MicrobesOnline Operon Predictions for Borrelia garinii Far04

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 6108896 6108897 BGAFAR04_0448 BGAFAR04_0449   rrf FALSE 0.039 258.000 0.000 NA   NA
 6108897 6108898 BGAFAR04_0449 BGAFAR04_0450 rrf rrl TRUE 0.601 23.000 0.000 NA   NA
 6108898 6108899 BGAFAR04_0450 BGAFAR04_0453 rrl   FALSE 0.045 198.000 0.000 NA   NA
 6108899 6108900 BGAFAR04_0453 BGAFAR04_0454     FALSE 0.148 161.000 0.016 1.000   NA
 6108904 6108905 BGAFAR04_0458 BGAFAR04_0459   rrs FALSE 0.049 174.000 0.000 NA   NA
 6108905 6108906 BGAFAR04_0459 BGAFAR04_0460 rrs   FALSE 0.043 218.000 0.000 NA   NA
 6108906 6108907 BGAFAR04_0460 BGAFAR04_0461     FALSE 0.126 95.000 0.006 NA   NA
 6108910 6108911 BGAFAR04_0464 BGAFAR04_0465     FALSE 0.217 112.000 0.027 1.000   NA
 6108911 6108912 BGAFAR04_0465 BGAFAR04_0466     TRUE 0.908 3.000 0.769 NA   NA
 6108913 6108914 BGAFAR04_0467 BGAFAR04_0468 spo0J gyrA FALSE 0.150 119.000 0.009 1.000 N NA
 6108914 6108915 BGAFAR04_0468 BGAFAR04_0469 gyrA gyrB TRUE 0.995 12.000 0.306 0.006 Y NA
 6108916 6108917 BGAFAR04_0470 BGAFAR04_0471 dnaA dnaN FALSE 0.455 242.000 0.328 1.000 Y NA
 6108917 6108918 BGAFAR04_0471 BGAFAR04_0472 dnaN   FALSE 0.126 95.000 0.006 NA   NA
 6108918 6108919 BGAFAR04_0472 BGAFAR04_0473   rpmH FALSE 0.140 92.000 0.010 NA   NA
 6108919 6108920 BGAFAR04_0473 BGAFAR04_0474 rpmH rnpA TRUE 0.720 -19.000 0.787 1.000   NA
 6108920 6108921 BGAFAR04_0474 BGAFAR04_0475 rnpA   TRUE 0.925 11.000 0.105 1.000 N NA
 6108921 6108922 BGAFAR04_0475 BGAFAR04_0476     TRUE 0.937 13.000 0.254 1.000   NA
 6108922 6108923 BGAFAR04_0476 BGAFAR04_0477     TRUE 0.610 46.000 0.024 1.000   NA
 6108923 6108924 BGAFAR04_0477 BGAFAR04_0478   fbaA FALSE 0.472 156.000 0.025 1.000 Y NA
 6108925 6108926 BGAFAR04_0479 BGAFAR04_0480 aspS   TRUE 0.887 4.000 0.007 1.000 N NA
 6108926 6108927 BGAFAR04_0480 BGAFAR04_0481     TRUE 0.960 15.000 0.029 0.023 N NA
 6108927 6108928 BGAFAR04_0481 BGAFAR04_0482     TRUE 0.826 13.000 0.033 NA N NA
 6108928 6108929 BGAFAR04_0482 BGAFAR04_0483   rpoN FALSE 0.556 -10.000 0.071 NA N NA
 6108929 6108930 BGAFAR04_0483 BGAFAR04_0484 rpoN   TRUE 0.910 3.000 0.050 1.000 N NA
 6108930 6108931 BGAFAR04_0484 BGAFAR04_0485     TRUE 0.990 -3.000 0.310 0.003 Y NA
 6108934 6108935 BGAFAR04_0488 BGAFAR04_0489     TRUE 0.809 4.000 0.006 NA   NA
 6108937 6108938 BGAFAR04_0491 BGAFAR04_0492     TRUE 0.727 -7.000 0.360 NA   NA
 6108938 6108939 BGAFAR04_0492 BGAFAR04_0493     FALSE 0.252 54.000 0.000 NA   NA
 6108939 6108940 BGAFAR04_0493 BGAFAR04_0494     FALSE 0.258 53.000 0.000 NA   NA
 6108942 6108943 BGAFAR04_0496 BGAFAR04_0497     TRUE 0.779 12.000 0.000 NA   NA
 6108943 6108944 BGAFAR04_0497 BGAFAR04_0498   srpB TRUE 0.688 -1.000 0.000 NA   NA
 6108944 6108945 BGAFAR04_0498 BGAFAR04_0499 srpB   FALSE 0.041 230.000 0.000 NA   NA
 6108945 6108946 BGAFAR04_0499 BGAFAR04_0500     TRUE 0.898 5.000 0.411 NA   NA
 6108946 6108947 BGAFAR04_0500 BGAFAR04_0501     FALSE 0.062 172.000 0.006 NA   NA
 6108947 6108948 BGAFAR04_0501 BGAFAR04_0502     FALSE 0.037 287.000 0.000 NA   NA
 6108948 6108949 BGAFAR04_0502 BGAFAR04_0503     TRUE 0.729 -3.000 0.018 NA   NA
 6108949 6108950 BGAFAR04_0503 BGAFAR04_0504     FALSE 0.531 -22.000 0.543 NA   NA
 6108950 6108951 BGAFAR04_0504 BGAFAR04_0505     TRUE 0.710 -3.000 0.011 NA   NA
 6108951 6108952 BGAFAR04_0505 BGAFAR04_0506     TRUE 0.804 2.000 0.011 NA   NA
 6108952 6108953 BGAFAR04_0506 BGAFAR04_0507   lspA TRUE 0.873 11.000 0.050 NA   NA
 6108953 6108954 BGAFAR04_0507 BGAFAR04_0508 lspA   TRUE 0.706 -45.000 0.053 0.044   NA
 6108954 6108955 BGAFAR04_0508 BGAFAR04_0509     TRUE 0.885 4.000 0.237 NA   NA
 6108955 6108956 BGAFAR04_0509 BGAFAR04_0510     TRUE 0.855 12.000 0.024 NA   NA
 6108956 6108957 BGAFAR04_0510 BGAFAR04_0511   murA FALSE 0.133 102.000 0.024 NA   NA
 6108957 6108958 BGAFAR04_0511 BGAFAR04_0512 murA   FALSE 0.059 540.000 0.000 1.000 N NA
 6108960 6108961 BGAFAR04_0514 BGAFAR04_0515 tuf rpsJ TRUE 0.875 52.000 0.318 1.000 Y NA
 6108961 6108962 BGAFAR04_0515 BGAFAR04_0516 rpsJ rplC TRUE 0.949 42.000 0.307 0.079 Y NA
 6108962 6108963 BGAFAR04_0516 BGAFAR04_0517 rplC rplD TRUE 0.992 10.000 0.040 0.059 Y NA
 6108963 6108964 BGAFAR04_0517 BGAFAR04_0518 rplD rplW TRUE 0.970 22.000 0.307 1.000 Y NA
 6108964 6108965 BGAFAR04_0518 BGAFAR04_0519 rplW rplB TRUE 0.975 22.000 0.849 1.000 Y NA
 6108965 6108966 BGAFAR04_0519 BGAFAR04_0520 rplB rpsS TRUE 0.993 10.000 0.820 0.079 Y NA
 6108966 6108967 BGAFAR04_0520 BGAFAR04_0521 rpsS rplV TRUE 0.993 8.000 0.769 0.079 Y NA
 6108967 6108968 BGAFAR04_0521 BGAFAR04_0522 rplV rpsC TRUE 0.993 4.000 0.719 0.079 Y NA
 6108968 6108969 BGAFAR04_0522 BGAFAR04_0523 rpsC rplP TRUE 0.993 5.000 0.828 0.079 Y NA
 6108969 6108970 BGAFAR04_0523 BGAFAR04_0524 rplP rpmC TRUE 0.993 3.000 0.802 0.059 Y NA
 6108970 6108971 BGAFAR04_0524 BGAFAR04_0525 rpmC rpsQ TRUE 0.993 3.000 0.828 0.059 Y NA
 6108971 6108972 BGAFAR04_0525 BGAFAR04_0526 rpsQ rplN TRUE 0.974 28.000 0.791 0.079 Y NA
 6108972 6108973 BGAFAR04_0526 BGAFAR04_0527 rplN rplX TRUE 0.992 15.000 0.810 0.079 Y NA
 6108973 6108974 BGAFAR04_0527 BGAFAR04_0528 rplX rplE TRUE 0.994 6.000 0.758 0.059 Y NA
 6108974 6108975 BGAFAR04_0528 BGAFAR04_0529 rplE rpsN TRUE 0.989 18.000 0.496 0.059 Y NA
 6108975 6108976 BGAFAR04_0529 BGAFAR04_0530 rpsN rpsH TRUE 0.993 10.000 0.473 0.059 Y NA
 6108976 6108977 BGAFAR04_0530 BGAFAR04_0531 rpsH rplF TRUE 0.990 18.000 0.808 0.059 Y NA
 6108977 6108978 BGAFAR04_0531 BGAFAR04_0532 rplF rplR TRUE 0.990 18.000 0.815 0.059 Y NA
 6108978 6108979 BGAFAR04_0532 BGAFAR04_0533 rplR rpsE TRUE 0.993 13.000 0.814 0.079 Y NA
 6108979 6108980 BGAFAR04_0533 BGAFAR04_0534 rpsE   TRUE 0.979 25.000 0.789 0.079 Y NA
 6108980 6108981 BGAFAR04_0534 BGAFAR04_0535   rplO TRUE 0.983 -7.000 0.653 0.011 Y NA
 6108981 6108982 BGAFAR04_0535 BGAFAR04_0536 rplO   TRUE 0.941 13.000 0.730 1.000 N NA
 6108982 6108983 BGAFAR04_0536 BGAFAR04_0537   rpmJ TRUE 0.930 13.000 0.089 1.000   NA
 6108983 6108984 BGAFAR04_0537 BGAFAR04_0538 rpmJ rpsM TRUE 0.955 18.000 0.194 0.059   NA
 6108984 6108985 BGAFAR04_0538 BGAFAR04_0539 rpsM rpsK TRUE 0.977 28.000 0.810 0.059 Y NA
 6108985 6108986 BGAFAR04_0539 BGAFAR04_0540 rpsK rpoA TRUE 0.911 16.000 0.308 1.000 N NA
 6108986 6108987 BGAFAR04_0540 BGAFAR04_0541 rpoA rplQ TRUE 0.893 22.000 0.873 1.000 N NA
 6108987 6108988 BGAFAR04_0541 BGAFAR04_0542 rplQ   FALSE 0.378 70.000 0.009 1.000   NA
 6108988 6108989 BGAFAR04_0542 BGAFAR04_0543     TRUE 0.642 -10.000 0.245 NA   NA
 6108989 6108990 BGAFAR04_0543 BGAFAR04_0545   rrmJ FALSE 0.420 -19.000 0.019 NA   NA
 6108992 6108993 BGAFAR04_0546 BGAFAR04_0547 engA   TRUE 0.696 -3.000 0.009 NA   NA
 6108993 6108994 BGAFAR04_0547 BGAFAR04_0548     TRUE 0.815 -3.000 0.429 NA   NA
 6108994 6108995 BGAFAR04_0548 BGAFAR04_0549     TRUE 0.829 20.000 0.381 NA   NA
 6108995 6108996 BGAFAR04_0549 BGAFAR04_0550     TRUE 0.816 12.000 0.006 NA   NA
 6108996 6108997 BGAFAR04_0550 BGAFAR04_0551   pheT TRUE 0.972 -12.000 0.046 0.003 Y NA
 6108997 6108998 BGAFAR04_0551 BGAFAR04_0552 pheT trxB FALSE 0.407 70.000 0.053 1.000 N NA
 6108999 6109000 BGAFAR04_0553 BGAFAR04_0554   dnaJ TRUE 0.892 3.000 0.014 1.000 N NA
 6109000 6109001 BGAFAR04_0554 BGAFAR04_0555 dnaJ dnaK TRUE 0.991 0.000 0.196 0.008 Y NA
 6109001 6109002 BGAFAR04_0555 BGAFAR04_0556 dnaK grpE TRUE 0.983 24.000 0.224 0.015 Y NA
 6109003 6109004 BGAFAR04_0557 BGAFAR04_0558 nadE   FALSE 0.184 67.000 0.000 NA   NA
 6109004 6109005 BGAFAR04_0558 BGAFAR04_0559     FALSE 0.030 781.000 0.000 NA   NA
 6109007 6109008 BGAFAR04_0561 BGAFAR04_0562     TRUE 0.606 -7.000 0.012 NA   NA
 6109009 6109010 BGAFAR04_0563 BGAFAR04_0564     FALSE 0.188 89.000 0.035 NA   NA
 6109010 6109011 BGAFAR04_0564 BGAFAR04_0565     FALSE 0.498 -16.000 0.063 NA   NA
 6109011 6109012 BGAFAR04_0565 BGAFAR04_0566     TRUE 0.887 3.000 0.375 NA   NA
 6109013 6109014 BGAFAR04_0567 BGAFAR04_0568   xth TRUE 0.851 21.000 0.015 1.000   NA
 6109014 6109015 BGAFAR04_0568 BGAFAR04_0569 xth   TRUE 0.795 16.000 0.015 NA   NA
 6109015 6109016 BGAFAR04_0569 BGAFAR04_0570     FALSE 0.517 -19.000 0.290 NA   NA
 6109017 6109018 BGAFAR04_0571 BGAFAR04_0571     FALSE 0.204 -76.000 0.000 NA   NA
 6109018 6109019 BGAFAR04_0571 BGAFAR04_0572     TRUE 0.727 1.000 0.000 NA   NA
 6109019 6109020 BGAFAR04_0572 BGAFAR04_0573     FALSE 0.079 106.000 0.000 NA   NA
 6109020 6109021 BGAFAR04_0573 BGAFAR04_0574     FALSE 0.292 48.000 0.000 NA   NA
 6109021 6109022 BGAFAR04_0574 BGAFAR04_0575     TRUE 0.833 -3.000 0.619 NA   NA
 6109022 6109023 BGAFAR04_0575 BGAFAR04_0576     FALSE 0.510 43.000 0.083 NA   NA
 6109023 6109024 BGAFAR04_0576 BGAFAR04_0577   fusA TRUE 0.727 23.000 0.029 NA   NA
 6109025 6109026 BGAFAR04_0578 BGAFAR04_0579     FALSE 0.042 228.000 0.000 NA   NA
 6109026 6109027 BGAFAR04_0579 BGAFAR04_0580     FALSE 0.222 102.000 0.778 NA   NA
 6109027 6109028 BGAFAR04_0580 BGAFAR04_0581     FALSE 0.094 206.000 0.222 NA   NA
 6109028 6109029 BGAFAR04_0581 BGAFAR04_0583     TRUE 0.921 4.000 0.134 1.000 N NA
 6109030 6109031 BGAFAR04_0582 BGAFAR04_0584   coaE FALSE 0.393 -16.000 0.008 NA   NA
 6109031 6109032 BGAFAR04_0584 BGAFAR04_0585 coaE polA TRUE 0.614 -18.000 0.068 1.000 N NA
 6109032 6109033 BGAFAR04_0585 BGAFAR04_0586 polA   TRUE 0.695 -3.000 0.009 NA   NA
 6109033 6109034 BGAFAR04_0586 BGAFAR04_0587   fliS TRUE 0.618 -10.000 0.114 NA   NA
 6109034 6109035 BGAFAR04_0587 BGAFAR04_0588 fliS   TRUE 0.927 9.000 0.114 1.000 N NA
 6109038 6109039 BGAFAR04_0591 BGAFAR04_0592     TRUE 0.670 -13.000 1.000 NA   NA
 6109039 6109040 BGAFAR04_0592 BGAFAR04_0593     TRUE 0.933 -7.000 0.474 NA Y NA
 6109040 6109041 BGAFAR04_0593 BGAFAR04_0594     FALSE 0.094 138.000 0.099 NA N NA
 6109041 6109042 BGAFAR04_0594 BGAFAR04_0595   ptsP TRUE 0.986 21.000 0.099 0.022 Y NA
 6109042 6109043 BGAFAR04_0595 BGAFAR04_0596 ptsP   TRUE 0.992 3.000 0.114 0.022 Y NA
 6109048 6109049 BGAFAR04_0601 BGAFAR04_0602     FALSE 0.311 82.000 0.667 NA   NA
 6109049 6109050 BGAFAR04_0602 BGAFAR04_0603     FALSE 0.153 77.000 0.000 NA   NA
 6109051 6109052 BGAFAR04_0604 BGAFAR04_0605     TRUE 0.887 13.000 0.273 NA   NA
 6109052 6109053 BGAFAR04_0605 BGAFAR04_0606     TRUE 0.866 16.000 0.333 NA   NA
 6109053 6109054 BGAFAR04_0606 BGAFAR04_0607     TRUE 0.943 56.000 0.692 0.014 Y NA
 6109054 6109055 BGAFAR04_0607 BGAFAR04_0608     TRUE 0.898 3.000 0.562 NA   NA
 6109055 6109056 BGAFAR04_0608 BGAFAR04_0609     TRUE 0.612 41.000 0.500 NA   NA
 6109057 6109058 BGAFAR04_0610 BGAFAR04_0611     TRUE 0.787 8.000 0.000 NA   NA
 6109059 6109060 BGAFAR04_0612 BGAFAR04_0613     FALSE 0.346 62.000 0.310 NA N NA
 6109060 6109061 BGAFAR04_0613 BGAFAR04_0614     TRUE 0.899 7.000 0.321 NA   NA
 6109061 6109062 BGAFAR04_0614 BGAFAR04_0615   pyrG FALSE 0.059 189.000 0.005 NA   NA
 6109064 6109065 BGAFAR04_0617 BGAFAR04_0618     FALSE 0.090 248.000 0.300 NA   NA
 6109065 6109066 BGAFAR04_0618 BGAFAR04_0619     FALSE 0.286 88.000 0.010 1.000   NA
 6109066 6109067 BGAFAR04_0619 BGAFAR04_0620     TRUE 0.832 9.000 0.009 NA   NA
 6109067 6109068 BGAFAR04_0620 BGAFAR04_0622   recG TRUE 0.903 10.000 0.429 NA   NA
 6109070 6109071 BGAFAR04_0623 BGAFAR04_0624     TRUE 0.763 178.000 0.778 0.006 Y NA
 6109071 6109072 BGAFAR04_0624 BGAFAR04_0626   murD TRUE 0.892 13.000 0.010 1.000 N NA
 6109073 6109074 BGAFAR04_0625 BGAFAR04_0627   metG TRUE 0.914 10.000 0.024 1.000 N NA
 6109075 6109076 BGAFAR04_0628 BGAFAR04_0630 mtnN pta FALSE 0.195 111.000 0.031 1.000 N NA
 6109077 6109078 BGAFAR04_0629 BGAFAR04_0631 ksgA   TRUE 0.565 32.000 0.016 NA   NA
 6109079 6109080 BGAFAR04_0632 BGAFAR04_0633     TRUE 0.702 26.000 0.182 NA   NA
 6109081 6109082 BGAFAR04_0634 BGAFAR04_0635 argS   TRUE 0.579 -7.000 0.008 NA   NA
 6109087 6109088 BGAFAR04_0640 BGAFAR04_0641 cysS   TRUE 0.811 4.000 0.007 NA   NA
 6109088 6109089 BGAFAR04_0641 BGAFAR04_0642   glyA TRUE 0.828 0.000 0.084 NA   NA
 6109089 6109090 BGAFAR04_0642 BGAFAR04_0643 glyA   TRUE 0.800 27.000 0.084 1.000   NA
 6109091 6109092 BGAFAR04_0644 BGAFAR04_0645     FALSE 0.072 319.000 0.167 NA   NA
 6109093 6109094 BGAFAR04_0646 BGAFAR04_0647     TRUE 0.906 17.000 0.316 1.000 N NA
 6109094 6109095 BGAFAR04_0647 BGAFAR04_0648   pcrA TRUE 0.902 3.000 0.024 1.000 N NA
 6109095 6109096 BGAFAR04_0648 BGAFAR04_0649 pcrA   FALSE 0.155 115.000 0.000 1.000   NA
 6109096 6109097 BGAFAR04_0649 BGAFAR04_0650     TRUE 0.973 6.000 0.000 0.003   NA
 6109097 6109098 BGAFAR04_0650 BGAFAR04_0651     FALSE 0.066 123.000 0.000 NA   NA
 6109098 6109099 BGAFAR04_0651 BGAFAR04_0652     TRUE 0.661 20.000 0.000 NA   NA
 6109099 6109100 BGAFAR04_0652 BGAFAR04_0653     FALSE 0.158 75.000 0.000 NA   NA
 6109100 6109101 BGAFAR04_0653 BGAFAR04_0654     TRUE 0.743 2.000 0.000 NA   NA
 6109101 6109102 BGAFAR04_0654 BGAFAR04_0655   tig FALSE 0.403 38.000 0.000 NA   NA
 6109102 6109103 BGAFAR04_0655 BGAFAR04_0656 tig clpP TRUE 0.986 6.000 0.351 1.000 Y NA
 6109103 6109104 BGAFAR04_0656 BGAFAR04_0657 clpP clpX TRUE 0.987 9.000 0.352 1.000 Y NA
 6109104 6109105 BGAFAR04_0657 BGAFAR04_0658 clpX   TRUE 0.593 -13.000 0.000 1.000   NA
 6109105 6109106 BGAFAR04_0658 BGAFAR04_0659     TRUE 0.972 9.000 0.000 0.004   NA
 6109107 6109108 BGAFAR04_0141 BGAFAR04_0140     TRUE 0.747 37.000 0.162 1.000   NA
 6109108 6109109 BGAFAR04_0140 BGAFAR04_0139   recA TRUE 0.752 48.000 0.009 0.042   NA
 6109109 6109110 BGAFAR04_0139 BGAFAR04_0138 recA   TRUE 0.623 24.000 0.003 NA   NA
 6109110 6109111 BGAFAR04_0138 BGAFAR04_0137     FALSE 0.540 -13.000 0.060 NA   NA
 6109111 6109112 BGAFAR04_0137 BGAFAR04_0136   cmk TRUE 0.582 -16.000 0.019 1.000 N NA
 6109112 6109113 BGAFAR04_0136 BGAFAR04_0135 cmk   TRUE 0.923 3.000 0.281 1.000 N NA
 6109113 6109114 BGAFAR04_0135 BGAFAR04_0134     FALSE 0.192 100.000 0.000 1.000   NA
 6109114 6109115 BGAFAR04_0134 BGAFAR04_0133     FALSE 0.058 141.000 0.000 NA   NA
 6109115 6109116 BGAFAR04_0133 BGAFAR04_0132     TRUE 0.661 20.000 0.000 NA   NA
 6109116 6109117 BGAFAR04_0132 BGAFAR04_0131   rpsB FALSE 0.042 221.000 0.000 NA   NA
 6109117 6109118 BGAFAR04_0131 BGAFAR04_0130 rpsB tsf TRUE 0.975 -3.000 0.748 1.000 Y NA
 6109118 6109119 BGAFAR04_0130 BGAFAR04_0129 tsf frr TRUE 0.913 38.000 0.021 1.000 Y NA
 6109119 6109120 BGAFAR04_0129 BGAFAR04_0128 frr uppS TRUE 0.934 5.000 0.409 1.000 N NA
 6109120 6109121 BGAFAR04_0128 BGAFAR04_0127 uppS cdsA TRUE 0.926 -10.000 0.027 1.000 Y NA
 6109121 6109122 BGAFAR04_0127 BGAFAR04_0125 cdsA rseP TRUE 0.812 22.000 0.014 1.000 N NA
 6109124 6109125 BGAFAR04_0124 BGAFAR04_0123     FALSE 0.127 139.000 0.006 1.000 N NA
 6109125 6109126 BGAFAR04_0123 BGAFAR04_0122     TRUE 0.907 12.000 0.018 1.000 N NA
 6109126 6109127 BGAFAR04_0122 BGAFAR04_0121   rpsR TRUE 0.889 15.000 0.019 1.000 N NA
 6109127 6109128 BGAFAR04_0121 BGAFAR04_0120 rpsR rplI TRUE 0.990 17.000 0.499 0.055 Y NA
 6109128 6109129 BGAFAR04_0120 BGAFAR04_0119 rplI dnaB TRUE 0.743 25.000 0.009 1.000 N NA
 6109131 6109132 BGAFAR04_0117 BGAFAR04_0116     FALSE 0.318 80.000 0.025 1.000 N NA
 6109132 6109133 BGAFAR04_0116 BGAFAR04_0115   nusB TRUE 0.645 38.000 0.016 1.000 N NA
 6109133 6109134 BGAFAR04_0115 BGAFAR04_0114 nusB   TRUE 0.626 -13.000 0.004 1.000   NA
 6109134 6109135 BGAFAR04_0114 BGAFAR04_0113   map TRUE 0.763 -7.000 0.010 1.000   NA
 6109135 6109136 BGAFAR04_0113 BGAFAR04_0112 map   TRUE 0.647 66.000 0.037 0.041 N NA
 6109136 6109137 BGAFAR04_0112 BGAFAR04_0111     FALSE 0.153 182.000 0.028 1.000   NA
 6109139 6109140 BGAFAR04_0109 BGAFAR04_0108 murI rsgA TRUE 0.846 -3.000 0.015 1.000   NA
 6109140 6109141 BGAFAR04_0108 BGAFAR04_0107 rsgA   TRUE 0.714 -10.000 0.016 1.000   NA
 6109141 6109142 BGAFAR04_0107 BGAFAR04_0106     TRUE 0.857 6.000 0.023 NA   NA
 6109142 6109143 BGAFAR04_0106 BGAFAR04_0105     FALSE 0.098 186.000 0.175 NA   NA
 6109143 6109144 BGAFAR04_0105 BGAFAR04_0104     TRUE 0.909 13.000 0.667 NA   NA
 6109144 6109145 BGAFAR04_0104 BGAFAR04_0103     TRUE 0.901 14.000 0.633 NA   NA
 6109145 6109146 BGAFAR04_0103 BGAFAR04_0102     TRUE 0.990 22.000 0.806 0.010 Y NA
 6109146 6109147 BGAFAR04_0102 BGAFAR04_0101     TRUE 0.995 3.000 0.903 0.010 Y NA
 6109147 6109148 BGAFAR04_0101 BGAFAR04_0100     TRUE 0.988 -3.000 0.270 0.010 Y NA
 6109148 6109149 BGAFAR04_0100 BGAFAR04_0099     TRUE 0.975 17.000 0.848 0.010   NA
 6109149 6109150 BGAFAR04_0099 BGAFAR04_0098     FALSE 0.347 60.000 0.050 NA   NA
 6109150 6109151 BGAFAR04_0098 BGAFAR04_0097     FALSE 0.039 260.000 0.000 NA   NA
 6109151 6109152 BGAFAR04_0097 BGAFAR04_0096   lepA FALSE 0.510 34.000 0.009 NA   NA
 6109152 6109153 BGAFAR04_0096 BGAFAR04_0095 lepA   FALSE 0.143 123.000 0.009 1.000 N NA
 6109154 6109155 BGAFAR04_0094 BGAFAR04_0093     FALSE 0.518 -7.000 0.000 NA   NA
 6109155 6109156 BGAFAR04_0093 BGAFAR04_0092     TRUE 0.647 -3.000 0.011 NA N NA
 6109156 6109157 BGAFAR04_0092 BGAFAR04_0091     FALSE 0.067 204.000 0.053 NA N NA
 6109158 6109159 BGAFAR04_0090 BGAFAR04_0089     TRUE 0.784 -7.000 1.000 NA   NA
 6109160 6109161 BGAFAR04_0088 BGAFAR04_0087     TRUE 0.794 -3.000 0.500 NA N NA
 6109161 6109162 BGAFAR04_0087 BGAFAR04_0086   lolE TRUE 0.868 2.000 0.529 NA N NA
 6109162 6109163 BGAFAR04_0086 BGAFAR04_0085 lolE   TRUE 0.880 1.000 0.529 NA   NA
 6109163 6109164 BGAFAR04_0085 BGAFAR04_0084   ftsY TRUE 0.690 -3.000 0.008 NA   NA
 6109164 6109165 BGAFAR04_0084 BGAFAR04_0083 ftsY   FALSE 0.485 37.000 0.009 NA   NA
 6109167 6109168 BGAFAR04_0081 BGAFAR04_0080   prfB FALSE 0.393 -18.000 0.010 NA   NA
 6109168 6109169 BGAFAR04_0080 BGAFAR04_0079 prfB   FALSE 0.422 41.000 0.005 NA   NA
 6109169 6109170 BGAFAR04_0079 BGAFAR04_0078     TRUE 0.834 -3.000 0.643 NA   NA
 6109170 6109171 BGAFAR04_0078 BGAFAR04_0077     TRUE 0.915 8.000 0.643 NA   NA
 6109171 6109172 BGAFAR04_0077 BGAFAR04_0076     TRUE 0.826 17.000 0.052 NA   NA
 6109172 6109173 BGAFAR04_0076 BGAFAR04_0075     TRUE 0.848 15.000 0.052 NA   NA
 6109173 6109174 BGAFAR04_0075 BGAFAR04_0074     TRUE 0.753 -15.000 0.818 1.000   NA
 6109175 6109176 BGAFAR04_0073 BGAFAR04_0072     TRUE 0.774 -3.000 0.066 NA   NA
 6109176 6109177 BGAFAR04_0072 BGAFAR04_0071   def TRUE 0.628 35.000 0.205 NA   NA
 6109177 6109178 BGAFAR04_0071 BGAFAR04_0070 def fmt TRUE 0.979 -3.000 0.026 0.084 Y NA
 6109178 6109179 BGAFAR04_0070 BGAFAR04_0069 fmt   FALSE 0.545 50.000 0.015 1.000   NA
 6109180 6109181 BGAFAR04_0068 BGAFAR04_0067     FALSE 0.040 248.000 0.000 NA   NA
 6109182 6109183 BGAFAR04_0066 BGAFAR04_0065 trx   FALSE 0.145 89.000 0.009 NA   NA
 6109183 6109184 BGAFAR04_0065 BGAFAR04_0064     TRUE 0.857 1.000 0.222 NA   NA
 6109184 6109185 BGAFAR04_0064 BGAFAR04_0063     TRUE 0.858 -3.000 0.025 1.000   NA
 6109185 6109186 BGAFAR04_0063 BGAFAR04_0062   gap FALSE 0.313 75.000 0.000 1.000   NA
 6109186 6109187 BGAFAR04_0062 BGAFAR04_0061 gap pgk TRUE 0.969 26.000 0.000 0.014 Y NA
 6109187 6109188 BGAFAR04_0061 BGAFAR04_0060 pgk tpiA TRUE 0.834 -43.000 0.141 1.000 Y NA
 6109188 6109189 BGAFAR04_0060 BGAFAR04_0059 tpiA   TRUE 0.893 16.000 0.044 1.000 N NA
 6109192 6109193 BGAFAR04_0057 BGAFAR04_0055     FALSE 0.248 77.000 0.035 NA   NA
 6109198 6109199 BGAFAR04_0048 BGAFAR04_0047     TRUE 0.723 26.000 0.310 NA   NA
 6109199 6109200 BGAFAR04_0047 BGAFAR04_0046     TRUE 0.850 -3.000 0.900 NA   NA
 6109200 6109201 BGAFAR04_0046 BGAFAR04_0045   phoU TRUE 0.885 11.000 0.164 NA   NA
 6109203 6109204 BGAFAR04_0043 BGAFAR04_0042     TRUE 0.905 12.000 0.500 NA   NA
 6109204 6109205 BGAFAR04_0042 BGAFAR04_0041     TRUE 0.906 9.000 0.462 NA   NA
 6109205 6109206 BGAFAR04_0041 BGAFAR04_0040     TRUE 0.857 21.000 0.064 1.000 N NA
 6109206 6109207 BGAFAR04_0040 BGAFAR04_0039     TRUE 0.992 0.000 0.110 0.005 Y NA
 6109207 6109208 BGAFAR04_0039 BGAFAR04_0038     FALSE 0.253 67.000 0.016 NA   NA
 6109209 6109210 BGAFAR04_0037 BGAFAR04_0036 smpB   TRUE 0.819 12.000 0.008 NA   NA
 6109211 6109212 BGAFAR04_0035 BGAFAR04_0034 lepB lepB TRUE 0.977 2.000 0.273 0.004   NA
 6109212 6109213 BGAFAR04_0034 BGAFAR04_0032 lepB   TRUE 0.563 -10.000 0.022 NA   NA
 6109214 6109215 BGAFAR04_0033 BGAFAR04_0031     TRUE 0.913 8.000 0.600 NA   NA
 6109216 6109217 BGAFAR04_0030 BGAFAR04_0029     TRUE 0.787 1.000 0.010 NA   NA
 6109219 6109220 BGAFAR04_0027 BGAFAR04_0026 ruvA ruvB TRUE 0.963 45.000 0.549 0.009 Y NA
 6109220 6109221 BGAFAR04_0026 BGAFAR04_0025 ruvB queA FALSE 0.525 -25.000 0.069 1.000 N NA
 6109221 6109222 BGAFAR04_0025 BGAFAR04_0024 queA queA FALSE 0.498 101.000 0.004 0.004   NA
 6109222 6109223 BGAFAR04_0024 BGAFAR04_0023 queA   FALSE 0.329 78.000 0.008 1.000   NA
 6109223 6109224 BGAFAR04_0023 BGAFAR04_0022     TRUE 0.887 8.000 0.158 NA   NA
 6109224 6109225 BGAFAR04_0022 BGAFAR04_0020     TRUE 0.790 2.000 0.009 NA   NA
 6109227 6109228 BGAFAR04_0019 BGAFAR04_0017   udk TRUE 0.754 0.000 0.022 NA N NA
 6109229 6109230 BGAFAR04_0018 BGAFAR04_0016 priA   TRUE 0.598 -7.000 0.010 NA   NA
 6109230 6109231 BGAFAR04_0016 BGAFAR04_0015   truA TRUE 0.667 -7.000 0.040 NA   NA
 6109231 6109232 BGAFAR04_0015 BGAFAR04_0014 truA   TRUE 0.838 1.000 0.054 NA   NA
 6109232 6109233 BGAFAR04_0014 BGAFAR04_0013     TRUE 0.833 4.000 0.015 NA   NA
 6109233 6109234 BGAFAR04_0013 BGAFAR04_0012     TRUE 0.719 -3.000 0.015 NA   NA
 6109234 6109235 BGAFAR04_0012 BGAFAR04_0011     TRUE 0.850 5.000 0.021 NA   NA
 6109236 6109237 BGAFAR04_0010 BGAFAR04_0009     FALSE 0.380 58.000 0.106 NA   NA
 6109238 6109239 BGAFAR04_0356 BGAFAR04_0357     FALSE 0.457 53.000 0.000 1.000   NA
 6109239 6109240 BGAFAR04_0357 BGAFAR04_0358     TRUE 0.723 -7.000 0.000 1.000   NA
 6109240 6109241 BGAFAR04_0358 BGAFAR04_0359     TRUE 0.979 -10.000 0.492 0.004 Y NA
 6109241 6109242 BGAFAR04_0359 BGAFAR04_0360   gatC TRUE 0.996 11.000 0.643 0.004 Y NA
 6109242 6109243 BGAFAR04_0360 BGAFAR04_0361 gatC   TRUE 0.906 10.000 0.015 1.000 N NA
 6109245 6109246 BGAFAR04_0363 BGAFAR04_0364     TRUE 0.743 15.000 0.000 NA   NA
 6109246 6109247 BGAFAR04_0364 BGAFAR04_0365     TRUE 0.886 11.000 0.173 NA   NA
 6109248 6109249 BGAFAR04_0366 BGAFAR04_0367   pyk FALSE 0.118 98.000 0.023 NA N NA
 6109249 6109250 BGAFAR04_0367 BGAFAR04_0368 pyk   TRUE 0.828 18.000 0.157 NA   NA
 6109251 6109252 BGAFAR04_0369 BGAFAR04_0370 rpmB   TRUE 0.689 22.000 0.009 NA   NA
 6109254 6109255 BGAFAR04_0371 BGAFAR04_0373     TRUE 0.911 13.000 0.727 NA   NA
 6109255 6109256 BGAFAR04_0373 BGAFAR04_0374     TRUE 0.609 34.000 0.055 NA   NA
 6109256 6109257 BGAFAR04_0374 BGAFAR04_0375     FALSE 0.369 41.000 0.000 NA   NA
 6109257 6109258 BGAFAR04_0375 BGAFAR04_0376     FALSE 0.518 -7.000 0.000 NA   NA
 6109258 6109259 BGAFAR04_0376 BGAFAR04_0377     TRUE 0.859 4.000 0.033 NA   NA
 6109260 6109261 BGAFAR04_0378 BGAFAR04_0379     TRUE 0.897 4.000 0.444 NA   NA
 6109261 6109262 BGAFAR04_0379 BGAFAR04_0380   lgt TRUE 0.870 0.000 0.021 1.000 N NA
 6109262 6109263 BGAFAR04_0380 BGAFAR04_0381 lgt   TRUE 0.724 21.000 0.013 NA   NA
 6109263 6109264 BGAFAR04_0381 BGAFAR04_0382     FALSE 0.408 -12.000 0.000 NA   NA
 6109264 6109265 BGAFAR04_0382 BGAFAR04_0383   mgsA FALSE 0.076 94.000 0.000 NA N NA
 6109267 6109268 BGAFAR04_0385 BGAFAR04_0386     TRUE 0.919 8.000 0.034 1.000 N NA
 6109269 6109270 BGAFAR04_0387 BGAFAR04_0388     TRUE 0.885 18.000 0.089 1.000 N NA
 6109270 6109271 BGAFAR04_0388 BGAFAR04_0389   tyrS TRUE 0.909 11.000 0.019 1.000 N NA
 6109271 6109272 BGAFAR04_0389 BGAFAR04_0390 tyrS glyS TRUE 0.964 -3.000 0.023 1.000 Y NA
 6109272 6109273 BGAFAR04_0390 BGAFAR04_0391 glyS gltX TRUE 0.973 18.000 0.025 1.000 Y NA
 6109273 6109274 BGAFAR04_0391 BGAFAR04_0392 gltX   TRUE 0.843 13.000 0.020 NA   NA
 6109275 6109276 BGAFAR04_0393 BGAFAR04_0394   mtnN TRUE 0.861 23.000 0.450 1.000 N NA
 6109276 6109277 BGAFAR04_0394 BGAFAR04_0395 mtnN metK TRUE 0.900 -3.000 1.000 1.000 N NA
 6109277 6109278 BGAFAR04_0395 BGAFAR04_0396 metK luxS TRUE 0.839 -3.000 0.029 1.000 N NA
 6109279 6109280 BGAFAR04_0397 BGAFAR04_0398     TRUE 0.646 27.000 0.034 NA   NA
 6109280 6109281 BGAFAR04_0398 BGAFAR04_0399   mgtE TRUE 0.780 49.000 0.051 0.014 N NA
 6109281 6109282 BGAFAR04_0399 BGAFAR04_0400 mgtE   TRUE 0.564 54.000 0.300 1.000 N NA
 6109282 6109283 BGAFAR04_0400 BGAFAR04_0401     FALSE 0.247 114.000 0.200 1.000   NA
 6109283 6109284 BGAFAR04_0401 BGAFAR04_0402     TRUE 0.617 97.000 0.667 0.010   NA
 6109284 6109285 BGAFAR04_0402 BGAFAR04_0403     TRUE 0.899 41.000 0.667 0.010   NA
 6109285 6109286 BGAFAR04_0403 BGAFAR04_0404     TRUE 0.863 -10.000 0.000 0.010   NA
 6109286 6109287 BGAFAR04_0404 BGAFAR04_0405     FALSE 0.061 132.000 0.000 NA   NA
 6109287 6109288 BGAFAR04_0405 BGAFAR04_0406     FALSE 0.166 129.000 0.667 NA   NA
 6109288 6109289 BGAFAR04_0406 BGAFAR04_0407     TRUE 0.907 41.000 1.000 0.010   NA
 6109289 6109290 BGAFAR04_0407 BGAFAR04_0408     FALSE 0.223 324.000 0.000 0.010   NA
 6109290 6109291 BGAFAR04_0408 BGAFAR04_0409   rpsG FALSE 0.228 99.000 0.009 1.000   NA
 6109291 6109292 BGAFAR04_0409 BGAFAR04_0410 rpsG rpsL TRUE 0.983 25.000 0.224 0.009 Y NA
 6109292 6109293 BGAFAR04_0410 BGAFAR04_0411 rpsL rpoC FALSE 0.423 66.000 0.035 1.000 N NA
 6109293 6109294 BGAFAR04_0411 BGAFAR04_0412 rpoC rpoB TRUE 0.995 16.000 0.851 0.003 Y NA
 6109294 6109295 BGAFAR04_0412 BGAFAR04_0413 rpoB rplL FALSE 0.349 84.000 0.223 1.000 N NA
 6109295 6109296 BGAFAR04_0413 BGAFAR04_0414 rplL   TRUE 0.906 71.000 0.884 0.050 Y NA
 6109296 6109297 BGAFAR04_0414 BGAFAR04_0415   rplA TRUE 0.992 5.000 0.302 0.067 Y NA
 6109297 6109298 BGAFAR04_0415 BGAFAR04_0416 rplA rplK TRUE 0.990 0.000 0.838 0.067 Y NA
 6109298 6109299 BGAFAR04_0416 BGAFAR04_0417 rplK nusG TRUE 0.605 55.000 0.681 1.000 N NA
 6109299 6109300 BGAFAR04_0417 BGAFAR04_0418 nusG   FALSE 0.043 217.000 0.000 NA   NA
 6109300 6109301 BGAFAR04_0418 BGAFAR04_0419   rpmG TRUE 0.787 8.000 0.000 NA   NA
 6109301 6109302 BGAFAR04_0419 BGAFAR04_0420 rpmG   FALSE 0.543 25.000 0.000 NA   NA
 6109302 6109303 BGAFAR04_0420 BGAFAR04_0421     FALSE 0.198 65.000 0.000 NA   NA
 6109303 6109304 BGAFAR04_0421 BGAFAR04_0422     TRUE 0.882 14.000 0.300 NA   NA
 6109308 6109309 BGAFAR04_0426 BGAFAR04_0427 proS   FALSE 0.343 53.000 0.016 NA   NA
 6109310 6109311 BGAFAR04_0428 BGAFAR04_0429     TRUE 0.837 -3.000 0.667 NA   NA
 6109311 6109312 BGAFAR04_0429 BGAFAR04_0430     TRUE 0.924 11.000 1.000 NA   NA
 6109313 6109314 BGAFAR04_0431 BGAFAR04_0432 manA   TRUE 0.970 -3.000 0.222 1.000 Y NA
 6109315 6109316 BGAFAR04_0433 BGAFAR04_0434     TRUE 0.786 -3.000 0.155 NA   NA
 6109316 6109317 BGAFAR04_0434 BGAFAR04_0435     TRUE 0.786 -3.000 0.155 NA   NA
 6109317 6109318 BGAFAR04_0435 BGAFAR04_0436     FALSE 0.034 321.000 0.000 NA   NA
 6109318 6109319 BGAFAR04_0436 BGAFAR04_0437     FALSE 0.033 344.000 0.000 NA   NA
 6109319 6109320 BGAFAR04_0437 BGAFAR04_0438     TRUE 0.944 33.000 0.450 1.000 Y NA
 6109320 6109321 BGAFAR04_0438 BGAFAR04_0439     TRUE 0.730 24.000 0.073 NA   NA
 6109321 6109322 BGAFAR04_0439 BGAFAR04_0440     FALSE 0.513 39.000 0.022 NA   NA
 6109322 6109323 BGAFAR04_0440 BGAFAR04_0441     TRUE 0.726 19.000 0.007 NA   NA
 6109324 6109325 BGAFAR04_0442 BGAFAR04_0443     TRUE 0.995 9.000 0.429 0.009 Y NA
 6109325 6109326 BGAFAR04_0443 BGAFAR04_0444   rrf FALSE 0.092 99.000 0.000 NA   NA
 6109326 6109327 BGAFAR04_0444 BGAFAR04_0445 rrf rrl TRUE 0.601 23.000 0.000 NA   NA
 6109328 6109329 BGAFAR04_0716 BGAFAR04_0717     FALSE 0.513 67.000 0.370 1.000   NA
 6109329 6109330 BGAFAR04_0717 BGAFAR04_0718     TRUE 0.994 8.000 0.436 0.023 Y NA
 6109330 6109331 BGAFAR04_0718 BGAFAR04_0719     TRUE 0.977 13.000 0.436 NA Y NA
 6109331 6109332 BGAFAR04_0719 BGAFAR04_0720     TRUE 0.597 40.000 0.625 NA N NA
 6109333 6109334 BGAFAR04_0721 BGAFAR04_0722     TRUE 0.849 -3.000 0.889 NA   NA
 6109334 6109335 BGAFAR04_0722 BGAFAR04_0723     TRUE 0.799 -6.000 0.750 NA   NA
 6109335 6109336 BGAFAR04_0723 BGAFAR04_0724     FALSE 0.315 63.000 0.029 NA   NA
 6109337 6109338 BGAFAR04_0725 BGAFAR04_0726 rbsA   TRUE 0.928 1.000 0.438 1.000   NA
 6109338 6109339 BGAFAR04_0726 BGAFAR04_0727     TRUE 0.797 -28.000 0.720 0.033   NA
 6109339 6109340 BGAFAR04_0727 BGAFAR04_0728     FALSE 0.275 158.000 0.032 0.098   NA
 6109340 6109341 BGAFAR04_0728 BGAFAR04_0729     TRUE 0.980 31.000 0.900 0.013 Y NA
 6109341 6109342 BGAFAR04_0729 BGAFAR04_0731     FALSE 0.249 -25.000 0.000 NA   NA
 6109344 6109345 BGAFAR04_0732 BGAFAR04_0733   fni TRUE 0.766 -31.000 0.034 0.006 N NA
 6109345 6109346 BGAFAR04_0733 BGAFAR04_0734 fni   TRUE 0.716 -10.000 0.053 1.000 N NA
 6109346 6109347 BGAFAR04_0734 BGAFAR04_0735   mvaD TRUE 0.895 -16.000 0.048 1.000 Y NA
 6109347 6109348 BGAFAR04_0735 BGAFAR04_0736 mvaD   TRUE 0.977 -9.000 0.082 0.006 Y NA
 6109348 6109349 BGAFAR04_0736 BGAFAR04_0737   mvk TRUE 0.984 -6.000 0.109 0.006 Y NA
 6109350 6109351 BGAFAR04_0738 BGAFAR04_0739     FALSE 0.355 42.000 0.000 NA   NA
 6109352 6109353 BGAFAR04_0740 BGAFAR04_0741   fusA FALSE 0.362 79.000 0.136 1.000 N NA
 6109353 6109354 BGAFAR04_0741 BGAFAR04_0742 fusA   FALSE 0.027 278.000 0.000 NA N NA
 6109354 6109355 BGAFAR04_0742 BGAFAR04_0743   ffh FALSE 0.198 63.000 0.007 NA N NA
 6109355 6109356 BGAFAR04_0743 BGAFAR04_0744 ffh rpsP TRUE 0.930 13.000 0.361 1.000 N NA
 6109356 6109357 BGAFAR04_0744 BGAFAR04_0745 rpsP   TRUE 0.926 1.000 0.385 1.000   NA
 6109357 6109358 BGAFAR04_0745 BGAFAR04_0746   rimM TRUE 0.939 4.000 0.324 1.000   NA
 6109358 6109359 BGAFAR04_0746 BGAFAR04_0747 rimM trmD TRUE 0.975 -3.000 0.672 1.000 Y NA
 6109359 6109360 BGAFAR04_0747 BGAFAR04_0748 trmD rplS TRUE 0.898 -22.000 0.567 1.000 Y NA
 6109360 6109361 BGAFAR04_0748 BGAFAR04_0749 rplS   FALSE 0.034 340.000 0.000 NA   NA
 6109361 6109362 BGAFAR04_0749 BGAFAR04_0750   coaD TRUE 0.805 2.000 0.012 NA   NA
 6109362 6109363 BGAFAR04_0750 BGAFAR04_0751 coaD rpmF FALSE 0.402 63.000 0.013 1.000 N NA
 6109363 6109364 BGAFAR04_0751 BGAFAR04_0752 rpmF acpP TRUE 0.785 24.000 0.017 1.000 N NA
 6109364 6109365 BGAFAR04_0752 BGAFAR04_0754 acpP rnc TRUE 0.828 -3.000 0.019 1.000 N NA
 6109367 6109368 BGAFAR04_0755 BGAFAR04_0756     TRUE 0.924 6.000 1.000 NA   NA
 6109368 6109369 BGAFAR04_0756 BGAFAR04_0757     FALSE 0.113 89.000 0.000 NA   NA
 6109369 6109370 BGAFAR04_0757 BGAFAR04_0758     TRUE 0.743 2.000 0.000 NA   NA
 6109370 6109371 BGAFAR04_0758 BGAFAR04_0759     FALSE 0.044 209.000 0.000 NA   NA
 6109371 6109372 BGAFAR04_0759 BGAFAR04_0760   dnaG TRUE 0.921 6.000 0.017 1.000   NA
 6109372 6109373 BGAFAR04_0760 BGAFAR04_0761 dnaG   TRUE 0.928 4.000 0.299 1.000 N NA
 6109373 6109374 BGAFAR04_0761 BGAFAR04_0762     TRUE 0.853 14.000 0.036 NA   NA
 6109374 6109375 BGAFAR04_0762 BGAFAR04_0763     FALSE 0.158 75.000 0.000 NA   NA
 6109375 6109376 BGAFAR04_0763 BGAFAR04_0764     FALSE 0.340 43.000 0.000 NA   NA
 6109376 6109377 BGAFAR04_0764 BGAFAR04_0765     TRUE 0.919 11.000 0.014 1.000   NA
 6109377 6109378 BGAFAR04_0765 BGAFAR04_0766   mreC TRUE 0.941 4.000 0.689 1.000 N NA
 6109378 6109379 BGAFAR04_0766 BGAFAR04_0767 mreC   TRUE 0.770 0.000 0.011 NA   NA
 6109379 6109380 BGAFAR04_0767 BGAFAR04_0768     TRUE 0.814 0.000 0.035 NA   NA
 6109380 6109381 BGAFAR04_0768 BGAFAR04_0769   mrdB TRUE 0.935 5.000 0.161 1.000   NA
 6109381 6109382 BGAFAR04_0769 BGAFAR04_0770 mrdB   TRUE 0.930 23.000 0.008 0.011   NA
 6109382 6109383 BGAFAR04_0770 BGAFAR04_0771   thrS FALSE 0.143 167.000 0.014 1.000   NA
 6109383 6109384 BGAFAR04_0771 BGAFAR04_0772 thrS pgsA TRUE 0.897 5.000 0.010 1.000 N NA
 6109384 6109385 BGAFAR04_0772 BGAFAR04_0774 pgsA   FALSE 0.455 -13.000 0.010 NA   NA
 6109387 6109388 BGAFAR04_0775 BGAFAR04_0776     TRUE 0.995 6.000 0.270 0.006 Y NA
 6109388 6109389 BGAFAR04_0776 BGAFAR04_0777     TRUE 0.931 10.000 0.231 1.000 N NA
 6109389 6109390 BGAFAR04_0777 BGAFAR04_0778     TRUE 0.785 31.000 0.474 1.000 N NA
 6109391 6109392 BGAFAR04_0779 BGAFAR04_0780 cdr   TRUE 0.914 15.000 0.034 1.000   NA
 6109392 6109393 BGAFAR04_0780 BGAFAR04_0781   pgi FALSE 0.485 65.000 0.051 1.000   NA
 6109393 6109394 BGAFAR04_0781 BGAFAR04_0782 pgi   TRUE 0.865 23.000 0.200 1.000   NA
 6109394 6109395 BGAFAR04_0782 BGAFAR04_0783     TRUE 0.950 7.000 0.560 1.000   NA
 6109398 6109399 BGAFAR04_0786 BGAFAR04_0787     FALSE 0.043 191.000 0.004 NA N NA
 6109399 6109400 BGAFAR04_0787 BGAFAR04_0788   valS TRUE 0.894 5.000 0.000 1.000   NA
 6109402 6109403 BGAFAR04_0790 BGAFAR04_0791     FALSE 0.198 78.000 0.013 NA   NA
 6109403 6109404 BGAFAR04_0791 BGAFAR04_0792   groS FALSE 0.049 313.000 0.011 NA   NA
 6109405 6109406 BGAFAR04_0793 BGAFAR04_0794     TRUE 0.714 34.000 0.013 1.000   NA
 6109406 6109407 BGAFAR04_0794 BGAFAR04_0795     FALSE 0.551 36.000 0.023 NA   NA
 6109407 6109408 BGAFAR04_0795 BGAFAR04_0796     FALSE 0.171 106.000 0.318 NA   NA
 6109409 6109410 BGAFAR04_0797 BGAFAR04_0798     TRUE 0.760 3.000 0.000 NA   NA
 6109412 6109413 BGAFAR04_0800 BGAFAR04_0801     TRUE 0.966 0.000 0.600 0.032   NA
 6109413 6109414 BGAFAR04_0801 BGAFAR04_0802     TRUE 0.877 6.000 0.000 1.000 N NA
 6109416 6109417 BGAFAR04_0804 BGAFAR04_0805     TRUE 0.839 17.000 0.145 NA   NA
 6109417 6109418 BGAFAR04_0805 BGAFAR04_0806     TRUE 0.803 18.000 0.032 NA   NA
 6109418 6109419 BGAFAR04_0806 BGAFAR04_0807     TRUE 0.879 5.000 0.129 NA   NA
 6109419 6109420 BGAFAR04_0807 BGAFAR04_0808     TRUE 0.861 3.000 0.061 NA   NA
 6109420 6109421 BGAFAR04_0808 BGAFAR04_0809   rnz TRUE 0.922 9.000 0.016 1.000   NA
 6109421 6109422 BGAFAR04_0809 BGAFAR04_0810 rnz   FALSE 0.119 191.000 0.005 1.000   NA
 6109423 6109424 BGAFAR04_0811 BGAFAR04_0812 clpP   FALSE 0.303 47.000 0.000 NA   NA
 6109424 6109425 BGAFAR04_0812 BGAFAR04_0813     FALSE 0.191 66.000 0.000 NA   NA
 6109426 6109427 BGAFAR04_0814 BGAFAR04_0815     TRUE 0.630 40.000 0.529 NA   NA
 6109429 6109430 BGAFAR04_0817 BGAFAR04_0818     TRUE 0.985 3.000 0.432 1.000 Y NA
 6109430 6109431 BGAFAR04_0818 BGAFAR04_0819     TRUE 0.859 -3.000 0.026 1.000   NA
 6109431 6109432 BGAFAR04_0819 BGAFAR04_0820   cvpA TRUE 0.926 11.000 0.023 1.000   NA
 6109432 6109433 BGAFAR04_0820 BGAFAR04_0821 cvpA murG TRUE 0.860 -3.000 0.026 1.000   NA
 6109433 6109434 BGAFAR04_0821 BGAFAR04_0822 murG   FALSE 0.138 150.000 0.016 1.000 N NA
 6109434 6109435 BGAFAR04_0822 BGAFAR04_0823     TRUE 0.851 0.000 0.009 1.000 N NA
 6109435 6109436 BGAFAR04_0823 BGAFAR04_0824     TRUE 0.842 -3.000 0.013 1.000   NA
 6109436 6109437 BGAFAR04_0824 BGAFAR04_0825     TRUE 0.578 51.000 0.038 1.000   NA
 6109437 6109438 BGAFAR04_0825 BGAFAR04_0826     FALSE 0.038 261.000 0.000 NA   NA
 6109438 6109439 BGAFAR04_0826 BGAFAR04_0827   flgI FALSE 0.438 -10.000 0.000 NA   NA
 6109441 6109442 BGAFAR04_0829 BGAFAR04_0830   flgG FALSE 0.289 71.000 0.066 NA   NA
 6109442 6109443 BGAFAR04_0830 BGAFAR04_0831 flgG   TRUE 0.993 13.000 0.180 0.012 Y NA
 6109444 6109445 BGAFAR04_0832 BGAFAR04_0833   apt FALSE 0.267 63.000 0.011 NA   NA
 6109445 6109446 BGAFAR04_0833 BGAFAR04_0834 apt rplU FALSE 0.422 58.000 0.009 1.000 N NA
 6109446 6109447 BGAFAR04_0834 BGAFAR04_0835 rplU   TRUE 0.977 6.000 0.208 NA Y NA
 6109447 6109448 BGAFAR04_0835 BGAFAR04_0836   rpmA TRUE 0.875 -13.000 0.203 NA Y NA
 6109448 6109449 BGAFAR04_0836 BGAFAR04_0837 rpmA   TRUE 0.693 44.000 0.335 1.000   NA
 6109449 6109450 BGAFAR04_0837 BGAFAR04_0838   nadD FALSE 0.341 87.000 0.045 1.000   NA
 6109450 6109451 BGAFAR04_0838 BGAFAR04_0839 nadD   FALSE 0.357 -15.000 0.010 NA N NA
 6109451 6109452 BGAFAR04_0839 BGAFAR04_0840     FALSE 0.324 -25.000 0.013 NA   NA
 6109452 6109453 BGAFAR04_0840 BGAFAR04_0841     FALSE 0.104 104.000 0.009 NA   NA
 6109454 6109455 BGAFAR04_0311 BGAFAR04_0312 hslU   TRUE 0.940 -7.000 0.013 1.000 Y NA
 6109455 6109456 BGAFAR04_0312 BGAFAR04_0313     TRUE 0.895 9.000 0.004 1.000 N NA
 6109456 6109457 BGAFAR04_0313 BGAFAR04_0314     TRUE 0.899 10.000 0.000 1.000   NA
 6109457 6109458 BGAFAR04_0314 BGAFAR04_0315   ftsZ TRUE 0.866 1.000 0.000 1.000   NA
 6109458 6109459 BGAFAR04_0315 BGAFAR04_0316 ftsZ ftsA TRUE 0.971 22.000 0.460 1.000 Y NA
 6109459 6109460 BGAFAR04_0316 BGAFAR04_0317 ftsA   TRUE 0.831 0.000 0.389 NA N NA
 6109460 6109461 BGAFAR04_0317 BGAFAR04_0318   ftsW FALSE 0.456 36.000 0.015 NA N NA
 6109461 6109462 BGAFAR04_0318 BGAFAR04_0319 ftsW mraY TRUE 0.820 42.000 0.018 0.013 N NA
 6109462 6109463 BGAFAR04_0319 BGAFAR04_0320 mraY   TRUE 0.988 18.000 0.018 0.013 Y NA
 6109463 6109464 BGAFAR04_0320 BGAFAR04_0321     TRUE 0.756 23.000 0.108 NA   NA
 6109464 6109465 BGAFAR04_0321 BGAFAR04_0322   mraW TRUE 0.696 -3.000 0.009 NA   NA
 6109465 6109466 BGAFAR04_0322 BGAFAR04_0323 mraW   TRUE 0.588 -7.000 0.009 NA   NA
 6109466 6109467 BGAFAR04_0323 BGAFAR04_0324     FALSE 0.191 66.000 0.000 NA   NA
 6109467 6109468 BGAFAR04_0324 BGAFAR04_0325     TRUE 0.850 -3.000 0.900 NA   NA
 6109468 6109469 BGAFAR04_0325 BGAFAR04_0326     TRUE 0.741 29.000 0.800 NA   NA
 6109469 6109470 BGAFAR04_0326 BGAFAR04_0327     FALSE 0.035 316.000 0.000 NA   NA
 6109470 6109471 BGAFAR04_0327 BGAFAR04_0328     TRUE 0.738 -10.000 0.191 1.000 N NA
 6109471 6109472 BGAFAR04_0328 BGAFAR04_0329   rrmJ FALSE 0.445 46.000 0.188 NA N NA
 6109473 6109474 BGAFAR04_0330 BGAFAR04_0331     TRUE 0.917 0.000 0.333 1.000   NA
 6109475 6109476 BGAFAR04_0332 BGAFAR04_0333     TRUE 0.880 1.000 0.529 NA   NA
 6109476 6109477 BGAFAR04_0333 BGAFAR04_0334     TRUE 0.888 -3.000 0.321 1.000   NA
 6109477 6109478 BGAFAR04_0334 BGAFAR04_0335     TRUE 0.914 0.000 0.281 1.000   NA
 6109478 6109479 BGAFAR04_0335 BGAFAR04_0336     FALSE 0.032 418.000 0.000 NA   NA
 6109480 6109481 BGAFAR04_0337 BGAFAR04_0338     FALSE 0.432 35.000 0.000 NA   NA
 6109481 6109482 BGAFAR04_0338 BGAFAR04_0339     TRUE 0.743 2.000 0.000 NA   NA
 6109483 6109484 BGAFAR04_0340 BGAFAR04_0341     FALSE 0.519 51.000 0.643 NA   NA
 6109484 6109485 BGAFAR04_0341 BGAFAR04_0342     TRUE 0.784 24.000 0.500 NA   NA
 6109485 6109486 BGAFAR04_0342 BGAFAR04_0343     FALSE 0.070 115.000 0.000 NA   NA
 6109487 6109488 BGAFAR04_0344 BGAFAR04_0345     TRUE 0.825 99.000 0.667 0.031 Y NA
 6109488 6109489 BGAFAR04_0345 BGAFAR04_0346     TRUE 0.750 133.000 0.667 0.031 Y NA
 6109489 6109490 BGAFAR04_0346 BGAFAR04_0347     FALSE 0.480 338.000 0.000 0.031 Y NA
 6109490 6109491 BGAFAR04_0347 BGAFAR04_0348     TRUE 0.970 13.000 0.096 0.031   NA
 6109492 6109493 BGAFAR04_0857 BGAFAR04_0858     TRUE 0.648 35.000 0.000 1.000   NA
 6109493 6109494 BGAFAR04_0858 BGAFAR04_0859     FALSE 0.115 101.000 0.010 NA   NA
 6109494 6109495 BGAFAR04_0859 BGAFAR04_0860     TRUE 0.907 14.000 0.759 NA   NA
 6109495 6109496 BGAFAR04_0860 BGAFAR04_0861     TRUE 0.926 3.000 0.342 1.000 N NA
 6109496 6109497 BGAFAR04_0861 BGAFAR04_0862   rbfA TRUE 0.966 24.000 0.530 1.000 Y NA
 6109497 6109498 BGAFAR04_0862 BGAFAR04_0863 rbfA truB TRUE 0.983 3.000 0.111 1.000 Y NA
 6109498 6109499 BGAFAR04_0863 BGAFAR04_0864 truB rpsO FALSE 0.431 173.000 0.013 1.000 Y NA
 6109499 6109500 BGAFAR04_0864 BGAFAR04_0865 rpsO   TRUE 0.983 15.000 0.335 1.000 Y NA
 6109500 6109501 BGAFAR04_0865 BGAFAR04_0866     TRUE 0.836 8.000 0.010 NA   NA
 6109501 6109502 BGAFAR04_0866 BGAFAR04_0867     FALSE 0.153 92.000 0.016 NA   NA
 6109502 6109503 BGAFAR04_0867 BGAFAR04_0868     TRUE 0.953 -3.000 0.631 0.043   NA
 6109503 6109504 BGAFAR04_0868 BGAFAR04_0869   tgt TRUE 0.761 30.000 0.028 1.000   NA
 6109504 6109505 BGAFAR04_0869 BGAFAR04_0870 tgt mviN TRUE 0.789 -7.000 0.024 1.000   NA
 6109505 6109506 BGAFAR04_0870 BGAFAR04_0871 mviN   TRUE 0.850 -3.000 0.018 1.000   NA
 6109507 6109508 BGAFAR04_0872 BGAFAR04_0873 coaBC   FALSE 0.058 141.000 0.000 NA   NA
 6109509 6109510 BGAFAR04_0874 BGAFAR04_0875 panF   TRUE 0.741 -21.000 0.000 0.031   NA
 6109510 6109511 BGAFAR04_0875 BGAFAR04_0876     TRUE 0.669 -9.000 0.005 1.000 N NA
 6109511 6109512 BGAFAR04_0876 BGAFAR04_0877     FALSE 0.188 86.000 0.021 NA   NA
 6109512 6109513 BGAFAR04_0877 BGAFAR04_0878   murC FALSE 0.514 -10.000 0.010 NA   NA
 6109513 6109514 BGAFAR04_0878 BGAFAR04_0879 murC   TRUE 0.850 11.000 0.018 NA   NA
 6109514 6109515 BGAFAR04_0879 BGAFAR04_0880     TRUE 0.682 -3.000 0.005 NA   NA
 6109515 6109516 BGAFAR04_0880 BGAFAR04_0881   rpoZ FALSE 0.471 49.000 0.004 1.000 N NA
 6109516 6109517 BGAFAR04_0881 BGAFAR04_0882 rpoZ miaA TRUE 0.623 -13.000 0.018 1.000 N NA
 6109520 6109521 BGAFAR04_0884 BGAFAR04_0886     TRUE 0.753 -7.000 0.600 NA   NA
 6109521 6109522 BGAFAR04_0886 BGAFAR04_0887     FALSE 0.060 234.000 0.015 NA   NA
 6109522 6109523 BGAFAR04_0887 BGAFAR04_0888   topA TRUE 0.978 3.000 0.010 1.000 Y NA
 6109526 6109527 BGAFAR04_0713 BGAFAR04_0712     TRUE 0.742 22.000 0.026 NA   NA
 6109527 6109528 BGAFAR04_0712 BGAFAR04_0711     TRUE 0.918 10.000 0.727 NA   NA
 6109529 6109530 BGAFAR04_0710 BGAFAR04_0709 era lysS FALSE 0.419 73.000 0.038 1.000   NA
 6109535 6109536 BGAFAR04_0705 BGAFAR04_0703   secF TRUE 0.737 26.000 0.450 NA   NA
 6109536 6109537 BGAFAR04_0703 BGAFAR04_0702 secF secD TRUE 0.968 -16.000 0.244 0.002 Y NA
 6109537 6109538 BGAFAR04_0702 BGAFAR04_0701 secD yajC TRUE 0.651 78.000 0.068 NA Y NA
 6109538 6109539 BGAFAR04_0701 BGAFAR04_0700 yajC   TRUE 0.607 -7.000 0.013 NA   NA
 6109539 6109540 BGAFAR04_0700 BGAFAR04_0699   groL FALSE 0.357 68.000 0.423 NA   NA
 6109541 6109542 BGAFAR04_0698 BGAFAR04_0697     FALSE 0.174 102.000 0.257 NA   NA
 6109542 6109543 BGAFAR04_0697 BGAFAR04_0696     TRUE 0.753 -3.000 0.184 NA N NA
 6109544 6109545 BGAFAR04_0695 BGAFAR04_0694     TRUE 0.887 48.000 0.246 1.000 Y NA
 6109546 6109547 BGAFAR04_0693 BGAFAR04_0692   potA FALSE 0.367 78.000 0.021 1.000   NA
 6109547 6109548 BGAFAR04_0692 BGAFAR04_0691 potA   TRUE 0.995 6.000 0.928 0.030 Y NA
 6109548 6109549 BGAFAR04_0691 BGAFAR04_0690     TRUE 0.993 4.000 0.492 0.030 Y NA
 6109549 6109550 BGAFAR04_0690 BGAFAR04_0689     TRUE 0.988 19.000 0.131 0.030 Y NA
 6109551 6109552 BGAFAR04_0688 BGAFAR04_0687     TRUE 0.582 100.000 0.667 NA Y NA
 6109552 6109553 BGAFAR04_0687 BGAFAR04_0686     FALSE 0.158 75.000 0.000 NA   NA
 6109553 6109554 BGAFAR04_0686 BGAFAR04_0685   zwf FALSE 0.218 60.000 0.000 NA   NA
 6109561 6109562 BGAFAR04_0665 BGAFAR04_0666     TRUE 0.783 11.000 0.000 NA   NA
 6109563 6109564 BGAFAR04_0667 BGAFAR04_0668 ackA mfd TRUE 0.744 25.000 0.009 1.000 N NA
 6109565 6109566 BGAFAR04_0669 BGAFAR04_0670     FALSE 0.388 -40.000 0.180 NA   NA
 6109566 6109567 BGAFAR04_0670 BGAFAR04_0672     FALSE 0.355 42.000 0.000 NA   NA
 6109568 6109569 BGAFAR04_0671 BGAFAR04_0673     TRUE 0.906 3.000 0.033 1.000 N NA
 6109571 6109572 BGAFAR04_0675 BGAFAR04_0676     TRUE 0.807 41.000 0.000 0.017   NA
 6109574 6109575 BGAFAR04_0678 BGAFAR04_0679     FALSE 0.056 150.000 0.000 NA   NA
 6109575 6109576 BGAFAR04_0679 BGAFAR04_0680   recD FALSE 0.416 37.000 0.000 NA   NA
 6109576 6109577 BGAFAR04_0680 BGAFAR04_0681 recD recB TRUE 0.991 -3.000 0.688 0.003 Y NA
 6109577 6109578 BGAFAR04_0681 BGAFAR04_0682 recB   TRUE 0.996 6.000 0.542 0.003 Y NA
 6109578 6109579 BGAFAR04_0682 BGAFAR04_0683     TRUE 0.920 4.000 0.023 1.000   NA
 6109582 6109583 BGAFAR04_0280 BGAFAR04_0281     FALSE 0.481 -22.000 0.225 NA   NA
 6109583 6109584 BGAFAR04_0281 BGAFAR04_0282     TRUE 0.868 20.000 1.000 NA   NA
 6109584 6109585 BGAFAR04_0282 BGAFAR04_0283     TRUE 0.717 27.000 0.391 NA   NA
 6109585 6109586 BGAFAR04_0283 BGAFAR04_0284     TRUE 0.887 3.000 0.348 NA   NA
 6109586 6109587 BGAFAR04_0284 BGAFAR04_0285     FALSE 0.361 58.000 0.047 NA   NA
 6109587 6109588 BGAFAR04_0285 BGAFAR04_0286     TRUE 0.964 12.000 0.382 0.089 N NA
 6109588 6109589 BGAFAR04_0286 BGAFAR04_0287   flhA TRUE 0.986 5.000 0.440 1.000 Y NA
 6109589 6109590 BGAFAR04_0287 BGAFAR04_0288 flhA flhB TRUE 0.994 12.000 0.207 0.008 Y NA
 6109590 6109591 BGAFAR04_0288 BGAFAR04_0289 flhB fliR TRUE 0.978 0.000 0.259 1.000 Y NA
 6109591 6109592 BGAFAR04_0289 BGAFAR04_0290 fliR fliQ TRUE 0.993 15.000 0.181 0.005 Y NA
 6109592 6109593 BGAFAR04_0290 BGAFAR04_0291 fliQ fliP TRUE 0.994 9.000 0.101 0.008 Y NA
 6109593 6109594 BGAFAR04_0291 BGAFAR04_0292 fliP   TRUE 0.866 11.000 0.032 NA   NA
 6109594 6109595 BGAFAR04_0292 BGAFAR04_0293     TRUE 0.668 -7.000 0.042 NA   NA
 6109595 6109596 BGAFAR04_0293 BGAFAR04_0294   fliM TRUE 0.966 46.000 0.508 0.003 Y NA
 6109596 6109597 BGAFAR04_0294 BGAFAR04_0295 fliM fliL TRUE 0.984 25.000 0.067 0.003 Y NA
 6109597 6109598 BGAFAR04_0295 BGAFAR04_0296 fliL   TRUE 0.900 48.000 0.615 1.000 Y NA
 6109598 6109599 BGAFAR04_0296 BGAFAR04_0297     TRUE 0.979 0.000 0.383 1.000 Y NA
 6109599 6109600 BGAFAR04_0297 BGAFAR04_0298     TRUE 0.955 -3.000 0.301 NA Y NA
 6109600 6109601 BGAFAR04_0298 BGAFAR04_0299     TRUE 0.957 22.000 0.545 NA Y NA
 6109601 6109602 BGAFAR04_0299 BGAFAR04_0300   flgD TRUE 0.977 5.000 0.298 NA Y NA
 6109602 6109603 BGAFAR04_0300 BGAFAR04_0301 flgD   TRUE 0.859 14.000 0.053 NA   NA
 6109603 6109604 BGAFAR04_0301 BGAFAR04_0302     TRUE 0.926 8.000 1.000 NA   NA
 6109604 6109605 BGAFAR04_0302 BGAFAR04_0303     TRUE 0.784 -7.000 1.000 NA   NA
 6109605 6109606 BGAFAR04_0303 BGAFAR04_0304   fliI TRUE 0.820 -3.000 0.474 NA   NA
 6109606 6109607 BGAFAR04_0304 BGAFAR04_0305 fliI   TRUE 0.974 19.000 0.124 1.000 Y NA
 6109607 6109608 BGAFAR04_0305 BGAFAR04_0306   fliG TRUE 0.983 15.000 0.308 1.000 Y NA
 6109608 6109609 BGAFAR04_0306 BGAFAR04_0307 fliG fliF TRUE 0.992 16.000 0.477 0.015 Y NA
 6109609 6109610 BGAFAR04_0307 BGAFAR04_0308 fliF fliE TRUE 0.992 15.000 0.164 0.015 Y NA
 6109610 6109611 BGAFAR04_0308 BGAFAR04_0309 fliE flgC TRUE 0.993 15.000 0.156 0.008 Y NA
 6109611 6109612 BGAFAR04_0309 BGAFAR04_0310 flgC   TRUE 0.969 24.000 0.804 1.000 Y NA
 6109614 6109615 BGAFAR04_0890 BGAFAR04_0891     TRUE 0.633 -3.000 0.000 NA   NA
 6109615 6109616 BGAFAR04_0891 BGAFAR04_0892     FALSE 0.375 -13.000 0.000 NA   NA
 6109616 6109617 BGAFAR04_0892 BGAFAR04_0893     TRUE 0.779 12.000 0.000 NA   NA
 6109617 6109618 BGAFAR04_0893 BGAFAR04_0894     FALSE 0.445 34.000 0.000 NA   NA
 6109619 6109620 BGAFAR04_0895 BGAFAR04_0896   ileS TRUE 0.564 -6.000 0.000 NA   NA
 6109620 6109621 BGAFAR04_0896 BGAFAR04_0897 ileS ileS FALSE 0.040 248.000 0.000 NA   NA
 6109621 6109622 BGAFAR04_0897 BGAFAR04_0898 ileS   TRUE 0.886 15.000 0.016 1.000 N NA
 6109622 6109623 BGAFAR04_0898 BGAFAR04_0899     TRUE 0.848 23.000 0.231 1.000 N NA
 6109624 6109625 BGAFAR04_0900 BGAFAR04_0901 uvrB uvrA TRUE 0.993 17.000 0.154 0.003 Y NA
 6109625 6109626 BGAFAR04_0901 BGAFAR04_0902 uvrA   FALSE 0.242 -45.000 0.017 NA N NA
 6109627 6109628 BGAFAR04_0903 BGAFAR04_0904     FALSE 0.496 -22.000 0.308 NA   NA
 6109628 6109629 BGAFAR04_0904 BGAFAR04_0905     TRUE 0.905 10.000 0.462 NA   NA
 6109630 6109631 BGAFAR04_0906 BGAFAR04_0907 arcA argF TRUE 0.845 56.000 0.067 1.000 Y NA
 6109632 6109633 BGAFAR04_0176 BGAFAR04_0177     FALSE 0.465 60.000 0.778 NA   NA
 6109635 6109636 BGAFAR04_0179 BGAFAR04_0180     TRUE 0.582 -13.000 0.257 NA   NA
 6109636 6109637 BGAFAR04_0180 BGAFAR04_0181     TRUE 0.880 7.000 0.068 NA   NA
 6109637 6109638 BGAFAR04_0181 BGAFAR04_0182     TRUE 0.900 15.000 0.764 NA   NA
 6109638 6109639 BGAFAR04_0182 BGAFAR04_0183   gidB FALSE 0.477 57.000 0.009 1.000   NA
 6109639 6109640 BGAFAR04_0183 BGAFAR04_0184 gidB gidA TRUE 0.878 -3.000 0.466 1.000 N NA
 6109640 6109641 BGAFAR04_0184 BGAFAR04_0185 gidA   TRUE 0.936 -3.000 0.000 0.009   NA
 6109641 6109642 BGAFAR04_0185 BGAFAR04_0186   trmE TRUE 0.885 3.000 0.000 1.000   NA
 6109643 6109644 BGAFAR04_0187 BGAFAR04_0188   flgK TRUE 0.896 12.000 0.321 NA   NA
 6109644 6109645 BGAFAR04_0188 BGAFAR04_0189 flgK flgL TRUE 0.994 3.000 0.186 0.003 Y NA
 6109645 6109646 BGAFAR04_0189 BGAFAR04_0190 flgL   TRUE 0.879 2.000 0.385 NA   NA
 6109646 6109647 BGAFAR04_0190 BGAFAR04_0192   csrA TRUE 0.862 3.000 0.064 NA   NA
 6109648 6109649 BGAFAR04_0191 BGAFAR04_0193     TRUE 0.706 -7.000 0.217 NA   NA
 6109649 6109650 BGAFAR04_0193 BGAFAR04_0194     FALSE 0.314 59.000 0.019 NA   NA
 6109650 6109651 BGAFAR04_0194 BGAFAR04_0195   rplT FALSE 0.053 214.000 0.002 NA   NA
 6109651 6109652 BGAFAR04_0195 BGAFAR04_0196 rplT rpmI TRUE 0.989 21.000 0.928 0.043 Y NA
 6109652 6109653 BGAFAR04_0196 BGAFAR04_0197 rpmI infC TRUE 0.971 23.000 0.652 1.000 Y NA
 6109654 6109655 BGAFAR04_0198 BGAFAR04_0199     TRUE 0.907 2.000 1.000 NA   NA
 6109656 6109657 BGAFAR04_0200 BGAFAR04_0201     TRUE 0.562 27.000 0.008 NA   NA
 6109657 6109658 BGAFAR04_0201 BGAFAR04_0202     TRUE 0.653 -3.000 0.012 NA N NA
 6109659 6109660 BGAFAR04_0203 BGAFAR04_0204 prfA   TRUE 0.982 3.000 0.081 1.000 Y NA
 6109660 6109661 BGAFAR04_0204 BGAFAR04_0205     TRUE 0.843 -3.000 0.035 1.000 N NA
 6109661 6109662 BGAFAR04_0205 BGAFAR04_0206     FALSE 0.075 386.000 0.333 NA   NA
 6109663 6109664 BGAFAR04_0225 BGAFAR04_0227     TRUE 0.691 35.000 0.009 1.000   NA
 6109664 6109665 BGAFAR04_0227 BGAFAR04_0228     TRUE 0.875 0.000 0.009 1.000   NA
 6109665 6109666 BGAFAR04_0228 BGAFAR04_0229     TRUE 0.647 -13.000 0.032 1.000 N NA
 6109666 6109667 BGAFAR04_0229 BGAFAR04_0230     TRUE 0.646 21.000 0.000 NA   NA
 6109667 6109668 BGAFAR04_0230 BGAFAR04_0231     TRUE 0.743 2.000 0.000 NA   NA
 6109668 6109669 BGAFAR04_0231 BGAFAR04_0232     FALSE 0.221 79.000 0.026 NA   NA
 6109672 6109673 BGAFAR04_0235 BGAFAR04_0236     TRUE 0.725 16.000 0.000 NA   NA
 6109674 6109675 BGAFAR04_0237 BGAFAR04_0238 rpmE rho FALSE 0.465 61.000 0.049 1.000 N NA
 6109675 6109676 BGAFAR04_0238 BGAFAR04_0239 rho   FALSE 0.285 80.000 0.010 1.000 N NA
 6109676 6109677 BGAFAR04_0239 BGAFAR04_0240   hup TRUE 0.918 1.000 0.476 1.000 N NA
 6109677 6109678 BGAFAR04_0240 BGAFAR04_0241 hup rpsT TRUE 0.898 13.000 0.015 1.000 N NA
 6109678 6109679 BGAFAR04_0241 BGAFAR04_0242 rpsT   FALSE 0.217 71.000 0.009 NA   NA
 6109679 6109680 BGAFAR04_0242 BGAFAR04_0243   ychF FALSE 0.305 54.000 0.009 NA   NA
 6109680 6109681 BGAFAR04_0243 BGAFAR04_0244 ychF   TRUE 0.716 30.000 0.007 1.000   NA
 6109683 6109684 BGAFAR04_0246 BGAFAR04_0247     FALSE 0.536 48.000 0.571 NA   NA
 6109685 6109686 BGAFAR04_0248 BGAFAR04_0249   glpK TRUE 0.662 40.000 0.044 1.000 N NA
 6109686 6109687 BGAFAR04_0249 BGAFAR04_0250 glpK   FALSE 0.245 55.000 0.000 NA   NA
 6109687 6109688 BGAFAR04_0250 BGAFAR04_0251     FALSE 0.166 72.000 0.000 NA   NA
 6109690 6109691 BGAFAR04_0260 BGAFAR04_0261     TRUE 0.661 20.000 0.000 NA   NA
 6109691 6109692 BGAFAR04_0261 BGAFAR04_0262   leuS FALSE 0.113 89.000 0.000 NA   NA
 6109692 6109693 BGAFAR04_0262 BGAFAR04_0263 leuS leuS TRUE 0.800 -33.000 0.021 0.002   NA
 6109693 6109694 BGAFAR04_0263 BGAFAR04_0265 leuS   TRUE 0.875 15.000 0.000 1.000   NA
 6109696 6109697 BGAFAR04_0266 BGAFAR04_0267     FALSE 0.321 45.000 0.000 NA   NA
 6109697 6109698 BGAFAR04_0267 BGAFAR04_0268   recJ FALSE 0.061 131.000 0.000 NA   NA
 6109698 6109699 BGAFAR04_0268 BGAFAR04_0269 recJ   TRUE 0.748 -7.000 0.018 1.000 N NA
 6109699 6109700 BGAFAR04_0269 BGAFAR04_0270   rpsU TRUE 0.918 15.000 0.059 1.000   NA
 6109701 6109702 BGAFAR04_0271 BGAFAR04_0272     FALSE 0.109 259.000 0.029 1.000 N NA
 6109702 6109703 BGAFAR04_0272 BGAFAR04_0273     TRUE 0.833 15.000 0.026 NA   NA
 6109703 6109704 BGAFAR04_0273 BGAFAR04_0274     TRUE 0.784 -7.000 1.000 NA   NA
 6109706 6109707 BGAFAR04_0207 BGAFAR04_0208     TRUE 0.991 2.000 0.033 0.012 Y NA
 6109708 6109709 BGAFAR04_0209 BGAFAR04_0210     FALSE 0.132 82.000 0.000 NA   NA
 6109709 6109710 BGAFAR04_0210 BGAFAR04_0211   hflK FALSE 0.113 300.000 0.022 1.000   NA
 6109710 6109711 BGAFAR04_0211 BGAFAR04_0212 hflK hflC TRUE 0.994 1.000 0.947 0.011 Y NA
 6109711 6109712 BGAFAR04_0212 BGAFAR04_0213 hflC   FALSE 0.035 307.000 0.000 NA   NA
 6109712 6109713 BGAFAR04_0213 BGAFAR04_0214     TRUE 0.712 17.000 0.000 NA   NA
 6109713 6109714 BGAFAR04_0214 BGAFAR04_0216     FALSE 0.543 25.000 0.000 NA   NA
 6109716 6109717 BGAFAR04_0217 BGAFAR04_0218 galU   TRUE 0.637 -13.000 0.643 NA   NA
 6109717 6109718 BGAFAR04_0218 BGAFAR04_0219     TRUE 0.749 27.000 0.667 NA   NA
 6109718 6109719 BGAFAR04_0219 BGAFAR04_0220     TRUE 0.881 -7.000 0.000 0.026   NA
 6109719 6109720 BGAFAR04_0220 BGAFAR04_0221     TRUE 0.879 7.000 0.000 1.000 N NA
 6109720 6109721 BGAFAR04_0221 BGAFAR04_0222     TRUE 0.745 19.000 0.011 NA   NA
 6109723 6109724 BGAFAR04_0165 BGAFAR04_0163 alr   FALSE 0.328 66.000 0.113 NA   NA
 6109724 6109725 BGAFAR04_0163 BGAFAR04_0162     TRUE 0.819 24.000 1.000 NA   NA
 6109725 6109726 BGAFAR04_0162 BGAFAR04_0161     FALSE 0.158 145.000 0.750 NA   NA
 6109726 6109727 BGAFAR04_0161 BGAFAR04_0160     TRUE 0.917 4.000 0.889 NA   NA
 6109727 6109728 BGAFAR04_0160 BGAFAR04_0159     TRUE 0.700 32.000 0.529 NA   NA
 6109729 6109730 BGAFAR04_0158 BGAFAR04_0157 secA   TRUE 0.902 15.000 0.046 1.000 N NA
 6109731 6109732 BGAFAR04_0156 BGAFAR04_0155 nagB nagA TRUE 0.985 27.000 0.500 0.002 Y NA
 6109733 6109734 BGAFAR04_0154 BGAFAR04_0153     FALSE 0.532 127.000 0.049 1.000 Y NA
 6109734 6109735 BGAFAR04_0153 BGAFAR04_0152     FALSE 0.219 152.000 0.750 1.000 N NA
 6109735 6109736 BGAFAR04_0152 BGAFAR04_0151     TRUE 0.978 7.000 0.000 1.000 Y NA
 6109736 6109737 BGAFAR04_0151 BGAFAR04_0150     TRUE 0.987 15.000 0.000 0.028 Y NA
 6109738 6109739 BGAFAR04_0149 BGAFAR04_0148     TRUE 0.940 12.000 0.273 1.000   NA
 6109739 6109740 BGAFAR04_0148 BGAFAR04_0147     TRUE 0.913 19.000 0.000 0.084   NA
 6109740 6109741 BGAFAR04_0147 BGAFAR04_0146     TRUE 0.743 2.000 0.000 NA   NA
 6109741 6109742 BGAFAR04_0146 BGAFAR04_0145     FALSE 0.033 343.000 0.000 NA   NA
 6109747 6109748 BGAFAR04_0168 BGAFAR04_0169     FALSE 0.224 -42.000 0.000 NA   NA
 6109748 6109749 BGAFAR04_0169 BGAFAR04_0170     FALSE 0.244 81.000 0.133 NA   NA
 6109749 6109750 BGAFAR04_0170 BGAFAR04_0171     TRUE 0.780 28.000 0.047 1.000   NA
 6109750 6109751 BGAFAR04_0171 BGAFAR04_0172     FALSE 0.458 111.000 0.000 0.002   NA
 6109752 6109753 BGAFAR04_0846 BGAFAR04_0847 hflB   TRUE 0.845 12.000 0.017 NA   NA
 6109753 6109754 BGAFAR04_0847 BGAFAR04_0849     FALSE 0.105 108.000 0.012 NA   NA
 6109755 6109756 BGAFAR04_0848 BGAFAR04_0850   tmk TRUE 0.813 14.000 0.010 NA   NA
 6109758 6109759 BGAFAR04_0856 BGAFAR04_0855     FALSE 0.107 190.000 0.000 1.000   NA
 6109759 6109760 BGAFAR04_0855 BGAFAR04_0854     TRUE 0.967 22.000 0.123 1.000 Y NA
 6109760 6109761 BGAFAR04_0854 BGAFAR04_0853     TRUE 0.795 18.000 0.025 NA   NA
 6109765 6109766 BGAFAR04_0353 BGAFAR04_0354 eno eno TRUE 0.980 8.000 0.017 0.002   NA
 6109768 6109769 BGAFAR04_0845 BGAFAR04_0844   tilS TRUE 0.922 15.000 0.145 1.000   NA
 6109769 6109770 BGAFAR04_0844 BGAFAR04_0843 tilS pth TRUE 0.941 0.000 0.025 0.065 N NA
 6109770 6109771 BGAFAR04_0843 BGAFAR04_0842 pth   TRUE 0.973 5.000 0.496 0.065   NA
 6109772 6109773 BGAFAR04_0226 BGAFAR04_0224     TRUE 0.978 1.000 0.428 0.003   NA
 6109773 6109774 BGAFAR04_0224 BGAFAR04_0223   pstC TRUE 0.990 -3.000 0.219 0.003 Y NA
 6109778 6109779 BGAFAR04_0252 BGAFAR04_0253     FALSE 0.541 -13.000 0.062 NA   NA
 6109779 6109780 BGAFAR04_0253 BGAFAR04_0254     TRUE 0.882 1.000 0.562 NA   NA
 6109784 6109785 BGAFAR04_0258 BGAFAR04_0257   pepF TRUE 0.759 14.000 0.000 NA   NA
 6109785 6109786 BGAFAR04_0257 BGAFAR04_0256 pepF   FALSE 0.178 120.000 0.010 1.000   NA
 6109787 6109788 BGAFAR04_0003 BGAFAR04_0002     FALSE 0.408 -12.000 0.000 NA   NA
 6109791 6109792 BGAFAR04_0007 BGAFAR04_0008 trpS   TRUE 0.863 3.000 0.066 NA   NA
 6109796 6109797 BGAFAR04_0350 BGAFAR04_0349     TRUE 0.916 1.000 0.138 1.000   NA
 5766569 5766570 BGAFAR04_K0001 BGAFAR04_K0002     FALSE 0.080 105.000 0.000 NA   NA
 5766571 5766572 BGAFAR04_K0003 BGAFAR04_K0004     TRUE 0.633 -3.000 0.000 NA   NA
 5766573 5766574 BGAFAR04_K0005 BGAFAR04_K0006     TRUE 0.777 5.000 0.000 NA   NA
 5766576 5766577 BGAFAR04_K0008 BGAFAR04_K0009     FALSE 0.037 279.000 0.000 NA   NA
 5766577 5766578 BGAFAR04_K0009 BGAFAR04_K0010     FALSE 0.031 530.000 0.000 NA   NA
 5766579 5766580 BGAFAR04_K0011 BGAFAR04_K0012     FALSE 0.040 243.000 0.000 NA   NA
 5766581 5766582 BGAFAR04_K0013 BGAFAR04_K0014     TRUE 0.787 9.000 0.000 NA   NA
 5766586 5766587 BGAFAR04_K0018 BGAFAR04_K0019     FALSE 0.036 300.000 0.000 NA   NA
 5766589 5766590 BGAFAR04_K0021 BGAFAR04_K0022     FALSE 0.099 96.000 0.000 NA   NA
 5766591 5766592 BGAFAR04_K0023 BGAFAR04_K0024     FALSE 0.222 97.000 0.500 NA   NA
 5766592 5766593 BGAFAR04_K0024 BGAFAR04_K0025     FALSE 0.042 228.000 0.000 NA   NA
 5766593 5766594 BGAFAR04_K0025 BGAFAR04_K0026     TRUE 0.727 1.000 0.000 NA   NA
 5766594 5766595 BGAFAR04_K0026 BGAFAR04_K0027     FALSE 0.241 -27.000 0.000 NA   NA
 5766595 5766596 BGAFAR04_K0027 BGAFAR04_K0028     TRUE 0.770 13.000 0.000 NA   NA
 5766596 5766597 BGAFAR04_K0028 BGAFAR04_K0029     FALSE 0.518 -7.000 0.000 NA   NA
 5766598 5766599 BGAFAR04_K0030 BGAFAR04_K0031     FALSE 0.069 117.000 0.000 NA   NA
 5766600 5766601 BGAFAR04_K0032 BGAFAR04_K0033     FALSE 0.031 465.000 0.000 NA   NA
 5766604 5766605 BGAFAR04_K0036 BGAFAR04_K0037     FALSE 0.029 960.000 0.000 NA   NA
 5766606 5766607 BGAFAR04_K0038 BGAFAR04_K0039     FALSE 0.031 496.000 0.000 NA   NA
 5766608 5766609 BGAFAR04_K0040 BGAFAR04_K0041     FALSE 0.072 112.000 0.000 NA   NA
 5766609 5766610 BGAFAR04_K0041 BGAFAR04_K0042     FALSE 0.518 -7.000 0.000 NA   NA
 5766610 5766611 BGAFAR04_K0042 BGAFAR04_K0043     FALSE 0.496 -24.000 0.500 NA   NA
 5766613 5766614 BGAFAR04_K0045 BGAFAR04_K0046     TRUE 0.857 17.000 0.000 1.000   NA
 5766614 5766615 BGAFAR04_K0046 BGAFAR04_K0047     FALSE 0.340 43.000 0.000 NA   NA
 5766615 5766616 BGAFAR04_K0047 BGAFAR04_K0048     TRUE 0.675 19.000 0.000 NA   NA
 5766616 5766617 BGAFAR04_K0048 BGAFAR04_K0049     FALSE 0.230 58.000 0.000 NA   NA
 5766617 5766618 BGAFAR04_K0049 BGAFAR04_K0050     FALSE 0.029 1490.000 0.000 NA   NA
 5766620 5766621 BGAFAR04_K0052 BGAFAR04_K0053     FALSE 0.032 437.000 0.000 NA   NA
 5766621 5766622 BGAFAR04_K0053 BGAFAR04_K0054     TRUE 0.675 19.000 0.000 NA   NA
 5766623 5766624 BGAFAR04_Ab0001 BGAFAR04_Ab0002     FALSE 0.037 282.000 0.000 NA   NA
 5766626 5766627 BGAFAR04_Ab0004 BGAFAR04_Ab0005     FALSE 0.030 825.000 0.000 NA   NA
 5766627 5766628 BGAFAR04_Ab0005 BGAFAR04_Ab0006     FALSE 0.245 55.000 0.000 NA   NA
 5766628 5766629 BGAFAR04_Ab0006 BGAFAR04_Ab0007     FALSE 0.031 537.000 0.000 NA   NA
 5766629 5766630 BGAFAR04_Ab0007 BGAFAR04_Ab0008     FALSE 0.031 461.000 0.000 NA   NA
 5766630 5766631 BGAFAR04_Ab0008 BGAFAR04_Ab0009     FALSE 0.520 26.000 0.000 NA   NA
 5766631 5766632 BGAFAR04_Ab0009 BGAFAR04_Ab0010     FALSE 0.340 43.000 0.000 NA   NA
 5766632 5766633 BGAFAR04_Ab0010 BGAFAR04_Ab0011     TRUE 0.574 24.000 0.000 NA   NA
 5766633 5766634 BGAFAR04_Ab0011 BGAFAR04_Ab0012     FALSE 0.290 -22.000 0.000 NA   NA
 5766634 5766635 BGAFAR04_Ab0012 BGAFAR04_Ab0013     FALSE 0.031 541.000 0.000 NA   NA
 5766635 5766636 BGAFAR04_Ab0013 BGAFAR04_Ab0014     FALSE 0.375 -13.000 0.000 NA   NA
 5766636 5766637 BGAFAR04_Ab0014 BGAFAR04_Ab0015     FALSE 0.057 149.000 0.000 NA   NA
 5766637 5766638 BGAFAR04_Ab0015 BGAFAR04_Ab0016     FALSE 0.045 193.000 0.000 NA   NA
 5766638 5766639 BGAFAR04_Ab0016 BGAFAR04_Ab0017     TRUE 0.760 3.000 0.000 NA   NA
 5766639 5766640 BGAFAR04_Ab0017 BGAFAR04_Ab0018     FALSE 0.084 102.000 0.000 NA   NA
 5766640 5766641 BGAFAR04_Ab0018 BGAFAR04_Ab0019     TRUE 0.783 6.000 0.000 NA   NA
 5766641 5766642 BGAFAR04_Ab0019 BGAFAR04_Ab0020     FALSE 0.032 406.000 0.000 NA   NA
 5766642 5766643 BGAFAR04_Ab0020 BGAFAR04_Ab0021     FALSE 0.084 102.000 0.000 NA   NA
 5766643 5766644 BGAFAR04_Ab0021 BGAFAR04_Ab0022     TRUE 0.787 8.000 0.000 NA   NA
 5766644 5766645 BGAFAR04_Ab0022 BGAFAR04_Ab0023     TRUE 0.574 24.000 0.000 NA   NA
 5766645 5766646 BGAFAR04_Ab0023 BGAFAR04_Ab0024     TRUE 0.771 4.000 0.000 NA   NA
 5766646 5766647 BGAFAR04_Ab0024 BGAFAR04_Ab0025     FALSE 0.375 -13.000 0.000 NA   NA
 5766647 5766648 BGAFAR04_Ab0025 BGAFAR04_Ab0026     TRUE 0.759 14.000 0.000 NA   NA
 5766648 5766649 BGAFAR04_Ab0026 BGAFAR04_Ab0027     FALSE 0.518 -7.000 0.000 NA   NA
 5766649 5766650 BGAFAR04_Ab0027 BGAFAR04_Ab0028     FALSE 0.052 157.000 0.000 NA   NA
 5766650 5766651 BGAFAR04_Ab0028 BGAFAR04_Ab0029     FALSE 0.137 80.000 0.000 NA   NA
 5766651 5766652 BGAFAR04_Ab0029 BGAFAR04_Ab0030     FALSE 0.055 153.000 0.000 NA   NA
 5766653 5766654 BGAFAR04_Ab0031 BGAFAR04_Ab0032     FALSE 0.127 84.000 0.000 NA   NA
 5766655 5766656 BGAFAR04_Ab0033 BGAFAR04_Ab0034     FALSE 0.050 171.000 0.000 NA   NA
 5766656 5766657 BGAFAR04_Ab0034 BGAFAR04_Ab0035     FALSE 0.270 51.000 0.000 NA   NA
 5766657 5766658 BGAFAR04_Ab0035 BGAFAR04_Ab0036     TRUE 0.785 10.000 0.000 NA   NA
 5766658 5766659 BGAFAR04_Ab0036 BGAFAR04_Ab0037     FALSE 0.267 -24.000 0.000 NA   NA
 5766659 5766660 BGAFAR04_Ab0037 BGAFAR04_Ab0038     TRUE 0.581 43.000 0.500 NA   NA
 5766662 5766663 BGAFAR04_Ab0040 BGAFAR04_Ab0041     FALSE 0.109 91.000 0.000 NA   NA
 5766663 5766664 BGAFAR04_Ab0041 BGAFAR04_Ab0042     FALSE 0.403 38.000 0.000 NA   NA
 5766664 5766665 BGAFAR04_Ab0042 BGAFAR04_Ab0043     FALSE 0.279 49.000 0.000 NA   NA
 5766667 5766668 BGAFAR04_Ab0045 BGAFAR04_Ab0046     FALSE 0.066 122.000 0.000 NA   NA
 5766668 5766669 BGAFAR04_Ab0046 BGAFAR04_Ab0047     FALSE 0.118 88.000 0.000 NA   NA
 5766673 5766674 BGAFAR04_Ab0051 BGAFAR04_Ab0052     FALSE 0.064 124.000 0.000 NA   NA
 5766674 5766675 BGAFAR04_Ab0052 BGAFAR04_Ab0053     FALSE 0.518 -7.000 0.000 NA   NA
 5766675 5766676 BGAFAR04_Ab0053 BGAFAR04_Ab0054     FALSE 0.034 338.000 0.000 NA   NA
 5766676 5766677 BGAFAR04_Ab0054 BGAFAR04_Ab0055     FALSE 0.182 108.000 0.500 NA   NA
 5766677 5766678 BGAFAR04_Ab0055 BGAFAR04_Ab0056     FALSE 0.052 157.000 0.000 NA   NA
 5766678 5766679 BGAFAR04_Ab0056 BGAFAR04_Ab0057     FALSE 0.163 73.000 0.000 NA   NA
 5766679 5766680 BGAFAR04_Ab0057 BGAFAR04_Ab0058     FALSE 0.031 539.000 0.000 NA   NA
 5766680 5766681 BGAFAR04_Ab0058 BGAFAR04_Ab0059     TRUE 0.785 10.000 0.000 NA   NA
 5766681 5766682 BGAFAR04_Ab0059 BGAFAR04_Ab0060     FALSE 0.468 -9.000 0.000 NA   NA
 5766682 5766683 BGAFAR04_Ab0060 BGAFAR04_Ab0061     FALSE 0.267 -24.000 0.000 NA   NA
 5766683 5766684 BGAFAR04_Ab0061 BGAFAR04_Ab0062     TRUE 0.633 -3.000 0.000 NA   NA
 5766684 5766685 BGAFAR04_Ab0062 BGAFAR04_Ab0063     FALSE 0.054 155.000 0.000 NA   NA
 5766685 5766686 BGAFAR04_Ab0063 BGAFAR04_Ab0064     FALSE 0.099 96.000 0.000 NA   NA
 5766686 5766687 BGAFAR04_Ab0064 BGAFAR04_Ab0065     FALSE 0.096 97.000 0.000 NA   NA
 5766687 5766688 BGAFAR04_Ab0065 BGAFAR04_Ab0066     FALSE 0.327 44.000 0.000 NA   NA
 5766688 5766689 BGAFAR04_Ab0066 BGAFAR04_Ab0067     TRUE 0.694 18.000 0.000 NA   NA
 5766689 5766690 BGAFAR04_Ab0067 BGAFAR04_Ab0068     FALSE 0.408 -12.000 0.000 NA   NA
 5766690 5766691 BGAFAR04_Ab0068 BGAFAR04_Ab0070     FALSE 0.033 345.000 0.000 NA   NA
 5766693 5766694 BGAFAR04_Ab0071 BGAFAR04_Ab0072     TRUE 0.633 -3.000 0.000 NA   NA
 5766694 5766695 BGAFAR04_Ab0072 BGAFAR04_Ab0073     FALSE 0.312 -19.000 0.000 NA   NA
 5766699 5766700 BGAFAR04_Ab0077 BGAFAR04_Ab0078     FALSE 0.064 124.000 0.000 NA   NA
 5766702 5766703 BGAFAR04_Ab0080 BGAFAR04_Ab0081     FALSE 0.032 445.000 0.000 NA   NA
 5766704 5766705 BGAFAR04_Ab0082 BGAFAR04_Ab0083     FALSE 0.109 91.000 0.000 NA   NA
 5766708 5766709 BGAFAR04_F0002 BGAFAR04_F0004     FALSE 0.102 95.000 0.000 NA   NA
 5766710 5766711 BGAFAR04_F0003 BGAFAR04_F0005     FALSE 0.124 86.000 0.000 NA   NA
 5766711 5766712 BGAFAR04_F0005 BGAFAR04_F0006     FALSE 0.468 -9.000 0.000 NA   NA
 5766719 5766720 BGAFAR04_F0013 BGAFAR04_F0015     FALSE 0.218 -43.000 0.000 NA   NA
 5766722 5766723 BGAFAR04_F0016 BGAFAR04_F0017     FALSE 0.520 26.000 0.000 NA   NA
 5766723 5766724 BGAFAR04_F0017 BGAFAR04_F0018     FALSE 0.375 -13.000 0.000 NA   NA
 5766728 5766729 BGAFAR04_F0022 BGAFAR04_F0023     TRUE 0.760 3.000 0.000 NA   NA
 5766729 5766730 BGAFAR04_F0023 BGAFAR04_F0024     FALSE 0.267 -24.000 0.000 NA   NA
 5766730 5766731 BGAFAR04_F0024 BGAFAR04_F0026     TRUE 0.717 34.000 0.800 NA   NA
 5766732 5766733 BGAFAR04_F0025 BGAFAR04_F0027     FALSE 0.030 574.000 0.000 NA   NA
 5766734 5766735 BGAFAR04_F0028 BGAFAR04_F0029     FALSE 0.218 -43.000 0.000 NA   NA
 5766736 5766737 BGAFAR04_F0030 BGAFAR04_F0031     FALSE 0.141 182.000 0.857 NA   NA
 5766737 5766738 BGAFAR04_F0031 BGAFAR04_F0032     FALSE 0.311 46.000 0.000 NA   NA
 5766738 5766739 BGAFAR04_F0032 BGAFAR04_F0033     FALSE 0.543 25.000 0.000 NA   NA
 5766739 5766740 BGAFAR04_F0033 BGAFAR04_F0034     TRUE 0.922 10.000 0.833 NA   NA
 5766740 5766741 BGAFAR04_F0034 BGAFAR04_F0035     FALSE 0.327 77.000 0.500 NA   NA
 5766741 5766742 BGAFAR04_F0035 BGAFAR04_F0036     FALSE 0.292 48.000 0.000 NA   NA
 5766742 5766743 BGAFAR04_F0036 BGAFAR04_F0037     FALSE 0.290 -22.000 0.000 NA   NA
 5766743 5766744 BGAFAR04_F0037 BGAFAR04_F0038     TRUE 0.974 6.000 0.600 0.070   NA
 5766744 5766745 BGAFAR04_F0038 BGAFAR04_F0039     TRUE 0.974 6.000 0.600 0.070   NA
 5766745 5766746 BGAFAR04_F0039 BGAFAR04_F0040     FALSE 0.465 -31.000 0.600 NA   NA
 5766746 5766747 BGAFAR04_F0040 BGAFAR04_F0041     TRUE 0.563 -19.000 0.600 NA   NA
 5766747 5766748 BGAFAR04_F0041 BGAFAR04_F0042     TRUE 0.974 6.000 0.600 0.070   NA
 5766748 5766749 BGAFAR04_F0042 BGAFAR04_F0043     TRUE 0.974 6.000 0.600 0.070   NA
 5766749 5766750 BGAFAR04_F0043 BGAFAR04_F0044     TRUE 0.974 6.000 0.600 0.070   NA
 5766750 5766751 BGAFAR04_F0044 BGAFAR04_F0045     TRUE 0.974 6.000 0.600 0.070   NA
 5766751 5766752 BGAFAR04_F0045 BGAFAR04_F0046     TRUE 0.974 6.000 0.600 0.070   NA
 5766752 5766753 BGAFAR04_F0046 BGAFAR04_F0047     TRUE 0.974 6.000 0.600 0.070   NA
 5766755 5766756 BGAFAR04_A0001 BGAFAR04_A0002     FALSE 0.198 65.000 0.000 NA   NA
 5766757 5766758 BGAFAR04_A0003 BGAFAR04_A0004     FALSE 0.030 932.000 0.000 NA   NA
 5766758 5766759 BGAFAR04_A0004 BGAFAR04_A0005     FALSE 0.032 371.000 0.000 NA   NA
 5766760 5766761 BGAFAR04_A0006 BGAFAR04_A0007     FALSE 0.087 101.000 0.000 NA   NA
 5766761 5766762 BGAFAR04_A0007 BGAFAR04_A0008     FALSE 0.032 413.000 0.000 NA   NA
 5766763 5766764 BGAFAR04_A0009 BGAFAR04_A0010     TRUE 0.837 -3.000 0.667 NA   NA
 5766764 5766765 BGAFAR04_A0010 BGAFAR04_A0011     FALSE 0.064 126.000 0.000 NA   NA
 5766765 5766766 BGAFAR04_A0011 BGAFAR04_A0012     TRUE 0.760 3.000 0.000 NA   NA
 5766766 5766767 BGAFAR04_A0012 BGAFAR04_A0013     FALSE 0.129 83.000 0.000 NA   NA
 5766767 5766768 BGAFAR04_A0013 BGAFAR04_A0014     TRUE 0.574 24.000 0.000 NA   NA
 5766768 5766769 BGAFAR04_A0014 BGAFAR04_A0015     TRUE 0.823 -3.000 0.500 NA   NA
 5766769 5766770 BGAFAR04_A0015 BGAFAR04_A0016     TRUE 0.725 -10.000 1.000 NA   NA
 5766770 5766771 BGAFAR04_A0016 BGAFAR04_A0017     FALSE 0.045 200.000 0.000 NA   NA
 5766771 5766772 BGAFAR04_A0017 BGAFAR04_A0018     FALSE 0.030 562.000 0.000 NA   NA
 5766772 5766773 BGAFAR04_A0018 BGAFAR04_A0019     FALSE 0.321 45.000 0.000 NA   NA
 5766773 5766774 BGAFAR04_A0019 BGAFAR04_A0020     FALSE 0.267 -24.000 0.000 NA   NA
 5766774 5766775 BGAFAR04_A0020 BGAFAR04_A0021     FALSE 0.484 28.000 0.000 NA   NA
 5766775 5766776 BGAFAR04_A0021 BGAFAR04_A0022     FALSE 0.038 264.000 0.000 NA   NA
 5766776 5766777 BGAFAR04_A0022 BGAFAR04_A0023     FALSE 0.033 360.000 0.000 NA   NA
 5766778 5766779 BGAFAR04_A0024 BGAFAR04_A0025     FALSE 0.067 121.000 0.000 NA   NA
 5766779 5766780 BGAFAR04_A0025 BGAFAR04_A0026     FALSE 0.032 374.000 0.000 NA   NA
 5766781 5766782 BGAFAR04_A0027 BGAFAR04_A0028     TRUE 0.771 4.000 0.000 NA   NA
 5766782 5766783 BGAFAR04_A0028 BGAFAR04_A0029     TRUE 0.812 -22.000 0.000 0.002   NA
 5766783 5766784 BGAFAR04_A0029 BGAFAR04_A0030     FALSE 0.036 299.000 0.000 NA   NA
 5766784 5766785 BGAFAR04_A0030 BGAFAR04_A0031     FALSE 0.062 130.000 0.000 NA   NA
 5766785 5766786 BGAFAR04_A0031 BGAFAR04_A0032     FALSE 0.046 191.000 0.000 NA   NA
 5766788 5766789 BGAFAR04_A0034 BGAFAR04_A0035     FALSE 0.218 108.000 1.000 NA   NA
 5766789 5766790 BGAFAR04_A0035 BGAFAR04_A0036     FALSE 0.060 134.000 0.000 NA   NA
 5766790 5766791 BGAFAR04_A0036 BGAFAR04_A0037     FALSE 0.033 350.000 0.000 NA   NA
 5766791 5766792 BGAFAR04_A0037 BGAFAR04_A0038     TRUE 0.922 12.000 1.000 NA   NA
 5766792 5766793 BGAFAR04_A0038 BGAFAR04_A0039     FALSE 0.502 58.000 1.000 NA   NA
 5766793 5766794 BGAFAR04_A0039 BGAFAR04_A0040     TRUE 0.899 16.000 1.000 NA   NA
 5766794 5766795 BGAFAR04_A0040 BGAFAR04_A0041     TRUE 0.909 4.000 0.667 NA   NA
 5766795 5766796 BGAFAR04_A0041 BGAFAR04_A0042     TRUE 0.633 -3.000 0.000 NA   NA
 5766796 5766797 BGAFAR04_A0042 BGAFAR04_A0043     TRUE 0.837 -3.000 0.667 NA   NA
 5766797 5766798 BGAFAR04_A0043 BGAFAR04_A0044     TRUE 0.837 -3.000 0.667 NA   NA
 5766798 5766799 BGAFAR04_A0044 BGAFAR04_A0045     TRUE 0.668 38.000 0.667 NA   NA
 5766799 5766800 BGAFAR04_A0045 BGAFAR04_A0046     TRUE 0.704 0.000 0.000 NA   NA
 5766800 5766801 BGAFAR04_A0046 BGAFAR04_A0047     FALSE 0.340 43.000 0.000 NA   NA
 5766801 5766802 BGAFAR04_A0047 BGAFAR04_A0048     FALSE 0.518 -7.000 0.000 NA   NA
 5766802 5766803 BGAFAR04_A0048 BGAFAR04_A0049     TRUE 0.919 9.000 0.750 NA   NA
 5766803 5766804 BGAFAR04_A0049 BGAFAR04_A0050     TRUE 0.860 21.000 1.000 NA   NA
 5766804 5766805 BGAFAR04_A0050 BGAFAR04_A0051     FALSE 0.390 39.000 0.000 NA   NA
 5766805 5766806 BGAFAR04_A0051 BGAFAR04_A0052     FALSE 0.099 96.000 0.000 NA   NA
 5766806 5766807 BGAFAR04_A0052 BGAFAR04_A0053     FALSE 0.390 39.000 0.000 NA   NA
 5766807 5766808 BGAFAR04_A0053 BGAFAR04_A0054     FALSE 0.146 78.000 0.000 NA   NA
 5766808 5766809 BGAFAR04_A0054 BGAFAR04_A0055     FALSE 0.438 -10.000 0.000 NA   NA
 5766812 5766813 BGAFAR04_A0058 BGAFAR04_A0059     FALSE 0.209 100.000 0.500 NA   NA
 5766817 5766818 BGAFAR04_A0063 BGAFAR04_A0064     FALSE 0.154 166.000 1.000 NA   NA
 5766820 5766821 BGAFAR04_A0066 BGAFAR04_A0067     TRUE 0.777 5.000 0.000 NA   NA
 5766821 5766822 BGAFAR04_A0067 BGAFAR04_A0068     FALSE 0.031 470.000 0.000 NA   NA
 5766822 5766823 BGAFAR04_A0068 BGAFAR04_A0069     FALSE 0.036 305.000 0.000 NA   NA
 5766823 5766824 BGAFAR04_A0069 BGAFAR04_A0070     FALSE 0.042 227.000 0.000 NA   NA
 5766824 5766825 BGAFAR04_A0070 BGAFAR04_A0071     FALSE 0.207 -46.000 0.000 NA   NA
 5766825 5766826 BGAFAR04_A0071 BGAFAR04_A0072     FALSE 0.039 251.000 0.000 NA   NA
 5766826 5766827 BGAFAR04_A0072 BGAFAR04_A0073     FALSE 0.033 362.000 0.000 NA   NA
 5766827 5766828 BGAFAR04_A0073 BGAFAR04_A0074     FALSE 0.080 105.000 0.000 NA   NA
 5766828 5766829 BGAFAR04_A0074 BGAFAR04_A0075     FALSE 0.036 305.000 0.000 NA   NA
 5766829 5766830 BGAFAR04_A0075 BGAFAR04_A0076     FALSE 0.036 295.000 0.000 NA   NA
 5766831 5766832 BGAFAR04_A0077 BGAFAR04_A0078   thyX FALSE 0.102 198.000 0.000 1.000   NA
 5766832 5766833 BGAFAR04_A0078 BGAFAR04_A0079 thyX thyX TRUE 0.830 48.000 0.007 0.002   NA
 5766835 5766836 BGAFAR04_B0001 BGAFAR04_B0003     FALSE 0.121 87.000 0.000 NA   NA
 5766836 5766837 BGAFAR04_B0003 BGAFAR04_B0004   celB FALSE 0.037 278.000 0.000 NA   NA
 5766838 5766839 BGAFAR04_B0005 BGAFAR04_B0006     TRUE 0.992 9.000 0.000 0.008 Y NA
 5766839 5766840 BGAFAR04_B0006 BGAFAR04_B0007     TRUE 0.950 12.000 0.667 1.000   NA
 5766842 5766843 BGAFAR04_B0009 BGAFAR04_B0010     FALSE 0.195 116.000 0.857 NA   NA
 5766843 5766844 BGAFAR04_B0010 BGAFAR04_B0011     FALSE 0.438 -10.000 0.000 NA   NA
 5766844 5766845 BGAFAR04_B0011 BGAFAR04_B0012     FALSE 0.267 -24.000 0.000 NA   NA
 5766845 5766846 BGAFAR04_B0012 BGAFAR04_B0013     FALSE 0.180 68.000 0.000 NA   NA
 5766849 5766850 BGAFAR04_B0016 BGAFAR04_B0017     TRUE 0.834 25.000 0.190 1.000   NA
 5766852 5766853 BGAFAR04_B0019 BGAFAR04_B0020     FALSE 0.206 63.000 0.000 NA   NA
 5766853 5766854 BGAFAR04_B0020 BGAFAR04_B0021     FALSE 0.542 110.000 1.000 0.022   NA
 5766854 5766855 BGAFAR04_B0021 BGAFAR04_B0022     FALSE 0.166 72.000 0.000 NA   NA
 5766855 5766856 BGAFAR04_B0022 BGAFAR04_B0023     FALSE 0.249 -25.000 0.000 NA   NA
 5766859 5766860 BGAFAR04_B0026 BGAFAR04_B0027     FALSE 0.034 326.000 0.000 NA   NA
 5766860 5766834 BGAFAR04_B0027 BGAFAR04_B0002     FALSE 0.409 88.000 1.000 1.000 N NA
 5766863 5766864 BGAFAR04_C0003 BGAFAR04_C0004     FALSE 0.030 698.000 0.000 NA   NA
 5766864 5766865 BGAFAR04_C0004 BGAFAR04_C0005     FALSE 0.030 823.000 0.000 NA   NA
 5766867 5766868 BGAFAR04_C0007 BGAFAR04_C0008     FALSE 0.056 151.000 0.000 NA   NA
 5766868 5766869 BGAFAR04_C0008 BGAFAR04_C0009     FALSE 0.053 156.000 0.000 NA   NA
 5766874 5766875 BGAFAR04_C0014 BGAFAR04_C0015     FALSE 0.030 673.000 0.000 NA   NA
 5766875 5766876 BGAFAR04_C0015 BGAFAR04_C0016     FALSE 0.038 272.000 0.000 NA   NA
 5766876 5766877 BGAFAR04_C0016 BGAFAR04_C0017     TRUE 0.574 24.000 0.000 NA   NA
 5766877 5766878 BGAFAR04_C0017 BGAFAR04_C0018     FALSE 0.518 -7.000 0.000 NA   NA
 5766878 5766879 BGAFAR04_C0018 BGAFAR04_C0019     FALSE 0.463 47.000 0.000 1.000 N NA
 5766879 5766880 BGAFAR04_C0019 BGAFAR04_C0020     FALSE 0.223 59.000 0.000 NA   NA
 5766880 5766881 BGAFAR04_C0020 BGAFAR04_C0021     FALSE 0.078 107.000 0.000 NA   NA
 5766881 5766882 BGAFAR04_C0021 BGAFAR04_C0022     FALSE 0.340 43.000 0.000 NA   NA
 5766882 5766883 BGAFAR04_C0022 BGAFAR04_C0023     FALSE 0.264 52.000 0.000 NA   NA
 5766883 5766884 BGAFAR04_C0023 BGAFAR04_C0024     FALSE 0.047 190.000 0.000 NA   NA
 5766885 5766886 BGAFAR04_E0002 BGAFAR04_E0003     FALSE 0.041 234.000 0.000 NA   NA
 5766889 5766890 BGAFAR04_E0006 BGAFAR04_E0007 bptA   FALSE 0.177 69.000 0.000 NA   NA
 5766890 5766891 BGAFAR04_E0007 BGAFAR04_E0008     FALSE 0.030 580.000 0.000 NA   NA
 5766891 5766892 BGAFAR04_E0008 BGAFAR04_E0009     FALSE 0.403 38.000 0.000 NA   NA
 5766892 5766893 BGAFAR04_E0009 BGAFAR04_E0010     FALSE 0.267 -24.000 0.000 NA   NA
 5766893 5766894 BGAFAR04_E0010 BGAFAR04_E0011     TRUE 0.785 10.000 0.000 NA   NA
 5766897 5766898 BGAFAR04_E0014 BGAFAR04_E0015     FALSE 0.030 859.000 0.000 NA   NA
 5766898 5766899 BGAFAR04_E0015 BGAFAR04_E0016     TRUE 0.785 10.000 0.000 NA   NA
 5766899 5766900 BGAFAR04_E0016 BGAFAR04_E0017     FALSE 0.267 -24.000 0.000 NA   NA
 5766900 5766901 BGAFAR04_E0017 BGAFAR04_E0018     TRUE 0.712 17.000 0.000 NA   NA
 5766904 5766905 BGAFAR04_E0021 BGAFAR04_E0022     FALSE 0.375 -13.000 0.000 NA   NA
 5766908 5766909 BGAFAR04_E0025 BGAFAR04_E0026     FALSE 0.029 1016.000 0.000 NA   NA
 5766910 5766911 BGAFAR04_E0027 BGAFAR04_E0028     FALSE 0.518 -7.000 0.000 NA   NA
 5766912 5766913 BGAFAR04_E0029 BGAFAR04_E0030   mtnN FALSE 0.035 313.000 0.000 NA   NA
 5766913 5766914 BGAFAR04_E0030 BGAFAR04_E0031 mtnN   FALSE 0.054 155.000 0.000 NA   NA
 5766916 5766917 BGAFAR04_E0033 BGAFAR04_E0034     FALSE 0.038 268.000 0.000 NA   NA
 5766917 5766918 BGAFAR04_E0034 BGAFAR04_E0035   ade FALSE 0.034 338.000 0.000 NA   NA