MicrobesOnline Operon Predictions for Escherichia coli IAI1

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5863540 5863541 ECIAI1_misc_RNA_1 ECIAI1_4628   thrL FALSE 0.415 -71.000 0.000 NA   NA
 5863541 5863542 ECIAI1_4628 ECIAI1_0002 thrL thrA FALSE 0.258 81.000 0.043 1.000   NA
 5863542 5863543 ECIAI1_0002 ECIAI1_0003 thrA thrB TRUE 0.992 2.000 0.133 1.000 Y NA
 5863543 5863544 ECIAI1_0003 ECIAI1_0004 thrB thrC TRUE 0.994 1.000 0.233 1.000 Y NA
 5863544 5863545 ECIAI1_0004 ECIAI1_0005 thrC yaaX FALSE 0.013 214.000 0.003 NA   NA
 5863546 5863547 ECIAI1_0006 ECIAI1_0007 yaaA yaaJ FALSE 0.195 70.000 0.028 NA   NA
 5863548 5863549 ECIAI1_0009 ECIAI1_0010 talB mogA FALSE 0.136 115.000 0.042 1.000 N NA
 5863550 5863551 ECIAI1_0011 ECIAI1_0012 yaaH htpY FALSE 0.067 149.000 0.043 NA   NA
 5863551 5863552 ECIAI1_0012 ECIAI1_0013 htpY yaaI TRUE 0.929 26.000 0.500 NA   NA
 5863553 5863554 ECIAI1_0014 ECIAI1_misc_RNA_2 dnaK tpke11 TRUE 0.876 1.000 0.000 NA   NA
 5863554 5863555 ECIAI1_misc_RNA_2 ECIAI1_0015 tpke11 dnaJ TRUE 0.880 0.000 0.000 NA   NA
 5863557 5863558 ECIAI1_misc_RNA_3 ECIAI1_0017 sokC nhaA FALSE 0.003 483.000 0.000 NA   NA
 5863558 5863559 ECIAI1_0017 ECIAI1_0018 nhaA nhaR TRUE 0.658 60.000 0.292 1.000 N NA
 5863560 5863561 ECIAI1_0019 ECIAI1_0020     TRUE 0.835 13.000 0.000 1.000   NA
 5863561 5863562 ECIAI1_0020 ECIAI1_0021     FALSE 0.008 583.000 0.000 0.064   NA
 5863562 5863563 ECIAI1_0021 ECIAI1_0022     FALSE 0.004 433.000 0.000 NA   NA
 5863563 5863564 ECIAI1_0022 ECIAI1_0024   rpsT FALSE 0.003 484.000 0.000 NA   NA
 5863565 5863566 ECIAI1_0025 ECIAI1_0026 yaaY ribF TRUE 0.798 8.000 0.019 NA   NA
 5863566 5863567 ECIAI1_0026 ECIAI1_0027 ribF ileS TRUE 0.717 43.000 0.254 1.000 N NA
 5863567 5863568 ECIAI1_0027 ECIAI1_0028 ileS lspA TRUE 0.884 0.000 0.045 1.000 N NA
 5863568 5863569 ECIAI1_0028 ECIAI1_0029 lspA fkpB FALSE 0.410 88.000 0.154 1.000 N NA
 5863569 5863570 ECIAI1_0029 ECIAI1_0030 fkpB ispH TRUE 0.991 2.000 0.626 1.000 N NA
 5863570 5863571 ECIAI1_0030 ECIAI1_0031 ispH rihC FALSE 0.139 66.000 0.028 NA N NA
 5863571 5863572 ECIAI1_0031 ECIAI1_0032 rihC dapB FALSE 0.016 167.000 0.003 NA N NA
 5863572 5863573 ECIAI1_0032 ECIAI1_0033 dapB carA FALSE 0.033 456.000 0.034 1.000 Y NA
 5863573 5863574 ECIAI1_0033 ECIAI1_0034 carA carB TRUE 0.994 18.000 0.345 0.001 Y NA
 5863577 5863578 ECIAI1_0037 ECIAI1_0038 caiE caiD TRUE 0.885 6.000 0.000 1.000   NA
 5863578 5863579 ECIAI1_0038 ECIAI1_0039 caiD caiC TRUE 0.763 109.000 0.000 0.023 Y NA
 5863579 5863580 ECIAI1_0039 ECIAI1_0040 caiC caiB TRUE 0.661 59.000 0.154 0.023 N NA
 5863580 5863581 ECIAI1_0040 ECIAI1_0041 caiB caiA TRUE 0.592 129.000 0.529 1.000 N NA
 5863581 5863582 ECIAI1_0041 ECIAI1_0042 caiA caiT TRUE 0.638 31.000 0.118 1.000 N NA
 5863583 5863584 ECIAI1_0043 ECIAI1_0044 fixA fixB TRUE 0.992 15.000 0.231 0.015 Y NA
 5863584 5863585 ECIAI1_0044 ECIAI1_0045 fixB fixC TRUE 0.870 51.000 0.000 0.062 Y NA
 5863585 5863586 ECIAI1_0045 ECIAI1_0046 fixC fixX TRUE 0.994 -3.000 0.167 0.062 Y NA
 5863586 5863587 ECIAI1_0046 ECIAI1_0047 fixX yaaU FALSE 0.243 58.000 0.000 1.000 N NA
 5863587 5863588 ECIAI1_0047 ECIAI1_0048 yaaU kefF FALSE 0.191 108.000 0.000 1.000   NA
 5863588 5863589 ECIAI1_0048 ECIAI1_0049 kefF kefC TRUE 0.976 -7.000 0.560 1.000   NA
 5863589 5863590 ECIAI1_0049 ECIAI1_0050 kefC folA FALSE 0.020 192.000 0.012 1.000 N NA
 5863591 5863592 ECIAI1_0051 ECIAI1_0052 apaH apaG TRUE 0.963 7.000 0.267 NA N NA
 5863592 5863593 ECIAI1_0052 ECIAI1_0053 apaG ksgA TRUE 0.891 3.000 0.078 NA N NA
 5863593 5863594 ECIAI1_0053 ECIAI1_0054 ksgA pdxA TRUE 0.954 -3.000 0.197 1.000 N NA
 5863594 5863595 ECIAI1_0054 ECIAI1_0055 pdxA surA TRUE 0.990 0.000 0.561 1.000 N NA
 5863595 5863596 ECIAI1_0055 ECIAI1_0056 surA imp TRUE 0.559 53.000 0.182 1.000 N NA
 5863598 5863599 ECIAI1_0058 ECIAI1_0059 rluA hepA TRUE 0.963 12.000 0.294 1.000 N NA
 5863599 5863600 ECIAI1_0059 ECIAI1_0060 hepA polB TRUE 0.542 165.000 0.098 0.061 Y NA
 5863600 5863601 ECIAI1_0060 ECIAI1_0061 polB araD FALSE 0.154 75.000 0.018 1.000 N NA
 5863601 5863602 ECIAI1_0061 ECIAI1_0062 araD araA FALSE 0.305 169.000 0.017 1.000 Y NA
 5863602 5863603 ECIAI1_0062 ECIAI1_0063 araA araB TRUE 0.926 11.000 0.138 1.000 N NA
 5863604 5863605 ECIAI1_0064 ECIAI1_0065 araC yabI FALSE 0.437 86.000 0.167 NA   NA
 5863606 5863607 ECIAI1_0066 ECIAI1_0067 thiQ thiP TRUE 0.969 -16.000 0.522 0.018 N NA
 5863607 5863608 ECIAI1_0067 ECIAI1_0068 thiP tbpA TRUE 0.971 -24.000 0.697 0.078 N NA
 5863608 5863609 ECIAI1_0068 ECIAI1_misc_RNA_4 tbpA   FALSE 0.440 31.000 0.000 NA   NA
 5863609 5863610 ECIAI1_misc_RNA_4 ECIAI1_0069   sgrR FALSE 0.415 34.000 0.000 NA   NA
 5863611 5863612 ECIAI1_0070 ECIAI1_misc_RNA_5   sgrS FALSE 0.338 -152.000 0.000 NA   NA
 5863612 5863613 ECIAI1_misc_RNA_5 ECIAI1_0071 sgrS setA TRUE 0.492 28.000 0.000 NA   NA
 5863614 5863615 ECIAI1_0072 ECIAI1_0073 leuD leuC TRUE 0.997 11.000 0.309 0.001 Y NA
 5863615 5863616 ECIAI1_0073 ECIAI1_0074 leuC leuB TRUE 0.997 3.000 0.275 0.002 Y NA
 5863616 5863617 ECIAI1_0074 ECIAI1_0075 leuB leuA TRUE 0.996 0.000 0.126 0.002 Y NA
 5863617 5863618 ECIAI1_0075 ECIAI1_misc_RNA_6 leuA   FALSE 0.327 44.000 0.000 NA   NA
 5863618 5863619 ECIAI1_misc_RNA_6 ECIAI1_4629   leuL FALSE 0.365 -100.000 0.000 NA   NA
 5863620 5863621 ECIAI1_0076 ECIAI1_0077 leuO ilvI FALSE 0.006 318.000 0.000 1.000 N NA
 5863621 5863622 ECIAI1_0077 ECIAI1_0078 ilvI ilvH TRUE 0.998 3.000 0.371 0.002 Y NA
 5863622 5863623 ECIAI1_0078 ECIAI1_0079 ilvH fruR FALSE 0.050 180.000 0.063 1.000 N NA
 5863623 5863624 ECIAI1_0079 ECIAI1_0080 fruR mraZ FALSE 0.003 602.000 0.000 NA   NA
 5863624 5863625 ECIAI1_0080 ECIAI1_0081 mraZ mraW TRUE 0.992 2.000 0.635 NA   NA
 5863625 5863626 ECIAI1_0081 ECIAI1_0082 mraW ftsL TRUE 0.962 -3.000 0.227 1.000 N NA
 5863626 5863627 ECIAI1_0082 ECIAI1_0083 ftsL ftsI TRUE 0.865 16.000 0.124 1.000 N NA
 5863627 5863628 ECIAI1_0083 ECIAI1_0084 ftsI murE TRUE 0.950 -13.000 0.059 1.000 Y NA
 5863628 5863629 ECIAI1_0084 ECIAI1_0085 murE murF TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 5863629 5863630 ECIAI1_0085 ECIAI1_0086 murF mraY TRUE 0.995 -6.000 0.309 0.005 Y NA
 5863630 5863631 ECIAI1_0086 ECIAI1_0087 mraY murD TRUE 0.999 3.000 0.647 0.005 Y NA
 5863631 5863632 ECIAI1_0087 ECIAI1_0088 murD ftsW TRUE 0.990 0.000 0.297 0.003 N NA
 5863632 5863633 ECIAI1_0088 ECIAI1_0089 ftsW murG TRUE 0.990 -3.000 0.647 1.000 N NA
 5863633 5863634 ECIAI1_0089 ECIAI1_0090 murG murC TRUE 0.915 54.000 0.283 1.000 Y NA
 5863634 5863635 ECIAI1_0090 ECIAI1_0091 murC ddlB TRUE 0.989 -7.000 0.153 0.005 Y NA
 5863635 5863636 ECIAI1_0091 ECIAI1_0092 ddlB ftsQ TRUE 0.996 2.000 0.372 NA Y NA
 5863636 5863637 ECIAI1_0092 ECIAI1_0093 ftsQ ftsA TRUE 0.977 -3.000 0.389 NA N NA
 5863637 5863638 ECIAI1_0093 ECIAI1_0095 ftsA ftsZ TRUE 0.940 61.000 0.460 1.000 Y NA
 5863638 5863639 ECIAI1_0095 ECIAI1_0096 ftsZ lpxC FALSE 0.335 101.000 0.134 1.000 N NA
 5863639 5863640 ECIAI1_0096 ECIAI1_0097 lpxC secM FALSE 0.021 231.000 0.000 1.000   NA
 5863640 5863641 ECIAI1_0097 ECIAI1_0098 secM secA FALSE 0.355 62.000 0.065 1.000   NA
 5863641 5863642 ECIAI1_0098 ECIAI1_0099 secA mutT TRUE 0.505 60.000 0.168 1.000 N NA
 5863643 5863644 ECIAI1_0100 ECIAI1_0101 yacF coaE TRUE 0.941 0.000 0.110 NA   NA
 5863646 5863647 ECIAI1_0103 ECIAI1_0104 hofC hofB TRUE 0.992 -10.000 0.571 1.000 Y NA
 5863647 5863648 ECIAI1_0104 ECIAI1_0105 hofB ppdD TRUE 0.997 10.000 0.556 NA Y NA
 5863648 5863649 ECIAI1_0105 ECIAI1_0106 ppdD nadC FALSE 0.010 203.000 0.015 NA N NA
 5863650 5863651 ECIAI1_0107 ECIAI1_0108 ampD ampE TRUE 0.993 -3.000 0.249 1.000 Y NA
 5863654 5863655 ECIAI1_misc_RNA_7 ECIAI1_0111 tp2   TRUE 0.769 -4.000 0.000 NA   NA
 5863656 5863657 ECIAI1_0112 ECIAI1_0113 aceE aceF TRUE 0.987 15.000 0.220 1.000 Y NA
 5863657 5863658 ECIAI1_0113 ECIAI1_0114 aceF lpd FALSE 0.232 325.000 0.463 1.000 Y NA
 5863660 5863661 ECIAI1_0116 ECIAI1_0117 acnB yacL FALSE 0.058 176.000 0.068 NA   NA
 5863662 5863663 ECIAI1_0118 ECIAI1_0119 speD speE TRUE 0.981 16.000 0.162 1.000 Y NA
 5863663 5863664 ECIAI1_0119 ECIAI1_0120 speE yacC TRUE 0.593 106.000 0.354 NA   NA
 5863669 5863670 ECIAI1_0125 ECIAI1_0126 yadG yadH TRUE 0.999 -3.000 0.688 0.100 Y NA
 5863670 5863671 ECIAI1_0126 ECIAI1_0127 yadH yadI FALSE 0.146 105.000 0.037 1.000 N NA
 5863671 5863672 ECIAI1_0127 ECIAI1_0128 yadI yadE TRUE 0.883 64.000 0.222 1.000 Y NA
 5863675 5863676 ECIAI1_0131 ECIAI1_0132 panC panB TRUE 0.997 12.000 0.395 0.001 Y NA
 5863676 5863677 ECIAI1_0132 ECIAI1_0133 panB   FALSE 0.136 113.000 0.000 1.000 N NA
 5863677 5863678 ECIAI1_0133 ECIAI1_0134   yadK TRUE 0.824 -19.000 0.000 0.013   NA
 5863678 5863679 ECIAI1_0134 ECIAI1_0135 yadK yadL TRUE 0.967 27.000 0.571 0.013   NA
 5863679 5863680 ECIAI1_0135 ECIAI1_0136 yadL yadM TRUE 0.989 15.000 0.571 0.013   NA
 5863680 5863681 ECIAI1_0136 ECIAI1_0137 yadM htrE TRUE 0.994 17.000 0.571 1.000 Y NA
 5863681 5863682 ECIAI1_0137 ECIAI1_0138 htrE ecpD TRUE 0.988 35.000 1.000 1.000 Y NA
 5863682 5863683 ECIAI1_0138 ECIAI1_0139 ecpD yadN TRUE 0.910 105.000 0.500 1.000 Y NA
 5863683 5863684 ECIAI1_0139 ECIAI1_0140 yadN folK FALSE 0.004 370.000 0.000 1.000 N NA
 5863684 5863685 ECIAI1_0140 ECIAI1_0141 folK pcnB TRUE 0.963 -3.000 0.234 1.000 N NA
 5863685 5863686 ECIAI1_0141 ECIAI1_0142 pcnB yadB TRUE 0.907 39.000 0.131 1.000 Y NA
 5863686 5863687 ECIAI1_0142 ECIAI1_0143 yadB dksA TRUE 0.741 37.000 0.231 1.000 N NA
 5863687 5863688 ECIAI1_0143 ECIAI1_0144 dksA sfsA FALSE 0.106 178.000 0.151 NA   NA
 5863688 5863689 ECIAI1_0144 ECIAI1_0145 sfsA ligT TRUE 0.767 15.000 0.045 NA   NA
 5863690 5863691 ECIAI1_0146 ECIAI1_0147 hrpB mrcB FALSE 0.078 196.000 0.158 1.000 N NA
 5863691 5863692 ECIAI1_0147 ECIAI1_0148 mrcB fhuA FALSE 0.018 220.000 0.000 1.000 N NA
 5863692 5863693 ECIAI1_0148 ECIAI1_0149 fhuA fhuC TRUE 0.880 51.000 0.156 1.000 Y NA
 5863693 5863694 ECIAI1_0149 ECIAI1_0150 fhuC fhuD TRUE 0.987 0.000 0.031 1.000 Y NA
 5863694 5863695 ECIAI1_0150 ECIAI1_0151 fhuD fhuB TRUE 0.983 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5863697 5863698 ECIAI1_0153 ECIAI1_0155 clcA yadR FALSE 0.181 82.000 0.031 NA   NA
 5863699 5863700 ECIAI1_0156 ECIAI1_0157 yadS btuF TRUE 0.711 38.000 0.213 NA   NA
 5863700 5863701 ECIAI1_0157 ECIAI1_0158 btuF pfs TRUE 0.796 -7.000 0.073 1.000 N NA
 5863702 5863703 ECIAI1_0159 ECIAI1_0160 dgt degP FALSE 0.182 130.000 0.101 1.000 N NA
 5863703 5863704 ECIAI1_0160 ECIAI1_0161 degP cdaR FALSE 0.069 155.000 0.080 NA N NA
 5863705 5863706 ECIAI1_0162 ECIAI1_0163 yaeH dapD FALSE 0.006 315.000 0.035 NA   NA
 5863706 5863707 ECIAI1_0163 ECIAI1_0164 dapD glnD TRUE 0.600 31.000 0.097 1.000 N NA
 5863707 5863708 ECIAI1_0164 ECIAI1_0165 glnD map TRUE 0.600 62.000 0.243 1.000 N NA
 5863708 5863709 ECIAI1_0165 ECIAI1_0166 map   TRUE 0.880 0.000 0.000 NA   NA
 5863710 5863711 ECIAI1_misc_RNA_8 ECIAI1_0167 t44 rpsB TRUE 0.510 27.000 0.000 NA   NA
 5863711 5863712 ECIAI1_0167 ECIAI1_0168 rpsB tsf TRUE 0.516 258.000 0.748 1.000 Y NA
 5863712 5863713 ECIAI1_0168 ECIAI1_0169 tsf pyrH FALSE 0.406 147.000 0.416 1.000 N NA
 5863713 5863714 ECIAI1_0169 ECIAI1_0170 pyrH frr FALSE 0.117 292.000 0.626 1.000 N NA
 5863714 5863715 ECIAI1_0170 ECIAI1_0171 frr dxr FALSE 0.163 92.000 0.032 1.000 N NA
 5863715 5863716 ECIAI1_0171 ECIAI1_0172 dxr ispU FALSE 0.249 186.000 0.025 1.000 Y NA
 5863716 5863717 ECIAI1_0172 ECIAI1_0173 ispU   TRUE 0.880 0.000 0.000 NA   NA
 5863717 5863718 ECIAI1_0173 ECIAI1_0174   cdsA FALSE 0.346 -139.000 0.000 NA   NA
 5863718 5863719 ECIAI1_0174 ECIAI1_0175 cdsA yaeL TRUE 0.873 12.000 0.080 1.000 N NA
 5863719 5863720 ECIAI1_0175 ECIAI1_0176 yaeL yaeT TRUE 0.949 30.000 0.204 1.000 Y NA
 5863720 5863721 ECIAI1_0176 ECIAI1_0178 yaeT hlpA TRUE 0.841 122.000 0.354 1.000 Y NA
 5863721 5863722 ECIAI1_0178 ECIAI1_0179 hlpA lpxD TRUE 0.998 4.000 0.814 1.000 Y NA
 5863722 5863723 ECIAI1_0179 ECIAI1_0180 lpxD fabZ TRUE 0.807 105.000 0.796 1.000 N NA
 5863723 5863724 ECIAI1_0180 ECIAI1_0181 fabZ lpxA TRUE 0.994 4.000 0.850 1.000 N NA
 5863724 5863725 ECIAI1_0181 ECIAI1_0182 lpxA lpxB TRUE 0.996 0.000 0.289 1.000 Y NA
 5863725 5863726 ECIAI1_0182 ECIAI1_0183 lpxB rnhB TRUE 0.952 -3.000 0.186 1.000 N NA
 5863726 5863727 ECIAI1_0183 ECIAI1_0184 rnhB dnaE TRUE 0.903 37.000 0.104 1.000 Y NA
 5863727 5863728 ECIAI1_0184 ECIAI1_0185 dnaE accA TRUE 0.899 13.000 0.122 1.000 N NA
 5863728 5863729 ECIAI1_0185 ECIAI1_0186 accA ldcC FALSE 0.112 99.000 0.010 1.000 N NA
 5863729 5863730 ECIAI1_0186 ECIAI1_0187 ldcC yaeR TRUE 0.759 57.000 0.039 NA Y NA
 5863730 5863731 ECIAI1_0187 ECIAI1_0188 yaeR tilS FALSE 0.107 65.000 0.015 NA N NA
 5863732 5863733 ECIAI1_0189 ECIAI1_0190 rof yaeP TRUE 0.901 -7.000 0.179 NA   NA
 5863734 5863735 ECIAI1_0191 ECIAI1_0192 yaeQ yaeJ TRUE 0.872 -3.000 0.034 1.000   NA
 5863735 5863736 ECIAI1_0192 ECIAI1_0193 yaeJ nlpE TRUE 0.739 14.000 0.027 NA   NA
 5863737 5863738 ECIAI1_0194 ECIAI1_0195 yaeF yaeF FALSE 0.417 -69.000 0.000 NA   NA
 5863738 5863739 ECIAI1_0195 ECIAI1_0196 yaeF proS TRUE 0.880 0.000 0.000 NA   NA
 5863739 5863740 ECIAI1_0196 ECIAI1_0197 proS yaeB FALSE 0.156 112.000 0.048 NA   NA
 5863740 5863741 ECIAI1_0197 ECIAI1_0198 yaeB rcsF TRUE 0.965 -3.000 0.247 NA   NA
 5863741 5863742 ECIAI1_0198 ECIAI1_0199 rcsF metQ TRUE 0.634 118.000 0.500 NA   NA
 5863742 5863743 ECIAI1_0199 ECIAI1_0200 metQ metI TRUE 0.974 40.000 0.411 0.063 Y NA
 5863743 5863744 ECIAI1_0200 ECIAI1_0201 metI metN TRUE 0.994 -7.000 0.584 1.000 Y NA
 5863745 5863746 ECIAI1_0202 ECIAI1_16S_3 gmhB   FALSE 0.005 364.000 0.000 NA   NA
 5863746 5863747 ECIAI1_16S_3 ECIAI1_tRNA1     FALSE 0.227 69.000 0.000 NA   NA
 5863747 5863748 ECIAI1_tRNA1 ECIAI1_tRNA2     FALSE 0.334 43.000 0.000 NA   NA
 5863748 5863749 ECIAI1_tRNA2 ECIAI1_23S_3     FALSE 0.035 184.000 0.000 NA   NA
 5863749 5863750 ECIAI1_23S_3 ECIAI1_5S_4     FALSE 0.180 94.000 0.000 NA   NA
 5863750 5863751 ECIAI1_5S_4 ECIAI1_tRNA3     FALSE 0.270 53.000 0.000 NA   NA
 5863751 5863752 ECIAI1_tRNA3 ECIAI1_0215   dkgB FALSE 0.051 163.000 0.000 NA   NA
 5863754 5863755 ECIAI1_0217 ECIAI1_0218 yafD yafE FALSE 0.265 78.000 0.066 NA   NA
 5863756 5863757 ECIAI1_0219 ECIAI1_0220 mltD gloB TRUE 0.602 72.000 0.233 1.000   NA
 5863760 5863761 ECIAI1_0223 ECIAI1_tRNA4 dnaQ   FALSE 0.096 133.000 0.000 NA   NA
 5863761 5863762 ECIAI1_tRNA4 ECIAI1_0225   yafT FALSE 0.006 327.000 0.000 NA   NA
 5863762 5863763 ECIAI1_0225 ECIAI1_misc_RNA_9 yafT c0067 FALSE 0.005 342.000 0.000 NA   NA
 5863764 5863765 ECIAI1_0226 ECIAI1_0227 yafU   TRUE 0.950 29.000 0.750 NA   NA
 5863765 5863766 ECIAI1_0227 ECIAI1_0228     TRUE 0.832 24.000 0.182 NA   NA
 5863766 5863767 ECIAI1_0228 ECIAI1_0229     TRUE 0.813 -79.000 0.312 NA   NA
 5863767 5863768 ECIAI1_0229 ECIAI1_0230     TRUE 0.978 19.000 0.750 NA   NA
 5863768 5863769 ECIAI1_0230 ECIAI1_0231     TRUE 0.937 -61.000 0.711 NA   NA
 5863769 5863770 ECIAI1_0231 ECIAI1_0232     TRUE 0.846 -3.000 0.039 NA   NA
 5863770 5863771 ECIAI1_0232 ECIAI1_0233     TRUE 0.859 -105.000 0.471 NA   NA
 5863771 5863772 ECIAI1_0233 ECIAI1_0234     TRUE 0.991 5.000 0.673 NA   NA
 5863772 5863773 ECIAI1_0234 ECIAI1_0235     TRUE 0.993 3.000 0.765 NA   NA
 5863773 5863774 ECIAI1_0235 ECIAI1_0236     TRUE 0.993 -3.000 0.862 NA   NA
 5863774 5863775 ECIAI1_0236 ECIAI1_0237     TRUE 0.987 4.000 0.510 NA   NA
 5863775 5863776 ECIAI1_0237 ECIAI1_0238     TRUE 0.953 -42.000 0.863 NA   NA
 5863776 5863777 ECIAI1_0238 ECIAI1_0239     TRUE 0.989 4.000 0.552 NA   NA
 5863777 5863778 ECIAI1_0239 ECIAI1_0240     TRUE 0.990 7.000 0.627 NA   NA
 5863778 5863779 ECIAI1_0240 ECIAI1_0241     FALSE 0.253 51.000 0.030 NA   NA
 5863779 5863780 ECIAI1_0241 ECIAI1_0242     FALSE 0.380 35.000 0.034 NA   NA
 5863781 5863782 ECIAI1_0243 ECIAI1_0244     FALSE 0.111 127.000 0.000 NA   NA
 5863782 5863783 ECIAI1_0244 ECIAI1_0245     FALSE 0.022 210.000 0.000 NA   NA
 5863783 5863784 ECIAI1_0245 ECIAI1_0246     TRUE 0.570 76.000 0.250 NA   NA
 5863784 5863785 ECIAI1_0246 ECIAI1_0247     TRUE 0.900 3.000 0.000 1.000   NA
 5863787 5863788 ECIAI1_0249 ECIAI1_0250 yhhI yhhI FALSE 0.358 40.000 0.000 NA   NA
 5863788 5863789 ECIAI1_0250 ECIAI1_0251 yhhI   TRUE 0.872 3.000 0.000 NA   NA
 5863789 5863790 ECIAI1_0251 ECIAI1_0252     FALSE 0.010 266.000 0.000 NA   NA
 5863790 5863791 ECIAI1_0252 ECIAI1_0253     FALSE 0.212 75.000 0.000 NA   NA
 5863791 5863792 ECIAI1_0253 ECIAI1_0254   ydcD TRUE 0.594 -16.000 0.000 NA   NA
 5863792 5863793 ECIAI1_0254 ECIAI1_0255 ydcD   FALSE 0.474 -34.000 0.000 NA   NA
 5863793 5863794 ECIAI1_0255 ECIAI1_0256   yncI FALSE 0.294 49.000 0.000 NA   NA
 5863794 5863795 ECIAI1_0256 ECIAI1_0257 yncI yncM TRUE 0.660 44.000 0.000 0.006   NA
 5863795 5863796 ECIAI1_0257 ECIAI1_0258 yncM yhhI FALSE 0.027 314.000 0.000 0.006   NA
 5863800 5863801 ECIAI1_0262 ECIAI1_0263 lpcA yafJ FALSE 0.113 206.000 0.229 1.000   NA
 5863802 5863803 ECIAI1_0264 ECIAI1_0265 yafK yafQ FALSE 0.055 156.000 0.000 NA   NA
 5863803 5863804 ECIAI1_0265 ECIAI1_0266 yafQ dinJ TRUE 0.955 3.000 0.167 NA   NA
 5863806 5863807 ECIAI1_0268 ECIAI1_0269     TRUE 0.930 -7.000 0.250 NA   NA
 5863807 5863808 ECIAI1_0269 ECIAI1_0270   fhiA FALSE 0.199 84.000 0.000 NA   NA
 5863809 5863810 ECIAI1_0271 ECIAI1_0272 mbhA dinB FALSE 0.216 71.000 0.000 1.000 N NA
 5863810 5863811 ECIAI1_0272 ECIAI1_0273 dinB yafP TRUE 0.841 -3.000 0.011 1.000   NA
 5863811 5863812 ECIAI1_0273 ECIAI1_0274 yafP   FALSE 0.019 219.000 0.000 NA   NA
 5863812 5863813 ECIAI1_0274 ECIAI1_0275   prfH TRUE 0.515 111.000 0.303 NA   NA
 5863815 5863816 ECIAI1_0277 ECIAI1_0278 gpt frsA FALSE 0.186 92.000 0.040 NA   NA
 5863816 5863817 ECIAI1_0278 ECIAI1_0279 frsA crl FALSE 0.269 58.000 0.048 NA   NA
 5863819 5863820 ECIAI1_0281 ECIAI1_0282 proB proA TRUE 0.990 12.000 0.026 0.001 Y NA
 5863820 5863821 ECIAI1_0282 ECIAI1_tRNA5 proA   FALSE 0.137 115.000 0.000 NA   NA
 5863822 5863823 ECIAI1_0283 ECIAI1_0284 yagP yagQ TRUE 0.556 -21.000 0.000 NA   NA
 5863823 5863824 ECIAI1_0284 ECIAI1_0285 yagQ yagR TRUE 0.900 10.000 0.111 NA N NA
 5863824 5863825 ECIAI1_0285 ECIAI1_0286 yagR yagS TRUE 0.999 -3.000 0.917 0.001 Y NA
 5863825 5863826 ECIAI1_0286 ECIAI1_0287 yagS yagT TRUE 0.999 -3.000 0.705 0.060 Y NA
 5863827 5863828 ECIAI1_0288 ECIAI1_0289 yagU   FALSE 0.215 74.000 0.000 NA   NA
 5863829 5863830 ECIAI1_0290 ECIAI1_0291 yagV yagW TRUE 0.932 -31.000 0.571 NA   NA
 5863830 5863831 ECIAI1_0291 ECIAI1_0292 yagW yagX TRUE 0.951 -10.000 0.429 NA   NA
 5863831 5863832 ECIAI1_0292 ECIAI1_0293 yagX yagY TRUE 0.879 26.000 0.308 NA   NA
 5863832 5863833 ECIAI1_0293 ECIAI1_0294 yagY ecpA TRUE 0.743 58.000 0.385 NA   NA
 5863833 5863834 ECIAI1_0294 ECIAI1_0295 ecpA ykgK TRUE 0.707 75.000 0.400 NA   NA
 5863834 5863835 ECIAI1_0295 ECIAI1_0296 ykgK ykgM FALSE 0.002 1177.000 0.000 1.000 N NA
 5863837 5863838 ECIAI1_0298 ECIAI1_0299 ykgA ykgB FALSE 0.003 596.000 0.000 NA   NA
 5863838 5863839 ECIAI1_0299 ECIAI1_0300 ykgB ykgI TRUE 0.877 3.000 0.043 NA   NA
 5863839 5863840 ECIAI1_0300 ECIAI1_0301 ykgI ykgC TRUE 0.760 109.000 0.667 NA   NA
 5863841 5863842 ECIAI1_0302 ECIAI1_0303 ykgD ykgE FALSE 0.002 527.000 0.000 NA N NA
 5863842 5863843 ECIAI1_0303 ECIAI1_0304 ykgE ykgF TRUE 0.992 11.000 0.286 NA Y NA
 5863843 5863844 ECIAI1_0304 ECIAI1_0305 ykgF ykgG TRUE 0.976 -7.000 0.286 0.001   NA
 5863845 5863846 ECIAI1_0306 ECIAI1_0307   ykgH TRUE 0.514 -25.000 0.000 NA   NA
 5863846 5863847 ECIAI1_0307 ECIAI1_0308 ykgH betA FALSE 0.021 212.000 0.000 NA   NA
 5863847 5863848 ECIAI1_0308 ECIAI1_0309 betA betB TRUE 0.983 14.000 0.634 1.000 N NA
 5863848 5863849 ECIAI1_0309 ECIAI1_0310 betB betI TRUE 0.973 14.000 0.459 1.000 N NA
 5863850 5863851 ECIAI1_0311 ECIAI1_0312 betT   FALSE 0.031 507.000 0.000 1.000 Y NA
 5863851 5863852 ECIAI1_0312 ECIAI1_0313   yahA FALSE 0.073 142.000 0.000 1.000 N NA
 5863853 5863854 ECIAI1_0314 ECIAI1_0315 yahB yahC FALSE 0.187 92.000 0.000 NA   NA
 5863855 5863856 ECIAI1_0316 ECIAI1_0317 yahD yahE TRUE 0.910 40.000 0.667 NA   NA
 5863856 5863857 ECIAI1_0317 ECIAI1_0318 yahE yahF TRUE 0.951 -10.000 0.429 NA   NA
 5863857 5863858 ECIAI1_0318 ECIAI1_0319 yahF yahG TRUE 0.993 0.000 0.714 NA   NA
 5863858 5863859 ECIAI1_0319 ECIAI1_0320 yahG yahI FALSE 0.163 143.000 0.125 NA   NA
 5863859 5863860 ECIAI1_0320 ECIAI1_0321 yahI yahJ TRUE 0.966 10.000 0.278 1.000 N NA
 5863860 5863861 ECIAI1_0321 ECIAI1_0322 yahJ   FALSE 0.010 269.000 0.000 NA   NA
 5863861 5863862 ECIAI1_0322 ECIAI1_0323     FALSE 0.013 252.000 0.000 NA   NA
 5863862 5863863 ECIAI1_0323 ECIAI1_0324     TRUE 0.976 34.000 0.571 NA Y NA
 5863863 5863864 ECIAI1_0324 ECIAI1_0325     TRUE 0.995 -7.000 0.667 1.000 Y NA
 5863864 5863865 ECIAI1_0325 ECIAI1_0326     TRUE 0.994 -33.000 1.000 0.062 Y NA
 5863865 5863866 ECIAI1_0326 ECIAI1_0327   yahK FALSE 0.243 87.000 0.000 1.000   NA
 5863866 5863867 ECIAI1_0327 ECIAI1_0328 yahK yahL FALSE 0.014 243.000 0.000 NA   NA
 5863867 5863868 ECIAI1_0328 ECIAI1_tRNA6 yahL   FALSE 0.005 343.000 0.000 NA   NA
 5863868 5863869 ECIAI1_tRNA6 ECIAI1_0329   yahM TRUE 0.662 -10.000 0.000 NA   NA
 5863873 5863874 ECIAI1_0333 ECIAI1_0334 prpB prpC TRUE 0.851 45.000 0.502 1.000 N NA
 5863874 5863875 ECIAI1_0334 ECIAI1_0335 prpC prpD TRUE 0.774 34.000 0.216 1.000   NA
 5863875 5863876 ECIAI1_0335 ECIAI1_0336 prpD prpE TRUE 0.729 40.000 0.038 0.001   NA
 5863876 5863877 ECIAI1_0336 ECIAI1_0337 prpE   FALSE 0.004 368.000 0.000 1.000 N NA
 5863877 5863878 ECIAI1_0337 ECIAI1_0338   codB FALSE 0.010 269.000 0.000 1.000 N NA
 5863878 5863879 ECIAI1_0338 ECIAI1_0339 codB codA TRUE 0.981 -10.000 0.250 1.000 Y NA
 5863881 5863882 ECIAI1_0341 ECIAI1_0342 cynT cynS TRUE 0.909 31.000 0.075 1.000 Y NA
 5863882 5863883 ECIAI1_0342 ECIAI1_0343 cynS cynX TRUE 0.885 33.000 0.000 1.000 Y NA
 5863884 5863885 ECIAI1_0344 ECIAI1_0345 lacY lacZ TRUE 0.696 52.000 0.261 1.000   NA
 5863885 5863886 ECIAI1_0345 ECIAI1_0346 lacZ lacI FALSE 0.307 123.000 0.174 1.000 N NA
 5863886 5863887 ECIAI1_0346 ECIAI1_0347 lacI mhpR TRUE 0.821 77.000 0.000 0.053 Y NA
 5863888 5863889 ECIAI1_0348 ECIAI1_0349 mhpA mhpB TRUE 0.991 2.000 0.333 0.006   NA
 5863889 5863890 ECIAI1_0349 ECIAI1_0350 mhpB mhpC TRUE 0.980 3.000 0.300 1.000   NA
 5863890 5863891 ECIAI1_0350 ECIAI1_0351 mhpC mhpD TRUE 0.973 10.000 0.300 1.000   NA
 5863891 5863892 ECIAI1_0351 ECIAI1_0352 mhpD mhpF TRUE 0.996 -3.000 0.444 1.000 Y NA
 5863892 5863893 ECIAI1_0352 ECIAI1_0353 mhpF mhpE TRUE 0.991 -3.000 0.750 1.000 N NA
 5863893 5863894 ECIAI1_0353 ECIAI1_0354 mhpE mhpT FALSE 0.392 176.000 0.600 1.000 N NA
 5863894 5863895 ECIAI1_0354 ECIAI1_0355 mhpT yaiL FALSE 0.164 102.000 0.000 NA   NA
 5863896 5863897 ECIAI1_0356 ECIAI1_0357 frmB frmA TRUE 0.639 93.000 0.327 1.000   NA
 5863897 5863898 ECIAI1_0357 ECIAI1_0358 frmA frmR TRUE 0.897 35.000 0.531 NA   NA
 5863898 5863899 ECIAI1_0358 ECIAI1_0360 frmR yaiO FALSE 0.034 185.000 0.000 NA   NA
 5863899 5863900 ECIAI1_0360 ECIAI1_0361 yaiO yaiX TRUE 0.875 2.000 0.000 NA   NA
 5863900 5863901 ECIAI1_0361 ECIAI1_0362 yaiX yaiP TRUE 0.681 -151.000 0.214 NA   NA
 5863901 5863902 ECIAI1_0362 ECIAI1_0363 yaiP yaiS TRUE 0.955 10.000 0.214 NA   NA
 5863903 5863904 ECIAI1_0364 ECIAI1_0365 tauA tauB TRUE 0.977 13.000 0.047 1.000 Y NA
 5863904 5863905 ECIAI1_0365 ECIAI1_0366 tauB tauC TRUE 0.998 -3.000 0.728 1.000 Y NA
 5863905 5863906 ECIAI1_0366 ECIAI1_0367 tauC tauD TRUE 0.957 -3.000 0.214 1.000 N NA
 5863908 5863909 ECIAI1_0369 ECIAI1_0370   yaiV TRUE 0.936 43.000 1.000 NA   NA
 5863911 5863912 ECIAI1_0372 ECIAI1_0373   sbmA TRUE 0.663 20.000 0.000 NA   NA
 5863912 5863913 ECIAI1_0373 ECIAI1_0374 sbmA yaiW TRUE 0.793 13.000 0.000 NA   NA
 5863918 5863919 ECIAI1_0379 ECIAI1_0380     TRUE 0.815 24.000 0.000 0.059   NA
 5863920 5863921 ECIAI1_0381 ECIAI1_0382 yaiB phoA FALSE 0.149 101.000 0.032 NA   NA
 5863921 5863922 ECIAI1_0382 ECIAI1_0383 phoA psiF FALSE 0.112 119.000 0.032 NA   NA
 5863922 5863923 ECIAI1_0383 ECIAI1_0384 psiF yaiC TRUE 0.495 102.000 0.250 NA   NA
 5863925 5863926 ECIAI1_0387 ECIAI1_0388 yaiI aroL FALSE 0.023 183.000 0.007 NA   NA
 5863926 5863927 ECIAI1_0388 ECIAI1_0389 aroL yaiA FALSE 0.301 50.000 0.044 NA   NA
 5863927 5863928 ECIAI1_0389 ECIAI1_0390 yaiA aroM FALSE 0.012 258.000 0.000 NA   NA
 5863928 5863929 ECIAI1_0390 ECIAI1_0391 aroM yaiE FALSE 0.240 72.000 0.049 NA   NA
 5863929 5863930 ECIAI1_0391 ECIAI1_0392 yaiE   FALSE 0.011 261.000 0.000 NA   NA
 5863933 5863934 ECIAI1_0395 ECIAI1_0396 araJ sbcC FALSE 0.066 126.000 0.030 NA N NA
 5863934 5863935 ECIAI1_0396 ECIAI1_0397 sbcC sbcD TRUE 0.992 -3.000 0.021 0.001 Y NA
 5863936 5863937 ECIAI1_0398 ECIAI1_0399 phoB phoR TRUE 0.964 58.000 0.453 0.016 Y NA
 5863939 5863940 ECIAI1_0401 ECIAI1_0402 brnQ proY TRUE 0.937 76.000 0.348 0.091 Y NA
 5863940 5863941 ECIAI1_0402 ECIAI1_0403 proY malZ FALSE 0.120 156.000 0.123 1.000 N NA
 5863943 5863944 ECIAI1_0405 ECIAI1_0406 queA tgt TRUE 0.965 56.000 0.360 0.001 Y NA
 5863944 5863945 ECIAI1_0406 ECIAI1_0407 tgt yajC TRUE 0.901 23.000 0.325 NA N NA
 5863945 5863946 ECIAI1_0407 ECIAI1_0408 yajC secD TRUE 0.903 28.000 0.045 NA Y NA
 5863946 5863947 ECIAI1_0408 ECIAI1_0409 secD secF TRUE 0.996 11.000 0.206 0.001 Y NA
 5863947 5863948 ECIAI1_0409 ECIAI1_0410 secF yajD FALSE 0.102 129.000 0.015 1.000   NA
 5863949 5863950 ECIAI1_0411 ECIAI1_0412 tsx yajI FALSE 0.007 299.000 0.000 NA   NA
 5863951 5863952 ECIAI1_0413 ECIAI1_0414 nrdR ribD TRUE 0.968 4.000 0.277 NA N NA
 5863952 5863953 ECIAI1_0414 ECIAI1_0415 ribD ribE TRUE 0.837 89.000 0.034 0.002 Y NA
 5863953 5863954 ECIAI1_0415 ECIAI1_0416 ribE nusB TRUE 0.937 20.000 0.347 1.000 N NA
 5863954 5863955 ECIAI1_0416 ECIAI1_0417 nusB thiL TRUE 0.531 78.000 0.225 1.000 N NA
 5863955 5863956 ECIAI1_0417 ECIAI1_0418 thiL pgpA TRUE 0.823 -22.000 0.206 1.000 N NA
 5863957 5863958 ECIAI1_0419 ECIAI1_0420 yajO dxs FALSE 0.178 55.000 0.009 1.000 N NA
 5863958 5863959 ECIAI1_0420 ECIAI1_0421 dxs ispA TRUE 0.937 25.000 0.060 1.000 Y NA
 5863959 5863960 ECIAI1_0421 ECIAI1_0422 ispA xseB TRUE 0.866 0.000 0.035 1.000 N NA
 5863962 5863963 ECIAI1_0424 ECIAI1_0425 yajL panE TRUE 0.719 -37.000 0.155 NA   NA
 5863967 5863968 ECIAI1_0429 ECIAI1_0430     TRUE 0.659 -16.000 0.000 1.000   NA
 5863968 5863969 ECIAI1_0430 ECIAI1_0431   cyoE FALSE 0.159 119.000 0.000 1.000   NA
 5863969 5863970 ECIAI1_0431 ECIAI1_0432 cyoE cyoD TRUE 0.949 12.000 0.118 0.091 N NA
 5863970 5863971 ECIAI1_0432 ECIAI1_0433 cyoD cyoC TRUE 0.998 0.000 0.485 0.059 Y NA
 5863971 5863972 ECIAI1_0433 ECIAI1_0434 cyoC cyoB TRUE 0.996 -10.000 0.697 0.059 Y NA
 5863972 5863973 ECIAI1_0434 ECIAI1_0435 cyoB cyoA TRUE 0.972 22.000 0.041 0.004 Y NA
 5863973 5863974 ECIAI1_0435 ECIAI1_0436 cyoA ampG FALSE 0.003 460.000 0.000 NA   NA
 5863974 5863975 ECIAI1_0436 ECIAI1_0437 ampG yajG TRUE 0.715 44.000 0.256 NA   NA
 5863976 5863977 ECIAI1_0438 ECIAI1_0439 bolA   FALSE 0.423 -66.000 0.000 NA   NA
 5863977 5863978 ECIAI1_0439 ECIAI1_0440   tig FALSE 0.069 147.000 0.000 NA   NA
 5863978 5863979 ECIAI1_0440 ECIAI1_0441 tig clpP FALSE 0.341 246.000 0.351 1.000 Y NA
 5863979 5863980 ECIAI1_0441 ECIAI1_0442 clpP clpX TRUE 0.830 126.000 0.352 1.000 Y NA
 5863982 5863983 ECIAI1_0443 ECIAI1_0444 lon hupB FALSE 0.022 209.000 0.000 1.000 N NA
 5863983 5863984 ECIAI1_0444 ECIAI1_0445 hupB ppiD FALSE 0.029 192.000 0.000 1.000 N NA
 5863984 5863985 ECIAI1_0445 ECIAI1_0446 ppiD ybaV FALSE 0.053 151.000 0.033 1.000 N NA
 5863985 5863986 ECIAI1_0446 ECIAI1_0447 ybaV ybaW FALSE 0.172 106.000 0.027 1.000   NA
 5863987 5863988 ECIAI1_0448 ECIAI1_0449 queC ybaE FALSE 0.239 65.000 0.019 1.000   NA
 5863989 5863990 ECIAI1_0450 ECIAI1_0451 cof ybaO TRUE 0.883 0.000 0.020 1.000   NA
 5863990 5863991 ECIAI1_0451 ECIAI1_0452 ybaO mdlA TRUE 0.740 30.000 0.179 1.000 N NA
 5863991 5863992 ECIAI1_0452 ECIAI1_0453 mdlA mdlB TRUE 0.998 -7.000 0.911 0.005 Y NA
 5863992 5863993 ECIAI1_0453 ECIAI1_0454 mdlB glnK FALSE 0.030 181.000 0.028 1.000 N NA
 5863993 5863994 ECIAI1_0454 ECIAI1_0455 glnK amtB TRUE 0.712 30.000 0.156 1.000 N NA
 5863998 5863999 ECIAI1_misc_RNA_11 ECIAI1_0459 ffs ybaA FALSE 0.147 110.000 0.000 NA   NA
 5864000 5864001 ECIAI1_0460 ECIAI1_0461 ylaB ylaC FALSE 0.050 164.000 0.000 NA   NA
 5864001 5864002 ECIAI1_0461 ECIAI1_0462 ylaC maa FALSE 0.277 116.000 0.101 1.000   NA
 5864002 5864003 ECIAI1_0462 ECIAI1_0463 maa hha FALSE 0.066 171.000 0.076 NA   NA
 5864003 5864004 ECIAI1_0463 ECIAI1_0464 hha ybaJ TRUE 0.646 26.000 0.080 NA   NA
 5864004 5864005 ECIAI1_0464 ECIAI1_0465 ybaJ acrB FALSE 0.003 546.000 0.000 NA   NA
 5864005 5864006 ECIAI1_0465 ECIAI1_0466 acrB acrA TRUE 0.941 23.000 0.458 1.000 N NA
 5864007 5864008 ECIAI1_0467 ECIAI1_0468 acrR kefA FALSE 0.075 128.000 0.000 NA N NA
 5864009 5864010 ECIAI1_0469 ECIAI1_0470 ybaM priC TRUE 0.974 14.000 0.474 NA   NA
 5864011 5864012 ECIAI1_0471 ECIAI1_0472 ybaN apt FALSE 0.060 153.000 0.043 NA   NA
 5864012 5864013 ECIAI1_0472 ECIAI1_0473 apt dnaX FALSE 0.168 129.000 0.088 1.000 N NA
 5864013 5864014 ECIAI1_0473 ECIAI1_0474 dnaX ybaB TRUE 0.774 53.000 0.411 NA   NA
 5864014 5864015 ECIAI1_0474 ECIAI1_0475 ybaB recR TRUE 0.991 0.000 0.604 NA   NA
 5864015 5864016 ECIAI1_0475 ECIAI1_0476 recR htpG FALSE 0.122 110.000 0.028 1.000 N NA
 5864016 5864017 ECIAI1_0476 ECIAI1_0477 htpG adk FALSE 0.081 181.000 0.035 0.096 N NA
 5864017 5864018 ECIAI1_0477 ECIAI1_0478 adk hemH FALSE 0.065 132.000 0.013 1.000 N NA
 5864021 5864022 ECIAI1_0481 ECIAI1_0482 ybaL fsr FALSE 0.010 238.000 0.000 NA N NA
 5864024 5864025 ECIAI1_misc_RNA_12 ECIAI1_0484 rybC ybaK FALSE 0.198 85.000 0.000 NA   NA
 5864030 5864031 ECIAI1_0488 ECIAI1_0489 ybaS ybaT TRUE 0.985 3.000 0.028 1.000 Y NA
 5864031 5864032 ECIAI1_0489 ECIAI1_0490 ybaT cueR FALSE 0.112 125.000 0.000 1.000 N NA
 5864033 5864034 ECIAI1_0491 ECIAI1_0492 ybbJ ybbK TRUE 0.995 0.000 0.313 NA Y NA
 5864035 5864036 ECIAI1_0493 ECIAI1_0494 ybbL ybbM TRUE 0.801 -13.000 0.127 NA   NA
 5864037 5864038 ECIAI1_0495 ECIAI1_0496 ybbN ybbO FALSE 0.470 61.000 0.118 1.000   NA
 5864038 5864039 ECIAI1_0496 ECIAI1_0497 ybbO tesA TRUE 0.786 -10.000 0.072 1.000   NA
 5864040 5864041 ECIAI1_0498 ECIAI1_0499 ybbA ybbP TRUE 0.997 -3.000 0.535 NA Y NA
 5864041 5864042 ECIAI1_0499 ECIAI1_0500 ybbP rhsD FALSE 0.002 430.000 0.000 NA N NA
 5864042 5864043 ECIAI1_0500 ECIAI1_0501 rhsD ybbC FALSE 0.358 40.000 0.000 NA   NA
 5864043 5864044 ECIAI1_0501 ECIAI1_0502 ybbC ylbH TRUE 0.880 0.000 0.000 NA   NA
 5864044 5864045 ECIAI1_0502 ECIAI1_0503 ylbH   FALSE 0.090 135.000 0.000 NA   NA
 5864046 5864047 ECIAI1_0504 ECIAI1_0505     TRUE 0.619 -13.000 0.000 NA   NA
 5864047 5864048 ECIAI1_0505 ECIAI1_0506   ybbB FALSE 0.203 80.000 0.000 NA   NA
 5864048 5864049 ECIAI1_0506 ECIAI1_0507 ybbB ybbS FALSE 0.164 69.000 0.012 NA   NA
 5864050 5864051 ECIAI1_0508 ECIAI1_0509 allA allR TRUE 0.807 78.000 0.625 1.000 N NA
 5864051 5864052 ECIAI1_0509 ECIAI1_0510 allR gcl FALSE 0.268 90.000 0.054 1.000   NA
 5864052 5864053 ECIAI1_0510 ECIAI1_0511 gcl hyi TRUE 0.869 13.000 0.065 1.000   NA
 5864053 5864054 ECIAI1_0511 ECIAI1_0512 hyi glxR FALSE 0.367 100.000 0.154 1.000 N NA
 5864054 5864055 ECIAI1_0512 ECIAI1_0513 glxR ybbW FALSE 0.043 169.000 0.000 1.000 N NA
 5864055 5864056 ECIAI1_0513 ECIAI1_0514 ybbW allB TRUE 0.860 60.000 0.161 1.000 Y NA
 5864056 5864057 ECIAI1_0514 ECIAI1_0515 allB ybbY TRUE 0.866 57.000 0.161 1.000 Y NA
 5864057 5864058 ECIAI1_0515 ECIAI1_0516 ybbY glxK TRUE 0.808 22.000 0.133 1.000 N NA
 5864059 5864060 ECIAI1_0517 ECIAI1_0518 ylbA allC TRUE 0.862 11.000 0.059 NA   NA
 5864060 5864061 ECIAI1_0518 ECIAI1_0519 allC allD TRUE 0.845 22.000 0.174 1.000 N NA
 5864062 5864063 ECIAI1_0520 ECIAI1_0521 fdrA ylbE TRUE 0.980 10.000 0.412 NA   NA
 5864063 5864064 ECIAI1_0521 ECIAI1_0522 ylbE ylbF TRUE 0.963 11.000 0.265 NA   NA
 5864064 5864065 ECIAI1_0522 ECIAI1_0523 ylbF ybcF TRUE 0.979 -3.000 0.375 NA   NA
 5864066 5864067 ECIAI1_0524 ECIAI1_0525 purK purE TRUE 0.995 -3.000 0.136 0.001 Y NA
 5864067 5864068 ECIAI1_0525 ECIAI1_0526 purE lpxH FALSE 0.128 118.000 0.016 1.000   NA
 5864068 5864069 ECIAI1_0526 ECIAI1_0527 lpxH ppiB TRUE 0.974 3.000 0.237 1.000   NA
 5864071 5864072 ECIAI1_0529 ECIAI1_0530 ybcI ybcJ FALSE 0.105 108.000 0.011 NA   NA
 5864072 5864073 ECIAI1_0530 ECIAI1_0531 ybcJ folD TRUE 0.917 2.000 0.055 1.000   NA
 5864074 5864075 ECIAI1_0532 ECIAI1_0533 sfmA sfmC FALSE 0.168 220.000 0.000 1.000 Y NA
 5864075 5864076 ECIAI1_0533 ECIAI1_0534 sfmC sfmD TRUE 0.989 31.000 0.875 1.000 Y NA
 5864076 5864077 ECIAI1_0534 ECIAI1_0535 sfmD sfmH TRUE 0.981 43.000 0.875 NA Y NA
 5864077 5864078 ECIAI1_0535 ECIAI1_0536 sfmH sfmF TRUE 0.998 11.000 0.875 NA Y NA
 5864081 5864082 ECIAI1_0538 ECIAI1_0539   envY TRUE 0.761 -6.000 0.000 NA   NA
 5864082 5864083 ECIAI1_0539 ECIAI1_0540 envY ybcH FALSE 0.036 183.000 0.000 NA   NA
 5864083 5864084 ECIAI1_0540 ECIAI1_0541 ybcH nfrA TRUE 0.988 1.000 0.500 NA   NA
 5864084 5864085 ECIAI1_0541 ECIAI1_0542 nfrA nfrB TRUE 0.853 -13.000 0.159 1.000   NA
 5864085 5864086 ECIAI1_0542 ECIAI1_0543 nfrB yhhI FALSE 0.010 269.000 0.000 1.000 N NA
 5864086 5864087 ECIAI1_0543 ECIAI1_0545 yhhI   FALSE 0.003 494.000 0.000 NA   NA
 5864087 5864088 ECIAI1_0545 ECIAI1_0546     FALSE 0.009 275.000 0.000 NA   NA
 5864088 5864089 ECIAI1_0546 ECIAI1_0547     TRUE 0.487 -31.000 0.000 NA   NA
 5864089 5864090 ECIAI1_0547 ECIAI1_0548     TRUE 0.663 20.000 0.000 NA   NA
 5864090 5864091 ECIAI1_0548 ECIAI1_0549     TRUE 0.829 28.000 0.250 NA   NA
 5864091 5864092 ECIAI1_0549 ECIAI1_0550   cusS FALSE 0.002 737.000 0.000 NA   NA
 5864092 5864093 ECIAI1_0550 ECIAI1_0551 cusS cusR TRUE 0.994 -22.000 0.600 0.001 Y NA
 5864094 5864095 ECIAI1_0553 ECIAI1_0554 cusC cusF TRUE 0.943 24.000 0.500 NA   NA
 5864095 5864096 ECIAI1_0554 ECIAI1_0555 cusF cusB TRUE 0.731 16.000 0.000 NA   NA
 5864096 5864097 ECIAI1_0555 ECIAI1_0556 cusB cusA TRUE 0.981 12.000 0.500 1.000 N NA
 5864097 5864098 ECIAI1_0556 ECIAI1_0557 cusA pheP FALSE 0.320 102.000 0.000 0.090 N NA
 5864099 5864100 ECIAI1_0558 ECIAI1_0559 ybdG nfnB FALSE 0.062 108.000 0.012 NA N NA
 5864100 5864101 ECIAI1_0559 ECIAI1_0560 nfnB ybdF TRUE 0.721 94.000 0.500 NA   NA
 5864101 5864102 ECIAI1_0560 ECIAI1_0561 ybdF ybdJ FALSE 0.235 65.000 0.000 NA   NA
 5864102 5864103 ECIAI1_0561 ECIAI1_0562 ybdJ ybdK FALSE 0.233 66.000 0.000 NA   NA
 5864104 5864105 ECIAI1_0563 ECIAI1_0564 hokE   FALSE 0.013 252.000 0.000 NA   NA
 5864106 5864107 ECIAI1_0565 ECIAI1_0566 entD fepA TRUE 0.494 166.000 0.700 1.000 N NA
 5864108 5864109 ECIAI1_0568 ECIAI1_0569 fes ybdZ TRUE 0.979 3.000 0.320 NA   NA
 5864109 5864110 ECIAI1_0569 ECIAI1_0570 ybdZ entF TRUE 0.901 -3.000 0.080 NA   NA
 5864110 5864111 ECIAI1_0570 ECIAI1_0571 entF fepE FALSE 0.019 216.000 0.000 1.000 N NA
 5864112 5864113 ECIAI1_0572 ECIAI1_0573 fepC fepG TRUE 0.983 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 5864113 5864114 ECIAI1_0573 ECIAI1_0574 fepG fepD TRUE 0.990 -3.000 0.000 0.060 Y NA
 5864117 5864118 ECIAI1_0577 ECIAI1_0578 entC entE TRUE 0.998 10.000 0.667 1.000 Y NA
 5864118 5864119 ECIAI1_0578 ECIAI1_0579 entE entB TRUE 0.996 14.000 0.667 1.000 Y NA
 5864119 5864120 ECIAI1_0579 ECIAI1_0580 entB entA TRUE 0.986 0.000 0.024 1.000 Y NA
 5864120 5864121 ECIAI1_0580 ECIAI1_0581 entA ybdB TRUE 0.986 3.000 0.065 NA Y NA
 5864121 5864122 ECIAI1_0581 ECIAI1_0582 ybdB cstA FALSE 0.126 181.000 0.222 NA N NA
 5864122 5864123 ECIAI1_0582 ECIAI1_0583 cstA ybdD FALSE 0.215 182.000 0.333 NA   NA
 5864126 5864127 ECIAI1_0586 ECIAI1_0587 ibrB ibrA TRUE 0.572 -27.000 0.000 1.000   NA
 5864127 5864128 ECIAI1_0587 ECIAI1_0588 ibrA ybdO FALSE 0.376 147.000 0.333 1.000   NA
 5864128 5864129 ECIAI1_0588 ECIAI1_0589 ybdO dsbG FALSE 0.030 209.000 0.067 1.000 N NA
 5864130 5864131 ECIAI1_0590 ECIAI1_0591 ahpC ahpF TRUE 0.936 129.000 0.551 0.001 Y NA
 5864134 5864135 ECIAI1_0594 ECIAI1_0595 rnk rna FALSE 0.011 230.000 0.018 1.000 N NA
 5864135 5864136 ECIAI1_0595 ECIAI1_0596 rna citT FALSE 0.107 114.000 0.024 1.000 N NA
 5864136 5864137 ECIAI1_0596 ECIAI1_0597 citT citG TRUE 0.590 51.000 0.194 1.000 N NA
 5864137 5864138 ECIAI1_0597 ECIAI1_0598 citG citX TRUE 0.978 -25.000 0.400 1.000 Y NA
 5864138 5864139 ECIAI1_0598 ECIAI1_0599 citX citF TRUE 0.860 4.000 0.000 1.000 N NA
 5864139 5864140 ECIAI1_0599 ECIAI1_0600 citF citE TRUE 0.952 11.000 0.000 0.001 N NA
 5864140 5864141 ECIAI1_0600 ECIAI1_0601 citE citD TRUE 0.994 -3.000 0.537 0.001 N NA
 5864141 5864142 ECIAI1_0601 ECIAI1_0602 citD citC TRUE 0.970 15.000 0.000 1.000 Y NA
 5864143 5864144 ECIAI1_0603 ECIAI1_0604 citA citB TRUE 0.909 -31.000 0.000 1.000 Y NA
 5864146 5864147 ECIAI1_0606 ECIAI1_0607 crcA cspE FALSE 0.261 175.000 0.333 1.000   NA
 5864149 5864150 ECIAI1_0609 ECIAI1_0610 ybeM tatE FALSE 0.336 129.000 0.196 1.000   NA
 5864151 5864152 ECIAI1_0611 ECIAI1_0612 lipA ybeF FALSE 0.013 209.000 0.005 1.000 N NA
 5864152 5864153 ECIAI1_0612 ECIAI1_0613 ybeF lipB FALSE 0.011 259.000 0.000 1.000 N NA
 5864153 5864154 ECIAI1_0613 ECIAI1_0614 lipB ybeD FALSE 0.459 101.000 0.219 NA   NA
 5864154 5864155 ECIAI1_0614 ECIAI1_0615 ybeD dacA FALSE 0.220 111.000 0.081 NA   NA
 5864155 5864156 ECIAI1_0615 ECIAI1_0617 dacA rlpA TRUE 0.806 139.000 0.475 NA Y NA
 5864156 5864157 ECIAI1_0617 ECIAI1_0618 rlpA mrdB TRUE 0.745 11.000 0.035 NA N NA
 5864157 5864158 ECIAI1_0618 ECIAI1_0619 mrdB mrdA TRUE 0.877 3.000 0.046 1.000 N NA
 5864158 5864159 ECIAI1_0619 ECIAI1_0620 mrdA ybeA FALSE 0.406 31.000 0.031 NA   NA
 5864159 5864160 ECIAI1_0620 ECIAI1_0621 ybeA ybeB TRUE 0.976 4.000 0.307 NA   NA
 5864160 5864161 ECIAI1_0621 ECIAI1_0622 ybeB phpB FALSE 0.011 260.000 0.000 NA   NA
 5864161 5864162 ECIAI1_0622 ECIAI1_0623 phpB nadD TRUE 0.632 24.000 0.057 1.000 N NA
 5864162 5864163 ECIAI1_0623 ECIAI1_0624 nadD holA TRUE 0.878 2.000 0.045 1.000 N NA
 5864163 5864164 ECIAI1_0624 ECIAI1_0625 holA rlpB TRUE 0.959 0.000 0.199 NA N NA
 5864164 5864165 ECIAI1_0625 ECIAI1_0626 rlpB leuS TRUE 0.901 15.000 0.182 NA N NA
 5864168 5864169 ECIAI1_0629 ECIAI1_0630 ybeR djlB TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 5864171 5864172 ECIAI1_0632 ECIAI1_0633 ybeU djlC TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 5864173 5864174 ECIAI1_0634 ECIAI1_0635 hscC rihA FALSE 0.144 84.000 0.000 NA N NA
 5864174 5864175 ECIAI1_0635 ECIAI1_0636 rihA gltL FALSE 0.317 118.000 0.195 NA N NA
 5864175 5864176 ECIAI1_0636 ECIAI1_0637 gltL gltK TRUE 0.997 0.000 0.379 1.000 Y NA
 5864176 5864177 ECIAI1_0637 ECIAI1_0638 gltK gltJ TRUE 0.999 0.000 0.933 0.017 Y NA
 5864177 5864178 ECIAI1_0638 ECIAI1_misc_RNA_14 gltJ   TRUE 0.814 12.000 0.000 NA   NA
 5864178 5864179 ECIAI1_misc_RNA_14 ECIAI1_0639   gltI TRUE 0.876 1.000 0.000 NA   NA
 5864181 5864182 ECIAI1_0641 ECIAI1_0642 lnt ybeX TRUE 0.945 25.000 0.557 1.000 N NA
 5864182 5864183 ECIAI1_0642 ECIAI1_0643 ybeX ybeY FALSE 0.403 90.000 0.150 NA   NA
 5864183 5864184 ECIAI1_0643 ECIAI1_0644 ybeY ybeZ TRUE 0.983 -3.000 0.457 NA   NA
 5864184 5864185 ECIAI1_0644 ECIAI1_0645 ybeZ miaB FALSE 0.404 114.000 0.220 1.000 N NA
 5864187 5864188 ECIAI1_tRNA86 ECIAI1_tRNA85     FALSE 0.376 38.000 0.000 NA   NA
 5864188 5864189 ECIAI1_tRNA85 ECIAI1_tRNA84     FALSE 0.294 49.000 0.000 NA   NA
 5864189 5864190 ECIAI1_tRNA84 ECIAI1_tRNA83     TRUE 0.731 16.000 0.000 NA   NA
 5864190 5864191 ECIAI1_tRNA83 ECIAI1_tRNA82     FALSE 0.404 35.000 0.000 NA   NA
 5864193 5864194 ECIAI1_tRNA81 ECIAI1_tRNA80     TRUE 0.842 9.000 0.000 NA   NA
 5864194 5864195 ECIAI1_tRNA80 ECIAI1_0650     FALSE 0.462 -38.000 0.000 NA   NA
 5864195 5864196 ECIAI1_0650 ECIAI1_0651   asnB FALSE 0.015 237.000 0.000 NA   NA
 5864196 5864197 ECIAI1_0651 ECIAI1_0652 asnB nagD FALSE 0.011 257.000 0.000 1.000 N NA
 5864197 5864198 ECIAI1_0652 ECIAI1_0653 nagD nagC TRUE 0.843 48.000 0.070 1.000 Y NA
 5864198 5864199 ECIAI1_0653 ECIAI1_0655 nagC nagA TRUE 0.997 9.000 0.571 1.000 Y NA
 5864199 5864200 ECIAI1_0655 ECIAI1_0656 nagA nagB TRUE 0.975 60.000 0.557 0.002 Y NA
 5864201 5864202 ECIAI1_0657 ECIAI1_0658 nagE glnS FALSE 0.015 203.000 0.006 1.000 N NA
 5864202 5864203 ECIAI1_0658 ECIAI1_0659 glnS ybfM FALSE 0.004 446.000 0.000 1.000   NA
 5864203 5864204 ECIAI1_0659 ECIAI1_0660 ybfM ybfN FALSE 0.288 50.000 0.000 NA   NA
 5864207 5864208 ECIAI1_0663 ECIAI1_0664 fldA ybfE TRUE 0.516 140.000 0.473 1.000   NA
 5864208 5864209 ECIAI1_0664 ECIAI1_0665 ybfE ybfF FALSE 0.326 140.000 0.276 NA   NA
 5864210 5864211 ECIAI1_0666 ECIAI1_0667 seqA pgm TRUE 0.760 26.000 0.151 1.000 N NA
 5864212 5864213 ECIAI1_0668 ECIAI1_0669 potE speF TRUE 0.987 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 5864213 5864214 ECIAI1_0669 ECIAI1_0670 speF kdpE FALSE 0.002 690.000 0.000 1.000 N NA
 5864214 5864215 ECIAI1_0670 ECIAI1_0671 kdpE kdpD TRUE 0.996 -3.000 0.385 1.000 Y NA
 5864215 5864216 ECIAI1_0671 ECIAI1_0672 kdpD kdpC TRUE 0.838 -7.000 0.100 1.000 N NA
 5864216 5864217 ECIAI1_0672 ECIAI1_0673 kdpC kdpB TRUE 0.999 9.000 0.877 0.001 Y NA
 5864217 5864218 ECIAI1_0673 ECIAI1_0674 kdpB kdpA TRUE 0.986 23.000 0.201 0.001 Y NA
 5864219 5864220 ECIAI1_0675 ECIAI1_0676 ybfA rhsC FALSE 0.014 243.000 0.000 NA   NA
 5864220 5864221 ECIAI1_0676 ECIAI1_0677 rhsC ybfO FALSE 0.003 444.000 0.000 NA   NA
 5864221 5864222 ECIAI1_0677 ECIAI1_0678 ybfO ybfC TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 5864222 5864223 ECIAI1_0678 ECIAI1_0679 ybfC yhhI FALSE 0.018 226.000 0.000 NA   NA
 5864223 5864224 ECIAI1_0679 ECIAI1_0680 yhhI yhhI FALSE 0.026 201.000 0.000 NA   NA
 5864224 5864225 ECIAI1_0680 ECIAI1_0681 yhhI ybgA FALSE 0.067 148.000 0.000 NA   NA
 5864225 5864226 ECIAI1_0681 ECIAI1_0682 ybgA phr TRUE 0.803 -3.000 0.019 NA   NA
 5864228 5864229 ECIAI1_0684 ECIAI1_0685 ybgI ybgJ TRUE 0.636 23.000 0.050 NA   NA
 5864229 5864230 ECIAI1_0685 ECIAI1_0686 ybgJ ybgK TRUE 0.992 -6.000 0.379 NA Y NA
 5864230 5864231 ECIAI1_0686 ECIAI1_0687 ybgK ybgL TRUE 0.888 -10.000 0.211 NA   NA
 5864231 5864232 ECIAI1_0687 ECIAI1_0688 ybgL nei FALSE 0.451 36.000 0.037 1.000   NA
 5864233 5864234 ECIAI1_0689 ECIAI1_0690 abrB ybgO FALSE 0.059 152.000 0.000 NA   NA
 5864234 5864235 ECIAI1_0690 ECIAI1_0691 ybgO ybgP TRUE 0.881 -3.000 0.000 1.000   NA
 5864235 5864236 ECIAI1_0691 ECIAI1_0692 ybgP ybgQ TRUE 0.959 -9.000 0.000 1.000 Y NA
 5864236 5864237 ECIAI1_0692 ECIAI1_0693 ybgQ   TRUE 0.983 9.000 0.000 1.000 Y NA
 5864237 5864238 ECIAI1_0693 ECIAI1_0694   gltA FALSE 0.004 391.000 0.000 1.000 N NA
 5864239 5864240 ECIAI1_0695 ECIAI1_0696 sdhC sdhD TRUE 0.997 -6.000 0.453 0.001 Y NA
 5864240 5864241 ECIAI1_0696 ECIAI1_0697 sdhD sdhA TRUE 0.999 0.000 0.705 0.002 Y NA
 5864241 5864242 ECIAI1_0697 ECIAI1_0698 sdhA sdhB TRUE 0.997 16.000 0.604 0.002 Y NA
 5864242 5864243 ECIAI1_0698 ECIAI1_0699 sdhB sucA FALSE 0.245 201.000 0.067 1.000 Y NA
 5864243 5864244 ECIAI1_0699 ECIAI1_0700 sucA sucB TRUE 0.996 15.000 0.667 1.000 Y NA
 5864244 5864245 ECIAI1_0700 ECIAI1_0701 sucB sucC TRUE 0.790 94.000 0.136 1.000 Y NA
 5864245 5864246 ECIAI1_0701 ECIAI1_0702 sucC sucD TRUE 0.999 0.000 0.806 0.001 Y NA
 5864246 5864247 ECIAI1_0702 ECIAI1_misc_RNA_15 sucD rybD TRUE 0.876 1.000 0.000 NA   NA
 5864249 5864250 ECIAI1_0704 ECIAI1_0705 mngA mngB TRUE 0.959 18.000 0.036 1.000 Y NA
 5864250 5864251 ECIAI1_0705 ECIAI1_0706 mngB   TRUE 0.556 25.000 0.000 NA   NA
 5864251 5864252 ECIAI1_0706 ECIAI1_0708   cydA FALSE 0.003 595.000 0.000 NA   NA
 5864252 5864253 ECIAI1_0708 ECIAI1_0709 cydA cydB TRUE 0.979 16.000 0.000 0.058 Y NA
 5864253 5864254 ECIAI1_0709 ECIAI1_0710 cydB ybgE FALSE 0.195 128.000 0.100 NA   NA
 5864254 5864255 ECIAI1_0710 ECIAI1_0711 ybgE ybgC FALSE 0.113 150.000 0.095 NA   NA
 5864255 5864256 ECIAI1_0711 ECIAI1_0712 ybgC tolQ TRUE 0.989 -3.000 0.593 1.000   NA
 5864256 5864257 ECIAI1_0712 ECIAI1_0713 tolQ tolR TRUE 0.998 4.000 0.556 0.073 Y NA
 5864257 5864258 ECIAI1_0713 ECIAI1_0714 tolR tolA FALSE 0.354 65.000 0.114 NA N NA
 5864258 5864259 ECIAI1_0714 ECIAI1_0715 tolA tolB FALSE 0.079 133.000 0.051 NA N NA
 5864259 5864260 ECIAI1_0715 ECIAI1_0716 tolB pal TRUE 0.909 35.000 0.592 1.000 N NA
 5864260 5864261 ECIAI1_0716 ECIAI1_0717 pal ybgF TRUE 0.919 10.000 0.088 1.000   NA
 5864261 5864262 ECIAI1_0717 ECIAI1_tRNA8 ybgF   FALSE 0.049 165.000 0.000 NA   NA
 5864262 5864263 ECIAI1_tRNA8 ECIAI1_tRNA9     FALSE 0.088 136.000 0.000 NA   NA
 5864263 5864264 ECIAI1_tRNA9 ECIAI1_tRNA10     TRUE 0.872 3.000 0.000 NA   NA
 5864264 5864265 ECIAI1_tRNA10 ECIAI1_tRNA11     FALSE 0.062 150.000 0.000 NA   NA
 5864265 5864266 ECIAI1_tRNA11 ECIAI1_tRNA12     TRUE 0.865 4.000 0.000 NA   NA
 5864266 5864267 ECIAI1_tRNA12 ECIAI1_tRNA13     FALSE 0.069 147.000 0.000 NA   NA
 5864267 5864268 ECIAI1_tRNA13 ECIAI1_tRNA14     FALSE 0.415 34.000 0.000 NA   NA
 5864268 5864269 ECIAI1_tRNA14 ECIAI1_0718   nadA FALSE 0.004 405.000 0.000 NA   NA
 5864269 5864270 ECIAI1_0718 ECIAI1_0719 nadA pnuC TRUE 0.853 38.000 0.023 1.000 Y NA
 5864271 5864272 ECIAI1_0720 ECIAI1_0721 zitB ybgS FALSE 0.171 114.000 0.057 NA   NA
 5864274 5864275 ECIAI1_0723 ECIAI1_0724 gpmA galM FALSE 0.184 205.000 0.009 1.000 Y NA
 5864275 5864276 ECIAI1_0724 ECIAI1_0725 galM galK TRUE 0.989 -6.000 0.083 0.002 Y NA
 5864276 5864277 ECIAI1_0725 ECIAI1_0726 galK galT TRUE 0.991 4.000 0.370 0.002 N NA
 5864277 5864278 ECIAI1_0726 ECIAI1_0727 galT galE TRUE 0.955 10.000 0.053 0.002 N NA
 5864278 5864279 ECIAI1_0727 ECIAI1_0728 galE modF FALSE 0.012 262.000 0.023 1.000   NA
 5864279 5864280 ECIAI1_0728 ECIAI1_0729 modF modE FALSE 0.411 68.000 0.009 0.094   NA
 5864281 5864282 ECIAI1_0730 ECIAI1_0731 ybhT modA FALSE 0.069 167.000 0.072 NA   NA
 5864282 5864283 ECIAI1_0731 ECIAI1_0732 modA modB TRUE 0.999 0.000 0.627 0.001 Y NA
 5864283 5864284 ECIAI1_0732 ECIAI1_0733 modB modC TRUE 0.999 3.000 0.537 0.001 Y NA
 5864288 5864289 ECIAI1_0737 ECIAI1_0738   ybhH FALSE 0.132 117.000 0.000 NA   NA
 5864289 5864290 ECIAI1_0738 ECIAI1_0739 ybhH ybhI FALSE 0.209 76.000 0.000 NA   NA
 5864290 5864291 ECIAI1_0739 ECIAI1_0740 ybhI   FALSE 0.367 -99.000 0.000 NA   NA
 5864291 5864292 ECIAI1_0740 ECIAI1_0741   ybhJ FALSE 0.142 112.000 0.000 NA   NA
 5864293 5864294 ECIAI1_0742 ECIAI1_0743 ybhC int FALSE 0.271 135.000 0.200 1.000 N NA
 5864294 5864295 ECIAI1_0743 ECIAI1_0745 int   FALSE 0.008 295.000 0.000 NA   NA
 5864295 5864296 ECIAI1_0745 ECIAI1_0746     TRUE 0.474 29.000 0.000 NA   NA
 5864296 5864297 ECIAI1_0746 ECIAI1_0747     TRUE 0.816 24.000 0.000 0.057   NA
 5864297 5864298 ECIAI1_0747 ECIAI1_0748     FALSE 0.047 236.000 0.000 0.057   NA
 5864298 5864299 ECIAI1_0748 ECIAI1_0749     TRUE 0.546 -22.000 0.000 NA   NA
 5864299 5864300 ECIAI1_0749 ECIAI1_0750     FALSE 0.198 85.000 0.000 NA   NA
 5864300 5864301 ECIAI1_0750 ECIAI1_0751     TRUE 0.828 11.000 0.000 NA   NA
 5864301 5864302 ECIAI1_0751 ECIAI1_0752     FALSE 0.451 -40.000 0.000 NA   NA
 5864302 5864303 ECIAI1_0752 ECIAI1_0753     TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 5864303 5864304 ECIAI1_0753 ECIAI1_0754     FALSE 0.472 99.000 0.222 NA   NA
 5864304 5864305 ECIAI1_0754 ECIAI1_0756     FALSE 0.005 354.000 0.000 NA   NA
 5864305 5864306 ECIAI1_0756 ECIAI1_0757     TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 5864306 5864307 ECIAI1_0757 ECIAI1_0758     TRUE 0.853 6.000 0.040 NA   NA
 5864307 5864308 ECIAI1_0758 ECIAI1_0759     FALSE 0.207 77.000 0.000 NA   NA
 5864308 5864309 ECIAI1_0759 ECIAI1_0760     FALSE 0.009 275.000 0.000 NA   NA
 5864309 5864310 ECIAI1_0760 ECIAI1_0761     TRUE 0.991 -3.000 0.726 NA   NA
 5864310 5864311 ECIAI1_0761 ECIAI1_0762     FALSE 0.070 130.000 0.000 NA N NA
 5864312 5864313 ECIAI1_0763 ECIAI1_0764 cro   TRUE 0.556 25.000 0.000 NA   NA
 5864313 5864314 ECIAI1_0764 ECIAI1_0765     TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 5864314 5864315 ECIAI1_0765 ECIAI1_0766     TRUE 0.979 -3.000 0.333 1.000   NA
 5864315 5864316 ECIAI1_0766 ECIAI1_0767     FALSE 0.003 579.000 0.000 NA   NA
 5864316 5864317 ECIAI1_0767 ECIAI1_0768     TRUE 0.814 12.000 0.000 NA   NA
 5864317 5864318 ECIAI1_0768 ECIAI1_0769     FALSE 0.044 171.000 0.000 NA   NA
 5864318 5864319 ECIAI1_0769 ECIAI1_0770   ybcN FALSE 0.031 190.000 0.000 NA   NA
 5864319 5864320 ECIAI1_0770 ECIAI1_0771 ybcN ninE TRUE 0.956 0.000 0.154 NA   NA
 5864320 5864321 ECIAI1_0771 ECIAI1_0772 ninE ybcO TRUE 0.725 -7.000 0.000 NA   NA
 5864321 5864322 ECIAI1_0772 ECIAI1_0773 ybcO rusA TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 5864322 5864323 ECIAI1_0773 ECIAI1_0774 rusA ybcQ FALSE 0.024 223.000 0.000 1.000   NA
 5864325 5864326 ECIAI1_0776 ECIAI1_0777 essD ybcS TRUE 0.880 0.000 0.000 NA   NA
 5864326 5864327 ECIAI1_0777 ECIAI1_0778 ybcS rzpD TRUE 0.881 -3.000 0.000 1.000   NA
 5864328 5864329 ECIAI1_0779 ECIAI1_0780 borD ynfO FALSE 0.007 315.000 0.000 NA   NA
 5864330 5864331 ECIAI1_0781 ECIAI1_0782 nohB A TRUE 0.514 -25.000 0.000 NA   NA
 5864331 5864332 ECIAI1_0782 ECIAI1_0783 A W TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 5864332 5864333 ECIAI1_0783 ECIAI1_0784 W B TRUE 0.932 -3.000 0.100 1.000   NA
 5864333 5864334 ECIAI1_0784 ECIAI1_0785 B C TRUE 0.631 -19.000 0.000 1.000   NA
 5864334 5864335 ECIAI1_0785 ECIAI1_0786 C D TRUE 0.894 4.000 0.000 1.000   NA
 5864335 5864336 ECIAI1_0786 ECIAI1_0787 D E TRUE 0.474 29.000 0.000 NA   NA
 5864336 5864337 ECIAI1_0787 ECIAI1_0788 E fI TRUE 0.872 3.000 0.000 NA   NA
 5864337 5864338 ECIAI1_0788 ECIAI1_0789 fI fII TRUE 0.814 12.000 0.000 NA   NA
 5864338 5864339 ECIAI1_0789 ECIAI1_0790 fII   TRUE 0.814 12.000 0.000 NA   NA
 5864339 5864340 ECIAI1_0790 ECIAI1_0791     TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 5864340 5864341 ECIAI1_0791 ECIAI1_0792     TRUE 0.546 -22.000 0.000 NA   NA
 5864341 5864342 ECIAI1_0792 ECIAI1_0793     TRUE 0.731 16.000 0.000 NA   NA
 5864342 5864343 ECIAI1_0793 ECIAI1_0794     TRUE 0.961 -18.000 0.667 NA   NA
 5864343 5864344 ECIAI1_0794 ECIAI1_0795     TRUE 0.725 -7.000 0.000 NA   NA
 5864344 5864345 ECIAI1_0795 ECIAI1_0796     FALSE 0.392 -82.000 0.000 NA   NA
 5864345 5864346 ECIAI1_0796 ECIAI1_0797     FALSE 0.398 -79.000 0.000 NA   NA
 5864346 5864347 ECIAI1_0797 ECIAI1_0798     TRUE 0.880 0.000 0.000 NA   NA
 5864347 5864348 ECIAI1_0798 ECIAI1_0799     TRUE 0.854 6.000 0.000 NA   NA
 5864348 5864349 ECIAI1_0799 ECIAI1_0800     FALSE 0.362 -102.000 0.000 NA   NA
 5864349 5864350 ECIAI1_0800 ECIAI1_0801     FALSE 0.242 61.000 0.000 NA   NA
 5864350 5864351 ECIAI1_0801 ECIAI1_0802     FALSE 0.227 69.000 0.000 NA   NA
 5864351 5864352 ECIAI1_0802 ECIAI1_0803     FALSE 0.302 59.000 0.000 1.000   NA
 5864357 5864358 ECIAI1_0808 ECIAI1_0809 ybhB bioA FALSE 0.167 59.000 0.003 NA   NA
 5864359 5864360 ECIAI1_0810 ECIAI1_0811 bioB bioF TRUE 0.995 -3.000 0.168 0.002 Y NA
 5864360 5864361 ECIAI1_0811 ECIAI1_0812 bioF bioC TRUE 0.982 -13.000 0.133 0.002 Y NA
 5864361 5864362 ECIAI1_0812 ECIAI1_0813 bioC bioD TRUE 0.984 -7.000 0.054 0.002 Y NA
 5864362 5864363 ECIAI1_0813 ECIAI1_0814 bioD uvrB FALSE 0.007 579.000 0.000 0.092 N NA
 5864365 5864366 ECIAI1_0816 ECIAI1_0817 moaA moaB TRUE 0.980 22.000 0.108 0.003 Y NA
 5864366 5864367 ECIAI1_0817 ECIAI1_0818 moaB moaC TRUE 0.995 3.000 0.109 0.003 Y NA
 5864367 5864368 ECIAI1_0818 ECIAI1_0819 moaC moaD TRUE 0.990 -7.000 0.175 0.003 Y NA
 5864368 5864369 ECIAI1_0819 ECIAI1_0820 moaD moaE TRUE 0.999 2.000 0.501 0.003 Y NA
 5864369 5864370 ECIAI1_0820 ECIAI1_0821 moaE ybhL FALSE 0.070 137.000 0.025 NA   NA
 5864370 5864371 ECIAI1_0821 ECIAI1_0822 ybhL   FALSE 0.068 145.000 0.037 NA   NA
 5864371 5864372 ECIAI1_0822 ECIAI1_0823   ybhM FALSE 0.215 70.000 0.037 NA   NA
 5864373 5864374 ECIAI1_0824 ECIAI1_0825 ybhN ybhO TRUE 0.916 0.000 0.071 NA   NA
 5864374 5864375 ECIAI1_0825 ECIAI1_0826 ybhO ybhP TRUE 0.976 -3.000 0.333 NA   NA
 5864377 5864378 ECIAI1_0828 ECIAI1_0829 ybhR ybhS TRUE 0.998 11.000 0.609 0.005 Y NA
 5864378 5864379 ECIAI1_0829 ECIAI1_0830 ybhS ybhF TRUE 0.984 -7.000 0.547 0.092   NA
 5864379 5864380 ECIAI1_0830 ECIAI1_0831 ybhF ybhG TRUE 0.975 -7.000 0.545 1.000   NA
 5864380 5864381 ECIAI1_0831 ECIAI1_0832 ybhG ybiH TRUE 0.972 0.000 0.236 1.000 N NA
 5864382 5864383 ECIAI1_0833 ECIAI1_0834 rhlE   TRUE 0.850 7.000 0.000 NA   NA
 5864383 5864384 ECIAI1_0834 ECIAI1_0835     FALSE 0.237 64.000 0.000 NA   NA
 5864386 5864387 ECIAI1_0837 ECIAI1_0838 dinG ybiB TRUE 0.485 28.000 0.041 1.000 N NA
 5864387 5864388 ECIAI1_0838 ECIAI1_0839 ybiB ybiC FALSE 0.178 141.000 0.000 0.059 N NA
 5864389 5864390 ECIAI1_0840 ECIAI1_0841 ybiJ ybiI FALSE 0.009 265.000 0.027 NA   NA
 5864390 5864391 ECIAI1_0841 ECIAI1_0842 ybiI ybiX FALSE 0.265 74.000 0.000 1.000   NA
 5864391 5864392 ECIAI1_0842 ECIAI1_0843 ybiX fiu TRUE 0.666 42.000 0.171 1.000   NA
 5864392 5864393 ECIAI1_0843 ECIAI1_0844 fiu ybiM FALSE 0.011 265.000 0.000 NA   NA
 5864395 5864396 ECIAI1_0846 ECIAI1_0847 ybiO glnQ FALSE 0.093 117.000 0.000 NA N NA
 5864396 5864397 ECIAI1_0847 ECIAI1_0848 glnQ glnP TRUE 0.983 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 5864397 5864398 ECIAI1_0848 ECIAI1_0849 glnP glnH TRUE 0.614 139.000 0.051 0.072 Y NA
 5864398 5864399 ECIAI1_0849 ECIAI1_0850 glnH dps FALSE 0.004 404.000 0.000 1.000 N NA
 5864399 5864400 ECIAI1_0850 ECIAI1_0851 dps rhtA FALSE 0.008 299.000 0.044 NA   NA
 5864402 5864403 ECIAI1_0853 ECIAI1_misc_RNA_16 ybiP rybA FALSE 0.005 355.000 0.000 NA   NA
 5864404 5864405 ECIAI1_0854 ECIAI1_0855 mntR ybiR TRUE 0.785 -3.000 0.014 1.000 N NA
 5864407 5864408 ECIAI1_0857 ECIAI1_0859 ybiT   FALSE 0.012 279.000 0.000 1.000   NA
 5864409 5864410 ECIAI1_0860 ECIAI1_0861 ybiU ybiV FALSE 0.059 152.000 0.000 NA   NA
 5864410 5864411 ECIAI1_0861 ECIAI1_0862 ybiV ybiW FALSE 0.091 146.000 0.000 1.000   NA
 5864411 5864412 ECIAI1_0862 ECIAI1_0863 ybiW ybiY TRUE 0.988 6.000 0.316 0.003 N NA
 5864414 5864415 ECIAI1_0865 ECIAI1_0866 moeB moeA TRUE 0.998 0.000 0.323 0.003 Y NA
 5864416 5864417 ECIAI1_0867 ECIAI1_0868 iaaA yliA TRUE 0.832 20.000 0.104 1.000   NA
 5864417 5864418 ECIAI1_0868 ECIAI1_0869 yliA yliB TRUE 0.806 20.000 0.083 1.000   NA
 5864418 5864419 ECIAI1_0869 ECIAI1_0870 yliB yliC TRUE 0.997 18.000 0.803 0.059 Y NA
 5864419 5864420 ECIAI1_0870 ECIAI1_0871 yliC yliD TRUE 0.999 3.000 0.689 0.059 Y NA
 5864420 5864421 ECIAI1_0871 ECIAI1_0872 yliD yliE FALSE 0.027 178.000 0.000 NA N NA
 5864421 5864422 ECIAI1_0872 ECIAI1_0873 yliE yliF TRUE 0.981 8.000 0.000 NA Y NA
 5864424 5864425 ECIAI1_0875 ECIAI1_0876 bssR yliI FALSE 0.157 111.000 0.047 NA   NA
 5864428 5864429 ECIAI1_0879 ECIAI1_0880 deoR ybjG TRUE 0.645 58.000 0.235 1.000   NA
 5864431 5864432 ECIAI1_0882 ECIAI1_0883 ybjH ybjI FALSE 0.197 86.000 0.000 NA   NA
 5864432 5864433 ECIAI1_0883 ECIAI1_0884 ybjI ybjJ TRUE 0.880 0.000 0.000 NA   NA
 5864435 5864436 ECIAI1_misc_RNA_17 ECIAI1_0886 rybB ybjL FALSE 0.207 77.000 0.000 NA   NA
 5864439 5864440 ECIAI1_0889 ECIAI1_0890 ybjC nfsA TRUE 0.817 -16.000 0.159 NA   NA
 5864440 5864441 ECIAI1_0890 ECIAI1_0891 nfsA rimK FALSE 0.235 61.000 0.000 1.000 N NA
 5864441 5864442 ECIAI1_0891 ECIAI1_0892 rimK ybjN FALSE 0.248 88.000 0.065 NA   NA
 5864442 5864443 ECIAI1_0892 ECIAI1_0893 ybjN potF FALSE 0.005 351.000 0.000 NA   NA
 5864443 5864444 ECIAI1_0893 ECIAI1_0894 potF potG TRUE 0.947 95.000 0.679 1.000 Y NA
 5864444 5864445 ECIAI1_0894 ECIAI1_0895 potG potH TRUE 0.998 10.000 0.857 1.000 Y NA
 5864445 5864446 ECIAI1_0895 ECIAI1_0896 potH potI TRUE 0.998 -3.000 0.528 0.058 Y NA
 5864446 5864447 ECIAI1_0896 ECIAI1_0897 potI ybjO TRUE 0.633 60.000 0.264 NA   NA
 5864447 5864448 ECIAI1_0897 ECIAI1_0898 ybjO rumB TRUE 0.709 41.000 0.226 NA   NA
 5864449 5864450 ECIAI1_0899 ECIAI1_0900 artJ artM FALSE 0.179 292.000 0.143 0.071 Y NA
 5864450 5864451 ECIAI1_0900 ECIAI1_0901 artM artQ TRUE 0.999 0.000 0.714 0.017 Y NA
 5864451 5864452 ECIAI1_0901 ECIAI1_0902 artQ artI TRUE 0.996 7.000 0.260 0.058 Y NA
 5864452 5864453 ECIAI1_0902 ECIAI1_0903 artI artP TRUE 0.987 18.000 0.323 1.000 Y NA
 5864453 5864454 ECIAI1_0903 ECIAI1_0905 artP ybjP FALSE 0.031 218.000 0.081 NA   NA
 5864455 5864456 ECIAI1_0906 ECIAI1_0907 ybjQ ybjR TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 5864457 5864458 ECIAI1_0908 ECIAI1_0909 ybjS ybjT TRUE 0.788 99.000 0.022 0.009 Y NA
 5864458 5864459 ECIAI1_0909 ECIAI1_0910 ybjT ltaE TRUE 0.878 11.000 0.074 1.000 N NA
 5864459 5864460 ECIAI1_0910 ECIAI1_0911 ltaE poxB TRUE 0.869 37.000 0.041 1.000 Y NA
 5864460 5864461 ECIAI1_0911 ECIAI1_0912 poxB hcr FALSE 0.075 133.000 0.025 1.000 N NA
 5864461 5864462 ECIAI1_0912 ECIAI1_0913 hcr hcp TRUE 0.988 12.000 0.000 0.017 Y NA
 5864462 5864463 ECIAI1_0913 ECIAI1_0914 hcp ybjE FALSE 0.073 144.000 0.000 NA   NA
 5864463 5864464 ECIAI1_0914 ECIAI1_0915 ybjE aqpZ FALSE 0.003 457.000 0.025 NA   NA
 5864467 5864468 ECIAI1_0918 ECIAI1_0919 macA macB TRUE 0.992 -3.000 0.789 1.000 N NA
 5864470 5864471 ECIAI1_0921 ECIAI1_0922 clpS clpA TRUE 0.922 31.000 0.596 NA   NA
 5864472 5864473 ECIAI1_0923 ECIAI1_tRNA79     TRUE 0.529 26.000 0.000 NA   NA
 5864473 5864474 ECIAI1_tRNA79 ECIAI1_0924   infA FALSE 0.012 254.000 0.000 NA   NA
 5864474 5864475 ECIAI1_0924 ECIAI1_0925 infA aat FALSE 0.006 285.000 0.020 1.000 N NA
 5864475 5864476 ECIAI1_0925 ECIAI1_0926 aat cydC TRUE 0.852 42.000 0.049 1.000 Y NA
 5864476 5864477 ECIAI1_0926 ECIAI1_0927 cydC cydD TRUE 0.999 1.000 0.631 0.005 Y NA
 5864477 5864478 ECIAI1_0927 ECIAI1_0928 cydD trxB TRUE 0.598 123.000 0.049 1.000 Y NA
 5864479 5864480 ECIAI1_0929 ECIAI1_0930 lrp ftsK FALSE 0.425 135.000 0.345 1.000 N NA
 5864480 5864481 ECIAI1_0930 ECIAI1_0931 ftsK lolA FALSE 0.283 152.000 0.305 1.000 N NA
 5864481 5864482 ECIAI1_0931 ECIAI1_0932 lolA ycaJ TRUE 0.938 11.000 0.167 1.000 N NA
 5864482 5864483 ECIAI1_0932 ECIAI1_0933 ycaJ serS FALSE 0.431 91.000 0.078 0.092 N NA
 5864483 5864484 ECIAI1_0933 ECIAI1_0934 serS dmsA FALSE 0.014 239.000 0.000 1.000 N NA
 5864484 5864485 ECIAI1_0934 ECIAI1_0935 dmsA dmsB TRUE 0.994 11.000 0.172 0.056 Y NA
 5864485 5864486 ECIAI1_0935 ECIAI1_0936 dmsB dmsC TRUE 0.983 2.000 0.333 1.000   NA
 5864488 5864489 ECIAI1_0938 ECIAI1_0939 ycaD ycaM FALSE 0.015 210.000 0.000 NA N NA
 5864492 5864493 ECIAI1_0942 ECIAI1_0943 pflA pflB FALSE 0.054 192.000 0.092 1.000 N NA
 5864493 5864494 ECIAI1_0943 ECIAI1_0944 pflB focA TRUE 0.724 55.000 0.345 1.000 N NA
 5864494 5864495 ECIAI1_0944 ECIAI1_0945 focA ycaO FALSE 0.004 406.000 0.000 NA   NA
 5864496 5864497 ECIAI1_0946 ECIAI1_0947 ycaP serC FALSE 0.018 199.000 0.014 NA   NA
 5864497 5864498 ECIAI1_0947 ECIAI1_0948 serC aroA TRUE 0.743 71.000 0.033 1.000 Y NA
 5864498 5864499 ECIAI1_0948 ECIAI1_0949 aroA ycaL FALSE 0.026 169.000 0.003 1.000 N NA
 5864501 5864502 ECIAI1_0951 ECIAI1_0952 cmk rpsA TRUE 0.488 111.000 0.281 1.000 N NA
 5864502 5864503 ECIAI1_0952 ECIAI1_0953 rpsA ihfB FALSE 0.246 160.000 0.292 1.000 N NA
 5864503 5864504 ECIAI1_0953 ECIAI1_0954 ihfB ycaI FALSE 0.021 207.000 0.003 1.000   NA
 5864504 5864505 ECIAI1_0954 ECIAI1_0955 ycaI msbA TRUE 0.707 37.000 0.075 0.086   NA
 5864505 5864506 ECIAI1_0955 ECIAI1_0956 msbA lpxK TRUE 0.956 -3.000 0.205 1.000 N NA
 5864506 5864507 ECIAI1_0956 ECIAI1_0957 lpxK ycaQ FALSE 0.305 37.000 0.017 NA   NA
 5864507 5864508 ECIAI1_0957 ECIAI1_0958 ycaQ ycaR FALSE 0.210 52.000 0.016 NA   NA
 5864508 5864509 ECIAI1_0958 ECIAI1_0959 ycaR kdsB TRUE 0.968 -3.000 0.265 NA   NA
 5864509 5864510 ECIAI1_0959 ECIAI1_0960 kdsB ycbJ FALSE 0.044 154.000 0.023 NA   NA
 5864512 5864513 ECIAI1_0962 ECIAI1_0963 smtA mukF TRUE 0.971 -3.000 0.325 NA N NA
 5864513 5864514 ECIAI1_0963 ECIAI1_0964 mukF mukE TRUE 0.980 8.000 0.036 NA Y NA
 5864514 5864515 ECIAI1_0964 ECIAI1_0965 mukE mukB TRUE 0.994 0.000 0.000 0.001 Y NA
 5864515 5864516 ECIAI1_0965 ECIAI1_0966 mukB ycbB FALSE 0.015 261.000 0.000 1.000   NA
 5864516 5864517 ECIAI1_0966 ECIAI1_0967 ycbB ycbK FALSE 0.244 181.000 0.372 NA   NA
 5864517 5864518 ECIAI1_0967 ECIAI1_0968 ycbK ycbL TRUE 0.655 27.000 0.089 NA   NA
 5864519 5864520 ECIAI1_0969 ECIAI1_0970 aspC ompF FALSE 0.030 185.000 0.036 1.000 N NA
 5864520 5864521 ECIAI1_0970 ECIAI1_0971 ompF asnS FALSE 0.003 602.000 0.000 1.000 N NA
 5864521 5864522 ECIAI1_0971 ECIAI1_0972 asnS pncB FALSE 0.039 169.000 0.034 1.000 N NA
 5864524 5864525 ECIAI1_0974 ECIAI1_0975 ssuB ssuC TRUE 0.996 -3.000 0.472 1.000 Y NA
 5864525 5864526 ECIAI1_0975 ECIAI1_0976 ssuC ssuD TRUE 0.955 11.000 0.226 1.000 N NA
 5864526 5864527 ECIAI1_0976 ECIAI1_0977 ssuD ssuA TRUE 0.976 -3.000 0.341 1.000 N NA
 5864527 5864528 ECIAI1_0977 ECIAI1_0978 ssuA ssuE TRUE 0.909 -7.000 0.169 1.000   NA
 5864529 5864530 ECIAI1_0979 ECIAI1_0980 ycbQ ycbR TRUE 0.931 83.000 0.500 1.000 Y NA
 5864530 5864531 ECIAI1_0980 ECIAI1_0981 ycbR ycbS TRUE 0.990 25.000 0.667 1.000 Y NA
 5864531 5864532 ECIAI1_0981 ECIAI1_0982 ycbS ycbT TRUE 0.959 -9.000 0.000 1.000 Y NA
 5864532 5864533 ECIAI1_0982 ECIAI1_0983 ycbT ycbU TRUE 0.988 12.000 0.000 0.012 Y NA
 5864533 5864534 ECIAI1_0983 ECIAI1_0984 ycbU ycbV TRUE 0.999 8.000 0.667 0.012 Y NA
 5864534 5864535 ECIAI1_0984 ECIAI1_0985 ycbV ycbF TRUE 0.993 -7.000 0.500 1.000 Y NA
 5864535 5864536 ECIAI1_0985 ECIAI1_0986 ycbF pyrD FALSE 0.140 111.000 0.000 1.000 N NA
 5864536 5864537 ECIAI1_0986 ECIAI1_0987 pyrD ycbW FALSE 0.068 174.000 0.081 NA   NA
 5864539 5864540 ECIAI1_0989 ECIAI1_0990 ycbY uup TRUE 0.880 12.000 0.061 1.000   NA
 5864540 5864541 ECIAI1_0990 ECIAI1_0991 uup pqiA FALSE 0.119 130.000 0.054 NA   NA
 5864541 5864542 ECIAI1_0991 ECIAI1_0992 pqiA pqiB TRUE 0.993 5.000 0.819 NA   NA
 5864542 5864543 ECIAI1_0992 ECIAI1_0993 pqiB ymbA TRUE 0.983 12.000 0.531 NA   NA
 5864543 5864544 ECIAI1_0993 ECIAI1_0994 ymbA rmf FALSE 0.012 256.000 0.000 NA   NA
 5864545 5864546 ECIAI1_0995 ECIAI1_0996 fabA ycbZ TRUE 0.632 69.000 0.290 1.000 N NA
 5864552 5864553 ECIAI1_1001 ECIAI1_1002 yccS yccF TRUE 0.796 19.000 0.090 NA   NA
 5864555 5864556 ECIAI1_1004 ECIAI1_1005 mgsA yccT FALSE 0.206 96.000 0.055 NA   NA
 5864558 5864559 ECIAI1_1007 ECIAI1_1008 yccV yccW FALSE 0.388 58.000 0.094 NA   NA
 5864561 5864562 ECIAI1_1010 ECIAI1_1011 tusE yccA FALSE 0.385 91.000 0.140 NA   NA
 5864562 5864563 ECIAI1_1011 ECIAI1_1012 yccA   FALSE 0.025 202.000 0.000 NA   NA
 5864563 5864564 ECIAI1_1012 ECIAI1_tRNA78     FALSE 0.374 -92.000 0.000 NA   NA
 5864565 5864566 ECIAI1_1013 ECIAI1_1014 hyaA hyaB TRUE 0.992 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 5864566 5864567 ECIAI1_1014 ECIAI1_1015 hyaB hyaC TRUE 0.992 19.000 0.355 0.056 Y NA
 5864567 5864568 ECIAI1_1015 ECIAI1_1016 hyaC hyaD TRUE 0.991 -3.000 0.177 1.000 Y NA
 5864568 5864569 ECIAI1_1016 ECIAI1_1017 hyaD hyaE TRUE 0.916 -3.000 0.096 NA   NA
 5864569 5864570 ECIAI1_1017 ECIAI1_1018 hyaE hyaF TRUE 0.992 -3.000 0.769 NA   NA
 5864570 5864571 ECIAI1_1018 ECIAI1_1019 hyaF appC FALSE 0.119 134.000 0.061 NA   NA
 5864571 5864572 ECIAI1_1019 ECIAI1_1020 appC appB TRUE 0.992 12.000 0.158 0.056 Y NA
 5864572 5864573 ECIAI1_1020 ECIAI1_1021 appB appA FALSE 0.044 185.000 0.000 1.000   NA
 5864574 5864575 ECIAI1_1022 ECIAI1_1023 yccC etp TRUE 0.983 20.000 1.000 1.000 N NA
 5864575 5864576 ECIAI1_1023 ECIAI1_1024 etp yccZ TRUE 0.973 -12.000 0.750 1.000 N NA
 5864576 5864577 ECIAI1_1024 ECIAI1_1025 yccZ ymcA FALSE 0.314 46.000 0.000 NA   NA
 5864577 5864578 ECIAI1_1025 ECIAI1_1026 ymcA ymcB TRUE 0.906 0.000 0.060 NA   NA
 5864578 5864579 ECIAI1_1026 ECIAI1_1027 ymcB ymcC TRUE 0.989 -3.000 0.600 NA   NA
 5864579 5864580 ECIAI1_1027 ECIAI1_1028 ymcC ymcD FALSE 0.154 107.000 0.000 NA   NA
 5864580 5864581 ECIAI1_1028 ECIAI1_1029 ymcD cspH FALSE 0.003 442.000 0.000 NA   NA
 5864582 5864583 ECIAI1_1030 ECIAI1_1031   cspG FALSE 0.014 241.000 0.000 NA   NA
 5864583 5864584 ECIAI1_1031 ECIAI1_1032 cspG   FALSE 0.429 -61.000 0.000 NA   NA
 5864584 5864585 ECIAI1_1032 ECIAI1_1033   gnsA FALSE 0.029 195.000 0.000 NA   NA
 5864586 5864587 ECIAI1_1034 ECIAI1_1035 yccM   FALSE 0.351 -126.000 0.000 NA   NA
 5864587 5864588 ECIAI1_1035 ECIAI1_1036   torS FALSE 0.415 34.000 0.000 NA   NA
 5864591 5864592 ECIAI1_1039 ECIAI1_1040 torC torA TRUE 0.992 0.000 0.000 0.056 Y NA
 5864592 5864593 ECIAI1_1040 ECIAI1_1041 torA torD TRUE 0.959 -3.000 0.077 0.056   NA
 5864594 5864595 ECIAI1_1042 ECIAI1_1043 cbpM cbpA TRUE 0.989 0.000 0.512 NA   NA
 5864596 5864597 ECIAI1_1044 ECIAI1_1045 yccE yccE TRUE 0.731 16.000 0.000 NA   NA
 5864597 5864598 ECIAI1_1045 ECIAI1_1046 yccE agp FALSE 0.008 293.000 0.000 NA   NA
 5864599 5864600 ECIAI1_1047 ECIAI1_1048 yccJ wrbA TRUE 0.916 21.000 0.290 NA   NA
 5864601 5864602 ECIAI1_1049 ECIAI1_1050   ymdF FALSE 0.420 -67.000 0.000 NA   NA
 5864603 5864604 ECIAI1_1051 ECIAI1_1052 rutG rutF TRUE 0.963 21.000 0.533 1.000   NA
 5864604 5864605 ECIAI1_1052 ECIAI1_1053 rutF rutE TRUE 0.993 11.000 0.625 0.030   NA
 5864605 5864606 ECIAI1_1053 ECIAI1_1054 rutE rutD TRUE 0.964 10.000 0.256 NA   NA
 5864606 5864607 ECIAI1_1054 ECIAI1_1055 rutD rutC TRUE 0.978 8.000 0.365 NA   NA
 5864607 5864608 ECIAI1_1055 ECIAI1_1056 rutC rutB TRUE 0.975 12.000 0.442 NA N NA
 5864608 5864609 ECIAI1_1056 ECIAI1_1057 rutB rutA TRUE 0.991 0.000 0.621 NA N NA
 5864611 5864612 ECIAI1_1059 ECIAI1_1060 putA   FALSE 0.059 152.000 0.000 NA   NA
 5864613 5864614 ECIAI1_1061 ECIAI1_1062 putP efeU FALSE 0.002 533.000 0.000 NA N NA
 5864614 5864615 ECIAI1_1062 ECIAI1_1063 efeU efeO TRUE 0.921 58.000 0.356 NA Y NA
 5864615 5864616 ECIAI1_1063 ECIAI1_1064 efeO efeB TRUE 0.995 6.000 0.378 NA Y NA
 5864616 5864617 ECIAI1_1064 ECIAI1_1065 efeB phoH FALSE 0.004 344.000 0.000 NA N NA
 5864617 5864618 ECIAI1_1065 ECIAI1_1066 phoH   FALSE 0.003 584.000 0.000 NA   NA
 5864620 5864621 ECIAI1_1067 ECIAI1_1068 ycdW ycdX TRUE 0.874 55.000 0.169 1.000 Y NA
 5864621 5864622 ECIAI1_1068 ECIAI1_1069 ycdX ycdY TRUE 0.937 24.000 0.417 1.000   NA
 5864622 5864623 ECIAI1_1069 ECIAI1_1070 ycdY ycdZ FALSE 0.353 102.000 0.145 NA   NA
 5864624 5864625 ECIAI1_1071 ECIAI1_1072 csgG csgF TRUE 0.517 27.000 0.043 NA   NA
 5864625 5864626 ECIAI1_1072 ECIAI1_1073 csgF csgE TRUE 0.962 25.000 0.723 NA   NA
 5864626 5864627 ECIAI1_1073 ECIAI1_1074 csgE csgD TRUE 0.954 5.000 0.176 NA   NA
 5864628 5864629 ECIAI1_1075 ECIAI1_1076 csgB csgA TRUE 0.891 41.000 0.333 0.012   NA
 5864629 5864630 ECIAI1_1076 ECIAI1_1077 csgA csgC TRUE 0.855 59.000 0.667 NA   NA
 5864630 5864631 ECIAI1_1077 ECIAI1_1078 csgC ymdA TRUE 0.577 121.000 0.429 NA   NA
 5864631 5864632 ECIAI1_1078 ECIAI1_1079 ymdA ymdB FALSE 0.151 95.000 0.028 NA   NA
 5864632 5864633 ECIAI1_1079 ECIAI1_1080 ymdB ymdC TRUE 0.884 2.000 0.046 NA   NA
 5864634 5864635 ECIAI1_1081 ECIAI1_1082 mdoC   FALSE 0.322 45.000 0.000 NA   NA
 5864635 5864636 ECIAI1_1082 ECIAI1_1083     TRUE 0.865 4.000 0.000 NA   NA
 5864637 5864638 ECIAI1_1084 ECIAI1_1085 mdoG mdoH TRUE 0.961 -7.000 0.469 NA N NA
 5864638 5864639 ECIAI1_1085 ECIAI1_1086 mdoH yceK FALSE 0.103 173.000 0.135 NA   NA
 5864640 5864641 ECIAI1_1087 ECIAI1_1088 msyB mdtG TRUE 0.644 83.000 0.333 NA   NA
 5864641 5864642 ECIAI1_1088 ECIAI1_1089 mdtG lpxL TRUE 0.626 172.000 0.857 0.085 N NA
 5864644 5864645 ECIAI1_1091 ECIAI1_1092 yceI yceJ TRUE 0.992 4.000 0.676 NA   NA
 5864645 5864646 ECIAI1_1092 ECIAI1_1093 yceJ yceO FALSE 0.011 261.000 0.000 NA   NA
 5864646 5864647 ECIAI1_1093 ECIAI1_1094 yceO solA TRUE 0.909 21.000 0.269 NA   NA
 5864647 5864648 ECIAI1_1094 ECIAI1_1095 solA bssS TRUE 0.603 115.000 0.423 NA   NA
 5864648 5864649 ECIAI1_1095 ECIAI1_1096 bssS dinI FALSE 0.008 290.000 0.000 NA   NA
 5864649 5864650 ECIAI1_1096 ECIAI1_1097 dinI pyrC FALSE 0.192 74.000 0.031 NA   NA
 5864650 5864651 ECIAI1_1097 ECIAI1_1098 pyrC yceB FALSE 0.123 106.000 0.022 NA   NA
 5864651 5864652 ECIAI1_1098 ECIAI1_1099 yceB grxB FALSE 0.140 134.000 0.078 NA   NA
 5864652 5864653 ECIAI1_1099 ECIAI1_1100 grxB mdtH FALSE 0.335 64.000 0.103 NA N NA
 5864654 5864655 ECIAI1_1101 ECIAI1_1102 rimJ yceH TRUE 0.916 11.000 0.116 NA   NA
 5864655 5864656 ECIAI1_1102 ECIAI1_1103 yceH mviM TRUE 0.935 2.000 0.103 NA   NA
 5864656 5864657 ECIAI1_1103 ECIAI1_1104 mviM mviN FALSE 0.155 110.000 0.022 1.000   NA
 5864658 5864659 ECIAI1_1105 ECIAI1_1106 flgN flgM TRUE 0.998 5.000 0.361 0.002 Y NA
 5864659 5864660 ECIAI1_1106 ECIAI1_1107 flgM flgA TRUE 0.892 76.000 0.330 NA Y NA
 5864661 5864662 ECIAI1_1108 ECIAI1_1109 flgB flgC TRUE 0.999 4.000 0.824 0.003 Y NA
 5864662 5864663 ECIAI1_1109 ECIAI1_1110 flgC flgD TRUE 0.988 12.000 0.186 NA Y NA
 5864663 5864664 ECIAI1_1110 ECIAI1_1111 flgD flgE TRUE 0.556 25.000 0.000 NA   NA
 5864664 5864665 ECIAI1_1111 ECIAI1_1112 flgE flgE TRUE 0.755 15.000 0.000 NA   NA
 5864665 5864666 ECIAI1_1112 ECIAI1_1113 flgE flgF TRUE 0.663 20.000 0.000 NA   NA
 5864666 5864667 ECIAI1_1113 ECIAI1_1114 flgF flgG TRUE 0.896 138.000 0.420 0.001 Y NA
 5864667 5864668 ECIAI1_1114 ECIAI1_1115 flgG flgH TRUE 0.951 53.000 0.268 0.005 Y NA
 5864668 5864669 ECIAI1_1115 ECIAI1_1116 flgH flgI TRUE 0.991 12.000 0.073 0.006 Y NA
 5864669 5864670 ECIAI1_1116 ECIAI1_1117 flgI flgJ TRUE 0.993 0.000 0.036 0.006 Y NA
 5864670 5864671 ECIAI1_1117 ECIAI1_1118 flgJ flgK TRUE 0.981 66.000 0.705 0.002 Y NA
 5864671 5864672 ECIAI1_1118 ECIAI1_1119 flgK flgL TRUE 0.994 12.000 0.142 0.001 Y NA
 5864673 5864674 ECIAI1_1120 ECIAI1_misc_RNA_19 rne   TRUE 0.556 25.000 0.000 NA   NA
 5864677 5864678 ECIAI1_misc_RNA_20 ECIAI1_1123 sraB yceD FALSE 0.385 37.000 0.000 NA   NA
 5864678 5864679 ECIAI1_1123 ECIAI1_1124 yceD rpmF TRUE 0.852 52.000 0.599 NA   NA
 5864679 5864680 ECIAI1_1124 ECIAI1_1125 rpmF plsX TRUE 0.702 81.000 0.418 1.000 N NA
 5864680 5864681 ECIAI1_1125 ECIAI1_1126 plsX fabH TRUE 0.958 68.000 0.380 0.004 Y NA
 5864681 5864682 ECIAI1_1126 ECIAI1_1127 fabH fabD TRUE 0.991 16.000 0.182 0.004 Y NA
 5864682 5864683 ECIAI1_1127 ECIAI1_1128 fabD fabG TRUE 0.997 13.000 0.432 0.004 Y NA
 5864683 5864684 ECIAI1_1128 ECIAI1_1129 fabG acpP TRUE 0.578 211.000 0.321 0.004 Y NA
 5864684 5864685 ECIAI1_1129 ECIAI1_1130 acpP fabF TRUE 0.900 88.000 0.346 1.000 Y NA
 5864685 5864686 ECIAI1_1130 ECIAI1_1131 fabF pabC FALSE 0.334 120.000 0.187 1.000 N NA
 5864686 5864687 ECIAI1_1131 ECIAI1_1132 pabC yceG TRUE 0.964 3.000 0.204 NA   NA
 5864687 5864688 ECIAI1_1132 ECIAI1_1133 yceG tmk TRUE 0.886 -10.000 0.209 NA   NA
 5864688 5864689 ECIAI1_1133 ECIAI1_1134 tmk holB TRUE 0.957 -3.000 0.211 1.000 N NA
 5864689 5864690 ECIAI1_1134 ECIAI1_1135 holB ycfH TRUE 0.985 11.000 0.110 NA Y NA
 5864690 5864691 ECIAI1_1135 ECIAI1_1137 ycfH ptsG FALSE 0.003 295.000 0.004 NA N NA
 5864693 5864694 ECIAI1_1140 ECIAI1_1141 hinT ycfL TRUE 0.888 3.000 0.051 NA   NA
 5864694 5864695 ECIAI1_1141 ECIAI1_1142 ycfL ycfM TRUE 0.977 14.000 0.516 NA   NA
 5864695 5864696 ECIAI1_1142 ECIAI1_1143 ycfM ycfN TRUE 0.894 -19.000 0.310 NA   NA
 5864696 5864697 ECIAI1_1143 ECIAI1_1144 ycfN nagZ TRUE 0.871 11.000 0.069 1.000 N NA
 5864697 5864698 ECIAI1_1144 ECIAI1_1145 nagZ ycfP TRUE 0.739 23.000 0.091 NA   NA
 5864698 5864699 ECIAI1_1145 ECIAI1_1146 ycfP ndh FALSE 0.005 408.000 0.057 NA   NA
 5864699 5864700 ECIAI1_1146 ECIAI1_1147 ndh ycfJ FALSE 0.040 210.000 0.071 1.000   NA
 5864703 5864704 ECIAI1_1150 ECIAI1_1151 ycfS mfd FALSE 0.067 144.000 0.006 1.000   NA
 5864704 5864705 ECIAI1_1151 ECIAI1_1152 mfd ycfT FALSE 0.097 128.000 0.003 1.000   NA
 5864706 5864707 ECIAI1_1153 ECIAI1_1154 lolC lolD TRUE 0.940 -7.000 0.175 0.069 N NA
 5864707 5864708 ECIAI1_1154 ECIAI1_1155 lolD lolE TRUE 0.971 0.000 0.125 0.069 N NA
 5864708 5864709 ECIAI1_1155 ECIAI1_1156 lolE ycfX TRUE 0.798 29.000 0.225 1.000 N NA
 5864709 5864710 ECIAI1_1156 ECIAI1_1157 ycfX cobB TRUE 0.977 16.000 0.119 1.000 Y NA
 5864711 5864712 ECIAI1_1158 ECIAI1_1159 ycfZ   FALSE 0.239 63.000 0.000 NA   NA
 5864712 5864713 ECIAI1_1159 ECIAI1_1160   potD FALSE 0.294 49.000 0.000 NA   NA
 5864713 5864714 ECIAI1_1160 ECIAI1_1161 potD potC TRUE 0.990 -3.000 0.000 0.057 Y NA
 5864714 5864715 ECIAI1_1161 ECIAI1_1162 potC potB TRUE 0.996 -3.000 0.286 0.057 Y NA
 5864715 5864716 ECIAI1_1162 ECIAI1_1163 potB potA TRUE 0.997 14.000 0.789 1.000 Y NA
 5864716 5864717 ECIAI1_1163 ECIAI1_1164 potA   TRUE 0.556 -21.000 0.000 NA   NA
 5864719 5864720 ECIAI1_1166 ECIAI1_1167 ycfD phoQ TRUE 0.709 76.000 0.408 NA   NA
 5864720 5864721 ECIAI1_1167 ECIAI1_1168 phoQ phoP TRUE 0.999 0.000 0.940 1.000 Y NA
 5864721 5864722 ECIAI1_1168 ECIAI1_1169 phoP purB FALSE 0.029 168.000 0.011 1.000 N NA
 5864722 5864723 ECIAI1_1169 ECIAI1_1170 purB hflD TRUE 0.924 4.000 0.093 NA   NA
 5864723 5864724 ECIAI1_1170 ECIAI1_1171 hflD trmU TRUE 0.693 36.000 0.180 NA   NA
 5864724 5864725 ECIAI1_1171 ECIAI1_1172 trmU ymfB TRUE 0.517 54.000 0.158 1.000 N NA
 5864725 5864726 ECIAI1_1172 ECIAI1_1173 ymfB ymfC TRUE 0.947 10.000 0.182 1.000 N NA
 5864728 5864729 ECIAI1_1175 ECIAI1_1176 ycgX ycgE FALSE 0.018 221.000 0.000 NA   NA
 5864729 5864730 ECIAI1_1176 ECIAI1_1177 ycgE   FALSE 0.379 -90.000 0.000 NA   NA
 5864730 5864731 ECIAI1_1177 ECIAI1_1178   ycgF FALSE 0.074 143.000 0.000 NA   NA
 5864732 5864733 ECIAI1_1179 ECIAI1_1180 ycgZ ymgA FALSE 0.334 43.000 0.000 NA   NA
 5864733 5864734 ECIAI1_1180 ECIAI1_1181 ymgA ymgB TRUE 0.474 29.000 0.000 NA   NA
 5864734 5864735 ECIAI1_1181 ECIAI1_1182 ymgB ymgC FALSE 0.140 113.000 0.000 NA   NA
 5864735 5864736 ECIAI1_1182 ECIAI1_1183 ymgC ycgG FALSE 0.006 332.000 0.000 NA   NA
 5864736 5864737 ECIAI1_1183 ECIAI1_1184 ycgG ymgF FALSE 0.097 132.000 0.000 NA   NA
 5864737 5864738 ECIAI1_1184 ECIAI1_1185 ymgF   FALSE 0.004 400.000 0.000 NA   NA
 5864738 5864739 ECIAI1_1185 ECIAI1_1186     FALSE 0.132 117.000 0.000 NA   NA
 5864740 5864741 ECIAI1_1187 ECIAI1_1188 ymgD ymgG TRUE 0.837 10.000 0.000 NA   NA
 5864743 5864744 ECIAI1_1190 ECIAI1_1191 minE minD TRUE 0.998 4.000 0.618 NA Y NA
 5864744 5864745 ECIAI1_1191 ECIAI1_1192 minD minC TRUE 0.986 24.000 0.466 1.000 Y NA
 5864748 5864749 ECIAI1_1195 ECIAI1_1196 ycgL ycgM FALSE 0.260 72.000 0.056 NA   NA
 5864749 5864750 ECIAI1_1196 ECIAI1_1197 ycgM ycgN FALSE 0.292 92.000 0.088 NA   NA
 5864751 5864752 ECIAI1_1198 ECIAI1_1199 hlyE hlyE FALSE 0.123 120.000 0.000 NA   NA
 5864753 5864754 ECIAI1_misc_RNA_21 ECIAI1_1200 c0299 umuD FALSE 0.244 60.000 0.000 NA   NA
 5864754 5864755 ECIAI1_1200 ECIAI1_1201 umuD umuC TRUE 0.876 0.000 0.000 1.000 N NA
 5864756 5864757 ECIAI1_1202 ECIAI1_1203 dsbB nhaB TRUE 0.601 146.000 0.723 1.000 N NA
 5864760 5864761 ECIAI1_1206 ECIAI1_1207 dadA dadX TRUE 0.942 10.000 0.168 1.000 N NA
 5864762 5864763 ECIAI1_1209 ECIAI1_1210 cvrA ldcA FALSE 0.261 95.000 0.103 NA N NA
 5864766 5864767 ECIAI1_1213 ECIAI1_1214 ymgE ycgY FALSE 0.040 178.000 0.000 NA   NA
 5864768 5864769 ECIAI1_1216 ECIAI1_1217 treA dhaH FALSE 0.008 320.000 0.000 1.000   NA
 5864769 5864770 ECIAI1_1217 ECIAI1_1218 dhaH dhaL TRUE 0.930 11.000 0.118 1.000   NA
 5864770 5864771 ECIAI1_1218 ECIAI1_1219 dhaL dhaK TRUE 0.996 11.000 0.226 0.001 Y NA
 5864773 5864774 ECIAI1_1221 ECIAI1_1222 ycgV ycgV FALSE 0.056 155.000 0.000 NA   NA
 5864774 5864775 ECIAI1_1222 ECIAI1_1224 ycgV ychF FALSE 0.002 841.000 0.000 NA   NA
 5864775 5864776 ECIAI1_1224 ECIAI1_1225 ychF pth TRUE 0.761 117.000 0.184 1.000 Y NA
 5864778 5864779 ECIAI1_1227 ECIAI1_1228 ychM prsA FALSE 0.093 125.000 0.027 1.000 N NA
 5864779 5864780 ECIAI1_1228 ECIAI1_1229 prsA ispE FALSE 0.069 151.000 0.053 1.000 N NA
 5864780 5864781 ECIAI1_1229 ECIAI1_1230 ispE lolB TRUE 0.956 0.000 0.157 1.000 N NA
 5864782 5864783 ECIAI1_1231 ECIAI1_1232 hemA prfA TRUE 0.768 42.000 0.171 0.044 N NA
 5864783 5864784 ECIAI1_1232 ECIAI1_1233 prfA prmC TRUE 0.997 0.000 0.229 0.044 Y NA
 5864784 5864785 ECIAI1_1233 ECIAI1_1234 prmC ychQ TRUE 0.924 -3.000 0.109 NA   NA
 5864785 5864786 ECIAI1_1234 ECIAI1_1235 ychQ ychA TRUE 0.960 4.000 0.195 NA   NA
 5864786 5864787 ECIAI1_1235 ECIAI1_1236 ychA kdsA TRUE 0.593 36.000 0.089 1.000   NA
 5864791 5864792 ECIAI1_1239 ECIAI1_1240 chaB chaC FALSE 0.201 137.000 0.140 NA   NA
 5864795 5864796 ECIAI1_1243 ECIAI1_1244 narL narX TRUE 0.996 -7.000 0.521 0.015 Y NA
 5864797 5864798 ECIAI1_1245 ECIAI1_1246   narK FALSE 0.177 95.000 0.000 NA   NA
 5864798 5864799 ECIAI1_1246 ECIAI1_1247 narK narG FALSE 0.003 516.000 0.000 1.000 N NA
 5864799 5864800 ECIAI1_1247 ECIAI1_1248 narG narH TRUE 0.998 -3.000 0.471 0.001 Y NA
 5864800 5864801 ECIAI1_1248 ECIAI1_1249 narH narJ TRUE 0.999 -3.000 0.588 0.003 Y NA
 5864801 5864802 ECIAI1_1249 ECIAI1_1250 narJ narI TRUE 0.999 0.000 0.500 0.003 Y NA
 5864802 5864803 ECIAI1_1250 ECIAI1_1251 narI ychS FALSE 0.036 183.000 0.000 NA   NA
 5864804 5864805 ECIAI1_misc_RNA_23 ECIAI1_tRNA76 rtt   TRUE 0.842 9.000 0.000 NA   NA
 5864805 5864806 ECIAI1_tRNA76 ECIAI1_tRNA75     FALSE 0.404 35.000 0.000 NA   NA
 5864806 5864807 ECIAI1_tRNA75 ECIAI1_1252   purU FALSE 0.052 160.000 0.000 NA   NA
 5864807 5864808 ECIAI1_1252 ECIAI1_1253 purU ychJ TRUE 0.608 50.000 0.200 NA   NA
 5864809 5864810 ECIAI1_1254 ECIAI1_1255 rssA rssB FALSE 0.249 92.000 0.048 1.000   NA
 5864810 5864811 ECIAI1_1255 ECIAI1_1256 rssB galU FALSE 0.108 202.000 0.235 1.000 N NA
 5864817 5864818 ECIAI1_1262 ECIAI1_1263 oppA oppB TRUE 0.877 86.000 0.151 0.056 Y NA
 5864818 5864819 ECIAI1_1263 ECIAI1_1264 oppB oppC TRUE 0.998 15.000 0.870 0.056 Y NA
 5864819 5864820 ECIAI1_1264 ECIAI1_1265 oppC oppD TRUE 0.996 12.000 0.554 1.000 Y NA
 5864820 5864821 ECIAI1_1265 ECIAI1_1266 oppD oppF TRUE 0.998 -3.000 0.420 0.002 Y NA
 5864822 5864823 ECIAI1_1267 ECIAI1_1268 yciU cls TRUE 0.758 35.000 0.231 NA   NA
 5864825 5864826 ECIAI1_1270 ECIAI1_1271 kch yciI FALSE 0.007 300.000 0.000 NA   NA
 5864828 5864829 ECIAI1_1273 ECIAI1_1274 yciA yciB FALSE 0.330 105.000 0.167 NA N NA
 5864829 5864830 ECIAI1_1274 ECIAI1_1275 yciB yciC TRUE 0.527 30.000 0.061 NA   NA
 5864832 5864833 ECIAI1_1277 ECIAI1_1278 yciE yciF TRUE 0.765 46.000 0.115 0.002   NA
 5864833 5864834 ECIAI1_1278 ECIAI1_1279 yciF yciG FALSE 0.197 86.000 0.000 NA   NA
 5864834 5864835 ECIAI1_1279 ECIAI1_1280 yciG trpA FALSE 0.004 381.000 0.000 NA   NA
 5864835 5864836 ECIAI1_1280 ECIAI1_1281 trpA trpB TRUE 0.999 0.000 0.947 0.001 Y NA
 5864836 5864837 ECIAI1_1281 ECIAI1_1282 trpB trpC TRUE 0.996 12.000 0.221 0.001 Y NA
 5864837 5864838 ECIAI1_1282 ECIAI1_1283 trpC trpD TRUE 0.995 4.000 0.293 1.000 Y NA
 5864838 5864839 ECIAI1_1283 ECIAI1_1284 trpD trpE TRUE 0.993 0.000 0.010 0.001 Y NA
 5864839 5864840 ECIAI1_1284 ECIAI1_misc_RNA_24 trpE   TRUE 0.625 22.000 0.000 NA   NA
 5864840 5864841 ECIAI1_misc_RNA_24 ECIAI1_4630   trpL TRUE 0.536 -23.000 0.000 NA   NA
 5864842 5864843 ECIAI1_1285 ECIAI1_1286 yciV yciO TRUE 0.970 -3.000 0.281 NA   NA
 5864843 5864844 ECIAI1_1286 ECIAI1_1287 yciO rluB TRUE 0.757 74.000 0.075 NA Y NA
 5864845 5864846 ECIAI1_1288 ECIAI1_1289 btuR yciK TRUE 0.861 -3.000 0.050 1.000 N NA
 5864846 5864847 ECIAI1_1289 ECIAI1_1290 yciK   FALSE 0.327 44.000 0.000 NA   NA
 5864850 5864851 ECIAI1_1293 ECIAI1_1294   topA FALSE 0.077 123.000 0.003 NA   NA
 5864851 5864852 ECIAI1_1294 ECIAI1_1295 topA cysB FALSE 0.013 210.000 0.008 1.000 N NA
 5864852 5864853 ECIAI1_1295 ECIAI1_1296 cysB   FALSE 0.008 294.000 0.000 NA   NA
 5864853 5864854 ECIAI1_1296 ECIAI1_1297     TRUE 0.949 -18.000 0.556 NA   NA
 5864854 5864855 ECIAI1_1297 ECIAI1_1298     FALSE 0.086 137.000 0.000 NA   NA
 5864855 5864856 ECIAI1_1298 ECIAI1_1299   acnA FALSE 0.264 54.000 0.000 NA   NA
 5864858 5864859 ECIAI1_1301 ECIAI1_1302 pgpB yciS FALSE 0.159 149.000 0.143 NA   NA
 5864859 5864860 ECIAI1_1302 ECIAI1_1303 yciS yciM TRUE 0.988 7.000 0.576 NA   NA
 5864860 5864861 ECIAI1_1303 ECIAI1_1304 yciM pyrF FALSE 0.069 193.000 0.125 1.000 N NA
 5864861 5864862 ECIAI1_1304 ECIAI1_1305 pyrF yciH TRUE 0.884 0.000 0.045 1.000 N NA
 5864862 5864863 ECIAI1_1305 ECIAI1_1306 yciH   TRUE 0.585 24.000 0.000 NA   NA
 5864864 5864865 ECIAI1_1307 ECIAI1_1308 osmB deoT FALSE 0.010 269.000 0.000 NA   NA
 5864865 5864866 ECIAI1_1308 ECIAI1_1309 deoT   FALSE 0.399 90.000 0.146 NA   NA
 5864866 5864867 ECIAI1_1309 ECIAI1_1310   gmr FALSE 0.244 105.000 0.083 NA   NA
 5864867 5864868 ECIAI1_1310 ECIAI1_1311 gmr rnb FALSE 0.015 236.000 0.000 1.000 N NA
 5864868 5864869 ECIAI1_1311 ECIAI1_1312 rnb yciW FALSE 0.385 68.000 0.105 NA   NA
 5864869 5864870 ECIAI1_1312 ECIAI1_1313 yciW fabI FALSE 0.089 145.000 0.057 NA   NA
 5864870 5864871 ECIAI1_1313 ECIAI1_1314 fabI ycjD FALSE 0.006 368.000 0.000 1.000   NA
 5864871 5864872 ECIAI1_1314 ECIAI1_1315 ycjD sapF FALSE 0.282 68.000 0.000 1.000   NA
 5864872 5864873 ECIAI1_1315 ECIAI1_1316 sapF sapD TRUE 0.999 2.000 0.684 0.017 Y NA
 5864873 5864874 ECIAI1_1316 ECIAI1_1317 sapD sapC TRUE 0.998 0.000 0.667 1.000 Y NA
 5864874 5864875 ECIAI1_1317 ECIAI1_1318 sapC sapB TRUE 0.987 -13.000 0.284 0.056 Y NA
 5864875 5864876 ECIAI1_1318 ECIAI1_1319 sapB sapA TRUE 0.981 -3.000 0.264 0.056 N NA
 5864876 5864877 ECIAI1_1319 ECIAI1_1320 sapA ymjA FALSE 0.007 312.000 0.000 NA   NA
 5864877 5864878 ECIAI1_1320 ECIAI1_1321 ymjA puuP FALSE 0.093 134.000 0.000 NA   NA
 5864878 5864879 ECIAI1_1321 ECIAI1_1322 puuP puuA FALSE 0.071 303.000 0.000 1.000 Y NA
 5864880 5864881 ECIAI1_1323 ECIAI1_1324 puuD puuR TRUE 0.595 27.000 0.046 1.000   NA
 5864881 5864882 ECIAI1_1324 ECIAI1_1325 puuR puuC FALSE 0.009 275.000 0.040 1.000 N NA
 5864882 5864883 ECIAI1_1325 ECIAI1_1326 puuC puuB TRUE 0.993 2.000 0.500 0.029 N NA
 5864883 5864884 ECIAI1_1326 ECIAI1_1327 puuB puuE TRUE 0.898 38.000 0.100 1.000 Y NA
 5864886 5864887 ECIAI1_1329 ECIAI1_1330 pspA pspB TRUE 0.881 54.000 0.739 NA   NA
 5864887 5864888 ECIAI1_1330 ECIAI1_1331 pspB pspC TRUE 0.995 0.000 0.913 NA   NA
 5864888 5864889 ECIAI1_1331 ECIAI1_1332 pspC pspD TRUE 0.944 9.000 0.167 NA   NA
 5864889 5864890 ECIAI1_1332 ECIAI1_1333 pspD pspE FALSE 0.409 75.000 0.133 NA   NA
 5864890 5864891 ECIAI1_1333 ECIAI1_1334 pspE ycjM FALSE 0.020 212.000 0.000 1.000 N NA
 5864891 5864892 ECIAI1_1334 ECIAI1_1335 ycjM ycjN TRUE 0.993 14.000 0.360 1.000 Y NA
 5864892 5864893 ECIAI1_1335 ECIAI1_1336 ycjN ycjO TRUE 0.995 21.000 0.620 0.056 Y NA
 5864893 5864894 ECIAI1_1336 ECIAI1_1337 ycjO ycjP TRUE 0.996 -13.000 0.805 0.056 Y NA
 5864894 5864895 ECIAI1_1337 ECIAI1_1338 ycjP ycjQ TRUE 0.751 31.000 0.205 1.000 N NA
 5864895 5864896 ECIAI1_1338 ECIAI1_1339 ycjQ ycjR TRUE 0.912 18.000 0.261 NA N NA
 5864896 5864897 ECIAI1_1339 ECIAI1_1340 ycjR ycjS TRUE 0.975 10.000 0.347 NA   NA
 5864897 5864898 ECIAI1_1340 ECIAI1_1341 ycjS ycjT TRUE 0.881 -3.000 0.000 1.000   NA
 5864898 5864899 ECIAI1_1341 ECIAI1_1342 ycjT ycjU TRUE 0.881 -3.000 0.000 1.000   NA
 5864899 5864900 ECIAI1_1342 ECIAI1_1343 ycjU ycjV TRUE 0.896 14.000 0.103 1.000   NA
 5864900 5864901 ECIAI1_1343 ECIAI1_1344 ycjV ompG TRUE 0.705 45.000 0.222 1.000   NA
 5864903 5864904 ECIAI1_1346 ECIAI1_1347 ycjX ycjF TRUE 0.992 -3.000 0.791 NA   NA
 5864904 5864905 ECIAI1_1347 ECIAI1_1348 ycjF tyrR FALSE 0.159 148.000 0.137 NA   NA
 5864908 5864909 ECIAI1_1351 ECIAI1_1352 mpaA ymjC FALSE 0.015 231.000 0.000 1.000 N NA
 5864909 5864910 ECIAI1_1352 ECIAI1_1353 ymjC ycjY TRUE 0.854 6.000 0.000 NA   NA
 5864910 5864911 ECIAI1_1353 ECIAI1_1354 ycjY ycjY TRUE 0.880 0.000 0.000 NA   NA
 5864911 5864912 ECIAI1_1354 ECIAI1_1355 ycjY   FALSE 0.395 36.000 0.000 NA   NA
 5864912 5864913 ECIAI1_1355 ECIAI1_1356   ycjY FALSE 0.429 -61.000 0.000 NA   NA
 5864914 5864915 ECIAI1_1357 ECIAI1_1358 ycjZ mppA FALSE 0.005 337.000 0.000 1.000 N NA
 5864918 5864919 ECIAI1_1361 ECIAI1_1362 uspE fnr TRUE 0.819 152.000 0.619 1.000 Y NA
 5864919 5864920 ECIAI1_1362 ECIAI1_1363 fnr ogt FALSE 0.028 195.000 0.000 1.000 N NA
 5864920 5864921 ECIAI1_1363 ECIAI1_1364 ogt abgT TRUE 0.765 11.000 0.000 NA N NA
 5864921 5864922 ECIAI1_1364 ECIAI1_1365 abgT   FALSE 0.137 115.000 0.000 NA   NA
 5864922 5864923 ECIAI1_1365 ECIAI1_1366   abgB FALSE 0.388 -87.000 0.000 NA   NA
 5864923 5864924 ECIAI1_1366 ECIAI1_1367 abgB abgA TRUE 0.982 0.000 0.128 0.002   NA
 5864925 5864926 ECIAI1_1368 ECIAI1_misc_RNA_25 abgR isrA TRUE 0.872 3.000 0.000 NA   NA
 5864926 5864927 ECIAI1_misc_RNA_25 ECIAI1_1369 isrA ydaL FALSE 0.044 170.000 0.000 NA   NA
 5864929 5864930 ECIAI1_1371 ECIAI1_1372 ydaN   FALSE 0.009 275.000 0.000 NA   NA
 5864930 5864931 ECIAI1_1372 ECIAI1_misc_RNA_26   c0343 FALSE 0.354 -118.000 0.000 NA   NA
 5864931 5864932 ECIAI1_misc_RNA_26 ECIAI1_1373 c0343 dbpA FALSE 0.215 74.000 0.000 NA   NA
 5864933 5864934 ECIAI1_1374 ECIAI1_1375 ydaO uspF FALSE 0.028 176.000 0.000 NA N NA
 5864934 5864935 ECIAI1_1375 ECIAI1_1376 uspF ompN FALSE 0.075 141.000 0.000 1.000 N NA
 5864939 5864940 ECIAI1_1379 ECIAI1_1380 hslJ ldhA FALSE 0.103 111.000 0.000 NA N NA
 5864941 5864942 ECIAI1_1381 ECIAI1_1382 ydbH ynbE TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 5864942 5864943 ECIAI1_1382 ECIAI1_1383 ynbE ydbL TRUE 0.991 8.000 0.726 NA   NA
 5864946 5864947 ECIAI1_1386 ECIAI1_1387 tynA maoC FALSE 0.013 248.000 0.000 1.000 N NA
 5864948 5864949 ECIAI1_1388 ECIAI1_1389 paaA paaB TRUE 0.992 12.000 0.920 NA   NA
 5864949 5864950 ECIAI1_1389 ECIAI1_1390 paaB paaC TRUE 0.993 9.000 0.943 NA   NA
 5864950 5864951 ECIAI1_1390 ECIAI1_1391 paaC paaD TRUE 0.988 15.000 0.919 NA   NA
 5864951 5864952 ECIAI1_1391 ECIAI1_1392 paaD paaJ TRUE 0.987 8.000 0.571 NA   NA
 5864952 5864953 ECIAI1_1392 ECIAI1_1393 paaJ paaF TRUE 0.912 -3.000 0.093 1.000 N NA
 5864953 5864954 ECIAI1_1393 ECIAI1_1394 paaF paaG TRUE 0.997 0.000 0.215 0.001 Y NA
 5864954 5864955 ECIAI1_1394 ECIAI1_1395 paaG paaH TRUE 0.987 2.000 0.051 1.000 Y NA
 5864955 5864956 ECIAI1_1395 ECIAI1_1396 paaH paaI FALSE 0.430 -10.000 0.013 NA N NA
 5864956 5864957 ECIAI1_1396 ECIAI1_1397 paaI paaE TRUE 0.871 0.000 0.058 NA N NA
 5864957 5864958 ECIAI1_1397 ECIAI1_1398 paaE paaK TRUE 0.861 27.000 0.293 1.000 N NA
 5864958 5864959 ECIAI1_1398 ECIAI1_1399 paaK paaX FALSE 0.291 101.000 0.132 NA N NA
 5864959 5864960 ECIAI1_1399 ECIAI1_1400 paaX paaY TRUE 0.757 -18.000 0.118 NA   NA
 5864960 5864961 ECIAI1_1400 ECIAI1_1401 paaY ydbC FALSE 0.021 232.000 0.000 1.000   NA
 5864961 5864962 ECIAI1_1401 ECIAI1_1402 ydbC ydbD FALSE 0.237 64.000 0.000 NA   NA
 5864962 5864963 ECIAI1_1402 ECIAI1_1403 ydbD ynbA FALSE 0.044 171.000 0.000 NA   NA
 5864963 5864964 ECIAI1_1403 ECIAI1_1404 ynbA ynbB TRUE 0.985 0.000 0.179 0.003   NA
 5864964 5864965 ECIAI1_1404 ECIAI1_1405 ynbB ynbC TRUE 0.731 16.000 0.000 NA   NA
 5864965 5864966 ECIAI1_1405 ECIAI1_1406 ynbC ynbD TRUE 0.989 14.000 0.285 NA Y NA
 5864968 5864969 ECIAI1_1408 ECIAI1_1409 hrpA ydcF FALSE 0.009 272.000 0.000 NA   NA
 5864969 5864970 ECIAI1_1409 ECIAI1_1410 ydcF aldA FALSE 0.027 197.000 0.040 NA   NA
 5864976 5864977 ECIAI1_misc_RNA_29 ECIAI1_1415 sokB trg FALSE 0.007 299.000 0.000 NA   NA
 5864979 5864980 ECIAI1_1417 ECIAI1_1419 ydcJ mdoD FALSE 0.012 255.000 0.000 NA   NA
 5864982 5864983 ECIAI1_1421 ECIAI1_1422 ydcH rimL FALSE 0.257 48.000 0.026 NA   NA
 5864985 5864986 ECIAI1_1424 ECIAI1_1425 tehA tehB TRUE 0.957 -3.000 0.175 1.000   NA
 5864986 5864987 ECIAI1_1425 ECIAI1_1426 tehB ydcL FALSE 0.013 303.000 0.088 NA   NA
 5864988 5864989 ECIAI1_1427 ECIAI1_1428   yncK TRUE 0.607 52.000 0.000 0.005   NA
 5864992 5864993 ECIAI1_1431 ECIAI1_1432 ydcN ydcP FALSE 0.269 73.000 0.000 1.000   NA
 5864995 5864996 ECIAI1_1434 ECIAI1_1435 ydcQ ydcR FALSE 0.253 79.000 0.000 1.000   NA
 5864996 5864997 ECIAI1_1435 ECIAI1_1436 ydcR ydcS FALSE 0.127 245.000 0.000 1.000 Y NA
 5864997 5864998 ECIAI1_1436 ECIAI1_1437 ydcS ydcT TRUE 0.996 18.000 0.609 0.055 Y NA
 5864998 5864999 ECIAI1_1437 ECIAI1_1438 ydcT ydcU TRUE 0.999 1.000 0.643 0.055 Y NA
 5864999 5865000 ECIAI1_1438 ECIAI1_1439 ydcU ydcV TRUE 0.997 -10.000 0.821 0.055 Y NA
 5865000 5865001 ECIAI1_1439 ECIAI1_1440 ydcV ydcW TRUE 0.873 22.000 0.216 1.000 N NA
 5865001 5865002 ECIAI1_1440 ECIAI1_1441 ydcW   FALSE 0.028 210.000 0.000 1.000   NA
 5865002 5865003 ECIAI1_1441 ECIAI1_1442   ydcX FALSE 0.003 617.000 0.000 NA   NA
 5865003 5865004 ECIAI1_1442 ECIAI1_1443 ydcX ydcY FALSE 0.197 86.000 0.000 NA   NA
 5865005 5865006 ECIAI1_1444 ECIAI1_1445 ydcZ yncA TRUE 0.892 -3.000 0.070 NA   NA
 5865007 5865008 ECIAI1_1446 ECIAI1_1447 yncB yncC FALSE 0.036 198.000 0.000 1.000   NA
 5865012 5865013 ECIAI1_1452 ECIAI1_1453 yncG vgrE FALSE 0.002 1073.000 0.000 NA   NA
 5865013 5865014 ECIAI1_1453 ECIAI1_1454 vgrE vgrE TRUE 0.625 22.000 0.000 NA   NA
 5865014 5865015 ECIAI1_1454 ECIAI1_1455 vgrE rhsD FALSE 0.231 67.000 0.000 NA   NA
 5865015 5865016 ECIAI1_1455 ECIAI1_1456 rhsD   TRUE 0.529 -24.000 0.000 NA   NA
 5865016 5865017 ECIAI1_1456 ECIAI1_1457     FALSE 0.231 67.000 0.000 NA   NA
 5865017 5865018 ECIAI1_1457 ECIAI1_1458   yhhI FALSE 0.008 292.000 0.000 NA   NA
 5865018 5865019 ECIAI1_1458 ECIAI1_1459 yhhI   TRUE 0.872 3.000 0.000 NA   NA
 5865019 5865020 ECIAI1_1459 ECIAI1_1460     FALSE 0.010 266.000 0.000 NA   NA
 5865020 5865021 ECIAI1_1460 ECIAI1_1461     FALSE 0.212 75.000 0.000 NA   NA
 5865021 5865022 ECIAI1_1461 ECIAI1_1462     TRUE 0.880 0.000 0.000 NA   NA
 5865022 5865023 ECIAI1_1462 ECIAI1_1463   yhhI FALSE 0.006 336.000 0.000 NA   NA
 5865023 5865024 ECIAI1_1463 ECIAI1_1464 yhhI   TRUE 0.480 -33.000 0.000 NA   NA
 5865027 5865028 ECIAI1_1467 ECIAI1_1468 yddE narV FALSE 0.252 80.000 0.000 1.000   NA
 5865028 5865029 ECIAI1_1468 ECIAI1_1469 narV narW TRUE 0.998 -3.000 0.429 0.003 Y NA
 5865029 5865030 ECIAI1_1469 ECIAI1_1470 narW narY TRUE 0.999 0.000 0.714 0.003 Y NA
 5865030 5865031 ECIAI1_1470 ECIAI1_1471 narY narZ TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.001 Y NA
 5865031 5865032 ECIAI1_1471 ECIAI1_1473 narZ narU TRUE 0.772 82.000 0.556 1.000 N NA
 5865032 5865033 ECIAI1_1473 ECIAI1_1474 narU   FALSE 0.008 324.000 0.000 1.000   NA
 5865033 5865034 ECIAI1_1474 ECIAI1_1475   yddL TRUE 0.651 24.000 0.000 1.000   NA
 5865034 5865035 ECIAI1_1475 ECIAI1_1476 yddL yddG FALSE 0.011 259.000 0.000 NA   NA
 5865036 5865037 ECIAI1_1477 ECIAI1_1479 fdnG fdnH TRUE 0.997 13.000 0.429 0.002 Y NA
 5865037 5865038 ECIAI1_1479 ECIAI1_1480 fdnH fdnI TRUE 0.995 -7.000 0.333 0.002 Y NA
 5865039 5865040 ECIAI1_1481 ECIAI1_1482 yddM adhP FALSE 0.279 69.000 0.000 1.000   NA
 5865040 5865041 ECIAI1_1482 ECIAI1_1483 adhP sfcA FALSE 0.119 134.000 0.000 1.000   NA
 5865041 5865042 ECIAI1_1483 ECIAI1_1484 sfcA bdm FALSE 0.004 396.000 0.000 NA   NA
 5865044 5865045 ECIAI1_1486 ECIAI1_1487     TRUE 0.962 12.000 0.288 1.000 N NA
 5865045 5865046 ECIAI1_1487 ECIAI1_1488     FALSE 0.363 46.000 0.058 1.000 N NA
 5865046 5865047 ECIAI1_1488 ECIAI1_1489     TRUE 0.983 -10.000 0.273 1.000 Y NA
 5865047 5865048 ECIAI1_1489 ECIAI1_1490   scoB TRUE 0.981 10.000 0.028 1.000 Y NA
 5865048 5865049 ECIAI1_1490 ECIAI1_1491 scoB scoA TRUE 0.998 3.000 0.352 0.001 Y NA
 5865051 5865052 ECIAI1_1493 ECIAI1_1494 ddpF ddpD TRUE 0.992 -7.000 0.219 0.002 Y NA
 5865052 5865053 ECIAI1_1494 ECIAI1_1495 ddpD ddpC TRUE 0.995 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 5865053 5865054 ECIAI1_1495 ECIAI1_1496 ddpC ddpB TRUE 0.994 -3.000 0.143 0.055 Y NA
 5865054 5865055 ECIAI1_1496 ECIAI1_1497 ddpB ddpA TRUE 0.994 2.000 0.091 0.055 Y NA
 5865055 5865056 ECIAI1_1497 ECIAI1_1498 ddpA ddpX TRUE 0.861 14.000 0.091 1.000 N NA
 5865056 5865057 ECIAI1_1498 ECIAI1_1499 ddpX dos FALSE 0.011 258.000 0.000 1.000 N NA
 5865057 5865058 ECIAI1_1499 ECIAI1_1500 dos yddV TRUE 0.975 25.000 0.130 0.005 Y NA
 5865058 5865059 ECIAI1_1500 ECIAI1_1501 yddV yddW FALSE 0.006 372.000 0.000 1.000   NA
 5865059 5865060 ECIAI1_1501 ECIAI1_1502 yddW gadC FALSE 0.126 131.000 0.000 1.000   NA
 5865060 5865061 ECIAI1_1502 ECIAI1_1503 gadC gadB FALSE 0.463 156.000 0.103 1.000 Y NA
 5865061 5865062 ECIAI1_1503 ECIAI1_1504 gadB pqqL FALSE 0.006 362.000 0.000 1.000   NA
 5865062 5865063 ECIAI1_1504 ECIAI1_1505 pqqL yddB TRUE 0.637 45.000 0.167 1.000   NA
 5865063 5865064 ECIAI1_1505 ECIAI1_1506 yddB yddA TRUE 0.645 38.000 0.000 0.067   NA
 5865064 5865065 ECIAI1_1506 ECIAI1_1507 yddA ydeM FALSE 0.011 291.000 0.000 1.000   NA
 5865065 5865066 ECIAI1_1507 ECIAI1_1508 ydeM ydeN TRUE 0.867 52.000 0.600 1.000   NA
 5865066 5865067 ECIAI1_1508 ECIAI1_1509 ydeN ydeO FALSE 0.004 402.000 0.000 1.000 N NA
 5865067 5865068 ECIAI1_1509 ECIAI1_1510 ydeO   FALSE 0.212 75.000 0.000 NA   NA
 5865068 5865069 ECIAI1_1510 ECIAI1_1511   ydeP FALSE 0.013 248.000 0.000 NA   NA
 5865069 5865070 ECIAI1_1511 ECIAI1_1512 ydeP ydeQ FALSE 0.007 334.000 0.000 1.000   NA
 5865070 5865071 ECIAI1_1512 ECIAI1_1513 ydeQ ydeR TRUE 0.548 60.000 0.000 0.011   NA
 5865071 5865072 ECIAI1_1513 ECIAI1_1514 ydeR ydeS TRUE 0.987 13.000 0.000 0.011 Y NA
 5865072 5865073 ECIAI1_1514 ECIAI1_1515 ydeS   TRUE 0.973 14.000 0.000 1.000 Y NA
 5865073 5865074 ECIAI1_1515 ECIAI1_1516     TRUE 0.846 42.000 0.000 1.000 Y NA
 5865076 5865077 ECIAI1_1518 ECIAI1_1519   yneL FALSE 0.004 409.000 0.000 NA   NA
 5865077 5865078 ECIAI1_1519 ECIAI1_1520 yneL hipA FALSE 0.007 317.000 0.000 NA   NA
 5865078 5865079 ECIAI1_1520 ECIAI1_1521 hipA hipB TRUE 0.993 0.000 0.675 NA   NA
 5865079 5865080 ECIAI1_1521 ECIAI1_1522 hipB   FALSE 0.022 209.000 0.000 1.000 N NA
 5865080 5865081 ECIAI1_1522 ECIAI1_1523   lsrK FALSE 0.003 531.000 0.000 1.000 N NA
 5865081 5865082 ECIAI1_1523 ECIAI1_1524 lsrK lsrR FALSE 0.198 79.000 0.000 1.000 N NA
 5865083 5865084 ECIAI1_1525 ECIAI1_1526 ego lsrC TRUE 0.997 -6.000 0.818 1.000 Y NA
 5865084 5865085 ECIAI1_1526 ECIAI1_1527 lsrC lsrD TRUE 0.999 0.000 0.788 0.055 Y NA
 5865085 5865086 ECIAI1_1527 ECIAI1_1528 lsrD lsrB TRUE 0.998 12.000 0.844 NA Y NA
 5865086 5865087 ECIAI1_1528 ECIAI1_1529 lsrB lsrF TRUE 0.907 27.000 0.000 NA Y NA
 5865087 5865088 ECIAI1_1529 ECIAI1_1530 lsrF lsrG TRUE 0.651 24.000 0.000 1.000   NA
 5865088 5865089 ECIAI1_1530 ECIAI1_1531 lsrG tam FALSE 0.310 57.000 0.000 1.000   NA
 5865090 5865091 ECIAI1_1532 ECIAI1_1533 yneE uxaB FALSE 0.061 207.000 0.143 NA   NA
 5865091 5865092 ECIAI1_1533 ECIAI1_1534 uxaB yneF FALSE 0.017 227.000 0.000 1.000 N NA
 5865092 5865093 ECIAI1_1534 ECIAI1_1535 yneF yneG FALSE 0.151 139.000 0.098 NA   NA
 5865093 5865094 ECIAI1_1535 ECIAI1_1536 yneG yneH TRUE 0.875 0.000 0.037 NA   NA
 5865094 5865095 ECIAI1_1536 ECIAI1_1537 yneH yneI FALSE 0.231 64.000 0.000 1.000 N NA
 5865096 5865097 ECIAI1_1538 ECIAI1_1539 yneJ yneK FALSE 0.206 78.000 0.000 NA   NA
 5865097 5865098 ECIAI1_1539 ECIAI1_1540 yneK yneK FALSE 0.438 -51.000 0.000 NA   NA
 5865098 5865099 ECIAI1_1540 ECIAI1_1541 yneK ydeA FALSE 0.062 150.000 0.000 NA   NA
 5865101 5865102 ECIAI1_1543 ECIAI1_1544 marR marA TRUE 0.996 20.000 0.667 0.046 Y NA
 5865102 5865103 ECIAI1_1544 ECIAI1_1545 marA marB FALSE 0.428 32.000 0.000 NA   NA
 5865104 5865105 ECIAI1_1546 ECIAI1_1547     TRUE 0.957 19.000 0.000 1.000 Y NA
 5865105 5865106 ECIAI1_1547 ECIAI1_1548     TRUE 0.940 56.000 0.250 0.013 Y NA
 5865106 5865107 ECIAI1_1548 ECIAI1_1549     TRUE 0.971 25.000 0.105 0.013 Y NA
 5865107 5865108 ECIAI1_1549 ECIAI1_1550     TRUE 0.977 76.000 0.789 0.013 Y NA
 5865112 5865113 ECIAI1_1554 ECIAI1_1555 ydeH ydeI FALSE 0.012 255.000 0.000 NA   NA
 5865116 5865117 ECIAI1_1558 ECIAI1_1559 ydfG ydfH FALSE 0.240 89.000 0.000 1.000   NA
 5865117 5865118 ECIAI1_1559 ECIAI1_1560 ydfH ydfZ FALSE 0.040 178.000 0.000 NA   NA
 5865119 5865120 ECIAI1_1561 ECIAI1_1562 ydfI ydfJ TRUE 0.717 89.000 0.000 1.000 Y NA
 5865121 5865122 ECIAI1_1563 ECIAI1_1564 ydfK pinR FALSE 0.007 317.000 0.000 NA   NA
 5865123 5865124 ECIAI1_1565 ECIAI1_1566 tfaQ   TRUE 0.880 0.000 0.000 NA   NA
 5865125 5865126 ECIAI1_1567 ECIAI1_1568     FALSE 0.004 388.000 0.000 NA   NA
 5865127 5865128 ECIAI1_1569 ECIAI1_1570     FALSE 0.222 71.000 0.000 NA   NA
 5865128 5865129 ECIAI1_1570 ECIAI1_1571     FALSE 0.242 61.000 0.000 NA   NA
 5865129 5865130 ECIAI1_1571 ECIAI1_1572     FALSE 0.362 -102.000 0.000 NA   NA
 5865130 5865131 ECIAI1_1572 ECIAI1_1573     TRUE 0.854 6.000 0.000 NA   NA
 5865131 5865132 ECIAI1_1573 ECIAI1_1574     FALSE 0.011 259.000 0.000 NA   NA
 5865132 5865133 ECIAI1_1574 ECIAI1_1575     TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 5865133 5865134 ECIAI1_1575 ECIAI1_1576     TRUE 0.725 -7.000 0.000 NA   NA
 5865134 5865135 ECIAI1_1576 ECIAI1_1577     TRUE 0.961 -18.000 0.667 NA   NA
 5865135 5865136 ECIAI1_1577 ECIAI1_1578     TRUE 0.731 16.000 0.000 NA   NA
 5865136 5865137 ECIAI1_1578 ECIAI1_1579     TRUE 0.546 -22.000 0.000 NA   NA
 5865137 5865138 ECIAI1_1579 ECIAI1_1580     TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 5865138 5865139 ECIAI1_1580 ECIAI1_1581   fII TRUE 0.814 12.000 0.000 NA   NA
 5865139 5865140 ECIAI1_1581 ECIAI1_1582 fII fI TRUE 0.814 12.000 0.000 NA   NA
 5865140 5865141 ECIAI1_1582 ECIAI1_1583 fI E TRUE 0.872 3.000 0.000 NA   NA
 5865141 5865142 ECIAI1_1583 ECIAI1_1584 E D TRUE 0.474 29.000 0.000 NA   NA
 5865142 5865143 ECIAI1_1584 ECIAI1_1585 D C TRUE 0.894 4.000 0.000 1.000   NA
 5865143 5865144 ECIAI1_1585 ECIAI1_1586 C B FALSE 0.401 -154.000 0.000 1.000   NA
 5865144 5865145 ECIAI1_1586 ECIAI1_1587 B W TRUE 0.932 -3.000 0.100 1.000   NA
 5865145 5865146 ECIAI1_1587 ECIAI1_1588 W A TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 5865146 5865147 ECIAI1_1588 ECIAI1_1589 A nohB TRUE 0.514 -25.000 0.000 NA   NA
 5865147 5865148 ECIAI1_1589 ECIAI1_1590 nohB   FALSE 0.080 140.000 0.000 NA   NA
 5865149 5865150 ECIAI1_1591 ECIAI1_1592 ynfO ydfO FALSE 0.250 58.000 0.000 NA   NA
 5865151 5865152 ECIAI1_1593 ECIAI1_1594 gnsB   FALSE 0.043 172.000 0.000 NA   NA
 5865152 5865153 ECIAI1_1594 ECIAI1_1595   cspI FALSE 0.016 230.000 0.000 NA   NA
 5865153 5865154 ECIAI1_1595 ECIAI1_1596 cspI ydfP FALSE 0.005 364.000 0.000 NA   NA
 5865154 5865155 ECIAI1_1596 ECIAI1_1597 ydfP ydfQ TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 5865155 5865156 ECIAI1_1597 ECIAI1_1598 ydfQ ydfR TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 5865156 5865157 ECIAI1_1598 ECIAI1_1599 ydfR essQ TRUE 0.858 5.000 0.000 NA   NA
 5865157 5865158 ECIAI1_1599 ECIAI1_1600 essQ cspB FALSE 0.002 754.000 0.000 NA   NA
 5865160 5865161 ECIAI1_1602 ECIAI1_1603 ydfT ydfU TRUE 0.775 14.000 0.000 NA   NA
 5865161 5865162 ECIAI1_1603 ECIAI1_1604 ydfU rem FALSE 0.005 347.000 0.000 NA   NA
 5865162 5865163 ECIAI1_1604 ECIAI1_1605 rem relE FALSE 0.003 444.000 0.000 NA   NA
 5865163 5865164 ECIAI1_1605 ECIAI1_1606 relE relB TRUE 0.832 0.000 0.000 NA N NA
 5865164 5865165 ECIAI1_1606 ECIAI1_1607 relB   FALSE 0.440 31.000 0.000 NA   NA
 5865167 5865168 ECIAI1_1609 ECIAI1_1610     FALSE 0.376 38.000 0.000 NA   NA
 5865170 5865171 ECIAI1_1612 ECIAI1_1613     FALSE 0.288 50.000 0.000 NA   NA
 5865171 5865172 ECIAI1_1613 ECIAI1_1614     FALSE 0.011 263.000 0.000 NA   NA
 5865172 5865173 ECIAI1_1614 ECIAI1_1615     TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 5865173 5865174 ECIAI1_1615 ECIAI1_1616     FALSE 0.350 41.000 0.000 NA   NA
 5865174 5865175 ECIAI1_1616 ECIAI1_1617     FALSE 0.408 -73.000 0.000 NA   NA
 5865175 5865176 ECIAI1_1617 ECIAI1_1618   dicC TRUE 0.594 -16.000 0.000 NA   NA
 5865177 5865178 ECIAI1_1619 ECIAI1_1620 dicA ydfA FALSE 0.193 89.000 0.000 NA   NA
 5865178 5865179 ECIAI1_1620 ECIAI1_1621 ydfA ydfB TRUE 0.875 2.000 0.000 NA   NA
 5865179 5865180 ECIAI1_1621 ECIAI1_1622 ydfB ydfC FALSE 0.457 30.000 0.000 NA   NA
 5865182 5865183 ECIAI1_misc_RNA_30 ECIAI1_1624 dicF   FALSE 0.224 70.000 0.000 NA   NA
 5865183 5865184 ECIAI1_1624 ECIAI1_1625   ydfD TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 5865184 5865185 ECIAI1_1625 ECIAI1_1626 ydfD   FALSE 0.253 57.000 0.000 NA   NA
 5865185 5865186 ECIAI1_1626 ECIAI1_1627   xis FALSE 0.218 73.000 0.000 NA   NA
 5865186 5865187 ECIAI1_1627 ECIAI1_1628 xis intQ TRUE 0.663 20.000 0.000 NA   NA
 5865188 5865189 ECIAI1_1629 ECIAI1_1630   rspB FALSE 0.250 58.000 0.000 NA   NA
 5865189 5865190 ECIAI1_1630 ECIAI1_1631 rspB rspA TRUE 0.826 12.000 0.049 1.000 N NA
 5865190 5865191 ECIAI1_1631 ECIAI1_1632 rspA ynfA FALSE 0.017 206.000 0.020 NA   NA
 5865192 5865193 ECIAI1_1633 ECIAI1_1634 ynfB speG FALSE 0.453 35.000 0.055 NA   NA
 5865195 5865196 ECIAI1_1636 ECIAI1_1637 ynfD ynfE FALSE 0.148 199.000 0.304 NA   NA
 5865196 5865197 ECIAI1_1637 ECIAI1_1638 ynfE ynfF TRUE 0.944 61.000 0.231 0.001 Y NA
 5865197 5865198 ECIAI1_1638 ECIAI1_1639 ynfF ynfG TRUE 0.998 11.000 0.667 0.052 Y NA
 5865198 5865199 ECIAI1_1639 ECIAI1_1640 ynfG ynfH TRUE 0.983 2.000 0.333 1.000   NA
 5865199 5865200 ECIAI1_1640 ECIAI1_1641 ynfH dmsD TRUE 0.592 43.000 0.125 1.000   NA
 5865200 5865201 ECIAI1_1641 ECIAI1_1642 dmsD clcB FALSE 0.054 196.000 0.079 1.000   NA
 5865202 5865203 ECIAI1_1643 ECIAI1_1644 ynfK dgsA TRUE 0.546 125.000 0.455 NA N NA
 5865203 5865204 ECIAI1_1644 ECIAI1_1645 dgsA ynfL TRUE 0.796 135.000 0.408 NA Y NA
 5865205 5865206 ECIAI1_1646 ECIAI1_1647 ynfM asr FALSE 0.004 424.000 0.000 NA   NA
 5865206 5865207 ECIAI1_1647 ECIAI1_1648 asr ydgD FALSE 0.009 276.000 0.000 NA   NA
 5865208 5865209 ECIAI1_1649 ECIAI1_1650 mdtI mdtJ TRUE 0.996 -13.000 0.869 0.080 Y NA
 5865211 5865212 ECIAI1_1652 ECIAI1_1653 pntB pntA TRUE 0.999 11.000 0.745 0.001 Y NA
 5865213 5865214 ECIAI1_1654 ECIAI1_1655 ydgH ydgI FALSE 0.085 186.000 0.143 NA   NA
 5865214 5865215 ECIAI1_1655 ECIAI1_1656 ydgI folM TRUE 0.621 37.000 0.140 1.000 N NA
 5865217 5865218 ECIAI1_1659 ECIAI1_1660 rstA rstB TRUE 0.992 4.000 0.181 1.000 Y NA
 5865218 5865219 ECIAI1_1660 ECIAI1_1661 rstB tus TRUE 0.540 76.000 0.200 1.000   NA
 5865220 5865221 ECIAI1_1662 ECIAI1_1663 fumC fumA TRUE 0.655 143.000 0.000 0.001 Y NA
 5865222 5865223 ECIAI1_1664 ECIAI1_1665 manA ydgA TRUE 0.811 101.000 0.778 NA   NA
 5865224 5865225 ECIAI1_1666 ECIAI1_1667 uidC uidB TRUE 0.847 39.000 0.375 1.000   NA
 5865225 5865226 ECIAI1_1667 ECIAI1_1668 uidB uidA TRUE 0.993 -3.000 0.235 1.000 Y NA
 5865226 5865227 ECIAI1_1668 ECIAI1_1669 uidA uidR FALSE 0.004 388.000 0.000 1.000 N NA
 5865227 5865228 ECIAI1_1669 ECIAI1_1670 uidR hdhA FALSE 0.016 229.000 0.000 1.000 N NA
 5865228 5865229 ECIAI1_1670 ECIAI1_1671 hdhA malI FALSE 0.137 112.000 0.000 1.000 N NA
 5865230 5865231 ECIAI1_1672 ECIAI1_1673 malX malY TRUE 0.985 10.000 0.531 1.000 N NA
 5865231 5865232 ECIAI1_1673 ECIAI1_1674 malY add FALSE 0.323 104.000 0.132 1.000 N NA
 5865234 5865235 ECIAI1_1676 ECIAI1_1677 blr ydgT FALSE 0.009 273.000 0.000 NA   NA
 5865235 5865236 ECIAI1_1677 ECIAI1_1678 ydgT ydgK FALSE 0.364 86.000 0.120 NA   NA
 5865236 5865237 ECIAI1_1678 ECIAI1_1679 ydgK rsxA FALSE 0.427 77.000 0.148 NA   NA
 5865237 5865238 ECIAI1_1679 ECIAI1_1680 rsxA rsxB TRUE 0.999 0.000 0.564 0.052 Y NA
 5865238 5865239 ECIAI1_1680 ECIAI1_1681 rsxB rsxC TRUE 0.996 -7.000 0.537 0.052 Y NA
 5865239 5865240 ECIAI1_1681 ECIAI1_1682 rsxC rsxD TRUE 0.999 1.000 0.814 0.052 Y NA
 5865240 5865241 ECIAI1_1682 ECIAI1_1683 rsxD rsxG TRUE 0.999 4.000 0.924 0.052 Y NA
 5865241 5865242 ECIAI1_1683 ECIAI1_1684 rsxG rsxE TRUE 0.999 4.000 0.908 0.052 Y NA
 5865242 5865243 ECIAI1_1684 ECIAI1_1685 rsxE nth TRUE 0.939 0.000 0.109 1.000 N NA
 5865243 5865244 ECIAI1_1685 ECIAI1_1686 nth ydgR FALSE 0.002 611.000 0.000 1.000 N NA
 5865244 5865245 ECIAI1_1686 ECIAI1_1687 ydgR gst TRUE 0.579 106.000 0.344 1.000 N NA
 5865246 5865247 ECIAI1_1688 ECIAI1_1689 pdxY tyrS FALSE 0.243 59.000 0.041 1.000 N NA
 5865247 5865248 ECIAI1_1689 ECIAI1_1690 tyrS pdxH FALSE 0.119 129.000 0.054 1.000 N NA
 5865248 5865249 ECIAI1_1690 ECIAI1_1691 pdxH ydhA FALSE 0.228 59.000 0.034 NA   NA
 5865249 5865250 ECIAI1_1691 ECIAI1_1692 ydhA anmK FALSE 0.159 98.000 0.034 NA   NA
 5865253 5865254 ECIAI1_1695 ECIAI1_1696 ydhI ydhJ TRUE 0.984 3.000 0.412 NA   NA
 5865254 5865255 ECIAI1_1696 ECIAI1_1697 ydhJ ydhK TRUE 0.880 0.000 0.000 NA   NA
 5865256 5865257 ECIAI1_1698 ECIAI1_1699 sodC ydhF FALSE 0.234 81.000 0.033 1.000   NA
 5865257 5865258 ECIAI1_1699 ECIAI1_1700 ydhF ydhL FALSE 0.309 49.000 0.045 NA   NA
 5865259 5865260 ECIAI1_1701 ECIAI1_1702 ydhM nemA TRUE 0.833 37.000 0.362 1.000 N NA
 5865260 5865261 ECIAI1_1702 ECIAI1_1703 nemA gloA FALSE 0.235 81.000 0.057 1.000 N NA
 5865261 5865262 ECIAI1_1703 ECIAI1_1704 gloA rnt FALSE 0.330 103.000 0.136 1.000 N NA
 5865262 5865263 ECIAI1_1704 ECIAI1_1705 rnt lhr FALSE 0.230 93.000 0.000 1.000   NA
 5865265 5865266 ECIAI1_1707 ECIAI1_1708 ydhO sodB FALSE 0.073 128.000 0.015 1.000 N NA
 5865270 5865271 ECIAI1_1712 ECIAI1_1713 ydhC cfa FALSE 0.008 291.000 0.000 1.000 N NA
 5865275 5865276 ECIAI1_tRNA15 ECIAI1_tRNA16     TRUE 0.858 5.000 0.000 NA   NA
 5865276 5865277 ECIAI1_tRNA16 ECIAI1_1718   ydhR FALSE 0.151 108.000 0.000 NA   NA
 5865277 5865278 ECIAI1_1718 ECIAI1_1719 ydhR ydhS FALSE 0.114 126.000 0.000 NA   NA
 5865279 5865280 ECIAI1_1720 ECIAI1_1721 ydhT ydhU TRUE 0.965 4.000 0.222 NA   NA
 5865280 5865281 ECIAI1_1721 ECIAI1_1722 ydhU ydhX TRUE 0.996 -3.000 0.444 NA Y NA
 5865281 5865282 ECIAI1_1722 ECIAI1_1723 ydhX ydhW TRUE 0.596 64.000 0.235 NA   NA
 5865282 5865283 ECIAI1_1723 ECIAI1_1724 ydhW ydhV TRUE 0.985 4.000 0.458 NA   NA
 5865283 5865284 ECIAI1_1724 ECIAI1_1725 ydhV ydhY TRUE 0.995 21.000 0.600 0.015 Y NA
 5865284 5865285 ECIAI1_1725 ECIAI1_1726 ydhY ydhZ FALSE 0.003 456.000 0.000 NA   NA
 5865286 5865287 ECIAI1_1728 ECIAI1_1729 pykF lpp FALSE 0.007 311.000 0.000 1.000 N NA
 5865288 5865289 ECIAI1_1730 ECIAI1_1731 ynhG sufE FALSE 0.091 149.000 0.069 NA   NA
 5865289 5865290 ECIAI1_1731 ECIAI1_1732 sufE sufS TRUE 0.932 13.000 0.183 NA   NA
 5865290 5865291 ECIAI1_1732 ECIAI1_1733 sufS sufD TRUE 0.954 -3.000 0.193 1.000 N NA
 5865291 5865292 ECIAI1_1733 ECIAI1_1734 sufD sufC TRUE 0.982 -25.000 0.482 1.000 Y NA
 5865292 5865293 ECIAI1_1734 ECIAI1_1735 sufC sufB TRUE 0.996 10.000 0.466 1.000 Y NA
 5865293 5865294 ECIAI1_1735 ECIAI1_1736 sufB sufA TRUE 0.845 9.000 0.041 NA   NA
 5865296 5865297 ECIAI1_1737 ECIAI1_1738 ydiH ydiI TRUE 0.653 19.000 0.032 NA   NA
 5865297 5865298 ECIAI1_1738 ECIAI1_1739 ydiI ydiJ TRUE 0.919 -3.000 0.129 NA N NA
 5865299 5865300 ECIAI1_1740 ECIAI1_misc_RNA_32 ydiK rprA FALSE 0.033 186.000 0.000 NA   NA
 5865302 5865303 ECIAI1_1742 ECIAI1_1743 ydiL ydiM FALSE 0.321 100.000 0.095 1.000   NA
 5865303 5865304 ECIAI1_1743 ECIAI1_1744 ydiM ydiN FALSE 0.141 227.000 0.000 NA Y NA
 5865304 5865305 ECIAI1_1744 ECIAI1_1745 ydiN ydiB TRUE 0.849 12.000 0.082 NA N NA
 5865305 5865306 ECIAI1_1745 ECIAI1_1746 ydiB aroD TRUE 0.924 31.000 0.113 1.000 Y NA
 5865306 5865307 ECIAI1_1746 ECIAI1_1747 aroD ydiF FALSE 0.051 144.000 0.019 1.000 N NA
 5865307 5865308 ECIAI1_1747 ECIAI1_1748 ydiF ydiO TRUE 0.995 14.000 0.500 1.000 Y NA
 5865309 5865310 ECIAI1_1749 ECIAI1_1750 ydiP   FALSE 0.162 103.000 0.000 NA   NA
 5865311 5865312 ECIAI1_1751 ECIAI1_1752 ydiQ ydiR TRUE 0.998 20.000 1.000 0.013 Y NA
 5865312 5865313 ECIAI1_1752 ECIAI1_1753 ydiR ydiS TRUE 0.985 56.000 1.000 0.051 Y NA
 5865313 5865314 ECIAI1_1753 ECIAI1_1754 ydiS ydiT TRUE 0.997 -3.000 0.400 0.051 Y NA
 5865314 5865315 ECIAI1_1754 ECIAI1_1755 ydiT ydiD TRUE 0.915 3.000 0.080 1.000 N NA
 5865316 5865317 ECIAI1_1756 ECIAI1_1757 pps   FALSE 0.264 54.000 0.000 NA   NA
 5865318 5865319 ECIAI1_1758 ECIAI1_1759 ydiA aroH FALSE 0.172 157.000 0.165 1.000   NA
 5865319 5865320 ECIAI1_1759 ECIAI1_1760 aroH ydiE FALSE 0.085 132.000 0.054 NA N NA
 5865321 5865322 ECIAI1_1761 ECIAI1_1762 ydiU ydiU TRUE 0.876 1.000 0.000 NA   NA
 5865322 5865323 ECIAI1_1762 ECIAI1_1763 ydiU ydiV FALSE 0.239 63.000 0.000 NA   NA
 5865323 5865324 ECIAI1_1763 ECIAI1_1764 ydiV nlpC FALSE 0.009 247.000 0.000 NA N NA
 5865324 5865325 ECIAI1_1764 ECIAI1_1765 nlpC btuD FALSE 0.149 78.000 0.000 NA N NA
 5865325 5865326 ECIAI1_1765 ECIAI1_1766 btuD btuE TRUE 0.876 0.000 0.000 1.000 N NA
 5865326 5865327 ECIAI1_1766 ECIAI1_1767 btuE btuC FALSE 0.346 63.000 0.084 1.000 N NA
 5865327 5865328 ECIAI1_1767 ECIAI1_1768 btuC ihfA FALSE 0.128 101.000 0.023 1.000 N NA
 5865328 5865329 ECIAI1_1768 ECIAI1_1769 ihfA pheT TRUE 0.959 5.000 0.208 1.000 N NA
 5865329 5865330 ECIAI1_1769 ECIAI1_1770 pheT pheS TRUE 0.998 15.000 0.574 0.001 Y NA
 5865330 5865331 ECIAI1_1770 ECIAI1_4631 pheS pheM FALSE 0.009 284.000 0.000 NA   NA
 5865331 5865332 ECIAI1_4631 ECIAI1_1771 pheM rplT FALSE 0.119 123.000 0.000 NA   NA
 5865332 5865333 ECIAI1_1771 ECIAI1_1772 rplT rpmI TRUE 0.987 53.000 0.928 0.011 Y NA
 5865333 5865334 ECIAI1_1772 ECIAI1_1773 rpmI infC FALSE 0.173 97.000 0.000 NA   NA
 5865334 5865335 ECIAI1_1773 ECIAI1_1775 infC thrS FALSE 0.142 112.000 0.000 NA   NA
 5865336 5865337 ECIAI1_1776 ECIAI1_1777   arpB FALSE 0.046 168.000 0.000 NA   NA
 5865337 5865338 ECIAI1_1777 ECIAI1_1778 arpB   FALSE 0.458 -39.000 0.000 NA   NA
 5865338 5865339 ECIAI1_1778 ECIAI1_1779     TRUE 0.619 -13.000 0.000 NA   NA
 5865341 5865342 ECIAI1_1781 ECIAI1_1782 pfkB ydiZ FALSE 0.166 101.000 0.000 NA   NA
 5865342 5865343 ECIAI1_1782 ECIAI1_1783 ydiZ yniA FALSE 0.156 106.000 0.000 NA   NA
 5865345 5865346 ECIAI1_1785 ECIAI1_1786 yniC ydjM FALSE 0.071 163.000 0.068 NA   NA
 5865349 5865350 ECIAI1_1789 ECIAI1_1790 ydjO ydjO FALSE 0.224 70.000 0.000 NA   NA
 5865350 5865351 ECIAI1_1790 ECIAI1_1791 ydjO cedA FALSE 0.010 268.000 0.000 NA   NA
 5865353 5865354 ECIAI1_1793 ECIAI1_1794 chbG chbF TRUE 0.987 13.000 0.429 0.019   NA
 5865354 5865355 ECIAI1_1794 ECIAI1_1795 chbF chbR TRUE 0.753 105.000 0.625 1.000 N NA
 5865355 5865356 ECIAI1_1795 ECIAI1_1796 chbR chbA TRUE 0.991 8.000 0.727 1.000 N NA
 5865356 5865357 ECIAI1_1796 ECIAI1_1797 chbA chbC TRUE 0.986 51.000 0.833 0.013 Y NA
 5865357 5865358 ECIAI1_1797 ECIAI1_1798 chbC chbB TRUE 0.958 85.000 0.500 0.013 Y NA
 5865358 5865359 ECIAI1_1798 ECIAI1_1799 chbB osmE FALSE 0.010 299.000 0.000 1.000   NA
 5865360 5865361 ECIAI1_1801 ECIAI1_1802 nadE ydjQ FALSE 0.010 230.000 0.010 1.000 N NA
 5865362 5865363 ECIAI1_1803 ECIAI1_1804 ydjR spy FALSE 0.021 203.000 0.028 NA   NA
 5865363 5865364 ECIAI1_1804 ECIAI1_1805 spy astE FALSE 0.004 330.000 0.000 NA N NA
 5865364 5865365 ECIAI1_1805 ECIAI1_1806 astE astB TRUE 0.977 -7.000 0.126 1.000 Y NA
 5865365 5865366 ECIAI1_1806 ECIAI1_1807 astB astD TRUE 0.972 -3.000 0.306 1.000 N NA
 5865366 5865367 ECIAI1_1807 ECIAI1_1808 astD astA TRUE 0.950 -3.000 0.179 1.000 N NA
 5865367 5865368 ECIAI1_1808 ECIAI1_1809 astA astC TRUE 0.998 -3.000 0.625 1.000 Y NA
 5865369 5865370 ECIAI1_1810 ECIAI1_1811 xthA ydjX FALSE 0.033 167.000 0.016 NA   NA
 5865370 5865371 ECIAI1_1811 ECIAI1_1812 ydjX ydjY TRUE 0.912 5.000 0.083 NA   NA
 5865371 5865372 ECIAI1_1812 ECIAI1_1813 ydjY ydjZ TRUE 0.911 15.000 0.174 NA   NA
 5865372 5865373 ECIAI1_1813 ECIAI1_1814 ydjZ ynjA TRUE 0.928 0.000 0.087 NA   NA
 5865373 5865374 ECIAI1_1814 ECIAI1_1815 ynjA ynjB TRUE 0.818 10.000 0.032 NA   NA
 5865374 5865375 ECIAI1_1815 ECIAI1_1816 ynjB ynjC TRUE 0.986 18.000 0.627 0.053   NA
 5865375 5865376 ECIAI1_1816 ECIAI1_1817 ynjC ynjD TRUE 0.992 0.000 0.602 1.000   NA
 5865376 5865377 ECIAI1_1817 ECIAI1_1818 ynjD ynjE FALSE 0.443 67.000 0.111 1.000   NA
 5865382 5865383 ECIAI1_1823 ECIAI1_1824 ynjI topB FALSE 0.107 128.000 0.000 NA   NA
 5865383 5865384 ECIAI1_1824 ECIAI1_1825 topB selD TRUE 0.855 5.000 0.041 1.000 N NA
 5865384 5865385 ECIAI1_1825 ECIAI1_1826 selD   FALSE 0.433 -58.000 0.000 NA   NA
 5865385 5865386 ECIAI1_1826 ECIAI1_1827   ydjA TRUE 0.529 26.000 0.000 NA   NA
 5865387 5865388 ECIAI1_1828 ECIAI1_1829   sppA FALSE 0.435 -57.000 0.000 NA   NA
 5865388 5865389 ECIAI1_1829 ECIAI1_1830 sppA ansA FALSE 0.097 167.000 0.113 1.000 N NA
 5865389 5865390 ECIAI1_1830 ECIAI1_1831 ansA pncA TRUE 0.821 11.000 0.040 1.000 N NA
 5865391 5865392 ECIAI1_1832 ECIAI1_1833 ydjE ydjF TRUE 0.713 117.000 0.125 1.000 Y NA
 5865392 5865393 ECIAI1_1833 ECIAI1_1834 ydjF ydjG FALSE 0.338 137.000 0.269 1.000 N NA
 5865393 5865394 ECIAI1_1834 ECIAI1_1835 ydjG ydjH TRUE 0.965 10.000 0.269 1.000 N NA
 5865394 5865395 ECIAI1_1835 ECIAI1_1836 ydjH ydjI TRUE 0.996 5.000 0.368 1.000 Y NA
 5865395 5865396 ECIAI1_1836 ECIAI1_1837 ydjI ydjJ TRUE 0.931 21.000 0.194 0.014 N NA
 5865396 5865397 ECIAI1_1837 ECIAI1_1838 ydjJ ydjK TRUE 0.885 17.000 0.167 1.000 N NA
 5865397 5865398 ECIAI1_1838 ECIAI1_1839 ydjK ydjL TRUE 0.837 27.000 0.250 1.000 N NA
 5865398 5865399 ECIAI1_1839 ECIAI1_1840 ydjL yeaC FALSE 0.004 370.000 0.000 NA   NA
 5865399 5865400 ECIAI1_1840 ECIAI1_1842 yeaC msrB TRUE 0.684 42.000 0.216 NA   NA
 5865401 5865402 ECIAI1_1843 ECIAI1_1844 gapA yeaD TRUE 0.821 84.000 0.154 1.000 Y NA
 5865403 5865404 ECIAI1_1845 ECIAI1_1846 yeaE mipA FALSE 0.251 90.000 0.067 NA   NA
 5865405 5865406 ECIAI1_1847 ECIAI1_1848 yeaG yeaH TRUE 0.756 113.000 0.683 NA   NA
 5865406 5865407 ECIAI1_1848 ECIAI1_1849 yeaH yeaI FALSE 0.069 147.000 0.000 NA   NA
 5865407 5865408 ECIAI1_1849 ECIAI1_1850 yeaI yeaJ FALSE 0.445 181.000 0.000 0.005 Y NA
 5865408 5865409 ECIAI1_1850 ECIAI1_1851 yeaJ yeaK FALSE 0.461 43.000 0.083 NA   NA
 5865413 5865414 ECIAI1_1856 ECIAI1_1857 yeaN yeaO FALSE 0.181 55.000 0.007 NA   NA
 5865417 5865418 ECIAI1_1860 ECIAI1_1861 yeaQ   TRUE 0.814 12.000 0.000 NA   NA
 5865418 5865419 ECIAI1_1861 ECIAI1_1862   ydcM FALSE 0.457 30.000 0.000 NA   NA
 5865421 5865422 ECIAI1_1864 ECIAI1_1865     FALSE 0.006 331.000 0.000 NA   NA
 5865422 5865423 ECIAI1_1865 ECIAI1_1866   yeaR TRUE 0.865 4.000 0.000 NA   NA
 5865423 5865424 ECIAI1_1866 ECIAI1_1867 yeaR yeaS FALSE 0.029 173.000 0.000 NA N NA
 5865424 5865425 ECIAI1_1867 ECIAI1_1868 yeaS yeaT FALSE 0.107 127.000 0.000 1.000 N NA
 5865426 5865427 ECIAI1_1869 ECIAI1_1870 yeaU yeaV FALSE 0.025 416.000 0.333 1.000 N NA
 5865427 5865428 ECIAI1_1870 ECIAI1_1871 yeaV yeaW FALSE 0.419 32.000 0.000 1.000 N NA
 5865428 5865429 ECIAI1_1871 ECIAI1_1872 yeaW yeaX TRUE 0.490 56.000 0.043 0.051 N NA
 5865430 5865431 ECIAI1_1873 ECIAI1_1874 rnd fadD FALSE 0.388 70.000 0.115 1.000 N NA
 5865431 5865432 ECIAI1_1874 ECIAI1_1875 fadD yeaY FALSE 0.073 205.000 0.169 1.000 N NA
 5865432 5865433 ECIAI1_1875 ECIAI1_1876 yeaY yeaZ FALSE 0.293 40.000 0.024 1.000 N NA
 5865433 5865434 ECIAI1_1876 ECIAI1_1877 yeaZ yoaA FALSE 0.353 58.000 0.082 1.000 N NA
 5865435 5865436 ECIAI1_1878 ECIAI1_1879 yoaB yoaC FALSE 0.005 363.000 0.000 NA   NA
 5865438 5865439 ECIAI1_1881 ECIAI1_1882 pabB yeaB TRUE 0.946 4.000 0.116 1.000   NA
 5865439 5865440 ECIAI1_1882 ECIAI1_1883 yeaB sdaA FALSE 0.273 184.000 0.409 1.000   NA
 5865440 5865441 ECIAI1_1883 ECIAI1_1884 sdaA adrB FALSE 0.455 131.000 0.389 NA N NA
 5865443 5865444 ECIAI1_1886 ECIAI1_1887 manX manY TRUE 0.853 63.000 0.000 0.017 Y NA
 5865444 5865445 ECIAI1_1887 ECIAI1_1888 manY manZ TRUE 0.999 4.000 0.939 0.017 Y NA
 5865445 5865446 ECIAI1_1888 ECIAI1_1889 manZ yobD TRUE 0.881 55.000 0.755 NA   NA
 5865446 5865447 ECIAI1_1889 ECIAI1_1890 yobD   FALSE 0.032 187.000 0.000 NA   NA
 5865447 5865448 ECIAI1_1890 ECIAI1_1891   yebN TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 5865449 5865450 ECIAI1_1892 ECIAI1_1893 rrmA cspC FALSE 0.061 166.000 0.038 1.000   NA
 5865450 5865451 ECIAI1_1893 ECIAI1_1894 cspC yobF TRUE 0.941 13.000 0.214 NA   NA
 5865451 5865452 ECIAI1_1894 ECIAI1_1895 yobF yebO FALSE 0.002 669.000 0.000 NA   NA
 5865452 5865453 ECIAI1_1895 ECIAI1_1896 yebO yobG TRUE 0.759 75.000 0.500 NA   NA
 5865457 5865458 ECIAI1_1900 ECIAI1_1901 htpX prc FALSE 0.084 192.000 0.042 0.020 N NA
 5865458 5865459 ECIAI1_1901 ECIAI1_1902 prc proQ TRUE 0.915 20.000 0.304 NA N NA
 5865459 5865460 ECIAI1_1902 ECIAI1_1903 proQ yebR TRUE 0.712 97.000 0.081 NA Y NA
 5865461 5865462 ECIAI1_1904 ECIAI1_1905 yebS yebT TRUE 0.959 -31.000 0.840 NA   NA
 5865462 5865463 ECIAI1_1905 ECIAI1_1906 yebT yebU TRUE 0.708 80.000 0.420 NA   NA
 5865463 5865464 ECIAI1_1906 ECIAI1_1907 yebU yebV FALSE 0.258 118.000 0.121 NA   NA
 5865464 5865465 ECIAI1_1907 ECIAI1_1908 yebV yebW TRUE 0.935 21.000 0.353 NA   NA
 5865466 5865467 ECIAI1_1909 ECIAI1_misc_RNA_34 pphA ryeB FALSE 0.029 195.000 0.000 NA   NA
 5865467 5865468 ECIAI1_misc_RNA_34 ECIAI1_1910 ryeB   FALSE 0.379 -90.000 0.000 NA   NA
 5865468 5865469 ECIAI1_1910 ECIAI1_1911   yebY FALSE 0.198 85.000 0.000 NA   NA
 5865469 5865470 ECIAI1_1911 ECIAI1_1912 yebY yebZ TRUE 0.987 13.000 0.704 NA   NA
 5865470 5865471 ECIAI1_1912 ECIAI1_1913 yebZ yobA TRUE 0.991 4.000 0.613 1.000   NA
 5865472 5865473 ECIAI1_1914 ECIAI1_1915 holE yobB TRUE 0.496 102.000 0.222 1.000   NA
 5865473 5865474 ECIAI1_1915 ECIAI1_1916 yobB exoX TRUE 0.949 24.000 0.500 1.000   NA
 5865475 5865476 ECIAI1_1917 ECIAI1_1918 ptrB yebE FALSE 0.041 209.000 0.092 NA   NA
 5865476 5865477 ECIAI1_1918 ECIAI1_1920 yebE yebF FALSE 0.005 327.000 0.028 NA   NA
 5865477 5865478 ECIAI1_1920 ECIAI1_1921 yebF yebG FALSE 0.222 55.000 0.027 NA   NA
 5865480 5865481 ECIAI1_1923 ECIAI1_1924 eda edd TRUE 0.973 37.000 0.523 1.000 Y NA
 5865481 5865482 ECIAI1_1924 ECIAI1_1925 edd zwf FALSE 0.144 235.000 0.041 1.000 Y NA
 5865483 5865484 ECIAI1_1926 ECIAI1_1927 yebK pykA FALSE 0.148 128.000 0.071 1.000 N NA
 5865485 5865486 ECIAI1_1928 ECIAI1_1929     FALSE 0.260 55.000 0.000 NA   NA
 5865486 5865487 ECIAI1_1929 ECIAI1_1930     FALSE 0.184 93.000 0.000 NA   NA
 5865487 5865488 ECIAI1_1930 ECIAI1_1931     TRUE 0.835 13.000 0.000 1.000   NA
 5865488 5865489 ECIAI1_1931 ECIAI1_1932     TRUE 0.957 18.000 0.024 1.000 Y NA
 5865489 5865490 ECIAI1_1932 ECIAI1_1933     TRUE 0.998 -3.000 0.600 0.052 Y NA
 5865490 5865491 ECIAI1_1933 ECIAI1_1934     TRUE 0.991 3.000 0.111 1.000 Y NA
 5865492 5865493 ECIAI1_1935 ECIAI1_1936     TRUE 0.723 19.000 0.056 NA   NA
 5865493 5865494 ECIAI1_1936 ECIAI1_1937     FALSE 0.190 91.000 0.000 NA   NA
 5865494 5865495 ECIAI1_1937 ECIAI1_1938     FALSE 0.178 83.000 0.030 NA   NA
 5865495 5865496 ECIAI1_1938 ECIAI1_1939     FALSE 0.003 362.000 0.000 NA N NA
 5865496 5865497 ECIAI1_1939 ECIAI1_1940     FALSE 0.193 89.000 0.000 NA   NA
 5865497 5865498 ECIAI1_1940 ECIAI1_1941     FALSE 0.453 37.000 0.000 1.000   NA
 5865499 5865500 ECIAI1_1942 ECIAI1_1943 lpxM yebA TRUE 0.816 120.000 0.299 1.000 Y NA
 5865500 5865501 ECIAI1_1943 ECIAI1_1944 yebA znuA TRUE 0.871 16.000 0.131 1.000 N NA
 5865502 5865503 ECIAI1_1945 ECIAI1_1946 znuC znuB TRUE 0.999 -3.000 0.755 0.082 Y NA
 5865504 5865505 ECIAI1_1947 ECIAI1_1948 ruvB ruvA TRUE 0.999 9.000 0.549 0.001 Y NA
 5865507 5865508 ECIAI1_1950 ECIAI1_1951 ruvC yebC TRUE 0.792 35.000 0.277 NA   NA
 5865508 5865509 ECIAI1_1951 ECIAI1_1952 yebC nudB FALSE 0.453 29.000 0.035 NA   NA
 5865509 5865510 ECIAI1_1952 ECIAI1_1953 nudB aspS FALSE 0.140 118.000 0.050 1.000 N NA
 5865511 5865512 ECIAI1_1954 ECIAI1_1955 yecD yecE TRUE 0.911 -3.000 0.089 NA   NA
 5865512 5865513 ECIAI1_1955 ECIAI1_1956 yecE yecN TRUE 0.475 53.000 0.126 NA   NA
 5865513 5865514 ECIAI1_1956 ECIAI1_1957 yecN yecO TRUE 0.493 41.000 0.089 NA   NA
 5865514 5865515 ECIAI1_1957 ECIAI1_1958 yecO yecP TRUE 0.974 -3.000 0.315 NA   NA
 5865516 5865517 ECIAI1_1959 ECIAI1_1960 torZ torY TRUE 0.990 25.000 0.481 0.050 Y NA
 5865517 5865518 ECIAI1_1960 ECIAI1_1961 torY cutC FALSE 0.004 388.000 0.000 1.000 N NA
 5865518 5865519 ECIAI1_1961 ECIAI1_1962 cutC yecM TRUE 0.813 14.000 0.057 NA   NA
 5865520 5865521 ECIAI1_1963 ECIAI1_1964 argS yecT FALSE 0.040 177.000 0.000 NA   NA
 5865522 5865523 ECIAI1_1965 ECIAI1_1966 flhE flhA TRUE 0.985 0.000 0.158 0.002   NA
 5865523 5865524 ECIAI1_1966 ECIAI1_1967 flhA flhB TRUE 0.993 -7.000 0.287 0.008 Y NA
 5865524 5865525 ECIAI1_1967 ECIAI1_1968 flhB cheZ FALSE 0.215 202.000 0.000 1.000 Y NA
 5865525 5865526 ECIAI1_1968 ECIAI1_1969 cheZ cheY TRUE 0.981 11.000 0.000 1.000 Y NA
 5865526 5865527 ECIAI1_1969 ECIAI1_1970 cheY cheB TRUE 0.984 15.000 0.000 0.011 Y NA
 5865527 5865528 ECIAI1_1970 ECIAI1_1971 cheB cheR TRUE 0.985 3.000 0.025 1.000 Y NA
 5865528 5865529 ECIAI1_1971 ECIAI1_1972 cheR tap TRUE 0.978 19.000 0.188 1.000 Y NA
 5865529 5865530 ECIAI1_1972 ECIAI1_1973 tap tar TRUE 0.961 46.000 0.235 0.001 Y NA
 5865532 5865533 ECIAI1_1974 ECIAI1_1975 cheW cheA TRUE 0.994 21.000 0.447 0.003 Y NA
 5865533 5865534 ECIAI1_1975 ECIAI1_1976 cheA motB TRUE 0.999 5.000 0.913 1.000 Y NA
 5865534 5865535 ECIAI1_1976 ECIAI1_1977 motB motA TRUE 0.996 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 5865535 5865536 ECIAI1_1977 ECIAI1_1978 motA flhC TRUE 0.563 127.000 0.408 1.000   NA
 5865536 5865537 ECIAI1_1978 ECIAI1_1979 flhC flhD TRUE 0.971 3.000 0.000 0.001   NA
 5865539 5865540 ECIAI1_1981 ECIAI1_1982 otsA otsB TRUE 0.966 -25.000 0.068 0.001 Y NA
 5865540 5865541 ECIAI1_1982 ECIAI1_1983 otsB araH FALSE 0.338 167.000 0.037 1.000 Y NA
 5865541 5865542 ECIAI1_1983 ECIAI1_1984 araH araG TRUE 0.995 12.000 0.451 1.000 Y NA
 5865542 5865543 ECIAI1_1984 ECIAI1_1985 araG araF TRUE 0.968 70.000 0.917 NA Y NA
 5865545 5865546 ECIAI1_1987 ECIAI1_misc_RNA_36 yecJ isrB FALSE 0.202 81.000 0.000 NA   NA
 5865547 5865548 ECIAI1_1988 ECIAI1_1989   yecR FALSE 0.025 202.000 0.000 NA   NA
 5865548 5865549 ECIAI1_1989 ECIAI1_1990 yecR ftn FALSE 0.044 171.000 0.000 NA   NA
 5865552 5865553 ECIAI1_1993 ECIAI1_tRNA74 yecA   FALSE 0.028 196.000 0.000 NA   NA
 5865553 5865554 ECIAI1_tRNA74 ECIAI1_tRNA73     TRUE 0.793 13.000 0.000 NA   NA
 5865554 5865555 ECIAI1_tRNA73 ECIAI1_tRNA72     FALSE 0.260 55.000 0.000 NA   NA
 5865555 5865556 ECIAI1_tRNA72 ECIAI1_1996   pgsA FALSE 0.059 152.000 0.000 NA   NA
 5865556 5865557 ECIAI1_1996 ECIAI1_1997 pgsA uvrC TRUE 0.602 57.000 0.227 1.000 N NA
 5865557 5865558 ECIAI1_1997 ECIAI1_1998 uvrC uvrY TRUE 0.958 -3.000 0.086 0.021 N NA
 5865559 5865560 ECIAI1_1999 ECIAI1_2000   yecF TRUE 0.619 -13.000 0.000 NA   NA
 5865561 5865562 ECIAI1_2001 ECIAI1_2002 sdiA yecC FALSE 0.024 230.000 0.071 1.000 N NA
 5865562 5865563 ECIAI1_2002 ECIAI1_2003 yecC yecS TRUE 0.990 -3.000 0.150 1.000 Y NA
 5865563 5865564 ECIAI1_2003 ECIAI1_2004 yecS yedO TRUE 0.972 15.000 0.050 1.000 Y NA
 5865564 5865565 ECIAI1_2004 ECIAI1_2005 yedO fliY TRUE 0.904 105.000 0.469 1.000 Y NA
 5865565 5865566 ECIAI1_2005 ECIAI1_2006 fliY fliZ TRUE 0.610 88.000 0.280 1.000   NA
 5865566 5865567 ECIAI1_2006 ECIAI1_2007 fliZ fliA TRUE 0.543 46.000 0.108 1.000   NA
 5865570 5865571 ECIAI1_2010 ECIAI1_2011 fliD fliS TRUE 0.987 25.000 0.284 0.002 Y NA
 5865571 5865572 ECIAI1_2011 ECIAI1_2012 fliS fliT TRUE 0.983 0.000 0.324 1.000   NA
 5865572 5865573 ECIAI1_2012 ECIAI1_2013 fliT amyA FALSE 0.411 78.000 0.115 1.000   NA
 5865575 5865576 ECIAI1_2015 ECIAI1_2016 yedE yedF TRUE 0.993 -3.000 0.844 NA   NA
 5865576 5865577 ECIAI1_2016 ECIAI1_2017 yedF yedK FALSE 0.154 107.000 0.000 NA   NA
 5865579 5865580 ECIAI1_2019 ECIAI1_2020 fliF fliG TRUE 0.992 -7.000 0.220 0.005 Y NA
 5865580 5865581 ECIAI1_2020 ECIAI1_2021 fliG fliH TRUE 0.982 -7.000 0.000 0.003 Y NA
 5865581 5865582 ECIAI1_2021 ECIAI1_2022 fliH fliI TRUE 0.987 0.000 0.000 1.000 Y NA
 5865582 5865583 ECIAI1_2022 ECIAI1_2023 fliI fliJ TRUE 0.951 19.000 0.006 1.000 Y NA
 5865583 5865584 ECIAI1_2023 ECIAI1_2024 fliJ fliK TRUE 0.997 -3.000 0.317 0.005 Y NA
 5865584 5865585 ECIAI1_2024 ECIAI1_2025 fliK fliL TRUE 0.750 105.000 0.119 1.000 Y NA
 5865585 5865586 ECIAI1_2025 ECIAI1_2026 fliL fliM TRUE 0.999 5.000 0.957 0.001 Y NA
 5865586 5865587 ECIAI1_2026 ECIAI1_2027 fliM fliN TRUE 0.995 -3.000 0.137 0.001 Y NA
 5865587 5865588 ECIAI1_2027 ECIAI1_2028 fliN fliO TRUE 0.997 3.000 0.443 1.000 Y NA
 5865588 5865589 ECIAI1_2028 ECIAI1_2029 fliO fliP TRUE 0.994 0.000 0.203 1.000 Y NA
 5865589 5865590 ECIAI1_2029 ECIAI1_2030 fliP fliQ TRUE 0.999 10.000 0.827 0.007 Y NA
 5865590 5865591 ECIAI1_2030 ECIAI1_2031 fliQ fliR TRUE 0.992 8.000 0.000 0.002 Y NA
 5865591 5865592 ECIAI1_2031 ECIAI1_2032 fliR rcsA FALSE 0.008 290.000 0.000 1.000 N NA
 5865593 5865594 ECIAI1_2033 ECIAI1_misc_RNA_37 dsrB dsrB FALSE 0.328 -186.000 0.000 NA   NA
 5865598 5865599 ECIAI1_2036 ECIAI1_2037 yedQ   FALSE 0.398 -79.000 0.000 NA   NA
 5865599 5865600 ECIAI1_2037 ECIAI1_2038   yodC FALSE 0.104 129.000 0.000 NA   NA
 5865600 5865601 ECIAI1_2038 ECIAI1_2039 yodC yedI FALSE 0.170 79.000 0.025 NA   NA
 5865603 5865604 ECIAI1_2041 ECIAI1_2042 vsr dcm TRUE 0.958 -19.000 0.000 0.050 Y NA
 5865604 5865605 ECIAI1_2042 ECIAI1_2043 dcm yedJ FALSE 0.284 67.000 0.000 1.000   NA
 5865605 5865606 ECIAI1_2043 ECIAI1_2044 yedJ yedR FALSE 0.427 40.000 0.062 NA   NA
 5865607 5865608 ECIAI1_misc_RNA_39 ECIAI1_2045 rseX   FALSE 0.009 282.000 0.000 NA   NA
 5865608 5865609 ECIAI1_2045 ECIAI1_2047   hchA FALSE 0.003 593.000 0.000 NA   NA
 5865610 5865611 ECIAI1_2048 ECIAI1_2049 yedV yedW TRUE 0.999 0.000 0.857 0.001 Y NA
 5865612 5865613 ECIAI1_2050 ECIAI1_2051 yedX yedY FALSE 0.188 109.000 0.000 1.000   NA
 5865613 5865614 ECIAI1_2051 ECIAI1_2052 yedY yedZ TRUE 0.996 1.000 0.790 0.050   NA
 5865614 5865615 ECIAI1_2052 ECIAI1_2053 yedZ yodA FALSE 0.016 257.000 0.000 1.000   NA
 5865615 5865616 ECIAI1_2053 ECIAI1_2054 yodA yodB FALSE 0.007 343.000 0.000 1.000   NA
 5865618 5865619 ECIAI1_2057 ECIAI1_tRNA17 yeeI   FALSE 0.166 101.000 0.000 NA   NA
 5865619 5865620 ECIAI1_tRNA17 ECIAI1_2058     FALSE 0.015 239.000 0.000 NA   NA
 5865620 5865621 ECIAI1_2058 ECIAI1_2059   yeeJ FALSE 0.384 -88.000 0.000 NA   NA
 5865622 5865623 ECIAI1_2060 ECIAI1_2061 insF insE TRUE 0.949 -3.000 0.000 0.050   NA
 5865623 5865624 ECIAI1_2061 ECIAI1_2062 insE   FALSE 0.004 463.000 0.000 1.000   NA
 5865625 5865626 ECIAI1_2063 ECIAI1_2064 shiA amn FALSE 0.122 102.000 0.021 1.000 N NA
 5865626 5865627 ECIAI1_2064 ECIAI1_2065 amn yeeN FALSE 0.005 343.000 0.000 NA   NA
 5865627 5865628 ECIAI1_2065 ECIAI1_2066 yeeN   FALSE 0.014 244.000 0.000 NA   NA
 5865629 5865630 ECIAI1_tRNA70 ECIAI1_2067   yeeO FALSE 0.166 101.000 0.000 NA   NA
 5865632 5865633 ECIAI1_2068 ECIAI1_2069 cbl nac TRUE 0.884 102.000 0.222 0.052 Y NA
 5865635 5865636 ECIAI1_2070 ECIAI1_2072 erfK cobT FALSE 0.175 65.000 0.015 NA   NA
 5865636 5865637 ECIAI1_2072 ECIAI1_2073 cobT cobS TRUE 0.990 12.000 0.056 0.003 Y NA
 5865637 5865638 ECIAI1_2073 ECIAI1_2074 cobS cobU TRUE 0.983 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5865638 5865639 ECIAI1_2074 ECIAI1_2075 cobU   FALSE 0.093 134.000 0.000 NA   NA
 5865641 5865642 ECIAI1_2077 ECIAI1_2078 yeeX yeeA FALSE 0.391 106.000 0.180 NA   NA
 5865642 5865643 ECIAI1_2078 ECIAI1_2079 yeeA sbmC FALSE 0.050 199.000 0.096 NA   NA
 5865643 5865644 ECIAI1_2079 ECIAI1_2080 sbmC dacD FALSE 0.198 119.000 0.110 NA N NA
 5865646 5865647 ECIAI1_2082 ECIAI1_2083 yeeD yeeE TRUE 0.970 14.000 0.419 NA   NA
 5865647 5865648 ECIAI1_2083 ECIAI1_2084 yeeE yeeF FALSE 0.039 179.000 0.000 NA   NA
 5865648 5865649 ECIAI1_2084 ECIAI1_2085 yeeF yeeY FALSE 0.010 267.000 0.000 1.000 N NA
 5865649 5865650 ECIAI1_2085 ECIAI1_2086 yeeY yeeZ FALSE 0.231 46.000 0.015 1.000 N NA
 5865650 5865651 ECIAI1_2086 ECIAI1_2087 yeeZ yoeB FALSE 0.201 83.000 0.000 NA   NA
 5865651 5865652 ECIAI1_2087 ECIAI1_2088 yoeB yefM TRUE 0.979 -3.000 0.366 NA   NA
 5865653 5865654 ECIAI1_4632 ECIAI1_misc_RNA_40 hisL   TRUE 0.529 -24.000 0.000 NA   NA
 5865654 5865655 ECIAI1_misc_RNA_40 ECIAI1_2089   hisG FALSE 0.307 47.000 0.000 NA   NA
 5865655 5865656 ECIAI1_2089 ECIAI1_2090 hisG hisD TRUE 0.996 6.000 0.171 0.003 Y NA
 5865656 5865657 ECIAI1_2090 ECIAI1_2091 hisD hisC TRUE 0.997 -3.000 0.294 0.003 Y NA
 5865657 5865658 ECIAI1_2091 ECIAI1_2092 hisC hisB TRUE 0.998 0.000 0.341 0.003 Y NA
 5865658 5865659 ECIAI1_2092 ECIAI1_2093 hisB hisH TRUE 0.996 0.000 0.128 0.003 Y NA
 5865659 5865660 ECIAI1_2093 ECIAI1_2094 hisH hisA TRUE 0.997 0.000 0.210 0.003 Y NA
 5865660 5865661 ECIAI1_2094 ECIAI1_2095 hisA hisF TRUE 0.992 -18.000 0.433 0.003 Y NA
 5865661 5865662 ECIAI1_2095 ECIAI1_2096 hisF hisI TRUE 0.996 -6.000 0.430 0.003 Y NA
 5865663 5865664 ECIAI1_2097 ECIAI1_2098 wbdC wbdB TRUE 0.996 10.000 0.256 0.012 Y NA
 5865664 5865665 ECIAI1_2098 ECIAI1_2099 wbdB wbdA TRUE 0.880 52.000 0.000 0.012 Y NA
 5865665 5865666 ECIAI1_2099 ECIAI1_2100 wbdA wbbD TRUE 0.900 3.000 0.000 1.000   NA
 5865666 5865667 ECIAI1_2100 ECIAI1_2101 wbbD wzt TRUE 0.952 0.000 0.116 1.000   NA
 5865667 5865668 ECIAI1_2101 ECIAI1_2102 wzt wzm TRUE 0.992 0.000 0.450 0.081 N NA
 5865668 5865669 ECIAI1_2102 ECIAI1_2103 wzm cpsG TRUE 0.991 2.000 0.125 1.000 Y NA
 5865669 5865670 ECIAI1_2103 ECIAI1_2104 cpsG cpsB TRUE 0.889 -6.000 0.133 1.000 N NA
 5865670 5865671 ECIAI1_2104 ECIAI1_2105 cpsB   FALSE 0.009 282.000 0.000 NA   NA
 5865671 5865672 ECIAI1_2105 ECIAI1_2106     FALSE 0.042 173.000 0.000 NA   NA
 5865672 5865673 ECIAI1_2106 ECIAI1_2107   cld TRUE 0.865 4.000 0.000 NA   NA
 5865673 5865674 ECIAI1_2107 ECIAI1_2108 cld ugd FALSE 0.459 143.000 0.000 1.000 Y NA
 5865674 5865675 ECIAI1_2108 ECIAI1_2109 ugd gnd FALSE 0.013 248.000 0.000 1.000 N NA
 5865675 5865676 ECIAI1_2109 ECIAI1_2110 gnd   FALSE 0.151 106.000 0.000 1.000 N NA
 5865676 5865677 ECIAI1_2110 ECIAI1_2111     TRUE 0.949 23.000 0.067 1.000 Y NA
 5865677 5865678 ECIAI1_2111 ECIAI1_2112     FALSE 0.358 40.000 0.000 NA   NA
 5865680 5865681 ECIAI1_2114 ECIAI1_2115     TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 5865681 5865682 ECIAI1_2115 ECIAI1_2116   galF FALSE 0.002 1429.000 0.000 NA N NA
 5865682 5865683 ECIAI1_2116 ECIAI1_2117 galF gne FALSE 0.153 243.000 0.074 1.000 Y NA
 5865683 5865684 ECIAI1_2117 ECIAI1_2118 gne wcaM FALSE 0.088 158.000 0.083 NA   NA
 5865684 5865685 ECIAI1_2118 ECIAI1_2119 wcaM wcaL TRUE 0.967 11.000 0.292 NA   NA
 5865685 5865686 ECIAI1_2119 ECIAI1_2120 wcaL wcaK TRUE 0.915 -3.000 0.095 NA   NA
 5865686 5865687 ECIAI1_2120 ECIAI1_2121 wcaK wzxC FALSE 0.005 565.000 0.095 NA   NA
 5865687 5865688 ECIAI1_2121 ECIAI1_2122 wzxC wcaJ TRUE 0.978 2.000 0.304 NA   NA
 5865688 5865689 ECIAI1_2122 ECIAI1_2123 wcaJ cpsG TRUE 0.802 55.000 0.538 NA N NA
 5865689 5865690 ECIAI1_2123 ECIAI1_2124 cpsG cpsB FALSE 0.469 193.000 1.000 1.000 N NA
 5865690 5865691 ECIAI1_2124 ECIAI1_2125 cpsB wcaI TRUE 0.991 3.000 0.123 1.000 Y NA
 5865691 5865692 ECIAI1_2125 ECIAI1_2126 wcaI nudD TRUE 0.922 -3.000 0.108 1.000 N NA
 5865692 5865693 ECIAI1_2126 ECIAI1_2127 nudD fcl TRUE 0.986 3.000 0.217 0.001 N NA
 5865693 5865694 ECIAI1_2127 ECIAI1_2128 fcl gmd TRUE 0.993 3.000 0.000 0.008 Y NA
 5865694 5865695 ECIAI1_2128 ECIAI1_2129 gmd wcaF TRUE 0.542 26.000 0.022 1.000   NA
 5865695 5865696 ECIAI1_2129 ECIAI1_2130 wcaF wcaE TRUE 0.811 16.000 0.077 NA   NA
 5865696 5865697 ECIAI1_2130 ECIAI1_2131 wcaE wcaD TRUE 0.972 11.000 0.333 NA   NA
 5865697 5865698 ECIAI1_2131 ECIAI1_2132 wcaD wcaC TRUE 0.905 -25.000 0.400 NA   NA
 5865698 5865699 ECIAI1_2132 ECIAI1_2133 wcaC wcaB TRUE 0.966 -3.000 0.259 1.000 N NA
 5865699 5865700 ECIAI1_2133 ECIAI1_2135 wcaB wcaA TRUE 0.968 3.000 0.259 NA N NA
 5865700 5865701 ECIAI1_2135 ECIAI1_2136 wcaA wzc TRUE 0.679 93.000 0.000 NA Y NA
 5865701 5865702 ECIAI1_2136 ECIAI1_2137 wzc wzb TRUE 0.867 3.000 0.000 1.000 N NA
 5865702 5865703 ECIAI1_2137 ECIAI1_2138 wzb wza TRUE 0.971 6.000 0.286 1.000 N NA
 5865705 5865706 ECIAI1_2140 ECIAI1_2141 asmA dcd TRUE 0.606 22.000 0.057 NA N NA
 5865706 5865707 ECIAI1_2141 ECIAI1_2142 dcd udk TRUE 0.769 92.000 0.098 1.000 Y NA
 5865711 5865712 ECIAI1_2147 ECIAI1_2148 yegI yegK TRUE 0.953 -12.000 0.455 1.000   NA
 5865712 5865713 ECIAI1_2148 ECIAI1_2149 yegK yegL TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 5865714 5865715 ECIAI1_misc_RNA_41 ECIAI1_misc_RNA_42 ryeC ryeD FALSE 0.032 187.000 0.000 NA   NA
 5865715 5865716 ECIAI1_misc_RNA_42 ECIAI1_misc_RNA_43 ryeD   FALSE 0.033 186.000 0.000 NA   NA
 5865716 5865717 ECIAI1_misc_RNA_43 ECIAI1_2150   mdtA FALSE 0.011 264.000 0.000 NA   NA
 5865717 5865718 ECIAI1_2150 ECIAI1_2151 mdtA mdtB TRUE 0.832 0.000 0.000 NA N NA
 5865718 5865719 ECIAI1_2151 ECIAI1_2152 mdtB mdtC TRUE 0.987 1.000 0.062 NA Y NA
 5865719 5865720 ECIAI1_2152 ECIAI1_2153 mdtC mdtD TRUE 0.986 1.000 0.438 1.000 N NA
 5865720 5865721 ECIAI1_2153 ECIAI1_2154 mdtD baeS TRUE 0.936 -3.000 0.139 1.000 N NA
 5865721 5865722 ECIAI1_2154 ECIAI1_2155 baeS baeR TRUE 0.997 -3.000 0.591 1.000 Y NA
 5865722 5865723 ECIAI1_2155 ECIAI1_2156 baeR   FALSE 0.451 -40.000 0.000 NA   NA
 5865723 5865724 ECIAI1_2156 ECIAI1_2157   yegP FALSE 0.358 40.000 0.000 NA   NA
 5865724 5865725 ECIAI1_2157 ECIAI1_2158 yegP   FALSE 0.022 209.000 0.000 NA   NA
 5865725 5865726 ECIAI1_2158 ECIAI1_2159     TRUE 0.875 2.000 0.000 NA   NA
 5865726 5865727 ECIAI1_2159 ECIAI1_2160   yegQ FALSE 0.162 103.000 0.000 NA   NA
 5865727 5865728 ECIAI1_2160 ECIAI1_misc_RNA_44 yegQ ryeE FALSE 0.201 83.000 0.000 NA   NA
 5865729 5865730 ECIAI1_2161 ECIAI1_2162   yegR TRUE 0.634 -12.000 0.000 NA   NA
 5865732 5865733 ECIAI1_2164 ECIAI1_2165 gatR gatD FALSE 0.163 100.000 0.000 1.000 N NA
 5865733 5865734 ECIAI1_2165 ECIAI1_2166 gatD gatC FALSE 0.294 48.000 0.000 1.000 N NA
 5865734 5865735 ECIAI1_2166 ECIAI1_2167 gatC gatB TRUE 0.992 4.000 0.000 0.016 Y NA
 5865735 5865736 ECIAI1_2167 ECIAI1_2168 gatB gatA TRUE 0.938 31.000 0.000 0.012 Y NA
 5865736 5865737 ECIAI1_2168 ECIAI1_2169 gatA gatZ TRUE 0.982 10.000 0.000 1.000 Y NA
 5865737 5865738 ECIAI1_2169 ECIAI1_2170 gatZ gatY TRUE 0.955 29.000 0.000 0.001 Y NA
 5865738 5865739 ECIAI1_2170 ECIAI1_2171 gatY fbaB FALSE 0.144 310.000 0.000 0.001 Y NA
 5865740 5865741 ECIAI1_2172 ECIAI1_2173 yegT yegU TRUE 0.978 -3.000 0.364 NA   NA
 5865741 5865742 ECIAI1_2173 ECIAI1_2174 yegU yegV TRUE 0.987 -3.000 0.600 NA N NA
 5865743 5865744 ECIAI1_2175 ECIAI1_2176 yegW yegX FALSE 0.268 52.000 0.000 1.000 N NA
 5865744 5865745 ECIAI1_2176 ECIAI1_2177 yegX thiD FALSE 0.228 65.000 0.000 1.000 N NA
 5865745 5865746 ECIAI1_2177 ECIAI1_2178 thiD thiM TRUE 0.991 -3.000 0.037 0.004 Y NA
 5865746 5865747 ECIAI1_2178 ECIAI1_misc_RNA_45 thiM   FALSE 0.404 35.000 0.000 NA   NA
 5865747 5865748 ECIAI1_misc_RNA_45 ECIAI1_2180   yohL FALSE 0.187 92.000 0.000 NA   NA
 5865749 5865750 ECIAI1_2181 ECIAI1_2182 rncA yohN FALSE 0.368 39.000 0.000 NA   NA
 5865751 5865752 ECIAI1_2183 ECIAI1_2184 yehA yehB TRUE 0.820 14.000 0.000 1.000   NA
 5865752 5865753 ECIAI1_2184 ECIAI1_2185 yehB yehC TRUE 0.997 16.000 1.000 1.000 Y NA
 5865753 5865754 ECIAI1_2185 ECIAI1_2186 yehC yehD TRUE 0.860 81.000 0.222 1.000 Y NA
 5865754 5865755 ECIAI1_2186 ECIAI1_2187 yehD yehE FALSE 0.008 293.000 0.000 NA   NA
 5865755 5865756 ECIAI1_2187 ECIAI1_2188 yehE mrp FALSE 0.011 263.000 0.000 NA   NA
 5865757 5865758 ECIAI1_2189 ECIAI1_2190 metG   FALSE 0.077 141.000 0.000 NA   NA
 5865758 5865759 ECIAI1_2190 ECIAI1_2191   yehI TRUE 0.837 10.000 0.000 NA   NA
 5865759 5865760 ECIAI1_2191 ECIAI1_2192 yehI yehK FALSE 0.242 61.000 0.000 NA   NA
 5865760 5865761 ECIAI1_2192 ECIAI1_2195 yehK yehL FALSE 0.002 1183.000 0.000 NA   NA
 5865761 5865762 ECIAI1_2195 ECIAI1_2196 yehL yehM TRUE 0.828 11.000 0.000 NA   NA
 5865762 5865763 ECIAI1_2196 ECIAI1_2197 yehM yehP TRUE 0.725 -7.000 0.000 NA   NA
 5865763 5865764 ECIAI1_2197 ECIAI1_2198 yehP yehQ TRUE 0.756 -27.000 0.160 NA   NA
 5865764 5865765 ECIAI1_2198 ECIAI1_2199 yehQ yehR FALSE 0.116 125.000 0.000 NA   NA
 5865766 5865767 ECIAI1_2200 ECIAI1_2201 yehS yehT FALSE 0.338 47.000 0.051 NA   NA
 5865767 5865768 ECIAI1_2201 ECIAI1_2202 yehT yehU TRUE 0.999 -3.000 0.877 0.013 Y NA
 5865772 5865773 ECIAI1_2206 ECIAI1_2207 yehW yehX TRUE 0.997 5.000 0.542 1.000 Y NA
 5865773 5865774 ECIAI1_2207 ECIAI1_2208 yehX yehY TRUE 0.993 -7.000 0.489 1.000 Y NA
 5865774 5865775 ECIAI1_2208 ECIAI1_2209 yehY yehZ TRUE 0.991 7.000 0.521 0.051 N NA
 5865775 5865776 ECIAI1_2209 ECIAI1_2210 yehZ bglX FALSE 0.040 211.000 0.099 1.000 N NA
 5865778 5865779 ECIAI1_2212 ECIAI1_2213 pbpG yohC FALSE 0.108 174.000 0.145 NA   NA
 5865781 5865782 ECIAI1_2215 ECIAI1_2216 yohF yohG FALSE 0.432 53.000 0.105 1.000 N NA
 5865782 5865783 ECIAI1_2216 ECIAI1_2217 yohG dusC FALSE 0.002 1028.000 0.000 1.000 N NA
 5865784 5865785 ECIAI1_2218 ECIAI1_2219 yohJ yohK TRUE 0.979 -3.000 0.340 1.000   NA
 5865785 5865786 ECIAI1_2219 ECIAI1_2220 yohK cdd FALSE 0.294 130.000 0.198 1.000 N NA
 5865786 5865787 ECIAI1_2220 ECIAI1_2221 cdd sanA FALSE 0.066 150.000 0.045 NA   NA
 5865787 5865788 ECIAI1_2221 ECIAI1_2222 sanA yeiS TRUE 0.831 3.000 0.019 NA   NA
 5865788 5865789 ECIAI1_2222 ECIAI1_2223 yeiS yeiT FALSE 0.006 319.000 0.036 NA   NA
 5865789 5865790 ECIAI1_2223 ECIAI1_2224 yeiT yeiA TRUE 0.805 -6.000 0.062 1.000 N NA
 5865791 5865792 ECIAI1_2225 ECIAI1_2226 mglC mglA TRUE 0.997 16.000 0.905 1.000 Y NA
 5865792 5865793 ECIAI1_2226 ECIAI1_2227 mglA mglB TRUE 0.885 61.000 0.250 NA Y NA
 5865793 5865794 ECIAI1_2227 ECIAI1_2228 mglB galS FALSE 0.006 280.000 0.000 NA N NA
 5865796 5865797 ECIAI1_2230 ECIAI1_2231 yeiB folE TRUE 0.980 17.000 0.719 NA   NA
 5865798 5865799 ECIAI1_2232 ECIAI1_2233   frmC FALSE 0.412 -72.000 0.000 NA   NA
 5865800 5865801 ECIAI1_2234 ECIAI1_2235 cirA   TRUE 0.725 -7.000 0.000 NA   NA
 5865801 5865802 ECIAI1_2235 ECIAI1_2236   lysP FALSE 0.173 97.000 0.000 NA   NA
 5865802 5865803 ECIAI1_2236 ECIAI1_2237 lysP yeiE FALSE 0.023 205.000 0.000 1.000 N NA
 5865804 5865805 ECIAI1_2238 ECIAI1_2239 yeiH nfo FALSE 0.215 74.000 0.040 NA   NA
 5865805 5865806 ECIAI1_2239 ECIAI1_2240 nfo yeiI TRUE 0.680 4.000 0.004 NA N NA
 5865807 5865808 ECIAI1_2241 ECIAI1_2242 yeiJ rihB TRUE 0.674 100.000 0.056 NA Y NA
 5865810 5865811 ECIAI1_2244 ECIAI1_2245 yeiM yeiN FALSE 0.129 94.000 0.000 NA N NA
 5865811 5865812 ECIAI1_2245 ECIAI1_2246 yeiN yeiC FALSE 0.376 -12.000 0.008 NA N NA
 5865812 5865813 ECIAI1_2246 ECIAI1_2247 yeiC fruA FALSE 0.033 424.000 0.000 NA Y NA
 5865813 5865814 ECIAI1_2247 ECIAI1_2248 fruA fruK TRUE 0.994 17.000 0.562 1.000 Y NA
 5865814 5865815 ECIAI1_2248 ECIAI1_2249 fruK fruB TRUE 0.991 0.000 0.112 1.000 Y NA
 5865815 5865816 ECIAI1_2249 ECIAI1_2250 fruB   FALSE 0.440 31.000 0.000 NA   NA
 5865819 5865820 ECIAI1_2253 ECIAI1_2254   yeiQ FALSE 0.017 223.000 0.000 1.000 N NA
 5865820 5865821 ECIAI1_2254 ECIAI1_2255 yeiQ yeiR FALSE 0.318 118.000 0.167 NA   NA
 5865821 5865822 ECIAI1_2255 ECIAI1_2256 yeiR yeiU TRUE 0.764 39.000 0.275 NA   NA
 5865822 5865823 ECIAI1_2256 ECIAI1_2257 yeiU spr FALSE 0.004 412.000 0.000 NA   NA
 5865823 5865824 ECIAI1_2257 ECIAI1_2258 spr rtn FALSE 0.122 181.000 0.219 NA N NA
 5865824 5865825 ECIAI1_2258 ECIAI1_2259 rtn yejA TRUE 0.659 82.000 0.394 NA N NA
 5865825 5865826 ECIAI1_2259 ECIAI1_2260 yejA yejB TRUE 0.997 1.000 0.848 0.051   NA
 5865826 5865827 ECIAI1_2260 ECIAI1_2261 yejB yejE TRUE 0.997 0.000 0.833 0.051   NA
 5865827 5865828 ECIAI1_2261 ECIAI1_2262 yejE yejF TRUE 0.994 2.000 0.758 1.000   NA
 5865829 5865830 ECIAI1_2263 ECIAI1_2264 yejG bcr FALSE 0.006 332.000 0.000 NA   NA
 5865830 5865831 ECIAI1_2264 ECIAI1_2265 bcr rsuA FALSE 0.465 28.000 0.036 1.000 N NA
 5865832 5865833 ECIAI1_2266 ECIAI1_2267 yejH rplY FALSE 0.253 125.000 0.024 0.016 N NA
 5865835 5865836 ECIAI1_2269 ECIAI1_2270 yejL yejM TRUE 0.661 20.000 0.040 NA   NA
 5865836 5865837 ECIAI1_2270 ECIAI1_tRNA20 yejM   FALSE 0.212 75.000 0.000 NA   NA
 5865838 5865839 ECIAI1_2271 ECIAI1_2272   yejO FALSE 0.467 -36.000 0.000 NA   NA
 5865839 5865840 ECIAI1_2272 ECIAI1_2273 yejO yejO TRUE 0.793 13.000 0.000 NA   NA
 5865840 5865841 ECIAI1_2273 ECIAI1_2274 yejO   FALSE 0.440 31.000 0.000 NA   NA
 5865843 5865844 ECIAI1_2276 ECIAI1_2277 ccmH ccmG TRUE 0.997 -3.000 0.578 1.000 Y NA
 5865844 5865845 ECIAI1_2277 ECIAI1_2278 ccmG ccmF TRUE 0.999 -3.000 0.804 0.002 Y NA
 5865845 5865846 ECIAI1_2278 ECIAI1_2279 ccmF ccmE TRUE 0.996 -3.000 0.211 0.002 Y NA
 5865846 5865847 ECIAI1_2279 ECIAI1_2280 ccmE ccmD TRUE 0.977 -3.000 0.344 1.000 N NA
 5865847 5865848 ECIAI1_2280 ECIAI1_2281 ccmD ccmC TRUE 0.985 -3.000 0.501 1.000 N NA
 5865848 5865849 ECIAI1_2281 ECIAI1_2282 ccmC ccmB TRUE 0.984 42.000 0.501 0.001 Y NA
 5865849 5865850 ECIAI1_2282 ECIAI1_2283 ccmB ccmA TRUE 0.998 -3.000 0.503 0.002 Y NA
 5865850 5865851 ECIAI1_2283 ECIAI1_2284 ccmA napC TRUE 0.792 13.000 0.043 1.000 N NA
 5865851 5865852 ECIAI1_2284 ECIAI1_2285 napC napB TRUE 0.998 10.000 0.490 0.004 Y NA
 5865852 5865853 ECIAI1_2285 ECIAI1_2286 napB napH TRUE 0.997 -3.000 0.316 0.008 Y NA
 5865853 5865854 ECIAI1_2286 ECIAI1_2288 napH napG TRUE 0.985 -13.000 0.795 0.049   NA
 5865854 5865855 ECIAI1_2288 ECIAI1_2289 napG napA TRUE 0.983 7.000 0.243 0.049   NA
 5865855 5865856 ECIAI1_2289 ECIAI1_2290 napA napD TRUE 0.992 -3.000 0.875 NA N NA
 5865856 5865857 ECIAI1_2290 ECIAI1_2291 napD napF TRUE 0.887 -10.000 0.209 NA   NA
 5865858 5865859 ECIAI1_2292 ECIAI1_2293   eco FALSE 0.083 135.000 0.034 NA   NA
 5865860 5865861 ECIAI1_2294 ECIAI1_2295 mqo yojI FALSE 0.025 218.000 0.000 1.000   NA
 5865861 5865862 ECIAI1_2295 ECIAI1_2296 yojI alkB FALSE 0.286 76.000 0.076 1.000 N NA
 5865862 5865863 ECIAI1_2296 ECIAI1_2297 alkB ada TRUE 0.949 0.000 0.015 0.012 N NA
 5865863 5865864 ECIAI1_2297 ECIAI1_2298 ada yojL FALSE 0.158 74.000 0.019 1.000 N NA
 5865864 5865865 ECIAI1_2298 ECIAI1_2299 yojL ompC FALSE 0.182 112.000 0.066 1.000 N NA
 5865866 5865867 ECIAI1_misc_RNA_46 ECIAI1_2300 micF rcsD FALSE 0.007 311.000 0.000 NA   NA
 5865867 5865868 ECIAI1_2300 ECIAI1_2301 rcsD rcsB TRUE 0.994 17.000 0.558 1.000 Y NA
 5865869 5865870 ECIAI1_2302 ECIAI1_2303 rcsC yfaP FALSE 0.006 323.000 0.000 NA   NA
 5865870 5865871 ECIAI1_2303 ECIAI1_2304 yfaP yfaQ TRUE 0.858 5.000 0.000 NA   NA
 5865871 5865872 ECIAI1_2304 ECIAI1_2305 yfaQ   TRUE 0.876 1.000 0.000 NA   NA
 5865872 5865873 ECIAI1_2305 ECIAI1_2306   yfaT FALSE 0.394 -81.000 0.000 NA   NA
 5865873 5865874 ECIAI1_2306 ECIAI1_2307 yfaT yfaA TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 5865874 5865875 ECIAI1_2307 ECIAI1_2308 yfaA   FALSE 0.422 33.000 0.000 NA   NA
 5865875 5865876 ECIAI1_2308 ECIAI1_2309   gyrA FALSE 0.395 36.000 0.000 NA   NA
 5865879 5865880 ECIAI1_2312 ECIAI1_2313 nrdA nrdB TRUE 0.850 89.000 0.000 0.001 Y NA
 5865880 5865881 ECIAI1_2313 ECIAI1_2314 nrdB yfaE TRUE 0.866 0.000 0.034 1.000 N NA
 5865884 5865885 ECIAI1_2317 ECIAI1_2318 glpQ glpT TRUE 0.981 5.000 0.396 1.000 N NA
 5865886 5865887 ECIAI1_2319 ECIAI1_2320 glpA glpB TRUE 0.986 -10.000 0.650 0.001 N NA
 5865887 5865888 ECIAI1_2320 ECIAI1_2321 glpB glpC TRUE 0.994 -3.000 0.547 0.001 N NA
 5865888 5865889 ECIAI1_2321 ECIAI1_2322 glpC yfaD FALSE 0.029 194.000 0.000 NA   NA
 5865890 5865891 ECIAI1_2323 ECIAI1_2324 yfaU yfaY TRUE 0.793 13.000 0.000 NA   NA
 5865891 5865892 ECIAI1_2324 ECIAI1_2325 yfaY yfaZ FALSE 0.155 100.000 0.005 1.000   NA
 5865895 5865896 ECIAI1_2329 ECIAI1_2330 yfbE yfbF TRUE 0.996 4.000 0.378 NA Y NA
 5865896 5865897 ECIAI1_2330 ECIAI1_2331 yfbF yfbG TRUE 0.994 0.000 0.220 NA Y NA
 5865897 5865898 ECIAI1_2331 ECIAI1_2332 yfbG yfbH TRUE 0.996 -3.000 0.447 1.000 Y NA
 5865898 5865899 ECIAI1_2332 ECIAI1_2334 yfbH arnT TRUE 0.859 0.000 0.031 1.000 N NA
 5865899 5865900 ECIAI1_2334 ECIAI1_2335 arnT yfbW TRUE 0.943 -3.000 0.158 1.000 N NA
 5865900 5865901 ECIAI1_2335 ECIAI1_2336 yfbW yfbJ TRUE 0.681 -282.000 0.226 NA   NA
 5865902 5865903 ECIAI1_2337 ECIAI1_2338 pmrD menE FALSE 0.098 110.000 0.005 NA   NA
 5865903 5865904 ECIAI1_2338 ECIAI1_2339 menE menC TRUE 0.987 -3.000 0.283 0.001 N NA
 5865904 5865905 ECIAI1_2339 ECIAI1_2340 menC menB TRUE 0.997 0.000 0.171 0.001 Y NA
 5865905 5865906 ECIAI1_2340 ECIAI1_2341 menB yfbB TRUE 0.946 15.000 0.280 NA   NA
 5865906 5865907 ECIAI1_2341 ECIAI1_2342 yfbB menD TRUE 0.978 -3.000 0.355 NA   NA
 5865907 5865908 ECIAI1_2342 ECIAI1_2343 menD menF TRUE 0.876 89.000 0.281 1.000 Y NA
 5865908 5865909 ECIAI1_2343 ECIAI1_2344 menF elaB FALSE 0.212 79.000 0.043 NA   NA
 5865909 5865910 ECIAI1_2344 ECIAI1_2345 elaB elaA FALSE 0.357 55.000 0.077 NA   NA
 5865911 5865912 ECIAI1_2346 ECIAI1_2347 elaC elaD FALSE 0.042 188.000 0.000 1.000   NA
 5865912 5865913 ECIAI1_2347 ECIAI1_2348 elaD   FALSE 0.002 645.000 0.000 NA   NA
 5865913 5865914 ECIAI1_2348 ECIAI1_2349   yfbM FALSE 0.114 126.000 0.000 NA   NA
 5865915 5865916 ECIAI1_2350 ECIAI1_2351 nuoN nuoM TRUE 0.998 7.000 0.437 0.002 Y NA
 5865916 5865917 ECIAI1_2351 ECIAI1_2352 nuoM nuoL TRUE 0.898 164.000 0.713 0.002 Y NA
 5865917 5865918 ECIAI1_2352 ECIAI1_2353 nuoL nuoK TRUE 0.996 -3.000 0.211 0.006 Y NA
 5865918 5865919 ECIAI1_2353 ECIAI1_2354 nuoK nuoJ TRUE 0.997 -3.000 0.269 0.003 Y NA
 5865919 5865920 ECIAI1_2354 ECIAI1_2355 nuoJ nuoI TRUE 0.997 12.000 0.428 0.006 Y NA
 5865920 5865921 ECIAI1_2355 ECIAI1_2356 nuoI nuoH TRUE 0.996 15.000 0.423 0.006 Y NA
 5865921 5865922 ECIAI1_2356 ECIAI1_2357 nuoH nuoG TRUE 0.999 -3.000 0.664 0.006 Y NA
 5865922 5865923 ECIAI1_2357 ECIAI1_2358 nuoG nuoF TRUE 0.944 47.000 0.180 0.006 Y NA
 5865923 5865924 ECIAI1_2358 ECIAI1_2359 nuoF nuoE TRUE 0.995 -3.000 0.186 0.006 Y NA
 5865924 5865925 ECIAI1_2359 ECIAI1_2360 nuoE nuoC TRUE 0.998 3.000 0.407 0.006 Y NA
 5865925 5865926 ECIAI1_2360 ECIAI1_2361 nuoC nuoB TRUE 0.972 94.000 0.691 0.003 Y NA
 5865926 5865927 ECIAI1_2361 ECIAI1_2362 nuoB nuoA TRUE 0.995 16.000 0.377 0.003 Y NA
 5865927 5865928 ECIAI1_2362 ECIAI1_2363 nuoA lrhA FALSE 0.002 631.000 0.000 1.000 N NA
 5865929 5865930 ECIAI1_2364 ECIAI1_2365 yfbQ yfbR FALSE 0.385 84.000 0.104 1.000   NA
 5865931 5865932 ECIAI1_2366 ECIAI1_2367 yfbS yfbT TRUE 0.641 87.000 0.308 1.000   NA
 5865932 5865933 ECIAI1_2367 ECIAI1_2368 yfbT yfbU TRUE 0.976 11.000 0.375 NA   NA
 5865933 5865934 ECIAI1_2368 ECIAI1_2369 yfbU yfbV TRUE 0.519 83.000 0.221 NA   NA
 5865935 5865936 ECIAI1_2370 ECIAI1_2371   ackA TRUE 0.819 9.000 0.029 NA   NA
 5865936 5865937 ECIAI1_2371 ECIAI1_2372 ackA pta TRUE 0.836 75.000 0.634 1.000   NA
 5865937 5865938 ECIAI1_2372 ECIAI1_2373 pta yfcC FALSE 0.045 169.000 0.000 NA   NA
 5865938 5865939 ECIAI1_2373 ECIAI1_2374 yfcC yfcC FALSE 0.368 39.000 0.000 NA   NA
 5865940 5865941 ECIAI1_2375 ECIAI1_2376 yfcD yfcE TRUE 0.705 58.000 0.143 0.009   NA
 5865941 5865942 ECIAI1_2376 ECIAI1_2377 yfcE yfcF FALSE 0.409 53.000 0.092 NA   NA
 5865943 5865944 ECIAI1_2378 ECIAI1_2379 yfcG folX FALSE 0.177 57.000 0.012 1.000 N NA
 5865944 5865945 ECIAI1_2379 ECIAI1_2380 folX yfcH TRUE 0.838 21.000 0.122 1.000   NA
 5865946 5865947 ECIAI1_2381 ECIAI1_2382 yfcI hisP FALSE 0.027 197.000 0.000 NA   NA
 5865947 5865948 ECIAI1_2382 ECIAI1_2383 hisP hisM TRUE 0.998 8.000 0.643 1.000 Y NA
 5865948 5865949 ECIAI1_2383 ECIAI1_2384 hisM hisQ TRUE 0.999 -3.000 0.900 0.014 Y NA
 5865949 5865950 ECIAI1_2384 ECIAI1_2385 hisQ hisJ TRUE 0.975 90.000 0.833 0.050 Y NA
 5865950 5865951 ECIAI1_2385 ECIAI1_2386 hisJ argT FALSE 0.018 221.000 0.000 NA   NA
 5865951 5865952 ECIAI1_2386 ECIAI1_2387 argT argT TRUE 0.793 13.000 0.000 NA   NA
 5865952 5865953 ECIAI1_2387 ECIAI1_2388 argT ubiX FALSE 0.010 266.000 0.000 NA   NA
 5865953 5865954 ECIAI1_2388 ECIAI1_2389 ubiX purF FALSE 0.206 95.000 0.056 1.000 N NA
 5865954 5865955 ECIAI1_2389 ECIAI1_2390 purF cvpA TRUE 0.792 37.000 0.262 1.000   NA
 5865955 5865956 ECIAI1_2390 ECIAI1_2391 cvpA dedD FALSE 0.025 259.000 0.116 NA   NA
 5865956 5865957 ECIAI1_2391 ECIAI1_2392 dedD folC TRUE 0.891 -10.000 0.216 NA   NA
 5865957 5865958 ECIAI1_2392 ECIAI1_2393 folC accD TRUE 0.712 70.000 0.383 1.000 N NA
 5865958 5865959 ECIAI1_2393 ECIAI1_2394 accD dedA FALSE 0.041 156.000 0.020 NA   NA
 5865959 5865960 ECIAI1_2394 ECIAI1_2395 dedA truA FALSE 0.194 83.000 0.038 NA   NA
 5865960 5865961 ECIAI1_2395 ECIAI1_2396 truA usg TRUE 0.875 0.000 0.040 1.000 N NA
 5865961 5865962 ECIAI1_2396 ECIAI1_2397 usg pdxB TRUE 0.890 66.000 0.097 0.009 Y NA
 5865964 5865965 ECIAI1_2399 ECIAI1_2400 yfcJ fabB FALSE 0.006 284.000 0.000 NA N NA
 5865967 5865968 ECIAI1_2402 ECIAI1_2403 yfcL yfcM TRUE 0.872 34.000 0.425 NA   NA
 5865968 5865969 ECIAI1_2403 ECIAI1_2404 yfcM yfcA TRUE 0.955 0.000 0.153 NA   NA
 5865969 5865970 ECIAI1_2404 ECIAI1_2405 yfcA mepA TRUE 0.963 0.000 0.160 1.000   NA
 5865970 5865971 ECIAI1_2405 ECIAI1_2406 mepA aroC TRUE 0.827 4.000 0.025 1.000 N NA
 5865971 5865972 ECIAI1_2406 ECIAI1_2407 aroC prmB TRUE 0.523 35.000 0.081 1.000 N NA
 5865974 5865975 ECIAI1_2409 ECIAI1_2410     FALSE 0.017 227.000 0.000 NA   NA
 5865975 5865976 ECIAI1_2410 ECIAI1_2411     TRUE 0.619 -13.000 0.000 NA   NA
 5865976 5865977 ECIAI1_2411 ECIAI1_2412     TRUE 0.997 -3.000 0.286 0.010 Y NA
 5865977 5865978 ECIAI1_2412 ECIAI1_2413     TRUE 0.997 -3.000 0.571 NA Y NA
 5865978 5865979 ECIAI1_2413 ECIAI1_2414   yfcS TRUE 0.951 -91.000 0.333 NA Y NA
 5865979 5865980 ECIAI1_2414 ECIAI1_2415 yfcS   TRUE 0.996 20.000 1.000 1.000 Y NA
 5865980 5865981 ECIAI1_2415 ECIAI1_2416   yfcV TRUE 0.969 82.000 1.000 1.000 Y NA
 5865981 5865982 ECIAI1_2416 ECIAI1_2417 yfcV sixA FALSE 0.002 684.000 0.000 1.000 N NA
 5865982 5865983 ECIAI1_2417 ECIAI1_2418 sixA yfcX FALSE 0.024 203.000 0.000 1.000 N NA
 5865983 5865984 ECIAI1_2418 ECIAI1_2419 yfcX yfcY TRUE 0.997 0.000 0.430 1.000 Y NA
 5865984 5865985 ECIAI1_2419 ECIAI1_2420 yfcY yfcZ FALSE 0.050 180.000 0.061 NA   NA
 5865986 5865987 ECIAI1_2421 ECIAI1_2422 fadL yfdF FALSE 0.005 366.000 0.000 NA   NA
 5865988 5865989 ECIAI1_2423 ECIAI1_2424 vacJ   TRUE 0.529 26.000 0.000 NA   NA
 5865990 5865991 ECIAI1_2425 ECIAI1_tRNA21 yfdC   FALSE 0.209 76.000 0.000 NA   NA
 5865992 5865993 ECIAI1_2426 ECIAI1_2427 cscB cscK FALSE 0.271 72.000 0.000 1.000   NA
 5865996 5865997 ECIAI1_2430 ECIAI1_2431 dsdX dsdA TRUE 0.696 18.000 0.000 NA   NA
 5865998 5865999 ECIAI1_2432 ECIAI1_2433 emrY emrK TRUE 0.996 0.000 1.000 1.000   NA
 5866000 5866001 ECIAI1_2434 ECIAI1_2435 evgA evgS TRUE 0.992 5.000 0.000 0.010 Y NA
 5866002 5866003 ECIAI1_2436 ECIAI1_2437 yfdE yfdV FALSE 0.265 74.000 0.000 1.000   NA
 5866003 5866004 ECIAI1_2437 ECIAI1_2438 yfdV oxc FALSE 0.276 70.000 0.000 1.000   NA
 5866004 5866005 ECIAI1_2438 ECIAI1_2439 oxc frc TRUE 0.477 54.000 0.134 1.000 N NA
 5866005 5866006 ECIAI1_2439 ECIAI1_2440 frc yfdX FALSE 0.003 513.000 0.000 NA   NA
 5866008 5866009 ECIAI1_2442 ECIAI1_2443 yfdY   FALSE 0.016 234.000 0.000 NA   NA
 5866011 5866012 ECIAI1_misc_RNA_47 ECIAI1_2445 tpke70 yfdZ FALSE 0.004 428.000 0.000 NA   NA
 5866013 5866014 ECIAI1_2446 ECIAI1_2447 ypdA ypdB TRUE 0.998 15.000 0.744 0.013 Y NA
 5866014 5866015 ECIAI1_2447 ECIAI1_2448 ypdB ypdC TRUE 0.986 13.000 0.051 0.069 Y NA
 5866016 5866017 ECIAI1_2449 ECIAI1_2450 ypdD ypdE TRUE 0.988 25.000 0.571 1.000 Y NA
 5866017 5866018 ECIAI1_2450 ECIAI1_2451 ypdE ypdF TRUE 0.945 0.000 0.009 0.019 N NA
 5866018 5866019 ECIAI1_2451 ECIAI1_2452 ypdF ypdG TRUE 0.659 15.000 0.011 1.000 N NA
 5866019 5866020 ECIAI1_2452 ECIAI1_2453 ypdG ypdH TRUE 0.997 22.000 0.875 0.012 Y NA
 5866020 5866021 ECIAI1_2453 ECIAI1_2454 ypdH glk FALSE 0.211 220.000 0.091 1.000 Y NA
 5866022 5866023 ECIAI1_2455 ECIAI1_2456 yfeO ypeC FALSE 0.137 115.000 0.000 NA   NA
 5866026 5866027 ECIAI1_2459 ECIAI1_tRNA69 yfeA   FALSE 0.022 209.000 0.000 NA   NA
 5866027 5866028 ECIAI1_tRNA69 ECIAI1_tRNA68     FALSE 0.358 40.000 0.000 NA   NA
 5866029 5866030 ECIAI1_2461 ECIAI1_2462 yfeC yfeD TRUE 0.966 2.000 0.000 0.005   NA
 5866032 5866033 ECIAI1_tRNA22 ECIAI1_tRNA23     FALSE 0.322 45.000 0.000 NA   NA
 5866033 5866034 ECIAI1_tRNA23 ECIAI1_tRNA24     FALSE 0.307 47.000 0.000 NA   NA
 5866034 5866035 ECIAI1_tRNA24 ECIAI1_tRNA25     TRUE 0.858 5.000 0.000 NA   NA
 5866035 5866036 ECIAI1_tRNA25 ECIAI1_2465     FALSE 0.009 276.000 0.000 NA   NA
 5866039 5866040 ECIAI1_2468 ECIAI1_2469   ligA FALSE 0.293 -97.000 0.017 NA   NA
 5866040 5866041 ECIAI1_2469 ECIAI1_2470 ligA zipA FALSE 0.141 71.000 0.002 1.000 N NA
 5866042 5866043 ECIAI1_2471 ECIAI1_2472 cysZ cysK FALSE 0.360 185.000 0.122 1.000 Y NA
 5866043 5866044 ECIAI1_2472 ECIAI1_2473 cysK ptsH FALSE 0.003 384.000 0.019 1.000 N NA
 5866044 5866045 ECIAI1_2473 ECIAI1_2474 ptsH ptsI TRUE 0.901 45.000 0.000 0.012 Y NA
 5866045 5866046 ECIAI1_2474 ECIAI1_2475 ptsI crr TRUE 0.912 41.000 0.000 0.012 Y NA
 5866049 5866050 ECIAI1_2478 ECIAI1_2479 cysM cysA FALSE 0.099 134.000 0.049 1.000 N NA
 5866050 5866051 ECIAI1_2479 ECIAI1_2480 cysA cysW TRUE 0.976 -10.000 0.180 1.000 Y NA
 5866051 5866052 ECIAI1_2480 ECIAI1_2481 cysW cysU TRUE 0.996 0.000 0.583 0.001 N NA
 5866052 5866053 ECIAI1_2481 ECIAI1_2482 cysU cysP TRUE 0.994 0.000 0.479 0.002 N NA
 5866053 5866054 ECIAI1_2482 ECIAI1_2483 cysP ucpA FALSE 0.054 158.000 0.043 1.000 N NA
 5866054 5866055 ECIAI1_2483 ECIAI1_2484 ucpA yfeT FALSE 0.100 129.000 0.000 1.000 N NA
 5866056 5866057 ECIAI1_2485 ECIAI1_2486 yfeU murP TRUE 0.958 4.000 0.158 1.000   NA
 5866057 5866058 ECIAI1_2486 ECIAI1_2487 murP murQ TRUE 0.949 5.000 0.167 1.000 N NA
 5866059 5866060 ECIAI1_2488 ECIAI1_2489 yfeX yfeY TRUE 0.605 96.000 0.333 NA   NA
 5866060 5866061 ECIAI1_2489 ECIAI1_2490 yfeY yfeZ TRUE 0.554 61.000 0.204 NA   NA
 5866061 5866062 ECIAI1_2490 ECIAI1_2491 yfeZ ypeA TRUE 0.680 -13.000 0.059 NA   NA
 5866063 5866064 ECIAI1_2492 ECIAI1_2493 amiA hemF TRUE 0.828 4.000 0.025 1.000 N NA
 5866065 5866066 ECIAI1_2494 ECIAI1_2495 yfeG yffI TRUE 0.662 46.000 0.250 NA N NA
 5866066 5866067 ECIAI1_2495 ECIAI1_2496 yffI eutL TRUE 0.866 13.000 0.106 NA N NA
 5866067 5866068 ECIAI1_2496 ECIAI1_2497 eutL eutC TRUE 0.982 10.000 0.000 1.000 Y NA
 5866068 5866069 ECIAI1_2497 ECIAI1_2498 eutC eutB TRUE 0.977 21.000 0.000 0.001 Y NA
 5866069 5866070 ECIAI1_2498 ECIAI1_2499 eutB eutA TRUE 0.976 12.000 0.000 NA Y NA
 5866070 5866071 ECIAI1_2499 ECIAI1_2500 eutA eutH TRUE 0.995 -3.000 0.400 NA Y NA
 5866071 5866072 ECIAI1_2500 ECIAI1_2501 eutH eutG FALSE 0.395 117.000 0.222 1.000 N NA
 5866072 5866073 ECIAI1_2501 ECIAI1_2502 eutG eutJ TRUE 0.964 -10.000 0.556 1.000 N NA
 5866073 5866074 ECIAI1_2502 ECIAI1_2503 eutJ eutE TRUE 0.976 11.000 0.375 1.000 N NA
 5866074 5866075 ECIAI1_2503 ECIAI1_2504 eutE cchB TRUE 0.997 12.000 0.667 NA Y NA
 5866075 5866076 ECIAI1_2504 ECIAI1_2505 cchB cchA TRUE 0.771 107.000 0.182 NA Y NA
 5866076 5866077 ECIAI1_2505 ECIAI1_2506 cchA eutI TRUE 0.962 39.000 0.455 NA Y NA
 5866077 5866078 ECIAI1_2506 ECIAI1_2507 eutI eutT TRUE 0.913 -3.000 0.095 1.000 N NA
 5866078 5866079 ECIAI1_2507 ECIAI1_2508 eutT eutQ TRUE 0.992 -3.000 0.214 NA Y NA
 5866079 5866080 ECIAI1_2508 ECIAI1_2509 eutQ eutP TRUE 0.948 -25.000 0.167 NA Y NA
 5866080 5866081 ECIAI1_2509 ECIAI1_2510 eutP ypfE TRUE 0.976 13.000 0.000 1.000 Y NA
 5866081 5866082 ECIAI1_2510 ECIAI1_2511 ypfE maeB FALSE 0.011 293.000 0.070 1.000 N NA
 5866083 5866084 ECIAI1_2512 ECIAI1_2513 talA tktB TRUE 0.994 20.000 0.739 1.000 Y NA
 5866085 5866086 ECIAI1_2514 ECIAI1_2515 ypfG yffH TRUE 0.480 126.000 0.333 NA   NA
 5866086 5866087 ECIAI1_2515 ECIAI1_2516 yffH aegA TRUE 0.480 68.000 0.167 1.000 N NA
 5866088 5866089 ECIAI1_2517 ECIAI1_2518 narQ acrD FALSE 0.200 164.000 0.133 0.074 N NA
 5866089 5866090 ECIAI1_2518 ECIAI1_2519 acrD yffB FALSE 0.003 539.000 0.000 1.000 N NA
 5866090 5866091 ECIAI1_2519 ECIAI1_2520 yffB dapE TRUE 0.974 4.000 0.292 1.000 N NA
 5866091 5866092 ECIAI1_2520 ECIAI1_2521 dapE ypfN FALSE 0.433 28.000 0.025 NA   NA
 5866093 5866094 ECIAI1_2522 ECIAI1_2523 ypfH ypfI FALSE 0.215 74.000 0.000 NA   NA
 5866094 5866095 ECIAI1_2523 ECIAI1_2524 ypfI ypfJ TRUE 0.723 15.000 0.029 NA   NA
 5866095 5866096 ECIAI1_2524 ECIAI1_2525 ypfJ   FALSE 0.069 147.000 0.000 NA   NA
 5866096 5866097 ECIAI1_2525 ECIAI1_2526     TRUE 0.993 0.000 0.727 NA   NA
 5866097 5866098 ECIAI1_2526 ECIAI1_2527   purC FALSE 0.134 116.000 0.000 NA   NA
 5866098 5866099 ECIAI1_2527 ECIAI1_2528 purC nlpB FALSE 0.009 213.000 0.019 NA N NA
 5866099 5866100 ECIAI1_2528 ECIAI1_2529 nlpB dapA TRUE 0.984 17.000 0.267 NA Y NA
 5866101 5866102 ECIAI1_2530 ECIAI1_2531 gcvR bcp TRUE 0.936 0.000 0.102 1.000 N NA
 5866102 5866103 ECIAI1_2531 ECIAI1_2532 bcp hyfA FALSE 0.012 253.000 0.000 1.000 N NA
 5866103 5866104 ECIAI1_2532 ECIAI1_2533 hyfA hyfB TRUE 0.987 0.000 0.000 1.000 Y NA
 5866104 5866105 ECIAI1_2533 ECIAI1_2534 hyfB hyfC TRUE 0.954 -10.000 0.000 1.000 Y NA
 5866105 5866106 ECIAI1_2534 ECIAI1_2535 hyfC hyfD TRUE 0.895 103.000 0.412 1.000 Y NA
 5866106 5866107 ECIAI1_2535 ECIAI1_2536 hyfD hyfE TRUE 0.991 12.000 0.093 0.006 Y NA
 5866107 5866108 ECIAI1_2536 ECIAI1_2537 hyfE hyfF TRUE 0.999 5.000 0.864 0.006 Y NA
 5866108 5866109 ECIAI1_2537 ECIAI1_2538 hyfF hyfG TRUE 0.916 38.000 0.016 0.006 Y NA
 5866109 5866110 ECIAI1_2538 ECIAI1_2539 hyfG hyfH TRUE 0.982 10.000 0.044 1.000 Y NA
 5866110 5866111 ECIAI1_2539 ECIAI1_2540 hyfH hyfI TRUE 0.993 -3.000 0.222 1.000 Y NA
 5866111 5866112 ECIAI1_2540 ECIAI1_2541 hyfI hyfJ TRUE 0.930 -7.000 0.250 NA   NA
 5866112 5866113 ECIAI1_2541 ECIAI1_2542 hyfJ hyfR FALSE 0.457 30.000 0.000 NA   NA
 5866113 5866114 ECIAI1_2542 ECIAI1_2543 hyfR focB TRUE 0.625 22.000 0.000 NA   NA
 5866114 5866115 ECIAI1_2543 ECIAI1_2544 focB focB FALSE 0.395 36.000 0.000 NA   NA
 5866117 5866118 ECIAI1_2546 ECIAI1_2547 yfgC yfgD TRUE 0.916 21.000 0.259 1.000   NA
 5866119 5866120 ECIAI1_2548 ECIAI1_2549 hda uraA FALSE 0.238 50.000 0.048 NA N NA
 5866120 5866121 ECIAI1_2549 ECIAI1_2550 uraA upp TRUE 0.784 86.000 0.101 1.000 Y NA
 5866122 5866123 ECIAI1_2551 ECIAI1_2552 purM purN TRUE 0.997 0.000 0.230 0.002 Y NA
 5866123 5866124 ECIAI1_2552 ECIAI1_2553 purN ppk FALSE 0.030 171.000 0.017 1.000 N NA
 5866124 5866125 ECIAI1_2553 ECIAI1_2554 ppk ppx TRUE 0.997 5.000 0.486 1.000 Y NA
 5866126 5866127 ECIAI1_2555 ECIAI1_2556 yfgF   FALSE 0.020 217.000 0.000 NA   NA
 5866128 5866129 ECIAI1_2557 ECIAI1_2558 yfgH yfgI TRUE 0.938 16.000 0.273 NA   NA
 5866130 5866131 ECIAI1_2559 ECIAI1_2560 guaA guaB TRUE 0.930 69.000 0.190 0.001 Y NA
 5866133 5866134 ECIAI1_2562 ECIAI1_2563 yfgJ der FALSE 0.159 69.000 0.009 NA   NA
 5866134 5866135 ECIAI1_2563 ECIAI1_2564 der yfgL FALSE 0.399 118.000 0.203 1.000   NA
 5866135 5866136 ECIAI1_2564 ECIAI1_2565 yfgL yfgM TRUE 0.984 11.000 0.492 1.000   NA
 5866136 5866137 ECIAI1_2565 ECIAI1_2566 yfgM hisS TRUE 0.932 18.000 0.259 1.000   NA
 5866137 5866138 ECIAI1_2566 ECIAI1_misc_RNA_48 hisS   TRUE 0.663 20.000 0.000 NA   NA
 5866138 5866139 ECIAI1_misc_RNA_48 ECIAI1_2567   ispG TRUE 0.876 1.000 0.000 NA   NA
 5866139 5866140 ECIAI1_2567 ECIAI1_2568 ispG yfgA TRUE 0.848 27.000 0.233 1.000   NA
 5866140 5866141 ECIAI1_2568 ECIAI1_2569 yfgA yfgB FALSE 0.009 285.000 0.020 1.000   NA
 5866141 5866142 ECIAI1_2569 ECIAI1_2570 yfgB ndk FALSE 0.188 150.000 0.156 1.000   NA
 5866142 5866143 ECIAI1_2570 ECIAI1_2571 ndk pbpC FALSE 0.040 149.000 0.008 1.000 N NA
 5866143 5866144 ECIAI1_2571 ECIAI1_2572 pbpC yfhM TRUE 0.994 1.000 0.711 1.000   NA
 5866148 5866149 ECIAI1_2574 ECIAI1_2575 sseB pepB FALSE 0.296 142.000 0.253 NA   NA
 5866149 5866150 ECIAI1_2575 ECIAI1_2576 pepB yfhJ FALSE 0.136 178.000 0.171 1.000   NA
 5866150 5866151 ECIAI1_2576 ECIAI1_2577 yfhJ fdx TRUE 0.988 12.000 0.625 1.000   NA
 5866151 5866152 ECIAI1_2577 ECIAI1_2578 fdx hscA TRUE 0.994 2.000 0.794 1.000 N NA
 5866152 5866153 ECIAI1_2578 ECIAI1_2579 hscA hscB TRUE 0.995 17.000 0.634 1.000 Y NA
 5866153 5866154 ECIAI1_2579 ECIAI1_2580 hscB iscA TRUE 0.737 96.000 0.500 1.000   NA
 5866154 5866155 ECIAI1_2580 ECIAI1_2581 iscA iscU TRUE 0.979 17.000 0.359 0.002   NA
 5866155 5866156 ECIAI1_2581 ECIAI1_2582 iscU iscS TRUE 0.907 28.000 0.448 1.000 N NA
 5866156 5866157 ECIAI1_2582 ECIAI1_2583 iscS iscR TRUE 0.610 112.000 0.424 1.000 N NA
 5866157 5866158 ECIAI1_2583 ECIAI1_2584 iscR yfhQ FALSE 0.017 301.000 0.126 1.000 N NA
 5866159 5866160 ECIAI1_2585 ECIAI1_2586 suhB yfhR FALSE 0.117 118.000 0.003 1.000   NA
 5866160 5866161 ECIAI1_2586 ECIAI1_2587 yfhR csiE FALSE 0.040 191.000 0.000 1.000   NA
 5866162 5866163 ECIAI1_2588 ECIAI1_2589 hcaT hcaR FALSE 0.068 160.000 0.000 1.000   NA
 5866164 5866165 ECIAI1_2590 ECIAI1_2591 hcaE hcaF TRUE 0.989 -3.000 0.333 0.001 N NA
 5866165 5866166 ECIAI1_2591 ECIAI1_2592 hcaF hcaC TRUE 0.906 0.000 0.083 NA N NA
 5866166 5866167 ECIAI1_2592 ECIAI1_2593 hcaC hcaB TRUE 0.880 -3.000 0.083 NA N NA
 5866167 5866168 ECIAI1_2593 ECIAI1_2594 hcaB hcaD TRUE 0.837 10.000 0.000 NA   NA
 5866168 5866169 ECIAI1_2594 ECIAI1_2595 hcaD hcaD FALSE 0.412 -72.000 0.000 NA   NA
 5866169 5866170 ECIAI1_2595 ECIAI1_2596 hcaD yphA TRUE 0.556 25.000 0.000 NA   NA
 5866171 5866172 ECIAI1_2597 ECIAI1_2598 yphB yphC TRUE 0.808 12.000 0.000 1.000 N NA
 5866172 5866173 ECIAI1_2598 ECIAI1_2599 yphC yphD FALSE 0.226 66.000 0.000 1.000 N NA
 5866173 5866174 ECIAI1_2599 ECIAI1_2600 yphD yphE TRUE 0.958 25.000 0.148 1.000 Y NA
 5866174 5866175 ECIAI1_2600 ECIAI1_2601 yphE yphF TRUE 0.963 23.000 0.161 NA Y NA
 5866175 5866176 ECIAI1_2601 ECIAI1_2602 yphF yphG FALSE 0.173 97.000 0.000 NA   NA
 5866180 5866181 ECIAI1_2606 ECIAI1_2607 glnB yfhA FALSE 0.468 61.000 0.146 1.000 N NA
 5866181 5866182 ECIAI1_2607 ECIAI1_2608 yfhA yfhG TRUE 0.626 -10.000 0.029 NA   NA
 5866184 5866185 ECIAI1_2610 ECIAI1_misc_RNA_51 yfhK tke1 FALSE 0.180 94.000 0.000 NA   NA
 5866185 5866186 ECIAI1_misc_RNA_51 ECIAI1_2612 tke1 purL FALSE 0.006 334.000 0.000 NA   NA
 5866188 5866189 ECIAI1_2614 ECIAI1_2615 tadA yfhB TRUE 0.550 25.000 0.062 NA N NA
 5866190 5866191 ECIAI1_2616 ECIAI1_2617 yfhH   FALSE 0.072 145.000 0.000 NA   NA
 5866191 5866192 ECIAI1_2617 ECIAI1_2618     FALSE 0.246 59.000 0.000 NA   NA
 5866192 5866193 ECIAI1_2618 ECIAI1_2619     FALSE 0.016 233.000 0.000 NA   NA
 5866193 5866194 ECIAI1_2619 ECIAI1_2620     FALSE 0.028 196.000 0.000 NA   NA
 5866195 5866196 ECIAI1_2621 ECIAI1_2622     TRUE 0.529 -24.000 0.000 NA   NA
 5866196 5866197 ECIAI1_2622 ECIAI1_2623     FALSE 0.325 -223.000 0.000 NA   NA
 5866197 5866198 ECIAI1_2623 ECIAI1_2624     FALSE 0.002 844.000 0.000 NA   NA
 5866198 5866199 ECIAI1_2624 ECIAI1_2625     TRUE 0.992 -3.000 0.792 NA   NA
 5866199 5866200 ECIAI1_2625 ECIAI1_2626     TRUE 0.937 0.000 0.100 NA   NA
 5866200 5866201 ECIAI1_2626 ECIAI1_2627     TRUE 0.989 0.000 0.500 NA   NA
 5866201 5866202 ECIAI1_2627 ECIAI1_2628     FALSE 0.240 62.000 0.000 NA   NA
 5866202 5866203 ECIAI1_2628 ECIAI1_2629     FALSE 0.003 534.000 0.000 NA   NA
 5866203 5866204 ECIAI1_2629 ECIAI1_2630     TRUE 0.995 0.000 1.000 NA   NA
 5866204 5866205 ECIAI1_2630 ECIAI1_2631     TRUE 0.990 3.000 0.600 NA   NA
 5866205 5866206 ECIAI1_2631 ECIAI1_2632     TRUE 0.986 0.000 0.429 NA   NA
 5866206 5866207 ECIAI1_2632 ECIAI1_2633     TRUE 0.977 0.000 0.286 NA   NA
 5866207 5866208 ECIAI1_2633 ECIAI1_2634     FALSE 0.055 156.000 0.000 NA   NA
 5866208 5866209 ECIAI1_2634 ECIAI1_2635     TRUE 0.995 4.000 1.000 NA   NA
 5866209 5866210 ECIAI1_2635 ECIAI1_2636     TRUE 0.907 11.000 0.100 NA   NA
 5866210 5866211 ECIAI1_2636 ECIAI1_2637     TRUE 0.928 4.000 0.100 NA   NA
 5866211 5866212 ECIAI1_2637 ECIAI1_2638     TRUE 0.966 -28.000 1.000 NA   NA
 5866212 5866213 ECIAI1_2638 ECIAI1_2639     TRUE 0.979 -13.000 1.000 NA   NA
 5866213 5866214 ECIAI1_2639 ECIAI1_2640     TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 5866214 5866215 ECIAI1_2640 ECIAI1_2641     FALSE 0.474 -34.000 0.000 NA   NA
 5866215 5866216 ECIAI1_2641 ECIAI1_2642     FALSE 0.342 42.000 0.000 NA   NA
 5866216 5866217 ECIAI1_2642 ECIAI1_2643     TRUE 0.992 12.000 1.000 NA   NA
 5866217 5866218 ECIAI1_2643 ECIAI1_2644     TRUE 0.865 4.000 0.000 NA   NA
 5866218 5866219 ECIAI1_2644 ECIAI1_2645     TRUE 0.755 15.000 0.000 NA   NA
 5866219 5866220 ECIAI1_2645 ECIAI1_2646     FALSE 0.341 -151.000 0.000 NA   NA
 5866220 5866221 ECIAI1_2646 ECIAI1_2647     TRUE 0.880 0.000 0.000 NA   NA
 5866221 5866222 ECIAI1_2647 ECIAI1_2648     TRUE 0.968 3.000 0.026 0.001   NA
 5866222 5866223 ECIAI1_2648 ECIAI1_2649     FALSE 0.240 62.000 0.000 NA   NA
 5866223 5866224 ECIAI1_2649 ECIAI1_2650   r TRUE 0.594 -16.000 0.000 NA   NA
 5866224 5866225 ECIAI1_2650 ECIAI1_2651 r S TRUE 0.995 4.000 1.000 NA   NA
 5866225 5866226 ECIAI1_2651 ECIAI1_2652 S Q FALSE 0.004 386.000 0.000 NA   NA
 5866226 5866227 ECIAI1_2652 ECIAI1_2653 Q   FALSE 0.032 187.000 0.000 NA   NA
 5866227 5866228 ECIAI1_2653 ECIAI1_2654     FALSE 0.369 -97.000 0.000 NA   NA
 5866228 5866229 ECIAI1_2654 ECIAI1_2655     TRUE 0.865 4.000 0.000 NA   NA
 5866231 5866232 ECIAI1_2657 ECIAI1_2658     FALSE 0.086 137.000 0.000 NA   NA
 5866233 5866234 ECIAI1_misc_RNA_52 ECIAI1_2659     FALSE 0.404 35.000 0.000 NA   NA
 5866234 5866235 ECIAI1_2659 ECIAI1_2660     TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 5866235 5866236 ECIAI1_2660 ECIAI1_2661     TRUE 0.990 3.000 0.571 NA   NA
 5866236 5866237 ECIAI1_2661 ECIAI1_2662     TRUE 0.986 16.000 0.875 NA   NA
 5866239 5866240 ECIAI1_2664 ECIAI1_2665     FALSE 0.235 65.000 0.000 NA   NA
 5866240 5866241 ECIAI1_2665 ECIAI1_2666     FALSE 0.016 235.000 0.000 NA   NA
 5866241 5866242 ECIAI1_2666 ECIAI1_2667     TRUE 0.880 0.000 0.000 NA   NA
 5866244 5866245 ECIAI1_2669 ECIAI1_2670     TRUE 0.966 -3.000 0.222 1.000   NA
 5866248 5866249 ECIAI1_misc_RNA_53 ECIAI1_2673 ryfB   FALSE 0.330 -183.000 0.000 NA   NA
 5866251 5866252 ECIAI1_2674 ECIAI1_2675 acpS pdxJ TRUE 0.980 0.000 0.326 1.000 N NA
 5866252 5866253 ECIAI1_2675 ECIAI1_2676 pdxJ recO TRUE 0.930 12.000 0.166 1.000 N NA
 5866253 5866254 ECIAI1_2676 ECIAI1_2677 recO era TRUE 0.919 12.000 0.109 1.000   NA
 5866254 5866255 ECIAI1_2677 ECIAI1_2678 era rnc TRUE 0.971 -3.000 0.127 0.041   NA
 5866255 5866256 ECIAI1_2678 ECIAI1_misc_RNA_55 rnc   TRUE 0.876 1.000 0.000 NA   NA
 5866256 5866257 ECIAI1_misc_RNA_55 ECIAI1_2680   lepB FALSE 0.140 113.000 0.000 NA   NA
 5866257 5866258 ECIAI1_2680 ECIAI1_2681 lepB lepA TRUE 0.920 16.000 0.187 1.000   NA
 5866260 5866261 ECIAI1_2683 ECIAI1_2684 rseC rseB TRUE 0.997 -3.000 0.609 NA Y NA
 5866261 5866262 ECIAI1_2684 ECIAI1_2685 rseB rseA TRUE 0.999 0.000 0.856 NA Y NA
 5866262 5866263 ECIAI1_2685 ECIAI1_2686 rseA rpoE TRUE 0.927 33.000 0.705 NA N NA
 5866266 5866267 ECIAI1_2690 ECIAI1_2692 srmB   FALSE 0.092 271.000 0.000 1.000 Y NA
 5866272 5866273 ECIAI1_2698 ECIAI1_2699 yfiF   TRUE 0.662 -10.000 0.000 NA   NA
 5866274 5866275 ECIAI1_2700 ECIAI1_2701 trxC yfiP FALSE 0.337 69.000 0.084 NA   NA
 5866275 5866276 ECIAI1_2701 ECIAI1_2702 yfiP yfiQ TRUE 0.766 32.000 0.222 NA   NA
 5866276 5866277 ECIAI1_2702 ECIAI1_2703 yfiQ pssA FALSE 0.439 114.000 0.121 0.049 N NA
 5866277 5866278 ECIAI1_2703 ECIAI1_2704 pssA yfiM FALSE 0.277 97.000 0.089 NA   NA
 5866279 5866280 ECIAI1_2705 ECIAI1_5S_3 kgtP   FALSE 0.006 321.000 0.000 NA   NA
 5866280 5866281 ECIAI1_5S_3 ECIAI1_23S_2     FALSE 0.180 94.000 0.000 NA   NA
 5866281 5866282 ECIAI1_23S_2 ECIAI1_tRNA67     FALSE 0.029 194.000 0.000 NA   NA
 5866282 5866283 ECIAI1_tRNA67 ECIAI1_16S_2     FALSE 0.043 172.000 0.000 NA   NA
 5866283 5866284 ECIAI1_16S_2 ECIAI1_2715   clpB FALSE 0.003 444.000 0.000 NA   NA
 5866284 5866285 ECIAI1_2715 ECIAI1_misc_RNA_56 clpB ryfD TRUE 0.546 -22.000 0.000 NA   NA
 5866285 5866286 ECIAI1_misc_RNA_56 ECIAI1_2716 ryfD yfiH TRUE 0.846 8.000 0.000 NA   NA
 5866286 5866287 ECIAI1_2716 ECIAI1_2717 yfiH rluD TRUE 0.948 -3.000 0.168 NA   NA
 5866288 5866289 ECIAI1_2718 ECIAI1_2719 yfiO yfiA FALSE 0.006 271.000 0.004 NA   NA
 5866289 5866290 ECIAI1_2719 ECIAI1_4633 yfiA pheL FALSE 0.161 104.000 0.000 NA   NA
 5866290 5866291 ECIAI1_4633 ECIAI1_2720 pheL pheA FALSE 0.170 99.000 0.000 NA   NA
 5866292 5866293 ECIAI1_2721 ECIAI1_2722 tyrA aroF TRUE 0.981 11.000 0.000 1.000 Y NA
 5866294 5866295 ECIAI1_2723 ECIAI1_2724 yfiL yfiR FALSE 0.158 150.000 0.148 NA   NA
 5866295 5866296 ECIAI1_2724 ECIAI1_2725 yfiR yfiN TRUE 0.956 -10.000 0.475 NA   NA
 5866296 5866297 ECIAI1_2725 ECIAI1_2726 yfiN yfiB TRUE 0.967 16.000 0.475 1.000 N NA
 5866298 5866299 ECIAI1_2727 ECIAI1_2728 rplS trmD TRUE 0.971 42.000 0.567 1.000 Y NA
 5866299 5866300 ECIAI1_2728 ECIAI1_2729 trmD rimM TRUE 0.985 31.000 0.672 1.000 Y NA
 5866300 5866301 ECIAI1_2729 ECIAI1_2730 rimM rpsP TRUE 0.993 19.000 0.342 0.010 Y NA
 5866301 5866302 ECIAI1_2730 ECIAI1_2731 rpsP   FALSE 0.145 111.000 0.000 NA   NA
 5866302 5866303 ECIAI1_2731 ECIAI1_2732   ffh FALSE 0.344 -147.000 0.000 NA   NA
 5866304 5866305 ECIAI1_2733 ECIAI1_2734 ypjD yfjD TRUE 0.568 111.000 0.349 NA   NA
 5866307 5866308 ECIAI1_2736 ECIAI1_2737 yfjB recN FALSE 0.440 86.000 0.170 1.000 N NA
 5866308 5866309 ECIAI1_2737 ECIAI1_2738 recN smpA FALSE 0.070 149.000 0.049 1.000 N NA
 5866310 5866311 ECIAI1_2739 ECIAI1_2740 yfjF yfjG TRUE 0.825 -10.000 0.124 NA   NA
 5866312 5866313 ECIAI1_2741 ECIAI1_misc_RNA_57 smpB ssrA FALSE 0.023 208.000 0.000 NA   NA
 5866314 5866315 ECIAI1_2742 ECIAI1_2743 ypjA ypjA TRUE 0.474 29.000 0.000 NA   NA
 5866316 5866317 ECIAI1_2745 ECIAI1_2746     TRUE 0.824 24.000 0.000 0.046   NA
 5866318 5866319 ECIAI1_2747 ECIAI1_2748 ypjA   FALSE 0.077 141.000 0.000 NA   NA
 5866321 5866322 ECIAI1_2750 ECIAI1_2751     TRUE 0.755 15.000 0.000 NA   NA
 5866322 5866323 ECIAI1_2751 ECIAI1_2752     FALSE 0.003 520.000 0.000 NA   NA
 5866323 5866324 ECIAI1_2752 ECIAI1_tRNA66     FALSE 0.372 -93.000 0.000 NA   NA
 5866325 5866326 ECIAI1_2753 ECIAI1_2754   yqaD FALSE 0.267 139.000 0.000 0.005   NA
 5866326 5866327 ECIAI1_2754 ECIAI1_2755 yqaD ygaT FALSE 0.006 336.000 0.000 NA   NA
 5866327 5866328 ECIAI1_2755 ECIAI1_2756 ygaT ygaF TRUE 0.663 20.000 0.000 NA   NA
 5866328 5866329 ECIAI1_2756 ECIAI1_2757 ygaF gabD TRUE 0.669 23.000 0.000 1.000   NA
 5866329 5866330 ECIAI1_2757 ECIAI1_2758 gabD gabT TRUE 0.955 14.000 0.303 1.000 N NA
 5866330 5866331 ECIAI1_2758 ECIAI1_2759 gabT gabP FALSE 0.101 311.000 0.121 1.000 Y NA
 5866331 5866332 ECIAI1_2759 ECIAI1_2760 gabP csiR TRUE 0.967 21.000 0.625 1.000 N NA
 5866333 5866334 ECIAI1_2761 ECIAI1_2762 ygaU yqaE FALSE 0.218 84.000 0.027 1.000   NA
 5866335 5866336 ECIAI1_2763 ECIAI1_2764 ygaV ygaP TRUE 0.871 10.000 0.083 NA N NA
 5866340 5866341 ECIAI1_2768 ECIAI1_2769 ygaM nrdH FALSE 0.013 248.000 0.000 NA   NA
 5866341 5866342 ECIAI1_2769 ECIAI1_2770 nrdH nrdI TRUE 0.737 -3.000 0.026 NA N NA
 5866342 5866343 ECIAI1_2770 ECIAI1_2771 nrdI nrdE TRUE 0.905 -27.000 0.000 NA Y NA
 5866343 5866344 ECIAI1_2771 ECIAI1_2772 nrdE nrdF TRUE 0.992 10.000 0.000 0.001 Y NA
 5866344 5866345 ECIAI1_2772 ECIAI1_2773 nrdF proV FALSE 0.005 355.000 0.000 1.000 N NA
 5866345 5866346 ECIAI1_2773 ECIAI1_2774 proV proW TRUE 0.997 -7.000 0.630 0.090 Y NA
 5866346 5866347 ECIAI1_2774 ECIAI1_2775 proW proX TRUE 0.979 57.000 0.695 0.048 Y NA
 5866347 5866348 ECIAI1_2775 ECIAI1_2776 proX   FALSE 0.022 292.000 0.174 NA N NA
 5866348 5866349 ECIAI1_2776 ECIAI1_2777   ygaZ FALSE 0.113 124.000 0.060 NA N NA
 5866349 5866350 ECIAI1_2777 ECIAI1_2778 ygaZ ygaH TRUE 0.982 -10.000 0.915 NA   NA
 5866350 5866351 ECIAI1_2778 ECIAI1_2779 ygaH mprA FALSE 0.244 91.000 0.065 NA   NA
 5866351 5866352 ECIAI1_2779 ECIAI1_2780 mprA emrA FALSE 0.206 127.000 0.107 1.000 N NA
 5866352 5866353 ECIAI1_2780 ECIAI1_2781 emrA emrB TRUE 0.985 17.000 0.875 1.000 N NA
 5866356 5866357 ECIAI1_2783 ECIAI1_2784 gshA yqaA FALSE 0.292 73.000 0.071 NA   NA
 5866357 5866358 ECIAI1_2784 ECIAI1_2785 yqaA yqaB TRUE 0.887 -3.000 0.067 NA   NA
 5866358 5866359 ECIAI1_2785 ECIAI1_tRNA65 yqaB   FALSE 0.067 148.000 0.000 NA   NA
 5866359 5866360 ECIAI1_tRNA65 ECIAI1_tRNA64     FALSE 0.027 199.000 0.000 NA   NA
 5866360 5866361 ECIAI1_tRNA64 ECIAI1_tRNA63     FALSE 0.237 64.000 0.000 NA   NA
 5866361 5866362 ECIAI1_tRNA63 ECIAI1_tRNA62     TRUE 0.865 4.000 0.000 NA   NA
 5866362 5866363 ECIAI1_tRNA62 ECIAI1_2787   csrA FALSE 0.007 316.000 0.000 NA   NA
 5866363 5866364 ECIAI1_2787 ECIAI1_2788 csrA alaS FALSE 0.011 235.000 0.020 1.000 N NA
 5866364 5866365 ECIAI1_2788 ECIAI1_2790 alaS recX FALSE 0.205 128.000 0.085 1.000   NA
 5866365 5866366 ECIAI1_2790 ECIAI1_2791 recX recA FALSE 0.090 243.000 0.296 1.000   NA
 5866366 5866367 ECIAI1_2791 ECIAI1_2792 recA ygaD FALSE 0.300 80.000 0.082 NA   NA
 5866367 5866368 ECIAI1_2792 ECIAI1_2793 ygaD mltB FALSE 0.059 145.000 0.026 NA   NA
 5866369 5866370 ECIAI1_2794 ECIAI1_2795 srlA srlE TRUE 0.997 -3.000 0.349 0.011 Y NA
 5866370 5866371 ECIAI1_2795 ECIAI1_2796 srlE srlB TRUE 0.989 11.000 0.000 0.011 Y NA
 5866371 5866372 ECIAI1_2796 ECIAI1_2797 srlB srlD TRUE 0.859 4.000 0.040 1.000 N NA
 5866372 5866373 ECIAI1_2797 ECIAI1_2798 srlD gutM FALSE 0.374 105.000 0.197 NA N NA
 5866373 5866374 ECIAI1_2798 ECIAI1_2799 gutM srlR TRUE 0.849 67.000 0.183 NA Y NA
 5866374 5866375 ECIAI1_2799 ECIAI1_2800 srlR gutQ TRUE 0.973 -7.000 0.562 1.000 N NA
 5866377 5866378 ECIAI1_2802 ECIAI1_2803 norV norW TRUE 0.906 -3.000 0.083 NA   NA
 5866379 5866380 ECIAI1_2804 ECIAI1_2805 hypF hydN FALSE 0.040 153.000 0.018 1.000 N NA
 5866380 5866381 ECIAI1_2805 ECIAI1_2806 hydN ascG FALSE 0.312 149.000 0.316 1.000 N NA
 5866382 5866383 ECIAI1_2807 ECIAI1_2808 ascF ascB TRUE 0.996 9.000 0.485 1.000 Y NA
 5866384 5866385 ECIAI1_2809 ECIAI1_2810     TRUE 0.858 5.000 0.000 NA   NA
 5866385 5866386 ECIAI1_2810 ECIAI1_2811   hycI TRUE 0.490 25.000 0.022 NA   NA
 5866386 5866387 ECIAI1_2811 ECIAI1_2812 hycI hycH TRUE 0.955 -7.000 0.360 NA   NA
 5866387 5866388 ECIAI1_2812 ECIAI1_2813 hycH hycG TRUE 0.944 -3.000 0.156 NA   NA
 5866388 5866389 ECIAI1_2813 ECIAI1_2814 hycG hycF TRUE 0.996 0.000 0.111 0.001 Y NA
 5866389 5866390 ECIAI1_2814 ECIAI1_2815 hycF hycE TRUE 0.996 10.000 0.200 0.001 Y NA
 5866390 5866391 ECIAI1_2815 ECIAI1_2816 hycE hycD TRUE 0.983 18.000 0.235 1.000 Y NA
 5866391 5866392 ECIAI1_2816 ECIAI1_2817 hycD hycC TRUE 0.996 3.000 0.382 1.000 Y NA
 5866392 5866393 ECIAI1_2817 ECIAI1_2818 hycC hycB TRUE 0.990 -3.000 0.154 1.000 Y NA
 5866393 5866394 ECIAI1_2818 ECIAI1_2819 hycB hycA FALSE 0.116 125.000 0.000 NA   NA
 5866395 5866396 ECIAI1_2821 ECIAI1_2822 hypA hypB TRUE 0.990 4.000 0.306 0.002   NA
 5866396 5866397 ECIAI1_2822 ECIAI1_2823 hypB hypC TRUE 0.972 -9.000 0.139 NA Y NA
 5866397 5866398 ECIAI1_2823 ECIAI1_2824 hypC hypD TRUE 0.984 0.000 0.021 NA Y NA
 5866398 5866399 ECIAI1_2824 ECIAI1_2825 hypD hypE TRUE 0.957 39.000 0.353 1.000 Y NA
 5866399 5866400 ECIAI1_2825 ECIAI1_2826 hypE fhlA FALSE 0.157 74.000 0.019 1.000 N NA
 5866402 5866403 ECIAI1_2828 ECIAI1_2829 mutS pphB FALSE 0.196 106.000 0.000 1.000   NA
 5866405 5866406 ECIAI1_2831 ECIAI1_2832 ygbJ ygbK TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 5866406 5866407 ECIAI1_2832 ECIAI1_2833 ygbK ygbL TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 5866407 5866408 ECIAI1_2833 ECIAI1_2834 ygbL ygbM TRUE 0.994 5.000 0.265 1.000 Y NA
 5866408 5866409 ECIAI1_2834 ECIAI1_2835 ygbM ygbN TRUE 0.808 89.000 0.143 1.000 Y NA
 5866410 5866411 ECIAI1_2836 ECIAI1_2837     TRUE 0.828 11.000 0.000 NA   NA
 5866411 5866412 ECIAI1_2837 ECIAI1_2838     TRUE 0.986 0.000 0.000 NA Y NA
 5866414 5866415 ECIAI1_2840 ECIAI1_2841 rpoS rpoS TRUE 0.625 22.000 0.000 NA   NA
 5866415 5866416 ECIAI1_2841 ECIAI1_2842 rpoS nlpD TRUE 0.510 27.000 0.000 NA   NA
 5866416 5866417 ECIAI1_2842 ECIAI1_2844 nlpD pcm FALSE 0.067 140.000 0.030 1.000 N NA
 5866417 5866418 ECIAI1_2844 ECIAI1_2845 pcm surE TRUE 0.966 -6.000 0.353 1.000   NA
 5866418 5866419 ECIAI1_2845 ECIAI1_2846 surE truD TRUE 0.875 -19.000 0.235 1.000   NA
 5866419 5866420 ECIAI1_2846 ECIAI1_2847 truD ispF TRUE 0.956 -3.000 0.173 1.000   NA
 5866420 5866421 ECIAI1_2847 ECIAI1_2848 ispF ispD TRUE 0.997 0.000 0.419 1.000 Y NA
 5866421 5866422 ECIAI1_2848 ECIAI1_2849 ispD ftsB TRUE 0.882 19.000 0.185 1.000 N NA
 5866422 5866423 ECIAI1_2849 ECIAI1_2851 ftsB ygbE FALSE 0.024 194.000 0.028 NA   NA
 5866423 5866424 ECIAI1_2851 ECIAI1_2852 ygbE cysC TRUE 0.606 50.000 0.198 NA   NA
 5866424 5866425 ECIAI1_2852 ECIAI1_2853 cysC cysN TRUE 0.996 0.000 0.340 1.000 Y NA
 5866425 5866426 ECIAI1_2853 ECIAI1_2854 cysN cysD TRUE 0.996 2.000 0.574 0.000 N NA
 11498683 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 5920.000 0.000 NA   NA
 11641046 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 5920.000 0.000 NA   NA
 11783438 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 5920.000 0.000 NA   NA
 11498684 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 5949.000 0.000 NA   NA
 11641047 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 5949.000 0.000 NA   NA
 11783439 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 5949.000 0.000 NA   NA
 11498685 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 5981.000 0.000 NA   NA
 11641048 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 5981.000 0.000 NA   NA
 11783440 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 5981.000 0.000 NA   NA
 11498686 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6010.000 0.000 NA   NA
 11641049 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6010.000 0.000 NA   NA
 11783441 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6010.000 0.000 NA   NA
 11498687 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6042.000 0.000 NA   NA
 11641050 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6042.000 0.000 NA   NA
 11783442 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6042.000 0.000 NA   NA
 11498688 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6071.000 0.000 NA   NA
 11641051 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6071.000 0.000 NA   NA
 11783443 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6071.000 0.000 NA   NA
 11498689 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6103.000 0.000 NA   NA
 11641052 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6103.000 0.000 NA   NA
 11783444 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6103.000 0.000 NA   NA
 11498690 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6132.000 0.000 NA   NA
 11641053 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6132.000 0.000 NA   NA
 11783445 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6132.000 0.000 NA   NA
 11498691 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6163.000 0.000 NA   NA
 11641054 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6163.000 0.000 NA   NA
 11783446 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6163.000 0.000 NA   NA
 11498692 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6192.000 0.000 NA   NA
 11641055 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6192.000 0.000 NA   NA
 11783447 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6192.000 0.000 NA   NA
 11498693 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6224.000 0.000 NA   NA
 11641056 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6224.000 0.000 NA   NA
 11783448 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6224.000 0.000 NA   NA
 11498694 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6253.000 0.000 NA   NA
 11641057 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6253.000 0.000 NA   NA
 11783449 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6253.000 0.000 NA   NA
 11498695 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6285.000 0.000 NA   NA
 11641058 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6285.000 0.000 NA   NA
 11783450 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6285.000 0.000 NA   NA
 11498696 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6314.000 0.000 NA   NA
 11641059 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6314.000 0.000 NA   NA
 11783451 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6314.000 0.000 NA   NA
 11498697 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6346.000 0.000 NA   NA
 11641060 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6346.000 0.000 NA   NA
 11783452 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6346.000 0.000 NA   NA
 11498698 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6375.000 0.000 NA   NA
 11641061 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6375.000 0.000 NA   NA
 11783453 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6375.000 0.000 NA   NA
 11498699 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6407.000 0.000 NA   NA
 11641062 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6407.000 0.000 NA   NA
 11783454 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6407.000 0.000 NA   NA
 11498700 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6436.000 0.000 NA   NA
 11641063 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6436.000 0.000 NA   NA
 11783455 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6436.000 0.000 NA   NA
 11498701 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6468.000 0.000 NA   NA
 11641064 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6468.000 0.000 NA   NA
 11783456 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6468.000 0.000 NA   NA
 11498702 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6497.000 0.000 NA   NA
 11641065 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6497.000 0.000 NA   NA
 11783457 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6497.000 0.000 NA   NA
 11498703 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6529.000 0.000 NA   NA
 11641066 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6529.000 0.000 NA   NA
 11783458 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6529.000 0.000 NA   NA
 11498704 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6558.000 0.000 NA   NA
 11641067 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6558.000 0.000 NA   NA
 11783459 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6558.000 0.000 NA   NA
 11498705 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6590.000 0.000 NA   NA
 11641068 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6590.000 0.000 NA   NA
 11783460 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6590.000 0.000 NA   NA
 11498706 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6619.000 0.000 NA   NA
 11641069 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6619.000 0.000 NA   NA
 11783461 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6619.000 0.000 NA   NA
 11498707 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6651.000 0.000 NA   NA
 11641070 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6651.000 0.000 NA   NA
 11783462 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6651.000 0.000 NA   NA
 11498708 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6680.000 0.000 NA   NA
 11641071 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6680.000 0.000 NA   NA
 11783463 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6680.000 0.000 NA   NA
 11498709 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6712.000 0.000 NA   NA
 11641072 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6712.000 0.000 NA   NA
 11783464 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6712.000 0.000 NA   NA
 11498710 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6741.000 0.000 NA   NA
 11641073 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6741.000 0.000 NA   NA
 11783465 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6741.000 0.000 NA   NA
 11498711 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6773.000 0.000 NA   NA
 11641074 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6773.000 0.000 NA   NA
 11783466 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6773.000 0.000 NA   NA
 11498712 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6802.000 0.000 NA   NA
 11641075 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6802.000 0.000 NA   NA
 11783467 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6802.000 0.000 NA   NA
 11498713 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6834.000 0.000 NA   NA
 11641076 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6834.000 0.000 NA   NA
 11783468 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6834.000 0.000 NA   NA
 11498714 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6863.000 0.000 NA   NA
 11641077 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6863.000 0.000 NA   NA
 11783469 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6863.000 0.000 NA   NA
 11498715 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6895.000 0.000 NA   NA
 11641078 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6895.000 0.000 NA   NA
 11783470 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6895.000 0.000 NA   NA
 11498716 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6924.000 0.000 NA   NA
 11641079 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6924.000 0.000 NA   NA
 11783471 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6924.000 0.000 NA   NA
 11498717 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6956.000 0.000 NA   NA
 11641080 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6956.000 0.000 NA   NA
 11783472 5866420   ECIAI1_2847   ispF FALSE NA 6956.000 0.000 NA   NA
 5866428 5866429 ECIAI1_2857 ECIAI1_2858 ygbF ygbT TRUE 0.986 -3.000 0.509 NA   NA
 5866429 5866430 ECIAI1_2858 ECIAI1_2859 ygbT   TRUE 0.926 -39.000 0.589 NA   NA
 5866430 5866431 ECIAI1_2859 ECIAI1_2860     TRUE 0.742 -156.000 0.282 NA   NA
 5866431 5866432 ECIAI1_2860 ECIAI1_2861     TRUE 0.991 11.000 0.780 NA   NA
 5866432 5866433 ECIAI1_2861 ECIAI1_2862     TRUE 0.961 12.000 0.276 NA   NA
 5866433 5866434 ECIAI1_2862 ECIAI1_2863     TRUE 0.977 -3.000 0.336 NA   NA
 5866434 5866435 ECIAI1_2863 ECIAI1_2864     TRUE 0.828 29.000 0.263 NA   NA
 5866435 5866436 ECIAI1_2864 ECIAI1_2865     FALSE 0.038 194.000 0.000 1.000   NA
 5866436 5866437 ECIAI1_2865 ECIAI1_2866   cysH FALSE 0.014 265.000 0.000 1.000   NA
 5866437 5866438 ECIAI1_2866 ECIAI1_2867 cysH cysI FALSE 0.376 74.000 0.116 1.000 N NA
 5866438 5866439 ECIAI1_2867 ECIAI1_2868 cysI cysJ TRUE 0.999 0.000 0.791 0.000 Y NA
 5866440 5866441 ECIAI1_2869 ECIAI1_2871 ygcM ygcN FALSE 0.143 78.000 0.014 1.000 N NA
 5866441 5866442 ECIAI1_2871 ECIAI1_2872 ygcN ygcO TRUE 0.951 -9.000 0.026 NA Y NA
 5866442 5866443 ECIAI1_2872 ECIAI1_2873 ygcO ygcP TRUE 0.556 17.000 0.026 NA N NA
 5866444 5866445 ECIAI1_2874 ECIAI1_2875 ygcQ ygcR TRUE 0.987 -3.000 0.102 NA Y NA
 5866445 5866446 ECIAI1_2875 ECIAI1_2876 ygcR ygcS TRUE 0.806 -22.000 0.182 1.000 N NA
 5866446 5866447 ECIAI1_2876 ECIAI1_2877 ygcS ygcU TRUE 0.521 94.000 0.250 1.000 N NA
 5866447 5866448 ECIAI1_2877 ECIAI1_2878 ygcU ygcW TRUE 0.852 70.000 0.500 0.024 N NA
 5866449 5866450 ECIAI1_2879 ECIAI1_2880 yqcE ygcE TRUE 0.491 27.000 0.058 NA N NA
 5866450 5866451 ECIAI1_2880 ECIAI1_2881 ygcE   FALSE 0.003 635.000 0.000 NA   NA
 11498718 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 640.000 0.000 NA   NA
 11641081 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 640.000 0.000 NA   NA
 11783473 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 640.000 0.000 NA   NA
 11498719 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 668.000 0.000 NA   NA
 11641082 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 668.000 0.000 NA   NA
 11783474 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 668.000 0.000 NA   NA
 11498720 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 701.000 0.000 NA   NA
 11641083 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 701.000 0.000 NA   NA
 11783475 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 701.000 0.000 NA   NA
 11498721 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 729.000 0.000 NA   NA
 11641084 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 729.000 0.000 NA   NA
 11783476 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 729.000 0.000 NA   NA
 11498722 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 762.000 0.000 NA   NA
 11641085 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 762.000 0.000 NA   NA
 11783477 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 762.000 0.000 NA   NA
 11498723 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 790.000 0.000 NA   NA
 11641086 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 790.000 0.000 NA   NA
 11783478 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 790.000 0.000 NA   NA
 11498724 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 823.000 0.000 NA   NA
 11641087 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 823.000 0.000 NA   NA
 11783479 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 823.000 0.000 NA   NA
 11498725 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 851.000 0.000 NA   NA
 11641088 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 851.000 0.000 NA   NA
 11783480 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 851.000 0.000 NA   NA
 11498726 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 884.000 0.000 NA   NA
 11641089 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 884.000 0.000 NA   NA
 11783481 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 884.000 0.000 NA   NA
 11498727 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 912.000 0.000 NA   NA
 11641090 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 912.000 0.000 NA   NA
 11783482 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 912.000 0.000 NA   NA
 11498728 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 945.000 0.000 NA   NA
 11641091 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 945.000 0.000 NA   NA
 11783483 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 945.000 0.000 NA   NA
 11498729 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 973.000 0.000 NA   NA
 11641092 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 973.000 0.000 NA   NA
 11783484 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 973.000 0.000 NA   NA
 11498730 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1006.000 0.000 NA   NA
 11641093 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1006.000 0.000 NA   NA
 11783485 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1006.000 0.000 NA   NA
 11498731 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1034.000 0.000 NA   NA
 11641094 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1034.000 0.000 NA   NA
 11783486 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1034.000 0.000 NA   NA
 11498732 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1067.000 0.000 NA   NA
 11641095 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1067.000 0.000 NA   NA
 11783487 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1067.000 0.000 NA   NA
 11498733 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1095.000 0.000 NA   NA
 11641096 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1095.000 0.000 NA   NA
 11783488 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1095.000 0.000 NA   NA
 11498734 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1128.000 0.000 NA   NA
 11641097 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1128.000 0.000 NA   NA
 11783489 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1128.000 0.000 NA   NA
 11498735 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1156.000 0.000 NA   NA
 11641098 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1156.000 0.000 NA   NA
 11783490 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1156.000 0.000 NA   NA
 11498736 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1189.000 0.000 NA   NA
 11641099 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1189.000 0.000 NA   NA
 11783491 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1189.000 0.000 NA   NA
 11498737 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1217.000 0.000 NA   NA
 11641100 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1217.000 0.000 NA   NA
 11783492 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1217.000 0.000 NA   NA
 11498738 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1250.000 0.000 NA   NA
 11641101 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1250.000 0.000 NA   NA
 11783493 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1250.000 0.000 NA   NA
 11498739 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1278.000 0.000 NA   NA
 11641102 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1278.000 0.000 NA   NA
 11783494 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1278.000 0.000 NA   NA
 11498740 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1311.000 0.000 NA   NA
 11641103 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1311.000 0.000 NA   NA
 11783495 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1311.000 0.000 NA   NA
 11498741 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1339.000 0.000 NA   NA
 11641104 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1339.000 0.000 NA   NA
 11783496 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1339.000 0.000 NA   NA
 11498742 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1372.000 0.000 NA   NA
 11641105 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1372.000 0.000 NA   NA
 11783497 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1372.000 0.000 NA   NA
 11498743 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1400.000 0.000 NA   NA
 11641106 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1400.000 0.000 NA   NA
 11783498 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1400.000 0.000 NA   NA
 11498744 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1433.000 0.000 NA   NA
 11641107 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1433.000 0.000 NA   NA
 11783499 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1433.000 0.000 NA   NA
 11498745 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1461.000 0.000 NA   NA
 11641108 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1461.000 0.000 NA   NA
 11783500 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1461.000 0.000 NA   NA
 11498746 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1494.000 0.000 NA   NA
 11641109 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1494.000 0.000 NA   NA
 11783501 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1494.000 0.000 NA   NA
 11498747 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1522.000 0.000 NA   NA
 11641110 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1522.000 0.000 NA   NA
 11783502 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1522.000 0.000 NA   NA
 11498748 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1555.000 0.000 NA   NA
 11641111 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1555.000 0.000 NA   NA
 11783503 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1555.000 0.000 NA   NA
 11498749 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1583.000 0.000 NA   NA
 11641112 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1583.000 0.000 NA   NA
 11783504 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1583.000 0.000 NA   NA
 11498750 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1616.000 0.000 NA   NA
 11641113 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1616.000 0.000 NA   NA
 11783505 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1616.000 0.000 NA   NA
 5866452 5866453 ECIAI1_2882 ECIAI1_2883   ygcF FALSE 0.003 523.000 0.000 NA   NA
 11498751 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1644.000 0.000 NA   NA
 11641114 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1644.000 0.000 NA   NA
 11783506 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1644.000 0.000 NA   NA
 11498752 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1677.000 0.000 NA   NA
 11641115 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1677.000 0.000 NA   NA
 11783507 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1677.000 0.000 NA   NA
 11498753 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1705.000 0.000 NA   NA
 11641116 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1705.000 0.000 NA   NA
 11783508 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1705.000 0.000 NA   NA
 11498754 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1738.000 0.000 NA   NA
 11641117 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1738.000 0.000 NA   NA
 11783509 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1738.000 0.000 NA   NA
 11498755 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1766.000 0.000 NA   NA
 11641118 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1766.000 0.000 NA   NA
 11783510 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1766.000 0.000 NA   NA
 11498756 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1799.000 0.000 NA   NA
 11641119 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1799.000 0.000 NA   NA
 11783511 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1799.000 0.000 NA   NA
 11498757 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1827.000 0.000 NA   NA
 11641120 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1827.000 0.000 NA   NA
 11783512 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1827.000 0.000 NA   NA
 11498758 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1860.000 0.000 NA   NA
 11641121 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1860.000 0.000 NA   NA
 11783513 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1860.000 0.000 NA   NA
 11498759 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1888.000 0.000 NA   NA
 11641122 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1888.000 0.000 NA   NA
 11783514 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1888.000 0.000 NA   NA
 11498760 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1921.000 0.000 NA   NA
 11641123 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1921.000 0.000 NA   NA
 11783515 5866450   ECIAI1_2880   ygcE FALSE NA 1921.000 0.000 NA   NA
 5866454 5866455 ECIAI1_2884 ECIAI1_2885     TRUE 0.594 -16.000 0.000 NA   NA
 5866455 5866456 ECIAI1_2885 ECIAI1_2886     FALSE 0.395 36.000 0.000 NA   NA
 5866457 5866458 ECIAI1_2887 ECIAI1_2888 eno pyrG FALSE 0.251 88.000 0.068 1.000 N NA
 5866458 5866459 ECIAI1_2888 ECIAI1_2889 pyrG mazG FALSE 0.018 228.000 0.025 1.000   NA
 5866459 5866460 ECIAI1_2889 ECIAI1_2890 mazG chpA FALSE 0.274 71.000 0.000 1.000   NA
 5866460 5866461 ECIAI1_2890 ECIAI1_2891 chpA chpR TRUE 0.997 0.000 0.531 NA Y NA
 5866461 5866462 ECIAI1_2891 ECIAI1_2892 chpR relA TRUE 0.708 78.000 0.000 NA Y NA
 5866462 5866463 ECIAI1_2892 ECIAI1_2893 relA rumA FALSE 0.414 48.000 0.082 1.000 N NA
 5866465 5866466 ECIAI1_2895 ECIAI1_2896 gudD gudX TRUE 0.978 21.000 0.000 0.000 Y NA
 5866466 5866467 ECIAI1_2896 ECIAI1_2897 gudX gudP TRUE 0.871 2.000 0.000 1.000 N NA
 5866467 5866468 ECIAI1_2897 ECIAI1_2899 gudP yqcA FALSE 0.003 435.000 0.000 1.000 N NA
 5866468 5866469 ECIAI1_2899 ECIAI1_2900 yqcA truC TRUE 0.900 18.000 0.209 1.000 N NA
 5866469 5866470 ECIAI1_2900 ECIAI1_2901 truC yqcC TRUE 0.989 0.000 0.518 NA   NA
 5866470 5866471 ECIAI1_2901 ECIAI1_misc_RNA_59 yqcC csrB FALSE 0.294 49.000 0.000 NA   NA
 5866471 5866472 ECIAI1_misc_RNA_59 ECIAI1_2902 csrB syd FALSE 0.019 218.000 0.000 NA   NA
 5866473 5866474 ECIAI1_2903 ECIAI1_2905 queF ygdH FALSE 0.209 112.000 0.079 NA   NA
 5866474 5866475 ECIAI1_2905 ECIAI1_2906 ygdH sdaC FALSE 0.003 557.000 0.000 NA   NA
 5866475 5866476 ECIAI1_2906 ECIAI1_2907 sdaC sdaB TRUE 0.779 58.000 0.000 1.000 Y NA
 5866476 5866477 ECIAI1_2907 ECIAI1_2908 sdaB exo TRUE 0.616 22.000 0.000 1.000 N NA
 5866478 5866479 ECIAI1_2909 ECIAI1_2910 fucO fucA TRUE 0.628 25.000 0.066 1.000 N NA
 5866480 5866481 ECIAI1_2911 ECIAI1_2912 fucP fucI TRUE 0.907 33.000 0.104 NA Y NA
 5866481 5866482 ECIAI1_2912 ECIAI1_2913 fucI fucK TRUE 0.880 79.000 0.269 1.000 Y NA
 5866482 5866483 ECIAI1_2913 ECIAI1_2914 fucK fucU TRUE 0.994 2.000 0.211 1.000 Y NA
 5866483 5866484 ECIAI1_2914 ECIAI1_2915 fucU fucR TRUE 0.916 58.000 0.308 1.000 Y NA
 5866485 5866486 ECIAI1_2916 ECIAI1_2917 ygdE ygdD TRUE 0.880 -7.000 0.144 NA   NA
 5866486 5866487 ECIAI1_2917 ECIAI1_2918 ygdD gcvA TRUE 0.780 19.000 0.081 NA   NA
 5866490 5866491 ECIAI1_2920 ECIAI1_2921 csdA ygdK TRUE 0.983 0.000 0.122 0.001   NA
 5866492 5866493 ECIAI1_2922 ECIAI1_2923 ygdL mltA FALSE 0.009 239.000 0.009 1.000 N NA
 5866494 5866495 ECIAI1_tRNA26 ECIAI1_tRNA27     FALSE 0.415 34.000 0.000 NA   NA
 5866500 5866501 ECIAI1_2927 ECIAI1_2928 recD recB TRUE 0.999 0.000 0.688 0.001 Y NA
 5866501 5866502 ECIAI1_2928 ECIAI1_2929 recB ptr TRUE 0.828 -7.000 0.092 1.000 N NA
 5866502 5866503 ECIAI1_2929 ECIAI1_2930 ptr recC FALSE 0.072 176.000 0.092 1.000 N NA
 5866503 5866504 ECIAI1_2930 ECIAI1_2931 recC ppdC TRUE 0.820 13.000 0.076 NA N NA
 5866504 5866505 ECIAI1_2931 ECIAI1_2932 ppdC ygdB TRUE 0.953 -15.000 0.538 NA   NA
 5866505 5866506 ECIAI1_2932 ECIAI1_2933 ygdB ppdB TRUE 0.979 -3.000 0.373 NA   NA
 5866506 5866507 ECIAI1_2933 ECIAI1_2934 ppdB ppdA TRUE 0.988 -9.000 0.368 NA Y NA
 5866507 5866508 ECIAI1_2934 ECIAI1_2935 ppdA thyA FALSE 0.014 185.000 0.016 NA N NA
 5866508 5866509 ECIAI1_2935 ECIAI1_2936 thyA lgt TRUE 0.945 7.000 0.164 1.000 N NA
 5866509 5866510 ECIAI1_2936 ECIAI1_2937 lgt ptsP FALSE 0.059 151.000 0.000 1.000 N NA
 5866510 5866511 ECIAI1_2937 ECIAI1_2938 ptsP nudH TRUE 0.699 13.000 0.008 1.000 N NA
 5866512 5866513 ECIAI1_2940 ECIAI1_2941 mutH ygdQ FALSE 0.249 69.000 0.052 1.000 N NA
 5866513 5866514 ECIAI1_2941 ECIAI1_2942 ygdQ ygdR TRUE 0.475 138.000 0.429 NA   NA
 5866514 5866515 ECIAI1_2942 ECIAI1_2943 ygdR tas FALSE 0.156 108.000 0.043 NA   NA
 5866516 5866517 ECIAI1_2944 ECIAI1_2945 ygeD aas TRUE 0.864 -7.000 0.124 NA   NA
 5866517 5866518 ECIAI1_2945 ECIAI1_misc_RNA_61 aas omrA FALSE 0.195 88.000 0.000 NA   NA
 5866518 5866519 ECIAI1_misc_RNA_61 ECIAI1_misc_RNA_62 omrA omrB FALSE 0.134 116.000 0.000 NA   NA
 5866523 5866524 ECIAI1_2950 ECIAI1_2951 ygeA araE FALSE 0.068 129.000 0.011 1.000 N NA
 5866524 5866525 ECIAI1_2951 ECIAI1_2952 araE kduD FALSE 0.006 315.000 0.000 1.000 N NA
 5866525 5866526 ECIAI1_2952 ECIAI1_2953 kduD kduI TRUE 0.820 30.000 0.269 1.000 N NA
 5866526 5866527 ECIAI1_2953 ECIAI1_2954 kduI yqeF FALSE 0.008 287.000 0.000 1.000 N NA
 5866528 5866529 ECIAI1_2955 ECIAI1_2956 yqeG yqeH FALSE 0.004 460.000 0.000 1.000   NA
 5866529 5866530 ECIAI1_2956 ECIAI1_2957 yqeH yqeI FALSE 0.017 334.000 0.000 0.063   NA
 5866530 5866531 ECIAI1_2957 ECIAI1_2958 yqeI yqeJ TRUE 0.959 -7.000 0.400 NA   NA
 5866532 5866533 ECIAI1_2959 ECIAI1_2960 yqeK   FALSE 0.358 40.000 0.000 NA   NA
 5866534 5866535 ECIAI1_2961 ECIAI1_2962 ygeF ygeG FALSE 0.009 278.000 0.000 NA   NA
 5866535 5866536 ECIAI1_2962 ECIAI1_2963 ygeG ygeH FALSE 0.007 335.000 0.000 1.000   NA
 5866536 5866537 ECIAI1_2963 ECIAI1_2964 ygeH ygeI FALSE 0.046 168.000 0.000 NA   NA
 5866537 5866538 ECIAI1_2964 ECIAI1_2966 ygeI   FALSE 0.201 83.000 0.000 NA   NA
 5866539 5866540 ECIAI1_2967 ECIAI1_2968     FALSE 0.440 31.000 0.000 NA   NA
 5866540 5866541 ECIAI1_2968 ECIAI1_2969   ygeM FALSE 0.018 221.000 0.000 NA   NA
 5866541 5866542 ECIAI1_2969 ECIAI1_2970 ygeM   FALSE 0.003 439.000 0.000 NA   NA
 5866542 5866543 ECIAI1_2970 ECIAI1_2971   eprK TRUE 0.957 16.000 0.333 1.000   NA
 5866543 5866544 ECIAI1_2971 ECIAI1_2972 eprK   FALSE 0.350 41.000 0.000 NA   NA
 5866544 5866545 ECIAI1_2972 ECIAI1_2973   eprI FALSE 0.040 177.000 0.000 NA   NA
 5866545 5866546 ECIAI1_2973 ECIAI1_2974 eprI eprH TRUE 0.984 14.000 0.667 NA   NA
 5866547 5866548 ECIAI1_2975 ECIAI1_2976     TRUE 0.902 2.000 0.000 1.000   NA
 5866549 5866550 ECIAI1_2977 ECIAI1_2978 spaS spaS TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 5866550 5866551 ECIAI1_2978 ECIAI1_2979 spaS   TRUE 0.842 9.000 0.000 NA   NA
 5866551 5866552 ECIAI1_2979 ECIAI1_2980   spaQ TRUE 0.875 2.000 0.000 NA   NA
 5866552 5866553 ECIAI1_2980 ECIAI1_2981 spaQ   TRUE 0.837 10.000 0.000 NA   NA
 5866553 5866554 ECIAI1_2981 ECIAI1_2982   epaO TRUE 0.662 -10.000 0.000 NA   NA
 5866554 5866555 ECIAI1_2982 ECIAI1_2983 epaO   FALSE 0.003 507.000 0.000 NA   NA
 5866555 5866556 ECIAI1_2983 ECIAI1_tRNA61     FALSE 0.030 192.000 0.000 NA   NA
 5866556 5866557 ECIAI1_tRNA61 ECIAI1_2984   ygeR FALSE 0.204 79.000 0.000 NA   NA
 5866557 5866558 ECIAI1_2984 ECIAI1_2985 ygeR   TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 5866559 5866560 ECIAI1_2986 ECIAI1_2987 xdhA xdhB TRUE 0.998 11.000 0.500 0.001 Y NA
 5866560 5866561 ECIAI1_2987 ECIAI1_2988 xdhB xdhC TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.043 Y NA
 5866563 5866564 ECIAI1_2990 ECIAI1_2991 ygeW ygeX TRUE 0.904 58.000 0.265 1.000 Y NA
 5866564 5866565 ECIAI1_2991 ECIAI1_2992 ygeX ygeY TRUE 0.876 58.000 0.188 1.000 Y NA
 5866565 5866566 ECIAI1_2992 ECIAI1_2993 ygeY hyuA FALSE 0.288 53.000 0.050 1.000 N NA
 5866566 5866567 ECIAI1_2993 ECIAI1_2994 hyuA yqeA FALSE 0.265 48.000 0.031 1.000 N NA
 5866568 5866569 ECIAI1_2995 ECIAI1_2996 yqeB yqeC TRUE 0.500 48.000 0.119 NA   NA
 5866570 5866571 ECIAI1_2997 ECIAI1_2998 ygfJ ygfK FALSE 0.006 322.000 0.000 NA   NA
 5866571 5866572 ECIAI1_2998 ECIAI1_2999 ygfK ssnA TRUE 0.985 3.000 0.443 1.000 N NA
 5866572 5866573 ECIAI1_2999 ECIAI1_3000 ssnA ygfM FALSE 0.345 51.000 0.066 1.000 N NA
 5866573 5866574 ECIAI1_3000 ECIAI1_3001 ygfM xdhD TRUE 0.999 -3.000 0.800 0.023 Y NA
 5866574 5866575 ECIAI1_3001 ECIAI1_3002 xdhD ygfO FALSE 0.047 165.000 0.000 1.000 N NA
 5866575 5866576 ECIAI1_3002 ECIAI1_3003 ygfO guaD TRUE 0.970 15.000 0.000 1.000 Y NA
 5866576 5866577 ECIAI1_3003 ECIAI1_3004 guaD ygfQ FALSE 0.463 36.000 0.000 1.000   NA
 5866578 5866579 ECIAI1_3005 ECIAI1_3006 ygfS ygfT TRUE 0.990 0.000 0.333 0.011 N NA
 5866580 5866581 ECIAI1_3007 ECIAI1_3008 ygfU idi FALSE 0.012 250.000 0.000 1.000 N NA
 5866582 5866583 ECIAI1_3009 ECIAI1_3010 lysS prfB TRUE 0.994 10.000 0.162 0.035 Y NA
 5866583 5866584 ECIAI1_3010 ECIAI1_3011 prfB recJ FALSE 0.157 91.000 0.028 1.000 N NA
 5866584 5866585 ECIAI1_3011 ECIAI1_3012 recJ dsbC TRUE 0.905 6.000 0.082 1.000 N NA
 5866585 5866586 ECIAI1_3012 ECIAI1_3013 dsbC xerD TRUE 0.663 25.000 0.079 1.000 N NA
 5866588 5866589 ECIAI1_3015 ECIAI1_3016 ygfX ygfY TRUE 0.632 -19.000 0.061 NA   NA
 5866591 5866592 ECIAI1_3018 ECIAI1_3019 yqfA yqfB FALSE 0.105 164.000 0.113 NA   NA
 5866594 5866595 ECIAI1_3021 ECIAI1_3022 ygfF gcvP FALSE 0.006 266.000 0.006 1.000 N NA
 5866595 5866596 ECIAI1_3022 ECIAI1_3023 gcvP gcvH TRUE 0.791 119.000 0.249 1.000 Y NA
 5866596 5866597 ECIAI1_3023 ECIAI1_3024 gcvH gcvT TRUE 0.990 24.000 0.317 0.001 Y NA
 5866597 5866598 ECIAI1_3024 ECIAI1_3025 gcvT visC FALSE 0.002 447.000 0.004 1.000 N NA
 5866598 5866599 ECIAI1_3025 ECIAI1_3026 visC ubiH TRUE 0.994 23.000 0.474 0.001 Y NA
 5866599 5866600 ECIAI1_3026 ECIAI1_3027 ubiH pepP TRUE 0.812 -3.000 0.026 1.000 N NA
 5866600 5866601 ECIAI1_3027 ECIAI1_3028 pepP ygfB TRUE 0.513 26.000 0.036 NA   NA
 5866604 5866605 ECIAI1_misc_RNA_63 ECIAI1_3031 ssrS ygfA FALSE 0.209 76.000 0.000 NA   NA
 5866605 5866606 ECIAI1_3031 ECIAI1_misc_RNA_64 ygfA rygC TRUE 0.529 26.000 0.000 NA   NA
 5866606 5866607 ECIAI1_misc_RNA_64 ECIAI1_misc_RNA_65 rygC   FALSE 0.014 242.000 0.000 NA   NA
 5866608 5866609 ECIAI1_3032 ECIAI1_3034 serA rpiA FALSE 0.010 256.000 0.029 1.000 N NA
 5866609 5866610 ECIAI1_3034 ECIAI1_3035 rpiA yqfE FALSE 0.256 56.000 0.000 NA   NA
 5866611 5866612 ECIAI1_3036 ECIAI1_3037 argP yliK FALSE 0.023 204.000 0.000 1.000 N NA
 5866612 5866613 ECIAI1_3037 ECIAI1_3038 yliK argK TRUE 0.955 -7.000 0.366 1.000 N NA
 5866613 5866614 ECIAI1_3038 ECIAI1_3039 argK ygfG TRUE 0.760 11.000 0.015 1.000 N NA
 5866614 5866615 ECIAI1_3039 ECIAI1_3040 ygfG ygfH TRUE 0.706 24.000 0.085 1.000 N NA
 5866616 5866617 ECIAI1_3041 ECIAI1_3042 ygfI yggE FALSE 0.045 167.000 0.037 NA   NA
 5866617 5866618 ECIAI1_3042 ECIAI1_3043 yggE argO FALSE 0.260 93.000 0.075 NA   NA
 5866618 5866619 ECIAI1_3043 ECIAI1_3044 argO mscS FALSE 0.116 139.000 0.049 1.000   NA
 5866619 5866620 ECIAI1_3044 ECIAI1_3045 mscS fbaA FALSE 0.005 358.000 0.038 1.000 N NA
 5866620 5866621 ECIAI1_3045 ECIAI1_3046 fbaA pgk FALSE 0.314 215.000 0.056 0.005 Y NA
 5866621 5866622 ECIAI1_3046 ECIAI1_3047 pgk epd TRUE 0.907 50.000 0.070 0.005 Y NA
 5866623 5866624 ECIAI1_3048 ECIAI1_3049     TRUE 0.583 -76.000 0.103 NA   NA
 5866624 5866625 ECIAI1_3049 ECIAI1_3050     TRUE 0.991 1.000 0.605 NA   NA
 5866625 5866626 ECIAI1_3050 ECIAI1_3051     TRUE 0.945 -18.000 0.093 NA Y NA
 5866626 5866627 ECIAI1_3051 ECIAI1_3052     TRUE 0.971 -39.000 0.214 0.014 Y NA
 5866628 5866629 ECIAI1_3053 ECIAI1_3054 yggC yggD TRUE 0.987 -3.000 0.588 NA N NA
 5866629 5866630 ECIAI1_3054 ECIAI1_3055 yggD yggF TRUE 0.951 22.000 0.545 NA N NA
 5866630 5866631 ECIAI1_3055 ECIAI1_3056 yggF yggP TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 5866631 5866632 ECIAI1_3056 ECIAI1_3057 yggP yggP FALSE 0.332 -178.000 0.000 NA   NA
 5866632 5866633 ECIAI1_3057 ECIAI1_3058 yggP cmtA TRUE 0.755 15.000 0.000 NA   NA
 5866633 5866634 ECIAI1_3058 ECIAI1_3059 cmtA cmtB TRUE 0.979 28.000 0.250 0.011 Y NA
 5866634 5866635 ECIAI1_3059 ECIAI1_3060 cmtB tktA FALSE 0.068 314.000 0.000 1.000 Y NA
 5866637 5866638 ECIAI1_3062 ECIAI1_3063     TRUE 0.934 -22.000 0.455 1.000   NA
 5866638 5866639 ECIAI1_3063 ECIAI1_3064     TRUE 0.981 4.000 0.364 1.000 N NA
 5866639 5866640 ECIAI1_3064 ECIAI1_3065     TRUE 0.998 0.000 0.500 0.014 Y NA
 5866640 5866641 ECIAI1_3065 ECIAI1_3066     TRUE 0.990 26.000 0.500 0.014 Y NA
 5866641 5866642 ECIAI1_3066 ECIAI1_3067     TRUE 0.998 11.000 0.667 0.011 Y NA
 5866642 5866643 ECIAI1_3067 ECIAI1_3068     TRUE 0.696 119.000 0.400 0.014 N NA
 5866643 5866644 ECIAI1_3068 ECIAI1_3069   speB FALSE 0.019 217.000 0.000 1.000 N NA
 5866644 5866645 ECIAI1_3069 ECIAI1_3070 speB   FALSE 0.088 136.000 0.000 NA   NA
 5866645 5866646 ECIAI1_3070 ECIAI1_3071   speA FALSE 0.070 146.000 0.000 NA   NA
 5866646 5866647 ECIAI1_3071 ECIAI1_3072 speA yqgB TRUE 0.842 9.000 0.000 NA   NA
 5866650 5866651 ECIAI1_3075 ECIAI1_3076 metK galP FALSE 0.003 436.000 0.000 1.000 N NA
 5866651 5866652 ECIAI1_3076 ECIAI1_3077 galP sprT FALSE 0.211 77.000 0.042 NA   NA
 5866652 5866653 ECIAI1_3077 ECIAI1_3078 sprT endA FALSE 0.463 95.000 0.210 NA   NA
 5866653 5866654 ECIAI1_3078 ECIAI1_3079 endA yggJ TRUE 0.496 80.000 0.201 NA   NA
 5866654 5866655 ECIAI1_3079 ECIAI1_3080 yggJ gshB TRUE 0.927 13.000 0.173 NA   NA
 5866655 5866656 ECIAI1_3080 ECIAI1_3081 gshB yqgE FALSE 0.247 109.000 0.120 NA N NA
 5866656 5866657 ECIAI1_3081 ECIAI1_3082 yqgE yqgF TRUE 0.971 0.000 0.263 NA N NA
 5866659 5866660 ECIAI1_3084 ECIAI1_3085 yggS yggT TRUE 0.894 18.000 0.189 NA   NA
 5866660 5866661 ECIAI1_3085 ECIAI1_3086 yggT yggU TRUE 0.903 -3.000 0.081 NA   NA
 5866661 5866662 ECIAI1_3086 ECIAI1_3087 yggU yggV TRUE 0.792 8.000 0.016 NA   NA
 5866662 5866663 ECIAI1_3087 ECIAI1_3088 yggV yggW TRUE 0.916 -7.000 0.218 1.000 N NA
 5866664 5866665 ECIAI1_3089 ECIAI1_3090 yggM ansB FALSE 0.097 117.000 0.018 NA   NA
 5866665 5866666 ECIAI1_3090 ECIAI1_3091 ansB yggN FALSE 0.034 176.000 0.027 NA   NA
 5866666 5866667 ECIAI1_3091 ECIAI1_3092 yggN yggL FALSE 0.096 184.000 0.155 NA   NA
 5866667 5866668 ECIAI1_3092 ECIAI1_3093 yggL yggH TRUE 0.932 0.000 0.092 NA   NA
 5866669 5866670 ECIAI1_3094 ECIAI1_3095 mutY yggX TRUE 0.695 28.000 0.150 NA N NA
 5866670 5866671 ECIAI1_3095 ECIAI1_3096 yggX mltC FALSE 0.380 65.000 0.128 NA N NA
 5866671 5866672 ECIAI1_3096 ECIAI1_3097 mltC nupG FALSE 0.031 202.000 0.056 NA   NA
 5866673 5866674 ECIAI1_3098 ECIAI1_3099 speC   FALSE 0.051 162.000 0.000 NA   NA
 5866675 5866676 ECIAI1_3100 ECIAI1_tRNA29 yqgA   FALSE 0.156 106.000 0.000 NA   NA
 5866677 5866678 ECIAI1_3101 ECIAI1_3102 yghD yghE TRUE 0.999 2.000 0.811 1.000 Y NA
 5866678 5866679 ECIAI1_3102 ECIAI1_3103 yghE   TRUE 0.998 -3.000 0.537 0.066 Y NA
 5866679 5866680 ECIAI1_3103 ECIAI1_3104     TRUE 0.997 3.000 0.461 1.000 Y NA
 5866680 5866681 ECIAI1_3104 ECIAI1_3105     TRUE 0.994 -3.000 0.569 0.003   NA
 5866681 5866682 ECIAI1_3105 ECIAI1_3106     TRUE 0.995 -3.000 0.605 0.003   NA
 5866682 5866683 ECIAI1_3106 ECIAI1_3107     TRUE 0.993 4.000 0.425 0.003   NA
 5866683 5866684 ECIAI1_3107 ECIAI1_3108   epsF TRUE 0.996 -10.000 0.599 0.003 Y NA
 5866684 5866685 ECIAI1_3108 ECIAI1_3109 epsF epsE TRUE 0.999 0.000 0.653 0.003 Y NA
 5866685 5866686 ECIAI1_3109 ECIAI1_3110 epsE epsD TRUE 0.999 0.000 0.776 0.003 Y NA
 5866686 5866687 ECIAI1_3110 ECIAI1_3111 epsD yghF TRUE 0.990 30.000 0.575 0.003 Y NA
 5866687 5866688 ECIAI1_3111 ECIAI1_3112 yghF yghG TRUE 0.696 18.000 0.000 NA   NA
 5866688 5866689 ECIAI1_3112 ECIAI1_3113 yghG pppA FALSE 0.233 66.000 0.000 NA   NA
 5866689 5866690 ECIAI1_3113 ECIAI1_3114 pppA yghJ FALSE 0.080 140.000 0.000 NA   NA
 5866694 5866695 ECIAI1_3117 ECIAI1_3118 glcB glcG TRUE 0.662 22.000 0.052 NA   NA
 5866695 5866696 ECIAI1_3118 ECIAI1_3119 glcG glcF TRUE 0.884 5.000 0.057 NA   NA
 5866696 5866697 ECIAI1_3119 ECIAI1_3120 glcF glcE TRUE 0.991 11.000 0.074 0.023 Y NA
 5866697 5866698 ECIAI1_3120 ECIAI1_3121 glcE glcD TRUE 0.994 0.000 0.070 0.007 Y NA
 5866701 5866702 ECIAI1_3124 ECIAI1_3125     FALSE 0.327 -213.000 0.000 NA   NA
 5866702 5866703 ECIAI1_3125 ECIAI1_3126     TRUE 0.562 32.000 0.064 1.000   NA
 5866703 5866704 ECIAI1_3126 ECIAI1_3127     TRUE 0.943 0.000 0.091 1.000   NA
 5866705 5866706 ECIAI1_3128 ECIAI1_3129     TRUE 0.949 -84.000 0.631 0.066   NA
 5866706 5866707 ECIAI1_3129 ECIAI1_3130     FALSE 0.440 31.000 0.000 NA   NA
 5866707 5866708 ECIAI1_3130 ECIAI1_3131     TRUE 0.842 9.000 0.000 NA   NA
 5866708 5866709 ECIAI1_3131 ECIAI1_3132     TRUE 0.993 0.000 0.667 NA   NA
 5866709 5866710 ECIAI1_3132 ECIAI1_3133   yghR TRUE 0.892 46.000 0.667 NA   NA
 5866710 5866711 ECIAI1_3133 ECIAI1_3134 yghR yghS FALSE 0.428 32.000 0.000 NA   NA
 5866713 5866714 ECIAI1_3136 ECIAI1_3137 pitB gss FALSE 0.008 292.000 0.000 1.000 N NA
 5866716 5866717 ECIAI1_3139 ECIAI1_3140 hybG hybF TRUE 0.793 13.000 0.000 NA   NA
 5866717 5866718 ECIAI1_3140 ECIAI1_3141 hybF hybE TRUE 0.762 -7.000 0.055 NA   NA
 5866718 5866719 ECIAI1_3141 ECIAI1_3142 hybE hybD TRUE 0.940 -7.000 0.291 NA   NA
 5866719 5866720 ECIAI1_3142 ECIAI1_3143 hybD hybC TRUE 0.999 0.000 0.828 1.000 Y NA
 5866720 5866721 ECIAI1_3143 ECIAI1_3144 hybC hybB TRUE 0.981 -3.000 0.000 NA Y NA
 5866721 5866722 ECIAI1_3144 ECIAI1_3145 hybB hybA TRUE 0.948 -10.000 0.000 NA Y NA
 5866722 5866723 ECIAI1_3145 ECIAI1_3146 hybA hybO TRUE 0.998 3.000 0.615 NA Y NA
 5866723 5866724 ECIAI1_3146 ECIAI1_3147 hybO   TRUE 0.868 7.000 0.051 NA   NA
 5866724 5866725 ECIAI1_3147 ECIAI1_3148   yghW TRUE 0.947 -3.000 0.167 NA   NA
 5866725 5866726 ECIAI1_3148 ECIAI1_3149 yghW   FALSE 0.091 119.000 0.017 NA   NA
 5866730 5866731 ECIAI1_3153 ECIAI1_3154 exbD exbB TRUE 0.999 7.000 0.810 0.054 Y NA
 5866731 5866732 ECIAI1_3154 ECIAI1_3155 exbB   TRUE 0.745 -7.000 0.048 NA   NA
 5866733 5866734 ECIAI1_3156 ECIAI1_3157 metC yghB FALSE 0.261 140.000 0.212 NA   NA
 5866736 5866737 ECIAI1_3160 ECIAI1_3161 yqhD dkgA FALSE 0.455 105.000 0.200 1.000   NA
 5866737 5866738 ECIAI1_3161 ECIAI1_3162 dkgA yqhG FALSE 0.026 200.000 0.000 NA   NA
 5866738 5866739 ECIAI1_3162 ECIAI1_3163 yqhG yqhH FALSE 0.282 51.000 0.000 NA   NA
 5866740 5866741 ECIAI1_3164 ECIAI1_3165 ygiQ sufI FALSE 0.113 111.000 0.025 1.000 N NA
 5866741 5866742 ECIAI1_3165 ECIAI1_3166 sufI plsC FALSE 0.435 75.000 0.154 1.000 N NA
 5866742 5866743 ECIAI1_3166 ECIAI1_3167 plsC   FALSE 0.301 48.000 0.000 NA   NA
 5866743 5866744 ECIAI1_3167 ECIAI1_3168   parC FALSE 0.457 30.000 0.000 NA   NA
 5866744 5866745 ECIAI1_3168 ECIAI1_3171 parC ygiV FALSE 0.022 546.000 0.005 NA Y NA
 5866745 5866746 ECIAI1_3171 ECIAI1_3172 ygiV ygiW FALSE 0.307 53.000 0.053 NA   NA
 5866747 5866748 ECIAI1_3173 ECIAI1_3174 qseB qseC TRUE 0.997 -3.000 0.526 1.000 Y NA
 5866750 5866751 ECIAI1_3176 ECIAI1_3177 mdaB ygiN TRUE 0.707 31.000 0.025 0.023   NA
 5866752 5866753 ECIAI1_3178 ECIAI1_3179 parE yqiA TRUE 0.792 29.000 0.217 NA   NA
 5866753 5866754 ECIAI1_3179 ECIAI1_3180 yqiA cpdA TRUE 0.986 0.000 0.427 NA   NA
 5866754 5866755 ECIAI1_3180 ECIAI1_3181 cpdA yqiB TRUE 0.926 25.000 0.433 NA   NA
 5866755 5866756 ECIAI1_3181 ECIAI1_3182 yqiB nudF TRUE 0.986 1.000 0.443 NA   NA
 5866757 5866758 ECIAI1_3183 ECIAI1_3184 tolC ygiB FALSE 0.134 244.000 0.480 NA   NA
 5866758 5866759 ECIAI1_3184 ECIAI1_3185 ygiB ygiC TRUE 0.990 6.000 0.632 NA   NA
 5866762 5866763 ECIAI1_3188 ECIAI1_3189   ribB FALSE 0.015 237.000 0.000 NA   NA
 5866763 5866764 ECIAI1_3189 ECIAI1_3190 ribB   FALSE 0.111 127.000 0.000 NA   NA
 5866765 5866766 ECIAI1_3191 ECIAI1_3192 yqiC ygiL FALSE 0.009 283.000 0.000 NA   NA
 5866766 5866767 ECIAI1_3192 ECIAI1_3193 ygiL yqiG TRUE 0.969 51.000 0.667 1.000 Y NA
 5866767 5866768 ECIAI1_3193 ECIAI1_3194 yqiG yqiH TRUE 0.995 16.000 0.667 1.000 Y NA
 5866768 5866769 ECIAI1_3194 ECIAI1_3195 yqiH yqiI TRUE 0.986 2.000 0.400 1.000   NA
 5866771 5866772 ECIAI1_3197 ECIAI1_3198 yqiJ yqiK TRUE 0.947 27.000 0.641 NA   NA
 5866773 5866774 ECIAI1_misc_RNA_67 ECIAI1_misc_RNA_68 rygD   FALSE 0.017 227.000 0.000 NA   NA
 5866774 5866775 ECIAI1_misc_RNA_68 ECIAI1_3199   rfaE FALSE 0.322 45.000 0.000 NA   NA
 5866775 5866776 ECIAI1_3199 ECIAI1_3200 rfaE glnE FALSE 0.415 48.000 0.083 1.000 N NA
 5866776 5866777 ECIAI1_3200 ECIAI1_3201 glnE ygiF TRUE 0.702 23.000 0.053 1.000   NA
 5866777 5866778 ECIAI1_3201 ECIAI1_3202 ygiF   TRUE 0.712 17.000 0.000 NA   NA
 5866779 5866780 ECIAI1_3203 ECIAI1_3204 htrG cca FALSE 0.343 64.000 0.106 NA N NA
 5866781 5866782 ECIAI1_3205 ECIAI1_3206 bacA folB FALSE 0.366 90.000 0.128 1.000 N NA
 5866785 5866786 ECIAI1_3209 ECIAI1_3210 ttdA ttdB TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.000 Y NA
 5866786 5866787 ECIAI1_3210 ECIAI1_3211 ttdB ygjE FALSE 0.282 48.000 0.037 1.000 N NA
 5866789 5866790 ECIAI1_3213 ECIAI1_3214 rpsU dnaG FALSE 0.188 111.000 0.067 1.000 N NA
 5866790 5866791 ECIAI1_3214 ECIAI1_3215 dnaG rpoD FALSE 0.152 195.000 0.299 1.000 N NA
 5866799 5866800 ECIAI1_3222 ECIAI1_3223 ebgR ebgA FALSE 0.085 184.000 0.136 1.000 N NA
 5866800 5866801 ECIAI1_3223 ECIAI1_3224 ebgA ebgC TRUE 0.998 -3.000 0.682 NA Y NA
 5866801 5866802 ECIAI1_3224 ECIAI1_3225 ebgC ygjI TRUE 0.719 63.000 0.412 NA N NA
 5866802 5866803 ECIAI1_3225 ECIAI1_3226 ygjI ygjJ FALSE 0.093 134.000 0.000 NA   NA
 5866803 5866804 ECIAI1_3226 ECIAI1_3227 ygjJ ygjK TRUE 0.712 17.000 0.000 NA   NA
 5866804 5866805 ECIAI1_3227 ECIAI1_3228 ygjK fadH FALSE 0.008 326.000 0.000 1.000   NA
 5866806 5866807 ECIAI1_3229 ECIAI1_3230 ygjM ygjO FALSE 0.009 270.000 0.000 1.000 N NA
 5866808 5866809 ECIAI1_3231 ECIAI1_3232 ygjP ygjQ FALSE 0.159 77.000 0.019 NA   NA
 5866809 5866810 ECIAI1_3232 ECIAI1_3233 ygjQ ygjR FALSE 0.188 61.000 0.019 NA   NA
 5866810 5866811 ECIAI1_3233 ECIAI1_misc_RNA_69 ygjR sraF FALSE 0.207 77.000 0.000 NA   NA
 5866811 5866812 ECIAI1_misc_RNA_69 ECIAI1_3234 sraF alx TRUE 0.680 19.000 0.000 NA   NA
 5866812 5866813 ECIAI1_3234 ECIAI1_3235 alx sstT FALSE 0.004 399.000 0.000 1.000 N NA
 5866814 5866815 ECIAI1_3236 ECIAI1_3237 ygjV uxaA FALSE 0.382 83.000 0.126 NA   NA
 5866815 5866816 ECIAI1_3237 ECIAI1_3238 uxaA uxaC TRUE 0.977 15.000 0.092 1.000 Y NA
 5866818 5866819 ECIAI1_3240 ECIAI1_3241     TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 5866819 5866820 ECIAI1_3241 ECIAI1_3242     TRUE 0.832 74.000 0.667 NA   NA
 5866820 5866821 ECIAI1_3242 ECIAI1_3243     TRUE 0.920 30.000 0.556 NA   NA
 5866822 5866823 ECIAI1_3244 ECIAI1_3245 exuR yqjA FALSE 0.005 345.000 0.000 NA   NA
 5866823 5866824 ECIAI1_3245 ECIAI1_3246 yqjA yqjB TRUE 0.988 4.000 0.529 NA   NA
 5866824 5866825 ECIAI1_3246 ECIAI1_3247 yqjB yqjC TRUE 0.585 147.000 0.684 NA   NA
 5866825 5866826 ECIAI1_3247 ECIAI1_3248 yqjC yqjD TRUE 0.905 38.000 0.609 NA   NA
 5866826 5866827 ECIAI1_3248 ECIAI1_3249 yqjD yqjE TRUE 0.961 3.000 0.185 NA   NA
 5866827 5866828 ECIAI1_3249 ECIAI1_3250 yqjE yqjK TRUE 0.876 -10.000 0.185 NA   NA
 5866828 5866829 ECIAI1_3250 ECIAI1_3251 yqjK yqjF FALSE 0.095 186.000 0.161 NA   NA
 5866829 5866830 ECIAI1_3251 ECIAI1_3252 yqjF yqjG FALSE 0.224 70.000 0.000 NA   NA
 5866830 5866831 ECIAI1_3252 ECIAI1_3253 yqjG yhaH FALSE 0.008 293.000 0.000 NA   NA
 5866831 5866832 ECIAI1_3253 ECIAI1_3254 yhaH yhaI FALSE 0.042 242.000 0.000 0.065   NA
 5866834 5866835 ECIAI1_3256 ECIAI1_3257 yhaK yhaL TRUE 0.488 23.000 0.005 NA   NA
 5866836 5866837 ECIAI1_3258 ECIAI1_3259   yhaM FALSE 0.242 61.000 0.000 NA   NA
 5866837 5866838 ECIAI1_3259 ECIAI1_3260 yhaM yhaO TRUE 0.744 28.000 0.157 NA   NA
 5866838 5866839 ECIAI1_3260 ECIAI1_3261 yhaO tdcG FALSE 0.055 338.000 0.000 1.000 Y NA
 5866839 5866840 ECIAI1_3261 ECIAI1_3262 tdcG tdcF FALSE 0.398 72.000 0.150 NA N NA
 5866840 5866841 ECIAI1_3262 ECIAI1_3263 tdcF tdcE TRUE 0.700 14.000 0.000 NA N NA
 5866841 5866842 ECIAI1_3263 ECIAI1_3264 tdcE tdcD TRUE 0.955 34.000 0.286 1.000 Y NA
 5866842 5866843 ECIAI1_3264 ECIAI1_3265 tdcD tdcC TRUE 0.956 14.000 0.308 1.000 N NA
 5866843 5866844 ECIAI1_3265 ECIAI1_3266 tdcC tdcB TRUE 0.943 22.000 0.029 1.000 Y NA
 5866844 5866845 ECIAI1_3266 ECIAI1_3267 tdcB tdcA FALSE 0.131 99.000 0.023 1.000 N NA
 5866846 5866847 ECIAI1_3268 ECIAI1_3269 tdcR yhaB FALSE 0.012 256.000 0.000 NA   NA
 5866847 5866848 ECIAI1_3269 ECIAI1_3270 yhaB yhaC TRUE 0.625 22.000 0.000 NA   NA
 5866848 5866849 ECIAI1_3270 ECIAI1_3271 yhaC   FALSE 0.242 61.000 0.000 NA   NA
 5866850 5866851 ECIAI1_misc_RNA_70 ECIAI1_3272   garK FALSE 0.184 93.000 0.000 NA   NA
 5866851 5866852 ECIAI1_3272 ECIAI1_3273 garK garR TRUE 0.885 16.000 0.152 1.000 N NA
 5866852 5866853 ECIAI1_3273 ECIAI1_3274 garR garL TRUE 0.889 30.000 0.424 1.000 N NA
 5866853 5866854 ECIAI1_3274 ECIAI1_3275 garL garP TRUE 0.979 16.000 0.143 1.000 Y NA
 5866855 5866856 ECIAI1_3276 ECIAI1_3277 garD sohA FALSE 0.045 149.000 0.000 NA N NA
 5866856 5866857 ECIAI1_3277 ECIAI1_3278 sohA yhaV TRUE 0.880 0.000 0.000 NA   NA
 5866859 5866860 ECIAI1_3280 ECIAI1_3281 kbaZ agaV TRUE 0.978 23.000 0.280 1.000 Y NA
 5866860 5866861 ECIAI1_3281 ECIAI1_3282 agaV   TRUE 0.999 11.000 0.905 0.014 Y NA
 5866861 5866862 ECIAI1_3282 ECIAI1_3283     TRUE 0.994 -16.000 0.619 0.014 Y NA
 5866862 5866863 ECIAI1_3283 ECIAI1_3284     TRUE 0.997 18.000 0.692 0.014 Y NA
 5866863 5866864 ECIAI1_3284 ECIAI1_3285   agaA TRUE 0.944 -24.000 0.104 1.000 Y NA
 5866864 5866865 ECIAI1_3285 ECIAI1_3286 agaA agaS FALSE 0.005 351.000 0.000 1.000 N NA
 5866865 5866866 ECIAI1_3286 ECIAI1_3287 agaS kbaY TRUE 0.971 13.000 0.391 1.000 N NA
 5866866 5866867 ECIAI1_3287 ECIAI1_3288 kbaY agaB FALSE 0.402 167.000 0.087 1.000 Y NA
 5866867 5866868 ECIAI1_3288 ECIAI1_3289 agaB agaC TRUE 0.973 39.000 0.333 0.010 Y NA
 5866868 5866869 ECIAI1_3289 ECIAI1_3290 agaC agaD TRUE 0.994 -10.000 0.444 0.010 Y NA
 5866869 5866870 ECIAI1_3290 ECIAI1_3291 agaD agaI TRUE 0.989 1.000 0.080 1.000 Y NA
 5866870 5866871 ECIAI1_3291 ECIAI1_3292 agaI yraH FALSE 0.004 400.000 0.000 1.000 N NA
 5866871 5866872 ECIAI1_3292 ECIAI1_3293 yraH yraI TRUE 0.901 80.000 0.333 1.000 Y NA
 5866872 5866873 ECIAI1_3293 ECIAI1_3294 yraI yraJ TRUE 0.899 30.000 0.000 1.000 Y NA
 5866873 5866874 ECIAI1_3294 ECIAI1_3295 yraJ yraK TRUE 0.978 11.000 0.000 NA Y NA
 5866876 5866877 ECIAI1_3297 ECIAI1_3298 yraM yraN TRUE 0.756 -42.000 0.172 1.000   NA
 5866877 5866878 ECIAI1_3298 ECIAI1_3299 yraN yraO TRUE 0.876 20.000 0.187 1.000 N NA
 5866878 5866879 ECIAI1_3299 ECIAI1_3300 yraO ecfH TRUE 0.988 10.000 0.613 NA   NA
 5866880 5866881 ECIAI1_3301 ECIAI1_3302 yraQ yraR FALSE 0.231 73.000 0.045 NA   NA
 5866885 5866886 ECIAI1_3306 ECIAI1_3307 yhbS yhbT TRUE 0.957 -6.000 0.295 1.000   NA
 5866887 5866888 ECIAI1_3308 ECIAI1_3309 yhbU yhbV TRUE 0.999 9.000 0.948 0.003 Y NA
 5866888 5866889 ECIAI1_3309 ECIAI1_3310 yhbV yhbW FALSE 0.016 206.000 0.041 NA N NA
 5866890 5866891 ECIAI1_3311 ECIAI1_3312 mtr deaD FALSE 0.036 154.000 0.009 1.000 N NA
 5866891 5866892 ECIAI1_3312 ECIAI1_3313 deaD nlpI FALSE 0.057 180.000 0.053 1.000   NA
 5866892 5866893 ECIAI1_3313 ECIAI1_3314 nlpI pnp FALSE 0.246 109.000 0.071 1.000   NA
 5866895 5866896 ECIAI1_3315 ECIAI1_3316 rpsO truB TRUE 0.613 149.000 0.211 1.000 Y NA
 5866896 5866897 ECIAI1_3316 ECIAI1_3317 truB rbfA TRUE 0.996 0.000 0.318 1.000 Y NA
 5866897 5866898 ECIAI1_3317 ECIAI1_3318 rbfA infB TRUE 0.753 164.000 0.530 1.000 Y NA
 5866898 5866899 ECIAI1_3318 ECIAI1_3319 infB nusA TRUE 0.903 25.000 0.342 1.000 N NA
 5866899 5866900 ECIAI1_3319 ECIAI1_3320 nusA yhbC TRUE 0.954 28.000 0.759 NA   NA
 5866900 5866901 ECIAI1_3320 ECIAI1_tRNA60 yhbC   FALSE 0.023 207.000 0.000 NA   NA
 5866903 5866904 ECIAI1_3322 ECIAI1_tRNA59 yhbX   FALSE 0.003 459.000 0.000 NA   NA
 5866904 5866905 ECIAI1_tRNA59 ECIAI1_3323   secG TRUE 0.755 15.000 0.000 NA   NA
 5866905 5866906 ECIAI1_3323 ECIAI1_3324 secG glmM FALSE 0.011 228.000 0.016 1.000 N NA
 5866906 5866907 ECIAI1_3324 ECIAI1_3325 glmM folP TRUE 0.931 -7.000 0.260 1.000 N NA
 5866907 5866908 ECIAI1_3325 ECIAI1_3326 folP ftsH TRUE 0.617 90.000 0.325 1.000 N NA
 5866908 5866909 ECIAI1_3326 ECIAI1_3327 ftsH rrmJ FALSE 0.364 100.000 0.152 1.000 N NA
 5866913 5866914 ECIAI1_3331 ECIAI1_3332 obgE yhbE TRUE 0.726 16.000 0.015 1.000   NA
 5866914 5866915 ECIAI1_3332 ECIAI1_3333 yhbE rpmA FALSE 0.112 127.000 0.019 1.000   NA
 5866915 5866916 ECIAI1_3333 ECIAI1_3334 rpmA rplU TRUE 0.996 21.000 0.667 0.009 Y NA
 5866917 5866918 ECIAI1_3335 ECIAI1_3336 ispB sfsB FALSE 0.016 228.000 0.000 1.000 N NA
 5866919 5866920 ECIAI1_3337 ECIAI1_3338 murA yrbA TRUE 0.608 55.000 0.258 NA N NA
 5866920 5866921 ECIAI1_3338 ECIAI1_3339 yrbA yrbB FALSE 0.363 160.000 0.453 NA   NA
 5866921 5866922 ECIAI1_3339 ECIAI1_3340 yrbB yrbC TRUE 0.979 0.000 0.308 NA   NA
 5866922 5866923 ECIAI1_3340 ECIAI1_3341 yrbC yrbD TRUE 0.886 19.000 0.188 NA   NA
 5866923 5866924 ECIAI1_3341 ECIAI1_3342 yrbD yrbE TRUE 0.988 5.000 0.562 NA   NA
 5866924 5866925 ECIAI1_3342 ECIAI1_3343 yrbE yrbF TRUE 0.997 8.000 0.530 NA Y NA
 5866926 5866927 ECIAI1_3344 ECIAI1_3345 yrbG kdsD TRUE 0.939 14.000 0.226 1.000 N NA
 5866927 5866928 ECIAI1_3345 ECIAI1_3346 kdsD kdsC TRUE 0.968 21.000 0.598 1.000   NA
 5866928 5866929 ECIAI1_3346 ECIAI1_3347 kdsC yrbK TRUE 0.989 -3.000 0.617 NA   NA
 5866929 5866930 ECIAI1_3347 ECIAI1_3348 yrbK lptA TRUE 0.909 -31.000 0.459 NA   NA
 5866930 5866931 ECIAI1_3348 ECIAI1_3349 lptA lptB TRUE 0.987 7.000 0.543 NA   NA
 5866931 5866932 ECIAI1_3349 ECIAI1_3350 lptB rpoN TRUE 0.611 48.000 0.163 1.000   NA
 5866932 5866933 ECIAI1_3350 ECIAI1_3351 rpoN yhbH TRUE 0.970 23.000 0.820 NA N NA
 5866933 5866934 ECIAI1_3351 ECIAI1_3352 yhbH ptsN TRUE 0.727 118.000 0.728 NA N NA
 5866934 5866935 ECIAI1_3352 ECIAI1_3353 ptsN yhbJ TRUE 0.623 46.000 0.186 NA   NA
 5866935 5866936 ECIAI1_3353 ECIAI1_3354 yhbJ npr TRUE 0.952 -3.000 0.182 NA   NA
 5866936 5866937 ECIAI1_3354 ECIAI1_3355 npr yrbL FALSE 0.013 214.000 0.007 NA   NA
 5866938 5866939 ECIAI1_3356 ECIAI1_3357 mtgA elbB TRUE 0.886 -3.000 0.066 NA   NA
 5866941 5866942 ECIAI1_3358 ECIAI1_3359 arcB yhcC FALSE 0.362 96.000 0.113 1.000   NA
 5866943 5866944 ECIAI1_3360 ECIAI1_3361 gltB gltD TRUE 0.992 13.000 0.096 0.000 Y NA
 5866944 5866945 ECIAI1_3361 ECIAI1_3362 gltD yhcG FALSE 0.035 184.000 0.000 NA   NA
 5866946 5866947 ECIAI1_3363 ECIAI1_3364 yhcH nanK TRUE 0.976 12.000 0.000 NA Y NA
 5866947 5866948 ECIAI1_3364 ECIAI1_3365 nanK nanE TRUE 0.894 -42.000 0.000 1.000 Y NA
 5866948 5866949 ECIAI1_3365 ECIAI1_3366 nanE nanT TRUE 0.820 48.000 0.000 1.000 Y NA
 5866949 5866950 ECIAI1_3366 ECIAI1_3367 nanT nanA TRUE 0.538 109.000 0.318 1.000 N NA
 5866950 5866951 ECIAI1_3367 ECIAI1_3368 nanA nanR FALSE 0.117 122.000 0.000 1.000 N NA
 5866953 5866954 ECIAI1_3370 ECIAI1_3371 sspB sspA TRUE 0.993 6.000 0.831 NA   NA
 5866954 5866955 ECIAI1_3371 ECIAI1_3372 sspA rpsI FALSE 0.002 395.000 0.014 NA N NA
 5866955 5866956 ECIAI1_3372 ECIAI1_3373 rpsI rplM TRUE 0.997 16.000 0.601 0.009 Y NA
 5866956 5866957 ECIAI1_3373 ECIAI1_3374 rplM yhcM FALSE 0.012 219.000 0.003 NA   NA
 5866958 5866959 ECIAI1_3375 ECIAI1_3376 yhcB degQ FALSE 0.151 154.000 0.154 NA   NA
 5866959 5866960 ECIAI1_3376 ECIAI1_3377 degQ degS TRUE 0.929 90.000 0.262 0.002 Y NA
 5866962 5866963 ECIAI1_3379 ECIAI1_3380 argR yhcN FALSE 0.005 365.000 0.000 NA   NA
 5866964 5866965 ECIAI1_3381 ECIAI1_3382 yhcO aaeB FALSE 0.160 92.000 0.027 NA   NA
 5866965 5866966 ECIAI1_3382 ECIAI1_3383 aaeB aaeA TRUE 0.991 6.000 0.667 NA   NA
 5866966 5866967 ECIAI1_3383 ECIAI1_3384 aaeA aaeX TRUE 0.917 8.000 0.100 NA   NA
 5866969 5866970 ECIAI1_3386 ECIAI1_3387 tldD yhdP FALSE 0.063 156.000 0.050 NA   NA
 5866970 5866971 ECIAI1_3387 ECIAI1_3388 yhdP rng TRUE 0.647 68.000 0.296 NA   NA
 5866971 5866972 ECIAI1_3388 ECIAI1_3389 rng yhdE TRUE 0.942 -10.000 0.417 NA N NA
 5866972 5866973 ECIAI1_3389 ECIAI1_3390 yhdE mreD TRUE 0.947 9.000 0.206 NA N NA
 5866973 5866974 ECIAI1_3390 ECIAI1_3391 mreD   TRUE 0.594 -16.000 0.000 NA   NA
 5866974 5866975 ECIAI1_3391 ECIAI1_3392   mreC FALSE 0.357 -115.000 0.000 NA   NA
 5866975 5866976 ECIAI1_3392 ECIAI1_3393 mreC mreB TRUE 0.852 66.000 0.689 1.000 N NA
 5866979 5866980 ECIAI1_3396 ECIAI1_3398 yhdH accB FALSE 0.002 978.000 0.000 1.000 N NA
 5866980 5866981 ECIAI1_3398 ECIAI1_3399 accB accC TRUE 0.997 11.000 0.275 0.000 Y NA
 5866981 5866982 ECIAI1_3399 ECIAI1_3400 accC yhdT FALSE 0.267 109.000 0.103 NA   NA
 5866982 5866983 ECIAI1_3400 ECIAI1_3401 yhdT panF TRUE 0.974 -10.000 0.682 NA   NA
 5866983 5866984 ECIAI1_3401 ECIAI1_3402 panF prmA TRUE 0.811 12.000 0.041 1.000 N NA
 5866984 5866985 ECIAI1_3402 ECIAI1_3403 prmA dusB FALSE 0.059 329.000 0.042 1.000 Y NA
 5866985 5866986 ECIAI1_3403 ECIAI1_3404 dusB fis TRUE 0.771 26.000 0.161 1.000 N NA
 5866986 5866987 ECIAI1_3404 ECIAI1_3405 fis yhdJ TRUE 0.696 86.000 0.016 1.000 Y NA
 5866987 5866988 ECIAI1_3405 ECIAI1_3406 yhdJ yhdU FALSE 0.405 84.000 0.143 NA   NA
 5866990 5866991 ECIAI1_3408 ECIAI1_3409 acrE acrF TRUE 0.991 12.000 0.889 1.000 N NA
 5866991 5866992 ECIAI1_3409 ECIAI1_3410 acrF yhdV FALSE 0.012 253.000 0.000 NA   NA
 5866992 5866993 ECIAI1_3410 ECIAI1_3411 yhdV   FALSE 0.018 226.000 0.000 NA   NA
 5866993 5866994 ECIAI1_3411 ECIAI1_3412   aapJ FALSE 0.066 137.000 0.022 NA   NA
 5866994 5866995 ECIAI1_3412 ECIAI1_3413 aapJ aapQ TRUE 0.967 68.000 0.548 0.043 Y NA
 5866995 5866996 ECIAI1_3413 ECIAI1_3414 aapQ aapM TRUE 0.999 10.000 0.815 0.012 Y NA
 5866996 5866997 ECIAI1_3414 ECIAI1_3415 aapM aapP TRUE 0.998 8.000 0.734 1.000 Y NA
 5866998 5866999 ECIAI1_5S_2 ECIAI1_tRNA58     FALSE 0.350 41.000 0.000 NA   NA
 5866999 5867000 ECIAI1_tRNA58 ECIAI1_5S_1     TRUE 0.793 13.000 0.000 NA   NA
 5867000 5867001 ECIAI1_5S_1 ECIAI1_23S_1     FALSE 0.184 93.000 0.000 NA   NA
 5867001 5867002 ECIAI1_23S_1 ECIAI1_tRNA57     FALSE 0.035 184.000 0.000 NA   NA
 5867002 5867003 ECIAI1_tRNA57 ECIAI1_tRNA56     FALSE 0.334 43.000 0.000 NA   NA
 5867003 5867004 ECIAI1_tRNA56 ECIAI1_16S_1     FALSE 0.227 69.000 0.000 NA   NA
 5867006 5867007 ECIAI1_3430 ECIAI1_3431 yrdB aroE TRUE 0.852 -3.000 0.043 NA   NA
 5867007 5867008 ECIAI1_3431 ECIAI1_3432 aroE yrdC TRUE 0.892 5.000 0.087 NA N NA
 5867008 5867009 ECIAI1_3432 ECIAI1_3433 yrdC yrdD TRUE 0.928 5.000 0.137 NA N NA
 5867009 5867010 ECIAI1_3433 ECIAI1_3434 yrdD smg TRUE 0.863 29.000 0.331 NA   NA
 5867010 5867011 ECIAI1_3434 ECIAI1_3435 smg smf TRUE 0.704 -28.000 0.124 NA   NA
 5867012 5867013 ECIAI1_3436 ECIAI1_3437 def fmt TRUE 0.985 15.000 0.058 0.014 Y NA
 5867013 5867014 ECIAI1_3437 ECIAI1_3438 fmt rsmB TRUE 0.936 46.000 0.305 1.000 Y NA
 5867014 5867015 ECIAI1_3438 ECIAI1_3439 rsmB trkA TRUE 0.794 22.000 0.122 1.000 N NA
 5867015 5867016 ECIAI1_3439 ECIAI1_3440 trkA mscL FALSE 0.090 130.000 0.035 1.000 N NA
 5867017 5867018 ECIAI1_3441 ECIAI1_3442 yhdL zntR TRUE 0.595 56.000 0.219 NA   NA
 5867018 5867019 ECIAI1_3442 ECIAI1_3443 zntR yhdN TRUE 0.903 11.000 0.095 NA   NA
 5867019 5867020 ECIAI1_3443 ECIAI1_3444 yhdN rplQ FALSE 0.108 107.000 0.012 NA   NA
 5867020 5867021 ECIAI1_3444 ECIAI1_3445 rplQ rpoA TRUE 0.932 41.000 0.873 1.000 N NA
 5867021 5867022 ECIAI1_3445 ECIAI1_3446 rpoA rpsD TRUE 0.937 26.000 0.549 1.000 N NA
 5867022 5867023 ECIAI1_3446 ECIAI1_3447 rpsD rpsK TRUE 0.985 34.000 0.509 0.012 Y NA
 5867023 5867024 ECIAI1_3447 ECIAI1_3448 rpsK rpsM TRUE 0.998 17.000 0.810 0.009 Y NA
 5867024 5867025 ECIAI1_3448 ECIAI1_misc_RNA_73 rpsM   TRUE 0.876 1.000 0.000 NA   NA
 5867025 5867026 ECIAI1_misc_RNA_73 ECIAI1_3449   secY FALSE 0.020 216.000 0.000 NA   NA
 5867026 5867027 ECIAI1_3449 ECIAI1_3450 secY rplO TRUE 0.991 8.000 0.730 1.000 N NA
 5867027 5867028 ECIAI1_3450 ECIAI1_3451 rplO rpmD TRUE 0.999 4.000 0.653 0.002 Y NA
 5867028 5867029 ECIAI1_3451 ECIAI1_3452 rpmD rpsE TRUE 0.999 4.000 0.789 0.012 Y NA
 5867029 5867030 ECIAI1_3452 ECIAI1_3453 rpsE rplR TRUE 0.998 15.000 0.814 0.012 Y NA
 5867030 5867031 ECIAI1_3453 ECIAI1_3454 rplR rplF TRUE 0.999 10.000 0.815 0.009 Y NA
 5867031 5867032 ECIAI1_3454 ECIAI1_3455 rplF rpsH TRUE 0.999 13.000 0.808 0.009 Y NA
 5867032 5867033 ECIAI1_3455 ECIAI1_3456 rpsH rpsN TRUE 0.984 34.000 0.473 0.009 Y NA
 5867033 5867034 ECIAI1_3456 ECIAI1_3457 rpsN rplE TRUE 0.997 15.000 0.496 0.009 Y NA
 5867034 5867035 ECIAI1_3457 ECIAI1_3458 rplE rplX TRUE 0.998 15.000 0.758 0.009 Y NA
 5867035 5867036 ECIAI1_3458 ECIAI1_3459 rplX rplN TRUE 0.999 11.000 0.810 0.012 Y NA
 5867036 5867037 ECIAI1_3459 ECIAI1_3460 rplN rpsQ TRUE 0.894 165.000 0.791 0.012 Y NA
 5867037 5867038 ECIAI1_3460 ECIAI1_3461 rpsQ rpmC TRUE 0.999 0.000 0.828 0.009 Y NA
 5867038 5867039 ECIAI1_3461 ECIAI1_3462 rpmC rplP TRUE 0.999 0.000 0.802 0.009 Y NA
 5867039 5867040 ECIAI1_3462 ECIAI1_3463 rplP rpsC TRUE 0.999 13.000 0.828 0.012 Y NA
 5867040 5867041 ECIAI1_3463 ECIAI1_3464 rpsC rplV TRUE 0.997 18.000 0.719 0.012 Y NA
 5867041 5867042 ECIAI1_3464 ECIAI1_3465 rplV rpsS TRUE 0.998 15.000 0.769 0.012 Y NA
 5867042 5867043 ECIAI1_3465 ECIAI1_3466 rpsS rplB TRUE 0.998 17.000 0.820 0.012 Y NA
 5867043 5867044 ECIAI1_3466 ECIAI1_3467 rplB rplW TRUE 0.998 18.000 0.849 0.012 Y NA
 5867044 5867045 ECIAI1_3467 ECIAI1_3468 rplW rplD TRUE 0.998 -3.000 0.513 0.009 Y NA
 5867045 5867046 ECIAI1_3468 ECIAI1_3469 rplD rplC TRUE 0.998 11.000 0.486 0.009 Y NA
 5867046 5867047 ECIAI1_3469 ECIAI1_3470 rplC rpsJ TRUE 0.976 33.000 0.307 0.012 Y NA
 5867047 5867048 ECIAI1_3470 ECIAI1_3471 rpsJ   FALSE 0.104 129.000 0.000 NA   NA
 5867050 5867051 ECIAI1_3473 ECIAI1_3474 bfr bfd TRUE 0.715 73.000 0.033 NA Y NA
 5867051 5867052 ECIAI1_3474 ECIAI1_3475 bfd tufA FALSE 0.013 183.000 0.007 NA N NA
 5867052 5867053 ECIAI1_3475 ECIAI1_3476 tufA fusA TRUE 0.962 71.000 0.400 0.001 Y NA
 5867053 5867054 ECIAI1_3476 ECIAI1_3477 fusA rpsG TRUE 0.933 97.000 0.579 1.000 Y NA
 5867054 5867055 ECIAI1_3477 ECIAI1_3478 rpsG rpsL TRUE 0.967 97.000 0.620 0.002 Y NA
 5867055 5867056 ECIAI1_3478 ECIAI1_3479 rpsL tusB FALSE 0.107 126.000 0.058 NA N NA
 5867056 5867057 ECIAI1_3479 ECIAI1_3480 tusB tusC TRUE 0.998 8.000 0.804 NA Y NA
 5867057 5867058 ECIAI1_3480 ECIAI1_3481 tusC tusD TRUE 0.998 0.000 0.790 NA Y NA
 5867058 5867059 ECIAI1_3481 ECIAI1_3482 tusD yheO TRUE 0.969 0.000 0.220 NA   NA
 5867059 5867060 ECIAI1_3482 ECIAI1_3483 yheO fkpA FALSE 0.244 167.000 0.310 NA   NA
 5867062 5867063 ECIAI1_3485 ECIAI1_3486 slyD yheV TRUE 0.640 95.000 0.370 NA   NA
 5867063 5867064 ECIAI1_3486 ECIAI1_3487 yheV kefB TRUE 0.979 10.000 0.400 NA   NA
 5867064 5867065 ECIAI1_3487 ECIAI1_3488 kefB kefG TRUE 0.996 0.000 0.927 1.000   NA
 5867066 5867067 ECIAI1_3490 ECIAI1_3491 yheS yheT TRUE 0.836 0.000 0.016 NA   NA
 5867067 5867068 ECIAI1_3491 ECIAI1_3492 yheT yheU TRUE 0.933 -6.000 0.222 NA   NA
 5867068 5867069 ECIAI1_3492 ECIAI1_3493 yheU prkB TRUE 0.693 54.000 0.303 NA   NA
 5867070 5867071 ECIAI1_3494 ECIAI1_misc_RNA_74 yhfA crpTic TRUE 0.755 15.000 0.000 NA   NA
 5867072 5867073 ECIAI1_3495 ECIAI1_3496   crp TRUE 0.798 7.000 0.016 NA   NA
 5867073 5867074 ECIAI1_3496 ECIAI1_3497 crp yhfK TRUE 0.561 39.000 0.111 NA   NA
 5867075 5867076 ECIAI1_3498 ECIAI1_3499 argD pabA TRUE 0.771 86.000 0.088 1.000 Y NA
 5867076 5867077 ECIAI1_3499 ECIAI1_3500 pabA fic FALSE 0.312 32.000 0.008 1.000 N NA
 5867077 5867078 ECIAI1_3500 ECIAI1_3501 fic yhfG TRUE 0.662 -10.000 0.000 NA   NA
 5867078 5867079 ECIAI1_3501 ECIAI1_3502 yhfG ppiA TRUE 0.604 105.000 0.364 NA   NA
 5867080 5867081 ECIAI1_3503 ECIAI1_3504 tsgA nirB FALSE 0.007 262.000 0.000 NA N NA
 5867081 5867082 ECIAI1_3504 ECIAI1_3505 nirB nirD TRUE 0.997 -3.000 0.829 0.000 N NA
 5867082 5867083 ECIAI1_3505 ECIAI1_3506 nirD nirC TRUE 0.787 127.000 0.283 1.000 Y NA
 5867083 5867084 ECIAI1_3506 ECIAI1_3507 nirC cysG TRUE 0.671 19.000 0.000 1.000 N NA
 5867084 5867085 ECIAI1_3507 ECIAI1_3508 cysG yhfL FALSE 0.013 247.000 0.000 NA   NA
 5867085 5867086 ECIAI1_3508 ECIAI1_3509 yhfL frlA FALSE 0.008 295.000 0.000 NA   NA
 5867086 5867087 ECIAI1_3509 ECIAI1_3510 frlA frlB TRUE 0.938 21.000 0.375 1.000 N NA
 5867087 5867088 ECIAI1_3510 ECIAI1_3511 frlB frlC TRUE 0.846 50.000 0.600 NA N NA
 5867088 5867089 ECIAI1_3511 ECIAI1_3512 frlC frlD TRUE 0.991 -3.000 0.200 NA Y NA
 5867089 5867090 ECIAI1_3512 ECIAI1_3513 frlD frlR TRUE 0.483 100.000 0.267 NA N NA
 5867091 5867092 ECIAI1_3514 ECIAI1_3515 yhfS yhfT TRUE 0.940 12.000 0.185 NA   NA
 5867092 5867093 ECIAI1_3515 ECIAI1_3516 yhfT yhfU TRUE 0.991 12.000 0.828 NA   NA
 5867093 5867094 ECIAI1_3516 ECIAI1_3517 yhfU php TRUE 0.973 11.000 0.312 1.000   NA
 5867094 5867095 ECIAI1_3517 ECIAI1_3518 php yhfW TRUE 0.928 -3.000 0.094 1.000   NA
 5867095 5867096 ECIAI1_3518 ECIAI1_3519 yhfW yhfX TRUE 0.991 0.000 0.625 NA N NA
 5867096 5867097 ECIAI1_3519 ECIAI1_3520 yhfX yhfY TRUE 0.538 84.000 0.233 NA   NA
 5867097 5867098 ECIAI1_3520 ECIAI1_3521 yhfY yhfZ TRUE 0.972 17.000 0.562 NA   NA
 5867098 5867099 ECIAI1_3521 ECIAI1_3522 yhfZ trpS FALSE 0.006 269.000 0.004 NA   NA
 5867099 5867100 ECIAI1_3522 ECIAI1_3523 trpS gph TRUE 0.879 -7.000 0.118 1.000   NA
 5867100 5867101 ECIAI1_3523 ECIAI1_3524 gph rpe TRUE 0.880 -7.000 0.120 1.000   NA
 5867101 5867102 ECIAI1_3524 ECIAI1_3525 rpe dam TRUE 0.686 18.000 0.040 1.000 N NA
 5867102 5867103 ECIAI1_3525 ECIAI1_3526 dam damX FALSE 0.460 107.000 0.234 NA   NA
 5867103 5867104 ECIAI1_3526 ECIAI1_3527 damX aroB FALSE 0.149 92.000 0.022 NA   NA
 5867104 5867105 ECIAI1_3527 ECIAI1_3528 aroB aroK TRUE 0.885 57.000 0.208 1.000 Y NA
 5867105 5867106 ECIAI1_3528 ECIAI1_3529 aroK hofQ FALSE 0.025 401.000 0.319 1.000 N NA
 5867106 5867107 ECIAI1_3529 ECIAI1_3530 hofQ yrfA TRUE 0.485 -88.000 0.072 NA   NA
 5867107 5867108 ECIAI1_3530 ECIAI1_3531 yrfA yrfB TRUE 0.952 -10.000 0.444 NA   NA
 5867108 5867109 ECIAI1_3531 ECIAI1_3532 yrfB yrfC TRUE 0.918 -16.000 0.348 NA   NA
 5867109 5867110 ECIAI1_3532 ECIAI1_3533 yrfC yrfD TRUE 0.995 0.000 0.870 NA   NA
 5867113 5867114 ECIAI1_3537 ECIAI1_3538 igaA yrfG FALSE 0.467 65.000 0.122 1.000   NA
 5867114 5867115 ECIAI1_3538 ECIAI1_3539 yrfG hslR TRUE 0.885 11.000 0.056 1.000   NA
 5867115 5867116 ECIAI1_3539 ECIAI1_3540 hslR hslO TRUE 0.766 25.000 0.140 1.000 N NA
 5867117 5867118 ECIAI1_3541 ECIAI1_3542 yhgE   TRUE 0.854 6.000 0.000 NA   NA
 5867118 5867119 ECIAI1_3542 ECIAI1_3543     FALSE 0.403 -76.000 0.000 NA   NA
 5867120 5867121 ECIAI1_3544 ECIAI1_3545 pck   FALSE 0.132 117.000 0.000 NA   NA
 5867121 5867122 ECIAI1_3545 ECIAI1_3546     TRUE 0.621 59.000 0.250 NA   NA
 5867123 5867124 ECIAI1_3547 ECIAI1_3548 envZ ompR TRUE 0.997 -3.000 0.584 1.000 Y NA
 5867125 5867126 ECIAI1_3549 ECIAI1_3550 greB yhgF TRUE 0.772 97.000 0.123 1.000 Y NA
 5867126 5867127 ECIAI1_3550 ECIAI1_3551 yhgF feoA FALSE 0.003 457.000 0.000 1.000 N NA
 5867127 5867128 ECIAI1_3551 ECIAI1_3552 feoA feoB TRUE 0.981 17.000 0.177 1.000 Y NA
 5867128 5867129 ECIAI1_3552 ECIAI1_3553 feoB yhgG TRUE 0.987 0.000 0.455 NA   NA
 5867129 5867130 ECIAI1_3553 ECIAI1_3554 yhgG yhgA FALSE 0.025 203.000 0.000 NA   NA
 5867132 5867133 ECIAI1_3557 ECIAI1_3558 gntX gntY FALSE 0.365 59.000 0.066 1.000   NA
 5867133 5867134 ECIAI1_3558 ECIAI1_3559 gntY gntT FALSE 0.006 361.000 0.000 1.000   NA
 5867135 5867136 ECIAI1_3560 ECIAI1_3561 malQ malP TRUE 0.993 10.000 0.137 0.015 Y NA
 5867138 5867139 ECIAI1_3563 ECIAI1_3564 rtcA rtcB TRUE 0.913 4.000 0.081 NA   NA
 5867141 5867142 ECIAI1_3566 ECIAI1_3567 glpR glpG TRUE 0.914 17.000 0.190 1.000   NA
 5867142 5867143 ECIAI1_3567 ECIAI1_3568 glpG glpE TRUE 0.830 45.000 0.405 1.000   NA
 5867145 5867146 ECIAI1_3570 ECIAI1_3571     TRUE 0.872 3.000 0.000 NA   NA
 5867146 5867147 ECIAI1_3571 ECIAI1_3572     TRUE 0.872 3.000 0.000 NA   NA
 5867147 5867148 ECIAI1_3572 ECIAI1_3573     TRUE 0.989 15.000 1.000 NA   NA
 5867148 5867149 ECIAI1_3573 ECIAI1_3574   glgP FALSE 0.059 116.000 0.016 NA N NA
 5867149 5867150 ECIAI1_3574 ECIAI1_3575 glgP glgA TRUE 0.981 19.000 0.228 1.000 Y NA
 5867150 5867151 ECIAI1_3575 ECIAI1_3576 glgA glgC TRUE 0.996 0.000 0.307 1.000 Y NA
 5867151 5867152 ECIAI1_3576 ECIAI1_3577 glgC glgX TRUE 0.983 18.000 0.228 1.000 Y NA
 5867152 5867153 ECIAI1_3577 ECIAI1_3578 glgX glgB TRUE 0.991 -3.000 0.020 0.002 Y NA
 5867153 5867154 ECIAI1_3578 ECIAI1_3579 glgB asd FALSE 0.009 273.000 0.000 1.000 N NA
 5867156 5867157 ECIAI1_3581 ECIAI1_3582 gntU gntK TRUE 0.985 4.000 0.000 1.000 Y NA
 5867157 5867158 ECIAI1_3582 ECIAI1_3583 gntK gntR FALSE 0.080 139.000 0.000 1.000 N NA
 5867158 5867159 ECIAI1_3583 ECIAI1_3584 gntR yhhW FALSE 0.018 224.000 0.000 NA   NA
 5867159 5867160 ECIAI1_3584 ECIAI1_3585 yhhW yhhX TRUE 0.548 123.000 0.400 NA   NA
 5867160 5867161 ECIAI1_3585 ECIAI1_misc_RNA_75 yhhX ryhB FALSE 0.122 121.000 0.000 NA   NA
 5867162 5867163 ECIAI1_3586 ECIAI1_3587 yhhY yhhZ FALSE 0.015 237.000 0.000 NA   NA
 5867163 5867164 ECIAI1_3587 ECIAI1_3588 yhhZ yrhA TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 5867164 5867165 ECIAI1_3588 ECIAI1_3589 yrhA yrhD FALSE 0.197 86.000 0.000 NA   NA
 5867165 5867166 ECIAI1_3589 ECIAI1_3590 yrhD yrhB FALSE 0.026 200.000 0.000 NA   NA
 5867169 5867170 ECIAI1_3593 ECIAI1_3594 ugpQ ugpC TRUE 0.899 -3.000 0.080 1.000 N NA
 5867170 5867171 ECIAI1_3594 ECIAI1_3595 ugpC ugpE TRUE 0.997 2.000 0.272 0.043 Y NA
 5867171 5867172 ECIAI1_3595 ECIAI1_3596 ugpE ugpA TRUE 0.997 -3.000 0.306 0.043 Y NA
 5867172 5867173 ECIAI1_3596 ECIAI1_3597 ugpA ugpB TRUE 0.970 98.000 0.793 0.043 Y NA
 5867173 5867174 ECIAI1_3597 ECIAI1_3598 ugpB livF FALSE 0.004 396.000 0.000 1.000 N NA
 5867174 5867175 ECIAI1_3598 ECIAI1_3599 livF livG TRUE 0.999 2.000 0.967 0.013 Y NA
 5867175 5867176 ECIAI1_3599 ECIAI1_3600 livG livM TRUE 0.997 -3.000 0.574 1.000 Y NA
 5867176 5867177 ECIAI1_3600 ECIAI1_3601 livM livH TRUE 0.998 -3.000 0.574 0.043 Y NA
 5867177 5867178 ECIAI1_3601 ECIAI1_3602 livH livK TRUE 0.910 48.000 0.217 1.000 Y NA
 5867180 5867181 ECIAI1_3604 ECIAI1_3605     TRUE 0.987 7.000 0.500 1.000   NA
 5867181 5867182 ECIAI1_3605 ECIAI1_3606   livJ FALSE 0.276 150.000 0.250 1.000   NA
 5867182 5867183 ECIAI1_3606 ECIAI1_3607 livJ rpoH FALSE 0.009 271.000 0.000 1.000 N NA
 5867183 5867184 ECIAI1_3607 ECIAI1_3609 rpoH ftsX FALSE 0.015 245.000 0.051 1.000 N NA
 5867184 5867185 ECIAI1_3609 ECIAI1_3610 ftsX ftsE TRUE 0.977 -7.000 0.121 1.000 Y NA
 5867185 5867186 ECIAI1_3610 ECIAI1_3611 ftsE ftsY TRUE 0.967 3.000 0.117 0.067 N NA
 5867187 5867188 ECIAI1_3612 ECIAI1_3613 yhhF   FALSE 0.418 -133.000 0.063 NA   NA
 5867190 5867191 ECIAI1_3615 ECIAI1_3616 yhhN zntA TRUE 0.777 74.000 0.325 0.063   NA
 5867193 5867194 ECIAI1_3618 ECIAI1_3619 yhhQ dcrB FALSE 0.279 73.000 0.066 NA   NA
 5867196 5867197 ECIAI1_3621 ECIAI1_3622 yhhT acpT TRUE 0.686 55.000 0.300 NA   NA
 5867197 5867198 ECIAI1_3622 ECIAI1_3623 acpT nikA FALSE 0.140 111.000 0.000 1.000 N NA
 5867198 5867199 ECIAI1_3623 ECIAI1_3624 nikA nikB TRUE 0.999 0.000 0.833 0.052 Y NA
 5867199 5867200 ECIAI1_3624 ECIAI1_3625 nikB nikC TRUE 0.999 -3.000 0.629 0.001 Y NA
 5867200 5867201 ECIAI1_3625 ECIAI1_3626 nikC nikD TRUE 0.997 0.000 0.409 1.000 Y NA
 5867201 5867202 ECIAI1_3626 ECIAI1_3627 nikD nikE TRUE 0.996 -3.000 0.290 0.067 Y NA
 5867202 5867203 ECIAI1_3627 ECIAI1_3628 nikE nikR TRUE 0.830 6.000 0.031 1.000 N NA
 5867204 5867205 ECIAI1_3629 ECIAI1_3630   yhhJ FALSE 0.008 331.000 0.000 1.000   NA
 5867205 5867206 ECIAI1_3630 ECIAI1_3631 yhhJ rbbA TRUE 0.995 0.000 0.500 0.004   NA
 5867206 5867207 ECIAI1_3631 ECIAI1_3632 rbbA yhiI TRUE 0.947 -3.000 0.049 0.080   NA
 5867207 5867208 ECIAI1_3632 ECIAI1_3633 yhiI yhiJ FALSE 0.005 366.000 0.000 NA   NA
 5867208 5867209 ECIAI1_3633 ECIAI1_3634 yhiJ   FALSE 0.011 262.000 0.000 NA   NA
 5867214 5867215 ECIAI1_3640 ECIAI1_3641 uspA yhiP FALSE 0.006 318.000 0.000 1.000 N NA
 5867216 5867217 ECIAI1_3642 ECIAI1_3643 yhiQ prlC TRUE 0.916 8.000 0.098 NA   NA
 5867218 5867219 ECIAI1_3644 ECIAI1_3645 yhiR gor FALSE 0.408 72.000 0.100 1.000   NA
 5867219 5867220 ECIAI1_3645 ECIAI1_3646 gor   FALSE 0.053 159.000 0.000 NA   NA
 5867220 5867221 ECIAI1_3646 ECIAI1_3648   arsR FALSE 0.003 539.000 0.000 NA   NA
 5867221 5867222 ECIAI1_3648 ECIAI1_3649 arsR arsB FALSE 0.257 54.000 0.000 1.000 N NA
 5867222 5867223 ECIAI1_3649 ECIAI1_3650 arsB arsC TRUE 0.976 13.000 0.000 1.000 Y NA
 5867225 5867226 ECIAI1_3652 ECIAI1_3653     FALSE 0.003 580.000 0.000 NA   NA
 5867226 5867227 ECIAI1_3653 ECIAI1_3654   slp FALSE 0.013 247.000 0.000 NA   NA
 5867227 5867228 ECIAI1_3654 ECIAI1_3655 slp yhiF FALSE 0.053 156.000 0.000 1.000 N NA
 5867229 5867230 ECIAI1_3656 ECIAI1_3657 yhiD hdeB FALSE 0.237 64.000 0.000 NA   NA
 5867230 5867231 ECIAI1_3657 ECIAI1_3658 hdeB hdeA FALSE 0.134 116.000 0.000 NA   NA
 5867232 5867233 ECIAI1_3659 ECIAI1_3660 hdeD gadE FALSE 0.002 799.000 0.000 NA   NA
 5867233 5867234 ECIAI1_3660 ECIAI1_3662 gadE mdtE FALSE 0.007 339.000 0.000 1.000   NA
 5867234 5867235 ECIAI1_3662 ECIAI1_3663 mdtE mdtF TRUE 0.547 25.000 0.000 1.000 N NA
 5867238 5867239 ECIAI1_3666 ECIAI1_3667 gadX gadA FALSE 0.004 370.000 0.000 1.000 N NA
 5867239 5867240 ECIAI1_3667 ECIAI1_3668 gadA yhjA FALSE 0.020 211.000 0.000 1.000 N NA
 5867243 5867244 ECIAI1_3671 ECIAI1_3672 yhjC yhjD TRUE 0.499 49.000 0.098 1.000   NA
 5867244 5867245 ECIAI1_3672 ECIAI1_3673 yhjD yhjE FALSE 0.005 411.000 0.000 1.000   NA
 5867246 5867247 ECIAI1_3674 ECIAI1_3675 yhjG yhjH FALSE 0.191 55.000 0.000 NA N NA
 5867248 5867249 ECIAI1_3676 ECIAI1_3677   kdgK FALSE 0.199 84.000 0.000 NA   NA
 5867250 5867251 ECIAI1_3678 ECIAI1_3679 yhjJ dctA FALSE 0.039 221.000 0.088 1.000   NA
 5867251 5867252 ECIAI1_3679 ECIAI1_3680 dctA yhjK FALSE 0.222 183.000 0.229 0.079 N NA
 5867252 5867253 ECIAI1_3680 ECIAI1_3681 yhjK bcsC FALSE 0.194 121.000 0.088 1.000 N NA
 5867253 5867254 ECIAI1_3681 ECIAI1_3682 bcsC bcsZ TRUE 0.877 -18.000 0.263 1.000 N NA
 5867254 5867255 ECIAI1_3682 ECIAI1_3683 bcsZ bcsB TRUE 0.882 7.000 0.000 1.000   NA
 5867255 5867256 ECIAI1_3683 ECIAI1_3684 bcsB bcsA TRUE 0.959 11.000 0.000 0.001   NA
 5867256 5867257 ECIAI1_3684 ECIAI1_3685 bcsA   TRUE 0.985 -3.000 0.545 NA N NA
 5867257 5867258 ECIAI1_3685 ECIAI1_3686   yhjR TRUE 0.979 12.000 0.464 NA   NA
 5867259 5867260 ECIAI1_3687 ECIAI1_3688 bcsE bcsF TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 5867260 5867261 ECIAI1_3688 ECIAI1_3689 bcsF bcsG TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 5867264 5867265 ECIAI1_3692 ECIAI1_3693 ldrD ldrD FALSE 0.023 208.000 0.000 NA   NA
 5867265 5867266 ECIAI1_3693 ECIAI1_3695 ldrD ldrD FALSE 0.014 241.000 0.000 NA   NA
 5867270 5867271 ECIAI1_3698 ECIAI1_3699 dppF dppD TRUE 0.998 -3.000 0.500 0.002 Y NA
 5867271 5867272 ECIAI1_3699 ECIAI1_3700 dppD dppC TRUE 0.997 11.000 0.560 1.000 Y NA
 5867272 5867273 ECIAI1_3700 ECIAI1_3701 dppC dppB TRUE 0.999 10.000 0.779 0.042 Y NA
 5867277 5867278 ECIAI1_tRNA55 ECIAI1_3705   eptB FALSE 0.187 92.000 0.000 NA   NA
 5867278 5867279 ECIAI1_3705 ECIAI1_3706 eptB lpfE FALSE 0.016 253.000 0.000 1.000   NA
 5867279 5867280 ECIAI1_3706 ECIAI1_3708 lpfE lpfD TRUE 0.999 6.000 0.667 0.009 Y NA
 5867280 5867281 ECIAI1_3708 ECIAI1_3709 lpfD lpfC TRUE 0.981 11.000 0.000 1.000 Y NA
 5867281 5867282 ECIAI1_3709 ECIAI1_3710 lpfC lpfB TRUE 0.994 24.000 1.000 1.000 Y NA
 5867282 5867283 ECIAI1_3710 ECIAI1_3711 lpfB lpfA TRUE 0.945 84.000 0.600 1.000 Y NA
 5867283 5867284 ECIAI1_3711 ECIAI1_3712 lpfA yhjX FALSE 0.006 325.000 0.000 1.000 N NA
 5867284 5867285 ECIAI1_3712 ECIAI1_3713 yhjX yhjY FALSE 0.034 184.000 0.000 1.000 N NA
 5867286 5867287 ECIAI1_3714 ECIAI1_3715 tag yiaC TRUE 0.865 -3.000 0.028 1.000   NA
 5867289 5867290 ECIAI1_3717 ECIAI1_3718 yiaD tiaE FALSE 0.156 104.000 0.000 1.000 N NA
 5867295 5867296 ECIAI1_3723 ECIAI1_3724 glyS glyQ TRUE 0.999 10.000 0.651 0.000 Y NA
 5867296 5867297 ECIAI1_3724 ECIAI1_3725 glyQ ysaB FALSE 0.123 95.000 0.010 NA   NA
 5867299 5867300 ECIAI1_3727 ECIAI1_3728 yiaA yiaB FALSE 0.289 46.000 0.032 NA   NA
 5867300 5867301 ECIAI1_3728 ECIAI1_3729 yiaB xylB FALSE 0.114 169.000 0.143 NA   NA
 5867301 5867302 ECIAI1_3729 ECIAI1_3730 xylB xylA TRUE 0.741 72.000 0.034 1.000 Y NA
 5867303 5867304 ECIAI1_3731 ECIAI1_3732 xylF xylG TRUE 0.930 78.000 0.518 NA Y NA
 5867304 5867305 ECIAI1_3732 ECIAI1_3733 xylG xylH TRUE 0.984 -22.000 0.469 1.000 Y NA
 5867305 5867306 ECIAI1_3733 ECIAI1_3734 xylH   FALSE 0.384 -88.000 0.000 NA   NA
 5867306 5867307 ECIAI1_3734 ECIAI1_3735   xylR TRUE 0.662 -10.000 0.000 NA   NA
 5867309 5867310 ECIAI1_3738 ECIAI1_3739 malS avtA FALSE 0.065 178.000 0.085 1.000 N NA
 5867311 5867312 ECIAI1_3740 ECIAI1_3741 yiaI yiaJ TRUE 0.634 102.000 0.400 1.000 N NA
 5867313 5867314 ECIAI1_3742 ECIAI1_3743 yiaK yiaL TRUE 0.747 12.000 0.000 NA N NA
 5867314 5867315 ECIAI1_3743 ECIAI1_3744 yiaL yiaM TRUE 0.581 118.000 0.000 NA Y NA
 5867315 5867316 ECIAI1_3744 ECIAI1_3745 yiaM yiaN TRUE 0.999 3.000 0.864 NA Y NA
 5867316 5867317 ECIAI1_3745 ECIAI1_3746 yiaN yiaO TRUE 0.976 13.000 0.000 1.000 Y NA
 5867317 5867318 ECIAI1_3746 ECIAI1_3747 yiaO lyxK TRUE 0.985 4.000 0.000 1.000 Y NA
 5867318 5867319 ECIAI1_3747 ECIAI1_3748 lyxK sgbH TRUE 0.998 -3.000 0.900 1.000 Y NA
 5867319 5867320 ECIAI1_3748 ECIAI1_3749 sgbH sgbU TRUE 0.990 -7.000 0.360 1.000 Y NA
 5867320 5867321 ECIAI1_3749 ECIAI1_3750 sgbU sgbE TRUE 0.986 -6.000 0.200 1.000 Y NA
 5867324 5867325 ECIAI1_3753 ECIAI1_3754 yiaV yiaW TRUE 0.854 6.000 0.000 NA   NA
 5867327 5867328 ECIAI1_3756 ECIAI1_3757 aldB yiaY FALSE 0.471 165.000 0.032 0.043 Y NA
 5867328 5867329 ECIAI1_3757 ECIAI1_3758 yiaY selB FALSE 0.021 190.000 0.015 1.000 N NA
 5867329 5867330 ECIAI1_3758 ECIAI1_3759 selB selA TRUE 0.994 -3.000 0.569 0.000 N NA
 5867330 5867331 ECIAI1_3759 ECIAI1_3760 selA yibF FALSE 0.164 98.000 0.040 1.000 N NA
 5867332 5867333 ECIAI1_3761 ECIAI1_3762   rhsC FALSE 0.196 87.000 0.000 NA   NA
 5867333 5867334 ECIAI1_3762 ECIAI1_3763 rhsC   TRUE 0.872 3.000 0.000 NA   NA
 5867334 5867335 ECIAI1_3763 ECIAI1_3764   yibG TRUE 0.814 12.000 0.000 NA   NA
 5867335 5867336 ECIAI1_3764 ECIAI1_3765 yibG   FALSE 0.037 182.000 0.000 NA   NA
 5867336 5867337 ECIAI1_3765 ECIAI1_3766     FALSE 0.005 367.000 0.000 NA   NA
 5867338 5867339 ECIAI1_3767 ECIAI1_3768 yibH yibI TRUE 0.989 3.000 0.556 NA   NA
 5867340 5867341 ECIAI1_3769 ECIAI1_3770 mtlA mtlD FALSE 0.340 230.000 0.292 1.000 Y NA
 5867341 5867342 ECIAI1_3770 ECIAI1_3771 mtlD mtlR TRUE 0.966 0.000 0.230 NA N NA
 5867344 5867345 ECIAI1_3773 ECIAI1_3774 yibL   FALSE 0.003 543.000 0.000 NA   NA
 5867345 5867346 ECIAI1_3774 ECIAI1_3775     TRUE 0.740 44.000 0.286 NA   NA
 5867346 5867347 ECIAI1_3775 ECIAI1_3776   lldP FALSE 0.004 369.000 0.000 1.000 N NA
 5867347 5867348 ECIAI1_3776 ECIAI1_3777 lldP lldR TRUE 0.992 0.000 0.652 1.000 N NA
 5867348 5867349 ECIAI1_3777 ECIAI1_3778 lldR lldD TRUE 0.973 -3.000 0.309 1.000 N NA
 5867349 5867350 ECIAI1_3778 ECIAI1_3779 lldD yibK FALSE 0.023 186.000 0.020 1.000 N NA
 5867351 5867352 ECIAI1_3780 ECIAI1_3781 cysE gpsA TRUE 0.711 80.000 0.429 1.000 N NA
 5867352 5867353 ECIAI1_3781 ECIAI1_3782 gpsA secB TRUE 0.966 0.000 0.206 1.000 N NA
 5867353 5867354 ECIAI1_3782 ECIAI1_3783 secB grxC FALSE 0.226 63.000 0.038 1.000 N NA
 5867354 5867355 ECIAI1_3783 ECIAI1_3784 grxC yibN FALSE 0.060 142.000 0.048 NA N NA
 5867356 5867357 ECIAI1_3785 ECIAI1_3786 gpmI envC TRUE 0.695 34.000 0.170 1.000 N NA
 5867357 5867358 ECIAI1_3786 ECIAI1_3787 envC yibQ TRUE 0.934 4.000 0.088 1.000   NA
 5867359 5867360 ECIAI1_3788 ECIAI1_3789 yibD tdh FALSE 0.010 239.000 0.000 NA N NA
 5867360 5867361 ECIAI1_3789 ECIAI1_3790 tdh kbl TRUE 0.985 10.000 0.547 1.000 N NA
 5867362 5867363 ECIAI1_3791 ECIAI1_3792 waaD waaF TRUE 0.989 10.000 0.146 1.000 Y NA
 5867363 5867364 ECIAI1_3792 ECIAI1_3793 waaF waaC TRUE 0.997 4.000 0.205 0.001 Y NA
 5867365 5867366 ECIAI1_3794 ECIAI1_3795 waaL waaV TRUE 0.541 46.000 0.133 NA   NA
 5867366 5867367 ECIAI1_3795 ECIAI1_3796 waaV waaW TRUE 0.699 85.000 0.000 NA Y NA
 5867367 5867368 ECIAI1_3796 ECIAI1_3797 waaW waaY TRUE 0.597 26.000 0.000 1.000   NA
 5867368 5867369 ECIAI1_3797 ECIAI1_3798 waaY waaT TRUE 0.980 10.000 0.375 1.000   NA
 5867369 5867370 ECIAI1_3798 ECIAI1_3799 waaT waaO TRUE 0.998 17.000 0.833 0.001 Y NA
 5867370 5867371 ECIAI1_3799 ECIAI1_3800 waaO waaP TRUE 0.782 16.000 0.000 1.000   NA
 5867371 5867372 ECIAI1_3800 ECIAI1_3801 waaP waaG TRUE 0.659 -16.000 0.000 1.000   NA
 5867372 5867373 ECIAI1_3801 ECIAI1_3802 waaG waaQ TRUE 0.986 -3.000 0.079 1.000 Y NA
 5867374 5867375 ECIAI1_3803 ECIAI1_3804 kdtA coaD TRUE 0.796 8.000 0.020 1.000 N NA
 5867376 5867377 ECIAI1_3805 ECIAI1_3806 mutM rpmG FALSE 0.153 98.000 0.034 1.000 N NA
 5867377 5867378 ECIAI1_3806 ECIAI1_3807 rpmG rpmB TRUE 0.991 21.000 0.332 0.009 Y NA
 5867381 5867382 ECIAI1_3810 ECIAI1_3811 dfp dut TRUE 0.831 -19.000 0.201 1.000 N NA
 5867382 5867383 ECIAI1_3811 ECIAI1_3812 dut ttk FALSE 0.188 107.000 0.060 1.000 N NA
 5867384 5867385 ECIAI1_3813 ECIAI1_3814 pyrE rph FALSE 0.181 65.000 0.022 1.000 N NA
 5867386 5867387 ECIAI1_3815 ECIAI1_3816 yicC dinD FALSE 0.022 209.000 0.000 NA   NA
 5867387 5867388 ECIAI1_3816 ECIAI1_3817 dinD yicG FALSE 0.008 291.000 0.000 NA   NA
 5867390 5867391 ECIAI1_3820 ECIAI1_3821 gmk rpoZ TRUE 0.790 55.000 0.471 1.000 N NA
 5867391 5867392 ECIAI1_3821 ECIAI1_3822 rpoZ spoT TRUE 0.985 19.000 0.291 1.000 Y NA
 5867392 5867393 ECIAI1_3822 ECIAI1_3823 spoT trmH TRUE 0.915 7.000 0.095 1.000 N NA
 5867393 5867394 ECIAI1_3823 ECIAI1_3824 trmH recG TRUE 0.899 6.000 0.076 1.000 N NA
 5867395 5867396 ECIAI1_3825 ECIAI1_3826   gltS TRUE 0.901 3.000 0.062 NA   NA
 5867397 5867398 ECIAI1_3828 ECIAI1_3829 yicE yicH FALSE 0.418 121.000 0.257 NA   NA
 5867399 5867400 ECIAI1_3830 ECIAI1_3831 yicI yicJ TRUE 0.982 10.000 0.000 1.000 Y NA
 5867401 5867402 ECIAI1_tRNA31 ECIAI1_3832     FALSE 0.147 110.000 0.000 NA   NA
 5867402 5867403 ECIAI1_3832 ECIAI1_3833   setC FALSE 0.004 388.000 0.000 NA   NA
 5867403 5867404 ECIAI1_3833 ECIAI1_3835 setC yicL TRUE 0.742 111.000 0.000 0.062 Y NA
 5867407 5867408 ECIAI1_3838 ECIAI1_3839 yicM yicN TRUE 0.696 46.000 0.250 NA   NA
 5867408 5867409 ECIAI1_3839 ECIAI1_3840 yicN yicO FALSE 0.270 53.000 0.000 NA   NA
 5867411 5867412 ECIAI1_3842 ECIAI1_3843 uhpT uhpC TRUE 0.625 138.000 0.000 0.042 Y NA
 5867412 5867413 ECIAI1_3843 ECIAI1_3844 uhpC uhpB TRUE 0.928 10.000 0.000 0.062 N NA
 5867413 5867414 ECIAI1_3844 ECIAI1_3845 uhpB uhpA TRUE 0.993 0.000 0.000 0.011 Y NA
 5867414 5867415 ECIAI1_3845 ECIAI1_3846 uhpA ilvN FALSE 0.424 75.000 0.118 1.000   NA
 5867415 5867416 ECIAI1_3846 ECIAI1_3847 ilvN ilvB TRUE 0.996 4.000 0.649 0.001   NA
 5867416 5867417 ECIAI1_3847 ECIAI1_4634 ilvB ivbL FALSE 0.436 106.000 0.216 NA   NA
 5867417 5867418 ECIAI1_4634 ECIAI1_misc_RNA_80 ivbL istR FALSE 0.101 130.000 0.000 NA   NA
 5867422 5867423 ECIAI1_3852 ECIAI1_3853 yidF yidG TRUE 0.982 -3.000 0.429 NA   NA
 5867423 5867424 ECIAI1_3853 ECIAI1_3854 yidG yidH TRUE 0.966 -10.000 0.571 NA   NA
 5867426 5867427 ECIAI1_3856 ECIAI1_3857 yidJ yidK TRUE 0.968 -3.000 0.235 1.000   NA
 5867429 5867430 ECIAI1_3859 ECIAI1_3860     FALSE 0.467 -36.000 0.000 NA   NA
 5867430 5867431 ECIAI1_3860 ECIAI1_3861     TRUE 0.880 0.000 0.000 NA   NA
 5867433 5867434 ECIAI1_3863 ECIAI1_3864 yidE ibpB FALSE 0.027 197.000 0.000 NA   NA
 5867434 5867435 ECIAI1_3864 ECIAI1_3865 ibpB ibpA TRUE 0.683 112.000 0.099 NA Y NA
 5867439 5867440 ECIAI1_3869 ECIAI1_3870 dgoT dgoD FALSE 0.339 120.000 0.192 1.000 N NA
 5867440 5867441 ECIAI1_3870 ECIAI1_3871 dgoD dgoA TRUE 0.988 -3.000 0.385 0.042 N NA
 5867441 5867442 ECIAI1_3871 ECIAI1_3872 dgoA dgoK TRUE 0.994 -16.000 0.909 1.000 Y NA
 5867442 5867443 ECIAI1_3872 ECIAI1_3873 dgoK dgoR TRUE 0.991 -3.000 0.733 1.000 N NA
 5867445 5867446 ECIAI1_3875 ECIAI1_3876 yidA yidB FALSE 0.137 115.000 0.000 NA   NA
 5867446 5867447 ECIAI1_3876 ECIAI1_3877 yidB gyrB FALSE 0.015 240.000 0.000 NA   NA
 5867447 5867448 ECIAI1_3877 ECIAI1_3878 gyrB recF TRUE 0.979 29.000 0.249 0.002 Y NA
 5867448 5867449 ECIAI1_3878 ECIAI1_3879 recF dnaN TRUE 0.996 0.000 0.318 1.000 Y NA
 5867449 5867450 ECIAI1_3879 ECIAI1_3880 dnaN dnaA TRUE 0.995 5.000 0.328 1.000 Y NA
 5867450 5867451 ECIAI1_3880 ECIAI1_3881 dnaA   FALSE 0.003 514.000 0.000 NA   NA
 5867452 5867453 ECIAI1_3882 ECIAI1_3883 rpmH rnpA TRUE 0.984 17.000 0.787 1.000   NA
 5867453 5867454 ECIAI1_3883 ECIAI1_3884 rnpA yidD TRUE 0.920 -36.000 0.540 NA   NA
 5867454 5867455 ECIAI1_3884 ECIAI1_3885 yidD yidC TRUE 0.986 3.000 0.461 NA   NA
 5867455 5867456 ECIAI1_3885 ECIAI1_3886 yidC trmE TRUE 0.479 106.000 0.221 1.000   NA
 5867456 5867457 ECIAI1_3886 ECIAI1_4635 trmE tnaC FALSE 0.014 243.000 0.000 NA   NA
 5867457 5867458 ECIAI1_4635 ECIAI1_3887 tnaC tnaA FALSE 0.029 221.000 0.077 NA   NA
 5867458 5867459 ECIAI1_3887 ECIAI1_3888 tnaA tnaB TRUE 0.811 91.000 0.154 1.000 Y NA
 5867459 5867460 ECIAI1_3888 ECIAI1_3890 tnaB mdtL FALSE 0.068 132.000 0.000 NA N NA
 5867460 5867461 ECIAI1_3890 ECIAI1_3891 mdtL yidZ TRUE 0.922 -25.000 0.526 NA N NA
 5867461 5867462 ECIAI1_3891 ECIAI1_3892 yidZ yieE FALSE 0.144 145.000 0.114 1.000 N NA
 5867462 5867463 ECIAI1_3892 ECIAI1_3893 yieE yieF TRUE 0.720 22.000 0.074 NA   NA
 5867465 5867466 ECIAI1_3895 ECIAI1_3896 yieH yieI FALSE 0.231 67.000 0.000 NA   NA
 5867466 5867467 ECIAI1_3896 ECIAI1_3897 yieI cbrC FALSE 0.294 49.000 0.000 NA   NA
 5867468 5867469 ECIAI1_3898 ECIAI1_3899 yieK yieL TRUE 0.830 15.000 0.080 1.000 N NA
 5867469 5867470 ECIAI1_3899 ECIAI1_3900 yieL bglH TRUE 0.975 0.000 0.267 1.000 N NA
 5867470 5867471 ECIAI1_3900 ECIAI1_3901 bglH bglB TRUE 0.906 86.000 0.364 1.000 Y NA
 5867471 5867472 ECIAI1_3901 ECIAI1_3902 bglB bglF TRUE 0.993 19.000 0.562 1.000 Y NA
 5867472 5867473 ECIAI1_3902 ECIAI1_3903 bglF bglG FALSE 0.433 134.000 0.312 1.000   NA
 5867473 5867474 ECIAI1_3903 ECIAI1_3904 bglG phoU FALSE 0.008 286.000 0.000 NA   NA
 5867474 5867475 ECIAI1_3904 ECIAI1_3905 phoU pstB TRUE 0.989 15.000 0.317 NA Y NA
 5867475 5867476 ECIAI1_3905 ECIAI1_3906 pstB pstA TRUE 0.965 91.000 0.526 0.001 Y NA
 5867476 5867477 ECIAI1_3906 ECIAI1_3907 pstA pstC TRUE 0.999 0.000 0.537 0.001 Y NA
 5867477 5867478 ECIAI1_3907 ECIAI1_3908 pstC pstS TRUE 0.903 87.000 0.145 0.001 Y NA
 5867478 5867479 ECIAI1_3908 ECIAI1_3909 pstS lpfD FALSE 0.013 248.000 0.000 1.000 N NA
 5867479 5867480 ECIAI1_3909 ECIAI1_3910 lpfD lpfC TRUE 0.981 11.000 0.000 1.000 Y NA
 5867480 5867481 ECIAI1_3910 ECIAI1_3911 lpfC lfpB TRUE 0.930 25.000 0.000 1.000 Y NA
 5867481 5867482 ECIAI1_3911 ECIAI1_3912 lfpB lpfA TRUE 0.982 48.000 1.000 1.000 Y NA
 5867482 5867483 ECIAI1_3912 ECIAI1_3913 lpfA glmS FALSE 0.007 302.000 0.000 1.000 N NA
 5867483 5867484 ECIAI1_3913 ECIAI1_3914 glmS glmU FALSE 0.382 162.000 0.055 1.000 Y NA
 5867484 5867485 ECIAI1_3914 ECIAI1_3915 glmU atpC FALSE 0.007 351.000 0.067 1.000 N NA
 5867485 5867486 ECIAI1_3915 ECIAI1_3916 atpC atpD TRUE 0.997 21.000 0.837 0.002 Y NA
 5867486 5867487 ECIAI1_3916 ECIAI1_3917 atpD atpG TRUE 0.994 27.000 0.724 0.002 Y NA
 5867487 5867488 ECIAI1_3917 ECIAI1_3918 atpG atpA TRUE 0.988 51.000 0.846 0.002 Y NA
 5867488 5867489 ECIAI1_3918 ECIAI1_3919 atpA atpH TRUE 0.999 13.000 0.864 0.002 Y NA
 5867489 5867490 ECIAI1_3919 ECIAI1_3920 atpH atpF TRUE 0.994 15.000 0.242 0.002 Y NA
 5867490 5867491 ECIAI1_3920 ECIAI1_3921 atpF atpE TRUE 0.979 62.000 0.666 0.002 Y NA
 5867491 5867492 ECIAI1_3921 ECIAI1_3922 atpE atpB TRUE 0.982 47.000 0.557 0.002 Y NA
 5867492 5867493 ECIAI1_3922 ECIAI1_3923 atpB atpI TRUE 0.997 9.000 0.291 0.002 Y NA
 5867493 5867494 ECIAI1_3923 ECIAI1_3924 atpI gidB FALSE 0.002 617.000 0.005 1.000 N NA
 5867494 5867495 ECIAI1_3924 ECIAI1_3925 gidB gidA TRUE 0.767 64.000 0.466 1.000 N NA
 5867495 5867496 ECIAI1_3925 ECIAI1_3926 gidA mioC FALSE 0.004 379.000 0.000 1.000 N NA
 5867496 5867497 ECIAI1_3926 ECIAI1_3927 mioC asnC FALSE 0.420 90.000 0.165 1.000 N NA
 5867499 5867500 ECIAI1_3929 ECIAI1_3930 yieM ravA TRUE 0.970 -6.000 0.443 NA   NA
 5867501 5867502 ECIAI1_3931 ECIAI1_3932 trkD rbsD FALSE 0.045 167.000 0.000 1.000 N NA
 5867502 5867503 ECIAI1_3932 ECIAI1_3933 rbsD rbsA TRUE 0.995 8.000 0.337 1.000 Y NA
 5867503 5867504 ECIAI1_3933 ECIAI1_3934 rbsA rbsC TRUE 0.997 5.000 0.504 1.000 Y NA
 5867504 5867505 ECIAI1_3934 ECIAI1_3935 rbsC rbsB TRUE 0.992 25.000 0.847 NA Y NA
 5867505 5867506 ECIAI1_3935 ECIAI1_3936 rbsB rbsK TRUE 0.813 126.000 0.347 NA Y NA
 5867506 5867507 ECIAI1_3936 ECIAI1_3937 rbsK rbsR TRUE 0.987 4.000 0.500 1.000 N NA
 5867508 5867509 ECIAI1_3938 ECIAI1_3939 hsrA yieP TRUE 0.789 23.000 0.100 1.000   NA
 5867510 5867511 ECIAI1_16S_4 ECIAI1_tRNA32     FALSE 0.197 86.000 0.000 NA   NA
 5867511 5867512 ECIAI1_tRNA32 ECIAI1_23S_4     FALSE 0.029 194.000 0.000 NA   NA
 5867512 5867513 ECIAI1_23S_4 ECIAI1_5S_5     FALSE 0.184 93.000 0.000 NA   NA
 5867513 5867514 ECIAI1_5S_5 ECIAI1_tRNA33     FALSE 0.270 53.000 0.000 NA   NA
 5867514 5867515 ECIAI1_tRNA33 ECIAI1_tRNA34     TRUE 0.842 9.000 0.000 NA   NA
 5867519 5867520 ECIAI1_3954 ECIAI1_3955 ilvL ilvG FALSE 0.353 140.000 0.091 0.002   NA
 5867520 5867521 ECIAI1_3955 ECIAI1_3956 ilvG ilvM TRUE 0.997 -3.000 0.943 0.001   NA
 5867521 5867522 ECIAI1_3956 ECIAI1_3957 ilvM ilvE TRUE 0.899 20.000 0.205 1.000   NA
 5867522 5867523 ECIAI1_3957 ECIAI1_3958 ilvE ilvD TRUE 0.797 65.000 0.075 1.000 Y NA
 5867523 5867524 ECIAI1_3958 ECIAI1_3959 ilvD ilvA TRUE 0.990 3.000 0.106 1.000 Y NA
 5867527 5867528 ECIAI1_3962 ECIAI1_3963 ppiC   FALSE 0.035 199.000 0.000 1.000   NA
 5867530 5867531 ECIAI1_3965 ECIAI1_3966 gpp rhlB TRUE 0.479 134.000 0.406 1.000 N NA
 5867532 5867533 ECIAI1_3967 ECIAI1_4636 trxA rhoL FALSE 0.049 141.000 0.004 NA   NA
 5867533 5867534 ECIAI1_4636 ECIAI1_3969 rhoL rho FALSE 0.131 85.000 0.002 NA   NA
 5867534 5867535 ECIAI1_3969 ECIAI1_3970 rho   TRUE 0.837 10.000 0.000 NA   NA
 5867535 5867536 ECIAI1_3970 ECIAI1_3971   rfe TRUE 0.814 12.000 0.000 NA   NA
 5867536 5867537 ECIAI1_3971 ECIAI1_3972 rfe wzzE TRUE 0.999 12.000 0.735 0.003 Y NA
 5867537 5867538 ECIAI1_3972 ECIAI1_3973 wzzE rffE TRUE 0.981 56.000 0.677 0.003 Y NA
 5867538 5867539 ECIAI1_3973 ECIAI1_3974 rffE rffD TRUE 0.995 -3.000 0.348 1.000 Y NA
 5867539 5867540 ECIAI1_3974 ECIAI1_3975 rffD rffG TRUE 0.995 0.000 0.273 1.000 Y NA
 5867540 5867541 ECIAI1_3975 ECIAI1_3976 rffG rffH TRUE 0.997 19.000 0.739 0.002 Y NA
 5867541 5867542 ECIAI1_3976 ECIAI1_3977 rffH rffC TRUE 0.798 -22.000 0.145 1.000   NA
 5867542 5867543 ECIAI1_3977 ECIAI1_3978 rffC rffA TRUE 0.971 5.000 0.248 1.000   NA
 5867543 5867544 ECIAI1_3978 ECIAI1_3979 rffA wzxE TRUE 0.972 2.000 0.218 1.000   NA
 5867544 5867545 ECIAI1_3979 ECIAI1_3980 wzxE rffT TRUE 0.990 -3.000 0.605 1.000   NA
 5867545 5867546 ECIAI1_3980 ECIAI1_3981 rffT wzyE TRUE 0.992 -3.000 0.684 1.000   NA
 5867546 5867547 ECIAI1_3981 ECIAI1_3982 wzyE rffM TRUE 0.952 3.000 0.126 1.000   NA
 5867547 5867548 ECIAI1_3982 ECIAI1_3983 rffM yifK FALSE 0.030 191.000 0.000 1.000 N NA
 5867548 5867549 ECIAI1_3983 ECIAI1_tRNA35 yifK   FALSE 0.162 103.000 0.000 NA   NA
 5867549 5867550 ECIAI1_tRNA35 ECIAI1_tRNA36     FALSE 0.246 59.000 0.000 NA   NA
 5867550 5867551 ECIAI1_tRNA36 ECIAI1_tRNA37     TRUE 0.646 21.000 0.000 NA   NA
 5867551 5867552 ECIAI1_tRNA37 ECIAI1_tRNA38     FALSE 0.334 43.000 0.000 NA   NA
 5867552 5867553 ECIAI1_tRNA38 ECIAI1_3985   aslB FALSE 0.069 147.000 0.000 NA   NA
 5867556 5867557 ECIAI1_3988 ECIAI1_3989 hemY hemX TRUE 0.992 3.000 0.144 1.000 Y NA
 5867557 5867558 ECIAI1_3989 ECIAI1_3990 hemX hemD TRUE 0.991 22.000 0.600 1.000 Y NA
 5867558 5867559 ECIAI1_3990 ECIAI1_3991 hemD hemC TRUE 0.996 -3.000 0.205 0.001 Y NA
 5867561 5867562 ECIAI1_3994 ECIAI1_3995 cyaY   FALSE 0.301 48.000 0.000 NA   NA
 5867562 5867563 ECIAI1_3995 ECIAI1_3996     TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 5867563 5867564 ECIAI1_3996 ECIAI1_3997     FALSE 0.005 338.000 0.000 NA   NA
 5867564 5867565 ECIAI1_3997 ECIAI1_3998     TRUE 0.850 7.000 0.000 NA   NA
 5867566 5867567 ECIAI1_3999 ECIAI1_4000 yifL dapF FALSE 0.220 37.000 0.021 NA N NA
 5867567 5867568 ECIAI1_4000 ECIAI1_4001 dapF yigA TRUE 0.950 -3.000 0.175 NA   NA
 5867568 5867569 ECIAI1_4001 ECIAI1_4002 yigA xerC TRUE 0.991 -3.000 0.714 NA   NA
 5867569 5867570 ECIAI1_4002 ECIAI1_4003 xerC yigB TRUE 0.985 0.000 0.367 1.000   NA
 5867570 5867571 ECIAI1_4003 ECIAI1_4004 yigB uvrD FALSE 0.426 84.000 0.128 1.000   NA
 5867574 5867575 ECIAI1_4007 ECIAI1_4008     TRUE 0.989 -3.000 0.600 NA   NA
 5867579 5867580 ECIAI1_4012 ECIAI1_4013 rarD yigI FALSE 0.432 52.000 0.099 NA   NA
 5867581 5867582 ECIAI1_4014 ECIAI1_4016 pldA recQ FALSE 0.114 133.000 0.057 1.000 N NA
 5867582 5867583 ECIAI1_4016 ECIAI1_4017 recQ rhtC FALSE 0.239 64.000 0.043 1.000 N NA
 5867585 5867586 ECIAI1_4019 ECIAI1_4020   pldB FALSE 0.408 -73.000 0.000 NA   NA
 5867586 5867587 ECIAI1_4020 ECIAI1_4021 pldB yigL TRUE 0.987 8.000 0.524 1.000   NA
 5867587 5867588 ECIAI1_4021 ECIAI1_4022 yigL yigM FALSE 0.318 76.000 0.067 1.000   NA
 5867592 5867593 ECIAI1_4026 ECIAI1_4027 udp rmuC FALSE 0.078 141.000 0.041 NA   NA
 5867593 5867594 ECIAI1_4027 ECIAI1_4028 rmuC ubiE FALSE 0.192 95.000 0.047 NA   NA
 5867594 5867595 ECIAI1_4028 ECIAI1_4029 ubiE yigP TRUE 0.919 14.000 0.145 1.000   NA
 5867595 5867596 ECIAI1_4029 ECIAI1_4030 yigP ubiB TRUE 0.984 -3.000 0.432 1.000   NA
 5867596 5867597 ECIAI1_4030 ECIAI1_4031 ubiB tatA FALSE 0.234 79.000 0.032 1.000   NA
 5867597 5867598 ECIAI1_4031 ECIAI1_4032 tatA tatB TRUE 0.993 4.000 0.188 1.000 Y NA
 5867598 5867599 ECIAI1_4032 ECIAI1_4033 tatB tatC TRUE 0.995 3.000 0.333 NA Y NA
 5867599 5867600 ECIAI1_4033 ECIAI1_4034 tatC tatD TRUE 0.495 42.000 0.121 NA N NA
 5867602 5867603 ECIAI1_4036 ECIAI1_4037 ubiD fre TRUE 0.850 46.000 0.090 NA Y NA
 5867604 5867605 ECIAI1_4038 ECIAI1_4039 fadA fadB TRUE 0.997 10.000 0.607 1.000 Y NA
 5867606 5867607 ECIAI1_4040 ECIAI1_4041 pepQ yigZ TRUE 0.956 0.000 0.127 1.000   NA
 5867607 5867608 ECIAI1_4041 ECIAI1_4042 yigZ trkH TRUE 0.723 39.000 0.202 1.000   NA
 5867608 5867609 ECIAI1_4042 ECIAI1_4043 trkH hemG TRUE 0.978 12.000 0.455 1.000 N NA
 5867609 5867610 ECIAI1_4043 ECIAI1_16S_5 hemG   FALSE 0.004 376.000 0.000 NA   NA
 5867610 5867611 ECIAI1_16S_5 ECIAI1_tRNA39     FALSE 0.227 69.000 0.000 NA   NA
 5867611 5867612 ECIAI1_tRNA39 ECIAI1_tRNA40     FALSE 0.334 43.000 0.000 NA   NA
 5867612 5867613 ECIAI1_tRNA40 ECIAI1_23S_5     FALSE 0.035 184.000 0.000 NA   NA
 5867613 5867614 ECIAI1_23S_5 ECIAI1_5S_6     FALSE 0.184 93.000 0.000 NA   NA
 5867615 5867616 ECIAI1_4055 ECIAI1_4056 mobB mobA TRUE 0.993 -3.000 0.064 0.002 Y NA
 5867617 5867618 ECIAI1_4057 ECIAI1_4058 yihD yihE FALSE 0.356 77.000 0.106 NA   NA
 5867618 5867619 ECIAI1_4058 ECIAI1_4059 yihE dsbA TRUE 0.844 17.000 0.111 NA   NA
 5867619 5867620 ECIAI1_4059 ECIAI1_4060 dsbA yihF FALSE 0.056 155.000 0.000 NA   NA
 5867622 5867623 ECIAI1_4062 ECIAI1_misc_RNA_82 polA spf FALSE 0.067 148.000 0.000 NA   NA
 5867624 5867625 ECIAI1_4063 ECIAI1_4064   yihA TRUE 0.775 14.000 0.000 NA   NA
 5867626 5867627 ECIAI1_misc_RNA_83 ECIAI1_4065 csrC yihI FALSE 0.231 67.000 0.000 NA   NA
 5867627 5867628 ECIAI1_4065 ECIAI1_4066 yihI hemN FALSE 0.065 189.000 0.107 NA   NA
 5867629 5867630 ECIAI1_4067 ECIAI1_4068 glnG glnL TRUE 0.998 12.000 0.587 0.058 Y NA
 5867630 5867631 ECIAI1_4068 ECIAI1_4069 glnL glnA FALSE 0.007 319.000 0.053 1.000 N NA
 5867631 5867632 ECIAI1_4069 ECIAI1_4070 glnA   FALSE 0.107 128.000 0.000 NA   NA
 5867633 5867634 ECIAI1_4071 ECIAI1_4072 bipA yihL FALSE 0.054 217.000 0.000 0.035 N NA
 5867634 5867635 ECIAI1_4072 ECIAI1_4073 yihL yihM TRUE 0.992 8.000 0.800 NA   NA
 5867635 5867636 ECIAI1_4073 ECIAI1_4074 yihM yihN TRUE 0.826 102.000 0.833 NA   NA
 5867637 5867638 ECIAI1_4075 ECIAI1_4076 ompL yihO TRUE 0.845 68.000 0.625 1.000   NA
 5867638 5867639 ECIAI1_4076 ECIAI1_4077 yihO yihP TRUE 0.962 43.000 0.250 0.003 Y NA
 5867639 5867640 ECIAI1_4077 ECIAI1_4078 yihP yihQ TRUE 0.930 25.000 0.000 1.000 Y NA
 5867640 5867641 ECIAI1_4078 ECIAI1_4079 yihQ yihR FALSE 0.367 199.000 0.000 0.003 Y NA
 5867641 5867642 ECIAI1_4079 ECIAI1_4080 yihR yihS TRUE 0.612 114.000 0.026 1.000 Y NA
 5867642 5867643 ECIAI1_4080 ECIAI1_4081 yihS yihT TRUE 0.965 17.000 0.051 1.000 Y NA
 5867643 5867644 ECIAI1_4081 ECIAI1_4082 yihT yihU TRUE 0.874 24.000 0.250 1.000 N NA
 5867645 5867646 ECIAI1_4083 ECIAI1_4084 yihV yihW TRUE 0.882 34.000 0.000 1.000 Y NA
 5867646 5867647 ECIAI1_4084 ECIAI1_4085 yihW yihX FALSE 0.213 99.000 0.000 1.000   NA
 5867647 5867648 ECIAI1_4085 ECIAI1_4086 yihX rbn TRUE 0.808 -6.000 0.000 1.000   NA
 5867648 5867649 ECIAI1_4086 ECIAI1_4087 rbn dtd TRUE 0.910 -3.000 0.069 1.000   NA
 5867649 5867650 ECIAI1_4087 ECIAI1_4088 dtd yiiD TRUE 0.907 -3.000 0.065 1.000   NA
 5867652 5867653 ECIAI1_4090 ECIAI1_4091     TRUE 0.976 1.000 0.280 NA   NA
 5867653 5867654 ECIAI1_4091 ECIAI1_4093   yiiE FALSE 0.003 605.000 0.000 1.000   NA
 5867654 5867655 ECIAI1_4093 ECIAI1_4094 yiiE yiiF FALSE 0.014 243.000 0.000 NA   NA
 5867656 5867657 ECIAI1_4095 ECIAI1_4096 fdhE fdoI TRUE 0.943 -3.000 0.182 NA N NA
 5867657 5867658 ECIAI1_4096 ECIAI1_4097 fdoI fdoH TRUE 0.999 -3.000 0.944 0.001 Y NA
 5867658 5867659 ECIAI1_4097 ECIAI1_4098 fdoH fdoG TRUE 0.999 13.000 0.833 0.001 Y NA
 5867660 5867661 ECIAI1_4100 ECIAI1_4101 fdhD yiiG FALSE 0.091 153.000 0.080 NA   NA
 5867662 5867663 ECIAI1_4102 ECIAI1_4103 frvR frvX TRUE 0.983 0.000 0.400 NA N NA
 5867663 5867664 ECIAI1_4103 ECIAI1_4104 frvX frvB TRUE 0.993 -10.000 0.667 NA Y NA
 5867664 5867665 ECIAI1_4104 ECIAI1_4105 frvB frvA TRUE 0.990 11.000 0.000 0.010 Y NA
 5867665 5867666 ECIAI1_4105 ECIAI1_4106 frvA yiiL FALSE 0.007 313.000 0.000 NA   NA
 5867666 5867667 ECIAI1_4106 ECIAI1_4107 yiiL rhaD TRUE 0.919 10.000 0.112 NA   NA
 5867667 5867668 ECIAI1_4107 ECIAI1_4108 rhaD rhaA FALSE 0.275 242.000 0.247 1.000 Y NA
 5867668 5867669 ECIAI1_4108 ECIAI1_4109 rhaA rhaB TRUE 0.996 -3.000 0.387 1.000 Y NA
 5867670 5867671 ECIAI1_4111 ECIAI1_4112 rhaS rhaR TRUE 0.996 -16.000 0.800 0.016 Y NA
 5867673 5867674 ECIAI1_4114 ECIAI1_4115 sodA kdgT FALSE 0.015 260.000 0.000 1.000   NA
 5867674 5867675 ECIAI1_4115 ECIAI1_4116 kdgT yiiM FALSE 0.084 149.000 0.000 1.000   NA
 5867676 5867677 ECIAI1_4117 ECIAI1_4118 cpxA cpxR TRUE 0.998 -3.000 0.791 1.000 Y NA
 5867678 5867679 ECIAI1_4119 ECIAI1_4120 cpxP fieF FALSE 0.382 149.000 0.031 NA Y NA
 5867679 5867680 ECIAI1_4120 ECIAI1_4121 fieF pfkA FALSE 0.036 181.000 0.040 1.000 N NA
 5867680 5867681 ECIAI1_4121 ECIAI1_4122 pfkA sbp FALSE 0.007 319.000 0.049 1.000 N NA
 5867681 5867682 ECIAI1_4122 ECIAI1_4123 sbp cdh FALSE 0.149 107.000 0.000 1.000 N NA
 5867683 5867684 ECIAI1_4124 ECIAI1_4125 tpiA yiiQ FALSE 0.186 108.000 0.058 NA   NA
 5867685 5867686 ECIAI1_4126 ECIAI1_4127 yiiR yiiS FALSE 0.021 212.000 0.000 NA   NA
 5867686 5867687 ECIAI1_4127 ECIAI1_4128 yiiS yiiT TRUE 0.510 27.000 0.000 NA   NA
 5867688 5867689 ECIAI1_4129 ECIAI1_4130 fpr glpX FALSE 0.318 97.000 0.117 1.000 N NA
 5867689 5867690 ECIAI1_4130 ECIAI1_4131 glpX glpK FALSE 0.068 136.000 0.025 1.000 N NA
 5867690 5867691 ECIAI1_4131 ECIAI1_4132 glpK glpF FALSE 0.473 23.000 0.004 1.000 N NA
 5867693 5867694 ECIAI1_4134 ECIAI1_4135 rraA menA TRUE 0.791 93.000 0.158 NA Y NA
 5867694 5867695 ECIAI1_4135 ECIAI1_4136 menA hslU FALSE 0.251 67.000 0.051 1.000 N NA
 5867695 5867696 ECIAI1_4136 ECIAI1_4137 hslU hslV TRUE 0.998 10.000 0.752 1.000 Y NA
 5867696 5867697 ECIAI1_4137 ECIAI1_4138 hslV ftsN FALSE 0.300 93.000 0.122 NA N NA
 5867697 5867698 ECIAI1_4138 ECIAI1_4139 ftsN cytR TRUE 0.487 92.000 0.245 NA N NA
 5867698 5867699 ECIAI1_4139 ECIAI1_4140 cytR priA FALSE 0.036 156.000 0.013 1.000 N NA
 5867700 5867701 ECIAI1_4141 ECIAI1_4142 rpmE rhsB FALSE 0.052 160.000 0.000 NA   NA
 5867701 5867702 ECIAI1_4142 ECIAI1_4143 rhsB rhsB TRUE 0.872 3.000 0.000 NA   NA
 5867703 5867704 ECIAI1_4144 ECIAI1_4145 insB insB TRUE 0.761 -6.000 0.000 NA   NA
 5867704 5867705 ECIAI1_4145 ECIAI1_4146 insB yiiX FALSE 0.003 444.000 0.000 NA   NA
 5867705 5867706 ECIAI1_4146 ECIAI1_4147 yiiX metJ FALSE 0.244 60.000 0.000 NA   NA
 5867707 5867708 ECIAI1_4148 ECIAI1_4149 metB metL TRUE 0.997 3.000 0.428 1.000 Y NA
 5867708 5867709 ECIAI1_4149 ECIAI1_4150 metL metF FALSE 0.046 349.000 0.017 1.000 Y NA
 5867709 5867710 ECIAI1_4150 ECIAI1_4151 metF katG FALSE 0.004 329.000 0.010 1.000 N NA
 5867710 5867711 ECIAI1_4151 ECIAI1_4152 katG yijE FALSE 0.173 94.000 0.012 1.000   NA
 5867712 5867713 ECIAI1_4153 ECIAI1_4154 yijF gldA FALSE 0.009 275.000 0.000 NA   NA
 5867713 5867714 ECIAI1_4154 ECIAI1_4155 gldA fsaB TRUE 0.987 11.000 0.600 1.000 N NA
 5867714 5867715 ECIAI1_4155 ECIAI1_4156 fsaB ptsA TRUE 0.979 12.000 0.000 1.000 Y NA
 5867716 5867717 ECIAI1_4157 ECIAI1_4158 frwC frwB TRUE 0.996 15.000 0.400 0.010 Y NA
 5867717 5867718 ECIAI1_4158 ECIAI1_4159 frwB pflD TRUE 0.687 51.000 0.280 1.000 N NA
 5867718 5867719 ECIAI1_4159 ECIAI1_4160 pflD pflC TRUE 0.928 -34.000 0.312 0.002 N NA
 5867719 5867720 ECIAI1_4160 ECIAI1_4161 pflC frwD TRUE 0.953 2.000 0.156 1.000 N NA
 5867721 5867722 ECIAI1_4162 ECIAI1_4163 yijO yijP FALSE 0.172 149.000 0.130 1.000   NA
 5867722 5867723 ECIAI1_4163 ECIAI1_4164 yijP ppc FALSE 0.047 183.000 0.000 1.000   NA
 5867723 5867724 ECIAI1_4164 ECIAI1_4165 ppc argE FALSE 0.006 352.000 0.053 1.000 N NA
 5867725 5867726 ECIAI1_4166 ECIAI1_4167 argC argB TRUE 0.993 11.000 0.097 0.001 Y NA
 5867726 5867727 ECIAI1_4167 ECIAI1_4168 argB argH TRUE 0.749 61.000 0.017 1.000 Y NA
 5867727 5867728 ECIAI1_4168 ECIAI1_4169 argH rspA FALSE 0.003 438.000 0.000 1.000 N NA
 5867728 5867729 ECIAI1_4169 ECIAI1_4170 rspA   FALSE 0.169 67.000 0.000 NA N NA
 5867733 5867734 ECIAI1_4173 ECIAI1_4174 fabR yijD TRUE 0.965 0.000 0.194 NA   NA
 5867736 5867737 ECIAI1_misc_RNA_85 ECIAI1_4176   btuB FALSE 0.235 65.000 0.000 NA   NA
 5867737 5867738 ECIAI1_4176 ECIAI1_4177 btuB murI FALSE 0.368 -55.000 0.025 1.000 N NA
 5867738 5867739 ECIAI1_4177 ECIAI1_16S_6 murI   FALSE 0.004 374.000 0.000 NA   NA
 5867739 5867740 ECIAI1_16S_6 ECIAI1_tRNA41     FALSE 0.197 86.000 0.000 NA   NA
 5867740 5867741 ECIAI1_tRNA41 ECIAI1_23S_6     FALSE 0.029 194.000 0.000 NA   NA
 5867741 5867742 ECIAI1_23S_6 ECIAI1_5S_7     FALSE 0.184 93.000 0.000 NA   NA
 5867742 5867743 ECIAI1_5S_7 ECIAI1_4189   murB FALSE 0.007 301.000 0.000 NA   NA
 5867743 5867744 ECIAI1_4189 ECIAI1_4190 murB birA TRUE 0.957 -3.000 0.211 1.000 N NA
 5867746 5867747 ECIAI1_tRNA42 ECIAI1_tRNA43     TRUE 0.842 9.000 0.000 NA   NA
 5867747 5867748 ECIAI1_tRNA43 ECIAI1_tRNA44     FALSE 0.132 117.000 0.000 NA   NA
 5867748 5867749 ECIAI1_tRNA44 ECIAI1_tRNA45     TRUE 0.850 7.000 0.000 NA   NA
 5867749 5867750 ECIAI1_tRNA45 ECIAI1_4194   tufB FALSE 0.137 115.000 0.000 NA   NA
 5867750 5867751 ECIAI1_4194 ECIAI1_4195 tufB secE FALSE 0.010 230.000 0.009 1.000 N NA
 5867751 5867752 ECIAI1_4195 ECIAI1_4196 secE nusG TRUE 0.994 2.000 0.843 1.000 N NA
 5867752 5867753 ECIAI1_4196 ECIAI1_4197 nusG rplK TRUE 0.511 159.000 0.681 1.000 N NA
 5867753 5867754 ECIAI1_4197 ECIAI1_4198 rplK rplA TRUE 0.999 4.000 0.838 0.011 Y NA
 5867754 5867755 ECIAI1_4198 ECIAI1_4199 rplA rplJ FALSE 0.171 413.000 0.302 0.011 Y NA
 5867755 5867756 ECIAI1_4199 ECIAI1_4200 rplJ rplL TRUE 0.984 67.000 0.884 0.008 Y NA
 5867756 5867757 ECIAI1_4200 ECIAI1_4201 rplL rpoB FALSE 0.031 320.000 0.223 1.000   NA
 5867757 5867758 ECIAI1_4201 ECIAI1_4202 rpoB rpoC TRUE 0.941 77.000 0.851 0.000   NA
 5867758 5867759 ECIAI1_4202 ECIAI1_4203 rpoC htrC FALSE 0.021 213.000 0.000 NA   NA
 5867760 5867761 ECIAI1_misc_RNA_86 ECIAI1_4204 sroH thiH FALSE 0.013 248.000 0.000 NA   NA
 5867761 5867762 ECIAI1_4204 ECIAI1_4205 thiH thiG TRUE 0.997 -3.000 0.277 0.003 Y NA
 5867762 5867763 ECIAI1_4205 ECIAI1_4206 thiG thiS TRUE 0.990 2.000 0.087 1.000 Y NA
 5867763 5867764 ECIAI1_4206 ECIAI1_4207 thiS thiF TRUE 0.989 -16.000 0.548 1.000 Y NA
 5867764 5867765 ECIAI1_4207 ECIAI1_4208 thiF thiE TRUE 0.986 -7.000 0.242 1.000 Y NA
 5867765 5867766 ECIAI1_4208 ECIAI1_4209 thiE thiC TRUE 0.994 0.000 0.063 0.003 Y NA
 5867766 5867767 ECIAI1_4209 ECIAI1_misc_RNA_87 thiC   FALSE 0.202 81.000 0.000 NA   NA
 5867767 5867768 ECIAI1_misc_RNA_87 ECIAI1_4210   rsd FALSE 0.276 52.000 0.000 NA   NA
 5867769 5867770 ECIAI1_4211 ECIAI1_4212 nudC hemE FALSE 0.349 40.000 0.040 1.000 N NA
 5867770 5867771 ECIAI1_4212 ECIAI1_4213 hemE nfi TRUE 0.804 10.000 0.028 1.000 N NA
 5867771 5867772 ECIAI1_4213 ECIAI1_4214 nfi yjaG FALSE 0.468 43.000 0.086 NA   NA
 5867772 5867773 ECIAI1_4214 ECIAI1_4215 yjaG hupA FALSE 0.208 187.000 0.355 NA   NA
 5867773 5867774 ECIAI1_4215 ECIAI1_4216 hupA yjaH TRUE 0.970 13.000 0.375 NA   NA
 5867776 5867777 ECIAI1_4218 ECIAI1_4219 zraS zraR TRUE 0.998 -3.000 0.500 0.065 Y NA
 5867778 5867779 ECIAI1_4220 ECIAI1_4221 purD purH TRUE 0.991 12.000 0.238 1.000 Y NA
 5867780 5867781 ECIAI1_16S_7 ECIAI1_tRNA46     FALSE 0.197 86.000 0.000 NA   NA
 5867781 5867782 ECIAI1_tRNA46 ECIAI1_23S_7     FALSE 0.029 194.000 0.000 NA   NA
 5867782 5867783 ECIAI1_23S_7 ECIAI1_5S_8     FALSE 0.184 93.000 0.000 NA   NA
 5867785 5867786 ECIAI1_4233 ECIAI1_4234 metA aceB FALSE 0.010 269.000 0.000 1.000 N NA
 5867786 5867787 ECIAI1_4234 ECIAI1_4235 aceB aceA TRUE 0.953 30.000 0.043 0.001 Y NA
 5867787 5867788 ECIAI1_4235 ECIAI1_4236 aceA   FALSE 0.227 69.000 0.000 NA   NA
 5867788 5867789 ECIAI1_4236 ECIAI1_4237   aceK TRUE 0.529 -24.000 0.000 NA   NA
 5867790 5867791 ECIAI1_4238 ECIAI1_4239 arpA arpA TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 5867791 5867792 ECIAI1_4239 ECIAI1_4240 arpA iclR FALSE 0.007 318.000 0.000 NA   NA
 5867793 5867794 ECIAI1_4241 ECIAI1_4242 metH yjbB FALSE 0.011 220.000 0.006 1.000 N NA
 5867798 5867799 ECIAI1_4246 ECIAI1_4247     TRUE 0.818 -3.000 0.026 NA   NA
 5867800 5867801 ECIAI1_4248 ECIAI1_4249   lysC FALSE 0.106 139.000 0.000 1.000   NA
 5867801 5867802 ECIAI1_4249 ECIAI1_misc_RNA_88 lysC   FALSE 0.187 92.000 0.000 NA   NA
 5867805 5867806 ECIAI1_4252 ECIAI1_4253 yjbF yjbG TRUE 0.994 -3.000 1.000 NA   NA
 5867806 5867807 ECIAI1_4253 ECIAI1_4254 yjbG yjbH TRUE 0.951 0.000 0.140 NA   NA
 5867807 5867808 ECIAI1_4254 ECIAI1_4255 yjbH   TRUE 0.865 4.000 0.000 NA   NA
 5867810 5867811 ECIAI1_4257 ECIAI1_4258   yjbA TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 5867812 5867813 ECIAI1_4259 ECIAI1_4260 xylE malG FALSE 0.006 372.000 0.000 1.000   NA
 5867813 5867814 ECIAI1_4260 ECIAI1_4261 malG malF TRUE 0.998 15.000 0.814 0.041 Y NA
 5867814 5867815 ECIAI1_4261 ECIAI1_4262 malF malE FALSE 0.390 154.000 0.000 1.000 Y NA
 5867816 5867817 ECIAI1_4264 ECIAI1_4265 malK lamB TRUE 0.878 72.000 0.111 0.050 Y NA
 5867817 5867818 ECIAI1_4265 ECIAI1_4266 lamB malM FALSE 0.169 152.000 0.143 1.000   NA
 5867818 5867819 ECIAI1_4266 ECIAI1_4267 malM   FALSE 0.018 226.000 0.000 NA   NA
 5867819 5867820 ECIAI1_4267 ECIAI1_4268   yjbI FALSE 0.250 58.000 0.000 NA   NA
 5867820 5867821 ECIAI1_4268 ECIAI1_4269 yjbI ubiC FALSE 0.018 223.000 0.000 NA   NA
 5867821 5867822 ECIAI1_4269 ECIAI1_4270 ubiC ubiA TRUE 0.989 13.000 0.248 NA Y NA
 5867824 5867825 ECIAI1_4272 ECIAI1_4274 dgkA lexA FALSE 0.313 110.000 0.141 1.000 N NA
 5867825 5867826 ECIAI1_4274 ECIAI1_4275 lexA dinF TRUE 0.647 19.000 0.033 1.000 N NA
 5867826 5867827 ECIAI1_4275 ECIAI1_4276 dinF yjbJ FALSE 0.104 116.000 0.021 NA   NA
 5867829 5867830 ECIAI1_4278 ECIAI1_4279 yjbL yjbM TRUE 0.585 24.000 0.000 NA   NA
 5867830 5867831 ECIAI1_4279 ECIAI1_4280 yjbM yjbN FALSE 0.005 363.000 0.000 NA   NA
 5867831 5867832 ECIAI1_4280 ECIAI1_4281 yjbN yjbO FALSE 0.403 -76.000 0.000 NA   NA
 5867834 5867835 ECIAI1_4283 ECIAI1_4284 dnaB alr TRUE 0.708 53.000 0.317 1.000 N NA
 5867835 5867836 ECIAI1_4284 ECIAI1_4285 alr tyrB FALSE 0.041 253.000 0.181 1.000 N NA
 5867838 5867839 ECIAI1_4287 ECIAI1_4288 aphA yjbQ FALSE 0.099 111.000 0.009 NA   NA
 5867839 5867840 ECIAI1_4288 ECIAI1_4289 yjbQ yjbR TRUE 0.820 4.000 0.018 NA   NA
 5867848 5867849 ECIAI1_4297 ECIAI1_4298 yjcD yjcE FALSE 0.162 151.000 0.130 1.000   NA
 5867850 5867851 ECIAI1_4299 ECIAI1_4300 yjcF actP FALSE 0.040 178.000 0.000 NA   NA
 5867851 5867852 ECIAI1_4300 ECIAI1_4301 actP yjcH TRUE 0.991 -3.000 0.733 NA   NA
 5867852 5867853 ECIAI1_4301 ECIAI1_4302 yjcH acs FALSE 0.070 200.000 0.147 NA   NA
 5867854 5867855 ECIAI1_4304 ECIAI1_4305 nrfA nrfB TRUE 0.754 45.000 0.083 0.001   NA
 5867855 5867856 ECIAI1_4305 ECIAI1_4306 nrfB nrfC TRUE 0.966 -3.000 0.049 0.001   NA
 5867856 5867857 ECIAI1_4306 ECIAI1_4307 nrfC nrfD TRUE 0.997 -3.000 0.927 0.001 N NA
 5867857 5867858 ECIAI1_4307 ECIAI1_4308 nrfD nrfE TRUE 0.693 80.000 0.400 1.000 N NA
 5867858 5867859 ECIAI1_4308 ECIAI1_4309 nrfE nrfF TRUE 0.982 -7.000 0.214 NA Y NA
 5867859 5867860 ECIAI1_4309 ECIAI1_4310 nrfF nrfG TRUE 0.996 -3.000 0.464 NA Y NA
 5867860 5867861 ECIAI1_4310 ECIAI1_4311 nrfG gltP FALSE 0.005 342.000 0.000 1.000 N NA
 5867862 5867863 ECIAI1_4312 ECIAI1_4313 yjcO fdhF FALSE 0.359 94.000 0.105 1.000   NA
 5867863 5867864 ECIAI1_4313 ECIAI1_4315 fdhF yjcP FALSE 0.036 198.000 0.000 1.000   NA
 5867864 5867865 ECIAI1_4315 ECIAI1_4316 yjcP yjcQ TRUE 0.989 -3.000 0.625 NA   NA
 5867865 5867866 ECIAI1_4316 ECIAI1_4317 yjcQ yjcR TRUE 0.995 0.000 1.000 NA   NA
 5867866 5867867 ECIAI1_4317 ECIAI1_4318 yjcR   TRUE 0.972 19.000 0.625 NA   NA
 5867867 5867868 ECIAI1_4318 ECIAI1_4319   yjcS FALSE 0.051 161.000 0.000 NA   NA
 5867869 5867870 ECIAI1_4320 ECIAI1_4321   yjdP FALSE 0.227 69.000 0.000 NA   NA
 5867871 5867872 ECIAI1_4322 ECIAI1_4323 phnP phnO TRUE 0.902 2.000 0.000 1.000   NA
 5867872 5867873 ECIAI1_4323 ECIAI1_4324 phnO phnN TRUE 0.523 -13.000 0.000 NA N NA
 5867873 5867874 ECIAI1_4324 ECIAI1_4325 phnN phnM TRUE 0.994 0.000 0.235 NA Y NA
 5867874 5867875 ECIAI1_4325 ECIAI1_4326 phnM phnL TRUE 0.995 -3.000 0.320 1.000 Y NA
 5867875 5867876 ECIAI1_4326 ECIAI1_4327 phnL phnK TRUE 0.969 111.000 0.859 0.012 Y NA
 5867876 5867877 ECIAI1_4327 ECIAI1_4328 phnK phnJ TRUE 0.998 -3.000 0.883 1.000 Y NA
 5867877 5867878 ECIAI1_4328 ECIAI1_4329 phnJ phnI TRUE 0.997 -7.000 0.880 1.000 Y NA
 5867878 5867879 ECIAI1_4329 ECIAI1_4330 phnI phnH TRUE 0.999 0.000 0.960 0.001 Y NA
 5867879 5867880 ECIAI1_4330 ECIAI1_4331 phnH phnG TRUE 0.999 -3.000 0.967 0.001 Y NA
 5867880 5867881 ECIAI1_4331 ECIAI1_4332 phnG phnF TRUE 0.993 1.000 0.691 1.000 N NA
 5867881 5867882 ECIAI1_4332 ECIAI1_4333 phnF phnE TRUE 0.844 21.000 0.158 1.000 N NA
 5867882 5867883 ECIAI1_4333 ECIAI1_4334 phnE phnD TRUE 0.960 62.000 0.330 0.000 Y NA
 5867883 5867884 ECIAI1_4334 ECIAI1_4335 phnD phnC TRUE 0.990 25.000 0.337 0.001 Y NA
 5867884 5867885 ECIAI1_4335 ECIAI1_4336 phnC phnB FALSE 0.139 133.000 0.074 NA   NA
 5867885 5867886 ECIAI1_4336 ECIAI1_4337 phnB phnA FALSE 0.036 160.000 0.013 NA   NA
 5867887 5867888 ECIAI1_4338 ECIAI1_4339 yjdA yjcZ TRUE 0.993 -3.000 0.857 NA   NA
 5867888 5867889 ECIAI1_4339 ECIAI1_4340 yjcZ proP FALSE 0.011 264.000 0.000 NA   NA
 5867890 5867891 ECIAI1_4342 ECIAI1_4343 basS basR TRUE 0.989 10.000 0.143 1.000 Y NA
 5867891 5867892 ECIAI1_4343 ECIAI1_4344 basR eptA TRUE 0.929 -3.000 0.095 1.000   NA
 5867892 5867893 ECIAI1_4344 ECIAI1_4345 eptA adiC FALSE 0.202 104.000 0.000 1.000   NA
 5867893 5867894 ECIAI1_4345 ECIAI1_4346 adiC adiY FALSE 0.227 137.000 0.167 1.000 N NA
 5867894 5867895 ECIAI1_4346 ECIAI1_4347 adiY adiA FALSE 0.006 325.000 0.000 1.000 N NA
 5867895 5867896 ECIAI1_4347 ECIAI1_4348 adiA melR FALSE 0.027 196.000 0.000 1.000 N NA
 5867897 5867898 ECIAI1_4349 ECIAI1_4350 melA melB TRUE 0.786 115.000 0.214 1.000 Y NA
 5867899 5867900 ECIAI1_4351 ECIAI1_4352 yjdF fumB FALSE 0.119 123.000 0.000 NA   NA
 5867900 5867901 ECIAI1_4352 ECIAI1_4353 fumB dcuB FALSE 0.255 78.000 0.000 1.000   NA
 5867901 5867902 ECIAI1_4353 ECIAI1_4354 dcuB dcuR FALSE 0.004 571.000 0.000 1.000   NA
 5867902 5867903 ECIAI1_4354 ECIAI1_4355 dcuR dcuS TRUE 0.992 -3.000 0.086 0.057 Y NA
 5867904 5867905 ECIAI1_4358 ECIAI1_4359 yjdI yjdJ TRUE 0.934 12.000 0.168 NA   NA
 5867905 5867906 ECIAI1_4359 ECIAI1_4360 yjdJ yjdK FALSE 0.017 227.000 0.000 NA   NA
 5867906 5867907 ECIAI1_4360 ECIAI1_4361 yjdK yjdO TRUE 0.492 28.000 0.000 NA   NA
 5867908 5867909 ECIAI1_4362 ECIAI1_4363 lysU yjdL FALSE 0.015 237.000 0.000 1.000 N NA
 5867909 5867910 ECIAI1_4363 ECIAI1_4364 yjdL cadA TRUE 0.775 59.000 0.000 1.000 Y NA
 5867910 5867911 ECIAI1_4364 ECIAI1_4365 cadA cadB TRUE 0.729 80.000 0.000 1.000 Y NA
 5867911 5867912 ECIAI1_4365 ECIAI1_4366 cadB cadC FALSE 0.004 366.000 0.000 1.000 N NA
 5867914 5867915 ECIAI1_tRNA54 ECIAI1_4368   yjdC FALSE 0.154 107.000 0.000 NA   NA
 5867915 5867916 ECIAI1_4368 ECIAI1_4369 yjdC dipZ TRUE 0.753 37.000 0.217 1.000   NA
 5867916 5867917 ECIAI1_4369 ECIAI1_4370 dipZ cutA TRUE 0.670 -24.000 0.092 1.000 N NA
 5867917 5867918 ECIAI1_4370 ECIAI1_4371 cutA dcuA FALSE 0.123 116.000 0.005 1.000   NA
 5867918 5867919 ECIAI1_4371 ECIAI1_4372 dcuA aspA FALSE 0.126 118.000 0.015 1.000   NA
 5867922 5867923 ECIAI1_4375 ECIAI1_4376 groS groL TRUE 0.982 44.000 0.631 0.064 Y NA
 5867923 5867924 ECIAI1_4376 ECIAI1_4377 groL yjeI FALSE 0.109 138.000 0.062 NA   NA
 5867924 5867925 ECIAI1_4377 ECIAI1_4378 yjeI   FALSE 0.358 40.000 0.000 NA   NA
 5867925 5867926 ECIAI1_4378 ECIAI1_4379     FALSE 0.237 64.000 0.000 NA   NA
 5867927 5867928 ECIAI1_4380 ECIAI1_4381 yjeJ yjeK FALSE 0.004 390.000 0.000 NA   NA
 5867929 5867930 ECIAI1_4382 ECIAI1_4383 efp ecnA FALSE 0.258 52.000 0.007 1.000   NA
 5867933 5867934 ECIAI1_4386 ECIAI1_4387 blc ampC FALSE 0.149 89.000 0.022 1.000 N NA
 5867934 5867935 ECIAI1_4387 ECIAI1_4388 ampC frdD FALSE 0.187 63.000 0.022 1.000 N NA
 5867935 5867936 ECIAI1_4388 ECIAI1_4389 frdD frdC TRUE 0.999 11.000 0.787 0.002 Y NA
 5867936 5867937 ECIAI1_4389 ECIAI1_4390 frdC frdB TRUE 0.998 11.000 0.454 0.002 Y NA
 5867937 5867938 ECIAI1_4390 ECIAI1_4391 frdB frdA TRUE 0.996 -7.000 0.470 0.002 Y NA
 5867939 5867940 ECIAI1_4392 ECIAI1_4393 poxA yjeM FALSE 0.012 219.000 0.009 1.000 N NA
 5867941 5867942 ECIAI1_4394 ECIAI1_4395 yjeP psd TRUE 0.822 22.000 0.148 1.000 N NA
 5867942 5867943 ECIAI1_4395 ECIAI1_4396 psd rsgA FALSE 0.328 97.000 0.095 1.000   NA
 5867944 5867945 ECIAI1_4397 ECIAI1_tRNA47 orn   FALSE 0.021 211.000 0.000 NA   NA
 5867945 5867946 ECIAI1_tRNA47 ECIAI1_tRNA48     FALSE 0.385 37.000 0.000 NA   NA
 5867946 5867947 ECIAI1_tRNA48 ECIAI1_tRNA49     FALSE 0.395 36.000 0.000 NA   NA
 5867949 5867950 ECIAI1_4400 ECIAI1_4401 yjeF yjeE TRUE 0.695 -28.000 0.118 NA   NA
 5867950 5867951 ECIAI1_4401 ECIAI1_4402 yjeE amiB TRUE 0.821 19.000 0.109 NA   NA
 5867951 5867952 ECIAI1_4402 ECIAI1_4403 amiB mutL TRUE 0.903 10.000 0.092 1.000 N NA
 5867952 5867953 ECIAI1_4403 ECIAI1_4404 mutL miaA TRUE 0.944 -7.000 0.188 0.064 N NA
 5867953 5867954 ECIAI1_4404 ECIAI1_4405 miaA hfq TRUE 0.778 86.000 0.531 1.000   NA
 5867954 5867955 ECIAI1_4405 ECIAI1_4406 hfq hflX FALSE 0.456 76.000 0.141 1.000   NA
 5867955 5867956 ECIAI1_4406 ECIAI1_4407 hflX hflK TRUE 0.644 86.000 0.184 0.060   NA
 5867956 5867957 ECIAI1_4407 ECIAI1_4408 hflK hflC TRUE 0.999 3.000 0.947 0.009 Y NA
 5867957 5867958 ECIAI1_4408 ECIAI1_4409 hflC yjeT TRUE 0.660 82.000 0.348 NA   NA
 5867958 5867959 ECIAI1_4409 ECIAI1_4410 yjeT purA FALSE 0.181 104.000 0.051 NA   NA
 5867959 5867960 ECIAI1_4410 ECIAI1_4411 purA nsrR FALSE 0.009 205.000 0.010 NA N NA
 5867960 5867961 ECIAI1_4411 ECIAI1_4412 nsrR rnr TRUE 0.843 39.000 0.038 NA Y NA
 5867961 5867962 ECIAI1_4412 ECIAI1_4413 rnr rlmB FALSE 0.196 180.000 0.147 0.012 N NA
 5867962 5867963 ECIAI1_4413 ECIAI1_4414 rlmB yjfI FALSE 0.070 127.000 0.002 NA   NA
 5867963 5867964 ECIAI1_4414 ECIAI1_4415 yjfI yjfJ TRUE 0.983 19.000 0.911 NA   NA
 5867964 5867965 ECIAI1_4415 ECIAI1_4416 yjfJ yjfK FALSE 0.370 51.000 0.071 NA   NA
 5867965 5867966 ECIAI1_4416 ECIAI1_4417 yjfK yjfL TRUE 0.952 18.000 0.379 NA   NA
 5867966 5867967 ECIAI1_4417 ECIAI1_4418 yjfL yjfM TRUE 0.982 10.000 0.470 NA   NA
 5867967 5867968 ECIAI1_4418 ECIAI1_4419 yjfM yjfC TRUE 0.884 3.000 0.049 NA   NA
 5867968 5867969 ECIAI1_4419 ECIAI1_4420 yjfC aidB FALSE 0.342 84.000 0.133 NA N NA
 5867970 5867971 ECIAI1_4421 ECIAI1_4422 yjfN yjfO TRUE 0.507 149.000 0.588 NA   NA
 5867973 5867974 ECIAI1_4424 ECIAI1_4425 ulaR ulaG FALSE 0.191 108.000 0.000 1.000   NA
 5867975 5867976 ECIAI1_4426 ECIAI1_4427 ulaA ulaB TRUE 0.919 16.000 0.059 0.013   NA
 5867976 5867977 ECIAI1_4427 ECIAI1_4428 ulaB ulaC TRUE 0.993 10.000 0.115 0.010 Y NA
 5867977 5867978 ECIAI1_4428 ECIAI1_4429 ulaC ulaD TRUE 0.992 14.000 0.328 1.000 Y NA
 5867978 5867979 ECIAI1_4429 ECIAI1_4430 ulaD ulaE TRUE 0.993 10.000 0.250 1.000 Y NA
 5867979 5867980 ECIAI1_4430 ECIAI1_4431 ulaE ulaF TRUE 0.994 0.000 0.200 1.000 Y NA
 5867982 5867983 ECIAI1_4433 ECIAI1_4434 rpsF priB TRUE 0.930 7.000 0.122 1.000 N NA
 5867983 5867984 ECIAI1_4434 ECIAI1_4435 priB rpsR TRUE 0.936 5.000 0.128 1.000 N NA
 5867984 5867985 ECIAI1_4435 ECIAI1_4436 rpsR rplI TRUE 0.980 42.000 0.499 0.008 Y NA
 5867986 5867987 ECIAI1_4437 ECIAI1_4438 yjfZ   FALSE 0.003 623.000 0.000 NA   NA
 5867990 5867991 ECIAI1_4441 ECIAI1_4442 fklB cycA FALSE 0.007 309.000 0.000 1.000 N NA
 5867992 5867993 ECIAI1_4443 ECIAI1_4444 ytfE ytfF FALSE 0.295 108.000 0.150 NA N NA
 5867993 5867994 ECIAI1_4444 ECIAI1_4445 ytfF ytfG TRUE 0.661 99.000 0.021 1.000 Y NA
 5868000 5868001 ECIAI1_4451 ECIAI1_4452 ytfL msrA FALSE 0.006 323.000 0.042 NA   NA
 5868002 5868003 ECIAI1_4453 ECIAI1_4454 ytfM ytfN TRUE 0.988 -3.000 0.575 NA   NA
 5868003 5868004 ECIAI1_4454 ECIAI1_4455 ytfN ytfP TRUE 0.955 3.000 0.167 NA   NA
 5868004 5868005 ECIAI1_4455 ECIAI1_4456 ytfP chpS FALSE 0.021 212.000 0.000 NA   NA
 5868005 5868006 ECIAI1_4456 ECIAI1_4457 chpS chpB TRUE 0.991 -6.000 0.375 NA Y NA
 5868008 5868009 ECIAI1_4460 ECIAI1_4461 ytfQ ytfR TRUE 0.886 140.000 0.804 NA Y NA
 5868009 5868010 ECIAI1_4461 ECIAI1_4462 ytfR ytfT TRUE 0.995 14.000 0.506 1.000 Y NA
 5868010 5868011 ECIAI1_4462 ECIAI1_4463 ytfT yjfF TRUE 0.997 -13.000 0.865 0.040 Y NA
 5868015 5868016 ECIAI1_4467 ECIAI1_4468 pmbA cybC FALSE 0.030 183.000 0.028 NA   NA
 5868017 5868018 ECIAI1_4469 ECIAI1_4470 nrdG nrdD FALSE 0.373 158.000 0.464 1.000 N NA
 5868018 5868019 ECIAI1_4470 ECIAI1_4471 nrdD treC FALSE 0.004 394.000 0.000 1.000 N NA
 5868019 5868020 ECIAI1_4471 ECIAI1_4472 treC treB TRUE 0.969 50.000 0.650 1.000 Y NA
 5868020 5868021 ECIAI1_4472 ECIAI1_4473 treB treR FALSE 0.312 119.000 0.168 1.000 N NA
 5868023 5868024 ECIAI1_4475 ECIAI1_4476 yjgF pyrI FALSE 0.271 73.000 0.084 NA N NA
 5868024 5868025 ECIAI1_4476 ECIAI1_4477 pyrI pyrB TRUE 0.994 13.000 0.197 0.002 Y NA
 5868025 5868026 ECIAI1_4477 ECIAI1_4637 pyrB pyrL TRUE 0.853 4.000 0.005 1.000   NA
 5868026 5868027 ECIAI1_4637 ECIAI1_4478 pyrL yjgH FALSE 0.009 281.000 0.000 NA   NA
 5868027 5868028 ECIAI1_4478 ECIAI1_4479 yjgH yjgI FALSE 0.069 131.000 0.000 NA N NA
 5868029 5868030 ECIAI1_4480 ECIAI1_4481 yjgJ yjgK FALSE 0.050 145.000 0.000 NA N NA
 5868030 5868031 ECIAI1_4481 ECIAI1_4482 yjgK yjgL FALSE 0.119 123.000 0.000 NA   NA
 5868031 5868032 ECIAI1_4482 ECIAI1_4483 yjgL yjgL FALSE 0.264 54.000 0.000 NA   NA
 5868032 5868033 ECIAI1_4483 ECIAI1_4484 yjgL yjgL FALSE 0.451 -40.000 0.000 NA   NA
 5868038 5868039 ECIAI1_4489 ECIAI1_4490 valS holC TRUE 0.928 0.000 0.089 1.000 N NA
 5868039 5868040 ECIAI1_4490 ECIAI1_4491 holC pepA TRUE 0.533 134.000 0.494 1.000 N NA
 5868041 5868042 ECIAI1_4492 ECIAI1_4493 yjgP yjgQ TRUE 0.995 0.000 0.631 0.060   NA
 5868043 5868044 ECIAI1_4494 ECIAI1_4495 yjgR yjgB FALSE 0.093 130.000 0.007 1.000   NA
 5868044 5868045 ECIAI1_4495 ECIAI1_4496 yjgB   FALSE 0.191 75.000 0.032 NA   NA
 5868046 5868047 ECIAI1_tRNA50 ECIAI1_4497   int FALSE 0.031 190.000 0.000 NA   NA
 5868047 5868048 ECIAI1_4497 ECIAI1_4498 int   TRUE 0.815 88.000 0.000 0.039 Y NA
 5868048 5868049 ECIAI1_4498 ECIAI1_4499     TRUE 0.712 -64.000 0.148 1.000   NA
 5868049 5868050 ECIAI1_4499 ECIAI1_4500     FALSE 0.076 142.000 0.000 NA   NA
 5868050 5868051 ECIAI1_4500 ECIAI1_4501   alpA FALSE 0.048 166.000 0.000 NA   NA
 5868051 5868052 ECIAI1_4501 ECIAI1_4502 alpA   TRUE 0.986 6.000 0.500 NA   NA
 5868052 5868053 ECIAI1_4502 ECIAI1_4503     FALSE 0.009 283.000 0.000 NA   NA
 5868053 5868054 ECIAI1_4503 ECIAI1_4504     TRUE 0.840 -67.000 0.128 0.003   NA
 5868054 5868055 ECIAI1_4504 ECIAI1_4505     TRUE 0.971 -3.000 0.128 0.039   NA
 5868055 5868056 ECIAI1_4505 ECIAI1_4506     TRUE 0.981 15.000 0.625 NA   NA
 5868056 5868057 ECIAI1_4506 ECIAI1_4507     TRUE 0.670 88.000 0.375 NA   NA
 5868058 5868059 ECIAI1_4508 ECIAI1_4509     TRUE 0.680 19.000 0.000 NA   NA
 5868059 5868060 ECIAI1_4509 ECIAI1_4510     FALSE 0.342 42.000 0.000 NA   NA
 5868060 5868061 ECIAI1_4510 ECIAI1_4511     FALSE 0.018 224.000 0.000 NA   NA
 5868061 5868062 ECIAI1_4511 ECIAI1_4513     TRUE 0.873 -40.000 0.375 NA   NA
 5868063 5868064 ECIAI1_4514 ECIAI1_4515     TRUE 0.913 39.000 0.667 NA   NA
 5868067 5868068 ECIAI1_4518 ECIAI1_4519     TRUE 0.837 10.000 0.000 NA   NA
 5868068 5868069 ECIAI1_4519 ECIAI1_4520     TRUE 0.971 -3.000 0.292 NA   NA
 5868071 5868072 ECIAI1_4522 ECIAI1_4523 yjhS yjhT FALSE 0.235 65.000 0.000 NA   NA
 5868072 5868073 ECIAI1_4523 ECIAI1_4524 yjhT yjhA TRUE 0.663 20.000 0.000 NA   NA
 5868075 5868076 ECIAI1_4526 ECIAI1_4527     TRUE 0.849 -3.000 0.000 NA   NA
 5868077 5868078 ECIAI1_4528 ECIAI1_4529 fimB fimE FALSE 0.063 478.000 0.000 0.003 Y NA
 5868078 5868079 ECIAI1_4529 ECIAI1_4530 fimE fimA FALSE 0.003 480.000 0.000 1.000 N NA
 5868079 5868080 ECIAI1_4530 ECIAI1_4531 fimA fimI TRUE 0.974 65.000 0.600 0.008 Y NA
 5868080 5868081 ECIAI1_4531 ECIAI1_4532 fimI fimC TRUE 0.984 37.000 0.800 1.000 Y NA
 5868081 5868082 ECIAI1_4532 ECIAI1_4533 fimC fimD TRUE 0.965 67.000 0.750 1.000 Y NA
 5868082 5868083 ECIAI1_4533 ECIAI1_4534 fimD fimF TRUE 0.982 10.000 0.000 1.000 Y NA
 5868083 5868084 ECIAI1_4534 ECIAI1_4535 fimF fimG TRUE 0.987 13.000 0.000 0.008 Y NA
 5868084 5868085 ECIAI1_4535 ECIAI1_4536 fimG fimH TRUE 0.990 20.000 0.833 0.008   NA
 5868087 5868088 ECIAI1_4538 ECIAI1_4539 uxuA uxuB TRUE 0.759 81.000 0.070 1.000 Y NA
 5868088 5868089 ECIAI1_4539 ECIAI1_4540 uxuB uxuR FALSE 0.019 215.000 0.000 1.000 N NA
 5868091 5868092 ECIAI1_4542 ECIAI1_4543   yjiD FALSE 0.474 -34.000 0.000 NA   NA
 5868093 5868094 ECIAI1_4544 ECIAI1_4545 yjiE iadA FALSE 0.220 65.000 0.037 1.000 N NA
 5868094 5868095 ECIAI1_4545 ECIAI1_4546 iadA yjiG TRUE 0.815 13.000 0.028 1.000   NA
 5868095 5868096 ECIAI1_4546 ECIAI1_4547 yjiG yjiH TRUE 0.960 -3.000 0.019 0.001   NA
 5868098 5868099 ECIAI1_4549 ECIAI1_4550 yjiJ yjiK FALSE 0.406 68.000 0.118 NA   NA
 5868099 5868100 ECIAI1_4550 ECIAI1_4551 yjiK   FALSE 0.440 -43.000 0.000 NA   NA
 5868100 5868101 ECIAI1_4551 ECIAI1_4552   hgdC TRUE 0.900 -3.000 0.078 NA   NA
 5868101 5868102 ECIAI1_4552 ECIAI1_4553 hgdC yjiM TRUE 0.861 10.000 0.078 NA N NA
 5868102 5868103 ECIAI1_4553 ECIAI1_4554 yjiM yjiN FALSE 0.095 116.000 0.013 NA   NA
 5868103 5868104 ECIAI1_4554 ECIAI1_4555 yjiN yjiO FALSE 0.283 41.000 0.020 NA   NA
 5868107 5868108 ECIAI1_4559 ECIAI1_4560   yjiS FALSE 0.354 -118.000 0.000 NA   NA
 5868108 5868109 ECIAI1_4560 ECIAI1_4561 yjiS   FALSE 0.005 352.000 0.000 NA   NA
 5868110 5868111 ECIAI1_4562 ECIAI1_4563 yjiA yjiX TRUE 0.952 11.000 0.212 NA   NA
 5868111 5868112 ECIAI1_4563 ECIAI1_4564 yjiX yjiY TRUE 0.839 50.000 0.531 NA   NA
 5868112 5868113 ECIAI1_4564 ECIAI1_4565 yjiY   FALSE 0.046 168.000 0.000 NA   NA
 5868113 5868114 ECIAI1_4565 ECIAI1_4566   hpaC FALSE 0.204 79.000 0.000 NA   NA
 5868114 5868115 ECIAI1_4566 ECIAI1_4567 hpaC hpaB TRUE 0.968 18.000 0.226 0.000   NA
 5868115 5868116 ECIAI1_4567 ECIAI1_4568 hpaB hpaA FALSE 0.025 251.000 0.100 1.000 N NA
 5868116 5868117 ECIAI1_4568 ECIAI1_4569 hpaA   TRUE 0.959 10.000 0.233 1.000 N NA
 5868117 5868118 ECIAI1_4569 ECIAI1_4570   hpaI TRUE 0.762 115.000 0.175 1.000 Y NA
 5868118 5868119 ECIAI1_4570 ECIAI1_4571 hpaI hpaH TRUE 0.842 -130.000 0.439 1.000 N NA
 5868119 5868120 ECIAI1_4571 ECIAI1_4572 hpaH hpaF TRUE 0.968 9.000 0.282 1.000 N NA
 5868120 5868121 ECIAI1_4572 ECIAI1_4573 hpaF hpaD TRUE 0.976 10.000 0.330 1.000   NA
 5868121 5868122 ECIAI1_4573 ECIAI1_4574 hpaD hpaE TRUE 0.985 2.000 0.378 1.000   NA
 5868122 5868123 ECIAI1_4574 ECIAI1_4575 hpaE hpaG TRUE 0.991 -3.000 0.510 0.040 N NA
 5868124 5868125 ECIAI1_4576 ECIAI1_4577 hpaR tsr FALSE 0.212 119.000 0.095 1.000 N NA
 5868126 5868127 ECIAI1_4578 ECIAI1_4579 yjiZ yjjM FALSE 0.057 215.000 0.182 NA N NA
 5868129 5868130 ECIAI1_4581 ECIAI1_4582 mdoB yjjA FALSE 0.012 254.000 0.000 NA   NA
 5868130 5868131 ECIAI1_4582 ECIAI1_4583 yjjA dnaC TRUE 0.774 49.000 0.368 NA   NA
 5868131 5868132 ECIAI1_4583 ECIAI1_4584 dnaC dnaT TRUE 0.993 3.000 0.778 NA   NA
 5868132 5868133 ECIAI1_4584 ECIAI1_4585 dnaT   FALSE 0.163 108.000 0.046 NA   NA
 5868133 5868134 ECIAI1_4585 ECIAI1_4586   yjjP TRUE 0.977 -9.000 0.704 NA   NA
 5868135 5868136 ECIAI1_4587 ECIAI1_4588 yjjQ bglJ TRUE 0.999 12.000 0.889 0.016 Y NA
 5868139 5868140 ECIAI1_tRNA53 ECIAI1_tRNA52     FALSE 0.404 35.000 0.000 NA   NA
 5868140 5868141 ECIAI1_tRNA52 ECIAI1_tRNA51     TRUE 0.474 29.000 0.000 NA   NA
 5868141 5868142 ECIAI1_tRNA51 ECIAI1_4593   rsmC FALSE 0.010 268.000 0.000 NA   NA
 5868143 5868144 ECIAI1_4594 ECIAI1_4595 holD rimI TRUE 0.727 -31.000 0.121 1.000   NA
 5868144 5868145 ECIAI1_4595 ECIAI1_4596 rimI yjjG TRUE 0.756 15.000 0.018 1.000   NA
 5868145 5868146 ECIAI1_4596 ECIAI1_4597 yjjG prfC FALSE 0.183 91.000 0.012 1.000   NA
 5868146 5868147 ECIAI1_4597 ECIAI1_4598 prfC osmY FALSE 0.004 393.000 0.000 NA   NA
 5868147 5868148 ECIAI1_4598 ECIAI1_4599 osmY ytjA FALSE 0.149 109.000 0.000 NA   NA
 5868148 5868149 ECIAI1_4599 ECIAI1_4600 ytjA yjjU FALSE 0.355 122.000 0.211 NA   NA
 5868149 5868150 ECIAI1_4600 ECIAI1_4601 yjjU yjjV TRUE 0.877 -3.000 0.057 NA   NA
 5868151 5868152 ECIAI1_4602 ECIAI1_4603 yjjW yjjI TRUE 0.958 -28.000 0.810 NA   NA
 5868153 5868154 ECIAI1_4604 ECIAI1_4605 deoC deoA TRUE 0.790 127.000 0.286 1.000 Y NA
 5868154 5868155 ECIAI1_4605 ECIAI1_4606 deoA deoB TRUE 0.769 52.000 0.398 1.000 N NA
 5868155 5868156 ECIAI1_4606 ECIAI1_4607 deoB deoD TRUE 0.702 80.000 0.414 1.000 N NA
 5868157 5868158 ECIAI1_4608 ECIAI1_4609   lplA FALSE 0.428 32.000 0.000 NA   NA
 5868158 5868159 ECIAI1_4609 ECIAI1_4610 lplA ytjB TRUE 0.574 28.000 0.066 NA   NA
 5868160 5868161 ECIAI1_4611 ECIAI1_4612 serB radA FALSE 0.237 49.000 0.024 1.000 N NA
 5868161 5868162 ECIAI1_4612 ECIAI1_4613 radA nadR TRUE 0.564 21.000 0.021 1.000 N NA
 5868162 5868163 ECIAI1_4613 ECIAI1_4614 nadR   FALSE 0.282 51.000 0.000 NA   NA
 5868165 5868166 ECIAI1_4616 ECIAI1_4617 slt trpR FALSE 0.427 90.000 0.167 1.000 N NA
 5868167 5868168 ECIAI1_4618 ECIAI1_4619   yjjX FALSE 0.010 270.000 0.000 NA   NA
 5868171 5868172 ECIAI1_4622 ECIAI1_4623 creA creB TRUE 0.787 13.000 0.038 NA   NA
 5868172 5868173 ECIAI1_4623 ECIAI1_4624 creB creC TRUE 0.999 0.000 0.776 1.000 Y NA
 5868173 5868174 ECIAI1_4624 ECIAI1_4625 creC creD TRUE 0.653 58.000 0.311 NA N NA
 5868176 5863540 ECIAI1_4627 ECIAI1_misc_RNA_1 yjtD   FALSE 0.023 208.000 0.000 NA   NA