MicrobesOnline Operon Predictions for Clostridium botulinum A2 str. Kyoto

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 7549854 7549855 CLM_0001 CLM_0002 dnaA dnaN TRUE 0.710 263.000 0.328 1.000 Y NA
 7549855 7549856 CLM_0002 CLM_0003 dnaN   TRUE 0.932 19.000 0.103 1.000   NA
 7549856 7549857 CLM_0003 CLM_0004   recF TRUE 0.792 79.000 0.209 1.000   NA
 7549857 7549858 CLM_0004 CLM_0005 recF   TRUE 0.876 21.000 0.024 NA   NA
 7549858 7549859 CLM_0005 CLM_0006   gyrB TRUE 0.863 18.000 0.017 NA   NA
 7549859 7549860 CLM_0006 CLM_0007 gyrB gyrA TRUE 0.989 26.000 0.306 0.003 Y NA
 7549860 7549861 CLM_0007 CLM_0008 gyrA rrs FALSE 0.007 415.000 0.000 NA   NA
 7549861 7549862 CLM_0008 CLM_0011 rrs rrl FALSE 0.089 227.000 0.000 NA   NA
 7549862 7549863 CLM_0011 CLM_0012 rrl rrf FALSE 0.256 94.000 0.000 NA   NA
 7549863 7549864 CLM_0012 CLM_0013 rrf   TRUE 0.722 10.000 0.000 NA   NA
 7549864 7549865 CLM_0013 CLM_0014     TRUE 0.815 2.000 0.000 NA   NA
 7549865 7549866 CLM_0014 CLM_0015     FALSE 0.207 164.000 0.000 NA   NA
 7549866 7549867 CLM_0015 CLM_0016     TRUE 0.884 16.000 0.029 NA   NA
 7549867 7549868 CLM_0016 CLM_0017     TRUE 0.936 2.000 0.014 NA   NA
 7549868 7549869 CLM_0017 CLM_0018     TRUE 0.908 5.000 0.011 NA   NA
 7549869 7549870 CLM_0018 CLM_0019     TRUE 0.560 137.000 0.016 NA   NA
 7549870 7549871 CLM_0019 CLM_0020     TRUE 0.947 25.000 0.214 NA   NA
 7549871 7549872 CLM_0020 CLM_0021     TRUE 0.964 17.000 0.370 NA   NA
 7549872 7549873 CLM_0021 CLM_0022   serS FALSE 0.013 370.000 0.000 NA   NA
 7549873 7549874 CLM_0022 CLM_0023 serS   FALSE 0.043 276.000 0.000 NA   NA
 7549874 7549875 CLM_0023 CLM_0024     TRUE 0.646 19.000 0.000 NA   NA
 7549875 7549876 CLM_0024 CLM_0025     FALSE 0.028 304.000 0.000 NA   NA
 7549876 7549877 CLM_0025 CLM_0026     TRUE 0.646 19.000 0.000 NA   NA
 7549877 7549878 CLM_0026 CLM_0027     FALSE 0.249 83.000 0.000 NA   NA
 7549879 7549880 CLM_0028 CLM_0029 psd   TRUE 0.594 103.000 0.026 NA   NA
 7549880 7549881 CLM_0029 CLM_0030     FALSE 0.267 76.000 0.000 NA   NA
 7549882 7549883 CLM_0031 CLM_0032     FALSE 0.274 133.000 0.000 NA   NA
 7549883 7549884 CLM_0032 CLM_0033   megL TRUE 0.637 160.000 0.034 1.000 N NA
 7549884 7549885 CLM_0033 CLM_0034 megL   FALSE 0.442 124.000 0.000 1.000 N NA
 7549885 7549886 CLM_0034 CLM_0035     FALSE 0.205 165.000 0.000 NA   NA
 7549886 7549887 CLM_0035 CLM_0036   srpB FALSE 0.273 123.000 0.000 NA   NA
 7549887 7549888 CLM_0036 CLM_0037 srpB dnaX FALSE 0.207 164.000 0.000 NA   NA
 7549888 7549889 CLM_0037 CLM_0038 dnaX   TRUE 0.744 65.000 0.100 NA   NA
 7549889 7549890 CLM_0038 CLM_0039   recR TRUE 0.964 33.000 0.604 NA   NA
 7549890 7549891 CLM_0039 CLM_0040 recR   TRUE 0.739 57.000 0.071 NA   NA
 7549891 7549892 CLM_0040 CLM_0041   bofA TRUE 0.845 150.000 0.417 NA   NA
 7549892 7549893 CLM_0041 CLM_0042 bofA sfsA FALSE 0.466 151.000 0.005 NA   NA
 7549893 7549894 CLM_0042 CLM_0043 sfsA   TRUE 0.631 56.000 0.015 NA   NA
 7549894 7549895 CLM_0043 CLM_0044     FALSE 0.314 118.000 0.000 1.000   NA
 7549895 7549896 CLM_0044 CLM_0045     FALSE 0.316 134.000 0.000 1.000   NA
 7549896 7549897 CLM_0045 CLM_0046     TRUE 0.951 19.000 0.222 NA   NA
 7549897 7549898 CLM_0046 CLM_0047     FALSE 0.012 383.000 0.000 NA   NA
 7549898 7549899 CLM_0047 CLM_0048     TRUE 0.581 83.000 0.007 NA N NA
 7549899 7549900 CLM_0048 CLM_0049     TRUE 0.892 29.000 0.035 NA N NA
 7549900 7549901 CLM_0049 CLM_0050   rrs FALSE 0.011 387.000 0.000 NA   NA
 7549902 7549903 CLM_0051 CLM_0052     TRUE 0.643 74.000 0.044 NA   NA
 7549904 7549905 CLM_0054 CLM_0055 rrf   TRUE 0.749 6.000 0.000 NA   NA
 7549908 7549909 CLM_0058 CLM_0059     TRUE 0.643 74.000 0.044 NA   NA
 7549910 7549911 CLM_0061 CLM_0062 rrf   TRUE 0.749 6.000 0.000 NA   NA
 7549911 7549912 CLM_0062 CLM_0063     FALSE 0.018 342.000 0.000 NA   NA
 7549912 7549913 CLM_0063 CLM_0064     TRUE 0.996 -3.000 0.800 NA   NA
 7549913 7549914 CLM_0064 CLM_0065   rrs FALSE 0.002 645.000 0.000 NA   NA
 7549915 7549916 CLM_0066 CLM_0067     TRUE 0.643 74.000 0.044 NA   NA
 7549917 7549918 CLM_0069 CLM_0071 rrf   TRUE 0.741 7.000 0.000 NA   NA
 7549918 7549919 CLM_0071 CLM_0072     FALSE 0.056 259.000 0.000 NA   NA
 7549919 7549920 CLM_0072 CLM_0073     FALSE 0.248 147.000 0.000 NA   NA
 7549920 7549921 CLM_0073 CLM_0074     FALSE 0.075 235.000 0.000 NA   NA
 7549921 7549922 CLM_0074 CLM_0076     FALSE 0.263 77.000 0.000 NA   NA
 7549922 7549923 CLM_0076 CLM_0077   rrs FALSE 0.002 719.000 0.000 NA   NA
 7549924 7549925 CLM_0078 CLM_0079     TRUE 0.643 74.000 0.044 NA   NA
 7549926 7549927 CLM_0081 CLM_0082 rrf   TRUE 0.741 7.000 0.000 NA   NA
 7549927 7549928 CLM_0082 CLM_0083     FALSE 0.263 140.000 0.000 NA   NA
 7549928 7549929 CLM_0083 CLM_0084   rrs FALSE 0.003 522.000 0.000 NA   NA
 7549929 7549930 CLM_0084 CLM_0087 rrs rrl FALSE 0.221 158.000 0.000 NA   NA
 7549930 7549931 CLM_0087 CLM_0088 rrl rrf FALSE 0.387 50.000 0.000 NA   NA
 7549931 7549932 CLM_0088 CLM_0089 rrf   FALSE 0.015 358.000 0.000 NA   NA
 7549932 7549933 CLM_0089 CLM_0090     FALSE 0.251 82.000 0.000 NA   NA
 7549934 7549935 CLM_0091 CLM_0092     TRUE 0.865 36.000 0.039 NA N NA
 7549938 7549939 CLM_0095 CLM_0096     TRUE 0.993 -21.000 0.120 NA   NA
 7549939 7549940 CLM_0096 CLM_0097     TRUE 0.919 24.000 0.034 1.000 N NA
 7549940 7549941 CLM_0097 CLM_0098     TRUE 0.597 81.000 0.034 NA   NA
 7549941 7549942 CLM_0098 CLM_0099     TRUE 0.865 18.000 0.018 NA   NA
 7549942 7549943 CLM_0099 CLM_0100     TRUE 0.985 2.000 0.372 NA   NA
 7549943 7549944 CLM_0100 CLM_0101     TRUE 0.881 12.000 0.011 NA   NA
 7549944 7549945 CLM_0101 CLM_0102     TRUE 0.835 82.000 0.333 1.000   NA
 7549945 7549946 CLM_0102 CLM_0103     FALSE 0.549 121.000 0.006 1.000   NA
 7549946 7549947 CLM_0103 CLM_0104     TRUE 0.940 20.000 0.078 0.006   NA
 7549947 7549948 CLM_0104 CLM_0105     FALSE 0.488 121.000 0.002 NA   NA
 7549950 7549951 CLM_0108 CLM_0109   arcA FALSE 0.008 423.000 0.000 1.000   NA
 7549952 7549953 CLM_0110 CLM_0111 ispF   FALSE 0.492 76.000 0.003 NA   NA
 7549956 7549957 CLM_0114 CLM_0115 spmA spmB TRUE 0.986 13.000 0.655 0.003   NA
 7549959 7549960 CLM_0117 CLM_0118 udgA   TRUE 0.879 29.000 0.016 1.000 N NA
 7549960 7549961 CLM_0118 CLM_0119   metG FALSE 0.024 382.000 0.000 1.000 N NA
 7549961 7549962 CLM_0119 CLM_0120 metG   FALSE 0.407 165.000 0.003 NA   NA
 7549962 7549963 CLM_0120 CLM_0121     FALSE 0.460 151.000 0.004 NA   NA
 7549963 7549964 CLM_0121 CLM_0122     FALSE 0.088 228.000 0.000 NA   NA
 7549964 7549965 CLM_0122 CLM_0123     TRUE 0.609 73.000 0.020 1.000   NA
 7549965 7549966 CLM_0123 CLM_0124   ksgA TRUE 0.976 2.000 0.093 1.000 N NA
 7549966 7549967 CLM_0124 CLM_0125 ksgA   FALSE 0.519 79.000 0.010 NA   NA
 7549967 7549968 CLM_0125 CLM_0126     TRUE 0.778 159.000 0.278 NA   NA
 7549968 7549969 CLM_0126 CLM_0127     TRUE 0.704 168.000 0.188 NA   NA
 7549969 7549970 CLM_0127 CLM_0128     TRUE 0.690 168.000 0.167 NA   NA
 7549970 7549971 CLM_0128 CLM_0129     TRUE 0.980 11.000 0.350 1.000 N NA
 7549971 7549972 CLM_0129 CLM_0130     TRUE 0.997 -3.000 0.349 NA Y NA
 7549972 7549973 CLM_0130 CLM_0131     TRUE 0.626 82.000 0.019 NA N NA
 7549973 7549974 CLM_0131 CLM_0132     FALSE 0.305 140.000 0.000 1.000   NA
 7549974 7549975 CLM_0132 CLM_0133     TRUE 0.663 15.000 0.000 NA   NA
 7549977 7549978 CLM_0135 CLM_0136     TRUE 0.687 57.000 0.037 NA   NA
 7549978 7549979 CLM_0136 CLM_0137   nrdD FALSE 0.037 290.000 0.000 NA   NA
 7549979 7549980 CLM_0137 CLM_0138 nrdD nrdG TRUE 0.977 17.000 0.315 0.001 N NA
 7549981 7549982 CLM_0139 CLM_0140     TRUE 0.970 2.000 0.111 NA   NA
 7549982 7549983 CLM_0140 CLM_0141     FALSE 0.271 120.000 0.000 NA   NA
 7549984 7549985 CLM_0142 CLM_0143 ileS   TRUE 0.595 151.000 0.009 1.000 N NA
 7549985 7549986 CLM_0143 CLM_0144     FALSE 0.374 216.000 0.017 1.000 N NA
 7549986 7549987 CLM_0144 CLM_0145     TRUE 0.818 75.000 0.160 1.000 N NA
 7549987 7549988 CLM_0145 CLM_0146     FALSE 0.019 336.000 0.000 NA   NA
 7549988 7549989 CLM_0146 CLM_0147     TRUE 0.946 5.000 0.066 NA   NA
 7549989 7549990 CLM_0147 CLM_0148     TRUE 0.953 20.000 0.210 1.000   NA
 7549990 7549991 CLM_0148 CLM_0149     FALSE 0.109 225.000 0.000 1.000   NA
 7549991 7549992 CLM_0149 CLM_0150     TRUE 0.733 187.000 0.333 1.000   NA
 7549994 7549995 CLM_0152 CLM_0153     TRUE 0.943 15.000 0.143 NA   NA
 7549995 7549996 CLM_0153 CLM_0154     TRUE 0.948 27.000 0.250 NA   NA
 7549996 7549997 CLM_0154 CLM_0155     TRUE 0.985 13.000 0.800 NA   NA
 7549999 7550000 CLM_0157 CLM_0158 cotS   TRUE 0.742 124.000 0.119 NA   NA
 7550000 7550001 CLM_0158 CLM_0159     FALSE 0.545 196.000 0.116 NA   NA
 7550001 7550002 CLM_0159 CLM_0160     TRUE 0.698 104.000 0.082 NA   NA
 7550002 7550003 CLM_0160 CLM_0161     FALSE 0.065 246.000 0.000 NA   NA
 7550003 7550004 CLM_0161 CLM_0162   cphB TRUE 0.952 -30.000 0.000 NA   NA
 7550004 7550005 CLM_0162 CLM_0163 cphB cphA TRUE 0.959 44.000 0.605 1.000 N NA
 7550005 7550006 CLM_0163 CLM_0164 cphA ispE TRUE 0.643 93.000 0.016 1.000 N NA
 7550006 7550007 CLM_0164 CLM_0165 ispE   FALSE 0.413 168.000 0.005 NA   NA
 7550007 7550008 CLM_0165 CLM_0166     TRUE 0.785 61.000 0.133 NA   NA
 7550008 7550009 CLM_0166 CLM_0167     TRUE 0.972 20.000 0.333 0.007   NA
 7550009 7550010 CLM_0167 CLM_0168     TRUE 0.942 50.000 0.500 0.007   NA
 7550010 7550011 CLM_0168 CLM_0169   spoIIR TRUE 0.730 74.000 0.109 NA   NA
 7550013 7550014 CLM_0171 CLM_0172 ypeB   FALSE 0.525 103.000 0.003 1.000   NA
 7550014 7550015 CLM_0172 CLM_0173     TRUE 0.843 25.000 0.011 NA   NA
 7550015 7550016 CLM_0173 CLM_0174     TRUE 0.630 132.000 0.039 NA   NA
 7550016 7550017 CLM_0174 CLM_0175   pyrG FALSE 0.189 234.000 0.004 NA   NA
 7550017 7550018 CLM_0175 CLM_0176 pyrG   FALSE 0.005 448.000 0.000 NA   NA
 7550018 7550019 CLM_0176 CLM_0177   rho FALSE 0.403 172.000 0.006 NA   NA
 7550021 7550022 CLM_0179 CLM_0180 tdk   TRUE 0.849 17.000 0.010 NA   NA
 7550022 7550023 CLM_0180 CLM_0181   prmC TRUE 0.950 8.000 0.098 NA   NA
 7550023 7550024 CLM_0181 CLM_0182 prmC prfA TRUE 0.883 82.000 0.081 1.000 Y NA
 7550024 7550025 CLM_0182 CLM_0183 prfA   TRUE 0.819 28.000 0.009 NA   NA
 7550025 7550026 CLM_0183 CLM_0184     TRUE 0.779 59.000 0.116 NA   NA
 7550026 7550027 CLM_0184 CLM_0185     TRUE 0.926 21.000 0.052 NA N NA
 7550027 7550028 CLM_0185 CLM_0186     TRUE 0.948 10.000 0.056 NA N NA
 7550028 7550029 CLM_0186 CLM_0187   rpiB TRUE 0.788 60.000 0.065 1.000 N NA
 7550029 7550030 CLM_0187 CLM_0188 rpiB upp TRUE 0.879 30.000 0.019 1.000 N NA
 7550032 7550033 CLM_0190 CLM_0191   tagO TRUE 0.697 108.000 0.029 1.000 N NA
 7550033 7550034 CLM_0191 CLM_0192 tagO mnaA TRUE 0.990 14.000 0.346 1.000 Y NA
 7550034 7550035 CLM_0192 CLM_0193 mnaA atpI FALSE 0.005 492.000 0.000 1.000   NA
 7550035 7550036 CLM_0193 CLM_0194 atpI atpB TRUE 0.967 15.000 0.330 1.000   NA
 7550036 7550037 CLM_0194 CLM_0195 atpB atpE TRUE 0.801 41.000 0.009 0.007   NA
 7550037 7550038 CLM_0195 CLM_0196 atpE atpF TRUE 0.773 76.000 0.095 0.007   NA
 7550038 7550039 CLM_0196 CLM_0197 atpF atpH TRUE 0.988 3.000 0.040 0.007 Y NA
 7550039 7550040 CLM_0197 CLM_0198 atpH atpA TRUE 0.997 11.000 0.864 0.007 Y NA
 7550040 7550041 CLM_0198 CLM_0199 atpA atpG TRUE 0.995 22.000 0.846 0.007 Y NA
 7550041 7550042 CLM_0199 CLM_0200 atpG atpD TRUE 0.995 14.000 0.724 0.007 Y NA
 7550042 7550043 CLM_0200 CLM_0201 atpD atpC TRUE 0.995 25.000 0.837 0.007 Y NA
 7550043 7550044 CLM_0201 CLM_0202 atpC   FALSE 0.333 193.000 0.007 NA   NA
 7550044 7550045 CLM_0202 CLM_0203   murA TRUE 0.962 24.000 0.346 NA   NA
 7550045 7550046 CLM_0203 CLM_0204 murA spoIID FALSE 0.443 268.000 0.243 1.000 N NA
 7550046 7550047 CLM_0204 CLM_0205 spoIID   FALSE 0.039 474.000 0.090 1.000 N NA
 7550047 7550048 CLM_0205 CLM_0206   spoIIID TRUE 0.730 108.000 0.093 1.000   NA
 7550048 7550049 CLM_0206 CLM_0207 spoIIID mbl TRUE 0.832 100.000 0.284 1.000   NA
 7550050 7550051 CLM_0208 CLM_0209     TRUE 0.670 49.000 0.010 NA   NA
 7550052 7550053 CLM_0210 CLM_0211     TRUE 0.759 5.000 0.000 NA   NA
 7550053 7550054 CLM_0211 CLM_0212     TRUE 0.700 12.000 0.000 NA   NA
 7550054 7550055 CLM_0212 CLM_0213     TRUE 0.644 17.000 0.000 NA   NA
 7550055 7550056 CLM_0213 CLM_0214     TRUE 0.759 5.000 0.000 NA   NA
 7550056 7550057 CLM_0214 CLM_0216   metK FALSE 0.026 310.000 0.000 NA   NA
 7550057 7550058 CLM_0216 CLM_0217 metK   FALSE 0.558 191.000 0.052 1.000 N NA
 7550058 7550059 CLM_0217 CLM_0218     TRUE 0.891 26.000 0.051 NA   NA
 7550059 7550060 CLM_0218 CLM_0219     TRUE 0.993 -27.000 0.130 NA   NA
 7550060 7550061 CLM_0219 CLM_0220   yfiA FALSE 0.039 425.000 0.080 NA   NA
 7550061 7550062 CLM_0220 CLM_0221 yfiA secA FALSE 0.390 228.000 0.050 NA N NA
 7550062 7550063 CLM_0221 CLM_0222 secA prfB FALSE 0.090 364.000 0.048 1.000 N NA
 7550065 7550066 CLM_0224 CLM_0226     FALSE 0.039 284.000 0.000 NA   NA
 7550066 7550067 CLM_0226 CLM_0227     FALSE 0.026 411.000 0.016 NA   NA
 7550067 7550068 CLM_0227 CLM_0228     TRUE 0.973 21.000 0.500 NA   NA
 7550068 7550069 CLM_0228 CLM_0229     TRUE 0.931 14.000 0.077 1.000   NA
 7550069 7550070 CLM_0229 CLM_0230     TRUE 0.575 84.000 0.022 1.000   NA
 7550070 7550071 CLM_0230 CLM_0231     TRUE 0.875 40.000 0.109 1.000   NA
 7550074 7550075 CLM_0234 CLM_0235 leuS   FALSE 0.023 377.000 0.000 NA N NA
 7550075 7550076 CLM_0235 CLM_0236     FALSE 0.070 239.000 0.000 NA   NA
 7550076 7550077 CLM_0236 CLM_0237     FALSE 0.362 53.000 0.000 NA   NA
 7550077 7550078 CLM_0237 CLM_0238     TRUE 0.631 25.000 0.000 NA   NA
 7550078 7550079 CLM_0238 CLM_0239     TRUE 0.936 -13.000 0.000 NA   NA
 7550079 7550080 CLM_0239 CLM_0240     TRUE 0.958 4.000 0.098 NA   NA
 7550082 7550083 CLM_0242 CLM_0243 fba   FALSE 0.105 214.000 0.000 NA   NA
 7550083 7550084 CLM_0243 CLM_0244     TRUE 0.698 117.000 0.082 NA   NA
 7550085 7550086 CLM_0245 CLM_0246     FALSE 0.543 138.000 0.013 NA   NA
 7550088 7550089 CLM_0248 CLM_0249     TRUE 0.730 106.000 0.094 1.000   NA
 7550089 7550090 CLM_0249 CLM_0250     TRUE 0.827 74.000 0.281 NA   NA
 7550092 7550093 CLM_0253 CLM_0254   sleB FALSE 0.370 229.000 0.041 0.064   NA
 7550093 7550094 CLM_0254 CLM_0255 sleB cysK FALSE 0.017 364.000 0.000 1.000   NA
 7550094 7550095 CLM_0255 CLM_0256 cysK cysE TRUE 0.984 15.000 0.101 0.002 Y NA
 7550095 7550096 CLM_0256 CLM_0257 cysE   TRUE 0.936 22.000 0.064 1.000 N NA
 7550096 7550097 CLM_0257 CLM_0258   plsD TRUE 0.720 148.000 0.064 1.000 N NA
 7550097 7550098 CLM_0258 CLM_0259 plsD nth TRUE 0.624 93.000 0.011 1.000 N NA
 7550098 7550099 CLM_0259 CLM_0260 nth   FALSE 0.089 275.000 0.000 1.000 N NA
 7550100 7550101 CLM_0261 CLM_0262     TRUE 0.831 26.000 0.004 1.000   NA
 7550101 7550102 CLM_0262 CLM_0263     TRUE 0.572 110.000 0.018 NA   NA
 7550103 7550104 CLM_0264 CLM_0265     FALSE 0.503 205.000 0.000 NA Y NA
 7550104 7550105 CLM_0265 CLM_0266   splB TRUE 0.663 147.000 0.027 1.000 N NA
 7550105 7550106 CLM_0266 CLM_0267 splB   TRUE 0.640 128.000 0.008 1.000 N NA
 7550106 7550107 CLM_0267 CLM_0268     TRUE 0.883 13.000 0.016 NA   NA
 7550107 7550108 CLM_0268 CLM_0269     FALSE 0.036 294.000 0.000 NA   NA
 7550108 7550109 CLM_0269 CLM_0270     TRUE 0.651 166.000 0.097 1.000   NA
 7550109 7550110 CLM_0270 CLM_0271     TRUE 0.988 2.000 0.438 1.000   NA
 7550110 7550111 CLM_0271 CLM_0272     TRUE 0.997 -7.000 0.720 0.034   NA
 7550111 7550112 CLM_0272 CLM_0273     FALSE 0.553 112.000 0.007 1.000   NA
 7550112 7550113 CLM_0273 CLM_0274   rpoN FALSE 0.184 329.000 0.125 1.000 N NA
 7550113 7550114 CLM_0274 CLM_0275 rpoN cggR FALSE 0.407 288.000 0.034 1.000 Y NA
 7550114 7550115 CLM_0275 CLM_0276 cggR gap TRUE 0.872 78.000 0.348 1.000 N NA
 7550115 7550116 CLM_0276 CLM_0277 gap pgk FALSE 0.471 297.000 0.063 0.004 Y NA
 7550116 7550117 CLM_0277 CLM_0278 pgk tpiA TRUE 0.927 62.000 0.141 1.000 Y NA
 7550117 7550118 CLM_0278 CLM_0279 tpiA gpmI TRUE 0.906 92.000 0.138 1.000 Y NA
 7550118 7550119 CLM_0279 CLM_0280 gpmI eno TRUE 0.884 56.000 0.016 1.000 Y NA
 7550119 7550120 CLM_0280 CLM_0281 eno secG FALSE 0.317 223.000 0.006 1.000 N NA
 7550120 7550121 CLM_0281 CLM_0282 secG rnr FALSE 0.499 209.000 0.064 1.000 N NA
 7550121 7550122 CLM_0282 CLM_0283 rnr surE FALSE 0.010 409.000 0.000 1.000   NA
 7550122 7550123 CLM_0283 CLM_0284 surE smpB FALSE 0.069 257.000 0.000 1.000   NA
 7550124 7550125 CLM_0285 CLM_0286     FALSE 0.002 1443.000 0.000 1.000   NA
 7550126 7550127 CLM_0287 CLM_0288     FALSE 0.005 497.000 0.000 1.000   NA
 7550127 7550128 CLM_0288 CLM_0289     FALSE 0.371 52.000 0.000 NA   NA
 7550128 7550129 CLM_0289 CLM_0290     FALSE 0.233 152.000 0.000 NA   NA
 7550129 7550130 CLM_0290 CLM_0291     FALSE 0.189 185.000 0.000 1.000   NA
 7550130 7550131 CLM_0291 CLM_0292     FALSE 0.152 188.000 0.000 NA   NA
 7550131 7550132 CLM_0292 CLM_0294     FALSE 0.015 359.000 0.000 NA   NA
 7550132 7550133 CLM_0294 CLM_0295     FALSE 0.114 221.000 0.000 1.000   NA
 7550133 7550134 CLM_0295 CLM_0296     TRUE 0.946 128.000 1.000 1.000 N NA
 7550134 7550135 CLM_0296 CLM_0297     TRUE 0.996 -7.000 0.667 NA   NA
 7550135 7550136 CLM_0297 CLM_0298     TRUE 0.891 88.000 0.667 NA   NA
 7550136 7550137 CLM_0298 CLM_0299     FALSE 0.280 178.000 0.000 NA N NA
 7550137 7550138 CLM_0299 CLM_0300     FALSE 0.018 343.000 0.000 NA   NA
 7550138 7550139 CLM_0300 CLM_0302     FALSE 0.003 545.000 0.000 NA   NA
 7550139 7550140 CLM_0302 CLM_0303     FALSE 0.004 544.000 0.000 1.000   NA
 7550140 7550141 CLM_0303 CLM_0304     FALSE 0.314 114.000 0.000 1.000   NA
 7550141 7550142 CLM_0304 CLM_0305     TRUE 0.666 26.000 0.000 1.000   NA
 7550142 7550143 CLM_0305 CLM_0306     FALSE 0.064 263.000 0.000 1.000   NA
 7550143 7550144 CLM_0306 CLM_0307     TRUE 0.899 26.000 0.050 1.000   NA
 7550144 7550145 CLM_0307 CLM_0308     TRUE 0.805 63.000 0.095 1.000 N NA
 7550145 7550146 CLM_0308 CLM_0309     FALSE 0.273 124.000 0.000 NA   NA
 7550148 7550149 CLM_0311 CLM_0313     TRUE 0.863 0.000 0.000 NA   NA
 7550150 7550151 CLM_0314 CLM_0315 spoVAE spoVAD TRUE 0.976 23.000 0.600 NA   NA
 7550151 7550152 CLM_0315 CLM_0316 spoVAD spoVAC TRUE 0.993 1.000 0.750 NA   NA
 7550152 7550153 CLM_0316 CLM_0317 spoVAC   TRUE 0.984 13.000 0.750 NA   NA
 7550153 7550154 CLM_0317 CLM_0318     TRUE 0.986 13.000 0.857 NA   NA
 7550155 7550156 CLM_0319 CLM_0320     FALSE 0.004 501.000 0.000 NA   NA
 7550156 7550157 CLM_0320 CLM_0321     TRUE 0.957 11.000 0.167 NA   NA
 7550157 7550158 CLM_0321 CLM_0322     TRUE 0.988 22.000 0.318 1.000 Y NA
 7550158 7550159 CLM_0322 CLM_0323     TRUE 0.940 25.000 0.091 1.000 N NA
 7550159 7550160 CLM_0323 CLM_0324     TRUE 0.938 137.000 0.278 1.000 Y NA
 7550162 7550163 CLM_0326 CLM_0327     TRUE 0.919 162.000 0.294 1.000 Y NA
 7550164 7550165 CLM_0328 CLM_0329     TRUE 0.993 16.000 0.500 0.004 Y NA
 7550166 7550167 CLM_0330 CLM_0331     FALSE 0.429 98.000 0.000 1.000 N NA
 7550167 7550168 CLM_0331 CLM_0332     TRUE 0.990 10.000 0.235 1.000 Y NA
 7550168 7550169 CLM_0332 CLM_0333     TRUE 0.880 120.000 0.353 1.000 N NA
 7550169 7550170 CLM_0333 CLM_0334     TRUE 0.964 14.000 0.286 NA   NA
 7550170 7550171 CLM_0334 CLM_0335     FALSE 0.006 428.000 0.000 NA   NA
 7550171 7550172 CLM_0335 CLM_0336   glvA FALSE 0.127 343.000 0.000 1.000 Y NA
 7550172 7550173 CLM_0336 CLM_0337 glvA   TRUE 0.640 175.000 0.000 1.000 Y NA
 7550173 7550174 CLM_0337 CLM_0338     FALSE 0.056 305.000 0.000 1.000 N NA
 7550176 7550177 CLM_0340 CLM_0341     FALSE 0.018 342.000 0.000 NA   NA
 7550177 7550178 CLM_0341 CLM_0342     FALSE 0.006 435.000 0.000 NA   NA
 7550178 7550179 CLM_0342 CLM_0343     TRUE 0.773 152.000 0.158 NA N NA
 7550179 7550180 CLM_0343 CLM_0344     TRUE 0.881 27.000 0.035 1.000   NA
 7550180 7550181 CLM_0344 CLM_0345     FALSE 0.007 438.000 0.000 1.000   NA
 7550181 7550182 CLM_0345 CLM_0346     TRUE 0.884 119.000 0.385 1.000 N NA
 7550182 7550183 CLM_0346 CLM_0347   glvA FALSE 0.319 396.000 0.385 1.000 Y NA
 7550183 7550184 CLM_0347 CLM_0348 glvA   TRUE 0.990 13.000 0.375 1.000 Y NA
 7550184 7550185 CLM_0348 CLM_0349   ilvD TRUE 0.938 138.000 0.286 1.000 Y NA
 7550185 7550186 CLM_0349 CLM_0350 ilvD eda TRUE 0.942 52.000 0.091 0.063 Y NA
 7550186 7550187 CLM_0350 CLM_0351 eda   TRUE 0.990 2.000 0.091 1.000 Y NA
 7550187 7550188 CLM_0351 CLM_0352   ade FALSE 0.235 201.000 0.000 1.000 N NA
 7550188 7550189 CLM_0352 CLM_0353 ade   FALSE 0.018 402.000 0.000 1.000 N NA
 7550189 7550190 CLM_0353 CLM_0354     TRUE 0.999 -3.000 0.889 1.000 Y NA
 7550190 7550191 CLM_0354 CLM_0355     FALSE 0.060 396.000 0.049 NA N NA
 7550191 7550192 CLM_0355 CLM_0356     TRUE 0.996 -16.000 0.400 NA   NA
 7550192 7550193 CLM_0356 CLM_0357     TRUE 0.911 119.000 0.750 NA   NA
 7550193 7550194 CLM_0357 CLM_0358     FALSE 0.015 356.000 0.000 NA   NA
 7550194 7550195 CLM_0358 CLM_0359     FALSE 0.101 265.000 0.000 1.000 N NA
 7550195 7550196 CLM_0359 CLM_0361     TRUE 0.786 3.000 0.000 NA   NA
 7550196 7550197 CLM_0361 CLM_0362     TRUE 0.815 2.000 0.000 NA   NA
 7550197 7550198 CLM_0362 CLM_0363     TRUE 0.938 34.000 0.200 1.000 N NA
 7550198 7550199 CLM_0363 CLM_0364     FALSE 0.004 491.000 0.000 NA   NA
 7550199 7550200 CLM_0364 CLM_0365     TRUE 0.673 14.000 0.000 NA   NA
 7550200 7550201 CLM_0365 CLM_0366     TRUE 0.789 24.000 0.000 1.000 N NA
 7550201 7550202 CLM_0366 CLM_0367     FALSE 0.113 257.000 0.000 1.000 N NA
 7550202 7550203 CLM_0367 CLM_0368     TRUE 0.700 12.000 0.000 NA   NA
 7550203 7550204 CLM_0368 CLM_0369     FALSE 0.002 748.000 0.000 NA   NA
 7550204 7550205 CLM_0369 CLM_0370   panD FALSE 0.318 175.000 0.000 1.000 N NA
 7550205 7550206 CLM_0370 CLM_0371 panD   FALSE 0.377 157.000 0.000 1.000 N NA
 7550206 7550207 CLM_0371 CLM_0372     FALSE 0.255 93.000 0.000 NA   NA
 7550207 7550208 CLM_0372 CLM_0373     TRUE 0.650 21.000 0.000 NA   NA
 7550208 7550209 CLM_0373 CLM_0374     TRUE 0.801 110.000 0.000 0.002 Y NA
 7550209 7550210 CLM_0374 CLM_0375     TRUE 0.790 141.000 0.000 0.002 Y NA
 7550210 7550211 CLM_0375 CLM_0376     FALSE 0.276 151.000 0.000 1.000   NA
 7550213 7550214 CLM_0378 CLM_0379     FALSE 0.528 203.000 0.000 1.000 Y NA
 7550214 7550215 CLM_0379 CLM_0380     TRUE 0.988 -3.000 0.000 0.033 Y NA
 7550215 7550216 CLM_0380 CLM_0381     TRUE 0.900 34.000 0.000 1.000 Y NA
 7550216 7550217 CLM_0381 CLM_0382     TRUE 0.990 -3.000 0.150 1.000 N NA
 7550217 7550218 CLM_0382 CLM_0384     FALSE 0.010 502.000 0.000 0.047 N NA
 7550218 7550219 CLM_0384 CLM_0385   xpt TRUE 0.969 23.000 0.032 1.000 Y NA
 7550219 7550220 CLM_0385 CLM_0386 xpt   FALSE 0.011 448.000 0.000 1.000 N NA
 7550220 7550221 CLM_0386 CLM_0387     TRUE 0.996 13.000 1.000 1.000 Y NA
 7550221 7550222 CLM_0387 CLM_0388   uppP TRUE 0.762 176.000 0.222 1.000 N NA
 7550222 7550223 CLM_0388 CLM_0389 uppP   TRUE 0.989 15.000 0.333 1.000 Y NA
 7550223 7550224 CLM_0389 CLM_0390     TRUE 0.994 0.000 0.750 NA   NA
 7550224 7550225 CLM_0390 CLM_0391     FALSE 0.274 125.000 0.000 NA   NA
 7550225 7550226 CLM_0391 CLM_0392     FALSE 0.026 327.000 0.000 1.000   NA
 7550226 7550227 CLM_0392 CLM_0393     TRUE 0.992 3.000 0.869 NA   NA
 7550227 7550228 CLM_0393 CLM_0394     FALSE 0.034 296.000 0.000 NA   NA
 7550228 7550229 CLM_0394 CLM_0395     FALSE 0.013 369.000 0.000 NA   NA
 7550229 7550230 CLM_0395 CLM_0396     FALSE 0.521 135.000 0.006 NA   NA
 7550230 7550231 CLM_0396 CLM_0397     FALSE 0.022 324.000 0.000 NA   NA
 7550231 7550232 CLM_0397 CLM_0398     TRUE 0.881 179.000 1.000 NA   NA
 7550232 7550233 CLM_0398 CLM_0399     TRUE 0.995 -7.000 0.556 NA   NA
 7550233 7550234 CLM_0399 CLM_0400     TRUE 0.997 -16.000 0.556 NA   NA
 7550234 7550235 CLM_0400 CLM_0401     TRUE 0.784 72.000 0.179 NA   NA
 7550235 7550236 CLM_0401 CLM_0402     FALSE 0.159 231.000 0.000 1.000 N NA
 7550236 7550237 CLM_0402 CLM_0403     FALSE 0.009 398.000 0.000 NA   NA
 7550237 7550238 CLM_0403 CLM_0404     TRUE 0.974 27.000 0.667 NA   NA
 7550238 7550239 CLM_0404 CLM_0405     FALSE 0.055 260.000 0.000 NA   NA
 7550239 7550240 CLM_0405 CLM_0406     TRUE 0.998 -13.000 1.000 NA   NA
 7550240 7550241 CLM_0406 CLM_0407     TRUE 0.924 95.000 1.000 NA   NA
 7550241 7550242 CLM_0407 CLM_0408     TRUE 0.921 83.000 1.000 NA   NA
 7550242 7550243 CLM_0408 CLM_0409     FALSE 0.139 232.000 0.000 NA N NA
 7550245 7550246 CLM_0411 CLM_0412     TRUE 0.965 119.000 0.667 1.000 Y NA
 7550246 7550247 CLM_0412 CLM_0413   adhE FALSE 0.017 407.000 0.000 1.000 N NA
 7550247 7550248 CLM_0413 CLM_0414 adhE   FALSE 0.024 319.000 0.000 NA   NA
 7550248 7550249 CLM_0414 CLM_0415     TRUE 0.613 63.000 0.019 NA   NA
 7550250 7550251 CLM_0416 CLM_0417     FALSE 0.063 248.000 0.000 NA   NA
 7550252 7550253 CLM_0418 CLM_0419     FALSE 0.004 554.000 0.000 1.000   NA
 7550253 7550254 CLM_0419 CLM_0420     TRUE 0.713 108.000 0.038 1.000 N NA
 7550254 7550255 CLM_0420 CLM_0421     TRUE 0.979 10.000 0.038 1.000 Y NA
 7550255 7550256 CLM_0421 CLM_0422     TRUE 0.741 63.000 0.091 NA   NA
 7550256 7550257 CLM_0422 CLM_0423     TRUE 0.831 44.000 0.087 NA   NA
 7550257 7550258 CLM_0423 CLM_0424     TRUE 0.912 26.000 0.087 NA   NA
 7550259 7550260 CLM_0425 CLM_0426     FALSE 0.017 345.000 0.000 NA   NA
 7550261 7550262 CLM_0427 CLM_0428     FALSE 0.174 192.000 0.000 1.000   NA
 7550262 7550263 CLM_0428 CLM_0429     FALSE 0.031 312.000 0.000 1.000   NA
 7550265 7550266 CLM_0431 CLM_0432     FALSE 0.553 131.000 0.013 NA   NA
 7550266 7550267 CLM_0432 CLM_0433     TRUE 0.994 -54.000 0.105 1.000   NA
 7550267 7550268 CLM_0433 CLM_0434     TRUE 0.999 -10.000 0.429 1.000 Y NA
 7550268 7550269 CLM_0434 CLM_0435     FALSE 0.443 108.000 0.000 1.000 N NA
 7550269 7550270 CLM_0435 CLM_0436     FALSE 0.003 1230.000 0.000 1.000 N NA
 7550270 7550271 CLM_0436 CLM_0437     TRUE 0.991 23.000 0.431 0.048 Y NA
 7550271 7550272 CLM_0437 CLM_0438     TRUE 0.998 0.000 0.678 0.048 Y NA
 7550272 7550273 CLM_0438 CLM_0439     TRUE 0.986 11.000 0.091 0.048 Y NA
 7550273 7550274 CLM_0439 CLM_0440     TRUE 0.963 51.000 0.237 0.048 Y NA
 7550274 7550275 CLM_0440 CLM_0441     TRUE 0.988 14.000 0.221 0.048 Y NA
 7550275 7550276 CLM_0441 CLM_0442     FALSE 0.014 362.000 0.000 NA   NA
 7550277 7550278 CLM_0443 CLM_0444     TRUE 0.907 18.000 0.059 NA   NA
 7550278 7550279 CLM_0444 CLM_0445     TRUE 0.806 114.000 0.231 NA   NA
 7550280 7550281 CLM_0446 CLM_0447     FALSE 0.004 486.000 0.000 NA   NA
 7550281 7550282 CLM_0447 CLM_0448     TRUE 0.894 93.000 0.667 NA   NA
 7550282 7550283 CLM_0448 CLM_0449     FALSE 0.023 321.000 0.000 NA   NA
 7550287 7550288 CLM_0453 CLM_0454     FALSE 0.010 395.000 0.000 NA   NA
 7550288 7550289 CLM_0454 CLM_0455     TRUE 0.649 205.000 0.014 NA Y NA
 7550289 7550290 CLM_0455 CLM_0456     TRUE 0.960 36.000 0.040 0.003 Y NA
 7550290 7550291 CLM_0456 CLM_0457     TRUE 0.995 2.000 0.270 0.003 Y NA
 7550291 7550292 CLM_0457 CLM_0458     TRUE 0.840 121.000 0.294 1.000   NA
 7550292 7550293 CLM_0458 CLM_0459     FALSE 0.019 355.000 0.000 1.000   NA
 7550295 7550296 CLM_0461 CLM_0462     TRUE 0.818 78.000 0.286 NA   NA
 7550296 7550297 CLM_0462 CLM_0463     TRUE 0.796 87.000 0.250 NA   NA
 7550297 7550298 CLM_0463 CLM_0464     FALSE 0.058 254.000 0.000 NA   NA
 7550298 7550299 CLM_0464 CLM_0466     TRUE 0.651 64.000 0.034 NA   NA
 7550301 7550302 CLM_0467 CLM_0468     TRUE 0.710 137.000 0.079 1.000   NA
 7550303 7550304 CLM_0469 CLM_0470     FALSE 0.003 960.000 0.000 1.000 N NA
 7550305 7550306 CLM_0471 CLM_0472   rnhA TRUE 0.980 -25.000 0.003 NA   NA
 7550306 7550307 CLM_0472 CLM_0473 rnhA   FALSE 0.539 63.000 0.003 NA   NA
 7550307 7550308 CLM_0473 CLM_0474     TRUE 0.764 182.000 0.400 NA   NA
 7550308 7550309 CLM_0474 CLM_0475     TRUE 0.962 32.000 0.400 0.031   NA
 7550309 7550310 CLM_0475 CLM_0476     FALSE 0.006 445.000 0.000 NA   NA
 7550310 7550311 CLM_0476 CLM_0477     TRUE 0.882 31.000 0.074 NA   NA
 7550313 7550314 CLM_0479 CLM_0480   clpB FALSE 0.014 364.000 0.000 NA   NA
 7550315 7550316 CLM_0481 CLM_0482     TRUE 0.937 58.000 0.796 1.000   NA
 7550317 7550318 CLM_0483 CLM_0484 manA   FALSE 0.016 349.000 0.000 NA   NA
 7550318 7550319 CLM_0484 CLM_0485     TRUE 0.881 108.000 0.500 NA   NA
 7550319 7550320 CLM_0485 CLM_0486   rrs FALSE 0.008 410.000 0.000 NA   NA
 7550320 7550321 CLM_0486 CLM_0487 rrs   FALSE 0.256 143.000 0.000 NA   NA
 7550321 7550322 CLM_0487 CLM_0488     TRUE 0.759 5.000 0.000 NA   NA
 7550323 7550324 CLM_0489 CLM_0490     TRUE 0.643 74.000 0.044 NA   NA
 7550325 7550326 CLM_0492 CLM_0493 rrf   TRUE 0.736 8.000 0.000 NA   NA
 7550328 7550329 CLM_0495 CLM_0496     FALSE 0.004 746.000 0.000 1.000 N NA
 7550329 7550330 CLM_0496 CLM_0497     TRUE 0.711 144.000 0.027 0.062 N NA
 7550330 7550331 CLM_0497 CLM_0498     TRUE 0.764 203.000 0.054 0.062 Y NA
 7550331 7550332 CLM_0498 CLM_0499     FALSE 0.343 250.000 0.000 1.000 Y NA
 7550332 7550333 CLM_0499 CLM_0501     FALSE 0.006 523.000 0.000 NA N NA
 7550334 7550335 CLM_0502 CLM_0503   panD FALSE 0.472 88.000 0.004 NA   NA
 7550335 7550336 CLM_0503 CLM_0504 panD panC TRUE 0.945 126.000 0.342 1.000 Y NA
 7550336 7550337 CLM_0504 CLM_0505 panC panB TRUE 0.971 55.000 0.395 0.001 Y NA
 7550340 7550341 CLM_0508 CLM_0509     TRUE 0.989 3.000 0.667 NA   NA
 7550343 7550344 CLM_0511 CLM_0512 hypB   FALSE 0.450 236.000 0.115 1.000 N NA
 7550344 7550345 CLM_0512 CLM_0513   hypA TRUE 0.884 56.000 0.333 1.000   NA
 7550345 7550346 CLM_0513 CLM_0514 hypA   TRUE 0.910 38.000 0.214 NA   NA
 7550348 7550349 CLM_0516 CLM_0518   addA FALSE 0.221 158.000 0.000 NA   NA
 7550349 7550350 CLM_0518 CLM_0519 addA   TRUE 0.631 140.000 0.010 1.000 N NA
 7550350 7550351 CLM_0519 CLM_0520   pepT TRUE 0.731 77.000 0.056 1.000 N NA
 7550353 7550354 CLM_0522 CLM_0523     FALSE 0.118 206.000 0.000 NA   NA
 7550354 7550355 CLM_0523 CLM_0524     FALSE 0.387 50.000 0.000 NA   NA
 7550355 7550356 CLM_0524 CLM_0525     FALSE 0.273 105.000 0.000 NA   NA
 7550356 7550357 CLM_0525 CLM_0526     FALSE 0.107 213.000 0.000 NA   NA
 7550358 7550359 CLM_0527 CLM_0528     TRUE 0.993 13.000 0.461 0.046 Y NA
 7550361 7550362 CLM_0530 CLM_0531   thiE FALSE 0.089 265.000 0.000 NA N NA
 7550362 7550363 CLM_0531 CLM_0532 thiE thiM TRUE 0.998 -9.000 0.190 0.005 Y NA
 7550363 7550364 CLM_0532 CLM_0533 thiM thiD TRUE 0.669 231.000 0.039 0.005 Y NA
 7550365 7550366 CLM_0535 CLM_0536 ddlB   FALSE 0.555 156.000 0.004 1.000 N NA
 7550366 7550367 CLM_0536 CLM_0537     TRUE 0.991 4.000 0.182 1.000 Y NA
 7550367 7550368 CLM_0537 CLM_0538     TRUE 0.996 1.000 0.241 0.033 Y NA
 7550368 7550369 CLM_0538 CLM_0539     TRUE 0.986 12.000 0.167 1.000 Y NA
 7550369 7550370 CLM_0539 CLM_0540     TRUE 0.990 2.000 0.048 0.035 Y NA
 7550370 7550371 CLM_0540 CLM_0541     TRUE 0.938 29.000 0.222 NA   NA
 7550371 7550372 CLM_0541 CLM_0542     FALSE 0.009 402.000 0.000 NA   NA
 7550372 7550373 CLM_0542 CLM_0543     TRUE 0.995 -6.000 0.500 NA   NA
 7550373 7550374 CLM_0543 CLM_0544     FALSE 0.258 142.000 0.000 NA   NA
 7550374 7550375 CLM_0544 CLM_0545     TRUE 0.570 61.000 0.007 NA   NA
 7550375 7550376 CLM_0545 CLM_0546     TRUE 0.722 10.000 0.000 NA   NA
 7550376 7550377 CLM_0546 CLM_0547     FALSE 0.003 518.000 0.000 NA   NA
 7550377 7550378 CLM_0547 CLM_0548     FALSE 0.127 274.000 0.010 NA   NA
 7550378 7550379 CLM_0548 CLM_0549     FALSE 0.538 134.000 0.010 NA   NA
 7550379 7550380 CLM_0549 CLM_0550     FALSE 0.522 176.000 0.050 NA   NA
 7550380 7550381 CLM_0550 CLM_0551     TRUE 0.945 2.000 0.025 NA   NA
 7550382 7550383 CLM_0552 CLM_0553     TRUE 0.650 21.000 0.000 NA   NA
 7550384 7550385 CLM_0554 CLM_0555   sbcD FALSE 0.064 247.000 0.000 NA   NA
 7550385 7550386 CLM_0555 CLM_0556 sbcD sbcC TRUE 0.998 -25.000 0.669 NA N NA
 7550386 7550387 CLM_0556 CLM_0557 sbcC   TRUE 0.804 28.000 0.005 NA   NA
 7550387 7550388 CLM_0557 CLM_0558     FALSE 0.002 829.000 0.000 NA   NA
 7550390 7550391 CLM_0560 CLM_0561   cadA TRUE 0.730 76.000 0.053 1.000 N NA
 7550391 7550392 CLM_0561 CLM_0562 cadA   FALSE 0.007 420.000 0.000 NA   NA
 7550392 7550393 CLM_0562 CLM_0563     FALSE 0.002 726.000 0.000 NA   NA
 7550393 7550394 CLM_0563 CLM_0564     FALSE 0.274 133.000 0.000 NA   NA
 7550394 7550395 CLM_0564 CLM_0565     FALSE 0.483 39.000 0.000 NA   NA
 7550395 7550396 CLM_0565 CLM_0566     FALSE 0.003 528.000 0.000 NA   NA
 7550398 7550399 CLM_0568 CLM_0569     FALSE 0.002 639.000 0.000 NA   NA
 7550399 7550400 CLM_0569 CLM_0570     FALSE 0.085 268.000 0.000 NA N NA
 7550400 7550401 CLM_0570 CLM_0571     TRUE 0.985 10.000 0.667 NA   NA
 7550401 7550402 CLM_0571 CLM_0572     FALSE 0.024 320.000 0.000 NA   NA
 7550402 7550403 CLM_0572 CLM_0573   sagB TRUE 0.734 165.000 0.222 NA   NA
 7550403 7550404 CLM_0573 CLM_0574 sagB   TRUE 0.973 4.000 0.222 NA   NA
 7550404 7550405 CLM_0574 CLM_0575   sagD TRUE 0.962 16.000 0.318 NA   NA
 7550405 7550406 CLM_0575 CLM_0576 sagD   TRUE 0.992 -25.000 0.091 NA   NA
 7550406 7550407 CLM_0576 CLM_0577     TRUE 0.990 8.000 1.000 NA   NA
 7550407 7550408 CLM_0577 CLM_0578   sagG FALSE 0.026 309.000 0.000 NA   NA
 7550408 7550409 CLM_0578 CLM_0580 sagG sagH TRUE 0.983 12.000 0.500 NA N NA
 7550409 7550410 CLM_0580 CLM_0581 sagH sagI TRUE 0.980 2.000 0.160 NA N NA
 7550410 7550411 CLM_0581 CLM_0582 sagI   FALSE 0.081 244.000 0.000 1.000   NA
 7550411 7550412 CLM_0582 CLM_0583     FALSE 0.072 253.000 0.000 1.000   NA
 7550412 7550413 CLM_0583 CLM_0584     TRUE 0.966 166.000 0.857 0.023 Y NA
 7550413 7550414 CLM_0584 CLM_0585     FALSE 0.014 422.000 0.000 1.000 N NA
 7550414 7550415 CLM_0585 CLM_0586     TRUE 0.983 12.000 0.500 NA N NA
 7550415 7550416 CLM_0586 CLM_0587     TRUE 0.996 0.000 0.280 NA Y NA
 7550417 7550418 CLM_0588 CLM_0589     TRUE 0.864 118.000 0.409 NA   NA
 7550418 7550419 CLM_0589 CLM_0590     TRUE 0.711 127.000 0.091 NA   NA
 7550420 7550421 CLM_0591 CLM_0592 trmB   FALSE 0.107 213.000 0.000 NA   NA
 7550423 7550424 CLM_0594 CLM_0595     FALSE 0.480 63.000 0.000 1.000 N NA
 7550426 7550427 CLM_0597 CLM_0598     FALSE 0.094 262.000 0.000 NA N NA
 7550427 7550428 CLM_0598 CLM_0599     FALSE 0.040 297.000 0.000 1.000   NA
 7550428 7550429 CLM_0599 CLM_0600     TRUE 0.948 36.000 0.400 1.000   NA
 7550429 7550430 CLM_0600 CLM_0601     FALSE 0.523 205.000 0.000 1.000 Y NA
 7550430 7550431 CLM_0601 CLM_0602   serS FALSE 0.009 482.000 0.000 1.000 N NA
 7550431 7550432 CLM_0602 CLM_0603 serS   FALSE 0.006 595.000 0.000 1.000 N NA
 7550433 7550434 CLM_0604 CLM_0605     FALSE 0.005 493.000 0.000 1.000   NA
 7550437 7550438 CLM_0608 CLM_0609     FALSE 0.128 201.000 0.000 NA   NA
 7550442 7550443 CLM_0613 CLM_0614     FALSE 0.003 657.000 0.000 1.000   NA
 7550443 7550444 CLM_0614 CLM_0615     TRUE 0.654 38.000 0.000 0.022   NA
 7550444 7550445 CLM_0615 CLM_0616     FALSE 0.115 207.000 0.000 NA   NA
 7550445 7550446 CLM_0616 CLM_0617     TRUE 0.571 30.000 0.000 NA   NA
 7550446 7550447 CLM_0617 CLM_0618     FALSE 0.136 198.000 0.000 NA   NA
 7550447 7550448 CLM_0618 CLM_0619     TRUE 0.995 -13.000 0.250 1.000   NA
 7550448 7550449 CLM_0619 CLM_0620     TRUE 0.609 45.000 0.000 1.000 N NA
 7550449 7550450 CLM_0620 CLM_0621     TRUE 0.998 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 7550450 7550451 CLM_0621 CLM_0622     FALSE 0.281 186.000 0.000 1.000 N NA
 7550451 7550452 CLM_0622 CLM_0623     TRUE 0.673 14.000 0.000 NA   NA
 7550453 7550454 CLM_0624 CLM_0625     FALSE 0.245 148.000 0.000 NA   NA
 7550457 7550458 CLM_0628 CLM_0629     FALSE 0.002 624.000 0.000 NA   NA
 7550458 7550459 CLM_0629 CLM_0630     FALSE 0.059 438.000 0.000 0.005 Y NA
 7550459 7550460 CLM_0630 CLM_0631     FALSE 0.020 348.000 0.000 1.000   NA
 7550460 7550461 CLM_0631 CLM_0632     TRUE 0.712 45.000 0.008 1.000   NA
 7550462 7550463 CLM_0633 CLM_0635     FALSE 0.229 294.000 0.000 1.000 Y NA
 7550463 7550464 CLM_0635 CLM_0636     TRUE 0.998 0.000 0.455 0.001 Y NA
 7550465 7550466 CLM_0637 CLM_0638     FALSE 0.005 447.000 0.000 NA   NA
 7550468 7550469 CLM_0640 CLM_0641     TRUE 0.993 3.000 0.313 NA Y NA
 7550469 7550470 CLM_0641 CLM_0642     FALSE 0.416 46.000 0.000 NA   NA
 7550470 7550471 CLM_0642 CLM_0643   pepP FALSE 0.005 471.000 0.000 NA   NA
 7550472 7550473 CLM_0644 CLM_0645     FALSE 0.007 418.000 0.000 NA   NA
 7550473 7550474 CLM_0645 CLM_0646     FALSE 0.283 149.000 0.000 1.000   NA
 7550475 7550476 CLM_0647 CLM_0648     FALSE 0.005 472.000 0.000 NA   NA
 7550476 7550477 CLM_0648 CLM_0649     FALSE 0.165 182.000 0.000 NA   NA
 7550477 7550478 CLM_0649 CLM_0650     FALSE 0.265 99.000 0.000 NA   NA
 7550478 7550479 CLM_0650 CLM_0651     FALSE 0.048 268.000 0.000 NA   NA
 7550479 7550480 CLM_0651 CLM_0652     TRUE 0.957 12.000 0.184 NA   NA
 7550480 7550481 CLM_0652 CLM_0653     FALSE 0.003 582.000 0.000 NA   NA
 7550481 7550482 CLM_0653 CLM_0654     FALSE 0.002 920.000 0.000 NA   NA
 7550484 7550485 CLM_0656 CLM_0658 mscL   FALSE 0.070 239.000 0.000 NA   NA
 7550487 7550488 CLM_0660 CLM_0661     FALSE 0.030 302.000 0.000 NA   NA
 7550488 7550489 CLM_0661 CLM_0662     TRUE 0.992 -7.000 0.165 1.000 N NA
 7550489 7550490 CLM_0662 CLM_0663     TRUE 0.965 0.000 0.035 NA   NA
 7550490 7550491 CLM_0663 CLM_0664     FALSE 0.015 359.000 0.000 NA   NA
 7550491 7550492 CLM_0664 CLM_0665   potA FALSE 0.002 803.000 0.000 NA   NA
 7550492 7550493 CLM_0665 CLM_0666 potA potB TRUE 0.998 0.000 0.789 1.000 Y NA
 7550493 7550494 CLM_0666 CLM_0667 potB potCD TRUE 0.992 0.000 0.022 0.032 Y NA
 7550496 7550497 CLM_0669 CLM_0670     FALSE 0.165 182.000 0.000 NA   NA
 7550497 7550498 CLM_0670 CLM_0671     FALSE 0.003 593.000 0.000 NA   NA
 7550498 7550499 CLM_0671 CLM_0672     FALSE 0.073 236.000 0.000 NA   NA
 7550499 7550500 CLM_0672 CLM_0673     FALSE 0.249 83.000 0.000 NA   NA
 7550502 7550503 CLM_0675 CLM_0676     FALSE 0.008 414.000 0.000 NA   NA
 7550503 7550504 CLM_0676 CLM_0678     FALSE 0.275 131.000 0.000 NA   NA
 7550504 7550505 CLM_0678 CLM_0679     TRUE 0.769 4.000 0.000 NA   NA
 7550506 7550507 CLM_0680 CLM_0681     FALSE 0.022 324.000 0.000 NA   NA
 7550508 7550509 CLM_0682 CLM_0683     FALSE 0.095 221.000 0.000 NA   NA
 7550509 7550510 CLM_0683 CLM_0684     TRUE 0.992 -10.000 0.208 NA   NA
 7550510 7550511 CLM_0684 CLM_0685   lepB TRUE 0.851 68.000 0.333 NA   NA
 7550511 7550512 CLM_0685 CLM_0686 lepB   FALSE 0.004 816.000 0.000 1.000 N NA
 7550512 7550513 CLM_0686 CLM_0687     FALSE 0.002 613.000 0.000 NA   NA
 7550513 7550514 CLM_0687 CLM_0688     TRUE 0.969 40.000 1.000 NA   NA
 7550514 7550515 CLM_0688 CLM_0689     FALSE 0.002 698.000 0.000 NA   NA
 7550515 7550516 CLM_0689 CLM_0690     FALSE 0.527 34.000 0.000 NA   NA
 7550516 7550517 CLM_0690 CLM_0691     FALSE 0.007 426.000 0.000 NA   NA
 7550517 7550518 CLM_0691 CLM_0692     TRUE 0.985 -7.000 0.080 NA   NA
 7550518 7550519 CLM_0692 CLM_0693     TRUE 0.973 37.000 1.000 NA   NA
 7550519 7550520 CLM_0693 CLM_0694     TRUE 0.920 35.000 0.222 NA   NA
 7550520 7550521 CLM_0694 CLM_0695     TRUE 0.923 34.000 0.222 NA   NA
 7550521 7550522 CLM_0695 CLM_0696     TRUE 0.968 23.000 0.400 NA   NA
 7550522 7550523 CLM_0696 CLM_0697     TRUE 0.982 -3.000 0.095 NA   NA
 7550523 7550524 CLM_0697 CLM_0698     TRUE 0.966 15.000 0.238 NA N NA
 7550524 7550525 CLM_0698 CLM_0699     FALSE 0.003 568.000 0.000 NA   NA
 7550525 7550526 CLM_0699 CLM_0700     FALSE 0.020 329.000 0.000 NA   NA
 7550526 7550527 CLM_0700 CLM_0701     FALSE 0.009 398.000 0.000 NA   NA
 7550530 7550531 CLM_0704 CLM_0705     FALSE 0.040 334.000 0.000 1.000 N NA
 7550532 7550533 CLM_0706 CLM_0707 asnS   FALSE 0.045 274.000 0.000 NA   NA
 7550533 7550534 CLM_0707 CLM_0708     TRUE 0.992 2.000 0.714 NA   NA
 7550534 7550535 CLM_0708 CLM_0709     FALSE 0.007 422.000 0.000 NA   NA
 7550537 7550538 CLM_0711 CLM_0712     TRUE 0.982 13.000 0.667 NA   NA
 7550538 7550539 CLM_0712 CLM_0713     FALSE 0.006 463.000 0.000 1.000   NA
 7550539 7550540 CLM_0713 CLM_0714     FALSE 0.214 175.000 0.000 1.000   NA
 7550540 7550541 CLM_0714 CLM_0715     TRUE 0.996 5.000 0.692 1.000 Y NA
 7550543 7550544 CLM_0717 CLM_0718     TRUE 0.943 21.000 0.085 1.000 N NA
 7550544 7550545 CLM_0718 CLM_0719     TRUE 0.993 29.000 0.932 1.000 Y NA
 7550546 7550547 CLM_0720 CLM_0721     FALSE 0.256 143.000 0.000 NA   NA
 7550547 7550548 CLM_0721 CLM_0722     TRUE 0.909 -3.000 0.000 1.000   NA
 7550551 7550552 CLM_0725 CLM_0726     TRUE 0.806 170.000 0.286 1.000 N NA
 7550554 7550555 CLM_0728 CLM_0729     TRUE 0.717 103.000 0.083 1.000   NA
 7550556 7550557 CLM_0730 CLM_0731 csaA   FALSE 0.345 208.000 0.023 1.000   NA
 7550557 7550558 CLM_0731 CLM_0732     FALSE 0.057 300.000 0.000 0.030   NA
 7550559 7550560 CLM_0733 CLM_0734     FALSE 0.011 386.000 0.000 NA   NA
 7550560 7550561 CLM_0734 CLM_0735     FALSE 0.264 383.000 0.667 NA N NA
 7550561 7550562 CLM_0735 CLM_0736     TRUE 0.993 0.000 0.636 NA   NA
 7550564 7550565 CLM_0738 CLM_0739     FALSE 0.031 345.000 0.000 NA N NA
 7550565 7550566 CLM_0739 CLM_0740     FALSE 0.274 108.000 0.000 NA   NA
 7550566 7550567 CLM_0740 CLM_0741     FALSE 0.275 132.000 0.000 NA   NA
 7550568 7550569 CLM_0742 CLM_0743     TRUE 0.861 23.000 0.015 NA   NA
 7550569 7550570 CLM_0743 CLM_0744     TRUE 0.985 -30.000 0.015 NA   NA
 7550572 7550573 CLM_0746 CLM_0747     FALSE 0.539 139.000 0.006 1.000   NA
 7550574 7550575 CLM_0748 CLM_0749   rhlE FALSE 0.011 402.000 0.000 1.000   NA
 7550575 7550576 CLM_0749 CLM_0750 rhlE   FALSE 0.003 599.000 0.000 1.000   NA
 7550576 7550577 CLM_0750 CLM_0751     TRUE 0.768 170.000 0.286 1.000   NA
 7550577 7550578 CLM_0751 CLM_0752     TRUE 0.959 28.000 0.250 1.000 N NA
 7550580 7550581 CLM_0754 CLM_0755     FALSE 0.483 39.000 0.000 NA   NA
 7550581 7550582 CLM_0755 CLM_0756     FALSE 0.162 184.000 0.000 NA   NA
 7550582 7550583 CLM_0756 CLM_0757     TRUE 0.991 -10.000 0.154 NA   NA
 7550583 7550584 CLM_0757 CLM_0758     FALSE 0.292 67.000 0.000 NA   NA
 7550584 7550585 CLM_0758 CLM_0759     FALSE 0.275 130.000 0.000 NA   NA
 7550587 7550588 CLM_0762 CLM_0763     FALSE 0.010 394.000 0.000 NA   NA
 7550588 7550589 CLM_0763 CLM_0764     TRUE 0.619 26.000 0.000 NA   NA
 7550590 7550591 CLM_0765 CLM_0766     FALSE 0.009 399.000 0.000 NA   NA
 7550592 7550593 CLM_0767 CLM_0768 licT   TRUE 0.699 208.000 0.409 1.000   NA
 7550593 7550594 CLM_0768 CLM_0769     TRUE 0.937 12.000 0.074 1.000   NA
 7550594 7550595 CLM_0769 CLM_0770     FALSE 0.179 176.000 0.000 NA   NA
 7550595 7550596 CLM_0770 CLM_0771     FALSE 0.024 319.000 0.000 NA   NA
 7550596 7550597 CLM_0771 CLM_0772     FALSE 0.367 279.000 0.190 1.000 N NA
 7550597 7550598 CLM_0772 CLM_0773     TRUE 0.793 60.000 0.071 1.000 N NA
 7550598 7550599 CLM_0773 CLM_0774     TRUE 0.912 26.000 0.089 NA   NA
 7550603 7550604 CLM_0778 CLM_0779     TRUE 0.952 7.000 0.100 NA   NA
 7550604 7550605 CLM_0779 CLM_0780     FALSE 0.049 267.000 0.000 NA   NA
 7550605 7550606 CLM_0780 CLM_0781     FALSE 0.022 342.000 0.000 1.000   NA
 7550606 7550607 CLM_0781 CLM_0782     TRUE 0.994 -37.000 0.118 1.000   NA
 7550607 7550608 CLM_0782 CLM_0783     TRUE 0.978 31.000 1.000 NA   NA
 7550608 7550609 CLM_0783 CLM_0784     TRUE 0.673 14.000 0.000 NA   NA
 7550609 7550610 CLM_0784 CLM_0785     FALSE 0.017 348.000 0.000 NA   NA
 7550610 7550611 CLM_0785 CLM_0786     FALSE 0.075 235.000 0.000 NA   NA
 7550612 7550613 CLM_0787 CLM_0788     TRUE 0.994 -3.000 0.571 NA   NA
 7550614 7550615 CLM_0789 CLM_0790   greA TRUE 0.575 157.000 0.008 1.000 N NA
 7550615 7550616 CLM_0790 CLM_0791 greA   FALSE 0.506 168.000 0.031 NA   NA
 7550616 7550617 CLM_0791 CLM_0792     FALSE 0.043 276.000 0.000 NA   NA
 7550617 7550618 CLM_0792 CLM_0793     TRUE 0.998 -19.000 0.092 0.060 Y NA
 7550618 7550619 CLM_0793 CLM_0794     FALSE 0.035 295.000 0.000 NA   NA
 7550619 7550620 CLM_0794 CLM_0795     FALSE 0.273 105.000 0.000 NA   NA
 7550620 7550621 CLM_0795 CLM_0796     FALSE 0.253 92.000 0.000 NA   NA
 7550621 7550622 CLM_0796 CLM_0797     FALSE 0.263 98.000 0.000 NA   NA
 7550622 7550623 CLM_0797 CLM_0798     FALSE 0.005 597.000 0.000 NA N NA
 7550623 7550624 CLM_0798 CLM_0799   blaI FALSE 0.219 206.000 0.000 1.000 N NA
 7550624 7550625 CLM_0799 CLM_0800 blaI   TRUE 0.952 11.000 0.000 1.000 Y NA
 7550627 7550628 CLM_0802 CLM_0803     FALSE 0.007 536.000 0.000 1.000 N NA
 7550628 7550629 CLM_0803 CLM_0804   fhuB TRUE 0.955 96.000 0.500 1.000 Y NA
 7550629 7550630 CLM_0804 CLM_0805 fhuB fhuG TRUE 0.998 0.000 0.750 0.031 Y NA
 7550630 7550631 CLM_0805 CLM_0806 fhuG fhuC TRUE 0.704 228.000 0.100 1.000 Y NA
 7550631 7550632 CLM_0806 CLM_0807 fhuC nifH TRUE 0.975 30.000 0.150 1.000 Y NA
 7550632 7550633 CLM_0807 CLM_0808 nifH   TRUE 0.992 3.000 0.571 0.045 N NA
 7550633 7550634 CLM_0808 CLM_0809     TRUE 0.993 32.000 1.000 0.035 Y NA
 7550634 7550635 CLM_0809 CLM_0810     FALSE 0.012 445.000 0.000 1.000 N NA
 7550635 7550636 CLM_0810 CLM_0811     FALSE 0.371 52.000 0.000 NA   NA
 7550637 7550638 CLM_0813 CLM_0814     FALSE 0.263 140.000 0.000 NA   NA
 7550639 7550640 CLM_0815 CLM_0816 gcvT gcvH TRUE 0.804 125.000 0.000 0.001 Y NA
 7550640 7550641 CLM_0816 CLM_0817 gcvH gcvPA TRUE 0.980 3.000 0.005 1.000 Y NA
 7550641 7550642 CLM_0817 CLM_0818 gcvPA gcvPB TRUE 0.997 0.000 0.316 0.001 Y NA
 7550642 7550643 CLM_0818 CLM_0819 gcvPB lpdA FALSE 0.458 189.000 0.010 1.000 N NA
 7550643 7550644 CLM_0819 CLM_0820 lpdA   TRUE 0.771 149.000 0.118 1.000 N NA
 7550644 7550645 CLM_0820 CLM_0821     FALSE 0.012 382.000 0.000 NA   NA
 7550645 7550646 CLM_0821 CLM_0822     FALSE 0.010 393.000 0.000 NA   NA
 7550646 7550647 CLM_0822 CLM_0823     FALSE 0.187 173.000 0.000 NA   NA
 7550647 7550648 CLM_0823 CLM_0824     FALSE 0.547 32.000 0.000 NA   NA
 7550648 7550649 CLM_0824 CLM_0825     TRUE 0.767 17.000 0.000 0.060   NA
 7550649 7550650 CLM_0825 CLM_0826     TRUE 0.999 -15.000 0.875 1.000 Y NA
 7550650 7550651 CLM_0826 CLM_0827     TRUE 0.943 73.000 0.875 1.000 N NA
 7550651 7550652 CLM_0827 CLM_0828     TRUE 0.997 -3.000 0.875 NA N NA
 7550652 7550653 CLM_0828 CLM_0829     FALSE 0.246 188.000 0.000 NA N NA
 7550653 7550654 CLM_0829 CLM_0830     FALSE 0.098 232.000 0.000 1.000   NA
 7550654 7550655 CLM_0830 CLM_0831     FALSE 0.014 362.000 0.000 NA   NA
 7550655 7550656 CLM_0831 CLM_0832     FALSE 0.309 62.000 0.000 NA   NA
 7550656 7550657 CLM_0832 CLM_0834     FALSE 0.070 239.000 0.000 NA   NA
 7550657 7550658 CLM_0834 CLM_0835     TRUE 0.908 52.000 0.273 1.000 N NA
 7550658 7550659 CLM_0835 CLM_0836     TRUE 0.997 -13.000 0.094 1.000 Y NA
 7550661 7550662 CLM_0838 CLM_0839     FALSE 0.002 1003.000 0.000 NA   NA
 7550662 7550663 CLM_0839 CLM_0840     FALSE 0.013 367.000 0.000 NA   NA
 7550663 7550664 CLM_0840 CLM_0841     FALSE 0.011 384.000 0.000 NA   NA
 7550664 7550665 CLM_0841 CLM_0842     FALSE 0.337 56.000 0.000 NA   NA
 7550665 7550666 CLM_0842 CLM_0843     FALSE 0.075 235.000 0.000 NA   NA
 7550666 7550667 CLM_0843 CLM_0844     TRUE 0.957 2.000 0.051 NA   NA
 7550669 7550670 CLM_0846 CLM_0847     TRUE 0.909 -3.000 0.000 1.000   NA
 7550670 7550671 CLM_0847 CLM_0848     FALSE 0.095 221.000 0.000 NA   NA
 7550671 7550672 CLM_0848 CLM_0849     FALSE 0.393 97.000 0.000 NA N NA
 7550672 7550673 CLM_0849 CLM_0850     FALSE 0.274 106.000 0.000 NA   NA
 7550673 7550674 CLM_0850 CLM_0851     FALSE 0.362 53.000 0.000 NA   NA
 7550674 7550675 CLM_0851 CLM_0852     FALSE 0.168 195.000 0.000 1.000   NA
 7550676 7550677 CLM_0853 CLM_0854     TRUE 0.810 99.000 0.250 NA   NA
 7550680 7550681 CLM_0857 CLM_0858     FALSE 0.004 494.000 0.000 NA   NA
 7550683 7550684 CLM_0860 CLM_0861     FALSE 0.221 158.000 0.000 NA   NA
 7550684 7550685 CLM_0861 CLM_0862     FALSE 0.301 64.000 0.000 NA   NA
 7550685 7550686 CLM_0862 CLM_0863     FALSE 0.002 678.000 0.000 NA   NA
 7550686 7550687 CLM_0863 CLM_0864     TRUE 0.995 0.000 0.800 NA   NA
 7550687 7550688 CLM_0864 CLM_0865     TRUE 0.827 162.000 0.444 NA   NA
 7550689 7550690 CLM_0866 CLM_0867   luxS TRUE 0.987 -16.000 0.010 1.000 N NA
 7550690 7550691 CLM_0867 CLM_0868 luxS metC TRUE 0.969 2.000 0.048 1.000 N NA
 7550691 7550692 CLM_0868 CLM_0869 metC   TRUE 0.670 101.000 0.021 1.000 N NA
 7550692 7550693 CLM_0869 CLM_0870     FALSE 0.003 556.000 0.000 NA   NA
 7550694 7550695 CLM_0871 CLM_0872     FALSE 0.118 252.000 0.000 1.000 N NA
 7550695 7550696 CLM_0872 CLM_0873     FALSE 0.093 222.000 0.000 NA   NA
 7550696 7550697 CLM_0873 CLM_0874     FALSE 0.032 298.000 0.000 NA   NA
 7550697 7550698 CLM_0874 CLM_0875     FALSE 0.035 303.000 0.000 1.000   NA
 7550699 7550700 CLM_0876 CLM_0877     TRUE 0.642 88.000 0.061 NA   NA
 7550700 7550701 CLM_0877 CLM_0878     FALSE 0.003 551.000 0.000 NA   NA
 7550701 7550702 CLM_0878 CLM_0879     FALSE 0.255 93.000 0.000 NA   NA
 7550703 7550704 CLM_0880 CLM_0881     FALSE 0.493 38.000 0.000 NA   NA
 7550704 7550705 CLM_0881 CLM_0882     TRUE 0.646 19.000 0.000 NA   NA
 7550705 7550706 CLM_0882 CLM_0883     FALSE 0.267 100.000 0.000 NA   NA
 7550706 7550707 CLM_0883 CLM_0884     FALSE 0.265 99.000 0.000 NA   NA
 7550707 7550708 CLM_0884 CLM_0885     FALSE 0.272 114.000 0.000 NA   NA
 7550708 7550709 CLM_0885 CLM_0886     FALSE 0.187 173.000 0.000 NA   NA
 7550709 7550710 CLM_0886 CLM_0887     FALSE 0.007 419.000 0.000 NA   NA
 7550710 7550711 CLM_0887 CLM_0888     TRUE 0.648 20.000 0.000 NA   NA
 7550711 7550712 CLM_0888 CLM_0889     FALSE 0.056 259.000 0.000 NA   NA
 7550712 7550713 CLM_0889 CLM_0890     FALSE 0.354 54.000 0.000 NA   NA
 7550714 7550715 CLM_0891 CLM_0892     TRUE 0.948 39.000 0.500 NA   NA
 7550715 7550716 CLM_0892 CLM_0893     TRUE 0.976 14.000 0.500 NA   NA
 7550716 7550717 CLM_0893 CLM_0894   botR FALSE 0.001 1226.000 0.000 NA   NA
 7550718 7550719 CLM_0895 CLM_0896 p47 ntnH TRUE 0.981 16.000 0.750 NA   NA
 7550719 7550720 CLM_0896 CLM_0897 ntnH botA TRUE 0.641 44.000 0.000 0.001   NA
 7550720 7550721 CLM_0897 CLM_0898 botA   FALSE 0.002 663.000 0.000 NA   NA
 7550721 7550722 CLM_0898 CLM_0899     FALSE 0.071 238.000 0.000 NA   NA
 7550722 7550723 CLM_0899 CLM_0900     FALSE 0.003 553.000 0.000 NA   NA
 7550723 7550724 CLM_0900 CLM_0901     TRUE 0.685 13.000 0.000 NA   NA
 7550724 7550725 CLM_0901 CLM_0902     FALSE 0.267 76.000 0.000 NA   NA
 7550725 7550726 CLM_0902 CLM_0903     FALSE 0.004 495.000 0.000 NA   NA
 7550728 7550729 CLM_0905 CLM_0906   arsD TRUE 0.695 21.000 0.000 1.000   NA
 7550729 7550730 CLM_0906 CLM_0907 arsD   TRUE 0.936 19.000 0.116 1.000   NA
 7550730 7550731 CLM_0907 CLM_0908     FALSE 0.422 95.000 0.000 1.000 N NA
 7550731 7550732 CLM_0908 CLM_0909   arsB TRUE 0.620 44.000 0.000 1.000 N NA
 7550732 7550733 CLM_0909 CLM_0910 arsB   TRUE 0.866 54.000 0.250 NA   NA
 7550733 7550734 CLM_0910 CLM_0912     FALSE 0.013 367.000 0.000 NA   NA
 7550736 7550737 CLM_0913 CLM_0914     FALSE 0.008 406.000 0.000 NA   NA
 7550737 7550738 CLM_0914 CLM_0915     FALSE 0.002 632.000 0.000 NA   NA
 7550738 7550739 CLM_0915 CLM_0916     TRUE 0.994 -7.000 0.400 NA   NA
 7550739 7550740 CLM_0916 CLM_0917     FALSE 0.005 454.000 0.000 NA   NA
 7550740 7550741 CLM_0917 CLM_0918   thyA TRUE 0.979 -10.000 0.017 NA   NA
 7550741 7550742 CLM_0918 CLM_0919 thyA   TRUE 0.925 12.000 0.017 1.000 N NA
 7550742 7550743 CLM_0919 CLM_0920     TRUE 0.834 46.000 0.047 1.000 N NA
 7550743 7550744 CLM_0920 CLM_0921   thiD TRUE 0.707 78.000 0.043 1.000 N NA
 7550744 7550745 CLM_0921 CLM_0922 thiD   FALSE 0.526 172.000 0.043 NA   NA
 7550747 7550748 CLM_0924 CLM_0925     TRUE 0.991 3.000 0.833 NA   NA
 7550748 7550749 CLM_0925 CLM_0926     FALSE 0.194 170.000 0.000 NA   NA
 7550749 7550750 CLM_0926 CLM_0927     TRUE 0.761 165.000 0.167 1.000 N NA
 7550750 7550751 CLM_0927 CLM_0928     TRUE 0.994 0.000 0.667 NA   NA
 7550751 7550752 CLM_0928 CLM_0929     FALSE 0.368 251.000 0.167 NA   NA
 7550752 7550753 CLM_0929 CLM_0930     FALSE 0.107 380.000 0.167 1.000   NA
 7550753 7550754 CLM_0930 CLM_0931     FALSE 0.002 801.000 0.000 NA   NA
 7550754 7550755 CLM_0931 CLM_0932     FALSE 0.047 269.000 0.000 NA   NA
 7550755 7550756 CLM_0932 CLM_0933     TRUE 0.573 184.000 0.100 NA   NA
 7550756 7550757 CLM_0933 CLM_0934     TRUE 0.999 -13.000 0.750 1.000 Y NA
 7550757 7550758 CLM_0934 CLM_0935     FALSE 0.107 213.000 0.000 NA   NA
 7550758 7550759 CLM_0935 CLM_0936     FALSE 0.083 231.000 0.000 NA   NA
 7550759 7550760 CLM_0936 CLM_0937     TRUE 0.943 172.000 0.636 1.000 Y NA
 7550760 7550761 CLM_0937 CLM_0938     FALSE 0.176 190.000 0.000 1.000   NA
 7550763 7550764 CLM_0940 CLM_0941     FALSE 0.005 465.000 0.000 NA   NA
 7550764 7550765 CLM_0941 CLM_0942   dapB FALSE 0.472 95.000 0.002 NA   NA
 7550765 7550766 CLM_0942 CLM_0943 dapB   TRUE 0.772 22.000 0.000 NA N NA
 7550766 7550767 CLM_0943 CLM_0944     FALSE 0.004 493.000 0.000 NA   NA
 7550767 7550768 CLM_0944 CLM_0946     FALSE 0.051 265.000 0.000 NA   NA
 7550768 7550769 CLM_0946 CLM_0947     FALSE 0.256 80.000 0.000 NA   NA
 7550769 7550770 CLM_0947 CLM_0948     FALSE 0.262 193.000 0.000 1.000 N NA
 7550772 7550773 CLM_0950 CLM_0951     FALSE 0.271 116.000 0.000 NA   NA
 7550773 7550774 CLM_0951 CLM_0952     FALSE 0.007 422.000 0.000 NA   NA
 7550774 7550775 CLM_0952 CLM_0953     FALSE 0.019 336.000 0.000 NA   NA
 7550775 7550776 CLM_0953 CLM_0954   brnQ FALSE 0.006 566.000 0.000 1.000 N NA
 7550776 7550777 CLM_0954 CLM_0955 brnQ brnQ TRUE 0.976 151.000 1.000 0.001 Y NA
 7550779 7550780 CLM_0957 CLM_0958   feoB TRUE 0.613 145.000 0.033 1.000   NA
 7550780 7550781 CLM_0958 CLM_0959 feoB   TRUE 0.988 -3.000 0.105 0.005   NA
 7550781 7550782 CLM_0959 CLM_0961   cobC FALSE 0.004 715.000 0.000 1.000 N NA
 7550782 7550783 CLM_0961 CLM_0962 cobC   FALSE 0.414 145.000 0.000 1.000 N NA
 7550783 7550784 CLM_0962 CLM_0963   cobS FALSE 0.018 401.000 0.000 1.000 N NA
 7550784 7550785 CLM_0963 CLM_0964 cobS   FALSE 0.005 459.000 0.000 NA   NA
 7550785 7550786 CLM_0964 CLM_0965     FALSE 0.026 309.000 0.000 NA   NA
 7550786 7550787 CLM_0965 CLM_0966     TRUE 0.660 131.000 0.053 NA   NA
 7550787 7550788 CLM_0966 CLM_0967     TRUE 0.982 18.000 0.828 NA   NA
 7550788 7550789 CLM_0967 CLM_0968     FALSE 0.003 569.000 0.000 NA   NA
 7550789 7550790 CLM_0968 CLM_0969   queD FALSE 0.047 269.000 0.000 NA   NA
 7550790 7550791 CLM_0969 CLM_0970 queD folP TRUE 0.826 104.000 0.003 1.000 Y NA
 7550791 7550792 CLM_0970 CLM_0972 folP   FALSE 0.445 153.000 0.003 NA   NA
 7550792 7550793 CLM_0972 CLM_0973   folK FALSE 0.490 101.000 0.003 NA   NA
 7550793 7550794 CLM_0973 CLM_0974 folK   FALSE 0.405 114.000 0.000 NA N NA
 7550794 7550795 CLM_0974 CLM_0975     FALSE 0.042 320.000 0.000 NA N NA
 7550795 7550796 CLM_0975 CLM_0976     TRUE 0.778 55.000 0.039 1.000 N NA
 7550796 7550797 CLM_0976 CLM_0977     FALSE 0.265 329.000 0.012 0.019 Y NA
 7550797 7550798 CLM_0977 CLM_0978     FALSE 0.002 815.000 0.000 NA   NA
 7550798 7550799 CLM_0978 CLM_0979     FALSE 0.006 441.000 0.000 NA   NA
 7550799 7550800 CLM_0979 CLM_0980     TRUE 0.984 5.000 0.500 NA   NA
 7550803 7550804 CLM_0983 CLM_0984     TRUE 0.948 19.000 0.200 NA   NA
 7550804 7550805 CLM_0984 CLM_0986     TRUE 0.993 -28.000 0.100 1.000   NA
 7550806 7550807 CLM_0987 CLM_0988     FALSE 0.002 685.000 0.000 NA   NA
 7550807 7550808 CLM_0988 CLM_0990     FALSE 0.004 496.000 0.000 NA   NA
 7550808 7550809 CLM_0990 CLM_0991     FALSE 0.397 49.000 0.000 NA   NA
 7550810 7550811 CLM_0992 CLM_0993     TRUE 0.792 18.000 0.000 0.005   NA
 7550811 7550812 CLM_0993 CLM_0994     FALSE 0.316 105.000 0.000 1.000   NA
 7550812 7550813 CLM_0994 CLM_0995     FALSE 0.147 344.000 0.000 0.060 Y NA
 7550814 7550815 CLM_0996 CLM_0997     FALSE 0.118 206.000 0.000 NA   NA
 7550815 7550816 CLM_0997 CLM_0998     FALSE 0.305 63.000 0.000 NA   NA
 7550817 7550818 CLM_0999 CLM_1000     FALSE 0.042 277.000 0.000 NA   NA
 7550819 7550820 CLM_1001 CLM_1002   lipA FALSE 0.014 364.000 0.000 NA   NA
 7550821 7550822 CLM_1003 CLM_1004 oxdD   FALSE 0.057 258.000 0.000 NA   NA
 7550822 7550823 CLM_1004 CLM_1005     TRUE 0.600 58.000 0.010 NA   NA
 7550824 7550825 CLM_1006 CLM_1007     FALSE 0.056 272.000 0.000 1.000   NA
 7550826 7550827 CLM_1008 CLM_1009     TRUE 0.990 0.000 0.400 NA   NA
 7550827 7550828 CLM_1009 CLM_1010     FALSE 0.002 661.000 0.000 NA   NA
 7550833 7550834 CLM_1015 CLM_1016     FALSE 0.083 231.000 0.000 NA   NA
 7550834 7550835 CLM_1016 CLM_1017     TRUE 0.954 -37.000 0.000 NA   NA
 7550835 7550836 CLM_1017 CLM_1019     FALSE 0.002 638.000 0.000 NA   NA
 7550836 7550837 CLM_1019 CLM_1020     FALSE 0.274 125.000 0.000 NA   NA
 7550837 7550838 CLM_1020 CLM_1021     FALSE 0.144 329.000 0.000 1.000 Y NA
 7550838 7550839 CLM_1021 CLM_1022     FALSE 0.275 128.000 0.000 NA   NA
 7550840 7550841 CLM_1023 CLM_1024 mraY   FALSE 0.260 96.000 0.000 NA   NA
 7550842 7550843 CLM_1025 CLM_1026     FALSE 0.008 425.000 0.000 1.000   NA
 7550843 7550844 CLM_1026 CLM_1028     FALSE 0.067 244.000 0.000 NA   NA
 7550844 7550845 CLM_1028 CLM_1029     FALSE 0.274 74.000 0.000 NA   NA
 7550847 7550848 CLM_1032 CLM_1033     FALSE 0.195 169.000 0.000 NA   NA
 7550848 7550849 CLM_1033 CLM_1034     FALSE 0.538 33.000 0.000 NA   NA
 7550849 7550850 CLM_1034 CLM_1035     FALSE 0.037 290.000 0.000 NA   NA
 7550852 7550853 CLM_1037 CLM_1038     FALSE 0.257 79.000 0.000 NA   NA
 7550853 7550854 CLM_1038 CLM_1039     FALSE 0.008 413.000 0.000 NA   NA
 7550855 7550856 CLM_1040 CLM_1041     FALSE 0.179 176.000 0.000 NA   NA
 7550858 7550859 CLM_1043 CLM_1044     FALSE 0.099 218.000 0.000 NA   NA
 7550859 7550860 CLM_1044 CLM_1045     TRUE 0.651 16.000 0.000 NA   NA
 7550861 7550862 CLM_1046 CLM_1047     FALSE 0.003 540.000 0.000 NA   NA
 7550864 7550865 CLM_1049 CLM_1050     TRUE 0.996 0.000 0.333 1.000 Y NA
 7550865 7550866 CLM_1050 CLM_1051   ilvE FALSE 0.016 410.000 0.000 1.000 N NA
 7550866 7550867 CLM_1051 CLM_1052 ilvE   FALSE 0.069 240.000 0.000 NA   NA
 7550867 7550868 CLM_1052 CLM_1053     FALSE 0.086 229.000 0.000 NA   NA
 7550868 7550869 CLM_1053 CLM_1054     FALSE 0.011 387.000 0.000 NA   NA
 7550869 7550870 CLM_1054 CLM_1055     TRUE 0.791 72.000 0.100 1.000 N NA
 7550870 7550871 CLM_1055 CLM_1056     FALSE 0.074 292.000 0.000 1.000 N NA
 7550871 7550872 CLM_1056 CLM_1057     FALSE 0.026 327.000 0.000 1.000   NA
 7550874 7550875 CLM_1060 CLM_1061   cobQ FALSE 0.549 61.000 0.003 NA   NA
 7550875 7550876 CLM_1061 CLM_1062 cobQ cobD TRUE 0.992 2.000 0.092 0.011 Y NA
 7550876 7550877 CLM_1062 CLM_1063 cobD   FALSE 0.062 385.000 0.026 1.000 N NA
 7550877 7550878 CLM_1063 CLM_1064   cbiM FALSE 0.486 185.000 0.013 1.000 N NA
 7550878 7550879 CLM_1064 CLM_1065 cbiM cbiN TRUE 0.997 4.000 0.861 0.011 Y NA
 7550879 7550880 CLM_1065 CLM_1066 cbiN cbiQ TRUE 1.000 -22.000 0.804 0.001 Y NA
 7550880 7550881 CLM_1066 CLM_1067 cbiQ   FALSE 0.029 349.000 0.000 NA N NA
 7550881 7550882 CLM_1067 CLM_1068   hemC TRUE 0.996 -31.000 0.009 NA Y NA
 7550882 7550883 CLM_1068 CLM_1069 hemC   TRUE 0.864 136.000 0.031 1.000 Y NA
 7550883 7550884 CLM_1069 CLM_1070     FALSE 0.252 145.000 0.000 NA   NA
 7550884 7550885 CLM_1070 CLM_1071   hemB FALSE 0.054 262.000 0.000 NA   NA
 7550885 7550886 CLM_1071 CLM_1072 hemB cobB FALSE 0.529 233.000 0.005 1.000 Y NA
 7550886 7550887 CLM_1072 CLM_1073 cobB cobH TRUE 0.981 25.000 0.097 0.011 Y NA
 7550887 7550888 CLM_1073 CLM_1074 cobH   FALSE 0.066 298.000 0.000 1.000 N NA
 7550888 7550889 CLM_1074 CLM_1075     FALSE 0.363 60.000 0.000 1.000   NA
 7550889 7550890 CLM_1075 CLM_1076     FALSE 0.039 299.000 0.000 1.000   NA
 7550890 7550891 CLM_1076 CLM_1077     FALSE 0.008 423.000 0.000 1.000   NA
 7550891 7550892 CLM_1077 CLM_1078     FALSE 0.019 353.000 0.000 1.000   NA
 7550892 7550893 CLM_1078 CLM_1079     FALSE 0.420 52.000 0.000 1.000   NA
 7550893 7550894 CLM_1079 CLM_1080     FALSE 0.073 252.000 0.000 1.000   NA
 7550894 7550895 CLM_1080 CLM_1081     TRUE 0.866 29.000 0.032 1.000   NA
 7550895 7550896 CLM_1081 CLM_1082     TRUE 0.627 70.000 0.032 NA   NA
 7550896 7550897 CLM_1082 CLM_1084     FALSE 0.255 93.000 0.000 NA   NA
 7550897 7550898 CLM_1084 CLM_1085     TRUE 0.956 -433.000 0.000 NA   NA
 7550898 7550899 CLM_1085 CLM_1086   cbiD TRUE 0.685 13.000 0.000 NA   NA
 7550899 7550900 CLM_1086 CLM_1087 cbiD cbiE TRUE 0.832 200.000 0.126 0.011 Y NA
 7550900 7550901 CLM_1087 CLM_1088 cbiE   TRUE 0.954 -37.000 0.000 NA   NA
 7550901 7550902 CLM_1088 CLM_1089     FALSE 0.270 102.000 0.000 NA   NA
 7550902 7550903 CLM_1089 CLM_1090   cbiT FALSE 0.301 64.000 0.000 NA   NA
 7550903 7550904 CLM_1090 CLM_1091 cbiT   TRUE 0.647 23.000 0.000 NA   NA
 7550904 7550905 CLM_1091 CLM_1092     FALSE 0.004 474.000 0.000 NA   NA
 7550905 7550906 CLM_1092 CLM_1093     TRUE 0.822 158.000 0.400 NA   NA
 7550906 7550907 CLM_1093 CLM_1094     FALSE 0.316 60.000 0.000 NA   NA
 7550907 7550908 CLM_1094 CLM_1095     FALSE 0.333 68.000 0.000 1.000   NA
 7550908 7550909 CLM_1095 CLM_1096     FALSE 0.387 50.000 0.000 NA   NA
 7550909 7550910 CLM_1096 CLM_1097   cobI FALSE 0.251 91.000 0.000 NA   NA
 7550910 7550911 CLM_1097 CLM_1098 cobI cobM TRUE 0.663 289.000 0.291 0.011 Y NA
 7550911 7550912 CLM_1098 CLM_1099 cobM cbiG TRUE 0.999 -22.000 0.397 0.011 Y NA
 7550912 7550913 CLM_1099 CLM_1100 cbiG cobJ TRUE 0.955 134.000 0.352 0.011 Y NA
 7550913 7550914 CLM_1100 CLM_1101 cobJ cobK TRUE 0.933 177.000 0.423 0.011 Y NA
 7550914 7550915 CLM_1101 CLM_1102 cobK   FALSE 0.500 80.000 0.006 NA   NA
 7550915 7550916 CLM_1102 CLM_1103   cbiK FALSE 0.373 216.000 0.056 NA   NA
 7550916 7550917 CLM_1103 CLM_1104 cbiK   TRUE 0.936 13.000 0.040 1.000 N NA
 7550917 7550918 CLM_1104 CLM_1105   cobO FALSE 0.443 127.000 0.000 1.000 N NA
 7550918 7550919 CLM_1105 CLM_1106 cobO   FALSE 0.117 253.000 0.000 1.000 N NA
 7550919 7550920 CLM_1106 CLM_1107     TRUE 0.811 100.000 0.152 1.000 N NA
 7550920 7550921 CLM_1107 CLM_1108   asrA TRUE 0.948 20.000 0.174 1.000   NA
 7550921 7550922 CLM_1108 CLM_1109 asrA asrB TRUE 0.998 -13.000 0.750 0.033   NA
 7550922 7550923 CLM_1109 CLM_1110 asrB arsC TRUE 0.995 13.000 0.720 0.033 Y NA
 7550923 7550924 CLM_1110 CLM_1111 arsC   FALSE 0.021 346.000 0.000 1.000   NA
 7550926 7550927 CLM_1113 CLM_1114     TRUE 0.983 21.000 0.833 NA   NA
 7550927 7550928 CLM_1114 CLM_1115     TRUE 0.990 4.000 0.833 NA   NA
 7550928 7550929 CLM_1115 CLM_1116     FALSE 0.019 650.000 0.154 NA   NA
 7550929 7550930 CLM_1116 CLM_1117     TRUE 0.999 -10.000 0.765 1.000 Y NA
 7550931 7550932 CLM_1118 CLM_1119     TRUE 0.997 1.000 0.625 1.000 Y NA
 7550932 7550933 CLM_1119 CLM_1120     TRUE 0.996 1.000 0.375 1.000 Y NA
 7550935 7550936 CLM_1123 CLM_1124     FALSE 0.560 31.000 0.000 NA   NA
 7550939 7550940 CLM_1127 CLM_1128     FALSE 0.003 682.000 0.000 1.000   NA
 7550941 7550942 CLM_1129 CLM_1130     FALSE 0.008 407.000 0.000 NA   NA
 7550942 7550943 CLM_1130 CLM_1131   dhaKL FALSE 0.010 393.000 0.000 NA   NA
 7550943 7550944 CLM_1131 CLM_1132 dhaKL dhaD TRUE 0.948 11.000 0.053 1.000 N NA
 7550944 7550945 CLM_1132 CLM_1133 dhaD   FALSE 0.052 521.000 0.250 1.000 N NA
 7550946 7550947 CLM_1134 CLM_1135     FALSE 0.206 207.000 0.000 0.012   NA
 7550947 7550948 CLM_1135 CLM_1136     FALSE 0.231 153.000 0.000 NA   NA
 7550948 7550949 CLM_1136 CLM_1137     FALSE 0.301 64.000 0.000 NA   NA
 7550949 7550950 CLM_1137 CLM_1138     FALSE 0.271 118.000 0.000 NA   NA
 7550950 7550951 CLM_1138 CLM_1139     TRUE 0.787 102.000 0.200 NA   NA
 7550951 7550952 CLM_1139 CLM_1140     TRUE 0.795 46.000 0.061 NA   NA
 7550952 7550953 CLM_1140 CLM_1141     FALSE 0.071 238.000 0.000 NA   NA
 7550953 7550954 CLM_1141 CLM_1142     FALSE 0.002 643.000 0.000 NA   NA
 11430799 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7197.000 0.000 NA   NA
 11573162 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7197.000 0.000 NA   NA
 11715554 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7197.000 0.000 NA   NA
 11430800 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7225.000 0.000 NA   NA
 11573163 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7225.000 0.000 NA   NA
 11715555 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7225.000 0.000 NA   NA
 11430801 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7264.000 0.000 NA   NA
 11573164 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7264.000 0.000 NA   NA
 11715556 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7264.000 0.000 NA   NA
 11430802 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7292.000 0.000 NA   NA
 11573165 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7292.000 0.000 NA   NA
 11715557 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7292.000 0.000 NA   NA
 11430803 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7328.000 0.000 NA   NA
 11573166 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7328.000 0.000 NA   NA
 11715558 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7328.000 0.000 NA   NA
 11430804 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7356.000 0.000 NA   NA
 11573167 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7356.000 0.000 NA   NA
 11715559 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7356.000 0.000 NA   NA
 11430805 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7392.000 0.000 NA   NA
 11573168 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7392.000 0.000 NA   NA
 11715560 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7392.000 0.000 NA   NA
 11430806 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7420.000 0.000 NA   NA
 11573169 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7420.000 0.000 NA   NA
 11715561 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7420.000 0.000 NA   NA
 11430807 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7456.000 0.000 NA   NA
 11573170 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7456.000 0.000 NA   NA
 11715562 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7456.000 0.000 NA   NA
 11430808 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7484.000 0.000 NA   NA
 11573171 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7484.000 0.000 NA   NA
 11715563 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7484.000 0.000 NA   NA
 11430809 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7521.000 0.000 NA   NA
 11573172 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7521.000 0.000 NA   NA
 11715564 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7521.000 0.000 NA   NA
 7550954 7550955 CLM_1142 CLM_1144     FALSE 0.004 498.000 0.000 NA   NA
 7550957 7550958 CLM_1146 CLM_1147     TRUE 0.980 26.000 0.833 NA   NA
 7550960 7550961 CLM_1149 CLM_1150   recQ FALSE 0.067 244.000 0.000 NA   NA
 7550961 7550962 CLM_1150 CLM_1151 recQ   FALSE 0.442 111.000 0.000 1.000 N NA
 7550964 7550965 CLM_1153 CLM_1154     TRUE 0.848 115.000 0.333 1.000   NA
 7550965 7550966 CLM_1154 CLM_1155     FALSE 0.005 448.000 0.000 NA   NA
 7550966 7550967 CLM_1155 CLM_1156     TRUE 0.987 2.000 0.444 NA   NA
 7550967 7550968 CLM_1156 CLM_1157     TRUE 0.983 0.000 0.167 NA   NA
 7550968 7550969 CLM_1157 CLM_1158     TRUE 0.990 2.000 0.077 1.000 Y NA
 7550969 7550970 CLM_1158 CLM_1159     TRUE 0.941 15.000 0.135 NA   NA
 7550970 7550971 CLM_1159 CLM_1160   lctP FALSE 0.004 481.000 0.000 NA   NA
 7550971 7550972 CLM_1160 CLM_1161 lctP   TRUE 0.905 29.000 0.098 NA   NA
 7550972 7550973 CLM_1161 CLM_1162     TRUE 0.846 43.000 0.098 NA   NA
 7550973 7550974 CLM_1162 CLM_1163     TRUE 0.993 32.000 0.875 0.012 Y NA
 7550974 7550975 CLM_1163 CLM_1164     TRUE 0.981 61.000 0.875 0.009 Y NA
 7550975 7550976 CLM_1164 CLM_1165     FALSE 0.047 269.000 0.000 NA   NA
 7550976 7550977 CLM_1165 CLM_1166     FALSE 0.275 128.000 0.000 NA   NA
 7550977 7550978 CLM_1166 CLM_1167     FALSE 0.141 195.000 0.000 NA   NA
 7550978 7550979 CLM_1167 CLM_1168     TRUE 0.957 2.000 0.051 NA   NA
 7550980 7550981 CLM_1169 CLM_1170     FALSE 0.002 929.000 0.000 NA   NA
 7550982 7550983 CLM_1171 CLM_1172     FALSE 0.222 303.000 0.000 0.058 Y NA
 7550983 7550984 CLM_1172 CLM_1173     FALSE 0.103 215.000 0.000 NA   NA
 7550986 7550987 CLM_1175 CLM_1176     TRUE 0.963 4.000 0.111 1.000   NA
 7550987 7550988 CLM_1176 CLM_1177     FALSE 0.107 262.000 0.000 1.000 N NA
 7550988 7550989 CLM_1177 CLM_1178     TRUE 0.797 16.000 0.000 1.000 N NA
 7550993 7550994 CLM_1182 CLM_1183     FALSE 0.273 134.000 0.000 NA   NA
 7550994 7550995 CLM_1183 CLM_1184     FALSE 0.003 584.000 0.000 NA   NA
 7550995 7550996 CLM_1184 CLM_1185   feoA TRUE 0.995 17.000 0.791 0.007 Y NA
 7550996 7550997 CLM_1185 CLM_1186 feoA feoB TRUE 0.991 32.000 0.871 1.000 Y NA
 7550997 7550998 CLM_1186 CLM_1187 feoB   TRUE 0.883 21.000 0.029 NA   NA
 7551000 7551001 CLM_1189 CLM_1190   tlp FALSE 0.032 299.000 0.000 NA   NA
 7551001 7551002 CLM_1190 CLM_1191 tlp   FALSE 0.099 218.000 0.000 NA   NA
 7551002 7551003 CLM_1191 CLM_1192     TRUE 0.997 1.000 0.462 1.000 Y NA
 7551003 7551004 CLM_1192 CLM_1193     FALSE 0.272 104.000 0.000 NA   NA
 7551004 7551005 CLM_1193 CLM_1194     FALSE 0.033 297.000 0.000 NA   NA
 7551007 7551008 CLM_1196 CLM_1197     FALSE 0.047 270.000 0.000 NA   NA
 7551008 7551009 CLM_1197 CLM_1198     TRUE 0.998 0.000 0.833 1.000 Y NA
 7551010 7551011 CLM_1199 CLM_1200     FALSE 0.126 236.000 0.000 NA N NA
 7551012 7551013 CLM_1201 CLM_1202     TRUE 0.999 -10.000 0.870 0.029 Y NA
 7551013 7551014 CLM_1202 CLM_1203     TRUE 0.999 -3.000 0.870 1.000 Y NA
 7551014 7551015 CLM_1203 CLM_1204     TRUE 0.925 74.000 0.196 1.000 Y NA
 7551015 7551016 CLM_1204 CLM_1205     FALSE 0.227 203.000 0.000 1.000 N NA
 7551016 7551017 CLM_1205 CLM_1206     FALSE 0.007 516.000 0.000 1.000 N NA
 7551017 7551018 CLM_1206 CLM_1207     TRUE 0.996 2.000 0.389 0.008 Y NA
 7551019 7551020 CLM_1208 CLM_1209     TRUE 0.997 3.000 1.000 NA Y NA
 7551020 7551021 CLM_1209 CLM_1210     FALSE 0.249 88.000 0.000 NA   NA
 7551021 7551022 CLM_1210 CLM_1212     FALSE 0.075 235.000 0.000 NA   NA
 7551023 7551024 CLM_1213 CLM_1214   chiA FALSE 0.274 188.000 0.000 0.005   NA
 7551024 7551025 CLM_1214 CLM_1215 chiA   FALSE 0.043 328.000 0.000 1.000 N NA
 7551025 7551026 CLM_1215 CLM_1216     FALSE 0.080 323.000 0.023 NA   NA
 7551026 7551027 CLM_1216 CLM_1217     FALSE 0.491 165.000 0.023 NA   NA
 7551027 7551028 CLM_1217 CLM_1218     FALSE 0.002 817.000 0.000 NA   NA
 7551028 7551029 CLM_1218 CLM_1219     TRUE 0.984 3.000 0.400 NA   NA
 7551030 7551031 CLM_1220 CLM_1221     FALSE 0.557 116.000 0.015 NA   NA
 7551032 7551033 CLM_1222 CLM_1223     FALSE 0.271 116.000 0.000 NA   NA
 7551035 7551036 CLM_1225 CLM_1226     FALSE 0.013 386.000 0.000 1.000   NA
 7551036 7551037 CLM_1226 CLM_1227     FALSE 0.078 247.000 0.000 1.000   NA
 7551037 7551038 CLM_1227 CLM_1228     FALSE 0.134 209.000 0.000 1.000   NA
 7551038 7551039 CLM_1228 CLM_1229     TRUE 0.827 56.000 0.107 0.032   NA
 7551039 7551040 CLM_1229 CLM_1230     TRUE 0.984 3.000 0.300 0.032   NA
 7551040 7551041 CLM_1230 CLM_1231   glpT TRUE 0.575 89.000 0.021 1.000   NA
 7551041 7551042 CLM_1231 CLM_1232 glpT argS FALSE 0.006 583.000 0.000 1.000 N NA
 7551042 7551043 CLM_1232 CLM_1233 argS arcT FALSE 0.019 399.000 0.000 1.000 N NA
 7551043 7551044 CLM_1233 CLM_1234 arcT   FALSE 0.308 139.000 0.000 1.000   NA
 7551045 7551046 CLM_1235 CLM_1236   feoB TRUE 0.876 26.000 0.034 NA   NA
 7551046 7551047 CLM_1236 CLM_1237 feoB feoA TRUE 0.988 15.000 0.308 1.000 Y NA
 7551048 7551049 CLM_1238 CLM_1239     FALSE 0.108 212.000 0.000 NA   NA
 7551049 7551050 CLM_1239 CLM_1240     FALSE 0.002 909.000 0.000 1.000   NA
 7551050 7551051 CLM_1240 CLM_1241     FALSE 0.009 412.000 0.000 1.000   NA
 7551051 7551052 CLM_1241 CLM_1243     FALSE 0.051 278.000 0.000 1.000   NA
 7551052 7551053 CLM_1243 CLM_1244     TRUE 0.996 2.000 0.511 1.000 Y NA
 7551053 7551054 CLM_1244 CLM_1245     TRUE 0.936 55.000 0.154 NA Y NA
 7551054 7551055 CLM_1245 CLM_1246     TRUE 0.866 188.000 0.250 NA Y NA
 7551055 7551056 CLM_1246 CLM_1247     FALSE 0.086 229.000 0.000 NA   NA
 7551056 7551057 CLM_1247 CLM_1248     FALSE 0.004 572.000 0.000 1.000   NA
 7551057 7551058 CLM_1248 CLM_1249     FALSE 0.004 506.000 0.000 1.000   NA
 7551058 7551059 CLM_1249 CLM_1250     FALSE 0.066 245.000 0.000 NA   NA
 7551059 7551060 CLM_1250 CLM_1251     FALSE 0.112 209.000 0.000 NA   NA
 7551064 7551065 CLM_1255 CLM_1256     FALSE 0.506 143.000 0.008 NA   NA
 7551065 7551066 CLM_1256 CLM_1257     TRUE 0.627 56.000 0.008 1.000   NA
 7551067 7551068 CLM_1258 CLM_1259     FALSE 0.027 597.000 0.000 0.003 Y NA
 7551069 7551070 CLM_1260 CLM_1261     TRUE 0.971 18.000 0.333 1.000 N NA
 7551070 7551071 CLM_1261 CLM_1262     FALSE 0.009 419.000 0.000 1.000   NA
 7551071 7551072 CLM_1262 CLM_1263     FALSE 0.265 99.000 0.000 NA   NA
 7551072 7551073 CLM_1263 CLM_1264     FALSE 0.002 803.000 0.000 NA   NA
 7551073 7551074 CLM_1264 CLM_1266     TRUE 0.979 2.000 0.217 NA   NA
 7551074 7551075 CLM_1266 CLM_1267     TRUE 0.980 19.000 0.084 0.029 Y NA
 7551075 7551076 CLM_1267 CLM_1268     TRUE 0.980 12.000 0.308 0.029 N NA
 7551076 7551077 CLM_1268 CLM_1269     FALSE 0.029 303.000 0.000 NA   NA
 7551077 7551078 CLM_1269 CLM_1270     TRUE 0.575 104.000 0.020 NA   NA
 7551078 7551079 CLM_1270 CLM_1271     TRUE 0.761 10.000 0.000 1.000   NA
 7551079 7551080 CLM_1271 CLM_1272     FALSE 0.267 76.000 0.000 NA   NA
 7551080 7551081 CLM_1272 CLM_1273     TRUE 0.963 1.000 0.050 NA   NA
 7551081 7551082 CLM_1273 CLM_1274   maa FALSE 0.038 288.000 0.000 NA   NA
 7551084 7551085 CLM_1276 CLM_1277     FALSE 0.053 276.000 0.000 1.000   NA
 7551085 7551086 CLM_1277 CLM_1278     FALSE 0.518 160.000 0.017 1.000   NA
 7551088 7551089 CLM_1280 CLM_1281   mgtE FALSE 0.004 501.000 0.000 NA   NA
 7551089 7551090 CLM_1281 CLM_1282 mgtE   FALSE 0.004 1009.000 0.000 0.055 N NA
 7551090 7551091 CLM_1282 CLM_1283     TRUE 0.745 226.000 0.110 0.055 Y NA
 7551091 7551092 CLM_1283 CLM_1284     TRUE 0.991 -22.000 0.072 NA   NA
 7551092 7551093 CLM_1284 CLM_1285     FALSE 0.002 653.000 0.000 NA   NA
 7551093 7551094 CLM_1285 CLM_1286     TRUE 0.591 167.000 0.056 1.000   NA
 7551096 7551097 CLM_1288 CLM_1289     TRUE 0.754 111.000 0.118 1.000   NA
 7551097 7551098 CLM_1289 CLM_1290     FALSE 0.039 299.000 0.000 1.000   NA
 7551098 7551099 CLM_1290 CLM_1291     FALSE 0.521 159.000 0.004 NA N NA
 7551099 7551100 CLM_1291 CLM_1292     FALSE 0.267 76.000 0.000 NA   NA
 7551100 7551101 CLM_1292 CLM_1293     FALSE 0.042 277.000 0.000 NA   NA
 7551101 7551102 CLM_1293 CLM_1294     TRUE 0.581 178.000 0.091 NA   NA
 7551102 7551103 CLM_1294 CLM_1295   xpt TRUE 0.564 161.000 0.009 1.000 N NA
 7551103 7551104 CLM_1295 CLM_1296 xpt   FALSE 0.032 298.000 0.000 NA   NA
 7551104 7551105 CLM_1296 CLM_1297     FALSE 0.034 296.000 0.000 NA   NA
 7551105 7551106 CLM_1297 CLM_1298     TRUE 0.790 199.000 0.667 NA   NA
 7551106 7551107 CLM_1298 CLM_1299     FALSE 0.018 344.000 0.000 NA   NA
 7551107 7551108 CLM_1299 CLM_1300     FALSE 0.170 180.000 0.000 NA   NA
 7551108 7551109 CLM_1300 CLM_1301     TRUE 0.674 137.000 0.065 NA   NA
 7551111 7551112 CLM_1303 CLM_1304     TRUE 0.875 182.000 1.000 NA   NA
 7551112 7551113 CLM_1304 CLM_1305     FALSE 0.010 393.000 0.000 NA   NA
 7551113 7551114 CLM_1305 CLM_1306     TRUE 0.997 2.000 0.667 0.029 Y NA
 7551114 7551115 CLM_1306 CLM_1307     TRUE 0.999 -37.000 0.900 0.029 N NA
 7551117 7551118 CLM_1309 CLM_1310   rpsA FALSE 0.010 392.000 0.000 NA   NA
 7551118 7551119 CLM_1310 CLM_1311 rpsA   FALSE 0.394 183.000 0.008 1.000   NA
 7551119 7551120 CLM_1311 CLM_1312     TRUE 0.570 172.000 0.067 NA   NA
 7551120 7551121 CLM_1312 CLM_1313     FALSE 0.002 871.000 0.000 NA   NA
 7551121 7551122 CLM_1313 CLM_1314     TRUE 0.995 0.000 0.857 NA   NA
 7551122 7551123 CLM_1314 CLM_1315     TRUE 0.996 -37.000 0.231 1.000   NA
 7551123 7551124 CLM_1315 CLM_1316     FALSE 0.020 329.000 0.000 NA   NA
 7551124 7551125 CLM_1316 CLM_1317     FALSE 0.006 433.000 0.000 NA   NA
 7551127 7551128 CLM_1319 CLM_1320     TRUE 0.977 -6.000 0.012 NA N NA
 7551128 7551129 CLM_1320 CLM_1321   panE FALSE 0.007 492.000 0.000 NA N NA
 7551129 7551130 CLM_1321 CLM_1322 panE   FALSE 0.055 307.000 0.000 1.000 N NA
 7551130 7551131 CLM_1322 CLM_1323   folD TRUE 0.987 0.000 0.082 0.001 N NA
 7551131 7551132 CLM_1323 CLM_1324 folD   FALSE 0.043 294.000 0.000 1.000   NA
 7551134 7551135 CLM_1326 CLM_1327     TRUE 0.827 117.000 0.286 NA   NA
 7551135 7551136 CLM_1327 CLM_1328     FALSE 0.545 120.000 0.012 NA   NA
 7551136 7551137 CLM_1328 CLM_1329     FALSE 0.004 672.000 0.000 NA N NA
 7551137 7551138 CLM_1329 CLM_1330   cysK FALSE 0.146 329.000 0.083 NA N NA
 7551138 7551139 CLM_1330 CLM_1331 cysK   TRUE 0.974 45.000 0.400 1.000 Y NA
 7551139 7551140 CLM_1331 CLM_1332     TRUE 0.985 35.000 0.400 0.029 Y NA
 7551140 7551141 CLM_1332 CLM_1333     TRUE 0.938 101.000 0.286 1.000 Y NA
 7551141 7551142 CLM_1333 CLM_1334     FALSE 0.324 72.000 0.000 1.000   NA
 7551142 7551143 CLM_1334 CLM_1335     FALSE 0.470 155.000 0.008 NA   NA
 7551143 7551144 CLM_1335 CLM_1336   trmU FALSE 0.504 116.000 0.004 NA   NA
 7551146 7551147 CLM_1338 CLM_1340     TRUE 0.999 -3.000 0.875 NA Y NA
 7551147 7551148 CLM_1340 CLM_1341   bcrA FALSE 0.023 374.000 0.000 NA N NA
 7551148 7551149 CLM_1341 CLM_1342 bcrA   TRUE 0.993 -7.000 0.333 NA   NA
 7551149 7551150 CLM_1342 CLM_1343     FALSE 0.007 423.000 0.000 NA   NA
 7551150 7551151 CLM_1343 CLM_1344     FALSE 0.015 355.000 0.000 NA   NA
 7551153 7551154 CLM_1346 CLM_1347     FALSE 0.270 137.000 0.000 NA   NA
 7551154 7551155 CLM_1347 CLM_1348     FALSE 0.031 300.000 0.000 NA   NA
 7551155 7551156 CLM_1348 CLM_1349     FALSE 0.003 589.000 0.000 NA   NA
 7551158 7551159 CLM_1352 CLM_1353     TRUE 0.812 14.000 0.000 1.000 N NA
 7551159 7551160 CLM_1353 CLM_1354     FALSE 0.440 64.000 0.000 NA N NA
 7551160 7551161 CLM_1354 CLM_1355     TRUE 0.965 3.000 0.000 NA Y NA
 7551161 7551162 CLM_1355 CLM_1356     FALSE 0.004 668.000 0.000 0.005   NA
 7551162 7551163 CLM_1356 CLM_1358   tyrS FALSE 0.003 639.000 0.000 1.000   NA
 7551163 7551164 CLM_1358 CLM_1359 tyrS   FALSE 0.081 281.000 0.000 1.000 N NA
 7551164 7551165 CLM_1359 CLM_1360     TRUE 0.998 -7.000 0.833 1.000 N NA
 7551165 7551166 CLM_1360 CLM_1361     TRUE 0.985 1.000 0.278 NA   NA
 7551168 7551169 CLM_1363 CLM_1364     FALSE 0.251 91.000 0.000 NA   NA
 7551169 7551170 CLM_1364 CLM_1365     FALSE 0.149 189.000 0.000 NA   NA
 7551170 7551171 CLM_1365 CLM_1367     FALSE 0.259 78.000 0.000 NA   NA
 7551171 7551172 CLM_1367 CLM_1368     TRUE 0.620 174.000 0.095 1.000   NA
 7551172 7551173 CLM_1368 CLM_1369   sdhB FALSE 0.019 400.000 0.000 1.000 N NA
 7551173 7551174 CLM_1369 CLM_1370 sdhB sdhA TRUE 0.988 13.000 0.146 0.001 Y NA
 7551178 7551179 CLM_1374 CLM_1375     FALSE 0.285 70.000 0.000 NA   NA
 7551180 7551181 CLM_1376 CLM_1377     FALSE 0.011 385.000 0.000 NA   NA
 7551181 7551182 CLM_1377 CLM_1378     TRUE 0.765 106.000 0.154 NA   NA
 7551182 7551183 CLM_1378 CLM_1379     TRUE 0.980 2.000 0.231 NA   NA
 7551183 7551184 CLM_1379 CLM_1380     TRUE 0.929 37.000 0.286 NA   NA
 7551184 7551185 CLM_1380 CLM_1381     TRUE 0.656 173.000 0.071 1.000 N NA
 7551185 7551186 CLM_1381 CLM_1382     TRUE 0.997 6.000 0.786 0.028 Y NA
 7551186 7551187 CLM_1382 CLM_1383     TRUE 0.934 199.000 0.688 0.028 Y NA
 7551188 7551189 CLM_1384 CLM_1385   cotJB TRUE 0.897 34.000 0.125 NA   NA
 7551189 7551190 CLM_1385 CLM_1386 cotJB cotJC TRUE 0.861 31.000 0.047 NA   NA
 7551190 7551191 CLM_1386 CLM_1387 cotJC   FALSE 0.144 230.000 0.000 NA N NA
 7551191 7551192 CLM_1387 CLM_1388     TRUE 0.978 17.000 0.667 NA   NA
 7551192 7551193 CLM_1388 CLM_1389     FALSE 0.003 594.000 0.000 NA   NA
 7551196 7551197 CLM_1392 CLM_1393     FALSE 0.004 516.000 0.000 NA   NA
 7551200 7551201 CLM_1396 CLM_1397     FALSE 0.503 37.000 0.000 NA   NA
 7551201 7551202 CLM_1397 CLM_1398     FALSE 0.077 234.000 0.000 NA   NA
 7551202 7551203 CLM_1398 CLM_1399     TRUE 0.970 15.000 0.400 NA   NA
 7551203 7551204 CLM_1399 CLM_1400     TRUE 0.995 -3.000 0.667 NA   NA
 7551204 7551205 CLM_1400 CLM_1401     TRUE 0.995 -3.000 0.667 NA   NA
 7551205 7551206 CLM_1401 CLM_1402     TRUE 0.985 20.000 1.000 NA   NA
 7551206 7551207 CLM_1402 CLM_1403     TRUE 0.988 12.000 1.000 NA   NA
 7551209 7551210 CLM_1405 CLM_1406     FALSE 0.002 663.000 0.000 NA   NA
 7551210 7551211 CLM_1406 CLM_1407     FALSE 0.273 123.000 0.000 NA   NA
 7551211 7551212 CLM_1407 CLM_1408     FALSE 0.002 647.000 0.000 NA   NA
 7551212 7551213 CLM_1408 CLM_1409     FALSE 0.040 283.000 0.000 NA   NA
 7551213 7551214 CLM_1409 CLM_1410     FALSE 0.024 319.000 0.000 NA   NA
 7551215 7551216 CLM_1411 CLM_1412     TRUE 0.819 40.000 0.014 1.000 N NA
 7551217 7551218 CLM_1414 CLM_1415 grdX grdE TRUE 0.846 91.000 0.400 NA   NA
 7551218 7551219 CLM_1415 CLM_1416 grdE grdB TRUE 0.946 33.000 0.222 0.003   NA
 7551219 7551220 CLM_1416 CLM_1418 grdB trxB FALSE 0.276 151.000 0.000 1.000   NA
 7551220 7551221 CLM_1418 CLM_1419 trxB   TRUE 0.976 34.000 0.226 1.000 Y NA
 7551221 7551222 CLM_1419 CLM_1420   grdA TRUE 0.667 86.000 0.065 1.000   NA
 7551222 7551223 CLM_1420 CLM_1421 grdA grdA TRUE 0.989 16.000 1.000 0.002   NA
 7551223 7551224 CLM_1421 CLM_1422 grdA grdC TRUE 0.727 95.000 0.054 0.003   NA
 7551224 7551225 CLM_1422 CLM_1423 grdC grdD TRUE 0.983 16.000 0.622 0.003   NA
 7551225 7551226 CLM_1423 CLM_1424 grdD   FALSE 0.013 427.000 0.000 1.000 N NA
 7551226 7551227 CLM_1424 CLM_1425     TRUE 0.630 66.000 0.005 0.055   NA
 7551227 7551228 CLM_1425 CLM_1426   mtnK FALSE 0.007 437.000 0.000 1.000   NA
 7551228 7551229 CLM_1426 CLM_1427 mtnK mtnA TRUE 0.731 140.000 0.104 1.000   NA
 7551229 7551230 CLM_1427 CLM_1428 mtnA   TRUE 0.640 24.000 0.000 NA   NA
 7551230 7551231 CLM_1428 CLM_1429     TRUE 0.644 17.000 0.000 NA   NA
 7551231 7551232 CLM_1429 CLM_1430     TRUE 0.920 174.000 0.400 1.000 Y NA
 7551232 7551233 CLM_1430 CLM_1431     FALSE 0.026 309.000 0.000 NA   NA
 7551235 7551236 CLM_1433 CLM_1434     TRUE 0.612 162.000 0.074 NA   NA
 7551236 7551237 CLM_1434 CLM_1435     TRUE 0.630 128.000 0.038 NA   NA
 7551237 7551238 CLM_1435 CLM_1436     TRUE 0.985 -3.000 0.135 NA   NA
 7551238 7551239 CLM_1436 CLM_1437     FALSE 0.003 535.000 0.000 NA   NA
 7551239 7551240 CLM_1437 CLM_1438     TRUE 0.805 48.000 0.080 NA   NA
 7551241 7551242 CLM_1439 CLM_1440     FALSE 0.012 381.000 0.000 NA   NA
 7551242 7551243 CLM_1440 CLM_1441     TRUE 0.631 25.000 0.000 NA   NA
 7551244 7551245 CLM_1442 CLM_1443     TRUE 0.973 28.000 0.667 NA   NA
 7551245 7551246 CLM_1443 CLM_1444     TRUE 0.831 57.000 0.200 NA   NA
 7551246 7551247 CLM_1444 CLM_1445     TRUE 0.994 14.000 0.500 0.001 Y NA
 7551247 7551248 CLM_1445 CLM_1446     TRUE 0.991 32.000 0.667 0.041 Y NA
 7551248 7551249 CLM_1446 CLM_1447     TRUE 0.783 116.000 0.100 1.000 N NA
 7551249 7551250 CLM_1447 CLM_1448   topB FALSE 0.022 388.000 0.000 1.000 N NA
 7551250 7551251 CLM_1448 CLM_1449 topB   FALSE 0.004 473.000 0.000 NA   NA
 7551251 7551252 CLM_1449 CLM_1450     FALSE 0.292 67.000 0.000 NA   NA
 7551254 7551255 CLM_1452 CLM_1453     FALSE 0.011 401.000 0.000 1.000   NA
 7551255 7551256 CLM_1453 CLM_1454     FALSE 0.034 305.000 0.000 1.000   NA
 7551256 7551257 CLM_1454 CLM_1455     FALSE 0.048 321.000 0.000 1.000 N NA
 7551257 7551258 CLM_1455 CLM_1456     TRUE 0.985 -7.000 0.067 1.000   NA
 7551258 7551259 CLM_1456 CLM_1457     TRUE 0.927 6.000 0.033 NA   NA
 7551259 7551260 CLM_1457 CLM_1458     FALSE 0.294 293.000 0.230 NA   NA
 7551260 7551261 CLM_1458 CLM_1459     FALSE 0.007 416.000 0.000 NA   NA
 7551261 7551262 CLM_1459 CLM_1460     FALSE 0.088 228.000 0.000 NA   NA
 7551262 7551263 CLM_1460 CLM_1461     FALSE 0.019 335.000 0.000 NA   NA
 7551263 7551264 CLM_1461 CLM_1462     FALSE 0.043 276.000 0.000 NA   NA
 7551264 7551265 CLM_1462 CLM_1463     TRUE 0.929 37.000 0.287 NA   NA
 7551265 7551266 CLM_1463 CLM_1464   copZ TRUE 0.887 123.000 0.024 0.001 Y NA
 7551266 7551267 CLM_1464 CLM_1465 copZ   FALSE 0.197 302.000 0.000 1.000 Y NA
 7551267 7551268 CLM_1465 CLM_1466     FALSE 0.069 296.000 0.000 1.000 N NA
 7551268 7551269 CLM_1466 CLM_1467     FALSE 0.019 340.000 0.000 NA   NA
 7551269 7551270 CLM_1467 CLM_1468     FALSE 0.545 164.000 0.040 NA   NA
 7551270 7551271 CLM_1468 CLM_1469     FALSE 0.046 271.000 0.000 NA   NA
 7551271 7551272 CLM_1469 CLM_1470     TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 7551272 7551273 CLM_1470 CLM_1471     FALSE 0.107 213.000 0.000 NA   NA
 7551273 7551274 CLM_1471 CLM_1473     FALSE 0.016 350.000 0.000 NA   NA
 7551276 7551277 CLM_1475 CLM_1476     TRUE 0.685 13.000 0.000 NA   NA
 7551277 7551278 CLM_1476 CLM_1477     TRUE 0.912 -7.000 0.000 NA   NA
 7551278 7551279 CLM_1477 CLM_1478     FALSE 0.248 85.000 0.000 NA   NA
 7551279 7551280 CLM_1478 CLM_1479     FALSE 0.043 276.000 0.000 NA   NA
 7551280 7551281 CLM_1479 CLM_1480     FALSE 0.044 275.000 0.000 NA   NA
 7551281 7551282 CLM_1480 CLM_1481     FALSE 0.274 108.000 0.000 NA   NA
 7551282 7551283 CLM_1481 CLM_1482     FALSE 0.301 64.000 0.000 NA   NA
 7551283 7551284 CLM_1482 CLM_1483     FALSE 0.473 40.000 0.000 NA   NA
 7551284 7551285 CLM_1483 CLM_1484     FALSE 0.002 1144.000 0.000 NA   NA
 7551285 7551286 CLM_1484 CLM_1485     TRUE 0.673 14.000 0.000 NA   NA
 7551286 7551287 CLM_1485 CLM_1486     FALSE 0.221 158.000 0.000 NA   NA
 7551287 7551288 CLM_1486 CLM_1487     FALSE 0.527 34.000 0.000 NA   NA
 7551288 7551289 CLM_1487 CLM_1488     FALSE 0.005 454.000 0.000 NA   NA
 7551289 7551290 CLM_1488 CLM_1489     TRUE 0.804 38.000 0.032 NA   NA
 7551292 7551293 CLM_1491 CLM_1492     FALSE 0.003 593.000 0.000 NA   NA
 7551293 7551294 CLM_1492 CLM_1493   trkA FALSE 0.002 782.000 0.000 NA   NA
 7551294 7551295 CLM_1493 CLM_1494 trkA trkH TRUE 0.997 -3.000 0.163 0.004 Y NA
 7551295 7551296 CLM_1494 CLM_1495 trkH   FALSE 0.017 407.000 0.000 1.000 N NA
 7551297 7551298 CLM_1496 CLM_1497     TRUE 0.945 15.000 0.158 NA   NA
 7551298 7551299 CLM_1497 CLM_1498     FALSE 0.006 457.000 0.000 1.000   NA
 7551300 7551301 CLM_1500 CLM_1501 rbr   FALSE 0.008 475.000 0.000 NA N NA
 7551303 7551304 CLM_1503 CLM_1504     FALSE 0.011 386.000 0.000 NA   NA
 7551304 7551305 CLM_1504 CLM_1505     FALSE 0.035 295.000 0.000 NA   NA
 7551305 7551306 CLM_1505 CLM_1506     TRUE 0.681 209.000 0.312 NA N NA
 7551306 7551307 CLM_1506 CLM_1507     TRUE 0.872 147.000 0.077 NA Y NA
 7551307 7551308 CLM_1507 CLM_1508   noxA FALSE 0.527 199.000 0.111 NA   NA
 7551310 7551311 CLM_1510 CLM_1511     FALSE 0.164 301.000 0.083 NA   NA
 7551313 7551314 CLM_1513 CLM_1514     FALSE 0.059 303.000 0.000 1.000 N NA
 7551314 7551315 CLM_1514 CLM_1515     TRUE 0.985 22.000 0.214 1.000 Y NA
 7551315 7551316 CLM_1515 CLM_1516     TRUE 0.993 3.000 0.255 1.000 Y NA
 7551317 7551318 CLM_1517 CLM_1518     TRUE 0.749 75.000 0.133 NA   NA
 7551319 7551320 CLM_1519 CLM_1520   murQ FALSE 0.085 280.000 0.000 0.003   NA
 7551320 7551321 CLM_1520 CLM_1521 murQ   TRUE 0.743 113.000 0.107 1.000   NA
 7551321 7551322 CLM_1521 CLM_1522     FALSE 0.545 191.000 0.089 1.000   NA
 7551322 7551323 CLM_1522 CLM_1523     FALSE 0.020 332.000 0.000 NA   NA
 7551323 7551324 CLM_1523 CLM_1524     FALSE 0.040 283.000 0.000 NA   NA
 7551324 7551325 CLM_1524 CLM_1525     FALSE 0.027 306.000 0.000 NA   NA
 7551325 7551326 CLM_1525 CLM_1526     TRUE 0.917 53.000 0.500 NA   NA
 7551326 7551327 CLM_1526 CLM_1527     TRUE 0.987 0.000 0.250 NA   NA
 7551329 7551330 CLM_1529 CLM_1530     FALSE 0.017 407.000 0.000 1.000 N NA
 7551330 7551331 CLM_1530 CLM_1531     TRUE 0.997 -3.000 0.235 0.028 Y NA
 7551331 7551332 CLM_1531 CLM_1532     TRUE 0.993 9.000 0.353 0.028 Y NA
 7551332 7551333 CLM_1532 CLM_1533     TRUE 0.905 99.000 0.118 1.000 Y NA
 7551333 7551334 CLM_1533 CLM_1534     TRUE 0.985 -6.000 0.059 0.029   NA
 7551334 7551335 CLM_1534 CLM_1535     FALSE 0.005 467.000 0.000 NA   NA
 7551336 7551337 CLM_1536 CLM_1537     TRUE 0.996 0.000 0.231 1.000 Y NA
 7551340 7551341 CLM_1540 CLM_1541     TRUE 0.684 135.000 0.025 1.000 N NA
 7551341 7551342 CLM_1541 CLM_1542     FALSE 0.003 913.000 0.000 NA N NA
 7551342 7551343 CLM_1542 CLM_1543     TRUE 0.999 -28.000 0.646 NA Y NA
 7551343 7551344 CLM_1543 CLM_1544     TRUE 0.934 140.000 0.270 1.000 Y NA
 7551344 7551345 CLM_1544 CLM_1545     FALSE 0.259 279.000 0.000 1.000 Y NA
 7551345 7551346 CLM_1545 CLM_1546     TRUE 0.992 -30.000 0.035 0.055   NA
 7551346 7551347 CLM_1546 CLM_1547     TRUE 0.646 127.000 0.035 1.000   NA
 7551347 7551348 CLM_1547 CLM_1548     FALSE 0.426 45.000 0.000 NA   NA
 7551348 7551349 CLM_1548 CLM_1549   rnz FALSE 0.275 132.000 0.000 NA   NA
 7551349 7551350 CLM_1549 CLM_1550 rnz   FALSE 0.021 346.000 0.000 1.000   NA
 7551350 7551351 CLM_1550 CLM_1551     FALSE 0.252 145.000 0.000 NA   NA
 7551351 7551352 CLM_1551 CLM_1552     FALSE 0.445 172.000 0.015 NA   NA
 7551352 7551353 CLM_1552 CLM_1553     TRUE 0.897 234.000 0.800 0.019 Y NA
 7551353 7551354 CLM_1553 CLM_1554     FALSE 0.203 403.000 0.600 1.000 N NA
 7551354 7551355 CLM_1554 CLM_1555     TRUE 0.974 106.000 1.000 NA Y NA
 7551355 7551356 CLM_1555 CLM_1556     TRUE 0.990 2.000 0.600 NA   NA
 7551356 7551357 CLM_1556 CLM_1557     TRUE 0.985 4.000 0.500 NA   NA
 7551358 7551359 CLM_1559 CLM_1560     FALSE 0.003 558.000 0.000 NA   NA
 7551359 7551360 CLM_1560 CLM_1561     TRUE 0.744 168.000 0.250 NA   NA
 7551361 7551362 CLM_1562 CLM_1563 pepD   FALSE 0.372 58.000 0.000 1.000   NA
 7551362 7551363 CLM_1563 CLM_1564   pdxK FALSE 0.060 266.000 0.000 1.000   NA
 7551365 7551366 CLM_1566 CLM_1567     TRUE 0.997 -13.000 0.500 1.000   NA
 7551366 7551367 CLM_1567 CLM_1568     TRUE 0.808 177.000 0.500 NA   NA
 7551367 7551368 CLM_1568 CLM_1569     FALSE 0.006 443.000 0.000 NA   NA
 7551368 7551369 CLM_1569 CLM_1570     TRUE 0.998 2.000 1.000 1.000 Y NA
 7551369 7551370 CLM_1570 CLM_1571     TRUE 0.907 74.000 0.500 1.000 N NA
 7551370 7551371 CLM_1571 CLM_1572     TRUE 0.993 -10.000 0.222 1.000   NA
 7551371 7551372 CLM_1572 CLM_1573     FALSE 0.286 69.000 0.000 NA   NA
 7551372 7551373 CLM_1573 CLM_1575     FALSE 0.017 347.000 0.000 NA   NA
 7551373 7551374 CLM_1575 CLM_1576     FALSE 0.011 384.000 0.000 NA   NA
 7551374 7551375 CLM_1576 CLM_1577     TRUE 0.716 197.000 0.024 1.000 Y NA
 7551375 7551376 CLM_1577 CLM_1578     TRUE 0.996 13.000 0.833 0.028 Y NA
 7551376 7551377 CLM_1578 CLM_1579     TRUE 0.989 19.000 0.400 1.000 Y NA
 7551377 7551378 CLM_1579 CLM_1580     FALSE 0.008 426.000 0.000 1.000   NA
 7551382 7551383 CLM_1584 CLM_1585     FALSE 0.011 384.000 0.000 NA   NA
 7551383 7551384 CLM_1585 CLM_1586     TRUE 0.818 173.000 0.500 NA   NA
 7551386 7551387 CLM_1588 CLM_1589     TRUE 0.997 2.000 0.643 0.028 Y NA
 7551387 7551388 CLM_1589 CLM_1590     TRUE 0.638 131.000 0.041 NA   NA
 7551388 7551389 CLM_1590 CLM_1591     FALSE 0.258 95.000 0.000 NA   NA
 7551389 7551390 CLM_1591 CLM_1592     FALSE 0.016 351.000 0.000 NA   NA
 7551390 7551391 CLM_1592 CLM_1593     FALSE 0.123 203.000 0.000 NA   NA
 7551391 7551392 CLM_1593 CLM_1594     TRUE 0.807 88.000 0.250 1.000   NA
 7551392 7551393 CLM_1594 CLM_1595     FALSE 0.384 56.000 0.000 1.000   NA
 7551393 7551394 CLM_1595 CLM_1596     FALSE 0.005 661.000 0.000 1.000 N NA
 7551394 7551395 CLM_1596 CLM_1597   spoVB TRUE 0.915 32.000 0.137 1.000   NA
 7551399 7551400 CLM_1601 CLM_1602     FALSE 0.029 361.000 0.000 1.000 N NA
 7551401 7551402 CLM_1604 CLM_1605   npr FALSE 0.195 169.000 0.000 NA   NA
 7551402 7551403 CLM_1605 CLM_1606 npr npr TRUE 0.979 137.000 1.000 0.004 Y NA
 7551403 7551404 CLM_1606 CLM_1607 npr npr TRUE 0.795 117.000 0.000 0.004 Y NA
 7551404 7551405 CLM_1607 CLM_1608 npr npr TRUE 0.796 120.000 0.000 0.004 Y NA
 7551405 7551406 CLM_1608 CLM_1609 npr   TRUE 0.796 121.000 0.000 0.004 Y NA
 7551406 7551407 CLM_1609 CLM_1610   nadC FALSE 0.005 603.000 0.000 1.000 N NA
 7551407 7551408 CLM_1610 CLM_1611 nadC nadB TRUE 0.997 -19.000 0.046 1.000 Y NA
 7551408 7551409 CLM_1611 CLM_1612 nadB nadA TRUE 0.985 3.000 0.042 1.000 Y NA
 7551411 7551412 CLM_1614 CLM_1615     TRUE 0.947 -13.000 0.000 1.000   NA
 7551415 7551416 CLM_1618 CLM_1619     TRUE 0.839 1.000 0.000 NA   NA
 7551416 7551417 CLM_1619 CLM_1620     TRUE 0.839 1.000 0.000 NA   NA
 7551417 7551418 CLM_1620 CLM_1621     TRUE 0.685 13.000 0.000 NA   NA
 7551418 7551419 CLM_1621 CLM_1622     TRUE 0.786 3.000 0.000 NA   NA
 7551419 7551420 CLM_1622 CLM_1623     TRUE 0.651 16.000 0.000 NA   NA
 7551420 7551421 CLM_1623 CLM_1624     TRUE 0.673 14.000 0.000 NA   NA
 7551421 7551422 CLM_1624 CLM_1625     TRUE 0.912 -7.000 0.000 NA   NA
 7551422 7551423 CLM_1625 CLM_1626     TRUE 0.786 3.000 0.000 NA   NA
 7551423 7551424 CLM_1626 CLM_1627     FALSE 0.397 49.000 0.000 NA   NA
 7551424 7551425 CLM_1627 CLM_1628     TRUE 0.947 -22.000 0.000 NA   NA
 7551425 7551426 CLM_1628 CLM_1629     TRUE 0.863 0.000 0.000 NA   NA
 7551426 7551427 CLM_1629 CLM_1631     FALSE 0.274 133.000 0.000 NA   NA
 7551427 7551428 CLM_1631 CLM_1632     TRUE 0.969 0.000 0.051 NA   NA
 7551428 7551429 CLM_1632 CLM_1633     TRUE 0.815 2.000 0.000 NA   NA
 7551429 7551430 CLM_1633 CLM_1634     TRUE 0.713 11.000 0.000 NA   NA
 7551430 7551431 CLM_1634 CLM_1635     FALSE 0.270 341.000 0.500 NA   NA
 7551431 7551432 CLM_1635 CLM_1636     TRUE 0.685 13.000 0.000 NA   NA
 7551432 7551433 CLM_1636 CLM_1637     TRUE 0.786 3.000 0.000 NA   NA
 7551433 7551434 CLM_1637 CLM_1638     TRUE 0.700 12.000 0.000 NA   NA
 7551434 7551435 CLM_1638 CLM_1639     FALSE 0.403 48.000 0.000 NA   NA
 7551435 7551436 CLM_1639 CLM_1640     FALSE 0.437 44.000 0.000 NA   NA
 7551436 7551437 CLM_1640 CLM_1641     TRUE 0.663 15.000 0.000 NA   NA
 7551437 7551438 CLM_1641 CLM_1642     FALSE 0.312 61.000 0.000 NA   NA
 7551438 7551439 CLM_1642 CLM_1643     FALSE 0.280 72.000 0.000 NA   NA
 7551439 7551440 CLM_1643 CLM_1644     FALSE 0.483 39.000 0.000 NA   NA
 7551440 7551441 CLM_1644 CLM_1645     FALSE 0.275 129.000 0.000 NA   NA
 7551441 7551442 CLM_1645 CLM_1646     FALSE 0.274 107.000 0.000 NA   NA
 7551442 7551443 CLM_1646 CLM_1647     TRUE 0.995 -3.000 0.667 NA   NA
 7551443 7551444 CLM_1647 CLM_1648     TRUE 0.998 -13.000 1.000 NA   NA
 7551444 7551445 CLM_1648 CLM_1649     TRUE 0.988 12.000 1.000 NA   NA
 7551445 7551446 CLM_1649 CLM_1650     TRUE 0.928 -10.000 0.000 NA   NA
 7551446 7551447 CLM_1650 CLM_1651     FALSE 0.055 260.000 0.000 NA   NA
 7551447 7551448 CLM_1651 CLM_1652     TRUE 0.987 1.000 0.333 NA   NA
 7551448 7551449 CLM_1652 CLM_1653     FALSE 0.032 298.000 0.000 NA   NA
 7551449 7551450 CLM_1653 CLM_1654     FALSE 0.345 55.000 0.000 NA   NA
 7551450 7551451 CLM_1654 CLM_1655     FALSE 0.214 161.000 0.000 NA   NA
 7551451 7551452 CLM_1655 CLM_1656     TRUE 0.994 0.000 0.750 NA   NA
 7551452 7551453 CLM_1656 CLM_1657     TRUE 0.959 12.000 0.200 NA   NA
 7551453 7551454 CLM_1657 CLM_1658     TRUE 0.993 -13.000 0.200 NA   NA
 7551454 7551455 CLM_1658 CLM_1659     FALSE 0.483 39.000 0.000 NA   NA
 7551455 7551456 CLM_1659 CLM_1660     FALSE 0.426 45.000 0.000 NA   NA
 7551456 7551457 CLM_1660 CLM_1661     TRUE 0.646 19.000 0.000 NA   NA
 7551457 7551458 CLM_1661 CLM_1662     TRUE 0.722 10.000 0.000 NA   NA
 7551458 7551459 CLM_1662 CLM_1663     TRUE 0.786 3.000 0.000 NA   NA
 7551459 7551460 CLM_1663 CLM_1664     FALSE 0.312 61.000 0.000 NA   NA
 7551460 7551461 CLM_1664 CLM_1665     FALSE 0.123 203.000 0.000 NA   NA
 7551461 7551462 CLM_1665 CLM_1666     TRUE 0.979 5.000 0.375 NA   NA
 7551462 7551463 CLM_1666 CLM_1667     TRUE 0.713 11.000 0.000 NA   NA
 7551463 7551464 CLM_1667 CLM_1668     TRUE 0.651 16.000 0.000 NA   NA
 7551464 7551465 CLM_1668 CLM_1669     FALSE 0.286 69.000 0.000 NA   NA
 7551465 7551466 CLM_1669 CLM_1670     FALSE 0.511 36.000 0.000 NA   NA
 7551466 7551467 CLM_1670 CLM_1671     FALSE 0.409 47.000 0.000 NA   NA
 7551467 7551468 CLM_1671 CLM_1672     TRUE 0.863 0.000 0.000 NA   NA
 7551468 7551469 CLM_1672 CLM_1673     TRUE 0.960 11.000 0.188 NA   NA
 7551469 7551470 CLM_1673 CLM_1674     TRUE 0.957 12.000 0.188 NA   NA
 7551470 7551471 CLM_1674 CLM_1675     TRUE 0.986 12.000 0.833 NA   NA
 7551471 7551472 CLM_1675 CLM_1676     TRUE 0.981 12.000 0.600 NA   NA
 7551472 7551473 CLM_1676 CLM_1677     TRUE 0.713 11.000 0.000 NA   NA
 7551473 7551474 CLM_1677 CLM_1678     TRUE 0.651 16.000 0.000 NA   NA
 7551474 7551475 CLM_1678 CLM_1679     TRUE 0.651 16.000 0.000 NA   NA
 7551475 7551476 CLM_1679 CLM_1680     FALSE 0.249 88.000 0.000 NA   NA
 7551476 7551477 CLM_1680 CLM_1681     TRUE 0.991 2.000 0.667 NA   NA
 7551477 7551478 CLM_1681 CLM_1682     FALSE 0.447 43.000 0.000 NA   NA
 7551478 7551479 CLM_1682 CLM_1683     FALSE 0.022 324.000 0.000 NA   NA
 7551479 7551480 CLM_1683 CLM_1684     TRUE 0.936 -13.000 0.000 NA   NA
 7551480 7551481 CLM_1684 CLM_1685     TRUE 0.713 11.000 0.000 NA   NA
 7551481 7551482 CLM_1685 CLM_1686     FALSE 0.252 145.000 0.000 NA   NA
 7551482 7551483 CLM_1686 CLM_1687     FALSE 0.224 157.000 0.000 NA   NA
 7551484 7551485 CLM_1688 CLM_1689 hlyIII ychF TRUE 0.582 121.000 0.002 0.044   NA
 7551486 7551487 CLM_1690 CLM_1691 mraZ mraW TRUE 0.888 80.000 0.635 NA   NA
 7551487 7551488 CLM_1691 CLM_1692 mraW   FALSE 0.529 82.000 0.008 1.000   NA
 7551488 7551489 CLM_1692 CLM_1693     TRUE 0.932 16.000 0.096 1.000   NA
 7551489 7551490 CLM_1693 CLM_1694   murE TRUE 0.785 230.000 0.265 1.000 Y NA
 7551490 7551491 CLM_1694 CLM_1695 murE murF TRUE 0.989 26.000 0.328 0.003 Y NA
 7551491 7551492 CLM_1695 CLM_1696 murF mraY TRUE 0.955 36.000 0.024 0.004 Y NA
 7551492 7551493 CLM_1696 CLM_1697 mraY   TRUE 0.702 79.000 0.014 0.004 N NA
 7551493 7551494 CLM_1697 CLM_1698     FALSE 0.098 323.000 0.015 NA N NA
 7551494 7551495 CLM_1698 CLM_1699     TRUE 0.891 11.000 0.014 NA   NA
 7551495 7551496 CLM_1699 CLM_1700   sbp TRUE 0.846 35.000 0.053 NA   NA
 7551496 7551497 CLM_1700 CLM_1701 sbp   TRUE 0.964 1.000 0.053 NA   NA
 7551497 7551498 CLM_1701 CLM_1702     FALSE 0.546 93.000 0.017 NA   NA
 7551498 7551499 CLM_1702 CLM_1703     TRUE 0.887 21.000 0.032 NA   NA
 7551499 7551500 CLM_1703 CLM_1704     TRUE 0.954 17.000 0.246 NA   NA
 7551500 7551501 CLM_1704 CLM_1705     TRUE 0.977 1.000 0.118 1.000   NA
 7551501 7551502 CLM_1705 CLM_1706   divIVA TRUE 0.976 16.000 0.579 NA   NA
 7551502 7551503 CLM_1706 CLM_1707 divIVA aroB FALSE 0.032 408.000 0.006 NA N NA
 7551503 7551504 CLM_1707 CLM_1708 aroB mtnN TRUE 0.957 1.000 0.003 1.000 N NA
 7551504 7551505 CLM_1708 CLM_1709 mtnN aroF TRUE 0.723 121.000 0.046 1.000 N NA
 7551505 7551506 CLM_1709 CLM_1710 aroF aroA TRUE 0.760 167.000 0.003 1.000 Y NA
 7551506 7551507 CLM_1710 CLM_1711 aroA   FALSE 0.189 217.000 0.000 1.000 N NA
 7551507 7551508 CLM_1711 CLM_1712   lspA FALSE 0.420 224.000 0.050 1.000 N NA
 7551508 7551509 CLM_1712 CLM_1713 lspA   TRUE 0.967 4.000 0.082 1.000 N NA
 7551509 7551510 CLM_1713 CLM_1715   pyrR FALSE 0.027 496.000 0.048 1.000 N NA
 7551510 7551511 CLM_1715 CLM_1716 pyrR uraA TRUE 0.957 44.000 0.140 1.000 Y NA
 7551513 7551514 CLM_1718 CLM_1719 xth   FALSE 0.447 224.000 0.000 1.000 Y NA
 7551514 7551515 CLM_1719 CLM_1720     FALSE 0.102 230.000 0.000 1.000   NA
 7551515 7551516 CLM_1720 CLM_1721   modA FALSE 0.442 178.000 0.015 1.000   NA
 7551516 7551517 CLM_1721 CLM_1722 modA modB TRUE 0.995 10.000 0.430 0.001 Y NA
 7551517 7551518 CLM_1722 CLM_1723 modB   FALSE 0.501 327.000 0.342 1.000 Y NA
 7551518 7551519 CLM_1723 CLM_1724     TRUE 0.642 54.000 0.013 NA   NA
 7551519 7551520 CLM_1724 CLM_1725     FALSE 0.017 348.000 0.000 NA   NA
 7551520 7551521 CLM_1725 CLM_1726     FALSE 0.031 300.000 0.000 NA   NA
 7551521 7551522 CLM_1726 CLM_1727     FALSE 0.045 273.000 0.000 NA   NA
 7551522 7551523 CLM_1727 CLM_1728     TRUE 0.848 88.000 0.308 NA N NA
 7551523 7551524 CLM_1728 CLM_1729     FALSE 0.258 142.000 0.000 NA   NA
 7551524 7551525 CLM_1729 CLM_1730     TRUE 0.738 90.000 0.147 NA   NA
 7551525 7551526 CLM_1730 CLM_1731     TRUE 0.954 23.000 0.235 NA   NA
 7551526 7551527 CLM_1731 CLM_1732   mtbC TRUE 0.930 26.000 0.118 1.000   NA
 7551527 7551528 CLM_1732 CLM_1733 mtbC   TRUE 0.729 85.000 0.118 1.000   NA
 7551528 7551529 CLM_1733 CLM_1734     FALSE 0.017 947.000 0.000 0.002 Y NA
 7551529 7551530 CLM_1734 CLM_1735     TRUE 0.927 23.000 0.044 1.000 N NA
 7551530 7551531 CLM_1735 CLM_1736     TRUE 0.993 2.000 0.178 1.000 Y NA
 7551531 7551532 CLM_1736 CLM_1737     TRUE 0.947 144.000 0.444 NA Y NA
 7551534 7551535 CLM_1739 CLM_1740   asnA FALSE 0.042 329.000 0.000 1.000 N NA
 7551537 7551538 CLM_1742 CLM_1743     TRUE 0.961 27.000 0.024 1.000 Y NA
 7551538 7551539 CLM_1743 CLM_1744     FALSE 0.030 317.000 0.000 1.000   NA
 7551541 7551542 CLM_1746 CLM_1747     TRUE 0.994 1.000 0.636 1.000 N NA
 7551542 7551543 CLM_1747 CLM_1748     TRUE 0.960 12.000 0.182 1.000   NA
 7551543 7551544 CLM_1748 CLM_1749     FALSE 0.014 362.000 0.000 NA   NA
 7551544 7551545 CLM_1749 CLM_1750     TRUE 0.910 13.000 0.041 NA   NA
 7551545 7551546 CLM_1750 CLM_1751     TRUE 0.999 -7.000 0.611 0.027 Y NA
 7551546 7551547 CLM_1751 CLM_1752     TRUE 0.980 36.000 0.278 0.027 Y NA
 7551547 7551548 CLM_1752 CLM_1753     TRUE 0.958 46.000 0.121 0.027 Y NA
 7551554 7551555 CLM_1759 CLM_1760     FALSE 0.274 108.000 0.000 NA   NA
 7551555 7551556 CLM_1760 CLM_1761     FALSE 0.013 368.000 0.000 NA   NA
 7551556 7551557 CLM_1761 CLM_1762     FALSE 0.219 206.000 0.000 1.000 N NA
 7551557 7551558 CLM_1762 CLM_1763     TRUE 0.929 14.000 0.087 NA   NA
 7551560 7551561 CLM_1765 CLM_1766   ogt TRUE 0.821 29.000 0.014 NA   NA
 7551561 7551562 CLM_1766 CLM_1767 ogt   TRUE 0.849 27.000 0.014 1.000   NA
 7551562 7551563 CLM_1767 CLM_1768     TRUE 0.758 165.000 0.263 NA   NA
 7551563 7551564 CLM_1768 CLM_1769     TRUE 0.940 25.000 0.168 NA   NA
 7551564 7551565 CLM_1769 CLM_1770     FALSE 0.013 390.000 0.000 1.000   NA
 7551567 7551568 CLM_1772 CLM_1773     FALSE 0.518 57.000 0.000 0.003   NA
 7551568 7551569 CLM_1773 CLM_1774     FALSE 0.012 486.000 0.000 0.087 N NA
 7551569 7551570 CLM_1774 CLM_1775     FALSE 0.013 438.000 0.000 1.000 N NA
 7551570 7551571 CLM_1775 CLM_1776     FALSE 0.263 98.000 0.000 NA   NA
 7551571 7551572 CLM_1776 CLM_1777     FALSE 0.125 381.000 0.250 NA   NA
 7551572 7551573 CLM_1777 CLM_1779     FALSE 0.271 117.000 0.000 NA   NA
 7551576 7551577 CLM_1784 CLM_1785     TRUE 0.673 14.000 0.000 NA   NA
 7551578 7551579 CLM_1787 CLM_1788     FALSE 0.271 120.000 0.000 NA   NA
 7551580 7551581 CLM_1790 CLM_1791     TRUE 0.708 58.000 0.051 NA   NA
 7551582 7551583 CLM_1793 CLM_1794   hgdC TRUE 0.925 117.000 0.722 NA N NA
 7551583 7551584 CLM_1794 CLM_1795 hgdC queD TRUE 0.950 18.000 0.135 NA N NA
 7551584 7551585 CLM_1795 CLM_1796 queD   TRUE 0.990 2.000 0.405 1.000 N NA
 7551585 7551586 CLM_1796 CLM_1797   folE TRUE 0.987 4.000 0.429 1.000 N NA
 7551586 7551587 CLM_1797 CLM_1798 folE   FALSE 0.418 184.000 0.015 1.000   NA
 7551587 7551588 CLM_1798 CLM_1799     FALSE 0.036 294.000 0.000 NA   NA
 7551588 7551589 CLM_1799 CLM_1800     FALSE 0.248 147.000 0.000 NA   NA
 7551589 7551590 CLM_1800 CLM_1801     FALSE 0.008 412.000 0.000 NA   NA
 7551590 7551591 CLM_1801 CLM_1802     FALSE 0.023 322.000 0.000 NA   NA
 7551591 7551592 CLM_1802 CLM_1803     TRUE 0.895 22.000 0.040 NA   NA
 7551592 7551593 CLM_1803 CLM_1804   deoC FALSE 0.243 292.000 0.077 1.000 N NA
 7551593 7551594 CLM_1804 CLM_1805 deoC rbsK TRUE 0.689 129.000 0.026 1.000 N NA
 7551594 7551595 CLM_1805 CLM_1806 rbsK hisZ FALSE 0.011 456.000 0.000 1.000 N NA
 7551595 7551596 CLM_1806 CLM_1807 hisZ hisG TRUE 0.988 25.000 0.239 0.004 Y NA
 7551596 7551597 CLM_1807 CLM_1808 hisG hisD TRUE 0.944 78.000 0.254 0.004 Y NA
 7551597 7551598 CLM_1808 CLM_1809 hisD hisB TRUE 0.905 150.000 0.096 0.004 Y NA
 7551598 7551599 CLM_1809 CLM_1810 hisB hisH TRUE 0.928 128.000 0.125 0.004 Y NA
 7551599 7551600 CLM_1810 CLM_1811 hisH hisA TRUE 0.996 -3.000 0.124 0.004 Y NA
 7551600 7551601 CLM_1811 CLM_1812 hisA hisC TRUE 0.993 -3.000 0.004 0.004 Y NA
 7551601 7551602 CLM_1812 CLM_1813 hisC hisF TRUE 0.717 197.000 0.002 0.004 Y NA
 7551602 7551603 CLM_1813 CLM_1814 hisF hisI TRUE 0.953 154.000 0.430 0.004 Y NA
 7551603 7551604 CLM_1814 CLM_1815 hisI hisE TRUE 0.933 128.000 0.152 0.004 Y NA
 7551604 7551605 CLM_1815 CLM_1816 hisE   FALSE 0.510 136.000 0.005 NA   NA
 7551605 7551606 CLM_1816 CLM_1817     TRUE 0.958 14.000 0.231 NA   NA
 7551606 7551607 CLM_1817 CLM_1818     TRUE 0.957 18.000 0.267 NA   NA
 7551609 7551610 CLM_1820 CLM_1821     TRUE 0.680 81.000 0.070 1.000   NA
 7551610 7551611 CLM_1821 CLM_1822     TRUE 0.592 153.000 0.047 NA   NA
 7551611 7551612 CLM_1822 CLM_1823     FALSE 0.075 235.000 0.000 NA   NA
 7551612 7551613 CLM_1823 CLM_1824     TRUE 0.945 3.000 0.041 NA   NA
 7551613 7551614 CLM_1824 CLM_1825     TRUE 0.986 3.000 0.490 NA   NA
 7551614 7551615 CLM_1825 CLM_1826     TRUE 0.844 117.000 0.352 NA   NA
 7551615 7551616 CLM_1826 CLM_1827     TRUE 0.999 -9.000 0.741 0.019 Y NA
 7551616 7551617 CLM_1827 CLM_1828   arcA FALSE 0.006 564.000 0.000 1.000 N NA
 7551617 7551618 CLM_1828 CLM_1829 arcA arcD TRUE 0.854 103.000 0.022 1.000 Y NA
 7551620 7551621 CLM_1831 CLM_1832     FALSE 0.272 136.000 0.000 NA   NA
 7551621 7551622 CLM_1832 CLM_1833     FALSE 0.296 93.000 0.000 1.000   NA
 7551622 7551623 CLM_1833 CLM_1834     FALSE 0.003 554.000 0.000 NA   NA
 7551623 7551624 CLM_1834 CLM_1836     TRUE 0.730 9.000 0.000 NA   NA
 7551626 7551627 CLM_1838 CLM_1839     FALSE 0.512 192.000 0.067 1.000   NA
 7551627 7551628 CLM_1839 CLM_1840     FALSE 0.119 218.000 0.000 1.000   NA
 7551628 7551629 CLM_1840 CLM_1841     FALSE 0.015 381.000 0.000 1.000   NA
 7551629 7551630 CLM_1841 CLM_1842     TRUE 0.824 149.000 0.222 1.000 N NA
 7551630 7551631 CLM_1842 CLM_1843     TRUE 0.998 2.000 0.900 0.007 Y NA
 7551631 7551632 CLM_1843 CLM_1844     FALSE 0.021 392.000 0.000 1.000 N NA
 7551632 7551633 CLM_1844 CLM_1845     FALSE 0.197 302.000 0.000 1.000 Y NA
 7551633 7551634 CLM_1845 CLM_1846     FALSE 0.356 247.000 0.000 1.000 Y NA
 7551634 7551635 CLM_1846 CLM_1847     TRUE 0.962 42.000 0.167 1.000 Y NA
 7551635 7551636 CLM_1847 CLM_1848     TRUE 0.987 4.000 0.610 NA   NA
 7551636 7551637 CLM_1848 CLM_1849     FALSE 0.090 225.000 0.000 NA   NA
 7551639 7551640 CLM_1851 CLM_1852     TRUE 0.864 158.000 0.600 NA   NA
 7551641 7551642 CLM_1853 CLM_1854     TRUE 0.975 38.000 0.261 1.000 Y NA
 7551644 7551645 CLM_1856 CLM_1857     FALSE 0.047 270.000 0.000 NA   NA
 7551645 7551646 CLM_1857 CLM_1858     TRUE 0.964 9.000 0.171 1.000   NA
 7551647 7551648 CLM_1859 CLM_1860     TRUE 0.859 190.000 1.000 NA   NA
 7551650 7551651 CLM_1863 CLM_1864 metF   TRUE 0.680 155.000 0.045 0.002   NA
 7551651 7551652 CLM_1864 CLM_1865     TRUE 0.991 -10.000 0.075 0.001   NA
 7551654 7551655 CLM_1867 CLM_1868     TRUE 0.996 -7.000 0.667 NA   NA
 7551655 7551656 CLM_1868 CLM_1869   acoR FALSE 0.016 350.000 0.000 NA   NA
 7551656 7551657 CLM_1869 CLM_1870 acoR   TRUE 0.696 169.000 0.182 NA   NA
 7551657 7551658 CLM_1870 CLM_1871   acoA TRUE 0.912 21.000 0.065 NA   NA
 7551658 7551659 CLM_1871 CLM_1872 acoA acoB TRUE 0.990 3.000 0.076 0.001 Y NA
 7551659 7551660 CLM_1872 CLM_1873 acoB   TRUE 0.865 53.000 0.162 0.050   NA
 7551660 7551661 CLM_1873 CLM_1874   acoC TRUE 0.894 36.000 0.081 0.050   NA
 7551661 7551662 CLM_1874 CLM_1875 acoC acoL TRUE 0.984 13.000 0.148 1.000 Y NA
 7551662 7551663 CLM_1875 CLM_1876 acoL   TRUE 0.935 25.000 0.074 1.000 N NA
 7551663 7551664 CLM_1876 CLM_1877     FALSE 0.022 389.000 0.000 1.000 N NA
 7551664 7551665 CLM_1877 CLM_1878     TRUE 0.998 -7.000 0.793 0.086 N NA
 7551665 7551666 CLM_1878 CLM_1879   thrC FALSE 0.072 294.000 0.000 1.000 N NA
 7551666 7551667 CLM_1879 CLM_1880 thrC thrB TRUE 0.990 10.000 0.233 1.000 Y NA
 7551667 7551668 CLM_1880 CLM_1881 thrB   TRUE 0.838 127.000 0.008 1.000 Y NA
 7551668 7551669 CLM_1881 CLM_1882   hom TRUE 0.649 222.000 0.010 0.002 Y NA
 7551669 7551670 CLM_1882 CLM_1883 hom   FALSE 0.004 686.000 0.000 1.000 N NA
 7551670 7551671 CLM_1883 CLM_1884     FALSE 0.008 509.000 0.000 1.000 N NA
 7551671 7551672 CLM_1884 CLM_1885     FALSE 0.144 329.000 0.000 1.000 Y NA
 7551672 7551673 CLM_1885 CLM_1886   gltA TRUE 0.996 0.000 0.667 0.038 N NA
 7551673 7551674 CLM_1886 CLM_1887 gltA   FALSE 0.165 229.000 0.000 1.000 N NA
 7551674 7551675 CLM_1887 CLM_1888     TRUE 0.741 7.000 0.000 NA   NA
 7551675 7551676 CLM_1888 CLM_1889     FALSE 0.007 423.000 0.000 NA   NA
 7551676 7551677 CLM_1889 CLM_1890     FALSE 0.274 109.000 0.000 NA   NA
 7551677 7551678 CLM_1890 CLM_1891     FALSE 0.170 180.000 0.000 NA   NA
 7551678 7551679 CLM_1891 CLM_1892     FALSE 0.015 359.000 0.000 NA   NA
 7551679 7551680 CLM_1892 CLM_1893     FALSE 0.038 288.000 0.000 NA   NA
 7551680 7551681 CLM_1893 CLM_1894     FALSE 0.157 186.000 0.000 NA   NA
 7551681 7551682 CLM_1894 CLM_1895     FALSE 0.005 468.000 0.000 NA   NA
 7551682 7551683 CLM_1895 CLM_1896     FALSE 0.226 156.000 0.000 NA   NA
 7551683 7551684 CLM_1896 CLM_1897     FALSE 0.545 38.000 0.000 1.000   NA
 7551684 7551685 CLM_1897 CLM_1898     FALSE 0.004 501.000 0.000 NA   NA
 7551685 7551686 CLM_1898 CLM_1899     TRUE 0.947 33.000 0.379 NA   NA
 7551686 7551687 CLM_1899 CLM_1900   alr FALSE 0.006 438.000 0.000 NA   NA
 7551687 7551688 CLM_1900 CLM_1901 alr   FALSE 0.010 459.000 0.000 1.000 N NA
 7551688 7551689 CLM_1901 CLM_1902     TRUE 0.612 88.000 0.016 0.086   NA
 7551689 7551690 CLM_1902 CLM_1903     FALSE 0.069 240.000 0.000 NA   NA
 7551692 7551693 CLM_1905 CLM_1906     FALSE 0.002 913.000 0.000 NA   NA
 7551697 7551698 CLM_1910 CLM_1911     FALSE 0.084 230.000 0.000 NA   NA
 7551698 7551699 CLM_1911 CLM_1912     TRUE 0.687 137.000 0.027 1.000 N NA
 7551699 7551700 CLM_1912 CLM_1913     TRUE 0.995 14.000 0.667 0.026 Y NA
 7551700 7551701 CLM_1913 CLM_1914     TRUE 0.998 4.000 1.000 0.026 Y NA
 7551701 7551702 CLM_1914 CLM_1915     TRUE 0.943 31.000 0.265 1.000   NA
 7551704 7551705 CLM_1917 CLM_1918     FALSE 0.046 271.000 0.000 NA   NA
 7551707 7551708 CLM_1920 CLM_1921     TRUE 0.603 151.000 0.011 1.000 N NA
 7551708 7551709 CLM_1921 CLM_1922     TRUE 0.973 -7.000 0.016 NA   NA
 7551709 7551710 CLM_1922 CLM_1923   pfkB TRUE 0.978 26.000 0.721 NA   NA
 7551712 7551713 CLM_1925 CLM_1926     TRUE 0.882 152.000 0.667 NA   NA
 7551715 7551716 CLM_1928 CLM_1929     FALSE 0.560 31.000 0.000 NA   NA
 7551717 7551718 CLM_1930 CLM_1931 safA   FALSE 0.009 401.000 0.000 NA   NA
 7551723 7551724 CLM_1936 CLM_1937     FALSE 0.028 323.000 0.000 1.000   NA
 7551724 7551725 CLM_1937 CLM_1938   deaD FALSE 0.399 180.000 0.006 1.000   NA
 7551725 7551726 CLM_1938 CLM_1939 deaD   FALSE 0.498 165.000 0.025 NA   NA
 7551726 7551727 CLM_1939 CLM_1940     FALSE 0.010 395.000 0.000 NA   NA
 7551727 7551728 CLM_1940 CLM_1941     FALSE 0.010 404.000 0.000 1.000   NA
 7551730 7551731 CLM_1943 CLM_1944   cheX TRUE 0.993 0.000 0.100 NA Y NA
 7551733 7551734 CLM_1946 CLM_1947     FALSE 0.498 62.000 0.000 0.002   NA
 7551739 7551740 CLM_1953 CLM_1954   hfq TRUE 0.690 101.000 0.064 1.000   NA
 7551740 7551741 CLM_1954 CLM_1955 hfq miaA TRUE 0.775 86.000 0.192 1.000   NA
 7551741 7551742 CLM_1955 CLM_1956 miaA   TRUE 0.949 15.000 0.097 1.000 N NA
 7551742 7551743 CLM_1956 CLM_1957   mutS TRUE 0.943 134.000 0.220 0.002 Y NA
 7551743 7551744 CLM_1957 CLM_1958 mutS miaB TRUE 0.701 80.000 0.041 1.000 N NA
 7551745 7551746 CLM_1959 CLM_1960     TRUE 0.677 85.000 0.087 NA   NA
 7551746 7551747 CLM_1960 CLM_1961   aspB TRUE 0.612 55.000 0.008 NA   NA
 7551748 7551749 CLM_1962 CLM_1963     TRUE 0.879 82.000 0.571 NA   NA
 7551749 7551750 CLM_1963 CLM_1964     FALSE 0.063 248.000 0.000 NA   NA
 7551750 7551751 CLM_1964 CLM_1965   cmk TRUE 0.753 64.000 0.047 1.000 N NA
 7551751 7551752 CLM_1965 CLM_1966 cmk aroH TRUE 0.667 76.000 0.020 1.000 N NA
 7551752 7551753 CLM_1966 CLM_1967 aroH   TRUE 0.972 -3.000 0.024 1.000   NA
 7551753 7551754 CLM_1967 CLM_1968   gluD FALSE 0.043 294.000 0.000 1.000   NA
 7551754 7551755 CLM_1968 CLM_1969 gluD   FALSE 0.405 234.000 0.068 1.000 N NA
 7551755 7551756 CLM_1969 CLM_1970   rluB FALSE 0.056 382.000 0.013 1.000 N NA
 7551756 7551757 CLM_1970 CLM_1971 rluB   FALSE 0.006 433.000 0.000 NA   NA
 7551757 7551758 CLM_1971 CLM_1972     FALSE 0.263 98.000 0.000 NA   NA
 7551758 7551759 CLM_1972 CLM_1973     FALSE 0.035 295.000 0.000 NA   NA
 7551760 7551761 CLM_1974 CLM_1975     FALSE 0.013 389.000 0.000 1.000   NA
 7551762 7551763 CLM_1976 CLM_1977     TRUE 0.954 2.000 0.034 1.000   NA
 7551763 7551764 CLM_1977 CLM_1978     TRUE 0.746 115.000 0.111 1.000   NA
 7551764 7551765 CLM_1978 CLM_1979     TRUE 0.734 131.000 0.111 NA   NA
 7551767 7551768 CLM_1981 CLM_1982 pcaC   FALSE 0.310 138.000 0.000 1.000   NA
 7551768 7551769 CLM_1982 CLM_1983     FALSE 0.160 185.000 0.000 NA   NA
 7551769 7551770 CLM_1983 CLM_1984     FALSE 0.077 234.000 0.000 NA   NA
 7551770 7551771 CLM_1984 CLM_1985     TRUE 0.984 -19.000 0.019 NA   NA
 7551772 7551773 CLM_1986 CLM_1987     TRUE 0.975 3.000 0.200 1.000   NA
 7551773 7551774 CLM_1987 CLM_1988     TRUE 0.985 -3.000 0.111 1.000   NA
 7551774 7551775 CLM_1988 CLM_1989     TRUE 0.682 136.000 0.056 1.000   NA
 7551776 7551777 CLM_1990 CLM_1991 hypE hypD TRUE 0.920 168.000 0.353 1.000 Y NA
 7551777 7551778 CLM_1991 CLM_1992 hypD hypC TRUE 0.998 -7.000 0.363 NA Y NA
 7551778 7551779 CLM_1992 CLM_1993 hypC hypF TRUE 0.998 -37.000 0.181 NA Y NA
 7551779 7551780 CLM_1993 CLM_1994 hypF   TRUE 0.981 -16.000 0.008 1.000   NA
 7551780 7551781 CLM_1994 CLM_1995     FALSE 0.070 255.000 0.000 1.000   NA
 7551781 7551782 CLM_1995 CLM_1996     FALSE 0.532 160.000 0.022 1.000   NA
 7551782 7551783 CLM_1996 CLM_1997   hupL TRUE 0.963 33.000 0.079 1.000 Y NA
 7551783 7551784 CLM_1997 CLM_1998 hupL hupS TRUE 0.976 102.000 0.778 0.001 Y NA
 7551785 7551786 CLM_1999 CLM_2000     FALSE 0.007 421.000 0.000 NA   NA
 7551787 7551788 CLM_2001 CLM_2002 carB carA TRUE 0.974 28.000 0.054 0.001 Y NA
 7551789 7551790 CLM_2003 CLM_2004     FALSE 0.003 602.000 0.000 NA   NA
 7551791 7551792 CLM_2005 CLM_2006     FALSE 0.128 201.000 0.000 NA   NA
 7551792 7551793 CLM_2006 CLM_2007     FALSE 0.017 362.000 0.000 1.000   NA
 7551793 7551794 CLM_2007 CLM_2008     TRUE 0.933 20.000 0.048 0.001   NA
 7551794 7551795 CLM_2008 CLM_2009     TRUE 0.989 12.000 0.154 0.001 Y NA
 7551795 7551796 CLM_2009 CLM_2010     FALSE 0.009 475.000 0.000 1.000 N NA
 7551796 7551797 CLM_2010 CLM_2011     FALSE 0.097 260.000 0.000 NA N NA
 7551800 7551801 CLM_2014 CLM_2015   ytfJ FALSE 0.289 68.000 0.000 NA   NA
 7551802 7551803 CLM_2016 CLM_2017 scpB scpA TRUE 0.996 -7.000 0.570 NA   NA
 7551803 7551804 CLM_2017 CLM_2018 scpA   TRUE 0.949 -25.000 0.000 NA   NA
 7551804 7551805 CLM_2018 CLM_2020   dacF FALSE 0.108 212.000 0.000 NA   NA
 7551805 7551806 CLM_2020 CLM_2021 dacF   TRUE 0.572 123.000 0.018 NA   NA
 7551806 7551807 CLM_2021 CLM_2022     FALSE 0.218 159.000 0.000 NA   NA
 7551807 7551808 CLM_2022 CLM_2023     TRUE 0.585 118.000 0.024 NA   NA
 7551808 7551809 CLM_2023 CLM_2024   pdp TRUE 0.672 107.000 0.061 NA   NA
 7551809 7551810 CLM_2024 CLM_2025 pdp punA FALSE 0.244 286.000 0.000 1.000 Y NA
 7551810 7551811 CLM_2025 CLM_2026 punA xerD TRUE 0.809 38.000 0.004 1.000 N NA
 7551811 7551812 CLM_2026 CLM_2027 xerD   TRUE 0.619 52.000 0.004 NA   NA
 7551812 7551813 CLM_2027 CLM_2028   spoIIM TRUE 0.981 -9.000 0.034 NA   NA
 7551815 7551816 CLM_2030 CLM_2031     FALSE 0.008 494.000 0.000 1.000 N NA
 7551816 7551817 CLM_2031 CLM_2032     FALSE 0.002 816.000 0.000 NA   NA
 7551817 7551818 CLM_2032 CLM_2033     FALSE 0.003 600.000 0.000 NA   NA
 7551818 7551819 CLM_2033 CLM_2034     FALSE 0.001 1322.000 0.000 NA   NA
 7551819 7551820 CLM_2034 CLM_2035     FALSE 0.002 679.000 0.000 NA   NA
 7551820 7551821 CLM_2035 CLM_2036     FALSE 0.318 129.000 0.000 1.000   NA
 7551821 7551822 CLM_2036 CLM_2037     TRUE 0.863 0.000 0.000 NA   NA
 7551822 7551823 CLM_2037 CLM_2038     TRUE 0.991 2.000 0.667 NA   NA
 7551823 7551824 CLM_2038 CLM_2039     FALSE 0.108 212.000 0.000 NA   NA
 7551826 7551827 CLM_2041 CLM_2042     TRUE 0.815 2.000 0.000 NA   NA
 7551827 7551828 CLM_2042 CLM_2043     TRUE 0.700 12.000 0.000 NA   NA
 7551828 7551829 CLM_2043 CLM_2044     TRUE 0.741 7.000 0.000 NA   NA
 7551829 7551830 CLM_2044 CLM_2045     TRUE 0.769 4.000 0.000 NA   NA
 7551830 7551831 CLM_2045 CLM_2046     TRUE 0.651 16.000 0.000 NA   NA
 7551831 7551832 CLM_2046 CLM_2047     FALSE 0.330 57.000 0.000 NA   NA
 7551832 7551833 CLM_2047 CLM_2048     TRUE 0.902 114.000 0.667 NA   NA
 7551833 7551834 CLM_2048 CLM_2049     TRUE 0.915 58.000 0.600 NA   NA
 7551834 7551835 CLM_2049 CLM_2050     TRUE 0.926 64.000 0.800 NA   NA
 7551835 7551836 CLM_2050 CLM_2051     TRUE 0.911 16.000 0.062 NA   NA
 7551836 7551837 CLM_2051 CLM_2052     TRUE 0.976 1.000 0.125 NA   NA
 7551837 7551838 CLM_2052 CLM_2053     TRUE 0.928 -10.000 0.000 NA   NA
 7551838 7551839 CLM_2053 CLM_2054     FALSE 0.248 85.000 0.000 NA   NA
 7551839 7551840 CLM_2054 CLM_2055     FALSE 0.362 53.000 0.000 NA   NA
 7551840 7551841 CLM_2055 CLM_2056     TRUE 0.912 -7.000 0.000 NA   NA
 7551841 7551842 CLM_2056 CLM_2057     FALSE 0.437 44.000 0.000 NA   NA
 7551842 7551843 CLM_2057 CLM_2058     FALSE 0.426 45.000 0.000 NA   NA
 7551843 7551844 CLM_2058 CLM_2059     TRUE 0.997 -7.000 0.750 NA   NA
 7551844 7551845 CLM_2059 CLM_2060     FALSE 0.272 136.000 0.000 NA   NA
 7551845 7551846 CLM_2060 CLM_2061     FALSE 0.289 68.000 0.000 NA   NA
 7551846 7551847 CLM_2061 CLM_2062     FALSE 0.259 78.000 0.000 NA   NA
 7551847 7551848 CLM_2062 CLM_2063     FALSE 0.155 187.000 0.000 NA   NA
 7551848 7551849 CLM_2063 CLM_2064     FALSE 0.194 170.000 0.000 NA   NA
 7551849 7551850 CLM_2064 CLM_2065     TRUE 0.651 16.000 0.000 NA   NA
 7551850 7551851 CLM_2065 CLM_2066     FALSE 0.455 42.000 0.000 NA   NA
 7551851 7551852 CLM_2066 CLM_2067     FALSE 0.267 76.000 0.000 NA   NA
 7551852 7551853 CLM_2067 CLM_2068     FALSE 0.379 51.000 0.000 NA   NA
 7551853 7551854 CLM_2068 CLM_2069     FALSE 0.274 74.000 0.000 NA   NA
 7551854 7551855 CLM_2069 CLM_2070     FALSE 0.010 395.000 0.000 NA   NA
 7551855 7551856 CLM_2070 CLM_2071     FALSE 0.547 32.000 0.000 NA   NA
 7551856 7551857 CLM_2071 CLM_2072     FALSE 0.029 303.000 0.000 NA   NA
 7551857 7551858 CLM_2072 CLM_2073     FALSE 0.271 119.000 0.000 NA   NA
 7551858 7551859 CLM_2073 CLM_2074     FALSE 0.015 358.000 0.000 NA   NA
 7551859 7551860 CLM_2074 CLM_2075     FALSE 0.426 45.000 0.000 NA   NA
 7551860 7551861 CLM_2075 CLM_2076     FALSE 0.283 71.000 0.000 NA   NA
 7551861 7551862 CLM_2076 CLM_2077     FALSE 0.379 51.000 0.000 NA   NA
 7551862 7551863 CLM_2077 CLM_2078     FALSE 0.010 390.000 0.000 NA   NA
 7551863 7551864 CLM_2078 CLM_2079     FALSE 0.272 121.000 0.000 NA   NA
 7551864 7551865 CLM_2079 CLM_2080     FALSE 0.275 132.000 0.000 NA   NA
 7551865 7551866 CLM_2080 CLM_2081     TRUE 0.912 -7.000 0.000 NA   NA
 7551867 7551868 CLM_2082 CLM_2083     FALSE 0.409 124.000 0.000 0.050   NA
 7551869 7551870 CLM_2084 CLM_2085     FALSE 0.379 51.000 0.000 NA   NA
 7551870 7551871 CLM_2085 CLM_2086     FALSE 0.005 448.000 0.000 NA   NA
 7551871 7551872 CLM_2086 CLM_2087     TRUE 0.863 0.000 0.000 NA   NA
 7551872 7551873 CLM_2087 CLM_2088   spo0A TRUE 0.690 136.000 0.027 1.000 N NA
 7551873 7551874 CLM_2088 CLM_2089 spo0A spoIVB FALSE 0.096 430.000 0.393 1.000   NA
 7551874 7551875 CLM_2089 CLM_2090 spoIVB metA FALSE 0.009 422.000 0.000 1.000   NA
 7551875 7551876 CLM_2090 CLM_2091 metA hom TRUE 0.953 27.000 0.005 1.000 Y NA
 7551876 7551877 CLM_2091 CLM_2092 hom   TRUE 0.931 40.000 0.017 1.000 Y NA
 7551877 7551878 CLM_2092 CLM_2094   recN FALSE 0.064 299.000 0.000 1.000 N NA
 7551878 7551879 CLM_2094 CLM_2095 recN argR TRUE 0.951 13.000 0.086 1.000 N NA
 7551879 7551880 CLM_2095 CLM_2096 argR ppnK TRUE 0.979 2.000 0.117 1.000 N NA
 7551880 7551881 CLM_2096 CLM_2097 ppnK   TRUE 0.985 0.000 0.120 1.000 N NA
 7551881 7551882 CLM_2097 CLM_2098   dxs TRUE 0.961 22.000 0.189 1.000 N NA
 7551882 7551883 CLM_2098 CLM_2099 dxs   TRUE 0.959 1.000 0.037 NA   NA
 7551883 7551884 CLM_2099 CLM_2100   ispA FALSE 0.002 803.000 0.000 NA   NA
 7551884 7551885 CLM_2100 CLM_2101 ispA xseB TRUE 0.737 125.000 0.053 1.000 N NA
 7551885 7551886 CLM_2101 CLM_2102 xseB xseA TRUE 0.962 123.000 0.412 0.001 Y NA
 7551886 7551887 CLM_2102 CLM_2103 xseA nusB TRUE 0.730 71.000 0.043 1.000 N NA
 7551887 7551888 CLM_2103 CLM_2104 nusB asp TRUE 0.799 139.000 0.223 NA   NA
 7551888 7551889 CLM_2104 CLM_2105 asp   TRUE 0.706 82.000 0.108 NA   NA
 7551889 7551890 CLM_2105 CLM_2106     TRUE 0.883 62.000 0.407 NA   NA
 7551890 7551891 CLM_2106 CLM_2107   spoIIIAF TRUE 0.924 138.000 0.907 NA   NA
 7551891 7551892 CLM_2107 CLM_2108 spoIIIAF   TRUE 0.972 36.000 0.918 NA   NA
 7551892 7551893 CLM_2108 CLM_2109     TRUE 0.989 9.000 0.864 NA   NA
 7551893 7551894 CLM_2109 CLM_2110     TRUE 0.981 27.000 0.895 NA   NA
 7551894 7551895 CLM_2110 CLM_2111     TRUE 0.964 43.000 0.926 NA   NA
 7551895 7551896 CLM_2111 CLM_2112     TRUE 0.958 37.000 0.604 NA   NA
 7551896 7551897 CLM_2112 CLM_2113     FALSE 0.548 195.000 0.112 NA   NA
 7551897 7551898 CLM_2113 CLM_2114   efp TRUE 0.793 41.000 0.037 NA   NA
 7551898 7551899 CLM_2114 CLM_2115 efp aroQ TRUE 0.617 89.000 0.010 1.000 N NA
 7551899 7551900 CLM_2115 CLM_2116 aroQ aroK TRUE 0.813 155.000 0.015 1.000 Y NA
 7551900 7551901 CLM_2116 CLM_2117 aroK   TRUE 0.577 134.000 0.020 NA   NA
 7551901 7551902 CLM_2117 CLM_2118     TRUE 0.991 6.000 1.000 NA   NA
 7551902 7551903 CLM_2118 CLM_2119     TRUE 0.963 16.000 0.333 NA   NA
 7551903 7551904 CLM_2119 CLM_2120     TRUE 0.966 28.000 0.500 NA   NA
 7551904 7551905 CLM_2120 CLM_2121     TRUE 0.997 -21.000 0.500 NA   NA
 7551905 7551906 CLM_2121 CLM_2122     TRUE 0.994 -3.000 0.500 NA   NA
 7551906 7551907 CLM_2122 CLM_2123     TRUE 0.998 -19.000 0.667 NA   NA
 7551907 7551908 CLM_2123 CLM_2124     FALSE 0.094 402.000 0.250 NA   NA
 7551908 7551909 CLM_2124 CLM_2125     TRUE 0.816 186.000 0.109 NA Y NA
 7551909 7551910 CLM_2125 CLM_2126     TRUE 0.905 145.000 0.135 1.000 Y NA
 7551910 7551911 CLM_2126 CLM_2127     FALSE 0.278 73.000 0.000 NA   NA
 7551911 7551912 CLM_2127 CLM_2128     FALSE 0.354 54.000 0.000 NA   NA
 7551912 7551913 CLM_2128 CLM_2129   dapF TRUE 0.933 1.000 0.003 NA   NA
 7551914 7551915 CLM_2130 CLM_2131   truA TRUE 0.618 69.000 0.005 NA N NA
 7551916 7551917 CLM_2132 CLM_2133     FALSE 0.511 36.000 0.000 NA   NA
 7551919 7551920 CLM_2135 CLM_2136     FALSE 0.004 505.000 0.000 NA   NA
 7551920 7551921 CLM_2136 CLM_2137   cloSI FALSE 0.006 470.000 0.000 1.000   NA
 7551922 7551923 CLM_2138 CLM_2139     TRUE 0.984 2.000 0.333 NA   NA
 7551923 7551924 CLM_2139 CLM_2140     TRUE 0.999 -10.000 0.857 1.000 Y NA
 7551925 7551926 CLM_2141 CLM_2142 msrA   FALSE 0.003 1218.000 0.000 1.000 N NA
 7551926 7551927 CLM_2142 CLM_2143     TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 7551927 7551928 CLM_2143 CLM_2144     FALSE 0.309 283.000 0.222 NA   NA
 7551928 7551929 CLM_2144 CLM_2145     TRUE 0.886 156.000 0.714 NA   NA
 7551929 7551930 CLM_2145 CLM_2146     TRUE 0.993 0.000 0.625 NA   NA
 7551932 7551933 CLM_2148 CLM_2149     TRUE 0.999 -3.000 0.933 0.007 Y NA
 7551935 7551936 CLM_2151 CLM_2152 moeB moaD TRUE 0.990 2.000 0.571 1.000   NA
 7551936 7551937 CLM_2152 CLM_2153 moaD aor TRUE 0.584 153.000 0.033 1.000   NA
 7551937 7551938 CLM_2153 CLM_2154 aor aorR FALSE 0.017 409.000 0.000 1.000 N NA
 7551938 7551939 CLM_2154 CLM_2155 aorR   TRUE 0.930 50.000 0.500 1.000   NA
 7551939 7551940 CLM_2155 CLM_2156   moaC TRUE 0.934 2.000 0.006 1.000   NA
 7551940 7551941 CLM_2156 CLM_2157 moaC moaA TRUE 0.989 4.000 0.071 0.002 Y NA
 7551941 7551942 CLM_2157 CLM_2158 moaA   TRUE 0.922 59.000 0.053 0.002 Y NA
 7551942 7551943 CLM_2158 CLM_2159   moeA TRUE 0.994 12.000 0.481 0.002 Y NA
 7551943 7551944 CLM_2159 CLM_2160 moeA mog TRUE 0.972 24.000 0.017 0.002 Y NA
 7551944 7551945 CLM_2160 CLM_2161 mog tupC TRUE 0.609 95.000 0.006 1.000 N NA
 7551945 7551946 CLM_2161 CLM_2162 tupC tupB TRUE 0.994 -3.000 0.389 1.000 N NA
 7551946 7551947 CLM_2162 CLM_2163 tupB   TRUE 0.995 9.000 0.524 0.026 Y NA
 7551947 7551948 CLM_2163 CLM_2164     FALSE 0.185 219.000 0.000 1.000 N NA
 7551948 7551949 CLM_2164 CLM_2165     TRUE 0.973 0.000 0.071 NA   NA
 7551949 7551950 CLM_2165 CLM_2166     FALSE 0.068 241.000 0.000 NA   NA
 7551950 7551951 CLM_2166 CLM_2167     FALSE 0.023 322.000 0.000 NA   NA
 7551951 7551952 CLM_2167 CLM_2168     TRUE 0.981 15.000 0.667 1.000   NA
 7551954 7551955 CLM_2170 CLM_2171     TRUE 0.999 -3.000 0.846 0.007 Y NA
 7551956 7551957 CLM_2172 CLM_2173     FALSE 0.007 419.000 0.000 NA   NA
 7551959 7551960 CLM_2175 CLM_2176     TRUE 0.695 22.000 0.000 1.000   NA
 7551961 7551962 CLM_2177 CLM_2178     FALSE 0.023 369.000 0.000 NA N NA
 7551962 7551963 CLM_2178 CLM_2179     TRUE 0.923 13.000 0.028 NA N NA
 7551963 7551964 CLM_2179 CLM_2180     TRUE 0.603 42.000 0.000 NA N NA
 7551964 7551965 CLM_2180 CLM_2181     TRUE 0.986 22.000 0.800 1.000 N NA
 7551966 7551967 CLM_2182 CLM_2183     FALSE 0.018 343.000 0.000 NA   NA
 7551967 7551968 CLM_2183 CLM_2184     TRUE 0.986 21.000 1.000 1.000   NA
 7551969 7551970 CLM_2185 CLM_2186     TRUE 0.999 -10.000 0.750 1.000 Y NA
 7551970 7551971 CLM_2186 CLM_2187     FALSE 0.006 444.000 0.000 NA   NA
 7551971 7551972 CLM_2187 CLM_2188     TRUE 0.898 26.000 0.061 NA   NA
 7551972 7551973 CLM_2188 CLM_2189     TRUE 0.973 16.000 0.469 1.000   NA
 7551973 7551974 CLM_2189 CLM_2190     TRUE 0.963 3.000 0.103 NA   NA
 7551974 7551975 CLM_2190 CLM_2191     TRUE 0.763 161.000 0.250 NA   NA
 7551976 7551977 CLM_2192 CLM_2193     FALSE 0.411 83.000 0.000 0.005   NA
 7551977 7551978 CLM_2193 CLM_2194     TRUE 0.997 -10.000 0.500 0.005   NA
 7551978 7551979 CLM_2194 CLM_2195     TRUE 0.996 -10.000 0.400 0.005   NA
 7551979 7551980 CLM_2195 CLM_2196     TRUE 0.948 42.000 0.400 0.005   NA
 7551982 7551983 CLM_2198 CLM_2199 pcaC   TRUE 0.952 13.000 0.144 1.000   NA
 7551983 7551984 CLM_2199 CLM_2200     FALSE 0.198 181.000 0.000 1.000   NA
 7551985 7551986 CLM_2201 CLM_2202   hsp90 FALSE 0.005 598.000 0.000 1.000 N NA
 7551987 7551988 CLM_2203 CLM_2204   treP FALSE 0.009 482.000 0.000 1.000 N NA
 7551988 7551989 CLM_2204 CLM_2205 treP treC TRUE 0.960 82.000 0.650 1.000 Y NA
 7551989 7551990 CLM_2205 CLM_2206 treC treR TRUE 0.957 33.000 0.336 1.000 N NA
 7551991 7551992 CLM_2207 CLM_2208     FALSE 0.463 273.000 0.015 0.008 Y NA
 7551992 7551993 CLM_2208 CLM_2209   pfkB TRUE 0.995 1.000 0.217 1.000 Y NA
 7551993 7551994 CLM_2209 CLM_2210 pfkB   TRUE 0.989 20.000 0.400 1.000 Y NA
 7551994 7551995 CLM_2210 CLM_2211     TRUE 0.686 200.000 0.222 1.000 N NA
 7551995 7551996 CLM_2211 CLM_2212     FALSE 0.251 82.000 0.000 NA   NA
 7552000 7552001 CLM_2216 CLM_2217     FALSE 0.275 131.000 0.000 NA   NA
 7552001 7552002 CLM_2217 CLM_2218     TRUE 0.903 -6.000 0.000 NA   NA
 7552002 7552003 CLM_2218 CLM_2219     FALSE 0.259 78.000 0.000 NA   NA
 7552003 7552004 CLM_2219 CLM_2220     FALSE 0.015 357.000 0.000 NA   NA
 7552006 7552007 CLM_2222 CLM_2223     TRUE 0.961 16.000 0.273 1.000   NA
 7552007 7552008 CLM_2223 CLM_2225     FALSE 0.007 443.000 0.000 1.000   NA
 7552008 7552009 CLM_2225 CLM_2226     FALSE 0.077 234.000 0.000 NA   NA
 7552009 7552010 CLM_2226 CLM_2227     FALSE 0.055 260.000 0.000 NA   NA
 7552011 7552012 CLM_2228 CLM_2229     FALSE 0.024 320.000 0.000 NA   NA
 7552015 7552016 CLM_2232 CLM_2233 aspB   TRUE 0.977 20.000 0.088 1.000 Y NA
 7552016 7552017 CLM_2233 CLM_2234     TRUE 0.936 -13.000 0.000 NA   NA
 7552017 7552018 CLM_2234 CLM_2235     FALSE 0.248 147.000 0.000 NA   NA
 7552018 7552019 CLM_2235 CLM_2236     TRUE 0.748 87.000 0.167 NA   NA
 7552019 7552020 CLM_2236 CLM_2237     FALSE 0.014 362.000 0.000 NA   NA
 7552020 7552021 CLM_2237 CLM_2238   catB FALSE 0.441 113.000 0.000 1.000 N NA
 7552021 7552022 CLM_2238 CLM_2239 catB   FALSE 0.004 495.000 0.000 NA   NA
 7552022 7552023 CLM_2239 CLM_2240     FALSE 0.034 296.000 0.000 NA   NA
 7552023 7552024 CLM_2240 CLM_2241     FALSE 0.268 138.000 0.000 NA   NA
 7552024 7552025 CLM_2241 CLM_2242     FALSE 0.152 188.000 0.000 NA   NA
 7552025 7552026 CLM_2242 CLM_2243     FALSE 0.008 410.000 0.000 NA   NA
 7552026 7552027 CLM_2243 CLM_2244     FALSE 0.124 340.000 0.000 NA Y NA
 7552028 7552029 CLM_2245 CLM_2246 pepQ pepIP TRUE 0.706 82.000 0.054 0.027   NA
 7552030 7552031 CLM_2247 CLM_2248     TRUE 0.867 17.000 0.019 NA   NA
 7552031 7552032 CLM_2248 CLM_2249     FALSE 0.010 410.000 0.000 1.000   NA
 7552033 7552034 CLM_2250 CLM_2251     TRUE 0.958 20.000 0.273 NA   NA
 7552035 7552036 CLM_2252 CLM_2253     FALSE 0.079 233.000 0.000 NA   NA
 7552036 7552037 CLM_2253 CLM_2254     FALSE 0.009 401.000 0.000 NA   NA
 7552037 7552038 CLM_2254 CLM_2255     TRUE 0.978 15.000 0.600 NA   NA
 7552038 7552039 CLM_2255 CLM_2256     TRUE 0.995 -3.000 0.600 NA   NA
 7552039 7552040 CLM_2256 CLM_2257     TRUE 0.880 122.000 0.500 NA   NA
 7552040 7552041 CLM_2257 CLM_2258     FALSE 0.244 304.000 0.231 NA   NA
 7552041 7552042 CLM_2258 CLM_2259     FALSE 0.212 162.000 0.000 NA   NA
 7552042 7552043 CLM_2259 CLM_2261     FALSE 0.560 31.000 0.000 NA   NA
 7552044 7552045 CLM_2262 CLM_2263     TRUE 0.845 9.000 0.000 0.011   NA
 7552046 7552047 CLM_2264 CLM_2265     FALSE 0.018 343.000 0.000 NA   NA
 7552049 7552050 CLM_2267 CLM_2268     TRUE 0.756 44.000 0.027 NA   NA
 7552050 7552051 CLM_2268 CLM_2269     TRUE 0.599 92.000 0.027 1.000   NA
 7552051 7552052 CLM_2269 CLM_2270     FALSE 0.416 46.000 0.000 NA   NA
 7552053 7552054 CLM_2271 CLM_2272   rfbB TRUE 0.951 42.000 0.087 1.000 Y NA
 7552054 7552055 CLM_2272 CLM_2273 rfbB   FALSE 0.447 43.000 0.000 NA   NA
 7552055 7552056 CLM_2273 CLM_2274     FALSE 0.426 45.000 0.000 NA   NA
 7552056 7552057 CLM_2274 CLM_2275     FALSE 0.061 251.000 0.000 NA   NA
 7552058 7552059 CLM_2276 CLM_2277     FALSE 0.004 475.000 0.000 NA   NA
 7552059 7552060 CLM_2277 CLM_2278     FALSE 0.002 861.000 0.000 NA   NA
 7552060 7552061 CLM_2278 CLM_2279     FALSE 0.391 141.000 0.000 NA N NA
 7552061 7552062 CLM_2279 CLM_2280     TRUE 0.993 -7.000 0.312 NA   NA
 7552062 7552063 CLM_2280 CLM_2281     FALSE 0.062 249.000 0.000 NA   NA
 7552063 7552064 CLM_2281 CLM_2282     FALSE 0.004 485.000 0.000 NA   NA
 7552064 7552065 CLM_2282 CLM_2283     FALSE 0.128 201.000 0.000 NA   NA
 7552065 7552066 CLM_2283 CLM_2284     FALSE 0.139 196.000 0.000 NA   NA
 7552066 7552067 CLM_2284 CLM_2285     TRUE 0.673 14.000 0.000 NA   NA
 7552067 7552068 CLM_2285 CLM_2286     FALSE 0.248 147.000 0.000 NA   NA
 7552068 7552069 CLM_2286 CLM_2287     FALSE 0.079 233.000 0.000 NA   NA
 7552069 7552070 CLM_2287 CLM_2288     FALSE 0.041 280.000 0.000 NA   NA
 7552070 7552071 CLM_2288 CLM_2289     FALSE 0.271 103.000 0.000 NA   NA
 7552071 7552072 CLM_2289 CLM_2290     TRUE 0.912 -7.000 0.000 NA   NA
 7552072 7552073 CLM_2290 CLM_2291     FALSE 0.255 93.000 0.000 NA   NA
 7552073 7552074 CLM_2291 CLM_2292     TRUE 0.736 8.000 0.000 NA   NA
 7552074 7552075 CLM_2292 CLM_2293     TRUE 0.647 23.000 0.000 NA   NA
 7552075 7552076 CLM_2293 CLM_2294     FALSE 0.267 76.000 0.000 NA   NA
 7552076 7552077 CLM_2294 CLM_2295     TRUE 0.993 3.000 0.150 0.001 Y NA
 7552077 7552078 CLM_2295 CLM_2296     TRUE 0.997 -7.000 0.134 0.048 Y NA
 7552078 7552079 CLM_2296 CLM_2297     FALSE 0.155 187.000 0.000 NA   NA
 7552079 7552080 CLM_2297 CLM_2298     FALSE 0.002 973.000 0.000 NA   NA
 7552080 7552081 CLM_2298 CLM_2299     TRUE 0.971 18.000 0.486 NA   NA
 7552081 7552082 CLM_2299 CLM_2300     FALSE 0.006 444.000 0.000 NA   NA
 7552082 7552083 CLM_2300 CLM_2301     FALSE 0.110 211.000 0.000 NA   NA
 7552083 7552084 CLM_2301 CLM_2302     FALSE 0.001 1236.000 0.000 NA   NA
 7552084 7552085 CLM_2302 CLM_2304     FALSE 0.005 448.000 0.000 NA   NA
 7552086 7552087 CLM_2305 CLM_2306     TRUE 0.966 23.000 0.385 NA   NA
 7552087 7552088 CLM_2306 CLM_2307     FALSE 0.236 193.000 0.000 NA N NA
 7552088 7552089 CLM_2307 CLM_2308     TRUE 0.966 5.000 0.171 NA   NA
 7552090 7552091 CLM_2309 CLM_2310   tetP FALSE 0.318 128.000 0.000 1.000   NA
 7552091 7552092 CLM_2310 CLM_2311 tetP   FALSE 0.004 543.000 0.000 1.000   NA
 7552092 7552093 CLM_2311 CLM_2312   cadA FALSE 0.007 442.000 0.000 1.000   NA
 7552093 7552094 CLM_2312 CLM_2313 cadA   TRUE 0.773 182.000 0.417 NA   NA
 7552094 7552095 CLM_2313 CLM_2314     FALSE 0.273 123.000 0.000 NA   NA
 7552095 7552096 CLM_2314 CLM_2315     TRUE 0.955 74.000 0.500 NA Y NA
 7552096 7552097 CLM_2315 CLM_2316   eutE TRUE 0.995 0.000 0.769 NA N NA
 7552097 7552098 CLM_2316 CLM_2317 eutE   TRUE 0.988 35.000 0.692 NA Y NA
 7552098 7552099 CLM_2317 CLM_2318     TRUE 0.984 21.000 0.750 NA N NA
 7552099 7552100 CLM_2318 CLM_2319     TRUE 0.706 199.000 0.273 NA N NA
 7552100 7552101 CLM_2319 CLM_2320     TRUE 0.992 -3.000 0.389 NA   NA
 7552101 7552102 CLM_2320 CLM_2321     TRUE 0.862 78.000 0.444 NA   NA
 7552102 7552103 CLM_2321 CLM_2322     TRUE 0.999 -18.000 0.615 NA Y NA
 7552103 7552104 CLM_2322 CLM_2323     TRUE 0.990 7.000 0.222 NA Y NA
 7552104 7552105 CLM_2323 CLM_2324     TRUE 0.995 -3.000 0.118 1.000 Y NA
 7552105 7552106 CLM_2324 CLM_2325     TRUE 0.948 40.000 0.375 1.000 N NA
 7552106 7552107 CLM_2325 CLM_2326     TRUE 0.928 164.000 0.815 0.002 N NA
 7552107 7552108 CLM_2326 CLM_2327     TRUE 0.968 50.000 0.370 1.000 Y NA
 7552108 7552109 CLM_2327 CLM_2328     TRUE 0.950 38.000 0.500 NA   NA
 7552109 7552110 CLM_2328 CLM_2329     TRUE 0.975 24.000 0.571 NA   NA
 7552110 7552111 CLM_2329 CLM_2330     FALSE 0.248 313.000 0.286 NA   NA
 7552111 7552112 CLM_2330 CLM_2331     TRUE 0.998 -13.000 0.810 NA   NA
 7552112 7552113 CLM_2331 CLM_2332     FALSE 0.004 486.000 0.000 NA   NA
 7552113 7552114 CLM_2332 CLM_2333     TRUE 0.777 104.000 0.094 1.000 N NA
 7552116 7552117 CLM_2335 CLM_2336     TRUE 0.845 41.000 0.044 NA N NA
 7552119 7552120 CLM_2339 CLM_2340     TRUE 0.596 28.000 0.000 NA   NA
 7552120 7552121 CLM_2340 CLM_2341     TRUE 0.922 -9.000 0.000 NA   NA
 7552121 7552122 CLM_2341 CLM_2342     FALSE 0.002 804.000 0.000 NA   NA
 7552122 7552123 CLM_2342 CLM_2343     TRUE 0.918 13.000 0.053 NA   NA
 7552123 7552124 CLM_2343 CLM_2344     FALSE 0.042 279.000 0.000 NA   NA
 7552124 7552125 CLM_2344 CLM_2345     TRUE 0.953 -31.000 0.000 NA   NA
 7552125 7552126 CLM_2345 CLM_2346     FALSE 0.030 317.000 0.000 1.000   NA
 7552126 7552127 CLM_2346 CLM_2347     TRUE 0.998 -3.000 0.700 1.000 Y NA
 7552127 7552128 CLM_2347 CLM_2348     TRUE 0.674 198.000 0.300 NA   NA
 7552128 7552129 CLM_2348 CLM_2349     TRUE 0.995 -7.000 0.500 NA   NA
 7552129 7552130 CLM_2349 CLM_2350     TRUE 0.891 72.000 0.500 1.000   NA
 7552130 7552131 CLM_2350 CLM_2351     FALSE 0.363 60.000 0.000 1.000   NA
 7552131 7552132 CLM_2351 CLM_2352     FALSE 0.033 306.000 0.000 1.000   NA
 7552132 7552133 CLM_2352 CLM_2353     TRUE 0.996 -7.000 0.400 1.000 N NA
 7552133 7552134 CLM_2353 CLM_2354     TRUE 0.966 16.000 0.375 NA   NA
 7552134 7552135 CLM_2354 CLM_2355     FALSE 0.005 452.000 0.000 NA   NA
 7552135 7552136 CLM_2355 CLM_2356     TRUE 0.778 67.000 0.091 NA N NA
 7552136 7552137 CLM_2356 CLM_2357     TRUE 0.818 84.000 0.222 NA N NA
 7552137 7552138 CLM_2357 CLM_2358     FALSE 0.004 566.000 0.000 1.000   NA
 7552138 7552139 CLM_2358 CLM_2359     TRUE 0.996 -10.000 0.429 1.000   NA
 7552139 7552140 CLM_2359 CLM_2360     FALSE 0.002 778.000 0.000 NA   NA
 7552140 7552141 CLM_2360 CLM_2361     FALSE 0.022 326.000 0.000 NA   NA
 7552141 7552142 CLM_2361 CLM_2362     FALSE 0.198 212.000 0.000 0.010   NA
 7552142 7552143 CLM_2362 CLM_2363     TRUE 0.971 13.000 0.241 0.010   NA
 7552143 7552144 CLM_2363 CLM_2364     TRUE 0.979 29.000 0.119 0.007 Y NA
 7552144 7552145 CLM_2364 CLM_2365     TRUE 0.976 24.000 0.081 1.000 Y NA
 7552145 7552146 CLM_2365 CLM_2366     FALSE 0.075 235.000 0.000 NA   NA
 7552146 7552147 CLM_2366 CLM_2367     FALSE 0.051 265.000 0.000 NA   NA
 7552147 7552148 CLM_2367 CLM_2368     FALSE 0.029 303.000 0.000 NA   NA
 7552148 7552149 CLM_2368 CLM_2369     FALSE 0.271 117.000 0.000 NA   NA
 7552150 7552151 CLM_2370 CLM_2372     FALSE 0.020 331.000 0.000 NA   NA
 7552152 7552153 CLM_2373 CLM_2374     TRUE 0.971 7.000 0.222 1.000   NA
 7552155 7552156 CLM_2376 CLM_2377 enr   TRUE 0.732 97.000 0.059 1.000 N NA
 7552156 7552157 CLM_2377 CLM_2378     TRUE 0.959 49.000 1.000 NA   NA
 7552157 7552158 CLM_2378 CLM_2379     FALSE 0.229 154.000 0.000 NA   NA
 7552158 7552159 CLM_2379 CLM_2380     FALSE 0.493 38.000 0.000 NA   NA
 7552159 7552160 CLM_2380 CLM_2382     FALSE 0.002 1096.000 0.000 NA   NA
 11430810 7552154   CLM_2375     FALSE NA 4310.000 0.000 NA   NA
 11573173 7552154   CLM_2375     FALSE NA 4310.000 0.000 NA   NA
 11715565 7552154   CLM_2375     FALSE NA 4310.000 0.000 NA   NA
 11430811 7552154   CLM_2375     FALSE NA 4340.000 0.000 NA   NA
 11573174 7552154   CLM_2375     FALSE NA 4340.000 0.000 NA   NA
 11715566 7552154   CLM_2375     FALSE NA 4340.000 0.000 NA   NA
 11430812 7552154   CLM_2375     FALSE NA 4375.000 0.000 NA   NA
 11573175 7552154   CLM_2375     FALSE NA 4375.000 0.000 NA   NA
 11715567 7552154   CLM_2375     FALSE NA 4375.000 0.000 NA   NA
 11430813 7552154   CLM_2375     FALSE NA 4405.000 0.000 NA   NA
 11573176 7552154   CLM_2375     FALSE NA 4405.000 0.000 NA   NA
 11715568 7552154   CLM_2375     FALSE NA 4405.000 0.000 NA   NA
 11430814 7552154   CLM_2375     FALSE NA 4442.000 0.000 NA   NA
 11573177 7552154   CLM_2375     FALSE NA 4442.000 0.000 NA   NA
 11715569 7552154   CLM_2375     FALSE NA 4442.000 0.000 NA   NA
 11430815 7552154   CLM_2375     FALSE NA 4472.000 0.000 NA   NA
 11573178 7552154   CLM_2375     FALSE NA 4472.000 0.000 NA   NA
 11715570 7552154   CLM_2375     FALSE NA 4472.000 0.000 NA   NA
 11430816 7552154   CLM_2375     FALSE NA 4508.000 0.000 NA   NA
 11573179 7552154   CLM_2375     FALSE NA 4508.000 0.000 NA   NA
 11715571 7552154   CLM_2375     FALSE NA 4508.000 0.000 NA   NA
 11430817 7552154   CLM_2375     FALSE NA 4538.000 0.000 NA   NA
 11573180 7552154   CLM_2375     FALSE NA 4538.000 0.000 NA   NA
 11715572 7552154   CLM_2375     FALSE NA 4538.000 0.000 NA   NA
 11430818 7552154   CLM_2375     FALSE NA 4573.000 0.000 NA   NA
 11573181 7552154   CLM_2375     FALSE NA 4573.000 0.000 NA   NA
 11715573 7552154   CLM_2375     FALSE NA 4573.000 0.000 NA   NA
 7552161 7552162 CLM_2383 CLM_2384     FALSE 0.002 1050.000 0.000 NA   NA
 11430819 7552154   CLM_2375     FALSE NA 8393.000 0.000 NA   NA
 11573182 7552154   CLM_2375     FALSE NA 8393.000 0.000 NA   NA
 11715574 7552154   CLM_2375     FALSE NA 8393.000 0.000 NA   NA
 11430820 7552154   CLM_2375     FALSE NA 8423.000 0.000 NA   NA
 11573183 7552154   CLM_2375     FALSE NA 8423.000 0.000 NA   NA
 11715575 7552154   CLM_2375     FALSE NA 8423.000 0.000 NA   NA
 11430821 7552154   CLM_2375     FALSE NA 8458.000 0.000 NA   NA
 11573184 7552154   CLM_2375     FALSE NA 8458.000 0.000 NA   NA
 11715576 7552154   CLM_2375     FALSE NA 8458.000 0.000 NA   NA
 11430822 7552154   CLM_2375     FALSE NA 8488.000 0.000 NA   NA
 11573185 7552154   CLM_2375     FALSE NA 8488.000 0.000 NA   NA
 11715577 7552154   CLM_2375     FALSE NA 8488.000 0.000 NA   NA
 7552163 7552164 CLM_2385 CLM_2386     TRUE 0.609 168.000 0.033 1.000 N NA
 7552164 7552165 CLM_2386 CLM_2387     FALSE 0.099 266.000 0.000 1.000 N NA
 7552165 7552166 CLM_2387 CLM_2388     TRUE 0.883 76.000 0.064 1.000 Y NA
 7552167 7552168 CLM_2390 CLM_2391     FALSE 0.019 340.000 0.000 NA   NA
 7552169 7552170 CLM_2392 CLM_2393   hgdC_1 FALSE 0.007 487.000 0.000 NA N NA
 7552170 7552171 CLM_2393 CLM_2394 hgdC_1   TRUE 0.834 77.000 0.333 NA   NA
 7552171 7552172 CLM_2394 CLM_2395     FALSE 0.030 301.000 0.000 NA   NA
 7552172 7552173 CLM_2395 CLM_2396     TRUE 0.995 19.000 0.750 0.010 Y NA
 7552173 7552174 CLM_2396 CLM_2397     TRUE 0.977 37.000 0.750 0.035 N NA
 7552174 7552175 CLM_2397 CLM_2398   hgdB FALSE 0.007 499.000 0.000 NA N NA
 7552175 7552176 CLM_2398 CLM_2399 hgdB   TRUE 0.998 0.000 0.750 NA Y NA
 7552176 7552177 CLM_2399 CLM_2400   hadA TRUE 0.931 63.000 0.667 NA N NA
 7552177 7552178 CLM_2400 CLM_2401 hadA   FALSE 0.002 741.000 0.000 1.000   NA
 7552179 7552180 CLM_2402 CLM_2403   bcrA TRUE 0.997 3.000 0.759 NA Y NA
 7552181 7552182 CLM_2404 CLM_2405     FALSE 0.003 584.000 0.000 1.000   NA
 7552182 7552183 CLM_2405 CLM_2406     FALSE 0.009 417.000 0.000 1.000   NA
 7552185 7552186 CLM_2408 CLM_2409 gntP pdxA TRUE 0.619 227.000 0.271 1.000 N NA
 7552186 7552187 CLM_2409 CLM_2410 pdxA   TRUE 0.965 13.000 0.283 NA   NA
 7552187 7552188 CLM_2410 CLM_2411     TRUE 0.800 65.000 0.182 NA   NA
 7552193 7552194 CLM_2416 CLM_2417     FALSE 0.258 142.000 0.000 NA   NA
 7552194 7552195 CLM_2417 CLM_2419     FALSE 0.050 266.000 0.000 NA   NA
 7552196 7552197 CLM_2420 CLM_2421     FALSE 0.011 449.000 0.000 1.000 N NA
 7552197 7552198 CLM_2421 CLM_2422     FALSE 0.155 187.000 0.000 NA   NA
 7552198 7552199 CLM_2422 CLM_2423     FALSE 0.263 140.000 0.000 NA   NA
 7552200 7552201 CLM_2424 CLM_2425 hypA hypB TRUE 0.982 3.000 0.215 0.002   NA
 7552202 7552203 CLM_2426 CLM_2427     TRUE 0.667 96.000 0.068 NA   NA
 7552203 7552204 CLM_2427 CLM_2428     TRUE 0.999 -9.000 0.838 0.004 Y NA
 7552204 7552205 CLM_2428 CLM_2429     TRUE 0.943 25.000 0.193 NA   NA
 7552205 7552206 CLM_2429 CLM_2430     FALSE 0.003 575.000 0.000 NA   NA
 7552206 7552207 CLM_2430 CLM_2431   motB FALSE 0.035 295.000 0.000 NA   NA
 7552207 7552208 CLM_2431 CLM_2432 motB motA TRUE 0.986 18.000 0.257 1.000 Y NA
 7552210 7552211 CLM_2434 CLM_2435     FALSE 0.026 310.000 0.000 NA   NA
 7552211 7552212 CLM_2435 CLM_2436     FALSE 0.041 280.000 0.000 NA   NA
 7552212 7552213 CLM_2436 CLM_2437     TRUE 0.962 6.000 0.153 NA   NA
 7552213 7552214 CLM_2437 CLM_2438   pepD FALSE 0.271 118.000 0.000 NA   NA
 7552214 7552215 CLM_2438 CLM_2439 pepD   FALSE 0.024 560.000 0.000 1.000 Y NA
 7552217 7552218 CLM_2440 CLM_2442 glxK   FALSE 0.096 220.000 0.000 NA   NA
 7552220 7552221 CLM_2444 CLM_2445     TRUE 0.991 14.000 0.448 NA Y NA
 7552221 7552222 CLM_2445 CLM_2446     FALSE 0.006 465.000 0.000 1.000   NA
 7552222 7552223 CLM_2446 CLM_2447     TRUE 0.717 14.000 0.000 1.000   NA
 7552225 7552226 CLM_2449 CLM_2450     FALSE 0.262 97.000 0.000 NA   NA
 7552226 7552227 CLM_2450 CLM_2451     FALSE 0.020 349.000 0.000 1.000   NA
 7552229 7552230 CLM_2453 CLM_2454     FALSE 0.006 436.000 0.000 NA   NA
 7552230 7552231 CLM_2454 CLM_2455     FALSE 0.012 381.000 0.000 NA   NA
 7552232 7552233 CLM_2456 CLM_2457     TRUE 0.646 19.000 0.000 NA   NA
 7552233 7552234 CLM_2457 CLM_2458     TRUE 0.969 3.000 0.148 NA   NA
 7552235 7552236 CLM_2459 CLM_2460   thiM FALSE 0.149 189.000 0.000 NA   NA
 7552236 7552237 CLM_2460 CLM_2461 thiM thiW TRUE 0.990 -22.000 0.059 NA   NA
 7552237 7552238 CLM_2461 CLM_2462 thiW   FALSE 0.173 179.000 0.000 NA   NA
 7552238 7552239 CLM_2462 CLM_2464     FALSE 0.209 163.000 0.000 NA   NA
 7552239 7552240 CLM_2464 CLM_2465     TRUE 0.733 128.000 0.095 1.000   NA
 7552240 7552241 CLM_2465 CLM_2466     FALSE 0.559 185.000 0.095 NA   NA
 7552241 7552242 CLM_2466 CLM_2467   bioD FALSE 0.039 285.000 0.000 NA   NA
 7552242 7552243 CLM_2467 CLM_2468 bioD bioB TRUE 0.987 3.000 0.025 0.001 Y NA
 7552243 7552244 CLM_2468 CLM_2469 bioB   TRUE 0.974 -7.000 0.018 NA   NA
 7552244 7552245 CLM_2469 CLM_2470     FALSE 0.270 137.000 0.000 NA   NA
 7552245 7552246 CLM_2470 CLM_2471     FALSE 0.321 59.000 0.000 NA   NA
 7552247 7552248 CLM_2472 CLM_2473     TRUE 0.949 31.000 0.015 1.000 Y NA
 7552249 7552250 CLM_2474 CLM_2475     FALSE 0.173 179.000 0.000 NA   NA
 7552250 7552251 CLM_2475 CLM_2476     FALSE 0.053 263.000 0.000 NA   NA
 7552251 7552252 CLM_2476 CLM_2477     FALSE 0.029 303.000 0.000 NA   NA
 7552254 7552255 CLM_2479 CLM_2480     FALSE 0.162 198.000 0.000 1.000   NA
 7552255 7552256 CLM_2480 CLM_2481     FALSE 0.006 429.000 0.000 NA   NA
 7552256 7552257 CLM_2481 CLM_2482     FALSE 0.173 179.000 0.000 NA   NA
 7552257 7552258 CLM_2482 CLM_2483     FALSE 0.362 53.000 0.000 NA   NA
 7552258 7552259 CLM_2483 CLM_2484     FALSE 0.025 311.000 0.000 NA   NA
 7552260 7552261 CLM_2485 CLM_2486     FALSE 0.002 642.000 0.000 NA   NA
 7552262 7552263 CLM_2487 CLM_2488     TRUE 0.722 10.000 0.000 NA   NA
 7552263 7552264 CLM_2488 CLM_2489     TRUE 0.749 6.000 0.000 NA   NA
 7552264 7552265 CLM_2489 CLM_2490     TRUE 0.685 13.000 0.000 NA   NA
 7552267 7552268 CLM_2492 CLM_2493     FALSE 0.148 190.000 0.000 NA   NA
 7552270 7552271 CLM_2495 CLM_2496     FALSE 0.015 358.000 0.000 NA   NA
 7552271 7552272 CLM_2496 CLM_2497     FALSE 0.141 195.000 0.000 NA   NA
 7552272 7552273 CLM_2497 CLM_2498     FALSE 0.063 248.000 0.000 NA   NA
 7552273 7552274 CLM_2498 CLM_2500     FALSE 0.493 38.000 0.000 NA   NA
 7552274 7552275 CLM_2500 CLM_2501     TRUE 0.644 17.000 0.000 NA   NA
 7552275 7552276 CLM_2501 CLM_2502     FALSE 0.274 107.000 0.000 NA   NA
 7552276 7552277 CLM_2502 CLM_2503     TRUE 0.863 0.000 0.000 NA   NA
 7552277 7552278 CLM_2503 CLM_2504     TRUE 0.651 16.000 0.000 NA   NA
 7552278 7552279 CLM_2504 CLM_2505     TRUE 0.786 3.000 0.000 NA   NA
 7552279 7552280 CLM_2505 CLM_2506     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 7552280 7552281 CLM_2506 CLM_2507     TRUE 0.985 6.000 0.571 NA   NA
 7552281 7552282 CLM_2507 CLM_2508     TRUE 0.996 -7.000 0.643 NA   NA
 7552282 7552283 CLM_2508 CLM_2509     TRUE 0.998 -16.000 0.900 NA   NA
 7552283 7552284 CLM_2509 CLM_2510     TRUE 0.992 0.000 0.500 NA   NA
 7552284 7552285 CLM_2510 CLM_2511     FALSE 0.560 31.000 0.000 NA   NA
 7552285 7552286 CLM_2511 CLM_2512     FALSE 0.354 54.000 0.000 NA   NA
 7552286 7552287 CLM_2512 CLM_2513     TRUE 0.839 1.000 0.000 NA   NA
 7552287 7552288 CLM_2513 CLM_2514     FALSE 0.511 36.000 0.000 NA   NA
 7552288 7552289 CLM_2514 CLM_2515     TRUE 0.640 24.000 0.000 NA   NA
 7552289 7552290 CLM_2515 CLM_2516     TRUE 0.685 13.000 0.000 NA   NA
 7552290 7552291 CLM_2516 CLM_2517     TRUE 0.992 0.000 0.500 NA   NA
 7552291 7552292 CLM_2517 CLM_2518     TRUE 0.713 11.000 0.000 NA   NA
 7552292 7552293 CLM_2518 CLM_2519     TRUE 0.984 3.000 0.400 NA   NA
 7552293 7552294 CLM_2519 CLM_2520     TRUE 0.989 2.000 0.500 NA   NA
 7552294 7552295 CLM_2520 CLM_2521     TRUE 0.987 1.000 0.333 NA   NA
 7552295 7552296 CLM_2521 CLM_2522     TRUE 0.989 3.000 0.667 NA   NA
 7552296 7552297 CLM_2522 CLM_2523     TRUE 0.831 57.000 0.200 NA   NA
 7552297 7552298 CLM_2523 CLM_2524     TRUE 0.971 14.000 0.400 NA   NA
 7552298 7552299 CLM_2524 CLM_2525     TRUE 0.979 21.000 0.667 NA   NA
 7552299 7552300 CLM_2525 CLM_2526     FALSE 0.292 67.000 0.000 NA   NA
 7552300 7552301 CLM_2526 CLM_2527     TRUE 0.749 6.000 0.000 NA   NA
 7552301 7552302 CLM_2527 CLM_2528     TRUE 0.988 0.000 0.300 NA   NA
 7552302 7552303 CLM_2528 CLM_2529     TRUE 0.990 0.000 0.375 NA   NA
 7552303 7552304 CLM_2529 CLM_2530     TRUE 0.886 0.000 0.000 1.000   NA
 7552304 7552305 CLM_2530 CLM_2531     FALSE 0.302 96.000 0.000 1.000   NA
 7552305 7552306 CLM_2531 CLM_2532     FALSE 0.271 116.000 0.000 NA   NA
 7552306 7552307 CLM_2532 CLM_2533     FALSE 0.253 92.000 0.000 NA   NA
 7552307 7552308 CLM_2533 CLM_2534     FALSE 0.008 414.000 0.000 NA   NA
 7552308 7552309 CLM_2534 CLM_2535     TRUE 0.713 11.000 0.000 NA   NA
 7552309 7552310 CLM_2535 CLM_2536     TRUE 0.815 2.000 0.000 NA   NA
 7552310 7552311 CLM_2536 CLM_2537     FALSE 0.249 89.000 0.000 NA   NA
 7552311 7552312 CLM_2537 CLM_2538     TRUE 0.650 21.000 0.000 NA   NA
 7552312 7552313 CLM_2538 CLM_2539     TRUE 0.663 15.000 0.000 NA   NA
 7552313 7552314 CLM_2539 CLM_2540     TRUE 0.644 17.000 0.000 NA   NA
 7552314 7552315 CLM_2540 CLM_2541     FALSE 0.280 72.000 0.000 NA   NA
 7552315 7552316 CLM_2541 CLM_2542     FALSE 0.258 95.000 0.000 NA   NA
 7552316 7552317 CLM_2542 CLM_2543     FALSE 0.527 34.000 0.000 NA   NA
 7552317 7552318 CLM_2543 CLM_2544     FALSE 0.538 33.000 0.000 NA   NA
 7552318 7552319 CLM_2544 CLM_2545     FALSE 0.273 134.000 0.000 NA   NA
 7552319 7552320 CLM_2545 CLM_2546     FALSE 0.312 61.000 0.000 NA   NA
 7552320 7552321 CLM_2546 CLM_2547     FALSE 0.527 34.000 0.000 NA   NA
 7552321 7552322 CLM_2547 CLM_2548     FALSE 0.547 32.000 0.000 NA   NA
 7552322 7552323 CLM_2548 CLM_2549     FALSE 0.416 46.000 0.000 NA   NA
 7552323 7552324 CLM_2549 CLM_2550     FALSE 0.371 52.000 0.000 NA   NA
 7552324 7552325 CLM_2550 CLM_2551     TRUE 0.640 24.000 0.000 NA   NA
 7552325 7552326 CLM_2551 CLM_2552     TRUE 0.786 3.000 0.000 NA   NA
 7552326 7552327 CLM_2552 CLM_2553     TRUE 0.890 -3.000 0.000 NA   NA
 7552327 7552328 CLM_2553 CLM_2554     TRUE 0.928 -10.000 0.000 NA   NA
 7552328 7552329 CLM_2554 CLM_2555     TRUE 0.691 77.000 0.083 NA   NA
 7552329 7552330 CLM_2555 CLM_2556     TRUE 0.976 27.000 0.708 NA   NA
 7552330 7552331 CLM_2556 CLM_2557     FALSE 0.263 98.000 0.000 NA   NA
 7552331 7552332 CLM_2557 CLM_2558     TRUE 0.863 0.000 0.000 NA   NA
 7552332 7552333 CLM_2558 CLM_2559     TRUE 0.786 3.000 0.000 NA   NA
 7552333 7552334 CLM_2559 CLM_2560     TRUE 0.815 2.000 0.000 NA   NA
 7552334 7552335 CLM_2560 CLM_2561     TRUE 0.700 12.000 0.000 NA   NA
 7552335 7552336 CLM_2561 CLM_2562     TRUE 0.644 17.000 0.000 NA   NA
 7552336 7552337 CLM_2562 CLM_2563     TRUE 0.955 -40.000 0.000 NA   NA
 7552337 7552338 CLM_2563 CLM_2564     TRUE 0.647 23.000 0.000 NA   NA
 7552338 7552339 CLM_2564 CLM_2565     FALSE 0.256 94.000 0.000 NA   NA
 7552339 7552340 CLM_2565 CLM_2566     TRUE 0.651 16.000 0.000 NA   NA
 7552340 7552341 CLM_2566 CLM_2567     TRUE 0.786 3.000 0.000 NA   NA
 7552341 7552342 CLM_2567 CLM_2568     TRUE 0.968 12.000 0.286 NA   NA
 7552342 7552343 CLM_2568 CLM_2569     FALSE 0.275 132.000 0.000 NA   NA
 7552343 7552344 CLM_2569 CLM_2570     TRUE 0.730 9.000 0.000 NA   NA
 7552344 7552345 CLM_2570 CLM_2571     FALSE 0.362 53.000 0.000 NA   NA
 7552345 7552346 CLM_2571 CLM_2572     TRUE 0.650 21.000 0.000 NA   NA
 7552346 7552347 CLM_2572 CLM_2573     TRUE 0.700 12.000 0.000 NA   NA
 7552347 7552348 CLM_2573 CLM_2574     FALSE 0.403 54.000 0.000 1.000   NA
 7552349 7552350 CLM_2575 CLM_2576     FALSE 0.409 47.000 0.000 NA   NA
 7552350 7552351 CLM_2576 CLM_2577     FALSE 0.256 143.000 0.000 NA   NA
 7552351 7552352 CLM_2577 CLM_2578     FALSE 0.258 95.000 0.000 NA   NA
 7552352 7552353 CLM_2578 CLM_2579     FALSE 0.076 289.000 0.000 1.000 N NA
 7552354 7552355 CLM_2580 CLM_2581     FALSE 0.030 301.000 0.000 NA   NA
 7552355 7552356 CLM_2581 CLM_2582     FALSE 0.254 81.000 0.000 NA   NA
 7552356 7552357 CLM_2582 CLM_2583   msrB TRUE 0.692 174.000 0.200 NA   NA
 7552357 7552358 CLM_2583 CLM_2584 msrB sodF FALSE 0.156 232.000 0.000 1.000 N NA
 7552358 7552359 CLM_2584 CLM_2585 sodF   FALSE 0.441 112.000 0.000 1.000 N NA
 7552359 7552360 CLM_2585 CLM_2586     TRUE 0.999 -7.000 0.867 0.006 Y NA
 7552360 7552361 CLM_2586 CLM_2587     FALSE 0.507 280.000 0.462 1.000 N NA
 7552361 7552362 CLM_2587 CLM_2588     FALSE 0.064 247.000 0.000 NA   NA
 7552362 7552363 CLM_2588 CLM_2589     FALSE 0.248 147.000 0.000 NA   NA
 7552363 7552364 CLM_2589 CLM_2590     TRUE 0.953 36.000 0.500 NA   NA
 7552364 7552365 CLM_2590 CLM_2591     TRUE 0.989 -7.000 0.167 NA   NA
 7552365 7552366 CLM_2591 CLM_2592     TRUE 0.800 202.000 0.556 1.000 N NA
 7552366 7552367 CLM_2592 CLM_2593     TRUE 0.996 -3.000 0.125 0.016 Y NA
 7552369 7552370 CLM_2595 CLM_2596     FALSE 0.514 83.000 0.011 NA   NA
 7552370 7552371 CLM_2596 CLM_2597   def FALSE 0.035 303.000 0.000 1.000   NA
 7552371 7552372 CLM_2597 CLM_2598 def   TRUE 0.993 1.000 0.529 1.000 N NA
 7552372 7552373 CLM_2598 CLM_2599   tgl FALSE 0.083 241.000 0.000 1.000   NA
 7552373 7552374 CLM_2599 CLM_2600 tgl   TRUE 0.980 -3.000 0.077 NA   NA
 7552374 7552375 CLM_2600 CLM_2601     FALSE 0.016 349.000 0.000 NA   NA
 7552375 7552376 CLM_2601 CLM_2602     FALSE 0.002 615.000 0.000 NA   NA
 7552376 7552377 CLM_2602 CLM_2603     FALSE 0.005 471.000 0.000 NA   NA
 7552377 7552378 CLM_2603 CLM_2604     FALSE 0.101 216.000 0.000 NA   NA
 7552380 7552381 CLM_2606 CLM_2607     TRUE 0.990 -7.000 0.179 NA   NA
 7552381 7552382 CLM_2607 CLM_2608     TRUE 0.993 -19.000 0.143 NA   NA
 7552382 7552383 CLM_2608 CLM_2609     TRUE 0.987 -3.000 0.182 NA   NA
 7552383 7552384 CLM_2609 CLM_2610     FALSE 0.006 453.000 0.000 1.000   NA
 7552384 7552385 CLM_2610 CLM_2611     FALSE 0.003 612.000 0.000 1.000   NA
 7552385 7552386 CLM_2611 CLM_2612     TRUE 0.819 71.000 0.241 NA   NA
 7552386 7552387 CLM_2612 CLM_2613     FALSE 0.118 206.000 0.000 NA   NA
 7552387 7552388 CLM_2613 CLM_2614     TRUE 0.673 14.000 0.000 NA   NA
 7552388 7552389 CLM_2614 CLM_2616     FALSE 0.002 633.000 0.000 NA   NA
 7552389 7552390 CLM_2616 CLM_2617     TRUE 0.974 -10.000 0.006 NA   NA
 7552390 7552391 CLM_2617 CLM_2618     FALSE 0.012 378.000 0.000 NA   NA
 7552391 7552392 CLM_2618 CLM_2619     TRUE 0.650 21.000 0.000 NA   NA
 7552392 7552393 CLM_2619 CLM_2620     FALSE 0.272 114.000 0.000 NA   NA
 7552395 7552396 CLM_2622 CLM_2623     TRUE 0.997 -7.000 0.138 1.000 Y NA
 7552396 7552397 CLM_2623 CLM_2624     TRUE 0.975 -7.000 0.023 NA   NA
 7552397 7552398 CLM_2624 CLM_2625     FALSE 0.237 151.000 0.000 NA   NA
 7552398 7552399 CLM_2625 CLM_2626     FALSE 0.015 359.000 0.000 NA   NA
 7552399 7552400 CLM_2626 CLM_2627     TRUE 0.998 -124.000 0.500 NA   NA
 7552401 7552402 CLM_2628 CLM_2629     FALSE 0.017 399.000 0.000 NA N NA
 7552402 7552403 CLM_2629 CLM_2630     FALSE 0.321 59.000 0.000 NA   NA
 7552404 7552405 CLM_2631 CLM_2632     FALSE 0.455 42.000 0.000 NA   NA
 7552405 7552406 CLM_2632 CLM_2633     TRUE 0.644 17.000 0.000 NA   NA
 7552406 7552407 CLM_2633 CLM_2634     FALSE 0.272 104.000 0.000 NA   NA
 7552407 7552408 CLM_2634 CLM_2635     FALSE 0.091 224.000 0.000 NA   NA
 7552408 7552409 CLM_2635 CLM_2636     FALSE 0.002 665.000 0.000 NA   NA
 7552409 7552410 CLM_2636 CLM_2637     FALSE 0.272 122.000 0.000 NA   NA
 7552410 7552411 CLM_2637 CLM_2638     TRUE 0.651 16.000 0.000 NA   NA
 7552411 7552412 CLM_2638 CLM_2639     TRUE 0.651 16.000 0.000 NA   NA
 7552412 7552413 CLM_2639 CLM_2640     TRUE 0.769 4.000 0.000 NA   NA
 7552413 7552414 CLM_2640 CLM_2641     TRUE 0.998 -19.000 0.708 NA   NA
 7552414 7552415 CLM_2641 CLM_2642     TRUE 0.993 1.000 0.720 NA   NA
 7552415 7552416 CLM_2642 CLM_2643     TRUE 0.970 3.000 0.160 NA   NA
 7552416 7552417 CLM_2643 CLM_2644     TRUE 0.981 10.000 0.500 NA   NA
 7552417 7552418 CLM_2644 CLM_2645     TRUE 0.700 12.000 0.000 NA   NA
 7552418 7552419 CLM_2645 CLM_2646     TRUE 0.863 0.000 0.000 NA   NA
 7552419 7552420 CLM_2646 CLM_2647     FALSE 0.248 86.000 0.000 NA   NA
 7552420 7552421 CLM_2647 CLM_2648     FALSE 0.297 65.000 0.000 NA   NA
 7552421 7552422 CLM_2648 CLM_2649     FALSE 0.254 81.000 0.000 NA   NA
 7552422 7552423 CLM_2649 CLM_2650     TRUE 0.651 16.000 0.000 NA   NA
 7552423 7552424 CLM_2650 CLM_2651     TRUE 0.769 4.000 0.000 NA   NA
 7552424 7552425 CLM_2651 CLM_2652     TRUE 0.991 2.000 0.667 NA   NA
 7552425 7552426 CLM_2652 CLM_2653     TRUE 0.928 -10.000 0.000 NA   NA
 7552426 7552427 CLM_2653 CLM_2654     TRUE 0.815 2.000 0.000 NA   NA
 7552427 7552428 CLM_2654 CLM_2655     TRUE 0.863 0.000 0.000 NA   NA
 7552428 7552429 CLM_2655 CLM_2656     TRUE 0.991 2.000 0.667 NA   NA
 7552429 7552430 CLM_2656 CLM_2657     TRUE 0.969 14.000 0.375 NA   NA
 7552430 7552431 CLM_2657 CLM_2658     TRUE 0.956 20.000 0.250 NA   NA
 7552431 7552432 CLM_2658 CLM_2659     TRUE 0.647 23.000 0.000 NA   NA
 7552432 7552433 CLM_2659 CLM_2660     FALSE 0.248 86.000 0.000 NA   NA
 7552433 7552434 CLM_2660 CLM_2661     FALSE 0.538 33.000 0.000 NA   NA
 7552434 7552435 CLM_2661 CLM_2662     TRUE 0.996 -28.000 0.263 NA   NA
 7552435 7552436 CLM_2662 CLM_2663     TRUE 0.950 13.000 0.158 NA   NA
 7552436 7552437 CLM_2663 CLM_2664     TRUE 0.988 -10.000 0.026 0.001   NA
 7552439 7552440 CLM_2666 CLM_2667     TRUE 0.815 2.000 0.000 NA   NA
 7552440 7552441 CLM_2667 CLM_2668     TRUE 0.786 3.000 0.000 NA   NA
 7552441 7552442 CLM_2668 CLM_2669     TRUE 0.912 -7.000 0.000 NA   NA
 7552442 7552443 CLM_2669 CLM_2670     FALSE 0.015 359.000 0.000 NA   NA
 7552443 7552444 CLM_2670 CLM_2671     FALSE 0.416 46.000 0.000 NA   NA
 7552444 7552445 CLM_2671 CLM_2672     FALSE 0.493 38.000 0.000 NA   NA
 7552445 7552446 CLM_2672 CLM_2673     FALSE 0.483 39.000 0.000 NA   NA
 7552446 7552447 CLM_2673 CLM_2674     TRUE 0.972 6.000 0.250 NA   NA
 7552447 7552448 CLM_2674 CLM_2675     TRUE 0.982 12.000 0.643 NA   NA
 7552448 7552449 CLM_2675 CLM_2676     TRUE 0.981 0.000 0.143 NA   NA
 7552449 7552450 CLM_2676 CLM_2677     FALSE 0.527 34.000 0.000 NA   NA
 7552450 7552451 CLM_2677 CLM_2678     TRUE 0.863 0.000 0.000 NA   NA
 7552451 7552452 CLM_2678 CLM_2679     TRUE 0.646 19.000 0.000 NA   NA
 7552452 7552453 CLM_2679 CLM_2680     FALSE 0.301 64.000 0.000 NA   NA
 7552453 7552454 CLM_2680 CLM_2681     FALSE 0.120 205.000 0.000 NA   NA
 7552454 7552455 CLM_2681 CLM_2682     TRUE 0.685 13.000 0.000 NA   NA
 7552455 7552456 CLM_2682 CLM_2683     FALSE 0.312 61.000 0.000 NA   NA
 7552456 7552457 CLM_2683 CLM_2684     FALSE 0.269 101.000 0.000 NA   NA
 7552458 7552459 CLM_2685 CLM_2686     TRUE 0.803 4.000 0.000 1.000   NA
 7552459 7552460 CLM_2686 CLM_2687     FALSE 0.317 125.000 0.000 1.000   NA
 7552463 7552464 CLM_2690 CLM_2691 ptsH aspB TRUE 0.726 111.000 0.047 1.000 N NA
 7552464 7552465 CLM_2691 CLM_2692 aspB   FALSE 0.293 145.000 0.000 1.000   NA
 7552465 7552466 CLM_2692 CLM_2693     TRUE 0.890 -3.000 0.000 NA   NA
 7552466 7552467 CLM_2693 CLM_2694     TRUE 0.870 19.000 0.020 NA   NA
 7552467 7552468 CLM_2694 CLM_2695   spoVS FALSE 0.492 163.000 0.020 NA   NA
 7552468 7552469 CLM_2695 CLM_2696 spoVS   FALSE 0.555 139.000 0.016 NA   NA
 7552469 7552470 CLM_2696 CLM_2697   recA FALSE 0.244 235.000 0.018 1.000   NA
 7552470 7552471 CLM_2697 CLM_2698 recA pgsA TRUE 0.668 139.000 0.022 1.000 N NA
 7552471 7552472 CLM_2698 CLM_2699 pgsA   TRUE 0.994 -16.000 0.132 1.000 N NA
 7552472 7552473 CLM_2699 CLM_2700   ftsK TRUE 0.683 95.000 0.031 1.000 N NA
 7552473 7552474 CLM_2700 CLM_2701 ftsK   FALSE 0.030 481.000 0.047 1.000 N NA
 7552474 7552475 CLM_2701 CLM_2702   dapG FALSE 0.319 248.000 0.045 1.000 N NA
 7552475 7552476 CLM_2702 CLM_2703 dapG   TRUE 0.940 16.000 0.148 NA   NA
 7552476 7552477 CLM_2703 CLM_2704     TRUE 0.715 77.000 0.104 NA   NA
 7552477 7552478 CLM_2704 CLM_2705   pnpA TRUE 0.566 174.000 0.057 1.000   NA
 7552478 7552479 CLM_2705 CLM_2706 pnpA rpsO TRUE 0.712 264.000 0.335 1.000 Y NA
 7552479 7552480 CLM_2706 CLM_2707 rpsO ribF TRUE 0.780 82.000 0.119 1.000 N NA
 7552480 7552481 CLM_2707 CLM_2708 ribF truB TRUE 0.975 13.000 0.308 1.000 N NA
 7552481 7552482 CLM_2708 CLM_2709 truB   TRUE 0.983 1.000 0.221 1.000   NA
 7552482 7552483 CLM_2709 CLM_2710   rbfA TRUE 0.992 -10.000 0.173 1.000   NA
 7552483 7552484 CLM_2710 CLM_2711 rbfA infB TRUE 0.988 31.000 0.530 1.000 Y NA
 7552484 7552485 CLM_2711 CLM_2712 infB   TRUE 0.984 18.000 0.223 NA Y NA
 7552485 7552486 CLM_2712 CLM_2713     TRUE 0.997 -13.000 0.408 NA N NA
 7552486 7552487 CLM_2713 CLM_2714   nusA TRUE 0.951 59.000 0.323 NA Y NA
 7552487 7552488 CLM_2714 CLM_2715 nusA   TRUE 0.981 17.000 0.759 NA   NA
 7552488 7552489 CLM_2715 CLM_2716   polC FALSE 0.133 305.000 0.059 NA   NA
 7552489 7552490 CLM_2716 CLM_2717 polC gcpE FALSE 0.225 279.000 0.040 1.000 N NA
 7552490 7552491 CLM_2717 CLM_2718 gcpE rseP TRUE 0.765 141.000 0.092 1.000 N NA
 7552491 7552492 CLM_2718 CLM_2719 rseP dxr TRUE 0.954 45.000 0.568 1.000 N NA
 7552492 7552493 CLM_2719 CLM_2720 dxr   TRUE 0.754 37.000 0.008 NA   NA
 7552493 7552494 CLM_2720 CLM_2721     TRUE 0.811 100.000 0.250 NA   NA
 7552494 7552495 CLM_2721 CLM_2722     FALSE 0.321 59.000 0.000 NA   NA
 7552495 7552496 CLM_2722 CLM_2723   cdsA FALSE 0.160 185.000 0.000 NA   NA
 7552496 7552497 CLM_2723 CLM_2724 cdsA uppS TRUE 0.972 25.000 0.055 1.000 Y NA
 7552497 7552498 CLM_2724 CLM_2725 uppS frr TRUE 0.905 66.000 0.409 1.000 N NA
 7552498 7552499 CLM_2725 CLM_2726 frr pyrH TRUE 0.983 16.000 0.626 1.000 N NA
 7552499 7552500 CLM_2726 CLM_2727 pyrH tsf FALSE 0.227 375.000 0.416 1.000 N NA
 7552500 7552501 CLM_2727 CLM_2728 tsf rpsB TRUE 0.964 88.000 0.748 1.000 Y NA
 7552501 7552502 CLM_2728 CLM_2729 rpsB codY FALSE 0.260 237.000 0.006 1.000 N NA
 7552502 7552503 CLM_2729 CLM_2730 codY topA FALSE 0.432 207.000 0.025 1.000 N NA
 7552503 7552504 CLM_2730 CLM_2731 topA dprA FALSE 0.300 384.000 0.238 1.000 Y NA
 7552505 7552506 CLM_2732 CLM_2733     TRUE 0.886 16.000 0.003 1.000 N NA
 7552507 7552508 CLM_2734 CLM_2735 rnhB   FALSE 0.239 297.000 0.148 1.000   NA
 7552508 7552509 CLM_2735 CLM_2736   lepB FALSE 0.085 305.000 0.007 1.000   NA
 7552509 7552510 CLM_2736 CLM_2737 lepB rplS TRUE 0.681 59.000 0.006 1.000 N NA
 7552510 7552511 CLM_2737 CLM_2738 rplS trmD TRUE 0.953 151.000 0.567 1.000 Y NA
 7552511 7552512 CLM_2738 CLM_2739 trmD rimM TRUE 0.999 -9.000 0.672 1.000 Y NA
 7552512 7552513 CLM_2739 CLM_2740 rimM   TRUE 0.846 113.000 0.324 1.000   NA
 7552513 7552514 CLM_2740 CLM_2741   rpsP TRUE 0.968 21.000 0.385 1.000   NA
 7552514 7552515 CLM_2741 CLM_2742 rpsP ffh TRUE 0.962 31.000 0.361 1.000 N NA
 7552515 7552516 CLM_2742 CLM_2743 ffh   TRUE 0.953 13.000 0.151 1.000   NA
 7552516 7552517 CLM_2743 CLM_2744   ftsY FALSE 0.401 224.000 0.081 1.000   NA
 7552517 7552518 CLM_2744 CLM_2745 ftsY smc TRUE 0.799 163.000 0.165 0.014 N NA
 7552518 7552519 CLM_2745 CLM_2746 smc   TRUE 0.852 13.000 0.003 NA   NA
 7552519 7552520 CLM_2746 CLM_2747     TRUE 0.562 123.000 0.016 NA   NA
 7552520 7552521 CLM_2747 CLM_2748   rnc TRUE 0.995 -7.000 0.064 1.000 Y NA
 7552521 7552522 CLM_2748 CLM_2749 rnc acpP TRUE 0.753 125.000 0.068 1.000 N NA
 7552522 7552523 CLM_2749 CLM_2750 acpP plsX TRUE 0.885 78.000 0.034 0.004 Y NA
 7552523 7552524 CLM_2750 CLM_2751 plsX   TRUE 0.885 90.000 0.418 1.000 N NA
 7552524 7552525 CLM_2751 CLM_2752     TRUE 0.979 14.000 0.599 NA   NA
 7552525 7552526 CLM_2752 CLM_2753   ackA TRUE 0.669 118.000 0.061 NA   NA
 7552526 7552527 CLM_2753 CLM_2754 ackA pta TRUE 0.910 140.000 0.137 1.000 Y NA
 7552527 7552528 CLM_2754 CLM_2755 pta   FALSE 0.024 335.000 0.000 1.000   NA
 7552528 7552529 CLM_2755 CLM_2757   prdB FALSE 0.016 367.000 0.000 1.000   NA
 7552529 7552530 CLM_2757 CLM_2758 prdB   TRUE 0.571 30.000 0.000 NA   NA
 7552530 7552531 CLM_2758 CLM_2759   prdA TRUE 0.990 9.000 1.000 NA   NA
 7552531 7552532 CLM_2759 CLM_2760 prdA   TRUE 0.976 33.000 1.000 NA   NA
 7552532 7552533 CLM_2760 CLM_2761     TRUE 0.979 22.000 0.667 NA   NA
 7552533 7552534 CLM_2761 CLM_2762     FALSE 0.002 997.000 0.000 1.000   NA
 7552534 7552535 CLM_2762 CLM_2763     FALSE 0.031 310.000 0.000 1.000   NA
 7552535 7552536 CLM_2763 CLM_2765     FALSE 0.010 390.000 0.000 NA   NA
 7552536 7552537 CLM_2765 CLM_2766     FALSE 0.006 445.000 0.000 NA   NA
 7552537 7552538 CLM_2766 CLM_2767     FALSE 0.263 77.000 0.000 NA   NA
 7552540 7552541 CLM_2769 CLM_2770     FALSE 0.004 530.000 0.000 1.000   NA
 7552541 7552542 CLM_2770 CLM_2771   prdE TRUE 0.673 14.000 0.000 NA   NA
 7552542 7552543 CLM_2771 CLM_2772 prdE prdD TRUE 0.673 14.000 0.000 NA   NA
 7552543 7552544 CLM_2772 CLM_2774 prdD   FALSE 0.019 341.000 0.000 NA   NA
 7552544 7552545 CLM_2774 CLM_2775     FALSE 0.267 76.000 0.000 NA   NA
 7552545 7552546 CLM_2775 CLM_2776   prdA TRUE 0.730 9.000 0.000 NA   NA
 7552546 7552547 CLM_2776 CLM_2777 prdA   TRUE 0.984 25.000 1.000 NA   NA
 7552547 7552548 CLM_2777 CLM_2778     TRUE 0.985 22.000 1.000 NA   NA
 7552548 7552549 CLM_2778 CLM_2779     FALSE 0.002 641.000 0.000 NA   NA
 7552549 7552550 CLM_2779 CLM_2780     TRUE 0.969 40.000 1.000 NA   NA
 7552552 7552553 CLM_2782 CLM_2783     FALSE 0.063 248.000 0.000 NA   NA
 7552553 7552554 CLM_2783 CLM_2784     TRUE 0.959 5.000 0.118 NA   NA
 7552554 7552555 CLM_2784 CLM_2786     FALSE 0.101 216.000 0.000 NA   NA
 7552555 7552556 CLM_2786 CLM_2787     FALSE 0.260 96.000 0.000 NA   NA
 7552556 7552557 CLM_2787 CLM_2788     TRUE 0.942 31.000 0.286 NA   NA
 7552557 7552558 CLM_2788 CLM_2789     FALSE 0.315 176.000 0.000 1.000 N NA
 7552559 7552560 CLM_2790 CLM_2791     TRUE 0.672 60.000 0.036 NA   NA
 7552561 7552562 CLM_2792 CLM_2793   coaD TRUE 0.919 13.000 0.055 NA   NA
 7552562 7552563 CLM_2793 CLM_2794 coaD   TRUE 0.989 2.000 0.367 1.000 N NA
 7552563 7552564 CLM_2794 CLM_2795   recG FALSE 0.458 262.000 0.016 1.000 Y NA
 7552564 7552565 CLM_2795 CLM_2796 recG   FALSE 0.080 350.000 0.048 1.000   NA
 7552565 7552566 CLM_2796 CLM_2797     TRUE 0.977 15.000 0.567 NA   NA
 7552568 7552569 CLM_2799 CLM_2800     TRUE 0.851 78.000 0.400 NA   NA
 7552569 7552570 CLM_2800 CLM_2801     FALSE 0.017 429.000 0.005 NA   NA
 7552570 7552571 CLM_2801 CLM_2802   rpe TRUE 0.982 2.000 0.166 1.000 N NA
 7552571 7552572 CLM_2802 CLM_2803 rpe rsgA TRUE 0.990 -6.000 0.213 1.000   NA
 7552572 7552573 CLM_2803 CLM_2804 rsgA   TRUE 0.579 207.000 0.196 1.000   NA
 7552573 7552574 CLM_2804 CLM_2805     TRUE 0.999 -22.000 0.704 1.000 Y NA
 7552574 7552575 CLM_2805 CLM_2806     TRUE 0.933 19.000 0.105 1.000   NA
 7552575 7552576 CLM_2806 CLM_2807   sun TRUE 0.953 12.000 0.135 1.000   NA
 7552576 7552577 CLM_2807 CLM_2808 sun   TRUE 0.917 21.000 0.076 NA   NA
 7552577 7552578 CLM_2808 CLM_2809   fmt FALSE 0.100 318.000 0.035 NA   NA
 7552578 7552579 CLM_2809 CLM_2810 fmt def TRUE 0.968 17.000 0.009 0.020 Y NA
 7552579 7552580 CLM_2810 CLM_2811 def priA TRUE 0.876 28.000 0.010 1.000 N NA
 7552580 7552581 CLM_2811 CLM_2812 priA coaBC FALSE 0.093 389.000 0.099 1.000 N NA
 7552581 7552582 CLM_2812 CLM_2813 coaBC rpoZ TRUE 0.957 2.000 0.013 1.000 N NA
 7552582 7552583 CLM_2813 CLM_2814 rpoZ gmk TRUE 0.991 -19.000 0.035 1.000 N NA
 7552583 7552584 CLM_2814 CLM_2815 gmk   TRUE 0.981 0.000 0.143 NA   NA
 7552584 7552585 CLM_2815 CLM_2816     TRUE 0.947 16.000 0.189 NA   NA
 7552585 7552586 CLM_2816 CLM_2817   ansA FALSE 0.308 194.000 0.003 NA   NA
 7552590 7552591 CLM_2823 CLM_2824   engA TRUE 0.595 171.000 0.068 1.000   NA
 7552591 7552592 CLM_2824 CLM_2825 engA   TRUE 0.956 3.000 0.061 1.000   NA
 7552592 7552593 CLM_2825 CLM_2826   phoU FALSE 0.037 422.000 0.028 NA N NA
 7552593 7552594 CLM_2826 CLM_2827 phoU pstB TRUE 0.976 30.000 0.182 NA Y NA
 7552594 7552595 CLM_2827 CLM_2828 pstB pstA TRUE 0.986 13.000 0.112 0.002 Y NA
 7552595 7552596 CLM_2828 CLM_2829 pstA pstC TRUE 0.999 0.000 0.907 0.002 Y NA
 7552596 7552597 CLM_2829 CLM_2830 pstC pstS TRUE 0.814 207.000 0.206 1.000 Y NA
 7552597 7552598 CLM_2830 CLM_2831 pstS   FALSE 0.292 247.000 0.028 1.000 N NA
 7552598 7552599 CLM_2831 CLM_2832     TRUE 0.983 12.000 0.110 1.000 Y NA
 7552599 7552600 CLM_2832 CLM_2833     TRUE 0.898 11.000 0.018 NA   NA
 7552600 7552601 CLM_2833 CLM_2834   nrdR FALSE 0.030 398.000 0.013 NA   NA
 7552601 7552602 CLM_2834 CLM_2835 nrdR   FALSE 0.518 131.000 0.005 NA   NA
 7552602 7552603 CLM_2835 CLM_2836   sigG FALSE 0.558 149.000 0.026 NA   NA
 7552603 7552604 CLM_2836 CLM_2837 sigG sigE TRUE 0.969 75.000 0.602 0.006 Y NA
 7552604 7552605 CLM_2837 CLM_2838 sigE spoIIGA TRUE 0.987 12.000 0.856 1.000   NA
 7552605 7552606 CLM_2838 CLM_2839 spoIIGA ftsZ FALSE 0.098 313.000 0.024 1.000   NA
 7552606 7552607 CLM_2839 CLM_2840 ftsZ ftsA TRUE 0.990 23.000 0.460 1.000 Y NA
 7552607 7552608 CLM_2840 CLM_2841 ftsA   FALSE 0.551 157.000 0.008 NA N NA
 7552610 7552611 CLM_2843 CLM_2844 pilT aroE TRUE 0.964 2.000 0.028 1.000 N NA
 7552611 7552612 CLM_2844 CLM_2845 aroE sigK TRUE 0.688 132.000 0.025 1.000 N NA
 7552612 7552613 CLM_2845 CLM_2846 sigK   FALSE 0.007 426.000 0.000 NA   NA
 7552613 7552614 CLM_2846 CLM_2847     FALSE 0.006 445.000 0.000 NA   NA
 7552614 7552615 CLM_2847 CLM_2848     FALSE 0.002 852.000 0.000 NA   NA
 7552617 7552618 CLM_2850 CLM_2851     FALSE 0.257 79.000 0.000 NA   NA
 7552618 7552619 CLM_2851 CLM_2852     FALSE 0.274 127.000 0.000 NA   NA
 7552619 7552620 CLM_2852 CLM_2853     FALSE 0.271 119.000 0.000 NA   NA
 7552620 7552621 CLM_2853 CLM_2855     TRUE 0.647 23.000 0.000 NA   NA
 7552621 7552622 CLM_2855 CLM_2856     TRUE 0.713 11.000 0.000 NA   NA
 7552622 7552623 CLM_2856 CLM_2857     TRUE 0.998 -46.000 0.500 NA   NA
 7552624 7552625 CLM_2858 CLM_2859     FALSE 0.115 207.000 0.000 NA   NA
 7552626 7552627 CLM_2860 CLM_2861   udk TRUE 0.621 86.000 0.012 1.000 N NA
 7552627 7552628 CLM_2861 CLM_2862 udk   TRUE 0.759 148.000 0.100 1.000 N NA
 7552628 7552629 CLM_2862 CLM_2863     TRUE 0.990 -7.000 0.146 1.000   NA
 7552629 7552630 CLM_2863 CLM_2864     TRUE 0.652 83.000 0.067 NA   NA
 7552630 7552631 CLM_2864 CLM_2865   typA FALSE 0.531 78.000 0.012 NA   NA
 7552631 7552632 CLM_2865 CLM_2866 typA   FALSE 0.007 644.000 0.004 1.000   NA
 7552632 7552633 CLM_2866 CLM_2867     TRUE 0.904 48.000 0.289 1.000   NA
 7552633 7552634 CLM_2867 CLM_2868     TRUE 0.794 122.000 0.211 NA   NA
 7552634 7552635 CLM_2868 CLM_2869     TRUE 0.909 14.000 0.047 NA   NA
 7552635 7552636 CLM_2869 CLM_2870     TRUE 0.730 207.000 0.537 NA   NA
 7552636 7552637 CLM_2870 CLM_2871   alaS TRUE 0.729 115.000 0.110 NA   NA
 7552637 7552638 CLM_2871 CLM_2872 alaS   FALSE 0.019 446.000 0.015 NA   NA
 7552638 7552639 CLM_2872 CLM_2873     TRUE 0.957 13.000 0.209 NA   NA
 7552639 7552640 CLM_2873 CLM_2874   nifU FALSE 0.371 182.000 0.008 NA   NA
 7552640 7552641 CLM_2874 CLM_2875 nifU iscS TRUE 0.966 2.000 0.035 1.000 N NA
 7552641 7552642 CLM_2875 CLM_2876 iscS   TRUE 0.991 -7.000 0.125 NA N NA
 7552642 7552643 CLM_2876 CLM_2877     FALSE 0.361 220.000 0.025 NA N NA
 7552643 7552644 CLM_2877 CLM_2878   hisJ FALSE 0.146 337.000 0.041 0.006 N NA
 7552644 7552645 CLM_2878 CLM_2879 hisJ   FALSE 0.217 264.000 0.041 1.000   NA
 7552645 7552646 CLM_2879 CLM_2880     TRUE 0.759 108.000 0.143 NA   NA
 7552648 7552649 CLM_2882 CLM_2883     TRUE 0.864 122.000 0.031 1.000 Y NA
 7552649 7552650 CLM_2883 CLM_2884     FALSE 0.020 744.000 0.000 0.002 Y NA
 7552652 7552653 CLM_2886 CLM_2887     FALSE 0.014 365.000 0.000 NA   NA
 7552653 7552654 CLM_2887 CLM_2888     FALSE 0.248 198.000 0.000 1.000 N NA
 7552654 7552655 CLM_2888 CLM_2889     TRUE 0.991 -3.000 0.182 1.000 N NA
 7552655 7552656 CLM_2889 CLM_2890     TRUE 0.982 5.000 0.400 1.000   NA
 7552656 7552657 CLM_2890 CLM_2891     TRUE 0.913 6.000 0.011 1.000   NA
 7552657 7552658 CLM_2891 CLM_2892     TRUE 0.960 17.000 0.011 NA Y NA
 7552658 7552659 CLM_2892 CLM_2893     TRUE 0.936 9.000 0.026 NA N NA
 7552659 7552660 CLM_2893 CLM_2894     TRUE 0.971 41.000 0.250 1.000 Y NA
 7552660 7552661 CLM_2894 CLM_2895     TRUE 0.907 40.000 0.143 0.042   NA
 7552661 7552662 CLM_2895 CLM_2896     TRUE 0.968 4.000 0.143 1.000   NA
 7552662 7552663 CLM_2896 CLM_2897     TRUE 0.934 9.000 0.044 1.000   NA
 7552663 7552664 CLM_2897 CLM_2898     TRUE 0.966 -3.000 0.011 1.000   NA
 7552664 7552665 CLM_2898 CLM_2899     TRUE 0.865 19.000 0.011 1.000   NA
 7552665 7552666 CLM_2899 CLM_2900   argF FALSE 0.010 465.000 0.000 1.000 N NA
 7552666 7552667 CLM_2900 CLM_2901 argF arcC TRUE 0.954 95.000 0.500 1.000 Y NA
 7552667 7552668 CLM_2901 CLM_2902 arcC glyA FALSE 0.023 564.000 0.000 1.000 Y NA
 7552669 7552670 CLM_2903 CLM_2904     TRUE 0.986 -3.000 0.154 NA   NA
 7552671 7552672 CLM_2905 CLM_2906     FALSE 0.494 201.000 0.095 NA   NA
 7552673 7552674 CLM_2908 CLM_2909     FALSE 0.008 411.000 0.000 NA   NA
 7552674 7552675 CLM_2909 CLM_2910     TRUE 0.824 77.000 0.185 1.000 N NA
 7552675 7552676 CLM_2910 CLM_2911     TRUE 0.684 154.000 0.111 NA   NA
 7552676 7552677 CLM_2911 CLM_2912     FALSE 0.019 339.000 0.000 NA   NA
 7552678 7552679 CLM_2913 CLM_2914     FALSE 0.152 188.000 0.000 NA   NA
 7552679 7552680 CLM_2914 CLM_2915     FALSE 0.318 129.000 0.000 1.000   NA
 7552680 7552681 CLM_2915 CLM_2916     FALSE 0.455 42.000 0.000 NA   NA
 7552681 7552682 CLM_2916 CLM_2917     TRUE 0.991 2.000 0.667 NA   NA
 7552682 7552683 CLM_2917 CLM_2918     FALSE 0.263 98.000 0.000 NA   NA
 7552683 7552684 CLM_2918 CLM_2919     TRUE 0.863 0.000 0.000 NA   NA
 7552684 7552685 CLM_2919 CLM_2920     TRUE 0.700 12.000 0.000 NA   NA
 7552685 7552686 CLM_2920 CLM_2921     TRUE 0.863 0.000 0.000 NA   NA
 7552686 7552687 CLM_2921 CLM_2922     TRUE 0.769 4.000 0.000 NA   NA
 7552687 7552688 CLM_2922 CLM_2923     TRUE 0.651 16.000 0.000 NA   NA
 7552688 7552689 CLM_2923 CLM_2924     FALSE 0.330 57.000 0.000 NA   NA
 7552689 7552690 CLM_2924 CLM_2925     TRUE 0.902 114.000 0.667 NA   NA
 7552690 7552691 CLM_2925 CLM_2926     TRUE 0.915 58.000 0.600 NA   NA
 7552691 7552692 CLM_2926 CLM_2927     TRUE 0.926 64.000 0.800 NA   NA
 7552692 7552693 CLM_2927 CLM_2928     TRUE 0.911 16.000 0.062 NA   NA
 7552693 7552694 CLM_2928 CLM_2929     TRUE 0.976 1.000 0.125 NA   NA
 7552694 7552695 CLM_2929 CLM_2930     TRUE 0.928 -10.000 0.000 NA   NA
 7552695 7552696 CLM_2930 CLM_2931     FALSE 0.248 85.000 0.000 NA   NA
 7552696 7552697 CLM_2931 CLM_2932   clpP FALSE 0.274 74.000 0.000 NA   NA
 7552697 7552698 CLM_2932 CLM_2933 clpP   TRUE 0.912 -7.000 0.000 NA   NA
 7552698 7552699 CLM_2933 CLM_2934     FALSE 0.437 44.000 0.000 NA   NA
 7552699 7552700 CLM_2934 CLM_2935     TRUE 0.640 24.000 0.000 NA   NA
 7552700 7552701 CLM_2935 CLM_2936     TRUE 0.993 1.000 0.750 NA   NA
 7552701 7552702 CLM_2936 CLM_2937     TRUE 0.866 147.000 0.500 NA   NA
 7552702 7552703 CLM_2937 CLM_2938     FALSE 0.269 101.000 0.000 NA   NA
 7552703 7552704 CLM_2938 CLM_2939     FALSE 0.097 219.000 0.000 NA   NA
 7552704 7552705 CLM_2939 CLM_2940     TRUE 0.650 22.000 0.000 NA   NA
 7552705 7552706 CLM_2940 CLM_2941     TRUE 0.571 30.000 0.000 NA   NA
 7552706 7552707 CLM_2941 CLM_2942     FALSE 0.274 125.000 0.000 NA   NA
 7552707 7552708 CLM_2942 CLM_2943     FALSE 0.286 69.000 0.000 NA   NA
 7552708 7552709 CLM_2943 CLM_2944     FALSE 0.263 77.000 0.000 NA   NA
 7552709 7552710 CLM_2944 CLM_2945     FALSE 0.560 31.000 0.000 NA   NA
 7552710 7552711 CLM_2945 CLM_2946     TRUE 0.839 1.000 0.000 NA   NA
 7552711 7552712 CLM_2946 CLM_2947     FALSE 0.403 48.000 0.000 NA   NA
 7552712 7552713 CLM_2947 CLM_2948     FALSE 0.034 296.000 0.000 NA   NA
 7552713 7552714 CLM_2948 CLM_2949     TRUE 0.596 28.000 0.000 NA   NA
 7552714 7552715 CLM_2949 CLM_2950     FALSE 0.031 300.000 0.000 NA   NA
 7552715 7552716 CLM_2950 CLM_2951     FALSE 0.224 157.000 0.000 NA   NA
 7552716 7552717 CLM_2951 CLM_2952     FALSE 0.015 359.000 0.000 NA   NA
 7552717 7552718 CLM_2952 CLM_2953     FALSE 0.416 46.000 0.000 NA   NA
 7552718 7552719 CLM_2953 CLM_2954     FALSE 0.263 77.000 0.000 NA   NA
 7552719 7552720 CLM_2954 CLM_2955     FALSE 0.387 50.000 0.000 NA   NA
 7552720 7552721 CLM_2955 CLM_2956     FALSE 0.301 64.000 0.000 NA   NA
 7552721 7552722 CLM_2956 CLM_2957     FALSE 0.006 436.000 0.000 NA   NA
 7552722 7552723 CLM_2957 CLM_2958     FALSE 0.275 132.000 0.000 NA   NA
 7552723 7552724 CLM_2958 CLM_2959     TRUE 0.713 11.000 0.000 NA   NA
 7552728 7552729 CLM_2963 CLM_2964     FALSE 0.294 66.000 0.000 NA   NA
 7552729 7552730 CLM_2964 CLM_2965     TRUE 0.673 14.000 0.000 NA   NA
 7552730 7552731 CLM_2965 CLM_2966     FALSE 0.002 790.000 0.000 NA   NA
 7552731 7552732 CLM_2966 CLM_2967     FALSE 0.441 135.000 0.000 1.000 N NA
 7552732 7552733 CLM_2967 CLM_2968     TRUE 0.987 -9.000 0.034 1.000 N NA
 7552733 7552734 CLM_2968 CLM_2969     FALSE 0.010 458.000 0.000 1.000 N NA
 7552734 7552735 CLM_2969 CLM_2970   hprK TRUE 0.983 -7.000 0.006 0.095 N NA
 7552735 7552736 CLM_2970 CLM_2971 hprK   TRUE 0.811 32.000 0.018 NA   NA
 7552736 7552737 CLM_2971 CLM_2972     FALSE 0.192 171.000 0.000 NA   NA
 7552737 7552738 CLM_2972 CLM_2973     TRUE 0.994 -34.000 0.130 NA   NA
 7552738 7552739 CLM_2973 CLM_2974     TRUE 0.802 109.000 0.222 NA   NA
 7552739 7552740 CLM_2974 CLM_2975     TRUE 0.969 0.000 0.049 NA   NA
 7552740 7552741 CLM_2975 CLM_2976     TRUE 0.987 -10.000 0.073 NA   NA
 7552741 7552742 CLM_2976 CLM_2977     TRUE 0.863 0.000 0.000 NA   NA
 7552746 7552747 CLM_2981 CLM_2982     FALSE 0.005 455.000 0.000 NA   NA
 7552747 7552748 CLM_2982 CLM_2983     FALSE 0.003 548.000 0.000 NA   NA
 7552748 7552749 CLM_2983 CLM_2984     FALSE 0.002 1052.000 0.000 NA   NA
 7552749 7552750 CLM_2984 CLM_2985   def TRUE 0.935 17.000 0.065 1.000 N NA
 7552752 7552753 CLM_2987 CLM_2988     TRUE 0.985 29.000 0.238 0.005 Y NA
 7552753 7552754 CLM_2988 CLM_2989     TRUE 0.999 -7.000 0.776 0.005 Y NA
 7552754 7552755 CLM_2989 CLM_2990     TRUE 0.993 14.000 0.462 0.005 Y NA
 7552755 7552756 CLM_2990 CLM_2991     TRUE 0.999 -16.000 0.487 0.005 Y NA
 7552756 7552757 CLM_2991 CLM_2992     TRUE 0.990 15.000 0.258 0.005 Y NA
 7552757 7552758 CLM_2992 CLM_2993     TRUE 0.958 39.000 0.489 0.005   NA
 7552758 7552759 CLM_2993 CLM_2994     TRUE 0.989 13.000 0.848 0.005   NA
 7552759 7552760 CLM_2994 CLM_2995     TRUE 0.994 -13.000 0.132 0.005   NA
 7552760 7552761 CLM_2995 CLM_2996     FALSE 0.027 324.000 0.000 1.000   NA
 7552761 7552762 CLM_2996 CLM_2997     TRUE 0.980 -25.000 0.002 NA   NA
 7552762 7552763 CLM_2997 CLM_2998     FALSE 0.378 172.000 0.002 NA   NA
 7552763 7552764 CLM_2998 CLM_2999     TRUE 0.964 22.000 0.312 1.000   NA
 7552764 7552765 CLM_2999 CLM_3000     TRUE 0.803 39.000 0.026 1.000   NA
 7552767 7552768 CLM_3002 CLM_3003     FALSE 0.037 292.000 0.000 NA   NA
 7552768 7552769 CLM_3003 CLM_3004     TRUE 0.940 55.000 0.088 0.002 Y NA
 7552769 7552770 CLM_3004 CLM_3005     TRUE 0.624 66.000 0.027 NA   NA
 7552770 7552771 CLM_3005 CLM_3006     TRUE 0.790 78.000 0.222 NA   NA
 7552771 7552772 CLM_3006 CLM_3007   fliA TRUE 0.863 29.000 0.029 1.000   NA
 7552772 7552773 CLM_3007 CLM_3008 fliA   TRUE 0.937 14.000 0.062 NA N NA
 7552773 7552774 CLM_3008 CLM_3009   flhG TRUE 0.945 15.000 0.094 NA N NA
 7552774 7552775 CLM_3009 CLM_3010 flhG flhF TRUE 0.995 -6.000 0.382 1.000 N NA
 7552775 7552776 CLM_3010 CLM_3011 flhF flhA TRUE 0.998 -3.000 0.440 1.000 Y NA
 7552776 7552777 CLM_3011 CLM_3012 flhA   TRUE 0.984 28.000 0.207 0.002 Y NA
 7552777 7552778 CLM_3012 CLM_3013   fliQ TRUE 0.974 34.000 0.114 0.002 Y NA
 7552778 7552779 CLM_3013 CLM_3014 fliQ fliP TRUE 0.989 12.000 0.162 0.002 Y NA
 7552779 7552780 CLM_3014 CLM_3015 fliP   TRUE 0.999 -16.000 0.386 1.000 Y NA
 7552780 7552781 CLM_3015 CLM_3016   fliL TRUE 0.859 73.000 0.023 1.000 Y NA
 7552781 7552782 CLM_3016 CLM_3017 fliL motB TRUE 0.997 -3.000 0.314 1.000 Y NA
 7552782 7552783 CLM_3017 CLM_3018 motB motA TRUE 0.998 -7.000 0.350 1.000 Y NA
 7552783 7552784 CLM_3018 CLM_3019 motA   TRUE 0.997 -3.000 0.301 NA Y NA
 7552784 7552785 CLM_3019 CLM_3020     TRUE 0.621 236.000 0.077 NA Y NA
 7552785 7552786 CLM_3020 CLM_3021     TRUE 0.699 82.000 0.100 NA   NA
 7552786 7552787 CLM_3021 CLM_3022   flgD TRUE 0.916 15.000 0.064 NA   NA
 7552787 7552788 CLM_3022 CLM_3023 flgD fliK TRUE 0.810 30.000 0.012 NA   NA
 7552788 7552789 CLM_3023 CLM_3024 fliK fliJ TRUE 0.932 6.000 0.006 0.004   NA
 7552789 7552790 CLM_3024 CLM_3025 fliJ fliI TRUE 0.934 104.000 0.241 1.000 Y NA
 7552790 7552791 CLM_3025 CLM_3026 fliI fliH TRUE 0.976 40.000 0.379 NA Y NA
 7552791 7552792 CLM_3026 CLM_3027 fliH fliG TRUE 0.998 -16.000 0.308 NA Y NA
 7552792 7552793 CLM_3027 CLM_3028 fliG fliF TRUE 0.995 7.000 0.477 0.004 Y NA
 7552793 7552794 CLM_3028 CLM_3029 fliF fliE TRUE 0.984 16.000 0.112 0.004 Y NA
 7552794 7552795 CLM_3029 CLM_3030 fliE flgC TRUE 0.986 12.000 0.095 0.002 Y NA
 7552795 7552796 CLM_3030 CLM_3031 flgC flgB TRUE 0.975 98.000 0.804 0.002 Y NA
 7552796 7552797 CLM_3031 CLM_3032 flgB   FALSE 0.006 573.000 0.000 0.004   NA
 7552797 7552798 CLM_3032 CLM_3033     TRUE 0.764 144.000 0.182 NA   NA
 7552798 7552799 CLM_3033 CLM_3034   argH FALSE 0.003 540.000 0.000 NA   NA
 7552799 7552800 CLM_3034 CLM_3035 argH argG TRUE 0.987 22.000 0.278 1.000 Y NA
 7552800 7552801 CLM_3035 CLM_3036 argG   FALSE 0.035 295.000 0.000 NA   NA
 7552801 7552802 CLM_3036 CLM_3037     TRUE 0.978 23.000 0.667 NA   NA
 7552802 7552803 CLM_3037 CLM_3038   cls FALSE 0.170 180.000 0.000 NA   NA
 7552805 7552806 CLM_3040 CLM_3041     FALSE 0.040 283.000 0.000 NA   NA
 7552806 7552807 CLM_3041 CLM_3042     FALSE 0.061 251.000 0.000 NA   NA
 7552807 7552808 CLM_3042 CLM_3043     FALSE 0.524 40.000 0.000 1.000   NA
 7552808 7552809 CLM_3043 CLM_3044     TRUE 0.918 29.000 0.000 1.000 Y NA
 7552809 7552810 CLM_3044 CLM_3045     TRUE 0.957 33.000 0.051 1.000 Y NA
 7552810 7552811 CLM_3045 CLM_3046     TRUE 0.928 15.000 0.091 NA   NA
 7552811 7552812 CLM_3046 CLM_3047     FALSE 0.527 34.000 0.000 NA   NA
 7552812 7552813 CLM_3047 CLM_3048     TRUE 0.606 27.000 0.000 NA   NA
 7552813 7552814 CLM_3048 CLM_3049   glf TRUE 0.953 0.000 0.012 NA   NA
 7552814 7552815 CLM_3049 CLM_3050 glf   TRUE 0.833 105.000 0.012 NA Y NA
 7552815 7552816 CLM_3050 CLM_3051     FALSE 0.183 211.000 0.000 NA N NA
 7552816 7552817 CLM_3051 CLM_3052     TRUE 0.793 19.000 0.000 1.000 N NA
 7552817 7552818 CLM_3052 CLM_3053     TRUE 0.981 5.000 0.027 1.000 Y NA
 7552818 7552819 CLM_3053 CLM_3054     TRUE 0.956 35.000 0.400 NA N NA
 7552819 7552820 CLM_3054 CLM_3055     FALSE 0.005 465.000 0.000 NA   NA
 7552820 7552821 CLM_3055 CLM_3056     FALSE 0.240 150.000 0.000 NA   NA
 7552821 7552822 CLM_3056 CLM_3057     TRUE 0.929 121.000 1.000 NA   NA
 7552822 7552823 CLM_3057 CLM_3058     FALSE 0.263 140.000 0.000 NA   NA
 7552823 7552824 CLM_3058 CLM_3059     FALSE 0.136 198.000 0.000 NA   NA
 7552824 7552825 CLM_3059 CLM_3060   fliC TRUE 0.819 77.000 0.250 1.000   NA
 7552825 7552826 CLM_3060 CLM_3061 fliC   TRUE 0.692 185.000 0.250 NA   NA
 7552826 7552827 CLM_3061 CLM_3062     FALSE 0.248 86.000 0.000 NA   NA
 7552827 7552828 CLM_3062 CLM_3064     FALSE 0.117 219.000 0.000 1.000   NA
 7552828 7552829 CLM_3064 CLM_3065     FALSE 0.008 495.000 0.000 1.000 N NA
 7552829 7552830 CLM_3065 CLM_3066     FALSE 0.291 90.000 0.000 1.000   NA
 7552830 7552831 CLM_3066 CLM_3067     TRUE 0.686 24.000 0.000 1.000   NA
 7552831 7552832 CLM_3067 CLM_3068     TRUE 0.644 18.000 0.000 NA   NA
 7552832 7552833 CLM_3068 CLM_3069     TRUE 0.741 7.000 0.000 NA   NA
 7552833 7552834 CLM_3069 CLM_3070     TRUE 0.890 -3.000 0.000 NA   NA
 7552834 7552835 CLM_3070 CLM_3071     TRUE 0.640 24.000 0.000 NA   NA
 7552835 7552836 CLM_3071 CLM_3072     TRUE 0.882 37.000 0.000 NA Y NA
 7552836 7552837 CLM_3072 CLM_3073     FALSE 0.271 116.000 0.000 NA   NA
 7552837 7552838 CLM_3073 CLM_3074     TRUE 0.839 1.000 0.000 NA   NA
 7552838 7552839 CLM_3074 CLM_3075     FALSE 0.493 38.000 0.000 NA   NA
 7552839 7552840 CLM_3075 CLM_3076     FALSE 0.233 152.000 0.000 NA   NA
 7552840 7552841 CLM_3076 CLM_3077     TRUE 0.689 18.000 0.000 1.000   NA
 7552841 7552842 CLM_3077 CLM_3078     TRUE 0.589 33.000 0.000 1.000   NA
 7552842 7552843 CLM_3078 CLM_3079     FALSE 0.367 59.000 0.000 1.000   NA
 7552843 7552844 CLM_3079 CLM_3080     FALSE 0.545 38.000 0.000 1.000   NA
 7552844 7552845 CLM_3080 CLM_3081     TRUE 0.773 41.000 0.018 1.000   NA
 7552845 7552846 CLM_3081 CLM_3082     TRUE 0.988 -13.000 0.073 NA   NA
 7552846 7552847 CLM_3082 CLM_3083     TRUE 0.906 25.000 0.067 NA   NA
 7552847 7552848 CLM_3083 CLM_3084   rfbA TRUE 0.598 32.000 0.000 1.000   NA
 7552848 7552849 CLM_3084 CLM_3085 rfbA rfbB TRUE 0.985 26.000 0.198 0.002 Y NA
 7552849 7552850 CLM_3085 CLM_3086 rfbB pseI TRUE 0.788 60.000 0.000 1.000 Y NA
 7552850 7552851 CLM_3086 CLM_3087 pseI   TRUE 0.861 142.000 0.037 1.000 Y NA
 7552851 7552852 CLM_3087 CLM_3088     TRUE 0.700 123.000 0.069 1.000   NA
 7552852 7552853 CLM_3088 CLM_3089     TRUE 0.946 40.000 0.468 1.000   NA
 7552853 7552854 CLM_3089 CLM_3090     FALSE 0.180 221.000 0.000 1.000 N NA
 7552854 7552855 CLM_3090 CLM_3091     TRUE 0.864 120.000 0.267 0.002   NA
 7552855 7552856 CLM_3091 CLM_3092     FALSE 0.514 41.000 0.000 1.000   NA
 7552856 7552857 CLM_3092 CLM_3093     TRUE 0.730 9.000 0.000 NA   NA
 7552857 7552858 CLM_3093 CLM_3094     TRUE 0.957 4.000 0.095 NA   NA
 7552858 7552859 CLM_3094 CLM_3095     TRUE 0.631 25.000 0.000 NA   NA
 7552859 7552860 CLM_3095 CLM_3096     TRUE 0.602 199.000 0.105 1.000 N NA
 7552860 7552861 CLM_3096 CLM_3097     TRUE 0.807 214.000 0.133 0.001 Y NA
 7552861 7552862 CLM_3097 CLM_3098     TRUE 0.759 150.000 0.200 NA   NA
 7552862 7552863 CLM_3098 CLM_3099   fliD TRUE 0.879 27.000 0.043 NA   NA
 7552863 7552864 CLM_3099 CLM_3100 fliD fliS TRUE 0.971 54.000 0.370 0.001 Y NA
 7552864 7552865 CLM_3100 CLM_3101 fliS   TRUE 0.870 37.000 0.093 NA   NA
 7552865 7552866 CLM_3101 CLM_3102     TRUE 0.682 55.000 0.028 NA   NA
 7552866 7552867 CLM_3102 CLM_3103   csrA TRUE 0.912 16.000 0.028 NA N NA
 7552867 7552868 CLM_3103 CLM_3104 csrA fliW TRUE 0.977 0.000 0.096 NA   NA
 7552868 7552869 CLM_3104 CLM_3105 fliW flgL TRUE 0.836 89.000 0.385 NA   NA
 7552869 7552870 CLM_3105 CLM_3106 flgL flgK TRUE 0.981 18.000 0.071 0.001 Y NA
 7552870 7552871 CLM_3106 CLM_3107 flgK   FALSE 0.264 289.000 0.082 0.001   NA
 7552871 7552872 CLM_3107 CLM_3108     TRUE 0.993 0.000 0.421 0.001   NA
 7552872 7552873 CLM_3108 CLM_3109   fliN FALSE 0.005 497.000 0.000 1.000   NA
 7552873 7552874 CLM_3109 CLM_3110 fliN fliM TRUE 0.999 -7.000 0.508 0.001 Y NA
 7552874 7552875 CLM_3110 CLM_3111 fliM   TRUE 0.970 28.000 0.039 0.010 Y NA
 7552875 7552876 CLM_3111 CLM_3112   cheY TRUE 0.951 100.000 0.417 1.000 Y NA
 7552876 7552877 CLM_3112 CLM_3113 cheY cheC TRUE 0.969 28.000 0.082 NA Y NA
 7552877 7552878 CLM_3113 CLM_3114 cheC cheA TRUE 0.979 26.000 0.176 NA Y NA
 7552878 7552879 CLM_3114 CLM_3115 cheA cheR TRUE 0.980 13.000 0.081 1.000 Y NA
 7552879 7552880 CLM_3115 CLM_3116 cheR cheB TRUE 0.980 15.000 0.107 1.000 Y NA
 7552880 7552881 CLM_3116 CLM_3117 cheB cheD TRUE 0.975 23.000 0.070 1.000 Y NA
 7552881 7552882 CLM_3117 CLM_3118 cheD cheW TRUE 0.974 17.000 0.063 1.000 Y NA
 7552882 7552883 CLM_3118 CLM_3119 cheW   TRUE 0.964 16.000 0.231 NA N NA
 7552883 7552884 CLM_3119 CLM_3120     FALSE 0.103 253.000 0.000 NA N NA
 7552884 7552885 CLM_3120 CLM_3121     TRUE 0.816 83.000 0.273 1.000   NA
 7552885 7552886 CLM_3121 CLM_3122     FALSE 0.075 249.000 0.000 1.000   NA
 7552886 7552887 CLM_3122 CLM_3123     TRUE 0.910 127.000 0.082 0.041 Y NA
 7552887 7552888 CLM_3123 CLM_3124     FALSE 0.057 257.000 0.000 NA   NA
 7552888 7552889 CLM_3124 CLM_3125     FALSE 0.055 261.000 0.000 NA   NA
 7552889 7552890 CLM_3125 CLM_3126     FALSE 0.050 266.000 0.000 NA   NA
 7552890 7552891 CLM_3126 CLM_3127   murG FALSE 0.005 631.000 0.000 1.000 N NA
 7552893 7552894 CLM_3129 CLM_3130   recJ FALSE 0.003 1231.000 0.000 1.000 N NA
 7552896 7552897 CLM_3132 CLM_3133     FALSE 0.003 589.000 0.000 1.000   NA
 7552898 7552899 CLM_3134 CLM_3135     TRUE 0.577 68.000 0.008 1.000   NA
 7552900 7552901 CLM_3136 CLM_3137 glpP   TRUE 0.779 49.000 0.018 1.000 N NA
 7552901 7552902 CLM_3137 CLM_3138     TRUE 0.968 74.000 0.552 0.002 Y NA
 7552902 7552903 CLM_3138 CLM_3139     FALSE 0.013 367.000 0.000 NA   NA
 7552904 7552905 CLM_3140 CLM_3141     TRUE 0.968 13.000 0.333 NA   NA
 7552905 7552906 CLM_3141 CLM_3142     FALSE 0.006 440.000 0.000 NA   NA
 7552906 7552907 CLM_3142 CLM_3143     TRUE 0.963 20.000 0.333 NA   NA
 7552908 7552909 CLM_3144 CLM_3145   galE FALSE 0.493 38.000 0.000 NA   NA
 7552909 7552910 CLM_3145 CLM_3146 galE   FALSE 0.035 347.000 0.000 1.000 N NA
 7552910 7552911 CLM_3146 CLM_3147     FALSE 0.096 268.000 0.000 1.000 N NA
 7552911 7552912 CLM_3147 CLM_3148     FALSE 0.005 621.000 0.000 1.000 N NA
 7552914 7552915 CLM_3150 CLM_3151 glpK   FALSE 0.409 253.000 0.131 1.000 N NA
 7552917 7552918 CLM_3153 CLM_3154     TRUE 0.860 132.000 0.400 NA   NA
 7552918 7552919 CLM_3154 CLM_3155     TRUE 0.986 -16.000 0.038 NA   NA
 7552919 7552920 CLM_3155 CLM_3156     TRUE 0.986 6.000 0.419 1.000 N NA
 7552920 7552921 CLM_3156 CLM_3157     FALSE 0.551 174.000 0.027 NA N NA
 7552922 7552923 CLM_3158 CLM_3159 hcp   FALSE 0.002 864.000 0.000 NA   NA
 7552923 7552924 CLM_3159 CLM_3160     FALSE 0.028 305.000 0.000 NA   NA
 7552925 7552926 CLM_3161 CLM_3162 gerAC   TRUE 0.999 -31.000 1.000 0.004   NA
 7552926 7552927 CLM_3162 CLM_3163   gerAA TRUE 0.998 -19.000 0.500 0.004   NA
 7552927 7552928 CLM_3163 CLM_3164 gerAA   FALSE 0.037 289.000 0.000 NA   NA
 7552928 7552929 CLM_3164 CLM_3165     FALSE 0.011 386.000 0.000 NA   NA
 7552929 7552930 CLM_3165 CLM_3166     FALSE 0.185 219.000 0.000 1.000 N NA
 7552930 7552931 CLM_3166 CLM_3167     FALSE 0.493 77.000 0.004 NA   NA
 7552933 7552934 CLM_3169 CLM_3170     TRUE 0.564 196.000 0.000 1.000 Y NA
 7552935 7552936 CLM_3171 CLM_3172     FALSE 0.256 143.000 0.000 NA   NA
 7552937 7552938 CLM_3173 CLM_3174     FALSE 0.012 395.000 0.000 1.000   NA
 7552938 7552939 CLM_3174 CLM_3175     FALSE 0.015 378.000 0.000 1.000   NA
 7552939 7552940 CLM_3175 CLM_3176     FALSE 0.003 519.000 0.000 NA   NA
 7552940 7552941 CLM_3176 CLM_3177   nrdB FALSE 0.017 345.000 0.000 NA   NA
 7552941 7552942 CLM_3177 CLM_3178 nrdB nrdA TRUE 0.910 196.000 0.393 0.001 Y NA
 7552943 7552944 CLM_3179 CLM_3180     FALSE 0.412 237.000 0.167 NA   NA
 7552945 7552946 CLM_3181 CLM_3182 dinB   FALSE 0.011 447.000 0.000 1.000 N NA
 7552946 7552947 CLM_3182 CLM_3183     TRUE 0.980 0.000 0.062 1.000 N NA
 7552947 7552948 CLM_3183 CLM_3184   pyrR FALSE 0.011 448.000 0.000 1.000 N NA
 7552948 7552949 CLM_3184 CLM_3185 pyrR   FALSE 0.021 328.000 0.000 NA   NA
 7552949 7552950 CLM_3185 CLM_3186     FALSE 0.002 768.000 0.000 NA   NA
 7552950 7552951 CLM_3186 CLM_3187     TRUE 0.981 18.000 0.571 1.000 N NA
 7552953 7552954 CLM_3189 CLM_3190 ligT   FALSE 0.501 173.000 0.034 NA   NA
 7552954 7552955 CLM_3190 CLM_3191     FALSE 0.003 573.000 0.000 NA   NA
 7552955 7552956 CLM_3191 CLM_3193     FALSE 0.004 721.000 0.000 1.000 N NA
 7552957 7552958 CLM_3194 CLM_3195     TRUE 0.903 132.000 0.667 NA   NA
 7552959 7552960 CLM_3196 CLM_3197   nagB FALSE 0.430 229.000 0.000 1.000 Y NA
 7552960 7552961 CLM_3197 CLM_3198 nagB nagA TRUE 0.945 83.000 0.273 0.001 Y NA
 7552961 7552962 CLM_3198 CLM_3199 nagA   TRUE 0.883 161.000 0.545 1.000 N NA
 7552965 7552966 CLM_3202 CLM_3203 nagE   FALSE 0.009 479.000 0.000 1.000 N NA
 7552967 7552968 CLM_3204 CLM_3205     TRUE 0.996 2.000 0.465 1.000 Y NA
 7552968 7552969 CLM_3205 CLM_3206     TRUE 0.668 90.000 0.028 1.000 N NA
 7552971 7552972 CLM_3208 CLM_3209     FALSE 0.122 249.000 0.000 1.000 N NA
 7552972 7552973 CLM_3209 CLM_3210     TRUE 0.941 59.000 0.571 0.031 N NA
 7552973 7552974 CLM_3210 CLM_3211     FALSE 0.031 357.000 0.000 1.000 N NA
 7552974 7552975 CLM_3211 CLM_3212     FALSE 0.161 222.000 0.000 0.041   NA
 7552976 7552977 CLM_3214 CLM_3215     FALSE 0.503 37.000 0.000 NA   NA
 7552977 7552978 CLM_3215 CLM_3216     TRUE 0.999 -13.000 0.812 0.009 Y NA
 7552978 7552979 CLM_3216 CLM_3217     TRUE 0.844 168.000 0.583 NA   NA
 7552979 7552980 CLM_3217 CLM_3218     FALSE 0.003 576.000 0.000 NA   NA
 7552980 7552981 CLM_3218 CLM_3219     TRUE 0.997 9.000 0.909 0.041 Y NA
 7552982 7552983 CLM_3220 CLM_3221     FALSE 0.117 219.000 0.000 1.000   NA
 7552983 7552984 CLM_3221 CLM_3222     TRUE 0.997 5.000 0.800 0.031 Y NA
 7552984 7552985 CLM_3222 CLM_3223     TRUE 0.999 -3.000 0.800 0.024 Y NA
 7552987 7552988 CLM_3227 CLM_3228     FALSE 0.271 115.000 0.000 NA   NA
 7552988 7552989 CLM_3228 CLM_3229     FALSE 0.002 640.000 0.000 NA   NA
 7552989 7552990 CLM_3229 CLM_3230     TRUE 0.571 30.000 0.000 NA   NA
 7552992 7552993 CLM_3232 CLM_3233     FALSE 0.002 706.000 0.000 NA   NA
 7552993 7552994 CLM_3233 CLM_3234     FALSE 0.233 152.000 0.000 NA   NA
 7552994 7552995 CLM_3234 CLM_3235     TRUE 0.650 22.000 0.000 NA   NA
 7552995 7552996 CLM_3235 CLM_3236     FALSE 0.008 413.000 0.000 NA   NA
 7552996 7552997 CLM_3236 CLM_3237     FALSE 0.443 163.000 0.003 1.000   NA
 7552997 7552998 CLM_3237 CLM_3238     FALSE 0.002 735.000 0.000 NA   NA
 7552999 7553000 CLM_3239 CLM_3240     FALSE 0.006 462.000 0.000 1.000   NA
 7553000 7553001 CLM_3240 CLM_3241     TRUE 0.726 123.000 0.105 NA   NA
 7553002 7553003 CLM_3242 CLM_3243     TRUE 0.928 -10.000 0.000 NA   NA
 7553003 7553004 CLM_3243 CLM_3244     FALSE 0.218 159.000 0.000 NA   NA
 7553004 7553005 CLM_3244 CLM_3245     FALSE 0.409 47.000 0.000 NA   NA
 7553005 7553006 CLM_3245 CLM_3246     TRUE 0.949 -25.000 0.000 NA   NA
 7553006 7553007 CLM_3246 CLM_3247     FALSE 0.273 134.000 0.000 NA   NA
 7553007 7553008 CLM_3247 CLM_3248     TRUE 0.958 14.000 0.208 1.000   NA
 7553008 7553009 CLM_3248 CLM_3249     FALSE 0.003 646.000 0.000 1.000   NA
 7553009 7553010 CLM_3249 CLM_3250     TRUE 0.651 16.000 0.000 NA   NA
 7553010 7553011 CLM_3250 CLM_3251     TRUE 0.685 13.000 0.000 NA   NA
 7553011 7553012 CLM_3251 CLM_3252     FALSE 0.560 31.000 0.000 NA   NA
 7553012 7553013 CLM_3252 CLM_3253     FALSE 0.294 66.000 0.000 NA   NA
 7553013 7553014 CLM_3253 CLM_3254     FALSE 0.274 110.000 0.000 NA   NA
 7553014 7553015 CLM_3254 CLM_3255   rumA FALSE 0.038 341.000 0.000 1.000 N NA
 7553015 7553016 CLM_3255 CLM_3256 rumA   FALSE 0.038 287.000 0.000 NA   NA
 7553017 7553018 CLM_3257 CLM_3258     TRUE 0.948 26.000 0.214 1.000   NA
 7553019 7553020 CLM_3259 CLM_3260 ribH ribAB TRUE 0.968 32.000 0.054 0.002 Y NA
 7553020 7553021 CLM_3260 CLM_3261 ribAB ribE FALSE 0.347 308.000 0.051 1.000 Y NA
 7553021 7553022 CLM_3261 CLM_3262 ribE ribD TRUE 0.999 -19.000 0.456 1.000 Y NA
 7553022 7553023 CLM_3262 CLM_3264 ribD pepD FALSE 0.018 404.000 0.000 1.000 N NA
 7553025 7553026 CLM_3266 CLM_3268 mgtA   FALSE 0.002 873.000 0.000 NA   NA
 7553026 7553027 CLM_3268 CLM_3269   purD FALSE 0.022 327.000 0.000 NA   NA
 7553027 7553028 CLM_3269 CLM_3270 purD purH TRUE 0.923 149.000 0.238 1.000 Y NA
 7553028 7553029 CLM_3270 CLM_3271 purH purN TRUE 0.809 214.000 0.225 1.000 Y NA
 7553029 7553030 CLM_3271 CLM_3272 purN purM TRUE 0.948 127.000 0.238 0.001 Y NA
 7553030 7553031 CLM_3272 CLM_3273 purM purF TRUE 0.945 61.000 0.248 1.000 Y NA
 7553031 7553032 CLM_3273 CLM_3274 purF purC TRUE 0.884 92.000 0.082 1.000 Y NA
 7553032 7553033 CLM_3274 CLM_3275 purC purE TRUE 0.991 0.000 0.035 1.000 Y NA
 7553033 7553034 CLM_3275 CLM_3277 purE   FALSE 0.005 629.000 0.000 1.000 N NA
 7553034 7553035 CLM_3277 CLM_3278     FALSE 0.026 375.000 0.000 1.000 N NA
 7553035 7553036 CLM_3278 CLM_3279     TRUE 0.911 26.000 0.033 1.000 N NA
 7553036 7553037 CLM_3279 CLM_3280     TRUE 0.968 31.000 0.443 1.000 N NA
 7553037 7553038 CLM_3280 CLM_3281     TRUE 0.952 36.000 0.049 1.000 Y NA
 7553038 7553039 CLM_3281 CLM_3282   hydA FALSE 0.038 342.000 0.000 1.000 N NA
 7553039 7553040 CLM_3282 CLM_3283 hydA   TRUE 0.900 50.000 0.012 1.000 Y NA
 7553040 7553041 CLM_3283 CLM_3284   dpaL TRUE 0.954 22.000 0.133 1.000 N NA
 7553041 7553042 CLM_3284 CLM_3285 dpaL   FALSE 0.079 284.000 0.000 1.000 N NA
 7553043 7553044 CLM_3286 CLM_3287     TRUE 0.933 15.000 0.104 NA   NA
 7553044 7553045 CLM_3287 CLM_3288     TRUE 0.992 -19.000 0.109 NA   NA
 7553045 7553046 CLM_3288 CLM_3289     TRUE 0.992 -18.000 0.109 NA   NA
 7553046 7553047 CLM_3289 CLM_3290     TRUE 0.910 26.000 0.032 1.000 N NA
 7553047 7553048 CLM_3290 CLM_3291     TRUE 0.983 -3.000 0.047 1.000 N NA
 7553048 7553049 CLM_3291 CLM_3292     TRUE 0.999 -3.000 0.862 1.000 Y NA
 7553049 7553050 CLM_3292 CLM_3293     FALSE 0.178 375.000 0.031 1.000 Y NA
 7553050 7553051 CLM_3293 CLM_3294     TRUE 0.877 138.000 0.500 NA   NA
 7553051 7553052 CLM_3294 CLM_3295     TRUE 0.660 128.000 0.053 NA   NA
 7553053 7553054 CLM_3296 CLM_3297     FALSE 0.003 574.000 0.000 NA   NA
 7553054 7553055 CLM_3297 CLM_3299     FALSE 0.006 520.000 0.000 0.069   NA
 7553055 7553056 CLM_3299 CLM_3300     FALSE 0.002 950.000 0.000 1.000   NA
 7553056 7553057 CLM_3300 CLM_3301   trmU FALSE 0.004 508.000 0.000 1.000   NA
 7553057 7553058 CLM_3301 CLM_3302 trmU   FALSE 0.387 173.000 0.004 NA   NA
 7553058 7553059 CLM_3302 CLM_3303     FALSE 0.008 406.000 0.000 NA   NA
 7553059 7553060 CLM_3303 CLM_3304     TRUE 0.962 0.000 0.005 NA N NA
 7553062 7553063 CLM_3306 CLM_3307   thiC TRUE 0.828 19.000 0.003 NA   NA
 7553063 7553064 CLM_3307 CLM_3308 thiC purF FALSE 0.341 211.000 0.003 1.000 N NA
 7553064 7553065 CLM_3308 CLM_3310 purF   FALSE 0.053 263.000 0.000 NA   NA
 7553065 7553066 CLM_3310 CLM_3311     TRUE 0.606 56.000 0.008 NA   NA
 7553066 7553067 CLM_3311 CLM_3312     TRUE 0.815 2.000 0.000 NA   NA
 7553067 7553068 CLM_3312 CLM_3313     FALSE 0.273 105.000 0.000 NA   NA
 7553068 7553069 CLM_3313 CLM_3314     TRUE 0.741 7.000 0.000 NA   NA
 7553069 7553070 CLM_3314 CLM_3315     TRUE 0.725 207.000 0.375 1.000 N NA
 7553073 7553074 CLM_3318 CLM_3319     FALSE 0.290 89.000 0.000 1.000   NA
 7553074 7553075 CLM_3319 CLM_3320     TRUE 0.984 23.000 0.917 NA   NA
 7553076 7553077 CLM_3321 CLM_3322     TRUE 0.770 119.000 0.167 NA   NA
 7553077 7553078 CLM_3322 CLM_3323     FALSE 0.026 309.000 0.000 NA   NA
 7553078 7553079 CLM_3323 CLM_3324     FALSE 0.015 380.000 0.000 1.000   NA
 7553081 7553082 CLM_3326 CLM_3327     FALSE 0.081 232.000 0.000 NA   NA
 7553082 7553083 CLM_3327 CLM_3328     FALSE 0.274 110.000 0.000 NA   NA
 7553083 7553084 CLM_3328 CLM_3329     TRUE 0.839 139.000 0.342 NA   NA
 7553084 7553085 CLM_3329 CLM_3330     TRUE 0.993 -9.000 0.283 NA   NA
 7553085 7553086 CLM_3330 CLM_3331     TRUE 0.597 76.000 0.028 NA   NA
 7553086 7553087 CLM_3331 CLM_3332   rpoD TRUE 0.595 75.000 0.026 NA   NA
 7553087 7553088 CLM_3332 CLM_3333 rpoD dnaG TRUE 0.960 25.000 0.209 1.000 N NA
 7553088 7553089 CLM_3333 CLM_3334 dnaG   FALSE 0.241 283.000 0.056 1.000 N NA
 7553091 7553092 CLM_3336 CLM_3337 ppdK   TRUE 0.577 80.000 0.019 1.000   NA
 7553092 7553093 CLM_3337 CLM_3338     FALSE 0.003 517.000 0.000 NA   NA
 7553093 7553094 CLM_3338 CLM_3339     TRUE 0.786 3.000 0.000 NA   NA
 7553094 7553095 CLM_3339 CLM_3340   era FALSE 0.011 388.000 0.000 NA   NA
 7553095 7553096 CLM_3340 CLM_3341 era cdd TRUE 0.924 16.000 0.077 1.000   NA
 7553096 7553097 CLM_3341 CLM_3342 cdd   TRUE 0.690 84.000 0.040 1.000 N NA
 7553097 7553098 CLM_3342 CLM_3343     TRUE 0.765 41.000 0.023 NA   NA
 7553098 7553099 CLM_3343 CLM_3344     TRUE 0.987 -3.000 0.182 NA   NA
 7553099 7553100 CLM_3344 CLM_3345     TRUE 0.885 23.000 0.032 NA   NA
 7553100 7553101 CLM_3345 CLM_3346   yqfC TRUE 0.998 -10.000 0.851 NA   NA
 7553101 7553102 CLM_3346 CLM_3347 yqfC   TRUE 0.606 114.000 0.029 NA   NA
 7553102 7553103 CLM_3347 CLM_3348   rpsU TRUE 0.901 43.000 0.150 0.019   NA
 7553103 7553104 CLM_3348 CLM_3349 rpsU   TRUE 0.699 137.000 0.071 1.000   NA
 7553104 7553105 CLM_3349 CLM_3350     TRUE 0.817 57.000 0.051 0.024 N NA
 7553105 7553106 CLM_3350 CLM_3351     TRUE 0.982 0.000 0.163 NA   NA
 7553106 7553107 CLM_3351 CLM_3352   prmA TRUE 0.798 98.000 0.227 NA   NA
 7553107 7553108 CLM_3352 CLM_3353 prmA dnaJ TRUE 0.707 176.000 0.133 1.000 N NA
 7553108 7553109 CLM_3353 CLM_3354 dnaJ dnaK TRUE 0.935 143.000 0.196 0.002 Y NA
 7553109 7553110 CLM_3354 CLM_3355 dnaK grpE TRUE 0.959 55.000 0.224 0.004 Y NA
 7553110 7553111 CLM_3355 CLM_3356 grpE hrcA TRUE 0.964 27.000 0.286 1.000 N NA
 7553111 7553112 CLM_3356 CLM_3357 hrcA   FALSE 0.535 201.000 0.062 1.000 N NA
 7553112 7553113 CLM_3357 CLM_3358   lepA TRUE 0.931 27.000 0.083 1.000 N NA
 7553113 7553114 CLM_3358 CLM_3359 lepA   FALSE 0.490 141.000 0.004 NA   NA
 7553114 7553115 CLM_3359 CLM_3360     TRUE 0.703 71.000 0.077 NA   NA
 7553115 7553116 CLM_3360 CLM_3361   gpr TRUE 0.797 185.000 0.521 NA   NA
 7553118 7553119 CLM_3363 CLM_3364 holA   TRUE 0.925 29.000 0.163 NA   NA
 7553119 7553120 CLM_3364 CLM_3365     TRUE 0.857 12.000 0.002 NA   NA
 7553120 7553121 CLM_3365 CLM_3366     TRUE 0.692 105.000 0.077 NA   NA
 7553121 7553122 CLM_3366 CLM_3367     FALSE 0.004 508.000 0.000 NA   NA
 7553122 7553123 CLM_3367 CLM_3369     FALSE 0.002 850.000 0.000 NA   NA
 7553123 7553124 CLM_3369 CLM_3370   selB FALSE 0.003 563.000 0.000 NA   NA
 7553124 7553125 CLM_3370 CLM_3371 selB selA TRUE 0.985 19.000 0.569 0.001 N NA
 7553125 7553126 CLM_3371 CLM_3372 selA selD TRUE 0.892 67.000 0.055 1.000 Y NA
 7553126 7553127 CLM_3372 CLM_3373 selD   FALSE 0.182 220.000 0.000 1.000 N NA
 7553129 7553130 CLM_3375 CLM_3376     FALSE 0.283 326.000 0.047 NA Y NA
 7553130 7553131 CLM_3376 CLM_3377     TRUE 0.964 16.000 0.231 NA N NA
 7553131 7553132 CLM_3377 CLM_3378     TRUE 0.935 11.000 0.033 NA N NA
 7553132 7553133 CLM_3378 CLM_3379   nadD TRUE 0.916 83.000 0.199 1.000 Y NA
 7553133 7553134 CLM_3379 CLM_3380 nadD   FALSE 0.442 243.000 0.150 NA N NA
 7553134 7553135 CLM_3380 CLM_3381   obg TRUE 0.881 27.000 0.046 NA   NA
 7553135 7553136 CLM_3381 CLM_3382 obg rpmA FALSE 0.159 379.000 0.335 1.000   NA
 7553136 7553137 CLM_3382 CLM_3383 rpmA   TRUE 0.991 3.000 0.203 NA Y NA
 7553137 7553138 CLM_3383 CLM_3384   rplU TRUE 0.991 3.000 0.208 NA Y NA
 7553138 7553139 CLM_3384 CLM_3386 rplU   TRUE 0.875 124.000 0.018 0.015 Y NA
 7553139 7553140 CLM_3386 CLM_3387     TRUE 0.897 39.000 0.180 NA   NA
 7553140 7553141 CLM_3387 CLM_3388     TRUE 0.997 -22.000 0.420 NA   NA
 7553141 7553142 CLM_3388 CLM_3389     TRUE 0.735 113.000 0.098 1.000   NA
 7553142 7553143 CLM_3389 CLM_3390     TRUE 0.856 55.000 0.135 0.005   NA
 7553143 7553144 CLM_3390 CLM_3391   rodA FALSE 0.048 320.000 0.000 1.000 N NA
 7553144 7553145 CLM_3391 CLM_3392 rodA minE TRUE 0.820 99.000 0.008 NA Y NA
 7553145 7553146 CLM_3392 CLM_3393 minE minD TRUE 0.989 14.000 0.347 NA Y NA
 7553146 7553147 CLM_3393 CLM_3394 minD minC TRUE 0.988 18.000 0.368 1.000 Y NA
 7553147 7553148 CLM_3394 CLM_3395 minC   TRUE 0.566 175.000 0.060 1.000   NA
 7553148 7553149 CLM_3395 CLM_3396   mreD TRUE 0.928 20.000 0.089 1.000   NA
 7553149 7553150 CLM_3396 CLM_3397 mreD mreC TRUE 0.986 11.000 0.550 0.002   NA
 7553150 7553151 CLM_3397 CLM_3398 mreC   TRUE 0.990 7.000 0.689 1.000 N NA
 7553151 7553152 CLM_3398 CLM_3399     TRUE 0.903 29.000 0.040 1.000 N NA
 7553152 7553153 CLM_3399 CLM_3400   maf TRUE 0.939 15.000 0.074 NA N NA
 7553153 7553154 CLM_3400 CLM_3401 maf   TRUE 0.880 16.000 0.026 NA   NA
 7553154 7553155 CLM_3401 CLM_3402     TRUE 0.847 110.000 0.357 NA   NA
 7553155 7553156 CLM_3402 CLM_3403     TRUE 0.593 226.000 0.364 NA   NA
 7553158 7553159 CLM_3405 CLM_3406 pheB   TRUE 0.641 57.000 0.020 NA   NA
 7553159 7553160 CLM_3406 CLM_3407     TRUE 0.928 -10.000 0.000 NA   NA
 7553160 7553161 CLM_3407 CLM_3408     FALSE 0.163 183.000 0.000 NA   NA
 7553161 7553162 CLM_3408 CLM_3409     FALSE 0.258 95.000 0.000 NA   NA
 7553162 7553163 CLM_3409 CLM_3410   coaE TRUE 0.906 18.000 0.058 NA   NA
 7553163 7553164 CLM_3410 CLM_3411 coaE polA TRUE 0.950 12.000 0.068 1.000 N NA
 7553164 7553165 CLM_3411 CLM_3412 polA aroC TRUE 0.883 18.000 0.003 1.000 N NA
 7553165 7553166 CLM_3412 CLM_3413 aroC   FALSE 0.036 399.000 0.002 1.000 N NA
 7553166 7553167 CLM_3413 CLM_3414     FALSE 0.248 147.000 0.000 NA   NA
 7553167 7553168 CLM_3414 CLM_3415     TRUE 0.646 19.000 0.000 NA   NA
 7553168 7553169 CLM_3415 CLM_3416     TRUE 0.832 152.000 0.400 NA   NA
 7553169 7553170 CLM_3416 CLM_3417     FALSE 0.371 52.000 0.000 NA   NA
 7553170 7553171 CLM_3417 CLM_3418     TRUE 0.673 14.000 0.000 NA   NA
 7553171 7553172 CLM_3418 CLM_3419     TRUE 0.815 2.000 0.000 NA   NA
 7553172 7553173 CLM_3419 CLM_3420     FALSE 0.047 270.000 0.000 NA   NA
 7553173 7553174 CLM_3420 CLM_3421     FALSE 0.354 54.000 0.000 NA   NA
 7553174 7553175 CLM_3421 CLM_3422     TRUE 0.673 14.000 0.000 NA   NA
 7553175 7553176 CLM_3422 CLM_3423     TRUE 0.786 3.000 0.000 NA   NA
 7553176 7553177 CLM_3423 CLM_3424     FALSE 0.251 91.000 0.000 NA   NA
 7553177 7553178 CLM_3424 CLM_3425     TRUE 0.979 12.000 0.500 NA   NA
 7553178 7553179 CLM_3425 CLM_3426     TRUE 0.700 12.000 0.000 NA   NA
 7553179 7553180 CLM_3426 CLM_3427     TRUE 0.749 6.000 0.000 NA   NA
 7553180 7553181 CLM_3427 CLM_3428     TRUE 0.978 15.000 0.600 NA   NA
 7553181 7553182 CLM_3428 CLM_3429     TRUE 0.976 23.000 0.600 NA   NA
 7553182 7553183 CLM_3429 CLM_3430     TRUE 0.989 2.000 0.500 NA   NA
 7553183 7553184 CLM_3430 CLM_3431     TRUE 0.975 15.000 0.500 NA   NA
 7553184 7553185 CLM_3431 CLM_3432     TRUE 0.980 13.000 0.600 NA   NA
 7553185 7553186 CLM_3432 CLM_3433     TRUE 0.996 -13.000 0.400 NA   NA
 7553186 7553187 CLM_3433 CLM_3434     TRUE 0.685 13.000 0.000 NA   NA
 7553187 7553188 CLM_3434 CLM_3435     FALSE 0.160 185.000 0.000 NA   NA
 7553188 7553189 CLM_3435 CLM_3436     TRUE 0.955 35.000 0.500 NA   NA
 7553189 7553190 CLM_3436 CLM_3437     TRUE 0.982 15.000 0.750 NA   NA
 7553190 7553191 CLM_3437 CLM_3438     TRUE 0.989 5.000 0.750 NA   NA
 7553191 7553192 CLM_3438 CLM_3439     TRUE 0.988 6.000 0.750 NA   NA
 7553192 7553193 CLM_3439 CLM_3440     TRUE 0.989 5.000 0.750 NA   NA
 7553193 7553194 CLM_3440 CLM_3441     TRUE 0.992 0.000 0.500 NA   NA
 7553194 7553195 CLM_3441 CLM_3442     FALSE 0.002 667.000 0.000 NA   NA
 7553195 7553196 CLM_3442 CLM_3443     TRUE 0.859 113.000 0.400 NA   NA
 7553196 7553197 CLM_3443 CLM_3444     TRUE 0.945 57.000 1.000 NA   NA
 7553197 7553198 CLM_3444 CLM_3445     TRUE 0.998 -10.000 1.000 NA   NA
 7553198 7553199 CLM_3445 CLM_3446     TRUE 0.895 94.000 0.667 NA   NA
 7553199 7553200 CLM_3446 CLM_3447     TRUE 0.933 62.000 0.667 0.020   NA
 7553201 7553202 CLM_3448 CLM_3449     FALSE 0.030 302.000 0.000 NA   NA
 7553204 7553205 CLM_3451 CLM_3452     TRUE 0.956 13.000 0.200 NA   NA
 7553206 7553207 CLM_3453 CLM_3454     TRUE 0.902 164.000 1.000 NA   NA
 7553207 7553208 CLM_3454 CLM_3455     FALSE 0.069 240.000 0.000 NA   NA
 7553208 7553209 CLM_3455 CLM_3456     TRUE 0.889 57.000 0.400 NA   NA
 7553209 7553210 CLM_3456 CLM_3457     TRUE 0.831 141.000 0.333 NA   NA
 7553212 7553213 CLM_3459 CLM_3460 aspS hisS TRUE 0.947 40.000 0.028 0.027 Y NA
 7553213 7553214 CLM_3460 CLM_3461 hisS   TRUE 0.949 19.000 0.111 1.000 N NA
 7553214 7553215 CLM_3461 CLM_3462     TRUE 0.825 38.000 0.035 1.000   NA
 7553215 7553216 CLM_3462 CLM_3463   dtd TRUE 0.709 61.000 0.048 1.000   NA
 7553216 7553217 CLM_3463 CLM_3464 dtd relA TRUE 0.911 43.000 0.177 1.000 N NA
 7553217 7553218 CLM_3464 CLM_3465 relA apt TRUE 0.754 125.000 0.068 1.000 N NA
 7553218 7553219 CLM_3465 CLM_3466 apt   TRUE 0.565 109.000 0.010 1.000   NA
 7553219 7553220 CLM_3466 CLM_3467   secF FALSE 0.295 229.000 0.028 1.000   NA
 7553220 7553221 CLM_3467 CLM_3468 secF secD TRUE 0.997 2.000 0.516 0.001 Y NA
 7553221 7553222 CLM_3468 CLM_3469 secD   TRUE 0.648 94.000 0.048 1.000   NA
 7553222 7553223 CLM_3469 CLM_3470     TRUE 0.857 157.000 0.540 NA   NA
 7553223 7553224 CLM_3470 CLM_3471     TRUE 0.775 90.000 0.212 NA   NA
 7553224 7553225 CLM_3471 CLM_3472   yajC TRUE 0.734 55.000 0.055 NA   NA
 7553225 7553226 CLM_3472 CLM_3473 yajC tgt FALSE 0.548 180.000 0.035 NA N NA
 7553226 7553227 CLM_3473 CLM_3474 tgt queA TRUE 0.906 56.000 0.014 0.001 Y NA
 7553227 7553228 CLM_3474 CLM_3475 queA ruvB TRUE 0.901 34.000 0.069 1.000 N NA
 7553228 7553229 CLM_3475 CLM_3476 ruvB ruvA TRUE 0.993 20.000 0.549 0.002 Y NA
 7553229 7553230 CLM_3476 CLM_3477 ruvA   FALSE 0.367 182.000 0.007 NA   NA
 7553230 7553231 CLM_3477 CLM_3478     FALSE 0.033 378.000 0.003 NA   NA
 7553231 7553232 CLM_3478 CLM_3479     FALSE 0.510 151.000 0.015 NA   NA
 7553232 7553233 CLM_3479 CLM_3480     TRUE 0.696 16.000 0.000 1.000   NA
 7553233 7553234 CLM_3480 CLM_3481     FALSE 0.289 88.000 0.000 1.000   NA
 7553234 7553235 CLM_3481 CLM_3482     FALSE 0.287 285.000 0.176 1.000   NA
 7553235 7553236 CLM_3482 CLM_3483     TRUE 0.647 150.000 0.071 NA   NA
 7553236 7553237 CLM_3483 CLM_3484     FALSE 0.537 173.000 0.051 NA   NA
 7553237 7553238 CLM_3484 CLM_3485     FALSE 0.525 129.000 0.002 1.000   NA
 7553242 7553243 CLM_3489 CLM_3490 spoVAE spoVAD TRUE 0.967 16.000 0.386 NA   NA
 7553243 7553244 CLM_3490 CLM_3491 spoVAD spoVAC TRUE 0.966 23.000 0.386 NA   NA
 7553244 7553245 CLM_3491 CLM_3492 spoVAC sigF FALSE 0.463 202.000 0.078 NA   NA
 7553245 7553246 CLM_3492 CLM_3493 sigF spoIIAB TRUE 0.987 19.000 0.842 1.000 N NA
 7553246 7553247 CLM_3493 CLM_3494 spoIIAB spoIIAA TRUE 0.994 17.000 0.669 0.001 Y NA
 7553251 7553252 CLM_3498 CLM_3499     FALSE 0.238 329.000 0.024 NA Y NA
 7553252 7553253 CLM_3499 CLM_3500     TRUE 0.938 11.000 0.079 NA   NA
 7553253 7553254 CLM_3500 CLM_3501   mviN FALSE 0.066 398.000 0.053 0.003   NA
 7553254 7553255 CLM_3501 CLM_3502 mviN   TRUE 0.922 19.000 0.075 1.000   NA
 7553255 7553256 CLM_3502 CLM_3503     TRUE 0.791 109.000 0.000 0.013 Y NA
 7553256 7553257 CLM_3503 CLM_3504     TRUE 0.734 115.000 0.000 NA Y NA
 7553257 7553258 CLM_3504 CLM_3505     TRUE 0.830 78.000 0.016 NA Y NA
 7553258 7553259 CLM_3505 CLM_3506     TRUE 0.981 19.000 0.146 1.000 Y NA
 7553259 7553260 CLM_3506 CLM_3507     TRUE 0.993 0.000 0.077 1.000 Y NA
 7553260 7553261 CLM_3507 CLM_3508     TRUE 0.958 23.000 0.176 0.013   NA
 7553261 7553262 CLM_3508 CLM_3509     TRUE 0.995 -10.000 0.375 NA   NA
 7553262 7553263 CLM_3509 CLM_3510     TRUE 0.663 15.000 0.000 NA   NA
 7553263 7553264 CLM_3510 CLM_3511     FALSE 0.555 37.000 0.000 1.000   NA
 7553264 7553265 CLM_3511 CLM_3512     TRUE 0.610 31.000 0.000 1.000   NA
 7553265 7553266 CLM_3512 CLM_3513     FALSE 0.309 100.000 0.000 1.000   NA
 7553266 7553267 CLM_3513 CLM_3514     TRUE 0.831 64.000 0.154 0.030   NA
 7553267 7553268 CLM_3514 CLM_3515     TRUE 0.869 130.000 0.035 1.000 Y NA
 7553268 7553269 CLM_3515 CLM_3516     TRUE 0.784 180.000 0.037 1.000 Y NA
 7553269 7553270 CLM_3516 CLM_3517     TRUE 0.632 195.000 0.000 0.004 Y NA
 7553270 7553271 CLM_3517 CLM_3518     FALSE 0.407 178.000 0.000 0.004 N NA
 7553271 7553272 CLM_3518 CLM_3519   galU FALSE 0.432 99.000 0.000 1.000 N NA
 7553272 7553273 CLM_3519 CLM_3520 galU   TRUE 0.930 50.000 0.500 1.000   NA
 7553273 7553274 CLM_3520 CLM_3521     TRUE 0.861 145.000 0.417 1.000   NA
 7553274 7553275 CLM_3521 CLM_3522     FALSE 0.010 641.000 0.002 1.000 N NA
 7553277 7553278 CLM_3524 CLM_3525     FALSE 0.136 198.000 0.000 NA   NA
 7553278 7553279 CLM_3525 CLM_3526     FALSE 0.037 463.000 0.000 1.000 Y NA
 7553279 7553280 CLM_3526 CLM_3527     FALSE 0.073 236.000 0.000 NA   NA
 7553280 7553281 CLM_3527 CLM_3528     FALSE 0.427 188.000 0.031 NA   NA
 7553281 7553282 CLM_3528 CLM_3529     TRUE 0.764 133.000 0.078 1.000 N NA
 7553282 7553283 CLM_3529 CLM_3530     FALSE 0.003 577.000 0.000 NA   NA
 7553285 7553286 CLM_3532 CLM_3533     FALSE 0.170 180.000 0.000 NA   NA
 7553288 7553289 CLM_3536 CLM_3537   pheT FALSE 0.379 205.000 0.038 NA   NA
 7553289 7553290 CLM_3537 CLM_3538 pheT pheS TRUE 0.959 161.000 0.574 0.001 Y NA
 7553290 7553291 CLM_3538 CLM_3539 pheS   FALSE 0.183 348.000 0.006 1.000 Y NA
 7553291 7553292 CLM_3539 CLM_3540     TRUE 0.654 91.000 0.022 1.000 N NA
 7553292 7553293 CLM_3540 CLM_3541     TRUE 0.989 11.000 0.137 0.003 Y NA
 7553293 7553294 CLM_3541 CLM_3542   rplT TRUE 0.621 124.000 0.004 1.000 N NA
 7553294 7553295 CLM_3542 CLM_3543 rplT rpmI TRUE 0.994 30.000 0.928 0.011 Y NA
 7553295 7553296 CLM_3543 CLM_3544 rpmI infC TRUE 0.992 22.000 0.652 1.000 Y NA
 7553296 7553297 CLM_3544 CLM_3546 infC thrS FALSE 0.452 255.000 0.007 1.000 Y NA
 7553297 7553298 CLM_3546 CLM_3547 thrS   FALSE 0.017 348.000 0.000 NA   NA
 7553300 7553301 CLM_3549 CLM_3550     TRUE 0.993 2.000 0.952 NA   NA
 7553301 7553302 CLM_3550 CLM_3551     FALSE 0.025 317.000 0.000 NA   NA
 7553302 7553303 CLM_3551 CLM_3552     TRUE 0.722 10.000 0.000 NA   NA
 7553303 7553304 CLM_3552 CLM_3553     TRUE 0.769 4.000 0.000 NA   NA
 7553304 7553305 CLM_3553 CLM_3554     TRUE 0.815 2.000 0.000 NA   NA
 7553305 7553306 CLM_3554 CLM_3555     TRUE 0.759 5.000 0.000 NA   NA
 7553306 7553307 CLM_3555 CLM_3556   hsp33 FALSE 0.297 65.000 0.000 NA   NA
 7553307 7553308 CLM_3556 CLM_3557 hsp33   TRUE 0.885 38.000 0.063 1.000 N NA
 7553308 7553309 CLM_3557 CLM_3558     TRUE 0.655 86.000 0.056 1.000   NA
 7553309 7553310 CLM_3558 CLM_3559     FALSE 0.031 310.000 0.000 1.000   NA
 7553310 7553311 CLM_3559 CLM_3560     TRUE 0.998 0.000 0.444 0.001 Y NA
 7553311 7553312 CLM_3560 CLM_3561     TRUE 0.992 15.000 0.571 1.000 Y NA
 7553312 7553313 CLM_3561 CLM_3562     TRUE 0.984 16.000 0.124 0.021 Y NA
 7553313 7553314 CLM_3562 CLM_3563     TRUE 0.906 81.000 0.093 0.021 Y NA
 7553315 7553316 CLM_3564 CLM_3565 asd dapA TRUE 0.968 23.000 0.029 1.000 Y NA
 7553316 7553317 CLM_3565 CLM_3566 dapA dapB TRUE 0.614 223.000 0.022 1.000 Y NA
 7553320 7553321 CLM_3569 CLM_3570     TRUE 0.670 78.000 0.071 NA   NA
 7553321 7553322 CLM_3570 CLM_3571     FALSE 0.397 199.000 0.034 NA   NA
 7553326 7553327 CLM_3575 CLM_3576 folC valS FALSE 0.030 446.000 0.006 0.089 N NA
 7553327 7553328 CLM_3576 CLM_3577 valS   TRUE 0.958 21.000 0.002 1.000 Y NA
 7553328 7553329 CLM_3577 CLM_3578     FALSE 0.011 454.000 0.000 1.000 N NA
 7553329 7553330 CLM_3578 CLM_3579     TRUE 0.993 3.000 1.000 1.000   NA
 7553333 7553334 CLM_3582 CLM_3583     TRUE 0.999 -3.000 0.876 1.000 Y NA
 7553334 7553335 CLM_3583 CLM_3584     TRUE 0.618 144.000 0.034 1.000   NA
 7553336 7553337 CLM_3585 CLM_3586   recX TRUE 0.846 25.000 0.012 NA   NA
 7553337 7553338 CLM_3586 CLM_3587 recX   TRUE 0.873 22.000 0.015 1.000   NA
 7553339 7553340 CLM_3589 CLM_3590     TRUE 0.800 38.000 0.029 NA   NA
 7553340 7553341 CLM_3590 CLM_3591     TRUE 0.685 58.000 0.029 1.000   NA
 7553342 7553343 CLM_3592 CLM_3593     TRUE 0.724 42.000 0.011 NA   NA
 7553343 7553344 CLM_3593 CLM_3594   proC FALSE 0.545 129.000 0.011 NA   NA
 7553344 7553345 CLM_3594 CLM_3595 proC   FALSE 0.441 112.000 0.000 1.000 N NA
 7553345 7553346 CLM_3595 CLM_3596     TRUE 0.989 3.000 0.333 0.002 N NA
 7553346 7553347 CLM_3596 CLM_3597     TRUE 0.851 52.000 0.167 1.000   NA
 7553347 7553348 CLM_3597 CLM_3598     FALSE 0.003 636.000 0.000 1.000   NA
 7553348 7553349 CLM_3598 CLM_3599     TRUE 0.723 37.000 0.002 NA   NA
 7553349 7553350 CLM_3599 CLM_3600     TRUE 0.957 12.000 0.182 NA   NA
 7553350 7553351 CLM_3600 CLM_3601     TRUE 0.945 23.000 0.182 NA   NA
 7553352 7553353 CLM_3602 CLM_3603     FALSE 0.286 69.000 0.000 NA   NA
 7553355 7553356 CLM_3605 CLM_3606     TRUE 0.988 3.000 0.583 NA   NA
 7553356 7553357 CLM_3606 CLM_3607     TRUE 0.997 -19.000 0.600 NA   NA
 7553358 7553359 CLM_3608 CLM_3609     FALSE 0.031 358.000 0.000 1.000 N NA
 7553359 7553360 CLM_3609 CLM_3610     TRUE 0.995 13.000 0.714 0.008 Y NA
 7553360 7553361 CLM_3610 CLM_3611   bcd TRUE 0.982 12.000 0.364 0.030 N NA
 7553361 7553362 CLM_3611 CLM_3612 bcd   TRUE 0.910 194.000 0.500 1.000 Y NA
 7553362 7553363 CLM_3612 CLM_3613   hbd TRUE 0.971 25.000 0.054 1.000 Y NA
 7553363 7553364 CLM_3613 CLM_3614 hbd crt TRUE 0.991 20.000 0.486 1.000 Y NA
 7553364 7553365 CLM_3614 CLM_3615 crt   FALSE 0.007 416.000 0.000 NA   NA
 7553365 7553366 CLM_3615 CLM_3616     TRUE 0.870 44.000 0.154 NA   NA
 7553366 7553367 CLM_3616 CLM_3617     FALSE 0.053 276.000 0.000 1.000   NA
 7553367 7553368 CLM_3617 CLM_3618     FALSE 0.011 402.000 0.000 1.000   NA
 7553368 7553369 CLM_3618 CLM_3619     TRUE 0.753 68.000 0.100 1.000   NA
 7553369 7553370 CLM_3619 CLM_3620   lgt FALSE 0.013 388.000 0.000 1.000   NA
 7553370 7553371 CLM_3620 CLM_3621 lgt   FALSE 0.134 209.000 0.000 1.000   NA
 7553371 7553372 CLM_3621 CLM_3622     TRUE 0.722 43.000 0.012 NA   NA
 7553374 7553375 CLM_3624 CLM_3625     TRUE 0.587 195.000 0.080 1.000 N NA
 7553375 7553376 CLM_3625 CLM_3626   pflA FALSE 0.005 642.000 0.000 1.000 N NA
 7553376 7553377 CLM_3626 CLM_3627 pflA pfl TRUE 0.714 180.000 0.163 1.000 N NA
 7553377 7553378 CLM_3627 CLM_3628 pfl   FALSE 0.004 513.000 0.000 NA   NA
 7553378 7553379 CLM_3628 CLM_3629     FALSE 0.013 377.000 0.000 NA   NA
 7553379 7553380 CLM_3629 CLM_3630     FALSE 0.396 167.000 0.002 NA   NA
 7553384 7553385 CLM_3634 CLM_3635     FALSE 0.103 215.000 0.000 NA   NA
 7553385 7553386 CLM_3635 CLM_3636     FALSE 0.345 55.000 0.000 NA   NA
 7553386 7553387 CLM_3636 CLM_3637     FALSE 0.371 52.000 0.000 NA   NA
 7553387 7553388 CLM_3637 CLM_3638     FALSE 0.097 219.000 0.000 NA   NA
 7553388 7553389 CLM_3638 CLM_3639   ysxC TRUE 0.833 24.000 0.005 NA   NA
 7553389 7553390 CLM_3639 CLM_3640 ysxC lon TRUE 0.914 15.000 0.048 1.000   NA
 7553390 7553391 CLM_3640 CLM_3641 lon lonB TRUE 0.911 138.000 0.072 0.001 Y NA
 7553391 7553392 CLM_3641 CLM_3642 lonB clpX TRUE 0.901 128.000 0.042 0.001 Y NA
 7553392 7553393 CLM_3642 CLM_3643 clpX clpP_1 TRUE 0.966 20.000 0.022 1.000 Y NA
 7553393 7553394 CLM_3643 CLM_3644 clpP_1 tig TRUE 0.857 126.000 0.024 1.000 Y NA
 7553394 7553395 CLM_3644 CLM_3645 tig   FALSE 0.463 178.000 0.005 NA N NA
 7553395 7553396 CLM_3645 CLM_3646     TRUE 0.795 107.000 0.211 NA   NA
 7553396 7553397 CLM_3646 CLM_3647   pyrE FALSE 0.105 214.000 0.000 NA   NA
 7553397 7553398 CLM_3647 CLM_3648 pyrE pyrD TRUE 0.958 34.000 0.060 1.000 Y NA
 7553398 7553399 CLM_3648 CLM_3649 pyrD pyrK TRUE 0.995 0.000 0.592 1.000 N NA
 7553399 7553400 CLM_3649 CLM_3650 pyrK pyrF TRUE 0.819 145.000 0.112 0.002 N NA
 7553400 7553401 CLM_3650 CLM_3651 pyrF pyrC TRUE 0.974 24.000 0.064 1.000 Y NA
 7553401 7553402 CLM_3651 CLM_3652 pyrC pyrI TRUE 0.969 22.000 0.032 1.000 Y NA
 7553402 7553403 CLM_3652 CLM_3653 pyrI pyrB TRUE 0.995 2.000 0.197 0.001 Y NA
 7553403 7553404 CLM_3653 CLM_3655 pyrB hgdC_2 FALSE 0.101 255.000 0.000 NA N NA
 7553404 7553405 CLM_3655 CLM_3656 hgdC_2   TRUE 0.892 23.000 0.039 NA   NA
 7553405 7553406 CLM_3656 CLM_3657     FALSE 0.014 360.000 0.000 NA   NA
 7553406 7553407 CLM_3657 CLM_3658     TRUE 0.866 129.000 0.041 NA Y NA
 7553407 7553408 CLM_3658 CLM_3659     TRUE 0.658 112.000 0.053 NA   NA
 7553408 7553409 CLM_3659 CLM_3660     TRUE 0.640 167.000 0.105 NA   NA
 7553409 7553410 CLM_3660 CLM_3661     TRUE 0.981 0.000 0.135 NA   NA
 7553410 7553411 CLM_3661 CLM_3662     TRUE 0.899 40.000 0.200 NA   NA
 7553411 7553412 CLM_3662 CLM_3663     TRUE 0.996 -51.000 0.240 NA   NA
 7553412 7553413 CLM_3663 CLM_3664     TRUE 0.920 52.000 0.500 NA   NA
 7553413 7553414 CLM_3664 CLM_3665     TRUE 0.730 9.000 0.000 NA   NA
 7553414 7553415 CLM_3665 CLM_3666     TRUE 0.741 7.000 0.000 NA   NA
 7553415 7553416 CLM_3666 CLM_3667     TRUE 0.919 28.000 0.105 1.000   NA
 7553416 7553417 CLM_3667 CLM_3668     TRUE 0.957 18.000 0.263 NA   NA
 7553417 7553418 CLM_3668 CLM_3669     TRUE 0.908 16.000 0.056 NA   NA
 7553418 7553419 CLM_3669 CLM_3670     TRUE 0.974 0.000 0.078 NA   NA
 7553419 7553420 CLM_3670 CLM_3671     FALSE 0.008 404.000 0.000 NA   NA
 7553420 7553421 CLM_3671 CLM_3672     TRUE 0.619 26.000 0.000 NA   NA
 7553421 7553422 CLM_3672 CLM_3673     TRUE 0.583 29.000 0.000 NA   NA
 7553422 7553423 CLM_3673 CLM_3674     TRUE 0.619 26.000 0.000 NA   NA
 7553423 7553424 CLM_3674 CLM_3675     TRUE 0.759 5.000 0.000 NA   NA
 7553424 7553425 CLM_3675 CLM_3676     TRUE 0.749 6.000 0.000 NA   NA
 7553425 7553426 CLM_3676 CLM_3677     TRUE 0.730 9.000 0.000 NA   NA
 7553426 7553427 CLM_3677 CLM_3678     FALSE 0.294 66.000 0.000 NA   NA
 7553427 7553428 CLM_3678 CLM_3679     TRUE 0.673 14.000 0.000 NA   NA
 7553428 7553429 CLM_3679 CLM_3680     TRUE 0.815 2.000 0.000 NA   NA
 7553429 7553430 CLM_3680 CLM_3681     TRUE 0.786 3.000 0.000 NA   NA
 7553430 7553431 CLM_3681 CLM_3682     TRUE 0.663 15.000 0.000 NA   NA
 7553431 7553432 CLM_3682 CLM_3683     TRUE 0.759 5.000 0.000 NA   NA
 7553432 7553433 CLM_3683 CLM_3684     TRUE 0.749 6.000 0.000 NA   NA
 7553433 7553434 CLM_3684 CLM_3685     TRUE 0.730 9.000 0.000 NA   NA
 7553434 7553435 CLM_3685 CLM_3687     FALSE 0.294 66.000 0.000 NA   NA
 7553435 7553436 CLM_3687 CLM_3688     TRUE 0.673 14.000 0.000 NA   NA
 7553436 7553437 CLM_3688 CLM_3689     TRUE 0.815 2.000 0.000 NA   NA
 7553437 7553438 CLM_3689 CLM_3690     TRUE 0.786 3.000 0.000 NA   NA
 7553438 7553439 CLM_3690 CLM_3691     TRUE 0.749 6.000 0.000 NA   NA
 7553439 7553440 CLM_3691 CLM_3692     TRUE 0.749 6.000 0.000 NA   NA
 7553440 7553441 CLM_3692 CLM_3693     TRUE 0.741 7.000 0.000 NA   NA
 7553441 7553442 CLM_3693 CLM_3694     FALSE 0.252 145.000 0.000 NA   NA
 7553442 7553443 CLM_3694 CLM_3695     TRUE 0.925 17.000 0.085 1.000   NA
 7553444 7553445 CLM_3696 CLM_3697     TRUE 0.832 113.000 0.300 NA   NA
 7553446 7553447 CLM_3698 CLM_3699   gatB FALSE 0.550 154.000 0.002 1.000 N NA
 7553447 7553448 CLM_3699 CLM_3700 gatB gatA TRUE 0.987 36.000 0.492 0.001 Y NA
 7553448 7553449 CLM_3700 CLM_3701 gatA gatC TRUE 0.989 37.000 0.643 0.001 Y NA
 7553449 7553450 CLM_3701 CLM_3702 gatC   TRUE 0.609 135.000 0.002 1.000 N NA
 7553450 7553451 CLM_3702 CLM_3703     FALSE 0.011 385.000 0.000 NA   NA
 7553451 7553452 CLM_3703 CLM_3704   ligA TRUE 0.777 101.000 0.182 NA   NA
 7553452 7553453 CLM_3704 CLM_3705 ligA pcrA TRUE 0.981 12.000 0.039 0.011 Y NA
 7553453 7553454 CLM_3705 CLM_3706 pcrA   TRUE 0.617 127.000 0.025 1.000   NA
 7553454 7553455 CLM_3706 CLM_3707     FALSE 0.040 298.000 0.000 1.000   NA
 7553455 7553456 CLM_3707 CLM_3708     TRUE 0.605 84.000 0.041 NA   NA
 7553456 7553457 CLM_3708 CLM_3709     TRUE 0.928 14.000 0.083 NA   NA
 7553459 7553460 CLM_3711 CLM_3712   pgi TRUE 0.899 11.000 0.018 NA   NA
 7553460 7553461 CLM_3712 CLM_3713 pgi   FALSE 0.248 84.000 0.000 NA   NA
 7553461 7553462 CLM_3713 CLM_3714     FALSE 0.020 331.000 0.000 NA   NA
 7553463 7553464 CLM_3715 CLM_3716   ldhA FALSE 0.009 544.000 0.000 0.039 N NA
 7553465 7553466 CLM_3717 CLM_3718 ldhA   FALSE 0.002 814.000 0.000 NA   NA
 7553466 7553467 CLM_3718 CLM_3719     FALSE 0.101 216.000 0.000 NA   NA
 7553467 7553468 CLM_3719 CLM_3720     TRUE 0.991 18.000 0.400 0.008 Y NA
 7553468 7553469 CLM_3720 CLM_3721     TRUE 0.990 13.000 0.800 0.030 N NA
 7553469 7553470 CLM_3721 CLM_3722   fldC TRUE 0.837 167.000 0.400 NA N NA
 7553470 7553471 CLM_3722 CLM_3723 fldC fldB TRUE 0.996 2.000 0.500 NA Y NA
 7553471 7553472 CLM_3723 CLM_3724 fldB fldI TRUE 0.992 5.000 0.875 NA N NA
 7553472 7553473 CLM_3724 CLM_3725 fldI fldA TRUE 0.993 0.000 0.429 NA N NA
 7553473 7553474 CLM_3725 CLM_3726 fldA   TRUE 0.943 54.000 0.500 0.039 N NA
 7553474 7553475 CLM_3726 CLM_3727     FALSE 0.010 466.000 0.000 1.000 N NA
 7553475 7553476 CLM_3727 CLM_3728   guaA FALSE 0.010 458.000 0.000 1.000 N NA
 7553476 7553477 CLM_3728 CLM_3729 guaA guaB TRUE 0.989 13.000 0.190 0.000 Y NA
 7553479 7553480 CLM_3732 CLM_3733 groL groES TRUE 0.992 30.000 0.674 0.088 Y NA
 7553482 7553483 CLM_3734 CLM_3736     FALSE 0.005 453.000 0.000 NA   NA
 7553483 7553484 CLM_3736 CLM_3737     FALSE 0.492 173.000 0.024 1.000   NA
 7553484 7553485 CLM_3737 CLM_3738   gltA TRUE 0.630 150.000 0.018 1.000 N NA
 7553485 7553486 CLM_3738 CLM_3739 gltA   TRUE 0.996 0.000 0.667 0.029 N NA
 7553486 7553487 CLM_3739 CLM_3740     FALSE 0.102 230.000 0.000 1.000   NA
 7553489 7553490 CLM_3742 CLM_3743     TRUE 0.997 1.000 0.444 0.014 Y NA
 7553492 7553493 CLM_3745 CLM_3746   pyc FALSE 0.004 512.000 0.000 1.000   NA
 7553493 7553494 CLM_3746 CLM_3747 pyc   FALSE 0.010 460.000 0.000 1.000 N NA
 7553495 7553496 CLM_3748 CLM_3749     FALSE 0.073 236.000 0.000 NA   NA
 7553497 7553498 CLM_3750 CLM_3751     FALSE 0.069 240.000 0.000 NA   NA
 7553498 7553499 CLM_3751 CLM_3752     FALSE 0.379 51.000 0.000 NA   NA
 7553499 7553500 CLM_3752 CLM_3753     TRUE 0.680 63.000 0.047 NA   NA
 7553500 7553501 CLM_3753 CLM_3754     TRUE 0.896 16.000 0.041 NA   NA
 7553502 7553503 CLM_3755 CLM_3756     FALSE 0.518 138.000 0.007 NA   NA
 7553503 7553504 CLM_3756 CLM_3757     TRUE 0.988 -3.000 0.217 NA   NA
 7553504 7553505 CLM_3757 CLM_3758   rimI TRUE 0.989 -7.000 0.127 1.000   NA
 7553506 7553507 CLM_3759 CLM_3760 tyrS   FALSE 0.079 233.000 0.000 NA   NA
 7553507 7553508 CLM_3760 CLM_3761     TRUE 0.672 136.000 0.062 NA   NA
 7553508 7553509 CLM_3761 CLM_3762     FALSE 0.558 148.000 0.025 NA   NA
 7553509 7553510 CLM_3762 CLM_3763     FALSE 0.254 81.000 0.000 NA   NA
 7553514 7553515 CLM_3767 CLM_3768 trpS   FALSE 0.176 178.000 0.000 NA   NA
 7553515 7553516 CLM_3768 CLM_3769     FALSE 0.033 297.000 0.000 NA   NA
 7553518 7553519 CLM_3771 CLM_3772     FALSE 0.002 726.000 0.000 NA   NA
 7553519 7553520 CLM_3772 CLM_3773     TRUE 0.994 -7.000 0.400 NA   NA
 7553520 7553521 CLM_3773 CLM_3774     FALSE 0.184 174.000 0.000 NA   NA
 7553521 7553522 CLM_3774 CLM_3775     FALSE 0.250 90.000 0.000 NA   NA
 7553522 7553523 CLM_3775 CLM_3776     FALSE 0.253 92.000 0.000 NA   NA
 7553523 7553524 CLM_3776 CLM_3777     TRUE 0.923 31.000 0.182 NA   NA
 7553524 7553525 CLM_3777 CLM_3778     TRUE 0.717 14.000 0.000 1.000   NA
 7553525 7553526 CLM_3778 CLM_3779   cgs FALSE 0.003 1340.000 0.000 1.000 N NA
 7553526 7553527 CLM_3779 CLM_3780 cgs lysA FALSE 0.186 265.000 0.003 1.000 N NA
 7553527 7553528 CLM_3780 CLM_3781 lysA lysC TRUE 0.943 34.000 0.016 1.000 Y NA
 7553528 7553529 CLM_3781 CLM_3783 lysC   FALSE 0.072 396.000 0.000 1.000 Y NA
 7553530 7553531 CLM_3784 CLM_3785     TRUE 0.697 137.000 0.069 1.000   NA
 7553532 7553533 CLM_3786 CLM_3787   ftsH TRUE 0.981 21.000 0.583 0.088   NA
 7553533 7553534 CLM_3787 CLM_3788 ftsH   FALSE 0.022 417.000 0.000 0.011 N NA
 7553534 7553535 CLM_3788 CLM_3789   proS FALSE 0.235 201.000 0.000 1.000 N NA
 7553535 7553536 CLM_3789 CLM_3790 proS   FALSE 0.014 424.000 0.000 1.000 N NA
 7553536 7553537 CLM_3790 CLM_3791     FALSE 0.272 121.000 0.000 NA   NA
 7553537 7553538 CLM_3791 CLM_3792     FALSE 0.260 96.000 0.000 NA   NA
 7553538 7553539 CLM_3792 CLM_3793     TRUE 0.822 158.000 0.400 NA   NA
 7553539 7553540 CLM_3793 CLM_3794     TRUE 0.996 -25.000 0.375 NA   NA
 7553540 7553541 CLM_3794 CLM_3795     FALSE 0.023 385.000 0.000 1.000 N NA
 7553541 7553542 CLM_3795 CLM_3796     FALSE 0.197 214.000 0.000 1.000 N NA
 7553542 7553543 CLM_3796 CLM_3797     TRUE 0.995 23.000 1.000 1.000 Y NA
 7553543 7553544 CLM_3797 CLM_3798     TRUE 0.573 264.000 0.667 NA   NA
 7553544 7553545 CLM_3798 CLM_3799     TRUE 0.987 5.000 0.667 NA   NA
 7553547 7553548 CLM_3801 CLM_3802     FALSE 0.013 367.000 0.000 NA   NA
 7553548 7553549 CLM_3802 CLM_3803     FALSE 0.308 308.000 0.400 NA   NA
 7553549 7553550 CLM_3803 CLM_3804     TRUE 0.957 60.000 0.400 NA Y NA
 7553550 7553551 CLM_3804 CLM_3805     FALSE 0.438 239.000 0.000 0.006 Y NA
 7553551 7553552 CLM_3805 CLM_3806     TRUE 0.914 120.000 0.429 0.008 N NA
 7553552 7553553 CLM_3806 CLM_3807     TRUE 0.799 126.000 0.071 0.008 N NA
 7553553 7553554 CLM_3807 CLM_3808     TRUE 0.880 81.000 0.071 1.000 Y NA
 7553554 7553555 CLM_3808 CLM_3809     FALSE 0.032 353.000 0.000 1.000 N NA
 7553557 7553558 CLM_3811 CLM_3812 speD   FALSE 0.316 60.000 0.000 NA   NA
 7553558 7553559 CLM_3812 CLM_3813     TRUE 0.947 -22.000 0.000 NA   NA
 7553559 7553560 CLM_3813 CLM_3814     FALSE 0.003 524.000 0.000 NA   NA
 7553562 7553563 CLM_3816 CLM_3817     FALSE 0.006 472.000 0.000 1.000   NA
 7553563 7553564 CLM_3817 CLM_3818     TRUE 0.928 24.000 0.111 NA   NA
 7553566 7553567 CLM_3820 CLM_3821     FALSE 0.395 151.000 0.000 1.000 N NA
 7553567 7553568 CLM_3821 CLM_3822     FALSE 0.535 54.000 0.000 1.000 N NA
 7553568 7553569 CLM_3822 CLM_3823     FALSE 0.434 76.000 0.000 1.000 N NA
 7553569 7553570 CLM_3823 CLM_3824   uvrA FALSE 0.254 81.000 0.000 NA   NA
 7553570 7553571 CLM_3824 CLM_3825 uvrA   FALSE 0.273 123.000 0.000 NA   NA
 7553571 7553572 CLM_3825 CLM_3826     FALSE 0.268 138.000 0.000 NA   NA
 7553572 7553573 CLM_3826 CLM_3827     FALSE 0.066 245.000 0.000 NA   NA
 7553573 7553574 CLM_3827 CLM_3828     FALSE 0.098 232.000 0.000 1.000   NA
 7553574 7553575 CLM_3828 CLM_3829   rumA FALSE 0.008 427.000 0.000 1.000   NA
 7553575 7553576 CLM_3829 CLM_3830 rumA   FALSE 0.079 233.000 0.000 NA   NA
 7553576 7553577 CLM_3830 CLM_3831     TRUE 0.815 2.000 0.000 NA   NA
 7553579 7553580 CLM_3833 CLM_3834   pykA TRUE 0.664 144.000 0.057 1.000   NA
 7553580 7553581 CLM_3834 CLM_3835 pykA pfkA TRUE 0.955 34.000 0.015 0.002 Y NA
 7553581 7553582 CLM_3835 CLM_3836 pfkA dnaE FALSE 0.306 242.000 0.029 1.000 N NA
 7553582 7553583 CLM_3836 CLM_3837 dnaE   FALSE 0.479 163.000 0.010 1.000   NA
 7553583 7553584 CLM_3837 CLM_3838     TRUE 0.981 7.000 0.470 NA   NA
 7553584 7553585 CLM_3838 CLM_3839     TRUE 0.990 -3.000 0.259 NA   NA
 7553585 7553586 CLM_3839 CLM_3840   murB TRUE 0.695 120.000 0.080 NA   NA
 7553586 7553587 CLM_3840 CLM_3841 murB   TRUE 0.656 69.000 0.009 1.000 N NA
 7553587 7553588 CLM_3841 CLM_3842   uvrC TRUE 0.783 49.000 0.004 0.039 N NA
 7553588 7553589 CLM_3842 CLM_3843 uvrC   TRUE 0.853 14.000 0.005 NA   NA
 7553589 7553590 CLM_3843 CLM_3844     FALSE 0.391 187.000 0.017 NA   NA
 7553590 7553591 CLM_3844 CLM_3845     TRUE 0.892 28.000 0.053 1.000   NA
 7553591 7553592 CLM_3845 CLM_3846     TRUE 0.982 5.000 0.285 1.000 N NA
 7553592 7553593 CLM_3846 CLM_3847     TRUE 0.923 11.000 0.047 NA   NA
 7553593 7553594 CLM_3847 CLM_3848   uvrA FALSE 0.503 99.000 0.005 NA   NA
 7553594 7553595 CLM_3848 CLM_3849 uvrA uvrB TRUE 0.986 19.000 0.154 0.001 Y NA
 7553595 7553596 CLM_3849 CLM_3850 uvrB   TRUE 0.941 2.000 0.013 1.000   NA
 7553596 7553597 CLM_3850 CLM_3851     TRUE 0.720 89.000 0.060 0.006   NA
 7553597 7553598 CLM_3851 CLM_3852     FALSE 0.389 210.000 0.015 1.000 N NA
 7553598 7553599 CLM_3852 CLM_3853     TRUE 0.999 -10.000 0.431 1.000 Y NA
 7553599 7553600 CLM_3853 CLM_3854     FALSE 0.474 156.000 0.010 NA   NA
 7553600 7553601 CLM_3854 CLM_3855     TRUE 0.786 93.000 0.222 NA   NA
 7553601 7553602 CLM_3855 CLM_3856     FALSE 0.513 214.000 0.167 NA   NA
 7553602 7553603 CLM_3856 CLM_3857     TRUE 0.996 0.000 0.180 0.000 Y NA
 7553603 7553604 CLM_3857 CLM_3858     FALSE 0.233 263.000 0.019 1.000 N NA
 7553604 7553605 CLM_3858 CLM_3859     TRUE 0.993 -43.000 0.039 1.000 N NA
 7553605 7553606 CLM_3859 CLM_3860   alr TRUE 0.912 139.000 0.571 1.000 N NA
 7553606 7553607 CLM_3860 CLM_3861 alr   TRUE 0.967 28.000 0.068 NA Y NA
 7553607 7553608 CLM_3861 CLM_3862     FALSE 0.522 200.000 0.064 NA N NA
 7553608 7553609 CLM_3862 CLM_3863   acpS TRUE 0.976 -3.000 0.020 NA N NA
 7553609 7553610 CLM_3863 CLM_3864 acpS   TRUE 0.576 115.000 0.020 NA   NA
 7553610 7553611 CLM_3864 CLM_3865     FALSE 0.010 394.000 0.000 NA   NA
 7553611 7553612 CLM_3865 CLM_3867     FALSE 0.034 305.000 0.000 1.000   NA
 7553612 7553613 CLM_3867 CLM_3868     FALSE 0.216 160.000 0.000 NA   NA
 7553613 7553614 CLM_3868 CLM_3869   rpsD FALSE 0.222 216.000 0.002 NA   NA
 7553615 7553616 CLM_3870 CLM_3871     FALSE 0.117 328.000 0.030 1.000 N NA
 7553617 7553618 CLM_3872 CLM_3873     TRUE 0.956 9.000 0.133 NA   NA
 7553618 7553619 CLM_3873 CLM_3874   sodC FALSE 0.125 202.000 0.000 NA   NA
 7553619 7553620 CLM_3874 CLM_3875 sodC glmS FALSE 0.093 270.000 0.000 1.000 N NA
 7553620 7553621 CLM_3875 CLM_3877 glmS   FALSE 0.005 603.000 0.000 1.000 N NA
 7553621 7553622 CLM_3877 CLM_3878     TRUE 0.851 19.000 0.005 1.000   NA
 7553622 7553623 CLM_3878 CLM_3879   srlD TRUE 0.918 24.000 0.040 0.038   NA
 7553623 7553624 CLM_3879 CLM_3880 srlD   TRUE 0.941 21.000 0.080 1.000 N NA
 7553624 7553625 CLM_3880 CLM_3881     TRUE 0.794 216.000 0.133 0.006 Y NA
 7553625 7553626 CLM_3881 CLM_3882     TRUE 0.992 13.000 0.349 0.006 Y NA
 7553626 7553627 CLM_3882 CLM_3883   gutM TRUE 0.886 43.000 0.116 NA N NA
 7553627 7553628 CLM_3883 CLM_3884 gutM   TRUE 0.973 14.000 0.333 NA N NA
 7553628 7553629 CLM_3884 CLM_3885     TRUE 0.908 35.000 0.091 1.000 N NA
 7553629 7553630 CLM_3885 CLM_3886   glmM FALSE 0.032 356.000 0.000 1.000 N NA
 7553630 7553631 CLM_3886 CLM_3887 glmM   TRUE 0.619 135.000 0.004 1.000 N NA
 7553631 7553632 CLM_3887 CLM_3888     TRUE 0.998 2.000 0.797 0.001 Y NA
 7553632 7553633 CLM_3888 CLM_3889     TRUE 0.999 0.000 0.822 0.001 Y NA
 7553633 7553634 CLM_3889 CLM_3890     TRUE 0.943 16.000 0.075 0.001   NA
 7553634 7553635 CLM_3890 CLM_3891     TRUE 0.799 102.000 0.200 1.000   NA
 7553635 7553636 CLM_3891 CLM_3892   buk FALSE 0.348 263.000 0.163 1.000   NA
 7553636 7553637 CLM_3892 CLM_3893 buk ptb TRUE 0.983 29.000 0.275 1.000 Y NA
 7553637 7553638 CLM_3893 CLM_3894 ptb buk TRUE 0.996 -7.000 0.118 1.000 Y NA
 7553638 7553639 CLM_3894 CLM_3895 buk   FALSE 0.518 101.000 0.007 NA   NA
 7553639 7553640 CLM_3895 CLM_3896     TRUE 0.965 2.000 0.083 NA   NA
 7553640 7553641 CLM_3896 CLM_3897     TRUE 0.998 -30.000 0.502 NA   NA
 7553643 7553644 CLM_3900 CLM_3901   trx TRUE 0.886 66.000 0.429 1.000   NA
 7553644 7553645 CLM_3901 CLM_3902 trx iadA TRUE 0.619 109.000 0.025 1.000   NA
 7553645 7553646 CLM_3902 CLM_3903 iadA   TRUE 0.614 75.000 0.025 1.000   NA
 7553646 7553647 CLM_3903 CLM_3904     TRUE 0.954 28.000 0.333 NA   NA
 7553647 7553648 CLM_3904 CLM_3905   ptsI TRUE 0.683 106.000 0.069 NA   NA
 7553650 7553651 CLM_3907 CLM_3908     TRUE 0.562 70.000 0.006 1.000   NA
 7553651 7553652 CLM_3908 CLM_3909     TRUE 0.945 92.000 0.262 0.000 Y NA
 7553652 7553653 CLM_3909 CLM_3910   cwlD TRUE 0.675 141.000 0.026 1.000 N NA
 7553653 7553654 CLM_3910 CLM_3911 cwlD   FALSE 0.099 266.000 0.000 1.000 N NA
 7553654 7553655 CLM_3911 CLM_3912   rpsI FALSE 0.055 306.000 0.000 1.000 N NA
 7553655 7553656 CLM_3912 CLM_3913 rpsI rplM TRUE 0.993 26.000 0.601 0.011 Y NA
 7553656 7553657 CLM_3913 CLM_3914 rplM truA TRUE 0.864 121.000 0.031 1.000 Y NA
 7553657 7553658 CLM_3914 CLM_3915 truA   TRUE 0.993 0.000 0.404 1.000 N NA
 7553658 7553659 CLM_3915 CLM_3916     TRUE 0.997 -3.000 0.304 1.000 Y NA
 7553659 7553660 CLM_3916 CLM_3917     TRUE 0.999 -15.000 0.713 0.021 Y NA
 7553660 7553661 CLM_3917 CLM_3918   rplQ TRUE 0.738 91.000 0.074 1.000 N NA
 7553661 7553662 CLM_3918 CLM_3919 rplQ rpoA TRUE 0.970 44.000 0.873 1.000 N NA
 7553662 7553663 CLM_3919 CLM_3920 rpoA rpsD TRUE 0.919 68.000 0.549 1.000 N NA
 7553663 7553664 CLM_3920 CLM_3921 rpsD rpsK TRUE 0.988 35.000 0.509 0.014 Y NA
 7553664 7553665 CLM_3921 CLM_3922 rpsK rpsM TRUE 0.995 18.000 0.810 0.011 Y NA
 7553665 7553666 CLM_3922 CLM_3923 rpsM rpmJ TRUE 0.830 113.000 0.194 0.011   NA
 7553666 7553667 CLM_3923 CLM_3924 rpmJ infA TRUE 0.959 17.000 0.257 1.000   NA
 7553667 7553668 CLM_3924 CLM_3925 infA   TRUE 0.947 8.000 0.090 NA   NA
 7553668 7553669 CLM_3925 CLM_3926   map TRUE 0.950 15.000 0.185 NA   NA
 7553669 7553670 CLM_3926 CLM_3927 map adk TRUE 0.991 0.000 0.290 1.000 N NA
 7553670 7553671 CLM_3927 CLM_3928 adk secY TRUE 0.965 24.000 0.241 1.000 N NA
 7553671 7553672 CLM_3928 CLM_3929 secY rplO TRUE 0.995 1.000 0.730 1.000 N NA
 7553672 7553673 CLM_3929 CLM_3930 rplO rpmD TRUE 0.994 20.000 0.653 0.002 Y NA
 7553673 7553674 CLM_3930 CLM_3931 rpmD rpsE TRUE 0.995 14.000 0.789 0.014 Y NA
 7553674 7553675 CLM_3931 CLM_3932 rpsE rplR TRUE 0.995 18.000 0.814 0.014 Y NA
 7553675 7553676 CLM_3932 CLM_3933 rplR rplF TRUE 0.995 19.000 0.815 0.011 Y NA
 7553676 7553677 CLM_3933 CLM_3934 rplF rpsH TRUE 0.995 24.000 0.808 0.011 Y NA
 7553677 7553678 CLM_3934 CLM_3935 rpsH rpsN TRUE 0.989 30.000 0.473 0.011 Y NA
 7553678 7553679 CLM_3935 CLM_3936 rpsN rplE TRUE 0.992 17.000 0.496 0.011 Y NA
 7553679 7553680 CLM_3936 CLM_3937 rplE rplX TRUE 0.978 23.000 0.057 0.011 Y NA
 7553680 7553681 CLM_3937 CLM_3938 rplX rplN TRUE 0.979 24.000 0.071 0.014 Y NA
 7553681 7553682 CLM_3938 CLM_3939 rplN rpsQ TRUE 0.991 35.000 0.791 0.014 Y NA
 7553682 7553683 CLM_3939 CLM_3940 rpsQ rpmC TRUE 0.995 22.000 0.828 0.011 Y NA
 7553683 7553684 CLM_3940 CLM_3941 rpmC rplP TRUE 0.999 -10.000 0.802 0.011 Y NA
 7553684 7553685 CLM_3941 CLM_3942 rplP rpsC TRUE 0.995 18.000 0.828 0.014 Y NA
 7553685 7553686 CLM_3942 CLM_3943 rpsC rplV TRUE 0.994 18.000 0.719 0.014 Y NA
 7553686 7553687 CLM_3943 CLM_3944 rplV rpsS TRUE 0.995 22.000 0.769 0.014 Y NA
 7553687 7553688 CLM_3944 CLM_3945 rpsS rplB TRUE 0.977 70.000 0.820 0.014 Y NA
 7553688 7553689 CLM_3945 CLM_3946 rplB rplW TRUE 0.983 55.000 0.849 0.014 Y NA
 7553689 7553690 CLM_3946 CLM_3947 rplW rplD TRUE 0.997 0.000 0.307 0.011 Y NA
 7553690 7553691 CLM_3947 CLM_3948 rplD rplC TRUE 0.992 25.000 0.544 0.011 Y NA
 7553691 7553692 CLM_3948 CLM_3949 rplC rpsJ TRUE 0.957 90.000 0.467 0.014 Y NA
 7553692 7553693 CLM_3949 CLM_3950 rpsJ tuf FALSE 0.294 397.000 0.318 1.000 Y NA
 7553693 7553694 CLM_3950 CLM_3951 tuf fusA TRUE 0.984 40.000 0.400 0.001 Y NA
 7553694 7553695 CLM_3951 CLM_3952 fusA rpsG TRUE 0.963 72.000 0.579 1.000 Y NA
 7553695 7553696 CLM_3952 CLM_3953 rpsG rpsL TRUE 0.926 161.000 0.224 0.002 Y NA
 7553696 7553697 CLM_3953 CLM_3954 rpsL   TRUE 0.942 76.000 0.239 0.014 Y NA
 7553697 7553698 CLM_3954 CLM_3955   rpoC TRUE 0.750 122.000 0.065 1.000 N NA
 7553698 7553699 CLM_3955 CLM_3956 rpoC rpoB TRUE 0.996 21.000 0.851 0.000 Y NA
 7553699 7553700 CLM_3956 CLM_3957 rpoB rplL FALSE 0.408 275.000 0.223 1.000 N NA
 7553700 7553701 CLM_3957 CLM_3958 rplL rplJ TRUE 0.985 48.000 0.884 1.000 Y NA
 7553701 7553702 CLM_3958 CLM_3959 rplJ rplA TRUE 0.859 202.000 0.302 1.000 Y NA
 7553702 7553703 CLM_3959 CLM_3960 rplA rplK TRUE 0.982 57.000 0.838 0.014 Y NA
 7553703 7553704 CLM_3960 CLM_3961 rplK nusG TRUE 0.931 71.000 0.681 1.000 N NA
 7553704 7553705 CLM_3961 CLM_3962 nusG secE TRUE 0.966 47.000 0.843 1.000 N NA
 7553705 7553706 CLM_3962 CLM_3963 secE rpmG TRUE 0.859 50.000 0.100 1.000 N NA
 7553706 7553707 CLM_3963 CLM_3964 rpmG tuf TRUE 0.777 202.000 0.099 1.000 Y NA
 7553707 7553708 CLM_3964 CLM_3965 tuf   FALSE 0.249 83.000 0.000 NA   NA
 7553708 7553709 CLM_3965 CLM_3966     TRUE 0.644 18.000 0.000 NA   NA
 7553709 7553710 CLM_3966 CLM_3967   sigH FALSE 0.301 64.000 0.000 NA   NA
 7553710 7553711 CLM_3967 CLM_3968 sigH   TRUE 0.848 74.000 0.361 NA   NA
 7553711 7553712 CLM_3968 CLM_3969     TRUE 0.964 3.000 0.109 NA   NA
 7553712 7553713 CLM_3969 CLM_3970   thyX TRUE 0.958 3.000 0.032 1.000 N NA
 7553713 7553714 CLM_3970 CLM_3971 thyX   TRUE 0.987 -10.000 0.055 1.000   NA
 7553714 7553715 CLM_3971 CLM_3972   cysS TRUE 0.849 49.000 0.129 1.000   NA
 7553715 7553716 CLM_3972 CLM_3973 cysS ilvA TRUE 0.854 29.000 0.003 1.000 N NA
 7553716 7553717 CLM_3973 CLM_3974 ilvA   TRUE 0.627 72.000 0.004 1.000 N NA
 7553717 7553718 CLM_3974 CLM_3975   ispD TRUE 0.611 111.000 0.002 1.000 N NA
 7553718 7553719 CLM_3975 CLM_3976 ispD   TRUE 0.973 2.000 0.134 NA   NA
 7553721 7553722 CLM_3978 CLM_3979   radA TRUE 0.935 19.000 0.126 NA   NA
 7553722 7553723 CLM_3979 CLM_3980 radA clpC TRUE 0.863 120.000 0.009 0.012 Y NA
 7553723 7553724 CLM_3980 CLM_3981 clpC   TRUE 0.980 2.000 0.129 1.000 N NA
 7553724 7553725 CLM_3981 CLM_3982     TRUE 0.991 5.000 0.848 1.000   NA
 7553725 7553726 CLM_3982 CLM_3983   ctsR TRUE 0.979 23.000 0.681 NA   NA
 7553726 7553727 CLM_3983 CLM_3984 ctsR   FALSE 0.010 396.000 0.000 NA   NA
 7553727 7553728 CLM_3984 CLM_3985   fusA FALSE 0.060 347.000 0.021 NA   NA
 7553728 7553729 CLM_3985 CLM_3986 fusA   FALSE 0.157 186.000 0.000 NA   NA
 7553729 7553730 CLM_3986 CLM_3987     TRUE 0.619 26.000 0.000 NA   NA
 7553730 7553731 CLM_3987 CLM_3988   rrf TRUE 0.736 8.000 0.000 NA   NA
 7553732 7553733 CLM_3990 CLM_3991     TRUE 0.643 74.000 0.044 NA   NA
 7553734 7553735 CLM_3992 CLM_3993   rrs FALSE 0.248 87.000 0.000 NA   NA
 7553735 7553736 CLM_3993 CLM_3994 rrs   FALSE 0.090 226.000 0.000 NA   NA
 7553736 7553737 CLM_3994 CLM_3995     TRUE 0.815 2.000 0.000 NA   NA
 7553737 7553738 CLM_3995 CLM_3997   rrf TRUE 0.741 7.000 0.000 NA   NA
 7553739 7553740 CLM_3999 CLM_4000     TRUE 0.643 74.000 0.044 NA   NA
 7553741 7553742 CLM_4001 CLM_4002 rrs murD FALSE 0.003 571.000 0.000 NA   NA
 7553742 7553743 CLM_4002 CLM_4003 murD glyS FALSE 0.009 826.000 0.002 0.086 N NA
 7553743 7553744 CLM_4003 CLM_4004 glyS lysS FALSE 0.188 320.000 0.000 0.086 Y NA
 7553744 7553745 CLM_4004 CLM_4005 lysS greA TRUE 0.946 19.000 0.098 1.000 N NA
 7553745 7553746 CLM_4005 CLM_4006 greA   TRUE 0.588 131.000 0.023 NA   NA
 7553746 7553747 CLM_4006 CLM_4007     TRUE 0.641 50.000 0.005 NA   NA
 7553747 7553748 CLM_4007 CLM_4008   coaX TRUE 0.951 10.000 0.054 1.000 N NA
 7553748 7553749 CLM_4008 CLM_4009 coaX fhs TRUE 0.590 155.000 0.011 1.000 N NA
 7553749 7553750 CLM_4009 CLM_4010 fhs ftsH FALSE 0.282 203.000 0.000 0.086 N NA
 7553750 7553751 CLM_4010 CLM_4011 ftsH hpt TRUE 0.811 82.000 0.180 1.000 N NA
 7553751 7553752 CLM_4011 CLM_4012 hpt tilS TRUE 0.995 -16.000 0.137 0.026 N NA
 7553752 7553753 CLM_4012 CLM_4013 tilS spoIIE TRUE 0.683 149.000 0.041 1.000 N NA
 7553753 7553754 CLM_4013 CLM_4014 spoIIE   FALSE 0.020 329.000 0.000 NA   NA
 7553754 7553755 CLM_4014 CLM_4015     TRUE 0.730 9.000 0.000 NA   NA
 7553755 7553756 CLM_4015 CLM_4016     FALSE 0.371 52.000 0.000 NA   NA
 7553756 7553757 CLM_4016 CLM_4017     TRUE 0.786 3.000 0.000 NA   NA
 7553757 7553758 CLM_4017 CLM_4018     TRUE 0.571 30.000 0.000 NA   NA
 7553758 7553759 CLM_4018 CLM_4019     TRUE 0.786 3.000 0.000 NA   NA
 7553759 7553760 CLM_4019 CLM_4020     TRUE 0.786 3.000 0.000 NA   NA
 7553760 7553761 CLM_4020 CLM_4021     FALSE 0.260 141.000 0.000 NA   NA
 7553761 7553762 CLM_4021 CLM_4022     TRUE 0.817 62.000 0.179 1.000   NA
 7553762 7553763 CLM_4022 CLM_4023     TRUE 0.822 95.000 0.303 NA   NA
 7553763 7553764 CLM_4023 CLM_4024   yabP TRUE 0.982 15.000 0.774 NA   NA
 7553764 7553765 CLM_4024 CLM_4025 yabP   TRUE 0.726 119.000 0.108 NA   NA
 7553765 7553766 CLM_4025 CLM_4026   hup TRUE 0.685 74.000 0.024 1.000 N NA
 7553766 7553767 CLM_4026 CLM_4027 hup   TRUE 0.581 128.000 0.014 1.000   NA
 7553767 7553768 CLM_4027 CLM_4028   spoVB TRUE 0.881 15.000 0.015 1.000   NA
 7553768 7553769 CLM_4028 CLM_4029 spoVB   TRUE 0.730 133.000 0.108 NA   NA
 7553769 7553770 CLM_4029 CLM_4030     TRUE 0.561 199.000 0.088 NA N NA
 7553770 7553771 CLM_4030 CLM_4031   mfd TRUE 0.633 84.000 0.016 1.000 N NA
 7553771 7553772 CLM_4031 CLM_4032 mfd pth TRUE 0.944 28.000 0.137 1.000 N NA
 7553772 7553773 CLM_4032 CLM_4033 pth   TRUE 0.640 110.000 0.009 1.000 N NA
 7553773 7553774 CLM_4033 CLM_4034     TRUE 0.910 35.000 0.095 1.000 N NA
 7553774 7553775 CLM_4034 CLM_4035     TRUE 0.997 1.000 0.653 1.000 Y NA
 7553775 7553776 CLM_4035 CLM_4036   prsA TRUE 0.687 180.000 0.123 1.000 N NA
 7553776 7553777 CLM_4036 CLM_4037 prsA glmU TRUE 0.938 21.000 0.069 1.000 N NA
 7553777 7553778 CLM_4037 CLM_4038 glmU spoVG TRUE 0.792 162.000 0.011 1.000 Y NA
 7553778 7553779 CLM_4038 CLM_4039 spoVG purR TRUE 0.781 103.000 0.099 1.000 N NA
 7553780 7553781 CLM_4040 CLM_4041 murC   FALSE 0.539 65.000 0.004 NA   NA
 7553781 7553782 CLM_4041 CLM_4042     FALSE 0.263 77.000 0.000 NA   NA
 7553782 7553783 CLM_4042 CLM_4043     FALSE 0.251 91.000 0.000 NA   NA
 7553783 7553784 CLM_4043 CLM_4044     TRUE 0.756 86.000 0.156 1.000   NA
 7553784 7553785 CLM_4044 CLM_4045     FALSE 0.097 326.000 0.044 NA   NA
 7553786 7553787 CLM_4046 CLM_4047     TRUE 0.820 45.000 0.067 1.000   NA
 7553787 7553788 CLM_4047 CLM_4048     TRUE 0.685 68.000 0.058 NA   NA
 7553789 7553790 CLM_4049 CLM_4050     TRUE 0.903 33.000 0.133 NA   NA
 7553791 7553792 CLM_4051 CLM_4052     FALSE 0.061 302.000 0.000 1.000 N NA
 7553792 7553793 CLM_4052 CLM_4053     TRUE 0.888 15.000 0.028 NA   NA
 7553793 7553794 CLM_4053 CLM_4054     TRUE 0.882 18.000 0.030 NA   NA
 7553794 7553795 CLM_4054 CLM_4055   murI TRUE 0.603 147.000 0.007 1.000 N NA
 7553798 7553799 CLM_4058 CLM_4059 murA   TRUE 0.904 26.000 0.058 1.000   NA
 7553799 7553800 CLM_4059 CLM_4060     TRUE 0.863 17.000 0.016 NA   NA
 7553800 7553801 CLM_4060 CLM_4061     TRUE 0.967 15.000 0.357 NA   NA
 7553801 7553802 CLM_4061 CLM_4062     FALSE 0.373 179.000 0.005 NA   NA
 7553803 7553804 CLM_4064 CLM_4065     FALSE 0.032 299.000 0.000 NA   NA
 7553804 7553805 CLM_4065 CLM_4066     TRUE 0.873 96.000 0.500 NA   NA
 7553806 7553807 CLM_4067 CLM_4068     FALSE 0.401 247.000 0.000 0.040 Y NA
 7553807 7553808 CLM_4068 CLM_4069   map TRUE 0.935 21.000 0.059 1.000 N NA
 7553810 7553811 CLM_4071 CLM_4072     TRUE 0.997 -7.000 0.810 NA   NA
 7553811 7553812 CLM_4072 CLM_4073     FALSE 0.007 416.000 0.000 NA   NA
 7553812 7553813 CLM_4073 CLM_4074     TRUE 0.949 3.000 0.053 NA   NA
 7553813 7553814 CLM_4074 CLM_4075     TRUE 0.996 1.000 0.237 0.001 Y NA
 7553814 7553815 CLM_4075 CLM_4076     TRUE 0.972 9.000 0.260 1.000   NA
 7553815 7553816 CLM_4076 CLM_4077     FALSE 0.030 315.000 0.000 1.000   NA
 7553816 7553817 CLM_4077 CLM_4078     FALSE 0.063 300.000 0.000 1.000 N NA
 7553819 7553820 CLM_4080 CLM_4081     TRUE 0.798 107.000 0.220 NA   NA
 7553820 7553821 CLM_4081 CLM_4082     FALSE 0.455 181.000 0.031 NA   NA
 7553821 7553822 CLM_4082 CLM_4083     TRUE 0.602 88.000 0.031 1.000   NA
 7553823 7553824 CLM_4084 CLM_4085     TRUE 0.891 29.000 0.025 1.000 N NA
 7553824 7553825 CLM_4085 CLM_4086   accA FALSE 0.385 200.000 0.003 1.000 N NA
 7553825 7553826 CLM_4086 CLM_4087 accA accD TRUE 0.970 47.000 0.234 0.001 Y NA
 7553826 7553827 CLM_4087 CLM_4088 accD accC TRUE 0.977 20.000 0.090 1.000 Y NA
 7553827 7553828 CLM_4088 CLM_4089 accC fabZ TRUE 0.964 32.000 0.077 1.000 Y NA
 7553828 7553829 CLM_4089 CLM_4090 fabZ accB TRUE 0.979 20.000 0.058 0.003 Y NA
 7553829 7553830 CLM_4090 CLM_4091 accB fabF TRUE 0.986 4.000 0.074 1.000 Y NA
 7553830 7553831 CLM_4091 CLM_4092 fabF fabG TRUE 0.937 20.000 0.000 1.000 Y NA
 7553831 7553832 CLM_4092 CLM_4093 fabG fabD TRUE 0.950 18.000 0.000 0.003 Y NA
 7553832 7553833 CLM_4093 CLM_4094 fabD   TRUE 0.932 21.000 0.099 1.000   NA
 7553833 7553834 CLM_4094 CLM_4095   acpP TRUE 0.809 126.000 0.216 1.000   NA
 7553834 7553835 CLM_4095 CLM_4096 acpP fabH TRUE 0.904 41.000 0.121 0.003   NA
 7553835 7553836 CLM_4096 CLM_4097 fabH   TRUE 0.990 -7.000 0.098 1.000 N NA
 7553836 7553837 CLM_4097 CLM_4098     TRUE 0.897 16.000 0.032 1.000   NA
 7553837 7553838 CLM_4098 CLM_4099     FALSE 0.541 98.000 0.007 1.000   NA
 7553839 7553840 CLM_4100 CLM_4101     TRUE 0.996 -7.000 0.083 NA Y NA
 7553841 7553842 CLM_4103 CLM_4104     TRUE 0.769 4.000 0.000 NA   NA
 7553842 7553843 CLM_4104 CLM_4106     TRUE 0.736 8.000 0.000 NA   NA
 7553843 7553844 CLM_4106 CLM_4107     TRUE 0.651 16.000 0.000 NA   NA
 7553844 7553845 CLM_4107 CLM_4108     FALSE 0.337 56.000 0.000 NA   NA
 7553845 7553846 CLM_4108 CLM_4109     TRUE 0.749 6.000 0.000 NA   NA
 7553846 7553847 CLM_4109 CLM_4110     TRUE 0.644 17.000 0.000 NA   NA
 7553847 7553848 CLM_4110 CLM_4113     FALSE 0.248 84.000 0.000 NA   NA
 7553848 7553849 CLM_4113 CLM_4114     TRUE 0.736 8.000 0.000 NA   NA
 7553849 7553850 CLM_4114 CLM_4115     TRUE 0.644 17.000 0.000 NA   NA
 7553850 7553851 CLM_4115 CLM_4116     FALSE 0.187 173.000 0.000 NA   NA
 7553851 7553852 CLM_4116 CLM_4117     TRUE 0.862 13.000 0.006 NA   NA
 7553854 7553855 CLM_4119 CLM_4120     TRUE 0.800 103.000 0.222 NA   NA
 7553855 7553856 CLM_4120 CLM_4121   purA FALSE 0.494 126.000 0.002 NA   NA
 7553856 7553857 CLM_4121 CLM_4122 purA   FALSE 0.274 232.000 0.033 NA   NA
 7553857 7553858 CLM_4122 CLM_4123     FALSE 0.433 168.000 0.010 NA   NA
 7553858 7553859 CLM_4123 CLM_4124     FALSE 0.552 193.000 0.111 NA   NA
 7553859 7553860 CLM_4124 CLM_4125   dnaB FALSE 0.133 242.000 0.000 1.000 N NA
 7553860 7553861 CLM_4125 CLM_4126 dnaB   TRUE 0.919 31.000 0.053 0.086 N NA
 7553861 7553862 CLM_4126 CLM_4127   rplI TRUE 0.935 11.000 0.024 1.000 N NA
 7553862 7553863 CLM_4127 CLM_4128 rplI   TRUE 0.985 0.000 0.119 1.000 N NA
 7553863 7553864 CLM_4128 CLM_4129     TRUE 0.982 1.000 0.210 NA   NA
 7553864 7553865 CLM_4129 CLM_4130     TRUE 0.945 12.000 0.116 NA   NA
 7553865 7553866 CLM_4130 CLM_4131   rpsR FALSE 0.521 148.000 0.015 NA   NA
 7553866 7553867 CLM_4131 CLM_4132 rpsR ssb TRUE 0.882 19.000 0.002 1.000 N NA
 7553867 7553868 CLM_4132 CLM_4133 ssb rpsF TRUE 0.884 16.000 0.002 1.000 N NA
 7553868 7553869 CLM_4133 CLM_4134 rpsF   TRUE 0.582 106.000 0.002 NA N NA
 7553869 7553870 CLM_4134 CLM_4135     FALSE 0.045 274.000 0.000 NA   NA
 7553870 7553871 CLM_4135 CLM_4136     TRUE 0.935 16.000 0.121 NA   NA
 7553871 7553872 CLM_4136 CLM_4137     TRUE 0.953 7.000 0.105 NA   NA
 7553873 7553874 CLM_4138 CLM_4139   ytvI TRUE 0.938 14.000 0.111 NA   NA
 7553874 7553875 CLM_4139 CLM_4140 ytvI   TRUE 0.720 58.000 0.058 NA   NA
 7553876 7553877 CLM_4141 CLM_4142     TRUE 0.682 53.000 0.024 NA   NA
 7553877 7553878 CLM_4142 CLM_4143     TRUE 0.826 38.000 0.047 NA   NA
 7553878 7553879 CLM_4143 CLM_4144   soj TRUE 0.987 16.000 0.827 1.000 N NA
 7553879 7553880 CLM_4144 CLM_4145 soj   TRUE 0.754 124.000 0.069 1.000 N NA
 7553880 7553881 CLM_4145 CLM_4146   gidB TRUE 0.767 100.000 0.089 1.000 N NA
 7553881 7553882 CLM_4146 CLM_4147 gidB gidA TRUE 0.977 24.000 0.466 1.000 N NA
 7553882 7553883 CLM_4147 CLM_4148 gidA trmE TRUE 0.973 9.000 0.266 1.000   NA
 7553883 7553884 CLM_4148 CLM_4149 trmE jag TRUE 0.845 48.000 0.116 1.000   NA
 7553884 7553885 CLM_4149 CLM_4150 jag oxaA TRUE 0.959 18.000 0.254 1.000   NA
 7553885 7553886 CLM_4150 CLM_4151 oxaA   TRUE 0.967 26.000 0.461 NA   NA
 7553886 7553887 CLM_4151 CLM_4152   rnpA TRUE 0.994 -3.000 0.540 NA   NA
 7553887 7553888 CLM_4152 CLM_4153 rnpA rpmH TRUE 0.941 55.000 0.787 1.000   NA