MicrobesOnline Operon Predictions for Candidatus Hamiltonella defensa 5AT (Acyrthosiphon pisum)

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
7636599	7636600	HDEF_0002	HDEF_0003			TRUE	0.467	141.000	0.000	0.046	Y	NA
7636600	7636601	HDEF_0003	HDEF_0004			TRUE	0.999	2.000	0.692	0.018	Y	NA
7636602	7636603	HDEF_0005	HDEF_0006	lysA		FALSE	0.395	66.000	0.000	NA		NA
7636603	7636604	HDEF_0006	HDEF_0007			TRUE	0.846	230.000	0.500	NA		NA
7636604	7636605	HDEF_0007	HDEF_0008			FALSE	0.113	213.000	0.000	NA		NA
7636605	7636606	HDEF_0008	HDEF_0009		lysU	FALSE	0.023	681.000	0.000	NA		NA
7636606	7636607	HDEF_0009	HDEF_0010	lysU	prfB	TRUE	0.992	10.000	0.162	0.063	Y	NA
7636607	7636608	HDEF_0010	HDEF_0011	prfB		FALSE	0.331	-25.000	0.000	NA		NA
7636609	7636610	HDEF_0012	HDEF_0013	alaS	csrA	TRUE	0.428	193.000	0.020	1.000	N	NA
7636610	7636611	HDEF_0013	HDEF_0014	csrA		FALSE	0.101	231.000	0.000	NA		NA
7636611	7636612	HDEF_0014	HDEF_0015			TRUE	0.835	10.000	0.000	NA		NA
7636613	7636614	HDEF_0016	HDEF_0017	cvrA	ftsK	FALSE	0.125	198.000	0.000	NA		NA
7636615	7636616	HDEF_0018	HDEF_0019	trxB		FALSE	0.237	109.000	0.000	NA		NA
7636616	7636617	HDEF_0019	HDEF_0020		minC	FALSE	0.420	-19.000	0.000	NA		NA
7636617	7636618	HDEF_0020	HDEF_0021	minC	minD	TRUE	0.998	17.000	0.466	1.000	Y	NA
7636618	7636619	HDEF_0021	HDEF_0022	minD	minE	TRUE	0.999	4.000	0.618	NA	Y	NA
7636620	7636621	HDEF_0023	HDEF_0024	gapA		FALSE	0.037	257.000	0.000	1.000		NA
7636621	7636622	HDEF_0024	HDEF_0025		recA	FALSE	0.206	68.000	0.000	1.000		NA
7636624	7636625	HDEF_0027	HDEF_0028	ubiH	pepP	TRUE	0.890	-2.000	0.000	NA		NA
7636627	7636628	HDEF_0030	HDEF_0031	ribD	nrdR	TRUE	0.994	13.000	0.277	NA	N	NA
7636628	7636629	HDEF_0031	HDEF_0032	nrdR	recD	TRUE	0.851	31.000	0.000	NA	N	NA
7636629	7636630	HDEF_0032	HDEF_0033	recD	recB	TRUE	0.999	3.000	0.688	0.003	Y	NA
7636630	7636631	HDEF_0033	HDEF_0034	recB	recC	TRUE	0.971	-34.000	0.542	0.003	Y	NA
7636631	7636632	HDEF_0034	HDEF_0035	recC		TRUE	0.904	59.000	0.076	NA	N	NA
7636632	7636633	HDEF_0035	HDEF_0036			TRUE	0.989	42.000	0.538	NA		NA
7636633	7636634	HDEF_0036	HDEF_0037		pulJ	TRUE	0.995	-3.000	0.373	NA		NA
7636634	7636635	HDEF_0037	HDEF_0038	pulJ		TRUE	0.997	-9.000	0.368	NA	Y	NA
7636635	7636636	HDEF_0038	HDEF_0039			FALSE	0.202	-46.000	0.000	NA		NA
7636636	7636637	HDEF_0039	HDEF_0040		gnd	FALSE	0.327	74.000	0.000	NA		NA
7636637	7636638	HDEF_0040	HDEF_0041	gnd	galU	TRUE	0.527	62.000	0.000	1.000	N	NA
7636638	7636639	HDEF_0041	HDEF_0042	galU	asmA	TRUE	0.438	236.000	0.000	NA	Y	NA
7636639	7636640	HDEF_0042	HDEF_0043	asmA	dcd	TRUE	0.477	82.000	0.000	NA	N	NA
7636640	7636641	HDEF_0043	HDEF_0044	dcd	lnt	TRUE	0.895	-3.000	0.000	1.000	N	NA
7636643	7636644	HDEF_0046	HDEF_0047	corC		TRUE	0.843	73.000	0.150	NA		NA
7636645	7636646	HDEF_0048	HDEF_0049	rfaD	pgi	TRUE	0.925	32.000	0.000	1.000	Y	NA
7636646	7636647	HDEF_0049	HDEF_0050	pgi	cmrA	TRUE	0.648	142.000	0.000	NA	Y	NA
7636647	7636648	HDEF_0050	HDEF_0051	cmrA	cmrB	TRUE	0.910	47.000	0.000	NA	Y	NA
7636648	7636649	HDEF_0051	HDEF_0052	cmrB	sod	TRUE	0.895	-3.000	0.000	1.000	N	NA
7636650	7636651	HDEF_0053	HDEF_0054	tpiA	fpr	TRUE	0.640	80.000	0.008	1.000	N	NA
7636653	7636654	HDEF_0056	HDEF_0057	typA	bolA	FALSE	0.268	365.000	0.000	NA	Y	NA
7636654	7636655	HDEF_0057	HDEF_0058	bolA	rgdC	TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA	N	NA
7636656	7636657	HDEF_0059	HDEF_0060	sufA	sufB	TRUE	0.854	51.000	0.041	NA		NA
7636657	7636658	HDEF_0060	HDEF_0061	sufB	sufC	TRUE	0.975	103.000	0.466	1.000	Y	NA
7636658	7636659	HDEF_0061	HDEF_0062	sufC	sufD	TRUE	0.990	-19.000	0.482	1.000	Y	NA
7636659	7636660	HDEF_0062	HDEF_0063	sufD	sufS	TRUE	0.990	-3.000	0.193	1.000	N	NA
7636660	7636661	HDEF_0063	HDEF_0064	sufS	sufE	TRUE	0.966	36.000	0.183	NA		NA
7636664	7636665	HDEF_0067	HDEF_0068	cyoD	cyoC	TRUE	0.999	1.000	0.485	0.025	Y	NA
7636665	7636666	HDEF_0068	HDEF_0069	cyoC	cyoB_1	TRUE	0.999	8.000	0.697	0.025	Y	NA
7636666	7636667	HDEF_0069	HDEF_0070	cyoB_1	cyoA_1	TRUE	0.995	4.000	0.204	0.003	Y	NA
7636667	7636668	HDEF_0070	HDEF_0071	cyoA_1	ubiF	FALSE	0.360	180.000	0.000	0.025	Y	NA
7636668	7636669	HDEF_0071	HDEF_0072	ubiF	accC	TRUE	0.811	23.000	0.000	1.000	N	NA
7636669	7636670	HDEF_0072	HDEF_0073	accC	accB	TRUE	0.995	12.000	0.275	0.002	Y	NA
7636670	7636671	HDEF_0073	HDEF_0074	accB	aroQ	TRUE	0.992	11.000	0.254	1.000	N	NA
7636671	7636672	HDEF_0074	HDEF_0075	aroQ	aroH	TRUE	0.454	103.000	0.000	0.004	Y	NA
7636672	7636673	HDEF_0075	HDEF_0076	aroH	tusB	FALSE	0.200	236.000	0.000	NA	N	NA
7636673	7636674	HDEF_0076	HDEF_0077	tusB	tusC	TRUE	0.999	13.000	0.804	NA	Y	NA
7636674	7636675	HDEF_0077	HDEF_0078	tusC	tusD	TRUE	0.999	14.000	0.790	NA	Y	NA
7636675	7636676	HDEF_0078	HDEF_0079	tusD	fkpA	TRUE	0.867	57.000	0.020	NA	N	NA
7636677	7636678	HDEF_0080	HDEF_0081	evgS		FALSE	0.235	117.000	0.000	NA		NA
7636679	7636680	HDEF_0082	HDEF_0083	secF	secD	TRUE	0.987	25.000	0.206	0.002	Y	NA
7636680	7636681	HDEF_0083	HDEF_0084	secD	yajC	TRUE	0.843	146.000	0.045	NA	Y	NA
7636681	7636682	HDEF_0084	HDEF_0085	yajC	tgt	TRUE	0.916	157.000	0.325	NA	N	NA
7636682	7636683	HDEF_0085	HDEF_0086	tgt	queA	TRUE	0.992	39.000	0.360	0.002	Y	NA
7636684	7636685	HDEF_0087	HDEF_0088	ahpC	vacJ	FALSE	0.311	100.000	0.000	1.000	N	NA
7636685	7636686	HDEF_0088	HDEF_0089	vacJ	plsB	FALSE	0.251	151.000	0.000	1.000	N	NA
7636689	7636690	HDEF_0092	HDEF_0093	fabB	grxA	FALSE	0.258	146.000	0.000	1.000	N	NA
7636690	7636691	HDEF_0093	HDEF_0094	grxA	dapE	TRUE	0.552	59.000	0.000	1.000	N	NA
7636691	7636692	HDEF_0094	HDEF_0095	dapE		TRUE	0.995	-3.000	0.292	1.000	N	NA
7636694	7636695	HDEF_0097	HDEF_0099	engB		FALSE	0.047	368.000	0.000	NA		NA
7636698	7636699	HDEF_0101	HDEF_0102	hinT		TRUE	0.950	9.000	0.010	NA		NA
7636700	7636701	HDEF_0103	HDEF_0104	hrpA	bcp	TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7636701	7636702	HDEF_0104	HDEF_0105	bcp	ribB	TRUE	0.694	34.000	0.000	NA		NA
7636702	7636703	HDEF_0105	HDEF_0106	ribB		FALSE	0.123	201.000	0.000	NA		NA
7636704	7636705	HDEF_0107	HDEF_0108	carA	carB	TRUE	0.995	16.000	0.345	0.002	Y	NA
7636705	7636706	HDEF_0108	HDEF_0109	carB		FALSE	0.092	241.000	0.000	NA		NA
7636706	7636707	HDEF_0109	HDEF_0110			TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7636710	7636711	HDEF_0113	HDEF_0114	yciH	pyrF	TRUE	0.973	7.000	0.045	1.000	N	NA
7636711	7636712	HDEF_0114	HDEF_0115	pyrF		TRUE	0.830	78.000	0.125	1.000	N	NA
7636712	7636713	HDEF_0115	HDEF_0116			TRUE	0.998	1.000	0.576	NA		NA
7636713	7636714	HDEF_0116	HDEF_0117		pgpB	TRUE	0.929	50.000	0.143	NA		NA
7636715	7636716	HDEF_0118	HDEF_0119	ribA		FALSE	0.319	92.000	0.000	1.000	N	NA
7636717	7636718	HDEF_0120	HDEF_0121	tpx	mfd	FALSE	0.109	266.000	0.000	1.000	N	NA
7636719	7636720	HDEF_0122	HDEF_0123	lolC	lolD	TRUE	0.965	-7.000	0.175	0.045	N	NA
7636720	7636721	HDEF_0123	HDEF_0124	lolD	lolE	TRUE	0.984	3.000	0.125	0.045	N	NA
7636722	7636723	HDEF_0125	HDEF_0126	ssaQ		TRUE	0.940	62.000	0.231	NA		NA
7636723	7636724	HDEF_0126	HDEF_0127		ssaO	TRUE	0.984	-19.000	1.000	NA		NA
7636724	7636725	HDEF_0127	HDEF_0128	ssaO	ssaN	TRUE	0.987	-3.000	0.176	NA		NA
7636725	7636726	HDEF_0128	HDEF_0129	ssaN	ssaV	TRUE	0.994	-13.000	0.647	0.019	Y	NA
7636726	7636727	HDEF_0129	HDEF_0130	ssaV	ssaM	TRUE	0.993	-9.000	0.636	NA		NA
7636727	7636728	HDEF_0130	HDEF_0131	ssaM	ssaL	TRUE	0.994	11.000	0.364	NA		NA
7636728	7636729	HDEF_0131	HDEF_0132	ssaL	ssaK	TRUE	0.996	-3.000	0.462	NA		NA
7636729	7636730	HDEF_0132	HDEF_0133	ssaK		TRUE	0.997	-3.000	0.538	NA		NA
7636730	7636731	HDEF_0133	HDEF_0134		ssaJ	TRUE	0.998	-3.000	0.786	NA		NA
7636731	7636732	HDEF_0134	HDEF_0135	ssaJ	ssaI	TRUE	0.992	-3.000	0.407	0.022		NA
7636732	7636733	HDEF_0135	HDEF_0136	ssaI	ssaH	TRUE	0.980	51.000	0.407	NA		NA
7636733	7636734	HDEF_0136	HDEF_0137	ssaH	ssaG	TRUE	0.997	-3.000	0.650	NA		NA
7636734	7636735	HDEF_0137	HDEF_0138	ssaG		TRUE	0.966	16.000	0.150	1.000		NA
7636737	7636738	HDEF_0140	HDEF_0141		sseD	FALSE	0.181	155.000	0.000	NA		NA
7636738	7636739	HDEF_0141	HDEF_0142	sseD	sseC	TRUE	0.586	46.000	0.000	NA		NA
7636739	7636740	HDEF_0142	HDEF_0143	sseC		FALSE	0.235	117.000	0.000	NA		NA
7636740	7636741	HDEF_0143	HDEF_0144		sseB	FALSE	0.404	65.000	0.000	NA		NA
7636741	7636742	HDEF_0144	HDEF_0145	sseB	ssaE	FALSE	0.197	144.000	0.000	NA		NA
7636742	7636743	HDEF_0145	HDEF_0146	ssaE	ssaD	TRUE	0.963	31.000	0.146	NA		NA
7636743	7636744	HDEF_0146	HDEF_0147	ssaD	ssaC	TRUE	0.994	4.000	0.268	NA		NA
7636744	7636745	HDEF_0147	HDEF_0148	ssaC	ssaB	FALSE	0.208	140.000	0.000	NA		NA
7636746	7636747	HDEF_0149	HDEF_0150			TRUE	0.985	72.000	0.688	0.010	Y	NA
7636747	7636748	HDEF_0150	HDEF_0151		map	FALSE	0.234	158.000	0.000	1.000	N	NA
7636748	7636749	HDEF_0151	HDEF_0152	map	dapD	TRUE	0.853	52.000	0.021	1.000	N	NA
7636749	7636750	HDEF_0152	HDEF_0153	dapD		FALSE	0.353	-24.000	0.000	NA		NA
7636750	7636751	HDEF_0153	HDEF_0154			FALSE	0.340	72.000	0.000	NA		NA
7636751	7636752	HDEF_0154	HDEF_0155		recJ	FALSE	0.023	720.000	0.000	NA		NA
7636753	7636754	HDEF_0156	HDEF_0157		manZ	TRUE	0.964	87.000	0.755	NA		NA
7636754	7636755	HDEF_0157	HDEF_0158	manZ	manY	TRUE	0.998	15.000	0.939	0.008	Y	NA
7636755	7636756	HDEF_0158	HDEF_0159	manY	manX	TRUE	0.946	52.000	0.106	0.008	Y	NA
7636756	7636757	HDEF_0159	HDEF_0160	manX	glyA	FALSE	0.063	376.000	0.000	1.000	N	NA
7636757	7636758	HDEF_0160	HDEF_0161	glyA		FALSE	0.044	383.000	0.000	NA		NA
7636758	7636759	HDEF_0161	HDEF_0163			TRUE	0.526	53.000	0.000	NA		NA
7636760	7636761	HDEF_0162	HDEF_0164	tolQ	tolR	TRUE	0.996	35.000	0.556	0.044	Y	NA
7636761	7636762	HDEF_0164	HDEF_0165	tolR	tolA	TRUE	0.954	44.000	0.114	NA	N	NA
7636762	7636763	HDEF_0165	HDEF_0166	tolA	tolB	TRUE	0.823	72.000	0.051	NA	N	NA
7636763	7636764	HDEF_0166	HDEF_0167	tolB	pal	TRUE	0.993	40.000	0.592	1.000	N	NA
7636764	7636765	HDEF_0167	HDEF_0168	pal	ybgF	TRUE	0.942	18.000	0.088	1.000		NA
7636765	7636766	HDEF_0168	HDEF_0169	ybgF		FALSE	0.028	529.000	0.000	NA		NA
7636766	7636767	HDEF_0169	HDEF_0170		codB_1	FALSE	0.264	86.000	0.000	NA		NA
7636767	7636768	HDEF_0170	HDEF_0171	codB_1		TRUE	0.814	12.000	0.000	NA		NA
7636768	7636769	HDEF_0171	HDEF_0172			TRUE	0.999	0.000	1.000	NA		NA
7636770	7636771	HDEF_0173	HDEF_0174			FALSE	0.021	1062.000	0.000	NA		NA
7636775	7636776	HDEF_0178	HDEF_0179		galE_1	FALSE	0.302	78.000	0.000	NA		NA
7636778	7636779	HDEF_0181	HDEF_0182			TRUE	0.854	7.000	0.000	NA		NA
7636779	7636780	HDEF_0182	HDEF_0183			TRUE	0.894	0.000	0.000	NA		NA
7636780	7636781	HDEF_0183	HDEF_0184		cpsB	TRUE	0.886	3.000	0.000	NA		NA
7636781	7636782	HDEF_0184	HDEF_0185	cpsB		TRUE	0.796	14.000	0.000	NA		NA
7636782	7636783	HDEF_0185	HDEF_0186			FALSE	0.351	71.000	0.000	NA		NA
7636783	7636784	HDEF_0186	HDEF_0187			TRUE	0.854	7.000	0.000	NA		NA
7636784	7636785	HDEF_0187	HDEF_0188			TRUE	0.705	32.000	0.000	NA		NA
7636785	7636786	HDEF_0188	HDEF_0189			TRUE	0.710	31.000	0.000	NA		NA
7636786	7636787	HDEF_0189	HDEF_0190		galE_2	FALSE	0.342	172.000	0.000	0.005	Y	NA
7636787	7636788	HDEF_0190	HDEF_0191	galE_2		FALSE	0.029	497.000	0.000	NA		NA
7636788	7636789	HDEF_0191	HDEF_0192			FALSE	0.175	158.000	0.000	NA		NA
7636789	7636790	HDEF_0192	HDEF_0193			FALSE	0.041	392.000	0.000	NA		NA
7636790	7636791	HDEF_0193	HDEF_0194			TRUE	0.898	1.000	0.000	NA		NA
7636791	7636792	HDEF_0194	HDEF_0195			TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7636792	7636793	HDEF_0195	HDEF_0196			TRUE	0.642	-10.000	0.000	NA		NA
7636793	7636794	HDEF_0196	HDEF_0197			TRUE	0.973	4.000	0.000	1.000	Y	NA
7636794	7636795	HDEF_0197	HDEF_0198			TRUE	0.495	56.000	0.000	NA		NA
7636795	7636796	HDEF_0198	HDEF_0199			FALSE	0.216	135.000	0.000	NA		NA
7636796	7636797	HDEF_0199	HDEF_0200			FALSE	0.420	-19.000	0.000	NA		NA
7636797	7636798	HDEF_0200	HDEF_0201			FALSE	0.098	19.000	0.000	0.032		NA
7636798	7636799	HDEF_0201	HDEF_0202			TRUE	0.981	0.000	0.114	1.000		NA
7636799	7636800	HDEF_0202	HDEF_0203			TRUE	0.997	-3.000	0.714	1.000		NA
7636800	7636801	HDEF_0203	HDEF_0204			TRUE	0.998	0.000	0.412	NA	N	NA
7636801	7636802	HDEF_0204	HDEF_0205			TRUE	0.586	46.000	0.000	NA		NA
7636802	7636803	HDEF_0205	HDEF_0206			TRUE	0.898	1.000	0.000	NA		NA
7636803	7636804	HDEF_0206	HDEF_0207		hemH	TRUE	0.700	33.000	0.000	NA		NA
7636804	7636805	HDEF_0207	HDEF_0208	hemH	accA	FALSE	0.241	155.000	0.000	1.000	N	NA
7636805	7636806	HDEF_0208	HDEF_0209	accA	dnaE	TRUE	0.978	13.000	0.122	1.000	N	NA
7636806	7636807	HDEF_0209	HDEF_0210	dnaE		TRUE	0.774	32.000	0.000	1.000	N	NA
7636809	7636810	HDEF_0212	HDEF_0213	nadE		FALSE	0.310	101.000	0.000	1.000	N	NA
7636810	7636811	HDEF_0213	HDEF_0214			FALSE	0.182	248.000	0.000	NA	N	NA
7636811	7636812	HDEF_0214	HDEF_0215			TRUE	0.774	17.000	0.000	NA		NA
7636814	7636815	HDEF_0217	HDEF_0218			FALSE	0.123	201.000	0.000	NA		NA
7636815	7636816	HDEF_0218	HDEF_0219		valS	FALSE	0.383	78.000	0.000	1.000	N	NA
7636816	7636817	HDEF_0219	HDEF_0220	valS	holC	TRUE	0.980	8.000	0.089	1.000	N	NA
7636817	7636818	HDEF_0220	HDEF_0221	holC	pepA	TRUE	0.993	28.000	0.494	1.000	N	NA
7636819	7636820	HDEF_0222	HDEF_0223			TRUE	0.997	0.000	0.631	0.076		NA
7636820	7636821	HDEF_0223	HDEF_0224		ompA	FALSE	0.003	251.000	0.000	0.076		NA
7636822	7636823	HDEF_0225	HDEF_0226	glmS	glmU	TRUE	0.985	15.000	0.055	1.000	Y	NA
7636824	7636825	HDEF_0227	HDEF_0228			TRUE	0.585	18.000	0.000	1.000		NA
7636827	7636828	HDEF_0229	HDEF_0231		lpxK	FALSE	0.050	356.000	0.000	NA		NA
7636830	7636831	HDEF_0233	HDEF_0234	cspE_1		FALSE	0.199	274.000	0.004	NA		NA
7636831	7636832	HDEF_0234	HDEF_0235		kdsB	TRUE	0.995	0.000	0.265	NA		NA
7636832	7636833	HDEF_0235	HDEF_0236	kdsB	yifB	FALSE	0.073	347.000	0.000	1.000	N	NA
7636834	7636835	HDEF_0237	HDEF_0238			TRUE	0.931	41.000	0.000	NA	Y	NA
7636835	7636836	HDEF_0238	HDEF_0239		gspE	TRUE	0.739	51.000	0.000	NA	N	NA
7636836	7636837	HDEF_0239	HDEF_0240	gspE		TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7636837	7636838	HDEF_0240	HDEF_0241		gspD	TRUE	0.998	-3.000	0.776	NA		NA
7636838	7636839	HDEF_0241	HDEF_0243	gspD		TRUE	0.971	69.000	0.575	NA		NA
7636839	7636840	HDEF_0243	HDEF_0245			FALSE	0.039	409.000	0.000	NA		NA
7636840	7636841	HDEF_0245	HDEF_0246			FALSE	0.041	394.000	0.000	NA		NA
7636843	7636844	HDEF_0248	HDEF_0249			TRUE	0.723	28.000	0.000	NA		NA
7636844	7636845	HDEF_0249	HDEF_0250			FALSE	0.046	373.000	0.000	NA		NA
7636846	7636847	HDEF_0251	HDEF_0252			FALSE	0.205	141.000	0.000	NA		NA
7636848	7636849	HDEF_0253	HDEF_0254			TRUE	0.705	32.000	0.000	NA		NA
7636850	7636851	HDEF_0255	HDEF_0256			TRUE	0.995	-3.000	0.351	NA		NA
7636851	7636852	HDEF_0256	HDEF_0257			FALSE	0.086	250.000	0.000	NA		NA
7636853	7636854	HDEF_0258	HDEF_0259			TRUE	0.814	12.000	0.000	NA		NA
7636855	7636856	HDEF_0260	HDEF_0261			TRUE	0.995	-3.000	0.318	NA		NA
7636858	7636859	HDEF_0263	HDEF_0264	mobA_1	hupA_1	FALSE	0.221	131.000	0.000	NA		NA
7636860	7636861	HDEF_0265	HDEF_2345			FALSE	0.083	-1764.000	0.000	NA		NA
7636861	7636862	HDEF_2345	HDEF_0266			FALSE	0.252	-35.000	0.000	NA		NA
7636862	7636863	HDEF_0266	HDEF_0267		gpmA	FALSE	0.238	101.000	0.000	NA		NA
7636863	7636864	HDEF_0267	HDEF_0268	gpmA		FALSE	0.310	101.000	0.000	1.000	N	NA
7636864	7636865	HDEF_0268	HDEF_0269			FALSE	0.125	198.000	0.000	NA		NA
7636866	7636867	HDEF_0270	HDEF_0271	seqA	nuoA	TRUE	0.574	57.000	0.000	1.000	N	NA
7636867	7636868	HDEF_0271	HDEF_0272	nuoA	nuoB	TRUE	0.998	6.000	0.377	0.005	Y	NA
7636868	7636869	HDEF_0272	HDEF_0273	nuoB	nuoC	TRUE	0.999	8.000	0.691	0.005	Y	NA
7636869	7636870	HDEF_0273	HDEF_0274	nuoC	nuoE	TRUE	0.998	3.000	0.407	0.010	Y	NA
7636870	7636871	HDEF_0274	HDEF_0275	nuoE	nuoF	TRUE	0.994	-3.000	0.186	0.010	Y	NA
7636872	7636873	HDEF_0276	HDEF_0277	rtxB_1	rtxD	TRUE	0.997	2.000	0.255	0.015	Y	NA
7636873	7636874	HDEF_0277	HDEF_0278	rtxD	rtxB_2	TRUE	0.993	-3.000	0.170	0.015	Y	NA
7636876	7636877	HDEF_0280	HDEF_0281			FALSE	0.115	211.000	0.000	NA		NA
7636879	7636880	HDEF_0283	HDEF_0284			FALSE	0.237	113.000	0.000	NA		NA
7636880	7636881	HDEF_0284	HDEF_0285			TRUE	0.931	41.000	0.000	NA	Y	NA
7636881	7636882	HDEF_0285	HDEF_0286			FALSE	0.035	434.000	0.000	NA		NA
7636882	7636883	HDEF_0286	HDEF_0287			FALSE	0.251	89.000	0.000	NA		NA
7636883	7636884	HDEF_0287	HDEF_0288			FALSE	0.255	88.000	0.000	NA		NA
7636885	7636886	HDEF_0289	HDEF_0290		serC	FALSE	0.162	77.000	0.000	1.000		NA
7636886	7636887	HDEF_0290	HDEF_0291	serC	gltP	TRUE	0.710	31.000	0.000	NA		NA
7636887	7636888	HDEF_0291	HDEF_0292	gltP	rhlE	FALSE	0.239	100.000	0.000	NA		NA
7636890	7636891	HDEF_0294	HDEF_0295	purE	purK	TRUE	0.990	-3.000	0.136	0.002	Y	NA
7636891	7636892	HDEF_0295	HDEF_0296	purK	coaE	FALSE	0.309	105.000	0.000	1.000	N	NA
7636892	7636893	HDEF_0296	HDEF_2346	coaE		TRUE	0.680	36.000	0.000	NA		NA
7636893	7636894	HDEF_2346	HDEF_0297			FALSE	0.083	-1764.000	0.000	NA		NA
7636894	7636895	HDEF_0297	HDEF_0298			FALSE	0.021	886.000	0.000	NA		NA
7636896	7636897	HDEF_0299	HDEF_0300			TRUE	0.446	61.000	0.000	NA		NA
7636897	7636898	HDEF_0300	HDEF_0301		rnr	TRUE	0.959	-7.000	0.147	0.050	N	NA
7636898	7636899	HDEF_0301	HDEF_0302	rnr	purA	TRUE	0.657	78.000	0.010	1.000	N	NA
7636900	7636901	HDEF_0303	HDEF_0304			FALSE	0.057	586.000	0.000	NA	N	NA
7636902	7636903	HDEF_0305	HDEF_0306	tyrP	nrdB	TRUE	0.746	39.000	0.000	1.000	N	NA
7636903	7636904	HDEF_0306	HDEF_0307	nrdB	nrdA	TRUE	0.843	36.000	0.000	0.002	Y	NA
7636904	7636905	HDEF_0307	HDEF_0308	nrdA	tadG	FALSE	0.062	309.000	0.000	NA		NA
7636905	7636906	HDEF_0308	HDEF_0309	tadG		TRUE	0.991	34.000	0.500	NA		NA
7636906	7636907	HDEF_0309	HDEF_0310		tadE	TRUE	0.881	-25.000	0.200	NA		NA
7636907	7636908	HDEF_0310	HDEF_0311	tadE	tadD	TRUE	0.998	-3.000	0.667	NA		NA
7636908	7636909	HDEF_0311	HDEF_0312	tadD	tadC	TRUE	0.998	-3.000	0.273	NA	Y	NA
7636909	7636910	HDEF_0312	HDEF_0313	tadC	tadB	TRUE	1.000	2.000	0.909	NA	Y	NA
7636910	7636911	HDEF_0313	HDEF_0314	tadB		FALSE	0.420	-19.000	0.000	NA		NA
7636911	7636912	HDEF_0314	HDEF_0315			TRUE	0.814	12.000	0.000	NA		NA
7636912	7636913	HDEF_0315	HDEF_0316			TRUE	0.866	5.000	0.000	NA		NA
7636913	7636914	HDEF_0316	HDEF_0317		rcpA	TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7636914	7636915	HDEF_0317	HDEF_0318	rcpA		TRUE	0.998	6.000	0.889	NA		NA
7636915	7636916	HDEF_0318	HDEF_0319			TRUE	0.954	53.000	0.222	NA		NA
7636916	7636917	HDEF_0319	HDEF_0320			FALSE	0.022	749.000	0.000	NA		NA
7636919	7636920	HDEF_0322	HDEF_0323	crr	ptsI	TRUE	0.883	137.000	0.203	0.005	Y	NA
7636920	7636921	HDEF_0323	HDEF_0324	ptsI	ptsH	TRUE	0.967	52.000	0.187	0.005	Y	NA
7636921	7636922	HDEF_0324	HDEF_0325	ptsH	deaD	FALSE	0.214	172.000	0.000	1.000	N	NA
7636922	7636923	HDEF_0325	HDEF_0326	deaD		FALSE	0.211	138.000	0.000	NA		NA
7636923	7636924	HDEF_0326	HDEF_0327		pnp	FALSE	0.083	256.000	0.000	NA		NA
7636924	7636925	HDEF_0327	HDEF_0328	pnp	rpsO	TRUE	0.953	158.000	0.335	1.000	Y	NA
7636925	7636926	HDEF_0328	HDEF_0329	rpsO	truB	TRUE	0.828	250.000	0.211	1.000	Y	NA
7636926	7636927	HDEF_0329	HDEF_0330	truB	rbfA	TRUE	0.994	-10.000	0.318	1.000	Y	NA
7636927	7636928	HDEF_0330	HDEF_0331	rbfA	infB	TRUE	0.988	71.000	0.530	1.000	Y	NA
7636928	7636929	HDEF_0331	HDEF_0332	infB	nusA	TRUE	0.925	110.000	0.342	1.000	N	NA
7636929	7636930	HDEF_0332	HDEF_0333	nusA		TRUE	0.996	24.000	0.759	NA		NA
7636930	7636931	HDEF_0333	HDEF_0334			FALSE	0.276	83.000	0.000	NA		NA
7636931	7636932	HDEF_0334	HDEF_0335			FALSE	0.385	67.000	0.000	NA		NA
7636932	7636933	HDEF_0335	HDEF_0336			FALSE	0.369	69.000	0.000	NA		NA
7636933	7636934	HDEF_0336	HDEF_0337		secG	FALSE	0.321	75.000	0.000	NA		NA
7636936	7636937	HDEF_0339	HDEF_0340	pabB	pilD	TRUE	0.625	52.000	0.000	1.000	N	NA
7636937	7636938	HDEF_0340	HDEF_0341	pilD		TRUE	0.894	0.000	0.000	NA		NA
7636938	7636939	HDEF_0341	HDEF_0342		gspM	FALSE	0.310	77.000	0.000	NA		NA
7636939	7636940	HDEF_0342	HDEF_0343	gspM	gspL	TRUE	0.999	11.000	0.811	1.000	Y	NA
7636940	7636941	HDEF_0343	HDEF_0344	gspL	gspK	TRUE	0.998	-3.000	0.537	0.073	Y	NA
7636941	7636942	HDEF_0344	HDEF_0345	gspK		FALSE	0.303	-28.000	0.000	NA		NA
7636942	7636943	HDEF_0345	HDEF_0346		gspJ	TRUE	0.875	4.000	0.000	NA		NA
7636943	7636944	HDEF_0346	HDEF_0347	gspJ	gspI	TRUE	0.994	-3.000	0.569	0.006		NA
7636944	7636945	HDEF_0347	HDEF_0348	gspI	gspH	TRUE	0.978	44.000	0.605	0.006		NA
7636945	7636946	HDEF_0348	HDEF_0349	gspH	gspG	TRUE	0.994	1.000	0.425	0.006		NA
7636946	7636947	HDEF_0349	HDEF_0350	gspG	gspF	TRUE	0.767	18.000	0.000	NA		NA
7636947	7636948	HDEF_0350	HDEF_2347	gspF		TRUE	0.628	42.000	0.000	NA		NA
7636948	7636949	HDEF_2347	HDEF_0351			FALSE	0.102	-1763.000	0.000	NA		NA
7636950	7636951	HDEF_0352	HDEF_0353	rne	pyrC	TRUE	0.559	-40.000	0.007	1.000	N	NA
7636951	7636952	HDEF_0353	HDEF_0354	pyrC	erpA	TRUE	0.473	58.000	0.000	NA		NA
7636953	7636954	HDEF_0355	HDEF_0356	obgE	mltC	TRUE	0.875	4.000	0.000	NA		NA
7636954	7636955	HDEF_0356	HDEF_0357	mltC		TRUE	0.973	33.000	0.128	NA	N	NA
7636955	7636956	HDEF_0357	HDEF_0358		mutY	TRUE	0.979	-7.000	0.150	NA	N	NA
7636958	7636959	HDEF_0360	HDEF_0361			FALSE	0.226	126.000	0.000	NA		NA
7636959	7636960	HDEF_0361	HDEF_0362			TRUE	0.875	4.000	0.000	NA		NA
7636961	7636962	HDEF_0363	HDEF_0364			FALSE	0.237	105.000	0.000	NA		NA
7636962	7636963	HDEF_0364	HDEF_0365			TRUE	0.676	38.000	0.000	NA		NA
7636964	7636965	HDEF_0366	HDEF_0367	gltX	fis	FALSE	0.359	82.000	0.000	1.000	N	NA
7636966	7636967	HDEF_0368	HDEF_0369		rpsT	FALSE	0.215	-43.000	0.000	NA		NA
7636968	7636969	HDEF_0370	HDEF_0371	nhaA	dnaJ	TRUE	0.680	79.000	0.022	1.000	N	NA
7636969	7636970	HDEF_0371	HDEF_0372	dnaJ	dnaK	TRUE	0.917	125.000	0.236	0.005	Y	NA
7636970	7636971	HDEF_0372	HDEF_0373	dnaK	ppa	TRUE	0.614	78.000	0.002	1.000	N	NA
7636971	7636972	HDEF_0373	HDEF_0374	ppa	sthA	TRUE	0.517	113.000	0.000	0.056	Y	NA
7636973	7636974	HDEF_0375	HDEF_0376	fabR	glnH	FALSE	0.041	505.000	0.000	1.000	N	NA
7636974	7636975	HDEF_0376	HDEF_0377	glnH	glnP	TRUE	0.974	35.000	0.103	0.041	Y	NA
7636975	7636976	HDEF_0377	HDEF_0378	glnP	glnQ	TRUE	0.990	-3.000	0.051	1.000	Y	NA
7636976	7636977	HDEF_0378	HDEF_0379	glnQ		TRUE	0.723	28.000	0.000	NA		NA
7636977	7636978	HDEF_0379	HDEF_0380			TRUE	0.759	-6.000	0.000	NA		NA
7636978	7636979	HDEF_0380	HDEF_0381			TRUE	0.825	11.000	0.000	NA		NA
7636979	7636980	HDEF_0381	HDEF_0382		pckA	FALSE	0.088	247.000	0.000	NA		NA
7636980	7636981	HDEF_0382	HDEF_0383	pckA		FALSE	0.255	88.000	0.000	NA		NA
7636983	7636984	HDEF_0385	HDEF_0386		kdsA	TRUE	0.965	9.000	0.089	1.000		NA
7636984	7636985	HDEF_0386	HDEF_0387	kdsA	metN	FALSE	0.102	279.000	0.000	1.000	N	NA
7636985	7636986	HDEF_0387	HDEF_0388	metN	metI	TRUE	0.998	-7.000	0.584	1.000	Y	NA
7636986	7636987	HDEF_0388	HDEF_0389	metI	metQ	TRUE	0.805	70.000	0.000	NA	Y	NA
7636989	7636990	HDEF_0391	HDEF_0392	proS		TRUE	0.845	9.000	0.000	NA		NA
7636993	7636994	HDEF_0395	HDEF_0396			TRUE	0.898	1.000	0.000	NA		NA
7636994	7636995	HDEF_0396	HDEF_0397			FALSE	0.251	89.000	0.000	NA		NA
7636999	7637000	HDEF_0401	HDEF_0402	proY	folE	TRUE	0.893	7.000	0.000	1.000	N	NA
7637000	7637001	HDEF_0402	HDEF_0403	folE		FALSE	0.147	81.000	0.000	1.000		NA
7637001	7637002	HDEF_0403	HDEF_0404			FALSE	0.054	342.000	0.000	NA		NA
7637002	7637003	HDEF_0404	HDEF_0405			TRUE	0.612	43.000	0.000	NA		NA
7637003	7637004	HDEF_0405	HDEF_0406			FALSE	0.292	80.000	0.000	NA		NA
7637004	7637005	HDEF_0406	HDEF_0408			TRUE	0.721	-7.000	0.000	NA		NA
7637007	7637008	HDEF_0409	HDEF_0410			FALSE	0.268	85.000	0.000	NA		NA
7637008	7637009	HDEF_0410	HDEF_0411			FALSE	0.024	633.000	0.000	NA		NA
7637010	7637011	HDEF_0412	HDEF_0413			TRUE	0.931	41.000	0.000	NA	Y	NA
7637012	7637013	HDEF_0414	HDEF_0415	virD4		TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7637013	7637014	HDEF_0415	HDEF_0416		virB11	TRUE	0.997	17.000	1.000	NA		NA
7637014	7637015	HDEF_0416	HDEF_0417	virB11	virB10	TRUE	0.985	-10.000	0.500	1.000		NA
7637015	7637016	HDEF_0417	HDEF_0418	virB10		TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7637016	7637017	HDEF_0418	HDEF_0419		virB9	TRUE	0.550	-13.000	0.000	NA		NA
7637017	7637018	HDEF_0419	HDEF_0420	virB9	mobB_1	TRUE	0.981	4.000	0.000	NA	Y	NA
7637018	7637019	HDEF_0420	HDEF_0421	mobB_1	mobC_1	TRUE	0.983	-10.000	0.333	NA		NA
7637020	7637021	HDEF_0422	HDEF_0423			FALSE	0.123	201.000	0.000	NA		NA
7637021	7637022	HDEF_0423	HDEF_0424		stbB_1	TRUE	0.894	2.000	0.000	NA		NA
7637022	7637023	HDEF_0424	HDEF_0425	stbB_1		TRUE	0.803	13.000	0.000	NA		NA
7637023	7637024	HDEF_0425	HDEF_0426			FALSE	0.169	164.000	0.000	NA		NA
7637024	7637025	HDEF_0426	HDEF_0427			TRUE	0.998	0.000	0.613	NA		NA
7637026	7637027	HDEF_0428	HDEF_0429	virB6		TRUE	0.996	23.000	1.000	NA		NA
7637027	7637028	HDEF_0429	HDEF_0430		vagD	TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7637028	7637029	HDEF_0430	HDEF_0431	vagD	vagC	TRUE	0.987	12.000	0.214	NA		NA
7637029	7637030	HDEF_0431	HDEF_0432	vagC	virB5	FALSE	0.327	74.000	0.000	NA		NA
7637030	7637031	HDEF_0432	HDEF_0433	virB5	virB4	TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7637031	7637032	HDEF_0433	HDEF_0434	virB4		FALSE	0.038	415.000	0.000	NA		NA
7637032	7637033	HDEF_0434	HDEF_0435			FALSE	0.210	139.000	0.000	NA		NA
7637033	7637034	HDEF_0435	HDEF_0436			FALSE	0.395	66.000	0.000	NA		NA
7637034	7637035	HDEF_0436	HDEF_0437		rtxA_02	FALSE	0.067	296.000	0.000	NA		NA
7637035	7637036	HDEF_0437	HDEF_0438	rtxA_02	rtxA_01	TRUE	0.835	10.000	0.000	NA		NA
7637037	7637038	HDEF_0439	HDEF_0440	rtxA_03		FALSE	0.213	136.000	0.000	NA		NA
7637038	7637039	HDEF_0440	HDEF_2348			FALSE	0.252	-35.000	0.000	NA		NA
7637039	7637040	HDEF_2348	HDEF_0441			FALSE	0.083	-1764.000	0.000	NA		NA
7637040	7637041	HDEF_0441	HDEF_0442		rluC	FALSE	0.036	348.000	0.000	0.047	N	NA
7637041	7637042	HDEF_0442	HDEF_0443	rluC		FALSE	0.361	70.000	0.000	NA		NA
7637042	7637043	HDEF_0443	HDEF_0444		rpmF	TRUE	0.995	17.000	0.599	NA		NA
7637043	7637044	HDEF_0444	HDEF_0445	rpmF	fabH	FALSE	0.356	220.000	0.014	1.000	N	NA
7637044	7637045	HDEF_0445	HDEF_0446	fabH	fabD	TRUE	0.987	20.000	0.182	0.008	Y	NA
7637045	7637046	HDEF_0446	HDEF_0447	fabD	fabG	TRUE	0.993	-10.000	0.432	0.008	Y	NA
7637046	7637047	HDEF_0447	HDEF_0448	fabG	acpP	TRUE	0.741	366.000	0.321	0.008	Y	NA
7637047	7637048	HDEF_0448	HDEF_0449	acpP	fabF	TRUE	0.985	65.000	0.346	1.000	Y	NA
7637048	7637049	HDEF_0449	HDEF_0450	fabF		FALSE	0.347	203.000	0.019	NA		NA
7637049	7637050	HDEF_0450	HDEF_0451		tmk	TRUE	0.968	-10.000	0.209	NA		NA
7637050	7637051	HDEF_0451	HDEF_0452	tmk	holB	TRUE	0.993	5.000	0.211	1.000	N	NA
7637051	7637052	HDEF_0452	HDEF_0453	holB		TRUE	0.988	30.000	0.110	NA	Y	NA
7637052	7637053	HDEF_0453	HDEF_0454		ptsG	FALSE	0.370	239.000	0.004	NA	N	NA
7637054	7637055	HDEF_0455	HDEF_0456	ung	srmB	TRUE	0.655	-34.000	0.000	1.000	Y	NA
7637055	7637056	HDEF_0456	HDEF_0457	srmB		FALSE	0.064	303.000	0.000	NA		NA
7637059	7637060	HDEF_0460	HDEF_0461	mdh	clpS	FALSE	0.237	105.000	0.000	NA		NA
7637060	7637061	HDEF_0461	HDEF_0462	clpS	clpA	TRUE	0.994	28.000	0.596	NA		NA
7637062	7637063	HDEF_0463	HDEF_0464	infA		FALSE	0.268	85.000	0.000	NA		NA
7637064	7637065	HDEF_0465	HDEF_0466		rplY	FALSE	0.412	121.000	0.000	NA	N	NA
7637066	7637067	HDEF_0467	HDEF_0468	folB		TRUE	0.835	10.000	0.000	NA		NA
7637068	7637069	HDEF_0469	HDEF_0470			FALSE	0.234	118.000	0.000	NA		NA
7637072	7637073	HDEF_0473	HDEF_0474	uspA	murI	FALSE	0.351	84.000	0.000	1.000	N	NA
7637073	7637074	HDEF_0474	HDEF_0475	murI		FALSE	0.351	71.000	0.000	NA		NA
7637074	7637075	HDEF_0475	HDEF_0476		orn	FALSE	0.255	88.000	0.000	NA		NA
7637076	7637077	HDEF_0477	HDEF_0478		psd	TRUE	0.950	16.000	0.095	1.000		NA
7637077	7637078	HDEF_0478	HDEF_0479	psd		TRUE	0.492	291.000	0.148	1.000	N	NA
7637079	7637080	HDEF_0480	HDEF_0481	lysS	pilT_1	FALSE	0.180	192.000	0.000	1.000	N	NA
7637081	7637082	HDEF_0482	HDEF_0483		proC	TRUE	0.918	-13.000	0.125	NA		NA
7637085	7637086	HDEF_0486	HDEF_0487		manA	TRUE	0.994	39.000	0.778	NA		NA
7637089	7637090	HDEF_0489	HDEF_0491		amiB	TRUE	0.980	-3.000	0.109	NA		NA
7637090	7637091	HDEF_0491	HDEF_0492	amiB	mutL_1	TRUE	0.924	48.000	0.092	1.000	N	NA
7637091	7637092	HDEF_0492	HDEF_0493	mutL_1	miaA	TRUE	0.954	-13.000	0.188	1.000	N	NA
7637092	7637093	HDEF_0493	HDEF_0494	miaA	hfq	TRUE	0.897	153.000	0.531	1.000		NA
7637094	7637095	HDEF_0495	HDEF_0496			FALSE	0.243	95.000	0.000	NA		NA
7637096	7637097	HDEF_0497	HDEF_0498	hflK	hflC	TRUE	0.999	6.000	0.947	0.018	Y	NA
7637098	7637099	HDEF_0499	HDEF_0500	rimI	holD	TRUE	0.851	-16.000	0.121	1.000		NA
7637100	7637101	HDEF_0501	HDEF_0502		nuoN	FALSE	0.340	72.000	0.000	NA		NA
7637103	7637104	HDEF_0504	HDEF_0505	priA	mscL	FALSE	0.200	180.000	0.000	1.000	N	NA
7637104	7637105	HDEF_0505	HDEF_0506	mscL	metK	FALSE	0.043	487.000	0.000	1.000	N	NA
7637105	7637106	HDEF_0506	HDEF_0507	metK		TRUE	0.705	32.000	0.000	NA		NA
7637107	7637108	HDEF_0508	HDEF_0509	pyrE	rph	TRUE	0.955	35.000	0.108	1.000	N	NA
7637110	7637111	HDEF_0511	HDEF_0512	speD	speE	TRUE	0.944	74.000	0.162	1.000	Y	NA
7637112	7637113	HDEF_0513	HDEF_0514			TRUE	0.751	4.000	0.000	1.000		NA
7637113	7637114	HDEF_0514	HDEF_0515		rnd	TRUE	0.525	-7.000	0.000	1.000		NA
7637116	7637117	HDEF_0517	HDEF_0518	sirA		FALSE	0.139	187.000	0.000	NA		NA
7637117	7637118	HDEF_0518	HDEF_0519			TRUE	0.568	49.000	0.000	NA		NA
7637118	7637119	HDEF_0519	HDEF_0520			FALSE	0.081	258.000	0.000	NA		NA
7637121	7637122	HDEF_0522	HDEF_0523			FALSE	0.195	-52.000	0.000	NA		NA
7637126	7637127	HDEF_0527	HDEF_0528	rpoE	rseA	TRUE	0.997	26.000	0.705	NA	N	NA
7637127	7637128	HDEF_0528	HDEF_0529	rseA	rseB	TRUE	0.999	24.000	0.856	NA	Y	NA
7637128	7637129	HDEF_0529	HDEF_0530	rseB	lepA	TRUE	0.933	-3.000	0.000	NA	N	NA
7637129	7637130	HDEF_0530	HDEF_0531	lepA	lepB	TRUE	0.945	42.000	0.187	1.000		NA
7637130	7637131	HDEF_0531	HDEF_0532	lepB	rnc	TRUE	0.716	80.000	0.117	1.000		NA
7637131	7637132	HDEF_0532	HDEF_0533	rnc	era	TRUE	0.964	-3.000	0.127	0.045		NA
7637132	7637133	HDEF_0533	HDEF_0534	era	recO	TRUE	0.959	13.000	0.109	1.000		NA
7637133	7637134	HDEF_0534	HDEF_0535	recO	mscS	FALSE	0.312	98.000	0.000	1.000	N	NA
7637134	7637135	HDEF_0535	HDEF_0536	mscS		TRUE	0.628	42.000	0.000	NA		NA
7637136	7637137	HDEF_0537	HDEF_0538	fepE	ugd	TRUE	0.836	56.000	0.000	1.000	Y	NA
7637137	7637138	HDEF_0538	HDEF_0539	ugd		FALSE	0.184	189.000	0.000	1.000	N	NA
7637138	7637139	HDEF_0539	HDEF_2349			FALSE	0.175	-63.000	0.000	NA		NA
7637139	7637140	HDEF_2349	HDEF_0540			FALSE	0.083	-1764.000	0.000	NA		NA
7637140	7637141	HDEF_0540	HDEF_0541			FALSE	0.035	602.000	0.000	1.000	N	NA
7637141	7637142	HDEF_0541	HDEF_0542		iscS	TRUE	0.694	43.000	0.000	1.000	N	NA
7637142	7637143	HDEF_0542	HDEF_0543	iscS	mutT	TRUE	0.681	44.000	0.000	1.000	N	NA
7637143	7637144	HDEF_0543	HDEF_0544	mutT		FALSE	0.292	80.000	0.000	NA		NA
7637144	7637145	HDEF_0544	HDEF_0545		nfuA	TRUE	0.548	51.000	0.000	NA		NA
7637145	7637146	HDEF_0545	HDEF_0546	nfuA	gntX	TRUE	0.820	54.000	0.066	1.000		NA
7637147	7637148	HDEF_0547	HDEF_0548	bioH		FALSE	0.131	194.000	0.000	NA		NA
7637148	7637149	HDEF_0548	HDEF_0549			TRUE	0.845	9.000	0.000	NA		NA
7637149	7637150	HDEF_0549	HDEF_0550			TRUE	0.700	33.000	0.000	NA		NA
7637150	7637151	HDEF_0550	HDEF_0551			TRUE	0.756	21.000	0.000	NA		NA
7637152	7637153	HDEF_0552	HDEF_0553		rluD	FALSE	0.385	-21.000	0.000	NA		NA
7637154	7637155	HDEF_0554	HDEF_0555	yfiO	raiA	TRUE	0.860	40.000	0.004	NA		NA
7637155	7637156	HDEF_0555	HDEF_0556	raiA	mnmA	TRUE	0.878	56.000	0.000	NA	Y	NA
7637156	7637157	HDEF_0556	HDEF_0557	mnmA	purB	TRUE	0.563	112.000	0.006	1.000	N	NA
7637158	7637159	HDEF_0558	HDEF_0559	pmbA		FALSE	0.241	97.000	0.000	NA		NA
7637159	7637160	HDEF_0559	HDEF_0560			TRUE	0.813	-19.000	0.061	NA		NA
7637160	7637161	HDEF_0560	HDEF_0561			FALSE	0.095	237.000	0.000	NA		NA
7637161	7637162	HDEF_0561	HDEF_0562			FALSE	0.036	430.000	0.000	NA		NA
7637162	7637163	HDEF_0562	HDEF_0563			TRUE	0.998	9.000	1.000	NA		NA
7637163	7637164	HDEF_0563	HDEF_0564			TRUE	0.943	-43.000	0.600	NA		NA
7637164	7637165	HDEF_0564	HDEF_0565			TRUE	0.963	-28.000	0.600	NA		NA
7637165	7637166	HDEF_0565	HDEF_0566			TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7637166	7637167	HDEF_0566	HDEF_0567			TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7637167	7637168	HDEF_0567	HDEF_0568			TRUE	0.477	-16.000	0.000	NA		NA
7637168	7637169	HDEF_0568	HDEF_0569			FALSE	0.027	548.000	0.000	NA		NA
7637170	7637171	HDEF_0570	HDEF_0571			FALSE	0.040	401.000	0.000	NA		NA
7637171	7637172	HDEF_0571	HDEF_0572			TRUE	0.782	16.000	0.000	NA		NA
7637175	7637176	HDEF_0575	HDEF_0576			TRUE	0.859	6.000	0.000	NA		NA
7637176	7637177	HDEF_0576	HDEF_0577			TRUE	0.894	0.000	0.000	NA		NA
7637177	7637178	HDEF_0577	HDEF_0578			TRUE	0.559	50.000	0.000	NA		NA
7637178	7637179	HDEF_0578	HDEF_0579		cox_1	FALSE	0.059	330.000	0.000	NA		NA
7637181	7637182	HDEF_0581	HDEF_2350			FALSE	0.175	-63.000	0.000	NA		NA
7637182	7637183	HDEF_2350	HDEF_0582			FALSE	0.083	-1764.000	0.000	NA		NA
7637183	7637184	HDEF_0582	HDEF_0583		rpsR	FALSE	0.038	546.000	0.000	1.000	N	NA
7637184	7637185	HDEF_0583	HDEF_0584	rpsR	priB	TRUE	0.987	5.000	0.128	1.000	N	NA
7637185	7637186	HDEF_0584	HDEF_0585	priB	rpsF	TRUE	0.985	-3.000	0.122	1.000	N	NA
7637186	7637187	HDEF_0585	HDEF_0586	rpsF	rnhB	FALSE	0.211	173.000	0.000	1.000	N	NA
7637187	7637188	HDEF_0586	HDEF_0587	rnhB	lpxB	TRUE	0.993	0.000	0.186	1.000	N	NA
7637188	7637189	HDEF_0587	HDEF_0588	lpxB	lpxA	TRUE	0.998	2.000	0.289	1.000	Y	NA
7637189	7637190	HDEF_0588	HDEF_0589	lpxA	fabZ	TRUE	0.999	4.000	0.850	1.000	N	NA
7637190	7637191	HDEF_0589	HDEF_0590	fabZ	lpxD	TRUE	0.951	162.000	0.796	1.000	N	NA
7637191	7637192	HDEF_0590	HDEF_0591	lpxD	hlpA	TRUE	0.999	6.000	0.814	1.000	Y	NA
7637192	7637193	HDEF_0591	HDEF_0592	hlpA		TRUE	0.996	29.000	0.354	1.000	Y	NA
7637193	7637194	HDEF_0592	HDEF_0593		rseP	TRUE	0.990	36.000	0.204	1.000	Y	NA
7637194	7637195	HDEF_0593	HDEF_0594	rseP	cdsA	TRUE	0.885	57.000	0.080	1.000	N	NA
7637195	7637196	HDEF_0594	HDEF_0595	cdsA	ispU	TRUE	0.998	10.000	0.400	1.000	Y	NA
7637197	7637198	HDEF_0596	HDEF_0597			TRUE	0.894	2.000	0.000	NA		NA
7637198	7637199	HDEF_0597	HDEF_0598			FALSE	0.371	-22.000	0.000	NA		NA
7637200	7637201	HDEF_0599	HDEF_0600	aguA	aguB	TRUE	0.978	0.000	0.095	1.000		NA
7637201	7637202	HDEF_0600	HDEF_0601	aguB		TRUE	0.754	44.000	0.004	1.000		NA
7637202	7637203	HDEF_0601	HDEF_0602			TRUE	0.997	0.000	0.263	NA	N	NA
7637203	7637204	HDEF_0602	HDEF_0603		gshB	TRUE	0.817	101.000	0.120	NA	N	NA
7637204	7637205	HDEF_0603	HDEF_0604	gshB	rsmE	TRUE	0.977	17.000	0.173	NA		NA
7637205	7637206	HDEF_0604	HDEF_0605	rsmE	thiQ	TRUE	0.774	17.000	0.000	NA		NA
7637206	7637207	HDEF_0605	HDEF_0606	thiQ	thiP	TRUE	0.981	-13.000	0.522	0.023	N	NA
7637207	7637208	HDEF_0606	HDEF_0607	thiP	tbpA	TRUE	0.971	-24.000	0.697	0.038	N	NA
7637208	7637209	HDEF_0607	HDEF_0608	tbpA	hofC	TRUE	0.822	19.000	0.000	1.000	N	NA
7637209	7637210	HDEF_0608	HDEF_0609	hofC	hofB	TRUE	0.998	15.000	0.571	1.000	Y	NA
7637210	7637211	HDEF_0609	HDEF_0610	hofB	pilA	TRUE	0.999	0.000	0.556	NA	Y	NA
7637212	7637213	HDEF_0611	HDEF_0612	glyQ	glyS	TRUE	0.997	24.000	0.651	0.001	Y	NA
7637215	7637216	HDEF_0614	HDEF_0615			TRUE	0.716	182.000	0.200	NA		NA
7637217	7637218	HDEF_0616	HDEF_0617			TRUE	0.931	41.000	0.000	NA	Y	NA
7637219	7637220	HDEF_0618	HDEF_2351			FALSE	0.205	-45.000	0.000	NA		NA
7637220	7637221	HDEF_2351	HDEF_0619			FALSE	0.083	-1764.000	0.000	NA		NA
7637221	7637222	HDEF_0619	HDEF_0620			TRUE	0.762	19.000	0.000	NA		NA
7637222	7637223	HDEF_0620	HDEF_0621		rtxA_04	TRUE	0.550	-13.000	0.000	NA		NA
7637223	7637224	HDEF_0621	HDEF_0622	rtxA_04	rtxA_05	TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7637226	7637227	HDEF_0624	HDEF_0625	gmk	rpoZ	TRUE	0.950	87.000	0.471	1.000	N	NA
7637227	7637228	HDEF_0625	HDEF_0626	rpoZ	spoT	TRUE	0.998	9.000	0.291	1.000	Y	NA
7637228	7637229	HDEF_0626	HDEF_0627	spoT	recG	TRUE	0.823	101.000	0.034	1.000	Y	NA
7637229	7637230	HDEF_0627	HDEF_0628	recG	groES	FALSE	0.142	226.000	0.000	1.000	N	NA
7637230	7637231	HDEF_0628	HDEF_0629	groES	groEL	TRUE	0.993	60.000	0.631	1.000	Y	NA
7637231	7637232	HDEF_0629	HDEF_0630	groEL		FALSE	0.039	404.000	0.000	NA		NA
7637232	7637233	HDEF_0630	HDEF_0631			FALSE	0.065	302.000	0.000	NA		NA
7637233	7637234	HDEF_0631	HDEF_0632			FALSE	0.067	297.000	0.000	NA		NA
7637235	7637236	HDEF_0633	HDEF_0634			TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7637236	7637237	HDEF_0634	HDEF_0635			TRUE	0.550	-13.000	0.000	NA		NA
7637237	7637238	HDEF_0635	HDEF_0636		rtxA_06	TRUE	0.759	-6.000	0.000	NA		NA
7637243	7637244	HDEF_0641	HDEF_0642	xthA	sppA	TRUE	0.816	54.000	0.006	1.000	N	NA
7637244	7637245	HDEF_0642	HDEF_0643	sppA	rpsU	FALSE	0.097	293.000	0.000	1.000	N	NA
7637245	7637246	HDEF_0643	HDEF_0644	rpsU	dnaG	TRUE	0.533	194.000	0.067	1.000	N	NA
7637246	7637247	HDEF_0644	HDEF_0645	dnaG	rpoD	TRUE	0.881	155.000	0.299	1.000	N	NA
7637247	7637248	HDEF_0645	HDEF_0646	rpoD	zwf	FALSE	0.294	127.000	0.000	1.000	N	NA
7637249	7637250	HDEF_0647	HDEF_0648			TRUE	0.814	12.000	0.000	NA		NA
7637250	7637251	HDEF_0648	HDEF_0649		znuB	FALSE	0.063	515.000	0.000	NA	N	NA
7637251	7637252	HDEF_0649	HDEF_0650	znuB	znuC	TRUE	0.998	-7.000	0.755	1.000	Y	NA
7637253	7637254	HDEF_0651	HDEF_0652	znuA		TRUE	0.817	83.000	0.131	1.000	N	NA
7637254	7637255	HDEF_0652	HDEF_0653		lpxM	TRUE	0.995	33.000	0.299	1.000	Y	NA
7637255	7637256	HDEF_0653	HDEF_0654	lpxM	rppH	FALSE	0.224	165.000	0.000	1.000	N	NA
7637256	7637257	HDEF_0654	HDEF_0655	rppH	pyrD	TRUE	0.819	20.000	0.000	1.000	N	NA
7637259	7637260	HDEF_0657	HDEF_0658		uup	TRUE	0.898	-9.000	0.061	1.000		NA
7637263	7637264	HDEF_0661	HDEF_0662			TRUE	0.835	10.000	0.000	NA		NA
7637265	7637266	HDEF_0663	HDEF_0664		slyA	TRUE	0.756	21.000	0.000	NA		NA
7637266	7637267	HDEF_0664	HDEF_0665	slyA		FALSE	0.169	164.000	0.000	NA		NA
7637267	7637268	HDEF_0665	HDEF_0666			TRUE	0.769	-5.000	0.000	NA		NA
7637269	7637270	HDEF_0667	HDEF_0668			FALSE	0.195	145.000	0.000	NA		NA
7637270	7637271	HDEF_0668	HDEF_0669		slyB	TRUE	0.731	26.000	0.000	NA		NA
7637272	7637273	HDEF_0670	HDEF_0671	pdxH	tyrS	TRUE	0.688	90.000	0.054	1.000	N	NA
7637273	7637274	HDEF_0671	HDEF_0672	tyrS	mrdA	TRUE	0.854	13.000	0.000	1.000	N	NA
7637274	7637275	HDEF_0672	HDEF_0673	mrdA	mrdB	TRUE	0.975	6.000	0.046	1.000	N	NA
7637275	7637276	HDEF_0673	HDEF_0674	mrdB	dacA	TRUE	0.546	110.000	0.003	1.000	N	NA
7637276	7637277	HDEF_0674	HDEF_0675	dacA		TRUE	0.950	25.000	0.081	NA		NA
7637277	7637278	HDEF_0675	HDEF_0676		lipB	TRUE	0.987	13.000	0.219	NA		NA
7637278	7637279	HDEF_0676	HDEF_0677	lipB	lipA	TRUE	0.991	36.000	0.319	0.001	Y	NA
7637279	7637280	HDEF_0677	HDEF_0678	lipA	dnaB	FALSE	0.194	182.000	0.000	1.000	N	NA
7637280	7637281	HDEF_0678	HDEF_0679	dnaB	alr	TRUE	0.991	19.000	0.317	1.000	N	NA
7637281	7637282	HDEF_0679	HDEF_0680	alr	lysP	FALSE	0.253	149.000	0.000	1.000	N	NA
7637282	7637283	HDEF_0680	HDEF_0681	lysP	yeeF	TRUE	0.523	79.000	0.000	0.003	Y	NA
7637285	7637286	HDEF_0683	HDEF_0684	dnaQ_1		FALSE	0.231	120.000	0.000	NA		NA
7637287	7637288	HDEF_0685	HDEF_0686			TRUE	0.756	21.000	0.000	NA		NA
7637288	7637289	HDEF_0686	HDEF_0687			TRUE	0.575	48.000	0.000	NA		NA
7637289	7637290	HDEF_0687	HDEF_0688			TRUE	0.437	62.000	0.000	NA		NA
7637291	7637292	HDEF_0689	HDEF_0690			TRUE	0.461	59.000	0.000	NA		NA
7637292	7637293	HDEF_0690	HDEF_0691		purM	FALSE	0.226	126.000	0.000	NA		NA
7637293	7637294	HDEF_0691	HDEF_0692	purM	purN	TRUE	0.994	11.000	0.230	0.004	Y	NA
7637294	7637295	HDEF_0692	HDEF_0693	purN	speG	TRUE	0.880	-12.000	0.017	1.000	N	NA
7637295	7637296	HDEF_0693	HDEF_0694	speG	aroA	TRUE	0.681	44.000	0.000	1.000	N	NA
7637296	7637297	HDEF_0694	HDEF_0695	aroA	cmk	TRUE	0.978	35.000	0.209	1.000	N	NA
7637297	7637298	HDEF_0695	HDEF_0696	cmk	rpsA	TRUE	0.902	120.000	0.281	1.000	N	NA
7637298	7637299	HDEF_0696	HDEF_0697	rpsA	ihfB	TRUE	0.978	48.000	0.292	1.000	N	NA
7637299	7637300	HDEF_0697	HDEF_0698	ihfB		FALSE	0.056	336.000	0.000	NA		NA
7637300	7637301	HDEF_0698	HDEF_0699		dapF	TRUE	0.937	13.000	0.012	NA		NA
7637301	7637302	HDEF_0699	HDEF_0700	dapF	uvrD	TRUE	0.646	50.000	0.000	1.000	N	NA
7637303	7637304	HDEF_0701	HDEF_0702		smpB	FALSE	0.199	143.000	0.000	NA		NA
7637305	7637306	HDEF_0703	HDEF_0704	hemC	hemD	TRUE	0.993	9.000	0.205	0.003	Y	NA
7637306	7637307	HDEF_0704	HDEF_0705	hemD	hemX	TRUE	0.997	34.000	0.600	1.000	Y	NA
7637307	7637308	HDEF_0705	HDEF_0706	hemX	hemY	TRUE	0.886	3.000	0.000	NA		NA
7637310	7637311	HDEF_0708	HDEF_0709			FALSE	0.008	-55.000	0.000	0.017		NA
7637312	7637313	HDEF_0710	HDEF_0711	rpoC	rpoB	TRUE	0.755	264.000	0.851	0.001		NA
7637313	7637314	HDEF_0711	HDEF_0712	rpoB	rplL	FALSE	0.333	439.000	0.223	1.000		NA
7637314	7637315	HDEF_0712	HDEF_0713	rplL	rplJ	TRUE	0.995	53.000	0.884	0.027	Y	NA
7637315	7637316	HDEF_0713	HDEF_0714	rplJ	rplA	TRUE	0.756	358.000	0.302	0.037	Y	NA
7637316	7637317	HDEF_0714	HDEF_0715	rplA	rplK	TRUE	0.999	5.000	0.838	0.037	Y	NA
7637317	7637318	HDEF_0715	HDEF_0716	rplK	nusG	TRUE	0.798	375.000	0.681	1.000	N	NA
7637318	7637319	HDEF_0716	HDEF_0717	nusG	secE	TRUE	0.980	2.000	0.037	1.000	N	NA
7637319	7637320	HDEF_0717	HDEF_0718	secE	tufB	TRUE	0.619	78.000	0.002	1.000	N	NA
7637320	7637321	HDEF_0718	HDEF_0719	tufB	fusA	TRUE	0.959	86.000	0.400	0.001	Y	NA
7637321	7637322	HDEF_0719	HDEF_0720	fusA	rpsG	TRUE	0.979	132.000	0.579	1.000	Y	NA
7637322	7637323	HDEF_0720	HDEF_0721	rpsG	rpsL	TRUE	0.973	98.000	0.620	0.006	Y	NA
7637325	7637326	HDEF_0724	HDEF_0725			FALSE	0.420	-19.000	0.000	NA		NA
7637326	7637327	HDEF_0725	HDEF_2353			FALSE	0.175	-63.000	0.000	NA		NA
7637327	7637328	HDEF_2353	HDEF_0726			FALSE	0.083	-1764.000	0.000	NA		NA
7637330	7637331	HDEF_0728	HDEF_0729	finO_1		TRUE	0.753	22.000	0.000	NA		NA
7637331	7637332	HDEF_0729	HDEF_0731		hupA_2	FALSE	0.021	2629.000	0.000	NA		NA
7637332	7637333	HDEF_0731	HDEF_0732	hupA_2	mobA_2	FALSE	0.221	131.000	0.000	NA		NA
7637333	7637334	HDEF_0732	HDEF_0733	mobA_2	mobB_2	TRUE	0.898	1.000	0.000	NA		NA
7637335	7637336	HDEF_0734	HDEF_0735	mobC_2		TRUE	0.850	8.000	0.000	NA		NA
7637337	7637338	HDEF_0736	HDEF_0737			TRUE	0.721	-7.000	0.000	NA		NA
7637339	7637340	HDEF_0738	HDEF_0739			TRUE	0.975	-3.000	0.077	NA		NA
7637344	7637345	HDEF_0743	HDEF_0744			TRUE	0.886	3.000	0.000	NA		NA
7637345	7637346	HDEF_0744	HDEF_0745			FALSE	0.024	617.000	0.000	NA		NA
7637347	7637348	HDEF_2355	HDEF_0746			FALSE	0.083	-1764.000	0.000	NA		NA
7637349	7637350	HDEF_0747	HDEF_0748	ndk		FALSE	0.371	-22.000	0.000	NA		NA
7637350	7637351	HDEF_0748	HDEF_0749			FALSE	0.168	-64.000	0.000	NA		NA
7637351	7637352	HDEF_0749	HDEF_0750		pilF	TRUE	0.576	98.000	0.067	1.000		NA
7637352	7637353	HDEF_0750	HDEF_0751	pilF		TRUE	0.642	-10.000	0.000	NA		NA
7637353	7637354	HDEF_0751	HDEF_0752		ispG	FALSE	0.148	180.000	0.000	NA		NA
7637354	7637355	HDEF_0752	HDEF_0753	ispG	hisS	TRUE	0.983	23.000	0.207	1.000	N	NA
7637355	7637356	HDEF_0753	HDEF_0754	hisS		TRUE	0.980	24.000	0.259	1.000		NA
7637356	7637357	HDEF_0754	HDEF_0755		yfgL	TRUE	0.994	12.000	0.492	1.000		NA
7637357	7637358	HDEF_0755	HDEF_0756	yfgL	engA	TRUE	0.713	156.000	0.203	1.000		NA
7637358	7637359	HDEF_0756	HDEF_0757	engA		FALSE	0.237	111.000	0.000	NA		NA
7637360	7637361	HDEF_0758	HDEF_0759			FALSE	0.094	238.000	0.000	NA		NA
7637361	7637362	HDEF_0759	HDEF_0760			TRUE	0.898	1.000	0.000	NA		NA
7637362	7637363	HDEF_0760	HDEF_0761			FALSE	0.232	-40.000	0.000	NA		NA
7637366	7637367	HDEF_0764	HDEF_0765	glnS	pyrG	TRUE	0.705	67.000	0.003	1.000	N	NA
7637367	7637368	HDEF_0765	HDEF_0766	pyrG	eno	TRUE	0.776	77.000	0.068	1.000	N	NA
7637368	7637369	HDEF_0766	HDEF_0767	eno	queC	FALSE	0.118	104.000	0.000	1.000		NA
7637369	7637370	HDEF_0767	HDEF_0768	queC	zipA	FALSE	0.116	118.000	0.000	1.000		NA
7637370	7637371	HDEF_0768	HDEF_0769	zipA	ligA	TRUE	0.983	-3.000	0.106	1.000	N	NA
7637372	7637373	HDEF_0770	HDEF_0771		cytR	FALSE	0.167	165.000	0.000	NA		NA
7637373	7637374	HDEF_0771	HDEF_0772	cytR		FALSE	0.046	370.000	0.000	NA		NA
7637374	7637375	HDEF_0772	HDEF_0773			TRUE	0.997	-3.000	0.575	NA		NA
7637375	7637376	HDEF_0773	HDEF_0774		apaH	TRUE	0.625	52.000	0.000	1.000	N	NA
7637376	7637377	HDEF_0774	HDEF_0775	apaH	ksgA	TRUE	0.816	59.000	0.025	1.000	N	NA
7637377	7637378	HDEF_0775	HDEF_0776	ksgA	pdxA	TRUE	0.969	-10.000	0.197	1.000	N	NA
7637378	7637379	HDEF_0776	HDEF_0777	pdxA	surA	TRUE	0.992	-10.000	0.561	1.000	N	NA
7637379	7637380	HDEF_0777	HDEF_0778	surA	imp	TRUE	0.830	101.000	0.182	1.000	N	NA
7637381	7637382	HDEF_0779	HDEF_0780		pdxB	FALSE	0.102	230.000	0.000	NA		NA
7637382	7637383	HDEF_0780	HDEF_0781	pdxB		TRUE	0.853	82.000	0.097	0.010	Y	NA
7637383	7637384	HDEF_0781	HDEF_0782		truA	TRUE	0.980	0.000	0.040	1.000	N	NA
7637384	7637385	HDEF_0782	HDEF_0783	truA	dedA	TRUE	0.788	61.000	0.038	NA		NA
7637385	7637386	HDEF_0783	HDEF_0784	dedA	accD	TRUE	0.849	46.000	0.020	NA		NA
7637386	7637387	HDEF_0784	HDEF_0785	accD	folC	TRUE	0.912	152.000	0.383	1.000	N	NA
7637387	7637388	HDEF_0785	HDEF_0786	folC		TRUE	0.970	-10.000	0.216	NA		NA
7637388	7637389	HDEF_0786	HDEF_0787			TRUE	0.919	48.000	0.116	NA		NA
7637389	7637390	HDEF_0787	HDEF_0788		purF	TRUE	0.985	15.000	0.262	1.000		NA
7637390	7637391	HDEF_0788	HDEF_0789	purF	ubiX	TRUE	0.961	16.000	0.056	1.000	N	NA
7637391	7637392	HDEF_0789	HDEF_0790	ubiX		TRUE	0.754	49.000	0.000	NA	N	NA
7637392	7637393	HDEF_0790	HDEF_0791		secB	TRUE	0.960	50.000	0.158	NA	N	NA
7637393	7637394	HDEF_0791	HDEF_0792	secB		TRUE	0.994	2.000	0.206	1.000	N	NA
7637394	7637395	HDEF_0792	HDEF_0793			FALSE	0.134	190.000	0.000	NA		NA
7637396	7637397	HDEF_0794	HDEF_0795	rfaE	rplI	FALSE	0.309	105.000	0.000	1.000	N	NA
7637397	7637398	HDEF_0795	HDEF_2356	rplI		TRUE	0.612	43.000	0.000	NA		NA
7637398	7637399	HDEF_2356	HDEF_0796			FALSE	0.083	-1764.000	0.000	NA		NA
7637400	7637401	HDEF_0797	HDEF_0798		lolA	FALSE	0.205	141.000	0.000	NA		NA
7637401	7637402	HDEF_0798	HDEF_0799	lolA	parE	FALSE	0.219	169.000	0.000	1.000	N	NA
7637402	7637403	HDEF_0799	HDEF_0800	parE		TRUE	0.467	84.000	0.000	NA	N	NA
7637403	7637404	HDEF_0800	HDEF_0801		parC	FALSE	0.279	184.000	0.000	NA	N	NA
7637404	7637405	HDEF_0801	HDEF_0802	parC	plsC	TRUE	0.831	61.000	0.043	1.000	N	NA
7637406	7637407	HDEF_0803	HDEF_0804	pykF		FALSE	0.060	314.000	0.000	NA		NA
7637407	7637408	HDEF_0804	HDEF_0805			FALSE	0.255	88.000	0.000	NA		NA
7637408	7637409	HDEF_0805	HDEF_0806			FALSE	0.415	148.000	0.033	1.000		NA
7637409	7637410	HDEF_0806	HDEF_0807		lon	TRUE	0.816	88.000	0.015	1.000	Y	NA
7637410	7637411	HDEF_0807	HDEF_0808	lon	clpX	TRUE	0.769	294.000	0.201	1.000	Y	NA
7637411	7637412	HDEF_0808	HDEF_0809	clpX	clpP	TRUE	0.994	43.000	0.352	1.000	Y	NA
7637412	7637413	HDEF_0809	HDEF_0810	clpP	tig	TRUE	0.959	148.000	0.351	1.000	Y	NA
7637413	7637414	HDEF_0810	HDEF_0811	tig		FALSE	0.061	313.000	0.000	NA		NA
7637414	7637415	HDEF_0811	HDEF_0812			FALSE	0.080	262.000	0.000	NA		NA
7637415	7637416	HDEF_0812	HDEF_0813			FALSE	0.327	74.000	0.000	NA		NA
7637416	7637417	HDEF_0813	HDEF_0814			TRUE	0.717	29.000	0.000	NA		NA
7637417	7637418	HDEF_0814	HDEF_0815			TRUE	0.886	3.000	0.000	NA		NA
7637420	7637421	HDEF_0817	HDEF_0818	prmA	panF	TRUE	0.764	-24.000	0.041	1.000	N	NA
7637421	7637422	HDEF_0818	HDEF_0819	panF		TRUE	0.998	-3.000	0.682	NA		NA
7637423	7637424	HDEF_0820	HDEF_0821			TRUE	0.453	60.000	0.000	NA		NA
7637424	7637425	HDEF_0821	HDEF_0822		pabA	FALSE	0.237	105.000	0.000	NA		NA
7637425	7637426	HDEF_0822	HDEF_0823	pabA	lpxL	FALSE	0.261	144.000	0.000	1.000	N	NA
7637427	7637428	HDEF_0824	HDEF_0825			TRUE	0.721	-7.000	0.000	NA		NA
7637431	7637432	HDEF_0828	HDEF_0829	recN	smpA	TRUE	0.864	56.000	0.049	1.000	N	NA
7637432	7637433	HDEF_0829	HDEF_0830	smpA	ribF	FALSE	0.345	85.000	0.000	1.000	N	NA
7637433	7637434	HDEF_0830	HDEF_0831	ribF	ileS	TRUE	0.986	28.000	0.254	1.000	N	NA
7637434	7637435	HDEF_0831	HDEF_0832	ileS	lspA	TRUE	0.982	1.000	0.045	1.000	N	NA
7637435	7637436	HDEF_0832	HDEF_0833	lspA	fkbP	TRUE	0.991	2.000	0.154	1.000	N	NA
7637436	7637437	HDEF_0833	HDEF_0834	fkbP	ispH	TRUE	0.982	-19.000	0.626	1.000	N	NA
7637437	7637438	HDEF_0834	HDEF_0835	ispH		FALSE	0.187	152.000	0.000	NA		NA
7637439	7637440	HDEF_0836	HDEF_0837			TRUE	0.931	41.000	0.000	NA	Y	NA
7637440	7637441	HDEF_0837	HDEF_0839			TRUE	0.774	17.000	0.000	NA		NA
7637444	7637445	HDEF_0841	HDEF_0842	rfaF	rfaC	TRUE	0.993	10.000	0.205	0.002	Y	NA
7637446	7637447	HDEF_0843	HDEF_0844			TRUE	0.898	1.000	0.000	NA		NA
7637448	7637449	HDEF_0845	HDEF_2357			FALSE	0.032	470.000	0.000	NA		NA
7637449	7637450	HDEF_2357	HDEF_0847			FALSE	0.083	-1764.000	0.000	NA		NA
7637451	7637452	HDEF_0848	HDEF_0849	rtxA_09	rtxA_08	FALSE	0.140	-88.000	0.000	NA		NA
7637452	7637453	HDEF_0849	HDEF_0850	rtxA_08		FALSE	0.161	171.000	0.000	NA		NA
7637455	7637456	HDEF_0852	HDEF_0853			TRUE	0.988	-3.000	0.185	NA		NA
7637456	7637457	HDEF_0853	HDEF_0854			TRUE	0.989	5.000	0.185	NA		NA
7637457	7637458	HDEF_0854	HDEF_0855		yqjA	FALSE	0.182	154.000	0.000	NA		NA
7637459	7637460	HDEF_0856	HDEF_0857	arnC	arnA	TRUE	0.998	0.000	0.220	NA	Y	NA
7637460	7637461	HDEF_0857	HDEF_0858	arnA	arnD	TRUE	0.999	-3.000	0.447	1.000	Y	NA
7637461	7637462	HDEF_0858	HDEF_0859	arnD	arnT	TRUE	0.979	5.000	0.061	1.000	N	NA
7637462	7637463	HDEF_0859	HDEF_0860	arnT	arnE	TRUE	0.983	-3.000	0.105	1.000	N	NA
7637463	7637464	HDEF_0860	HDEF_0861	arnE	arnF	TRUE	0.991	-3.000	0.226	NA		NA
7637465	7637466	HDEF_0862	HDEF_0863	mrcB	polA	TRUE	0.605	54.000	0.000	1.000	N	NA
7637466	7637467	HDEF_0863	HDEF_0864	polA		FALSE	0.055	337.000	0.000	NA		NA
7637467	7637468	HDEF_0864	HDEF_0865			FALSE	0.058	332.000	0.000	NA		NA
7637468	7637469	HDEF_0865	HDEF_0866		pssA	FALSE	0.076	273.000	0.000	NA		NA
7637469	7637470	HDEF_0866	HDEF_0867	pssA		FALSE	0.184	153.000	0.000	NA		NA
7637471	7637472	HDEF_0868	HDEF_0869	aspS		TRUE	0.849	51.000	0.039	NA		NA
7637472	7637473	HDEF_0869	HDEF_0870		ruvC	TRUE	0.993	6.000	0.277	NA		NA
7637475	7637476	HDEF_0872	HDEF_0873		expI	FALSE	0.033	451.000	0.000	NA		NA
7637477	7637478	HDEF_0874	HDEF_0875	expR	purL	TRUE	0.474	67.000	0.000	1.000	N	NA
7637478	7637479	HDEF_0875	HDEF_0876	purL	pepN	FALSE	0.261	144.000	0.000	1.000	N	NA
7637480	7637481	HDEF_0877	HDEF_0878	asnS		TRUE	0.550	-13.000	0.000	NA		NA
7637483	7637484	HDEF_0880	HDEF_0881			TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7637485	7637486	HDEF_0882	HDEF_0883			FALSE	0.237	109.000	0.000	NA		NA
7637487	7637488	HDEF_0884	HDEF_0885		rus	TRUE	0.886	3.000	0.000	NA		NA
7637488	7637489	HDEF_0885	HDEF_0886	rus		TRUE	0.854	7.000	0.000	NA		NA
7637489	7637490	HDEF_0886	HDEF_0887			FALSE	0.236	114.000	0.000	NA		NA
7637492	7637493	HDEF_0889	HDEF_0890			FALSE	0.119	205.000	0.000	NA		NA
7637493	7637494	HDEF_0890	HDEF_0891			TRUE	0.875	4.000	0.000	NA		NA
7637494	7637495	HDEF_0891	HDEF_0892			TRUE	0.894	0.000	0.000	NA		NA
7637495	7637496	HDEF_0892	HDEF_0893			FALSE	0.236	115.000	0.000	NA		NA
7637496	7637497	HDEF_0893	HDEF_0894			TRUE	0.898	1.000	0.000	NA		NA
7637497	7637498	HDEF_0894	HDEF_0895			TRUE	0.774	17.000	0.000	NA		NA
7637498	7637499	HDEF_0895	HDEF_0896			FALSE	0.178	156.000	0.000	NA		NA
7637499	7637500	HDEF_0896	HDEF_0897			TRUE	0.721	-7.000	0.000	NA		NA
7637500	7637501	HDEF_0897	HDEF_0898			TRUE	0.980	3.000	0.074	NA		NA
7637501	7637502	HDEF_0898	HDEF_0899			TRUE	0.803	13.000	0.000	NA		NA
7637502	7637503	HDEF_0899	HDEF_0900			TRUE	0.590	45.000	0.000	NA		NA
7637503	7637504	HDEF_0900	HDEF_0901			FALSE	0.136	189.000	0.000	NA		NA
7637504	7637505	HDEF_0901	HDEF_0902			TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7637505	7637506	HDEF_0902	HDEF_0903			TRUE	0.537	52.000	0.000	NA		NA
7637506	7637507	HDEF_0903	HDEF_0904			TRUE	0.866	5.000	0.000	NA		NA
7637508	7637509	HDEF_0905	HDEF_0906			FALSE	0.107	219.000	0.000	NA		NA
7637514	7637515	HDEF_0911	HDEF_0912			FALSE	0.302	78.000	0.000	NA		NA
7637515	7637516	HDEF_0912	HDEF_0913			FALSE	0.369	69.000	0.000	NA		NA
7637516	7637517	HDEF_0913	HDEF_0914			FALSE	0.236	115.000	0.000	NA		NA
7637517	7637518	HDEF_0914	HDEF_0915			FALSE	0.245	93.000	0.000	NA		NA
7637519	7637520	HDEF_0916	HDEF_0917		C_2	TRUE	0.581	47.000	0.000	NA		NA
7637521	7637522	HDEF_0918	HDEF_0919	cox_2		FALSE	0.059	326.000	0.000	NA		NA
7637524	7637525	HDEF_0921	HDEF_0922			FALSE	0.236	116.000	0.000	NA		NA
7637525	7637526	HDEF_0922	HDEF_0923		O_1	FALSE	0.022	808.000	0.000	NA		NA
7637526	7637527	HDEF_0923	HDEF_0924	O_1		FALSE	0.221	131.000	0.000	NA		NA
7637528	7637529	HDEF_0925	HDEF_0926			FALSE	0.068	295.000	0.000	NA		NA
7637531	7637532	HDEF_0928	HDEF_0929			FALSE	0.321	75.000	0.000	NA		NA
7637532	7637533	HDEF_0929	HDEF_0930		aexT_1	FALSE	0.351	71.000	0.000	NA		NA
7637534	7637535	HDEF_0931	HDEF_0932			FALSE	0.069	35.000	0.000	0.007		NA
7637535	7637536	HDEF_0932	HDEF_0933			FALSE	0.081	260.000	0.000	NA		NA
7637536	7637537	HDEF_0933	HDEF_0934			FALSE	0.027	539.000	0.000	NA		NA
7637538	7637539	HDEF_0935	HDEF_0936			TRUE	0.931	41.000	0.000	NA	Y	NA
7637542	7637543	HDEF_0939	HDEF_0940			FALSE	0.205	141.000	0.000	NA		NA
7637543	7637544	HDEF_0940	HDEF_0941			FALSE	0.210	139.000	0.000	NA		NA
7637544	7637545	HDEF_0941	HDEF_0942		pilL_1	TRUE	0.894	0.000	0.000	NA		NA
7637545	7637546	HDEF_0942	HDEF_0943	pilL_1	pilN_1	TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7637547	7637548	HDEF_0944	HDEF_0945			TRUE	0.960	-25.000	0.500	NA		NA
7637549	7637550	HDEF_0946	HDEF_0947	pilO_1	pilP_1	TRUE	0.989	-13.000	0.750	NA		NA
7637550	7637551	HDEF_0947	HDEF_0948	pilP_1	pilQ_1	TRUE	0.998	-3.000	0.750	NA		NA
7637551	7637552	HDEF_0948	HDEF_0949	pilQ_1	pilR_1	TRUE	0.996	-13.000	0.600	NA	Y	NA
7637552	7637553	HDEF_0949	HDEF_0950	pilR_1	pilS2_1	TRUE	0.997	11.000	0.600	NA		NA
7637554	7637555	HDEF_0951	HDEF_0952			TRUE	0.987	-12.000	0.514	NA		NA
7637556	7637557	HDEF_0953	HDEF_0954	pilV_1	pilM_1	TRUE	0.559	50.000	0.000	NA		NA
7637557	7637558	HDEF_0954	HDEF_0955	pilM_1		TRUE	0.998	3.000	0.750	NA		NA
7637558	7637559	HDEF_0955	HDEF_0956		pilT_2	FALSE	0.404	43.000	0.000	1.000		NA
7637559	7637560	HDEF_0956	HDEF_0957	pilT_2	traH_1	FALSE	0.377	68.000	0.000	NA		NA
7637560	7637561	HDEF_0957	HDEF_0958	traH_1	traI_1	TRUE	0.789	15.000	0.000	NA		NA
7637561	7637562	HDEF_0958	HDEF_0959	traI_1	traJ_1	TRUE	0.550	-13.000	0.000	NA		NA
7637563	7637564	HDEF_0960	HDEF_0961			TRUE	0.996	9.000	0.487	NA		NA
7637565	7637566	HDEF_0962	HDEF_0963	traK_1	traC_1	TRUE	0.767	18.000	0.000	NA		NA
7637566	7637567	HDEF_0963	HDEF_0964	traC_1		TRUE	0.898	1.000	0.000	NA		NA
7637567	7637568	HDEF_0964	HDEF_0965		traL	TRUE	0.814	12.000	0.000	NA		NA
7637568	7637569	HDEF_0965	HDEF_0966	traL	traM_1	TRUE	0.737	25.000	0.000	NA		NA
7637569	7637570	HDEF_0966	HDEF_0967	traM_1	traN	TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7637570	7637571	HDEF_0967	HDEF_0968	traN	traO	TRUE	0.835	10.000	0.000	NA		NA
7637571	7637572	HDEF_0968	HDEF_0969	traO		TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7637572	7637573	HDEF_0969	HDEF_0970		traU	TRUE	0.721	-7.000	0.000	NA		NA
7637573	7637574	HDEF_0970	HDEF_0971	traU	traW	TRUE	0.473	58.000	0.000	NA		NA
7637574	7637575	HDEF_0971	HDEF_0972	traW	traX	TRUE	0.721	-7.000	0.000	NA		NA
7637575	7637576	HDEF_0972	HDEF_0973	traX	traY	FALSE	0.238	102.000	0.000	NA		NA
7637576	7637577	HDEF_0973	HDEF_0974	traY		FALSE	0.351	71.000	0.000	NA		NA
7637577	7637578	HDEF_0974	HDEF_0975			FALSE	0.310	77.000	0.000	NA		NA
7637578	7637579	HDEF_0975	HDEF_0976			TRUE	0.998	10.000	1.000	NA		NA
7637579	7637580	HDEF_0976	HDEF_0977			FALSE	0.327	74.000	0.000	NA		NA
7637580	7637581	HDEF_0977	HDEF_0978		trbA	FALSE	0.361	70.000	0.000	NA		NA
7637581	7637582	HDEF_0978	HDEF_0979	trbA	trbB	FALSE	0.317	76.000	0.000	NA		NA
7637582	7637583	HDEF_0979	HDEF_0980	trbB	trbC_2	TRUE	0.721	-7.000	0.000	NA		NA
7637584	7637585	HDEF_2358	HDEF_0981			FALSE	0.121	-502.000	0.000	NA		NA
7637586	7637587	HDEF_2359	HDEF_0982			FALSE	0.102	-1763.000	0.000	NA		NA
7637588	7637589	HDEF_0983	HDEF_2360			FALSE	0.114	-1178.000	0.000	NA		NA
7637589	7637590	HDEF_2360	HDEF_0984		dnaC	FALSE	0.252	-35.000	0.000	NA		NA
7637590	7637591	HDEF_0984	HDEF_0985	dnaC	O_2	TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7637591	7637592	HDEF_0985	HDEF_0986	O_2		TRUE	0.721	-7.000	0.000	NA		NA
7637592	7637593	HDEF_0986	HDEF_0987			TRUE	0.484	57.000	0.000	NA		NA
7637593	7637594	HDEF_0987	HDEF_0988			FALSE	0.212	137.000	0.000	NA		NA
7637594	7637595	HDEF_0988	HDEF_0989			FALSE	0.351	71.000	0.000	NA		NA
7637598	7637599	HDEF_2361	HDEF_0992			FALSE	0.083	-1764.000	0.000	NA		NA
7637601	7637602	HDEF_0994	HDEF_0995			FALSE	0.165	167.000	0.000	NA		NA
7637602	7637603	HDEF_0995	HDEF_0996			TRUE	0.679	-9.000	0.000	NA		NA
7637605	7637606	HDEF_0998	HDEF_999			TRUE	0.642	-10.000	0.000	NA		NA
7637607	7637608	HDEF_1000	HDEF_1001			TRUE	0.931	41.000	0.000	NA	Y	NA
7637609	7637610	HDEF_1002	HDEF_1003			FALSE	0.193	147.000	0.000	NA		NA
7637610	7637611	HDEF_1003	HDEF_1004			TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7637611	7637612	HDEF_1004	HDEF_1005			FALSE	0.268	85.000	0.000	NA		NA
7637612	7637613	HDEF_1005	HDEF_1006			FALSE	0.351	71.000	0.000	NA		NA
7637613	7637614	HDEF_1006	HDEF_1007			TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7637616	7637617	HDEF_1009	HDEF_1010			TRUE	0.700	33.000	0.000	NA		NA
7637617	7637618	HDEF_1010	HDEF_1011			FALSE	0.237	-19.000	0.000	1.000		NA
7637618	7637619	HDEF_1011	HDEF_1012			FALSE	0.130	-163.000	0.000	NA		NA
7637620	7637621	HDEF_1013	HDEF_1014			TRUE	0.998	4.000	0.833	NA		NA
7637623	7637624	HDEF_1016	HDEF_1017			FALSE	0.205	141.000	0.000	NA		NA
7637624	7637625	HDEF_1017	HDEF_1018			FALSE	0.286	81.000	0.000	NA		NA
7637625	7637626	HDEF_1018	HDEF_1019			TRUE	0.814	12.000	0.000	NA		NA
7637626	7637627	HDEF_1019	HDEF_1020			FALSE	0.247	91.000	0.000	NA		NA
7637627	7637628	HDEF_1020	HDEF_1021			FALSE	0.062	310.000	0.000	NA		NA
7637629	7637630	HDEF_1022	HDEF_1023			FALSE	0.070	290.000	0.000	NA		NA
7637630	7637631	HDEF_1023	HDEF_1024			TRUE	0.484	57.000	0.000	NA		NA
7637632	7637633	HDEF_1025	HDEF_1026	pilN_2		FALSE	0.223	130.000	0.000	NA		NA
7637633	7637634	HDEF_1026	HDEF_1027			FALSE	0.041	399.000	0.000	NA		NA
7637636	7637637	HDEF_1029	HDEF_2362	repA_1		FALSE	0.225	127.000	0.000	NA		NA
7637637	7637638	HDEF_2362	HDEF_1030		mobA_3	FALSE	0.317	76.000	0.000	NA		NA
7637638	7637639	HDEF_1030	HDEF_1031	mobA_3	mobB_3	TRUE	0.898	1.000	0.000	NA		NA
7637643	7637644	HDEF_1035	HDEF_1036			TRUE	0.774	17.000	0.000	NA		NA
7637644	7637645	HDEF_1036	HDEF_1037			TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7637646	7637647	HDEF_1038	HDEF_1039			TRUE	0.991	-6.000	0.357	NA		NA
7637648	7637649	HDEF_1040	HDEF_1041			FALSE	0.238	103.000	0.000	NA		NA
7637650	7637651	HDEF_1042	HDEF_1043			TRUE	0.612	43.000	0.000	NA		NA
7637651	7637652	HDEF_1043	HDEF_1044			TRUE	0.642	-10.000	0.000	NA		NA
7637652	7637653	HDEF_1044	HDEF_1045		queF_1	TRUE	0.971	3.000	0.027	NA		NA
7637654	7637655	HDEF_1046	HDEF_1047			TRUE	0.598	44.000	0.000	NA		NA
7637655	7637656	HDEF_1047	HDEF_1048			TRUE	0.894	2.000	0.000	NA		NA
7637656	7637657	HDEF_1048	HDEF_1049			TRUE	0.992	-3.000	0.242	NA		NA
7637658	7637659	HDEF_1050	HDEF_1051			TRUE	0.835	10.000	0.000	NA		NA
7637660	7637661	HDEF_1052	HDEF_1053			FALSE	0.013	-31.000	0.000	0.005		NA
7637661	7637662	HDEF_1053	HDEF_1055			FALSE	0.298	190.000	0.000	0.005	Y	NA
7637663	7637664	HDEF_1054	HDEF_1056			FALSE	0.013	-31.000	0.000	0.005		NA
7637665	7637666	HDEF_1057	HDEF_1058		repA_2	TRUE	0.495	-15.000	0.000	NA		NA
7637668	7637669	HDEF_1060	HDEF_1061			FALSE	0.225	-42.000	0.000	NA		NA
7637671	7637672	HDEF_1063	HDEF_1064			FALSE	0.094	238.000	0.000	NA		NA
7637673	7637674	HDEF_1065	HDEF_1066			TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7637674	7637675	HDEF_1066	HDEF_1067			TRUE	0.898	1.000	0.000	NA		NA
7637675	7637676	HDEF_1067	HDEF_1068			FALSE	0.241	96.000	0.000	NA		NA
7637676	7637677	HDEF_1068	HDEF_1069		mobD	TRUE	0.898	1.000	0.000	NA		NA
7637677	7637678	HDEF_1069	HDEF_1070	mobD		FALSE	0.236	116.000	0.000	NA		NA
7637678	7637679	HDEF_1070	HDEF_1071			TRUE	0.559	50.000	0.000	NA		NA
7637679	7637680	HDEF_1071	HDEF_1072			TRUE	0.477	-16.000	0.000	NA		NA
7637681	7637682	HDEF_1073	HDEF_1074			FALSE	0.146	181.000	0.000	NA		NA
7637682	7637683	HDEF_1074	HDEF_1075			TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7637684	7637685	HDEF_1076	HDEF_1077			TRUE	0.977	-16.000	0.490	NA		NA
7637685	7637686	HDEF_1077	HDEF_1078			FALSE	0.153	175.000	0.000	NA		NA
7637687	7637688	HDEF_1079	HDEF_1080			TRUE	0.931	41.000	0.000	NA	Y	NA
7637689	7637690	HDEF_1081	HDEF_1082			TRUE	0.835	10.000	0.000	NA		NA
7637690	7637691	HDEF_1082	HDEF_1083			TRUE	0.568	49.000	0.000	NA		NA
7637691	7637692	HDEF_1083	HDEF_1084			TRUE	0.890	90.000	0.471	0.068		NA
7637693	7637694	HDEF_1085	HDEF_1086			TRUE	0.995	-3.000	0.366	NA		NA
7637694	7637695	HDEF_1086	HDEF_1087			FALSE	0.237	105.000	0.000	NA		NA
7637695	7637696	HDEF_1087	HDEF_1088			TRUE	0.774	17.000	0.000	NA		NA
7637696	7637697	HDEF_1088	HDEF_1089			FALSE	0.146	181.000	0.000	NA		NA
7637697	7637698	HDEF_1089	HDEF_1090			TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7637698	7637699	HDEF_1090	HDEF_1091			FALSE	0.232	-40.000	0.000	NA		NA
7637703	7637704	HDEF_1095	HDEF_1096			TRUE	0.598	44.000	0.000	NA		NA
7637704	7637705	HDEF_1096	HDEF_1097			FALSE	0.139	187.000	0.000	NA		NA
7637705	7637706	HDEF_1097	HDEF_1098			TRUE	0.642	-10.000	0.000	NA		NA
7637706	7637707	HDEF_1098	HDEF_1099			TRUE	0.992	-3.000	0.235	NA		NA
7637711	7637712	HDEF_1103	HDEF_1104	yopT_1		FALSE	0.420	-19.000	0.000	NA		NA
7637712	7637713	HDEF_1104	HDEF_1105			TRUE	0.537	52.000	0.000	NA		NA
7637713	7637714	HDEF_1105	HDEF_1106			FALSE	0.315	-27.000	0.000	NA		NA
7637714	7637715	HDEF_1106	HDEF_1107			TRUE	0.850	8.000	0.000	NA		NA
7637715	7637716	HDEF_1107	HDEF_1108			TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7637716	7637717	HDEF_1108	HDEF_1109			FALSE	0.029	496.000	0.000	NA		NA
7637717	7637718	HDEF_1109	HDEF_1110			TRUE	0.894	0.000	0.000	NA		NA
7637718	7637719	HDEF_1110	HDEF_1111			FALSE	0.100	233.000	0.000	NA		NA
7637719	7637720	HDEF_1111	HDEF_1112			FALSE	0.331	-25.000	0.000	NA		NA
7637721	7637722	HDEF_1113	HDEF_1114			TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7637723	7637724	HDEF_1115	HDEF_1116	topB		FALSE	0.187	152.000	0.000	NA		NA
7637724	7637725	HDEF_1116	HDEF_1117			FALSE	0.035	439.000	0.000	NA		NA
7637726	7637727	HDEF_1118	HDEF_1119		nleD	FALSE	0.035	433.000	0.000	NA		NA
7637727	7637728	HDEF_1119	HDEF_1120	nleD		FALSE	0.051	350.000	0.000	NA		NA
7637730	7637731	HDEF_1122	HDEF_1123	mpg_1		FALSE	0.043	385.000	0.000	NA		NA
7637731	7637732	HDEF_1123	HDEF_1124			FALSE	0.053	344.000	0.000	NA		NA
7637732	7637733	HDEF_1124	HDEF_1125			FALSE	0.074	277.000	0.000	NA		NA
7637733	7637734	HDEF_1125	HDEF_1126			FALSE	0.038	415.000	0.000	NA		NA
7637734	7637735	HDEF_1126	HDEF_1127			FALSE	0.416	64.000	0.000	NA		NA
7637740	7637741	HDEF_1132	HDEF_1133			FALSE	0.088	245.000	0.000	NA		NA
7637741	7637742	HDEF_1133	HDEF_1134			TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7637742	7637743	HDEF_1134	HDEF_1135			TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7637743	7637744	HDEF_1135	HDEF_1136			FALSE	0.128	196.000	0.000	NA		NA
7637744	7637745	HDEF_1136	HDEF_1137			FALSE	0.237	107.000	0.000	NA		NA
7637745	7637746	HDEF_1137	HDEF_1138			TRUE	0.994	2.000	0.229	NA		NA
7637746	7637747	HDEF_1138	HDEF_1139			FALSE	0.057	334.000	0.000	NA		NA
7637749	7637750	HDEF_1141	HDEF_1142	repA_3		FALSE	0.146	181.000	0.000	NA		NA
7637753	7637754	HDEF_1145	HDEF_1146		exoY_1	FALSE	0.093	240.000	0.000	NA		NA
7637755	7637756	HDEF_1147	HDEF_1148			TRUE	0.759	-6.000	0.000	NA		NA
7637756	7637757	HDEF_1148	HDEF_1149			FALSE	0.056	336.000	0.000	NA		NA
7637757	7637758	HDEF_1149	HDEF_1150			TRUE	0.427	63.000	0.000	NA		NA
7637759	7637760	HDEF_1151	HDEF_1152			FALSE	0.109	217.000	0.000	NA		NA
7637761	7637762	HDEF_1153	HDEF_1154			TRUE	0.705	32.000	0.000	NA		NA
7637763	7637764	HDEF_1155	HDEF_2363	yopT_2		TRUE	0.642	-10.000	0.000	NA		NA
7637764	7637765	HDEF_2363	HDEF_1156			FALSE	0.083	-1764.000	0.000	NA		NA
7637765	7637766	HDEF_1156	HDEF_1157		rtxA_10	FALSE	0.218	132.000	0.000	NA		NA
7637766	7637767	HDEF_1157	HDEF_1158	rtxA_10	rtxA_11	TRUE	0.789	15.000	0.000	NA		NA
7637767	7637768	HDEF_1158	HDEF_1159	rtxA_11	rtxA_12	FALSE	0.232	119.000	0.000	NA		NA
7637770	7637771	HDEF_1161	HDEF_1162		hupB	FALSE	0.027	313.000	0.000	1.000		NA
7637772	7637773	HDEF_1163	HDEF_1164			FALSE	0.037	426.000	0.000	NA		NA
7637773	7637774	HDEF_1164	HDEF_1165			TRUE	0.605	-12.000	0.000	NA		NA
7637775	7637776	HDEF_1166	HDEF_1167	dcm_2	vsr	TRUE	0.721	-7.000	0.000	NA		NA
7637776	7637777	HDEF_1167	HDEF_1168	vsr		TRUE	0.932	-3.000	0.048	0.066		NA
7637777	7637778	HDEF_1168	HDEF_1169			FALSE	0.066	299.000	0.000	NA		NA
7637779	7637780	HDEF_1170	HDEF_1171			FALSE	0.044	377.000	0.000	NA		NA
7637781	7637782	HDEF_1172	HDEF_1173			FALSE	0.161	171.000	0.000	NA		NA
7637782	7637783	HDEF_1173	HDEF_1174			FALSE	0.048	361.000	0.000	NA		NA
7637783	7637784	HDEF_1174	HDEF_1175			FALSE	0.217	134.000	0.000	NA		NA
7637784	7637785	HDEF_1175	HDEF_1176			FALSE	0.107	219.000	0.000	NA		NA
7637785	7637786	HDEF_1176	HDEF_1177			FALSE	0.034	441.000	0.000	NA		NA
7637789	7637790	HDEF_1180	HDEF_1181			TRUE	0.998	0.000	0.605	NA		NA
7637790	7637791	HDEF_1181	HDEF_1182			FALSE	0.058	569.000	0.000	NA	N	NA
7637793	7637794	HDEF_1184	HDEF_1185	rtxA_13		FALSE	0.333	73.000	0.000	NA		NA
7637794	7637795	HDEF_1185	HDEF_1186		rtxA_14	FALSE	0.021	1662.000	0.000	NA		NA
7637796	7637797	HDEF_1187	HDEF_1188			FALSE	0.351	71.000	0.000	NA		NA
7637798	7637799	HDEF_1189	HDEF_1190			TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7637799	7637800	HDEF_1190	HDEF_1191			FALSE	0.031	475.000	0.000	NA		NA
7637803	7637804	HDEF_1194	HDEF_1195	rtxA_15		FALSE	0.302	78.000	0.000	NA		NA
7637804	7637805	HDEF_1195	HDEF_1196			FALSE	0.327	74.000	0.000	NA		NA
7637807	7637808	HDEF_1198	HDEF_1199			FALSE	0.237	110.000	0.000	NA		NA
7637809	7637810	HDEF_1200	HDEF_1201	bioD	bioC	TRUE	0.854	-22.000	0.054	0.003	Y	NA
7637810	7637811	HDEF_1201	HDEF_1202	bioC	bioF	TRUE	0.994	-3.000	0.133	1.000	Y	NA
7637811	7637812	HDEF_1202	HDEF_1203	bioF	bioB	TRUE	0.997	1.000	0.168	1.000	Y	NA
7637812	7637813	HDEF_1203	HDEF_1204	bioB	msbA	FALSE	0.299	124.000	0.000	1.000	N	NA
7637813	7637814	HDEF_1204	HDEF_1205	msbA		TRUE	0.915	16.000	0.075	0.053		NA
7637816	7637817	HDEF_1207	HDEF_1208		putA	FALSE	0.385	67.000	0.000	NA		NA
7637818	7637819	HDEF_1209	HDEF_1210		putP	FALSE	0.156	-79.000	0.000	NA		NA
7637820	7637821	HDEF_1211	HDEF_1212			TRUE	0.721	-7.000	0.000	NA		NA
7637821	7637822	HDEF_1212	HDEF_1213			TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7637822	7637823	HDEF_1213	HDEF_1214		orgAb	TRUE	0.990	-7.000	0.400	NA		NA
7637823	7637824	HDEF_1214	HDEF_1215	orgAb	orgA	TRUE	0.959	-43.000	1.000	NA		NA
7637824	7637825	HDEF_1215	HDEF_1216	orgA	prgK	TRUE	0.993	1.000	0.238	1.000		NA
7637825	7637826	HDEF_1216	HDEF_1217	prgK	prgJ	TRUE	0.996	0.000	0.286	NA		NA
7637826	7637827	HDEF_1217	HDEF_1218	prgJ		TRUE	0.982	62.000	0.667	NA		NA
7637827	7637828	HDEF_1218	HDEF_1219		prgH	TRUE	0.996	15.000	0.667	NA		NA
7637828	7637829	HDEF_1219	HDEF_1220	prgH		TRUE	0.737	25.000	0.000	NA		NA
7637830	7637831	HDEF_1221	HDEF_1222			FALSE	0.181	155.000	0.000	NA		NA
7637831	7637832	HDEF_1222	HDEF_2364			FALSE	0.252	-35.000	0.000	NA		NA
7637832	7637833	HDEF_2364	HDEF_1223			FALSE	0.067	-1765.000	0.000	NA		NA
7637833	7637834	HDEF_1223	HDEF_1224		pilQ_2	FALSE	0.420	-19.000	0.000	NA		NA
7637834	7637835	HDEF_1224	HDEF_1225	pilQ_2		TRUE	0.427	63.000	0.000	NA		NA
7637837	7637838	HDEF_1227	HDEF_1228	pilR_2	pilS	TRUE	0.998	3.000	0.667	NA		NA
7637838	7637839	HDEF_1228	HDEF_1229	pilS		TRUE	0.694	34.000	0.000	NA		NA
7637839	7637840	HDEF_1229	HDEF_1230		pilT_3	FALSE	0.190	-55.000	0.000	NA		NA
7637840	7637841	HDEF_1230	HDEF_1231	pilT_3		TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7637842	7637843	HDEF_1232	HDEF_1233			TRUE	0.886	3.000	0.000	NA		NA
7637843	7637844	HDEF_1233	HDEF_1234			FALSE	0.155	174.000	0.000	NA		NA
7637845	7637846	HDEF_1235	HDEF_1236			FALSE	0.068	295.000	0.000	NA		NA
7637846	7637847	HDEF_1236	HDEF_1237			FALSE	0.416	64.000	0.000	NA		NA
7637848	7637849	HDEF_1238	HDEF_1239			TRUE	0.859	6.000	0.000	NA		NA
7637849	7637850	HDEF_1239	HDEF_1240			FALSE	0.054	338.000	0.000	NA		NA
7637850	7637851	HDEF_1240	HDEF_1241			FALSE	0.205	141.000	0.000	NA		NA
7637851	7637852	HDEF_1241	HDEF_1243			FALSE	0.079	265.000	0.000	NA		NA
7637854	7637855	HDEF_1244	HDEF_1245	kup		FALSE	0.208	140.000	0.000	NA		NA
7637857	7637858	HDEF_1247	HDEF_1248		fbp_1	FALSE	0.029	495.000	0.000	NA		NA
7637858	7637859	HDEF_1248	HDEF_1249	fbp_1		FALSE	0.243	95.000	0.000	NA		NA
7637859	7637860	HDEF_1249	HDEF_1250		rtxA_16	FALSE	0.032	472.000	0.000	NA		NA
7637861	7637862	HDEF_2365	HDEF_1251			FALSE	0.083	-1764.000	0.000	NA		NA
7637862	7637863	HDEF_1251	HDEF_1252			FALSE	0.232	119.000	0.000	NA		NA
7637863	7637864	HDEF_1252	HDEF_1253			FALSE	0.049	359.000	0.000	NA		NA
7637865	7637866	HDEF_1254	HDEF_1255	aroE	rsuA	TRUE	0.924	0.000	0.000	1.000	N	NA
7637866	7637867	HDEF_1255	HDEF_1256	rsuA	pgl	TRUE	0.856	29.000	0.000	NA	N	NA
7637867	7637868	HDEF_1256	HDEF_1257	pgl		TRUE	0.774	17.000	0.000	NA		NA
7637869	7637870	HDEF_1258	HDEF_1259	hemF	rplM	FALSE	0.100	282.000	0.000	1.000	N	NA
7637870	7637871	HDEF_1259	HDEF_1260	rplM	rpsI	TRUE	0.998	15.000	0.601	0.022	Y	NA
7637871	7637872	HDEF_1260	HDEF_1261	rpsI	sspA	TRUE	0.489	196.000	0.014	NA	N	NA
7637872	7637873	HDEF_1261	HDEF_1262	sspA	sspB	TRUE	0.974	77.000	0.831	NA		NA
7637874	7637875	HDEF_1263	HDEF_1264	rtxA_17		FALSE	0.151	177.000	0.000	NA		NA
7637875	7637876	HDEF_1264	HDEF_1265			FALSE	0.420	-19.000	0.000	NA		NA
7637876	7637877	HDEF_1265	HDEF_1266			FALSE	0.283	-31.000	0.000	NA		NA
7637877	7637878	HDEF_1266	HDEF_1267			TRUE	0.859	6.000	0.000	NA		NA
7637879	7637880	HDEF_1268	HDEF_1269			FALSE	0.098	235.000	0.000	NA		NA
7637881	7637882	HDEF_1270	HDEF_1271	hslU	hslV	TRUE	0.999	7.000	0.752	1.000	Y	NA
7637882	7637883	HDEF_1271	HDEF_1272	hslV	ftsN	TRUE	0.831	89.000	0.122	NA	N	NA
7637884	7637885	HDEF_1273	HDEF_1274	aroP	nadC	FALSE	0.345	85.000	0.000	1.000	N	NA
7637887	7637888	HDEF_1276	HDEF_1277		phrB	TRUE	0.737	25.000	0.000	NA		NA
7637888	7637889	HDEF_1277	HDEF_1278	phrB		TRUE	0.882	-10.000	0.027	NA		NA
7637889	7637890	HDEF_1278	HDEF_1279		serS	FALSE	0.190	150.000	0.000	NA		NA
7637890	7637891	HDEF_1279	HDEF_1280	serS		FALSE	0.129	195.000	0.000	NA		NA
7637892	7637893	HDEF_1281	HDEF_1282		xseA	FALSE	0.034	447.000	0.000	NA		NA
7637893	7637894	HDEF_1282	HDEF_1283	xseA		FALSE	0.236	116.000	0.000	NA		NA
7637894	7637895	HDEF_1283	HDEF_1284			FALSE	0.143	182.000	0.000	NA		NA
7637895	7637896	HDEF_1284	HDEF_1285			TRUE	0.526	53.000	0.000	NA		NA
7637897	7637898	HDEF_1286	HDEF_1287		mgtA	TRUE	0.612	43.000	0.000	NA		NA
7637898	7637899	HDEF_1287	HDEF_1288	mgtA	cspE_2	FALSE	0.088	305.000	0.000	1.000	N	NA
7637900	7637901	HDEF_1289	HDEF_1290		pqiB	TRUE	0.998	0.000	0.531	NA		NA
7637901	7637902	HDEF_1290	HDEF_1291	pqiB	pqiA	TRUE	0.998	-3.000	0.819	NA		NA
7637902	7637903	HDEF_1291	HDEF_1292	pqiA		FALSE	0.268	85.000	0.000	NA		NA
7637903	7637904	HDEF_1292	HDEF_1293			TRUE	0.642	-10.000	0.000	NA		NA
7637904	7637905	HDEF_1293	HDEF_1294			FALSE	0.273	84.000	0.000	NA		NA
7637905	7637906	HDEF_1294	HDEF_1295			FALSE	0.121	95.000	0.000	1.000		NA
7637906	7637907	HDEF_1295	HDEF_1296			TRUE	0.931	41.000	0.000	NA	Y	NA
7637908	7637909	HDEF_2366	HDEF_1297			FALSE	0.107	-1429.000	0.000	NA		NA
7637909	7637910	HDEF_1297	HDEF_1298			FALSE	0.047	367.000	0.000	NA		NA
7637910	7637911	HDEF_1298	HDEF_1299			FALSE	0.230	1.000	0.000	0.014		NA
7637911	7637912	HDEF_1299	HDEF_1300			TRUE	0.719	-3.000	0.000	1.000		NA
7637913	7637914	HDEF_1301	HDEF_1302	radA		FALSE	0.157	173.000	0.000	NA		NA
7637914	7637915	HDEF_1302	HDEF_1303			FALSE	0.213	136.000	0.000	NA		NA
7637916	7637917	HDEF_1304	HDEF_1305			FALSE	0.361	70.000	0.000	NA		NA
7637917	7637918	HDEF_1305	HDEF_1306			TRUE	0.995	4.000	0.315	NA		NA
7637919	7637920	HDEF_1307	HDEF_1308	acnA	dxr	FALSE	0.034	629.000	0.000	1.000	N	NA
7637920	7637921	HDEF_1308	HDEF_1309	dxr	frr	TRUE	0.627	106.000	0.032	1.000	N	NA
7637921	7637922	HDEF_1309	HDEF_1310	frr	pyrH	TRUE	0.988	53.000	0.626	1.000	N	NA
7637922	7637923	HDEF_1310	HDEF_1311	pyrH	tsf	TRUE	0.997	5.000	0.416	1.000	N	NA
7637923	7637924	HDEF_1311	HDEF_1312	tsf	rpsB	TRUE	0.997	42.000	0.748	1.000	Y	NA
7637924	7637925	HDEF_1312	HDEF_1313	rpsB	pldA	FALSE	0.036	579.000	0.000	1.000	N	NA
7637927	7637928	HDEF_1315	HDEF_1316			FALSE	0.340	72.000	0.000	NA		NA
7637928	7637929	HDEF_1316	HDEF_1317			TRUE	0.473	58.000	0.000	NA		NA
7637929	7637930	HDEF_1317	HDEF_1318			FALSE	0.273	84.000	0.000	NA		NA
7637930	7637931	HDEF_1318	HDEF_1319			TRUE	0.484	57.000	0.000	NA		NA
7637931	7637932	HDEF_1319	HDEF_1320			FALSE	0.264	86.000	0.000	NA		NA
7637933	7637934	HDEF_1321	HDEF_2367			FALSE	0.121	-502.000	0.000	NA		NA
7637934	7637935	HDEF_2367	HDEF_1322			FALSE	0.175	-63.000	0.000	NA		NA
7637935	7637936	HDEF_1322	HDEF_1323		mpg_2	TRUE	0.875	4.000	0.000	NA		NA
7637938	7637939	HDEF_1324	HDEF_1326			FALSE	0.070	290.000	0.000	NA		NA
7637941	7637942	HDEF_1328	HDEF_1329			TRUE	0.737	25.000	0.000	NA		NA
7637942	7637943	HDEF_1329	HDEF_1330		triA	TRUE	0.717	29.000	0.000	NA		NA
7637943	7637944	HDEF_1330	HDEF_1331	triA	triB	TRUE	0.756	21.000	0.000	NA		NA
7637944	7637945	HDEF_1331	HDEF_1332	triB	triC	TRUE	0.789	15.000	0.000	NA		NA
7637945	7637946	HDEF_1332	HDEF_1333	triC	triD	TRUE	0.825	11.000	0.000	NA		NA
7637946	7637947	HDEF_1333	HDEF_1334	triD		TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7637947	7637948	HDEF_1334	HDEF_1335		triE	TRUE	0.778	74.000	0.091	NA		NA
7637949	7637950	HDEF_1336	HDEF_1337			FALSE	0.141	185.000	0.000	NA		NA
7637951	7637952	HDEF_1338	HDEF_1339	triG	triH	TRUE	0.983	3.000	0.000	NA	Y	NA
7637952	7637953	HDEF_1339	HDEF_1340	triH	triI	TRUE	0.594	165.000	0.000	NA	Y	NA
7637953	7637954	HDEF_1340	HDEF_1341	triI	triJ	TRUE	0.969	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
7637954	7637955	HDEF_1341	HDEF_1342	triJ	taxB	TRUE	0.864	-13.000	0.000	1.000	Y	NA
7637955	7637956	HDEF_1342	HDEF_1343	taxB		TRUE	0.612	43.000	0.000	NA		NA
7637956	7637957	HDEF_1343	HDEF_1344			FALSE	0.260	87.000	0.000	NA		NA
7637957	7637958	HDEF_1344	HDEF_1345			TRUE	0.931	41.000	0.000	NA	Y	NA
7637958	7637959	HDEF_1345	HDEF_1346		pilM_2	TRUE	0.737	25.000	0.000	NA		NA
7637959	7637960	HDEF_1346	HDEF_1347	pilM_2	pilN_3	FALSE	0.239	99.000	0.000	NA		NA
7637960	7637961	HDEF_1347	HDEF_1348	pilN_3	pilO_2	TRUE	0.999	0.000	1.000	NA		NA
7637961	7637962	HDEF_1348	HDEF_1349	pilO_2		TRUE	0.989	-13.000	0.750	NA		NA
7637962	7637963	HDEF_1349	HDEF_1350		pilQ_3	TRUE	0.996	18.000	0.750	NA		NA
7637966	7637967	HDEF_1353	HDEF_1354	stbC_1	stbB_2	TRUE	0.894	2.000	0.000	NA		NA
7637967	7637968	HDEF_1354	HDEF_1355	stbB_2	stbA	TRUE	0.845	9.000	0.000	NA		NA
7637971	7637972	HDEF_1358	HDEF_1359	repA_4		FALSE	0.074	278.000	0.000	NA		NA
7637973	7637974	HDEF_1360	HDEF_1361			TRUE	0.854	7.000	0.000	NA		NA
7637974	7637975	HDEF_1361	HDEF_1362		repA_5	TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7637975	7637976	HDEF_1362	HDEF_1363	repA_5		FALSE	0.033	468.000	0.000	NA		NA
7637976	7637977	HDEF_1363	HDEF_1365		pilQ_4	FALSE	0.125	-214.000	0.000	NA		NA
7637979	7637980	HDEF_1366	HDEF_1367			TRUE	0.996	2.000	0.300	NA		NA
7637980	7637981	HDEF_1367	HDEF_1368			FALSE	0.022	780.000	0.000	NA		NA
7637983	7637984	HDEF_1370	HDEF_1371			FALSE	0.031	484.000	0.000	NA		NA
7637984	7637985	HDEF_1371	HDEF_1372			TRUE	0.931	41.000	0.000	NA	Y	NA
7637988	7637989	HDEF_2368	HDEF_1375			FALSE	0.083	-1764.000	0.000	NA		NA
7637989	7637990	HDEF_1375	HDEF_1376		traM_2	FALSE	0.023	732.000	0.000	NA		NA
7637991	7637992	HDEF_1377	HDEF_1378		cro_1	FALSE	0.234	118.000	0.000	NA		NA
7637992	7637993	HDEF_1378	HDEF_1379	cro_1		TRUE	0.845	9.000	0.000	NA		NA
7637995	7637996	HDEF_1381	HDEF_1382			FALSE	0.028	525.000	0.000	NA		NA
7637996	7637997	HDEF_1382	HDEF_1383			TRUE	0.996	-3.000	0.533	1.000		NA
7637997	7637998	HDEF_1383	HDEF_1384			FALSE	0.059	328.000	0.000	NA		NA
7637999	7638000	HDEF_1385	HDEF_1386		mutL_2	FALSE	0.090	242.000	0.000	NA		NA
7638000	7638001	HDEF_1386	HDEF_1387	mutL_2		TRUE	0.814	12.000	0.000	NA		NA
7638002	7638003	HDEF_1388	HDEF_1389			FALSE	0.281	82.000	0.000	NA		NA
7638004	7638005	HDEF_1390	HDEF_1391			TRUE	0.516	54.000	0.000	NA		NA
7638005	7638006	HDEF_1391	HDEF_1392			FALSE	0.043	389.000	0.000	NA		NA
7638007	7638008	HDEF_1393	HDEF_1394	chpB	chpS	TRUE	0.996	0.000	0.083	NA	Y	NA
7638008	7638009	HDEF_1394	HDEF_1395	chpS		FALSE	0.096	385.000	0.000	NA	N	NA
7638009	7638010	HDEF_1395	HDEF_1396			FALSE	0.229	124.000	0.000	NA		NA
7638010	7638011	HDEF_1396	HDEF_1397			FALSE	0.223	130.000	0.000	NA		NA
7638012	7638013	HDEF_1398	HDEF_1399			TRUE	0.948	40.000	0.176	1.000		NA
7638013	7638014	HDEF_1399	HDEF_1400		msrB_1	FALSE	0.031	294.000	0.000	1.000		NA
7638014	7638015	HDEF_1400	HDEF_1401	msrB_1		FALSE	0.051	355.000	0.000	NA		NA
7638015	7638016	HDEF_1401	HDEF_1402			FALSE	0.213	136.000	0.000	NA		NA
7638017	7638018	HDEF_1403	HDEF_1404	rtxA_20	rtxA_19	FALSE	0.215	-43.000	0.000	NA		NA
7638018	7638019	HDEF_1404	HDEF_1405	rtxA_19	rtxA_18	FALSE	0.353	-24.000	0.000	NA		NA
7638020	7638021	HDEF_1406	HDEF_1407		mobB_4	FALSE	0.040	401.000	0.000	NA		NA
7638021	7638022	HDEF_1407	HDEF_1408	mobB_4	mobA_4	TRUE	0.898	1.000	0.000	NA		NA
7638022	7638023	HDEF_1408	HDEF_1409	mobA_4	hu	FALSE	0.221	131.000	0.000	NA		NA
7638023	7638024	HDEF_1409	HDEF_1410	hu		FALSE	0.273	84.000	0.000	NA		NA
7638024	7638025	HDEF_1410	HDEF_2369			FALSE	0.252	-35.000	0.000	NA		NA
7638025	7638026	HDEF_2369	HDEF_1411			FALSE	0.105	-1760.000	0.000	NA		NA
7638026	7638027	HDEF_1411	HDEF_1412			TRUE	0.598	44.000	0.000	NA		NA
7638027	7638028	HDEF_1412	HDEF_1413		finO_2	TRUE	0.753	22.000	0.000	NA		NA
7638030	7638031	HDEF_2370	HDEF_1415			FALSE	0.083	-1764.000	0.000	NA		NA
7638032	7638033	HDEF_1416	HDEF_1417	traC_2	traK_2	TRUE	0.789	15.000	0.000	NA		NA
7638033	7638034	HDEF_1417	HDEF_1418	traK_2	traJ_2	TRUE	0.437	62.000	0.000	NA		NA
7638034	7638035	HDEF_1418	HDEF_1419	traJ_2	traI_2	TRUE	0.550	-13.000	0.000	NA		NA
7638035	7638036	HDEF_1419	HDEF_1420	traI_2	traH_2	TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7638036	7638037	HDEF_1420	HDEF_1421	traH_2	pilT_4	TRUE	0.516	54.000	0.000	NA		NA
7638037	7638038	HDEF_1421	HDEF_1422	pilT_4		TRUE	0.612	43.000	0.000	NA		NA
7638038	7638039	HDEF_1422	HDEF_1423		pilM_3	TRUE	0.998	6.000	0.750	NA		NA
7638039	7638040	HDEF_1423	HDEF_1424	pilM_3	pilV_3	TRUE	0.559	50.000	0.000	NA		NA
7638040	7638041	HDEF_1424	HDEF_1425	pilV_3	pilS2_2	FALSE	0.083	253.000	0.000	NA		NA
7638041	7638042	HDEF_1425	HDEF_1426	pilS2_2	pilR_3	TRUE	0.825	11.000	0.000	NA		NA
7638042	7638043	HDEF_1426	HDEF_1427	pilR_3	pilQ_5	TRUE	0.550	-13.000	0.000	NA		NA
7638043	7638044	HDEF_1427	HDEF_1428	pilQ_5	pilP_2	TRUE	0.998	-3.000	0.750	NA		NA
7638044	7638045	HDEF_1428	HDEF_1429	pilP_2	pilO_3	TRUE	0.989	-13.000	0.750	NA		NA
7638046	7638047	HDEF_1430	HDEF_1431			FALSE	0.420	-19.000	0.000	NA		NA
7638048	7638049	HDEF_1432	HDEF_1433	pilN_4	pilL_2	TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7638049	7638050	HDEF_1433	HDEF_1434	pilL_2		FALSE	0.075	274.000	0.000	NA		NA
7638050	7638051	HDEF_1434	HDEF_1435			FALSE	0.128	196.000	0.000	NA		NA
7638051	7638052	HDEF_1435	HDEF_1436			FALSE	0.184	153.000	0.000	NA		NA
7638052	7638053	HDEF_1436	HDEF_1437			FALSE	0.120	204.000	0.000	NA		NA
7638053	7638054	HDEF_1437	HDEF_1438			TRUE	0.931	41.000	0.000	NA	Y	NA
7638054	7638055	HDEF_1438	HDEF_1439			TRUE	0.548	51.000	0.000	NA		NA
7638055	7638056	HDEF_1439	HDEF_1440			TRUE	0.994	11.000	0.357	NA		NA
7638056	7638057	HDEF_1440	HDEF_1441			TRUE	0.984	-7.000	0.262	NA		NA
7638057	7638058	HDEF_1441	HDEF_1442			TRUE	0.642	-10.000	0.000	NA		NA
7638059	7638060	HDEF_1443	HDEF_1444			TRUE	0.931	41.000	0.000	NA	Y	NA
7638061	7638062	HDEF_1445	HDEF_1446			TRUE	0.984	0.000	0.094	NA		NA
7638063	7638064	HDEF_1447	HDEF_1448			TRUE	0.550	-13.000	0.000	NA		NA
7638064	7638065	HDEF_1448	HDEF_1449			TRUE	0.612	43.000	0.000	NA		NA
7638066	7638067	HDEF_1450	HDEF_1451			TRUE	0.898	1.000	0.000	NA		NA
7638067	7638068	HDEF_1451	HDEF_1452			FALSE	0.420	-19.000	0.000	NA		NA
7638068	7638069	HDEF_1452	HDEF_1453			TRUE	0.774	17.000	0.000	NA		NA
7638069	7638070	HDEF_1453	HDEF_1454			TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7638070	7638071	HDEF_1454	HDEF_1455			TRUE	0.550	-13.000	0.000	NA		NA
7638071	7638072	HDEF_1455	HDEF_1456			TRUE	0.894	0.000	0.000	NA		NA
7638072	7638073	HDEF_1456	HDEF_1457			FALSE	0.051	352.000	0.000	NA		NA
7638073	7638074	HDEF_1457	HDEF_1458			TRUE	0.753	22.000	0.000	NA		NA
7638074	7638075	HDEF_1458	HDEF_1459			FALSE	0.153	175.000	0.000	NA		NA
7638075	7638076	HDEF_1459	HDEF_1460			TRUE	0.721	-7.000	0.000	NA		NA
7638076	7638077	HDEF_1460	HDEF_1461			FALSE	0.187	152.000	0.000	NA		NA
7638077	7638078	HDEF_1461	HDEF_1462			TRUE	0.931	41.000	0.000	NA	Y	NA
7638078	7638079	HDEF_1462	HDEF_1463			TRUE	0.506	55.000	0.000	NA		NA
7638081	7638082	HDEF_1465	HDEF_1466			FALSE	0.112	214.000	0.000	NA		NA
7638085	7638086	HDEF_1469	HDEF_1470		fbp_2	TRUE	0.803	13.000	0.000	NA		NA
7638087	7638088	HDEF_1471	HDEF_1472			TRUE	0.803	13.000	0.000	NA		NA
7638089	7638090	HDEF_1473	HDEF_1474			TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7638090	7638091	HDEF_1474	HDEF_1475			TRUE	0.898	1.000	0.000	NA		NA
7638093	7638094	HDEF_1477	HDEF_1478			FALSE	0.038	420.000	0.000	NA		NA
7638094	7638095	HDEF_1478	HDEF_1479		degP_1	FALSE	0.134	190.000	0.000	NA		NA
7638095	7638096	HDEF_1479	HDEF_1480	degP_1	proQ_1	FALSE	0.117	342.000	0.000	NA	N	NA
7638096	7638097	HDEF_1480	HDEF_1481	proQ_1	prc_1	TRUE	0.997	0.000	0.304	NA	N	NA
7638097	7638098	HDEF_1481	HDEF_1482	prc_1	htpX_1	TRUE	0.800	53.000	0.042	0.017	N	NA
7638098	7638099	HDEF_1482	HDEF_1483	htpX_1	amiD_1	FALSE	0.336	87.000	0.000	1.000	N	NA
7638100	7638101	HDEF_1484	HDEF_1485	amiD_2	htpX_2	FALSE	0.336	87.000	0.000	1.000	N	NA
7638101	7638102	HDEF_1485	HDEF_1486	htpX_2	prc_2	TRUE	0.800	53.000	0.042	0.017	N	NA
7638102	7638103	HDEF_1486	HDEF_1487	prc_2	proQ_2	TRUE	0.997	0.000	0.304	NA	N	NA
7638103	7638104	HDEF_1487	HDEF_1488	proQ_2	degP_2	FALSE	0.117	342.000	0.000	NA	N	NA
7638104	7638105	HDEF_1488	HDEF_1489	degP_2	dgt	TRUE	0.714	138.000	0.101	1.000	N	NA
7638106	7638107	HDEF_1490	HDEF_1491	mtn		TRUE	0.494	65.000	0.000	1.000	N	NA
7638108	7638109	HDEF_1492	HDEF_1493	dnaQ_2	hilA	FALSE	0.149	217.000	0.000	1.000	N	NA
7638109	7638110	HDEF_1493	HDEF_1494	hilA		FALSE	0.208	140.000	0.000	NA		NA
7638111	7638112	HDEF_1495	HDEF_1496	orfC	invF	FALSE	0.115	211.000	0.000	NA		NA
7638112	7638113	HDEF_1496	HDEF_1497	invF	invG	TRUE	0.822	19.000	0.000	1.000	N	NA
7638113	7638114	HDEF_1497	HDEF_1498	invG	invE	TRUE	0.994	-3.000	0.360	1.000		NA
7638114	7638115	HDEF_1498	HDEF_1499	invE	invA	TRUE	0.987	18.000	0.320	1.000		NA
7638115	7638116	HDEF_1499	HDEF_1500	invA	invB	TRUE	0.953	23.000	0.200	0.013		NA
7638116	7638117	HDEF_1500	HDEF_1501	invB	invC	TRUE	0.989	0.000	0.200	1.000		NA
7638117	7638118	HDEF_1501	HDEF_1502	invC	spaM	TRUE	0.963	-16.000	0.300	NA		NA
7638118	7638119	HDEF_1502	HDEF_1503	spaM	spaN	TRUE	0.982	-15.000	0.571	NA		NA
7638119	7638120	HDEF_1503	HDEF_1504	spaN		TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7638120	7638121	HDEF_1504	HDEF_1505		spaO	FALSE	0.150	178.000	0.000	NA		NA
7638121	7638122	HDEF_1505	HDEF_1506	spaO	spaP	TRUE	0.999	12.000	0.625	1.000	Y	NA
7638122	7638123	HDEF_1506	HDEF_1507	spaP	spaQ	TRUE	0.998	17.000	0.833	0.013	Y	NA
7638123	7638124	HDEF_1507	HDEF_1508	spaQ	spaR	TRUE	0.999	3.000	1.000	0.048	Y	NA
7638124	7638125	HDEF_1508	HDEF_1509	spaR	spaS	TRUE	0.963	176.000	0.682	0.048	Y	NA
7638125	7638126	HDEF_1509	HDEF_1510	spaS	sicA	FALSE	0.118	105.000	0.000	1.000		NA
7638126	7638127	HDEF_1510	HDEF_1511	sicA	sipB	FALSE	0.056	202.000	0.000	1.000		NA
7638127	7638128	HDEF_1511	HDEF_1512	sipB		TRUE	0.710	31.000	0.000	NA		NA
7638128	7638129	HDEF_1512	HDEF_1513			FALSE	0.292	80.000	0.000	NA		NA
7638129	7638130	HDEF_1513	HDEF_1514			FALSE	0.198	-48.000	0.000	NA		NA
7638130	7638131	HDEF_1514	HDEF_1515			FALSE	0.112	214.000	0.000	NA		NA
7638134	7638135	HDEF_1518	HDEF_1519	rffA	arcB	TRUE	0.895	-3.000	0.000	1.000	N	NA
7638136	7638137	HDEF_1520	HDEF_1521	dsbB	hupA_3	FALSE	0.101	281.000	0.000	1.000	N	NA
7638137	7638138	HDEF_1521	HDEF_1522	hupA_3	queF_2	FALSE	0.059	196.000	0.000	1.000		NA
7638138	7638139	HDEF_1522	HDEF_1523	queF_2		TRUE	0.568	49.000	0.000	NA		NA
7638139	7638140	HDEF_1523	HDEF_1524		speA	TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7638140	7638141	HDEF_1524	HDEF_1525	speA	tktB	TRUE	0.563	58.000	0.000	1.000	N	NA
7638141	7638142	HDEF_1525	HDEF_1526	tktB		FALSE	0.116	209.000	0.000	NA		NA
7638142	7638143	HDEF_1526	HDEF_1527			FALSE	0.057	333.000	0.000	NA		NA
7638143	7638144	HDEF_1527	HDEF_1528		uvrY	FALSE	0.162	170.000	0.000	NA		NA
7638144	7638145	HDEF_1528	HDEF_1529	uvrY	uvrC	TRUE	0.987	1.000	0.086	1.000	N	NA
7638145	7638146	HDEF_1529	HDEF_1530	uvrC	pgsA	TRUE	0.745	214.000	0.227	1.000	N	NA
7638146	7638147	HDEF_1530	HDEF_1531	pgsA		FALSE	0.232	119.000	0.000	NA		NA
7638147	7638148	HDEF_1531	HDEF_1532			TRUE	0.671	39.000	0.000	NA		NA
7638148	7638149	HDEF_1532	HDEF_1533			TRUE	0.835	10.000	0.000	NA		NA
7638149	7638150	HDEF_1533	HDEF_1534			FALSE	0.138	188.000	0.000	NA		NA
7638151	7638152	HDEF_1535	HDEF_1536		ssb	FALSE	0.244	94.000	0.000	NA		NA
7638152	7638153	HDEF_1536	HDEF_1537	ssb		FALSE	0.177	157.000	0.000	NA		NA
7638153	7638154	HDEF_1537	HDEF_1538		cca	TRUE	0.705	32.000	0.000	NA		NA
7638154	7638155	HDEF_1538	HDEF_1539	cca	fbaA	TRUE	0.926	1.000	0.000	1.000	N	NA
7638155	7638156	HDEF_1539	HDEF_1540	fbaA	pgk	TRUE	0.888	63.000	0.056	0.005	Y	NA
7638158	7638159	HDEF_1542	HDEF_1544	cysS		FALSE	0.251	89.000	0.000	NA		NA
7638160	7638161	HDEF_1543	HDEF_1545	lpxH	dsbA	TRUE	0.467	39.000	0.000	1.000		NA
7638162	7638163	HDEF_1546	HDEF_1547			TRUE	0.694	34.000	0.000	NA		NA
7638163	7638164	HDEF_1547	HDEF_1548			FALSE	0.025	594.000	0.000	NA		NA
7638167	7638168	HDEF_1551	HDEF_1552			FALSE	0.227	125.000	0.000	NA		NA
7638168	7638169	HDEF_1552	HDEF_1553			FALSE	0.183	-58.000	0.000	NA		NA
7638169	7638170	HDEF_1553	HDEF_1554			FALSE	0.151	177.000	0.000	NA		NA
7638170	7638171	HDEF_1554	HDEF_1555			FALSE	0.148	180.000	0.000	NA		NA
7638171	7638172	HDEF_1555	HDEF_1556			TRUE	0.894	0.000	0.000	NA		NA
7638172	7638173	HDEF_1556	HDEF_1557			FALSE	0.129	195.000	0.000	NA		NA
7638174	7638175	HDEF_1558	HDEF_1560			FALSE	0.163	-76.000	0.000	NA		NA
7638178	7638179	HDEF_1562	HDEF_1563			TRUE	0.825	11.000	0.000	NA		NA
7638182	7638183	HDEF_1566	HDEF_1567			TRUE	0.774	17.000	0.000	NA		NA
7638183	7638184	HDEF_1567	HDEF_1568			FALSE	0.062	309.000	0.000	NA		NA
7638185	7638186	HDEF_1569	HDEF_1570			TRUE	0.461	59.000	0.000	NA		NA
7638186	7638187	HDEF_1570	HDEF_1571			TRUE	0.835	10.000	0.000	NA		NA
7638187	7638188	HDEF_1571	HDEF_1572			FALSE	0.077	267.000	0.000	NA		NA
7638189	7638190	HDEF_1573	HDEF_1574			TRUE	0.686	35.000	0.000	NA		NA
7638191	7638192	HDEF_1575	HDEF_1576			FALSE	0.036	430.000	0.000	NA		NA
7638193	7638194	HDEF_1577	HDEF_1578			FALSE	0.361	70.000	0.000	NA		NA
7638195	7638196	HDEF_1579	HDEF_1580			TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7638196	7638197	HDEF_1580	HDEF_1581			TRUE	0.628	42.000	0.000	NA		NA
7638197	7638198	HDEF_1581	HDEF_1582			TRUE	0.894	0.000	0.000	NA		NA
7638199	7638200	HDEF_1583	HDEF_1584			FALSE	0.416	64.000	0.000	NA		NA
7638200	7638201	HDEF_1584	HDEF_1585			TRUE	0.690	118.000	0.000	NA	Y	NA
7638201	7638202	HDEF_1585	HDEF_1586			FALSE	0.237	104.000	0.000	NA		NA
7638202	7638203	HDEF_1586	HDEF_1587			FALSE	0.281	82.000	0.000	NA		NA
7638203	7638204	HDEF_1587	HDEF_1588			FALSE	0.138	188.000	0.000	NA		NA
7638204	7638205	HDEF_1588	HDEF_1589			FALSE	0.089	243.000	0.000	NA		NA
7638205	7638206	HDEF_1589	HDEF_1590			TRUE	0.723	28.000	0.000	NA		NA
7638206	7638207	HDEF_1590	HDEF_1591			TRUE	0.759	-6.000	0.000	NA		NA
7638209	7638210	HDEF_1593	HDEF_1594			FALSE	0.243	95.000	0.000	NA		NA
7638210	7638211	HDEF_1594	HDEF_1595		sdaC	FALSE	0.098	235.000	0.000	NA		NA
7638211	7638212	HDEF_1595	HDEF_1596	sdaC	nth	FALSE	0.090	304.000	0.000	1.000	N	NA
7638212	7638213	HDEF_1596	HDEF_1597	nth		FALSE	0.296	79.000	0.000	NA		NA
7638213	7638214	HDEF_1597	HDEF_1598		birA	TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7638214	7638215	HDEF_1598	HDEF_1599	birA	murB	TRUE	0.992	-3.000	0.211	1.000	N	NA
7638218	7638219	HDEF_1602	HDEF_1603			TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7638219	7638220	HDEF_1603	HDEF_1604			FALSE	0.040	403.000	0.000	NA		NA
7638222	7638223	HDEF_1606	HDEF_1607	xseB	ispA	TRUE	0.973	5.000	0.035	1.000	N	NA
7638223	7638224	HDEF_1607	HDEF_1608	ispA	dxs	TRUE	0.980	27.000	0.060	1.000	Y	NA
7638225	7638226	HDEF_1609	HDEF_1610		nuoM	FALSE	0.041	394.000	0.000	NA		NA
7638226	7638227	HDEF_1610	HDEF_1611	nuoM	nuoL	TRUE	0.995	42.000	0.713	0.002	Y	NA
7638227	7638228	HDEF_1611	HDEF_1612	nuoL	nuoK	TRUE	0.995	-3.000	0.211	0.006	Y	NA
7638228	7638229	HDEF_1612	HDEF_1613	nuoK	nuoJ	TRUE	0.912	144.000	0.269	0.003	Y	NA
7638229	7638230	HDEF_1613	HDEF_1614	nuoJ	nuoI	TRUE	0.958	123.000	0.428	0.006	Y	NA
7638230	7638231	HDEF_1614	HDEF_1615	nuoI	nuoH	TRUE	0.972	75.000	0.423	0.006	Y	NA
7638231	7638232	HDEF_1615	HDEF_1616	nuoH	nuoG	TRUE	0.999	-3.000	0.664	0.006	Y	NA
7638232	7638233	HDEF_1616	HDEF_1617	nuoG		FALSE	0.420	-19.000	0.000	NA		NA
7638233	7638234	HDEF_1617	HDEF_1618		gltL	FALSE	0.093	240.000	0.000	NA		NA
7638234	7638235	HDEF_1618	HDEF_1619	gltL	uvrB	FALSE	0.327	66.000	0.000	0.079	N	NA
7638236	7638237	HDEF_1620	HDEF_1621	dksA	pcnB	FALSE	0.401	207.000	0.023	1.000	N	NA
7638237	7638238	HDEF_1621	HDEF_1622	pcnB	folK	TRUE	0.990	13.000	0.234	1.000	N	NA
7638238	7638239	HDEF_1622	HDEF_1623	folK		FALSE	0.143	225.000	0.000	1.000	N	NA
7638239	7638240	HDEF_1623	HDEF_1624			TRUE	0.976	64.000	0.500	1.000	N	NA
7638240	7638241	HDEF_1624	HDEF_1625		hha	FALSE	0.030	487.000	0.000	NA		NA
7638241	7638242	HDEF_1625	HDEF_1626	hha	folA	FALSE	0.024	608.000	0.000	NA		NA
7638244	7638245	HDEF_1628	HDEF_1629	mutS	barA	TRUE	0.596	40.000	0.000	0.079	N	NA
7638245	7638246	HDEF_1629	HDEF_1630	barA	metJ	FALSE	0.198	82.000	0.000	0.029	N	NA
7638247	7638248	HDEF_1631	HDEF_1632	ubiA	ubiC	TRUE	0.995	-7.000	0.248	NA	Y	NA
7638248	7638249	HDEF_1632	HDEF_1633	ubiC		FALSE	0.286	81.000	0.000	NA		NA
7638249	7638250	HDEF_1633	HDEF_1634		trpS	TRUE	0.710	31.000	0.000	NA		NA
7638250	7638251	HDEF_1634	HDEF_1636	trpS		FALSE	0.241	96.000	0.000	NA		NA
7638253	7638254	HDEF_1637	HDEF_1639	rpe	dam	TRUE	0.958	14.000	0.040	1.000	N	NA
7638256	7638257	HDEF_1640	HDEF_1641	aroB	aroK	TRUE	0.991	34.000	0.208	1.000	Y	NA
7638257	7638258	HDEF_1641	HDEF_1642	aroK		FALSE	0.188	103.000	0.000	0.079	N	NA
7638258	7638259	HDEF_1642	HDEF_1643		pta	FALSE	0.118	109.000	0.000	1.000		NA
7638259	7638260	HDEF_1643	HDEF_1644	pta	ackA	TRUE	0.964	71.000	0.634	1.000		NA
7638260	7638261	HDEF_1644	HDEF_1645	ackA		FALSE	0.115	211.000	0.000	NA		NA
7638263	7638264	HDEF_1648	HDEF_1649	P38_1	P40	FALSE	0.062	-144.000	0.000	1.000		NA
7638264	7638265	HDEF_1649	HDEF_1650	P40	P41	FALSE	0.051	215.000	0.000	1.000		NA
7638265	7638266	HDEF_1650	HDEF_1651	P41	P42	TRUE	0.759	20.000	0.000	NA		NA
7638266	7638267	HDEF_1651	HDEF_1652	P42	P43	FALSE	0.395	66.000	0.000	NA		NA
7638267	7638268	HDEF_1652	HDEF_1653	P43	G	FALSE	0.063	305.000	0.000	NA		NA
7638268	7638269	HDEF_1653	HDEF_1654	G	P44	FALSE	0.039	412.000	0.000	NA		NA
7638269	7638270	HDEF_1654	HDEF_1655	P44	P45	FALSE	0.004	235.000	0.000	0.056		NA
7638270	7638271	HDEF_1655	HDEF_1656	P45	I	TRUE	0.803	13.000	0.000	NA		NA
7638272	7638273	HDEF_1657	HDEF_1658	P47		TRUE	0.850	8.000	0.000	NA		NA
7638274	7638275	HDEF_1660	HDEF_1661	P50	P51	TRUE	0.997	16.000	0.875	NA		NA
7638275	7638276	HDEF_1661	HDEF_1662	P51	P53	TRUE	0.961	-28.000	0.571	NA		NA
7638276	7638277	HDEF_1662	HDEF_1663	P53	P1	FALSE	0.026	565.000	0.000	NA		NA
7638278	7638279	HDEF_1664	HDEF_1665	P2	P3	TRUE	0.875	4.000	0.000	NA		NA
7638279	7638280	HDEF_1665	HDEF_1666	P3	P4	FALSE	0.237	104.000	0.000	NA		NA
7638280	7638281	HDEF_1666	HDEF_1667	P4	P5	FALSE	0.225	127.000	0.000	NA		NA
7638281	7638282	HDEF_1667	HDEF_1668	P5		FALSE	0.046	371.000	0.000	NA		NA
7638282	7638283	HDEF_1668	HDEF_1669		A	FALSE	0.172	162.000	0.000	NA		NA
7638283	7638284	HDEF_1669	HDEF_1670	A	B	FALSE	0.044	382.000	0.000	NA		NA
7638284	7638285	HDEF_1670	HDEF_1671	B	cdtB	FALSE	0.084	252.000	0.000	NA		NA
7638285	7638286	HDEF_1671	HDEF_1672	cdtB	D	FALSE	0.081	258.000	0.000	NA		NA
7638286	7638287	HDEF_1672	HDEF_1673	D	P11	FALSE	0.028	508.000	0.000	NA		NA
7638287	7638288	HDEF_1673	HDEF_1674	P11	E	FALSE	0.126	197.000	0.000	NA		NA
7638288	7638289	HDEF_1674	HDEF_1675	E	F	FALSE	0.239	-37.000	0.000	NA		NA
7638289	7638290	HDEF_1675	HDEF_1676	F	P14	TRUE	0.866	5.000	0.000	NA		NA
7638290	7638291	HDEF_1676	HDEF_1677	P14	P16	TRUE	0.877	-181.000	0.500	NA		NA
7638291	7638292	HDEF_1677	HDEF_1678	P16	P17	FALSE	0.327	74.000	0.000	NA		NA
7638292	7638293	HDEF_1678	HDEF_1679	P17	P18	TRUE	0.774	17.000	0.000	NA		NA
7638293	7638294	HDEF_1679	HDEF_1680	P18	P19	TRUE	0.894	0.000	0.000	NA		NA
7638294	7638295	HDEF_1680	HDEF_1681	P19	P23	TRUE	0.548	51.000	0.000	NA		NA
7638295	7638296	HDEF_1681	HDEF_1682	P23	P24	TRUE	0.825	11.000	0.000	NA		NA
7638296	7638297	HDEF_1682	HDEF_1683	P24	P27	FALSE	0.106	220.000	0.000	NA		NA
7638297	7638298	HDEF_1683	HDEF_1684	P27	P28	TRUE	0.955	-28.000	0.500	NA		NA
7638298	7638299	HDEF_1684	HDEF_1685	P28	P30	TRUE	0.996	0.000	0.286	NA		NA
7638299	7638300	HDEF_1685	HDEF_1686	P30	P31	TRUE	0.998	0.000	0.500	NA		NA
7638300	7638301	HDEF_1686	HDEF_1687	P31	P32	TRUE	0.958	-22.000	0.400	NA		NA
7638301	7638302	HDEF_1687	HDEF_1688	P32	P33	TRUE	0.803	13.000	0.000	NA		NA
7638302	7638303	HDEF_1688	HDEF_1689	P33	P35	TRUE	0.894	0.000	0.000	NA		NA
7638303	7638304	HDEF_1689	HDEF_1690	P35	P36	TRUE	0.717	29.000	0.000	NA		NA
7638304	7638305	HDEF_1690	HDEF_1691	P36	P37	TRUE	0.894	2.000	0.000	NA		NA
7638306	7638307	HDEF_1693	HDEF_1694	P38_2		FALSE	0.106	220.000	0.000	NA		NA
7638307	7638308	HDEF_1694	HDEF_1695			FALSE	0.310	77.000	0.000	NA		NA
7638309	7638310	HDEF_1696	HDEF_1697			TRUE	0.605	-12.000	0.000	NA		NA
7638310	7638311	HDEF_1697	HDEF_1698			FALSE	0.237	109.000	0.000	NA		NA
7638311	7638312	HDEF_1698	HDEF_1699			FALSE	0.060	321.000	0.000	NA		NA
7638312	7638313	HDEF_1699	HDEF_1700			FALSE	0.133	191.000	0.000	NA		NA
7638313	7638314	HDEF_1700	HDEF_1701			FALSE	0.385	-21.000	0.000	NA		NA
7638314	7638315	HDEF_1701	HDEF_1702			FALSE	0.172	162.000	0.000	NA		NA
7638315	7638316	HDEF_1702	HDEF_1703			TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7638316	7638317	HDEF_1703	HDEF_1704			TRUE	0.477	-16.000	0.000	NA		NA
7638317	7638318	HDEF_1704	HDEF_1705			TRUE	0.886	3.000	0.000	NA		NA
7638319	7638320	HDEF_1706	HDEF_1707			TRUE	0.931	41.000	0.000	NA	Y	NA
7638321	7638322	HDEF_1708	HDEF_1709			FALSE	0.237	112.000	0.000	NA		NA
7638322	7638323	HDEF_1709	HDEF_1710			FALSE	0.146	181.000	0.000	NA		NA
7638323	7638324	HDEF_1710	HDEF_1711		rtxA_21	FALSE	0.066	301.000	0.000	NA		NA
7638325	7638326	HDEF_1712	HDEF_1713	rpoS	nlpD	TRUE	0.927	55.000	0.142	1.000	N	NA
7638326	7638327	HDEF_1713	HDEF_1714	nlpD	ispF	TRUE	0.871	11.000	0.000	1.000	N	NA
7638327	7638328	HDEF_1714	HDEF_1715	ispF	ispD	TRUE	0.998	9.000	0.419	1.000	Y	NA
7638328	7638329	HDEF_1715	HDEF_1716	ispD	ftsB	TRUE	0.992	3.000	0.185	1.000	N	NA
7638331	7638332	HDEF_1718	HDEF_1719	rimN	dprA	TRUE	0.767	18.000	0.000	NA		NA
7638333	7638334	HDEF_1720	HDEF_1721	def	fmt	TRUE	0.859	74.000	0.058	0.029	Y	NA
7638334	7638335	HDEF_1721	HDEF_1722	fmt	sun	TRUE	0.999	0.000	0.305	1.000	Y	NA
7638335	7638336	HDEF_1722	HDEF_1723	sun	trkA	TRUE	0.972	18.000	0.122	1.000	N	NA
7638336	7638337	HDEF_1723	HDEF_1724	trkA		TRUE	0.494	65.000	0.000	1.000	N	NA
7638337	7638338	HDEF_1724	HDEF_1725		hemL	TRUE	0.822	19.000	0.000	1.000	N	NA
7638338	7638339	HDEF_1725	HDEF_1726	hemL	mreB	FALSE	0.092	301.000	0.000	1.000	N	NA
7638339	7638340	HDEF_1726	HDEF_1727	mreB	mreC	TRUE	0.998	10.000	0.689	1.000	N	NA
7638340	7638341	HDEF_1727	HDEF_1728	mreC	mreD	TRUE	0.962	135.000	0.550	0.003	Y	NA
7638341	7638342	HDEF_1728	HDEF_1729	mreD	rng	TRUE	0.765	34.000	0.000	1.000	N	NA
7638342	7638343	HDEF_1729	HDEF_1730	rng	tldD	TRUE	0.534	88.000	0.007	NA		NA
7638343	7638344	HDEF_1730	HDEF_1731	tldD	yabI	FALSE	0.238	102.000	0.000	NA		NA
7638344	7638345	HDEF_1731	HDEF_1732	yabI	ubiE	TRUE	0.782	16.000	0.000	NA		NA
7638345	7638346	HDEF_1732	HDEF_1733	ubiE		TRUE	0.894	53.000	0.145	1.000		NA
7638346	7638347	HDEF_1733	HDEF_1734		ubiB	TRUE	0.995	-3.000	0.432	1.000		NA
7638347	7638348	HDEF_1734	HDEF_1735	ubiB	tatA	TRUE	0.896	24.000	0.032	1.000		NA
7638348	7638349	HDEF_1735	HDEF_1736	tatA		TRUE	0.875	4.000	0.000	NA		NA
7638349	7638350	HDEF_1736	HDEF_1737		tatC	TRUE	0.700	33.000	0.000	NA		NA
7638352	7638353	HDEF_1739	HDEF_1740	dnaA	dnaN	TRUE	0.997	17.000	0.328	1.000	Y	NA
7638353	7638354	HDEF_1740	HDEF_1741	dnaN	recF	TRUE	0.762	19.000	0.000	NA		NA
7638354	7638355	HDEF_1741	HDEF_1742	recF	gyrB	TRUE	0.737	25.000	0.000	NA		NA
7638358	7638359	HDEF_1745	HDEF_1746	fumC	nadA	TRUE	0.807	24.000	0.000	1.000	N	NA
7638359	7638360	HDEF_1746	HDEF_1747	nadA		FALSE	0.086	250.000	0.000	NA		NA
7638362	7638363	HDEF_1749	HDEF_1750			FALSE	0.340	72.000	0.000	NA		NA
7638363	7638364	HDEF_1750	HDEF_1751			TRUE	0.473	58.000	0.000	NA		NA
7638364	7638365	HDEF_1751	HDEF_1752			FALSE	0.236	114.000	0.000	NA		NA
7638365	7638366	HDEF_1752	HDEF_1753			TRUE	0.427	63.000	0.000	NA		NA
7638366	7638367	HDEF_1753	HDEF_1754		grpE	FALSE	0.057	333.000	0.000	NA		NA
7638368	7638369	HDEF_1755	HDEF_1756	nadK		FALSE	0.331	-25.000	0.000	NA		NA
7638370	7638371	HDEF_1757	HDEF_1758	yfjB	diaA	TRUE	0.997	-3.000	0.613	NA		NA
7638371	7638372	HDEF_1758	HDEF_1759	diaA		TRUE	0.957	49.000	0.187	1.000	N	NA
7638372	7638373	HDEF_1759	HDEF_1761			FALSE	0.023	680.000	0.000	NA		NA
7638375	7638376	HDEF_1762	HDEF_1763			TRUE	0.737	25.000	0.000	NA		NA
7638378	7638379	HDEF_1765	HDEF_1766	hemG	cysB	TRUE	0.615	53.000	0.000	1.000	N	NA
7638379	7638380	HDEF_1766	HDEF_1767	cysB	topA	TRUE	0.583	91.000	0.008	1.000	N	NA
7638380	7638381	HDEF_1767	HDEF_1768	topA	sohB	TRUE	0.509	142.000	0.006	1.000	N	NA
7638381	7638382	HDEF_1768	HDEF_1769	sohB		FALSE	0.289	180.000	0.000	NA	N	NA
7638383	7638384	HDEF_1770	HDEF_1771	artP	artI	TRUE	0.966	105.000	0.323	1.000	Y	NA
7638384	7638385	HDEF_1771	HDEF_1772	artI	artM	TRUE	0.996	9.000	0.260	0.025	Y	NA
7638385	7638386	HDEF_1772	HDEF_1773	artM	artQ	TRUE	0.999	6.000	0.714	0.010	Y	NA
7638386	7638387	HDEF_1773	HDEF_1774	artQ		FALSE	0.238	103.000	0.000	NA		NA
7638388	7638389	HDEF_1775	HDEF_1776	yadH	yadG	TRUE	0.997	-3.000	0.688	0.077	N	NA
7638389	7638390	HDEF_1776	HDEF_1777	yadG	lpxC	FALSE	0.073	347.000	0.000	1.000	N	NA
7638390	7638391	HDEF_1777	HDEF_1778	lpxC	ftsZ	TRUE	0.498	270.000	0.134	1.000	N	NA
7638391	7638392	HDEF_1778	HDEF_1779	ftsZ	ftsA	TRUE	0.966	152.000	0.460	1.000	Y	NA
7638392	7638393	HDEF_1779	HDEF_1780	ftsA	ftsQ	TRUE	0.994	28.000	0.389	NA	N	NA
7638393	7638394	HDEF_1780	HDEF_1781	ftsQ	ddlB	TRUE	0.999	2.000	0.372	NA	Y	NA
7638394	7638395	HDEF_1781	HDEF_1782	ddlB	murC	TRUE	0.981	-7.000	0.153	0.005	Y	NA
7638395	7638396	HDEF_1782	HDEF_1783	murC	murG	TRUE	0.998	9.000	0.283	1.000	Y	NA
7638396	7638397	HDEF_1783	HDEF_1784	murG	ftsW	TRUE	0.998	-3.000	0.647	1.000	N	NA
7638397	7638398	HDEF_1784	HDEF_1785	ftsW	murD	TRUE	0.991	-3.000	0.297	0.003	N	NA
7638398	7638399	HDEF_1785	HDEF_1786	murD	mraY	TRUE	0.999	0.000	0.647	0.005	Y	NA
7638399	7638400	HDEF_1786	HDEF_1787	mraY	murF	TRUE	0.994	-6.000	0.309	0.005	Y	NA
7638400	7638401	HDEF_1787	HDEF_1788	murF	murE	TRUE	0.999	2.000	0.569	0.003	Y	NA
7638401	7638402	HDEF_1788	HDEF_1789	murE	ftsI	TRUE	0.957	-13.000	0.059	1.000	Y	NA
7638402	7638403	HDEF_1789	HDEF_1790	ftsI	ftsL	TRUE	0.982	10.000	0.124	1.000	N	NA
7638403	7638404	HDEF_1790	HDEF_1791	ftsL	mraW	TRUE	0.995	0.000	0.227	1.000	N	NA
7638404	7638405	HDEF_1791	HDEF_1792	mraW	mraZ	TRUE	0.994	27.000	0.635	NA		NA
7638405	7638406	HDEF_1792	HDEF_1793	mraZ	leuO	FALSE	0.078	266.000	0.000	NA		NA
7638406	7638407	HDEF_1793	HDEF_1794	leuO		FALSE	0.136	189.000	0.000	NA		NA
7638408	7638409	HDEF_1795	HDEF_1796			FALSE	0.152	-82.000	0.000	NA		NA
7638410	7638411	HDEF_1797	HDEF_1798			TRUE	0.762	19.000	0.000	NA		NA
7638411	7638412	HDEF_1798	HDEF_1799			TRUE	0.941	80.000	0.400	NA		NA
7638413	7638414	HDEF_1800	HDEF_1801	yojN	rcsB	TRUE	0.981	-13.000	0.558	1.000		NA
7638414	7638415	HDEF_1801	HDEF_1803	rcsB	cpxR	FALSE	0.055	2956.000	0.000	0.006	Y	NA
7638415	7638416	HDEF_1803	HDEF_1804	cpxR	yibK	TRUE	0.715	69.000	0.008	1.000	N	NA
7638417	7638418	HDEF_1805	HDEF_1806	sanA	sfcA	TRUE	0.477	174.000	0.045	NA		NA
7638418	7638419	HDEF_1806	HDEF_1807	sfcA	metG	TRUE	0.794	27.000	0.000	1.000	N	NA
7638422	7638423	HDEF_1810	HDEF_1811	kdtA		TRUE	0.994	-3.000	0.083	NA	Y	NA
7638423	7638424	HDEF_1811	HDEF_1812		coaD	TRUE	0.973	10.000	0.023	NA	N	NA
7638424	7638425	HDEF_1812	HDEF_1813	coaD		FALSE	0.030	494.000	0.000	NA		NA
7638425	7638426	HDEF_1813	HDEF_1814			FALSE	0.042	391.000	0.000	NA		NA
7638426	7638427	HDEF_1814	HDEF_1815		uvrA	FALSE	0.037	429.000	0.000	NA		NA
7638429	7638430	HDEF_1817	HDEF_1818	yhcB	degS	FALSE	0.404	65.000	0.000	NA		NA
7638432	7638433	HDEF_1820	HDEF_1821	fruB	fruK	TRUE	0.993	-3.000	0.112	1.000	Y	NA
7638433	7638434	HDEF_1821	HDEF_1822	fruK	fruA	TRUE	0.999	12.000	0.562	1.000	Y	NA
7638434	7638435	HDEF_1822	HDEF_1823	fruA	aspC_2	FALSE	0.372	80.000	0.000	1.000	N	NA
7638435	7638436	HDEF_1823	HDEF_1824	aspC_2	thrS	FALSE	0.299	124.000	0.000	1.000	N	NA
7638436	7638437	HDEF_1824	HDEF_1825	thrS	infC	TRUE	0.993	17.000	0.186	1.000	Y	NA
7638437	7638438	HDEF_1825	HDEF_1826	infC	rpmI	TRUE	0.984	98.000	0.652	1.000	Y	NA
7638438	7638439	HDEF_1826	HDEF_1827	rpmI	rplT	TRUE	0.997	40.000	0.928	0.018	Y	NA
7638441	7638442	HDEF_1828	HDEF_1830	pheS	pheT	TRUE	0.997	15.000	0.574	0.001	Y	NA
7638442	7638443	HDEF_1830	HDEF_1831	pheT	ihfA	TRUE	0.992	6.000	0.208	1.000	N	NA
7638443	7638444	HDEF_1831	HDEF_1832	ihfA	mukF	TRUE	0.911	12.000	0.000	NA	N	NA
7638444	7638445	HDEF_1832	HDEF_1833	mukF	mukE	TRUE	0.976	8.000	0.000	NA	Y	NA
7638445	7638446	HDEF_1833	HDEF_1834	mukE	mukB	TRUE	0.936	-3.000	0.000	0.001	Y	NA
7638446	7638447	HDEF_1834	HDEF_1835	mukB		FALSE	0.234	64.000	0.000	1.000		NA
7638448	7638449	HDEF_1836	HDEF_1837	prlC	purC	TRUE	0.552	59.000	0.000	1.000	N	NA
7638449	7638450	HDEF_1837	HDEF_1838	purC	nlpB	TRUE	0.920	42.000	0.019	NA	N	NA
7638450	7638451	HDEF_1838	HDEF_1839	nlpB	dapA	TRUE	0.995	38.000	0.267	NA	Y	NA
7638451	7638452	HDEF_1839	HDEF_1840	dapA	rplQ	FALSE	0.270	141.000	0.000	1.000	N	NA
7638452	7638453	HDEF_1840	HDEF_1841	rplQ	rpoA	TRUE	0.995	39.000	0.873	1.000	N	NA
7638453	7638454	HDEF_1841	HDEF_1842	rpoA	rpsD	TRUE	0.994	26.000	0.549	1.000	N	NA
7638454	7638455	HDEF_1842	HDEF_1843	rpsD	rpsK	TRUE	0.996	31.000	0.509	0.025	Y	NA
7638455	7638456	HDEF_1843	HDEF_1844	rpsK	rpsM	TRUE	0.998	16.000	0.810	0.018	Y	NA
7638456	7638457	HDEF_1844	HDEF_1845	rpsM	rpmJ	TRUE	0.795	136.000	0.086	0.018	Y	NA
7638457	7638458	HDEF_1845	HDEF_1846	rpmJ	secY	TRUE	0.928	34.000	0.036	1.000	N	NA
7638458	7638459	HDEF_1846	HDEF_1847	secY	rplO	TRUE	0.998	8.000	0.730	1.000	N	NA
7638459	7638460	HDEF_1847	HDEF_1848	rplO	rpmD	TRUE	0.996	-9.000	0.653	0.003	Y	NA
7638460	7638461	HDEF_1848	HDEF_1849	rpmD	rpsE	TRUE	0.999	5.000	0.789	0.025	Y	NA
7638461	7638462	HDEF_1849	HDEF_1850	rpsE	rplR	TRUE	0.998	20.000	0.814	0.025	Y	NA
7638462	7638463	HDEF_1850	HDEF_1851	rplR	rplF	TRUE	0.999	10.000	0.815	0.018	Y	NA
7638463	7638464	HDEF_1851	HDEF_1852	rplF	rpsH	TRUE	0.998	14.000	0.808	0.018	Y	NA
7638464	7638465	HDEF_1852	HDEF_1853	rpsH	rpsN	TRUE	0.995	35.000	0.473	0.018	Y	NA
7638465	7638466	HDEF_1853	HDEF_1854	rpsN	rplE	TRUE	0.997	16.000	0.496	0.018	Y	NA
7638466	7638467	HDEF_1854	HDEF_1855	rplE	rplX	TRUE	0.998	22.000	0.758	0.018	Y	NA
7638467	7638468	HDEF_1855	HDEF_1856	rplX	rplN	TRUE	0.999	11.000	0.810	0.025	Y	NA
7638468	7638469	HDEF_1856	HDEF_1857	rplN	rpsQ	TRUE	0.970	159.000	0.791	0.025	Y	NA
7638469	7638470	HDEF_1857	HDEF_1858	rpsQ	rpmC	TRUE	0.996	-3.000	0.828	0.018		NA
7638470	7638471	HDEF_1858	HDEF_1859	rpmC	rplP	TRUE	0.985	42.000	0.802	0.018		NA
7638471	7638472	HDEF_1859	HDEF_1860	rplP	rpsC	TRUE	0.999	0.000	0.828	0.025	Y	NA
7638472	7638473	HDEF_1860	HDEF_1861	rpsC	rplV	TRUE	0.999	0.000	0.719	0.025	Y	NA
7638473	7638474	HDEF_1861	HDEF_1862	rplV	rpsS	TRUE	0.998	14.000	0.769	0.025	Y	NA
7638474	7638475	HDEF_1862	HDEF_1863	rpsS	rplB	TRUE	0.998	17.000	0.820	0.025	Y	NA
7638475	7638476	HDEF_1863	HDEF_1864	rplB	rplW	TRUE	0.998	17.000	0.849	0.025	Y	NA
7638476	7638477	HDEF_1864	HDEF_1865	rplW	rplD	TRUE	0.998	-3.000	0.513	0.018	Y	NA
7638477	7638478	HDEF_1865	HDEF_1866	rplD	rplC	TRUE	0.997	17.000	0.486	0.018	Y	NA
7638478	7638479	HDEF_1866	HDEF_1867	rplC	rpsJ	TRUE	0.993	33.000	0.307	0.025	Y	NA
7638479	7638480	HDEF_1867	HDEF_1868	rpsJ	fecE	FALSE	0.086	250.000	0.000	NA		NA
7638480	7638481	HDEF_1868	HDEF_1869	fecE	fecD	TRUE	0.759	-6.000	0.000	NA		NA
7638481	7638482	HDEF_1869	HDEF_1870	fecD	fecC	TRUE	0.796	14.000	0.000	NA		NA
7638482	7638483	HDEF_1870	HDEF_1871	fecC		TRUE	0.782	16.000	0.000	NA		NA
7638483	7638484	HDEF_1871	HDEF_1872			FALSE	0.221	131.000	0.000	NA		NA
7638484	7638485	HDEF_1872	HDEF_1873		cysK	TRUE	0.719	-3.000	0.000	1.000		NA
7638485	7638486	HDEF_1873	HDEF_1874	cysK		FALSE	0.145	-31.000	0.000	1.000		NA
7638486	7638487	HDEF_1874	HDEF_1875			FALSE	0.138	-91.000	0.000	NA		NA
7638488	7638489	HDEF_1876	HDEF_1877	feoA	feoB	TRUE	0.992	18.000	0.177	1.000	Y	NA
7638489	7638490	HDEF_1877	HDEF_1878	feoB		TRUE	0.996	-3.000	0.455	NA		NA
7638491	7638492	HDEF_1879	HDEF_1880			TRUE	0.854	7.000	0.000	NA		NA
7638492	7638493	HDEF_1880	HDEF_1881			TRUE	0.548	51.000	0.000	NA		NA
7638493	7638494	HDEF_1881	HDEF_1882		gltA	FALSE	0.241	97.000	0.000	NA		NA
7638495	7638496	HDEF_1883	HDEF_1884	sdhC	sdhD	TRUE	0.995	-6.000	0.453	0.001	Y	NA
7638496	7638497	HDEF_1884	HDEF_1885	sdhD	sdhA	TRUE	0.999	1.000	0.705	0.002	Y	NA
7638497	7638498	HDEF_1885	HDEF_1886	sdhA	sdhB	TRUE	0.985	66.000	0.604	0.002	Y	NA
7638498	7638499	HDEF_1886	HDEF_1887	sdhB	sucA	TRUE	0.977	37.000	0.067	1.000	Y	NA
7638499	7638500	HDEF_1887	HDEF_1888	sucA	sucB	TRUE	0.997	42.000	0.667	1.000	Y	NA
7638500	7638501	HDEF_1888	HDEF_1889	sucB	sucC	TRUE	0.904	118.000	0.136	1.000	Y	NA
7638501	7638502	HDEF_1889	HDEF_1890	sucC	sucD	TRUE	0.999	0.000	0.806	0.001	Y	NA
7638502	7638503	HDEF_1890	HDEF_1891	sucD		FALSE	0.018	391.000	0.000	1.000		NA
7638503	7638504	HDEF_1891	HDEF_1892			FALSE	0.031	57.000	0.000	0.001		NA
7638504	7638505	HDEF_1892	HDEF_1893			FALSE	0.169	164.000	0.000	NA		NA
7638506	7638507	HDEF_1894	HDEF_1895	pfkA	efp	FALSE	0.336	87.000	0.000	1.000	N	NA
7638509	7638510	HDEF_1897	HDEF_1898	folD	thrC	TRUE	0.708	42.000	0.000	1.000	N	NA
7638510	7638511	HDEF_1898	HDEF_1899	thrC	thrB	TRUE	0.997	8.000	0.233	1.000	Y	NA
7638511	7638512	HDEF_1899	HDEF_1900	thrB	thrA	TRUE	0.995	4.000	0.133	1.000	Y	NA
7638513	7638514	HDEF_1901	HDEF_1902	arcA		TRUE	0.423	99.000	0.000	NA	N	NA
7638514	7638515	HDEF_1902	HDEF_1903			TRUE	0.931	41.000	0.000	NA	Y	NA
7638515	7638516	HDEF_1903	HDEF_1904		mutH_1	TRUE	0.938	24.000	0.000	1.000	Y	NA
7638516	7638517	HDEF_1904	HDEF_1905	mutH_1	mutH_2	FALSE	0.255	88.000	0.000	NA		NA
7638517	7638518	HDEF_1905	HDEF_1906	mutH_2		FALSE	0.230	123.000	0.000	NA		NA
7638518	7638519	HDEF_1906	HDEF_1907			FALSE	0.141	185.000	0.000	NA		NA
7638520	7638521	HDEF_1908	HDEF_1909	rhtA	lpd_1	TRUE	0.723	6.000	0.000	1.000		NA
7638521	7638522	HDEF_1909	HDEF_1910	lpd_1	hda	FALSE	0.222	217.000	0.000	NA	N	NA
7638522	7638523	HDEF_1910	HDEF_1911	hda		FALSE	0.103	229.000	0.000	NA		NA
7638523	7638524	HDEF_1911	HDEF_1912			FALSE	0.027	549.000	0.000	NA		NA
7638525	7638526	HDEF_1913	HDEF_1914	radC	rpmB	TRUE	0.476	147.000	0.002	1.000	N	NA
7638526	7638527	HDEF_1914	HDEF_1915	rpmB	rpmG	TRUE	0.996	12.000	0.332	0.018	Y	NA
7638527	7638528	HDEF_1915	HDEF_1916	rpmG	lgt	FALSE	0.116	253.000	0.000	1.000	N	NA
7638528	7638529	HDEF_1916	HDEF_1917	lgt	thyA	TRUE	0.973	30.000	0.164	1.000	N	NA
7638529	7638530	HDEF_1917	HDEF_1918	thyA	tusE	TRUE	0.948	3.000	0.000	NA	N	NA
7638530	7638531	HDEF_1918	HDEF_1919	tusE		FALSE	0.246	92.000	0.000	NA		NA
7638532	7638533	HDEF_1920	HDEF_1921	sbcB	hemN	FALSE	0.351	84.000	0.000	1.000	N	NA
7638533	7638534	HDEF_1921	HDEF_1922	hemN	rdgB	TRUE	0.982	-7.000	0.218	1.000	N	NA
7638534	7638535	HDEF_1922	HDEF_1924	rdgB		TRUE	0.852	26.000	0.005	1.000		NA
7638536	7638537	HDEF_1923	HDEF_1925		guaB	FALSE	0.175	158.000	0.000	NA		NA
7638537	7638538	HDEF_1925	HDEF_1926	guaB	guaA	TRUE	0.856	144.000	0.190	0.001	Y	NA
7638539	7638540	HDEF_1927	HDEF_1928	pgpA	thiL	TRUE	0.993	3.000	0.206	1.000	N	NA
7638540	7638541	HDEF_1928	HDEF_1929	thiL	nusB	TRUE	0.969	48.000	0.225	1.000	N	NA
7638541	7638542	HDEF_1929	HDEF_1930	nusB	ribE	TRUE	0.994	12.000	0.347	1.000	N	NA
7638544	7638545	HDEF_1932	HDEF_1933		rtxA_23	TRUE	0.550	-13.000	0.000	NA		NA
7638546	7638547	HDEF_1934	HDEF_1935			TRUE	0.931	41.000	0.000	NA	Y	NA
7638549	7638550	HDEF_2372	HDEF_1937			FALSE	0.067	-1765.000	0.000	NA		NA
7638551	7638552	HDEF_1938	HDEF_1939		ruvB	FALSE	0.206	68.000	0.000	1.000		NA
7638552	7638553	HDEF_1939	HDEF_1940	ruvB	ruvA	TRUE	0.995	34.000	0.549	0.002	Y	NA
7638553	7638554	HDEF_1940	HDEF_1941	ruvA	pyrB	TRUE	0.754	36.000	0.000	1.000	N	NA
7638554	7638555	HDEF_1941	HDEF_1942	pyrB		TRUE	0.648	67.000	0.002	NA		NA
7638555	7638556	HDEF_1942	HDEF_1943		ptsN	TRUE	0.812	98.000	0.186	NA		NA
7638556	7638557	HDEF_1943	HDEF_1944	ptsN	yhbG	TRUE	0.504	81.000	0.017	1.000		NA
7638557	7638558	HDEF_1944	HDEF_1945	yhbG		TRUE	0.998	0.000	0.543	NA		NA
7638558	7638559	HDEF_1945	HDEF_1946			TRUE	0.955	-25.000	0.459	NA		NA
7638559	7638560	HDEF_1946	HDEF_1947		kdsC	TRUE	0.996	14.000	0.617	NA		NA
7638560	7638561	HDEF_1947	HDEF_1948	kdsC	kdsD	TRUE	0.994	16.000	0.598	1.000		NA
7638562	7638563	HDEF_1949	HDEF_1950		yrbF	TRUE	0.782	16.000	0.000	NA		NA
7638563	7638564	HDEF_1950	HDEF_1951	yrbF	yrbE	TRUE	0.998	28.000	0.530	NA	Y	NA
7638564	7638565	HDEF_1951	HDEF_1952	yrbE	yrbD	TRUE	0.998	3.000	0.562	NA		NA
7638565	7638566	HDEF_1952	HDEF_1953	yrbD		TRUE	0.981	16.000	0.188	NA		NA
7638566	7638567	HDEF_1953	HDEF_1954		bolA_2	TRUE	0.905	13.000	0.000	NA	N	NA
7638567	7638568	HDEF_1954	HDEF_1955	bolA_2	murA	TRUE	0.988	35.000	0.258	NA	N	NA
7638568	7638569	HDEF_1955	HDEF_1956	murA	can	FALSE	0.418	73.000	0.000	1.000	N	NA
7638571	7638572	HDEF_1958	HDEF_1959		siiB	TRUE	0.796	14.000	0.000	NA		NA
7638572	7638573	HDEF_1959	HDEF_1960	siiB	siiC	FALSE	0.371	-22.000	0.000	NA		NA
7638573	7638574	HDEF_1960	HDEF_1961	siiC	siiD	TRUE	0.997	5.000	0.667	1.000		NA
7638575	7638576	HDEF_1962	HDEF_1963	glmM	folP	TRUE	0.994	7.000	0.260	1.000	N	NA
7638576	7638577	HDEF_1963	HDEF_1964	folP	hflB	TRUE	0.801	237.000	0.325	1.000	N	NA
7638577	7638578	HDEF_1964	HDEF_1965	hflB	rrmJ	TRUE	0.937	60.000	0.152	NA	N	NA
7638578	7638579	HDEF_1965	HDEF_1966	rrmJ	greA	TRUE	0.589	152.000	0.009	NA	N	NA
7638581	7638582	HDEF_1968	HDEF_1969		exoY_2	FALSE	0.057	333.000	0.000	NA		NA
7638582	7638583	HDEF_1969	HDEF_1970	exoY_2		FALSE	0.036	430.000	0.000	NA		NA
7638583	7638584	HDEF_1970	HDEF_1971			TRUE	0.495	56.000	0.000	NA		NA
7638584	7638585	HDEF_1971	HDEF_1972			FALSE	0.072	283.000	0.000	NA		NA
7638585	7638586	HDEF_1972	HDEF_1973			TRUE	0.446	61.000	0.000	NA		NA
7638586	7638587	HDEF_1973	HDEF_1974		cro_2	FALSE	0.056	336.000	0.000	NA		NA
7638588	7638589	HDEF_1975	HDEF_1976			FALSE	0.026	557.000	0.000	NA		NA
7638591	7638592	HDEF_1978	HDEF_1979			TRUE	0.457	-18.000	0.000	NA		NA
7638592	7638593	HDEF_1979	HDEF_1980			TRUE	0.992	-3.000	0.250	NA		NA
7638593	7638594	HDEF_1980	HDEF_1981			TRUE	0.767	18.000	0.000	NA		NA
7638594	7638595	HDEF_1981	HDEF_1982			TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7638595	7638596	HDEF_1982	HDEF_1983			TRUE	0.803	13.000	0.000	NA		NA
7638596	7638597	HDEF_1983	HDEF_1984			FALSE	0.205	141.000	0.000	NA		NA
7638597	7638598	HDEF_1984	HDEF_1985			FALSE	0.124	200.000	0.000	NA		NA
7638599	7638600	HDEF_1986	HDEF_1987			FALSE	0.152	-82.000	0.000	NA		NA
7638600	7638601	HDEF_1987	HDEF_1988			FALSE	0.140	186.000	0.000	NA		NA
7638602	7638603	HDEF_1989	HDEF_1990			TRUE	0.744	24.000	0.000	NA		NA
7638605	7638606	HDEF_1992	HDEF_1993	ldhA		FALSE	0.164	168.000	0.000	NA		NA
7638608	7638609	HDEF_1995	HDEF_1996	cyoA_2	cyoB_2	TRUE	0.723	28.000	0.000	NA		NA
7638609	7638610	HDEF_1996	HDEF_1997	cyoB_2		FALSE	0.042	390.000	0.000	NA		NA
7638610	7638611	HDEF_1997	HDEF_1998			FALSE	0.173	160.000	0.000	NA		NA
7638613	7638614	HDEF_2373	HDEF_2000			FALSE	0.111	-1179.000	0.000	NA		NA
7638615	7638616	HDEF_2374	HDEF_2001			FALSE	0.083	-1764.000	0.000	NA		NA
7638617	7638618	HDEF_2375	HDEF_2002			FALSE	0.121	-502.000	0.000	NA		NA
7638618	7638619	HDEF_2002	HDEF_2003			FALSE	0.264	86.000	0.000	NA		NA
7638621	7638622	HDEF_2004	HDEF_2006			FALSE	0.340	72.000	0.000	NA		NA
7638623	7638624	HDEF_2007	HDEF_2008		mnmE	TRUE	0.808	-10.000	0.010	1.000		NA
7638624	7638625	HDEF_2008	HDEF_2009	mnmE	yidC	TRUE	0.747	114.000	0.221	0.043		NA
7638625	7638626	HDEF_2009	HDEF_2010	yidC		TRUE	0.997	3.000	0.461	NA		NA
7638626	7638627	HDEF_2010	HDEF_2011		rnpA	TRUE	0.994	24.000	0.540	NA		NA
7638627	7638628	HDEF_2011	HDEF_2012	rnpA	rpmH	TRUE	0.995	15.000	0.787	1.000		NA
7638628	7638629	HDEF_2012	HDEF_2013	rpmH		FALSE	0.215	-43.000	0.000	NA		NA
7638630	7638631	HDEF_2014	HDEF_2015			TRUE	0.700	33.000	0.000	NA		NA
7638631	7638632	HDEF_2015	HDEF_2016		rtxA_24	TRUE	0.550	-13.000	0.000	NA		NA
7638632	7638633	HDEF_2016	HDEF_2017	rtxA_24	rtxA_25	FALSE	0.361	70.000	0.000	NA		NA
7638638	7638639	HDEF_2376	HDEF_2022			FALSE	0.116	-532.000	0.000	NA		NA
7638640	7638641	HDEF_2377	HDEF_2023			FALSE	0.083	-1764.000	0.000	NA		NA
7638642	7638643	HDEF_2024	HDEF_2378			FALSE	0.111	-1179.000	0.000	NA		NA
7638645	7638646	HDEF_2026	HDEF_2027	rfe	rho	FALSE	0.393	77.000	0.000	1.000	N	NA
7638648	7638649	HDEF_2029	HDEF_2030			FALSE	0.121	202.000	0.000	NA		NA
7638649	7638650	HDEF_2030	HDEF_2031			FALSE	0.340	72.000	0.000	NA		NA
7638650	7638651	HDEF_2031	HDEF_2032			TRUE	0.473	58.000	0.000	NA		NA
7638651	7638652	HDEF_2032	HDEF_2033			FALSE	0.236	114.000	0.000	NA		NA
7638652	7638653	HDEF_2033	HDEF_2034			TRUE	0.427	63.000	0.000	NA		NA
7638654	7638655	HDEF_2035	HDEF_2036	purH	purD	TRUE	0.960	82.000	0.238	1.000	Y	NA
7638655	7638656	HDEF_2036	HDEF_2037	purD	trkH	FALSE	0.400	76.000	0.000	1.000	N	NA
7638656	7638657	HDEF_2037	HDEF_2038	trkH	leuS	FALSE	0.321	91.000	0.000	1.000	N	NA
7638657	7638658	HDEF_2038	HDEF_2039	leuS	rlpB	TRUE	0.982	-7.000	0.182	NA	N	NA
7638658	7638659	HDEF_2039	HDEF_2040	rlpB	holA	TRUE	0.993	-3.000	0.199	NA	N	NA
7638659	7638660	HDEF_2040	HDEF_2041	holA	nadD	TRUE	0.917	-10.000	0.045	1.000	N	NA
7638661	7638662	HDEF_2042	HDEF_2043	lpd_2	aceF	TRUE	0.998	17.000	0.463	1.000	Y	NA
7638662	7638663	HDEF_2043	HDEF_2044	aceF	aceE	TRUE	0.993	27.000	0.220	1.000	Y	NA
7638663	7638664	HDEF_2044	HDEF_2045	aceE		FALSE	0.022	743.000	0.000	NA		NA
7638664	7638665	HDEF_2045	HDEF_2046			TRUE	0.759	-6.000	0.000	NA		NA
7638667	7638668	HDEF_2048	HDEF_2049			TRUE	0.737	25.000	0.000	NA		NA
7638668	7638669	HDEF_2049	HDEF_2050			TRUE	0.931	41.000	0.000	NA	Y	NA
7638669	7638670	HDEF_2050	HDEF_2051			TRUE	0.506	55.000	0.000	NA		NA
7638670	7638671	HDEF_2051	HDEF_2052			FALSE	0.416	64.000	0.000	NA		NA
7638671	7638672	HDEF_2052	HDEF_2053			TRUE	0.690	118.000	0.000	NA	Y	NA
7638672	7638673	HDEF_2053	HDEF_2054			FALSE	0.237	104.000	0.000	NA		NA
7638673	7638674	HDEF_2054	HDEF_2055			FALSE	0.281	82.000	0.000	NA		NA
7638674	7638675	HDEF_2055	HDEF_2056			FALSE	0.138	188.000	0.000	NA		NA
7638675	7638676	HDEF_2056	HDEF_2057			FALSE	0.089	243.000	0.000	NA		NA
7638677	7638678	HDEF_2058	HDEF_2059			FALSE	0.157	173.000	0.000	NA		NA
7638679	7638680	HDEF_2060	HDEF_2061		purU	FALSE	0.314	96.000	0.000	1.000	N	NA
7638682	7638683	HDEF_2063	HDEF_2064	hns	cls	FALSE	0.013	490.000	0.000	1.000		NA
7638684	7638685	HDEF_2065	HDEF_2066	ompX	tonB	TRUE	0.700	77.000	0.000	1.000	Y	NA
7638686	7638687	HDEF_2067	HDEF_2068	ispZ		TRUE	0.980	2.000	0.061	NA		NA
7638687	7638688	HDEF_2068	HDEF_2069			FALSE	0.049	360.000	0.000	NA		NA
7638689	7638690	HDEF_2070	HDEF_2071	asd		FALSE	0.237	105.000	0.000	NA		NA
7638690	7638691	HDEF_2071	HDEF_2072			TRUE	0.959	29.000	0.125	NA		NA
7638691	7638692	HDEF_2072	HDEF_2073		rpiA	TRUE	0.705	55.000	0.000	NA	N	NA
7638692	7638693	HDEF_2073	HDEF_2074	rpiA	serA	TRUE	0.969	7.000	0.029	1.000	N	NA
7638694	7638695	HDEF_2075	HDEF_2076		zapA	FALSE	0.149	425.000	0.034	NA		NA
7638695	7638696	HDEF_2076	HDEF_2078	zapA		FALSE	0.105	222.000	0.000	NA		NA
7638697	7638698	HDEF_2077	HDEF_2079			TRUE	0.835	10.000	0.000	NA		NA
7638702	7638703	HDEF_2083	HDEF_2084	prsA	pth	TRUE	0.905	38.000	0.011	1.000	N	NA
7638703	7638704	HDEF_2084	HDEF_2085	pth	sxy	FALSE	0.161	273.000	0.000	NA	N	NA
7638704	7638705	HDEF_2085	HDEF_2086	sxy	apt	FALSE	0.355	149.000	0.000	NA	N	NA
7638705	7638706	HDEF_2086	HDEF_2087	apt	dnaX	TRUE	0.927	44.000	0.088	1.000	N	NA
7638706	7638707	HDEF_2087	HDEF_2088	dnaX		TRUE	0.986	42.000	0.411	NA		NA
7638707	7638708	HDEF_2088	HDEF_2089		recR	TRUE	0.998	4.000	0.604	NA		NA
7638708	7638709	HDEF_2089	HDEF_2090	recR		TRUE	0.686	35.000	0.000	NA		NA
7638711	7638712	HDEF_2092	HDEF_2093		htpG	FALSE	0.101	232.000	0.000	NA		NA
7638712	7638713	HDEF_2093	HDEF_2094	htpG		TRUE	0.789	15.000	0.000	NA		NA
7638713	7638714	HDEF_2094	HDEF_2095		adk	TRUE	0.516	54.000	0.000	NA		NA
7638717	7638718	HDEF_2098	HDEF_2099	asnB		TRUE	0.626	14.000	0.000	1.000		NA
7638718	7638719	HDEF_2099	HDEF_2100		fabI	FALSE	0.004	235.000	0.000	0.017		NA
7638719	7638720	HDEF_2100	HDEF_2101	fabI	sapF	TRUE	0.724	95.000	0.078	1.000	N	NA
7638720	7638721	HDEF_2101	HDEF_2102	sapF	sapD	TRUE	0.999	0.000	0.684	0.009	Y	NA
7638721	7638722	HDEF_2102	HDEF_2103	sapD	sapC	TRUE	0.999	0.000	0.667	1.000	Y	NA
7638722	7638723	HDEF_2103	HDEF_2104	sapC	sapB	TRUE	0.983	-13.000	0.284	0.009	Y	NA
7638723	7638724	HDEF_2104	HDEF_2105	sapB		TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7638724	7638725	HDEF_2105	HDEF_2106		lpcA	TRUE	0.721	-7.000	0.000	NA		NA
7638727	7638728	HDEF_2108	HDEF_2109	fre	ubiD	TRUE	0.996	1.000	0.090	NA	Y	NA
7638732	7638733	HDEF_2113	HDEF_2114			TRUE	0.731	26.000	0.000	NA		NA
7638733	7638734	HDEF_2114	HDEF_2115			TRUE	0.995	21.000	0.632	NA		NA
7638734	7638735	HDEF_2115	HDEF_2116		prmC	FALSE	0.237	106.000	0.000	NA		NA
7638735	7638736	HDEF_2116	HDEF_2117	prmC	prfA	TRUE	0.997	2.000	0.229	0.032	Y	NA
7638736	7638737	HDEF_2117	HDEF_2118	prfA	hemA	TRUE	0.590	45.000	0.000	NA		NA
7638738	7638739	HDEF_2119	HDEF_2120	lolB	ispE	TRUE	0.988	-3.000	0.157	1.000	N	NA
7638740	7638741	HDEF_2121	HDEF_2122	ydjN	ydjM	TRUE	0.985	0.000	0.102	NA		NA
7638741	7638742	HDEF_2122	HDEF_2123	ydjM	yfeD	TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7638742	7638743	HDEF_2123	HDEF_2124	yfeD	yfeC	TRUE	0.999	0.000	0.525	0.004	Y	NA
7638743	7638744	HDEF_2124	HDEF_2125	yfeC	yfeB	TRUE	0.999	1.000	0.857	0.072	Y	NA
7638744	7638745	HDEF_2125	HDEF_2126	yfeB	yfeA	TRUE	0.999	-3.000	0.894	1.000	Y	NA
7638747	7638748	HDEF_2128	HDEF_2129		gloB	TRUE	0.737	173.000	0.233	1.000		NA
7638749	7638750	HDEF_2130	HDEF_2131	yafS	hmuR	FALSE	0.032	288.000	0.000	1.000		NA
7638750	7638751	HDEF_2131	HDEF_2132	hmuR	hmuS	TRUE	0.893	78.000	0.064	1.000	Y	NA
7638751	7638752	HDEF_2132	HDEF_2133	hmuS	hmuT	TRUE	0.997	17.000	0.384	1.000	Y	NA
7638752	7638753	HDEF_2133	HDEF_2134	hmuT	hmuU	TRUE	0.999	-3.000	0.852	1.000	Y	NA
7638753	7638754	HDEF_2134	HDEF_2135	hmuU	hmuV	TRUE	0.991	-9.000	0.220	1.000	Y	NA
7638755	7638756	HDEF_2136	HDEF_2137			TRUE	0.457	-18.000	0.000	NA		NA
7638757	7638758	HDEF_2138	HDEF_2139			TRUE	0.728	72.000	0.000	1.000	Y	NA
7638759	7638760	HDEF_2140	HDEF_2141			FALSE	0.205	141.000	0.000	NA		NA
7638761	7638762	HDEF_2142	HDEF_2143			FALSE	0.237	108.000	0.000	NA		NA
7638763	7638764	HDEF_2144	HDEF_2145			TRUE	0.989	-3.000	0.235	1.000		NA
7638764	7638765	HDEF_2145	HDEF_2146			FALSE	0.163	169.000	0.000	NA		NA
7638766	7638767	HDEF_2147	HDEF_2148	rtxA_26		FALSE	0.032	472.000	0.000	NA		NA
7638768	7638769	HDEF_2149	HDEF_2150			TRUE	0.998	-3.000	0.750	NA		NA
7638769	7638770	HDEF_2150	HDEF_2151			FALSE	0.048	365.000	0.000	NA		NA
7638771	7638772	HDEF_2152	HDEF_2153			FALSE	0.041	242.000	0.000	1.000		NA
7638772	7638773	HDEF_2153	HDEF_2154			FALSE	0.013	-31.000	0.000	0.004		NA
7638774	7638775	HDEF_2155	HDEF_2156			TRUE	0.750	23.000	0.000	NA		NA
7638775	7638776	HDEF_2156	HDEF_2157			FALSE	0.033	463.000	0.000	NA		NA
7638777	7638778	HDEF_2158	HDEF_2159			TRUE	0.996	2.000	0.300	NA		NA
7638779	7638780	HDEF_2160	HDEF_2161			TRUE	0.671	39.000	0.000	NA		NA
7638784	7638785	HDEF_2165	HDEF_2166			FALSE	0.034	447.000	0.000	NA		NA
7638786	7638787	HDEF_2167	HDEF_2168			FALSE	0.155	174.000	0.000	NA		NA
7638791	7638792	HDEF_2173	HDEF_2174			FALSE	0.163	-76.000	0.000	NA		NA
7638794	7638795	HDEF_2176	HDEF_2177			TRUE	0.994	-3.000	0.286	NA		NA
7638797	7638798	HDEF_2179	HDEF_2180	mobB_5	mobA_5	TRUE	0.875	4.000	0.000	NA		NA
7638799	7638800	HDEF_2181	HDEF_2182			TRUE	0.931	41.000	0.000	NA	Y	NA
7638801	7638802	HDEF_2183	HDEF_2184	mobA_6		FALSE	0.118	206.000	0.000	NA		NA
7638802	7638803	HDEF_2184	HDEF_2185			FALSE	0.146	-85.000	0.000	NA		NA
7638804	7638805	HDEF_2186	HDEF_2187			TRUE	0.859	6.000	0.000	NA		NA
7638805	7638806	HDEF_2187	HDEF_2188			TRUE	0.506	55.000	0.000	NA		NA
7638806	7638807	HDEF_2188	HDEF_2189			TRUE	0.931	41.000	0.000	NA	Y	NA
7638808	7638809	HDEF_2190	HDEF_2191	mobA_7		FALSE	0.118	206.000	0.000	NA		NA
7638809	7638810	HDEF_2191	HDEF_2192			FALSE	0.146	-85.000	0.000	NA		NA
7638811	7638812	HDEF_2193	HDEF_2194			TRUE	0.859	6.000	0.000	NA		NA
7638812	7638813	HDEF_2194	HDEF_2195			TRUE	0.506	55.000	0.000	NA		NA
7638813	7638814	HDEF_2195	HDEF_2196			TRUE	0.931	41.000	0.000	NA	Y	NA
7638815	7638816	HDEF_2197	HDEF_2198	mobA_8		FALSE	0.118	206.000	0.000	NA		NA
7638816	7638817	HDEF_2198	HDEF_2199			FALSE	0.146	-85.000	0.000	NA		NA
7638818	7638819	HDEF_2200	HDEF_2201			TRUE	0.859	6.000	0.000	NA		NA
7638819	7638820	HDEF_2201	HDEF_2202			TRUE	0.506	55.000	0.000	NA		NA
7638820	7638821	HDEF_2202	HDEF_2203			TRUE	0.931	41.000	0.000	NA	Y	NA
7638821	7638822	HDEF_2203	HDEF_2204			TRUE	0.548	51.000	0.000	NA		NA
7638822	7638823	HDEF_2204	HDEF_2205			TRUE	0.990	2.000	0.167	NA		NA
7638823	7638824	HDEF_2205	HDEF_2206			TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7638824	7638825	HDEF_2206	HDEF_2207			TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7638825	7638826	HDEF_2207	HDEF_2208			TRUE	0.971	-3.000	0.059	NA		NA
7638826	7638827	HDEF_2208	HDEF_2209			TRUE	0.960	28.000	0.125	NA		NA
7638827	7638828	HDEF_2209	HDEF_2210			TRUE	0.894	0.000	0.000	NA		NA
7638828	7638829	HDEF_2210	HDEF_2211			TRUE	0.854	7.000	0.000	NA		NA
7638829	7638830	HDEF_2211	HDEF_2212			TRUE	0.894	2.000	0.000	NA		NA
7638830	7638831	HDEF_2212	HDEF_2213			FALSE	0.225	127.000	0.000	NA		NA
7638831	7638832	HDEF_2213	HDEF_2214			TRUE	0.996	-3.000	0.476	NA		NA
7638832	7638833	HDEF_2214	HDEF_2215			TRUE	0.628	42.000	0.000	NA		NA
7638833	7638834	HDEF_2215	HDEF_2216			TRUE	0.457	-18.000	0.000	NA		NA
7638834	7638835	HDEF_2216	HDEF_2217			TRUE	0.997	0.000	0.381	NA		NA
7638836	7638837	HDEF_2218	HDEF_2219			FALSE	0.216	135.000	0.000	NA		NA
7638838	7638839	HDEF_2220	HDEF_2221		gldA	FALSE	0.147	81.000	0.000	1.000		NA
7638840	7638841	HDEF_2222	HDEF_2223			FALSE	0.216	135.000	0.000	NA		NA
7638841	7638842	HDEF_2223	HDEF_2224			FALSE	0.161	171.000	0.000	NA		NA
7638842	7638843	HDEF_2224	HDEF_2225			TRUE	0.898	1.000	0.000	NA		NA
7638843	7638844	HDEF_2225	HDEF_2226			FALSE	0.032	473.000	0.000	NA		NA
7638844	7638845	HDEF_2226	HDEF_2227			FALSE	0.237	110.000	0.000	NA		NA
7638845	7638846	HDEF_2227	HDEF_2228			FALSE	0.159	-78.000	0.000	NA		NA
7638850	7638851	HDEF_2232	HDEF_2233	msrB_2		FALSE	0.037	427.000	0.000	NA		NA
7638855	7638856	HDEF_2237	HDEF_2238		aexT_2	TRUE	0.710	31.000	0.000	NA		NA
7638858	7638859	HDEF_2240	HDEF_2241			FALSE	0.050	358.000	0.000	NA		NA
7638859	7638860	HDEF_2241	HDEF_2242			TRUE	0.931	41.000	0.000	NA	Y	NA
7638860	7638861	HDEF_2242	HDEF_2243			FALSE	0.237	109.000	0.000	NA		NA
7638861	7638862	HDEF_2243	HDEF_2244		appA	TRUE	0.866	5.000	0.000	NA		NA
7638862	7638863	HDEF_2244	HDEF_2245	appA	ada	FALSE	0.093	147.000	0.000	1.000		NA
7638863	7638864	HDEF_2245	HDEF_2246	ada		FALSE	0.199	143.000	0.000	NA		NA
7638864	7638865	HDEF_2246	HDEF_2247		aspA	FALSE	0.077	267.000	0.000	NA		NA
7638866	7638867	HDEF_2248	HDEF_2249	ssaU	ssaT	TRUE	0.998	3.000	0.406	0.040	Y	NA
7638867	7638868	HDEF_2249	HDEF_2250	ssaT	ssaS	TRUE	0.999	2.000	0.516	0.040	Y	NA
7638868	7638869	HDEF_2250	HDEF_2251	ssaS	ssaR	TRUE	0.991	-3.000	0.136	0.011	Y	NA
7638869	7638870	HDEF_2251	HDEF_2252	ssaR	phoU	FALSE	0.368	143.000	0.000	NA	N	NA
7638870	7638871	HDEF_2252	HDEF_2253	phoU	ptsB	TRUE	0.998	14.000	0.317	NA	Y	NA
7638871	7638872	HDEF_2253	HDEF_2254	ptsB	pstA	TRUE	0.949	156.000	0.526	0.002	Y	NA
7638872	7638873	HDEF_2254	HDEF_2255	pstA	pstC	TRUE	0.999	1.000	0.537	0.002	Y	NA
7638873	7638874	HDEF_2255	HDEF_2256	pstC	pstS	TRUE	0.645	241.000	0.145	0.002	Y	NA
7638874	7638875	HDEF_2256	HDEF_2258	pstS		FALSE	0.404	65.000	0.000	NA		NA
7638878	7638879	HDEF_2260	HDEF_2261	pilM_4	pilN_5	TRUE	0.999	0.000	0.870	NA		NA
7638879	7638880	HDEF_2261	HDEF_2262	pilN_5		TRUE	0.982	12.000	0.174	NA		NA
7638880	7638881	HDEF_2262	HDEF_2263			TRUE	0.968	-7.000	0.167	NA		NA
7638881	7638882	HDEF_2263	HDEF_2264		hofQ	TRUE	0.898	47.000	0.072	NA		NA
7638883	7638884	HDEF_2265	HDEF_2266		rtxA_29	TRUE	0.814	12.000	0.000	NA		NA
7638884	7638885	HDEF_2266	HDEF_2267	rtxA_29	rtxA_28	TRUE	0.717	29.000	0.000	NA		NA
7638885	7638886	HDEF_2267	HDEF_2268	rtxA_28	rtxA_27	FALSE	0.186	-57.000	0.000	NA		NA
7638886	7638887	HDEF_2268	HDEF_2269	rtxA_27	osmY	FALSE	0.022	782.000	0.000	NA		NA
7638888	7638889	HDEF_2270	HDEF_2271			TRUE	0.993	8.000	0.281	NA		NA
7638889	7638890	HDEF_2271	HDEF_2272		yciL	TRUE	0.941	69.000	0.075	NA	Y	NA
7638890	7638891	HDEF_2272	HDEF_2273	yciL	prfC	FALSE	0.120	577.000	0.000	1.000	Y	NA
7638892	7638893	HDEF_2274	HDEF_2275	hemE	ompN	FALSE	0.227	164.000	0.000	1.000	N	NA
7638895	7638896	HDEF_2277	HDEF_2278			TRUE	0.477	-16.000	0.000	NA		NA
7638896	7638897	HDEF_2278	HDEF_2279			TRUE	0.894	0.000	0.000	NA		NA
7638897	7638898	HDEF_2279	HDEF_2281			TRUE	0.628	42.000	0.000	NA		NA
7638899	7638900	HDEF_2280	HDEF_2282			FALSE	0.109	217.000	0.000	NA		NA
7638900	7638901	HDEF_2282	HDEF_2283			FALSE	0.098	235.000	0.000	NA		NA
7638903	7638904	HDEF_2285	HDEF_2286		yfcH	FALSE	0.182	154.000	0.000	NA		NA
7638906	7638907	HDEF_2288	HDEF_2289	fldA	fur	TRUE	0.819	90.000	0.156	1.000	N	NA
7638907	7638908	HDEF_2289	HDEF_2290	fur		FALSE	0.057	200.000	0.000	1.000		NA
7638909	7638910	HDEF_2291	HDEF_2292		acpS	FALSE	0.217	134.000	0.000	NA		NA
7638910	7638911	HDEF_2292	HDEF_2293	acpS	pdxJ	TRUE	0.997	0.000	0.326	1.000	N	NA
7638913	7638914	HDEF_2295	HDEF_2296	rtxA_32	rtxA_31	FALSE	0.033	449.000	0.000	NA		NA
7638914	7638915	HDEF_2296	HDEF_2298	rtxA_31	rtxA_30	FALSE	0.165	167.000	0.000	NA		NA
7638916	7638917	HDEF_2297	HDEF_2299		ycbZ	FALSE	0.340	72.000	0.000	NA		NA
7638917	7638918	HDEF_2299	HDEF_2300	ycbZ	fabA	TRUE	0.946	71.000	0.290	1.000	N	NA
7638918	7638919	HDEF_2300	HDEF_2301	fabA	rsmC	TRUE	0.782	30.000	0.000	1.000	N	NA
7638919	7638920	HDEF_2301	HDEF_2302	rsmC		FALSE	0.237	110.000	0.000	NA		NA
7638920	7638921	HDEF_2302	HDEF_2303		rep	FALSE	0.236	116.000	0.000	NA		NA
7638921	7638922	HDEF_2303	HDEF_2304	rep	icdA	TRUE	0.448	70.000	0.000	1.000	N	NA
7638923	7638924	HDEF_2305	HDEF_2306		ftsX	FALSE	0.184	153.000	0.000	NA		NA
7638924	7638925	HDEF_2306	HDEF_2307	ftsX	ftsE	TRUE	0.920	-28.000	0.121	1.000	Y	NA
7638925	7638926	HDEF_2307	HDEF_2308	ftsE	ftsY	TRUE	0.974	-3.000	0.117	0.009	N	NA
7638929	7638930	HDEF_2311	HDEF_2312			FALSE	0.112	214.000	0.000	NA		NA
7638931	7638932	HDEF_2313	HDEF_2314			FALSE	0.237	106.000	0.000	NA		NA
7638932	7638933	HDEF_2314	HDEF_2315			FALSE	0.029	505.000	0.000	NA		NA
7638934	7638935	HDEF_2316	HDEF_2317	hepA	dfp	TRUE	0.671	46.000	0.000	1.000	N	NA
7638935	7638936	HDEF_2317	HDEF_2318	dfp	dut	TRUE	0.958	-13.000	0.201	1.000	N	NA
7638936	7638937	HDEF_2318	HDEF_2319	dut		FALSE	0.244	94.000	0.000	NA		NA
7638937	7638938	HDEF_2319	HDEF_2320			FALSE	0.268	-34.000	0.000	NA		NA
7638938	7638939	HDEF_2320	HDEF_2393			FALSE	0.252	-35.000	0.000	NA		NA
7638939	7638940	HDEF_2393	HDEF_2321			FALSE	0.083	-1764.000	0.000	NA		NA
7638940	7638941	HDEF_2321	HDEF_2322			TRUE	0.835	10.000	0.000	NA		NA
7638942	7638943	HDEF_2323	HDEF_2324	rplS	trmD	TRUE	0.990	67.000	0.567	1.000	Y	NA
7638943	7638944	HDEF_2324	HDEF_2325	trmD	rimM	TRUE	0.999	0.000	0.672	1.000	Y	NA
7638944	7638945	HDEF_2325	HDEF_2326	rimM	rpsP	TRUE	0.994	28.000	0.342	0.016	Y	NA
7638945	7638946	HDEF_2326	HDEF_2327	rpsP	ffh	TRUE	0.915	142.000	0.361	1.000	N	NA
7638947	7638948	HDEF_2328	HDEF_2329		corB	TRUE	0.981	44.000	0.349	NA		NA
7638948	7638949	HDEF_2329	HDEF_2330	corB		TRUE	0.671	39.000	0.000	NA		NA
7638950	7638951	HDEF_2331	HDEF_2332	gshA	rpmA	FALSE	0.309	104.000	0.000	1.000	N	NA
7638951	7638952	HDEF_2332	HDEF_2333	rpmA	rplU	TRUE	0.998	21.000	0.667	0.016	Y	NA
7638952	7638953	HDEF_2333	HDEF_2334	rplU	atpC	FALSE	0.102	280.000	0.000	1.000	N	NA
7638953	7638954	HDEF_2334	HDEF_2335	atpC	atpA	TRUE	0.998	25.000	0.837	0.004	Y	NA
7638954	7638955	HDEF_2335	HDEF_2336	atpA	atpG	TRUE	0.997	28.000	0.724	0.004	Y	NA
7638955	7638956	HDEF_2336	HDEF_2337	atpG	atpD	TRUE	0.996	41.000	0.846	0.004	Y	NA
7638956	7638957	HDEF_2337	HDEF_2338	atpD	atpH	TRUE	0.989	68.000	0.864	0.004	Y	NA
7638957	7638958	HDEF_2338	HDEF_2339	atpH	atpF	TRUE	0.993	15.000	0.242	0.004	Y	NA
7638958	7638959	HDEF_2339	HDEF_2340	atpF	atpE	TRUE	0.988	64.000	0.666	0.004	Y	NA
7638959	7638960	HDEF_2340	HDEF_2341	atpE	atpB	TRUE	0.971	87.000	0.557	0.004	Y	NA
7638960	7638961	HDEF_2341	HDEF_2342	atpB	gidB	FALSE	0.220	168.000	0.000	1.000	N	NA
7638961	7638962	HDEF_2342	HDEF_2343	gidB	gidA	TRUE	0.994	23.000	0.466	1.000	N	NA
7638962	7636598	HDEF_2343	HDEF_0001	gidA	mioC	FALSE	0.076	338.000	0.000	1.000	N	NA
7638963	7638964	HDEF_p0001	HDEF_p0004	repA		FALSE	0.021	1471.000	0.000	NA		NA
7638965	7638966	HDEF_p0005	HDEF_p0006	mutL		FALSE	0.090	242.000	0.000	NA		NA
7638967	7638968	HDEF_p0007	HDEF_p0008			FALSE	0.025	598.000	0.000	NA		NA
7638970	7638971	HDEF_p0010	HDEF_p0011			TRUE	0.994	-3.000	0.286	NA		NA
7638971	7638972	HDEF_p0011	HDEF_p0012		mobB	FALSE	0.021	1170.000	0.000	NA		NA
7638972	7638973	HDEF_p0012	HDEF_p0013	mobB	mobA	TRUE	0.875	4.000	0.000	NA		NA
7638973	7638974	HDEF_p0013	HDEF_p0014	mobA	hu	FALSE	0.221	131.000	0.000	NA		NA
7638975	7638976	HDEF_p0015	HDEF_p0016		trbC	FALSE	0.023	721.000	0.000	NA		NA
7638976	7638977	HDEF_p0016	HDEF_p0018	trbC	trbB	FALSE	0.020	3576.000	0.000	NA		NA
7638977	7638978	HDEF_p0018	HDEF_p0019	trbB	trbA	FALSE	0.317	76.000	0.000	NA		NA
7638979	7638980	HDEF_p0020	HDEF_p0021			TRUE	0.911	76.000	0.250	NA		NA
7638981	7638982	HDEF_p0022	HDEF_p0023		traY	TRUE	0.495	56.000	0.000	NA		NA
7638982	7638983	HDEF_p0023	HDEF_p0024	traY	traX	FALSE	0.238	102.000	0.000	NA		NA
7638983	7638984	HDEF_p0024	HDEF_p0025	traX	traW	TRUE	0.721	-7.000	0.000	NA		NA
7638984	7638985	HDEF_p0025	HDEF_p0027	traW	traU	TRUE	0.782	16.000	0.000	NA		NA
7638986	7638987	HDEF_p0026	HDEF_p0028			TRUE	0.993	15.000	0.400	NA		NA
7638988	7638989	HDEF_p0029	HDEF_p0030	traT	traR	TRUE	0.714	30.000	0.000	NA		NA
7638989	7638990	HDEF_p0030	HDEF_p0031	traR	traQ	TRUE	0.575	48.000	0.000	NA		NA
7638990	7638991	HDEF_p0031	HDEF_p0032	traQ	traP	TRUE	0.796	14.000	0.000	NA		NA
7638991	7638992	HDEF_p0032	HDEF_p0033	traP	traO	FALSE	0.135	-124.000	0.000	NA		NA
7638992	7638993	HDEF_p0033	HDEF_p0034	traO	traN	TRUE	0.875	4.000	0.000	NA		NA
7638993	7638994	HDEF_p0034	HDEF_p0035	traN	traM	TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7638994	7638995	HDEF_p0035	HDEF_p0036	traM	traL	TRUE	0.737	25.000	0.000	NA		NA
7638995	7638996	HDEF_p0036	HDEF_p0037	traL	traC	TRUE	0.526	53.000	0.000	NA		NA
7638996	7638997	HDEF_p0037	HDEF_p0038	traC	traK	TRUE	0.789	15.000	0.000	NA		NA
7638997	7638998	HDEF_p0038	HDEF_p0039	traK	traJ	TRUE	0.437	62.000	0.000	NA		NA
7638998	7638999	HDEF_p0039	HDEF_p0041	traJ	traI	TRUE	0.550	-13.000	0.000	NA		NA
7638999	7639000	HDEF_p0041	HDEF_p0040	traI	traH	TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		NA
7639000	7639001	HDEF_p0040	HDEF_p0042	traH	pilT	FALSE	0.377	68.000	0.000	NA		NA
7639001	7639002	HDEF_p0042	HDEF_p0043	pilT		FALSE	0.404	43.000	0.000	1.000		NA
7639002	7639003	HDEF_p0043	HDEF_p0044		pilM	TRUE	0.998	-3.000	0.750	NA		NA
7639003	7639004	HDEF_p0044	HDEF_p0045	pilM	pilV	TRUE	0.559	50.000	0.000	NA		NA
7639004	7639005	HDEF_p0045	HDEF_p0046	pilV	pilS2	FALSE	0.205	141.000	0.000	NA		NA
7639005	7639006	HDEF_p0046	HDEF_p0047	pilS2	pilR	TRUE	0.997	11.000	0.600	NA		NA
7639006	7639007	HDEF_p0047	HDEF_p0048	pilR	pilQ	TRUE	0.996	-13.000	0.600	NA	Y	NA
7639007	7639008	HDEF_p0048	HDEF_p0049	pilQ	pilP	TRUE	0.998	-3.000	0.750	NA		NA
7639008	7639009	HDEF_p0049	HDEF_p0050	pilP	pilO	TRUE	0.989	-13.000	0.750	NA		NA
7639010	7639011	HDEF_p0051	HDEF_p0052			TRUE	0.960	-25.000	0.500	NA		NA
7639012	7639013	HDEF_p0053	HDEF_p0054	pilN	pilL	TRUE	0.994	-3.000	0.300	NA		NA
7639013	7639014	HDEF_p0054	HDEF_p0055	pilL	rfaH	FALSE	0.063	305.000	0.000	NA		NA
7639014	7639015	HDEF_p0055	HDEF_p0056	rfaH		FALSE	0.001	483.000	0.000	0.024		NA
7639015	7639016	HDEF_p0056	HDEF_p0057			FALSE	0.072	34.000	0.000	0.015		NA
7639016	7639017	HDEF_p0057	HDEF_p0058			FALSE	0.113	213.000	0.000	NA		NA