MicrobesOnline Operon Predictions for Anaplasma centrale str. Israel

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 10347722 10347723 ACIS_00003 ACIS_00004 purE   TRUE 0.872 -3.000 0.005 NA   NA
 10347724 10347725 ACIS_00006 ACIS_00007 rodA ihfA FALSE 0.342 66.000 0.003 1.000 N NA
 10347725 10347726 ACIS_00007 ACIS_00008 ihfA   TRUE 0.989 -3.000 0.535 1.000 N NA
 10347726 10347727 ACIS_00008 ACIS_01301     FALSE 0.680 -9.000 0.000 NA   NA
 10347728 10347729 ACIS_00009 ACIS_00010     TRUE 0.904 102.000 1.000 NA   NA
 10347730 10347731 ACIS_01302 ACIS_00011   murC FALSE 0.393 39.000 0.000 NA   NA
 10347732 10347733 ACIS_00012 ACIS_00013 trpS grpE TRUE 0.967 -3.000 0.016 1.000 N NA
 10347735 10347736 ACIS_00016 ACIS_00017 pyrG secG TRUE 0.978 13.000 0.083 1.000 N NA
 10347737 10347738 ACIS_00018 ACIS_00019   xerD FALSE 0.618 -7.000 0.003 NA   NA
 10347740 10347741 ACIS_00022 ACIS_00024 maeB   FALSE 0.582 174.000 0.200 NA   NA
 10347741 10347742 ACIS_00024 ACIS_00027     FALSE 0.016 223.000 0.000 NA   NA
 10347743 10347744 ACIS_00028 ACIS_00029 virB2   FALSE 0.080 162.000 0.000 NA   NA
 10347744 10347745 ACIS_00029 ACIS_00030     FALSE 0.565 -69.000 0.000 NA   NA
 10347749 10347750 ACIS_00037 ACIS_00039 glmU   FALSE 0.566 178.000 0.167 1.000 N NA
 10347750 10347751 ACIS_00039 ACIS_00040   pheS FALSE 0.203 142.000 0.004 1.000 N NA
 10347751 10347752 ACIS_00040 ACIS_00041 pheS rplT TRUE 0.987 -25.000 0.202 1.000 Y NA
 10347752 10347753 ACIS_00041 ACIS_00042 rplT rpmI TRUE 0.990 27.000 0.928 0.058 Y NA
 10347754 10347755 ACIS_00044 ACIS_00045   rho FALSE 0.284 109.000 0.005 NA   NA
 10347755 10347756 ACIS_00045 ACIS_00047 rho   TRUE 0.778 1.000 0.000 NA   NA
 10347756 10347757 ACIS_00047 ACIS_00049     FALSE 0.002 503.000 0.000 NA   NA
 10347757 10347758 ACIS_00049 ACIS_00050     FALSE 0.565 -69.000 0.000 NA   NA
 10347758 10347759 ACIS_00050 ACIS_00051   virB2 FALSE 0.080 162.000 0.000 NA   NA
 10347760 10347761 ACIS_00052 ACIS_00053     TRUE 0.914 29.000 0.017 1.000   NA
 10347761 10347762 ACIS_00053 ACIS_01337     FALSE 0.159 122.000 0.000 NA   NA
 10347762 10347763 ACIS_01337 ACIS_00054   gltX FALSE 0.028 202.000 0.000 NA   NA
 10347765 10347766 ACIS_00056 ACIS_00058 thiG thiS TRUE 0.920 84.000 0.064 1.000 Y NA
 10347767 10347768 ACIS_00059 ACIS_00061     FALSE 0.004 356.000 0.000 NA   NA
 10347771 10347772 ACIS_01336 ACIS_00066   nrdR FALSE 0.268 70.000 0.000 NA   NA
 10347773 10347774 ACIS_00064 ACIS_00067     TRUE 0.819 103.000 0.199 NA   NA
 10347774 10347775 ACIS_00067 ACIS_00068   omp14 FALSE 0.161 186.000 0.007 NA   NA
 10347777 10347778 ACIS_00071 ACIS_00072 rplY pth TRUE 0.996 5.000 0.496 0.090 Y NA
 10347778 10347779 ACIS_00072 ACIS_00073 pth purF FALSE 0.029 165.000 0.002 1.000 N NA
 10347780 10347781 ACIS_00074 ACIS_00075   recG FALSE 0.181 183.000 0.007 1.000 N NA
 10347783 10347784 ACIS_00077 ACIS_00078 trmE dapD FALSE 0.688 1.000 0.003 1.000   NA
 10347785 10347786 ACIS_00079 ACIS_00080   xseA TRUE 0.946 2.000 0.007 NA   NA
 10347788 10347789 ACIS_00082 ACIS_00083     TRUE 0.735 143.000 0.250 NA   NA
 10347789 10347790 ACIS_00083 ACIS_00084   dapF FALSE 0.215 42.000 0.002 NA   NA
 10347790 10347791 ACIS_00084 ACIS_00087 dapF   FALSE 0.136 76.000 0.002 NA   NA
 10347791 10347792 ACIS_00087 ACIS_00088     TRUE 0.878 67.000 0.133 NA   NA
 10347792 10347793 ACIS_00088 ACIS_01303     FALSE 0.234 82.000 0.000 NA   NA
 10347793 10347794 ACIS_01303 ACIS_00089   ribA FALSE 0.629 19.000 0.000 NA   NA
 10347794 10347795 ACIS_00089 ACIS_00090 ribA virB8 TRUE 0.772 118.000 0.095 NA N NA
 10347795 10347796 ACIS_00090 ACIS_00091 virB8 virB9 TRUE 0.993 -13.000 0.579 NA Y NA
 10347796 10347797 ACIS_00091 ACIS_00092 virB9 virB10 TRUE 0.991 20.000 0.526 NA Y NA
 10347797 10347798 ACIS_00092 ACIS_00093 virB10 virB11 TRUE 0.968 58.000 0.452 1.000 Y NA
 10347798 10347799 ACIS_00093 ACIS_00094 virB11 virD4 TRUE 0.972 48.000 0.405 1.000 Y NA
 10347799 10347800 ACIS_00094 ACIS_00095 virD4 infC FALSE 0.474 -3.000 0.002 1.000   NA
 10347803 10347804 ACIS_00098 ACIS_00099 nadA   TRUE 0.963 20.000 0.008 1.000 Y NA
 10347805 10347806 ACIS_00100 ACIS_00101     TRUE 0.954 -31.000 0.055 NA   NA
 10347808 10347809 ACIS_00103 ACIS_00104 hemE coxC FALSE 0.642 70.000 0.007 1.000 N NA
 10347809 10347810 ACIS_00104 ACIS_00105 coxC ruvC TRUE 0.948 15.000 0.011 1.000 N NA
 10347813 10347814 ACIS_00108 ACIS_00109 dnaJ glyS TRUE 0.713 74.000 0.009 1.000 N NA
 10347814 10347815 ACIS_00109 ACIS_00110 glyS glyQ TRUE 0.996 2.000 0.651 0.003 Y NA
 10347816 10347817 ACIS_01304 ACIS_00111     FALSE 0.467 34.000 0.000 NA   NA
 10347818 10347819 ACIS_00112 ACIS_01335 ubiH   FALSE 0.570 23.000 0.000 NA   NA
 10347820 10347821 ACIS_00113 ACIS_00114 metK ftsW TRUE 0.941 -18.000 0.014 1.000 N NA
 10347822 10347823 ACIS_00115 ACIS_00117 elbB   TRUE 0.958 17.000 0.021 NA   NA
 10347824 10347825 ACIS_00119 ACIS_00121 gap dnaX FALSE 0.288 67.000 0.003 1.000 N NA
 10347825 10347826 ACIS_00121 ACIS_00123 dnaX   TRUE 0.990 6.000 0.411 NA   NA
 10347826 10347827 ACIS_00123 ACIS_00124   asd TRUE 0.935 2.000 0.007 NA   NA
 10347827 10347828 ACIS_00124 ACIS_00125 asd   FALSE 0.035 192.000 0.003 NA   NA
 10347828 10347829 ACIS_00125 ACIS_00126     TRUE 0.862 4.000 0.004 NA   NA
 10347830 10347831 ACIS_00127 ACIS_00128 infC thrS TRUE 0.980 30.000 0.186 1.000 Y NA
 10347833 10347834 ACIS_00130 ACIS_00131 rplS trmD TRUE 0.994 -7.000 0.567 1.000 Y NA
 10347834 10347835 ACIS_00131 ACIS_00132 trmD rimM TRUE 0.996 -3.000 0.672 1.000 Y NA
 10347835 10347836 ACIS_00132 ACIS_00133 rimM parB FALSE 0.404 70.000 0.004 1.000 N NA
 10347836 10347837 ACIS_00133 ACIS_00134 parB soj TRUE 0.991 -3.000 0.827 1.000 N NA
 10347837 10347838 ACIS_00134 ACIS_00135 soj   FALSE 0.226 80.000 0.003 NA   NA
 10347838 10347839 ACIS_00135 ACIS_00137   ftsZ FALSE 0.003 399.000 0.000 NA   NA
 10347840 10347841 ACIS_00138 ACIS_00139 omp13 omp12 FALSE 0.030 209.000 0.000 0.023   NA
 10347841 10347842 ACIS_00139 ACIS_00140 omp12 omp11 FALSE 0.592 196.000 1.000 0.023   NA
 10347842 10347843 ACIS_00140 ACIS_00141 omp11 ubiD FALSE 0.564 112.000 0.009 NA   NA
 10347845 10347846 ACIS_00145 ACIS_00146   virB2 FALSE 0.003 416.000 0.000 NA   NA
 10347846 10347847 ACIS_00146 ACIS_00147 virB2   FALSE 0.138 133.000 0.000 NA   NA
 10347848 10347849 ACIS_00150 ACIS_00154   secD FALSE 0.002 447.000 0.000 NA   NA
 10347850 10347851 ACIS_00155 ACIS_00158 uvrB   FALSE 0.002 578.000 0.000 NA   NA
 10347851 10347852 ACIS_00158 ACIS_00159     TRUE 0.960 44.000 1.000 NA   NA
 10347852 10347853 ACIS_00159 ACIS_00160     FALSE 0.010 249.000 0.000 NA   NA
 10347853 10347854 ACIS_00160 ACIS_00161     TRUE 0.989 16.000 1.000 NA   NA
 10347855 10347856 ACIS_00162 ACIS_00164     FALSE 0.013 234.000 0.000 NA   NA
 10347856 10347857 ACIS_00164 ACIS_00165   def FALSE 0.622 122.000 0.014 1.000 N NA
 10347858 10347859 ACIS_00166 ACIS_00167 plsC rpsT FALSE 0.493 118.000 0.007 1.000 N NA
 10347860 10347861 ACIS_00168 ACIS_00169   lgt FALSE 0.022 214.000 0.000 NA   NA
 10347862 10347863 ACIS_00170 ACIS_00171 mviN   FALSE 0.263 152.000 0.006 NA   NA
 10347865 10347866 ACIS_00176 ACIS_00177   omp10 FALSE 0.010 249.000 0.000 NA   NA
 10347866 10347867 ACIS_00177 ACIS_00178 omp10 omp7 TRUE 0.934 78.000 1.000 0.023   NA
 10347867 10347868 ACIS_00178 ACIS_00179 omp7 omp9 TRUE 0.871 129.000 1.000 NA   NA
 10347869 10347870 ACIS_00180 ACIS_00181 recF argF FALSE 0.620 15.000 0.003 1.000 N NA
 10347873 10347874 ACIS_00186 ACIS_00187 polA rpe FALSE 0.404 38.000 0.003 1.000 N NA
 10347874 10347875 ACIS_00187 ACIS_00188 rpe   TRUE 0.801 19.000 0.005 NA N NA
 10347875 10347876 ACIS_00188 ACIS_00189     TRUE 0.995 5.000 0.178 NA Y NA
 10347876 10347877 ACIS_00189 ACIS_00190     FALSE 0.535 159.000 0.029 NA   NA
 10347878 10347879 ACIS_00192 ACIS_00193 ispB mraY FALSE 0.527 10.000 0.002 1.000 N NA
 10347879 10347880 ACIS_00193 ACIS_00194 mraY glnA FALSE 0.498 12.000 0.002 1.000 N NA
 10347881 10347882 ACIS_01305 ACIS_00196   tyrS FALSE 0.426 37.000 0.000 NA   NA
 10347882 10347883 ACIS_00196 ACIS_00197 tyrS hemA FALSE 0.482 144.000 0.010 1.000 N NA
 10347885 10347886 ACIS_00200 ACIS_00201 secF   TRUE 0.955 -19.000 0.026 1.000 N NA
 10347887 10347888 ACIS_01334 ACIS_00202   fbaB TRUE 0.791 3.000 0.000 NA   NA
 10347888 10347889 ACIS_00202 ACIS_00204 fbaB pdhC FALSE 0.026 213.000 0.000 1.000 N NA
 10347889 10347890 ACIS_00204 ACIS_00207 pdhC   FALSE 0.002 516.000 0.000 NA   NA
 10347891 10347892 ACIS_00208 ACIS_00209 guaA gltA FALSE 0.433 32.000 0.003 1.000 N NA
 10347892 10347893 ACIS_00209 ACIS_00210 gltA gshA FALSE 0.004 370.000 0.000 1.000   NA
 10347895 10347896 ACIS_00212 ACIS_00213 lolE   TRUE 0.980 5.000 0.030 NA   NA
 10347896 10347897 ACIS_00213 ACIS_00214     TRUE 0.978 -3.000 0.058 NA   NA
 10347897 10347898 ACIS_00214 ACIS_00216     TRUE 0.979 1.000 0.033 NA   NA
 10347898 10347899 ACIS_00216 ACIS_00217   atpH FALSE 0.002 486.000 0.000 NA   NA
 10347899 10347900 ACIS_00217 ACIS_00219 atpH atpA TRUE 0.993 20.000 0.864 0.011 Y NA
 10347900 10347901 ACIS_00219 ACIS_00220 atpA greA TRUE 0.903 22.000 0.009 1.000 N NA
 10347901 10347902 ACIS_00220 ACIS_00221 greA ribA TRUE 0.963 -3.000 0.014 1.000 N NA
 10347902 10347903 ACIS_00221 ACIS_00222 ribA smpB TRUE 0.906 3.000 0.005 1.000 N NA
 10347905 10347906 ACIS_00224 ACIS_00225 ccmF   TRUE 0.727 51.000 0.007 1.000   NA
 10347907 10347908 ACIS_00226 ACIS_00227 omp5 omp4 FALSE 0.004 358.000 0.000 0.022   NA
 10347908 10800755 ACIS_00227 ACIS_00228 omp4   FALSE 0.003 400.000 0.000 NA   NA
 10800755 10347909 ACIS_00228 ACIS_00229   msp2 FALSE 0.002 513.000 0.000 NA   NA
 10347909 10347910 ACIS_00229 ACIS_00231 msp2 opag1 FALSE 0.329 55.000 0.000 NA   NA
 10347910 10347911 ACIS_00231 ACIS_00232 opag1 opag2 FALSE 0.585 -31.000 0.000 NA   NA
 10347911 10347912 ACIS_00232 ACIS_00233 opag2 opag3 TRUE 0.967 31.000 0.500 0.022   NA
 10347912 10347913 ACIS_00233 ACIS_00234 opag3 omp1 TRUE 0.717 153.000 0.333 0.022   NA
 10347913 10347914 ACIS_00234 ACIS_00235 omp1   FALSE 0.004 372.000 0.000 1.000   NA
 10347918 10347919 ACIS_00240 ACIS_00241 recJ icd FALSE 0.168 141.000 0.004 1.000 N NA
 10347919 10347920 ACIS_00241 ACIS_00243 icd ftsY FALSE 0.007 290.000 0.000 1.000 N NA
 10347923 10347924 ACIS_00246 ACIS_01306 ccmB   FALSE 0.138 133.000 0.000 NA   NA
 10347924 10347925 ACIS_01306 ACIS_00247   czcD FALSE 0.607 20.000 0.000 NA   NA
 10347925 10347926 ACIS_00247 ACIS_00248 czcD   TRUE 0.979 4.000 0.025 NA N NA
 10347927 10347928 ACIS_00249 ACIS_00250 secA   FALSE 0.037 210.000 0.004 1.000 N NA
 10347928 10347929 ACIS_00250 ACIS_00251     TRUE 0.981 13.000 0.145 1.000 N NA
 10347929 10347930 ACIS_00251 ACIS_01333     TRUE 0.786 9.000 0.000 NA   NA
 10347931 10347932 ACIS_00252 ACIS_00253 trkH ftsA TRUE 0.805 68.000 0.018 1.000 N NA
 10347933 10347934 ACIS_00254 ACIS_00255     TRUE 0.986 -3.000 0.333 0.013   NA
 10347934 10347935 ACIS_00255 ACIS_00256   atpE TRUE 0.900 7.000 0.005 0.013   NA
 10347941 10347942 ACIS_00262 ACIS_00263 slt   TRUE 0.907 31.000 0.016 1.000   NA
 10347944 10347945 ACIS_00265 ACIS_00266 purH fabZ TRUE 0.913 13.000 0.006 1.000 N NA
 10347945 10347946 ACIS_00266 ACIS_00267 fabZ   TRUE 0.986 7.000 0.102 1.000 N NA
 10347946 10347947 ACIS_00267 ACIS_00268   oma87 TRUE 0.918 91.000 0.089 1.000 Y NA
 10347947 10347948 ACIS_00268 ACIS_00269 oma87   TRUE 0.991 6.000 0.016 1.000 Y NA
 10347949 10347950 ACIS_00270 ACIS_00271     TRUE 0.916 18.000 0.008 NA   NA
 10347952 10347953 ACIS_00273 ACIS_00274 panC   FALSE 0.129 88.000 0.002 1.000   NA
 10347953 10347954 ACIS_00274 ACIS_00275     FALSE 0.519 100.000 0.007 1.000   NA
 10347954 10347955 ACIS_00275 ACIS_00276   map TRUE 0.920 4.000 0.005 1.000 N NA
 10347955 10347956 ACIS_00276 ACIS_00279 map   FALSE 0.540 190.000 0.018 1.000 Y NA
 10347958 10347959 ACIS_00281 ACIS_00282 ribF lspA TRUE 0.740 79.000 0.013 1.000 N NA
 10347959 10347960 ACIS_00282 ACIS_00283 lspA   TRUE 0.875 55.000 0.038 0.037   NA
 10347960 10347961 ACIS_00283 ACIS_00284     TRUE 0.988 13.000 0.598 0.011   NA
 10347961 10347962 ACIS_00284 ACIS_00285     FALSE 0.299 183.000 0.013 NA   NA
 10347962 10347963 ACIS_00285 ACIS_00286   ana29 FALSE 0.003 376.000 0.000 NA   NA
 10347963 10347964 ACIS_00286 ACIS_00289 ana29   FALSE 0.004 330.000 0.000 NA   NA
 10347965 10347966 ACIS_00290 ACIS_00291 ctaG rnc TRUE 0.877 -13.000 0.006 1.000 N NA
 10347966 10347967 ACIS_00291 ACIS_00292 rnc   FALSE 0.090 157.000 0.000 NA   NA
 10347967 10347968 ACIS_00292 ACIS_00293     TRUE 0.786 9.000 0.000 NA   NA
 10347968 10347969 ACIS_00293 ACIS_00294   hflC TRUE 0.994 3.000 0.084 0.018 Y NA
 10347969 10347970 ACIS_00294 ACIS_00296 hflC hflK TRUE 0.997 3.000 0.947 0.018 Y NA
 10347970 10347971 ACIS_00296 ACIS_00298 hflK   FALSE 0.002 513.000 0.000 NA   NA
 10347972 10347973 ACIS_00299 ACIS_00302 virB2 virB2 FALSE 0.002 821.000 0.000 NA   NA
 10347973 10347974 ACIS_00302 ACIS_00303 virB2 virB2 FALSE 0.004 327.000 0.000 NA   NA
 10347974 10347975 ACIS_00303 ACIS_00304 virB2   TRUE 0.752 131.000 0.133 NA   NA
 10347975 10347976 ACIS_00304 ACIS_00306     FALSE 0.002 556.000 0.000 NA   NA
 10347976 10347977 ACIS_00306 ACIS_00307     FALSE 0.004 323.000 0.000 NA   NA
 10347977 10347978 ACIS_00307 ACIS_00309     FALSE 0.043 189.000 0.000 NA   NA
 10347979 10347980 ACIS_00311 ACIS_00313     FALSE 0.002 473.000 0.000 NA   NA
 10347980 10347981 ACIS_00313 ACIS_00314     FALSE 0.035 194.000 0.000 NA   NA
 10347984 10347985 ACIS_00319 ACIS_00321 apaG acnA FALSE 0.004 339.000 0.000 NA N NA
 10347986 10347987 ACIS_00322 ACIS_00323   prsA TRUE 0.952 -3.000 0.009 1.000 N NA
 10347989 10347990 ACIS_00326 ACIS_00327   tolC TRUE 0.969 19.000 0.146 NA   NA
 10347991 10347992 ACIS_00328 ACIS_00329 rplM rpsI TRUE 0.990 -13.000 0.231 0.051 Y NA
 10347992 10347993 ACIS_00329 ACIS_00330 rpsI ppa FALSE 0.003 398.000 0.000 1.000 N NA
 10347993 10347994 ACIS_00330 ACIS_00331 ppa   FALSE 0.002 531.000 0.000 1.000 N NA
 10347994 10347995 ACIS_00331 ACIS_00333     FALSE 0.044 291.000 0.000 1.000 Y NA
 10347995 10347996 ACIS_00333 ACIS_00335     TRUE 0.853 65.000 0.036 1.000   NA
 10347996 10347997 ACIS_00335 ACIS_00336   dnaN FALSE 0.020 222.000 0.003 0.005   NA
 10347998 10347999 ACIS_00337 ACIS_00338 glmS yajC FALSE 0.491 82.000 0.006 NA N NA
 10347999 10348000 ACIS_00338 ACIS_00340 yajC purD FALSE 0.077 86.000 0.002 NA N NA
 10348002 10348003 ACIS_00343 ACIS_00344 ctaB coxA TRUE 0.987 8.000 0.153 0.077 N NA
 10348003 10348004 ACIS_00344 ACIS_00345 coxA   TRUE 0.946 108.000 0.741 0.004 Y NA
 10348004 10348005 ACIS_00345 ACIS_00346     FALSE 0.041 194.000 0.000 1.000 N NA
 10348007 10348008 ACIS_00348 ACIS_00350 ubiE hslU TRUE 0.957 4.000 0.008 1.000 N NA
 10348008 10348009 ACIS_00350 ACIS_00351 hslU hslV TRUE 0.996 -3.000 0.752 1.000 Y NA
 10348010 10348011 ACIS_00352 ACIS_00354 rho   FALSE 0.003 378.000 0.000 NA   NA
 10348016 10348017 ACIS_00361 ACIS_00362     FALSE 0.012 240.000 0.000 NA   NA
 10348018 10348019 ACIS_00363 ACIS_00364     TRUE 0.839 78.000 0.059 NA   NA
 10348020 10348021 ACIS_00365 ACIS_00367   purL FALSE 0.003 463.000 0.000 1.000 N NA
 10348021 10348022 ACIS_00367 ACIS_00369 purL   FALSE 0.002 776.000 0.000 1.000 N NA
 10348022 10348023 ACIS_00369 ACIS_00370     TRUE 0.732 -13.000 0.004 NA   NA
 10348023 10348024 ACIS_00370 ACIS_00371     TRUE 0.784 102.000 0.060 NA   NA
 10348024 10348025 ACIS_00371 ACIS_00373     FALSE 0.337 194.000 0.040 NA   NA
 10348031 10348032 ACIS_00384 ACIS_00385 purN pepA TRUE 0.970 7.000 0.012 1.000 N NA
 10348033 10348034 ACIS_00386 ACIS_00387     TRUE 0.709 104.000 0.019 NA   NA
 10348034 10348035 ACIS_00387 ACIS_00388     FALSE 0.007 280.000 0.000 NA   NA
 10348037 10348038 ACIS_00391 ACIS_00393     FALSE 0.033 197.000 0.000 NA   NA
 10348039 10348040 ACIS_00394 ACIS_00395 groEL groES TRUE 0.958 48.000 0.079 1.000 Y NA
 10348041 10348042 ACIS_00396 ACIS_00397 radC lipB FALSE 0.330 91.000 0.004 1.000 N NA
 10348042 10348043 ACIS_00397 ACIS_00398 lipB glmM FALSE 0.356 37.000 0.003 1.000 N NA
 10348044 10348045 ACIS_00399 ACIS_00401 pyrC dfp TRUE 0.743 1.000 0.003 1.000   NA
 10348046 10348047 ACIS_00402 ACIS_00403 fumC   FALSE 0.335 165.000 0.009 NA   NA
 10348051 10348052 ACIS_00408 ACIS_00411   qor TRUE 0.795 106.000 0.100 1.000   NA
 10348054 10348055 ACIS_00414 ACIS_00415     TRUE 0.729 78.000 0.012 NA   NA
 10348055 10348056 ACIS_00415 ACIS_00416     FALSE 0.002 570.000 0.000 NA   NA
 10348056 10348057 ACIS_00416 ACIS_00417     FALSE 0.015 228.000 0.000 NA   NA
 10348058 10348059 ACIS_00418 ACIS_00419     FALSE 0.005 316.000 0.000 NA   NA
 10348059 10348060 ACIS_00419 ACIS_00420     FALSE 0.077 163.000 0.000 NA   NA
 10348060 10348061 ACIS_00420 ACIS_00421     TRUE 0.954 1.000 0.008 NA   NA
 10348061 10348062 ACIS_00421 ACIS_00422     TRUE 0.725 160.000 0.500 NA   NA
 10348062 10348063 ACIS_00422 ACIS_00423     TRUE 0.981 8.000 0.030 1.000 N NA
 10348063 10348064 ACIS_00423 ACIS_00424   rpsA TRUE 0.984 5.000 0.057 1.000 N NA
 10348064 10348065 ACIS_00424 ACIS_00425 rpsA cmk TRUE 0.905 64.000 0.281 1.000 N NA
 10348065 10348066 ACIS_00425 ACIS_00426 cmk   TRUE 0.828 -10.000 0.005 1.000 N NA
 10348067 10348068 ACIS_01307 ACIS_01308     TRUE 0.786 9.000 0.000 NA   NA
 10348068 10348069 ACIS_01308 ACIS_00427   tuf FALSE 0.336 54.000 0.000 NA   NA
 10348069 10348070 ACIS_00427 ACIS_00428 tuf rpsJ TRUE 0.995 7.000 0.318 1.000 Y NA
 10348070 10348071 ACIS_00428 ACIS_00430 rpsJ rplC TRUE 0.995 2.000 0.307 0.067 Y NA
 10348071 10348072 ACIS_00430 ACIS_00431 rplC rplD TRUE 0.992 18.000 0.486 0.050 Y NA
 10348072 10348073 ACIS_00431 ACIS_00432 rplD rplW TRUE 0.994 -7.000 0.513 1.000 Y NA
 10348073 10348074 ACIS_00432 ACIS_00433 rplW rplB TRUE 0.996 -3.000 0.849 1.000 Y NA
 10348074 10348075 ACIS_00433 ACIS_00434 rplB rpsS TRUE 0.997 5.000 0.820 0.067 Y NA
 10348075 10348076 ACIS_00434 ACIS_00435 rpsS rplV TRUE 0.994 3.000 0.119 0.067 Y NA
 10348076 10348077 ACIS_00435 ACIS_00436 rplV rpsC TRUE 0.994 4.000 0.109 0.067 Y NA
 10348077 10348078 ACIS_00436 ACIS_00437 rpsC rplP TRUE 0.997 10.000 0.828 0.067 Y NA
 10348078 10348079 ACIS_00437 ACIS_00438 rplP rpmC TRUE 0.993 3.000 0.802 0.050   NA
 10348079 10348080 ACIS_00438 ACIS_00439 rpmC rpsQ TRUE 0.989 -7.000 0.828 0.050   NA
 10348080 10348081 ACIS_00439 ACIS_00440 rpsQ rplN TRUE 0.995 13.000 0.791 0.067 Y NA
 10348081 10348082 ACIS_00440 ACIS_00441 rplN rplX TRUE 0.996 0.000 0.810 0.067 Y NA
 10348082 10348083 ACIS_00441 ACIS_00442 rplX rplE TRUE 0.997 7.000 0.758 0.050 Y NA
 10348083 10348084 ACIS_00442 ACIS_00443 rplE rpsN TRUE 0.994 12.000 0.309 0.050 Y NA
 10348084 10348085 ACIS_00443 ACIS_00444 rpsN rpsH TRUE 0.990 18.000 0.295 0.050 Y NA
 10348085 10348086 ACIS_00444 ACIS_00445 rpsH rplF TRUE 0.996 12.000 0.808 0.050 Y NA
 10348086 10348087 ACIS_00445 ACIS_00446 rplF rplR TRUE 0.996 10.000 0.815 0.050 Y NA
 10348087 10348088 ACIS_00446 ACIS_00447 rplR rpsE TRUE 0.996 10.000 0.814 0.067 Y NA
 10348088 10348089 ACIS_00447 ACIS_00448 rpsE rplO TRUE 0.992 13.000 0.148 0.067 Y NA
 10348089 10348090 ACIS_00448 ACIS_00449 rplO secY TRUE 0.977 24.000 0.730 1.000 N NA
 10348090 10348091 ACIS_00449 ACIS_00450 secY adk TRUE 0.974 -18.000 0.241 1.000 N NA
 10348091 10348092 ACIS_00450 ACIS_00451 adk rpsM TRUE 0.820 62.000 0.017 1.000 N NA
 10348092 10348093 ACIS_00451 ACIS_00452 rpsM rpsK TRUE 0.996 10.000 0.810 0.050 Y NA
 10348093 10348094 ACIS_00452 ACIS_00454 rpsK rpoA TRUE 0.971 21.000 0.308 1.000 N NA
 10348094 10348095 ACIS_00454 ACIS_00455 rpoA rplQ TRUE 0.961 41.000 0.873 1.000 N NA
 10348095 10348096 ACIS_00455 ACIS_00456 rplQ pheT TRUE 0.979 4.000 0.006 1.000 Y NA
 10348096 10348097 ACIS_00456 ACIS_00457 pheT   FALSE 0.004 339.000 0.000 NA   NA
 10348098 10348099 ACIS_00459 ACIS_00460     TRUE 0.903 14.000 0.006 1.000   NA
 10348099 10348100 ACIS_00460 ACIS_00461   rpmH TRUE 0.987 -9.000 0.787 1.000   NA
 10348101 10348102 ACIS_00463 ACIS_00464 alp1 alp2 FALSE 0.104 150.000 0.000 NA   NA
 10348102 10348103 ACIS_00464 ACIS_00466 alp2 ubiA FALSE 0.100 151.000 0.000 NA   NA
 11420411 10348097   ACIS_00457     FALSE NA 3704.000 0.000 NA   NA
 11562774 10348097   ACIS_00457     FALSE NA 3704.000 0.000 NA   NA
 11705166 10348097   ACIS_00457     FALSE NA 3704.000 0.000 NA   NA
 11420412 10348097   ACIS_00457     FALSE NA 3724.000 0.000 NA   NA
 11562775 10348097   ACIS_00457     FALSE NA 3724.000 0.000 NA   NA
 11705167 10348097   ACIS_00457     FALSE NA 3724.000 0.000 NA   NA
 11420413 10348097   ACIS_00457     FALSE NA 3755.000 0.000 NA   NA
 11562776 10348097   ACIS_00457     FALSE NA 3755.000 0.000 NA   NA
 11705168 10348097   ACIS_00457     FALSE NA 3755.000 0.000 NA   NA
 11420414 10348097   ACIS_00457     FALSE NA 3775.000 0.000 NA   NA
 11562777 10348097   ACIS_00457     FALSE NA 3775.000 0.000 NA   NA
 11705169 10348097   ACIS_00457     FALSE NA 3775.000 0.000 NA   NA
 11420415 10348097   ACIS_00457     FALSE NA 3794.000 0.000 NA   NA
 11562778 10348097   ACIS_00457     FALSE NA 3794.000 0.000 NA   NA
 11705170 10348097   ACIS_00457     FALSE NA 3794.000 0.000 NA   NA
 11420416 10348097   ACIS_00457     FALSE NA 3814.000 0.000 NA   NA
 11562779 10348097   ACIS_00457     FALSE NA 3814.000 0.000 NA   NA
 11705171 10348097   ACIS_00457     FALSE NA 3814.000 0.000 NA   NA
 11420417 10348097   ACIS_00457     FALSE NA 3845.000 0.000 NA   NA
 11562780 10348097   ACIS_00457     FALSE NA 3845.000 0.000 NA   NA
 11705172 10348097   ACIS_00457     FALSE NA 3845.000 0.000 NA   NA
 10348103 10348104 ACIS_00466 ACIS_00467 ubiA   TRUE 0.965 13.000 0.018 1.000   NA
 10348104 10348105 ACIS_00467 ACIS_00468   dapB FALSE 0.302 182.000 0.011 1.000   NA
 10348105 10348106 ACIS_00468 ACIS_00469 dapB pstB TRUE 0.962 6.000 0.009 1.000 N NA
 10348108 10348109 ACIS_00472 ACIS_00473 rpmF plsX TRUE 0.991 7.000 0.418 1.000 N NA
 10348109 10348110 ACIS_00473 ACIS_00474 plsX fabH TRUE 0.995 0.000 0.380 0.009 Y NA
 10348112 10348113 ACIS_00476 ACIS_00478   dnaB TRUE 0.834 54.000 0.017 NA   NA
 10348113 10348114 ACIS_00478 ACIS_00479 dnaB   TRUE 0.765 66.000 0.011 1.000 N NA
 10348115 10348116 ACIS_00480 ACIS_00481   ispA TRUE 0.965 -3.000 0.016 1.000   NA
 10348117 10348118 ACIS_01309 ACIS_00482   nrdA FALSE 0.095 153.000 0.000 NA   NA
 10348118 10348119 ACIS_00482 ACIS_00483 nrdA   FALSE 0.627 66.000 0.007 1.000 N NA
 10348119 10348120 ACIS_00483 ACIS_00484     FALSE 0.062 109.000 0.002 1.000   NA
 10348121 10348122 ACIS_00485 ACIS_00486 purA   FALSE 0.009 268.000 0.000 1.000   NA
 10348123 10348124 ACIS_00487 ACIS_00488   tktA TRUE 0.973 18.000 0.118 1.000 N NA
 10348124 10348125 ACIS_00488 ACIS_00489 tktA   TRUE 0.976 -3.000 0.045 1.000   NA
 10348125 10348126 ACIS_00489 ACIS_00490     TRUE 0.992 8.000 0.655 1.000   NA
 10348126 10348127 ACIS_00490 ACIS_00491     TRUE 0.986 1.000 0.184 NA   NA
 10348127 10348128 ACIS_00491 ACIS_00492     TRUE 0.973 -25.000 0.333 NA   NA
 10348128 10348129 ACIS_00492 ACIS_00493     TRUE 0.824 84.000 0.074 NA   NA
 10348129 10348130 ACIS_00493 ACIS_00494   rne TRUE 0.716 94.000 0.016 1.000 N NA
 10348130 10348131 ACIS_00494 ACIS_00495 rne dnaK FALSE 0.206 185.000 0.008 1.000 N NA
 10348131 10348132 ACIS_00495 ACIS_00496 dnaK   FALSE 0.014 237.000 0.000 NA N NA
 10348132 10348133 ACIS_00496 ACIS_00498     FALSE 0.375 75.000 0.004 NA N NA
 10348133 10348134 ACIS_00498 ACIS_00499     TRUE 0.931 -7.000 0.008 1.000 N NA
 10348134 10348135 ACIS_00499 ACIS_00500   era FALSE 0.165 95.000 0.003 0.020   NA
 10348135 10348136 ACIS_00500 ACIS_00501 era   TRUE 0.964 -6.000 0.021 1.000   NA
 10348136 10348137 ACIS_00501 ACIS_00503     FALSE 0.003 388.000 0.000 1.000   NA
 10348137 10348138 ACIS_00503 ACIS_00504     FALSE 0.674 126.000 0.022 0.032   NA
 10348138 10348139 ACIS_00504 ACIS_00505   hemD FALSE 0.221 197.000 0.013 1.000 N NA
 10348139 10348140 ACIS_00505 ACIS_00506 hemD   FALSE 0.109 126.000 0.003 1.000   NA
 10348140 10348141 ACIS_00506 ACIS_00507   priA FALSE 0.005 217.000 0.002 1.000   NA
 10348141 10348142 ACIS_00507 ACIS_00508 priA rpmB FALSE 0.002 557.000 0.000 1.000 N NA
 10348144 10348145 ACIS_00511 ACIS_00512 pccA   TRUE 0.716 104.000 0.021 NA   NA
 10348145 10348146 ACIS_00512 ACIS_00514     FALSE 0.160 283.000 0.500 NA   NA
 10348146 10348147 ACIS_00514 ACIS_00515   lipA FALSE 0.005 299.000 0.000 NA   NA
 10348147 10348148 ACIS_00515 ACIS_01310 lipA   TRUE 0.746 12.000 0.000 NA   NA
 10348148 10348149 ACIS_01310 ACIS_00516     TRUE 0.714 -4.000 0.000 NA   NA
 10348151 10348152 ACIS_00520 ACIS_00521 sodB virB3 FALSE 0.498 95.000 0.007 NA N NA
 10348152 10348153 ACIS_00521 ACIS_00522 virB3 virB4 TRUE 0.997 4.000 0.789 NA Y NA
 10348153 10348154 ACIS_00522 ACIS_00523 virB4 virB6 TRUE 0.994 -7.000 0.579 1.000 Y NA
 10348154 10348155 ACIS_00523 ACIS_00524 virB6   TRUE 0.843 181.000 0.818 0.005 Y NA
 10348155 10348156 ACIS_00524 ACIS_00526     TRUE 0.994 12.000 0.333 0.005 Y NA
 10348156 10348157 ACIS_00526 ACIS_00530     TRUE 0.988 24.000 0.429 0.005 Y NA
 10348160 10348161 ACIS_00534 ACIS_00535 dut ispH FALSE 0.019 202.000 0.002 1.000 N NA
 10348161 10348162 ACIS_00535 ACIS_00537 ispH carA FALSE 0.016 211.000 0.002 1.000 N NA
 10348165 10348166 ACIS_00541 ACIS_00543   lpdA TRUE 0.973 8.000 0.015 NA   NA
 10348166 10348167 ACIS_00543 ACIS_00544 lpdA   TRUE 0.927 -34.000 0.015 1.000 N NA
 10348167 10348168 ACIS_00544 ACIS_00545   infA FALSE 0.523 81.000 0.006 1.000 N NA
 10348168 10348169 ACIS_00545 ACIS_00546 infA maf TRUE 0.952 -6.000 0.012 NA N NA
 10348169 10348170 ACIS_00546 ACIS_00547 maf rpsB FALSE 0.629 82.000 0.008 NA N NA
 10348170 10348171 ACIS_00547 ACIS_00548 rpsB tsf TRUE 0.983 37.000 0.748 1.000 Y NA
 10348171 10348172 ACIS_00548 ACIS_00549 tsf   FALSE 0.246 27.000 0.002 NA   NA
 10348172 10348173 ACIS_00549 ACIS_00550     TRUE 0.981 6.000 0.032 NA   NA
 10348173 10348174 ACIS_00550 ACIS_00552     FALSE 0.011 244.000 0.000 NA   NA
 10348174 10348175 ACIS_00552 ACIS_00553   petA FALSE 0.018 222.000 0.000 NA   NA
 10348175 10348176 ACIS_00553 ACIS_00554 petA petB TRUE 0.989 12.000 0.024 0.003 Y NA
 10348176 10348177 ACIS_00554 ACIS_00555 petB petC TRUE 0.996 1.000 0.630 0.003 Y NA
 10348177 10348178 ACIS_00555 ACIS_00556 petC   FALSE 0.007 288.000 0.000 1.000   NA
 10348178 10348179 ACIS_00556 ACIS_00557     TRUE 0.978 28.000 1.000 NA   NA
 10348179 10348180 ACIS_00557 ACIS_00558     FALSE 0.007 283.000 0.000 NA   NA
 10348181 10348182 ACIS_00559 ACIS_00560   gltX TRUE 0.845 5.000 0.004 NA   NA
 10348183 10348184 ACIS_00561 ACIS_00562   pccB FALSE 0.234 82.000 0.000 NA   NA
 10348186 10348187 ACIS_00565 ACIS_00566 engB argB TRUE 0.964 -13.000 0.046 1.000   NA
 10348187 10348188 ACIS_00566 ACIS_00567 argB hemF FALSE 0.012 223.000 0.003 1.000 N NA
 10348188 10348189 ACIS_00567 ACIS_00568 hemF   FALSE 0.007 274.000 0.000 NA   NA
 10348191 10348192 ACIS_00570 ACIS_00571     FALSE 0.013 236.000 0.000 NA   NA
 10348194 10348195 ACIS_00575 ACIS_00576     TRUE 0.893 36.000 0.019 NA   NA
 10348195 10348196 ACIS_00576 ACIS_00577   nuoF FALSE 0.526 79.000 0.006 1.000 N NA
 10348196 10348197 ACIS_00577 ACIS_00578 nuoF nuoJ FALSE 0.307 190.000 0.005 0.008 Y NA
 10348197 10348198 ACIS_00578 ACIS_00579 nuoJ nuoK TRUE 0.977 40.000 0.484 0.008 Y NA
 10348198 10348199 ACIS_00579 ACIS_00580 nuoK nuoL TRUE 0.973 49.000 0.451 0.023 Y NA
 10348199 10348200 ACIS_00580 ACIS_00582 nuoL nuoM TRUE 0.993 -3.000 0.251 0.008 Y NA
 10348200 10348201 ACIS_00582 ACIS_00583 nuoM nuoN TRUE 0.995 -3.000 0.453 0.008 Y NA
 10348201 10348202 ACIS_00583 ACIS_00584 nuoN dxr TRUE 0.866 22.000 0.007 1.000 N NA
 10348202 10348203 ACIS_00584 ACIS_00585 dxr   FALSE 0.235 101.000 0.004 NA   NA
 10348203 10348204 ACIS_00585 ACIS_00588   ispG TRUE 0.878 28.000 0.009 NA   NA
 10348204 10348205 ACIS_00588 ACIS_00589 ispG tatC FALSE 0.402 135.000 0.007 NA N NA
 10348205 10348206 ACIS_00589 ACIS_00590 tatC   FALSE 0.106 231.000 0.014 NA N NA
 10348206 10348207 ACIS_00590 ACIS_00592   nusA FALSE 0.011 296.000 0.005 NA N NA
 10348207 10348208 ACIS_00592 ACIS_00594 nusA infB TRUE 0.977 19.000 0.342 1.000 N NA
 10348208 10348209 ACIS_00594 ACIS_00595 infB rbfA TRUE 0.995 -3.000 0.530 1.000 Y NA
 10348211 10348212 ACIS_00599 ACIS_00600 clpA typA FALSE 0.309 82.000 0.003 0.029 N NA
 10348214 10348215 ACIS_00602 ACIS_00603 orfY virB2 TRUE 0.768 0.000 0.000 NA   NA
 10348215 10348216 ACIS_00603 ACIS_00606 virB2   FALSE 0.004 367.000 0.000 NA   NA
 10348218 10348219 ACIS_00613 ACIS_00614   lepB TRUE 0.960 10.000 0.010 NA   NA
 10348219 10348220 ACIS_00614 ACIS_00615 lepB nuoI TRUE 0.942 18.000 0.013 1.000 N NA
 10348220 10348221 ACIS_00615 ACIS_00617 nuoI msp3 FALSE 0.205 98.000 0.000 1.000   NA
 10348222 10348223 ACIS_00618 ACIS_00619 ankA murB FALSE 0.007 283.000 0.000 NA   NA
 10348223 10348224 ACIS_00619 ACIS_00620 murB hemC TRUE 0.849 -25.000 0.006 1.000 N NA
 10348224 10348225 ACIS_00620 ACIS_00621 hemC folC FALSE 0.422 158.000 0.003 1.000 Y NA
 10348226 10348227 ACIS_00622 ACIS_00624 gatA   FALSE 0.005 325.000 0.003 NA   NA
 10348227 10348228 ACIS_00624 ACIS_00625   prfB FALSE 0.005 300.000 0.000 NA   NA
 10348229 10348230 ACIS_00626 ACIS_00628     FALSE 0.004 337.000 0.000 NA   NA
 10348230 10348231 ACIS_00628 ACIS_00629     TRUE 0.790 34.000 0.007 NA   NA
 10348232 10348233 ACIS_00630 ACIS_00633 ileS   FALSE 0.008 270.000 0.000 NA   NA
 10348234 10348235 ACIS_00634 ACIS_00635   recO FALSE 0.124 79.000 0.002 NA   NA
 10348236 10348237 ACIS_00636 ACIS_00637 argS   FALSE 0.169 112.000 0.000 NA   NA
 10348237 10348238 ACIS_00637 ACIS_01311     FALSE 0.218 87.000 0.000 NA   NA
 10348238 10348239 ACIS_01311 ACIS_00639   atpD FALSE 0.439 36.000 0.000 NA   NA
 10348239 10348240 ACIS_00639 ACIS_00640 atpD atpC TRUE 0.964 82.000 0.837 0.009 Y NA
 10348240 10348241 ACIS_00640 ACIS_00641 atpC   FALSE 0.576 -3.000 0.002 1.000 N NA
 10348241 10348242 ACIS_00641 ACIS_00644   pyrB FALSE 0.048 147.000 0.002 1.000 N NA
 10348242 10348243 ACIS_00644 ACIS_00645 pyrB truA TRUE 0.874 -3.000 0.005 1.000 N NA
 10348244 10348245 ACIS_00646 ACIS_00647   lysK TRUE 0.932 53.000 0.017 NA Y NA
 10348245 10348246 ACIS_00647 ACIS_00649 lysK   FALSE 0.005 304.000 0.000 1.000   NA
 10348247 10348248 ACIS_00650 ACIS_00651   iscS TRUE 0.973 33.000 0.052 0.002 Y NA
 10348248 10348249 ACIS_00651 ACIS_00652 iscS nifU TRUE 0.990 9.000 0.448 1.000 N NA
 10348249 10348250 ACIS_00652 ACIS_00653 nifU   TRUE 0.960 -22.000 0.056 NA   NA
 10348250 10348251 ACIS_00653 ACIS_00654   hscB TRUE 0.970 -7.000 0.046 NA   NA
 10348251 10348252 ACIS_00654 ACIS_00655 hscB hscA TRUE 0.993 -12.000 0.634 NA Y NA
 10348252 10348253 ACIS_00655 ACIS_00656 hscA fdx TRUE 0.952 26.000 0.091 NA N NA
 10348253 10348254 ACIS_00656 ACIS_00657 fdx   TRUE 0.916 34.000 0.029 NA   NA
 10348254 10348255 ACIS_00657 ACIS_00658     FALSE 0.166 116.000 0.000 NA   NA
 10348257 10348258 ACIS_00662 ACIS_00663 gyrB   FALSE 0.092 178.000 0.004 NA   NA
 10348258 10348259 ACIS_00663 ACIS_00664   nuoG TRUE 0.981 8.000 0.033 NA   NA
 10348259 10348260 ACIS_00664 ACIS_00665 nuoG nuoH TRUE 0.990 23.000 0.515 0.023 Y NA
 10348261 10348262 ACIS_00669 ACIS_00670     FALSE 0.003 398.000 0.000 NA   NA
 10348263 10348264 ACIS_00671 ACIS_00672 rpoH   TRUE 0.709 -6.000 0.000 NA   NA
 10348264 10348265 ACIS_00672 ACIS_00673     TRUE 0.794 4.000 0.000 NA   NA
 10348265 10348266 ACIS_00673 ACIS_00674     FALSE 0.163 118.000 0.000 NA   NA
 10348268 10348269 ACIS_00676 ACIS_00677 mutM   FALSE 0.002 543.000 0.000 NA   NA
 10348270 10348271 ACIS_00678 ACIS_00679     FALSE 0.152 125.000 0.000 NA   NA
 10348271 10348272 ACIS_00679 ACIS_00680     FALSE 0.002 443.000 0.000 NA   NA
 10348272 10348273 ACIS_00680 ACIS_00681     FALSE 0.003 387.000 0.000 NA   NA
 10348274 10348275 ACIS_01312 ACIS_00684     FALSE 0.002 532.000 0.000 NA   NA
 10348278 10348279 ACIS_00687 ACIS_00688     FALSE 0.003 438.000 0.000 NA   NA
 10348281 10348282 ACIS_00690 ACIS_00691 dnaQ nuoE TRUE 0.904 -10.000 0.007 1.000 N NA
 10348282 10348283 ACIS_00691 ACIS_00692 nuoE nuoD TRUE 0.996 5.000 0.355 0.009 Y NA
 10348284 10348285 ACIS_00694 ACIS_00695 atpG folE TRUE 0.960 7.000 0.008 1.000 N NA
 10348285 10348286 ACIS_00695 ACIS_00696 folE pmbA TRUE 0.968 10.000 0.015 NA   NA
 10348286 10348287 ACIS_00696 ACIS_00697 pmbA trxB FALSE 0.437 81.000 0.005 NA   NA
 10348287 10348288 ACIS_00697 ACIS_00698 trxB   FALSE 0.016 225.000 0.000 NA   NA
 10348288 10348289 ACIS_00698 ACIS_00700     TRUE 0.852 137.000 1.000 NA   NA
 10348290 10348291 ACIS_00701 ACIS_00703     FALSE 0.014 230.000 0.000 NA   NA
 10348291 10348292 ACIS_00703 ACIS_00707     FALSE 0.009 252.000 0.000 NA   NA
 10348293 10348294 ACIS_00710 ACIS_00712   mraW FALSE 0.031 166.000 0.002 1.000 N NA
 10348294 10348295 ACIS_00712 ACIS_00713 mraW   TRUE 0.985 4.000 0.089 NA   NA
 10348296 10348297 ACIS_00714 ACIS_00715 obgE eno TRUE 0.959 2.000 0.009 1.000   NA
 10348298 10348299 ACIS_00716 ACIS_00718 rplU rpmA TRUE 0.997 4.000 0.667 0.042 Y NA
 10348299 10348300 ACIS_00718 ACIS_01313 rpmA   TRUE 0.799 7.000 0.000 NA   NA
 10348300 10348301 ACIS_01313 ACIS_00719     FALSE 0.303 63.000 0.000 NA   NA
 10348302 10348303 ACIS_00720 ACIS_00721   rpmJ TRUE 0.881 29.000 0.010 1.000   NA
 10348304 10348305 ACIS_00722 ACIS_00724   xth TRUE 0.746 124.000 0.069 1.000   NA
 10348305 10348306 ACIS_00724 ACIS_00725 xth rlpA TRUE 0.762 61.000 0.010 NA   NA
 10348310 10348311 ACIS_00730 ACIS_00732 putA   FALSE 0.002 878.000 0.000 NA   NA
 10348311 10348312 ACIS_00732 ACIS_00733     TRUE 0.984 10.000 0.143 NA   NA
 10348312 10348313 ACIS_00733 ACIS_00734     TRUE 0.989 0.000 0.429 NA   NA
 10348313 10348314 ACIS_00734 ACIS_00735     TRUE 0.978 -25.000 0.500 NA   NA
 10348314 10348315 ACIS_00735 ACIS_00736     FALSE 0.345 51.000 0.000 NA   NA
 10348315 10348316 ACIS_00736 ACIS_00737     FALSE 0.241 81.000 0.000 NA   NA
 10348316 10348317 ACIS_00737 ACIS_00738     FALSE 0.107 148.000 0.000 NA   NA
 10348318 10348319 ACIS_00739 ACIS_00740   ubiG FALSE 0.140 50.000 0.002 1.000   NA
 10348319 10348320 ACIS_00740 ACIS_00742 ubiG rpiB FALSE 0.629 106.000 0.011 1.000 N NA
 10348322 10348323 ACIS_00745 ACIS_00746 mdh folB TRUE 0.842 46.000 0.015 1.000 N NA
 10348325 10348326 ACIS_00748 ACIS_00749     TRUE 0.952 9.000 0.008 1.000   NA
 10348326 10348327 ACIS_00749 ACIS_00750   tpiA TRUE 0.981 16.000 0.353 1.000   NA
 10348327 10348328 ACIS_00750 ACIS_01331 tpiA   FALSE 0.701 15.000 0.000 NA   NA
 10348330 10348331 ACIS_00752 ACIS_01330     FALSE 0.258 76.000 0.000 NA   NA
 10348331 10348332 ACIS_01330 ACIS_00753   bioA FALSE 0.007 278.000 0.000 NA   NA
 10348332 10348333 ACIS_00753 ACIS_00754 bioA   FALSE 0.099 182.000 0.005 1.000   NA
 10348335 10348336 ACIS_00757 ACIS_00758     FALSE 0.005 319.000 0.000 NA   NA
 10348336 10348337 ACIS_00758 ACIS_00760     FALSE 0.055 182.000 0.000 NA   NA
 10348337 10348338 ACIS_00760 ACIS_00761     FALSE 0.002 829.000 0.000 NA   NA
 10348338 10348339 ACIS_00761 ACIS_00762     FALSE 0.003 417.000 0.000 NA   NA
 10348339 10348340 ACIS_00762 ACIS_00764     TRUE 0.950 37.000 0.400 NA   NA
 10348340 10348341 ACIS_00764 ACIS_00765     FALSE 0.002 1285.000 0.000 NA   NA
 10348341 10348342 ACIS_00765 ACIS_00766   mlp2-1 FALSE 0.555 24.000 0.000 NA   NA
 10348342 10348343 ACIS_00766 ACIS_00768 mlp2-1 mlp4 FALSE 0.003 389.000 0.000 NA   NA
 10348343 10348344 ACIS_00768 ACIS_00770 mlp4 mlp3 FALSE 0.002 505.000 0.000 NA   NA
 10348344 10348345 ACIS_00770 ACIS_00771 mlp3 mlp2-2 FALSE 0.555 24.000 0.000 NA   NA
 10348345 10348346 ACIS_00771 ACIS_00773 mlp2-2 msp1aS FALSE 0.003 389.000 0.000 NA   NA
 10348348 10348349 ACIS_00776 ACIS_00777 lepA   FALSE 0.238 135.000 0.005 1.000   NA
 10348349 10348350 ACIS_00777 ACIS_00779   pnp TRUE 0.942 6.000 0.007 1.000   NA
 10348350 10348351 ACIS_00779 ACIS_00780 pnp rpsO TRUE 0.966 55.000 0.335 1.000 Y NA
 10348351 10348352 ACIS_00780 ACIS_00781 rpsO truB TRUE 0.972 38.000 0.211 1.000 Y NA
 10348355 10348356 ACIS_01315 ACIS_00787     FALSE 0.002 1374.000 0.000 NA   NA
 10348356 10348357 ACIS_00787 ACIS_00788     TRUE 0.784 1.000 0.003 1.000   NA
 10348357 10348358 ACIS_00788 ACIS_00790     FALSE 0.013 199.000 0.002 1.000   NA
 10348360 10348361 ACIS_00793 ACIS_00794   trxB TRUE 0.989 -3.000 0.024 1.000 Y NA
 10348363 10348364 ACIS_01316 ACIS_00797     FALSE 0.223 85.000 0.000 NA   NA
 10348364 10348365 ACIS_00797 ACIS_00798   proS FALSE 0.006 299.000 0.000 1.000   NA
 10348365 10348366 ACIS_00798 ACIS_00799 proS acpS TRUE 0.957 -3.000 0.011 1.000 N NA
 10348366 10348367 ACIS_00799 ACIS_01317 acpS   FALSE 0.003 436.000 0.000 NA   NA
 10348367 10348368 ACIS_01317 ACIS_00801     FALSE 0.002 576.000 0.000 NA   NA
 10348369 10348370 ACIS_00802 ACIS_00803 topA   FALSE 0.095 158.000 0.000 NA N NA
 10348370 10348371 ACIS_00803 ACIS_00805     FALSE 0.093 154.000 0.000 NA   NA
 10348372 10348373 ACIS_00806 ACIS_00807     FALSE 0.019 222.000 0.000 1.000   NA
 10348373 10348374 ACIS_00807 ACIS_00808   cutA TRUE 0.736 45.000 0.007 1.000 N NA
 10348374 10348375 ACIS_00808 ACIS_00810 cutA   FALSE 0.004 354.000 0.000 NA   NA
 10348377 10348378 ACIS_00813 ACIS_00814   rpoD FALSE 0.117 151.000 0.003 1.000 N NA
 10348379 10348380 ACIS_00815 ACIS_00816 dnaG   FALSE 0.058 139.000 0.002 NA   NA
 10348382 10348383 ACIS_00819 ACIS_00820   nrdF TRUE 0.903 38.000 0.032 1.000 N NA
 10348383 10348384 ACIS_00820 ACIS_00821 nrdF cysS FALSE 0.013 241.000 0.000 1.000 N NA
 10348384 10348385 ACIS_00821 ACIS_00822 cysS   TRUE 0.732 2.000 0.003 NA   NA
 10348386 10348387 ACIS_00825 ACIS_00826 gdh   TRUE 0.978 -7.000 0.160 1.000   NA
 10348387 10348388 ACIS_00826 ACIS_00827   pleD FALSE 0.102 254.000 0.029 1.000   NA
 10348389 10348390 ACIS_00828 ACIS_00829 rluC   TRUE 0.863 -3.000 0.005 1.000 N NA
 10348390 10348391 ACIS_00829 ACIS_00830   efp TRUE 0.983 3.000 0.047 1.000 N NA
 10348391 10348392 ACIS_00830 ACIS_00831 efp murG FALSE 0.038 151.000 0.002 1.000 N NA
 10348393 10348394 ACIS_00832 ACIS_00837     FALSE 0.003 423.000 0.000 NA   NA
 10348394 10348395 ACIS_00837 ACIS_00839   psd FALSE 0.008 280.000 0.000 1.000 N NA
 10348395 10348396 ACIS_00839 ACIS_00840 psd pssA TRUE 0.967 61.000 0.466 1.000 Y NA
 10348396 10348397 ACIS_00840 ACIS_00841 pssA yidC FALSE 0.005 320.000 0.000 1.000 N NA
 10348397 10348398 ACIS_00841 ACIS_00842 yidC ribH TRUE 0.835 39.000 0.011 1.000 N NA
 10348398 10348399 ACIS_00842 ACIS_00843 ribH nusB TRUE 0.990 5.000 0.347 1.000 N NA
 10348399 10348400 ACIS_00843 ACIS_00844 nusB uvrA FALSE 0.467 34.000 0.003 1.000 N NA
 10348400 10348401 ACIS_00844 ACIS_00846 uvrA nuoA FALSE 0.003 462.000 0.000 1.000 N NA
 10348401 10348402 ACIS_00846 ACIS_00847 nuoA nuoB TRUE 0.996 5.000 0.507 0.007 Y NA
 10348402 10348403 ACIS_00847 ACIS_00848 nuoB nuoC TRUE 0.996 6.000 0.328 0.007 Y NA
 10348403 10348404 ACIS_00848 ACIS_00849 nuoC surE FALSE 0.002 493.000 0.000 1.000   NA
 10348404 10348405 ACIS_00849 ACIS_00850 surE ccmE FALSE 0.609 122.000 0.013 1.000   NA
 10348406 10348407 ACIS_00851 ACIS_00852 pyrF   TRUE 0.766 -10.000 0.004 NA N NA
 10348407 10348408 ACIS_00852 ACIS_00854   leuS FALSE 0.006 295.000 0.000 NA N NA
 10348409 10348410 ACIS_00856 ACIS_00857     FALSE 0.113 144.000 0.000 NA   NA
 10348410 10348411 ACIS_00857 ACIS_00858   rpoZ TRUE 0.742 -3.000 0.000 NA   NA
 10348411 10348412 ACIS_00858 ACIS_00859 rpoZ   FALSE 0.546 105.000 0.008 NA   NA
 10348412 10348413 ACIS_00859 ACIS_00860   thiC FALSE 0.648 45.000 0.006 NA   NA
 10348415 10348416 ACIS_00862 ACIS_00863     TRUE 0.960 0.000 0.010 NA N NA
 10348416 10348417 ACIS_00863 ACIS_00864     FALSE 0.162 210.000 0.000 1.000 Y NA
 10348418 10348419 ACIS_00866 ACIS_00867 pdxJ   FALSE 0.406 173.000 0.005 1.000 Y NA
 10348421 10348422 ACIS_00869 ACIS_00870 dnaA fabI FALSE 0.013 241.000 0.000 1.000 N NA
 10348422 10348423 ACIS_00870 ACIS_01329 fabI   TRUE 0.796 8.000 0.000 NA   NA
 10348423 10348424 ACIS_01329 ACIS_00871   gatB FALSE 0.003 419.000 0.000 NA   NA
 10348424 10348425 ACIS_00871 ACIS_00872 gatB mcd TRUE 0.906 13.000 0.006 1.000   NA
 10348427 10348428 ACIS_00875 ACIS_00877     FALSE 0.034 201.000 0.000 0.015   NA
 10348428 10348429 ACIS_00877 ACIS_00878     FALSE 0.671 162.000 0.333 NA   NA
 10348429 10348430 ACIS_00878 ACIS_00879   pbpA TRUE 0.886 67.000 0.182 NA N NA
 10348431 10348432 ACIS_00880 ACIS_00881 hemB nadE TRUE 0.988 7.000 0.010 1.000 Y NA
 10348433 10348434 ACIS_00883 ACIS_00884     TRUE 0.901 107.000 1.000 0.015   NA
 10348437 10348438 ACIS_00888 ACIS_00889     FALSE 0.207 93.000 0.000 NA   NA
 10348438 10348439 ACIS_00889 ACIS_00890     TRUE 0.952 -3.000 0.010 NA   NA
 10348439 10348440 ACIS_00890 ACIS_00892   dapA FALSE 0.040 198.000 0.003 1.000 N NA
 10348440 10348441 ACIS_00892 ACIS_00894 dapA   FALSE 0.019 217.000 0.000 NA   NA
 10348443 10348444 ACIS_00897 ACIS_00899     FALSE 0.005 296.000 0.000 NA   NA
 10348444 10348445 ACIS_00899 ACIS_00900     FALSE 0.043 137.000 0.002 NA   NA
 10348446 10348447 ACIS_00901 ACIS_00902     FALSE 0.599 38.000 0.005 NA   NA
 10348447 10348448 ACIS_00902 ACIS_00904     TRUE 0.963 -7.000 0.022 1.000   NA
 10348449 10348450 ACIS_00905 ACIS_00906     FALSE 0.010 247.000 0.000 NA   NA
 10348451 10348452 ACIS_00907 ACIS_00908 recR   FALSE 0.010 263.000 0.000 1.000 N NA
 10348453 10348454 ACIS_00909 ACIS_00910   gst TRUE 0.883 83.000 0.015 NA Y NA
 10348454 10348455 ACIS_00910 ACIS_00911 gst birA TRUE 0.975 10.000 0.023 1.000 N NA
 10348455 10348456 ACIS_00911 ACIS_00915 birA   FALSE 0.002 457.000 0.000 NA   NA
 10348457 10348458 ACIS_00916 ACIS_01328 uvrC   FALSE 0.009 250.000 0.000 NA   NA
 10348458 10348459 ACIS_01328 ACIS_01327     FALSE 0.323 57.000 0.000 NA   NA
 10348460 10800756 ACIS_00917 ACIS_00918 purB   FALSE 0.496 31.000 0.000 NA   NA
 10348461 10348462 ACIS_00919 ACIS_00921     FALSE 0.003 399.000 0.000 NA   NA
 10348462 10348463 ACIS_00921 ACIS_00922   htpG FALSE 0.008 272.000 0.000 1.000   NA
 10348463 10348464 ACIS_00922 ACIS_00923 htpG   TRUE 0.732 61.000 0.008 NA   NA
 10348464 10348465 ACIS_00923 ACIS_00924   nth FALSE 0.004 347.000 0.000 NA   NA
 10348465 10348466 ACIS_00924 ACIS_00926 nth gyrA TRUE 0.971 0.000 0.005 1.000 Y NA
 10348466 10348467 ACIS_00926 ACIS_00929 gyrA   FALSE 0.009 257.000 0.000 NA   NA
 10348467 10348468 ACIS_00929 ACIS_00931   alp3 FALSE 0.002 500.000 0.000 NA   NA
 10348468 10348469 ACIS_00931 ACIS_00932 alp3   FALSE 0.027 203.000 0.000 NA   NA
 10348469 10348470 ACIS_00932 ACIS_00933     FALSE 0.051 183.000 0.000 NA   NA
 10348470 10348471 ACIS_00933 ACIS_00934     FALSE 0.014 229.000 0.000 NA   NA
 10348472 10348473 ACIS_00935 ACIS_00938 uvrD   FALSE 0.002 536.000 0.000 NA   NA
 10348473 10348474 ACIS_00938 ACIS_00940     FALSE 0.002 670.000 0.000 NA   NA
 10348474 10348475 ACIS_00940 ACIS_00943     FALSE 0.002 1043.000 0.000 NA   NA
 10348475 10348476 ACIS_00943 ACIS_00945     FALSE 0.002 961.000 0.000 NA   NA
 10348476 10348477 ACIS_00945 ACIS_00946     FALSE 0.005 322.000 0.000 NA   NA
 10348478 10348479 ACIS_00948 ACIS_00950   coq7 TRUE 0.740 57.000 0.008 NA   NA
 10348481 10348482 ACIS_00952 ACIS_00954     FALSE 0.002 1109.000 0.000 NA   NA
 10348482 10348483 ACIS_00954 ACIS_00955     TRUE 0.979 0.000 0.045 NA   NA
 10348484 10348485 ACIS_00956 ACIS_00958 rpmG acpP FALSE 0.002 908.000 0.000 1.000 N NA
 10348485 10348486 ACIS_00958 ACIS_00959 acpP fabF TRUE 0.878 132.000 0.106 1.000 Y NA
 10348486 10348487 ACIS_00959 ACIS_00960 fabF   FALSE 0.004 344.000 0.000 NA N NA
 10348487 10348488 ACIS_00960 ACIS_00961   trmU FALSE 0.061 190.000 0.004 NA N NA
 10348492 10348493 ACIS_00969 ACIS_00970 tolQ tolR TRUE 0.990 -19.000 0.333 0.018 Y NA
 10348493 10348494 ACIS_00970 ACIS_00972 tolR   TRUE 0.968 -28.000 0.250 NA   NA
 10348496 10348497 ACIS_00974 ACIS_00975 argD   TRUE 0.792 137.000 0.429 NA   NA
 10348498 10348499 ACIS_00977 ACIS_00980     FALSE 0.002 1565.000 0.000 NA   NA
 10348499 10348500 ACIS_00980 ACIS_00982     TRUE 0.944 -25.000 0.021 1.000   NA
 10348502 10348503 ACIS_00985 ACIS_00986 thiE   FALSE 0.003 413.000 0.000 NA   NA
 10348503 10348504 ACIS_00986 ACIS_00987     FALSE 0.122 204.000 0.008 NA   NA
 10348504 10348505 ACIS_00987 ACIS_00988   fmt FALSE 0.028 148.000 0.002 NA   NA
 10348505 10348506 ACIS_00988 ACIS_01326 fmt   FALSE 0.198 97.000 0.000 NA   NA
 10348506 10348507 ACIS_01326 ACIS_00989   lon FALSE 0.004 358.000 0.000 NA   NA
 10348507 10348508 ACIS_00989 ACIS_00990 lon clpX TRUE 0.988 19.000 0.201 1.000 Y NA
 10348508 10348509 ACIS_00990 ACIS_00991 clpX clpP TRUE 0.995 10.000 0.352 1.000 Y NA
 10348509 10348510 ACIS_00991 ACIS_00992 clpP tig TRUE 0.996 5.000 0.351 1.000 Y NA
 10348510 10348511 ACIS_00992 ACIS_01325 tig   FALSE 0.439 36.000 0.000 NA   NA
 10348511 10348512 ACIS_01325 ACIS_01324     FALSE 0.130 136.000 0.000 NA   NA
 10348513 10348514 ACIS_00993 ACIS_00994   pgpA FALSE 0.301 127.000 0.005 NA   NA
 10348514 10348515 ACIS_00994 ACIS_00995 pgpA   TRUE 0.935 -33.000 0.018 1.000   NA
 10348515 10348516 ACIS_00995 ACIS_00996     TRUE 0.939 60.000 0.700 NA   NA
 10348517 10348518 ACIS_01323 ACIS_00997   rpsD FALSE 0.701 15.000 0.000 NA   NA
 10348519 10348520 ACIS_00998 ACIS_00999     FALSE 0.002 502.000 0.000 NA   NA
 10348520 10348521 ACIS_00999 ACIS_01000     TRUE 0.989 1.000 0.362 NA   NA
 10348521 10348522 ACIS_01000 ACIS_01001   thiD TRUE 0.982 8.000 0.038 1.000   NA
 10348523 10348524 ACIS_01002 ACIS_01003     FALSE 0.172 110.000 0.000 NA   NA
 10348524 10348525 ACIS_01003 ACIS_01004   sdhD FALSE 0.282 166.000 0.008 NA   NA
 10348525 10348526 ACIS_01004 ACIS_01005 sdhD sdhC TRUE 0.993 -9.000 0.453 0.002 Y NA
 10348526 10348527 ACIS_01005 ACIS_01352 sdhC   FALSE 0.213 89.000 0.000 NA   NA
 10348527 10348528 ACIS_01352 ACIS_01006   aroA FALSE 0.021 216.000 0.000 NA   NA
 10348528 10348529 ACIS_01006 ACIS_01007 aroA dnaE FALSE 0.014 237.000 0.000 1.000 N NA
 10348530 10348531 ACIS_01010 ACIS_01011 bolA metC TRUE 0.969 -3.000 0.018 NA N NA
 10348531 10348532 ACIS_01011 ACIS_01012 metC murE FALSE 0.191 191.000 0.008 1.000 N NA
 10348533 10348534 ACIS_01013 ACIS_01015 pdhX   FALSE 0.006 372.000 0.004 1.000   NA
 10348534 10348535 ACIS_01015 ACIS_01016     FALSE 0.004 353.000 0.000 NA   NA
 10348535 10348536 ACIS_01016 ACIS_01017     FALSE 0.018 222.000 0.000 NA   NA
 10348537 10348538 ACIS_01019 ACIS_01021 pyrD panK TRUE 0.966 7.000 0.010 1.000 N NA
 10348540 10348541 ACIS_01023 ACIS_01024   bioF FALSE 0.091 156.000 0.000 NA   NA
 10348541 10348542 ACIS_01024 ACIS_01318 bioF   FALSE 0.038 192.000 0.000 NA   NA
 10348542 10348543 ACIS_01318 ACIS_01026     FALSE 0.345 51.000 0.000 NA   NA
 10348544 10348545 ACIS_01027 ACIS_01028     FALSE 0.005 317.000 0.000 NA   NA
 10348547 10348548 ACIS_01030 ACIS_01032 rpoC rpoB TRUE 0.991 12.000 0.851 0.003   NA
 10348548 10348549 ACIS_01032 ACIS_01033 rpoB rplL TRUE 0.935 38.000 0.223 1.000   NA
 10348549 10348550 ACIS_01033 ACIS_01034 rplL rplJ TRUE 0.924 141.000 0.884 1.000 Y NA
 10348550 10348551 ACIS_01034 ACIS_01035 rplJ rplA TRUE 0.978 35.000 0.302 1.000 Y NA
 10348551 10348552 ACIS_01035 ACIS_01036 rplA rplK TRUE 0.992 21.000 0.838 0.050 Y NA
 10348552 10348553 ACIS_01036 ACIS_01038 rplK nusG TRUE 0.992 4.000 0.681 1.000 N NA
 10348553 10348554 ACIS_01038 ACIS_01039 nusG secE TRUE 0.987 -10.000 0.843 1.000   NA
 10348554 10348555 ACIS_01039 ACIS_01322 secE   FALSE 0.701 15.000 0.000 NA   NA
 10348555 10348556 ACIS_01322 ACIS_01040   tuf FALSE 0.701 15.000 0.000 NA   NA
 10348556 10348557 ACIS_01040 ACIS_01042 tuf fusA TRUE 0.990 16.000 0.102 0.003 Y NA
 10348557 10348558 ACIS_01042 ACIS_01044 fusA rpsG TRUE 0.975 34.000 0.114 1.000 Y NA
 10348558 10348559 ACIS_01044 ACIS_01045 rpsG rpsL TRUE 0.993 18.000 0.620 0.008 Y NA
 10348559 10348560 ACIS_01045 ACIS_01046 rpsL   FALSE 0.034 185.000 0.003 1.000   NA
 10348560 10348561 ACIS_01046 ACIS_01047     TRUE 0.886 73.000 0.286 NA   NA
 10348562 10348563 ACIS_01048 ACIS_01049   tolB TRUE 0.894 7.000 0.005 1.000   NA
 10348565 10348566 ACIS_01051 ACIS_01052     TRUE 0.759 88.000 0.022 1.000   NA
 10348568 10348569 ACIS_01055 ACIS_01056 cybB   TRUE 0.984 2.000 0.086 0.014   NA
 10348569 10348570 ACIS_01056 ACIS_01057   msp5 FALSE 0.486 183.000 0.097 0.033   NA
 10348570 10348571 ACIS_01057 ACIS_01058 msp5 pstS TRUE 0.942 48.000 0.500 1.000   NA
 10348571 10348572 ACIS_01058 ACIS_01059 pstS rpsU TRUE 0.857 108.000 0.462 1.000   NA
 10348572 10348573 ACIS_01059 ACIS_01060 rpsU sucC TRUE 0.742 103.000 0.028 1.000   NA
 10348573 10348574 ACIS_01060 ACIS_01062 sucC sucD TRUE 0.995 9.000 0.256 0.002 Y NA
 10348575 10348576 ACIS_01063 ACIS_01064   alaS FALSE 0.011 245.000 0.000 NA   NA
 10348577 10348578 ACIS_01065 ACIS_01066 pstC glnA TRUE 0.877 -22.000 0.007 1.000 N NA
 10348579 10348580 ACIS_01067 ACIS_01068     FALSE 0.152 177.000 0.005 NA   NA
 10348580 10348581 ACIS_01068 ACIS_01069     TRUE 0.989 -3.000 0.667 NA   NA
 10348581 10348582 ACIS_01069 ACIS_01071     TRUE 0.992 10.000 0.889 NA   NA
 10348582 10348583 ACIS_01071 ACIS_01072     TRUE 0.867 93.000 0.375 NA   NA
 10348583 10348584 ACIS_01072 ACIS_01073     FALSE 0.643 -16.000 0.000 NA   NA
 10348586 10348587 ACIS_01076 ACIS_01077   ntrX FALSE 0.010 246.000 0.000 NA   NA
 10348587 10348588 ACIS_01077 ACIS_01078 ntrX ftsQ FALSE 0.012 242.000 0.000 NA N NA
 10348588 10348589 ACIS_01078 ACIS_01079 ftsQ ddlB TRUE 0.990 -22.000 0.372 NA Y NA
 10348589 10348590 ACIS_01079 ACIS_01080 ddlB gshB FALSE 0.178 135.000 0.004 1.000 N NA
 10348590 10348591 ACIS_01080 ACIS_01081 gshB   TRUE 0.964 15.000 0.023 NA   NA
 10348592 10348593 ACIS_01082 ACIS_01083 aspS   FALSE 0.012 187.000 0.002 1.000   NA
 10348593 10348594 ACIS_01083 ACIS_01084     TRUE 0.991 3.000 0.500 NA   NA
 10348594 10348595 ACIS_01084 ACIS_01086   ppdK FALSE 0.005 296.000 0.000 NA   NA
 10348595 10348596 ACIS_01086 ACIS_01088 ppdK nuoL FALSE 0.004 370.000 0.000 1.000 N NA
 10348596 10348597 ACIS_01088 ACIS_01090 nuoL cycM FALSE 0.021 403.000 0.000 1.000 Y NA
 10348597 10348598 ACIS_01090 ACIS_01091 cycM   FALSE 0.186 108.000 0.000 1.000   NA
 10348598 10348599 ACIS_01091 ACIS_01093     FALSE 0.199 96.000 0.000 NA   NA
 10348599 10348600 ACIS_01093 ACIS_01094     FALSE 0.274 68.000 0.000 NA   NA
 10348601 10348602 ACIS_01095 ACIS_01096     FALSE 0.274 68.000 0.000 NA   NA
 10348602 10348603 ACIS_01096 ACIS_01097   msp1B-1 FALSE 0.006 291.000 0.000 NA   NA
 10348603 10348604 ACIS_01097 ACIS_01321 msp1B-1   FALSE 0.003 413.000 0.000 NA   NA
 10348604 10348605 ACIS_01321 ACIS_01098   folD FALSE 0.521 28.000 0.000 NA   NA
 10348605 10348606 ACIS_01098 ACIS_01100 folD   FALSE 0.618 150.000 0.034 1.000 N NA
 10348606 10348607 ACIS_01100 ACIS_01101   gmk FALSE 0.086 127.000 0.002 1.000 N NA
 10348608 10348609 ACIS_01102 ACIS_01103   ruvA TRUE 0.920 -3.000 0.007 1.000 N NA
 10348609 10348610 ACIS_01103 ACIS_01104 ruvA ruvB TRUE 0.995 -3.000 0.549 0.003 Y NA
 10348611 10348612 ACIS_01105 ACIS_01106 bcr thyX FALSE 0.227 136.000 0.005 NA N NA
 10348612 10348613 ACIS_01106 ACIS_01107 thyX sdhB TRUE 0.932 1.000 0.006 1.000 N NA
 10348613 10348614 ACIS_01107 ACIS_01108 sdhB sdhA TRUE 0.989 25.000 0.604 0.004 Y NA
 10348614 10348615 ACIS_01108 ACIS_01109 sdhA   FALSE 0.009 271.000 0.000 1.000 N NA
 10348615 10348616 ACIS_01109 ACIS_01110     TRUE 0.980 8.000 0.028 NA N NA
 10348616 10348617 ACIS_01110 ACIS_01111   glyA FALSE 0.599 143.000 0.021 NA N NA
 10348617 10348618 ACIS_01111 ACIS_01113 glyA rplI TRUE 0.805 26.000 0.006 1.000 N NA
 10348618 10348619 ACIS_01113 ACIS_01114 rplI rpsR TRUE 0.994 15.000 0.499 0.037 Y NA
 10348619 10348620 ACIS_01114 ACIS_01115 rpsR rpsF TRUE 0.995 4.000 0.319 0.037 Y NA
 10348620 10348621 ACIS_01115 ACIS_01116 rpsF   FALSE 0.555 67.000 0.006 1.000   NA
 10348621 10348622 ACIS_01116 ACIS_01118     TRUE 0.960 11.000 0.012 NA   NA
 10348623 10348624 ACIS_01119 ACIS_01120 radA   TRUE 0.916 9.000 0.005 1.000   NA
 10348624 10348625 ACIS_01120 ACIS_01121   bolA FALSE 0.371 144.000 0.007 NA   NA
 10348625 10348626 ACIS_01121 ACIS_01122 bolA   TRUE 0.977 -10.000 0.216 NA N NA
 10348626 10348627 ACIS_01122 ACIS_01124   ligA TRUE 0.935 9.000 0.006 1.000 N NA
 10348628 10348629 ACIS_01125 ACIS_01126 rnd ntrY TRUE 0.901 -31.000 0.009 1.000 N NA
 10348629 10348630 ACIS_01126 ACIS_01127 ntrY   TRUE 0.892 41.000 0.032 1.000 N NA
 10348631 10348632 ACIS_01128 ACIS_01129   dcd FALSE 0.308 99.000 0.004 NA N NA
 10348632 10348633 ACIS_01129 ACIS_01131 dcd murA TRUE 0.941 2.000 0.007 1.000 N NA
 10348633 10348634 ACIS_01131 ACIS_01132 murA ccmA TRUE 0.806 33.000 0.007 1.000 N NA
 10348635 10348636 ACIS_01133 ACIS_01134 panB coxW FALSE 0.328 35.000 0.002 1.000 N NA
 10348639 10348640 ACIS_01137 ACIS_01138 purC   FALSE 0.145 144.000 0.004 NA   NA
 10348641 10348642 ACIS_01142 ACIS_01143 cdsA uppS TRUE 0.955 35.000 0.400 1.000   NA
 10348642 10348643 ACIS_01143 ACIS_01144 uppS frr TRUE 0.985 14.000 0.409 1.000 N NA
 10348643 10348644 ACIS_01144 ACIS_01145 frr pyrH TRUE 0.992 9.000 0.626 1.000 N NA
 10348644 10348645 ACIS_01145 ACIS_01146 pyrH   FALSE 0.222 41.000 0.002 1.000   NA
 10348645 10348646 ACIS_01146 ACIS_01147   rnhA TRUE 0.896 31.000 0.014 1.000   NA
 10348647 10348648 ACIS_01148 ACIS_01150 mfd msp1B-2 FALSE 0.202 38.000 0.002 NA   NA
 10348648 10348649 ACIS_01150 ACIS_01151 msp1B-2 ribE FALSE 0.004 328.000 0.000 NA   NA
 10348650 10348651 ACIS_01152 ACIS_01153     FALSE 0.006 292.000 0.000 1.000   NA
 10348653 10348654 ACIS_01155 ACIS_01156   secB TRUE 0.946 18.000 0.015 NA N NA
 10348656 10348657 ACIS_01158 ACIS_01159   tmk TRUE 0.938 9.000 0.007 NA N NA
 10348657 10348658 ACIS_01159 ACIS_01160 tmk fabD TRUE 0.835 2.000 0.003 1.000 N NA
 10348659 10348660 ACIS_01161 ACIS_01163 rpmE ppnK TRUE 0.968 -3.000 0.018 1.000 N NA
 10348660 10348661 ACIS_01163 ACIS_01164 ppnK guaB FALSE 0.581 58.000 0.005 1.000 N NA
 10348662 10348663 ACIS_01351 ACIS_01353     FALSE 0.221 86.000 0.000 NA   NA
 10348664 10348665 ACIS_01166 ACIS_01167   pdhA TRUE 0.885 -28.000 0.008 NA   NA
 10348665 10348666 ACIS_01167 ACIS_01168 pdhA trbG FALSE 0.010 251.000 0.000 NA N NA
 10348666 10348667 ACIS_01168 ACIS_01169 trbG trxA TRUE 0.890 21.000 0.008 NA N NA
 10348669 10348670 ACIS_01171 ACIS_01172     TRUE 0.741 112.000 0.042 1.000   NA
 10348670 10348671 ACIS_01172 ACIS_01173     TRUE 0.778 1.000 0.000 NA   NA
 10348673 10348674 ACIS_01175 ACIS_01176     FALSE 0.023 213.000 0.000 NA   NA
 10348676 10348677 ACIS_01178 ACIS_01180     FALSE 0.021 216.000 0.000 NA   NA
 10348679 10348680 ACIS_01182 ACIS_01183     FALSE 0.565 -69.000 0.000 NA   NA
 10348680 10348681 ACIS_01183 ACIS_01184   recA FALSE 0.007 280.000 0.000 NA   NA
 10348681 10348682 ACIS_01184 ACIS_01185 recA pyrE FALSE 0.243 123.000 0.004 1.000 N NA
 10348682 10348683 ACIS_01185 ACIS_01186 pyrE   TRUE 0.939 24.000 0.025 1.000 N NA
 10348684 10348685 ACIS_01187 ACIS_01188 msp4 virB2 FALSE 0.002 452.000 0.000 NA   NA
 10348686 10348687 ACIS_01189 ACIS_01190     FALSE 0.002 448.000 0.000 NA   NA
 10348687 10348688 ACIS_01190 ACIS_01319     FALSE 0.008 272.000 0.000 NA   NA
 10348689 10348690 ACIS_01191 ACIS_01192   dapE TRUE 0.870 -19.000 0.007 1.000   NA
 10348690 10348691 ACIS_01192 ACIS_01194 dapE kefB FALSE 0.155 170.000 0.005 1.000 N NA
 10348691 10348692 ACIS_01194 ACIS_01195 kefB   TRUE 0.975 14.000 0.057 1.000 N NA
 10348692 10348693 ACIS_01195 ACIS_01196     FALSE 0.124 228.000 0.016 NA   NA
 10348693 10348694 ACIS_01196 ACIS_01197   pdhB FALSE 0.287 136.000 0.005 NA   NA
 10348694 10348695 ACIS_01197 ACIS_01198 pdhB   FALSE 0.533 65.000 0.005 NA   NA
 10348696 10348697 ACIS_01320 ACIS_01199   tldD FALSE 0.171 111.000 0.000 NA   NA
 10348698 10348699 ACIS_01200 ACIS_01201 ychF ispF FALSE 0.053 181.000 0.003 1.000 N NA
 10348699 10348700 ACIS_01201 ACIS_01202 ispF ispD FALSE 0.376 250.000 0.419 1.000 Y NA