880979 5880980 EC55989_2944 EC55989_2945 nrdF proV FALSE 0.006 355.000 0.000 1.000 N NA
 5880980 5880981 EC55989_2945 EC55989_2946 proV proW TRUE 0.997 -7.000 0.630 0.083 Y NA
 5880981 5880982 EC55989_2946 EC55989_2947 proW proX TRUE 0.979 57.000 0.695 0.044 Y NA
 5880982 5880983 EC55989_2947 EC55989_2948 proX   FALSE 0.070 192.000 0.174 NA N NA
 5880983 5880984 EC55989_2948 EC55989_2949   ygaZ FALSE 0.085 124.000 0.060 NA N NA
 5880984 5880985 EC55989_2949 EC55989_2950 ygaZ ygaH TRUE 0.985 -10.000 0.915 NA   NA
 5880985 5880986 EC55989_2950 EC55989_2951 ygaH mprA FALSE 0.244 91.000 0.065 NA   NA
 5880986 5880987 EC55989_2951 EC55989_2952 mprA emrA FALSE 0.161 127.000 0.107 1.000 N NA
 5880987 5880988 EC55989_2952 EC55989_2953 emrA emrB TRUE 0.988 17.000 0.875 1.000 N NA
 5880991 5880992 EC55989_2955 EC55989_2956 gshA yqaA FALSE 0.319 73.000 0.071 NA   NA
 5880992 5880993 EC55989_2956 EC55989_2957 yqaA yqaB TRUE 0.916 -3.000 0.067 NA   NA
 5880993 5880994 EC55989_2957 EC55989_tRNA71 yqaB   FALSE 0.014 281.000 0.000 NA   NA
 5880994 5880995 EC55989_tRNA71 EC55989_tRNA70     FALSE 0.037 199.000 0.000 NA   NA
 5880995 5880996 EC55989_tRNA70 EC55989_tRNA69     FALSE 0.037 199.000 0.000 NA   NA
 5880996 5880997 EC55989_tRNA69 EC55989_tRNA68     FALSE 0.037 198.000 0.000 NA   NA
 5880997 5880998 EC55989_tRNA68 EC55989_tRNA67     TRUE 0.909 4.000 0.000 NA   NA
 5880998 5880999 EC55989_tRNA67 EC55989_2958   csrA FALSE 0.011 316.000 0.000 NA   NA
 5880999 5881000 EC55989_2958 EC55989_2959 csrA alaS FALSE 0.008 235.000 0.020 1.000 N NA
 5881000 5881001 EC55989_2959 EC55989_2960 alaS recX FALSE 0.195 128.000 0.085 1.000   NA
 5881001 5881002 EC55989_2960 EC55989_2961 recX recA FALSE 0.096 243.000 0.296 1.000   NA
 5881002 5881003 EC55989_2961 EC55989_2962 recA ygaD FALSE 0.310 80.000 0.082 NA   NA
 5881003 5881004 EC55989_2962 EC55989_2963 ygaD mltB FALSE 0.065 145.000 0.026 NA   NA
 5881005 5881006 EC55989_2964 EC55989_2965 srlA srlE TRUE 0.997 -3.000 0.349 0.011 Y NA
 5881006 5881007 EC55989_2965 EC55989_2966 srlE srlB TRUE 0.989 11.000 0.000 0.011 Y NA
 5881007 5881008 EC55989_2966 EC55989_2967 srlB srlD TRUE 0.836 4.000 0.040 1.000 N NA
 5881008 5881009 EC55989_2967 EC55989_2968 srlD gutM FALSE 0.315 105.000 0.197 NA N NA
 5881009 5881010 EC55989_2968 EC55989_2969 gutM srlR TRUE 0.840 67.000 0.183 NA Y NA
 5881010 5881011 EC55989_2969 EC55989_2970 srlR gutQ TRUE 0.975 -7.000 0.562 1.000 N NA
 5881013 5881014 EC55989_2972 EC55989_2973 norV norW TRUE 0.929 -3.000 0.083 NA   NA
 5881014 5881015 EC55989_2973 EC55989_misc_RNA_64 norW C0664 FALSE 0.179 108.000 0.000 NA   NA
 5881016 5881017 EC55989_2974 EC55989_2975 hypF hydN FALSE 0.027 153.000 0.018 1.000 N NA
 5881017 5881018 EC55989_2975 EC55989_2976 hydN ascG FALSE 0.273 149.000 0.316 1.000 N NA
 5881019 5881020 EC55989_2977 EC55989_2978 ascF ascB TRUE 0.996 9.000 0.485 1.000 Y NA
 5881021 5881022 EC55989_2979 EC55989_2981     FALSE 0.014 245.000 0.000 1.000 N NA
 5881022 5881023 EC55989_2981 EC55989_2982     TRUE 0.902 5.000 0.000 NA   NA
 5881023 5881024 EC55989_2982 EC55989_2983   hycI TRUE 0.660 25.000 0.022 NA   NA
 5881024 5881025 EC55989_2983 EC55989_2984 hycI hycH TRUE 0.964 -7.000 0.360 NA   NA
 5881025 5881026 EC55989_2984 EC55989_2985 hycH hycG TRUE 0.957 -3.000 0.156 NA   NA
 5881026 5881027 EC55989_2985 EC55989_2986 hycG hycF TRUE 0.996 0.000 0.111 0.001 Y NA
 5881027 5881028 EC55989_2986 EC55989_2987 hycF hycE TRUE 0.995 10.000 0.200 0.001 Y NA
 5881028 5881029 EC55989_2987 EC55989_2988 hycE hycD TRUE 0.987 18.000 0.235 1.000 Y NA
 5881029 5881030 EC55989_2988 EC55989_2989 hycD hycC TRUE 0.996 3.000 0.382 1.000 Y NA
 5881030 5881031 EC55989_2989 EC55989_2990 hycC hycB TRUE 0.991 -3.000 0.154 1.000 Y NA
 5881031 5881032 EC55989_2990 EC55989_2991 hycB hycA FALSE 0.142 125.000 0.000 NA   NA
 5881033 5881034 EC55989_2993 EC55989_2994 hypA hypB TRUE 0.991 4.000 0.306 0.002   NA
 5881034 5881035 EC55989_2994 EC55989_2995 hypB hypC TRUE 0.972 -9.000 0.139 NA Y NA
 5881035 5881036 EC55989_2995 EC55989_2996 hypC hypD TRUE 0.984 0.000 0.021 NA Y NA
 5881036 5881037 EC55989_2996 EC55989_2997 hypD hypE TRUE 0.969 39.000 0.353 1.000 Y NA
 5881037 5881038 EC55989_2997 EC55989_2998 hypE fhlA FALSE 0.118 74.000 0.019 1.000 N NA
 5881040 5881041 EC55989_3000 EC55989_3001 mutS pphB FALSE 0.213 106.000 0.000 1.000   NA
 5881043 5881044 EC55989_3003 EC55989_3004 ygbJ ygbK TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5881044 5881045 EC55989_3004 EC55989_3005 ygbK ygbL TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5881045 5881046 EC55989_3005 EC55989_3006 ygbL ygbM TRUE 0.994 5.000 0.265 1.000 Y NA
 5881046 5881047 EC55989_3006 EC55989_3007 ygbM ygbN TRUE 0.761 89.000 0.143 1.000 Y NA
 5881048 5881049 EC55989_3008 EC55989_3009     TRUE 0.884 11.000 0.000 NA   NA
 5881049 5881050 EC55989_3009 EC55989_3010     TRUE 0.987 0.000 0.000 NA Y NA
 5881052 5881053 EC55989_3012 EC55989_3013 rpoS nlpD FALSE 0.440 63.000 0.142 1.000 N NA
 5881053 5881054 EC55989_3013 EC55989_3015 nlpD pcm FALSE 0.047 140.000 0.030 1.000 N NA
 5881054 5881055 EC55989_3015 EC55989_3016 pcm surE TRUE 0.973 -6.000 0.353 1.000   NA
 5881055 5881056 EC55989_3016 EC55989_3017 surE truD TRUE 0.887 -19.000 0.235 1.000   NA
 5881056 5881057 EC55989_3017 EC55989_3018 truD ispF TRUE 0.965 -3.000 0.173 1.000   NA
 5881057 5881058 EC55989_3018 EC55989_3019 ispF ispD TRUE 0.997 0.000 0.419 1.000 Y NA
 5881058 5881059 EC55989_3019 EC55989_3020 ispD ftsB TRUE 0.908 19.000 0.185 1.000 N NA
 5881059 5881060 EC55989_3020 EC55989_3022 ftsB ygbE FALSE 0.028 194.000 0.028 NA   NA
 5881060 5881061 EC55989_3022 EC55989_3023 ygbE cysC TRUE 0.682 50.000 0.198 NA   NA
 5881061 5881062 EC55989_3023 EC55989_3024 cysC cysN TRUE 0.996 0.000 0.340 1.000 Y NA
 5881062 5881063 EC55989_3024 EC55989_3025 cysN cysD TRUE 0.996 2.000 0.574 0.000 N NA
 5881065 5881066 EC55989_3027 EC55989_3028 ygbF ygbT TRUE 0.991 0.000 0.509 NA   NA
 5881066 5881067 EC55989_3028 EC55989_3029 ygbT   TRUE 0.991 -3.000 0.589 NA   NA
 5881067 5881068 EC55989_3029 EC55989_3030     TRUE 0.669 -156.000 0.282 NA   NA
 5881068 5881069 EC55989_3030 EC55989_3031     TRUE 0.992 11.000 0.780 NA   NA
 5881069 5881070 EC55989_3031 EC55989_3032     TRUE 0.967 12.000 0.276 NA   NA
 5881070 5881071 EC55989_3032 EC55989_3033     TRUE 0.982 -3.000 0.336 NA   NA
 5881071 5881072 EC55989_3033 EC55989_3034     TRUE 0.899 29.000 0.263 NA   NA
 5881072 5881073 EC55989_3034 EC55989_3035     FALSE 0.048 194.000 0.000 1.000   NA
 5881073 5881074 EC55989_3035 EC55989_3036   cysH FALSE 0.019 265.000 0.000 1.000   NA
 5881074 5881075 EC55989_3036 EC55989_3037 cysH cysI FALSE 0.336 74.000 0.116 1.000 N NA
 5881075 5881076 EC55989_3037 EC55989_3038 cysI cysJ TRUE 0.999 0.000 0.791 0.000 Y NA
 5881077 5881078 EC55989_3039 EC55989_3040 ygcM ygcN FALSE 0.102 78.000 0.014 1.000 N NA
 5881078 5881079 EC55989_3040 EC55989_3041 ygcN ygcO TRUE 0.950 -9.000 0.026 NA Y NA
 5881079 5881080 EC55989_3041 EC55989_3042 ygcO ygcP TRUE 0.569 17.000 0.026 NA N NA
 5881081 5881082 EC55989_3043 EC55989_3044 ygcQ ygcR TRUE 0.987 -3.000 0.102 NA Y NA
 5881082 5881083 EC55989_3044 EC55989_3045 ygcR ygcS TRUE 0.790 -22.000 0.182 1.000 N NA
 5881083 5881084 EC55989_3045 EC55989_3046 ygcS ygcU FALSE 0.462 94.000 0.250 1.000 N NA
 5881084 5881085 EC55989_3046 EC55989_3047 ygcU ygcW TRUE 0.844 70.000 0.500 0.024 N NA
 5881086 5881087 EC55989_3048 EC55989_3049 yqcE ygcE TRUE 0.583 27.000 0.058 NA N NA
 11524212 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2387.000 0.000 NA   NA
 11666575 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2387.000 0.000 NA   NA
 11808967 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2387.000 0.000 NA   NA
 11524213 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2354.000 0.000 NA   NA
 11666576 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2354.000 0.000 NA   NA
 11808968 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2354.000 0.000 NA   NA
 11524214 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2326.000 0.000 NA   NA
 11666577 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2326.000 0.000 NA   NA
 11808969 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2326.000 0.000 NA   NA
 11524215 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2293.000 0.000 NA   NA
 11666578 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2293.000 0.000 NA   NA
 11808970 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2293.000 0.000 NA   NA
 11524216 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2265.000 0.000 NA   NA
 11666579 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2265.000 0.000 NA   NA
 11808971 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2265.000 0.000 NA   NA
 11524217 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2232.000 0.000 NA   NA
 11666580 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2232.000 0.000 NA   NA
 11808972 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2232.000 0.000 NA   NA
 11524218 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2204.000 0.000 NA   NA
 11666581 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2204.000 0.000 NA   NA
 11808973 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2204.000 0.000 NA   NA
 11524219 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2171.000 0.000 NA   NA
 11666582 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2171.000 0.000 NA   NA
 11808974 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2171.000 0.000 NA   NA
 11524220 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2143.000 0.000 NA   NA
 11666583 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2143.000 0.000 NA   NA
 11808975 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2143.000 0.000 NA   NA
 11524221 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2110.000 0.000 NA   NA
 11666584 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2110.000 0.000 NA   NA
 11808976 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2110.000 0.000 NA   NA
 11524222 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2082.000 0.000 NA   NA
 11666585 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2082.000 0.000 NA   NA
 11808977 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2082.000 0.000 NA   NA
 11524223 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2049.000 0.000 NA   NA
 11666586 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2049.000 0.000 NA   NA
 11808978 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2049.000 0.000 NA   NA
 11524224 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2021.000 0.000 NA   NA
 11666587 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2021.000 0.000 NA   NA
 11808979 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 2021.000 0.000 NA   NA
 11524225 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1988.000 0.000 NA   NA
 11666588 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1988.000 0.000 NA   NA
 11808980 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1988.000 0.000 NA   NA
 11524226 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1960.000 0.000 NA   NA
 11666589 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1960.000 0.000 NA   NA
 11808981 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1960.000 0.000 NA   NA
 11524227 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1927.000 0.000 NA   NA
 11666590 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1927.000 0.000 NA   NA
 11808982 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1927.000 0.000 NA   NA
 11524228 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1899.000 0.000 NA   NA
 11666591 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1899.000 0.000 NA   NA
 11808983 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1899.000 0.000 NA   NA
 11524229 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1866.000 0.000 NA   NA
 11666592 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1866.000 0.000 NA   NA
 11808984 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1866.000 0.000 NA   NA
 11524230 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1838.000 0.000 NA   NA
 11666593 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1838.000 0.000 NA   NA
 11808985 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1838.000 0.000 NA   NA
 11524231 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1805.000 0.000 NA   NA
 11666594 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1805.000 0.000 NA   NA
 11808986 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1805.000 0.000 NA   NA
 11524232 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1777.000 0.000 NA   NA
 11666595 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1777.000 0.000 NA   NA
 11808987 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1777.000 0.000 NA   NA
 11524233 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1744.000 0.000 NA   NA
 11666596 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1744.000 0.000 NA   NA
 11808988 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1744.000 0.000 NA   NA
 11524234 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1716.000 0.000 NA   NA
 11666597 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1716.000 0.000 NA   NA
 11808989 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1716.000 0.000 NA   NA
 11524235 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1683.000 0.000 NA   NA
 11666598 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1683.000 0.000 NA   NA
 11808990 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1683.000 0.000 NA   NA
 11524236 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1655.000 0.000 NA   NA
 11666599 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1655.000 0.000 NA   NA
 11808991 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1655.000 0.000 NA   NA
 11524237 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1622.000 0.000 NA   NA
 11666600 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1622.000 0.000 NA   NA
 11808992 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1622.000 0.000 NA   NA
 11524238 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1594.000 0.000 NA   NA
 11666601 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1594.000 0.000 NA   NA
 11808993 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1594.000 0.000 NA   NA
 11524239 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1561.000 0.000 NA   NA
 11666602 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1561.000 0.000 NA   NA
 11808994 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1561.000 0.000 NA   NA
 11524240 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1533.000 0.000 NA   NA
 11666603 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1533.000 0.000 NA   NA
 11808995 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1533.000 0.000 NA   NA
 11524241 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1500.000 0.000 NA   NA
 11666604 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1500.000 0.000 NA   NA
 11808996 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1500.000 0.000 NA   NA
 11524242 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1472.000 0.000 NA   NA
 11666605 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1472.000 0.000 NA   NA
 11808997 5881089   EC55989_3052   ygcG FALSE NA 1472.000 0.000 NA   NA
 5881089 5881090 EC55989_3052 EC55989_3053 ygcG   FALSE 0.308 -190.000 0.000 NA   NA
 5881091 5881092 EC55989_3054 EC55989_3055 eno pyrG FALSE 0.197 88.000 0.068 1.000 N NA
 5881092 5881093 EC55989_3055 EC55989_3056 pyrG mazG FALSE 0.020 228.000 0.025 1.000   NA
 5881093 5881094 EC55989_3056 EC55989_3057 mazG chpA FALSE 0.334 71.000 0.000 1.000   NA
 5881094 5881095 EC55989_3057 EC55989_3058 chpA chpR TRUE 0.998 0.000 0.531 NA Y NA
 5881095 5881096 EC55989_3058 EC55989_3059 chpR relA TRUE 0.688 78.000 0.000 NA Y NA
 5881096 5881097 EC55989_3059 EC55989_3060 relA rumA FALSE 0.443 48.000 0.082 1.000 N NA
 5881098 5881099 EC55989_3061 EC55989_3062 barA   TRUE 0.690 29.000 0.000 NA   NA
 5881099 5881100 EC55989_3062 EC55989_3063     TRUE 0.899 -81.000 0.000 0.022 Y NA
 5881100 5881101 EC55989_3063 EC55989_3064   barA TRUE 0.540 42.000 0.000 NA   NA
 5881102 5881103 EC55989_3065 EC55989_3066 gudD gudX TRUE 0.804 21.000 0.000 NA   NA
 5881103 5881104 EC55989_3066 EC55989_3067 gudX gudX TRUE 0.896 7.000 0.000 NA   NA
 5881104 5881105 EC55989_3067 EC55989_3068 gudX gudP TRUE 0.920 2.000 0.000 NA   NA
 5881105 5881106 EC55989_3068 EC55989_3069 gudP yqcA FALSE 0.004 435.000 0.000 1.000 N NA
 5881106 5881107 EC55989_3069 EC55989_3070 yqcA truC TRUE 0.922 18.000 0.209 1.000 N NA
 5881107 5881108 EC55989_3070 EC55989_3071 truC yqcC TRUE 0.991 0.000 0.518 NA   NA
 5881108 5881109 EC55989_3071 EC55989_misc_RNA_65 yqcC csrB FALSE 0.442 49.000 0.000 NA   NA
 5881109 5881110 EC55989_misc_RNA_65 EC55989_3072 csrB syd FALSE 0.027 218.000 0.000 NA   NA
 5881111 5881112 EC55989_3073 EC55989_3074 queF ygdH FALSE 0.203 112.000 0.079 NA   NA
 5881112 5881113 EC55989_3074 EC55989_3075 ygdH sdaC FALSE 0.005 557.000 0.000 NA   NA
 5881113 5881114 EC55989_3075 EC55989_3076 sdaC sdaB TRUE 0.793 58.000 0.000 1.000 Y NA
 5881114 5881115 EC55989_3076 EC55989_3077 sdaB exo TRUE 0.721 22.000 0.000 1.000 N NA
 5881116 5881117 EC55989_3078 EC55989_3079 fucO fucA TRUE 0.697 25.000 0.066 1.000 N NA
 5881118 5881119 EC55989_3080 EC55989_3081 fucP fucI TRUE 0.934 33.000 0.104 NA Y NA
 5881119 5881120 EC55989_3081 EC55989_3082 fucI fucK TRUE 0.858 79.000 0.269 1.000 Y NA
 5881120 5881121 EC55989_3082 EC55989_3083 fucK fucU TRUE 0.994 2.000 0.211 1.000 Y NA
 5881121 5881122 EC55989_3083 EC55989_3084 fucU fucR TRUE 0.917 58.000 0.308 1.000 Y NA
 5881123 5881124 EC55989_3085 EC55989_3086 ygdE ygdD TRUE 0.904 -7.000 0.144 NA   NA
 5881124 5881125 EC55989_3086 EC55989_3087 ygdD gcvA TRUE 0.857 19.000 0.081 NA   NA
 5881128 5881129 EC55989_3089 EC55989_3090 csdA ygdK TRUE 0.985 0.000 0.122 0.001   NA
 5881130 5881131 EC55989_3091 EC55989_3092 ygdL mltA FALSE 0.098 77.000 0.009 1.000 N NA
 5881132 5881133 EC55989_tRNA31 EC55989_tRNA32     TRUE 0.630 34.000 0.000 NA   NA
 5881133 5881134 EC55989_tRNA32 EC55989_tRNA33     TRUE 0.639 33.000 0.000 NA   NA
 5881137 5881138 EC55989_3095 EC55989_3096 recD recB TRUE 0.999 0.000 0.688 0.001 Y NA
 5881138 5881139 EC55989_3096 EC55989_3097 recB ptr TRUE 0.827 -7.000 0.092 1.000 N NA
 5881139 5881140 EC55989_3097 EC55989_3098 ptr recC FALSE 0.057 176.000 0.092 1.000 N NA
 5881140 5881141 EC55989_3098 EC55989_3099 recC ppdC TRUE 0.821 13.000 0.076 NA N NA
 5881141 5881142 EC55989_3099 EC55989_3100 ppdC ygdB TRUE 0.961 -15.000 0.538 NA   NA
 5881142 5881143 EC55989_3100 EC55989_3101 ygdB ppdB TRUE 0.984 -3.000 0.373 NA   NA
 5881143 5881144 EC55989_3101 EC55989_3102 ppdB ppdA TRUE 0.988 -9.000 0.368 NA Y NA
 5881144 5881145 EC55989_3102 EC55989_3103 ppdA thyA FALSE 0.009 185.000 0.016 NA N NA
 5881145 5881146 EC55989_3103 EC55989_3104 thyA lgt TRUE 0.941 7.000 0.164 1.000 N NA
 5881146 5881147 EC55989_3104 EC55989_3105 lgt ptsP FALSE 0.056 151.000 0.000 1.000 N NA
 5881147 5881148 EC55989_3105 EC55989_3106 ptsP nudH TRUE 0.655 13.000 0.008 1.000 N NA
 5881149 5881150 EC55989_3107 EC55989_3108 mutH ygdQ FALSE 0.216 69.000 0.052 1.000 N NA
 5881150 5881151 EC55989_3108 EC55989_3109 ygdQ ygdR TRUE 0.468 138.000 0.429 NA   NA
 5881151 5881152 EC55989_3109 EC55989_3110 ygdR tas FALSE 0.154 108.000 0.043 NA   NA
 5881153 5881154 EC55989_3111 EC55989_3112 ygeD aas TRUE 0.891 -7.000 0.124 NA   NA
 5881154 5881155 EC55989_3112 EC55989_misc_RNA_67 aas omrA FALSE 0.237 88.000 0.000 NA   NA
 5881155 5881156 EC55989_misc_RNA_67 EC55989_misc_RNA_68 omrA omrB FALSE 0.161 116.000 0.000 NA   NA
 5881160 5881161 EC55989_3117 EC55989_3118 ygeA araE FALSE 0.043 129.000 0.011 1.000 N NA
 5881161 5881162 EC55989_3118 EC55989_3119 araE kduD FALSE 0.008 315.000 0.000 1.000 N NA
 5881162 5881163 EC55989_3119 EC55989_3120 kduD kduI TRUE 0.876 30.000 0.269 1.000 N NA
 5881163 5881164 EC55989_3120 EC55989_3121 kduI yqeF FALSE 0.009 287.000 0.000 1.000 N NA
 5881165 5881166 EC55989_3122 EC55989_3123 yqeG yqeH FALSE 0.007 460.000 0.000 1.000   NA
 5881166 5881167 EC55989_3123 EC55989_3124 yqeH yqeI FALSE 0.023 334.000 0.000 0.062   NA
 5881167 5881168 EC55989_3124 EC55989_3125 yqeI yqeJ TRUE 0.968 -7.000 0.400 NA   NA
 5881170 5881171 EC55989_3127 EC55989_3128 ygeF ygeG FALSE 0.014 278.000 0.000 NA   NA
 5881171 5881172 EC55989_3128 EC55989_3129 ygeG ygeH FALSE 0.011 335.000 0.000 1.000   NA
 5881172 5881173 EC55989_3129 EC55989_3130 ygeH ygeI FALSE 0.061 168.000 0.000 NA   NA
 5881173 5881174 EC55989_3130 EC55989_3132 ygeI   FALSE 0.249 83.000 0.000 NA   NA
 5881175 5881176 EC55989_3133 EC55989_3134     TRUE 0.661 31.000 0.000 NA   NA
 5881176 5881177 EC55989_3134 EC55989_3135   ygeM FALSE 0.025 221.000 0.000 NA   NA
 5881177 5881178 EC55989_3135 EC55989_3136 ygeM   FALSE 0.027 217.000 0.000 NA   NA
 5881178 5881179 EC55989_3136 EC55989_3137   eprK TRUE 0.969 16.000 0.333 1.000   NA
 5881179 5881180 EC55989_3137 EC55989_3138 eprK   TRUE 0.555 41.000 0.000 NA   NA
 5881180 5881181 EC55989_3138 EC55989_3139   eprI FALSE 0.053 177.000 0.000 NA   NA
 5881181 5881182 EC55989_3139 EC55989_3140 eprI eprH TRUE 0.988 14.000 0.667 NA   NA
 5881183 5881184 EC55989_3141 EC55989_3142     TRUE 0.932 2.000 0.000 1.000   NA
 5881185 5881186 EC55989_3143 EC55989_3144 spaS spaS TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5881186 5881187 EC55989_3144 EC55989_3145 spaS spaS FALSE 0.287 73.000 0.000 NA   NA
 5881187 5881188 EC55989_3145 EC55989_3146 spaS   TRUE 0.893 9.000 0.000 NA   NA
 5881188 5881189 EC55989_3146 EC55989_3147   spaQ TRUE 0.920 2.000 0.000 NA   NA
 5881189 5881190 EC55989_3147 EC55989_3148 spaQ   TRUE 0.890 10.000 0.000 NA   NA
 5881190 5881191 EC55989_3148 EC55989_3149   epaO FALSE 0.406 -85.000 0.000 NA   NA
 5881191 5881192 EC55989_3149 EC55989_3150 epaO epaO TRUE 0.890 10.000 0.000 NA   NA
 5881192 5881193 EC55989_3150 EC55989_3151 epaO   FALSE 0.122 132.000 0.000 NA   NA
 5881193 5881194 EC55989_3151 EC55989_tRNA66     FALSE 0.041 192.000 0.000 NA   NA
 5881194 5881195 EC55989_tRNA66 EC55989_3152   ygeR FALSE 0.259 79.000 0.000 NA   NA
 5881196 5881197 EC55989_3153 EC55989_3154 xdhA xdhB TRUE 0.998 11.000 0.500 0.001 Y NA
 5881197 5881198 EC55989_3154 EC55989_3155 xdhB xdhC TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.038 Y NA
 5881200 5881201 EC55989_3157 EC55989_3158 ygeW ygeX TRUE 0.906 58.000 0.265 1.000 Y NA
 5881201 5881202 EC55989_3158 EC55989_3159 ygeX ygeY TRUE 0.878 58.000 0.188 1.000 Y NA
 5881202 5881203 EC55989_3159 EC55989_3160 ygeY hyuA FALSE 0.285 53.000 0.050 1.000 N NA
 5881203 5881204 EC55989_3160 EC55989_3161 hyuA yqeA FALSE 0.267 48.000 0.031 1.000 N NA
 5881205 5881206 EC55989_3162 EC55989_3163 yqeB yqeC TRUE 0.595 48.000 0.119 NA   NA
 5881207 5881208 EC55989_3164 EC55989_3165 ygfJ ygfK FALSE 0.010 322.000 0.000 NA   NA
 5881208 5881209 EC55989_3165 EC55989_3166 ygfK ssnA TRUE 0.986 3.000 0.443 1.000 N NA
 5881209 5881210 EC55989_3166 EC55989_3167 ssnA ygfM FALSE 0.354 51.000 0.066 1.000 N NA
 5881210 5881211 EC55989_3167 EC55989_3168 ygfM xdhD TRUE 0.999 -3.000 0.800 0.024 Y NA
 5881211 5881212 EC55989_3168 EC55989_3169 xdhD ygfO FALSE 0.045 165.000 0.000 1.000 N NA
 5881212 5881213 EC55989_3169 EC55989_3170 ygfO guaD TRUE 0.975 15.000 0.000 1.000 Y NA
 5881213 5881214 EC55989_3170 EC55989_3171 guaD ygfQ TRUE 0.653 36.000 0.000 1.000   NA
 5881215 5881216 EC55989_3172 EC55989_3173 ygfS ygfT TRUE 0.990 0.000 0.333 0.010 N NA
 5881217 5881218 EC55989_3174 EC55989_3175 ygfU idi FALSE 0.013 250.000 0.000 1.000 N NA
 5881219 5881220 EC55989_3176 EC55989_3177 lysS prfB TRUE 0.993 10.000 0.162 0.034 Y NA
 5881220 5881221 EC55989_3177 EC55989_3178 prfB recJ FALSE 0.108 91.000 0.028 1.000 N NA
 5881221 5881222 EC55989_3178 EC55989_3179 recJ dsbC TRUE 0.894 6.000 0.082 1.000 N NA
 5881222 5881223 EC55989_3179 EC55989_3180 dsbC xerD TRUE 0.732 25.000 0.079 1.000 N NA
 5881225 5881226 EC55989_3182 EC55989_3183 ygfX ygfY TRUE 0.677 -19.000 0.061 NA   NA
 5881227 5881228 EC55989_3184 EC55989_3185 ygfZ   FALSE 0.022 253.000 0.000 1.000   NA
 5881229 5881230 EC55989_3186 EC55989_3187 yqfA yqfB FALSE 0.106 164.000 0.113 NA   NA
 5881232 5881233 EC55989_3189 EC55989_3190 ygfF gcvP FALSE 0.005 261.000 0.006 1.000 N NA
 5881233 5881234 EC55989_3190 EC55989_3191 gcvP gcvH TRUE 0.743 119.000 0.249 1.000 Y NA
 5881234 5881235 EC55989_3191 EC55989_3192 gcvH gcvT TRUE 0.993 24.000 0.317 0.001 Y NA
 5881235 5881236 EC55989_3192 EC55989_3194 gcvT visC FALSE 0.002 448.000 0.004 1.000 N NA
 5881236 5881237 EC55989_3194 EC55989_3195 visC ubiH TRUE 0.996 23.000 0.474 0.001 Y NA
 5881237 5881238 EC55989_3195 EC55989_3196 ubiH pepP TRUE 0.797 -3.000 0.026 1.000 N NA
 5881238 5881239 EC55989_3196 EC55989_3197 pepP ygfB TRUE 0.681 26.000 0.036 NA   NA
 5881240 5881241 EC55989_3198 EC55989_misc_RNA_69 zapA ssrS TRUE 0.540 42.000 0.000 NA   NA
 5881241 5881242 EC55989_misc_RNA_69 EC55989_3199 ssrS ygfA FALSE 0.271 76.000 0.000 NA   NA
 5881242 5881243 EC55989_3199 EC55989_misc_RNA_71 ygfA rygC TRUE 0.736 26.000 0.000 NA   NA
 5881243 5881244 EC55989_misc_RNA_71 EC55989_misc_RNA_70 rygC rygD FALSE 0.330 -148.000 0.000 NA   NA
 5881245 5881246 EC55989_3200 EC55989_3202 serA rpiA FALSE 0.007 256.000 0.029 1.000 N NA
 5881247 5881248 EC55989_3203 EC55989_3204 argP yliK FALSE 0.048 183.000 0.000 NA   NA
 5881248 5881249 EC55989_3204 EC55989_3205 yliK yliK FALSE 0.169 112.000 0.000 NA   NA
 5881249 5881250 EC55989_3205 EC55989_3206 yliK argK TRUE 0.819 -7.000 0.000 NA   NA
 5881250 5881251 EC55989_3206 EC55989_3207 argK ygfG TRUE 0.713 11.000 0.015 1.000 N NA
 5881251 5881252 EC55989_3207 EC55989_3208 ygfG ygfH TRUE 0.765 24.000 0.085 1.000 N NA
 5881253 5881254 EC55989_3209 EC55989_3210 ygfI yggE FALSE 0.049 167.000 0.037 NA   NA
 5881254 5881255 EC55989_3210 EC55989_3211 yggE argO FALSE 0.259 93.000 0.075 NA   NA
 5881255 5881256 EC55989_3211 EC55989_3212 argO mscS FALSE 0.115 139.000 0.049 1.000   NA
 5881256 5881257 EC55989_3212 EC55989_3213 mscS fbaA FALSE 0.004 358.000 0.038 1.000 N NA
 5881257 5881258 EC55989_3213 EC55989_3214 fbaA pgk FALSE 0.271 215.000 0.056 0.005 Y NA
 5881258 5881259 EC55989_3214 EC55989_3215 pgk epd TRUE 0.913 50.000 0.070 0.005 Y NA
 5881260 5881261 EC55989_3216 EC55989_3217     TRUE 0.571 -76.000 0.103 NA   NA
 5881261 5881262 EC55989_3217 EC55989_3218     TRUE 0.993 1.000 0.605 NA   NA
 5881262 5881263 EC55989_3218 EC55989_3219     TRUE 0.942 -18.000 0.093 NA Y NA
 5881263 5881264 EC55989_3219 EC55989_3220     TRUE 0.968 -39.000 0.214 0.012 Y NA
 5881265 5881266 EC55989_3221 EC55989_3222 yggC yggD TRUE 0.988 -3.000 0.588 NA N NA
 5881266 5881267 EC55989_3222 EC55989_3223 yggD yggF TRUE 0.967 22.000 0.545 NA N NA
 5881267 5881268 EC55989_3223 EC55989_3224 yggF yggP TRUE 0.986 -3.000 0.500 1.000 N NA
 5881268 5881269 EC55989_3224 EC55989_3225 yggP cmtA TRUE 0.974 15.000 0.458 1.000 N NA
 5881269 5881270 EC55989_3225 EC55989_3226 cmtA cmtB TRUE 0.986 28.000 0.250 0.010 Y NA
 5881270 5881271 EC55989_3226 EC55989_3227 cmtB tktA FALSE 0.071 314.000 0.000 1.000 Y NA
 5881273 5881274 EC55989_3229 EC55989_3230 speB   FALSE 0.112 136.000 0.000 NA   NA
 5881274 5881275 EC55989_3230 EC55989_3231   speA FALSE 0.091 146.000 0.000 NA   NA
 5881275 5881276 EC55989_3231 EC55989_3232 speA yqgB TRUE 0.893 9.000 0.000 NA   NA
 5881279 5881280 EC55989_3235 EC55989_3236 metK galP FALSE 0.004 436.000 0.000 1.000 N NA
 5881280 5881281 EC55989_3236 EC55989_3237 galP sprT FALSE 0.232 77.000 0.042 NA   NA
 5881281 5881282 EC55989_3237 EC55989_3238 sprT endA FALSE 0.451 95.000 0.210 NA   NA
 5881282 5881283 EC55989_3238 EC55989_3239 endA yggJ TRUE 0.500 80.000 0.201 NA   NA
 5881283 5881284 EC55989_3239 EC55989_3240 yggJ gshB TRUE 0.942 13.000 0.173 NA   NA
 5881284 5881285 EC55989_3240 EC55989_3241 gshB yqgE FALSE 0.195 109.000 0.120 NA N NA
 5881285 5881286 EC55989_3241 EC55989_3242 yqgE yqgF TRUE 0.972 0.000 0.263 NA N NA
 5881288 5881289 EC55989_3244 EC55989_3245 yggS yggT TRUE 0.931 18.000 0.189 NA   NA
 5881289 5881290 EC55989_3245 EC55989_3246 yggT yggU TRUE 0.928 -3.000 0.081 NA   NA
 5881290 5881291 EC55989_3246 EC55989_3247 yggU yggV TRUE 0.833 8.000 0.016 NA   NA
 5881291 5881292 EC55989_3247 EC55989_3248 yggV yggW TRUE 0.921 -7.000 0.218 1.000 N NA
 5881293 5881294 EC55989_3249 EC55989_3250 yggM ansB FALSE 0.102 117.000 0.018 NA   NA
 5881294 5881295 EC55989_3250 EC55989_3251 ansB yggN FALSE 0.037 176.000 0.027 NA   NA
 5881295 5881296 EC55989_3251 EC55989_3252 yggN yggL FALSE 0.097 184.000 0.155 NA   NA
 5881296 5881297 EC55989_3252 EC55989_3253 yggL yggH TRUE 0.946 0.000 0.092 NA   NA
 5881298 5881299 EC55989_3254 EC55989_3255 mutY yggX TRUE 0.776 28.000 0.150 NA N NA
 5881299 5881300 EC55989_3255 EC55989_3256 yggX mltC FALSE 0.367 65.000 0.128 NA N NA
 5881300 5881301 EC55989_3256 EC55989_3257 mltC nupG FALSE 0.034 202.000 0.056 NA   NA
 5881303 5881304 EC55989_3259 EC55989_tRNA34 yqgA   FALSE 0.184 106.000 0.000 NA   NA
 5881304 5881305 EC55989_tRNA34 EC55989_3260   int FALSE 0.037 198.000 0.000 NA   NA
 5881305 5881306 EC55989_3260 EC55989_3261 int   FALSE 0.006 478.000 0.000 NA   NA
 5881307 5881308 EC55989_misc_RNA_72 EC55989_3262 RNAII   FALSE 0.300 70.000 0.000 NA   NA
 5881308 5881309 EC55989_3262 EC55989_3263     TRUE 0.477 -72.000 0.000 NA   NA
 5881310 5881311 EC55989_3265 EC55989_3266     TRUE 0.965 2.000 0.000 0.070   NA
 5881311 5881312 EC55989_3266 EC55989_3267     TRUE 0.965 10.000 0.212 1.000   NA
 5881312 5881313 EC55989_3267 EC55989_3268     TRUE 0.906 10.000 0.000 1.000   NA
 5881313 5881314 EC55989_3268 EC55989_3269     TRUE 0.994 3.000 0.129 0.064 Y NA
 5881314 5881315 EC55989_3269 EC55989_3270     FALSE 0.234 89.000 0.000 NA   NA
 5881315 5881316 EC55989_3270 EC55989_3271     TRUE 0.630 34.000 0.000 NA   NA
 5881318 5881319 EC55989_misc_RNA_73 EC55989_3273 RNAC   FALSE 0.005 634.000 0.000 NA   NA
 5881320 5881321 EC55989_3274 EC55989_3275     TRUE 0.923 31.000 0.000 NA Y NA
 5881321 5881322 EC55989_3275 EC55989_3276     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA Y NA
 5881323 5881324 EC55989_3277 EC55989_3278     FALSE 0.334 63.000 0.000 NA   NA
 5881325 5881326 EC55989_3279 EC55989_3280     FALSE 0.006 462.000 0.000 NA   NA
 5881326 5881327 EC55989_3280 EC55989_misc_RNA_74     FALSE 0.334 63.000 0.000 NA   NA
 5881327 5881328 EC55989_misc_RNA_74 EC55989_3281     TRUE 0.909 4.000 0.000 NA   NA
 5881328 5881329 EC55989_3281 EC55989_3282     FALSE 0.005 592.000 0.000 NA   NA
 5881329 5881330 EC55989_3282 EC55989_3283     FALSE 0.006 428.000 0.000 NA   NA
 5881330 5881331 EC55989_3283 EC55989_3284     TRUE 0.898 4.000 0.047 NA   NA
 5881331 5881332 EC55989_3284 EC55989_3285     TRUE 0.901 -3.000 0.050 NA   NA
 5881332 5881333 EC55989_3285 EC55989_3286     TRUE 0.714 -15.000 0.000 NA   NA
 5881333 5881334 EC55989_3286 EC55989_3287     TRUE 0.705 28.000 0.000 NA   NA
 5881334 5881335 EC55989_3287 EC55989_3288     TRUE 0.989 1.000 0.465 NA   NA
 5881335 5881336 EC55989_3288 EC55989_3289     TRUE 0.905 5.000 0.059 NA   NA
 5881336 5881337 EC55989_3289 EC55989_3290     TRUE 0.911 4.000 0.059 NA   NA
 5881337 5881338 EC55989_3290 EC55989_3291     TRUE 0.909 4.000 0.000 NA   NA
 5881338 5881339 EC55989_3291 EC55989_3292     TRUE 0.884 11.000 0.000 NA   NA
 5881339 5881340 EC55989_3292 EC55989_3293     TRUE 0.968 13.000 0.300 NA   NA
 5881340 5881341 EC55989_3293 EC55989_3294     TRUE 0.859 -36.000 0.300 NA   NA
 5881341 5881342 EC55989_3294 EC55989_3295     TRUE 0.984 -7.000 0.667 NA   NA
 5881342 5881343 EC55989_3295 EC55989_3296     TRUE 0.890 10.000 0.000 NA   NA
 5881343 5881344 EC55989_3296 EC55989_3297     TRUE 0.890 10.000 0.000 NA   NA
 5881344 5881345 EC55989_3297 EC55989_3298     TRUE 0.995 3.000 0.920 NA   NA
 5881345 5881346 EC55989_3298 EC55989_misc_RNA_75   RNAout FALSE 0.007 386.000 0.000 NA   NA
 5881347 5881348 EC55989_3299 EC55989_3300     FALSE 0.256 80.000 0.000 NA   NA
 5881348 5881349 EC55989_3300 EC55989_3302     FALSE 0.022 236.000 0.000 NA   NA
 5881349 5881350 EC55989_3302 EC55989_3303     FALSE 0.389 54.000 0.000 NA   NA
 5881351 5881352 EC55989_3305 EC55989_3306     FALSE 0.356 -106.000 0.000 NA   NA
 5881353 5881354 EC55989_3307 EC55989_3308     FALSE 0.315 -174.000 0.000 NA   NA
 5881355 5881356 EC55989_3309 EC55989_3310     FALSE 0.318 66.000 0.000 NA   NA
 5881356 5881357 EC55989_3310 EC55989_3311     TRUE 0.804 21.000 0.000 NA   NA
 5881357 5881358 EC55989_3311 EC55989_3312   ibrB TRUE 0.566 40.000 0.000 NA   NA
 5881358 5881359 EC55989_3312 EC55989_3313 ibrB ibrA TRUE 0.750 -15.000 0.000 1.000   NA
 5881359 5881360 EC55989_3313 EC55989_3314 ibrA   TRUE 0.555 41.000 0.000 NA   NA
 5881360 5881361 EC55989_3314 EC55989_3315     FALSE 0.004 778.000 0.000 NA   NA
 5881361 5881362 EC55989_3315 EC55989_3316     FALSE 0.006 425.000 0.000 NA   NA
 5881362 5881363 EC55989_3316 EC55989_3317     FALSE 0.040 194.000 0.000 NA   NA
 5881363 5881364 EC55989_3317 EC55989_3318     FALSE 0.022 233.000 0.000 NA   NA
 5881364 5881365 EC55989_3318 EC55989_3319     FALSE 0.093 145.000 0.000 NA   NA
 5881365 5881366 EC55989_3319 EC55989_3320     TRUE 0.991 0.000 0.500 NA   NA
 5881366 5881367 EC55989_3320 EC55989_3321     TRUE 0.969 -19.000 0.750 NA   NA
 5881367 5881368 EC55989_3321 EC55989_3322     TRUE 0.956 -45.000 0.857 NA   NA
 5881368 5881369 EC55989_3322 EC55989_3323     TRUE 0.894 8.000 0.000 NA   NA
 5881369 5881370 EC55989_3323 EC55989_3324     FALSE 0.363 -103.000 0.000 NA   NA
 5881370 5881371 EC55989_3324 EC55989_3325     TRUE 0.949 0.000 0.100 NA   NA
 5881371 5881372 EC55989_3325 EC55989_3326     TRUE 0.970 -7.000 0.429 NA   NA
 5881372 5881373 EC55989_3326 EC55989_3327     TRUE 0.993 4.000 0.667 NA   NA
 5881373 5881374 EC55989_3327 EC55989_3328     TRUE 0.859 32.000 0.222 NA   NA
 5881374 5881375 EC55989_3328 EC55989_3329     FALSE 0.442 144.000 0.444 NA   NA
 5881375 5881376 EC55989_3329 EC55989_3330     TRUE 0.814 20.000 0.000 NA   NA
 5881376 5881377 EC55989_3330 EC55989_3331     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5881377 5881378 EC55989_3331 EC55989_3333     FALSE 0.005 523.000 0.000 NA   NA
 5881378 5881379 EC55989_3333 EC55989_3334     TRUE 0.896 -12.000 0.208 NA   NA
 5881379 5881380 EC55989_3334 EC55989_3335     FALSE 0.121 160.000 0.125 NA   NA
 5881380 5881381 EC55989_3335 EC55989_3336     TRUE 0.979 6.000 0.333 NA   NA
 5881381 5881382 EC55989_3336 EC55989_3337     TRUE 0.921 -93.000 0.857 NA   NA
 5881382 5881383 EC55989_3337 EC55989_3338     TRUE 0.955 -69.000 1.000 NA   NA
 5881383 5881384 EC55989_3338 EC55989_3339     TRUE 0.959 16.000 0.286 NA   NA
 5881384 5881385 EC55989_3339 EC55989_3340     TRUE 0.983 22.000 0.750 NA   NA
 5881387 5881388 EC55989_3343 EC55989_3344     TRUE 0.989 21.000 1.000 NA   NA
 5881388 5881389 EC55989_3344 EC55989_3345     FALSE 0.015 273.000 0.000 NA   NA
 5881389 5881390 EC55989_3345 EC55989_3346     TRUE 0.502 -64.000 0.000 NA   NA
 5881390 5881391 EC55989_3346 EC55989_3348     FALSE 0.068 162.000 0.000 NA   NA
 5881393 5881394 EC55989_3350 EC55989_3351     FALSE 0.063 167.000 0.000 NA   NA
 5881395 5881396 EC55989_3352 EC55989_3353     FALSE 0.352 59.000 0.000 NA   NA
 5881398 5881399 EC55989_3355 EC55989_3356     TRUE 0.785 71.000 0.500 NA   NA
 5881399 5881400 EC55989_3356 EC55989_misc_RNA_76   isrC FALSE 0.199 100.000 0.000 NA   NA
 5881400 5881401 EC55989_misc_RNA_76 EC55989_3357 isrC flu TRUE 0.779 23.000 0.000 NA   NA
 5881401 5881402 EC55989_3357 EC55989_3358 flu   FALSE 0.163 115.000 0.000 NA   NA
 5881402 5881403 EC55989_3358 EC55989_3359     FALSE 0.271 76.000 0.000 NA   NA
 5881403 5881404 EC55989_3359 EC55989_3360     FALSE 0.259 79.000 0.000 NA   NA
 5881404 5881405 EC55989_3360 EC55989_3361     FALSE 0.199 100.000 0.000 NA   NA
 5881405 5881406 EC55989_3361 EC55989_3362     FALSE 0.012 302.000 0.000 NA   NA
 5881406 5881407 EC55989_3362 EC55989_3363   yeeS TRUE 0.478 46.000 0.000 NA   NA
 5881407 5881408 EC55989_3363 EC55989_3364 yeeS yeeT FALSE 0.239 87.000 0.000 NA   NA
 5881408 5881409 EC55989_3364 EC55989_3365 yeeT yeeU FALSE 0.256 80.000 0.000 NA   NA
 5881409 5881410 EC55989_3365 EC55989_3366 yeeU yeeV TRUE 0.522 -58.000 0.000 NA   NA
 5881410 5881411 EC55989_3366 EC55989_3367 yeeV yeeW TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5881411 5881412 EC55989_3367 EC55989_3368 yeeW   FALSE 0.244 85.000 0.000 NA   NA
 5881413 5881414 EC55989_3369 EC55989_3370 yghD yghE TRUE 0.999 2.000 0.811 1.000 Y NA
 5881414 5881415 EC55989_3370 EC55989_3371 yghE   TRUE 0.998 -3.000 0.537 0.064 Y NA
 5881415 5881416 EC55989_3371 EC55989_3372     TRUE 0.997 3.000 0.461 1.000 Y NA
 5881416 5881417 EC55989_3372 EC55989_3373     TRUE 0.996 -3.000 0.569 0.002   NA
 5881417 5881418 EC55989_3373 EC55989_3374     TRUE 0.996 -3.000 0.605 0.002   NA
 5881418 5881419 EC55989_3374 EC55989_3375     TRUE 0.994 4.000 0.425 0.002   NA
 5881419 5881420 EC55989_3375 EC55989_3376   epsF TRUE 0.996 -10.000 0.599 0.002 Y NA
 5881420 5881421 EC55989_3376 EC55989_3377 epsF epsE TRUE 0.999 0.000 0.653 0.002 Y NA
 5881421 5881422 EC55989_3377 EC55989_3378 epsE epsD TRUE 0.999 0.000 0.776 0.002 Y NA
 5881422 5881423 EC55989_3378 EC55989_3379 epsD yghF TRUE 0.994 30.000 0.575 0.002 Y NA
 5881423 5881424 EC55989_3379 EC55989_3380 yghF yghG TRUE 0.829 18.000 0.000 NA   NA
 5881424 5881425 EC55989_3380 EC55989_3381 yghG pppA FALSE 0.318 66.000 0.000 NA   NA
 5881425 5881426 EC55989_3381 EC55989_3382 pppA yghJ FALSE 0.103 140.000 0.000 NA   NA
 5881428 5881429 EC55989_3384 EC55989_3385 yghK glcB FALSE 0.054 356.000 0.000 1.000 Y NA
 5881429 5881430 EC55989_3385 EC55989_3386 glcB glcG TRUE 0.781 22.000 0.052 NA   NA
 5881430 5881431 EC55989_3386 EC55989_3387 glcG glcF TRUE 0.903 5.000 0.057 NA   NA
 5881431 5881432 EC55989_3387 EC55989_3388 glcF glcE TRUE 0.990 11.000 0.074 0.023 Y NA
 5881432 5881433 EC55989_3388 EC55989_3389 glcE glcD TRUE 0.994 0.000 0.070 0.006 Y NA
 5881435 5881436 EC55989_3391 EC55989_3392   insA TRUE 0.899 -81.000 0.000 0.021 Y NA
 5881437 5881438 EC55989_3393 EC55989_3394     TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5881439 5881440 EC55989_3395 EC55989_3396     TRUE 0.934 -84.000 0.631 0.064   NA
 5881440 5881441 EC55989_3396 EC55989_3397     TRUE 0.661 31.000 0.000 NA   NA
 5881441 5881442 EC55989_3397 EC55989_3398     TRUE 0.893 9.000 0.000 NA   NA
 5881442 5881443 EC55989_3398 EC55989_3399     TRUE 0.994 0.000 0.667 NA   NA
 5881443 5881444 EC55989_3399 EC55989_3400   yghR TRUE 0.924 46.000 0.667 NA   NA
 5881444 5881445 EC55989_3400 EC55989_3401 yghR yghS TRUE 0.647 32.000 0.000 NA   NA
 5881447 5881448 EC55989_3403 EC55989_3404 pitB gss FALSE 0.009 292.000 0.000 1.000 N NA
 5881449 5881450 EC55989_3405 EC55989_3406 yghU   FALSE 0.008 300.000 0.000 1.000 N NA
 5881451 5881452 EC55989_3407 EC55989_3408 hybG hybF TRUE 0.867 13.000 0.000 NA   NA
 5881452 5881453 EC55989_3408 EC55989_3409 hybF hybE TRUE 0.814 -7.000 0.055 NA   NA
 5881453 5881454 EC55989_3409 EC55989_3410 hybE hybD TRUE 0.953 -7.000 0.291 NA   NA
 5881454 5881455 EC55989_3410 EC55989_3411 hybD hybC TRUE 0.999 0.000 0.828 1.000 Y NA
 5881455 5881456 EC55989_3411 EC55989_3412 hybC hybB TRUE 0.984 -3.000 0.000 NA Y NA
 5881456 5881457 EC55989_3412 EC55989_3413 hybB hybA TRUE 0.952 -10.000 0.000 NA Y NA
 5881457 5881458 EC55989_3413 EC55989_3414 hybA hybO TRUE 0.998 3.000 0.615 NA Y NA
 5881458 5881459 EC55989_3414 EC55989_3415 hybO   TRUE 0.890 7.000 0.051 NA   NA
 5881459 5881460 EC55989_3415 EC55989_3416   yghW TRUE 0.959 -3.000 0.167 NA   NA
 5881460 5881461 EC55989_3416 EC55989_3417 yghW   FALSE 0.097 119.000 0.017 NA   NA
 5881465 5881466 EC55989_3422 EC55989_3423 exbD exbB TRUE 0.999 7.000 0.810 0.051 Y NA
 5881466 5881467 EC55989_3423 EC55989_3424 exbB   TRUE 0.800 -7.000 0.048 NA   NA
 5881468 5881469 EC55989_3425 EC55989_3426 metC yghB FALSE 0.261 140.000 0.212 NA   NA
 5881471 5881472 EC55989_3428 EC55989_3429 yqhD dkgA FALSE 0.426 105.000 0.200 1.000   NA
 5881472 5881473 EC55989_3429 EC55989_3430 dkgA yqhG FALSE 0.036 200.000 0.000 NA   NA
 5881473 5881474 EC55989_3430 EC55989_3431 yqhG yqhH FALSE 0.419 51.000 0.000 NA   NA
 5881475 5881476 EC55989_3432 EC55989_3433 ygiQ sufI FALSE 0.074 111.000 0.025 1.000 N NA
 5881476 5881477 EC55989_3433 EC55989_3434 sufI plsC FALSE 0.397 75.000 0.154 1.000 N NA
 5881477 5881478 EC55989_3434 EC55989_3435 plsC   FALSE 0.456 48.000 0.000 NA   NA
 5881478 5881479 EC55989_3435 EC55989_3436   parC TRUE 0.677 30.000 0.000 NA   NA
 5881479 5881480 EC55989_3436 EC55989_3439 parC ygiV FALSE 0.024 546.000 0.005 NA Y NA
 5881480 5881481 EC55989_3439 EC55989_3440 ygiV ygiW FALSE 0.387 53.000 0.053 NA   NA
 5881482 5881483 EC55989_3441 EC55989_3442 qseB qseC TRUE 0.997 -3.000 0.526 1.000 Y NA
 5881485 5881486 EC55989_3444 EC55989_3445 mdaB ygiN TRUE 0.808 31.000 0.025 0.023   NA
 5881487 5881488 EC55989_3446 EC55989_3447 parE yqiA TRUE 0.877 29.000 0.217 NA   NA
 5881488 5881489 EC55989_3447 EC55989_3448 yqiA cpdA TRUE 0.989 0.000 0.427 NA   NA
 5881489 5881490 EC55989_3448 EC55989_3449 cpdA yqiB TRUE 0.957 25.000 0.433 NA   NA
 5881490 5881491 EC55989_3449 EC55989_3450 yqiB nudF TRUE 0.989 1.000 0.443 NA   NA
 5881492 5881493 EC55989_3451 EC55989_3452 tolC ygiB FALSE 0.146 244.000 0.480 NA   NA
 5881493 5881494 EC55989_3452 EC55989_3453 ygiB ygiC TRUE 0.991 6.000 0.632 NA   NA
 5881497 5881498 EC55989_3456 EC55989_3457   ribB FALSE 0.022 237.000 0.000 NA   NA
 5881498 5881499 EC55989_3457 EC55989_misc_RNA_77 ribB   FALSE 0.190 104.000 0.000 NA   NA
 5881500 5881501 EC55989_3458 EC55989_3459 yqiC ygiL FALSE 0.014 283.000 0.000 NA   NA
 5881501 5881502 EC55989_3459 EC55989_3460 ygiL yqiG TRUE 0.972 51.000 0.667 1.000 Y NA
 5881502 5881503 EC55989_3460 EC55989_3461 yqiG yqiH TRUE 0.996 16.000 0.667 1.000 Y NA
 5881503 5881504 EC55989_3461 EC55989_3462 yqiH yqiI TRUE 0.988 2.000 0.400 1.000   NA
 5881506 5881507 EC55989_3464 EC55989_3465 yqiJ yqiK TRUE 0.970 27.000 0.641 NA   NA
 5881508 5881509 EC55989_misc_RNA_78 EC55989_misc_RNA_79 rygD rygC FALSE 0.334 -147.000 0.000 NA   NA
 5881509 5881510 EC55989_misc_RNA_79 EC55989_misc_RNA_80 rygC   FALSE 0.024 227.000 0.000 NA   NA
 5881510 5881511 EC55989_misc_RNA_80 EC55989_3466   rfaE TRUE 0.496 45.000 0.000 NA   NA
 5881511 5881512 EC55989_3466 EC55989_3467 rfaE glnE FALSE 0.444 48.000 0.083 1.000 N NA
 5881512 5881513 EC55989_3467 EC55989_3468 glnE ygiF TRUE 0.802 23.000 0.053 1.000   NA
 5881513 5881514 EC55989_3468 EC55989_3469 ygiF   TRUE 0.836 17.000 0.000 NA   NA
 5881515 5881516 EC55989_3470 EC55989_3471 htrG cca FALSE 0.330 64.000 0.106 NA N NA
 5881517 5881518 EC55989_3472 EC55989_3473 bacA folB FALSE 0.298 91.000 0.128 1.000 N NA
 5881521 5881522 EC55989_3476 EC55989_3477 ttdA ttdB TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.000 Y NA
 5881522 5881523 EC55989_3477 EC55989_3478 ttdB ygjE FALSE 0.278 49.000 0.037 1.000 N NA
 5881525 5881526 EC55989_3480 EC55989_3481 rpsU dnaG FALSE 0.139 111.000 0.067 1.000 N NA
 5881526 5881527 EC55989_3481 EC55989_3482 dnaG rpoD FALSE 0.134 195.000 0.299 1.000 N NA
 5881535 5881536 EC55989_3489 EC55989_3490 ebgR ebgA FALSE 0.069 184.000 0.136 1.000 N NA
 5881536 5881537 EC55989_3490 EC55989_3491 ebgA ebgC TRUE 0.998 -3.000 0.682 NA Y NA
 5881537 5881538 EC55989_3491 EC55989_3492 ebgC ygjI TRUE 0.725 63.000 0.412 NA N NA
 5881538 5881539 EC55989_3492 EC55989_3493 ygjI ygjJ FALSE 0.116 134.000 0.000 NA   NA
 5881539 5881540 EC55989_3493 EC55989_3494 ygjJ ygjK TRUE 0.836 17.000 0.000 NA   NA
 5881540 5881541 EC55989_3494 EC55989_3495 ygjK fadH FALSE 0.012 326.000 0.000 1.000   NA
 5881542 5881543 EC55989_3496 EC55989_3497 ygjM   TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5881543 5881544 EC55989_3497 EC55989_3498   ygjO FALSE 0.190 104.000 0.000 NA   NA
 5881545 5881546 EC55989_3499 EC55989_3500 ygjP ygjQ FALSE 0.182 77.000 0.019 NA   NA
 5881546 5881547 EC55989_3500 EC55989_3501 ygjQ ygjR FALSE 0.241 61.000 0.019 NA   NA
 5881547 5881548 EC55989_3501 EC55989_misc_RNA_81 ygjR sraF FALSE 0.266 77.000 0.000 NA   NA
 5881548 5881549 EC55989_misc_RNA_81 EC55989_3502 sraF alx TRUE 0.822 19.000 0.000 NA   NA
 5881549 5881550 EC55989_3502 EC55989_3503 alx sstT FALSE 0.005 399.000 0.000 1.000 N NA
 5881551 5881552 EC55989_3504 EC55989_3505 ygjV uxaA FALSE 0.380 83.000 0.126 NA   NA
 5881552 5881553 EC55989_3505 EC55989_3506 uxaA uxaC TRUE 0.980 15.000 0.092 1.000 Y NA
 5881555 5881556 EC55989_3508 EC55989_3509     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5881556 5881557 EC55989_3509 EC55989_3510     TRUE 0.839 74.000 0.667 NA   NA
 5881557 5881558 EC55989_3510 EC55989_3511     TRUE 0.955 30.000 0.556 NA   NA
 5881559 5881560 EC55989_3512 EC55989_3513 exuR yqjA FALSE 0.009 345.000 0.000 NA   NA
 5881560 5881561 EC55989_3513 EC55989_3514 yqjA yqjB TRUE 0.989 4.000 0.529 NA   NA
 5881561 5881562 EC55989_3514 EC55989_3515 yqjB yqjC TRUE 0.580 147.000 0.684 NA   NA
 5881562 5881563 EC55989_3515 EC55989_3516 yqjC yqjD TRUE 0.943 38.000 0.609 NA   NA
 5881563 5881564 EC55989_3516 EC55989_3517 yqjD yqjE TRUE 0.967 3.000 0.185 NA   NA
 5881564 5881565 EC55989_3517 EC55989_3518 yqjE yqjK TRUE 0.897 -10.000 0.185 NA   NA
 5881565 5881566 EC55989_3518 EC55989_3519 yqjK yqjF FALSE 0.097 186.000 0.161 NA   NA
 5881566 5881567 EC55989_3519 EC55989_3520 yqjF yqjG FALSE 0.300 70.000 0.000 NA   NA
 5881567 5881568 EC55989_3520 EC55989_3521 yqjG yhaH FALSE 0.013 293.000 0.000 NA   NA
 5881568 5881569 EC55989_3521 EC55989_3522 yhaH yhaI FALSE 0.049 242.000 0.000 0.064   NA
 5881571 5881572 EC55989_3524 EC55989_3525 yhaK yhaL TRUE 0.656 23.000 0.005 NA   NA
 5881573 5881574 EC55989_3526 EC55989_3528 yhaM yhaO TRUE 0.844 28.000 0.157 NA   NA
 5881574 5881575 EC55989_3528 EC55989_3529 yhaO tdcG FALSE 0.059 338.000 0.000 1.000 Y NA
 5881575 5881576 EC55989_3529 EC55989_3530 tdcG tdcF FALSE 0.372 72.000 0.150 NA N NA
 5881576 5881577 EC55989_3530 EC55989_3531 tdcF tdcE TRUE 0.761 14.000 0.000 NA N NA
 5881577 5881578 EC55989_3531 EC55989_3532 tdcE tdcD TRUE 0.969 34.000 0.286 1.000 Y NA
 5881578 5881579 EC55989_3532 EC55989_3533 tdcD tdcC TRUE 0.960 14.000 0.308 1.000 N NA
 5881579 5881580 EC55989_3533 EC55989_3534 tdcC tdcB TRUE 0.957 22.000 0.029 1.000 Y NA
 5881580 5881581 EC55989_3534 EC55989_3535 tdcB tdcA FALSE 0.087 99.000 0.023 1.000 N NA
 5881582 5881583 EC55989_3536 EC55989_3537 tdcR yhaB FALSE 0.018 256.000 0.000 NA   NA
 5881583 5881584 EC55989_3537 EC55989_3538 yhaB yhaC TRUE 0.792 22.000 0.000 NA   NA
 5881584 5881585 EC55989_3538 EC55989_3540 yhaC   FALSE 0.009 338.000 0.000 NA   NA
 5881586 5881587 EC55989_misc_RNA_82 EC55989_3542 rnpB garK TRUE 0.639 33.000 0.000 NA   NA
 5881587 5881588 EC55989_3542 EC55989_3543 garK garR TRUE 0.902 16.000 0.152 1.000 N NA
 5881588 5881589 EC55989_3543 EC55989_3544 garR garL TRUE 0.926 30.000 0.424 1.000 N NA
 5881589 5881590 EC55989_3544 EC55989_3545 garL garP TRUE 0.982 16.000 0.143 1.000 Y NA
 5881591 5881592 EC55989_3546 EC55989_3547 garD sohA FALSE 0.046 149.000 0.000 NA N NA
 5881592 5881593 EC55989_3547 EC55989_3548 sohA yhaV TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5881595 5881596 EC55989_3550 EC55989_3551 kbaZ agaV TRUE 0.984 23.000 0.280 1.000 Y NA
 5881596 5881597 EC55989_3551 EC55989_3552 agaV   TRUE 0.999 11.000 0.905 0.013 Y NA
 5881597 5881598 EC55989_3552 EC55989_3553     TRUE 0.994 -16.000 0.619 0.013 Y NA
 5881598 5881599 EC55989_3553 EC55989_3554     TRUE 0.998 18.000 0.692 0.013 Y NA
 5881599 5881600 EC55989_3554 EC55989_3555   agaA TRUE 0.937 -24.000 0.104 1.000 Y NA
 5881600 5881601 EC55989_3555 EC55989_3556 agaA agaS FALSE 0.006 350.000 0.000 1.000 N NA
 5881601 5881602 EC55989_3556 EC55989_3557 agaS kbaY TRUE 0.973 13.000 0.391 1.000 N NA
 5881602 5881603 EC55989_3557 EC55989_3558 kbaY agaB FALSE 0.350 167.000 0.087 1.000 Y NA
 5881603 5881604 EC55989_3558 EC55989_3559 agaB agaC TRUE 0.981 39.000 0.333 0.010 Y NA
 5881604 5881605 EC55989_3559 EC55989_3560 agaC agaD TRUE 0.994 -10.000 0.444 0.010 Y NA
 5881605 5881606 EC55989_3560 EC55989_3561 agaD agaI TRUE 0.989 1.000 0.080 1.000 Y NA
 5881606 5881607 EC55989_3561 EC55989_3562 agaI yraH FALSE 0.005 400.000 0.000 1.000 N NA
 5881607 5881608 EC55989_3562 EC55989_3563 yraH yraI TRUE 0.881 80.000 0.333 1.000 Y NA
 5881608 5881609 EC55989_3563 EC55989_3564 yraI yraJ TRUE 0.935 30.000 0.000 1.000 Y NA
 5881609 5881610 EC55989_3564 EC55989_3565 yraJ yraK TRUE 0.979 11.000 0.000 NA Y NA
 5881612 5881613 EC55989_3567 EC55989_3568 yraM yraN TRUE 0.772 -42.000 0.172 1.000   NA
 5881613 5881614 EC55989_3568 EC55989_3569 yraN yraO TRUE 0.905 20.000 0.187 1.000 N NA
 5881614 5881615 EC55989_3569 EC55989_3570 yraO ecfH TRUE 0.990 10.000 0.613 NA   NA
 5881616 5881617 EC55989_3571 EC55989_3572 yraQ yraR FALSE 0.259 73.000 0.045 NA   NA
 5881621 5881622 EC55989_3576 EC55989_3577 yhbS yhbT TRUE 0.965 -6.000 0.295 1.000   NA
 5881623 5881624 EC55989_3578 EC55989_3579 yhbU yhbV TRUE 0.999 9.000 0.948 0.003 Y NA
 5881624 5881625 EC55989_3579 EC55989_3580 yhbV yhbW FALSE 0.013 206.000 0.041 NA N NA
 5881626 5881627 EC55989_3581 EC55989_3582 mtr deaD FALSE 0.024 154.000 0.009 1.000 N NA
 5881627 5881628 EC55989_3582 EC55989_3583 deaD nlpI FALSE 0.057 180.000 0.053 1.000   NA
 5881628 5881629 EC55989_3583 EC55989_3584 nlpI pnp FALSE 0.228 109.000 0.071 1.000   NA
 5881631 5881632 EC55989_3585 EC55989_3586 rpsO truB TRUE 0.560 149.000 0.211 1.000 Y NA
 5881632 5881633 EC55989_3586 EC55989_3587 truB rbfA TRUE 0.996 0.000 0.318 1.000 Y NA
 5881633 5881634 EC55989_3587 EC55989_3588 rbfA infB TRUE 0.717 164.000 0.530 1.000 Y NA
 5881634 5881635 EC55989_3588 EC55989_3589 infB nusA TRUE 0.934 25.000 0.342 1.000 N NA
 5881635 5881636 EC55989_3589 EC55989_3590 nusA yhbC TRUE 0.974 28.000 0.759 NA   NA
 5881636 5881637 EC55989_3590 EC55989_tRNA65 yhbC   FALSE 0.032 207.000 0.000 NA   NA
 5881639 5881640 EC55989_3592 EC55989_tRNA64 yhbX   FALSE 0.006 457.000 0.000 NA   NA
 5881640 5881641 EC55989_tRNA64 EC55989_3593   secG TRUE 0.852 15.000 0.000 NA   NA
 5881641 5881642 EC55989_3593 EC55989_3594 secG glmM FALSE 0.008 228.000 0.016 1.000 N NA
 5881642 5881643 EC55989_3594 EC55989_3595 glmM folP TRUE 0.935 -7.000 0.260 1.000 N NA
 5881643 5881644 EC55989_3595 EC55989_3596 folP ftsH TRUE 0.561 90.000 0.325 1.000 N NA
 5881644 5881645 EC55989_3596 EC55989_3597 ftsH rrmJ FALSE 0.297 100.000 0.152 1.000 N NA
 5881649 5881650 EC55989_3601 EC55989_3602 obgE yhbE TRUE 0.801 16.000 0.015 1.000   NA
 5881650 5881651 EC55989_3602 EC55989_3603 yhbE rpmA FALSE 0.110 127.000 0.019 1.000   NA
 5881651 5881652 EC55989_3603 EC55989_3604 rpmA rplU TRUE 0.997 21.000 0.667 0.008 Y NA
 5881653 5881654 EC55989_3605 EC55989_3606 ispB sfsB FALSE 0.016 228.000 0.000 1.000 N NA
 5881655 5881656 EC55989_3607 EC55989_3608 murA yrbA TRUE 0.635 55.000 0.258 NA N NA
 5881656 5881657 EC55989_3608 EC55989_3609 yrbA yrbB FALSE 0.366 160.000 0.453 NA   NA
 5881657 5881658 EC55989_3609 EC55989_3610 yrbB yrbC TRUE 0.983 0.000 0.308 NA   NA
 5881658 5881659 EC55989_3610 EC55989_3611 yrbC yrbD TRUE 0.927 19.000 0.188 NA   NA
 5881659 5881660 EC55989_3611 EC55989_3612 yrbD yrbE TRUE 0.990 5.000 0.562 NA   NA
 5881660 5881661 EC55989_3612 EC55989_3613 yrbE yrbF TRUE 0.996 8.000 0.530 NA Y NA
 5881662 5881663 EC55989_3614 EC55989_3615 yrbG kdsD TRUE 0.944 14.000 0.226 1.000 N NA
 5881663 5881664 EC55989_3615 EC55989_3616 kdsD kdsC TRUE 0.980 21.000 0.598 1.000   NA
 5881664 5881665 EC55989_3616 EC55989_3617 kdsC yrbK TRUE 0.992 -3.000 0.617 NA   NA
 5881665 5881666 EC55989_3617 EC55989_3618 yrbK lptA TRUE 0.917 -31.000 0.459 NA   NA
 5881666 5881667 EC55989_3618 EC55989_3619 lptA lptB TRUE 0.988 7.000 0.543 NA   NA
 5881667 5881668 EC55989_3619 EC55989_3620 lptB rpoN TRUE 0.689 48.000 0.163 1.000   NA
 5881668 5881669 EC55989_3620 EC55989_3621 rpoN yhbH TRUE 0.980 23.000 0.820 NA N NA
 5881669 5881670 EC55989_3621 EC55989_3622 yhbH ptsN TRUE 0.685 118.000 0.728 NA N NA
 5881670 5881671 EC55989_3622 EC55989_3623 ptsN yhbJ TRUE 0.714 46.000 0.186 NA   NA
 5881671 5881672 EC55989_3623 EC55989_3624 yhbJ npr TRUE 0.964 -3.000 0.182 NA   NA
 5881672 5881673 EC55989_3624 EC55989_3625 npr yrbL FALSE 0.016 213.000 0.007 NA   NA
 5881674 5881675 EC55989_3626 EC55989_3627 mtgA elbB TRUE 0.916 -3.000 0.066 NA   NA
 5881677 5881678 EC55989_3628 EC55989_3629 arcB yhcC FALSE 0.340 96.000 0.113 1.000   NA
 5881679 5881680 EC55989_3630 EC55989_3631 gltB gltD TRUE 0.992 13.000 0.096 0.000 Y NA
 5881680 5881681 EC55989_3631 EC55989_3632 gltD yhcG FALSE 0.046 184.000 0.000 NA   NA
 5881681 5881682 EC55989_3632 EC55989_3633 yhcG   TRUE 0.665 -19.000 0.000 NA   NA
 5881683 5881684 EC55989_3634 EC55989_3635 yhcH nanK TRUE 0.984 -3.000 0.000 NA Y NA
 5881684 5881685 EC55989_3635 EC55989_3636 nanK nanE TRUE 0.985 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5881685 5881686 EC55989_3636 EC55989_3637 nanE nanT TRUE 0.851 48.000 0.000 1.000 Y NA
 5881686 5881687 EC55989_3637 EC55989_3638 nanT nanA TRUE 0.471 109.000 0.318 1.000 N NA
 5881687 5881688 EC55989_3638 EC55989_3639 nanA nanR FALSE 0.154 122.000 0.091 1.000 N NA
 5881690 5881691 EC55989_3641 EC55989_3642 sspB sspA TRUE 0.994 6.000 0.831 NA   NA
 5881691 5881692 EC55989_3642 EC55989_3643 sspA rpsI FALSE 0.001 395.000 0.014 NA N NA
 5881692 5881693 EC55989_3643 EC55989_3644 rpsI rplM TRUE 0.997 16.000 0.601 0.008 Y NA
 5881693 5881694 EC55989_3644 EC55989_3645 rplM yhcM FALSE 0.014 219.000 0.003 NA   NA
 5881695 5881696 EC55989_3646 EC55989_3647 yhcB degQ FALSE 0.151 154.000 0.154 NA   NA
 5881696 5881697 EC55989_3647 EC55989_3648 degQ degS TRUE 0.905 90.000 0.262 0.003 Y NA
 5881699 5881700 EC55989_3650 EC55989_3651 argR yhcN FALSE 0.008 365.000 0.000 NA   NA
 5881701 5881702 EC55989_3652 EC55989_3653 yhcO aaeB FALSE 0.166 92.000 0.027 NA   NA
 5881702 5881703 EC55989_3653 EC55989_3654 aaeB aaeA TRUE 0.992 6.000 0.667 NA   NA
 5881703 5881704 EC55989_3654 EC55989_3655 aaeA aaeX TRUE 0.928 8.000 0.100 NA   NA
 5881706 5881707 EC55989_3657 EC55989_3658 tldD yhdP FALSE 0.067 156.000 0.050 NA   NA
 5881707 5881708 EC55989_3658 EC55989_3659 yhdP rng TRUE 0.672 68.000 0.296 NA   NA
 5881708 5881709 EC55989_3659 EC55989_3660 rng yhdE TRUE 0.945 -10.000 0.417 NA N NA
 5881709 5881710 EC55989_3660 EC55989_3661 yhdE mreD TRUE 0.946 9.000 0.206 NA N NA
 5881710 5881711 EC55989_3661 EC55989_3662 mreD   TRUE 0.698 -16.000 0.000 NA   NA
 5881711 5881712 EC55989_3662 EC55989_3663   mreC FALSE 0.350 -115.000 0.000 NA   NA
 5881712 5881713 EC55989_3663 EC55989_3664 mreC mreB TRUE 0.851 66.000 0.689 1.000 N NA
 5881716 5881717 EC55989_3667 EC55989_3669 yhdH accB FALSE 0.003 978.000 0.000 1.000 N NA
 5881717 5881718 EC55989_3669 EC55989_3670 accB accC TRUE 0.997 11.000 0.275 0.000 Y NA
 5881718 5881719 EC55989_3670 EC55989_3671 accC yhdT FALSE 0.252 109.000 0.103 NA   NA
 5881719 5881720 EC55989_3671 EC55989_3672 yhdT panF TRUE 0.978 -10.000 0.682 NA   NA
 5881720 5881721 EC55989_3672 EC55989_3673 panF prmA TRUE 0.788 12.000 0.041 1.000 N NA
 5881721 5881722 EC55989_3673 EC55989_3674 prmA dusB FALSE 0.058 329.000 0.042 1.000 Y NA
 5881722 5881723 EC55989_3674 EC55989_3675 dusB fis TRUE 0.835 26.000 0.161 1.000 N NA
 5881723 5881724 EC55989_3675 EC55989_3676 fis yhdJ TRUE 0.634 86.000 0.016 1.000 Y NA
 5881724 5881725 EC55989_3676 EC55989_3677 yhdJ yhdU FALSE 0.402 84.000 0.143 NA   NA
 5881727 5881728 EC55989_3679 EC55989_3680 acrE acrF TRUE 0.992 12.000 0.889 1.000 N NA
 5881728 5881729 EC55989_3680 EC55989_3681 acrF yhdV FALSE 0.018 253.000 0.000 NA   NA
 5881729 5881730 EC55989_3681 EC55989_3682 yhdV   FALSE 0.024 226.000 0.000 NA   NA
 5881730 5881731 EC55989_3682 EC55989_3683   aapJ FALSE 0.073 137.000 0.022 NA   NA
 5881731 5881732 EC55989_3683 EC55989_3684 aapJ aapQ TRUE 0.964 68.000 0.548 0.041 Y NA
 5881732 5881733 EC55989_3684 EC55989_3685 aapQ aapM TRUE 0.999 10.000 0.815 0.012 Y NA
 5881733 5881734 EC55989_3685 EC55989_3686 aapM aapP TRUE 0.998 8.000 0.734 1.000 Y NA
 5881735 5881736 EC55989_5S_2 EC55989_tRNA63     TRUE 0.555 41.000 0.000 NA   NA
 5881736 5881737 EC55989_tRNA63 EC55989_5S_1     TRUE 0.867 13.000 0.000 NA   NA
 5881737 5881738 EC55989_5S_1 EC55989_23S_1     FALSE 0.218 94.000 0.000 NA   NA
 5881738 5881739 EC55989_23S_1 EC55989_tRNA62     FALSE 0.046 184.000 0.000 NA   NA
 5881739 5881740 EC55989_tRNA62 EC55989_tRNA61     TRUE 0.523 43.000 0.000 NA   NA
 5881740 5881741 EC55989_tRNA61 EC55989_16S_1     FALSE 0.306 69.000 0.000 NA   NA
 5881743 5881744 EC55989_3697 EC55989_3698 yrdB aroE TRUE 0.892 -3.000 0.043 NA   NA
 5881744 5881745 EC55989_3698 EC55989_3699 aroE yrdC TRUE 0.884 5.000 0.087 NA N NA
 5881745 5881746 EC55989_3699 EC55989_3700 yrdC yrdD TRUE 0.924 5.000 0.137 NA N NA
 5881746 5881747 EC55989_3700 EC55989_3701 yrdD smg TRUE 0.920 29.000 0.331 NA   NA
 5881747 5881748 EC55989_3701 EC55989_3702 smg smf TRUE 0.726 -28.000 0.124 NA   NA
 5881749 5881750 EC55989_3703 EC55989_3704 def fmt TRUE 0.986 15.000 0.058 0.013 Y NA
 5881750 5881751 EC55989_3704 EC55989_3705 fmt rsmB TRUE 0.947 46.000 0.305 1.000 Y NA
 5881751 5881752 EC55989_3705 EC55989_3706 rsmB trkA TRUE 0.837 22.000 0.122 1.000 N NA
 5881752 5881753 EC55989_3706 EC55989_3707 trkA mscL FALSE 0.063 130.000 0.035 1.000 N NA
 5881754 5881755 EC55989_3708 EC55989_3709 yhdL zntR TRUE 0.657 56.000 0.219 NA   NA
 5881755 5881756 EC55989_3709 EC55989_3710 zntR yhdN TRUE 0.918 11.000 0.095 NA   NA
 5881756 5881757 EC55989_3710 EC55989_3711 yhdN rplQ FALSE 0.113 107.000 0.012 NA   NA
 5881757 5881758 EC55989_3711 EC55989_3712 rplQ rpoA TRUE 0.953 41.000 0.873 1.000 N NA
 5881758 5881759 EC55989_3712 EC55989_3713 rpoA rpsD TRUE 0.959 26.000 0.549 1.000 N NA
 5881759 5881760 EC55989_3713 EC55989_3714 rpsD rpsK TRUE 0.990 34.000 0.509 0.011 Y NA
 5881760 5881761 EC55989_3714 EC55989_3715 rpsK rpsM TRUE 0.998 17.000 0.810 0.008 Y NA
 5881761 5881762 EC55989_3715 EC55989_misc_RNA_85 rpsM   TRUE 0.921 1.000 0.000 NA   NA
 5881762 5881763 EC55989_misc_RNA_85 EC55989_3716   secY FALSE 0.028 216.000 0.000 NA   NA
 5881763 5881764 EC55989_3716 EC55989_3717 secY rplO TRUE 0.991 8.000 0.730 1.000 N NA
 5881764 5881765 EC55989_3717 EC55989_3718 rplO rpmD TRUE 0.999 4.000 0.653 0.001 Y NA
 5881765 5881766 EC55989_3718 EC55989_3719 rpmD rpsE TRUE 0.999 4.000 0.789 0.011 Y NA
 5881766 5881767 EC55989_3719 EC55989_3720 rpsE rplR TRUE 0.998 15.000 0.814 0.011 Y NA
 5881767 5881768 EC55989_3720 EC55989_3721 rplR rplF TRUE 0.999 10.000 0.815 0.008 Y NA
 5881768 5881769 EC55989_3721 EC55989_3722 rplF rpsH TRUE 0.999 13.000 0.808 0.008 Y NA
 5881769 5881770 EC55989_3722 EC55989_3723 rpsH rpsN TRUE 0.989 34.000 0.473 0.008 Y NA
 5881770 5881771 EC55989_3723 EC55989_3724 rpsN rplE TRUE 0.997 15.000 0.496 0.008 Y NA
 5881771 5881772 EC55989_3724 EC55989_3725 rplE rplX TRUE 0.998 15.000 0.758 0.008 Y NA
 5881772 5881773 EC55989_3725 EC55989_3726 rplX rplN TRUE 0.999 11.000 0.810 0.011 Y NA
 5881773 5881774 EC55989_3726 EC55989_3727 rplN rpsQ TRUE 0.874 165.000 0.791 0.011 Y NA
 5881774 5881775 EC55989_3727 EC55989_3728 rpsQ rpmC TRUE 0.999 0.000 0.828 0.008 Y NA
 5881775 5881776 EC55989_3728 EC55989_3729 rpmC rplP TRUE 0.999 0.000 0.802 0.008 Y NA
 5881776 5881777 EC55989_3729 EC55989_3730 rplP rpsC TRUE 0.999 13.000 0.828 0.011 Y NA
 5881777 5881778 EC55989_3730 EC55989_3731 rpsC rplV TRUE 0.998 18.000 0.719 0.011 Y NA
 5881778 5881779 EC55989_3731 EC55989_3732 rplV rpsS TRUE 0.998 15.000 0.769 0.011 Y NA
 5881779 5881780 EC55989_3732 EC55989_3733 rpsS rplB TRUE 0.998 17.000 0.820 0.011 Y NA
 5881780 5881781 EC55989_3733 EC55989_3734 rplB rplW TRUE 0.998 18.000 0.849 0.011 Y NA
 5881781 5881782 EC55989_3734 EC55989_3735 rplW rplD TRUE 0.998 -3.000 0.513 0.008 Y NA
 5881782 5881783 EC55989_3735 EC55989_3736 rplD rplC TRUE 0.998 11.000 0.486 0.008 Y NA
 5881783 5881784 EC55989_3736 EC55989_3737 rplC rpsJ TRUE 0.983 33.000 0.307 0.011 Y NA
 5881784 5881785 EC55989_3737 EC55989_3738 rpsJ   FALSE 0.129 129.000 0.000 NA   NA
 5881787 5881788 EC55989_3740 EC55989_3741 bfr bfd TRUE 0.683 73.000 0.033 NA Y NA
 5881788 5881789 EC55989_3741 EC55989_3742 bfd tufA FALSE 0.008 183.000 0.007 NA N NA
 5881789 5881790 EC55989_3742 EC55989_3743 tufA fusA TRUE 0.957 71.000 0.400 0.001 Y NA
 5881790 5881791 EC55989_3743 EC55989_3744 fusA rpsG TRUE 0.914 97.000 0.579 1.000 Y NA
 5881791 5881792 EC55989_3744 EC55989_3745 rpsG rpsL TRUE 0.956 97.000 0.620 0.002 Y NA
 5881792 5881793 EC55989_3745 EC55989_3746 rpsL tusB FALSE 0.080 126.000 0.058 NA N NA
 5881793 5881794 EC55989_3746 EC55989_3747 tusB tusC TRUE 0.998 8.000 0.804 NA Y NA
 5881794 5881795 EC55989_3747 EC55989_3748 tusC tusD TRUE 0.998 0.000 0.790 NA Y NA
 5881795 5881796 EC55989_3748 EC55989_3749 tusD yheO TRUE 0.975 0.000 0.220 NA   NA
 5881796 5881797 EC55989_3749 EC55989_3750 yheO fkpA FALSE 0.245 167.000 0.310 NA   NA
 5881799 5881800 EC55989_3752 EC55989_3753 slyD yheV TRUE 0.624 95.000 0.370 NA   NA
 5881800 5881801 EC55989_3753 EC55989_3754 yheV kefB TRUE 0.982 10.000 0.400 NA   NA
 5881801 5881802 EC55989_3754 EC55989_3755 kefB kefG TRUE 0.996 0.000 0.927 1.000   NA
 5881803 5881804 EC55989_3757 EC55989_3758 yheS yheT TRUE 0.878 0.000 0.016 NA   NA
 5881804 5881805 EC55989_3758 EC55989_3759 yheT yheU TRUE 0.948 -6.000 0.222 NA   NA
 5881805 5881806 EC55989_3759 EC55989_3760 yheU prkB TRUE 0.749 54.000 0.303 NA   NA
 5881807 5881808 EC55989_3761 EC55989_misc_RNA_86 yhfA crpTic TRUE 0.852 15.000 0.000 NA   NA
 5881809 5881810 EC55989_3762 EC55989_3763   crp TRUE 0.837 7.000 0.016 NA   NA
 5881810 5881811 EC55989_3763 EC55989_3764 crp yhfK TRUE 0.693 39.000 0.111 NA   NA
 5881812 5881813 EC55989_3765 EC55989_3766 argD pabA TRUE 0.721 86.000 0.088 1.000 Y NA
 5881813 5881814 EC55989_3766 EC55989_3767 pabA fic FALSE 0.350 32.000 0.008 1.000 N NA
 5881814 5881815 EC55989_3767 EC55989_3768 fic yhfG TRUE 0.764 -10.000 0.000 NA   NA
 5881815 5881816 EC55989_3768 EC55989_3769 yhfG ppiA TRUE 0.580 105.000 0.364 NA   NA
 5881817 5881818 EC55989_3770 EC55989_3771 tsgA nirB FALSE 0.009 262.000 0.000 NA N NA
 5881818 5881819 EC55989_3771 EC55989_3772 nirB nirD TRUE 0.997 -3.000 0.829 0.000 N NA
 5881819 5881820 EC55989_3772 EC55989_3773 nirD nirC TRUE 0.739 127.000 0.283 1.000 Y NA
 5881820 5881821 EC55989_3773 EC55989_3774 nirC cysG TRUE 0.758 19.000 0.000 1.000 N NA
 5881821 5881822 EC55989_3774 EC55989_3775 cysG yhfL FALSE 0.020 247.000 0.000 NA   NA
 5881822 5881823 EC55989_3775 EC55989_3776 yhfL frlA FALSE 0.012 295.000 0.000 NA   NA
 5881823 5881824 EC55989_3776 EC55989_3777 frlA frlB TRUE 0.955 21.000 0.375 1.000 N NA
 5881824 5881825 EC55989_3777 EC55989_3778 frlB frlC TRUE 0.869 50.000 0.600 NA N NA
 5881825 5881826 EC55989_3778 EC55989_3779 frlC frlD TRUE 0.992 -3.000 0.200 NA Y NA
 5881826 5881827 EC55989_3779 EC55989_3780 frlD frlR FALSE 0.424 100.000 0.267 NA N NA
 5881828 5881829 EC55989_3781 EC55989_3782 yhfS yhfT TRUE 0.950 12.000 0.185 NA   NA
 5881829 5881830 EC55989_3782 EC55989_3783 yhfT yhfU TRUE 0.992 12.000 0.828 NA   NA
 5881830 5881831 EC55989_3783 EC55989_3784 yhfU php TRUE 0.976 11.000 0.312 1.000   NA
 5881831 5881832 EC55989_3784 EC55989_3785 php yhfW TRUE 0.944 -3.000 0.094 1.000   NA
 5881832 5881833 EC55989_3785 EC55989_3786 yhfW yhfX TRUE 0.991 0.000 0.625 NA N NA
 5881833 5881834 EC55989_3786 EC55989_3787 yhfX yhfY TRUE 0.536 84.000 0.233 NA   NA
 5881834 5881835 EC55989_3787 EC55989_3788 yhfY yhfZ TRUE 0.981 17.000 0.562 NA   NA
 5881835 5881836 EC55989_3788 EC55989_3789 yhfZ trpS FALSE 0.008 269.000 0.004 NA   NA
 5881836 5881837 EC55989_3789 EC55989_3790 trpS gph TRUE 0.900 -7.000 0.118 1.000   NA
 5881837 5881838 EC55989_3790 EC55989_3791 gph rpe TRUE 0.901 -7.000 0.120 1.000   NA
 5881838 5881839 EC55989_3791 EC55989_3792 rpe dam TRUE 0.712 18.000 0.040 1.000 N NA
 5881839 5881840 EC55989_3792 EC55989_3793 dam damX FALSE 0.440 107.000 0.234 NA   NA
 5881840 5881841 EC55989_3793 EC55989_3794 damX aroB FALSE 0.156 92.000 0.022 NA   NA
 5881841 5881842 EC55989_3794 EC55989_3795 aroB aroK TRUE 0.887 57.000 0.208 1.000 Y NA
 5881842 5881843 EC55989_3795 EC55989_3796 aroK hofQ FALSE 0.028 401.000 0.319 1.000 N NA
 5881843 5881844 EC55989_3796 EC55989_3797 hofQ yrfA FALSE 0.443 -88.000 0.072 NA   NA
 5881844 5881845 EC55989_3797 EC55989_3798 yrfA yrfB TRUE 0.961 -10.000 0.444 NA   NA
 5881845 5881846 EC55989_3798 EC55989_3799 yrfB yrfC TRUE 0.930 -16.000 0.348 NA   NA
 5881846 5881847 EC55989_3799 EC55989_3800 yrfC yrfD TRUE 0.996 0.000 0.870 NA   NA
 5881850 5881851 EC55989_3803 EC55989_3804 igaA yrfG TRUE 0.497 65.000 0.122 1.000   NA
 5881851 5881852 EC55989_3804 EC55989_3805 yrfG hslR TRUE 0.901 11.000 0.056 1.000   NA
 5881852 5881853 EC55989_3805 EC55989_3806 hslR hslO TRUE 0.824 25.000 0.140 1.000 N NA
 5881854 5881855 EC55989_3807 EC55989_3808 yhgE   FALSE 0.271 76.000 0.000 NA   NA
 5881856 5881857 EC55989_3809 EC55989_3810 pck   FALSE 0.159 117.000 0.000 NA   NA
 5881857 5881858 EC55989_3810 EC55989_3811     TRUE 0.672 59.000 0.250 NA   NA
 5881859 5881860 EC55989_3812 EC55989_3813 envZ ompR TRUE 0.998 -3.000 0.584 1.000 Y NA
 5881861 5881862 EC55989_3814 EC55989_3815 greB yhgF TRUE 0.713 97.000 0.123 1.000 Y NA
 5881862 5881863 EC55989_3815 EC55989_3816 yhgF feoA FALSE 0.004 438.000 0.000 1.000 N NA
 5881863 5881864 EC55989_3816 EC55989_3817 feoA feoB TRUE 0.984 17.000 0.177 1.000 Y NA
 5881864 5881865 EC55989_3817 EC55989_3818 feoB yhgG TRUE 0.989 0.000 0.455 NA   NA
 5881865 5881866 EC55989_3818 EC55989_3819 yhgG yhgA FALSE 0.034 203.000 0.000 NA   NA
 5881868 5881869 EC55989_3821 EC55989_3822 gntX gntY FALSE 0.415 59.000 0.066 1.000   NA
 5881869 5881870 EC55989_3822 EC55989_3823 gntY gntT FALSE 0.010 361.000 0.000 1.000   NA
 5881871 5881872 EC55989_3824 EC55989_3825 malQ malP TRUE 0.993 10.000 0.137 0.015 Y NA
 5881874 5881875 EC55989_3827 EC55989_3828 rtcA rtcB TRUE 0.928 4.000 0.081 NA   NA
 5881877 5881878 EC55989_3830 EC55989_3831 glpR glpG TRUE 0.941 17.000 0.190 1.000   NA
 5881878 5881879 EC55989_3831 EC55989_3832 glpG glpE TRUE 0.880 45.000 0.405 1.000   NA
 5881881 5881882 EC55989_3834 EC55989_3835     TRUE 0.916 3.000 0.000 NA   NA
 5881882 5881883 EC55989_3835 EC55989_3836     TRUE 0.916 3.000 0.000 NA   NA
 5881883 5881884 EC55989_3836 EC55989_3837     TRUE 0.991 16.000 1.000 NA   NA
 5881884 5881885 EC55989_3837 EC55989_3838   glgP FALSE 0.036 116.000 0.016 NA N NA
 5881885 5881886 EC55989_3838 EC55989_3839 glgP glgA TRUE 0.986 19.000 0.228 1.000 Y NA
 5881886 5881887 EC55989_3839 EC55989_3840 glgA glgC TRUE 0.996 0.000 0.307 1.000 Y NA
 5881887 5881888 EC55989_3840 EC55989_3841 glgC glgX TRUE 0.987 18.000 0.228 1.000 Y NA
 5881888 5881889 EC55989_3841 EC55989_3842 glgX glgB TRUE 0.992 -3.000 0.020 0.001 Y NA
 5881889 5881890 EC55989_3842 EC55989_3843 glgB asd FALSE 0.010 273.000 0.000 1.000 N NA
 5881892 5881893 EC55989_3845 EC55989_3846 gntU gntK TRUE 0.986 4.000 0.000 1.000 Y NA
 5881893 5881894 EC55989_3846 EC55989_3847 gntK gntR FALSE 0.075 139.000 0.000 1.000 N NA
 5881894 5881895 EC55989_3847 EC55989_3848 gntR yhhW FALSE 0.025 224.000 0.000 NA   NA
 5881895 5881896 EC55989_3848 EC55989_3849 yhhW yhhX TRUE 0.531 123.000 0.400 NA   NA
 5881896 5881897 EC55989_3849 EC55989_misc_RNA_87 yhhX ryhB FALSE 0.149 121.000 0.000 NA   NA
 5881898 5881899 EC55989_3850 EC55989_3851 yhhY yhhZ FALSE 0.022 237.000 0.000 NA   NA
 5881899 5881900 EC55989_3851 EC55989_3852 yhhZ yrhA TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5881900 5881901 EC55989_3852 EC55989_3853 yrhA yrhD FALSE 0.242 86.000 0.000 NA   NA
 5881901 5881902 EC55989_3853 EC55989_3854 yrhD yrhB FALSE 0.036 200.000 0.000 NA   NA
 5881905 5881906 EC55989_3857 EC55989_3858 ugpQ ugpC TRUE 0.901 -3.000 0.080 1.000 N NA
 5881906 5881907 EC55989_3858 EC55989_3859 ugpC ugpE TRUE 0.997 2.000 0.272 0.040 Y NA
 5881907 5881908 EC55989_3859 EC55989_3860 ugpE ugpA TRUE 0.997 -3.000 0.306 0.040 Y NA
 5881908 5881909 EC55989_3860 EC55989_3861 ugpA ugpB TRUE 0.960 98.000 0.793 0.040 Y NA
 5881909 5881910 EC55989_3861 EC55989_3862 ugpB livF FALSE 0.005 396.000 0.000 1.000 N NA
 5881910 5881911 EC55989_3862 EC55989_3863 livF livG TRUE 0.999 2.000 0.967 0.012 Y NA
 5881911 5881912 EC55989_3863 EC55989_3864 livG livM TRUE 0.997 -3.000 0.574 1.000 Y NA
 5881912 5881913 EC55989_3864 EC55989_3865 livM livH TRUE 0.998 -3.000 0.574 0.040 Y NA
 5881913 5881914 EC55989_3865 EC55989_3866 livH livK TRUE 0.923 48.000 0.217 1.000 Y NA
 5881916 5881917 EC55989_3868 EC55989_3869 livJ rpoH FALSE 0.010 271.000 0.000 1.000 N NA
 5881917 5881918 EC55989_3869 EC55989_3870 rpoH ftsX FALSE 0.013 245.000 0.051 1.000 N NA
 5881918 5881919 EC55989_3870 EC55989_3871 ftsX ftsE TRUE 0.977 -7.000 0.121 1.000 Y NA
 5881919 5881920 EC55989_3871 EC55989_3872 ftsE ftsY TRUE 0.965 3.000 0.117 0.066 N NA
 5881921 5881922 EC55989_3873 EC55989_3874 yhhF   FALSE 0.353 -133.000 0.063 NA   NA
 5881924 5881925 EC55989_3876 EC55989_3877 yhhN zntA TRUE 0.778 74.000 0.325 0.062   NA
 5881927 5881928 EC55989_3879 EC55989_3880 yhhQ dcrB FALSE 0.307 73.000 0.066 NA   NA
 5881930 5881931 EC55989_3882 EC55989_3883 yhhT acpT TRUE 0.740 55.000 0.300 NA   NA
 5881931 5881932 EC55989_3883 EC55989_3884 acpT nikA FALSE 0.124 111.000 0.000 1.000 N NA
 5881932 5881933 EC55989_3884 EC55989_3885 nikA nikB TRUE 0.999 0.000 0.833 0.050 Y NA
 5881933 5881934 EC55989_3885 EC55989_3886 nikB nikC TRUE 0.999 -3.000 0.629 0.001 Y NA
 5881934 5881935 EC55989_3886 EC55989_3887 nikC nikD TRUE 0.997 0.000 0.409 1.000 Y NA
 5881935 5881936 EC55989_3887 EC55989_3888 nikD nikE TRUE 0.996 -3.000 0.290 0.066 Y NA
 5881936 5881937 EC55989_3888 EC55989_3889 nikE nikR TRUE 0.794 6.000 0.031 1.000 N NA
 5881938 5881939 EC55989_3890 EC55989_3891   yhhJ FALSE 0.012 331.000 0.000 1.000   NA
 5881939 5881940 EC55989_3891 EC55989_3892 yhhJ rbbA TRUE 0.995 0.000 0.500 0.004   NA
 5881940 5881941 EC55989_3892 EC55989_3893 rbbA yhiI TRUE 0.956 -3.000 0.049 0.075   NA
 5881941 5881942 EC55989_3893 EC55989_3894 yhiI yhiJ FALSE 0.008 366.000 0.000 NA   NA
 5881942 5881943 EC55989_3894 EC55989_3895 yhiJ yhiJ FALSE 0.276 75.000 0.000 NA   NA
 5881943 5881944 EC55989_3895 EC55989_3896 yhiJ   FALSE 0.016 262.000 0.000 NA   NA
 5881944 5881945 EC55989_3896 EC55989_3897     FALSE 0.089 147.000 0.000 NA   NA
 5881945 5881946 EC55989_3897 EC55989_3898     TRUE 0.822 19.000 0.000 NA   NA
 5881948 5881949 EC55989_3900 EC55989_3901     FALSE 0.045 185.000 0.000 NA   NA
 5881949 5881950 EC55989_3901 EC55989_3902     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.002 Y NA
 5881950 5881951 EC55989_3902 EC55989_3903     FALSE 0.350 49.000 0.000 1.000 N NA
 5881951 5881952 EC55989_3903 EC55989_3904     TRUE 0.917 5.000 0.000 1.000   NA
 5881952 5881953 EC55989_3904 EC55989_3905     TRUE 0.818 40.000 0.000 0.002   NA
 5881953 5881954 EC55989_3905 EC55989_3906     TRUE 0.993 -3.000 0.500 0.002 N NA
 5881955 5881956 EC55989_3907 EC55989_3908     FALSE 0.013 289.000 0.000 NA   NA
 5881957 5881958 EC55989_3910 EC55989_3911 silP   TRUE 0.678 127.000 0.667 NA   NA
 5881958 5881959 EC55989_3911 EC55989_3912   cusA TRUE 0.833 81.000 0.714 NA   NA
 5881959 5881960 EC55989_3912 EC55989_3913 cusA silB TRUE 0.965 11.000 0.286 1.000 N NA
 5881960 5881961 EC55989_3913 EC55989_3914 silB   FALSE 0.463 114.000 0.286 NA   NA
 5881961 5881962 EC55989_3914 EC55989_3915   silC TRUE 0.978 28.000 0.857 NA   NA
 5881963 5881964 EC55989_3917 EC55989_3918 cusR   TRUE 0.984 -7.000 0.000 0.002 Y NA
 5881964 5881965 EC55989_3918 EC55989_3919   silE TRUE 0.526 128.000 0.429 NA   NA
 5881965 5881966 EC55989_3919 EC55989_3920 silE   FALSE 0.173 148.000 0.154 NA   NA
 5881967 5881968 EC55989_3921 EC55989_3922     FALSE 0.006 504.000 0.000 NA   NA
 5881968 5881969 EC55989_3922 EC55989_3923     FALSE 0.010 323.000 0.000 NA   NA
 5881970 5881971 EC55989_3924 EC55989_3925     TRUE 0.899 -81.000 0.000 0.021 Y NA
 5881972 5881973 EC55989_3926 EC55989_3927     TRUE 0.647 32.000 0.000 NA   NA
 5881973 5881974 EC55989_3927 EC55989_3928     TRUE 0.936 0.000 0.000 1.000   NA
 5881974 5881975 EC55989_3928 EC55989_3929     TRUE 0.972 -13.000 0.444 0.061   NA
 5881975 5881976 EC55989_3929 EC55989_3930   yhiN FALSE 0.056 143.000 0.009 NA   NA
 5881979 5881980 EC55989_3933 EC55989_3934 uspA yhiP FALSE 0.007 318.000 0.000 1.000 N NA
 5881981 5881982 EC55989_3935 EC55989_3936 yhiQ prlC TRUE 0.927 8.000 0.098 NA   NA
 5881983 5881984 EC55989_3937 EC55989_3938 yhiR gor FALSE 0.421 72.000 0.100 1.000   NA
 5881986 5881987 EC55989_3940 EC55989_3942   arsR FALSE 0.005 539.000 0.000 NA   NA
 5881987 5881988 EC55989_3942 EC55989_3943 arsR arsB FALSE 0.303 54.000 0.000 1.000 N NA
 5881988 5881989 EC55989_3943 EC55989_3944 arsB arsC TRUE 0.978 13.000 0.000 1.000 Y NA
 5881991 5881992 EC55989_3946 EC55989_3947     FALSE 0.005 580.000 0.000 NA   NA
 5881992 5881993 EC55989_3947 EC55989_3948   slp FALSE 0.010 324.000 0.000 NA   NA
 5881993 5881994 EC55989_3948 EC55989_3950 slp yhiF FALSE 0.051 156.000 0.000 1.000 N NA
 5881995 5881996 EC55989_3951 EC55989_3952 yhiD hdeB FALSE 0.329 64.000 0.000 NA   NA
 5881996 5881997 EC55989_3952 EC55989_3953 hdeB hdeA FALSE 0.161 116.000 0.000 NA   NA
 5881998 5881999 EC55989_3954 EC55989_3955 hdeD gadE FALSE 0.004 799.000 0.000 NA   NA
 5881999 5882000 EC55989_3955 EC55989_3957 gadE mdtE FALSE 0.011 339.000 0.000 1.000   NA
 5882000 5882001 EC55989_3957 EC55989_3958 mdtE mdtF TRUE 0.673 25.000 0.000 1.000 N NA
 5882004 5882005 EC55989_3961 EC55989_3962 gadX gadA FALSE 0.005 370.000 0.000 1.000 N NA
 5882005 5882006 EC55989_3962 EC55989_3963 gadA yhjA FALSE 0.020 211.000 0.000 1.000 N NA
 5882009 5882010 EC55989_3967 EC55989_3968 yhjC yhjD TRUE 0.580 49.000 0.098 1.000   NA
 5882010 5882011 EC55989_3968 EC55989_3969 yhjD yhjE FALSE 0.008 411.000 0.000 1.000   NA
 5882012 5882013 EC55989_3970 EC55989_3971 yhjG yhjH FALSE 0.243 55.000 0.000 NA N NA
 5882014 5882015 EC55989_3972 EC55989_3973   kdgK FALSE 0.247 84.000 0.000 NA   NA
 5882016 5882017 EC55989_3974 EC55989_3975 yhjJ dctA FALSE 0.040 221.000 0.088 1.000   NA
 5882017 5882018 EC55989_3975 EC55989_3976 dctA yhjK FALSE 0.191 183.000 0.229 0.075 N NA
 5882018 5882019 EC55989_3976 EC55989_3977 yhjK bcsC FALSE 0.151 121.000 0.088 1.000 N NA
 5882019 5882020 EC55989_3977 EC55989_3978 bcsC bcsZ TRUE 0.874 -18.000 0.263 1.000 N NA
 5882020 5882021 EC55989_3978 EC55989_3979 bcsZ bcsB TRUE 0.912 7.000 0.000 1.000   NA
 5882021 5882022 EC55989_3979 EC55989_3980 bcsB bcsA TRUE 0.966 11.000 0.000 0.001   NA
 5882022 5882023 EC55989_3980 EC55989_3981 bcsA   TRUE 0.987 -3.000 0.545 NA N NA
 5882023 5882024 EC55989_3981 EC55989_3982   yhjR TRUE 0.982 12.000 0.464 NA   NA
 5882025 5882026 EC55989_3983 EC55989_3984 bcsE bcsF TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5882026 5882027 EC55989_3984 EC55989_3985 bcsF bcsG TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5882034 5882035 EC55989_3991 EC55989_3992 dppF dppD TRUE 0.998 -3.000 0.500 0.002 Y NA
 5882035 5882036 EC55989_3992 EC55989_3993 dppD dppC TRUE 0.997 11.000 0.560 1.000 Y NA
 5882036 5882037 EC55989_3993 EC55989_3994 dppC dppB TRUE 0.999 10.000 0.779 0.040 Y NA
 5882039 5882040 EC55989_3996 EC55989_tRNA60 dppA   FALSE 0.004 744.000 0.000 NA   NA
 5882040 5882041 EC55989_tRNA60 EC55989_3997   eptB FALSE 0.226 92.000 0.000 NA   NA
 5882041 5882042 EC55989_3997 EC55989_3998 eptB lpfE FALSE 0.022 253.000 0.000 1.000   NA
 5882042 5882043 EC55989_3998 EC55989_3999 lpfE lpfD TRUE 0.999 6.000 0.667 0.007 Y NA
 5882043 5882044 EC55989_3999 EC55989_4000 lpfD lpfC TRUE 0.981 11.000 0.000 1.000 Y NA
 5882044 5882045 EC55989_4000 EC55989_4001 lpfC lpfB TRUE 0.996 24.000 1.000 1.000 Y NA
 5882045 5882046 EC55989_4001 EC55989_4002 lpfB lpfA TRUE 0.932 84.000 0.600 1.000 Y NA
 5882046 5882047 EC55989_4002 EC55989_4003 lpfA yhjX FALSE 0.007 324.000 0.000 1.000 N NA
 5882047 5882048 EC55989_4003 EC55989_4004 yhjX yhjY FALSE 0.032 184.000 0.000 1.000 N NA
 5882049 5882050 EC55989_4005 EC55989_4006 tag yiaC TRUE 0.896 -3.000 0.028 1.000   NA
 5882052 5882053 EC55989_4008 EC55989_4009 yiaD tiaE FALSE 0.137 104.000 0.000 1.000 N NA
 5882055 5882056 EC55989_4011 EC55989_4012 yiaG cspA FALSE 0.087 281.000 0.000 1.000 Y NA
 5882057 5882058 EC55989_4013 EC55989_4014 glyS glyQ TRUE 0.999 10.000 0.651 0.000 Y NA
 5882058 5882059 EC55989_4014 EC55989_4015 glyQ ysaB FALSE 0.132 95.000 0.010 NA   NA
 5882061 5882062 EC55989_4017 EC55989_4018 yiaA yiaB FALSE 0.400 46.000 0.032 NA   NA
 5882062 5882063 EC55989_4018 EC55989_4019 yiaB xylB FALSE 0.117 169.000 0.143 NA   NA
 5882063 5882064 EC55989_4019 EC55989_4020 xylB xylA TRUE 0.708 72.000 0.034 1.000 Y NA
 5882065 5882066 EC55989_4021 EC55989_4022 xylF xylG TRUE 0.920 78.000 0.518 NA Y NA
 5882066 5882067 EC55989_4022 EC55989_4023 xylG xylH TRUE 0.982 -22.000 0.469 1.000 Y NA
 5882067 5882068 EC55989_4023 EC55989_4024 xylH   FALSE 0.401 -88.000 0.000 NA   NA
 5882068 5882069 EC55989_4024 EC55989_4025   xylR TRUE 0.764 -10.000 0.000 NA   NA
 5882071 5882072 EC55989_4028 EC55989_4029 malS avtA FALSE 0.051 178.000 0.085 1.000 N NA
 5882073 5882074 EC55989_4030 EC55989_4031 yiaI yiaJ TRUE 0.573 102.000 0.400 1.000 N NA
 5882075 5882076 EC55989_4032 EC55989_4033 yiaK yiaL TRUE 0.787 12.000 0.000 NA N NA
 5882076 5882077 EC55989_4033 EC55989_4034 yiaL yiaM TRUE 0.533 118.000 0.000 NA Y NA
 5882077 5882078 EC55989_4034 EC55989_4035 yiaM yiaN TRUE 0.999 3.000 0.864 NA Y NA
 5882078 5882079 EC55989_4035 EC55989_4036 yiaN yiaO TRUE 0.978 13.000 0.000 1.000 Y NA
 5882079 5882080 EC55989_4036 EC55989_4037 yiaO lyxK TRUE 0.986 4.000 0.000 1.000 Y NA
 5882080 5882081 EC55989_4037 EC55989_4038 lyxK sgbH TRUE 0.999 -3.000 0.900 1.000 Y NA
 5882081 5882082 EC55989_4038 EC55989_4039 sgbH sgbU TRUE 0.991 -7.000 0.360 1.000 Y NA
 5882082 5882083 EC55989_4039 EC55989_4040 sgbU sgbE TRUE 0.987 -6.000 0.200 1.000 Y NA
 5882086 5882087 EC55989_4043 EC55989_4044 yiaV yiaW TRUE 0.899 6.000 0.000 NA   NA
 5882089 5882090 EC55989_4046 EC55989_4047 aldB yiaY FALSE 0.408 165.000 0.032 0.040 Y NA
 5882090 5882091 EC55989_4047 EC55989_4048 yiaY selB FALSE 0.014 190.000 0.015 1.000 N NA
 5882091 5882092 EC55989_4048 EC55989_4049 selB selA TRUE 0.995 -3.000 0.569 0.000 N NA
 5882092 5882093 EC55989_4049 EC55989_4050 selA yibF FALSE 0.115 98.000 0.040 1.000 N NA
 5882094 5882095 EC55989_4051 EC55989_4052   rhsB FALSE 0.239 87.000 0.000 NA   NA
 5882095 5882096 EC55989_4052 EC55989_4053 rhsB yhhH FALSE 0.021 242.000 0.000 NA   NA
 5882096 5882097 EC55989_4053 EC55989_4054 yhhH yibA FALSE 0.232 90.000 0.000 NA   NA
 5882098 5882099 EC55989_4055 EC55989_4056     TRUE 0.900 -81.000 0.000 0.020 Y NA
 5882100 5882101 EC55989_4057 EC55989_4058 yibA   TRUE 0.540 42.000 0.000 NA   NA
 5882101 5882102 EC55989_4058 EC55989_4059   yibG TRUE 0.876 12.000 0.000 NA   NA
 5882102 5882103 EC55989_4059 EC55989_4060 yibG   FALSE 0.004 707.000 0.000 NA   NA
 5882104 5882105 EC55989_4061 EC55989_4062 yibH yibI TRUE 0.991 3.000 0.556 NA   NA
 5882106 5882107 EC55989_4063 EC55989_4064 mtlA mtlD FALSE 0.305 230.000 0.292 1.000 Y NA
 5882107 5882108 EC55989_4064 EC55989_4065 mtlD mtlR TRUE 0.968 0.000 0.230 NA N NA
 5882110 5882111 EC55989_4067 EC55989_4068 yibL   FALSE 0.005 544.000 0.000 NA   NA
 5882111 5882112 EC55989_4068 EC55989_4069     TRUE 0.818 44.000 0.286 NA   NA
 5882112 5882113 EC55989_4069 EC55989_4070   lldP FALSE 0.005 369.000 0.000 1.000 N NA
 5882113 5882114 EC55989_4070 EC55989_4071 lldP lldR TRUE 0.992 0.000 0.652 1.000 N NA
 5882114 5882115 EC55989_4071 EC55989_4072 lldR lldD TRUE 0.975 -3.000 0.309 1.000 N NA
 5882115 5882116 EC55989_4072 EC55989_4073 lldD yibK FALSE 0.016 186.000 0.020 1.000 N NA
 5882117 5882118 EC55989_4074 EC55989_4075 cysE gpsA TRUE 0.677 80.000 0.429 1.000 N NA
 5882118 5882119 EC55989_4075 EC55989_4076 gpsA secB TRUE 0.967 0.000 0.206 1.000 N NA
 5882119 5882120 EC55989_4076 EC55989_4077 secB grxC FALSE 0.199 63.000 0.038 1.000 N NA
 5882120 5882121 EC55989_4077 EC55989_4078 grxC yibN FALSE 0.045 142.000 0.048 NA N NA
 5882122 5882123 EC55989_4079 EC55989_4080 gpmI envC TRUE 0.768 34.000 0.170 1.000 N NA
 5882123 5882124 EC55989_4080 EC55989_4081 envC yibQ TRUE 0.942 4.000 0.088 1.000   NA
 5882125 5882126 EC55989_4082 EC55989_4083 yibD tdh FALSE 0.011 239.000 0.000 NA N NA
 5882126 5882127 EC55989_4083 EC55989_4084 tdh kbl TRUE 0.986 10.000 0.547 1.000 N NA
 5882127 5882128 EC55989_4084 EC55989_4085 kbl htrL FALSE 0.014 275.000 0.000 NA   NA
 5882129 5882130 EC55989_4086 EC55989_4087 waaD waaF TRUE 0.988 10.000 0.146 1.000 Y NA
 5882130 5882131 EC55989_4087 EC55989_4088 waaF waaC TRUE 0.996 4.000 0.205 0.001 Y NA
 5882131 5882132 EC55989_4088 EC55989_4089 waaC rfaL TRUE 0.982 -3.000 0.036 NA Y NA
 5882133 5882134 EC55989_4090 EC55989_4091 rfaK rfaJ TRUE 0.994 9.000 0.333 1.000 Y NA
 5882134 5882135 EC55989_4091 EC55989_4092 rfaJ rfaY TRUE 0.954 25.000 0.375 1.000   NA
 5882135 5882136 EC55989_4092 EC55989_4093 rfaY rfaI TRUE 0.769 26.000 0.000 1.000   NA
 5882136 5882137 EC55989_4093 EC55989_4094 rfaI waaP TRUE 0.568 43.000 0.000 1.000   NA
 5882137 5882138 EC55989_4094 EC55989_4095 waaP waaG TRUE 0.735 -16.000 0.000 1.000   NA
 5882138 5882139 EC55989_4095 EC55989_4096 waaG waaQ TRUE 0.987 -3.000 0.079 1.000 Y NA
 5882140 5882141 EC55989_4097 EC55989_4098 kdtA coaD TRUE 0.751 8.000 0.020 1.000 N NA
 5882142 5882143 EC55989_4099 EC55989_4100 mutM rpmG FALSE 0.105 98.000 0.034 1.000 N NA
 5882143 5882144 EC55989_4100 EC55989_4101 rpmG rpmB TRUE 0.993 21.000 0.332 0.008 Y NA
 5882144 5882145 EC55989_4101 EC55989_4103 rpmB yicR FALSE 0.008 217.000 0.002 1.000 N NA
 5882146 5882147 EC55989_4104 EC55989_4105 dfp dut TRUE 0.823 -19.000 0.201 1.000 N NA
 5882147 5882148 EC55989_4105 EC55989_4106 dut ttk FALSE 0.138 107.000 0.060 1.000 N NA
 5882149 5882150 EC55989_4107 EC55989_4108 pyrE rph FALSE 0.145 66.000 0.022 1.000 N NA
 5882151 5882152 EC55989_4109 EC55989_4110 yicC dinD FALSE 0.031 209.000 0.000 NA   NA
 5882152 5882153 EC55989_4110 EC55989_4111 dinD yicG FALSE 0.013 292.000 0.000 NA   NA
 5882155 5882156 EC55989_4114 EC55989_4115 gmk rpoZ TRUE 0.808 55.000 0.471 1.000 N NA
 5882156 5882157 EC55989_4115 EC55989_4116 rpoZ spoT TRUE 0.989 19.000 0.291 1.000 Y NA
 5882157 5882158 EC55989_4116 EC55989_4117 spoT trmH TRUE 0.905 7.000 0.095 1.000 N NA
 5882158 5882159 EC55989_4117 EC55989_4118 trmH recG TRUE 0.886 6.000 0.076 1.000 N NA
 5882161 5882162 EC55989_4121 EC55989_4122 yicE yicH FALSE 0.404 121.000 0.257 NA   NA
 5882163 5882164 EC55989_4123 EC55989_4124 yicI yicJ TRUE 0.982 10.000 0.000 1.000 Y NA
 5882165 5882166 EC55989_tRNA36 EC55989_4125     FALSE 0.175 110.000 0.000 NA   NA
 5882166 5882167 EC55989_4125 EC55989_4126   setC FALSE 0.007 382.000 0.000 NA   NA
 5882167 5882168 EC55989_4126 EC55989_4127 setC yicL TRUE 0.690 111.000 0.000 0.061 Y NA
 5882171 5882172 EC55989_4130 EC55989_4131 yicM yicN TRUE 0.776 46.000 0.250 NA   NA
 5882172 5882173 EC55989_4131 EC55989_4132 yicN yicO FALSE 0.398 53.000 0.000 NA   NA
 5882175 5882176 EC55989_4134 EC55989_4135 uhpT uhpC TRUE 0.582 138.000 0.000 0.039 Y NA
 5882176 5882177 EC55989_4135 EC55989_4136 uhpC uhpB TRUE 0.931 10.000 0.000 0.061 N NA
 5882177 5882178 EC55989_4136 EC55989_4137 uhpB uhpA TRUE 0.993 0.000 0.000 0.011 Y NA
 5882178 5882179 EC55989_4137 EC55989_4138 uhpA ilvN FALSE 0.431 75.000 0.118 1.000   NA
 5882179 5882180 EC55989_4138 EC55989_4139 ilvN ilvB TRUE 0.997 4.000 0.649 0.001   NA
 5882182 5882183 EC55989_5072 EC55989_misc_RNA_91 ivbL istR FALSE 0.126 130.000 0.000 NA   NA
 5882183 5882184 EC55989_misc_RNA_91 EC55989_4141 istR   FALSE 0.017 260.000 0.000 NA   NA
 5882186 5882187 EC55989_4143 EC55989_4144 yidF yidG TRUE 0.986 -3.000 0.429 NA   NA
 5882187 5882188 EC55989_4144 EC55989_4145 yidG yidH TRUE 0.972 -10.000 0.571 NA   NA
 5882190 5882191 EC55989_4147 EC55989_4148 yidJ yidK TRUE 0.975 -3.000 0.235 1.000   NA
 5882193 5882194 EC55989_4150 EC55989_4151     TRUE 0.568 -36.000 0.000 NA   NA
 5882194 5882195 EC55989_4151 EC55989_4152     TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5882197 5882198 EC55989_4154 EC55989_4155 yidE ibpB FALSE 0.038 197.000 0.000 NA   NA
 5882198 5882199 EC55989_4155 EC55989_4156 ibpB ibpA TRUE 0.613 112.000 0.099 NA Y NA
 5882203 5882204 EC55989_4160 EC55989_4161 dgoT dgoD FALSE 0.285 120.000 0.192 1.000 N NA
 5882204 5882205 EC55989_4161 EC55989_4162 dgoD dgoA TRUE 0.989 -3.000 0.385 0.039 N NA
 5882205 5882206 EC55989_4162 EC55989_4163 dgoA dgoK TRUE 0.994 -16.000 0.909 1.000 Y NA
 5882206 5882207 EC55989_4163 EC55989_4164 dgoK dgoR TRUE 0.992 -3.000 0.733 1.000 N NA
 5882209 5882210 EC55989_4166 EC55989_4167 yidA yidB FALSE 0.163 115.000 0.000 NA   NA
 5882210 5882211 EC55989_4167 EC55989_4168 yidB gyrB FALSE 0.021 240.000 0.000 NA   NA
 5882211 5882212 EC55989_4168 EC55989_4169 gyrB recF TRUE 0.985 29.000 0.249 0.003 Y NA
 5882212 5882213 EC55989_4169 EC55989_4170 recF dnaN TRUE 0.996 0.000 0.318 1.000 Y NA
 5882213 5882214 EC55989_4170 EC55989_4171 dnaN dnaA TRUE 0.995 5.000 0.328 1.000 Y NA
 5882215 5882216 EC55989_4173 EC55989_4174 rpmH rnpA TRUE 0.989 17.000 0.787 1.000   NA
 5882216 5882217 EC55989_4174 EC55989_4175 rnpA yidD TRUE 0.928 -36.000 0.540 NA   NA
 5882217 5882218 EC55989_4175 EC55989_4176 yidD yidC TRUE 0.988 3.000 0.461 NA   NA
 5882218 5882219 EC55989_4176 EC55989_4177 yidC trmE FALSE 0.451 106.000 0.221 1.000   NA
 5882219 5882220 EC55989_4177 EC55989_5073 trmE tnaC FALSE 0.021 243.000 0.000 NA   NA
 5882220 5882221 EC55989_5073 EC55989_4178 tnaC tnaA FALSE 0.031 221.000 0.077 NA   NA
 5882221 5882222 EC55989_4178 EC55989_4179 tnaA tnaB TRUE 0.764 91.000 0.154 1.000 Y NA
 5882222 5882223 EC55989_4179 EC55989_4180 tnaB mdtL FALSE 0.066 133.000 0.000 NA N NA
 5882223 5882224 EC55989_4180 EC55989_4181 mdtL yidZ TRUE 0.920 -25.000 0.526 NA N NA
 5882224 5882225 EC55989_4181 EC55989_4182 yidZ yieE FALSE 0.115 145.000 0.114 1.000 N NA
 5882225 5882226 EC55989_4182 EC55989_4183 yieE yieF TRUE 0.822 22.000 0.074 NA   NA
 5882228 5882229 EC55989_4185 EC55989_4186 yieH yieI FALSE 0.315 67.000 0.000 NA   NA
 5882229 5882230 EC55989_4186 EC55989_4187 yieI cbrC FALSE 0.442 49.000 0.000 NA   NA
 5882231 5882232 EC55989_4188 EC55989_4189 yieK yieL TRUE 0.841 15.000 0.080 1.000 N NA
 5882232 5882233 EC55989_4189 EC55989_4190 yieL bglH TRUE 0.976 0.000 0.267 1.000 N NA
 5882233 5882234 EC55989_4190 EC55989_4191 bglH bglB TRUE 0.884 86.000 0.364 1.000 Y NA
 5882234 5882235 EC55989_4191 EC55989_4192 bglB bglF TRUE 0.994 19.000 0.562 1.000 Y NA
 5882235 5882236 EC55989_4192 EC55989_4193 bglF bglG FALSE 0.116 134.000 0.000 NA   NA
 5882236 5882237 EC55989_4193 EC55989_4194 bglG bglG TRUE 0.843 16.000 0.000 NA   NA
 5882237 5882238 EC55989_4194 EC55989_4195 bglG phoU FALSE 0.016 262.000 0.000 NA   NA
 5882238 5882239 EC55989_4195 EC55989_4196 phoU pstB TRUE 0.991 15.000 0.317 NA Y NA
 5882239 5882240 EC55989_4196 EC55989_4197 pstB pstA TRUE 0.954 91.000 0.526 0.001 Y NA
 5882240 5882241 EC55989_4197 EC55989_4198 pstA pstC TRUE 0.999 0.000 0.537 0.001 Y NA
 5882241 5882242 EC55989_4198 EC55989_4199 pstC pstS TRUE 0.874 87.000 0.145 0.001 Y NA
 5882242 5882243 EC55989_4199 EC55989_4200 pstS lpfD FALSE 0.013 248.000 0.000 1.000 N NA
 5882243 5882244 EC55989_4200 EC55989_4201 lpfD lpfC TRUE 0.981 11.000 0.000 1.000 Y NA
 5882244 5882245 EC55989_4201 EC55989_4202 lpfC lfpB TRUE 0.954 25.000 0.000 1.000 Y NA
 5882245 5882246 EC55989_4202 EC55989_4203 lfpB lpfA TRUE 0.985 48.000 1.000 1.000 Y NA
 5882246 5882247 EC55989_4203 EC55989_4204 lpfA glmS FALSE 0.008 302.000 0.000 1.000 N NA
 5882247 5882248 EC55989_4204 EC55989_4205 glmS glmU FALSE 0.330 162.000 0.055 1.000 Y NA
 5882248 5882249 EC55989_4205 EC55989_4206 glmU atpC FALSE 0.007 351.000 0.067 1.000 N NA
 5882249 5882250 EC55989_4206 EC55989_4207 atpC atpD TRUE 0.998 21.000 0.837 0.002 Y NA
 5882250 5882251 EC55989_4207 EC55989_4208 atpD atpG TRUE 0.996 27.000 0.724 0.002 Y NA
 5882251 5882252 EC55989_4208 EC55989_4209 atpG atpA TRUE 0.989 51.000 0.846 0.002 Y NA
 5882252 5882253 EC55989_4209 EC55989_4210 atpA atpH TRUE 0.999 13.000 0.864 0.002 Y NA
 5882253 5882254 EC55989_4210 EC55989_4211 atpH atpF TRUE 0.994 15.000 0.242 0.002 Y NA
 5882254 5882255 EC55989_4211 EC55989_4212 atpF atpE TRUE 0.978 62.000 0.666 0.002 Y NA
 5882255 5882256 EC55989_4212 EC55989_4213 atpE atpB TRUE 0.984 47.000 0.557 0.002 Y NA
 5882256 5882257 EC55989_4213 EC55989_4214 atpB atpI TRUE 0.997 9.000 0.291 0.002 Y NA
 5882257 5882258 EC55989_4214 EC55989_4215 atpI gidB FALSE 0.001 617.000 0.005 1.000 N NA
 5882258 5882259 EC55989_4215 EC55989_4216 gidB gidA TRUE 0.768 64.000 0.466 1.000 N NA
 5882259 5882260 EC55989_4216 EC55989_4217 gidA mioC FALSE 0.005 379.000 0.000 1.000 N NA
 5882260 5882261 EC55989_4217 EC55989_4218 mioC asnC FALSE 0.357 90.000 0.165 1.000 N NA
 5882263 5882264 EC55989_4220 EC55989_4221 yieM ravA TRUE 0.977 -6.000 0.443 NA   NA
 5882265 5882266 EC55989_4222 EC55989_4223 trkD rbsD FALSE 0.043 167.000 0.000 1.000 N NA
 5882266 5882267 EC55989_4223 EC55989_4224 rbsD rbsA TRUE 0.995 8.000 0.337 1.000 Y NA
 5882267 5882268 EC55989_4224 EC55989_4225 rbsA rbsC TRUE 0.997 5.000 0.504 1.000 Y NA
 5882268 5882269 EC55989_4225 EC55989_4226 rbsC rbsB TRUE 0.995 25.000 0.847 NA Y NA
 5882269 5882270 EC55989_4226 EC55989_4227 rbsB rbsK TRUE 0.773 126.000 0.347 NA Y NA
 5882270 5882271 EC55989_4227 EC55989_4228 rbsK rbsR TRUE 0.987 4.000 0.500 1.000 N NA
 5882272 5882273 EC55989_4229 EC55989_4230 hsrA yieP TRUE 0.862 23.000 0.100 1.000   NA
 5882274 5882275 EC55989_16S_4 EC55989_tRNA37     FALSE 0.242 86.000 0.000 NA   NA
 5882275 5882276 EC55989_tRNA37 EC55989_23S_4     FALSE 0.040 194.000 0.000 NA   NA
 5882276 5882277 EC55989_23S_4 EC55989_5S_5     FALSE 0.222 93.000 0.000 NA   NA
 5882277 5882278 EC55989_5S_5 EC55989_tRNA38     FALSE 0.398 53.000 0.000 NA   NA
 5882278 5882279 EC55989_tRNA38 EC55989_tRNA39     TRUE 0.893 9.000 0.000 NA   NA
 5882283 5882284 EC55989_5074 EC55989_4240 ilvL ilvG FALSE 0.347 140.000 0.091 0.001   NA
 5882284 5882285 EC55989_4240 EC55989_4241 ilvG ilvM TRUE 0.998 -3.000 0.943 0.001   NA
 5882285 5882286 EC55989_4241 EC55989_4242 ilvM ilvE TRUE 0.935 20.000 0.205 1.000   NA
 5882286 5882287 EC55989_4242 EC55989_4243 ilvE ilvD TRUE 0.784 65.000 0.075 1.000 Y NA
 5882287 5882288 EC55989_4243 EC55989_4244 ilvD ilvA TRUE 0.990 3.000 0.106 1.000 Y NA
 5882291 5882292 EC55989_4247 EC55989_4248 ppiC   FALSE 0.043 199.000 0.000 1.000   NA
 5882294 5882295 EC55989_4250 EC55989_4251 gpp rhlB FALSE 0.429 134.000 0.406 1.000 N NA
 5882296 5882297 EC55989_4252 EC55989_5075 trxA rhoL FALSE 0.057 141.000 0.004 NA   NA
 5882297 5882298 EC55989_5075 EC55989_4254 rhoL rho FALSE 0.147 85.000 0.002 NA   NA
 5882298 5882299 EC55989_4254 EC55989_4255 rho   TRUE 0.890 10.000 0.000 NA   NA
 5882299 5882300 EC55989_4255 EC55989_4256   rfe TRUE 0.876 12.000 0.000 NA   NA
 5882300 5882301 EC55989_4256 EC55989_4257 rfe wzzE TRUE 0.999 12.000 0.735 0.004 Y NA
 5882301 5882302 EC55989_4257 EC55989_4258 wzzE rffE TRUE 0.982 56.000 0.677 0.004 Y NA
 5882302 5882303 EC55989_4258 EC55989_4259 rffE rffD TRUE 0.996 -3.000 0.348 1.000 Y NA
 5882303 5882304 EC55989_4259 EC55989_4260 rffD rffG TRUE 0.995 0.000 0.273 1.000 Y NA
 5882304 5882305 EC55989_4260 EC55989_4261 rffG rffH TRUE 0.998 19.000 0.739 0.001 Y NA
 5882305 5882306 EC55989_4261 EC55989_4262 rffH rffC TRUE 0.810 -22.000 0.145 1.000   NA
 5882306 5882307 EC55989_4262 EC55989_4263 rffC rffA TRUE 0.974 5.000 0.248 1.000   NA
 5882307 5882308 EC55989_4263 EC55989_4264 rffA wzxE TRUE 0.976 2.000 0.218 1.000   NA
 5882308 5882309 EC55989_4264 EC55989_4265 wzxE rffT TRUE 0.992 -3.000 0.605 1.000   NA
 5882309 5882310 EC55989_4265 EC55989_4266 rffT wzyE TRUE 0.994 -3.000 0.684 1.000   NA
 5882310 5882311 EC55989_4266 EC55989_4267 wzyE rffM TRUE 0.958 3.000 0.126 1.000   NA
 5882311 5882312 EC55989_4267 EC55989_4268 rffM yifK FALSE 0.029 191.000 0.000 1.000 N NA
 5882312 5882313 EC55989_4268 EC55989_tRNA40 yifK   FALSE 0.192 103.000 0.000 NA   NA
 5882313 5882314 EC55989_tRNA40 EC55989_tRNA41     FALSE 0.352 59.000 0.000 NA   NA
 5882314 5882315 EC55989_tRNA41 EC55989_tRNA42     TRUE 0.804 21.000 0.000 NA   NA
 5882315 5882316 EC55989_tRNA42 EC55989_tRNA43     TRUE 0.523 43.000 0.000 NA   NA
 5882316 5882317 EC55989_tRNA43 EC55989_4270   aslB FALSE 0.089 147.000 0.000 NA   NA
 5882320 5882321 EC55989_4272 EC55989_4273 hemY hemX TRUE 0.991 3.000 0.144 1.000 Y NA
 5882321 5882322 EC55989_4273 EC55989_4274 hemX hemD TRUE 0.994 22.000 0.600 1.000 Y NA
 5882322 5882323 EC55989_4274 EC55989_4275 hemD hemC TRUE 0.996 -3.000 0.205 0.001 Y NA
 5882325 5882326 EC55989_4277 EC55989_4278 cyaY   FALSE 0.456 48.000 0.000 NA   NA
 5882326 5882327 EC55989_4278 EC55989_4279     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5882327 5882328 EC55989_4279 EC55989_4280     FALSE 0.009 338.000 0.000 NA   NA
 5882328 5882329 EC55989_4280 EC55989_4281     TRUE 0.896 7.000 0.000 NA   NA
 5882330 5882331 EC55989_4282 EC55989_4283 yifL dapF FALSE 0.253 37.000 0.021 NA N NA
 5882331 5882332 EC55989_4283 EC55989_4284 dapF yigA TRUE 0.962 -3.000 0.175 NA   NA
 5882332 5882333 EC55989_4284 EC55989_4285 yigA xerC TRUE 0.993 -3.000 0.714 NA   NA
 5882333 5882334 EC55989_4285 EC55989_4286 xerC yigB TRUE 0.988 0.000 0.367 1.000   NA
 5882334 5882335 EC55989_4286 EC55989_4287 yigB uvrD FALSE 0.412 84.000 0.128 1.000   NA
 5882338 5882339 EC55989_4290 EC55989_4291     TRUE 0.991 -3.000 0.600 NA   NA
 5882342 5882343 EC55989_4294 EC55989_4295     FALSE 0.007 387.000 0.000 NA   NA
 5882344 5882345 EC55989_4296 EC55989_4297 rarD yigI TRUE 0.511 52.000 0.099 NA   NA
 5882346 5882347 EC55989_4298 EC55989_4299 pldA recQ FALSE 0.085 133.000 0.057 1.000 N NA
 5882347 5882348 EC55989_4299 EC55989_4300 recQ rhtC FALSE 0.211 64.000 0.043 1.000 N NA
 5882350 5882351 EC55989_4302 EC55989_4303 pldB yigL TRUE 0.989 8.000 0.524 1.000   NA
 5882351 5882352 EC55989_4303 EC55989_4304 yigL yigM FALSE 0.328 76.000 0.067 1.000   NA
 5882356 5882357 EC55989_4308 EC55989_4309 udp rmuC FALSE 0.084 141.000 0.041 NA   NA
 5882357 5882358 EC55989_4309 EC55989_4310 rmuC ubiE FALSE 0.194 95.000 0.047 NA   NA
 5882358 5882359 EC55989_4310 EC55989_4311 ubiE yigP TRUE 0.936 14.000 0.145 1.000   NA
 5882359 5882360 EC55989_4311 EC55989_4312 yigP ubiB TRUE 0.988 -3.000 0.432 1.000   NA
 5882360 5882361 EC55989_4312 EC55989_4313 ubiB tatA FALSE 0.239 79.000 0.032 1.000   NA
 5882361 5882362 EC55989_4313 EC55989_4314 tatA tatB TRUE 0.992 4.000 0.188 1.000 Y NA
 5882362 5882363 EC55989_4314 EC55989_4315 tatB tatC TRUE 0.995 3.000 0.333 NA Y NA
 5882363 5882364 EC55989_4315 EC55989_4316 tatC tatD TRUE 0.573 42.000 0.121 NA N NA
 5882366 5882367 EC55989_4318 EC55989_4319 ubiD fre TRUE 0.873 46.000 0.090 NA Y NA
 5882368 5882369 EC55989_4320 EC55989_4321 fadA fadB TRUE 0.997 10.000 0.607 1.000 Y NA
 5882370 5882371 EC55989_4322 EC55989_4323 pepQ yigZ TRUE 0.963 0.000 0.127 1.000   NA
 5882371 5882372 EC55989_4323 EC55989_4324 yigZ trkH TRUE 0.817 39.000 0.202 1.000   NA
 5882372 5882373 EC55989_4324 EC55989_4325 trkH hemG TRUE 0.979 12.000 0.455 1.000 N NA
 5882373 5882374 EC55989_4325 EC55989_16S_5 hemG   FALSE 0.007 378.000 0.000 NA   NA
 5882374 5882375 EC55989_16S_5 EC55989_tRNA44     FALSE 0.306 69.000 0.000 NA   NA
 5882375 5882376 EC55989_tRNA44 EC55989_tRNA45     TRUE 0.523 43.000 0.000 NA   NA
 5882376 5882377 EC55989_tRNA45 EC55989_23S_5     FALSE 0.046 184.000 0.000 NA   NA
 5882377 5882378 EC55989_23S_5 EC55989_5S_6     FALSE 0.218 94.000 0.000 NA   NA
 5882379 5882380 EC55989_4332 EC55989_4333 mobB mobA TRUE 0.993 -3.000 0.064 0.002 Y NA
 5882381 5882382 EC55989_4334 EC55989_4335 yihD yihE FALSE 0.367 77.000 0.106 NA   NA
 5882382 5882383 EC55989_4335 EC55989_4336 yihE dsbA TRUE 0.893 17.000 0.111 NA   NA
 5882383 5882384 EC55989_4336 EC55989_4337 dsbA yihF FALSE 0.074 155.000 0.000 NA   NA
 5882386 5882387 EC55989_4339 EC55989_misc_RNA_93 polA spf FALSE 0.087 148.000 0.000 NA   NA
 5882389 5882390 EC55989_misc_RNA_94 EC55989_4341 csrC yihI FALSE 0.315 67.000 0.000 NA   NA
 5882390 5882391 EC55989_4341 EC55989_4342 yihI hemN FALSE 0.067 189.000 0.107 NA   NA
 5882392 5882393 EC55989_4343 EC55989_4344 glnG glnL TRUE 0.998 12.000 0.587 0.057 Y NA
 5882393 5882394 EC55989_4344 EC55989_4345 glnL glnA FALSE 0.009 286.000 0.053 1.000 N NA
 5882394 5882395 EC55989_4345 EC55989_4346 glnA   FALSE 0.133 128.000 0.000 NA   NA
 5882396 5882397 EC55989_4347 EC55989_4348 bipA yihL FALSE 0.050 216.000 0.000 0.035 N NA
 5882397 5882398 EC55989_4348 EC55989_4349 yihL yihM TRUE 0.993 8.000 0.800 NA   NA
 5882398 5882399 EC55989_4349 EC55989_4350 yihM yihN TRUE 0.811 102.000 0.833 NA   NA
 5882400 5882401 EC55989_4351 EC55989_4352     TRUE 0.990 40.000 1.000 1.000 Y NA
 5882402 5882403 EC55989_4353 EC55989_4354     TRUE 0.808 25.000 0.125 1.000 N NA
 5882403 5882404 EC55989_4354 EC55989_4355     TRUE 0.795 33.000 0.188 1.000 N NA
 5882404 5882405 EC55989_4355 EC55989_4356     FALSE 0.279 70.000 0.079 1.000 N NA
 5882405 5882406 EC55989_4356 EC55989_4357     FALSE 0.395 99.000 0.053 0.039   NA
 5882406 5882407 EC55989_4357 EC55989_4358     TRUE 0.854 -67.000 0.333 1.000   NA
 5882407 5882408 EC55989_4358 EC55989_4359   yihX FALSE 0.118 141.000 0.000 1.000   NA
 5882408 5882409 EC55989_4359 EC55989_4360 yihX rbn TRUE 0.869 -6.000 0.000 1.000   NA
 5882409 5882410 EC55989_4360 EC55989_4361 rbn dtd TRUE 0.930 -3.000 0.069 1.000   NA
 5882410 5882411 EC55989_4361 EC55989_4362 dtd yiiD TRUE 0.927 -3.000 0.065 1.000   NA
 5882413 5882414 EC55989_4364 EC55989_4365     TRUE 0.980 1.000 0.280 NA   NA
 5882414 5882415 EC55989_4365 EC55989_4366   yiiE FALSE 0.006 586.000 0.000 1.000   NA
 5882415 5882416 EC55989_4366 EC55989_4367 yiiE yiiF FALSE 0.020 244.000 0.000 NA   NA
 5882417 5882418 EC55989_4368 EC55989_4369 fdhE fdoI TRUE 0.948 -3.000 0.182 NA N NA
 5882418 5882419 EC55989_4369 EC55989_4370 fdoI fdoH TRUE 0.999 -3.000 0.944 0.001 Y NA
 5882419 5882420 EC55989_4370 EC55989_4371 fdoH fdoG TRUE 0.999 13.000 0.833 0.001 Y NA
 5882421 5882422 EC55989_4373 EC55989_4374 fdhD yiiG FALSE 0.094 153.000 0.080 NA   NA
 5882423 5882424 EC55989_4375 EC55989_4376 frvR frvX TRUE 0.984 0.000 0.400 NA N NA
 5882424 5882425 EC55989_4376 EC55989_4377 frvX frvB TRUE 0.993 -10.000 0.667 NA Y NA
 5882425 5882426 EC55989_4377 EC55989_4378 frvB frvA TRUE 0.990 11.000 0.000 0.009 Y NA
 5882426 5882427 EC55989_4378 EC55989_4379 frvA yiiL FALSE 0.011 313.000 0.000 NA   NA
 5882427 5882428 EC55989_4379 EC55989_4380 yiiL rhaD TRUE 0.931 10.000 0.112 NA   NA
 5882428 5882429 EC55989_4380 EC55989_4381 rhaD rhaA FALSE 0.254 242.000 0.247 1.000 Y NA
 5882429 5882430 EC55989_4381 EC55989_4382 rhaA rhaB TRUE 0.996 -3.000 0.387 1.000 Y NA
 5882431 5882432 EC55989_4384 EC55989_4385 rhaS rhaR TRUE 0.996 -16.000 0.800 0.018 Y NA
 5882434 5882435 EC55989_4387 EC55989_4388 sodA kdgT FALSE 0.032 218.000 0.000 1.000   NA
 5882435 5882436 EC55989_4388 EC55989_4389 kdgT yiiM FALSE 0.044 198.000 0.000 1.000   NA
 5882437 5882438 EC55989_4390 EC55989_4391 cpxA cpxR TRUE 0.998 -3.000 0.791 1.000 Y NA
 5882439 5882440 EC55989_4392 EC55989_4393 cpxP fieF FALSE 0.328 149.000 0.031 NA Y NA
 5882440 5882441 EC55989_4393 EC55989_4394 fieF pfkA FALSE 0.026 181.000 0.040 1.000 N NA
 5882441 5882442 EC55989_4394 EC55989_4395 pfkA sbp FALSE 0.006 320.000 0.049 1.000 N NA
 5882442 5882443 EC55989_4395 EC55989_4396 sbp cdh FALSE 0.131 107.000 0.000 1.000 N NA
 5882444 5882445 EC55989_4397 EC55989_4398 tpiA yiiQ FALSE 0.182 108.000 0.058 NA   NA
 5882446 5882447 EC55989_4399 EC55989_4400 yiiR yiiS FALSE 0.029 212.000 0.000 NA   NA
 5882447 5882448 EC55989_4400 EC55989_4401 yiiS yiiT TRUE 0.723 27.000 0.000 NA   NA
 5882449 5882450 EC55989_4402 EC55989_4403 fpr glpX FALSE 0.253 97.000 0.117 1.000 N NA
 5882450 5882451 EC55989_4403 EC55989_4404 glpX glpK FALSE 0.046 136.000 0.025 1.000 N NA
 5882451 5882452 EC55989_4404 EC55989_4405 glpK glpF TRUE 0.497 23.000 0.004 1.000 N NA
 5882454 5882455 EC55989_4407 EC55989_4408 rraA menA TRUE 0.744 93.000 0.158 NA Y NA
 5882455 5882456 EC55989_4408 EC55989_4409 menA hslU FALSE 0.220 67.000 0.051 1.000 N NA
 5882456 5882457 EC55989_4409 EC55989_4410 hslU hslV TRUE 0.998 10.000 0.752 1.000 Y NA
 5882457 5882458 EC55989_4410 EC55989_4411 hslV ftsN FALSE 0.246 93.000 0.122 NA N NA
 5882458 5882459 EC55989_4411 EC55989_4412 ftsN cytR FALSE 0.436 92.000 0.245 NA N NA
 5882459 5882460 EC55989_4412 EC55989_4413 cytR priA FALSE 0.024 156.000 0.013 1.000 N NA
 5882461 5882462 EC55989_4414 EC55989_4415 rpmE rhsB FALSE 0.038 160.000 0.000 NA N NA
 5882463 5882464 EC55989_4416 EC55989_4417     TRUE 0.847 -6.000 0.000 NA   NA
 5882464 5882465 EC55989_4417 EC55989_4418   yiiX FALSE 0.006 444.000 0.000 NA   NA
 5882465 5882466 EC55989_4418 EC55989_4419 yiiX yiiX FALSE 0.396 -90.000 0.000 NA   NA
 5882466 5882467 EC55989_4419 EC55989_4420 yiiX metJ FALSE 0.346 60.000 0.000 NA   NA
 5882468 5882469 EC55989_4421 EC55989_4422 metB metL TRUE 0.997 3.000 0.428 1.000 Y NA
 5882469 5882470 EC55989_4422 EC55989_4424 metL metF FALSE 0.045 349.000 0.017 1.000 Y NA
 5882470 5882471 EC55989_4424 EC55989_4425 metF katG FALSE 0.003 329.000 0.010 1.000 N NA
 5882471 5882472 EC55989_4425 EC55989_4426 katG yijE FALSE 0.170 94.000 0.012 1.000   NA
 5882473 5882474 EC55989_4427 EC55989_4428 yijF gldA FALSE 0.014 275.000 0.000 NA   NA
 5882474 5882475 EC55989_4428 EC55989_4429 gldA fsaB TRUE 0.987 11.000 0.600 1.000 N NA
 5882475 5882476 EC55989_4429 EC55989_4430 fsaB ptsA TRUE 0.980 12.000 0.000 1.000 Y NA
 5882477 5882478 EC55989_4431 EC55989_4432 frwC frwB TRUE 0.996 15.000 0.400 0.010 Y NA
 5882478 5882479 EC55989_4432 EC55989_4433 frwB pflD TRUE 0.714 51.000 0.280 1.000 N NA
 5882479 5882480 EC55989_4433 EC55989_4434 pflD pflC TRUE 0.922 -34.000 0.312 0.002 N NA
 5882480 5882481 EC55989_4434 EC55989_4435 pflC frwD TRUE 0.953 2.000 0.156 1.000 N NA
 5882482 5882483 EC55989_4436 EC55989_4437 yijO yijP FALSE 0.059 215.000 0.130 1.000   NA
 5882483 5882484 EC55989_4437 EC55989_4438 yijP ppc FALSE 0.056 183.000 0.000 1.000   NA
 5882484 5882485 EC55989_4438 EC55989_4439 ppc argE FALSE 0.005 352.000 0.053 1.000 N NA
 5882486 5882487 EC55989_4440 EC55989_4441 argC argB TRUE 0.993 11.000 0.097 0.001 Y NA
 5882487 5882488 EC55989_4441 EC55989_4442 argB argH TRUE 0.738 61.000 0.017 1.000 Y NA
 5882488 5882489 EC55989_4442 EC55989_4443 argH rspA FALSE 0.004 498.000 0.000 1.000 N NA
 5882489 5882490 EC55989_4443 EC55989_4444 rspA   FALSE 0.193 67.000 0.000 NA N NA
 5882494 5882495 EC55989_4448 EC55989_4449 fabR yijD TRUE 0.971 0.000 0.194 NA   NA
 5882497 5882498 EC55989_misc_RNA_96 EC55989_4451   btuB FALSE 0.324 65.000 0.000 NA   NA
 5882498 5882499 EC55989_4451 EC55989_4452 btuB murI FALSE 0.303 -55.000 0.025 1.000 N NA
 5882499 5882500 EC55989_4452 EC55989_16S_6 murI   FALSE 0.007 374.000 0.000 NA   NA
 5882500 5882501 EC55989_16S_6 EC55989_tRNA46     FALSE 0.242 86.000 0.000 NA   NA
 5882501 5882502 EC55989_tRNA46 EC55989_23S_6     FALSE 0.040 194.000 0.000 NA   NA
 5882502 5882503 EC55989_23S_6 EC55989_5S_7     FALSE 0.222 93.000 0.000 NA   NA
 5882503 5882504 EC55989_5S_7 EC55989_4458   murB FALSE 0.012 301.000 0.000 NA   NA
 5882504 5882505 EC55989_4458 EC55989_4459 murB birA TRUE 0.961 -3.000 0.211 1.000 N NA
 5882507 5882508 EC55989_tRNA47 EC55989_tRNA48     TRUE 0.893 9.000 0.000 NA   NA
 5882508 5882509 EC55989_tRNA48 EC55989_tRNA49     FALSE 0.159 117.000 0.000 NA   NA
 5882509 5882510 EC55989_tRNA49 EC55989_tRNA50     TRUE 0.896 7.000 0.000 NA   NA
 5882510 5882511 EC55989_tRNA50 EC55989_4464   tufB FALSE 0.163 115.000 0.000 NA   NA
 5882511 5882512 EC55989_4464 EC55989_4465 tufB secE FALSE 0.007 230.000 0.009 1.000 N NA
 5882512 5882513 EC55989_4465 EC55989_4466 secE nusG TRUE 0.994 2.000 0.843 1.000 N NA
 5882513 5882514 EC55989_4466 EC55989_4467 nusG rplK TRUE 0.478 159.000 0.681 1.000 N NA
 5882514 5882515 EC55989_4467 EC55989_4468 rplK rplA TRUE 0.999 4.000 0.838 0.011 Y NA
 5882515 5882516 EC55989_4468 EC55989_4469 rplA rplJ FALSE 0.178 413.000 0.302 0.011 Y NA
 5882516 5882517 EC55989_4469 EC55989_4470 rplJ rplL TRUE 0.982 67.000 0.884 0.008 Y NA
 5882517 5882518 EC55989_4470 EC55989_4471 rplL rpoB FALSE 0.038 320.000 0.223 1.000   NA
 5882518 5882519 EC55989_4471 EC55989_4472 rpoB rpoC TRUE 0.939 77.000 0.851 0.000   NA
 5882519 5882520 EC55989_4472 EC55989_4473 rpoC htrC FALSE 0.029 213.000 0.000 NA   NA
 5882521 5882522 EC55989_misc_RNA_97 EC55989_4474 sroH thiH FALSE 0.019 248.000 0.000 NA   NA
 5882522 5882523 EC55989_4474 EC55989_4475 thiH thiG TRUE 0.997 -3.000 0.277 0.003 Y NA
 5882523 5882524 EC55989_4475 EC55989_4476 thiG thiS TRUE 0.989 2.000 0.087 1.000 Y NA
 5882524 5882525 EC55989_4476 EC55989_4477 thiS thiF TRUE 0.989 -16.000 0.548 1.000 Y NA
 5882525 5882526 EC55989_4477 EC55989_4478 thiF thiE TRUE 0.986 -7.000 0.242 1.000 Y NA
 5882526 5882527 EC55989_4478 EC55989_4479 thiE thiC TRUE 0.994 0.000 0.063 0.003 Y NA
 5882527 5882528 EC55989_4479 EC55989_misc_RNA_98 thiC   FALSE 0.253 81.000 0.000 NA   NA
 5882528 5882529 EC55989_misc_RNA_98 EC55989_4480   rsd FALSE 0.408 52.000 0.000 NA   NA
 5882530 5882531 EC55989_4481 EC55989_4482 nudC hemE FALSE 0.402 40.000 0.040 1.000 N NA
 5882531 5882532 EC55989_4482 EC55989_4483 hemE nfi TRUE 0.769 10.000 0.028 1.000 N NA
 5882532 5882533 EC55989_4483 EC55989_4484 nfi yjaG TRUE 0.597 43.000 0.086 NA   NA
 5882533 5882534 EC55989_4484 EC55989_4485 yjaG hupA FALSE 0.211 187.000 0.355 NA   NA
 5882534 5882535 EC55989_4485 EC55989_4486 hupA yjaH TRUE 0.976 13.000 0.375 NA   NA
 5882537 5882538 EC55989_4488 EC55989_4489 zraS zraR TRUE 0.998 -3.000 0.500 0.064 Y NA
 5882539 5882540 EC55989_4490 EC55989_4491 purD purH TRUE 0.991 12.000 0.238 1.000 Y NA
 5882541 5882542 EC55989_16S_7 EC55989_tRNA51     FALSE 0.242 86.000 0.000 NA   NA
 5882542 5882543 EC55989_tRNA51 EC55989_23S_7     FALSE 0.040 194.000 0.000 NA   NA
 5882543 5882544 EC55989_23S_7 EC55989_5S_8     FALSE 0.222 93.000 0.000 NA   NA
 5882546 5882547 EC55989_4498 EC55989_4499 metA aceB FALSE 0.010 269.000 0.000 1.000 N NA
 5882547 5882548 EC55989_4499 EC55989_4500 aceB aceA TRUE 0.966 30.000 0.043 0.001 Y NA
 5882548 5882549 EC55989_4500 EC55989_4501 aceA aceK FALSE 0.009 281.000 0.000 1.000 N NA
 5882550 5882551 EC55989_4502 EC55989_4503 arpA iclR FALSE 0.011 317.000 0.000 NA   NA
 5882552 5882553 EC55989_4504 EC55989_4505 metH yjbB FALSE 0.007 220.000 0.006 1.000 N NA
 5882557 5882558 EC55989_4509 EC55989_4510     TRUE 0.869 -3.000 0.026 NA   NA
 5882559 5882560 EC55989_4511 EC55989_4512   lysC FALSE 0.124 139.000 0.000 1.000   NA
 5882560 5882561 EC55989_4512 EC55989_misc_RNA_99 lysC   FALSE 0.226 92.000 0.000 NA   NA
 5882564 5882565 EC55989_4515 EC55989_4516 yjbF yjbG TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 5882565 5882566 EC55989_4516 EC55989_4517 yjbG yjbH TRUE 0.961 0.000 0.140 NA   NA
 5882566 5882567 EC55989_4517 EC55989_4518 yjbH   TRUE 0.909 4.000 0.000 NA   NA
 5882570 5882571 EC55989_4522 EC55989_4523 xylE malG FALSE 0.009 372.000 0.000 1.000   NA
 5882571 5882572 EC55989_4523 EC55989_4524 malG malF TRUE 0.998 15.000 0.814 0.038 Y NA
 5882572 5882573 EC55989_4524 EC55989_4525 malF malE FALSE 0.355 154.000 0.000 1.000 Y NA
 5882574 5882575 EC55989_4526 EC55989_4527 malK lamB TRUE 0.857 72.000 0.111 0.048 Y NA
 5882575 5882576 EC55989_4527 EC55989_4528 lamB malM FALSE 0.164 152.000 0.143 1.000   NA
 5882576 5882577 EC55989_4528 EC55989_4529 malM   FALSE 0.023 229.000 0.000 NA   NA
 5882577 5882578 EC55989_4529 EC55989_4530   yjbI FALSE 0.360 58.000 0.000 NA   NA
 5882578 5882579 EC55989_4530 EC55989_4531 yjbI ubiC FALSE 0.025 223.000 0.000 NA   NA
 5882579 5882580 EC55989_4531 EC55989_4532 ubiC ubiA TRUE 0.990 13.000 0.248 NA Y NA
 5882582 5882583 EC55989_4534 EC55989_4536 dgkA lexA FALSE 0.249 110.000 0.141 1.000 N NA
 5882583 5882584 EC55989_4536 EC55989_4537 lexA dinF TRUE 0.676 19.000 0.033 1.000 N NA
 5882584 5882585 EC55989_4537 EC55989_4538 dinF yjbJ FALSE 0.144 96.000 0.021 NA   NA
 5882587 5882588 EC55989_4540 EC55989_4541 yjbL yjbM TRUE 0.786 -9.000 0.000 NA   NA
 5882588 5882589 EC55989_4541 EC55989_4542 yjbM yjbN FALSE 0.008 364.000 0.000 NA   NA
 5882589 5882590 EC55989_4542 EC55989_4543 yjbN yjbO FALSE 0.460 -76.000 0.000 NA   NA
 5882592 5882593 EC55989_4545 EC55989_4546 dnaB alr TRUE 0.730 53.000 0.317 1.000 N NA
 5882593 5882594 EC55989_4546 EC55989_4547 alr tyrB FALSE 0.038 253.000 0.181 1.000 N NA
 5882596 5882597 EC55989_4549 EC55989_4550 aphA yjbQ FALSE 0.104 111.000 0.009 NA   NA
 5882597 5882598 EC55989_4550 EC55989_4551 yjbQ yjbR TRUE 0.858 4.000 0.018 NA   NA
 5882606 5882607 EC55989_4559 EC55989_4560 yjcD yjcE FALSE 0.157 151.000 0.130 1.000   NA
 5882608 5882609 EC55989_4561 EC55989_4562 yjcF actP FALSE 0.052 178.000 0.000 NA   NA
 5882609 5882610 EC55989_4562 EC55989_4563 actP yjcH TRUE 0.993 -3.000 0.733 NA   NA
 5882610 5882611 EC55989_4563 EC55989_4564 yjcH acs FALSE 0.073 200.000 0.147 NA   NA
 5882612 5882613 EC55989_4565 EC55989_4566 nrfA nrfB TRUE 0.813 45.000 0.083 0.001   NA
 5882613 5882614 EC55989_4566 EC55989_4567 nrfB nrfC TRUE 0.972 -3.000 0.049 0.001   NA
 5882614 5882615 EC55989_4567 EC55989_4568 nrfC nrfD TRUE 0.997 -3.000 0.927 0.001 N NA
 5882615 5882616 EC55989_4568 EC55989_4569 nrfD nrfE TRUE 0.657 80.000 0.400 1.000 N NA
 5882616 5882617 EC55989_4569 EC55989_4570 nrfE nrfF TRUE 0.983 -7.000 0.214 NA Y NA
 5882617 5882618 EC55989_4570 EC55989_4571 nrfF nrfG TRUE 0.996 -3.000 0.464 NA Y NA
 5882618 5882619 EC55989_4571 EC55989_4572 nrfG gltP FALSE 0.006 342.000 0.000 1.000 N NA
 5882620 5882621 EC55989_4573 EC55989_4574 yjcO fdhF FALSE 0.339 94.000 0.105 1.000   NA
 5882621 5882622 EC55989_4574 EC55989_4576 fdhF yjcP FALSE 0.044 198.000 0.000 1.000   NA
 5882622 5882623 EC55989_4576 EC55989_4577 yjcP yjcQ TRUE 0.992 -3.000 0.625 NA   NA
 5882623 5882624 EC55989_4577 EC55989_4578 yjcQ yjcR TRUE 0.996 0.000 1.000 NA   NA
 5882624 5882625 EC55989_4578 EC55989_4579 yjcR yjcS FALSE 0.004 503.000 0.000 1.000 N NA
 5882626 5882627 EC55989_4580 EC55989_4582   yjdP FALSE 0.306 69.000 0.000 NA   NA
 5882628 5882629 EC55989_4583 EC55989_4584 phnP phnO TRUE 0.932 2.000 0.000 1.000   NA
 5882629 5882630 EC55989_4584 EC55989_4585 phnO phnN TRUE 0.584 -13.000 0.000 NA N NA
 5882630 5882631 EC55989_4585 EC55989_4586 phnN phnM TRUE 0.994 0.000 0.235 NA Y NA
 5882631 5882632 EC55989_4586 EC55989_4587 phnM phnL TRUE 0.995 -3.000 0.320 1.000 Y NA
 5882632 5882633 EC55989_4587 EC55989_4588 phnL phnK TRUE 0.864 177.000 0.859 0.011 Y NA
 5882633 5882634 EC55989_4588 EC55989_4589 phnK phnJ TRUE 0.999 -3.000 0.883 1.000 Y NA
 5882634 5882635 EC55989_4589 EC55989_4590 phnJ phnI TRUE 0.997 -7.000 0.880 1.000 Y NA
 5882635 5882636 EC55989_4590 EC55989_4591 phnI phnH TRUE 0.999 0.000 0.960 0.001 Y NA
 5882636 5882637 EC55989_4591 EC55989_4592 phnH phnG TRUE 0.999 -3.000 0.967 0.001 Y NA
 5882637 5882638 EC55989_4592 EC55989_4593 phnG phnF TRUE 0.993 1.000 0.691 1.000 N NA
 5882638 5882639 EC55989_4593 EC55989_4594 phnF phnE TRUE 0.880 21.000 0.158 1.000 N NA
 5882639 5882640 EC55989_4594 EC55989_4595 phnE phnD TRUE 0.980 43.000 0.330 0.000 Y NA
 5882640 5882641 EC55989_4595 EC55989_4596 phnD phnC TRUE 0.993 25.000 0.337 0.001 Y NA
 5882641 5882642 EC55989_4596 EC55989_4597 phnC phnB FALSE 0.140 133.000 0.074 NA   NA
 5882642 5882643 EC55989_4597 EC55989_4598 phnB   FALSE 0.042 160.000 0.013 NA   NA
 5882644 5882645 EC55989_4599 EC55989_4600 yjdA yjcZ TRUE 0.995 -3.000 0.857 NA   NA
 5882645 5882646 EC55989_4600 EC55989_4601 yjcZ proP FALSE 0.016 264.000 0.000 NA   NA
 5882647 5882648 EC55989_4603 EC55989_4604 basS basR TRUE 0.988 10.000 0.143 1.000 Y NA
 5882648 5882649 EC55989_4604 EC55989_4605 basR eptA TRUE 0.944 -3.000 0.095 1.000   NA
 5882649 5882650 EC55989_4605 EC55989_4606 eptA adiC FALSE 0.219 104.000 0.000 1.000   NA
 5882650 5882651 EC55989_4606 EC55989_4607 adiC adiY FALSE 0.189 137.000 0.167 1.000 N NA
 5882651 5882652 EC55989_4607 EC55989_4608 adiY adiA FALSE 0.007 325.000 0.000 1.000 N NA
 5882652 5882653 EC55989_4608 EC55989_4609 adiA melR FALSE 0.027 196.000 0.000 1.000 N NA
 5882654 5882655 EC55989_4610 EC55989_4611 melA melB TRUE 0.733 115.000 0.214 1.000 Y NA
 5882656 5882657 EC55989_4612 EC55989_4613 yjdF fumB FALSE 0.146 123.000 0.000 NA   NA
 5882657 5882658 EC55989_4613 EC55989_4614 fumB dcuB FALSE 0.299 78.000 0.000 1.000   NA
 5882658 5882659 EC55989_4614 EC55989_4615 dcuB dcuR FALSE 0.006 571.000 0.000 1.000   NA
 5882659 5882660 EC55989_4615 EC55989_4616 dcuR dcuS TRUE 0.992 -3.000 0.086 0.056 Y NA
 5882661 5882662 EC55989_4618 EC55989_4619 yjdI yjdJ TRUE 0.945 12.000 0.168 NA   NA
 5882662 5882663 EC55989_4619 EC55989_4620 yjdJ yjdK FALSE 0.024 227.000 0.000 NA   NA
 5882663 5882664 EC55989_4620 EC55989_4621 yjdK yjdO TRUE 0.705 28.000 0.000 NA   NA
 5882665 5882666 EC55989_4622 EC55989_4623 lysU yjdL FALSE 0.015 237.000 0.000 1.000 N NA
 5882666 5882667 EC55989_4623 EC55989_4624 yjdL cadA TRUE 0.787 59.000 0.000 1.000 Y NA
 5882667 5882668 EC55989_4624 EC55989_4625 cadA cadB TRUE 0.701 80.000 0.000 1.000 Y NA
 5882668 5882669 EC55989_4625 EC55989_4626 cadB cadC FALSE 0.005 366.000 0.000 1.000 N NA
 5882671 5882672 EC55989_4628 EC55989_4629     TRUE 0.875 85.000 1.000 NA   NA
 5882672 5882673 EC55989_4629 EC55989_4630   yeeW FALSE 0.296 -217.000 0.000 NA   NA
 5882673 5882674 EC55989_4630 EC55989_4631 yeeW yeeV TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5882674 5882675 EC55989_4631 EC55989_4632 yeeV yeeU TRUE 0.522 -58.000 0.000 NA   NA
 5882675 5882676 EC55989_4632 EC55989_4634 yeeU yeeT FALSE 0.256 80.000 0.000 NA   NA
 5882676 5882677 EC55989_4634 EC55989_4635 yeeT yeeS FALSE 0.239 87.000 0.000 NA   NA
 5882677 5882678 EC55989_4635 EC55989_4636 yeeS   TRUE 0.478 46.000 0.000 NA   NA
 5882679 5882680 EC55989_4637 EC55989_4638     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5882680 5882681 EC55989_4638 EC55989_4639     FALSE 0.005 592.000 0.000 NA   NA
 5882681 5882682 EC55989_4639 EC55989_misc_RNA_101     TRUE 0.909 4.000 0.000 NA   NA
 5882682 5882683 EC55989_misc_RNA_101 EC55989_4640     TRUE 0.723 27.000 0.000 NA   NA
 5882684 5882685 EC55989_4641 EC55989_4642 iutA iucD FALSE 0.338 -78.000 0.050 1.000 N NA
 5882685 5882686 EC55989_4642 EC55989_4643 iucD iucC TRUE 0.996 -3.000 0.417 1.000 Y NA
 5882686 5882687 EC55989_4643 EC55989_4644 iucC iucB TRUE 0.981 0.000 0.250 1.000   NA
 5882687 5882688 EC55989_4644 EC55989_4645 iucB iucA TRUE 0.993 1.000 0.609 1.000   NA
 5882694 5882695 EC55989_4651 EC55989_misc_RNA_102     TRUE 0.723 27.000 0.000 NA   NA
 5882695 5882696 EC55989_misc_RNA_102 EC55989_4652     TRUE 0.909 4.000 0.000 NA   NA
 5882696 5882697 EC55989_4652 EC55989_4653     FALSE 0.005 592.000 0.000 NA   NA
 5882697 5882698 EC55989_4653 EC55989_4654     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5882698 5882699 EC55989_4654 EC55989_4655     FALSE 0.023 229.000 0.000 NA   NA
 5882699 5882700 EC55989_4655 EC55989_4656     FALSE 0.363 -103.000 0.000 NA   NA
 5882700 5882701 EC55989_4656 EC55989_4657     FALSE 0.315 67.000 0.000 NA   NA
 5882702 5882703 EC55989_4658 EC55989_4659     FALSE 0.334 63.000 0.000 NA   NA
 5882704 5882705 EC55989_4660 EC55989_4661     FALSE 0.065 165.000 0.000 NA   NA
 5882705 5882706 EC55989_4661 EC55989_misc_RNA_103     FALSE 0.239 87.000 0.000 NA   NA
 5882706 5882707 EC55989_misc_RNA_103 EC55989_4662     TRUE 0.909 4.000 0.000 NA   NA
 5882707 5882708 EC55989_4662 EC55989_4663     FALSE 0.005 592.000 0.000 NA   NA
 5882708 5882709 EC55989_4663 EC55989_4664     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5882709 5882710 EC55989_4664 EC55989_4665     FALSE 0.005 645.000 0.000 NA   NA
 5882710 5882711 EC55989_4665 EC55989_4666     FALSE 0.005 533.000 0.000 NA   NA
 5882711 5882712 EC55989_4666 EC55989_4667     FALSE 0.133 128.000 0.000 NA   NA
 5882712 5882713 EC55989_4667 EC55989_4668     FALSE 0.051 180.000 0.000 NA   NA
 5882714 5882715 EC55989_4669 EC55989_4670     FALSE 0.022 234.000 0.000 NA   NA
 5882717 5882718 EC55989_4672 EC55989_4673     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5882718 5882719 EC55989_4673 EC55989_4674     FALSE 0.005 592.000 0.000 NA   NA
 5882719 5882720 EC55989_4674 EC55989_misc_RNA_104     TRUE 0.909 4.000 0.000 NA   NA
 5882720 5882721 EC55989_misc_RNA_104 EC55989_4675     TRUE 0.723 27.000 0.000 NA   NA
 5882722 5882723 EC55989_4676 EC55989_4677     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5882723 5882724 EC55989_4677 EC55989_4678     FALSE 0.024 228.000 0.000 NA   NA
 5882724 5882725 EC55989_4678 EC55989_4679     FALSE 0.239 87.000 0.000 NA   NA
 5882727 5882728 EC55989_4681 EC55989_4682     FALSE 0.343 -121.000 0.000 NA   NA
 5882728 5882729 EC55989_4682 EC55989_4683   traF FALSE 0.008 361.000 0.000 NA   NA
 5882731 5882732 EC55989_4685 EC55989_4686     FALSE 0.009 340.000 0.000 NA   NA
 5882734 5882735 EC55989_4688 EC55989_4689 int   FALSE 0.329 64.000 0.000 NA   NA
 5882735 5882736 EC55989_4689 EC55989_tRNA59     FALSE 0.352 -114.000 0.000 NA   NA
 5882736 5882737 EC55989_tRNA59 EC55989_4690   yjdC FALSE 0.182 107.000 0.000 NA   NA
 5882737 5882738 EC55989_4690 EC55989_4691 yjdC dipZ TRUE 0.842 37.000 0.217 1.000   NA
 5882738 5882739 EC55989_4691 EC55989_4692 dipZ cutA TRUE 0.639 -24.000 0.092 1.000 N NA
 5882739 5882740 EC55989_4692 EC55989_4693 cutA dcuA FALSE 0.118 116.000 0.005 1.000   NA
 5882740 5882741 EC55989_4693 EC55989_4694 dcuA aspA FALSE 0.122 118.000 0.015 1.000   NA
 5882744 5882745 EC55989_4697 EC55989_4698 groS groL TRUE 0.986 44.000 0.631 0.063 Y NA
 5882745 5882746 EC55989_4698 EC55989_4699 groL yjeI FALSE 0.114 138.000 0.062 NA   NA
 5882747 5882748 EC55989_4700 EC55989_4701 yjeJ yjeK FALSE 0.007 390.000 0.000 NA   NA
 5882749 5882750 EC55989_4702 EC55989_4703 efp ecnA FALSE 0.328 52.000 0.007 1.000   NA
 5882750 5882751 EC55989_4703 EC55989_4704 ecnA ecnB TRUE 0.639 111.000 0.212 0.000   NA
 5882751 5882752 EC55989_4704 EC55989_4705 ecnB sugE FALSE 0.077 175.000 0.074 1.000   NA
 5882753 5882754 EC55989_4706 EC55989_4707 blc ampC FALSE 0.102 89.000 0.022 1.000 N NA
 5882754 5882755 EC55989_4707 EC55989_4708 ampC frdD FALSE 0.157 63.000 0.022 1.000 N NA
 5882755 5882756 EC55989_4708 EC55989_4709 frdD frdC TRUE 0.999 11.000 0.787 0.002 Y NA
 5882756 5882757 EC55989_4709 EC55989_4710 frdC frdB TRUE 0.998 11.000 0.454 0.002 Y NA
 5882757 5882758 EC55989_4710 EC55989_4711 frdB frdA TRUE 0.996 -7.000 0.470 0.002 Y NA
 5882759 5882760 EC55989_4712 EC55989_4713 poxA yjeM FALSE 0.008 219.000 0.009 1.000 N NA
 5882760 5882761 EC55989_4713 EC55989_4714 yjeM yjeN TRUE 0.821 52.000 0.400 NA   NA
 5882761 5882762 EC55989_4714 EC55989_4715 yjeN yjeO TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5882763 5882764 EC55989_4716 EC55989_4717 yjeP psd TRUE 0.863 22.000 0.148 1.000 N NA
 5882764 5882765 EC55989_4717 EC55989_4718 psd rsgA FALSE 0.307 97.000 0.095 1.000   NA
 5882766 5882767 EC55989_4719 EC55989_tRNA52 orn   FALSE 0.030 211.000 0.000 NA   NA
 5882767 5882768 EC55989_tRNA52 EC55989_tRNA53     TRUE 0.600 37.000 0.000 NA   NA
 5882768 5882769 EC55989_tRNA53 EC55989_tRNA54     TRUE 0.611 36.000 0.000 NA   NA
 5882771 5882772 EC55989_4722 EC55989_4723 yjeF yjeE TRUE 0.719 -28.000 0.118 NA   NA
 5882772 5882773 EC55989_4723 EC55989_4724 yjeE amiB TRUE 0.883 19.000 0.109 NA   NA
 5882773 5882774 EC55989_4724 EC55989_4725 amiB mutL TRUE 0.895 10.000 0.092 1.000 N NA
 5882774 5882775 EC55989_4725 EC55989_4726 mutL miaA TRUE 0.947 -7.000 0.188 0.062 N NA
 5882775 5882776 EC55989_4726 EC55989_4727 miaA hfq TRUE 0.768 86.000 0.531 1.000   NA
 5882776 5882777 EC55989_4727 EC55989_4728 hfq hflX FALSE 0.455 77.000 0.141 1.000   NA
 5882777 5882778 EC55989_4728 EC55989_4729 hflX hflK TRUE 0.621 86.000 0.184 0.059   NA
 5882778 5882779 EC55989_4729 EC55989_4730 hflK hflC TRUE 0.999 3.000 0.947 0.008 Y NA
 5882779 5882780 EC55989_4730 EC55989_4731 hflC yjeT TRUE 0.657 82.000 0.348 NA   NA
 5882780 5882781 EC55989_4731 EC55989_4732 yjeT purA FALSE 0.178 104.000 0.051 NA   NA
 5882781 5882782 EC55989_4732 EC55989_4733 purA nsrR FALSE 0.006 205.000 0.010 NA N NA
 5882782 5882783 EC55989_4733 EC55989_4734 nsrR rnr TRUE 0.883 39.000 0.038 NA Y NA
 5882783 5882784 EC55989_4734 EC55989_4735 rnr rlmB FALSE 0.163 180.000 0.147 0.012 N NA
 5882784 5882785 EC55989_4735 EC55989_4736 rlmB yjfI FALSE 0.077 127.000 0.002 NA   NA
 5882785 5882786 EC55989_4736 EC55989_4737 yjfI yjfJ TRUE 0.989 19.000 0.911 NA   NA
 5882786 5882787 EC55989_4737 EC55989_4738 yjfJ yjfK FALSE 0.458 51.000 0.071 NA   NA
 5882787 5882788 EC55989_4738 EC55989_4739 yjfK yjfL TRUE 0.968 18.000 0.379 NA   NA
 5882790 5882791 EC55989_4741 EC55989_4743 yjfM yjfC TRUE 0.907 3.000 0.049 NA   NA
 5882791 5882792 EC55989_4743 EC55989_4744 yjfC aidB FALSE 0.294 84.000 0.133 NA N NA
 5882793 5882794 EC55989_4745 EC55989_4746 yjfN yjfO TRUE 0.503 149.000 0.588 NA   NA
 5882796 5882797 EC55989_4748 EC55989_4749 ulaR ulaG FALSE 0.207 108.000 0.000 1.000   NA
 5882798 5882799 EC55989_4750 EC55989_4751 ulaA ulaB TRUE 0.940 16.000 0.059 0.012   NA
 5882799 5882800 EC55989_4751 EC55989_4752 ulaB ulaC TRUE 0.993 10.000 0.115 0.009 Y NA
 5882800 5882801 EC55989_4752 EC55989_4753 ulaC ulaD TRUE 0.992 14.000 0.328 1.000 Y NA
 5882801 5882802 EC55989_4753 EC55989_4754 ulaD ulaE TRUE 0.992 10.000 0.250 1.000 Y NA
 5882802 5882803 EC55989_4754 EC55989_4755 ulaE ulaF TRUE 0.994 0.000 0.200 1.000 Y NA
 5882803 5882804 EC55989_4755 EC55989_4756 ulaF yagU FALSE 0.209 97.000 0.057 NA   NA
 5882806 5882807 EC55989_4758 EC55989_4759 rpsF priB TRUE 0.922 7.000 0.122 1.000 N NA
 5882807 5882808 EC55989_4759 EC55989_4760 priB rpsR TRUE 0.930 5.000 0.128 1.000 N NA
 5882808 5882809 EC55989_4760 EC55989_4761 rpsR rplI TRUE 0.985 42.000 0.499 0.008 Y NA
 5882815 5882816 EC55989_4767 EC55989_4768 fklB cycA FALSE 0.008 309.000 0.000 1.000 N NA
 5882817 5882818 EC55989_4769 EC55989_4770 ytfE ytfF FALSE 0.240 108.000 0.150 NA N NA
 5882818 5882819 EC55989_4770 EC55989_4771 ytfF ytfG TRUE 0.583 99.000 0.021 1.000 Y NA
 5882825 5882826 EC55989_4777 EC55989_4778 ytfL msrA FALSE 0.009 323.000 0.042 NA   NA
 5882827 5882828 EC55989_4779 EC55989_4780 ytfM ytfN TRUE 0.991 -3.000 0.575 NA   NA
 5882828 5882829 EC55989_4780 EC55989_4781 ytfN ytfP TRUE 0.963 3.000 0.167 NA   NA
 5882829 5882830 EC55989_4781 EC55989_4782 ytfP chpS FALSE 0.029 212.000 0.000 NA   NA
 5882830 5882831 EC55989_4782 EC55989_4783 chpS chpB TRUE 0.992 -6.000 0.375 NA Y NA
 5882833 5882834 EC55989_4786 EC55989_4787 ytfQ ytfR FALSE 0.394 310.000 0.804 NA Y NA
 5882834 5882835 EC55989_4787 EC55989_4788 ytfR ytfT TRUE 0.995 14.000 0.506 1.000 Y NA
 5882835 5882836 EC55989_4788 EC55989_4789 ytfT yjfF TRUE 0.997 -13.000 0.865 0.038 Y NA
 5882840 5882841 EC55989_4793 EC55989_4794 pmbA cybC FALSE 0.033 183.000 0.028 NA   NA
 5882842 5882843 EC55989_4795 EC55989_4796 nrdG nrdD FALSE 0.339 158.000 0.464 1.000 N NA
 5882843 5882844 EC55989_4796 EC55989_4797 nrdD treC FALSE 0.005 403.000 0.000 1.000 N NA
 5882844 5882845 EC55989_4797 EC55989_4798 treC treB TRUE 0.972 50.000 0.650 1.000 Y NA
 5882845 5882846 EC55989_4798 EC55989_4799 treB treR FALSE 0.257 119.000 0.168 1.000 N NA
 5882848 5882849 EC55989_4801 EC55989_4803   yjgF FALSE 0.007 277.000 0.000 NA N NA
 5882849 5882850 EC55989_4803 EC55989_4804 yjgF pyrI FALSE 0.243 73.000 0.084 NA N NA
 5882850 5882851 EC55989_4804 EC55989_4805 pyrI pyrB TRUE 0.994 13.000 0.197 0.002 Y NA
 5882851 5882852 EC55989_4805 EC55989_5076 pyrB pyrL TRUE 0.875 4.000 0.005 1.000   NA
 5882852 5882853 EC55989_5076 EC55989_4806 pyrL yjgH FALSE 0.014 281.000 0.000 NA   NA
 5882853 5882854 EC55989_4806 EC55989_4807 yjgH yjgI FALSE 0.069 131.000 0.000 NA N NA
 5882855 5882856 EC55989_4808 EC55989_4809 yjgJ yjgK FALSE 0.051 145.000 0.000 NA N NA
 5882856 5882857 EC55989_4809 EC55989_4810 yjgK yjgL FALSE 0.146 123.000 0.000 NA   NA
 5882857 5882858 EC55989_4810 EC55989_4811 yjgL yjgL TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5882863 5882864 EC55989_4816 EC55989_4817 valS holC TRUE 0.926 0.000 0.089 1.000 N NA
 5882864 5882865 EC55989_4817 EC55989_4818 holC pepA TRUE 0.483 134.000 0.494 1.000 N NA
 5882866 5882867 EC55989_4819 EC55989_4820 yjgP yjgQ TRUE 0.996 0.000 0.631 0.058   NA
 5882868 5882869 EC55989_4821 EC55989_4822 yjgR idnR FALSE 0.202 78.000 0.007 1.000   NA
 5882869 5882870 EC55989_4822 EC55989_4823 idnR idnT TRUE 0.515 67.000 0.200 1.000 N NA
 5882870 5882871 EC55989_4823 EC55989_4824 idnT idnO FALSE 0.374 65.000 0.111 1.000 N NA
 5882871 5882872 EC55989_4824 EC55989_4825 idnO idnD TRUE 0.955 24.000 0.444 1.000 N NA
 5882874 5882875 EC55989_4827 EC55989_4828 yjgB   FALSE 0.216 75.000 0.032 NA   NA
 5882876 5882877 EC55989_tRNA55 EC55989_4829   intB FALSE 0.016 262.000 0.000 NA   NA
 5882878 5882879 EC55989_4830 EC55989_4831     FALSE 0.066 174.000 0.000 1.000   NA
 5882880 5882881 EC55989_4832 EC55989_4833     TRUE 0.995 5.000 0.917 NA   NA
 5882881 5882882 EC55989_4833 EC55989_4834     TRUE 0.962 -40.000 0.957 NA   NA
 5882882 5882883 EC55989_4834 EC55989_4835     TRUE 0.587 38.000 0.000 NA   NA
 5882883 5882884 EC55989_4835 EC55989_4836     TRUE 0.921 1.000 0.000 NA   NA
 5882884 5882885 EC55989_4836 EC55989_4837     FALSE 0.016 262.000 0.000 NA   NA
 5882886 5882887 EC55989_4838 EC55989_4839     TRUE 0.993 0.000 0.623 NA   NA
 5882887 5882888 EC55989_4839 EC55989_4840     TRUE 0.879 -58.000 0.365 1.000   NA
 5882888 5882889 EC55989_4840 EC55989_4841     TRUE 0.982 -3.000 0.344 NA   NA
 5882889 5882890 EC55989_4841 EC55989_4842     FALSE 0.028 215.000 0.000 NA   NA
 5882891 5882892 EC55989_4843 EC55989_4844     TRUE 0.853 -3.000 0.015 NA   NA
 5882893 5882894 EC55989_4845 EC55989_4846     TRUE 0.600 37.000 0.000 NA   NA
 5882894 5882895 EC55989_4846 EC55989_4847     TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 5882895 5882896 EC55989_4847 EC55989_4848     TRUE 0.905 69.000 1.000 NA   NA
 5882896 5882897 EC55989_4848 EC55989_4849     FALSE 0.163 115.000 0.000 NA   NA
 5882897 5882898 EC55989_4849 EC55989_misc_RNA_105   RNAout FALSE 0.381 55.000 0.000 NA   NA
 5882900 5882901 EC55989_4851 EC55989_4852     TRUE 0.656 -25.000 0.000 1.000   NA
 5882901 5882902 EC55989_4852 EC55989_4853     TRUE 0.559 -60.000 0.000 1.000   NA
 5882903 5882904 EC55989_misc_RNA_106 EC55989_4854 RNAout   FALSE 0.004 1462.000 0.000 NA   NA
 5882904 5882905 EC55989_4854 EC55989_4855     FALSE 0.384 -118.000 0.071 NA   NA
 5882905 5882906 EC55989_4855 EC55989_4856     TRUE 0.943 8.000 0.136 NA   NA
 5882913 5882914 EC55989_4862 EC55989_4863     FALSE 0.093 145.000 0.000 NA   NA
 5882915 5882916 EC55989_4864 EC55989_4865 insE insF TRUE 0.961 -3.000 0.000 0.057   NA
 5882917 5882918 EC55989_4866 EC55989_4867     FALSE 0.295 71.000 0.000 NA   NA
 5882918 5882919 EC55989_4867 EC55989_4868     TRUE 0.587 38.000 0.000 NA   NA
 5882919 5882920 EC55989_4868 EC55989_4869     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5882920 5882921 EC55989_4869 EC55989_4870     FALSE 0.068 162.000 0.000 NA   NA
 5882922 5882923 EC55989_4871 EC55989_4872     FALSE 0.045 185.000 0.000 NA   NA
 5882924 5882925 EC55989_4873 EC55989_4874     TRUE 0.916 3.000 0.000 NA   NA
 5882926 5882927 EC55989_4875 EC55989_4876     TRUE 0.614 -82.000 0.158 NA   NA
 5882927 5882928 EC55989_4876 EC55989_4877     TRUE 0.859 14.000 0.000 NA   NA
 5882928 5882929 EC55989_4877 EC55989_4878     TRUE 0.985 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5882930 5882931 EC55989_4879 EC55989_4880     FALSE 0.412 -82.000 0.000 NA   NA
 5882931 5882932 EC55989_4880 EC55989_4881     FALSE 0.009 342.000 0.000 NA   NA
 5882937 5882938 EC55989_4886 EC55989_4887   yfjR FALSE 0.034 203.000 0.000 NA   NA
 5882938 5882939 EC55989_4887 EC55989_4888 yfjR   TRUE 0.523 43.000 0.000 NA   NA
 5882939 5882940 EC55989_4888 EC55989_4889     TRUE 0.899 6.000 0.000 NA   NA
 5882940 5882941 EC55989_4889 EC55989_4890     FALSE 0.232 90.000 0.000 NA   NA
 5882941 5882942 EC55989_4890 EC55989_4891     FALSE 0.226 92.000 0.000 NA   NA
 5882942 5882943 EC55989_4891 EC55989_4892   yeeS TRUE 0.496 45.000 0.000 NA   NA
 5882943 5882944 EC55989_4892 EC55989_4893 yeeS yeeT TRUE 0.872 87.000 1.000 NA   NA
 5882944 5882945 EC55989_4893 EC55989_4894 yeeT yeeU FALSE 0.256 80.000 0.000 NA   NA
 5882945 5882946 EC55989_4894 EC55989_4895 yeeU   TRUE 0.533 -51.000 0.000 NA   NA
 5882946 5882947 EC55989_4895 EC55989_4896   yeeW TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5882947 5882948 EC55989_4896 EC55989_4897 yeeW   FALSE 0.287 -352.000 0.000 NA   NA
 5882948 5882949 EC55989_4897 EC55989_4898     FALSE 0.244 85.000 0.000 NA   NA
 5882950 5882951 EC55989_4899 EC55989_4900     TRUE 0.755 -91.000 0.286 1.000   NA
 5882951 5882952 EC55989_4900 EC55989_4901     TRUE 0.968 10.000 0.250 NA   NA
 5882952 5882953 EC55989_4901 EC55989_4902     TRUE 0.864 -43.000 0.333 NA   NA
 5882953 5882954 EC55989_4902 EC55989_4903     FALSE 0.009 335.000 0.000 NA   NA
 5882954 5882955 EC55989_4903 EC55989_4904     FALSE 0.020 245.000 0.000 NA   NA
 5882955 5882956 EC55989_4904 EC55989_4905     FALSE 0.389 54.000 0.000 NA   NA
 5882956 5882957 EC55989_4905 EC55989_4906     TRUE 0.900 -81.000 0.000 0.019 Y NA
 5882958 5882959 EC55989_4907 EC55989_4908     FALSE 0.017 260.000 0.000 NA   NA
 5882959 5882960 EC55989_4908 EC55989_4909     FALSE 0.081 150.000 0.000 NA   NA
 5882960 5882961 EC55989_4909 EC55989_4910     TRUE 0.556 -39.000 0.000 NA   NA
 5882965 5882966 EC55989_4914 EC55989_4915 insA insB TRUE 0.900 -81.000 0.000 0.019 Y NA
 5882968 5882969 EC55989_4917 EC55989_4918 ptsG nanE TRUE 0.995 0.000 0.246 1.000 Y NA
 5882969 5882970 EC55989_4918 EC55989_4919 nanE   FALSE 0.341 61.000 0.000 NA   NA
 5882970 5882971 EC55989_4919 EC55989_4920     TRUE 0.653 -21.000 0.000 NA   NA
 5882974 5882975 EC55989_4923 EC55989_4924     TRUE 0.523 43.000 0.000 NA   NA
 5882975 5882976 EC55989_4924 EC55989_4925   vpeR FALSE 0.124 131.000 0.000 NA   NA
 5882977 5882978 EC55989_4926 EC55989_4927 vpeA vpeB TRUE 0.990 16.000 0.130 0.009 Y NA
 5882978 5882979 EC55989_4927 EC55989_4928 vpeB vpeC TRUE 0.988 13.000 0.377 0.012   NA
 5882982 5882983 EC55989_4931 EC55989_4932 deoM deoP TRUE 0.982 12.000 0.464 NA   NA
 5882983 5882984 EC55989_4932 EC55989_4933 deoP deoK TRUE 0.968 28.000 0.209 NA Y NA
 5882986 5882987 EC55989_4936 EC55989_4937 ilvN ilvN TRUE 0.921 1.000 0.000 NA   NA
 5882987 5882988 EC55989_4937 EC55989_4940 ilvN   FALSE 0.004 967.000 0.000 NA   NA
 5882988 5882989 EC55989_4940 EC55989_4941     TRUE 0.923 31.000 0.000 NA Y NA
 5882989 5882990 EC55989_4941 EC55989_4942     TRUE 0.984 -3.000 0.000 NA Y NA
 5882992 5882993 EC55989_4944 EC55989_4945     FALSE 0.026 219.000 0.000 NA   NA
 5882993 5882994 EC55989_4945 EC55989_4947     TRUE 0.463 48.000 0.059 NA   NA
 5882994 5882995 EC55989_4947 EC55989_4948     FALSE 0.061 148.000 0.000 1.000 N NA
 5882995 5882996 EC55989_4948 EC55989_4949   msbB FALSE 0.034 181.000 0.000 1.000 N NA
 5882996 5882997 EC55989_4949 EC55989_4950 msbB virK FALSE 0.324 65.000 0.000 NA   NA
 5882997 5882998 EC55989_4950 EC55989_4951 virK   TRUE 0.902 5.000 0.000 NA   NA
 5882998 5882999 EC55989_4951 EC55989_4952   shf TRUE 0.881 3.000 0.000 1.000 N NA
 5883000 5883001 EC55989_4953 EC55989_4954   insO FALSE 0.372 56.000 0.000 NA   NA
 5883001 5883002 EC55989_4954 EC55989_4955 insO   FALSE 0.005 592.000 0.000 NA   NA
 5883002 5883003 EC55989_4955 EC55989_misc_RNA_108     TRUE 0.909 4.000 0.000 NA   NA
 5883003 5883004 EC55989_misc_RNA_108 EC55989_4956   insO FALSE 0.334 63.000 0.000 NA   NA
 5883004 5883005 EC55989_4956 EC55989_4957 insO   FALSE 0.306 69.000 0.000 NA   NA
 5883005 5883006 EC55989_4957 EC55989_4958   yjhV TRUE 0.468 -73.000 0.000 NA   NA
 5883009 5883010 EC55989_4961 EC55989_4962 fecD fecC TRUE 0.997 -3.000 0.340 0.037 Y NA
 5883010 5883011 EC55989_4962 EC55989_4963 fecC fecB TRUE 0.999 -3.000 0.864 1.000 Y NA
 5883011 5883012 EC55989_4963 EC55989_4964 fecB fecA TRUE 0.931 45.000 0.211 1.000 Y NA
 5883012 5883013 EC55989_4964 EC55989_4965 fecA fecR TRUE 0.832 87.000 0.267 NA Y NA
 5883013 5883014 EC55989_4965 EC55989_4966 fecR fecI TRUE 0.972 -3.000 0.308 NA N NA
 5883014 5883015 EC55989_4966 EC55989_4968 fecI   FALSE 0.004 1338.000 0.000 NA   NA
 5883017 5883018 EC55989_4970 EC55989_4971     TRUE 0.823 50.000 0.000 NA Y NA
 5883018 5883019 EC55989_4971 EC55989_4972     TRUE 0.984 -3.000 0.000 NA Y NA
 5883019 5883020 EC55989_4972 EC55989_4973     FALSE 0.009 334.000 0.000 NA   NA
 5883020 5883021 EC55989_4973 EC55989_4974     FALSE 0.379 -99.000 0.000 NA   NA
 5883021 5883022 EC55989_4974 EC55989_4975     FALSE 0.018 254.000 0.000 NA   NA
 5883022 5883023 EC55989_4975 EC55989_4976     FALSE 0.004 705.000 0.000 NA   NA
 5883023 5883024 EC55989_4976 EC55989_4977     FALSE 0.012 301.000 0.000 NA   NA
 5883025 5883026 EC55989_4978 EC55989_4979     FALSE 0.256 80.000 0.000 NA   NA
 5883026 5883027 EC55989_4979 EC55989_4980     FALSE 0.058 172.000 0.000 NA   NA
 5883027 5883028 EC55989_4980 EC55989_4981     FALSE 0.004 832.000 0.000 NA   NA
 5883029 5883030 EC55989_4982 EC55989_4983     TRUE 0.900 -81.000 0.000 0.019 Y NA
 5883033 5883034 EC55989_4986 EC55989_4987   uxuA TRUE 0.538 -48.000 0.000 NA   NA
 5883034 5883035 EC55989_4987 EC55989_4988 uxuA uxuB TRUE 0.712 81.000 0.070 1.000 Y NA
 5883035 5883036 EC55989_4988 EC55989_4989 uxuB uxuR FALSE 0.019 215.000 0.000 1.000 N NA
 5883038 5883039 EC55989_4991 EC55989_4992   yjiD TRUE 0.574 -34.000 0.000 NA   NA
 5883040 5883041 EC55989_4993 EC55989_4994 yjiE iadA FALSE 0.190 65.000 0.037 1.000 N NA
 5883041 5883042 EC55989_4994 EC55989_4995 iadA yjiG TRUE 0.850 13.000 0.028 1.000   NA
 5883042 5883043 EC55989_4995 EC55989_4996 yjiG yjiH TRUE 0.966 -3.000 0.019 0.001   NA
 5883045 5883046 EC55989_4998 EC55989_4999 yjiJ yjiK FALSE 0.438 68.000 0.118 NA   NA
 5883046 5883047 EC55989_4999 EC55989_5000 yjiK   FALSE 0.324 65.000 0.000 NA   NA
 5883047 5883048 EC55989_5000 EC55989_5001   hgdC TRUE 0.925 -3.000 0.078 NA   NA
 5883048 5883049 EC55989_5001 EC55989_5002 hgdC yjiM TRUE 0.853 10.000 0.078 NA N NA
 5883049 5883050 EC55989_5002 EC55989_5003 yjiM yjiN FALSE 0.100 116.000 0.013 NA   NA
 5883050 5883051 EC55989_5003 EC55989_5004 yjiN yjiO FALSE 0.436 41.000 0.020 NA   NA
 5883054 5883055 EC55989_5007 EC55989_5008     TRUE 0.896 7.000 0.000 NA   NA
 5883058 5883059 EC55989_5010 EC55989_5011   hsdM TRUE 0.988 0.000 0.239 0.056   NA
 5883059 5883060 EC55989_5011 EC55989_5012 hsdM hsdR TRUE 0.991 31.000 0.564 0.056 Y NA
 5883062 5883063 EC55989_5014 EC55989_5015 yjiA   TRUE 0.959 11.000 0.212 NA   NA
 5883063 5883064 EC55989_5015 EC55989_5016   yjiY TRUE 0.989 5.000 0.531 NA   NA
 5883066 5883067 EC55989_5018 EC55989_5019 yjiZ yjjM FALSE 0.050 215.000 0.182 NA N NA
 5883069 5883070 EC55989_5021 EC55989_5022 mdoB yjjA FALSE 0.018 254.000 0.000 NA   NA
 5883070 5883071 EC55989_5022 EC55989_5023 yjjA dnaC TRUE 0.829 49.000 0.368 NA   NA
 5883071 5883072 EC55989_5023 EC55989_5024 dnaC dnaT TRUE 0.994 3.000 0.778 NA   NA
 5883072 5883073 EC55989_5024 EC55989_5025 dnaT   FALSE 0.163 107.000 0.046 NA   NA
 5883073 5883074 EC55989_5025 EC55989_5026   yjjP TRUE 0.982 -9.000 0.704 NA   NA
 5883075 5883076 EC55989_5027 EC55989_5028 yjjQ bglJ TRUE 0.999 12.000 0.889 0.017 Y NA
 5883079 5883080 EC55989_tRNA58 EC55989_tRNA57     TRUE 0.619 35.000 0.000 NA   NA
 5883080 5883081 EC55989_tRNA57 EC55989_tRNA56     TRUE 0.690 29.000 0.000 NA   NA
 5883081 5883082 EC55989_tRNA56 EC55989_5032   rsmC FALSE 0.012 309.000 0.000 NA   NA
 5883083 5883084 EC55989_5033 EC55989_5034 holD rimI TRUE 0.742 -31.000 0.121 1.000   NA
 5883084 5883085 EC55989_5034 EC55989_5035 rimI yjjG TRUE 0.816 15.000 0.018 1.000   NA
 5883085 5883086 EC55989_5035 EC55989_5036 yjjG prfC FALSE 0.179 91.000 0.012 1.000   NA
 5883086 5883087 EC55989_5036 EC55989_5037 prfC osmY FALSE 0.007 393.000 0.000 NA   NA
 5883087 5883088 EC55989_5037 EC55989_5038 osmY ytjA FALSE 0.177 109.000 0.000 NA   NA
 5883088 5883089 EC55989_5038 EC55989_5039 ytjA yjjU FALSE 0.344 122.000 0.211 NA   NA
 5883089 5883090 EC55989_5039 EC55989_5040 yjjU yjjV TRUE 0.909 -3.000 0.057 NA   NA
 5883091 5883092 EC55989_5041 EC55989_5042 yjjW yjjI TRUE 0.962 -28.000 0.810 NA   NA
 5883093 5883094 EC55989_5043 EC55989_5044 deoC deoA TRUE 0.867 78.000 0.286 1.000 Y NA
 5883094 5883095 EC55989_5044 EC55989_5045 deoA deoB TRUE 0.791 52.000 0.398 1.000 N NA
 5883095 5883096 EC55989_5045 EC55989_5046 deoB deoD TRUE 0.667 80.000 0.414 1.000 N NA
 5883097 5883098 EC55989_5047 EC55989_5048   lplA TRUE 0.647 32.000 0.000 NA   NA
 5883098 5883099 EC55989_5048 EC55989_5049 lplA ytjB TRUE 0.724 28.000 0.066 NA   NA
 5883100 5883101 EC55989_5050 EC55989_5051 serB radA FALSE 0.232 49.000 0.024 1.000 N NA
 5883101 5883102 EC55989_5051 EC55989_5052 radA nadR TRUE 0.594 21.000 0.021 1.000 N NA
 5883104 5883105 EC55989_5054 EC55989_5055 slt trpR FALSE 0.365 90.000 0.167 1.000 N NA
 5883109 5883110 EC55989_5059 EC55989_5060 creA creB TRUE 0.836 13.000 0.038 NA   NA
 5883110 5883111 EC55989_5060 EC55989_5061 creB creC TRUE 0.999 0.000 0.776 1.000 Y NA
 5883111 5883112 EC55989_5061 EC55989_5062 creC creD TRUE 0.670 58.000 0.311 NA N NA
 5883113 5883114 EC55989_5063 EC55989_5064 arcA insI FALSE 0.231 121.000 0.000 0.056 N NA
 5883115 5883116 EC55989_misc_RNA_110 EC55989_5065 RNAC yjtD FALSE 0.004 1090.000 0.000 NA   NA
 5883116 5877972 EC55989_5065 EC55989_5066 yjtD thrL FALSE 0.034 214.000 0.000 1.000   NA
 5877867 5877868 pEC55989_0002 pEC55989_0003     FALSE 0.008 370.000 0.000 NA   NA
 5877868 5877869 pEC55989_0003 pEC55989_0004     FALSE 0.035 202.000 0.000 NA   NA
 5877871 5877872 pEC55989_0006 pEC55989_0007     FALSE 0.184 106.000 0.000 NA   NA
 5877872 5877873 pEC55989_0007 pEC55989_0008     TRUE 0.995 0.000 0.800 NA   NA
 5877873 5877874 pEC55989_0008 pEC55989_0009     TRUE 0.523 43.000 0.000 NA   NA
 5877874 5877875 pEC55989_0009 pEC55989_0010     FALSE 0.004 707.000 0.000 NA   NA
 5877875 5877876 pEC55989_0010 pEC55989_0011     TRUE 0.896 -16.000 0.000 0.001   NA
 5877880 5877881 pEC55989_0014 pEC55989_0015 yihA   FALSE 0.012 294.000 0.000 NA   NA
 5877881 5877882 pEC55989_0015 pEC55989_0016     FALSE 0.059 170.000 0.000 NA   NA
 5877882 5877883 pEC55989_0016 pEC55989_0017     FALSE 0.005 532.000 0.000 NA   NA
 5877883 5877884 pEC55989_0017 pEC55989_0018     FALSE 0.005 629.000 0.000 NA   NA
 5877884 5877885 pEC55989_0018 pEC55989_0019     TRUE 0.891 55.000 0.667 NA   NA
 5877885 5877886 pEC55989_0019 pEC55989_0020     TRUE 0.561 -37.000 0.000 NA   NA
 5877886 5877887 pEC55989_0020 pEC55989_0021     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5877887 5877888 pEC55989_0021 pEC55989_0022     TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5877888 5877889 pEC55989_0022 pEC55989_0023     TRUE 0.909 -13.000 0.000 0.001   NA
 5877889 5877890 pEC55989_0023 pEC55989_0024     TRUE 0.934 22.000 0.000 0.001   NA
 5877890 5877891 pEC55989_0024 pEC55989_0025     TRUE 0.972 5.000 0.000 0.001   NA
 5877891 5877892 pEC55989_0025 pEC55989_0026   traY TRUE 0.864 34.000 0.000 0.001   NA
 5877892 5877893 pEC55989_0026 pEC55989_0027 traY   FALSE 0.271 88.000 0.000 1.000   NA
 5877897 5877898 pEC55989_0030 pEC55989_0031     TRUE 0.587 38.000 0.000 NA   NA
 5877898 5877899 pEC55989_0031 pEC55989_0032     FALSE 0.011 319.000 0.000 NA   NA
 5877899 5877900 pEC55989_0032 pEC55989_0033     TRUE 0.850 97.000 1.000 NA   NA
 5877901 5877902 pEC55989_0034 pEC55989_misc_rna21835D   flmB FALSE 0.354 -110.000 0.000 NA   NA
 5877903 5877904 pEC55989_0035 pEC55989_0036     FALSE 0.004 832.000 0.000 NA   NA
 5877904 5877905 pEC55989_0036 pEC55989_0037     TRUE 0.568 -36.000 0.000 NA   NA
 5877907 5877908 pEC55989_0039 pEC55989_0040     FALSE 0.006 471.000 0.000 NA   NA
 5877908 5877909 pEC55989_0040 pEC55989_0041     FALSE 0.097 143.000 0.000 NA   NA
 5877909 5877910 pEC55989_0041 pEC55989_0042     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5877910 5877911 pEC55989_0042 pEC55989_0043     FALSE 0.027 217.000 0.000 NA   NA
 5877911 5877912 pEC55989_0043 pEC55989_0044     TRUE 0.982 10.000 0.400 NA   NA
 5877914 5877915 pEC55989_0046 pEC55989_0047     FALSE 0.031 209.000 0.000 NA   NA
 5877915 5877916 pEC55989_0047 pEC55989_0048     TRUE 0.651 90.000 0.000 NA Y NA
 5877916 5877917 pEC55989_0048 pEC55989_0049     TRUE 0.923 31.000 0.000 NA Y NA
 5877917 5877918 pEC55989_0049 pEC55989_0050     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA Y NA
 5877918 5877919 pEC55989_0050 pEC55989_0051     FALSE 0.333 120.000 0.000 0.016   NA
 5877919 5877920 pEC55989_0051 pEC55989_0052   renD FALSE 0.065 217.000 0.000 0.055   NA
 5877920 5877921 pEC55989_0052 pEC55989_0053 renD   TRUE 0.961 -3.000 0.000 0.055   NA
 5877921 5877922 pEC55989_0053 pEC55989_0054   aatD FALSE 0.005 723.000 0.000 1.000   NA
 5877922 5877923 pEC55989_0054 pEC55989_0055 aatD aatC TRUE 0.894 12.000 0.000 1.000   NA
 5877923 5877924 pEC55989_0055 pEC55989_0056 aatC aatB TRUE 0.990 -7.000 1.000 NA   NA
 5877924 5877925 pEC55989_0056 pEC55989_0057 aatB aatA TRUE 0.654 -103.000 0.222 NA   NA
 5877925 5877926 pEC55989_0057 pEC55989_0058 aatA aatP TRUE 0.970 -3.000 0.222 NA   NA
 5877927 5877928 pEC55989_0059 pEC55989_0060     FALSE 0.097 143.000 0.000 NA   NA
 5877929 5877930 pEC55989_0061 pEC55989_0062     FALSE 0.036 318.000 0.000 0.002   NA
 5877930 5877931 pEC55989_0062 pEC55989_0063     FALSE 0.004 704.000 0.000 NA   NA
 5877931 5877932 pEC55989_0063 pEC55989_0064     FALSE 0.312 -183.000 0.000 NA   NA
 5877932 5877933 pEC55989_0064 pEC55989_0065     FALSE 0.408 52.000 0.000 NA   NA
 5877933 5877934 pEC55989_0065 pEC55989_0066     TRUE 0.899 6.000 0.000 NA   NA
 5877934 5877935 pEC55989_0066 pEC55989_0067     FALSE 0.027 218.000 0.000 NA   NA
 5877935 5877936 pEC55989_0067 pEC55989_0068     FALSE 0.166 114.000 0.000 NA   NA
 5877939 5877940 pEC55989_0072 pEC55989_0073 aggR   FALSE 0.296 101.000 0.000 0.055 N NA
 5877940 5877941 pEC55989_0073 pEC55989_0074     FALSE 0.046 196.000 0.000 1.000   NA
 5877941 5877942 pEC55989_0074 pEC55989_0075     FALSE 0.019 264.000 0.000 1.000   NA
 5877943 5877944 pEC55989_0077 pEC55989_0078     TRUE 0.899 6.000 0.000 NA   NA
 5877944 5877945 pEC55989_0078 pEC55989_0079     FALSE 0.352 59.000 0.000 NA   NA
 5877945 5877946 pEC55989_0079 pEC55989_0080     TRUE 0.909 4.000 0.000 NA   NA
 5877947 5877948 pEC55989_0081 pEC55989_0082     FALSE 0.055 175.000 0.000 NA   NA
 5877949 5877950 pEC55989_0083 pEC55989_0084   agg3A FALSE 0.442 49.000 0.000 NA   NA
 5877950 5877951 pEC55989_0084 pEC55989_0085 agg3A agg3B FALSE 0.055 175.000 0.000 NA   NA
 5877951 5877952 pEC55989_0085 pEC55989_0086 agg3B agg3C TRUE 0.880 14.000 0.000 1.000   NA
 5877952 5877953 pEC55989_0086 pEC55989_0087 agg3C agg3D TRUE 0.813 54.000 0.000 1.000 Y NA
 5877954 5877955 pEC55989_0088 pEC55989_0089     TRUE 0.957 6.000 0.000 0.055   NA
 5877955 5877956 pEC55989_0089 pEC55989_0090     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5877956 5877957 pEC55989_0090 pEC55989_0091     FALSE 0.005 592.000 0.000 NA   NA
 5877957 5877958 pEC55989_0091 pEC55989_0092     FALSE 0.184 117.000 0.000 1.000   NA
 5877958 5877959 pEC55989_0092 pEC55989_0093     FALSE 0.378 -142.000 0.000 1.000   NA
 5877960 5877961 pEC55989_0094 pEC55989_0095 stbB stbA TRUE 0.916 -31.000 0.455 NA   NA
 5877962 5877963 pEC55989_0096 pEC55989_0097     TRUE 0.847 -6.000 0.000 NA   NA
 5877964 5877965 pEC55989_0098 pEC55989_0099     TRUE 0.933 1.000 0.000 1.000   NA
 5877965 5877966 pEC55989_0099 pEC55989_0100     TRUE 0.614 -25.000 0.000 NA   NA
 5877966 5877967 pEC55989_0100 pEC55989_0101     FALSE 0.012 302.000 0.000 NA   NA
 5877969 5877970 pEC55989_0103 pEC55989_0104     TRUE 0.923 31.000 0.000 NA Y NA
 5877970 5877971 pEC55989_0104 pEC55989_0105     TRUE 0.984 -3.000 0.000 NA Y NA