MicrobesOnline Operon Predictions for Stenotrophomonas maltophilia K279a

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5775362 5775363 Smlt0001 Smlt0002 dnaA dnaN FALSE 0.478 276.000 0.328 1.000 Y NA
 5775365 10768808 Smlt0004 Smlt0004a recF   TRUE 0.763 -1082.000 0.000 NA   NA
 10768808 5775366 Smlt0004a Smlt0005   gyrB FALSE 0.137 125.000 0.000 NA   NA
 5775366 5775367 Smlt0005 Smlt0006 gyrB   FALSE 0.332 68.000 0.005 NA   NA
 5775367 5775368 Smlt0006 Smlt0007     TRUE 0.570 72.000 0.079 NA   NA
 5775368 5775369 Smlt0007 Smlt0008     FALSE 0.139 133.000 0.000 1.000   NA
 5775369 5775370 Smlt0008 Smlt0009     FALSE 0.117 144.000 0.000 1.000   NA
 5775370 5775371 Smlt0009 Smlt0010   exbB1 TRUE 0.841 95.000 0.600 0.023 N NA
 5775371 5775372 Smlt0010 Smlt0011 exbB1 exbD1 TRUE 0.972 63.000 0.600 0.064 Y NA
 5775372 5775373 Smlt0011 Smlt0012 exbD1 exbD2 TRUE 0.999 4.000 0.857 0.049 Y NA
 5775373 5775374 Smlt0012 Smlt0013 exbD2 cls FALSE 0.048 103.000 0.000 1.000 N NA
 5775374 5775375 Smlt0013 Smlt0014 cls   TRUE 0.871 41.000 0.417 NA   NA
 5775375 5775376 Smlt0014 Smlt0015     TRUE 0.840 10.000 0.009 NA   NA
 5775376 5775377 Smlt0015 Smlt0016     FALSE 0.190 102.000 0.000 NA   NA
 5775379 5775380 Smlt0018 Smlt0019     FALSE 0.218 91.000 0.000 NA   NA
 5775380 5775381 Smlt0019 Smlt0020     FALSE 0.049 198.000 0.000 NA   NA
 5775381 5775382 Smlt0020 Smlt0021     FALSE 0.154 119.000 0.000 NA   NA
 5775382 5775383 Smlt0021 Smlt0023     FALSE 0.010 620.000 0.000 NA   NA
 5775383 5775384 Smlt0023 Smlt0024     FALSE 0.016 364.000 0.000 NA   NA
 5775384 5775385 Smlt0024 Smlt0025     TRUE 0.818 39.000 0.250 NA   NA
 5775386 5775387 Smlt0026 Smlt0027     TRUE 0.996 9.000 0.409 0.073 Y NA
 5775387 5775388 Smlt0027 Smlt0028     FALSE 0.040 343.000 0.000 0.073   NA
 5775388 5775389 Smlt0028 Smlt0029     TRUE 0.928 -10.000 0.000 0.073   NA
 5775389 5775390 Smlt0029 Smlt0032     FALSE 0.001 687.000 0.000 NA N NA
 5775390 5775391 Smlt0032 Smlt0033     FALSE 0.073 166.000 0.000 NA   NA
 5775391 5775392 Smlt0033 Smlt0034     TRUE 0.849 40.000 0.333 NA   NA
 5775392 5775393 Smlt0034 Smlt0035     TRUE 0.979 20.000 1.000 NA   NA
 5775393 5775394 Smlt0035 Smlt0036   smmL TRUE 0.992 -3.000 0.333 NA   NA
 5775394 5775395 Smlt0036 Smlt0037 smmL smmK TRUE 0.889 10.000 0.100 1.000 N NA
 5775395 5775396 Smlt0037 Smlt0038 smmK smmJ TRUE 0.996 -3.000 0.100 1.000 Y NA
 5775396 5775397 Smlt0038 Smlt0039 smmJ   FALSE 0.218 91.000 0.000 NA   NA
 5775398 5775399 Smlt0040 Smlt0041     FALSE 0.160 115.000 0.000 NA   NA
 5775399 5775400 Smlt0041 Smlt0042     FALSE 0.052 193.000 0.000 NA   NA
 5775400 5775401 Smlt0042 Smlt0043     FALSE 0.058 184.000 0.000 NA   NA
 5775401 5775402 Smlt0043 Smlt0044     FALSE 0.128 130.000 0.000 NA   NA
 5775402 5775403 Smlt0044 Smlt0045     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5775404 5775405 Smlt0046 Smlt0047     FALSE 0.192 109.000 0.000 1.000   NA
 5775405 5775406 Smlt0047 Smlt0048   aspC FALSE 0.007 234.000 0.000 1.000 N NA
 5775409 5775410 Smlt0051 Smlt0052     FALSE 0.190 165.000 0.043 NA   NA
 5775410 5775411 Smlt0052 Smlt0053     TRUE 0.845 4.000 0.000 1.000   NA
 5775412 5775413 Smlt0054 Smlt0055     FALSE 0.026 261.000 0.000 NA   NA
 5775413 10768809 Smlt0055 Smlt0072     TRUE 0.767 -527.000 0.000 NA   NA
 5775414 5775415 Smlt0056 Smlt0057     FALSE 0.002 595.000 0.000 1.000 N NA
 5775415 5775416 Smlt0057 Smlt0058     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5775416 5775417 Smlt0058 Smlt0059     TRUE 0.762 10.000 0.000 NA   NA
 5775417 5775418 Smlt0059 Smlt0060     FALSE 0.477 30.000 0.000 NA   NA
 5775418 5775419 Smlt0060 Smlt0061     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5775419 5775420 Smlt0061 Smlt0062     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5775420 5775421 Smlt0062 Smlt0063     TRUE 0.829 -13.000 0.000 NA   NA
 5775421 5775422 Smlt0063 Smlt0064     FALSE 0.281 59.000 0.000 NA   NA
 5775422 5775423 Smlt0064 Smlt0065     FALSE 0.423 34.000 0.000 NA   NA
 5775423 5775424 Smlt0065 Smlt0066   Q FALSE 0.396 36.000 0.000 NA   NA
 5775425 5775426 Smlt0067 Smlt0068     TRUE 0.992 -3.000 0.349 NA   NA
 5775426 5775427 Smlt0068 Smlt0069     FALSE 0.171 110.000 0.000 NA   NA
 5775427 5775428 Smlt0069 Smlt0073     FALSE 0.009 1026.000 0.000 NA   NA
 5775428 5775429 Smlt0073 Smlt0074     FALSE 0.181 114.000 0.000 1.000   NA
 5775431 5775432 Smlt0076 Smlt0077   phhA FALSE 0.029 243.000 0.000 NA   NA
 5775433 5775434 Smlt0078 Smlt0079     FALSE 0.050 196.000 0.000 NA   NA
 5775435 5775436 Smlt0080 Smlt0082     FALSE 0.012 451.000 0.000 NA   NA
 5775439 5775440 Smlt0085 Smlt0086     TRUE 0.987 12.000 0.846 NA   NA
 5775442 5775443 Smlt0088 Smlt0089     TRUE 0.933 -3.000 0.000 1.000   NA
 5775443 5775444 Smlt0089 Smlt0090b   fpg TRUE 0.638 20.000 0.000 1.000   NA
 5775444 10768810 Smlt0090b Smlt0090a fpg   TRUE 0.769 -344.000 0.000 NA   NA
 10768810 5775445 Smlt0090a Smlt0091   mdoD FALSE 0.011 575.000 0.000 NA   NA
 5775446 5775447 Smlt0092 Smlt0093 tdk   TRUE 0.784 10.000 0.000 1.000   NA
 5775447 5775448 Smlt0093 Smlt0094     TRUE 0.608 39.000 0.000 0.018   NA
 5775449 5775450 Smlt0095 Smlt0096 rep   FALSE 0.003 261.000 0.000 NA N NA
 5775452 5775453 Smlt0098 Smlt0099 hel pyrF TRUE 0.955 -3.000 0.008 1.000   NA
 5775453 5775454 Smlt0099 Smlt0101 pyrF   FALSE 0.013 425.000 0.000 NA   NA
 5775454 5775455 Smlt0101 Smlt0102   plsB TRUE 0.909 9.000 0.043 NA   NA
 5775455 5775456 Smlt0102 Smlt0103 plsB   FALSE 0.002 374.000 0.000 NA N NA
 5775456 5775457 Smlt0103 Smlt0104   rdgC FALSE 0.297 37.000 0.012 NA N NA
 5775457 5775458 Smlt0104 Smlt0105 rdgC   TRUE 0.641 60.000 0.121 NA   NA
 5775461 5775462 Smlt0108 Smlt0109 gltD gltB TRUE 0.881 85.000 0.032 0.001 Y NA
 5775465 5775466 Smlt0112 Smlt0113     FALSE 0.142 123.000 0.000 NA   NA
 5775466 5775467 Smlt0113 Smlt0114     TRUE 0.827 4.000 0.000 NA   NA
 5775469 5775470 Smlt0116 Smlt0117     TRUE 0.996 4.000 0.500 NA Y NA
 5775471 5775472 Smlt0118 Smlt0119     FALSE 0.288 67.000 0.000 1.000   NA
 5775472 5775473 Smlt0119 Smlt0120   lhr TRUE 0.603 102.000 0.185 1.000   NA
 5775474 5775475 Smlt0121 Smlt0122     FALSE 0.349 41.000 0.000 NA   NA
 5775476 5775477 Smlt0123 Smlt0124     TRUE 0.996 -3.000 0.724 NA   NA
 5775477 5775478 Smlt0124 Smlt0125     TRUE 0.986 -3.000 0.172 NA   NA
 5775478 5775479 Smlt0125 Smlt0126     TRUE 0.985 -3.000 0.161 NA   NA
 5775479 5775480 Smlt0126 Smlt0127     TRUE 0.957 8.000 0.193 NA   NA
 5775480 5775481 Smlt0127 Smlt0128     TRUE 0.917 17.000 0.168 NA   NA
 5775481 5775482 Smlt0128 Smlt0129     TRUE 0.994 0.000 0.720 NA   NA
 5775482 5775483 Smlt0129 Smlt0130     TRUE 0.897 22.000 0.200 NA   NA
 5775483 5775484 Smlt0130 Smlt0131     FALSE 0.233 85.000 0.000 NA   NA
 5775486 5775487 Smlt0134 Smlt0135 hipA hipB TRUE 0.827 4.000 0.000 NA   NA
 5775487 5775488 Smlt0135 Smlt0136 hipB   FALSE 0.018 162.000 0.000 1.000 N NA
 5775491 5775492 Smlt0139 Smlt0140     FALSE 0.469 50.000 0.079 NA N NA
 5775492 5775493 Smlt0140 Smlt0141     TRUE 0.943 5.000 0.083 NA   NA
 5775493 5775494 Smlt0141 Smlt0142     TRUE 0.983 -3.000 0.128 NA   NA
 5775494 5775495 Smlt0142 Smlt0143     TRUE 0.877 11.000 0.107 NA N NA
 5775495 5775496 Smlt0143 Smlt0144     FALSE 0.217 93.000 0.023 NA N NA
 5775496 5775497 Smlt0144 Smlt0145     TRUE 0.892 8.000 0.023 NA   NA
 5775497 5775498 Smlt0145 Smlt0146     FALSE 0.287 57.000 0.000 NA   NA
 5775498 5775499 Smlt0146 Smlt0147     TRUE 0.747 11.000 0.000 NA   NA
 5775500 5775501 Smlt0148 Smlt0149     TRUE 0.810 5.000 0.000 NA   NA
 5775501 5775502 Smlt0149 Smlt0150     FALSE 0.446 74.000 0.100 NA N NA
 5775503 5775504 Smlt0151 Smlt0152 glnA glnB FALSE 0.117 348.000 0.000 1.000 Y NA
 5775504 5775505 Smlt0152 Smlt0153 glnB amtB TRUE 0.632 28.000 0.048 1.000 N NA
 5775505 5775506 Smlt0153 Smlt0154 amtB   FALSE 0.008 224.000 0.000 1.000 N NA
 5775506 5775507 Smlt0154 Smlt0155     FALSE 0.072 68.000 0.000 1.000 N NA
 5775507 5775508 Smlt0155 Smlt0156     FALSE 0.173 109.000 0.000 NA   NA
 5775508 5775509 Smlt0156 Smlt0157     FALSE 0.175 108.000 0.000 NA   NA
 5775509 5775510 Smlt0157 Smlt0158   glnL FALSE 0.015 171.000 0.000 1.000 N NA
 5775510 5775511 Smlt0158 Smlt0159 glnL glnG TRUE 0.998 -7.000 0.587 1.000 Y NA
 5775511 5775512 Smlt0159 Smlt0160 glnG sodC1 FALSE 0.133 94.000 0.007 1.000 N NA
 5775512 5775513 Smlt0160 Smlt0161 sodC1 sodC2 TRUE 0.984 32.000 0.375 0.002 Y NA
 5775514 5775515 Smlt0162 Smlt0163     FALSE 0.263 66.000 0.000 NA   NA
 5775517 5775518 Smlt0165 Smlt0166     TRUE 0.997 7.000 0.765 1.000 Y NA
 5775518 5775519 Smlt0166 Smlt0167   hemD TRUE 0.936 105.000 0.600 1.000 Y NA
 5775520 5775521 Smlt0168 Smlt0169     TRUE 0.679 33.000 0.035 NA   NA
 5775521 5775522 Smlt0169 Smlt0170     FALSE 0.459 58.000 0.019 NA   NA
 5775522 5775523 Smlt0170 Smlt0171   secB FALSE 0.432 100.000 0.158 NA N NA
 5775523 5775524 Smlt0171 Smlt0172 secB gpsA TRUE 0.568 21.000 0.015 1.000 N NA
 5775527 5775528 Smlt0175 Smlt0176     FALSE 0.029 244.000 0.000 NA   NA
 5775528 5775529 Smlt0176 Smlt0177   arsC TRUE 0.603 -3.000 0.000 NA N NA
 5775529 5775530 Smlt0177 Smlt0178 arsC arsR FALSE 0.070 38.000 0.000 NA N NA
 5775532 5775533 Smlt0180 Smlt0181     FALSE 0.063 175.000 0.000 NA   NA
 5775533 5775534 Smlt0181 Smlt0182     FALSE 0.317 47.000 0.000 NA   NA
 5775534 5775535 Smlt0182 Smlt0183     FALSE 0.040 215.000 0.000 NA   NA
 5775536 5775537 Smlt0184 Smlt0185     FALSE 0.225 97.000 0.000 1.000   NA
 5775537 5775538 Smlt0185 Smlt0186     TRUE 0.599 68.000 0.100 NA   NA
 5775538 5775539 Smlt0186 Smlt0187     FALSE 0.140 124.000 0.000 NA   NA
 5775539 5775540 Smlt0187 Smlt0188     FALSE 0.233 85.000 0.000 NA   NA
 5775541 5775542 Smlt0189 Smlt0190     TRUE 0.979 -3.000 0.186 1.000 N NA
 5775542 5775543 Smlt0190 Smlt0191     FALSE 0.040 291.000 0.014 NA   NA
 5775543 5775544 Smlt0191 Smlt0192     FALSE 0.236 84.000 0.000 NA   NA
 5775544 5775545 Smlt0192 Smlt0193     FALSE 0.029 246.000 0.000 NA   NA
 5775545 5775546 Smlt0193 Smlt0194     FALSE 0.164 113.000 0.000 NA   NA
 5775546 5775547 Smlt0194 Smlt0195     FALSE 0.224 88.000 0.000 NA   NA
 5775549 5775550 Smlt0197 Smlt0198     TRUE 0.808 66.000 0.000 0.050 Y NA
 5775552 5775553 Smlt0200 Smlt0201     FALSE 0.347 70.000 0.007 NA   NA
 5775554 5775555 Smlt0203 Smlt0204     FALSE 0.041 213.000 0.000 NA   NA
 5775555 5775556 Smlt0204 Smlt0205   fabH FALSE 0.459 104.000 0.078 NA   NA
 5775556 5775557 Smlt0205 Smlt0206 fabH dhaA TRUE 0.761 95.000 0.377 1.000   NA
 5775559 5775560 Smlt0208 Smlt0209     TRUE 0.991 -3.000 0.418 1.000 N NA
 5775560 5775561 Smlt0209 Smlt0210     TRUE 0.529 82.000 0.070 NA   NA
 5775563 5775564 Smlt0212 Smlt0213   ubiB TRUE 0.994 -3.000 0.432 1.000   NA
 5775565 5775566 Smlt0214 Smlt0215     TRUE 0.960 5.000 0.167 NA   NA
 5775566 5775567 Smlt0215 Smlt0216     TRUE 0.953 11.000 0.214 NA   NA
 5775567 5775568 Smlt0216 Smlt0217     TRUE 0.980 0.000 0.214 NA   NA
 5775569 5775570 Smlt0218 Smlt0219   truC FALSE 0.070 177.000 0.000 1.000   NA
 5775572 5775573 Smlt0221 Smlt0222     FALSE 0.487 47.000 0.014 1.000   NA
 5775573 5775574 Smlt0222 Smlt0223   dcp FALSE 0.042 112.000 0.000 1.000 N NA
 5775575 5775576 Smlt0224 Smlt0225     TRUE 0.989 4.000 0.600 NA   NA
 5775577 5775578 Smlt0226 Smlt0227     FALSE 0.034 125.000 0.000 1.000 N NA
 5775579 5775580 Smlt0228 Smlt0230     FALSE 0.134 414.000 0.000 0.071 Y NA
 5775581 5775582 Smlt0231 Smlt0232 mls aceA TRUE 0.796 66.000 0.016 1.000 Y NA
 5775582 5775583 Smlt0232 Smlt0233 aceA   FALSE 0.003 418.000 0.000 1.000 N NA
 5775583 5775584 Smlt0233 Smlt0234     TRUE 0.979 18.000 0.062 0.011 Y NA
 5775584 5775585 Smlt0234 Smlt0236     FALSE 0.003 449.000 0.000 1.000 N NA
 5775586 5775587 Smlt0237 Smlt0238     TRUE 0.987 9.000 0.158 1.000 Y NA
 5775587 5775588 Smlt0238 Smlt0239     TRUE 0.991 11.000 0.316 1.000 Y NA
 5775589 5775590 Smlt0240 Smlt0241     FALSE 0.010 205.000 0.000 1.000 N NA
 5775590 5775591 Smlt0241 Smlt0242     TRUE 0.729 44.000 0.158 NA   NA
 5775593 5775594 Smlt0245 Smlt0246     TRUE 0.906 6.000 0.026 NA   NA
 5775594 5775595 Smlt0246 Smlt0247   RRM1 FALSE 0.010 708.000 0.000 NA   NA
 5775595 5775596 Smlt0247 Smlt0248 RRM1   TRUE 0.955 144.000 0.917 0.001 Y NA
 5775596 5775597 Smlt0248 Smlt0249     FALSE 0.029 243.000 0.000 NA   NA
 5775599 5775600 Smlt0251 Smlt0252     FALSE 0.049 56.000 0.000 NA N NA
 5775600 5775601 Smlt0252 Smlt0253     FALSE 0.187 122.000 0.031 1.000 N NA
 5775604 5775605 Smlt0257 Smlt0258 pncA   FALSE 0.352 56.000 0.004 NA   NA
 5775605 5775606 Smlt0258 Smlt0259     FALSE 0.024 276.000 0.000 NA   NA
 5775606 5775607 Smlt0259 Smlt0260     FALSE 0.423 34.000 0.000 NA   NA
 5775607 5775608 Smlt0260 Smlt0261     TRUE 0.857 65.000 0.078 1.000 Y NA
 5775611 5775612 Smlt0264 Smlt0265     TRUE 0.693 15.000 0.019 1.000 N NA
 5775612 5775613 Smlt0265 Smlt0266     TRUE 0.997 -3.000 0.242 1.000 Y NA
 5775613 5775614 Smlt0266 Smlt0267     TRUE 0.999 -3.000 0.627 0.002 Y NA
 5775614 5775615 Smlt0267 Smlt0268   mmsB TRUE 0.999 -3.000 0.687 1.000 Y NA
 5775616 5775617 Smlt0269 Smlt0270 ohr   FALSE 0.042 112.000 0.000 1.000 N NA
 5775618 5775619 Smlt0271 Smlt0272     FALSE 0.306 50.000 0.000 NA   NA
 5775620 5775621 Smlt0273 Smlt0274     TRUE 0.867 43.000 0.429 NA   NA
 5775622 5775623 Smlt0275 Smlt0276 dusA   FALSE 0.040 214.000 0.000 NA   NA
 5775623 5775624 Smlt0276 Smlt0277     TRUE 0.641 74.000 0.143 NA   NA
 5775624 5775625 Smlt0277 Smlt0278     TRUE 0.972 23.000 0.214 1.000 Y NA
 5775626 5775627 Smlt0279 Smlt0280     TRUE 0.877 0.000 0.000 NA   NA
 5775627 5775628 Smlt0280 Smlt0281     TRUE 0.882 9.000 0.020 NA   NA
 5775629 5775630 Smlt0282 Smlt0283 birA   TRUE 0.975 -3.000 0.147 1.000 N NA
 5775630 5775631 Smlt0283 Smlt0284     TRUE 0.820 10.000 0.005 NA   NA
 5775631 10768811 Smlt0284 Smlt_t11     FALSE 0.341 42.000 0.000 NA   NA
 5775632 5775633 Smlt0285 Smlt0286     TRUE 0.995 0.000 1.000 NA   NA
 5775633 5775634 Smlt0286 Smlt0287     FALSE 0.017 348.000 0.000 NA   NA
 5775634 5775635 Smlt0287 Smlt0288     FALSE 0.063 175.000 0.000 NA   NA
 5775635 5775636 Smlt0288 Smlt0289     FALSE 0.252 77.000 0.000 NA   NA
 5775636 5775637 Smlt0289 Smlt0290     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5775637 5775638 Smlt0290 Smlt0291     FALSE 0.015 371.000 0.000 NA   NA
 5775638 5775639 Smlt0291 Smlt0293     FALSE 0.014 410.000 0.000 NA   NA
 5775639 5775640 Smlt0293 Smlt0294     FALSE 0.261 69.000 0.000 NA   NA
 5775640 5775641 Smlt0294 Smlt0295     TRUE 0.584 24.000 0.000 1.000   NA
 5775642 5775643 Smlt0296 Smlt0297 Gp17   FALSE 0.022 287.000 0.000 NA   NA
 5775643 5775644 Smlt0297 Smlt0298     FALSE 0.057 186.000 0.000 NA   NA
 5775645 5775646 Smlt0299 Smlt0300 D GpU TRUE 0.996 -3.000 0.600 NA   NA
 5775646 5775647 Smlt0300 Smlt0301 GpU GpT TRUE 0.964 12.000 0.333 NA   NA
 5775647 5775648 Smlt0301 Smlt0302 GpT   TRUE 0.527 26.000 0.000 NA   NA
 5775648 5775649 Smlt0302 Smlt0303   GpE+E' TRUE 0.976 9.000 0.400 NA   NA
 5775649 5775650 Smlt0303 Smlt0304 GpE+E' FII TRUE 0.882 56.000 0.600 NA   NA
 5775650 5775651 Smlt0304 Smlt0305 FII FI TRUE 0.936 21.000 0.333 NA   NA
 5775651 5775652 Smlt0305 Smlt0306 FI W TRUE 0.954 16.000 0.333 NA   NA
 5775652 5775653 Smlt0306 Smlt0307 W V TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5775653 5775654 Smlt0307 Smlt0308 V   FALSE 0.227 87.000 0.000 NA   NA
 5775654 5775655 Smlt0308 Smlt0309     TRUE 0.762 10.000 0.000 NA   NA
 5775655 5775656 Smlt0309 Smlt0310   I TRUE 0.991 5.000 0.833 NA   NA
 5775656 5775657 Smlt0310 Smlt0311 I J TRUE 0.990 -7.000 0.500 NA   NA
 5775657 5775658 Smlt0311 Smlt0312 J S FALSE 0.227 87.000 0.000 NA   NA
 5775658 5775659 Smlt0312 Smlt0313 S R TRUE 0.983 -3.000 0.130 NA   NA
 5775659 5775660 Smlt0313 Smlt0314 R   TRUE 0.988 -3.000 0.217 NA   NA
 5775660 5775661 Smlt0314 Smlt0315   lys TRUE 0.982 0.000 0.250 NA   NA
 5775661 5775662 Smlt0315 Smlt0316 lys   TRUE 0.978 2.000 0.250 NA   NA
 5775662 5775663 Smlt0316 Smlt0317     TRUE 0.994 -7.000 0.750 NA   NA
 5775663 5775664 Smlt0317 Smlt0318   X TRUE 0.994 3.000 1.000 NA   NA
 5775664 5775665 Smlt0318 Smlt0319 X L TRUE 0.961 0.000 0.068 NA   NA
 5775665 5775666 Smlt0319 Smlt0320 L M TRUE 0.704 105.000 0.136 0.001   NA
 5775666 5775667 Smlt0320 Smlt0321 M N TRUE 0.987 4.000 0.500 1.000   NA
 5775667 5775668 Smlt0321 Smlt0322 N O TRUE 0.875 34.000 0.300 1.000   NA
 5775669 5775670 Smlt0323 Smlt0324 P Q TRUE 0.987 0.000 0.348 NA   NA
 5775670 5775671 Smlt0324 Smlt0325 Q   FALSE 0.215 172.000 0.087 NA   NA
 5775671 5775672 Smlt0325 Smlt0327     FALSE 0.009 771.000 0.000 NA   NA
 5775672 5775673 Smlt0327 Smlt0328     FALSE 0.027 254.000 0.000 NA   NA
 5775674 5775675 Smlt0329 Smlt0330     FALSE 0.025 267.000 0.000 NA   NA
 5775675 5775676 Smlt0330 Smlt0331     TRUE 0.796 -25.000 0.000 NA   NA
 5775676 5775677 Smlt0331 Smlt0332     FALSE 0.016 366.000 0.000 NA   NA
 5775677 5775678 Smlt0332 Smlt0333     FALSE 0.504 28.000 0.000 NA   NA
 5775679 5775680 Smlt0334 Smlt0335     TRUE 0.686 59.000 0.167 NA   NA
 5775681 5775682 Smlt0336 Smlt0337     FALSE 0.246 80.000 0.000 NA   NA
 5775683 5775684 Smlt0339 Smlt0340     FALSE 0.277 60.000 0.000 NA   NA
 5775684 5775685 Smlt0340 Smlt0341   arcA FALSE 0.182 105.000 0.000 NA   NA
 5775685 5775686 Smlt0341 Smlt0342 arcA ecnA FALSE 0.090 161.000 0.000 1.000   NA
 5775686 5775687 Smlt0342 Smlt0343 ecnA   FALSE 0.043 208.000 0.000 NA   NA
 5775689 5775690 Smlt0345 Smlt0346     FALSE 0.116 168.000 0.011 NA   NA
 5775690 5775691 Smlt0346 Smlt0347     FALSE 0.052 250.000 0.014 NA   NA
 5775691 5775692 Smlt0347 Smlt0348     FALSE 0.313 106.000 0.014 1.000   NA
 5775693 5775694 Smlt0349 Smlt0350     FALSE 0.377 38.000 0.000 NA   NA
 5775694 5775695 Smlt0350 Smlt0351     FALSE 0.221 222.000 0.000 1.000 Y NA
 5775695 5775696 Smlt0351 Smlt0352     TRUE 0.980 12.000 0.833 1.000 N NA
 5775696 5775697 Smlt0352 Smlt0353     TRUE 0.829 -13.000 0.000 NA   NA
 5775697 5775698 Smlt0353 Smlt0354     TRUE 0.754 52.000 0.222 NA   NA
 5775699 5775700 Smlt0355 Smlt0357     FALSE 0.016 357.000 0.000 NA   NA
 5775700 5775701 Smlt0357 Smlt0358     TRUE 0.946 -3.000 0.006 NA   NA
 5775702 5775703 Smlt0359 Smlt0360     FALSE 0.014 394.000 0.000 NA   NA
 5775703 5775704 Smlt0360 Smlt0361     TRUE 0.976 14.000 0.820 NA N NA
 5775704 5775705 Smlt0361 Smlt0362     TRUE 0.975 15.000 0.839 NA N NA
 5775705 5775706 Smlt0362 Smlt0363     TRUE 0.804 103.000 0.810 1.000 N NA
 5775707 5775708 Smlt0364 Smlt0365     TRUE 0.993 -3.000 0.357 NA   NA
 5775708 5775709 Smlt0365 Smlt0366     TRUE 0.789 7.000 0.000 NA   NA
 5775709 5775710 Smlt0366 Smlt0367     TRUE 0.998 -3.000 0.270 0.037 Y NA
 5775711 5775712 Smlt0368 Smlt0369     TRUE 0.784 25.000 0.049 NA   NA
 5775712 5775713 Smlt0369 Smlt0370     FALSE 0.140 124.000 0.000 NA   NA
 5775713 5775714 Smlt0370 Smlt0371     FALSE 0.504 28.000 0.000 NA   NA
 5775714 5775715 Smlt0371 Smlt0372   katA TRUE 0.998 -3.000 0.719 0.049   NA
 5775715 5775716 Smlt0372 Smlt0373 katA   FALSE 0.131 137.000 0.000 1.000   NA
 5775716 5775717 Smlt0373 Smlt0374     TRUE 0.923 4.000 0.022 1.000   NA
 5775717 5775718 Smlt0374 Smlt0375     FALSE 0.257 75.000 0.000 NA   NA
 5775718 5775719 Smlt0375 Smlt0376     FALSE 0.262 67.000 0.000 NA   NA
 5775719 5775720 Smlt0376 Smlt0377     TRUE 0.527 26.000 0.000 NA   NA
 5775720 5775721 Smlt0377 Smlt0378     TRUE 0.828 68.000 0.455 NA   NA
 5775721 5775722 Smlt0378 Smlt0379     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 5775722 5775723 Smlt0379 Smlt0380     TRUE 0.989 9.000 0.857 NA   NA
 5775723 5775724 Smlt0380 Smlt0381     TRUE 0.595 102.000 0.192 NA   NA
 5775725 5775726 Smlt0382 Smlt0383     TRUE 0.527 26.000 0.000 NA   NA
 5775726 5775727 Smlt0383 Smlt0384     FALSE 0.251 78.000 0.000 NA   NA
 5775728 5775729 Smlt0385 Smlt0386     FALSE 0.216 92.000 0.000 NA   NA
 5775730 5775731 Smlt0387 Smlt0389     FALSE 0.061 191.000 0.000 1.000   NA
 5775737 5775738 Smlt0395 Smlt0396     FALSE 0.224 88.000 0.000 NA   NA
 5775739 5775740 Smlt0397 Smlt0398   argS TRUE 0.700 22.000 0.062 NA N NA
 5775740 5775741 Smlt0398 Smlt0399 argS radC FALSE 0.089 114.000 0.005 1.000 N NA
 5775741 5775742 Smlt0399 Smlt0400 radC   FALSE 0.072 70.000 0.000 1.000 N NA
 5775743 5775744 Smlt0401 Smlt0402 dfp dut TRUE 0.981 -3.000 0.201 1.000 N NA
 5775744 5775745 Smlt0402 Smlt0403 dut algC TRUE 0.795 13.000 0.039 1.000 N NA
 5775746 5775747 Smlt0404 Smlt0405 kdpE kdpD TRUE 0.976 29.000 0.379 1.000 Y NA
 5775747 5775748 Smlt0405 Smlt0406 kdpD kdpC FALSE 0.439 37.000 0.026 1.000 N NA
 5775748 5775749 Smlt0406 Smlt0407 kdpC kdpB TRUE 1.000 -3.000 0.877 0.001 Y NA
 5775749 5775750 Smlt0407 Smlt0408 kdpB kdpA TRUE 0.991 11.000 0.145 0.001 Y NA
 5775750 5775751 Smlt0408 Smlt0410 kdpA   FALSE 0.024 280.000 0.000 NA   NA
 5775751 5775752 Smlt0410 Smlt0411   pyrE TRUE 0.766 20.000 0.018 NA   NA
 5775753 5775754 Smlt0412 Smlt0413   ampG TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5775754 5775755 Smlt0413 Smlt0414 ampG   FALSE 0.251 78.000 0.000 NA   NA
 5775756 5775757 Smlt0415 Smlt0416     TRUE 0.589 57.000 0.184 NA N NA
 5775758 10768812 Smlt0417 Smlt_r10     FALSE 0.011 521.000 0.000 NA   NA
 10768812 10768813 Smlt_r10 Smlt_t33     FALSE 0.055 189.000 0.000 NA   NA
 10768813 10768814 Smlt_t33 Smlt_r01     FALSE 0.036 223.000 0.000 NA   NA
 10768814 10768815 Smlt_r01 Smlt_r05     FALSE 0.145 122.000 0.000 NA   NA
 10768815 10768816 Smlt_r05 Smlt_r12     FALSE 0.012 492.000 0.000 NA   NA
 10768816 10768817 Smlt_r12 Smlt_t44     FALSE 0.236 84.000 0.000 NA   NA
 10768817 10768818 Smlt_t44 Smlt_t55     FALSE 0.477 30.000 0.000 NA   NA
 10768818 10768819 Smlt_t55 Smlt_r06     FALSE 0.036 223.000 0.000 NA   NA
 10768819 10768820 Smlt_r06 Smlt_r04     FALSE 0.145 122.000 0.000 NA   NA
 5775759 5775760 Smlt0418 Smlt0419     FALSE 0.476 87.000 0.049 NA   NA
 5775761 5775762 Smlt0420 Smlt0421   ctpA TRUE 0.735 109.000 0.408 0.033 N NA
 5775764 5775765 Smlt0423 Smlt0424     FALSE 0.041 113.000 0.000 1.000 N NA
 5775765 5775766 Smlt0424 Smlt0425   nadR TRUE 0.990 -13.000 0.143 NA Y NA
 5775768 5775769 Smlt0427 Smlt0428   ctaC TRUE 0.887 12.000 0.042 NA   NA
 5775769 5775770 Smlt0428 Smlt0429 ctaC ctaD TRUE 0.982 60.000 0.741 0.001 Y NA
 5775770 5775771 Smlt0429 Smlt0430 ctaD   TRUE 0.858 9.000 0.012 NA   NA
 5775771 5775772 Smlt0430 Smlt0431     TRUE 0.953 -3.000 0.010 NA   NA
 5775772 5775773 Smlt0431 Smlt0432     TRUE 0.963 14.000 0.536 1.000 N NA
 5775775 5775776 Smlt0434 Smlt0435     TRUE 0.846 100.000 0.722 NA   NA
 5775776 5775777 Smlt0435 Smlt0436     TRUE 0.959 11.000 0.255 NA   NA
 5775777 5775778 Smlt0436 Smlt0436A     TRUE 0.994 5.000 0.321 1.000 Y NA
 5775778 5775779 Smlt0436A Smlt0438     FALSE 0.099 147.000 0.000 NA   NA
 5775780 5775781 Smlt0439 Smlt0440     FALSE 0.490 29.000 0.000 NA   NA
 5775781 5775782 Smlt0440 Smlt0441   dnaG FALSE 0.504 28.000 0.000 NA   NA
 5775782 5775783 Smlt0441 Smlt0442 dnaG   FALSE 0.375 61.000 0.006 1.000   NA
 5775783 5775784 Smlt0442 Smlt0443     FALSE 0.199 106.000 0.000 1.000   NA
 5775784 5775785 Smlt0443 Smlt0444   rpsU TRUE 0.587 135.000 0.173 0.021   NA
 5775788 5775789 Smlt0447 Smlt0448 folB   FALSE 0.222 92.000 0.023 NA N NA
 5775789 5775790 Smlt0448 Smlt0449   bglX FALSE 0.018 129.000 0.000 NA N NA
 5775790 5775791 Smlt0449 Smlt0450 bglX   FALSE 0.073 166.000 0.000 NA   NA
 5775794 5775795 Smlt0453 Smlt0454     FALSE 0.169 111.000 0.000 NA   NA
 5775795 5775796 Smlt0454 Smlt0455     TRUE 0.966 -3.000 0.024 NA   NA
 5775796 5775797 Smlt0455 Smlt0456     TRUE 0.804 16.000 0.016 NA   NA
 5775797 5775798 Smlt0456 Smlt0458     FALSE 0.003 506.000 0.000 1.000 N NA
 5775798 5775799 Smlt0458 Smlt0459     TRUE 0.952 1.000 0.055 NA   NA
 5775800 5775801 Smlt0460 Smlt0461     FALSE 0.307 52.000 0.023 NA N NA
 5775801 5775802 Smlt0461 Smlt0462     TRUE 0.564 56.000 0.143 1.000 N NA
 5775802 5775803 Smlt0462 Smlt0463     FALSE 0.402 44.000 0.031 1.000 N NA
 5775803 5775804 Smlt0463 Smlt0465     FALSE 0.002 536.000 0.000 1.000 N NA
 5775804 5775805 Smlt0465 Smlt0466     FALSE 0.239 83.000 0.000 NA   NA
 5775805 5775806 Smlt0466 Smlt0467     FALSE 0.020 305.000 0.000 NA   NA
 5775806 5775807 Smlt0467 Smlt0468     FALSE 0.257 85.000 0.000 1.000   NA
 5775807 5775808 Smlt0468 Smlt0469     TRUE 0.614 32.000 0.015 NA   NA
 5775808 5775809 Smlt0469 Smlt0470     FALSE 0.298 167.000 0.160 NA   NA
 5775812 5775813 Smlt0476 Smlt0477     FALSE 0.255 76.000 0.000 NA   NA
 5775813 5775814 Smlt0477 Smlt0478     FALSE 0.435 33.000 0.000 NA   NA
 5775814 5775815 Smlt0478 Smlt0479     TRUE 0.608 20.000 0.000 NA   NA
 5775815 5775816 Smlt0479 Smlt0480     FALSE 0.310 49.000 0.000 NA   NA
 5775816 5775817 Smlt0480 Smlt0481     FALSE 0.088 154.000 0.000 NA   NA
 5775818 5775819 Smlt0482 Smlt0483     TRUE 0.590 87.000 0.132 NA   NA
 5775822 5775823 Smlt0487 Smlt0488     TRUE 0.625 60.000 0.223 NA N NA
 5775824 5775825 Smlt0490 Smlt0490A     FALSE 0.264 65.000 0.000 NA   NA
 5775826 5775827 Smlt0493 Smlt0494     TRUE 0.977 18.000 0.071 0.067 Y NA
 5775828 5775829 Smlt0496 Smlt0497     TRUE 0.991 4.000 0.759 NA   NA
 5775830 5775831 Smlt0498 Smlt0498A     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5775831 5775832 Smlt0498A Smlt0499     FALSE 0.325 45.000 0.000 NA   NA
 5775832 5775833 Smlt0499 Smlt0500     FALSE 0.227 87.000 0.000 NA   NA
 5775833 5775834 Smlt0500 Smlt0501     TRUE 0.575 22.000 0.000 NA   NA
 5775835 5775836 Smlt0502 Smlt0503     FALSE 0.208 95.000 0.000 NA   NA
 5775836 5775837 Smlt0503 Smlt0504     FALSE 0.062 177.000 0.000 NA   NA
 5775838 5775839 Smlt0505 Smlt0506     FALSE 0.377 38.000 0.000 NA   NA
 5775840 5775841 Smlt0507 Smlt0508     TRUE 0.762 10.000 0.000 NA   NA
 5775843 5775844 Smlt0510 Smlt0510A     FALSE 0.026 265.000 0.000 NA   NA
 5775844 5775845 Smlt0510A Smlt0510B     FALSE 0.078 162.000 0.000 NA   NA
 5775845 5775846 Smlt0510B Smlt0512     FALSE 0.108 142.000 0.000 NA   NA
 5775847 5775848 Smlt0513 Smlt0514     FALSE 0.349 41.000 0.000 NA   NA
 5775848 5775849 Smlt0514 Smlt0515     FALSE 0.271 62.000 0.000 NA   NA
 5775851 5775852 Smlt0517 Smlt0518     FALSE 0.004 358.000 0.000 1.000 N NA
 5775852 5775853 Smlt0518 Smlt0519     FALSE 0.085 156.000 0.000 NA   NA
 5775855 5775856 Smlt0521 Smlt0522     FALSE 0.039 226.000 0.000 1.000   NA
 5775857 5775858 Smlt0523 Smlt0524     TRUE 0.603 -3.000 0.000 NA N NA
 5775860 5775861 Smlt0526 Smlt0527     FALSE 0.019 318.000 0.000 NA   NA
 5775861 5775862 Smlt0527 Smlt0528     TRUE 0.714 13.000 0.000 NA   NA
 5775864 5775865 Smlt0531 Smlt0532     FALSE 0.261 69.000 0.000 NA   NA
 5775865 5775866 Smlt0532 Smlt0533     TRUE 0.526 58.000 0.037 NA   NA
 5775866 5775867 Smlt0533 Smlt0534     TRUE 0.767 25.000 0.037 NA   NA
 5775867 5775868 Smlt0534 Smlt0535     FALSE 0.320 46.000 0.000 NA   NA
 5775868 5775869 Smlt0535 Smlt0537     FALSE 0.057 186.000 0.000 NA   NA
 5775869 5775870 Smlt0537 Smlt0538     TRUE 0.855 -9.000 0.000 NA   NA
 5775870 5775871 Smlt0538 Smlt0539     FALSE 0.200 98.000 0.000 NA   NA
 5775871 5775872 Smlt0539 Smlt0540     FALSE 0.096 149.000 0.000 NA   NA
 5775872 5775873 Smlt0540 Smlt0541     FALSE 0.015 381.000 0.000 NA   NA
 5775873 5775874 Smlt0541 Smlt0542     FALSE 0.026 282.000 0.000 1.000   NA
 5775874 5775875 Smlt0542 Smlt0543     TRUE 0.856 44.000 0.000 0.036 Y NA
 5775875 5775876 Smlt0543 Smlt0544     TRUE 0.744 35.000 0.100 NA   NA
 5775880 5775881 Smlt0548 Smlt0549     TRUE 0.956 30.000 0.188 NA Y NA
 5775885 5775886 Smlt0553 Smlt0554     TRUE 0.683 32.000 0.032 NA   NA
 5775886 5775887 Smlt0554 Smlt0555     FALSE 0.174 118.000 0.000 1.000   NA
 5775889 5775890 Smlt0557 Smlt0558     FALSE 0.052 192.000 0.000 NA   NA
 5775891 5775892 Smlt0559 Smlt0560     TRUE 0.702 14.000 0.000 NA   NA
 5775892 5775893 Smlt0560 Smlt0561   motB TRUE 0.724 128.000 0.571 NA   NA
 5775893 5775894 Smlt0561 Smlt0562 motB motA TRUE 0.997 4.000 0.571 1.000 Y NA
 5775894 5775895 Smlt0562 Smlt0563 motA   FALSE 0.058 91.000 0.000 1.000 N NA
 5775898 5775899 Smlt0567 Smlt0568     TRUE 0.912 -21.000 0.099 1.000 N NA
 5775901 5775902 Smlt0570 Smlt0571     TRUE 0.882 44.000 0.500 NA   NA
 5775904 5775905 Smlt0573 Smlt0574   rsuA TRUE 0.995 -3.000 0.088 1.000 Y NA
 5775905 5775906 Smlt0574 Smlt0575 rsuA   TRUE 0.977 -3.000 0.053 1.000   NA
 5775907 5775908 Smlt0576 Smlt0577 fabB fabA TRUE 0.997 0.000 0.451 1.000 Y NA
 5775910 5775911 Smlt0580 Smlt0581     FALSE 0.127 139.000 0.000 1.000   NA
 5775912 5775913 Smlt0582 Smlt0583     TRUE 0.933 -3.000 0.000 1.000   NA
 5775913 5775914 Smlt0583 Smlt0584   gph FALSE 0.460 66.000 0.000 0.064   NA
 5775917 5775918 Smlt0587 Smlt0588     TRUE 0.952 -3.000 0.009 NA   NA
 5775920 5775921 Smlt0590 Smlt0591     FALSE 0.007 241.000 0.000 1.000 N NA
 5775921 5775922 Smlt0591 Smlt0592     TRUE 0.978 15.000 0.130 1.000 Y NA
 5775922 5775923 Smlt0592 Smlt0593     TRUE 0.989 3.000 0.080 1.000 Y NA
 5775924 5775925 Smlt0594 Smlt0595     TRUE 0.999 -3.000 0.566 1.000 Y NA
 5775926 5775927 Smlt0596 Smlt0597     TRUE 0.931 18.000 0.000 1.000 Y NA
 5775929 5775930 Smlt0599 Smlt0600     FALSE 0.242 82.000 0.000 NA   NA
 5775930 5775931 Smlt0600 Smlt0601     FALSE 0.316 117.000 0.028 NA   NA
 5775932 5775933 Smlt0602 Smlt0603     FALSE 0.324 54.000 0.000 1.000   NA
 5775935 5775936 Smlt0608 Smlt0609     TRUE 0.956 15.000 0.495 1.000 N NA
 5775937 5775938 Smlt0610 Smlt0611     TRUE 0.991 -19.000 0.748 1.000   NA
 5775938 5775939 Smlt0611 Smlt0612   pilU FALSE 0.142 131.000 0.000 1.000   NA
 5775940 5775941 Smlt0613 Smlt0614     TRUE 0.991 6.000 0.857 NA   NA
 5775941 5775942 Smlt0614 Smlt0615     FALSE 0.019 325.000 0.000 NA   NA
 5775942 5775943 Smlt0615 Smlt0616   cbsB FALSE 0.074 301.000 0.081 NA   NA
 5775943 5775944 Smlt0616 Smlt0617 cbsB CYS1 TRUE 0.844 124.000 0.133 0.013 Y NA
 5775944 5775945 Smlt0617 Smlt0618 CYS1 wzm TRUE 0.728 6.000 0.009 1.000 N NA
 5775945 5775946 Smlt0618 Smlt0619 wzm wzt TRUE 0.969 -10.000 0.169 0.098 N NA
 5775946 5775947 Smlt0619 Smlt0620 wzt cat TRUE 0.933 -3.000 0.000 1.000   NA
 5775947 5775948 Smlt0620 Smlt0621 cat wxocD FALSE 0.440 35.000 0.000 1.000   NA
 5775948 5775949 Smlt0621 Smlt0622 wxocD wxocA FALSE 0.098 148.000 0.000 NA   NA
 5775949 5775950 Smlt0622 Smlt0623 wxocA wxocBC TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA   NA
 5775950 5775951 Smlt0623 Smlt0624 wxocBC   FALSE 0.075 164.000 0.000 NA   NA
 5775954 5775955 Smlt0627 Smlt0628     FALSE 0.387 115.000 0.000 0.001   NA
 5775955 5775956 Smlt0628 Smlt0629     TRUE 0.994 -3.000 0.429 1.000   NA
 5775956 5775957 Smlt0629 Smlt0630     TRUE 0.903 30.000 0.500 1.000 N NA
 5775957 5775958 Smlt0630 Smlt0631     TRUE 0.522 29.000 0.000 1.000   NA
 5775958 5775959 Smlt0631 Smlt0632     TRUE 0.591 38.000 0.000 0.063   NA
 5775959 5775960 Smlt0632 Smlt0633     TRUE 0.986 3.000 0.250 0.033   NA
 5775960 5775961 Smlt0633 Smlt0634     TRUE 0.980 -3.000 0.192 1.000 N NA
 5775961 5775962 Smlt0634 Smlt0635     FALSE 0.067 170.000 0.000 NA   NA
 5775962 5775963 Smlt0635 Smlt0636     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5775963 5775964 Smlt0636 Smlt0637     FALSE 0.269 11.000 0.000 NA N NA
 5775964 5775965 Smlt0637 Smlt0638     TRUE 0.950 -3.000 0.049 NA N NA
 5775965 5775966 Smlt0638 Smlt0639     TRUE 0.995 -3.000 0.098 NA Y NA
 5775966 5775967 Smlt0639 Smlt0640     FALSE 0.035 87.000 0.000 NA N NA
 5775967 5775968 Smlt0640 Smlt0641   arnC FALSE 0.448 -7.000 0.000 NA N NA
 5775968 5775969 Smlt0641 Smlt0642 arnC   FALSE 0.216 92.000 0.000 NA   NA
 5775969 5775970 Smlt0642 Smlt0644     FALSE 0.182 105.000 0.000 NA   NA
 5775970 5775971 Smlt0644 Smlt0645   etfA FALSE 0.003 402.000 0.000 1.000 N NA
 5775971 5775972 Smlt0645 Smlt0646 etfA etfB TRUE 0.998 0.000 0.316 0.012 Y NA
 5775973 5775974 Smlt0647 Smlt0648 rfbB rmlA TRUE 0.988 15.000 0.143 0.003 Y NA
 5775974 5775975 Smlt0648 Smlt0649 rmlA rmlC TRUE 0.996 -3.000 0.163 1.000 Y NA
 5775975 5775976 Smlt0649 Smlt0650 rmlC rfbD TRUE 0.995 -3.000 0.063 1.000 Y NA
 5775976 5775977 Smlt0650 Smlt0651 rfbD   FALSE 0.259 73.000 0.000 NA   NA
 5775978 5775979 Smlt0652 Smlt0653 manA manB TRUE 0.965 12.000 0.500 1.000 N NA
 5775979 5775980 Smlt0653 Smlt0654 manB   FALSE 0.053 97.000 0.000 1.000 N NA
 5775981 5775982 Smlt0655 Smlt0656 lpsI lpsJ TRUE 0.994 2.000 0.070 0.001 Y NA
 5775985 5775986 Smlt0659 Smlt0660     TRUE 0.988 -3.000 0.201 NA   NA
 5775986 5775987 Smlt0660 Smlt0661     TRUE 0.993 4.000 0.275 NA Y NA
 5775987 5775988 Smlt0661 Smlt0662     TRUE 0.996 2.000 0.472 NA Y NA
 5775990 5775991 Smlt0664 Smlt0665   proS FALSE 0.052 223.000 0.004 1.000   NA
 5775991 5775992 Smlt0665 Smlt0666 proS   FALSE 0.005 288.000 0.000 1.000 N NA
 5775992 5775993 Smlt0666 Smlt0668     FALSE 0.010 672.000 0.000 NA   NA
 5775994 5775995 Smlt0669 Smlt0670     TRUE 0.933 -3.000 0.000 1.000   NA
 5775995 5775996 Smlt0670 Smlt0671   rimI TRUE 0.933 -3.000 0.000 1.000   NA
 5775997 5775998 Smlt0672 Smlt0673   valS FALSE 0.094 151.000 0.000 NA   NA
 5775998 5775999 Smlt0673 Smlt0674 valS   FALSE 0.451 73.000 0.089 1.000 N NA
 5775999 5776000 Smlt0674 Smlt0675   pepA TRUE 0.755 83.000 0.494 1.000 N NA
 5776001 5776002 Smlt0676 Smlt0677     TRUE 0.997 -3.000 0.631 0.062   NA
 5776002 5776003 Smlt0677 Smlt0678     FALSE 0.293 55.000 0.000 NA   NA
 5776005 5776006 Smlt0680 Smlt0681   dsbC FALSE 0.103 101.000 0.004 1.000 N NA
 5776008 5776009 Smlt0684 Smlt0685 purL   FALSE 0.016 395.000 0.000 1.000   NA
 5776009 5776010 Smlt0685 Smlt0686     FALSE 0.093 158.000 0.000 1.000   NA
 5776010 5776011 Smlt0686 Smlt0687   xpsE FALSE 0.028 138.000 0.000 1.000 N NA
 5776011 5776012 Smlt0687 Smlt0688 xpsE xpsF TRUE 0.984 25.000 0.255 0.005 Y NA
 5776012 5776013 Smlt0688 Smlt0689 xpsF xpsG TRUE 0.937 50.000 0.125 0.005 Y NA
 5776013 5776014 Smlt0689 Smlt0690 xpsG xpsH TRUE 0.995 10.000 0.348 0.005 Y NA
 5776014 5776015 Smlt0690 Smlt0691 xpsH xpsI TRUE 0.996 -3.000 0.130 NA Y NA
 5776015 5776016 Smlt0691 Smlt0692 xpsI xpsJ TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776016 5776017 Smlt0692 Smlt0693 xpsJ pefK TRUE 0.991 -3.000 0.308 NA   NA
 5776017 5776018 Smlt0693 Smlt0694 pefK pefL TRUE 0.998 -3.000 0.385 NA Y NA
 5776018 5776019 Smlt0694 Smlt0695 pefL xpsM TRUE 0.980 -19.000 0.364 NA   NA
 5776019 5776020 Smlt0695 Smlt0696 xpsM xpsN TRUE 0.992 -10.000 0.700 NA   NA
 5776020 5776021 Smlt0696 Smlt0697 xpsN xpsD TRUE 0.970 10.000 0.333 NA   NA
 5776022 5776023 Smlt0698 Smlt0700     FALSE 0.032 234.000 0.000 NA   NA
 5776024 5776025 Smlt0701 Smlt0702     TRUE 0.967 -3.000 0.026 NA   NA
 5776025 5776026 Smlt0702 Smlt0703   pncB FALSE 0.264 102.000 0.007 NA   NA
 5776028 5776029 Smlt0706 Smlt0707 smf-1   TRUE 0.692 86.000 0.000 1.000 Y NA
 5776029 5776030 Smlt0707 Smlt0708   mrkC TRUE 0.963 72.000 0.667 1.000 Y NA
 5776030 5776031 Smlt0708 Smlt0709 mrkC   TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 5776031 5776032 Smlt0709 Smlt0710   wecB FALSE 0.006 268.000 0.000 1.000 N NA
 5776032 5776033 Smlt0710 Smlt0711 wecB   TRUE 0.994 -3.000 0.429 NA   NA
 5776033 5776034 Smlt0711 Smlt0712   nfrB TRUE 0.953 7.000 0.159 NA   NA
 5776034 5776035 Smlt0712 Smlt0713 nfrB   TRUE 0.933 -3.000 0.000 1.000   NA
 5776036 5776037 Smlt0714 Smlt0715     FALSE 0.034 227.000 0.000 NA   NA
 5776037 5776038 Smlt0715 Smlt0716     FALSE 0.211 102.000 0.000 1.000   NA
 5776039 5776040 Smlt0717 Smlt0718   glyA FALSE 0.261 188.000 0.182 NA   NA
 5776040 5776041 Smlt0718 Smlt0719 glyA   FALSE 0.137 125.000 0.000 NA   NA
 5776041 5776042 Smlt0719 Smlt0720     FALSE 0.255 76.000 0.000 NA   NA
 5776042 5776043 Smlt0720 Smlt0721     FALSE 0.504 28.000 0.000 NA   NA
 5776043 5776044 Smlt0721 Smlt0722     FALSE 0.095 150.000 0.000 NA   NA
 5776044 5776045 Smlt0722 Smlt0723     FALSE 0.248 179.000 0.277 NA N NA
 5776046 5776047 Smlt0724 Smlt0725     FALSE 0.206 96.000 0.000 NA   NA
 5776047 5776048 Smlt0725 Smlt0726     FALSE 0.091 153.000 0.000 NA   NA
 5776049 5776050 Smlt0727 Smlt0728 ribE ribB TRUE 0.992 -3.000 0.010 1.000 Y NA
 5776050 5776051 Smlt0728 Smlt0729 ribB ribH TRUE 0.783 208.000 0.417 0.002 Y NA
 5776051 5776052 Smlt0729 Smlt0730 ribH nusB TRUE 0.900 -3.000 0.011 1.000 N NA
 5776052 5776053 Smlt0730 Smlt0731 nusB   FALSE 0.182 204.000 0.225 1.000 N NA
 5776054 5776055 Smlt0732 Smlt0733     TRUE 0.752 57.000 0.000 1.000 Y NA
 5776056 5776057 Smlt0734 Smlt0735     TRUE 0.509 30.000 0.000 1.000   NA
 5776057 5776058 Smlt0735 Smlt0736     TRUE 0.933 -3.000 0.000 1.000   NA
 5776058 5776059 Smlt0736 Smlt0737     FALSE 0.028 272.000 0.000 1.000   NA
 5776060 5776061 Smlt0738 Smlt0739 glcD   TRUE 0.983 -3.000 0.130 NA   NA
 5776061 5776062 Smlt0739 Smlt0741     FALSE 0.214 111.000 0.004 NA   NA
 5776062 5776063 Smlt0741 Smlt0742     TRUE 0.970 -10.000 0.172 NA   NA
 5776065 5776066 Smlt0745 Smlt0746     FALSE 0.190 102.000 0.000 NA   NA
 5776067 5776068 Smlt0747 Smlt0748     TRUE 0.977 15.000 0.635 NA   NA
 5776068 5776069 Smlt0748 Smlt0749   ftsL TRUE 0.983 -3.000 0.227 1.000 N NA
 5776069 5776070 Smlt0749 Smlt0750 ftsL ftsI TRUE 0.936 -3.000 0.024 1.000 N NA
 5776070 5776071 Smlt0750 Smlt0751 ftsI murE TRUE 0.992 -3.000 0.012 1.000 Y NA
 5776071 5776072 Smlt0751 Smlt0752 murE murF TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.003 Y NA
 5776072 5776073 Smlt0752 Smlt0753 murF mraY TRUE 0.997 -10.000 0.309 0.004 Y NA
 5776073 5776074 Smlt0753 Smlt0754 mraY ftsW TRUE 0.940 2.000 0.018 0.004 N NA
 5776074 5776075 Smlt0754 Smlt0755 ftsW murG TRUE 0.994 -3.000 0.647 1.000 N NA
 5776075 5776076 Smlt0755 Smlt0756 murG murC TRUE 0.946 41.000 0.283 1.000 Y NA
 5776076 5776077 Smlt0756 Smlt0757 murC ddlB TRUE 0.998 -3.000 0.153 0.004 Y NA
 5776077 5776078 Smlt0757 Smlt0758 ddlB ftsQ TRUE 0.998 -3.000 0.372 NA Y NA
 5776078 5776079 Smlt0758 Smlt0759 ftsQ ftsA TRUE 0.989 -3.000 0.389 NA N NA
 5776079 5776080 Smlt0759 Smlt0760 ftsA ftsZ TRUE 0.784 170.000 0.460 1.000 Y NA
 5776080 5776081 Smlt0760 Smlt0761 ftsZ lpxC FALSE 0.142 193.000 0.134 1.000 N NA
 5776083 5776084 Smlt0763 Smlt0764   secA FALSE 0.046 279.000 0.068 1.000 N NA
 5776084 5776085 Smlt0764 Smlt0765 secA   FALSE 0.109 103.000 0.006 1.000 N NA
 5776086 5776087 Smlt0766 Smlt0767   metF FALSE 0.501 41.000 0.014 NA   NA
 5776088 5776089 Smlt0768 Smlt0769     TRUE 0.655 19.000 0.000 1.000   NA
 5776089 5776090 Smlt0769 Smlt0770     TRUE 0.969 -3.000 0.000 0.035   NA
 5776093 5776094 Smlt0773 Smlt0774     TRUE 0.877 0.000 0.000 NA   NA
 5776094 5776095 Smlt0774 Smlt0775   sahH FALSE 0.053 202.000 0.000 1.000   NA
 5776096 5776097 Smlt0777 Smlt0778   ppc FALSE 0.139 173.000 0.089 1.000 N NA
 5776098 5776099 Smlt0779 Smlt0780   metK FALSE 0.011 161.000 0.000 NA N NA
 5776100 5776101 Smlt0781 Smlt0782     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776101 5776102 Smlt0782 Smlt0783     FALSE 0.094 151.000 0.000 NA   NA
 5776103 5776104 Smlt0784 Smlt0785     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776104 5776105 Smlt0785 Smlt0786     FALSE 0.113 139.000 0.000 NA   NA
 5776105 5776106 Smlt0786 Smlt0787   dusB FALSE 0.363 58.000 0.002 1.000   NA
 5776106 5776107 Smlt0787 Smlt0788 dusB   FALSE 0.098 148.000 0.000 NA   NA
 5776107 5776108 Smlt0788 Smlt0789     FALSE 0.171 110.000 0.000 NA   NA
 5776110 5776111 Smlt0791 Smlt0792 rbsK   TRUE 0.584 26.000 0.027 1.000 N NA
 5776112 5776113 Smlt0793 Smlt0794     FALSE 0.044 315.000 0.023 NA   NA
 5776113 5776114 Smlt0794 Smlt0795   huvA FALSE 0.147 191.000 0.046 NA   NA
 5776114 5776115 Smlt0795 Smlt0796 huvA   TRUE 0.959 5.000 0.160 NA   NA
 5776115 5776116 Smlt0796 Smlt0797     TRUE 0.875 11.000 0.024 NA   NA
 5776117 5776118 Smlt0798 Smlt0799     TRUE 0.992 -3.000 0.535 NA N NA
 5776119 5776120 Smlt0800 Smlt0801     FALSE 0.276 55.000 0.016 1.000 N NA
 5776120 5776121 Smlt0801 Smlt0802     TRUE 0.834 157.000 0.500 1.000 Y NA
 5776123 5776124 Smlt0804 Smlt0805 dgkA   TRUE 0.522 34.000 0.037 1.000 N NA
 5776124 5776125 Smlt0805 Smlt0806     FALSE 0.004 226.000 0.000 NA N NA
 5776125 5776126 Smlt0806 Smlt0807     FALSE 0.064 174.000 0.000 NA   NA
 5776126 5776127 Smlt0807 Smlt0808     TRUE 0.989 -3.000 0.111 0.065   NA
 5776127 5776128 Smlt0808 Smlt0809   lemA FALSE 0.012 463.000 0.000 NA   NA
 5776128 5776129 Smlt0809 Smlt0810 lemA   TRUE 0.827 4.000 0.000 NA   NA
 5776129 5776130 Smlt0810 Smlt0811     TRUE 0.933 0.000 0.015 NA   NA
 5776130 5776131 Smlt0811 Smlt0812   lgt FALSE 0.373 52.000 0.005 NA   NA
 5776131 5776132 Smlt0812 Smlt0813 lgt thyA TRUE 0.977 -3.000 0.164 1.000 N NA
 5776132 5776133 Smlt0813 Smlt0814 thyA folA TRUE 0.923 6.000 0.134 1.000 N NA
 5776134 5776135 Smlt0815 Smlt0816   apaH TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776135 5776136 Smlt0816 Smlt0817 apaH   TRUE 0.944 16.000 0.267 NA   NA
 5776136 5776137 Smlt0817 Smlt0818   ksgA TRUE 0.824 14.000 0.078 NA N NA
 5776137 5776138 Smlt0818 Smlt0819 ksgA pdxA TRUE 0.980 -3.000 0.197 1.000 N NA
 5776138 5776139 Smlt0819 Smlt0820 pdxA surA TRUE 0.982 4.000 0.561 1.000 N NA
 5776139 5776140 Smlt0820 Smlt0821 surA ostA TRUE 0.928 -3.000 0.020 1.000 N NA
 5776140 5776141 Smlt0821 Smlt0822 ostA   TRUE 0.663 90.000 0.357 NA N NA
 5776141 5776142 Smlt0822 Smlt0823     TRUE 0.853 10.000 0.013 NA   NA
 5776142 5776143 Smlt0823 Smlt0824     TRUE 0.860 9.000 0.013 NA   NA
 5776144 5776145 Smlt0825 Smlt0826 ubiH ubiF TRUE 0.999 -3.000 0.474 0.001 Y NA
 5776146 5776147 Smlt0827 Smlt0828     FALSE 0.301 52.000 0.000 NA   NA
 5776147 5776148 Smlt0828 Smlt0829     TRUE 0.922 -16.000 0.032 NA   NA
 5776148 5776149 Smlt0829 Smlt0830     FALSE 0.200 98.000 0.000 NA   NA
 5776149 5776150 Smlt0830 Smlt0831     TRUE 0.860 1.000 0.000 NA   NA
 5776150 5776151 Smlt0831 Smlt0832   glnS FALSE 0.331 44.000 0.000 NA   NA
 5776152 5776153 Smlt0833 Smlt0834   msrA TRUE 0.825 10.000 0.006 NA   NA
 5776154 5776155 Smlt0835 Smlt0836     TRUE 0.989 -3.000 0.111 0.065   NA
 5776155 5776156 Smlt0836 Smlt0837   talB FALSE 0.081 167.000 0.000 1.000   NA
 5776156 5776157 Smlt0837 Smlt0838 talB rnk FALSE 0.353 51.000 0.027 1.000 N NA
 5776157 5776158 Smlt0838 Smlt0839 rnk oxyR TRUE 0.690 124.000 0.008 0.099 Y NA
 5776158 5776159 Smlt0839 Smlt0840 oxyR ahpF FALSE 0.320 86.000 0.041 1.000 N NA
 5776159 5776160 Smlt0840 Smlt0841 ahpF ahpC TRUE 0.685 224.000 0.551 1.000 Y NA
 5776161 5776162 Smlt0842 Smlt0843 hemK pip FALSE 0.467 49.000 0.012 1.000   NA
 5776165 5776166 Smlt0846 Smlt0847   nudF TRUE 0.972 -7.000 0.135 1.000   NA
 5776166 5776167 Smlt0847 Smlt0848 nudF   TRUE 0.978 -3.000 0.068 1.000   NA
 5776167 5776168 Smlt0848 Smlt0849     TRUE 0.913 -3.000 0.014 1.000 N NA
 5776169 5776170 Smlt0851 Smlt0852   pntAa FALSE 0.447 52.000 0.014 NA   NA
 5776171 5776172 Smlt0853 Smlt0854     TRUE 0.988 4.000 0.556 NA   NA
 5776172 5776173 Smlt0854 Smlt0855     TRUE 0.976 -3.000 0.065 NA   NA
 5776174 5776175 Smlt0856 Smlt0857 pntAb pntB TRUE 0.996 -3.000 0.321 0.001   NA
 5776177 5776178 Smlt0859 Smlt0860   ilvE FALSE 0.441 60.000 0.017 NA   NA
 5776178 5776179 Smlt0860 Smlt0861 ilvE StmPr1 FALSE 0.003 451.000 0.000 1.000 N NA
 5776180 5776181 Smlt0862 Smlt0863     FALSE 0.408 80.000 0.018 NA   NA
 5776181 5776182 Smlt0863 Smlt0864     TRUE 0.996 -3.000 0.657 NA   NA
 5776183 5776184 Smlt0865 Smlt0866     TRUE 0.967 -3.000 0.020 1.000   NA
 5776185 5776186 Smlt0868 Smlt0869     FALSE 0.050 205.000 0.000 1.000   NA
 5776186 5776187 Smlt0869 Smlt0870   prfA TRUE 0.646 6.000 0.004 1.000 N NA
 5776187 5776188 Smlt0870 Smlt0871 prfA hemA TRUE 0.962 -22.000 0.171 0.036 N NA
 5776189 5776190 Smlt0872 Smlt0873     TRUE 0.969 -3.000 0.024 1.000   NA
 5776190 5776191 Smlt0873 Smlt0874   ipk TRUE 0.933 -21.000 0.157 1.000 N NA
 5776191 10768821 Smlt0874 Smlt_t66 ipk   TRUE 0.714 13.000 0.000 NA   NA
 10768821 5776192 Smlt_t66 Smlt0875   prs FALSE 0.111 140.000 0.000 NA   NA
 5776192 5776193 Smlt0875 Smlt0876 prs rplY FALSE 0.370 110.000 0.122 1.000 N NA
 5776193 5776194 Smlt0876 Smlt0877 rplY pth TRUE 0.974 49.000 0.496 0.020 Y NA
 5776194 5776195 Smlt0877 Smlt0878 pth   FALSE 0.392 265.000 0.184 1.000 Y NA
 5776196 5776197 Smlt0880 Smlt0881     FALSE 0.042 111.000 0.000 1.000 N NA
 5776197 5776198 Smlt0881 Smlt0882     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.029 Y NA
 5776198 5776199 Smlt0882 Smlt0883     TRUE 0.666 124.000 0.000 0.029 Y NA
 5776199 5776200 Smlt0883 Smlt0884     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.029 Y NA
 5776200 5776201 Smlt0884 Smlt0885     FALSE 0.086 163.000 0.000 1.000   NA
 5776202 5776203 Smlt0886 Smlt0887     FALSE 0.089 149.000 0.015 1.000 N NA
 5776203 10768822 Smlt0887 Smlt_t72     FALSE 0.113 139.000 0.000 NA   NA
 10768822 10768823 Smlt_t72 Smlt_t74     FALSE 0.098 148.000 0.000 NA   NA
 10768823 5776204 Smlt_t74 Smlt0890   tufB FALSE 0.349 41.000 0.000 NA   NA
 5776204 10768824 Smlt0890 Smlt_t01 tufB   FALSE 0.182 105.000 0.000 NA   NA
 10768824 5776205 Smlt_t01 Smlt0891     FALSE 0.310 49.000 0.000 NA   NA
 5776205 5776206 Smlt0891 Smlt0892   nusG TRUE 0.982 11.000 0.843 1.000 N NA
 5776206 5776207 Smlt0892 Smlt0894 nusG rplK FALSE 0.252 287.000 0.681 1.000 N NA
 5776207 5776208 Smlt0894 Smlt0895 rplK rplA TRUE 0.998 5.000 0.838 0.017 Y NA
 5776208 5776209 Smlt0895 Smlt0896 rplA rplJ FALSE 0.338 384.000 0.302 1.000 Y NA
 5776209 5776210 Smlt0896 Smlt0897 rplJ rplL TRUE 0.973 64.000 0.884 1.000 Y NA
 5776210 5776211 Smlt0897 Smlt0898 rplL rpoB FALSE 0.116 352.000 0.223 1.000   NA
 5776211 5776212 Smlt0898 Smlt0899 rpoB rpoC TRUE 0.937 90.000 0.851 0.001   NA
 5776212 5776213 Smlt0899 Smlt0901 rpoC rpsL FALSE 0.049 342.000 0.122 1.000 N NA
 5776213 5776214 Smlt0901 Smlt0902 rpsL rpsG TRUE 0.997 13.000 0.620 0.003 Y NA
 5776214 5776215 Smlt0902 Smlt0903 rpsG fusA TRUE 0.885 142.000 0.579 1.000 Y NA
 5776215 5776216 Smlt0903 Smlt0904 fusA tuf TRUE 0.972 53.000 0.400 0.001 Y NA
 5776216 5776217 Smlt0904 Smlt0905 tuf rpsJ FALSE 0.403 333.000 0.318 1.000 Y NA
 5776217 5776218 Smlt0905 Smlt0906 rpsJ rplC TRUE 0.993 12.000 0.307 0.017 Y NA
 5776218 5776219 Smlt0906 Smlt0907 rplC rplD TRUE 0.995 13.000 0.486 0.013 Y NA
 5776219 5776220 Smlt0907 Smlt0908 rplD rplW TRUE 0.999 -3.000 0.513 0.013 Y NA
 5776220 5776221 Smlt0908 Smlt0909 rplW rplB TRUE 0.998 11.000 0.849 0.017 Y NA
 5776221 5776222 Smlt0909 Smlt0910 rplB rpsS TRUE 0.998 7.000 0.820 0.017 Y NA
 5776222 5776223 Smlt0910 Smlt0911 rpsS rplV TRUE 0.998 7.000 0.769 0.017 Y NA
 5776223 5776224 Smlt0911 Smlt0912 rplV rpsC TRUE 0.995 19.000 0.719 0.017 Y NA
 5776224 5776225 Smlt0912 Smlt0913 rpsC rplP TRUE 0.998 6.000 0.828 0.017 Y NA
 5776225 5776226 Smlt0913 Smlt0914 rplP rpmC TRUE 0.999 0.000 0.802 0.013 Y NA
 5776226 5776227 Smlt0914 Smlt0915 rpmC rpsQ TRUE 0.997 12.000 0.828 0.013 Y NA
 5776227 5776228 Smlt0915 Smlt0916 rpsQ rplN TRUE 0.997 12.000 0.791 0.017 Y NA
 5776228 5776229 Smlt0916 Smlt0917 rplN rplX TRUE 0.996 17.000 0.810 0.017 Y NA
 5776229 5776230 Smlt0917 Smlt0918 rplX rplE TRUE 0.997 12.000 0.758 0.013 Y NA
 5776230 5776231 Smlt0918 Smlt0919 rplE rpsN TRUE 0.989 19.000 0.309 0.013 Y NA
 5776231 5776232 Smlt0919 Smlt0920 rpsN rpsH TRUE 0.596 259.000 0.295 0.013 Y NA
 5776232 5776233 Smlt0920 Smlt0921 rpsH rplF TRUE 0.996 19.000 0.808 0.013 Y NA
 5776233 5776234 Smlt0921 Smlt0922 rplF rplR TRUE 0.977 87.000 0.815 0.013 Y NA
 5776234 5776235 Smlt0922 Smlt0923 rplR rpsE TRUE 0.923 162.000 0.814 0.017 Y NA
 5776235 5776236 Smlt0923 Smlt0924 rpsE rpmD TRUE 0.999 -7.000 0.789 0.017 Y NA
 5776236 5776237 Smlt0924 Smlt0925 rpmD rplO TRUE 0.998 7.000 0.653 0.002 Y NA
 5776237 5776238 Smlt0925 Smlt0926 rplO secY TRUE 0.983 8.000 0.730 1.000 N NA
 5776238 5776239 Smlt0926 Smlt0928 secY rpsM FALSE 0.013 348.000 0.011 1.000 N NA
 5776239 5776240 Smlt0928 Smlt0929 rpsM rpsK TRUE 0.997 12.000 0.810 0.013 Y NA
 5776240 5776241 Smlt0929 Smlt0930 rpsK rpsD TRUE 0.995 16.000 0.509 0.017 Y NA
 5776241 5776242 Smlt0930 Smlt0931 rpsD rpoA TRUE 0.822 56.000 0.549 1.000 N NA
 5776242 5776243 Smlt0931 Smlt0933 rpoA rplQ TRUE 0.520 192.000 0.873 1.000 N NA
 5776243 5776244 Smlt0933 Smlt0935 rplQ   FALSE 0.007 242.000 0.000 1.000 N NA
 5776246 5776247 Smlt0937 Smlt0939 aroH   FALSE 0.007 888.000 0.015 NA N NA
 5776248 5776249 Smlt0940 Smlt0941     TRUE 0.608 42.000 0.045 NA   NA
 5776249 5776250 Smlt0941 Smlt0942   typA TRUE 0.794 12.000 0.006 NA   NA
 5776251 5776252 Smlt0943 Smlt0944 ppi mdh FALSE 0.154 119.000 0.018 1.000 N NA
 5776252 5776253 Smlt0944 Smlt0945 mdh rluA TRUE 0.609 0.000 0.000 1.000 N NA
 5776253 5776254 Smlt0945 Smlt0947 rluA prpE FALSE 0.002 774.000 0.000 1.000 N NA
 5776254 5776255 Smlt0947 Smlt0948 prpE   FALSE 0.039 216.000 0.000 NA   NA
 5776255 5776256 Smlt0948 Smlt0949     TRUE 0.792 -28.000 0.000 NA   NA
 5776257 5776258 Smlt0950 Smlt0951 gst   TRUE 0.592 85.000 0.111 1.000   NA
 5776258 5776259 Smlt0951 Smlt0952   fadH FALSE 0.043 218.000 0.000 1.000   NA
 5776259 5776260 Smlt0952 Smlt0953 fadH   FALSE 0.015 374.000 0.000 NA   NA
 5776260 5776261 Smlt0953 Smlt0954     FALSE 0.044 207.000 0.000 NA   NA
 5776262 5776263 Smlt0955 Smlt0956     FALSE 0.037 220.000 0.000 NA   NA
 5776263 5776264 Smlt0956 Smlt0957     TRUE 0.989 -3.000 0.227 NA   NA
 5776264 5776265 Smlt0957 Smlt0958     TRUE 0.546 86.000 0.091 NA   NA
 5776269 5776270 Smlt0962 Smlt0963     FALSE 0.232 192.000 0.143 1.000   NA
 5776270 5776271 Smlt0963 Smlt0964   folC FALSE 0.231 41.000 0.006 1.000 N NA
 5776271 5776272 Smlt0964 Smlt0965 folC   FALSE 0.369 82.000 0.013 NA   NA
 5776272 5776273 Smlt0965 Smlt0966     FALSE 0.417 47.000 0.007 NA   NA
 5776273 5776274 Smlt0966 Smlt0967   purF TRUE 0.881 31.000 0.262 1.000   NA
 5776274 5776275 Smlt0967 Smlt0968 purF   TRUE 0.863 10.000 0.012 1.000   NA
 5776278 5776279 Smlt0971 Smlt0972 lpxH   FALSE 0.316 94.000 0.008 1.000   NA
 5776279 5776280 Smlt0972 Smlt0973   pimB TRUE 0.956 -19.000 0.125 1.000   NA
 5776280 5776281 Smlt0973 Smlt0974 pimB   FALSE 0.119 143.000 0.000 1.000   NA
 5776281 5776282 Smlt0974 Smlt0975   ppx FALSE 0.016 395.000 0.000 1.000   NA
 5776282 5776283 Smlt0975 Smlt0976 ppx ppk FALSE 0.280 284.000 0.076 1.000 Y NA
 5776283 5776284 Smlt0976 Smlt0977 ppk phoR TRUE 0.875 5.000 0.045 1.000 N NA
 5776284 5776285 Smlt0977 Smlt0978 phoR phoB TRUE 0.914 107.000 0.453 1.000 Y NA
 5776285 5776286 Smlt0978 Smlt0979 phoB   FALSE 0.288 117.000 0.016 1.000   NA
 5776287 5776288 Smlt0980 Smlt0981 grxC   TRUE 0.973 -3.000 0.045 NA   NA
 5776288 5776289 Smlt0981 Smlt0982     FALSE 0.039 352.000 0.025 NA   NA
 5776289 5776290 Smlt0982 Smlt0983     FALSE 0.023 292.000 0.000 0.062 N NA
 5776290 5776291 Smlt0983 Smlt0984     TRUE 0.873 54.000 0.750 1.000 N NA
 5776292 5776293 Smlt0985 Smlt0986     FALSE 0.216 92.000 0.000 NA   NA
 10768825 10768826 Smlt_t02 Smlt_t04     FALSE 0.022 290.000 0.000 NA   NA
 10768826 10768827 Smlt_t04 Smlt_t05     FALSE 0.246 80.000 0.000 NA   NA
 10768827 10768828 Smlt_t05 Smlt_t06     FALSE 0.049 197.000 0.000 NA   NA
 10768828 5776294 Smlt_t06 Smlt0987     FALSE 0.037 220.000 0.000 NA   NA
 5776294 10768829 Smlt0987 Smlt_t07     FALSE 0.113 139.000 0.000 NA   NA
 10768829 5776295 Smlt_t07 Smlt0988   tig FALSE 0.055 190.000 0.000 NA   NA
 5776295 5776296 Smlt0988 Smlt0989 tig clpP TRUE 0.932 77.000 0.351 1.000 Y NA
 5776296 5776297 Smlt0989 Smlt0990 clpP clpX TRUE 0.862 127.000 0.352 1.000 Y NA
 5776297 5776298 Smlt0990 Smlt0991 clpX lon TRUE 0.813 144.000 0.201 0.095 Y NA
 5776298 5776299 Smlt0991 Smlt0992 lon hupB FALSE 0.024 218.000 0.008 1.000 N NA
 5776299 10768830 Smlt0992 Smlt_t08 hupB   TRUE 0.714 13.000 0.000 NA   NA
 10768830 10768831 Smlt_t08 Smlt_t10     FALSE 0.057 187.000 0.000 NA   NA
 10768831 10768832 Smlt_t10 Smlt_t12     FALSE 0.230 86.000 0.000 NA   NA
 10768832 10768833 Smlt_t12 Smlt_t13     FALSE 0.176 107.000 0.000 NA   NA
 10768833 5776300 Smlt_t13 Smlt0993     FALSE 0.102 146.000 0.000 NA   NA
 5776301 5776302 Smlt0994 Smlt0995     TRUE 0.890 0.000 0.000 1.000   NA
 5776303 5776304 Smlt0996 Smlt0997   rnhA TRUE 0.702 14.000 0.000 NA   NA
 5776304 5776305 Smlt0997 Smlt0998 rnhA dnaQ TRUE 0.992 5.000 0.248 1.000 Y NA
 5776310 5776311 Smlt1004 Smlt1005     TRUE 0.953 0.000 0.032 1.000   NA
 5776311 5776312 Smlt1005 Smlt1006     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776312 5776313 Smlt1006 Smlt1007     FALSE 0.012 476.000 0.000 NA   NA
 5776313 5776314 Smlt1007 Smlt1009     FALSE 0.018 359.000 0.000 1.000   NA
 5776315 5776316 Smlt1010 Smlt1011     FALSE 0.255 76.000 0.000 NA   NA
 5776316 5776317 Smlt1011 Smlt1012     FALSE 0.203 97.000 0.000 NA   NA
 5776317 5776318 Smlt1012 Smlt1013     TRUE 0.527 63.000 0.045 NA   NA
 5776318 10768835 Smlt1013 Smlt_t15     FALSE 0.018 332.000 0.000 NA   NA
 5776319 5776320 Smlt1014 Smlt1015 dnaX   TRUE 0.979 7.000 0.411 NA   NA
 5776320 5776321 Smlt1015 Smlt1016   recR TRUE 0.789 112.000 0.604 NA   NA
 5776321 5776322 Smlt1016 Smlt1017 recR   FALSE 0.219 68.000 0.013 1.000 N NA
 5776323 5776324 Smlt1018 Smlt1019     TRUE 0.929 -3.000 0.025 NA N NA
 5776324 5776325 Smlt1019 Smlt1020     TRUE 0.993 -7.000 0.727 NA   NA
 5776325 5776326 Smlt1020 Smlt1021     TRUE 0.996 -3.000 0.739 NA   NA
 5776329 5776330 Smlt1024 Smlt1025   rpmF TRUE 0.793 108.000 0.599 NA   NA
 5776330 5776331 Smlt1025 Smlt1026 rpmF fabH FALSE 0.195 92.000 0.014 1.000 N NA
 5776331 5776332 Smlt1026 Smlt1027 fabH   FALSE 0.249 79.000 0.000 NA   NA
 5776332 5776333 Smlt1027 Smlt1028   fabD FALSE 0.027 257.000 0.000 NA   NA
 5776333 5776334 Smlt1028 Smlt1029 fabD fabG TRUE 0.962 83.000 0.432 0.004 Y NA
 5776334 5776335 Smlt1029 Smlt1030 fabG acpP TRUE 0.858 153.000 0.321 0.004 Y NA
 5776335 5776336 Smlt1030 Smlt1031 acpP fabF TRUE 0.824 144.000 0.346 1.000 Y NA
 5776336 5776337 Smlt1031 Smlt1032 fabF   FALSE 0.114 215.000 0.030 0.012 N NA
 5776337 5776338 Smlt1032 Smlt1034     FALSE 0.080 198.000 0.010 NA   NA
 5776338 5776339 Smlt1034 Smlt1035     TRUE 0.988 -3.000 0.209 NA   NA
 5776339 5776340 Smlt1035 Smlt1036   holB TRUE 0.988 -3.000 0.211 0.094 N NA
 5776340 5776341 Smlt1036 Smlt1037 holB   TRUE 0.989 -3.000 0.382 NA N NA
 5776341 10768836 Smlt1037 Smlt_t16     FALSE 0.164 113.000 0.000 NA   NA
 10768836 5776342 Smlt_t16 Smlt1038     FALSE 0.032 233.000 0.000 NA   NA
 5776343 5776344 Smlt1039 Smlt1040     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776344 5776345 Smlt1040 Smlt1041     TRUE 0.993 -16.000 1.000 NA   NA
 5776345 5776346 Smlt1041 Smlt1042     TRUE 0.842 3.000 0.000 NA   NA
 5776346 5776347 Smlt1042 Smlt1043     FALSE 0.148 121.000 0.000 NA   NA
 5776347 5776348 Smlt1043 Smlt1044     TRUE 0.632 81.000 0.154 NA   NA
 5776348 5776349 Smlt1044 Smlt1045     TRUE 0.980 3.000 0.308 NA   NA
 5776349 5776350 Smlt1045 Smlt1046     FALSE 0.176 107.000 0.000 NA   NA
 5776350 5776351 Smlt1046 Smlt1047     TRUE 0.853 2.000 0.000 NA   NA
 5776351 5776352 Smlt1047 Smlt1048     TRUE 0.782 8.000 0.000 NA   NA
 5776352 5776353 Smlt1048 Smlt1049     TRUE 0.867 -7.000 0.000 NA   NA
 5776353 5776354 Smlt1049 Smlt1050   gpW TRUE 0.842 3.000 0.000 NA   NA
 5776354 5776355 Smlt1050 Smlt1051 gpW V FALSE 0.298 53.000 0.000 NA   NA
 5776355 5776356 Smlt1051 Smlt1052 V   TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA   NA
 5776356 5776357 Smlt1052 Smlt1053     FALSE 0.017 354.000 0.000 NA   NA
 5776357 5776358 Smlt1053 Smlt1054     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776358 5776359 Smlt1054 Smlt1055     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776359 5776360 Smlt1055 Smlt1056     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776360 5776361 Smlt1056 Smlt1057     FALSE 0.013 425.000 0.000 NA   NA
 5776361 5776362 Smlt1057 Smlt1058     FALSE 0.091 153.000 0.000 NA   NA
 5776362 5776363 Smlt1058 Smlt1059     FALSE 0.341 42.000 0.000 NA   NA
 5776363 5776364 Smlt1059 Smlt1060     FALSE 0.257 75.000 0.000 NA   NA
 5776364 5776365 Smlt1060 Smlt1061     TRUE 0.860 1.000 0.000 NA   NA
 5776366 5776367 Smlt1064 Smlt1065     TRUE 0.729 12.000 0.000 NA   NA
 5776367 5776368 Smlt1065 Smlt1066     FALSE 0.080 161.000 0.000 NA   NA
 5776368 5776369 Smlt1066 Smlt1067     FALSE 0.128 130.000 0.000 NA   NA
 5776369 5776370 Smlt1067 Smlt1068     TRUE 0.951 12.000 0.224 NA   NA
 5776371 5776372 Smlt1069 Smlt1070     TRUE 0.729 12.000 0.000 NA   NA
 5776374 5776375 Smlt1072 Smlt1073     FALSE 0.035 88.000 0.000 NA N NA
 5776382 5776383 Smlt1081 Smlt1082     TRUE 0.979 -3.000 0.078 NA   NA
 5776388 5776389 Smlt1087 Smlt1088     TRUE 0.948 19.000 0.357 NA   NA
 5776390 5776391 Smlt1089 Smlt1090 pilT pilU TRUE 0.948 101.000 0.436 0.015 Y NA
 5776391 5776392 Smlt1090 Smlt1091 pilU   FALSE 0.010 208.000 0.000 1.000 N NA
 5776393 5776394 Smlt1092 Smlt1093     FALSE 0.008 229.000 0.000 1.000 N NA
 5776395 5776396 Smlt1094 Smlt1095     FALSE 0.269 63.000 0.000 NA   NA
 5776397 5776398 Smlt1096 Smlt1097 tag yhgE TRUE 0.975 -3.000 0.051 NA   NA
 5776399 5776400 Smlt1098 Smlt1099     TRUE 0.970 -7.000 0.263 NA N NA
 5776400 5776401 Smlt1099 Smlt1100   pyrB TRUE 0.698 16.000 0.022 1.000 N NA
 5776401 5776402 Smlt1100 Smlt1101 pyrB   FALSE 0.011 198.000 0.000 1.000 N NA
 5776403 5776404 Smlt1102 Smlt1103     FALSE 0.047 274.000 0.012 1.000   NA
 5776404 5776405 Smlt1103 Smlt1104   ptsI FALSE 0.053 229.000 0.042 1.000 N NA
 5776405 5776406 Smlt1104 Smlt1105 ptsI ptsH TRUE 0.996 3.000 0.205 0.002 Y NA
 5776406 5776407 Smlt1105 Smlt1106 ptsH   TRUE 0.997 -7.000 0.261 0.002 Y NA
 5776407 5776408 Smlt1106 Smlt1108     FALSE 0.062 501.000 0.171 NA   NA
 5776408 5776409 Smlt1108 Smlt1109     TRUE 0.864 28.000 0.194 NA   NA
 5776409 5776410 Smlt1109 Smlt1110   rpoP TRUE 0.995 -3.000 0.053 1.000 Y NA
 5776410 5776411 Smlt1110 Smlt1111 rpoP   TRUE 0.576 22.000 0.022 NA N NA
 5776411 5776412 Smlt1111 Smlt1112   rpoN FALSE 0.381 59.000 0.050 NA N NA
 5776412 5776413 Smlt1112 Smlt1113 rpoN   TRUE 0.768 40.000 0.163 1.000   NA
 5776413 5776414 Smlt1113 Smlt1114     TRUE 0.991 0.000 0.543 NA   NA
 5776414 5776415 Smlt1114 Smlt1115     TRUE 0.756 104.000 0.459 NA   NA
 5776415 5776416 Smlt1115 Smlt1116     TRUE 0.996 -3.000 0.617 NA   NA
 5776416 5776417 Smlt1116 Smlt1117   kdsD TRUE 0.871 67.000 0.598 1.000   NA
 5776418 5776419 Smlt1118 Smlt1119   murA TRUE 0.786 22.000 0.129 NA N NA
 5776419 5776420 Smlt1119 Smlt1120 murA   TRUE 0.957 -3.000 0.013 NA   NA
 5776421 5776422 Smlt1121 Smlt1122     TRUE 0.994 3.000 1.000 NA   NA
 5776422 5776423 Smlt1122 Smlt1123   purN FALSE 0.440 68.000 0.020 NA   NA
 5776423 5776424 Smlt1123 Smlt1124 purN   TRUE 0.948 -3.000 0.007 NA   NA
 5776424 5776425 Smlt1124 Smlt1125     FALSE 0.012 467.000 0.000 NA   NA
 5776425 5776426 Smlt1125 Smlt1126   purM TRUE 0.634 24.000 0.005 NA   NA
 5776427 5776428 Smlt1127 Smlt1128     TRUE 0.980 -3.000 0.087 NA   NA
 5776428 5776429 Smlt1128 Smlt1129     TRUE 0.988 -3.000 0.217 NA   NA
 5776430 5776431 Smlt1130 Smlt1131     TRUE 0.996 -3.000 0.642 NA   NA
 5776431 5776432 Smlt1131 Smlt1132     FALSE 0.342 65.000 0.006 NA   NA
 5776432 5776433 Smlt1132 Smlt1133     FALSE 0.287 69.000 0.000 1.000   NA
 5776434 5776435 Smlt1134 Smlt1135     FALSE 0.017 353.000 0.000 NA   NA
 5776435 5776436 Smlt1135 Smlt1136     TRUE 0.907 12.000 0.074 NA   NA
 5776436 5776437 Smlt1136 Smlt1137     FALSE 0.409 35.000 0.000 NA   NA
 5776438 5776439 Smlt1138 Smlt1139   apbE TRUE 0.992 -3.000 0.500 1.000 N NA
 5776439 5776440 Smlt1139 Smlt1140 apbE   TRUE 0.968 15.000 0.462 NA   NA
 5776440 5776441 Smlt1140 Smlt1141     TRUE 0.809 123.000 0.808 NA   NA
 5776441 5776442 Smlt1141 Smlt1142     TRUE 0.967 27.000 0.848 NA   NA
 5776442 5776443 Smlt1142 Smlt1144c   bfrA FALSE 0.073 255.000 0.038 NA   NA
 5776443 10768837 Smlt1144c Smlt1144b bfrA   TRUE 0.764 -869.000 0.000 NA   NA
 10768837 10768838 Smlt1144b Smlt1144     FALSE 0.009 1462.000 0.000 NA   NA
 10768838 5776444 Smlt1144 Smlt1145     FALSE 0.099 147.000 0.000 NA   NA
 5776444 5776445 Smlt1145 Smlt1146     FALSE 0.140 124.000 0.000 NA   NA
 5776445 5776446 Smlt1146 Smlt1147     TRUE 0.771 11.000 0.000 1.000   NA
 5776446 5776447 Smlt1147 Smlt1148     TRUE 0.814 69.000 0.395 1.000   NA
 5776447 5776448 Smlt1148 Smlt1149     TRUE 0.591 21.000 0.000 NA   NA
 5776448 5776449 Smlt1149 Smlt1150     FALSE 0.046 202.000 0.000 NA   NA
 5776449 5776450 Smlt1150 Smlt1151     TRUE 0.988 -3.000 0.217 NA   NA
 5776452 5776453 Smlt1153 Smlt1154     TRUE 0.950 -3.000 0.041 1.000 N NA
 5776453 5776454 Smlt1154 Smlt1155     TRUE 0.997 0.000 0.482 1.000 Y NA
 5776454 5776455 Smlt1155 Smlt1156     TRUE 0.842 3.000 0.000 NA   NA
 5776455 5776456 Smlt1156 Smlt1157     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776456 5776457 Smlt1157 Smlt1158     TRUE 0.797 18.000 0.078 1.000 N NA
 5776458 5776459 Smlt1159 Smlt1160     TRUE 0.567 163.000 0.500 1.000   NA
 5776460 5776461 Smlt1161 Smlt1162     TRUE 0.709 83.000 0.250 NA   NA
 5776461 5776462 Smlt1162 Smlt1163     TRUE 0.898 52.000 0.667 NA   NA
 5776462 5776463 Smlt1163 Smlt1164     FALSE 0.021 296.000 0.000 NA   NA
 5776465 5776466 Smlt1166 Smlt1167 pab   TRUE 0.859 132.000 0.800 0.012   NA
 5776467 5776468 Smlt1168 Smlt1169     FALSE 0.460 77.000 0.029 NA   NA
 5776468 5776469 Smlt1169 Smlt1170   murD TRUE 0.902 -19.000 0.019 NA   NA
 5776474 5776475 Smlt1175 Smlt1176     FALSE 0.248 88.000 0.000 1.000   NA
 5776476 5776477 Smlt1177 Smlt1178     TRUE 0.987 -3.000 0.200 NA   NA
 5776477 5776478 Smlt1178 Smlt1179   amyM TRUE 0.992 -3.000 0.333 NA   NA
 5776478 5776479 Smlt1179 Smlt1180 amyM   FALSE 0.145 122.000 0.000 NA   NA
 5776479 5776480 Smlt1180 Smlt1181     FALSE 0.094 151.000 0.000 NA   NA
 5776480 5776481 Smlt1181 Smlt1182     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776482 5776483 Smlt1183 Smlt1184     FALSE 0.220 90.000 0.000 NA   NA
 5776483 5776484 Smlt1184 Smlt1185     TRUE 0.933 13.000 0.150 1.000   NA
 5776484 5776485 Smlt1185 Smlt1186     FALSE 0.032 129.000 0.000 1.000 N NA
 5776486 5776487 Smlt1187 Smlt1188 ssb   FALSE 0.006 203.000 0.000 NA N NA
 5776487 5776488 Smlt1188 Smlt1189     TRUE 0.901 28.000 0.471 NA N NA
 5776488 5776489 Smlt1189 Smlt1190     TRUE 0.992 0.000 0.600 NA   NA
 5776489 5776490 Smlt1190 Smlt1191     TRUE 0.960 0.000 0.064 NA   NA
 5776491 5776492 Smlt1192 Smlt1193     FALSE 0.172 19.000 0.000 NA N NA
 5776492 5776493 Smlt1193 Smlt1194     TRUE 0.608 20.000 0.000 NA   NA
 5776493 5776494 Smlt1194 Smlt1195     TRUE 0.740 13.000 0.000 1.000   NA
 5776494 5776495 Smlt1195 Smlt1196     TRUE 0.778 28.000 0.067 NA   NA
 5776496 5776497 Smlt1197 Smlt1198   adrA FALSE 0.023 148.000 0.000 1.000 N NA
 5776497 5776498 Smlt1198 Smlt1199 adrA   FALSE 0.175 108.000 0.000 NA   NA
 5776498 5776499 Smlt1199 Smlt1200     FALSE 0.119 136.000 0.000 NA   NA
 5776500 5776501 Smlt1201 Smlt1202     FALSE 0.396 36.000 0.000 NA   NA
 5776503 5776504 Smlt1204 Smlt1205     TRUE 0.829 19.000 0.042 NA   NA
 5776505 5776506 Smlt1206 Smlt1207     FALSE 0.185 104.000 0.000 NA   NA
 5776506 5776507 Smlt1207 Smlt1208     TRUE 0.877 0.000 0.000 NA   NA
 5776507 5776508 Smlt1208 Smlt1209     FALSE 0.360 44.000 0.000 1.000   NA
 5776508 5776509 Smlt1209 Smlt1210     FALSE 0.135 135.000 0.000 1.000   NA
 5776510 5776511 Smlt1211 Smlt1212     FALSE 0.098 148.000 0.000 NA   NA
 5776511 5776512 Smlt1212 Smlt1213     TRUE 0.995 -7.000 0.914 NA   NA
 5776512 5776513 Smlt1213 Smlt1214     TRUE 0.504 57.000 0.029 NA   NA
 5776513 5776514 Smlt1214 Smlt1215     FALSE 0.206 96.000 0.000 NA   NA
 5776515 5776516 Smlt1216 Smlt1217     TRUE 0.827 4.000 0.000 NA   NA
 5776516 5776517 Smlt1217 Smlt1218     FALSE 0.311 58.000 0.000 1.000   NA
 5776517 5776518 Smlt1218 Smlt1219     TRUE 0.999 -3.000 0.897 1.000 Y NA
 5776518 5776519 Smlt1219 Smlt1220     FALSE 0.135 126.000 0.000 NA   NA
 5776519 5776520 Smlt1220 Smlt1221     FALSE 0.249 79.000 0.000 NA   NA
 5776523 5776524 Smlt1224 Smlt1225     TRUE 0.676 106.000 0.300 1.000   NA
 5776524 5776525 Smlt1225 Smlt1226     FALSE 0.456 105.000 0.070 1.000   NA
 5776525 5776526 Smlt1226 Smlt1227     TRUE 0.981 -3.000 0.203 1.000 N NA
 5776526 5776527 Smlt1227 Smlt1228     TRUE 0.981 -3.000 0.085 1.000   NA
 5776527 5776528 Smlt1228 Smlt1229     TRUE 0.965 -7.000 0.102 NA   NA
 5776528 5776529 Smlt1229 Smlt1230     TRUE 0.991 3.000 0.700 NA   NA
 5776529 5776530 Smlt1230 Smlt1231     TRUE 0.994 -3.000 0.438 NA   NA
 5776530 5776531 Smlt1231 Smlt1232     TRUE 0.969 11.000 0.342 NA   NA
 5776531 5776532 Smlt1232 Smlt1233     FALSE 0.061 191.000 0.000 1.000   NA
 5776532 5776533 Smlt1233 Smlt1234   mqo FALSE 0.019 355.000 0.000 1.000   NA
 5776533 5776534 Smlt1234 Smlt1235 mqo   FALSE 0.037 230.000 0.000 1.000   NA
 5776534 5776535 Smlt1235 Smlt1236     FALSE 0.102 153.000 0.000 1.000   NA
 5776535 5776536 Smlt1236 Smlt1237     FALSE 0.093 159.000 0.000 1.000   NA
 5776537 5776538 Smlt1238 Smlt1240     FALSE 0.070 168.000 0.000 NA   NA
 5776538 10768839 Smlt1240 Smlt1239     TRUE 0.777 -80.000 0.000 NA   NA
 5776539 5776540 Smlt1241 Smlt1242     FALSE 0.246 80.000 0.000 NA   NA
 5776540 5776541 Smlt1242 Smlt1243     FALSE 0.216 92.000 0.000 NA   NA
 5776542 5776543 Smlt1245 Smlt1246     FALSE 0.218 155.000 0.043 NA   NA
 5776543 5776544 Smlt1246 Smlt1247     FALSE 0.109 141.000 0.000 NA   NA
 5776545 5776546 Smlt1249 Smlt1250   minE TRUE 0.542 38.000 0.015 NA   NA
 5776546 5776547 Smlt1250 Smlt1251 minE minD TRUE 0.997 3.000 0.618 NA Y NA
 5776547 5776548 Smlt1251 Smlt1252 minD minC TRUE 0.969 38.000 0.466 1.000 Y NA
 5776548 5776549 Smlt1252 Smlt1253 minC   TRUE 0.915 3.000 0.013 1.000   NA
 5776550 5776551 Smlt1254 Smlt1255     TRUE 0.999 0.000 0.900 0.034 Y NA
 5776551 5776552 Smlt1255 Smlt1256     FALSE 0.031 235.000 0.000 NA   NA
 5776552 5776553 Smlt1256 Smlt1257     FALSE 0.296 104.000 0.013 NA   NA
 5776554 5776555 Smlt1259 Smlt1260     FALSE 0.222 178.000 0.107 NA   NA
 5776555 5776556 Smlt1260 Smlt1261     TRUE 0.827 4.000 0.000 NA   NA
 5776556 5776557 Smlt1261 Smlt1262     TRUE 0.964 -3.000 0.020 NA   NA
 5776557 5776558 Smlt1262 Smlt1263     TRUE 0.886 46.000 0.549 NA   NA
 5776560 5776561 Smlt1265 Smlt1266     FALSE 0.473 45.000 0.014 NA   NA
 5776563 5776564 Smlt1269 Smlt1270 rfaY   FALSE 0.042 209.000 0.000 NA   NA
 5776564 5776565 Smlt1270 Smlt1271   tesB TRUE 0.912 5.000 0.026 NA   NA
 5776565 5776566 Smlt1271 Smlt1273 tesB   TRUE 0.585 142.000 0.021 1.000 Y NA
 5776568 5776569 Smlt1275 Smlt1276     FALSE 0.200 98.000 0.000 NA   NA
 5776569 5776570 Smlt1276 Smlt1277   uvrA TRUE 0.917 0.000 0.005 1.000   NA
 5776571 5776572 Smlt1278 Smlt1279 rplU rpmA TRUE 0.995 19.000 0.667 0.012 Y NA
 5776572 5776573 Smlt1279 Smlt1280 rpmA   FALSE 0.371 194.000 0.335 1.000   NA
 5776574 5776575 Smlt1282 Smlt1283   trbI TRUE 0.988 -3.000 0.214 NA   NA
 5776575 5776576 Smlt1283 Smlt1284 trbI trbG TRUE 0.974 3.000 0.000 NA Y NA
 5776576 5776577 Smlt1284 Smlt1285 trbG trbF TRUE 0.989 -3.000 0.000 NA Y NA
 5776577 5776578 Smlt1285 Smlt1286 trbF trbL TRUE 0.984 19.000 0.333 NA Y NA
 5776578 5776579 Smlt1286 Smlt1287 trbL trbJ TRUE 0.950 12.000 0.000 NA Y NA
 5776579 5776580 Smlt1287 Smlt1288 trbJ trbE TRUE 0.989 -3.000 0.000 NA Y NA
 5776580 5776581 Smlt1288 Smlt1289 trbE trbD TRUE 0.991 11.000 0.333 NA Y NA
 5776581 5776582 Smlt1289 Smlt1290 trbD trbC TRUE 0.998 -3.000 0.333 NA Y NA
 5776582 5776583 Smlt1290 Smlt1291 trbC trbB TRUE 0.997 -3.000 0.227 NA Y NA
 5776583 5776584 Smlt1291 Smlt1292 trbB   TRUE 0.985 -3.000 0.136 1.000   NA
 5776584 5776585 Smlt1292 Smlt1293   traG TRUE 0.996 -3.000 0.667 1.000   NA
 5776585 5776586 Smlt1293 Smlt1294 traG   FALSE 0.032 234.000 0.000 NA   NA
 5776586 5776587 Smlt1294 Smlt1295     FALSE 0.325 45.000 0.000 NA   NA
 5776587 5776588 Smlt1295 Smlt1296     TRUE 0.747 11.000 0.000 NA   NA
 5776588 5776589 Smlt1296 Smlt1297     TRUE 0.673 16.000 0.000 NA   NA
 5776589 5776590 Smlt1297 Smlt1298     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776590 5776591 Smlt1298 Smlt1299     TRUE 0.925 -13.000 0.029 NA   NA
 5776593 5776594 Smlt1301 Smlt1302     FALSE 0.388 37.000 0.000 NA   NA
 5776594 5776595 Smlt1302 Smlt1303     FALSE 0.467 33.000 0.000 1.000   NA
 5776595 5776596 Smlt1303 Smlt1304     TRUE 0.933 -3.000 0.000 1.000   NA
 5776596 5776597 Smlt1304 Smlt1305     TRUE 0.962 -67.000 0.211 1.000   NA
 5776597 5776598 Smlt1305 Smlt1306     FALSE 0.060 88.000 0.000 1.000 N NA
 5776600 5776601 Smlt1308 Smlt1309     TRUE 0.990 -3.000 0.250 NA   NA
 5776601 5776602 Smlt1309 Smlt1310     TRUE 0.527 26.000 0.000 NA   NA
 5776602 5776603 Smlt1310 Smlt1311     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776603 5776604 Smlt1311 Smlt1312     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776604 5776605 Smlt1312 Smlt1313     TRUE 0.933 -3.000 0.000 1.000   NA
 5776605 5776606 Smlt1313 Smlt1314     FALSE 0.004 251.000 0.000 NA N NA
 5776606 5776607 Smlt1314 Smlt1315     TRUE 0.967 27.000 0.857 NA   NA
 5776607 5776608 Smlt1315 Smlt1316     TRUE 0.799 84.000 0.429 NA   NA
 5776608 5776609 Smlt1316 Smlt1318     FALSE 0.017 352.000 0.000 NA   NA
 5776611 5776612 Smlt1320 Smlt1320A     FALSE 0.018 335.000 0.000 NA   NA
 5776613 5776614 Smlt1322 Smlt1323     FALSE 0.341 42.000 0.000 NA   NA
 5776614 5776615 Smlt1323 Smlt1324     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776616 5776617 Smlt1325 Smlt1326     TRUE 0.847 63.000 0.500 NA   NA
 5776617 5776618 Smlt1326 Smlt1327     TRUE 0.829 81.000 0.500 NA   NA
 5776618 5776619 Smlt1327 Smlt1328     FALSE 0.435 33.000 0.000 NA   NA
 5776620 5776621 Smlt1329 Smlt1331     TRUE 0.987 -34.000 0.667 NA   NA
 5776622 5776623 Smlt1332 Smlt1333     FALSE 0.388 37.000 0.000 NA   NA
 5776623 5776624 Smlt1333 Smlt1334     TRUE 0.527 26.000 0.000 NA   NA
 5776624 5776625 Smlt1334 Smlt1335     TRUE 0.986 -19.000 0.545 NA   NA
 5776625 5776626 Smlt1335 Smlt1336     FALSE 0.111 140.000 0.000 NA   NA
 5776626 5776627 Smlt1336 Smlt1337   rpsT FALSE 0.009 211.000 0.000 1.000 N NA
 5776628 5776629 Smlt1338 Smlt1339 mviN ribF TRUE 0.675 76.000 0.169 1.000   NA
 5776629 5776630 Smlt1339 Smlt1340 ribF ileS1 TRUE 0.984 -3.000 0.254 1.000 N NA
 5776630 5776631 Smlt1340 Smlt1341 ileS1 lspA TRUE 0.958 0.000 0.147 1.000 N NA
 5776631 5776632 Smlt1341 Smlt1342 lspA ispH TRUE 0.948 28.000 0.095 1.000 Y NA
 5776632 5776633 Smlt1342 Smlt1343 ispH   FALSE 0.040 224.000 0.000 1.000   NA
 5776633 5776634 Smlt1343 Smlt1344     TRUE 0.933 -3.000 0.000 1.000   NA
 5776635 5776636 Smlt1345 Smlt1346     TRUE 0.996 -3.000 0.600 NA   NA
 5776636 5776637 Smlt1346 Smlt1347     FALSE 0.317 47.000 0.000 NA   NA
 5776637 5776638 Smlt1347 Smlt1348     TRUE 0.939 15.000 0.000 NA Y NA
 5776638 5776639 Smlt1348 Smlt1349     TRUE 0.987 -3.000 0.333 NA N NA
 5776640 5776641 Smlt1350 Smlt1351   ldhA FALSE 0.222 98.000 0.000 1.000   NA
 5776641 10768840 Smlt1351 Smlt_t17 ldhA   FALSE 0.301 52.000 0.000 NA   NA
 10768840 5776642 Smlt_t17 Smlt1353     FALSE 0.010 661.000 0.000 NA   NA
 5776642 5776643 Smlt1353 Smlt1354     FALSE 0.016 358.000 0.000 NA   NA
 5776643 5776644 Smlt1354 Smlt1355     FALSE 0.074 165.000 0.000 NA   NA
 5776644 5776645 Smlt1355 Smlt1356     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776646 5776647 Smlt1357 Smlt1358     TRUE 0.877 0.000 0.000 NA   NA
 5776647 5776648 Smlt1358 Smlt1359     FALSE 0.359 40.000 0.000 NA   NA
 5776649 5776650 Smlt1360 Smlt1361 cyoA qoxB TRUE 0.999 -3.000 0.385 0.007 Y NA
 5776650 5776651 Smlt1361 Smlt1362 qoxB qoxC TRUE 0.999 -3.000 0.385 0.043 Y NA
 5776651 5776652 Smlt1362 Smlt1363 qoxC cyoxD TRUE 0.999 0.000 0.917 0.043 Y NA
 5776654 5776655 Smlt1366 Smlt1367 radA htpG TRUE 0.655 122.000 0.000 0.090 Y NA
 5776655 5776656 Smlt1367 Smlt1368 htpG   TRUE 0.916 49.000 0.727 1.000   NA
 5776656 5776657 Smlt1368 Smlt1369     FALSE 0.296 54.000 0.000 NA   NA
 5776659 5776660 Smlt1371 Smlt1372 ffh   FALSE 0.286 92.000 0.003 1.000   NA
 5776660 5776661 Smlt1372 Smlt1373     TRUE 0.975 -3.000 0.045 1.000   NA
 5776661 5776662 Smlt1373 Smlt1374   rpsP FALSE 0.103 99.000 0.004 1.000 N NA
 5776662 5776663 Smlt1374 Smlt1375 rpsP rimM TRUE 0.968 45.000 0.342 0.012 Y NA
 5776663 5776664 Smlt1375 Smlt1376 rimM trmD TRUE 0.996 9.000 0.672 1.000 Y NA
 5776664 5776665 Smlt1376 Smlt1377 trmD rplS TRUE 0.853 155.000 0.567 1.000 Y NA
 5776665 5776666 Smlt1377 Smlt1378 rplS   FALSE 0.239 83.000 0.000 NA   NA
 5776666 5776667 Smlt1378 Smlt1379     FALSE 0.244 81.000 0.000 NA   NA
 5776667 5776668 Smlt1379 Smlt1380     TRUE 0.795 39.000 0.208 NA   NA
 5776671 5776672 Smlt1384 Smlt1385   katA FALSE 0.173 109.000 0.000 NA   NA
 5776672 5776673 Smlt1385 Smlt1386 katA   FALSE 0.020 313.000 0.000 NA   NA
 5776673 5776674 Smlt1386 Smlt1387   mutS FALSE 0.122 134.000 0.000 NA   NA
 5776674 5776675 Smlt1387 Smlt1388 mutS   FALSE 0.119 136.000 0.000 NA   NA
 5776676 5776677 Smlt1389 Smlt1390     TRUE 0.924 22.000 0.300 NA   NA
 5776677 5776678 Smlt1390 Smlt1391     FALSE 0.257 75.000 0.000 NA   NA
 5776678 5776679 Smlt1391 Smlt1395     FALSE 0.010 632.000 0.000 NA   NA
 5776679 5776680 Smlt1395 Smlt1396A     FALSE 0.010 611.000 0.000 NA   NA
 5776680 5776681 Smlt1396A Smlt1399     TRUE 0.860 1.000 0.000 NA   NA
 5776681 5776682 Smlt1399 Smlt1400     FALSE 0.127 131.000 0.000 NA   NA
 5776682 5776683 Smlt1400 Smlt1401     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776683 5776684 Smlt1401 Smlt1402     FALSE 0.041 211.000 0.000 NA   NA
 5776684 5776685 Smlt1402 Smlt1403     FALSE 0.081 167.000 0.000 1.000   NA
 5776686 5776687 Smlt1404 Smlt1405     TRUE 0.999 -3.000 0.743 NA Y NA
 5776687 5776688 Smlt1405 Smlt1406     TRUE 0.989 -15.000 0.119 NA Y NA
 5776688 5776689 Smlt1406 Smlt1407     TRUE 0.925 -7.000 0.062 1.000 N NA
 5776689 5776690 Smlt1407 Smlt1408     FALSE 0.046 106.000 0.000 1.000 N NA
 5776692 5776693 Smlt1410 Smlt1411 map   TRUE 0.984 5.000 0.492 NA   NA
 5776693 5776694 Smlt1411 Smlt1412     FALSE 0.262 68.000 0.000 NA   NA
 5776694 5776695 Smlt1412 Smlt1413     FALSE 0.099 147.000 0.000 NA   NA
 5776695 5776696 Smlt1413 Smlt1414     TRUE 0.949 4.000 0.086 NA   NA
 5776696 5776697 Smlt1414 Smlt1415   dat TRUE 0.806 30.000 0.118 NA   NA
 5776697 5776698 Smlt1415 Smlt1416 dat   TRUE 0.889 64.000 0.152 1.000 Y NA
 5776698 5776699 Smlt1416 Smlt1417     FALSE 0.015 175.000 0.000 1.000 N NA
 5776699 5776700 Smlt1417 Smlt1418     TRUE 0.967 11.000 0.333 NA   NA
 5776700 5776701 Smlt1418 Smlt1419     TRUE 0.995 -3.000 0.583 NA   NA
 5776701 5776702 Smlt1419 Smlt1420     TRUE 0.978 2.000 0.241 NA   NA
 5776702 5776703 Smlt1420 Smlt1421   qseC TRUE 0.559 26.000 0.000 1.000   NA
 5776703 5776704 Smlt1421 Smlt1422 qseC   TRUE 0.995 -3.000 0.083 1.000 Y NA
 5776704 5776705 Smlt1422 Smlt1423     TRUE 0.875 1.000 0.000 1.000   NA
 5776712 5776713 Smlt1430 Smlt1431 gpmA   FALSE 0.018 162.000 0.000 1.000 N NA
 5776714 5776715 Smlt1432 Smlt1433   mfd FALSE 0.354 45.000 0.000 1.000   NA
 5776715 5776716 Smlt1433 Smlt1434 mfd   FALSE 0.042 150.000 0.002 1.000 N NA
 5776716 5776717 Smlt1434 Smlt1435     FALSE 0.282 96.000 0.007 NA   NA
 5776718 5776719 Smlt1436 Smlt1437     TRUE 0.998 4.000 0.776 1.000 Y NA
 5776719 5776720 Smlt1437 Smlt1438     TRUE 0.649 82.000 0.311 NA N NA
 5776720 5776721 Smlt1438 Smlt1439     TRUE 0.747 11.000 0.000 NA   NA
 5776721 5776722 Smlt1439 Smlt1440     FALSE 0.086 155.000 0.000 NA   NA
 5776722 5776723 Smlt1440 Smlt1441   gltX FALSE 0.099 154.000 0.000 1.000   NA
 5776723 5776724 Smlt1441 Smlt1442 gltX fur FALSE 0.346 35.000 0.012 1.000 N NA
 5776725 5776726 Smlt1443 Smlt1444     TRUE 0.981 11.000 0.578 NA   NA
 5776726 5776727 Smlt1444 Smlt1445     TRUE 0.983 0.000 0.276 NA   NA
 5776727 5776728 Smlt1445 Smlt1446     FALSE 0.159 123.000 0.000 1.000   NA
 5776729 5776730 Smlt1447 Smlt1448     TRUE 0.861 111.000 1.000 NA   NA
 5776733 5776734 Smlt1451 Smlt1452 ogt   TRUE 0.997 -3.000 0.275 1.000 Y NA
 5776734 5776735 Smlt1452 Smlt1453     TRUE 0.762 10.000 0.000 NA   NA
 5776736 5776737 Smlt1454 Smlt1455     FALSE 0.281 59.000 0.000 NA   NA
 5776737 5776738 Smlt1455 Smlt1456     FALSE 0.337 43.000 0.000 NA   NA
 5776738 5776739 Smlt1456 Smlt1458     FALSE 0.038 218.000 0.000 NA   NA
 5776739 5776740 Smlt1458 Smlt1459     FALSE 0.421 80.000 0.021 NA   NA
 5776742 5776743 Smlt1461 Smlt1462 deaD   FALSE 0.018 219.000 0.004 1.000 N NA
 5776743 5776744 Smlt1462 Smlt1463     TRUE 0.727 110.000 0.000 0.009 Y NA
 5776744 5776745 Smlt1463 Smlt1464     TRUE 0.591 35.000 0.074 1.000 N NA
 5776745 5776746 Smlt1464 Smlt1465     FALSE 0.194 145.000 0.074 1.000 N NA
 5776746 5776747 Smlt1465 Smlt1466     FALSE 0.122 134.000 0.000 NA   NA
 5776748 5776749 Smlt1467 Smlt1468     FALSE 0.409 35.000 0.000 NA   NA
 5776749 5776750 Smlt1468 Smlt1469     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776751 5776752 Smlt1470 Smlt1471     FALSE 0.273 200.000 0.000 1.000 Y NA
 5776752 5776753 Smlt1471 Smlt1472     FALSE 0.287 68.000 0.000 1.000   NA
 5776754 5776755 Smlt1473 Smlt1474     FALSE 0.102 146.000 0.000 NA   NA
 5776756 5776757 Smlt1475 Smlt1476     TRUE 0.763 24.000 0.031 NA   NA
 5776758 5776759 Smlt1477 Smlt1478     TRUE 0.591 69.000 0.095 NA   NA
 5776762 10768841 Smlt1481 Smlt1482     FALSE 0.026 264.000 0.000 NA   NA
 5776764 5776765 Smlt1484 Smlt1485     TRUE 0.994 -3.000 0.417 NA   NA
 5776766 5776767 Smlt1486 Smlt1487     FALSE 0.421 94.000 0.034 NA   NA
 5776769 5776770 Smlt1490 Smlt1491 accA   FALSE 0.162 114.000 0.000 NA   NA
 5776770 5776771 Smlt1491 Smlt1492   dnaE TRUE 0.838 -12.000 0.000 NA   NA
 5776771 5776772 Smlt1492 Smlt1493 dnaE rnhB FALSE 0.392 229.000 0.104 1.000 Y NA
 5776772 5776773 Smlt1493 Smlt1494 rnhB lpxB TRUE 0.979 -3.000 0.186 1.000 N NA
 5776773 5776774 Smlt1494 Smlt1495 lpxB lpxA TRUE 0.998 -3.000 0.289 1.000 Y NA
 5776774 5776775 Smlt1495 Smlt1496 lpxA fabZ TRUE 0.683 17.000 0.022 1.000 N NA
 5776775 5776776 Smlt1496 Smlt1497 fabZ lpxD TRUE 0.927 -3.000 0.019 1.000 N NA
 5776776 5776777 Smlt1497 Smlt1498 lpxD   FALSE 0.088 441.000 0.000 1.000 Y NA
 5776777 5776778 Smlt1498 Smlt1499     TRUE 0.991 -3.000 0.007 1.000 Y NA
 5776778 5776779 Smlt1499 Smlt1500   dxr TRUE 0.827 56.000 0.568 1.000 N NA
 5776779 5776780 Smlt1500 Smlt1501 dxr cdsA TRUE 0.996 3.000 0.372 1.000 Y NA
 5776780 5776781 Smlt1501 Smlt1502 cdsA uppS TRUE 0.998 -3.000 0.400 1.000 Y NA
 5776781 5776782 Smlt1502 Smlt1503 uppS frr TRUE 0.971 6.000 0.409 1.000 N NA
 5776782 5776783 Smlt1503 Smlt1504 frr pyrH TRUE 0.772 97.000 0.626 1.000 N NA
 5776783 5776784 Smlt1504 Smlt1505 pyrH   FALSE 0.076 122.000 0.004 1.000 N NA
 5776784 5776785 Smlt1505 Smlt1506   tsf FALSE 0.015 225.000 0.002 1.000 N NA
 5776785 5776786 Smlt1506 Smlt1507 tsf rpsB TRUE 0.928 126.000 0.748 1.000 Y NA
 5776786 5776787 Smlt1507 Smlt1508 rpsB   FALSE 0.005 221.000 0.000 NA N NA
 5776787 5776788 Smlt1508 Smlt1509     TRUE 0.877 0.000 0.000 NA   NA
 5776788 5776789 Smlt1509 Smlt1510     FALSE 0.045 204.000 0.000 NA   NA
 5776789 5776790 Smlt1510 Smlt1511     TRUE 0.994 -3.000 0.444 NA   NA
 5776790 5776791 Smlt1511 Smlt1512     TRUE 0.997 5.000 0.667 NA Y NA
 5776791 5776792 Smlt1512 Smlt1513     TRUE 0.983 -3.000 0.125 NA   NA
 5776793 5776794 Smlt1513A Smlt1514 map glnD TRUE 0.940 3.000 0.128 1.000 N NA
 5776794 5776795 Smlt1514 Smlt1515 glnD   TRUE 0.846 0.000 0.012 1.000 N NA
 5776795 5776796 Smlt1515 Smlt1517     FALSE 0.024 441.000 0.061 1.000 N NA
 5776796 5776797 Smlt1517 Smlt1518   dapE TRUE 0.986 -3.000 0.292 1.000 N NA
 5776797 5776798 Smlt1518 Smlt1520 dapE asnB FALSE 0.078 536.000 0.000 1.000 Y NA
 5776798 5776799 Smlt1520 Smlt1521 asnB   FALSE 0.050 100.000 0.000 1.000 N NA
 5776802 5776803 Smlt1525 Smlt1526 parC   FALSE 0.165 60.000 0.005 1.000 N NA
 5776804 5776805 Smlt1527 Smlt1528     TRUE 0.988 -3.000 0.333 1.000 N NA
 5776805 5776806 Smlt1528 Smlt1529   emrA TRUE 0.937 12.000 0.278 1.000 N NA
 5776806 5776807 Smlt1529 Smlt1530 emrA emrB TRUE 0.991 8.000 0.900 1.000   NA
 5776808 10768842 Smlt1530A Smlt_t18     FALSE 0.019 326.000 0.000 NA   NA
 10768842 5776809 Smlt_t18 Smlt1532     FALSE 0.306 50.000 0.000 NA   NA
 5776811 5776812 Smlt1534 Smlt1535 rnr   FALSE 0.285 95.000 0.004 1.000   NA
 5776812 5776813 Smlt1535 Smlt1536     FALSE 0.128 152.000 0.002 1.000   NA
 5776814 5776815 Smlt1537 Smlt1538   macB TRUE 0.960 6.000 0.303 1.000 N NA
 5776815 5776816 Smlt1538 Smlt1539 macB   TRUE 0.953 -3.000 0.045 1.000 N NA
 5776817 5776818 Smlt1540 Smlt1541     TRUE 0.997 7.000 0.800 1.000 Y NA
 5776818 5776819 Smlt1541 Smlt1542     FALSE 0.329 178.000 0.000 1.000 Y NA
 5776820 5776821 Smlt1543 Smlt1544 rnt   FALSE 0.069 169.000 0.000 NA   NA
 5776821 5776822 Smlt1544 Smlt1545     TRUE 0.902 26.000 0.271 NA   NA
 5776822 5776823 Smlt1545 Smlt1546     TRUE 0.995 -7.000 0.914 NA   NA
 5776823 5776824 Smlt1546 Smlt1547     TRUE 0.925 -13.000 0.029 NA   NA
 5776824 5776825 Smlt1547 Smlt1548     FALSE 0.030 239.000 0.000 NA   NA
 5776825 5776826 Smlt1548 Smlt1549   pstB TRUE 0.810 77.000 0.034 NA Y NA
 5776826 5776827 Smlt1549 Smlt1550 pstB pstA TRUE 0.998 -7.000 0.526 0.002 Y NA
 5776827 5776828 Smlt1550 Smlt1551 pstA pstC TRUE 0.999 0.000 0.537 0.002 Y NA
 5776828 5776829 Smlt1551 Smlt1552 pstC pstS TRUE 0.881 83.000 0.033 0.002 Y NA
 5776829 5776830 Smlt1552 Smlt1554 pstS pstS FALSE 0.394 687.000 0.333 0.002 Y NA
 5776830 5776831 Smlt1554 Smlt1555 pstS   TRUE 0.747 223.000 0.750 NA Y NA
 5776831 5776832 Smlt1555 Smlt1556   nth FALSE 0.006 197.000 0.000 NA N NA
 5776832 5776833 Smlt1556 Smlt1557 nth   TRUE 0.910 0.000 0.005 NA   NA
 5776833 5776834 Smlt1557 Smlt1558   crt2 TRUE 0.959 5.000 0.160 NA   NA
 5776835 5776836 Smlt1559 Smlt1560     FALSE 0.069 258.000 0.028 1.000   NA
 5776836 5776837 Smlt1560 Smlt1561     TRUE 0.967 -3.000 0.021 1.000   NA
 5776839 5776840 Smlt1563 Smlt1564     FALSE 0.102 146.000 0.000 NA   NA
 5776841 5776842 Smlt1565 Smlt1566     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776842 5776843 Smlt1566 Smlt1567     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776843 5776844 Smlt1567 Smlt1568     FALSE 0.073 166.000 0.000 NA   NA
 5776844 5776845 Smlt1568 Smlt1569     FALSE 0.252 119.000 0.013 NA   NA
 5776845 5776846 Smlt1569 Smlt1570   aptA TRUE 0.552 64.000 0.064 NA   NA
 5776847 10768844 Smlt1571a Smlt1571 aldH   TRUE 0.762 -1412.000 0.000 NA   NA
 5776850 5776851 Smlt1574 Smlt1575     TRUE 0.613 86.000 0.267 1.000 N NA
 5776851 5776852 Smlt1575 Smlt1576     FALSE 0.203 97.000 0.000 NA   NA
 5776852 5776853 Smlt1576 Smlt1577     FALSE 0.224 88.000 0.000 NA   NA
 5776853 5776854 Smlt1577 Smlt1578     FALSE 0.303 51.000 0.000 NA   NA
 5776855 5776856 Smlt1579 Smlt1580     TRUE 0.933 -3.000 0.000 1.000   NA
 5776856 5776857 Smlt1580 Smlt1581   potF TRUE 0.674 92.000 0.000 1.000 Y NA
 5776859 5776860 Smlt1584 Smlt1585 potG potH TRUE 0.998 -3.000 0.385 1.000 Y NA
 5776860 5776861 Smlt1585 Smlt1586 potH potI TRUE 0.997 -3.000 0.094 0.040 Y NA
 5776861 5776862 Smlt1586 Smlt1587 potI   FALSE 0.320 84.000 0.038 1.000 N NA
 5776863 5776864 Smlt1589 Smlt1590 corA   TRUE 0.939 7.000 0.095 NA   NA
 5776864 5776865 Smlt1590 Smlt1591     TRUE 0.968 -3.000 0.029 NA   NA
 5776865 5776866 Smlt1591 Smlt1592     FALSE 0.458 65.000 0.024 NA   NA
 5776866 5776867 Smlt1592 Smlt1593     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776867 5776868 Smlt1593 Smlt1594     FALSE 0.257 75.000 0.000 NA   NA
 5776868 5776869 Smlt1594 Smlt1595     FALSE 0.310 49.000 0.000 NA   NA
 5776869 5776870 Smlt1595 Smlt1596     TRUE 0.994 -3.000 0.457 NA   NA
 5776871 5776872 Smlt1597 Smlt1598     TRUE 0.992 21.000 0.752 1.000 Y NA
 5776872 5776873 Smlt1598 Smlt1599     TRUE 0.996 -3.000 0.671 0.088 N NA
 5776874 5776875 Smlt1600 Smlt1601   gstA FALSE 0.025 167.000 0.003 NA N NA
 5776876 5776877 Smlt1602 Smlt1603     TRUE 0.818 47.000 0.500 NA N NA
 5776877 5776878 Smlt1603 Smlt1604   petA FALSE 0.042 230.000 0.033 NA N NA
 5776878 5776879 Smlt1604 Smlt1605 petA petB TRUE 0.997 0.000 0.233 0.001 Y NA
 5776879 5776880 Smlt1605 Smlt1606 petB petC TRUE 0.999 -7.000 0.630 0.001 Y NA
 5776880 5776881 Smlt1606 Smlt1607 petC sspA FALSE 0.493 135.000 0.370 NA N NA
 5776881 5776882 Smlt1607 Smlt1608 sspA sspB TRUE 0.889 85.000 0.831 NA   NA
 5776883 5776884 Smlt1609 Smlt1610     FALSE 0.377 38.000 0.000 NA   NA
 5776884 5776885 Smlt1610 Smlt1611   nadC FALSE 0.210 115.000 0.005 NA   NA
 5776885 5776886 Smlt1611 Smlt1612 nadC   TRUE 0.947 -3.000 0.006 NA   NA
 5776887 5776888 Smlt1613 Smlt1614 purE purK TRUE 0.998 -3.000 0.136 0.001 Y NA
 5776888 5776889 Smlt1614 Smlt1615 purK   FALSE 0.164 113.000 0.000 NA   NA
 5776890 10768845 Smlt1616b Smlt1616a sodB   TRUE 0.770 -323.000 0.000 NA   NA
 5776891 5776892 Smlt1617 Smlt1618     TRUE 0.919 -3.000 0.016 1.000 N NA
 5776892 5776893 Smlt1618 Smlt1619     FALSE 0.036 233.000 0.000 1.000   NA
 5776893 5776894 Smlt1619 Smlt1620     FALSE 0.051 253.000 0.014 NA   NA
 5776894 5776895 Smlt1620 Smlt1621   fimU FALSE 0.137 162.000 0.014 NA   NA
 5776895 5776896 Smlt1621 Smlt1622 fimU pilV TRUE 0.996 -3.000 0.119 NA Y NA
 5776896 5776897 Smlt1622 Smlt1623 pilV pilW TRUE 0.996 -3.000 0.143 NA Y NA
 5776897 5776898 Smlt1623 Smlt1624 pilW pilX TRUE 0.991 4.000 0.171 NA Y NA
 5776898 5776899 Smlt1624 Smlt1625 pilX pilY1 TRUE 0.977 12.000 0.077 NA Y NA
 5776899 5776900 Smlt1625 Smlt1626 pilY1 pilE TRUE 0.993 8.000 0.346 NA Y NA
 5776900 10768846 Smlt1626 Smlt_t21 pilE   FALSE 0.310 49.000 0.000 NA   NA
 5776902 10768847 Smlt1628 Smlt_t23 uvrB   FALSE 0.173 109.000 0.000 NA   NA
 5776903 5776904 Smlt1629 Smlt1630     FALSE 0.260 72.000 0.000 NA   NA
 5776904 5776905 Smlt1630 Smlt1631     TRUE 0.660 17.000 0.000 NA   NA
 5776907 5776908 Smlt1633 Smlt1634     FALSE 0.465 31.000 0.000 NA   NA
 5776909 5776910 Smlt1635 Smlt1636     TRUE 0.998 2.000 0.667 1.000 Y NA
 5776910 5776911 Smlt1636 Smlt1637     FALSE 0.304 60.000 0.000 1.000   NA
 5776911 5776912 Smlt1637 Smlt1638     TRUE 0.939 4.000 0.045 1.000   NA
 5776912 5776913 Smlt1638 Smlt1639     TRUE 0.998 4.000 0.746 0.051 Y NA
 5776913 5776914 Smlt1639 Smlt1640   msbA TRUE 0.972 -3.000 0.120 1.000 N NA
 5776914 5776915 Smlt1640 Smlt1641 msbA lpxK TRUE 0.968 0.000 0.205 1.000 N NA
 5776915 5776916 Smlt1641 Smlt1642 lpxK kdsB TRUE 0.839 75.000 0.054 1.000 Y NA
 5776916 5776917 Smlt1642 Smlt1643 kdsB   TRUE 0.955 -3.000 0.050 1.000 N NA
 5776917 5776918 Smlt1643 Smlt1644     TRUE 0.953 -3.000 0.006 1.000   NA
 5776918 5776919 Smlt1644 Smlt1645   uvrC TRUE 0.949 -3.000 0.004 1.000   NA
 5776919 5776920 Smlt1645 Smlt1646 uvrC pgsA TRUE 0.887 19.000 0.227 1.000 N NA
 5776920 10768848 Smlt1646 Smlt_t25 pgsA   FALSE 0.031 238.000 0.000 NA   NA
 10768848 5776921 Smlt_t25 Smlt1648     FALSE 0.115 138.000 0.000 NA   NA
 5776921 10768849 Smlt1648 Smlt_t26     FALSE 0.157 117.000 0.000 NA   NA
 10768849 5776922 Smlt_t26 Smlt1651     FALSE 0.015 369.000 0.000 NA   NA
 5776922 5776923 Smlt1651 Smlt1652     TRUE 0.992 -3.000 0.333 NA   NA
 5776923 5776924 Smlt1652 Smlt1653     TRUE 0.971 11.000 0.375 NA   NA
 5776924 5776925 Smlt1653 Smlt1654     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5776926 5776927 Smlt1655 Smlt1656     TRUE 0.867 -7.000 0.000 NA   NA
 10768850 10768851 Smlt_t27 Smlt_t29     FALSE 0.023 285.000 0.000 NA   NA
 10768851 5776928 Smlt_t29 Smlt1657     FALSE 0.409 35.000 0.000 NA   NA
 5776930 5776931 Smlt1659 Smlt1660     FALSE 0.025 271.000 0.000 NA   NA
 5776931 5776932 Smlt1660 Smlt1661     FALSE 0.026 261.000 0.000 NA   NA
 5776933 5776934 Smlt1662 Smlt1663     TRUE 0.977 18.000 0.071 0.059 Y NA
 5776935 5776936 Smlt1664 Smlt1665     FALSE 0.249 79.000 0.000 NA   NA
 5776936 5776937 Smlt1665 Smlt1666     FALSE 0.301 52.000 0.000 NA   NA
 5776939 5776940 Smlt1668 Smlt1669     TRUE 0.581 44.000 0.000 0.010   NA
 5776940 5776941 Smlt1669 Smlt1670     FALSE 0.257 75.000 0.000 NA   NA
 5776943 5776944 Smlt1672 Smlt1674     FALSE 0.331 44.000 0.000 NA   NA
 5776948 5776949 Smlt1679 Smlt1680     TRUE 0.921 21.000 0.262 NA   NA
 5776952 5776953 Smlt1683 Smlt1684     FALSE 0.069 169.000 0.000 NA   NA
 5776954 5776955 Smlt1685 Smlt1686     FALSE 0.017 353.000 0.000 NA   NA
 5776956 5776957 Smlt1687 Smlt1688     TRUE 0.977 -3.000 0.067 NA   NA
 5776958 5776959 Smlt1689 Smlt1690   hemN FALSE 0.354 45.000 0.000 1.000   NA
 5776960 5776961 Smlt1691 Smlt1692   wbpO FALSE 0.119 143.000 0.000 1.000   NA
 5776961 5776962 Smlt1692 Smlt1693 wbpO   FALSE 0.316 38.000 0.012 1.000 N NA
 5776962 5776963 Smlt1693 Smlt1694     FALSE 0.338 49.000 0.000 1.000   NA
 5776964 5776965 Smlt1695 Smlt1696   fkbP TRUE 0.924 -13.000 0.028 NA   NA
 5776966 5776967 Smlt1697 Smlt1699     FALSE 0.040 296.000 0.015 NA   NA
 5776967 5776968 Smlt1699 Smlt1700     FALSE 0.035 224.000 0.000 NA   NA
 5776968 5776969 Smlt1700 Smlt1701     FALSE 0.404 69.000 0.011 1.000   NA
 5776970 5776971 Smlt1703 Smlt1704 exoD   TRUE 0.967 -16.000 0.200 NA   NA
 5776972 5776973 Smlt1705 Smlt1706   pitA TRUE 0.966 14.000 0.030 NA Y NA
 5776974 5776975 Smlt1707 Smlt1708     FALSE 0.042 112.000 0.000 1.000 N NA
 5776975 5776976 Smlt1708 Smlt1709   parE FALSE 0.012 192.000 0.000 1.000 N NA
 5776976 5776977 Smlt1709 Smlt1710 parE   FALSE 0.262 68.000 0.000 NA   NA
 5776978 5776979 Smlt1711 Smlt1712 pyrG kdsA FALSE 0.466 90.000 0.138 1.000 N NA
 5776979 5776980 Smlt1712 Smlt1713 kdsA   TRUE 0.942 -3.000 0.004 NA   NA
 5776980 5776981 Smlt1713 Smlt1714     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776981 5776982 Smlt1714 Smlt1715   eno FALSE 0.252 97.000 0.003 NA   NA
 5776982 5776983 Smlt1715 Smlt1716 eno   TRUE 0.954 5.000 0.241 1.000 N NA
 5776983 5776984 Smlt1716 Smlt1717   ispD TRUE 0.979 -3.000 0.185 1.000 N NA
 5776984 5776985 Smlt1717 Smlt1718 ispD ispF TRUE 0.970 35.000 0.419 1.000 Y NA
 5776985 5776986 Smlt1718 Smlt1719 ispF truD TRUE 0.987 -3.000 0.173 1.000   NA
 5776988 5776989 Smlt1721 Smlt1722 surE pcm TRUE 0.993 -3.000 0.353 1.000   NA
 5776989 5776990 Smlt1722 Smlt1723 pcm   TRUE 0.844 19.000 0.055 NA   NA
 5776990 5776991 Smlt1723 Smlt1724     TRUE 0.938 -21.000 0.074 NA   NA
 5776991 5776992 Smlt1724 Smlt1725     FALSE 0.042 210.000 0.000 NA   NA
 5776993 5776994 Smlt1726 Smlt1727     TRUE 0.820 14.000 0.014 NA   NA
 5776995 5776996 Smlt1728 Smlt1729 ftsJ ftsH FALSE 0.392 64.000 0.066 NA N NA
 5776996 5776997 Smlt1729 Smlt1730 ftsH   FALSE 0.188 103.000 0.000 NA   NA
 5776997 5776998 Smlt1730 Smlt1731     TRUE 0.810 5.000 0.000 NA   NA
 5776998 5776999 Smlt1731 Smlt1733     FALSE 0.032 234.000 0.000 NA   NA
 5776999 5777000 Smlt1733 Smlt1734   folP FALSE 0.006 247.000 0.000 1.000 N NA
 5777000 5777001 Smlt1734 Smlt1735 folP miaA TRUE 0.831 0.000 0.009 1.000 N NA
 5777001 5777002 Smlt1735 Smlt1736 miaA hfq TRUE 0.813 97.000 0.531 1.000   NA
 5777002 5777003 Smlt1736 Smlt1737 hfq hflX TRUE 0.922 15.000 0.141 1.000   NA
 5777003 5777004 Smlt1737 Smlt1738 hflX   FALSE 0.198 115.000 0.002 NA   NA
 5777004 5777005 Smlt1738 Smlt1739     TRUE 0.540 35.000 0.011 NA   NA
 5777005 5777006 Smlt1739 Smlt1740   lexA TRUE 0.526 172.000 0.500 1.000   NA
 5777006 5777007 Smlt1740 Smlt1741 lexA   FALSE 0.065 205.000 0.005 0.058 N NA
 5777007 5777008 Smlt1741 Smlt1742   recX TRUE 0.656 111.000 0.296 1.000   NA
 5777008 5777009 Smlt1742 Smlt1743 recX alaS FALSE 0.461 110.000 0.085 1.000   NA
 5777009 5777010 Smlt1743 Smlt1744 alaS   FALSE 0.102 148.000 0.020 1.000 N NA
 5777010 10768853 Smlt1744 Smlt_t31     FALSE 0.246 80.000 0.000 NA   NA
 5777011 5777012 Smlt1745 Smlt1746     FALSE 0.409 35.000 0.000 NA   NA
 5777014 5777015 Smlt1748 Smlt1749 aceE   FALSE 0.040 214.000 0.000 NA   NA
 5777016 5777017 Smlt1750 Smlt1751     TRUE 0.987 -3.000 0.333 NA N NA
 5777017 5777018 Smlt1751 Smlt1753     FALSE 0.479 138.000 0.000 NA Y NA
 5777018 5777019 Smlt1753 Smlt1754     TRUE 0.957 11.000 0.000 1.000 Y NA
 5777020 5777021 Smlt1755 Smlt1756 plcN1   TRUE 0.986 -3.000 0.300 1.000 N NA
 5777021 5777022 Smlt1756 Smlt1757     FALSE 0.037 121.000 0.000 1.000 N NA
 5777022 5777023 Smlt1757 Smlt1758   adhB TRUE 0.992 -3.000 0.139 0.007   NA
 5777026 5777027 Smlt1761 Smlt1762     FALSE 0.124 133.000 0.000 NA   NA
 10768854 10768855 Smlt_t32 Smlt_t35     FALSE 0.070 168.000 0.000 NA   NA
 10768855 5777030 Smlt_t35 Smlt1766     TRUE 0.847 -10.000 0.000 NA   NA
 5777030 5777031 Smlt1766 Smlt1767   thiD TRUE 0.984 -3.000 0.148 NA   NA
 5777031 5777032 Smlt1767 Smlt1768 thiD   TRUE 0.551 65.000 0.065 NA   NA
 5777032 5777033 Smlt1768 Smlt1769     TRUE 0.895 13.000 0.065 NA   NA
 5777033 5777034 Smlt1769 Smlt1770     TRUE 0.968 -3.000 0.027 NA   NA
 5777034 5777035 Smlt1770 Smlt1771     FALSE 0.345 85.000 0.050 1.000 N NA
 5777035 5777036 Smlt1771 Smlt1772     FALSE 0.409 93.000 0.102 1.000 N NA
 5777037 5777038 Smlt1773 Smlt1774 dapA   TRUE 0.655 33.000 0.028 NA   NA
 5777041 5777042 Smlt1777 Smlt1778 pcnB   TRUE 0.958 4.000 0.234 1.000 N NA
 5777042 5777043 Smlt1778 Smlt1779   panB TRUE 0.931 35.000 0.117 1.000 Y NA
 5777043 5777044 Smlt1779 Smlt1780 panB panC TRUE 0.999 -3.000 0.395 0.001 Y NA
 5777044 5777045 Smlt1780 Smlt1781 panC   FALSE 0.504 28.000 0.000 NA   NA
 5777045 5777046 Smlt1781 Smlt1782   panD FALSE 0.224 88.000 0.000 NA   NA
 5777046 5777047 Smlt1782 Smlt1783 panD pgi TRUE 0.899 -3.000 0.011 1.000 N NA
 5777048 5777049 Smlt1784 Smlt1785     TRUE 0.997 -3.000 0.197 1.000 Y NA
 5777050 5777051 Smlt1786 Smlt1787     TRUE 0.975 -19.000 0.006 1.000 Y NA
 5777051 5777052 Smlt1787 Smlt1788     FALSE 0.011 201.000 0.000 1.000 N NA
 5777053 5777054 Smlt1789 Smlt1790 kgdA edd FALSE 0.304 207.000 0.008 1.000 Y NA
 5777054 5777055 Smlt1790 Smlt1791 edd pgl TRUE 0.912 59.000 0.202 1.000 Y NA
 5777055 5777056 Smlt1791 Smlt1792 pgl glk TRUE 0.993 -3.000 0.021 1.000 Y NA
 5777056 5777057 Smlt1792 Smlt1793 glk zwf TRUE 0.995 -3.000 0.055 1.000 Y NA
 5777060 5777061 Smlt1796 Smlt1797 sdhC sdhD TRUE 0.999 -3.000 0.291 0.001 Y NA
 5777061 5777062 Smlt1797 Smlt1798 sdhD sdhA TRUE 0.991 32.000 0.705 0.001 Y NA
 5777062 5777063 Smlt1798 Smlt1799 sdhA sdhB TRUE 0.977 67.000 0.604 0.001 Y NA
 5777063 5777064 Smlt1799 Smlt1800 sdhB   TRUE 0.565 99.000 0.151 NA   NA
 5777064 5777065 Smlt1800 Smlt1801     TRUE 0.518 41.000 0.016 NA   NA
 5777065 5777066 Smlt1801 Smlt1802     TRUE 0.728 24.000 0.020 NA   NA
 5777066 5777067 Smlt1802 Smlt1803     TRUE 0.992 -7.000 0.620 0.051 N NA
 5777067 5777068 Smlt1803 Smlt1804     FALSE 0.036 222.000 0.000 NA   NA
 5777069 5777070 Smlt1805 Smlt1806   mutY TRUE 0.923 6.000 0.150 NA N NA
 5777070 5777071 Smlt1806 Smlt1807 mutY ftsY FALSE 0.122 85.000 0.004 1.000 N NA
 5777074 5777075 Smlt1810 Smlt1811   coaD TRUE 0.889 27.000 0.367 1.000 N NA
 5777075 5777076 Smlt1811 Smlt1812 coaD   FALSE 0.366 61.000 0.007 NA   NA
 5777076 5777077 Smlt1812 Smlt1813   fdx FALSE 0.238 133.000 0.020 NA   NA
 5777077 5777078 Smlt1813 Smlt1814 fdx ggt TRUE 0.978 -3.000 0.076 NA   NA
 5777078 5777079 Smlt1814 Smlt1815 ggt   FALSE 0.271 121.000 0.015 1.000   NA
 5777081 5777082 Smlt1817 Smlt1818     TRUE 0.973 -19.000 0.273 NA   NA
 5777084 5777085 Smlt1820 Smlt1821     TRUE 0.981 -3.000 0.220 NA N NA
 5777085 5777086 Smlt1821 Smlt1822     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777086 5777087 Smlt1822 Smlt1823     TRUE 0.728 14.000 0.000 1.000   NA
 5777089 5777090 Smlt1825 Smlt1826     FALSE 0.055 140.000 0.004 1.000 N NA
 5777092 5777093 Smlt1828 Smlt1829     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777093 5777094 Smlt1829 Smlt1830   smeV TRUE 0.549 140.000 0.009 1.000 Y NA
 5777094 5777095 Smlt1830 Smlt1831 smeV smeW TRUE 0.763 113.000 0.750 1.000 N NA
 5777095 5777096 Smlt1831 Smlt1832 smeW   TRUE 0.793 26.000 0.160 1.000 N NA
 5777096 5777097 Smlt1832 Smlt1833   smeX TRUE 0.977 -3.000 0.160 1.000 N NA
 5777100 5777101 Smlt1836 Smlt1837     FALSE 0.160 115.000 0.000 NA   NA
 5777101 5777102 Smlt1837 Smlt1838     FALSE 0.220 90.000 0.000 NA   NA
 5777102 5777103 Smlt1838 Smlt1839     FALSE 0.423 34.000 0.000 NA   NA
 5777103 5777104 Smlt1839 Smlt1840     TRUE 0.964 6.000 0.208 NA   NA
 5777104 5777105 Smlt1840 Smlt1841     FALSE 0.233 85.000 0.000 NA   NA
 5777108 5777109 Smlt1844 Smlt1844A     TRUE 0.976 -3.000 0.000 0.001   NA
 5777109 5777110 Smlt1844A Smlt1844B     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777110 5777111 Smlt1844B Smlt1845     FALSE 0.341 42.000 0.000 NA   NA
 5777111 5777112 Smlt1845 Smlt1846     TRUE 0.977 18.000 0.071 0.058 Y NA
 5777112 5777113 Smlt1846 Smlt1846A     FALSE 0.179 106.000 0.000 NA   NA
 5777113 5777114 Smlt1846A Smlt1846B     TRUE 0.867 -7.000 0.000 NA   NA
 5777115 5777116 Smlt1849 Smlt1849A     FALSE 0.094 151.000 0.000 NA   NA
 5777116 5777117 Smlt1849A Smlt1850     FALSE 0.020 314.000 0.000 NA   NA
 5777117 5777118 Smlt1850 Smlt1851     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777118 5777119 Smlt1851 Smlt1852     FALSE 0.037 221.000 0.000 NA   NA
 5777119 5777120 Smlt1852 Smlt1853     TRUE 0.757 64.000 0.286 NA   NA
 5777120 5777121 Smlt1853 Smlt1854     TRUE 0.877 0.000 0.000 NA   NA
 5777121 5777122 Smlt1854 Smlt1855     TRUE 0.877 0.000 0.000 NA   NA
 5777122 5777123 Smlt1855 Smlt1856     TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA   NA
 5777123 5777124 Smlt1856 Smlt1857     TRUE 0.883 20.000 0.130 NA   NA
 5777124 5777125 Smlt1857 Smlt1858     TRUE 0.954 3.000 0.087 NA   NA
 5777125 5777126 Smlt1858 Smlt1859     FALSE 0.236 84.000 0.000 NA   NA
 5777126 5777127 Smlt1859 Smlt1860     TRUE 0.798 6.000 0.000 NA   NA
 5777127 5777128 Smlt1860 Smlt1861     TRUE 0.877 0.000 0.000 NA   NA
 5777128 5777129 Smlt1861 Smlt1862     FALSE 0.055 190.000 0.000 NA   NA
 5777129 5777130 Smlt1862 Smlt1863     TRUE 0.991 -3.000 0.286 NA   NA
 5777130 5777131 Smlt1863 Smlt1864     TRUE 0.842 3.000 0.000 NA   NA
 5777131 5777132 Smlt1864 Smlt1865     TRUE 0.987 8.000 0.667 NA   NA
 5777132 5777133 Smlt1865 Smlt1866     FALSE 0.033 229.000 0.000 NA   NA
 5777133 5777134 Smlt1866 Smlt1867     TRUE 0.976 3.000 0.250 NA   NA
 5777134 5777135 Smlt1867 Smlt1868     TRUE 0.991 2.000 0.625 NA   NA
 5777135 5777136 Smlt1868 Smlt1869   B TRUE 0.989 11.000 0.857 1.000   NA
 5777136 5777137 Smlt1869 Smlt1870 B   TRUE 0.987 2.000 0.444 NA   NA
 5777137 5777138 Smlt1870 Smlt1871     TRUE 0.986 0.000 0.333 NA   NA
 5777138 5777139 Smlt1871 Smlt1872     TRUE 0.992 0.000 0.571 NA   NA
 5777139 5777140 Smlt1872 Smlt1873     TRUE 0.729 12.000 0.000 NA   NA
 5777140 5777141 Smlt1873 Smlt1874     TRUE 0.878 71.000 0.667 NA   NA
 5777142 5777143 Smlt1875 Smlt1876     TRUE 0.611 107.000 0.231 NA   NA
 5777143 5777144 Smlt1876 Smlt1877     FALSE 0.206 96.000 0.000 NA   NA
 5777144 5777145 Smlt1877 Smlt1878     FALSE 0.012 485.000 0.000 NA   NA
 5777145 5777146 Smlt1878 Smlt1879     TRUE 0.995 -3.000 0.521 NA   NA
 5777146 5777147 Smlt1879 Smlt1880     FALSE 0.154 119.000 0.000 NA   NA
 5777148 5777149 Smlt1881 Smlt1882     TRUE 0.999 -3.000 0.429 0.001 Y NA
 5777149 5777150 Smlt1882 Smlt1883     FALSE 0.020 311.000 0.000 NA   NA
 5777150 5777151 Smlt1883 Smlt1884     TRUE 0.988 -22.000 0.667 NA   NA
 5777151 5777152 Smlt1884 Smlt1885     TRUE 0.899 2.000 0.007 NA   NA
 5777152 5777153 Smlt1885 Smlt1886     FALSE 0.200 132.000 0.011 NA   NA
 5777153 5777154 Smlt1886 Smlt1887     TRUE 0.985 -3.000 0.156 NA   NA
 5777154 5777155 Smlt1887 Smlt1888     TRUE 0.996 -3.000 0.600 NA   NA
 5777155 5777156 Smlt1888 Smlt1889     TRUE 0.747 11.000 0.000 NA   NA
 5777156 5777157 Smlt1889 Smlt1890     TRUE 0.715 71.000 0.222 NA   NA
 5777157 5777158 Smlt1890 Smlt1891     TRUE 0.985 6.000 0.556 NA   NA
 5777158 5777159 Smlt1891 Smlt1892     TRUE 0.994 -3.000 0.444 NA   NA
 5777159 5777160 Smlt1892 Smlt1893     TRUE 0.978 6.000 0.375 NA   NA
 5777160 5777161 Smlt1893 Smlt1894     TRUE 0.989 6.000 0.750 NA   NA
 5777161 5777162 Smlt1894 Smlt1895     FALSE 0.208 95.000 0.000 NA   NA
 5777162 5777163 Smlt1895 Smlt1896     TRUE 0.702 14.000 0.000 NA   NA
 5777163 5777164 Smlt1896 Smlt1897     FALSE 0.200 98.000 0.000 NA   NA
 5777164 5777165 Smlt1897 Smlt1898     TRUE 0.987 1.000 0.400 NA   NA
 5777166 5777167 Smlt1900 Smlt1901     TRUE 0.986 -3.000 0.167 NA   NA
 5777167 5777168 Smlt1901 Smlt1902     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777168 5777169 Smlt1902 Smlt1903     TRUE 0.976 12.000 0.500 NA   NA
 5777169 5777170 Smlt1903 Smlt1905     FALSE 0.009 772.000 0.000 NA   NA
 5777170 5777171 Smlt1905 Smlt1906     TRUE 0.847 -10.000 0.000 NA   NA
 5777172 5777173 Smlt1907 Smlt1908     TRUE 0.779 -57.000 0.000 NA   NA
 5777174 5777175 Smlt1911 Smlt1912     FALSE 0.266 64.000 0.000 NA   NA
 5777176 5777177 Smlt1913 Smlt1914     TRUE 0.829 -13.000 0.000 NA   NA
 5777177 5777178 Smlt1914 Smlt1915     TRUE 0.842 3.000 0.000 NA   NA
 5777178 5777179 Smlt1915 Smlt1916     TRUE 0.563 23.000 0.000 NA   NA
 5777179 5777180 Smlt1916 Smlt1917     TRUE 0.827 4.000 0.000 NA   NA
 5777180 5777181 Smlt1917 Smlt1918   rdgC FALSE 0.027 259.000 0.000 NA   NA
 5777181 5777182 Smlt1918 Smlt1920 rdgC   FALSE 0.086 155.000 0.000 NA   NA
 5777182 5777183 Smlt1920 Smlt1921     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777183 5777184 Smlt1921 Smlt1922     FALSE 0.148 121.000 0.000 NA   NA
 5777184 5777185 Smlt1922 Smlt1923     TRUE 0.877 0.000 0.000 NA   NA
 5777185 5777186 Smlt1923 Smlt1924     FALSE 0.274 61.000 0.000 NA   NA
 5777186 5777187 Smlt1924 Smlt1925     TRUE 0.853 2.000 0.000 NA   NA
 5777189 5777190 Smlt1927 Smlt1929     FALSE 0.011 504.000 0.000 NA   NA
 5777191 5777192 Smlt1930 Smlt1931     TRUE 0.789 -31.000 0.000 NA   NA
 5777192 5777193 Smlt1931 Smlt1932     TRUE 0.643 18.000 0.000 NA   NA
 5777193 5777194 Smlt1932 Smlt1933     TRUE 0.867 -7.000 0.000 NA   NA
 5777194 5777195 Smlt1933 Smlt1934     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777195 5777196 Smlt1934 Smlt1935     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777196 5777197 Smlt1935 Smlt1936     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777197 5777198 Smlt1936 Smlt1937     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777198 5777199 Smlt1937 Smlt1938     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777201 5777202 Smlt1940 Smlt1941     FALSE 0.310 49.000 0.000 NA   NA
 5777202 10768857 Smlt1941 Smlt_t37     FALSE 0.063 175.000 0.000 NA   NA
 10768857 5777203 Smlt_t37 Smlt1944     FALSE 0.015 379.000 0.000 NA   NA
 5777203 10768858 Smlt1944 Smlt1945     TRUE 0.591 21.000 0.000 NA   NA
 10768858 5777204 Smlt1945 Smlt1946     FALSE 0.024 279.000 0.000 NA   NA
 5777204 5777205 Smlt1946 Smlt1947     TRUE 0.810 5.000 0.000 NA   NA
 5777205 5777206 Smlt1947 Smlt1948     FALSE 0.477 30.000 0.000 NA   NA
 5777206 5777207 Smlt1948 Smlt1949     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777207 5777208 Smlt1949 Smlt1950     TRUE 0.877 0.000 0.000 NA   NA
 5777208 5777209 Smlt1950 Smlt1951     TRUE 0.991 5.000 0.800 NA   NA
 5777209 5777210 Smlt1951 Smlt1952     FALSE 0.045 205.000 0.000 NA   NA
 5777210 5777211 Smlt1952 Smlt1953     FALSE 0.012 464.000 0.000 NA   NA
 5777211 5777212 Smlt1953 Smlt1954     TRUE 0.931 4.000 0.038 NA   NA
 5777212 5777213 Smlt1954 Smlt1955     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777213 5777214 Smlt1955 Smlt1956     TRUE 0.853 2.000 0.000 NA   NA
 5777214 5777215 Smlt1956 Smlt1957     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777215 5777216 Smlt1957 Smlt1958     TRUE 0.877 0.000 0.000 NA   NA
 5777216 5777217 Smlt1958 Smlt1959     TRUE 0.829 -13.000 0.000 NA   NA
 5777217 5777218 Smlt1959 Smlt1960     TRUE 0.798 6.000 0.000 NA   NA
 5777218 5777219 Smlt1960 Smlt1961     FALSE 0.251 78.000 0.000 NA   NA
 5777219 5777220 Smlt1961 Smlt1962     FALSE 0.260 72.000 0.000 NA   NA
 5777220 5777221 Smlt1962 Smlt1963     FALSE 0.293 55.000 0.000 NA   NA
 5777221 5777222 Smlt1963 Smlt1964     TRUE 0.853 2.000 0.000 NA   NA
 5777222 5777223 Smlt1964 Smlt1965     TRUE 0.853 2.000 0.000 NA   NA
 5777223 5777224 Smlt1965 Smlt1967     FALSE 0.044 206.000 0.000 NA   NA
 5777224 5777225 Smlt1967 Smlt1968     TRUE 0.877 0.000 0.000 NA   NA
 5777225 5777226 Smlt1968 Smlt1969     TRUE 0.772 9.000 0.000 NA   NA
 5777226 5777227 Smlt1969 Smlt1970     TRUE 0.660 17.000 0.000 NA   NA
 5777227 5777228 Smlt1970 Smlt1971     TRUE 0.853 2.000 0.000 NA   NA
 5777228 5777229 Smlt1971 Smlt1972     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777229 5777230 Smlt1972 Smlt1973     TRUE 0.842 3.000 0.000 NA   NA
 5777230 5777231 Smlt1973 Smlt1974     TRUE 0.702 14.000 0.000 NA   NA
 5777231 5777232 Smlt1974 Smlt1975     FALSE 0.490 29.000 0.000 NA   NA
 5777232 5777233 Smlt1975 Smlt1976     TRUE 0.827 4.000 0.000 NA   NA
 5777233 5777234 Smlt1976 Smlt1977     FALSE 0.197 99.000 0.000 NA   NA
 5777234 5777235 Smlt1977 Smlt1978     FALSE 0.239 83.000 0.000 NA   NA
 5777235 5777236 Smlt1978 Smlt1979     FALSE 0.465 31.000 0.000 NA   NA
 5777236 5777237 Smlt1979 Smlt1980     FALSE 0.185 104.000 0.000 NA   NA
 5777237 5777238 Smlt1980 Smlt1982     FALSE 0.014 413.000 0.000 NA   NA
 5777240 5777241 Smlt1983A Smlt1984     TRUE 0.941 4.000 0.063 NA   NA
 5777247 5777248 Smlt1990 Smlt1991     FALSE 0.306 64.000 0.025 1.000 N NA
 5777248 5777249 Smlt1991 Smlt1992   dnaK TRUE 0.605 183.000 0.049 0.006 Y NA
 5777249 5777250 Smlt1992 Smlt1993 dnaK dnaJ TRUE 0.824 155.000 0.236 0.003 Y NA
 5777252 5777253 Smlt1995 Smlt1997   pdxK FALSE 0.001 575.000 0.000 NA N NA
 5777253 5777254 Smlt1997 Smlt1998 pdxK   TRUE 0.875 -3.000 0.007 1.000 N NA
 5777255 5777256 Smlt2000 Smlt2001     FALSE 0.260 71.000 0.000 NA   NA
 5777256 5777257 Smlt2001 Smlt2002     TRUE 0.927 -7.000 0.012 1.000   NA
 5777257 5777258 Smlt2002 Smlt2003     FALSE 0.427 41.000 0.005 NA   NA
 5777258 5777259 Smlt2003 Smlt2004     TRUE 0.961 -3.000 0.017 NA   NA
 5777261 5777262 Smlt2006 Smlt2007     FALSE 0.058 184.000 0.000 NA   NA
 5777263 5777264 Smlt2008 Smlt2009 queA tgt TRUE 0.830 178.000 0.360 0.001 Y NA
 5777264 5777265 Smlt2009 Smlt2010 tgt   FALSE 0.457 134.000 0.325 NA N NA
 5777265 5777266 Smlt2010 Smlt2011   secD TRUE 0.907 38.000 0.083 NA Y NA
 5777266 5777267 Smlt2011 Smlt2012 secD secF TRUE 0.984 17.000 0.084 0.001 Y NA
 5777267 5777268 Smlt2012 Smlt2015 secF   FALSE 0.010 694.000 0.000 NA   NA
 5777269 5777270 Smlt2016 Smlt2017     FALSE 0.291 92.000 0.007 NA   NA
 5777270 5777271 Smlt2017 Smlt2018     TRUE 0.955 -3.000 0.011 NA   NA
 5777274 5777275 Smlt2022 Smlt2023 cspG   FALSE 0.122 157.000 0.046 NA N NA
 5777275 5777276 Smlt2023 Smlt2024     TRUE 0.642 33.000 0.023 NA   NA
 5777276 5777277 Smlt2024 Smlt2026   apt FALSE 0.013 694.000 0.004 NA   NA
 5777278 5777279 Smlt2027 Smlt2028 dbpA   FALSE 0.091 153.000 0.000 NA   NA
 5777280 5777281 Smlt2029 Smlt2030   uup FALSE 0.107 150.000 0.000 1.000   NA
 5777282 5777283 Smlt2031 Smlt2032     TRUE 0.977 10.000 0.000 0.006 Y NA
 5777284 5777285 Smlt2033 Smlt2034 smmG smmH TRUE 0.995 -3.000 0.778 NA N NA
 5777285 5777286 Smlt2034 Smlt2035 smmH smmI TRUE 0.998 -3.000 0.481 NA Y NA
 5777287 5777288 Smlt2036 Smlt2037     TRUE 0.939 -7.000 0.024 NA   NA
 5777288 5777289 Smlt2037 Smlt2038     TRUE 0.828 15.000 0.016 1.000   NA
 5777289 5777290 Smlt2038 Smlt2039     FALSE 0.486 162.000 0.364 NA   NA
 5777290 5777291 Smlt2039 Smlt2040     TRUE 0.724 40.000 0.123 NA   NA
 5777291 5777292 Smlt2040 Smlt2041   rpmJ2 FALSE 0.173 147.000 0.014 NA   NA
 5777293 5777294 Smlt2042 Smlt2043 cmk rpsA FALSE 0.219 199.000 0.281 1.000 N NA
 5777294 5777295 Smlt2043 Smlt2044 rpsA ihfB TRUE 0.621 89.000 0.292 1.000 N NA
 5777295 5777296 Smlt2044 Smlt2045 ihfB   TRUE 0.696 76.000 0.208 NA   NA
 5777296 5777297 Smlt2045 Smlt2046     TRUE 0.985 7.000 0.576 NA   NA
 5777297 5777298 Smlt2046 Smlt2047   wbpL TRUE 0.879 4.000 0.038 1.000 N NA
 5777298 5777299 Smlt2047 Smlt2048 wbpL wbiI TRUE 0.986 4.000 0.048 1.000 Y NA
 5777299 5777300 Smlt2048 Smlt2049 wbiI galU TRUE 0.998 -3.000 0.350 1.000 Y NA
 5777301 5777302 Smlt2051 Smlt2052     TRUE 0.940 100.000 0.588 1.000 Y NA
 5777302 5777303 Smlt2052 Smlt2053     TRUE 0.567 40.000 0.019 1.000   NA
 5777304 5777305 Smlt2054 Smlt2055 ndk   TRUE 0.944 11.000 0.156 1.000   NA
 5777305 5777306 Smlt2055 Smlt2056     TRUE 0.953 -13.000 0.086 1.000   NA
 5777306 5777307 Smlt2056 Smlt2057     TRUE 0.922 19.000 0.204 1.000   NA
 5777307 5777308 Smlt2057 Smlt2058     FALSE 0.433 66.000 0.015 1.000   NA
 5777308 5777309 Smlt2058 Smlt2059     TRUE 0.995 -3.000 0.492 1.000   NA
 5777309 5777310 Smlt2059 Smlt2060     TRUE 0.927 18.000 0.203 1.000   NA
 5777311 5777312 Smlt2061 Smlt2062     FALSE 0.208 95.000 0.000 NA   NA
 5777312 5777313 Smlt2062 Smlt2063     TRUE 0.523 75.000 0.143 1.000 N NA
 5777314 5777315 Smlt2064 Smlt2065     TRUE 0.527 26.000 0.000 NA   NA
 5777315 5777316 Smlt2065 Smlt2066     FALSE 0.028 250.000 0.000 NA   NA
 5777318 5777319 Smlt2069 Smlt2071 folD guaB FALSE 0.018 478.000 0.004 1.000   NA
 5777319 5777320 Smlt2071 Smlt2072 guaB guaA TRUE 0.745 104.000 0.190 0.001   NA
 5777320 5777321 Smlt2072 Smlt2074 guaA   FALSE 0.014 386.000 0.000 NA   NA
 5777321 5777322 Smlt2074 Smlt2075     TRUE 0.714 13.000 0.000 NA   NA
 5777322 5777323 Smlt2075 Smlt2076     FALSE 0.078 162.000 0.000 NA   NA
 5777323 10768859 Smlt2076 Smlt2077     FALSE 0.017 347.000 0.000 NA   NA
 10768859 5777324 Smlt2077 Smlt2077A     FALSE 0.086 155.000 0.000 NA   NA
 5777325 5777326 Smlt2079 Smlt2080     FALSE 0.014 396.000 0.000 NA   NA
 5777327 5777328 Smlt2081 Smlt2082     TRUE 0.643 18.000 0.000 NA   NA
 5777328 5777329 Smlt2082 Smlt2083     FALSE 0.230 86.000 0.000 NA   NA
 5777329 5777330 Smlt2083 Smlt2084     FALSE 0.236 84.000 0.000 NA   NA
 5777331 5777332 Smlt2085 Smlt2086     FALSE 0.200 98.000 0.000 NA   NA
 5777333 5777334 Smlt2087 Smlt2088     FALSE 0.310 49.000 0.000 NA   NA
 5777335 5777336 Smlt2089 Smlt2090     TRUE 0.993 -3.000 0.355 NA   NA
 5777336 5777337 Smlt2090 Smlt2091     TRUE 0.747 11.000 0.000 NA   NA
 5777338 5777339 Smlt2092 Smlt2093     FALSE 0.208 95.000 0.000 NA   NA
 5777339 5777340 Smlt2093 Smlt2094     FALSE 0.227 87.000 0.000 NA   NA
 5777340 5777341 Smlt2094 Smlt2095     TRUE 0.614 93.000 0.176 NA   NA
 5777342 5777343 Smlt2096 Smlt2097 cheW   FALSE 0.194 108.000 0.000 1.000   NA
 5777343 5777344 Smlt2097 Smlt2098     FALSE 0.228 96.000 0.000 1.000   NA
 5777345 5777346 Smlt2099 Smlt2100   ssuE FALSE 0.326 53.000 0.000 1.000   NA
 5777346 5777347 Smlt2100 Smlt2101 ssuE   FALSE 0.127 131.000 0.000 NA   NA
 5777347 5777348 Smlt2101 Smlt2102     TRUE 0.687 15.000 0.000 NA   NA
 5777348 5777349 Smlt2102 Smlt2103     TRUE 0.927 18.000 0.000 NA Y NA
 5777349 5777350 Smlt2103 Smlt2104     TRUE 0.810 5.000 0.000 NA   NA
 5777350 5777351 Smlt2104 Smlt2105     TRUE 0.933 -3.000 0.000 1.000   NA
 5777351 5777352 Smlt2105 Smlt2106     TRUE 0.933 -3.000 0.000 1.000   NA
 5777352 5777353 Smlt2106 Smlt2107     TRUE 0.961 16.000 0.000 0.037 Y NA
 5777355 5777356 Smlt2109 Smlt2110     TRUE 0.941 34.000 0.706 NA   NA
 5777359 5777360 Smlt2113 Smlt2114     FALSE 0.013 148.000 0.000 NA N NA
 5777362 5777363 Smlt2116 Smlt2117     TRUE 0.700 29.000 0.000 0.053   NA
 5777363 5777364 Smlt2117 Smlt2118     TRUE 0.714 15.000 0.000 1.000   NA
 5777365 5777366 Smlt2119 Smlt2120     FALSE 0.349 41.000 0.000 NA   NA
 5777368 5777369 Smlt2123 Smlt2124     TRUE 0.996 -3.000 0.714 NA   NA
 5777369 5777370 Smlt2124 Smlt2125   spcN FALSE 0.195 100.000 0.000 NA   NA
 5777371 5777372 Smlt2126 Smlt2127   murB TRUE 0.920 -6.000 0.008 NA   NA
 5777372 5777373 Smlt2127 Smlt2128 murB pyrD TRUE 0.698 9.000 0.009 1.000 N NA
 5777373 5777374 Smlt2128 Smlt2129 pyrD   TRUE 0.847 9.000 0.006 1.000   NA
 5777374 5777375 Smlt2129 Smlt2130     TRUE 0.955 5.000 0.138 NA   NA
 5777375 5777376 Smlt2130 Smlt2131     FALSE 0.255 76.000 0.000 NA   NA
 5777376 5777377 Smlt2131 Smlt2132     TRUE 0.886 0.000 0.000 0.053 N NA
 10768860 5777378 Smlt_t38 Smlt2133     FALSE 0.274 61.000 0.000 NA   NA
 5777378 5777379 Smlt2133 Smlt2134     FALSE 0.064 174.000 0.000 NA   NA
 5777384 5777385 Smlt2139 Smlt2140     TRUE 0.996 -10.000 0.200 0.030 Y NA
 5777386 5777387 Smlt2141 Smlt2142     TRUE 0.996 -3.000 0.156 1.000 Y NA
 5777387 5777388 Smlt2142 Smlt2143     TRUE 0.990 0.000 0.416 1.000   NA
 5777388 5777389 Smlt2143 Smlt2144     TRUE 0.977 -3.000 0.059 1.000   NA
 5777390 5777391 Smlt2144A Smlt2148     TRUE 0.540 25.000 0.000 NA   NA
 5777392 5777393 Smlt2149 Smlt2150     TRUE 0.978 -3.000 0.077 NA   NA
 5777393 5777394 Smlt2150 Smlt2151     FALSE 0.260 70.000 0.000 NA   NA
 5777396 5777397 Smlt2153 Smlt2154     FALSE 0.154 119.000 0.000 NA   NA
 5777397 5777398 Smlt2154 Smlt2156   thrA FALSE 0.016 358.000 0.000 NA   NA
 5777398 5777399 Smlt2156 Smlt2157 thrA thrB TRUE 0.992 -3.000 0.009 1.000 Y NA
 5777399 5777400 Smlt2157 Smlt2158 thrB thrC TRUE 0.964 30.000 0.233 1.000 Y NA
 5777402 5777403 Smlt2160 Smlt2161     FALSE 0.024 295.000 0.000 1.000   NA
 5777403 5777404 Smlt2161 Smlt2162   hisG TRUE 0.585 35.000 0.013 1.000   NA
 5777404 5777405 Smlt2162 Smlt2163 hisG hisD TRUE 0.998 -3.000 0.171 0.002 Y NA
 5777405 5777406 Smlt2163 Smlt2164 hisD hisC TRUE 0.999 -3.000 0.294 0.002 Y NA
 5777406 5777407 Smlt2164 Smlt2165 hisC hisB TRUE 0.999 -3.000 0.341 0.001 Y NA
 5777407 5777408 Smlt2165 Smlt2166 hisB hisH TRUE 0.998 -3.000 0.128 0.002 Y NA
 5777408 5777409 Smlt2166 Smlt2167 hisH hisA TRUE 0.998 -3.000 0.210 0.002 Y NA
 5777409 5777410 Smlt2167 Smlt2168 hisA hisF TRUE 0.998 -6.000 0.433 0.002 Y NA
 5777410 5777411 Smlt2168 Smlt2169 hisF hisI TRUE 0.998 -10.000 0.430 0.002 Y NA
 5777411 5777412 Smlt2169 Smlt2170 hisI   FALSE 0.251 104.000 0.003 1.000   NA
 5777412 5777413 Smlt2170 Smlt2171     FALSE 0.396 36.000 0.000 NA   NA
 5777413 5777414 Smlt2171 Smlt2172     FALSE 0.233 85.000 0.000 NA   NA
 5777414 5777415 Smlt2172 Smlt2173     FALSE 0.086 52.000 0.000 1.000 N NA
 5777415 5777416 Smlt2173 Smlt2174     TRUE 0.949 -3.000 0.038 1.000 N NA
 5777416 5777417 Smlt2174 Smlt2175     FALSE 0.095 402.000 0.000 1.000 Y NA
 5777417 5777418 Smlt2175 Smlt2176   actP FALSE 0.340 174.000 0.000 1.000 Y NA
 5777418 5777419 Smlt2176 Smlt2177 actP   TRUE 0.967 12.000 0.304 0.004 N NA
 5777420 5777421 Smlt2178 Smlt2179     FALSE 0.263 204.000 0.000 1.000 Y NA
 5777422 5777423 Smlt2180 Smlt2181     FALSE 0.026 142.000 0.000 1.000 N NA
 5777423 5777424 Smlt2181 Smlt2182     TRUE 0.507 61.000 0.115 1.000 N NA
 5777424 5777425 Smlt2182 Smlt2183   scrK TRUE 0.992 8.000 0.308 1.000 Y NA
 5777425 5777426 Smlt2183 Smlt2184 scrK   TRUE 0.994 -3.000 0.043 1.000 Y NA
 5777426 5777427 Smlt2184 Smlt2185   bmnA TRUE 0.921 20.000 0.000 1.000 Y NA
 5777428 5777429 Smlt2187 Smlt2188 masA   TRUE 0.974 4.000 0.231 1.000   NA
 5777429 5777430 Smlt2188 Smlt2189     TRUE 0.601 93.000 0.148 1.000   NA
 5777431 5777432 Smlt2190 Smlt2191     FALSE 0.249 79.000 0.000 NA   NA
 5777433 5777434 Smlt2192 Smlt2193     TRUE 0.981 83.000 0.833 0.002 Y NA
 5777437 5777438 Smlt2196 Smlt2197     TRUE 0.621 63.000 0.111 NA   NA
 5777438 5777439 Smlt2197 Smlt2198     TRUE 0.826 41.000 0.294 NA   NA
 5777440 5777441 Smlt2199 Smlt2200     TRUE 0.982 0.000 0.000 1.000 Y NA
 5777442 5777443 Smlt2201 Smlt2202 smeY smeZ FALSE 0.122 37.000 0.000 1.000 N NA
 5777443 5777444 Smlt2202 Smlt2203 smeZ   TRUE 0.812 -19.000 0.000 NA   NA
 5777444 5777445 Smlt2203 Smlt2204     FALSE 0.236 84.000 0.000 NA   NA
 5777446 5777447 Smlt2205 Smlt2206     FALSE 0.500 50.000 0.085 1.000 N NA
 5777447 5777448 Smlt2206 Smlt2207   hmgcL TRUE 0.542 101.000 0.125 0.053 N NA
 5777448 5777449 Smlt2207 Smlt2208 hmgcL   TRUE 0.973 -3.000 0.042 NA   NA
 5777449 5777450 Smlt2208 Smlt2209     TRUE 0.929 3.000 0.027 NA   NA
 5777451 5777452 Smlt2210 Smlt2211 feoA feoB TRUE 0.997 -3.000 0.178 1.000 Y NA
 5777452 5777453 Smlt2211 Smlt2212 feoB   TRUE 0.938 0.000 0.019 NA   NA
 5777454 5777455 Smlt2213 Smlt2214     FALSE 0.154 119.000 0.000 NA   NA
 5777455 5777456 Smlt2214 Smlt2215     TRUE 0.731 56.000 0.193 1.000   NA
 5777456 5777457 Smlt2215 Smlt2216     FALSE 0.483 5.000 0.000 1.000 N NA
 5777458 5777459 Smlt2217 Smlt2218 dapB carA FALSE 0.271 256.000 0.034 1.000 Y NA
 5777459 5777460 Smlt2218 Smlt2219 carA carB TRUE 0.883 150.000 0.345 0.001 Y NA
 5777460 5777461 Smlt2219 Smlt2220 carB greA TRUE 0.983 -3.000 0.241 1.000 N NA
 5777461 5777462 Smlt2220 Smlt2221 greA   TRUE 0.880 5.000 0.011 NA   NA
 5777464 5777465 Smlt2223 Smlt2224 recJ   FALSE 0.116 145.000 0.000 1.000   NA
 5777467 5777468 Smlt2226 Smlt2227 lytT prfB FALSE 0.103 145.000 0.000 NA   NA
 5777468 10768861 Smlt2227 Smlt2228a prfB   TRUE 0.765 -585.000 0.000 NA   NA
 10768861 5777469 Smlt2228a Smlt2229     FALSE 0.010 695.000 0.000 NA   NA
 5777469 5777470 Smlt2229 Smlt2230     FALSE 0.011 702.000 0.000 1.000   NA
 5777470 5777471 Smlt2230 Smlt2231   ilvK FALSE 0.074 64.000 0.000 1.000 N NA
 5777471 5777472 Smlt2231 Smlt2232 ilvK lysS FALSE 0.007 231.000 0.000 1.000 N NA
 5777472 5777473 Smlt2232 Smlt2233 lysS rpfG FALSE 0.023 206.000 0.005 1.000 N NA
 5777473 5777474 Smlt2233 Smlt2234 rpfG rpfC TRUE 0.964 74.000 0.450 0.025 Y NA
 5777475 5777476 Smlt2235 Smlt2236a rpfF fadD TRUE 0.583 201.000 0.108 0.053 Y NA
 5777476 10768862 Smlt2236a Smlt2236 fadD   TRUE 0.761 -1463.000 0.000 NA   NA
 10768862 5777477 Smlt2236 Smlt2237   betA FALSE 0.015 376.000 0.000 NA   NA
 5777477 5777478 Smlt2237 Smlt2238 betA betB TRUE 0.760 102.000 0.634 1.000 N NA
 5777478 5777479 Smlt2238 Smlt2239 betB betI TRUE 0.844 39.000 0.459 1.000 N NA
 5777481 5777482 Smlt2241 Smlt2242 acn smpA FALSE 0.030 261.000 0.000 1.000   NA
 5777483 5777484 Smlt2243 Smlt2244     TRUE 0.966 4.000 0.177 NA   NA
 5777484 5777485 Smlt2244 Smlt2245   acnB TRUE 0.535 44.000 0.023 NA   NA
 5777486 5777487 Smlt2246 Smlt2247     FALSE 0.218 91.000 0.000 NA   NA
 5777487 5777488 Smlt2247 Smlt2248   cheB FALSE 0.367 39.000 0.000 NA   NA
 5777488 5777489 Smlt2248 Smlt2249 cheB cheD TRUE 0.997 -3.000 0.267 1.000 Y NA
 5777489 5777490 Smlt2249 Smlt2250 cheD cheR TRUE 0.995 -3.000 0.056 1.000 Y NA
 5777490 5777491 Smlt2250 Smlt2251 cheR   TRUE 0.820 38.000 0.000 1.000 Y NA
 5777493 5777494 Smlt2254 Smlt2255     TRUE 0.626 102.000 0.222 NA   NA
 5777494 5777495 Smlt2255 Smlt2256   cheW TRUE 0.572 137.000 0.333 NA   NA
 5777495 5777496 Smlt2256 Smlt2257 cheW   FALSE 0.120 233.000 0.200 1.000 N NA
 5777496 5777497 Smlt2257 Smlt2258     FALSE 0.010 205.000 0.000 1.000 N NA
 5777497 5777498 Smlt2258 Smlt2260   cheA FALSE 0.166 371.000 0.000 0.008 Y NA
 5777498 5777499 Smlt2260 Smlt2261 cheA cheY TRUE 0.908 46.000 0.135 1.000 Y NA
 5777499 5777500 Smlt2261 Smlt2262 cheY   TRUE 0.995 -3.000 0.514 NA   NA
 5777500 5777501 Smlt2262 Smlt2263     FALSE 0.022 287.000 0.000 NA   NA
 5777501 5777502 Smlt2263 Smlt2264     TRUE 0.727 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5777502 5777503 Smlt2264 Smlt2265   motB TRUE 0.945 5.000 0.199 1.000 N NA
 5777503 5777504 Smlt2265 Smlt2266 motB motA TRUE 0.994 2.000 0.248 1.000 Y NA
 5777504 5777505 Smlt2266 Smlt2267 motA cheA TRUE 0.696 102.000 0.009 1.000 Y NA
 5777505 5777506 Smlt2267 Smlt2268 cheA cheZ TRUE 0.995 3.000 0.341 1.000 Y NA
 5777506 5777507 Smlt2268 Smlt2269 cheZ cheY2 TRUE 0.998 0.000 0.516 1.000 Y NA
 5777507 5777508 Smlt2269 Smlt2270 cheY2 fliA TRUE 0.773 58.000 0.283 0.083 N NA
 5777508 5777509 Smlt2270 Smlt2271 fliA   TRUE 0.992 -3.000 0.482 1.000 N NA
 5777509 5777510 Smlt2271 Smlt2272   flhF TRUE 0.974 -13.000 0.241 0.081 N NA
 5777510 5777511 Smlt2272 Smlt2273 flhF flhA TRUE 0.515 146.000 0.008 1.000 Y NA
 5777511 5777512 Smlt2273 Smlt2274 flhA flhB TRUE 0.996 -3.000 0.029 0.011 Y NA
 5777512 5777513 Smlt2274 Smlt2275 flhB   FALSE 0.257 85.000 0.000 1.000   NA
 5777513 5777514 Smlt2275 Smlt2276     FALSE 0.283 75.000 0.000 1.000   NA
 5777514 5777515 Smlt2276 Smlt2277   fliR FALSE 0.017 165.000 0.000 1.000 N NA
 5777515 5777516 Smlt2277 Smlt2278 fliR fliQ TRUE 0.958 32.000 0.215 1.000 Y NA
 5777516 5777517 Smlt2278 Smlt2279 fliQ fliP TRUE 0.925 83.000 0.177 0.011 Y NA
 5777517 5777518 Smlt2279 Smlt2280 fliP fliO TRUE 0.987 2.000 0.029 1.000 Y NA
 5777518 5777519 Smlt2280 Smlt2281 fliO fliN TRUE 0.994 -3.000 0.443 1.000   NA
 5777519 5777520 Smlt2281 Smlt2282 fliN fliM TRUE 0.998 -3.000 0.741 0.001   NA
 5777520 5777521 Smlt2282 Smlt2283 fliM fliL TRUE 0.986 11.000 0.029 0.001 Y NA
 5777521 5777522 Smlt2283 Smlt2284 fliL fliK FALSE 0.333 216.000 0.025 1.000 Y NA
 5777522 5777523 Smlt2284 Smlt2285 fliK fliJ TRUE 0.992 0.000 0.317 0.004   NA
 5777523 5777524 Smlt2285 Smlt2286 fliJ fliI TRUE 0.939 4.000 0.044 1.000   NA
 5777524 5777525 Smlt2286 Smlt2287 fliI fliH TRUE 0.995 -3.000 0.085 NA Y NA
 5777525 5777526 Smlt2287 Smlt2288 fliH fliG TRUE 0.998 -3.000 0.320 NA Y NA
 5777526 5777527 Smlt2288 Smlt2289 fliG fliF TRUE 0.996 -7.000 0.189 0.004 Y NA
 5777527 5777528 Smlt2289 Smlt2290 fliF fliE TRUE 0.997 14.000 0.910 0.004 Y NA
 5777529 5777530 Smlt2291 Smlt2292     TRUE 0.989 -3.000 0.111 0.055   NA
 5777531 5777532 Smlt2293 Smlt2294     FALSE 0.103 145.000 0.000 NA   NA
 5777532 5777533 Smlt2294 Smlt2295     FALSE 0.109 141.000 0.000 NA   NA
 5777533 5777534 Smlt2295 Smlt2296     TRUE 0.996 -3.000 0.050 0.083 Y NA
 5777534 5777535 Smlt2296 Smlt2297     TRUE 0.874 15.000 0.050 0.083 N NA
 5777535 5777536 Smlt2297 Smlt2299     FALSE 0.145 439.000 0.000 0.007 Y NA
 5777536 5777537 Smlt2299 Smlt2300     TRUE 0.669 93.000 0.238 NA   NA
 5777537 5777538 Smlt2300 Smlt2301     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777538 5777539 Smlt2301 Smlt2302   fliS TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777539 5777540 Smlt2302 Smlt2303 fliS fliD TRUE 0.934 129.000 0.500 0.002 Y NA
 5777540 5777541 Smlt2303 Smlt2304 fliD fliC FALSE 0.088 441.000 0.000 1.000 Y NA
 5777541 5777542 Smlt2304 Smlt2305 fliC flaA TRUE 0.811 87.000 0.000 0.001 Y NA
 5777542 5777543 Smlt2305 Smlt2306 flaA   TRUE 0.836 73.000 0.000 0.001 Y NA
 5777543 5777544 Smlt2306 Smlt2307     FALSE 0.165 418.000 0.000 0.001 Y NA
 5777544 5777545 Smlt2307 Smlt2308     TRUE 0.998 -3.000 0.108 0.001 Y NA
 5777545 5777546 Smlt2308 Smlt2309     TRUE 0.998 9.000 0.705 0.002 Y NA
 5777546 5777547 Smlt2309 Smlt2310   flgI TRUE 0.947 101.000 0.405 0.006 Y NA
 5777547 5777548 Smlt2310 Smlt2311 flgI flgH TRUE 0.994 3.000 0.106 0.006 Y NA
 5777548 5777549 Smlt2311 Smlt2312 flgH flgG TRUE 0.977 23.000 0.120 0.004 Y NA
 5777549 5777550 Smlt2312 Smlt2313 flgG flgF TRUE 0.909 103.000 0.174 0.001 Y NA
 5777550 5777551 Smlt2313 Smlt2314 flgF   TRUE 0.988 33.000 0.594 0.003 Y NA
 5777551 5777552 Smlt2314 Smlt2315   flgD TRUE 0.986 33.000 0.875 NA Y NA
 5777552 5777553 Smlt2315 Smlt2316 flgD flgC TRUE 0.965 24.000 0.174 NA Y NA
 5777553 5777554 Smlt2316 Smlt2317 flgC flgB TRUE 0.998 4.000 0.611 0.002 Y NA
 5777554 5777555 Smlt2317 Smlt2318 flgB   TRUE 0.803 138.000 0.267 1.000 Y NA
 5777556 5777557 Smlt2319 Smlt2320 flgA flgM TRUE 0.794 76.000 0.371 NA   NA
 5777557 5777558 Smlt2320 Smlt2321 flgM flgN TRUE 0.989 -3.000 0.052 0.001   NA
 5777558 5777559 Smlt2321 Smlt2322 flgN   TRUE 0.764 92.000 0.364 1.000   NA
 5777560 5777561 Smlt2323 Smlt2324     TRUE 0.980 5.000 0.200 0.030   NA
 5777565 5777566 Smlt2329 Smlt2330     TRUE 0.798 6.000 0.000 NA   NA
 5777566 5777567 Smlt2330 Smlt2331     FALSE 0.183 164.000 0.036 NA   NA
 5777567 5777568 Smlt2331 Smlt2332   trmU TRUE 0.986 -3.000 0.180 NA   NA
 5777568 5777569 Smlt2332 Smlt2333 trmU   TRUE 0.976 -3.000 0.158 1.000 N NA
 5777569 5777570 Smlt2333 Smlt2334     TRUE 0.907 2.000 0.010 NA   NA
 5777574 5777575 Smlt2338 Smlt2339   infA FALSE 0.047 201.000 0.000 NA   NA
 5777575 5777576 Smlt2339 Smlt2340 infA aat FALSE 0.240 87.000 0.020 1.000 N NA
 5777578 5777579 Smlt2342 Smlt2343   trxB FALSE 0.279 103.000 0.010 NA   NA
 5777580 5777581 Smlt2344 Smlt2345 ftsK   TRUE 0.602 40.000 0.033 NA   NA
 5777581 5777582 Smlt2345 Smlt2346     FALSE 0.109 112.000 0.011 NA N NA
 5777582 5777583 Smlt2346 Smlt2348     FALSE 0.064 318.000 0.167 1.000 N NA
 5777583 5777584 Smlt2348 Smlt2349     FALSE 0.074 171.000 0.000 1.000   NA
 5777585 5777586 Smlt2350 Smlt2351     TRUE 0.772 9.000 0.000 NA   NA
 5777586 5777587 Smlt2351 Smlt2352     FALSE 0.140 124.000 0.000 NA   NA
 5777588 5777589 Smlt2353 Smlt2354     FALSE 0.361 123.000 0.065 NA   NA
 5777589 5777590 Smlt2354 Smlt2355     FALSE 0.320 46.000 0.000 NA   NA
 5777590 5777591 Smlt2355 Smlt2356     TRUE 0.992 -3.000 0.014 1.000 Y NA
 5777591 5777592 Smlt2356 Smlt2357     TRUE 0.998 -3.000 0.292 1.000 Y NA
 5777592 5777593 Smlt2357 Smlt2358     FALSE 0.264 65.000 0.000 NA   NA
 5777595 5777596 Smlt2361 Smlt2362     FALSE 0.028 251.000 0.000 NA   NA
 5777596 5777597 Smlt2362 Smlt2364     FALSE 0.169 111.000 0.000 NA   NA
 5777598 5777599 Smlt2365 Smlt2366     TRUE 0.985 3.000 0.000 0.025 Y NA
 5777599 5777600 Smlt2366 Smlt2367     FALSE 0.021 154.000 0.000 1.000 N NA
 5777600 5777601 Smlt2367 Smlt2368     TRUE 0.962 9.000 0.000 1.000 Y NA
 5777601 5777602 Smlt2368 Smlt2369     FALSE 0.234 245.000 0.324 1.000   NA
 5777602 5777603 Smlt2369 Smlt2370     TRUE 0.982 -3.000 0.113 NA   NA
 5777603 5777604 Smlt2370 Smlt2371     TRUE 0.958 2.000 0.087 NA   NA
 5777604 5777605 Smlt2371 Smlt2372     TRUE 0.975 -3.000 0.053 NA   NA
 5777605 5777606 Smlt2372 Smlt2373     TRUE 0.996 -3.000 0.722 NA   NA
 5777606 5777607 Smlt2373 Smlt2374     TRUE 0.950 2.000 0.047 1.000   NA
 5777607 5777608 Smlt2374 Smlt2375     FALSE 0.244 81.000 0.000 NA   NA
 5777609 5777610 Smlt2377 Smlt2378     TRUE 0.996 -3.000 0.898 NA N NA
 5777610 5777611 Smlt2378 Smlt2379     TRUE 0.729 12.000 0.000 NA   NA
 5777612 5777613 Smlt2380 Smlt2381     TRUE 0.895 35.000 0.000 0.024 Y NA
 5777613 5777614 Smlt2381 Smlt2382     TRUE 0.999 -3.000 0.395 0.083 Y NA
 5777616 5777617 Smlt2384 Smlt2385     FALSE 0.310 49.000 0.000 NA   NA
 5777618 5777619 Smlt2386 Smlt2387     FALSE 0.260 72.000 0.000 NA   NA
 5777620 5777621 Smlt2388 Smlt2389     FALSE 0.281 59.000 0.000 NA   NA
 5777622 5777623 Smlt2390 Smlt2391     FALSE 0.012 471.000 0.000 NA   NA
 5777623 5777624 Smlt2391 Smlt2392     FALSE 0.051 194.000 0.000 NA   NA
 5777624 5777625 Smlt2392 Smlt2393     TRUE 0.842 3.000 0.000 NA   NA
 5777625 5777626 Smlt2393 Smlt2394     TRUE 0.798 6.000 0.000 NA   NA
 5777626 5777627 Smlt2394 Smlt2395     TRUE 0.552 24.000 0.000 NA   NA
 5777627 10768863 Smlt2395 Smlt2396     FALSE 0.249 79.000 0.000 NA   NA
 10768863 5777628 Smlt2396 Smlt2397     TRUE 0.782 8.000 0.000 NA   NA
 5777628 5777629 Smlt2397 Smlt2398     TRUE 0.877 0.000 0.000 NA   NA
 5777629 5777630 Smlt2398 Smlt2399     TRUE 0.687 15.000 0.000 NA   NA
 5777631 5777632 Smlt2400 Smlt2401     FALSE 0.341 42.000 0.000 NA   NA
 5777632 5777633 Smlt2401 Smlt2403     FALSE 0.020 304.000 0.000 NA   NA
 5777633 5777634 Smlt2403 Smlt2404     FALSE 0.010 661.000 0.000 NA   NA
 5777634 5777635 Smlt2404 Smlt2405     FALSE 0.075 164.000 0.000 NA   NA
 5777637 5777638 Smlt2407 Smlt2407A     FALSE 0.108 142.000 0.000 NA   NA
 5777638 5777639 Smlt2407A Smlt2408     FALSE 0.019 317.000 0.000 NA   NA
 5777639 5777640 Smlt2408 Smlt2409   merR FALSE 0.005 278.000 0.000 1.000 N NA
 5777641 5777642 Smlt2410 Smlt2411 merT merP TRUE 0.992 13.000 0.833 0.001   NA
 5777642 5777643 Smlt2411 Smlt2412 merP merA TRUE 0.979 11.000 0.400 0.001 N NA
 5777644 5777645 Smlt2413 Smlt2414     TRUE 0.768 97.000 0.000 0.008 Y NA
 5777646 5777647 Smlt2416 Smlt2417     TRUE 0.945 -6.000 0.000 0.054   NA
 5777648 5777649 Smlt2418 Smlt2419   arsR TRUE 0.672 64.000 0.286 1.000 N NA
 5777649 5777650 Smlt2419 Smlt2420 arsR   FALSE 0.451 32.000 0.000 NA   NA
 5777650 5777651 Smlt2420 Smlt2421   arsC FALSE 0.465 31.000 0.000 NA   NA
 5777651 5777652 Smlt2421 Smlt2422 arsC arsH TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777653 5777654 Smlt2423 Smlt2424 arsR2 arsC2 FALSE 0.112 28.000 0.000 NA N NA
 5777654 5777655 Smlt2424 Smlt2425 arsC2 arsB FALSE 0.153 21.000 0.000 NA N NA
 5777655 5777656 Smlt2425 Smlt2426 arsB trxB TRUE 0.511 4.000 0.000 1.000 N NA
 5777656 5777657 Smlt2426 Smlt2427 trxB   TRUE 0.901 1.000 0.003 0.038 N NA
 5777657 5777658 Smlt2427 Smlt2428     FALSE 0.006 251.000 0.000 1.000 N NA
 5777658 10768864 Smlt2428 Smlt2429     TRUE 0.775 -175.000 0.000 NA   NA
 10768864 5777659 Smlt2429 Smlt2431     FALSE 0.017 351.000 0.000 NA   NA
 5777659 5777660 Smlt2431 Smlt2432   smmD FALSE 0.258 74.000 0.000 NA   NA
 5777660 5777661 Smlt2432 Smlt2433 smmD cusB TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5777661 5777662 Smlt2433 Smlt2434 cusB cusA TRUE 0.727 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5777663 5777664 Smlt2435 Smlt2436     TRUE 0.515 27.000 0.000 NA   NA
 5777666 5777667 Smlt2438 Smlt2439     FALSE 0.257 75.000 0.000 NA   NA
 5777667 5777668 Smlt2439 Smlt2440   copF TRUE 0.522 29.000 0.000 1.000   NA
 5777668 5777669 Smlt2440 Smlt2441 copF copD TRUE 0.844 62.000 0.000 0.001 Y NA
 5777669 5777670 Smlt2441 Smlt2442 copD copC TRUE 0.771 11.000 0.000 1.000   NA
 5777670 5777671 Smlt2442 Smlt2443 copC   FALSE 0.060 179.000 0.000 NA   NA
 5777671 5777672 Smlt2443 Smlt2444   copG FALSE 0.260 71.000 0.000 NA   NA
 5777672 5777673 Smlt2444 Smlt2445 copG   TRUE 0.687 15.000 0.000 NA   NA
 5777673 5777674 Smlt2445 Smlt2446   copM TRUE 0.608 20.000 0.000 NA   NA
 5777674 5777675 Smlt2446 Smlt2447 copM copB TRUE 0.740 13.000 0.000 1.000   NA
 5777675 5777676 Smlt2447 Smlt2448 copB copA TRUE 0.947 -3.000 0.000 0.004 N NA
 5777676 5777677 Smlt2448 Smlt2449 copA copL FALSE 0.162 114.000 0.000 NA   NA
 5777677 5777678 Smlt2449 Smlt2450 copL   FALSE 0.063 175.000 0.000 NA   NA
 5777679 5777680 Smlt2451 Smlt2452     FALSE 0.359 40.000 0.000 NA   NA
 5777682 5777683 Smlt2454 Smlt2455     TRUE 0.985 -22.000 0.514 NA   NA
 5777684 5777685 Smlt2456 Smlt2457     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777685 5777686 Smlt2457 Smlt2458     TRUE 0.982 -3.000 0.100 1.000   NA
 5777686 5777687 Smlt2458 Smlt2459     TRUE 0.988 -3.000 0.200 1.000   NA
 5777687 5777688 Smlt2459 Smlt2460     FALSE 0.290 56.000 0.000 NA   NA
 5777688 5777689 Smlt2460 Smlt2461     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777689 5777690 Smlt2461 Smlt2462     TRUE 0.898 25.000 0.000 1.000 Y NA
 5777691 5777692 Smlt2463 Smlt2464     TRUE 0.727 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5777692 5777693 Smlt2464 Smlt2465   tnpA TRUE 0.932 25.000 0.000 0.054 Y NA
 5777696 5777697 Smlt2468 Smlt2469     TRUE 0.801 -22.000 0.000 NA   NA
 5777697 5777698 Smlt2469 Smlt2470     TRUE 0.829 -13.000 0.000 NA   NA
 5777698 5777699 Smlt2470 Smlt2471     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777700 5777701 Smlt2472 Smlt2474     FALSE 0.088 154.000 0.000 NA   NA
 5777703 5777704 Smlt2476 Smlt2477     FALSE 0.069 169.000 0.000 NA   NA
 5777705 5777706 Smlt2478 Smlt2479     TRUE 0.996 9.000 0.409 0.053 Y NA
 5777706 5777707 Smlt2479 Smlt2479A     TRUE 0.762 10.000 0.000 NA   NA
 5777707 5777708 Smlt2479A Smlt2481     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777708 5777709 Smlt2481 Smlt2482     TRUE 0.729 12.000 0.000 NA   NA
 5777709 5777710 Smlt2482 Smlt2482A     TRUE 0.818 -16.000 0.000 NA   NA
 5777714 5777715 Smlt2488 Smlt2489     FALSE 0.013 487.000 0.000 1.000   NA
 5777715 5777716 Smlt2489 Smlt2490     TRUE 0.978 18.000 0.071 0.053 Y NA
 5777716 5777717 Smlt2490 Smlt2491     FALSE 0.135 179.000 0.000 0.053   NA
 5777717 5777718 Smlt2491 Smlt2492     FALSE 0.009 861.000 0.000 NA   NA
 5777718 5777719 Smlt2492 Smlt2493     FALSE 0.173 109.000 0.000 NA   NA
 5777719 5777720 Smlt2493 Smlt2494     FALSE 0.074 165.000 0.000 NA   NA
 5777720 5777721 Smlt2494 Smlt2495     TRUE 0.527 26.000 0.000 NA   NA
 5777722 5777723 Smlt2496 Smlt2497     FALSE 0.218 91.000 0.000 NA   NA
 5777725 5777726 Smlt2499 Smlt2500     TRUE 0.860 1.000 0.000 NA   NA
 5777727 5777728 Smlt2501 Smlt2502     TRUE 0.798 -24.000 0.000 NA   NA
 5777728 5777729 Smlt2502 Smlt2503   yagR FALSE 0.035 87.000 0.000 NA N NA
 5777729 5777730 Smlt2503 Smlt2504 yagR yagS TRUE 0.999 0.000 0.917 0.001 Y NA
 5777730 5777731 Smlt2504 Smlt2505 yagS yagT TRUE 0.999 -3.000 0.705 0.038 Y NA
 5777731 5777732 Smlt2505 Smlt2506 yagT   FALSE 0.028 248.000 0.000 NA   NA
 5777732 5777733 Smlt2506 Smlt2507     FALSE 0.130 129.000 0.000 NA   NA
 5777733 5777734 Smlt2507 Smlt2508     TRUE 0.754 48.000 0.333 1.000 N NA
 5777734 5777735 Smlt2508 Smlt2509     FALSE 0.033 127.000 0.000 1.000 N NA
 5777735 5777736 Smlt2509 Smlt2510     TRUE 0.967 -3.000 0.000 0.054   NA
 5777737 5777738 Smlt2511 Smlt2512     FALSE 0.290 56.000 0.000 NA   NA
 5777738 5777739 Smlt2512 Smlt2513     FALSE 0.255 76.000 0.000 NA   NA
 5777742 5777743 Smlt2518 Smlt2519     FALSE 0.026 264.000 0.000 NA   NA
 5777744 5777745 Smlt2521 Smlt2522     TRUE 0.687 15.000 0.000 NA   NA
 5777747 5777748 Smlt2524 Smlt2525     FALSE 0.140 124.000 0.000 NA   NA
 5777748 5777749 Smlt2525 Smlt2526     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777750 5777751 Smlt2527 Smlt2528     FALSE 0.014 465.000 0.000 1.000   NA
 5777753 5777754 Smlt2530 Smlt2531     TRUE 0.968 13.000 0.400 NA   NA
 5777756 5777757 Smlt2533 Smlt2534     TRUE 0.942 -7.000 0.029 NA   NA
 5777757 5777758 Smlt2534 Smlt2535     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777760 5777761 Smlt2537 Smlt2538     TRUE 0.909 38.000 0.286 0.002   NA
 5777763 5777764 Smlt2541 Smlt2543     FALSE 0.083 158.000 0.000 NA   NA
 5777764 5777765 Smlt2543 Smlt2544     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777765 5777766 Smlt2544 Smlt2545     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777766 5777767 Smlt2545 Smlt2546     TRUE 0.942 -12.000 0.051 NA   NA
 5777767 5777768 Smlt2546 Smlt2547     FALSE 0.179 106.000 0.000 NA   NA
 5777768 5777769 Smlt2547 Smlt2548     TRUE 0.747 11.000 0.000 NA   NA
 5777770 5777771 Smlt2549 Smlt2550     FALSE 0.490 101.000 0.091 NA   NA
 5777771 5777772 Smlt2550 Smlt2551     FALSE 0.337 43.000 0.000 NA   NA
 5777772 5777773 Smlt2551 Smlt2552     TRUE 0.827 4.000 0.000 NA   NA
 5777774 5777775 Smlt2553 Smlt2554     FALSE 0.142 123.000 0.000 NA   NA
 5777775 5777776 Smlt2554 Smlt2555     FALSE 0.465 31.000 0.000 NA   NA
 5777777 5777778 Smlt2556 Smlt2557   fruK TRUE 0.997 -3.000 0.195 1.000 Y NA
 5777778 5777779 Smlt2557 Smlt2558 fruK fruA TRUE 0.948 86.000 0.562 1.000 Y NA
 5777779 5777780 Smlt2558 Smlt2559 fruA rpfN FALSE 0.447 83.000 0.025 0.050 N NA
 5777782 5777783 Smlt2561 Smlt2562     FALSE 0.052 50.000 0.000 NA N NA
 5777785 5777786 Smlt2566 Smlt2567     FALSE 0.023 115.000 0.000 NA N NA
 5777788 5777789 Smlt2569 Smlt2570     FALSE 0.018 163.000 0.000 1.000 N NA
 5777790 5777791 Smlt2571 Smlt2572     FALSE 0.492 135.000 0.000 NA Y NA
 5777791 5777792 Smlt2572 Smlt2573     TRUE 0.998 -16.000 0.833 1.000 Y NA
 5777792 5777793 Smlt2573 Smlt2574     TRUE 0.995 15.000 0.833 1.000 Y NA
 5777793 5777794 Smlt2574 Smlt2575     TRUE 0.856 94.000 0.714 NA   NA
 5777799 5777800 Smlt2580 Smlt2581     FALSE 0.220 90.000 0.000 NA   NA
 5777801 5777802 Smlt2582 Smlt2583     TRUE 0.907 0.000 0.031 1.000 N NA
 5777803 5777804 Smlt2584 Smlt2585 msuE   TRUE 0.614 57.000 0.088 NA   NA
 5777804 5777805 Smlt2585 Smlt2586   metE TRUE 0.932 40.000 0.775 NA   NA
 5777806 5777807 Smlt2587 Smlt2588     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777807 5777808 Smlt2588 Smlt2589     FALSE 0.006 246.000 0.000 1.000 N NA
 5777808 5777809 Smlt2589 Smlt2590     FALSE 0.032 129.000 0.000 1.000 N NA
 5777810 5777811 Smlt2591 Smlt2592     FALSE 0.475 33.000 0.029 NA N NA
 5777811 5777812 Smlt2592 Smlt2593     TRUE 0.989 -3.000 0.000 NA Y NA
 5777812 5777813 Smlt2593 Smlt2594     FALSE 0.122 37.000 0.000 1.000 N NA
 5777816 5777817 Smlt2597 Smlt2598 ssuE   FALSE 0.039 216.000 0.000 NA   NA
 5777817 5777818 Smlt2598 Smlt2599     FALSE 0.156 118.000 0.000 NA   NA
 5777818 5777819 Smlt2599 Smlt2600     TRUE 0.655 103.000 0.250 1.000   NA
 5777820 5777821 Smlt2601 Smlt2602     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777821 5777822 Smlt2602 Smlt2603     TRUE 0.980 -3.000 0.091 NA   NA
 5777822 5777823 Smlt2603 Smlt2604     TRUE 0.750 43.000 0.318 NA N NA
 5777823 5777824 Smlt2604 Smlt2605     FALSE 0.228 22.000 0.000 1.000 N NA
 5777824 5777825 Smlt2605 Smlt2606     FALSE 0.392 11.000 0.000 1.000 N NA
 5777825 5777826 Smlt2606 Smlt2607     FALSE 0.269 63.000 0.000 NA   NA
 5777827 5777828 Smlt2608 Smlt2609     FALSE 0.266 64.000 0.000 NA   NA
 5777829 5777830 Smlt2610 Smlt2611     FALSE 0.057 187.000 0.000 NA   NA
 5777830 5777831 Smlt2611 Smlt2612     FALSE 0.202 105.000 0.000 1.000   NA
 5777832 5777833 Smlt2613 Smlt2614     TRUE 0.977 -3.000 0.069 NA   NA
 5777833 5777834 Smlt2614 Smlt2615     TRUE 0.909 11.000 0.172 NA N NA
 5777834 5777835 Smlt2615 Smlt2616     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.054 Y NA
 5777836 5777837 Smlt2617 Smlt2618     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777837 5777838 Smlt2618 Smlt2619     FALSE 0.262 68.000 0.000 NA   NA
 5777838 5777839 Smlt2619 Smlt2620     TRUE 0.985 -7.000 0.333 NA   NA
 5777841 5777842 Smlt2622 Smlt2623     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777842 5777843 Smlt2623 Smlt2624     TRUE 0.905 44.000 0.625 NA   NA
 5777843 5777844 Smlt2624 Smlt2625     TRUE 0.872 100.000 0.875 NA   NA
 5777844 5777845 Smlt2625 Smlt2626     TRUE 0.987 7.000 0.667 NA   NA
 5777845 5777846 Smlt2626 Smlt2627     TRUE 0.802 47.000 0.292 NA   NA
 5777846 5777847 Smlt2627 Smlt2628     FALSE 0.106 143.000 0.000 NA   NA
 5777847 5777848 Smlt2628 Smlt2629     TRUE 0.828 21.000 0.062 NA   NA
 5777848 5777849 Smlt2629 Smlt2630     TRUE 0.997 -3.000 0.800 NA   NA
 5777849 5777850 Smlt2630 Smlt2631     TRUE 0.515 27.000 0.000 NA   NA
 5777850 5777851 Smlt2631 Smlt2632     FALSE 0.286 70.000 0.000 1.000   NA
 5777851 5777852 Smlt2632 Smlt2633     FALSE 0.439 -46.000 0.000 1.000 N NA
 5777852 5777853 Smlt2633 Smlt2634     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777853 5777854 Smlt2634 Smlt2635     FALSE 0.148 121.000 0.000 NA   NA
 5777858 5777859 Smlt2639 Smlt2640     FALSE 0.193 101.000 0.000 NA   NA
 5777859 5777860 Smlt2640 Smlt2641     TRUE 0.798 6.000 0.000 NA   NA
 5777861 5777862 Smlt2642 Smlt2643     TRUE 0.979 3.000 0.439 1.000 N NA
 5777863 5777864 Smlt2644 Smlt2645     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777864 5777865 Smlt2645 Smlt2646     TRUE 0.997 5.000 0.826 1.000 Y NA
 5777865 5777866 Smlt2646 Smlt2647     FALSE 0.178 156.000 0.000 0.078   NA
 5777867 5777868 Smlt2648 Smlt2649     FALSE 0.182 105.000 0.000 NA   NA
 5777871 5777872 Smlt2653 Smlt2654 pip   FALSE 0.013 425.000 0.000 NA   NA
 5777872 5777873 Smlt2654 Smlt2655   mgtA FALSE 0.266 64.000 0.000 NA   NA
 5777873 5777874 Smlt2655 Smlt2656 mgtA mgtC TRUE 0.746 32.000 0.072 NA   NA
 5777874 5777875 Smlt2656 Smlt2657 mgtC   FALSE 0.049 314.000 0.029 NA   NA
 5777875 5777876 Smlt2657 Smlt2658     TRUE 0.998 -7.000 0.800 1.000 Y NA
 5777876 5777877 Smlt2658 Smlt2659     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777878 5777879 Smlt2660 Smlt2661     FALSE 0.423 34.000 0.000 NA   NA
 5777879 5777880 Smlt2661 Smlt2662     FALSE 0.224 88.000 0.000 NA   NA
 5777880 5777881 Smlt2662 Smlt2663     TRUE 0.911 10.000 0.053 NA   NA
 5777882 5777883 Smlt2664 Smlt2665     TRUE 0.994 -3.000 0.667 NA N NA
 5777883 5777884 Smlt2665 Smlt2666     TRUE 0.713 72.000 0.000 NA Y NA
 5777884 5777885 Smlt2666 Smlt2667     FALSE 0.228 96.000 0.000 1.000   NA
 5777886 5777887 Smlt2668 Smlt2669     FALSE 0.158 116.000 0.000 NA   NA
 5777893 5777894 Smlt2677 Smlt2678     TRUE 0.974 5.000 0.270 1.000   NA
 5777894 5777895 Smlt2678 Smlt2679     FALSE 0.091 153.000 0.000 NA   NA
 5777895 5777896 Smlt2679 Smlt2680     TRUE 0.877 0.000 0.000 NA   NA
 5777896 5777897 Smlt2680 Smlt2681     TRUE 0.847 -10.000 0.000 NA   NA
 5777897 5777898 Smlt2681 Smlt2682     TRUE 0.694 27.000 0.019 NA   NA
 5777898 5777899 Smlt2682 Smlt2683     TRUE 0.997 -16.000 0.605 NA Y NA
 5777899 5777900 Smlt2683 Smlt2684     TRUE 0.992 -3.000 0.336 NA   NA
 5777903 5777904 Smlt2687 Smlt2688     TRUE 0.906 12.000 0.072 NA   NA
 5777904 5777905 Smlt2688 Smlt2689     TRUE 0.608 20.000 0.000 NA   NA
 5777905 5777906 Smlt2689 Smlt2690     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777906 5777907 Smlt2690 Smlt2691   copC FALSE 0.149 127.000 0.000 1.000   NA
 5777907 5777908 Smlt2691 Smlt2692 copC copD TRUE 0.771 11.000 0.000 1.000   NA
 5777908 5777909 Smlt2692 Smlt2693 copD   FALSE 0.093 46.000 0.000 1.000 N NA
 5777909 5777910 Smlt2693 Smlt2694     TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 5777913 5777914 Smlt2697 Smlt2698 smmA smmB TRUE 0.991 -3.000 0.455 1.000 N NA
 5777914 5777915 Smlt2698 Smlt2699 smmB smmC TRUE 0.998 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 5777916 5777917 Smlt2700 Smlt2701     TRUE 0.995 -7.000 0.222 1.000 Y NA
 5777918 5777919 Smlt2702 Smlt2703     FALSE 0.225 97.000 0.000 1.000   NA
 5777919 5777920 Smlt2703 Smlt2704     TRUE 0.798 6.000 0.000 NA   NA
 5777922 5777923 Smlt2707 Smlt2708     FALSE 0.179 106.000 0.000 NA   NA
 5777923 5777924 Smlt2708 Smlt2709     TRUE 0.976 4.000 0.278 NA   NA
 5777924 5777925 Smlt2709 Smlt2710     FALSE 0.260 71.000 0.000 NA   NA
 5777925 5777926 Smlt2710 Smlt2711     TRUE 0.830 58.000 0.000 0.028 Y NA
 5777926 5777927 Smlt2711 Smlt2712     FALSE 0.131 137.000 0.000 1.000   NA
 5777927 5777928 Smlt2712 Smlt2713     TRUE 0.854 70.000 0.556 NA   NA
 5777928 5777929 Smlt2713 Smlt2714     TRUE 0.848 54.000 0.444 NA   NA
 5777929 5777930 Smlt2714 Smlt2715     FALSE 0.307 183.000 0.000 NA Y NA
 5777930 5777931 Smlt2715 Smlt2716     FALSE 0.308 8.000 0.000 NA N NA
 5777931 5777932 Smlt2716 Smlt2718     FALSE 0.266 240.000 0.000 0.053 Y NA
 5777933 5777934 Smlt2719 Smlt2720     FALSE 0.259 73.000 0.000 NA   NA
 5777934 5777935 Smlt2720 Smlt2721     TRUE 0.837 55.000 0.000 0.021 Y NA
 5777935 5777936 Smlt2721 Smlt2722     FALSE 0.071 73.000 0.000 1.000 N NA
 5777937 5777938 Smlt2723 Smlt2724     FALSE 0.200 98.000 0.000 NA   NA
 5777938 5777939 Smlt2724 Smlt2725     TRUE 0.906 31.000 0.360 NA   NA
 5777939 5777940 Smlt2725 Smlt2726   exbD TRUE 0.949 4.000 0.190 1.000 N NA
 5777940 5777941 Smlt2726 Smlt2727 exbD exbB TRUE 0.989 11.000 0.655 0.045   NA
 5777941 5777942 Smlt2727 Smlt2728 exbB   TRUE 0.896 39.000 0.472 1.000   NA
 5777945 5777946 Smlt2731 Smlt2732 gspH gspI TRUE 0.973 -3.000 0.000 0.004   NA
 5777946 5777947 Smlt2732 Smlt2733 gspI gspJ TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777947 5777948 Smlt2733 Smlt2735 gspJ   FALSE 0.002 343.000 0.000 NA N NA
 5777949 5777950 Smlt2737 Smlt2738   pstS FALSE 0.054 200.000 0.000 1.000   NA
 5777950 5777951 Smlt2738 Smlt2740 pstS gspF FALSE 0.003 425.000 0.000 1.000 N NA
 5777951 5777952 Smlt2740 Smlt2741 gspF gspE TRUE 0.998 8.000 0.653 0.004 Y NA
 5777952 5777953 Smlt2741 Smlt2742 gspE gspD TRUE 0.999 -3.000 0.776 0.004 Y NA
 5777953 5777954 Smlt2742 Smlt2743 gspD gspM TRUE 0.994 -3.000 0.044 1.000 Y NA
 5777954 5777955 Smlt2743 Smlt2744 gspM gspL TRUE 0.999 -3.000 0.811 1.000 Y NA
 5777955 5777956 Smlt2744 Smlt2745 gspL gspK TRUE 0.997 -3.000 0.150 0.049 Y NA
 5777956 5777957 Smlt2745 Smlt2746 gspK gspG TRUE 0.976 10.000 0.029 1.000 Y NA
 5777957 5777958 Smlt2746 Smlt2747 gspG   FALSE 0.284 58.000 0.000 NA   NA
 5777958 5777959 Smlt2747 Smlt2748     FALSE 0.148 121.000 0.000 NA   NA
 5777959 5777960 Smlt2748 Smlt2749   fecR FALSE 0.281 59.000 0.000 NA   NA
 5777960 5777961 Smlt2749 Smlt2750 fecR   TRUE 0.826 70.000 0.667 NA N NA
 5777961 5777962 Smlt2750 Smlt2751     TRUE 0.688 17.000 0.000 1.000   NA
 5777962 5777963 Smlt2751 Smlt2753     FALSE 0.013 526.000 0.000 1.000   NA
 5777964 5777965 Smlt2754 Smlt2755     TRUE 0.997 -3.000 0.880 NA   NA
 5777966 5777967 Smlt2756 Smlt2757 glgX   TRUE 0.680 126.000 0.000 0.003 Y NA
 5777967 5777968 Smlt2757 Smlt2758     TRUE 0.998 -3.000 0.141 0.003 Y NA
 5777968 5777969 Smlt2758 Smlt2759     TRUE 0.997 -3.000 0.093 0.003 Y NA
 5777969 5777970 Smlt2759 Smlt2760   glgB TRUE 0.999 -3.000 0.600 0.002 Y NA
 5777970 5777971 Smlt2760 Smlt2761 glgB glgA TRUE 0.999 -3.000 0.600 1.000 Y NA
 5777972 5777973 Smlt2762 Smlt2763   cysJ TRUE 0.995 -3.000 0.500 1.000   NA
 5777974 5777975 Smlt2764 Smlt2765     TRUE 0.997 -10.000 0.500 1.000 Y NA
 5777975 5777976 Smlt2765 Smlt2766     TRUE 0.998 4.000 0.583 0.001 Y NA
 5777976 5777977 Smlt2766 Smlt2767   fnr2 FALSE 0.253 20.000 0.000 1.000 N NA
 5777977 5777978 Smlt2767 Smlt2768 fnr2   FALSE 0.370 12.000 0.000 1.000 N NA
 5777978 5777979 Smlt2768 Smlt2769   narK2 FALSE 0.013 186.000 0.000 1.000 N NA
 5777979 5777980 Smlt2769 Smlt2770 narK2   FALSE 0.212 24.000 0.000 1.000 N NA
 5777980 5777981 Smlt2770 Smlt2771   narI TRUE 0.511 4.000 0.000 1.000 N NA
 5777981 5777982 Smlt2771 Smlt2772 narI narJ TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 5777982 5777983 Smlt2772 Smlt2773 narJ narH TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 5777983 5777984 Smlt2773 Smlt2774 narH narG TRUE 0.990 0.000 0.000 0.001 Y NA
 5777984 5777985 Smlt2774 Smlt2775 narG narK FALSE 0.071 73.000 0.000 1.000 N NA
 5777985 5777986 Smlt2775 Smlt2776 narK   FALSE 0.102 146.000 0.000 NA   NA
 5777986 5777987 Smlt2776 Smlt2777   mobA TRUE 0.944 -3.000 0.005 NA   NA
 5777987 5777988 Smlt2777 Smlt2778 mobA moaE TRUE 0.669 109.000 0.013 NA Y NA
 5777988 5777989 Smlt2778 Smlt2779 moaE moaD TRUE 0.981 4.000 0.014 1.000 Y NA
 5777989 5777990 Smlt2779 Smlt2780 moaD moeA TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5777990 5777991 Smlt2780 Smlt2781 moeA   TRUE 0.990 0.000 0.000 0.001 Y NA
 5777991 5777992 Smlt2781 Smlt2782   moaA TRUE 0.926 39.000 0.019 0.001 Y NA
 5777996 5777997 Smlt2786 Smlt2787     FALSE 0.012 458.000 0.000 NA   NA
 5777997 5777998 Smlt2787 Smlt2788     FALSE 0.031 237.000 0.000 NA   NA
 5777998 5777999 Smlt2788 Smlt2789     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777999 5778000 Smlt2789 Smlt2790     TRUE 0.838 -12.000 0.000 NA   NA
 5778000 5778001 Smlt2790 Smlt2791     FALSE 0.016 360.000 0.000 NA   NA
 5778001 5778002 Smlt2791 Smlt2792     FALSE 0.009 778.000 0.000 NA   NA
 5778002 5778003 Smlt2792 Smlt2793     TRUE 0.801 -22.000 0.000 NA   NA
 5778006 5778007 Smlt2796 Smlt2797     FALSE 0.039 216.000 0.000 NA   NA
 5778007 5778008 Smlt2797 Smlt2798     TRUE 0.992 -3.000 0.500 1.000 N NA
 5778008 5778009 Smlt2798 Smlt2799     FALSE 0.121 135.000 0.000 NA   NA
 5778009 5778010 Smlt2799 Smlt2800     FALSE 0.260 72.000 0.000 NA   NA
 5778010 5778011 Smlt2800 Smlt2801     FALSE 0.185 104.000 0.000 NA   NA
 5778011 5778012 Smlt2801 Smlt2802     TRUE 0.997 -3.000 0.250 1.000 Y NA
 5778012 5778013 Smlt2802 Smlt2803   dgk FALSE 0.077 60.000 0.000 1.000 N NA
 5778013 5778014 Smlt2803 Smlt2804 dgk   FALSE 0.284 74.000 0.000 1.000   NA
 5778016 5778017 Smlt2806 Smlt2807     TRUE 0.924 11.000 0.098 NA   NA
 5778017 5778018 Smlt2807 Smlt2808     TRUE 0.996 -3.000 0.679 NA   NA
 5778018 5778019 Smlt2808 Smlt2809     TRUE 0.992 -10.000 0.717 NA   NA
 5778020 5778021 Smlt2816 Smlt2817   entA FALSE 0.013 185.000 0.000 1.000 N NA
 5778021 5778022 Smlt2817 Smlt2818 entA entF TRUE 0.986 -9.000 0.024 1.000 Y NA
 5778022 5778023 Smlt2818 Smlt2819 entF   TRUE 0.998 -3.000 0.200 0.002 Y NA
 5778023 5778024 Smlt2819 Smlt2820     TRUE 0.996 -3.000 0.100 1.000 Y NA
 5778024 5778025 Smlt2820 Smlt2821     TRUE 0.994 0.000 0.067 0.050 Y NA
 5778025 5778026 Smlt2821 Smlt2822   entC TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 5778026 5778027 Smlt2822 Smlt2823 entC   TRUE 0.603 -3.000 0.000 NA N NA
 5778027 5778028 Smlt2823 Smlt2824     FALSE 0.088 154.000 0.000 NA   NA
 5778028 5778029 Smlt2824 Smlt2825     FALSE 0.145 122.000 0.000 NA   NA
 5778030 5778031 Smlt2826 Smlt2827     FALSE 0.292 64.000 0.000 1.000   NA
 5778031 5778032 Smlt2827 Smlt2828   sodA FALSE 0.007 243.000 0.000 1.000 N NA
 5778032 5778033 Smlt2828 Smlt2829 sodA   TRUE 0.933 -3.000 0.000 1.000   NA
 5778033 5778034 Smlt2829 Smlt2830     TRUE 0.890 0.000 0.000 1.000   NA
 5778035 5778036 Smlt2831 Smlt2832     TRUE 0.972 12.000 0.615 1.000 N NA
 5778037 5778038 Smlt2833 Smlt2834     FALSE 0.018 367.000 0.000 1.000   NA
 5778038 5778039 Smlt2834 Smlt2835     FALSE 0.021 153.000 0.000 1.000 N NA
 5778039 5778040 Smlt2835 Smlt2836     TRUE 0.863 -10.000 0.000 1.000   NA
 5778043 5778044 Smlt2839 Smlt2840     TRUE 0.983 -28.000 0.484 1.000   NA
 5778044 5778045 Smlt2840 Smlt2841   nrdF TRUE 0.849 26.000 0.250 1.000 N NA
 5778045 5778046 Smlt2841 Smlt2842 nrdF nrdE TRUE 0.676 175.000 0.079 0.001 Y NA
 5778047 5778048 Smlt2843 Smlt2844     FALSE 0.490 29.000 0.000 NA   NA
 5778048 5778049 Smlt2844 Smlt2845     FALSE 0.218 91.000 0.000 NA   NA
 5778050 5778051 Smlt2846 Smlt2847 betT   FALSE 0.050 196.000 0.000 NA   NA
 5778052 5778053 Smlt2848 Smlt2849     TRUE 0.603 -3.000 0.000 NA N NA
 5778053 5778054 Smlt2849 Smlt2850     TRUE 0.714 70.000 0.000 NA Y NA
 5778055 5778056 Smlt2851 Smlt2852     TRUE 0.999 0.000 0.869 0.049 Y NA
 5778059 5778060 Smlt2858 Smlt2859     TRUE 0.804 63.000 0.000 0.100 Y NA
 5778060 5778061 Smlt2859 Smlt2860     FALSE 0.255 128.000 0.000 0.100   NA
 5778064 5778065 Smlt2863 Smlt2864     FALSE 0.171 110.000 0.000 NA   NA
 5778065 5778066 Smlt2864 Smlt2865     TRUE 0.727 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5778066 5778067 Smlt2865 Smlt2866     FALSE 0.007 236.000 0.000 1.000 N NA
 5778068 5778069 Smlt2867 Smlt2868     FALSE 0.230 86.000 0.000 NA   NA
 5778069 5778070 Smlt2868 Smlt2869     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5778070 5778071 Smlt2869 Smlt2870     TRUE 0.552 24.000 0.000 NA   NA
 5778071 5778072 Smlt2870 Smlt2871     TRUE 0.988 19.000 0.468 NA Y NA
 5778072 5778073 Smlt2871 Smlt2872     TRUE 0.987 28.000 0.696 NA Y NA
 5778073 5778074 Smlt2872 Smlt2873     TRUE 0.997 -15.000 0.732 NA Y NA
 5778074 5778075 Smlt2873 Smlt2874     TRUE 0.994 18.000 0.822 NA Y NA
 5778075 5778076 Smlt2874 Smlt2875     TRUE 0.989 29.000 0.844 NA Y NA
 5778076 5778077 Smlt2875 Smlt2876     TRUE 0.998 0.000 0.620 NA Y NA
 5778077 5778078 Smlt2876 Smlt2877     TRUE 0.798 6.000 0.000 NA   NA
 5778078 5778079 Smlt2877 Smlt2878     TRUE 0.772 9.000 0.000 NA   NA
 5778079 5778080 Smlt2878 Smlt2880     FALSE 0.195 100.000 0.000 NA   NA
 5778080 5778081 Smlt2880 Smlt2882   cpo FALSE 0.010 651.000 0.000 NA   NA
 5778082 5778083 Smlt2883 Smlt2884     TRUE 0.838 -12.000 0.000 NA   NA
 5778083 5778084 Smlt2884 Smlt2885     TRUE 0.806 -21.000 0.000 NA   NA
 5778084 5778085 Smlt2885 Smlt2886     FALSE 0.323 120.000 0.033 NA   NA
 5778085 5778086 Smlt2886 Smlt2887     TRUE 0.950 3.000 0.071 NA   NA
 5778086 5778087 Smlt2887 Smlt2888     TRUE 0.970 -3.000 0.107 1.000 N NA
 5778087 5778088 Smlt2888 Smlt2889     FALSE 0.303 51.000 0.000 NA   NA
 5778089 5778090 Smlt2890 Smlt2891     TRUE 0.998 -7.000 0.600 0.028 Y NA
 5778093 5778094 Smlt2894 Smlt2895     TRUE 0.860 1.000 0.000 NA   NA
 5778095 5778096 Smlt2896 Smlt2897     FALSE 0.124 133.000 0.000 NA   NA
 5778099 5778100 Smlt2900 Smlt2901     FALSE 0.257 75.000 0.000 NA   NA
 5778102 5778103 Smlt2903 Smlt2904     FALSE 0.261 69.000 0.000 NA   NA
 5778105 5778106 Smlt2906 Smlt2907   dld FALSE 0.167 112.000 0.000 NA   NA
 5778106 5778107 Smlt2907 Smlt2908 dld lctD TRUE 0.995 -3.000 0.053 1.000 Y NA
 5778107 5778108 Smlt2908 Smlt2909 lctD lctR TRUE 0.963 5.000 0.309 1.000 N NA
 5778108 5778109 Smlt2909 Smlt2910 lctR lctP TRUE 0.852 54.000 0.652 1.000 N NA
 5778109 5778110 Smlt2910 Smlt2911 lctP   FALSE 0.040 224.000 0.000 1.000   NA
 5778110 5778111 Smlt2911 Smlt2912     FALSE 0.149 127.000 0.000 1.000   NA
 5778113 5778114 Smlt2915 Smlt2916     FALSE 0.021 297.000 0.000 NA   NA
 5778114 5778115 Smlt2916 Smlt2917     TRUE 0.877 0.000 0.000 NA   NA
 5778118 5778119 Smlt2920 Smlt2921     FALSE 0.020 314.000 0.000 NA   NA
 5778121 5778122 Smlt2923 Smlt2924     FALSE 0.182 93.000 0.013 1.000 N NA
 5778122 5778123 Smlt2924 Smlt2925     TRUE 0.548 36.000 0.013 NA   NA
 5778123 5778124 Smlt2925 Smlt2926     FALSE 0.037 221.000 0.000 NA   NA
 5778124 5778125 Smlt2926 Smlt2927     TRUE 0.985 10.000 0.667 NA   NA
 5778125 5778126 Smlt2927 Smlt2928   dnaE TRUE 0.995 7.000 0.500 1.000 Y NA
 5778126 5778127 Smlt2928 Smlt2929 dnaE   FALSE 0.052 192.000 0.000 NA   NA
 5778129 5778130 Smlt2931 Smlt2932     TRUE 0.965 -3.000 0.022 NA   NA
 5778130 5778131 Smlt2932 Smlt2933     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5778131 5778132 Smlt2933 Smlt2934     TRUE 0.810 5.000 0.000 NA   NA
 5778132 5778133 Smlt2934 Smlt2935     FALSE 0.137 125.000 0.000 NA   NA
 5778133 5778134 Smlt2935 Smlt2936     TRUE 0.603 -3.000 0.000 NA N NA
 5778134 5778135 Smlt2936 Smlt2937     TRUE 0.972 -13.000 0.000 NA Y NA
 5778135 5778136 Smlt2937 Smlt2938     TRUE 0.829 -13.000 0.000 NA   NA
 5778136 5778137 Smlt2938 Smlt2939     TRUE 0.782 -43.000 0.000 NA   NA
 5778138 5778139 Smlt2940 Smlt2941     FALSE 0.008 181.000 0.000 NA N NA
 5778139 5778140 Smlt2941 Smlt2942     FALSE 0.174 29.000 0.000 1.000 N NA
 5778140 5778141 Smlt2942 Smlt2943     TRUE 0.916 21.000 0.000 1.000 Y NA
 5778141 5778142 Smlt2943 Smlt2944     FALSE 0.480 56.000 0.000 0.099   NA
 5778142 5778143 Smlt2944 Smlt2946   dsbG FALSE 0.011 519.000 0.000 NA   NA
 5778143 5778144 Smlt2946 Smlt2947 dsbG dsbE TRUE 0.693 82.000 0.000 NA Y NA
 5778144 5778145 Smlt2947 Smlt2948 dsbE   FALSE 0.066 81.000 0.000 1.000 N NA
 5778146 10768865 Smlt2949 Smlt_t39 zntR   FALSE 0.218 91.000 0.000 NA   NA
 10768865 10768866 Smlt_t39 Smlt_t41     FALSE 0.019 315.000 0.000 NA   NA
 10768866 10768867 Smlt_t41 Smlt_t42     FALSE 0.306 50.000 0.000 NA   NA
 10768867 10768868 Smlt_t42 Smlt_t43     FALSE 0.320 46.000 0.000 NA   NA
 10768868 10768869 Smlt_t43 Smlt_t45     FALSE 0.314 48.000 0.000 NA   NA
 10768870 5778150 Smlt_t46 Smlt2953     FALSE 0.056 188.000 0.000 NA   NA
 5778151 5778152 Smlt2954 Smlt2955 mcpA   FALSE 0.028 253.000 0.000 NA   NA
 5778153 5778154 Smlt2956 Smlt2957     FALSE 0.271 62.000 0.000 NA   NA
 5778155 5778156 Smlt2958 Smlt2959     FALSE 0.269 63.000 0.000 NA   NA
 5778156 5778157 Smlt2959 Smlt2960   tex FALSE 0.010 209.000 0.000 1.000 N NA
 5778157 5778158 Smlt2960 Smlt2961 tex   FALSE 0.070 208.000 0.010 NA   NA
 5778158 5778159 Smlt2961 Smlt2962     FALSE 0.009 720.000 0.000 NA   NA
 5778159 5778160 Smlt2962 Smlt2963     FALSE 0.020 313.000 0.000 NA   NA
 5778160 5778161 Smlt2963 Smlt2964   phaC TRUE 0.685 32.000 0.032 NA   NA
 5778161 5778162 Smlt2964 Smlt2965 phaC phaE TRUE 0.988 -3.000 0.210 NA   NA
 5778162 5778163 Smlt2965 Smlt2966 phaE   TRUE 0.743 23.000 0.022 NA   NA
 5778165 5778166 Smlt2970 Smlt2971     FALSE 0.148 121.000 0.000 NA   NA
 5778166 5778167 Smlt2971 Smlt2972   mutX FALSE 0.076 163.000 0.000 NA   NA
 5778167 5778168 Smlt2972 Smlt2973 mutX   TRUE 0.665 33.000 0.030 NA   NA
 5778168 5778169 Smlt2973 Smlt2974     FALSE 0.178 169.000 0.043 NA   NA
 5778170 5778171 Smlt2975 Smlt2977 pps   FALSE 0.202 98.000 0.018 1.000 N NA
 5778172 5778173 Smlt2978 Smlt2979     FALSE 0.111 140.000 0.000 NA   NA
 5778173 5778174 Smlt2979 Smlt2981   orn FALSE 0.066 171.000 0.000 NA   NA
 5778174 5778175 Smlt2981 Smlt2982 orn   FALSE 0.199 76.000 0.011 1.000 N NA
 5778175 5778176 Smlt2982 Smlt2983     FALSE 0.041 76.000 0.000 NA N NA
 5778177 5778178 Smlt2984 Smlt2985     FALSE 0.287 69.000 0.000 1.000   NA
 5778178 5778179 Smlt2985 Smlt2986     FALSE 0.287 57.000 0.000 NA   NA
 5778181 5778182 Smlt2988 Smlt2989     TRUE 0.866 41.000 0.400 NA   NA
 5778182 5778183 Smlt2989 Smlt2990     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5778184 5778185 Smlt2991 Smlt2992     FALSE 0.200 98.000 0.000 NA   NA
 5778185 5778186 Smlt2992 Smlt2993     FALSE 0.284 58.000 0.000 NA   NA
 5778186 5778187 Smlt2993 Smlt2994     FALSE 0.022 291.000 0.000 NA   NA
 5778187 5778188 Smlt2994 Smlt2995     FALSE 0.020 313.000 0.000 NA   NA
 5778188 5778189 Smlt2995 Smlt2996     FALSE 0.435 33.000 0.000 NA   NA
 5778189 5778190 Smlt2996 Smlt2997   trwI TRUE 0.729 12.000 0.000 NA   NA
 5778190 5778191 Smlt2997 Smlt2998 trwI   FALSE 0.257 75.000 0.000 NA   NA
 5778191 5778192 Smlt2998 Smlt2999     FALSE 0.284 58.000 0.000 NA   NA
 5778192 5778193 Smlt2999 Smlt3000     TRUE 0.879 85.000 0.192 NA Y NA
 5778193 5778194 Smlt3000 Smlt3001     TRUE 0.995 -7.000 1.000 NA   NA
 5778194 5778195 Smlt3001 Smlt3002     FALSE 0.258 74.000 0.000 NA   NA
 5778195 5778196 Smlt3002 Smlt3003     TRUE 0.827 4.000 0.000 NA   NA
 5778196 5778197 Smlt3003 Smlt3004     TRUE 0.994 15.000 0.714 1.000 Y NA
 5778197 5778198 Smlt3004 Smlt3005     TRUE 0.999 -3.000 0.800 NA Y NA
 5778198 5778199 Smlt3005 Smlt3006     TRUE 0.998 -3.000 0.400 NA Y NA
 5778199 5778200 Smlt3006 Smlt3007     TRUE 0.773 90.000 0.400 NA   NA
 5778200 5778201 Smlt3007 Smlt3008     FALSE 0.013 425.000 0.000 NA   NA
 5778201 5778202 Smlt3008 Smlt3009     TRUE 0.929 37.000 0.667 NA   NA
 5778203 5778204 Smlt3010 Smlt3011     FALSE 0.135 126.000 0.000 NA   NA
 5778206 5778207 Smlt3013 Smlt3014     FALSE 0.490 29.000 0.000 NA   NA
 5778207 5778208 Smlt3014 Smlt3015     FALSE 0.122 134.000 0.000 NA   NA
 5778208 5778209 Smlt3015 Smlt3016     FALSE 0.396 36.000 0.000 NA   NA
 5778209 5778210 Smlt3016 Smlt3017     FALSE 0.041 212.000 0.000 NA   NA
 5778210 5778211 Smlt3017 Smlt3018     FALSE 0.176 107.000 0.000 NA   NA
 5778211 5778212 Smlt3018 Smlt3019     FALSE 0.059 182.000 0.000 NA   NA
 5778214 5778215 Smlt3021 Smlt3022     FALSE 0.071 74.000 0.000 1.000 N NA
 5778215 5778216 Smlt3022 Smlt3023     FALSE 0.078 162.000 0.000 NA   NA
 5778217 5778218 Smlt3024 Smlt3025     FALSE 0.451 32.000 0.000 NA   NA
 5778218 5778219 Smlt3025 Smlt3026     TRUE 0.702 14.000 0.000 NA   NA
 5778220 5778221 Smlt3027 Smlt3028     FALSE 0.099 147.000 0.000 NA   NA
 5778223 5778224 Smlt3030 Smlt3031     FALSE 0.025 288.000 0.000 1.000   NA
 5778227 5778228 Smlt3034 Smlt3035     FALSE 0.258 74.000 0.000 NA   NA
 5778228 5778229 Smlt3035 Smlt3036     FALSE 0.216 92.000 0.000 NA   NA
 5778229 5778230 Smlt3036 Smlt3037     FALSE 0.014 395.000 0.000 NA   NA
 5778230 5778231 Smlt3037 Smlt3038     TRUE 0.515 27.000 0.000 NA   NA
 5778232 5778233 Smlt3039 Smlt3040 umuC   FALSE 0.175 108.000 0.000 NA   NA
 5778235 5778236 Smlt3042 Smlt3043     TRUE 0.901 48.000 0.409 0.050   NA
 5778237 5778238 Smlt3044 Smlt3045     FALSE 0.260 72.000 0.000 NA   NA
 5778238 5778239 Smlt3045 Smlt3046     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5778243 5778244 Smlt3051 Smlt3052 traA   FALSE 0.156 118.000 0.000 NA   NA
 5778244 5778245 Smlt3052 Smlt3053   traD TRUE 0.575 22.000 0.000 NA   NA
 5778245 5778246 Smlt3053 Smlt3054 traD   TRUE 0.801 -22.000 0.000 NA   NA
 5778246 5778247 Smlt3054 Smlt3055     FALSE 0.367 39.000 0.000 NA   NA
 5778247 5778248 Smlt3055 Smlt3056     FALSE 0.052 192.000 0.000 NA   NA
 5778248 5778249 Smlt3056 Smlt3057     FALSE 0.115 138.000 0.000 NA   NA
 5778249 5778250 Smlt3057 Smlt3058     FALSE 0.227 87.000 0.000 NA   NA
 5778250 5778251 Smlt3058 Smlt3059     TRUE 0.552 24.000 0.000 NA   NA
 5778251 5778252 Smlt3059 Smlt3060     FALSE 0.263 66.000 0.000 NA   NA
 5778252 5778253 Smlt3060 Smlt3061     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5778253 5778254 Smlt3061 Smlt3062     FALSE 0.490 29.000 0.000 NA   NA
 5778255 5778256 Smlt3062AA Smlt3062A     TRUE 0.829 -13.000 0.000 NA   NA
 5778256 5778257 Smlt3062A Smlt3065     TRUE 0.798 6.000 0.000 NA   NA
 5778257 5778258 Smlt3065 Smlt3066     FALSE 0.151 120.000 0.000 NA   NA
 5778259 5778260 Smlt3067 Smlt3068     FALSE 0.025 273.000 0.000 NA   NA
 5778260 5778261 Smlt3068 Smlt3069     TRUE 0.877 0.000 0.000 NA   NA
 5778261 5778262 Smlt3069 Smlt3070     FALSE 0.160 115.000 0.000 NA   NA
 5778264 5778265 Smlt3073 Smlt3074     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5778265 5778266 Smlt3074 Smlt3075     FALSE 0.222 89.000 0.000 NA   NA
 5778266 5778267 Smlt3075 Smlt3076     FALSE 0.036 222.000 0.000 NA   NA
 5778269 5778270 Smlt3078 Smlt3079     TRUE 0.867 -7.000 0.000 NA   NA
 5778270 5778271 Smlt3079 Smlt3080     FALSE 0.188 103.000 0.000 NA   NA
 5778271 5778272 Smlt3080 Smlt3081     TRUE 0.783 -40.000 0.000 NA   NA
 5778272 5778273 Smlt3081 Smlt3082     FALSE 0.277 60.000 0.000 NA   NA
 5778273 5778274 Smlt3082 Smlt3083     FALSE 0.058 184.000 0.000 NA   NA
 5778274 5778275 Smlt3083 Smlt3083A     TRUE 0.772 9.000 0.000 NA   NA
 5778275 5778276 Smlt3083A Smlt3084     FALSE 0.010 620.000 0.000 NA   NA
 5778276 5778277 Smlt3084 Smlt3085     FALSE 0.179 106.000 0.000 NA   NA
 5778277 5778278 Smlt3085 Smlt3086     TRUE 0.877 0.000 0.000 NA   NA
 5778278 10768871 Smlt3086 Smlt_t47     FALSE 0.233 85.000 0.000 NA   NA
 5778281 5778282 Smlt3090 Smlt3091 acpD   FALSE 0.056 188.000 0.000 NA   NA
 5778284 5778285 Smlt3093 Smlt3094     TRUE 0.770 120.000 0.333 0.003   NA
 5778285 5778286 Smlt3094 Smlt3095     TRUE 0.591 21.000 0.000 NA   NA
 5778287 5778288 Smlt3096 Smlt3097 aroA pheA TRUE 0.819 77.000 0.035 1.000 Y NA
 5778288 5778289 Smlt3097 Smlt3098 pheA serC TRUE 0.990 4.000 0.121 1.000 Y NA
 5778289 5778290 Smlt3098 Smlt3099 serC   FALSE 0.007 195.000 0.000 NA N NA
 5778291 5778292 Smlt3100 Smlt3101   phaF TRUE 0.567 82.000 0.095 NA   NA
 5778292 5778293 Smlt3101 Smlt3103 phaF   FALSE 0.110 238.000 0.087 NA   NA
 5778294 5778295 Smlt3104 Smlt3105     FALSE 0.026 285.000 0.000 1.000   NA
 5778295 5778296 Smlt3105 Smlt3106     TRUE 0.545 29.000 0.027 1.000 N NA
 5778297 5778298 Smlt3107 Smlt3108 hutI hutH1 TRUE 0.988 -3.000 0.192 0.028 N NA
 5778298 5778299 Smlt3108 Smlt3109 hutH1   TRUE 0.994 -3.000 0.039 1.000 Y NA
 5778299 5778300 Smlt3109 Smlt3110     TRUE 0.995 -3.000 0.061 1.000 Y NA
 5778300 5778301 Smlt3110 Smlt3111     FALSE 0.028 253.000 0.000 NA   NA
 5778301 5778302 Smlt3111 Smlt3112     FALSE 0.211 94.000 0.000 NA   NA
 5778302 5778303 Smlt3112 Smlt3114     FALSE 0.025 273.000 0.000 NA   NA
 5778303 5778304 Smlt3114 Smlt3115     FALSE 0.012 194.000 0.000 1.000 N NA
 5778305 5778306 Smlt3116 Smlt3117     TRUE 0.702 14.000 0.000 NA   NA
 5778306 5778307 Smlt3117 Smlt3118     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5778307 5778308 Smlt3118 Smlt3119     FALSE 0.298 53.000 0.000 NA   NA
 5778308 5778309 Smlt3119 Smlt3120     FALSE 0.227 87.000 0.000 NA   NA
 5778309 5778310 Smlt3120 Smlt3121     FALSE 0.298 53.000 0.000 NA   NA
 5778312 5778313 Smlt3123 Smlt3124     FALSE 0.306 50.000 0.000 NA   NA
 5778315 5778316 Smlt3126 Smlt3128     FALSE 0.054 191.000 0.000 NA   NA
 5778316 5778317 Smlt3128 Smlt3129     FALSE 0.070 168.000 0.000 NA   NA
 5778318 5778319 Smlt3130 Smlt3131     TRUE 0.801 -22.000 0.000 NA   NA
 5778320 5778321 Smlt3132 Smlt3133     FALSE 0.264 65.000 0.000 NA   NA
 5778321 5778322 Smlt3133 Smlt3134     FALSE 0.258 74.000 0.000 NA   NA
 5778324 5778325 Smlt3136 Smlt3137 gcd gyrA FALSE 0.057 132.000 0.002 1.000 N NA
 5778325 5778326 Smlt3137 Smlt3138 gyrA mtnA FALSE 0.008 219.000 0.000 1.000 N NA
 5778326 5778327 Smlt3138 Smlt3139 mtnA   FALSE 0.314 48.000 0.000 NA   NA
 5778327 5778328 Smlt3139 Smlt3140     FALSE 0.235 139.000 0.026 NA   NA
 5778328 5778329 Smlt3140 Smlt3141     TRUE 0.956 -3.000 0.009 1.000   NA
 5778329 5778330 Smlt3141 Smlt3142   ligA TRUE 0.580 29.000 0.002 1.000   NA
 5778332 5778333 Smlt3144 Smlt3145 zipA   TRUE 0.802 47.000 0.115 0.007   NA
 5778334 5778335 Smlt3146 Smlt3147     FALSE 0.182 105.000 0.000 NA   NA
 5778336 5778337 Smlt3148 Smlt3149 rplI rpsR TRUE 0.950 105.000 0.499 0.010 Y NA
 5778337 5778338 Smlt3149 Smlt3150 rpsR rpsF TRUE 0.994 12.000 0.319 0.010 Y NA
 5778338 5778339 Smlt3150 Smlt3152 rpsF   FALSE 0.027 258.000 0.000 NA   NA
 5778339 5778340 Smlt3152 Smlt3153     FALSE 0.262 67.000 0.000 NA   NA
 5778341 5778342 Smlt3154 Smlt3155 asnS   TRUE 0.587 31.000 0.009 NA   NA
 5778342 5778343 Smlt3155 Smlt3156     TRUE 0.990 8.000 0.833 NA   NA
 5778343 5778344 Smlt3156 Smlt3157     TRUE 0.942 8.000 0.116 NA   NA
 5778344 5778345 Smlt3157 Smlt3158     FALSE 0.280 75.000 0.022 1.000 N NA
 5778345 5778346 Smlt3158 Smlt3159   nbaC TRUE 0.794 21.000 0.027 1.000   NA
 5778346 5778347 Smlt3159 Smlt3160 nbaC   FALSE 0.209 163.000 0.043 1.000   NA
 5778347 5778348 Smlt3160 Smlt3161   qbsG TRUE 0.673 32.000 0.100 1.000 N NA
 5778348 5778349 Smlt3161 Smlt3162 qbsG sbcB TRUE 0.874 0.000 0.017 1.000 N NA
 5778349 5778350 Smlt3162 Smlt3163 sbcB   TRUE 0.971 -3.000 0.034 NA   NA
 5778350 5778351 Smlt3163 Smlt3164     TRUE 0.673 56.000 0.139 NA   NA
 5778352 5778353 Smlt3165 Smlt3166     TRUE 0.578 48.000 0.036 1.000   NA
 5778353 5778354 Smlt3166 Smlt3167     FALSE 0.060 191.000 0.022 1.000 N NA
 5778355 5778356 Smlt3169 Smlt3170   smeG TRUE 0.988 0.000 0.571 1.000 N NA
 5778356 5778357 Smlt3170 Smlt3171 smeG acrD TRUE 0.978 16.000 1.000 1.000 N NA
 5778361 5778362 Smlt3175 Smlt3176   metH2 TRUE 0.691 14.000 0.017 1.000 N NA
 5778362 5778363 Smlt3176 Smlt3177 metH2 metH1 TRUE 0.991 1.000 0.009 0.001 Y NA
 5778363 5778364 Smlt3177 Smlt3178 metH1   FALSE 0.254 86.000 0.000 1.000   NA
 5778365 5778366 Smlt3179 Smlt3179A     TRUE 0.875 11.000 0.024 NA   NA
 5778366 10768872 Smlt3179A Smlt3180     TRUE 0.774 -209.000 0.000 NA   NA
 10768872 5778367 Smlt3180 Smlt3181     TRUE 0.527 26.000 0.000 NA   NA
 5778367 5778368 Smlt3181 Smlt3182     TRUE 0.901 24.000 0.357 1.000 N NA
 5778368 5778369 Smlt3182 Smlt3183     TRUE 0.972 13.000 0.042 1.000 Y NA
 5778370 5778371 Smlt3184 Smlt3185     TRUE 0.955 3.000 0.091 NA   NA
 5778371 5778372 Smlt3185 Smlt3186     TRUE 0.986 0.000 0.500 1.000 N NA
 5778372 5778373 Smlt3186 Smlt3187     TRUE 0.996 -3.000 0.667 NA   NA
 5778373 5778374 Smlt3187 Smlt3188     TRUE 0.896 26.000 0.250 NA   NA
 5778374 5778375 Smlt3188 Smlt3189     TRUE 0.861 31.000 0.222 NA   NA
 5778375 5778376 Smlt3189 Smlt3190     FALSE 0.262 68.000 0.000 NA   NA
 5778378 5778379 Smlt3193 Smlt3195 purB   FALSE 0.025 656.000 0.029 NA   NA
 5778379 5778380 Smlt3195 Smlt3196     TRUE 0.950 9.000 0.167 NA   NA
 5778380 5778381 Smlt3196 Smlt3197   sucA FALSE 0.064 187.000 0.000 1.000   NA
 5778381 5778382 Smlt3197 Smlt3198 sucA sucB TRUE 0.975 41.000 0.667 1.000 Y NA
 5778382 5778383 Smlt3198 Smlt3199 sucB odhL TRUE 0.918 64.000 0.253 1.000 Y NA
 5778384 5778385 Smlt3200 Smlt3201     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5778385 5778386 Smlt3201 Smlt3202   phoD FALSE 0.069 169.000 0.000 NA   NA
 5778386 5778387 Smlt3202 Smlt3203 phoD   TRUE 0.982 0.000 0.000 1.000 Y NA
 5778387 5778388 Smlt3203 Smlt3204   dnaB FALSE 0.021 153.000 0.000 1.000 N NA
 5778388 5778389 Smlt3204 Smlt3205 dnaB   FALSE 0.045 315.000 0.024 NA   NA
 5778389 5778390 Smlt3205 Smlt3206     TRUE 0.522 67.000 0.048 NA   NA
 5778390 5778391 Smlt3206 Smlt3207     TRUE 0.860 4.000 0.028 1.000 N NA
 5778391 5778392 Smlt3207 Smlt3208     FALSE 0.044 63.000 0.000 NA N NA
 5778392 5778393 Smlt3208 Smlt3209     FALSE 0.008 177.000 0.000 NA N NA
 5778393 5778394 Smlt3209 Smlt3210     FALSE 0.156 124.000 0.000 1.000   NA
 5778395 5778396 Smlt3211 Smlt3212     TRUE 0.958 -3.000 0.013 NA   NA
 5778398 5778399 Smlt3214 Smlt3215     TRUE 0.700 137.000 0.556 1.000   NA
 5778401 5778402 Smlt3217 Smlt3218     FALSE 0.285 120.000 0.021 NA   NA
 5778402 5778403 Smlt3218 Smlt3219   arsC2 TRUE 0.892 0.000 0.023 1.000 N NA
 5778404 5778405 Smlt3220 Smlt3221     FALSE 0.281 59.000 0.000 NA   NA
 5778405 5778406 Smlt3221 Smlt3222     FALSE 0.084 157.000 0.000 NA   NA
 5778407 5778408 Smlt3223 Smlt3224     TRUE 0.697 37.000 0.074 NA   NA
 5778408 5778409 Smlt3224 Smlt3226     FALSE 0.030 240.000 0.000 NA   NA
 5778409 5778410 Smlt3226 Smlt3227   fpr FALSE 0.293 81.000 0.028 1.000 N NA
 5778413 5778414 Smlt3230 Smlt3231   cfa FALSE 0.106 143.000 0.000 NA   NA
 5778414 5778415 Smlt3231 Smlt3232 cfa   TRUE 0.870 20.000 0.105 NA   NA
 5778415 5778416 Smlt3232 Smlt3233     TRUE 0.844 65.000 0.500 NA   NA
 5778418 5778419 Smlt3235 Smlt3236     TRUE 0.939 8.000 0.091 1.000   NA
 5778422 5778423 Smlt3239 Smlt3240     TRUE 0.949 0.000 0.031 NA   NA
 5778424 5778425 Smlt3241 Smlt3242     TRUE 0.884 11.000 0.030 NA   NA
 5778426 5778427 Smlt3243 Smlt3244 moaB3   TRUE 0.969 -3.000 0.025 1.000   NA
 5778427 5778428 Smlt3244 Smlt3245     TRUE 0.569 99.000 0.050 0.095   NA
 5778431 5778432 Smlt3248 Smlt3249     TRUE 0.842 3.000 0.000 NA   NA
 5778432 5778433 Smlt3249 Smlt3250     TRUE 0.995 -3.000 0.500 1.000   NA
 5778433 5778434 Smlt3250 Smlt3251     TRUE 0.998 -3.000 0.160 0.033 Y NA
 5778434 5778435 Smlt3251 Smlt3252     TRUE 0.999 -3.000 0.660 0.033 Y NA
 5778435 5778436 Smlt3252 Smlt3253     TRUE 0.958 5.000 0.156 NA   NA
 5778436 5778437 Smlt3253 Smlt3254     FALSE 0.042 209.000 0.000 NA   NA
 5778437 5778438 Smlt3254 Smlt3255     FALSE 0.069 77.000 0.000 1.000 N NA
 5778438 5778439 Smlt3255 Smlt3256     FALSE 0.013 150.000 0.000 NA N NA
 5778439 5778440 Smlt3256 Smlt3257     TRUE 0.981 -3.000 0.103 NA   NA
 5778441 5778442 Smlt3259 Smlt3260     TRUE 0.900 14.000 0.083 NA   NA
 5778442 5778443 Smlt3260 Smlt3261   rluB TRUE 0.963 -7.000 0.210 NA N NA
 5778445 5778446 Smlt3263 Smlt3264     TRUE 0.787 -33.000 0.000 NA   NA
 5778447 5778448 Smlt3265 Smlt3266     FALSE 0.341 104.000 0.022 NA   NA
 5778448 5778449 Smlt3266 Smlt3267     TRUE 0.913 14.000 0.099 1.000   NA
 5778450 5778451 Smlt3268 Smlt3269 ccmA ccmB TRUE 0.997 -3.000 0.074 0.002 Y NA
 5778451 5778452 Smlt3269 Smlt3270 ccmB ccmC TRUE 0.931 44.000 0.051 0.001 Y NA
 5778452 5778453 Smlt3270 Smlt3271 ccmC   TRUE 0.963 -3.000 0.015 1.000   NA
 5778453 5778454 Smlt3271 Smlt3272   ccmE TRUE 0.964 -3.000 0.016 1.000   NA
 5778454 5778455 Smlt3272 Smlt3273 ccmE ccmF TRUE 0.992 1.000 0.016 0.002 Y NA
 5778455 5778456 Smlt3273 Smlt3274 ccmF dsbE TRUE 0.998 9.000 1.000 0.002 Y NA
 5778456 5778457 Smlt3274 Smlt3275 dsbE ccmH TRUE 0.998 5.000 1.000 NA Y NA
 5778457 5778458 Smlt3275 Smlt3276 ccmH cycH TRUE 0.999 -6.000 1.000 NA Y NA
 5778458 5778459 Smlt3276 Smlt3277 cycH metX FALSE 0.142 149.000 0.039 1.000 N NA
 5778459 5778460 Smlt3277 Smlt3278 metX   TRUE 0.925 0.000 0.011 NA   NA
 5778461 5778462 Smlt3279 Smlt3280 cydC cydD TRUE 0.999 -3.000 0.631 0.003 Y NA
 5778463 5778464 Smlt3282 Smlt3283 cydA appB TRUE 0.997 16.000 0.953 0.035 Y NA
 5778464 5778465 Smlt3283 Smlt3284 appB   TRUE 0.756 59.000 0.256 NA   NA
 5778465 10768873 Smlt3284 Smlt_t48     FALSE 0.287 57.000 0.000 NA   NA
 10768873 5778466 Smlt_t48 Smlt3287     FALSE 0.013 438.000 0.000 NA   NA
 5778466 5778467 Smlt3287 Smlt3289   hmsH FALSE 0.018 345.000 0.000 NA   NA
 5778467 5778468 Smlt3289 Smlt3290 hmsH hmsF TRUE 0.992 2.000 0.696 1.000   NA
 5778468 5778469 Smlt3290 Smlt3291 hmsF hmsR TRUE 0.839 -52.000 0.043 NA N NA
 5778469 5778470 Smlt3291 Smlt3292 hmsR hmsS TRUE 0.978 -3.000 0.077 NA   NA
 5778471 5778472 Smlt3293 Smlt3294 proA proB TRUE 0.995 -3.000 0.007 0.001 Y NA
 5778472 5778473 Smlt3294 Smlt3295 proB   TRUE 0.564 81.000 0.091 NA   NA
 5778473 5778474 Smlt3295 Smlt3296   argH TRUE 0.907 0.000 0.004 NA   NA
 5778474 5778475 Smlt3296 Smlt3297 argH argC TRUE 0.943 21.000 0.020 1.000 Y NA
 5778475 5778476 Smlt3297 Smlt3298 argC   TRUE 0.866 -3.000 0.008 NA N NA
 5778476 5778477 Smlt3298 Smlt3299     TRUE 0.686 4.000 0.006 NA N NA
 5778477 5778478 Smlt3299 Smlt3300     TRUE 0.766 77.000 0.009 1.000 Y NA
 5778478 5778479 Smlt3300 Smlt3301   argG FALSE 0.471 152.000 0.004 1.000 Y NA
 5778479 5778480 Smlt3301 Smlt3302 argG   TRUE 0.623 120.000 0.007 1.000 Y NA
 5778480 5778481 Smlt3302 Smlt3303     TRUE 0.877 0.000 0.000 NA   NA
 5778481 5778482 Smlt3303 Smlt3304     FALSE 0.151 120.000 0.000 NA   NA
 5778483 5778484 Smlt3305 Smlt3306 cysS sufE FALSE 0.375 55.000 0.006 NA   NA
 5778484 5778485 Smlt3306 Smlt3307 sufE   TRUE 0.971 -3.000 0.034 NA   NA
 5778487 5778488 Smlt3309 Smlt3310     TRUE 0.906 2.000 0.010 NA   NA
 5778488 5778489 Smlt3310 Smlt3311     TRUE 0.891 0.000 0.023 1.000 N NA
 5778490 5778491 Smlt3312 Smlt3313     TRUE 0.860 12.000 0.022 NA   NA
 5778491 5778492 Smlt3313 Smlt3314   ubiG TRUE 0.990 -3.000 0.259 1.000   NA
 5778492 5778493 Smlt3314 Smlt3315 ubiG   TRUE 0.742 26.000 0.104 1.000 N NA
 5778493 5778494 Smlt3315 Smlt3316   efp FALSE 0.020 202.000 0.002 1.000 N NA
 5778496 5778497 Smlt3318 Smlt3319     TRUE 0.979 -3.000 0.200 NA N NA
 5778497 5778498 Smlt3319 Smlt3320     FALSE 0.183 48.000 0.007 NA N NA
 5778501 5778502 Smlt3324 Smlt3325   phbB TRUE 0.964 -3.000 0.014 0.027 N NA
 5778502 5778503 Smlt3325 Smlt3326 phbB   FALSE 0.140 183.000 0.031 NA   NA
 5778504 5778505 Smlt3327 Smlt3328     TRUE 0.991 2.000 0.625 NA   NA
 5778505 5778506 Smlt3328 Smlt3329   mutL TRUE 0.806 12.000 0.007 NA   NA
 5778506 5778507 Smlt3329 Smlt3330 mutL   FALSE 0.069 166.000 0.016 1.000 N NA
 5778507 5778508 Smlt3330 Smlt3331     FALSE 0.373 83.000 0.014 NA   NA
 5778508 5778509 Smlt3331 Smlt3332     TRUE 0.982 -3.000 0.118 NA   NA
 5778510 5778511 Smlt3333 Smlt3334a2   ex7L FALSE 0.181 45.000 0.004 1.000 N NA
 5778511 10768874 Smlt3334a2 Smlt3334a ex7L   TRUE 0.772 -311.000 0.000 NA   NA
 10768874 5778512 Smlt3334a Smlt3335     FALSE 0.009 1025.000 0.000 NA   NA
 5778513 5778514 Smlt3336 Smlt3337     FALSE 0.337 89.000 0.008 1.000   NA
 5778515 5778516 Smlt3338 Smlt3339 rnd   FALSE 0.169 120.000 0.000 1.000   NA
 10768876 5778523 Smlt_t51 Smlt3348     FALSE 0.018 342.000 0.000 NA   NA
 5778523 5778524 Smlt3348 Smlt3351     TRUE 0.533 170.000 0.500 1.000   NA
 5778524 5778525 Smlt3351 Smlt3352     TRUE 0.792 66.000 0.333 1.000   NA
 5778525 5778526 Smlt3352 Smlt3354     FALSE 0.002 556.000 0.000 1.000 N NA
 5778526 5778527 Smlt3354 Smlt3355   dxs FALSE 0.118 106.000 0.007 1.000 N NA
 5778528 5778529 Smlt3357 Smlt3358     FALSE 0.082 160.000 0.000 NA   NA
 5778529 5778530 Smlt3358 Smlt3359     TRUE 0.687 15.000 0.000 NA   NA
 5778531 5778532 Smlt3360 Smlt3361     TRUE 0.714 13.000 0.000 NA   NA
 5778532 5778533 Smlt3361 Smlt3362     FALSE 0.222 89.000 0.000 NA   NA
 5778533 5778534 Smlt3362 Smlt3363     FALSE 0.340 14.000 0.000 1.000 N NA
 5778535 5778536 Smlt3364 Smlt3365     FALSE 0.208 95.000 0.000 NA   NA
 5778539 5778540 Smlt3368 Smlt3369     FALSE 0.227 87.000 0.000 NA   NA
 5778540 5778541 Smlt3369 Smlt3370     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 10768877 5778542 Smlt_t53 Smlt3371     FALSE 0.262 68.000 0.000 NA   NA
 5778542 5778543 Smlt3371 Smlt3372   himA TRUE 0.979 -19.000 0.535 1.000 N NA
 5778543 5778544 Smlt3372 Smlt3373 himA pheT TRUE 0.814 28.000 0.208 1.000 N NA
 5778544 5778545 Smlt3373 Smlt3374 pheT pheS TRUE 0.953 121.000 0.574 0.000 Y NA
 5778545 5778546 Smlt3374 Smlt3375 pheS rplT TRUE 0.586 194.000 0.202 1.000 Y NA
 5778546 5778547 Smlt3375 Smlt3376 rplT RL35 TRUE 0.998 12.000 0.928 0.010 Y NA
 5778547 5778548 Smlt3376 Smlt3377 RL35 infC TRUE 0.889 146.000 0.652 1.000 Y NA
 5778548 5778549 Smlt3377 Smlt3378 infC thrS TRUE 0.917 49.000 0.186 1.000 Y NA
 5778550 5778551 Smlt3379 Smlt3380     TRUE 0.877 0.000 0.000 NA   NA
 5778551 5778552 Smlt3380 Smlt3381     TRUE 0.925 11.000 0.100 NA   NA
 5778553 5778554 Smlt3382 Smlt3383   chiA1 FALSE 0.034 91.000 0.000 NA N NA
 5778556 5778557 Smlt3385 Smlt3386 pnp rpsO TRUE 0.800 152.000 0.335 1.000 Y NA
 5778557 5778558 Smlt3386 Smlt3387 rpsO truB TRUE 0.652 173.000 0.211 1.000 Y NA
 5778558 5778559 Smlt3387 Smlt3388 truB rbfA TRUE 0.943 48.000 0.318 1.000 Y NA
 5778559 5778560 Smlt3388 Smlt3389 rbfA infB TRUE 0.892 133.000 0.530 1.000 Y NA
 5778560 5778561 Smlt3389 Smlt3390 infB nusA TRUE 0.657 93.000 0.342 1.000 N NA
 5778561 5778562 Smlt3390 Smlt3391 nusA   TRUE 0.990 5.000 0.759 NA   NA
 5778562 10768878 Smlt3391 Smlt_t54     FALSE 0.015 368.000 0.000 NA   NA
 10768878 5778563 Smlt_t54 Smlt3392   nuoN FALSE 0.022 289.000 0.000 NA   NA
 5778563 5778564 Smlt3392 Smlt3393 nuoN nuoM TRUE 0.993 16.000 0.340 0.001 Y NA
 5778564 5778565 Smlt3393 Smlt3394 nuoM nuoL TRUE 0.982 24.000 0.175 0.001 Y NA
 5778565 5778566 Smlt3394 Smlt3395 nuoL nuoK TRUE 0.997 8.000 0.451 0.004 Y NA
 5778566 5778567 Smlt3395 Smlt3396 nuoK nuoJ TRUE 0.999 -3.000 0.484 0.002 Y NA
 5778567 5778568 Smlt3396 Smlt3397 nuoJ nuoI TRUE 0.996 10.000 0.442 0.004 Y NA
 5778568 5778569 Smlt3397 Smlt3398 nuoI nuoH TRUE 0.998 2.000 0.500 0.004 Y NA
 5778569 5778570 Smlt3398 Smlt3399 nuoH nuoG TRUE 0.999 -3.000 0.515 0.004 Y NA
 5778570 5778571 Smlt3399 Smlt3400 nuoG nuoF TRUE 0.999 -3.000 0.395 0.004 Y NA
 5778571 5778572 Smlt3400 Smlt3401 nuoF nuoE TRUE 0.996 5.000 0.343 0.004 Y NA
 5778572 5778573 Smlt3401 Smlt3402 nuoE nuoD TRUE 0.945 98.000 0.355 0.004 Y NA
 5778573 5778574 Smlt3402 Smlt3403 nuoD nuoC TRUE 0.999 -3.000 0.483 0.004 Y NA
 5778574 5778575 Smlt3403 Smlt3404 nuoC nuoB TRUE 0.979 34.000 0.328 0.002 Y NA
 5778575 5778576 Smlt3404 Smlt3405 nuoB nuoA TRUE 0.998 -9.000 0.507 0.002 Y NA
 5778576 10768879 Smlt3405 Smlt_t57 nuoA   FALSE 0.264 65.000 0.000 NA   NA
 10768879 5778577 Smlt_t57 Smlt3406   secG FALSE 0.303 51.000 0.000 NA   NA
 5778577 5778578 Smlt3406 Smlt3407 secG tpiA TRUE 0.759 32.000 0.184 1.000 N NA
 5778578 5778579 Smlt3407 Smlt3409 tpiA   FALSE 0.011 716.000 0.000 1.000   NA
 5778580 5778581 Smlt3410 Smlt3411     TRUE 0.784 10.000 0.000 1.000   NA
 5778581 5778582 Smlt3411 Smlt3412     TRUE 0.968 -7.000 0.222 1.000 N NA
 5778582 5778583 Smlt3412 Smlt3413   galE FALSE 0.072 68.000 0.000 1.000 N NA
 5778584 5778585 Smlt3414 Smlt3415   accD TRUE 0.818 0.000 0.008 1.000 N NA
 5778585 5778586 Smlt3415 Smlt3417 accD trpA FALSE 0.081 340.000 0.232 1.000 N NA
 5778586 5778587 Smlt3417 Smlt3418 trpA   TRUE 0.900 2.000 0.008 NA   NA
 5778587 5778588 Smlt3418 Smlt3419   trpB TRUE 0.945 -3.000 0.005 NA   NA
 5778590 5778591 Smlt3421 Smlt3422     FALSE 0.271 62.000 0.000 NA   NA
 5778591 5778592 Smlt3422 Smlt3423   trpF FALSE 0.023 281.000 0.000 NA   NA
 5778592 5778593 Smlt3423 Smlt3424 trpF truA TRUE 0.974 -3.000 0.139 1.000 N NA
 5778593 5778594 Smlt3424 Smlt3425 truA   FALSE 0.435 33.000 0.000 NA   NA
 5778594 5778595 Smlt3425 Smlt3426   fimV TRUE 0.515 27.000 0.000 NA   NA
 5778595 5778596 Smlt3426 Smlt3427 fimV asd FALSE 0.189 49.000 0.008 NA N NA
 5778596 5778597 Smlt3427 Smlt3428 asd   FALSE 0.358 94.000 0.008 0.005 N NA
 5778597 5778598 Smlt3428 Smlt3429   aroC TRUE 0.761 -7.000 0.005 1.000 N NA
 5778598 5778599 Smlt3429 Smlt3430 aroC   TRUE 0.964 -3.000 0.081 1.000 N NA
 5778600 5778601 Smlt3431 Smlt3432   psd TRUE 0.976 -3.000 0.051 1.000   NA
 5778602 5778603 Smlt3433 Smlt3434   mltD TRUE 0.591 21.000 0.000 NA   NA
 5778604 5778605 Smlt3435 Smlt3436   greB FALSE 0.447 80.000 0.000 0.049   NA
 5778606 5778607 Smlt3437 Smlt3438     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5778608 5778609 Smlt3439 Smlt3440 clcD   TRUE 0.923 -3.000 0.017 1.000 N NA
 5778609 5778610 Smlt3440 Smlt3441     TRUE 0.810 16.000 0.017 NA   NA
 5778611 5778612 Smlt3442 Smlt3443 dcd   FALSE 0.473 79.000 0.112 1.000 N NA
 5778613 5778614 Smlt3444 Smlt3446     FALSE 0.042 362.000 0.000 0.016   NA
 5778614 5778615 Smlt3446 Smlt3447   pepO FALSE 0.050 195.000 0.000 0.094 N NA
 5778615 5778616 Smlt3447 Smlt3449 pepO   FALSE 0.054 273.000 0.000 0.094   NA
 5778616 5778617 Smlt3449 Smlt3450     FALSE 0.118 188.000 0.000 0.094   NA
 5778617 5778618 Smlt3450 Smlt3451     FALSE 0.133 127.000 0.000 NA   NA
 5778618 5778619 Smlt3451 Smlt3452     FALSE 0.260 71.000 0.000 NA   NA
 5778620 5778621 Smlt3453 Smlt3454     FALSE 0.468 94.000 0.046 1.000   NA
 5778621 5778622 Smlt3454 Smlt3455     FALSE 0.467 33.000 0.000 1.000   NA
 5778622 5778623 Smlt3455 Smlt3456   gor FALSE 0.171 119.000 0.000 1.000   NA
 5778623 5778624 Smlt3456 Smlt3457 gor   TRUE 0.909 -3.000 0.013 1.000 N NA
 5778624 5778625 Smlt3457 Smlt3458     TRUE 0.972 4.000 0.231 NA   NA
 5778625 5778626 Smlt3458 Smlt3459     FALSE 0.502 100.000 0.098 NA   NA
 5778627 5778628 Smlt3460 Smlt3461     TRUE 0.708 282.000 1.000 NA Y NA
 5778630 5778631 Smlt3463 Smlt3464     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5778631 5778632 Smlt3464 Smlt3465   mesJ FALSE 0.012 493.000 0.000 NA   NA
 5778632 5778633 Smlt3465 Smlt3466 mesJ xseB FALSE 0.255 37.000 0.006 1.000 N NA
 5778633 5778634 Smlt3466 Smlt3467 xseB ispA TRUE 0.954 -10.000 0.177 1.000 N NA
 5778635 5778636 Smlt3468 Smlt3469     FALSE 0.357 70.000 0.008 NA   NA
 5778638 5778639 Smlt3471 Smlt3472 tldD   TRUE 0.542 61.000 0.050 NA   NA
 5778639 5778640 Smlt3472 Smlt3473   rnG TRUE 0.885 31.000 0.296 NA   NA
 5778640 5778641 Smlt3473 Smlt3474 rnG   TRUE 0.981 -7.000 0.417 NA N NA
 5778642 5778643 Smlt3475 Smlt3477     FALSE 0.040 214.000 0.000 NA   NA
 5778643 5778644 Smlt3477 Smlt3478     FALSE 0.049 197.000 0.000 0.094 N NA
 5778644 5778645 Smlt3478 Smlt3479   arcD FALSE 0.031 130.000 0.000 1.000 N NA
 10768880 5778646 Smlt_t58 Smlt3480     TRUE 0.575 22.000 0.000 NA   NA
 5778646 5778647 Smlt3480 Smlt3481     TRUE 0.767 65.000 0.307 NA   NA
 5778647 5778648 Smlt3481 Smlt3482   nadD TRUE 0.537 59.000 0.044 NA   NA
 5778648 5778649 Smlt3482 Smlt3483 nadD   TRUE 0.772 1.000 0.006 1.000 N NA
 5778649 5778650 Smlt3483 Smlt3484     TRUE 0.923 10.000 0.199 NA N NA
 5778650 5778651 Smlt3484 Smlt3485   leuS FALSE 0.320 137.000 0.182 NA N NA
 5778651 5778652 Smlt3485 Smlt3486 leuS   FALSE 0.232 106.000 0.005 NA   NA
 5778653 5778654 Smlt3487 Smlt3488     FALSE 0.099 154.000 0.000 1.000   NA
 5778654 5778655 Smlt3488 Smlt3489     TRUE 0.973 -3.000 0.034 1.000   NA
 5778655 5778656 Smlt3489 Smlt3490     FALSE 0.258 74.000 0.000 NA   NA
 5778658 5778659 Smlt3492 Smlt3493     TRUE 0.964 -3.000 0.020 NA   NA
 5778659 5778660 Smlt3493 Smlt3494     FALSE 0.405 96.000 0.032 NA   NA
 5778660 5778661 Smlt3494 Smlt3495     TRUE 0.660 17.000 0.000 NA   NA
 5778661 5778662 Smlt3495 Smlt3496     TRUE 0.603 -3.000 0.000 NA N NA
 5778662 5778663 Smlt3496 Smlt3497     FALSE 0.023 411.000 0.010 NA   NA
 5778663 5778664 Smlt3497 Smlt3498   metG FALSE 0.329 103.000 0.019 NA   NA
 5778664 5778665 Smlt3498 Smlt3499 metG   FALSE 0.376 79.000 0.055 1.000 N NA
 5778665 5778666 Smlt3499 Smlt3500     FALSE 0.500 25.000 0.014 1.000 N NA
 5778669 5778670 Smlt3503 Smlt3504 acvB   FALSE 0.249 79.000 0.000 NA   NA
 5778670 5778671 Smlt3504 Smlt3505     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5778671 5778672 Smlt3505 Smlt3506     TRUE 0.692 35.000 0.056 NA   NA
 5778675 5778676 Smlt3509 Smlt3510     FALSE 0.117 137.000 0.000 NA   NA
 5778676 5778677 Smlt3510 Smlt3511     TRUE 0.729 12.000 0.000 NA   NA
 5778678 5778679 Smlt3512 Smlt3513     TRUE 0.747 11.000 0.000 NA   NA
 5778679 5778680 Smlt3513 Smlt3514   sigMa TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5778682 5778683 Smlt3517 Smlt3518     FALSE 0.066 171.000 0.000 NA   NA
 5778684 5778685 Smlt3519 Smlt3520     FALSE 0.314 48.000 0.000 NA   NA
 5778685 5778686 Smlt3520 Smlt3521     FALSE 0.031 131.000 0.000 1.000 N NA
 5778690 5778691 Smlt3525 Smlt3526     FALSE 0.137 125.000 0.000 NA   NA
 5778691 5778692 Smlt3526 Smlt3527     FALSE 0.083 158.000 0.000 NA   NA
 5778694 5778695 Smlt3529 Smlt3530   ligB TRUE 0.995 -3.000 0.751 NA N NA
 5778695 5778696 Smlt3530 Smlt3531 ligB   TRUE 0.993 -3.000 0.214 0.071   NA
 5778696 5778697 Smlt3531 Smlt3532     TRUE 0.988 -10.000 0.460 1.000   NA
 5778698 5778699 Smlt3533 Smlt3534     FALSE 0.218 91.000 0.000 NA   NA
 5778699 5778700 Smlt3534 Smlt3535   cspA FALSE 0.369 105.000 0.107 1.000 N NA
 5778700 5778701 Smlt3535 Smlt3536 cspA   FALSE 0.190 89.000 0.013 1.000 N NA
 5778701 5778702 Smlt3536 Smlt3537   hpt TRUE 0.907 74.000 0.067 0.002 Y NA
 5778702 5778703 Smlt3537 Smlt3538 hpt nagZ TRUE 0.912 0.000 0.034 1.000 N NA
 5778703 5778704 Smlt3538 Smlt3539 nagZ   FALSE 0.046 161.000 0.006 1.000 N NA
 5778704 5778705 Smlt3539 Smlt3540     FALSE 0.320 114.000 0.021 1.000   NA
 5778705 5778706 Smlt3540 Smlt3541     TRUE 0.540 35.000 0.007 1.000   NA
 5778707 5778708 Smlt3542 Smlt3544     FALSE 0.061 191.000 0.000 1.000   NA
 5778708 5778709 Smlt3544 Smlt3545     TRUE 0.990 -3.000 0.111 0.048   NA
 5778710 5778711 Smlt3546 Smlt3547   recO TRUE 0.643 18.000 0.000 NA   NA
 5778711 5778712 Smlt3547 Smlt3548 recO era TRUE 0.767 19.000 0.012 1.000   NA
 5778712 5778713 Smlt3548 Smlt3549 era rnc TRUE 0.981 -3.000 0.017 0.034   NA
 5778713 5778714 Smlt3549 Smlt3550 rnc   TRUE 0.847 -10.000 0.000 NA   NA
 5778714 5778715 Smlt3550 Smlt3551   lepB FALSE 0.298 53.000 0.000 NA   NA
 5778715 5778716 Smlt3551 Smlt3552 lepB lepA TRUE 0.617 55.000 0.187 1.000 N NA
 5778716 5778717 Smlt3552 Smlt3553 lepA   FALSE 0.043 166.000 0.007 1.000 N NA
 5778717 5778718 Smlt3553 Smlt3554   rseA FALSE 0.313 75.000 0.035 NA N NA
 5778718 5778719 Smlt3554 Smlt3555 rseA rpoE TRUE 0.994 -3.000 0.705 NA N NA
 5778720 5778721 Smlt3556 Smlt3558     FALSE 0.010 636.000 0.000 NA   NA
 5778721 5778722 Smlt3558 Smlt3559   aqpZ FALSE 0.145 122.000 0.000 NA   NA
 5778722 5778723 Smlt3559 Smlt3560 aqpZ   FALSE 0.050 196.000 0.000 NA   NA
 5778725 5778726 Smlt3562 Smlt3563 cstA   TRUE 0.975 0.000 0.156 NA   NA
 5778729 5778730 Smlt3567 Smlt3568     TRUE 0.998 -13.000 0.833 1.000 Y NA
 5778731 5778732 Smlt3569 Smlt3570     FALSE 0.398 112.000 0.061 NA   NA
 5778732 5778733 Smlt3570 Smlt3571     TRUE 0.986 -3.000 0.152 1.000   NA
 5778733 5778734 Smlt3571 Smlt3573     FALSE 0.012 621.000 0.000 1.000   NA
 5778734 5778735 Smlt3573 Smlt3574     FALSE 0.024 295.000 0.000 1.000   NA
 5778736 5778737 Smlt3576 Smlt3577     FALSE 0.260 71.000 0.000 NA   NA
 5778737 5778738 Smlt3577 Smlt3578   bcr FALSE 0.031 96.000 0.000 NA N NA
 5778740 5778741 Smlt3580 Smlt3581     FALSE 0.185 104.000 0.000 NA   NA
 5778741 5778742 Smlt3581 Smlt3582     FALSE 0.064 83.000 0.000 1.000 N NA
 5778743 5778744 Smlt3583 Smlt3584 katE   TRUE 0.563 23.000 0.000 NA   NA
 5778746 5778747 Smlt3586 Smlt3587     TRUE 0.591 21.000 0.000 NA   NA
 5778749 5778750 Smlt3589 Smlt3590     TRUE 0.981 5.000 0.364 1.000   NA
 5778751 5778752 Smlt3591 Smlt3592   purA FALSE 0.504 28.000 0.000 NA   NA
 5778752 5778753 Smlt3592 Smlt3593 purA   TRUE 0.796 -25.000 0.000 NA   NA
 5778753 5778754 Smlt3593 Smlt3594     TRUE 0.782 8.000 0.000 NA   NA
 5778754 5778755 Smlt3594 Smlt3595     TRUE 0.791 68.000 0.348 NA   NA
 5778755 5778756 Smlt3595 Smlt3596   hflK TRUE 1.000 -3.000 0.947 0.007 Y NA
 5778757 5778758 Smlt3597 Smlt3598     FALSE 0.482 89.000 0.150 1.000 N NA
 5778760 5778761 Smlt3600 Smlt3601   bfr TRUE 0.681 30.000 0.016 0.024 N NA
 5778762 5778763 Smlt3602 Smlt3603 pbpC   TRUE 0.911 50.000 0.711 1.000   NA
 5778763 5778764 Smlt3603 Smlt3604   prpD FALSE 0.084 164.000 0.000 1.000   NA
 5778764 5778765 Smlt3604 Smlt3605 prpD   FALSE 0.249 151.000 0.053 NA   NA
 5778765 5778766 Smlt3605 Smlt3606     TRUE 0.906 4.000 0.017 NA   NA
 5778766 5778767 Smlt3606 Smlt3607     TRUE 0.988 -3.000 0.207 NA   NA
 5778767 5778768 Smlt3607 Smlt3608   acnA FALSE 0.379 41.000 0.000 1.000   NA
 5778768 5778769 Smlt3608 Smlt3609 acnA prpC TRUE 0.893 98.000 0.289 1.000 Y NA
 5778769 5778770 Smlt3609 Smlt3610 prpC prpB TRUE 0.871 37.000 0.502 1.000 N NA
 5778772 5778773 Smlt3612 Smlt3613     TRUE 0.515 27.000 0.000 NA   NA
 5778773 5778774 Smlt3613 Smlt3614     FALSE 0.325 45.000 0.000 NA   NA
 5778774 5778775 Smlt3614 Smlt3615     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5778775 5778776 Smlt3615 Smlt3616   pdxH TRUE 0.949 -3.000 0.004 1.000   NA
 5778779 5778780 Smlt3619 Smlt3620 aroK aroB TRUE 0.997 -3.000 0.208 1.000 Y NA
 5778780 5778781 Smlt3620 Smlt3621 aroB   FALSE 0.234 102.000 0.002 NA   NA
 5778781 5778782 Smlt3621 Smlt3622   hemE TRUE 0.609 27.000 0.006 NA   NA
 5778782 5778783 Smlt3622 Smlt3623 hemE   FALSE 0.077 60.000 0.000 1.000 N NA
 5778784 5778785 Smlt3625 Smlt3626     FALSE 0.158 116.000 0.000 NA   NA
 5778786 5778787 Smlt3627 Smlt3628     TRUE 0.955 11.000 0.222 NA   NA
 5778787 5778788 Smlt3628 Smlt3629     TRUE 0.948 4.000 0.080 NA   NA
 5778790 5778791 Smlt3631 Smlt3632 sdaA   FALSE 0.045 204.000 0.000 NA   NA
 5778792 5778793 Smlt3633 Smlt3634 thrA metB TRUE 0.994 -3.000 0.039 1.000 Y NA
 5778793 5778794 Smlt3634 Smlt3635 metB met2 TRUE 0.995 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 5778795 5778796 Smlt3636 Smlt3637   prfC FALSE 0.342 67.000 0.006 NA   NA
 5778796 5778797 Smlt3637 Smlt3638 prfC   FALSE 0.133 160.000 0.008 1.000   NA
 5778797 5778798 Smlt3638 Smlt3639     FALSE 0.427 84.000 0.025 NA   NA
 5778799 5778800 Smlt3640 Smlt3641   gtrB TRUE 0.821 29.000 0.128 NA   NA
 5778800 5778801 Smlt3641 Smlt3642 gtrB mtgA FALSE 0.457 47.000 0.013 NA   NA
 5778802 5778803 Smlt3643 Smlt3644     FALSE 0.157 147.000 0.010 NA   NA
 5778804 5778805 Smlt3645 Smlt3646     FALSE 0.044 216.000 0.000 1.000   NA
 5778806 5778807 Smlt3647 Smlt3648 bpoA fadE TRUE 0.994 -3.000 0.045 NA Y NA
 5778807 5778808 Smlt3648 Smlt3649 fadE   FALSE 0.255 77.000 0.022 NA N NA
 5778809 5778810 Smlt3650 Smlt3651     TRUE 0.513 43.000 0.017 NA   NA
 5778814 5778815 Smlt3655 Smlt3656     FALSE 0.065 172.000 0.000 NA   NA
 11422230 5778807   Smlt3648   fadE FALSE NA 6518.000 0.000 NA   NA
 11564593 5778807   Smlt3648   fadE FALSE NA 6518.000 0.000 NA   NA
 11706985 5778807   Smlt3648   fadE FALSE NA 6518.000 0.000 NA   NA
 11422231 5778807   Smlt3648   fadE FALSE NA 6537.000 0.000 NA   NA
 11564594 5778807   Smlt3648   fadE FALSE NA 6537.000 0.000 NA   NA
 11706986 5778807   Smlt3648   fadE FALSE NA 6537.000 0.000 NA   NA
 11422232 5778807   Smlt3648   fadE FALSE NA 6557.000 0.000 NA   NA
 11564595 5778807   Smlt3648   fadE FALSE NA 6557.000 0.000 NA   NA
 11706987 5778807   Smlt3648   fadE FALSE NA 6557.000 0.000 NA   NA
 11422233 5778807   Smlt3648   fadE FALSE NA 6576.000 0.000 NA   NA
 11564596 5778807   Smlt3648   fadE FALSE NA 6576.000 0.000 NA   NA
 11706988 5778807   Smlt3648   fadE FALSE NA 6576.000 0.000 NA   NA
 11422234 5778807   Smlt3648   fadE FALSE NA 6620.000 0.000 NA   NA
 11564597 5778807   Smlt3648   fadE FALSE NA 6620.000 0.000 NA   NA
 11706989 5778807   Smlt3648   fadE FALSE NA 6620.000 0.000 NA   NA
 11422235 5778807   Smlt3648   fadE FALSE NA 6639.000 0.000 NA   NA
 11564598 5778807   Smlt3648   fadE FALSE NA 6639.000 0.000 NA   NA
 11706990 5778807   Smlt3648   fadE FALSE NA 6639.000 0.000 NA   NA
 11422236 5778807   Smlt3648   fadE FALSE NA 6695.000 0.000 NA   NA
 11564599 5778807   Smlt3648   fadE FALSE NA 6695.000 0.000 NA   NA
 11706991 5778807   Smlt3648   fadE FALSE NA 6695.000 0.000 NA   NA
 11422237 5778807   Smlt3648   fadE FALSE NA 6714.000 0.000 NA   NA
 11564600 5778807   Smlt3648   fadE FALSE NA 6714.000 0.000 NA   NA
 11706992 5778807   Smlt3648   fadE FALSE NA 6714.000 0.000 NA   NA
 11422238 5778807   Smlt3648   fadE FALSE NA 6758.000 0.000 NA   NA
 11564601 5778807   Smlt3648   fadE FALSE NA 6758.000 0.000 NA   NA
 11706993 5778807   Smlt3648   fadE FALSE NA 6758.000 0.000 NA   NA
 5778815 5778816 Smlt3656 Smlt3657   gcvH FALSE 0.388 37.000 0.000 NA   NA
 5778816 5778817 Smlt3657 Smlt3658 gcvH gcvT TRUE 0.945 94.000 0.317 0.001 Y NA
 5778817 5778818 Smlt3658 Smlt3659 gcvT   FALSE 0.046 156.000 0.008 NA N NA
 5778818 5778819 Smlt3659 Smlt3660     TRUE 0.995 2.000 0.313 NA Y NA
 5778819 5778820 Smlt3660 Smlt3661     FALSE 0.262 67.000 0.000 NA   NA
 5778820 5778821 Smlt3661 Smlt3662     FALSE 0.236 84.000 0.000 NA   NA
 5778821 5778822 Smlt3662 Smlt3663     TRUE 0.855 -33.000 0.006 1.000   NA
 5778822 5778823 Smlt3663 Smlt3664   cysQ TRUE 0.799 14.000 0.007 1.000   NA
 5778823 5778824 Smlt3664 Smlt3665 cysQ nudE TRUE 0.989 -3.000 0.373 1.000 N NA
 5778825 5778826 Smlt3666 Smlt3667 bioA   TRUE 0.944 -9.000 0.041 NA   NA
 5778827 5778828 Smlt3668 Smlt3669     TRUE 0.989 -3.000 0.071 0.007   NA
 5778828 5778829 Smlt3669 Smlt3670   frzE TRUE 0.970 -13.000 0.054 0.007   NA
 5778829 5778830 Smlt3670 Smlt3671 frzE pilJ TRUE 0.959 101.000 0.554 0.007 Y NA
 5778830 5778831 Smlt3671 Smlt3672 pilJ pilI TRUE 0.987 42.000 0.795 0.007 Y NA
 5778831 5778832 Smlt3672 Smlt3673 pilI pilH TRUE 0.992 0.000 0.076 1.000 Y NA
 5778832 5778833 Smlt3673 Smlt3674 pilH pilG TRUE 0.978 19.000 0.085 0.021 Y NA
 5778834 5778835 Smlt3675 Smlt3676 gshB   TRUE 0.944 0.000 0.089 1.000 N NA
 5778836 5778837 Smlt3677 Smlt3678     TRUE 0.877 10.000 0.082 1.000 N NA
 5778837 5778838 Smlt3678 Smlt3680     FALSE 0.012 593.000 0.000 1.000   NA
 5778838 5778839 Smlt3680 Smlt3681   mrcB TRUE 0.753 12.000 0.000 1.000   NA
 5778839 5778840 Smlt3681 Smlt3682 mrcB   TRUE 0.701 79.000 0.000 NA Y NA
 5778840 5778841 Smlt3682 Smlt3683   wbpV TRUE 0.837 73.000 0.062 NA Y NA
 5778841 5778842 Smlt3683 Smlt3684 wbpV   FALSE 0.284 58.000 0.000 NA   NA
 5778842 5778843 Smlt3684 Smlt3685   relA TRUE 0.761 31.000 0.065 1.000   NA
 5778846 5778847 Smlt3688 Smlt3689   recQ FALSE 0.006 547.000 0.005 1.000 N NA
 5778847 5778848 Smlt3689 Smlt3690 recQ copL2 FALSE 0.054 191.000 0.000 NA   NA
 5778848 5778849 Smlt3690 Smlt3691b2 copL2 copA2 FALSE 0.255 76.000 0.000 NA   NA
 5778849 10768881 Smlt3691b2 Smlt3691b copA2   TRUE 0.766 -545.000 0.000 NA   NA
 10768881 10768882 Smlt3691b Smlt3691     FALSE 0.009 898.000 0.000 NA   NA
 10768882 5778850 Smlt3691 Smlt3692   copB2 TRUE 0.842 3.000 0.000 NA   NA
 5778850 5778851 Smlt3692 Smlt3693 copB2   FALSE 0.267 82.000 0.000 1.000   NA
 5778851 5778852 Smlt3693 Smlt3694     FALSE 0.012 460.000 0.000 NA   NA
 5778852 5778853 Smlt3694 Smlt3695     FALSE 0.213 93.000 0.000 NA   NA
 5778854 5778855 Smlt3696 Smlt3697     FALSE 0.252 77.000 0.000 NA   NA
 5778858 5778859 Smlt3700 Smlt3701     TRUE 0.741 79.000 0.270 1.000   NA
 5778859 5778860 Smlt3701 Smlt3702     FALSE 0.307 140.000 0.059 1.000   NA
 5778860 5778861 Smlt3702 Smlt3703     TRUE 0.977 4.000 0.278 1.000   NA
 5778861 5778862 Smlt3703 Smlt3704   tolB TRUE 0.815 65.000 0.592 1.000 N NA
 5778862 5778863 Smlt3704 Smlt3705 tolB tolA FALSE 0.140 284.000 0.215 NA   NA
 5778863 5778864 Smlt3705 Smlt3706 tolA tolR TRUE 0.987 -10.000 0.460 NA   NA
 5778864 5778865 Smlt3706 Smlt3707 tolR tolQ TRUE 0.991 25.000 0.556 0.041 Y NA
 5778865 5778866 Smlt3707 Smlt3708 tolQ   TRUE 0.982 11.000 0.593 1.000   NA
 5778866 5778867 Smlt3708 Smlt3709   ruvB TRUE 0.958 -10.000 0.082 1.000   NA
 5778867 5778868 Smlt3709 Smlt3710 ruvB kup FALSE 0.008 370.000 0.005 1.000 N NA
 5778868 5778869 Smlt3710 Smlt3711 kup ruvA FALSE 0.201 50.000 0.007 1.000 N NA
 5778869 5778870 Smlt3711 Smlt3712 ruvA ruvC TRUE 0.995 14.000 0.451 0.008 Y NA
 5778870 5778871 Smlt3712 Smlt3713 ruvC   TRUE 0.646 106.000 0.277 NA   NA
 5778871 5778872 Smlt3713 Smlt3715     FALSE 0.045 234.000 0.006 NA   NA
 5778872 5778873 Smlt3715 Smlt3716     TRUE 0.555 76.000 0.075 NA   NA
 5778873 5778874 Smlt3716 Smlt3718   aspS FALSE 0.018 366.000 0.000 1.000   NA
 5778876 5778877 Smlt3720 Smlt3721     FALSE 0.296 54.000 0.000 NA   NA
 5778877 5778878 Smlt3721 Smlt3722     FALSE 0.061 86.000 0.000 1.000 N NA
 5778881 5778882 Smlt3725 Smlt3726     FALSE 0.192 238.000 0.000 1.000 Y NA
 5778883 5778884 Smlt3728 Smlt3729     FALSE 0.151 120.000 0.000 NA   NA
 5778885 5778886 Smlt3730 Smlt3731     FALSE 0.483 141.000 0.400 NA N NA
 5778887 5778888 Smlt3732 Smlt3733 clpB   FALSE 0.059 182.000 0.000 NA   NA
 5778890 5778891 Smlt3735 Smlt3737   poxB FALSE 0.010 610.000 0.000 NA   NA
 5778891 5778892 Smlt3737 Smlt3738 poxB   FALSE 0.148 121.000 0.000 NA   NA
 5778892 5778893 Smlt3738 Smlt3739     TRUE 0.845 19.000 0.057 NA   NA
 5778894 5778895 Smlt3740 Smlt3741   otsB FALSE 0.009 215.000 0.000 1.000 N NA
 5778895 5778896 Smlt3741 Smlt3742 otsB   TRUE 0.925 42.000 0.174 1.000 Y NA
 5778896 5778897 Smlt3742 Smlt3743   otsA TRUE 0.995 -3.000 0.057 1.000 Y NA
 5778898 5778899 Smlt3744 Smlt3745     TRUE 0.926 -25.000 0.052 NA   NA
 5778899 5778900 Smlt3745 Smlt3746     FALSE 0.351 57.000 0.004 NA   NA
 5778900 5778901 Smlt3746 Smlt3747   rluD TRUE 0.976 0.000 0.168 NA   NA
 5778902 5778903 Smlt3748 Smlt3749 comL   FALSE 0.317 47.000 0.000 NA   NA
 5778904 5778905 Smlt3751 Smlt3752 nadE sucD FALSE 0.063 242.000 0.079 1.000 N NA
 5778905 5778906 Smlt3752 Smlt3753 sucD sucC TRUE 0.995 22.000 0.806 0.000 Y NA
 5778907 5778908 Smlt3754 Smlt3755 pilS hydG TRUE 0.970 61.000 0.556 0.069 Y NA
 5778909 5778910 Smlt3756 Smlt3757 pilF ppdD FALSE 0.041 223.000 0.000 1.000   NA
 5778910 5778911 Smlt3757 Smlt3758 ppdD pilE FALSE 0.237 153.000 0.000 0.002   NA
 5778912 5778913 Smlt3759 Smlt3760 pilG   TRUE 0.994 8.000 0.454 1.000 Y NA
 5778913 5778914 Smlt3760 Smlt3761   coaE TRUE 0.884 12.000 0.122 1.000 N NA
 5778915 5778916 Smlt3763 Smlt3764     TRUE 0.798 6.000 0.000 NA   NA
 5778916 5778917 Smlt3764 Smlt3765     TRUE 0.625 19.000 0.000 NA   NA
 5778917 5778918 Smlt3765 Smlt3766     TRUE 0.994 -37.000 0.400 1.000 Y NA
 5778918 5778919 Smlt3766 Smlt3767     TRUE 0.772 9.000 0.000 NA   NA
 5778919 5778920 Smlt3767 Smlt3768     TRUE 0.591 21.000 0.000 NA   NA
 5778920 5778921 Smlt3768 Smlt3769   rimK FALSE 0.034 228.000 0.000 NA   NA
 5778923 5778924 Smlt3771 Smlt3772     FALSE 0.083 158.000 0.000 NA   NA
 5778924 10768884 Smlt3772 Smlt_t60     TRUE 0.860 1.000 0.000 NA   NA
 10768884 5778925 Smlt_t60 Smlt3773     FALSE 0.162 114.000 0.000 NA   NA
 5778926 5778927 Smlt3774 Smlt3775 thiS thiG TRUE 0.676 152.000 0.130 1.000 Y NA
 5778927 5778928 Smlt3775 Smlt3776 thiG   TRUE 0.962 0.000 0.060 1.000   NA
 5778928 5778929 Smlt3776 Smlt3777     TRUE 0.665 28.000 0.012 1.000   NA
 5778930 5778931 Smlt3778 Smlt3779     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5778932 5778933 Smlt3780 Smlt3781     TRUE 0.876 76.000 0.667 NA   NA
 5778933 5778934 Smlt3781 Smlt3782   mscL FALSE 0.214 55.000 0.008 1.000 N NA
 5778934 5778935 Smlt3782 Smlt3783 mscL   FALSE 0.127 161.000 0.007 1.000   NA
 5778936 5778937 Smlt3784 Smlt3785     TRUE 0.922 -7.000 0.055 1.000 N NA
 5778937 5778938 Smlt3785 Smlt3786     FALSE 0.196 169.000 0.154 1.000 N NA
 5778938 5778939 Smlt3786 Smlt3787   smeN TRUE 0.956 -7.000 0.154 1.000 N NA
 5778939 5778940 Smlt3787 Smlt3788 smeN smeM TRUE 0.990 -3.000 0.260 0.090 N NA
 5778940 5778941 Smlt3788 Smlt3789 smeM   FALSE 0.024 277.000 0.000 0.090 N NA
 5778941 5778942 Smlt3789 Smlt3790     FALSE 0.251 78.000 0.000 NA   NA
 5778942 5778943 Smlt3790 Smlt3793   cysB FALSE 0.011 605.000 0.000 NA   NA
 5778944 5778945 Smlt3794 Smlt3795 cysK1   FALSE 0.041 213.000 0.000 NA   NA
 5778946 5778947 Smlt3796 Smlt3797   alf1 FALSE 0.128 130.000 0.000 NA   NA
 5778947 5778948 Smlt3797 Smlt3798 alf1 pykA FALSE 0.476 197.000 0.010 0.003 Y NA
 5778948 5778949 Smlt3798 Smlt3799 pykA   FALSE 0.067 218.000 0.009 1.000   NA
 5778949 5778950 Smlt3799 Smlt3800   pgk TRUE 0.947 -3.000 0.004 1.000   NA
 5778950 5778951 Smlt3800 Smlt3802 pgk   FALSE 0.009 711.000 0.000 NA   NA
 5778951 5778952 Smlt3802 Smlt3803     TRUE 0.990 -3.000 0.283 NA   NA
 5778952 5778953 Smlt3803 Smlt3804   gap FALSE 0.135 126.000 0.000 NA   NA
 5778954 5778955 Smlt3805 Smlt3806     FALSE 0.070 232.000 0.017 1.000   NA
 5778955 5778956 Smlt3806 Smlt3807     TRUE 0.940 12.000 0.158 1.000   NA
 5778957 5778958 Smlt3808 Smlt3809     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 5778958 5778959 Smlt3809 Smlt3810   blaI TRUE 0.998 -7.000 0.833 1.000 Y NA
 5778960 5778961 Smlt3811 Smlt3812     TRUE 0.682 35.000 0.040 1.000   NA
 5778962 5778963 Smlt3813 Smlt3814 tktA   FALSE 0.117 216.000 0.150 1.000 N NA
 5778963 5778964 Smlt3814 Smlt3815     TRUE 0.625 58.000 0.100 NA   NA
 5778964 5778965 Smlt3815 Smlt3816     TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA   NA
 5778965 5778966 Smlt3816 Smlt3817     TRUE 0.972 -3.000 0.041 NA   NA
 5778966 5778967 Smlt3817 Smlt3818     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5778967 5778968 Smlt3818 Smlt3819     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5778968 5778969 Smlt3819 Smlt3820     TRUE 0.918 9.000 0.060 NA   NA
 5778969 5778970 Smlt3820 Smlt3821   pilQ FALSE 0.101 199.000 0.017 1.000   NA
 5778970 5778971 Smlt3821 Smlt3822 pilQ pilP TRUE 0.990 22.000 0.668 NA Y NA
 5778971 5778972 Smlt3822 Smlt3823 pilP pilO TRUE 0.999 -3.000 0.680 NA Y NA
 5778972 5778973 Smlt3823 Smlt3824 pilO pilN TRUE 0.999 -3.000 0.770 NA Y NA
 5778973 5778974 Smlt3824 Smlt3825 pilN pilM TRUE 0.998 0.000 0.616 NA Y NA
 5778975 5778976 Smlt3826 Smlt3827 mrcA   FALSE 0.055 331.000 0.050 NA   NA
 5778977 5778978 Smlt3828 Smlt3829     TRUE 0.827 4.000 0.000 NA   NA
 5778978 5778979 Smlt3829 Smlt3830   cblB FALSE 0.056 188.000 0.000 NA   NA
 5778979 5778980 Smlt3830 Smlt3831 cblB cblD TRUE 0.660 17.000 0.000 NA   NA
 5778980 5778981 Smlt3831 Smlt3832a cblD cblC TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5778981 10768885 Smlt3832a Smlt3832 cblC   TRUE 0.778 -74.000 0.000 NA   NA
 10768885 5778982 Smlt3832 Smlt3833   cblA FALSE 0.303 51.000 0.000 NA   NA
 5778982 5778983 Smlt3833 Smlt3834 cblA   FALSE 0.011 519.000 0.000 NA   NA
 5778983 5778984 Smlt3834 Smlt3835   gltA FALSE 0.016 366.000 0.000 NA   NA
 5778984 5778985 Smlt3835 Smlt3836 gltA rpmE FALSE 0.010 297.000 0.004 1.000 N NA
 5778985 5778986 Smlt3836 Smlt3837 rpmE   FALSE 0.130 89.000 0.008 NA N NA
 5778986 5778987 Smlt3837 Smlt3838   recG FALSE 0.007 385.000 0.007 NA N NA
 5778987 5778988 Smlt3838 Smlt3839 recG   TRUE 0.875 8.000 0.076 NA N NA
 5778988 5778989 Smlt3839 Smlt3840   spoT FALSE 0.205 184.000 0.215 NA N NA
 5778989 5778990 Smlt3840 Smlt3841 spoT   TRUE 0.879 106.000 0.291 1.000 Y NA
 5778990 5778991 Smlt3841 Smlt3842   gmk TRUE 0.658 111.000 0.471 1.000 N NA
 5778992 10768886 Smlt3843a Smlt3843 fdnG   TRUE 0.771 -314.000 0.000 NA   NA
 10768886 10768887 Smlt3843 Smlt3844     FALSE 0.009 2374.000 0.000 NA   NA
 10768887 5778993 Smlt3844 Smlt3845   fdnH FALSE 0.451 32.000 0.000 NA   NA
 5778993 5778994 Smlt3845 Smlt3846 fdnH fdnI TRUE 0.999 -3.000 0.333 0.001 Y NA
 5778994 5778995 Smlt3846 Smlt3848 fdnI fdhE FALSE 0.049 385.000 0.182 NA N NA
 5778995 5778996 Smlt3848 Smlt3849 fdhE selA TRUE 0.908 4.000 0.083 NA N NA
 5778996 5778997 Smlt3849 Smlt3850 selA selB TRUE 0.996 -3.000 0.569 0.000 N NA
 5778997 10768888 Smlt3850 Smlt_t61 selB   TRUE 0.515 27.000 0.000 NA   NA
 10768888 5778998 Smlt_t61 Smlt3851   selD TRUE 0.527 26.000 0.000 NA   NA
 5778998 5778999 Smlt3851 Smlt3852 selD   FALSE 0.286 71.000 0.000 1.000   NA
 5778999 5779000 Smlt3852 Smlt3853     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5779002 5779003 Smlt3855 Smlt3856 rph   TRUE 0.944 -3.000 0.005 NA   NA
 5779003 5779004 Smlt3856 Smlt3857     TRUE 0.941 -3.000 0.003 NA   NA
 5779004 5779005 Smlt3857 Smlt3858     TRUE 0.646 57.000 0.218 1.000 N NA
 5779005 5779006 Smlt3858 Smlt3859     FALSE 0.065 203.000 0.006 NA   NA
 5779006 5779007 Smlt3859 Smlt3860     TRUE 0.996 -3.000 0.667 NA   NA
 5779007 5779008 Smlt3860 Smlt3861   pepQ TRUE 0.550 76.000 0.072 NA   NA
 5779009 5779010 Smlt3862 Smlt3863     FALSE 0.119 136.000 0.000 NA   NA
 5779010 5779011 Smlt3863 Smlt3864     TRUE 0.986 0.000 0.329 NA   NA
 5779012 5779013 Smlt3865 Smlt3866     FALSE 0.035 423.000 0.034 NA   NA
 5779013 5779014 Smlt3866 Smlt3867     TRUE 0.955 -3.000 0.011 NA   NA
 5779014 5779015 Smlt3867 Smlt3868   rpiA TRUE 0.687 23.000 0.011 NA   NA
 5779015 5779016 Smlt3868 Smlt3869 rpiA   TRUE 0.663 22.000 0.006 NA   NA
 5779016 5779017 Smlt3869 Smlt3870     FALSE 0.217 139.000 0.020 NA   NA
 5779019 5779020 Smlt3872 Smlt3873 thiE hemL TRUE 0.979 17.000 0.173 1.000 Y NA
 5779025 5779026 Smlt3878 Smlt3879     FALSE 0.293 55.000 0.000 NA   NA
 5779028 5779029 Smlt3881 Smlt3882     TRUE 0.687 15.000 0.000 NA   NA
 5779031 5779032 Smlt3884 Smlt3885   mpl TRUE 0.963 -3.000 0.015 1.000   NA
 5779032 5779033 Smlt3885 Smlt3886 mpl adk FALSE 0.019 330.000 0.000 0.068 N NA
 5779034 5779035 Smlt3887 Smlt3888     FALSE 0.154 119.000 0.000 NA   NA
 5779038 5779039 Smlt3892 Smlt3893     TRUE 0.924 -3.000 0.000 0.089 N NA
 5779039 5779040 Smlt3893 Smlt3894     TRUE 0.975 10.000 0.000 0.040 Y NA
 5779040 5779041 Smlt3894 Smlt3895     TRUE 0.917 -28.000 0.042 NA   NA
 5779041 5779042 Smlt3895 Smlt3896   pigA TRUE 0.676 32.000 0.029 NA   NA
 5779044 5779045 Smlt3898 Smlt3899     FALSE 0.386 160.000 0.000 NA Y NA
 5779045 5779046 Smlt3899 Smlt3900   rpoE FALSE 0.039 81.000 0.000 NA N NA
 5779046 5779047 Smlt3900 Smlt3900A rpoE   FALSE 0.259 73.000 0.000 NA   NA
 5779048 5779049 Smlt3902 Smlt3903 ppa   FALSE 0.062 153.000 0.009 1.000 N NA
 5779050 5779051 Smlt3904 Smlt3905     FALSE 0.162 114.000 0.000 NA   NA
 5779051 5779052 Smlt3905 Smlt3906     TRUE 0.916 50.000 0.750 1.000   NA
 5779052 5779053 Smlt3906 Smlt3907     FALSE 0.178 115.000 0.000 0.046 N NA
 5779053 5779054 Smlt3907 Smlt3908     FALSE 0.025 270.000 0.000 NA   NA
 5779054 5779055 Smlt3908 Smlt3909   thiC FALSE 0.111 140.000 0.000 NA   NA
 5779057 5779058 Smlt3911 Smlt3912     FALSE 0.027 258.000 0.000 NA   NA
 5779059 5779060 Smlt3913 Smlt3914   ilvG TRUE 0.915 40.000 0.012 0.001 Y NA
 5779060 5779061 Smlt3914 Smlt3915 ilvG ilvN TRUE 0.996 -16.000 0.943 0.001   NA
 5779061 5779062 Smlt3915 Smlt3916 ilvN tdcB FALSE 0.450 64.000 0.017 1.000   NA
 5779062 5779063 Smlt3916 Smlt3917 tdcB leuA TRUE 0.992 -3.000 0.013 1.000 Y NA
 5779063 5779064 Smlt3917 Smlt3918 leuA tam TRUE 0.813 11.000 0.003 1.000   NA
 5779064 5779065 Smlt3918 Smlt3919 tam leuC FALSE 0.447 61.000 0.015 1.000   NA
 5779065 5779066 Smlt3919 Smlt3920 leuC leuD TRUE 0.998 0.000 0.449 0.000 Y NA
 5779066 5779067 Smlt3920 Smlt3921 leuD leuB TRUE 0.994 -10.000 0.074 0.001 Y NA
 5779070 5779071 Smlt3924 Smlt3925 smeP smeO TRUE 0.979 5.000 0.354 0.089 N NA
 5779072 5779073 Smlt3926 Smlt3927   pcm FALSE 0.135 137.000 0.023 1.000 N NA
 5779073 5779074 Smlt3927 Smlt3928 pcm tolC TRUE 0.712 17.000 0.028 1.000 N NA
 5779075 5779076 Smlt3929 Smlt3930   kdtA FALSE 0.005 217.000 0.000 NA N NA
 5779078 5779079 Smlt3932 Smlt3933     TRUE 0.984 -19.000 0.050 NA Y NA
 5779079 5779080 Smlt3933 Smlt3934     TRUE 0.871 16.000 0.058 NA   NA
 5779081 5779082 Smlt3935 Smlt3936     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5779083 5779084 Smlt3938 Smlt3940   maeB FALSE 0.002 542.000 0.000 1.000 N NA
 5779084 5779085 Smlt3940 Smlt3942 maeB dctA FALSE 0.339 232.000 0.058 1.000 Y NA
 5779086 5779087 Smlt3943 Smlt3944 oprP   FALSE 0.495 67.000 0.130 NA N NA
 5779088 5779089 Smlt3946 Smlt3947     TRUE 0.765 29.000 0.158 1.000 N NA
 5779089 5779090 Smlt3947 Smlt3948     TRUE 0.980 -3.000 0.190 1.000 N NA
 5779090 5779091 Smlt3948 Smlt3949     TRUE 0.994 -7.000 0.190 1.000 Y NA
 5779092 5779093 Smlt3950 Smlt3951   citM FALSE 0.346 75.000 0.048 NA N NA
 5779093 5779094 Smlt3951 Smlt3952 citM phbB TRUE 0.739 25.000 0.094 1.000 N NA
 5779094 5779095 Smlt3952 Smlt3953 phbB   FALSE 0.067 170.000 0.000 NA   NA
 5779095 5779096 Smlt3953 Smlt3954     FALSE 0.102 146.000 0.000 NA   NA
 5779097 5779098 Smlt3955 Smlt3956     FALSE 0.121 211.000 0.052 NA   NA
 5779099 5779100 Smlt3957 Smlt3958     TRUE 0.982 3.000 0.013 1.000 Y NA
 5779100 5779101 Smlt3958 Smlt3959     TRUE 0.935 5.000 0.050 1.000   NA
 5779104 5779105 Smlt3962 Smlt3963     FALSE 0.379 41.000 0.000 1.000   NA
 5779106 5779107 Smlt3964 Smlt3965     TRUE 0.999 3.000 0.874 0.004 Y NA
 5779107 5779108 Smlt3965 Smlt3966     TRUE 0.916 21.000 0.000 1.000 Y NA
 5779108 5779109 Smlt3966 Smlt3967     TRUE 0.798 95.000 0.500 NA   NA
 5779109 5779110 Smlt3967 Smlt3968     TRUE 0.860 78.000 0.600 NA   NA
 5779111 5779112 Smlt3969 Smlt3970     TRUE 0.994 -3.000 0.423 0.089 N NA
 5779112 5779113 Smlt3970 Smlt3971     TRUE 0.940 22.000 0.385 NA   NA
 5779113 5779114 Smlt3971 Smlt3972     TRUE 0.538 154.000 0.400 NA   NA
 5779115 5779116 Smlt3973 Smlt3974     TRUE 0.798 6.000 0.000 NA   NA
 5779117 5779118 Smlt3975 Smlt3976     FALSE 0.324 54.000 0.000 1.000   NA
 5779118 5779119 Smlt3976 Smlt3977     FALSE 0.266 64.000 0.000 NA   NA
 5779119 5779120 Smlt3977 Smlt3978   adhC TRUE 0.772 9.000 0.000 NA   NA
 5779120 5779121 Smlt3978 Smlt3979 adhC   TRUE 0.861 60.000 0.531 NA   NA
 5779121 5779122 Smlt3979 Smlt3980     FALSE 0.260 71.000 0.000 NA   NA
 5779131 5779132 Smlt3989 Smlt3990     FALSE 0.246 80.000 0.000 NA   NA
 5779132 5779133 Smlt3990 Smlt3991     FALSE 0.014 413.000 0.000 NA   NA
 5779135 5779136 Smlt3992A Smlt3993   dsbA TRUE 0.717 107.000 0.571 1.000 N NA
 5779136 5779137 Smlt3993 Smlt3994 dsbA   TRUE 0.893 107.000 0.714 0.005   NA
 5779137 5779138 Smlt3994 Smlt3995     TRUE 0.816 24.000 0.074 NA   NA
 5779140 5779141 Smlt3997 Smlt3998     TRUE 0.762 10.000 0.000 NA   NA
 5779141 5779142 Smlt3998 Smlt3999   fhuE FALSE 0.119 136.000 0.000 NA   NA
 5779143 5779144 Smlt3999A Smlt4003     FALSE 0.135 126.000 0.000 NA   NA
 5779145 5779146 Smlt4005 Smlt4006     FALSE 0.062 177.000 0.000 NA   NA
 5779146 5779147 Smlt4006 Smlt4007     TRUE 0.625 19.000 0.000 NA   NA
 5779147 5779148 Smlt4007 Smlt4008   cca FALSE 0.062 207.000 0.034 1.000 N NA
 5779149 5779150 Smlt4009 Smlt4010     FALSE 0.465 31.000 0.000 NA   NA
 5779151 5779152 Smlt4011 Smlt4012     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5779153 5779154 Smlt4013 Smlt4014     TRUE 0.827 4.000 0.000 NA   NA
 5779155 5779156 Smlt4016 Smlt4017     TRUE 0.860 1.000 0.000 NA   NA
 5779157 5779158 Smlt4018 Smlt4019     FALSE 0.021 300.000 0.000 NA   NA
 5779158 5779159 Smlt4019 Smlt4020   nagA TRUE 0.949 0.000 0.031 NA   NA
 5779159 5779160 Smlt4020 Smlt4021 nagA   TRUE 0.905 0.000 0.030 1.000 N NA
 5779160 5779161 Smlt4021 Smlt4022     TRUE 0.827 8.000 0.030 1.000 N NA
 5779161 5779162 Smlt4022 Smlt4023     TRUE 0.635 40.000 0.140 1.000 N NA
 5779163 5779164 Smlt4025 Smlt4026     FALSE 0.025 144.000 0.000 1.000 N NA
 5779164 5779165 Smlt4026 Smlt4027   nahB FALSE 0.042 112.000 0.000 1.000 N NA
 5779166 5779167 Smlt4028 Smlt4029     TRUE 0.956 -3.000 0.012 NA   NA
 5779171 5779172 Smlt4033 Smlt4037     TRUE 0.877 0.000 0.000 NA   NA
 5779172 5779173 Smlt4037 Smlt4038     TRUE 0.992 5.000 0.116 0.021 Y NA
 5779173 5779174 Smlt4038 Smlt4039     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5779174 5779175 Smlt4039 Smlt4040     FALSE 0.031 235.000 0.000 NA   NA
 5779177 5779178 Smlt4042 Smlt4043     TRUE 0.896 11.000 0.042 NA   NA
 5779178 5779179 Smlt4043 Smlt4044     TRUE 0.643 18.000 0.000 NA   NA
 5779179 5779180 Smlt4044 Smlt4045     FALSE 0.029 247.000 0.000 NA   NA
 5779180 5779181 Smlt4045 Smlt4046   lipA FALSE 0.005 280.000 0.000 1.000 N NA
 5779181 5779182 Smlt4046 Smlt4047 lipA lipB TRUE 0.992 18.000 0.319 0.000 Y NA
 5779182 5779183 Smlt4047 Smlt4048 lipB   TRUE 0.973 -12.000 0.219 NA   NA
 5779185 5779186 Smlt4050 Smlt4051 dacC rlpA TRUE 0.794 101.000 0.080 NA Y NA
 5779186 5779187 Smlt4051 Smlt4052 rlpA mltB TRUE 0.997 -3.000 0.298 NA Y NA
 5779187 5779188 Smlt4052 Smlt4054 mltB rodA FALSE 0.020 992.000 0.096 NA N NA
 5779188 5779189 Smlt4054 Smlt4055 rodA mrdB TRUE 0.696 137.000 0.008 0.002 Y NA
 5779189 5779190 Smlt4055 Smlt4056 mrdB mrdA TRUE 0.908 -3.000 0.013 1.000 N NA
 5779190 5779191 Smlt4056 Smlt4057 mrdA mreD TRUE 0.980 4.000 0.013 1.000 Y NA
 5779191 5779192 Smlt4057 Smlt4058 mreD mreC TRUE 0.999 -3.000 0.550 0.002 Y NA
 5779192 5779193 Smlt4058 Smlt4059 mreC mreB TRUE 0.716 122.000 0.689 1.000 N NA
 5779195 5779196 Smlt4061 Smlt4062     TRUE 0.608 20.000 0.000 NA   NA
 5779196 5779197 Smlt4062 Smlt4063     TRUE 0.930 -12.000 0.031 NA   NA
 5779197 5779198 Smlt4063 Smlt4064     FALSE 0.347 128.000 0.070 NA   NA
 5779198 5779199 Smlt4064 Smlt4065   ubiE FALSE 0.005 286.000 0.000 1.000 N NA
 5779200 5779201 Smlt4066 Smlt4067     FALSE 0.048 199.000 0.000 NA   NA
 5779201 5779202 Smlt4067 Smlt4068     FALSE 0.255 76.000 0.000 NA   NA
 5779202 5779203 Smlt4068 Smlt4069     FALSE 0.262 68.000 0.000 NA   NA
 5779204 5779205 Smlt4070 Smlt4071 smeF acrB TRUE 0.551 93.000 0.095 0.031 N NA
 5779205 5779206 Smlt4071 Smlt4072 acrB acrA TRUE 0.859 13.000 0.095 1.000 N NA
 5779207 5779208 Smlt4073 Smlt4074 smeT   FALSE 0.349 46.000 0.000 1.000   NA
 5779209 5779210 Smlt4075 Smlt4076 hslU hslV TRUE 0.951 104.000 0.752 1.000 Y NA
 5779210 5779211 Smlt4076 Smlt4077 hslV xerC FALSE 0.242 86.000 0.020 1.000 N NA
 5779211 5779212 Smlt4077 Smlt4078 xerC   TRUE 0.981 14.000 0.714 NA   NA
 5779212 5779213 Smlt4078 Smlt4079   dapF TRUE 0.986 -3.000 0.175 NA   NA
 5779213 5779214 Smlt4079 Smlt4080 dapF   TRUE 0.867 -7.000 0.000 NA   NA
 5779214 5779215 Smlt4080 Smlt4081     FALSE 0.239 83.000 0.000 NA   NA
 5779215 5779216 Smlt4081 Smlt4082   ptrB TRUE 0.643 55.000 0.105 NA   NA
 5779218 5779219 Smlt4084 Smlt4085     FALSE 0.488 70.000 0.034 NA   NA
 5779221 5779222 Smlt4087 Smlt4088     TRUE 0.998 -3.000 0.312 1.000 Y NA
 5779222 5779223 Smlt4088 Smlt4089     FALSE 0.053 202.000 0.000 1.000   NA
 5779224 5779225 Smlt4090 Smlt4091     FALSE 0.282 102.000 0.010 NA   NA
 5779225 5779226 Smlt4091 Smlt4092     TRUE 0.962 -3.000 0.018 NA   NA
 5779230 5779231 Smlt4096 Smlt4097     TRUE 0.651 95.000 0.000 NA Y NA
 5779232 5779233 Smlt4098 Smlt4099   glmS FALSE 0.014 447.000 0.000 1.000   NA
 5779234 5779235 Smlt4100 Smlt4101     TRUE 0.822 49.000 0.500 1.000 N NA
 5779235 5779236 Smlt4101 Smlt4102     TRUE 0.989 11.000 0.250 1.000 Y NA
 5779236 5779237 Smlt4102 Smlt4103     TRUE 0.995 21.000 1.000 0.088 Y NA
 5779237 5779238 Smlt4103 Smlt4104     TRUE 0.868 2.000 0.000 1.000   NA
 5779238 5779239 Smlt4104 Smlt4105     FALSE 0.156 124.000 0.000 1.000   NA
 5779239 5779240 Smlt4105 Smlt4106     TRUE 0.999 -3.000 0.957 0.067 Y NA
 5779241 5779242 Smlt4107 Smlt4108   glmU TRUE 0.844 -31.000 0.002 1.000   NA
 5779244 5779245 Smlt4110 Smlt4111 atpC atpD TRUE 0.969 114.000 0.837 0.002 Y NA
 5779245 5779246 Smlt4111 Smlt4112 atpD atpG TRUE 0.988 38.000 0.724 0.002 Y NA
 5779246 5779247 Smlt4112 Smlt4113 atpG atpA TRUE 0.976 98.000 0.846 0.002 Y NA
 5779247 5779248 Smlt4113 Smlt4114 atpA atpH TRUE 0.988 45.000 0.864 0.002 Y NA
 5779248 5779249 Smlt4114 Smlt4115 atpH atpF TRUE 0.996 3.000 0.242 0.002 Y NA
 5779249 5779250 Smlt4115 Smlt4116a atpF atpC TRUE 0.888 107.000 0.666 0.002   NA
 5779250 10768889 Smlt4116a Smlt4116 atpC   TRUE 0.773 -251.000 0.000 NA   NA
 10768889 5779251 Smlt4116 Smlt4117     FALSE 0.258 74.000 0.000 NA   NA
 5779251 5779252 Smlt4117 Smlt4118     TRUE 0.609 32.000 0.014 NA   NA
 5779254 5779255 Smlt4120 Smlt4121 lpdA pdhB TRUE 0.914 109.000 0.463 1.000 Y NA
 5779255 5779256 Smlt4121 Smlt4122 pdhB   FALSE 0.009 168.000 0.000 NA N NA
 5779257 5779258 Smlt4123 Smlt4124   glpD FALSE 0.032 129.000 0.000 1.000 N NA
 5779258 5779259 Smlt4124 Smlt4125 glpD glpK TRUE 0.842 106.000 0.032 0.001 Y NA
 5779260 5779261 Smlt4126 Smlt4127     FALSE 0.117 27.000 0.000 NA N NA
 5779263 5779264 Smlt4129 Smlt4130 hemC   FALSE 0.015 574.000 0.032 1.000 N NA
 5779264 5779265 Smlt4130 Smlt4131     TRUE 0.997 11.000 0.775 0.025 Y NA
 5779265 5779266 Smlt4131 Smlt4132   estB TRUE 0.935 4.000 0.037 1.000   NA
 5779266 5779267 Smlt4132 Smlt4133 estB   TRUE 0.569 51.000 0.046 NA   NA
 5779267 5779268 Smlt4133 Smlt4134     TRUE 0.877 0.000 0.000 NA   NA
 5779272 5779273 Smlt4138 Smlt4139     FALSE 0.458 -27.000 0.000 1.000 N NA
 5779277 5779278 Smlt4143 Smlt4144     FALSE 0.084 157.000 0.000 NA   NA
 5779280 5779281 Smlt4146 Smlt4147     FALSE 0.504 28.000 0.000 NA   NA
 5779281 5779282 Smlt4147 Smlt4148     TRUE 0.540 25.000 0.000 NA   NA
 5779282 5779283 Smlt4148 Smlt4149     FALSE 0.019 318.000 0.000 NA   NA
 5779283 5779284 Smlt4149 Smlt4150     FALSE 0.069 169.000 0.000 NA   NA
 5779285 5779286 Smlt4151 Smlt4152     FALSE 0.026 261.000 0.000 NA   NA
 5779288 5779289 Smlt4154 Smlt4155     FALSE 0.061 86.000 0.000 1.000 N NA
 5779290 5779291 Smlt4156 Smlt4157   hns1 FALSE 0.306 50.000 0.000 NA   NA
 5779293 5779294 Smlt4159 Smlt4160     FALSE 0.154 119.000 0.000 NA   NA
 5779295 5779296 Smlt4161 Smlt4162     FALSE 0.013 441.000 0.000 NA   NA
 10768890 5779297 Smlt_t62 Smlt4163     FALSE 0.359 40.000 0.000 NA   NA
 5779297 5779298 Smlt4163 Smlt4164     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5779298 5779299 Smlt4164 Smlt4165   rpoD TRUE 0.575 22.000 0.000 NA   NA
 5779299 5779300 Smlt4165 Smlt4166 rpoD dtd FALSE 0.138 90.000 0.006 1.000 N NA
 5779301 5779302 Smlt4167 Smlt4168 htrB   FALSE 0.072 66.000 0.000 1.000 N NA
 5779302 5779303 Smlt4168 Smlt4169     TRUE 0.728 28.000 0.032 NA   NA
 5779303 5779304 Smlt4169 Smlt4170     TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA   NA
 5779306 5779307 Smlt4172 Smlt4173 waaE   TRUE 0.833 44.000 0.014 NA Y NA
 5779308 5779309 Smlt4174 Smlt4175     TRUE 0.723 118.000 0.053 NA Y NA
 5779309 5779310 Smlt4175 Smlt4176   sun FALSE 0.443 24.000 0.008 1.000 N NA
 5779310 5779311 Smlt4176 Smlt4177 sun fmt TRUE 0.994 4.000 0.305 1.000 Y NA
 5779311 5779312 Smlt4177 Smlt4178 fmt def TRUE 0.839 121.000 0.105 0.014 Y NA
 5779313 5779314 Smlt4179 Smlt4180   smf FALSE 0.182 167.000 0.033 1.000   NA
 5779314 5779315 Smlt4180 Smlt4181 smf smg TRUE 0.713 44.000 0.124 1.000   NA
 5779315 5779316 Smlt4181 Smlt4182 smg   TRUE 0.611 40.000 0.030 1.000   NA
 5779316 5779317 Smlt4182 Smlt4183     TRUE 0.643 50.000 0.095 NA   NA
 5779317 5779318 Smlt4183 Smlt4184   topA FALSE 0.066 194.000 0.003 NA   NA
 5779318 5779319 Smlt4184 Smlt4185 topA   FALSE 0.053 160.000 0.011 NA N NA
 5779319 5779320 Smlt4185 Smlt4186     TRUE 0.530 44.000 0.022 NA   NA
 5779320 5779321 Smlt4186 Smlt4187     TRUE 0.975 23.000 1.000 NA   NA
 5779324 5779325 Smlt4190 Smlt4191 sppA   FALSE 0.133 116.000 0.013 1.000 N NA
 5779325 5779326 Smlt4191 Smlt4192     FALSE 0.023 283.000 0.000 NA   NA
 5779326 5779327 Smlt4192 Smlt4193     TRUE 0.993 -7.000 0.667 NA   NA
 5779329 5779330 Smlt4195 Smlt4196     FALSE 0.189 144.000 0.016 NA   NA
 5779332 5779333 Smlt4198 Smlt4199     TRUE 0.798 6.000 0.000 NA   NA
 5779333 5779334 Smlt4199 Smlt4200     FALSE 0.396 36.000 0.000 NA   NA
 5779334 5779335 Smlt4200 Smlt4201     FALSE 0.218 91.000 0.000 NA   NA
 5779337 5779338 Smlt4203 Smlt4204 aroG   FALSE 0.021 295.000 0.000 NA   NA
 5779338 5779339 Smlt4204 Smlt4205     FALSE 0.164 113.000 0.000 NA   NA
 5779339 5779340 Smlt4205 Smlt4206     TRUE 0.877 0.000 0.000 NA   NA
 5779340 5779341 Smlt4206 Smlt4207     TRUE 0.727 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5779341 5779342 Smlt4207 Smlt4208     FALSE 0.074 64.000 0.000 1.000 N NA
 5779342 5779343 Smlt4208 Smlt4209     TRUE 0.853 33.000 0.000 1.000 Y NA
 5779344 5779345 Smlt4210 Smlt4211     FALSE 0.287 68.000 0.000 1.000   NA
 5779346 5779347 Smlt4213 Smlt4214   groEL FALSE 0.121 135.000 0.000 NA   NA
 5779347 5779348 Smlt4214 Smlt4215 groEL cpn10 TRUE 0.936 82.000 0.269 0.067 Y NA
 5779349 5779350 Smlt4216 Smlt4217   cutA FALSE 0.072 69.000 0.000 1.000 N NA
 5779350 5779351 Smlt4217 Smlt4218 cutA   TRUE 0.915 -3.000 0.014 1.000 N NA
 5779351 5779352 Smlt4218 Smlt4219     TRUE 0.994 -3.000 0.032 1.000 Y NA
 5779352 5779353 Smlt4219 Smlt4220     FALSE 0.009 733.000 0.000 NA   NA
 5779353 5779354 Smlt4220 Smlt4221     TRUE 0.883 13.000 0.045 NA   NA
 5779355 5779356 Smlt4222 Smlt4223     FALSE 0.085 156.000 0.000 NA   NA
 5779356 5779357 Smlt4223 Smlt4224     TRUE 0.660 17.000 0.000 NA   NA
 5779357 5779358 Smlt4224 Smlt4225     TRUE 0.999 -3.000 0.333 0.024 Y NA
 5779359 5779360 Smlt4226 Smlt4227     TRUE 0.810 27.000 0.091 NA   NA
 5779360 5779361 Smlt4227 Smlt4228     FALSE 0.044 63.000 0.000 NA N NA
 5779362 5779363 Smlt4229 Smlt4231     FALSE 0.028 250.000 0.000 NA   NA
 5779363 5779364 Smlt4231 Smlt4232   phoA FALSE 0.337 43.000 0.000 NA   NA
 5779366 5779367 Smlt4234 Smlt4235     TRUE 0.951 17.000 0.317 1.000   NA
 5779370 5779371 Smlt4238 Smlt4239   aroQ1 FALSE 0.002 381.000 0.000 NA N NA
 5779371 5779372 Smlt4239 Smlt4240 aroQ1 accB TRUE 0.664 60.000 0.254 1.000 N NA
 5779372 5779373 Smlt4240 Smlt4241 accB accC TRUE 0.994 11.000 0.275 0.001 Y NA
 5779374 5779375 Smlt4242 Smlt4243     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5779376 5779377 Smlt4244 Smlt4245 prmA   TRUE 0.625 43.000 0.058 NA   NA
 5779377 5779378 Smlt4245 Smlt4246   fis FALSE 0.348 115.000 0.037 NA   NA
 5779379 5779380 Smlt4247 Smlt4248     TRUE 0.996 -3.000 0.595 1.000   NA
 5779380 5779381 Smlt4248 Smlt4249     TRUE 0.922 14.000 0.140 NA   NA
 5779381 5779382 Smlt4249 Smlt4250     TRUE 0.980 -3.000 0.090 NA   NA
 5779382 5779383 Smlt4250 Smlt4251     TRUE 0.990 -3.000 0.285 NA   NA
 5779383 5779384 Smlt4251 Smlt4252     TRUE 0.948 35.000 0.215 NA Y NA
 5779385 5779386 Smlt4253 Smlt4254 purH purD TRUE 0.916 62.000 0.238 1.000 Y NA
 5779387 5779388 Smlt4255 Smlt4256     TRUE 0.985 -16.000 0.500 NA   NA
 5779388 5779389 Smlt4256 Smlt4258   rpoH FALSE 0.069 169.000 0.000 NA   NA
 5779389 5779390 Smlt4258 Smlt4259 rpoH ung FALSE 0.013 279.000 0.005 1.000 N NA
 5779390 5779391 Smlt4259 Smlt4260 ung   FALSE 0.411 10.000 0.000 1.000 N NA
 5779391 5779392 Smlt4260 Smlt4261   ftsX FALSE 0.439 8.000 0.000 1.000 N NA
 5779392 5779393 Smlt4261 Smlt4262 ftsX ftsE TRUE 0.979 4.000 0.010 1.000 Y NA
 5779393 5779394 Smlt4262 Smlt4263 ftsE   FALSE 0.186 132.000 0.007 0.067 N NA
 5779395 5779396 Smlt4264 Smlt4265 trxA rho FALSE 0.022 694.000 0.087 1.000 N NA
 5779396 5779397 Smlt4265 Smlt4266 rho   FALSE 0.009 210.000 0.000 1.000 N NA
 5779398 5779399 Smlt4267 Smlt4268     TRUE 0.973 11.000 0.375 1.000   NA
 5779399 5779400 Smlt4268 Smlt4269     FALSE 0.099 147.000 0.000 NA   NA
 5779400 5779401 Smlt4269 Smlt4270     TRUE 0.835 54.000 0.400 NA   NA
 5779401 5779402 Smlt4270 Smlt4271     TRUE 0.867 -7.000 0.000 NA   NA
 5779402 5779403 Smlt4271 Smlt4272     TRUE 0.867 -7.000 0.000 NA   NA
 5779403 5779404 Smlt4272 Smlt4273   icd FALSE 0.019 315.000 0.000 NA   NA
 5779404 5779405 Smlt4273 Smlt4275 icd   FALSE 0.018 343.000 0.000 NA   NA
 5779405 5779406 Smlt4275 Smlt4276     FALSE 0.496 46.000 0.018 NA   NA
 5779406 5779407 Smlt4276 Smlt4277     FALSE 0.026 286.000 0.000 1.000   NA
 5779407 5779408 Smlt4277 Smlt4278     FALSE 0.021 553.000 0.011 1.000   NA
 5779409 5779410 Smlt4279 Smlt4280     TRUE 0.644 75.000 0.148 0.087 N NA
 5779410 5779411 Smlt4280 Smlt4281     TRUE 0.988 32.000 0.963 NA Y NA
 5779411 5779412 Smlt4281 Smlt4282     FALSE 0.069 169.000 0.000 NA   NA
 5779412 5779413 Smlt4282 Smlt4283     FALSE 0.084 157.000 0.000 NA   NA
 5779413 5779414 Smlt4283 Smlt4284     FALSE 0.220 99.000 0.000 0.043 N NA
 5779414 5779415 Smlt4284 Smlt4285     FALSE 0.066 183.000 0.000 1.000   NA
 5779415 5779416 Smlt4285 Smlt4286     TRUE 0.706 35.000 0.000 0.000   NA
 5779416 5779417 Smlt4286 Smlt4287     FALSE 0.331 44.000 0.000 NA   NA
 5779418 5779419 Smlt4289 Smlt4290   nudC FALSE 0.127 135.000 0.020 1.000 N NA
 5779419 5779420 Smlt4290 Smlt4291 nudC   FALSE 0.213 120.000 0.007 NA   NA
 5779420 5779421 Smlt4291 Smlt4292     TRUE 0.755 32.000 0.079 NA   NA
 5779421 5779422 Smlt4292 Smlt4293     TRUE 0.937 5.000 0.069 NA   NA
 5779423 5779424 Smlt4294 Smlt4295     TRUE 0.592 45.000 0.045 NA   NA
 5779424 5779425 Smlt4295 Smlt4296     TRUE 0.997 8.000 0.556 0.020 Y NA
 5779426 5779427 Smlt4297 Smlt4298 bfr   TRUE 0.644 143.000 0.070 NA Y NA
 5779427 5779428 Smlt4298 Smlt4299   nudH FALSE 0.138 109.000 0.015 NA N NA
 5779429 5779430 Smlt4301 Smlt4302 rpsI rplM TRUE 0.998 3.000 0.601 0.009 Y NA
 5779432 5779433 Smlt4304 Smlt4305 sugE speD FALSE 0.070 170.000 0.019 1.000 N NA
 5779434 10768892 Smlt4306a2 Smlt4306a cap   TRUE 0.768 -377.000 0.000 NA   NA
 10768892 5779435 Smlt4306a Smlt4307     FALSE 0.015 375.000 0.000 NA   NA
 5779436 5779437 Smlt4308 Smlt4309   trpC TRUE 0.990 -3.000 0.005 NA Y NA
 5779437 5779438 Smlt4309 Smlt4310 trpC trpD TRUE 0.921 76.000 0.293 1.000 Y NA
 5779438 5779439 Smlt4310 Smlt4311 trpD pabA TRUE 0.973 17.000 0.105 1.000 Y NA
 5779439 5779440 Smlt4311 Smlt4312 pabA   TRUE 0.915 3.000 0.017 NA   NA
 5779440 5779441 Smlt4312 Smlt4313   trpE FALSE 0.406 68.000 0.014 NA   NA
 5779441 5779442 Smlt4313 Smlt4314 trpE   FALSE 0.005 302.000 0.000 1.000 N NA
 5779442 5779443 Smlt4314 Smlt4315     FALSE 0.021 326.000 0.000 1.000   NA
 5779443 5779444 Smlt4315 Smlt4316   rpe TRUE 0.564 60.000 0.050 1.000   NA
 5779444 5779445 Smlt4316 Smlt4317 rpe   TRUE 0.659 30.000 0.015 1.000   NA
 5779446 5779447 Smlt4318 Smlt4319 purC   FALSE 0.046 202.000 0.000 NA   NA
 5779447 5779448 Smlt4319 Smlt4320   phaAB FALSE 0.018 334.000 0.000 NA   NA
 5779448 5779449 Smlt4320 Smlt4321 phaAB phaC TRUE 0.999 0.000 0.881 0.004 Y NA
 5779449 5779450 Smlt4321 Smlt4322 phaC phaD TRUE 1.000 -3.000 0.976 0.004 Y NA
 5779450 5779451 Smlt4322 Smlt4323 phaD   TRUE 0.999 -3.000 0.944 1.000 Y NA
 5779451 5779452 Smlt4323 Smlt4324   phaF TRUE 0.999 -3.000 0.937 0.042 Y NA
 5779452 5779453 Smlt4324 Smlt4325 phaF phaG TRUE 0.999 -3.000 0.937 1.000 Y NA
 5779454 5779455 Smlt4326 Smlt4327 yrbG   TRUE 0.692 74.000 0.200 NA   NA
 5779457 5779458 Smlt4329 Smlt4330 hmgA   FALSE 0.392 86.000 0.077 1.000 N NA
 5779459 5779460 Smlt4331 Smlt4332     FALSE 0.019 327.000 0.000 NA   NA
 5779461 5779462 Smlt4333 Smlt4334     FALSE 0.274 61.000 0.000 NA   NA
 5779462 5779463 Smlt4334 Smlt4335     TRUE 0.913 20.000 0.211 NA   NA
 5779463 5779464 Smlt4335 Smlt4336     FALSE 0.322 182.000 0.000 1.000 Y NA
 5779465 5779466 Smlt4338 Smlt4339 pdhA   TRUE 0.998 -7.000 0.458 0.001 Y NA
 5779466 5779467 Smlt4339 Smlt4340     TRUE 0.944 2.000 0.042 NA   NA
 5779467 5779468 Smlt4340 Smlt4341     TRUE 0.976 -3.000 0.064 NA   NA
 5779469 5779470 Smlt4342 Smlt4343 ehpR   FALSE 0.052 193.000 0.000 NA   NA
 5779470 5779471 Smlt4343 Smlt4344     FALSE 0.470 0.000 0.000 NA N NA
 5779474 5779475 Smlt4347 Smlt4348   mdoB FALSE 0.029 245.000 0.000 NA   NA
 5779476 5779477 Smlt4350 Smlt4352     FALSE 0.022 289.000 0.000 NA   NA
 5779478 5779479 Smlt4353 Smlt4354     FALSE 0.370 12.000 0.000 1.000 N NA
 5779479 5779480 Smlt4354 Smlt4356     FALSE 0.133 127.000 0.000 NA   NA
 5779482 5779483 Smlt4359 Smlt4360     TRUE 0.890 0.000 0.000 1.000   NA
 5779483 5779484 Smlt4360 Smlt4361     TRUE 0.995 -3.000 0.080 1.000 Y NA
 5779484 5779485 Smlt4361 Smlt4362     TRUE 0.540 25.000 0.000 NA   NA
 5779486 5779487 Smlt4363 Smlt4364   speA FALSE 0.377 38.000 0.000 NA   NA
 5779491 5779492 Smlt4369 Smlt4370   glnB FALSE 0.010 209.000 0.000 1.000 N NA
 5779493 5779494 Smlt4371 Smlt4372     FALSE 0.140 124.000 0.000 NA   NA
 5779495 5779496 Smlt4373 Smlt4374     FALSE 0.197 99.000 0.000 NA   NA
 5779496 5779497 Smlt4374 Smlt4375     FALSE 0.281 59.000 0.000 NA   NA
 5779497 5779498 Smlt4375 Smlt4376     FALSE 0.012 500.000 0.000 NA   NA
 5779498 5779499 Smlt4376 Smlt4378     FALSE 0.030 239.000 0.000 NA   NA
 5779500 5779501 Smlt4380 Smlt4381     FALSE 0.331 44.000 0.000 NA   NA
 5779501 5779502 Smlt4381 Smlt4382     FALSE 0.200 98.000 0.000 NA   NA
 5779502 5779503 Smlt4382 Smlt4383     FALSE 0.341 42.000 0.000 NA   NA
 5779506 5779507 Smlt4386 Smlt4387     FALSE 0.173 109.000 0.000 NA   NA
 5779511 5779512 Smlt4392 Smlt4392A sndH   TRUE 0.989 -7.000 0.488 NA   NA
 5779512 5779513 Smlt4392A Smlt4394     FALSE 0.034 228.000 0.000 NA   NA
 5779514 5779515 Smlt4395 Smlt4396     TRUE 0.842 3.000 0.000 NA   NA
 5779516 5779517 Smlt4397 Smlt4398     TRUE 0.874 12.000 0.000 0.031   NA
 5779517 5779518 Smlt4398 Smlt4399   cyoC TRUE 0.994 2.000 0.100 0.031 Y NA
 5779518 5779519 Smlt4399 Smlt4400 cyoC cyoB TRUE 0.998 -3.000 0.250 0.031 Y NA
 5779519 5779520 Smlt4400 Smlt4401 cyoB cyoA TRUE 0.993 6.000 0.136 0.005 Y NA
 5779521 5779522 Smlt4402 Smlt4403     FALSE 0.290 56.000 0.000 NA   NA
 5779522 5779523 Smlt4403 Smlt4404     TRUE 0.877 0.000 0.000 NA   NA
 5779523 5779524 Smlt4404 Smlt4405     FALSE 0.113 139.000 0.000 NA   NA
 5779525 5779526 Smlt4409 Smlt4410     TRUE 0.609 0.000 0.000 1.000 N NA
 5779526 5779527 Smlt4410 Smlt4411     FALSE 0.034 227.000 0.000 NA   NA
 5779528 5779529 Smlt4412 Smlt4413     TRUE 0.728 14.000 0.000 1.000   NA
 5779529 5779530 Smlt4413 Smlt4414     FALSE 0.296 54.000 0.000 NA   NA
 5779531 5779532 Smlt4415 Smlt4416     TRUE 0.842 3.000 0.000 NA   NA
 5779532 5779533 Smlt4416 Smlt4417     FALSE 0.258 74.000 0.000 NA   NA
 5779535 5779536 Smlt4420 Smlt4422   ubiA FALSE 0.003 376.000 0.000 1.000 N NA
 5779537 5779538 Smlt4423 Smlt4424 afaD   TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5779538 5779539 Smlt4424 Smlt4426     FALSE 0.010 645.000 0.000 NA   NA
 5779539 5779540 Smlt4426 Smlt4428     FALSE 0.016 356.000 0.000 NA   NA
 5779540 5779541 Smlt4428 Smlt4429     FALSE 0.038 219.000 0.000 NA   NA
 5779541 5779542 Smlt4429 Smlt4430     FALSE 0.148 121.000 0.000 NA   NA
 5779542 5779543 Smlt4430 Smlt4431     FALSE 0.019 315.000 0.000 NA   NA
 5779543 5779544 Smlt4431 Smlt4432     FALSE 0.314 57.000 0.000 1.000   NA
 5779544 5779545 Smlt4432 Smlt4433     FALSE 0.137 134.000 0.000 1.000   NA
 5779546 5779547 Smlt4434 Smlt4435 agaS   FALSE 0.367 74.000 0.056 NA N NA
 5779547 5779548 Smlt4435 Smlt4436   agaZ TRUE 0.958 17.000 0.028 NA Y NA
 5779548 5779549 Smlt4436 Smlt4437 agaZ agaR TRUE 0.970 34.000 0.400 1.000 Y NA
 5779549 5779550 Smlt4437 Smlt4438 agaR nagA TRUE 0.994 -3.000 0.049 1.000 Y NA
 5779550 5779551 Smlt4438 Smlt4439 nagA   FALSE 0.174 118.000 0.000 1.000   NA
 5779552 5779553 Smlt4440 Smlt4441     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5779553 5779554 Smlt4441 Smlt4443     FALSE 0.009 783.000 0.000 NA   NA
 5779554 5779555 Smlt4443 Smlt4444A     TRUE 0.714 13.000 0.000 NA   NA
 5779555 5779556 Smlt4444A Smlt4451     FALSE 0.306 50.000 0.000 NA   NA
 5779556 10768894 Smlt4451 Smlt4447     TRUE 0.776 -131.000 0.000 NA   NA
 10768894 5779557 Smlt4447 Smlt4447A     FALSE 0.102 146.000 0.000 NA   NA
 5779557 5779558 Smlt4447A Smlt4447B     FALSE 0.049 198.000 0.000 NA   NA
 5779558 5779559 Smlt4447B Smlt4447C     TRUE 0.798 6.000 0.000 NA   NA
 5779559 5779560 Smlt4447C Smlt4450     TRUE 0.785 -36.000 0.000 NA   NA
 5779560 5779561 Smlt4450 Smlt4452     TRUE 0.827 4.000 0.000 NA   NA
 5779561 5779562 Smlt4452 Smlt4453     TRUE 0.965 33.000 0.333 NA Y NA
 5779562 5779563 Smlt4453 Smlt4454     FALSE 0.033 230.000 0.000 NA   NA
 5779563 5779564 Smlt4454 Smlt4455     FALSE 0.222 89.000 0.000 NA   NA
 5779564 5779565 Smlt4455 Smlt4458     FALSE 0.001 720.000 0.000 NA N NA
 5779566 5779567 Smlt4459 Smlt4460 bioB bioF TRUE 0.937 68.000 0.168 0.001 Y NA
 5779567 5779568 Smlt4460 Smlt4461 bioF bioH TRUE 0.943 18.000 0.096 0.001   NA
 5779568 5779569 Smlt4461 Smlt4462 bioH   TRUE 0.727 30.000 0.033 1.000   NA
 5779569 5779570 Smlt4462 Smlt4463     TRUE 0.958 13.000 0.006 1.000 Y NA
 5779571 5779572 Smlt4469 Smlt4470     TRUE 0.973 -3.000 0.042 NA   NA
 5779576 5779577 Smlt4474 Smlt4475 oprM smeB TRUE 0.997 -3.000 0.900 0.030 N NA
 5779577 5779578 Smlt4475 Smlt4476 smeB acrA TRUE 0.937 13.000 0.300 1.000 N NA
 5779579 5779580 Smlt4477 Smlt4478 smeS smeR TRUE 0.999 -3.000 0.591 1.000 Y NA
 5779580 5779581 Smlt4478 Smlt4479 smeR   FALSE 0.124 133.000 0.000 NA   NA
 5779581 5779582 Smlt4479 Smlt4480     FALSE 0.109 141.000 0.000 NA   NA
 5779582 5779583 Smlt4480 Smlt4481     FALSE 0.140 124.000 0.000 NA   NA
 5779583 5779584 Smlt4481 Smlt4482     TRUE 0.996 -3.000 0.708 NA   NA
 5779584 5779585 Smlt4482 Smlt4483     TRUE 0.964 -10.000 0.129 NA   NA
 5779585 5779586 Smlt4483 Smlt4484     TRUE 0.997 -3.000 0.955 NA   NA
 5779586 5779587 Smlt4484 Smlt4485     TRUE 0.995 -3.000 0.583 NA   NA
 5779587 5779588 Smlt4485 Smlt4486     TRUE 0.987 -3.000 0.182 NA   NA
 5779589 5779590 Smlt4487 Smlt4489     FALSE 0.091 153.000 0.000 NA   NA
 5779590 5779591 Smlt4489 Smlt4490     TRUE 0.877 0.000 0.000 NA   NA
 5779591 5779592 Smlt4490 Smlt4491     TRUE 0.964 8.000 0.244 NA   NA
 5779594 5779595 Smlt4493 Smlt4494 dinG   FALSE 0.070 168.000 0.000 NA   NA
 5779595 5779596 Smlt4494 Smlt4495   aroE TRUE 0.878 4.000 0.007 NA   NA
 5779598 5779599 Smlt4496 Smlt4497   hemB FALSE 0.296 54.000 0.000 NA   NA
 5779599 5779600 Smlt4497 Smlt4498 hemB   TRUE 0.682 20.000 0.005 NA   NA
 5779600 5779601 Smlt4498 Smlt4499     FALSE 0.145 122.000 0.000 NA   NA
 5779603 5779604 Smlt4501 Smlt4502     FALSE 0.025 267.000 0.000 NA   NA
 5779604 5779605 Smlt4502 Smlt4503     TRUE 0.740 26.000 0.029 NA   NA
 5779605 5779606 Smlt4503 Smlt4504     FALSE 0.080 163.000 0.020 1.000 N NA
 5779607 5779608 Smlt4505 Smlt4506     FALSE 0.046 203.000 0.000 NA   NA
 5779610 5779611 Smlt4508 Smlt4509     FALSE 0.215 101.000 0.000 0.044 N NA
 5779612 5779613 Smlt4510 Smlt4511     TRUE 0.997 -3.000 0.271 NA Y NA
 5779613 5779614 Smlt4511 Smlt4512     TRUE 0.991 -3.000 0.292 1.000   NA
 5779614 5779615 Smlt4512 Smlt4513     FALSE 0.287 69.000 0.000 1.000   NA
 5779616 5779617 Smlt4514 Smlt4515   cbpD1 FALSE 0.054 191.000 0.000 NA   NA
 5779617 5779618 Smlt4515 Smlt4516 cbpD1 cbpD2 FALSE 0.176 179.000 0.000 0.001   NA
 5779620 5779621 Smlt4518 Smlt4519     TRUE 0.996 -3.000 0.688 0.065 N NA
 5779621 5779622 Smlt4519 Smlt4520     FALSE 0.017 351.000 0.000 NA   NA
 5779622 5779623 Smlt4520 Smlt4521     FALSE 0.055 189.000 0.000 NA   NA
 5779623 5779624 Smlt4521 Smlt4522     TRUE 0.603 -3.000 0.000 NA N NA
 5779626 5779627 Smlt4524 Smlt4525 hrpB   FALSE 0.071 212.000 0.012 NA   NA
 5779628 5779629 Smlt4526 Smlt4527     FALSE 0.264 65.000 0.000 NA   NA
 5779629 5779630 Smlt4527 Smlt4528     FALSE 0.206 96.000 0.000 NA   NA
 5779631 10768895 Smlt4529 Smlt_t67     FALSE 0.010 650.000 0.000 NA   NA
 10768895 5779632 Smlt_t67 Smlt4532     FALSE 0.016 357.000 0.000 NA   NA
 5779632 5779633 Smlt4532 Smlt4533     TRUE 0.682 57.000 0.155 NA   NA
 5779634 5779635 Smlt4534 Smlt4535     TRUE 0.881 -10.000 0.037 NA N NA
 5779638 5779639 Smlt4538 Smlt4539     FALSE 0.403 115.000 0.058 1.000   NA
 5779640 5779641 Smlt4540 Smlt4541     TRUE 0.853 2.000 0.000 NA   NA
 5779641 10768896 Smlt4541 Smlt4542     FALSE 0.088 154.000 0.000 NA   NA
 5779643 5779644 Smlt4544 Smlt4545     FALSE 0.132 128.000 0.000 NA   NA
 5779644 5779645 Smlt4545 Smlt4546     FALSE 0.017 354.000 0.000 NA   NA
 5779646 5779647 Smlt4547 Smlt4548     FALSE 0.025 270.000 0.000 NA   NA
 5779647 5779648 Smlt4548 Smlt4549     FALSE 0.023 281.000 0.000 NA   NA
 5779649 5779650 Smlt4550 Smlt4551     FALSE 0.149 179.000 0.028 0.042 N NA
 5779652 5779653 Smlt4553 Smlt4554     TRUE 0.949 -7.000 0.040 NA   NA
 5779653 5779654 Smlt4554 Smlt4555     FALSE 0.080 161.000 0.000 NA   NA
 5779654 5779655 Smlt4555 Smlt4556     FALSE 0.269 63.000 0.000 NA   NA
 5779655 5779656 Smlt4556 Smlt4557   fabG TRUE 0.997 0.000 0.486 1.000 Y NA
 5779656 5779657 Smlt4557 Smlt4558 fabG   TRUE 0.998 -3.000 0.397 NA Y NA
 5779657 5779658 Smlt4558 Smlt4559     TRUE 0.999 -3.000 0.514 NA Y NA
 5779658 5779659 Smlt4559 Smlt4560     TRUE 0.994 -3.000 0.422 NA   NA
 5779659 5779660 Smlt4560 Smlt4561     TRUE 0.979 -12.000 0.297 NA   NA
 5779660 5779661 Smlt4561 Smlt4562     TRUE 0.805 53.000 0.329 NA   NA
 5779661 5779662 Smlt4562 Smlt4563     TRUE 0.952 -28.000 0.146 NA   NA
 5779662 5779663 Smlt4563 Smlt4564     TRUE 0.982 -3.000 0.110 NA   NA
 5779663 5779664 Smlt4564 Smlt4565     TRUE 0.984 -13.000 0.413 NA   NA
 5779664 5779665 Smlt4565 Smlt4566     TRUE 0.983 -10.000 0.333 1.000   NA
 5779665 5779666 Smlt4566 Smlt4567     TRUE 0.941 2.000 0.036 NA   NA
 5779666 5779667 Smlt4567 Smlt4568     TRUE 0.944 -10.000 0.046 NA   NA
 5779667 5779668 Smlt4568 Smlt4569     TRUE 0.964 26.000 0.758 NA   NA
 5779668 5779669 Smlt4569 Smlt4570   acpP TRUE 0.943 23.000 0.422 NA   NA
 5779669 5779670 Smlt4570 Smlt4571 acpP   TRUE 0.985 18.000 0.117 0.001 Y NA
 5779670 5779671 Smlt4571 Smlt4572     TRUE 0.991 -13.000 0.170 1.000 Y NA
 5779671 5779672 Smlt4572 Smlt4573     TRUE 0.992 -7.000 0.636 NA   NA
 5779672 5779673 Smlt4573 Smlt4574   cioB FALSE 0.038 218.000 0.000 NA   NA
 5779673 5779674 Smlt4574 Smlt4575 cioB   TRUE 0.986 2.000 0.000 0.031 Y NA
 5779674 5779675 Smlt4575 Smlt4576     FALSE 0.254 130.000 0.000 0.084   NA
 5779675 5779676 Smlt4576 Smlt4577     TRUE 0.930 2.000 0.000 0.084   NA
 5779676 5779677 Smlt4577 Smlt4578     FALSE 0.019 322.000 0.000 NA   NA
 5779677 5779678 Smlt4578 Smlt4579     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5779678 5779679 Smlt4579 Smlt4580     TRUE 0.796 38.000 0.200 NA   NA
 5779680 5779681 Smlt4581 Smlt4582     TRUE 0.944 -3.000 0.031 1.000 N NA
 5779681 5779682 Smlt4582 Smlt4583     TRUE 0.712 31.000 0.038 NA   NA
 5779682 5779683 Smlt4583 Smlt4584     FALSE 0.409 35.000 0.000 NA   NA
 5779683 5779684 Smlt4584 Smlt4585     FALSE 0.377 38.000 0.000 NA   NA
 5779684 5779685 Smlt4585 Smlt4586   hemF FALSE 0.293 55.000 0.000 NA   NA
 5779685 5779686 Smlt4586 Smlt4587 hemF   TRUE 0.552 24.000 0.000 NA   NA
 5779687 5779688 Smlt4588 Smlt4589   polA FALSE 0.018 341.000 0.000 NA   NA
 5779690 5779691 Smlt4591 Smlt4592     FALSE 0.014 382.000 0.000 NA   NA
 5779693 5779694 Smlt4594 Smlt4595   uvrD FALSE 0.065 172.000 0.000 NA   NA
 5779694 5779695 Smlt4595 Smlt4596 uvrD   TRUE 0.878 10.000 0.022 NA   NA
 5779695 5779696 Smlt4596 Smlt4597   cls TRUE 0.766 64.000 0.300 NA   NA
 5779696 5779697 Smlt4597 Smlt4598 cls rpmG FALSE 0.014 233.000 0.002 1.000 N NA
 5779697 5779698 Smlt4598 Smlt4599 rpmG rpmB TRUE 0.993 14.000 0.332 0.009 Y NA
 5779700 5779701 Smlt4602 Smlt4603     FALSE 0.082 56.000 0.000 1.000 N NA
 5779702 5779703 Smlt4604 Smlt4605     FALSE 0.078 162.000 0.000 NA   NA
 5779703 5779704 Smlt4605 Smlt4606   smmO FALSE 0.287 57.000 0.000 NA   NA
 5779704 5779705 Smlt4606 Smlt4607 smmO smmP TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 5779705 5779706 Smlt4607 Smlt4608 smmP smmQ TRUE 0.981 11.000 0.800 1.000 N NA
 5779707 5779708 Smlt4609 Smlt4610     FALSE 0.011 525.000 0.000 NA   NA
 5779708 5779709 Smlt4610 Smlt4611     TRUE 0.984 0.000 0.273 1.000   NA
 5779709 5779710 Smlt4611 Smlt4612     TRUE 0.891 90.000 0.227 1.000 Y NA
 5779710 5779711 Smlt4612 Smlt4613     TRUE 0.738 46.000 0.182 NA   NA
 5779711 5779712 Smlt4613 Smlt4614   parB FALSE 0.135 126.000 0.000 NA   NA
 5779712 5779713 Smlt4614 Smlt4615 parB parA TRUE 0.992 0.000 0.827 1.000 N NA
 5779713 5779714 Smlt4615 Smlt4616 parA gidB TRUE 0.575 114.000 0.339 1.000 N NA
 5779714 5779715 Smlt4616 Smlt4617 gidB hetI FALSE 0.198 40.000 0.003 1.000 N NA
 5779715 5779716 Smlt4617 Smlt4618 hetI   TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5779716 5779717 Smlt4618 Smlt4619     TRUE 0.643 18.000 0.000 NA   NA
 5779717 5779718 Smlt4619 Smlt4620   calB FALSE 0.018 162.000 0.000 1.000 N NA
 5779718 5779719 Smlt4620 Smlt4621 calB   FALSE 0.009 214.000 0.000 1.000 N NA
 5779719 5779720 Smlt4621 Smlt4622     FALSE 0.211 162.000 0.051 NA   NA
 5779721 5779722 Smlt4623 Smlt4624 acsA   TRUE 0.707 80.000 0.357 1.000 N NA
 5779722 5779723 Smlt4624 Smlt4626     FALSE 0.014 412.000 0.000 NA   NA
 5779724 5779725 Smlt4627 Smlt4628     FALSE 0.049 208.000 0.000 1.000   NA
 5779726 5779727 Smlt4629 Smlt4630 hscC   TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5779727 5779728 Smlt4630 Smlt4631     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5779729 5779730 Smlt4632 Smlt4633     TRUE 0.995 -3.000 0.575 NA   NA
 5779730 5779731 Smlt4633 Smlt4634   glyS FALSE 0.015 227.000 0.003 1.000 N NA
 5779731 5779732 Smlt4634 Smlt4635 glyS glyQ TRUE 0.974 88.000 0.651 0.000 Y NA
 5779733 5779734 Smlt4636 Smlt4637     FALSE 0.455 -28.000 0.000 1.000 N NA
 5779734 5779735 Smlt4637 Smlt4638     TRUE 0.627 45.000 0.070 NA   NA
 5779736 5779737 Smlt4639 Smlt4640 tatC tatB TRUE 0.992 -3.000 0.015 NA Y NA
 5779737 5779738 Smlt4640 Smlt4641 tatB tatE TRUE 0.979 16.000 0.037 0.006 Y NA
 5779738 5779739 Smlt4641 Smlt4642 tatE   TRUE 0.551 76.000 0.073 NA   NA
 5779740 5779741 Smlt4643 Smlt4644 hemH   TRUE 0.971 -3.000 0.037 NA   NA
 5779741 5779742 Smlt4644 Smlt4645     FALSE 0.022 291.000 0.000 NA   NA
 10768897 10768898 Smlt_r11 Smlt_t68     FALSE 0.009 3227.000 0.000 NA   NA
 10768898 10768899 Smlt_t68 Smlt_t69     FALSE 0.477 30.000 0.000 NA   NA
 10768899 10768900 Smlt_t69 Smlt_r09     FALSE 0.236 84.000 0.000 NA   NA
 10768900 10768901 Smlt_r09 Smlt_r07     FALSE 0.012 492.000 0.000 NA   NA
 10768901 10768902 Smlt_r07 Smlt_r08     FALSE 0.145 122.000 0.000 NA   NA
 10768902 10768903 Smlt_r08 Smlt_t70     FALSE 0.036 223.000 0.000 NA   NA
 10768903 10768904 Smlt_t70 Smlt_t71     FALSE 0.477 30.000 0.000 NA   NA
 10768904 10768905 Smlt_t71 Smlt_r02     FALSE 0.236 84.000 0.000 NA   NA
 5779744 5779745 Smlt4648 Smlt4649     FALSE 0.015 367.000 0.000 NA   NA
 5779745 5779746 Smlt4649 Smlt4650     FALSE 0.298 41.000 0.013 1.000 N NA
 5779746 5779747 Smlt4650 Smlt4651     FALSE 0.233 85.000 0.000 NA   NA
 5779747 5779748 Smlt4651 Smlt4652     TRUE 0.993 -3.000 0.354 NA   NA
 5779752 5779753 Smlt4656 Smlt4657     TRUE 0.970 17.000 0.561 NA   NA
 5779753 5779754 Smlt4657 Smlt4658     TRUE 0.978 -13.000 0.311 NA   NA
 5779754 5779755 Smlt4658 Smlt4659   folE FALSE 0.403 113.000 0.066 NA   NA
 5779756 5779757 Smlt4660 Smlt4661     FALSE 0.445 111.000 0.088 NA   NA
 5779757 5779758 Smlt4661 Smlt4662     TRUE 0.995 -3.000 0.529 NA   NA
 5779758 5779759 Smlt4662 Smlt4663     TRUE 0.997 -3.000 0.800 0.084 N NA
 5779759 5779760 Smlt4663 Smlt4664     TRUE 0.948 4.000 0.080 NA   NA
 5779760 5779761 Smlt4664 Smlt4665     FALSE 0.271 62.000 0.000 NA   NA
 5779761 5779762 Smlt4665 Smlt4666     TRUE 0.842 3.000 0.000 NA   NA
 5779763 5779764 Smlt4667 Smlt4668 recD recB TRUE 0.999 -3.000 0.688 0.001 Y NA
 5779764 5779765 Smlt4668 Smlt4669 recB recC TRUE 0.999 -3.000 0.542 0.001 Y NA
 5779766 5779767 Smlt4670 Smlt4671     TRUE 0.997 0.000 0.530 NA Y NA
 5779767 5779768 Smlt4671 Smlt4672     TRUE 0.866 60.000 0.562 NA   NA
 5779768 5779769 Smlt4672 Smlt4673     TRUE 0.967 -3.000 0.024 NA   NA
 5779769 5779770 Smlt4673 Smlt4674     TRUE 0.588 44.000 0.041 NA   NA
 5779770 5779771 Smlt4674 Smlt4675     TRUE 0.941 2.000 0.035 NA   NA
 5779772 5779773 Smlt4676 Smlt4677 btuE   FALSE 0.214 138.000 0.018 NA   NA
 5779773 5779774 Smlt4677 Smlt4678     FALSE 0.325 72.000 0.004 NA   NA
 5779777 5779778 Smlt4681 Smlt4682     FALSE 0.324 15.000 0.000 1.000 N NA
 5779778 5779779 Smlt4682 Smlt4683     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5779779 5779780 Smlt4683 Smlt4684     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5779780 5779781 Smlt4684 Smlt4685     FALSE 0.072 167.000 0.000 NA   NA
 5779782 5779783 Smlt4686 Smlt4687     FALSE 0.047 211.000 0.000 1.000   NA
 5779784 5779785 Smlt4688 Smlt4689     FALSE 0.402 94.000 0.000 0.041   NA
 5779786 5779787 Smlt4690 Smlt4691   trmE FALSE 0.092 160.000 0.000 1.000   NA
 5779787 5779788 Smlt4691 Smlt4692 trmE   TRUE 0.882 4.000 0.005 1.000   NA
 5779788 5779789 Smlt4692 Smlt4693     FALSE 0.113 164.000 0.005 1.000   NA
 5779789 5779790 Smlt4693 Smlt4694     TRUE 0.949 0.000 0.105 1.000 N NA
 5779790 5779791 Smlt4694 Smlt4695   rpmH TRUE 0.990 6.000 0.787 1.000   NA