MicrobesOnline Operon Predictions for Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
7603398	7603399	JTY_0001	JTY_0002	dnaA	dnaN	FALSE	0.086	528.000	0.328	1.000	Y	NA
7603399	7603400	JTY_0002	JTY_0003	dnaN	recF	TRUE	0.933	20.000	0.318	1.000	Y	NA
7603400	7603401	JTY_0003	JTY_0004	recF		TRUE	0.956	-3.000	0.099	NA		NA
7603401	7603402	JTY_0004	JTY_0005		gyrB	FALSE	0.114	126.000	0.022	NA		NA
7603402	7603403	JTY_0005	JTY_0006	gyrB	gyrA	TRUE	0.951	35.000	0.306	0.001	Y	NA
7603403	7603404	JTY_0006	JTY_0007	gyrA		FALSE	0.171	96.000	0.009	NA		NA
7603404	7603405	JTY_0007	JTY_t0001		ileT	FALSE	0.153	59.000	0.000	NA		NA
7603405	7603406	JTY_t0001	JTY_t0002	ileT	alaT	FALSE	0.041	152.000	0.000	NA		NA
7603409	7603410	JTY_0010	JTY_0011			FALSE	0.124	156.000	0.181	NA		NA
7603411	7603412	JTY_0012	JTY_0013		trpG	FALSE	0.372	37.000	0.098	NA		NA
7603413	7603414	JTY_0014	JTY_0015	pknB	pknA	TRUE	0.999	-3.000	0.426	0.005	Y	NA
7603414	7603415	JTY_0015	JTY_0016	pknA	pbpA	TRUE	0.989	-3.000	0.574	1.000	N	NA
7603415	7603416	JTY_0016	JTY_0017	pbpA	rodA	TRUE	0.970	-3.000	0.250	1.000	N	NA
7603416	7603417	JTY_0017	JTY_0018	rodA	ppp	TRUE	0.951	-3.000	0.145	1.000	N	NA
7603417	7603418	JTY_0018	JTY_0019	ppp		TRUE	0.747	89.000	0.216	NA	Y	NA
7603418	7603419	JTY_0019	JTY_0020		TB39.8	FALSE	0.154	124.000	0.069	NA		NA
7603421	7603422	JTY_0021	JTY_0022		whiB5	FALSE	0.082	142.000	0.000	1.000		NA
7603423	7603424	JTY_0023	JTY_0024			TRUE	0.991	-3.000	0.600	NA		NA
7603424	7603425	JTY_0024	JTY_0025			FALSE	0.181	-258.000	0.000	NA		NA
7603425	7603426	JTY_0025	JTY_0026			FALSE	0.179	38.000	0.000	NA		NA
7603426	7603427	JTY_0026	JTY_0027			TRUE	0.680	115.000	1.000	NA		NA
7603427	7603428	JTY_0027	JTY_0028			TRUE	0.737	38.000	0.600	NA		NA
7603428	7603429	JTY_0028	JTY_0029			TRUE	0.973	8.000	0.800	NA		NA
7603429	7603430	JTY_0029	JTY_0030			FALSE	0.012	238.000	0.000	NA		NA
7603430	7603431	JTY_0030	JTY_0031			TRUE	0.801	70.000	1.000	NA		NA
7603431	7603432	JTY_0031	JTY_0032			FALSE	0.211	29.000	0.000	NA		NA
7603432	7603433	JTY_0032	JTY_0033		bioF2	FALSE	0.003	501.000	0.000	NA		NA
7603433	7603434	JTY_0033	JTY_0034	bioF2	acpA	TRUE	0.807	-3.000	0.000	1.000	N	NA
7603434	7603435	JTY_0034	JTY_0035	acpA		TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7603435	7603436	JTY_0035	JTY_0036		fadD34	TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7603437	7603438	JTY_0037	JTY_0038			FALSE	0.396	48.000	0.174	NA		NA
7603440	7603441	JTY_0040	JTY_0041		mtc28	TRUE	0.769	82.000	0.875	NA		NA
7603443	7603444	JTY_0043	JTY_0044			FALSE	0.487	159.000	0.000	0.036	Y	NA
7603444	7603445	JTY_0044	JTY_0045			FALSE	0.264	133.000	0.412	NA	N	NA
7603445	7603446	JTY_0045	JTY_0046			TRUE	0.728	16.000	0.235	NA		NA
7603446	7603447	JTY_0046	JTY_0047		ino1	FALSE	0.259	82.000	0.059	NA		NA
7603447	7603448	JTY_0047	JTY_0048	ino1		TRUE	0.623	61.000	0.608	NA	N	NA
7603448	7603449	JTY_0048	JTY_0049			FALSE	0.264	101.000	0.122	NA		NA
7603450	7603451	JTY_0050	JTY_0051		ponA1	FALSE	0.014	419.000	0.200	NA		NA
7603451	7603452	JTY_0051	JTY_0052	ponA1		TRUE	0.970	-3.000	0.204	NA		NA
7603452	7603453	JTY_0052	JTY_0053			FALSE	0.357	32.000	0.061	NA		NA
7603453	7603454	JTY_0053	JTY_0054		rpsF	FALSE	0.021	219.000	0.002	NA		NA
7603454	7603455	JTY_0054	JTY_0055	rpsF	ssb	FALSE	0.131	104.000	0.029	1.000	N	NA
7603455	7603456	JTY_0055	JTY_0056	ssb	rpsR1	FALSE	0.207	42.000	0.030	1.000	N	NA
7603456	7603457	JTY_0056	JTY_0057	rpsR1	rplI	TRUE	0.955	33.000	0.499	0.018	Y	NA
7603457	7603458	JTY_0057	JTY_0058	rplI		FALSE	0.211	29.000	0.000	NA		NA
7603458	7603459	JTY_0058	JTY_0059		dnaB	FALSE	0.302	-21.000	0.000	NA		NA
7603459	7603460	JTY_0059	JTY_0060	dnaB		FALSE	0.027	180.000	0.000	NA		NA
7603460	7603461	JTY_0060	JTY_0061			TRUE	0.768	17.000	0.317	NA		NA
7603461	7603462	JTY_0061	JTY_0062			FALSE	0.254	24.000	0.000	NA		NA
7603462	7603463	JTY_0062	JTY_0063		celA1	FALSE	0.055	136.000	0.000	NA		NA
7603463	7603464	JTY_0063	JTY_0064	celA1		FALSE	0.007	229.000	0.000	1.000	N	NA
7603464	7603465	JTY_0064	JTY_0065			FALSE	0.017	258.000	0.000	1.000		NA
7603465	7603466	JTY_0065	JTY_0066			FALSE	0.228	67.000	0.000	1.000		NA
7603466	7603467	JTY_0066	JTY_0067			FALSE	0.483	-7.000	0.000	NA		NA
7603468	7603469	JTY_0068	JTY_0069	icd2		FALSE	0.041	118.000	0.000	1.000	N	NA
7603471	7603472	JTY_0071	JTY_0072	sdaA	glyA2	TRUE	0.994	-3.000	0.118	1.000	Y	NA
7603473	7603474	JTY_0073	JTY_0074			FALSE	0.002	431.000	0.000	1.000	N	NA
7603474	7603475	JTY_0074	JTY_0075			TRUE	0.989	3.000	1.000	1.000	N	NA
7603475	7603476	JTY_0075	JTY_0076			FALSE	0.076	80.000	0.000	1.000	N	NA
7603476	7603477	JTY_0076	JTY_0077			FALSE	0.287	13.000	0.000	1.000	N	NA
7603478	7603479	JTY_0078	JTY_0079			FALSE	0.147	64.000	0.000	NA		NA
7603481	7603482	JTY_0081	JTY_0082			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7603483	7603484	JTY_0083	JTY_0084			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7603484	7603485	JTY_0084	JTY_0085			FALSE	0.194	95.000	0.000	1.000		NA
7603485	7603486	JTY_0085	JTY_0086			TRUE	0.815	5.000	0.043	1.000	N	NA
7603486	7603487	JTY_0086	JTY_0087			TRUE	0.997	-3.000	0.085	0.008	Y	NA
7603487	7603488	JTY_0087	JTY_0088		hycD	TRUE	0.996	0.000	0.398	1.000	Y	NA
7603488	7603489	JTY_0088	JTY_0089	hycD	hycP	TRUE	0.985	11.000	0.679	NA	Y	NA
7603489	7603490	JTY_0089	JTY_0090	hycP	hycQ	TRUE	0.998	0.000	0.864	NA	Y	NA
7603490	7603491	JTY_0090	JTY_0091	hycQ	hycE	TRUE	0.999	-3.000	0.659	0.008	Y	NA
7603491	7603492	JTY_0091	JTY_0092	hycE		FALSE	0.186	35.000	0.000	NA		NA
7603492	7603493	JTY_0092	JTY_0093			FALSE	0.038	157.000	0.000	NA		NA
7603493	7603494	JTY_0093	JTY_0094			FALSE	0.066	129.000	0.000	NA		NA
7603494	7603495	JTY_0094	JTY_0095		mtn	FALSE	0.003	434.000	0.000	NA		NA
7603495	7603496	JTY_0095	JTY_0096	mtn	ctpA	FALSE	0.033	132.000	0.000	1.000	N	NA
7603497	7603498	JTY_0097	JTY_0098			FALSE	0.162	47.000	0.000	NA		NA
7603498	7603499	JTY_0098	JTY_0099			FALSE	0.187	-229.000	0.000	NA		NA
7603500	7603501	JTY_0100	JTY_0101	PPE1		FALSE	0.436	19.000	0.167	NA	N	NA
7603501	7603502	JTY_0101	JTY_0102			TRUE	0.989	-3.000	0.500	NA		NA
7603502	7603503	JTY_0102	JTY_0103		fadD10	TRUE	0.966	5.000	0.444	NA		NA
7603503	7603504	JTY_0103	JTY_0104	fadD10		TRUE	0.986	5.000	0.800	1.000		NA
7603504	7603505	JTY_0104	JTY_0105		nrp	TRUE	0.817	-18.000	0.364	1.000		NA
7603505	7603506	JTY_0105	JTY_0106	nrp		FALSE	0.029	175.000	0.000	NA		NA
7603511	7603512	JTY_0111	JTY_0112	ctpI		FALSE	0.005	354.000	0.000	NA		NA
7603513	7603514	JTY_0113	JTY_0114	PE_PGRS1		FALSE	0.106	148.000	0.091	NA		NA
7603514	7603515	JTY_0114	JTY_0115			FALSE	0.045	181.000	0.000	1.000		NA
7603515	7603516	JTY_0115	JTY_0116		gca	FALSE	0.004	282.000	0.000	1.000	N	NA
7603516	7603517	JTY_0116	JTY_0117	gca	gmhA	FALSE	0.078	74.000	0.000	1.000	N	NA
7603517	7603518	JTY_0117	JTY_0118	gmhA		FALSE	0.111	32.000	0.000	1.000	N	NA
7603518	7603519	JTY_0118	JTY_0119			TRUE	0.927	0.000	0.000	1.000		NA
7603524	7603525	JTY_0124	JTY_0125	fusA2b		FALSE	0.121	136.000	0.009	1.000		NA
7603526	7603527	JTY_0126	JTY_0127			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7603527	7603528	JTY_0127	JTY_0128		PE_PGRS2	FALSE	0.006	309.000	0.000	NA		NA
7603528	7603529	JTY_0128	JTY_0129	PE_PGRS2	pepA	FALSE	0.041	152.000	0.000	NA		NA
7603529	7603530	JTY_0129	JTY_0130	pepA	treS	FALSE	0.096	109.000	0.013	1.000	N	NA
7603530	7603531	JTY_0130	JTY_0131	treS		TRUE	0.645	103.000	0.071	NA	Y	NA
7603531	7603532	JTY_0131	JTY_0132			FALSE	0.333	68.000	0.136	NA		NA
7603535	7603536	JTY_0135	JTY_0136	fadE1	fgd2	FALSE	0.416	42.000	0.286	NA	N	NA
7603537	7603538	JTY_0137	JTY_0138			FALSE	0.004	420.000	0.000	NA		NA
7603538	7603539	JTY_0138	JTY_0139			TRUE	0.880	0.000	0.000	NA		NA
7603539	7603540	JTY_0139	JTY_0140			TRUE	0.836	2.000	0.000	NA		NA
7603544	7603545	JTY_0144	JTY_0145			TRUE	0.985	1.000	0.538	NA		NA
7603545	7603546	JTY_0145	JTY_0146			FALSE	0.253	61.000	0.034	NA		NA
7603550	7603551	JTY_0150	JTY_0151			FALSE	0.550	89.000	0.571	NA	N	NA
7603551	7603552	JTY_0151	JTY_0152			TRUE	0.901	43.000	0.556	NA	Y	NA
7603552	7603553	JTY_0152	JTY_0153			FALSE	0.463	95.000	0.444	NA	N	NA
7603553	7603554	JTY_0153	JTY_0154			TRUE	0.755	75.000	0.875	1.000	N	NA
7603554	7603555	JTY_0154	JTY_0155			TRUE	0.968	7.000	0.700	1.000	N	NA
7603556	7603557	JTY_0156	JTY_0157		PE1	FALSE	0.003	591.000	0.000	NA		NA
7603557	7603558	JTY_0157	JTY_0158	PE1	PE2	TRUE	0.599	10.000	0.000	NA		NA
7603558	7603559	JTY_0158	JTY_0159	PE2	ptbB	FALSE	0.010	259.000	0.000	NA		NA
7603559	7603560	JTY_0159	JTY_0160	ptbB	fadE2	TRUE	0.948	2.000	0.226	1.000	N	NA
7603561	7603562	JTY_0161	JTY_0162	pntAa	pntAb	TRUE	0.997	1.000	0.829	0.001		NA
7603562	7603563	JTY_0162	JTY_0163	pntAb	pntB	TRUE	0.995	-3.000	0.321	0.001		NA
7603563	7603564	JTY_0163	JTY_0164	pntB		FALSE	0.003	306.000	0.000	1.000	N	NA
7603565	7603566	JTY_0165	JTY_0166	PE3	PE4	FALSE	0.124	92.000	0.000	NA		NA
7603569	7603570	JTY_0169	JTY_0170		TB18.5	FALSE	0.240	54.000	0.020	NA		NA
7603572	7603573	JTY_0172	JTY_0173	fadD5	yrbE1A	FALSE	0.166	204.000	0.000	NA	Y	NA
7603573	7603574	JTY_0173	JTY_0174	yrbE1A	yrbE1B	TRUE	0.998	2.000	1.000	NA	Y	NA
7603574	7603575	JTY_0174	JTY_0175	yrbE1B	mce1A	TRUE	0.996	5.000	1.000	NA	Y	NA
7603575	7603576	JTY_0175	JTY_0176	mce1A	mce1B	TRUE	0.999	-3.000	0.500	0.008	Y	NA
7603576	7603577	JTY_0176	JTY_0177	mce1B	mce1C	TRUE	0.999	-3.000	1.000	0.008	Y	NA
7603577	7603578	JTY_0177	JTY_0178	mce1C	mce1D	TRUE	0.999	-3.000	1.000	0.008	Y	NA
7603578	7603579	JTY_0178	JTY_0179	mce1D	lprK	TRUE	0.999	-3.000	0.500	0.008	Y	NA
7603579	7603580	JTY_0179	JTY_0180	lprK	mce1F	TRUE	0.995	-6.000	0.800	0.008	Y	NA
7603580	7603581	JTY_0180	JTY_0181	mce1F		FALSE	0.560	36.000	0.286	NA		NA
7603581	7603582	JTY_0181	JTY_0182			TRUE	0.993	-3.000	0.750	NA		NA
7603582	7603583	JTY_0182	JTY_0183			TRUE	0.995	-3.000	1.000	NA		NA
7603583	7603584	JTY_0183	JTY_0184			TRUE	0.885	-33.000	1.000	NA		NA
7603585	7603586	JTY_0185	JTY_0186	lprO		FALSE	0.520	80.000	0.333	NA		NA
7603586	7603587	JTY_0186	JTY_0187			FALSE	0.221	27.000	0.000	NA		NA
7603587	7603588	JTY_0187	JTY_0188		sigG	FALSE	0.343	17.000	0.000	NA		NA
7603589	7603590	JTY_0189	JTY_0190			FALSE	0.327	42.000	0.068	NA		NA
7603590	7603591	JTY_0190	JTY_0191			TRUE	0.991	-3.000	0.600	NA		NA
7603591	7603592	JTY_0191	JTY_0192		bglS	FALSE	0.510	45.000	0.273	NA		NA
7603592	7603593	JTY_0192	JTY_0193	bglS		FALSE	0.008	361.000	0.000	1.000		NA
7603593	7603594	JTY_0193	JTY_0194			FALSE	0.075	119.000	0.000	NA		NA
7603596	7603597	JTY_0196	JTY_0197			FALSE	0.172	128.000	0.125	NA		NA
7603597	7603598	JTY_0197	JTY_0198			FALSE	0.556	77.000	0.375	NA		NA
7603600	7603601	JTY_0200	JTY_0201			FALSE	0.002	438.000	0.000	1.000	N	NA
7603601	7603602	JTY_0201	JTY_0202			FALSE	0.328	113.000	0.000	0.058		NA
7603602	7603603	JTY_0202	JTY_0203			TRUE	0.981	0.000	0.276	1.000		NA
7603605	7603606	JTY_0205	JTY_0206			TRUE	0.995	-3.000	1.000	NA		NA
7603607	7603608	JTY_0207	JTY_0208		mmpL11	TRUE	0.994	-3.000	0.750	1.000		NA
7603612	7603613	JTY_0212	JTY_0213	mmpL3		FALSE	0.416	66.000	0.217	NA		NA
7603613	7603614	JTY_0213	JTY_0214			TRUE	0.897	3.000	0.040	NA		NA
7603615	7603616	JTY_0215	JTY_0216			TRUE	0.989	-3.000	0.529	NA		NA
7603616	7603617	JTY_0216	JTY_0217		pckA	FALSE	0.044	184.000	0.026	NA		NA
7603618	7603619	JTY_0218	JTY_0219	nadR		TRUE	0.807	-3.000	0.000	1.000	N	NA
7603624	7603625	JTY_0224	JTY_0225			TRUE	0.965	2.000	0.273	NA		NA
7603625	7603626	JTY_0225	JTY_0226		lipC	TRUE	0.841	10.000	0.182	NA		NA
7603626	7603627	JTY_0226	JTY_0227	lipC		TRUE	0.944	14.000	1.000	NA		NA
7603628	7603629	JTY_0228	JTY_0229			TRUE	0.978	-3.000	0.000	0.051		NA
7603629	7603630	JTY_0229	JTY_0230			FALSE	0.328	99.000	0.104	1.000		NA
7603632	7603633	JTY_0232	JTY_0233			TRUE	0.885	10.000	0.265	NA		NA
7603635	7603636	JTY_0235	JTY_0236		php	TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7603637	7603638	JTY_0237	JTY_0238	fadE4		FALSE	0.195	135.000	0.250	1.000	N	NA
7603638	7603639	JTY_0238	JTY_0239		nrdB	TRUE	0.980	-3.000	0.357	1.000	N	NA
7603640	7603641	JTY_0240	JTY_0241	gabD1		FALSE	0.231	26.000	0.000	NA		NA
7603641	7603642	JTY_0241	JTY_0242			FALSE	0.329	35.000	0.053	NA		NA
7603642	7603643	JTY_0242	JTY_0243			TRUE	0.686	47.000	0.526	NA		NA
7603644	7603645	JTY_0244	JTY_0245	lpqI		FALSE	0.318	76.000	0.185	1.000	N	NA
7603645	7603646	JTY_0245	JTY_0246			FALSE	0.150	62.000	0.000	NA		NA
7603646	7603647	JTY_0246	JTY_0247			TRUE	0.658	8.000	0.000	NA		NA
7603648	7603649	JTY_0248	JTY_0249		fabG4	TRUE	0.979	11.000	0.412	1.000	Y	NA
7603652	7603653	JTY_0252	JTY_0253			FALSE	0.006	316.000	0.000	NA		NA
7603654	7603655	JTY_0254	JTY_0255		sdhA	TRUE	0.999	1.000	0.826	0.006	Y	NA
7603655	7603656	JTY_0255	JTY_0256	sdhA		TRUE	0.841	31.000	0.860	NA		NA
7603656	7603657	JTY_0256	JTY_0257			FALSE	0.353	80.000	0.171	NA		NA
7603657	7603658	JTY_0257	JTY_0258		hsp	FALSE	0.112	145.000	0.091	NA		NA
7603659	7603660	JTY_0259	JTY_0260	nirB	nirD	TRUE	0.832	26.000	0.286	0.001	N	NA
7603661	7603662	JTY_0261	JTY_0262	cobU	cobQ1	TRUE	0.837	25.000	0.031	1.000	Y	NA
7603662	7603663	JTY_0262	JTY_0263	cobQ1	PPE2	FALSE	0.029	19.000	0.000	NA	N	NA
7603665	7603666	JTY_0265	JTY_0266			FALSE	0.522	25.000	0.071	1.000		NA
7603666	7603667	JTY_0266	JTY_0267			TRUE	0.974	-3.000	0.173	1.000		NA
7603667	7603668	JTY_0267	JTY_0268		narK3	FALSE	0.008	100.000	0.000	NA	N	NA
7603668	7603669	JTY_0268	JTY_0269	narK3	aac	FALSE	0.050	141.000	0.000	NA		NA
7603669	7603670	JTY_0269	JTY_0270	aac		TRUE	0.800	10.000	0.101	NA		NA
7603670	7603671	JTY_0270	JTY_0271			TRUE	0.959	17.000	0.551	NA	Y	NA
7603671	7603672	JTY_0271	JTY_0272			FALSE	0.169	96.000	0.050	1.000	N	NA
7603672	7603673	JTY_0272	JTY_0273		oplA	FALSE	0.165	22.000	0.000	1.000	N	NA
7603675	7603676	JTY_0275	JTY_0276			FALSE	0.011	65.000	0.000	NA	N	NA
7603678	7603679	JTY_0278	JTY_0279	fadE6		FALSE	0.083	114.000	0.000	NA		NA
7603679	7603680	JTY_0279	JTY_0280			TRUE	0.982	-3.000	0.333	NA		NA
7603684	7603685	JTY_0284	JTY_0285			FALSE	0.254	24.000	0.000	NA		NA
7603685	7603686	JTY_0285	JTY_0286		PE_PGRS3b	FALSE	0.300	20.000	0.000	NA		NA
7603686	7603687	JTY_0286	JTY_0287	PE_PGRS3b	PE_PGRS3a	FALSE	0.196	-177.000	0.000	NA		NA
7603687	7603688	JTY_0287	JTY_0288	PE_PGRS3a	PE_PGRS3	FALSE	0.010	264.000	0.000	NA		NA
7603688	7603689	JTY_0288	JTY_0289	PE_PGRS3	PE_PGRS4	FALSE	0.011	250.000	0.000	NA		NA
7603690	7603691	JTY_0290	JTY_0291	PPE3		TRUE	0.783	24.000	0.667	NA	N	NA
7603691	7603692	JTY_0291	JTY_0292			FALSE	0.015	224.000	0.000	NA		NA
7603692	7603693	JTY_0292	JTY_0293			TRUE	0.995	-3.000	1.000	NA		NA
7603693	7603694	JTY_0293	JTY_0294			TRUE	0.993	-3.000	0.750	NA		NA
7603694	7603695	JTY_0294	JTY_0295		PE5	TRUE	0.982	-3.000	0.333	NA		NA
7603695	7603696	JTY_0295	JTY_0296	PE5	PPE4	TRUE	0.979	3.000	0.500	NA		NA
7603696	7603697	JTY_0296	JTY_0297	PPE4	esxG	FALSE	0.159	49.000	0.000	NA		NA
7603697	7603698	JTY_0297	JTY_0298	esxG	esxH	FALSE	0.207	30.000	0.000	NA		NA
7603698	7603699	JTY_0298	JTY_0299	esxH		FALSE	0.542	11.000	0.000	NA		NA
7603699	7603700	JTY_0299	JTY_0300			TRUE	0.792	47.000	0.818	NA		NA
7603700	7603701	JTY_0300	JTY_0301			TRUE	0.990	-3.000	0.556	NA		NA
7603701	7603702	JTY_0301	JTY_0302			TRUE	0.990	-3.000	0.556	NA		NA
7603705	7603706	JTY_0305	JTY_0306			TRUE	0.807	10.000	0.118	NA		NA
7603707	7603708	JTY_0307	JTY_0308	PE_PGRS5		FALSE	0.048	143.000	0.000	NA		NA
7603708	7603709	JTY_0308	JTY_0309			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7603709	7603710	JTY_0309	JTY_0310			FALSE	0.161	48.000	0.000	NA		NA
7603710	7603711	JTY_0310	JTY_0311			TRUE	0.987	-3.000	0.444	NA		NA
7603711	7603712	JTY_0311	JTY_0312			FALSE	0.054	137.000	0.000	NA		NA
7603712	7603713	JTY_0312	JTY_0313			TRUE	0.807	-3.000	0.000	1.000	N	NA
7603714	7603715	JTY_0314	JTY_0315	PPE5	PPE6	FALSE	0.340	144.000	0.000	NA	Y	NA
7603718	7603719	JTY_0318	JTY_0319			FALSE	0.226	102.000	0.067	NA		NA
7603721	7603722	JTY_0321	JTY_0322			FALSE	0.217	155.000	0.333	NA		NA
7603722	7603723	JTY_0322	JTY_0323			FALSE	0.143	72.000	0.000	NA		NA
7603725	7603726	JTY_0325	JTY_0326			FALSE	0.468	49.000	0.286	1.000	N	NA
7603727	7603728	JTY_0327	JTY_t0004	glpQ2	glyU	FALSE	0.010	261.000	0.000	NA		NA
7603728	7603729	JTY_t0004	JTY_0328	glyU		FALSE	0.201	31.000	0.000	NA		NA
7603730	7603731	JTY_0329	JTY_0330	pcp		FALSE	0.143	72.000	0.000	NA		NA
7603731	7603732	JTY_0330	JTY_0331		dcd	FALSE	0.267	32.000	0.007	NA		NA
7603732	7603733	JTY_0331	JTY_0332	dcd	udgA	FALSE	0.054	106.000	0.000	1.000	N	NA
7603735	7603736	JTY_0334	JTY_0335			TRUE	0.792	7.000	0.000	1.000		NA
7603739	7603740	JTY_0338	JTY_0339			FALSE	0.331	27.000	0.000	1.000		NA
7603741	7603742	JTY_0340	JTY_0341			FALSE	0.142	75.000	0.000	NA		NA
7603742	7603743	JTY_0341	JTY_0342			TRUE	0.680	27.000	0.368	NA		NA
7603743	7603744	JTY_0342	JTY_0343		rmlA	TRUE	0.581	30.000	0.273	NA		NA
7603747	7603748	JTY_0346	JTY_0347	aspC		FALSE	0.227	31.000	0.023	1.000	N	NA
7603748	7603749	JTY_0347	JTY_0348			FALSE	0.140	109.000	0.057	1.000	N	NA
7603750	7603751	JTY_0349	JTY_0350		iniB	FALSE	0.118	189.000	0.286	NA		NA
7603751	7603752	JTY_0350	JTY_0351	iniB	iniA	TRUE	0.703	37.000	0.500	NA		NA
7603752	7603753	JTY_0351	JTY_0352	iniA	iniC	TRUE	0.996	-3.000	0.583	0.007		NA
7603757	7603758	JTY_0356	JTY_0357			TRUE	0.815	3.000	0.000	NA		NA
7603758	7603759	JTY_0357	JTY_0358			TRUE	0.815	3.000	0.000	NA		NA
7603759	7603760	JTY_0358	JTY_0359		dnaK	FALSE	0.014	227.000	0.000	NA		NA
7603760	7603761	JTY_0359	JTY_0360	dnaK	grpE	TRUE	0.997	-3.000	0.074	0.004	Y	NA
7603761	7603762	JTY_0360	JTY_0361	grpE	dnaJ1	TRUE	0.905	36.000	0.068	0.004	Y	NA
7603762	7603763	JTY_0361	JTY_0362	dnaJ1	hspR	TRUE	0.930	0.000	0.074	1.000	N	NA
7603764	7603765	JTY_0363	JTY_0364	PPE8		FALSE	0.042	151.000	0.000	NA		NA
7603765	7603766	JTY_0364	JTY_0365		purA	TRUE	0.946	-3.000	0.052	NA		NA
7603767	7603768	JTY_0366	JTY_0367			TRUE	0.668	11.000	0.020	NA		NA
7603770	7603771	JTY_0369	JTY_0370		mgtE	FALSE	0.015	222.000	0.000	NA		NA
7603774	7603775	JTY_0373	JTY_0374			FALSE	0.358	25.000	0.000	1.000		NA
7603775	7603776	JTY_0374	JTY_0375			FALSE	0.211	29.000	0.000	NA		NA
7603776	7603777	JTY_0375	JTY_0376			FALSE	0.137	81.000	0.000	NA		NA
7603777	7603778	JTY_0376	JTY_0377			TRUE	0.911	6.000	0.208	NA		NA
7603778	7603779	JTY_0377	JTY_0378			FALSE	0.382	101.000	0.250	NA		NA
7603779	7603780	JTY_0378	JTY_0379			TRUE	0.969	-3.000	0.200	NA		NA
7603780	7603781	JTY_0379	JTY_0380			TRUE	0.982	-3.000	0.333	NA		NA
7603781	7603782	JTY_0380	JTY_0381			TRUE	0.849	19.000	0.750	NA	N	NA
7603782	7603783	JTY_0381	JTY_0382			TRUE	0.999	-3.000	0.818	0.001	Y	NA
7603783	7603784	JTY_0382	JTY_0383			TRUE	0.993	15.000	0.909	0.001	Y	NA
7603784	7603785	JTY_0383	JTY_0384			FALSE	0.324	76.000	0.250	NA	N	NA
7603786	7603787	JTY_0385	JTY_0386			FALSE	0.011	251.000	0.000	NA		NA
7603787	7603788	JTY_0386	JTY_0387		secE2	FALSE	0.075	119.000	0.000	NA		NA
7603789	7603790	JTY_0388	JTY_0389			FALSE	0.230	96.000	0.055	NA		NA
7603790	7603791	JTY_0389	JTY_0390		pyrE	FALSE	0.429	18.000	0.012	NA		NA
7603791	7603792	JTY_0390	JTY_0391	pyrE		FALSE	0.189	81.000	0.006	NA		NA
7603792	7603793	JTY_0391	JTY_0392		clpB	FALSE	0.074	141.000	0.009	NA		NA
7603794	7603795	JTY_0393	JTY_0394			FALSE	0.058	104.000	0.000	1.000	N	NA
7603797	7603798	JTY_0396	JTY_0397	purT		TRUE	0.796	-3.000	0.019	NA	N	NA
7603798	7603799	JTY_0397	JTY_0398		metZ	TRUE	0.906	-3.000	0.092	NA	N	NA
7603803	7603804	JTY_0402	JTY_0403			TRUE	0.718	6.000	0.000	NA		NA
7603804	7603805	JTY_0403	JTY_0404			FALSE	0.142	74.000	0.000	NA		NA
7603806	7603807	JTY_0405	JTY_0406		lpqK	TRUE	0.915	7.000	0.250	NA		NA
7603807	7603808	JTY_0406	JTY_0407	lpqK	fadE7	FALSE	0.433	10.000	0.000	1.000	N	NA
7603810	7603811	JTY_0409	JTY_0410	mmpL1b	mmpL1a	TRUE	0.978	-3.000	0.000	0.048		NA
7603811	7603812	JTY_0410	JTY_0411	mmpL1a	mmpS1	TRUE	0.995	-3.000	1.000	NA		NA
7603813	7603814	JTY_0412	JTY_0413	fadD30	pks6a	TRUE	0.998	-3.000	1.000	0.049		NA
7603814	7603815	JTY_0413	JTY_0414	pks6a	pks6b	TRUE	0.789	-13.000	0.000	0.010		NA
7603817	7603818	JTY_0416	JTY_0417	fgd1	pta	TRUE	0.615	-7.000	0.021	NA		NA
7603818	7603819	JTY_0417	JTY_0418	pta	ackA	TRUE	0.817	-7.000	0.185	1.000		NA
7603820	7603821	JTY_0419	JTY_0420	pknG	glnH	TRUE	0.998	0.000	0.622	1.000	Y	NA
7603821	7603822	JTY_0420	JTY_0421	glnH		TRUE	0.994	0.000	0.895	NA		NA
7603825	7603826	JTY_0424	JTY_0425	thiO	thiS	TRUE	0.990	-3.000	0.625	1.000	N	NA
7603826	7603827	JTY_0425	JTY_0426	thiS	thiG	TRUE	0.947	-7.000	0.104	1.000	Y	NA
7603827	7603828	JTY_0426	JTY_0427	thiG	lpqL	FALSE	0.008	372.000	0.000	1.000		NA
7603828	7603829	JTY_0427	JTY_0428	lpqL	lpqM	FALSE	0.127	88.000	0.000	NA		NA
7603830	7603831	JTY_0429	JTY_0430			FALSE	0.035	161.000	0.000	NA		NA
7603831	7603832	JTY_0430	JTY_0431		thiD	TRUE	0.948	-3.000	0.059	NA		NA
7603832	7603833	JTY_0431	JTY_0432	thiD	thiC	TRUE	0.907	27.000	0.015	0.006	Y	NA
7603833	7603834	JTY_0432	JTY_0433	thiC		FALSE	0.041	152.000	0.000	NA		NA
7603834	7603835	JTY_0433	JTY_0434		ctpH	TRUE	0.667	50.000	0.500	NA		NA
7603835	7603836	JTY_0434	JTY_0435	ctpH		FALSE	0.477	52.000	0.250	NA		NA
7603836	7603837	JTY_0435	JTY_0436		xthA	FALSE	0.032	201.000	0.015	NA		NA
7603837	7603838	JTY_0436	JTY_0437	xthA		TRUE	0.919	3.000	0.088	NA		NA
7603838	7603839	JTY_0437	JTY_0438		def	TRUE	0.987	0.000	0.488	NA		NA
7603840	7603841	JTY_0439	JTY_0440			FALSE	0.457	32.000	0.176	NA		NA
7603841	7603842	JTY_0440	JTY_0441		sodC	TRUE	0.716	33.000	0.500	NA		NA
7603842	7603843	JTY_0441	JTY_0442	sodC		TRUE	0.953	2.000	0.128	1.000		NA
7603843	7603844	JTY_0442	JTY_0443			FALSE	0.298	60.000	0.010	1.000		NA
7603845	7603846	JTY_0444	JTY_0445		pssA	TRUE	0.908	-3.000	0.025	1.000	N	NA
7603846	7603847	JTY_0445	JTY_0446	pssA	psd	TRUE	0.997	-3.000	0.466	1.000	Y	NA
7603847	7603848	JTY_0446	JTY_0447	psd	moeA2	FALSE	0.165	61.000	0.018	1.000	N	NA
7603848	7603849	JTY_0447	JTY_0448	moeA2		TRUE	0.686	19.000	0.188	1.000		NA
7603851	7603852	JTY_0450	JTY_0451		PPE10	FALSE	0.221	27.000	0.000	NA		NA
7603854	7603855	JTY_0453	JTY_0454		sigK	TRUE	0.784	44.000	0.778	NA		NA
7603855	7603856	JTY_0454	JTY_0455	sigK		FALSE	0.384	49.000	0.065	1.000		NA
7603856	7603857	JTY_0455	JTY_0456		ufaA1	TRUE	0.858	9.000	0.081	1.000		NA
7603857	7603858	JTY_0456	JTY_0457	ufaA1		TRUE	0.951	-3.000	0.067	NA		NA
7603858	7603859	JTY_0457	JTY_0458			TRUE	0.746	60.000	0.722	NA		NA
7603859	7603860	JTY_0458	JTY_0459		mmpL4	FALSE	0.327	40.000	0.007	1.000		NA
7603860	7603861	JTY_0459	JTY_0460	mmpL4	mmpS4	TRUE	0.992	-3.000	0.667	NA		NA
7603862	7603863	JTY_0461	JTY_0462		PPE11	FALSE	0.006	322.000	0.000	NA		NA
7603863	7603864	JTY_0462	JTY_0463	PPE11		FALSE	0.104	105.000	0.000	NA		NA
7603865	7603866	JTY_0464	JTY_0465		echA2	FALSE	0.249	68.000	0.039	NA		NA
7603866	7603867	JTY_0465	JTY_0466	echA2		FALSE	0.015	273.000	0.000	1.000		NA
7603867	7603868	JTY_0466	JTY_0467			FALSE	0.024	229.000	0.000	1.000		NA
7603869	7603870	JTY_0468	JTY_0469			TRUE	0.926	0.000	0.021	NA		NA
7603870	7603871	JTY_0469	JTY_0470			FALSE	0.264	60.000	0.042	NA		NA
7603871	7603872	JTY_0470	JTY_0471			TRUE	0.840	38.000	1.000	NA		NA
7603872	7603873	JTY_0471	JTY_0472		lpd	FALSE	0.224	64.000	0.017	NA		NA
7603873	7603874	JTY_0472	JTY_0473	lpd		TRUE	0.778	8.000	0.028	NA		NA
7603875	7603876	JTY_0474	JTY_0475			TRUE	0.979	-3.000	0.286	NA		NA
7603877	7603878	JTY_0476	JTY_0477		icl	FALSE	0.005	275.000	0.000	1.000	N	NA
7603878	7603879	JTY_0477	JTY_0478	icl	fadB2	FALSE	0.172	82.000	0.036	1.000	N	NA
7603879	7603880	JTY_0478	JTY_0479	fadB2	umaA1	FALSE	0.123	133.000	0.130	1.000	N	NA
7603881	7603882	JTY_0480	JTY_0481	pcaA		FALSE	0.080	143.000	0.000	1.000		NA
7603882	7603883	JTY_0481	JTY_0482			FALSE	0.214	-69.000	0.000	NA		NA
7603883	7603884	JTY_0482	JTY_0483			TRUE	0.599	10.000	0.000	NA		NA
7603885	7603886	JTY_0484	JTY_0485			FALSE	0.233	87.000	0.047	NA		NA
7603886	7603887	JTY_0485	JTY_0486		hbhA	FALSE	0.026	354.000	0.282	NA		NA
7603887	7603888	JTY_0486	JTY_0487	hbhA		FALSE	0.329	112.000	0.270	NA		NA
7603888	7603889	JTY_0487	JTY_0488			TRUE	0.904	5.000	0.143	NA		NA
7603889	7603890	JTY_0488	JTY_0489		deoC	TRUE	0.931	0.000	0.030	NA		NA
7603891	7603892	JTY_0490	JTY_0491			TRUE	0.955	-3.000	0.091	NA		NA
7603892	7603893	JTY_0491	JTY_0492			FALSE	0.349	33.000	0.061	NA		NA
7603894	7603895	JTY_0493	JTY_0494	murB	lprQ	FALSE	0.252	62.000	0.036	NA		NA
7603897	7603898	JTY_0496	JTY_0497			FALSE	0.176	48.000	0.082	NA	N	NA
7603898	7603899	JTY_0497	JTY_0498			TRUE	0.990	-3.000	0.541	NA		NA
7603899	7603900	JTY_0498	JTY_0499			FALSE	0.004	384.000	0.000	NA		NA
7603900	7603901	JTY_0499	JTY_0500		gpm1	FALSE	0.064	157.000	0.000	1.000		NA
7603901	7603902	JTY_0500	JTY_0501	gpm1	senX3	FALSE	0.082	174.000	0.196	1.000	N	NA
7603902	7603903	JTY_0501	JTY_0502	senX3	regX3	FALSE	0.376	228.000	0.437	1.000	Y	NA
7603904	7603905	JTY_0503	JTY_0504			TRUE	0.980	-3.000	0.300	NA		NA
7603905	7603906	JTY_0504	JTY_0505			TRUE	0.969	-3.000	0.200	NA		NA
7603909	7603910	JTY_0508	JTY_0509			TRUE	0.979	-3.000	0.286	NA		NA
7603910	7603911	JTY_0509	JTY_0510			TRUE	0.627	16.000	0.127	NA		NA
7603911	7603912	JTY_0510	JTY_0511			TRUE	0.592	16.000	0.076	NA		NA
7603912	7603913	JTY_0511	JTY_0512		proC	TRUE	0.568	25.000	0.143	1.000		NA
7603913	7603914	JTY_0512	JTY_0513	proC		FALSE	0.202	141.000	0.186	1.000		NA
7603914	7603915	JTY_0513	JTY_0514		galE2	FALSE	0.011	307.000	0.000	1.000		NA
7603915	7603916	JTY_0514	JTY_0515	galE2		TRUE	0.972	7.000	0.796	1.000	N	NA
7603917	7603918	JTY_0516	JTY_0517	cmaA2		TRUE	0.785	23.000	0.400	1.000		NA
7603918	7603919	JTY_0517	JTY_0518		serB1	FALSE	0.129	162.000	0.145	1.000		NA
7603920	7603921	JTY_0519	JTY_0520	mmpS2	mmpL2	TRUE	0.995	-3.000	1.000	NA		NA
7603921	7603922	JTY_0520	JTY_0521	mmpL2		TRUE	0.581	-7.000	0.007	NA		NA
7603922	7603923	JTY_0521	JTY_0522		hemA	FALSE	0.229	50.000	0.012	NA		NA
7603923	7603924	JTY_0522	JTY_0523	hemA	hemC	TRUE	0.988	10.000	0.178	0.002	Y	NA
7603924	7603925	JTY_0523	JTY_0524	hemC	hemD	TRUE	0.911	33.000	0.044	0.002	Y	NA
7603925	7603926	JTY_0524	JTY_0525	hemD	hemB	TRUE	0.938	86.000	0.429	0.002	Y	NA
7603926	7603927	JTY_0525	JTY_0526	hemB		TRUE	0.606	13.000	0.039	NA		NA
7603927	7603928	JTY_0526	JTY_0527			TRUE	0.985	-3.000	0.389	NA		NA
7603928	7603929	JTY_0527	JTY_0528			FALSE	0.109	103.000	0.000	NA		NA
7603931	7603932	JTY_0530	JTY_0531			FALSE	0.270	132.000	0.333	1.000	N	NA
7603934	7603935	JTY_0533	JTY_0534			FALSE	0.483	-7.000	0.000	NA		NA
7603935	7603936	JTY_0534	JTY_0535		gabP	FALSE	0.057	135.000	0.000	NA		NA
7603938	7603939	JTY_0537	JTY_0538	hemL		TRUE	0.941	0.000	0.204	NA	N	NA
7603939	7603940	JTY_0538	JTY_0539			FALSE	0.293	15.000	0.035	NA	N	NA
7603940	7603941	JTY_0539	JTY_0540		ccdA	TRUE	0.997	-3.000	0.500	1.000	Y	NA
7603941	7603942	JTY_0540	JTY_0541	ccdA		TRUE	0.797	33.000	0.131	NA	Y	NA
7603942	7603943	JTY_0541	JTY_0542		ccsA	TRUE	0.992	-3.000	0.082	NA	Y	NA
7603943	7603944	JTY_0542	JTY_0543	ccsA		FALSE	0.514	42.000	0.308	1.000	N	NA
7603944	7603945	JTY_0543	JTY_0544			FALSE	0.018	205.000	0.000	NA		NA
7603945	7603946	JTY_0544	JTY_0545		PE_PGRS6a	FALSE	0.045	147.000	0.000	NA		NA
7603946	7603947	JTY_0545	JTY_0546	PE_PGRS6a	PE_PGRS6b	FALSE	0.210	-94.000	0.000	NA		NA
7603948	7603949	JTY_0547	JTY_0548	fabH	menA	FALSE	0.135	82.000	0.011	1.000	N	NA
7603950	7603951	JTY_0549	JTY_0550	pnp	galE3	TRUE	0.886	-3.000	0.008	1.000	N	NA
7603953	7603954	JTY_0552	JTY_0553			FALSE	0.276	57.000	0.048	NA		NA
7603954	7603955	JTY_0553	JTY_0554			TRUE	0.957	-3.000	0.109	NA		NA
7603956	7603957	JTY_0555	JTY_0556		menE	TRUE	0.581	12.000	0.008	NA		NA
7603957	7603958	JTY_0556	JTY_0557	menE		FALSE	0.229	69.000	0.024	NA		NA
7603958	7603959	JTY_0557	JTY_0558			FALSE	0.152	60.000	0.000	NA		NA
7603959	7603960	JTY_0558	JTY_0559		pitA	TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7603960	7603961	JTY_0559	JTY_0560	pitA		FALSE	0.208	120.000	0.167	NA		NA
7603961	7603962	JTY_0560	JTY_0561			FALSE	0.294	63.000	0.069	NA		NA
7603962	7603963	JTY_0561	JTY_0562		menB	FALSE	0.241	96.000	0.008	1.000		NA
7603963	7603964	JTY_0562	JTY_0563	menB		FALSE	0.009	272.000	0.000	NA		NA
7603964	7603965	JTY_0563	JTY_0564			FALSE	0.244	-33.000	0.000	NA		NA
7603965	7603966	JTY_0564	JTY_0565			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7603966	7603967	JTY_0565	JTY_0566		fadD8	FALSE	0.022	192.000	0.000	NA		NA
7603968	7603969	JTY_0567	JTY_0568		menC	TRUE	0.957	-3.000	0.028	1.000		NA
7603969	7603970	JTY_0568	JTY_0569	menC	bpoC	TRUE	0.984	-3.000	0.038	0.047		NA
7603970	7603971	JTY_0569	JTY_0570	bpoC	menD	FALSE	0.343	43.000	0.022	1.000		NA
7603971	7603972	JTY_0570	JTY_0571	menD		TRUE	0.947	-3.000	0.055	NA		NA
7603972	7603973	JTY_0571	JTY_0572		pimB	FALSE	0.474	62.000	0.259	NA		NA
7603973	7603974	JTY_0572	JTY_0573	pimB	ubiE	FALSE	0.354	17.000	0.013	1.000	N	NA
7603975	7603976	JTY_0574	JTY_0575			FALSE	0.501	34.000	0.222	NA		NA
7603976	7603977	JTY_0575	JTY_0576			FALSE	0.287	25.000	0.029	1.000	N	NA
7603978	7603979	JTY_0577	JTY_0578	grcC1	htpX	FALSE	0.150	101.000	0.042	1.000	N	NA
7603980	7603981	JTY_0579	JTY_0580	gpdA1		FALSE	0.284	61.000	0.133	1.000	N	NA
7603981	7603982	JTY_0580	JTY_0581			FALSE	0.190	78.000	0.005	NA		NA
7603983	7603984	JTY_t0005	JTY_0582	tyrT		FALSE	0.062	132.000	0.000	NA		NA
7603984	7603985	JTY_0582	JTY_0583		cyp135B1	FALSE	0.048	110.000	0.000	1.000	N	NA
7603985	7603986	JTY_0583	JTY_0584	cyp135B1		FALSE	0.057	135.000	0.000	NA		NA
7603986	7603987	JTY_0584	JTY_0585		nrdZ	TRUE	0.628	26.000	0.286	NA		NA
7603988	7603989	JTY_0586	JTY_0587			FALSE	0.015	224.000	0.000	NA		NA
7603989	7603990	JTY_0587	JTY_0588			FALSE	0.003	468.000	0.000	NA		NA
7603990	7603991	JTY_0588	JTY_0589			FALSE	0.089	10.000	0.000	NA	N	NA
7603991	7603992	JTY_0589	JTY_0590			FALSE	0.001	216.000	0.000	NA	N	NA
7603993	7603994	JTY_0591	JTY_0592		TB27.3	TRUE	0.640	14.000	0.080	NA		NA
7603998	7603999	JTY_0596	JTY_0597			TRUE	0.967	-3.000	0.182	NA		NA
7604003	7604004	JTY_0601	JTY_0602		yrbE2A	TRUE	0.796	-3.000	0.019	NA	N	NA
7604004	7604005	JTY_0602	JTY_0603	yrbE2A	yrbE2B	TRUE	0.993	2.000	0.333	NA	Y	NA
7604005	7604006	JTY_0603	JTY_0604	yrbE2B	mce2A	TRUE	0.995	6.000	1.000	NA	Y	NA
7604006	7604007	JTY_0604	JTY_0605	mce2A	mce2B	TRUE	0.999	-3.000	1.000	0.007	Y	NA
7604007	7604008	JTY_0605	JTY_0606	mce2B	mce2C	TRUE	0.999	-3.000	0.667	0.007	Y	NA
7604008	7604009	JTY_0606	JTY_0607	mce2C	mce2Da	TRUE	0.999	-3.000	0.667	0.007	Y	NA
7604009	7604010	JTY_0607	JTY_0608	mce2Da	lprL	TRUE	0.963	-25.000	0.333	0.007	Y	NA
7604010	7604011	JTY_0608	JTY_0609	lprL	mce2F	TRUE	0.997	5.000	0.500	0.007	Y	NA
7604012	7604013	JTY_0610	JTY_0611			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7604013	7604014	JTY_0611	JTY_0612			FALSE	0.025	183.000	0.000	NA		NA
7604014	7604015	JTY_0612	JTY_0613			FALSE	0.011	251.000	0.000	NA		NA
7604015	7604016	JTY_0613	JTY_0614			TRUE	0.985	-3.000	0.400	NA		NA
7604016	7604017	JTY_0614	JTY_0615			FALSE	0.107	104.000	0.000	NA		NA
7604017	7604018	JTY_0615	JTY_0616			FALSE	0.135	114.000	0.000	1.000		NA
7604018	7604019	JTY_0616	JTY_0617		tcrA	FALSE	0.257	44.000	0.000	1.000		NA
7604020	7604021	JTY_0618	JTY_0619		lpqO	FALSE	0.143	72.000	0.000	NA		NA
7604021	7604022	JTY_0619	JTY_0620	lpqO		FALSE	0.016	217.000	0.000	NA		NA
7604022	7604023	JTY_0620	JTY_0621			TRUE	0.836	2.000	0.000	NA		NA
7604023	7604024	JTY_0621	JTY_0622			FALSE	0.156	54.000	0.000	NA		NA
7604024	7604025	JTY_0622	JTY_0623			FALSE	0.164	45.000	0.000	NA		NA
7604025	7604026	JTY_0623	JTY_0624			TRUE	0.978	-3.000	0.273	NA		NA
7604026	7604027	JTY_0624	JTY_0625			FALSE	0.224	-57.000	0.000	NA		NA
7604028	7604029	JTY_0626	JTY_0627			FALSE	0.157	52.000	0.000	NA		NA
7604032	7604033	JTY_0630	JTY_0631			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7604035	7604036	JTY_0633	JTY_0634			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7604036	7604037	JTY_0634	JTY_0635		galT	FALSE	0.066	129.000	0.000	NA		NA
7604037	7604038	JTY_0635	JTY_0636	galT	galK	TRUE	0.994	-3.000	0.370	0.001	N	NA
7604038	7604039	JTY_0636	JTY_0637	galK		FALSE	0.004	395.000	0.000	NA		NA
7604039	7604040	JTY_0637	JTY_0638			TRUE	0.889	11.000	0.333	NA		NA
7604040	7604041	JTY_0638	JTY_0639			FALSE	0.123	93.000	0.000	NA		NA
7604041	7604042	JTY_0639	JTY_0640			TRUE	0.966	0.000	0.200	NA		NA
7604044	7604045	JTY_0642	JTY_0643			TRUE	0.995	-3.000	1.000	NA		NA
7604046	7604047	JTY_0644	JTY_0645		recD	FALSE	0.123	93.000	0.000	NA		NA
7604047	7604048	JTY_0645	JTY_0646	recD	recBb	TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7604048	7604049	JTY_0646	JTY_0647	recBb	recBa	FALSE	0.203	-114.000	0.000	NA		NA
7604049	7604050	JTY_0647	JTY_0648	recBa	recC	TRUE	0.999	0.000	0.542	0.001	Y	NA
7604050	7604051	JTY_0648	JTY_0649	recC	echA3	FALSE	0.004	277.000	0.000	1.000	N	NA
7604051	7604052	JTY_0649	JTY_0650	echA3		FALSE	0.308	49.000	0.067	NA		NA
7604052	7604053	JTY_0650	JTY_0651			FALSE	0.058	154.000	0.006	NA		NA
7604054	7604055	JTY_0652	JTY_t0006		thrT	FALSE	0.065	130.000	0.000	NA		NA
7604055	7604056	JTY_t0006	JTY_t0007	thrT	metT	FALSE	0.182	37.000	0.000	NA		NA
7604056	7604057	JTY_t0007	JTY_0653	metT	rpmG2	FALSE	0.184	36.000	0.000	NA		NA
7604057	7604058	JTY_0653	JTY_0654	rpmG2		FALSE	0.319	51.000	0.079	NA		NA
7604058	7604059	JTY_0654	JTY_0655			TRUE	0.919	-13.000	0.818	NA		NA
7604059	7604060	JTY_0655	JTY_0656			TRUE	0.996	4.000	0.818	NA	Y	NA
7604060	7604061	JTY_0656	JTY_t0008		trpT	FALSE	0.020	199.000	0.000	NA		NA
7604061	7604062	JTY_t0008	JTY_0657	trpT	secE	FALSE	0.050	141.000	0.000	NA		NA
7604062	7604063	JTY_0657	JTY_0658	secE	nusG	FALSE	0.186	32.000	0.006	1.000	N	NA
7604063	7604064	JTY_0658	JTY_0659	nusG	rplK	TRUE	0.716	52.000	0.681	1.000	N	NA
7604064	7604065	JTY_0659	JTY_0660	rplK	rplA	TRUE	0.964	67.000	0.838	0.021	Y	NA
7604066	7604067	JTY_0661	JTY_0662	mmaA4	mmaA3	TRUE	0.921	65.000	0.286	0.004	Y	NA
7604067	7604068	JTY_0662	JTY_0663	mmaA3	mmaA2	TRUE	0.866	148.000	0.667	0.004	Y	NA
7604068	7604069	JTY_0663	JTY_0664	mmaA2	mmaA1	TRUE	0.740	167.000	0.400	0.004	Y	NA
7604069	7604070	JTY_0664	JTY_0665	mmaA1	lipG	TRUE	0.641	47.000	0.444	NA		NA
7604070	7604071	JTY_0665	JTY_0666	lipG		TRUE	0.814	12.000	0.243	NA		NA
7604072	7604073	JTY_0667	JTY_0668		fabD2	TRUE	0.995	-3.000	0.857	1.000		NA
7604073	7604074	JTY_0668	JTY_0669	fabD2		TRUE	0.927	0.000	0.000	1.000		NA
7604074	7604075	JTY_0669	JTY_0670		rplJ	FALSE	0.003	331.000	0.000	1.000	N	NA
7604075	7604076	JTY_0670	JTY_0671	rplJ	rplL	TRUE	0.974	37.000	0.884	0.016	Y	NA
7604078	7604079	JTY_0673	JTY_0674		mkl	FALSE	0.383	12.000	0.038	NA	N	NA
7604080	7604081	JTY_0675	JTY_0676			FALSE	0.122	95.000	0.000	NA		NA
7604081	7604082	JTY_0676	JTY_0677			FALSE	0.141	76.000	0.000	NA		NA
7604082	7604083	JTY_0677	JTY_0678			FALSE	0.009	276.000	0.000	NA		NA
7604083	7604084	JTY_0678	JTY_0679			FALSE	0.501	-13.000	0.000	1.000		NA
7604084	7604085	JTY_0679	JTY_0680			FALSE	0.090	110.000	0.000	NA		NA
7604085	7604086	JTY_0680	JTY_0681			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7604087	7604088	JTY_0682	JTY_0683	atsD		FALSE	0.196	32.000	0.000	NA		NA
7604088	7604089	JTY_0683	JTY_0684			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7604089	7604090	JTY_0684	JTY_0685			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7604090	7604091	JTY_0685	JTY_0686		rpoB	FALSE	0.003	498.000	0.000	NA		NA
7604091	7604092	JTY_0686	JTY_0687	rpoB	rpoC	TRUE	0.977	45.000	0.851	0.001	Y	NA
7604094	7604095	JTY_0689	JTY_0690	end	lpqP	FALSE	0.178	32.000	0.004	1.000	N	NA
7604095	7604096	JTY_0690	JTY_0691	lpqP	fadE8	FALSE	0.243	60.000	0.071	1.000	N	NA
7604096	7604097	JTY_0691	JTY_0692	fadE8	echA4	TRUE	0.973	11.000	0.286	1.000	Y	NA
7604097	7604098	JTY_0692	JTY_0693	echA4		TRUE	0.941	3.000	0.292	NA	N	NA
7604098	7604099	JTY_0693	JTY_0694		echA5	TRUE	0.902	-3.000	0.083	NA	N	NA
7604100	7604101	JTY_0695	JTY_0696	mmpL5	mmpS5	TRUE	0.995	-3.000	1.000	NA		NA
7604103	7604104	JTY_0698	JTY_0699			TRUE	0.989	2.000	0.778	NA		NA
7604105	7604106	JTY_0700	JTY_0701		rpsL	FALSE	0.006	249.000	0.000	1.000	N	NA
7604106	7604107	JTY_0701	JTY_0702	rpsL	rpsG	TRUE	0.999	0.000	0.620	0.003	Y	NA
7604107	7604108	JTY_0702	JTY_0703	rpsG	fusA1	TRUE	0.897	81.000	0.579	1.000	Y	NA
7604108	7604109	JTY_0703	JTY_0704	fusA1	tuf	TRUE	0.588	231.000	0.400	0.001	Y	NA
7604109	7604110	JTY_0704	JTY_0705	tuf		FALSE	0.053	138.000	0.000	NA		NA
7604110	7604111	JTY_0705	JTY_0706		fabG	FALSE	0.222	153.000	0.333	NA		NA
7604111	7604112	JTY_0706	JTY_0707	fabG		TRUE	0.893	14.000	0.214	0.045		NA
7604113	7604114	JTY_0708	JTY_0709			FALSE	0.003	613.000	0.000	NA		NA
7604114	7604115	JTY_0709	JTY_0710			TRUE	0.955	-3.000	0.088	NA		NA
7604116	7604117	JTY_0711	JTY_0712		pqqE	TRUE	0.988	-3.000	0.484	NA		NA
7604117	7604118	JTY_0712	JTY_0713	pqqE	lldD1	TRUE	0.984	3.000	0.548	1.000		NA
7604118	7604119	JTY_0713	JTY_0714	lldD1		FALSE	0.182	190.000	0.464	NA		NA
7604119	7604120	JTY_0714	JTY_0715			TRUE	0.633	49.000	0.440	NA		NA
7604120	7604121	JTY_0715	JTY_0716			TRUE	0.987	2.000	0.667	NA		NA
7604121	7604122	JTY_0716	JTY_0717			FALSE	0.003	461.000	0.000	NA		NA
7604122	7604123	JTY_0717	JTY_0718			FALSE	0.161	48.000	0.000	NA		NA
7604123	7604124	JTY_0718	JTY_0719			FALSE	0.024	185.000	0.000	NA		NA
7604124	7604125	JTY_0719	JTY_0720		rpsJ	FALSE	0.002	637.000	0.000	NA		NA
7604125	7604126	JTY_0720	JTY_0721	rpsJ	rplC	TRUE	0.978	17.000	0.467	0.021	Y	NA
7604126	7604127	JTY_0721	JTY_0722	rplC	rplD	TRUE	0.998	0.000	0.361	0.016	Y	NA
7604127	7604128	JTY_0722	JTY_0723	rplD	rplW	TRUE	0.999	0.000	0.513	0.016	Y	NA
7604128	7604129	JTY_0723	JTY_0724	rplW	rplB	TRUE	0.884	147.000	0.849	0.015	Y	NA
7604129	7604130	JTY_0724	JTY_0725	rplB	rpsS	TRUE	0.969	41.000	0.820	0.021	Y	NA
7604130	7604131	JTY_0725	JTY_0726	rpsS	rplV	TRUE	0.999	-3.000	0.769	0.021	Y	NA
7604131	7604132	JTY_0726	JTY_0727	rplV	rpsC	TRUE	0.999	0.000	0.719	0.021	Y	NA
7604132	7604133	JTY_0727	JTY_0728	rpsC	rplP	TRUE	0.998	4.000	0.828	0.021	Y	NA
7604133	7604134	JTY_0728	JTY_0729	rplP	rpmC	TRUE	0.999	0.000	0.802	0.016	Y	NA
7604134	7604135	JTY_0729	JTY_0730	rpmC	rpsQ	TRUE	0.999	-3.000	0.828	0.016	Y	NA
7604135	7604136	JTY_0730	JTY_0731	rpsQ	atsA	FALSE	0.028	169.000	0.005	1.000	N	NA
7604136	7604137	JTY_0731	JTY_0732	atsA		FALSE	0.484	48.000	0.250	NA		NA
7604137	7604138	JTY_0732	JTY_0733			FALSE	0.083	301.000	0.600	NA		NA
7604138	7604139	JTY_0733	JTY_0734		rplN	FALSE	0.003	486.000	0.000	NA		NA
7604139	7604140	JTY_0734	JTY_0735	rplN	rplX	TRUE	0.999	1.000	0.810	0.021	Y	NA
7604140	7604141	JTY_0735	JTY_0736	rplX	rplE	TRUE	0.999	0.000	0.758	0.016	Y	NA
7604141	7604142	JTY_0736	JTY_0737	rplE	rpsN1	TRUE	0.996	5.000	0.496	0.016	Y	NA
7604142	7604143	JTY_0737	JTY_0738	rpsN1	rpsH	TRUE	0.745	164.000	0.473	0.016	Y	NA
7604143	7604144	JTY_0738	JTY_0739	rpsH	rplF	TRUE	0.981	24.000	0.808	0.016	Y	NA
7604144	7604145	JTY_0739	JTY_0740	rplF	rplR	TRUE	0.999	3.000	0.815	0.016	Y	NA
7604145	7604146	JTY_0740	JTY_0741	rplR	rpsE	TRUE	0.985	20.000	0.814	0.021	Y	NA
7604146	7604147	JTY_0741	JTY_0742	rpsE	rpmD	TRUE	0.998	3.000	0.789	0.021	Y	NA
7604147	7604148	JTY_0742	JTY_0743	rpmD	rplO	TRUE	0.999	0.000	0.653	0.003	Y	NA
7604148	7604149	JTY_0743	JTY_0744	rplO	sppA	FALSE	0.108	33.000	0.000	1.000	N	NA
7604150	7604151	JTY_0745	JTY_0746			TRUE	0.596	93.000	0.000	NA	Y	NA
7604151	7604152	JTY_0746	JTY_0747		fucA	FALSE	0.001	203.000	0.000	NA	N	NA
7604152	7604153	JTY_0747	JTY_0748	fucA	serA2	TRUE	0.929	-3.000	0.058	1.000	N	NA
7604154	7604155	JTY_0749	JTY_0750	xylB		TRUE	0.665	13.000	0.018	1.000		NA
7604157	7604158	JTY_0752	JTY_0753	secY	adk	TRUE	0.929	-3.000	0.057	1.000	N	NA
7604158	7604159	JTY_0753	JTY_0754	adk	mapA	TRUE	0.980	3.000	0.606	1.000	N	NA
7604159	7604160	JTY_0754	JTY_0755	mapA	sigL	FALSE	0.248	73.000	0.099	1.000	N	NA
7604160	7604161	JTY_0755	JTY_0756	sigL		TRUE	0.909	64.000	0.697	NA	Y	NA
7604161	7604162	JTY_0756	JTY_0757			FALSE	0.084	315.000	0.065	NA	Y	NA
7604162	7604163	JTY_0757	JTY_0758			FALSE	0.005	358.000	0.000	NA		NA
7604163	7604164	JTY_0758	JTY_0759			FALSE	0.018	205.000	0.000	NA		NA
7604164	7604165	JTY_0759	JTY_0760			FALSE	0.081	115.000	0.000	NA		NA
7604165	7604166	JTY_0760	JTY_0761			FALSE	0.014	231.000	0.000	NA		NA
7604166	7604167	JTY_0761	JTY_0762		PE_PGRS8	FALSE	0.049	142.000	0.000	NA		NA
7604168	7604169	JTY_0763	JTY_0764			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7604170	7604171	JTY_0765	JTY_0766		PE_PGRS9	FALSE	0.300	20.000	0.000	NA		NA
7604171	7604172	JTY_0766	JTY_0767	PE_PGRS9	PE_PGRS10	FALSE	0.004	399.000	0.000	NA		NA
7604172	7604173	JTY_0767	JTY_0768	PE_PGRS10		FALSE	0.125	91.000	0.000	NA		NA
7604173	7604174	JTY_0768	JTY_0769			FALSE	0.254	24.000	0.000	NA		NA
7604177	7604178	JTY_0772	JTY_0773	mmsB	fadE9	TRUE	0.953	11.000	0.051	1.000	Y	NA
7604178	7604179	JTY_0773	JTY_0774	fadE9	mmsA	TRUE	0.866	7.000	0.197	1.000	N	NA
7604181	7604182	JTY_0776	JTY_0777	PPE12		FALSE	0.007	302.000	0.000	NA		NA
7604182	7604183	JTY_0777	JTY_t0009		thrV	FALSE	0.081	115.000	0.000	NA		NA
7604183	7604184	JTY_t0009	JTY_0778	thrV		FALSE	0.216	28.000	0.000	NA		NA
7604185	7604186	JTY_0779	JTY_0780	phoP	phoR	TRUE	0.942	45.000	0.824	1.000	Y	NA
7604187	7604188	JTY_0781	JTY_0782			FALSE	0.200	109.000	0.014	1.000		NA
7604188	7604189	JTY_0782	JTY_0783		adhB	TRUE	0.943	13.000	0.750	1.000		NA
7604189	7604190	JTY_0783	JTY_0784	adhB		FALSE	0.516	99.000	0.400	NA		NA
7604190	7604191	JTY_0784	JTY_0785			TRUE	0.988	3.000	0.800	NA		NA
7604191	7604192	JTY_0785	JTY_0786		cyp51	TRUE	0.982	3.000	0.733	NA	N	NA
7604192	7604193	JTY_0786	JTY_0787	cyp51		TRUE	0.975	0.000	0.212	1.000		NA
7604193	7604194	JTY_0787	JTY_0788		cyp123	FALSE	0.545	-418.000	0.231	1.000		NA
7604194	7604195	JTY_0788	JTY_0789	cyp123		TRUE	0.988	-3.000	0.571	1.000	N	NA
7604196	7604197	JTY_0790	JTY_0791	aldA		TRUE	0.809	31.000	0.812	1.000	N	NA
7604197	7604198	JTY_0791	JTY_0792			TRUE	0.858	98.000	0.480	1.000	Y	NA
7604198	7604199	JTY_0792	JTY_0793			TRUE	0.992	-3.000	0.560	1.000		NA
7604199	7604200	JTY_0793	JTY_0794		purD	TRUE	0.670	12.000	0.003	1.000		NA
7604201	7604202	JTY_0795	JTY_0796	ggtA		FALSE	0.315	51.000	0.073	NA		NA
7604205	7604206	JTY_0799	JTY_0800	purB	cyp126	TRUE	0.740	5.000	0.006	1.000	N	NA
7604208	7604209	JTY_0802	JTY_0803	purC	ptrB	TRUE	0.915	-3.000	0.035	1.000	N	NA
7604211	7604212	JTY_0805	JTY_0806			TRUE	0.638	16.000	0.048	1.000		NA
7604212	7604213	JTY_0806	JTY_0807			TRUE	0.769	18.000	0.024	0.045		NA
7604215	7604216	JTY_0809	JTY_0810			FALSE	0.101	106.000	0.000	NA		NA
7604216	7604217	JTY_0810	JTY_0811		purQ	TRUE	0.999	-3.000	0.656	0.001	Y	NA
7604218	7604219	JTY_0812	JTY_0813			FALSE	0.278	22.000	0.000	NA		NA
7604219	7604220	JTY_0813	JTY_0814			TRUE	0.951	-3.000	0.070	NA		NA
7604220	7604221	JTY_0814	JTY_0815			TRUE	0.960	-3.000	0.250	NA	N	NA
7604223	7604224	JTY_0817	JTY_0818			FALSE	0.521	-12.000	0.000	1.000		NA
7604224	7604225	JTY_0818	JTY_0820		cfp29	FALSE	0.002	1476.000	0.000	NA		NA
7604225	7604226	JTY_0820	JTY_0821	cfp29		TRUE	0.977	-3.000	0.267	NA		NA
7604227	7604228	JTY_0822	JTY_0823	pepC		TRUE	0.644	12.000	0.038	NA		NA
7604230	7604231	JTY_0825	JTY_0826	purL		TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7604231	7604232	JTY_0826	JTY_0827			FALSE	0.073	121.000	0.000	NA		NA
7604234	7604235	JTY_0829	JTY_0830		purF	FALSE	0.218	87.000	0.034	NA		NA
7604235	7604236	JTY_0830	JTY_0831	purF	purM	TRUE	0.870	31.000	0.248	1.000	Y	NA
7604237	7604238	JTY_0832	JTY_0833			FALSE	0.072	147.000	0.017	NA		NA
7604240	7604241	JTY_0835	JTY_0836		sseC2	FALSE	0.065	163.000	0.043	NA		NA
7604241	7604242	JTY_0836	JTY_0837	sseC2	cysA2	TRUE	0.987	2.000	0.557	1.000		NA
7604242	7604243	JTY_0837	JTY_0838	cysA2	thiX	FALSE	0.013	293.000	0.000	1.000		NA
7604243	7604244	JTY_0838	JTY_0839	thiX		TRUE	0.984	-3.000	0.371	NA		NA
7604245	7604246	JTY_0840	JTY_0841			TRUE	0.976	-3.000	0.196	1.000		NA
7604246	7604247	JTY_0841	JTY_0842		phoTa	FALSE	0.336	43.000	0.016	1.000		NA
7604247	7604248	JTY_0842	JTY_0843	phoTa	phoTb	FALSE	0.219	-60.000	0.000	NA		NA
7604249	7604250	JTY_0844	JTY_0845	phoY2		TRUE	0.611	58.000	0.579	NA	N	NA
7604250	7604251	JTY_0845	JTY_0846			FALSE	0.009	166.000	0.005	NA	N	NA
7604251	7604252	JTY_0846	JTY_0847		desA1	FALSE	0.246	88.000	0.004	1.000		NA
7604252	7604253	JTY_0847	JTY_0848	desA1		FALSE	0.252	162.000	0.375	1.000		NA
7604255	7604256	JTY_0850	JTY_0851			FALSE	0.086	58.000	0.000	1.000	N	NA
7604257	7604258	JTY_0852	JTY_0853			FALSE	0.104	105.000	0.000	NA		NA
7604259	7604260	JTY_0854	JTY_t0010		lysT	FALSE	0.122	94.000	0.000	NA		NA
7604261	7604262	JTY_t0011	JTY_t0012	gluT	aspT	FALSE	0.179	38.000	0.000	NA		NA
7604262	7604263	JTY_t0012	JTY_t0013	aspT	pheU	FALSE	0.207	30.000	0.000	NA		NA
7604263	7604264	JTY_t0013	JTY_0855	pheU	PE_PGRS13	FALSE	0.002	665.000	0.000	NA		NA
7604267	7604268	JTY_0858	JTY_0859			FALSE	0.143	71.000	0.000	NA		NA
7604269	7604270	JTY_0860	JTY_0861	lpqR		FALSE	0.160	87.000	0.033	1.000	N	NA
7604272	7604273	JTY_0863	JTY_0864			FALSE	0.008	277.000	0.000	NA		NA
7604273	7604274	JTY_0864	JTY_0865			FALSE	0.335	-16.000	0.000	NA		NA
7604278	7604279	JTY_0869	JTY_0870	lpqS	cysK2	FALSE	0.019	203.000	0.000	NA		NA
7604279	7604280	JTY_0870	JTY_0871	cysK2		TRUE	0.987	0.000	0.500	NA		NA
7604280	7604281	JTY_0871	JTY_0872			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7604285	7604286	JTY_0876	JTY_0877		far	TRUE	0.945	6.000	0.333	NA		NA
7604286	7604287	JTY_0877	JTY_0878	far		FALSE	0.084	113.000	0.000	NA		NA
7604287	7604288	JTY_0878	JTY_0879			FALSE	0.216	28.000	0.000	NA		NA
7604290	7604291	JTY_0881	JTY_0882	fadA	fadB	TRUE	0.996	5.000	0.750	1.000	Y	NA
7604292	7604293	JTY_0883	JTY_0884			FALSE	0.182	138.000	0.206	NA		NA
7604294	7604295	JTY_0885	JTY_0886		moaC2	FALSE	0.191	84.000	0.012	NA		NA
7604295	7604296	JTY_0886	JTY_0887	moaC2	mog	TRUE	0.997	-3.000	0.016	0.005	Y	NA
7604296	7604297	JTY_0887	JTY_0888	mog	moaE2	TRUE	0.997	-3.000	0.015	0.005	Y	NA
7604298	7604299	JTY_0889	JTY_0890	rpfA	moaD2	FALSE	0.006	448.000	0.000	1.000		NA
7604299	7604300	JTY_0890	JTY_0891	moaD2	moaA	TRUE	0.993	4.000	0.410	1.000	Y	NA
7604300	7604301	JTY_0891	JTY_0892	moaA		TRUE	0.936	-3.000	0.026	NA		NA
7604305	7604306	JTY_0896	JTY_0897			FALSE	0.114	100.000	0.000	NA		NA
7604306	7604307	JTY_0897	JTY_0898			TRUE	0.987	-3.000	0.432	NA		NA
7604309	7604310	JTY_0900	JTY_0901	PPE13		FALSE	0.008	278.000	0.000	NA		NA
7604311	7604312	JTY_0902	JTY_0903			TRUE	0.912	-3.000	0.029	1.000	N	NA
7604312	7604313	JTY_0903	JTY_0904			TRUE	0.953	-3.000	0.075	NA		NA
7604314	7604315	JTY_0905	JTY_0906		serC	FALSE	0.139	157.000	0.214	NA		NA
7604316	7604317	JTY_0907	JTY_0908		fprB	TRUE	0.918	19.000	0.846	1.000		NA
7604320	7604321	JTY_0911	JTY_0912	citA		FALSE	0.204	87.000	0.000	1.000		NA
7604321	7604322	JTY_0912	JTY_0913			TRUE	0.899	2.000	0.000	1.000		NA
7604325	7604326	JTY_0916	JTY_0917			FALSE	0.141	77.000	0.000	NA		NA
7604326	7604327	JTY_0917	JTY_0918		gltA	FALSE	0.023	190.000	0.000	NA		NA
7604328	7604329	JTY_0919	JTY_0920			FALSE	0.438	26.000	0.091	NA		NA
7604330	7604331	JTY_0921	JTY_0922	ompA		TRUE	0.816	13.000	0.286	NA		NA
7604331	7604332	JTY_0922	JTY_0923			TRUE	0.991	0.000	0.667	NA		NA
7604333	7604334	JTY_0924	JTY_0925	prrB	prrA	TRUE	0.976	11.000	0.333	1.000	Y	NA
7604334	7604335	JTY_0925	JTY_0926	prrA	accD3	FALSE	0.033	131.000	0.000	1.000	N	NA
7604336	7604337	JTY_0927	JTY_0928	echA6		TRUE	0.941	6.000	0.314	NA		NA
7604337	7604338	JTY_0928	JTY_0929			FALSE	0.324	93.000	0.171	NA		NA
7604338	7604339	JTY_0929	JTY_0930		ctpE	TRUE	0.946	-3.000	0.119	1.000	N	NA
7604339	7604340	JTY_0930	JTY_0931	ctpE		FALSE	0.003	557.000	0.000	NA		NA
7604340	7604341	JTY_0931	JTY_0932			TRUE	0.900	6.000	0.182	NA		NA
7604341	7604342	JTY_0932	JTY_0933			FALSE	0.117	98.000	0.000	NA		NA
7604342	7604343	JTY_0933	JTY_0934			FALSE	0.294	65.000	0.071	NA		NA
7604344	7604345	JTY_0935	JTY_0936			TRUE	0.967	2.000	0.417	NA	N	NA
7604345	7604346	JTY_0936	JTY_0937		PPE14	FALSE	0.009	93.000	0.000	NA	N	NA
7604346	7604347	JTY_0937	JTY_0938	PPE14	PE7	FALSE	0.392	15.000	0.000	NA		NA
7604348	7604349	JTY_0939	JTY_0940	betP		FALSE	0.009	343.000	0.000	1.000		NA
7604349	7604350	JTY_0940	JTY_0941			TRUE	0.967	-3.000	0.091	1.000		NA
7604351	7604352	JTY_t0014	JTY_0942	argT		FALSE	0.107	104.000	0.000	NA		NA
7604353	7604354	JTY_0943	JTY_0944			TRUE	0.987	0.000	0.000	NA	Y	NA
7604355	7604356	JTY_0945	JTY_0946		mntH	TRUE	0.913	1.000	0.029	NA		NA
7604356	7604357	JTY_0946	JTY_0947	mntH		FALSE	0.283	32.000	0.014	NA		NA
7604357	7604358	JTY_0947	JTY_0948			FALSE	0.216	77.000	0.018	NA		NA
7604358	7604359	JTY_0948	JTY_0949			TRUE	0.706	54.000	0.500	1.000		NA
7604360	7604361	JTY_0950	JTY_0951	pstS3	pstC2	TRUE	0.977	13.000	0.200	0.004	Y	NA
7604361	7604362	JTY_0951	JTY_0952	pstC2	pstA1	TRUE	0.997	-3.000	0.037	0.004	Y	NA
7604363	7604364	JTY_0953	JTY_0954	pknDb	pknDa	TRUE	0.900	11.000	0.000	0.004		NA
7604364	7604365	JTY_0954	JTY_0955	pknDa	pstS2	TRUE	0.833	22.000	0.667	1.000	N	NA
7604366	7604367	JTY_0956	JTY_0957	pstBa	pstBb	FALSE	0.268	-25.000	0.000	NA		NA
7604367	7604368	JTY_0957	JTY_0958	pstBb	pstS1	TRUE	0.927	21.000	0.000	0.004	Y	NA
7604368	7604369	JTY_0958	JTY_0959	pstS1	pstC1	TRUE	0.975	60.000	1.000	0.004	Y	NA
7604369	7604370	JTY_0959	JTY_0960	pstC1	pstA2	TRUE	0.999	2.000	0.636	0.004	Y	NA
7604372	7604373	JTY_0962	JTY_0963			TRUE	0.921	-3.000	0.043	1.000	N	NA
7604374	7604375	JTY_0964	JTY_0965			FALSE	0.347	85.000	0.182	NA		NA
7604378	7604379	JTY_0968	JTY_0969			TRUE	0.900	6.000	0.082	1.000		NA
7604380	7604381	JTY_0970	JTY_0971	pgi		FALSE	0.002	615.000	0.000	NA		NA
7604381	7604382	JTY_0971	JTY_0972			FALSE	0.080	116.000	0.000	NA		NA
7604385	7604386	JTY_0975	JTY_0976	sucC	sucD	TRUE	0.987	13.000	0.382	0.001	Y	NA
7604388	7604389	JTY_0978	JTY_0979			FALSE	0.468	40.000	0.218	NA		NA
7604389	7604390	JTY_0979	JTY_0980		purN	FALSE	0.149	116.000	0.044	NA		NA
7604390	7604391	JTY_0980	JTY_0981	purN	purH	TRUE	0.995	-3.000	0.225	1.000	Y	NA
7604391	7604392	JTY_0981	JTY_0982	purH		FALSE	0.085	107.000	0.002	1.000	N	NA
7604392	7604393	JTY_0982	JTY_0983			TRUE	0.929	-7.000	0.645	NA		NA
7604393	7604394	JTY_0983	JTY_0984			FALSE	0.156	54.000	0.000	NA		NA
7604394	7604395	JTY_0984	JTY_0985			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7604395	7604396	JTY_0985	JTY_0986			FALSE	0.045	146.000	0.000	NA		NA
7604397	7604398	JTY_0987	JTY_0988	lprP		FALSE	0.025	183.000	0.000	NA		NA
7604398	7604399	JTY_0988	JTY_0989			FALSE	0.116	99.000	0.000	NA		NA
7604399	7604400	JTY_0989	JTY_0990			FALSE	0.114	100.000	0.000	NA		NA
7604400	7604401	JTY_0990	JTY_0991			FALSE	0.184	36.000	0.000	NA		NA
7604402	7604403	JTY_0992	JTY_0993			FALSE	0.224	57.000	0.012	NA		NA
7604403	7604404	JTY_0993	JTY_0994		ctpV	TRUE	0.662	56.000	0.500	NA		NA
7604404	7604405	JTY_0994	JTY_0995	ctpV		TRUE	0.992	-3.000	0.667	NA		NA
7604406	7604407	JTY_0996	JTY_0997	echA7	fadE12	TRUE	0.994	0.000	0.203	1.000	Y	NA
7604407	7604408	JTY_0997	JTY_0998	fadE12	accA2	TRUE	0.998	-3.000	0.812	1.000	Y	NA
7604408	7604409	JTY_0998	JTY_0999	accA2	accD2	TRUE	0.996	6.000	0.875	1.000	Y	NA
7604409	7604410	JTY_0999	JTY_1000	accD2	fadE13	TRUE	0.996	3.000	0.548	1.000	Y	NA
7604410	7604411	JTY_1000	JTY_1001	fadE13		TRUE	0.990	-3.000	0.562	NA		NA
7604412	7604413	JTY_1002	JTY_1003	PE_PGRS16	PE_PGRS16	FALSE	0.231	-43.000	0.000	NA		NA
7604414	7604415	JTY_1004	JTY_1005	PE_PGRS17		FALSE	0.006	314.000	0.000	NA		NA
7604418	7604419	JTY_1008	JTY_1009	mprA	mprB	TRUE	0.999	0.000	0.655	0.008	Y	NA
7604419	7604420	JTY_1009	JTY_1010	mprB		TRUE	0.593	44.000	0.424	1.000	N	NA
7604420	7604421	JTY_1010	JTY_1011		moaB2	TRUE	0.982	0.000	0.423	1.000	N	NA
7604423	7604424	JTY_1013	JTY_1014			TRUE	0.957	-7.000	0.210	1.000	Y	NA
7604424	7604425	JTY_1014	JTY_1015			TRUE	0.903	7.000	0.152	1.000		NA
7604426	7604427	JTY_1016	JTY_1017	grcC2		FALSE	0.151	61.000	0.000	NA		NA
7604427	7604428	JTY_1017	JTY_1018			FALSE	0.223	73.000	0.022	NA		NA
7604428	7604429	JTY_1018	JTY_1019			FALSE	0.248	74.000	0.041	NA		NA
7604430	7604431	JTY_1020	JTY_1021	galU	moeA1	FALSE	0.326	77.000	0.196	1.000	N	NA
7604431	7604432	JTY_1021	JTY_1022	moeA1	rimJ	FALSE	0.562	63.000	0.427	1.000	N	NA
7604432	7604433	JTY_1022	JTY_1023	rimJ		FALSE	0.116	161.000	0.183	NA		NA
7604433	7604434	JTY_1023	JTY_t0015		alaV	FALSE	0.158	51.000	0.000	NA		NA
7604434	7604435	JTY_t0015	JTY_1024	alaV		FALSE	0.158	51.000	0.000	NA		NA
7604435	7604436	JTY_1024	JTY_1025			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7604436	7604437	JTY_1025	JTY_1026			FALSE	0.026	181.000	0.000	NA		NA
7604437	7604438	JTY_1026	JTY_1027			FALSE	0.254	24.000	0.000	NA		NA
7604438	7604439	JTY_1027	JTY_1028			FALSE	0.322	18.000	0.000	NA		NA
7604444	7604445	JTY_1033	JTY_1034		pabB	FALSE	0.195	74.000	0.006	NA		NA
7604448	7604449	JTY_1037	JTY_1038	tatD	rpfB	FALSE	0.027	208.000	0.008	NA		NA
7604449	7604450	JTY_1038	JTY_1039	rpfB	ksgA	FALSE	0.451	-27.000	0.008	1.000		NA
7604450	7604451	JTY_1039	JTY_1040	ksgA	ispE	FALSE	0.204	86.000	0.068	1.000	N	NA
7604451	7604452	JTY_1040	JTY_1041	ispE		TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7604452	7604453	JTY_1041	JTY_1042		pks16	FALSE	0.019	204.000	0.000	NA		NA
7604454	7604455	JTY_1043	JTY_1044	pth	rplY	TRUE	0.986	13.000	0.496	0.023	Y	NA
7604455	7604456	JTY_1044	JTY_1045	rplY	lpqT	FALSE	0.059	134.000	0.000	NA		NA
7604456	7604457	JTY_1045	JTY_1046	lpqT	prsA	FALSE	0.184	36.000	0.000	NA		NA
7604457	7604458	JTY_1046	JTY_1047	prsA	glmU	FALSE	0.148	92.000	0.026	1.000	N	NA
7604458	7604459	JTY_1047	JTY_t0016	glmU	glnT	FALSE	0.369	16.000	0.000	NA		NA
7604460	7604461	JTY_1048	JTY_1049		mfd	TRUE	0.836	59.000	0.013	0.048	Y	NA
7604461	7604462	JTY_1049	JTY_1050	mfd		TRUE	0.951	0.000	0.026	1.000		NA
7604462	7604463	JTY_1050	JTY_1051		lpqU	FALSE	0.127	88.000	0.000	NA		NA
7604463	7604464	JTY_1051	JTY_1052	lpqU	eno	FALSE	0.049	97.000	0.012	NA	N	NA
7604464	7604465	JTY_1052	JTY_1053	eno		TRUE	0.816	5.000	0.043	1.000	N	NA
7604465	7604466	JTY_1053	JTY_1054			TRUE	0.724	17.000	0.252	NA		NA
7604466	7604467	JTY_1054	JTY_1055			TRUE	0.781	-9.000	0.243	NA		NA
7604468	7604469	JTY_1056	JTY_1057	kdpE	kdpD	TRUE	0.997	-3.000	0.429	1.000	Y	NA
7604470	7604471	JTY_1058	JTY_1059	kdpF	kdpA	TRUE	0.991	0.000	0.152	0.001		NA
7604471	7604472	JTY_1059	JTY_1060	kdpA	kdpB	TRUE	0.998	-3.000	0.124	0.001	Y	NA
7604472	7604473	JTY_1060	JTY_1061	kdpB	kdpC	TRUE	0.997	0.000	0.015	0.001	Y	NA
7604474	7604475	JTY_1062	JTY_1063	trcS	trcR	TRUE	0.990	8.000	0.556	1.000	Y	NA
7604475	7604476	JTY_1063	JTY_1064	trcR		FALSE	0.002	182.000	0.000	NA	N	NA
7604476	7604477	JTY_1064	JTY_1065			FALSE	0.144	68.000	0.000	NA		NA
7604477	7604478	JTY_1065	JTY_1066			FALSE	0.189	34.000	0.000	NA		NA
7604478	7604479	JTY_1066	JTY_1067		esxI	FALSE	0.087	111.000	0.000	NA		NA
7604479	7604480	JTY_1067	JTY_1068	esxI	esxJ	FALSE	0.221	27.000	0.000	NA		NA
7604480	7604481	JTY_1068	JTY_1069	esxJ	PPE15	FALSE	0.045	146.000	0.000	NA		NA
7604481	7604482	JTY_1069	JTY_1070	PPE15	PE8	TRUE	0.711	77.000	0.667	NA		NA
7604482	7604483	JTY_1070	JTY_1071	PE8		FALSE	0.002	1196.000	0.000	NA		NA
7604483	7604484	JTY_1071	JTY_1072			FALSE	0.250	-31.000	0.000	NA		NA
7604484	7604485	JTY_1072	JTY_1073			FALSE	0.008	283.000	0.000	NA		NA
7604486	7604487	JTY_1074	JTY_1075			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7604491	7604492	JTY_1079	JTY_1080			FALSE	0.250	48.000	0.000	1.000		NA
7604496	7604497	JTY_1084	JTY_1085			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7604497	7604498	JTY_1085	JTY_t0017		leuX	FALSE	0.266	23.000	0.000	NA		NA
7604498	7604499	JTY_t0017	JTY_1086	leuX		FALSE	0.036	159.000	0.000	NA		NA
7604499	7604500	JTY_1086	JTY_1087			FALSE	0.002	1004.000	0.000	NA		NA
7604500	7604501	JTY_1087	JTY_1088		fadD14	FALSE	0.238	107.000	0.125	NA		NA
7604501	7604502	JTY_1088	JTY_1089	fadD14		FALSE	0.541	76.000	0.286	1.000		NA
7604502	7604503	JTY_1089	JTY_1090			FALSE	0.512	53.000	0.286	NA		NA
7604503	7604504	JTY_1090	JTY_1091			TRUE	0.611	34.000	0.333	NA		NA
7604504	7604505	JTY_1091	JTY_1092			TRUE	0.952	5.000	0.250	1.000		NA
7604506	7604507	JTY_1093	JTY_1094		lpqV	FALSE	0.207	81.000	0.016	NA		NA
7604508	7604509	JTY_1095	JTY_1096			TRUE	0.986	-3.000	0.429	NA		NA
7604510	7604511	JTY_1097	JTY_1098	PE_PGRS19	PE_PGRS20.1	FALSE	0.006	333.000	0.000	NA		NA
7604511	7604512	JTY_1098	JTY_1099	PE_PGRS20.1	PE_PGRS20.2	FALSE	0.266	23.000	0.000	NA		NA
7604512	7604513	JTY_1099	JTY_1100	PE_PGRS20.2		FALSE	0.004	389.000	0.000	NA		NA
7604513	7604514	JTY_1100	JTY_1101		echA8	TRUE	0.977	-3.000	0.259	NA		NA
7604514	7604515	JTY_1101	JTY_1102	echA8	echA9	TRUE	0.976	12.000	0.128	0.007	Y	NA
7604516	7604517	JTY_1103	JTY_1104			FALSE	0.080	116.000	0.000	NA		NA
7604518	7604519	JTY_1105	JTY_1106	fadA3		FALSE	0.087	53.000	0.000	1.000	N	NA
7604520	7604521	JTY_1107	JTY_1108	lipU	cbs	FALSE	0.169	57.000	0.017	1.000	N	NA
7604521	7604522	JTY_1108	JTY_1109	cbs	pra	FALSE	0.036	202.000	0.034	NA		NA
7604522	7604523	JTY_1109	JTY_1110	pra	metB	FALSE	0.307	32.000	0.028	NA		NA
7604524	7604525	JTY_1111	JTY_1112	greA		FALSE	0.107	186.000	0.250	NA		NA
7604526	7604527	JTY_1113	JTY_1114	mca		TRUE	0.956	-3.000	0.099	NA		NA
7604527	7604528	JTY_1114	JTY_1115			FALSE	0.473	-13.000	0.011	NA		NA
7604530	7604531	JTY_1117	JTY_1118		PE_PGRS21	FALSE	0.028	177.000	0.000	NA		NA
7604531	7604532	JTY_1118	JTY_1119	PE_PGRS21		FALSE	0.028	177.000	0.000	NA		NA
7604532	7604533	JTY_1119	JTY_1120		PE9	FALSE	0.040	153.000	0.000	NA		NA
7604533	7604534	JTY_1120	JTY_1121	PE9	PE10	FALSE	0.201	-121.000	0.000	NA		NA
7604534	7604535	JTY_1121	JTY_1122	PE10	celA2a	FALSE	0.007	386.000	0.000	1.000		NA
7604535	7604536	JTY_1122	JTY_1123	celA2a	celA2b	TRUE	0.788	-22.000	0.000	0.001		NA
7604536	7604537	JTY_1123	JTY_1124	celA2b	PE_PGRS22	FALSE	0.004	415.000	0.000	NA		NA
7604539	7604540	JTY_1126	JTY_1127	glyA	desA2	FALSE	0.322	105.000	0.143	1.000		NA
7604540	7604541	JTY_1127	JTY_1128	desA2	phoH2	FALSE	0.050	211.000	0.046	1.000		NA
7604541	7604542	JTY_1128	JTY_1129	phoH2		FALSE	0.230	87.000	0.108	1.000	N	NA
7604543	7604544	JTY_1130	JTY_1131		fumC	TRUE	0.930	-3.000	0.014	NA		NA
7604544	7604545	JTY_1131	JTY_1132	fumC	glpX	FALSE	0.310	31.000	0.071	1.000	N	NA
7604547	7604548	JTY_1134	JTY_1135			FALSE	0.012	240.000	0.000	NA		NA
7604548	7604549	JTY_1135	JTY_1136			TRUE	0.976	0.000	0.286	NA		NA
7604550	7604551	JTY_1137	JTY_1138			FALSE	0.006	321.000	0.000	NA		NA
7604552	7604553	JTY_1139	JTY_1140		xseB	TRUE	0.593	10.000	0.009	1.000	N	NA
7604553	7604554	JTY_1140	JTY_1141	xseB	xseA	TRUE	0.986	-10.000	0.412	0.001	Y	NA
7604554	7604555	JTY_1141	JTY_1142	xseA		TRUE	0.935	-3.000	0.024	NA		NA
7604558	7604559	JTY_1145	JTY_1146	ychF		FALSE	0.127	88.000	0.000	NA		NA
7604559	7604560	JTY_1146	JTY_1147			TRUE	0.992	-3.000	0.689	NA		NA
7604560	7604561	JTY_1147	JTY_1148			FALSE	0.019	203.000	0.000	NA		NA
7604561	7604562	JTY_1148	JTY_1149			FALSE	0.077	118.000	0.000	NA		NA
7604565	7604566	JTY_1152	JTY_1153			FALSE	0.192	33.000	0.000	NA		NA
7604566	7604567	JTY_1153	JTY_1154			TRUE	0.983	-3.000	0.000	0.005		NA
7604568	7604569	JTY_1155	JTY_1156	zwf1	gnd2	TRUE	0.872	22.000	0.062	1.000	Y	NA
7604571	7604572	JTY_1158	JTY_1159	ephC		TRUE	0.882	5.000	0.070	NA		NA
7604573	7604574	JTY_1160	JTY_1161		ppdK	TRUE	0.993	-3.000	0.750	NA		NA
7604574	7604575	JTY_1161	JTY_1162	ppdK		FALSE	0.017	213.000	0.000	NA		NA
7604575	7604576	JTY_1162	JTY_1163			FALSE	0.110	102.000	0.000	NA		NA
7604577	7604578	JTY_1164	JTY_1165		gltA1	TRUE	0.978	-3.000	0.216	1.000		NA
7604578	7604579	JTY_1165	JTY_1166	gltA1		FALSE	0.480	12.000	0.000	NA		NA
7604583	7604584	JTY_1170	JTY_1171			FALSE	0.247	50.000	0.000	1.000		NA
7604585	7604586	JTY_1172	JTY_1173			FALSE	0.343	17.000	0.000	NA		NA
7604586	7604587	JTY_1173	JTY_1174			TRUE	0.974	-3.000	0.176	1.000		NA
7604589	7604590	JTY_1176	JTY_1177	echA11	echA10	TRUE	0.594	143.000	0.000	0.007	Y	NA
7604591	7604592	JTY_1178	JTY_1179	mcr		TRUE	0.953	12.000	0.636	0.098	N	NA
7604592	7604593	JTY_1179	JTY_1180		mmpL13	FALSE	0.005	515.000	0.000	1.000		NA
7604593	7604594	JTY_1180	JTY_1181	mmpL13		FALSE	0.183	133.000	0.080	1.000		NA
7604596	7604597	JTY_1183	JTY_1184			FALSE	0.250	-31.000	0.000	NA		NA
7604600	7604601	JTY_1187	JTY_1188	omt		TRUE	0.955	-3.000	0.091	NA		NA
7604602	7604603	JTY_1189	JTY_1190			FALSE	0.006	434.000	0.000	1.000		NA
7604604	7604605	JTY_1191	JTY_1192			TRUE	0.893	8.000	0.222	NA		NA
7604608	7604609	JTY_1195	JTY_1196	mutT2	narG	FALSE	0.003	308.000	0.000	1.000	N	NA
7604609	7604610	JTY_1196	JTY_1197	narG	narH	TRUE	0.936	39.000	0.227	0.001	Y	NA
7604610	7604611	JTY_1197	JTY_1198	narH	narJ	TRUE	0.912	57.000	0.182	0.002	Y	NA
7604611	7604612	JTY_1198	JTY_1199	narJ	narI	TRUE	0.995	3.000	0.059	0.002	Y	NA
7604612	7604613	JTY_1199	JTY_1200	narI	typA	FALSE	0.247	22.000	0.002	1.000	N	NA
7604613	7604614	JTY_1200	JTY_1201	typA	lpqW	FALSE	0.138	98.000	0.025	1.000	N	NA
7604615	7604616	JTY_1202	JTY_1203		PPE17b	FALSE	0.143	72.000	0.000	NA		NA
7604616	7604617	JTY_1203	JTY_1204	PPE17b	PPE17a	FALSE	0.228	-46.000	0.000	NA		NA
7604617	7604618	JTY_1204	JTY_1205	PPE17a	PE11	FALSE	0.322	18.000	0.000	NA		NA
7604619	7604620	JTY_1206	JTY_1207	mshB		FALSE	0.526	92.000	0.387	NA		NA
7604623	7604624	JTY_1210	JTY_1211		fadH	FALSE	0.020	201.000	0.000	NA		NA
7604624	7604625	JTY_1211	JTY_1212	fadH		TRUE	0.906	-3.000	0.093	NA	N	NA
7604626	7604627	JTY_1213	JTY_1214	fdxC		FALSE	0.231	33.000	0.029	1.000	N	NA
7604629	7604630	JTY_1216	JTY_1217	pks3	papA3	FALSE	0.476	53.000	0.250	NA		NA
7604630	7604631	JTY_1217	JTY_1218	papA3	mmpL10	TRUE	0.803	67.000	1.000	NA		NA
7604632	7604633	JTY_1219	JTY_1220		fadD21	FALSE	0.032	165.000	0.000	NA		NA
7604633	7604634	JTY_1220	JTY_1221	fadD21		FALSE	0.231	177.000	0.000	NA	Y	NA
7604635	7604636	JTY_1222	JTY_1223	rocA		TRUE	0.953	0.000	0.181	1.000	N	NA
7604636	7604637	JTY_1223	JTY_1224		sigI	FALSE	0.074	82.000	0.000	1.000	N	NA
7604637	7604638	JTY_1224	JTY_1225	sigI		FALSE	0.369	16.000	0.000	NA		NA
7604638	7604639	JTY_1225	JTY_1226			FALSE	0.143	73.000	0.000	NA		NA
7604639	7604640	JTY_1226	JTY_1227			FALSE	0.135	82.000	0.000	NA		NA
7604640	7604641	JTY_1227	JTY_1228			FALSE	0.174	40.000	0.000	NA		NA
7604643	7604644	JTY_1230	JTY_1231	PE13	PPE18	FALSE	0.162	47.000	0.000	NA		NA
7604644	7604645	JTY_1231	JTY_1232	PPE18	esxK	FALSE	0.057	135.000	0.000	NA		NA
7604645	7604646	JTY_1232	JTY_1233	esxK	esxL	FALSE	0.158	51.000	0.000	NA		NA
7604651	7604652	JTY_1238	JTY_1239			FALSE	0.305	31.000	0.000	1.000		NA
7604653	7604654	JTY_1240	JTY_1241		fadD6	FALSE	0.549	50.000	0.324	NA		NA
7604654	7604655	JTY_1241	JTY_1242	fadD6	folP2	FALSE	0.312	66.000	0.172	1.000	N	NA
7604655	7604656	JTY_1242	JTY_1243	folP2		TRUE	0.960	-3.000	0.136	NA		NA
7604656	7604657	JTY_1243	JTY_1244			FALSE	0.305	39.000	0.045	NA		NA
7604657	7604658	JTY_1244	JTY_1245		tagA	TRUE	0.929	-3.000	0.013	NA		NA
7604658	7604659	JTY_1245	JTY_1246	tagA		FALSE	0.157	107.000	0.021	NA		NA
7604662	7604663	JTY_1249	JTY_1250	PE14		FALSE	0.059	134.000	0.000	NA		NA
7604663	7604664	JTY_1250	JTY_1251			FALSE	0.491	28.000	0.080	1.000		NA
7604664	7604665	JTY_1251	JTY_1252			TRUE	0.687	9.000	0.111	NA	N	NA
7604665	7604666	JTY_1252	JTY_1253			TRUE	0.940	-3.000	0.185	NA	N	NA
7604666	7604667	JTY_1253	JTY_1254			FALSE	0.545	-10.000	0.000	1.000		NA
7604667	7604668	JTY_1254	JTY_1255			FALSE	0.082	142.000	0.000	1.000		NA
7604669	7604670	JTY_1256	JTY_1257	sigE		FALSE	0.144	158.000	0.224	NA		NA
7604670	7604671	JTY_1257	JTY_1258		htrA	TRUE	0.689	69.000	0.607	NA		NA
7604671	7604672	JTY_1258	JTY_1259	htrA	tatB	TRUE	0.951	2.000	0.242	1.000	N	NA
7604673	7604674	JTY_1260	JTY_1261			FALSE	0.171	111.000	0.054	NA		NA
7604674	7604675	JTY_1261	JTY_1262			TRUE	0.990	-3.000	0.542	NA		NA
7604677	7604678	JTY_1264	JTY_1265	mrp		TRUE	0.601	13.000	0.089	1.000	N	NA
7604678	7604679	JTY_1265	JTY_1266			FALSE	0.184	125.000	0.139	NA		NA
7604679	7604680	JTY_1266	JTY_1267			TRUE	0.994	-3.000	0.806	NA		NA
7604680	7604681	JTY_1267	JTY_1268			FALSE	0.150	62.000	0.000	NA		NA
7604682	7604683	JTY_1269	JTY_1270		lpqY	TRUE	0.623	21.000	0.211	NA		NA
7604683	7604684	JTY_1270	JTY_1271	lpqY	sugA	TRUE	0.998	-3.000	0.252	0.012	Y	NA
7604684	7604685	JTY_1271	JTY_1272	sugA	sugB	TRUE	0.998	5.000	0.723	0.012	Y	NA
7604685	7604686	JTY_1272	JTY_1273	sugB	sugC	TRUE	0.993	5.000	0.191	0.012	Y	NA
7604688	7604689	JTY_1275	JTY_1276	mdh		FALSE	0.141	76.000	0.000	NA		NA
7604689	7604690	JTY_1276	JTY_1277			TRUE	0.994	-3.000	0.800	NA		NA
7604693	7604694	JTY_1280	JTY_1281			FALSE	0.155	57.000	0.000	NA		NA
7604694	7604695	JTY_1281	JTY_1282			TRUE	0.988	-3.000	0.000	NA	Y	NA
7604695	7604696	JTY_1282	JTY_1283		kgd	FALSE	0.006	113.000	0.000	NA	N	NA
7604696	7604697	JTY_1283	JTY_1284	kgd		FALSE	0.034	193.000	0.013	NA		NA
7604699	7604700	JTY_1286	JTY_1287		lprE	FALSE	0.350	56.000	0.133	NA		NA
7604701	7604702	JTY_1288	JTY_1289	deaD		TRUE	0.882	-3.000	0.006	1.000	N	NA
7604703	7604704	JTY_1290	JTY_1291			TRUE	0.961	-3.000	0.143	NA		NA
7604705	7604706	JTY_1292	JTY_1293			TRUE	0.690	2.000	0.016	NA	N	NA
7604706	7604707	JTY_1293	JTY_1294			TRUE	0.790	-15.000	0.000	0.006		NA
7604708	7604709	JTY_1295	JTY_1296			TRUE	0.902	5.000	0.136	NA		NA
7604710	7604711	JTY_1297	JTY_1298	amiB2		FALSE	0.078	75.000	0.000	1.000	N	NA
7604711	7604712	JTY_1298	JTY_1299			FALSE	0.030	173.000	0.000	NA		NA
7604713	7604714	JTY_1300	JTY_1301	pknH	embR	FALSE	0.064	341.000	0.000	1.000	Y	NA
7604714	7604715	JTY_1301	JTY_1302	embR		FALSE	0.011	311.000	0.000	1.000		NA
7604715	7604716	JTY_1302	JTY_1303			FALSE	0.015	223.000	0.000	NA		NA
7604716	7604717	JTY_1303	JTY_1304		lprA	TRUE	0.727	61.000	0.667	NA		NA
7604717	7604718	JTY_1304	JTY_1305	lprA		FALSE	0.017	213.000	0.000	NA		NA
7604718	7604719	JTY_1305	JTY_1306			FALSE	0.096	108.000	0.000	NA		NA
7604719	7604720	JTY_1306	JTY_1307			TRUE	0.999	-3.000	1.000	0.003	Y	NA
7604721	7604722	JTY_1308	JTY_1309	lprB	lprC	TRUE	0.992	-3.000	0.692	NA		NA
7604724	7604725	JTY_1311	JTY_1312			TRUE	0.996	-3.000	0.312	NA	Y	NA
7604725	7604726	JTY_1312	JTY_1313			FALSE	0.155	21.000	0.017	NA	N	NA
7604727	7604728	JTY_1314	JTY_1315	oppA	oppD	TRUE	0.961	-7.000	0.242	1.000	Y	NA
7604728	7604729	JTY_1315	JTY_1316	oppD	oppC	TRUE	0.996	-3.000	0.303	1.000	Y	NA
7604729	7604730	JTY_1316	JTY_1317	oppC	oppB	TRUE	0.999	-3.000	0.846	0.012	Y	NA
7604731	7604732	JTY_1318	JTY_1319	canA	cysD	FALSE	0.240	94.000	0.136	1.000	N	NA
7604732	7604733	JTY_1319	JTY_1320	cysD	cysN	TRUE	0.995	0.000	0.483	0.001	N	NA
7604733	7604734	JTY_1320	JTY_1321	cysN		FALSE	0.164	54.000	0.073	NA	N	NA
7604734	7604735	JTY_1321	JTY_1322			FALSE	0.154	58.000	0.000	NA		NA
7604735	7604736	JTY_1322	JTY_1323			FALSE	0.159	49.000	0.000	NA		NA
7604739	7604740	JTY_1326	JTY_t0018		argV	FALSE	0.005	359.000	0.000	NA		NA
7604741	7604742	JTY_1327	JTY_1328	argS	lysA	TRUE	0.935	-3.000	0.071	1.000	N	NA
7604742	7604743	JTY_1328	JTY_1329	lysA	thrA	TRUE	0.985	4.000	0.071	1.000	Y	NA
7604743	7604744	JTY_1329	JTY_1330	thrA	thrC	TRUE	0.995	-3.000	0.194	1.000	Y	NA
7604744	7604745	JTY_1330	JTY_1331	thrC	thrB	FALSE	0.283	218.000	0.221	1.000	Y	NA
7604745	7604746	JTY_1331	JTY_1332	thrB	rho	FALSE	0.031	257.000	0.000	0.078	N	NA
7604746	7604747	JTY_1332	JTY_1333	rho	rpmE	FALSE	0.084	151.000	0.115	1.000	N	NA
7604747	7604748	JTY_1333	JTY_1334	rpmE	prfA	TRUE	0.734	90.000	0.110	1.000	Y	NA
7604748	7604749	JTY_1334	JTY_1335	prfA	hemK	TRUE	0.993	-3.000	0.069	1.000	Y	NA
7604749	7604750	JTY_1335	JTY_1336	hemK		TRUE	0.965	16.000	0.583	NA	Y	NA
7604750	7604751	JTY_1336	JTY_1337		rfe	FALSE	0.299	84.000	0.248	NA	N	NA
7604751	7604752	JTY_1337	JTY_1338	rfe		FALSE	0.018	257.000	0.000	1.000		NA
7604752	7604753	JTY_1338	JTY_1339		atpB	TRUE	0.706	-7.000	0.021	1.000		NA
7604753	7604754	JTY_1339	JTY_1340	atpB	atpE	TRUE	0.959	49.000	0.557	0.003	Y	NA
7604754	7604755	JTY_1340	JTY_1341	atpE	atpF	TRUE	0.905	31.000	0.012	0.003	Y	NA
7604755	7604756	JTY_1341	JTY_1342	atpF	atpH	TRUE	0.988	7.000	0.008	0.003	Y	NA
7604756	7604757	JTY_1342	JTY_1343	atpH	atpA	TRUE	0.975	45.000	0.864	0.003	Y	NA
7604757	7604758	JTY_1343	JTY_1344	atpA	atpG	TRUE	0.998	7.000	0.846	0.003	Y	NA
7604758	7604759	JTY_1344	JTY_1345	atpG	atpD	TRUE	0.971	40.000	0.724	0.003	Y	NA
7604759	7604760	JTY_1345	JTY_1346	atpD	atpC	TRUE	0.993	14.000	0.837	0.003	Y	NA
7604760	7604761	JTY_1346	JTY_1347	atpC		TRUE	0.806	8.000	0.054	NA		NA
7604762	7604763	JTY_1348	JTY_1349			FALSE	0.054	166.000	0.000	1.000		NA
7604764	7604765	JTY_1350	JTY_r0001	murA	16S_rRNA	FALSE	0.009	269.000	0.000	NA		NA
7604765	7604766	JTY_r0001	JTY_r0002	16S_rRNA	23S_rRNA	FALSE	0.009	276.000	0.000	NA		NA
7604766	7604767	JTY_r0002	JTY_r0003	23S_rRNA	5S_rRNA	FALSE	0.107	104.000	0.000	NA		NA
7604768	7604769	JTY_1351	JTY_1352	ogt	alkA	TRUE	0.998	-3.000	0.093	0.001	Y	NA
7604769	7604770	JTY_1352	JTY_1353	alkA		FALSE	0.075	81.000	0.000	1.000	N	NA
7604770	7604771	JTY_1353	JTY_1354			TRUE	0.852	70.000	0.000	0.002	Y	NA
7604771	7604772	JTY_1354	JTY_1355			TRUE	0.964	13.000	0.000	0.002	Y	NA
7604773	7604774	JTY_1356	JTY_1357			FALSE	0.521	23.000	0.141	NA		NA
7604776	7604777	JTY_1359	JTY_1360	fadA4		FALSE	0.084	130.000	0.035	1.000	N	NA
7604778	7604779	JTY_1361	JTY_1362	PE_PGRS24	glgB	FALSE	0.041	152.000	0.000	NA		NA
7604779	7604780	JTY_1362	JTY_1363	glgB	glgE	TRUE	0.989	8.000	0.159	0.004	Y	NA
7604782	7604783	JTY_1365	JTY_1366	dinG		FALSE	0.388	24.000	0.080	1.000	N	NA
7604784	7604785	JTY_1367	JTY_1368	clpS		TRUE	0.859	-40.000	0.823	NA		NA
7604785	7604786	JTY_1368	JTY_1369			TRUE	0.578	17.000	0.093	NA		NA
7604786	7604787	JTY_1369	JTY_1370			TRUE	0.796	8.000	0.044	NA		NA
7604787	7604788	JTY_1370	JTY_1371			FALSE	0.502	22.000	0.093	NA		NA
7604788	7604789	JTY_1371	JTY_1372		cysM	TRUE	0.694	10.000	0.052	1.000	N	NA
7604789	7604790	JTY_1372	JTY_1373	cysM		TRUE	0.678	-9.000	0.032	1.000		NA
7604790	7604791	JTY_1373	JTY_1374		murI	TRUE	0.955	-3.000	0.024	1.000		NA
7604791	7604792	JTY_1374	JTY_1375	murI		FALSE	0.469	27.000	0.054	1.000		NA
7604792	7604793	JTY_1375	JTY_1376		rph	TRUE	0.617	17.000	0.053	1.000		NA
7604793	7604794	JTY_1376	JTY_1377	rph		FALSE	0.474	39.000	0.262	1.000	N	NA
7604795	7604796	JTY_1378	JTY_1379		lprD	TRUE	0.979	-3.000	0.286	NA		NA
7604797	7604798	JTY_1380	JTY_1381		fadD33	TRUE	0.965	-7.000	0.286	1.000	Y	NA
7604798	7604799	JTY_1381	JTY_1382	fadD33	fadE14	TRUE	0.994	0.000	0.200	1.000	Y	NA
7604801	7604802	JTY_t0019	JTY_1384	leuW		FALSE	0.013	236.000	0.000	NA		NA
7604802	7604803	JTY_1384	JTY_1385			TRUE	0.999	-3.000	0.686	0.003	Y	NA
7604803	7604804	JTY_1385	JTY_1386		fabG	FALSE	0.035	129.000	0.000	1.000	N	NA
7604804	7604805	JTY_1386	JTY_1387	fabG		TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7604805	7604806	JTY_1387	JTY_1388			FALSE	0.019	203.000	0.000	NA		NA
7604807	7604808	JTY_1389	JTY_1390			FALSE	0.180	20.000	0.000	1.000	N	NA
7604808	7604809	JTY_1390	JTY_1391		moeY	FALSE	0.468	9.000	0.000	1.000	N	NA
7604809	7604810	JTY_1391	JTY_1392	moeY		TRUE	0.969	-3.000	0.200	NA		NA
7604810	7604811	JTY_1392	JTY_1393			FALSE	0.003	473.000	0.000	NA		NA
7604812	7604813	JTY_1394	JTY_1395			FALSE	0.530	82.000	0.000	0.005		NA
7604813	7604814	JTY_1395	JTY_1396			FALSE	0.000	423.000	0.000	NA	N	NA
7604815	7604816	JTY_1397	JTY_1398	PPE19		FALSE	0.006	315.000	0.000	NA		NA
7604816	7604817	JTY_1398	JTY_1399			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7604817	7604818	JTY_1399	JTY_1400			FALSE	0.007	291.000	0.000	NA		NA
7604818	7604819	JTY_1400	JTY_1401			FALSE	0.415	139.000	0.000	1.000	Y	NA
7604822	7604823	JTY_1404	JTY_1405	lprF		FALSE	0.021	196.000	0.000	NA		NA
7604823	7604824	JTY_1405	JTY_1406			FALSE	0.261	-478.000	0.000	1.000		NA
7604824	7604825	JTY_1406	JTY_1407			TRUE	0.910	-3.000	0.028	1.000	N	NA
7604825	7604826	JTY_1407	JTY_1408			TRUE	0.816	6.000	0.000	1.000		NA
7604826	7604827	JTY_1408	JTY_1409			TRUE	0.750	-33.000	0.000	0.001		NA
7604829	7604830	JTY_1411	JTY_1412			TRUE	0.978	-3.000	0.282	NA		NA
7604831	7604832	JTY_1413	JTY_1414			FALSE	0.542	11.000	0.000	NA		NA
7604833	7604834	JTY_1415	JTY_1416	pyrR	pyrB	TRUE	0.995	-3.000	0.247	1.000	Y	NA
7604834	7604835	JTY_1416	JTY_1417	pyrB	pyrC	TRUE	0.997	-3.000	0.452	1.000	Y	NA
7604835	7604836	JTY_1417	JTY_1418	pyrC		TRUE	0.947	-3.000	0.057	NA		NA
7604836	7604837	JTY_1418	JTY_1419		carA	TRUE	0.945	-3.000	0.050	NA		NA
7604837	7604838	JTY_1419	JTY_1420	carA	carB	TRUE	0.999	0.000	0.345	0.001	Y	NA
7604838	7604839	JTY_1420	JTY_1421	carB	pyrF	TRUE	0.993	-3.000	0.075	1.000	Y	NA
7604839	7604840	JTY_1421	JTY_1422	pyrF	PE15	FALSE	0.021	195.000	0.000	NA		NA
7604840	7604841	JTY_1422	JTY_1423	PE15	PPE20	TRUE	0.992	-3.000	0.667	NA		NA
7604841	7604842	JTY_1423	JTY_1424	PPE20	mihF	FALSE	0.007	306.000	0.000	NA		NA
7604842	7604843	JTY_1424	JTY_1425	mihF	gmk	FALSE	0.159	135.000	0.054	1.000		NA
7604843	7604844	JTY_1425	JTY_1426	gmk	rpoZ	TRUE	0.588	66.000	0.471	1.000	N	NA
7604844	7604845	JTY_1426	JTY_1427	rpoZ	dfp	TRUE	0.631	16.000	0.192	1.000	N	NA
7604845	7604846	JTY_1427	JTY_1428	dfp	metK	FALSE	0.557	128.000	0.059	1.000	Y	NA
7604847	7604848	JTY_1429	JTY_1430		cyp132	TRUE	0.807	-3.000	0.000	1.000	N	NA
7604850	7604851	JTY_1432	JTY_1433	PE_PGRS25		FALSE	0.011	255.000	0.000	NA		NA
7604851	7604852	JTY_1433	JTY_1434			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7604852	7604853	JTY_1434	JTY_1435		lipH	FALSE	0.210	83.000	0.000	1.000		NA
7604853	7604854	JTY_1435	JTY_1436	lipH	lipI	TRUE	0.944	25.000	0.250	0.019	Y	NA
7604855	7604856	JTY_1437	JTY_1438		priA	FALSE	0.250	81.000	0.050	NA		NA
7604860	7604861	JTY_1442	JTY_1443	fmt	fmu	TRUE	0.996	-3.000	0.305	1.000	Y	NA
7604861	7604862	JTY_1443	JTY_1444	fmu	rpe	FALSE	0.336	25.000	0.056	1.000	N	NA
7604862	7604863	JTY_1444	JTY_1445	rpe	ribG	TRUE	0.910	-3.000	0.028	1.000	N	NA
7604864	7604865	JTY_1446	JTY_1447		lprG	TRUE	0.935	6.000	0.286	NA		NA
7604866	7604867	JTY_1448	JTY_1449	ribC		FALSE	0.017	214.000	0.000	NA		NA
7604867	7604868	JTY_1449	JTY_1450			FALSE	0.408	-10.000	0.000	NA		NA
7604868	7604869	JTY_1450	JTY_1451		ribA2	FALSE	0.104	105.000	0.000	NA		NA
7604869	7604870	JTY_1451	JTY_1452	ribA2	ribH	TRUE	0.965	15.000	0.041	0.002	Y	NA
7604870	7604871	JTY_1452	JTY_1453	ribH		TRUE	0.929	-3.000	0.014	NA		NA
7604871	7604872	JTY_1453	JTY_1454		lprH	FALSE	0.492	25.000	0.143	NA		NA
7604872	7604873	JTY_1454	JTY_1455	lprH		FALSE	0.027	180.000	0.000	NA		NA
7604873	7604874	JTY_1455	JTY_1456		uvrC	FALSE	0.147	64.000	0.000	NA		NA
7604874	7604875	JTY_1456	JTY_1457	uvrC		TRUE	0.952	-3.000	0.073	NA		NA
7604875	7604876	JTY_1457	JTY_1458			TRUE	0.977	-3.000	0.259	NA		NA
7604876	7604877	JTY_1458	JTY_1459		whiA	TRUE	0.988	-3.000	0.470	NA		NA
7604880	7604881	JTY_1462	JTY_1463	lipO	fadD12	TRUE	0.998	0.000	0.857	1.000	Y	NA
7604881	7604882	JTY_1463	JTY_1464	fadD12		TRUE	0.996	4.000	0.429	0.095	Y	NA
7604883	7604884	JTY_1465	JTY_1466		PE16	FALSE	0.012	240.000	0.000	NA		NA
7604884	7604885	JTY_1466	JTY_1467	PE16		FALSE	0.087	111.000	0.000	NA		NA
7604885	7604886	JTY_1467	JTY_1468			TRUE	0.989	-3.000	0.500	NA		NA
7604886	7604887	JTY_1468	JTY_1469			FALSE	0.033	164.000	0.000	NA		NA
7604887	7604888	JTY_1469	JTY_1470			TRUE	0.880	0.000	0.000	NA		NA
7604890	7604891	JTY_1472	JTY_1473	gap	pgk	TRUE	0.995	3.000	0.055	0.003	Y	NA
7604891	7604892	JTY_1473	JTY_1474	pgk	tpiA	TRUE	0.993	-3.000	0.075	1.000	Y	NA
7604897	7604898	JTY_1479	JTY_1480			FALSE	0.003	607.000	0.000	NA		NA
7604898	7604899	JTY_1480	JTY_1481		devB	FALSE	0.504	17.000	0.038	NA		NA
7604899	7604900	JTY_1481	JTY_1482	devB	opcA	TRUE	0.993	-3.000	0.179	NA	Y	NA
7604900	7604901	JTY_1482	JTY_1483	opcA	zwf2	TRUE	0.746	53.000	0.104	NA	Y	NA
7604901	7604902	JTY_1483	JTY_1484	zwf2	tal	TRUE	0.993	-3.000	0.067	1.000	Y	NA
7604902	7604903	JTY_1484	JTY_1485	tal	tkt	TRUE	0.907	17.000	0.090	1.000	Y	NA
7604903	7604904	JTY_1485	JTY_1486	tkt	PE_PGRS27	FALSE	0.003	439.000	0.000	NA		NA
7604910	7604911	JTY_1492	JTY_1493			FALSE	0.397	112.000	0.022	0.041		NA
7604911	7604912	JTY_1493	JTY_1494			TRUE	0.975	-3.000	0.186	1.000		NA
7604912	7604913	JTY_1494	JTY_1495			FALSE	0.227	156.000	0.357	NA		NA
7604914	7604915	JTY_1496	JTY_1497			TRUE	0.942	-3.000	0.100	1.000	N	NA
7604915	7604916	JTY_1497	JTY_1498			TRUE	0.992	-3.000	0.266	0.001	N	NA
7604916	7604917	JTY_1498	JTY_1499			TRUE	0.997	-3.000	0.482	1.000	Y	NA
7604917	7604918	JTY_1499	JTY_1500		csd	TRUE	0.909	2.000	0.093	1.000	N	NA
7604918	7604919	JTY_1500	JTY_1501	csd		TRUE	0.969	-3.000	0.249	1.000	N	NA
7604919	7604920	JTY_1501	JTY_1502			FALSE	0.534	-25.000	0.152	NA		NA
7604921	7604922	JTY_1503	JTY_1504	fadE15	PE_PGRS29	FALSE	0.320	107.000	0.222	NA		NA
7604923	7604924	JTY_1505	JTY_1506	ctpD	trxA	FALSE	0.181	44.000	0.018	1.000	N	NA
7604924	7604925	JTY_1506	JTY_1507	trxA	trxB1	TRUE	0.973	16.000	0.222	0.003	Y	NA
7604925	7604926	JTY_1507	JTY_1508	trxB1	echA12	TRUE	0.822	22.000	0.636	1.000	N	NA
7604926	7604927	JTY_1508	JTY_1509	echA12		FALSE	0.448	36.000	0.090	1.000		NA
7604927	7604928	JTY_1509	JTY_1510			FALSE	0.333	97.000	0.191	NA		NA
7604929	7604930	JTY_1511	JTY_1512		acn	TRUE	0.830	11.000	0.256	1.000	N	NA
7604931	7604932	JTY_1513	JTY_1514			FALSE	0.014	226.000	0.000	NA		NA
7604932	7604933	JTY_1514	JTY_1515			TRUE	0.853	11.000	0.250	NA		NA
7604933	7604934	JTY_1515	JTY_1516		moxR1	FALSE	0.135	139.000	0.120	NA		NA
7604934	7604935	JTY_1516	JTY_1517	moxR1		TRUE	0.995	-3.000	0.920	NA		NA
7604935	7604936	JTY_1517	JTY_1518			TRUE	0.955	11.000	0.760	NA		NA
7604938	7604939	JTY_1520	JTY_1521	fabG1	inhA	TRUE	0.936	19.000	0.078	0.094	Y	NA
7604939	7604940	JTY_1521	JTY_1522	inhA	hemZ	TRUE	0.776	6.000	0.038	1.000	N	NA
7604942	7604943	JTY_1524	JTY_1525			TRUE	0.900	22.000	0.259	NA	Y	NA
7604943	7604944	JTY_1525	JTY_1526			TRUE	0.757	10.000	0.049	NA		NA
7604944	7604945	JTY_1526	JTY_1527			FALSE	0.189	34.000	0.000	NA		NA
7604945	7604946	JTY_1527	JTY_1528			FALSE	0.043	150.000	0.000	NA		NA
7604948	7604949	JTY_1530	JTY_1531	mutA	mutB	TRUE	0.997	1.000	0.115	0.001	Y	NA
7604949	7604950	JTY_1531	JTY_1532	mutB		FALSE	0.415	14.000	0.000	NA		NA
7604950	7604951	JTY_1532	JTY_1533			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7604951	7604952	JTY_1533	JTY_1534			TRUE	0.807	-3.000	0.000	1.000	N	NA
7604952	7604953	JTY_1534	JTY_1535		lipL	FALSE	0.158	53.000	0.011	1.000	N	NA
7604954	7604955	JTY_1536	JTY_1537			FALSE	0.017	214.000	0.000	NA		NA
7604956	7604957	JTY_1538	JTY_1539			FALSE	0.164	45.000	0.000	NA		NA
7604957	7604958	JTY_1539	JTY_1540			TRUE	0.612	12.000	0.167	NA	N	NA
7604958	7604959	JTY_1540	JTY_1541			FALSE	0.044	213.000	0.105	NA		NA
7604960	7604961	JTY_1542	JTY_1543			FALSE	0.133	137.000	0.027	1.000		NA
7604962	7604963	JTY_1544	JTY_1545			TRUE	0.631	9.000	0.000	NA		NA
7604963	7604964	JTY_1545	JTY_1546			FALSE	0.065	130.000	0.000	NA		NA
7604964	7604965	JTY_1546	JTY_1547			FALSE	0.231	26.000	0.000	NA		NA
7604965	7604966	JTY_1547	JTY_1548		fadD25	FALSE	0.001	234.000	0.000	NA	N	NA
7604968	7604969	JTY_1550	JTY_1551			FALSE	0.118	30.000	0.000	1.000	N	NA
7604969	7604970	JTY_1551	JTY_1552		wbbL2	FALSE	0.162	47.000	0.000	NA		NA
7604971	7604972	JTY_1553	JTY_1554		pks5	FALSE	0.157	23.000	0.000	1.000	N	NA
7604972	7604973	JTY_1554	JTY_1555	pks5	papA4	FALSE	0.003	544.000	0.000	NA		NA
7604974	7604975	JTY_1556	JTY_1557	fadD24	adh	FALSE	0.042	117.000	0.000	1.000	N	NA
7604975	7604976	JTY_1557	JTY_1558	adh		TRUE	0.980	-3.000	0.300	NA		NA
7604978	7604979	JTY_1560	JTY_1561			TRUE	0.934	-3.000	0.000	1.000		NA
7604979	7604980	JTY_1561	JTY_1562			FALSE	0.003	565.000	0.000	NA		NA
7604980	7604981	JTY_1562	JTY_1563		ileS	FALSE	0.007	307.000	0.000	NA		NA
7604981	7604982	JTY_1563	JTY_1564	ileS	dinX	FALSE	0.018	212.000	0.014	1.000	N	NA
7604984	7604985	JTY_1566	JTY_1567	lspA		TRUE	0.627	-7.000	0.073	1.000	N	NA
7604986	7604987	JTY_1568	JTY_1569	lprI	glbN	FALSE	0.279	55.000	0.050	NA		NA
7604988	7604989	JTY_1570	JTY_1571			TRUE	0.992	5.000	0.750	0.040		NA
7604989	7604990	JTY_1571	JTY_1572			FALSE	0.278	22.000	0.000	NA		NA
7604990	7604991	JTY_1572	JTY_1573			FALSE	0.159	49.000	0.000	NA		NA
7604991	7604992	JTY_1573	JTY_1574		dnaE	FALSE	0.192	68.000	0.003	NA		NA
7604994	7604995	JTY_1576	JTY_1577	fadD11	plsB1	TRUE	0.976	14.000	0.333	0.093	Y	NA
7604995	7604996	JTY_1577	JTY_1578	plsB1	frdA	FALSE	0.002	370.000	0.000	1.000	N	NA
7604996	7604997	JTY_1578	JTY_1579	frdA	frdB	TRUE	0.998	3.000	0.470	0.005	Y	NA
7604997	7604998	JTY_1579	JTY_1580	frdB	frdC	TRUE	0.943	63.000	0.454	0.005	Y	NA
7604998	7604999	JTY_1580	JTY_1581	frdC	frdD	TRUE	0.999	-3.000	0.787	0.005	Y	NA
7604999	7605000	JTY_1581	JTY_1582	frdD		FALSE	0.080	68.000	0.000	1.000	N	NA
7605000	7605001	JTY_1582	JTY_1583		mmpS6	FALSE	0.327	139.000	0.429	NA		NA
7605001	7605002	JTY_1583	JTY_1584	mmpS6	mmpL6	TRUE	0.993	-3.000	0.750	NA		NA
7605002	7605003	JTY_1584	JTY_1585	mmpL6		TRUE	0.599	10.000	0.000	NA		NA
7605003	7605004	JTY_1585	JTY_1586		ilvA	FALSE	0.302	35.000	0.033	NA		NA
7605004	7605005	JTY_1586	JTY_1587	ilvA		FALSE	0.014	38.000	0.000	NA	N	NA
7605005	7605006	JTY_1587	JTY_1588			TRUE	0.718	6.000	0.000	NA		NA
7605007	7605008	JTY_1589	JTY_1590	treZb	treZa	TRUE	0.984	-3.000	0.000	0.004		NA
7605008	7605009	JTY_1590	JTY_1591	treZa	treY	TRUE	0.877	-7.000	0.000	0.004		NA
7605009	7605010	JTY_1591	JTY_1592	treY	treX	TRUE	0.994	4.000	0.061	0.004	Y	NA
7605010	7605011	JTY_1592	JTY_1593	treX		FALSE	0.279	39.000	0.073	1.000	N	NA
7605011	7605012	JTY_1593	JTY_1594			FALSE	0.414	99.000	0.400	NA	N	NA
7605012	7605013	JTY_1594	JTY_1595			FALSE	0.012	240.000	0.000	NA		NA
7605014	7605015	JTY_1596	JTY_1597	bioA	bioF1	TRUE	0.997	-3.000	0.033	0.001	Y	NA
7605015	7605016	JTY_1597	JTY_1598	bioF1	bioD	TRUE	0.998	-3.000	0.214	0.001	Y	NA
7605016	7605017	JTY_1598	JTY_1599	bioD		TRUE	0.954	0.000	0.036	1.000		NA
7605018	7605019	JTY_1600	JTY_1601			FALSE	0.187	-229.000	0.000	NA		NA
7605020	7605021	JTY_1602	JTY_1603	bioB		TRUE	0.919	1.000	0.041	NA		NA
7605021	7605022	JTY_1603	JTY_1604			TRUE	0.984	-3.000	0.361	NA		NA
7605023	7605024	JTY_1605	JTY_1606			FALSE	0.052	257.000	0.273	NA		NA
7605025	7605026	JTY_1607	JTY_1608	nadA	nadB	TRUE	0.998	0.000	0.210	0.003	Y	NA
7605026	7605027	JTY_1608	JTY_1609	nadB	nadC	TRUE	0.998	0.000	0.223	0.003	Y	NA
7605027	7605028	JTY_1609	JTY_1610	nadC		FALSE	0.248	49.000	0.000	1.000		NA
7605030	7605031	JTY_1612	JTY_1613	hisD	hisC1	TRUE	0.997	-3.000	0.112	0.004	Y	NA
7605031	7605032	JTY_1613	JTY_1614	hisC1	hisB	TRUE	0.998	-3.000	0.341	0.004	Y	NA
7605032	7605033	JTY_1614	JTY_1615	hisB	hisH	TRUE	0.997	-3.000	0.046	0.004	Y	NA
7605033	7605034	JTY_1615	JTY_1616	hisH	hisA	TRUE	0.994	10.000	0.491	0.004	Y	NA
7605034	7605035	JTY_1616	JTY_1617	hisA	impA	TRUE	0.891	8.000	0.266	1.000	N	NA
7605035	7605036	JTY_1617	JTY_1618	impA	hisF	TRUE	0.855	2.000	0.021	1.000	N	NA
7605036	7605037	JTY_1618	JTY_1619	hisF	hisI	TRUE	0.999	-3.000	0.430	0.004	Y	NA
7605037	7605038	JTY_1619	JTY_1620	hisI	chaA	FALSE	0.022	181.000	0.002	1.000	N	NA
7605040	7605041	JTY_1622	JTY_1623	trpE		TRUE	0.916	-10.000	0.690	NA		NA
7605041	7605042	JTY_1623	JTY_1624		trpC	FALSE	0.256	90.000	0.070	NA		NA
7605042	7605043	JTY_1624	JTY_1625	trpC	trpB	TRUE	0.893	69.000	0.070	0.001	Y	NA
7605043	7605044	JTY_1625	JTY_1626	trpB	trpA	TRUE	0.998	0.000	0.153	0.001	Y	NA
7605044	7605045	JTY_1626	JTY_1627	trpA	lgt	TRUE	0.880	0.000	0.011	1.000	N	NA
7605045	7605046	JTY_1627	JTY_1628	lgt		FALSE	0.002	676.000	0.000	NA		NA
7605046	7605047	JTY_1628	JTY_1629			TRUE	0.654	-10.000	0.111	NA		NA
7605047	7605048	JTY_1629	JTY_1630		pykA	FALSE	0.212	108.000	0.083	NA		NA
7605048	7605049	JTY_1630	JTY_1631	pykA	tesB1	TRUE	0.922	8.000	0.361	1.000	N	NA
7605049	7605050	JTY_1631	JTY_1632	tesB1		FALSE	0.429	58.000	0.214	NA		NA
7605051	7605052	JTY_1633	JTY_1634	cydC	cydD	TRUE	0.999	-3.000	0.631	0.003	Y	NA
7605052	7605053	JTY_1634	JTY_1635	cydD	cydB	TRUE	0.751	87.000	0.151	1.000	Y	NA
7605053	7605054	JTY_1635	JTY_1636	cydB	cydA	TRUE	0.977	30.000	0.925	0.040	Y	NA
7605054	7605055	JTY_1636	JTY_1637	cydA		FALSE	0.205	111.000	0.104	NA		NA
7605055	7605056	JTY_1637	JTY_1638		cya	FALSE	0.481	29.000	0.176	NA		NA
7605056	7605057	JTY_1638	JTY_t0020	cya	leuV	FALSE	0.046	145.000	0.000	NA		NA
7605059	7605060	JTY_1640	JTY_1641			TRUE	0.994	-3.000	0.850	NA		NA
7605061	7605062	JTY_1642	JTY_1643	polA	rpsA	FALSE	0.030	163.000	0.005	1.000	N	NA
7605062	7605063	JTY_1643	JTY_1644	rpsA	coaE	FALSE	0.261	26.000	0.024	1.000	N	NA
7605065	7605066	JTY_1646	JTY_1647	uvrB		TRUE	0.923	-3.000	0.006	NA		NA
7605071	7605072	JTY_1652	JTY_1653			FALSE	0.369	16.000	0.000	NA		NA
7605072	7605073	JTY_1653	JTY_1654		lysS	FALSE	0.287	59.000	0.057	NA		NA
7605074	7605075	JTY_1655	JTY_1656	infC	rpmI	TRUE	0.920	50.000	0.652	1.000	Y	NA
7605075	7605076	JTY_1656	JTY_1657	rpmI	rplT	TRUE	0.968	62.000	0.928	0.014	Y	NA
7605076	7605077	JTY_1657	JTY_1658	rplT	tsnR	TRUE	0.894	33.000	0.057	0.013	Y	NA
7605079	7605080	JTY_1660	JTY_1661	PE17		FALSE	0.331	78.000	0.143	NA		NA
7605080	7605081	JTY_1661	JTY_1662			TRUE	0.900	7.000	0.214	NA		NA
7605081	7605082	JTY_1662	JTY_1663		pheS	FALSE	0.029	196.000	0.002	NA		NA
7605082	7605083	JTY_1663	JTY_1664	pheS	pheT	TRUE	0.999	0.000	0.574	0.001	Y	NA
7605085	7605086	JTY_1666	JTY_1667	argC	argJ	TRUE	0.998	-3.000	0.303	0.002	Y	NA
7605086	7605087	JTY_1667	JTY_1668	argJ	argB	TRUE	0.998	-3.000	0.239	0.002	Y	NA
7605087	7605088	JTY_1668	JTY_1669	argB	argD	TRUE	0.994	-3.000	0.105	1.000	Y	NA
7605088	7605089	JTY_1669	JTY_1670	argD	argF	TRUE	0.994	-3.000	0.091	1.000	Y	NA
7605089	7605090	JTY_1670	JTY_1671	argF	argR	TRUE	0.940	-3.000	0.088	1.000	N	NA
7605090	7605091	JTY_1671	JTY_1672	argR	argG	TRUE	0.726	9.000	0.054	1.000	N	NA
7605091	7605092	JTY_1672	JTY_1673	argG	argH	TRUE	0.824	80.000	0.278	1.000	Y	NA
7605092	7605093	JTY_1673	JTY_1674	argH	pks10	FALSE	0.082	109.000	0.003	1.000	N	NA
7605093	7605094	JTY_1674	JTY_1675	pks10	pks7	TRUE	0.965	83.000	1.000	0.018	Y	NA
7605094	7605095	JTY_1675	JTY_1676	pks7	pks8	TRUE	0.988	20.000	1.000	0.008	Y	NA
7605095	7605096	JTY_1676	JTY_1677	pks8	pks17	TRUE	0.995	0.000	0.000	0.009	Y	NA
7605096	7605097	JTY_1677	JTY_1678	pks17	pks9	TRUE	0.987	6.000	0.000	0.005	Y	NA
7605097	7605098	JTY_1678	JTY_1679	pks9	pks11	TRUE	0.865	147.000	0.750	0.018	Y	NA
7605099	7605100	JTY_1680	JTY_1681	cyp139		TRUE	0.600	15.000	0.008	1.000		NA
7605101	7605102	JTY_1682	JTY_1683			FALSE	0.192	33.000	0.000	NA		NA
7605102	7605103	JTY_1683	JTY_1684			TRUE	0.658	8.000	0.000	NA		NA
7605104	7605105	JTY_1685	JTY_1686			FALSE	0.009	93.000	0.000	NA	N	NA
7605105	7605106	JTY_1686	JTY_1687			FALSE	0.018	28.000	0.000	NA	N	NA
7605106	7605107	JTY_1687	JTY_1688			FALSE	0.021	325.000	0.000	0.027	N	NA
7605108	7605109	JTY_1689	JTY_1690		dsbF	TRUE	0.986	-3.000	0.000	0.002		NA
7605109	7605110	JTY_1690	JTY_1691	dsbF		FALSE	0.112	101.000	0.000	NA		NA
7605110	7605111	JTY_1691	JTY_1692		fadE16	TRUE	0.934	0.000	0.037	NA		NA
7605111	7605112	JTY_1692	JTY_1693	fadE16		TRUE	0.809	9.000	0.222	NA	N	NA
7605112	7605113	JTY_1693	JTY_1694		moeX	TRUE	0.944	-3.000	0.047	NA		NA
7605113	7605114	JTY_1694	JTY_1695	moeX		FALSE	0.035	161.000	0.000	NA		NA
7605114	7605115	JTY_1695	JTY_1696			FALSE	0.010	263.000	0.000	NA		NA
7605115	7605116	JTY_1696	JTY_1697			TRUE	0.597	-7.000	0.013	NA		NA
7605117	7605118	JTY_1698	JTY_1699			TRUE	0.981	2.000	0.400	1.000		NA
7605118	7605119	JTY_1699	JTY_1700			TRUE	0.848	72.000	0.089	0.075	Y	NA
7605120	7605121	JTY_1701	JTY_1702		tyrS	TRUE	0.614	12.000	0.067	1.000	N	NA
7605121	7605122	JTY_1702	JTY_1703	tyrS	lprJ	FALSE	0.002	651.000	0.000	NA		NA
7605122	7605123	JTY_1703	JTY_1704	lprJ		FALSE	0.176	39.000	0.000	NA		NA
7605123	7605124	JTY_1704	JTY_1705			TRUE	0.991	-3.000	0.500	1.000		NA
7605124	7605125	JTY_1705	JTY_1706			TRUE	0.954	-3.000	0.083	NA		NA
7605125	7605126	JTY_1706	JTY_1707		tlyA	TRUE	0.757	8.000	0.014	NA		NA
7605126	7605127	JTY_1707	JTY_1708	tlyA	ppnK	TRUE	0.940	0.000	0.120	1.000	N	NA
7605127	7605128	JTY_1708	JTY_1709	ppnK	recN	TRUE	0.582	14.000	0.094	1.000	N	NA
7605128	7605129	JTY_1709	JTY_1710	recN		FALSE	0.499	96.000	0.049	0.075		NA
7605129	7605130	JTY_1710	JTY_1711			TRUE	0.878	22.000	0.798	NA		NA
7605130	7605131	JTY_1711	JTY_1712		pyrG	FALSE	0.080	140.000	0.014	NA		NA
7605131	7605132	JTY_1712	JTY_1713	pyrG		TRUE	0.745	-7.000	0.055	1.000		NA
7605132	7605133	JTY_1713	JTY_1714		xerD	TRUE	0.964	-3.000	0.063	1.000		NA
7605134	7605135	JTY_1715	JTY_1716			FALSE	0.003	555.000	0.000	NA		NA
7605135	7605136	JTY_1716	JTY_1717		cycA	FALSE	0.230	65.000	0.000	1.000		NA
7605136	7605137	JTY_1717	JTY_1718	cycA	PPE22	FALSE	0.013	41.000	0.000	NA	N	NA
7605137	7605138	JTY_1718	JTY_1719	PPE22	PPE23	TRUE	0.689	40.000	0.000	NA	Y	NA
7605138	7605139	JTY_1719	JTY_1720	PPE23		FALSE	0.003	604.000	0.000	NA		NA
7605140	7605141	JTY_1721	JTY_1722			FALSE	0.196	18.000	0.000	1.000	N	NA
7605141	7605142	JTY_1722	JTY_1723			TRUE	0.950	-3.000	0.065	NA		NA
7605142	7605143	JTY_1723	JTY_1724			TRUE	0.990	-3.000	0.570	NA		NA
7605143	7605144	JTY_1724	JTY_1725			TRUE	0.954	-3.000	0.224	NA	N	NA
7605144	7605145	JTY_1725	JTY_1726		cmk	TRUE	0.920	-3.000	0.042	1.000	N	NA
7605145	7605146	JTY_1726	JTY_1727	cmk	engA	TRUE	0.963	-3.000	0.060	1.000		NA
7605146	7605147	JTY_1727	JTY_1728	engA		FALSE	0.050	174.000	0.000	1.000		NA
7605147	7605148	JTY_1728	JTY_1729		fadB3	TRUE	0.938	-6.000	0.000	1.000	Y	NA
7605148	7605149	JTY_1729	JTY_1730	fadB3		TRUE	0.923	3.000	0.105	NA		NA
7605149	7605150	JTY_1730	JTY_1731			TRUE	0.880	0.000	0.000	NA		NA
7605150	7605151	JTY_1731	JTY_1732			FALSE	0.157	53.000	0.000	NA		NA
7605151	7605152	JTY_1732	JTY_1733			FALSE	0.031	208.000	0.000	1.000		NA
7605152	7605153	JTY_1733	JTY_t0021		proT	FALSE	0.022	193.000	0.000	NA		NA
7605154	7605155	JTY_1734	JTY_1735			TRUE	0.964	-3.000	0.167	NA		NA
7605156	7605157	JTY_1736	JTY_1737			TRUE	0.946	-3.000	0.121	1.000	N	NA
7605158	7605159	JTY_1738	JTY_1739			FALSE	0.408	-10.000	0.000	NA		NA
7605160	7605161	JTY_1740	JTY_1741			FALSE	0.192	33.000	0.000	NA		NA
7605162	7605163	JTY_1742	JTY_1743			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7605163	7605164	JTY_1743	JTY_1744			FALSE	0.011	66.000	0.000	NA	N	NA
7605166	7605167	JTY_1746	JTY_1747			FALSE	0.147	64.000	0.000	NA		NA
7605167	7605168	JTY_1747	JTY_1748			FALSE	0.008	287.000	0.000	NA		NA
7605168	7605169	JTY_1748	JTY_1749			FALSE	0.015	275.000	0.000	1.000		NA
7605169	7605170	JTY_1749	JTY_1750		narX	FALSE	0.006	440.000	0.000	1.000		NA
7605170	7605171	JTY_1750	JTY_1751	narX	narK2	FALSE	0.348	-3.000	0.000	NA	N	NA
7605174	7605175	JTY_1754	JTY_1755			TRUE	0.880	0.000	0.000	NA		NA
7605175	7605176	JTY_1755	JTY_1756			FALSE	0.137	81.000	0.000	NA		NA
7605176	7605177	JTY_1756	JTY_1757		pknE	FALSE	0.122	94.000	0.000	NA		NA
7605178	7605179	JTY_1758	JTY_1759		idi	FALSE	0.143	71.000	0.000	NA		NA
7605180	7605181	JTY_1760	JTY_1761	pknF		FALSE	0.357	62.000	0.000	0.074	N	NA
7605181	7605182	JTY_1761	JTY_1762			FALSE	0.004	373.000	0.000	NA		NA
7605183	7605184	JTY_1763	JTY_1764		fadD1	FALSE	0.131	84.000	0.000	NA		NA
7605185	7605186	JTY_1765	JTY_1766			FALSE	0.068	127.000	0.000	NA		NA
7605187	7605188	JTY_1767	JTY_1768	PPE24		FALSE	0.019	204.000	0.000	NA		NA
7605188	7605189	JTY_1768	JTY_1769		plcD	FALSE	0.025	184.000	0.000	NA		NA
7605189	7605190	JTY_1769	JTY_1770	plcD		FALSE	0.477	129.000	0.000	1.000	Y	NA
7605191	7605192	JTY_1771	JTY_1772		mmpL14	FALSE	0.034	201.000	0.000	1.000		NA
7605192	7605193	JTY_1772	JTY_1773	mmpL14	cut1	FALSE	0.010	321.000	0.000	1.000		NA
7605194	7605195	JTY_1774	JTY_1775	wag22b	wag22a	TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7605197	7605198	JTY_1777	JTY_1778			TRUE	0.994	0.000	1.000	NA		NA
7605198	7605199	JTY_1778	JTY_1779			FALSE	0.051	140.000	0.000	NA		NA
7605199	7605200	JTY_1779	JTY_1780			FALSE	0.117	98.000	0.000	NA		NA
7605200	7605201	JTY_1780	JTY_1781			FALSE	0.035	161.000	0.000	NA		NA
7605201	7605202	JTY_1781	JTY_1782			FALSE	0.004	627.000	0.000	1.000		NA
7605203	7605204	JTY_1783	JTY_1784			FALSE	0.144	68.000	0.000	NA		NA
7605204	7605205	JTY_1784	JTY_1785		PE_PGRS31	FALSE	0.064	181.000	0.087	NA		NA
7605205	7605206	JTY_1785	JTY_1786	PE_PGRS31		FALSE	0.067	156.000	0.025	NA		NA
7605206	7605207	JTY_1786	JTY_1787			TRUE	0.761	8.000	0.016	NA		NA
7605207	7605208	JTY_1787	JTY_1788			TRUE	0.953	-3.000	0.016	1.000		NA
7605208	7605209	JTY_1788	JTY_1789			FALSE	0.023	189.000	0.000	NA		NA
7605211	7605212	JTY_1791	JTY_1792			TRUE	0.948	0.000	0.080	NA		NA
7605215	7605216	JTY_1795	JTY_1796			FALSE	0.039	156.000	0.000	NA		NA
7605219	7605220	JTY_1799	JTY_1800			TRUE	0.995	-3.000	1.000	NA		NA
7605222	7605223	JTY_1802	JTY_1803		PPE25	FALSE	0.001	270.000	0.000	NA	N	NA
7605223	7605224	JTY_1803	JTY_1804	PPE25	PE18	FALSE	0.140	79.000	0.000	NA		NA
7605224	7605225	JTY_1804	JTY_1805	PE18	PPE26	TRUE	0.914	14.000	0.667	NA		NA
7605225	7605226	JTY_1805	JTY_1806	PPE26	PPE27	FALSE	0.033	454.000	0.000	NA	Y	NA
7605226	7605227	JTY_1806	JTY_1807	PPE27	PE19	FALSE	0.004	427.000	0.000	NA		NA
7605227	7605228	JTY_1807	JTY_1808	PE19	esxM	FALSE	0.047	144.000	0.000	NA		NA
7605228	7605229	JTY_1808	JTY_1809	esxM	esxN	TRUE	0.737	51.000	0.667	NA		NA
7605229	7605230	JTY_1809	JTY_1810	esxN		FALSE	0.562	88.000	0.429	NA		NA
7605230	7605231	JTY_1810	JTY_1811			FALSE	0.009	272.000	0.000	NA		NA
7605231	7605232	JTY_1811	JTY_1812			TRUE	0.905	-22.000	1.000	NA		NA
7605232	7605233	JTY_1812	JTY_1813			TRUE	0.995	-3.000	1.000	NA		NA
7605233	7605234	JTY_1813	JTY_1814			TRUE	0.992	-3.000	0.667	NA		NA
7605234	7605235	JTY_1814	JTY_1815		lppT	FALSE	0.002	627.000	0.000	NA		NA
7605235	7605236	JTY_1815	JTY_1816	lppT	PPE28	FALSE	0.109	103.000	0.000	NA		NA
7605236	7605237	JTY_1816	JTY_1817	PPE28	PPE29	FALSE	0.027	581.000	0.000	NA	Y	NA
7605237	7605238	JTY_1817	JTY_1818	PPE29	PPE30	FALSE	0.494	112.000	0.000	NA	Y	NA
7605239	7605240	JTY_1819	JTY_1820	PE_PGRS32b	PE_PGRS32a	FALSE	0.189	34.000	0.000	NA		NA
7605240	7605241	JTY_1820	JTY_1821	PE_PGRS32a		FALSE	0.026	181.000	0.000	NA		NA
7605241	7605242	JTY_1821	JTY_1822			FALSE	0.005	338.000	0.000	NA		NA
7605243	7605244	JTY_1823	JTY_1824	PE20	PPE31	FALSE	0.392	15.000	0.000	NA		NA
7605244	7605245	JTY_1824	JTY_1825	PPE31	PPE32	FALSE	0.058	324.000	0.000	NA	Y	NA
7605245	7605246	JTY_1825	JTY_1826	PPE32	PPE33a	FALSE	0.497	132.000	0.667	NA		NA
7605246	7605247	JTY_1826	JTY_1827	PPE33a	PPE33b	TRUE	0.851	1.000	0.000	NA		NA
7605247	7605248	JTY_1827	JTY_1828	PPE33b		FALSE	0.012	239.000	0.000	NA		NA
7605248	7605249	JTY_1828	JTY_1829			FALSE	0.063	154.000	0.014	NA		NA
7605250	7605251	JTY_1830	JTY_1831			FALSE	0.006	322.000	0.000	NA		NA
7605252	7605253	JTY_1832	JTY_1833	erg3		FALSE	0.191	105.000	0.045	NA		NA
7605253	7605254	JTY_1833	JTY_1834			FALSE	0.233	63.000	0.000	1.000		NA
7605254	7605255	JTY_1834	JTY_1835			FALSE	0.003	481.000	0.000	NA		NA
7605255	7605256	JTY_1835	JTY_1836			FALSE	0.142	74.000	0.000	NA		NA
7605257	7605258	JTY_1837	JTY_1838	PE_PGRS33		FALSE	0.057	135.000	0.000	NA		NA
7605259	7605260	JTY_1839	JTY_1840	ilvG	secA2	FALSE	0.547	15.000	0.082	1.000	N	NA
7605260	7605261	JTY_1840	JTY_1841	secA2	pgsA2	FALSE	0.028	197.000	0.038	1.000	N	NA
7605261	7605262	JTY_1841	JTY_1842	pgsA2		TRUE	0.721	-7.000	0.114	NA		NA
7605262	7605263	JTY_1842	JTY_1843			TRUE	0.691	29.000	0.409	NA		NA
7605263	7605264	JTY_1843	JTY_1844			TRUE	0.813	17.000	0.409	NA		NA
7605264	7605265	JTY_1844	JTY_1845		gcvH	TRUE	0.663	38.000	0.434	NA		NA
7605265	7605266	JTY_1845	JTY_1846	gcvH	cfp17	FALSE	0.032	240.000	0.242	NA	N	NA
7605266	7605267	JTY_1846	JTY_1847	cfp17		TRUE	0.989	-3.000	0.707	NA	N	NA
7605267	7605268	JTY_1847	JTY_1848			FALSE	0.191	119.000	0.133	NA		NA
7605268	7605269	JTY_1848	JTY_1849			FALSE	0.010	348.000	0.043	NA		NA
7605269	7605270	JTY_1849	JTY_1850			FALSE	0.253	53.000	0.028	NA		NA
7605270	7605271	JTY_1850	JTY_1851		gcvB	FALSE	0.208	49.000	0.002	NA		NA
7605274	7605275	JTY_1854	JTY_1855			FALSE	0.369	16.000	0.000	NA		NA
7605275	7605276	JTY_1855	JTY_1856		glcB	FALSE	0.170	120.000	0.089	NA		NA
7605276	7605277	JTY_1856	JTY_1857	glcB		FALSE	0.009	276.000	0.000	NA		NA
7605277	7605278	JTY_1857	JTY_1858			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7605278	7605279	JTY_1858	JTY_1859		PE_PGRS34b	FALSE	0.153	59.000	0.000	NA		NA
7605279	7605280	JTY_1859	JTY_1860	PE_PGRS34b	PE_PGRS34a	FALSE	0.177	-318.000	0.000	NA		NA
11493287	7605278		JTY_1858			FALSE	NA	369.000	0.000	NA		NA
11635650	7605278		JTY_1858			FALSE	NA	369.000	0.000	NA		NA
11778042	7605278		JTY_1858			FALSE	NA	369.000	0.000	NA		NA
11493288	7605278		JTY_1858			FALSE	NA	389.000	0.000	NA		NA
11635651	7605278		JTY_1858			FALSE	NA	389.000	0.000	NA		NA
11778043	7605278		JTY_1858			FALSE	NA	389.000	0.000	NA		NA
11493289	7605278		JTY_1858			FALSE	NA	438.000	0.000	NA		NA
11635652	7605278		JTY_1858			FALSE	NA	438.000	0.000	NA		NA
11778044	7605278		JTY_1858			FALSE	NA	438.000	0.000	NA		NA
11493290	7605278		JTY_1858			FALSE	NA	458.000	0.000	NA		NA
11635653	7605278		JTY_1858			FALSE	NA	458.000	0.000	NA		NA
11778045	7605278		JTY_1858			FALSE	NA	458.000	0.000	NA		NA
11493291	7605278		JTY_1858			FALSE	NA	477.000	0.000	NA		NA
11635654	7605278		JTY_1858			FALSE	NA	477.000	0.000	NA		NA
11778046	7605278		JTY_1858			FALSE	NA	477.000	0.000	NA		NA
11493292	7605278		JTY_1858			FALSE	NA	497.000	0.000	NA		NA
11635655	7605278		JTY_1858			FALSE	NA	497.000	0.000	NA		NA
11778047	7605278		JTY_1858			FALSE	NA	497.000	0.000	NA		NA
11493293	7605278		JTY_1858			FALSE	NA	528.000	0.000	NA		NA
11635656	7605278		JTY_1858			FALSE	NA	528.000	0.000	NA		NA
11778048	7605278		JTY_1858			FALSE	NA	528.000	0.000	NA		NA
11493294	7605278		JTY_1858			FALSE	NA	548.000	0.000	NA		NA
11635657	7605278		JTY_1858			FALSE	NA	548.000	0.000	NA		NA
11778049	7605278		JTY_1858			FALSE	NA	548.000	0.000	NA		NA
11493295	7605278		JTY_1858			FALSE	NA	567.000	0.000	NA		NA
11635658	7605278		JTY_1858			FALSE	NA	567.000	0.000	NA		NA
11778050	7605278		JTY_1858			FALSE	NA	567.000	0.000	NA		NA
11493296	7605278		JTY_1858			FALSE	NA	587.000	0.000	NA		NA
11635659	7605278		JTY_1858			FALSE	NA	587.000	0.000	NA		NA
11778051	7605278		JTY_1858			FALSE	NA	587.000	0.000	NA		NA
11493297	7605278		JTY_1858			FALSE	NA	612.000	0.000	NA		NA
11635660	7605278		JTY_1858			FALSE	NA	612.000	0.000	NA		NA
11778052	7605278		JTY_1858			FALSE	NA	612.000	0.000	NA		NA
7605280	7605281	JTY_1860	JTY_1861	PE_PGRS34a		FALSE	0.033	163.000	0.000	NA		NA
7605281	7605282	JTY_1861	JTY_1862			TRUE	0.997	0.000	0.815	0.039		NA
7605282	7605283	JTY_1862	JTY_1863		guaB1	FALSE	0.173	174.000	0.038	0.089		NA
7605283	7605284	JTY_1863	JTY_1864	guaB1	gnd1	FALSE	0.188	-634.000	0.023	1.000	N	NA
7605284	7605285	JTY_1864	JTY_1865	gnd1		FALSE	0.144	90.000	0.023	1.000	N	NA
7605285	7605286	JTY_1865	JTY_1866			TRUE	0.921	15.000	0.850	1.000	N	NA
7605287	7605288	JTY_1867	JTY_1868		ureA	FALSE	0.319	49.000	0.222	NA	N	NA
7605288	7605289	JTY_1868	JTY_1869	ureA	ureB	TRUE	0.997	-3.000	0.052	0.001	Y	NA
7605289	7605290	JTY_1869	JTY_1870	ureB	ureC	TRUE	0.999	0.000	0.486	0.001	Y	NA
7605290	7605291	JTY_1870	JTY_1871	ureC	ureF	TRUE	0.984	0.000	0.061	0.002	N	NA
7605291	7605292	JTY_1871	JTY_1872	ureF	ureG	TRUE	0.992	11.000	0.439	0.002	Y	NA
7605292	7605293	JTY_1872	JTY_1873	ureG	ureD	TRUE	0.955	8.000	0.032	0.002		NA
7605294	7605295	JTY_1874	JTY_1875	ndh		TRUE	0.683	141.000	0.500	NA	Y	NA
7605295	7605296	JTY_1875	JTY_1876			TRUE	0.645	39.000	0.571	NA	N	NA
7605297	7605298	JTY_1877	JTY_1878	modA	modB	TRUE	0.998	3.000	0.578	0.001	Y	NA
7605298	7605299	JTY_1878	JTY_1879	modB	modC	TRUE	0.971	7.000	0.018	1.000	Y	NA
7605299	7605300	JTY_1879	JTY_1880	modC	apa	FALSE	0.363	53.000	0.052	1.000		NA
7605300	7605301	JTY_1880	JTY_1881	apa		FALSE	0.019	452.000	0.238	1.000		NA
7605301	7605302	JTY_1881	JTY_1882		adhA	FALSE	0.446	75.000	0.189	1.000		NA
7605303	7605304	JTY_1883	JTY_1884			FALSE	0.483	-7.000	0.000	NA		NA
7605304	7605305	JTY_1884	JTY_1885			TRUE	0.934	-3.000	0.000	1.000		NA
7605306	7605307	JTY_1886	JTY_1887			FALSE	0.017	288.000	0.143	1.000	N	NA
7605307	7605308	JTY_1887	JTY_1888			FALSE	0.233	99.000	0.214	NA	N	NA
7605309	7605310	JTY_1889	JTY_1890			FALSE	0.228	67.000	0.000	1.000		NA
7605310	7605311	JTY_1890	JTY_1891			FALSE	0.146	65.000	0.000	NA		NA
7605311	7605312	JTY_1891	JTY_1892		lldD2	FALSE	0.266	23.000	0.000	NA		NA
7605313	7605314	JTY_1893	JTY_1894			FALSE	0.143	73.000	0.000	NA		NA
7605314	7605315	JTY_1894	JTY_1895			TRUE	0.812	11.000	0.188	NA		NA
7605315	7605316	JTY_1895	JTY_1896		bfrA	FALSE	0.005	516.000	0.000	1.000		NA
7605316	7605317	JTY_1896	JTY_1897	bfrA		FALSE	0.375	85.000	0.135	1.000		NA
7605317	7605318	JTY_1897	JTY_1898			FALSE	0.163	-685.000	0.000	NA		NA
7605318	7605319	JTY_1898	JTY_1899		glnA3	FALSE	0.156	55.000	0.000	NA		NA
7605319	7605320	JTY_1899	JTY_1900	glnA3		TRUE	0.976	3.000	0.364	1.000		NA
7605321	7605322	JTY_1901	JTY_1902	cyp140	lppE	FALSE	0.500	50.000	0.273	NA		NA
7605322	7605323	JTY_1902	JTY_1903	lppE		FALSE	0.332	41.000	0.070	NA		NA
7605323	7605324	JTY_1903	JTY_1904			FALSE	0.419	28.000	0.093	NA		NA
7605324	7605325	JTY_1904	JTY_1905		rpfC	TRUE	0.620	39.000	0.375	NA		NA
7605325	7605326	JTY_1905	JTY_1906	rpfC		TRUE	0.700	12.000	0.018	1.000		NA
7605326	7605327	JTY_1906	JTY_1907		fbpB	FALSE	0.443	18.000	0.018	NA		NA
7605329	7605330	JTY_1909	JTY_1910			FALSE	0.005	365.000	0.000	NA		NA
7605330	7605331	JTY_1910	JTY_1911			FALSE	0.166	44.000	0.000	NA		NA
7605331	7605332	JTY_1911	JTY_1912			FALSE	0.153	59.000	0.000	NA		NA
7605333	7605334	JTY_1913	JTY_1914			TRUE	0.779	17.000	0.333	NA		NA
7605334	7605335	JTY_1914	JTY_1915			TRUE	0.919	10.000	0.375	NA		NA
7605337	7605338	JTY_1917	JTY_1918			TRUE	0.981	-3.000	0.000	0.013		NA
7605339	7605340	JTY_1919	JTY_1920			FALSE	0.457	5.000	0.004	NA	N	NA
7605342	7605343	JTY_1922	JTY_1923	lppD	lipJ	TRUE	0.880	0.000	0.000	NA		NA
7605346	7605347	JTY_1926	JTY_1927			FALSE	0.024	186.000	0.000	NA		NA
7605348	7605349	JTY_1928	JTY_1929	aao		FALSE	0.441	30.000	0.143	NA		NA
7605349	7605350	JTY_1929	JTY_1930			FALSE	0.005	340.000	0.000	NA		NA
7605350	7605351	JTY_1930	JTY_1931		katG	TRUE	0.687	7.000	0.000	NA		NA
7605351	7605352	JTY_1931	JTY_1932	katG	furA	TRUE	0.791	38.000	0.057	1.000	Y	NA
7605352	7605353	JTY_1932	JTY_1933	furA		FALSE	0.104	105.000	0.000	NA		NA
7605353	7605354	JTY_1933	JTY_1934		lppC	FALSE	0.133	83.000	0.000	NA		NA
7605354	7605355	JTY_1934	JTY_1935	lppC	fadB5	FALSE	0.114	100.000	0.000	NA		NA
7605359	7605360	JTY_1939	JTY_1940	PPE34	PPE35b	FALSE	0.005	338.000	0.000	NA		NA
7605360	7605361	JTY_1940	JTY_1941	PPE35b	PPE35a	FALSE	0.133	83.000	0.000	NA		NA
7605361	7605362	JTY_1941	JTY_1942	PPE35a		FALSE	0.003	449.000	0.000	NA		NA
7605365	7605366	JTY_1945	JTY_1946		lipD	TRUE	0.983	-9.000	0.333	0.004	Y	NA
7605371	7605372	JTY_1951	JTY_1952			FALSE	0.164	45.000	0.000	NA		NA
7605372	7605373	JTY_1952	JTY_1953			FALSE	0.480	12.000	0.000	NA		NA
7605373	7605374	JTY_1953	JTY_1954			FALSE	0.322	18.000	0.000	NA		NA
7605376	7605377	JTY_1956	JTY_1957	fadE18	fadE17	TRUE	0.999	2.000	0.800	0.011	Y	NA
7605377	7605378	JTY_1957	JTY_1958	fadE17	echA13	TRUE	0.973	15.000	0.600	1.000	Y	NA
7605379	7605380	JTY_1959	JTY_1960			TRUE	0.994	3.000	0.500	NA	Y	NA
7605380	7605381	JTY_1960	JTY_1961		ephB	TRUE	0.963	12.000	1.000	1.000		NA
7605381	7605382	JTY_1961	JTY_1962	ephB		TRUE	0.986	-3.000	0.333	1.000		NA
7605382	7605383	JTY_1962	JTY_1963		ribA1	TRUE	0.958	-3.000	0.036	1.000		NA
7605383	7605384	JTY_1963	JTY_1964	ribA1		TRUE	0.916	-3.000	0.036	1.000	N	NA
7605385	7605386	JTY_1965	JTY_1966			TRUE	0.993	-3.000	0.750	NA		NA
7605386	7605387	JTY_1966	JTY_1967			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7605391	7605392	JTY_1971	JTY_1972			FALSE	0.542	11.000	0.000	NA		NA
7605392	7605393	JTY_1972	JTY_1973			FALSE	0.289	21.000	0.000	NA		NA
7605393	7605394	JTY_1973	JTY_1974			TRUE	0.851	1.000	0.000	NA		NA
7605395	7605396	JTY_1975	JTY_1976			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7605398	7605399	JTY_1978	JTY_1979			FALSE	0.170	42.000	0.000	NA		NA
7605399	7605400	JTY_1979	JTY_1980			TRUE	0.934	-3.000	0.000	1.000		NA
7605401	7605402	JTY_1981	JTY_1982			FALSE	0.159	49.000	0.000	NA		NA
7605402	7605403	JTY_1982	JTY_1983			TRUE	0.984	-3.000	0.385	NA		NA
7605405	7605406	JTY_1985	JTY_1986			TRUE	0.955	4.000	0.286	NA		NA
7605406	7605407	JTY_1986	JTY_1987			FALSE	0.192	33.000	0.000	NA		NA
7605408	7605409	JTY_1988	JTY_1989	yrbE3A		FALSE	0.130	85.000	0.000	NA		NA
7605410	7605411	JTY_1990	JTY_1991		mpt64	FALSE	0.027	179.000	0.000	NA		NA
7605411	7605412	JTY_1991	JTY_1992	mpt64	nrdF	FALSE	0.022	191.000	0.000	NA		NA
7605412	7605413	JTY_1992	JTY_1993	nrdF		FALSE	0.015	225.000	0.000	NA		NA
7605415	7605416	JTY_1995	JTY_1996	cfp21		FALSE	0.006	430.000	0.000	1.000		NA
7605417	7605418	JTY_1997	JTY_1998			FALSE	0.007	416.000	0.000	1.000		NA
7605418	7605419	JTY_1998	JTY_1999			FALSE	0.025	226.000	0.000	1.000		NA
7605420	7605421	JTY_2000	JTY_2001			TRUE	0.995	-3.000	1.000	NA		NA
7605421	7605422	JTY_2001	JTY_2002			FALSE	0.011	244.000	0.000	NA		NA
7605422	7605423	JTY_2002	JTY_2003			FALSE	0.126	89.000	0.000	NA		NA
7605423	7605424	JTY_2003	JTY_2004		ctpG	FALSE	0.003	342.000	0.000	1.000	N	NA
7605424	7605425	JTY_2004	JTY_2005	ctpG		TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7605425	7605426	JTY_2005	JTY_2006			FALSE	0.157	53.000	0.000	NA		NA
7605427	7605428	JTY_2007	JTY_2008			FALSE	0.120	96.000	0.000	NA		NA
7605428	7605429	JTY_2008	JTY_2009		ctpF	FALSE	0.010	202.000	0.000	1.000	N	NA
7605430	7605431	JTY_2010	JTY_2011			FALSE	0.066	95.000	0.000	1.000	N	NA
7605432	7605433	JTY_2012	JTY_2013			TRUE	0.807	10.000	0.118	NA		NA
7605433	7605434	JTY_2013	JTY_2014		fabG3	TRUE	0.679	76.000	0.000	1.000	Y	NA
7605435	7605436	JTY_2015	JTY_2016			FALSE	0.241	58.000	0.000	1.000		NA
7605436	7605437	JTY_2016	JTY_2017			FALSE	0.401	22.000	0.000	1.000		NA
7605439	7605440	JTY_2019	JTY_2020	fdxA		FALSE	0.023	189.000	0.000	NA		NA
7605441	7605442	JTY_2021	JTY_2022			TRUE	0.851	1.000	0.000	NA		NA
7605444	7605445	JTY_2024	JTY_2025			FALSE	0.002	704.000	0.000	NA		NA
7605445	7605446	JTY_2025	JTY_2026			TRUE	0.671	-46.000	0.000	0.007		NA
7605448	7605449	JTY_2028	JTY_2029			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7605449	7605450	JTY_2029	JTY_2030			FALSE	0.012	242.000	0.000	NA		NA
7605450	7605451	JTY_2030	JTY_2031			TRUE	0.801	-10.000	0.294	NA		NA
7605452	7605453	JTY_2032	JTY_2033			FALSE	0.130	85.000	0.000	NA		NA
7605453	7605454	JTY_2033	JTY_2034			TRUE	0.929	9.000	0.375	NA		NA
7605454	7605455	JTY_2034	JTY_2035			FALSE	0.243	25.000	0.000	NA		NA
7605455	7605456	JTY_2035	JTY_2036			FALSE	0.036	160.000	0.000	NA		NA
7605456	7605457	JTY_2036	JTY_2037			FALSE	0.004	395.000	0.000	NA		NA
7605457	7605458	JTY_2037	JTY_2038			FALSE	0.025	184.000	0.000	NA		NA
7605458	7605459	JTY_2038	JTY_2039			FALSE	0.005	510.000	0.000	1.000		NA
7605459	7605460	JTY_2039	JTY_2040			FALSE	0.043	115.000	0.000	1.000	N	NA
7605460	7605461	JTY_2040	JTY_2041			TRUE	0.730	40.000	0.000	1.000	Y	NA
7605461	7605462	JTY_2041	JTY_2042			TRUE	0.696	61.000	0.000	1.000	Y	NA
7605462	7605463	JTY_2042	JTY_2043		pfkB	TRUE	0.807	-3.000	0.000	1.000	N	NA
7605463	7605464	JTY_2043	JTY_2044	pfkB		TRUE	0.612	17.000	0.050	1.000		NA
7605464	7605465	JTY_2044	JTY_2045		hspX	TRUE	0.847	12.000	0.300	NA		NA
7605468	7605469	JTY_2048	JTY_2049			TRUE	0.969	-3.000	0.200	NA		NA
7605469	7605470	JTY_2049	JTY_2050			TRUE	0.962	-3.000	0.150	NA		NA
7605471	7605472	JTY_2051	JTY_2052			TRUE	0.983	2.000	0.444	1.000		NA
7605472	7605473	JTY_2052	JTY_2053			TRUE	0.995	3.000	0.211	0.011	Y	NA
7605473	7605474	JTY_2053	JTY_2054			TRUE	0.966	-13.000	0.211	0.011	Y	NA
7605474	7605475	JTY_2054	JTY_2055			TRUE	0.998	-3.000	0.235	0.011	Y	NA
7605475	7605476	JTY_2055	JTY_2056			TRUE	0.684	38.000	0.118	0.018		NA
7605476	7605477	JTY_2056	JTY_2057		pncA	TRUE	0.943	0.000	0.005	1.000		NA
7605477	7605478	JTY_2057	JTY_2058	pncA		FALSE	0.172	41.000	0.000	NA		NA
7605478	7605479	JTY_2058	JTY_2059		lipT	FALSE	0.129	86.000	0.000	NA		NA
7605481	7605482	JTY_2061	JTY_2062		pks12	TRUE	0.985	5.000	1.000	1.000	N	NA
7605482	7605483	JTY_2062	JTY_2063	pks12		FALSE	0.007	307.000	0.000	NA		NA
7605485	7605486	JTY_2065	JTY_2066	ppm1		FALSE	0.291	158.000	0.041	0.003		NA
7605486	7605487	JTY_2066	JTY_2067		fxsA	TRUE	0.898	5.000	0.037	1.000		NA
7605489	7605490	JTY_2069	JTY_2070	rpsR2	rpsN2	TRUE	0.995	1.000	0.024	0.013	Y	NA
7605490	7605491	JTY_2070	JTY_2071	rpsN2	rpmG1	TRUE	0.994	2.000	0.052	0.013	Y	NA
7605491	7605492	JTY_2071	JTY_2072	rpmG1	rpmB2	TRUE	0.998	0.000	0.332	0.013	Y	NA
7605494	7605495	JTY_2074	JTY_2075		cobN	FALSE	0.309	84.000	0.045	1.000		NA
7605496	7605497	JTY_2076	JTY_2077		cobG	FALSE	0.007	387.000	0.000	1.000		NA
7605497	7605498	JTY_2077	JTY_2078	cobG	cobH	TRUE	0.860	10.000	0.255	1.000	N	NA
7605498	7605499	JTY_2078	JTY_2079	cobH	cobI	TRUE	0.997	-3.000	0.096	0.007	Y	NA
7605500	7605501	JTY_2080	JTY_2081		blaC	FALSE	0.505	16.000	0.000	1.000		NA
7605503	7605504	JTY_2083	JTY_2084	cobK	cobM	TRUE	0.899	37.000	0.076	0.007	Y	NA
7605504	7605505	JTY_2084	JTY_2085	cobM	cobLb	TRUE	0.997	-3.000	0.065	0.007	Y	NA
7605505	7605506	JTY_2085	JTY_2086	cobLb	cobLa	TRUE	0.727	-58.000	0.000	0.001		NA
7605506	7605507	JTY_2086	JTY_2087	cobLa		FALSE	0.223	75.000	0.000	1.000		NA
7605507	7605508	JTY_2087	JTY_2088			FALSE	0.037	158.000	0.000	NA		NA
7605508	7605509	JTY_2088	JTY_2089			FALSE	0.186	35.000	0.000	NA		NA
7605509	7605510	JTY_2089	JTY_2090			TRUE	0.851	1.000	0.000	NA		NA
7605511	7605512	JTY_2091	JTY_2092			TRUE	0.838	-18.000	0.500	NA		NA
7605512	7605513	JTY_2092	JTY_2093		lppJ	FALSE	0.314	-19.000	0.000	NA		NA
7605515	7605516	JTY_2095	JTY_2096			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7605516	7605517	JTY_2096	JTY_2097			FALSE	0.483	-7.000	0.000	NA		NA
7605517	7605518	JTY_2097	JTY_2098			FALSE	0.194	-180.000	0.000	NA		NA
7605518	7605519	JTY_2098	JTY_2099			FALSE	0.133	83.000	0.000	NA		NA
7605519	7605520	JTY_2099	JTY_2100			FALSE	0.302	-21.000	0.000	NA		NA
7605520	7605521	JTY_2100	JTY_2101			FALSE	0.140	78.000	0.000	NA		NA
7605521	7605522	JTY_2101	JTY_2102		pknJ	FALSE	0.024	187.000	0.000	NA		NA
7605525	7605526	JTY_2105	JTY_2106		helY	FALSE	0.356	42.000	0.105	NA		NA
7605526	7605527	JTY_2106	JTY_2107	helY	tatC	FALSE	0.241	49.000	0.166	NA	N	NA
7605527	7605528	JTY_2107	JTY_2108	tatC	tatA	TRUE	0.874	17.000	0.031	NA	Y	NA
7605528	7605529	JTY_2108	JTY_2109	tatA		FALSE	0.176	68.000	0.110	NA	N	NA
7605529	7605530	JTY_2109	JTY_2110			TRUE	0.998	-3.000	0.767	NA	Y	NA
7605530	7605531	JTY_2110	JTY_2111			TRUE	0.863	9.000	0.188	NA		NA
7605531	7605532	JTY_2111	JTY_2112		PE_PGRS36	FALSE	0.157	52.000	0.000	NA		NA
7605533	7605534	JTY_2113	JTY_2114		helZ	FALSE	0.020	199.000	0.000	NA		NA
7605534	7605535	JTY_2114	JTY_2115	helZ		FALSE	0.356	110.000	0.222	1.000		NA
7605536	7605537	JTY_2116	JTY_2117			TRUE	0.970	7.000	0.667	NA		NA
7605538	7605539	JTY_2118	JTY_2119	PE22	PPE36	TRUE	0.815	56.000	1.000	NA		NA
7605540	7605541	JTY_2120	JTY_2121	prcA	prcB	TRUE	0.999	-3.000	0.797	0.001	Y	NA
7605541	7605542	JTY_2121	JTY_2122	prcB		TRUE	0.989	-3.000	0.512	NA		NA
7605542	7605543	JTY_2122	JTY_2123			TRUE	0.596	113.000	0.706	NA		NA
7605544	7605545	JTY_2124	JTY_2125			TRUE	0.820	11.000	0.200	NA		NA
7605547	7605548	JTY_2127	JTY_2128	lppK		TRUE	0.781	8.000	0.030	NA		NA
7605551	7605552	JTY_2131	JTY_2132		hisG	FALSE	0.193	79.000	0.006	NA		NA
7605552	7605553	JTY_2132	JTY_2133	hisG	hisE	TRUE	0.995	3.000	0.081	0.003	Y	NA
7605558	7605559	JTY_2138	JTY_2139	ansP1		TRUE	0.880	0.000	0.000	NA		NA
7605560	7605561	JTY_2140	JTY_2141		cysS2	FALSE	0.524	26.000	0.096	1.000		NA
7605561	7605562	JTY_2141	JTY_2142	cysS2	cysQ	FALSE	0.255	58.000	0.082	1.000	N	NA
7605564	7605565	JTY_2144	JTY_2145			TRUE	0.958	11.000	0.810	NA		NA
7605565	7605566	JTY_2145	JTY_2146			TRUE	0.696	64.000	0.608	NA		NA
7605566	7605567	JTY_2146	JTY_2147			TRUE	0.893	-3.000	0.071	NA	N	NA
7605567	7605568	JTY_2147	JTY_2148			FALSE	0.237	64.000	0.026	NA		NA
7605569	7605570	JTY_2149	JTY_2150	lppL	pyrD	FALSE	0.006	314.000	0.000	NA		NA
7605571	7605572	JTY_2151	JTY_2152	TB18.6		FALSE	0.457	48.000	0.224	NA		NA
7605576	7605577	JTY_2155	JTY_2156		wag31	FALSE	0.300	95.000	0.149	NA		NA
7605577	7605578	JTY_2156	JTY_2157	wag31		FALSE	0.025	268.000	0.114	NA		NA
7605578	7605579	JTY_2157	JTY_2158			FALSE	0.104	162.000	0.165	NA		NA
7605579	7605580	JTY_2158	JTY_2159			TRUE	0.990	-3.000	0.581	NA		NA
7605580	7605581	JTY_2159	JTY_2160		yfiH	TRUE	0.853	6.000	0.061	NA		NA
7605581	7605582	JTY_2160	JTY_2161	yfiH	ftsZ	TRUE	0.750	11.000	0.082	NA		NA
7605582	7605583	JTY_2161	JTY_2162	ftsZ	ftsQ	FALSE	0.029	173.000	0.067	NA	N	NA
7605583	7605584	JTY_2162	JTY_2163	ftsQ	murC	TRUE	0.993	-3.000	0.134	NA	Y	NA
7605584	7605585	JTY_2163	JTY_2164	murC	murG	TRUE	0.996	-3.000	0.270	1.000	Y	NA
7605585	7605586	JTY_2164	JTY_2165	murG	ftsW	FALSE	0.402	-100.000	0.167	1.000	N	NA
7605586	7605587	JTY_2165	JTY_2166	ftsW	murD	TRUE	0.879	12.000	0.081	0.004	N	NA
7605587	7605588	JTY_2166	JTY_2167	murD	mraY	TRUE	0.999	2.000	0.647	0.004	Y	NA
7605588	7605589	JTY_2167	JTY_2168	mraY	murF	TRUE	0.997	-3.000	0.071	0.004	Y	NA
7605589	7605590	JTY_2168	JTY_2169	murF	murE	TRUE	0.999	-3.000	0.367	0.001	Y	NA
7605590	7605591	JTY_2169	JTY_2170	murE		FALSE	0.266	23.000	0.000	NA		NA
7605591	7605592	JTY_2170	JTY_2171			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7605592	7605593	JTY_2171	JTY_2172			FALSE	0.483	-7.000	0.000	NA		NA
7605593	7605594	JTY_2172	JTY_2173		PE_PGRS38	FALSE	0.109	103.000	0.000	NA		NA
7605594	7605595	JTY_2173	JTY_2174	PE_PGRS38	pbpB	FALSE	0.018	210.000	0.000	NA		NA
7605595	7605596	JTY_2174	JTY_2175	pbpB		TRUE	0.962	-3.000	0.144	NA		NA
7605596	7605597	JTY_2175	JTY_2176		mraW	TRUE	0.937	-3.000	0.028	NA		NA
7605597	7605598	JTY_2176	JTY_2177	mraW		TRUE	0.986	2.000	0.635	NA		NA
7605598	7605599	JTY_2177	JTY_2178			FALSE	0.005	349.000	0.000	NA		NA
7605600	7605601	JTY_2179	JTY_2180		lppM	FALSE	0.401	96.000	0.250	NA		NA
7605603	7605604	JTY_2182	JTY_2183	idsA2		TRUE	0.957	4.000	0.298	NA		NA
7605607	7605608	JTY_2186	JTY_2187		aroG	FALSE	0.007	385.000	0.000	1.000		NA
7605608	7605609	JTY_2187	JTY_2188	aroG		FALSE	0.522	91.000	0.301	1.000		NA
7605609	7605610	JTY_2188	JTY_2189			TRUE	0.813	10.000	0.132	NA		NA
7605612	7605613	JTY_2191	JTY_2192			FALSE	0.558	86.000	0.417	NA		NA
7605613	7605614	JTY_2192	JTY_2193			TRUE	0.989	-3.000	0.500	NA		NA
7605614	7605615	JTY_2193	JTY_2194		TB16.3	FALSE	0.222	120.000	0.184	NA		NA
7605615	7605616	JTY_2194	JTY_2195	TB16.3		FALSE	0.273	105.000	0.164	NA		NA
7605617	7605618	JTY_2196	JTY_2197		fadD15	TRUE	0.677	-237.000	0.000	0.001		NA
7605619	7605620	JTY_2198	JTY_2199			FALSE	0.406	97.000	0.258	NA		NA
7605620	7605621	JTY_2199	JTY_2200			TRUE	0.575	95.000	0.471	NA		NA
7605624	7605625	JTY_2203	JTY_2204	ctaE	qcrC	TRUE	0.876	41.000	0.088	0.053	Y	NA
7605625	7605626	JTY_2204	JTY_2205	qcrC	qcrA	TRUE	0.996	-3.000	0.421	NA	Y	NA
7605626	7605627	JTY_2205	JTY_2206	qcrA	qcrB	TRUE	0.998	-3.000	0.660	NA	Y	NA
7605628	7605629	JTY_2207	JTY_2208		mmpS3	TRUE	0.994	0.000	0.900	NA		NA
7605629	7605630	JTY_2208	JTY_2209	mmpS3		FALSE	0.060	186.000	0.092	NA		NA
7605630	7605631	JTY_2209	JTY_2210		ctaC	TRUE	0.932	8.000	0.342	NA		NA
7605635	7605636	JTY_2214	JTY_2215			FALSE	0.174	100.000	0.016	NA		NA
7605637	7605638	JTY_2216	JTY_2217		cobT	FALSE	0.300	79.000	0.095	NA		NA
7605638	7605639	JTY_2217	JTY_2218	cobT	cobS	TRUE	0.997	-3.000	0.039	0.007	Y	NA
7605639	7605640	JTY_2218	JTY_2219	cobS		FALSE	0.051	158.000	0.003	NA		NA
7605641	7605642	JTY_2220	JTY_2221	ilvE	gcvT	TRUE	0.724	72.000	0.025	1.000	Y	NA
7605643	7605644	JTY_2222	JTY_2223		pepB	FALSE	0.562	12.000	0.041	1.000	N	NA
7605646	7605647	JTY_2225	JTY_2226	dlaT		TRUE	0.984	0.000	0.333	1.000		NA
7605647	7605648	JTY_2226	JTY_2227		lipB	TRUE	0.569	53.000	0.019	0.037		NA
7605648	7605649	JTY_2227	JTY_2228	lipB	lipA	TRUE	0.999	-3.000	0.319	0.001	Y	NA
7605649	7605650	JTY_2228	JTY_2229	lipA		FALSE	0.390	27.000	0.059	NA		NA
7605653	7605654	JTY_2232	JTY_2233	glnE	glnA2	FALSE	0.216	49.000	0.046	1.000	N	NA
7605654	7605655	JTY_2233	JTY_2234	glnA2		FALSE	0.216	95.000	0.042	NA		NA
7605655	7605656	JTY_2234	JTY_2235			TRUE	0.709	62.000	0.636	NA		NA
7605657	7605658	JTY_2236	JTY_2237	panB		FALSE	0.019	245.000	0.000	1.000		NA
7605660	7605661	JTY_2238	JTY_2239			TRUE	0.658	8.000	0.000	NA		NA
7605662	7605663	JTY_2240	JTY_2241			TRUE	0.986	-3.000	0.422	NA		NA
7605663	7605664	JTY_2241	JTY_2242			TRUE	0.988	-3.000	0.468	NA		NA
7605664	7605665	JTY_2242	JTY_2243		cobC	TRUE	0.959	-3.000	0.121	NA		NA
7605666	7605667	JTY_2244	JTY_2245		ptpA	TRUE	0.718	-7.000	0.029	1.000		NA
7605667	7605668	JTY_2245	JTY_2246	ptpA		TRUE	0.921	0.000	0.013	NA		NA
7605671	7605672	JTY_t0023	JTY_2249	valV	ahpE	FALSE	0.163	46.000	0.000	NA		NA
7605672	7605673	JTY_2249	JTY_2250	ahpE		TRUE	0.989	0.000	0.575	NA		NA
7605673	7605674	JTY_2250	JTY_2251			FALSE	0.376	38.000	0.113	NA		NA
7605675	7605676	JTY_2252	JTY_2253	aceE		FALSE	0.239	60.000	0.169	NA	N	NA
7605676	7605677	JTY_2253	JTY_2254		fabD	FALSE	0.071	239.000	0.441	NA	N	NA
7605677	7605678	JTY_2254	JTY_2255	fabD	acpP	TRUE	0.765	76.000	0.127	1.000	Y	NA
7605678	7605679	JTY_2255	JTY_2256	acpP	kasA	TRUE	0.993	-3.000	0.089	1.000	Y	NA
7605679	7605680	JTY_2256	JTY_2257	kasA	kasB	TRUE	0.950	31.000	0.400	0.017	Y	NA
7605680	7605681	JTY_2257	JTY_2258	kasB	accD6	TRUE	0.863	31.000	0.222	1.000	Y	NA
7605681	7605682	JTY_2258	JTY_2259	accD6		FALSE	0.225	108.000	0.111	NA		NA
7605682	7605683	JTY_2259	JTY_2260			FALSE	0.179	-292.000	0.000	NA		NA
7605684	7605685	JTY_2261	JTY_2262	glpD1		TRUE	0.944	-6.000	0.727	1.000	N	NA
7605686	7605687	JTY_2263	JTY_2264			TRUE	0.962	-3.000	0.204	1.000	N	NA
7605687	7605688	JTY_2264	JTY_2265			FALSE	0.256	66.000	0.043	NA		NA
7605689	7605690	JTY_2266	JTY_2267			TRUE	0.757	5.000	0.000	NA		NA
7605690	7605691	JTY_2267	JTY_2268			FALSE	0.031	167.000	0.000	NA		NA
7605691	7605692	JTY_2268	JTY_2269			FALSE	0.210	130.000	0.200	NA		NA
7605692	7605693	JTY_2269	JTY_2270			TRUE	0.640	14.000	0.163	1.000	N	NA
7605694	7605695	JTY_2271	JTY_2272	adhE2		TRUE	0.990	0.000	0.538	1.000		NA
7605699	7605700	JTY_2276	JTY_2277		cyp124	FALSE	0.029	175.000	0.000	NA		NA
7605701	7605702	JTY_2278	JTY_2279		cyp128	TRUE	0.934	-3.000	0.000	1.000		NA
7605702	7605703	JTY_2279	JTY_2280	cyp128		FALSE	0.440	13.000	0.000	NA		NA
7605704	7605705	JTY_2281	JTY_2282	lppN		FALSE	0.098	107.000	0.000	NA		NA
7605705	7605706	JTY_2282	JTY_2283			FALSE	0.101	106.000	0.000	NA		NA
7605706	7605707	JTY_2283	JTY_2284			TRUE	0.968	-3.000	0.190	NA		NA
7605709	7605710	JTY_2286	JTY_2287		cyp121	TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7605712	7605713	JTY_2289	JTY_2290		pitB	FALSE	0.007	234.000	0.000	1.000	N	NA
7605715	7605716	JTY_2292	JTY_2293		lipM	TRUE	0.599	10.000	0.000	NA		NA
7605716	7605717	JTY_2293	JTY_2294	lipM		FALSE	0.192	33.000	0.000	NA		NA
7605718	7605719	JTY_2295	JTY_2296			FALSE	0.216	28.000	0.000	NA		NA
7605720	7605721	JTY_2297	JTY_2298	yjcE		TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7605721	7605722	JTY_2298	JTY_2299		cdh	FALSE	0.254	-30.000	0.000	NA		NA
7605722	7605723	JTY_2299	JTY_2300	cdh	lppOa	FALSE	0.049	142.000	0.000	NA		NA
7605723	7605724	JTY_2300	JTY_2301	lppOa	lppOb	FALSE	0.540	-6.000	0.000	NA		NA
7605724	7605725	JTY_2301	JTY_2302	lppOb	sseB	FALSE	0.152	60.000	0.000	NA		NA
7605727	7605728	JTY_2304	JTY_2305			FALSE	0.015	223.000	0.000	NA		NA
7605728	7605729	JTY_2305	JTY_2306			FALSE	0.122	94.000	0.000	NA		NA
7605729	7605730	JTY_2306	JTY_2307			FALSE	0.196	32.000	0.000	NA		NA
7605730	7605731	JTY_2307	JTY_2308			FALSE	0.022	192.000	0.000	NA		NA
7605732	7605733	JTY_2309	JTY_2310	htpG		FALSE	0.224	74.000	0.000	1.000		NA
7605734	7605735	JTY_2311	JTY_2312	cut2		FALSE	0.101	106.000	0.000	NA		NA
7605736	7605737	JTY_2313	JTY_2314			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7605738	7605739	JTY_2315	JTY_2316			TRUE	0.599	10.000	0.000	NA		NA
7605739	7605740	JTY_2316	JTY_2317			FALSE	0.192	-213.000	0.000	NA		NA
7605741	7605742	JTY_2318	JTY_2319			FALSE	0.003	532.000	0.000	NA		NA
7605742	7605743	JTY_2319	JTY_2320			FALSE	0.130	85.000	0.000	NA		NA
7605743	7605744	JTY_2320	JTY_2321			FALSE	0.123	93.000	0.000	NA		NA
7605746	7605747	JTY_t0024	JTY_2323	metV		TRUE	0.718	6.000	0.000	NA		NA
7605748	7605749	JTY_2324	JTY_2325			FALSE	0.109	103.000	0.000	NA		NA
7605749	7605750	JTY_2325	JTY_2326			FALSE	0.104	105.000	0.000	NA		NA
7605750	7605751	JTY_2326	JTY_2327			FALSE	0.140	78.000	0.000	NA		NA
7605752	7605753	JTY_2328	JTY_2329			TRUE	0.771	11.000	0.121	NA		NA
7605753	7605754	JTY_2329	JTY_2330			TRUE	0.995	-3.000	0.914	NA		NA
7605755	7605756	JTY_2331	JTY_2332	uspA	uspB	TRUE	0.989	-13.000	0.818	0.010	Y	NA
7605756	7605757	JTY_2332	JTY_2333	uspB	uspC	TRUE	0.999	-3.000	0.727	0.010	Y	NA
7605758	7605759	JTY_2334	JTY_2335		rocE	TRUE	0.985	-3.000	0.444	1.000	N	NA
7605759	7605760	JTY_2335	JTY_2336	rocE	rocD2	TRUE	0.934	1.000	0.015	1.000		NA
7605760	7605761	JTY_2336	JTY_2337	rocD2	rocD1	TRUE	0.986	0.000	0.000	0.001		NA
7605761	7605762	JTY_2337	JTY_2338	rocD1		TRUE	0.959	-3.000	0.038	1.000		NA
7605764	7605765	JTY_2340	JTY_2341			TRUE	0.980	-3.000	0.240	1.000		NA
7605766	7605767	JTY_2342	JTY_2343		PE23	FALSE	0.011	252.000	0.000	NA		NA
7605768	7605769	JTY_2344	JTY_2345	narK1	lppP	FALSE	0.013	234.000	0.000	NA		NA
7605770	7605771	JTY_2346	JTY_2347			FALSE	0.155	57.000	0.000	NA		NA
7605771	7605772	JTY_2347	JTY_2348		mez	FALSE	0.207	30.000	0.000	NA		NA
7605774	7605775	JTY_2350	JTY_2351	cysK1		TRUE	0.995	4.000	0.133	0.001	Y	NA
7605775	7605776	JTY_2351	JTY_2352			FALSE	0.004	416.000	0.000	NA		NA
7605777	7605778	JTY_2353	JTY_2354		moeW	FALSE	0.073	120.000	0.000	NA		NA
7605779	7605780	JTY_2355	JTY_2356	mmpL9a	mmpL9b	TRUE	0.817	13.000	0.000	0.036		NA
7605781	7605782	JTY_2357	JTY_t0025	PE_PGRS39	asnT	FALSE	0.003	499.000	0.000	NA		NA
7605783	7605784	JTY_2358	JTY_2359	lppQ		FALSE	0.010	256.000	0.000	NA		NA
7605785	7605786	JTY_2360	JTY_2361	dnaG	dgt	TRUE	0.807	5.000	0.037	1.000	N	NA
7605788	7605789	JTY_2363	JTY_2364	esxO	PPE71	FALSE	0.335	-16.000	0.000	NA		NA
7605789	7605790	JTY_2364	JTY_2365	PPE71	glyS	FALSE	0.004	138.000	0.000	NA	N	NA
7605791	7605792	JTY_2366	JTY_2367		furB	TRUE	0.974	-3.000	0.021	0.040	N	NA
7605793	7605794	JTY_2368	JTY_2369			TRUE	0.924	0.000	0.017	NA		NA
7605794	7605795	JTY_2369	JTY_2370		recO	TRUE	0.631	-7.000	0.076	1.000	N	NA
7605797	7605798	JTY_2372	JTY_2373	era		FALSE	0.222	74.000	0.021	NA		NA
7605798	7605799	JTY_2373	JTY_2374			FALSE	0.382	-28.000	0.025	NA		NA
7605799	7605800	JTY_2374	JTY_2375			TRUE	0.972	-3.000	0.222	NA		NA
7605800	7605801	JTY_2375	JTY_2376		phoH1	TRUE	0.973	4.000	0.457	NA		NA
7605801	7605802	JTY_2376	JTY_2377	phoH1		FALSE	0.258	-28.000	0.000	NA		NA
7605802	7605803	JTY_2377	JTY_2378			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7605805	7605806	JTY_2380	JTY_2381		dnaJ2	TRUE	0.635	14.000	0.073	NA		NA
7605806	7605807	JTY_2381	JTY_2382	dnaJ2	hrcA	FALSE	0.218	75.000	0.064	1.000	N	NA
7605809	7605810	JTY_2384	JTY_2385	cfp2	mbtH	FALSE	0.114	100.000	0.000	NA		NA
7605810	7605811	JTY_2385	JTY_2386	mbtH	mbtG	FALSE	0.285	-22.000	0.000	NA		NA
7605811	7605812	JTY_2386	JTY_2387	mbtG	mbtF	TRUE	0.997	-3.000	0.400	1.000	Y	NA
7605812	7605813	JTY_2387	JTY_2388	mbtF	mbtE	TRUE	0.981	-18.000	0.462	0.002	Y	NA
7605813	7605814	JTY_2388	JTY_2389	mbtE	mbtD	TRUE	0.629	140.000	0.000	0.004	Y	NA
7605814	7605815	JTY_2389	JTY_2390	mbtD	mbtC	TRUE	0.978	0.000	0.000	0.016		NA
7605815	7605816	JTY_2390	JTY_2391	mbtC	mbtB	TRUE	0.809	-10.000	0.000	0.016		NA
7605817	7605818	JTY_2392	JTY_2393	mbtA	mbtJ	FALSE	0.429	96.000	0.095	0.083	N	NA
7605821	7605822	JTY_2396	JTY_2397	hemN	rpfD	FALSE	0.163	106.000	0.000	1.000		NA
7605822	7605823	JTY_2397	JTY_2398	rpfD		TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7605824	7605825	JTY_2399	JTY_2400	nirA	cysH	TRUE	0.919	-3.000	0.041	1.000	N	NA
7605825	7605826	JTY_2400	JTY_2401	cysH		TRUE	0.951	-3.000	0.010	1.000		NA
7605826	7605827	JTY_2401	JTY_2402		ggtB	FALSE	0.428	37.000	0.069	1.000		NA
7605827	7605828	JTY_2402	JTY_2403	ggtB		FALSE	0.110	131.000	0.029	NA		NA
7605828	7605829	JTY_2403	JTY_2404			TRUE	0.565	14.000	0.029	NA		NA
7605829	7605830	JTY_2404	JTY_2405		PE_PGRS41	FALSE	0.002	724.000	0.000	NA		NA
7605831	7605832	JTY_2406	JTY_2407	cysA1	cysW	TRUE	0.907	17.000	0.087	1.000	Y	NA
7605832	7605833	JTY_2407	JTY_2408	cysW	cysT	TRUE	0.990	-3.000	0.177	0.001	N	NA
7605833	7605834	JTY_2408	JTY_2409	cysT	subI	TRUE	0.989	-3.000	0.188	0.003	N	NA
7605838	7605839	JTY_2413	JTY_2414	lppR	lepA	TRUE	0.921	-3.000	0.004	NA		NA
7605842	7605843	JTY_2417	JTY_2418		PE24	FALSE	0.003	593.000	0.000	NA		NA
7605844	7605845	JTY_2419	JTY_2420			TRUE	0.950	0.000	0.089	NA		NA
7605845	7605846	JTY_2420	JTY_2421			TRUE	0.937	0.000	0.044	NA		NA
7605848	7605849	JTY_2423	JTY_2424			FALSE	0.450	31.000	0.163	NA		NA
7605849	7605850	JTY_2424	JTY_2425			TRUE	0.651	15.000	0.130	NA		NA
7605850	7605851	JTY_2425	JTY_2426			FALSE	0.009	340.000	0.000	1.000		NA
7605851	7605852	JTY_2426	JTY_2427			FALSE	0.072	122.000	0.000	NA		NA
7605852	7605853	JTY_2427	JTY_2428			TRUE	0.612	81.000	0.484	NA		NA
7605853	7605854	JTY_2428	JTY_2429			TRUE	0.808	-10.000	0.245	1.000		NA
7605854	7605855	JTY_2429	JTY_2430			TRUE	0.943	-3.000	0.045	NA		NA
7605855	7605856	JTY_2430	JTY_2431		nadD	TRUE	0.972	-3.000	0.221	NA		NA
7605857	7605858	JTY_2432	JTY_2433			FALSE	0.012	242.000	0.000	NA		NA
7605859	7605860	JTY_2434	JTY_2435			TRUE	0.831	14.000	0.000	0.007		NA
7605860	7605861	JTY_2435	JTY_2436			FALSE	0.126	89.000	0.000	NA		NA
7605861	7605862	JTY_2436	JTY_2437			TRUE	0.994	0.000	0.862	NA		NA
7605862	7605863	JTY_2437	JTY_2438		proA	FALSE	0.421	27.000	0.019	1.000		NA
7605863	7605864	JTY_2438	JTY_2439	proA		FALSE	0.133	83.000	0.000	NA		NA
7605864	7605865	JTY_2439	JTY_2440			TRUE	0.851	1.000	0.000	NA		NA
7605866	7605867	JTY_2441	JTY_2442	ahpC	ahpD	FALSE	0.523	26.000	0.095	1.000		NA
7605868	7605869	JTY_2443	JTY_2444	PPE41	PE25	FALSE	0.162	47.000	0.000	NA		NA
7605869	7605870	JTY_2444	JTY_2445	PE25		FALSE	0.030	171.000	0.000	NA		NA
7605870	7605871	JTY_2445	JTY_2446			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7605871	7605872	JTY_2446	JTY_2447			FALSE	0.314	-19.000	0.000	NA		NA
7605872	7605873	JTY_2447	JTY_2448			TRUE	0.995	-3.000	0.667	0.036	N	NA
7605874	7605875	JTY_2449	JTY_2450	rbsK		FALSE	0.007	232.000	0.000	1.000	N	NA
7605878	7605879	JTY_2453	JTY_2454	proB	obg	TRUE	0.974	0.000	0.206	1.000		NA
7605879	7605880	JTY_2454	JTY_2455	obg	rpmA	TRUE	0.564	86.000	0.335	1.000		NA
7605880	7605881	JTY_2455	JTY_2456	rpmA	rplU	TRUE	0.988	15.000	0.667	0.012	Y	NA
7605883	7605884	JTY_2458	JTY_2459	rne	ndkA	FALSE	0.003	330.000	0.000	1.000	N	NA
7605884	7605885	JTY_2459	JTY_2460	ndkA		FALSE	0.245	43.000	0.014	NA		NA
7605885	7605886	JTY_2460	JTY_2461		folC	TRUE	0.968	-3.000	0.188	NA		NA
7605886	7605887	JTY_2461	JTY_2462	folC	valS	TRUE	0.984	-3.000	0.208	0.067	N	NA
7605887	7605888	JTY_2462	JTY_2463	valS		FALSE	0.224	88.000	0.041	NA		NA
7605888	7605889	JTY_2463	JTY_2464		rpfE	TRUE	0.889	11.000	0.333	NA		NA
7605891	7605892	JTY_2466	JTY_2467		mobA	FALSE	0.254	24.000	0.000	NA		NA
7605892	7605893	JTY_2467	JTY_2468	mobA		TRUE	0.887	2.000	0.053	1.000	N	NA
7605893	7605894	JTY_2468	JTY_2469			TRUE	0.999	-3.000	0.832	0.001	Y	NA
7605894	7605895	JTY_2469	JTY_2470			FALSE	0.001	232.000	0.000	NA	N	NA
7605895	7605896	JTY_2470	JTY_2471		clpX	FALSE	0.122	16.000	0.002	NA	N	NA
7605897	7605898	JTY_2472	JTY_2473	mmuM		FALSE	0.002	167.000	0.000	NA	N	NA
7605899	7605900	JTY_2474	JTY_2475	clpP2	clpP	TRUE	0.999	-3.000	0.341	0.001	Y	NA
7605900	7605901	JTY_2475	JTY_2476	clpP	tig	TRUE	0.566	117.000	0.018	1.000	Y	NA
7605901	7605902	JTY_2476	JTY_t0026	tig	proU	FALSE	0.174	40.000	0.000	NA		NA
7605903	7605904	JTY_t0027	JTY_2477	glyV	lipP	FALSE	0.166	44.000	0.000	NA		NA
7605905	7605906	JTY_2478	JTY_2479		rpiB	TRUE	0.945	6.000	0.398	1.000	N	NA
7605906	7605907	JTY_2479	JTY_2480	rpiB		FALSE	0.369	102.000	0.182	1.000		NA
7605909	7605910	JTY_2482	JTY_2483			FALSE	0.015	220.000	0.000	NA		NA
7605911	7605912	JTY_2484	JTY_2485	glbO	aglA	TRUE	0.958	0.000	0.055	1.000		NA
7605912	7605913	JTY_2485	JTY_2486	aglA		FALSE	0.144	68.000	0.000	NA		NA
7605913	7605914	JTY_2486	JTY_2487			TRUE	0.815	3.000	0.000	NA		NA
7605915	7605916	JTY_2488	JTY_2489			TRUE	0.940	6.000	0.305	NA		NA
7605916	7605917	JTY_2489	JTY_2490		gdh	TRUE	0.962	-3.000	0.153	NA		NA
7605917	7605918	JTY_2490	JTY_2491	gdh		FALSE	0.233	104.000	0.018	1.000		NA
7605918	7605919	JTY_2491	JTY_2492			FALSE	0.328	81.000	0.053	1.000		NA
7605919	7605920	JTY_2492	JTY_2493			FALSE	0.003	609.000	0.000	NA		NA
7605920	7605921	JTY_2493	JTY_2494		plsB2	FALSE	0.369	16.000	0.000	NA		NA
7605921	7605922	JTY_2494	JTY_2495	plsB2	plsC	TRUE	0.996	-3.000	0.044	0.082	Y	NA
7605922	7605923	JTY_2495	JTY_2496	plsC		TRUE	0.943	-3.000	0.044	NA		NA
7605923	7605924	JTY_2496	JTY_2497		lipQ	FALSE	0.064	229.000	0.250	NA		NA
7605925	7605926	JTY_t0028	JTY_2498	argW	echA14	FALSE	0.112	101.000	0.000	NA		NA
7605927	7605928	JTY_2499	JTY_2500	PE_PGRS42d	PE_PGRS42ab	FALSE	0.175	-324.000	0.000	NA		NA
7605928	7605929	JTY_2500	JTY_2501	PE_PGRS42ab		FALSE	0.135	82.000	0.000	NA		NA
7605929	7605930	JTY_2501	JTY_2502			FALSE	0.237	-34.000	0.000	NA		NA
7605930	7605931	JTY_2502	JTY_2503		PE_PGRS43b	FALSE	0.013	237.000	0.000	NA		NA
7605931	7605932	JTY_2503	JTY_2504	PE_PGRS43b	PE_PGRS43a	FALSE	0.124	92.000	0.000	NA		NA
7605933	7605934	JTY_2505	JTY_2506			FALSE	0.408	-10.000	0.000	NA		NA
7605934	7605935	JTY_2506	JTY_2507			FALSE	0.157	53.000	0.000	NA		NA
7605935	7605936	JTY_2507	JTY_2508			TRUE	0.718	6.000	0.000	NA		NA
7605937	7605938	JTY_2509	JTY_2510	pdhC	pdhB	TRUE	0.999	-3.000	1.000	0.082	Y	NA
7605938	7605939	JTY_2510	JTY_2511	pdhB	pdhA	TRUE	0.997	11.000	1.000	0.001	Y	NA
7605939	7605940	JTY_2511	JTY_2512	pdhA	citE	FALSE	0.019	259.000	0.083	1.000	N	NA
7605940	7605941	JTY_2512	JTY_2513	citE		TRUE	0.978	-3.000	0.326	1.000	N	NA
7605941	7605942	JTY_2513	JTY_2514		fadE19	TRUE	0.994	-3.000	0.117	1.000	Y	NA
7605942	7605943	JTY_2514	JTY_2515	fadE19	accA1	TRUE	0.986	5.000	0.190	1.000	Y	NA
7605943	7605944	JTY_2515	JTY_2516	accA1	accD1	TRUE	0.984	5.000	0.136	1.000	Y	NA
7605944	7605945	JTY_2516	JTY_2517	accD1	scoB	TRUE	0.992	-3.000	0.006	1.000	Y	NA
7605945	7605946	JTY_2517	JTY_2518	scoB	scoA	TRUE	0.999	-3.000	0.538	0.001	Y	NA
7605946	7605947	JTY_2518	JTY_2519	scoA	fadD35	TRUE	0.824	83.000	0.054	0.082	Y	NA
7605948	7605949	JTY_2520	JTY_2521			FALSE	0.350	79.000	0.167	NA		NA
7605953	7605954	JTY_2525	JTY_t0029	orn	hisT	FALSE	0.158	50.000	0.000	NA		NA
7605956	7605957	JTY_2527	JTY_2528			FALSE	0.015	221.000	0.000	NA		NA
7605958	7605959	JTY_2529	JTY_2530			TRUE	0.977	6.000	0.726	NA		NA
7605959	7605960	JTY_2530	JTY_2531			FALSE	0.124	119.000	0.000	1.000		NA
7605960	7605961	JTY_2531	JTY_2532			TRUE	0.976	-3.000	0.250	NA		NA
7605961	7605962	JTY_2532	JTY_2533		lppS	FALSE	0.005	348.000	0.000	NA		NA
7605963	7605964	JTY_t0030	JTY_2534	lysU	PE26	FALSE	0.016	219.000	0.000	NA		NA
7605967	7605968	JTY_2537	JTY_2538		acpS	TRUE	0.916	-3.000	0.036	1.000	N	NA
7605968	7605969	JTY_2538	JTY_2539	acpS	fas	FALSE	0.525	193.000	0.138	0.003	Y	NA
7605969	7605970	JTY_2539	JTY_2540	fas		FALSE	0.003	520.000	0.000	NA		NA
7605971	7605972	JTY_2541	JTY_2542			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7605975	7605976	JTY_2545	JTY_2546			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7605976	7605977	JTY_2546	JTY_2547			FALSE	0.305	31.000	0.000	1.000		NA
7605977	7605978	JTY_2547	JTY_2548			FALSE	0.335	72.000	0.143	NA		NA
7605978	7605979	JTY_2548	JTY_2549		nusB	TRUE	0.913	0.000	0.004	NA		NA
7605979	7605980	JTY_2549	JTY_2550	nusB	efp	TRUE	0.891	3.000	0.078	1.000	N	NA
7605980	7605981	JTY_2550	JTY_2551	efp	pepQ	TRUE	0.787	10.000	0.160	1.000	N	NA
7605983	7605984	JTY_2553	JTY_2554	aroD	aroB	TRUE	0.997	-3.000	0.052	0.002	Y	NA
7605984	7605985	JTY_2554	JTY_2555	aroB	aroK	TRUE	0.994	-3.000	0.147	1.000	Y	NA
7605985	7605986	JTY_2555	JTY_2556	aroK	aroF	TRUE	0.984	4.000	0.041	1.000	Y	NA
7605987	7605988	JTY_2557	JTY_2558			FALSE	0.007	296.000	0.000	NA		NA
7605988	7605989	JTY_2558	JTY_2559		lppA	FALSE	0.068	127.000	0.000	NA		NA
7605989	7605990	JTY_2559	JTY_2560	lppA	lprR	TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7605990	7605991	JTY_2560	JTY_2561	lprR	lppB	TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7605991	7605992	JTY_2561	JTY_2562	lppB		TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7605992	7605993	JTY_2562	JTY_2563			FALSE	0.123	93.000	0.000	NA		NA
7605993	7605994	JTY_2563	JTY_2564			FALSE	0.176	39.000	0.000	NA		NA
7605994	7605995	JTY_2564	JTY_2565			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7605996	7605997	JTY_2566	JTY_2567			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7605997	7605998	JTY_2567	JTY_2568			FALSE	0.007	411.000	0.000	1.000		NA
7605998	7605999	JTY_2568	JTY_2569		aroE	TRUE	0.705	12.000	0.022	1.000		NA
7605999	7606000	JTY_2569	JTY_2570	aroE		TRUE	0.844	23.000	0.667	NA		NA
7606000	7606001	JTY_2570	JTY_2571			TRUE	0.647	-7.000	0.039	NA		NA
7606001	7606002	JTY_2571	JTY_2572		alaS	TRUE	0.920	1.000	0.103	1.000	N	NA
7606002	7606003	JTY_2572	JTY_2573	alaS		FALSE	0.182	91.000	0.011	NA		NA
7606004	7606005	JTY_2574	JTY_2575			FALSE	0.130	85.000	0.000	NA		NA
7606007	7606008	JTY_2577	JTY_2578			FALSE	0.005	357.000	0.000	NA		NA
7606008	7606009	JTY_2578	JTY_2579			FALSE	0.080	143.000	0.000	1.000		NA
7606009	7606010	JTY_2579	JTY_2580		glnQ	TRUE	0.694	3.000	0.000	1.000	N	NA
7606010	7606011	JTY_2580	JTY_2581	glnQ		FALSE	0.015	277.000	0.000	1.000		NA
7606011	7606012	JTY_2581	JTY_2582			FALSE	0.542	11.000	0.000	NA		NA
7606012	7606013	JTY_2582	JTY_2583			FALSE	0.325	26.000	0.014	NA		NA
7606013	7606014	JTY_2583	JTY_2584			TRUE	0.991	0.000	0.667	NA		NA
7606015	7606016	JTY_2585	JTY_2586			TRUE	0.658	-7.000	0.046	NA		NA
7606018	7606019	JTY_2588	JTY_2589		aspS	TRUE	0.687	7.000	0.000	NA		NA
7606020	7606021	JTY_2590	JTY_2591			FALSE	0.490	23.000	0.098	NA		NA
7606021	7606022	JTY_2591	JTY_2592			FALSE	0.310	30.000	0.021	NA		NA
7606027	7606028	JTY_2597	JTY_2598	hisS		TRUE	0.962	-3.000	0.051	1.000		NA
7606030	7606031	JTY_2600	JTY_2601	relA	apt	FALSE	0.275	31.000	0.051	1.000	N	NA
7606031	7606032	JTY_2601	JTY_2602	apt		FALSE	0.123	104.000	0.023	1.000	N	NA
7606032	7606033	JTY_2602	JTY_2603		secF	TRUE	0.828	6.000	0.083	1.000	N	NA
7606033	7606034	JTY_2603	JTY_2604	secF	secD	TRUE	0.997	4.000	0.336	0.001	Y	NA
7606034	7606035	JTY_2604	JTY_2605	secD	yajC	TRUE	0.590	110.000	0.062	NA	Y	NA
7606036	7606037	JTY_2606	JTY_2607	gabT	fadD9	FALSE	0.218	162.000	0.444	1.000	N	NA
7606037	7606038	JTY_2607	JTY_2608	fadD9	PE_PGRS44	FALSE	0.029	174.000	0.000	NA		NA
7606039	7606040	JTY_2609	JTY_2610	ruvB	ruvA	TRUE	0.999	-3.000	0.549	0.002	Y	NA
7606040	7606041	JTY_2610	JTY_2611	ruvA	ruvC	TRUE	0.999	-3.000	0.451	0.008	Y	NA
7606042	7606043	JTY_2612	JTY_2613			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7606043	7606044	JTY_2613	JTY_2614			FALSE	0.016	217.000	0.000	NA		NA
7606044	7606045	JTY_2614	JTY_2615			TRUE	0.918	11.000	0.455	NA		NA
7606045	7606046	JTY_2615	JTY_2616			TRUE	0.975	-3.000	0.242	NA		NA
7606046	7606047	JTY_2616	JTY_2617			TRUE	0.589	82.000	0.444	NA		NA
7606047	7606048	JTY_2617	JTY_2618			TRUE	0.718	6.000	0.000	NA		NA
7606048	7606049	JTY_2618	JTY_2619		speE	TRUE	0.950	-3.000	0.065	NA		NA
7606049	7606050	JTY_2619	JTY_2620	speE		FALSE	0.143	111.000	0.000	1.000		NA
7606050	7606051	JTY_2620	JTY_2621			FALSE	0.365	-13.000	0.000	NA		NA
7606052	7606053	JTY_2622	JTY_2623			FALSE	0.123	133.000	0.055	NA		NA
7606053	7606054	JTY_2623	JTY_2624		tesB2	FALSE	0.520	8.000	0.027	NA	N	NA
7606054	7606055	JTY_2624	JTY_2625	tesB2		FALSE	0.221	29.000	0.014	1.000	N	NA
7606056	7606057	JTY_2626	JTY_2627	pdxH	PPE42	FALSE	0.002	174.000	0.000	NA	N	NA
7606058	7606059	JTY_2628	JTY_2629		pimA	TRUE	0.878	0.000	0.010	1.000	N	NA
7606059	7606060	JTY_2629	JTY_2630	pimA		TRUE	0.990	11.000	0.831	1.000	Y	NA
7606060	7606061	JTY_2630	JTY_2631		pgsA1	TRUE	0.992	-3.000	0.737	1.000	N	NA
7606061	7606062	JTY_2631	JTY_2632	pgsA1		TRUE	0.949	-3.000	0.140	1.000	N	NA
7606062	7606063	JTY_2632	JTY_2633		thrS	TRUE	0.748	-7.000	0.208	1.000	N	NA
7606065	7606066	JTY_2635	JTY_2636	PE_PGRS45b	PE_PGRS45a	FALSE	0.384	-12.000	0.000	NA		NA
7606070	7606071	JTY_2640	JTY_2641			TRUE	0.670	13.000	0.090	NA		NA
7606071	7606072	JTY_2641	JTY_2642			TRUE	0.959	-3.000	0.129	NA		NA
7606073	7606074	JTY_2643	JTY_2644		TB31.7	FALSE	0.125	136.000	0.013	1.000		NA
7606075	7606076	JTY_2645	JTY_2646			FALSE	0.529	15.000	0.000	1.000		NA
7606076	7606077	JTY_2646	JTY_2647			FALSE	0.240	59.000	0.000	1.000		NA
7606077	7606078	JTY_2647	JTY_2648			FALSE	0.003	514.000	0.000	NA		NA
7606079	7606080	JTY_2649	JTY_2650			FALSE	0.005	347.000	0.000	NA		NA
7606080	7606081	JTY_2650	JTY_2651			TRUE	0.836	2.000	0.000	NA		NA
7606081	7606082	JTY_2651	JTY_2652			FALSE	0.231	139.000	0.279	NA		NA
7606083	7606084	JTY_2653	JTY_2654			FALSE	0.046	145.000	0.000	NA		NA
7606084	7606085	JTY_2654	JTY_2655		PE_PGRS46	FALSE	0.008	285.000	0.000	NA		NA
7606086	7606087	JTY_2656	JTY_2657			TRUE	0.851	1.000	0.000	NA		NA
7606087	7606088	JTY_2657	JTY_2658		dedA	FALSE	0.021	196.000	0.000	NA		NA
7606088	7606089	JTY_2658	JTY_2659	dedA		FALSE	0.033	163.000	0.000	NA		NA
7606090	7606091	JTY_2660	JTY_2661			FALSE	0.121	120.000	0.000	1.000		NA
7606092	7606093	JTY_2662	JTY_2663	cadI		FALSE	0.323	136.000	0.400	NA		NA
7606093	7606094	JTY_2663	JTY_2664		arsC	TRUE	0.989	-3.000	0.600	1.000	N	NA
7606095	7606096	JTY_2665	JTY_t0031		valT	FALSE	0.002	647.000	0.000	NA		NA
7606097	7606098	JTY_t0032	JTY_t0033	glyT	cysU	FALSE	0.207	30.000	0.000	NA		NA
7606098	7606099	JTY_t0033	JTY_t0034	cysU	valU	FALSE	0.343	17.000	0.000	NA		NA
7606100	7606101	JTY_2666	JTY_2667			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7606102	7606103	JTY_2668	JTY_2669			FALSE	0.116	99.000	0.000	NA		NA
7606103	7606104	JTY_2669	JTY_2670			FALSE	0.542	11.000	0.000	NA		NA
7606104	7606105	JTY_2670	JTY_2673			FALSE	0.002	720.000	0.000	NA		NA
7606105	7606106	JTY_2673	JTY_2674		clpX'	FALSE	0.401	22.000	0.000	1.000		NA
7606106	7606107	JTY_2674	JTY_2675	clpX'		FALSE	0.335	79.000	0.150	NA		NA
7606107	7606108	JTY_2675	JTY_2676			FALSE	0.362	29.000	0.051	NA		NA
7606110	7606111	JTY_2678	JTY_2679	ribD		FALSE	0.478	67.000	0.275	NA		NA
7606111	7606112	JTY_2679	JTY_2680			TRUE	0.770	23.000	0.444	NA		NA
7606112	7606113	JTY_2680	JTY_2681			FALSE	0.117	169.000	0.217	NA		NA
7606114	7606115	JTY_2682	JTY_2683			TRUE	0.929	-3.000	0.014	NA		NA
7606115	7606116	JTY_2683	JTY_2684		hemY	TRUE	0.891	6.000	0.158	NA		NA
7606116	7606117	JTY_2684	JTY_2685	hemY	hemE	TRUE	0.997	-3.000	0.049	0.001	Y	NA
7606118	7606119	JTY_2686	JTY_2687			FALSE	0.019	262.000	0.038	NA		NA
7606119	7606120	JTY_2687	JTY_2688			TRUE	0.934	2.000	0.115	NA		NA
7606122	7606123	JTY_2690	JTY_2691		arsA	TRUE	0.845	5.000	0.000	1.000		NA
7606123	7606124	JTY_2691	JTY_2692	arsA	arsB1	TRUE	0.855	80.000	0.000	0.001	Y	NA
7606125	7606126	JTY_2693	JTY_2694			TRUE	0.966	-3.000	0.176	NA		NA
7606126	7606127	JTY_2694	JTY_2695			TRUE	0.972	-3.000	0.222	NA		NA
7606127	7606128	JTY_2695	JTY_2696			FALSE	0.006	195.000	0.004	NA	N	NA
7606128	7606129	JTY_2696	JTY_2697			FALSE	0.043	156.000	0.082	NA	N	NA
7606130	7606131	JTY_2698	JTY_2699	ceoB	ceoC	TRUE	0.998	-3.000	0.162	0.002	Y	NA
7606132	7606133	JTY_2700	JTY_2701			FALSE	0.436	31.000	0.145	NA		NA
7606135	7606136	JTY_2703	JTY_2704		dut	FALSE	0.292	75.000	0.078	NA		NA
7606141	7606142	JTY_2709	JTY_2710	ppgK	sigA	FALSE	0.335	180.000	0.075	1.000	Y	NA
7606142	7606143	JTY_2710	JTY_2711	sigA		FALSE	0.106	37.000	0.024	NA	N	NA
7606144	7606145	JTY_2712	JTY_2713			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7606148	7606149	JTY_2716	JTY_2717		sigB	FALSE	0.150	176.000	0.303	NA		NA
7606149	7606150	JTY_2717	JTY_2718	sigB	ideR	TRUE	0.707	133.000	0.134	0.038	Y	NA
7606152	7606153	JTY_2720	JTY_2721	sthA		FALSE	0.027	218.000	0.000	1.000		NA
7606153	7606154	JTY_2721	JTY_2722			TRUE	0.716	59.000	0.538	1.000		NA
7606154	7606155	JTY_2722	JTY_2723			TRUE	0.739	49.000	0.280	0.035		NA
7606156	7606157	JTY_2724	JTY_2725			FALSE	0.212	52.000	0.005	NA		NA
7606157	7606158	JTY_2725	JTY_2726			FALSE	0.051	163.000	0.012	NA		NA
7606161	7606162	JTY_2729	JTY_2730			FALSE	0.231	26.000	0.000	NA		NA
7606163	7606164	JTY_2731	JTY_2732	fadE20	hflX	FALSE	0.115	136.000	0.003	1.000		NA
7606164	7606165	JTY_2732	JTY_2733	hflX	dapF	TRUE	0.580	17.000	0.025	1.000		NA
7606165	7606166	JTY_2733	JTY_2734	dapF	miaA	FALSE	0.346	25.000	0.062	1.000	N	NA
7606166	7606167	JTY_2734	JTY_2735	miaA		TRUE	0.942	-3.000	0.043	NA		NA
7606167	7606168	JTY_2735	JTY_2736			FALSE	0.093	109.000	0.000	NA		NA
7606169	7606170	JTY_2737	JTY_2738			TRUE	0.658	8.000	0.000	NA		NA
7606171	7606172	JTY_2739	JTY_2740			TRUE	0.935	-3.000	0.024	NA		NA
7606174	7606175	JTY_2742	JTY_2743		recX	TRUE	0.599	10.000	0.000	NA		NA
7606175	7606176	JTY_2743	JTY_2744	recX	recA	TRUE	0.698	-34.000	0.296	1.000		NA
7606178	7606179	JTY_2746	JTY_2747			TRUE	0.787	11.000	0.152	NA		NA
7606180	7606181	JTY_2748	JTY_2749	ephG	PE_PGRS47a	FALSE	0.013	232.000	0.000	NA		NA
7606181	7606182	JTY_2749	JTY_2750	PE_PGRS47a	PE_PGRS47	FALSE	0.480	12.000	0.000	NA		NA
7606183	7606184	JTY_2751	JTY_2752			FALSE	0.289	21.000	0.000	NA		NA
7606184	7606185	JTY_2752	JTY_2753			FALSE	0.356	72.000	0.167	NA		NA
7606185	7606186	JTY_2753	JTY_2754		35kd_ag	TRUE	0.736	19.000	0.306	NA		NA
7606186	7606187	JTY_2754	JTY_2755	35kd_ag		FALSE	0.262	130.000	0.260	NA		NA
7606187	7606188	JTY_2755	JTY_2756		pgsA3	FALSE	0.276	71.000	0.006	1.000		NA
7606191	7606192	JTY_2759	JTY_2760			TRUE	0.991	-3.000	0.250	0.034		NA
7606192	7606193	JTY_2760	JTY_2761			TRUE	0.994	4.000	0.600	NA	Y	NA
7606194	7606195	JTY_2762	JTY_2763		dapA	TRUE	0.783	31.000	0.550	1.000		NA
7606195	7606196	JTY_2763	JTY_2764	dapA	thyX	FALSE	0.184	69.000	0.037	1.000	N	NA
7606196	7606197	JTY_2764	JTY_2765	thyX	hsdS'	FALSE	0.020	244.000	0.000	1.000		NA
7606197	7606198	JTY_2765	JTY_2766	hsdS'	hsdM	TRUE	0.934	-3.000	0.000	1.000		NA
7606198	7606199	JTY_2766	JTY_2767	hsdM		FALSE	0.128	87.000	0.000	NA		NA
7606199	7606200	JTY_2767	JTY_2768			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7606200	7606201	JTY_2768	JTY_2769			FALSE	0.231	26.000	0.000	NA		NA
7606201	7606202	JTY_2769	JTY_2770			TRUE	0.993	-3.000	0.750	NA		NA
7606202	7606203	JTY_2770	JTY_2771		hsdS	TRUE	0.599	10.000	0.000	NA		NA
7606203	7606204	JTY_2771	JTY_2772	hsdS		TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7606204	7606205	JTY_2772	JTY_2773			FALSE	0.369	16.000	0.000	NA		NA
7606205	7606206	JTY_2773	JTY_2774		dfrA	FALSE	0.142	74.000	0.000	NA		NA
7606206	7606207	JTY_2774	JTY_2775	dfrA	thyA	FALSE	0.446	71.000	0.295	1.000	N	NA
7606209	7606210	JTY_2777	JTY_2778	fabG		TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7606210	7606211	JTY_2778	JTY_2779		PPE43	FALSE	0.029	174.000	0.000	NA		NA
7606211	7606212	JTY_2779	JTY_2780	PPE43	PE27	TRUE	0.794	80.000	1.000	NA		NA
7606212	7606213	JTY_2780	JTY_2781	PE27	PPE44	FALSE	0.006	324.000	0.000	NA		NA
7606213	7606214	JTY_2781	JTY_2782	PPE44		FALSE	0.071	124.000	0.000	NA		NA
7606214	7606215	JTY_2782	JTY_2783			FALSE	0.129	86.000	0.000	NA		NA
7606215	7606216	JTY_2783	JTY_2784		dapB	TRUE	0.712	12.000	0.027	1.000		NA
7606216	7606217	JTY_2784	JTY_2785	dapB		FALSE	0.542	11.000	0.000	NA		NA
7606219	7606220	JTY_2787	JTY_2788			FALSE	0.026	182.000	0.000	NA		NA
7606220	7606221	JTY_2788	JTY_2789			FALSE	0.252	158.000	0.429	NA		NA
7606221	7606222	JTY_2789	JTY_2790			FALSE	0.375	32.000	0.074	NA		NA
7606223	7606224	JTY_2791	JTY_2792	ald_a	aldB	TRUE	0.987	-3.000	0.000	0.001		NA
7606225	7606226	JTY_2793	JTY_2794		pepR	FALSE	0.297	61.000	0.010	1.000		NA
7606226	7606227	JTY_2794	JTY_2795	pepR	gpsI	TRUE	0.644	-22.000	0.171	1.000		NA
7606227	7606228	JTY_2795	JTY_2796	gpsI	lppU	FALSE	0.005	354.000	0.000	NA		NA
7606228	7606229	JTY_2796	JTY_2797	lppU	rpsO	FALSE	0.528	13.000	0.004	NA		NA
7606229	7606230	JTY_2797	JTY_2798	rpsO	ribF	FALSE	0.077	157.000	0.119	1.000	N	NA
7606231	7606232	JTY_2799	JTY_2800		sirR	FALSE	0.071	85.000	0.000	1.000	N	NA
7606233	7606234	JTY_2801	JTY_2802	fadE21	ltp1	TRUE	0.786	26.000	0.011	NA	Y	NA
7606234	7606235	JTY_2802	JTY_2803	ltp1		FALSE	0.015	33.000	0.000	NA	N	NA
7606235	7606236	JTY_2803	JTY_2804			TRUE	0.987	0.000	0.000	NA	Y	NA
7606236	7606237	JTY_2804	JTY_2805		truB	FALSE	0.010	202.000	0.000	1.000	N	NA
7606237	7606238	JTY_2805	JTY_2806	truB		TRUE	0.914	-3.000	0.034	1.000	N	NA
7606238	7606239	JTY_2806	JTY_2807			TRUE	0.977	-3.000	0.203	1.000		NA
7606239	7606240	JTY_2807	JTY_2808		lppV	FALSE	0.117	145.000	0.111	NA		NA
7606240	7606241	JTY_2808	JTY_2809	lppV		TRUE	0.915	0.000	0.006	NA		NA
7606241	7606242	JTY_2809	JTY_2810			TRUE	0.846	4.000	0.006	NA		NA
7606243	7606244	JTY_2811	JTY_2812			TRUE	0.775	19.000	0.375	NA		NA
7606245	7606246	JTY_2813	JTY_2814			FALSE	0.010	257.000	0.000	NA		NA
7606249	7606250	JTY_2817	JTY_2818			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7606250	7606251	JTY_2818	JTY_2819			FALSE	0.020	199.000	0.000	NA		NA
7606251	7606252	JTY_2819	JTY_2820			FALSE	0.013	234.000	0.000	NA		NA
7606252	7606253	JTY_2820	JTY_2821			FALSE	0.104	105.000	0.000	NA		NA
7606255	7606256	JTY_2823	JTY_2824			TRUE	0.682	71.000	0.600	NA		NA
7606256	7606257	JTY_2824	JTY_2825			TRUE	0.970	-3.000	0.125	1.000		NA
7606258	7606259	JTY_2826	JTY_2827			TRUE	0.677	99.000	0.308	0.044		NA
7606259	7606260	JTY_2827	JTY_2828			FALSE	0.003	2254.000	0.000	1.000		NA
11493388	7606261		JTY_2829			FALSE	NA	650.000	0.000	NA		NA
11635751	7606261		JTY_2829			FALSE	NA	650.000	0.000	NA		NA
11778143	7606261		JTY_2829			FALSE	NA	650.000	0.000	NA		NA
11493389	7606261		JTY_2829			FALSE	NA	614.000	0.000	NA		NA
11635752	7606261		JTY_2829			FALSE	NA	614.000	0.000	NA		NA
11778144	7606261		JTY_2829			FALSE	NA	614.000	0.000	NA		NA
11493390	7606261		JTY_2829			FALSE	NA	578.000	0.000	NA		NA
11635753	7606261		JTY_2829			FALSE	NA	578.000	0.000	NA		NA
11778145	7606261		JTY_2829			FALSE	NA	578.000	0.000	NA		NA
11493391	7606261		JTY_2829			FALSE	NA	542.000	0.000	NA		NA
11635754	7606261		JTY_2829			FALSE	NA	542.000	0.000	NA		NA
11778146	7606261		JTY_2829			FALSE	NA	542.000	0.000	NA		NA
11493392	7606261		JTY_2829			FALSE	NA	501.000	0.000	NA		NA
11635755	7606261		JTY_2829			FALSE	NA	501.000	0.000	NA		NA
11778147	7606261		JTY_2829			FALSE	NA	501.000	0.000	NA		NA
11493393	7606261		JTY_2829			FALSE	NA	465.000	0.000	NA		NA
11635756	7606261		JTY_2829			FALSE	NA	465.000	0.000	NA		NA
11778148	7606261		JTY_2829			FALSE	NA	465.000	0.000	NA		NA
11493394	7606261		JTY_2829			FALSE	NA	427.000	0.000	NA		NA
11635757	7606261		JTY_2829			FALSE	NA	427.000	0.000	NA		NA
11778149	7606261		JTY_2829			FALSE	NA	427.000	0.000	NA		NA
11493395	7606261		JTY_2829			FALSE	NA	391.000	0.000	NA		NA
11635758	7606261		JTY_2829			FALSE	NA	391.000	0.000	NA		NA
11778150	7606261		JTY_2829			FALSE	NA	391.000	0.000	NA		NA
7606260	7606261	JTY_2828	JTY_2829			TRUE	0.993	1.000	0.280	NA	Y	NA
7606261	7606262	JTY_2829	JTY_2830			FALSE	0.440	13.000	0.000	NA		NA
7606262	7606263	JTY_2830	JTY_2831			FALSE	0.243	25.000	0.000	NA		NA
7606263	7606264	JTY_2831	JTY_2832			TRUE	0.946	-3.000	0.052	NA		NA
7606264	7606265	JTY_2832	JTY_2833			TRUE	0.997	-3.000	0.597	NA	Y	NA
7606265	7606266	JTY_2833	JTY_2834			TRUE	0.953	-19.000	0.547	NA	Y	NA
7606266	7606267	JTY_2834	JTY_2835			TRUE	0.933	10.000	0.453	NA		NA
7606267	7606268	JTY_2835	JTY_2836			TRUE	0.983	-3.000	0.347	NA		NA
7606268	7606269	JTY_2836	JTY_2837			TRUE	0.956	-3.000	0.102	NA		NA
7606269	7606270	JTY_2837	JTY_2838			FALSE	0.027	178.000	0.000	NA		NA
7606270	7606271	JTY_2838	JTY_2839			FALSE	0.031	170.000	0.000	NA		NA
7606271	7606272	JTY_2839	JTY_2840			TRUE	0.815	3.000	0.000	NA		NA
7606272	7606273	JTY_2840	JTY_2841			FALSE	0.007	305.000	0.000	NA		NA
7606273	7606274	JTY_2841	JTY_2842			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7606274	7606275	JTY_2842	JTY_2843			FALSE	0.289	21.000	0.000	NA		NA
7606275	7606276	JTY_2843	JTY_2844			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7606278	7606279	JTY_2846	JTY_2847	ugpC	ugpBb	FALSE	0.483	-7.000	0.000	NA		NA
7606279	7606280	JTY_2847	JTY_2848	ugpBb	ugpBa	TRUE	0.851	1.000	0.000	NA		NA
7606280	7606281	JTY_2848	JTY_2849	ugpBa	ugpE	TRUE	0.991	3.000	0.467	0.009		NA
7606281	7606282	JTY_2849	JTY_2850	ugpE	ugpA	TRUE	0.998	-3.000	0.389	0.009	Y	NA
7606282	7606283	JTY_2850	JTY_2851	ugpA	dinF	FALSE	0.389	87.000	0.006	0.031	N	NA
7606283	7606284	JTY_2851	JTY_2852	dinF		TRUE	0.872	7.000	0.054	1.000		NA
7606284	7606285	JTY_2852	JTY_2853		rbfA	TRUE	0.626	-25.000	0.173	1.000		NA
7606285	7606286	JTY_2853	JTY_2854	rbfA	infB	TRUE	0.997	0.000	0.530	1.000	Y	NA
7606286	7606287	JTY_2854	JTY_2855	infB		FALSE	0.209	86.000	0.171	NA	N	NA
7606287	7606288	JTY_2855	JTY_2856		nusA	TRUE	0.670	127.000	0.323	NA	Y	NA
7606288	7606289	JTY_2856	JTY_2857	nusA		TRUE	0.993	-3.000	0.759	NA		NA
7606290	7606291	JTY_2858	JTY_2859			TRUE	0.961	-3.000	0.139	NA		NA
7606292	7606293	JTY_2860	JTY_2861	proS	efpA	FALSE	0.170	89.000	0.004	NA		NA
7606293	7606294	JTY_2861	JTY_2862	efpA	cysG	FALSE	0.534	23.000	0.156	NA		NA
7606294	7606295	JTY_2862	JTY_2863	cysG	cobB	FALSE	0.103	331.000	0.145	1.000	Y	NA
7606295	7606296	JTY_2863	JTY_2864	cobB	cobO	TRUE	0.997	0.000	0.114	0.006	Y	NA
7606296	7606297	JTY_2864	JTY_2865	cobO		TRUE	0.928	21.000	0.057	0.059	Y	NA
7606297	7606298	JTY_2865	JTY_2866			TRUE	0.985	-3.000	0.314	1.000		NA
7606298	7606299	JTY_2866	JTY_2867		mqo	FALSE	0.412	59.000	0.119	1.000		NA
7606300	7606301	JTY_2868	JTY_2869	PE_PGRS48		FALSE	0.182	37.000	0.000	NA		NA
7606301	7606302	JTY_2869	JTY_2870		mtr	TRUE	0.781	13.000	0.341	NA	N	NA
7606302	7606303	JTY_2870	JTY_2871	mtr	nicT	FALSE	0.140	100.000	0.030	1.000	N	NA
7606303	7606304	JTY_2871	JTY_2872	nicT		FALSE	0.146	66.000	0.000	NA		NA
7606304	7606305	JTY_2872	JTY_2873			FALSE	0.480	12.000	0.000	NA		NA
7606306	7606307	JTY_2874	JTY_2875		aldC	TRUE	0.996	-3.000	0.839	0.031	N	NA
7606307	7606308	JTY_2875	JTY_2876	aldC		TRUE	0.989	-3.000	0.419	1.000		NA
7606308	7606309	JTY_2876	JTY_2877		glnA4	TRUE	0.662	-19.000	0.157	1.000		NA
7606309	7606310	JTY_2877	JTY_2878	glnA4	mapB	FALSE	0.019	160.000	0.000	1.000	N	NA
7606310	7606311	JTY_2878	JTY_2879	mapB		FALSE	0.290	42.000	0.042	NA		NA
7606314	7606315	JTY_2882	JTY_2883			TRUE	0.975	4.000	0.000	NA	Y	NA
7606316	7606317	JTY_2884	JTY_2885		gcpE	FALSE	0.318	56.000	0.018	1.000		NA
7606317	7606318	JTY_2885	JTY_2886	gcpE		FALSE	0.484	17.000	0.072	1.000	N	NA
7606318	7606319	JTY_2886	JTY_2887		dxr	TRUE	0.786	8.000	0.088	1.000	N	NA
7606320	7606321	JTY_2888	JTY_2889			FALSE	0.365	-13.000	0.000	NA		NA
7606321	7606322	JTY_2889	JTY_2890		mpb83	FALSE	0.138	80.000	0.000	NA		NA
7606322	7606323	JTY_2890	JTY_2891	mpb83	dipZ	FALSE	0.004	280.000	0.000	1.000	N	NA
7606323	7606324	JTY_2891	JTY_2892	dipZ	mpb70	FALSE	0.065	96.000	0.000	1.000	N	NA
7606324	7606325	JTY_2892	JTY_2893	mpb70		FALSE	0.157	52.000	0.000	NA		NA
7606326	7606327	JTY_2894	JTY_2895		mpb53	TRUE	0.997	5.000	1.000	1.000	Y	NA
7606327	7606328	JTY_2895	JTY_2896	mpb53		FALSE	0.052	186.000	0.003	1.000		NA
7606328	7606329	JTY_2896	JTY_2897		cdsA	FALSE	0.502	23.000	0.033	1.000		NA
7606329	7606330	JTY_2897	JTY_2898	cdsA	frr	FALSE	0.398	23.000	0.076	1.000	N	NA
7606330	7606331	JTY_2898	JTY_2899	frr	pyrH	FALSE	0.267	172.000	0.626	1.000	N	NA
7606333	7606334	JTY_2901	JTY_2902			TRUE	0.988	-3.000	0.000	NA	Y	NA
7606336	7606337	JTY_2904	JTY_2905	amiC	tsf	TRUE	0.970	7.000	0.006	1.000	Y	NA
7606337	7606338	JTY_2905	JTY_2906	tsf	rpsB	TRUE	0.985	12.000	0.748	1.000	Y	NA
7606342	7606343	JTY_2910	JTY_2911	xerC	viuB	FALSE	0.044	91.000	0.008	NA	N	NA
7606343	7606344	JTY_2911	JTY_2912	viuB		FALSE	0.069	33.000	0.007	NA	N	NA
7606344	7606345	JTY_2912	JTY_2913			TRUE	0.926	-3.000	0.053	1.000	N	NA
7606345	7606346	JTY_2913	JTY_2914			TRUE	0.916	0.000	0.050	1.000	N	NA
7606346	7606347	JTY_2914	JTY_2915		fdhD	FALSE	0.010	248.000	0.003	1.000	N	NA
7606347	7606348	JTY_2915	JTY_2916	fdhD	fdhF	TRUE	0.998	0.000	0.261	0.000	Y	NA
7606348	7606349	JTY_2916	JTY_2917	fdhF		FALSE	0.154	58.000	0.000	NA		NA
7606349	7606350	JTY_2917	JTY_2918		rnhB	FALSE	0.302	54.000	0.067	NA		NA
7606350	7606351	JTY_2918	JTY_2919	rnhB	lepB	FALSE	0.457	14.000	0.024	1.000	N	NA
7606351	7606352	JTY_2919	JTY_2920	lepB	rplS	FALSE	0.170	58.000	0.018	1.000	N	NA
7606354	7606355	JTY_2922	JTY_2923	trmD	rimM	TRUE	0.996	4.000	0.672	1.000	Y	NA
7606355	7606356	JTY_2923	JTY_2924	rimM		TRUE	0.852	14.000	0.324	1.000		NA
7606356	7606357	JTY_2924	JTY_2925		rpsP	TRUE	0.949	8.000	0.385	1.000		NA
7606357	7606358	JTY_2925	JTY_2926	rpsP		FALSE	0.034	184.000	0.002	NA		NA
7606360	7606361	JTY_2928	JTY_2929			TRUE	0.972	2.000	0.278	1.000		NA
7606361	7606362	JTY_2929	JTY_2930		pknI	FALSE	0.079	69.000	0.000	1.000	N	NA
7606362	7606363	JTY_2930	JTY_2931	pknI		FALSE	0.092	44.000	0.000	1.000	N	NA
7606363	7606364	JTY_2931	JTY_2932		ffh	FALSE	0.250	28.000	0.025	1.000	N	NA
7606366	7606367	JTY_2934	JTY_2935	glnD	glnB	FALSE	0.222	58.000	0.055	1.000	N	NA
7606367	7606368	JTY_2935	JTY_2936	glnB	amt	TRUE	0.985	-3.000	0.467	1.000	N	NA
7606368	7606369	JTY_2936	JTY_2937	amt	ftsY	FALSE	0.013	477.000	0.004	0.031	N	NA
7606369	7606370	JTY_2937	JTY_2938	ftsY	smc	TRUE	0.601	50.000	0.165	0.010	N	NA
7606370	7606371	JTY_2938	JTY_2939	smc	acyP	FALSE	0.515	12.000	0.021	1.000	N	NA
7606371	7606372	JTY_2939	JTY_2940	acyP		FALSE	0.417	-13.000	0.028	1.000	N	NA
7606372	7606373	JTY_2940	JTY_2941		fpg	FALSE	0.110	102.000	0.010	1.000	N	NA
7606373	7606374	JTY_2941	JTY_2942	fpg	rnc	FALSE	0.012	304.000	0.068	1.000	N	NA
7606374	7606375	JTY_2942	JTY_2943	rnc		TRUE	0.936	-3.000	0.026	NA		NA
7606375	7606376	JTY_2943	JTY_2944			FALSE	0.257	51.000	0.029	NA		NA
7606377	7606378	JTY_2945	JTY_2946	tesA		FALSE	0.365	-13.000	0.000	NA		NA
7606378	7606379	JTY_2946	JTY_2947		fadD26	FALSE	0.004	416.000	0.000	NA		NA
7606379	7606380	JTY_2947	JTY_2948	fadD26	ppsA	TRUE	0.998	-3.000	0.667	1.000	Y	NA
7606380	7606381	JTY_2948	JTY_2949	ppsA	ppsB	TRUE	0.999	-3.000	0.667	0.006	Y	NA
7606381	7606382	JTY_2949	JTY_2950	ppsB	ppsC	TRUE	0.999	-3.000	0.500	0.006	Y	NA
7606382	7606383	JTY_2950	JTY_2951	ppsC	ppsD	TRUE	0.999	-3.000	0.833	0.004	Y	NA
7606383	7606384	JTY_2951	JTY_2952	ppsD	ppsE	TRUE	0.995	6.000	0.417	0.006	Y	NA
7606384	7606385	JTY_2952	JTY_2953	ppsE	drrA	TRUE	0.915	11.000	0.500	1.000	N	NA
7606385	7606386	JTY_2953	JTY_2954	drrA	drrB	TRUE	0.994	-3.000	0.750	1.000		NA
7606386	7606387	JTY_2954	JTY_2955	drrB	drrC	TRUE	0.998	-3.000	0.857	0.001		NA
7606387	7606388	JTY_2955	JTY_2956	drrC	papA5	TRUE	0.588	47.000	0.364	NA		NA
7606390	7606391	JTY_2958	JTY_2959	fadD28	mmpL7	TRUE	0.936	-7.000	0.600	1.000		NA
7606391	7606392	JTY_2959	JTY_2960	mmpL7		FALSE	0.004	632.000	0.000	1.000		NA
7606392	7606393	JTY_2960	JTY_2961			TRUE	0.927	0.000	0.000	1.000		NA
7606394	7606395	JTY_2962	JTY_2963	lppX	pks1	FALSE	0.050	349.000	0.500	NA		NA
7606395	7606396	JTY_2963	JTY_2964	pks1	fadD22	TRUE	0.999	-3.000	0.750	0.007	Y	NA
7606396	7606397	JTY_2964	JTY_2965	fadD22		FALSE	0.155	17.000	0.010	NA	N	NA
7606397	7606398	JTY_2965	JTY_2966		fadD29	FALSE	0.095	26.000	0.010	NA	N	NA
7606398	7606399	JTY_2966	JTY_2967	fadD29		FALSE	0.000	648.000	0.000	NA	N	NA
7606400	7606401	JTY_2968	JTY_2969			FALSE	0.231	26.000	0.000	NA		NA
7606402	7606403	JTY_2970	JTY_2971			FALSE	0.023	189.000	0.000	NA		NA
7606404	7606405	JTY_2972	JTY_2973			FALSE	0.289	71.000	0.071	NA		NA
7606406	7606407	JTY_2974	JTY_2975			FALSE	0.008	101.000	0.000	NA	N	NA
7606407	7606408	JTY_2975	JTY_2976			FALSE	0.081	115.000	0.000	NA		NA
7606411	7606412	JTY_2979	JTY_2980		purU	FALSE	0.208	73.000	0.012	NA		NA
7606413	7606414	JTY_2981	JTY_2982	coaD		FALSE	0.481	86.000	0.367	1.000	N	NA
7606414	7606415	JTY_2982	JTY_2983		pca	FALSE	0.022	196.000	0.014	1.000	N	NA
7606415	7606416	JTY_2983	JTY_2984	pca		FALSE	0.355	25.000	0.021	NA		NA
7606416	7606417	JTY_2984	JTY_2985			TRUE	0.928	6.000	0.257	NA		NA
7606417	7606418	JTY_2985	JTY_2986		lipN	FALSE	0.435	97.000	0.421	NA	N	NA
7606419	7606420	JTY_2987	JTY_2988			TRUE	0.979	-3.000	0.000	0.031		NA
7606421	7606422	JTY_2989	JTY_2990		recG	TRUE	0.932	-3.000	0.018	NA		NA
7606422	7606423	JTY_2990	JTY_2991	recG		TRUE	0.927	3.000	0.040	1.000		NA
7606423	7606424	JTY_2991	JTY_2992		ung	FALSE	0.009	459.000	0.029	1.000		NA
7606424	7606425	JTY_2992	JTY_2993	ung	thiL	FALSE	0.228	33.000	0.028	1.000	N	NA
7606425	7606426	JTY_2993	JTY_2994	thiL		FALSE	0.348	-3.000	0.000	NA	N	NA
7606426	7606427	JTY_2994	JTY_2995			TRUE	0.987	0.000	0.000	NA	Y	NA
7606429	7606430	JTY_2997	JTY_2998	ddl	gpsA	FALSE	0.238	78.000	0.088	1.000	N	NA
7606431	7606432	JTY_2999	JTY_3000		ppk	FALSE	0.203	92.000	0.026	NA		NA
7606432	7606433	JTY_3000	JTY_3001	ppk	mutT1	FALSE	0.194	83.000	0.056	1.000	N	NA
7606434	7606435	JTY_3002	JTY_3003	hupB	leuD	FALSE	0.028	213.000	0.066	1.000	N	NA
7606435	7606436	JTY_3003	JTY_3004	leuD	leuC	TRUE	0.975	25.000	0.477	0.000	Y	NA
7606440	7606441	JTY_t0035	JTY_t0036	gluU	glnU	FALSE	0.174	40.000	0.000	NA		NA
7606441	7606442	JTY_t0036	JTY_3008	glnU	gltx	FALSE	0.142	75.000	0.000	NA		NA
7606442	7606443	JTY_3008	JTY_3009	gltx		TRUE	0.935	-3.000	0.070	1.000	N	NA
7606445	7606446	JTY_3011	JTY_3012	leuB	serA1	TRUE	0.914	15.000	0.039	1.000	Y	NA
7606447	7606448	JTY_3013	JTY_3014			FALSE	0.009	274.000	0.000	NA		NA
7606450	7606451	JTY_3016	JTY_3017	lppY		FALSE	0.164	45.000	0.000	NA		NA
7606452	7606453	JTY_3018	JTY_3019	ilvC	ilvN	TRUE	0.916	38.000	0.071	0.001	Y	NA
7606453	7606454	JTY_3019	JTY_3020	ilvN	ilvB1	TRUE	0.999	0.000	0.380	0.001	Y	NA
7606460	7606461	JTY_3026	JTY_3027	gatB	pfkA	FALSE	0.206	30.000	0.011	1.000	N	NA
7606461	7606462	JTY_3027	JTY_3028	pfkA	gatA	FALSE	0.115	96.000	0.007	1.000	N	NA
7606462	7606463	JTY_3028	JTY_3029	gatA	gatC	TRUE	0.999	-3.000	0.643	0.001	Y	NA
7606465	7606466	JTY_3031	JTY_3032	ligA		FALSE	0.195	31.000	0.009	1.000	N	NA
7606468	7606469	JTY_3034	JTY_3035	esxQ	PPE46	FALSE	0.128	87.000	0.000	NA		NA
7606469	7606470	JTY_3035	JTY_3036	PPE46	PE27A	FALSE	0.289	21.000	0.000	NA		NA
7606470	7606471	JTY_3036	JTY_3037	PE27A	esxR	FALSE	0.007	296.000	0.000	NA		NA
7606471	7606472	JTY_3037	JTY_3038	esxR	esxS	FALSE	0.186	35.000	0.000	NA		NA
7606472	7606473	JTY_3038	JTY_3039	esxS	PPE47	FALSE	0.162	47.000	0.000	NA		NA
7606473	7606474	JTY_3039	JTY_3040	PPE47	PE29	TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7606474	7606475	JTY_3040	JTY_3041	PE29		FALSE	0.004	382.000	0.000	NA		NA
7606475	7606476	JTY_3041	JTY_3042		trmU	FALSE	0.017	163.000	0.000	1.000	N	NA
7606476	7606477	JTY_3042	JTY_3043	trmU	iscS	TRUE	0.941	-3.000	0.094	1.000	N	NA
7606477	7606478	JTY_3043	JTY_3044	iscS		FALSE	0.389	97.000	0.045	0.071	N	NA
7606478	7606479	JTY_3044	JTY_3045			TRUE	0.979	-3.000	0.286	NA		NA
7606479	7606480	JTY_3045	JTY_3046		fixB	FALSE	0.022	261.000	0.062	NA		NA
7606480	7606481	JTY_3046	JTY_3047	fixB	fixA	TRUE	0.975	39.000	0.877	0.007	Y	NA
7606482	7606483	JTY_3048	JTY_3049			TRUE	0.954	-3.000	0.019	1.000		NA
7606483	7606484	JTY_3049	JTY_3050			FALSE	0.463	32.000	0.082	1.000		NA
7606484	7606485	JTY_3050	JTY_3051			FALSE	0.189	34.000	0.000	NA		NA
7606485	7606486	JTY_3051	JTY_3052			FALSE	0.027	179.000	0.000	NA		NA
7606489	7606490	JTY_3055	JTY_3056	TB22.2		FALSE	0.240	73.000	0.034	NA		NA
7606490	7606491	JTY_3056	JTY_3057			FALSE	0.144	135.000	0.112	NA		NA
7606491	7606492	JTY_3057	JTY_3058		echA17	TRUE	0.897	11.000	0.292	1.000		NA
7606492	7606493	JTY_3058	JTY_3059	echA17		TRUE	0.833	9.000	0.043	1.000		NA
7606493	7606494	JTY_3059	JTY_3060			TRUE	0.955	-3.000	0.024	1.000		NA
7606494	7606495	JTY_3060	JTY_3061		serB2	FALSE	0.404	15.000	0.014	1.000	N	NA
7606495	7606496	JTY_3061	JTY_3062	serB2	ctaD	FALSE	0.171	38.000	0.007	1.000	N	NA
7606497	7606498	JTY_3063	JTY_3064	fecB	adhC	FALSE	0.359	70.000	0.068	1.000		NA
7606499	7606500	JTY_3065	JTY_3066			FALSE	0.005	334.000	0.000	NA		NA
7606500	7606501	JTY_3066	JTY_3067		nrdF2	FALSE	0.117	98.000	0.000	NA		NA
7606501	7606502	JTY_3067	JTY_3068	nrdF2		FALSE	0.104	131.000	0.067	1.000	N	NA
7606502	7606503	JTY_3068	JTY_3069			FALSE	0.301	134.000	0.400	1.000	N	NA
7606503	7606504	JTY_3069	JTY_3070		nrdE	FALSE	0.126	128.000	0.100	1.000	N	NA
7606504	7606505	JTY_3070	JTY_3071	nrdE	nrdI	TRUE	0.817	66.000	0.300	NA	Y	NA
7606505	7606506	JTY_3071	JTY_3072	nrdI	nrdH	TRUE	0.625	35.000	0.500	NA	N	NA
7606506	7606507	JTY_3072	JTY_3073	nrdH		FALSE	0.504	-22.000	0.083	NA		NA
7606507	7606508	JTY_3073	JTY_3074			FALSE	0.176	117.000	0.080	NA		NA
7606509	7606510	JTY_3075	JTY_3076		dinP	TRUE	0.827	10.000	0.060	1.000		NA
7606511	7606512	JTY_3077	JTY_3078			TRUE	0.579	64.000	0.316	1.000		NA
7606514	7606515	JTY_3080	JTY_3081		fadE22	FALSE	0.042	117.000	0.000	1.000	N	NA
7606516	7606517	JTY_3082	JTY_3083	ligB	cstA	FALSE	0.080	136.000	0.049	1.000	N	NA
7606519	7606520	JTY_3085	JTY_3086	mmr		TRUE	0.971	-3.000	0.143	1.000		NA
7606520	7606521	JTY_3086	JTY_3087			FALSE	0.084	113.000	0.000	NA		NA
7606522	7606523	JTY_t0037	JTY_3088	alaU	pgmA	FALSE	0.145	67.000	0.000	NA		NA
7606524	7606525	JTY_3089	JTY_3090			TRUE	0.998	-3.000	0.290	0.031	Y	NA
7606525	7606526	JTY_3090	JTY_3091			TRUE	0.973	-3.000	0.226	NA		NA
7606527	7606528	JTY_3092	JTY_3093			TRUE	0.687	7.000	0.000	NA		NA
7606531	7606532	JTY_3096	JTY_3097			TRUE	0.863	-7.000	0.333	NA		NA
7606532	7606533	JTY_3097	JTY_3098		hab	TRUE	0.851	1.000	0.000	NA		NA
7606534	7606535	JTY_3099	JTY_3100		pknK	FALSE	0.153	59.000	0.000	NA		NA
7606538	7606539	JTY_3103	JTY_3104		lipR	TRUE	0.824	6.000	0.077	1.000	N	NA
7606539	7606540	JTY_3104	JTY_3105	lipR		TRUE	0.985	-3.000	0.077	0.071		NA
7606540	7606541	JTY_3105	JTY_3106		adhD	FALSE	0.305	31.000	0.000	1.000		NA
7606541	7606542	JTY_3106	JTY_3107	adhD		FALSE	0.179	38.000	0.000	NA		NA
7606542	7606543	JTY_3107	JTY_3108			TRUE	0.979	-3.000	0.286	NA		NA
7606543	7606544	JTY_3108	JTY_3109		fadD13	TRUE	0.995	-3.000	1.000	NA		NA
7606544	7606545	JTY_3109	JTY_3110	fadD13		FALSE	0.000	939.000	0.000	NA	N	NA
7606545	7606546	JTY_3110	JTY_3111			FALSE	0.322	18.000	0.000	NA		NA
7606547	7606548	JTY_3112	JTY_3113			FALSE	0.231	26.000	0.000	NA		NA
7606548	7606549	JTY_3113	JTY_3114			TRUE	0.955	-3.000	0.231	NA	N	NA
7606550	7606551	JTY_3115	JTY_3116			FALSE	0.117	98.000	0.000	NA		NA
7606552	7606553	JTY_3117	JTY_3118	PE_PGRS63		FALSE	0.075	119.000	0.000	NA		NA
7606553	7606554	JTY_3118	JTY_r0005			FALSE	0.042	151.000	0.000	NA		NA
7606554	7606555	JTY_r0005	JTY_3119			FALSE	0.540	-6.000	0.000	NA		NA
7606555	7606556	JTY_3119	JTY_3120		smpB	FALSE	0.182	37.000	0.000	NA		NA
7606556	7606557	JTY_3120	JTY_3121	smpB	ftsX	TRUE	0.858	3.000	0.038	1.000	N	NA
7606557	7606558	JTY_3121	JTY_3122	ftsX	ftsE	TRUE	0.996	1.000	0.431	1.000	Y	NA
7606558	7606559	JTY_3122	JTY_3123	ftsE		FALSE	0.233	44.000	0.010	NA		NA
7606559	7606560	JTY_3123	JTY_3124			TRUE	0.931	2.000	0.096	NA		NA
7606560	7606561	JTY_3124	JTY_3125		prfB	FALSE	0.416	-10.000	0.013	1.000	N	NA
7606564	7606565	JTY_3128	JTY_3129		moaA1	FALSE	0.043	149.000	0.000	NA		NA
7606565	7606566	JTY_3129	JTY_3130	moaA1	moaB1	TRUE	0.706	51.000	0.000	1.000	Y	NA
7606566	7606567	JTY_3130	JTY_3131	moaB1	moaC	TRUE	0.991	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
7606567	7606568	JTY_3131	JTY_3132	moaC	moaD1	TRUE	0.964	17.000	0.175	0.004	Y	NA
7606568	7606569	JTY_3132	JTY_3133	moaD1		FALSE	0.119	122.000	0.000	1.000		NA
7606569	7606570	JTY_3133	JTY_3134			FALSE	0.476	17.000	0.000	1.000		NA
7606570	7606571	JTY_3134	JTY_3135			FALSE	0.018	162.000	0.000	1.000	N	NA
7606571	7606572	JTY_3135	JTY_3136		moeB2	FALSE	0.077	78.000	0.000	1.000	N	NA
7606572	7606573	JTY_3136	JTY_3137	moeB2	cysA3	FALSE	0.121	29.000	0.000	1.000	N	NA
7606573	7606574	JTY_3137	JTY_3138	cysA3		FALSE	0.004	378.000	0.000	NA		NA
7606574	7606575	JTY_3138	JTY_3139			TRUE	0.599	10.000	0.000	NA		NA
7606575	7606576	JTY_3139	JTY_3140			FALSE	0.003	443.000	0.000	NA		NA
7606577	7606578	JTY_3141	JTY_3142	PPE49b	PPE49a	FALSE	0.480	12.000	0.000	NA		NA
7606578	7606579	JTY_3142	JTY_3143	PPE49a		FALSE	0.038	157.000	0.000	NA		NA
7606581	7606582	JTY_3145	JTY_3146			FALSE	0.135	82.000	0.000	NA		NA
7606586	7606587	JTY_3150	JTY_3151	devS	devR	TRUE	0.997	-3.000	0.091	0.006	Y	NA
7606587	7606588	JTY_3151	JTY_3152	devR		TRUE	0.964	28.000	1.000	1.000	Y	NA
7606589	7606590	JTY_3153	JTY_3154	PPE50	PPE51	FALSE	0.024	652.000	0.000	NA	Y	NA
7606590	7606591	JTY_3154	JTY_3155	PPE51		FALSE	0.000	457.000	0.000	NA	N	NA
7606591	7606592	JTY_3155	JTY_3156		pflA	FALSE	0.180	20.000	0.000	1.000	N	NA
7606592	7606593	JTY_3156	JTY_3157	pflA	fadE24	FALSE	0.076	80.000	0.000	1.000	N	NA
7606593	7606594	JTY_3157	JTY_3158	fadE24	fadE23	TRUE	0.979	21.000	0.604	0.009	Y	NA
7606594	7606595	JTY_3158	JTY_3159	fadE23	fadB4	FALSE	0.170	100.000	0.057	1.000	N	NA
7606599	7606600	JTY_3163	JTY_3164	nuoA	nuoB	TRUE	0.995	9.000	0.498	0.002	Y	NA
7606600	7606601	JTY_3164	JTY_3165	nuoB	nuoC	TRUE	0.999	-3.000	0.691	0.002	Y	NA
7606601	7606602	JTY_3165	JTY_3166	nuoC	nuoD	TRUE	0.998	0.000	0.299	0.004	Y	NA
7606602	7606603	JTY_3166	JTY_3167	nuoD	nuoE	TRUE	0.998	-3.000	0.161	0.004	Y	NA
7606603	7606604	JTY_3167	JTY_3168	nuoE	nuoF	TRUE	0.998	-3.000	0.163	0.004	Y	NA
7606604	7606605	JTY_3168	JTY_3169	nuoF	nuoG	TRUE	0.999	-3.000	0.753	0.004	Y	NA
7606605	7606606	JTY_3169	JTY_3170	nuoG	nuoH	TRUE	0.806	116.000	0.151	0.004	Y	NA
7606606	7606607	JTY_3170	JTY_3171	nuoH	nuoI	TRUE	0.982	-7.000	0.221	0.004	Y	NA
7606607	7606608	JTY_3171	JTY_3172	nuoI	nuoJ	TRUE	0.998	-3.000	0.210	0.004	Y	NA
7606608	7606609	JTY_3172	JTY_3173	nuoJ	nuoK	TRUE	0.998	-3.000	0.306	0.002	Y	NA
7606609	7606610	JTY_3173	JTY_3174	nuoK	nuoL	TRUE	0.995	11.000	0.790	0.004	Y	NA
7606610	7606611	JTY_3174	JTY_3175	nuoL	nuoM	TRUE	0.999	-3.000	0.373	0.001	Y	NA
7606611	7606612	JTY_3175	JTY_3176	nuoM	nuoN	TRUE	0.998	-3.000	0.257	0.001	Y	NA
7606613	7606614	JTY_3177	JTY_3178	PPE53	PPE70	FALSE	0.106	248.000	0.000	NA	Y	NA
7606614	7606615	JTY_3178	JTY_3179	PPE70		FALSE	0.002	175.000	0.000	NA	N	NA
7606615	7606616	JTY_3179	JTY_3180			FALSE	0.377	11.000	0.000	1.000	N	NA
7606616	7606617	JTY_3180	JTY_3181			FALSE	0.212	-84.000	0.000	NA		NA
7606617	7606618	JTY_3181	JTY_3182			TRUE	0.971	-3.000	0.212	NA		NA
7606618	7606619	JTY_3182	JTY_3183		moxR3	TRUE	0.816	30.000	0.744	NA		NA
7606619	7606620	JTY_3183	JTY_3184	moxR3		TRUE	0.896	8.000	0.231	NA		NA
7606620	7606621	JTY_3184	JTY_3185			TRUE	0.983	-3.000	0.345	NA		NA
7606621	7606622	JTY_3185	JTY_3186			FALSE	0.138	80.000	0.000	NA		NA
7606623	7606624	JTY_3187	JTY_3188			TRUE	0.985	0.000	0.444	NA		NA
7606624	7606625	JTY_3188	JTY_3189		aofH	FALSE	0.048	143.000	0.000	NA		NA
7606626	7606627	JTY_3190	JTY_3191	hpx		FALSE	0.054	137.000	0.000	NA		NA
7606627	7606628	JTY_3191	JTY_3192			FALSE	0.140	79.000	0.000	NA		NA
7606629	7606630	JTY_3193	JTY_3194			FALSE	0.529	15.000	0.000	1.000		NA
7606631	7606632	JTY_3195	JTY_3196	mesTb	mesTa	FALSE	0.480	12.000	0.000	NA		NA
7606633	7606634	JTY_3197	JTY_3198			FALSE	0.063	131.000	0.000	NA		NA
7606634	7606635	JTY_3198	JTY_3199			FALSE	0.012	240.000	0.000	NA		NA
7606635	7606636	JTY_3199	JTY_3200			FALSE	0.008	288.000	0.000	NA		NA
7606637	7606638	JTY_3201	JTY_3202			TRUE	0.961	3.000	0.286	NA		NA
7606639	7606640	JTY_3203	JTY_3204			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7606640	7606641	JTY_3204	JTY_3205			FALSE	0.005	538.000	0.000	1.000		NA
7606641	7606642	JTY_3205	JTY_3206			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7606643	7606644	JTY_3207	JTY_3208			FALSE	0.002	624.000	0.000	NA		NA
7606644	7606645	JTY_3208	JTY_t0038		metU	FALSE	0.002	1022.000	0.000	NA		NA
7606647	7606648	JTY_3210	JTY_3211			FALSE	0.323	92.000	0.069	1.000		NA
7606649	7606650	JTY_3212	JTY_3213			TRUE	0.862	6.000	0.072	NA		NA
7606653	7606654	JTY_3216	JTY_3217	whiB7	UvrD2	FALSE	0.006	430.000	0.000	1.000		NA
7606656	7606657	JTY_3219	JTY_3220	nudC		FALSE	0.211	59.000	0.048	1.000	N	NA
7606657	7606658	JTY_3220	JTY_3221			FALSE	0.266	62.000	0.110	1.000	N	NA
7606658	7606659	JTY_3221	JTY_3222			TRUE	0.999	-3.000	0.493	0.002	Y	NA
7606660	7606661	JTY_3223	JTY_3224		lipV	FALSE	0.125	142.000	0.115	NA		NA
7606661	7606662	JTY_3224	JTY_3225	lipV		TRUE	0.977	3.000	0.111	0.031		NA
7606663	7606664	JTY_3226	JTY_3227		moeB1	TRUE	0.602	27.000	0.273	NA		NA
7606664	7606665	JTY_3227	JTY_3228	moeB1		FALSE	0.459	91.000	0.236	1.000		NA
7606670	7606671	JTY_3233	JTY_3234	rhlE		TRUE	0.675	13.000	0.096	NA		NA
7606673	7606674	JTY_3236	JTY_3237	gpm2_1	entC_1	TRUE	0.955	-3.000	0.167	1.000	N	NA
7606674	7606675	JTY_3237	JTY_3238	entC_1		FALSE	0.171	148.000	0.170	1.000		NA
7606677	7606678	JTY_3240	JTY_3241		whiB1_1	FALSE	0.014	280.000	0.000	1.000		NA
7606679	7606680	JTY_3242	JTY_3243		TB7.3_1	TRUE	0.583	17.000	0.102	NA		NA
7606680	7606681	JTY_3243	JTY_3244	TB7.3_1		FALSE	0.016	285.000	0.046	NA		NA
7606681	7606682	JTY_3244	JTY_3245			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7606682	7606683	JTY_3245	JTY_3246		sigH_1	TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7606684	7606685	JTY_3247	JTY_3248			FALSE	0.217	-64.000	0.000	NA		NA
7606685	7606686	JTY_3248	JTY_3249			FALSE	0.285	-22.000	0.000	NA		NA
7606687	7606688	JTY_3250	JTY_3251			FALSE	0.071	124.000	0.000	NA		NA
7606689	7606690	JTY_3252	JTY_3253	aroA_1		TRUE	0.964	-3.000	0.063	1.000		NA
7606691	7606692	JTY_3254	JTY_3255	desA3_1		TRUE	0.636	78.000	0.583	1.000	N	NA
7606692	7606693	JTY_3255	JTY_3256			FALSE	0.282	110.000	0.208	NA		NA
7606693	7606694	JTY_3256	JTY_3257		pvdS	TRUE	0.938	-3.000	0.029	NA		NA
7606694	7606695	JTY_3257	JTY_3258	pvdS		FALSE	0.372	24.000	0.022	NA		NA
7606695	7606696	JTY_3258	JTY_3259			TRUE	0.658	8.000	0.000	NA		NA
7606698	7606699	JTY_3261	JTY_3262			TRUE	0.996	5.000	0.889	1.000	Y	NA
7606699	7606700	JTY_3262	JTY_3263			FALSE	0.204	61.000	0.136	NA	N	NA
7606700	7606701	JTY_3263	JTY_3264			FALSE	0.174	59.000	0.091	NA	N	NA
7606701	7606702	JTY_3264	JTY_3265		secA1	FALSE	0.156	79.000	0.020	1.000	N	NA
7606702	7606703	JTY_3265	JTY_3266	secA1		FALSE	0.162	79.000	0.094	NA	N	NA
7606703	7606704	JTY_3266	JTY_3267			FALSE	0.015	316.000	0.072	NA		NA
7606704	7606705	JTY_3267	JTY_3268			FALSE	0.274	38.000	0.022	NA		NA
7606705	7606706	JTY_3268	JTY_3269		lpqB	FALSE	0.276	68.000	0.061	NA		NA
7606706	7606707	JTY_3269	JTY_3270	lpqB	mtrB	TRUE	0.984	0.000	0.418	NA		NA
7606707	7606708	JTY_3270	JTY_3271	mtrB	mtrA	TRUE	0.934	50.000	0.772	1.000	Y	NA
7606708	7606709	JTY_3271	JTY_3272	mtrA	tmk	FALSE	0.162	70.000	0.021	1.000	N	NA
7606709	7606710	JTY_3272	JTY_3273	tmk	sahH	FALSE	0.128	97.000	0.016	1.000	N	NA
7606710	7606711	JTY_3273	JTY_3274	sahH		FALSE	0.106	105.000	0.012	1.000	N	NA
7606711	7606712	JTY_3274	JTY_3275			TRUE	0.989	-3.000	0.600	1.000	N	NA
7606712	7606713	JTY_3275	JTY_3276			TRUE	0.998	5.000	0.750	0.006	Y	NA
7606713	7606714	JTY_3276	JTY_3277		alkB	TRUE	0.994	0.000	0.778	1.000		NA
7606714	7606715	JTY_3277	JTY_3278	alkB		TRUE	0.691	109.000	0.778	1.000		NA
7606717	7606718	JTY_3280	JTY_3281	manA		TRUE	0.879	8.000	0.198	NA		NA
7606718	7606719	JTY_3281	JTY_3282		manB	TRUE	0.961	-3.000	0.138	NA		NA
7606719	7606720	JTY_3282	JTY_3283	manB		FALSE	0.542	102.000	0.460	NA		NA
7606723	7606724	JTY_3286	JTY_3287	fbiA	fbiB	TRUE	0.984	-3.000	0.371	NA		NA
7606724	7606725	JTY_3287	JTY_3288	fbiB		FALSE	0.018	296.000	0.018	1.000		NA
7606726	7606727	JTY_3289	JTY_3290	manC	wbbL1	TRUE	0.941	2.000	0.151	NA		NA
7606727	7606728	JTY_3290	JTY_3291	wbbL1	rmld	TRUE	0.895	11.000	0.354	NA		NA
7606729	7606730	JTY_3292	JTY_3293			TRUE	0.705	39.000	0.517	NA		NA
7606730	7606731	JTY_3293	JTY_3294			FALSE	0.168	125.000	0.103	NA		NA
7606731	7606732	JTY_3294	JTY_3295		ctpC	TRUE	0.926	11.000	0.500	NA		NA
7606734	7606735	JTY_3297	JTY_3298			TRUE	0.615	5.000	0.000	1.000	N	NA
7606736	7606737	JTY_3299	JTY_3300	fadE25	purE	FALSE	0.238	25.000	0.009	1.000	N	NA
7606737	7606738	JTY_3300	JTY_3301	purE	purK	TRUE	0.998	-3.000	0.141	0.000	Y	NA
7606740	7606741	JTY_3303	JTY_3304		birA	FALSE	0.250	43.000	0.016	NA		NA
7606742	7606743	JTY_3305	JTY_3306	accD5		TRUE	0.879	-19.000	0.692	NA		NA
7606743	7606744	JTY_3306	JTY_3307			TRUE	0.930	-3.000	0.015	NA		NA
7606744	7606745	JTY_3307	JTY_3308		sseA	FALSE	0.071	41.000	0.011	NA	N	NA
7606745	7606746	JTY_3308	JTY_3309	sseA		TRUE	0.983	-3.000	0.351	NA		NA
7606746	7606747	JTY_3309	JTY_3310		accA3	FALSE	0.178	108.000	0.045	NA		NA
7606748	7606749	JTY_3311	JTY_3312	sigF	rsbW	TRUE	0.988	-3.000	0.636	NA	N	NA
7606749	7606750	JTY_3312	JTY_3313	rsbW	usfY	FALSE	0.021	198.000	0.000	NA		NA
7606750	7606751	JTY_3313	JTY_3314	usfY		TRUE	0.607	35.000	0.333	NA		NA
7606751	7606752	JTY_3314	JTY_3315		lat	FALSE	0.372	34.000	0.083	NA		NA
7606752	7606753	JTY_3315	JTY_3316	lat		FALSE	0.400	51.000	0.224	1.000	N	NA
7606754	7606755	JTY_3317	JTY_3318		pcd	FALSE	0.433	27.000	0.103	NA		NA
7606757	7606758	JTY_3320	JTY_3321		lhr	FALSE	0.364	44.000	0.040	1.000		NA
7606758	7606759	JTY_3321	JTY_3322	lhr	nei_1	TRUE	0.971	4.000	0.352	1.000		NA
7606760	7606761	JTY_3323	JTY_3324	lpqC	atsB_1	FALSE	0.127	27.000	0.000	1.000	N	NA
7606761	7606762	JTY_3324	JTY_3325	atsB_1		FALSE	0.315	20.000	0.015	1.000	N	NA
7606762	7606763	JTY_3325	JTY_3326		phoY1_1	FALSE	0.057	12.000	0.000	NA	N	NA
7606763	7606764	JTY_3326	JTY_3327	phoY1_1	glpD2_1	FALSE	0.007	108.000	0.000	NA	N	NA
7606764	7606765	JTY_3327	JTY_3328	glpD2_1	lpdA_1	TRUE	0.843	81.000	0.071	0.043	Y	NA
7606767	7606768	JTY_3330	JTY_3331	amiA1_1	amiB1_1	TRUE	0.991	-3.000	0.132	0.003		NA
7606769	7606770	JTY_3332	JTY_3333	deoD_1	pmmB_1	TRUE	0.932	4.000	0.235	1.000	N	NA
7606772	7606773	JTY_3335	JTY_3336	sapM_1		FALSE	0.477	24.000	0.100	NA		NA
7606774	7606775	JTY_3337	JTY_3338			FALSE	0.004	375.000	0.000	NA		NA
7606775	7606776	JTY_3338	JTY_3339		add_1	FALSE	0.143	71.000	0.000	NA		NA
7606776	7606777	JTY_3339	JTY_3340	add_1	deoA_1	TRUE	0.992	0.000	0.062	1.000	Y	NA
7606777	7606778	JTY_3340	JTY_3341	deoA_1	cdd_1	TRUE	0.995	-3.000	0.221	1.000	Y	NA
7606779	7606780	JTY_3342	JTY_3343	sdhC_1	sdhD_1	TRUE	0.998	-3.000	0.157	0.001	Y	NA
7606781	7606782	JTY_3344	JTY_3345	atsB_2		FALSE	0.300	20.000	0.000	NA		NA
7606782	7606783	JTY_3345	JTY_3346		phoY1_2	FALSE	0.057	12.000	0.000	NA	N	NA
7606783	7606784	JTY_3346	JTY_3347	phoY1_2	glpD2_2	FALSE	0.007	108.000	0.000	NA	N	NA
7606784	7606785	JTY_3347	JTY_3348	glpD2_2	lpdA_2	TRUE	0.843	81.000	0.071	0.043	Y	NA
7606787	7606788	JTY_3350	JTY_3351	amiA1_2	amiB1_2	TRUE	0.991	-3.000	0.132	0.003		NA
7606789	7606790	JTY_3352	JTY_3353	deoD_2	pmmB_2	TRUE	0.932	4.000	0.235	1.000	N	NA
7606792	7606793	JTY_3355	JTY_3356	sapM_2		FALSE	0.477	24.000	0.100	NA		NA
7606794	7606795	JTY_3357	JTY_3358			FALSE	0.004	375.000	0.000	NA		NA
7606795	7606796	JTY_3358	JTY_3359		add_2	FALSE	0.143	71.000	0.000	NA		NA
7606796	7606797	JTY_3359	JTY_3360	add_2	deoA_2	TRUE	0.992	0.000	0.062	1.000	Y	NA
7606797	7606798	JTY_3360	JTY_3361	deoA_2	cdd_2	TRUE	0.995	-3.000	0.221	1.000	Y	NA
7606799	7606800	JTY_3362	JTY_3363	sdhC_2	sdhD_2	TRUE	0.998	-3.000	0.157	0.001	Y	NA
7606801	7606802	JTY_3364	JTY_3365	atsB_3		FALSE	0.300	20.000	0.000	NA		NA
7606802	7606803	JTY_3365	JTY_3366		phoY1_3	FALSE	0.057	12.000	0.000	NA	N	NA
7606803	7606804	JTY_3366	JTY_3367	phoY1_3	glpD2_3	FALSE	0.007	108.000	0.000	NA	N	NA
7606804	7606805	JTY_3367	JTY_3368	glpD2_3	lpdA_3	TRUE	0.843	81.000	0.071	0.043	Y	NA
7606807	7606808	JTY_3370	JTY_3371	amiA1_3	amiB1_3	TRUE	0.991	-3.000	0.132	0.003		NA
7606809	7606810	JTY_3372	JTY_3373	deoD_3	pmmB_3	TRUE	0.932	4.000	0.235	1.000	N	NA
7606812	7606813	JTY_3375	JTY_3376	sapM_3		FALSE	0.477	24.000	0.100	NA		NA
7606814	7606815	JTY_3377	JTY_3378			FALSE	0.004	375.000	0.000	NA		NA
7606815	7606816	JTY_3378	JTY_3379		add_3	FALSE	0.143	71.000	0.000	NA		NA
7606816	7606817	JTY_3379	JTY_3380	add_3	deoA_3	TRUE	0.992	0.000	0.062	1.000	Y	NA
7606817	7606818	JTY_3380	JTY_3381	deoA_3	cdd_3	TRUE	0.995	-3.000	0.221	1.000	Y	NA
7606819	7606820	JTY_3382	JTY_3383	sdhC_3	sdhD_3	TRUE	0.998	-3.000	0.157	0.001	Y	NA
7606820	7606821	JTY_3383	JTY_3384	sdhD_3	sdhA	FALSE	0.564	280.000	0.705	0.003	Y	NA
7606821	7606822	JTY_3384	JTY_3385	sdhA	sdhB	TRUE	0.999	0.000	0.604	0.003	Y	NA
7606823	7606824	JTY_3386	JTY_3387			TRUE	0.789	4.000	0.000	NA		NA
7606824	7606825	JTY_3387	JTY_3388			FALSE	0.072	122.000	0.000	NA		NA
7606825	7606826	JTY_3388	JTY_3389		moaX	TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7606826	7606827	JTY_3389	JTY_3390	moaX	moaC	TRUE	0.995	1.000	0.025	0.004	Y	NA
7606827	7606828	JTY_3390	JTY_3391	moaC	moaB3	TRUE	0.991	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
7606828	7606829	JTY_3391	JTY_3392	moaB3	moaA3	TRUE	0.633	97.000	0.000	1.000	Y	NA
7606830	7606831	JTY_3393	JTY_3394			FALSE	0.285	-22.000	0.000	NA		NA
7606831	7606832	JTY_3394	JTY_3395		embR2	FALSE	0.198	-124.000	0.000	NA		NA
7606836	7606837	JTY_3399	JTY_3400		dacB1	FALSE	0.236	69.000	0.077	1.000	N	NA
7606837	7606838	JTY_3400	JTY_3401	dacB1	sugI	FALSE	0.198	96.000	0.074	1.000	N	NA
7606838	7606839	JTY_3401	JTY_3402	sugI	nagA	TRUE	0.993	-3.000	0.054	1.000	Y	NA
7606841	7606842	JTY_3404	JTY_3405			FALSE	0.311	19.000	0.000	NA		NA
7606843	7606844	JTY_3406	JTY_3407		trpS	FALSE	0.546	21.000	0.045	1.000		NA
7606847	7606848	JTY_3410	JTY_3411	metC	metX	TRUE	0.980	12.000	0.542	1.000	Y	NA
7606848	7606849	JTY_3411	JTY_3412	metX		TRUE	0.948	-3.000	0.136	1.000	N	NA
7606850	7606851	JTY_3413	JTY_3414	PPE54	PE_PGRS50	FALSE	0.159	49.000	0.000	NA		NA
7606851	7606852	JTY_3414	JTY_3415	PE_PGRS50		FALSE	0.004	424.000	0.000	NA		NA
7606852	7606853	JTY_3415	JTY_3416		PPE55b	FALSE	0.010	256.000	0.000	NA		NA
7606853	7606854	JTY_3416	JTY_3417	PPE55b	PPE55a	TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7606856	7606857	JTY_3419	JTY_3420		PPE56d	FALSE	0.002	914.000	0.000	NA		NA
7606857	7606858	JTY_3420	JTY_3421	PPE56d	PPE56b	FALSE	0.540	-6.000	0.000	NA		NA
7606858	7606859	JTY_3421	JTY_3422	PPE56b	PPE56a	FALSE	0.154	58.000	0.000	NA		NA
7606859	7606860	JTY_3422	JTY_3423	PPE56a		FALSE	0.011	244.000	0.000	NA		NA
7606860	7606861	JTY_3423	JTY_3424			FALSE	0.135	82.000	0.000	NA		NA
7606861	7606862	JTY_3424	JTY_3425			FALSE	0.048	143.000	0.000	NA		NA
7606864	7606865	JTY_3427	JTY_3428		folD	TRUE	0.987	-3.000	0.453	NA		NA
7606866	7606867	JTY_3429	JTY_3430			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7606867	7606868	JTY_3430	JTY_3431			FALSE	0.170	42.000	0.000	NA		NA
7606868	7606869	JTY_3431	JTY_3432			FALSE	0.078	117.000	0.000	NA		NA
7606870	7606871	JTY_3433	JTY_3434			TRUE	0.949	7.000	0.412	NA		NA
7606871	7606872	JTY_3434	JTY_3435			TRUE	0.838	-19.000	0.529	NA		NA
7606872	7606873	JTY_3435	JTY_3436			TRUE	0.887	-22.000	0.818	NA		NA
7606873	7606874	JTY_3436	JTY_3437			TRUE	0.991	-3.000	0.636	NA		NA
7606875	7606876	JTY_3438	JTY_3439	spoU	PE_PGRS51	FALSE	0.005	367.000	0.000	NA		NA
7606880	7606881	JTY_3443	JTY_3444		otsB2	FALSE	0.252	42.000	0.016	NA		NA
7606881	7606882	JTY_3444	JTY_3445	otsB2	echA18	FALSE	0.006	237.000	0.000	1.000	N	NA
7606882	7606883	JTY_3445	JTY_3446	echA18	amiD	TRUE	0.615	5.000	0.000	1.000	N	NA
7606883	7606884	JTY_3446	JTY_3447	amiD		FALSE	0.156	108.000	0.000	1.000		NA
7606885	7606886	JTY_3448	JTY_3449			TRUE	0.757	5.000	0.000	NA		NA
7606886	7606887	JTY_3449	JTY_3450		dxs2	TRUE	0.900	9.000	0.000	0.069		NA
7606887	7606888	JTY_3450	JTY_3451	dxs2	lytB1	FALSE	0.334	225.000	0.333	1.000	Y	NA
7606888	7606889	JTY_3451	JTY_3452	lytB1	idsB	TRUE	0.790	0.000	0.000	1.000	N	NA
7606889	7606890	JTY_3452	JTY_3453	idsB		FALSE	0.002	754.000	0.000	NA		NA
7606890	7606891	JTY_3453	JTY_3454			TRUE	0.987	0.000	0.500	NA		NA
7606892	7606893	JTY_3455	JTY_3456			TRUE	0.878	-10.000	0.000	NA	Y	NA
7606893	7606894	JTY_3456	JTY_3457		PE_PGRS52	FALSE	0.023	190.000	0.000	NA		NA
7606896	7606897	JTY_3459	JTY_3460	lpqD	acrA1	FALSE	0.174	46.000	0.077	NA	N	NA
7606900	7606901	JTY_3463	JTY_3464			TRUE	0.991	-3.000	0.636	NA		NA
7606903	7606904	JTY_3466	JTY_3467	guaA	phyA	FALSE	0.321	12.000	0.000	1.000	N	NA
7606904	7606905	JTY_3467	JTY_3468	phyA	idsA1	FALSE	0.121	29.000	0.000	1.000	N	NA
7606906	7606907	JTY_3469	JTY_3470			FALSE	0.147	64.000	0.000	NA		NA
7606907	7606908	JTY_3470	JTY_3471			TRUE	0.909	15.000	0.286	0.030		NA
7606909	7606910	JTY_3472	JTY_3473			FALSE	0.004	371.000	0.000	NA		NA
7606910	7606911	JTY_3473	JTY_3474			FALSE	0.343	17.000	0.000	NA		NA
7606911	7606912	JTY_3474	JTY_3475			FALSE	0.077	118.000	0.000	NA		NA
7606913	7606914	JTY_3476	JTY_3477			FALSE	0.015	35.000	0.000	NA	N	NA
7606914	7606915	JTY_3477	JTY_3478			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7606916	7606917	JTY_3479	JTY_3480	choD	guaB3	FALSE	0.228	56.000	0.057	1.000	N	NA
7606917	7606918	JTY_3480	JTY_3481	guaB3	guaB2	TRUE	0.953	20.000	0.056	0.001	Y	NA
7606920	7606921	JTY_3483	JTY_3484		sigD	TRUE	0.926	-7.000	0.615	NA		NA
7606921	7606922	JTY_3484	JTY_3485	sigD		TRUE	0.902	18.000	0.706	1.000		NA
7606924	7606925	JTY_3487	JTY_3488	groEL	groES	TRUE	0.930	95.000	0.592	0.056	Y	NA
7606925	7606926	JTY_3488	JTY_3489	groES	gcp	FALSE	0.120	267.000	0.004	1.000	Y	NA
7606926	7606927	JTY_3489	JTY_3490	gcp	rimI	TRUE	0.963	-3.000	0.056	1.000		NA
7606927	7606928	JTY_3490	JTY_3491	rimI		TRUE	0.964	-3.000	0.062	1.000		NA
7606928	7606929	JTY_3491	JTY_3492			TRUE	0.971	-3.000	0.217	NA		NA
7606929	7606930	JTY_3492	JTY_3493		alr	TRUE	0.937	-3.000	0.028	NA		NA
7606930	7606931	JTY_3493	JTY_3494	alr		FALSE	0.007	294.000	0.000	NA		NA
7606933	7606934	JTY_3496	JTY_3497			FALSE	0.071	489.000	0.000	0.040	Y	NA
7606934	7606935	JTY_3497	JTY_3498		gadB	FALSE	0.007	233.000	0.000	1.000	N	NA
7606935	7606936	JTY_3498	JTY_3499	gadB		FALSE	0.069	38.000	0.009	NA	N	NA
7606936	7606937	JTY_3499	JTY_3500			TRUE	0.879	2.000	0.004	NA		NA
7606937	7606938	JTY_3500	JTY_3501			TRUE	0.876	11.000	0.300	NA		NA
7606938	7606939	JTY_3501	JTY_3502		glmS	FALSE	0.022	222.000	0.005	NA		NA
7606940	7606941	JTY_3503	JTY_3504			TRUE	0.797	10.000	0.095	NA		NA
7606942	7606943	JTY_3505	JTY_3506			TRUE	0.990	3.000	0.875	NA		NA
7606943	7606944	JTY_3506	JTY_3507		mrsA	FALSE	0.225	48.000	0.009	NA		NA
7606944	7606945	JTY_3507	JTY_3508	mrsA	rpsI	FALSE	0.116	125.000	0.068	1.000	N	NA
7606945	7606946	JTY_3508	JTY_3509	rpsI	rplM	TRUE	0.999	-3.000	0.601	0.010	Y	NA
7606946	7606947	JTY_3509	JTY_3510	rplM	esxT	FALSE	0.013	233.000	0.000	NA		NA
7606947	7606948	JTY_3510	JTY_3511	esxT	esxU	TRUE	0.600	21.000	0.190	NA		NA
7606948	7606949	JTY_3511	JTY_3512	esxU		TRUE	0.854	-7.000	0.310	NA		NA
7606949	7606950	JTY_3512	JTY_3513			TRUE	0.982	-3.000	0.333	NA		NA
7606951	7606952	JTY_3514	JTY_3515			TRUE	0.993	-3.000	0.727	NA		NA
7606954	7606955	JTY_3517	JTY_3518	cut3	cut4	TRUE	0.824	47.000	0.500	0.068		NA
7606955	7606956	JTY_3518	JTY_3519	cut4		FALSE	0.009	272.000	0.000	NA		NA
7606957	7606958	JTY_3520	JTY_3521	truA	rplQ	TRUE	0.763	68.000	0.102	1.000	Y	NA
7606958	7606959	JTY_3521	JTY_3522	rplQ	rpoA	TRUE	0.819	32.000	0.873	1.000	N	NA
7606959	7606960	JTY_3522	JTY_3523	rpoA	rpsD	FALSE	0.307	151.000	0.549	1.000	N	NA
7606960	7606961	JTY_3523	JTY_3524	rpsD	rpsK	TRUE	0.994	9.000	0.509	0.013	Y	NA
7606961	7606962	JTY_3524	JTY_3525	rpsK	rpsM	TRUE	0.998	4.000	0.810	0.010	Y	NA
7606962	7606963	JTY_3525	JTY_3526	rpsM	rpmJ	FALSE	0.390	216.000	0.086	0.010	Y	NA
7606963	7606964	JTY_3526	JTY_3527	rpmJ	infA	TRUE	0.809	33.000	0.067	1.000	Y	NA
7606965	7606966	JTY_3528	JTY_3529		rmlB1	FALSE	0.011	73.000	0.000	NA	N	NA
7606966	7606967	JTY_3529	JTY_3530	rmlB1	rmlC	TRUE	0.993	2.000	0.250	1.000	Y	NA
7606967	7606968	JTY_3530	JTY_3531	rmlC		FALSE	0.133	83.000	0.000	NA		NA
7606968	7606969	JTY_3531	JTY_3532			FALSE	0.187	-229.000	0.000	NA		NA
7606970	7606971	JTY_3533	JTY_3534	rmlB2	mhpE	TRUE	0.658	4.000	0.000	1.000	N	NA
7606971	7606972	JTY_3534	JTY_3535	mhpE	ilvB2	TRUE	0.696	61.000	0.000	1.000	Y	NA
7606972	7606973	JTY_3535	JTY_3536	ilvB2		TRUE	0.567	6.000	0.000	1.000	N	NA
7606975	7606976	JTY_3538	JTY_3539	bpoA	kgtP	FALSE	0.004	280.000	0.000	1.000	N	NA
7606977	7606978	JTY_3540	JTY_3541	PE31	PPE60	TRUE	0.842	37.000	1.000	NA		NA
7606978	7606979	JTY_3541	JTY_3542	PPE60		FALSE	0.017	213.000	0.000	NA		NA
7606979	7606980	JTY_3542	JTY_3543			TRUE	0.757	5.000	0.000	NA		NA
7606981	7606982	JTY_3544	JTY_3545			FALSE	0.125	91.000	0.000	NA		NA
7606982	7606983	JTY_3545	JTY_3546			FALSE	0.167	-565.000	0.000	NA		NA
7606983	7606984	JTY_3546	JTY_3547			TRUE	0.826	44.000	1.000	NA		NA
7606989	7606990	JTY_3552	JTY_3553			FALSE	0.236	82.000	0.041	NA		NA
7606990	7606991	JTY_3553	JTY_3554		otsA	TRUE	0.993	0.000	0.800	NA		NA
7606991	7606992	JTY_3554	JTY_3555	otsA		FALSE	0.142	152.000	0.200	NA		NA
7606993	7606994	JTY_3556	JTY_3557			TRUE	0.993	0.000	0.800	NA		NA
7606994	7606995	JTY_3557	JTY_3558		mce4F	TRUE	0.991	0.000	0.667	NA		NA
7606995	7606996	JTY_3558	JTY_3559	mce4F	lprN	TRUE	0.994	11.000	0.667	0.004	Y	NA
7606996	7606997	JTY_3559	JTY_3560	lprN	mce4D	TRUE	0.999	-3.000	0.727	0.004	Y	NA
7606997	7606998	JTY_3560	JTY_3561	mce4D	mce4C	TRUE	0.999	-3.000	0.727	0.004	Y	NA
7606998	7606999	JTY_3561	JTY_3562	mce4C	mce4B	TRUE	0.990	-10.000	0.667	0.004	Y	NA
7606999	7607000	JTY_3562	JTY_3563	mce4B	mce4A	TRUE	0.999	0.000	0.667	0.004	Y	NA
7607000	7607001	JTY_3563	JTY_3564	mce4A	yrbE4B	TRUE	0.973	20.000	1.000	NA	Y	NA
7607001	7607002	JTY_3564	JTY_3565	yrbE4B	yrbE4A	TRUE	0.950	35.000	1.000	NA	Y	NA
7607002	7607003	JTY_3565	JTY_3566	yrbE4A	fabG	FALSE	0.132	226.000	0.000	NA	Y	NA
7607003	7607004	JTY_3566	JTY_3567	fabG	fdxD	TRUE	0.705	25.000	0.429	1.000	N	NA
7607005	7607006	JTY_3568	JTY_3569	fadE26	fadE27	TRUE	0.983	25.000	0.882	0.008	Y	NA
7607006	7607007	JTY_3569	JTY_3570	fadE27	fadD17	TRUE	0.911	71.000	0.647	1.000	Y	NA
7607007	7607008	JTY_3570	JTY_3571	fadD17	PE_PGRS53	FALSE	0.030	171.000	0.000	NA		NA
7607008	7607009	JTY_3571	JTY_3572	PE_PGRS53	PE_PGRS54	FALSE	0.007	291.000	0.000	NA		NA
7607010	7607011	JTY_3573	JTY_3574	ilvX		TRUE	0.973	-3.000	0.167	1.000		NA
7607014	7607015	JTY_3577	JTY_3578	PE_PGRS57	PE_PGRS57	FALSE	0.007	305.000	0.000	NA		NA
7607017	7607018	JTY_3580	JTY_3581	echA19		FALSE	0.334	96.000	0.097	1.000		NA
7607019	7607020	JTY_3582	JTY_3583	cyp142b	cyp142a	TRUE	0.983	-3.000	0.000	0.007		NA
7607023	7607024	JTY_3586	JTY_3587			TRUE	0.927	16.000	0.880	NA		NA
7607024	7607025	JTY_3587	JTY_3588			TRUE	0.975	17.000	0.880	NA	Y	NA
7607025	7607026	JTY_3588	JTY_3589			FALSE	0.170	42.000	0.000	NA		NA
7607028	7607029	JTY_3591	JTY_3592			TRUE	0.977	6.000	0.727	NA		NA
7607030	7607031	JTY_3593	JTY_3594			FALSE	0.002	692.000	0.000	NA		NA
7607031	7607032	JTY_3594	JTY_3595			TRUE	0.992	0.000	0.625	1.000		NA
7607032	7607033	JTY_3595	JTY_3596			TRUE	0.978	-3.000	0.273	NA		NA
7607035	7607036	JTY_3598	JTY_3599	PPE62		FALSE	0.008	99.000	0.000	NA	N	NA
7607036	7607037	JTY_3599	JTY_3600			TRUE	0.979	-3.000	0.333	1.000	N	NA
7607037	7607038	JTY_3600	JTY_3601			TRUE	0.968	11.000	0.231	1.000	Y	NA
7607039	7607040	JTY_3602	JTY_3603			TRUE	0.992	2.000	0.625	0.029	N	NA
7607040	7607041	JTY_3603	JTY_3604		PPE63	FALSE	0.004	137.000	0.000	NA	N	NA
7607042	7607043	JTY_3605	JTY_3606	ltp2		TRUE	0.987	0.000	0.500	NA		NA
7607043	7607044	JTY_3606	JTY_3607			TRUE	0.994	-3.000	0.889	NA		NA
7607044	7607045	JTY_3607	JTY_3608		fadE29	TRUE	0.991	-3.000	0.652	NA		NA
7607045	7607046	JTY_3608	JTY_3609	fadE29	fadE28	TRUE	0.986	-15.000	0.696	0.008	Y	NA
7607046	7607047	JTY_3609	JTY_3610	fadE28	cyp125	TRUE	0.990	0.000	0.381	0.042	N	NA
7607048	7607049	JTY_3611	JTY_3612	fadA5		FALSE	0.140	112.000	0.000	1.000		NA
7607050	7607051	JTY_3613	JTY_3614			TRUE	0.971	23.000	0.515	0.029	Y	NA
7607052	7607053	JTY_3615	JTY_3616	echA20		TRUE	0.999	0.000	0.647	0.068	Y	NA
7607053	7607054	JTY_3616	JTY_3617			TRUE	0.998	-3.000	0.912	NA	Y	NA
7607054	7607055	JTY_3617	JTY_3618			TRUE	0.616	98.000	0.561	NA		NA
7607055	7607056	JTY_3618	JTY_3619		fdxB	TRUE	0.984	-3.000	0.037	0.042		NA
7607057	7607058	JTY_3620	JTY_3621		fadA6	FALSE	0.168	105.000	0.000	1.000		NA
7607058	7607059	JTY_3621	JTY_3622	fadA6		FALSE	0.556	65.000	0.423	1.000	N	NA
7607061	7607062	JTY_3624	JTY_3625		fadE30	TRUE	0.998	-3.000	0.629	1.000	Y	NA
7607063	7607064	JTY_3626	JTY_3627	fadD3	fadE31	TRUE	0.993	1.000	0.242	1.000	Y	NA
7607064	7607065	JTY_3627	JTY_3628	fadE31	fadE32	TRUE	0.998	-3.000	0.879	0.008		NA
7607065	7607066	JTY_3628	JTY_3629	fadE32	fadE33	TRUE	0.996	-3.000	0.484	0.008		NA
7607066	7607067	JTY_3629	JTY_3630	fadE33	aspB	TRUE	0.907	-3.000	0.024	1.000	N	NA
7607068	7607069	JTY_3631	JTY_3632	nat		FALSE	0.345	-15.000	0.000	NA		NA
7607069	7607070	JTY_3632	JTY_3633			FALSE	0.008	286.000	0.000	NA		NA
7607070	7607071	JTY_3633	JTY_3634		bphC	TRUE	0.898	15.000	0.520	1.000		NA
7607071	7607072	JTY_3634	JTY_3635	bphC	bphD	TRUE	0.993	-3.000	0.733	NA		NA
7607072	7607073	JTY_3635	JTY_3636	bphD		TRUE	0.916	15.000	0.733	NA		NA
7607074	7607075	JTY_3637	JTY_3638	hmp		TRUE	0.888	18.000	0.727	NA		NA
7607079	7607080	JTY_3642	JTY_3643	lppH		FALSE	0.022	191.000	0.000	NA		NA
7607080	7607081	JTY_3643	JTY_3644		arsB2	TRUE	0.639	14.000	0.078	NA		NA
7607082	7607083	JTY_3645	JTY_3646		cysS	TRUE	0.991	1.000	0.088	1.000	Y	NA
7607083	7607084	JTY_3646	JTY_3647	cysS	ispF	FALSE	0.187	65.000	0.037	1.000	N	NA
7607084	7607085	JTY_3647	JTY_3648	ispF	ispD	TRUE	0.997	-3.000	0.419	1.000	Y	NA
7607085	7607086	JTY_3648	JTY_3649	ispD		FALSE	0.476	17.000	0.068	1.000	N	NA
7607087	7607088	JTY_3650	JTY_3651	lpqE	radA	FALSE	0.216	66.000	0.014	NA		NA
7607088	7607089	JTY_3651	JTY_3652	radA		TRUE	0.900	5.000	0.126	NA		NA
7607090	7607091	JTY_3653	JTY_3654		canB	FALSE	0.408	109.000	0.333	NA		NA
7607093	7607094	JTY_3656	JTY_3657	PE_PGRS58		FALSE	0.087	111.000	0.000	NA		NA
7607095	7607096	JTY_3658	JTY_3659	TB11.2	lpqF	FALSE	0.562	-22.000	0.160	NA		NA
7607096	7607097	JTY_3659	JTY_3660	lpqF		FALSE	0.045	147.000	0.000	NA		NA
7607098	7607099	JTY_3661	JTY_3662	PE_PGRS59	clpC	FALSE	0.096	108.000	0.000	NA		NA
7607099	7607100	JTY_3662	JTY_3663	clpC	lsr2	FALSE	0.008	277.000	0.000	NA		NA
7607100	7607101	JTY_3663	JTY_3664	lsr2	lysS	FALSE	0.362	104.000	0.247	NA		NA
7607101	7607102	JTY_3664	JTY_3665	lysS		FALSE	0.119	101.000	0.015	1.000	N	NA
7607102	7607103	JTY_3665	JTY_3666		panD	TRUE	0.849	3.000	0.030	1.000	N	NA
7607103	7607104	JTY_3666	JTY_3667	panD	panC	TRUE	0.996	0.000	0.342	1.000	Y	NA
7607104	7607105	JTY_3667	JTY_3668	panC		TRUE	0.965	-3.000	0.067	1.000		NA
7607105	7607106	JTY_3668	JTY_3669			FALSE	0.052	185.000	0.054	NA		NA
7607106	7607107	JTY_3669	JTY_3670			FALSE	0.077	209.000	0.237	NA		NA
7607107	7607108	JTY_3670	JTY_3671		folK	TRUE	0.949	0.000	0.081	NA		NA
7607108	7607109	JTY_3671	JTY_3672	folK	folB	TRUE	0.993	-3.000	0.075	1.000	Y	NA
7607109	7607110	JTY_3672	JTY_3673	folB	folP1	TRUE	0.977	-7.000	0.471	1.000	Y	NA
7607110	7607111	JTY_3673	JTY_3674	folP1	folE	TRUE	0.998	-3.000	0.609	1.000	Y	NA
7607111	7607112	JTY_3674	JTY_3675	folE	ftsH	TRUE	0.656	16.000	0.212	1.000	N	NA
7607114	7607115	JTY_3677	JTY_3678			FALSE	0.189	34.000	0.000	NA		NA
7607115	7607116	JTY_3678	JTY_3679			FALSE	0.114	100.000	0.000	NA		NA
7607116	7607117	JTY_3679	JTY_3680			TRUE	0.675	116.000	1.000	NA		NA
7607117	7607118	JTY_3680	JTY_3681			TRUE	0.799	74.000	1.000	NA		NA
7607120	7607121	JTY_3683	JTY_3684	hpt	mesJ	TRUE	0.982	-3.000	0.137	0.022	N	NA
7607121	7607122	JTY_3684	JTY_3685	mesJ		FALSE	0.477	-21.000	0.050	NA		NA
7607122	7607123	JTY_3685	JTY_3686			TRUE	0.989	-3.000	0.500	NA		NA
7607126	7607127	JTY_3689	JTY_3690			FALSE	0.166	44.000	0.000	NA		NA
7607127	7607128	JTY_3690	JTY_3691			TRUE	0.954	-3.000	0.081	NA		NA
7607128	7607129	JTY_3691	JTY_3692			FALSE	0.017	211.000	0.000	NA		NA
7607131	7607132	JTY_3694	JTY_3695			FALSE	0.005	343.000	0.000	NA		NA
7607132	7607133	JTY_3695	JTY_3696			FALSE	0.004	385.000	0.000	NA		NA
7607133	7607134	JTY_3696	JTY_3697			TRUE	0.987	0.000	0.000	NA	Y	NA
7607135	7607136	JTY_3698	JTY_3699			FALSE	0.144	70.000	0.000	NA		NA
7607136	7607137	JTY_3699	JTY_3700		fic	FALSE	0.015	176.000	0.000	1.000	N	NA
7607137	7607138	JTY_3700	JTY_3701	fic		TRUE	0.853	11.000	0.250	NA		NA
7607140	7607141	JTY_t0039	JTY_3703	thrU		FALSE	0.140	79.000	0.000	NA		NA
7607143	7607144	JTY_3705	JTY_3706	topA		FALSE	0.007	353.000	0.008	NA		NA
7607144	7607145	JTY_3706	JTY_3707		cspA	FALSE	0.418	140.000	0.611	NA		NA
7607146	7607147	JTY_3708	JTY_3709		PE33	FALSE	0.054	137.000	0.000	NA		NA
7607147	7607148	JTY_3709	JTY_3710	PE33		FALSE	0.006	324.000	0.000	NA		NA
7607148	7607149	JTY_3710	JTY_3711		PE_PGRS60	FALSE	0.002	754.000	0.000	NA		NA
7607149	7607150	JTY_3711	JTY_3712	PE_PGRS60	PE_PGRS61	FALSE	0.540	-6.000	0.000	NA		NA
7607151	7607152	JTY_3713	JTY_3714			FALSE	0.294	86.000	0.118	NA		NA
7607152	7607153	JTY_3714	JTY_3715			FALSE	0.254	24.000	0.000	NA		NA
7607153	7607154	JTY_3715	JTY_3716			TRUE	0.789	10.000	0.080	NA		NA
7607154	7607155	JTY_3716	JTY_3717			TRUE	0.688	24.000	0.323	NA		NA
7607155	7607156	JTY_3717	JTY_3718			TRUE	0.998	-3.000	0.659	NA	Y	NA
7607156	7607157	JTY_3718	JTY_3719			TRUE	0.617	102.000	0.776	NA	N	NA
7607159	7607160	JTY_3721	JTY_3722		dppD	TRUE	0.968	-3.000	0.104	1.000		NA
7607160	7607161	JTY_3722	JTY_3723	dppD	dppC	TRUE	0.994	-3.000	0.725	1.000		NA
7607161	7607162	JTY_3723	JTY_3724	dppC	dppB	TRUE	0.967	56.000	0.811	0.008	Y	NA
7607162	7607163	JTY_3724	JTY_3725	dppB	dppA	TRUE	0.996	2.000	0.147	0.008	Y	NA
7607166	7607167	JTY_3728	JTY_3729		ephE	TRUE	0.983	1.000	0.494	NA		NA
7607168	7607169	JTY_3730	JTY_3731			TRUE	0.959	6.000	0.367	1.000		NA
7607169	7607170	JTY_3731	JTY_3732			FALSE	0.251	132.000	0.304	1.000	N	NA
7607170	7607171	JTY_3732	JTY_3733		nth	TRUE	0.895	0.000	0.022	1.000	N	NA
7607172	7607173	JTY_3734	JTY_3735			FALSE	0.267	99.000	0.116	NA		NA
7607174	7607175	JTY_3736	JTY_3737			TRUE	0.812	7.000	0.039	NA		NA
7607175	7607176	JTY_3737	JTY_3738			TRUE	0.607	16.000	0.094	NA		NA
7607177	7607178	JTY_3739	JTY_3740			TRUE	0.999	-3.000	0.709	0.001	Y	NA
7607180	7607181	JTY_3742	JTY_3743	ponA2		FALSE	0.366	69.000	0.072	1.000		NA
7607181	7607182	JTY_3743	JTY_3744			FALSE	0.355	63.000	0.057	1.000		NA
7607182	7607183	JTY_3744	JTY_t0040		proY	FALSE	0.150	62.000	0.000	NA		NA
7607184	7607185	JTY_3745	JTY_3746	cyp137		FALSE	0.231	26.000	0.000	NA		NA
7607185	7607186	JTY_3746	JTY_3747			FALSE	0.012	240.000	0.000	NA		NA
7607186	7607187	JTY_3747	JTY_3748			FALSE	0.006	325.000	0.000	NA		NA
7607188	7607189	JTY_3749	JTY_3750			TRUE	0.794	27.000	0.628	NA		NA
7607189	7607190	JTY_3750	JTY_3751			TRUE	0.605	126.000	0.841	NA		NA
7607190	7607191	JTY_3751	JTY_3752		moxR2	TRUE	0.980	-3.000	0.302	NA		NA
7607191	7607192	JTY_3752	JTY_3753	moxR2		FALSE	0.471	134.000	0.648	NA		NA
7607195	7607196	JTY_3756	JTY_3757	glpK		FALSE	0.158	50.000	0.000	NA		NA
7607196	7607197	JTY_3757	JTY_3758			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7607198	7607199	JTY_3759	JTY_3760			TRUE	0.597	22.000	0.200	NA		NA
7607200	7607201	JTY_3761	JTY_3762			FALSE	0.385	31.000	0.077	NA		NA
7607201	7607202	JTY_3762	JTY_3763			TRUE	0.981	-3.000	0.316	NA		NA
7607202	7607203	JTY_3763	JTY_3764			TRUE	0.989	0.000	0.597	NA		NA
7607203	7607204	JTY_3764	JTY_3765		gshA	TRUE	0.983	-3.000	0.337	NA		NA
7607204	7607205	JTY_3765	JTY_3766	gshA		FALSE	0.132	132.000	0.063	NA		NA
7607205	7607206	JTY_3766	JTY_3767			FALSE	0.234	129.000	0.222	NA		NA
7607206	7607207	JTY_3767	JTY_3768			TRUE	0.589	111.000	0.667	NA		NA
7607207	7607208	JTY_3768	JTY_3769			FALSE	0.260	119.000	0.222	NA		NA
7607208	7607209	JTY_3769	JTY_3770		asd	FALSE	0.079	140.000	0.012	NA		NA
7607209	7607210	JTY_3770	JTY_3771	asd	ask	TRUE	0.991	1.000	0.119	1.000	Y	NA
7607213	7607214	JTY_3774	JTY_3775		cobQ2	TRUE	0.986	5.000	0.796	1.000		NA
7607215	7607216	JTY_3776	JTY_3777		recR	FALSE	0.272	68.000	0.003	1.000		NA
7607216	7607217	JTY_3777	JTY_3778	recR		TRUE	0.924	12.000	0.604	NA		NA
7607220	7607221	JTY_3781	JTY_3782			TRUE	0.849	18.000	0.633	1.000	N	NA
7607222	7607223	JTY_3783	JTY_3784	dnaZX		FALSE	0.190	90.000	0.061	1.000	N	NA
7607224	7607225	JTY_t0041	JTY_3785	serV		FALSE	0.101	106.000	0.000	NA		NA
7607225	7607226	JTY_3785	JTY_3786		cut5	FALSE	0.031	167.000	0.000	NA		NA
7607226	7607227	JTY_3786	JTY_3787	cut5		FALSE	0.254	45.000	0.000	1.000		NA
7607227	7607228	JTY_3787	JTY_3788			FALSE	0.009	207.000	0.000	1.000	N	NA
7607228	7607229	JTY_3788	JTY_3789			FALSE	0.009	341.000	0.000	1.000		NA
7607229	7607230	JTY_3789	JTY_3790			FALSE	0.218	110.000	0.036	1.000		NA
7607230	7607231	JTY_3790	JTY_3791			FALSE	0.028	215.000	0.000	1.000		NA
7607233	7607234	JTY_3793	JTY_3794	ligC		FALSE	0.114	100.000	0.000	NA		NA
7607235	7607236	JTY_3795	JTY_3796			TRUE	0.567	14.000	0.029	NA		NA
7607237	7607238	JTY_3797	JTY_3798			FALSE	0.155	57.000	0.000	NA		NA
7607238	7607239	JTY_3798	JTY_3799			TRUE	0.789	4.000	0.000	NA		NA
7607240	7607241	JTY_3800	JTY_3801	PPE66		FALSE	0.231	26.000	0.000	NA		NA
7607241	7607242	JTY_3801	JTY_3802			TRUE	0.880	0.000	0.000	NA		NA
7607242	7607243	JTY_3802	JTY_3803			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7607243	7607244	JTY_3803	JTY_3804		ctpJ	FALSE	0.045	146.000	0.000	NA		NA
7607246	7607247	JTY_3806	JTY_3807		PE34	FALSE	0.206	73.000	0.012	NA		NA
7607248	7607249	JTY_3808	JTY_3809			FALSE	0.065	130.000	0.000	NA		NA
7607250	7607251	JTY_3810	JTY_3811			FALSE	0.144	68.000	0.000	NA		NA
7607253	7607254	JTY_t0042	JTY_3813	serX		FALSE	0.207	30.000	0.000	NA		NA
7607254	7607255	JTY_3813	JTY_3814			FALSE	0.557	16.000	0.053	NA		NA
7607257	7607258	JTY_3816	JTY_3817		proZ	TRUE	0.882	6.000	0.136	NA		NA
7607258	7607259	JTY_3817	JTY_3818	proZ	proW	TRUE	0.999	-3.000	0.918	0.008	Y	NA
7607259	7607260	JTY_3818	JTY_3819	proW	proV	TRUE	0.977	-12.000	0.694	1.000	Y	NA
7607260	7607261	JTY_3819	JTY_3820	proV	proX	TRUE	0.765	9.000	0.085	1.000	N	NA
7607263	7607264	JTY_3822	JTY_3823	fadE36		FALSE	0.140	79.000	0.000	NA		NA
7607266	7607267	JTY_3825	JTY_3826			TRUE	0.923	71.000	0.742	1.000	Y	NA
7607270	7607271	JTY_3829	JTY_3830			FALSE	0.024	186.000	0.000	NA		NA
7607272	7607273	JTY_3831	JTY_3832			FALSE	0.101	106.000	0.000	NA		NA
7607273	7607274	JTY_3832	JTY_3833			FALSE	0.392	15.000	0.000	NA		NA
7607274	7607275	JTY_3833	JTY_3834			FALSE	0.057	135.000	0.000	NA		NA
7607275	7607276	JTY_3834	JTY_t0043		argU	FALSE	0.057	135.000	0.000	NA		NA
7607276	7607277	JTY_t0043	JTY_t0044	argU	serT	FALSE	0.201	31.000	0.000	NA		NA
7607279	7607280	JTY_3836	JTY_3837			TRUE	0.757	5.000	0.000	NA		NA
7607281	7607282	JTY_3838	JTY_3839	echA21	lipE	TRUE	0.687	12.000	0.148	1.000	N	NA
7607286	7607287	JTY_3843	JTY_3844			TRUE	0.908	4.000	0.093	NA		NA
7607287	7607288	JTY_3844	JTY_3845		rbfE	TRUE	0.917	4.000	0.136	NA		NA
7607288	7607289	JTY_3845	JTY_3846	rbfE		TRUE	0.980	-3.000	0.303	NA		NA
7607289	7607290	JTY_3846	JTY_3847		rfbD	TRUE	0.972	-3.000	0.220	NA		NA
7607290	7607291	JTY_3847	JTY_3848	rfbD	rfbB	FALSE	0.298	156.000	0.000	NA	Y	NA
7607291	7607292	JTY_3848	JTY_3849	rfbB		FALSE	0.131	84.000	0.000	NA		NA
7607293	7607294	JTY_3850	JTY_3851			FALSE	0.049	13.000	0.000	NA	N	NA
7607295	7607296	JTY_3852	JTY_3853			FALSE	0.436	109.000	0.300	1.000		NA
7607296	7607297	JTY_3853	JTY_3854			FALSE	0.369	40.000	0.033	1.000		NA
7607297	7607298	JTY_3854	JTY_3855			TRUE	0.972	1.000	0.242	1.000		NA
7607298	7607299	JTY_3855	JTY_3856			TRUE	0.981	3.000	0.543	NA		NA
7607299	7607300	JTY_3856	JTY_3857		embC	TRUE	0.982	0.000	0.360	NA		NA
7607300	7607301	JTY_3857	JTY_3858	embC	embA	TRUE	0.834	86.000	0.455	0.001		NA
7607301	7607302	JTY_3858	JTY_3859	embA	embB	TRUE	0.996	-3.000	0.400	0.001		NA
7607302	7607303	JTY_3859	JTY_3860	embB		FALSE	0.443	68.000	0.182	1.000		NA
7607303	7607304	JTY_3860	JTY_3861		fadE35	FALSE	0.219	80.000	0.000	1.000		NA
7607304	7607305	JTY_3861	JTY_3862	fadE35		FALSE	0.036	127.000	0.000	1.000	N	NA
7607306	7607307	JTY_3863	JTY_3864	accD4	pks13	TRUE	0.993	-3.000	0.800	1.000	N	NA
7607307	7607308	JTY_3864	JTY_3865	pks13	fadD32	TRUE	0.991	7.000	0.520	1.000	Y	NA
7607308	7607309	JTY_3865	JTY_3866	fadD32		FALSE	0.060	289.000	0.091	0.066		NA
7607309	7607310	JTY_3866	JTY_3867		fbpD	FALSE	0.058	198.000	0.136	NA		NA
7607310	7607311	JTY_3867	JTY_3868	fbpD	fbpA	FALSE	0.106	180.000	0.222	NA		NA
7607311	7607312	JTY_3868	JTY_3869	fbpA		FALSE	0.007	295.000	0.000	NA		NA
7607312	7607313	JTY_3869	JTY_3870			FALSE	0.270	89.000	0.086	NA		NA
7607313	7607314	JTY_3870	JTY_3871			TRUE	0.898	7.000	0.136	1.000		NA
7607314	7607315	JTY_3871	JTY_3872			TRUE	0.740	29.000	0.500	NA		NA
7607315	7607316	JTY_3872	JTY_3873		glf	TRUE	0.957	-3.000	0.105	NA		NA
7607317	7607318	JTY_3874	JTY_3875	pirG		FALSE	0.089	205.000	0.269	NA		NA
7607318	7607319	JTY_3875	JTY_3876		PE_PGRS62	FALSE	0.040	154.000	0.000	NA		NA
7607320	7607321	JTY_3877	JTY_3878			TRUE	0.860	15.000	0.154	0.066		NA
7607321	7607322	JTY_3878	JTY_3879			TRUE	0.988	18.000	0.750	0.003	Y	NA
7607322	7607323	JTY_3879	JTY_3880			TRUE	0.996	4.000	0.267	0.003	Y	NA
7607324	7607325	JTY_3881	JTY_3882			FALSE	0.319	47.000	0.071	NA		NA
7607325	7607326	JTY_3882	JTY_3883			TRUE	0.976	-3.000	0.250	NA		NA
7607328	7607329	JTY_3885	JTY_3886			FALSE	0.186	35.000	0.000	NA		NA
7607329	7607330	JTY_3886	JTY_3887			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7607331	7607332	JTY_3888	JTY_3889	mmpL8	papA1	FALSE	0.090	110.000	0.000	NA		NA
7607332	7607333	JTY_3889	JTY_3890	papA1	pks2	FALSE	0.158	51.000	0.000	NA		NA
7607335	7607336	JTY_3892	JTY_3893			TRUE	0.988	-3.000	0.000	NA	Y	NA
7607336	7607337	JTY_3893	JTY_3894			FALSE	0.272	1.000	0.000	NA	N	NA
7607337	7607338	JTY_3894	JTY_3895			TRUE	0.769	48.000	1.000	NA	N	NA
7607343	7607344	JTY_3900	JTY_3901			TRUE	0.961	5.000	0.387	NA		NA
7607345	7607346	JTY_3902	JTY_3903		pheA	TRUE	0.899	-3.000	0.079	NA	N	NA
7607347	7607348	JTY_3904	JTY_3905			FALSE	0.384	26.000	0.048	NA		NA
7607348	7607349	JTY_3905	JTY_3906		bfrB	FALSE	0.040	198.000	0.042	NA		NA
7607350	7607351	JTY_3907	JTY_3908	glpQ1		TRUE	0.867	6.000	0.087	NA		NA
7607352	7607353	JTY_3909	JTY_3910			FALSE	0.392	15.000	0.000	NA		NA
7607353	7607354	JTY_3910	JTY_3911		sodA	FALSE	0.002	1064.000	0.000	NA		NA
7607354	7607355	JTY_3911	JTY_3912	sodA		FALSE	0.017	211.000	0.000	NA		NA
7607355	7607356	JTY_3912	JTY_3913			FALSE	0.016	255.000	0.008	NA		NA
7607356	7607357	JTY_3913	JTY_3914			FALSE	0.016	265.000	0.000	1.000		NA
7607357	7607358	JTY_3914	JTY_3915			FALSE	0.204	118.000	0.148	NA		NA
7607358	7607359	JTY_3915	JTY_3916			FALSE	0.480	12.000	0.000	NA		NA
7607359	7607360	JTY_3916	JTY_3917		hns	FALSE	0.098	107.000	0.000	NA		NA
7607360	7607361	JTY_3917	JTY_3918	hns	menG	FALSE	0.535	17.000	0.056	NA		NA
7607364	7607365	JTY_3921	JTY_3922			TRUE	0.631	9.000	0.000	NA		NA
7607365	7607366	JTY_3922	JTY_3923		gltD	FALSE	0.004	425.000	0.000	NA		NA
7607366	7607367	JTY_3923	JTY_3924	gltD	gltB	TRUE	0.978	-7.000	0.043	0.000	Y	NA
7607368	7607369	JTY_3925	JTY_3926			FALSE	0.098	107.000	0.000	NA		NA
7607371	7607372	JTY_3928	JTY_3929			FALSE	0.012	243.000	0.000	NA		NA
7607372	7607373	JTY_3929	JTY_3930			TRUE	0.777	88.000	1.000	NA		NA
7607373	7607374	JTY_3930	JTY_3931			TRUE	0.944	3.000	0.200	NA		NA
7607374	7607375	JTY_3931	JTY_3932			FALSE	0.451	39.000	0.200	NA		NA
7607375	7607376	JTY_3932	JTY_3933			TRUE	0.909	-7.000	0.500	NA		NA
7607376	7607377	JTY_3933	JTY_3934			TRUE	0.789	4.000	0.000	NA		NA
7607377	7607378	JTY_3934	JTY_3935			TRUE	0.880	0.000	0.000	NA		NA
7607378	7607379	JTY_3935	JTY_3936			TRUE	0.897	103.000	1.000	0.002		NA
7607380	7607381	JTY_3937	JTY_3938			TRUE	0.919	-3.000	0.002	NA		NA
7607381	7607382	JTY_3938	JTY_3939			FALSE	0.381	107.000	0.286	NA		NA
7607382	7607383	JTY_3939	JTY_3940			TRUE	0.995	-3.000	1.000	NA		NA
7607383	7607384	JTY_3940	JTY_3941			FALSE	0.165	222.000	0.000	1.000	Y	NA
7607384	7607385	JTY_3941	JTY_3942			TRUE	0.641	70.000	0.500	NA		NA
7607385	7607386	JTY_3942	JTY_3943			TRUE	0.995	-3.000	1.000	NA		NA
7607386	7607387	JTY_3943	JTY_3944			TRUE	0.927	-15.000	1.000	NA		NA
7607387	7607388	JTY_3944	JTY_3945			TRUE	0.992	-3.000	0.667	NA		NA
7607388	7607389	JTY_3945	JTY_3946			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7607389	7607390	JTY_3946	JTY_3947			TRUE	0.677	94.000	0.667	NA		NA
7607390	7607391	JTY_3947	JTY_3948		esxC	TRUE	0.979	8.000	1.000	NA		NA
7607391	7607392	JTY_3948	JTY_3949	esxC	esxD	TRUE	0.648	36.000	0.400	NA		NA
7607392	7607393	JTY_3949	JTY_3950	esxD	PPE69	FALSE	0.087	111.000	0.000	NA		NA
7607393	7607394	JTY_3950	JTY_3951	PPE69	PE36	TRUE	0.795	79.000	1.000	NA		NA
7607394	7607395	JTY_3951	JTY_3952	PE36		FALSE	0.009	267.000	0.000	NA		NA
7607395	7607396	JTY_3952	JTY_3953			TRUE	0.964	5.000	0.000	0.002		NA
7607396	7607397	JTY_3953	JTY_3954			TRUE	0.984	1.000	0.500	NA		NA
7607397	7607398	JTY_3954	JTY_3955			TRUE	0.618	44.000	0.400	NA		NA
7607398	7607399	JTY_3955	JTY_3956			FALSE	0.043	150.000	0.000	NA		NA
7607399	7607400	JTY_3956	JTY_3957			FALSE	0.460	162.000	1.000	NA		NA
7607400	7607401	JTY_3957	JTY_3958			FALSE	0.173	-393.000	0.000	NA		NA
7607401	7607402	JTY_3958	JTY_3959			FALSE	0.540	-6.000	0.000	NA		NA
7607402	7607403	JTY_3959	JTY_3960			FALSE	0.093	109.000	0.000	NA		NA
7607403	7607404	JTY_3960	JTY_3961			FALSE	0.003	551.000	0.000	NA		NA
7607404	7607405	JTY_3961	JTY_3962			TRUE	0.891	-3.000	0.000	NA		NA
7607405	7607406	JTY_3962	JTY_3963		esxE	TRUE	0.965	5.000	0.429	NA		NA
7607406	7607407	JTY_3963	JTY_3964	esxE	esxF	FALSE	0.284	149.000	0.429	NA		NA
7607407	7607408	JTY_3964	JTY_3965	esxF		FALSE	0.146	66.000	0.000	NA		NA
7607408	7607409	JTY_3965	JTY_3966		pcnA	FALSE	0.444	25.000	0.078	NA		NA
7607410	7607411	JTY_3967	JTY_3968			TRUE	0.983	-3.000	0.351	NA		NA
7607411	7607412	JTY_3968	JTY_3969			TRUE	0.986	-3.000	0.411	NA		NA
7607412	7607413	JTY_3969	JTY_3970		sigMa	TRUE	0.642	35.000	0.306	1.000		NA
7607413	7607414	JTY_3970	JTY_3971	sigMa	sigMb	FALSE	0.205	-111.000	0.000	NA		NA
7607414	7607415	JTY_3971	JTY_3972	sigMb		FALSE	0.369	16.000	0.000	NA		NA
7607415	7607416	JTY_3972	JTY_3973		trxB2	FALSE	0.186	94.000	0.015	NA		NA
7607416	7607417	JTY_3973	JTY_3974	trxB2	trxC	TRUE	0.992	-3.000	0.025	1.000	Y	NA
7607417	7607418	JTY_3974	JTY_3975	trxC		FALSE	0.268	110.000	0.237	1.000	N	NA
7607419	7607420	JTY_3976	JTY_3977		parB	FALSE	0.012	290.000	0.013	NA		NA
7607420	7607421	JTY_3977	JTY_3978	parB	parA	TRUE	0.993	-3.000	0.827	1.000	N	NA
7607421	7607422	JTY_3978	JTY_3979	parA	gidB	TRUE	0.980	-3.000	0.339	1.000	N	NA
7607422	7607423	JTY_3979	JTY_3980	gidB		FALSE	0.182	132.000	0.070	1.000		NA
7607423	7607424	JTY_3980	JTY_3981			FALSE	0.304	72.000	0.024	1.000		NA
7607424	7607425	JTY_3981	JTY_3982			FALSE	0.435	-16.000	0.010	NA		NA
7607425	7607426	JTY_3982	JTY_3983		rnpA	TRUE	0.989	-3.000	0.540	NA		NA
7607426	7607427	JTY_3983	JTY_3984	rnpA	rpmH	TRUE	0.994	-3.000	0.787	1.000		NA