MicrobesOnline Operon Predictions for Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5855046 5855047 E2348C_0001 E2348C_0002 thrL thrA FALSE 0.262 81.000 0.043 1.000   NA
 5855047 5855048 E2348C_0002 E2348C_0003 thrA thrB TRUE 0.993 2.000 0.133 1.000 Y NA
 5855048 5855049 E2348C_0003 E2348C_0004 thrB thrC TRUE 0.996 1.000 0.233 1.000 Y NA
 5855049 5855050 E2348C_0004 E2348C_0005 thrC yaaX FALSE 0.025 214.000 0.003 NA   NA
 5855051 5855052 E2348C_0006 E2348C_0007 yaaA yaaJ FALSE 0.223 70.000 0.028 NA   NA
 5855053 5855054 E2348C_0008 E2348C_0009 talB mog FALSE 0.148 115.000 0.042 1.000 N NA
 5855054 5855055 E2348C_0009 E2348C_0010 mog   FALSE 0.084 184.000 0.000 1.000   NA
 5855056 5855057 E2348C_0011 E2348C_0012 yaaH yaaW FALSE 0.116 149.000 0.043 NA   NA
 5855057 5855058 E2348C_0012 E2348C_0013 yaaW yaaI TRUE 0.941 26.000 0.500 NA   NA
 5855059 5855060 E2348C_0014 E2348C_0015 dnaK dnaJ TRUE 0.899 89.000 0.236 0.004 Y NA
 5855061 5855062 E2348C_0016 E2348C_0017 mokC1 hokC1 TRUE 0.585 -152.000 0.000 NA   NA
 5855063 5855064 E2348C_ncR01 E2348C_0018 sokC   FALSE 0.005 512.000 0.000 NA   NA
 5855064 5855065 E2348C_0018 E2348C_0019     TRUE 0.964 21.000 0.571 NA   NA
 5855065 5855066 E2348C_0019 E2348C_0020     FALSE 0.158 129.000 0.000 NA   NA
 5855066 5855067 E2348C_0020 E2348C_0021   nhaA FALSE 0.029 235.000 0.000 NA   NA
 5855067 5855068 E2348C_0021 E2348C_0022 nhaA nhaR TRUE 0.674 60.000 0.292 1.000 N NA
 5855070 5855071 E2348C_0024 E2348C_0025 yaaY ribF TRUE 0.873 8.000 0.019 NA   NA
 5855071 5855072 E2348C_0025 E2348C_0026 ribF ileS TRUE 0.765 43.000 0.254 1.000 N NA
 5855072 5855073 E2348C_0026 E2348C_0027 ileS lspA TRUE 0.921 0.000 0.045 1.000 N NA
 5855073 5855074 E2348C_0027 E2348C_0028 lspA fkpB FALSE 0.354 108.000 0.154 1.000 N NA
 5855074 5855075 E2348C_0028 E2348C_0029 fkpB ispH TRUE 0.993 2.000 0.626 1.000 N NA
 5855075 5855076 E2348C_0029 E2348C_0030 ispH rihC FALSE 0.155 66.000 0.028 NA N NA
 5855076 5855077 E2348C_0030 E2348C_0031 rihC dapB FALSE 0.032 167.000 0.003 NA N NA
 5855077 5855078 E2348C_0031 E2348C_0032 dapB carA FALSE 0.032 456.000 0.034 1.000 Y NA
 5855078 5855079 E2348C_0032 E2348C_0033 carA carB TRUE 0.993 18.000 0.345 0.001 Y NA
 5855082 5855083 E2348C_0036 E2348C_0037 caiE caiD TRUE 0.926 6.000 0.000 1.000   NA
 5855083 5855084 E2348C_0037 E2348C_0038 caiD caiC TRUE 0.726 109.000 0.000 0.022 Y NA
 5855084 5855085 E2348C_0038 E2348C_0039 caiC caiB TRUE 0.602 73.000 0.154 0.022 N NA
 5855085 5855086 E2348C_0039 E2348C_0040 caiB caiA TRUE 0.661 118.000 0.529 1.000 N NA
 5855086 5855087 E2348C_0040 E2348C_0041 caiA caiT TRUE 0.700 31.000 0.118 1.000 N NA
 5855088 5855089 E2348C_0042 E2348C_0043 fixA fixB TRUE 0.992 15.000 0.231 0.013 Y NA
 5855089 5855090 E2348C_0043 E2348C_0044 fixB fixC TRUE 0.865 51.000 0.000 0.053 Y NA
 5855090 5855091 E2348C_0044 E2348C_0045 fixC fixX TRUE 0.995 -3.000 0.167 0.053 Y NA
 5855091 5855092 E2348C_0045 E2348C_0046 fixX yaaU FALSE 0.274 59.000 0.000 1.000 N NA
 5855092 5855093 E2348C_0046 E2348C_0047 yaaU kefF FALSE 0.224 108.000 0.000 1.000   NA
 5855093 5855094 E2348C_0047 E2348C_0048 kefF kefC TRUE 0.983 -7.000 0.560 1.000   NA
 5855094 5855095 E2348C_0048 E2348C_0049 kefC folA FALSE 0.032 192.000 0.012 1.000 N NA
 5855095 5855096 E2348C_0049 E2348C_0050 folA   FALSE 0.263 86.000 0.000 1.000   NA
 5855096 5855097 E2348C_0050 E2348C_0051     TRUE 0.939 3.000 0.000 1.000   NA
 5855098 5855099 E2348C_0052 E2348C_0053 apaH apaG TRUE 0.974 7.000 0.267 NA N NA
 5855099 5855100 E2348C_0053 E2348C_0054 apaG ksgA TRUE 0.929 3.000 0.078 NA N NA
 5855100 5855101 E2348C_0054 E2348C_0055 ksgA pdxA TRUE 0.970 -3.000 0.197 1.000 N NA
 5855101 5855102 E2348C_0055 E2348C_0056 pdxA surA TRUE 0.993 0.000 0.561 1.000 N NA
 5855102 5855103 E2348C_0056 E2348C_0057 surA imp TRUE 0.605 53.000 0.182 1.000 N NA
 5855105 5855106 E2348C_0059 E2348C_0060 rluA hepA TRUE 0.968 12.000 0.294 1.000 N NA
 5855106 5855107 E2348C_0060 E2348C_0061 hepA polB TRUE 0.593 165.000 0.098 0.083 Y NA
 5855107 5855108 E2348C_0061 E2348C_0062 polB araD FALSE 0.150 75.000 0.018 1.000 N NA
 5855108 5855109 E2348C_0062 E2348C_0063 araD araA TRUE 0.552 115.000 0.017 1.000 Y NA
 5855109 5855110 E2348C_0063 E2348C_0064 araA araB TRUE 0.940 11.000 0.138 1.000 N NA
 5855111 5855112 E2348C_0065 E2348C_0066 araC   FALSE 0.064 225.000 0.000 0.051 N NA
 5855112 5855113 E2348C_0066 E2348C_0067     TRUE 0.854 26.000 0.222 1.000 N NA
 5855113 5855114 E2348C_0067 E2348C_0068     FALSE 0.385 55.000 0.000 1.000   NA
 5855114 5855115 E2348C_0068 E2348C_0069     TRUE 0.899 49.000 0.667 NA   NA
 5855115 5855116 E2348C_0069 E2348C_0070     TRUE 0.990 10.000 0.600 NA   NA
 5855116 5855117 E2348C_0070 E2348C_0071   yabI FALSE 0.071 184.000 0.000 NA   NA
 5855118 5855119 E2348C_0072 E2348C_0073 thiQ thiP TRUE 0.974 -16.000 0.522 0.018 N NA
 5855119 5855120 E2348C_0073 E2348C_0074 thiP tbpA TRUE 0.976 -24.000 0.697 0.075 N NA
 5855120 5855121 E2348C_0074 E2348C_ncR02 tbpA   TRUE 0.571 31.000 0.000 NA   NA
 5855121 5855122 E2348C_ncR02 E2348C_0075   sgrR TRUE 0.540 34.000 0.000 NA   NA
 5855124 5855125 E2348C_0076 E2348C_0077 leuD leuC TRUE 0.997 11.000 0.309 0.001 Y NA
 5855125 5855126 E2348C_0077 E2348C_0078 leuC leuB TRUE 0.998 3.000 0.275 0.002 Y NA
 5855126 5855127 E2348C_0078 E2348C_0079 leuB leuA TRUE 0.997 0.000 0.126 0.002 Y NA
 5855127 5855128 E2348C_0079 E2348C_0080 leuA leuL FALSE 0.434 93.000 0.010 0.002   NA
 5855129 5855130 E2348C_0081 E2348C_0082 leuO ilvI FALSE 0.010 318.000 0.000 1.000 N NA
 5855130 5855131 E2348C_0082 E2348C_0083 ilvI ilvH TRUE 0.998 3.000 0.371 0.002 Y NA
 5855131 5855132 E2348C_0083 E2348C_0084 ilvH   TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 5855132 5855133 E2348C_0084 E2348C_0085   fruR FALSE 0.234 82.000 0.000 NA   NA
 5855133 5855134 E2348C_0085 E2348C_0086 fruR mraZ FALSE 0.004 602.000 0.000 NA   NA
 5855134 5855135 E2348C_0086 E2348C_0087 mraZ mraW TRUE 0.994 2.000 0.635 NA   NA
 5855135 5855136 E2348C_0087 E2348C_0088 mraW ftsL TRUE 0.974 -3.000 0.227 1.000 N NA
 5855136 5855137 E2348C_0088 E2348C_0089 ftsL ftsI TRUE 0.875 16.000 0.124 1.000 N NA
 5855137 5855138 E2348C_0089 E2348C_0090 ftsI murE TRUE 0.955 -13.000 0.059 1.000 Y NA
 5855138 5855139 E2348C_0090 E2348C_0091 murE murF TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 5855139 5855140 E2348C_0091 E2348C_0092 murF mraY TRUE 0.996 -6.000 0.309 0.005 Y NA
 5855140 5855141 E2348C_0092 E2348C_0093 mraY murD TRUE 0.999 3.000 0.647 0.005 Y NA
 5855141 5855142 E2348C_0093 E2348C_0094 murD ftsW TRUE 0.993 0.000 0.297 0.003 N NA
 5855142 5855143 E2348C_0094 E2348C_0095 ftsW murG TRUE 0.992 -3.000 0.647 1.000 N NA
 5855143 5855144 E2348C_0095 E2348C_0096 murG murC TRUE 0.911 54.000 0.283 1.000 Y NA
 5855144 5855145 E2348C_0096 E2348C_0097 murC ddlB TRUE 0.991 -7.000 0.153 0.005 Y NA
 5855145 5855146 E2348C_0097 E2348C_0098 ddlB ftsQ TRUE 0.997 2.000 0.372 NA Y NA
 5855146 5855147 E2348C_0098 E2348C_0099 ftsQ ftsA TRUE 0.985 -3.000 0.389 NA N NA
 5855147 5855148 E2348C_0099 E2348C_0100 ftsA ftsZ TRUE 0.931 61.000 0.460 1.000 Y NA
 5855148 5855149 E2348C_0100 E2348C_0101 ftsZ lpxC FALSE 0.335 101.000 0.134 1.000 N NA
 5855149 5855150 E2348C_0101 E2348C_0102 lpxC secM FALSE 0.036 230.000 0.000 1.000   NA
 5855150 5855151 E2348C_0102 E2348C_0103 secM secA FALSE 0.388 62.000 0.065 1.000   NA
 5855151 5855152 E2348C_0103 E2348C_0104 secA mutT TRUE 0.532 60.000 0.168 1.000 N NA
 5855153 5855154 E2348C_0105 E2348C_0106 yacG yacF TRUE 0.982 10.000 0.356 NA   NA
 5855154 5855155 E2348C_0106 E2348C_0107 yacF coaE TRUE 0.966 0.000 0.110 NA   NA
 5855157 5855158 E2348C_0109 E2348C_0110 hofC hofB TRUE 0.993 -10.000 0.571 1.000 Y NA
 5855158 5855159 E2348C_0110 E2348C_0111 hofB ppdD TRUE 0.997 10.000 0.556 NA Y NA
 5855159 5855160 E2348C_0111 E2348C_0112 ppdD nadC FALSE 0.019 204.000 0.015 NA N NA
 5855161 5855162 E2348C_0113 E2348C_0114 ampD ampE TRUE 0.995 -3.000 0.249 1.000 Y NA
 5855164 5855165 E2348C_0116 E2348C_0117 pdhR aceE FALSE 0.324 161.000 0.276 1.000 N NA
 5855165 5855166 E2348C_0117 E2348C_0118 aceE aceF TRUE 0.985 15.000 0.220 1.000 Y NA
 5855166 5855167 E2348C_0118 E2348C_0119 aceF lpd TRUE 0.586 208.000 0.463 1.000 Y NA
 5855169 5855170 E2348C_0121 E2348C_0122 acnB yacL FALSE 0.104 175.000 0.068 NA   NA
 5855171 5855172 E2348C_0123 E2348C_0124 speD speE TRUE 0.979 16.000 0.162 1.000 Y NA
 5855172 5855173 E2348C_0124 E2348C_0125 speE yacC TRUE 0.610 106.000 0.354 NA   NA
 5855178 5855179 E2348C_0130 E2348C_0131 yadG yadH TRUE 0.998 -3.000 0.688 1.000 Y NA
 5855179 5855180 E2348C_0131 E2348C_0132 yadH yadI FALSE 0.148 105.000 0.037 1.000 N NA
 5855180 5855181 E2348C_0132 E2348C_0133 yadI yadE TRUE 0.865 64.000 0.222 1.000 Y NA
 5855184 5855185 E2348C_0136 E2348C_0137 panC panB TRUE 0.997 12.000 0.395 0.001 Y NA
 5855185 5855186 E2348C_0137 E2348C_0138 panB yadC FALSE 0.189 112.000 0.000 NA   NA
 5855186 5855187 E2348C_0138 E2348C_0139 yadC yadK FALSE 0.392 50.000 0.000 NA   NA
 5855187 5855188 E2348C_0139 E2348C_0140 yadK yadL TRUE 0.618 27.000 0.000 NA   NA
 5855188 5855189 E2348C_0140 E2348C_0141 yadL yadM TRUE 0.812 15.000 0.000 NA   NA
 5855189 5855190 E2348C_0141 E2348C_0142 yadM htrE TRUE 0.774 17.000 0.000 NA   NA
 5855190 5855191 E2348C_0142 E2348C_0143 htrE ecpD TRUE 0.529 35.000 0.000 NA   NA
 5855191 5855192 E2348C_0143 E2348C_0144 ecpD yadN FALSE 0.194 109.000 0.000 NA   NA
 5855192 5855193 E2348C_0144 E2348C_0145 yadN folK FALSE 0.007 359.000 0.000 1.000 N NA
 5855193 5855194 E2348C_0145 E2348C_0146 folK pcnB TRUE 0.975 -3.000 0.234 1.000 N NA
 5855194 5855195 E2348C_0146 E2348C_0147 pcnB yadB TRUE 0.744 93.000 0.131 1.000 Y NA
 5855195 5855196 E2348C_0147 E2348C_0148 yadB dksA TRUE 0.789 37.000 0.231 1.000 N NA
 5855196 5855197 E2348C_0148 E2348C_0149 dksA sfsA FALSE 0.178 178.000 0.151 NA   NA
 5855197 5855198 E2348C_0149 E2348C_0150 sfsA ligT TRUE 0.809 15.000 0.045 NA   NA
 5855199 5855200 E2348C_0151 E2348C_0152 hrpB mrcB FALSE 0.391 94.000 0.158 1.000 N NA
 5855200 5855201 E2348C_0152 E2348C_0153 mrcB   FALSE 0.009 327.000 0.000 1.000 N NA
 5855201 5855202 E2348C_0153 E2348C_0154     FALSE 0.430 46.000 0.000 NA   NA
 5855202 5855203 E2348C_0154 E2348C_0155     FALSE 0.454 43.000 0.000 NA   NA
 5855203 5855204 E2348C_0155 E2348C_0156     TRUE 0.981 22.000 0.333 1.000 Y NA
 5855204 5855205 E2348C_0156 E2348C_0157   fhuA FALSE 0.029 221.000 0.000 1.000 N NA
 5855205 5855206 E2348C_0157 E2348C_0158 fhuA fhuC TRUE 0.879 51.000 0.156 1.000 Y NA
 5855206 5855207 E2348C_0158 E2348C_0159 fhuC fhuD TRUE 0.988 0.000 0.031 1.000 Y NA
 5855207 5855208 E2348C_0159 E2348C_0160 fhuD fhuB TRUE 0.986 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5855210 5855211 E2348C_0162 E2348C_0163 clcA yadR FALSE 0.202 82.000 0.031 NA   NA
 5855212 5855213 E2348C_0164 E2348C_0165 yadS btuF TRUE 0.783 38.000 0.213 NA   NA
 5855213 5855214 E2348C_0165 E2348C_0166 btuF pfs TRUE 0.855 -7.000 0.073 1.000 N NA
 5855215 5855216 E2348C_0167 E2348C_0168 dgt degP FALSE 0.223 130.000 0.101 1.000 N NA
 5855216 5855217 E2348C_0168 E2348C_0169 degP cdaR FALSE 0.115 155.000 0.080 NA N NA
 5855218 5855219 E2348C_0170 E2348C_0171 yaeH dapD FALSE 0.012 310.000 0.035 NA   NA
 5855219 5855220 E2348C_0171 E2348C_0172 dapD glnD TRUE 0.668 31.000 0.097 1.000 N NA
 5855220 5855221 E2348C_0172 E2348C_0173 glnD map TRUE 0.614 62.000 0.243 1.000 N NA
 5855222 5855223 E2348C_ncR04 E2348C_0174 tff rpsB TRUE 0.618 27.000 0.000 NA   NA
 5855223 5855224 E2348C_0174 E2348C_0175 rpsB tsf TRUE 0.554 258.000 0.748 1.000 Y NA
 5855224 5855225 E2348C_0175 E2348C_0176 tsf pyrH TRUE 0.495 147.000 0.416 1.000 N NA
 5855225 5855226 E2348C_0176 E2348C_0177 pyrH frr FALSE 0.151 292.000 0.626 1.000 N NA
 5855226 5855227 E2348C_0177 E2348C_0178 frr dxr FALSE 0.156 92.000 0.032 1.000 N NA
 5855227 5855228 E2348C_0178 E2348C_0179 dxr ispU FALSE 0.289 186.000 0.025 1.000 Y NA
 5855228 5855229 E2348C_0179 E2348C_0180 ispU cdsA TRUE 0.957 43.000 0.400 1.000 Y NA
 5855229 5855230 E2348C_0180 E2348C_0181 cdsA yaeL TRUE 0.891 12.000 0.080 1.000 N NA
 5855230 5855231 E2348C_0181 E2348C_0182 yaeL yaeT TRUE 0.952 30.000 0.204 1.000 Y NA
 5855231 5855232 E2348C_0182 E2348C_0183 yaeT skp TRUE 0.834 122.000 0.354 1.000 Y NA
 5855232 5855233 E2348C_0183 E2348C_0184 skp lpxD TRUE 0.999 4.000 0.814 1.000 Y NA
 5855233 5855234 E2348C_0184 E2348C_0185 lpxD fabZ TRUE 0.785 105.000 0.796 1.000 N NA
 5855234 5855235 E2348C_0185 E2348C_0186 fabZ lpxA TRUE 0.995 4.000 0.850 1.000 N NA
 5855235 5855236 E2348C_0186 E2348C_0187 lpxA lpxB TRUE 0.996 0.000 0.289 1.000 Y NA
 5855236 5855237 E2348C_0187 E2348C_0188 lpxB rnhB TRUE 0.969 -3.000 0.186 1.000 N NA
 5855237 5855238 E2348C_0188 E2348C_0189 rnhB dnaE TRUE 0.921 32.000 0.104 1.000 Y NA
 5855238 5855239 E2348C_0189 E2348C_0190 dnaE accA TRUE 0.911 13.000 0.122 1.000 N NA
 5855239 5855240 E2348C_0190 E2348C_0191 accA ldcC FALSE 0.115 99.000 0.010 1.000 N NA
 5855240 5855241 E2348C_0191 E2348C_0192 ldcC yaeR TRUE 0.734 57.000 0.039 NA Y NA
 5855241 5855242 E2348C_0192 E2348C_0193 yaeR tilS FALSE 0.131 65.000 0.015 NA N NA
 5855243 5855244 E2348C_0194 E2348C_0195 rof yaeP TRUE 0.939 -7.000 0.179 NA   NA
 5855245 5855246 E2348C_0196 E2348C_0197 yaeQ yaeJ TRUE 0.919 -3.000 0.034 1.000   NA
 5855246 5855247 E2348C_0197 E2348C_0198 yaeJ nlpE TRUE 0.795 14.000 0.027 NA   NA
 5855248 5855249 E2348C_0199 E2348C_0200 yaeF proS FALSE 0.260 53.000 0.002 NA   NA
 5855249 5855250 E2348C_0200 E2348C_0201 proS yaeB FALSE 0.194 111.000 0.048 NA   NA
 5855250 5855251 E2348C_0201 E2348C_0202 yaeB rcsF TRUE 0.979 -3.000 0.247 NA   NA
 5855251 5855252 E2348C_0202 E2348C_0203 rcsF metQ TRUE 0.667 118.000 0.500 NA   NA
 5855252 5855253 E2348C_0203 E2348C_0204 metQ metI TRUE 0.976 40.000 0.411 0.059 Y NA
 5855253 5855254 E2348C_0204 E2348C_0205 metI metN TRUE 0.995 -7.000 0.584 1.000 Y NA
 5855255 5855256 E2348C_0206 E2348C_rRNA1 gmhB rrsH FALSE 0.008 366.000 0.000 NA   NA
 5855256 5855257 E2348C_rRNA1 E2348C_tRNA01 rrsH ileV FALSE 0.268 69.000 0.000 NA   NA
 5855257 5855258 E2348C_tRNA01 E2348C_tRNA02 ileV alaV FALSE 0.454 43.000 0.000 NA   NA
 5855258 5855259 E2348C_tRNA02 E2348C_rRNA2 alaV rrlH FALSE 0.071 184.000 0.000 NA   NA
 5855259 5855260 E2348C_rRNA2 E2348C_rRNA3 rrlH rrfH FALSE 0.206 99.000 0.000 NA   NA
 5855260 5855261 E2348C_rRNA3 E2348C_tRNA03 rrfH aspU FALSE 0.360 53.000 0.000 NA   NA
 5855261 5855262 E2348C_tRNA03 E2348C_0207 aspU dkgB FALSE 0.101 162.000 0.000 NA   NA
 5855264 5855265 E2348C_0209 E2348C_0210 yafD yafE FALSE 0.287 78.000 0.066 NA   NA
 5855266 5855267 E2348C_0211 E2348C_0212 mltD gloB TRUE 0.607 72.000 0.233 1.000   NA
 5855270 5855271 E2348C_0215 E2348C_tRNA04 dnaQ aspV FALSE 0.150 133.000 0.000 NA   NA
 5855275 5855276 E2348C_0219 E2348C_0220 lpcA yafJ FALSE 0.176 205.000 0.229 1.000   NA
 5855279 5855280 E2348C_0223 E2348C_0224   fhiA FALSE 0.008 376.000 0.000 NA   NA
 5855281 5855282 E2348C_0225 E2348C_0226 mbhA dinB FALSE 0.222 71.000 0.000 1.000 N NA
 5855282 5855283 E2348C_0226 E2348C_0227 dinB yafP TRUE 0.902 -3.000 0.011 1.000   NA
 5855283 5855284 E2348C_0227 E2348C_0228 yafP   FALSE 0.063 191.000 0.000 NA   NA
 5855284 5855285 E2348C_0228 E2348C_0229   prfH TRUE 0.983 -3.000 0.303 NA   NA
 5855287 5855288 E2348C_0231 E2348C_0232 gpt frsA FALSE 0.207 92.000 0.040 NA   NA
 5855288 5855289 E2348C_0232 E2348C_0233 frsA crl FALSE 0.329 58.000 0.048 NA   NA
 5855291 5855292 E2348C_0235 E2348C_0236 proB proA TRUE 0.988 12.000 0.026 0.001 Y NA
 5855292 5855293 E2348C_0236 E2348C_tRNA05 proA thrW FALSE 0.185 115.000 0.000 NA   NA
 5855293 10800733 E2348C_tRNA05 E2348C_IE1a thrW   TRUE 0.615 -45.000 0.000 NA   NA
 5855295 5855296 E2348C_0238 E2348C_0239     TRUE 0.618 27.000 0.000 NA   NA
 5855296 5855297 E2348C_0239 E2348C_0240     FALSE 0.018 282.000 0.000 NA   NA
 5855297 5855298 E2348C_0240 E2348C_0241     TRUE 0.791 16.000 0.000 NA   NA
 5855298 10800734 E2348C_0241 E2348C_IE1b     FALSE 0.121 149.000 0.000 NA   NA
 5855301 5855302 E2348C_0244 E2348C_0245 ykgJ ecpE FALSE 0.013 313.000 0.000 NA   NA
 5855302 5855303 E2348C_0245 E2348C_0246 ecpE ecpD TRUE 0.949 -31.000 0.571 NA   NA
 5855303 5855304 E2348C_0246 E2348C_0247 ecpD ecpC TRUE 0.967 -10.000 0.429 NA   NA
 5855304 5855305 E2348C_0247 E2348C_0248 ecpC ecpB TRUE 0.903 26.000 0.308 NA   NA
 5855305 5855306 E2348C_0248 E2348C_0249 ecpB ecpA TRUE 0.776 57.000 0.385 NA   NA
 5855306 5855307 E2348C_0249 E2348C_0250 ecpA ecpR TRUE 0.705 74.000 0.400 NA   NA
 5855308 5855309 E2348C_0251 E2348C_0252   ykgL FALSE 0.301 62.000 0.000 NA   NA
 5855310 5855311 E2348C_0253 E2348C_0254 ykgO ykgM TRUE 0.970 0.000 0.004 0.013   NA
 5855311 5855312 E2348C_0254 E2348C_0255 ykgM   FALSE 0.003 939.000 0.000 1.000 N NA
 5855312 5855313 E2348C_0255 E2348C_0256     FALSE 0.101 172.000 0.000 1.000   NA
 5855314 5855315 E2348C_0257 E2348C_0258     FALSE 0.360 200.000 0.000 0.061 Y NA
 5855316 5855317 E2348C_0259 E2348C_0260     TRUE 0.934 27.000 0.438 1.000   NA
 5855321 5855322 E2348C_0264 E2348C_0265 ykgB ykgI TRUE 0.865 12.000 0.043 NA   NA
 5855322 5855323 E2348C_0265 E2348C_0266 ykgI ykgC TRUE 0.763 109.000 0.667 NA   NA
 5855324 5855325 E2348C_0267 E2348C_0268 ykgD ykgE FALSE 0.003 528.000 0.000 NA N NA
 5855325 5855326 E2348C_0268 E2348C_0269 ykgE ykgF TRUE 0.993 11.000 0.286 NA Y NA
 5855326 5855327 E2348C_0269 E2348C_0270 ykgF ykgG TRUE 0.984 -7.000 0.286 0.001   NA
 5855328 5855329 E2348C_0271 E2348C_0272   ykgH FALSE 0.244 76.000 0.000 NA   NA
 5855329 5855330 E2348C_0272 E2348C_0273 ykgH betA FALSE 0.041 213.000 0.000 NA   NA
 5855330 5855331 E2348C_0273 E2348C_0274 betA betB TRUE 0.982 14.000 0.634 1.000 N NA
 5855331 5855332 E2348C_0274 E2348C_0275 betB betI TRUE 0.974 14.000 0.459 1.000 N NA
 5855333 5855334 E2348C_0276 E2348C_0277 betT yahA FALSE 0.003 878.000 0.000 1.000 N NA
 5855335 5855336 E2348C_0278 E2348C_0279 yahB yahC FALSE 0.221 92.000 0.000 NA   NA
 5855337 5855338 E2348C_0280 E2348C_0281 yahD yahE TRUE 0.927 40.000 0.667 NA   NA
 5855338 5855339 E2348C_0281 E2348C_0282 yahE yahF TRUE 0.967 -10.000 0.429 NA   NA
 5855339 5855340 E2348C_0282 E2348C_0283 yahF yahG TRUE 0.995 0.000 0.714 NA   NA
 5855340 5855341 E2348C_0283 E2348C_0284 yahG yahH TRUE 0.635 26.000 0.000 NA   NA
 5855341 5855342 E2348C_0284 E2348C_0285 yahH yahI TRUE 0.558 32.000 0.000 NA   NA
 5855342 5855343 E2348C_0285 E2348C_0286 yahI yahJ TRUE 0.974 10.000 0.278 1.000 N NA
 5855343 5855344 E2348C_0286 E2348C_0287 yahJ yahK FALSE 0.008 377.000 0.000 NA   NA
 5855348 5855349 E2348C_0291 E2348C_0292 prpB prpC TRUE 0.458 169.000 0.502 1.000 N NA
 5855349 5855350 E2348C_0292 E2348C_0293 prpC prpD TRUE 0.826 34.000 0.216 1.000   NA
 5855350 5855351 E2348C_0293 E2348C_0294 prpD prpE TRUE 0.770 40.000 0.038 0.001   NA
 5855351 5855352 E2348C_0294 E2348C_0295 prpE codB FALSE 0.010 325.000 0.000 1.000 N NA
 5855352 5855353 E2348C_0295 E2348C_0296 codB codA TRUE 0.985 -10.000 0.250 1.000 Y NA
 5855354 5855355 E2348C_0297 E2348C_0298 lacA lacY TRUE 0.619 66.000 0.222 1.000   NA
 5855355 5855356 E2348C_0298 E2348C_0299 lacY lacZ TRUE 0.744 52.000 0.261 1.000   NA
 5855356 5855357 E2348C_0299 E2348C_0300 lacZ lacI FALSE 0.350 123.000 0.174 1.000 N NA
 5855359 5855360 E2348C_0302 E2348C_0303 frmB frmA TRUE 0.636 93.000 0.327 1.000   NA
 5855360 5855361 E2348C_0303 E2348C_0304 frmA frmR TRUE 0.917 35.000 0.531 NA   NA
 5855362 5855363 E2348C_0305 E2348C_0306 tauA tauB TRUE 0.973 13.000 0.047 1.000 Y NA
 5855363 5855364 E2348C_0306 E2348C_0307 tauB tauC TRUE 0.998 -3.000 0.728 1.000 Y NA
 5855364 5855365 E2348C_0307 E2348C_0308 tauC tauD TRUE 0.972 -3.000 0.214 1.000 N NA
 5855367 5855368 E2348C_0310 E2348C_0311 yaiT yaiV FALSE 0.230 86.000 0.000 NA   NA
 5855370 5855371 E2348C_0313 E2348C_0314 sbmA yaiW TRUE 0.849 13.000 0.000 NA   NA
 5855375 5855376 E2348C_0318 E2348C_0319 iraP phoA FALSE 0.174 101.000 0.032 NA   NA
 5855376 5855377 E2348C_0319 E2348C_0320 phoA psiF FALSE 0.152 119.000 0.032 NA   NA
 5855377 5855378 E2348C_0320 E2348C_0321 psiF adrA TRUE 0.519 102.000 0.250 NA   NA
 5855380 5855381 E2348C_0323 E2348C_0324 yaiI aroL FALSE 0.049 183.000 0.007 NA   NA
 5855381 5855382 E2348C_0324 E2348C_0325 aroL yaiA FALSE 0.387 50.000 0.044 NA   NA
 5855382 5855383 E2348C_0325 E2348C_0326 yaiA aroM FALSE 0.023 258.000 0.000 NA   NA
 5855383 5855384 E2348C_0326 E2348C_0327 aroM yaiE FALSE 0.263 72.000 0.049 NA   NA
 5855384 5855385 E2348C_0327 E2348C_0328 yaiE ykiA FALSE 0.044 208.000 0.000 NA   NA
 5855388 5855389 E2348C_0331 E2348C_0332 araJ sbcC FALSE 0.087 126.000 0.030 NA N NA
 5855389 5855390 E2348C_0332 E2348C_0333 sbcC sbcD TRUE 0.993 -3.000 0.021 0.001 Y NA
 5855391 5855392 E2348C_0334 E2348C_0335 phoB phoR TRUE 0.960 58.000 0.453 0.015 Y NA
 5855392 5855393 E2348C_0335 E2348C_0336 phoR brnQ FALSE 0.005 407.000 0.000 1.000 N NA
 5855393 5855394 E2348C_0336 E2348C_0337 brnQ proY TRUE 0.919 76.000 0.348 0.090 Y NA
 5855394 5855395 E2348C_0337 E2348C_0338 proY malZ FALSE 0.183 156.000 0.123 1.000 N NA
 5855397 5855398 E2348C_0340 E2348C_0341 queA tgt TRUE 0.963 55.000 0.360 0.001 Y NA
 5855398 5855399 E2348C_0341 E2348C_0342 tgt yajC TRUE 0.908 23.000 0.325 NA N NA
 5855399 5855400 E2348C_0342 E2348C_0343 yajC secD TRUE 0.897 28.000 0.045 NA Y NA
 5855400 5855401 E2348C_0343 E2348C_0344 secD secF TRUE 0.996 11.000 0.206 0.001 Y NA
 5855401 5855402 E2348C_0344 E2348C_0345 secF yajD FALSE 0.139 129.000 0.015 1.000   NA
 5855403 5855404 E2348C_0346 E2348C_0347 tsx yajI FALSE 0.015 299.000 0.000 NA   NA
 5855405 5855406 E2348C_0348 E2348C_0349 nrdR ribD TRUE 0.978 4.000 0.277 NA N NA
 5855406 5855407 E2348C_0349 E2348C_0350 ribD ribE TRUE 0.782 89.000 0.034 0.002 Y NA
 5855407 5855408 E2348C_0350 E2348C_0351 ribE nusB TRUE 0.938 20.000 0.347 1.000 N NA
 5855408 5855409 E2348C_0351 E2348C_0352 nusB thiL TRUE 0.518 78.000 0.225 1.000 N NA
 5855409 5855410 E2348C_0352 E2348C_0353 thiL pgpA TRUE 0.867 -22.000 0.206 1.000 N NA
 5855411 5855412 E2348C_0354 E2348C_0355 yajO dxs FALSE 0.206 55.000 0.009 1.000 N NA
 5855412 5855413 E2348C_0355 E2348C_0356 dxs ispA TRUE 0.929 25.000 0.060 1.000 Y NA
 5855413 5855414 E2348C_0356 E2348C_0357 ispA xseB TRUE 0.909 0.000 0.035 1.000 N NA
 5855416 5855417 E2348C_0359 E2348C_0360 yajL panE TRUE 0.811 -37.000 0.155 NA   NA
 5855419 5855420 E2348C_0362 E2348C_0363 yajR cyoE FALSE 0.101 149.000 0.061 NA N NA
 5855420 5855421 E2348C_0363 E2348C_0364 cyoE cyoD TRUE 0.955 12.000 0.118 0.090 N NA
 5855421 5855422 E2348C_0364 E2348C_0365 cyoD cyoC TRUE 0.999 0.000 0.485 0.052 Y NA
 5855422 5855423 E2348C_0365 E2348C_0366 cyoC cyoB TRUE 0.997 -10.000 0.697 0.052 Y NA
 5855423 5855424 E2348C_0366 E2348C_0367 cyoB cyoA TRUE 0.965 22.000 0.041 0.004 Y NA
 5855424 5855425 E2348C_0367 E2348C_0368 cyoA ampG FALSE 0.006 460.000 0.000 NA   NA
 5855425 5855426 E2348C_0368 E2348C_0369 ampG yajG TRUE 0.779 44.000 0.256 NA   NA
 5855427 5855428 E2348C_0370 E2348C_0371 bolA tig FALSE 0.006 344.000 0.000 NA N NA
 5855428 5855429 E2348C_0371 E2348C_0372 tig clpP FALSE 0.386 246.000 0.351 1.000 Y NA
 5855429 5855430 E2348C_0372 E2348C_0373 clpP clpX TRUE 0.825 126.000 0.352 1.000 Y NA
 5855430 5855431 E2348C_0373 E2348C_0374 clpX lon TRUE 0.597 189.000 0.201 0.100 Y NA
 5855431 5855432 E2348C_0374 E2348C_0375 lon hupB FALSE 0.036 209.000 0.000 1.000 N NA
 5855432 5855433 E2348C_0375 E2348C_0376 hupB ppiD FALSE 0.050 192.000 0.000 1.000 N NA
 5855433 5855434 E2348C_0376 E2348C_0377 ppiD ybaV FALSE 0.080 151.000 0.033 1.000 N NA
 5855434 5855435 E2348C_0377 E2348C_0378 ybaV ybaW FALSE 0.191 106.000 0.027 1.000   NA
 5855436 5855437 E2348C_0379 E2348C_0380 queC ybaE FALSE 0.262 65.000 0.019 1.000   NA
 5855438 5855439 E2348C_0381 E2348C_0382 cof ybaO FALSE 0.103 153.000 0.020 1.000   NA
 5855439 5855440 E2348C_0382 E2348C_0383 ybaO mdlA TRUE 0.789 30.000 0.179 1.000 N NA
 5855440 5855441 E2348C_0383 E2348C_0384 mdlA mdlB TRUE 0.998 -7.000 0.911 0.005 Y NA
 5855441 5855442 E2348C_0384 E2348C_0385 mdlB glnK FALSE 0.048 181.000 0.028 1.000 N NA
 5855442 5855443 E2348C_0385 E2348C_0386 glnK amtB TRUE 0.764 30.000 0.156 1.000 N NA
 5855445 5855446 E2348C_0388 E2348C_0389 ybaY   FALSE 0.064 190.000 0.000 NA   NA
 5855448 5855449 E2348C_ncR05 E2348C_0391 ffs ybaA FALSE 0.191 111.000 0.000 NA   NA
 5855450 5855451 E2348C_0392 E2348C_0393 ylaB ylaC FALSE 0.098 164.000 0.000 NA   NA
 5855451 5855452 E2348C_0393 E2348C_0394 ylaC maa FALSE 0.184 116.000 0.000 NA   NA
 5855452 5855453 E2348C_0394 E2348C_0395 maa hha FALSE 0.083 174.000 0.000 NA   NA
 5855453 5855454 E2348C_0395 E2348C_0396 hha ybaJ TRUE 0.721 26.000 0.080 NA   NA
 5855454 5855455 E2348C_0396 E2348C_0397 ybaJ acrB FALSE 0.005 545.000 0.000 NA   NA
 5855455 5855456 E2348C_0397 E2348C_0398 acrB acrA TRUE 0.941 23.000 0.458 1.000 N NA
 5855457 5855458 E2348C_0399 E2348C_0400 acrR kefA FALSE 0.109 128.000 0.000 NA N NA
 5855459 5855460 E2348C_0401 E2348C_0402 ybaM priC TRUE 0.977 14.000 0.474 NA   NA
 5855461 5855462 E2348C_0403 E2348C_0404 ybaN apt FALSE 0.109 153.000 0.043 NA   NA
 5855462 5855463 E2348C_0404 E2348C_0405 apt dnaX FALSE 0.205 129.000 0.088 1.000 N NA
 5855463 5855464 E2348C_0405 E2348C_0406 dnaX ybaB TRUE 0.807 53.000 0.411 NA   NA
 5855464 5855465 E2348C_0406 E2348C_0407 ybaB recR TRUE 0.994 0.000 0.604 NA   NA
 5855465 5855466 E2348C_0407 E2348C_0408 recR htpG FALSE 0.129 110.000 0.028 1.000 N NA
 5855466 5855467 E2348C_0408 E2348C_0409 htpG adk FALSE 0.116 181.000 0.035 0.099 N NA
 5855467 5855468 E2348C_0409 E2348C_0410 adk hemH FALSE 0.084 132.000 0.013 1.000 N NA
 5855471 5855472 E2348C_0413 E2348C_0414 ybaL fsr FALSE 0.018 239.000 0.000 NA N NA
 5855479 5855480 E2348C_0420 E2348C_0421 ybaS ybaT TRUE 0.987 3.000 0.028 1.000 Y NA
 5855480 5855481 E2348C_0421 E2348C_0422 ybaT cueR FALSE 0.140 125.000 0.000 1.000 N NA
 5855482 5855483 E2348C_0423 E2348C_0424     FALSE 0.015 296.000 0.000 NA   NA
 5855483 5855484 E2348C_0424 E2348C_0425     FALSE 0.352 54.000 0.000 NA   NA
 5855486 5855487 E2348C_0427 E2348C_0428 ybbJ ybbK TRUE 0.996 0.000 0.313 NA Y NA
 5855488 5855489 E2348C_0429 E2348C_0430 ybbL ybbM TRUE 0.870 -13.000 0.127 NA   NA
 5855490 5855491 E2348C_0431 E2348C_0432 ybbN ybbO TRUE 0.508 61.000 0.118 1.000   NA
 5855491 5855492 E2348C_0432 E2348C_0433 ybbO tesA TRUE 0.858 -10.000 0.072 1.000   NA
 5855493 5855494 E2348C_0434 E2348C_0435 ybbA ybbP TRUE 0.997 -3.000 0.535 NA Y NA
 5855494 5855495 E2348C_0435 E2348C_0436 ybbP   FALSE 0.003 585.000 0.000 NA N NA
 5855496 5855497 E2348C_0437 E2348C_0438 ybbB allS FALSE 0.198 69.000 0.012 NA   NA
 5855498 5855499 E2348C_0439 E2348C_0440 allA allR TRUE 0.777 78.000 0.625 1.000 N NA
 5855499 5855500 E2348C_0440 E2348C_0441 allR gcl FALSE 0.274 90.000 0.054 1.000   NA
 5855500 5855501 E2348C_0441 E2348C_0442 gcl hyi TRUE 0.892 13.000 0.065 1.000   NA
 5855501 5855502 E2348C_0442 E2348C_0443 hyi glxR FALSE 0.367 100.000 0.154 1.000 N NA
 5855502 5855503 E2348C_0443 E2348C_0444 glxR ybbW FALSE 0.073 170.000 0.000 1.000 N NA
 5855503 5855504 E2348C_0444 E2348C_0445 ybbW allB TRUE 0.845 60.000 0.161 1.000 Y NA
 5855504 5855505 E2348C_0445 E2348C_0446 allB ybbY TRUE 0.859 56.000 0.161 1.000 Y NA
 5855505 5855506 E2348C_0446 E2348C_0447 ybbY glxK TRUE 0.820 22.000 0.133 1.000 N NA
 5855507 5855508 E2348C_0448 E2348C_0449 ylbA allC TRUE 0.901 11.000 0.059 NA   NA
 5855508 5855509 E2348C_0449 E2348C_0450 allC allD TRUE 0.858 22.000 0.174 1.000 N NA
 5855510 5855511 E2348C_0451 E2348C_0452 fdrA ylbE TRUE 0.985 10.000 0.412 NA   NA
 5855511 5855512 E2348C_0452 E2348C_0453 ylbE ylbF TRUE 0.972 11.000 0.265 NA   NA
 5855512 5855513 E2348C_0453 E2348C_0454 ylbF ybcF TRUE 0.987 -3.000 0.375 NA   NA
 5855514 5855515 E2348C_0455 E2348C_0456 purK purE TRUE 0.996 -3.000 0.136 0.001 Y NA
 5855515 5855516 E2348C_0456 E2348C_0457 purE lpxH FALSE 0.160 118.000 0.016 1.000   NA
 5855516 5855517 E2348C_0457 E2348C_0458 lpxH ppiB TRUE 0.983 3.000 0.237 1.000   NA
 5855519 5855520 E2348C_0460 E2348C_0461 ybcI ybcJ FALSE 0.139 108.000 0.011 NA   NA
 5855520 5855521 E2348C_0461 E2348C_0462 ybcJ folD TRUE 0.947 2.000 0.055 1.000   NA
 5855522 10800735 E2348C_tRNA06 E2348C_PP1 argU   TRUE 0.613 -47.000 0.000 NA   NA
 5855525 5855526 E2348C_0465 E2348C_0466   ompT FALSE 0.031 244.000 0.000 1.000   NA
 5855526 5855527 E2348C_0466 E2348C_0467 ompT ybcH FALSE 0.004 658.000 0.000 NA   NA
 5855527 5855528 E2348C_0467 E2348C_0468 ybcH nfrA TRUE 0.992 1.000 0.500 NA   NA
 5855528 5855529 E2348C_0468 E2348C_0469 nfrA nfrB TRUE 0.902 -13.000 0.159 1.000   NA
 5855529 5855530 E2348C_0469 E2348C_0470 nfrB cusS FALSE 0.193 150.000 0.000 0.099 N NA
 5855530 5855531 E2348C_0470 E2348C_0471 cusS cusR TRUE 0.997 -10.000 0.600 0.001 Y NA
 5855532 5855533 E2348C_0472 E2348C_0473 cusC cusF TRUE 0.948 24.000 0.500 NA   NA
 5855533 5855534 E2348C_0473 E2348C_0474 cusF cusB TRUE 0.791 16.000 0.000 NA   NA
 5855534 5855535 E2348C_0474 E2348C_0475 cusB cusA TRUE 0.982 12.000 0.500 1.000 N NA
 5855535 5855536 E2348C_0475 E2348C_0476 cusA pheP FALSE 0.313 102.000 0.000 0.089 N NA
 5855537 5855538 E2348C_0477 E2348C_0478 ybdG nfsB FALSE 0.081 108.000 0.012 NA N NA
 5855538 5855539 E2348C_0478 E2348C_0479 nfsB ybdF TRUE 0.740 79.000 0.500 NA   NA
 5855539 5855540 E2348C_0479 E2348C_0480 ybdF ybdJ FALSE 0.285 65.000 0.000 NA   NA
 5855540 5855541 E2348C_0480 E2348C_0481 ybdJ ybdK FALSE 0.279 66.000 0.000 NA   NA
 5855542 5855543 E2348C_0482 E2348C_0483 mokC2 hokC2 TRUE 0.585 -152.000 0.000 NA   NA
 5855544 5855545 E2348C_0484 E2348C_0485 entD fepA TRUE 0.578 166.000 0.700 1.000 N NA
 5855546 5855547 E2348C_0486 E2348C_0487 fes ybdZ TRUE 0.986 3.000 0.320 NA   NA
 5855547 5855548 E2348C_0487 E2348C_0488 ybdZ entF TRUE 0.943 -3.000 0.080 NA   NA
 5855548 5855549 E2348C_0488 E2348C_0489 entF fepE FALSE 0.039 216.000 0.000 NA   NA
 5855550 5855551 E2348C_0490 E2348C_0491 fepC fepG TRUE 0.985 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 5855551 5855552 E2348C_0491 E2348C_0492 fepG fepD TRUE 0.991 -3.000 0.000 0.057 Y NA
 5855555 5855556 E2348C_0495 E2348C_0496 entC entE TRUE 0.998 10.000 0.667 1.000 Y NA
 5855556 5855557 E2348C_0496 E2348C_0497 entE entB TRUE 0.996 14.000 0.667 1.000 Y NA
 5855557 5855558 E2348C_0497 E2348C_0498 entB entA TRUE 0.988 0.000 0.024 1.000 Y NA
 5855558 5855559 E2348C_0498 E2348C_0499 entA ybdB TRUE 0.988 3.000 0.065 NA Y NA
 5855559 5855560 E2348C_0499 E2348C_0500 ybdB cstA FALSE 0.197 181.000 0.222 NA N NA
 5855560 5855561 E2348C_0500 E2348C_0501 cstA ybdD TRUE 0.577 113.000 0.333 NA   NA
 5855564 5855565 E2348C_0504 E2348C_0505 ybdM ybdN TRUE 0.696 -27.000 0.000 1.000   NA
 5855565 5855566 E2348C_0505 E2348C_0506 ybdN ybdO TRUE 0.484 147.000 0.333 1.000   NA
 5855566 5855567 E2348C_0506 E2348C_0507 ybdO dsbG FALSE 0.042 205.000 0.067 NA N NA
 5855568 5855569 E2348C_0508 E2348C_0509 ahpC ahpF TRUE 0.780 171.000 0.551 1.000 Y NA
 5855570 5855571 E2348C_0510 E2348C_0511 uspG rnk FALSE 0.008 354.000 0.000 1.000 N NA
 5855571 5855572 E2348C_0511 E2348C_0512 rnk rna FALSE 0.017 230.000 0.018 1.000 N NA
 5855572 5855573 E2348C_0512 E2348C_0513 rna citT FALSE 0.118 114.000 0.024 1.000 N NA
 5855573 5855574 E2348C_0513 E2348C_0514 citT citG TRUE 0.642 51.000 0.194 1.000 N NA
 5855574 5855575 E2348C_0514 E2348C_0515 citG citX TRUE 0.982 -25.000 0.400 1.000 Y NA
 5855575 5855576 E2348C_0515 E2348C_0516 citX citF TRUE 0.905 4.000 0.000 1.000 N NA
 5855576 5855577 E2348C_0516 E2348C_0517 citF citE TRUE 0.958 11.000 0.000 0.001 N NA
 5855577 5855578 E2348C_0517 E2348C_0518 citE citD TRUE 0.995 -3.000 0.537 0.001 N NA
 5855578 5855579 E2348C_0518 E2348C_0519 citD citC TRUE 0.992 15.000 0.426 1.000 Y NA
 5855580 5855581 E2348C_0520 E2348C_0521 citA citB TRUE 0.917 -31.000 0.000 1.000 Y NA
 5855583 5855584 E2348C_0523 E2348C_0524 pagP cspE FALSE 0.365 175.000 0.333 1.000   NA
 5855586 5855587 E2348C_0526 E2348C_0527 ybeM tatE FALSE 0.408 129.000 0.196 1.000   NA
 5855588 5855589 E2348C_0528 E2348C_0529 lipA ybeF FALSE 0.027 241.000 0.000 NA   NA
 5855589 5855590 E2348C_0529 E2348C_0530 ybeF lipB FALSE 0.022 260.000 0.000 NA   NA
 5855590 5855591 E2348C_0530 E2348C_0531 lipB ybeD TRUE 0.484 101.000 0.219 NA   NA
 5855591 5855592 E2348C_0531 E2348C_0532 ybeD dacA FALSE 0.265 110.000 0.081 NA   NA
 5855592 5855593 E2348C_0532 E2348C_0533 dacA rlpA TRUE 0.821 140.000 0.475 NA Y NA
 5855593 5855594 E2348C_0533 E2348C_0534 rlpA mrdB TRUE 0.802 11.000 0.035 NA N NA
 5855594 5855595 E2348C_0534 E2348C_0535 mrdB mrdA TRUE 0.912 3.000 0.046 1.000 N NA
 5855595 5855596 E2348C_0535 E2348C_0536 mrdA ybeA TRUE 0.522 31.000 0.031 NA   NA
 5855596 5855597 E2348C_0536 E2348C_0537 ybeA ybeB TRUE 0.984 4.000 0.307 NA   NA
 5855597 5855598 E2348C_0537 E2348C_0538 ybeB cobC FALSE 0.022 260.000 0.000 NA   NA
 5855598 5855599 E2348C_0538 E2348C_0539 cobC nadD TRUE 0.655 24.000 0.057 1.000 N NA
 5855599 5855600 E2348C_0539 E2348C_0540 nadD holA TRUE 0.915 2.000 0.045 1.000 N NA
 5855600 5855601 E2348C_0540 E2348C_0541 holA rlpB TRUE 0.975 0.000 0.199 NA N NA
 5855601 5855602 E2348C_0541 E2348C_0542 rlpB leuS TRUE 0.914 15.000 0.182 NA N NA
 5855604 5855605 E2348C_0544 E2348C_0545 rihA gltL FALSE 0.363 118.000 0.195 NA N NA
 5855605 5855606 E2348C_0545 E2348C_0546 gltL gltK TRUE 0.997 0.000 0.379 1.000 Y NA
 5855606 5855607 E2348C_0546 E2348C_0547 gltK gltJ TRUE 0.999 0.000 0.933 0.017 Y NA
 5855607 5855608 E2348C_0547 E2348C_ncR07 gltJ sroC TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 5855608 5855609 E2348C_ncR07 E2348C_0548 sroC gltI TRUE 0.864 -4.000 0.000 NA   NA
 5855611 5855612 E2348C_0550 E2348C_0551 lnt ybeX TRUE 0.947 25.000 0.557 1.000 N NA
 5855612 5855613 E2348C_0551 E2348C_0552 ybeX ybeY FALSE 0.421 90.000 0.150 NA   NA
 5855613 5855614 E2348C_0552 E2348C_0553 ybeY ybeZ TRUE 0.989 -3.000 0.457 NA   NA
 5855614 5855615 E2348C_0553 E2348C_0554 ybeZ miaB FALSE 0.432 114.000 0.220 1.000 N NA
 5855617 5855618 E2348C_tRNA07 E2348C_tRNA08 glnV metU FALSE 0.401 49.000 0.000 NA   NA
 5855618 5855619 E2348C_tRNA08 E2348C_tRNA09 metU glnW TRUE 0.791 16.000 0.000 NA   NA
 5855619 5855620 E2348C_tRNA09 E2348C_tRNA10 glnW glnU TRUE 0.529 35.000 0.000 NA   NA
 5855620 5855621 E2348C_tRNA10 E2348C_tRNA11 glnU leuW TRUE 0.668 24.000 0.000 NA   NA
 5855621 5855622 E2348C_tRNA11 E2348C_tRNA12 leuW metT TRUE 0.885 11.000 0.000 NA   NA
 5855622 5855623 E2348C_tRNA12 E2348C_0556 metT asnB FALSE 0.008 381.000 0.000 NA   NA
 5855623 5855624 E2348C_0556 E2348C_0557 asnB nagD FALSE 0.019 257.000 0.000 1.000 N NA
 5855624 5855625 E2348C_0557 E2348C_0558 nagD nagC TRUE 0.839 48.000 0.070 1.000 Y NA
 5855625 5855626 E2348C_0558 E2348C_0559 nagC nagA TRUE 0.997 9.000 0.571 1.000 Y NA
 5855626 5855627 E2348C_0559 E2348C_0560 nagA nagB TRUE 0.972 60.000 0.557 0.001 Y NA
 5855629 5855630 E2348C_0562 E2348C_0563     TRUE 0.760 14.000 0.000 NA N NA
 5855630 5855631 E2348C_0563 E2348C_0564     TRUE 0.989 -3.000 0.092 NA Y NA
 5855631 5855632 E2348C_0564 E2348C_0565     FALSE 0.413 36.000 0.031 1.000 N NA
 5855632 5855633 E2348C_0565 E2348C_0566     TRUE 0.459 60.000 0.125 1.000 N NA
 5855633 5855634 E2348C_0566 E2348C_0567     TRUE 0.984 4.000 0.208 0.061 N NA
 5855635 5855636 E2348C_0568 E2348C_0569     TRUE 0.971 -7.000 0.361 NA   NA
 5855636 5855637 E2348C_0569 E2348C_0570     TRUE 0.992 2.000 0.533 1.000 N NA
 5855637 5855638 E2348C_0570 E2348C_0571   glnS FALSE 0.030 220.000 0.000 1.000 N NA
 5855638 5855639 E2348C_0571 E2348C_0572 glnS ybfM FALSE 0.007 442.000 0.000 1.000   NA
 5855639 5855640 E2348C_0572 E2348C_0573 ybfM ybfN FALSE 0.392 50.000 0.000 NA   NA
 5855641 5855642 E2348C_0574 E2348C_0575 fur uof TRUE 0.836 -7.000 0.000 NA   NA
 5855642 5855643 E2348C_0575 E2348C_0576 uof fldA FALSE 0.043 210.000 0.000 NA   NA
 5855643 5855644 E2348C_0576 E2348C_0577 fldA ybfE TRUE 0.599 140.000 0.473 1.000   NA
 5855644 5855645 E2348C_0577 E2348C_0578 ybfE ybfF FALSE 0.429 140.000 0.276 NA   NA
 5855646 5855647 E2348C_0579 E2348C_0580 seqA pgm TRUE 0.795 26.000 0.151 1.000 N NA
 5855648 5855649 E2348C_0581 E2348C_0582 potE speF TRUE 0.989 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 5855649 5855650 E2348C_0582 E2348C_0583 speF kdpE FALSE 0.004 596.000 0.000 1.000 N NA
 5855650 5855651 E2348C_0583 E2348C_0584 kdpE kdpD TRUE 0.997 -3.000 0.385 1.000 Y NA
 5855651 5855652 E2348C_0584 E2348C_0585 kdpD kdpC TRUE 0.888 -7.000 0.100 1.000 N NA
 5855652 5855653 E2348C_0585 E2348C_0586 kdpC kdpB TRUE 0.999 9.000 0.877 0.001 Y NA
 5855653 5855654 E2348C_0586 E2348C_0587 kdpB kdpA TRUE 0.984 23.000 0.201 0.001 Y NA
 5855654 5855655 E2348C_0587 E2348C_0588 kdpA kdpF TRUE 0.991 0.000 0.172 0.001   NA
 5855656 5855657 E2348C_0589 E2348C_0590 ybfA ybgA TRUE 0.501 101.000 0.231 NA   NA
 5855657 5855658 E2348C_0590 E2348C_0591 ybgA phr TRUE 0.888 -3.000 0.019 NA   NA
 5855660 5855661 E2348C_0593 E2348C_0594 ybgI ybgJ TRUE 0.692 23.000 0.050 NA   NA
 5855661 5855662 E2348C_0594 E2348C_0595 ybgJ ybgK TRUE 0.993 -6.000 0.379 NA Y NA
 5855662 5855663 E2348C_0595 E2348C_0596 ybgK ybgL TRUE 0.931 -10.000 0.211 NA   NA
 5855663 5855664 E2348C_0596 E2348C_0597 ybgL nei TRUE 0.539 36.000 0.037 1.000   NA
 5855665 5855666 E2348C_0598 E2348C_0599 abrB ybgO FALSE 0.110 155.000 0.000 NA   NA
 5855666 5855667 E2348C_0599 E2348C_0600 ybgO gltA FALSE 0.162 127.000 0.000 NA   NA
 5855668 5855669 E2348C_0601 E2348C_0602 sdhC sdhD TRUE 0.997 -6.000 0.453 0.001 Y NA
 5855669 5855670 E2348C_0602 E2348C_0603 sdhD sdhA TRUE 0.999 0.000 0.705 0.002 Y NA
 5855670 5855671 E2348C_0603 E2348C_0604 sdhA sdhB TRUE 0.997 16.000 0.604 0.002 Y NA
 5855671 5855672 E2348C_0604 E2348C_0605 sdhB sucA FALSE 0.090 312.000 0.067 1.000 Y NA
 5855672 5855673 E2348C_0605 E2348C_0606 sucA sucB TRUE 0.995 15.000 0.667 1.000 Y NA
 5855673 5855674 E2348C_0606 E2348C_0607 sucB sucC TRUE 0.746 94.000 0.136 1.000 Y NA
 5855674 5855675 E2348C_0607 E2348C_0608 sucC sucD TRUE 0.999 0.000 0.806 0.001 Y NA
 5855677 5855678 E2348C_0610 E2348C_0611 mngA   FALSE 0.098 164.000 0.000 NA   NA
 5855679 5855680 E2348C_0612 E2348C_0613     FALSE 0.067 187.000 0.000 NA   NA
 5855680 5855681 E2348C_0613 E2348C_0614     FALSE 0.060 193.000 0.000 NA   NA
 5855681 5855682 E2348C_0614 E2348C_0615     FALSE 0.235 81.000 0.000 NA   NA
 5855683 5855684 E2348C_0616 E2348C_0617 cydA cydB TRUE 0.975 16.000 0.000 0.051 Y NA
 5855684 5855685 E2348C_0617 E2348C_0618 cydB ybgT TRUE 0.915 15.000 0.149 NA   NA
 5855685 5855686 E2348C_0618 E2348C_0619 ybgT ybgE TRUE 0.987 0.000 0.310 NA   NA
 5855686 5855687 E2348C_0619 E2348C_0620 ybgE ybgC FALSE 0.188 150.000 0.095 NA   NA
 5855687 5855688 E2348C_0620 E2348C_0621 ybgC tolQ TRUE 0.993 -3.000 0.593 1.000   NA
 5855688 5855689 E2348C_0621 E2348C_0622 tolQ tolR TRUE 0.998 4.000 0.556 0.072 Y NA
 5855689 5855690 E2348C_0622 E2348C_0623 tolR tolA FALSE 0.371 65.000 0.114 NA N NA
 5855690 5855691 E2348C_0623 E2348C_0624 tolA tolB FALSE 0.109 133.000 0.051 NA N NA
 5855691 5855692 E2348C_0624 E2348C_0625 tolB pal TRUE 0.919 35.000 0.592 1.000 N NA
 5855692 5855693 E2348C_0625 E2348C_0626 pal ybgF TRUE 0.942 10.000 0.088 1.000   NA
 5855693 5855694 E2348C_0626 E2348C_tRNA13 ybgF lysT FALSE 0.098 164.000 0.000 NA   NA
 5855694 5855695 E2348C_tRNA13 E2348C_tRNA14 lysT valT TRUE 0.522 36.000 0.000 NA   NA
 5855695 5855696 E2348C_tRNA14 E2348C_tRNA15 valT lysW TRUE 0.928 3.000 0.000 NA   NA
 5855696 5855697 E2348C_tRNA15 E2348C_tRNA16 lysW valZ FALSE 0.371 52.000 0.000 NA   NA
 5855697 5855698 E2348C_tRNA16 E2348C_tRNA17 valZ lysY TRUE 0.922 4.000 0.000 NA   NA
 5855698 5855699 E2348C_tRNA17 E2348C_tRNA18 lysY lysZ FALSE 0.401 49.000 0.000 NA   NA
 5855699 5855700 E2348C_tRNA18 E2348C_tRNA19 lysZ lysQ_1 TRUE 0.540 34.000 0.000 NA   NA
 5855700 5855701 E2348C_tRNA19 E2348C_tRNA20 lysQ_1 lysQ_2 TRUE 0.540 34.000 0.000 NA   NA
 5855701 5855702 E2348C_tRNA20 E2348C_0627 lysQ_2 nadA FALSE 0.006 434.000 0.000 NA   NA
 5855702 5855703 E2348C_0627 E2348C_0628 nadA pnuC TRUE 0.849 38.000 0.023 1.000 Y NA
 5855704 5855705 E2348C_0629 E2348C_0630 zitB ybgS FALSE 0.212 114.000 0.057 NA   NA
 5855707 5855708 E2348C_0632 E2348C_0633 gpmA galM FALSE 0.214 203.000 0.009 1.000 Y NA
 5855708 5855709 E2348C_0633 E2348C_0634 galM galK TRUE 0.990 -6.000 0.083 0.002 Y NA
 5855709 5855710 E2348C_0634 E2348C_0635 galK galT TRUE 0.993 4.000 0.370 0.002 N NA
 5855710 5855711 E2348C_0635 E2348C_0636 galT   TRUE 0.961 10.000 0.053 0.002 N NA
 5855711 5855712 E2348C_0636 E2348C_0637   modF FALSE 0.023 250.000 0.023 1.000   NA
 5855712 5855713 E2348C_0637 E2348C_0638 modF modE FALSE 0.403 68.000 0.009 0.097   NA
 5855714 5855715 E2348C_0639 E2348C_0640 ybhT modA FALSE 0.122 167.000 0.072 NA   NA
 5855715 5855716 E2348C_0640 E2348C_0641 modA modB TRUE 0.999 0.000 0.627 0.001 Y NA
 5855716 5855717 E2348C_0641 E2348C_0642 modB modC TRUE 0.999 3.000 0.537 0.001 Y NA
 5855721 5855722 E2348C_0646 E2348C_0647 ybhH ybhI FALSE 0.244 76.000 0.000 NA   NA
 5855722 5855723 E2348C_0647 E2348C_0648 ybhI ybhJ FALSE 0.096 260.000 0.300 1.000 N NA
 5855725 5855726 E2348C_0650 E2348C_0651     TRUE 0.929 -22.000 0.174 0.016   NA
 5855726 5855727 E2348C_0651 E2348C_0652     TRUE 0.486 40.000 0.000 NA   NA
 5855727 5855728 E2348C_0652 E2348C_0653     FALSE 0.254 73.000 0.000 NA   NA
 5855728 5855729 E2348C_0653 E2348C_0654     TRUE 0.836 -7.000 0.000 NA   NA
 5855729 5855730 E2348C_0654 E2348C_0655     TRUE 0.885 11.000 0.000 NA   NA
 5855730 5855731 E2348C_0655 E2348C_0656     TRUE 0.931 2.000 0.000 NA   NA
 5855731 5855732 E2348C_0656 E2348C_0657     TRUE 0.743 19.000 0.000 NA   NA
 5855732 5855733 E2348C_0657 E2348C_0658     FALSE 0.430 46.000 0.000 NA   NA
 5855733 5855734 E2348C_0658 E2348C_0659     TRUE 0.754 -13.000 0.000 NA   NA
 5855734 5855735 E2348C_0659 E2348C_0660     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5855735 5855736 E2348C_0660 E2348C_0661     TRUE 0.990 11.000 0.667 NA   NA
 5855736 5855737 E2348C_0661 E2348C_0662     TRUE 0.831 14.000 0.000 NA   NA
 5855737 5855738 E2348C_0662 E2348C_0663     TRUE 0.930 -3.000 0.000 1.000   NA
 5855738 5855739 E2348C_0663 E2348C_0664     TRUE 0.943 1.000 0.000 1.000   NA
 5855739 5855740 E2348C_0664 E2348C_0665     TRUE 0.903 9.000 0.000 NA   NA
 5855740 5855741 E2348C_0665 E2348C_0666     FALSE 0.244 76.000 0.000 NA   NA
 5855741 5855742 E2348C_0666 E2348C_0667     TRUE 0.933 1.000 0.000 NA   NA
 5855742 5855743 E2348C_0667 E2348C_0668     FALSE 0.077 180.000 0.000 NA   NA
 5855743 5855744 E2348C_0668 E2348C_0669     FALSE 0.297 63.000 0.000 NA   NA
 5855744 5855745 E2348C_0669 E2348C_0670     TRUE 0.922 4.000 0.000 NA   NA
 5855745 5855746 E2348C_0670 E2348C_0671     FALSE 0.006 443.000 0.000 NA   NA
 5855746 5855747 E2348C_0671 E2348C_0672     FALSE 0.047 205.000 0.000 NA   NA
 5855748 5855749 E2348C_0673 E2348C_0674     FALSE 0.369 107.000 0.000 0.078   NA
 5855749 5855750 E2348C_0674 E2348C_0675     FALSE 0.100 163.000 0.000 NA   NA
 5855750 5855751 E2348C_0675 E2348C_0676     FALSE 0.195 108.000 0.000 NA   NA
 5855751 5855752 E2348C_0676 E2348C_0677     FALSE 0.240 78.000 0.000 NA   NA
 5855752 5855753 E2348C_0677 E2348C_0678     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5855753 5855754 E2348C_0678 E2348C_0679     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5855754 5855755 E2348C_0679 E2348C_0680     TRUE 0.477 41.000 0.000 NA   NA
 5855755 5855756 E2348C_0680 E2348C_0681     FALSE 0.352 54.000 0.000 NA   NA
 5855756 5855757 E2348C_0681 E2348C_0682     TRUE 0.836 -7.000 0.000 NA   NA
 5855758 5855759 E2348C_0683 E2348C_0684     FALSE 0.021 266.000 0.000 NA   NA
 5855760 5855761 E2348C_0685 E2348C_0686     FALSE 0.042 212.000 0.000 NA   NA
 5855761 5855762 E2348C_0686 E2348C_0687     FALSE 0.230 86.000 0.000 NA   NA
 5855762 5855763 E2348C_0687 E2348C_0688     FALSE 0.015 299.000 0.000 NA   NA
 5855763 5855764 E2348C_0688 E2348C_0689     FALSE 0.006 448.000 0.000 NA   NA
 5855764 5855765 E2348C_0689 E2348C_0690     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5855765 5855766 E2348C_0690 E2348C_0691     TRUE 0.930 -3.000 0.000 1.000   NA
 5855766 5855767 E2348C_0691 E2348C_0692     TRUE 0.621 -238.000 0.000 1.000   NA
 5855767 5855768 E2348C_0692 E2348C_0693     FALSE 0.049 203.000 0.000 NA   NA
 5855770 5855771 E2348C_0695 E2348C_0696     TRUE 0.648 -28.000 0.000 NA   NA
 5855771 5855772 E2348C_0696 E2348C_0697     TRUE 0.719 -16.000 0.000 NA   NA
 5855772 5855773 E2348C_0697 E2348C_0698     TRUE 0.930 -3.000 0.000 1.000   NA
 5855773 5855774 E2348C_0698 E2348C_0699     TRUE 0.915 -10.000 0.150 1.000   NA
 5855774 5855775 E2348C_0699 E2348C_0700     TRUE 0.557 37.000 0.000 1.000   NA
 5855775 5855776 E2348C_0700 E2348C_0701     FALSE 0.326 58.000 0.000 NA   NA
 5855776 5855777 E2348C_0701 E2348C_0702     FALSE 0.371 52.000 0.000 NA   NA
 5855777 5855778 E2348C_0702 E2348C_0703     TRUE 0.836 -7.000 0.000 NA   NA
 5855778 5855779 E2348C_0703 E2348C_0704     TRUE 0.812 15.000 0.000 NA   NA
 5855779 5855780 E2348C_0704 E2348C_0705     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5855780 5855781 E2348C_0705 E2348C_0706     TRUE 0.907 8.000 0.000 NA   NA
 5855781 5855782 E2348C_0706 E2348C_0707     TRUE 0.831 14.000 0.000 NA   NA
 5855782 5855783 E2348C_0707 E2348C_0708     TRUE 0.956 27.000 0.667 NA   NA
 5855783 5855784 E2348C_0708 E2348C_0709     TRUE 0.696 -19.000 0.000 NA   NA
 5855784 5855785 E2348C_0709 E2348C_0710     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5855785 5855786 E2348C_0710 E2348C_0711     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5855786 5855787 E2348C_0711 E2348C_0712     TRUE 0.912 6.000 0.000 NA   NA
 5855787 5855788 E2348C_0712 E2348C_0713     TRUE 0.594 -102.000 0.000 NA   NA
 5855788 5855789 E2348C_0713 E2348C_0714     TRUE 0.801 61.000 0.500 NA   NA
 5855789 5855790 E2348C_0714 E2348C_0715     FALSE 0.264 70.000 0.000 NA   NA
 5855790 5855791 E2348C_0715 E2348C_0716     FALSE 0.323 65.000 0.000 1.000   NA
 5855791 5855792 E2348C_0716 E2348C_0717     TRUE 0.931 2.000 0.000 NA   NA
 5855792 5855793 E2348C_0717 E2348C_0718     FALSE 0.197 106.000 0.000 NA   NA
 5855793 5855794 E2348C_0718 E2348C_0719     FALSE 0.034 224.000 0.000 NA   NA
 5855794 5855795 E2348C_0719 E2348C_0720     FALSE 0.226 89.000 0.000 NA   NA
 5855795 5855796 E2348C_0720 E2348C_0721     FALSE 0.015 293.000 0.000 NA   NA
 5855796 5855797 E2348C_0721 E2348C_0722     FALSE 0.232 84.000 0.000 NA   NA
 5855798 5855799 E2348C_0723 E2348C_0724   ybhB FALSE 0.005 504.000 0.000 NA   NA
 5855802 5855803 E2348C_0727 E2348C_0728 bioB bioF TRUE 0.996 -3.000 0.168 0.002 Y NA
 5855803 5855804 E2348C_0728 E2348C_0729 bioF bioC TRUE 0.937 -13.000 0.133 0.002 N NA
 5855804 5855805 E2348C_0729 E2348C_0730 bioC bioD TRUE 0.936 -7.000 0.054 0.002 N NA
 5855805 5855806 E2348C_0730 E2348C_0731 bioD uvrB FALSE 0.008 579.000 0.000 0.096 N NA
 5855808 5855809 E2348C_0733 E2348C_0734 moaA moaB TRUE 0.977 22.000 0.108 0.003 Y NA
 5855809 5855810 E2348C_0734 E2348C_0735 moaB moaC TRUE 0.996 3.000 0.109 0.003 Y NA
 5855810 5855811 E2348C_0735 E2348C_0736 moaC moaD TRUE 0.992 -7.000 0.175 0.003 Y NA
 5855811 5855812 E2348C_0736 E2348C_0737 moaD moaE TRUE 0.999 2.000 0.501 0.003 Y NA
 5855812 5855813 E2348C_0737 E2348C_0738 moaE ybhL FALSE 0.113 137.000 0.025 NA   NA
 5855813 5855814 E2348C_0738 E2348C_0739 ybhL ybhM FALSE 0.042 205.000 0.037 NA   NA
 5855815 5855816 E2348C_0740 E2348C_0741 ybhN ybhO TRUE 0.952 0.000 0.071 NA   NA
 5855816 5855817 E2348C_0741 E2348C_0742 ybhO ybhP TRUE 0.985 -3.000 0.333 NA   NA
 5855819 5855820 E2348C_0744 E2348C_0745 ybhR ybhS TRUE 0.998 11.000 0.609 0.005 Y NA
 5855820 5855821 E2348C_0745 E2348C_0746 ybhS ybhF TRUE 0.988 -7.000 0.547 0.095   NA
 5855821 5855822 E2348C_0746 E2348C_0747 ybhF ybhG TRUE 0.983 -7.000 0.545 1.000   NA
 5855822 5855823 E2348C_0747 E2348C_0748 ybhG ybiH TRUE 0.982 0.000 0.236 1.000 N NA
 5855826 5855827 E2348C_0751 E2348C_0752 dinG ybiB TRUE 0.531 28.000 0.041 1.000 N NA
 5855827 5855828 E2348C_0752 E2348C_0753 ybiB ybiC FALSE 0.230 141.000 0.000 0.059 N NA
 5855829 5855830 E2348C_0754 E2348C_0755 ybiJ ybiI FALSE 0.016 265.000 0.027 NA   NA
 5855830 5855831 E2348C_0755 E2348C_0756 ybiI ybiX FALSE 0.285 74.000 0.000 1.000   NA
 5855831 5855832 E2348C_0756 E2348C_0757 ybiX fiu TRUE 0.740 42.000 0.171 1.000   NA
 5855832 5855833 E2348C_0757 E2348C_0758 fiu ybiM FALSE 0.021 265.000 0.000 NA   NA
 5855835 5855836 E2348C_0760 E2348C_0761 ybiO glnQ FALSE 0.126 117.000 0.000 NA N NA
 5855836 5855837 E2348C_0761 E2348C_0762 glnQ glnP TRUE 0.985 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 5855837 5855838 E2348C_0762 E2348C_0763 glnP glnH TRUE 0.616 142.000 0.051 0.070 Y NA
 5855838 5855839 E2348C_0763 E2348C_0764 glnH dps FALSE 0.006 404.000 0.000 1.000 N NA
 5855839 5855840 E2348C_0764 E2348C_0765 dps rhtA FALSE 0.014 300.000 0.044 NA   NA
 5855841 5855842 E2348C_0766 E2348C_0767 ompX   FALSE 0.052 190.000 0.000 1.000 N NA
 5855843 5855844 E2348C_0768 E2348C_ncR08 ybiP rybA FALSE 0.009 355.000 0.000 NA   NA
 5855845 5855846 E2348C_0769 E2348C_0770 mntR ybiR TRUE 0.852 -3.000 0.014 1.000 N NA
 5855849 5855850 E2348C_0773 E2348C_0774 ybiV ybiW FALSE 0.151 145.000 0.000 1.000   NA
 5855850 5855851 E2348C_0774 E2348C_0775 ybiW ybiY TRUE 0.990 6.000 0.316 0.003 N NA
 5855853 5855854 E2348C_0777 E2348C_0778 moeB moeA TRUE 0.998 0.000 0.323 0.003 Y NA
 5855855 5855856 E2348C_0779 E2348C_0780 iaaA gsiA TRUE 0.867 -13.000 0.104 1.000   NA
 5855856 5855857 E2348C_0780 E2348C_0781 gsiA gsiB TRUE 0.828 20.000 0.083 1.000   NA
 5855857 5855858 E2348C_0781 E2348C_0782 gsiB gsiC TRUE 0.996 18.000 0.803 0.055 Y NA
 5855858 5855859 E2348C_0782 E2348C_0783 gsiC gsiD TRUE 0.999 3.000 0.689 0.055 Y NA
 5855859 5855860 E2348C_0783 E2348C_0784 gsiD yliE FALSE 0.053 177.000 0.000 NA N NA
 5855860 5855861 E2348C_0784 E2348C_0785 yliE yliF TRUE 0.983 8.000 0.000 NA Y NA
 5855863 5855864 E2348C_0787 E2348C_0788 bssR yliI FALSE 0.192 111.000 0.047 NA   NA
 5855867 5855868 E2348C_0791 E2348C_0792 deoR ybjG TRUE 0.685 58.000 0.235 1.000   NA
 5855870 5855871 E2348C_0794 E2348C_0795 ybjH ybjI FALSE 0.230 86.000 0.000 NA   NA
 5855871 5855872 E2348C_0795 E2348C_0796 ybjI ybjJ TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5855873 10800737 E2348C_0797 E2348C_PP3 ybjK   TRUE 0.916 5.000 0.000 NA   NA
 5855874 5855875 E2348C_0798 E2348C_0799     FALSE 0.229 87.000 0.000 NA   NA
 5855875 5855876 E2348C_0799 E2348C_0800     TRUE 0.635 26.000 0.000 NA   NA
 5855876 5855877 E2348C_0800 E2348C_0801     TRUE 0.668 51.000 0.000 0.003   NA
 5855878 5855879 E2348C_0802 E2348C_0803     TRUE 0.549 33.000 0.000 NA   NA
 5855879 5855880 E2348C_0803 E2348C_0804     TRUE 0.907 8.000 0.000 NA   NA
 5855880 5855881 E2348C_0804 E2348C_0805     TRUE 0.964 -36.000 0.800 NA   NA
 5855881 5855882 E2348C_0805 E2348C_0806     TRUE 0.728 68.000 0.400 NA   NA
 5855882 5855883 E2348C_0806 E2348C_0807     TRUE 0.997 0.000 1.000 NA   NA
 5855883 5855884 E2348C_0807 E2348C_0808     TRUE 0.995 -3.000 1.000 1.000 N NA
 5855884 5855885 E2348C_0808 E2348C_0809     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 5855885 5855886 E2348C_0809 E2348C_0810     TRUE 0.530 155.000 0.500 NA   NA
 5855886 5855887 E2348C_0810 E2348C_0811     TRUE 0.992 11.000 0.750 NA   NA
 5855889 5855890 E2348C_0813 E2348C_0814     TRUE 0.733 -15.000 0.000 NA   NA
 5855890 5855891 E2348C_0814 E2348C_0815     TRUE 0.916 5.000 0.000 NA   NA
 5855892 5855893 E2348C_0816 E2348C_0817     TRUE 0.995 0.000 0.667 NA   NA
 5855894 5855895 E2348C_0818 E2348C_0819     TRUE 0.804 17.000 0.000 1.000   NA
 5855895 5855896 E2348C_0819 E2348C_0820     TRUE 0.996 4.000 1.000 1.000   NA
 5855896 5855897 E2348C_0820 E2348C_0821     TRUE 0.919 96.000 1.000 0.002   NA
 5855897 5855898 E2348C_0821 E2348C_0822     TRUE 0.997 0.000 1.000 NA   NA
 5855898 5855899 E2348C_0822 E2348C_0823     TRUE 0.996 4.000 1.000 NA   NA
 5855899 5855900 E2348C_0823 E2348C_0824     TRUE 0.968 -19.000 0.667 NA   NA
 5855900 5855901 E2348C_0824 E2348C_0825     TRUE 0.995 2.000 0.667 NA   NA
 5855901 5855902 E2348C_0825 E2348C_0826     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 5855902 5855903 E2348C_0826 E2348C_0827     TRUE 0.843 96.000 1.000 NA   NA
 5855903 5855904 E2348C_0827 E2348C_0828     TRUE 0.836 -7.000 0.000 NA   NA
 5855905 5855906 E2348C_0829 E2348C_0830     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 5855906 5855907 E2348C_0830 E2348C_0831     TRUE 0.990 -7.000 1.000 NA   NA
 5855907 5855908 E2348C_0831 E2348C_0832     TRUE 0.754 -13.000 0.000 NA   NA
 5855908 5855909 E2348C_0832 E2348C_0833     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5855910 5855911 E2348C_0834 E2348C_0835     FALSE 0.180 118.000 0.000 NA   NA
 5855911 5855912 E2348C_0835 E2348C_0836     FALSE 0.132 143.000 0.000 NA   NA
 5855912 5855913 E2348C_0836 E2348C_0837     TRUE 0.897 10.000 0.000 NA   NA
 5855913 5855914 E2348C_0837 E2348C_0838     FALSE 0.344 55.000 0.000 NA   NA
 5855914 5855915 E2348C_0838 E2348C_0839     TRUE 0.812 15.000 0.000 NA   NA
 5855915 5855916 E2348C_0839 E2348C_0840     TRUE 0.836 -7.000 0.000 NA   NA
 5855916 5855917 E2348C_0840 E2348C_0841     TRUE 0.985 -3.000 0.333 NA   NA
 5855917 5855918 E2348C_0841 E2348C_0842     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 5855918 5855919 E2348C_0842 E2348C_0843     FALSE 0.228 88.000 0.000 NA   NA
 5855920 5855921 E2348C_ncR09 E2348C_0844 rybB ybjL FALSE 0.237 80.000 0.000 NA   NA
 5855924 5855925 E2348C_0847 E2348C_0848 ybjC nfsA TRUE 0.873 -16.000 0.159 NA   NA
 5855925 5855926 E2348C_0848 E2348C_0849 nfsA rimK FALSE 0.263 61.000 0.000 1.000 N NA
 5855926 5855927 E2348C_0849 E2348C_0850 rimK ybjN FALSE 0.269 88.000 0.065 NA   NA
 5855927 5855928 E2348C_0850 E2348C_0851 ybjN potF FALSE 0.010 350.000 0.000 NA   NA
 5855928 5855929 E2348C_0851 E2348C_0852 potF potG TRUE 0.930 95.000 0.679 1.000 Y NA
 5855929 5855930 E2348C_0852 E2348C_0853 potG potH TRUE 0.998 10.000 0.857 1.000 Y NA
 5855930 5855931 E2348C_0853 E2348C_0854 potH potI TRUE 0.998 -3.000 0.528 0.055 Y NA
 5855931 5855932 E2348C_0854 E2348C_0855 potI ybjO TRUE 0.672 60.000 0.264 NA   NA
 5855932 5855933 E2348C_0855 E2348C_0856 ybjO rumB TRUE 0.779 41.000 0.226 NA   NA
 5855934 5855935 E2348C_0857 E2348C_0858 artJ artM FALSE 0.367 226.000 0.143 0.069 Y NA
 5855935 5855936 E2348C_0858 E2348C_0859 artM artQ TRUE 0.999 0.000 0.714 0.017 Y NA
 5855936 5855937 E2348C_0859 E2348C_0860 artQ artI TRUE 0.996 7.000 0.260 0.055 Y NA
 5855937 5855938 E2348C_0860 E2348C_0861 artI artP TRUE 0.985 18.000 0.323 1.000 Y NA
 5855938 5855939 E2348C_0861 E2348C_0862 artP ybjP FALSE 0.056 218.000 0.081 NA   NA
 5855940 5855941 E2348C_0863 E2348C_0864 ybjQ ybjR TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5855942 5855943 E2348C_0865 E2348C_0866 ybjS ybjT TRUE 0.727 99.000 0.022 0.010 Y NA
 5855943 5855944 E2348C_0866 E2348C_0867 ybjT ltaE TRUE 0.900 11.000 0.074 1.000 N NA
 5855944 5855945 E2348C_0867 E2348C_0868 ltaE poxB TRUE 0.867 37.000 0.041 1.000 Y NA
 5855945 5855946 E2348C_0868 E2348C_0869 poxB hcr FALSE 0.095 133.000 0.025 1.000 N NA
 5855946 5855947 E2348C_0869 E2348C_0870 hcr hcp TRUE 0.987 12.000 0.000 0.015 Y NA
 5855947 5855948 E2348C_0870 E2348C_0871 hcp ybjE FALSE 0.131 144.000 0.000 NA   NA
 5855948 5855949 E2348C_0871 E2348C_0872 ybjE aqpZ FALSE 0.004 484.000 0.025 NA   NA
 5855952 5855953 E2348C_0875 E2348C_0876 macA macB TRUE 0.994 -3.000 0.789 1.000 N NA
 5855955 5855956 E2348C_0878 E2348C_0879 clpS clpA TRUE 0.937 31.000 0.596 NA   NA
 5855957 5855958 E2348C_tRNA21 E2348C_0880 serW infA FALSE 0.024 254.000 0.000 NA   NA
 5855958 5855959 E2348C_0880 E2348C_0881 infA aat FALSE 0.010 285.000 0.020 1.000 N NA
 5855959 5855960 E2348C_0881 E2348C_0882 aat cydC TRUE 0.851 42.000 0.049 1.000 Y NA
 5855960 5855961 E2348C_0882 E2348C_0883 cydC cydD TRUE 0.999 1.000 0.631 0.005 Y NA
 5855961 5855962 E2348C_0883 E2348C_0884 cydD trxB TRUE 0.571 123.000 0.049 1.000 Y NA
 5855963 5855964 E2348C_0885 E2348C_0886 lrp ftsK TRUE 0.489 135.000 0.345 1.000 N NA
 5855964 5855965 E2348C_0886 E2348C_0887 ftsK lolA FALSE 0.365 156.000 0.305 1.000 N NA
 5855965 5855966 E2348C_0887 E2348C_0888 lolA rarA TRUE 0.950 11.000 0.167 1.000 N NA
 5855966 5855967 E2348C_0888 E2348C_0889 rarA serS FALSE 0.408 91.000 0.078 0.094 N NA
 5855967 5855968 E2348C_0889 E2348C_0890 serS dmsA FALSE 0.028 239.000 0.000 NA   NA
 5855968 5855969 E2348C_0890 E2348C_0891 dmsA dmsB TRUE 0.885 11.000 0.000 NA   NA
 5855969 5855970 E2348C_0891 E2348C_0892 dmsB dmsC TRUE 0.989 2.000 0.333 1.000   NA
 5855973 5855974 E2348C_0895 E2348C_0896 pflA pflB FALSE 0.087 192.000 0.092 1.000 N NA
 5855974 5855975 E2348C_0896 E2348C_0897 pflB focA TRUE 0.745 55.000 0.345 1.000 N NA
 5855975 5855976 E2348C_0897 E2348C_0898 focA ycaO FALSE 0.007 406.000 0.000 NA   NA
 5855977 5855978 E2348C_0899 E2348C_0900 ycaP serC FALSE 0.037 199.000 0.014 NA   NA
 5855978 5855979 E2348C_0900 E2348C_0901 serC aroA TRUE 0.673 71.000 0.033 1.000 Y NA
 5855979 5855980 E2348C_0901 E2348C_0902 aroA ycaL FALSE 0.043 170.000 0.003 1.000 N NA
 5855980 5855981 E2348C_0902 E2348C_0903 ycaL cmk FALSE 0.041 173.000 0.004 1.000 N NA
 5855981 5855982 E2348C_0903 E2348C_0904 cmk rpsA TRUE 0.504 111.000 0.281 1.000 N NA
 5855982 5855983 E2348C_0904 E2348C_0905 rpsA ihfB FALSE 0.341 160.000 0.292 1.000 N NA
 5855983 5855984 E2348C_0905 E2348C_0906 ihfB ycaI FALSE 0.037 206.000 0.003 1.000   NA
 5855984 5855985 E2348C_0906 E2348C_0907 ycaI msbA TRUE 0.761 37.000 0.075 0.084   NA
 5855985 5855986 E2348C_0907 E2348C_0908 msbA lpxK TRUE 0.971 -3.000 0.205 1.000 N NA
 5855986 5855987 E2348C_0908 E2348C_0909 lpxK ycaQ FALSE 0.424 37.000 0.017 NA   NA
 5855987 5855988 E2348C_0909 E2348C_0910 ycaQ ycaR FALSE 0.291 52.000 0.016 NA   NA
 5855988 5855989 E2348C_0910 E2348C_0911 ycaR kdsB TRUE 0.981 -3.000 0.265 NA   NA
 5855989 5855990 E2348C_0911 E2348C_0912 kdsB ycbJ FALSE 0.085 154.000 0.023 NA   NA
 5855992 5855993 E2348C_0914 E2348C_0915 smtA mukF TRUE 0.981 -3.000 0.325 NA N NA
 5855993 5855994 E2348C_0915 E2348C_0916 mukF mukE TRUE 0.925 -19.000 0.036 NA Y NA
 5855994 5855995 E2348C_0916 E2348C_0917 mukE mukB TRUE 0.995 0.000 0.000 0.001 Y NA
 5855995 5855996 E2348C_0917 E2348C_0918 mukB ycbB FALSE 0.026 261.000 0.000 1.000   NA
 5855996 5855997 E2348C_0918 E2348C_0919 ycbB ycbK FALSE 0.354 181.000 0.372 NA   NA
 5855997 5855998 E2348C_0919 E2348C_0920 ycbK ycbL TRUE 0.727 27.000 0.089 NA   NA
 5855999 5856000 E2348C_0921 E2348C_0922 aspC ompF FALSE 0.050 184.000 0.036 1.000 N NA
 5856000 5856001 E2348C_0922 E2348C_0923 ompF asnS FALSE 0.003 603.000 0.000 1.000 N NA
 5856001 5856002 E2348C_0923 E2348C_0924 asnS pncB FALSE 0.062 169.000 0.034 1.000 N NA
 5856004 5856005 E2348C_0926 E2348C_0927 ssuB ssuC TRUE 0.997 -3.000 0.472 1.000 Y NA
 5856005 5856006 E2348C_0927 E2348C_0928 ssuC ssuD TRUE 0.958 12.000 0.226 1.000 N NA
 5856006 5856007 E2348C_0928 E2348C_0929 ssuD ssuA TRUE 0.984 -3.000 0.341 1.000 N NA
 5856007 5856008 E2348C_0929 E2348C_0930 ssuA ssuE TRUE 0.943 -7.000 0.169 1.000   NA
 5856009 5856010 E2348C_0931 E2348C_0932 pyrD ycbW FALSE 0.121 174.000 0.081 NA   NA
 5856012 5856013 E2348C_0934 E2348C_0935 rlmL uup TRUE 0.904 12.000 0.061 1.000   NA
 5856013 5856014 E2348C_0935 E2348C_0936 uup pqiA FALSE 0.169 130.000 0.054 NA   NA
 5856014 5856015 E2348C_0936 E2348C_0937 pqiA pqiB TRUE 0.995 5.000 0.819 NA   NA
 5856015 5856016 E2348C_0937 E2348C_0938 pqiB ymbA TRUE 0.991 -3.000 0.531 NA   NA
 5856016 5856017 E2348C_0938 E2348C_0939 ymbA rmf FALSE 0.024 256.000 0.000 NA   NA
 5856018 5856019 E2348C_0940 E2348C_0941 fabA ycbZ TRUE 0.622 69.000 0.290 1.000 N NA
 5856021 5856022 E2348C_0943 E2348C_0944 ompA sulA FALSE 0.007 356.000 0.000 1.000 N NA
 5856024 5856025 E2348C_0946 E2348C_0947 yccS yccF TRUE 0.828 19.000 0.090 NA   NA
 5856027 5856028 E2348C_0949 E2348C_0950 mgsA yccT FALSE 0.229 96.000 0.055 NA   NA
 5856030 5856031 E2348C_0952 E2348C_0953 hspQ yccW FALSE 0.454 58.000 0.094 NA   NA
 5856033 5856034 E2348C_0955 E2348C_0956 yccK yccA FALSE 0.400 92.000 0.140 NA   NA
 5856034 5856035 E2348C_0956 E2348C_tRNA22 yccA serT FALSE 0.045 207.000 0.000 NA   NA
 5856036 5856037 E2348C_0957 E2348C_0958 hyaA hyaB TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 5856037 5856038 E2348C_0958 E2348C_0959 hyaB hyaC TRUE 0.991 19.000 0.355 0.048 Y NA
 5856038 5856039 E2348C_0959 E2348C_0960 hyaC hyaD TRUE 0.993 -3.000 0.177 1.000 Y NA
 5856039 5856040 E2348C_0960 E2348C_0961 hyaD hyaE TRUE 0.951 -3.000 0.096 NA   NA
 5856040 5856041 E2348C_0961 E2348C_0962 hyaE hyaF TRUE 0.994 -3.000 0.769 NA   NA
 5856041 5856042 E2348C_0962 E2348C_0963 hyaF appC FALSE 0.173 134.000 0.061 NA   NA
 5856042 5856043 E2348C_0963 E2348C_0964 appC appB TRUE 0.992 12.000 0.158 0.048 Y NA
 5856043 5856044 E2348C_0964 E2348C_0965 appB appA FALSE 0.081 185.000 0.000 1.000   NA
 5856045 5856046 E2348C_0966 E2348C_0967 etk etp TRUE 0.980 20.000 1.000 1.000 N NA
 5856046 5856047 E2348C_0967 E2348C_0968 etp gfcE TRUE 0.979 -12.000 0.750 1.000 N NA
 5856047 5856048 E2348C_0968 E2348C_0969 gfcE gfcD FALSE 0.430 46.000 0.000 NA   NA
 5856048 5856049 E2348C_0969 E2348C_0970 gfcD gfcC TRUE 0.946 0.000 0.060 NA   NA
 5856049 5856050 E2348C_0970 E2348C_0971 gfcC gfcB TRUE 0.992 -3.000 0.600 NA   NA
 5856050 5856051 E2348C_0971 E2348C_0972 gfcB gfcA FALSE 0.195 108.000 0.000 NA   NA
 5856051 5856052 E2348C_0972 E2348C_0973 gfcA cspH FALSE 0.006 442.000 0.000 NA   NA
 5856053 5856054 E2348C_0974 E2348C_0975 cspG ymcE FALSE 0.083 174.000 0.000 NA   NA
 5856054 5856055 E2348C_0975 E2348C_0976 ymcE gnsA TRUE 0.792 -10.000 0.000 NA   NA
 5856056 5856057 E2348C_0977 E2348C_0978 yccM torS FALSE 0.164 83.000 0.000 NA N NA
 5856058 5856059 E2348C_0979 E2348C_0980     TRUE 0.930 -22.000 0.174 0.015   NA
 5856059 5856060 E2348C_0980 E2348C_0981     TRUE 0.486 40.000 0.000 NA   NA
 5856060 5856061 E2348C_0981 E2348C_0982     FALSE 0.226 89.000 0.000 NA   NA
 5856061 5856062 E2348C_0982 E2348C_0983     FALSE 0.049 203.000 0.000 NA   NA
 5856062 5856063 E2348C_0983 E2348C_0984     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856063 5856064 E2348C_0984 E2348C_0985     FALSE 0.086 172.000 0.000 NA   NA
 5856064 5856065 E2348C_0985 E2348C_0986     TRUE 0.831 14.000 0.000 NA   NA
 5856065 5856066 E2348C_0986 E2348C_0987     TRUE 0.995 1.000 0.667 1.000   NA
 5856066 5856067 E2348C_0987 E2348C_0988     TRUE 0.903 9.000 0.000 NA   NA
 5856067 5856068 E2348C_0988 E2348C_0989     TRUE 0.601 -79.000 0.000 NA   NA
 5856068 5856069 E2348C_0989 E2348C_0990     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856069 5856070 E2348C_0990 E2348C_0991     TRUE 0.733 -15.000 0.000 NA   NA
 5856070 5856071 E2348C_0991 E2348C_0992     FALSE 0.244 76.000 0.000 NA   NA
 5856071 5856072 E2348C_0992 E2348C_0993     FALSE 0.116 151.000 0.000 NA   NA
 5856072 5856073 E2348C_0993 E2348C_0994     FALSE 0.318 59.000 0.000 NA   NA
 5856073 5856074 E2348C_0994 E2348C_0995     FALSE 0.006 439.000 0.000 NA   NA
 5856074 5856075 E2348C_0995 E2348C_0996     FALSE 0.235 81.000 0.000 NA   NA
 5856076 5856077 E2348C_0997 E2348C_0998     FALSE 0.155 142.000 0.000 1.000   NA
 5856077 5856078 E2348C_0998 E2348C_0999     TRUE 0.593 33.000 0.000 1.000   NA
 5856078 5856079 E2348C_0999 E2348C_1000     TRUE 0.986 -3.000 0.333 1.000   NA
 5856079 5856080 E2348C_1000 E2348C_1001     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856080 5856081 E2348C_1001 E2348C_1002     FALSE 0.254 73.000 0.000 NA   NA
 5856081 5856082 E2348C_1002 E2348C_1003     TRUE 0.682 23.000 0.000 NA   NA
 5856082 5856083 E2348C_1003 E2348C_1004     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856083 5856084 E2348C_1004 E2348C_1005     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856084 5856085 E2348C_1005 E2348C_1006     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856085 5856086 E2348C_1006 E2348C_1007     TRUE 0.836 -7.000 0.000 NA   NA
 5856086 5856087 E2348C_1007 E2348C_1008     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5856087 5856088 E2348C_1008 E2348C_1009     TRUE 0.993 -3.000 0.667 NA   NA
 5856088 5856089 E2348C_1009 E2348C_1010     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856089 5856090 E2348C_1010 E2348C_1011     TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 5856090 5856091 E2348C_1011 E2348C_1012     FALSE 0.019 280.000 0.000 NA   NA
 5856093 5856094 E2348C_1014 E2348C_1015     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5856094 5856095 E2348C_1015 E2348C_1016     TRUE 0.930 -3.000 0.000 1.000   NA
 5856095 5856096 E2348C_1016 E2348C_1017     TRUE 0.619 -247.000 0.000 1.000   NA
 5856096 5856097 E2348C_1017 E2348C_1018     FALSE 0.027 240.000 0.000 NA   NA
 5856097 5856098 E2348C_1018 E2348C_1019     FALSE 0.004 608.000 0.000 NA   NA
 5856098 5856099 E2348C_1019 E2348C_1020     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5856099 5856100 E2348C_1020 E2348C_1021     TRUE 0.993 -3.000 0.667 NA   NA
 5856100 5856101 E2348C_1021 E2348C_1022     TRUE 0.995 0.000 0.667 NA   NA
 5856101 5856102 E2348C_1022 E2348C_1023     TRUE 0.636 -118.000 0.049 1.000   NA
 5856102 5856103 E2348C_1023 E2348C_1024     TRUE 0.747 87.000 0.537 NA   NA
 5856103 5856104 E2348C_1024 E2348C_1025     TRUE 0.929 -7.000 0.152 NA   NA
 5856104 5856105 E2348C_1025 E2348C_1026     TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 5856105 5856106 E2348C_1026 E2348C_1027     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 5856106 5856107 E2348C_1027 E2348C_1028     TRUE 0.994 11.000 1.000 NA   NA
 5856107 5856108 E2348C_1028 E2348C_1029     FALSE 0.306 61.000 0.000 NA   NA
 5856108 5856109 E2348C_1029 E2348C_1030     TRUE 0.903 9.000 0.000 NA   NA
 5856109 5856110 E2348C_1030 E2348C_1031     TRUE 0.648 -28.000 0.000 NA   NA
 5856110 5856111 E2348C_1031 E2348C_1032     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5856111 5856112 E2348C_1032 E2348C_1033     TRUE 0.897 10.000 0.000 NA   NA
 5856112 5856113 E2348C_1033 E2348C_1034     TRUE 0.916 5.000 0.000 NA   NA
 5856113 5856114 E2348C_1034 E2348C_1035     TRUE 0.594 -102.000 0.000 NA   NA
 5856114 5856115 E2348C_1035 E2348C_1036     FALSE 0.306 61.000 0.000 NA   NA
 5856115 5856116 E2348C_1036 E2348C_1037     FALSE 0.264 70.000 0.000 NA   NA
 5856116 5856117 E2348C_1037 E2348C_1038     FALSE 0.323 65.000 0.000 1.000   NA
 5856117 5856118 E2348C_1038 E2348C_1039     TRUE 0.931 2.000 0.000 NA   NA
 5856118 5856119 E2348C_1039 E2348C_1040     FALSE 0.185 115.000 0.000 NA   NA
 5856119 5856120 E2348C_1040 E2348C_1041     FALSE 0.009 362.000 0.000 NA   NA
 5856120 5856121 E2348C_1041 E2348C_1042     FALSE 0.306 61.000 0.000 NA   NA
 5856121 5856122 E2348C_1042 E2348C_1043     FALSE 0.285 65.000 0.000 NA   NA
 5856122 5856123 E2348C_1043 E2348C_1044     FALSE 0.030 231.000 0.000 NA   NA
 5856123 5856124 E2348C_1044 E2348C_1045   torT FALSE 0.005 475.000 0.000 NA   NA
 5856126 5856127 E2348C_1047 E2348C_1048 torC torA TRUE 0.994 0.000 0.000 0.048 Y NA
 5856127 5856128 E2348C_1048 E2348C_1049 torA torD TRUE 0.974 -3.000 0.077 0.048   NA
 5856129 5856130 E2348C_1050 E2348C_1051 cbpM cbpA TRUE 0.993 0.000 0.512 NA   NA
 5856131 5856132 E2348C_1052 E2348C_1053 agp   FALSE 0.077 189.000 0.000 1.000   NA
 5856133 5856134 E2348C_1054 E2348C_1055 yccJ wrbA TRUE 0.926 21.000 0.290 NA   NA
 5856136 5856137 E2348C_1057 E2348C_1058 rutG rutF TRUE 0.964 21.000 0.533 1.000   NA
 5856137 5856138 E2348C_1058 E2348C_1059 rutF rutE TRUE 0.994 11.000 0.625 0.027   NA
 5856138 5856139 E2348C_1059 E2348C_1060 rutE rutD TRUE 0.974 10.000 0.256 NA   NA
 5856139 5856140 E2348C_1060 E2348C_1061 rutD rutC TRUE 0.985 8.000 0.365 NA   NA
 5856140 5856141 E2348C_1061 E2348C_1062 rutC rutB TRUE 0.978 12.000 0.442 NA N NA
 5856141 5856142 E2348C_1062 E2348C_1063 rutB rutA TRUE 0.993 0.000 0.621 NA N NA
 5856145 5856146 E2348C_1066 E2348C_1067 putP efeU FALSE 0.030 220.000 0.000 1.000 N NA
 5856146 5856147 E2348C_1067 E2348C_1068 efeU ycdO TRUE 0.915 58.000 0.356 NA Y NA
 5856147 5856148 E2348C_1068 E2348C_1069 ycdO ycdB TRUE 0.996 6.000 0.378 NA Y NA
 5856148 5856149 E2348C_1069 E2348C_1070 ycdB phoH FALSE 0.006 351.000 0.000 NA N NA
 5856149 5856150 E2348C_1070 E2348C_1071 phoH   FALSE 0.005 563.000 0.000 NA   NA
 5856150 10800739 E2348C_1071 E2348C_IE2     FALSE 0.203 101.000 0.000 NA   NA
 10800739 5856151 E2348C_IE2 E2348C_1072     TRUE 0.563 -1382.000 0.000 NA   NA
 5856153 5856154 E2348C_1074 E2348C_1075     FALSE 0.003 1375.000 0.000 NA   NA
 5856157 5856158 E2348C_1078 E2348C_1079     FALSE 0.017 287.000 0.000 NA   NA
 5856158 5856159 E2348C_1079 E2348C_1080     FALSE 0.005 471.000 0.000 NA   NA
 5856159 5856160 E2348C_1080 E2348C_1081     FALSE 0.401 49.000 0.000 NA   NA
 5856160 5856161 E2348C_1081 E2348C_1082     FALSE 0.004 607.000 0.000 NA   NA
 5856161 5856162 E2348C_1082 E2348C_1083     FALSE 0.004 796.000 0.000 NA   NA
 5856163 5856164 E2348C_1084 E2348C_1085     TRUE 0.622 52.000 0.000 0.015   NA
 5856164 5856165 E2348C_1085 E2348C_1086     TRUE 0.964 -3.000 0.000 0.073   NA
 5856167 5856168 E2348C_1088 E2348C_1089     TRUE 0.989 0.000 0.000 1.000 Y NA
 5856169 5856170 E2348C_1090 E2348C_1091     TRUE 0.991 0.000 0.411 NA   NA
 5856170 5856171 E2348C_1091 E2348C_1092     TRUE 0.709 19.000 0.033 NA   NA
 5856171 5856172 E2348C_1092 E2348C_1093     TRUE 0.857 36.000 0.317 NA   NA
 5856172 5856173 E2348C_1093 E2348C_1094     TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 5856173 5856174 E2348C_1094 E2348C_1095     TRUE 0.985 12.000 0.045 0.073 Y NA
 5856174 5856175 E2348C_1095 E2348C_1096     TRUE 0.617 40.000 0.093 NA   NA
 5856175 5856176 E2348C_1096 E2348C_1097     FALSE 0.031 229.000 0.000 NA   NA
 5856177 5856178 E2348C_1098 E2348C_1099     FALSE 0.264 70.000 0.000 NA   NA
 5856179 5856180 E2348C_1100 E2348C_1101     FALSE 0.004 596.000 0.000 NA   NA
 5856180 5856181 E2348C_1101 E2348C_1102     TRUE 0.964 -3.000 0.000 0.073   NA
 5856182 5856183 E2348C_1103 E2348C_1104     FALSE 0.155 130.000 0.000 NA   NA
 5856184 5856185 E2348C_1105 E2348C_1106     TRUE 0.964 -3.000 0.000 0.073   NA
 5856185 5856186 E2348C_1106 E2348C_1107     FALSE 0.044 208.000 0.000 NA   NA
 5856187 5856188 E2348C_1108 E2348C_1109     FALSE 0.049 203.000 0.000 NA   NA
 5856188 5856189 E2348C_1109 E2348C_1110     TRUE 0.759 18.000 0.000 NA   NA
 5856189 5856190 E2348C_1110 E2348C_1111     TRUE 0.992 -3.000 0.600 NA   NA
 5856190 5856191 E2348C_1111 E2348C_1112     TRUE 0.994 -3.000 0.800 NA   NA
 5856193 5856194 E2348C_1114 E2348C_1115     FALSE 0.223 91.000 0.000 NA   NA
 5856194 5856195 E2348C_1115 E2348C_1116     TRUE 0.791 16.000 0.000 NA   NA
 5856195 5856196 E2348C_1116 E2348C_1117     FALSE 0.297 63.000 0.000 NA   NA
 5856196 5856197 E2348C_1117 E2348C_1118     FALSE 0.100 163.000 0.000 NA   NA
 5856197 5856198 E2348C_1118 E2348C_1119     FALSE 0.421 47.000 0.000 NA   NA
 5856198 5856199 E2348C_1119 E2348C_1120     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856199 5856200 E2348C_1120 E2348C_1121     TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 5856200 5856201 E2348C_1121 E2348C_1122     FALSE 0.232 85.000 0.000 NA   NA
 5856203 5856204 E2348C_1123 E2348C_1124 ghrA ycdX TRUE 0.868 55.000 0.169 1.000 Y NA
 5856204 5856205 E2348C_1124 E2348C_1125 ycdX ycdY TRUE 0.943 24.000 0.417 1.000   NA
 5856205 5856206 E2348C_1125 E2348C_1126 ycdY ycdZ TRUE 0.460 72.000 0.145 NA   NA
 5856207 5856208 E2348C_1127 E2348C_1128 csgG csgF TRUE 0.607 27.000 0.043 NA   NA
 5856208 5856209 E2348C_1128 E2348C_1129 csgF csgE TRUE 0.965 25.000 0.723 NA   NA
 5856209 5856210 E2348C_1129 E2348C_1130 csgE csgD TRUE 0.970 5.000 0.176 NA   NA
 5856210 5856211 E2348C_1130 E2348C_1131 csgD   FALSE 0.007 412.000 0.000 NA   NA
 5856212 5856213 E2348C_1132 E2348C_1133 csgB csgA TRUE 0.917 41.000 0.333 0.008   NA
 5856213 5856214 E2348C_1133 E2348C_1134 csgA csgC TRUE 0.862 59.000 0.667 NA   NA
 5856214 5856215 E2348C_1134 E2348C_1135 csgC ymdA TRUE 0.623 121.000 0.429 NA   NA
 5856215 5856216 E2348C_1135 E2348C_1136 ymdA ymdB FALSE 0.177 95.000 0.028 NA   NA
 5856216 5856217 E2348C_1136 E2348C_1137 ymdB ymdC TRUE 0.931 2.000 0.046 NA   NA
 5856219 5856220 E2348C_1139 E2348C_1140 mdoG mdoH TRUE 0.973 -7.000 0.469 NA N NA
 5856220 5856221 E2348C_1140 E2348C_1141 mdoH yceK FALSE 0.174 173.000 0.135 NA   NA
 5856222 5856223 E2348C_1142 E2348C_1143 msyB mdtG TRUE 0.642 83.000 0.333 NA   NA
 5856223 5856224 E2348C_1143 E2348C_1144 mdtG lpxL TRUE 0.697 172.000 0.857 0.081 N NA
 5856226 5856227 E2348C_1146 E2348C_1147 yceI yceJ TRUE 0.994 4.000 0.676 NA   NA
 5856227 5856228 E2348C_1147 E2348C_1148 yceJ yceO FALSE 0.022 262.000 0.000 NA   NA
 5856228 5856229 E2348C_1148 E2348C_1149 yceO solA TRUE 0.763 48.000 0.269 NA   NA
 5856229 5856230 E2348C_1149 E2348C_1150 solA bssS TRUE 0.634 115.000 0.423 NA   NA
 5856230 5856231 E2348C_1150 E2348C_1151 bssS dinI FALSE 0.017 290.000 0.000 NA   NA
 5856231 5856232 E2348C_1151 E2348C_1152 dinI pyrC FALSE 0.214 74.000 0.031 NA   NA
 5856232 5856233 E2348C_1152 E2348C_1153 pyrC yceB FALSE 0.153 106.000 0.022 NA   NA
 5856233 5856234 E2348C_1153 E2348C_1154 yceB grxB FALSE 0.202 134.000 0.078 NA   NA
 5856234 5856235 E2348C_1154 E2348C_1155 grxB mdtH FALSE 0.358 64.000 0.103 NA N NA
 5856236 5856237 E2348C_1156 E2348C_1157 rimJ yceH TRUE 0.939 11.000 0.116 NA   NA
 5856237 5856238 E2348C_1157 E2348C_1158 yceH yceM TRUE 0.961 2.000 0.103 NA   NA
 5856238 5856239 E2348C_1158 E2348C_1159 yceM yceN FALSE 0.179 110.000 0.022 1.000   NA
 5856240 5856241 E2348C_1160 E2348C_1161 flgN flgM TRUE 0.998 5.000 0.361 0.002 Y NA
 5856241 5856242 E2348C_1161 E2348C_1162 flgM flgA TRUE 0.866 76.000 0.330 NA Y NA
 5856243 5856244 E2348C_1163 E2348C_1164 flgB flgC TRUE 0.999 4.000 0.824 0.003 Y NA
 5856244 5856245 E2348C_1164 E2348C_1165 flgC flgD TRUE 0.988 12.000 0.186 NA Y NA
 5856245 5856246 E2348C_1165 E2348C_1166 flgD flgE TRUE 0.943 25.000 0.116 NA Y NA
 5856246 5856247 E2348C_1166 E2348C_1167 flgE flgF TRUE 0.994 20.000 0.476 0.003 Y NA
 5856247 5856248 E2348C_1167 E2348C_1168 flgF flgG TRUE 0.842 172.000 0.420 0.001 Y NA
 5856248 5856249 E2348C_1168 E2348C_1169 flgG flgH TRUE 0.949 53.000 0.268 0.005 Y NA
 5856249 5856250 E2348C_1169 E2348C_1170 flgH flgI TRUE 0.990 12.000 0.073 0.006 Y NA
 5856250 5856251 E2348C_1170 E2348C_1171 flgI flgJ TRUE 0.994 0.000 0.036 0.006 Y NA
 5856251 5856252 E2348C_1171 E2348C_1172 flgJ flgK TRUE 0.974 66.000 0.705 0.002 Y NA
 5856252 5856253 E2348C_1172 E2348C_1173 flgK flgL TRUE 0.993 12.000 0.142 0.001 Y NA
 5856254 5856255 E2348C_1174 E2348C_1175     TRUE 0.930 -3.000 0.000 1.000   NA
 5856255 5856256 E2348C_1175 E2348C_1176   rne FALSE 0.172 134.000 0.000 1.000   NA
 5856256 5856257 E2348C_1176 E2348C_ncR10 rne rne5 TRUE 0.653 25.000 0.000 NA   NA
 5856258 5856259 E2348C_1177 E2348C_1178 yceQ rluC FALSE 0.123 118.000 0.005 NA   NA
 5856261 5856262 E2348C_ncR11 E2348C_1180 psrD yceD TRUE 0.513 37.000 0.000 NA   NA
 5856262 5856263 E2348C_1180 E2348C_1181 yceD rpmF TRUE 0.869 52.000 0.599 NA   NA
 5856263 5856264 E2348C_1181 E2348C_1182 rpmF plsX TRUE 0.616 111.000 0.418 1.000 N NA
 5856264 5856265 E2348C_1182 E2348C_1183 plsX fabH TRUE 0.946 68.000 0.380 0.004 Y NA
 5856265 5856266 E2348C_1183 E2348C_1184 fabH fabD TRUE 0.989 16.000 0.182 0.004 Y NA
 5856266 5856267 E2348C_1184 E2348C_1185 fabD fabG TRUE 0.997 13.000 0.432 0.004 Y NA
 5856267 5856268 E2348C_1185 E2348C_1186 fabG acpP TRUE 0.634 211.000 0.321 0.004 Y NA
 5856268 5856269 E2348C_1186 E2348C_1187 acpP fabF TRUE 0.874 88.000 0.346 1.000 Y NA
 5856269 5856270 E2348C_1187 E2348C_1188 fabF pabC FALSE 0.377 120.000 0.187 1.000 N NA
 5856270 5856271 E2348C_1188 E2348C_1189 pabC yceG TRUE 0.978 3.000 0.204 NA   NA
 5856271 5856272 E2348C_1189 E2348C_1190 yceG tmk TRUE 0.930 -10.000 0.209 NA   NA
 5856272 5856273 E2348C_1190 E2348C_1191 tmk holB TRUE 0.972 -3.000 0.211 1.000 N NA
 5856273 5856274 E2348C_1191 E2348C_1192 holB ycfH TRUE 0.985 11.000 0.110 NA Y NA
 5856274 5856275 E2348C_1192 E2348C_1193 ycfH ptsG FALSE 0.005 294.000 0.004 NA N NA
 5856277 5856278 E2348C_1195 E2348C_1196 hinT ycfL TRUE 0.932 3.000 0.051 NA   NA
 5856278 5856279 E2348C_1196 E2348C_1197 ycfL ycfM TRUE 0.979 14.000 0.516 NA   NA
 5856279 5856280 E2348C_1197 E2348C_1198 ycfM thiK TRUE 0.925 -19.000 0.310 NA   NA
 5856280 5856281 E2348C_1198 E2348C_1199 thiK nagZ TRUE 0.894 11.000 0.069 1.000 N NA
 5856281 5856282 E2348C_1199 E2348C_1200 nagZ ycfP TRUE 0.782 23.000 0.091 NA   NA
 5856282 5856283 E2348C_1200 E2348C_1201 ycfP ndh FALSE 0.008 399.000 0.057 NA   NA
 5856283 5856284 E2348C_1201 E2348C_1202 ndh ycfJ FALSE 0.051 227.000 0.071 1.000   NA
 5856287 5856288 E2348C_1205 E2348C_1206 ycfS mfd FALSE 0.109 143.000 0.006 1.000   NA
 5856288 5856289 E2348C_1206 E2348C_1207 mfd ycfT FALSE 0.131 128.000 0.003 1.000   NA
 5856290 5856291 E2348C_1208 E2348C_1209 lolC lolD TRUE 0.959 -7.000 0.175 0.066 N NA
 5856291 5856292 E2348C_1209 E2348C_1210 lolD lolE TRUE 0.981 0.000 0.125 0.066 N NA
 5856292 5856293 E2348C_1210 E2348C_1211 lolE nagK TRUE 0.832 29.000 0.225 1.000 N NA
 5856293 5856294 E2348C_1211 E2348C_1212 nagK cobB TRUE 0.974 16.000 0.119 1.000 Y NA
 5856295 5856296 E2348C_1213 E2348C_1214 ycfZ ymfA TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856296 5856297 E2348C_1214 E2348C_1215 ymfA potD FALSE 0.326 58.000 0.000 NA   NA
 5856297 5856298 E2348C_1215 E2348C_1216 potD potC TRUE 0.991 -3.000 0.000 0.052 Y NA
 5856299 5856300 E2348C_1217 E2348C_1218     TRUE 0.968 -31.000 0.500 0.014   NA
 5856300 5856301 E2348C_1218 E2348C_1219     FALSE 0.339 62.000 0.000 1.000   NA
 5856301 5856302 E2348C_1219 E2348C_1220     FALSE 0.218 93.000 0.000 NA   NA
 5856302 5856303 E2348C_1220 E2348C_1221     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856303 5856304 E2348C_1221 E2348C_ncR12   dicF_1 FALSE 0.081 175.000 0.000 NA   NA
 5856306 5856307 E2348C_1223 E2348C_1224     TRUE 0.583 30.000 0.000 NA   NA
 5856307 5856308 E2348C_1224 E2348C_1225     TRUE 0.931 2.000 0.000 NA   NA
 5856308 5856309 E2348C_1225 E2348C_1226     FALSE 0.206 99.000 0.000 NA   NA
 5856310 5856311 E2348C_1227 E2348C_1228     TRUE 0.719 -16.000 0.000 NA   NA
 5856311 5856312 E2348C_1228 E2348C_1229     TRUE 0.648 -28.000 0.000 NA   NA
 5856312 5856313 E2348C_1229 E2348C_1230     TRUE 0.581 -211.000 0.000 NA   NA
 5856313 5856314 E2348C_1230 E2348C_1231     FALSE 0.196 107.000 0.000 NA   NA
 5856314 5856315 E2348C_1231 E2348C_1232     FALSE 0.006 440.000 0.000 NA   NA
 5856315 5856316 E2348C_1232 E2348C_1233     FALSE 0.197 106.000 0.000 NA   NA
 5856316 5856317 E2348C_1233 E2348C_1234     FALSE 0.007 413.000 0.000 NA   NA
 5856317 5856318 E2348C_1234 E2348C_1235     TRUE 0.961 -13.000 0.444 NA   NA
 5856320 5856321 E2348C_1237 E2348C_1238     FALSE 0.037 220.000 0.000 NA   NA
 5856321 5856322 E2348C_1238 E2348C_1239     FALSE 0.275 67.000 0.000 NA   NA
 5856322 5856323 E2348C_1239 E2348C_1240     TRUE 0.931 2.000 0.000 NA   NA
 5856323 5856324 E2348C_1240 E2348C_1241     TRUE 0.933 1.000 0.000 NA   NA
 5856324 5856325 E2348C_1241 E2348C_1242     TRUE 0.903 9.000 0.000 NA   NA
 5856325 5856326 E2348C_1242 E2348C_1243     FALSE 0.019 278.000 0.000 NA   NA
 5856326 5856327 E2348C_1243 E2348C_1244     FALSE 0.116 151.000 0.000 NA   NA
 5856327 5856328 E2348C_1244 E2348C_tRNA24   tRNA_24 FALSE 0.392 50.000 0.000 NA   NA
 5856328 5856329 E2348C_tRNA24 E2348C_tRNA25 tRNA_24 tRNA_25 TRUE 0.907 8.000 0.000 NA   NA
 5856329 5856330 E2348C_tRNA25 E2348C_tRNA26 tRNA_25 tRNA_26 TRUE 0.831 14.000 0.000 NA   NA
 5856332 5856333 E2348C_1246 E2348C_1247     FALSE 0.006 435.000 0.000 NA   NA
 5856333 5856334 E2348C_1247 E2348C_1248     FALSE 0.315 138.000 0.000 0.015   NA
 5856334 5856335 E2348C_1248 E2348C_1249     FALSE 0.103 160.000 0.000 NA   NA
 5856335 5856336 E2348C_1249 E2348C_1250     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5856336 5856337 E2348C_1250 E2348C_1251     TRUE 0.930 -3.000 0.000 1.000   NA
 5856337 5856338 E2348C_1251 E2348C_1252     TRUE 0.621 -238.000 0.000 1.000   NA
 5856338 5856339 E2348C_1252 E2348C_1253     FALSE 0.004 1076.000 0.000 1.000   NA
 5856339 5856340 E2348C_1253 E2348C_1254     FALSE 0.005 692.000 0.000 1.000   NA
 5856340 5856341 E2348C_1254 E2348C_1255     TRUE 0.648 -28.000 0.000 NA   NA
 5856341 5856342 E2348C_1255 E2348C_1256     TRUE 0.719 -16.000 0.000 NA   NA
 5856342 5856343 E2348C_1256 E2348C_1257     TRUE 0.930 -3.000 0.000 1.000   NA
 5856343 5856344 E2348C_1257 E2348C_1258     TRUE 0.792 -10.000 0.000 NA   NA
 5856344 5856345 E2348C_1258 E2348C_1259     TRUE 0.635 26.000 0.000 NA   NA
 5856345 5856346 E2348C_1259 E2348C_1260     TRUE 0.801 61.000 0.500 NA   NA
 5856346 5856347 E2348C_1260 E2348C_1261     FALSE 0.264 70.000 0.000 NA   NA
 5856347 5856348 E2348C_1261 E2348C_1262     FALSE 0.323 65.000 0.000 1.000   NA
 5856348 5856349 E2348C_1262 E2348C_1263     TRUE 0.931 2.000 0.000 NA   NA
 5856352 5856353 E2348C_1266 E2348C_1267 potB potA TRUE 0.993 -16.000 0.789 1.000 Y NA
 5856355 5856356 E2348C_1269 E2348C_1270 ycfD phoQ TRUE 0.705 76.000 0.408 NA   NA
 5856356 5856357 E2348C_1270 E2348C_1271 phoQ phoP TRUE 0.999 0.000 0.940 1.000 Y NA
 5856357 5856358 E2348C_1271 E2348C_1272 phoP purB FALSE 0.047 170.000 0.011 1.000 N NA
 5856358 5856359 E2348C_1272 E2348C_1273 purB hflD TRUE 0.953 4.000 0.093 NA   NA
 5856359 5856360 E2348C_1273 E2348C_1274 hflD mnmA TRUE 0.769 36.000 0.180 NA   NA
 5856360 5856361 E2348C_1274 E2348C_1275 mnmA nudJ TRUE 0.560 54.000 0.158 1.000 N NA
 5856361 5856362 E2348C_1275 E2348C_1276 nudJ rluE TRUE 0.960 10.000 0.182 1.000 N NA
 5856364 5856365 E2348C_1278 E2348C_1279 ycgX ycgE FALSE 0.036 221.000 0.000 NA   NA
 5856365 5856366 E2348C_1279 E2348C_1280 ycgE ycgF FALSE 0.208 205.000 0.333 1.000 N NA
 5856367 5856368 E2348C_1281 E2348C_1282 ycgZ ymgA TRUE 0.857 43.000 0.400 NA   NA
 5856368 5856369 E2348C_1282 E2348C_1283 ymgA ymgB TRUE 0.592 29.000 0.000 NA   NA
 5856369 5856370 E2348C_1283 E2348C_1284 ymgB ymgC FALSE 0.188 113.000 0.000 NA   NA
 5856370 5856371 E2348C_1284 E2348C_1285 ymgC ycgG FALSE 0.015 298.000 0.000 NA   NA
 5856371 5856372 E2348C_1285 E2348C_1286 ycgG ymgF FALSE 0.168 125.000 0.000 NA   NA
 5856372 5856373 E2348C_1286 E2348C_1287 ymgF ycgH FALSE 0.007 399.000 0.000 NA   NA
 5856374 5856375 E2348C_1288 E2348C_1289 ymgD ymgG TRUE 0.897 10.000 0.000 NA   NA
 5856375 5856376 E2348C_1289 E2348C_1290 ymgG ymgI TRUE 0.931 2.000 0.000 NA   NA
 5856377 5856378 E2348C_1291 E2348C_1292 ymgJ ycgI FALSE 0.152 132.000 0.000 NA   NA
 5856379 5856380 E2348C_1293 E2348C_1294 minE minD TRUE 0.998 4.000 0.618 NA Y NA
 5856380 5856381 E2348C_1294 E2348C_1295 minD minC TRUE 0.984 24.000 0.466 1.000 Y NA
 5856384 5856385 E2348C_1298 E2348C_1299 ycgL ycgM FALSE 0.284 72.000 0.056 NA   NA
 5856385 5856386 E2348C_1299 E2348C_1300 ycgM ycgN FALSE 0.315 92.000 0.088 NA   NA
 5856388 5856389 E2348C_ncR13 E2348C_1302   umuD FALSE 0.313 60.000 0.000 NA   NA
 5856389 5856390 E2348C_1302 E2348C_1303 umuD umuC TRUE 0.922 0.000 0.000 1.000 N NA
 5856391 5856392 E2348C_1304 E2348C_1305 dsbB nhaB TRUE 0.664 146.000 0.723 1.000 N NA
 5856395 5856396 E2348C_1308 E2348C_1309 dadA dadX TRUE 0.956 10.000 0.168 1.000 N NA
 5856397 5856398 E2348C_1310 E2348C_1311 cvrA ldcA FALSE 0.270 95.000 0.103 NA N NA
 5856402 5856403 E2348C_1315 E2348C_1316     TRUE 0.539 26.000 0.034 1.000 N NA
 5856403 5856404 E2348C_1316 E2348C_1317     TRUE 0.904 -3.000 0.034 NA   NA
 5856404 5856405 E2348C_1317 E2348C_1318     TRUE 0.949 10.000 0.123 NA   NA
 5856405 5856406 E2348C_1318 E2348C_1319     TRUE 0.999 -3.000 0.862 1.000 Y NA
 5856406 5856407 E2348C_1319 E2348C_1320     TRUE 0.998 0.000 0.422 1.000 Y NA
 5856407 5856408 E2348C_1320 E2348C_1321   treA FALSE 0.009 337.000 0.000 1.000 N NA
 5856408 5856409 E2348C_1321 E2348C_1322 treA dhaM FALSE 0.015 320.000 0.000 1.000   NA
 5856409 5856410 E2348C_1322 E2348C_1323 dhaM dhaL TRUE 0.947 11.000 0.118 1.000   NA
 5856410 5856411 E2348C_1323 E2348C_1324 dhaL dhaK TRUE 0.996 11.000 0.226 0.001 Y NA
 5856413 5856414 E2348C_1326 E2348C_1327 ychF pth TRUE 0.750 117.000 0.184 1.000 Y NA
 5856416 5856417 E2348C_1329 E2348C_1330 ychM prs FALSE 0.109 125.000 0.027 1.000 N NA
 5856417 5856418 E2348C_1330 E2348C_1331 prs ispE FALSE 0.104 151.000 0.053 1.000 N NA
 5856418 5856419 E2348C_1331 E2348C_1332 ispE lolB TRUE 0.971 0.000 0.157 1.000 N NA
 5856420 5856421 E2348C_1333 E2348C_1334 hemA prfA TRUE 0.807 42.000 0.171 0.043 N NA
 5856421 5856422 E2348C_1334 E2348C_1335 prfA prmC TRUE 0.997 0.000 0.229 0.043 Y NA
 5856422 5856423 E2348C_1335 E2348C_1336 prmC ychQ TRUE 0.955 -3.000 0.109 NA   NA
 5856423 5856424 E2348C_1336 E2348C_1337 ychQ ychA TRUE 0.975 4.000 0.195 NA   NA
 5856424 5856425 E2348C_1337 E2348C_1338 ychA kdsA TRUE 0.674 36.000 0.089 1.000   NA
 5856429 5856430 E2348C_1341 E2348C_1342 chaB chaC FALSE 0.216 158.000 0.140 NA   NA
 5856433 5856434 E2348C_1345 E2348C_1346 narL narX TRUE 0.997 -7.000 0.521 0.013 Y NA
 5856435 5856436 E2348C_1347 E2348C_1348 narK narG FALSE 0.006 393.000 0.000 1.000 N NA
 5856436 5856437 E2348C_1348 E2348C_1349 narG narH TRUE 0.999 -3.000 0.471 0.001 Y NA
 5856437 5856438 E2348C_1349 E2348C_1350 narH narJ TRUE 0.999 -3.000 0.588 0.003 Y NA
 5856438 5856439 E2348C_1350 E2348C_1351 narJ narI TRUE 0.999 0.000 0.500 0.003 Y NA
 5856439 5856440 E2348C_1351 E2348C_1352 narI   FALSE 0.131 112.000 0.000 NA N NA
 5856440 5856441 E2348C_1352 E2348C_1353     TRUE 0.967 -3.000 0.200 NA N NA
 5856441 5856442 E2348C_1353 E2348C_1354     TRUE 0.845 -22.000 0.133 1.000   NA
 5856442 5856443 E2348C_1354 E2348C_1355     TRUE 0.991 -3.000 0.550 NA   NA
 5856443 5856444 E2348C_1355 E2348C_1356     TRUE 0.968 -3.000 0.162 NA   NA
 5856444 5856445 E2348C_1356 E2348C_1357     TRUE 0.940 -7.000 0.179 NA   NA
 5856445 5856446 E2348C_1357 E2348C_1358     TRUE 0.849 -13.000 0.103 NA   NA
 5856447 5856448 E2348C_tRNA27 E2348C_1359 tyrT purU FALSE 0.103 160.000 0.000 NA   NA
 5856448 5856449 E2348C_1359 E2348C_1360 purU ychJ TRUE 0.684 50.000 0.200 NA   NA
 5856450 5856451 E2348C_1361 E2348C_1362 rssA rssB FALSE 0.256 92.000 0.048 1.000   NA
 5856451 5856452 E2348C_1362 E2348C_1363 rssB galU FALSE 0.162 202.000 0.235 1.000 N NA
 5856455 5856456 E2348C_1366 E2348C_1367   adhE FALSE 0.165 126.000 0.000 NA   NA
 5856457 5856458 E2348C_1368 E2348C_1369 ychE oppA FALSE 0.002 738.000 0.000 NA N NA
 5856458 5856459 E2348C_1369 E2348C_1370 oppA oppB TRUE 0.844 86.000 0.151 0.051 Y NA
 5856459 5856460 E2348C_1370 E2348C_1371 oppB oppC TRUE 0.998 15.000 0.870 0.051 Y NA
 5856460 5856461 E2348C_1371 E2348C_1372 oppC oppD TRUE 0.996 12.000 0.554 1.000 Y NA
 5856461 5856462 E2348C_1372 E2348C_1373 oppD oppF TRUE 0.998 -3.000 0.420 0.002 Y NA
 5856463 5856464 E2348C_1374 E2348C_1375 yciU cls TRUE 0.817 35.000 0.231 NA   NA
 5856466 5856467 E2348C_1377 E2348C_1378 kch yciI FALSE 0.015 300.000 0.000 NA   NA
 5856469 5856470 E2348C_1380 E2348C_1381 yciA yciB FALSE 0.349 105.000 0.167 NA N NA
 5856470 5856471 E2348C_1381 E2348C_1382 yciB yciC TRUE 0.628 30.000 0.061 NA   NA
 5856472 10800741 E2348C_1383 E2348C_PP6 ompW   TRUE 0.589 -114.000 0.000 NA   NA
 5856473 5856474 E2348C_1384 E2348C_1385     TRUE 0.857 -22.000 0.000 0.014   NA
 5856474 5856475 E2348C_1385 E2348C_1386     FALSE 0.323 65.000 0.000 1.000   NA
 5856475 5856476 E2348C_1386 E2348C_1387     FALSE 0.218 93.000 0.000 NA   NA
 5856476 5856477 E2348C_1387 E2348C_1388     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856477 5856478 E2348C_1388 E2348C_ncR15   dicF_2 FALSE 0.081 175.000 0.000 NA   NA
 5856480 5856481 E2348C_1390 E2348C_1391     TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 5856481 5856482 E2348C_1391 E2348C_1392     FALSE 0.069 185.000 0.000 NA   NA
 5856483 5856484 E2348C_1393 E2348C_1394     TRUE 0.719 -16.000 0.000 NA   NA
 5856484 5856485 E2348C_1394 E2348C_1395     TRUE 0.682 23.000 0.000 NA   NA
 5856485 5856486 E2348C_1395 E2348C_1396     TRUE 0.477 41.000 0.000 NA   NA
 5856486 5856487 E2348C_1396 E2348C_1397     FALSE 0.026 244.000 0.000 NA   NA
 5856487 5856488 E2348C_1397 E2348C_1398     FALSE 0.014 301.000 0.000 NA   NA
 5856489 5856490 E2348C_1399 E2348C_1400     TRUE 0.836 -7.000 0.000 NA   NA
 5856490 5856491 E2348C_1400 E2348C_1401     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856492 5856493 E2348C_1402 E2348C_1403     TRUE 0.767 -155.000 0.000 0.095   NA
 5856493 5856494 E2348C_1403 E2348C_1404     FALSE 0.092 167.000 0.000 NA   NA
 5856494 5856495 E2348C_1404 E2348C_1405     TRUE 0.931 2.000 0.000 NA   NA
 5856495 5856496 E2348C_1405 E2348C_1406     TRUE 0.849 13.000 0.000 NA   NA
 5856496 5856497 E2348C_1406 E2348C_1407     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856497 5856498 E2348C_1407 E2348C_tRNA28   tRNA_28 FALSE 0.055 196.000 0.000 NA   NA
 5856498 5856499 E2348C_tRNA28 E2348C_tRNA29 tRNA_28 tRNA_29 TRUE 0.931 2.000 0.000 NA   NA
 5856499 5856500 E2348C_tRNA29 E2348C_tRNA30 tRNA_29 tRNA_30 TRUE 0.831 14.000 0.000 NA   NA
 5856502 5856503 E2348C_1409 E2348C_1410     FALSE 0.116 151.000 0.000 NA   NA
 5856503 5856504 E2348C_1410 E2348C_1411     TRUE 0.916 5.000 0.000 NA   NA
 5856504 5856505 E2348C_1411 E2348C_1412     FALSE 0.292 64.000 0.000 NA   NA
 5856505 5856506 E2348C_1412 E2348C_1413     FALSE 0.108 156.000 0.000 NA   NA
 5856506 5856507 E2348C_1413 E2348C_1414     TRUE 0.503 38.000 0.000 NA   NA
 5856507 5856508 E2348C_1414 E2348C_1415     FALSE 0.204 100.000 0.000 NA   NA
 5856508 5856509 E2348C_1415 E2348C_1416     TRUE 0.617 -274.000 0.000 1.000   NA
 5856509 5856510 E2348C_1416 E2348C_1417     FALSE 0.230 86.000 0.000 NA   NA
 5856512 5856513 E2348C_1419 E2348C_1420     FALSE 0.010 291.000 0.026 1.000 N NA
 5856513 5856514 E2348C_1420 E2348C_1421     TRUE 0.932 -3.000 0.064 NA   NA
 5856514 5856515 E2348C_1421 E2348C_1422     FALSE 0.380 64.000 0.080 NA   NA
 5856515 5856516 E2348C_1422 E2348C_1423     FALSE 0.420 45.000 0.040 NA   NA
 5856516 5856517 E2348C_1423 E2348C_1424     TRUE 0.612 -54.000 0.000 NA   NA
 5856517 5856518 E2348C_1424 E2348C_1425     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856518 5856519 E2348C_1425 E2348C_1426     TRUE 0.981 10.000 0.333 NA   NA
 5856519 5856520 E2348C_1426 E2348C_1427     TRUE 0.945 -3.000 0.083 NA   NA
 5856520 5856521 E2348C_1427 E2348C_1428     TRUE 0.993 -3.000 0.635 NA   NA
 5856521 5856522 E2348C_1428 E2348C_1429     TRUE 0.631 65.000 0.250 NA   NA
 5856522 5856523 E2348C_1429 E2348C_1430     TRUE 0.982 15.000 0.643 NA   NA
 5856523 5856524 E2348C_1430 E2348C_1431     TRUE 0.971 24.000 0.818 NA   NA
 5856524 5856525 E2348C_1431 E2348C_1432     FALSE 0.410 48.000 0.000 NA   NA
 5856525 5856526 E2348C_1432 E2348C_1433     TRUE 0.836 -7.000 0.000 NA   NA
 5856526 5856527 E2348C_1433 E2348C_1434     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5856527 5856528 E2348C_1434 E2348C_1435     TRUE 0.912 6.000 0.000 NA   NA
 5856528 5856529 E2348C_1435 E2348C_1436     TRUE 0.594 -102.000 0.000 NA   NA
 5856529 5856530 E2348C_1436 E2348C_1437     FALSE 0.027 241.000 0.000 NA   NA
 5856530 5856531 E2348C_1437 E2348C_1438     FALSE 0.272 68.000 0.000 NA   NA
 5856531 5856532 E2348C_1438 E2348C_1439     FALSE 0.134 152.000 0.000 1.000   NA
 5856532 5856533 E2348C_1439 E2348C_1440     TRUE 0.931 2.000 0.000 NA   NA
 5856533 5856534 E2348C_1440 E2348C_1441     FALSE 0.036 221.000 0.000 NA   NA
 5856535 5856536 E2348C_1442 E2348C_1443     FALSE 0.004 655.000 0.000 NA   NA
 5856537 5856538 E2348C_1444 E2348C_1445     FALSE 0.279 66.000 0.000 NA   NA
 5856539 5856540 E2348C_1446 E2348C_1447     FALSE 0.005 487.000 0.000 NA   NA
 5856540 5856541 E2348C_1447 E2348C_1448     FALSE 0.003 1173.000 0.000 NA   NA
 5856543 5856544 E2348C_1450 E2348C_1451 trpA trpB TRUE 0.999 0.000 0.947 0.001 Y NA
 5856544 5856545 E2348C_1451 E2348C_1452 trpB trpC TRUE 0.995 12.000 0.221 0.001 Y NA
 5856545 5856546 E2348C_1452 E2348C_1453 trpC trpD TRUE 0.996 4.000 0.293 1.000 Y NA
 5856546 5856547 E2348C_1453 E2348C_1454 trpD trpE TRUE 0.994 0.000 0.010 0.001 Y NA
 5856547 5856548 E2348C_1454 E2348C_1455 trpE trpL FALSE 0.176 92.000 0.023 NA   NA
 5856549 5856550 E2348C_1456 E2348C_1457 trpH yciO TRUE 0.982 -3.000 0.281 NA   NA
 5856550 5856551 E2348C_1457 E2348C_1458 yciO yciQ TRUE 0.602 28.000 0.000 NA   NA
 5856551 5856552 E2348C_1458 E2348C_1459 yciQ rluB FALSE 0.041 213.000 0.000 NA   NA
 5856553 5856554 E2348C_1460 E2348C_1461 btuR yciK TRUE 0.904 -3.000 0.050 1.000 N NA
 5856557 5856558 E2348C_1464 E2348C_1465 topA cysB FALSE 0.021 210.000 0.008 1.000 N NA
 5856558 5856559 E2348C_1465 E2348C_1466 cysB ymiA FALSE 0.011 331.000 0.000 NA   NA
 5856559 5856560 E2348C_1466 E2348C_1467 ymiA yciX TRUE 0.993 3.000 0.556 NA   NA
 5856560 5856561 E2348C_1467 E2348C_1468 yciX acnA FALSE 0.008 372.000 0.000 NA   NA
 5856563 5856564 E2348C_1470 E2348C_1471 pgpB yciS FALSE 0.248 149.000 0.143 NA   NA
 5856564 5856565 E2348C_1471 E2348C_1472 yciS yciM TRUE 0.991 7.000 0.576 NA   NA
 5856565 5856566 E2348C_1472 E2348C_1473 yciM pyrF FALSE 0.109 192.000 0.125 1.000 N NA
 5856566 5856567 E2348C_1473 E2348C_1474 pyrF yciH TRUE 0.921 0.000 0.045 1.000 N NA
 5856568 5856569 E2348C_1475 E2348C_1476 osmB yciT FALSE 0.020 269.000 0.000 NA   NA
 5856569 5856570 E2348C_1476 E2348C_1477 yciT yciZ FALSE 0.416 90.000 0.146 NA   NA
 5856570 5856571 E2348C_1477 E2348C_1478 yciZ gmr FALSE 0.180 148.000 0.083 NA   NA
 5856571 5856572 E2348C_1478 E2348C_1479 gmr   FALSE 0.009 330.000 0.000 1.000 N NA
 5856572 5856573 E2348C_1479 E2348C_1480   rnb FALSE 0.057 185.000 0.000 1.000 N NA
 5856573 5856574 E2348C_1480 E2348C_1481 rnb yciW TRUE 0.640 40.000 0.105 NA   NA
 5856574 5856575 E2348C_1481 E2348C_1482 yciW fabI FALSE 0.146 145.000 0.057 NA   NA
 5856576 5856577 E2348C_1483 E2348C_1484     FALSE 0.377 149.000 0.286 1.000 N NA
 5856577 5856578 E2348C_1484 E2348C_1485     TRUE 0.973 0.000 0.167 1.000 N NA
 5856578 5856579 E2348C_1485 E2348C_1486     TRUE 0.992 4.000 0.367 0.050 N NA
 5856579 5856580 E2348C_1486 E2348C_1487     TRUE 0.974 9.000 0.143 0.050 N NA
 5856581 5856582 E2348C_1488 E2348C_1489   sapF FALSE 0.058 203.000 0.000 1.000   NA
 5856582 5856583 E2348C_1489 E2348C_1490 sapF sapD TRUE 0.999 2.000 0.684 0.015 Y NA
 5856583 5856584 E2348C_1490 E2348C_1491 sapD sapC TRUE 0.999 0.000 0.667 1.000 Y NA
 5856584 5856585 E2348C_1491 E2348C_1492 sapC sapB TRUE 0.989 -13.000 0.284 0.050 Y NA
 5856585 5856586 E2348C_1492 E2348C_1493 sapB sapA TRUE 0.987 -3.000 0.264 0.050 N NA
 5856586 5856587 E2348C_1493 E2348C_1494 sapA ymjA FALSE 0.013 313.000 0.000 NA   NA
 5856587 5856588 E2348C_1494 E2348C_1495 ymjA pspF FALSE 0.006 425.000 0.000 NA   NA
 5856589 5856590 E2348C_1496 E2348C_1497 pspA pspB TRUE 0.892 54.000 0.739 NA   NA
 5856590 5856591 E2348C_1497 E2348C_1498 pspB pspC TRUE 0.996 0.000 0.913 NA   NA
 5856591 5856592 E2348C_1498 E2348C_1499 pspC pspD TRUE 0.963 9.000 0.167 NA   NA
 5856592 5856593 E2348C_1499 E2348C_1500 pspD pspE FALSE 0.426 75.000 0.133 NA   NA
 5856593 5856594 E2348C_1500 E2348C_1501 pspE ycjM FALSE 0.032 214.000 0.000 1.000 N NA
 5856594 5856595 E2348C_1501 E2348C_1502 ycjM ycjN TRUE 0.992 14.000 0.360 1.000 Y NA
 5856595 5856596 E2348C_1502 E2348C_1503 ycjN ycjO TRUE 0.994 21.000 0.620 0.050 Y NA
 5856596 5856597 E2348C_1503 E2348C_1504 ycjO ycjP TRUE 0.996 -13.000 0.805 0.050 Y NA
 5856597 5856598 E2348C_1504 E2348C_1505 ycjP ycjQ TRUE 0.802 31.000 0.205 1.000 N NA
 5856598 5856599 E2348C_1505 E2348C_1506 ycjQ ycjR TRUE 0.912 19.000 0.261 NA N NA
 5856599 5856600 E2348C_1506 E2348C_1507 ycjR ycjS TRUE 0.982 10.000 0.347 NA   NA
 5856600 5856601 E2348C_1507 E2348C_1508 ycjS ycjT TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856601 5856602 E2348C_1508 E2348C_1509 ycjT   FALSE 0.094 166.000 0.000 NA   NA
 5856602 5856603 E2348C_1509 E2348C_1510   ycjU FALSE 0.064 197.000 0.000 1.000   NA
 5856603 5856604 E2348C_1510 E2348C_1511 ycjU ycjV TRUE 0.912 14.000 0.103 1.000   NA
 5856604 5856605 E2348C_1511 E2348C_1512 ycjV ompG TRUE 0.850 45.000 0.222 0.050   NA
 5856607 5856608 E2348C_1514 E2348C_1515 ycjX ycjF TRUE 0.994 -3.000 0.791 NA   NA
 5856608 5856609 E2348C_1515 E2348C_1516 ycjF tyrR FALSE 0.247 148.000 0.137 NA   NA
 5856612 5856613 E2348C_1519 E2348C_1520 mpaA ymjC FALSE 0.013 291.000 0.000 1.000 N NA
 5856613 5856614 E2348C_1520 E2348C_1521 ymjC ycjY FALSE 0.296 71.000 0.000 1.000   NA
 5856615 5856616 E2348C_1522 E2348C_1523 ycjZ mppA FALSE 0.009 337.000 0.000 1.000 N NA
 5856619 5856620 E2348C_1526 E2348C_1527 uspE fnr TRUE 0.845 152.000 0.619 1.000 Y NA
 5856620 5856621 E2348C_1527 E2348C_1528 fnr ogt FALSE 0.047 195.000 0.000 1.000 N NA
 5856624 5856625 E2348C_1530 E2348C_1531     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5856625 5856626 E2348C_1531 E2348C_1532   ydaL FALSE 0.057 195.000 0.000 NA   NA
 5856628 5856629 E2348C_1534 E2348C_ncR17 ydaN   FALSE 0.011 330.000 0.000 NA   NA
 5856629 5856630 E2348C_ncR17 E2348C_1535   dbpA FALSE 0.250 74.000 0.000 NA   NA
 5856632 5856633 E2348C_1537 E2348C_1538 uspF ompN FALSE 0.112 141.000 0.000 1.000 N NA
 5856637 5856638 E2348C_1541 E2348C_1542 hslJ ldhA FALSE 0.132 111.000 0.000 NA N NA
 5856639 5856640 E2348C_1543 E2348C_1544 ydbH ynbE TRUE 0.935 -3.000 0.068 NA   NA
 5856640 5856641 E2348C_1544 E2348C_1545 ynbE ydbL TRUE 0.993 8.000 0.726 NA   NA
 5856643 5856644 E2348C_1547 E2348C_1548 paaY ydbC FALSE 0.051 201.000 0.000 NA   NA
 5856645 5856646 E2348C_1549 E2348C_1550   azoR FALSE 0.072 192.000 0.000 1.000   NA
 5856647 5856648 E2348C_1551 E2348C_1552 hrpA ydcF FALSE 0.019 274.000 0.000 NA   NA
 5856648 5856649 E2348C_1552 E2348C_1553 ydcF aldA FALSE 0.050 197.000 0.040 NA   NA
 5856654 5856655 E2348C_1557 E2348C_1558     TRUE 0.774 17.000 0.000 NA   NA
 5856655 5856656 E2348C_1558 E2348C_1559     FALSE 0.018 281.000 0.000 NA   NA
 5856656 5856657 E2348C_1559 E2348C_1560     TRUE 0.618 27.000 0.000 NA   NA
 5856657 5856658 E2348C_1560 E2348C_1561     FALSE 0.010 348.000 0.000 NA   NA
 5856658 5856659 E2348C_1561 E2348C_1562     TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 5856659 5856660 E2348C_1562 E2348C_1563     FALSE 0.094 166.000 0.000 NA   NA
 5856660 5856661 E2348C_1563 E2348C_1564     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856664 5856665 E2348C_1567 E2348C_1568 ydcJ mdoD FALSE 0.034 225.000 0.000 NA   NA
 5856665 5856666 E2348C_1568 E2348C_1569 mdoD ydcH FALSE 0.109 140.000 0.026 NA   NA
 5856666 5856667 E2348C_1569 E2348C_1570 ydcH rimL FALSE 0.245 63.000 0.026 NA   NA
 5856669 5856670 E2348C_1572 E2348C_1573 tehA tehB TRUE 0.974 -3.000 0.175 1.000   NA
 5856670 5856671 E2348C_1573 E2348C_1574 tehB ydcL FALSE 0.023 303.000 0.088 NA   NA
 5856673 5856674 E2348C_1576 E2348C_1577 ydcN ydcP FALSE 0.216 73.000 0.000 1.000 N NA
 5856676 5856677 E2348C_1579 E2348C_1580 ydcR ydcS FALSE 0.146 245.000 0.000 1.000 Y NA
 5856677 5856678 E2348C_1580 E2348C_1581 ydcS ydcT TRUE 0.995 18.000 0.609 0.050 Y NA
 5856678 5856679 E2348C_1581 E2348C_1582 ydcT ydcU TRUE 0.999 1.000 0.643 0.050 Y NA
 5856679 5856680 E2348C_1582 E2348C_1583 ydcU ydcV TRUE 0.997 -10.000 0.821 0.050 Y NA
 5856680 5856681 E2348C_1583 E2348C_1584 ydcV ydcW TRUE 0.882 22.000 0.216 1.000 N NA
 5856683 5856684 E2348C_1586 E2348C_1587 ydcX ydcY FALSE 0.230 86.000 0.000 NA   NA
 5856685 5856686 E2348C_1588 E2348C_1589 ydcZ yncA TRUE 0.937 -3.000 0.070 NA   NA
 5856691 5856692 E2348C_1594 E2348C_1595     TRUE 0.831 14.000 0.000 NA   NA
 5856692 5856693 E2348C_1595 E2348C_1596     FALSE 0.035 222.000 0.000 NA   NA
 5856693 5856694 E2348C_1596 E2348C_1597     FALSE 0.214 95.000 0.000 NA   NA
 5856694 5856695 E2348C_1597 E2348C_1598   pptA FALSE 0.003 1451.000 0.000 NA   NA
 5856698 5856699 E2348C_1601 E2348C_1602 yddE narV FALSE 0.270 80.000 0.000 1.000   NA
 5856699 5856700 E2348C_1602 E2348C_1603 narV narW TRUE 0.999 -3.000 0.714 0.003 Y NA
 5856700 5856701 E2348C_1603 E2348C_1604 narW narY TRUE 0.999 0.000 0.714 0.003 Y NA
 5856701 5856702 E2348C_1604 E2348C_1605 narY narZ TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.001 Y NA
 5856702 5856703 E2348C_1605 E2348C_1606 narZ narU TRUE 0.720 95.000 0.556 1.000 N NA
 5856703 5856704 E2348C_1606 E2348C_1607 narU yddG FALSE 0.022 279.000 0.000 1.000   NA
 5856705 5856706 E2348C_1608 E2348C_1609 fdnG fdnH TRUE 0.997 13.000 0.429 0.002 Y NA
 5856706 5856707 E2348C_1609 E2348C_1610 fdnH fdnI TRUE 0.995 -7.000 0.333 0.002 Y NA
 5856708 5856709 E2348C_1611 E2348C_1612 yddM adhP FALSE 0.007 464.000 0.000 1.000   NA
 5856709 5856710 E2348C_1612 E2348C_1613 adhP maeA FALSE 0.172 134.000 0.000 1.000   NA
 5856710 5856711 E2348C_1613 E2348C_1614 maeA sra TRUE 0.669 156.000 0.750 1.000   NA
 5856711 5856712 E2348C_1614 E2348C_1615 sra bdm TRUE 0.731 102.000 0.571 NA   NA
 5856714 5856715 E2348C_1617 E2348C_1618 dos yddW FALSE 0.006 567.000 0.000 1.000   NA
 5856715 5856716 E2348C_1618 E2348C_1619 yddW gadC FALSE 0.178 131.000 0.000 1.000   NA
 5856716 5856717 E2348C_1619 E2348C_1620 gadC gadB TRUE 0.524 156.000 0.103 1.000 Y NA
 5856717 5856718 E2348C_1620 E2348C_1621 gadB pqqL FALSE 0.011 362.000 0.000 1.000   NA
 5856718 5856719 E2348C_1621 E2348C_1622 pqqL yddB TRUE 0.609 57.000 0.167 1.000   NA
 5856719 5856720 E2348C_1622 E2348C_1623 yddB yddA TRUE 0.714 38.000 0.000 0.063   NA
 5856720 5856721 E2348C_1623 E2348C_1624 yddA ydeM FALSE 0.019 291.000 0.000 1.000   NA
 5856721 5856722 E2348C_1624 E2348C_1625 ydeM ydeN TRUE 0.921 52.000 0.600 0.053   NA
 5856722 5856723 E2348C_1625 E2348C_1626 ydeN ydeO FALSE 0.006 402.000 0.000 1.000 N NA
 5856723 5856724 E2348C_1626 E2348C_1627 ydeO   FALSE 0.247 75.000 0.000 NA   NA
 5856724 5856725 E2348C_1627 E2348C_1628   ydeP FALSE 0.026 248.000 0.000 NA   NA
 5856725 5856726 E2348C_1628 E2348C_1629 ydeP ydeQ FALSE 0.012 339.000 0.000 1.000   NA
 5856726 5856727 E2348C_1629 E2348C_1630 ydeQ ydeR TRUE 0.590 59.000 0.000 0.007   NA
 5856727 5856728 E2348C_1630 E2348C_1631 ydeR ydeS TRUE 0.986 13.000 0.000 0.007 Y NA
 5856728 5856729 E2348C_1631 E2348C_1632 ydeS   TRUE 0.969 14.000 0.000 1.000 Y NA
 5856729 5856730 E2348C_1632 E2348C_1633     TRUE 0.848 42.000 0.000 1.000 Y NA
 5856730 5856731 E2348C_1633 E2348C_1634     FALSE 0.054 362.000 0.000 1.000 Y NA
 5856732 5856733 E2348C_1635 E2348C_1636     FALSE 0.005 478.000 0.000 NA   NA
 5856733 5856734 E2348C_1636 E2348C_ncR20     FALSE 0.004 866.000 0.000 NA   NA
 5856734 5856735 E2348C_ncR20 E2348C_1637     FALSE 0.275 67.000 0.000 NA   NA
 5856736 5856737 E2348C_1638 E2348C_1639 hipA hipB TRUE 0.995 0.000 0.675 NA   NA
 5856739 5856740 E2348C_1641 E2348C_1642 yneE uxaB FALSE 0.120 197.000 0.143 NA   NA
 5856740 5856741 E2348C_1642 E2348C_1643 uxaB yneF FALSE 0.026 227.000 0.000 1.000 N NA
 5856741 5856742 E2348C_1643 E2348C_1644 yneF yneG FALSE 0.224 139.000 0.098 NA   NA
 5856742 5856743 E2348C_1644 E2348C_1645 yneG yneH TRUE 0.929 0.000 0.037 NA   NA
 5856743 5856744 E2348C_1645 E2348C_1646 yneH yneI FALSE 0.250 64.000 0.000 1.000 N NA
 5856745 5856746 E2348C_1647 E2348C_1648 yneJ ydeA FALSE 0.005 339.000 0.027 NA N NA
 5856748 5856749 E2348C_1650 E2348C_1651 marR marA TRUE 0.995 21.000 0.667 0.042 Y NA
 5856749 5856750 E2348C_1651 E2348C_1652 marA marB TRUE 0.558 32.000 0.000 NA   NA
 5856752 5856753 E2348C_1654 E2348C_1655 ydeE yneM FALSE 0.218 127.000 0.077 NA   NA
 5856754 5856755 E2348C_1656 E2348C_1657 ydeH ydeI FALSE 0.024 254.000 0.000 NA   NA
 5856755 5856756 E2348C_1657 E2348C_1658 ydeI dcp FALSE 0.096 165.000 0.000 NA   NA
 5856757 5856758 E2348C_1659 E2348C_1660 ydfG ydfH FALSE 0.259 89.000 0.000 1.000   NA
 5856758 5856759 E2348C_1660 E2348C_1661 ydfH ydfZ FALSE 0.080 177.000 0.000 NA   NA
 5856760 5856761 E2348C_1662 E2348C_1663 ydfI ydfJ FALSE 0.191 89.000 0.000 1.000 N NA
 5856761 5856762 E2348C_1663 E2348C_1664 ydfJ rspB FALSE 0.281 58.000 0.000 1.000 N NA
 5856762 5856763 E2348C_1664 E2348C_1665 rspB rspA TRUE 0.847 12.000 0.049 1.000 N NA
 5856763 5856764 E2348C_1665 E2348C_1666 rspA ynfA FALSE 0.041 206.000 0.020 1.000   NA
 5856765 5856766 E2348C_1667 E2348C_1668 ynfB speG TRUE 0.556 35.000 0.055 NA   NA
 5856768 5856769 E2348C_1670 E2348C_1671 ynfD ynfE FALSE 0.226 199.000 0.304 NA   NA
 5856769 5856770 E2348C_1671 E2348C_1672 ynfE ynfF TRUE 0.908 88.000 0.231 0.001 Y NA
 5856770 5856771 E2348C_1672 E2348C_1673 ynfF ynfG TRUE 0.998 11.000 0.667 0.044 Y NA
 5856771 5856772 E2348C_1673 E2348C_1674 ynfG ynfH TRUE 0.989 2.000 0.333 1.000   NA
 5856772 5856773 E2348C_1674 E2348C_1675 ynfH dmsD TRUE 0.670 43.000 0.125 1.000   NA
 5856773 5856774 E2348C_1675 E2348C_1676 dmsD clcB FALSE 0.090 196.000 0.079 1.000   NA
 5856775 5856776 E2348C_1677 E2348C_1678 ynfK dgsA TRUE 0.577 125.000 0.455 NA N NA
 5856776 5856777 E2348C_1678 E2348C_1679 dgsA ynfL TRUE 0.811 135.000 0.408 NA Y NA
 5856778 5856779 E2348C_1680 E2348C_1681 ynfM asr FALSE 0.006 425.000 0.000 NA   NA
 5856779 5856780 E2348C_1681 E2348C_1682 asr ydgU FALSE 0.218 93.000 0.000 NA   NA
 5856780 5856781 E2348C_1682 E2348C_1683 ydgU ydgD FALSE 0.204 100.000 0.000 NA   NA
 5856782 5856783 E2348C_1684 E2348C_1685 mdtI mdtJ TRUE 0.996 -13.000 0.869 0.076 Y NA
 5856785 5856786 E2348C_1687 E2348C_1688 pntB pntA TRUE 0.999 11.000 0.745 0.001 Y NA
 5856787 5856788 E2348C_1689 E2348C_1690 ydgH ydgI FALSE 0.148 186.000 0.143 NA   NA
 5856788 5856789 E2348C_1690 E2348C_1691 ydgI folM TRUE 0.683 37.000 0.140 1.000 N NA
 5856791 5856792 E2348C_1693 E2348C_1694 rstA rstB TRUE 0.994 4.000 0.181 1.000 Y NA
 5856792 5856793 E2348C_1694 E2348C_1695 rstB tus TRUE 0.548 76.000 0.200 1.000   NA
 5856794 5856795 E2348C_1696 E2348C_1697 fumC fumA TRUE 0.681 143.000 0.000 0.001 Y NA
 5856796 5856797 E2348C_1698 E2348C_1699 manA ydgA TRUE 0.800 101.000 0.778 NA   NA
 5856798 5856799 E2348C_1700 E2348C_1701 uidC uidB TRUE 0.496 39.000 0.000 NA   NA
 5856799 5856800 E2348C_1701 E2348C_1702 uidB uidA TRUE 0.995 -3.000 0.235 1.000 Y NA
 5856800 5856801 E2348C_1702 E2348C_1703 uidA uidR FALSE 0.006 390.000 0.000 1.000 N NA
 5856801 5856802 E2348C_1703 E2348C_1704 uidR hdhA FALSE 0.025 229.000 0.000 1.000 N NA
 5856802 5856803 E2348C_1704 E2348C_1705 hdhA malI FALSE 0.159 112.000 0.000 1.000 N NA
 5856804 5856805 E2348C_1706 E2348C_1707 malX malY TRUE 0.987 10.000 0.531 1.000 N NA
 5856805 5856806 E2348C_1707 E2348C_1708 malY add FALSE 0.327 104.000 0.132 1.000 N NA
 5856807 5856808 E2348C_1709 E2348C_1710   ydgJ FALSE 0.092 178.000 0.000 1.000   NA
 5856809 5856810 E2348C_1711 E2348C_1712 blr cnu FALSE 0.020 273.000 0.000 NA   NA
 5856810 5856811 E2348C_1712 E2348C_1713 cnu ydgK FALSE 0.382 86.000 0.120 NA   NA
 5856811 5856812 E2348C_1713 E2348C_1714 ydgK rsxA FALSE 0.444 77.000 0.148 NA   NA
 5856812 5856813 E2348C_1714 E2348C_1715 rsxA rsxB TRUE 0.999 0.000 0.564 0.044 Y NA
 5856813 5856814 E2348C_1715 E2348C_1716 rsxB rsxC TRUE 0.997 -7.000 0.537 0.044 Y NA
 5856814 5856815 E2348C_1716 E2348C_1717 rsxC rsxD TRUE 0.999 1.000 0.814 0.044 Y NA
 5856815 5856816 E2348C_1717 E2348C_1718 rsxD rsxG TRUE 0.999 4.000 0.924 0.044 Y NA
 5856816 5856817 E2348C_1718 E2348C_1719 rsxG rsxE TRUE 0.999 4.000 0.908 0.044 Y NA
 5856817 5856818 E2348C_1719 E2348C_1720 rsxE nth TRUE 0.960 0.000 0.109 1.000 N NA
 5856818 5856819 E2348C_1720 E2348C_1721 nth tppB FALSE 0.003 611.000 0.000 1.000 N NA
 5856819 5856820 E2348C_1721 E2348C_1722 tppB gst TRUE 0.577 106.000 0.344 1.000 N NA
 5856821 5856822 E2348C_1723 E2348C_1724 pdxY tyrS FALSE 0.246 62.000 0.041 1.000 N NA
 5856822 5856823 E2348C_1724 E2348C_1725 tyrS pdxH FALSE 0.144 129.000 0.054 1.000 N NA
 5856823 5856824 E2348C_1725 E2348C_1726 pdxH ydhA FALSE 0.283 59.000 0.034 NA   NA
 5856824 5856825 E2348C_1726 E2348C_1727 ydhA anmK FALSE 0.176 104.000 0.034 NA   NA
 5856828 5856829 E2348C_1730 E2348C_1731 ydhI ydhJ TRUE 0.990 3.000 0.412 NA   NA
 5856829 5856830 E2348C_1731 E2348C_1732 ydhJ ydhK TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5856831 5856832 E2348C_1733 E2348C_1734 sodC ydhF FALSE 0.239 81.000 0.033 1.000   NA
 5856832 5856833 E2348C_1734 E2348C_1735 ydhF ydhL FALSE 0.398 49.000 0.045 NA   NA
 5856834 5856835 E2348C_1736 E2348C_1737 ydhM nemA TRUE 0.861 37.000 0.362 1.000 N NA
 5856835 5856836 E2348C_1737 E2348C_1738 nemA gloA FALSE 0.225 81.000 0.057 1.000 N NA
 5856836 5856837 E2348C_1738 E2348C_1739 gloA rnt FALSE 0.334 103.000 0.136 1.000 N NA
 5856839 5856840 E2348C_1741 E2348C_1742 ydhO sodB FALSE 0.091 128.000 0.015 1.000 N NA
 5856841 5856842 E2348C_1743 E2348C_1744 ydhP ynhF FALSE 0.094 166.000 0.000 NA   NA
 5856845 5856846 E2348C_1747 E2348C_1748 ydhC cfa FALSE 0.014 285.000 0.000 1.000 N NA
 5856850 5856851 E2348C_tRNA31 E2348C_tRNA32 valV valW TRUE 0.916 5.000 0.000 NA   NA
 5856851 5856852 E2348C_tRNA32 E2348C_1752 valW ydhR FALSE 0.189 112.000 0.000 NA   NA
 5856852 5856853 E2348C_1752 E2348C_1753 ydhR ydhS FALSE 0.165 126.000 0.000 NA   NA
 5856854 5856855 E2348C_1754 E2348C_1755 ydhT ydhU TRUE 0.690 52.000 0.222 NA   NA
 5856855 5856856 E2348C_1755 E2348C_1756 ydhU ydhX TRUE 0.997 -3.000 0.444 NA Y NA
 5856856 5856857 E2348C_1756 E2348C_1757 ydhX ydhW TRUE 0.958 13.000 0.235 NA   NA
 5856857 5856858 E2348C_1757 E2348C_1758 ydhW ydhV TRUE 0.979 13.000 0.458 NA   NA
 5856858 5856859 E2348C_1758 E2348C_1759 ydhV ydhY TRUE 0.994 21.000 0.600 0.013 Y NA
 5856859 5856860 E2348C_1759 E2348C_1760 ydhY ydhZ FALSE 0.006 456.000 0.000 NA   NA
 5856861 5856862 E2348C_1761 E2348C_1762 pykF lpp FALSE 0.011 311.000 0.000 1.000 N NA
 5856863 5856864 E2348C_1763 E2348C_1764 ynhG sufE FALSE 0.153 149.000 0.069 NA   NA
 5856864 5856865 E2348C_1764 E2348C_1765 sufE sufS TRUE 0.946 13.000 0.183 NA   NA
 5856865 5856866 E2348C_1765 E2348C_1766 sufS sufD TRUE 0.970 -3.000 0.193 1.000 N NA
 5856866 5856867 E2348C_1766 E2348C_1767 sufD sufC TRUE 0.984 -25.000 0.482 1.000 Y NA
 5856867 5856868 E2348C_1767 E2348C_1768 sufC sufB TRUE 0.996 10.000 0.466 1.000 Y NA
 5856868 5856869 E2348C_1768 E2348C_1769 sufB sufA TRUE 0.898 9.000 0.041 NA   NA
 5856869 5856870 E2348C_1769 E2348C_ncR21 sufA rydB FALSE 0.012 326.000 0.000 NA   NA
 5856870 5856871 E2348C_ncR21 E2348C_1770 rydB ydiH FALSE 0.110 155.000 0.000 NA   NA
 5856871 5856872 E2348C_1770 E2348C_1771 ydiH ydiI FALSE 0.176 100.000 0.032 NA   NA
 5856872 5856873 E2348C_1771 E2348C_1772 ydiI ydiJ TRUE 0.949 -3.000 0.129 NA N NA
 5856874 5856875 E2348C_1773 E2348C_ncR22 ydiK rprA FALSE 0.068 186.000 0.000 NA   NA
 5856875 5856876 E2348C_ncR22 E2348C_1774 rprA ydiL FALSE 0.141 138.000 0.000 NA   NA
 5856876 5856877 E2348C_1774 E2348C_1775 ydiL ydiM FALSE 0.339 100.000 0.095 1.000   NA
 5856877 5856878 E2348C_1775 E2348C_1776 ydiM ydiN FALSE 0.032 227.000 0.000 NA   NA
 5856878 5856879 E2348C_1776 E2348C_1777 ydiN ydiB TRUE 0.878 12.000 0.082 NA N NA
 5856879 5856880 E2348C_1777 E2348C_1778 ydiB aroD TRUE 0.927 31.000 0.113 1.000 Y NA
 5856880 5856881 E2348C_1778 E2348C_1779 aroD ydiF FALSE 0.075 145.000 0.019 1.000 N NA
 5856881 5856882 E2348C_1779 E2348C_1780 ydiF ydiO TRUE 0.994 14.000 0.500 1.000 Y NA
 5856884 5856885 E2348C_1782 E2348C_1783 ydiQ ydiR TRUE 0.997 20.000 1.000 0.011 Y NA
 5856885 5856886 E2348C_1783 E2348C_1784 ydiR ydiS TRUE 0.983 55.000 1.000 0.044 Y NA
 5856886 5856887 E2348C_1784 E2348C_1785 ydiS ydiT TRUE 0.998 -3.000 0.400 0.044 Y NA
 5856887 5856888 E2348C_1785 E2348C_1786 ydiT fadK FALSE 0.384 57.000 0.080 1.000 N NA
 5856890 5856891 E2348C_1788 E2348C_1789 ydiA aroH FALSE 0.268 157.000 0.165 1.000   NA
 5856891 5856892 E2348C_1789 E2348C_1790 aroH ydiE FALSE 0.115 132.000 0.054 NA N NA
 5856893 5856894 E2348C_1791 E2348C_1792 ydiU ydiV FALSE 0.257 63.000 0.031 NA   NA
 5856894 5856895 E2348C_1792 E2348C_1793 ydiV nlpC FALSE 0.017 247.000 0.000 NA N NA
 5856895 5856896 E2348C_1793 E2348C_1794 nlpC btuD FALSE 0.169 78.000 0.000 NA N NA
 5856896 5856897 E2348C_1794 E2348C_1795 btuD btuE TRUE 0.922 0.000 0.000 1.000 N NA
 5856897 5856898 E2348C_1795 E2348C_1796 btuE btuC FALSE 0.366 62.000 0.084 1.000 N NA
 5856899 5856900 E2348C_1797 E2348C_1798     FALSE 0.435 50.000 0.000 1.000   NA
 5856901 5856902 E2348C_1799 E2348C_1800     TRUE 0.812 15.000 0.000 NA   NA
 5856902 5856903 E2348C_1800 E2348C_1801     TRUE 0.885 11.000 0.000 NA   NA
 5856903 5856904 E2348C_1801 E2348C_1802     TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 5856904 5856905 E2348C_1802 E2348C_1803     FALSE 0.054 197.000 0.000 NA   NA
 5856905 5856906 E2348C_1803 E2348C_1804     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856906 5856907 E2348C_1804 E2348C_1805     FALSE 0.133 142.000 0.000 NA   NA
 5856907 5856908 E2348C_1805 E2348C_1806     FALSE 0.130 145.000 0.000 NA   NA
 5856908 5856909 E2348C_1806 E2348C_1807     TRUE 0.811 77.000 0.667 NA   NA
 5856909 5856910 E2348C_1807 E2348C_1808     TRUE 0.916 5.000 0.000 NA   NA
 5856910 5856911 E2348C_1808 E2348C_1809     FALSE 0.008 379.000 0.000 NA   NA
 5856911 5856912 E2348C_1809 E2348C_1810     TRUE 0.993 -3.000 0.600 1.000   NA
 5856913 5856914 E2348C_1811 E2348C_1812     TRUE 0.970 0.000 0.130 NA   NA
 5856915 5856916 E2348C_1813 E2348C_1814     TRUE 0.706 24.000 0.000 1.000   NA
 5856916 5856917 E2348C_1814 E2348C_1815     TRUE 0.474 46.000 0.000 1.000   NA
 5856917 5856918 E2348C_1815 E2348C_1816     TRUE 0.878 102.000 0.667 0.002   NA
 5856918 5856919 E2348C_1816 E2348C_1817     TRUE 0.988 0.000 0.333 NA   NA
 5856919 5856920 E2348C_1817 E2348C_1818     TRUE 0.928 3.000 0.000 NA   NA
 5856920 5856921 E2348C_1818 E2348C_1819     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856921 5856922 E2348C_1819 E2348C_1820     TRUE 0.993 -3.000 0.667 NA   NA
 5856922 5856923 E2348C_1820 E2348C_1821     TRUE 0.688 138.000 0.667 NA   NA
 5856923 5856924 E2348C_1821 E2348C_1822     TRUE 0.719 -16.000 0.000 NA   NA
 5856924 5856925 E2348C_1822 E2348C_1823     TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 5856925 5856926 E2348C_1823 E2348C_1824     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856926 5856927 E2348C_1824 E2348C_1825     TRUE 0.994 4.000 0.667 NA   NA
 5856927 5856928 E2348C_1825 E2348C_1826     TRUE 0.836 -7.000 0.000 NA   NA
 5856928 5856929 E2348C_1826 E2348C_1827     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856929 5856930 E2348C_1827 E2348C_1828     TRUE 0.885 11.000 0.000 NA   NA
 5856931 5856932 E2348C_1829 E2348C_1830     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5856934 5856935 E2348C_1832 E2348C_1833     TRUE 0.849 13.000 0.000 NA   NA
 5856935 5856936 E2348C_1833 E2348C_1834     TRUE 0.754 -13.000 0.000 NA   NA
 5856936 5856937 E2348C_1834 E2348C_1835     TRUE 0.602 -72.000 0.000 NA   NA
 5856937 5856938 E2348C_1835 E2348C_1836     FALSE 0.337 56.000 0.000 NA   NA
 5856938 5856939 E2348C_1836 E2348C_1837     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5856940 5856941 E2348C_1838 E2348C_1839     FALSE 0.057 195.000 0.000 NA   NA
 5856941 5856942 E2348C_1839 E2348C_1840     FALSE 0.118 150.000 0.000 NA   NA
 5856943 5856944 E2348C_1841 E2348C_1842 ihfA pheT TRUE 0.971 5.000 0.208 1.000 N NA
 5856944 5856945 E2348C_1842 E2348C_1843 pheT pheS TRUE 0.997 15.000 0.574 0.001 Y NA
 5856945 5856946 E2348C_1843 E2348C_1844 pheS pheM FALSE 0.018 284.000 0.000 NA   NA
 5856946 5856947 E2348C_1844 E2348C_1845 pheM rplT FALSE 0.171 123.000 0.000 NA   NA
 5856947 5856948 E2348C_1845 E2348C_1846 rplT rpmI TRUE 0.984 53.000 0.928 0.011 Y NA
 5856948 5856949 E2348C_1846 E2348C_1847 rpmI infC TRUE 0.923 97.000 0.652 1.000 Y NA
 5856949 5856950 E2348C_1847 E2348C_1848 infC thrS TRUE 0.994 4.000 0.186 1.000 Y NA
 5856951 5856952 E2348C_1849 E2348C_1850   yniD FALSE 0.083 174.000 0.000 NA   NA
 5856954 5856955 E2348C_1852 E2348C_1853 pfkB ydiZ FALSE 0.203 101.000 0.000 NA   NA
 5856955 5856956 E2348C_1853 E2348C_1854 ydiZ yniA FALSE 0.197 106.000 0.000 NA   NA
 5856958 5856959 E2348C_1856 E2348C_1857 yniC ydjM FALSE 0.127 163.000 0.068 NA   NA
 5856959 5856960 E2348C_1857 E2348C_1858 ydjM ydjN FALSE 0.244 133.000 0.102 NA   NA
 5856963 5856964 E2348C_1861 E2348C_1862 chbG chbF TRUE 0.988 13.000 0.429 0.018   NA
 5856964 5856965 E2348C_1862 E2348C_1863 chbF chbR TRUE 0.733 104.000 0.625 1.000 N NA
 5856965 5856966 E2348C_1863 E2348C_1864 chbR chbA TRUE 0.992 8.000 0.727 1.000 N NA
 5856966 5856967 E2348C_1864 E2348C_1865 chbA chbC TRUE 0.985 51.000 0.833 0.009 Y NA
 5856967 5856968 E2348C_1865 E2348C_1866 chbC chbB TRUE 0.945 85.000 0.500 0.009 Y NA
 5856968 5856969 E2348C_1866 E2348C_1867 chbB osmE FALSE 0.017 300.000 0.000 1.000   NA
 5856970 5856971 E2348C_1868 E2348C_1869 nadE cho FALSE 0.015 230.000 0.010 1.000 N NA
 5856972 5856973 E2348C_1870 E2348C_1871 vse spy FALSE 0.040 203.000 0.028 NA   NA
 5856973 5856974 E2348C_1871 E2348C_1872 spy astE FALSE 0.007 330.000 0.000 NA N NA
 5856974 5856975 E2348C_1872 E2348C_1873 astE astB TRUE 0.981 -7.000 0.126 1.000 Y NA
 5856975 5856976 E2348C_1873 E2348C_1874 astB astD TRUE 0.981 -3.000 0.306 1.000 N NA
 5856976 5856977 E2348C_1874 E2348C_1875 astD astA TRUE 0.968 -3.000 0.179 1.000 N NA
 5856977 5856978 E2348C_1875 E2348C_1876 astA astC TRUE 0.998 -3.000 0.625 1.000 Y NA
 5856979 5856980 E2348C_1877 E2348C_1878 xthA ydjX FALSE 0.066 167.000 0.016 NA   NA
 5856980 5856981 E2348C_1878 E2348C_1879 ydjX ydjY TRUE 0.944 5.000 0.083 NA   NA
 5856981 5856982 E2348C_1879 E2348C_1880 ydjY ydjZ TRUE 0.910 17.000 0.174 NA   NA
 5856982 5856983 E2348C_1880 E2348C_1881 ydjZ ynjA TRUE 0.959 0.000 0.087 NA   NA
 5856983 5856984 E2348C_1881 E2348C_1882 ynjA ynjB TRUE 0.878 10.000 0.032 NA   NA
 5856984 5856985 E2348C_1882 E2348C_1883 ynjB ynjC TRUE 0.976 -27.000 0.627 0.048   NA
 5856985 5856986 E2348C_1883 E2348C_1884 ynjC ynjD TRUE 0.995 0.000 0.602 1.000   NA
 5856986 5856987 E2348C_1884 E2348C_1885 ynjD ynjE TRUE 0.458 67.000 0.111 1.000   NA
 5856992 5856993 E2348C_1890 E2348C_1891 topB selD TRUE 0.891 5.000 0.041 1.000 N NA
 5856993 5856994 E2348C_1891 E2348C_1892 selD ydjA FALSE 0.129 117.000 0.033 1.000 N NA
 5856995 5856996 E2348C_1893 E2348C_1894 sppA ansA FALSE 0.153 165.000 0.113 1.000 N NA
 5856996 5856997 E2348C_1894 E2348C_1895 ansA pncA TRUE 0.849 11.000 0.040 1.000 N NA
 5856998 5856999 E2348C_1896 E2348C_1897 ydjE ydjF TRUE 0.691 118.000 0.125 1.000 Y NA
 5856999 5857000 E2348C_1897 E2348C_1898 ydjF ydjG FALSE 0.409 137.000 0.269 1.000 N NA
 5857000 5857001 E2348C_1898 E2348C_1899 ydjG ydjH TRUE 0.973 10.000 0.269 1.000 N NA
 5857001 5857002 E2348C_1899 E2348C_1900 ydjH ydjI TRUE 0.996 5.000 0.368 1.000 Y NA
 5857002 5857003 E2348C_1900 E2348C_1901 ydjI ydjJ TRUE 0.933 21.000 0.194 0.015 N NA
 5857003 5857004 E2348C_1901 E2348C_1902 ydjJ ydjK TRUE 0.894 17.000 0.167 1.000 N NA
 5857004 5857005 E2348C_1902 E2348C_1903 ydjK ydjL TRUE 0.861 27.000 0.250 1.000 N NA
 5857005 5857006 E2348C_1903 E2348C_1904 ydjL yeaC FALSE 0.008 370.000 0.000 NA   NA
 5857006 5857007 E2348C_1904 E2348C_1905 yeaC msrB TRUE 0.760 42.000 0.216 NA   NA
 5857008 5857009 E2348C_1906 E2348C_1907 gapA yeaD TRUE 0.779 84.000 0.154 1.000 Y NA
 5857010 5857011 E2348C_1908 E2348C_1909 yeaE mipA FALSE 0.273 90.000 0.067 NA   NA
 5857012 5857013 E2348C_1910 E2348C_1911 yeaG yeaH TRUE 0.766 113.000 0.683 NA   NA
 5857013 5857014 E2348C_1911 E2348C_1912 yeaH yeaI FALSE 0.019 279.000 0.000 NA   NA
 5857014 5857015 E2348C_1912 E2348C_1913 yeaI yeaJ TRUE 0.508 181.000 0.000 0.003 Y NA
 5857015 5857016 E2348C_1913 E2348C_1914 yeaJ yeaK TRUE 0.564 43.000 0.083 NA   NA
 5857020 5857021 E2348C_1918 E2348C_1919 yeaN yeaO FALSE 0.252 55.000 0.007 NA   NA
 5857024 5857025 E2348C_1922 E2348C_1923 yeaQ yoaG FALSE 0.124 148.000 0.000 NA   NA
 5857025 5857026 E2348C_1923 E2348C_1924 yoaG yeaR TRUE 0.922 4.000 0.000 NA   NA
 5857026 5857027 E2348C_1924 E2348C_1925 yeaR leuE FALSE 0.057 172.000 0.000 NA N NA
 5857027 5857028 E2348C_1925 E2348C_1926 leuE yeaT FALSE 0.162 127.000 0.000 NA   NA
 5857028 5857029 E2348C_1926 E2348C_1927 yeaT rnd FALSE 0.025 249.000 0.000 NA   NA
 5857029 5857030 E2348C_1927 E2348C_ncR23 rnd sroD TRUE 0.635 26.000 0.000 NA   NA
 5857030 5857031 E2348C_ncR23 E2348C_1928 sroD fadD TRUE 0.619 -41.000 0.000 NA   NA
 5857031 5857032 E2348C_1928 E2348C_1929 fadD yeaY FALSE 0.111 205.000 0.169 1.000 N NA
 5857032 5857033 E2348C_1929 E2348C_1930 yeaY yeaZ FALSE 0.355 40.000 0.024 1.000 N NA
 5857033 5857034 E2348C_1930 E2348C_1931 yeaZ yoaA FALSE 0.385 58.000 0.082 1.000 N NA
 5857035 5857036 E2348C_1932 E2348C_1933 yoaB yoaC FALSE 0.006 422.000 0.000 NA   NA
 5857038 5857039 E2348C_1935 E2348C_1936 pabB nudL TRUE 0.964 4.000 0.116 1.000   NA
 5857039 5857040 E2348C_1936 E2348C_1937 nudL sdaA FALSE 0.384 184.000 0.409 1.000   NA
 5857040 5857041 E2348C_1937 E2348C_1938 sdaA yoaD TRUE 0.511 131.000 0.389 NA N NA
 5857042 5857043 E2348C_1939 E2348C_1940 yoaE   TRUE 0.742 -12.000 0.034 NA   NA
 5857044 5857045 E2348C_1941 E2348C_1942 manX manY TRUE 0.826 63.000 0.000 0.015 Y NA
 5857045 5857046 E2348C_1942 E2348C_1943 manY manZ TRUE 0.999 4.000 0.939 0.015 Y NA
 5857046 5857047 E2348C_1943 E2348C_1944 manZ yobD TRUE 0.890 55.000 0.755 NA   NA
 5857047 5857048 E2348C_1944 E2348C_ncR24 yobD   FALSE 0.053 198.000 0.000 NA   NA
 5857048 5857049 E2348C_ncR24 E2348C_1945   yebN FALSE 0.194 109.000 0.000 NA   NA
 5857050 5857051 E2348C_1946 E2348C_1947 rrmA cspC FALSE 0.101 166.000 0.038 1.000   NA
 5857051 5857052 E2348C_1947 E2348C_1948 cspC yobF TRUE 0.953 13.000 0.214 NA   NA
 5857052 5857053 E2348C_1948 E2348C_1949 yobF yebO FALSE 0.004 671.000 0.000 NA   NA
 5857053 5857054 E2348C_1949 E2348C_1950 yebO mgrB TRUE 0.749 75.000 0.500 NA   NA
 5857058 5857059 E2348C_1954 E2348C_1955 htpX prc FALSE 0.119 192.000 0.042 0.018 N NA
 5857059 5857060 E2348C_1955 E2348C_1956 prc proQ TRUE 0.919 20.000 0.304 NA N NA
 5857060 5857061 E2348C_1956 E2348C_1957 proQ yebR TRUE 0.660 97.000 0.081 NA Y NA
 5857062 5857063 E2348C_1958 E2348C_1959 yebS yebT TRUE 0.968 -31.000 0.840 NA   NA
 5857063 5857064 E2348C_1959 E2348C_1960 yebT rsmF TRUE 0.701 80.000 0.420 NA   NA
 5857064 5857065 E2348C_1960 E2348C_1961 rsmF yebV FALSE 0.314 118.000 0.121 NA   NA
 5857065 5857066 E2348C_1961 E2348C_1962 yebV yebW TRUE 0.941 21.000 0.353 NA   NA
 5857069 5857070 E2348C_ncR26 E2348C_1964 ryeB yebY FALSE 0.237 80.000 0.000 NA   NA
 5857070 5857071 E2348C_1964 E2348C_1965 yebY yebZ TRUE 0.988 13.000 0.704 NA   NA
 5857071 5857072 E2348C_1965 E2348C_1966 yebZ yobA TRUE 0.993 4.000 0.613 1.000   NA
 5857073 5857074 E2348C_1967 E2348C_1968 holE yobB TRUE 0.514 102.000 0.222 1.000   NA
 5857074 5857075 E2348C_1968 E2348C_1969 yobB exoX TRUE 0.952 24.000 0.500 1.000   NA
 5857076 5857077 E2348C_1970 E2348C_1971 ptrB yebE FALSE 0.074 207.000 0.092 NA   NA
 5857077 5857078 E2348C_1971 E2348C_1972 yebE yebF FALSE 0.009 327.000 0.028 NA   NA
 5857078 5857079 E2348C_1972 E2348C_1973 yebF yebG FALSE 0.228 67.000 0.027 NA   NA
 5857081 5857082 E2348C_1975 E2348C_1976 eda edd TRUE 0.973 37.000 0.523 1.000 Y NA
 5857082 5857083 E2348C_1976 E2348C_1977 edd zwf FALSE 0.156 235.000 0.041 1.000 Y NA
 5857084 5857085 E2348C_1978 E2348C_1979 yebK pykA FALSE 0.177 128.000 0.071 1.000 N NA
 5857086 5857087 E2348C_1980 E2348C_1981 lpxM yebA TRUE 0.811 119.000 0.299 1.000 Y NA
 5857087 5857088 E2348C_1981 E2348C_1982 yebA znuA TRUE 0.880 16.000 0.131 1.000 N NA
 5857089 5857090 E2348C_1983 E2348C_1984 znuC znuB TRUE 0.999 -3.000 0.755 0.082 Y NA
 5857091 5857092 E2348C_1985 E2348C_1986 ruvB ruvA TRUE 0.999 9.000 0.549 0.001 Y NA
 5857094 5857095 E2348C_1988 E2348C_1989 ruvC yebC TRUE 0.842 35.000 0.277 NA   NA
 5857095 5857096 E2348C_1989 E2348C_1990 yebC nudB TRUE 0.555 29.000 0.035 NA   NA
 5857096 5857097 E2348C_1990 E2348C_1991 nudB aspS TRUE 0.921 2.000 0.050 1.000 N NA
 5857098 5857099 E2348C_1992 E2348C_1993 yecD yecE TRUE 0.948 -3.000 0.089 NA   NA
 5857099 5857100 E2348C_1993 E2348C_1994 yecE yecN TRUE 0.549 53.000 0.126 NA   NA
 5857100 5857101 E2348C_1994 E2348C_1995 yecN cmoA TRUE 0.599 41.000 0.089 NA   NA
 5857101 5857102 E2348C_1995 E2348C_1996 cmoA cmoB TRUE 0.984 -3.000 0.315 NA   NA
 5857103 5857104 E2348C_1997 E2348C_1998 torZ torY TRUE 0.989 25.000 0.481 0.043 Y NA
 5857104 5857105 E2348C_1998 E2348C_1999 torY cutC FALSE 0.006 388.000 0.000 1.000 N NA
 5857105 5857106 E2348C_1999 E2348C_2000 cutC yecM TRUE 0.850 14.000 0.057 NA   NA
 5857108 5857109 E2348C_2002 E2348C_2003 flhE flhA TRUE 0.990 0.000 0.158 0.002   NA
 5857109 5857110 E2348C_2003 E2348C_2004 flhA flhB TRUE 0.994 -7.000 0.287 0.009 Y NA
 5857110 5857111 E2348C_2004 E2348C_2005 flhB cheZ FALSE 0.309 189.000 0.000 1.000 Y NA
 5857111 5857112 E2348C_2005 E2348C_2006 cheZ cheY TRUE 0.980 11.000 0.000 1.000 Y NA
 5857112 5857113 E2348C_2006 E2348C_2007 cheY cheB TRUE 0.981 15.000 0.000 0.010 Y NA
 5857113 5857114 E2348C_2007 E2348C_2008 cheB cheR TRUE 0.988 3.000 0.000 1.000 Y NA
 5857114 5857115 E2348C_2008 E2348C_2009 cheR tar FALSE 0.091 291.000 0.037 1.000 Y NA
 5857117 5857118 E2348C_2010 E2348C_2011 cheW cheA TRUE 0.993 21.000 0.447 0.003 Y NA
 5857118 5857119 E2348C_2011 E2348C_2012 cheA motB TRUE 0.999 5.000 0.913 1.000 Y NA
 5857119 5857120 E2348C_2012 E2348C_2013 motB motA TRUE 0.997 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 5857120 5857121 E2348C_2013 E2348C_2014 motA flhC TRUE 0.611 127.000 0.408 1.000   NA
 5857121 5857122 E2348C_2014 E2348C_2015 flhC flhD TRUE 0.980 3.000 0.000 0.001   NA
 5857124 5857125 E2348C_2017 E2348C_2018 otsA otsB TRUE 0.970 -25.000 0.068 0.001 Y NA
 5857125 5857126 E2348C_2018 E2348C_2019 otsB araH FALSE 0.092 167.000 0.000 NA   NA
 5857126 5857127 E2348C_2019 E2348C_2020 araH   TRUE 0.849 13.000 0.000 NA   NA
 5857127 5857128 E2348C_2020 E2348C_2021   araG FALSE 0.004 791.000 0.000 1.000   NA
 5857128 5857129 E2348C_2021 E2348C_2022 araG araF TRUE 0.955 70.000 0.917 NA Y NA
 5857131 5857132 E2348C_2024 E2348C_ncR28 yecJ isrB FALSE 0.235 81.000 0.000 NA   NA
 5857133 5857134 E2348C_2025 E2348C_2026 yecR ftnA FALSE 0.086 172.000 0.000 NA   NA
 5857137 5857138 E2348C_2029 E2348C_tRNA33 yecA leuZ FALSE 0.055 196.000 0.000 NA   NA
 5857138 5857139 E2348C_tRNA33 E2348C_tRNA34 leuZ cysT TRUE 0.849 13.000 0.000 NA   NA
 5857139 5857140 E2348C_tRNA34 E2348C_tRNA35 cysT glyW FALSE 0.352 54.000 0.000 NA   NA
 5857140 5857141 E2348C_tRNA35 E2348C_2030 glyW pgsA FALSE 0.114 152.000 0.000 NA   NA
 5857141 5857142 E2348C_2030 E2348C_2031 pgsA uvrC TRUE 0.632 57.000 0.227 1.000 N NA
 5857142 5857143 E2348C_2031 E2348C_2032 uvrC uvrY TRUE 0.971 -3.000 0.086 0.022 N NA
 5857145 5857146 E2348C_2034 E2348C_2035 sdiA yecC FALSE 0.035 230.000 0.071 1.000 N NA
 5857146 5857147 E2348C_2035 E2348C_2036 yecC yecS TRUE 0.992 -3.000 0.150 1.000 Y NA
 5857147 5857148 E2348C_2036 E2348C_2037 yecS dcyD TRUE 0.966 15.000 0.050 1.000 Y NA
 5857148 5857149 E2348C_2037 E2348C_2038 dcyD fliY TRUE 0.884 105.000 0.469 1.000 Y NA
 5857149 5857150 E2348C_2038 E2348C_2039 fliY fliZ TRUE 0.609 88.000 0.280 1.000   NA
 5857150 5857151 E2348C_2039 E2348C_2040 fliZ fliA TRUE 0.623 46.000 0.108 1.000   NA
 5857151 5857152 E2348C_2040 E2348C_2041 fliA fliC FALSE 0.006 321.000 0.012 1.000 N NA
 5857153 5857154 E2348C_2042 E2348C_2043 fliD fliS TRUE 0.986 25.000 0.284 0.002 Y NA
 5857154 5857155 E2348C_2043 E2348C_2044 fliS fliT TRUE 0.989 0.000 0.324 1.000   NA
 5857155 5857156 E2348C_2044 E2348C_2045 fliT amyA FALSE 0.418 78.000 0.115 1.000   NA
 5857158 5857159 E2348C_2047 E2348C_2048 yedE yedF TRUE 0.995 -3.000 0.844 NA   NA
 5857159 5857160 E2348C_2048 E2348C_2049 yedF yedK FALSE 0.194 109.000 0.000 NA   NA
 5857160 5857161 E2348C_2049 E2348C_2050 yedK yedL FALSE 0.191 111.000 0.000 NA   NA
 5857163 5857164 E2348C_2052 E2348C_2053 fliF fliG TRUE 0.993 -7.000 0.220 0.005 Y NA
 5857164 5857165 E2348C_2053 E2348C_2054 fliG fliH TRUE 0.985 -7.000 0.000 0.003 Y NA
 5857165 5857166 E2348C_2054 E2348C_2055 fliH fliI TRUE 0.989 0.000 0.000 1.000 Y NA
 5857166 5857167 E2348C_2055 E2348C_2056 fliI fliJ TRUE 0.938 19.000 0.006 1.000 Y NA
 5857167 5857168 E2348C_2056 E2348C_2057 fliJ fliK TRUE 0.998 -3.000 0.317 0.005 Y NA
 5857168 5857169 E2348C_2057 E2348C_2058 fliK fliL TRUE 0.709 105.000 0.119 1.000 Y NA
 5857169 5857170 E2348C_2058 E2348C_2059 fliL fliM TRUE 0.999 5.000 0.957 0.001 Y NA
 5857170 5857171 E2348C_2059 E2348C_2060 fliM fliN TRUE 0.996 -3.000 0.137 0.001 Y NA
 5857171 5857172 E2348C_2060 E2348C_2061 fliN fliO TRUE 0.997 3.000 0.443 1.000 Y NA
 5857172 5857173 E2348C_2061 E2348C_2062 fliO fliP TRUE 0.995 0.000 0.203 1.000 Y NA
 5857173 5857174 E2348C_2062 E2348C_2063 fliP fliQ TRUE 0.999 10.000 0.827 0.009 Y NA
 5857174 5857175 E2348C_2063 E2348C_2064 fliQ fliR TRUE 0.992 9.000 0.000 0.002 Y NA
 5857175 5857176 E2348C_2064 E2348C_2065 fliR rcsA FALSE 0.013 290.000 0.000 1.000 N NA
 5857181 5857182 E2348C_2069 E2348C_2070 yedQ yodC FALSE 0.088 171.000 0.000 NA   NA
 5857182 5857183 E2348C_2070 E2348C_2071 yodC yedI FALSE 0.192 79.000 0.025 NA   NA
 5857185 5857186 E2348C_2073 E2348C_2074 vsr dcm TRUE 0.959 -19.000 0.000 0.065 Y NA
 5857186 5857187 E2348C_2074 E2348C_2075 dcm yedJ FALSE 0.312 67.000 0.000 1.000   NA
 5857187 5857188 E2348C_2075 E2348C_2076 yedJ yedR TRUE 0.535 40.000 0.062 NA   NA
 5857189 5857190 E2348C_ncR30 E2348C_2077 rseX ysdS FALSE 0.014 310.000 0.000 NA   NA
 5857190 5857191 E2348C_2077 E2348C_2078 ysdS hchA FALSE 0.004 594.000 0.000 NA   NA
 5857192 5857193 E2348C_2079 E2348C_2080 yedV yedW TRUE 0.999 0.000 0.857 0.001 Y NA
 5857194 5857195 E2348C_2081 E2348C_2082 yedX yedY FALSE 0.223 109.000 0.000 1.000   NA
 5857195 5857196 E2348C_2082 E2348C_2083 yedY yedZ TRUE 0.997 1.000 0.790 0.042   NA
 5857196 5857197 E2348C_2083 E2348C_2084 yedZ yodA FALSE 0.028 257.000 0.000 1.000   NA
 5857199 5857200 E2348C_2085 E2348C_tRNA37 mtfA asnT FALSE 0.203 101.000 0.000 NA   NA
 5857200 5857201 E2348C_tRNA37 E2348C_2086 asnT yeeJ FALSE 0.017 285.000 0.000 NA   NA
 5857203 5857204 E2348C_2088 E2348C_2089 shiA amn FALSE 0.124 102.000 0.021 1.000 N NA
 5857204 5857205 E2348C_2089 E2348C_2090 amn yeeN FALSE 0.010 343.000 0.000 NA   NA
 5857205 10800744 E2348C_2090 E2348C_IE3 yeeN   FALSE 0.006 451.000 0.000 NA   NA
 10800744 5857206 E2348C_IE3 E2348C_2091     TRUE 0.568 -1255.000 0.000 NA   NA
 5857206 5857207 E2348C_2091 E2348C_2092     FALSE 0.069 185.000 0.000 NA   NA
 5857207 5857208 E2348C_2092 E2348C_2093     FALSE 0.177 119.000 0.000 NA   NA
 5857208 5857209 E2348C_2093 E2348C_2094     TRUE 0.940 45.000 1.000 NA   NA
 5857209 5857210 E2348C_2094 E2348C_2095     TRUE 0.836 74.000 0.750 NA   NA
 5857210 5857211 E2348C_2095 E2348C_2096     FALSE 0.392 50.000 0.000 NA   NA
 5857212 5857213 E2348C_2097 E2348C_2098     TRUE 0.907 8.000 0.000 NA   NA
 5857213 5857214 E2348C_2098 E2348C_2099     TRUE 0.968 28.000 1.000 NA   NA
 5857215 5857216 E2348C_2100 E2348C_2101     FALSE 0.026 245.000 0.000 NA   NA
 5857217 5857218 E2348C_2102 E2348C_2103     TRUE 0.901 32.000 0.400 NA   NA
 5857220 5857221 E2348C_2105 E2348C_2106     TRUE 0.849 13.000 0.000 NA   NA
 5857221 5857222 E2348C_2106 E2348C_2107     FALSE 0.194 109.000 0.000 NA   NA
 5857223 5857224 E2348C_2108 E2348C_2109     FALSE 0.009 398.000 0.000 1.000   NA
 5857224 5857225 E2348C_2109 E2348C_2110     TRUE 0.611 53.000 0.167 NA   NA
 5857226 5857227 E2348C_2111 E2348C_2112     TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 5857227 5857228 E2348C_2112 E2348C_2113     TRUE 0.792 -10.000 0.000 NA   NA
 5857230 5857231 E2348C_2115 E2348C_2116     TRUE 0.774 17.000 0.000 NA   NA
 5857232 5857233 E2348C_2117 E2348C_2118     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5857234 5857235 E2348C_2119 E2348C_tRNA38   asnW FALSE 0.077 180.000 0.000 NA   NA
 5857235 5857236 E2348C_tRNA38 E2348C_2120 asnW yeeO FALSE 0.203 101.000 0.000 NA   NA
 5857238 5857239 E2348C_2121 E2348C_2122 cbl nac TRUE 0.861 102.000 0.222 0.049 Y NA
 5857241 5857242 E2348C_2123 E2348C_2124 erfK cobT FALSE 0.216 65.000 0.015 NA   NA
 5857242 5857243 E2348C_2124 E2348C_2125 cobT cobS TRUE 0.989 12.000 0.056 0.003 Y NA
 5857243 5857244 E2348C_2125 E2348C_2126 cobS cobU TRUE 0.986 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5857244 5857245 E2348C_2126 E2348C_2127 cobU   FALSE 0.148 134.000 0.000 NA   NA
 5857245 5857246 E2348C_2127 E2348C_ncR31     FALSE 0.105 158.000 0.000 NA   NA
 5857246 5857247 E2348C_ncR31 E2348C_2128   pocR FALSE 0.221 92.000 0.000 NA   NA
 5857247 5857248 E2348C_2128 E2348C_2129 pocR pduF FALSE 0.155 203.000 0.231 1.000 N NA
 5857249 5857250 E2348C_2130 E2348C_2131 pduA pduB TRUE 0.945 -3.000 0.083 NA   NA
 5857250 5857251 E2348C_2131 E2348C_2132 pduB pduC TRUE 0.817 19.000 0.100 1.000 N NA
 5857251 5857252 E2348C_2132 E2348C_2133 pduC pduD TRUE 0.798 73.000 0.273 0.001   NA
 5857252 5857253 E2348C_2133 E2348C_2134 pduD pduE TRUE 0.993 15.000 0.759 0.001   NA
 5857253 5857254 E2348C_2134 E2348C_2135 pduE pduG TRUE 0.988 10.000 0.500 NA   NA
 5857254 5857255 E2348C_2135 E2348C_2136 pduG pduH TRUE 0.791 -10.000 0.045 NA   NA
 5857255 5857256 E2348C_2136 E2348C_2137 pduH pduJ TRUE 0.811 20.000 0.087 NA   NA
 5857256 5857257 E2348C_2137 E2348C_2138 pduJ pduK TRUE 0.988 24.000 0.645 NA Y NA
 5857257 5857258 E2348C_2138 E2348C_2139 pduK pduL TRUE 0.995 3.000 0.242 NA Y NA
 5857258 5857259 E2348C_2139 E2348C_2140 pduL pduM TRUE 0.979 -3.000 0.242 NA   NA
 5857259 5857260 E2348C_2140 E2348C_2141 pduM pduN TRUE 0.984 4.000 0.296 NA   NA
 5857260 5857261 E2348C_2141 E2348C_2142 pduN pduO TRUE 0.968 12.000 0.268 NA   NA
 5857261 5857262 E2348C_2142 E2348C_2143 pduO pduP TRUE 0.930 -3.000 0.000 1.000   NA
 5857262 5857263 E2348C_2143 E2348C_2144 pduP pduQ TRUE 0.988 11.000 0.000 0.024 Y NA
 5857263 5857264 E2348C_2144 E2348C_2145 pduQ pduS TRUE 0.995 -3.000 0.259 1.000 Y NA
 5857264 5857265 E2348C_2145 E2348C_2146 pduS pduT TRUE 0.998 3.000 0.714 NA Y NA
 5857265 5857266 E2348C_2146 E2348C_2147 pduT pduU TRUE 0.904 0.000 0.000 NA N NA
 5857266 5857267 E2348C_2147 E2348C_2148 pduU pduV TRUE 0.986 5.000 0.000 1.000 Y NA
 5857268 5857269 E2348C_2149 E2348C_2150 yeeX yeeA FALSE 0.223 172.000 0.180 NA   NA
 5857269 5857270 E2348C_2150 E2348C_2151 yeeA sbmC FALSE 0.047 240.000 0.096 NA   NA
 5857270 5857271 E2348C_2151 E2348C_2152 sbmC dacD FALSE 0.236 119.000 0.110 NA N NA
 5857273 5857274 E2348C_2154 E2348C_2155 yeeF yeeY FALSE 0.017 267.000 0.000 1.000 N NA
 5857274 5857275 E2348C_2155 E2348C_2156 yeeY yeeZ FALSE 0.284 46.000 0.015 1.000 N NA
 5857275 5857276 E2348C_2156 E2348C_2157 yeeZ yoeB FALSE 0.234 83.000 0.000 NA   NA
 5857276 5857277 E2348C_2157 E2348C_2158 yoeB yefM TRUE 0.986 -3.000 0.366 NA   NA
 5857278 5857279 E2348C_2159 E2348C_2160 hisL hisG FALSE 0.282 146.000 0.003 0.002   NA
 5857279 5857280 E2348C_2160 E2348C_2161 hisG hisD TRUE 0.996 6.000 0.171 0.002 Y NA
 5857280 5857281 E2348C_2161 E2348C_2162 hisD hisC TRUE 0.998 -3.000 0.294 0.002 Y NA
 5857281 5857282 E2348C_2162 E2348C_2163 hisC hisB TRUE 0.998 0.000 0.341 0.002 Y NA
 5857282 5857283 E2348C_2163 E2348C_2164 hisB hisH TRUE 0.997 0.000 0.128 0.002 Y NA
 5857283 5857284 E2348C_2164 E2348C_2165 hisH hisA TRUE 0.994 0.000 0.010 0.002 Y NA
 5857284 5857285 E2348C_2165 E2348C_2166 hisA hisF TRUE 0.963 -18.000 0.003 0.002 Y NA
 5857285 5857286 E2348C_2166 E2348C_2167 hisF hisI TRUE 0.997 -6.000 0.430 0.002 Y NA
 5857287 5857288 E2348C_2168 E2348C_2169 wzz ugd TRUE 0.480 147.000 0.000 1.000 Y NA
 5857288 5857289 E2348C_2169 E2348C_2170 ugd gnd FALSE 0.021 249.000 0.000 1.000 N NA
 5857289 5857290 E2348C_2170 E2348C_2171 gnd wbiQ FALSE 0.202 121.000 0.000 1.000   NA
 5857290 5857291 E2348C_2171 E2348C_2172 wbiQ wbiP TRUE 0.907 8.000 0.000 NA   NA
 5857291 5857292 E2348C_2172 E2348C_2173 wbiP wzy TRUE 0.933 1.000 0.000 NA   NA
 5857292 5857293 E2348C_2173 E2348C_2174 wzy wbiO TRUE 0.907 8.000 0.000 NA   NA
 5857293 5857294 E2348C_2174 E2348C_2175 wbiO wzx TRUE 0.930 -3.000 0.000 1.000   NA
 5857294 5857295 E2348C_2175 E2348C_2176 wzx manB TRUE 0.871 13.000 0.000 1.000   NA
 5857295 5857296 E2348C_2176 E2348C_2177 manB manC TRUE 0.905 4.000 0.000 1.000 N NA
 5857296 5857297 E2348C_2177 E2348C_2178 manC   TRUE 0.805 -7.000 0.000 1.000 N NA
 5857297 5857298 E2348C_2178 E2348C_2179     TRUE 0.977 3.000 0.217 1.000 N NA
 5857298 5857299 E2348C_2179 E2348C_2180     TRUE 0.994 3.000 0.000 0.008 Y NA
 5857299 5857300 E2348C_2180 E2348C_2181   wbiN TRUE 0.912 27.000 0.000 1.000 Y NA
 5857300 5857301 E2348C_2181 E2348C_2182 wbiN galE TRUE 0.955 19.000 0.067 1.000 Y NA
 5857301 5857302 E2348C_2182 E2348C_2183 galE galF FALSE 0.081 310.000 0.000 1.000 Y NA
 5857302 5857303 E2348C_2183 E2348C_2184 galF gne FALSE 0.174 243.000 0.074 1.000 Y NA
 5857303 5857304 E2348C_2184 E2348C_2185 gne wcaM FALSE 0.155 158.000 0.083 NA   NA
 5857304 5857305 E2348C_2185 E2348C_2186 wcaM wcaL TRUE 0.975 11.000 0.292 NA   NA
 5857305 5857306 E2348C_2186 E2348C_2187 wcaL wcaK TRUE 0.950 -3.000 0.095 NA   NA
 5857306 5857307 E2348C_2187 E2348C_2188 wcaK wzxC FALSE 0.375 72.000 0.095 NA   NA
 5857307 5857308 E2348C_2188 E2348C_2189 wzxC wcaJ TRUE 0.986 2.000 0.304 NA   NA
 5857308 5857309 E2348C_2189 E2348C_2190 wcaJ cpsG TRUE 0.813 55.000 0.538 NA N NA
 5857309 5857310 E2348C_2190 E2348C_2191 cpsG cpsB TRUE 0.540 193.000 1.000 1.000 N NA
 5857310 5857311 E2348C_2191 E2348C_2192 cpsB wcaI TRUE 0.992 3.000 0.123 1.000 Y NA
 5857311 5857312 E2348C_2192 E2348C_2193 wcaI gmm TRUE 0.948 -3.000 0.108 1.000 N NA
 5857312 5857313 E2348C_2193 E2348C_2194 gmm fcl TRUE 0.977 3.000 0.217 1.000 N NA
 5857313 5857314 E2348C_2194 E2348C_2195 fcl gmd TRUE 0.994 3.000 0.000 0.008 Y NA
 5857314 5857315 E2348C_2195 E2348C_2196 gmd wcaF TRUE 0.595 27.000 0.022 1.000   NA
 5857315 5857316 E2348C_2196 E2348C_2197 wcaF wcaE TRUE 0.845 16.000 0.077 NA   NA
 5857316 5857317 E2348C_2197 E2348C_2198 wcaE wcaD TRUE 0.978 11.000 0.333 NA   NA
 5857317 5857318 E2348C_2198 E2348C_2199 wcaD wcaC TRUE 0.935 -25.000 0.400 NA   NA
 5857318 5857319 E2348C_2199 E2348C_2200 wcaC wcaB TRUE 0.978 -3.000 0.259 1.000 N NA
 5857319 5857320 E2348C_2200 E2348C_2201 wcaB wcaA TRUE 0.979 3.000 0.259 NA N NA
 5857320 5857321 E2348C_2201 E2348C_2202 wcaA wzc FALSE 0.331 178.000 0.000 NA Y NA
 5857321 5857322 E2348C_2202 E2348C_2203 wzc wzb TRUE 0.912 3.000 0.000 1.000 N NA
 5857322 5857323 E2348C_2203 E2348C_2204 wzb wza TRUE 0.979 6.000 0.286 1.000 N NA
 5857325 5857326 E2348C_2206 E2348C_2207 asmA dcd TRUE 0.644 22.000 0.057 NA N NA
 5857326 5857327 E2348C_2207 E2348C_2208 dcd udk TRUE 0.716 92.000 0.098 1.000 Y NA
 5857328 5857329 E2348C_2209 E2348C_2210 yegE   FALSE 0.092 167.000 0.000 NA   NA
 5857332 5857333 E2348C_2213 E2348C_2214 yegI yegK TRUE 0.990 -3.000 0.455 1.000   NA
 5857333 5857334 E2348C_2214 E2348C_2215 yegK yegL TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5857335 5857336 E2348C_ncR32 E2348C_2216 ryeD   FALSE 0.071 184.000 0.000 NA   NA
 5857336 5857337 E2348C_2216 E2348C_2217   mdtA FALSE 0.025 265.000 0.000 1.000   NA
 5857337 5857338 E2348C_2217 E2348C_2218 mdtA mdtB TRUE 0.904 0.000 0.000 NA N NA
 5857338 5857339 E2348C_2218 E2348C_2219 mdtB mdtC TRUE 0.989 1.000 0.062 NA Y NA
 5857339 5857340 E2348C_2219 E2348C_2220 mdtC mdtD TRUE 0.989 1.000 0.438 NA N NA
 5857340 5857341 E2348C_2220 E2348C_2221 mdtD baeS TRUE 0.957 -3.000 0.139 1.000 N NA
 5857341 5857342 E2348C_2221 E2348C_2222 baeS baeR TRUE 0.998 -3.000 0.591 1.000 Y NA
 5857342 5857343 E2348C_2222 E2348C_2223 baeR yegP FALSE 0.093 180.000 0.062 NA   NA
 5857343 5857344 E2348C_2223 E2348C_2224 yegP yegQ FALSE 0.085 147.000 0.008 NA   NA
 5857344 5857345 E2348C_2224 E2348C_ncR33 yegQ ryeE FALSE 0.234 83.000 0.000 NA   NA
 5857348 5857349 E2348C_2227 E2348C_2228   atlT TRUE 0.945 45.000 1.000 1.000   NA
 5857349 5857350 E2348C_2228 E2348C_2229 atlT atlK TRUE 0.731 69.000 0.375 1.000   NA
 5857350 5857351 E2348C_2229 E2348C_2230 atlK atlD TRUE 0.986 14.000 0.200 1.000 Y NA
 5857354 5857355 E2348C_2233 E2348C_2234 rbtD rtlK TRUE 0.885 11.000 0.000 NA   NA
 5857356 5857357 E2348C_2235 E2348C_2236 gatR gatD FALSE 0.172 100.000 0.000 1.000 N NA
 5857357 5857358 E2348C_2236 E2348C_2237 gatD gatC FALSE 0.360 48.000 0.000 1.000 N NA
 5857358 5857359 E2348C_2237 E2348C_2238 gatC gatB TRUE 0.993 4.000 0.000 0.014 Y NA
 5857359 5857360 E2348C_2238 E2348C_2239 gatB gatA TRUE 0.940 31.000 0.000 0.009 Y NA
 5857360 5857361 E2348C_2239 E2348C_2240 gatA gatZ TRUE 0.982 10.000 0.000 1.000 Y NA
 5857361 5857362 E2348C_2240 E2348C_2241 gatZ gatY TRUE 0.953 29.000 0.000 0.001 Y NA
 5857362 5857363 E2348C_2241 E2348C_2242 gatY fbaB FALSE 0.306 227.000 0.000 0.002 Y NA
 5857364 5857365 E2348C_2243 E2348C_2244 yegT yegU TRUE 0.986 -3.000 0.364 NA   NA
 5857365 5857366 E2348C_2244 E2348C_2245 yegU yegV TRUE 0.991 -3.000 0.600 NA N NA
 5857367 5857368 E2348C_2246 E2348C_2247 yegW yegX FALSE 0.323 52.000 0.000 1.000 N NA
 5857368 5857369 E2348C_2247 E2348C_2248 yegX thiD FALSE 0.244 65.000 0.000 1.000 N NA
 5857369 5857370 E2348C_2248 E2348C_2249 thiD thiM TRUE 0.992 -3.000 0.037 0.003 Y NA
 5857370 5857371 E2348C_2249 E2348C_ncR34 thiM   TRUE 0.529 35.000 0.000 NA   NA
 5857371 5857372 E2348C_ncR34 E2348C_2250   rcnR FALSE 0.221 92.000 0.000 NA   NA
 5857373 5857374 E2348C_2251 E2348C_2252 rcnA yohN FALSE 0.038 219.000 0.000 NA   NA
 5857375 5857376 E2348C_2253 E2348C_2254   yehA FALSE 0.035 234.000 0.000 1.000   NA
 5857376 5857377 E2348C_2254 E2348C_2255 yehA yehB TRUE 0.819 16.000 0.000 1.000   NA
 5857377 5857378 E2348C_2255 E2348C_2256 yehB yehC TRUE 0.743 19.000 0.000 NA   NA
 5857378 5857379 E2348C_2256 E2348C_2257 yehC yehD FALSE 0.235 81.000 0.000 NA   NA
 5857379 5857380 E2348C_2257 E2348C_2258 yehD yehE FALSE 0.015 294.000 0.000 NA   NA
 5857380 5857381 E2348C_2258 E2348C_2259 yehE mrp FALSE 0.021 263.000 0.000 NA   NA
 5857382 5857383 E2348C_2260 E2348C_2261 metG yehH FALSE 0.135 141.000 0.000 NA   NA
 5857383 5857384 E2348C_2261 E2348C_2262 yehH yehI TRUE 0.496 39.000 0.000 NA   NA
 5857384 5857385 E2348C_2262 E2348C_2263 yehI yehK FALSE 0.306 61.000 0.000 NA   NA
 5857387 5857388 E2348C_2265 E2348C_2266 yehL yehM TRUE 0.885 11.000 0.000 NA   NA
 5857388 5857389 E2348C_2266 E2348C_2267 yehM yehP TRUE 0.836 -7.000 0.000 NA   NA
 5857389 5857390 E2348C_2267 E2348C_2268 yehP yehQ TRUE 0.968 -3.000 0.160 NA   NA
 5857390 5857391 E2348C_2268 E2348C_2269 yehQ yehR FALSE 0.168 125.000 0.000 NA   NA
 5857392 5857393 E2348C_2270 E2348C_2271 yehS yehT FALSE 0.434 47.000 0.051 NA   NA
 5857393 5857394 E2348C_2271 E2348C_2272 yehT yehU TRUE 0.999 -3.000 0.877 0.012 Y NA
 5857395 5857396 E2348C_2273 E2348C_2274 mlrA yohO FALSE 0.313 60.000 0.000 NA   NA
 5857397 5857398 E2348C_2275 E2348C_2276 yehW yehX TRUE 0.997 5.000 0.542 1.000 Y NA
 5857398 5857399 E2348C_2276 E2348C_2277 yehX yehY TRUE 0.994 -7.000 0.489 1.000 Y NA
 5857399 5857400 E2348C_2277 E2348C_2278 yehY osmF TRUE 0.993 7.000 0.521 0.046 N NA
 5857400 5857401 E2348C_2278 E2348C_2279 osmF bglX FALSE 0.095 190.000 0.099 1.000 N NA
 5857403 5857404 E2348C_2281 E2348C_2282 pbpG yohC FALSE 0.181 174.000 0.145 NA   NA
 5857406 5857407 E2348C_2284 E2348C_2285 yohF mdtQ TRUE 0.476 53.000 0.105 1.000 N NA
 5857407 5857408 E2348C_2285 E2348C_2286 mdtQ dusC FALSE 0.003 695.000 0.000 1.000 N NA
 5857409 5857410 E2348C_2287 E2348C_2288 yohJ yohK TRUE 0.987 -3.000 0.340 1.000   NA
 5857410 5857411 E2348C_2288 E2348C_2289 yohK cdd FALSE 0.351 130.000 0.198 1.000 N NA
 5857411 5857412 E2348C_2289 E2348C_2290 cdd sanA FALSE 0.117 150.000 0.045 NA   NA
 5857412 5857413 E2348C_2290 E2348C_2291 sanA yeiS TRUE 0.902 3.000 0.019 NA   NA
 5857413 5857414 E2348C_2291 E2348C_2292 yeiS yeiT FALSE 0.052 194.000 0.036 NA   NA
 5857414 5857415 E2348C_2292 E2348C_2293 yeiT yeiA TRUE 0.861 -6.000 0.062 1.000 N NA
 5857416 5857417 E2348C_2294 E2348C_2295 mglC mglA TRUE 0.996 16.000 0.905 1.000 Y NA
 5857417 5857418 E2348C_2295 E2348C_2296 mglA mglB TRUE 0.874 61.000 0.250 NA Y NA
 5857418 5857419 E2348C_2296 E2348C_2297 mglB galS FALSE 0.012 280.000 0.000 NA N NA
 5857419 5857420 E2348C_2297 E2348C_2298 galS yeiB TRUE 0.583 142.000 0.500 NA   NA
 5857420 5857421 E2348C_2298 E2348C_2299 yeiB folE TRUE 0.981 17.000 0.719 NA   NA
 5857423 5857424 E2348C_2301 E2348C_2302 cirA lysP FALSE 0.013 292.000 0.000 1.000 N NA
 5857424 5857425 E2348C_2302 E2348C_2303 lysP yeiE FALSE 0.038 205.000 0.000 1.000 N NA
 5857426 5857427 E2348C_2304 E2348C_2305 yeiH nfo FALSE 0.236 74.000 0.040 NA   NA
 5857427 5857428 E2348C_2305 E2348C_2306 nfo yeiI TRUE 0.797 4.000 0.004 NA N NA
 5857429 5857430 E2348C_2307 E2348C_2308 nupX rihB TRUE 0.613 100.000 0.056 NA Y NA
 5857432 5857433 E2348C_2310 E2348C_2311 yeiM yeiN FALSE 0.151 94.000 0.000 NA N NA
 5857433 5857434 E2348C_2311 E2348C_2312 yeiN yeiC TRUE 0.535 -12.000 0.008 NA N NA
 5857434 5857435 E2348C_2312 E2348C_2313 yeiC fruA FALSE 0.032 456.000 0.000 NA Y NA
 5857435 5857436 E2348C_2313 E2348C_2314 fruA fruK TRUE 0.992 17.000 0.562 1.000 Y NA
 5857436 5857437 E2348C_2314 E2348C_2315 fruK fruB TRUE 0.993 0.000 0.112 1.000 Y NA
 5857440 5857441 E2348C_2318 E2348C_2319 yeiP yeiQ FALSE 0.028 223.000 0.000 1.000 N NA
 5857441 5857442 E2348C_2319 E2348C_2320 yeiQ yeiR FALSE 0.380 118.000 0.167 NA   NA
 5857442 5857443 E2348C_2320 E2348C_2321 yeiR yeiU TRUE 0.822 39.000 0.275 NA   NA
 5857443 5857444 E2348C_2321 E2348C_2322 yeiU spr FALSE 0.007 412.000 0.000 NA   NA
 5857444 5857445 E2348C_2322 E2348C_2323 spr rtn FALSE 0.193 181.000 0.219 NA N NA
 5857445 5857446 E2348C_2323 E2348C_2324 rtn yejA TRUE 0.639 82.000 0.394 NA N NA
 5857446 5857447 E2348C_2324 E2348C_2325 yejA yejB TRUE 0.998 1.000 0.848 0.046   NA
 5857447 5857448 E2348C_2325 E2348C_2326 yejB yejE TRUE 0.998 0.000 0.833 0.046   NA
 5857448 5857449 E2348C_2326 E2348C_2327 yejE yejF TRUE 0.996 2.000 0.758 1.000   NA
 5857450 5857451 E2348C_2328 E2348C_2329 yejG bcr FALSE 0.011 334.000 0.000 NA   NA
 5857451 5857452 E2348C_2329 E2348C_2330 bcr rsuA TRUE 0.513 28.000 0.036 1.000 N NA
 5857453 5857454 E2348C_2331 E2348C_2332 yejH rplY FALSE 0.264 125.000 0.024 0.016 N NA
 5857456 5857457 E2348C_2334 E2348C_2335 yejL yejM TRUE 0.712 20.000 0.040 NA   NA
 5857457 5857458 E2348C_2335 E2348C_tRNA41 yejM proL FALSE 0.247 75.000 0.000 NA   NA
 5857461 5857462 E2348C_2338 E2348C_2339 ccmH ccmG TRUE 0.998 -3.000 0.578 1.000 Y NA
 5857462 5857463 E2348C_2339 E2348C_2340 ccmG ccmF TRUE 0.999 -3.000 0.804 0.002 Y NA
 5857463 5857464 E2348C_2340 E2348C_2341 ccmF ccmE TRUE 0.997 -3.000 0.211 0.002 Y NA
 5857464 5857465 E2348C_2341 E2348C_2342 ccmE ccmD TRUE 0.984 -3.000 0.344 1.000 N NA
 5857465 5857466 E2348C_2342 E2348C_2343 ccmD ccmC TRUE 0.990 -3.000 0.501 1.000 N NA
 5857466 5857467 E2348C_2343 E2348C_2344 ccmC ccmB TRUE 0.984 42.000 0.501 0.001 Y NA
 5857467 5857468 E2348C_2344 E2348C_2345 ccmB ccmA TRUE 0.999 -3.000 0.503 0.002 Y NA
 5857468 5857469 E2348C_2345 E2348C_2346 ccmA napC TRUE 0.689 19.000 0.043 1.000 N NA
 5857469 5857470 E2348C_2346 E2348C_2347 napC napB TRUE 0.998 10.000 0.490 0.003 Y NA
 5857470 5857471 E2348C_2347 E2348C_2348 napB napH TRUE 0.998 -3.000 0.316 0.008 Y NA
 5857471 5857472 E2348C_2348 E2348C_2349 napH napG TRUE 0.989 -13.000 0.795 0.041   NA
 5857472 5857473 E2348C_2349 E2348C_2350 napG napA TRUE 0.988 7.000 0.243 0.041   NA
 5857473 5857474 E2348C_2350 E2348C_2351 napA napD TRUE 0.994 -3.000 0.875 NA N NA
 5857474 5857475 E2348C_2351 E2348C_2352 napD napF TRUE 0.930 -10.000 0.209 NA   NA
 5857476 5857477 E2348C_2353 E2348C_2354 yojO eco FALSE 0.128 135.000 0.034 NA   NA
 5857478 5857479 E2348C_2355 E2348C_2356 mqo yojI FALSE 0.045 218.000 0.000 1.000   NA
 5857479 5857480 E2348C_2356 E2348C_2357 yojI alkB FALSE 0.279 76.000 0.076 1.000 N NA
 5857480 5857481 E2348C_2357 E2348C_2358 alkB ada TRUE 0.963 0.000 0.015 0.011 N NA
 5857481 5857482 E2348C_2358 E2348C_2359 ada apbE FALSE 0.153 74.000 0.019 1.000 N NA
 5857482 5857483 E2348C_2359 E2348C_2360 apbE ompC FALSE 0.198 112.000 0.066 1.000 N NA
 5857484 5857485 E2348C_ncR35 E2348C_2361 micF rcsD FALSE 0.013 312.000 0.000 NA   NA
 5857485 5857486 E2348C_2361 E2348C_2362 rcsD rcsB TRUE 0.992 17.000 0.558 1.000 Y NA
 5857488 5857489 E2348C_2364 E2348C_2365 atoS atoC TRUE 0.998 -3.000 0.364 0.012 Y NA
 5857489 5857490 E2348C_2365 E2348C_2366 atoC atoD FALSE 0.197 196.000 0.273 1.000 N NA
 5857490 5857491 E2348C_2366 E2348C_2367 atoD atoA TRUE 0.999 0.000 0.800 0.001 Y NA
 5857491 5857492 E2348C_2367 E2348C_2368 atoA atoE TRUE 0.993 -3.000 0.174 1.000 Y NA
 5857492 5857493 E2348C_2368 E2348C_2369 atoE atoB TRUE 0.944 31.000 0.174 1.000 Y NA
 5857494 5857495 E2348C_2370 E2348C_2371 yfaP yfaQ TRUE 0.916 5.000 0.000 NA   NA
 5857495 5857496 E2348C_2371 E2348C_2372 yfaQ yfaS TRUE 0.977 1.000 0.182 NA   NA
 5857496 5857497 E2348C_2372 E2348C_2373 yfaS yfaT TRUE 0.682 -66.000 0.074 NA   NA
 5857497 5857498 E2348C_2373 E2348C_2374 yfaT yfaA TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5857498 5857499 E2348C_2374 E2348C_2375 yfaA gyrA FALSE 0.121 149.000 0.000 NA   NA
 5857502 5857503 E2348C_2378 E2348C_2379 nrdA nrdB TRUE 0.491 190.000 0.000 0.001 Y NA
 5857503 5857504 E2348C_2379 E2348C_2380 nrdB yfaE TRUE 0.908 0.000 0.034 1.000 N NA
 5857505 5857506 E2348C_2381 E2348C_2382 inaA glpQ FALSE 0.058 203.000 0.000 1.000   NA
 5857506 5857507 E2348C_2382 E2348C_2383 glpQ glpT TRUE 0.986 5.000 0.396 1.000 N NA
 5857508 5857509 E2348C_2384 E2348C_2385 glpA glpB TRUE 0.989 -10.000 0.650 0.001 N NA
 5857509 5857510 E2348C_2385 E2348C_2386 glpB glpC TRUE 0.995 -3.000 0.547 0.001 N NA
 5857510 5857511 E2348C_2386 E2348C_2387 glpC yfaD FALSE 0.060 193.000 0.000 NA   NA
 5857511 5857512 E2348C_2387 E2348C_2388 yfaD ypaA TRUE 0.849 13.000 0.000 NA   NA
 5857513 5857514 E2348C_2389 E2348C_2390 yfaU yfaV TRUE 0.852 69.000 0.250 NA Y NA
 5857514 5857515 E2348C_2390 E2348C_2391 yfaV yfaW FALSE 0.287 57.000 0.060 NA N NA
 5857515 5857516 E2348C_2391 E2348C_2392 yfaW yfaX TRUE 0.948 3.000 0.090 1.000 N NA
 5857516 5857517 E2348C_2392 E2348C_2393 yfaX yfaY FALSE 0.044 220.000 0.000 1.000   NA
 5857517 5857518 E2348C_2393 E2348C_2394 yfaY yfaZ FALSE 0.171 100.000 0.005 1.000   NA
 5857521 5857522 E2348C_2397 E2348C_2398 arnB arnC TRUE 0.996 4.000 0.378 NA Y NA
 5857522 5857523 E2348C_2398 E2348C_2399 arnC arnA TRUE 0.995 0.000 0.220 NA Y NA
 5857523 5857524 E2348C_2399 E2348C_2400 arnA yfbH TRUE 0.997 -3.000 0.447 1.000 Y NA
 5857524 5857525 E2348C_2400 E2348C_2401 yfbH arnT TRUE 0.903 0.000 0.031 1.000 N NA
 5857525 5857526 E2348C_2401 E2348C_2402 arnT yfbW TRUE 0.955 -3.000 0.091 1.000   NA
 5857526 5857527 E2348C_2402 E2348C_2403 yfbW yfbJ TRUE 0.994 0.000 0.613 NA   NA
 5857528 5857529 E2348C_2404 E2348C_2405 pmrD menE FALSE 0.137 105.000 0.005 NA   NA
 5857529 5857530 E2348C_2405 E2348C_2406 menE menC TRUE 0.991 -3.000 0.283 0.001 N NA
 5857530 5857531 E2348C_2406 E2348C_2407 menC menB TRUE 0.997 0.000 0.171 0.001 Y NA
 5857531 5857532 E2348C_2407 E2348C_2408 menB yfbB TRUE 0.954 15.000 0.280 NA   NA
 5857532 5857533 E2348C_2408 E2348C_2409 yfbB menD TRUE 0.986 -3.000 0.355 NA   NA
 5857533 5857534 E2348C_2409 E2348C_2410 menD menF TRUE 0.847 89.000 0.281 1.000 Y NA
 5857534 5857535 E2348C_2410 E2348C_2411 menF elaB FALSE 0.232 79.000 0.043 NA   NA
 5857535 5857536 E2348C_2411 E2348C_2412 elaB elaA FALSE 0.430 55.000 0.077 NA   NA
 5857537 5857538 E2348C_2413 E2348C_2414 rbn yfbL FALSE 0.011 356.000 0.000 1.000   NA
 5857538 5857539 E2348C_2414 E2348C_2415 yfbL yfbM FALSE 0.200 103.000 0.000 NA   NA
 5857540 5857541 E2348C_2416 E2348C_2417 nuoN nuoM TRUE 0.998 7.000 0.437 0.001 Y NA
 5857541 5857542 E2348C_2417 E2348C_2418 nuoM nuoL TRUE 0.760 231.000 0.713 0.001 Y NA
 5857542 5857543 E2348C_2418 E2348C_2419 nuoL nuoK TRUE 0.997 -3.000 0.211 0.004 Y NA
 5857543 5857544 E2348C_2419 E2348C_2420 nuoK nuoJ TRUE 0.997 -3.000 0.269 0.002 Y NA
 5857544 5857545 E2348C_2420 E2348C_2421 nuoJ nuoI TRUE 0.997 12.000 0.428 0.004 Y NA
 5857545 5857546 E2348C_2421 E2348C_2422 nuoI nuoH TRUE 0.995 15.000 0.423 0.004 Y NA
 5857546 5857547 E2348C_2422 E2348C_2423 nuoH nuoG TRUE 0.999 -3.000 0.664 0.004 Y NA
 5857547 5857548 E2348C_2423 E2348C_2424 nuoG nuoF TRUE 0.932 53.000 0.180 0.004 Y NA
 5857548 5857549 E2348C_2424 E2348C_2425 nuoF nuoE TRUE 0.996 -3.000 0.186 0.004 Y NA
 5857549 5857550 E2348C_2425 E2348C_2426 nuoE nuoC TRUE 0.998 3.000 0.407 0.004 Y NA
 5857550 5857551 E2348C_2426 E2348C_2427 nuoC nuoB TRUE 0.963 94.000 0.691 0.002 Y NA
 5857551 5857552 E2348C_2427 E2348C_2428 nuoB nuoA TRUE 0.995 16.000 0.377 0.002 Y NA
 5857552 5857553 E2348C_2428 E2348C_2429 nuoA lrhA FALSE 0.003 629.000 0.000 1.000 N NA
 5857554 5857555 E2348C_2430 E2348C_2431 yfbQ yfbR FALSE 0.391 84.000 0.104 1.000   NA
 5857556 5857557 E2348C_2432 E2348C_2433 yfbS yfbT TRUE 0.636 87.000 0.308 1.000   NA
 5857557 5857558 E2348C_2433 E2348C_2434 yfbT yfbU TRUE 0.981 11.000 0.375 NA   NA
 5857558 5857559 E2348C_2434 E2348C_2435 yfbU yfbV TRUE 0.532 83.000 0.221 NA   NA
 5857560 5857561 E2348C_2436 E2348C_2437 ackA pta TRUE 0.817 75.000 0.634 1.000   NA
 5857561 5857562 E2348C_2437 E2348C_2438 pta yfcC FALSE 0.064 190.000 0.000 NA   NA
 5857563 5857564 E2348C_2439 E2348C_2440 yfcD yfcE TRUE 0.726 58.000 0.143 0.010   NA
 5857564 5857565 E2348C_2440 E2348C_2441 yfcE yfcF TRUE 0.463 56.000 0.092 NA   NA
 5857566 5857567 E2348C_2442 E2348C_2443 yfcG folX FALSE 0.203 57.000 0.012 1.000 N NA
 5857567 5857568 E2348C_2443 E2348C_2444 folX yfcH TRUE 0.857 21.000 0.122 1.000   NA
 5857569 5857570 E2348C_2445 E2348C_2446 yfcI hisP FALSE 0.055 196.000 0.000 NA   NA
 5857570 5857571 E2348C_2446 E2348C_2447 hisP hisM TRUE 0.998 8.000 0.643 1.000 Y NA
 5857571 5857572 E2348C_2447 E2348C_2448 hisM hisQ TRUE 0.999 -3.000 0.900 0.014 Y NA
 5857572 5857573 E2348C_2448 E2348C_2449 hisQ hisJ TRUE 0.965 90.000 0.833 0.046 Y NA
 5857573 5857574 E2348C_2449 E2348C_2450 hisJ argT FALSE 0.301 221.000 0.000 0.010 Y NA
 5857574 5857575 E2348C_2450 E2348C_2451 argT ubiX FALSE 0.017 266.000 0.000 1.000 N NA
 5857575 5857576 E2348C_2451 E2348C_2452 ubiX purF FALSE 0.202 95.000 0.056 1.000 N NA
 5857576 5857577 E2348C_2452 E2348C_2453 purF cvpA TRUE 0.839 37.000 0.262 1.000   NA
 5857577 5857578 E2348C_2453 E2348C_2454 cvpA dedD FALSE 0.022 330.000 0.116 NA   NA
 5857578 5857579 E2348C_2454 E2348C_2455 dedD folC TRUE 0.932 -10.000 0.216 NA   NA
 5857579 5857580 E2348C_2455 E2348C_2456 folC accD TRUE 0.692 70.000 0.383 1.000 N NA
 5857580 5857581 E2348C_2456 E2348C_2457 accD dedA FALSE 0.081 156.000 0.020 NA   NA
 5857581 5857582 E2348C_2457 E2348C_2458 dedA truA FALSE 0.215 83.000 0.038 NA   NA
 5857582 5857583 E2348C_2458 E2348C_2459 truA usg TRUE 0.915 0.000 0.040 1.000 N NA
 5857583 5857584 E2348C_2459 E2348C_2460 usg pdxB TRUE 0.863 66.000 0.097 0.008 Y NA
 5857586 5857587 E2348C_2462 E2348C_2463 yfcJ fabB FALSE 0.014 265.000 0.000 NA N NA
 5857589 5857590 E2348C_2465 E2348C_2466 yfcL yfcM TRUE 0.900 34.000 0.425 NA   NA
 5857590 5857591 E2348C_2466 E2348C_2467 yfcM yfcA TRUE 0.974 0.000 0.153 NA   NA
 5857591 5857592 E2348C_2467 E2348C_2468 yfcA mepA TRUE 0.978 0.000 0.160 1.000   NA
 5857592 5857593 E2348C_2468 E2348C_2469 mepA aroC TRUE 0.873 4.000 0.025 1.000 N NA
 5857593 5857594 E2348C_2469 E2348C_2470 aroC prmB TRUE 0.590 35.000 0.081 1.000 N NA
 5857596 5857597 E2348C_2472 E2348C_2473 yfcO yfcP TRUE 0.931 2.000 0.000 NA   NA
 5857597 5857598 E2348C_2473 E2348C_2474 yfcP yfcQ TRUE 0.997 -3.000 0.286 0.007 Y NA
 5857598 5857599 E2348C_2474 E2348C_2475 yfcQ yfcR TRUE 0.999 -3.000 0.571 0.007 Y NA
 5857599 5857600 E2348C_2475 E2348C_2476 yfcR yfcS TRUE 0.988 16.000 0.333 1.000 Y NA
 5857600 5857601 E2348C_2476 E2348C_2477 yfcS yfcU TRUE 0.995 20.000 1.000 1.000 Y NA
 5857601 5857602 E2348C_2477 E2348C_2478 yfcU yfcV TRUE 0.659 84.000 0.000 1.000 Y NA
 5857602 5857603 E2348C_2478 E2348C_2479 yfcV sixA FALSE 0.003 663.000 0.000 1.000 N NA
 5857603 5857604 E2348C_2479 E2348C_2480 sixA fadJ FALSE 0.040 203.000 0.000 1.000 N NA
 5857604 5857605 E2348C_2480 E2348C_2481 fadJ fadI TRUE 0.998 0.000 0.430 1.000 Y NA
 5857605 5857606 E2348C_2481 E2348C_2482 fadI yfcZ FALSE 0.040 226.000 0.061 NA   NA
 5857609 5857610 E2348C_2485 E2348C_tRNA42 yfdC argW FALSE 0.244 76.000 0.000 NA   NA
 5857610 10800745 E2348C_tRNA42 E2348C_PP8 argW   TRUE 0.737 -14.000 0.000 NA   NA
 10800745 5857611 E2348C_PP8 E2348C_2486     TRUE 0.566 -1333.000 0.000 NA   NA
 5857612 5857613 E2348C_2487 E2348C_2488     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5857613 5857614 E2348C_2488 E2348C_2489     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5857614 5857615 E2348C_2489 E2348C_2490     TRUE 0.994 -3.000 0.792 NA   NA
 5857615 5857616 E2348C_2490 E2348C_2491     TRUE 0.963 0.000 0.100 NA   NA
 5857616 5857617 E2348C_2491 E2348C_2492     TRUE 0.993 0.000 0.500 NA   NA
 5857617 5857618 E2348C_2492 E2348C_2493     TRUE 0.663 65.000 0.286 NA   NA
 5857618 5857619 E2348C_2493 E2348C_2494     TRUE 0.754 -13.000 0.000 NA   NA
 5857619 5857620 E2348C_2494 E2348C_2495     FALSE 0.175 121.000 0.000 NA   NA
 5857620 5857621 E2348C_2495 E2348C_2496     TRUE 0.996 3.000 1.000 NA   NA
 5857621 5857622 E2348C_2496 E2348C_2497     TRUE 0.993 3.000 0.600 NA   NA
 5857622 5857623 E2348C_2497 E2348C_2498     TRUE 0.991 0.000 0.429 NA   NA
 5857623 5857624 E2348C_2498 E2348C_2499     TRUE 0.991 0.000 0.429 NA   NA
 5857624 5857625 E2348C_2499 E2348C_2500     TRUE 0.533 178.000 0.667 NA   NA
 5857625 5857626 E2348C_2500 E2348C_2501     TRUE 0.922 4.000 0.000 NA   NA
 5857626 5857627 E2348C_2501 E2348C_2502     TRUE 0.943 12.000 0.150 NA   NA
 5857627 5857628 E2348C_2502 E2348C_2503     TRUE 0.955 4.000 0.100 NA   NA
 5857628 5857629 E2348C_2503 E2348C_2504     TRUE 0.987 -10.000 1.000 NA   NA
 5857629 5857630 E2348C_2504 E2348C_2505     TRUE 0.984 -13.000 1.000 NA   NA
 5857630 5857631 E2348C_2505 E2348C_2506     TRUE 0.990 -3.000 0.500 NA   NA
 5857631 5857632 E2348C_2506 E2348C_2507     TRUE 0.627 -34.000 0.000 NA   NA
 5857632 5857633 E2348C_2507 E2348C_2508     TRUE 0.467 42.000 0.000 NA   NA
 5857633 5857634 E2348C_2508 E2348C_2509     TRUE 0.993 12.000 1.000 NA   NA
 5857634 5857635 E2348C_2509 E2348C_2510     TRUE 0.922 4.000 0.000 NA   NA
 5857635 5857636 E2348C_2510 E2348C_2511     TRUE 0.829 15.000 0.056 NA   NA
 5857636 5857637 E2348C_2511 E2348C_2512     TRUE 0.503 38.000 0.000 NA   NA
 5857637 5857638 E2348C_2512 E2348C_2513     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5857638 5857639 E2348C_2513 E2348C_2514     TRUE 0.976 3.000 0.026 0.001   NA
 5857639 5857640 E2348C_2514 E2348C_2515     FALSE 0.004 701.000 0.000 NA   NA
 5857640 5857641 E2348C_2515 E2348C_2516     TRUE 0.489 117.000 0.250 NA   NA
 5857641 5857642 E2348C_2516 E2348C_2517     TRUE 0.916 -16.000 0.250 NA   NA
 5857642 5857643 E2348C_2517 E2348C_2518     TRUE 0.719 -16.000 0.000 NA   NA
 5857643 5857644 E2348C_2518 E2348C_tRNA43   tRNA_43 FALSE 0.027 243.000 0.000 NA   NA
 5857644 5857645 E2348C_tRNA43 E2348C_tRNA44 tRNA_43 tRNA_44 TRUE 0.912 6.000 0.000 NA   NA
 5857645 5857646 E2348C_tRNA44 E2348C_2519 tRNA_44   FALSE 0.344 55.000 0.000 NA   NA
 5857646 5857647 E2348C_2519 E2348C_2520     FALSE 0.068 195.000 0.000 1.000   NA
 5857647 5857648 E2348C_2520 E2348C_2521     FALSE 0.088 182.000 0.000 1.000   NA
 5857648 5857649 E2348C_2521 E2348C_2522     TRUE 0.993 -3.000 0.667 NA   NA
 5857649 5857650 E2348C_2522 E2348C_2523     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5857650 5857651 E2348C_2523 E2348C_2524     TRUE 0.836 -7.000 0.000 NA   NA
 5857651 5857652 E2348C_2524 E2348C_2525     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5857652 5857653 E2348C_2525 E2348C_2526     TRUE 0.928 3.000 0.000 NA   NA
 5857653 5857654 E2348C_2526 E2348C_2527     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5857654 5857655 E2348C_2527 E2348C_2528     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5857655 5857656 E2348C_2528 E2348C_2529     TRUE 0.705 74.000 0.400 NA   NA
 5857656 5857657 E2348C_2529 E2348C_2530     TRUE 0.972 -3.000 0.000 0.007   NA
 5857657 5857658 E2348C_2530 E2348C_2531     TRUE 0.928 3.000 0.000 NA   NA
 5857658 5857659 E2348C_2531 E2348C_2532     TRUE 0.682 23.000 0.000 NA   NA
 5857659 5857660 E2348C_2532 E2348C_2533     FALSE 0.162 139.000 0.000 1.000   NA
 5857661 5857662 E2348C_2534 E2348C_2535     TRUE 0.907 8.000 0.000 NA   NA
 5857662 5857663 E2348C_2535 E2348C_2536     TRUE 0.754 -13.000 0.000 NA   NA
 5857663 5857664 E2348C_2536 E2348C_2537     FALSE 0.005 502.000 0.000 NA   NA
 5857664 5857665 E2348C_2537 E2348C_2538     FALSE 0.318 59.000 0.000 NA   NA
 5857665 5857666 E2348C_2538 E2348C_2539     FALSE 0.421 47.000 0.000 NA   NA
 5857666 5857667 E2348C_2539 E2348C_2540     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5857667 5857668 E2348C_2540 E2348C_2541     FALSE 0.146 135.000 0.000 NA   NA
 5857668 5857669 E2348C_2541 E2348C_2542     TRUE 0.668 24.000 0.000 NA   NA
 5857669 5857670 E2348C_2542 E2348C_2543     TRUE 0.733 -15.000 0.000 NA   NA
 5857670 5857671 E2348C_2543 E2348C_2544     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5857671 5857672 E2348C_2544 E2348C_2545     FALSE 0.204 100.000 0.000 NA   NA
 5857672 5857673 E2348C_2545 E2348C_2546     TRUE 0.943 1.000 0.000 1.000   NA
 5857673 5857674 E2348C_2546 E2348C_2547     TRUE 0.930 -3.000 0.000 1.000   NA
 5857674 5857675 E2348C_2547 E2348C_2548     TRUE 0.831 14.000 0.000 NA   NA
 5857675 5857676 E2348C_2548 E2348C_2549     FALSE 0.081 175.000 0.000 NA   NA
 5857676 5857677 E2348C_2549 E2348C_2550     TRUE 0.754 -13.000 0.000 NA   NA
 5857677 5857678 E2348C_2550 E2348C_2551     FALSE 0.055 196.000 0.000 NA   NA
 5857678 5857679 E2348C_2551 E2348C_2552     FALSE 0.043 210.000 0.000 NA   NA
 5857679 5857680 E2348C_2552 E2348C_2553   torI FALSE 0.012 326.000 0.000 NA   NA
 5857681 5857682 E2348C_2554 E2348C_2555     FALSE 0.339 62.000 0.000 1.000   NA
 5857685 5857686 E2348C_2558 E2348C_2559 dsdX dsdA TRUE 0.759 18.000 0.000 NA   NA
 5857687 5857688 E2348C_2560 E2348C_2561 emrY emrK TRUE 0.997 0.000 1.000 1.000   NA
 5857689 5857690 E2348C_2562 E2348C_2563 evgA evgS TRUE 0.992 5.000 0.000 0.009 Y NA
 5857691 5857692 E2348C_2564 E2348C_2565 yfdE yfdV FALSE 0.285 74.000 0.000 1.000   NA
 5857692 5857693 E2348C_2565 E2348C_2566 yfdV oxc FALSE 0.300 70.000 0.000 1.000   NA
 5857693 5857694 E2348C_2566 E2348C_2567 oxc frc TRUE 0.519 54.000 0.134 1.000 N NA
 5857694 5857695 E2348C_2567 E2348C_2568 frc yfdX FALSE 0.005 512.000 0.000 NA   NA
 5857700 5857701 E2348C_2573 E2348C_2574 ypdA ypdB TRUE 0.997 15.000 0.744 0.012 Y NA
 5857701 5857702 E2348C_2574 E2348C_2575 ypdB ypdC TRUE 0.983 13.000 0.051 0.064 Y NA
 5857703 5857704 E2348C_2576 E2348C_2577 fryA ypdE TRUE 0.986 25.000 0.571 1.000 Y NA
 5857704 5857705 E2348C_2577 E2348C_2578 ypdE ypdF TRUE 0.960 0.000 0.009 0.017 N NA
 5857705 5857706 E2348C_2578 E2348C_2579 ypdF fryC TRUE 0.685 15.000 0.011 1.000 N NA
 5857706 5857707 E2348C_2579 E2348C_2580 fryC fryB TRUE 0.698 22.000 0.000 NA   NA
 5857707 5857708 E2348C_2580 E2348C_2581 fryB glk FALSE 0.038 219.000 0.000 NA   NA
 5857709 5857710 E2348C_2582 E2348C_2583 yfeO ypeC FALSE 0.185 115.000 0.000 NA   NA
 5857713 5857714 E2348C_2586 E2348C_tRNA45 yfeA alaX FALSE 0.045 207.000 0.000 NA   NA
 5857714 5857715 E2348C_tRNA45 E2348C_tRNA46 alaX alaW TRUE 0.486 40.000 0.000 NA   NA
 5857716 5857717 E2348C_2587 E2348C_2588 yfeC yfeD TRUE 0.977 2.000 0.000 0.006   NA
 5857719 5857720 E2348C_tRNA47 E2348C_tRNA48 valU valX FALSE 0.440 45.000 0.000 NA   NA
 5857720 5857721 E2348C_tRNA48 E2348C_tRNA49 valX valY FALSE 0.421 47.000 0.000 NA   NA
 5857721 5857722 E2348C_tRNA49 E2348C_tRNA50 valY lysV TRUE 0.916 5.000 0.000 NA   NA
 5857723 5857724 E2348C_2590 E2348C_2591 xapR xapB FALSE 0.025 252.000 0.000 NA   NA
 5857724 5857725 E2348C_2591 E2348C_2592 xapB xapA TRUE 0.496 61.000 0.111 1.000   NA
 5857729 5857730 E2348C_2596 E2348C_2597 ypeB ligA TRUE 0.905 2.000 0.017 NA   NA
 5857730 5857731 E2348C_2597 E2348C_2598 ligA zipA FALSE 0.141 71.000 0.002 1.000 N NA
 5857732 5857733 E2348C_2599 E2348C_2600 cysZ cysK FALSE 0.425 185.000 0.122 1.000 Y NA
 5857733 5857734 E2348C_2600 E2348C_2601 cysK ptsH FALSE 0.004 384.000 0.019 1.000 N NA
 5857734 5857735 E2348C_2601 E2348C_2602 ptsH ptsI TRUE 0.901 45.000 0.000 0.011 Y NA
 5857735 5857736 E2348C_2602 E2348C_2603 ptsI crr TRUE 0.914 41.000 0.000 0.011 Y NA
 5857739 5857740 E2348C_2606 E2348C_2607 cysM cysA FALSE 0.126 134.000 0.049 1.000 N NA
 5857740 5857741 E2348C_2607 E2348C_2608 cysA cysW TRUE 0.980 -10.000 0.180 1.000 Y NA
 5857741 5857742 E2348C_2608 E2348C_2609 cysW cysU TRUE 0.997 0.000 0.583 0.000 N NA
 5857742 5857743 E2348C_2609 E2348C_2610 cysU cysP TRUE 0.996 0.000 0.479 0.002 N NA
 5857746 5857747 E2348C_2613 E2348C_2614 murQ murP TRUE 0.973 4.000 0.158 1.000   NA
 5857748 5857749 E2348C_2615 E2348C_2616 yfeX yfeY TRUE 0.612 96.000 0.333 NA   NA
 5857749 5857750 E2348C_2616 E2348C_2617 yfeY yfeZ TRUE 0.601 61.000 0.204 NA   NA
 5857750 5857751 E2348C_2617 E2348C_2618 yfeZ ypeA TRUE 0.784 -13.000 0.059 NA   NA
 5857752 5857753 E2348C_2619 E2348C_2620 amiA hemF TRUE 0.873 4.000 0.025 1.000 N NA
 5857753 5857754 E2348C_2620 E2348C_2621 hemF   FALSE 0.338 44.000 0.004 NA   NA
 5857756 5857757 E2348C_2623 E2348C_2624     TRUE 0.673 41.000 0.133 NA   NA
 5857758 5857759 E2348C_2625 E2348C_2626 eutR eutK TRUE 0.721 46.000 0.250 NA N NA
 5857759 5857760 E2348C_2626 E2348C_2627 eutK eutL TRUE 0.887 13.000 0.106 NA N NA
 5857760 5857761 E2348C_2627 E2348C_2628 eutL eutC TRUE 0.897 10.000 0.000 NA   NA
 5857763 5857764 E2348C_2630 E2348C_2631     TRUE 0.998 0.000 1.000 0.062   NA
 5857764 5857765 E2348C_2631 E2348C_2632     TRUE 0.923 19.000 0.083 0.006   NA
 5857765 5857766 E2348C_2632 E2348C_2633     TRUE 0.812 15.000 0.000 NA   NA
 5857766 5857767 E2348C_2633 E2348C_2634     FALSE 0.023 257.000 0.000 NA   NA
 5857767 5857768 E2348C_2634 E2348C_2635     TRUE 0.972 2.000 0.154 NA   NA
 5857768 5857769 E2348C_2635 E2348C_2636     TRUE 0.968 -19.000 0.667 NA   NA
 5857771 5857772 E2348C_2638 E2348C_2639     TRUE 0.987 3.000 0.333 NA   NA
 5857772 5857773 E2348C_2639 E2348C_2640     TRUE 0.990 -3.000 0.500 NA   NA
 5857773 5857774 E2348C_2640 E2348C_2641     TRUE 0.972 -10.000 0.500 NA   NA
 5857774 5857775 E2348C_2641 E2348C_2642     TRUE 0.974 -28.000 1.000 NA   NA
 5857775 5857776 E2348C_2642 E2348C_2643     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5857776 5857777 E2348C_2643 E2348C_2644     TRUE 0.754 -13.000 0.000 NA   NA
 5857777 5857778 E2348C_2644 E2348C_2645     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5857778 5857779 E2348C_2645 E2348C_2646     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5857779 5857780 E2348C_2646 E2348C_2647     FALSE 0.168 125.000 0.000 NA   NA
 5857780 5857781 E2348C_2647 E2348C_2648     TRUE 0.732 -28.000 0.080 NA   NA
 5857781 5857782 E2348C_2648 E2348C_2649     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5857782 5857783 E2348C_2649 E2348C_2650     FALSE 0.203 101.000 0.000 NA   NA
 5857783 5857784 E2348C_2650 E2348C_2651     TRUE 0.618 27.000 0.000 NA   NA
 5857784 5857785 E2348C_2651 E2348C_2652     FALSE 0.280 183.000 0.286 NA   NA
 5857785 5857786 E2348C_2652 E2348C_2653     TRUE 0.949 -10.000 0.286 NA   NA
 5857786 5857787 E2348C_2653 E2348C_2654     TRUE 0.981 -16.000 1.000 NA   NA
 5857787 5857788 E2348C_2654 E2348C_2655     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 5857788 5857789 E2348C_2655 E2348C_2656     FALSE 0.032 227.000 0.000 NA   NA
 5857789 5857790 E2348C_2656 E2348C_2657     TRUE 0.490 47.000 0.069 NA   NA
 5857790 5857791 E2348C_2657 E2348C_2658     TRUE 0.942 2.000 0.061 NA   NA
 5857791 5857792 E2348C_2658 E2348C_2659     TRUE 0.968 4.000 0.152 NA   NA
 5857792 5857793 E2348C_2659 E2348C_2660     TRUE 0.929 -13.000 0.250 NA   NA
 5857793 5857794 E2348C_2660 E2348C_2661     TRUE 0.962 -3.000 0.133 NA   NA
 5857794 5857795 E2348C_2661 E2348C_2662     FALSE 0.043 210.000 0.045 NA   NA
 5857795 5857796 E2348C_2662 E2348C_2663     TRUE 0.990 1.000 0.386 NA   NA
 5857796 5857797 E2348C_2663 E2348C_2664     TRUE 0.914 11.000 0.073 NA   NA
 5857797 5857798 E2348C_2664 E2348C_2665     TRUE 0.942 4.000 0.073 NA   NA
 5857798 5857799 E2348C_2665 E2348C_2666     TRUE 0.976 4.000 0.207 NA   NA
 5857799 5857800 E2348C_2666 E2348C_2667     TRUE 0.820 57.000 0.500 NA   NA
 5857800 5857801 E2348C_2667 E2348C_2668     TRUE 0.912 -19.000 0.265 NA   NA
 5857801 5857802 E2348C_2668 E2348C_2669     TRUE 0.976 -7.000 0.429 NA   NA
 5857802 5857803 E2348C_2669 E2348C_2670     TRUE 0.988 13.000 0.714 NA   NA
 5857803 5857804 E2348C_2670 E2348C_2671     TRUE 0.992 -3.000 0.579 NA   NA
 5857804 5857805 E2348C_2671 E2348C_2672     FALSE 0.341 163.000 0.273 NA   NA
 5857805 5857806 E2348C_2672 E2348C_2673     TRUE 0.978 0.000 0.182 NA   NA
 5857806 5857807 E2348C_2673 E2348C_2674     TRUE 0.893 -16.000 0.190 NA   NA
 5857807 5857808 E2348C_2674 E2348C_2675     TRUE 0.994 -3.000 0.714 NA   NA
 5857808 5857809 E2348C_2675 E2348C_2676     TRUE 0.786 54.000 0.375 NA   NA
 5857809 5857810 E2348C_2676 E2348C_2677     TRUE 0.983 0.000 0.231 NA   NA
 5857810 5857811 E2348C_2677 E2348C_2678     TRUE 0.986 4.000 0.333 NA   NA
 5857811 5857812 E2348C_2678 E2348C_2679     FALSE 0.232 84.000 0.000 NA   NA
 5857812 5857813 E2348C_2679 E2348C_2680     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5857814 5857815 E2348C_2681 E2348C_2682     TRUE 0.928 3.000 0.000 NA   NA
 5857815 5857816 E2348C_2682 E2348C_2683   eutB FALSE 0.004 725.000 0.000 NA   NA
 5857816 5857817 E2348C_2683 E2348C_2684 eutB eutA TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 5857817 5857818 E2348C_2684 E2348C_2685 eutA   TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 5857818 5857819 E2348C_2685 E2348C_2686   eutH FALSE 0.012 340.000 0.000 1.000   NA
 5857819 5857820 E2348C_2686 E2348C_2687 eutH eutG FALSE 0.119 217.000 0.222 1.000 N NA
 5857820 5857821 E2348C_2687 E2348C_2688 eutG eutJ TRUE 0.973 -10.000 0.556 1.000 N NA
 5857821 5857822 E2348C_2688 E2348C_2689 eutJ eutE TRUE 0.979 11.000 0.375 1.000 N NA
 5857822 5857823 E2348C_2689 E2348C_2690 eutE eutN TRUE 0.997 12.000 0.667 NA Y NA
 5857823 5857824 E2348C_2690 E2348C_2691 eutN eutM TRUE 0.748 107.000 0.182 NA Y NA
 5857824 5857825 E2348C_2691 E2348C_2692 eutM eutD TRUE 0.964 39.000 0.455 NA Y NA
 5857825 5857826 E2348C_2692 E2348C_2693 eutD eutT TRUE 0.943 -3.000 0.095 1.000 N NA
 5857826 5857827 E2348C_2693 E2348C_2694 eutT eutQ TRUE 0.993 -3.000 0.214 NA Y NA
 5857827 5857828 E2348C_2694 E2348C_2695 eutQ eutP TRUE 0.957 -25.000 0.167 NA Y NA
 5857828 5857829 E2348C_2695 E2348C_2696 eutP eutS TRUE 0.973 13.000 0.000 1.000 Y NA
 5857829 5857830 E2348C_2696 E2348C_2697 eutS maeB FALSE 0.018 292.000 0.070 1.000 N NA
 5857831 5857832 E2348C_2698 E2348C_2699 talA tktB TRUE 0.993 20.000 0.739 1.000 Y NA
 5857833 5857834 E2348C_2700 E2348C_2701 ypfG nudK TRUE 0.537 126.000 0.333 NA   NA
 5857834 5857835 E2348C_2701 E2348C_2702 nudK aegA TRUE 0.478 68.000 0.167 1.000 N NA
 5857837 5857838 E2348C_2704 E2348C_2705     TRUE 0.987 4.000 0.000 1.000 Y NA
 5857839 5857840 E2348C_2706 E2348C_2707 acrD yffB FALSE 0.004 539.000 0.000 1.000 N NA
 5857840 5857841 E2348C_2707 E2348C_2708 yffB dapE TRUE 0.982 4.000 0.292 1.000 N NA
 5857841 5857842 E2348C_2708 E2348C_2709 dapE ypfN TRUE 0.534 28.000 0.025 NA   NA
 5857843 5857844 E2348C_2710 E2348C_2711 ypfH ypfI FALSE 0.250 74.000 0.000 NA   NA
 5857844 5857845 E2348C_2711 E2348C_2712 ypfI ypfJ TRUE 0.776 15.000 0.029 NA   NA
 5857845 5857846 E2348C_2712 E2348C_2713 ypfJ purC FALSE 0.060 168.000 0.006 NA   NA
 5857846 5857847 E2348C_2713 E2348C_2714 purC nlpB FALSE 0.017 213.000 0.019 NA N NA
 5857847 5857848 E2348C_2714 E2348C_2715 nlpB dapA TRUE 0.983 17.000 0.267 NA Y NA
 5857849 5857850 E2348C_2716 E2348C_2717 gcvR bcp TRUE 0.958 0.000 0.102 1.000 N NA
 5857852 5857853 E2348C_2719 E2348C_2720 yfgC yfgD TRUE 0.924 21.000 0.259 1.000   NA
 5857854 5857855 E2348C_2721 E2348C_2722 hda uraA FALSE 0.297 50.000 0.048 NA N NA
 5857855 5857856 E2348C_2722 E2348C_2723 uraA upp TRUE 0.730 86.000 0.101 1.000 Y NA
 5857857 5857858 E2348C_2724 E2348C_2725 purM purN TRUE 0.998 0.000 0.230 0.001 Y NA
 5857858 5857859 E2348C_2725 E2348C_2726 purN ppk FALSE 0.048 172.000 0.017 1.000 N NA
 5857859 5857860 E2348C_2726 E2348C_2727 ppk ppx TRUE 0.997 5.000 0.486 1.000 Y NA
 5857862 5857863 E2348C_2729 E2348C_2730 yfgG yfgH FALSE 0.013 314.000 0.000 NA   NA
 5857863 5857864 E2348C_2730 E2348C_2731 yfgH yfgI TRUE 0.946 16.000 0.273 NA   NA
 5857864 10800747 E2348C_2731 E2348C_PP10 yfgI   TRUE 0.486 40.000 0.000 NA   NA
 5857865 5857866 E2348C_2732 E2348C_2733     TRUE 0.573 -283.000 0.000 NA   NA
 5857866 5857867 E2348C_2733 E2348C_2734     FALSE 0.055 196.000 0.000 NA   NA
 5857867 5857868 E2348C_2734 E2348C_2735     TRUE 0.792 -10.000 0.000 NA   NA
 5857868 5857869 E2348C_2735 E2348C_2736     TRUE 0.974 -13.000 0.625 NA   NA
 5857870 5857871 E2348C_2737 E2348C_2738     FALSE 0.216 94.000 0.000 NA   NA
 5857874 5857875 E2348C_2741 E2348C_2742     TRUE 0.990 5.000 0.500 NA   NA
 5857875 5857876 E2348C_2742 E2348C_2743     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5857876 5857877 E2348C_2743 E2348C_2744     TRUE 0.849 13.000 0.000 NA   NA
 5857877 5857878 E2348C_2744 E2348C_2745     TRUE 0.980 0.000 0.200 NA   NA
 5857878 5857879 E2348C_2745 E2348C_2746     TRUE 0.987 0.000 0.300 NA   NA
 5857879 5857880 E2348C_2746 E2348C_2747     TRUE 0.987 0.000 0.300 NA   NA
 5857880 5857881 E2348C_2747 E2348C_2748     TRUE 0.980 0.000 0.200 NA   NA
 5857881 5857882 E2348C_2748 E2348C_2749     FALSE 0.371 52.000 0.000 NA   NA
 5857882 5857883 E2348C_2749 E2348C_2750     TRUE 0.885 11.000 0.000 NA   NA
 5857883 5857884 E2348C_2750 E2348C_2751     TRUE 0.857 52.000 0.545 NA   NA
 5857884 5857885 E2348C_2751 E2348C_2752     TRUE 0.983 15.000 0.667 NA   NA
 5857885 5857886 E2348C_2752 E2348C_2753     TRUE 0.812 15.000 0.000 NA   NA
 5857886 5857887 E2348C_2753 E2348C_2754     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5857887 5857888 E2348C_2754 E2348C_2755     TRUE 0.990 -3.000 0.500 NA   NA
 5857888 5857889 E2348C_2755 E2348C_2756     TRUE 0.939 15.000 0.214 NA   NA
 5857890 5857891 E2348C_ncR36 E2348C_2757     FALSE 0.045 207.000 0.000 NA   NA
 5857892 5857893 E2348C_2758 E2348C_2759     TRUE 0.922 -3.000 0.051 NA   NA
 5857893 5857894 E2348C_2759 E2348C_2760     FALSE 0.200 104.000 0.000 NA   NA
 5857894 5857895 E2348C_2760 E2348C_2761     FALSE 0.185 115.000 0.000 NA   NA
 5857895 5857896 E2348C_2761 E2348C_2762     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5857896 5857897 E2348C_2762 E2348C_2763     TRUE 0.885 11.000 0.000 NA   NA
 5857897 5857898 E2348C_2763 E2348C_2764     TRUE 0.627 -34.000 0.000 NA   NA
 5857898 5857899 E2348C_2764 E2348C_2765     TRUE 0.743 19.000 0.000 NA   NA
 5857899 5857900 E2348C_2765 E2348C_2766     FALSE 0.301 62.000 0.000 NA   NA
 5857900 5857901 E2348C_2766 E2348C_2767     FALSE 0.208 118.000 0.000 1.000   NA
 5857901 5857902 E2348C_2767 E2348C_2768     TRUE 0.467 42.000 0.000 NA   NA
 5857902 5857903 E2348C_2768 E2348C_2769     TRUE 0.791 16.000 0.000 NA   NA
 5857903 5857904 E2348C_2769 E2348C_2770     FALSE 0.124 148.000 0.000 NA   NA
 5857905 5857906 E2348C_2771 E2348C_2772     FALSE 0.034 225.000 0.000 NA   NA
 5857906 5857907 E2348C_2772 E2348C_2773     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5857907 5857908 E2348C_2773 E2348C_2774     TRUE 0.907 8.000 0.000 NA   NA
 5857908 5857909 E2348C_2774 E2348C_2775     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5857909 5857910 E2348C_2775 E2348C_2776     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5857910 5857911 E2348C_2776 E2348C_2777     FALSE 0.421 47.000 0.000 NA   NA
 5857911 5857912 E2348C_2777 E2348C_2778     FALSE 0.192 110.000 0.000 NA   NA
 5857912 5857913 E2348C_2778 E2348C_2779     FALSE 0.124 148.000 0.000 NA   NA
 5857913 5857914 E2348C_2779 E2348C_2780     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5857915 5857916 E2348C_2781 E2348C_2782   guaA FALSE 0.029 193.000 0.002 1.000 N NA
 5857916 5857917 E2348C_2782 E2348C_2783 guaA guaB TRUE 0.916 69.000 0.190 0.000 Y NA
 5857918 10800748 E2348C_2784 E2348C_IE4 xseA   FALSE 0.187 114.000 0.000 NA   NA
 5857919 5857920 E2348C_2785 E2348C_2786     TRUE 0.505 110.000 0.250 NA   NA
 5857920 5857921 E2348C_2786 E2348C_2787     TRUE 0.864 48.000 0.500 NA   NA
 5857921 5857922 E2348C_2787 E2348C_2788     FALSE 0.004 920.000 0.000 1.000   NA
 5857922 5857923 E2348C_2788 E2348C_2789     FALSE 0.006 507.000 0.000 1.000   NA
 5857923 5857924 E2348C_2789 E2348C_2790     TRUE 0.931 2.000 0.000 NA   NA
 5857924 5857925 E2348C_2790 E2348C_2791     FALSE 0.003 1346.000 0.000 NA   NA
 5857925 5857926 E2348C_2791 E2348C_2792     FALSE 0.360 53.000 0.000 NA   NA
 5857926 5857927 E2348C_2792 E2348C_2793     FALSE 0.229 87.000 0.000 NA   NA
 5857927 5857928 E2348C_2793 E2348C_2794   der FALSE 0.039 226.000 0.000 1.000   NA
 5857928 5857929 E2348C_2794 E2348C_2795 der yfgL TRUE 0.455 118.000 0.203 1.000   NA
 5857929 5857930 E2348C_2795 E2348C_2796 yfgL yfgM TRUE 0.987 11.000 0.492 1.000   NA
 5857930 5857931 E2348C_2796 E2348C_2797 yfgM hisS TRUE 0.939 18.000 0.259 1.000   NA
 5857931 5857932 E2348C_2797 E2348C_ncR37 hisS sroE TRUE 0.728 20.000 0.000 NA   NA
 5857932 5857933 E2348C_ncR37 E2348C_2798 sroE ispG TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5857933 5857934 E2348C_2798 E2348C_2799 ispG yfgA TRUE 0.878 27.000 0.233 1.000   NA
 5857934 5857935 E2348C_2799 E2348C_2800 yfgA yfgB FALSE 0.016 285.000 0.020 1.000   NA
 5857935 5857936 E2348C_2800 E2348C_2801 yfgB ndk FALSE 0.283 150.000 0.156 1.000   NA
 5857936 5857937 E2348C_2801 E2348C_2802 ndk pbpC FALSE 0.063 149.000 0.008 1.000 N NA
 5857937 5857938 E2348C_2802 E2348C_2803 pbpC yfhM TRUE 0.995 1.000 0.711 1.000   NA
 5857939 5857940 E2348C_2804 E2348C_ncR38 sseA ryfA FALSE 0.064 190.000 0.000 NA   NA
 5857941 5857942 E2348C_2805 E2348C_2806 sseB pepB FALSE 0.399 143.000 0.253 NA   NA
 5857942 5857943 E2348C_2806 E2348C_2807 pepB iscX TRUE 0.603 59.000 0.171 1.000   NA
 5857943 5857944 E2348C_2807 E2348C_2808 iscX fdx TRUE 0.989 12.000 0.625 1.000   NA
 5857944 5857945 E2348C_2808 E2348C_2809 fdx hscA TRUE 0.995 2.000 0.794 1.000 N NA
 5857945 5857946 E2348C_2809 E2348C_2810 hscA hscB TRUE 0.993 17.000 0.634 1.000 Y NA
 5857946 5857947 E2348C_2810 E2348C_2811 hscB iscA TRUE 0.728 96.000 0.500 1.000   NA
 5857947 5857948 E2348C_2811 E2348C_2812 iscA iscU TRUE 0.980 17.000 0.359 0.002   NA
 5857948 5857949 E2348C_2812 E2348C_2813 iscU iscS TRUE 0.917 28.000 0.448 1.000 N NA
 5857949 5857950 E2348C_2813 E2348C_2814 iscS iscR TRUE 0.617 112.000 0.424 1.000 N NA
 5857950 5857951 E2348C_2814 E2348C_2815 iscR trmJ FALSE 0.037 270.000 0.126 1.000 N NA
 5857952 5857953 E2348C_2816 E2348C_2817 suhB yfhR FALSE 0.106 145.000 0.003 1.000   NA
 5857953 5857954 E2348C_2817 E2348C_2818 yfhR csiE FALSE 0.074 191.000 0.000 1.000   NA
 5857957 5857958 E2348C_2821 E2348C_2822 yphB yphC TRUE 0.843 12.000 0.000 1.000 N NA
 5857958 5857959 E2348C_2822 E2348C_2823 yphC yphD FALSE 0.238 66.000 0.000 1.000 N NA
 5857959 5857960 E2348C_2823 E2348C_2824 yphD yphE TRUE 0.955 25.000 0.148 1.000 Y NA
 5857960 5857961 E2348C_2824 E2348C_2825 yphE yphF TRUE 0.959 23.000 0.161 NA Y NA
 5857961 5857962 E2348C_2825 E2348C_2826 yphF yphG FALSE 0.209 97.000 0.000 NA   NA
 5857966 5857967 E2348C_2830 E2348C_2831 glnB qseF TRUE 0.488 61.000 0.146 1.000 N NA
 5857967 5857968 E2348C_2831 E2348C_2832 qseF yfhG TRUE 0.755 -10.000 0.029 NA   NA
 5857968 5857969 E2348C_2832 E2348C_2833 yfhG qseE FALSE 0.080 165.000 0.029 NA   NA
 5857969 5857970 E2348C_2833 E2348C_ncR39 qseE sroF FALSE 0.301 62.000 0.000 NA   NA
 5857970 5857971 E2348C_ncR39 E2348C_2834 sroF purL FALSE 0.011 334.000 0.000 NA   NA
 5857973 5857974 E2348C_2836 E2348C_2837 tadA yfhB FALSE 0.285 58.000 0.062 NA N NA
 5857975 5857976 E2348C_2838 E2348C_2839 yfhH yfhL FALSE 0.365 56.000 0.056 NA   NA
 5857979 5857980 E2348C_2840 E2348C_2841 acpS pdxJ TRUE 0.987 0.000 0.326 1.000 N NA
 5857980 5857981 E2348C_2841 E2348C_2842 pdxJ recO TRUE 0.941 12.000 0.166 1.000 N NA
 5857981 5857982 E2348C_2842 E2348C_2843 recO era TRUE 0.936 12.000 0.109 1.000   NA
 5857982 5857983 E2348C_2843 E2348C_2844 era rnc TRUE 0.981 -3.000 0.127 0.037   NA
 5857983 5857984 E2348C_2844 E2348C_2845 rnc lepB FALSE 0.045 271.000 0.117 1.000   NA
 5857984 5857985 E2348C_2845 E2348C_2846 lepB lepA TRUE 0.931 16.000 0.187 1.000   NA
 5857985 5857986 E2348C_2846 E2348C_2847 lepA rseC FALSE 0.035 198.000 0.045 NA N NA
 5857986 5857987 E2348C_2847 E2348C_2848 rseC rseB TRUE 0.998 -3.000 0.609 NA Y NA
 5857987 5857988 E2348C_2848 E2348C_2849 rseB rseA TRUE 0.999 0.000 0.856 NA Y NA
 5857988 5857989 E2348C_2849 E2348C_2850 rseA rpoE TRUE 0.937 33.000 0.705 NA N NA
 5857998 5857999 E2348C_2859 E2348C_2860 trxC yfiP FALSE 0.366 69.000 0.084 NA   NA
 5857999 5858000 E2348C_2860 E2348C_2861 yfiP yfiQ TRUE 0.827 32.000 0.222 NA   NA
 5858000 5858001 E2348C_2861 E2348C_2862 yfiQ pssA FALSE 0.450 114.000 0.121 0.046 N NA
 5858001 5858002 E2348C_2862 E2348C_2863 pssA yfiM FALSE 0.304 97.000 0.089 NA   NA
 5858005 5858006 E2348C_rRNA4 E2348C_rRNA5 rrfG rrlG FALSE 0.206 99.000 0.000 NA   NA
 5858006 5858007 E2348C_rRNA5 E2348C_tRNA51 rrlG gltW FALSE 0.059 194.000 0.000 NA   NA
 5858007 5858008 E2348C_tRNA51 E2348C_rRNA6 gltW rrsG FALSE 0.230 86.000 0.000 NA   NA
 5858008 5858009 E2348C_rRNA6 E2348C_2866 rrsG clpB FALSE 0.006 442.000 0.000 NA   NA
 5858009 5858010 E2348C_2866 E2348C_ncR42 clpB ryfD TRUE 0.688 -20.000 0.000 NA   NA
 5858010 5858011 E2348C_ncR42 E2348C_2867 ryfD yfiH TRUE 0.907 8.000 0.000 NA   NA
 5858011 5858012 E2348C_2867 E2348C_2868 yfiH rluD TRUE 0.969 -3.000 0.168 NA   NA
 5858013 5858014 E2348C_2869 E2348C_2870 yfiO   FALSE 0.175 121.000 0.000 NA   NA
 5858014 5858015 E2348C_2870 E2348C_2871   raiA FALSE 0.022 262.000 0.000 NA   NA
 5858015 5858016 E2348C_2871 E2348C_2872 raiA pheL FALSE 0.200 104.000 0.000 NA   NA
 5858016 5858017 E2348C_2872 E2348C_2873 pheL pheA FALSE 0.206 99.000 0.000 NA   NA
 5858018 5858019 E2348C_2874 E2348C_2875 tyrA aroF TRUE 0.980 11.000 0.000 1.000 Y NA
 5858020 5858021 E2348C_2876 E2348C_2877 yfiL yfiR FALSE 0.260 148.000 0.148 NA   NA
 5858021 5858022 E2348C_2877 E2348C_2878 yfiR yfiN TRUE 0.970 -10.000 0.475 NA   NA
 5858022 5858023 E2348C_2878 E2348C_2879 yfiN yfiB TRUE 0.967 16.000 0.475 1.000 N NA
 5858023 10800749 E2348C_2879 E2348C_PP11 yfiB   FALSE 0.225 90.000 0.000 NA   NA
 5858024 5858025 E2348C_2880 E2348C_2881     TRUE 0.792 -10.000 0.000 NA   NA
 5858026 5858027 E2348C_2882 E2348C_2883     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5858028 5858029 E2348C_2884 E2348C_2885     TRUE 0.698 22.000 0.000 NA   NA
 5858030 5858031 E2348C_2886 E2348C_2887     FALSE 0.285 65.000 0.000 NA   NA
 5858031 5858032 E2348C_2887 E2348C_2888     TRUE 0.971 13.000 0.333 NA   NA
 5858032 5858033 E2348C_2888 E2348C_2889     TRUE 0.767 63.000 0.429 NA   NA
 5858033 5858034 E2348C_2889 E2348C_2890     FALSE 0.382 154.000 0.286 NA   NA
 5858034 5858035 E2348C_2890 E2348C_2891     TRUE 0.988 12.000 0.625 NA   NA
 5858035 5858036 E2348C_2891 E2348C_2892     TRUE 0.993 3.000 0.600 NA   NA
 5858036 5858037 E2348C_2892 E2348C_2893     FALSE 0.242 77.000 0.000 NA   NA
 5858038 5858039 E2348C_2894 E2348C_2895   rplS FALSE 0.046 206.000 0.000 NA   NA
 5858039 5858040 E2348C_2895 E2348C_2896 rplS trmD TRUE 0.971 42.000 0.567 1.000 Y NA
 5858040 5858041 E2348C_2896 E2348C_2897 trmD rimM TRUE 0.985 31.000 0.672 1.000 Y NA
 5858041 5858042 E2348C_2897 E2348C_2898 rimM rpsP TRUE 0.991 19.000 0.342 0.010 Y NA
 5858042 5858043 E2348C_2898 E2348C_2899 rpsP ffh TRUE 0.495 137.000 0.361 1.000 N NA
 5858044 5858045 E2348C_2900 E2348C_2901 ypjD yfjD TRUE 0.832 45.000 0.349 NA   NA
 5858047 5858048 E2348C_2903 E2348C_2904 nadK recN FALSE 0.432 86.000 0.170 1.000 N NA
 5858048 5858049 E2348C_2904 E2348C_2905 recN smpA FALSE 0.103 149.000 0.049 1.000 N NA
 5858050 5858051 E2348C_2906 E2348C_2907 yfjF yfjG TRUE 0.890 -10.000 0.124 NA   NA
 5858052 5858053 E2348C_2908 E2348C_ncR43 smpB ssrA FALSE 0.040 214.000 0.000 NA   NA
 5858053 10800750 E2348C_ncR43 E2348C_IE5 ssrA   TRUE 0.661 -26.000 0.000 NA   NA
 5858054 5858055 E2348C_2909 E2348C_2910     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5858058 5858059 E2348C_2913 E2348C_2914     FALSE 0.045 261.000 0.121 NA   NA
 5858060 5858061 E2348C_2915 E2348C_2916 espC   FALSE 0.005 570.000 0.000 NA   NA
 5858061 5858062 E2348C_2916 E2348C_2917     FALSE 0.238 79.000 0.000 NA   NA
 5858063 5858064 E2348C_2918 E2348C_2919     FALSE 0.003 1153.000 0.000 NA   NA
 5858066 5858067 E2348C_2921 E2348C_2922   csiD FALSE 0.014 308.000 0.000 NA   NA
 5858067 5858068 E2348C_2922 E2348C_2923 csiD ihgO TRUE 0.728 20.000 0.000 NA   NA
 5858068 5858069 E2348C_2923 E2348C_2924 ihgO gabD TRUE 0.719 23.000 0.000 1.000   NA
 5858069 5858070 E2348C_2924 E2348C_2925 gabD gabT TRUE 0.959 14.000 0.303 1.000 N NA
 5858070 5858071 E2348C_2925 E2348C_2926 gabT gabP FALSE 0.224 237.000 0.121 1.000 Y NA
 5858071 5858072 E2348C_2926 E2348C_2927 gabP csiR TRUE 0.965 21.000 0.625 1.000 N NA
 5858073 5858074 E2348C_2928 E2348C_2929 ygaU yqaE FALSE 0.225 84.000 0.027 1.000   NA
 5858075 5858076 E2348C_2930 E2348C_2931 ygaV ygaP TRUE 0.907 10.000 0.083 NA N NA
 5858082 5858083 E2348C_2937 E2348C_2938   nrdH FALSE 0.029 209.000 0.009 NA   NA
 5858083 5858084 E2348C_2938 E2348C_2939 nrdH nrdI TRUE 0.832 -3.000 0.026 NA N NA
 5858084 5858085 E2348C_2939 E2348C_2940 nrdI nrdE TRUE 0.917 -27.000 0.000 NA Y NA
 5858085 5858086 E2348C_2940 E2348C_2941 nrdE nrdF TRUE 0.992 10.000 0.000 0.001 Y NA
 5858086 5858087 E2348C_2941 E2348C_2942 nrdF proV FALSE 0.007 357.000 0.000 1.000 N NA
 5858087 5858088 E2348C_2942 E2348C_2943 proV proW TRUE 0.997 -7.000 0.630 0.080 Y NA
 5858088 5858089 E2348C_2943 E2348C_2944 proW proX TRUE 0.974 58.000 0.695 0.043 Y NA
 5858089 5858090 E2348C_2944 E2348C_2945 proX ygaY FALSE 0.013 449.000 0.174 NA N NA
 5858090 5858091 E2348C_2945 E2348C_2946 ygaY ygaZ FALSE 0.142 124.000 0.060 NA N NA
 5858091 5858092 E2348C_2946 E2348C_2947 ygaZ ygaH TRUE 0.986 -10.000 0.915 NA   NA
 5858092 5858093 E2348C_2947 E2348C_2948 ygaH mprA FALSE 0.266 91.000 0.065 NA   NA
 5858093 5858094 E2348C_2948 E2348C_2949 mprA emrA FALSE 0.240 127.000 0.107 1.000 N NA
 5858094 5858095 E2348C_2949 E2348C_2950 emrA emrB TRUE 0.983 17.000 0.875 1.000 N NA
 5858095 5858096 E2348C_2950 E2348C_2951 emrB   FALSE 0.023 258.000 0.000 NA   NA
 5858096 5858097 E2348C_2951 E2348C_2952     TRUE 0.986 -3.000 0.344 NA   NA
 5858097 5858098 E2348C_2952 E2348C_2953     FALSE 0.066 188.000 0.000 NA   NA
 5858099 5858100 E2348C_2954 E2348C_2955   luxS FALSE 0.049 193.000 0.000 1.000 N NA
 5858102 5858103 E2348C_2956 E2348C_2957 gshA yqaA FALSE 0.315 73.000 0.071 NA   NA
 5858103 5858104 E2348C_2957 E2348C_2958 yqaA yqaB TRUE 0.934 -3.000 0.067 NA   NA
 5858104 5858105 E2348C_2958 E2348C_tRNA52 yqaB argQ FALSE 0.124 148.000 0.000 NA   NA
 5858105 5858106 E2348C_tRNA52 E2348C_tRNA53 argQ argZ FALSE 0.292 64.000 0.000 NA   NA
 5858106 5858107 E2348C_tRNA53 E2348C_tRNA54 argZ argY FALSE 0.292 64.000 0.000 NA   NA
 5858107 5858108 E2348C_tRNA54 E2348C_tRNA55 argY argV FALSE 0.292 64.000 0.000 NA   NA
 5858108 5858109 E2348C_tRNA55 E2348C_tRNA56 argV serV TRUE 0.922 4.000 0.000 NA   NA
 5858109 5858110 E2348C_tRNA56 E2348C_2959 serV csrA FALSE 0.013 316.000 0.000 NA   NA
 5858110 5858111 E2348C_2959 E2348C_2960 csrA alaS FALSE 0.016 235.000 0.020 1.000 N NA
 5858111 5858112 E2348C_2960 E2348C_2961 alaS recX FALSE 0.255 129.000 0.085 1.000   NA
 5858112 5858113 E2348C_2961 E2348C_2962 recX recA TRUE 0.674 69.000 0.296 1.000   NA
 5858113 5858114 E2348C_2962 E2348C_2963 recA ygaD FALSE 0.322 80.000 0.082 NA   NA
 5858114 5858115 E2348C_2963 E2348C_2964 ygaD mltB FALSE 0.103 145.000 0.026 NA   NA
 5858118 5858119 E2348C_2967 E2348C_2968 norV norW TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5858119 5858120 E2348C_2968 E2348C_2969 norW   FALSE 0.069 185.000 0.000 NA   NA
 5858120 5858121 E2348C_2969 E2348C_2970     FALSE 0.198 105.000 0.000 NA   NA
 5858122 5858123 E2348C_2971 E2348C_2972     TRUE 0.791 16.000 0.000 NA   NA
 5858123 5858124 E2348C_2972 E2348C_2973     FALSE 0.018 282.000 0.000 NA   NA
 5858124 5858125 E2348C_2973 E2348C_2974     FALSE 0.041 213.000 0.000 NA   NA
 5858127 5858128 E2348C_2976 E2348C_2977 hypF hydN FALSE 0.113 153.000 0.000 NA   NA
 5858129 5858130 E2348C_2978 E2348C_2979     FALSE 0.318 138.000 0.000 0.013   NA
 5858130 5858131 E2348C_2979 E2348C_2980     FALSE 0.114 152.000 0.000 NA   NA
 5858132 5858133 E2348C_2981 E2348C_2982   hycI FALSE 0.004 475.000 0.000 1.000 N NA
 5858133 5858134 E2348C_2982 E2348C_2983 hycI hycH TRUE 0.971 -7.000 0.360 NA   NA
 5858134 5858135 E2348C_2983 E2348C_2984 hycH hycG TRUE 0.967 -3.000 0.156 NA   NA
 5858135 5858136 E2348C_2984 E2348C_2985 hycG hycF TRUE 0.993 0.000 0.111 1.000 Y NA
 5858136 5858137 E2348C_2985 E2348C_2986 hycF hycE TRUE 0.992 10.000 0.200 1.000 Y NA
 5858137 5858138 E2348C_2986 E2348C_2987 hycE hycD TRUE 0.981 18.000 0.235 1.000 Y NA
 5858138 5858139 E2348C_2987 E2348C_2988 hycD hycC TRUE 0.997 3.000 0.382 1.000 Y NA
 5858139 5858140 E2348C_2988 E2348C_2989 hycC hycB TRUE 0.992 -3.000 0.154 1.000 Y NA
 5858140 5858141 E2348C_2989 E2348C_2990 hycB hycA FALSE 0.168 125.000 0.000 NA   NA
 5858142 5858143 E2348C_2991 E2348C_2992 hypA hypB TRUE 0.994 4.000 0.306 0.001   NA
 5858143 5858144 E2348C_2992 E2348C_2993 hypB hypC TRUE 0.977 -9.000 0.139 NA Y NA
 5858144 5858145 E2348C_2993 E2348C_2994 hypC hypD TRUE 0.986 0.000 0.021 NA Y NA
 5858145 5858146 E2348C_2994 E2348C_2995 hypD hypE TRUE 0.959 39.000 0.353 1.000 Y NA
 5858146 5858147 E2348C_2995 E2348C_2996 hypE fhlA FALSE 0.152 74.000 0.019 1.000 N NA
 5858147 5858148 E2348C_2996 E2348C_2997 fhlA   TRUE 0.984 6.000 0.231 0.074 N NA
 5858150 5858151 E2348C_2999 E2348C_3000 mutS pphB FALSE 0.227 106.000 0.000 1.000   NA
 5858153 5858154 E2348C_3002 E2348C_3003 ygbJ ygbK TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5858154 5858155 E2348C_3003 E2348C_3004 ygbK ygbL TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5858155 5858156 E2348C_3004 E2348C_3005 ygbL ygbM TRUE 0.995 5.000 0.265 1.000 Y NA
 5858156 5858157 E2348C_3005 E2348C_3006 ygbM ygbN TRUE 0.762 89.000 0.143 1.000 Y NA
 5858158 5858159 E2348C_3007 E2348C_3008     TRUE 0.885 11.000 0.000 NA   NA
 5858159 5858160 E2348C_3008 E2348C_3009     TRUE 0.988 0.000 0.000 NA Y NA
 5858162 5858163 E2348C_3011 E2348C_3012 rpoS nlpD FALSE 0.297 63.000 0.000 NA   NA
 5858163 5858164 E2348C_3012 E2348C_3013 nlpD pcm FALSE 0.092 140.000 0.030 1.000 N NA
 5858164 5858165 E2348C_3013 E2348C_3014 pcm surE TRUE 0.977 -6.000 0.353 1.000   NA
 5858165 5858166 E2348C_3014 E2348C_3015 surE truD TRUE 0.911 -19.000 0.235 1.000   NA
 5858166 5858167 E2348C_3015 E2348C_3016 truD ispF TRUE 0.973 -3.000 0.173 1.000   NA
 5858167 5858168 E2348C_3016 E2348C_3017 ispF ispD TRUE 0.998 0.000 0.419 1.000 Y NA
 5858168 5858169 E2348C_3017 E2348C_3018 ispD ftsB TRUE 0.890 19.000 0.185 1.000 N NA
 5858169 5858170 E2348C_3018 E2348C_3019 ftsB ygbE FALSE 0.048 193.000 0.028 NA   NA
 5858170 5858171 E2348C_3019 E2348C_3020 ygbE cysC TRUE 0.681 50.000 0.198 NA   NA
 5858171 5858172 E2348C_3020 E2348C_3021 cysC cysN TRUE 0.997 0.000 0.340 1.000 Y NA
 5858172 5858173 E2348C_3021 E2348C_3022 cysN cysD TRUE 0.997 2.000 0.574 0.000 N NA
 5858174 5858175 E2348C_3023 E2348C_3024 iap   FALSE 0.012 339.000 0.000 1.000   NA
 5858176 5858177 E2348C_3025 E2348C_3026 cysH cysI FALSE 0.365 74.000 0.116 1.000 N NA
 5858177 5858178 E2348C_3026 E2348C_3027 cysI cysJ TRUE 0.999 0.000 0.791 0.000 Y NA
 5858179 5858180 E2348C_3028 E2348C_3029 sscR ygcN FALSE 0.141 78.000 0.014 1.000 N NA
 5858180 5858181 E2348C_3029 E2348C_3030 ygcN ygcO TRUE 0.956 -9.000 0.026 NA Y NA
 5858181 5858182 E2348C_3030 E2348C_3031 ygcO ygcP TRUE 0.608 17.000 0.026 NA N NA
 5858183 5858184 E2348C_3032 E2348C_3033 ygcQ ygcR TRUE 0.989 -3.000 0.102 NA Y NA
 5858184 5858185 E2348C_3033 E2348C_3034 ygcR ygcS TRUE 0.853 -22.000 0.182 1.000 N NA
 5858185 5858186 E2348C_3034 E2348C_3035 ygcS ygcU TRUE 0.513 94.000 0.250 1.000 N NA
 5858186 5858187 E2348C_3035 E2348C_3036 ygcU ygcW TRUE 0.834 70.000 0.500 0.022 N NA
 5858188 5858189 E2348C_3037 E2348C_3038 yqcE ygcE TRUE 0.560 27.000 0.058 NA N NA
 5858189 5858190 E2348C_3038 E2348C_3039 ygcE scrK FALSE 0.404 165.000 0.000 1.000 Y NA
 5858190 5858191 E2348C_3039 E2348C_3040 scrK scrY TRUE 0.549 168.000 0.167 1.000 Y NA
 5858191 5858192 E2348C_3040 E2348C_3041 scrY scrA TRUE 0.934 61.000 0.275 0.010 Y NA
 5858192 5858193 E2348C_3041 E2348C_3042 scrA scrB TRUE 0.998 0.000 0.475 1.000 Y NA
 5858193 5858194 E2348C_3042 E2348C_3043 scrB scrR TRUE 0.919 26.000 0.400 1.000 N NA
 5858197 5858198 E2348C_3046 E2348C_3047 eno pyrG FALSE 0.243 88.000 0.068 1.000 N NA
 5858198 5858199 E2348C_3047 E2348C_3048 pyrG mazG FALSE 0.030 228.000 0.025 1.000   NA
 5858199 5858200 E2348C_3048 E2348C_3049 mazG chpA FALSE 0.293 72.000 0.000 1.000   NA
 5858200 5858201 E2348C_3049 E2348C_3050 chpA chpR TRUE 0.998 0.000 0.531 NA Y NA
 5858201 5858202 E2348C_3050 E2348C_3051 chpR relA TRUE 0.646 78.000 0.000 NA Y NA
 5858202 5858203 E2348C_3051 E2348C_3052 relA rumA TRUE 0.475 48.000 0.082 1.000 N NA
 5858205 5858206 E2348C_3054 E2348C_3055 gudD gudX TRUE 0.973 21.000 0.000 0.000 Y NA
 5858206 5858207 E2348C_3055 E2348C_3056 gudX gudP TRUE 0.916 2.000 0.000 1.000 N NA
 5858207 5858208 E2348C_3056 E2348C_3057 gudP yqcA FALSE 0.005 434.000 0.000 1.000 N NA
 5858208 5858209 E2348C_3057 E2348C_3058 yqcA truC TRUE 0.907 18.000 0.209 1.000 N NA
 5858209 5858210 E2348C_3058 E2348C_3059 truC ygcC TRUE 0.993 0.000 0.518 NA   NA
 5858210 5858211 E2348C_3059 E2348C_ncR45 ygcC csrB FALSE 0.454 43.000 0.000 NA   NA
 5858211 5858212 E2348C_ncR45 E2348C_3060 csrB syd FALSE 0.037 220.000 0.000 NA   NA
 5858213 5858214 E2348C_3061 E2348C_3062 queF ygdH FALSE 0.254 112.000 0.079 NA   NA
 5858214 5858215 E2348C_3062 E2348C_3063 ygdH sdaC FALSE 0.005 557.000 0.000 NA   NA
 5858215 5858216 E2348C_3063 E2348C_3064 sdaC sdaB TRUE 0.755 58.000 0.000 1.000 Y NA
 5858216 5858217 E2348C_3064 E2348C_3065 sdaB xni TRUE 0.669 21.000 0.000 1.000 N NA
 5858218 5858219 E2348C_3066 E2348C_3067 fucO fucA TRUE 0.664 25.000 0.066 1.000 N NA
 5858220 5858221 E2348C_3068 E2348C_3069 fucP fucI TRUE 0.911 33.000 0.104 NA Y NA
 5858221 5858222 E2348C_3069 E2348C_3070 fucI fucK TRUE 0.850 79.000 0.269 1.000 Y NA
 5858222 5858223 E2348C_3070 E2348C_3071 fucK fucU TRUE 0.995 2.000 0.211 1.000 Y NA
 5858223 5858224 E2348C_3071 E2348C_3072 fucU fucR TRUE 0.909 58.000 0.308 1.000 Y NA
 5858225 5858226 E2348C_3073 E2348C_3074 ygdE ygdD TRUE 0.925 -7.000 0.144 NA   NA
 5858226 5858227 E2348C_3074 E2348C_3075 ygdD gcvA TRUE 0.815 19.000 0.081 NA   NA
 5858230 5858231 E2348C_3077 E2348C_3078 csdA ygdK TRUE 0.989 0.000 0.122 0.001   NA
 5858232 5858233 E2348C_3079 E2348C_3080 ygdL mltA FALSE 0.136 77.000 0.009 1.000 N NA
 5858234 5858235 E2348C_tRNA57 E2348C_tRNA58 metZ metW TRUE 0.540 34.000 0.000 NA   NA
 5858235 5858236 E2348C_tRNA58 E2348C_tRNA59 metW metV TRUE 0.540 34.000 0.000 NA   NA
 5858237 5858238 E2348C_3081 E2348C_3082     FALSE 0.219 72.000 0.000 1.000 N NA
 5858238 5858239 E2348C_3082 E2348C_3083     TRUE 0.929 3.000 0.062 1.000 N NA
 5858239 5858240 E2348C_3083 E2348C_3084     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5858240 5858241 E2348C_3084 E2348C_3085     TRUE 0.558 32.000 0.000 NA   NA
 5858241 5858242 E2348C_3085 E2348C_3086   amiC FALSE 0.061 201.000 0.000 1.000   NA
 5858244 5858245 E2348C_3088 E2348C_3089 recD recB TRUE 0.999 0.000 0.688 0.001 Y NA
 5858245 5858246 E2348C_3089 E2348C_3090 recB ptr TRUE 0.880 -7.000 0.092 1.000 N NA
 5858246 5858247 E2348C_3090 E2348C_3091 ptr recC FALSE 0.112 176.000 0.092 1.000 N NA
 5858247 5858248 E2348C_3091 E2348C_3092 recC ppdC TRUE 0.850 13.000 0.076 NA N NA
 5858248 5858249 E2348C_3092 E2348C_3093 ppdC ygdB TRUE 0.965 -15.000 0.538 NA   NA
 5858249 5858250 E2348C_3093 E2348C_3094 ygdB ppdB TRUE 0.987 -3.000 0.373 NA   NA
 5858250 5858251 E2348C_3094 E2348C_3095 ppdB ppdA TRUE 0.990 -9.000 0.368 NA Y NA
 5858251 5858252 E2348C_3095 E2348C_3096 ppdA thyA FALSE 0.028 185.000 0.016 NA N NA
 5858252 5858253 E2348C_3096 E2348C_3097 thyA lgt TRUE 0.960 7.000 0.164 1.000 N NA
 5858253 5858254 E2348C_3097 E2348C_3098 lgt ptsP FALSE 0.096 151.000 0.000 1.000 N NA
 5858254 5858255 E2348C_3098 E2348C_3099 ptsP nudH TRUE 0.732 13.000 0.008 1.000 N NA
 5858255 5858256 E2348C_3099 E2348C_3100 nudH ygdT FALSE 0.010 353.000 0.000 NA   NA
 5858257 5858258 E2348C_3101 E2348C_3102 mutH ygdQ FALSE 0.242 69.000 0.052 1.000 N NA
 5858258 5858259 E2348C_3102 E2348C_3103 ygdQ ygdR TRUE 0.562 138.000 0.429 NA   NA
 5858259 5858260 E2348C_3103 E2348C_3104 ygdR tas FALSE 0.188 108.000 0.043 NA   NA
 5858261 5858262 E2348C_3105 E2348C_3106 lplT aas TRUE 0.916 -7.000 0.124 NA   NA
 5858262 5858263 E2348C_3106 E2348C_ncR47 aas omrA FALSE 0.228 88.000 0.000 NA   NA
 5858263 5858264 E2348C_ncR47 E2348C_ncR48 omrA omrB FALSE 0.173 122.000 0.000 NA   NA
 5858268 5858269 E2348C_3110 E2348C_3111 ygeA araE FALSE 0.086 129.000 0.011 1.000 N NA
 5858269 5858270 E2348C_3111 E2348C_3112 araE   FALSE 0.017 300.000 0.000 1.000   NA
 5858270 5858271 E2348C_3112 E2348C_3113   kduD FALSE 0.060 202.000 0.000 1.000   NA
 5858271 5858272 E2348C_3113 E2348C_3114 kduD kduI TRUE 0.852 30.000 0.269 1.000 N NA
 5858272 5858273 E2348C_3114 E2348C_3115 kduI yqeF FALSE 0.014 287.000 0.000 1.000 N NA
 5858275 5858276 E2348C_tRNA60 E2348C_3117 glyU ygeR FALSE 0.238 79.000 0.000 NA   NA
 5858277 5858278 E2348C_3118 E2348C_3119 xdhA xdhB TRUE 0.998 11.000 0.500 0.000 Y NA
 5858278 5858279 E2348C_3119 E2348C_3120 xdhB xdhC TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.038 Y NA
 5858281 5858282 E2348C_3122 E2348C_3123 ygeW ygeX TRUE 0.897 58.000 0.265 1.000 Y NA
 5858282 5858283 E2348C_3123 E2348C_3124 ygeX ygeY TRUE 0.868 58.000 0.188 1.000 Y NA
 5858283 5858284 E2348C_3124 E2348C_3125 ygeY hyuA FALSE 0.323 53.000 0.050 1.000 N NA
 5858284 5858285 E2348C_3125 E2348C_3126 hyuA yqeA FALSE 0.311 48.000 0.031 1.000 N NA
 5858286 5858287 E2348C_3127 E2348C_3128 yqeB yqeC TRUE 0.589 48.000 0.119 NA   NA
 5858288 5858289 E2348C_3129 E2348C_3130 ygfJ ygfK FALSE 0.012 322.000 0.000 NA   NA
 5858291 5858292 E2348C_3132 E2348C_3133 ssnA ygfM FALSE 0.394 51.000 0.066 1.000 N NA
 5858292 5858293 E2348C_3133 E2348C_3134 ygfM xdhD TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5858293 5858294 E2348C_3134 E2348C_3135 xdhD ygfO FALSE 0.096 165.000 0.000 NA   NA
 5858294 5858295 E2348C_3135 E2348C_3136 ygfO guaD TRUE 0.953 18.000 0.000 1.000 Y NA
 5858295 5858296 E2348C_3136 E2348C_3137 guaD ygfQ TRUE 0.566 36.000 0.000 1.000   NA
 5858297 5858298 E2348C_3138 E2348C_3139 ygfS ygfT TRUE 0.993 0.000 0.333 0.009 N NA
 5858299 5858300 E2348C_3140 E2348C_3141 ygfU   TRUE 0.931 2.000 0.000 NA   NA
 5858300 5858301 E2348C_3141 E2348C_3142   idi FALSE 0.173 122.000 0.000 NA   NA
 5858302 5858303 E2348C_3143 E2348C_3144 lysS prfB TRUE 0.994 10.000 0.162 0.036 Y NA
 5858303 5858304 E2348C_3144 E2348C_3145 prfB recJ FALSE 0.151 91.000 0.028 1.000 N NA
 5858304 5858305 E2348C_3145 E2348C_3146 recJ dsbC TRUE 0.931 6.000 0.082 1.000 N NA
 5858305 5858306 E2348C_3146 E2348C_3147 dsbC xerD TRUE 0.699 25.000 0.079 1.000 N NA
 5858308 5858309 E2348C_3149 E2348C_3150 ygfX ygfY TRUE 0.735 -19.000 0.061 NA   NA
 5858311 5858312 E2348C_3152 E2348C_3153 yqfA yqfB FALSE 0.177 164.000 0.113 NA   NA
 5858314 5858315 E2348C_3155 E2348C_3156 gcvP gcvH TRUE 0.784 119.000 0.249 1.000 Y NA
 5858315 5858316 E2348C_3156 E2348C_3157 gcvH gcvT TRUE 0.989 24.000 0.317 0.001 Y NA
 5858316 5858317 E2348C_3157 E2348C_3158 gcvT visC FALSE 0.003 448.000 0.004 1.000 N NA
 5858317 5858318 E2348C_3158 E2348C_3159 visC ubiH TRUE 0.993 23.000 0.474 0.001 Y NA
 5858318 5858319 E2348C_3159 E2348C_3160 ubiH pepP TRUE 0.869 -3.000 0.026 1.000 N NA
 5858319 5858320 E2348C_3160 E2348C_3161 pepP ygfB TRUE 0.606 26.000 0.036 NA   NA
 5858321 5858322 E2348C_3162 E2348C_ncR49 zapA ssrS TRUE 0.467 42.000 0.000 NA   NA
 5858322 5858323 E2348C_ncR49 E2348C_3163 ssrS ygfA TRUE 0.698 22.000 0.000 NA   NA
 5858323 5858324 E2348C_3163 E2348C_ncR50 ygfA rygC FALSE 0.313 60.000 0.000 NA   NA
 5858325 5858326 E2348C_3164 E2348C_3165 serA rpiA FALSE 0.015 256.000 0.029 1.000 N NA
 5858327 5858328 E2348C_3166 E2348C_3167 argP scpA FALSE 0.048 204.000 0.000 NA   NA
 5858329 5858330 E2348C_3168 E2348C_3169 ygfI yggE FALSE 0.095 158.000 0.037 NA   NA
 5858330 5858331 E2348C_3169 E2348C_3170 yggE argO FALSE 0.283 93.000 0.075 NA   NA
 5858331 5858332 E2348C_3170 E2348C_3171 argO mscS FALSE 0.167 139.000 0.049 1.000   NA
 5858332 5858333 E2348C_3171 E2348C_3172 mscS fbaA FALSE 0.046 191.000 0.038 1.000 N NA
 5858333 5858334 E2348C_3172 E2348C_3173 fbaA pgk FALSE 0.350 214.000 0.056 0.006 Y NA
 5858334 5858335 E2348C_3173 E2348C_3174 pgk epd TRUE 0.901 50.000 0.070 0.006 Y NA
 5858336 5858337 E2348C_3175 E2348C_3176     TRUE 0.798 23.000 0.103 NA   NA
 5858337 5858338 E2348C_3176 E2348C_3177     TRUE 0.994 1.000 0.605 NA   NA
 5858338 5858339 E2348C_3177 E2348C_3178     TRUE 0.964 -12.000 0.093 NA Y NA
 5858339 5858340 E2348C_3178 E2348C_3179     TRUE 0.860 -6.000 0.000 NA   NA
 5858341 5858342 E2348C_3180 E2348C_3181 yggC yggD TRUE 0.990 -3.000 0.588 NA N NA
 5858342 5858343 E2348C_3181 E2348C_3182 yggD yggF TRUE 0.951 22.000 0.545 NA N NA
 5858343 5858344 E2348C_3182 E2348C_3183 yggF yggP TRUE 0.989 -3.000 0.500 1.000 N NA
 5858344 5858345 E2348C_3183 E2348C_3184 yggP cmtA TRUE 0.970 15.000 0.458 1.000 N NA
 5858345 5858346 E2348C_3184 E2348C_3185 cmtA cmtB TRUE 0.979 28.000 0.250 0.008 Y NA
 5858350 5858351 E2348C_3189 E2348C_3190 speB   FALSE 0.144 136.000 0.000 NA   NA
 5858351 5858352 E2348C_3190 E2348C_3191   speA FALSE 0.128 146.000 0.000 NA   NA
 5858352 5858353 E2348C_3191 E2348C_3192 speA yqgB TRUE 0.903 9.000 0.000 NA   NA
 5858356 5858357 E2348C_3195 E2348C_3196 metK galP FALSE 0.005 436.000 0.000 1.000 N NA
 5858357 5858358 E2348C_3196 E2348C_3197 galP yggI FALSE 0.233 77.000 0.042 NA   NA
 5858358 5858359 E2348C_3197 E2348C_3198 yggI endA TRUE 0.488 95.000 0.210 NA   NA
 5858359 5858360 E2348C_3198 E2348C_3199 endA rsmE TRUE 0.514 79.000 0.201 NA   NA
 5858360 5858361 E2348C_3199 E2348C_3200 rsmE gshB TRUE 0.943 13.000 0.173 NA   NA
 5858361 5858362 E2348C_3200 E2348C_3201 gshB yqgE FALSE 0.271 109.000 0.120 NA N NA
 5858362 5858363 E2348C_3201 E2348C_3202 yqgE yqgF TRUE 0.981 0.000 0.263 NA N NA
 5858365 5858366 E2348C_3204 E2348C_3205 yggS yggT TRUE 0.911 18.000 0.189 NA   NA
 5858366 5858367 E2348C_3205 E2348C_3206 yggT yggU TRUE 0.944 -3.000 0.081 NA   NA
 5858367 5858368 E2348C_3206 E2348C_3207 yggU rdgB TRUE 0.870 8.000 0.016 NA   NA
 5858368 5858369 E2348C_3207 E2348C_3208 rdgB rdgW TRUE 0.944 -7.000 0.218 1.000 N NA
 5858370 5858371 E2348C_3209 E2348C_3210 yggM ansB FALSE 0.136 117.000 0.018 NA   NA
 5858371 5858372 E2348C_3210 E2348C_3211 ansB yggN FALSE 0.064 176.000 0.027 NA   NA
 5858372 5858373 E2348C_3211 E2348C_3212 yggN yggL FALSE 0.167 184.000 0.155 NA   NA
 5858373 5858374 E2348C_3212 E2348C_3213 yggL trmI TRUE 0.961 0.000 0.092 NA   NA
 5858375 5858376 E2348C_3214 E2348C_3215 mutY yggX TRUE 0.746 28.000 0.150 NA N NA
 5858376 5858377 E2348C_3215 E2348C_3216 yggX mltC FALSE 0.398 65.000 0.128 NA N NA
 5858377 5858378 E2348C_3216 E2348C_3217 mltC nupG FALSE 0.057 202.000 0.056 NA   NA
 5858380 5858381 E2348C_3219 E2348C_tRNA61 yqgA pheV FALSE 0.197 106.000 0.000 NA   NA
 5858381 10800751 E2348C_tRNA61 E2348C_IE6 pheV   TRUE 0.737 -14.000 0.000 NA   NA
 10800751 5858382 E2348C_IE6 E2348C_3220     TRUE 0.561 -1477.000 0.000 NA   NA
 5858384 5858385 E2348C_3222 E2348C_3223     TRUE 0.985 -3.000 0.000 NA Y NA
 5858385 5858386 E2348C_3223 E2348C_3224     TRUE 0.728 20.000 0.000 NA   NA
 5858387 5858388 E2348C_3225 E2348C_3226     FALSE 0.209 97.000 0.000 NA   NA
 5858388 5858389 E2348C_3226 E2348C_3227     FALSE 0.195 108.000 0.000 NA   NA
 5858390 5858391 E2348C_3228 E2348C_3229     FALSE 0.010 353.000 0.000 NA   NA
 5858391 5858392 E2348C_3229 E2348C_3230     FALSE 0.044 208.000 0.000 NA   NA
 5858392 5858393 E2348C_3230 E2348C_3231     FALSE 0.004 609.000 0.000 NA   NA
 5858393 5858394 E2348C_3231 E2348C_3232     TRUE 0.899 49.000 0.667 NA   NA
 5858394 5858395 E2348C_3232 E2348C_3233     FALSE 0.011 336.000 0.000 NA   NA
 5858395 5858396 E2348C_3233 E2348C_3234     FALSE 0.004 651.000 0.000 NA   NA
 5858396 5858397 E2348C_3234 E2348C_3235     FALSE 0.086 172.000 0.000 NA   NA
 5858397 5858398 E2348C_3235 E2348C_3236     FALSE 0.152 132.000 0.000 NA   NA
 5858398 5858399 E2348C_3236 E2348C_3237     TRUE 0.985 -3.000 0.000 NA Y NA
 5858399 5858400 E2348C_3237 E2348C_3238     FALSE 0.198 213.000 0.000 NA Y NA
 5858400 5858401 E2348C_3238 E2348C_3239     FALSE 0.059 336.000 0.000 NA Y NA
 5858402 5858403 E2348C_3240 E2348C_3241 gspM gspL TRUE 0.999 2.000 0.811 1.000 Y NA
 5858403 5858404 E2348C_3241 E2348C_3242 gspL gspK TRUE 0.998 6.000 0.537 0.065 Y NA
 5858404 5858405 E2348C_3242 E2348C_3243 gspK gspJ TRUE 0.997 -3.000 0.461 1.000 Y NA
 5858405 5858406 E2348C_3243 E2348C_3244 gspJ gspI TRUE 0.996 -3.000 0.569 0.002   NA
 5858406 5858407 E2348C_3244 E2348C_3245 gspI gspH TRUE 0.996 -3.000 0.605 0.002   NA
 5858407 5858408 E2348C_3245 E2348C_3246 gspH gspG TRUE 0.995 4.000 0.425 0.002   NA
 5858408 5858409 E2348C_3246 E2348C_3247 gspG gspF TRUE 0.996 17.000 0.599 0.002 Y NA
 5858409 5858410 E2348C_3247 E2348C_3248 gspF gspE TRUE 0.999 0.000 0.653 0.002 Y NA
 5858410 5858411 E2348C_3248 E2348C_3249 gspE gspD TRUE 0.999 0.000 0.776 0.002 Y NA
 5858411 5858412 E2348C_3249 E2348C_3250 gspD gspC TRUE 0.990 30.000 0.575 0.002 Y NA
 5858412 5858413 E2348C_3250 E2348C_3251 gspC yghG TRUE 0.759 18.000 0.000 NA   NA
 5858413 5858414 E2348C_3251 E2348C_3252 yghG pppA FALSE 0.279 66.000 0.000 NA   NA
 5858414 5858415 E2348C_3252 E2348C_3253 pppA yghJ FALSE 0.057 195.000 0.000 NA   NA
 5858415 5858416 E2348C_3253 E2348C_3254 yghJ glcA FALSE 0.005 486.000 0.000 NA   NA
 5858418 5858419 E2348C_3255 E2348C_3256 glcB glcG TRUE 0.712 22.000 0.052 NA   NA
 5858419 5858420 E2348C_3256 E2348C_3257 glcG glcF TRUE 0.927 5.000 0.057 NA   NA
 5858420 5858421 E2348C_3257 E2348C_3258 glcF glcE TRUE 0.990 11.000 0.074 0.021 Y NA
 5858421 5858422 E2348C_3258 E2348C_3259 glcE glcD TRUE 0.995 0.000 0.070 0.007 Y NA
 5858425 5858426 E2348C_3262 E2348C_3263     TRUE 0.943 -3.000 0.096 1.000 N NA
 5858426 5858427 E2348C_3263 E2348C_3264     TRUE 0.648 32.000 0.064 1.000   NA
 5858427 5858428 E2348C_3264 E2348C_3265     TRUE 0.966 0.000 0.091 1.000   NA
 5858429 5858430 E2348C_3266 E2348C_3267     TRUE 0.996 -3.000 0.631 0.065   NA
 5858430 5858431 E2348C_3267 E2348C_3268     TRUE 0.583 30.000 0.000 NA   NA
 5858431 5858432 E2348C_3268 E2348C_3269     TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 5858432 5858433 E2348C_3269 E2348C_3270   yghQ TRUE 0.995 0.000 0.667 NA   NA
 5858433 5858434 E2348C_3270 E2348C_3271 yghQ yghR TRUE 0.910 46.000 0.667 NA   NA
 5858434 5858435 E2348C_3271 E2348C_3272 yghR yghS TRUE 0.558 32.000 0.000 NA   NA
 5858437 5858438 E2348C_3274 E2348C_3275 pitB gsp FALSE 0.013 291.000 0.000 1.000 N NA
 5858440 5858441 E2348C_3277 E2348C_3278 hybG hybF TRUE 0.849 13.000 0.000 NA   NA
 5858441 5858442 E2348C_3278 E2348C_3279 hybF hybE TRUE 0.850 -7.000 0.055 NA   NA
 5858442 5858443 E2348C_3279 E2348C_3280 hybE hybD TRUE 0.962 -7.000 0.291 NA   NA
 5858443 5858444 E2348C_3280 E2348C_3281 hybD hybC TRUE 0.999 0.000 0.828 1.000 Y NA
 5858444 5858445 E2348C_3281 E2348C_3282 hybC hybB TRUE 0.985 -3.000 0.000 NA Y NA
 5858445 5858446 E2348C_3282 E2348C_3283 hybB hybA TRUE 0.957 -10.000 0.000 NA Y NA
 5858446 5858447 E2348C_3283 E2348C_3284 hybA hybO TRUE 0.998 3.000 0.615 NA Y NA
 5858447 5858448 E2348C_3284 E2348C_3285 hybO yghW FALSE 0.092 189.000 0.077 NA   NA
 5858448 5858449 E2348C_3285 E2348C_3286 yghW yghX FALSE 0.131 119.000 0.017 NA   NA
 5858450 5858451 E2348C_3287 E2348C_3288 yghZ   FALSE 0.371 52.000 0.000 NA   NA
 5858451 5858452 E2348C_3288 E2348C_3289     FALSE 0.441 102.000 0.167 1.000   NA
 5858455 5858456 E2348C_3292 E2348C_3293 exbD exbB TRUE 0.999 7.000 0.810 0.053 Y NA
 5858457 5858458 E2348C_3294 E2348C_3295 metC yghB FALSE 0.361 140.000 0.212 NA   NA
 5858460 5858461 E2348C_3297 E2348C_3298 yqhD dkgA TRUE 0.481 105.000 0.200 1.000   NA
 5858461 5858462 E2348C_3298 E2348C_3299 dkgA yqhG FALSE 0.075 200.000 0.080 NA   NA
 5858462 5858463 E2348C_3299 E2348C_3300 yqhG yqhH FALSE 0.382 51.000 0.000 NA   NA
 5858465 5858466 E2348C_3302 E2348C_3303     FALSE 0.010 323.000 0.000 1.000 N NA
 5858466 5858467 E2348C_3303 E2348C_3304     TRUE 0.952 -3.000 0.027 0.021 N NA
 5858467 5858468 E2348C_3304 E2348C_3305     TRUE 0.823 11.000 0.027 1.000 N NA
 5858468 5858469 E2348C_3305 E2348C_3306     FALSE 0.216 73.000 0.000 1.000 N NA
 5858469 5858470 E2348C_3306 E2348C_3307     TRUE 0.982 42.000 1.000 NA Y NA
 5858470 5858471 E2348C_3307 E2348C_3308     TRUE 0.998 11.000 1.000 NA Y NA
 5858472 5858473 E2348C_3309 E2348C_3310 sufI plsC FALSE 0.426 75.000 0.154 1.000 N NA
 5858473 5858474 E2348C_3310 E2348C_3311 plsC parC FALSE 0.023 235.000 0.043 1.000 N NA
 5858474 5858475 E2348C_3311 E2348C_3312 parC ygiS FALSE 0.118 138.000 0.000 1.000 N NA
 5858475 5858476 E2348C_3312 E2348C_3313 ygiS ygiV FALSE 0.134 109.000 0.000 NA N NA
 5858476 5858477 E2348C_3313 E2348C_3314 ygiV ygiW FALSE 0.380 53.000 0.053 NA   NA
 5858478 5858479 E2348C_3315 E2348C_3316 qseB qseC TRUE 0.997 -3.000 0.526 1.000 Y NA
 5858479 5858480 E2348C_3316 E2348C_3317 qseC mdaB FALSE 0.200 110.000 0.035 1.000   NA
 5858480 5858481 E2348C_3317 E2348C_3318 mdaB ygiN TRUE 0.755 31.000 0.025 0.021   NA
 5858482 5858483 E2348C_3319 E2348C_3320     TRUE 0.976 -3.000 0.242 1.000 N NA
 5858483 5858484 E2348C_3320 E2348C_3321     TRUE 0.989 11.000 0.156 1.000 Y NA
 5858484 5858485 E2348C_3321 E2348C_3322     TRUE 0.996 -3.000 0.182 0.042 Y NA
 5858485 5858486 E2348C_3322 E2348C_3323     TRUE 0.999 -3.000 0.857 1.000 Y NA
 5858488 5858489 E2348C_3325 E2348C_3326 parE yqiA TRUE 0.842 29.000 0.217 NA   NA
 5858489 5858490 E2348C_3326 E2348C_3327 yqiA cpdA TRUE 0.991 0.000 0.427 NA   NA
 5858490 5858491 E2348C_3327 E2348C_3328 cpdA yqiB TRUE 0.937 25.000 0.433 NA   NA
 5858491 5858492 E2348C_3328 E2348C_3329 yqiB nudF TRUE 0.991 1.000 0.443 NA   NA
 5858493 5858494 E2348C_3330 E2348C_3331 tolC   TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5858494 5858495 E2348C_3331 E2348C_3332   ygiB TRUE 0.682 -112.000 0.080 NA   NA
 5858495 5858496 E2348C_3332 E2348C_3333 ygiB ygiC TRUE 0.992 6.000 0.632 NA   NA
 5858496 5858497 E2348C_3333 E2348C_3334 ygiC   FALSE 0.005 485.000 0.000 NA   NA
 5858497 5858498 E2348C_3334 E2348C_3335     TRUE 0.969 18.000 0.500 1.000   NA
 5858498 5858499 E2348C_3335 E2348C_3336     TRUE 0.984 15.000 0.375 0.003   NA
 5858502 5858503 E2348C_3339 E2348C_3340   ribB FALSE 0.022 262.000 0.000 NA   NA
 5858503 5858504 E2348C_3340 E2348C_ncR52 ribB   FALSE 0.200 104.000 0.000 NA   NA
 5858507 5858508 E2348C_3343 E2348C_3344 yqiJ yqiK TRUE 0.953 27.000 0.641 NA   NA
 5858509 5858510 E2348C_ncR53 E2348C_3345 rygD rfaE FALSE 0.237 80.000 0.000 NA   NA
 5858510 5858511 E2348C_3345 E2348C_3346 rfaE glnE TRUE 0.476 48.000 0.083 1.000 N NA
 5858511 5858512 E2348C_3346 E2348C_3347 glnE ygiF TRUE 0.734 23.000 0.053 1.000   NA
 5858513 5858514 E2348C_3348 E2348C_3349 htrG cca FALSE 0.366 64.000 0.106 NA N NA
 5858515 5858516 E2348C_3350 E2348C_3351 bacA folB FALSE 0.355 91.000 0.128 1.000 N NA
 5858519 5858520 E2348C_3354 E2348C_3355 ttdA ttdB TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.000 Y NA
 5858520 5858521 E2348C_3355 E2348C_3356 ttdB ttdT FALSE 0.329 48.000 0.037 1.000 N NA
 5858523 5858524 E2348C_3358 E2348C_3359 rpsU dnaG FALSE 0.202 111.000 0.067 1.000 N NA
 5858524 5858525 E2348C_3359 E2348C_3360 dnaG rpoD FALSE 0.219 195.000 0.299 1.000 N NA
 5858525 5858526 E2348C_3360 E2348C_3361 rpoD   FALSE 0.318 59.000 0.000 NA   NA
 5858534 5858535 E2348C_3368 E2348C_3369 ebgR ebgA FALSE 0.133 184.000 0.136 1.000 N NA
 5858535 5858536 E2348C_3369 E2348C_3370 ebgA ebgC TRUE 0.998 -3.000 0.682 NA Y NA
 5858536 5858537 E2348C_3370 E2348C_3371 ebgC ygjI TRUE 0.722 63.000 0.412 NA N NA
 5858537 5858538 E2348C_3371 E2348C_3372 ygjI ygjJ FALSE 0.148 134.000 0.000 NA   NA
 5858538 5858539 E2348C_3372 E2348C_3373 ygjJ ygjK TRUE 0.774 17.000 0.000 NA   NA
 5858539 5858540 E2348C_3373 E2348C_3374 ygjK fadH FALSE 0.014 324.000 0.000 1.000   NA
 5858541 5858542 E2348C_3375 E2348C_3376 ygjM rlmG FALSE 0.016 271.000 0.000 1.000 N NA
 5858543 5858544 E2348C_3377 E2348C_3378 ygjP ygjQ FALSE 0.186 77.000 0.019 NA   NA
 5858544 5858545 E2348C_3378 E2348C_3379 ygjQ ygjR FALSE 0.183 79.000 0.019 NA   NA
 5858545 5858546 E2348C_3379 E2348C_ncR54 ygjR psrN FALSE 0.242 77.000 0.000 NA   NA
 5858546 5858547 E2348C_ncR54 E2348C_3380 psrN alx TRUE 0.743 19.000 0.000 NA   NA
 5858547 5858548 E2348C_3380 E2348C_3381 alx   FALSE 0.034 237.000 0.000 1.000   NA
 5858548 5858549 E2348C_3381 E2348C_3382   sstT FALSE 0.023 274.000 0.000 1.000   NA
 5858550 5858551 E2348C_3383 E2348C_3384 ygjV uxaA FALSE 0.399 83.000 0.126 NA   NA
 5858551 5858552 E2348C_3384 E2348C_3385 uxaA uxaC TRUE 0.974 15.000 0.092 1.000 Y NA
 5858553 5858554 E2348C_3386 E2348C_3387 exuT exuR TRUE 0.569 130.000 0.433 1.000 N NA
 5858554 5858555 E2348C_3387 E2348C_3388 exuR yqjA FALSE 0.010 345.000 0.000 NA   NA
 5858555 5858556 E2348C_3388 E2348C_3389 yqjA yqjB TRUE 0.991 4.000 0.529 NA   NA
 5858556 5858557 E2348C_3389 E2348C_3390 yqjB yqjC TRUE 0.672 147.000 0.684 NA   NA
 5858557 5858558 E2348C_3390 E2348C_3391 yqjC yqjD TRUE 0.922 38.000 0.609 NA   NA
 5858558 5858559 E2348C_3391 E2348C_3392 yqjD yqjE TRUE 0.976 3.000 0.185 NA   NA
 5858559 5858560 E2348C_3392 E2348C_3393 yqjE yqjK TRUE 0.923 -10.000 0.185 NA   NA
 5858560 5858561 E2348C_3393 E2348C_3394 yqjK yqjF FALSE 0.163 187.000 0.161 NA   NA
 5858561 5858562 E2348C_3394 E2348C_3395 yqjF yqjG FALSE 0.264 70.000 0.000 NA   NA
 5858562 5858563 E2348C_3395 E2348C_3396 yqjG yhaH FALSE 0.018 283.000 0.000 NA   NA
 5858565 5858566 E2348C_3398 E2348C_3399 yhaK yhaL TRUE 0.577 23.000 0.005 NA   NA
 5858567 5858568 E2348C_3400 E2348C_3401 yhaM yhaO TRUE 0.800 28.000 0.157 NA   NA
 5858568 5858569 E2348C_3401 E2348C_3402 yhaO tdcG FALSE 0.110 278.000 0.000 1.000 Y NA
 5858569 5858570 E2348C_3402 E2348C_3403 tdcG tdcF FALSE 0.401 72.000 0.150 NA N NA
 5858570 5858571 E2348C_3403 E2348C_3404 tdcF tdcE TRUE 0.760 14.000 0.000 NA N NA
 5858571 5858572 E2348C_3404 E2348C_3405 tdcE tdcD TRUE 0.957 34.000 0.286 1.000 Y NA
 5858572 5858573 E2348C_3405 E2348C_3406 tdcD tdcC TRUE 0.893 26.000 0.308 1.000 N NA
 5858573 5858574 E2348C_3406 E2348C_3407 tdcC tdcB TRUE 0.930 22.000 0.029 1.000 Y NA
 5858574 5858575 E2348C_3407 E2348C_3408 tdcB tdcA FALSE 0.131 99.000 0.023 1.000 N NA
 5858577 5858578 E2348C_ncR55 E2348C_3410 rnpB garK TRUE 0.549 33.000 0.000 NA   NA
 5858578 5858579 E2348C_3410 E2348C_3411 garK garR FALSE 0.371 97.000 0.152 1.000 N NA
 5858579 5858580 E2348C_3411 E2348C_3412 garR garL TRUE 0.906 30.000 0.424 1.000 N NA
 5858580 5858581 E2348C_3412 E2348C_3413 garL garP TRUE 0.976 16.000 0.143 1.000 Y NA
 5858584 5858585 E2348C_3416 E2348C_3417 kbaZ agaV TRUE 0.976 23.000 0.280 1.000 Y NA
 5858585 5858586 E2348C_3417 E2348C_3418 agaV agaW TRUE 0.999 11.000 0.905 0.013 Y NA
 5858586 5858587 E2348C_3418 E2348C_3419 agaW   TRUE 0.996 -10.000 0.619 0.013 Y NA
 5858587 5858588 E2348C_3419 E2348C_3420     TRUE 0.996 18.000 0.692 0.013 Y NA
 5858588 5858589 E2348C_3420 E2348C_3421   agaA TRUE 0.990 -3.000 0.104 1.000 Y NA
 5858589 5858590 E2348C_3421 E2348C_3422 agaA agaS FALSE 0.008 349.000 0.000 1.000 N NA
 5858590 5858591 E2348C_3422 E2348C_3423 agaS kbaY TRUE 0.973 13.000 0.391 1.000 N NA
 5858591 5858592 E2348C_3423 E2348C_3424 kbaY agaB TRUE 0.459 167.000 0.087 1.000 Y NA
 5858592 5858593 E2348C_3424 E2348C_3425 agaB agaC TRUE 0.974 39.000 0.333 0.013 Y NA
 5858593 5858594 E2348C_3425 E2348C_3426 agaC agaD TRUE 0.995 -10.000 0.444 0.013 Y NA
 5858594 5858595 E2348C_3426 E2348C_3427 agaD agaI TRUE 0.807 55.000 0.080 1.000 Y NA
 5858597 5858598 E2348C_3429 E2348C_3430 yraM yraN TRUE 0.841 -42.000 0.172 1.000   NA
 5858598 5858599 E2348C_3430 E2348C_3431 yraN diaA TRUE 0.884 20.000 0.187 1.000 N NA
 5858599 5858600 E2348C_3431 E2348C_3432 diaA yraP TRUE 0.990 10.000 0.613 NA   NA
 5858601 5858602 E2348C_3433 E2348C_3434 yraQ yraR FALSE 0.253 73.000 0.045 NA   NA
 5858602 5858603 E2348C_3434 E2348C_3435 yraR yhbP TRUE 0.499 42.000 0.056 NA   NA
 5858605 5858606 E2348C_3437 E2348C_3438 yhbS yhbT TRUE 0.972 -6.000 0.295 1.000   NA
 5858607 5858608 E2348C_3439 E2348C_3440 yhbU yhbV TRUE 0.999 9.000 0.948 0.003 Y NA
 5858608 5858609 E2348C_3440 E2348C_3441 yhbV yhbW FALSE 0.154 81.000 0.041 NA N NA
 5858610 5858611 E2348C_3442 E2348C_3443 mtr deaD FALSE 0.059 154.000 0.009 1.000 N NA
 5858611 5858612 E2348C_3443 E2348C_3444 deaD nlpI FALSE 0.096 180.000 0.053 1.000   NA
 5858612 5858613 E2348C_3444 E2348C_3445 nlpI pnp FALSE 0.275 109.000 0.071 1.000   NA
 5858615 5858616 E2348C_3446 E2348C_ncR57 rpsO   TRUE 0.607 -56.000 0.000 NA   NA
 5858616 5858617 E2348C_ncR57 E2348C_3447   truB FALSE 0.223 91.000 0.000 NA   NA
 5858617 5858618 E2348C_3447 E2348C_3448 truB rbfA TRUE 0.997 0.000 0.318 1.000 Y NA
 5858618 5858619 E2348C_3448 E2348C_3449 rbfA infB TRUE 0.793 164.000 0.530 1.000 Y NA
 5858619 5858620 E2348C_3449 E2348C_3450 infB nusA TRUE 0.912 25.000 0.342 1.000 N NA
 5858620 5858621 E2348C_3450 E2348C_3451 nusA yhbC TRUE 0.959 28.000 0.759 NA   NA
 5858621 5858622 E2348C_3451 E2348C_tRNA63 yhbC metY FALSE 0.028 237.000 0.000 NA   NA
 5858624 5858625 E2348C_3453 E2348C_tRNA64 yhbX leuU FALSE 0.006 457.000 0.000 NA   NA
 5858625 5858626 E2348C_tRNA64 E2348C_3454 leuU secG TRUE 0.812 15.000 0.000 NA   NA
 5858626 5858627 E2348C_3454 E2348C_3455 secG glmM FALSE 0.017 228.000 0.016 1.000 N NA
 5858627 5858628 E2348C_3455 E2348C_3456 glmM folP TRUE 0.953 -7.000 0.260 1.000 N NA
 5858628 5858629 E2348C_3456 E2348C_3457 folP hflB TRUE 0.596 90.000 0.325 1.000 N NA
 5858629 5858630 E2348C_3457 E2348C_3458 hflB rrmJ FALSE 0.364 100.000 0.152 1.000 N NA
 5858634 5858635 E2348C_3462 E2348C_3463 obgE yhbE TRUE 0.764 16.000 0.015 1.000   NA
 5858635 5858636 E2348C_3463 E2348C_3464 yhbE rpmA FALSE 0.147 127.000 0.019 1.000   NA
 5858636 5858637 E2348C_3464 E2348C_3465 rpmA rplU TRUE 0.995 21.000 0.667 0.009 Y NA
 5858638 5858639 E2348C_3466 E2348C_3467 ispB sfsB FALSE 0.024 234.000 0.000 1.000 N NA
 5858640 5858641 E2348C_3468 E2348C_3469 murA yrbA TRUE 0.649 55.000 0.258 NA N NA
 5858641 5858642 E2348C_3469 E2348C_3470 yrbA yrbB TRUE 0.483 160.000 0.453 NA   NA
 5858642 5858643 E2348C_3470 E2348C_3471 yrbB yrbC TRUE 0.987 0.000 0.308 NA   NA
 5858643 5858644 E2348C_3471 E2348C_3472 yrbC yrbD TRUE 0.903 19.000 0.188 NA   NA
 5858644 5858645 E2348C_3472 E2348C_3473 yrbD yrbE TRUE 0.991 5.000 0.562 NA   NA
 5858645 5858646 E2348C_3473 E2348C_3474 yrbE yrbF TRUE 0.997 8.000 0.530 NA Y NA
 5858647 5858648 E2348C_3475 E2348C_3476 yrbG kdsD TRUE 0.944 14.000 0.226 1.000 N NA
 5858648 5858649 E2348C_3476 E2348C_3477 kdsD kdsC TRUE 0.968 21.000 0.598 1.000   NA
 5858649 5858650 E2348C_3477 E2348C_3478 kdsC yrbK TRUE 0.992 -3.000 0.617 NA   NA
 5858650 5858651 E2348C_3478 E2348C_3479 yrbK lptA TRUE 0.935 -31.000 0.459 NA   NA
 5858651 5858652 E2348C_3479 E2348C_3480 lptA lptB TRUE 0.990 7.000 0.543 NA   NA
 5858652 5858653 E2348C_3480 E2348C_3481 lptB rpoN TRUE 0.681 48.000 0.163 1.000   NA
 5858653 5858654 E2348C_3481 E2348C_3482 rpoN hpf TRUE 0.968 23.000 0.820 NA N NA
 5858654 5858655 E2348C_3482 E2348C_3483 hpf ptsN TRUE 0.734 118.000 0.728 NA N NA
 5858655 5858656 E2348C_3483 E2348C_3484 ptsN yhbJ TRUE 0.706 46.000 0.186 NA   NA
 5858656 5858657 E2348C_3484 E2348C_3485 yhbJ npr TRUE 0.972 -3.000 0.182 NA   NA
 5858657 5858658 E2348C_3485 E2348C_3486 npr yrbL FALSE 0.027 213.000 0.007 NA   NA
 5858659 5858660 E2348C_3487 E2348C_3488 mtgA elbB TRUE 0.934 -3.000 0.066 NA   NA
 5858662 5858663 E2348C_3489 E2348C_3490 arcB yhcC FALSE 0.376 96.000 0.113 1.000   NA
 5858664 5858665 E2348C_3491 E2348C_3492 gltB gltD TRUE 0.991 13.000 0.096 0.000 Y NA
 5858666 5858667 E2348C_3493 E2348C_3494 yhcH nanK TRUE 0.985 -3.000 0.000 NA Y NA
 5858667 5858668 E2348C_3494 E2348C_3495 nanK nanE TRUE 0.986 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5858668 5858669 E2348C_3495 E2348C_3496 nanE nanT TRUE 0.816 48.000 0.000 1.000 Y NA
 5858669 5858670 E2348C_3496 E2348C_3497 nanT nanA TRUE 0.544 109.000 0.318 1.000 N NA
 5858670 5858671 E2348C_3497 E2348C_3498 nanA nanR FALSE 0.230 122.000 0.091 1.000 N NA
 5858671 5858672 E2348C_3498 E2348C_3499 nanR sspB FALSE 0.137 108.000 0.009 NA   NA
 5858672 5858673 E2348C_3499 E2348C_3500 sspB sspA TRUE 0.994 6.000 0.831 NA   NA
 5858673 5858674 E2348C_3500 E2348C_3501 sspA rpsI FALSE 0.003 395.000 0.014 NA N NA
 5858674 5858675 E2348C_3501 E2348C_3502 rpsI rplM TRUE 0.996 16.000 0.601 0.009 Y NA
 5858675 5858676 E2348C_3502 E2348C_3503 rplM yhcM FALSE 0.023 220.000 0.003 NA   NA
 5858677 5858678 E2348C_3504 E2348C_3505 yhcB degQ FALSE 0.245 154.000 0.154 NA   NA
 5858678 5858679 E2348C_3505 E2348C_3506 degQ degS TRUE 0.909 90.000 0.262 0.002 Y NA
 5858681 5858682 E2348C_3508 E2348C_3509 argR yhcN FALSE 0.009 364.000 0.000 NA   NA
 5858683 5858684 E2348C_3510 E2348C_3511 yhcO aaeB FALSE 0.183 92.000 0.027 NA   NA
 5858684 5858685 E2348C_3511 E2348C_3512 aaeB aaeA TRUE 0.993 6.000 0.667 NA   NA
 5858685 5858686 E2348C_3512 E2348C_3513 aaeA aaeX TRUE 0.946 8.000 0.100 NA   NA
 5858687 5858688 E2348C_3514 E2348C_3515 aaeR   FALSE 0.037 229.000 0.000 1.000   NA
 5858689 5858690 E2348C_3516 E2348C_3517 tldD yhdP FALSE 0.113 156.000 0.050 NA   NA
 5858690 5858691 E2348C_3517 E2348C_3518 yhdP rng TRUE 0.657 68.000 0.296 NA   NA
 5858691 5858692 E2348C_3518 E2348C_3519 rng yhdE TRUE 0.959 -10.000 0.417 NA N NA
 5858692 5858693 E2348C_3519 E2348C_3520 yhdE mreD TRUE 0.962 9.000 0.206 NA N NA
 5858693 5858694 E2348C_3520 E2348C_3521 mreD mreC TRUE 0.999 0.000 0.550 0.002 Y NA
 5858694 5858695 E2348C_3521 E2348C_3522 mreC mreB TRUE 0.834 66.000 0.689 1.000 N NA
 5858695 5858696 E2348C_3522 E2348C_3523 mreB csrD FALSE 0.011 305.000 0.000 1.000 N NA
 5858697 5858698 E2348C_3524 E2348C_3525 yhdH accB FALSE 0.003 978.000 0.000 1.000 N NA
 5858698 5858699 E2348C_3525 E2348C_3526 accB accC TRUE 0.997 11.000 0.275 0.000 Y NA
 5858699 5858700 E2348C_3526 E2348C_3527 accC yhdT FALSE 0.307 109.000 0.103 NA   NA
 5858700 5858701 E2348C_3527 E2348C_3528 yhdT panF TRUE 0.982 -10.000 0.682 NA   NA
 5858701 5858702 E2348C_3528 E2348C_3529 panF prmA TRUE 0.833 12.000 0.041 1.000 N NA
 5858702 5858703 E2348C_3529 E2348C_3530 prmA dusB FALSE 0.067 329.000 0.042 1.000 Y NA
 5858703 5858704 E2348C_3530 E2348C_3531 dusB fis TRUE 0.805 26.000 0.161 1.000 N NA
 5858704 5858705 E2348C_3531 E2348C_3532 fis yhdJ TRUE 0.617 86.000 0.016 1.000 Y NA
 5858705 5858706 E2348C_3532 E2348C_3533 yhdJ yhdU FALSE 0.421 84.000 0.143 NA   NA
 5858708 5858709 E2348C_3535 E2348C_3536 acrE acrF TRUE 0.991 12.000 0.889 1.000 N NA
 5858709 5858710 E2348C_3536 E2348C_3537 acrF yhdV FALSE 0.025 253.000 0.000 NA   NA
 5858710 5858711 E2348C_3537 E2348C_3538 yhdV yhdW FALSE 0.006 431.000 0.000 NA   NA
 5858711 5858712 E2348C_3538 E2348C_3539 yhdW yhdX TRUE 0.956 68.000 0.548 0.041 Y NA
 5858712 5858713 E2348C_3539 E2348C_3540 yhdX yhdY TRUE 0.999 10.000 0.815 0.012 Y NA
 5858713 5858714 E2348C_3540 E2348C_3541 yhdY yhdZ TRUE 0.998 8.000 0.734 1.000 Y NA
 5858715 5858716 E2348C_rRNA7 E2348C_tRNA65 rrfF thrV TRUE 0.503 38.000 0.000 NA   NA
 5858716 5858717 E2348C_tRNA65 E2348C_rRNA8 thrV rrfD TRUE 0.849 13.000 0.000 NA   NA
 5858717 5858718 E2348C_rRNA8 E2348C_rRNA9 rrfD rrlD FALSE 0.216 94.000 0.000 NA   NA
 5858718 5858719 E2348C_rRNA9 E2348C_tRNA66 rrlD gltV_1 FALSE 0.059 194.000 0.000 NA   NA
 5858719 5858720 E2348C_tRNA66 E2348C_rRNA10 gltV_1 rrsD FALSE 0.230 86.000 0.000 NA   NA
 5858722 5858723 E2348C_3543 E2348C_3544 yrdB aroE TRUE 0.913 -3.000 0.043 NA   NA
 5858723 5858724 E2348C_3544 E2348C_3545 aroE rimN TRUE 0.927 5.000 0.087 NA N NA
 5858724 5858725 E2348C_3545 E2348C_3546 rimN yrdD TRUE 0.951 5.000 0.137 NA N NA
 5858725 5858726 E2348C_3546 E2348C_3547 yrdD smg TRUE 0.892 29.000 0.331 NA   NA
 5858726 5858727 E2348C_3547 E2348C_3548 smg smf TRUE 0.797 -28.000 0.124 NA   NA
 5858728 5858729 E2348C_3549 E2348C_3550 def fmt TRUE 0.981 15.000 0.058 0.014 Y NA
 5858729 5858730 E2348C_3550 E2348C_3551 fmt rsmB TRUE 0.939 46.000 0.305 1.000 Y NA
 5858730 5858731 E2348C_3551 E2348C_3552 rsmB trkA TRUE 0.807 22.000 0.122 1.000 N NA
 5858731 5858732 E2348C_3552 E2348C_3553 trkA mscL FALSE 0.112 130.000 0.035 1.000 N NA
 5858733 5858734 E2348C_3554 E2348C_3555 yhdL zntR TRUE 0.653 56.000 0.219 NA   NA
 5858734 5858735 E2348C_3555 E2348C_3556 zntR yhdN TRUE 0.930 11.000 0.095 NA   NA
 5858735 5858736 E2348C_3556 E2348C_3557 yhdN rplQ FALSE 0.142 107.000 0.012 NA   NA
 5858736 5858737 E2348C_3557 E2348C_3558 rplQ rpoA TRUE 0.938 41.000 0.873 1.000 N NA
 5858737 5858738 E2348C_3558 E2348C_3559 rpoA rpsD TRUE 0.942 26.000 0.549 1.000 N NA
 5858738 5858739 E2348C_3559 E2348C_3560 rpsD rpsK TRUE 0.985 34.000 0.509 0.012 Y NA
 5858739 5858740 E2348C_3560 E2348C_3561 rpsK rpsM TRUE 0.997 17.000 0.810 0.009 Y NA
 5858740 5858741 E2348C_3561 E2348C_ncR59 rpsM   TRUE 0.630 -32.000 0.000 NA   NA
 5858741 5858742 E2348C_ncR59 E2348C_3562   rpmJ FALSE 0.272 68.000 0.000 NA   NA
 5858742 5858743 E2348C_3562 E2348C_3563 rpmJ secY TRUE 0.467 32.000 0.036 1.000 N NA
 5858743 5858744 E2348C_3563 E2348C_3564 secY rplO TRUE 0.993 8.000 0.730 1.000 N NA
 5858744 5858745 E2348C_3564 E2348C_3565 rplO rpmD TRUE 0.999 4.000 0.653 0.002 Y NA
 5858745 5858746 E2348C_3565 E2348C_3566 rpmD rpsE TRUE 0.999 4.000 0.789 0.012 Y NA
 5858746 5858747 E2348C_3566 E2348C_3567 rpsE rplR TRUE 0.998 15.000 0.814 0.012 Y NA
 5858747 5858748 E2348C_3567 E2348C_3568 rplR rplF TRUE 0.999 10.000 0.815 0.009 Y NA
 5858748 5858749 E2348C_3568 E2348C_3569 rplF rpsH TRUE 0.998 13.000 0.808 0.009 Y NA
 5858749 5858750 E2348C_3569 E2348C_3570 rpsH rpsN TRUE 0.984 34.000 0.473 0.009 Y NA
 5858750 5858751 E2348C_3570 E2348C_3571 rpsN rplE TRUE 0.996 15.000 0.496 0.009 Y NA
 5858751 5858752 E2348C_3571 E2348C_3572 rplE rplX TRUE 0.998 15.000 0.758 0.009 Y NA
 5858752 5858753 E2348C_3572 E2348C_3573 rplX rplN TRUE 0.999 11.000 0.810 0.012 Y NA
 5858753 5858754 E2348C_3573 E2348C_3574 rplN rpsQ TRUE 0.909 165.000 0.791 0.012 Y NA
 5858754 5858755 E2348C_3574 E2348C_3575 rpsQ rpmC TRUE 0.999 0.000 0.828 0.009 Y NA
 5858755 5858756 E2348C_3575 E2348C_3576 rpmC rplP TRUE 0.999 0.000 0.802 0.009 Y NA
 5858756 5858757 E2348C_3576 E2348C_3577 rplP rpsC TRUE 0.998 13.000 0.828 0.012 Y NA
 5858757 5858758 E2348C_3577 E2348C_3578 rpsC rplV TRUE 0.996 18.000 0.719 0.012 Y NA
 5858758 5858759 E2348C_3578 E2348C_3579 rplV rpsS TRUE 0.997 15.000 0.769 0.012 Y NA
 5858759 5858760 E2348C_3579 E2348C_3580 rpsS rplB TRUE 0.997 17.000 0.820 0.012 Y NA
 5858760 5858761 E2348C_3580 E2348C_3581 rplB rplW TRUE 0.997 18.000 0.849 0.012 Y NA
 5858761 5858762 E2348C_3581 E2348C_3582 rplW rplD TRUE 0.998 -3.000 0.513 0.009 Y NA
 5858762 5858763 E2348C_3582 E2348C_3583 rplD rplC TRUE 0.998 11.000 0.486 0.009 Y NA
 5858763 5858764 E2348C_3583 E2348C_3584 rplC rpsJ TRUE 0.977 33.000 0.307 0.012 Y NA
 5858766 5858767 E2348C_3586 E2348C_3587 bfr bfd TRUE 0.644 73.000 0.033 NA Y NA
 5858767 5858768 E2348C_3587 E2348C_3588 bfd tufA FALSE 0.026 183.000 0.007 NA N NA
 5858768 5858769 E2348C_3588 E2348C_3589 tufA fusA TRUE 0.951 71.000 0.400 0.001 Y NA
 5858769 5858770 E2348C_3589 E2348C_3590 fusA rpsG TRUE 0.912 97.000 0.579 1.000 Y NA
 5858770 5858771 E2348C_3590 E2348C_3591 rpsG rpsL TRUE 0.955 97.000 0.620 0.002 Y NA
 5858771 5858772 E2348C_3591 E2348C_3592 rpsL yheL FALSE 0.135 126.000 0.058 NA N NA
 5858772 5858773 E2348C_3592 E2348C_3593 yheL yheM TRUE 0.998 8.000 0.804 NA Y NA
 5858773 5858774 E2348C_3593 E2348C_3594 yheM yheN TRUE 0.999 0.000 0.790 NA Y NA
 5858774 5858775 E2348C_3594 E2348C_3595 yheN yheO TRUE 0.982 0.000 0.220 NA   NA
 5858775 5858776 E2348C_3595 E2348C_3596 yheO fkpA FALSE 0.354 167.000 0.310 NA   NA
 5858778 5858779 E2348C_3598 E2348C_3599 slyD yheV TRUE 0.644 95.000 0.370 NA   NA
 5858779 5858780 E2348C_3599 E2348C_3600 yheV kefB TRUE 0.984 10.000 0.400 NA   NA
 5858780 5858781 E2348C_3600 E2348C_3601 kefB kefG TRUE 0.997 0.000 0.927 1.000   NA
 5858782 5858783 E2348C_3602 E2348C_3603 yheS yheT TRUE 0.910 0.000 0.016 NA   NA
 5858783 5858784 E2348C_3603 E2348C_3604 yheT yheU TRUE 0.959 -6.000 0.222 NA   NA
 5858784 5858785 E2348C_3604 E2348C_3605 yheU prkB TRUE 0.739 54.000 0.303 NA   NA
 5858787 5858788 E2348C_3607 E2348C_3608 crp yhfK TRUE 0.547 51.000 0.111 NA   NA
 5858789 5858790 E2348C_3609 E2348C_3610 argD pabA TRUE 0.819 86.000 0.088 0.010 Y NA
 5858790 5858791 E2348C_3610 E2348C_3611 pabA fic FALSE 0.381 32.000 0.008 1.000 N NA
 5858791 5858792 E2348C_3611 E2348C_3612 fic yhfG TRUE 0.792 -10.000 0.000 NA   NA
 5858792 5858793 E2348C_3612 E2348C_3613 yhfG ppiA TRUE 0.619 105.000 0.364 NA   NA
 5858794 5858795 E2348C_3614 E2348C_3615 tsgA nirB FALSE 0.014 262.000 0.000 NA N NA
 5858795 5858796 E2348C_3615 E2348C_3616 nirB nirD TRUE 0.997 -3.000 0.829 0.000 N NA
 5858796 5858797 E2348C_3616 E2348C_3617 nirD nirC TRUE 0.789 126.000 0.283 1.000 Y NA
 5858797 5858798 E2348C_3617 E2348C_3618 nirC cysG TRUE 0.701 19.000 0.000 1.000 N NA
 5858798 5858799 E2348C_3618 E2348C_3619 cysG yhfL FALSE 0.025 252.000 0.000 NA   NA
 5858800 5858801 E2348C_3620 E2348C_3621 yhfS yhfT TRUE 0.954 12.000 0.185 NA   NA
 5858801 5858802 E2348C_3621 E2348C_3622 yhfT yhfU TRUE 0.991 12.000 0.828 NA   NA
 5858802 5858803 E2348C_3622 E2348C_3623 yhfU php TRUE 0.979 11.000 0.312 1.000   NA
 5858803 5858804 E2348C_3623 E2348C_3624 php yhfW TRUE 0.956 -3.000 0.094 1.000   NA
 5858804 5858805 E2348C_3624 E2348C_3625 yhfW yhfX TRUE 0.993 1.000 0.625 NA N NA
 5858805 5858806 E2348C_3625 E2348C_3626 yhfX yhfY TRUE 0.549 84.000 0.233 NA   NA
 5858806 5858807 E2348C_3626 E2348C_3627 yhfY yhfZ TRUE 0.973 17.000 0.562 NA   NA
 5858807 5858808 E2348C_3627 E2348C_3628 yhfZ trpS FALSE 0.067 160.000 0.004 NA   NA
 5858808 5858809 E2348C_3628 E2348C_3629 trpS gph TRUE 0.922 -7.000 0.118 1.000   NA
 5858809 5858810 E2348C_3629 E2348C_3630 gph rpe TRUE 0.923 -7.000 0.120 1.000   NA
 5858810 5858811 E2348C_3630 E2348C_3631 rpe dam TRUE 0.697 18.000 0.040 1.000 N NA
 5858811 5858812 E2348C_3631 E2348C_3632 dam damX TRUE 0.496 107.000 0.234 NA   NA
 5858812 5858813 E2348C_3632 E2348C_3633 damX aroB FALSE 0.173 92.000 0.022 NA   NA
 5858813 5858814 E2348C_3633 E2348C_3634 aroB aroK TRUE 0.878 57.000 0.208 1.000 Y NA
 5858814 5858815 E2348C_3634 E2348C_3635 aroK hofQ FALSE 0.034 401.000 0.319 1.000 N NA
 5858815 5858816 E2348C_3635 E2348C_3636 hofQ hofP TRUE 0.599 -88.000 0.000 NA   NA
 5858816 5858817 E2348C_3636 E2348C_3637 hofP hofO TRUE 0.792 -10.000 0.000 NA   NA
 5858817 5858818 E2348C_3637 E2348C_3638 hofO hofN TRUE 0.941 -16.000 0.348 NA   NA
 5858818 5858819 E2348C_3638 E2348C_3639 hofN hofM TRUE 0.996 0.000 0.870 NA   NA
 5858822 5858823 E2348C_3642 E2348C_3643 yrfF yrfG TRUE 0.490 65.000 0.122 1.000   NA
 5858823 5858824 E2348C_3643 E2348C_3644 yrfG hslR TRUE 0.912 11.000 0.056 1.000   NA
 5858824 5858825 E2348C_3644 E2348C_3645 hslR hslO TRUE 0.793 25.000 0.140 1.000 N NA
 5858827 5858828 E2348C_3647 E2348C_3648 pck   FALSE 0.004 485.000 0.000 1.000 N NA
 5858829 5858830 E2348C_3649 E2348C_3650 envZ ompR TRUE 0.998 -3.000 0.584 1.000 Y NA
 5858831 5858832 E2348C_3651 E2348C_3652 greB yhgF TRUE 0.727 97.000 0.123 1.000 Y NA
 5858832 5858833 E2348C_3652 E2348C_3653 yhgF feoA FALSE 0.005 438.000 0.000 1.000 N NA
 5858833 5858834 E2348C_3653 E2348C_3654 feoA feoB TRUE 0.978 17.000 0.177 1.000 Y NA
 5858834 5858835 E2348C_3654 E2348C_3655 feoB feoC TRUE 0.992 0.000 0.455 NA   NA
 5858835 5858836 E2348C_3655 E2348C_3656 feoC yhgA FALSE 0.049 203.000 0.000 NA   NA
 5858838 5858839 E2348C_3658 E2348C_3659 gntX gntY FALSE 0.411 59.000 0.066 1.000   NA
 5858839 5858840 E2348C_3659 E2348C_3660 gntY gntT FALSE 0.010 364.000 0.000 1.000   NA
 5858841 5858842 E2348C_3661 E2348C_3662 malQ malP TRUE 0.994 10.000 0.137 0.015 Y NA
 5858844 5858845 E2348C_3664 E2348C_3665 rtcA rtcB TRUE 0.947 4.000 0.081 NA   NA
 5858847 5858848 E2348C_3667 E2348C_3668 glpR glpG TRUE 0.926 17.000 0.190 1.000   NA
 5858848 5858849 E2348C_3668 E2348C_3669 glpG glpE TRUE 0.863 45.000 0.405 1.000   NA
 5858851 5858852 E2348C_3671 E2348C_3672     TRUE 0.928 3.000 0.000 NA   NA
 5858852 5858853 E2348C_3672 E2348C_3673     FALSE 0.200 103.000 0.000 NA   NA
 5858853 5858854 E2348C_3673 E2348C_3674   glgP FALSE 0.155 130.000 0.000 NA   NA
 5858854 5858855 E2348C_3674 E2348C_3675 glgP glgA TRUE 0.979 19.000 0.228 1.000 Y NA
 5858855 5858856 E2348C_3675 E2348C_3676 glgA glgC TRUE 0.997 0.000 0.307 1.000 Y NA
 5858856 5858857 E2348C_3676 E2348C_3677 glgC glgX TRUE 0.980 18.000 0.228 1.000 Y NA
 5858857 5858858 E2348C_3677 E2348C_3678 glgX glgB TRUE 0.992 -3.000 0.020 0.002 Y NA
 5858858 5858859 E2348C_3678 E2348C_3679 glgB asd FALSE 0.016 273.000 0.000 1.000 N NA
 5858861 5858862 E2348C_3681 E2348C_3682 gntU gntK TRUE 0.987 4.000 0.000 1.000 Y NA
 5858862 5858863 E2348C_3682 E2348C_3683 gntK gntR FALSE 0.116 139.000 0.000 1.000 N NA
 5858863 5858864 E2348C_3683 E2348C_3684 gntR yhhW FALSE 0.218 93.000 0.000 NA   NA
 5858864 5858865 E2348C_3684 E2348C_3685 yhhW yhhX TRUE 0.597 123.000 0.400 NA   NA
 5858865 5858866 E2348C_3685 E2348C_ncR60 yhhX rhyB FALSE 0.171 123.000 0.000 NA   NA
 5858870 5858871 E2348C_3689 E2348C_3690 ugpQ ugpC TRUE 0.933 -3.000 0.080 1.000 N NA
 5858871 5858872 E2348C_3690 E2348C_3691 ugpC ugpE TRUE 0.998 2.000 0.272 0.041 Y NA
 5858872 5858873 E2348C_3691 E2348C_3692 ugpE ugpA TRUE 0.997 -3.000 0.306 0.041 Y NA
 5858873 5858874 E2348C_3692 E2348C_3693 ugpA ugpB TRUE 0.959 98.000 0.793 0.041 Y NA
 5858874 5858875 E2348C_3693 E2348C_3694 ugpB livF FALSE 0.006 397.000 0.000 1.000 N NA
 5858875 5858876 E2348C_3694 E2348C_3695 livF livG TRUE 0.999 2.000 0.967 0.012 Y NA
 5858876 5858877 E2348C_3695 E2348C_3696 livG livM TRUE 0.998 -3.000 0.574 1.000 Y NA
 5858877 5858878 E2348C_3696 E2348C_3697 livM livH TRUE 0.999 -3.000 0.574 0.041 Y NA
 5858878 5858879 E2348C_3697 E2348C_3698 livH livK TRUE 0.816 48.000 0.000 1.000 Y NA
 5858881 5858882 E2348C_3700 E2348C_3701 livJ rpoH FALSE 0.016 271.000 0.000 1.000 N NA
 5858882 5858883 E2348C_3701 E2348C_3702 rpoH ftsX FALSE 0.023 245.000 0.051 1.000 N NA
 5858883 5858884 E2348C_3702 E2348C_3703 ftsX ftsE TRUE 0.981 -7.000 0.121 1.000 Y NA
 5858884 5858885 E2348C_3703 E2348C_3704 ftsE ftsY TRUE 0.977 3.000 0.117 0.070 N NA
 5858886 5858887 E2348C_3705 E2348C_3706 rsmD yhhL TRUE 0.825 -10.000 0.063 NA   NA
 5858889 5858890 E2348C_3708 E2348C_3709 yhhN zntA TRUE 0.769 74.000 0.325 0.063   NA
 5858890 5858891 E2348C_3709 E2348C_3710 zntA   FALSE 0.009 380.000 0.000 1.000   NA
 5858893 5858894 E2348C_3712 E2348C_3713 yhhQ dcrB TRUE 0.628 31.000 0.066 NA   NA
 5858896 5858897 E2348C_3715 E2348C_3716 yhhT acpT TRUE 0.731 55.000 0.300 NA   NA
 5858897 5858898 E2348C_3716 E2348C_3717 acpT nikA FALSE 0.160 111.000 0.000 1.000 N NA
 5858898 5858899 E2348C_3717 E2348C_3718 nikA nikB TRUE 0.999 0.000 0.833 0.051 Y NA
 5858899 5858900 E2348C_3718 E2348C_3719 nikB nikC TRUE 0.999 -3.000 0.629 0.001 Y NA
 5858900 5858901 E2348C_3719 E2348C_3720 nikC nikD TRUE 0.998 0.000 0.409 1.000 Y NA
 5858901 5858902 E2348C_3720 E2348C_3721 nikD nikE TRUE 0.997 -3.000 0.290 0.070 Y NA
 5858902 5858903 E2348C_3721 E2348C_3722 nikE nikR TRUE 0.870 6.000 0.031 1.000 N NA
 5858904 5858905 E2348C_3723 E2348C_3724     TRUE 0.981 -3.000 0.273 NA   NA
 5858905 5858906 E2348C_3724 E2348C_3725   yhhJ FALSE 0.254 73.000 0.000 NA   NA
 5858906 5858907 E2348C_3725 E2348C_3726 yhhJ rbbA TRUE 0.996 0.000 0.500 0.003   NA
 5858907 5858908 E2348C_3726 E2348C_3727 rbbA yhiI TRUE 0.964 -3.000 0.049 0.076   NA
 5858913 5858914 E2348C_3732 E2348C_3733 uspA yhiP FALSE 0.010 317.000 0.000 1.000 N NA
 5858915 5858916 E2348C_3734 E2348C_3735 yhiQ prlC TRUE 0.945 8.000 0.098 NA   NA
 5858917 5858918 E2348C_3736 E2348C_3737 yhiR gor FALSE 0.418 72.000 0.100 1.000   NA
 5858920 5858921 E2348C_3739 E2348C_3740 arsC slp FALSE 0.003 1184.000 0.000 1.000 N NA
 5858921 5858922 E2348C_3740 E2348C_3741 slp yhiF FALSE 0.094 153.000 0.000 1.000 N NA
 5858923 5858924 E2348C_3742 E2348C_3743 chuS chuA TRUE 0.820 49.000 0.056 1.000 Y NA
 5858925 5858926 E2348C_3744 E2348C_3745 chuT chuW TRUE 0.571 20.000 0.010 1.000 N NA
 5858926 5858927 E2348C_3745 E2348C_3746 chuW chuX TRUE 0.918 13.000 0.135 1.000 N NA
 5858927 5858928 E2348C_3746 E2348C_3747 chuX chuY TRUE 0.929 0.000 0.054 1.000 N NA
 5858928 5858929 E2348C_3747 E2348C_3748 chuY chuU FALSE 0.130 85.000 0.010 1.000 N NA
 5858929 5858930 E2348C_3748 E2348C_3749 chuU   TRUE 0.994 -3.000 0.220 1.000 Y NA
 5858931 5858932 E2348C_3750 E2348C_3751 yhiD hdeB FALSE 0.292 64.000 0.000 NA   NA
 5858932 5858933 E2348C_3751 E2348C_3752 hdeB hdeA FALSE 0.200 104.000 0.000 NA   NA
 5858934 5858935 E2348C_3753 E2348C_3754 hdeD gadE FALSE 0.004 799.000 0.000 NA   NA
 5858935 5858936 E2348C_3754 E2348C_3755 gadE mdtE FALSE 0.012 339.000 0.000 1.000   NA
 5858936 5858937 E2348C_3755 E2348C_3756 mdtE mdtF TRUE 0.603 25.000 0.000 1.000 N NA
 5858940 5858941 E2348C_3758 E2348C_3759 gadX gadA FALSE 0.007 368.000 0.000 1.000 N NA
 5858941 5858942 E2348C_3759 E2348C_3760 gadA yhjA FALSE 0.035 211.000 0.000 1.000 N NA
 5858945 5858946 E2348C_3763 E2348C_3764 yhjC yhjD TRUE 0.576 49.000 0.098 1.000   NA
 5858946 5858947 E2348C_3764 E2348C_3765 yhjD yhjE FALSE 0.009 393.000 0.000 1.000   NA
 5858948 5858949 E2348C_3766 E2348C_3767 yhjG yhjH FALSE 0.252 55.000 0.000 NA N NA
 5858951 5858952 E2348C_3769 E2348C_3770 yhjJ dctA FALSE 0.065 221.000 0.088 1.000   NA
 5858952 5858953 E2348C_3770 E2348C_3771 dctA yhjK FALSE 0.313 183.000 0.229 0.076 N NA
 5858953 5858954 E2348C_3771 E2348C_3772 yhjK bcsC FALSE 0.238 115.000 0.088 1.000 N NA
 5858954 5858955 E2348C_3772 E2348C_3773 bcsC bcsZ TRUE 0.906 -18.000 0.263 1.000 N NA
 5858955 5858956 E2348C_3773 E2348C_3774 bcsZ bcsB TRUE 0.923 7.000 0.000 1.000   NA
 5858956 5858957 E2348C_3774 E2348C_3775 bcsB bcsA TRUE 0.966 11.000 0.000 0.001   NA
 5858957 5858958 E2348C_3775 E2348C_3776 bcsA yhjQ TRUE 0.989 -3.000 0.545 NA N NA
 5858958 5858959 E2348C_3776 E2348C_3777 yhjQ yhjR TRUE 0.982 12.000 0.464 NA   NA
 5858960 5858961 E2348C_3778 E2348C_3779 bcsE bcsF TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5858961 5858962 E2348C_3779 E2348C_3780 bcsF bcsG TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5858963 5858964 E2348C_3781 E2348C_3782   ldrD1 FALSE 0.034 224.000 0.000 NA   NA
 5858967 5858968 E2348C_ncR63 E2348C_3784 rdlD_2 yhjV FALSE 0.009 364.000 0.000 NA   NA
 5858969 5858970 E2348C_3785 E2348C_3786     TRUE 0.950 0.000 0.068 NA   NA
 5858970 5858971 E2348C_3786 E2348C_3787     TRUE 0.733 -15.000 0.000 NA   NA
 5858971 5858972 E2348C_3787 E2348C_3788   dppF FALSE 0.040 225.000 0.000 1.000   NA
 5858972 5858973 E2348C_3788 E2348C_3789 dppF dppD TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.001 Y NA
 5858973 5858974 E2348C_3789 E2348C_3790 dppD dppC TRUE 0.997 11.000 0.560 1.000 Y NA
 5858974 5858975 E2348C_3790 E2348C_3791 dppC dppB TRUE 0.999 10.000 0.779 0.040 Y NA
 5858975 5858976 E2348C_3791 E2348C_3792 dppB dppA FALSE 0.165 308.000 0.087 0.040 Y NA
 5858976 5858977 E2348C_3792 E2348C_tRNA67 dppA proK FALSE 0.004 744.000 0.000 NA   NA
 5858977 5858978 E2348C_tRNA67 E2348C_3793 proK eptB FALSE 0.221 92.000 0.000 NA   NA
 5858978 5858979 E2348C_3793 E2348C_3794 eptB lpfE FALSE 0.025 264.000 0.000 1.000   NA
 5858979 5858980 E2348C_3794 E2348C_3795 lpfE lpfD TRUE 0.996 6.000 0.667 0.006   NA
 5858980 5858981 E2348C_3795 E2348C_3796 lpfD lpfC TRUE 0.982 16.000 0.667 1.000   NA
 5858981 5858982 E2348C_3796 E2348C_3797 lpfC lpfB TRUE 0.993 24.000 1.000 1.000 Y NA
 5858982 5858983 E2348C_3797 E2348C_3798 lpfB lpfA TRUE 0.912 100.000 0.600 1.000 Y NA
 5858983 5858984 E2348C_3798 E2348C_3799 lpfA yhjX FALSE 0.008 347.000 0.000 1.000 N NA
 5858984 5858985 E2348C_3799 E2348C_3800 yhjX yhjY FALSE 0.031 229.000 0.000 NA   NA
 5858986 5858987 E2348C_3801 E2348C_3802 tag yiaC TRUE 0.916 -3.000 0.028 1.000   NA
 5858989 5858990 E2348C_3804 E2348C_3805 yiaD ghrB FALSE 0.168 104.000 0.000 1.000 N NA
 5858992 5858993 E2348C_3807 E2348C_3808 yiaG cspA FALSE 0.107 281.000 0.000 1.000 Y NA
 5858994 5858995 E2348C_3809 E2348C_3810 hokA glyS FALSE 0.015 323.000 0.000 1.000   NA
 5858995 5858996 E2348C_3810 E2348C_3811 glyS glyQ TRUE 0.999 10.000 0.651 0.000 Y NA
 5858996 5858997 E2348C_3811 E2348C_3812 glyQ ysaB FALSE 0.152 95.000 0.010 NA   NA
 5858999 5859000 E2348C_3814 E2348C_3815 yiaA yiaB FALSE 0.386 46.000 0.032 NA   NA
 5859000 5859001 E2348C_3815 E2348C_3816 yiaB xylB FALSE 0.191 169.000 0.143 NA   NA
 5859001 5859002 E2348C_3816 E2348C_3817 xylB xylA TRUE 0.671 72.000 0.034 1.000 Y NA
 5859003 5859004 E2348C_3818 E2348C_3819 xylF xylG TRUE 0.909 78.000 0.518 NA Y NA
 5859004 5859005 E2348C_3819 E2348C_3820 xylG xylH TRUE 0.985 -22.000 0.469 1.000 Y NA
 5859005 5859006 E2348C_3820 E2348C_3821 xylH xylR FALSE 0.404 78.000 0.146 1.000 N NA
 5859008 5859009 E2348C_3823 E2348C_3824 malS avtA FALSE 0.103 178.000 0.085 1.000 N NA
 5859010 5859011 E2348C_3825 E2348C_3826 ysaA yiaJ TRUE 0.621 102.000 0.400 1.000 N NA
 5859012 5859013 E2348C_3827 E2348C_3828 yiaK yiaL TRUE 0.810 12.000 0.000 NA N NA
 5859013 5859014 E2348C_3828 E2348C_3829 yiaL   TRUE 0.682 23.000 0.000 NA   NA
 5859014 5859015 E2348C_3829 E2348C_3830   yiaM FALSE 0.278 114.000 0.091 NA   NA
 5859015 5859016 E2348C_3830 E2348C_3831 yiaM yiaN TRUE 0.999 3.000 0.864 NA Y NA
 5859016 5859017 E2348C_3831 E2348C_3832 yiaN yiaO TRUE 0.973 13.000 0.000 1.000 Y NA
 5859017 5859018 E2348C_3832 E2348C_3833 yiaO lyx TRUE 0.987 4.000 0.000 1.000 Y NA
 5859018 5859019 E2348C_3833 E2348C_3834 lyx sgbH TRUE 0.999 -3.000 0.900 1.000 Y NA
 5859019 5859020 E2348C_3834 E2348C_3835 sgbH sgbU TRUE 0.992 -7.000 0.360 1.000 Y NA
 5859020 5859021 E2348C_3835 E2348C_3836 sgbU sgbE TRUE 0.989 -6.000 0.200 1.000 Y NA
 5859022 5859023 E2348C_3837 E2348C_3838 aldB   FALSE 0.224 108.000 0.000 1.000   NA
 5859023 5859024 E2348C_3838 E2348C_3839   yiaY FALSE 0.180 130.000 0.000 1.000   NA
 5859024 5859025 E2348C_3839 E2348C_3840 yiaY selB FALSE 0.036 189.000 0.015 1.000 N NA
 5859025 5859026 E2348C_3840 E2348C_3841 selB selA TRUE 0.996 -3.000 0.569 0.000 N NA
 5859026 5859027 E2348C_3841 E2348C_3842 selA yibF FALSE 0.161 98.000 0.040 1.000 N NA
 5859027 5859028 E2348C_3842 E2348C_3843 yibF yibH FALSE 0.311 71.000 0.081 1.000 N NA
 5859028 5859029 E2348C_3843 E2348C_3844 yibH yibI TRUE 0.993 3.000 0.556 NA   NA
 5859030 5859031 E2348C_3845 E2348C_3846 mtlA mtlD FALSE 0.438 218.000 0.292 1.000 Y NA
 5859031 5859032 E2348C_3846 E2348C_3847 mtlD mtlR TRUE 0.979 0.000 0.230 NA N NA
 5859034 5859035 E2348C_3849 E2348C_3850 yibL   FALSE 0.005 570.000 0.000 NA   NA
 5859035 5859036 E2348C_3850 E2348C_3851     FALSE 0.446 44.000 0.000 NA   NA
 5859036 5859037 E2348C_3851 E2348C_3852   lldP FALSE 0.007 412.000 0.000 NA   NA
 5859037 5859038 E2348C_3852 E2348C_3853 lldP lldR TRUE 0.994 0.000 0.652 1.000 N NA
 5859038 5859039 E2348C_3853 E2348C_3854 lldR lldD TRUE 0.982 -3.000 0.309 1.000 N NA
 5859039 5859040 E2348C_3854 E2348C_3855 lldD yibK FALSE 0.279 48.000 0.020 1.000 N NA
 5859041 5859042 E2348C_3856 E2348C_3857 cysE gpsA TRUE 0.686 80.000 0.429 1.000 N NA
 5859042 5859043 E2348C_3857 E2348C_3858 gpsA secB TRUE 0.978 0.000 0.206 1.000 N NA
 5859043 5859044 E2348C_3858 E2348C_3859 secB grxC FALSE 0.229 64.000 0.038 1.000 N NA
 5859044 5859045 E2348C_3859 E2348C_3860 grxC yibN FALSE 0.093 141.000 0.048 NA N NA
 5859046 5859047 E2348C_3861 E2348C_3862 gpmM envC TRUE 0.749 34.000 0.170 1.000 N NA
 5859047 5859048 E2348C_3862 E2348C_3863 envC yibQ TRUE 0.957 4.000 0.088 1.000   NA
 5859049 5859050 E2348C_3864 E2348C_3865 yibD tdh FALSE 0.018 239.000 0.000 NA N NA
 5859050 5859051 E2348C_3865 E2348C_3866 tdh kbl TRUE 0.988 10.000 0.547 1.000 N NA
 5859052 5859053 E2348C_3867 E2348C_3868 rfaD rfaF TRUE 0.990 10.000 0.146 1.000 Y NA
 5859053 5859054 E2348C_3868 E2348C_3869 rfaF rfaC TRUE 0.997 4.000 0.205 0.001 Y NA
 5859054 5859055 E2348C_3869 E2348C_3870 rfaC rfaL TRUE 0.864 34.000 0.036 NA Y NA
 5859056 5859057 E2348C_3871 E2348C_3872   rfaZ TRUE 0.515 88.000 0.214 NA   NA
 5859057 5859058 E2348C_3872 E2348C_3873 rfaZ rfaY TRUE 0.545 74.000 0.214 NA   NA
 5859058 5859059 E2348C_3873 E2348C_3874 rfaY rfaJ TRUE 0.959 18.000 0.375 1.000   NA
 5859059 5859060 E2348C_3874 E2348C_3875 rfaJ rfaI TRUE 0.991 40.000 0.833 0.001 Y NA
 5859060 5859061 E2348C_3875 E2348C_3876 rfaI rfaB TRUE 0.994 0.000 0.167 1.000 Y NA
 5859061 5859062 E2348C_3876 E2348C_3877 rfaB rfaS TRUE 0.906 14.000 0.111 NA   NA
 5859062 5859063 E2348C_3877 E2348C_3878 rfaS rfaP TRUE 0.513 37.000 0.000 NA   NA
 5859063 5859064 E2348C_3878 E2348C_3879 rfaP rfaG TRUE 0.859 -7.000 0.000 1.000   NA
 5859064 5859065 E2348C_3879 E2348C_3880 rfaG rfaQ TRUE 0.989 -3.000 0.079 1.000 Y NA
 5859066 5859067 E2348C_3881 E2348C_3882 waaA coaD TRUE 0.844 8.000 0.020 1.000 N NA
 5859068 5859069 E2348C_3883 E2348C_3884 mutM rpmG FALSE 0.151 98.000 0.034 1.000 N NA
 5859069 5859070 E2348C_3884 E2348C_3885 rpmG rpmB TRUE 0.990 21.000 0.332 0.009 Y NA
 5859070 5859071 E2348C_3885 E2348C_3886 rpmB yicR FALSE 0.018 217.000 0.002 1.000 N NA
 5859072 5859073 E2348C_3887 E2348C_3888 dfp dut TRUE 0.873 -19.000 0.201 1.000 N NA
 5859073 5859074 E2348C_3888 E2348C_3889 dut slmA FALSE 0.195 107.000 0.060 1.000 N NA
 5859075 5859076 E2348C_3890 E2348C_ncR64     TRUE 0.571 -401.000 0.000 NA   NA
 5859076 5859077 E2348C_ncR64 E2348C_3891   pyrE FALSE 0.004 626.000 0.000 NA   NA
 5859077 5859078 E2348C_3891 E2348C_3892 pyrE rph FALSE 0.180 66.000 0.022 1.000 N NA
 5859079 10800752 E2348C_3893 E2348C_PP12 yicC   FALSE 0.192 110.000 0.000 NA   NA
 10800752 5859080 E2348C_PP12 E2348C_3894     TRUE 0.565 -1337.000 0.000 NA   NA
 5859080 5859081 E2348C_3894 E2348C_3895     FALSE 0.005 504.000 0.000 NA   NA
 5859081 5859082 E2348C_3895 E2348C_3896     FALSE 0.225 90.000 0.000 NA   NA
 5859082 5859083 E2348C_3896 E2348C_3897     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5859084 5859085 E2348C_3898 E2348C_3899     TRUE 0.966 -3.000 0.152 NA   NA
 5859086 5859087 E2348C_3900 E2348C_3901     FALSE 0.200 103.000 0.000 NA   NA
 5859087 5859088 E2348C_3901 E2348C_3902     TRUE 0.907 8.000 0.000 NA   NA
 5859088 5859089 E2348C_3902 E2348C_3903     TRUE 0.916 5.000 0.000 NA   NA
 5859089 5859090 E2348C_3903 E2348C_3904     TRUE 0.836 -7.000 0.000 NA   NA
 5859090 5859091 E2348C_3904 E2348C_3905     TRUE 0.836 -7.000 0.000 NA   NA
 5859091 5859092 E2348C_3905 E2348C_3906     TRUE 0.836 -7.000 0.000 NA   NA
 5859092 5859093 E2348C_3906 E2348C_3907     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5859093 5859094 E2348C_3907 E2348C_3908     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5859094 5859095 E2348C_3908 E2348C_3909   dinD FALSE 0.004 627.000 0.000 NA   NA
 5859095 5859096 E2348C_3909 E2348C_3910 dinD yicG FALSE 0.016 292.000 0.000 NA   NA
 5859098 5859099 E2348C_3912 E2348C_3913 gmk rpoZ TRUE 0.802 55.000 0.471 1.000 N NA
 5859099 5859100 E2348C_3913 E2348C_3914 rpoZ spoT TRUE 0.983 19.000 0.291 1.000 Y NA
 5859100 5859101 E2348C_3914 E2348C_3915 spoT trmH TRUE 0.938 7.000 0.095 1.000 N NA
 5859101 5859102 E2348C_3915 E2348C_3916 trmH recG TRUE 0.926 6.000 0.076 1.000 N NA
 5859104 5859105 E2348C_3918 E2348C_3919 yicE yicH TRUE 0.482 121.000 0.257 NA   NA
 5859106 5859107 E2348C_3920 E2348C_3921     TRUE 0.732 -19.000 0.000 1.000   NA
 5859107 5859108 E2348C_3921 E2348C_3922     TRUE 0.981 15.000 0.000 0.005 Y NA
 5859108 5859109 E2348C_3922 E2348C_3923     TRUE 0.888 81.000 0.167 0.001 Y NA
 5859109 5859110 E2348C_3923 E2348C_3924     TRUE 0.996 12.000 0.600 1.000 Y NA
 5859110 5859111 E2348C_3924 E2348C_3925     TRUE 0.969 25.000 0.107 0.009 Y NA
 5859111 5859112 E2348C_3925 E2348C_3926     TRUE 0.988 18.000 0.214 0.008 Y NA
 5859112 5859113 E2348C_3926 E2348C_3927     TRUE 0.880 27.000 0.143 0.009 N NA
 5859113 5859114 E2348C_3927 E2348C_3928   yicI FALSE 0.012 295.000 0.000 1.000 N NA
 5859114 5859115 E2348C_3928 E2348C_3929 yicI yicJ TRUE 0.982 10.000 0.000 1.000 Y NA
 5859116 10800753 E2348C_tRNA68 E2348C_LEE1 selC   TRUE 0.597 -90.000 0.000 NA   NA
 5859117 5859118 E2348C_3930 E2348C_3931 espF   FALSE 0.437 85.000 0.154 NA   NA
 5859118 5859119 E2348C_3931 E2348C_3932   escF TRUE 0.993 6.000 0.650 NA   NA
 5859119 5859120 E2348C_3932 E2348C_3933 escF cesD2 TRUE 0.655 37.000 0.100 NA   NA
 5859120 5859121 E2348C_3933 E2348C_3934 cesD2 espB TRUE 0.983 7.000 0.333 NA   NA
 5859121 5859122 E2348C_3934 E2348C_3935 espB espD TRUE 0.898 21.000 0.211 NA   NA
 5859122 5859123 E2348C_3935 E2348C_3936 espD espA TRUE 0.914 13.000 0.105 NA   NA
 5859123 5859124 E2348C_3936 E2348C_3937 espA speL TRUE 0.607 57.000 0.182 NA   NA
 5859126 5859127 E2348C_3939 E2348C_3940 eaeA cesT TRUE 0.712 60.000 0.286 1.000   NA
 5859127 5859128 E2348C_3940 E2348C_3941 cesT tir TRUE 0.472 138.000 0.286 1.000   NA
 5859128 5859129 E2348C_3941 E2348C_3942 tir map FALSE 0.014 327.000 0.000 1.000   NA
 5859131 5859132 E2348C_3944 E2348C_3945 espH sepQ TRUE 0.924 31.000 0.500 NA   NA
 5859132 5859133 E2348C_3945 E2348C_3946 sepQ   TRUE 0.937 -37.000 0.500 NA   NA
 5859133 5859134 E2348C_3946 E2348C_3947     TRUE 0.990 -7.000 1.000 NA   NA
 5859134 5859135 E2348C_3947 E2348C_3948   escN TRUE 0.963 3.000 0.118 NA   NA
 5859135 5859136 E2348C_3948 E2348C_3949 escN escV TRUE 0.995 -16.000 0.647 0.004 Y NA
 5859136 5859137 E2348C_3949 E2348C_3950 escV mpc TRUE 0.972 -3.000 0.182 NA   NA
 5859138 5859139 E2348C_3951 E2348C_3952 espZ rorf8 TRUE 0.661 30.000 0.074 NA   NA
 5859139 5859140 E2348C_3952 E2348C_3953 rorf8 escJ TRUE 0.980 3.000 0.074 0.007   NA
 5859140 5859141 E2348C_3953 E2348C_3954 escJ sepD TRUE 0.995 6.000 1.000 NA   NA
 5859141 5859142 E2348C_3954 E2348C_3955 sepD escC TRUE 0.972 0.000 0.143 NA   NA
 5859142 5859143 E2348C_3955 E2348C_3956 escC cesD TRUE 0.919 14.000 0.118 1.000   NA
 5859144 5859145 E2348C_3957 E2348C_3958 grlA grlR TRUE 0.823 56.000 0.500 NA   NA
 5859147 5859148 E2348C_3960 E2348C_3961 escU escT TRUE 0.995 -7.000 0.406 0.062 Y NA
 5859148 5859149 E2348C_3961 E2348C_3962 escT escS TRUE 0.999 0.000 0.516 0.062 Y NA
 5859149 5859150 E2348C_3962 E2348C_3963 escS escR TRUE 0.996 0.000 0.091 0.007 Y NA
 5859150 5859151 E2348C_3963 E2348C_3964 escR   TRUE 0.995 5.000 1.000 NA   NA
 5859151 5859152 E2348C_3964 E2348C_3965     TRUE 0.969 -55.000 1.000 NA   NA
 5859152 5859153 E2348C_3965 E2348C_3966     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 5859153 5859154 E2348C_3966 E2348C_3967     TRUE 0.981 4.000 0.250 NA   NA
 5859154 5859155 E2348C_3967 E2348C_3968   ler TRUE 0.953 15.000 0.250 1.000   NA
 5859155 5859156 E2348C_3968 E2348C_3969 ler   FALSE 0.005 504.000 0.000 NA   NA
 5859157 5859158 E2348C_3970 E2348C_3971 espG   TRUE 0.718 128.000 0.667 NA   NA
 5859159 5859160 E2348C_3972 E2348C_3973     FALSE 0.039 216.000 0.000 NA   NA
 5859164 5859165 E2348C_3977 E2348C_3978 nepI yicN FALSE 0.159 211.000 0.250 NA   NA
 5859165 5859166 E2348C_3978 E2348C_3979 yicN yicO FALSE 0.360 53.000 0.000 NA   NA
 5859168 5859169 E2348C_3981 E2348C_3982 uhpT uhpC FALSE 0.209 256.000 0.000 0.040 Y NA
 5859169 5859170 E2348C_3982 E2348C_3983 uhpC uhpB TRUE 0.943 10.000 0.000 0.062 N NA
 5859170 5859171 E2348C_3983 E2348C_3984 uhpB uhpA TRUE 0.994 0.000 0.000 0.010 Y NA
 5859171 5859172 E2348C_3984 E2348C_3985 uhpA ilvN FALSE 0.440 73.000 0.118 1.000   NA
 5859172 5859173 E2348C_3985 E2348C_3986 ilvN ilvB TRUE 0.997 4.000 0.649 0.001   NA
 5859173 5859174 E2348C_3986 E2348C_3987 ilvB ivbL TRUE 0.472 106.000 0.216 NA   NA
 5859176 5859177 E2348C_3989 E2348C_3990 yidF yidG TRUE 0.989 -3.000 0.429 NA   NA
 5859177 5859178 E2348C_3990 E2348C_3991 yidG yidH TRUE 0.976 -10.000 0.571 NA   NA
 5859178 5859179 E2348C_3991 E2348C_3992 yidH yidJ FALSE 0.438 60.000 0.094 NA   NA
 5859179 5859180 E2348C_3992 E2348C_3993 yidJ yidK TRUE 0.980 -3.000 0.235 1.000   NA
 5859182 5859183 E2348C_3995 E2348C_3996 yidP ibpB FALSE 0.055 196.000 0.000 NA   NA
 5859183 5859184 E2348C_3996 E2348C_3997 ibpB ibpA TRUE 0.656 112.000 0.099 NA Y NA
 5859188 5859189 E2348C_4001 E2348C_4002 dgoT dgoD FALSE 0.176 120.000 0.000 NA   NA
 5859189 5859190 E2348C_4002 E2348C_4003 dgoD   TRUE 0.916 5.000 0.000 NA   NA
 5859190 5859191 E2348C_4003 E2348C_4004   dgoA FALSE 0.004 948.000 0.000 1.000   NA
 5859191 5859192 E2348C_4004 E2348C_4005 dgoA dgoK TRUE 0.994 -16.000 0.909 1.000 Y NA
 5859192 5859193 E2348C_4005 E2348C_4006 dgoK dgoR TRUE 0.993 -3.000 0.733 1.000 N NA
 5859195 5859196 E2348C_4008 E2348C_4009 yidA yidB FALSE 0.185 115.000 0.000 NA   NA
 5859196 5859197 E2348C_4009 E2348C_4010 yidB gyrB FALSE 0.030 234.000 0.000 NA   NA
 5859197 5859198 E2348C_4010 E2348C_4011 gyrB recF TRUE 0.979 29.000 0.249 0.002 Y NA
 5859198 5859199 E2348C_4011 E2348C_4012 recF dnaN TRUE 0.997 0.000 0.318 1.000 Y NA
 5859199 5859200 E2348C_4012 E2348C_4013 dnaN dnaA TRUE 0.996 5.000 0.328 1.000 Y NA
 5859201 5859202 E2348C_4014 E2348C_4015 rpmH rnpA TRUE 0.983 17.000 0.787 1.000   NA
 5859202 5859203 E2348C_4015 E2348C_4016 rnpA yidC FALSE 0.054 224.000 0.105 1.000 N NA
 5859203 5859204 E2348C_4016 E2348C_4017 yidC mnmE TRUE 0.506 106.000 0.221 1.000   NA
 5859204 5859205 E2348C_4017 E2348C_4018 mnmE tanC FALSE 0.027 242.000 0.000 NA   NA
 5859205 5859206 E2348C_4018 E2348C_4019 tanC tnaA FALSE 0.050 221.000 0.077 NA   NA
 5859206 5859207 E2348C_4019 E2348C_4020 tnaA tnaB TRUE 0.661 136.000 0.154 1.000 Y NA
 5859207 5859208 E2348C_4020 E2348C_4021 tnaB mdtL FALSE 0.104 132.000 0.000 NA N NA
 5859208 5859209 E2348C_4021 E2348C_4022 mdtL yidZ TRUE 0.941 -25.000 0.526 NA N NA
 5859209 5859210 E2348C_4022 E2348C_4023 yidZ yieE FALSE 0.203 145.000 0.114 1.000 N NA
 5859210 5859211 E2348C_4023 E2348C_4024 yieE yieF TRUE 0.765 22.000 0.074 NA   NA
 5859213 5859214 E2348C_4026 E2348C_4027 yieH cbrB FALSE 0.275 67.000 0.000 NA   NA
 5859215 5859216 E2348C_4028 E2348C_4029 yieK yieL TRUE 0.812 15.000 0.000 NA   NA
 5859216 5859217 E2348C_4029 E2348C_4030 yieL bglH TRUE 0.868 27.000 0.267 1.000 N NA
 5859217 5859218 E2348C_4030 E2348C_4031 bglH bglB TRUE 0.880 86.000 0.364 1.000 Y NA
 5859218 5859219 E2348C_4031 E2348C_4032 bglB bglF TRUE 0.991 19.000 0.562 1.000 Y NA
 5859219 5859220 E2348C_4032 E2348C_4033 bglF bglG TRUE 0.514 133.000 0.312 1.000   NA
 5859220 5859221 E2348C_4033 E2348C_4034 bglG phoU FALSE 0.017 286.000 0.000 NA   NA
 5859221 5859222 E2348C_4034 E2348C_4035 phoU pstB TRUE 0.988 15.000 0.317 NA Y NA
 5859222 5859223 E2348C_4035 E2348C_4036 pstB pstA TRUE 0.953 91.000 0.526 0.001 Y NA
 5859223 5859224 E2348C_4036 E2348C_4037 pstA pstC TRUE 0.999 0.000 0.537 0.001 Y NA
 5859224 5859225 E2348C_4037 E2348C_4038 pstC pstS TRUE 0.874 87.000 0.145 0.001 Y NA
 5859225 5859226 E2348C_4038 E2348C_4039 pstS glmS FALSE 0.010 314.000 0.000 1.000 N NA
 5859226 5859227 E2348C_4039 E2348C_4040 glmS glmU FALSE 0.432 162.000 0.055 1.000 Y NA
 5859227 5859228 E2348C_4040 E2348C_4041 glmU atpC FALSE 0.010 354.000 0.067 1.000 N NA
 5859228 5859229 E2348C_4041 E2348C_4042 atpC atpD TRUE 0.997 21.000 0.837 0.002 Y NA
 5859229 5859230 E2348C_4042 E2348C_4043 atpD atpG TRUE 0.994 27.000 0.724 0.002 Y NA
 5859230 5859231 E2348C_4043 E2348C_4044 atpG atpA TRUE 0.986 51.000 0.846 0.002 Y NA
 5859231 5859232 E2348C_4044 E2348C_4045 atpA atpH TRUE 0.998 13.000 0.864 0.002 Y NA
 5859232 5859233 E2348C_4045 E2348C_4046 atpH atpF TRUE 0.993 15.000 0.242 0.002 Y NA
 5859233 5859234 E2348C_4046 E2348C_4047 atpF atpE TRUE 0.974 62.000 0.666 0.002 Y NA
 5859234 5859235 E2348C_4047 E2348C_4048 atpE atpB TRUE 0.981 47.000 0.557 0.002 Y NA
 5859235 5859236 E2348C_4048 E2348C_4049 atpB atpI TRUE 0.995 9.000 0.291 1.000 Y NA
 5859236 5859237 E2348C_4049 E2348C_4050 atpI gidB FALSE 0.002 617.000 0.005 1.000 N NA
 5859237 5859238 E2348C_4050 E2348C_4051 gidB mnmG TRUE 0.759 64.000 0.466 1.000 N NA
 5859238 5859239 E2348C_4051 E2348C_4052 mnmG mioC FALSE 0.006 379.000 0.000 1.000 N NA
 5859239 5859240 E2348C_4052 E2348C_4053 mioC asnC FALSE 0.411 90.000 0.165 1.000 N NA
 5859242 5859243 E2348C_4055 E2348C_4056 viaA ravA TRUE 0.980 -6.000 0.443 NA   NA
 5859244 5859245 E2348C_4057 E2348C_4058 kup rbsD FALSE 0.076 167.000 0.000 1.000 N NA
 5859245 5859246 E2348C_4058 E2348C_4059 rbsD rbsA TRUE 0.996 8.000 0.337 1.000 Y NA
 5859246 5859247 E2348C_4059 E2348C_4060 rbsA rbsC TRUE 0.997 5.000 0.504 1.000 Y NA
 5859247 5859248 E2348C_4060 E2348C_4061 rbsC rbsB TRUE 0.991 25.000 0.847 NA Y NA
 5859248 5859249 E2348C_4061 E2348C_4062 rbsB rbsK TRUE 0.810 126.000 0.347 NA Y NA
 5859249 5859250 E2348C_4062 E2348C_4063 rbsK rbsR TRUE 0.990 4.000 0.500 1.000 N NA
 5859251 5859252 E2348C_4064 E2348C_4065 hsrA yieP TRUE 0.816 23.000 0.100 1.000   NA
 5859253 5859254 E2348C_rRNA11 E2348C_tRNA69 rrsC gltU FALSE 0.230 86.000 0.000 NA   NA
 5859254 5859255 E2348C_tRNA69 E2348C_rRNA12 gltU rrlC FALSE 0.059 194.000 0.000 NA   NA
 5859255 5859256 E2348C_rRNA12 E2348C_rRNA13 rrlC rrfC FALSE 0.206 99.000 0.000 NA   NA
 5859256 5859257 E2348C_rRNA13 E2348C_tRNA70 rrfC aspT FALSE 0.360 53.000 0.000 NA   NA
 5859257 5859258 E2348C_tRNA70 E2348C_tRNA71 aspT trpT TRUE 0.903 9.000 0.000 NA   NA
 5859262 5859263 E2348C_4069 E2348C_4070 ilvL ilvG FALSE 0.433 140.000 0.091 0.002   NA
 5859263 5859264 E2348C_4070 E2348C_4071 ilvG ilvM TRUE 0.998 -3.000 0.943 0.001   NA
 5859264 5859265 E2348C_4071 E2348C_4072 ilvM ilvE TRUE 0.911 20.000 0.205 1.000   NA
 5859265 5859266 E2348C_4072 E2348C_4073 ilvE ilvD TRUE 0.755 65.000 0.075 1.000 Y NA
 5859266 5859267 E2348C_4073 E2348C_4074 ilvD ilvA TRUE 0.992 3.000 0.106 1.000 Y NA
 5859272 5859273 E2348C_4079 E2348C_4080 gpp rhlB TRUE 0.528 136.000 0.406 1.000 N NA
 5859274 5859275 E2348C_4081 E2348C_4082 trxA rhoL FALSE 0.090 141.000 0.004 NA   NA
 5859275 5859276 E2348C_4082 E2348C_4083 rhoL rho FALSE 0.159 85.000 0.002 NA   NA
 5859276 5859277 E2348C_4083 E2348C_4084 rho   TRUE 0.897 10.000 0.000 NA   NA
 5859277 5859278 E2348C_4084 E2348C_4085   rfe TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 5859278 5859279 E2348C_4085 E2348C_4086 rfe wzzE TRUE 0.998 12.000 0.735 0.003 Y NA
 5859279 5859280 E2348C_4086 E2348C_4087 wzzE rffE TRUE 0.979 56.000 0.677 0.003 Y NA
 5859280 5859281 E2348C_4087 E2348C_4088 rffE rffD TRUE 0.996 -3.000 0.348 1.000 Y NA
 5859281 5859282 E2348C_4088 E2348C_4089 rffD rffG TRUE 0.996 0.000 0.273 1.000 Y NA
 5859282 5859283 E2348C_4089 E2348C_4090 rffG rffH TRUE 0.997 19.000 0.739 0.002 Y NA
 5859283 5859284 E2348C_4090 E2348C_4091 rffH rffC TRUE 0.854 -22.000 0.145 1.000   NA
 5859284 5859285 E2348C_4091 E2348C_4092 rffC rffA TRUE 0.981 5.000 0.248 1.000   NA
 5859285 5859286 E2348C_4092 E2348C_4093 rffA wzxE TRUE 0.982 2.000 0.218 1.000   NA
 5859286 5859287 E2348C_4093 E2348C_4094 wzxE rffT TRUE 0.993 -3.000 0.605 1.000   NA
 5859287 5859288 E2348C_4094 E2348C_4095 rffT wzyE TRUE 0.994 -3.000 0.684 1.000   NA
 5859288 5859289 E2348C_4095 E2348C_4096 wzyE rffM TRUE 0.969 3.000 0.126 1.000   NA
 5859289 5859290 E2348C_4096 E2348C_4097 rffM yifK FALSE 0.051 191.000 0.000 1.000 N NA
 5859290 5859291 E2348C_4097 E2348C_tRNA72 yifK argX FALSE 0.200 103.000 0.000 NA   NA
 5859291 5859292 E2348C_tRNA72 E2348C_tRNA73 argX hisR FALSE 0.318 59.000 0.000 NA   NA
 5859292 5859293 E2348C_tRNA73 E2348C_tRNA74 hisR leuT TRUE 0.714 21.000 0.000 NA   NA
 5859293 5859294 E2348C_tRNA74 E2348C_tRNA75 leuT proM FALSE 0.454 43.000 0.000 NA   NA
 5859294 5859295 E2348C_tRNA75 E2348C_4098 proM aslB FALSE 0.126 147.000 0.000 NA   NA
 5859298 5859299 E2348C_4100 E2348C_4101 hemY hemX TRUE 0.993 3.000 0.144 1.000 Y NA
 5859299 5859300 E2348C_4101 E2348C_4102 hemX hemD TRUE 0.989 22.000 0.600 1.000 Y NA
 5859300 5859301 E2348C_4102 E2348C_4103 hemD hemC TRUE 0.997 -3.000 0.205 0.001 Y NA
 5859303 5859304 E2348C_4105 E2348C_4106 cyaY   FALSE 0.410 48.000 0.000 NA   NA
 5859304 5859305 E2348C_4106 E2348C_4107     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5859306 5859307 E2348C_4108 E2348C_4109 yifL dapF FALSE 0.305 37.000 0.021 NA N NA
 5859307 5859308 E2348C_4109 E2348C_4110 dapF yigA TRUE 0.971 -3.000 0.175 NA   NA
 5859308 5859309 E2348C_4110 E2348C_4111 yigA xerC TRUE 0.994 -3.000 0.714 NA   NA
 5859309 5859310 E2348C_4111 E2348C_4112 xerC yigB TRUE 0.991 0.000 0.367 1.000   NA
 5859310 5859311 E2348C_4112 E2348C_4113 yigB uvrD FALSE 0.431 84.000 0.128 1.000   NA
 5859312 5859313 E2348C_4114 E2348C_4115   yigE FALSE 0.234 83.000 0.000 NA   NA
 5859315 5859316 E2348C_4117 E2348C_4118     TRUE 0.992 -3.000 0.600 NA   NA
 5859316 5859317 E2348C_4118 E2348C_4119   rarD FALSE 0.013 311.000 0.000 NA   NA
 5859317 5859318 E2348C_4119 E2348C_4120 rarD yigI TRUE 0.514 52.000 0.099 NA   NA
 5859319 5859320 E2348C_4121 E2348C_4122 pldA recQ FALSE 0.161 125.000 0.057 1.000 N NA
 5859320 5859321 E2348C_4122 E2348C_4123 recQ rhtC FALSE 0.243 64.000 0.043 1.000 N NA
 5859322 5859323 E2348C_4124 E2348C_4125   rhtB FALSE 0.125 159.000 0.062 NA   NA
 5859324 5859325 E2348C_4126 E2348C_4127 pldB yigL TRUE 0.990 8.000 0.524 1.000   NA
 5859325 5859326 E2348C_4127 E2348C_4128 yigL yigM FALSE 0.327 76.000 0.067 1.000   NA
 5859328 5859329 E2348C_4130 E2348C_4131 metE   FALSE 0.009 327.000 0.000 1.000 N NA
 5859329 5859330 E2348C_4131 E2348C_4132     FALSE 0.414 42.000 0.000 1.000 N NA
 5859330 5859331 E2348C_4132 E2348C_4133     TRUE 0.798 51.000 0.000 1.000 Y NA
 5859332 5859333 E2348C_4134 E2348C_4135     FALSE 0.372 200.000 0.000 0.041 Y NA
 5859333 5859334 E2348C_4135 E2348C_4136     FALSE 0.203 78.000 0.000 1.000 N NA
 5859334 5859335 E2348C_4136 E2348C_4137     TRUE 0.818 26.000 0.154 NA   NA
 5859335 5859336 E2348C_4137 E2348C_4138     TRUE 0.961 17.000 0.400 NA   NA
 5859336 5859337 E2348C_4138 E2348C_4139     TRUE 0.836 -7.000 0.000 NA   NA
 5859339 5859340 E2348C_4141 E2348C_4142     FALSE 0.321 95.000 0.095 NA   NA
 5859340 5859341 E2348C_4142 E2348C_4143     TRUE 0.914 6.000 0.048 NA   NA
 5859341 5859342 E2348C_4143 E2348C_4144   ysgA FALSE 0.132 257.000 0.000 1.000 Y NA
 5859343 5859344 E2348C_4145 E2348C_4146 udp rmuC FALSE 0.127 141.000 0.041 NA   NA
 5859344 5859345 E2348C_4146 E2348C_4147 rmuC ubiE FALSE 0.216 95.000 0.047 NA   NA
 5859345 5859346 E2348C_4147 E2348C_4148 ubiE yigP TRUE 0.931 14.000 0.145 1.000   NA
 5859346 5859347 E2348C_4148 E2348C_4149 yigP ubiB TRUE 0.990 -3.000 0.432 1.000   NA
 5859347 5859348 E2348C_4149 E2348C_4150 ubiB tatA FALSE 0.240 79.000 0.032 1.000   NA
 5859348 5859349 E2348C_4150 E2348C_4151 tatA tatB TRUE 0.994 4.000 0.188 1.000 Y NA
 5859349 5859350 E2348C_4151 E2348C_4152 tatB tatC TRUE 0.996 3.000 0.333 NA Y NA
 5859350 5859351 E2348C_4152 E2348C_4153 tatC tatD TRUE 0.578 42.000 0.121 NA N NA
 5859353 5859354 E2348C_4155 E2348C_4156 ubiD fre TRUE 0.854 46.000 0.090 NA Y NA
 5859355 5859356 E2348C_4157 E2348C_4158 fadA fadB TRUE 0.997 10.000 0.607 1.000 Y NA
 5859357 5859358 E2348C_4159 E2348C_4160 pepQ yigZ TRUE 0.973 0.000 0.127 1.000   NA
 5859358 5859359 E2348C_4160 E2348C_4161 yigZ trkH TRUE 0.788 39.000 0.202 1.000   NA
 5859359 5859360 E2348C_4161 E2348C_4162 trkH hemG TRUE 0.980 12.000 0.455 1.000 N NA
 5859360 5859361 E2348C_4162 E2348C_rRNA14 hemG rrsA FALSE 0.008 377.000 0.000 NA   NA
 5859361 5859362 E2348C_rRNA14 E2348C_tRNA76 rrsA ileT FALSE 0.268 69.000 0.000 NA   NA
 5859362 5859363 E2348C_tRNA76 E2348C_tRNA77 ileT alaT FALSE 0.454 43.000 0.000 NA   NA
 5859363 5859364 E2348C_tRNA77 E2348C_rRNA15 alaT rrlA FALSE 0.071 184.000 0.000 NA   NA
 5859364 5859365 E2348C_rRNA15 E2348C_rRNA16 rrlA rrfA FALSE 0.206 99.000 0.000 NA   NA
 5859366 5859367 E2348C_4163 E2348C_4164 mobB mobA TRUE 0.972 -18.000 0.064 0.002 Y NA
 5859368 5859369 E2348C_4165 E2348C_4166 yihD rdoA FALSE 0.375 77.000 0.106 NA   NA
 5859369 5859370 E2348C_4166 E2348C_4167 rdoA dsbA TRUE 0.869 17.000 0.111 NA   NA
 5859370 5859371 E2348C_4167 E2348C_4168 dsbA yihF FALSE 0.110 155.000 0.000 NA   NA
 5859373 5859374 E2348C_4170 E2348C_ncR66 polA spf FALSE 0.124 148.000 0.000 NA   NA
 5859376 5859377 E2348C_ncR67 E2348C_4172 csrC yihI FALSE 0.275 67.000 0.000 NA   NA
 5859377 5859378 E2348C_4172 E2348C_4173 yihI hemN FALSE 0.118 189.000 0.107 NA   NA
 5859379 5859380 E2348C_4174 E2348C_4175 glnG glnL TRUE 0.997 12.000 0.587 0.056 Y NA
 5859380 5859381 E2348C_4175 E2348C_4176 glnL glnA FALSE 0.074 174.000 0.053 1.000 N NA
 5859383 5859384 E2348C_4178 E2348C_4179     TRUE 0.985 40.000 1.000 1.000 Y NA
 5859385 5859386 E2348C_4180 E2348C_4181     TRUE 0.778 25.000 0.125 1.000 N NA
 5859386 5859387 E2348C_4181 E2348C_4182     TRUE 0.776 33.000 0.188 1.000 N NA
 5859387 5859388 E2348C_4182 E2348C_4183     FALSE 0.306 70.000 0.079 1.000 N NA
 5859388 5859389 E2348C_4183 E2348C_4184     FALSE 0.424 99.000 0.053 0.039   NA
 5859389 5859390 E2348C_4184 E2348C_4185   yihW TRUE 0.961 -10.000 0.333 1.000   NA
 5859390 5859391 E2348C_4185 E2348C_4186 yihW yihX FALSE 0.157 141.000 0.000 1.000   NA
 5859391 5859392 E2348C_4186 E2348C_4187 yihX yihY TRUE 0.880 -6.000 0.000 1.000   NA
 5859392 5859393 E2348C_4187 E2348C_4188 yihY dtd TRUE 0.944 -3.000 0.069 1.000   NA
 5859393 5859394 E2348C_4188 E2348C_4189 dtd yiiD TRUE 0.536 45.000 0.065 1.000   NA
 5859396 5859397 E2348C_4191 E2348C_4192     TRUE 0.985 1.000 0.280 NA   NA
 5859397 5859398 E2348C_4192 E2348C_4193   yiiE FALSE 0.005 605.000 0.000 1.000   NA
 5859399 5859400 E2348C_4194 E2348C_4195 fdhE fdoI TRUE 0.964 -3.000 0.182 NA N NA
 5859400 5859401 E2348C_4195 E2348C_4196 fdoI fdoH TRUE 0.999 -3.000 0.944 0.001 Y NA
 5859401 5859402 E2348C_4196 E2348C_4197 fdoH fdoG TRUE 0.999 13.000 0.833 0.001 Y NA
 5859403 5859404 E2348C_4198 E2348C_4199 fdhD   FALSE 0.011 311.000 0.000 1.000 N NA
 5859404 5859405 E2348C_4199 E2348C_4200     TRUE 0.995 2.000 0.727 1.000   NA
 5859406 5859407 E2348C_4201 E2348C_4202 frvR frvX TRUE 0.989 0.000 0.400 NA N NA
 5859407 5859408 E2348C_4202 E2348C_4203 frvX frvB TRUE 0.994 -10.000 0.667 NA Y NA
 5859408 5859409 E2348C_4203 E2348C_4204 frvB frvA TRUE 0.989 11.000 0.000 0.008 Y NA
 5859411 5859412 E2348C_4206 E2348C_4207 rhaM rhaD TRUE 0.945 10.000 0.112 NA   NA
 5859412 5859413 E2348C_4207 E2348C_4208 rhaD rhaA TRUE 0.529 191.000 0.247 1.000 Y NA
 5859413 5859414 E2348C_4208 E2348C_4209 rhaA rhaB TRUE 0.997 -3.000 0.387 1.000 Y NA
 5859415 5859416 E2348C_4210 E2348C_4211 rhaS rhaR TRUE 0.996 -16.000 0.800 0.018 Y NA
 5859418 5859419 E2348C_4213 E2348C_4214 sodA kdgT FALSE 0.027 260.000 0.000 1.000   NA
 5859419 5859420 E2348C_4214 E2348C_4215 kdgT yiiM FALSE 0.141 149.000 0.000 1.000   NA
 5859421 5859422 E2348C_4216 E2348C_4217 cpxA cpxR TRUE 0.998 -3.000 0.791 1.000 Y NA
 5859423 5859424 E2348C_4218 E2348C_4219 cpxP fieF FALSE 0.427 148.000 0.031 NA Y NA
 5859424 5859425 E2348C_4219 E2348C_4220 fieF pfkA FALSE 0.056 181.000 0.040 1.000 N NA
 5859425 5859426 E2348C_4220 E2348C_4221 pfkA sbp FALSE 0.011 320.000 0.049 1.000 N NA
 5859426 5859427 E2348C_4221 E2348C_4222 sbp cdh FALSE 0.165 107.000 0.000 1.000 N NA
 5859428 5859429 E2348C_4223 E2348C_4224 tpiA yiiQ FALSE 0.221 108.000 0.058 NA   NA
 5859430 5859431 E2348C_4225 E2348C_4226 yiiR yiiS FALSE 0.042 212.000 0.000 NA   NA
 5859431 5859432 E2348C_4226 E2348C_4227 yiiS uspD TRUE 0.618 27.000 0.000 NA   NA
 5859433 5859434 E2348C_4228 E2348C_4229 fpr glpX FALSE 0.315 97.000 0.117 1.000 N NA
 5859434 5859435 E2348C_4229 E2348C_4230 glpX glpK FALSE 0.053 171.000 0.025 1.000 N NA
 5859435 5859436 E2348C_4230 E2348C_4231 glpK glpF TRUE 0.502 23.000 0.004 1.000 N NA
 5859438 5859439 E2348C_4233 E2348C_4234 rraA menA TRUE 0.751 93.000 0.158 NA Y NA
 5859439 5859440 E2348C_4234 E2348C_4235 menA hslU FALSE 0.246 67.000 0.051 1.000 N NA
 5859440 5859441 E2348C_4235 E2348C_4236 hslU hslV TRUE 0.998 10.000 0.752 1.000 Y NA
 5859441 5859442 E2348C_4236 E2348C_4237 hslV ftsN FALSE 0.305 93.000 0.122 NA N NA
 5859442 5859443 E2348C_4237 E2348C_4238 ftsN cytR TRUE 0.485 92.000 0.245 NA N NA
 5859443 5859444 E2348C_4238 E2348C_4239 cytR priA FALSE 0.058 156.000 0.013 1.000 N NA
 5859446 5859447 E2348C_4241 E2348C_4242 yiiX metJ FALSE 0.313 60.000 0.000 NA   NA
 5859448 5859449 E2348C_4243 E2348C_4244 metB metL TRUE 0.997 3.000 0.428 1.000 Y NA
 5859450 5859451 E2348C_4245 E2348C_4246     FALSE 0.205 77.000 0.000 1.000 N NA
 5859451 5859452 E2348C_4246 E2348C_4247     TRUE 0.928 41.000 0.000 0.001 Y NA
 5859452 5859453 E2348C_4247 E2348C_4248     FALSE 0.036 230.000 0.000 1.000   NA
 5859454 5859455 E2348C_4249 E2348C_4250   metF FALSE 0.006 382.000 0.000 1.000 N NA
 5859455 5859456 E2348C_4250 E2348C_4251 metF katG FALSE 0.006 329.000 0.010 1.000 N NA
 5859456 5859457 E2348C_4251 E2348C_4252 katG yijE FALSE 0.188 94.000 0.012 1.000   NA
 5859459 5859460 E2348C_4254 E2348C_4255     FALSE 0.198 105.000 0.000 NA   NA
 5859460 5859461 E2348C_4255 E2348C_4256     FALSE 0.018 282.000 0.000 NA   NA
 5859461 5859462 E2348C_4256 E2348C_4257     TRUE 0.774 17.000 0.000 NA   NA
 5859463 5859464 E2348C_4258 E2348C_4259 gldA fsaB TRUE 0.988 11.000 0.600 1.000 N NA
 5859464 5859465 E2348C_4259 E2348C_4260 fsaB ptsA TRUE 0.977 12.000 0.000 1.000 Y NA
 5859466 5859467 E2348C_4261 E2348C_4262 frwC frwB TRUE 0.995 15.000 0.400 0.008 Y NA
 5859467 5859468 E2348C_4262 E2348C_4263 frwB pflD TRUE 0.726 51.000 0.280 1.000 N NA
 5859468 5859469 E2348C_4263 E2348C_4264 pflD pflC TRUE 0.946 -34.000 0.312 0.002 N NA
 5859469 5859470 E2348C_4264 E2348C_4265 pflC frwD TRUE 0.969 2.000 0.156 1.000 N NA
 5859471 5859472 E2348C_4266 E2348C_4267 yijO yijP FALSE 0.080 226.000 0.130 1.000   NA
 5859472 5859473 E2348C_4267 E2348C_4268 yijP ppc FALSE 0.086 183.000 0.000 1.000   NA
 5859473 5859474 E2348C_4268 E2348C_4269 ppc argE FALSE 0.013 302.000 0.053 1.000 N NA
 5859475 5859476 E2348C_4270 E2348C_4271 argC argB TRUE 0.993 11.000 0.097 0.001 Y NA
 5859476 5859477 E2348C_4271 E2348C_4272 argB argH TRUE 0.705 61.000 0.017 1.000 Y NA
 5859477 5859478 E2348C_4272 E2348C_4273 argH   FALSE 0.004 498.000 0.000 1.000 N NA
 5859478 5859479 E2348C_4273 E2348C_4274     FALSE 0.196 67.000 0.000 NA N NA
 5859483 5859484 E2348C_4277 E2348C_4278     TRUE 0.498 43.000 0.000 1.000   NA
 5859484 5859485 E2348C_4278 E2348C_4279   fabR FALSE 0.342 50.000 0.000 1.000 N NA
 5859485 5859486 E2348C_4279 E2348C_4280 fabR yijD TRUE 0.980 0.000 0.194 NA   NA
 5859488 5859489 E2348C_ncR69 E2348C_4282   btuB FALSE 0.285 65.000 0.000 NA   NA
 5859489 5859490 E2348C_4282 E2348C_4283 btuB murI TRUE 0.477 -55.000 0.025 1.000 N NA
 5859490 5859491 E2348C_4283 E2348C_rRNA17 murI rrsB FALSE 0.008 374.000 0.000 NA   NA
 5859491 5859492 E2348C_rRNA17 E2348C_tRNA78 rrsB gltT FALSE 0.230 86.000 0.000 NA   NA
 5859492 5859493 E2348C_tRNA78 E2348C_rRNA18 gltT rrlB FALSE 0.059 194.000 0.000 NA   NA
 5859493 5859494 E2348C_rRNA18 E2348C_rRNA19 rrlB rrfB FALSE 0.206 99.000 0.000 NA   NA
 5859494 5859495 E2348C_rRNA19 E2348C_4284 rrfB murB FALSE 0.146 135.000 0.000 NA   NA
 5859495 5859496 E2348C_4284 E2348C_4285 murB birA TRUE 0.972 -3.000 0.211 1.000 N NA
 5859498 5859499 E2348C_tRNA79 E2348C_tRNA80 thrU tyrU TRUE 0.903 9.000 0.000 NA   NA
 5859499 5859500 E2348C_tRNA80 E2348C_tRNA81 tyrU glyT FALSE 0.183 117.000 0.000 NA   NA
 5859500 5859501 E2348C_tRNA81 E2348C_tRNA82 glyT thrT TRUE 0.910 7.000 0.000 NA   NA
 5859501 5859502 E2348C_tRNA82 E2348C_4287 thrT tufB FALSE 0.185 115.000 0.000 NA   NA
 5859502 5859503 E2348C_4287 E2348C_4288 tufB secE FALSE 0.015 230.000 0.009 1.000 N NA
 5859503 5859504 E2348C_4288 E2348C_4289 secE nusG TRUE 0.995 2.000 0.843 1.000 N NA
 5859504 5859505 E2348C_4289 E2348C_4290 nusG rplK TRUE 0.598 159.000 0.681 1.000 N NA
 5859505 5859506 E2348C_4290 E2348C_4291 rplK rplA TRUE 0.999 4.000 0.838 0.012 Y NA
 5859506 5859507 E2348C_4291 E2348C_4292 rplA rplJ FALSE 0.355 292.000 0.302 0.012 Y NA
 5859507 5859508 E2348C_4292 E2348C_4293 rplJ rplL TRUE 0.976 67.000 0.884 0.009 Y NA
 5859508 5859509 E2348C_4293 E2348C_ncR70 rplL   TRUE 0.916 5.000 0.000 NA   NA
 5859509 5859510 E2348C_ncR70 E2348C_4294   rpoB FALSE 0.024 254.000 0.000 NA   NA
 5859510 5859511 E2348C_4294 E2348C_4295 rpoB rpoC TRUE 0.930 77.000 0.851 0.000   NA
 5859512 5859513 E2348C_4296 E2348C_4297 thiH thiG TRUE 0.997 -3.000 0.277 0.003 Y NA
 5859513 5859514 E2348C_4297 E2348C_4298 thiG thiS TRUE 0.991 2.000 0.087 1.000 Y NA
 5859514 5859515 E2348C_4298 E2348C_4299 thiS thiF TRUE 0.989 -16.000 0.548 1.000 Y NA
 5859515 5859516 E2348C_4299 E2348C_4300 thiF thiE TRUE 0.988 -7.000 0.242 1.000 Y NA
 5859516 5859517 E2348C_4300 E2348C_4301 thiE thiC TRUE 0.995 0.000 0.063 0.003 Y NA
 5859517 5859518 E2348C_4301 E2348C_ncR71 thiC   FALSE 0.235 81.000 0.000 NA   NA
 5859518 5859519 E2348C_ncR71 E2348C_4302   rsd FALSE 0.371 52.000 0.000 NA   NA
 5859520 5859521 E2348C_4303 E2348C_4304 nudC hemE FALSE 0.412 40.000 0.040 1.000 N NA
 5859521 5859522 E2348C_4304 E2348C_4305 hemE nfi TRUE 0.844 10.000 0.028 1.000 N NA
 5859522 5859523 E2348C_4305 E2348C_4306 nfi yjaG TRUE 0.570 43.000 0.086 NA   NA
 5859523 5859524 E2348C_4306 E2348C_4307 yjaG hupA FALSE 0.315 187.000 0.355 NA   NA
 5859524 5859525 E2348C_4307 E2348C_4308 hupA yjaH TRUE 0.974 13.000 0.375 NA   NA
 5859527 5859528 E2348C_4310 E2348C_4311 zraS zraR TRUE 0.998 -3.000 0.500 0.067 Y NA
 5859529 5859530 E2348C_4312 E2348C_4313 purD purH TRUE 0.991 12.000 0.238 1.000 Y NA
 5859531 5859532 E2348C_rRNA20 E2348C_tRNA83 rrsE ileU_1 FALSE 0.268 69.000 0.000 NA   NA
 5859532 5859533 E2348C_tRNA83 E2348C_tRNA84 ileU_1 alaU_1 FALSE 0.454 43.000 0.000 NA   NA
 5859533 5859534 E2348C_tRNA84 E2348C_rRNA21 alaU_1 rrlE FALSE 0.071 184.000 0.000 NA   NA
 5859534 5859535 E2348C_rRNA21 E2348C_rRNA22 rrlE rrfE FALSE 0.206 99.000 0.000 NA   NA
 5859535 5859536 E2348C_rRNA22 E2348C_4314 rrfE yjaA FALSE 0.247 75.000 0.000 NA   NA
 5859538 5859539 E2348C_4316 E2348C_4317 metA aceB FALSE 0.016 269.000 0.000 1.000 N NA
 5859539 5859540 E2348C_4317 E2348C_4318 aceB aceA TRUE 0.951 30.000 0.043 0.001 Y NA
 5859540 5859541 E2348C_4318 E2348C_4319 aceA aceK FALSE 0.140 125.000 0.000 1.000 N NA
 5859543 5859544 E2348C_4321 E2348C_4322 metH   FALSE 0.352 54.000 0.000 NA   NA
 5859544 5859545 E2348C_4322 E2348C_4323     FALSE 0.454 43.000 0.000 NA   NA
 5859545 5859546 E2348C_4323 E2348C_4324   yjbB FALSE 0.088 171.000 0.000 NA   NA
 5859546 5859547 E2348C_4324 E2348C_4325 yjbB   FALSE 0.263 86.000 0.000 1.000   NA
 5859547 5859548 E2348C_4325 E2348C_4326     FALSE 0.201 102.000 0.000 NA   NA
 5859548 5859549 E2348C_4326 E2348C_4327     FALSE 0.018 282.000 0.000 NA   NA
 5859549 5859550 E2348C_4327 E2348C_4328     TRUE 0.774 17.000 0.000 NA   NA
 5859551 5859552 E2348C_4329 E2348C_4330 pepE   FALSE 0.048 381.000 0.000 1.000 Y NA
 5859552 5859553 E2348C_4330 E2348C_4331     TRUE 0.722 52.000 0.286 1.000 N NA
 5859553 5859554 E2348C_4331 E2348C_4332     TRUE 0.997 11.000 0.333 0.012 Y NA
 5859554 5859555 E2348C_4332 E2348C_4333     TRUE 0.946 66.000 0.400 0.012 Y NA
 5859555 5859556 E2348C_4333 E2348C_4334     TRUE 0.997 0.000 0.167 0.007 Y NA
 5859556 5859557 E2348C_4334 E2348C_4335     TRUE 0.920 10.000 0.083 1.000 N NA
 5859557 5859558 E2348C_4335 E2348C_4336     FALSE 0.338 70.000 0.091 1.000 N NA
 5859560 5859561 E2348C_4338 E2348C_4339 pagB lysC FALSE 0.024 254.000 0.000 NA   NA
 5859561 5859562 E2348C_4339 E2348C_ncR72 lysC   FALSE 0.221 92.000 0.000 NA   NA
 5859563 5859564 E2348C_4340 E2348C_4341 pgi yjbE FALSE 0.009 354.000 0.000 NA   NA
 5859564 5859565 E2348C_4341 E2348C_4342 yjbE yjbF TRUE 0.784 114.000 0.778 NA   NA
 5859565 5859566 E2348C_4342 E2348C_4343 yjbF yjbG TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 5859566 5859567 E2348C_4343 E2348C_4344 yjbG yjbH TRUE 0.972 0.000 0.140 NA   NA
 5859570 5859571 E2348C_4347 E2348C_4348 malG malF TRUE 0.998 15.000 0.814 0.039 Y NA
 5859571 5859572 E2348C_4348 E2348C_4349 malF malE FALSE 0.445 154.000 0.000 1.000 Y NA
 5859573 5859574 E2348C_4350 E2348C_4351 malK lamB TRUE 0.843 72.000 0.111 0.049 Y NA
 5859576 5859577 E2348C_4353 E2348C_4354 malM ubiC FALSE 0.061 179.000 0.025 NA   NA
 5859577 5859578 E2348C_4354 E2348C_4355 ubiC ubiA TRUE 0.989 13.000 0.248 NA Y NA
 5859580 5859581 E2348C_4357 E2348C_4358 dgkA lexA FALSE 0.329 110.000 0.141 1.000 N NA
 5859581 5859582 E2348C_4358 E2348C_4359 lexA dinF TRUE 0.658 19.000 0.033 1.000 N NA
 5859582 5859583 E2348C_4359 E2348C_4360 dinF yjbJ FALSE 0.141 116.000 0.021 NA   NA
 5859585 5859586 E2348C_4362 E2348C_4363 dusA pspG FALSE 0.190 134.000 0.070 NA   NA
 5859588 5859589 E2348C_4365 E2348C_4366 dnaB alr TRUE 0.735 53.000 0.317 1.000 N NA
 5859589 5859590 E2348C_4366 E2348C_4367 alr   TRUE 0.634 23.000 0.000 1.000 N NA
 5859590 5859591 E2348C_4367 E2348C_4368     TRUE 0.991 -3.000 0.143 NA Y NA
 5859591 5859592 E2348C_4368 E2348C_4369   tyrB FALSE 0.165 82.000 0.000 NA N NA
 5859592 5859593 E2348C_4369 E2348C_4370 tyrB   FALSE 0.036 182.000 0.003 1.000 N NA
 5859593 5859594 E2348C_4370 E2348C_4371     TRUE 0.983 33.000 0.667 1.000 Y NA
 5859594 5859595 E2348C_4371 E2348C_4372     TRUE 0.991 12.000 0.253 1.000 Y NA
 5859595 5859596 E2348C_4372 E2348C_4373     TRUE 0.945 22.000 0.069 1.000 Y NA
 5859596 5859597 E2348C_4373 E2348C_4374     TRUE 0.998 13.000 0.806 0.001 Y NA
 5859597 5859598 E2348C_4374 E2348C_4375     FALSE 0.034 212.000 0.000 1.000 N NA
 5859598 5859599 E2348C_4375 E2348C_4376     TRUE 0.938 12.000 0.156 1.000 N NA
 5859600 5859601 E2348C_4377 E2348C_4378     TRUE 0.992 -7.000 0.214 0.067 Y NA
 5859602 5859603 E2348C_4379 E2348C_4380 aphA yjbQ FALSE 0.134 111.000 0.009 NA   NA
 5859603 5859604 E2348C_4380 E2348C_4381 yjbQ yjbR TRUE 0.893 4.000 0.018 NA   NA
 5859612 5859613 E2348C_4388 E2348C_4389 yjcD yjcE FALSE 0.248 151.000 0.130 1.000   NA
 5859614 5859615 E2348C_4390 E2348C_4391 actP yjcH TRUE 0.994 -3.000 0.733 NA   NA
 5859615 5859616 E2348C_4391 E2348C_4392 yjcH acs FALSE 0.038 292.000 0.147 NA   NA
 5859617 5859618 E2348C_4393 E2348C_4394 nrfA nrfB TRUE 0.795 45.000 0.083 0.001   NA
 5859618 5859619 E2348C_4394 E2348C_4395 nrfB nrfC TRUE 0.977 -3.000 0.049 0.001   NA
 5859619 5859620 E2348C_4395 E2348C_4396 nrfC nrfD TRUE 0.997 -3.000 0.927 0.001 N NA
 5859620 5859621 E2348C_4396 E2348C_4397 nrfD nrfE TRUE 0.668 80.000 0.400 1.000 N NA
 5859621 5859622 E2348C_4397 E2348C_4398 nrfE nrfF TRUE 0.986 -7.000 0.214 NA Y NA
 5859622 5859623 E2348C_4398 E2348C_4399 nrfF nrfG TRUE 0.997 -3.000 0.464 NA Y NA
 5859623 5859624 E2348C_4399 E2348C_4400 nrfG gltP FALSE 0.008 343.000 0.000 1.000 N NA
 5859625 5859626 E2348C_4401 E2348C_4402 yjcO   FALSE 0.220 111.000 0.000 1.000   NA
 5859626 5859627 E2348C_4402 E2348C_4403     TRUE 0.995 -13.000 0.550 0.012 Y NA
 5859627 5859628 E2348C_4403 E2348C_4404     TRUE 0.991 -7.000 0.324 1.000 Y NA
 5859628 5859629 E2348C_4404 E2348C_4405     TRUE 0.999 0.000 0.441 0.039 Y NA
 5859629 5859630 E2348C_4405 E2348C_4406     TRUE 0.917 100.000 0.400 0.039 Y NA
 5859630 5859631 E2348C_4406 E2348C_4407   fdhF FALSE 0.010 375.000 0.000 1.000   NA
 5859631 5859632 E2348C_4407 E2348C_4408 fdhF mdtP FALSE 0.063 198.000 0.000 1.000   NA
 5859632 5859633 E2348C_4408 E2348C_4409 mdtP mdtO TRUE 0.993 -3.000 0.625 NA   NA
 5859633 5859634 E2348C_4409 E2348C_4410 mdtO mdtN TRUE 0.997 0.000 1.000 NA   NA
 5859634 5859635 E2348C_4410 E2348C_4411 mdtN ytcA TRUE 0.972 19.000 0.625 NA   NA
 5859635 5859636 E2348C_4411 E2348C_4412 ytcA yjcS FALSE 0.044 209.000 0.000 NA   NA
 5859636 5859637 E2348C_4412 E2348C_4413 yjcS alsK FALSE 0.016 273.000 0.000 1.000 N NA
 5859637 5859638 E2348C_4413 E2348C_4414 alsK alsE TRUE 0.954 -16.000 0.081 1.000 Y NA
 5859638 5859639 E2348C_4414 E2348C_4415 alsE alsC TRUE 0.983 11.000 0.385 1.000   NA
 5859639 5859640 E2348C_4415 E2348C_4416 alsC alsA TRUE 0.906 -21.000 0.231 1.000   NA
 5859640 5859641 E2348C_4416 E2348C_4417 alsA alsB TRUE 0.749 128.000 0.250 NA Y NA
 5859641 5859642 E2348C_4417 E2348C_4418 alsB rpiR TRUE 0.615 59.000 0.250 NA N NA
 5859643 5859644 E2348C_4419 E2348C_4420 rpiB yjdP FALSE 0.440 69.000 0.125 NA   NA
 5859645 5859646 E2348C_4421 E2348C_4422 phnP phnO TRUE 0.942 2.000 0.000 1.000   NA
 5859646 5859647 E2348C_4422 E2348C_4423 phnO phnN TRUE 0.663 -13.000 0.000 NA N NA
 5859647 5859648 E2348C_4423 E2348C_4424 phnN phnM TRUE 0.995 0.000 0.235 NA Y NA
 5859648 5859649 E2348C_4424 E2348C_4425 phnM phnL TRUE 0.996 -3.000 0.320 1.000 Y NA
 5859649 5859650 E2348C_4425 E2348C_4426 phnL phnK TRUE 0.961 111.000 0.859 0.012 Y NA
 5859650 5859651 E2348C_4426 E2348C_4427 phnK phnJ TRUE 0.999 -3.000 0.883 1.000 Y NA
 5859651 5859652 E2348C_4427 E2348C_4428 phnJ phnI TRUE 0.997 -7.000 0.880 1.000 Y NA
 5859652 5859653 E2348C_4428 E2348C_4429 phnI phnH TRUE 0.999 0.000 0.960 0.001 Y NA
 5859653 5859654 E2348C_4429 E2348C_4430 phnH phnG TRUE 0.999 -3.000 0.967 0.001 Y NA
 5859654 5859655 E2348C_4430 E2348C_4431 phnG phnF TRUE 0.995 1.000 0.691 1.000 N NA
 5859655 5859656 E2348C_4431 E2348C_4432 phnF phnE TRUE 0.854 21.000 0.158 1.000 N NA
 5859656 5859657 E2348C_4432 E2348C_4433 phnE phnD TRUE 0.965 52.000 0.330 0.000 Y NA
 5859657 5859658 E2348C_4433 E2348C_4434 phnD phnC TRUE 0.989 25.000 0.337 0.001 Y NA
 5859658 5859659 E2348C_4434 E2348C_4435 phnC yjdN FALSE 0.198 133.000 0.074 NA   NA
 5859659 5859660 E2348C_4435 E2348C_4436 yjdN yjdM FALSE 0.072 160.000 0.013 NA   NA
 5859661 5859662 E2348C_4437 E2348C_4438 yjdA yjdZ TRUE 0.995 -3.000 0.857 NA   NA
 5859662 5859663 E2348C_4438 E2348C_4439 yjdZ proP FALSE 0.021 264.000 0.000 NA   NA
 5859664 5859665 E2348C_4440 E2348C_4441 basS basR TRUE 0.990 10.000 0.143 1.000 Y NA
 5859665 5859666 E2348C_4441 E2348C_4442 basR eptA TRUE 0.957 -3.000 0.095 1.000   NA
 5859666 5859667 E2348C_4442 E2348C_4443 eptA adiC FALSE 0.229 104.000 0.000 1.000   NA
 5859667 5859668 E2348C_4443 E2348C_4444 adiC adiY FALSE 0.291 137.000 0.167 1.000 N NA
 5859668 5859669 E2348C_4444 E2348C_4445 adiY adiA FALSE 0.010 324.000 0.000 1.000 N NA
 5859669 5859670 E2348C_4445 E2348C_4446 adiA melR FALSE 0.045 196.000 0.000 1.000 N NA
 5859672 5859673 E2348C_4448 E2348C_4449 yjdF fumB FALSE 0.171 123.000 0.000 NA   NA
 5859673 5859674 E2348C_4449 E2348C_4450 fumB dcuB FALSE 0.274 78.000 0.000 1.000   NA
 5859674 5859675 E2348C_4450 E2348C_4451 dcuB dcuR FALSE 0.005 571.000 0.000 1.000   NA
 5859675 5859676 E2348C_4451 E2348C_4452 dcuR dcuS TRUE 0.993 -3.000 0.086 0.055 Y NA
 5859677 5859678 E2348C_4453 E2348C_4454 yjdI yjdJ TRUE 0.950 12.000 0.168 NA   NA
 5859678 5859679 E2348C_4454 E2348C_4455 yjdJ yjdK FALSE 0.032 228.000 0.000 NA   NA
 5859680 5859681 E2348C_4456 E2348C_4457 lysU yjdL FALSE 0.023 237.000 0.000 1.000 N NA
 5859681 5859682 E2348C_4457 E2348C_4458 yjdL cadA TRUE 0.749 59.000 0.000 1.000 Y NA
 5859682 5859683 E2348C_4458 E2348C_4459 cadA cadB TRUE 0.664 80.000 0.000 1.000 Y NA
 5859683 5859684 E2348C_4459 E2348C_4460 cadB cadC FALSE 0.008 366.000 0.000 NA   NA
 5859684 5859685 E2348C_4460 E2348C_tRNA85 cadC pheU FALSE 0.004 617.000 0.000 NA   NA
 5859685 5859686 E2348C_tRNA85 E2348C_4461 pheU yjdC FALSE 0.196 107.000 0.000 NA   NA
 5859686 5859687 E2348C_4461 E2348C_4462 yjdC dipZ TRUE 0.811 37.000 0.217 1.000   NA
 5859687 5859688 E2348C_4462 E2348C_4463 dipZ cutA TRUE 0.747 -24.000 0.092 1.000 N NA
 5859688 5859689 E2348C_4463 E2348C_4464 cutA dcuA FALSE 0.154 115.000 0.005 1.000   NA
 5859689 5859690 E2348C_4464 E2348C_4465 dcuA aspA FALSE 0.159 118.000 0.015 1.000   NA
 5859693 5859694 E2348C_4468 E2348C_4469 groS groL TRUE 0.981 44.000 0.631 0.067 Y NA
 5859694 5859695 E2348C_4469 E2348C_4470 groL yjeI FALSE 0.167 138.000 0.062 NA   NA
 5859696 5859697 E2348C_4471 E2348C_4472 yjeJ yjeK FALSE 0.029 235.000 0.000 NA   NA
 5859698 5859699 E2348C_4473 E2348C_4474 efp ecnA FALSE 0.322 52.000 0.007 1.000   NA
 5859699 5859700 E2348C_4474 E2348C_4475 ecnA ecnB TRUE 0.695 111.000 0.212 0.000   NA
 5859700 5859701 E2348C_4475 E2348C_4476 ecnB sugE FALSE 0.124 176.000 0.074 1.000   NA
 5859702 5859703 E2348C_4477 E2348C_4478 blc ampC FALSE 0.143 89.000 0.022 1.000 N NA
 5859703 5859704 E2348C_4478 E2348C_4479 ampC frdD FALSE 0.194 63.000 0.022 1.000 N NA
 5859704 5859705 E2348C_4479 E2348C_4480 frdD frdC TRUE 0.999 11.000 0.787 0.002 Y NA
 5859705 5859706 E2348C_4480 E2348C_4481 frdC frdB TRUE 0.998 11.000 0.454 0.002 Y NA
 5859706 5859707 E2348C_4481 E2348C_4482 frdB frdA TRUE 0.997 -7.000 0.470 0.002 Y NA
 5859708 5859709 E2348C_4483 E2348C_4484 poxA yjeM FALSE 0.019 219.000 0.009 1.000 N NA
 5859710 5859711 E2348C_4485 E2348C_4486 yjeP psd TRUE 0.834 22.000 0.148 1.000 N NA
 5859711 5859712 E2348C_4486 E2348C_4487 psd rsgA FALSE 0.344 97.000 0.095 1.000   NA
 5859713 5859714 E2348C_4488 E2348C_tRNA86 orn glyV FALSE 0.042 211.000 0.000 NA   NA
 5859714 5859715 E2348C_tRNA86 E2348C_tRNA87 glyV glyX FALSE 0.105 158.000 0.000 NA   NA
 5859715 5859716 E2348C_tRNA87 E2348C_tRNA88 glyX glyY TRUE 0.522 36.000 0.000 NA   NA
 5859718 5859719 E2348C_4490 E2348C_4491 yjeF yjeE TRUE 0.790 -28.000 0.118 NA   NA
 5859719 5859720 E2348C_4491 E2348C_4492 yjeE amiB TRUE 0.848 19.000 0.109 NA   NA
 5859720 5859721 E2348C_4492 E2348C_4493 amiB mutL TRUE 0.926 10.000 0.092 1.000 N NA
 5859721 5859722 E2348C_4493 E2348C_4494 mutL miaA TRUE 0.962 -7.000 0.188 0.067 N NA
 5859722 5859723 E2348C_4494 E2348C_4495 miaA hfq TRUE 0.762 86.000 0.531 1.000   NA
 5859723 5859724 E2348C_4495 E2348C_4496 hfq hflX TRUE 0.462 76.000 0.141 1.000   NA
 5859724 5859725 E2348C_4496 E2348C_4497 hflX hflK TRUE 0.641 86.000 0.184 0.060   NA
 5859725 5859726 E2348C_4497 E2348C_4498 hflK hflC TRUE 0.999 3.000 0.947 0.007 Y NA
 5859726 5859727 E2348C_4498 E2348C_4499 hflC yjeT TRUE 0.657 82.000 0.348 NA   NA
 5859727 5859728 E2348C_4499 E2348C_4500 yjeT purA FALSE 0.209 104.000 0.051 NA   NA
 5859728 5859729 E2348C_4500 E2348C_4501 purA nsrR FALSE 0.017 205.000 0.010 NA N NA
 5859729 5859730 E2348C_4501 E2348C_4502 nsrR rnr TRUE 0.844 39.000 0.038 NA Y NA
 5859730 5859731 E2348C_4502 E2348C_4503 rnr rlmB TRUE 0.560 92.000 0.147 0.012 N NA
 5859731 5859732 E2348C_4503 E2348C_4504 rlmB yjfI FALSE 0.108 127.000 0.002 NA   NA
 5859732 5859733 E2348C_4504 E2348C_4505 yjfI yjfJ TRUE 0.982 19.000 0.911 NA   NA
 5859733 5859734 E2348C_4505 E2348C_4506 yjfJ yjfK TRUE 0.457 51.000 0.071 NA   NA
 5859734 5859735 E2348C_4506 E2348C_4507 yjfK yjfL TRUE 0.956 18.000 0.379 NA   NA
 5859735 5859736 E2348C_4507 E2348C_4508 yjfL yjfM TRUE 0.987 10.000 0.470 NA   NA
 5859736 5859737 E2348C_4508 E2348C_4509 yjfM yjfC TRUE 0.930 3.000 0.049 NA   NA
 5859737 5859738 E2348C_4509 E2348C_4510 yjfC aidB FALSE 0.342 84.000 0.133 NA N NA
 5859739 5859740 E2348C_4511 E2348C_4512 yjfN yjfO TRUE 0.604 149.000 0.588 NA   NA
 5859742 5859743 E2348C_4514 E2348C_4515 ulaR ulaG FALSE 0.224 108.000 0.000 1.000   NA
 5859744 5859745 E2348C_4516 E2348C_4517 ulaA ulaB TRUE 0.924 16.000 0.059 0.012   NA
 5859745 5859746 E2348C_4517 E2348C_4518 ulaB ulaC TRUE 0.994 10.000 0.115 0.007 Y NA
 5859746 5859747 E2348C_4518 E2348C_4519 ulaC ulaD TRUE 0.991 14.000 0.328 1.000 Y NA
 5859747 5859748 E2348C_4519 E2348C_4520 ulaD ulaE TRUE 0.993 10.000 0.250 1.000 Y NA
 5859748 5859749 E2348C_4520 E2348C_4521 ulaE ulaF TRUE 0.995 0.000 0.200 1.000 Y NA
 5859751 5859752 E2348C_4523 E2348C_4524 rpsF priB TRUE 0.948 7.000 0.122 1.000 N NA
 5859752 5859753 E2348C_4524 E2348C_4525 priB rpsR TRUE 0.954 5.000 0.128 1.000 N NA
 5859753 5859754 E2348C_4525 E2348C_4526 rpsR rplI TRUE 0.980 42.000 0.499 0.009 Y NA
 5859754 5859755 E2348C_4526 E2348C_4527 rplI   FALSE 0.008 402.000 0.000 1.000   NA
 5859755 5859756 E2348C_4527 E2348C_4528     TRUE 0.831 14.000 0.000 NA   NA
 5859757 5859758 E2348C_4529 E2348C_4530     FALSE 0.184 93.000 0.000 1.000 N NA
 5859758 5859759 E2348C_4530 E2348C_4531     TRUE 0.900 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5859759 5859760 E2348C_4531 E2348C_4532     TRUE 0.995 10.000 0.200 0.041 Y NA
 5859760 5859761 E2348C_4532 E2348C_4533     TRUE 0.848 10.000 0.000 NA N NA
 5859761 5859762 E2348C_4533 E2348C_4534     TRUE 0.848 10.000 0.000 NA N NA
 5859765 5859766 E2348C_4537 E2348C_4538 fklB   FALSE 0.059 194.000 0.000 NA   NA
 5859766 5859767 E2348C_4538 E2348C_4539   cycA FALSE 0.015 300.000 0.000 NA   NA
 5859768 5859769 E2348C_4540 E2348C_4541 ytfE ytfF FALSE 0.319 108.000 0.150 NA N NA
 5859769 5859770 E2348C_4541 E2348C_4542 ytfF ytfG TRUE 0.585 100.000 0.021 1.000 Y NA
 5859776 5859777 E2348C_4548 E2348C_4549 ytfL msrA FALSE 0.012 323.000 0.042 NA   NA
 5859778 5859779 E2348C_4550 E2348C_4551 ytfM ytfN TRUE 0.992 -3.000 0.575 NA   NA
 5859779 5859780 E2348C_4551 E2348C_4552 ytfN ytfP TRUE 0.973 3.000 0.167 NA   NA
 5859782 5859783 E2348C_4554 E2348C_4555 ytfQ ytfR TRUE 0.893 140.000 0.804 NA Y NA
 5859783 5859784 E2348C_4555 E2348C_4556 ytfR ytfT TRUE 0.994 14.000 0.506 1.000 Y NA
 5859784 5859785 E2348C_4556 E2348C_4557 ytfT yjfF TRUE 0.997 -13.000 0.865 0.038 Y NA
 5859789 5859790 E2348C_4561 E2348C_4562 pmbA cybC FALSE 0.059 183.000 0.028 NA   NA
 5859791 5859792 E2348C_4563 E2348C_4564 nrdG nrdD TRUE 0.472 158.000 0.464 1.000 N NA
 5859792 5859793 E2348C_4564 E2348C_4565 nrdD treC FALSE 0.006 394.000 0.000 1.000 N NA
 5859793 5859794 E2348C_4565 E2348C_4566 treC treB TRUE 0.967 50.000 0.650 1.000 Y NA
 5859794 5859795 E2348C_4566 E2348C_4567 treB treR FALSE 0.352 119.000 0.168 1.000 N NA
 5859797 5859798 E2348C_4569 E2348C_4570 yjgF pyrI FALSE 0.279 73.000 0.084 NA N NA
 5859798 5859799 E2348C_4570 E2348C_4571 pyrI pyrB TRUE 0.994 13.000 0.197 0.002 Y NA
 5859799 5859800 E2348C_4571 E2348C_4572 pyrB pyrL TRUE 0.904 4.000 0.005 1.000   NA
 5859800 5859801 E2348C_4572 E2348C_4573 pyrL yjgH FALSE 0.018 281.000 0.000 NA   NA
 5859801 5859802 E2348C_4573 E2348C_4574 yjgH yjgI FALSE 0.104 131.000 0.000 NA N NA
 5859803 5859804 E2348C_4575 E2348C_4576 yjgJ yjgK FALSE 0.087 145.000 0.000 NA N NA
 5859804 5859805 E2348C_4576 E2348C_4577 yjgK yjgL FALSE 0.171 123.000 0.000 NA   NA
 5859810 5859811 E2348C_4582 E2348C_4583 valS holC TRUE 0.953 0.000 0.089 1.000 N NA
 5859811 5859812 E2348C_4583 E2348C_4584 holC pepA TRUE 0.472 162.000 0.494 1.000 N NA
 5859813 5859814 E2348C_4585 E2348C_4586 yjgP yjgQ TRUE 0.997 0.000 0.631 0.060   NA
 5859815 5859816 E2348C_4587 E2348C_4588 yjgR yjgB FALSE 0.129 130.000 0.007 1.000   NA
 5859817 10800754 E2348C_tRNA89 E2348C_PP13 leuX   TRUE 0.641 -30.000 0.000 NA   NA
 10800754 5859818 E2348C_PP13 E2348C_4589     TRUE 0.570 -1096.000 0.000 NA   NA
 5859820 5859821 E2348C_4591 E2348C_4592     TRUE 0.928 3.000 0.000 NA   NA
 5859821 5859822 E2348C_4592 E2348C_4593     FALSE 0.003 1624.000 0.000 NA   NA
 5859822 5859823 E2348C_4593 E2348C_4594     TRUE 0.503 38.000 0.000 NA   NA
 5859823 5859824 E2348C_4594 E2348C_4595     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5859824 5859825 E2348C_4595 E2348C_4596     FALSE 0.089 170.000 0.000 NA   NA
 5859825 5859826 E2348C_4596 E2348C_4597     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5859826 5859827 E2348C_4597 E2348C_4598     TRUE 0.849 13.000 0.000 NA   NA
 5859827 5859828 E2348C_4598 E2348C_4599     TRUE 0.922 4.000 0.000 NA   NA
 5859828 5859829 E2348C_4599 E2348C_4600     FALSE 0.137 140.000 0.000 NA   NA
 5859829 5859830 E2348C_4600 E2348C_4601     FALSE 0.037 220.000 0.000 NA   NA
 5859830 5859831 E2348C_4601 E2348C_4602     TRUE 0.774 17.000 0.000 NA   NA
 5859831 5859832 E2348C_4602 E2348C_4603     TRUE 0.743 19.000 0.000 NA   NA
 5859832 5859833 E2348C_4603 E2348C_4604     TRUE 0.558 32.000 0.000 NA   NA
 5859833 5859834 E2348C_4604 E2348C_4605     TRUE 0.657 -27.000 0.000 NA   NA
 5859835 5859836 E2348C_4606 E2348C_4607     FALSE 0.228 88.000 0.000 NA   NA
 5859836 5859837 E2348C_4607 E2348C_4608     FALSE 0.019 389.000 0.000 0.053   NA
 5859837 5859838 E2348C_4608 E2348C_4609     TRUE 0.724 122.000 0.025 0.001 Y NA
 5859838 5859839 E2348C_4609 E2348C_4610     TRUE 0.993 -3.000 0.072 0.053 Y NA
 5859840 5859841 E2348C_4611 E2348C_4612     FALSE 0.009 362.000 0.000 NA   NA
 5859841 5859842 E2348C_4612 E2348C_4613     TRUE 0.998 -3.000 0.759 NA Y NA
 5859845 5859846 E2348C_4616 E2348C_4617 yjhS yjhT FALSE 0.285 65.000 0.000 NA   NA
 5859846 5859847 E2348C_4617 E2348C_4618 yjhT nanC TRUE 0.728 20.000 0.000 NA   NA
 5859848 5859849 E2348C_4619 E2348C_4620 fimB fimE FALSE 0.061 478.000 0.000 0.007 Y NA
 5859849 5859850 E2348C_4620 E2348C_4621 fimE fimA FALSE 0.004 481.000 0.000 1.000 N NA
 5859850 5859851 E2348C_4621 E2348C_4622 fimA fimI TRUE 0.967 65.000 0.600 0.005 Y NA
 5859851 5859852 E2348C_4622 E2348C_4623 fimI fimC TRUE 0.983 37.000 0.800 1.000 Y NA
 5859852 5859853 E2348C_4623 E2348C_4624 fimC fimD TRUE 0.954 66.000 0.750 1.000 Y NA
 5859853 5859854 E2348C_4624 E2348C_4625 fimD fimF TRUE 0.982 10.000 0.000 1.000 Y NA
 5859854 5859855 E2348C_4625 E2348C_4626 fimF fimG TRUE 0.986 13.000 0.000 0.005 Y NA
 5859855 5859856 E2348C_4626 E2348C_4627 fimG fimH TRUE 0.989 20.000 0.833 0.005   NA
 5859856 5859857 E2348C_4627 E2348C_4628 fimH uxuA FALSE 0.004 732.000 0.000 1.000   NA
 5859857 5859858 E2348C_4628 E2348C_4629 uxuA uxuB TRUE 0.697 81.000 0.070 1.000 Y NA
 5859858 5859859 E2348C_4629 E2348C_4630 uxuB uxuR FALSE 0.032 215.000 0.000 1.000 N NA
 5859859 5859860 E2348C_4630 E2348C_4631 uxuR   FALSE 0.007 414.000 0.000 NA   NA
 5859861 5859862 E2348C_4632 E2348C_4633 pptE yjiE TRUE 0.513 37.000 0.000 NA   NA
 5859862 5859863 E2348C_4633 E2348C_4634 yjiE iadA FALSE 0.221 65.000 0.037 1.000 N NA
 5859863 5859864 E2348C_4634 E2348C_4635 iadA yjiG TRUE 0.846 13.000 0.028 1.000   NA
 5859864 5859865 E2348C_4635 E2348C_4636 yjiG yjiH TRUE 0.972 -3.000 0.019 0.001   NA
 5859867 5859868 E2348C_4638 E2348C_4639 yjiJ yjiK FALSE 0.431 68.000 0.118 NA   NA
 5859868 5859869 E2348C_4639 E2348C_4640 yjiK   FALSE 0.285 65.000 0.000 NA   NA
 5859869 5859870 E2348C_4640 E2348C_4641   yjiL TRUE 0.941 -3.000 0.078 NA   NA
 5859870 5859871 E2348C_4641 E2348C_4642 yjiL yjiM TRUE 0.899 10.000 0.078 NA N NA
 5859871 5859872 E2348C_4642 E2348C_4643 yjiM yjiN FALSE 0.133 116.000 0.013 NA   NA
 5859874 5859875 E2348C_4645 E2348C_4646 yjiR yjiW FALSE 0.008 383.000 0.000 NA   NA
 5859875 5859876 E2348C_4646 E2348C_4647 yjiW   FALSE 0.004 653.000 0.000 NA   NA
 5859876 5859877 E2348C_4647 E2348C_4648   yjiA FALSE 0.011 331.000 0.000 NA   NA
 5859877 5859878 E2348C_4648 E2348C_4649 yjiA yjiX TRUE 0.965 11.000 0.212 NA   NA
 5859878 5859879 E2348C_4649 E2348C_4650 yjiX yjiY TRUE 0.864 50.000 0.531 NA   NA
 5859881 5859882 E2348C_4652 E2348C_4653     TRUE 0.985 -3.000 0.000 NA Y NA
 5859882 5859883 E2348C_4653 E2348C_4654     FALSE 0.292 64.000 0.000 NA   NA
 5859887 5859888 E2348C_4658 E2348C_4659 mdoB yjjA FALSE 0.024 254.000 0.000 NA   NA
 5859888 5859889 E2348C_4659 E2348C_4660 yjjA dnaC TRUE 0.834 46.000 0.368 NA   NA
 5859889 5859890 E2348C_4660 E2348C_4661 dnaC dnaT TRUE 0.995 3.000 0.778 NA   NA
 5859890 5859891 E2348C_4661 E2348C_4662 dnaT yjjB FALSE 0.197 107.000 0.046 NA   NA
 5859891 5859892 E2348C_4662 E2348C_4663 yjjB yjjP TRUE 0.984 -9.000 0.704 NA   NA
 5859893 5859894 E2348C_4664 E2348C_4665 yjjQ bglJ TRUE 0.994 -42.000 0.889 0.017 Y NA
 5859897 5859898 E2348C_tRNA90 E2348C_tRNA91 leuV leuP TRUE 0.529 35.000 0.000 NA   NA
 5859898 5859899 E2348C_tRNA91 E2348C_tRNA92 leuP leuQ TRUE 0.592 29.000 0.000 NA   NA
 5859899 5859900 E2348C_tRNA92 E2348C_4668 leuQ rsmC FALSE 0.014 301.000 0.000 NA   NA
 5859901 5859902 E2348C_4669 E2348C_4670 holD rimI TRUE 0.804 -31.000 0.121 1.000   NA
 5859902 5859903 E2348C_4670 E2348C_4671 rimI yjjG TRUE 0.791 15.000 0.018 1.000   NA
 5859903 5859904 E2348C_4671 E2348C_4672 yjjG prfC FALSE 0.195 91.000 0.012 1.000   NA
 5859904 5859905 E2348C_4672 E2348C_4673 prfC osmY FALSE 0.007 393.000 0.000 NA   NA
 5859905 5859906 E2348C_4673 E2348C_4674 osmY ytjA FALSE 0.162 127.000 0.000 NA   NA
 5859906 5859907 E2348C_4674 E2348C_4675 ytjA yjjU FALSE 0.424 122.000 0.211 NA   NA
 5859907 5859908 E2348C_4675 E2348C_4676 yjjU yjjV TRUE 0.928 -3.000 0.057 NA   NA
 5859909 5859910 E2348C_4677 E2348C_4678 yjjW yjjI TRUE 0.968 -28.000 0.810 NA   NA
 5859911 5859912 E2348C_4679 E2348C_4680 deoC deoA TRUE 0.858 78.000 0.286 1.000 Y NA
 5859912 5859913 E2348C_4680 E2348C_4681 deoA deoB TRUE 0.790 52.000 0.398 1.000 N NA
 5859913 5859914 E2348C_4681 E2348C_4682 deoB deoD TRUE 0.772 57.000 0.414 1.000 N NA
 5859915 5859916 E2348C_4683 E2348C_4684   lplA TRUE 0.602 32.000 0.000 1.000   NA
 5859916 5859917 E2348C_4684 E2348C_4685 lplA ytjB TRUE 0.658 28.000 0.066 NA   NA
 5859918 5859919 E2348C_4686 E2348C_4687 serB radA FALSE 0.280 49.000 0.024 1.000 N NA
 5859919 5859920 E2348C_4687 E2348C_4688 radA nadR TRUE 0.583 21.000 0.021 1.000 N NA
 5859920 5859921 E2348C_4688 E2348C_4689 nadR   FALSE 0.221 92.000 0.000 NA   NA
 5859921 5859922 E2348C_4689 E2348C_4690     TRUE 0.981 2.000 0.229 NA   NA
 5859924 5859925 E2348C_4692 E2348C_4693 slt trpR FALSE 0.420 90.000 0.167 1.000 N NA
 5859929 5859930 E2348C_4697 E2348C_4698 creA creB TRUE 0.835 13.000 0.038 NA   NA
 5859930 5859931 E2348C_4698 E2348C_4699 creB creC TRUE 0.999 0.000 0.776 1.000 Y NA
 5859931 5859932 E2348C_4699 E2348C_4700 creC creD FALSE 0.326 58.000 0.000 NA   NA
 5859934 5859935 E2348C_4702 E2348C_4703 yjjY yjtD FALSE 0.007 400.000 0.000 NA   NA
 5859935 5855046 E2348C_4703 E2348C_0001 yjtD thrL FALSE 0.047 214.000 0.000 1.000   NA
 5854921 5854922 E2348_P2_01 E2348_P2_02 sulII strA TRUE 0.807 61.000 0.556 1.000 N NA
 5854922 5854923 E2348_P2_02 E2348_P2_03 strA strB TRUE 0.994 0.000 0.318 0.000 N NA
 5854924 5854925 E2348_P2_04 E2348_P2_05     FALSE 0.446 44.000 0.000 NA   NA
 5854927 5854928 E2348_P2_07 E2348_P2_08     FALSE 0.009 358.000 0.000 NA   NA
 5854929 5854930 E2348_P2_09 E2348_P2_mR_1     FALSE 0.036 221.000 0.000 NA   NA
 5854930 5854921 E2348_P2_mR_1 E2348_P2_01   sulII FALSE 0.010 338.000 0.000 NA   NA
 5854933 5854934 E2348_P1_003 E2348_P1_004 bfpA bfpG FALSE 0.421 47.000 0.000 NA   NA
 5854934 5854935 E2348_P1_004 E2348_P1_005 bfpG bfpB TRUE 0.910 7.000 0.000 NA   NA
 5854935 5854936 E2348_P1_005 E2348_P1_006 bfpB bfpC TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5854936 5854937 E2348_P1_006 E2348_P1_007 bfpC bfpU TRUE 0.680 -22.000 0.000 NA   NA
 5854937 5854938 E2348_P1_007 E2348_P1_008 bfpU bfpD TRUE 0.910 7.000 0.000 NA   NA
 5854938 5854939 E2348_P1_008 E2348_P1_009 bfpD bfpE TRUE 0.991 7.000 0.167 NA Y NA
 5854939 5854940 E2348_P1_009 E2348_P1_010 bfpE bfpF TRUE 0.966 -16.000 0.167 NA Y NA
 5854940 5854941 E2348_P1_010 E2348_P1_011 bfpF bfpP TRUE 0.985 7.000 0.000 1.000 Y NA
 5854941 5854942 E2348_P1_011 E2348_P1_012 bfpP bfpH TRUE 0.970 -18.000 0.667 NA   NA
 5854942 5854943 E2348_P1_012 E2348_P1_013 bfpH bfpI TRUE 0.714 21.000 0.000 NA   NA
 5854943 5854944 E2348_P1_013 E2348_P1_014 bfpI bfpJ TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5854944 5854945 E2348_P1_014 E2348_P1_015 bfpJ bfpK TRUE 0.792 -10.000 0.000 NA   NA
 5854945 5854946 E2348_P1_015 E2348_P1_016 bfpK bfpL TRUE 0.928 3.000 0.000 NA   NA
 5854946 5854947 E2348_P1_016 E2348_P1_017 bfpL   FALSE 0.017 288.000 0.000 NA   NA
 5854948 5854949 E2348_P1_018 E2348_P1_019     TRUE 0.966 -3.000 0.000 0.052   NA
 5854950 5854951 E2348_P1_020 E2348_P1_021 perA perB FALSE 0.410 48.000 0.000 NA   NA
 5854951 5854952 E2348_P1_021 E2348_P1_022 perB perC FALSE 0.392 50.000 0.000 NA   NA
 5854954 5854955 E2348_P1_024 E2348_P1_025     FALSE 0.003 1913.000 0.000 NA   NA
 5854957 5854958 E2348_P1_027 E2348_P1_028     FALSE 0.225 90.000 0.000 NA   NA
 5854959 5854960 E2348_P1_029 E2348_P1_030     TRUE 0.849 13.000 0.000 NA   NA
 5854961 5854962 E2348_P1_031 E2348_P1_032     TRUE 0.928 3.000 0.000 NA   NA
 5854963 5854964 E2348_P1_033 E2348_P1_034     TRUE 0.995 -3.000 0.286 NA Y NA
 5854964 5854965 E2348_P1_034 E2348_P1_035   repA FALSE 0.003 965.000 0.000 NA   NA
 5854967 5854968 E2348_P1_036 E2348_P1_037 copB srnB FALSE 0.021 284.000 0.000 1.000   NA
 5854970 5854971 E2348_P1_039 E2348_P1_040 finO   FALSE 0.200 103.000 0.000 NA   NA
 5854971 5854972 E2348_P1_040 E2348_P1_041   traX FALSE 0.318 59.000 0.000 NA   NA
 5854972 5854973 E2348_P1_041 E2348_P1_042 traX traI TRUE 0.940 20.000 0.333 NA   NA
 5854974 5854975 E2348_P1_043 E2348_P1_044 mvpT mvpA TRUE 0.995 0.000 0.727 NA   NA
 5854976 5854977 E2348_P1_045 E2348_P1_046 traD traT FALSE 0.029 253.000 0.000 1.000   NA
 5854977 5854978 E2348_P1_046 E2348_P1_047 traT traS TRUE 0.831 14.000 0.000 NA   NA
 5854978 5854979 E2348_P1_047 E2348_P1_048 traS traG TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5854979 5854980 E2348_P1_048 E2348_P1_049 traG traH TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5854980 5854981 E2348_P1_049 E2348_P1_050 traH trbF TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5854981 5854982 E2348_P1_050 E2348_P1_051 trbF trbJ TRUE 0.754 -13.000 0.000 NA   NA
 5854982 5854983 E2348_P1_051 E2348_P1_052 trbJ trbB TRUE 0.604 -70.000 0.000 NA   NA
 5854983 5854984 E2348_P1_052 E2348_P1_053 trbB traQ TRUE 0.754 -13.000 0.000 NA   NA
 5854986 5854987 E2348_P1_055 E2348_P1_056 trbA traF TRUE 0.571 31.000 0.000 NA   NA
 5854987 5854988 E2348_P1_056 E2348_P1_057 traF trbE TRUE 0.666 -25.000 0.000 NA   NA
 5854988 5854989 E2348_P1_057 E2348_P1_058 trbE traN TRUE 0.653 25.000 0.000 NA   NA
 5854989 5854990 E2348_P1_058 E2348_P1_059 traN trbC TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5854990 5854991 E2348_P1_059 E2348_P1_060 trbC traU TRUE 0.903 9.000 0.000 NA   NA
 5854991 5854992 E2348_P1_060 E2348_P1_061 traU traW TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5854992 5854993 E2348_P1_061 E2348_P1_062 traW trbI TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5854993 5854994 E2348_P1_062 E2348_P1_063 trbI traC TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5854994 5854995 E2348_P1_063 E2348_P1_064 traC traR FALSE 0.069 160.000 0.000 NA N NA
 5854995 5854996 E2348_P1_064 E2348_P1_065 traR traV FALSE 0.146 135.000 0.000 NA   NA
 5854996 5854997 E2348_P1_065 E2348_P1_066 traV trbG TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5854997 5854998 E2348_P1_066 E2348_P1_067 trbG trbD TRUE 0.836 -7.000 0.000 NA   NA
 5854998 5854999 E2348_P1_067 E2348_P1_068 trbD traP TRUE 0.754 -13.000 0.000 NA   NA
 5854999 5855000 E2348_P1_068 E2348_P1_069 traP traB TRUE 0.792 -10.000 0.000 NA   NA
 5855000 5855001 E2348_P1_069 E2348_P1_070 traB traK TRUE 0.946 0.000 0.000 1.000   NA
 5855001 5855002 E2348_P1_070 E2348_P1_071 traK traE TRUE 0.913 -13.000 0.000 0.002   NA
 5855002 5855003 E2348_P1_071 E2348_P1_072 traE traL TRUE 0.888 22.000 0.000 0.002   NA
 5855003 5855004 E2348_P1_072 E2348_P1_073 traL traA TRUE 0.937 15.000 0.000 0.002   NA
 5855004 5855005 E2348_P1_073 E2348_P1_074 traA traY TRUE 0.801 34.000 0.000 0.002   NA
 5855005 5855006 E2348_P1_074 E2348_P1_075 traY traJ FALSE 0.245 95.000 0.000 1.000   NA
 5855008 5855009 E2348_P1_mR_3 E2348_P1_076   traM FALSE 0.228 88.000 0.000 NA   NA
 5855011 5855012 E2348_P1_078 E2348_P1_079     FALSE 0.177 119.000 0.000 NA   NA
 5855012 5855013 E2348_P1_079 E2348_P1_080     FALSE 0.004 701.000 0.000 NA   NA
 5855013 5855014 E2348_P1_080 E2348_P1_081     TRUE 0.849 13.000 0.000 NA   NA
 5855014 5855015 E2348_P1_081 E2348_P1_082     FALSE 0.098 164.000 0.000 NA   NA
 5855015 5855016 E2348_P1_082 E2348_P1_083     FALSE 0.421 47.000 0.000 NA   NA
 5855017 5855018 E2348_P1_084 E2348_P1_085     FALSE 0.006 436.000 0.000 NA   NA
 5855019 5855020 E2348_P1_086 E2348_P1_087     FALSE 0.421 47.000 0.000 NA   NA
 5855021 5855022 E2348_P1_088 E2348_P1_089     TRUE 0.503 38.000 0.000 NA   NA
 5855024 5855025 E2348_P1_091 E2348_P1_092     FALSE 0.017 287.000 0.000 NA   NA
 5855025 5855026 E2348_P1_092 E2348_P1_093     TRUE 0.774 17.000 0.000 NA   NA
 5855026 5855027 E2348_P1_093 E2348_P1_094     FALSE 0.382 51.000 0.000 NA   NA
 5855027 5855028 E2348_P1_094 E2348_P1_095     FALSE 0.028 238.000 0.000 NA   NA
 5855028 5855029 E2348_P1_095 E2348_P1_096     FALSE 0.170 124.000 0.000 NA   NA
 5855029 5855030 E2348_P1_096 E2348_P1_097     TRUE 0.487 34.000 0.000 1.000 N NA
 5855031 5855032 E2348_P1_098 E2348_P1_099     TRUE 0.992 27.000 0.667 0.011 Y NA
 5855034 5855035 E2348_P1_101 E2348_P1_102 stbB stbA TRUE 0.989 5.000 0.455 NA   NA
 5855036 5855037 E2348_P1_103 E2348_P1_104     TRUE 0.860 -6.000 0.000 NA   NA
 5855038 5855039 E2348_P1_105 E2348_P1_106 rsvB ccdB TRUE 0.943 1.000 0.000 1.000   NA
 5855039 5855040 E2348_P1_106 E2348_P1_107 ccdB ccdA TRUE 0.931 2.000 0.000 NA   NA
 5855041 5855042 E2348_P1_108 E2348_P1_109     FALSE 0.053 199.000 0.000 NA   NA
 5855042 5855043 E2348_P1_109 E2348_P1_110     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5855044 5855045 E2348_P1_111 E2348_P1_112     TRUE 0.934 4.000 0.000 1.000   NA