MicrobesOnline Operon Predictions for Bacteroides cellulosilyticus DSM 14838

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
6376988	6376989	BACCELL_00002	BACCELL_00003			TRUE	0.976	0.000	0.875	1.000	N	NA
6376989	6376990	BACCELL_00003	BACCELL_00004			TRUE	0.667	67.000	0.102	1.000	N	NA
6376990	6376991	BACCELL_00004	BACCELL_00005			TRUE	0.978	19.000	0.136	0.057	Y	NA
6376992	6376993	BACCELL_00006	BACCELL_00007			FALSE	0.190	206.000	0.118	NA		NA
6376993	6376994	BACCELL_00007	BACCELL_00008			FALSE	0.379	2.000	0.000	NA		NA
6376994	6376995	BACCELL_00008	BACCELL_00009			TRUE	0.989	32.000	0.980	0.085		NA
6376995	6376996	BACCELL_00009	BACCELL_00010			TRUE	0.958	16.000	0.373	0.081		NA
6376996	6376997	BACCELL_00010	BACCELL_00011			TRUE	0.963	27.000	0.500	1.000		NA
6376997	6376998	BACCELL_00011	BACCELL_00012			TRUE	0.811	14.000	0.172	NA	N	NA
6376998	6376999	BACCELL_00012	BACCELL_00013			FALSE	0.381	6.000	0.000	NA		NA
6376999	6377000	BACCELL_00013	BACCELL_00014			FALSE	0.040	230.000	0.000	1.000		NA
6377000	6377001	BACCELL_00014	BACCELL_00015			TRUE	0.926	-3.000	0.393	NA		NA
6377001	6377002	BACCELL_00015	BACCELL_00016			TRUE	0.954	3.000	0.526	NA		NA
6377002	6377003	BACCELL_00016	BACCELL_00017			TRUE	0.912	12.000	0.316	NA		NA
6377005	6377006	BACCELL_00019	BACCELL_00020			FALSE	0.384	4.000	0.000	NA		NA
6377006	6377007	BACCELL_00020	BACCELL_00021			FALSE	0.228	77.000	0.000	NA		NA
6377007	6377008	BACCELL_00021	BACCELL_00022			FALSE	0.212	101.000	0.000	NA		NA
6377008	6377009	BACCELL_00022	BACCELL_00023			FALSE	0.120	145.000	0.000	NA		NA
6377009	6377010	BACCELL_00023	BACCELL_00024			FALSE	0.370	12.000	0.000	NA		NA
6377010	6377011	BACCELL_00024	BACCELL_00025			FALSE	0.367	14.000	0.000	NA		NA
6377011	6377012	BACCELL_00025	BACCELL_00026			FALSE	0.368	13.000	0.000	NA		NA
6377012	6377013	BACCELL_00026	BACCELL_00027			FALSE	0.375	8.000	0.000	NA		NA
6377013	6377014	BACCELL_00027	BACCELL_00028			FALSE	0.212	86.000	0.000	NA		NA
6377014	6377015	BACCELL_00028	BACCELL_00029			FALSE	0.260	61.000	0.000	NA		NA
6377015	6377016	BACCELL_00029	BACCELL_00030			FALSE	0.322	-13.000	0.000	NA		NA
6377016	6377017	BACCELL_00030	BACCELL_00031			FALSE	0.003	608.000	0.000	NA		NA
6377017	6377018	BACCELL_00031	BACCELL_00032			TRUE	0.955	110.000	1.000	NA		NA
6377018	6377019	BACCELL_00032	BACCELL_00033			TRUE	0.911	22.000	0.286	NA		NA
6377019	6377020	BACCELL_00033	BACCELL_00034			TRUE	0.945	27.000	0.429	NA		NA
6377020	6377021	BACCELL_00034	BACCELL_00035			TRUE	0.954	57.000	0.750	NA		NA
6377021	6377022	BACCELL_00035	BACCELL_00036			TRUE	0.877	116.000	0.500	NA		NA
6377022	6377023	BACCELL_00036	BACCELL_00037			TRUE	0.945	39.000	0.500	NA		NA
6377023	6377024	BACCELL_00037	BACCELL_00038			TRUE	0.931	-19.000	0.500	NA		NA
6377024	6377025	BACCELL_00038	BACCELL_00039			TRUE	0.960	-37.000	0.800	NA		NA
6377025	6377026	BACCELL_00039	BACCELL_00040			FALSE	0.004	429.000	0.000	NA		NA
6377026	6377027	BACCELL_00040	BACCELL_00041			FALSE	0.290	-28.000	0.000	NA		NA
6377027	6377028	BACCELL_00041	BACCELL_00042			FALSE	0.206	106.000	0.000	NA		NA
6377028	6377029	BACCELL_00042	BACCELL_00043			FALSE	0.188	117.000	0.000	NA		NA
6377029	6377030	BACCELL_00043	BACCELL_00044			FALSE	0.384	5.000	0.000	NA		NA
6377030	6377031	BACCELL_00044	BACCELL_00045			TRUE	0.973	-24.000	1.000	NA		NA
6377031	6377032	BACCELL_00045	BACCELL_00046			TRUE	0.965	2.000	0.667	NA		NA
6377032	6377033	BACCELL_00046	BACCELL_00047			FALSE	0.340	-7.000	0.000	NA		NA
6377033	6377034	BACCELL_00047	BACCELL_00048			FALSE	0.375	0.000	0.000	NA		NA
6377035	6377036	BACCELL_00049	BACCELL_00050			TRUE	0.904	18.000	0.000	1.000	Y	NA
6377037	6377038	BACCELL_00051	BACCELL_00052			FALSE	0.386	41.000	0.007	NA		NA
6377038	6377039	BACCELL_00052	BACCELL_00053			FALSE	0.377	37.000	0.002	NA		NA
6377040	6377041	BACCELL_00054	BACCELL_00055			FALSE	0.251	65.000	0.000	NA		NA
6377041	6377042	BACCELL_00055	BACCELL_00056			FALSE	0.375	17.000	0.000	NA		NA
6377042	6377043	BACCELL_00056	BACCELL_00057			TRUE	0.468	46.000	0.000	1.000		NA
6377045	6377046	BACCELL_00059	BACCELL_00060			FALSE	0.370	12.000	0.000	NA		NA
6377047	6377048	BACCELL_00061	BACCELL_00062			TRUE	0.981	19.000	1.000	NA		NA
6377048	6377049	BACCELL_00062	BACCELL_00063			FALSE	0.219	81.000	0.000	NA		NA
6377049	6377050	BACCELL_00063	BACCELL_00064			TRUE	0.943	32.000	0.000	0.048	Y	NA
6377050	6377051	BACCELL_00064	BACCELL_00065			TRUE	0.738	19.000	0.000	0.048		NA
6377051	6377052	BACCELL_00065	BACCELL_00066			FALSE	0.246	68.000	0.000	NA		NA
6377052	6377053	BACCELL_00066	BACCELL_00067			FALSE	0.235	74.000	0.000	NA		NA
6377053	6377054	BACCELL_00067	BACCELL_00068			FALSE	0.375	8.000	0.000	NA		NA
6377056	6377057	BACCELL_00070	BACCELL_00071			TRUE	0.838	-7.000	0.182	1.000	N	NA
6377057	6377058	BACCELL_00071	BACCELL_00072			TRUE	0.622	3.000	0.034	1.000	N	NA
6377058	6377059	BACCELL_00072	BACCELL_00073			FALSE	0.016	252.000	0.000	NA		NA
6377061	6377062	BACCELL_00075	BACCELL_00076			TRUE	0.948	-15.000	0.600	NA		NA
6377064	6377065	BACCELL_00078	BACCELL_00079			TRUE	0.936	20.000	0.035	1.000	Y	NA
6377065	6377066	BACCELL_00079	BACCELL_00080			TRUE	0.915	4.000	0.200	0.084	N	NA
6377070	6377071	BACCELL_00084	BACCELL_00085			TRUE	0.519	202.000	0.500	NA		NA
6377071	6377072	BACCELL_00085	BACCELL_00086			FALSE	0.224	79.000	0.000	NA		NA
6377072	6377073	BACCELL_00086	BACCELL_00087			FALSE	0.392	22.000	0.000	NA		NA
6377073	6377074	BACCELL_00087	BACCELL_00088			FALSE	0.103	149.000	0.000	1.000	N	NA
6377076	6377077	BACCELL_00090	BACCELL_00091			FALSE	0.340	-7.000	0.000	NA		NA
6377077	6377078	BACCELL_00091	BACCELL_00092			FALSE	0.242	70.000	0.000	NA		NA
6377079	6377080	BACCELL_00093	BACCELL_00094			FALSE	0.004	424.000	0.000	NA		NA
6377080	6377081	BACCELL_00094	BACCELL_00095			FALSE	0.028	143.000	0.000	NA	N	NA
6377081	6377082	BACCELL_00095	BACCELL_00096			FALSE	0.035	238.000	0.000	1.000		NA
6377082	6377083	BACCELL_00096	BACCELL_00097			TRUE	0.544	4.000	0.000	1.000		NA
6377084	6377085	BACCELL_00098	BACCELL_00099			FALSE	0.368	13.000	0.000	NA		NA
6377086	6377087	BACCELL_00100	BACCELL_00101			FALSE	0.368	15.000	0.000	NA		NA
6377087	6377088	BACCELL_00101	BACCELL_00102			FALSE	0.368	13.000	0.000	NA		NA
6377088	6377089	BACCELL_00102	BACCELL_00103			FALSE	0.185	119.000	0.000	NA		NA
6377089	6377090	BACCELL_00103	BACCELL_00104			TRUE	0.739	36.000	0.000	0.050		NA
6377090	6377091	BACCELL_00104	BACCELL_00105			TRUE	0.566	174.000	0.333	NA		NA
6377094	6377095	BACCELL_00108	BACCELL_00109			TRUE	0.981	4.000	1.000	NA		NA
6377095	6377096	BACCELL_00109	BACCELL_00110			TRUE	0.406	24.000	0.000	NA		NA
6377096	6377097	BACCELL_00110	BACCELL_00111			TRUE	0.996	10.000	1.000	1.000	Y	NA
6377100	6377101	BACCELL_00114	BACCELL_00115			FALSE	0.375	0.000	0.000	NA		NA
6377101	6377102	BACCELL_00115	BACCELL_00116			FALSE	0.367	14.000	0.000	NA		NA
6377102	6377103	BACCELL_00116	BACCELL_00117			FALSE	0.127	142.000	0.000	NA		NA
6377103	6377104	BACCELL_00117	BACCELL_00118			FALSE	0.352	40.000	0.000	NA		NA
6377104	6377105	BACCELL_00118	BACCELL_00119			FALSE	0.228	77.000	0.000	NA		NA
6377105	6377106	BACCELL_00119	BACCELL_00120			FALSE	0.233	75.000	0.000	NA		NA
6377106	6377107	BACCELL_00120	BACCELL_00121			FALSE	0.371	16.000	0.000	NA		NA
6377107	6377108	BACCELL_00121	BACCELL_00122			TRUE	0.955	-43.000	0.062	0.009	Y	NA
6377108	6377109	BACCELL_00122	BACCELL_00123			FALSE	0.378	37.000	0.000	NA		NA
6377109	6377110	BACCELL_00123	BACCELL_00124			FALSE	0.379	18.000	0.000	NA		NA
6377110	6377111	BACCELL_00124	BACCELL_00125			FALSE	0.288	-30.000	0.000	NA		NA
6377111	6377112	BACCELL_00125	BACCELL_00126			FALSE	0.361	-3.000	0.000	NA		NA
6377113	6377114	BACCELL_00127	BACCELL_00128			FALSE	0.373	9.000	0.000	NA		NA
6377114	6377115	BACCELL_00128	BACCELL_00129			FALSE	0.382	3.000	0.000	NA		NA
6377115	6377116	BACCELL_00129	BACCELL_00130			TRUE	0.401	31.000	0.000	NA		NA
6377116	6377117	BACCELL_00130	BACCELL_00131			TRUE	0.410	25.000	0.000	NA		NA
6377118	6377119	BACCELL_00132	BACCELL_00133			FALSE	0.035	238.000	0.000	1.000		NA
6377120	6377121	BACCELL_00134	BACCELL_00135			TRUE	0.756	111.000	0.222	NA		NA
6377121	6377122	BACCELL_00135	BACCELL_00136			FALSE	0.007	333.000	0.000	NA		NA
6377123	6377124	BACCELL_00137	BACCELL_00138			TRUE	0.535	17.000	0.000	1.000		NA
6377126	6377127	BACCELL_00140	BACCELL_00141			FALSE	0.133	140.000	0.000	NA		NA
6377128	6377129	BACCELL_00142	BACCELL_00143			FALSE	0.039	196.000	0.000	NA		NA
6377131	6377132	BACCELL_00145	BACCELL_00146			TRUE	0.746	23.000	0.000	0.059		NA
6377132	6377133	BACCELL_00146	BACCELL_00147			TRUE	0.526	14.000	0.000	1.000		NA
6377133	6377134	BACCELL_00147	BACCELL_00148			FALSE	0.279	127.000	0.000	1.000		NA
6377134	6377135	BACCELL_00148	BACCELL_00149			FALSE	0.337	90.000	0.000	1.000		NA
6377137	6377138	BACCELL_00151	BACCELL_00152			TRUE	0.520	-3.000	0.000	1.000		NA
6377140	6377141	BACCELL_00154	BACCELL_00155			FALSE	0.318	112.000	0.000	1.000		NA
6377141	6377142	BACCELL_00155	BACCELL_00156			TRUE	0.956	-7.000	0.636	NA		NA
6377142	6377143	BACCELL_00156	BACCELL_00157			FALSE	0.285	53.000	0.000	NA		NA
6377145	6377146	BACCELL_00159	BACCELL_00160			TRUE	0.965	2.000	0.667	NA		NA
6377146	6377147	BACCELL_00160	BACCELL_00161			FALSE	0.378	7.000	0.000	NA		NA
6377147	6377148	BACCELL_00161	BACCELL_00162			FALSE	0.382	3.000	0.000	NA		NA
6377148	6377149	BACCELL_00162	BACCELL_00163			TRUE	0.963	-3.000	0.667	NA		NA
6377149	6377150	BACCELL_00163	BACCELL_00164			TRUE	0.928	29.000	0.333	NA		NA
6377150	6377151	BACCELL_00164	BACCELL_00165			TRUE	0.919	0.000	0.333	NA		NA
6377151	6377152	BACCELL_00165	BACCELL_00166			FALSE	0.315	46.000	0.000	NA		NA
6377152	6377153	BACCELL_00166	BACCELL_00167			FALSE	0.361	-3.000	0.000	NA		NA
6377153	6377154	BACCELL_00167	BACCELL_00168			FALSE	0.375	0.000	0.000	NA		NA
6377154	6377155	BACCELL_00168	BACCELL_00169			FALSE	0.361	-3.000	0.000	NA		NA
6377156	6377157	BACCELL_00170	BACCELL_00171			FALSE	0.361	-3.000	0.000	NA		NA
6377157	6377158	BACCELL_00171	BACCELL_00172			FALSE	0.370	12.000	0.000	NA		NA
6377158	6377159	BACCELL_00172	BACCELL_00173			FALSE	0.379	2.000	0.000	NA		NA
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