MicrobesOnline Operon Predictions for Clostridium botulinum Ba4 str. 657

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 7504217 7504218 CLJ_B0001 CLJ_B0002 dnaA dnaN_1 TRUE 0.555 263.000 0.328 1.000 Y NA
 7504218 7504219 CLJ_B0002 CLJ_B0003 dnaN_1   TRUE 0.948 20.000 0.103 1.000   NA
 7504219 7504220 CLJ_B0003 CLJ_B0004   recF TRUE 0.819 69.000 0.209 1.000   NA
 7504220 7504221 CLJ_B0004 CLJ_B0005 recF   TRUE 0.910 21.000 0.024 NA   NA
 7504221 7504222 CLJ_B0005 CLJ_B0006   gyrB TRUE 0.912 18.000 0.017 NA   NA
 7504222 7504223 CLJ_B0006 CLJ_B0007 gyrB gyrA TRUE 0.987 26.000 0.306 0.002 Y NA
 7504223 7504224 CLJ_B0007 CLJ_B0008 gyrA rrs_1 FALSE 0.010 416.000 0.000 NA   NA
 7504224 7504225 CLJ_B0008 CLJ_B0010 rrs_1 rrl_1 FALSE 0.116 222.000 0.000 NA   NA
 7504225 7504226 CLJ_B0010 CLJ_B0011 rrl_1 rrf_1 FALSE 0.418 93.000 0.000 NA   NA
 7504226 7504227 CLJ_B0011 CLJ_B0012 rrf_1   TRUE 0.877 8.000 0.000 NA   NA
 7504227 7504228 CLJ_B0012 CLJ_B0013     TRUE 0.902 2.000 0.000 NA   NA
 7504228 7504229 CLJ_B0013 CLJ_B0014     FALSE 0.301 162.000 0.000 NA   NA
 7504229 7504230 CLJ_B0014 CLJ_B0015     TRUE 0.928 16.000 0.029 NA   NA
 7504230 7504231 CLJ_B0015 CLJ_B0016     TRUE 0.953 2.000 0.014 NA   NA
 7504231 7504232 CLJ_B0016 CLJ_B0017     TRUE 0.942 5.000 0.011 NA   NA
 7504232 7504233 CLJ_B0017 CLJ_B0018     TRUE 0.599 137.000 0.016 NA   NA
 7504233 7504234 CLJ_B0018 CLJ_B0019     TRUE 0.948 25.000 0.214 NA   NA
 7504234 7504235 CLJ_B0019 CLJ_B0020     TRUE 0.971 17.000 0.370 NA   NA
 7504235 7504236 CLJ_B0020 CLJ_B0021   serS_1 FALSE 0.015 370.000 0.000 NA   NA
 7504236 7504237 CLJ_B0021 CLJ_B0022 serS_1   FALSE 0.048 276.000 0.000 NA   NA
 7504237 7504238 CLJ_B0022 CLJ_B0023     TRUE 0.816 19.000 0.000 NA   NA
 7504238 7504239 CLJ_B0023 CLJ_B0024     FALSE 0.031 305.000 0.000 NA   NA
 7504239 7504240 CLJ_B0024 CLJ_B0025     TRUE 0.816 19.000 0.000 NA   NA
 7504240 7504241 CLJ_B0025 CLJ_B0026     FALSE 0.416 83.000 0.000 NA   NA
 7504242 7504243 CLJ_B0027 CLJ_B0028 psd   TRUE 0.650 103.000 0.026 NA   NA
 7504243 7504244 CLJ_B0028 CLJ_B0029     TRUE 0.800 76.000 0.205 NA   NA
 7504245 7504246 CLJ_B0030 CLJ_B0031     FALSE 0.289 165.000 0.000 NA   NA
 7504246 7504247 CLJ_B0031 CLJ_B0032   megL FALSE 0.103 227.000 0.000 NA   NA
 7504247 7504248 CLJ_B0032 CLJ_B0033 megL   FALSE 0.466 124.000 0.000 1.000 N NA
 7504248 7504249 CLJ_B0033 CLJ_B0034     FALSE 0.323 156.000 0.000 NA   NA
 7504249 7504250 CLJ_B0034 CLJ_B0035   srpB FALSE 0.413 123.000 0.000 NA   NA
 7504250 7504251 CLJ_B0035 CLJ_B0036 srpB dnaX_1 FALSE 0.293 164.000 0.000 NA   NA
 7504251 7504252 CLJ_B0036 CLJ_B0037 dnaX_1   TRUE 0.770 65.000 0.100 NA   NA
 7504252 7504253 CLJ_B0037 CLJ_B0038   recR TRUE 0.953 33.000 0.604 NA   NA
 7504253 7504254 CLJ_B0038 CLJ_B0039 recR   TRUE 0.767 57.000 0.071 NA   NA
 7504254 7504255 CLJ_B0039 CLJ_B0040   bofA TRUE 0.805 150.000 0.417 NA   NA
 7504255 7504256 CLJ_B0040 CLJ_B0041 bofA sfsA FALSE 0.502 151.000 0.005 NA   NA
 7504256 7504257 CLJ_B0041 CLJ_B0042 sfsA   TRUE 0.687 56.000 0.015 NA   NA
 7504257 7504258 CLJ_B0042 CLJ_B0043     FALSE 0.439 118.000 0.000 1.000   NA
 7504258 7504259 CLJ_B0043 CLJ_B0044     FALSE 0.432 134.000 0.000 1.000   NA
 7504259 7504260 CLJ_B0044 CLJ_B0045     TRUE 0.960 19.000 0.222 NA   NA
 7504260 7504261 CLJ_B0045 CLJ_B0046     FALSE 0.014 383.000 0.000 NA   NA
 7504261 7504262 CLJ_B0046 CLJ_B0047     TRUE 0.605 83.000 0.007 NA N NA
 7504262 7504263 CLJ_B0047 CLJ_B0048     TRUE 0.885 29.000 0.035 NA N NA
 7504263 7504264 CLJ_B0048 CLJ_B0049   rrs_2 FALSE 0.013 387.000 0.000 NA   NA
 7504264 7504265 CLJ_B0049 CLJ_B0051 rrs_2 rrl_2 FALSE 0.116 222.000 0.000 NA   NA
 7504265 7504266 CLJ_B0051 CLJ_B0052 rrl_2 rrf_2 FALSE 0.424 105.000 0.000 NA   NA
 7504266 7504267 CLJ_B0052 CLJ_B0053 rrf_2   TRUE 0.882 6.000 0.000 NA   NA
 7504268 7504269 CLJ_B0054 CLJ_B0055     TRUE 0.821 18.000 0.000 NA   NA
 7504270 7504271 CLJ_B0056 CLJ_B0058 rrs_3 rrl_3 FALSE 0.116 222.000 0.000 NA   NA
 7504271 7504272 CLJ_B0058 CLJ_B0059 rrl_3 rrf_3 FALSE 0.277 168.000 0.000 NA   NA
 7504272 7504273 CLJ_B0059 CLJ_B0060 rrf_3   TRUE 0.882 6.000 0.000 NA   NA
 7504273 7504274 CLJ_B0060 CLJ_B0061     FALSE 0.018 354.000 0.000 NA   NA
 7504274 7504275 CLJ_B0061 CLJ_B0062     TRUE 0.992 -3.000 0.800 NA   NA
 7504275 7504276 CLJ_B0062 CLJ_B0063   rrs_4 FALSE 0.004 645.000 0.000 NA   NA
 7504276 7504277 CLJ_B0063 CLJ_B0065 rrs_4 rrl_4 FALSE 0.116 222.000 0.000 NA   NA
 7504277 7504278 CLJ_B0065 CLJ_B0066 rrl_4 rrf_4 FALSE 0.424 105.000 0.000 NA   NA
 7504278 7504279 CLJ_B0066 CLJ_B0067 rrf_4   TRUE 0.879 7.000 0.000 NA   NA
 7504279 7504280 CLJ_B0067 CLJ_B0068     FALSE 0.144 208.000 0.000 NA   NA
 7504280 7504281 CLJ_B0068 CLJ_B0069     TRUE 0.592 43.000 0.000 NA   NA
 7504281 7504282 CLJ_B0069 CLJ_B0070   rrs_5 FALSE 0.003 719.000 0.000 NA   NA
 7504282 7504283 CLJ_B0070 CLJ_B0072 rrs_5 rrl_5 FALSE 0.110 224.000 0.000 NA   NA
 7504283 7504284 CLJ_B0072 CLJ_B0073 rrl_5 rrf_5 FALSE 0.424 105.000 0.000 NA   NA
 7504284 7504285 CLJ_B0073 CLJ_B0074 rrf_5   TRUE 0.879 7.000 0.000 NA   NA
 7504285 7504286 CLJ_B0074 CLJ_B0075     FALSE 0.386 140.000 0.000 NA   NA
 7504286 7504287 CLJ_B0075 CLJ_B0076   rrs_6 FALSE 0.005 522.000 0.000 NA   NA
 7504287 7504288 CLJ_B0076 CLJ_B0078 rrs_6 rrl_6 FALSE 0.116 222.000 0.000 NA   NA
 7504288 7504289 CLJ_B0078 CLJ_B0079 rrl_6 rrf_6 FALSE 0.424 105.000 0.000 NA   NA
 7504289 7504290 CLJ_B0079 CLJ_B0080 rrf_6   FALSE 0.015 373.000 0.000 NA   NA
 7504290 7504291 CLJ_B0080 CLJ_B0081     FALSE 0.419 82.000 0.000 NA   NA
 7504292 7504293 CLJ_B0082 CLJ_B0083     TRUE 0.853 36.000 0.039 NA N NA
 7504296 7504297 CLJ_B0086 CLJ_B0087     TRUE 0.986 -21.000 0.120 NA   NA
 7504297 7504298 CLJ_B0087 CLJ_B0088     TRUE 0.918 24.000 0.034 1.000 N NA
 7504298 7504299 CLJ_B0088 CLJ_B0089     TRUE 0.667 81.000 0.034 NA   NA
 7504299 7504300 CLJ_B0089 CLJ_B0090     TRUE 0.913 18.000 0.018 NA   NA
 7504300 7504301 CLJ_B0090 CLJ_B0091     TRUE 0.985 2.000 0.372 NA   NA
 7504301 7504302 CLJ_B0091 CLJ_B0092     TRUE 0.930 12.000 0.011 NA   NA
 7504302 7504303 CLJ_B0092 CLJ_B0093     TRUE 0.834 82.000 0.333 1.000   NA
 7504303 7504304 CLJ_B0093 CLJ_B0094     TRUE 0.599 121.000 0.006 1.000   NA
 7504304 7504305 CLJ_B0094 CLJ_B0095     TRUE 0.953 20.000 0.078 0.008   NA
 7504305 7504306 CLJ_B0095 CLJ_B0096     FALSE 0.459 156.000 0.002 NA   NA
 7504308 7504309 CLJ_B0098 CLJ_B0099   arcA_1 FALSE 0.010 422.000 0.000 1.000   NA
 7504310 7504311 CLJ_B0100 CLJ_B0101 ispF   TRUE 0.583 76.000 0.003 NA   NA
 7504314 7504315 CLJ_B0104 CLJ_B0105 spmA spmB TRUE 0.987 13.000 0.655 0.003   NA
 7504315 7504316 CLJ_B0105 CLJ_B0106 spmB   FALSE 0.116 222.000 0.000 NA   NA
 7504316 7504317 CLJ_B0106 CLJ_B0107     TRUE 0.876 66.000 0.500 NA   NA
 7504317 7504318 CLJ_B0107 CLJ_B0108     TRUE 0.784 93.000 0.188 NA   NA
 7504318 7504319 CLJ_B0108 CLJ_B0109     TRUE 0.994 3.000 0.312 NA Y NA
 7504321 7504322 CLJ_B0111 CLJ_B0112 udgA   TRUE 0.870 29.000 0.016 1.000 N NA
 7504322 7504323 CLJ_B0112 CLJ_B0113   metG FALSE 0.017 382.000 0.000 1.000 N NA
 7504323 7504324 CLJ_B0113 CLJ_B0114 metG   FALSE 0.427 165.000 0.003 NA   NA
 7504324 7504325 CLJ_B0114 CLJ_B0115     FALSE 0.496 151.000 0.004 NA   NA
 7504325 7504326 CLJ_B0115 CLJ_B0116     FALSE 0.101 228.000 0.000 NA   NA
 7504326 7504327 CLJ_B0116 CLJ_B0117     TRUE 0.665 73.000 0.020 1.000   NA
 7504327 7504328 CLJ_B0117 CLJ_B0118   ksgA TRUE 0.975 2.000 0.093 1.000 N NA
 7504328 7504329 CLJ_B0118 CLJ_B0119 ksgA   TRUE 0.606 79.000 0.010 NA   NA
 7504329 7504330 CLJ_B0119 CLJ_B0120     TRUE 0.736 159.000 0.278 NA   NA
 7504330 7504331 CLJ_B0120 CLJ_B0121     TRUE 0.660 168.000 0.188 NA   NA
 7504331 7504332 CLJ_B0121 CLJ_B0122     TRUE 0.649 168.000 0.167 NA   NA
 7504332 7504333 CLJ_B0122 CLJ_B0123     TRUE 0.980 11.000 0.350 1.000 N NA
 7504333 7504334 CLJ_B0123 CLJ_B0124     TRUE 0.923 -3.000 0.000 NA   NA
 7504334 7504335 CLJ_B0124 CLJ_B0125     FALSE 0.419 82.000 0.000 NA   NA
 7504335 7504336 CLJ_B0125 CLJ_B0126     FALSE 0.386 146.000 0.000 1.000   NA
 7504336 7504337 CLJ_B0126 CLJ_B0127     TRUE 0.841 15.000 0.000 NA   NA
 7504339 7504340 CLJ_B0129 CLJ_B0130     TRUE 0.730 57.000 0.037 NA   NA
 7504340 7504341 CLJ_B0130 CLJ_B0131   nrdD FALSE 0.041 290.000 0.000 NA   NA
 7504341 7504342 CLJ_B0131 CLJ_B0132 nrdD nrdG TRUE 0.978 17.000 0.315 0.001 N NA
 7504343 7504344 CLJ_B0133 CLJ_B0134     FALSE 0.395 138.000 0.000 NA   NA
 7504344 7504345 CLJ_B0134 CLJ_B0135     TRUE 0.974 2.000 0.111 NA   NA
 7504345 7504346 CLJ_B0135 CLJ_B0136     FALSE 0.414 121.000 0.000 NA   NA
 7504347 7504348 CLJ_B0137 CLJ_B0138 ileS   TRUE 0.555 151.000 0.009 1.000 N NA
 7504348 7504349 CLJ_B0138 CLJ_B0139     FALSE 0.275 217.000 0.017 1.000 N NA
 7504349 7504350 CLJ_B0139 CLJ_B0140     TRUE 0.803 75.000 0.160 1.000 N NA
 7504350 7504351 CLJ_B0140 CLJ_B0141     FALSE 0.022 336.000 0.000 NA   NA
 7504351 7504352 CLJ_B0141 CLJ_B0142     TRUE 0.963 5.000 0.066 NA   NA
 7504352 7504353 CLJ_B0142 CLJ_B0143     TRUE 0.960 20.000 0.210 1.000   NA
 7504353 7504354 CLJ_B0143 CLJ_B0144     FALSE 0.118 225.000 0.000 1.000   NA
 7504354 7504355 CLJ_B0144 CLJ_B0145     TRUE 0.637 187.000 0.333 1.000   NA
 7504357 7504358 CLJ_B0147 CLJ_B0148     TRUE 0.960 15.000 0.143 NA   NA
 7504358 7504359 CLJ_B0148 CLJ_B0149     TRUE 0.945 27.000 0.250 NA   NA
 7504359 7504360 CLJ_B0149 CLJ_B0150     TRUE 0.985 13.000 0.800 NA   NA
 7504362 7504363 CLJ_B0152 CLJ_B0153 cotS   TRUE 0.750 124.000 0.119 NA   NA
 7504363 7504364 CLJ_B0153 CLJ_B0154     FALSE 0.477 196.000 0.116 NA   NA
 7504364 7504365 CLJ_B0154 CLJ_B0155     TRUE 0.728 104.000 0.082 NA   NA
 7504365 7504366 CLJ_B0155 CLJ_B0156     FALSE 0.414 116.000 0.000 NA   NA
 7504366 7504367 CLJ_B0156 CLJ_B0157   cphB TRUE 0.944 -30.000 0.000 NA   NA
 7504367 7504368 CLJ_B0157 CLJ_B0158 cphB cphA TRUE 0.935 44.000 0.605 1.000 N NA
 7504368 7504369 CLJ_B0158 CLJ_B0159 cphA ispE TRUE 0.652 93.000 0.016 1.000 N NA
 7504369 7504370 CLJ_B0159 CLJ_B0160 ispE   FALSE 0.433 167.000 0.005 NA   NA
 7504370 7504371 CLJ_B0160 CLJ_B0161     TRUE 0.797 61.000 0.133 NA   NA
 7504371 7504372 CLJ_B0161 CLJ_B0162     TRUE 0.974 20.000 0.333 0.007   NA
 7504372 7504373 CLJ_B0162 CLJ_B0163     TRUE 0.927 50.000 0.500 0.007   NA
 7504373 7504374 CLJ_B0163 CLJ_B0164   spoIIR TRUE 0.761 74.000 0.109 NA   NA
 7504376 7504377 CLJ_B0166 CLJ_B0167 ypeB   TRUE 0.592 103.000 0.003 1.000   NA
 7504377 7504378 CLJ_B0167 CLJ_B0168     TRUE 0.876 25.000 0.011 NA   NA
 7504378 7504379 CLJ_B0168 CLJ_B0169     TRUE 0.661 132.000 0.039 NA   NA
 7504379 7504380 CLJ_B0169 CLJ_B0170   pyrG FALSE 0.156 234.000 0.004 NA   NA
 7504380 7504381 CLJ_B0170 CLJ_B0171 pyrG   FALSE 0.055 267.000 0.000 NA   NA
 7504381 7504382 CLJ_B0171 CLJ_B0172   rho FALSE 0.403 172.000 0.006 NA   NA
 7504384 7504385 CLJ_B0174 CLJ_B0175 tdk   TRUE 0.908 17.000 0.010 NA   NA
 7504385 7504386 CLJ_B0175 CLJ_B0176   prmC TRUE 0.965 8.000 0.098 NA   NA
 7504386 7504387 CLJ_B0176 CLJ_B0177 prmC prfA TRUE 0.897 82.000 0.081 1.000 Y NA
 7504387 7504388 CLJ_B0177 CLJ_B0178 prfA   TRUE 0.851 28.000 0.009 NA   NA
 7504388 7504389 CLJ_B0178 CLJ_B0179     TRUE 0.792 60.000 0.116 NA   NA
 7504389 7504390 CLJ_B0179 CLJ_B0180     TRUE 0.932 21.000 0.052 NA N NA
 7504390 7504391 CLJ_B0180 CLJ_B0181     TRUE 0.959 10.000 0.056 NA N NA
 7504391 7504392 CLJ_B0181 CLJ_B0182   rpiB TRUE 0.774 60.000 0.065 1.000 N NA
 7504392 7504393 CLJ_B0182 CLJ_B0183 rpiB upp TRUE 0.867 30.000 0.019 1.000 N NA
 7504395 7504396 CLJ_B0185 CLJ_B0186   tagO TRUE 0.685 108.000 0.029 1.000 N NA
 7504396 7504397 CLJ_B0186 CLJ_B0187 tagO mnaA TRUE 0.991 14.000 0.346 1.000 Y NA
 7504397 7504398 CLJ_B0187 CLJ_B0188 mnaA atpI FALSE 0.007 492.000 0.000 1.000   NA
 7504398 7504399 CLJ_B0188 CLJ_B0189 atpI atpB TRUE 0.973 15.000 0.330 1.000   NA
 7504399 7504400 CLJ_B0189 CLJ_B0190 atpB atpE TRUE 0.828 40.000 0.009 0.007   NA
 7504400 7504401 CLJ_B0190 CLJ_B0191 atpE atpF TRUE 0.798 76.000 0.095 0.007   NA
 7504401 7504402 CLJ_B0191 CLJ_B0192 atpF atpH TRUE 0.990 3.000 0.040 0.007 Y NA
 7504402 7504403 CLJ_B0192 CLJ_B0193 atpH atpA TRUE 0.996 11.000 0.864 0.007 Y NA
 7504403 7504404 CLJ_B0193 CLJ_B0194 atpA atpG TRUE 0.994 22.000 0.846 0.007 Y NA
 7504404 7504405 CLJ_B0194 CLJ_B0195 atpG atpD TRUE 0.995 14.000 0.724 0.007 Y NA
 7504405 7504406 CLJ_B0195 CLJ_B0196 atpD atpC TRUE 0.992 25.000 0.837 0.007 Y NA
 7504406 7504407 CLJ_B0196 CLJ_B0197 atpC   FALSE 0.302 196.000 0.007 NA   NA
 7504407 7504408 CLJ_B0197 CLJ_B0198   murA_1 TRUE 0.960 24.000 0.346 NA   NA
 7504408 7504409 CLJ_B0198 CLJ_B0199 murA_1 spoIID FALSE 0.314 256.000 0.243 1.000 N NA
 7504409 7504410 CLJ_B0199 CLJ_B0200 spoIID   FALSE 0.043 406.000 0.090 1.000 N NA
 7504410 7504411 CLJ_B0200 CLJ_B0201   spoIIID_1 TRUE 0.746 108.000 0.093 1.000   NA
 7504411 7504412 CLJ_B0201 CLJ_B0202 spoIIID_1 mbl TRUE 0.827 100.000 0.284 1.000   NA
 7504413 7504414 CLJ_B0203 CLJ_B0204     TRUE 0.713 49.000 0.010 NA   NA
 7504415 7504416 CLJ_B0205 CLJ_B0206     TRUE 0.885 5.000 0.000 NA   NA
 7504416 7504417 CLJ_B0206 CLJ_B0207     TRUE 0.863 12.000 0.000 NA   NA
 7504417 7504418 CLJ_B0207 CLJ_B0208     TRUE 0.826 17.000 0.000 NA   NA
 7504418 7504419 CLJ_B0208 CLJ_B0209     TRUE 0.885 5.000 0.000 NA   NA
 7504419 7504420 CLJ_B0209 CLJ_B0210     FALSE 0.424 101.000 0.000 NA   NA
 7504420 7504421 CLJ_B0210 CLJ_B0212   metK_1 FALSE 0.416 83.000 0.000 NA   NA
 7504421 7504422 CLJ_B0212 CLJ_B0213 metK_1   FALSE 0.450 193.000 0.052 1.000 N NA
 7504422 7504423 CLJ_B0213 CLJ_B0214     TRUE 0.907 26.000 0.051 NA   NA
 7504423 7504424 CLJ_B0214 CLJ_B0215     TRUE 0.987 -27.000 0.130 NA   NA
 7504424 7504425 CLJ_B0215 CLJ_B0216   yfiA FALSE 0.031 425.000 0.080 NA   NA
 7504425 7504426 CLJ_B0216 CLJ_B0217 yfiA secA FALSE 0.269 228.000 0.050 NA N NA
 7504426 7504427 CLJ_B0217 CLJ_B0218 secA   TRUE 0.689 32.000 0.000 NA   NA
 7504427 7504428 CLJ_B0218 CLJ_B0219   prfB TRUE 0.580 44.000 0.000 NA   NA
 7504430 7504431 CLJ_B0221 CLJ_B0223     FALSE 0.044 284.000 0.000 NA   NA
 7504431 7504432 CLJ_B0223 CLJ_B0224     FALSE 0.198 229.000 0.016 NA   NA
 7504432 7504433 CLJ_B0224 CLJ_B0225     TRUE 0.972 21.000 0.500 NA   NA
 7504433 7504434 CLJ_B0225 CLJ_B0226     TRUE 0.954 14.000 0.077 1.000   NA
 7504434 7504435 CLJ_B0226 CLJ_B0227     TRUE 0.645 84.000 0.022 1.000   NA
 7504435 7504436 CLJ_B0227 CLJ_B0228     TRUE 0.878 40.000 0.109 1.000   NA
 7504439 7504440 CLJ_B0231 CLJ_B0232   leuS FALSE 0.323 156.000 0.000 NA   NA
 7504440 7504441 CLJ_B0232 CLJ_B0233 leuS   FALSE 0.016 377.000 0.000 NA N NA
 7504441 7504442 CLJ_B0233 CLJ_B0234     FALSE 0.277 168.000 0.000 NA   NA
 7504442 7504443 CLJ_B0234 CLJ_B0235     FALSE 0.520 53.000 0.000 NA   NA
 7504443 7504444 CLJ_B0235 CLJ_B0236     TRUE 0.772 25.000 0.000 NA   NA
 7504444 7504445 CLJ_B0236 CLJ_B0237     TRUE 0.938 -13.000 0.000 NA   NA
 7504445 7504446 CLJ_B0237 CLJ_B0238     TRUE 0.969 4.000 0.098 NA   NA
 7504448 7504449 CLJ_B0240 CLJ_B0241 fba   FALSE 0.105 226.000 0.000 NA   NA
 7504449 7504450 CLJ_B0241 CLJ_B0242     TRUE 0.720 117.000 0.082 NA   NA
 7504451 7504452 CLJ_B0243 CLJ_B0244     FALSE 0.395 138.000 0.000 NA   NA
 7504454 7504455 CLJ_B0246 CLJ_B0247     TRUE 0.749 106.000 0.094 1.000   NA
 7504455 7504456 CLJ_B0247 CLJ_B0248     TRUE 0.828 74.000 0.281 NA   NA
 7504458 7504459 CLJ_B0251 CLJ_B0252   sleB FALSE 0.315 224.000 0.041 0.063   NA
 7504459 7504460 CLJ_B0252 CLJ_B0253 sleB cysK_1 FALSE 0.018 364.000 0.000 1.000   NA
 7504460 7504461 CLJ_B0253 CLJ_B0254 cysK_1 cysE TRUE 0.989 15.000 0.101 0.002 Y NA
 7504461 7504462 CLJ_B0254 CLJ_B0255 cysE   TRUE 0.937 22.000 0.064 1.000 N NA
 7504462 7504463 CLJ_B0255 CLJ_B0256   plsD TRUE 0.710 138.000 0.064 1.000 N NA
 7504463 7504464 CLJ_B0256 CLJ_B0257 plsD nth TRUE 0.636 93.000 0.011 1.000 N NA
 7504464 7504465 CLJ_B0257 CLJ_B0258 nth   FALSE 0.389 152.000 0.000 1.000 N NA
 7504466 7504467 CLJ_B0259 CLJ_B0260     TRUE 0.863 26.000 0.004 1.000   NA
 7504467 7504468 CLJ_B0260 CLJ_B0261     TRUE 0.623 110.000 0.018 NA   NA
 7504469 7504470 CLJ_B0262 CLJ_B0263     FALSE 0.477 205.000 0.000 NA Y NA
 7504470 7504471 CLJ_B0263 CLJ_B0264   splB TRUE 0.625 146.000 0.027 1.000 N NA
 7504471 7504472 CLJ_B0264 CLJ_B0265 splB   FALSE 0.139 258.000 0.008 1.000 N NA
 7504472 7504473 CLJ_B0265 CLJ_B0266     TRUE 0.930 13.000 0.016 NA   NA
 7504473 7504474 CLJ_B0266 CLJ_B0267     FALSE 0.039 294.000 0.000 NA   NA
 7504474 7504475 CLJ_B0267 CLJ_B0268     TRUE 0.528 183.000 0.097 1.000   NA
 7504475 7504476 CLJ_B0268 CLJ_B0269     TRUE 0.987 2.000 0.438 1.000   NA
 7504476 7504477 CLJ_B0269 CLJ_B0270     TRUE 0.994 -7.000 0.720 0.033   NA
 7504477 7504478 CLJ_B0270 CLJ_B0271     TRUE 0.604 112.000 0.007 1.000   NA
 7504478 7504479 CLJ_B0271 CLJ_B0272   rpoN TRUE 0.545 188.000 0.125 1.000 N NA
 7504479 7504480 CLJ_B0272 CLJ_B0273 rpoN cggR FALSE 0.301 288.000 0.034 1.000 Y NA
 7504480 7504481 CLJ_B0273 CLJ_B0274 cggR gap_1 TRUE 0.850 78.000 0.348 1.000 N NA
 7504481 7504482 CLJ_B0274 CLJ_B0275 gap_1 pgk FALSE 0.341 297.000 0.063 0.004 Y NA
 7504482 7504483 CLJ_B0275 CLJ_B0276 pgk tpiA TRUE 0.927 62.000 0.141 1.000 Y NA
 7504483 7504484 CLJ_B0276 CLJ_B0277 tpiA gpmI TRUE 0.911 87.000 0.138 1.000 Y NA
 7504484 7504485 CLJ_B0277 CLJ_B0278 gpmI eno TRUE 0.895 56.000 0.016 1.000 Y NA
 7504485 7504486 CLJ_B0278 CLJ_B0279 eno secG FALSE 0.221 224.000 0.006 1.000 N NA
 7504486 7504487 CLJ_B0279 CLJ_B0280 secG rnr FALSE 0.387 208.000 0.064 1.000 N NA
 7504487 7504488 CLJ_B0280 CLJ_B0281 rnr surE FALSE 0.013 396.000 0.000 1.000   NA
 7504488 7504489 CLJ_B0281 CLJ_B0282 surE smpB FALSE 0.072 257.000 0.000 1.000   NA
 7504491 7504492 CLJ_B0284 CLJ_B0285 ssrA   FALSE 0.017 362.000 0.000 NA   NA
 7504492 7504493 CLJ_B0285 CLJ_B0286     FALSE 0.055 267.000 0.000 NA   NA
 7504493 7504494 CLJ_B0286 CLJ_B0287     FALSE 0.340 152.000 0.000 NA   NA
 7504494 7504495 CLJ_B0287 CLJ_B0288     FALSE 0.420 95.000 0.000 NA   NA
 7504495 7504496 CLJ_B0288 CLJ_B0289     FALSE 0.237 187.000 0.000 1.000 N NA
 7504496 7504497 CLJ_B0289 CLJ_B0290     FALSE 0.020 357.000 0.000 1.000   NA
 7504497 7504498 CLJ_B0290 CLJ_B0291     FALSE 0.006 499.000 0.000 NA   NA
 7504498 7504499 CLJ_B0291 CLJ_B0292     FALSE 0.074 256.000 0.000 NA N NA
 7504499 7504500 CLJ_B0292 CLJ_B0293     TRUE 0.951 67.000 0.455 1.000 Y NA
 7504500 7504501 CLJ_B0293 CLJ_B0294     TRUE 0.883 75.000 0.545 1.000 N NA
 7504501 7504502 CLJ_B0294 CLJ_B0295     TRUE 0.994 -13.000 0.833 NA   NA
 7504502 7504503 CLJ_B0295 CLJ_B0296     TRUE 0.985 -7.000 0.167 NA   NA
 7504503 7504504 CLJ_B0296 CLJ_B0297     FALSE 0.027 316.000 0.000 NA   NA
 7504504 7504505 CLJ_B0297 CLJ_B0299     FALSE 0.005 545.000 0.000 NA   NA
 7504505 7504506 CLJ_B0299 CLJ_B0300     FALSE 0.005 552.000 0.000 1.000   NA
 7504506 7504507 CLJ_B0300 CLJ_B0301     FALSE 0.411 140.000 0.000 1.000   NA
 7504507 7504508 CLJ_B0301 CLJ_B0302     TRUE 0.656 39.000 0.000 1.000   NA
 7504508 7504509 CLJ_B0302 CLJ_B0303     TRUE 0.778 26.000 0.000 1.000   NA
 7504509 7504510 CLJ_B0303 CLJ_B0304     FALSE 0.287 170.000 0.000 1.000   NA
 7504510 7504511 CLJ_B0304 CLJ_B0305     FALSE 0.205 193.000 0.000 1.000   NA
 7504513 7504514 CLJ_B0307 CLJ_B0308     FALSE 0.080 240.000 0.000 NA   NA
 7504515 7504516 CLJ_B0309 CLJ_B0310 spoVAE_1 spoVAD_1 TRUE 0.972 23.000 0.600 NA   NA
 7504516 7504517 CLJ_B0310 CLJ_B0311 spoVAD_1 spoVAC_1 TRUE 0.991 1.000 0.750 NA   NA
 7504517 7504518 CLJ_B0311 CLJ_B0312 spoVAC_1   TRUE 0.984 13.000 0.750 NA   NA
 7504518 7504519 CLJ_B0312 CLJ_B0313     TRUE 0.986 13.000 0.857 NA   NA
 7504520 7504521 CLJ_B0314 CLJ_B0315     FALSE 0.006 501.000 0.000 NA   NA
 7504521 7504522 CLJ_B0315 CLJ_B0316     TRUE 0.970 11.000 0.167 NA   NA
 7504522 7504523 CLJ_B0316 CLJ_B0317     TRUE 0.987 22.000 0.318 1.000 Y NA
 7504523 7504524 CLJ_B0317 CLJ_B0318     TRUE 0.936 25.000 0.091 1.000 N NA
 7504524 7504525 CLJ_B0318 CLJ_B0319     TRUE 0.996 -7.000 0.278 1.000 Y NA
 7504527 7504528 CLJ_B0321 CLJ_B0322     TRUE 0.889 164.000 0.294 1.000 Y NA
 7504529 7504530 CLJ_B0323 CLJ_B0324     TRUE 0.993 16.000 0.500 0.004 Y NA
 7504531 7504532 CLJ_B0325 CLJ_B0326     TRUE 0.989 8.000 1.000 NA   NA
 7504532 7504533 CLJ_B0326 CLJ_B0327     TRUE 0.982 6.000 0.400 NA   NA
 7504533 7504534 CLJ_B0327 CLJ_B0328     TRUE 0.992 10.000 0.235 1.000 Y NA
 7504534 7504535 CLJ_B0328 CLJ_B0329     TRUE 0.843 120.000 0.353 1.000 N NA
 7504535 7504536 CLJ_B0329 CLJ_B0330     TRUE 0.972 14.000 0.286 NA   NA
 7504536 7504537 CLJ_B0330 CLJ_B0331     FALSE 0.009 427.000 0.000 NA   NA
 7504537 7504538 CLJ_B0331 CLJ_B0332   glvA_1 FALSE 0.128 317.000 0.000 1.000 Y NA
 7504538 7504539 CLJ_B0332 CLJ_B0333 glvA_1   TRUE 0.587 183.000 0.000 1.000 Y NA
 7504539 7504540 CLJ_B0333 CLJ_B0334     FALSE 0.055 283.000 0.000 1.000 N NA
 7504542 7504543 CLJ_B0336 CLJ_B0337     FALSE 0.362 146.000 0.000 NA   NA
 7504543 7504544 CLJ_B0337 CLJ_B0338     FALSE 0.340 152.000 0.000 NA   NA
 7504544 7504545 CLJ_B0338 CLJ_B0339     TRUE 0.715 153.000 0.158 NA N NA
 7504545 7504546 CLJ_B0339 CLJ_B0340     TRUE 0.897 27.000 0.035 1.000   NA
 7504546 7504547 CLJ_B0340 CLJ_B0341     FALSE 0.010 419.000 0.000 1.000   NA
 7504547 7504548 CLJ_B0341 CLJ_B0342     TRUE 0.847 119.000 0.385 1.000 N NA
 7504548 7504549 CLJ_B0342 CLJ_B0343   glvA_2 FALSE 0.200 397.000 0.385 1.000 Y NA
 7504549 7504550 CLJ_B0343 CLJ_B0344 glvA_2   TRUE 0.992 13.000 0.375 1.000 Y NA
 7504550 7504551 CLJ_B0344 CLJ_B0345   ilvD TRUE 0.926 138.000 0.286 1.000 Y NA
 7504551 7504552 CLJ_B0345 CLJ_B0346 ilvD eda TRUE 0.942 52.000 0.091 0.062 Y NA
 7504552 7504553 CLJ_B0346 CLJ_B0347 eda   TRUE 0.991 2.000 0.091 1.000 Y NA
 7504555 7504556 CLJ_B0349 CLJ_B0350 ade   FALSE 0.013 403.000 0.000 1.000 N NA
 7504556 7504557 CLJ_B0350 CLJ_B0351     TRUE 0.998 -3.000 0.889 1.000 Y NA
 7504557 7504558 CLJ_B0351 CLJ_B0352     FALSE 0.130 284.000 0.049 NA N NA
 7504558 7504559 CLJ_B0352 CLJ_B0353     TRUE 0.991 -16.000 0.400 NA   NA
 7504559 7504560 CLJ_B0353 CLJ_B0354     FALSE 0.414 119.000 0.000 NA   NA
 7504560 7504561 CLJ_B0354 CLJ_B0355     FALSE 0.018 356.000 0.000 NA   NA
 7504561 7504562 CLJ_B0355 CLJ_B0356     FALSE 0.069 265.000 0.000 1.000 N NA
 7504562 7504563 CLJ_B0356 CLJ_B0357     TRUE 0.992 3.000 0.167 1.000 Y NA
 7504563 7504564 CLJ_B0357 CLJ_B0358     TRUE 0.996 2.000 0.750 1.000 Y NA
 7504564 7504565 CLJ_B0358 CLJ_B0359     TRUE 0.925 33.000 0.200 1.000 N NA
 7504569 7504570 CLJ_B0363 CLJ_B0364     TRUE 0.939 27.000 0.000 1.000 Y NA
 7504570 7504571 CLJ_B0364 CLJ_B0365     TRUE 0.987 -3.000 0.000 0.032 Y NA
 7504571 7504572 CLJ_B0365 CLJ_B0366     TRUE 0.972 11.000 0.000 1.000 Y NA
 7504572 7504573 CLJ_B0366 CLJ_B0367     TRUE 0.937 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7504575 7504576 CLJ_B0370 CLJ_B0371   xpt_1 TRUE 0.973 23.000 0.032 1.000 Y NA
 7504576 7504577 CLJ_B0371 CLJ_B0372 xpt_1   FALSE 0.009 451.000 0.000 1.000 N NA
 7504577 7504578 CLJ_B0372 CLJ_B0373     TRUE 0.995 13.000 1.000 1.000 Y NA
 7504578 7504579 CLJ_B0373 CLJ_B0374   uppP_1 TRUE 0.655 177.000 0.222 1.000 N NA
 7504579 7504580 CLJ_B0374 CLJ_B0375 uppP_1   TRUE 0.991 15.000 0.333 1.000 Y NA
 7504580 7504581 CLJ_B0375 CLJ_B0376     TRUE 0.991 0.000 0.750 NA   NA
 7504581 7504582 CLJ_B0376 CLJ_B0377     TRUE 0.782 24.000 0.000 NA   NA
 7504582 7504583 CLJ_B0377 CLJ_B0378     FALSE 0.024 327.000 0.000 NA   NA
 7504583 7504584 CLJ_B0378 CLJ_B0379     TRUE 0.990 3.000 0.869 NA   NA
 7504585 7504586 CLJ_B0380 CLJ_B0381     TRUE 0.940 0.000 0.000 0.075   NA
 7504587 7504588 CLJ_B0382 CLJ_B0383     FALSE 0.015 369.000 0.000 NA   NA
 7504588 7504589 CLJ_B0383 CLJ_B0384     TRUE 0.571 135.000 0.006 NA   NA
 7504589 7504590 CLJ_B0384 CLJ_B0385     FALSE 0.025 323.000 0.000 NA   NA
 7504590 7504591 CLJ_B0385 CLJ_B0386     TRUE 0.789 179.000 1.000 NA   NA
 7504591 7504592 CLJ_B0386 CLJ_B0387     TRUE 0.992 -7.000 0.556 NA   NA
 7504592 7504593 CLJ_B0387 CLJ_B0388     TRUE 0.993 -16.000 0.556 NA   NA
 7504593 7504594 CLJ_B0388 CLJ_B0389     TRUE 0.795 73.000 0.179 NA   NA
 7504594 7504595 CLJ_B0389 CLJ_B0390     FALSE 0.114 231.000 0.000 1.000 N NA
 7504595 7504596 CLJ_B0390 CLJ_B0391     FALSE 0.012 396.000 0.000 NA   NA
 7504596 7504597 CLJ_B0391 CLJ_B0392     TRUE 0.967 27.000 0.667 NA   NA
 7504597 7504598 CLJ_B0392 CLJ_B0393     FALSE 0.099 229.000 0.000 NA   NA
 7504598 7504599 CLJ_B0393 CLJ_B0394     TRUE 0.995 -13.000 1.000 NA   NA
 7504599 7504600 CLJ_B0394 CLJ_B0395     TRUE 0.900 81.000 1.000 NA   NA
 7504600 7504601 CLJ_B0395 CLJ_B0396     FALSE 0.303 301.000 1.000 NA   NA
 7504601 7504602 CLJ_B0396 CLJ_B0397     FALSE 0.102 233.000 0.000 NA N NA
 7504604 7504605 CLJ_B0399 CLJ_B0400     TRUE 0.953 119.000 0.667 1.000 Y NA
 7504605 7504606 CLJ_B0400 CLJ_B0401   adhE FALSE 0.011 429.000 0.000 1.000 N NA
 7504606 7504607 CLJ_B0401 CLJ_B0402 adhE   FALSE 0.032 304.000 0.000 NA   NA
 7504607 7504608 CLJ_B0402 CLJ_B0403     TRUE 0.668 63.000 0.019 NA   NA
 7504609 7504610 CLJ_B0404 CLJ_B0405     FALSE 0.021 342.000 0.000 NA   NA
 7504611 7504612 CLJ_B0406 CLJ_B0407     FALSE 0.005 554.000 0.000 1.000   NA
 7504612 7504613 CLJ_B0407 CLJ_B0408     TRUE 0.700 108.000 0.038 1.000 N NA
 7504613 7504614 CLJ_B0408 CLJ_B0409     TRUE 0.986 10.000 0.038 1.000 Y NA
 7504614 7504615 CLJ_B0409 CLJ_B0410     TRUE 0.766 63.000 0.091 NA   NA
 7504615 7504616 CLJ_B0410 CLJ_B0411     FALSE 0.392 207.000 0.087 NA   NA
 7504616 7504617 CLJ_B0411 CLJ_B0412     TRUE 0.921 26.000 0.087 NA   NA
 7504618 7504619 CLJ_B0413 CLJ_B0414     FALSE 0.167 200.000 0.000 NA   NA
 7504620 7504621 CLJ_B0415 CLJ_B0416     FALSE 0.201 194.000 0.000 1.000   NA
 7504621 7504622 CLJ_B0416 CLJ_B0417     FALSE 0.031 312.000 0.000 1.000   NA
 7504624 7504625 CLJ_B0419 CLJ_B0420     TRUE 0.596 134.000 0.013 NA   NA
 7504625 7504626 CLJ_B0420 CLJ_B0421     TRUE 0.987 -54.000 0.105 1.000   NA
 7504626 7504627 CLJ_B0421 CLJ_B0422     TRUE 0.997 -10.000 0.429 1.000 Y NA
 7504627 7504628 CLJ_B0422 CLJ_B0423     FALSE 0.473 108.000 0.000 1.000 N NA
 7504628 7504629 CLJ_B0423 CLJ_B0424     FALSE 0.003 1392.000 0.000 1.000 N NA
 7504629 7504630 CLJ_B0424 CLJ_B0425     TRUE 0.990 23.000 0.431 0.046 Y NA
 7504630 7504631 CLJ_B0425 CLJ_B0426     TRUE 0.997 0.000 0.678 0.046 Y NA
 7504631 7504632 CLJ_B0426 CLJ_B0427     TRUE 0.990 11.000 0.091 0.046 Y NA
 7504632 7504633 CLJ_B0427 CLJ_B0428     TRUE 0.959 51.000 0.237 0.046 Y NA
 7504633 7504634 CLJ_B0428 CLJ_B0429     TRUE 0.991 14.000 0.221 0.046 Y NA
 7504634 7504635 CLJ_B0429 CLJ_B0430     FALSE 0.018 356.000 0.000 NA   NA
 7504636 7504637 CLJ_B0431 CLJ_B0432     TRUE 0.936 18.000 0.059 NA   NA
 7504637 7504638 CLJ_B0432 CLJ_B0433     TRUE 0.800 115.000 0.231 NA   NA
 7504639 7504640 CLJ_B0434 CLJ_B0435     FALSE 0.011 402.000 0.000 NA   NA
 7504640 7504641 CLJ_B0435 CLJ_B0436     TRUE 0.876 93.000 0.667 NA   NA
 7504641 7504642 CLJ_B0436 CLJ_B0437     FALSE 0.053 270.000 0.000 NA   NA
 7504646 7504647 CLJ_B0441 CLJ_B0442     FALSE 0.012 397.000 0.000 NA   NA
 7504647 7504648 CLJ_B0442 CLJ_B0443     FALSE 0.182 195.000 0.000 NA   NA
 7504648 7504649 CLJ_B0443 CLJ_B0444   pstA_1 TRUE 0.655 36.000 0.000 NA   NA
 7504649 7504650 CLJ_B0444 CLJ_B0445 pstA_1   TRUE 0.995 2.000 0.270 0.002 Y NA
 7504650 7504651 CLJ_B0445 CLJ_B0446     TRUE 0.825 121.000 0.294 1.000   NA
 7504651 7504652 CLJ_B0446 CLJ_B0447     FALSE 0.020 355.000 0.000 1.000   NA
 7504654 7504655 CLJ_B0449 CLJ_B0450     TRUE 0.824 78.000 0.286 NA   NA
 7504655 7504656 CLJ_B0450 CLJ_B0451     TRUE 0.806 87.000 0.250 NA   NA
 7504656 7504657 CLJ_B0451 CLJ_B0452     FALSE 0.068 254.000 0.000 NA   NA
 7504657 7504658 CLJ_B0452 CLJ_B0454     TRUE 0.699 64.000 0.034 NA   NA
 7504660 7504661 CLJ_B0455 CLJ_B0456     TRUE 0.716 137.000 0.079 1.000   NA
 7504662 7504663 CLJ_B0457 CLJ_B0458     FALSE 0.003 958.000 0.000 1.000 N NA
 7504664 7504665 CLJ_B0459 CLJ_B0460   rnhA TRUE 0.968 -25.000 0.003 NA   NA
 7504665 7504666 CLJ_B0460 CLJ_B0461 rnhA   TRUE 0.612 63.000 0.003 NA   NA
 7504666 7504667 CLJ_B0461 CLJ_B0462     TRUE 0.677 181.000 0.400 NA   NA
 7504667 7504668 CLJ_B0462 CLJ_B0463     TRUE 0.953 32.000 0.400 0.028   NA
 7504668 7504669 CLJ_B0463 CLJ_B0464     FALSE 0.029 309.000 0.000 NA   NA
 7504669 7504670 CLJ_B0464 CLJ_B0465     TRUE 0.709 30.000 0.000 NA   NA
 7504670 7504671 CLJ_B0465 CLJ_B0466     FALSE 0.249 174.000 0.000 NA   NA
 7504671 7504672 CLJ_B0466 CLJ_B0467     FALSE 0.050 273.000 0.000 NA   NA
 7504672 7504673 CLJ_B0467 CLJ_B0468   clpB FALSE 0.008 442.000 0.000 NA   NA
 7504674 7504675 CLJ_B0469 CLJ_B0470     TRUE 0.915 58.000 0.796 1.000   NA
 7504676 7504677 CLJ_B0471 CLJ_B0472 manA   FALSE 0.019 350.000 0.000 NA   NA
 7504677 7504678 CLJ_B0472 CLJ_B0473   uppP_2 TRUE 0.859 108.000 0.500 NA   NA
 7504678 7504679 CLJ_B0473 CLJ_B0474 uppP_2   TRUE 0.782 24.000 0.000 NA   NA
 7504679 7504680 CLJ_B0474 CLJ_B0475   rrs_7 FALSE 0.058 264.000 0.000 NA   NA
 7504680 7504681 CLJ_B0475 CLJ_B0476 rrs_7   FALSE 0.374 143.000 0.000 NA   NA
 7504681 7504682 CLJ_B0476 CLJ_B0477     TRUE 0.885 5.000 0.000 NA   NA
 7504682 7504683 CLJ_B0477 CLJ_B0480   rrl_7 FALSE 0.438 74.000 0.000 NA   NA
 7504683 7504684 CLJ_B0480 CLJ_B0481 rrl_7 rrf_7 FALSE 0.423 106.000 0.000 NA   NA
 7504684 7504685 CLJ_B0481 CLJ_B0482 rrf_7   TRUE 0.877 8.000 0.000 NA   NA
 7504687 7504688 CLJ_B0484 CLJ_B0485     FALSE 0.003 923.000 0.000 1.000 N NA
 7504688 7504689 CLJ_B0485 CLJ_B0486     TRUE 0.679 143.000 0.027 0.061 N NA
 7504689 7504690 CLJ_B0486 CLJ_B0487     TRUE 0.703 203.000 0.054 0.061 Y NA
 7504690 7504691 CLJ_B0487 CLJ_B0488     FALSE 0.050 415.000 0.000 1.000 Y NA
 7504691 7504692 CLJ_B0488 CLJ_B0490     FALSE 0.006 523.000 0.000 NA N NA
 7504693 7504694 CLJ_B0491 CLJ_B0492   panD TRUE 0.567 88.000 0.004 NA   NA
 7504694 7504695 CLJ_B0492 CLJ_B0493 panD panC FALSE 0.384 308.000 0.342 1.000 Y NA
 7504695 7504696 CLJ_B0493 CLJ_B0494 panC panB TRUE 0.579 276.000 0.395 0.001 Y NA
 7504699 7504700 CLJ_B0497 CLJ_B0498     TRUE 0.988 3.000 0.667 NA   NA
 7504702 7504703 CLJ_B0500 CLJ_B0501 hypB   FALSE 0.306 236.000 0.115 1.000 N NA
 7504703 7504704 CLJ_B0501 CLJ_B0502   hypA TRUE 0.875 56.000 0.333 1.000   NA
 7504704 7504705 CLJ_B0502 CLJ_B0503 hypA   TRUE 0.905 38.000 0.214 NA   NA
 7504707 7504708 CLJ_B0505 CLJ_B0506     FALSE 0.418 93.000 0.000 NA   NA
 7504708 7504709 CLJ_B0506 CLJ_B0507   addA FALSE 0.316 158.000 0.000 NA   NA
 7504709 7504710 CLJ_B0507 CLJ_B0508 addA   TRUE 0.595 142.000 0.010 1.000 N NA
 7504710 7504711 CLJ_B0508 CLJ_B0509   pepT TRUE 0.733 76.000 0.056 1.000 N NA
 7504713 7504714 CLJ_B0511 CLJ_B0512     FALSE 0.152 206.000 0.000 NA   NA
 7504714 7504715 CLJ_B0512 CLJ_B0513     TRUE 0.823 140.000 0.400 NA   NA
 7504715 7504716 CLJ_B0513 CLJ_B0514     FALSE 0.254 173.000 0.000 NA   NA
 7504716 7504717 CLJ_B0514 CLJ_B0515     TRUE 0.816 19.000 0.000 NA   NA
 7504717 7504718 CLJ_B0515 CLJ_B0516     FALSE 0.423 138.000 0.000 NA N NA
 7504719 7504720 CLJ_B0517 CLJ_B0518     TRUE 0.994 13.000 0.461 0.045 Y NA
 7504722 7504723 CLJ_B0520 CLJ_B0521   thiE FALSE 0.063 265.000 0.000 NA N NA
 7504723 7504724 CLJ_B0521 CLJ_B0522 thiE thiM_1 TRUE 0.996 -9.000 0.190 0.005 Y NA
 7504724 7504725 CLJ_B0522 CLJ_B0523 thiM_1 thiD_1 TRUE 0.620 222.000 0.039 0.005 Y NA
 7504726 7504727 CLJ_B0525 CLJ_B0526   ddlB FALSE 0.417 112.000 0.000 NA   NA
 7504727 7504728 CLJ_B0526 CLJ_B0527 ddlB   FALSE 0.503 157.000 0.004 1.000 N NA
 7504728 7504729 CLJ_B0527 CLJ_B0528     TRUE 0.992 4.000 0.182 1.000 Y NA
 7504729 7504730 CLJ_B0528 CLJ_B0529     TRUE 0.995 1.000 0.241 0.031 Y NA
 7504730 7504731 CLJ_B0529 CLJ_B0530     TRUE 0.990 12.000 0.167 1.000 Y NA
 7504731 7504732 CLJ_B0530 CLJ_B0531     TRUE 0.991 2.000 0.048 0.033 Y NA
 7504732 7504733 CLJ_B0531 CLJ_B0532     TRUE 0.934 29.000 0.222 NA   NA
 7504733 7504734 CLJ_B0532 CLJ_B0533     FALSE 0.011 402.000 0.000 NA   NA
 7504734 7504735 CLJ_B0533 CLJ_B0534     TRUE 0.991 -6.000 0.500 NA   NA
 7504735 7504736 CLJ_B0534 CLJ_B0535     FALSE 0.374 143.000 0.000 NA   NA
 7504736 7504737 CLJ_B0535 CLJ_B0536     TRUE 0.636 61.000 0.007 NA   NA
 7504737 7504738 CLJ_B0536 CLJ_B0537     TRUE 0.872 10.000 0.000 NA   NA
 7504738 7504739 CLJ_B0537 CLJ_B0538     FALSE 0.005 519.000 0.000 NA   NA
 7504739 7504740 CLJ_B0538 CLJ_B0539     FALSE 0.466 163.000 0.010 NA   NA
 7504740 7504741 CLJ_B0539 CLJ_B0540     TRUE 0.586 134.000 0.010 NA   NA
 7504741 7504742 CLJ_B0540 CLJ_B0541     FALSE 0.490 176.000 0.050 NA   NA
 7504742 7504743 CLJ_B0541 CLJ_B0542     TRUE 0.958 2.000 0.025 NA   NA
 7504744 7504745 CLJ_B0543 CLJ_B0544     TRUE 0.805 21.000 0.000 NA   NA
 7504746 7504747 CLJ_B0545 CLJ_B0546 sbcD sbcC TRUE 0.994 -25.000 0.669 NA N NA
 7504747 7504748 CLJ_B0546 CLJ_B0547 sbcC   TRUE 0.789 35.000 0.005 NA   NA
 7504748 7504749 CLJ_B0547 CLJ_B0548     FALSE 0.003 827.000 0.000 NA   NA
 7504749 7504750 CLJ_B0548 CLJ_B0549     FALSE 0.007 465.000 0.000 NA   NA
 7504750 7504751 CLJ_B0549 CLJ_B0550   cadA_1 TRUE 0.730 76.000 0.053 1.000 N NA
 7504751 7504752 CLJ_B0550 CLJ_B0551 cadA_1   FALSE 0.009 420.000 0.000 NA   NA
 7504752 7504753 CLJ_B0551 CLJ_B0552     FALSE 0.192 190.000 0.000 NA   NA
 7504753 7504754 CLJ_B0552 CLJ_B0553     TRUE 0.816 19.000 0.000 NA   NA
 7504754 7504755 CLJ_B0553 CLJ_B0554     FALSE 0.006 497.000 0.000 NA   NA
 7504759 7504760 CLJ_B0558 CLJ_B0559     FALSE 0.008 450.000 0.000 NA N NA
 7504760 7504761 CLJ_B0559 CLJ_B0560     TRUE 0.985 10.000 0.667 NA   NA
 7504762 7504763 CLJ_B0561 CLJ_B0562     TRUE 0.940 0.000 0.000 0.072   NA
 7504764 7504765 CLJ_B0563 CLJ_B0564   sagB TRUE 0.690 165.000 0.222 NA   NA
 7504765 7504766 CLJ_B0564 CLJ_B0565 sagB sagC TRUE 0.978 4.000 0.222 NA   NA
 7504766 7504767 CLJ_B0565 CLJ_B0566 sagC sagD TRUE 0.970 16.000 0.318 NA   NA
 7504767 7504768 CLJ_B0566 CLJ_B0567 sagD   TRUE 0.984 -25.000 0.091 NA   NA
 7504768 7504769 CLJ_B0567 CLJ_B0568     TRUE 0.989 8.000 1.000 NA   NA
 7504769 7504770 CLJ_B0568 CLJ_B0569   sagG FALSE 0.020 344.000 0.000 NA   NA
 7504770 7504771 CLJ_B0569 CLJ_B0570 sagG sagH TRUE 0.982 12.000 0.500 NA N NA
 7504771 7504772 CLJ_B0570 CLJ_B0571 sagH sagI TRUE 0.979 2.000 0.160 NA N NA
 7504772 7504773 CLJ_B0571 CLJ_B0572 sagI   FALSE 0.016 375.000 0.000 1.000   NA
 7504774 7504775 CLJ_B0573 CLJ_B0574     TRUE 0.843 118.000 0.409 NA   NA
 7504775 7504776 CLJ_B0574 CLJ_B0575     TRUE 0.726 127.000 0.091 NA   NA
 7504777 7504778 CLJ_B0576 CLJ_B0577 trmB   FALSE 0.136 212.000 0.000 NA   NA
 7504780 7504781 CLJ_B0579 CLJ_B0580     FALSE 0.516 63.000 0.000 1.000 N NA
 7504783 7504784 CLJ_B0582 CLJ_B0583     FALSE 0.068 262.000 0.000 NA N NA
 7504784 7504785 CLJ_B0583 CLJ_B0584     FALSE 0.040 297.000 0.000 1.000   NA
 7504785 7504786 CLJ_B0584 CLJ_B0585     TRUE 0.937 36.000 0.400 1.000   NA
 7504786 7504787 CLJ_B0585 CLJ_B0586     FALSE 0.491 205.000 0.000 1.000 Y NA
 7504787 7504788 CLJ_B0586 CLJ_B0587   serS_2 FALSE 0.008 481.000 0.000 1.000 N NA
 7504788 7504789 CLJ_B0587 CLJ_B0588 serS_2   FALSE 0.005 595.000 0.000 1.000 N NA
 7504790 7504791 CLJ_B0589 CLJ_B0590     FALSE 0.018 362.000 0.000 1.000   NA
 7504794 7504795 CLJ_B0593 CLJ_B0594     FALSE 0.179 196.000 0.000 NA   NA
 7504800 7504801 CLJ_B0599 CLJ_B0600     FALSE 0.359 147.000 0.000 NA   NA
 7504804 7504805 CLJ_B0603 CLJ_B0604     FALSE 0.004 623.000 0.000 NA   NA
 7504805 7504806 CLJ_B0604 CLJ_B0605     FALSE 0.022 680.000 0.000 0.005 Y NA
 7504806 7504807 CLJ_B0605 CLJ_B0606     FALSE 0.021 351.000 0.000 1.000   NA
 7504807 7504808 CLJ_B0606 CLJ_B0607     TRUE 0.741 45.000 0.008 1.000   NA
 7504809 7504810 CLJ_B0608 CLJ_B0610     FALSE 0.174 294.000 0.000 1.000 Y NA
 7504810 7504811 CLJ_B0610 CLJ_B0611     TRUE 0.997 0.000 0.455 0.001 Y NA
 7504812 7504813 CLJ_B0612 CLJ_B0613     FALSE 0.006 488.000 0.000 NA   NA
 7504815 7504816 CLJ_B0615 CLJ_B0616     TRUE 0.994 3.000 0.313 NA Y NA
 7504816 7504817 CLJ_B0616 CLJ_B0617     FALSE 0.017 361.000 0.000 NA   NA
 7504817 7504818 CLJ_B0617 CLJ_B0618     TRUE 0.875 9.000 0.000 NA   NA
 7504818 7504819 CLJ_B0618 CLJ_B0619   pepP FALSE 0.006 508.000 0.000 NA   NA
 7504820 7504821 CLJ_B0620 CLJ_B0621     FALSE 0.383 141.000 0.000 NA   NA
 7504821 7504822 CLJ_B0621 CLJ_B0622     FALSE 0.448 69.000 0.000 NA   NA
 7504822 7504823 CLJ_B0622 CLJ_B0623     TRUE 0.566 67.000 0.000 0.013   NA
 7504824 7504825 CLJ_B0624 CLJ_B0625     FALSE 0.005 516.000 0.000 NA   NA
 7504825 7504826 CLJ_B0625 CLJ_B0626     TRUE 0.902 2.000 0.000 NA   NA
 7504826 7504827 CLJ_B0626 CLJ_B0627     FALSE 0.217 182.000 0.000 NA   NA
 7504827 7504828 CLJ_B0627 CLJ_B0628     FALSE 0.455 66.000 0.000 NA   NA
 7504828 7504829 CLJ_B0628 CLJ_B0629     FALSE 0.054 269.000 0.000 NA   NA
 7504829 7504830 CLJ_B0629 CLJ_B0630     TRUE 0.841 15.000 0.000 NA   NA
 7504830 7504831 CLJ_B0630 CLJ_B0631     TRUE 0.863 12.000 0.000 NA   NA
 7504831 7504832 CLJ_B0631 CLJ_B0632     FALSE 0.009 422.000 0.000 NA   NA
 7504832 7504833 CLJ_B0632 CLJ_B0633     FALSE 0.003 919.000 0.000 NA   NA
 7504835 7504836 CLJ_B0635 CLJ_B0637 mscL   FALSE 0.084 237.000 0.000 NA   NA
 7504838 7504839 CLJ_B0639 CLJ_B0640     FALSE 0.433 76.000 0.000 NA   NA
 7504839 7504840 CLJ_B0640 CLJ_B0641     FALSE 0.058 264.000 0.000 NA   NA
 7504840 7504841 CLJ_B0641 CLJ_B0642     TRUE 0.986 -7.000 0.165 1.000 N NA
 7504841 7504842 CLJ_B0642 CLJ_B0643     TRUE 0.967 0.000 0.035 NA   NA
 7504842 7504843 CLJ_B0643 CLJ_B0644     FALSE 0.025 325.000 0.000 NA   NA
 7504843 7504844 CLJ_B0644 CLJ_B0645   potA FALSE 0.004 665.000 0.000 1.000 N NA
 7504844 7504845 CLJ_B0645 CLJ_B0646 potA potB TRUE 0.997 0.000 0.789 1.000 Y NA
 7504845 7504846 CLJ_B0646 CLJ_B0647 potB potCD TRUE 0.991 0.000 0.022 0.031 Y NA
 7504846 7504847 CLJ_B0647 CLJ_B0648 potCD   FALSE 0.005 606.000 0.000 NA N NA
 7504847 7504848 CLJ_B0648 CLJ_B0649     TRUE 0.894 3.000 0.000 NA   NA
 7504852 7504853 CLJ_B0653 CLJ_B0654     FALSE 0.089 234.000 0.000 NA   NA
 7504853 7504854 CLJ_B0654 CLJ_B0655     FALSE 0.416 83.000 0.000 NA   NA
 7504856 7504857 CLJ_B0657 CLJ_B0658     FALSE 0.006 477.000 0.000 NA   NA
 7504857 7504858 CLJ_B0658 CLJ_B0659     FALSE 0.010 418.000 0.000 NA   NA
 7504860 7504861 CLJ_B0661 CLJ_B0662   lepB_1 FALSE 0.329 161.000 0.000 1.000   NA
 7504861 7504862 CLJ_B0662 CLJ_B0663 lepB_1   FALSE 0.004 832.000 0.000 1.000 N NA
 7504862 7504863 CLJ_B0663 CLJ_B0664     FALSE 0.004 605.000 0.000 NA   NA
 7504863 7504864 CLJ_B0664 CLJ_B0665     TRUE 0.954 40.000 1.000 NA   NA
 7504864 7504865 CLJ_B0665 CLJ_B0666     FALSE 0.003 694.000 0.000 NA   NA
 7504865 7504866 CLJ_B0666 CLJ_B0667     FALSE 0.003 789.000 0.000 NA   NA
 7504866 7504867 CLJ_B0667 CLJ_B0668     TRUE 0.979 -7.000 0.080 NA   NA
 7504867 7504868 CLJ_B0668 CLJ_B0669     TRUE 0.958 37.000 1.000 NA   NA
 7504868 7504869 CLJ_B0669 CLJ_B0670     TRUE 0.915 35.000 0.222 NA   NA
 7504869 7504870 CLJ_B0670 CLJ_B0671     TRUE 0.633 176.000 0.222 NA   NA
 7504870 7504871 CLJ_B0671 CLJ_B0672     TRUE 0.965 23.000 0.400 NA   NA
 7504871 7504872 CLJ_B0672 CLJ_B0673     TRUE 0.736 93.000 0.095 NA   NA
 7504872 7504873 CLJ_B0673 CLJ_B0674     TRUE 0.970 15.000 0.238 NA N NA
 7504873 7504874 CLJ_B0674 CLJ_B0675     FALSE 0.005 565.000 0.000 1.000   NA
 7504874 7504875 CLJ_B0675 CLJ_B0676     FALSE 0.400 137.000 0.000 NA   NA
 7504875 7504876 CLJ_B0676 CLJ_B0677     FALSE 0.003 729.000 0.000 NA   NA
 7504876 7504877 CLJ_B0677 CLJ_B0678     FALSE 0.023 329.000 0.000 NA   NA
 7504877 7504878 CLJ_B0678 CLJ_B0679     FALSE 0.012 397.000 0.000 NA   NA
 7504878 7504879 CLJ_B0679 CLJ_B0680     FALSE 0.006 488.000 0.000 NA   NA
 7504880 7504881 CLJ_B0681 CLJ_B0682     FALSE 0.027 335.000 0.000 1.000 N NA
 7504882 7504883 CLJ_B0683 CLJ_B0684 asnS   FALSE 0.003 720.000 0.000 NA   NA
 7504885 7504886 CLJ_B0686 CLJ_B0687     TRUE 0.826 17.000 0.000 NA   NA
 7504886 7504887 CLJ_B0687 CLJ_B0688     FALSE 0.003 736.000 0.000 NA   NA
 7504887 7504888 CLJ_B0688 CLJ_B0689     TRUE 0.945 21.000 0.085 1.000 N NA
 7504888 7504889 CLJ_B0689 CLJ_B0690     TRUE 0.989 29.000 0.932 1.000 Y NA
 7504889 7504890 CLJ_B0690 CLJ_B0691     TRUE 0.572 53.000 0.000 1.000 N NA
 7504890 7504891 CLJ_B0691 CLJ_B0692     FALSE 0.133 214.000 0.000 NA   NA
 7504891 7504892 CLJ_B0692 CLJ_B0693     FALSE 0.414 87.000 0.000 NA   NA
 7504893 7504894 CLJ_B0694 CLJ_B0695     TRUE 0.774 141.000 0.200 NA N NA
 7504894 7504895 CLJ_B0695 CLJ_B0696     TRUE 0.995 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 7504898 7504899 CLJ_B0699 CLJ_B0700     TRUE 0.722 169.000 0.286 1.000 N NA
 7504901 7504902 CLJ_B0702 CLJ_B0703     TRUE 0.742 102.000 0.083 1.000   NA
 7504903 7504904 CLJ_B0704 CLJ_B0705 csaA   FALSE 0.303 208.000 0.023 1.000   NA
 7504904 7504905 CLJ_B0705 CLJ_B0706     FALSE 0.039 298.000 0.000 1.000   NA
 7504908 7504909 CLJ_B0709 CLJ_B0710     FALSE 0.005 520.000 0.000 NA   NA
 7504910 7504911 CLJ_B0711 CLJ_B0712     FALSE 0.226 180.000 0.000 NA   NA
 7504912 7504913 CLJ_B0713 CLJ_B0714 rhlE   FALSE 0.005 599.000 0.000 1.000   NA
 7504913 7504914 CLJ_B0714 CLJ_B0715     TRUE 0.696 172.000 0.286 1.000   NA
 7504914 7504915 CLJ_B0715 CLJ_B0716     TRUE 0.948 28.000 0.250 1.000 N NA
 7504917 7504918 CLJ_B0718 CLJ_B0719     FALSE 0.413 123.000 0.000 NA   NA
 7504918 7504919 CLJ_B0719 CLJ_B0720     FALSE 0.007 473.000 0.000 NA   NA
 7504919 7504920 CLJ_B0720 CLJ_B0721     FALSE 0.453 67.000 0.000 NA   NA
 7504920 7504921 CLJ_B0721 CLJ_B0722     FALSE 0.410 130.000 0.000 NA   NA
 7504922 7504923 CLJ_B0723 CLJ_B0724     FALSE 0.271 169.000 0.000 NA   NA
 7504924 7504925 CLJ_B0725 CLJ_B0726 licT   TRUE 0.582 207.000 0.409 1.000   NA
 7504925 7504926 CLJ_B0726 CLJ_B0727     TRUE 0.959 12.000 0.074 1.000   NA
 7504926 7504927 CLJ_B0727 CLJ_B0728     FALSE 0.004 628.000 0.000 1.000   NA
 7504927 7504928 CLJ_B0728 CLJ_B0729     TRUE 0.724 158.000 0.190 1.000 N NA
 7504928 7504929 CLJ_B0729 CLJ_B0730   ric TRUE 0.779 60.000 0.071 1.000 N NA
 7504929 7504930 CLJ_B0730 CLJ_B0731 ric   TRUE 0.922 26.000 0.089 NA   NA
 7504934 7504935 CLJ_B0735 CLJ_B0736     TRUE 0.879 7.000 0.000 NA   NA
 7504935 7504936 CLJ_B0736 CLJ_B0737     FALSE 0.003 899.000 0.000 NA   NA
 7504936 7504937 CLJ_B0737 CLJ_B0738     FALSE 0.340 152.000 0.000 NA   NA
 7504937 7504938 CLJ_B0738 CLJ_B0739     FALSE 0.491 57.000 0.000 NA   NA
 7504938 7504939 CLJ_B0739 CLJ_B0740     TRUE 0.987 -37.000 0.118 1.000   NA
 7504939 7504940 CLJ_B0740 CLJ_B0741     TRUE 0.966 31.000 1.000 NA   NA
 7504940 7504941 CLJ_B0741 CLJ_B0742     FALSE 0.003 1301.000 0.000 NA   NA
 7504941 7504942 CLJ_B0742 CLJ_B0743     FALSE 0.045 290.000 0.000 1.000   NA
 7504942 7504943 CLJ_B0743 CLJ_B0744   greA_1 TRUE 0.614 136.000 0.008 1.000 N NA
 7504943 7504944 CLJ_B0744 CLJ_B0745 greA_1   FALSE 0.503 168.000 0.031 NA   NA
 7504944 7504945 CLJ_B0745 CLJ_B0746     FALSE 0.049 274.000 0.000 NA   NA
 7504945 7504946 CLJ_B0746 CLJ_B0747     TRUE 0.895 95.000 0.041 0.070 Y NA
 7504946 7504947 CLJ_B0747 CLJ_B0748     FALSE 0.415 88.000 0.000 NA   NA
 7504947 7504948 CLJ_B0748 CLJ_B0749     FALSE 0.123 219.000 0.000 NA   NA
 7504948 7504949 CLJ_B0749 CLJ_B0750     FALSE 0.204 186.000 0.000 NA   NA
 7504949 7504950 CLJ_B0750 CLJ_B0751     TRUE 0.988 -3.000 0.333 NA   NA
 7504950 7504951 CLJ_B0751 CLJ_B0752     TRUE 0.984 4.000 0.444 NA   NA
 7504951 7504952 CLJ_B0752 CLJ_B0753     FALSE 0.176 197.000 0.000 NA   NA
 7504952 7504953 CLJ_B0753 CLJ_B0754     FALSE 0.358 153.000 0.000 1.000   NA
 7504953 7504954 CLJ_B0754 CLJ_B0755     TRUE 0.908 1.000 0.000 NA   NA
 7504954 7504955 CLJ_B0755 CLJ_B0756     FALSE 0.266 170.000 0.000 NA   NA
 7504955 7504956 CLJ_B0756 CLJ_B0757     FALSE 0.006 555.000 0.000 1.000 N NA
 7504956 7504957 CLJ_B0757 CLJ_B0758     FALSE 0.112 351.000 0.000 0.004 Y NA
 7504957 7504958 CLJ_B0758 CLJ_B0759   fhuB TRUE 0.947 96.000 0.500 1.000 Y NA
 7504958 7504959 CLJ_B0759 CLJ_B0760 fhuB fhuG TRUE 0.997 0.000 0.750 0.030 Y NA
 7504959 7504960 CLJ_B0760 CLJ_B0761 fhuG fhuC TRUE 0.589 229.000 0.100 1.000 Y NA
 7504960 7504961 CLJ_B0761 CLJ_B0762 fhuC nifH TRUE 0.973 30.000 0.150 1.000 Y NA
 7504961 7504962 CLJ_B0762 CLJ_B0763 nifH   TRUE 0.990 3.000 0.571 0.044 N NA
 7504962 7504963 CLJ_B0763 CLJ_B0764     TRUE 0.998 -13.000 1.000 0.031 Y NA
 7504963 7504964 CLJ_B0764 CLJ_B0765     FALSE 0.010 445.000 0.000 1.000 N NA
 7504964 7504965 CLJ_B0765 CLJ_B0766     FALSE 0.470 61.000 0.000 NA   NA
 7504967 7504968 CLJ_B0768 CLJ_B0769 gcvT gcvH TRUE 0.829 125.000 0.000 0.001 Y NA
 7504968 7504969 CLJ_B0769 CLJ_B0770 gcvH gcvPA TRUE 0.985 3.000 0.005 1.000 Y NA
 7504969 7504970 CLJ_B0770 CLJ_B0771 gcvPA gcvPB TRUE 0.996 0.000 0.316 0.001 Y NA
 7504970 7504971 CLJ_B0771 CLJ_B0772 gcvPB   FALSE 0.080 298.000 0.010 1.000 N NA
 7504971 7504972 CLJ_B0772 CLJ_B0773     FALSE 0.519 194.000 0.118 1.000 N NA
 7504972 7504973 CLJ_B0773 CLJ_B0774     FALSE 0.093 232.000 0.000 NA   NA
 7504973 7504974 CLJ_B0774 CLJ_B0775     TRUE 0.877 8.000 0.000 NA   NA
 7504974 7504975 CLJ_B0775 CLJ_B0776     FALSE 0.024 326.000 0.000 NA   NA
 7504975 7504976 CLJ_B0776 CLJ_B0777     TRUE 0.883 52.000 0.273 1.000 N NA
 7504976 7504977 CLJ_B0777 CLJ_B0778     TRUE 0.984 -13.000 0.094 1.000   NA
 7504979 7504980 CLJ_B0780 CLJ_B0781     FALSE 0.403 136.000 0.000 NA   NA
 7504980 7504981 CLJ_B0781 CLJ_B0782     TRUE 0.759 26.000 0.000 NA   NA
 7504983 7504984 CLJ_B0784 CLJ_B0785     FALSE 0.010 415.000 0.000 NA   NA
 7504984 7504985 CLJ_B0785 CLJ_B0786     FALSE 0.343 199.000 0.027 NA   NA
 7504985 7504986 CLJ_B0786 CLJ_B0787     TRUE 0.582 152.000 0.027 1.000   NA
 7504986 7504987 CLJ_B0787 CLJ_B0788     TRUE 0.725 54.000 0.025 NA   NA
 7504987 7504988 CLJ_B0788 CLJ_B0789     FALSE 0.008 438.000 0.000 NA   NA
 7504989 7504990 CLJ_B0790 CLJ_B0791   luxS TRUE 0.974 -16.000 0.010 1.000 N NA
 7504990 7504991 CLJ_B0791 CLJ_B0792 luxS metC TRUE 0.969 2.000 0.048 1.000 N NA
 7504991 7504992 CLJ_B0792 CLJ_B0793 metC   TRUE 0.668 100.000 0.021 1.000 N NA
 7504995 7504996 CLJ_B0796 CLJ_B0797     FALSE 0.240 181.000 0.000 1.000   NA
 7504997 7504998 CLJ_B0798 CLJ_B0799     TRUE 0.697 88.000 0.061 NA   NA
 7504998 7504999 CLJ_B0799 CLJ_B0800     FALSE 0.005 533.000 0.000 NA   NA
 7504999 7505000 CLJ_B0800 CLJ_B0801     TRUE 0.748 93.000 0.111 NA   NA
 7505001 7505002 CLJ_B0802 CLJ_B0803     FALSE 0.110 224.000 0.000 NA   NA
 7505002 7505003 CLJ_B0803 CLJ_B0804     TRUE 0.832 19.000 0.000 NA N NA
 7505003 7505004 CLJ_B0804 CLJ_B0805     FALSE 0.424 105.000 0.000 NA   NA
 7505004 7505005 CLJ_B0805 CLJ_B0806     FALSE 0.120 220.000 0.000 NA   NA
 7505005 7505006 CLJ_B0806 CLJ_B0807     FALSE 0.083 238.000 0.000 NA   NA
 7505006 7505007 CLJ_B0807 CLJ_B0808     TRUE 0.810 20.000 0.000 NA   NA
 7505007 7505008 CLJ_B0808 CLJ_B0809     FALSE 0.140 210.000 0.000 NA   NA
 7505008 7505009 CLJ_B0809 CLJ_B0810     FALSE 0.016 388.000 0.000 1.000 N NA
 7505009 7505010 CLJ_B0810 CLJ_B0811     FALSE 0.370 144.000 0.000 NA   NA
 7505010 7505011 CLJ_B0811 CLJ_B0812     FALSE 0.008 433.000 0.000 NA   NA
 7505013 7505014 CLJ_B0814 CLJ_B0815     TRUE 0.990 -7.000 0.400 NA   NA
 7505014 7505015 CLJ_B0815 CLJ_B0816     FALSE 0.007 454.000 0.000 NA   NA
 7505015 7505016 CLJ_B0816 CLJ_B0817   thyA TRUE 0.970 -10.000 0.017 NA   NA
 7505016 7505017 CLJ_B0817 CLJ_B0818 thyA   TRUE 0.943 12.000 0.017 1.000 N NA
 7505017 7505018 CLJ_B0818 CLJ_B0819     TRUE 0.815 46.000 0.047 1.000 N NA
 7505018 7505019 CLJ_B0819 CLJ_B0820   thiD_2 TRUE 0.714 78.000 0.043 1.000 N NA
 7505019 7505020 CLJ_B0820 CLJ_B0821 thiD_2   FALSE 0.477 177.000 0.043 NA   NA
 7505022 7505023 CLJ_B0823 CLJ_B0824     TRUE 0.990 3.000 0.833 NA   NA
 7505023 7505024 CLJ_B0824 CLJ_B0825     FALSE 0.048 276.000 0.000 NA   NA
 7505024 7505025 CLJ_B0825 CLJ_B0826     FALSE 0.037 461.000 0.167 1.000 N NA
 7505025 7505026 CLJ_B0826 CLJ_B0827     TRUE 0.991 0.000 0.667 NA   NA
 7505026 7505027 CLJ_B0827 CLJ_B0828     TRUE 0.772 118.000 0.167 NA   NA
 7505027 7505028 CLJ_B0828 CLJ_B0829     TRUE 0.868 46.000 0.167 1.000   NA
 7505028 7505029 CLJ_B0829 CLJ_B0830     FALSE 0.003 863.000 0.000 NA   NA
 7505029 7505030 CLJ_B0830 CLJ_B0831     FALSE 0.051 271.000 0.000 NA   NA
 7505030 7505031 CLJ_B0831 CLJ_B0832     FALSE 0.512 184.000 0.100 NA   NA
 7505031 7505032 CLJ_B0832 CLJ_B0833     TRUE 0.998 -13.000 0.750 1.000 Y NA
 7505032 7505033 CLJ_B0833 CLJ_B0834     FALSE 0.006 507.000 0.000 NA   NA
 7505033 7505034 CLJ_B0834 CLJ_B0835     FALSE 0.395 138.000 0.000 NA   NA
 7505034 7505035 CLJ_B0835 CLJ_B0836     TRUE 0.906 172.000 0.636 1.000 Y NA
 7505035 7505036 CLJ_B0836 CLJ_B0837     FALSE 0.212 189.000 0.000 1.000   NA
 7505038 7505039 CLJ_B0839 CLJ_B0840     TRUE 0.993 0.000 0.080 0.030 Y NA
 7505039 7505040 CLJ_B0840 CLJ_B0841     TRUE 0.992 3.000 0.167 1.000 Y NA
 7505042 7505043 CLJ_B0843 CLJ_B0844   dapB_1 FALSE 0.004 664.000 0.000 NA   NA
 7505043 7505044 CLJ_B0844 CLJ_B0845 dapB_1   TRUE 0.817 22.000 0.000 NA N NA
 7505044 7505045 CLJ_B0845 CLJ_B0846     FALSE 0.008 466.000 0.000 NA N NA
 7505045 7505046 CLJ_B0846 CLJ_B0847     FALSE 0.152 206.000 0.000 NA   NA
 7505046 7505047 CLJ_B0847 CLJ_B0848     FALSE 0.423 80.000 0.000 NA   NA
 7505047 7505048 CLJ_B0848 CLJ_B0849     FALSE 0.223 193.000 0.000 1.000 N NA
 7505050 7505051 CLJ_B0851 CLJ_B0852     FALSE 0.414 116.000 0.000 NA   NA
 7505051 7505052 CLJ_B0852 CLJ_B0853     FALSE 0.005 533.000 0.000 NA   NA
 7505052 7505053 CLJ_B0853 CLJ_B0854     FALSE 0.021 341.000 0.000 NA   NA
 7505053 7505054 CLJ_B0854 CLJ_B0855   brnQ FALSE 0.004 746.000 0.000 1.000 N NA
 7505056 7505057 CLJ_B0857 CLJ_B0858 feoA_1   TRUE 0.633 143.000 0.033 1.000   NA
 7505057 7505058 CLJ_B0858 CLJ_B0859   feoB_1 TRUE 0.985 -3.000 0.105 0.005   NA
 7505058 7505059 CLJ_B0859 CLJ_B0861 feoB_1 cobC FALSE 0.011 431.000 0.000 1.000 N NA
 7505059 7505060 CLJ_B0861 CLJ_B0862 cobC   FALSE 0.417 145.000 0.000 1.000 N NA
 7505060 7505061 CLJ_B0862 CLJ_B0863   cobS FALSE 0.063 271.000 0.000 1.000 N NA
 7505061 7505062 CLJ_B0863 CLJ_B0864 cobS   FALSE 0.266 170.000 0.000 NA   NA
 7505062 7505063 CLJ_B0864 CLJ_B0865     FALSE 0.029 309.000 0.000 NA   NA
 7505063 7505064 CLJ_B0865 CLJ_B0866     TRUE 0.683 131.000 0.053 NA   NA
 7505064 7505065 CLJ_B0866 CLJ_B0867     TRUE 0.981 18.000 0.828 NA   NA
 7505065 7505066 CLJ_B0867 CLJ_B0868     FALSE 0.005 517.000 0.000 NA   NA
 7505066 7505067 CLJ_B0868 CLJ_B0869     FALSE 0.050 273.000 0.000 NA   NA
 7505067 7505068 CLJ_B0869 CLJ_B0870   folP TRUE 0.846 104.000 0.003 1.000 Y NA
 7505068 7505069 CLJ_B0870 CLJ_B0871 folP   FALSE 0.441 162.000 0.003 NA   NA
 7505069 7505070 CLJ_B0871 CLJ_B0872   folK TRUE 0.571 100.000 0.003 NA   NA
 7505070 7505071 CLJ_B0872 CLJ_B0873 folK   FALSE 0.442 119.000 0.000 NA N NA
 7505071 7505072 CLJ_B0873 CLJ_B0874     FALSE 0.049 284.000 0.000 NA N NA
 7505072 7505073 CLJ_B0874 CLJ_B0875     TRUE 0.769 55.000 0.039 1.000 N NA
 7505073 7505074 CLJ_B0875 CLJ_B0876     TRUE 0.857 142.000 0.012 0.017 Y NA
 7505074 7505075 CLJ_B0876 CLJ_B0877     FALSE 0.003 727.000 0.000 NA   NA
 7505075 7505076 CLJ_B0877 CLJ_B0878     FALSE 0.008 443.000 0.000 NA   NA
 7505076 7505077 CLJ_B0878 CLJ_B0879     TRUE 0.985 5.000 0.500 NA   NA
 7505080 7505081 CLJ_B0882 CLJ_B0883     TRUE 0.958 19.000 0.200 NA   NA
 7505081 7505082 CLJ_B0883 CLJ_B0884     TRUE 0.986 -28.000 0.100 1.000   NA
 7505083 7505084 CLJ_B0885 CLJ_B0886     FALSE 0.003 685.000 0.000 NA   NA
 7505084 7505085 CLJ_B0886 CLJ_B0887     FALSE 0.003 721.000 0.000 1.000   NA
 7505085 7505086 CLJ_B0887 CLJ_B0888     FALSE 0.484 58.000 0.000 NA   NA
 7505087 7505088 CLJ_B0889 CLJ_B0890     TRUE 0.884 18.000 0.000 0.004   NA
 7505088 7505089 CLJ_B0890 CLJ_B0891     FALSE 0.450 105.000 0.000 1.000   NA
 7505090 7505091 CLJ_B0892 CLJ_B0893     TRUE 0.930 -7.000 0.000 NA   NA
 7505091 7505092 CLJ_B0893 CLJ_B0894     FALSE 0.249 174.000 0.000 NA   NA
 7505092 7505093 CLJ_B0894 CLJ_B0895     FALSE 0.044 284.000 0.000 NA   NA
 7505094 7505095 CLJ_B0896 CLJ_B0897     FALSE 0.048 277.000 0.000 NA   NA
 7505096 7505097 CLJ_B0898 CLJ_B0899   lipA FALSE 0.016 364.000 0.000 NA   NA
 7505098 7505099 CLJ_B0900 CLJ_B0901 oxdD   FALSE 0.323 156.000 0.000 NA   NA
 7505099 7505100 CLJ_B0901 CLJ_B0902     TRUE 0.661 58.000 0.010 NA   NA
 7505101 7505102 CLJ_B0903 CLJ_B0904     FALSE 0.012 399.000 0.000 1.000   NA
 7505105 7505106 CLJ_B0907 CLJ_B0908     FALSE 0.039 294.000 0.000 NA   NA
 7505108 7505109 CLJ_B0910 CLJ_B0911     TRUE 0.988 0.000 0.400 NA   NA
 7505110 7505111 CLJ_B0912 CLJ_B0913     FALSE 0.007 457.000 0.000 NA   NA
 7505111 7505112 CLJ_B0913 CLJ_B0914     FALSE 0.012 392.000 0.000 NA   NA
 7505120 7505121 CLJ_B0922 CLJ_B0923     TRUE 0.945 -37.000 0.000 NA   NA
 7505121 7505122 CLJ_B0923 CLJ_B0924     FALSE 0.007 469.000 0.000 NA   NA
 7505122 7505123 CLJ_B0924 CLJ_B0925     FALSE 0.433 76.000 0.000 NA   NA
 7505123 7505124 CLJ_B0925 CLJ_B0926     FALSE 0.412 127.000 0.000 NA   NA
 7505126 7505127 CLJ_B0928 CLJ_B0929     FALSE 0.346 156.000 0.000 1.000   NA
 7505127 7505128 CLJ_B0929 CLJ_B0930     FALSE 0.136 212.000 0.000 NA   NA
 7505128 7505129 CLJ_B0930 CLJ_B0931     FALSE 0.080 240.000 0.000 NA   NA
 7505129 7505130 CLJ_B0931 CLJ_B0932     TRUE 0.602 42.000 0.000 NA   NA
 7505131 7505132 CLJ_B0933 CLJ_B0934     FALSE 0.028 312.000 0.000 NA   NA
 7505132 7505133 CLJ_B0934 CLJ_B0935     TRUE 0.602 42.000 0.000 NA   NA
 7505136 7505137 CLJ_B0938 CLJ_B0939     FALSE 0.266 170.000 0.000 NA   NA
 7505137 7505138 CLJ_B0939 CLJ_B0940     TRUE 0.681 33.000 0.000 NA   NA
 7505138 7505139 CLJ_B0940 CLJ_B0941     FALSE 0.040 293.000 0.000 NA   NA
 7505139 7505140 CLJ_B0941 CLJ_B0942     FALSE 0.039 294.000 0.000 NA   NA
 7505141 7505142 CLJ_B0943 CLJ_B0944     FALSE 0.239 176.000 0.000 NA   NA
 7505145 7505146 CLJ_B0947 CLJ_B0948     FALSE 0.413 125.000 0.000 NA   NA
 7505146 7505147 CLJ_B0948 CLJ_B0949     TRUE 0.940 0.000 0.000 0.068   NA
 7505149 7505150 CLJ_B0951 CLJ_B0952     TRUE 0.995 0.000 0.333 1.000 Y NA
 7505150 7505151 CLJ_B0952 CLJ_B0953   ilvE FALSE 0.013 410.000 0.000 1.000 N NA
 7505151 7505152 CLJ_B0953 CLJ_B0954 ilvE   FALSE 0.080 240.000 0.000 NA   NA
 7505152 7505153 CLJ_B0954 CLJ_B0955     FALSE 0.094 231.000 0.000 NA   NA
 7505153 7505154 CLJ_B0955 CLJ_B0956     FALSE 0.013 387.000 0.000 NA   NA
 7505154 7505155 CLJ_B0956 CLJ_B0957     TRUE 0.781 72.000 0.100 1.000 N NA
 7505155 7505156 CLJ_B0957 CLJ_B0958     FALSE 0.028 330.000 0.000 1.000 N NA
 7505156 7505157 CLJ_B0958 CLJ_B0959     FALSE 0.027 327.000 0.000 1.000   NA
 7505158 7505159 CLJ_B0960 CLJ_B0961 tipA   FALSE 0.012 397.000 0.000 NA   NA
 7505160 7505161 CLJ_B0963 CLJ_B0964   cobQ TRUE 0.621 61.000 0.003 NA   NA
 7505161 7505162 CLJ_B0964 CLJ_B0965 cobQ cobD TRUE 0.993 2.000 0.092 0.011 Y NA
 7505162 7505163 CLJ_B0965 CLJ_B0966 cobD   FALSE 0.037 385.000 0.026 1.000 N NA
 7505163 7505164 CLJ_B0966 CLJ_B0967   cbiM FALSE 0.375 189.000 0.013 1.000 N NA
 7505164 7505165 CLJ_B0967 CLJ_B0968 cbiM cbiN TRUE 0.997 4.000 0.861 0.011 Y NA
 7505165 7505166 CLJ_B0968 CLJ_B0969 cbiN cbiQ TRUE 0.998 -22.000 0.804 0.001 Y NA
 7505166 7505167 CLJ_B0969 CLJ_B0970 cbiQ   FALSE 0.022 346.000 0.000 NA N NA
 7505167 7505168 CLJ_B0970 CLJ_B0971   hemC TRUE 0.992 -31.000 0.009 NA Y NA
 7505168 7505169 CLJ_B0971 CLJ_B0972 hemC   FALSE 0.245 303.000 0.031 1.000 Y NA
 7505169 7505170 CLJ_B0972 CLJ_B0973     FALSE 0.350 150.000 0.000 NA   NA
 7505170 7505171 CLJ_B0973 CLJ_B0974   hemB FALSE 0.013 385.000 0.000 NA   NA
 7505171 7505172 CLJ_B0974 CLJ_B0975 hemB cobB FALSE 0.119 358.000 0.005 1.000 Y NA
 7505172 7505173 CLJ_B0975 CLJ_B0976 cobB   FALSE 0.415 115.000 0.000 NA   NA
 7505173 7505174 CLJ_B0976 CLJ_B0977   cobH FALSE 0.455 66.000 0.000 NA   NA
 7505174 7505175 CLJ_B0977 CLJ_B0978 cobH   FALSE 0.283 167.000 0.000 NA   NA
 7505175 7505176 CLJ_B0978 CLJ_B0979     FALSE 0.050 273.000 0.000 NA   NA
 7505176 7505177 CLJ_B0979 CLJ_B0980     FALSE 0.043 285.000 0.000 NA   NA
 7505177 7505178 CLJ_B0980 CLJ_B0981     FALSE 0.440 115.000 0.000 1.000   NA
 7505178 7505179 CLJ_B0981 CLJ_B0982     FALSE 0.477 68.000 0.000 1.000   NA
 7505179 7505180 CLJ_B0982 CLJ_B0983     FALSE 0.158 208.000 0.000 1.000   NA
 7505180 7505181 CLJ_B0983 CLJ_B0984     TRUE 0.683 70.000 0.032 NA   NA
 7505181 7505182 CLJ_B0984 CLJ_B0985     TRUE 0.808 93.000 0.250 NA   NA
 7505182 7505183 CLJ_B0985 CLJ_B0986   cbiD TRUE 0.722 29.000 0.000 NA   NA
 7505183 7505184 CLJ_B0986 CLJ_B0987 cbiD cbiE TRUE 0.776 199.000 0.126 0.011 Y NA
 7505184 7505185 CLJ_B0987 CLJ_B0988 cbiE   FALSE 0.423 106.000 0.000 NA   NA
 7505185 7505186 CLJ_B0988 CLJ_B0989   cbiT FALSE 0.423 98.000 0.000 NA   NA
 7505186 7505187 CLJ_B0989 CLJ_B0990 cbiT   TRUE 0.993 0.000 1.000 NA   NA
 7505187 7505188 CLJ_B0990 CLJ_B0991     FALSE 0.005 514.000 0.000 NA   NA
 7505188 7505189 CLJ_B0991 CLJ_B0992     TRUE 0.773 158.000 0.400 NA   NA
 7505189 7505190 CLJ_B0992 CLJ_B0993     FALSE 0.475 60.000 0.000 NA   NA
 7505190 7505191 CLJ_B0993 CLJ_B0994     FALSE 0.474 69.000 0.000 1.000   NA
 7505191 7505192 CLJ_B0994 CLJ_B0995     TRUE 0.539 50.000 0.000 NA   NA
 7505192 7505193 CLJ_B0995 CLJ_B0996   cobI FALSE 0.416 91.000 0.000 NA   NA
 7505193 7505194 CLJ_B0996 CLJ_B0997 cobI cobM FALSE 0.499 289.000 0.291 0.011 Y NA
 7505194 7505195 CLJ_B0997 CLJ_B0998 cobM   TRUE 0.713 183.000 0.397 0.011   NA
 7505195 7505196 CLJ_B0998 CLJ_B0999   cobJ TRUE 0.857 134.000 0.352 0.011   NA
 7505196 7505197 CLJ_B0999 CLJ_B1000 cobJ cobK TRUE 0.970 49.000 0.423 0.011 Y NA
 7505197 7505198 CLJ_B1000 CLJ_B1001 cobK   FALSE 0.092 275.000 0.006 NA   NA
 7505198 7505199 CLJ_B1001 CLJ_B1002     TRUE 0.791 23.000 0.000 NA   NA
 7505199 7505200 CLJ_B1002 CLJ_B1003   cbiK FALSE 0.266 170.000 0.000 NA   NA
 7505200 7505201 CLJ_B1003 CLJ_B1004 cbiK   TRUE 0.951 13.000 0.040 1.000 N NA
 7505201 7505202 CLJ_B1004 CLJ_B1005   cobO FALSE 0.407 148.000 0.000 1.000 N NA
 7505202 7505203 CLJ_B1005 CLJ_B1006 cobO   FALSE 0.084 253.000 0.000 1.000 N NA
 7505203 7505204 CLJ_B1006 CLJ_B1007     TRUE 0.793 100.000 0.152 1.000 N NA
 7505204 7505205 CLJ_B1007 CLJ_B1008   asrA TRUE 0.957 20.000 0.174 1.000   NA
 7505205 7505206 CLJ_B1008 CLJ_B1009 asrA asrB TRUE 0.995 -13.000 0.750 0.030   NA
 7505206 7505207 CLJ_B1009 CLJ_B1010 asrB arsC TRUE 0.995 13.000 0.720 0.030 Y NA
 7505207 7505208 CLJ_B1010 CLJ_B1011 arsC   FALSE 0.022 346.000 0.000 1.000   NA
 7505208 7505209 CLJ_B1011 CLJ_B1012     FALSE 0.003 986.000 0.000 NA   NA
 7505209 7505210 CLJ_B1012 CLJ_B1013     TRUE 0.979 21.000 0.833 NA   NA
 7505210 7505211 CLJ_B1013 CLJ_B1014     TRUE 0.989 4.000 0.833 NA   NA
 7505211 7505212 CLJ_B1014 CLJ_B1015     FALSE 0.017 650.000 0.154 NA   NA
 7505212 7505213 CLJ_B1015 CLJ_B1016     TRUE 0.998 -10.000 0.765 1.000 Y NA
 7505214 7505215 CLJ_B1017 CLJ_B1018     TRUE 0.996 1.000 0.625 1.000 Y NA
 7505215 7505216 CLJ_B1018 CLJ_B1019     TRUE 0.995 1.000 0.375 1.000 Y NA
 7505216 7505217 CLJ_B1019 CLJ_B1020   dhaKL FALSE 0.015 390.000 0.000 1.000 N NA
 7505217 7505218 CLJ_B1020 CLJ_B1021 dhaKL dhaD TRUE 0.959 11.000 0.053 1.000 N NA
 7505218 7505219 CLJ_B1021 CLJ_B1022 dhaD   FALSE 0.156 315.000 0.250 1.000 N NA
 7505220 7505221 CLJ_B1023 CLJ_B1024     FALSE 0.181 219.000 0.000 0.012   NA
 7505221 7505222 CLJ_B1024 CLJ_B1025     FALSE 0.335 153.000 0.000 NA   NA
 7505222 7505223 CLJ_B1025 CLJ_B1026     FALSE 0.077 243.000 0.000 NA   NA
 7505223 7505224 CLJ_B1026 CLJ_B1027     TRUE 0.793 101.000 0.200 NA   NA
 7505224 7505225 CLJ_B1027 CLJ_B1028     TRUE 0.808 46.000 0.061 NA   NA
 7505225 7505226 CLJ_B1028 CLJ_B1029     FALSE 0.005 537.000 0.000 1.000   NA
 7505226 7505227 CLJ_B1029 CLJ_B1030     TRUE 0.655 36.000 0.000 NA   NA
 7505228 7505229 CLJ_B1031 CLJ_B1032     TRUE 0.894 3.000 0.000 NA   NA
 7505229 7505230 CLJ_B1032 CLJ_B1033     TRUE 0.984 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7505230 7505231 CLJ_B1033 CLJ_B1034     TRUE 0.919 2.000 0.000 1.000 N NA
 7505231 7505232 CLJ_B1034 CLJ_B1035   add FALSE 0.005 636.000 0.000 1.000 N NA
 7505233 7505234 CLJ_B1036 CLJ_B1037     TRUE 0.973 26.000 0.833 NA   NA
 7505236 7505237 CLJ_B1039 CLJ_B1040   recQ FALSE 0.075 246.000 0.000 NA   NA
 7505237 7505238 CLJ_B1040 CLJ_B1041 recQ   FALSE 0.470 111.000 0.000 1.000 N NA
 7505240 7505241 CLJ_B1043 CLJ_B1044     FALSE 0.440 115.000 0.000 1.000   NA
 7505241 7505242 CLJ_B1044 CLJ_B1045     FALSE 0.015 373.000 0.000 NA   NA
 7505242 7505243 CLJ_B1045 CLJ_B1046     TRUE 0.986 2.000 0.444 NA   NA
 7505243 7505244 CLJ_B1046 CLJ_B1047     TRUE 0.981 0.000 0.167 NA   NA
 7505244 7505245 CLJ_B1047 CLJ_B1048     TRUE 0.985 14.000 0.077 1.000 Y NA
 7505245 7505246 CLJ_B1048 CLJ_B1049     TRUE 0.959 15.000 0.135 NA   NA
 7505246 7505247 CLJ_B1049 CLJ_B1050   lctP FALSE 0.006 482.000 0.000 NA   NA
 7505247 7505248 CLJ_B1050 CLJ_B1051 lctP   TRUE 0.911 29.000 0.098 NA   NA
 7505248 7505249 CLJ_B1051 CLJ_B1052     TRUE 0.851 43.000 0.098 NA   NA
 7505249 7505250 CLJ_B1052 CLJ_B1053     TRUE 0.989 32.000 0.875 0.012 Y NA
 7505250 7505251 CLJ_B1053 CLJ_B1054     TRUE 0.973 61.000 0.875 0.009 Y NA
 7505251 7505252 CLJ_B1054 CLJ_B1055     FALSE 0.053 270.000 0.000 NA   NA
 7505252 7505253 CLJ_B1055 CLJ_B1056     FALSE 0.411 128.000 0.000 NA   NA
 7505253 7505254 CLJ_B1056 CLJ_B1057     FALSE 0.188 193.000 0.000 NA   NA
 7505254 7505255 CLJ_B1057 CLJ_B1058     TRUE 0.966 2.000 0.051 NA   NA
 7505256 7505257 CLJ_B1059 CLJ_B1060     FALSE 0.003 949.000 0.000 NA   NA
 7505258 7505259 CLJ_B1061 CLJ_B1062     FALSE 0.161 307.000 0.000 0.058 Y NA
 7505259 7505260 CLJ_B1062 CLJ_B1063     FALSE 0.131 215.000 0.000 NA   NA
 7505262 7505263 CLJ_B1065 CLJ_B1066     FALSE 0.003 712.000 0.000 NA   NA
 7505263 7505264 CLJ_B1066 CLJ_B1067     TRUE 0.899 4.000 0.000 1.000   NA
 7505264 7505265 CLJ_B1067 CLJ_B1068     FALSE 0.074 262.000 0.000 1.000 N NA
 7505265 7505266 CLJ_B1068 CLJ_B1069     TRUE 0.861 16.000 0.000 1.000 N NA
 7505270 7505271 CLJ_B1073 CLJ_B1074     FALSE 0.407 134.000 0.000 NA   NA
 7505271 7505272 CLJ_B1074 CLJ_B1075     FALSE 0.004 584.000 0.000 NA   NA
 7505272 7505273 CLJ_B1075 CLJ_B1076   feoA_2 TRUE 0.826 17.000 0.000 NA   NA
 7505273 7505274 CLJ_B1076 CLJ_B1077 feoA_2 feoB_2 TRUE 0.987 32.000 0.871 1.000 Y NA
 7505274 7505275 CLJ_B1077 CLJ_B1078 feoB_2   TRUE 0.915 21.000 0.029 NA   NA
 7505277 7505278 CLJ_B1080 CLJ_B1081   tlp FALSE 0.034 299.000 0.000 NA   NA
 7505278 7505279 CLJ_B1081 CLJ_B1082 tlp   FALSE 0.125 218.000 0.000 NA   NA
 7505279 7505280 CLJ_B1082 CLJ_B1083     TRUE 0.996 1.000 0.462 1.000 Y NA
 7505280 7505281 CLJ_B1083 CLJ_B1084     TRUE 0.655 36.000 0.000 NA   NA
 7505281 7505282 CLJ_B1084 CLJ_B1085     FALSE 0.135 213.000 0.000 NA   NA
 7505282 7505283 CLJ_B1085 CLJ_B1086     TRUE 0.898 117.000 1.000 NA   NA
 7505283 7505284 CLJ_B1086 CLJ_B1087     TRUE 0.744 54.000 0.034 NA   NA
 7505286 7505287 CLJ_B1089 CLJ_B1090     FALSE 0.026 320.000 0.000 NA   NA
 7505287 7505288 CLJ_B1090 CLJ_B1091     FALSE 0.063 260.000 0.000 NA   NA
 7505288 7505289 CLJ_B1091 CLJ_B1092     TRUE 0.997 0.000 0.833 1.000 Y NA
 7505290 7505291 CLJ_B1093 CLJ_B1094     FALSE 0.095 236.000 0.000 NA N NA
 7505292 7505293 CLJ_B1095 CLJ_B1096     TRUE 0.998 -10.000 0.870 0.029 Y NA
 7505293 7505294 CLJ_B1096 CLJ_B1097     TRUE 0.998 -3.000 0.870 1.000 Y NA
 7505294 7505295 CLJ_B1097 CLJ_B1098     TRUE 0.928 70.000 0.196 1.000 Y NA
 7505295 7505296 CLJ_B1098 CLJ_B1099     FALSE 0.491 57.000 0.000 NA   NA
 7505296 7505297 CLJ_B1099 CLJ_B1100     TRUE 0.826 17.000 0.000 NA   NA
 7505297 7505298 CLJ_B1100 CLJ_B1101     FALSE 0.019 360.000 0.000 1.000   NA
 7505299 7505300 CLJ_B1102 CLJ_B1103     TRUE 0.996 3.000 1.000 NA Y NA
 7505300 7505301 CLJ_B1103 CLJ_B1104     FALSE 0.026 321.000 0.000 NA   NA
 7505302 7505303 CLJ_B1105 CLJ_B1106     FALSE 0.014 382.000 0.000 NA   NA
 7505303 7505304 CLJ_B1106 CLJ_B1107     FALSE 0.092 233.000 0.000 NA   NA
 7505304 7505305 CLJ_B1107 CLJ_B1108     FALSE 0.005 521.000 0.000 NA   NA
 7505305 7505306 CLJ_B1108 CLJ_B1109     FALSE 0.017 368.000 0.000 1.000   NA
 7505306 7505307 CLJ_B1109 CLJ_B1110     FALSE 0.389 184.000 0.023 NA   NA
 7505307 7505308 CLJ_B1110 CLJ_B1111     FALSE 0.495 165.000 0.023 NA   NA
 7505309 7505310 CLJ_B1112 CLJ_B1113     TRUE 0.610 116.000 0.015 NA   NA
 7505310 7505311 CLJ_B1113 CLJ_B1114     FALSE 0.015 384.000 0.000 1.000   NA
 7505312 7505313 CLJ_B1115 CLJ_B1116     FALSE 0.103 227.000 0.000 NA   NA
 7505313 7505314 CLJ_B1116 CLJ_B1117     FALSE 0.170 204.000 0.000 1.000   NA
 7505314 7505315 CLJ_B1117 CLJ_B1118     FALSE 0.155 209.000 0.000 1.000   NA
 7505315 7505316 CLJ_B1118 CLJ_B1119     TRUE 0.834 57.000 0.107 0.030   NA
 7505316 7505317 CLJ_B1119 CLJ_B1120     TRUE 0.985 3.000 0.300 0.030   NA
 7505317 7505318 CLJ_B1120 CLJ_B1121   glpT TRUE 0.643 89.000 0.021 1.000   NA
 7505318 7505319 CLJ_B1121 CLJ_B1122 glpT argS FALSE 0.005 581.000 0.000 1.000 N NA
 7505319 7505320 CLJ_B1122 CLJ_B1123 argS arcT FALSE 0.008 472.000 0.000 1.000 N NA
 7505320 7505321 CLJ_B1123 CLJ_B1124 arcT   FALSE 0.046 289.000 0.000 1.000   NA
 7505322 7505323 CLJ_B1125 CLJ_B1126   feoB_3 TRUE 0.897 26.000 0.034 NA   NA
 7505323 7505324 CLJ_B1126 CLJ_B1127 feoB_3 feoA_3 TRUE 0.990 15.000 0.308 1.000 Y NA
 7505325 7505326 CLJ_B1128 CLJ_B1129     FALSE 0.133 214.000 0.000 NA   NA
 7505326 7505327 CLJ_B1129 CLJ_B1130     FALSE 0.009 443.000 0.000 1.000   NA
 7505327 7505328 CLJ_B1130 CLJ_B1131     FALSE 0.011 412.000 0.000 1.000   NA
 7505328 7505329 CLJ_B1131 CLJ_B1133     FALSE 0.052 278.000 0.000 1.000   NA
 7505329 7505330 CLJ_B1133 CLJ_B1134     TRUE 0.996 2.000 0.511 1.000 Y NA
 7505330 7505331 CLJ_B1134 CLJ_B1135     TRUE 0.934 56.000 0.154 NA Y NA
 7505331 7505332 CLJ_B1135 CLJ_B1136     TRUE 0.807 189.000 0.250 NA Y NA
 7505332 7505333 CLJ_B1136 CLJ_B1137     FALSE 0.099 229.000 0.000 NA   NA
 7505333 7505334 CLJ_B1137 CLJ_B1138     FALSE 0.005 572.000 0.000 1.000   NA
 7505336 7505337 CLJ_B1140 CLJ_B1141     FALSE 0.086 236.000 0.000 NA   NA
 7505337 7505338 CLJ_B1141 CLJ_B1142     FALSE 0.142 209.000 0.000 NA   NA
 7505342 7505343 CLJ_B1146 CLJ_B1147     TRUE 0.544 143.000 0.008 NA   NA
 7505343 7505344 CLJ_B1147 CLJ_B1148     TRUE 0.682 56.000 0.008 1.000   NA
 7505345 7505346 CLJ_B1149 CLJ_B1150     FALSE 0.027 599.000 0.000 0.003 Y NA
 7505347 7505348 CLJ_B1151 CLJ_B1152     TRUE 0.971 18.000 0.333 1.000 N NA
 7505348 7505349 CLJ_B1152 CLJ_B1153     FALSE 0.010 419.000 0.000 1.000   NA
 7505349 7505350 CLJ_B1153 CLJ_B1154     FALSE 0.423 99.000 0.000 NA   NA
 7505350 7505351 CLJ_B1154 CLJ_B1155     FALSE 0.003 808.000 0.000 NA   NA
 7505351 7505352 CLJ_B1155 CLJ_B1156     TRUE 0.980 2.000 0.217 NA   NA
 7505352 7505353 CLJ_B1156 CLJ_B1157     TRUE 0.979 26.000 0.084 0.029 Y NA
 7505353 7505354 CLJ_B1157 CLJ_B1158     TRUE 0.982 12.000 0.308 0.029 N NA
 7505354 7505355 CLJ_B1158 CLJ_B1159     FALSE 0.032 304.000 0.000 NA   NA
 7505355 7505356 CLJ_B1159 CLJ_B1160     TRUE 0.634 104.000 0.020 NA   NA
 7505356 7505357 CLJ_B1160 CLJ_B1161     TRUE 0.883 10.000 0.000 1.000   NA
 7505357 7505358 CLJ_B1161 CLJ_B1162     FALSE 0.436 75.000 0.000 NA   NA
 7505358 7505359 CLJ_B1162 CLJ_B1163     TRUE 0.968 1.000 0.050 NA   NA
 7505359 7505360 CLJ_B1163 CLJ_B1164     FALSE 0.350 150.000 0.000 NA   NA
 7505360 7505361 CLJ_B1164 CLJ_B1165   maa TRUE 0.908 1.000 0.000 NA   NA
 7505363 7505364 CLJ_B1167 CLJ_B1168     FALSE 0.052 278.000 0.000 1.000   NA
 7505364 7505365 CLJ_B1168 CLJ_B1169     FALSE 0.523 160.000 0.017 1.000   NA
 7505367 7505368 CLJ_B1171 CLJ_B1172   mgtE FALSE 0.006 501.000 0.000 NA   NA
 7505368 7505369 CLJ_B1172 CLJ_B1173 mgtE   FALSE 0.004 1010.000 0.000 0.055 N NA
 7505369 7505370 CLJ_B1173 CLJ_B1174     TRUE 0.650 225.000 0.110 0.055 Y NA
 7505370 7505371 CLJ_B1174 CLJ_B1175     TRUE 0.983 -22.000 0.072 NA   NA
 7505371 7505372 CLJ_B1175 CLJ_B1176     FALSE 0.004 652.000 0.000 NA   NA
 7505372 7505373 CLJ_B1176 CLJ_B1177     TRUE 0.550 170.000 0.056 1.000   NA
 7505375 7505376 CLJ_B1179 CLJ_B1180     TRUE 0.762 111.000 0.118 1.000   NA
 7505376 7505377 CLJ_B1180 CLJ_B1181     FALSE 0.038 299.000 0.000 1.000   NA
 7505377 7505378 CLJ_B1181 CLJ_B1182     FALSE 0.479 159.000 0.004 NA N NA
 7505378 7505379 CLJ_B1182 CLJ_B1183     TRUE 0.600 76.000 0.006 NA   NA
 7505379 7505380 CLJ_B1183 CLJ_B1184     FALSE 0.047 278.000 0.000 NA   NA
 7505380 7505381 CLJ_B1184 CLJ_B1185     TRUE 0.536 178.000 0.091 NA   NA
 7505381 7505382 CLJ_B1185 CLJ_B1186   xpt_2 FALSE 0.512 161.000 0.009 1.000 N NA
 7505382 7505383 CLJ_B1186 CLJ_B1187 xpt_2   FALSE 0.035 298.000 0.000 NA   NA
 7505383 7505384 CLJ_B1187 CLJ_B1188     FALSE 0.037 295.000 0.000 NA   NA
 7505384 7505385 CLJ_B1188 CLJ_B1189     TRUE 0.664 200.000 0.667 NA   NA
 7505385 7505386 CLJ_B1189 CLJ_B1190     FALSE 0.020 344.000 0.000 NA   NA
 7505386 7505387 CLJ_B1190 CLJ_B1191     FALSE 0.016 363.000 0.000 NA   NA
 7505387 7505388 CLJ_B1191 CLJ_B1192     TRUE 0.689 137.000 0.065 NA   NA
 7505388 7505389 CLJ_B1192 CLJ_B1193     FALSE 0.003 773.000 0.000 NA   NA
 7505389 7505390 CLJ_B1193 CLJ_B1194     TRUE 0.775 182.000 1.000 NA   NA
 7505390 7505391 CLJ_B1194 CLJ_B1195     FALSE 0.012 394.000 0.000 NA   NA
 7505391 7505392 CLJ_B1195 CLJ_B1196     TRUE 0.997 2.000 0.667 0.028 Y NA
 7505392 7505393 CLJ_B1196 CLJ_B1197     TRUE 0.996 -37.000 0.900 0.028 N NA
 7505395 7505396 CLJ_B1199 CLJ_B1200     TRUE 0.964 14.000 0.167 NA   NA
 7505396 7505397 CLJ_B1200 CLJ_B1201   rpsA FALSE 0.014 383.000 0.000 NA   NA
 7505397 7505398 CLJ_B1201 CLJ_B1202 rpsA   FALSE 0.368 183.000 0.008 1.000   NA
 7505398 7505399 CLJ_B1202 CLJ_B1203     TRUE 0.538 172.000 0.067 NA   NA
 7505399 7505400 CLJ_B1203 CLJ_B1204     FALSE 0.003 865.000 0.000 NA   NA
 7505400 7505401 CLJ_B1204 CLJ_B1205     TRUE 0.992 0.000 0.857 NA   NA
 7505401 7505402 CLJ_B1205 CLJ_B1206     TRUE 0.990 -37.000 0.231 1.000   NA
 7505402 7505403 CLJ_B1206 CLJ_B1207     FALSE 0.004 673.000 0.000 1.000   NA
 7505405 7505406 CLJ_B1209 CLJ_B1210     TRUE 0.967 -6.000 0.012 NA N NA
 7505406 7505407 CLJ_B1210 CLJ_B1211   panE FALSE 0.007 492.000 0.000 NA N NA
 7505407 7505408 CLJ_B1211 CLJ_B1212 panE   FALSE 0.040 303.000 0.000 1.000 N NA
 7505408 7505409 CLJ_B1212 CLJ_B1213   folD TRUE 0.983 0.000 0.082 0.001 N NA
 7505409 7505410 CLJ_B1213 CLJ_B1214 folD   FALSE 0.027 326.000 0.000 1.000   NA
 7505412 7505413 CLJ_B1216 CLJ_B1217     TRUE 0.815 118.000 0.286 NA   NA
 7505413 7505414 CLJ_B1217 CLJ_B1218     TRUE 0.602 113.000 0.012 NA   NA
 7505414 7505415 CLJ_B1218 CLJ_B1219     FALSE 0.004 669.000 0.000 NA N NA
 7505415 7505416 CLJ_B1219 CLJ_B1220   cysK_2 FALSE 0.083 333.000 0.083 NA N NA
 7505416 7505417 CLJ_B1220 CLJ_B1221 cysK_2   TRUE 0.967 45.000 0.400 1.000 Y NA
 7505417 7505418 CLJ_B1221 CLJ_B1222     TRUE 0.981 35.000 0.400 0.028 Y NA
 7505418 7505419 CLJ_B1222 CLJ_B1223     TRUE 0.933 105.000 0.286 1.000 Y NA
 7505419 7505420 CLJ_B1223 CLJ_B1224     FALSE 0.021 350.000 0.000 1.000   NA
 7505420 7505421 CLJ_B1224 CLJ_B1225     FALSE 0.495 155.000 0.008 NA   NA
 7505421 7505422 CLJ_B1225 CLJ_B1226   trmU_1 TRUE 0.569 118.000 0.004 NA   NA
 7505422 7505423 CLJ_B1226 CLJ_B1227 trmU_1   FALSE 0.226 180.000 0.000 NA   NA
 7505423 7505424 CLJ_B1227 CLJ_B1228     FALSE 0.019 349.000 0.000 NA   NA
 7505424 7505425 CLJ_B1228 CLJ_B1229     TRUE 0.997 -3.000 0.875 NA Y NA
 7505425 7505426 CLJ_B1229 CLJ_B1230   bcrA FALSE 0.016 375.000 0.000 NA N NA
 7505426 7505427 CLJ_B1230 CLJ_B1231 bcrA   TRUE 0.930 -7.000 0.000 NA   NA
 7505427 7505428 CLJ_B1231 CLJ_B1232     FALSE 0.004 604.000 0.000 NA   NA
 7505428 7505429 CLJ_B1232 CLJ_B1233     FALSE 0.019 347.000 0.000 NA   NA
 7505431 7505432 CLJ_B1235 CLJ_B1236     FALSE 0.034 300.000 0.000 NA   NA
 7505432 7505433 CLJ_B1236 CLJ_B1237     FALSE 0.004 589.000 0.000 NA   NA
 7505435 7505436 CLJ_B1239 CLJ_B1240     FALSE 0.428 78.000 0.000 NA   NA
 7505436 7505437 CLJ_B1240 CLJ_B1241     FALSE 0.489 64.000 0.000 NA N NA
 7505437 7505438 CLJ_B1241 CLJ_B1242     TRUE 0.977 3.000 0.000 NA Y NA
 7505438 7505439 CLJ_B1242 CLJ_B1243     FALSE 0.006 657.000 0.000 0.005   NA
 7505439 7505440 CLJ_B1243 CLJ_B3989     FALSE 0.407 134.000 0.000 NA   NA
 7505440 7505441 CLJ_B3989 CLJ_B1244   tyrS_1 FALSE 0.009 426.000 0.000 NA   NA
 7505441 7505442 CLJ_B1244 CLJ_B1245 tyrS_1   FALSE 0.052 287.000 0.000 1.000 N NA
 7505442 7505443 CLJ_B1245 CLJ_B1246     TRUE 0.994 -7.000 0.833 1.000 N NA
 7505443 7505444 CLJ_B1246 CLJ_B1247     TRUE 0.984 1.000 0.278 NA   NA
 7505446 7505447 CLJ_B1249 CLJ_B1250     FALSE 0.416 91.000 0.000 NA   NA
 7505447 7505448 CLJ_B1250 CLJ_B1251     FALSE 0.195 189.000 0.000 NA   NA
 7505448 7505449 CLJ_B1251 CLJ_B1252     FALSE 0.428 78.000 0.000 NA   NA
 7505449 7505450 CLJ_B1252 CLJ_B1253     TRUE 0.569 175.000 0.095 1.000   NA
 7505450 7505451 CLJ_B1253 CLJ_B1254     TRUE 0.946 -49.000 0.000 NA   NA
 7505451 7505452 CLJ_B1254 CLJ_B1255   sdhB FALSE 0.027 318.000 0.000 NA   NA
 7505452 7505453 CLJ_B1255 CLJ_B1256 sdhB sdhA TRUE 0.991 13.000 0.146 0.001 Y NA
 7505458 7505459 CLJ_B1261 CLJ_B1262     FALSE 0.014 381.000 0.000 NA   NA
 7505459 7505460 CLJ_B1262 CLJ_B1263     FALSE 0.422 107.000 0.000 NA   NA
 7505460 7505461 CLJ_B1263 CLJ_B1264     TRUE 0.759 26.000 0.000 NA   NA
 7505461 7505462 CLJ_B1264 CLJ_B1265     TRUE 0.647 37.000 0.000 NA   NA
 7505462 7505463 CLJ_B1265 CLJ_B1266     TRUE 0.658 154.000 0.071 1.000 N NA
 7505463 7505464 CLJ_B1266 CLJ_B1267     TRUE 0.996 6.000 0.786 0.028 Y NA
 7505464 7505465 CLJ_B1267 CLJ_B1268     TRUE 0.873 200.000 0.688 0.028 Y NA
 7505466 7505467 CLJ_B1269 CLJ_B1270   cotJB TRUE 0.899 34.000 0.125 NA   NA
 7505467 7505468 CLJ_B1270 CLJ_B1271 cotJB cotJC TRUE 0.874 31.000 0.047 NA   NA
 7505468 7505469 CLJ_B1271 CLJ_B1272 cotJC   FALSE 0.106 230.000 0.000 NA N NA
 7505469 7505470 CLJ_B1272 CLJ_B1273     TRUE 0.979 17.000 0.667 NA   NA
 7505470 7505471 CLJ_B1273 CLJ_B1274     FALSE 0.009 424.000 0.000 NA   NA
 7505474 7505475 CLJ_B1277 CLJ_B1278     FALSE 0.005 516.000 0.000 NA   NA
 7505478 7505479 CLJ_B1281 CLJ_B1282     TRUE 0.647 37.000 0.000 NA   NA
 7505479 7505480 CLJ_B1282 CLJ_B1283     FALSE 0.030 307.000 0.000 NA   NA
 7505480 7505481 CLJ_B1283 CLJ_B1284     TRUE 0.975 15.000 0.400 NA   NA
 7505481 7505482 CLJ_B1284 CLJ_B1285     TRUE 0.992 -3.000 0.667 NA   NA
 7505482 7505483 CLJ_B1285 CLJ_B1286     TRUE 0.816 19.000 0.000 NA   NA
 7505483 7505484 CLJ_B1286 CLJ_B1287     TRUE 0.987 12.000 1.000 NA   NA
 7505486 7505487 CLJ_B1289 CLJ_B1290     FALSE 0.004 586.000 0.000 NA   NA
 7505487 7505488 CLJ_B1290 CLJ_B1291     FALSE 0.047 278.000 0.000 NA   NA
 7505488 7505489 CLJ_B1291 CLJ_B1292     TRUE 0.930 -7.000 0.000 NA   NA
 7505489 7505490 CLJ_B1292 CLJ_B1293     FALSE 0.003 799.000 0.000 NA   NA
 7505490 7505491 CLJ_B1293 CLJ_B1294     FALSE 0.053 270.000 0.000 NA   NA
 7505491 7505492 CLJ_B1294 CLJ_B1295     FALSE 0.024 327.000 0.000 NA   NA
 7505493 7505494 CLJ_B1296 CLJ_B1297 gapN   TRUE 0.806 40.000 0.014 1.000 N NA
 7505495 7505496 CLJ_B1299 CLJ_B1300 grdX grdE TRUE 0.841 91.000 0.400 NA   NA
 7505496 7505497 CLJ_B1300 CLJ_B1301 grdE   TRUE 0.941 33.000 0.222 0.002   NA
 7505497 7505498 CLJ_B1301 CLJ_B1302   trxB FALSE 0.346 156.000 0.000 1.000   NA
 7505498 7505499 CLJ_B1302 CLJ_B1303 trxB   TRUE 0.972 35.000 0.226 1.000 Y NA
 7505499 7505500 CLJ_B1303 CLJ_B1304     FALSE 0.415 86.000 0.000 NA   NA
 7505500 7505501 CLJ_B1304 CLJ_B1306   grdC FALSE 0.421 96.000 0.000 NA   NA
 7505501 7505502 CLJ_B1306 CLJ_B1307 grdC grdD TRUE 0.984 16.000 0.622 0.002   NA
 7505502 7505503 CLJ_B1307 CLJ_B1308 grdD   FALSE 0.005 610.000 0.000 1.000 N NA
 7505503 7505504 CLJ_B1308 CLJ_B1309     TRUE 0.682 66.000 0.005 0.065   NA
 7505504 7505505 CLJ_B1309 CLJ_B1310   mtnK FALSE 0.009 435.000 0.000 1.000   NA
 7505505 7505506 CLJ_B1310 CLJ_B1311 mtnK mtnA TRUE 0.728 140.000 0.104 1.000   NA
 7505506 7505507 CLJ_B1311 CLJ_B1312 mtnA   TRUE 0.816 24.000 0.000 1.000 N NA
 7505507 7505508 CLJ_B1312 CLJ_B1313     TRUE 0.980 2.000 0.000 1.000 Y NA
 7505508 7505509 CLJ_B1313 CLJ_B1314     TRUE 0.841 15.000 0.000 NA   NA
 7505509 7505510 CLJ_B1314 CLJ_B1315     TRUE 0.805 21.000 0.000 NA   NA
 7505510 7505511 CLJ_B1315 CLJ_B1316   araD TRUE 0.882 58.000 0.014 NA Y NA
 7505511 7505512 CLJ_B1316 CLJ_B1317 araD   TRUE 0.876 175.000 0.400 1.000 Y NA
 7505512 7505513 CLJ_B1317 CLJ_B1318     FALSE 0.437 128.000 0.000 1.000   NA
 7505513 7505514 CLJ_B1318 CLJ_B1319     TRUE 0.558 110.000 0.000 0.001   NA
 7505514 7505515 CLJ_B1319 CLJ_B1320     FALSE 0.099 229.000 0.000 NA   NA
 7505517 7505518 CLJ_B1322 CLJ_B1323     TRUE 0.599 162.000 0.074 NA   NA
 7505518 7505519 CLJ_B1323 CLJ_B1324     TRUE 0.664 128.000 0.038 NA   NA
 7505519 7505520 CLJ_B1324 CLJ_B1325     TRUE 0.982 -3.000 0.135 NA   NA
 7505520 7505521 CLJ_B1325 CLJ_B1326     FALSE 0.005 533.000 0.000 NA   NA
 7505521 7505522 CLJ_B1326 CLJ_B1327     TRUE 0.816 48.000 0.080 NA   NA
 7505523 7505524 CLJ_B1328 CLJ_B1329     FALSE 0.014 381.000 0.000 NA   NA
 7505524 7505525 CLJ_B1329 CLJ_B1330     TRUE 0.772 25.000 0.000 NA   NA
 7505526 7505527 CLJ_B1331 CLJ_B1332     TRUE 0.965 28.000 0.667 NA   NA
 7505527 7505528 CLJ_B1332 CLJ_B1333     TRUE 0.834 57.000 0.200 NA   NA
 7505528 7505529 CLJ_B1333 CLJ_B1334     TRUE 0.994 14.000 0.500 0.001 Y NA
 7505529 7505530 CLJ_B1334 CLJ_B1335     TRUE 0.986 32.000 0.667 0.040 Y NA
 7505530 7505531 CLJ_B1335 CLJ_B1336   guaD TRUE 0.760 116.000 0.100 1.000 N NA
 7505531 7505532 CLJ_B1336 CLJ_B1337 guaD topB FALSE 0.017 384.000 0.000 1.000 N NA
 7505532 7505533 CLJ_B1337 CLJ_B1338 topB   FALSE 0.028 312.000 0.000 NA   NA
 7505533 7505534 CLJ_B1338 CLJ_B1339     TRUE 0.629 66.000 0.008 NA   NA
 7505534 7505535 CLJ_B1339 CLJ_B1340     FALSE 0.003 693.000 0.000 NA   NA
 7505535 7505536 CLJ_B1340 CLJ_B1341     FALSE 0.012 401.000 0.000 1.000   NA
 7505536 7505537 CLJ_B1341 CLJ_B1342     FALSE 0.034 305.000 0.000 1.000   NA
 7505537 7505538 CLJ_B1342 CLJ_B1343     FALSE 0.032 320.000 0.000 1.000 N NA
 7505538 7505539 CLJ_B1343 CLJ_B1344     TRUE 0.979 -7.000 0.067 1.000   NA
 7505539 7505540 CLJ_B1344 CLJ_B1345     TRUE 0.953 6.000 0.033 NA   NA
 7505540 7505541 CLJ_B1345 CLJ_B1346     FALSE 0.179 295.000 0.230 NA   NA
 7505541 7505542 CLJ_B1346 CLJ_B1347     FALSE 0.010 415.000 0.000 NA   NA
 7505542 7505543 CLJ_B1347 CLJ_B1348     FALSE 0.101 228.000 0.000 NA   NA
 7505543 7505544 CLJ_B1348 CLJ_B1349     FALSE 0.022 334.000 0.000 NA   NA
 7505544 7505545 CLJ_B1349 CLJ_B1350     FALSE 0.123 219.000 0.000 NA   NA
 7505545 7505546 CLJ_B1350 CLJ_B1351     TRUE 0.920 37.000 0.287 NA   NA
 7505546 7505547 CLJ_B1351 CLJ_B1352   copZ TRUE 0.891 123.000 0.024 0.001 Y NA
 7505547 7505548 CLJ_B1352 CLJ_B1353 copZ   FALSE 0.154 302.000 0.000 1.000 Y NA
 7505548 7505549 CLJ_B1353 CLJ_B1354     FALSE 0.011 426.000 0.000 1.000 N NA
 7505549 7505550 CLJ_B1354 CLJ_B1355     FALSE 0.040 292.000 0.000 NA   NA
 7505550 7505551 CLJ_B1355 CLJ_B1356     TRUE 0.542 164.000 0.040 NA   NA
 7505551 7505552 CLJ_B1356 CLJ_B1357     FALSE 0.009 431.000 0.000 NA   NA
 7505553 7505554 CLJ_B1358 CLJ_B1359 nimB   FALSE 0.430 135.000 0.000 1.000   NA
 7505554 7505555 CLJ_B1359 CLJ_B1360     TRUE 0.856 13.000 0.000 NA   NA
 7505555 7505556 CLJ_B1360 CLJ_B1361     TRUE 0.816 19.000 0.000 NA   NA
 7505557 7505558 CLJ_B1362 CLJ_B1363     TRUE 0.965 24.000 0.400 1.000   NA
 7505558 7505559 CLJ_B1363 CLJ_B1364     TRUE 0.863 12.000 0.000 NA   NA
 7505559 7505560 CLJ_B1364 CLJ_B1366     TRUE 0.848 14.000 0.000 NA   NA
 7505562 7505563 CLJ_B1367 CLJ_B1368     TRUE 0.902 2.000 0.000 NA   NA
 7505563 7505564 CLJ_B1368 CLJ_B1369     TRUE 0.826 17.000 0.000 NA   NA
 7505564 7505565 CLJ_B1369 CLJ_B1370     FALSE 0.421 96.000 0.000 NA   NA
 7505565 7505566 CLJ_B1370 CLJ_B1371     FALSE 0.420 95.000 0.000 NA   NA
 7505566 7505567 CLJ_B1371 CLJ_B1372     TRUE 0.841 15.000 0.000 NA   NA
 7505567 7505568 CLJ_B1372 CLJ_B1373     TRUE 0.894 3.000 0.000 NA   NA
 7505568 7505569 CLJ_B1373 CLJ_B1374     FALSE 0.470 61.000 0.000 NA   NA
 7505569 7505570 CLJ_B1374 CLJ_B1375     FALSE 0.514 54.000 0.000 NA   NA
 7505570 7505571 CLJ_B1375 CLJ_B1376     TRUE 0.826 17.000 0.000 NA   NA
 7505571 7505572 CLJ_B1376 CLJ_B1377     FALSE 0.478 59.000 0.000 NA   NA
 7505572 7505573 CLJ_B1377 CLJ_B1378     TRUE 0.592 43.000 0.000 NA   NA
 7505573 7505574 CLJ_B1378 CLJ_B1379     FALSE 0.422 107.000 0.000 NA   NA
 7505574 7505575 CLJ_B1379 CLJ_B1380     FALSE 0.451 68.000 0.000 NA   NA
 7505575 7505576 CLJ_B1380 CLJ_B1381     TRUE 0.580 44.000 0.000 NA   NA
 7505576 7505577 CLJ_B1381 CLJ_B1382     TRUE 0.664 35.000 0.000 NA   NA
 7505577 7505578 CLJ_B1382 CLJ_B1383     FALSE 0.499 56.000 0.000 NA   NA
 7505578 7505579 CLJ_B1383 CLJ_B1384     TRUE 0.640 38.000 0.000 NA   NA
 7505579 7505580 CLJ_B1384 CLJ_B1385     TRUE 0.848 14.000 0.000 NA   NA
 7505580 7505581 CLJ_B1385 CLJ_B1386     TRUE 0.746 27.000 0.000 NA   NA
 7505581 7505582 CLJ_B1386 CLJ_B1387     FALSE 0.422 107.000 0.000 NA   NA
 7505582 7505583 CLJ_B1387 CLJ_B1388     TRUE 0.534 51.000 0.000 NA   NA
 7505583 7505584 CLJ_B1388 CLJ_B1389     TRUE 0.894 3.000 0.000 NA   NA
 7505584 7505585 CLJ_B1389 CLJ_B1390     TRUE 0.923 -3.000 0.000 NA   NA
 7505585 7505586 CLJ_B1390 CLJ_B1391     FALSE 0.113 223.000 0.000 NA   NA
 7505586 7505587 CLJ_B1391 CLJ_B1392     TRUE 0.902 2.000 0.000 NA   NA
 7505587 7505588 CLJ_B1392 CLJ_B1393     FALSE 0.381 148.000 0.000 1.000   NA
 7505588 7505589 CLJ_B1393 CLJ_B1394     TRUE 0.701 165.000 0.222 1.000   NA
 7505589 7505590 CLJ_B1394 CLJ_B1395     TRUE 0.992 -13.000 0.444 NA   NA
 7505590 7505591 CLJ_B1395 CLJ_B1396     TRUE 0.871 57.000 0.375 NA   NA
 7505591 7505592 CLJ_B1396 CLJ_B1397     TRUE 0.943 -25.000 0.000 NA   NA
 7505592 7505593 CLJ_B1397 CLJ_B1398     TRUE 0.889 4.000 0.000 NA   NA
 7505593 7505594 CLJ_B1398 CLJ_B1399     TRUE 0.983 0.000 0.222 NA   NA
 7505594 7505595 CLJ_B1399 CLJ_B1400     TRUE 0.927 -6.000 0.000 NA   NA
 7505595 7505596 CLJ_B1400 CLJ_B1401     TRUE 0.810 20.000 0.000 NA   NA
 7505596 7505597 CLJ_B1401 CLJ_B1402     FALSE 0.073 248.000 0.000 NA   NA
 7505597 7505598 CLJ_B1402 CLJ_B1403     TRUE 0.564 46.000 0.000 NA   NA
 7505598 7505599 CLJ_B1403 CLJ_B1404     TRUE 0.923 -3.000 0.000 NA   NA
 7505599 7505600 CLJ_B1404 CLJ_B1405     TRUE 0.882 6.000 0.000 NA   NA
 7505600 7505601 CLJ_B1405 CLJ_B1406     TRUE 0.987 3.000 0.600 NA   NA
 7505601 7505602 CLJ_B1406 CLJ_B1407     FALSE 0.442 72.000 0.000 NA   NA
 7505602 7505603 CLJ_B1407 CLJ_B1408     TRUE 0.632 39.000 0.000 NA   NA
 7505603 7505604 CLJ_B1408 CLJ_B1409     TRUE 0.986 -3.000 0.273 NA   NA
 7505604 7505605 CLJ_B1409 CLJ_B1410     TRUE 0.863 12.000 0.000 NA   NA
 7505605 7505606 CLJ_B1410 CLJ_B1411     TRUE 0.894 3.000 0.000 NA   NA
 7505606 7505607 CLJ_B1411 CLJ_B1412     TRUE 0.990 -7.000 0.400 NA   NA
 7505607 7505608 CLJ_B1412 CLJ_B1413     TRUE 0.987 -7.000 0.250 NA   NA
 7505608 7505609 CLJ_B1413 CLJ_B1414     TRUE 0.908 1.000 0.000 NA   NA
 7505609 7505610 CLJ_B1414 CLJ_B1415     TRUE 0.863 12.000 0.000 NA   NA
 7505610 7505611 CLJ_B1415 CLJ_B1416     TRUE 0.930 -7.000 0.000 NA   NA
 7505611 7505612 CLJ_B1416 CLJ_B1417     FALSE 0.423 98.000 0.000 NA   NA
 7505612 7505613 CLJ_B1417 CLJ_B1418     TRUE 0.848 14.000 0.000 NA   NA
 7505613 7505614 CLJ_B1418 CLJ_B1419     TRUE 0.623 40.000 0.000 NA   NA
 7505614 7505615 CLJ_B1419 CLJ_B1420     FALSE 0.078 242.000 0.000 NA   NA
 7505615 7505616 CLJ_B1420 CLJ_B1421     FALSE 0.015 372.000 0.000 NA   NA
 7505616 7505617 CLJ_B1421 CLJ_B1422     FALSE 0.029 311.000 0.000 NA   NA
 7505617 7505618 CLJ_B1422 CLJ_B1423     FALSE 0.249 174.000 0.000 NA   NA
 7505618 7505619 CLJ_B1423 CLJ_B1424     TRUE 0.939 -15.000 0.000 NA   NA
 7505619 7505620 CLJ_B1424 CLJ_B1425     FALSE 0.362 146.000 0.000 NA   NA
 7505620 7505621 CLJ_B1425 CLJ_B1426     FALSE 0.007 454.000 0.000 NA   NA
 7505621 7505622 CLJ_B1426 CLJ_B1427     TRUE 0.640 38.000 0.000 NA   NA
 7505624 7505625 CLJ_B1429 CLJ_B1430     FALSE 0.004 600.000 0.000 NA   NA
 7505625 7505626 CLJ_B1430 CLJ_B1431   trkA FALSE 0.003 788.000 0.000 NA   NA
 7505626 7505627 CLJ_B1431 CLJ_B1432 trkA trkH TRUE 0.995 -3.000 0.163 0.004 Y NA
 7505627 7505628 CLJ_B1432 CLJ_B1433 trkH   FALSE 0.008 451.000 0.000 NA   NA
 7505628 7505629 CLJ_B1433 CLJ_B1434     TRUE 0.941 -19.000 0.000 NA   NA
 7505630 7505631 CLJ_B1435 CLJ_B1436     TRUE 0.961 15.000 0.158 NA   NA
 7505631 7505632 CLJ_B1436 CLJ_B1437     FALSE 0.006 507.000 0.000 NA   NA
 7505633 7505634 CLJ_B1439 CLJ_B1440 rbr   FALSE 0.041 296.000 0.000 NA N NA
 7505636 7505637 CLJ_B1442 CLJ_B1443     FALSE 0.243 175.000 0.000 NA   NA
 7505637 7505638 CLJ_B1443 CLJ_B1444     FALSE 0.422 97.000 0.000 NA   NA
 7505638 7505639 CLJ_B1444 CLJ_B1445     FALSE 0.045 282.000 0.000 NA   NA
 7505639 7505640 CLJ_B1445 CLJ_B1446     FALSE 0.527 210.000 0.312 NA N NA
 7505640 7505641 CLJ_B1446 CLJ_B1447     TRUE 0.864 147.000 0.077 NA Y NA
 7505641 7505642 CLJ_B1447 CLJ_B1448   noxA FALSE 0.465 198.000 0.111 NA   NA
 7505643 7505644 CLJ_B1449 CLJ_B1450     FALSE 0.484 58.000 0.000 NA   NA
 7505645 7505646 CLJ_B1451 CLJ_B1452     TRUE 0.790 55.000 0.083 NA   NA
 7505648 7505649 CLJ_B1454 CLJ_B1455     FALSE 0.040 303.000 0.000 1.000 N NA
 7505649 7505650 CLJ_B1455 CLJ_B1456     TRUE 0.985 22.000 0.214 1.000 Y NA
 7505650 7505651 CLJ_B1456 CLJ_B1457     TRUE 0.994 3.000 0.255 1.000 Y NA
 7505652 7505653 CLJ_B1458 CLJ_B1459     TRUE 0.774 75.000 0.133 NA   NA
 7505654 7505655 CLJ_B1460 CLJ_B1461   murQ FALSE 0.075 279.000 0.000 0.003   NA
 7505655 7505656 CLJ_B1461 CLJ_B1462 murQ   TRUE 0.754 113.000 0.107 1.000   NA
 7505656 7505657 CLJ_B1462 CLJ_B1463     FALSE 0.035 425.000 0.089 1.000   NA
 7505657 7505658 CLJ_B1463 CLJ_B1464     FALSE 0.439 118.000 0.000 1.000   NA
 7505658 7505659 CLJ_B1464 CLJ_B1465     FALSE 0.442 83.000 0.000 1.000   NA
 7505659 7505660 CLJ_B1465 CLJ_B1466     FALSE 0.014 381.000 0.000 NA   NA
 7505660 7505661 CLJ_B1466 CLJ_B1467     FALSE 0.044 284.000 0.000 NA   NA
 7505661 7505662 CLJ_B1467 CLJ_B1468     FALSE 0.068 254.000 0.000 NA   NA
 7505662 7505663 CLJ_B1468 CLJ_B1469     TRUE 0.901 53.000 0.500 NA   NA
 7505663 7505664 CLJ_B1469 CLJ_B1470     TRUE 0.984 0.000 0.250 NA   NA
 7505666 7505667 CLJ_B1472 CLJ_B1473     FALSE 0.057 278.000 0.000 1.000 N NA
 7505667 7505668 CLJ_B1473 CLJ_B1474     TRUE 0.996 -3.000 0.235 0.027 Y NA
 7505668 7505669 CLJ_B1474 CLJ_B1475     TRUE 0.994 9.000 0.353 0.027 Y NA
 7505669 7505670 CLJ_B1475 CLJ_B1476     FALSE 0.423 99.000 0.000 NA   NA
 7505670 7505671 CLJ_B1476 CLJ_B1477     FALSE 0.007 458.000 0.000 NA   NA
 7505672 7505673 CLJ_B1478 CLJ_B1479     TRUE 0.995 0.000 0.231 1.000 Y NA
 7505676 7505677 CLJ_B1482 CLJ_B1483     TRUE 0.659 135.000 0.025 1.000 N NA
 7505677 7505678 CLJ_B1483 CLJ_B1484     FALSE 0.003 1004.000 0.000 NA N NA
 7505678 7505679 CLJ_B1484 CLJ_B1485     TRUE 0.988 -28.000 0.000 NA Y NA
 7505679 7505680 CLJ_B1485 CLJ_B1486     TRUE 0.787 126.000 0.000 1.000 Y NA
 7505680 7505681 CLJ_B1486 CLJ_B1487     TRUE 0.782 135.000 0.000 1.000 Y NA
 7505681 7505682 CLJ_B1487 CLJ_B1488     TRUE 0.984 -30.000 0.035 0.054   NA
 7505682 7505683 CLJ_B1488 CLJ_B1489     TRUE 0.674 127.000 0.035 1.000   NA
 7505683 7505684 CLJ_B1489 CLJ_B1490   rnz FALSE 0.049 284.000 0.000 1.000   NA
 7505684 7505685 CLJ_B1490 CLJ_B1491 rnz   FALSE 0.015 369.000 0.000 NA   NA
 7505685 7505686 CLJ_B1491 CLJ_B1492     FALSE 0.366 145.000 0.000 NA   NA
 7505686 7505687 CLJ_B1492 CLJ_B1493     TRUE 0.929 13.000 0.015 NA   NA
 7505687 7505688 CLJ_B1493 CLJ_B1494     TRUE 0.975 54.000 0.800 0.018 Y NA
 7505688 7505689 CLJ_B1494 CLJ_B1495     TRUE 0.716 188.000 0.600 1.000 N NA
 7505689 7505690 CLJ_B1495 CLJ_B1496     TRUE 0.900 109.000 1.000 NA   NA
 7505690 7505691 CLJ_B1496 CLJ_B1497     TRUE 0.988 2.000 0.600 NA   NA
 7505691 7505692 CLJ_B1497 CLJ_B1498     TRUE 0.974 19.000 0.500 NA   NA
 7505693 7505694 CLJ_B1499 CLJ_B1500     FALSE 0.005 553.000 0.000 NA   NA
 7505694 7505695 CLJ_B1500 CLJ_B1501   cspA TRUE 0.692 168.000 0.250 NA   NA
 7505696 7505697 CLJ_B1502 CLJ_B1503 pepD_1   TRUE 0.696 34.000 0.000 1.000   NA
 7505697 7505698 CLJ_B1503 CLJ_B1504     FALSE 0.009 446.000 0.000 1.000   NA
 7505700 7505701 CLJ_B1506 CLJ_B1507     TRUE 0.993 -13.000 0.500 1.000   NA
 7505701 7505702 CLJ_B1507 CLJ_B1508     TRUE 0.730 175.000 0.500 NA   NA
 7505702 7505703 CLJ_B1508 CLJ_B1509     FALSE 0.009 428.000 0.000 NA   NA
 7505703 7505704 CLJ_B1509 CLJ_B1510     TRUE 0.997 2.000 1.000 1.000 Y NA
 7505704 7505705 CLJ_B1510 CLJ_B1511     TRUE 0.900 57.000 0.500 1.000 N NA
 7505705 7505706 CLJ_B1511 CLJ_B1512     TRUE 0.988 -10.000 0.222 1.000   NA
 7505706 7505707 CLJ_B1512 CLJ_B1513     FALSE 0.448 69.000 0.000 NA   NA
 7505707 7505708 CLJ_B1513 CLJ_B1514     FALSE 0.020 346.000 0.000 NA   NA
 7505708 7505709 CLJ_B1514 CLJ_B1515     FALSE 0.011 401.000 0.000 NA   NA
 7505709 7505710 CLJ_B1515 CLJ_B1516     FALSE 0.415 88.000 0.000 NA   NA
 7505710 7505711 CLJ_B1516 CLJ_B1517     TRUE 0.816 19.000 0.000 NA   NA
 7505712 7505713 CLJ_B1518 CLJ_B1519     TRUE 0.940 0.000 0.000 0.062   NA
 7505718 7505719 CLJ_B1524 CLJ_B1525 bdhA   FALSE 0.014 384.000 0.000 NA   NA
 7505719 7505720 CLJ_B1525 CLJ_B1526     TRUE 0.737 174.000 0.500 NA   NA
 7505722 7505723 CLJ_B1528 CLJ_B1529     TRUE 0.997 2.000 0.643 0.027 Y NA
 7505723 7505724 CLJ_B1529 CLJ_B1530     TRUE 0.668 130.000 0.041 NA   NA
 7505724 7505725 CLJ_B1530 CLJ_B1531     FALSE 0.420 95.000 0.000 NA   NA
 7505725 7505726 CLJ_B1531 CLJ_B1532     FALSE 0.018 354.000 0.000 NA   NA
 7505726 7505727 CLJ_B1532 CLJ_B1533     FALSE 0.158 203.000 0.000 NA   NA
 7505727 7505728 CLJ_B1533 CLJ_B1534     FALSE 0.174 270.000 0.079 1.000   NA
 7505728 7505729 CLJ_B1534 CLJ_B1535     FALSE 0.525 56.000 0.000 1.000   NA
 7505729 7505730 CLJ_B1535 CLJ_B1536     FALSE 0.008 480.000 0.000 1.000 N NA
 7505730 7505731 CLJ_B1536 CLJ_B1537     TRUE 0.913 32.000 0.137 1.000   NA
 7505735 7505736 CLJ_B1541 CLJ_B1542     FALSE 0.021 361.000 0.000 1.000 N NA
 7505737 7505738 CLJ_B1543 CLJ_B1544   npr_1 FALSE 0.283 167.000 0.000 NA   NA
 7505738 7505739 CLJ_B1544 CLJ_B1545 npr_1 npr_2 TRUE 0.966 137.000 1.000 0.006 Y NA
 7505739 7505740 CLJ_B1545 CLJ_B1546 npr_2 npr_3 TRUE 0.823 116.000 0.000 0.006 Y NA
 7505740 7505741 CLJ_B1546 CLJ_B1547 npr_3 npr_4 TRUE 0.823 120.000 0.000 0.006 Y NA
 7505741 7505742 CLJ_B1547 CLJ_B1548 npr_4 npr_5 TRUE 0.931 34.000 0.000 0.006 Y NA
 7505742 7505743 CLJ_B1548 CLJ_B1549 npr_5 nadC FALSE 0.005 602.000 0.000 1.000 N NA
 7505743 7505744 CLJ_B1549 CLJ_B1550 nadC nadB TRUE 0.994 -19.000 0.046 1.000 Y NA
 7505744 7505745 CLJ_B1550 CLJ_B1551 nadB nadA TRUE 0.989 3.000 0.042 1.000 Y NA
 7505747 7505748 CLJ_B1553 CLJ_B1554 hlyIII ychF TRUE 0.630 121.000 0.002 0.042   NA
 7505749 7505750 CLJ_B1555 CLJ_B1556 mraZ mraW TRUE 0.875 80.000 0.635 NA   NA
 7505750 7505751 CLJ_B1556 CLJ_B1557 mraW   TRUE 0.609 82.000 0.008 1.000   NA
 7505751 7505752 CLJ_B1557 CLJ_B1558     TRUE 0.954 16.000 0.096 1.000   NA
 7505752 7505753 CLJ_B1558 CLJ_B1559   murE TRUE 0.661 230.000 0.265 1.000 Y NA
 7505753 7505754 CLJ_B1559 CLJ_B1560 murE murF TRUE 0.987 26.000 0.328 0.003 Y NA
 7505754 7505755 CLJ_B1560 CLJ_B1561 murF mraY_2 TRUE 0.955 36.000 0.024 0.004 Y NA
 7505755 7505756 CLJ_B1561 CLJ_B1562 mraY_2   TRUE 0.713 79.000 0.014 0.004 N NA
 7505756 7505757 CLJ_B1562 CLJ_B1563     FALSE 0.061 319.000 0.015 NA N NA
 7505757 7505758 CLJ_B1563 CLJ_B1564     TRUE 0.935 11.000 0.014 NA   NA
 7505758 7505759 CLJ_B1564 CLJ_B1565   sbp TRUE 0.865 34.000 0.053 NA   NA
 7505759 7505760 CLJ_B1565 CLJ_B1566 sbp   TRUE 0.968 1.000 0.053 NA   NA
 7505760 7505761 CLJ_B1566 CLJ_B1567     TRUE 0.622 93.000 0.017 NA   NA
 7505761 7505762 CLJ_B1567 CLJ_B1568     TRUE 0.917 21.000 0.032 NA   NA
 7505762 7505763 CLJ_B1568 CLJ_B1569     TRUE 0.965 17.000 0.246 NA   NA
 7505763 7505764 CLJ_B1569 CLJ_B1570     TRUE 0.978 1.000 0.118 1.000   NA
 7505764 7505765 CLJ_B1570 CLJ_B1571     TRUE 0.978 16.000 0.579 NA   NA
 7505765 7505766 CLJ_B1571 CLJ_B1572   aroB FALSE 0.022 408.000 0.006 NA N NA
 7505766 7505767 CLJ_B1572 CLJ_B1573 aroB mtnN TRUE 0.955 1.000 0.003 1.000 N NA
 7505767 7505768 CLJ_B1573 CLJ_B1574 mtnN aroF TRUE 0.705 121.000 0.046 1.000 N NA
 7505768 7505769 CLJ_B1574 CLJ_B1575 aroF aroA TRUE 0.745 167.000 0.003 1.000 Y NA
 7505769 7505770 CLJ_B1575 CLJ_B1576 aroA   FALSE 0.152 217.000 0.000 1.000 N NA
 7505770 7505771 CLJ_B1576 CLJ_B1577   lspA FALSE 0.060 354.000 0.050 1.000 N NA
 7505771 7505772 CLJ_B1577 CLJ_B1578 lspA   TRUE 0.970 4.000 0.082 1.000 N NA
 7505772 7505773 CLJ_B1578 CLJ_B1580   pyrR_1 FALSE 0.020 497.000 0.048 1.000 N NA
 7505773 7505774 CLJ_B1580 CLJ_B1581 pyrR_1 pyrP TRUE 0.953 44.000 0.140 1.000 Y NA
 7505776 7505777 CLJ_B1583 CLJ_B1584 xth   FALSE 0.347 233.000 0.000 1.000 Y NA
 7505777 7505778 CLJ_B1584 CLJ_B1585     FALSE 0.103 231.000 0.000 1.000   NA
 7505778 7505779 CLJ_B1585 CLJ_B1586   modA FALSE 0.245 180.000 0.000 1.000   NA
 7505779 7505780 CLJ_B1586 CLJ_B1587 modA modB TRUE 0.995 10.000 0.430 0.001 Y NA
 7505780 7505781 CLJ_B1587 CLJ_B1588 modB   FALSE 0.344 323.000 0.342 1.000 Y NA
 7505781 7505782 CLJ_B1588 CLJ_B1589     TRUE 0.695 54.000 0.013 NA   NA
 7505782 7505783 CLJ_B1589 CLJ_B1590     FALSE 0.019 348.000 0.000 NA   NA
 7505783 7505784 CLJ_B1590 CLJ_B1591     FALSE 0.019 350.000 0.000 NA   NA
 7505784 7505785 CLJ_B1591 CLJ_B1592     FALSE 0.050 273.000 0.000 NA   NA
 7505785 7505786 CLJ_B1592 CLJ_B1593     TRUE 0.894 48.000 0.308 NA N NA
 7505786 7505787 CLJ_B1593 CLJ_B1594     FALSE 0.379 142.000 0.000 NA   NA
 7505787 7505788 CLJ_B1594 CLJ_B1595     TRUE 0.765 88.000 0.147 NA   NA
 7505788 7505789 CLJ_B1595 CLJ_B1596     TRUE 0.953 24.000 0.235 NA   NA
 7505789 7505790 CLJ_B1596 CLJ_B1597   mtbC TRUE 0.934 26.000 0.118 1.000   NA
 7505790 7505791 CLJ_B1597 CLJ_B1598 mtbC   TRUE 0.767 80.000 0.118 1.000   NA
 7505791 7505792 CLJ_B1598 CLJ_B1599     FALSE 0.008 449.000 0.000 NA   NA
 7505792 7505793 CLJ_B1599 CLJ_B1600     TRUE 0.759 26.000 0.000 NA   NA
 7505793 7505794 CLJ_B1600 CLJ_B1601     TRUE 0.927 23.000 0.044 1.000 N NA
 7505794 7505795 CLJ_B1601 CLJ_B1602     TRUE 0.993 2.000 0.178 1.000 Y NA
 7505795 7505796 CLJ_B1602 CLJ_B1603     TRUE 0.890 170.000 0.444 NA Y NA
 7505798 7505799 CLJ_B1605 CLJ_B1606   asnA FALSE 0.028 330.000 0.000 1.000 N NA
 7505801 7505802 CLJ_B1608 CLJ_B1609     TRUE 0.964 27.000 0.024 1.000 Y NA
 7505802 7505803 CLJ_B1609 CLJ_B1610     FALSE 0.034 306.000 0.000 1.000   NA
 7505805 7505806 CLJ_B1612 CLJ_B1613     TRUE 0.945 13.000 0.041 NA   NA
 7505806 7505807 CLJ_B1613 CLJ_B1614     TRUE 0.994 -7.000 0.611 0.027 N NA
 7505807 7505808 CLJ_B1614 CLJ_B1615     TRUE 0.977 36.000 0.278 0.027 Y NA
 7505808 7505809 CLJ_B1615 CLJ_B1616     TRUE 0.955 46.000 0.121 0.027 Y NA
 7505815 7505816 CLJ_B1622 CLJ_B1623     FALSE 0.420 108.000 0.000 NA   NA
 7505816 7505817 CLJ_B1623 CLJ_B1624     FALSE 0.016 367.000 0.000 NA   NA
 7505817 7505818 CLJ_B1624 CLJ_B1625     TRUE 0.664 35.000 0.000 NA   NA
 7505818 7505819 CLJ_B1625 CLJ_B1626     FALSE 0.004 655.000 0.000 NA   NA
 7505820 7505821 CLJ_B1627 CLJ_B1628 chiA   TRUE 0.885 5.000 0.000 NA   NA
 7505824 7505825 CLJ_B1631 CLJ_B1632     FALSE 0.345 151.000 0.000 NA   NA
 7505825 7505826 CLJ_B1632 CLJ_B1633   ogt TRUE 0.849 29.000 0.014 NA   NA
 7505826 7505827 CLJ_B1633 CLJ_B1634 ogt   TRUE 0.872 27.000 0.014 1.000   NA
 7505827 7505828 CLJ_B1634 CLJ_B1635     TRUE 0.709 165.000 0.263 NA   NA
 7505828 7505829 CLJ_B1635 CLJ_B1636     TRUE 0.943 25.000 0.168 NA   NA
 7505829 7505830 CLJ_B1636 CLJ_B1637     FALSE 0.006 513.000 0.000 1.000   NA
 7505830 7505831 CLJ_B1637 CLJ_B1638     FALSE 0.146 214.000 0.000 1.000   NA
 7505831 7505832 CLJ_B1638 CLJ_B1639     FALSE 0.010 477.000 0.000 0.088 N NA
 7505832 7505833 CLJ_B1639 CLJ_B1640     FALSE 0.010 437.000 0.000 1.000 N NA
 7505833 7505834 CLJ_B1640 CLJ_B1641     TRUE 0.885 5.000 0.000 NA   NA
 7505834 7505835 CLJ_B1641 CLJ_B1642     FALSE 0.413 126.000 0.000 NA   NA
 7505835 7505836 CLJ_B1642 CLJ_B1643     FALSE 0.104 236.000 0.000 1.000 N NA
 7505836 7505837 CLJ_B1643 CLJ_B1644     TRUE 0.996 13.000 1.000 0.006 Y NA
 7505837 7505838 CLJ_B1644 CLJ_B1645     FALSE 0.067 255.000 0.000 NA   NA
 7505838 7505839 CLJ_B1645 CLJ_B1646     TRUE 0.811 99.000 0.250 NA   NA
 7505839 7505840 CLJ_B1646 CLJ_B1647     TRUE 0.722 29.000 0.000 NA   NA
 7505843 7505844 CLJ_B1651 CLJ_B1652     TRUE 0.976 14.000 0.386 NA   NA
 7505845 7505846 CLJ_B1653 CLJ_B1654     TRUE 0.783 121.000 0.143 1.000 N NA
 7505846 7505847 CLJ_B1654 CLJ_B1655     TRUE 0.987 11.000 0.750 1.000   NA
 7505847 7505848 CLJ_B1655 CLJ_B1656     TRUE 0.990 0.000 0.600 NA   NA
 7505848 7505849 CLJ_B1656 CLJ_B1657     TRUE 0.865 132.000 0.600 NA   NA
 7505850 7505851 CLJ_B1658 CLJ_B1659     TRUE 0.742 58.000 0.051 NA   NA
 7505851 7505852 CLJ_B1659 CLJ_B1660     FALSE 0.234 178.000 0.000 NA   NA
 7505853 7505854 CLJ_B1662 CLJ_B1663     TRUE 0.992 0.000 0.722 NA N NA
 7505854 7505855 CLJ_B1663 CLJ_B1664   queD TRUE 0.958 17.000 0.135 NA N NA
 7505855 7505856 CLJ_B1664 CLJ_B1665 queD   TRUE 0.987 2.000 0.405 1.000 N NA
 7505856 7505857 CLJ_B1665 CLJ_B1666   folE TRUE 0.986 4.000 0.429 1.000 N NA
 7505857 7505858 CLJ_B1666 CLJ_B1667 folE   FALSE 0.396 182.000 0.015 1.000   NA
 7505858 7505859 CLJ_B1667 CLJ_B1668     TRUE 0.593 114.000 0.005 1.000   NA
 7505859 7505860 CLJ_B1668 CLJ_B1669     FALSE 0.271 169.000 0.000 NA   NA
 7505860 7505861 CLJ_B1669 CLJ_B1670   deoC FALSE 0.025 324.000 0.000 NA   NA
 7505861 7505862 CLJ_B1670 CLJ_B1671 deoC rbsK FALSE 0.059 339.000 0.026 1.000 N NA
 7505862 7505863 CLJ_B1671 CLJ_B1672 rbsK hisZ FALSE 0.008 468.000 0.000 1.000 N NA
 7505863 7505864 CLJ_B1672 CLJ_B1673 hisZ hisG TRUE 0.987 25.000 0.239 0.004 Y NA
 7505864 7505865 CLJ_B1673 CLJ_B1674 hisG hisD TRUE 0.943 79.000 0.254 0.004 Y NA
 7505865 7505866 CLJ_B1674 CLJ_B1675 hisD hisB TRUE 0.902 145.000 0.096 0.004 Y NA
 7505866 7505867 CLJ_B1675 CLJ_B1676 hisB hisH TRUE 0.924 126.000 0.125 0.004 Y NA
 7505867 7505868 CLJ_B1676 CLJ_B1677 hisH hisA TRUE 0.995 -3.000 0.124 0.004 Y NA
 7505868 7505869 CLJ_B1677 CLJ_B1678 hisA hisC TRUE 0.991 -3.000 0.004 0.004 Y NA
 7505869 7505870 CLJ_B1678 CLJ_B1679 hisC hisF TRUE 0.648 200.000 0.002 0.004 Y NA
 7505870 7505871 CLJ_B1679 CLJ_B1680 hisF hisI TRUE 0.987 28.000 0.430 0.004 Y NA
 7505871 7505872 CLJ_B1680 CLJ_B1681 hisI hisE FALSE 0.414 121.000 0.000 NA   NA
 7505872 7505873 CLJ_B1681 CLJ_B1682 hisE   FALSE 0.395 138.000 0.000 NA   NA
 7505873 7505874 CLJ_B1682 CLJ_B1683     TRUE 0.969 14.000 0.231 NA   NA
 7505874 7505875 CLJ_B1683 CLJ_B1684     TRUE 0.965 18.000 0.267 NA   NA
 7505877 7505878 CLJ_B1686 CLJ_B1687     TRUE 0.725 81.000 0.070 1.000   NA
 7505878 7505879 CLJ_B1687 CLJ_B1688     TRUE 0.600 153.000 0.047 NA   NA
 7505879 7505880 CLJ_B1688 CLJ_B1689     FALSE 0.087 235.000 0.000 NA   NA
 7505880 7505881 CLJ_B1689 CLJ_B1690     TRUE 0.961 3.000 0.041 NA   NA
 7505881 7505882 CLJ_B1690 CLJ_B1691     TRUE 0.986 3.000 0.490 NA   NA
 7505882 7505883 CLJ_B1691 CLJ_B1692     TRUE 0.828 117.000 0.352 NA   NA
 7505883 7505884 CLJ_B1692 CLJ_B1693     TRUE 0.998 -9.000 0.741 0.017 Y NA
 7505884 7505885 CLJ_B1693 CLJ_B1694   arcA_2 FALSE 0.006 564.000 0.000 1.000 N NA
 7505885 7505886 CLJ_B1694 CLJ_B1695 arcA_2 arcD TRUE 0.863 125.000 0.022 1.000 Y NA
 7505888 7505889 CLJ_B1697 CLJ_B1698     FALSE 0.395 138.000 0.000 NA   NA
 7505889 7505890 CLJ_B1698 CLJ_B1699     FALSE 0.418 93.000 0.000 NA   NA
 7505890 7505891 CLJ_B1699 CLJ_B1700     TRUE 0.623 40.000 0.000 NA   NA
 7505893 7505894 CLJ_B1702 CLJ_B1703     FALSE 0.462 189.000 0.067 1.000   NA
 7505895 7505896 CLJ_B1704 CLJ_B1705     TRUE 0.940 0.000 0.000 0.061   NA
 7505897 7505898 CLJ_B1706 CLJ_B1707     FALSE 0.014 381.000 0.000 NA   NA
 7505898 7505899 CLJ_B1707 CLJ_B1708     TRUE 0.770 149.000 0.222 1.000 N NA
 7505899 7505900 CLJ_B1708 CLJ_B1709     TRUE 0.997 2.000 0.900 0.006 Y NA
 7505900 7505901 CLJ_B1709 CLJ_B1710     FALSE 0.015 393.000 0.000 1.000 N NA
 7505901 7505902 CLJ_B1710 CLJ_B1711     FALSE 0.178 293.000 0.000 1.000 Y NA
 7505902 7505903 CLJ_B1711 CLJ_B1712     FALSE 0.293 248.000 0.000 1.000 Y NA
 7505903 7505904 CLJ_B1712 CLJ_B1713     TRUE 0.958 42.000 0.167 1.000 Y NA
 7505904 7505905 CLJ_B1713 CLJ_B1714     TRUE 0.987 4.000 0.610 NA   NA
 7505905 7505906 CLJ_B1714 CLJ_B1715     FALSE 0.105 226.000 0.000 NA   NA
 7505908 7505909 CLJ_B1717 CLJ_B1718     TRUE 0.873 101.000 0.600 NA   NA
 7505909 7505910 CLJ_B1718 CLJ_B1719     FALSE 0.379 142.000 0.000 NA   NA
 7505911 7505912 CLJ_B1720 CLJ_B1721     TRUE 0.997 -22.000 0.261 1.000 Y NA
 7505913 7505914 CLJ_B1722 CLJ_B1723     TRUE 0.527 52.000 0.000 NA   NA
 7505915 7505916 CLJ_B1724 CLJ_B1725     FALSE 0.053 270.000 0.000 NA   NA
 7505916 7505917 CLJ_B1725 CLJ_B1726     TRUE 0.973 9.000 0.171 1.000   NA
 7505917 7505918 CLJ_B1726 CLJ_B1727     FALSE 0.029 309.000 0.000 NA   NA
 7505919 7505920 CLJ_B1728 CLJ_B1729     TRUE 0.954 40.000 1.000 NA   NA
 7505922 7505923 CLJ_B1732 CLJ_B1733 metF   TRUE 0.654 160.000 0.045 0.002   NA
 7505923 7505924 CLJ_B1733 CLJ_B1734     TRUE 0.986 -10.000 0.075 0.001   NA
 7505926 7505927 CLJ_B1736 CLJ_B1737   acoR FALSE 0.011 403.000 0.000 NA   NA
 7505927 7505928 CLJ_B1737 CLJ_B1738 acoR   TRUE 0.779 122.000 0.182 NA   NA
 7505928 7505929 CLJ_B1738 CLJ_B1739   acoA TRUE 0.932 21.000 0.065 NA   NA
 7505929 7505930 CLJ_B1739 CLJ_B1740 acoA acoB TRUE 0.992 3.000 0.076 0.001 Y NA
 7505930 7505931 CLJ_B1740 CLJ_B1741 acoB   FALSE 0.436 75.000 0.000 NA   NA
 7505931 7505932 CLJ_B1741 CLJ_B1742   acoC TRUE 0.655 36.000 0.000 NA   NA
 7505932 7505933 CLJ_B1742 CLJ_B1743 acoC acoL TRUE 0.989 13.000 0.148 1.000 Y NA
 7505933 7505934 CLJ_B1743 CLJ_B1744 acoL   TRUE 0.930 25.000 0.074 1.000 N NA
 7505934 7505935 CLJ_B1744 CLJ_B1745     FALSE 0.025 344.000 0.000 1.000 N NA
 7505935 7505936 CLJ_B1745 CLJ_B1746     TRUE 0.995 -7.000 0.793 0.087 N NA
 7505936 7505937 CLJ_B1746 CLJ_B1747   thrC FALSE 0.044 297.000 0.000 1.000 N NA
 7505937 7505938 CLJ_B1747 CLJ_B1748 thrC thrB TRUE 0.992 10.000 0.233 1.000 Y NA
 7505938 7505939 CLJ_B1748 CLJ_B1749 thrB   TRUE 0.847 127.000 0.008 1.000 Y NA
 7505939 7505940 CLJ_B1749 CLJ_B1750   hom_1 TRUE 0.564 223.000 0.010 0.003 Y NA
 7505940 7505941 CLJ_B1750 CLJ_B1751 hom_1   FALSE 0.005 615.000 0.000 1.000 N NA
 7505941 7505942 CLJ_B1751 CLJ_B1752     FALSE 0.007 510.000 0.000 1.000 N NA
 7505942 7505943 CLJ_B1752 CLJ_B1753     FALSE 0.111 329.000 0.000 1.000 Y NA
 7505943 7505944 CLJ_B1753 CLJ_B1754   gltA_1 TRUE 0.993 0.000 0.667 0.038 N NA
 7505944 7505945 CLJ_B1754 CLJ_B1755 gltA_1   FALSE 0.119 229.000 0.000 1.000 N NA
 7505945 7505946 CLJ_B1755 CLJ_B1756     FALSE 0.004 664.000 0.000 NA   NA
 7505946 7505947 CLJ_B1756 CLJ_B1757     FALSE 0.005 564.000 0.000 NA   NA
 7505947 7505948 CLJ_B1757 CLJ_B1758     FALSE 0.008 440.000 0.000 NA   NA
 7505948 7505949 CLJ_B1758 CLJ_B1759     FALSE 0.419 94.000 0.000 NA   NA
 7505949 7505950 CLJ_B1759 CLJ_B1760     FALSE 0.226 180.000 0.000 NA   NA
 7505950 7505951 CLJ_B1760 CLJ_B1761     FALSE 0.017 358.000 0.000 NA   NA
 7505951 7505952 CLJ_B1761 CLJ_B1762     FALSE 0.011 403.000 0.000 NA   NA
 7505952 7505953 CLJ_B1762 CLJ_B1763     FALSE 0.271 169.000 0.000 NA   NA
 7505954 7505955 CLJ_B1764 CLJ_B1765     FALSE 0.496 62.000 0.000 NA N NA
 7505955 7505956 CLJ_B1765 CLJ_B1766     TRUE 0.816 19.000 0.000 NA   NA
 7505957 7505958 CLJ_B1767 CLJ_B1768     TRUE 0.826 17.000 0.000 NA   NA
 7505958 7505959 CLJ_B1768 CLJ_B1769     TRUE 0.805 21.000 0.000 NA   NA
 7505959 7505960 CLJ_B1769 CLJ_B1770     TRUE 0.863 12.000 0.000 NA   NA
 7505960 7505961 CLJ_B1770 CLJ_B1771     TRUE 0.930 -7.000 0.000 NA   NA
 7505961 7505962 CLJ_B1771 CLJ_B1772     TRUE 0.640 38.000 0.000 NA   NA
 7505962 7505963 CLJ_B1772 CLJ_B1773     FALSE 0.491 57.000 0.000 NA   NA
 7505963 7505964 CLJ_B1773 CLJ_B1774     TRUE 0.942 -22.000 0.000 NA   NA
 7505964 7505965 CLJ_B1774 CLJ_B1775     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 7505965 7505966 CLJ_B1775 CLJ_B1776     TRUE 0.902 2.000 0.000 NA   NA
 7505966 7505967 CLJ_B1776 CLJ_B1777     TRUE 0.923 -3.000 0.000 NA   NA
 7505967 7505968 CLJ_B1777 CLJ_B1778     TRUE 0.970 0.000 0.051 NA   NA
 7505968 7505969 CLJ_B1778 CLJ_B1779     TRUE 0.902 2.000 0.000 NA   NA
 7505969 7505970 CLJ_B1779 CLJ_B1780     TRUE 0.869 11.000 0.000 NA   NA
 7505970 7505971 CLJ_B1780 CLJ_B1781     FALSE 0.153 341.000 0.500 NA   NA
 7505971 7505972 CLJ_B1781 CLJ_B1782     TRUE 0.848 14.000 0.000 NA   NA
 7505972 7505973 CLJ_B1782 CLJ_B1783     TRUE 0.856 13.000 0.000 NA   NA
 7505973 7505974 CLJ_B1783 CLJ_B1784     FALSE 0.455 66.000 0.000 NA   NA
 7505974 7505975 CLJ_B1784 CLJ_B1785     TRUE 0.602 42.000 0.000 NA   NA
 7505975 7505976 CLJ_B1785 CLJ_B1786     FALSE 0.453 67.000 0.000 NA   NA
 7505976 7505977 CLJ_B1786 CLJ_B1787     FALSE 0.458 65.000 0.000 NA   NA
 7505977 7505978 CLJ_B1787 CLJ_B1788     TRUE 0.689 32.000 0.000 NA   NA
 7505978 7505979 CLJ_B1788 CLJ_B1789     TRUE 0.709 30.000 0.000 NA   NA
 7505979 7505980 CLJ_B1789 CLJ_B1790     FALSE 0.451 68.000 0.000 NA   NA
 7505980 7505981 CLJ_B1790 CLJ_B1791     TRUE 0.799 22.000 0.000 NA   NA
 7505981 7505982 CLJ_B1791 CLJ_B1792     FALSE 0.458 65.000 0.000 NA   NA
 7505982 7505983 CLJ_B1792 CLJ_B1793     FALSE 0.514 54.000 0.000 NA   NA
 7505983 7505984 CLJ_B1793 CLJ_B1794     TRUE 0.826 17.000 0.000 NA   NA
 7505984 7505985 CLJ_B1794 CLJ_B1795     FALSE 0.478 59.000 0.000 NA   NA
 7505985 7505986 CLJ_B1795 CLJ_B1796     FALSE 0.046 279.000 0.000 NA   NA
 7505986 7505987 CLJ_B1796 CLJ_B1797     TRUE 0.848 14.000 0.000 NA   NA
 7505987 7505988 CLJ_B1797 CLJ_B1798     TRUE 0.923 -3.000 0.000 NA   NA
 7505988 7505989 CLJ_B1798 CLJ_B1799     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 7505989 7505990 CLJ_B1799 CLJ_B1800     TRUE 0.894 3.000 0.000 NA   NA
 7505990 7505991 CLJ_B1800 CLJ_B1801     TRUE 0.894 3.000 0.000 NA   NA
 7505991 7505992 CLJ_B1801 CLJ_B1802     TRUE 0.869 11.000 0.000 NA   NA
 7505992 7505993 CLJ_B1802 CLJ_B1803     TRUE 0.902 2.000 0.000 NA   NA
 7505993 7505994 CLJ_B1803 CLJ_B1804     FALSE 0.413 122.000 0.000 NA   NA
 7505994 7505995 CLJ_B1804 CLJ_B1805     FALSE 0.425 104.000 0.000 NA   NA
 7505995 7505996 CLJ_B1805 CLJ_B1806     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 7505996 7505997 CLJ_B1806 CLJ_B1807     TRUE 0.930 -7.000 0.000 NA   NA
 7505997 7505998 CLJ_B1807 CLJ_B1808     FALSE 0.370 144.000 0.000 NA   NA
 7505998 7505999 CLJ_B1808 CLJ_B1809     TRUE 0.848 14.000 0.000 NA   NA
 7505999 7506000 CLJ_B1809 CLJ_B1810     FALSE 0.262 171.000 0.000 NA   NA
 7506000 7506001 CLJ_B1810 CLJ_B1811     FALSE 0.271 169.000 0.000 NA   NA
 7506001 7506002 CLJ_B1811 CLJ_B1812     TRUE 0.611 41.000 0.000 NA   NA
 7506002 7506003 CLJ_B1812 CLJ_B1813     TRUE 0.991 -7.000 0.294 0.001   NA
 7506003 7506004 CLJ_B1813 CLJ_B1814     TRUE 0.975 14.000 0.368 NA   NA
 7506004 7506005 CLJ_B1814 CLJ_B1815     TRUE 0.989 -10.000 0.263 NA   NA
 7506005 7506006 CLJ_B1815 CLJ_B1816     TRUE 0.805 21.000 0.000 NA   NA
 7506006 7506007 CLJ_B1816 CLJ_B1817     FALSE 0.446 70.000 0.000 NA   NA
 7506007 7506008 CLJ_B1817 CLJ_B1818     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 7506008 7506009 CLJ_B1818 CLJ_B1819     TRUE 0.791 23.000 0.000 NA   NA
 7506009 7506010 CLJ_B1819 CLJ_B1820     TRUE 0.810 20.000 0.000 NA   NA
 7506010 7506011 CLJ_B1820 CLJ_B1821     TRUE 0.962 20.000 0.250 NA   NA
 7506011 7506012 CLJ_B1821 CLJ_B1822     TRUE 0.848 14.000 0.000 NA   NA
 7506012 7506013 CLJ_B1822 CLJ_B1823     TRUE 0.902 2.000 0.000 NA   NA
 7506013 7506014 CLJ_B1823 CLJ_B1824     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 7506014 7506015 CLJ_B1824 CLJ_B1825     TRUE 0.938 -13.000 0.000 NA   NA
 7506015 7506016 CLJ_B1825 CLJ_B1826     TRUE 0.935 -10.000 0.000 NA   NA
 7506016 7506017 CLJ_B1826 CLJ_B1827     TRUE 0.989 2.000 0.667 NA   NA
 7506017 7506018 CLJ_B1827 CLJ_B1828     TRUE 0.889 4.000 0.000 NA   NA
 7506018 7506019 CLJ_B1828 CLJ_B1829     TRUE 0.826 17.000 0.000 NA   NA
 7506019 7506020 CLJ_B1829 CLJ_B1830     FALSE 0.421 81.000 0.000 NA   NA
 7506020 7506021 CLJ_B1830 CLJ_B1831     FALSE 0.458 65.000 0.000 NA   NA
 7506021 7506022 CLJ_B1831 CLJ_B1832     FALSE 0.415 88.000 0.000 NA   NA
 7506022 7506023 CLJ_B1832 CLJ_B1833     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 7506023 7506024 CLJ_B1833 CLJ_B1834     TRUE 0.863 12.000 0.000 NA   NA
 7506024 7506025 CLJ_B1834 CLJ_B1835     TRUE 0.986 3.000 0.500 NA   NA
 7506025 7506026 CLJ_B1835 CLJ_B1836     TRUE 0.975 3.000 0.160 NA   NA
 7506026 7506027 CLJ_B1836 CLJ_B1837     TRUE 0.990 1.000 0.720 NA   NA
 7506027 7506028 CLJ_B1837 CLJ_B1838     TRUE 0.994 -19.000 0.708 NA   NA
 7506028 7506029 CLJ_B1838 CLJ_B1839     TRUE 0.889 4.000 0.000 NA   NA
 7506029 7506030 CLJ_B1839 CLJ_B1840     TRUE 0.681 33.000 0.000 NA   NA
 7506030 7506031 CLJ_B1840 CLJ_B1841     TRUE 0.994 -7.000 1.000 NA   NA
 7506031 7506032 CLJ_B1841 CLJ_B1842     FALSE 0.012 396.000 0.000 NA   NA
 7506032 7506033 CLJ_B1842 CLJ_B1843     FALSE 0.043 287.000 0.000 NA   NA
 7506033 7506034 CLJ_B1843 CLJ_B1844     TRUE 0.791 23.000 0.000 NA   NA
 7506034 7506035 CLJ_B1844 CLJ_B1845     TRUE 0.848 14.000 0.000 NA   NA
 7506035 7506036 CLJ_B1845 CLJ_B1846     TRUE 0.611 41.000 0.000 NA   NA
 7506036 7506037 CLJ_B1846 CLJ_B1847     FALSE 0.005 550.000 0.000 NA   NA
 7506037 7506038 CLJ_B1847 CLJ_B1848     FALSE 0.032 304.000 0.000 NA   NA
 7506038 7506039 CLJ_B1848 CLJ_B1849     TRUE 0.938 -13.000 0.000 NA   NA
 7506039 7506040 CLJ_B1849 CLJ_B1850     TRUE 0.939 -15.000 0.000 NA   NA
 7506040 7506041 CLJ_B1850 CLJ_B1851     FALSE 0.356 148.000 0.000 NA   NA
 7506041 7506042 CLJ_B1851 CLJ_B1852     FALSE 0.005 561.000 0.000 NA   NA
 7506042 7506043 CLJ_B1852 CLJ_B1853     TRUE 0.938 33.000 0.379 NA   NA
 7506043 7506044 CLJ_B1853 CLJ_B1854   alr_1 FALSE 0.008 438.000 0.000 NA   NA
 7506044 7506045 CLJ_B1854 CLJ_B1855 alr_1   FALSE 0.009 452.000 0.000 1.000 N NA
 7506045 7506046 CLJ_B1855 CLJ_B1856     TRUE 0.675 88.000 0.016 0.085   NA
 7506046 7506047 CLJ_B1856 CLJ_B1857     FALSE 0.080 240.000 0.000 NA   NA
 7506053 7506054 CLJ_B1863 CLJ_B1864     TRUE 0.660 137.000 0.027 1.000 N NA
 7506054 7506055 CLJ_B1864 CLJ_B1865     TRUE 0.995 14.000 0.667 0.025 Y NA
 7506055 7506056 CLJ_B1865 CLJ_B1866     TRUE 0.997 4.000 1.000 0.025 Y NA
 7506056 7506057 CLJ_B1866 CLJ_B1867     TRUE 0.977 31.000 0.265 1.000 Y NA
 7506058 7506059 CLJ_B1868 CLJ_B1869     TRUE 0.944 -13.000 0.000 1.000   NA
 7506059 7506060 CLJ_B1869 CLJ_B1870     FALSE 0.279 187.000 0.000 0.022   NA
 7506061 7506062 CLJ_B1871 CLJ_B1872     TRUE 0.908 1.000 0.000 NA   NA
 7506062 7506063 CLJ_B1872 CLJ_B1873     TRUE 0.902 2.000 0.000 NA   NA
 7506063 7506064 CLJ_B1873 CLJ_B1874     TRUE 0.856 13.000 0.000 NA   NA
 7506064 7506065 CLJ_B1874 CLJ_B1875     TRUE 0.592 43.000 0.000 NA   NA
 7506065 7506066 CLJ_B1875 CLJ_B1876     TRUE 0.848 14.000 0.000 NA   NA
 7506066 7506067 CLJ_B1876 CLJ_B1877     TRUE 0.833 16.000 0.000 NA   NA
 7506067 7506068 CLJ_B1877 CLJ_B1878     FALSE 0.446 70.000 0.000 NA   NA
 7506068 7506069 CLJ_B1878 CLJ_B1879     FALSE 0.420 95.000 0.000 NA   NA
 7506069 7506070 CLJ_B1879 CLJ_B1880     TRUE 0.863 12.000 0.000 NA   NA
 7506070 7506071 CLJ_B1880 CLJ_B1881     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 7506071 7506072 CLJ_B1881 CLJ_B1882     TRUE 0.547 49.000 0.000 NA   NA
 7506072 7506073 CLJ_B1882 CLJ_B1883     FALSE 0.514 54.000 0.000 NA   NA
 7506073 7506074 CLJ_B1883 CLJ_B1884     TRUE 0.826 17.000 0.000 NA   NA
 7506074 7506075 CLJ_B1884 CLJ_B1885     FALSE 0.478 59.000 0.000 NA   NA
 7506075 7506076 CLJ_B1885 CLJ_B1886     TRUE 0.592 43.000 0.000 NA   NA
 7506076 7506077 CLJ_B1886 CLJ_B1887     TRUE 0.709 30.000 0.000 NA   NA
 7506077 7506078 CLJ_B1887 CLJ_B1888     TRUE 0.592 43.000 0.000 NA   NA
 7506078 7506079 CLJ_B1888 CLJ_B1889     TRUE 0.869 11.000 0.000 NA   NA
 7506079 7506080 CLJ_B1889 CLJ_B1890     TRUE 0.697 31.000 0.000 NA   NA
 7506080 7506081 CLJ_B1890 CLJ_B1891     FALSE 0.451 68.000 0.000 NA   NA
 7506081 7506082 CLJ_B1891 CLJ_B1892     TRUE 0.799 22.000 0.000 NA   NA
 7506082 7506083 CLJ_B1892 CLJ_B1893     TRUE 0.592 43.000 0.000 NA   NA
 7506083 7506084 CLJ_B1893 CLJ_B1894     TRUE 0.640 38.000 0.000 NA   NA
 7506084 7506085 CLJ_B1894 CLJ_B1895     FALSE 0.422 107.000 0.000 NA   NA
 7506085 7506086 CLJ_B1895 CLJ_B1896     TRUE 0.992 -3.000 0.667 NA   NA
 7506086 7506087 CLJ_B1896 CLJ_B1897     TRUE 0.987 12.000 1.000 NA   NA
 7506087 7506088 CLJ_B1897 CLJ_B1898     TRUE 0.987 12.000 1.000 NA   NA
 7506088 7506089 CLJ_B1898 CLJ_B1899     TRUE 0.935 -10.000 0.000 NA   NA
 7506089 7506090 CLJ_B1899 CLJ_B1900     FALSE 0.063 260.000 0.000 NA   NA
 7506090 7506091 CLJ_B1900 CLJ_B1901     TRUE 0.985 1.000 0.333 NA   NA
 7506091 7506092 CLJ_B1901 CLJ_B1902     FALSE 0.035 298.000 0.000 NA   NA
 7506092 7506093 CLJ_B1902 CLJ_B1903     FALSE 0.345 151.000 0.000 NA   NA
 7506093 7506094 CLJ_B1903 CLJ_B1904     FALSE 0.306 161.000 0.000 NA   NA
 7506094 7506095 CLJ_B1904 CLJ_B1905     TRUE 0.991 0.000 0.750 NA   NA
 7506095 7506096 CLJ_B1905 CLJ_B1906     TRUE 0.970 12.000 0.200 NA   NA
 7506096 7506097 CLJ_B1906 CLJ_B1907     TRUE 0.986 -7.000 0.200 NA   NA
 7506097 7506098 CLJ_B1907 CLJ_B1908     TRUE 0.632 39.000 0.000 NA   NA
 7506098 7506099 CLJ_B1908 CLJ_B1909     TRUE 0.571 45.000 0.000 NA   NA
 7506099 7506100 CLJ_B1909 CLJ_B1910     TRUE 0.816 19.000 0.000 NA   NA
 7506100 7506101 CLJ_B1910 CLJ_B1911     TRUE 0.872 10.000 0.000 NA   NA
 7506101 7506102 CLJ_B1911 CLJ_B1912     TRUE 0.894 3.000 0.000 NA   NA
 7506102 7506103 CLJ_B1912 CLJ_B1913     FALSE 0.470 61.000 0.000 NA   NA
 7506103 7506104 CLJ_B1913 CLJ_B1914     FALSE 0.006 498.000 0.000 NA   NA
 7506104 7506105 CLJ_B1914 CLJ_B1915     TRUE 0.863 12.000 0.000 NA   NA
 7506105 7506106 CLJ_B1915 CLJ_B1916     TRUE 0.856 13.000 0.000 NA   NA
 7506106 7506107 CLJ_B1916 CLJ_B1917     FALSE 0.110 224.000 0.000 NA   NA
 7506107 7506108 CLJ_B1917 CLJ_B1918     TRUE 0.580 44.000 0.000 NA   NA
 7506108 7506109 CLJ_B1918 CLJ_B1919     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 7506109 7506110 CLJ_B1919 CLJ_B1920     TRUE 0.971 11.000 0.188 NA   NA
 7506110 7506111 CLJ_B1920 CLJ_B1921     TRUE 0.970 12.000 0.188 NA   NA
 7506111 7506112 CLJ_B1921 CLJ_B1922     TRUE 0.987 9.000 0.833 NA   NA
 7506112 7506113 CLJ_B1922 CLJ_B1923     TRUE 0.983 12.000 0.600 NA   NA
 7506113 7506114 CLJ_B1923 CLJ_B1924     TRUE 0.856 13.000 0.000 NA   NA
 7506114 7506115 CLJ_B1924 CLJ_B1925     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 7506115 7506116 CLJ_B1925 CLJ_B1926     TRUE 0.885 5.000 0.000 NA   NA
 7506116 7506117 CLJ_B1926 CLJ_B1927   uviB FALSE 0.425 102.000 0.000 NA   NA
 7506117 7506118 CLJ_B1927 CLJ_B1928 uviB   TRUE 0.989 2.000 0.667 NA   NA
 7506118 7506119 CLJ_B1928 CLJ_B1929     TRUE 0.602 42.000 0.000 NA   NA
 7506119 7506120 CLJ_B1929 CLJ_B1930     FALSE 0.206 185.000 0.000 NA   NA
 7506120 7506121 CLJ_B1930 CLJ_B1931     FALSE 0.484 58.000 0.000 NA   NA
 7506121 7506122 CLJ_B1931 CLJ_B1932     FALSE 0.412 127.000 0.000 NA   NA
 7506122 7506123 CLJ_B1932 CLJ_B1933     TRUE 0.655 36.000 0.000 NA   NA
 7506123 7506124 CLJ_B1933 CLJ_B1934     TRUE 0.995 -13.000 1.000 NA   NA
 7506124 7506125 CLJ_B1934 CLJ_B1935     TRUE 0.939 -15.000 0.000 NA   NA
 7506125 7506126 CLJ_B1935 CLJ_B1936     FALSE 0.014 379.000 0.000 NA   NA
 7506128 7506129 CLJ_B1938 CLJ_B1939     FALSE 0.051 271.000 0.000 NA   NA
 7506131 7506132 CLJ_B1941 CLJ_B1942     TRUE 0.563 151.000 0.011 1.000 N NA
 7506132 7506133 CLJ_B1942 CLJ_B1943     TRUE 0.968 -7.000 0.016 NA   NA
 7506133 7506134 CLJ_B1943 CLJ_B1944   pfkB_1 TRUE 0.970 26.000 0.721 NA   NA
 7506136 7506137 CLJ_B1946 CLJ_B1947     TRUE 0.835 152.000 0.667 NA   NA
 7506139 7506140 CLJ_B1949 CLJ_B1950     TRUE 0.697 31.000 0.000 NA   NA
 7506141 7506142 CLJ_B1951 CLJ_B1952 safA   FALSE 0.011 401.000 0.000 NA   NA
 7506145 7506146 CLJ_B1955 CLJ_B1956     TRUE 0.944 -28.000 0.000 NA   NA
 7506148 7506149 CLJ_B1958 CLJ_B1959     FALSE 0.028 323.000 0.000 1.000   NA
 7506149 7506150 CLJ_B1959 CLJ_B1960   dbpA FALSE 0.381 180.000 0.006 1.000   NA
 7506150 7506151 CLJ_B1960 CLJ_B1961 dbpA   FALSE 0.500 165.000 0.025 NA   NA
 7506151 7506152 CLJ_B1961 CLJ_B1962     FALSE 0.012 395.000 0.000 NA   NA
 7506152 7506153 CLJ_B1962 CLJ_B1963     FALSE 0.012 404.000 0.000 1.000   NA
 7506155 7506156 CLJ_B1965 CLJ_B1966   cheX TRUE 0.993 0.000 0.100 NA Y NA
 7506158 7506159 CLJ_B1968 CLJ_B1969     TRUE 0.603 61.000 0.000 0.002   NA
 7506164 7506165 CLJ_B1974 CLJ_B1975   hfq TRUE 0.721 101.000 0.064 1.000   NA
 7506165 7506166 CLJ_B1975 CLJ_B1976 hfq miaA TRUE 0.792 86.000 0.192 1.000   NA
 7506166 7506167 CLJ_B1976 CLJ_B1977 miaA   TRUE 0.957 16.000 0.097 1.000 N NA
 7506167 7506168 CLJ_B1977 CLJ_B1978   mutS TRUE 0.923 145.000 0.220 0.002 Y NA
 7506168 7506169 CLJ_B1978 CLJ_B1979 mutS miaB TRUE 0.711 79.000 0.041 1.000 N NA
 7506170 7506171 CLJ_B1980 CLJ_B1981     TRUE 0.724 85.000 0.087 NA   NA
 7506171 7506172 CLJ_B1981 CLJ_B1982   aspB_1 TRUE 0.674 55.000 0.008 NA   NA
 7506173 7506174 CLJ_B1983 CLJ_B1984     TRUE 0.871 78.000 0.571 NA   NA
 7506174 7506175 CLJ_B1984 CLJ_B1985     FALSE 0.074 247.000 0.000 NA   NA
 7506175 7506176 CLJ_B1985 CLJ_B1986   cmk TRUE 0.744 64.000 0.047 1.000 N NA
 7506176 7506177 CLJ_B1986 CLJ_B1987 cmk aroH TRUE 0.666 80.000 0.020 1.000 N NA
 7506177 7506178 CLJ_B1987 CLJ_B1988 aroH   TRUE 0.966 0.000 0.024 1.000   NA
 7506178 7506179 CLJ_B1988 CLJ_B1989   gluD FALSE 0.043 294.000 0.000 1.000   NA
 7506179 7506180 CLJ_B1989 CLJ_B1990 gluD   FALSE 0.272 234.000 0.068 1.000 N NA
 7506180 7506181 CLJ_B1990 CLJ_B1991   rluB FALSE 0.034 382.000 0.013 1.000 N NA
 7506181 7506182 CLJ_B1991 CLJ_B1992 rluB   FALSE 0.008 433.000 0.000 NA   NA
 7506182 7506183 CLJ_B1992 CLJ_B1993     FALSE 0.423 98.000 0.000 NA   NA
 7506183 7506184 CLJ_B1993 CLJ_B1994     FALSE 0.040 293.000 0.000 NA   NA
 7506185 7506186 CLJ_B1995 CLJ_B1996     FALSE 0.014 387.000 0.000 1.000   NA
 7506187 7506188 CLJ_B1997 CLJ_B1998     TRUE 0.964 2.000 0.034 1.000   NA
 7506188 7506189 CLJ_B1998 CLJ_B1999     TRUE 0.756 115.000 0.111 1.000   NA
 7506189 7506190 CLJ_B1999 CLJ_B2000     TRUE 0.741 131.000 0.111 NA   NA
 7506192 7506193 CLJ_B2002 CLJ_B2003 pcaC_1   FALSE 0.420 138.000 0.000 1.000   NA
 7506193 7506194 CLJ_B2003 CLJ_B2004     FALSE 0.206 185.000 0.000 NA   NA
 7506194 7506195 CLJ_B2004 CLJ_B2005     FALSE 0.089 234.000 0.000 NA   NA
 7506195 7506196 CLJ_B2005 CLJ_B2006     TRUE 0.974 -19.000 0.019 NA   NA
 7506197 7506198 CLJ_B2007 CLJ_B2008     TRUE 0.979 3.000 0.200 1.000   NA
 7506198 7506199 CLJ_B2008 CLJ_B2009     TRUE 0.981 -3.000 0.111 1.000   NA
 7506199 7506200 CLJ_B2009 CLJ_B2010     TRUE 0.698 134.000 0.056 1.000   NA
 7506201 7506202 CLJ_B2011 CLJ_B2012 hypE   TRUE 0.527 52.000 0.000 NA   NA
 7506202 7506203 CLJ_B2012 CLJ_B2013     FALSE 0.005 548.000 0.000 NA   NA
 7506204 7506205 CLJ_B2014 CLJ_B2015     FALSE 0.009 421.000 0.000 NA   NA
 7506207 7506208 CLJ_B2017 CLJ_B2018     FALSE 0.005 548.000 0.000 NA   NA
 7506209 7506210 CLJ_B2019 CLJ_B2020     FALSE 0.019 360.000 0.000 1.000   NA
 7506210 7506211 CLJ_B2020 CLJ_B2021     TRUE 0.949 20.000 0.048 0.001   NA
 7506211 7506212 CLJ_B2021 CLJ_B2022     TRUE 0.992 12.000 0.154 0.001 Y NA
 7506212 7506213 CLJ_B2022 CLJ_B2023     FALSE 0.019 369.000 0.000 1.000 N NA
 7506213 7506214 CLJ_B2023 CLJ_B2024     FALSE 0.071 259.000 0.000 NA N NA
 7506217 7506218 CLJ_B2027 CLJ_B2028   ytfJ FALSE 0.451 68.000 0.000 NA   NA
 7506219 7506220 CLJ_B2029 CLJ_B2030 scpB scpA TRUE 0.992 -7.000 0.570 NA   NA
 7506220 7506221 CLJ_B2030 CLJ_B2031 scpA   TRUE 0.970 -25.000 0.006 NA   NA
 7506221 7506222 CLJ_B2031 CLJ_B2032   dacF TRUE 0.687 70.000 0.021 1.000 N NA
 7506222 7506223 CLJ_B2032 CLJ_B2033 dacF   TRUE 0.619 123.000 0.018 NA   NA
 7506223 7506224 CLJ_B2033 CLJ_B2034     FALSE 0.312 159.000 0.000 NA   NA
 7506224 7506225 CLJ_B2034 CLJ_B2035     TRUE 0.598 142.000 0.024 NA   NA
 7506225 7506226 CLJ_B2035 CLJ_B2036   pdp TRUE 0.704 107.000 0.061 NA   NA
 7506226 7506227 CLJ_B2036 CLJ_B2037 pdp punA FALSE 0.191 286.000 0.000 1.000 Y NA
 7506227 7506228 CLJ_B2037 CLJ_B2038 punA xerD TRUE 0.796 38.000 0.004 1.000 N NA
 7506228 7506229 CLJ_B2038 CLJ_B2039 xerD   TRUE 0.677 52.000 0.004 NA   NA
 7506229 7506230 CLJ_B2039 CLJ_B2040   spoIIM TRUE 0.974 -9.000 0.034 NA   NA
 7506232 7506233 CLJ_B2042 CLJ_B2043     FALSE 0.150 218.000 0.000 1.000 N NA
 7506233 7506234 CLJ_B2043 CLJ_B2044     FALSE 0.003 782.000 0.000 NA   NA
 7506234 7506235 CLJ_B2044 CLJ_B2045     FALSE 0.004 600.000 0.000 NA   NA
 7506235 7506236 CLJ_B2045 CLJ_B2046     FALSE 0.003 1332.000 0.000 NA   NA
 7506236 7506237 CLJ_B2046 CLJ_B2047     FALSE 0.003 829.000 0.000 NA   NA
 7506237 7506238 CLJ_B2047 CLJ_B2048     FALSE 0.003 844.000 0.000 NA   NA
 7506238 7506239 CLJ_B2048 CLJ_B2049     FALSE 0.003 686.000 0.000 NA   NA
 7506239 7506240 CLJ_B2049 CLJ_B2050     FALSE 0.444 71.000 0.000 NA   NA
 7506240 7506241 CLJ_B2050 CLJ_B2051     TRUE 0.611 41.000 0.000 NA   NA
 7506241 7506242 CLJ_B2051 CLJ_B2052     TRUE 0.826 17.000 0.000 NA   NA
 7506242 7506243 CLJ_B2052 CLJ_B2053     FALSE 0.415 88.000 0.000 NA   NA
 7506243 7506244 CLJ_B2053 CLJ_B2054     FALSE 0.327 155.000 0.000 NA   NA
 7506244 7506245 CLJ_B2054 CLJ_B2055     FALSE 0.410 131.000 0.000 NA   NA
 7506245 7506246 CLJ_B2055 CLJ_B2056     FALSE 0.374 143.000 0.000 NA   NA
 7506246 7506247 CLJ_B2056 CLJ_B2057     FALSE 0.316 158.000 0.000 NA   NA
 7506247 7506248 CLJ_B2057 CLJ_B2058   spo0A TRUE 0.664 136.000 0.027 1.000 N NA
 7506248 7506249 CLJ_B2058 CLJ_B2059 spo0A spoIVB FALSE 0.062 429.000 0.393 1.000   NA
 7506249 7506250 CLJ_B2059 CLJ_B2060 spoIVB metA FALSE 0.010 422.000 0.000 1.000   NA
 7506250 7506251 CLJ_B2060 CLJ_B2061 metA hom_2 TRUE 0.958 27.000 0.005 1.000 Y NA
 7506251 7506252 CLJ_B2061 CLJ_B2062 hom_2   TRUE 0.934 40.000 0.017 1.000 Y NA
 7506252 7506253 CLJ_B2062 CLJ_B2064   recN FALSE 0.043 298.000 0.000 1.000 N NA
 7506253 7506254 CLJ_B2064 CLJ_B2065 recN argR TRUE 0.961 13.000 0.086 1.000 N NA
 7506254 7506255 CLJ_B2065 CLJ_B2066 argR ppnK TRUE 0.978 2.000 0.117 1.000 N NA
 7506255 7506256 CLJ_B2066 CLJ_B2067 ppnK   TRUE 0.981 0.000 0.120 1.000 N NA
 7506256 7506257 CLJ_B2067 CLJ_B2068   dxs TRUE 0.957 22.000 0.189 1.000 N NA
 7506257 7506258 CLJ_B2068 CLJ_B2069 dxs   TRUE 0.965 1.000 0.037 NA   NA
 7506258 7506259 CLJ_B2069 CLJ_B2070     FALSE 0.003 803.000 0.000 NA   NA
 7506259 7506260 CLJ_B2070 CLJ_B2071   xseB TRUE 0.715 125.000 0.053 1.000 N NA
 7506260 7506261 CLJ_B2071 CLJ_B2072 xseB xseA TRUE 0.953 122.000 0.412 0.001 Y NA
 7506261 7506262 CLJ_B2072 CLJ_B2073 xseA nusB TRUE 0.727 71.000 0.043 1.000 N NA
 7506262 7506263 CLJ_B2073 CLJ_B2074 nusB   TRUE 0.780 139.000 0.223 NA   NA
 7506263 7506264 CLJ_B2074 CLJ_B2075     TRUE 0.746 82.000 0.108 NA   NA
 7506264 7506265 CLJ_B2075 CLJ_B2076   spoIIIAG TRUE 0.869 62.000 0.407 NA   NA
 7506265 7506266 CLJ_B2076 CLJ_B2077 spoIIIAG spoIIIAF TRUE 0.884 139.000 0.907 NA   NA
 7506266 7506267 CLJ_B2077 CLJ_B2078 spoIIIAF spoIIIAE TRUE 0.958 36.000 0.918 NA   NA
 7506267 7506268 CLJ_B2078 CLJ_B2079 spoIIIAE spoIIIAD TRUE 0.988 9.000 0.864 NA   NA
 7506268 7506269 CLJ_B2079 CLJ_B2080 spoIIIAD   TRUE 0.972 27.000 0.895 NA   NA
 7506269 7506270 CLJ_B2080 CLJ_B2081   spoIIIAB TRUE 0.946 43.000 0.926 NA   NA
 7506270 7506271 CLJ_B2081 CLJ_B2082 spoIIIAB spoIIIAA TRUE 0.945 37.000 0.604 NA   NA
 7506271 7506272 CLJ_B2082 CLJ_B2083 spoIIIAA   FALSE 0.517 186.000 0.112 NA   NA
 7506272 7506273 CLJ_B2083 CLJ_B2084   efp TRUE 0.815 41.000 0.037 NA   NA
 7506273 7506274 CLJ_B2084 CLJ_B2085 efp aroQ TRUE 0.632 89.000 0.010 1.000 N NA
 7506274 7506275 CLJ_B2085 CLJ_B2086 aroQ aroK TRUE 0.805 155.000 0.015 1.000 Y NA
 7506275 7506276 CLJ_B2086 CLJ_B2087 aroK   TRUE 0.599 139.000 0.020 NA   NA
 7506276 7506277 CLJ_B2087 CLJ_B2088     TRUE 0.989 6.000 1.000 NA   NA
 7506277 7506278 CLJ_B2088 CLJ_B2089     TRUE 0.969 17.000 0.333 NA   NA
 7506278 7506279 CLJ_B2089 CLJ_B2090     TRUE 0.959 28.000 0.500 NA   NA
 7506279 7506280 CLJ_B2090 CLJ_B2091     TRUE 0.993 -21.000 0.500 NA   NA
 7506280 7506281 CLJ_B2091 CLJ_B2092     TRUE 0.990 -3.000 0.500 NA   NA
 7506281 7506282 CLJ_B2092 CLJ_B2093     TRUE 0.994 -19.000 0.667 NA   NA
 7506282 7506283 CLJ_B2093 CLJ_B2094     FALSE 0.492 209.000 0.250 NA   NA
 7506283 7506284 CLJ_B2094 CLJ_B2095     FALSE 0.414 118.000 0.000 NA   NA
 7506284 7506285 CLJ_B2095 CLJ_B2096     FALSE 0.425 103.000 0.000 NA   NA
 7506287 7506288 CLJ_B2098 CLJ_B2099     FALSE 0.403 136.000 0.000 NA   NA
 7506288 7506289 CLJ_B2099 CLJ_B2100     TRUE 0.982 -9.000 0.100 NA   NA
 7506289 7506290 CLJ_B2100 CLJ_B2101     TRUE 0.882 6.000 0.000 NA   NA
 7506290 7506291 CLJ_B2101 CLJ_B2102     TRUE 0.935 -10.000 0.000 NA   NA
 7506291 7506292 CLJ_B2102 CLJ_B2103     FALSE 0.099 229.000 0.000 NA   NA
 7506292 7506293 CLJ_B2103 CLJ_B2104     FALSE 0.425 103.000 0.000 NA   NA
 7506293 7506294 CLJ_B2104 CLJ_B2105     FALSE 0.415 89.000 0.000 NA   NA
 7506294 7506295 CLJ_B2105 CLJ_B2106     TRUE 0.975 12.000 0.281 NA   NA
 7506295 7506296 CLJ_B2106 CLJ_B2107     FALSE 0.425 103.000 0.000 NA   NA
 7506296 7506297 CLJ_B2107 CLJ_B2108     TRUE 0.991 0.000 0.714 NA   NA
 7506297 7506298 CLJ_B2108 CLJ_B2109     TRUE 0.986 0.000 0.000 0.007 Y NA
 7506298 7506299 CLJ_B2109 CLJ_B2110     FALSE 0.361 153.000 0.000 NA N NA
 7506299 7506300 CLJ_B2110 CLJ_B2111     TRUE 0.888 145.000 0.135 NA Y NA
 7506300 7506301 CLJ_B2111 CLJ_B2112     FALSE 0.354 149.000 0.000 NA   NA
 7506301 7506302 CLJ_B2112 CLJ_B2113     FALSE 0.421 96.000 0.000 NA   NA
 7506302 7506303 CLJ_B2113 CLJ_B2114   dapF TRUE 0.948 1.000 0.003 NA   NA
 7506304 7506305 CLJ_B2115 CLJ_B2116 fbp68 truA_1 TRUE 0.628 69.000 0.005 NA N NA
 7506306 7506307 CLJ_B2117 CLJ_B2118     TRUE 0.655 36.000 0.000 NA   NA
 7506309 7506310 CLJ_B2120 CLJ_B2121     FALSE 0.006 505.000 0.000 NA   NA
 7506310 7506311 CLJ_B2121 CLJ_B2122   cloSI FALSE 0.007 470.000 0.000 1.000   NA
 7506312 7506313 CLJ_B2123 CLJ_B2124     TRUE 0.980 6.000 0.333 NA   NA
 7506313 7506314 CLJ_B2124 CLJ_B2125     TRUE 0.962 77.000 0.857 1.000 Y NA
 7506317 7506318 CLJ_B2128 CLJ_B2129     TRUE 0.997 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 7506318 7506319 CLJ_B2129 CLJ_B2130     FALSE 0.205 283.000 0.222 NA   NA
 7506319 7506320 CLJ_B2130 CLJ_B2131     TRUE 0.831 156.000 0.714 NA   NA
 7506320 7506321 CLJ_B2131 CLJ_B2132     TRUE 0.990 0.000 0.625 NA   NA
 7506323 7506324 CLJ_B2134 CLJ_B2135     TRUE 0.998 -3.000 0.933 0.006 Y NA
 7506325 7506326 CLJ_B2136 CLJ_B2137     FALSE 0.441 113.000 0.000 1.000   NA
 7506327 7506328 CLJ_B2138 CLJ_B2139 moeB moaD TRUE 0.989 2.000 0.571 1.000   NA
 7506328 7506329 CLJ_B2139 CLJ_B2140 moaD aor TRUE 0.591 153.000 0.033 1.000   NA
 7506329 7506330 CLJ_B2140 CLJ_B2141 aor aorR FALSE 0.013 407.000 0.000 1.000 N NA
 7506330 7506331 CLJ_B2141 CLJ_B2142 aorR   TRUE 0.914 49.000 0.500 1.000   NA
 7506331 7506332 CLJ_B2142 CLJ_B2143   moaC TRUE 0.951 2.000 0.006 1.000   NA
 7506332 7506333 CLJ_B2143 CLJ_B2144 moaC moaA TRUE 0.991 4.000 0.071 0.002 Y NA
 7506333 7506334 CLJ_B2144 CLJ_B2145 moaA   TRUE 0.926 59.000 0.053 0.002 Y NA
 7506334 7506335 CLJ_B2145 CLJ_B2146   moeA TRUE 0.995 12.000 0.481 0.002 Y NA
 7506335 7506336 CLJ_B2146 CLJ_B2147 moeA mog TRUE 0.975 24.000 0.017 0.002 Y NA
 7506336 7506337 CLJ_B2147 CLJ_B2148 mog   FALSE 0.302 202.000 0.006 1.000 N NA
 7506337 7506338 CLJ_B2148 CLJ_B2149     TRUE 0.990 -3.000 0.389 1.000 N NA
 7506338 7506339 CLJ_B2149 CLJ_B2150   tupA TRUE 0.994 9.000 0.524 NA Y NA
 7506339 7506340 CLJ_B2150 CLJ_B2151 tupA   FALSE 0.133 220.000 0.000 NA N NA
 7506340 7506341 CLJ_B2151 CLJ_B2152     TRUE 0.930 -7.000 0.000 NA   NA
 7506341 7506342 CLJ_B2152 CLJ_B2153     FALSE 0.366 145.000 0.000 NA   NA
 7506342 7506343 CLJ_B2153 CLJ_B2154     FALSE 0.026 319.000 0.000 NA   NA
 7506343 7506344 CLJ_B2154 CLJ_B2155     TRUE 0.982 15.000 0.667 1.000   NA
 7506346 7506347 CLJ_B2157 CLJ_B2158     FALSE 0.056 272.000 0.000 1.000   NA
 7506347 7506348 CLJ_B2158 CLJ_B2159     TRUE 0.998 -3.000 0.846 0.006 Y NA
 7506349 7506350 CLJ_B2160 CLJ_B2161     FALSE 0.006 504.000 0.000 NA   NA
 7506350 7506351 CLJ_B2161 CLJ_B2162     FALSE 0.003 951.000 0.000 NA   NA
 7506351 7506352 CLJ_B2162 CLJ_B2163     TRUE 0.981 22.000 1.000 1.000   NA
 7506353 7506354 CLJ_B2164 CLJ_B2165     FALSE 0.077 253.000 0.000 NA N NA
 7506354 7506355 CLJ_B2165 CLJ_B2166     TRUE 0.869 13.000 0.000 NA N NA
 7506355 7506356 CLJ_B2166 CLJ_B2167     TRUE 0.813 41.000 0.028 NA N NA
 7506356 7506357 CLJ_B2167 CLJ_B2168     TRUE 0.912 45.000 0.400 NA N NA
 7506357 7506358 CLJ_B2168 CLJ_B2169     TRUE 0.980 22.000 0.800 1.000 N NA
 7506359 7506360 CLJ_B2170 CLJ_B2171     FALSE 0.020 344.000 0.000 NA   NA
 7506360 7506361 CLJ_B2171 CLJ_B2172     TRUE 0.982 21.000 1.000 1.000   NA
 7506362 7506363 CLJ_B2173 CLJ_B2174     TRUE 0.998 -10.000 0.750 1.000 Y NA
 7506363 7506364 CLJ_B2174 CLJ_B2175     FALSE 0.007 473.000 0.000 NA   NA
 7506364 7506365 CLJ_B2175 CLJ_B2176     TRUE 0.911 26.000 0.061 NA   NA
 7506365 7506366 CLJ_B2176 CLJ_B2177     TRUE 0.977 16.000 0.469 1.000   NA
 7506366 7506367 CLJ_B2177 CLJ_B2178     TRUE 0.971 3.000 0.103 NA   NA
 7506367 7506368 CLJ_B2178 CLJ_B2179     TRUE 0.725 160.000 0.250 NA   NA
 7506369 7506370 CLJ_B2180 CLJ_B2181     FALSE 0.133 214.000 0.000 NA   NA
 7506370 7506371 CLJ_B2181 CLJ_B2182     TRUE 0.994 -10.000 0.500 0.005   NA
 7506371 7506372 CLJ_B2182 CLJ_B2183     TRUE 0.993 -10.000 0.400 0.005   NA
 7506372 7506373 CLJ_B2183 CLJ_B2184     TRUE 0.936 42.000 0.400 0.005   NA
 7506375 7506376 CLJ_B2186 CLJ_B2187 pcaC_2   TRUE 0.966 13.000 0.144 1.000   NA
 7506376 7506377 CLJ_B2187 CLJ_B2188     FALSE 0.253 178.000 0.000 1.000   NA
 7506378 7506379 CLJ_B2189 CLJ_B2190   hsp90 FALSE 0.005 609.000 0.000 1.000 N NA
 7506380 7506381 CLJ_B2191 CLJ_B2192   treP FALSE 0.008 479.000 0.000 1.000 N NA
 7506381 7506382 CLJ_B2192 CLJ_B2193 treP treC TRUE 0.952 82.000 0.650 1.000 Y NA
 7506382 7506383 CLJ_B2193 CLJ_B2194 treC treR TRUE 0.941 33.000 0.336 1.000 N NA
 7506384 7506385 CLJ_B2195 CLJ_B2196     FALSE 0.407 134.000 0.000 NA   NA
 7506385 7506386 CLJ_B2196 CLJ_B2197   pfkB_2 TRUE 0.994 1.000 0.217 1.000 Y NA
 7506386 7506387 CLJ_B2197 CLJ_B2198 pfkB_2   TRUE 0.989 20.000 0.400 1.000 Y NA
 7506387 7506388 CLJ_B2198 CLJ_B2199     TRUE 0.551 200.000 0.222 1.000 N NA
 7506388 7506389 CLJ_B2199 CLJ_B2200     FALSE 0.415 84.000 0.000 NA   NA
 7506393 7506394 CLJ_B2204 CLJ_B2205     TRUE 0.927 -6.000 0.000 NA   NA
 7506394 7506395 CLJ_B2205 CLJ_B2206     FALSE 0.428 78.000 0.000 NA   NA
 7506395 7506396 CLJ_B2206 CLJ_B2207     FALSE 0.018 357.000 0.000 NA   NA
 7506398 7506399 CLJ_B2209 CLJ_B2210     TRUE 0.970 16.000 0.273 1.000   NA
 7506399 7506400 CLJ_B2210 CLJ_B2212     FALSE 0.009 442.000 0.000 1.000   NA
 7506400 7506401 CLJ_B2212 CLJ_B2213     FALSE 0.110 224.000 0.000 NA   NA
 7506401 7506402 CLJ_B2213 CLJ_B2214     FALSE 0.063 260.000 0.000 NA   NA
 7506403 7506404 CLJ_B2215 CLJ_B2216     FALSE 0.026 320.000 0.000 NA   NA
 7506407 7506408 CLJ_B2219 CLJ_B2220     TRUE 0.981 20.000 0.088 1.000 Y NA
 7506408 7506409 CLJ_B2220 CLJ_B2221     TRUE 0.938 -13.000 0.000 NA   NA
 7506409 7506410 CLJ_B2221 CLJ_B2222     FALSE 0.446 70.000 0.000 NA   NA
 7506410 7506411 CLJ_B2222 CLJ_B2223     FALSE 0.414 87.000 0.000 NA   NA
 7506411 7506412 CLJ_B2223 CLJ_B2224     FALSE 0.016 365.000 0.000 NA   NA
 7506412 7506413 CLJ_B2224 CLJ_B2225     FALSE 0.020 363.000 0.000 1.000 N NA
 7506413 7506414 CLJ_B2225 CLJ_B2226     FALSE 0.006 496.000 0.000 NA   NA
 7506414 7506415 CLJ_B2226 CLJ_B2227     FALSE 0.036 296.000 0.000 NA   NA
 7506415 7506416 CLJ_B2227 CLJ_B2228     FALSE 0.395 138.000 0.000 NA   NA
 7506416 7506417 CLJ_B2228 CLJ_B2229     FALSE 0.415 114.000 0.000 NA   NA
 7506417 7506418 CLJ_B2229 CLJ_B2230     FALSE 0.080 240.000 0.000 NA   NA
 7506418 7506419 CLJ_B2230 CLJ_B2231     TRUE 0.945 -37.000 0.000 NA   NA
 7506419 7506420 CLJ_B2231 CLJ_B2232     FALSE 0.006 475.000 0.000 NA   NA
 7506420 7506421 CLJ_B2232 CLJ_B2233   tnpA TRUE 0.908 1.000 0.000 NA   NA
 7506421 7506422 CLJ_B2233 CLJ_B2234 tnpA   FALSE 0.003 953.000 0.000 NA   NA
 7506422 7506423 CLJ_B2234 CLJ_B2235     FALSE 0.422 97.000 0.000 NA   NA
 7506423 7506424 CLJ_B2235 CLJ_B2236     FALSE 0.056 266.000 0.000 NA   NA
 7506424 7506425 CLJ_B2236 CLJ_B2237     FALSE 0.164 201.000 0.000 NA   NA
 7506425 7506426 CLJ_B2237 CLJ_B2238     FALSE 0.277 168.000 0.000 NA   NA
 7506426 7506427 CLJ_B2238 CLJ_B2239     TRUE 0.980 22.000 1.000 NA   NA
 7506427 7506428 CLJ_B2239 CLJ_B2240     TRUE 0.980 22.000 1.000 NA   NA
 7506429 7506430 CLJ_B2241 CLJ_B2242     FALSE 0.071 249.000 0.000 NA   NA
 7506430 7506431 CLJ_B2242 CLJ_B2243     TRUE 0.856 13.000 0.000 NA   NA
 7506432 7506433 CLJ_B2244 CLJ_B2245     FALSE 0.098 339.000 0.000 NA Y NA
 7506434 7506435 CLJ_B2246 CLJ_B2247     TRUE 0.748 82.000 0.054 0.026   NA
 7506436 7506437 CLJ_B2248 CLJ_B2249     TRUE 0.941 0.000 0.000 0.056   NA
 7506437 7506438 CLJ_B2249 CLJ_B2250     FALSE 0.340 152.000 0.000 NA   NA
 7506438 7506439 CLJ_B2250 CLJ_B2251     TRUE 0.917 17.000 0.019 NA   NA
 7506439 7506440 CLJ_B2251 CLJ_B2252     FALSE 0.008 444.000 0.000 NA   NA
 7506440 7506441 CLJ_B2252 CLJ_B2253     TRUE 0.580 44.000 0.000 NA   NA
 7506441 7506442 CLJ_B2253 CLJ_B2254     FALSE 0.441 73.000 0.000 NA   NA
 7506442 7506443 CLJ_B2254 CLJ_B2255     FALSE 0.010 415.000 0.000 NA   NA
 7506443 7506444 CLJ_B2255 CLJ_B2256     FALSE 0.424 105.000 0.000 NA   NA
 7506444 7506445 CLJ_B2256 CLJ_B2257     TRUE 0.980 15.000 0.600 NA   NA
 7506445 7506446 CLJ_B2257 CLJ_B2258     TRUE 0.991 -3.000 0.600 NA   NA
 7506446 7506447 CLJ_B2258 CLJ_B2259     TRUE 0.856 122.000 0.500 NA   NA
 7506447 7506448 CLJ_B2259 CLJ_B2260     FALSE 0.156 304.000 0.231 NA   NA
 7506448 7506449 CLJ_B2260 CLJ_B2261     FALSE 0.301 162.000 0.000 NA   NA
 7506449 7506450 CLJ_B2261 CLJ_B2262     FALSE 0.152 206.000 0.000 NA   NA
 7506450 7506451 CLJ_B2262 CLJ_B2263     FALSE 0.379 142.000 0.000 NA   NA
 7506453 7506454 CLJ_B2265 CLJ_B2266     TRUE 0.779 44.000 0.027 NA   NA
 7506454 7506455 CLJ_B2266 CLJ_B2267     TRUE 0.662 92.000 0.027 1.000   NA
 7506455 7506456 CLJ_B2267 CLJ_B2268     TRUE 0.564 46.000 0.000 NA   NA
 7506457 7506458 CLJ_B2269 CLJ_B2270   rfbB TRUE 0.949 42.000 0.087 1.000 Y NA
 7506458 7506459 CLJ_B2270 CLJ_B2271 rfbB   FALSE 0.048 276.000 0.000 NA   NA
 7506459 7506460 CLJ_B2271 CLJ_B2272     FALSE 0.070 251.000 0.000 NA   NA
 7506461 7506462 CLJ_B2273 CLJ_B2274     FALSE 0.470 61.000 0.000 NA   NA
 7506462 7506463 CLJ_B2274 CLJ_B2275     FALSE 0.007 472.000 0.000 NA   NA
 7506463 7506464 CLJ_B2275 CLJ_B2276     FALSE 0.003 851.000 0.000 NA   NA
 7506464 7506465 CLJ_B2276 CLJ_B2277   codA FALSE 0.004 624.000 0.000 NA N NA
 7506465 7506466 CLJ_B2277 CLJ_B2278 codA codB TRUE 0.961 44.000 0.250 1.000 Y NA
 7506466 7506467 CLJ_B2278 CLJ_B2280 codB   FALSE 0.065 258.000 0.000 NA   NA
 7506467 7506468 CLJ_B2280 CLJ_B2281     FALSE 0.471 168.000 0.018 NA   NA
 7506468 7506469 CLJ_B2281 CLJ_B2282     FALSE 0.022 338.000 0.000 NA   NA
 7506469 7506470 CLJ_B2282 CLJ_B2283     FALSE 0.258 172.000 0.000 NA   NA
 7506470 7506471 CLJ_B2283 CLJ_B2284     FALSE 0.071 250.000 0.000 NA   NA
 7506471 7506472 CLJ_B2284 CLJ_B2285     TRUE 0.948 21.000 0.133 NA   NA
 7506472 7506473 CLJ_B2285 CLJ_B2286     TRUE 0.974 12.000 0.267 NA   NA
 7506473 7506474 CLJ_B2286 CLJ_B2287     TRUE 0.990 0.000 0.636 NA   NA
 7506474 7506475 CLJ_B2287 CLJ_B2288     TRUE 0.848 14.000 0.000 NA   NA
 7506475 7506476 CLJ_B2288 CLJ_B2289     FALSE 0.030 308.000 0.000 NA   NA
 7506476 7506477 CLJ_B2289 CLJ_B2290     FALSE 0.425 103.000 0.000 NA   NA
 7506478 7506479 CLJ_B2291 CLJ_B2292     TRUE 0.974 5.000 0.171 NA   NA
 7506481 7506482 CLJ_B2294 CLJ_B2295     TRUE 0.791 23.000 0.000 NA   NA
 7506483 7506484 CLJ_B2296 CLJ_B2297     FALSE 0.345 151.000 0.000 NA   NA
 7506486 7506487 CLJ_B2299 CLJ_B2300     FALSE 0.005 519.000 0.000 NA   NA
 7506487 7506488 CLJ_B2300 CLJ_B2301     FALSE 0.158 203.000 0.000 NA   NA
 7506488 7506489 CLJ_B2301 CLJ_B2302     FALSE 0.407 134.000 0.000 NA   NA
 7506489 7506490 CLJ_B2302 CLJ_B2303     FALSE 0.415 89.000 0.000 NA   NA
 7506490 7506491 CLJ_B2303 CLJ_B2304     TRUE 0.930 -7.000 0.000 NA   NA
 7506491 7506492 CLJ_B2304 CLJ_B2305     FALSE 0.132 220.000 0.000 1.000   NA
 7506492 7506493 CLJ_B2305 CLJ_B2306     FALSE 0.030 306.000 0.000 NA   NA
 7506493 7506494 CLJ_B2306 CLJ_B2307     FALSE 0.419 94.000 0.000 NA   NA
 7506494 7506495 CLJ_B2307 CLJ_B2308   cadA_2 FALSE 0.009 444.000 0.000 1.000   NA
 7506495 7506496 CLJ_B2308 CLJ_B2309 cadA_2   TRUE 0.681 182.000 0.417 NA   NA
 7506496 7506497 CLJ_B2309 CLJ_B2310     FALSE 0.413 123.000 0.000 NA   NA
 7506497 7506498 CLJ_B2310 CLJ_B2311     TRUE 0.949 74.000 0.500 NA Y NA
 7506498 7506499 CLJ_B2311 CLJ_B2312   eutE TRUE 0.992 0.000 0.769 1.000 N NA
 7506499 7506500 CLJ_B2312 CLJ_B2313 eutE   TRUE 0.982 35.000 0.692 NA Y NA
 7506500 7506501 CLJ_B2313 CLJ_B2314     TRUE 0.979 21.000 0.750 NA N NA
 7506501 7506502 CLJ_B2314 CLJ_B2315     TRUE 0.896 45.000 0.273 NA N NA
 7506502 7506503 CLJ_B2315 CLJ_B2316     TRUE 0.988 -3.000 0.389 NA   NA
 7506503 7506504 CLJ_B2316 CLJ_B2317     TRUE 0.855 78.000 0.444 NA   NA
 7506504 7506505 CLJ_B2317 CLJ_B2318     TRUE 0.998 -18.000 0.615 NA Y NA
 7506505 7506506 CLJ_B2318 CLJ_B2319     TRUE 0.992 7.000 0.250 NA Y NA
 7506506 7506507 CLJ_B2319 CLJ_B2320     TRUE 0.995 -3.000 0.176 1.000 Y NA
 7506507 7506508 CLJ_B2320 CLJ_B2321     TRUE 0.928 40.000 0.375 1.000 N NA
 7506508 7506509 CLJ_B2321 CLJ_B2322     TRUE 0.864 164.000 0.815 0.002 N NA
 7506509 7506510 CLJ_B2322 CLJ_B2323     TRUE 0.961 50.000 0.370 1.000 Y NA
 7506510 7506511 CLJ_B2323 CLJ_B2324     TRUE 0.640 38.000 0.000 NA   NA
 7506511 7506512 CLJ_B2324 CLJ_B2325     TRUE 0.782 24.000 0.000 NA   NA
 7506512 7506513 CLJ_B2325 CLJ_B2326     FALSE 0.416 91.000 0.000 NA   NA
 7506513 7506514 CLJ_B2326 CLJ_B2327     FALSE 0.425 79.000 0.000 NA   NA
 7506514 7506515 CLJ_B2327 CLJ_B2328     TRUE 0.994 -13.000 0.810 NA   NA
 7506515 7506516 CLJ_B2328 CLJ_B2329     FALSE 0.006 486.000 0.000 NA   NA
 7506516 7506517 CLJ_B2329 CLJ_B2330     TRUE 0.762 105.000 0.094 1.000 N NA
 7506519 7506520 CLJ_B2332 CLJ_B2333     TRUE 0.832 41.000 0.044 NA N NA
 7506522 7506523 CLJ_B2335 CLJ_B2336     TRUE 0.673 34.000 0.000 NA   NA
 7506523 7506524 CLJ_B2336 CLJ_B2337     TRUE 0.939 -15.000 0.000 NA   NA
 7506524 7506525 CLJ_B2337 CLJ_B2338     FALSE 0.003 703.000 0.000 NA   NA
 7506525 7506526 CLJ_B2338 CLJ_B2339     TRUE 0.949 13.000 0.053 NA   NA
 7506526 7506527 CLJ_B2339 CLJ_B2340     FALSE 0.008 439.000 0.000 NA   NA
 7506527 7506528 CLJ_B2340 CLJ_B2341     TRUE 0.945 -31.000 0.000 NA   NA
 7506528 7506529 CLJ_B2341 CLJ_B2342     FALSE 0.007 476.000 0.000 1.000   NA
 7506529 7506530 CLJ_B2342 CLJ_B2343     TRUE 0.992 -19.000 0.400 1.000 N NA
 7506530 7506531 CLJ_B2343 CLJ_B2344     TRUE 0.971 17.000 0.375 NA   NA
 7506531 7506532 CLJ_B2344 CLJ_B2345     FALSE 0.051 272.000 0.000 NA   NA
 7506532 7506533 CLJ_B2345 CLJ_B2346     TRUE 0.746 81.000 0.091 NA N NA
 7506533 7506534 CLJ_B2346 CLJ_B2347     TRUE 0.805 84.000 0.222 NA N NA
 7506534 7506535 CLJ_B2347 CLJ_B2348     FALSE 0.010 442.000 0.000 1.000 N NA
 7506535 7506536 CLJ_B2348 CLJ_B2349     TRUE 0.997 -3.000 0.700 1.000 Y NA
 7506536 7506537 CLJ_B2349 CLJ_B2350     FALSE 0.174 198.000 0.000 NA   NA
 7506537 7506538 CLJ_B2350 CLJ_B2351     FALSE 0.415 88.000 0.000 NA   NA
 7506538 7506539 CLJ_B2351 CLJ_B2352     TRUE 0.987 3.000 0.500 1.000   NA
 7506539 7506540 CLJ_B2352 CLJ_B2353     FALSE 0.501 60.000 0.000 1.000   NA
 7506540 7506541 CLJ_B2353 CLJ_B2354     FALSE 0.083 264.000 0.000 0.078   NA
 7506541 7506542 CLJ_B2354 CLJ_B2355     TRUE 0.992 -10.000 0.429 1.000   NA
 7506542 7506543 CLJ_B2355 CLJ_B2356     FALSE 0.003 729.000 0.000 NA   NA
 7506543 7506544 CLJ_B2356 CLJ_B2357     FALSE 0.022 338.000 0.000 NA   NA
 7506544 7506545 CLJ_B2357 CLJ_B2358     FALSE 0.204 211.000 0.000 0.009   NA
 7506545 7506546 CLJ_B2358 CLJ_B2359     TRUE 0.978 13.000 0.241 0.009   NA
 7506546 7506547 CLJ_B2359 CLJ_B2360     TRUE 0.977 29.000 0.119 0.007 Y NA
 7506547 7506548 CLJ_B2360 CLJ_B2361     TRUE 0.977 24.000 0.081 1.000 Y NA
 7506548 7506549 CLJ_B2361 CLJ_B2362     FALSE 0.013 389.000 0.000 NA   NA
 7506549 7506550 CLJ_B2362 CLJ_B2363   plsY FALSE 0.007 454.000 0.000 NA   NA
 7506552 7506553 CLJ_B2365 CLJ_B2366     FALSE 0.408 133.000 0.000 NA   NA
 7506553 7506554 CLJ_B2366 CLJ_B2367     FALSE 0.006 482.000 0.000 NA   NA
 7506555 7506556 CLJ_B2368 CLJ_B2369     FALSE 0.438 74.000 0.000 NA   NA
 7506557 7506558 CLJ_B2370 CLJ_B2371     TRUE 0.977 7.000 0.222 1.000   NA
 7506559 7506560 CLJ_B2372 CLJ_B2373     FALSE 0.004 611.000 0.000 NA   NA
 7506561 7506562 CLJ_B2374 CLJ_B2375 enr   TRUE 0.728 97.000 0.059 1.000 N NA
 7506562 7506563 CLJ_B2375 CLJ_B2376     TRUE 0.939 48.000 1.000 NA   NA
 7506563 7506564 CLJ_B2376 CLJ_B2377     FALSE 0.025 323.000 0.000 NA   NA
 7506564 7506565 CLJ_B2377 CLJ_B2378     FALSE 0.414 121.000 0.000 NA   NA
 7506565 7506566 CLJ_B2378 CLJ_B2379   cmr5 TRUE 0.948 137.000 0.667 NA Y NA
 7506566 7506567 CLJ_B2379 CLJ_B2380 cmr5 cmr4 TRUE 0.988 17.000 0.256 NA Y NA
 7506567 7506568 CLJ_B2380 CLJ_B2381 cmr4   TRUE 0.950 16.000 0.091 NA   NA
 7506568 7506569 CLJ_B2381 CLJ_B2382     TRUE 0.990 -7.000 0.429 NA   NA
 7506569 7506570 CLJ_B2382 CLJ_B2383     TRUE 0.969 2.000 0.068 NA   NA
 7506570 7506571 CLJ_B2383 CLJ_B2384   cmr1 TRUE 0.975 -15.000 0.027 NA   NA
 7506571 7506572 CLJ_B2384 CLJ_B2385 cmr1 cas6 FALSE 0.467 62.000 0.000 NA   NA
 7506572 7506573 CLJ_B2385 CLJ_B2386 cas6   FALSE 0.003 703.000 0.000 NA   NA
 7506576 7506577 CLJ_B2389 CLJ_B2390     FALSE 0.003 1805.000 0.000 1.000   NA
 7506577 7506578 CLJ_B2390 CLJ_B2391     FALSE 0.061 262.000 0.000 NA   NA
 7506578 7506579 CLJ_B2391 CLJ_B2392     FALSE 0.089 234.000 0.000 NA   NA
 7506580 7506581 CLJ_B2393 CLJ_B2394     TRUE 0.543 168.000 0.033 1.000 N NA
 7506581 7506582 CLJ_B2394 CLJ_B2395     FALSE 0.105 226.000 0.000 NA   NA
 7506582 7506583 CLJ_B2395 CLJ_B2396     FALSE 0.148 207.000 0.000 NA   NA
 7506584 7506585 CLJ_B2398 CLJ_B2399     FALSE 0.021 340.000 0.000 NA   NA
 7506586 7506587 CLJ_B2400 CLJ_B2401     TRUE 0.834 77.000 0.333 NA   NA
 7506587 7506588 CLJ_B2401 CLJ_B2402     FALSE 0.034 301.000 0.000 NA   NA
 7506588 7506589 CLJ_B2402 CLJ_B2403     TRUE 0.994 19.000 0.750 0.010 Y NA
 7506589 7506590 CLJ_B2403 CLJ_B2404     TRUE 0.958 40.000 0.750 0.033 N NA
 7506590 7506591 CLJ_B2404 CLJ_B2405     FALSE 0.068 262.000 0.000 NA N NA
 7506591 7506592 CLJ_B2405 CLJ_B2406     TRUE 0.997 0.000 0.750 NA Y NA
 7506592 7506593 CLJ_B2406 CLJ_B2407     TRUE 0.900 63.000 0.667 NA N NA
 7506593 7506594 CLJ_B2407 CLJ_B2408     FALSE 0.003 741.000 0.000 1.000   NA
 7506595 7506596 CLJ_B2409 CLJ_B2410     TRUE 0.996 3.000 0.759 NA Y NA
 7506597 7506598 CLJ_B2411 CLJ_B2412     FALSE 0.005 584.000 0.000 1.000   NA
 7506598 7506599 CLJ_B2412 CLJ_B2413     FALSE 0.011 417.000 0.000 1.000   NA
 7506601 7506602 CLJ_B2415 CLJ_B2416 gntP pdxA FALSE 0.436 227.000 0.271 1.000 N NA
 7506602 7506603 CLJ_B2416 CLJ_B2417 pdxA   TRUE 0.973 13.000 0.283 NA   NA
 7506603 7506604 CLJ_B2417 CLJ_B2418     TRUE 0.810 64.000 0.182 NA   NA
 7506608 7506609 CLJ_B2422 CLJ_B2423     FALSE 0.323 162.000 0.000 1.000   NA
 7506610 7506611 CLJ_B2424 CLJ_B2425     TRUE 0.691 142.000 0.083 NA   NA
 7506611 7506612 CLJ_B2425 CLJ_B2426     FALSE 0.053 270.000 0.000 NA   NA
 7506613 7506614 CLJ_B2427 CLJ_B2428     FALSE 0.009 449.000 0.000 1.000 N NA
 7506614 7506615 CLJ_B2428 CLJ_B2429     FALSE 0.008 444.000 0.000 NA   NA
 7506616 7506617 CLJ_B2430 CLJ_B2431     TRUE 0.856 13.000 0.000 NA   NA
 7506618 7506619 CLJ_B2432 CLJ_B2433     TRUE 0.711 96.000 0.068 NA   NA
 7506619 7506620 CLJ_B2433 CLJ_B2434     TRUE 0.998 -9.000 0.838 0.003 Y NA
 7506620 7506621 CLJ_B2434 CLJ_B2435     TRUE 0.945 25.000 0.193 NA   NA
 7506621 7506622 CLJ_B2435 CLJ_B2436     FALSE 0.021 342.000 0.000 NA   NA
 7506622 7506623 CLJ_B2436 CLJ_B2437   motB_1 FALSE 0.037 295.000 0.000 NA   NA
 7506623 7506624 CLJ_B2437 CLJ_B2438 motB_1 motA_1 TRUE 0.821 18.000 0.000 NA   NA
 7506624 7506625 CLJ_B2438 CLJ_B2439 motA_1   FALSE 0.003 1026.000 0.000 NA N NA
 7506625 7506626 CLJ_B2439 CLJ_B2440     FALSE 0.029 311.000 0.000 NA   NA
 7506626 7506627 CLJ_B2440 CLJ_B2441     FALSE 0.046 280.000 0.000 NA   NA
 7506627 7506628 CLJ_B2441 CLJ_B2442     TRUE 0.972 6.000 0.153 NA   NA
 7506628 7506629 CLJ_B2442 CLJ_B2443   pepD_2 FALSE 0.414 118.000 0.000 NA   NA
 7506629 7506630 CLJ_B2443 CLJ_B2444 pepD_2   FALSE 0.024 559.000 0.000 1.000 Y NA
 7506633 7506634 CLJ_B2447 CLJ_B2448     FALSE 0.416 83.000 0.000 NA   NA
 7506635 7506636 CLJ_B2449 CLJ_B2450     TRUE 0.992 14.000 0.448 NA Y NA
 7506636 7506637 CLJ_B2450 CLJ_B2451     FALSE 0.008 466.000 0.000 1.000   NA
 7506637 7506638 CLJ_B2451 CLJ_B2452     TRUE 0.861 14.000 0.000 1.000   NA
 7506640 7506641 CLJ_B2454 CLJ_B2455     FALSE 0.008 437.000 0.000 NA   NA
 7506641 7506642 CLJ_B2455 CLJ_B2456     FALSE 0.021 348.000 0.000 1.000   NA
 7506644 7506645 CLJ_B2458 CLJ_B2459     FALSE 0.004 631.000 0.000 NA   NA
 7506645 7506646 CLJ_B2459 CLJ_B2460     FALSE 0.015 377.000 0.000 NA   NA
 7506647 7506648 CLJ_B2461 CLJ_B2462     TRUE 0.975 3.000 0.148 NA   NA
 7506649 7506650 CLJ_B2463 CLJ_B2464     TRUE 0.981 -22.000 0.059 NA   NA
 7506650 7506651 CLJ_B2464 CLJ_B2465     FALSE 0.350 150.000 0.000 NA   NA
 7506651 7506652 CLJ_B2465 CLJ_B2467     FALSE 0.319 157.000 0.000 NA   NA
 7506652 7506653 CLJ_B2467 CLJ_B2468     TRUE 0.732 137.000 0.095 1.000   NA
 7506653 7506654 CLJ_B2468 CLJ_B2469     FALSE 0.505 184.000 0.095 NA   NA
 7506654 7506655 CLJ_B2469 CLJ_B2470     FALSE 0.463 63.000 0.000 NA   NA
 7506655 7506656 CLJ_B2470 CLJ_B2471   bioD FALSE 0.414 87.000 0.000 NA   NA
 7506656 7506657 CLJ_B2471 CLJ_B2472 bioD bioB TRUE 0.990 3.000 0.025 0.001 Y NA
 7506657 7506658 CLJ_B2472 CLJ_B2473 bioB   TRUE 0.947 5.000 0.018 NA   NA
 7506658 7506659 CLJ_B2473 CLJ_B2474     FALSE 0.390 139.000 0.000 NA   NA
 7506659 7506660 CLJ_B2474 CLJ_B2475     TRUE 0.937 -12.000 0.000 NA   NA
 7506660 7506661 CLJ_B2475 CLJ_B2476     FALSE 0.370 144.000 0.000 NA   NA
 7506662 7506663 CLJ_B2477 CLJ_B2478     TRUE 0.951 31.000 0.015 1.000 Y NA
 7506664 7506665 CLJ_B2479 CLJ_B2480     FALSE 0.058 264.000 0.000 NA   NA
 7506665 7506666 CLJ_B2480 CLJ_B2481     TRUE 0.805 21.000 0.000 NA   NA
 7506666 7506667 CLJ_B2481 CLJ_B2482     FALSE 0.413 122.000 0.000 NA   NA
 7506667 7506668 CLJ_B2482 CLJ_B2483     FALSE 0.422 107.000 0.000 NA   NA
 7506670 7506671 CLJ_B2485 CLJ_B2486     FALSE 0.209 190.000 0.000 1.000   NA
 7506671 7506672 CLJ_B2486 CLJ_B2487     FALSE 0.010 415.000 0.000 NA   NA
 7506672 7506673 CLJ_B2487 CLJ_B2488     FALSE 0.266 170.000 0.000 NA   NA
 7506673 7506674 CLJ_B2488 CLJ_B2489     FALSE 0.484 58.000 0.000 NA   NA
 7506674 7506675 CLJ_B2489 CLJ_B2490     FALSE 0.029 311.000 0.000 NA   NA
 7506675 7506676 CLJ_B2490 CLJ_B2491     FALSE 0.015 370.000 0.000 NA   NA
 7506676 7506677 CLJ_B2491 CLJ_B2492     TRUE 0.913 19.000 0.021 NA   NA
 7506679 7506680 CLJ_B2495 CLJ_B2496     TRUE 0.937 -12.000 0.000 NA   NA
 7506680 7506681 CLJ_B2496 CLJ_B2497     TRUE 0.856 13.000 0.000 NA   NA
 7506681 7506682 CLJ_B2497 CLJ_B2498     FALSE 0.016 367.000 0.000 NA   NA
 7506682 7506683 CLJ_B2498 CLJ_B2499     FALSE 0.231 179.000 0.000 NA   NA
 7506683 7506684 CLJ_B2499 CLJ_B2500     FALSE 0.419 94.000 0.000 NA   NA
 7506684 7506685 CLJ_B2500 CLJ_B2501     TRUE 0.958 3.000 0.032 NA   NA
 7506685 7506686 CLJ_B2501 CLJ_B2502     FALSE 0.014 386.000 0.000 1.000   NA
 7506686 7506687 CLJ_B2502 CLJ_B2503     FALSE 0.031 305.000 0.000 NA   NA
 7506687 7506688 CLJ_B2503 CLJ_B2504     TRUE 0.558 47.000 0.000 NA   NA
 7506688 7506689 CLJ_B2504 CLJ_B2505     FALSE 0.008 445.000 0.000 NA   NA
 7506689 7506690 CLJ_B2505 CLJ_B2506     FALSE 0.064 259.000 0.000 NA   NA
 7506690 7506691 CLJ_B2506 CLJ_B2507     TRUE 0.961 -7.000 0.003 NA   NA
 7506691 7506692 CLJ_B2507 CLJ_B2508     FALSE 0.466 119.000 0.000 1.000 N NA
 7506692 7506693 CLJ_B2508 CLJ_B2509     TRUE 0.623 40.000 0.000 NA   NA
 7506693 7506694 CLJ_B2509 CLJ_B2510     TRUE 0.826 17.000 0.000 NA   NA
 7506694 7506695 CLJ_B2510 CLJ_B2511     TRUE 0.553 48.000 0.000 NA   NA
 7506695 7506696 CLJ_B2511 CLJ_B2512     FALSE 0.249 174.000 0.000 NA   NA
 7506696 7506697 CLJ_B2512 CLJ_B2513     TRUE 0.894 3.000 0.000 NA   NA
 7506697 7506698 CLJ_B2513 CLJ_B2514     TRUE 0.885 5.000 0.000 NA   NA
 7506698 7506699 CLJ_B2514 CLJ_B2515     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 7506699 7506700 CLJ_B2515 CLJ_B2516     TRUE 0.889 4.000 0.000 NA   NA
 7506700 7506701 CLJ_B2516 CLJ_B2517     TRUE 0.848 14.000 0.000 NA   NA
 7506701 7506702 CLJ_B2517 CLJ_B2518     FALSE 0.463 63.000 0.000 NA   NA
 7506702 7506703 CLJ_B2518 CLJ_B2519     FALSE 0.463 63.000 0.000 NA   NA
 7506703 7506704 CLJ_B2519 CLJ_B2520     TRUE 0.930 -7.000 0.000 NA   NA
 7506704 7506705 CLJ_B2520 CLJ_B2521     FALSE 0.491 57.000 0.000 NA   NA
 7506705 7506706 CLJ_B2521 CLJ_B2522     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 7506706 7506707 CLJ_B2522 CLJ_B2523     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 7506707 7506708 CLJ_B2523 CLJ_B2524     TRUE 0.930 -7.000 0.000 NA   NA
 7506708 7506709 CLJ_B2524 CLJ_B2525     TRUE 0.923 -3.000 0.000 NA   NA
 7506709 7506710 CLJ_B2525 CLJ_B2526     TRUE 0.894 3.000 0.000 NA   NA
 7506710 7506711 CLJ_B2526 CLJ_B2527     TRUE 0.826 59.000 0.200 NA   NA
 7506711 7506712 CLJ_B2527 CLJ_B2528     TRUE 0.976 14.000 0.400 NA   NA
 7506712 7506713 CLJ_B2528 CLJ_B2529     TRUE 0.976 21.000 0.667 NA   NA
 7506713 7506714 CLJ_B2529 CLJ_B2530     FALSE 0.345 151.000 0.000 NA   NA
 7506716 7506717 CLJ_B2532 CLJ_B2533     TRUE 0.611 41.000 0.000 NA   NA
 7506717 7506718 CLJ_B2533 CLJ_B2534     TRUE 0.872 10.000 0.000 NA   NA
 7506718 7506719 CLJ_B2534 CLJ_B2535     TRUE 0.986 0.000 0.300 NA   NA
 7506719 7506720 CLJ_B2535 CLJ_B2536     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 7506720 7506721 CLJ_B2536 CLJ_B2537     TRUE 0.730 30.000 0.000 1.000   NA
 7506721 7506722 CLJ_B2537 CLJ_B2538     TRUE 0.596 45.000 0.000 1.000   NA
 7506722 7506723 CLJ_B2538 CLJ_B2539     TRUE 0.983 -7.000 0.051 0.001   NA
 7506723 7506724 CLJ_B2539 CLJ_B2540     TRUE 0.903 3.000 0.000 1.000   NA
 7506724 7506725 CLJ_B2540 CLJ_B2541     FALSE 0.221 186.000 0.000 1.000   NA
 7506725 7506726 CLJ_B2541 CLJ_B2542     FALSE 0.414 116.000 0.000 NA   NA
 7506726 7506727 CLJ_B2542 CLJ_B2543     TRUE 0.945 -37.000 0.000 NA   NA
 7506727 7506728 CLJ_B2543 CLJ_B2544     FALSE 0.424 101.000 0.000 NA   NA
 7506728 7506729 CLJ_B2544 CLJ_B2545     FALSE 0.022 336.000 0.000 NA   NA
 7506729 7506730 CLJ_B2545 CLJ_B2546     TRUE 0.869 11.000 0.000 NA   NA
 7506730 7506731 CLJ_B2546 CLJ_B2547     TRUE 0.923 -3.000 0.000 NA   NA
 7506731 7506732 CLJ_B2547 CLJ_B2548     FALSE 0.416 90.000 0.000 NA   NA
 7506732 7506733 CLJ_B2548 CLJ_B2549     TRUE 0.841 15.000 0.000 NA   NA
 7506733 7506734 CLJ_B2549 CLJ_B2550     FALSE 0.416 83.000 0.000 NA   NA
 7506734 7506735 CLJ_B2550 CLJ_B2551     FALSE 0.016 363.000 0.000 NA   NA
 7506735 7506736 CLJ_B2551 CLJ_B2552     TRUE 0.875 9.000 0.000 NA   NA
 7506736 7506737 CLJ_B2552 CLJ_B2553     TRUE 0.930 -7.000 0.000 NA   NA
 7506737 7506738 CLJ_B2553 CLJ_B2554     TRUE 0.863 12.000 0.000 NA   NA
 7506738 7506739 CLJ_B2554 CLJ_B2555     TRUE 0.816 19.000 0.000 NA   NA
 7506739 7506740 CLJ_B2555 CLJ_B2556     TRUE 0.989 -12.000 0.294 NA   NA
 7506740 7506741 CLJ_B2556 CLJ_B2557     TRUE 0.923 -3.000 0.000 NA   NA
 7506741 7506742 CLJ_B2557 CLJ_B2558     FALSE 0.416 91.000 0.000 NA   NA
 7506742 7506743 CLJ_B2558 CLJ_B2559     TRUE 0.826 17.000 0.000 NA   NA
 7506743 7506744 CLJ_B2559 CLJ_B2560     TRUE 0.879 7.000 0.000 NA   NA
 7506744 7506745 CLJ_B2560 CLJ_B2561     TRUE 0.709 30.000 0.000 NA   NA
 7506745 7506746 CLJ_B2561 CLJ_B2562     TRUE 0.856 13.000 0.000 NA   NA
 7506746 7506747 CLJ_B2562 CLJ_B2563     TRUE 0.810 20.000 0.000 NA   NA
 7506747 7506748 CLJ_B2563 CLJ_B2564     TRUE 0.930 -7.000 0.000 NA   NA
 7506748 7506749 CLJ_B2564 CLJ_B2565     TRUE 0.673 34.000 0.000 NA   NA
 7506749 7506750 CLJ_B2565 CLJ_B2566     FALSE 0.330 154.000 0.000 NA   NA
 7506750 7506751 CLJ_B2566 CLJ_B2567     TRUE 0.833 16.000 0.000 NA   NA
 7506751 7506752 CLJ_B2567 CLJ_B2568     TRUE 0.894 3.000 0.000 NA   NA
 7506752 7506753 CLJ_B2568 CLJ_B2569     TRUE 0.989 13.000 0.095 0.052 Y NA
 7506753 7506754 CLJ_B2569 CLJ_B2570     FALSE 0.066 256.000 0.000 NA   NA
 7506754 7506755 CLJ_B2570 CLJ_B2571     TRUE 0.875 9.000 0.000 NA   NA
 7506755 7506756 CLJ_B2571 CLJ_B2572     FALSE 0.520 53.000 0.000 NA   NA
 7506756 7506757 CLJ_B2572 CLJ_B2573     TRUE 0.805 21.000 0.000 NA   NA
 7506759 7506760 CLJ_B2575 CLJ_B2576     TRUE 0.908 1.000 0.000 NA   NA
 7506760 7506761 CLJ_B2576 CLJ_B2577     TRUE 0.582 58.000 0.000 0.052   NA
 7506762 7506763 CLJ_B2578 CLJ_B2579     TRUE 0.558 47.000 0.000 NA   NA
 7506763 7506764 CLJ_B2579 CLJ_B2580     FALSE 0.176 197.000 0.000 NA   NA
 7506764 7506765 CLJ_B2580 CLJ_B2581     FALSE 0.420 95.000 0.000 NA   NA
 7506765 7506766 CLJ_B2581 CLJ_B2582     FALSE 0.086 250.000 0.000 1.000 N NA
 7506767 7506768 CLJ_B2583 CLJ_B2584     FALSE 0.003 688.000 0.000 NA   NA
 7506768 7506769 CLJ_B2584 CLJ_B2585   msrB TRUE 0.632 174.000 0.200 NA   NA
 7506769 7506770 CLJ_B2585 CLJ_B2586 msrB sodA FALSE 0.111 233.000 0.000 1.000 N NA
 7506770 7506771 CLJ_B2586 CLJ_B2587 sodA   FALSE 0.469 112.000 0.000 1.000 N NA
 7506771 7506772 CLJ_B2587 CLJ_B2588     TRUE 0.997 7.000 0.867 0.005 Y NA
 7506772 7506773 CLJ_B2588 CLJ_B2589     FALSE 0.298 280.000 0.462 1.000 N NA
 7506773 7506774 CLJ_B2589 CLJ_B2590     FALSE 0.007 458.000 0.000 NA   NA
 7506774 7506775 CLJ_B2590 CLJ_B2591     TRUE 0.941 36.000 0.500 NA   NA
 7506777 7506778 CLJ_B2593 CLJ_B2594     TRUE 0.685 202.000 0.556 0.099 N NA
 7506778 7506779 CLJ_B2594 CLJ_B2595     TRUE 0.994 -3.000 0.125 1.000 Y NA
 7506779 7506780 CLJ_B2595 CLJ_B2596     FALSE 0.005 593.000 0.000 1.000   NA
 7506782 7506783 CLJ_B2598 CLJ_B2599     TRUE 0.601 83.000 0.011 NA   NA
 7506783 7506784 CLJ_B2599 CLJ_B2600   def_1 FALSE 0.036 303.000 0.000 1.000   NA
 7506784 7506785 CLJ_B2600 CLJ_B2601 def_1   TRUE 0.990 1.000 0.529 1.000 N NA
 7506785 7506786 CLJ_B2601 CLJ_B2602   tgl FALSE 0.086 241.000 0.000 1.000   NA
 7506786 7506787 CLJ_B2602 CLJ_B2603 tgl   TRUE 0.977 -3.000 0.077 NA   NA
 7506787 7506788 CLJ_B2603 CLJ_B2604     FALSE 0.004 622.000 0.000 NA   NA
 7506788 7506789 CLJ_B2604 CLJ_B2605     FALSE 0.006 491.000 0.000 NA   NA
 7506789 7506790 CLJ_B2605 CLJ_B2606     FALSE 0.440 86.000 0.000 1.000   NA
 7506790 7506791 CLJ_B2606 CLJ_B2607     TRUE 0.935 -10.000 0.000 NA   NA
 7506791 7506792 CLJ_B2607 CLJ_B2608     FALSE 0.441 73.000 0.000 NA   NA
 7506792 7506793 CLJ_B2608 CLJ_B2609     FALSE 0.016 367.000 0.000 NA   NA
 7506793 7506794 CLJ_B2609 CLJ_B2610     TRUE 0.745 191.000 1.000 NA   NA
 7506795 7506796 CLJ_B2611 CLJ_B2612     FALSE 0.438 74.000 0.000 NA   NA
 7506797 7506798 CLJ_B2613 CLJ_B2614     TRUE 0.995 -7.000 0.138 1.000 Y NA
 7506798 7506799 CLJ_B2614 CLJ_B2615     TRUE 0.972 -7.000 0.023 1.000   NA
 7506799 7506800 CLJ_B2615 CLJ_B2616     FALSE 0.350 150.000 0.000 NA   NA
 7506800 7506801 CLJ_B2616 CLJ_B2617     FALSE 0.017 359.000 0.000 NA   NA
 7506801 7506802 CLJ_B2617 CLJ_B2618     TRUE 0.993 -61.000 0.500 NA   NA
 7506806 7506807 CLJ_B2622 CLJ_B2623 ptsH aspB_3 TRUE 0.709 111.000 0.047 1.000 N NA
 7506807 7506808 CLJ_B2623 CLJ_B2624 aspB_3   FALSE 0.004 689.000 0.000 1.000   NA
 7506808 7506809 CLJ_B2624 CLJ_B2625     TRUE 0.923 -3.000 0.000 NA   NA
 7506809 7506810 CLJ_B2625 CLJ_B2626     TRUE 0.913 19.000 0.020 NA   NA
 7506810 7506811 CLJ_B2626 CLJ_B2627   spoVS FALSE 0.499 163.000 0.020 NA   NA
 7506811 7506812 CLJ_B2627 CLJ_B2628 spoVS   TRUE 0.589 139.000 0.016 NA   NA
 7506812 7506813 CLJ_B2628 CLJ_B2629   recA FALSE 0.191 235.000 0.018 1.000   NA
 7506813 7506814 CLJ_B2629 CLJ_B2630 recA pgsA TRUE 0.638 139.000 0.022 1.000 N NA
 7506814 7506815 CLJ_B2630 CLJ_B2631 pgsA   TRUE 0.987 -16.000 0.132 1.000 N NA
 7506815 7506816 CLJ_B2631 CLJ_B2632   ftsK TRUE 0.682 122.000 0.031 1.000 N NA
 7506816 7506817 CLJ_B2632 CLJ_B2633 ftsK   FALSE 0.286 226.000 0.047 1.000 N NA
 7506817 7506818 CLJ_B2633 CLJ_B2634   dapG FALSE 0.231 239.000 0.045 1.000 N NA
 7506818 7506819 CLJ_B2634 CLJ_B2635 dapG   TRUE 0.958 16.000 0.148 NA   NA
 7506819 7506820 CLJ_B2635 CLJ_B2636     TRUE 0.752 77.000 0.104 NA   NA
 7506820 7506821 CLJ_B2636 CLJ_B2637   pnpA FALSE 0.521 175.000 0.057 1.000   NA
 7506821 7506822 CLJ_B2637 CLJ_B2638 pnpA rpsO TRUE 0.555 264.000 0.335 1.000 Y NA
 7506822 7506823 CLJ_B2638 CLJ_B2639 rpsO ribF TRUE 0.775 82.000 0.119 1.000 N NA
 7506823 7506824 CLJ_B2639 CLJ_B2640 ribF truB TRUE 0.977 13.000 0.308 1.000 N NA
 7506824 7506825 CLJ_B2640 CLJ_B2641 truB   TRUE 0.983 1.000 0.221 1.000   NA
 7506825 7506826 CLJ_B2641 CLJ_B2642   rbfA TRUE 0.987 -10.000 0.173 1.000   NA
 7506826 7506827 CLJ_B2642 CLJ_B2643 rbfA infB TRUE 0.983 31.000 0.530 1.000 Y NA
 7506827 7506828 CLJ_B2643 CLJ_B2644 infB   TRUE 0.987 18.000 0.223 NA Y NA
 7506828 7506829 CLJ_B2644 CLJ_B2645     TRUE 0.992 -13.000 0.408 NA N NA
 7506829 7506830 CLJ_B2645 CLJ_B2646   nusA TRUE 0.958 49.000 0.323 NA Y NA
 7506830 7506831 CLJ_B2646 CLJ_B2647 nusA   TRUE 0.981 17.000 0.759 NA   NA
 7506831 7506832 CLJ_B2647 CLJ_B2648   polC FALSE 0.094 305.000 0.059 NA   NA
 7506832 7506833 CLJ_B2648 CLJ_B2649 polC ispG FALSE 0.139 278.000 0.040 1.000 N NA
 7506833 7506834 CLJ_B2649 CLJ_B2650 ispG rseP TRUE 0.742 137.000 0.092 1.000 N NA
 7506834 7506835 CLJ_B2650 CLJ_B2651 rseP dxr TRUE 0.930 45.000 0.568 1.000 N NA
 7506835 7506836 CLJ_B2651 CLJ_B2652 dxr   TRUE 0.831 30.000 0.008 NA   NA
 7506836 7506837 CLJ_B2652 CLJ_B2653     TRUE 0.812 100.000 0.250 NA   NA
 7506837 7506838 CLJ_B2653 CLJ_B2654   cdsA TRUE 0.620 143.000 0.034 NA   NA
 7506838 7506839 CLJ_B2654 CLJ_B2655 cdsA uppS TRUE 0.974 25.000 0.055 1.000 Y NA
 7506839 7506840 CLJ_B2655 CLJ_B2656 uppS frr TRUE 0.876 66.000 0.409 1.000 N NA
 7506840 7506841 CLJ_B2656 CLJ_B2657 frr pyrH TRUE 0.981 16.000 0.626 1.000 N NA
 7506843 7506844 CLJ_B2659 CLJ_B2660 tsf rpsB TRUE 0.955 88.000 0.748 1.000 Y NA
 7506844 7506845 CLJ_B2660 CLJ_B2661 rpsB codY FALSE 0.172 237.000 0.006 1.000 N NA
 7506845 7506846 CLJ_B2661 CLJ_B2662 codY topA FALSE 0.333 207.000 0.025 1.000 N NA
 7506846 7506847 CLJ_B2662 CLJ_B2663 topA dprA FALSE 0.195 384.000 0.238 1.000 Y NA
 7506848 7506849 CLJ_B2664 CLJ_B2665     TRUE 0.914 16.000 0.003 1.000 N NA
 7506850 7506851 CLJ_B2666 CLJ_B2667 rnhB   FALSE 0.153 297.000 0.148 1.000   NA
 7506851 7506852 CLJ_B2667 CLJ_B2668   lepB_2 FALSE 0.067 303.000 0.007 1.000   NA
 7506852 7506853 CLJ_B2668 CLJ_B2669 lepB_2 rplS TRUE 0.675 59.000 0.006 1.000 N NA
 7506853 7506854 CLJ_B2669 CLJ_B2670 rplS trmD TRUE 0.931 152.000 0.567 1.000 Y NA
 7506854 7506855 CLJ_B2670 CLJ_B2671 trmD rimM TRUE 0.998 -9.000 0.672 1.000 Y NA
 7506855 7506856 CLJ_B2671 CLJ_B2672 rimM   TRUE 0.831 113.000 0.324 1.000   NA
 7506856 7506857 CLJ_B2672 CLJ_B2673   rpsP TRUE 0.969 21.000 0.385 1.000   NA
 7506857 7506858 CLJ_B2673 CLJ_B2674 rpsP ffh TRUE 0.946 31.000 0.361 1.000 N NA
 7506858 7506859 CLJ_B2674 CLJ_B2675 ffh   TRUE 0.967 13.000 0.151 1.000   NA
 7506859 7506860 CLJ_B2675 CLJ_B2676   ftsY FALSE 0.322 224.000 0.081 1.000   NA
 7506860 7506861 CLJ_B2676 CLJ_B2677 ftsY smc TRUE 0.732 163.000 0.165 0.017 N NA
 7506861 7506862 CLJ_B2677 CLJ_B2678 smc   FALSE 0.159 262.000 0.027 1.000 N NA
 7506862 7506863 CLJ_B2678 CLJ_B2679   rnc TRUE 0.993 -7.000 0.064 1.000 Y NA
 7506863 7506864 CLJ_B2679 CLJ_B2680 rnc acpP_1 TRUE 0.728 126.000 0.068 1.000 N NA
 7506864 7506865 CLJ_B2680 CLJ_B2681 acpP_1 plsX TRUE 0.901 78.000 0.034 0.004 Y NA
 7506865 7506866 CLJ_B2681 CLJ_B2682 plsX rpmF TRUE 0.859 90.000 0.418 1.000 N NA
 7506866 7506867 CLJ_B2682 CLJ_B2683 rpmF   TRUE 0.981 14.000 0.599 NA   NA
 7506867 7506868 CLJ_B2683 CLJ_B2684   ackA TRUE 0.697 117.000 0.061 NA   NA
 7506868 7506869 CLJ_B2684 CLJ_B2685 ackA pta TRUE 0.902 139.000 0.137 1.000 Y NA
 7506869 7506870 CLJ_B2685 CLJ_B2686 pta   FALSE 0.025 334.000 0.000 1.000   NA
 7506870 7506871 CLJ_B2686 CLJ_B2687     FALSE 0.113 223.000 0.000 NA   NA
 7506871 7506872 CLJ_B2687 CLJ_B2688     TRUE 0.799 22.000 0.000 NA   NA
 7506872 7506873 CLJ_B2688 CLJ_B2689     TRUE 0.972 28.000 1.000 NA   NA
 7506873 7506874 CLJ_B2689 CLJ_B2690     TRUE 0.968 30.000 1.000 NA   NA
 7506874 7506875 CLJ_B2690 CLJ_B2691   prdA_1 TRUE 0.989 9.000 1.000 NA   NA
 7506875 7506876 CLJ_B2691 CLJ_B2692 prdA_1   TRUE 0.689 32.000 0.000 NA   NA
 7506876 7506877 CLJ_B2692 CLJ_B2693     TRUE 0.799 22.000 0.000 NA   NA
 7506877 7506878 CLJ_B2693 CLJ_B2694     FALSE 0.003 891.000 0.000 NA   NA
 7506878 7506879 CLJ_B2694 CLJ_B2695     FALSE 0.010 409.000 0.000 NA   NA
 7506879 7506880 CLJ_B2695 CLJ_B2696     FALSE 0.040 292.000 0.000 NA   NA
 7506880 7506881 CLJ_B2696 CLJ_B2697     FALSE 0.448 69.000 0.000 NA   NA
 7506881 7506882 CLJ_B2697 CLJ_B2698     FALSE 0.152 206.000 0.000 NA   NA
 7506884 7506885 CLJ_B2700 CLJ_B2701     FALSE 0.006 520.000 0.000 1.000   NA
 7506885 7506886 CLJ_B2701 CLJ_B2702   prdE TRUE 0.848 14.000 0.000 NA   NA
 7506886 7506887 CLJ_B2702 CLJ_B2703 prdE prdD TRUE 0.848 14.000 0.000 NA   NA
 7506887 7506888 CLJ_B2703 CLJ_B2704 prdD   TRUE 0.945 -37.000 0.000 NA   NA
 7506888 7506889 CLJ_B2704 CLJ_B2705   prdB FALSE 0.047 278.000 0.000 NA   NA
 7506889 7506890 CLJ_B2705 CLJ_B2706 prdB   FALSE 0.433 76.000 0.000 NA   NA
 7506890 7506891 CLJ_B2706 CLJ_B2707   prdA_2 TRUE 0.875 9.000 0.000 NA   NA
 7506891 7506892 CLJ_B2707 CLJ_B2708 prdA_2   TRUE 0.799 22.000 0.000 NA   NA
 7506892 7506893 CLJ_B2708 CLJ_B2709     TRUE 0.799 22.000 0.000 NA   NA
 7506893 7506894 CLJ_B2709 CLJ_B2710     FALSE 0.004 636.000 0.000 NA   NA
 7506894 7506895 CLJ_B2710 CLJ_B2711     TRUE 0.954 40.000 1.000 NA   NA
 7506897 7506898 CLJ_B2713 CLJ_B2714     FALSE 0.073 248.000 0.000 NA   NA
 7506898 7506899 CLJ_B2714 CLJ_B2715     TRUE 0.970 5.000 0.118 NA   NA
 7506899 7506900 CLJ_B2715 CLJ_B2716     FALSE 0.425 104.000 0.000 NA   NA
 7506900 7506901 CLJ_B2716 CLJ_B2717     FALSE 0.433 76.000 0.000 NA   NA
 7506901 7506902 CLJ_B2717 CLJ_B2718     TRUE 0.935 31.000 0.286 NA   NA
 7506902 7506903 CLJ_B2718 CLJ_B2719     FALSE 0.284 175.000 0.000 1.000 N NA
 7506904 7506905 CLJ_B2720 CLJ_B2721     TRUE 0.716 60.000 0.036 NA   NA
 7506906 7506907 CLJ_B2722 CLJ_B2723   coaD TRUE 0.949 13.000 0.055 NA   NA
 7506907 7506908 CLJ_B2723 CLJ_B2724 coaD   TRUE 0.986 2.000 0.367 1.000 N NA
 7506908 7506909 CLJ_B2724 CLJ_B2725   recG FALSE 0.358 261.000 0.016 1.000 Y NA
 7506909 7506910 CLJ_B2725 CLJ_B2726 recG   TRUE 0.553 168.000 0.048 1.000   NA
 7506910 7506911 CLJ_B2726 CLJ_B2727     TRUE 0.979 15.000 0.567 NA   NA
 7506913 7506914 CLJ_B2729 CLJ_B2730     TRUE 0.847 78.000 0.400 NA   NA
 7506914 7506915 CLJ_B2730 CLJ_B2731     FALSE 0.016 432.000 0.005 NA   NA
 7506915 7506916 CLJ_B2731 CLJ_B2732   rpe TRUE 0.980 2.000 0.166 1.000 N NA
 7506916 7506917 CLJ_B2732 CLJ_B2733 rpe rsgA TRUE 0.986 -6.000 0.213 1.000   NA
 7506917 7506918 CLJ_B2733 CLJ_B2734 rsgA   FALSE 0.484 207.000 0.196 1.000   NA
 7506918 7506919 CLJ_B2734 CLJ_B2735     TRUE 0.998 -22.000 0.704 1.000 Y NA
 7506919 7506920 CLJ_B2735 CLJ_B2736     TRUE 0.950 19.000 0.105 1.000   NA
 7506920 7506921 CLJ_B2736 CLJ_B2737   sun TRUE 0.967 12.000 0.135 1.000   NA
 7506921 7506922 CLJ_B2737 CLJ_B2738 sun   TRUE 0.935 21.000 0.076 NA   NA
 7506922 7506923 CLJ_B2738 CLJ_B2739   fmt FALSE 0.071 318.000 0.035 NA   NA
 7506923 7506924 CLJ_B2739 CLJ_B2740 fmt def_2 TRUE 0.978 17.000 0.009 0.020 Y NA
 7506924 7506925 CLJ_B2740 CLJ_B2741 def_2 priA TRUE 0.870 28.000 0.010 1.000 N NA
 7506925 7506926 CLJ_B2741 CLJ_B2742 priA coaBC FALSE 0.090 338.000 0.099 1.000 N NA
 7506926 7506927 CLJ_B2742 CLJ_B2743 coaBC rpoZ TRUE 0.958 2.000 0.013 1.000 N NA
 7506927 7506928 CLJ_B2743 CLJ_B2744 rpoZ gmk TRUE 0.981 -19.000 0.035 1.000 N NA
 7506928 7506929 CLJ_B2744 CLJ_B2745 gmk   TRUE 0.980 0.000 0.143 NA   NA
 7506929 7506930 CLJ_B2745 CLJ_B2746     TRUE 0.962 16.000 0.189 NA   NA
 7506930 7506931 CLJ_B2746 CLJ_B2747   ansA FALSE 0.294 194.000 0.003 NA   NA
 7506931 7506932 CLJ_B2747 CLJ_B2748 ansA spoIVA FALSE 0.003 706.000 0.000 NA   NA
 7506932 7506933 CLJ_B2748 CLJ_B2749 spoIVA   FALSE 0.067 338.000 0.060 NA   NA
 7506933 7506934 CLJ_B2749 CLJ_B2750   engA TRUE 0.549 173.000 0.068 1.000   NA
 7506934 7506935 CLJ_B2750 CLJ_B2751 engA   TRUE 0.967 3.000 0.061 1.000   NA
 7506935 7506936 CLJ_B2751 CLJ_B2752   phoU FALSE 0.013 538.000 0.028 NA N NA
 7506936 7506937 CLJ_B2752 CLJ_B2753 phoU pstB TRUE 0.973 30.000 0.182 NA Y NA
 7506937 7506938 CLJ_B2753 CLJ_B2754 pstB pstA_2 TRUE 0.990 13.000 0.112 0.001 Y NA
 7506938 7506939 CLJ_B2754 CLJ_B2755 pstA_2 pstC TRUE 0.998 0.000 0.907 0.001 Y NA
 7506939 7506940 CLJ_B2755 CLJ_B2756 pstC pstS TRUE 0.735 208.000 0.206 1.000 Y NA
 7506940 7506941 CLJ_B2756 CLJ_B2757 pstS   FALSE 0.188 248.000 0.028 1.000 N NA
 7506941 7506942 CLJ_B2757 CLJ_B2758     TRUE 0.988 12.000 0.110 1.000 Y NA
 7506942 7506943 CLJ_B2758 CLJ_B2759     TRUE 0.938 11.000 0.018 NA   NA
 7506943 7506944 CLJ_B2759 CLJ_B2760   nrdR FALSE 0.024 398.000 0.013 NA   NA
 7506944 7506945 CLJ_B2760 CLJ_B2761 nrdR   TRUE 0.572 131.000 0.005 NA   NA
 7506945 7506946 CLJ_B2761 CLJ_B2762   sigG TRUE 0.587 146.000 0.026 NA   NA
 7506946 7506947 CLJ_B2762 CLJ_B2763 sigG sigE TRUE 0.962 75.000 0.602 0.007 Y NA
 7506947 7506948 CLJ_B2763 CLJ_B2764 sigE spoIIGA TRUE 0.987 12.000 0.856 1.000   NA
 7506948 7506949 CLJ_B2764 CLJ_B2765 spoIIGA ftsZ FALSE 0.070 313.000 0.024 1.000   NA
 7506949 7506950 CLJ_B2765 CLJ_B2766 ftsZ ftsA TRUE 0.989 23.000 0.460 1.000 Y NA
 7506950 7506951 CLJ_B2766 CLJ_B2767 ftsA   FALSE 0.506 157.000 0.008 NA N NA
 7506953 7506954 CLJ_B2769 CLJ_B2770 pilT aroE TRUE 0.965 2.000 0.028 1.000 N NA
 7506954 7506955 CLJ_B2770 CLJ_B2771 aroE sigK TRUE 0.646 139.000 0.025 1.000 N NA
 7506955 7506956 CLJ_B2771 CLJ_B2772 sigK   FALSE 0.009 426.000 0.000 NA   NA
 7506956 7506957 CLJ_B2772 CLJ_B2773     FALSE 0.463 63.000 0.000 NA   NA
 7506957 7506958 CLJ_B2773 CLJ_B2774     FALSE 0.003 1383.000 0.000 NA   NA
 7506958 7506959 CLJ_B2774 CLJ_B2775     FALSE 0.425 79.000 0.000 NA   NA
 7506959 7506960 CLJ_B2775 CLJ_B2776     FALSE 0.027 318.000 0.000 NA   NA
 7506960 7506961 CLJ_B2776 CLJ_B2777     FALSE 0.010 407.000 0.000 NA   NA
 7506961 7506962 CLJ_B2777 CLJ_B2778     TRUE 0.791 23.000 0.000 NA   NA
 7506962 7506963 CLJ_B2778 CLJ_B2779     TRUE 0.869 11.000 0.000 NA   NA
 7506963 7506964 CLJ_B2779 CLJ_B2780     TRUE 0.993 -19.000 0.500 NA   NA
 7506964 7506965 CLJ_B2780 CLJ_B2781     FALSE 0.014 390.000 0.000 1.000   NA
 7506967 7506968 CLJ_B2783 CLJ_B2784   udk TRUE 0.637 86.000 0.012 1.000 N NA
 7506968 7506969 CLJ_B2784 CLJ_B2785 udk   TRUE 0.713 148.000 0.100 1.000 N NA
 7506969 7506970 CLJ_B2785 CLJ_B2786     TRUE 0.985 -7.000 0.146 1.000   NA
 7506970 7506971 CLJ_B2786 CLJ_B2787     TRUE 0.705 83.000 0.067 NA   NA
 7506971 7506972 CLJ_B2787 CLJ_B2788   typA TRUE 0.615 78.000 0.012 NA   NA
 7506972 7506973 CLJ_B2788 CLJ_B2789 typA   FALSE 0.007 647.000 0.004 1.000   NA
 7506973 7506974 CLJ_B2789 CLJ_B2790     TRUE 0.891 48.000 0.289 1.000   NA
 7506974 7506975 CLJ_B2790 CLJ_B2791     TRUE 0.789 122.000 0.211 NA   NA
 7506975 7506976 CLJ_B2791 CLJ_B2792     TRUE 0.943 14.000 0.047 NA   NA
 7506976 7506977 CLJ_B2792 CLJ_B2793     TRUE 0.597 208.000 0.537 NA   NA
 7506977 7506978 CLJ_B2793 CLJ_B2794   alaS TRUE 0.744 115.000 0.110 NA   NA
 7506978 7506979 CLJ_B2794 CLJ_B2795 alaS   FALSE 0.013 496.000 0.015 NA   NA
 7506979 7506980 CLJ_B2795 CLJ_B2796     TRUE 0.969 13.000 0.209 NA   NA
 7506980 7506981 CLJ_B2796 CLJ_B2797     FALSE 0.362 181.000 0.008 NA   NA
 7506981 7506982 CLJ_B2797 CLJ_B2798   iscS TRUE 0.967 2.000 0.035 1.000 N NA
 7506982 7506983 CLJ_B2798 CLJ_B2799 iscS   TRUE 0.984 -7.000 0.125 NA N NA
 7506983 7506984 CLJ_B2799 CLJ_B2800     FALSE 0.265 221.000 0.025 NA N NA
 7506984 7506985 CLJ_B2800 CLJ_B2801   hisJ TRUE 0.618 168.000 0.041 0.008 N NA
 7506985 7506986 CLJ_B2801 CLJ_B2802 hisJ   TRUE 0.677 135.000 0.041 1.000   NA
 7506986 7506987 CLJ_B2802 CLJ_B2803     TRUE 0.767 108.000 0.143 NA   NA
 7506989 7506990 CLJ_B2805 CLJ_B2806     TRUE 0.871 122.000 0.031 1.000 Y NA
 7506990 7506991 CLJ_B2806 CLJ_B2807     FALSE 0.021 715.000 0.000 0.002 Y NA
 7506993 7506994 CLJ_B2809 CLJ_B2810     FALSE 0.016 363.000 0.000 NA   NA
 7506994 7506995 CLJ_B2810 CLJ_B2811     FALSE 0.181 206.000 0.000 1.000 N NA
 7506995 7506996 CLJ_B2811 CLJ_B2812     TRUE 0.985 -3.000 0.182 1.000 N NA
 7506996 7506997 CLJ_B2812 CLJ_B2813     TRUE 0.984 5.000 0.400 1.000   NA
 7506997 7506998 CLJ_B2813 CLJ_B2814     TRUE 0.944 6.000 0.011 1.000   NA
 7506998 7506999 CLJ_B2814 CLJ_B2815     TRUE 0.973 17.000 0.011 NA Y NA
 7506999 7507000 CLJ_B2815 CLJ_B2816     TRUE 0.977 -16.000 0.026 NA N NA
 7507000 7507001 CLJ_B2816 CLJ_B2817     TRUE 0.966 41.000 0.250 1.000 Y NA
 7507001 7507002 CLJ_B2817 CLJ_B2818     TRUE 0.900 41.000 0.143 0.042   NA
 7507002 7507003 CLJ_B2818 CLJ_B2819     TRUE 0.975 4.000 0.143 1.000   NA
 7507003 7507004 CLJ_B2819 CLJ_B2820     TRUE 0.956 9.000 0.044 1.000   NA
 7507004 7507005 CLJ_B2820 CLJ_B2821     TRUE 0.964 -3.000 0.011 1.000   NA
 7507005 7507006 CLJ_B2821 CLJ_B2822     TRUE 0.909 19.000 0.011 1.000   NA
 7507006 7507007 CLJ_B2822 CLJ_B2823   argF FALSE 0.008 466.000 0.000 1.000 N NA
 7507007 7507008 CLJ_B2823 CLJ_B2824 argF arcC TRUE 0.947 95.000 0.500 1.000 Y NA
 7507008 7507009 CLJ_B2824 CLJ_B2825 arcC glyA FALSE 0.023 564.000 0.000 1.000 Y NA
 7507010 7507011 CLJ_B2826 CLJ_B2827     TRUE 0.923 -3.000 0.000 NA   NA
 7507012 7507013 CLJ_B2828 CLJ_B2829     FALSE 0.444 199.000 0.095 NA   NA
 7507014 7507015 CLJ_B2830 CLJ_B2831     FALSE 0.010 412.000 0.000 NA   NA
 7507015 7507016 CLJ_B2831 CLJ_B2832     TRUE 0.813 75.000 0.185 1.000 N NA
 7507016 7507017 CLJ_B2832 CLJ_B2833     TRUE 0.671 154.000 0.111 NA   NA
 7507017 7507018 CLJ_B2833 CLJ_B2834     FALSE 0.021 339.000 0.000 NA   NA
 7507019 7507020 CLJ_B2835 CLJ_B2836     TRUE 0.978 -9.000 0.034 1.000 N NA
 7507020 7507021 CLJ_B2836 CLJ_B2837     FALSE 0.091 246.000 0.000 1.000 N NA
 7507021 7507022 CLJ_B2837 CLJ_B2838   hprK TRUE 0.973 -7.000 0.006 0.097 N NA
 7507022 7507023 CLJ_B2838 CLJ_B2839 hprK   TRUE 0.836 32.000 0.018 NA   NA
 7507023 7507024 CLJ_B2839 CLJ_B2840     FALSE 0.262 171.000 0.000 NA   NA
 7507024 7507025 CLJ_B2840 CLJ_B2841     TRUE 0.987 -34.000 0.130 NA   NA
 7507025 7507026 CLJ_B2841 CLJ_B2842     TRUE 0.798 109.000 0.222 NA   NA
 7507026 7507027 CLJ_B2842 CLJ_B2843     TRUE 0.970 0.000 0.049 NA   NA
 7507027 7507028 CLJ_B2843 CLJ_B2844     TRUE 0.983 -22.000 0.073 NA   NA
 7507028 7507029 CLJ_B2844 CLJ_B2845     TRUE 0.986 -3.000 0.273 NA   NA
 7507029 7507030 CLJ_B2845 CLJ_B2846   glpX FALSE 0.012 397.000 0.000 NA   NA
 7507032 7507033 CLJ_B2848 CLJ_B2849     FALSE 0.007 455.000 0.000 NA   NA
 7507033 7507034 CLJ_B2849 CLJ_B2850     FALSE 0.028 315.000 0.000 NA   NA
 7507034 7507035 CLJ_B2850 CLJ_B2851     FALSE 0.003 1041.000 0.000 NA   NA
 7507035 7507036 CLJ_B2851 CLJ_B2852   def_3 TRUE 0.945 18.000 0.065 1.000 N NA
 7507036 7507037 CLJ_B2852 CLJ_B2853 def_3   FALSE 0.006 553.000 0.000 1.000 N NA
 7507037 7507038 CLJ_B2853 CLJ_B2854     TRUE 0.982 29.000 0.238 0.005 Y NA
 7507038 7507039 CLJ_B2854 CLJ_B2855     TRUE 0.998 -7.000 0.776 0.005 Y NA
 7507039 7507040 CLJ_B2855 CLJ_B2856     TRUE 0.994 14.000 0.462 0.005 Y NA
 7507040 7507041 CLJ_B2856 CLJ_B2857     TRUE 0.997 -7.000 0.487 0.005 Y NA
 7507041 7507042 CLJ_B2857 CLJ_B2858     TRUE 0.992 15.000 0.258 0.005 Y NA
 7507042 7507043 CLJ_B2858 CLJ_B2859     TRUE 0.948 39.000 0.489 0.005   NA
 7507043 7507044 CLJ_B2859 CLJ_B2860     TRUE 0.989 13.000 0.848 0.005   NA
 7507044 7507045 CLJ_B2860 CLJ_B2861     TRUE 0.989 -13.000 0.132 0.005   NA
 7507045 7507046 CLJ_B2861 CLJ_B2862     FALSE 0.021 351.000 0.000 1.000   NA
 7507046 7507047 CLJ_B2862 CLJ_B2863     TRUE 0.968 -25.000 0.002 NA   NA
 7507047 7507048 CLJ_B2863 CLJ_B2864     FALSE 0.394 170.000 0.002 NA   NA
 7507048 7507049 CLJ_B2864 CLJ_B2865     TRUE 0.963 23.000 0.312 1.000   NA
 7507049 7507050 CLJ_B2865 CLJ_B2866     TRUE 0.827 38.000 0.026 1.000   NA
 7507052 7507053 CLJ_B2868 CLJ_B2869     FALSE 0.015 371.000 0.000 NA   NA
 7507053 7507054 CLJ_B2869 CLJ_B2870     TRUE 0.941 55.000 0.088 0.002 Y NA
 7507054 7507055 CLJ_B2870 CLJ_B2871     TRUE 0.679 66.000 0.027 NA   NA
 7507055 7507056 CLJ_B2871 CLJ_B2872     TRUE 0.804 78.000 0.222 NA   NA
 7507056 7507057 CLJ_B2872 CLJ_B2873   fliA TRUE 0.879 29.000 0.029 1.000   NA
 7507057 7507058 CLJ_B2873 CLJ_B2874 fliA   TRUE 0.951 14.000 0.062 NA N NA
 7507058 7507059 CLJ_B2874 CLJ_B2875   flhG TRUE 0.956 15.000 0.094 NA N NA
 7507059 7507060 CLJ_B2875 CLJ_B2876 flhG flhF TRUE 0.990 -6.000 0.382 1.000 N NA
 7507060 7507061 CLJ_B2876 CLJ_B2877 flhF flhA TRUE 0.996 -3.000 0.440 1.000 Y NA
 7507061 7507062 CLJ_B2877 CLJ_B2878 flhA   TRUE 0.983 28.000 0.207 0.002 Y NA
 7507062 7507063 CLJ_B2878 CLJ_B2879   fliQ TRUE 0.972 34.000 0.114 0.002 Y NA
 7507063 7507064 CLJ_B2879 CLJ_B2880 fliQ fliP TRUE 0.992 12.000 0.162 0.002 Y NA
 7507064 7507065 CLJ_B2880 CLJ_B2881 fliP   TRUE 0.997 -16.000 0.386 1.000 Y NA
 7507065 7507066 CLJ_B2881 CLJ_B2882   fliL TRUE 0.876 73.000 0.023 1.000 Y NA
 7507066 7507067 CLJ_B2882 CLJ_B2883 fliL motB_2 TRUE 0.996 -3.000 0.314 1.000 Y NA
 7507067 7507068 CLJ_B2883 CLJ_B2884 motB_2 motA_2 TRUE 0.996 -7.000 0.350 1.000 Y NA
 7507068 7507069 CLJ_B2884 CLJ_B2885 motA_2   TRUE 0.996 -3.000 0.301 NA Y NA
 7507069 7507070 CLJ_B2885 CLJ_B2886     FALSE 0.526 234.000 0.077 NA Y NA
 7507070 7507071 CLJ_B2886 CLJ_B2887     TRUE 0.741 82.000 0.100 NA   NA
 7507071 7507072 CLJ_B2887 CLJ_B2888   flgD TRUE 0.946 15.000 0.064 NA   NA
 7507072 7507073 CLJ_B2888 CLJ_B2889 flgD fliK TRUE 0.838 30.000 0.012 NA   NA
 7507073 7507074 CLJ_B2889 CLJ_B2890 fliK fliJ TRUE 0.955 6.000 0.006 0.004   NA
 7507074 7507075 CLJ_B2890 CLJ_B2891 fliJ fliI TRUE 0.929 104.000 0.241 1.000 Y NA
 7507075 7507076 CLJ_B2891 CLJ_B2892 fliI fliH TRUE 0.971 40.000 0.379 NA Y NA
 7507076 7507077 CLJ_B2892 CLJ_B2893 fliH fliG TRUE 0.997 -16.000 0.308 NA Y NA
 7507077 7507078 CLJ_B2893 CLJ_B2894 fliG fliF TRUE 0.995 7.000 0.477 0.004 Y NA
 7507078 7507079 CLJ_B2894 CLJ_B2895 fliF fliE TRUE 0.988 16.000 0.112 0.004 Y NA
 7507079 7507080 CLJ_B2895 CLJ_B2896 fliE flgC TRUE 0.990 12.000 0.095 0.002 Y NA
 7507080 7507081 CLJ_B2896 CLJ_B2897 flgC flgB TRUE 0.966 98.000 0.804 0.002 Y NA
 7507081 7507082 CLJ_B2897 CLJ_B2898 flgB   FALSE 0.007 573.000 0.000 0.004   NA
 7507082 7507083 CLJ_B2898 CLJ_B2899     TRUE 0.742 145.000 0.182 NA   NA
 7507083 7507084 CLJ_B2899 CLJ_B2900   argH FALSE 0.005 543.000 0.000 NA   NA
 7507084 7507085 CLJ_B2900 CLJ_B2901 argH argG TRUE 0.987 22.000 0.278 1.000 Y NA
 7507085 7507086 CLJ_B2901 CLJ_B2902 argG   FALSE 0.039 294.000 0.000 NA   NA
 7507086 7507087 CLJ_B2902 CLJ_B2903     TRUE 0.974 23.000 0.667 NA   NA
 7507087 7507088 CLJ_B2903 CLJ_B2904   cls FALSE 0.226 180.000 0.000 NA   NA
 7507090 7507091 CLJ_B2906 CLJ_B2907     FALSE 0.037 295.000 0.000 NA   NA
 7507091 7507092 CLJ_B2907 CLJ_B2908     FALSE 0.070 251.000 0.000 NA   NA
 7507092 7507093 CLJ_B2908 CLJ_B2909     TRUE 0.647 40.000 0.000 1.000   NA
 7507093 7507094 CLJ_B2909 CLJ_B2910     TRUE 0.932 29.000 0.000 1.000 Y NA
 7507094 7507095 CLJ_B2910 CLJ_B2911     TRUE 0.959 32.000 0.051 1.000 Y NA
 7507095 7507096 CLJ_B2911 CLJ_B2912     TRUE 0.952 15.000 0.091 NA   NA
 7507096 7507097 CLJ_B2912 CLJ_B2913     TRUE 0.673 34.000 0.000 NA   NA
 7507097 7507098 CLJ_B2913 CLJ_B2914     TRUE 0.746 27.000 0.000 NA   NA
 7507098 7507099 CLJ_B2914 CLJ_B2915   glf TRUE 0.958 0.000 0.012 NA   NA
 7507099 7507100 CLJ_B2915 CLJ_B2916 glf   TRUE 0.852 105.000 0.012 NA Y NA
 7507100 7507101 CLJ_B2916 CLJ_B2917     FALSE 0.152 211.000 0.000 NA N NA
 7507101 7507102 CLJ_B2917 CLJ_B2918     TRUE 0.846 19.000 0.000 1.000 N NA
 7507102 7507103 CLJ_B2918 CLJ_B2919     TRUE 0.979 16.000 0.027 1.000 Y NA
 7507103 7507104 CLJ_B2919 CLJ_B2920     TRUE 0.939 35.000 0.400 NA N NA
 7507104 7507105 CLJ_B2920 CLJ_B2921     FALSE 0.007 465.000 0.000 NA   NA
 7507105 7507106 CLJ_B2921 CLJ_B2922     FALSE 0.350 150.000 0.000 NA   NA
 7507106 7507107 CLJ_B2922 CLJ_B2923     TRUE 0.897 121.000 1.000 NA   NA
 7507107 7507108 CLJ_B2923 CLJ_B2924     FALSE 0.386 140.000 0.000 NA   NA
 7507108 7507109 CLJ_B2924 CLJ_B2925     FALSE 0.174 198.000 0.000 NA   NA
 7507109 7507110 CLJ_B2925 CLJ_B2926   fliC TRUE 0.824 77.000 0.250 1.000   NA
 7507110 7507111 CLJ_B2926 CLJ_B2927 fliC   FALSE 0.212 196.000 0.000 1.000 N NA
 7507111 7507112 CLJ_B2927 CLJ_B2928     FALSE 0.003 691.000 0.000 NA   NA
 7507112 7507113 CLJ_B2928 CLJ_B2929     FALSE 0.030 308.000 0.000 NA   NA
 7507113 7507114 CLJ_B2929 CLJ_B2930     FALSE 0.007 508.000 0.000 1.000 N NA
 7507114 7507115 CLJ_B2930 CLJ_B2931     FALSE 0.440 86.000 0.000 1.000   NA
 7507115 7507116 CLJ_B2931 CLJ_B2932     FALSE 0.510 58.000 0.000 1.000   NA
 7507116 7507117 CLJ_B2932 CLJ_B2933     TRUE 0.826 20.000 0.000 1.000   NA
 7507117 7507118 CLJ_B2933 CLJ_B2934     FALSE 0.451 79.000 0.000 1.000   NA
 7507118 7507119 CLJ_B2934 CLJ_B2935     TRUE 0.632 39.000 0.000 NA   NA
 7507119 7507120 CLJ_B2935 CLJ_B2936     TRUE 0.863 12.000 0.000 NA   NA
 7507120 7507121 CLJ_B2936 CLJ_B2937     FALSE 0.064 259.000 0.000 NA   NA
 7507121 7507122 CLJ_B2937 CLJ_B2938     TRUE 0.942 -22.000 0.000 NA   NA
 7507122 7507123 CLJ_B2938 CLJ_B2939     TRUE 0.722 29.000 0.000 NA   NA
 7507123 7507124 CLJ_B2939 CLJ_B2940     TRUE 0.935 -10.000 0.000 NA   NA
 7507124 7507125 CLJ_B2940 CLJ_B2941     TRUE 0.856 13.000 0.000 NA   NA
 7507125 7507126 CLJ_B2941 CLJ_B2942     TRUE 0.636 41.000 0.000 1.000   NA
 7507126 7507127 CLJ_B2942 CLJ_B2943     TRUE 0.892 6.000 0.000 1.000   NA
 7507127 7507128 CLJ_B2943 CLJ_B2944     TRUE 0.861 16.000 0.000 1.000 N NA
 7507128 7507129 CLJ_B2944 CLJ_B2945     TRUE 0.532 59.000 0.000 1.000 N NA
 7507129 7507130 CLJ_B2945 CLJ_B2946     TRUE 0.553 52.000 0.000 1.000   NA
 7507130 7507131 CLJ_B2946 CLJ_B2947     FALSE 0.091 238.000 0.000 1.000   NA
 7507131 7507132 CLJ_B2947 CLJ_B2948     TRUE 0.860 142.000 0.037 1.000 Y NA
 7507132 7507133 CLJ_B2948 CLJ_B2949     TRUE 0.717 124.000 0.069 1.000   NA
 7507133 7507134 CLJ_B2949 CLJ_B2950     TRUE 0.911 49.000 0.468 1.000   NA
 7507134 7507135 CLJ_B2950 CLJ_B2951     FALSE 0.143 221.000 0.000 1.000 N NA
 7507135 7507136 CLJ_B2951 CLJ_B2952     TRUE 0.851 120.000 0.267 0.002   NA
 7507136 7507137 CLJ_B2952 CLJ_B2953     TRUE 0.636 41.000 0.000 1.000   NA
 7507137 7507138 CLJ_B2953 CLJ_B2954     TRUE 0.875 9.000 0.000 NA   NA
 7507138 7507139 CLJ_B2954 CLJ_B2955     TRUE 0.968 5.000 0.095 NA   NA
 7507139 7507140 CLJ_B2955 CLJ_B2956     TRUE 0.772 25.000 0.000 NA   NA
 7507140 7507141 CLJ_B2956 CLJ_B2957     FALSE 0.347 224.000 0.105 1.000   NA
 7507141 7507142 CLJ_B2957 CLJ_B2958     TRUE 0.724 216.000 0.133 0.002 Y NA
 7507142 7507143 CLJ_B2958 CLJ_B2959     TRUE 0.732 151.000 0.200 NA   NA
 7507143 7507144 CLJ_B2959 CLJ_B2960   fliD TRUE 0.896 27.000 0.043 NA   NA
 7507144 7507145 CLJ_B2960 CLJ_B2961 fliD fliS TRUE 0.958 63.000 0.370 0.001 Y NA
 7507145 7507146 CLJ_B2961 CLJ_B2962 fliS   TRUE 0.876 37.000 0.093 NA   NA
 7507146 7507147 CLJ_B2962 CLJ_B2963     TRUE 0.727 55.000 0.028 NA   NA
 7507147 7507148 CLJ_B2963 CLJ_B2964   csrA TRUE 0.933 16.000 0.028 NA N NA
 7507148 7507149 CLJ_B2964 CLJ_B2965 csrA fliW TRUE 0.977 0.000 0.096 NA   NA
 7507149 7507150 CLJ_B2965 CLJ_B2966 fliW flgL TRUE 0.854 67.000 0.385 NA   NA
 7507150 7507151 CLJ_B2966 CLJ_B2967 flgL flgK TRUE 0.985 18.000 0.071 0.001 Y NA
 7507151 7507152 CLJ_B2967 CLJ_B2968 flgK   FALSE 0.183 289.000 0.082 0.001   NA
 7507152 7507153 CLJ_B2968 CLJ_B2969     TRUE 0.991 0.000 0.421 0.002   NA
 7507153 7507154 CLJ_B2969 CLJ_B2970   fliN FALSE 0.006 497.000 0.000 1.000   NA
 7507154 7507155 CLJ_B2970 CLJ_B2971 fliN fliM TRUE 0.998 -7.000 0.508 0.001 Y NA
 7507155 7507156 CLJ_B2971 CLJ_B2972 fliM   TRUE 0.971 28.000 0.039 0.010 Y NA
 7507156 7507157 CLJ_B2972 CLJ_B2973   cheY TRUE 0.944 100.000 0.417 1.000 Y NA
 7507157 7507158 CLJ_B2973 CLJ_B2974 cheY cheC TRUE 0.970 28.000 0.082 NA Y NA
 7507158 7507159 CLJ_B2974 CLJ_B2975 cheC cheA TRUE 0.979 26.000 0.176 NA Y NA
 7507159 7507160 CLJ_B2975 CLJ_B2976 cheA cheR TRUE 0.986 13.000 0.081 1.000 Y NA
 7507160 7507161 CLJ_B2976 CLJ_B2977 cheR cheB TRUE 0.986 15.000 0.107 1.000 Y NA
 7507161 7507162 CLJ_B2977 CLJ_B2978 cheB cheD TRUE 0.978 23.000 0.070 1.000 Y NA
 7507162 7507163 CLJ_B2978 CLJ_B2979 cheD cheW TRUE 0.982 17.000 0.063 1.000 Y NA
 7507163 7507164 CLJ_B2979 CLJ_B2980 cheW   TRUE 0.968 16.000 0.231 NA N NA
 7507164 7507165 CLJ_B2980 CLJ_B2981     FALSE 0.077 253.000 0.000 NA N NA
 7507165 7507166 CLJ_B2981 CLJ_B2982     TRUE 0.821 83.000 0.273 1.000   NA
 7507166 7507167 CLJ_B2982 CLJ_B2983     FALSE 0.079 249.000 0.000 1.000   NA
 7507167 7507168 CLJ_B2983 CLJ_B2984     TRUE 0.908 127.000 0.082 0.041 Y NA
 7507168 7507169 CLJ_B2984 CLJ_B2985     FALSE 0.065 257.000 0.000 NA   NA
 7507169 7507170 CLJ_B2985 CLJ_B2986     FALSE 0.062 261.000 0.000 NA   NA
 7507170 7507171 CLJ_B2986 CLJ_B2987     FALSE 0.055 267.000 0.000 NA   NA
 7507171 7507172 CLJ_B2987 CLJ_B2988   murG FALSE 0.005 631.000 0.000 1.000 N NA
 7507174 7507175 CLJ_B2990 CLJ_B2991   recJ FALSE 0.006 519.000 0.000 1.000 N NA
 7507180 7507181 CLJ_B2996 CLJ_B2997     TRUE 0.640 68.000 0.008 1.000   NA
 7507182 7507183 CLJ_B2998 CLJ_B2999 glpP   TRUE 0.762 49.000 0.018 1.000 N NA
 7507183 7507184 CLJ_B2999 CLJ_B3000     TRUE 0.962 74.000 0.552 0.001 Y NA
 7507184 7507185 CLJ_B3000 CLJ_B3001     FALSE 0.016 366.000 0.000 NA   NA
 7507186 7507187 CLJ_B3002 CLJ_B3003     TRUE 0.975 13.000 0.333 NA   NA
 7507187 7507188 CLJ_B3003 CLJ_B3004     FALSE 0.007 462.000 0.000 NA   NA
 7507188 7507189 CLJ_B3004 CLJ_B3005     TRUE 0.810 20.000 0.000 NA   NA
 7507190 7507191 CLJ_B3006 CLJ_B3007   galE TRUE 0.640 38.000 0.000 NA   NA
 7507191 7507192 CLJ_B3007 CLJ_B3008 galE   FALSE 0.023 353.000 0.000 1.000 N NA
 7507192 7507193 CLJ_B3008 CLJ_B3009     FALSE 0.066 268.000 0.000 1.000 N NA
 7507193 7507194 CLJ_B3009 CLJ_B3010     FALSE 0.005 620.000 0.000 1.000 N NA
 7507196 7507197 CLJ_B3012 CLJ_B3013 glpK glpF FALSE 0.300 240.000 0.131 1.000 N NA
 7507199 7507200 CLJ_B3015 CLJ_B3016     TRUE 0.978 -16.000 0.038 NA   NA
 7507200 7507201 CLJ_B3016 CLJ_B3017     TRUE 0.985 6.000 0.419 1.000 N NA
 7507201 7507202 CLJ_B3017 CLJ_B3018     FALSE 0.477 174.000 0.027 NA N NA
 7507208 7507209 CLJ_B3024 CLJ_B3025 gerAC   TRUE 0.996 -31.000 1.000 0.004   NA
 7507209 7507210 CLJ_B3025 CLJ_B3026   gerAA TRUE 0.994 -19.000 0.500 0.004   NA
 7507210 7507211 CLJ_B3026 CLJ_B3027 gerAA   FALSE 0.042 289.000 0.000 NA   NA
 7507211 7507212 CLJ_B3027 CLJ_B3028     FALSE 0.013 385.000 0.000 NA   NA
 7507212 7507213 CLJ_B3028 CLJ_B3029     FALSE 0.145 220.000 0.000 1.000 N NA
 7507213 7507214 CLJ_B3029 CLJ_B3030     TRUE 0.585 77.000 0.004 NA   NA
 7507216 7507217 CLJ_B3032 CLJ_B3033     TRUE 0.528 197.000 0.000 1.000 Y NA
 7507219 7507220 CLJ_B3035 CLJ_B3036     FALSE 0.012 402.000 0.000 1.000   NA
 7507220 7507221 CLJ_B3036 CLJ_B3037     FALSE 0.054 268.000 0.000 NA   NA
 7507221 7507222 CLJ_B3037 CLJ_B3038     FALSE 0.409 132.000 0.000 NA   NA
 7507222 7507223 CLJ_B3038 CLJ_B3039     TRUE 0.772 25.000 0.000 NA   NA
 7507223 7507224 CLJ_B3039 CLJ_B3040     FALSE 0.005 519.000 0.000 NA   NA
 7507224 7507225 CLJ_B3040 CLJ_B3041   nrdB FALSE 0.020 345.000 0.000 NA   NA
 7507225 7507226 CLJ_B3041 CLJ_B3042 nrdB nrdA TRUE 0.855 196.000 0.393 0.001 Y NA
 7507227 7507228 CLJ_B3043 CLJ_B3044     FALSE 0.306 237.000 0.167 NA   NA
 7507229 7507230 CLJ_B3045 CLJ_B3046 dinB   FALSE 0.009 465.000 0.000 1.000 N NA
 7507230 7507231 CLJ_B3046 CLJ_B3047     TRUE 0.975 0.000 0.062 1.000 N NA
 7507231 7507232 CLJ_B3047 CLJ_B3048   pyrR FALSE 0.010 446.000 0.000 1.000 N NA
 7507232 7507233 CLJ_B3048 CLJ_B3049 pyrR   FALSE 0.024 328.000 0.000 NA   NA
 7507233 7507234 CLJ_B3049 CLJ_B3050     FALSE 0.005 515.000 0.000 NA   NA
 7507234 7507235 CLJ_B3050 CLJ_B3051     FALSE 0.316 158.000 0.000 NA   NA
 7507235 7507236 CLJ_B3051 CLJ_B3052     TRUE 0.979 18.000 0.571 1.000 N NA
 7507236 7507237 CLJ_B3052 CLJ_B3053     FALSE 0.012 416.000 0.000 1.000 N NA
 7507237 7507238 CLJ_B3053 CLJ_B3054     FALSE 0.484 173.000 0.034 NA   NA
 7507238 7507239 CLJ_B3054 CLJ_B3055     FALSE 0.004 573.000 0.000 NA   NA
 7507239 7507240 CLJ_B3055 CLJ_B3056     FALSE 0.004 712.000 0.000 1.000 N NA
 7507241 7507242 CLJ_B3057 CLJ_B3058     TRUE 0.872 132.000 0.667 NA   NA
 7507243 7507244 CLJ_B3059 CLJ_B3060   nagB FALSE 0.365 229.000 0.000 1.000 Y NA
 7507244 7507245 CLJ_B3060 CLJ_B3061 nagB nagA TRUE 0.944 83.000 0.273 0.001 Y NA
 7507245 7507246 CLJ_B3061 CLJ_B3062 nagA   TRUE 0.812 161.000 0.545 1.000 N NA
 7507249 7507250 CLJ_B3065 CLJ_B3066 nagE   FALSE 0.008 479.000 0.000 1.000 N NA
 7507251 7507252 CLJ_B3067 CLJ_B3068     TRUE 0.995 2.000 0.465 1.000 Y NA
 7507252 7507253 CLJ_B3068 CLJ_B3069     TRUE 0.678 90.000 0.028 1.000 N NA
 7507255 7507256 CLJ_B3071 CLJ_B3072     FALSE 0.108 234.000 0.000 1.000 N NA
 7507256 7507257 CLJ_B3072 CLJ_B3073     TRUE 0.915 59.000 0.571 0.031 N NA
 7507257 7507258 CLJ_B3073 CLJ_B3074     FALSE 0.005 515.000 0.000 NA   NA
 7507258 7507259 CLJ_B3074 CLJ_B3075     FALSE 0.116 222.000 0.000 NA   NA
 7507260 7507261 CLJ_B3076 CLJ_B3077     FALSE 0.441 73.000 0.000 NA   NA
 7507261 7507262 CLJ_B3077 CLJ_B3078     TRUE 0.647 37.000 0.000 NA   NA
 7507262 7507263 CLJ_B3078 CLJ_B3079     TRUE 0.998 -13.000 0.812 0.008 Y NA
 7507263 7507264 CLJ_B3079 CLJ_B3080     TRUE 0.773 169.000 0.583 NA   NA
 7507264 7507265 CLJ_B3080 CLJ_B3081     FALSE 0.004 575.000 0.000 NA   NA
 7507265 7507266 CLJ_B3081 CLJ_B3082     TRUE 0.875 9.000 0.000 NA   NA
 7507267 7507268 CLJ_B3083 CLJ_B3084     FALSE 0.134 219.000 0.000 1.000   NA
 7507268 7507269 CLJ_B3084 CLJ_B3085     TRUE 0.996 5.000 0.800 0.031 Y NA
 7507269 7507270 CLJ_B3085 CLJ_B3086     TRUE 0.998 -3.000 0.800 0.022 Y NA
 7507272 7507273 CLJ_B3088 CLJ_B3089     FALSE 0.415 115.000 0.000 NA   NA
 7507273 7507274 CLJ_B3089 CLJ_B3090     FALSE 0.004 646.000 0.000 NA   NA
 7507274 7507275 CLJ_B3090 CLJ_B3091     TRUE 0.709 30.000 0.000 NA   NA
 7507277 7507278 CLJ_B3093 CLJ_B3094     FALSE 0.003 706.000 0.000 NA   NA
 7507278 7507279 CLJ_B3094 CLJ_B3095     FALSE 0.335 153.000 0.000 NA   NA
 7507279 7507280 CLJ_B3095 CLJ_B3096     TRUE 0.799 22.000 0.000 NA   NA
 7507280 7507281 CLJ_B3096 CLJ_B3097     FALSE 0.010 413.000 0.000 NA   NA
 7507281 7507282 CLJ_B3097 CLJ_B3098     FALSE 0.456 163.000 0.003 1.000   NA
 7507282 7507283 CLJ_B3098 CLJ_B3099     FALSE 0.007 472.000 0.000 NA   NA
 7507283 7507284 CLJ_B3099 CLJ_B3100     FALSE 0.016 368.000 0.000 NA   NA
 7507284 7507285 CLJ_B3100 CLJ_B3101     FALSE 0.413 125.000 0.000 NA   NA
 7507285 7507286 CLJ_B3101 CLJ_B3102     FALSE 0.463 63.000 0.000 NA   NA
 7507286 7507287 CLJ_B3102 CLJ_B3103     FALSE 0.475 60.000 0.000 NA   NA
 7507287 7507288 CLJ_B3103 CLJ_B3104     FALSE 0.414 118.000 0.000 NA   NA
 7507288 7507289 CLJ_B3104 CLJ_B3105     TRUE 0.816 19.000 0.000 NA   NA
 7507290 7507291 CLJ_B3106 CLJ_B3107     TRUE 0.746 27.000 0.000 NA   NA
 7507291 7507292 CLJ_B3107 CLJ_B3108     FALSE 0.012 394.000 0.000 NA   NA
 7507292 7507293 CLJ_B3108 CLJ_B3109     FALSE 0.011 431.000 0.000 1.000 N NA
 7507293 7507294 CLJ_B3109 CLJ_B3110     TRUE 0.980 -3.000 0.105 NA   NA
 7507294 7507295 CLJ_B3110 CLJ_B3111     FALSE 0.005 549.000 0.000 NA   NA
 7507296 7507297 CLJ_B3112 CLJ_B3113   rumA_1 FALSE 0.041 291.000 0.000 NA   NA
 7507297 7507298 CLJ_B3113 CLJ_B3114 rumA_1   FALSE 0.043 287.000 0.000 NA   NA
 7507299 7507300 CLJ_B3115 CLJ_B3116     TRUE 0.947 26.000 0.214 1.000   NA
 7507301 7507302 CLJ_B3117 CLJ_B3118 ribH   TRUE 0.724 202.000 0.054 0.002 Y NA
 7507302 7507303 CLJ_B3118 CLJ_B3119   ribE FALSE 0.247 308.000 0.051 1.000 Y NA
 7507303 7507304 CLJ_B3119 CLJ_B3120 ribE ribD TRUE 0.997 -19.000 0.456 1.000 Y NA
 7507304 7507305 CLJ_B3120 CLJ_B3122 ribD pepD_3 FALSE 0.013 402.000 0.000 1.000 N NA
 7507307 7507308 CLJ_B3124 CLJ_B3126 mgtA   FALSE 0.003 687.000 0.000 NA   NA
 7507308 7507309 CLJ_B3126 CLJ_B3127   purD FALSE 0.025 322.000 0.000 NA   NA
 7507309 7507310 CLJ_B3127 CLJ_B3128 purD purH TRUE 0.952 52.000 0.238 1.000 Y NA
 7507310 7507311 CLJ_B3128 CLJ_B3129 purH purN TRUE 0.669 226.000 0.225 1.000 Y NA
 7507311 7507312 CLJ_B3129 CLJ_B3130 purN purM TRUE 0.940 127.000 0.238 0.001 Y NA
 7507312 7507313 CLJ_B3130 CLJ_B3131 purM purF_1 TRUE 0.941 61.000 0.248 1.000 Y NA
 7507313 7507314 CLJ_B3131 CLJ_B3132 purF_1 purC TRUE 0.897 92.000 0.082 1.000 Y NA
 7507314 7507315 CLJ_B3132 CLJ_B3133 purC purE TRUE 0.991 0.000 0.035 1.000 Y NA
 7507315 7507316 CLJ_B3133 CLJ_B3135 purE   FALSE 0.005 641.000 0.000 1.000 N NA
 7507316 7507317 CLJ_B3135 CLJ_B3136     FALSE 0.022 357.000 0.000 1.000 N NA
 7507317 7507318 CLJ_B3136 CLJ_B3137     TRUE 0.907 26.000 0.033 1.000 N NA
 7507318 7507319 CLJ_B3137 CLJ_B3138     TRUE 0.953 31.000 0.443 1.000 N NA
 7507319 7507320 CLJ_B3138 CLJ_B3139     TRUE 0.953 36.000 0.049 1.000 Y NA
 7507320 7507321 CLJ_B3139 CLJ_B3140   hydA FALSE 0.025 342.000 0.000 1.000 N NA
 7507321 7507322 CLJ_B3140 CLJ_B3141 hydA   TRUE 0.906 50.000 0.012 1.000 Y NA
 7507322 7507323 CLJ_B3141 CLJ_B3142   dpaL TRUE 0.952 22.000 0.133 1.000 N NA
 7507323 7507324 CLJ_B3142 CLJ_B3143 dpaL   FALSE 0.075 261.000 0.000 1.000 N NA
 7507325 7507326 CLJ_B3144 CLJ_B3145     TRUE 0.955 15.000 0.104 NA   NA
 7507326 7507327 CLJ_B3145 CLJ_B3146     TRUE 0.985 -19.000 0.109 NA   NA
 7507327 7507328 CLJ_B3146 CLJ_B3147     TRUE 0.985 -18.000 0.109 NA   NA
 7507328 7507329 CLJ_B3147 CLJ_B3148     TRUE 0.901 26.000 0.032 NA N NA
 7507329 7507330 CLJ_B3148 CLJ_B3149     TRUE 0.976 -3.000 0.047 1.000 N NA
 7507330 7507331 CLJ_B3149 CLJ_B3150     TRUE 0.997 -3.000 0.862 1.000 Y NA
 7507331 7507332 CLJ_B3150 CLJ_B3151     TRUE 0.914 52.000 0.031 1.000 Y NA
 7507332 7507333 CLJ_B3151 CLJ_B3152     TRUE 0.846 138.000 0.500 NA   NA
 7507333 7507334 CLJ_B3152 CLJ_B3153     TRUE 0.685 128.000 0.053 NA   NA
 7507335 7507336 CLJ_B3154 CLJ_B3155     FALSE 0.012 395.000 0.000 NA   NA
 7507336 7507337 CLJ_B3155 CLJ_B3157     FALSE 0.006 589.000 0.000 0.070   NA
 7507337 7507338 CLJ_B3157 CLJ_B3158     FALSE 0.003 950.000 0.000 1.000   NA
 7507338 7507339 CLJ_B3158 CLJ_B3159   trmU_2 FALSE 0.006 502.000 0.000 1.000   NA
 7507339 7507340 CLJ_B3159 CLJ_B3160 trmU_2   TRUE 0.580 102.000 0.004 NA   NA
 7507340 7507341 CLJ_B3160 CLJ_B3161     FALSE 0.020 345.000 0.000 NA   NA
 7507341 7507342 CLJ_B3161 CLJ_B3162     TRUE 0.957 0.000 0.005 NA N NA
 7507344 7507345 CLJ_B3164 CLJ_B3165   thiC TRUE 0.890 19.000 0.003 NA   NA
 7507345 7507346 CLJ_B3165 CLJ_B3166 thiC purF_2 FALSE 0.254 211.000 0.003 1.000 N NA
 7507346 7507347 CLJ_B3166 CLJ_B3168 purF_2   FALSE 0.059 263.000 0.000 NA   NA
 7507347 7507348 CLJ_B3168 CLJ_B3169     TRUE 0.669 56.000 0.008 NA   NA
 7507348 7507349 CLJ_B3169 CLJ_B3170     TRUE 0.902 2.000 0.000 NA   NA
 7507349 7507350 CLJ_B3170 CLJ_B3171     TRUE 0.879 7.000 0.000 NA   NA
 7507350 7507351 CLJ_B3171 CLJ_B3172     TRUE 0.575 207.000 0.375 1.000 N NA
 7507354 7507355 CLJ_B3175 CLJ_B3176     FALSE 0.440 89.000 0.000 1.000   NA
 7507355 7507356 CLJ_B3176 CLJ_B3177     TRUE 0.978 23.000 0.917 NA   NA
 7507357 7507358 CLJ_B3178 CLJ_B3179     TRUE 0.772 119.000 0.167 NA   NA
 7507358 7507359 CLJ_B3179 CLJ_B3180     FALSE 0.029 309.000 0.000 NA   NA
 7507360 7507361 CLJ_B3181 CLJ_B3182     TRUE 0.941 0.000 0.000 0.049   NA
 7507364 7507365 CLJ_B3185 CLJ_B3186     FALSE 0.424 101.000 0.000 NA   NA
 7507365 7507366 CLJ_B3186 CLJ_B3187     FALSE 0.424 101.000 0.000 NA   NA
 7507368 7507369 CLJ_B3189 CLJ_B3190     FALSE 0.418 110.000 0.000 NA   NA
 7507369 7507370 CLJ_B3190 CLJ_B3191     TRUE 0.816 138.000 0.342 NA   NA
 7507370 7507371 CLJ_B3191 CLJ_B3192     TRUE 0.989 -9.000 0.283 NA   NA
 7507371 7507372 CLJ_B3192 CLJ_B3193     TRUE 0.664 76.000 0.028 NA   NA
 7507372 7507373 CLJ_B3193 CLJ_B3194   rpoD TRUE 0.661 75.000 0.026 NA   NA
 7507373 7507374 CLJ_B3194 CLJ_B3195 rpoD dnaG TRUE 0.952 25.000 0.209 1.000 N NA
 7507374 7507375 CLJ_B3195 CLJ_B3196 dnaG   FALSE 0.145 283.000 0.056 1.000 N NA
 7507377 7507378 CLJ_B3198 CLJ_B3199 ppdK   TRUE 0.646 80.000 0.019 1.000   NA
 7507378 7507379 CLJ_B3199 CLJ_B3200     FALSE 0.005 510.000 0.000 NA   NA
 7507379 7507380 CLJ_B3200 CLJ_B3201     TRUE 0.894 3.000 0.000 NA   NA
 7507380 7507381 CLJ_B3201 CLJ_B3202   era FALSE 0.011 399.000 0.000 NA   NA
 7507381 7507382 CLJ_B3202 CLJ_B3203 era cdd TRUE 0.949 16.000 0.077 1.000   NA
 7507382 7507383 CLJ_B3203 CLJ_B3204 cdd   TRUE 0.699 84.000 0.040 1.000 N NA
 7507383 7507384 CLJ_B3204 CLJ_B3205     TRUE 0.792 41.000 0.023 NA   NA
 7507384 7507385 CLJ_B3205 CLJ_B3206     TRUE 0.984 -3.000 0.182 NA   NA
 7507385 7507386 CLJ_B3206 CLJ_B3207     TRUE 0.910 23.000 0.032 NA   NA
 7507386 7507387 CLJ_B3207 CLJ_B3208   yqfC TRUE 0.994 -10.000 0.851 NA   NA
 7507387 7507388 CLJ_B3208 CLJ_B3209 yqfC   TRUE 0.650 114.000 0.029 NA   NA
 7507388 7507389 CLJ_B3209 CLJ_B3210   rpsU TRUE 0.896 43.000 0.150 0.019   NA
 7507389 7507390 CLJ_B3210 CLJ_B3211 rpsU   TRUE 0.707 137.000 0.071 1.000   NA
 7507390 7507391 CLJ_B3211 CLJ_B3212     TRUE 0.807 57.000 0.051 0.025 N NA
 7507391 7507392 CLJ_B3212 CLJ_B3213     TRUE 0.981 0.000 0.163 NA   NA
 7507392 7507393 CLJ_B3213 CLJ_B3214   prmA TRUE 0.804 98.000 0.227 NA   NA
 7507393 7507394 CLJ_B3214 CLJ_B3215 prmA dnaJ FALSE 0.079 359.000 0.133 1.000 N NA
 7507394 7507395 CLJ_B3215 CLJ_B3216 dnaJ dnaK TRUE 0.924 143.000 0.196 0.001 Y NA
 7507395 7507396 CLJ_B3216 CLJ_B3217 dnaK grpE TRUE 0.956 55.000 0.224 0.003 Y NA
 7507396 7507397 CLJ_B3217 CLJ_B3218 grpE hrcA TRUE 0.953 27.000 0.286 1.000 N NA
 7507397 7507398 CLJ_B3218 CLJ_B3219 hrcA   FALSE 0.422 201.000 0.062 1.000 N NA
 7507398 7507399 CLJ_B3219 CLJ_B3220   lepA TRUE 0.924 27.000 0.083 1.000 N NA
 7507399 7507400 CLJ_B3220 CLJ_B3221 lepA   TRUE 0.537 141.000 0.004 NA   NA
 7507400 7507401 CLJ_B3221 CLJ_B3222     TRUE 0.738 71.000 0.077 NA   NA
 7507401 7507402 CLJ_B3222 CLJ_B3223   gpr TRUE 0.702 183.000 0.521 NA   NA
 7507404 7507405 CLJ_B3225 CLJ_B3226 holA   TRUE 0.925 29.000 0.163 NA   NA
 7507405 7507406 CLJ_B3226 CLJ_B3227     TRUE 0.919 12.000 0.002 NA   NA
 7507406 7507407 CLJ_B3227 CLJ_B3228     TRUE 0.722 105.000 0.077 NA   NA
 7507407 7507408 CLJ_B3228 CLJ_B3229     FALSE 0.005 511.000 0.000 NA   NA
 7507410 7507411 CLJ_B3231 CLJ_B3232   selB FALSE 0.003 753.000 0.000 NA   NA
 7507411 7507412 CLJ_B3232 CLJ_B3233 selB selA TRUE 0.982 19.000 0.569 0.001 N NA
 7507412 7507413 CLJ_B3233 CLJ_B3234 selA   FALSE 0.453 67.000 0.000 NA   NA
 7507413 7507414 CLJ_B3234 CLJ_B3235     FALSE 0.423 106.000 0.000 NA   NA
 7507416 7507417 CLJ_B3237 CLJ_B3238     FALSE 0.200 326.000 0.047 NA Y NA
 7507417 7507418 CLJ_B3238 CLJ_B3239     TRUE 0.968 16.000 0.231 NA N NA
 7507418 7507419 CLJ_B3239 CLJ_B3240     TRUE 0.950 11.000 0.033 NA N NA
 7507419 7507420 CLJ_B3240 CLJ_B3241   nadD TRUE 0.920 83.000 0.199 1.000 Y NA
 7507420 7507421 CLJ_B3241 CLJ_B3242 nadD   FALSE 0.286 246.000 0.150 NA N NA
 7507421 7507422 CLJ_B3242 CLJ_B3243   obg TRUE 0.897 27.000 0.046 NA   NA
 7507422 7507423 CLJ_B3243 CLJ_B3244 obg rpmA FALSE 0.094 379.000 0.335 1.000   NA
 7507423 7507424 CLJ_B3244 CLJ_B3245 rpmA   TRUE 0.992 3.000 0.203 NA Y NA
 7507424 7507425 CLJ_B3245 CLJ_B3246   rplU TRUE 0.919 93.000 0.208 NA Y NA
 7507425 7507426 CLJ_B3246 CLJ_B3248 rplU   TRUE 0.880 124.000 0.018 0.016 Y NA
 7507426 7507427 CLJ_B3248 CLJ_B3249     TRUE 0.895 39.000 0.180 NA   NA
 7507427 7507428 CLJ_B3249 CLJ_B3250     TRUE 0.992 -22.000 0.420 NA   NA
 7507428 7507429 CLJ_B3250 CLJ_B3251     TRUE 0.748 113.000 0.098 1.000   NA
 7507429 7507430 CLJ_B3251 CLJ_B3252     TRUE 0.860 55.000 0.135 0.005   NA
 7507430 7507431 CLJ_B3252 CLJ_B3253   rodA_2 FALSE 0.032 320.000 0.000 1.000 N NA
 7507431 7507432 CLJ_B3253 CLJ_B3254 rodA_2 minE TRUE 0.846 99.000 0.008 NA Y NA
 7507432 7507433 CLJ_B3254 CLJ_B3255 minE minD TRUE 0.991 14.000 0.347 NA Y NA
 7507433 7507434 CLJ_B3255 CLJ_B3256 minD minC TRUE 0.990 18.000 0.368 1.000 Y NA
 7507434 7507435 CLJ_B3256 CLJ_B3257 minC   FALSE 0.525 175.000 0.060 1.000   NA
 7507435 7507436 CLJ_B3257 CLJ_B3258   mreD TRUE 0.944 20.000 0.089 1.000   NA
 7507436 7507437 CLJ_B3258 CLJ_B3259 mreD mreC TRUE 0.987 11.000 0.550 0.002   NA
 7507437 7507438 CLJ_B3259 CLJ_B3260 mreC   TRUE 0.988 7.000 0.689 1.000 N NA
 7507438 7507439 CLJ_B3260 CLJ_B3261     TRUE 0.894 29.000 0.040 1.000 N NA
 7507439 7507440 CLJ_B3261 CLJ_B3262   maf TRUE 0.952 15.000 0.074 NA N NA
 7507440 7507441 CLJ_B3262 CLJ_B3263 maf   TRUE 0.926 16.000 0.026 NA   NA
 7507441 7507442 CLJ_B3263 CLJ_B3264     TRUE 0.832 110.000 0.357 NA   NA
 7507442 7507443 CLJ_B3264 CLJ_B3265     FALSE 0.446 226.000 0.364 NA   NA
 7507445 7507446 CLJ_B3267 CLJ_B3268 pheB   TRUE 0.739 49.000 0.020 NA   NA
 7507446 7507447 CLJ_B3268 CLJ_B3269     TRUE 0.935 -10.000 0.000 NA   NA
 7507447 7507448 CLJ_B3269 CLJ_B3270     FALSE 0.213 183.000 0.000 NA   NA
 7507448 7507449 CLJ_B3270 CLJ_B3271     FALSE 0.423 98.000 0.000 NA   NA
 7507449 7507450 CLJ_B3271 CLJ_B3272   coaE TRUE 0.936 18.000 0.058 NA   NA
 7507450 7507451 CLJ_B3272 CLJ_B3273 coaE polA TRUE 0.960 12.000 0.068 1.000 N NA
 7507451 7507452 CLJ_B3273 CLJ_B3274 polA aroC TRUE 0.907 18.000 0.003 1.000 N NA
 7507452 7507453 CLJ_B3274 CLJ_B3275 aroC   FALSE 0.011 399.000 0.000 NA   NA
 7507453 7507454 CLJ_B3275 CLJ_B3276     TRUE 0.885 5.000 0.000 NA   NA
 7507454 7507455 CLJ_B3276 CLJ_B3277     FALSE 0.359 147.000 0.000 NA   NA
 7507455 7507456 CLJ_B3277 CLJ_B3278     TRUE 0.982 19.000 1.000 NA   NA
 7507456 7507457 CLJ_B3278 CLJ_B3279     TRUE 0.765 161.000 0.400 NA   NA
 7507457 7507458 CLJ_B3279 CLJ_B3280     TRUE 0.681 33.000 0.000 NA   NA
 7507458 7507459 CLJ_B3280 CLJ_B3281     FALSE 0.455 66.000 0.000 NA   NA
 7507459 7507460 CLJ_B3281 CLJ_B3282     TRUE 0.527 52.000 0.000 NA   NA
 7507460 7507461 CLJ_B3282 CLJ_B3283     TRUE 0.894 3.000 0.000 NA   NA
 7507461 7507462 CLJ_B3283 CLJ_B3284     TRUE 0.681 33.000 0.000 NA   NA
 7507462 7507463 CLJ_B3284 CLJ_B3285     TRUE 0.982 12.000 0.500 NA   NA
 7507463 7507464 CLJ_B3285 CLJ_B3286     TRUE 0.863 12.000 0.000 NA   NA
 7507464 7507465 CLJ_B3286 CLJ_B3287     TRUE 0.882 6.000 0.000 NA   NA
 7507465 7507466 CLJ_B3287 CLJ_B3288     TRUE 0.980 15.000 0.600 NA   NA
 7507466 7507467 CLJ_B3288 CLJ_B3289     TRUE 0.972 23.000 0.600 NA   NA
 7507467 7507468 CLJ_B3289 CLJ_B3290     TRUE 0.987 2.000 0.500 NA   NA
 7507468 7507469 CLJ_B3290 CLJ_B3291     TRUE 0.978 15.000 0.500 NA   NA
 7507469 7507470 CLJ_B3291 CLJ_B3292     TRUE 0.982 13.000 0.600 NA   NA
 7507470 7507471 CLJ_B3292 CLJ_B3293     TRUE 0.991 -13.000 0.400 NA   NA
 7507471 7507472 CLJ_B3293 CLJ_B3294     TRUE 0.856 13.000 0.000 NA   NA
 7507472 7507473 CLJ_B3294 CLJ_B3295     FALSE 0.217 182.000 0.000 NA   NA
 7507473 7507474 CLJ_B3295 CLJ_B3296     TRUE 0.943 35.000 0.500 NA   NA
 7507474 7507475 CLJ_B3296 CLJ_B3297     TRUE 0.982 15.000 0.750 NA   NA
 7507475 7507476 CLJ_B3297 CLJ_B3298     TRUE 0.988 5.000 0.750 NA   NA
 7507476 7507477 CLJ_B3298 CLJ_B3299     TRUE 0.988 6.000 0.750 NA   NA
 7507477 7507478 CLJ_B3299 CLJ_B3300     TRUE 0.988 5.000 0.750 NA   NA
 7507478 7507479 CLJ_B3300 CLJ_B3301     TRUE 0.989 0.000 0.500 NA   NA
 7507479 7507480 CLJ_B3301 CLJ_B3302     FALSE 0.003 687.000 0.000 NA   NA
 7507480 7507481 CLJ_B3302 CLJ_B3303     TRUE 0.840 114.000 0.400 NA   NA
 7507481 7507482 CLJ_B3303 CLJ_B3304     TRUE 0.923 57.000 1.000 NA   NA
 7507482 7507483 CLJ_B3304 CLJ_B3305     TRUE 0.994 -10.000 1.000 NA   NA
 7507483 7507484 CLJ_B3305 CLJ_B3306     TRUE 0.877 94.000 0.667 NA   NA
 7507484 7507485 CLJ_B3306 CLJ_B3307     TRUE 0.915 62.000 0.667 0.018   NA
 7507486 7507487 CLJ_B3308 CLJ_B3309     FALSE 0.033 302.000 0.000 NA   NA
 7507489 7507490 CLJ_B3311 CLJ_B3312     TRUE 0.969 13.000 0.200 NA   NA
 7507491 7507492 CLJ_B3313 CLJ_B3314     TRUE 0.837 164.000 1.000 NA   NA
 7507492 7507493 CLJ_B3314 CLJ_B3315     FALSE 0.080 240.000 0.000 NA   NA
 7507493 7507494 CLJ_B3315 CLJ_B3316     TRUE 0.877 57.000 0.400 NA   NA
 7507494 7507495 CLJ_B3316 CLJ_B3317     TRUE 0.805 141.000 0.333 NA   NA
 7507497 7507498 CLJ_B3319 CLJ_B3320 aspS_2 hisS TRUE 0.948 40.000 0.028 0.028 Y NA
 7507498 7507499 CLJ_B3320 CLJ_B3321 hisS   TRUE 0.954 19.000 0.111 1.000 N NA
 7507499 7507500 CLJ_B3321 CLJ_B3322     TRUE 0.840 38.000 0.035 1.000   NA
 7507500 7507501 CLJ_B3322 CLJ_B3323   dtd TRUE 0.738 62.000 0.048 1.000   NA
 7507501 7507502 CLJ_B3323 CLJ_B3324 dtd relA TRUE 0.889 43.000 0.177 1.000 N NA
 7507502 7507503 CLJ_B3324 CLJ_B3325 relA apt TRUE 0.729 125.000 0.068 1.000 N NA
 7507503 7507504 CLJ_B3325 CLJ_B3326 apt   TRUE 0.615 109.000 0.010 1.000   NA
 7507504 7507505 CLJ_B3326 CLJ_B3327   secF FALSE 0.231 229.000 0.028 1.000   NA
 7507505 7507506 CLJ_B3327 CLJ_B3328 secF secD TRUE 0.997 2.000 0.516 0.001 Y NA
 7507506 7507507 CLJ_B3328 CLJ_B3329 secD   TRUE 0.700 96.000 0.048 1.000   NA
 7507507 7507508 CLJ_B3329 CLJ_B3330     TRUE 0.805 157.000 0.540 NA   NA
 7507508 7507509 CLJ_B3330 CLJ_B3331     TRUE 0.791 90.000 0.212 NA   NA
 7507509 7507510 CLJ_B3331 CLJ_B3332   yajC TRUE 0.764 55.000 0.055 NA   NA
 7507510 7507511 CLJ_B3332 CLJ_B3333 yajC tgt FALSE 0.464 180.000 0.035 NA N NA
 7507511 7507512 CLJ_B3333 CLJ_B3334 tgt queA TRUE 0.915 56.000 0.014 0.001 Y NA
 7507512 7507513 CLJ_B3334 CLJ_B3335 queA ruvB TRUE 0.888 34.000 0.069 1.000 N NA
 7507513 7507514 CLJ_B3335 CLJ_B3336 ruvB ruvA TRUE 0.993 19.000 0.549 0.002 Y NA
 7507514 7507515 CLJ_B3336 CLJ_B3337 ruvA   FALSE 0.354 182.000 0.007 NA   NA
 7507515 7507516 CLJ_B3337 CLJ_B3338     TRUE 0.568 113.000 0.003 NA   NA
 7507516 7507517 CLJ_B3338 CLJ_B3339     TRUE 0.537 151.000 0.015 NA   NA
 7507517 7507518 CLJ_B3339 CLJ_B3340     TRUE 0.847 16.000 0.000 1.000   NA
 7507518 7507519 CLJ_B3340 CLJ_B3341     FALSE 0.440 88.000 0.000 1.000   NA
 7507519 7507520 CLJ_B3341 CLJ_B3342     FALSE 0.190 285.000 0.176 1.000   NA
 7507520 7507521 CLJ_B3342 CLJ_B3343     TRUE 0.650 150.000 0.071 NA   NA
 7507521 7507522 CLJ_B3343 CLJ_B3344     FALSE 0.505 174.000 0.051 NA   NA
 7507522 7507523 CLJ_B3344 CLJ_B3345     TRUE 0.575 129.000 0.002 1.000   NA
 7507527 7507528 CLJ_B3349 CLJ_B3350 spoVAE_2 spoVAD_2 TRUE 0.973 16.000 0.386 NA   NA
 7507528 7507529 CLJ_B3350 CLJ_B3351 spoVAD_2 spoVAC_2 TRUE 0.964 23.000 0.386 NA   NA
 7507529 7507530 CLJ_B3351 CLJ_B3352 spoVAC_2 sigF FALSE 0.389 206.000 0.078 NA   NA
 7507530 7507531 CLJ_B3352 CLJ_B3353 sigF spoIIAB TRUE 0.982 19.000 0.842 1.000 N NA
 7507531 7507532 CLJ_B3353 CLJ_B3354 spoIIAB spoIIAA TRUE 0.994 17.000 0.669 0.001 Y NA
 7507536 7507537 CLJ_B3358 CLJ_B3359     FALSE 0.173 328.000 0.024 NA Y NA
 7507537 7507538 CLJ_B3359 CLJ_B3360     TRUE 0.805 21.000 0.000 NA   NA
 7507538 7507539 CLJ_B3360 CLJ_B3361   mviN FALSE 0.011 398.000 0.000 NA   NA
 7507539 7507540 CLJ_B3361 CLJ_B3362 mviN   TRUE 0.943 19.000 0.075 1.000   NA
 7507540 7507541 CLJ_B3362 CLJ_B3363     TRUE 0.823 110.000 0.000 0.011 Y NA
 7507541 7507542 CLJ_B3363 CLJ_B3364     TRUE 0.779 115.000 0.000 NA Y NA
 7507542 7507543 CLJ_B3364 CLJ_B3365     TRUE 0.859 78.000 0.016 NA Y NA
 7507543 7507544 CLJ_B3365 CLJ_B3366     TRUE 0.985 19.000 0.146 1.000 Y NA
 7507544 7507545 CLJ_B3366 CLJ_B3367     TRUE 0.992 0.000 0.077 1.000 Y NA
 7507545 7507546 CLJ_B3367 CLJ_B3368     TRUE 0.960 23.000 0.176 0.011   NA
 7507546 7507547 CLJ_B3368 CLJ_B3369     TRUE 0.990 -10.000 0.375 NA   NA
 7507547 7507548 CLJ_B3369 CLJ_B3370     TRUE 0.841 15.000 0.000 NA   NA
 7507548 7507549 CLJ_B3370 CLJ_B3371     TRUE 0.671 37.000 0.000 1.000   NA
 7507549 7507550 CLJ_B3371 CLJ_B3372     TRUE 0.719 31.000 0.000 1.000   NA
 7507550 7507551 CLJ_B3372 CLJ_B3373     FALSE 0.450 100.000 0.000 1.000   NA
 7507551 7507552 CLJ_B3373 CLJ_B3374     TRUE 0.837 63.000 0.154 0.030   NA
 7507552 7507553 CLJ_B3374 CLJ_B3375     TRUE 0.873 130.000 0.035 1.000 Y NA
 7507553 7507554 CLJ_B3375 CLJ_B3376     TRUE 0.745 180.000 0.037 1.000 Y NA
 7507554 7507555 CLJ_B3376 CLJ_B3377     TRUE 0.896 200.000 1.000 0.003 Y NA
 7507555 7507556 CLJ_B3377 CLJ_B3378     FALSE 0.305 190.000 0.000 0.003 N NA
 7507556 7507557 CLJ_B3378 CLJ_B3379   galU FALSE 0.476 99.000 0.000 1.000 N NA
 7507557 7507558 CLJ_B3379 CLJ_B3380 galU   TRUE 0.565 50.000 0.000 1.000   NA
 7507558 7507559 CLJ_B3380 CLJ_B3381     FALSE 0.391 145.000 0.000 1.000   NA
 7507559 7507560 CLJ_B3381 CLJ_B3382   rplY_1 FALSE 0.006 949.000 0.002 1.000 N NA
 7507562 7507563 CLJ_B3384 CLJ_B3385     FALSE 0.013 387.000 0.000 NA   NA
 7507563 7507564 CLJ_B3385 CLJ_B3386     FALSE 0.036 463.000 0.000 1.000 Y NA
 7507564 7507565 CLJ_B3386 CLJ_B3387     FALSE 0.086 236.000 0.000 NA   NA
 7507565 7507566 CLJ_B3387 CLJ_B3388     FALSE 0.394 188.000 0.031 NA   NA
 7507566 7507567 CLJ_B3388 CLJ_B3389     TRUE 0.734 134.000 0.078 1.000 N NA
 7507567 7507568 CLJ_B3389 CLJ_B3390     FALSE 0.003 723.000 0.000 NA   NA
 7507571 7507572 CLJ_B3393 CLJ_B3394     FALSE 0.213 183.000 0.000 NA   NA
 7507573 7507574 CLJ_B3395 CLJ_B3396   pheT FALSE 0.340 205.000 0.038 NA   NA
 7507574 7507575 CLJ_B3396 CLJ_B3397 pheT pheS TRUE 0.936 161.000 0.574 0.001 Y NA
 7507575 7507576 CLJ_B3397 CLJ_B3398 pheS   FALSE 0.133 347.000 0.006 1.000 Y NA
 7507576 7507577 CLJ_B3398 CLJ_B3399     TRUE 0.664 91.000 0.022 1.000 N NA
 7507577 7507578 CLJ_B3399 CLJ_B3400     TRUE 0.992 11.000 0.137 0.003 Y NA
 7507578 7507579 CLJ_B3400 CLJ_B3401   rplT TRUE 0.607 124.000 0.004 1.000 N NA
 7507579 7507580 CLJ_B3401 CLJ_B3402 rplT rpmI TRUE 0.990 30.000 0.928 0.011 Y NA
 7507580 7507581 CLJ_B3402 CLJ_B3403 rpmI infC TRUE 0.991 22.000 0.652 1.000 Y NA
 7507581 7507582 CLJ_B3403 CLJ_B3405 infC thrS FALSE 0.361 255.000 0.007 1.000 Y NA
 7507582 7507583 CLJ_B3405 CLJ_B3406 thrS   FALSE 0.019 348.000 0.000 NA   NA
 7507585 7507586 CLJ_B3408 CLJ_B3409     TRUE 0.991 2.000 0.952 NA   NA
 7507586 7507587 CLJ_B3409 CLJ_B3410     FALSE 0.028 314.000 0.000 NA   NA
 7507587 7507588 CLJ_B3410 CLJ_B3411     TRUE 0.872 10.000 0.000 NA   NA
 7507588 7507589 CLJ_B3411 CLJ_B3412     TRUE 0.889 4.000 0.000 NA   NA
 7507589 7507590 CLJ_B3412 CLJ_B3413     TRUE 0.902 2.000 0.000 NA   NA
 7507590 7507591 CLJ_B3413 CLJ_B3414     TRUE 0.885 5.000 0.000 NA   NA
 7507591 7507592 CLJ_B3414 CLJ_B3415   hsp33 FALSE 0.458 65.000 0.000 NA   NA
 7507592 7507593 CLJ_B3415 CLJ_B3416 hsp33   TRUE 0.869 38.000 0.063 1.000 N NA
 7507593 7507594 CLJ_B3416 CLJ_B3417     TRUE 0.705 86.000 0.056 1.000   NA
 7507594 7507595 CLJ_B3417 CLJ_B3418     FALSE 0.195 196.000 0.000 1.000   NA
 7507595 7507596 CLJ_B3418 CLJ_B3419     TRUE 0.997 0.000 0.444 0.001 Y NA
 7507596 7507597 CLJ_B3419 CLJ_B3420     TRUE 0.993 15.000 0.571 1.000 Y NA
 7507597 7507598 CLJ_B3420 CLJ_B3421     TRUE 0.988 16.000 0.124 0.020 Y NA
 7507598 7507599 CLJ_B3421 CLJ_B3422     TRUE 0.916 81.000 0.093 0.020 Y NA
 7507600 7507601 CLJ_B3423 CLJ_B3424 asd dapA TRUE 0.973 23.000 0.029 1.000 Y NA
 7507601 7507602 CLJ_B3424 CLJ_B3425 dapA dapB_2 TRUE 0.865 93.000 0.022 1.000 Y NA
 7507605 7507606 CLJ_B3428 CLJ_B3429     TRUE 0.720 78.000 0.071 NA   NA
 7507606 7507607 CLJ_B3429 CLJ_B3430     FALSE 0.359 199.000 0.034 NA   NA
 7507611 7507612 CLJ_B3434 CLJ_B3435 folC valS FALSE 0.200 238.000 0.006 0.092 N NA
 7507612 7507613 CLJ_B3435 CLJ_B3436 valS   TRUE 0.968 21.000 0.002 1.000 Y NA
 7507613 7507614 CLJ_B3436 CLJ_B3437     FALSE 0.004 693.000 0.000 1.000 N NA
 7507615 7507616 CLJ_B3438 CLJ_B3439     FALSE 0.335 153.000 0.000 NA   NA
 7507616 7507617 CLJ_B3439 CLJ_B3440     TRUE 0.941 0.000 0.000 0.048   NA
 7507619 7507620 CLJ_B3442 CLJ_B3443     TRUE 0.998 -3.000 0.876 1.000 Y NA
 7507620 7507621 CLJ_B3443 CLJ_B3444     TRUE 0.630 144.000 0.034 1.000   NA
 7507622 7507623 CLJ_B3445 CLJ_B3446   recX TRUE 0.878 25.000 0.012 NA   NA
 7507623 7507624 CLJ_B3446 CLJ_B3447 recX   TRUE 0.903 22.000 0.015 1.000   NA
 7507625 7507626 CLJ_B3449 CLJ_B3450     TRUE 0.823 38.000 0.029 NA   NA
 7507626 7507627 CLJ_B3450 CLJ_B3451     TRUE 0.729 57.000 0.029 1.000   NA
 7507628 7507629 CLJ_B3452 CLJ_B3453     TRUE 0.760 42.000 0.011 NA   NA
 7507629 7507630 CLJ_B3453 CLJ_B3454   proC TRUE 0.594 129.000 0.011 NA   NA
 7507630 7507631 CLJ_B3454 CLJ_B3455 proC   FALSE 0.469 112.000 0.000 1.000 N NA
 7507631 7507632 CLJ_B3455 CLJ_B3456     TRUE 0.986 7.000 0.333 0.002 N NA
 7507632 7507633 CLJ_B3456 CLJ_B3457     TRUE 0.853 51.000 0.167 1.000   NA
 7507633 7507634 CLJ_B3457 CLJ_B3458     FALSE 0.004 638.000 0.000 1.000   NA
 7507634 7507635 CLJ_B3458 CLJ_B3459     TRUE 0.766 37.000 0.002 NA   NA
 7507635 7507636 CLJ_B3459 CLJ_B3460     TRUE 0.969 12.000 0.182 NA   NA
 7507636 7507637 CLJ_B3460 CLJ_B3461     TRUE 0.950 23.000 0.182 NA   NA
 7507638 7507639 CLJ_B3462 CLJ_B3463     FALSE 0.448 69.000 0.000 NA   NA
 7507641 7507642 CLJ_B3465 CLJ_B3466     TRUE 0.987 3.000 0.583 NA   NA
 7507642 7507643 CLJ_B3466 CLJ_B3467     TRUE 0.993 -19.000 0.600 NA   NA
 7507644 7507645 CLJ_B3468 CLJ_B3469     FALSE 0.021 358.000 0.000 1.000 N NA
 7507645 7507646 CLJ_B3469 CLJ_B3470     TRUE 0.995 13.000 0.714 0.009 Y NA
 7507646 7507647 CLJ_B3470 CLJ_B3471   bcd TRUE 0.983 12.000 0.364 0.030 N NA
 7507647 7507648 CLJ_B3471 CLJ_B3472 bcd   TRUE 0.849 194.000 0.500 1.000 Y NA
 7507648 7507649 CLJ_B3472 CLJ_B3473   hbd TRUE 0.974 25.000 0.054 1.000 Y NA
 7507649 7507650 CLJ_B3473 CLJ_B3474 hbd crt TRUE 0.990 20.000 0.486 1.000 Y NA
 7507650 7507651 CLJ_B3474 CLJ_B3475 crt   FALSE 0.010 416.000 0.000 NA   NA
 7507651 7507652 CLJ_B3475 CLJ_B3476     TRUE 0.866 44.000 0.154 NA   NA
 7507652 7507653 CLJ_B3476 CLJ_B3477     FALSE 0.053 276.000 0.000 1.000   NA
 7507653 7507654 CLJ_B3477 CLJ_B3478     FALSE 0.012 402.000 0.000 1.000   NA
 7507654 7507655 CLJ_B3478 CLJ_B3479     TRUE 0.776 68.000 0.100 1.000   NA
 7507655 7507656 CLJ_B3479 CLJ_B3480     FALSE 0.005 517.000 0.000 NA   NA
 7507656 7507657 CLJ_B3480 CLJ_B3481   lgt FALSE 0.018 354.000 0.000 NA   NA
 7507657 7507658 CLJ_B3481 CLJ_B3482 lgt   FALSE 0.158 208.000 0.000 1.000   NA
 7507658 7507659 CLJ_B3482 CLJ_B3483     TRUE 0.756 43.000 0.012 NA   NA
 7507661 7507662 CLJ_B3485 CLJ_B3486     FALSE 0.469 196.000 0.080 1.000 N NA
 7507662 7507663 CLJ_B3486 CLJ_B3487   pflA FALSE 0.005 642.000 0.000 1.000 N NA
 7507663 7507664 CLJ_B3487 CLJ_B3488 pflA pfl TRUE 0.609 180.000 0.163 1.000 N NA
 7507664 7507665 CLJ_B3488 CLJ_B3489 pfl   FALSE 0.005 512.000 0.000 NA   NA
 7507665 7507666 CLJ_B3489 CLJ_B3490   rplY_2 FALSE 0.182 195.000 0.000 NA   NA
 7507666 7507667 CLJ_B3490 CLJ_B3491 rplY_2   FALSE 0.416 167.000 0.002 NA   NA
 7507671 7507672 CLJ_B3495 CLJ_B3496     FALSE 0.131 215.000 0.000 NA   NA
 7507672 7507673 CLJ_B3496 CLJ_B3497     FALSE 0.507 55.000 0.000 NA   NA
 7507673 7507674 CLJ_B3497 CLJ_B3498     TRUE 0.527 52.000 0.000 NA   NA
 7507674 7507675 CLJ_B3498 CLJ_B3499     FALSE 0.123 219.000 0.000 NA   NA
 7507675 7507676 CLJ_B3499 CLJ_B3500     TRUE 0.872 24.000 0.005 NA   NA
 7507676 7507677 CLJ_B3500 CLJ_B3501   lon TRUE 0.936 18.000 0.048 1.000   NA
 7507677 7507678 CLJ_B3501 CLJ_B3502 lon lonB TRUE 0.907 138.000 0.072 0.001 Y NA
 7507678 7507679 CLJ_B3502 CLJ_B3503 lonB clpX TRUE 0.900 128.000 0.042 0.002 Y NA
 7507679 7507680 CLJ_B3503 CLJ_B3504 clpX clpP_1 TRUE 0.974 20.000 0.022 1.000 Y NA
 7507680 7507681 CLJ_B3504 CLJ_B3505 clpP_1 tig TRUE 0.864 126.000 0.024 1.000 Y NA
 7507681 7507682 CLJ_B3505 CLJ_B3506 tig   FALSE 0.389 178.000 0.005 NA N NA
 7507682 7507683 CLJ_B3506 CLJ_B3507     TRUE 0.795 107.000 0.211 NA   NA
 7507683 7507684 CLJ_B3507 CLJ_B3508   pyrE FALSE 0.133 214.000 0.000 NA   NA
 7507684 7507685 CLJ_B3508 CLJ_B3509 pyrE pyrD TRUE 0.958 34.000 0.060 1.000 Y NA
 7507685 7507686 CLJ_B3509 CLJ_B3510 pyrD pyrK TRUE 0.991 0.000 0.592 1.000 N NA
 7507686 7507687 CLJ_B3510 CLJ_B3511 pyrK pyrF TRUE 0.779 145.000 0.112 0.002 N NA
 7507687 7507688 CLJ_B3511 CLJ_B3512 pyrF pyrC TRUE 0.976 24.000 0.064 1.000 Y NA
 7507688 7507689 CLJ_B3512 CLJ_B3513 pyrC pyrI TRUE 0.975 22.000 0.032 1.000 Y NA
 7507689 7507690 CLJ_B3513 CLJ_B3514 pyrI pyrB TRUE 0.995 2.000 0.197 0.002 Y NA
 7507690 7507691 CLJ_B3514 CLJ_B3516 pyrB hgdC_3 FALSE 0.075 255.000 0.000 NA N NA
 7507691 7507692 CLJ_B3516 CLJ_B3517 hgdC_3   TRUE 0.915 23.000 0.039 NA   NA
 7507692 7507693 CLJ_B3517 CLJ_B3518     FALSE 0.015 374.000 0.000 NA   NA
 7507693 7507694 CLJ_B3518 CLJ_B3519     FALSE 0.013 388.000 0.000 NA   NA
 7507694 7507695 CLJ_B3519 CLJ_B3520     TRUE 0.772 25.000 0.000 NA   NA
 7507695 7507696 CLJ_B3520 CLJ_B3521     TRUE 0.722 29.000 0.000 NA   NA
 7507696 7507697 CLJ_B3521 CLJ_B3522     TRUE 0.759 26.000 0.000 NA   NA
 7507697 7507698 CLJ_B3522 CLJ_B3523     TRUE 0.885 5.000 0.000 NA   NA
 7507698 7507699 CLJ_B3523 CLJ_B3524     TRUE 0.882 6.000 0.000 NA   NA
 7507699 7507700 CLJ_B3524 CLJ_B3525     TRUE 0.875 9.000 0.000 NA   NA
 7507700 7507701 CLJ_B3525 CLJ_B3526     FALSE 0.442 72.000 0.000 NA   NA
 7507701 7507702 CLJ_B3526 CLJ_B3527     TRUE 0.848 14.000 0.000 NA   NA
 7507702 7507703 CLJ_B3527 CLJ_B3528     TRUE 0.902 2.000 0.000 NA   NA
 7507703 7507704 CLJ_B3528 CLJ_B3529     TRUE 0.894 3.000 0.000 NA   NA
 7507704 7507705 CLJ_B3529 CLJ_B3530     TRUE 0.841 15.000 0.000 NA   NA
 7507705 7507706 CLJ_B3530 CLJ_B3531     TRUE 0.885 5.000 0.000 NA   NA
 7507706 7507707 CLJ_B3531 CLJ_B3532     TRUE 0.882 6.000 0.000 NA   NA
 7507707 7507708 CLJ_B3532 CLJ_B3533     TRUE 0.875 9.000 0.000 NA   NA
 7507708 7507709 CLJ_B3533 CLJ_B3534     FALSE 0.442 72.000 0.000 NA   NA
 7507709 7507710 CLJ_B3534 CLJ_B3535     TRUE 0.848 14.000 0.000 NA   NA
 7507710 7507711 CLJ_B3535 CLJ_B3536     TRUE 0.902 2.000 0.000 NA   NA
 7507711 7507712 CLJ_B3536 CLJ_B3537     TRUE 0.894 3.000 0.000 NA   NA
 7507712 7507713 CLJ_B3537 CLJ_B3538     TRUE 0.882 6.000 0.000 NA   NA
 7507713 7507714 CLJ_B3538 CLJ_B3539     TRUE 0.882 6.000 0.000 NA   NA
 7507714 7507715 CLJ_B3539 CLJ_B3540     TRUE 0.879 7.000 0.000 NA   NA
 7507715 7507716 CLJ_B3540 CLJ_B3541     FALSE 0.366 145.000 0.000 NA   NA
 7507716 7507717 CLJ_B3541 CLJ_B3542     TRUE 0.949 17.000 0.085 1.000   NA
 7507718 7507719 CLJ_B3543 CLJ_B3544     TRUE 0.819 113.000 0.300 NA   NA
 7507720 7507721 CLJ_B3545 CLJ_B3546   gatB FALSE 0.508 154.000 0.002 1.000 N NA
 7507721 7507722 CLJ_B3546 CLJ_B3547 gatB gatA TRUE 0.982 37.000 0.492 0.001 Y NA
 7507722 7507723 CLJ_B3547 CLJ_B3548 gatA gatC TRUE 0.985 37.000 0.643 0.001 Y NA
 7507723 7507724 CLJ_B3548 CLJ_B3549 gatC   TRUE 0.587 136.000 0.002 1.000 N NA
 7507724 7507725 CLJ_B3549 CLJ_B3550     FALSE 0.014 384.000 0.000 NA   NA
 7507725 7507726 CLJ_B3550 CLJ_B3551   ligA TRUE 0.786 101.000 0.182 NA   NA
 7507726 7507727 CLJ_B3551 CLJ_B3552 ligA pcrA TRUE 0.987 12.000 0.039 0.012 Y NA
 7507727 7507728 CLJ_B3552 CLJ_B3553 pcrA   TRUE 0.649 127.000 0.025 1.000   NA
 7507728 7507729 CLJ_B3553 CLJ_B3554     FALSE 0.039 298.000 0.000 1.000   NA
 7507729 7507730 CLJ_B3554 CLJ_B3555     TRUE 0.672 84.000 0.041 NA   NA
 7507730 7507731 CLJ_B3555 CLJ_B3556     TRUE 0.771 59.000 0.083 NA   NA
 7507733 7507734 CLJ_B3558 CLJ_B3559   pgi TRUE 0.939 11.000 0.018 NA   NA
 7507734 7507735 CLJ_B3559 CLJ_B3560 pgi   FALSE 0.415 84.000 0.000 NA   NA
 7507735 7507736 CLJ_B3560 CLJ_B3561     FALSE 0.026 321.000 0.000 NA   NA
 7507737 7507738 CLJ_B3562 CLJ_B3563   ldhA_1 FALSE 0.008 545.000 0.000 0.039 N NA
 7507739 7507740 CLJ_B3564 CLJ_B3565 ldhA_2   FALSE 0.003 815.000 0.000 NA   NA
 7507740 7507741 CLJ_B3565 CLJ_B3566     FALSE 0.125 218.000 0.000 NA   NA
 7507741 7507742 CLJ_B3566 CLJ_B3567     TRUE 0.992 18.000 0.400 0.009 Y NA
 7507742 7507743 CLJ_B3567 CLJ_B3568     TRUE 0.988 13.000 0.800 0.029 N NA
 7507743 7507744 CLJ_B3568 CLJ_B3569   fldC TRUE 0.757 166.000 0.400 NA N NA
 7507744 7507745 CLJ_B3569 CLJ_B3570 fldC fldB TRUE 0.995 2.000 0.500 NA Y NA
 7507745 7507746 CLJ_B3570 CLJ_B3571 fldB fldI TRUE 0.990 5.000 0.875 NA N NA
 7507746 7507747 CLJ_B3571 CLJ_B3572 fldI fldA TRUE 0.989 0.000 0.429 NA N NA
 7507747 7507748 CLJ_B3572 CLJ_B3573 fldA   TRUE 0.918 55.000 0.500 0.039 N NA
 7507748 7507749 CLJ_B3573 CLJ_B3574     FALSE 0.008 466.000 0.000 1.000 N NA
 7507749 7507750 CLJ_B3574 CLJ_B3575   guaA FALSE 0.009 455.000 0.000 1.000 N NA
 7507750 7507751 CLJ_B3575 CLJ_B3576 guaA guaB TRUE 0.992 13.000 0.190 0.001 Y NA
 7507753 7507754 CLJ_B3579 CLJ_B3580 groL groES TRUE 0.988 30.000 0.674 0.090 Y NA
 7507756 7507757 CLJ_B3581 CLJ_B3583     FALSE 0.008 451.000 0.000 NA   NA
 7507757 7507758 CLJ_B3583 CLJ_B3584     FALSE 0.471 173.000 0.024 1.000   NA
 7507758 7507759 CLJ_B3584 CLJ_B3585   gltA_2 TRUE 0.589 150.000 0.018 1.000 N NA
 7507759 7507760 CLJ_B3585 CLJ_B3586 gltA_2   TRUE 0.993 0.000 0.667 0.029 N NA
 7507760 7507761 CLJ_B3586 CLJ_B3587     FALSE 0.105 230.000 0.000 1.000   NA
 7507763 7507764 CLJ_B3589 CLJ_B3590     TRUE 0.996 1.000 0.444 0.013 Y NA
 7507766 7507767 CLJ_B3592 CLJ_B3593   pyc FALSE 0.016 381.000 0.000 1.000   NA
 7507767 7507768 CLJ_B3593 CLJ_B3594 pyc   FALSE 0.009 460.000 0.000 1.000 N NA
 7507770 7507771 CLJ_B3596 CLJ_B3597     FALSE 0.082 239.000 0.000 NA   NA
 7507771 7507772 CLJ_B3597 CLJ_B3598     TRUE 0.534 51.000 0.000 NA   NA
 7507772 7507773 CLJ_B3598 CLJ_B3599     TRUE 0.720 63.000 0.047 NA   NA
 7507773 7507774 CLJ_B3599 CLJ_B3600     TRUE 0.935 16.000 0.041 NA   NA
 7507775 7507776 CLJ_B3601 CLJ_B3602     TRUE 0.564 138.000 0.007 NA   NA
 7507776 7507777 CLJ_B3602 CLJ_B3603     TRUE 0.985 -3.000 0.217 NA   NA
 7507777 7507778 CLJ_B3603 CLJ_B3604   rimI TRUE 0.984 -7.000 0.127 1.000   NA
 7507779 7507780 CLJ_B3605 CLJ_B3606 tyrS_2   FALSE 0.092 233.000 0.000 NA   NA
 7507780 7507781 CLJ_B3606 CLJ_B3607     TRUE 0.689 136.000 0.062 NA   NA
 7507781 7507782 CLJ_B3607 CLJ_B3608     TRUE 0.579 148.000 0.025 NA   NA
 7507782 7507783 CLJ_B3608 CLJ_B3609     FALSE 0.421 81.000 0.000 NA   NA
 7507787 7507788 CLJ_B3613 CLJ_B3614 trpS   FALSE 0.237 177.000 0.000 NA   NA
 7507788 7507789 CLJ_B3614 CLJ_B3615     FALSE 0.036 296.000 0.000 NA   NA
 7507791 7507792 CLJ_B3617 CLJ_B3618 cgs lysA FALSE 0.114 265.000 0.003 1.000 N NA
 7507792 7507793 CLJ_B3618 CLJ_B3619 lysA lysC TRUE 0.977 16.000 0.016 1.000 Y NA
 7507793 7507794 CLJ_B3619 CLJ_B3621 lysC   FALSE 0.058 397.000 0.000 1.000 Y NA
 7507795 7507796 CLJ_B3622 CLJ_B3623     TRUE 0.717 122.000 0.069 1.000   NA
 7507797 7507798 CLJ_B3624 CLJ_B3625   ftsH_1 TRUE 0.979 21.000 0.583 0.090   NA
 7507798 7507799 CLJ_B3625 CLJ_B3626 ftsH_1   FALSE 0.008 570.000 0.000 0.012 N NA
 7507799 7507800 CLJ_B3626 CLJ_B3627   proS FALSE 0.192 202.000 0.000 1.000 N NA
 7507800 7507801 CLJ_B3627 CLJ_B3628 proS   FALSE 0.011 424.000 0.000 1.000 N NA
 7507801 7507802 CLJ_B3628 CLJ_B3629     TRUE 0.591 140.000 0.018 NA   NA
 7507802 7507803 CLJ_B3629 CLJ_B3630     TRUE 0.845 102.000 0.400 NA   NA
 7507803 7507804 CLJ_B3630 CLJ_B3631     TRUE 0.771 159.000 0.400 NA   NA
 7507804 7507805 CLJ_B3631 CLJ_B3632     TRUE 0.991 -25.000 0.375 NA   NA
 7507805 7507806 CLJ_B3632 CLJ_B3633     FALSE 0.029 328.000 0.000 1.000 N NA
 7507806 7507807 CLJ_B3633 CLJ_B3634     FALSE 0.160 214.000 0.000 1.000 N NA
 7507807 7507808 CLJ_B3634 CLJ_B3635     TRUE 0.993 23.000 1.000 1.000 Y NA
 7507808 7507809 CLJ_B3635 CLJ_B3636     FALSE 0.383 263.000 0.667 NA   NA
 7507809 7507810 CLJ_B3636 CLJ_B3637     TRUE 0.987 5.000 0.667 NA   NA
 7507812 7507813 CLJ_B3639 CLJ_B3640     FALSE 0.016 367.000 0.000 NA   NA
 7507813 7507814 CLJ_B3640 CLJ_B3641     FALSE 0.243 289.000 0.400 NA   NA
 7507814 7507815 CLJ_B3641 CLJ_B3642     TRUE 0.950 60.000 0.400 NA Y NA
 7507815 7507816 CLJ_B3642 CLJ_B3643     FALSE 0.357 242.000 0.000 0.006 Y NA
 7507816 7507817 CLJ_B3643 CLJ_B3644     TRUE 0.881 120.000 0.429 0.008 N NA
 7507817 7507818 CLJ_B3644 CLJ_B3645     TRUE 0.775 127.000 0.071 0.008 N NA
 7507818 7507819 CLJ_B3645 CLJ_B3646     TRUE 0.895 81.000 0.071 1.000 Y NA
 7507819 7507820 CLJ_B3646 CLJ_B3647     FALSE 0.010 419.000 0.000 1.000   NA
 7507820 7507821 CLJ_B3647 CLJ_B3648     TRUE 0.689 32.000 0.000 NA   NA
 7507821 7507822 CLJ_B3648 CLJ_B3649   speD FALSE 0.383 141.000 0.000 NA   NA
 7507822 7507823 CLJ_B3649 CLJ_B3650 speD   FALSE 0.330 154.000 0.000 NA   NA
 7507823 7507824 CLJ_B3650 CLJ_B3651     FALSE 0.005 522.000 0.000 NA   NA
 7507824 7507825 CLJ_B3651 CLJ_B3652     FALSE 0.006 496.000 0.000 NA   NA
 7507825 7507826 CLJ_B3652 CLJ_B3653     FALSE 0.009 438.000 0.000 1.000   NA
 7507826 7507827 CLJ_B3653 CLJ_B3654     TRUE 0.945 -34.000 0.000 NA   NA
 7507827 7507828 CLJ_B3654 CLJ_B3655     TRUE 0.863 12.000 0.000 NA   NA
 7507828 7507829 CLJ_B3655 CLJ_B3656     TRUE 0.939 -15.000 0.000 NA   NA
 7507829 7507830 CLJ_B3656 CLJ_B3657     FALSE 0.379 142.000 0.000 NA   NA
 7507830 7507831 CLJ_B3657 CLJ_B3658     FALSE 0.004 578.000 0.000 NA   NA
 7507831 7507832 CLJ_B3658 CLJ_B3659     FALSE 0.004 625.000 0.000 NA   NA
 7507832 7507833 CLJ_B3659 CLJ_B3660     FALSE 0.415 89.000 0.000 NA   NA
 7507833 7507834 CLJ_B3660 CLJ_B3661     FALSE 0.400 150.000 0.000 1.000 N NA
 7507834 7507835 CLJ_B3661 CLJ_B3662     FALSE 0.006 537.000 0.000 1.000 N NA
 7507835 7507836 CLJ_B3662 CLJ_B3663     FALSE 0.010 413.000 0.000 NA   NA
 7507836 7507837 CLJ_B3663 CLJ_B3664     FALSE 0.323 156.000 0.000 NA   NA
 7507837 7507838 CLJ_B3664 CLJ_B3665     FALSE 0.076 245.000 0.000 NA   NA
 7507838 7507839 CLJ_B3665 CLJ_B3666     FALSE 0.004 1108.000 0.000 0.040   NA
 7507839 7507840 CLJ_B3666 CLJ_B3667     FALSE 0.004 622.000 0.000 1.000   NA
 7507840 7507841 CLJ_B3667 CLJ_B3668     TRUE 0.997 -3.000 0.700 1.000 Y NA
 7507841 7507842 CLJ_B3668 CLJ_B3669     TRUE 0.859 83.000 0.333 0.090 N NA
 7507842 7507843 CLJ_B3669 CLJ_B3670     TRUE 0.997 -7.000 0.583 1.000 Y NA
 7507843 7507844 CLJ_B3670 CLJ_B3671     TRUE 0.979 -3.000 0.083 1.000   NA
 7507844 7507845 CLJ_B3671 CLJ_B3672   rumA_2 FALSE 0.004 695.000 0.000 1.000   NA
 7507845 7507846 CLJ_B3672 CLJ_B3673 rumA_2   FALSE 0.089 234.000 0.000 NA   NA
 7507846 7507847 CLJ_B3673 CLJ_B3674     FALSE 0.023 331.000 0.000 NA   NA
 7507847 7507848 CLJ_B3674 CLJ_B3675   pykA TRUE 0.666 144.000 0.057 1.000   NA
 7507848 7507849 CLJ_B3675 CLJ_B3676 pykA pfkA TRUE 0.956 34.000 0.015 0.002 Y NA
 7507849 7507850 CLJ_B3676 CLJ_B3677 pfkA dnaE FALSE 0.201 242.000 0.029 1.000 N NA
 7507850 7507851 CLJ_B3677 CLJ_B3678 dnaE   FALSE 0.485 163.000 0.010 1.000   NA
 7507851 7507852 CLJ_B3678 CLJ_B3679     TRUE 0.983 7.000 0.470 NA   NA
 7507852 7507853 CLJ_B3679 CLJ_B3680     TRUE 0.986 -3.000 0.259 NA   NA
 7507853 7507854 CLJ_B3680 CLJ_B3681   murB TRUE 0.717 120.000 0.080 NA   NA
 7507854 7507855 CLJ_B3681 CLJ_B3682 murB   TRUE 0.659 69.000 0.009 1.000 N NA
 7507855 7507856 CLJ_B3682 CLJ_B3683   uvrC TRUE 0.711 60.000 0.004 0.046 N NA
 7507856 7507857 CLJ_B3683 CLJ_B3684 uvrC   TRUE 0.914 14.000 0.005 NA   NA
 7507857 7507858 CLJ_B3684 CLJ_B3685     FALSE 0.364 187.000 0.017 NA   NA
 7507858 7507859 CLJ_B3685 CLJ_B3686     TRUE 0.902 28.000 0.053 1.000   NA
 7507859 7507860 CLJ_B3686 CLJ_B3687     TRUE 0.982 5.000 0.285 1.000 N NA
 7507860 7507861 CLJ_B3687 CLJ_B3688     TRUE 0.952 11.000 0.047 NA   NA
 7507861 7507862 CLJ_B3688 CLJ_B3689   uvrA TRUE 0.583 99.000 0.005 NA   NA
 7507862 7507863 CLJ_B3689 CLJ_B3690 uvrA uvrB TRUE 0.988 19.000 0.154 0.001 Y NA
 7507863 7507864 CLJ_B3690 CLJ_B3691 uvrB   TRUE 0.955 2.000 0.013 1.000   NA
 7507864 7507865 CLJ_B3691 CLJ_B3692     TRUE 0.758 89.000 0.060 0.006   NA
 7507865 7507866 CLJ_B3692 CLJ_B3693     FALSE 0.292 210.000 0.015 1.000 N NA
 7507866 7507867 CLJ_B3693 CLJ_B3694     TRUE 0.997 -10.000 0.431 1.000 Y NA
 7507867 7507868 CLJ_B3694 CLJ_B3695     FALSE 0.496 156.000 0.010 NA   NA
 7507868 7507869 CLJ_B3695 CLJ_B3696     TRUE 0.796 91.000 0.222 NA   NA
 7507869 7507870 CLJ_B3696 CLJ_B3697     FALSE 0.425 214.000 0.167 NA   NA
 7507870 7507871 CLJ_B3697 CLJ_B3698     TRUE 0.995 0.000 0.180 0.000 Y NA
 7507871 7507872 CLJ_B3698 CLJ_B3699     FALSE 0.145 263.000 0.019 1.000 N NA
 7507872 7507873 CLJ_B3699 CLJ_B3700     TRUE 0.983 -43.000 0.039 1.000 N NA
 7507873 7507874 CLJ_B3700 CLJ_B3701   alr_2 TRUE 0.865 139.000 0.571 1.000 N NA
 7507874 7507875 CLJ_B3701 CLJ_B3702 alr_2   TRUE 0.968 28.000 0.068 NA Y NA
 7507875 7507876 CLJ_B3702 CLJ_B3703     FALSE 0.414 200.000 0.064 NA N NA
 7507876 7507877 CLJ_B3703 CLJ_B3704   acpS TRUE 0.968 -3.000 0.020 NA N NA
 7507877 7507878 CLJ_B3704 CLJ_B3705 acpS   TRUE 0.625 115.000 0.020 NA   NA
 7507878 7507879 CLJ_B3705 CLJ_B3706     FALSE 0.012 396.000 0.000 NA   NA
 7507879 7507880 CLJ_B3706 CLJ_B3708     FALSE 0.034 305.000 0.000 1.000   NA
 7507880 7507881 CLJ_B3708 CLJ_B3709     FALSE 0.306 161.000 0.000 NA   NA
 7507881 7507882 CLJ_B3709 CLJ_B3710   rpsD_1 FALSE 0.114 254.000 0.002 NA   NA
 7507883 7507884 CLJ_B3711 CLJ_B3712     FALSE 0.068 328.000 0.030 1.000 N NA
 7507885 7507886 CLJ_B3713 CLJ_B3714     TRUE 0.969 9.000 0.133 NA   NA
 7507886 7507887 CLJ_B3714 CLJ_B3715   sodC FALSE 0.156 204.000 0.000 NA   NA
 7507887 7507888 CLJ_B3715 CLJ_B3716 sodC glmS FALSE 0.066 269.000 0.000 1.000 N NA
 7507888 7507889 CLJ_B3716 CLJ_B3718 glmS   FALSE 0.004 665.000 0.000 1.000 N NA
 7507889 7507890 CLJ_B3718 CLJ_B3719     TRUE 0.900 19.000 0.005 1.000   NA
 7507890 7507891 CLJ_B3719 CLJ_B3720   srlD TRUE 0.930 24.000 0.040 0.039   NA
 7507891 7507892 CLJ_B3720 CLJ_B3721 srlD   TRUE 0.945 20.000 0.080 1.000 N NA
 7507892 7507893 CLJ_B3721 CLJ_B3722     TRUE 0.719 216.000 0.133 0.006 Y NA
 7507893 7507894 CLJ_B3722 CLJ_B3723     TRUE 0.993 13.000 0.349 0.006 Y NA
 7507894 7507895 CLJ_B3723 CLJ_B3724   gutM TRUE 0.867 43.000 0.116 NA N NA
 7507895 7507896 CLJ_B3724 CLJ_B3725 gutM   TRUE 0.975 14.000 0.333 NA N NA
 7507896 7507897 CLJ_B3725 CLJ_B3726     TRUE 0.894 35.000 0.091 1.000 N NA
 7507897 7507898 CLJ_B3726 CLJ_B3727   glmM FALSE 0.022 357.000 0.000 1.000 N NA
 7507898 7507899 CLJ_B3727 CLJ_B3728 glmM   FALSE 0.405 135.000 0.000 NA   NA
 7507899 7507900 CLJ_B3728 CLJ_B3729     TRUE 0.902 2.000 0.000 NA   NA
 7507900 7507901 CLJ_B3729 CLJ_B3730     TRUE 0.998 0.000 0.822 0.001 Y NA
 7507901 7507902 CLJ_B3730 CLJ_B3731     TRUE 0.961 16.000 0.075 0.001   NA
 7507902 7507903 CLJ_B3731 CLJ_B3732     TRUE 0.802 102.000 0.200 1.000   NA
 7507903 7507904 CLJ_B3732 CLJ_B3733   buk_1 FALSE 0.240 263.000 0.163 1.000   NA
 7507904 7507905 CLJ_B3733 CLJ_B3734 buk_1 ptb TRUE 0.980 29.000 0.275 1.000 Y NA
 7507905 7507906 CLJ_B3734 CLJ_B3735 ptb buk_2 TRUE 0.995 -7.000 0.118 1.000 Y NA
 7507906 7507907 CLJ_B3735 CLJ_B3736 buk_2   TRUE 0.593 101.000 0.007 NA   NA
 7507907 7507908 CLJ_B3736 CLJ_B3737     TRUE 0.971 2.000 0.083 NA   NA
 7507908 7507909 CLJ_B3737 CLJ_B3738     TRUE 0.993 -30.000 0.502 NA   NA
 7507911 7507912 CLJ_B3741 CLJ_B3742 gidA_2 trx TRUE 0.872 66.000 0.429 1.000   NA
 7507912 7507913 CLJ_B3742 CLJ_B3743 trx iadA TRUE 0.657 109.000 0.025 1.000   NA
 7507913 7507914 CLJ_B3743 CLJ_B3744 iadA   TRUE 0.672 75.000 0.025 1.000   NA
 7507914 7507915 CLJ_B3744 CLJ_B3745     TRUE 0.949 28.000 0.333 NA   NA
 7507915 7507916 CLJ_B3745 CLJ_B3746   ptsI TRUE 0.714 105.000 0.069 NA   NA
 7507918 7507919 CLJ_B3748 CLJ_B3749     TRUE 0.628 70.000 0.006 1.000   NA
 7507919 7507920 CLJ_B3749 CLJ_B3750     TRUE 0.943 92.000 0.262 0.000 Y NA
 7507920 7507921 CLJ_B3750 CLJ_B3751   cwlD TRUE 0.643 141.000 0.026 1.000 N NA
 7507921 7507922 CLJ_B3751 CLJ_B3752 cwlD   FALSE 0.077 260.000 0.000 1.000 N NA
 7507922 7507923 CLJ_B3752 CLJ_B3753   rpsI FALSE 0.037 306.000 0.000 1.000 N NA
 7507923 7507924 CLJ_B3753 CLJ_B3754 rpsI rplM TRUE 0.990 26.000 0.601 0.011 Y NA
 7507924 7507925 CLJ_B3754 CLJ_B3755 rplM truA_2 TRUE 0.871 121.000 0.031 1.000 Y NA
 7507925 7507926 CLJ_B3755 CLJ_B3756 truA_2   TRUE 0.989 0.000 0.404 1.000 N NA
 7507926 7507927 CLJ_B3756 CLJ_B3757     TRUE 0.996 -3.000 0.304 1.000 Y NA
 7507927 7507928 CLJ_B3757 CLJ_B3758     TRUE 0.998 -15.000 0.713 0.021 Y NA
 7507928 7507929 CLJ_B3758 CLJ_B3759   rplQ TRUE 0.738 91.000 0.074 1.000 N NA
 7507929 7507930 CLJ_B3759 CLJ_B3760 rplQ rpoA TRUE 0.947 44.000 0.873 1.000 N NA
 7507930 7507931 CLJ_B3760 CLJ_B3761 rpoA rpsD_2 TRUE 0.890 68.000 0.549 1.000 N NA
 7507931 7507932 CLJ_B3761 CLJ_B3762 rpsD_2 rpsK TRUE 0.983 35.000 0.509 0.015 Y NA
 7507932 7507933 CLJ_B3762 CLJ_B3763 rpsK rpsM TRUE 0.994 18.000 0.810 0.011 Y NA
 7507933 7507934 CLJ_B3763 CLJ_B3764 rpsM rpmJ TRUE 0.825 113.000 0.194 0.011   NA
 7507934 7507935 CLJ_B3764 CLJ_B3765 rpmJ infA TRUE 0.967 17.000 0.257 1.000   NA
 7507935 7507936 CLJ_B3765 CLJ_B3766 infA   TRUE 0.964 8.000 0.090 NA   NA
 7507936 7507937 CLJ_B3766 CLJ_B3767   map_1 TRUE 0.964 15.000 0.185 NA   NA
 7507937 7507938 CLJ_B3767 CLJ_B3768 map_1 adk TRUE 0.987 0.000 0.290 1.000 N NA
 7507938 7507939 CLJ_B3768 CLJ_B3769 adk secY TRUE 0.958 24.000 0.241 1.000 N NA
 7507939 7507940 CLJ_B3769 CLJ_B3770 secY rplO TRUE 0.991 1.000 0.730 1.000 N NA
 7507940 7507941 CLJ_B3770 CLJ_B3771 rplO rpmD TRUE 0.993 20.000 0.653 0.002 Y NA
 7507941 7507942 CLJ_B3771 CLJ_B3772 rpmD rpsE TRUE 0.995 14.000 0.789 0.015 Y NA
 7507942 7507943 CLJ_B3772 CLJ_B3773 rpsE rplR TRUE 0.994 18.000 0.814 0.015 Y NA
 7507943 7507944 CLJ_B3773 CLJ_B3774 rplR rplF TRUE 0.994 19.000 0.815 0.011 Y NA
 7507944 7507945 CLJ_B3774 CLJ_B3775 rplF rpsH TRUE 0.993 24.000 0.808 0.011 Y NA
 7507945 7507946 CLJ_B3775 CLJ_B3776 rpsH rpsN TRUE 0.986 30.000 0.473 0.011 Y NA
 7507946 7507947 CLJ_B3776 CLJ_B3777 rpsN rplE TRUE 0.993 17.000 0.496 0.011 Y NA
 7507947 7507948 CLJ_B3777 CLJ_B3778 rplE rplX TRUE 0.980 23.000 0.057 0.011 Y NA
 7507948 7507949 CLJ_B3778 CLJ_B3779 rplX rplN TRUE 0.980 24.000 0.071 0.015 Y NA
 7507949 7507950 CLJ_B3779 CLJ_B3780 rplN rpsQ TRUE 0.986 35.000 0.791 0.015 Y NA
 7507950 7507951 CLJ_B3780 CLJ_B3781 rpsQ rpmC TRUE 0.993 22.000 0.828 0.011 Y NA
 7507951 7507952 CLJ_B3781 CLJ_B3782 rpmC rplP TRUE 0.998 -10.000 0.802 0.011 Y NA
 7507952 7507953 CLJ_B3782 CLJ_B3783 rplP rpsC TRUE 0.994 18.000 0.828 0.015 Y NA
 7507953 7507954 CLJ_B3783 CLJ_B3784 rpsC rplV TRUE 0.994 18.000 0.719 0.015 Y NA
 7507954 7507955 CLJ_B3784 CLJ_B3785 rplV rpsS TRUE 0.993 22.000 0.769 0.015 Y NA
 7507955 7507956 CLJ_B3785 CLJ_B3786 rpsS rplB TRUE 0.968 70.000 0.820 0.015 Y NA
 7507956 7507957 CLJ_B3786 CLJ_B3787 rplB rplW TRUE 0.975 55.000 0.849 0.015 Y NA
 7507957 7507958 CLJ_B3787 CLJ_B3788 rplW rplD TRUE 0.996 0.000 0.307 0.011 Y NA
 7507958 7507959 CLJ_B3788 CLJ_B3789 rplD rplC TRUE 0.990 25.000 0.544 0.011 Y NA
 7507959 7507960 CLJ_B3789 CLJ_B3790 rplC rpsJ TRUE 0.952 90.000 0.467 0.015 Y NA
 7507960 7507961 CLJ_B3790 CLJ_B3791 rpsJ tuf_1 FALSE 0.179 402.000 0.318 1.000 Y NA
 7507961 7507962 CLJ_B3791 CLJ_B3792 tuf_1 fusA_1 TRUE 0.980 39.000 0.400 0.001 Y NA
 7507962 7507963 CLJ_B3792 CLJ_B3793 fusA_1 rpsG TRUE 0.954 73.000 0.579 1.000 Y NA
 7507963 7507964 CLJ_B3793 CLJ_B3794 rpsG rpsL TRUE 0.901 163.000 0.224 0.002 Y NA
 7507964 7507965 CLJ_B3794 CLJ_B3795 rpsL   TRUE 0.941 76.000 0.239 0.015 Y NA
 7507965 7507966 CLJ_B3795 CLJ_B3796   rpoC TRUE 0.727 122.000 0.065 1.000 N NA
 7507966 7507967 CLJ_B3796 CLJ_B3797 rpoC rpoB TRUE 0.994 21.000 0.851 0.001 Y NA
 7507967 7507968 CLJ_B3797 CLJ_B3798 rpoB rplL FALSE 0.271 265.000 0.223 1.000 N NA
 7507968 7507969 CLJ_B3798 CLJ_B3799 rplL rplJ TRUE 0.977 47.000 0.884 1.000 Y NA
 7507969 7507970 CLJ_B3799 CLJ_B3800 rplJ rplA TRUE 0.789 202.000 0.302 1.000 Y NA
 7507970 7507971 CLJ_B3800 CLJ_B3801 rplA rplK TRUE 0.974 57.000 0.838 0.015 Y NA
 7507971 7507972 CLJ_B3801 CLJ_B3802 rplK nusG TRUE 0.900 71.000 0.681 1.000 N NA
 7507972 7507973 CLJ_B3802 CLJ_B3803 nusG secE TRUE 0.941 47.000 0.843 1.000 N NA
 7507973 7507974 CLJ_B3803 CLJ_B3804 secE rpmG TRUE 0.752 50.000 0.016 1.000 N NA
 7507974 7507975 CLJ_B3804 CLJ_B3805 rpmG tuf_2 TRUE 0.598 202.000 0.006 1.000 Y NA
 7507975 7507976 CLJ_B3805 CLJ_B3806 tuf_2   FALSE 0.416 83.000 0.000 NA   NA
 7507976 7507977 CLJ_B3806 CLJ_B3807     TRUE 0.821 18.000 0.000 NA   NA
 7507977 7507978 CLJ_B3807 CLJ_B3808   sigH FALSE 0.460 64.000 0.000 NA   NA
 7507978 7507979 CLJ_B3808 CLJ_B3809 sigH   TRUE 0.843 74.000 0.361 NA   NA
 7507979 7507980 CLJ_B3809 CLJ_B3810     TRUE 0.972 3.000 0.109 NA   NA
 7507980 7507981 CLJ_B3810 CLJ_B3811   thyX TRUE 0.963 3.000 0.032 1.000 N NA
 7507981 7507982 CLJ_B3811 CLJ_B3812 thyX   TRUE 0.980 -10.000 0.055 1.000   NA
 7507982 7507983 CLJ_B3812 CLJ_B3813   cysS TRUE 0.844 50.000 0.129 1.000   NA
 7507983 7507984 CLJ_B3813 CLJ_B3814 cysS ilvA TRUE 0.847 29.000 0.003 1.000 N NA
 7507984 7507985 CLJ_B3814 CLJ_B3815 ilvA   TRUE 0.633 72.000 0.004 1.000 N NA
 7507985 7507986 CLJ_B3815 CLJ_B3816   ispD TRUE 0.603 111.000 0.002 1.000 N NA
 7507986 7507987 CLJ_B3816 CLJ_B3817 ispD   TRUE 0.976 2.000 0.134 NA   NA
 7507989 7507990 CLJ_B3819 CLJ_B3820   radA TRUE 0.951 19.000 0.126 NA   NA
 7507990 7507991 CLJ_B3820 CLJ_B3821 radA clpC TRUE 0.871 121.000 0.009 0.015 Y NA
 7507991 7507992 CLJ_B3821 CLJ_B3822 clpC   TRUE 0.978 2.000 0.129 1.000 N NA
 7507992 7507993 CLJ_B3822 CLJ_B3823     TRUE 0.989 5.000 0.848 1.000   NA
 7507993 7507994 CLJ_B3823 CLJ_B3824   ctsR TRUE 0.975 23.000 0.681 NA   NA
 7507994 7507995 CLJ_B3824 CLJ_B3825 ctsR   FALSE 0.012 396.000 0.000 NA   NA
 7507995 7507996 CLJ_B3825 CLJ_B3826   fusA_2 FALSE 0.073 304.000 0.021 NA   NA
 7507996 7507997 CLJ_B3826 CLJ_B3827 fusA_2   FALSE 0.200 187.000 0.000 NA   NA
 7507997 7507998 CLJ_B3827 CLJ_B3828     TRUE 0.759 26.000 0.000 NA   NA
 7507998 7507999 CLJ_B3828 CLJ_B3829   rrf_8 TRUE 0.877 8.000 0.000 NA   NA
 7507999 7508000 CLJ_B3829 CLJ_B3830 rrf_8 rrl_8 FALSE 0.416 91.000 0.000 NA   NA
 7508000 7508001 CLJ_B3830 CLJ_B3832 rrl_8   FALSE 0.438 74.000 0.000 NA   NA
 7508001 7508002 CLJ_B3832 CLJ_B3833   rrs_8 FALSE 0.414 87.000 0.000 NA   NA
 7508002 7508003 CLJ_B3833 CLJ_B3834 rrs_8   FALSE 0.107 225.000 0.000 NA   NA
 7508003 7508004 CLJ_B3834 CLJ_B3835     TRUE 0.902 2.000 0.000 NA   NA
 7508004 7508005 CLJ_B3835 CLJ_B3836   rrf_9 TRUE 0.879 7.000 0.000 NA   NA
 7508005 7508006 CLJ_B3836 CLJ_B3837 rrf_9 rrl_9 FALSE 0.418 93.000 0.000 NA   NA
 7508006 7508007 CLJ_B3837 CLJ_B3839 rrl_9 rrs_9 FALSE 0.113 223.000 0.000 NA   NA
 7508007 7508008 CLJ_B3839 CLJ_B3840 rrs_9 murD FALSE 0.004 571.000 0.000 NA   NA
 7508008 7508009 CLJ_B3840 CLJ_B3841 murD glyS FALSE 0.007 845.000 0.002 0.089 N NA
 7508009 7508010 CLJ_B3841 CLJ_B3842 glyS lysS FALSE 0.143 319.000 0.000 0.089 Y NA
 7508010 7508011 CLJ_B3842 CLJ_B3843 lysS greA_2 TRUE 0.952 19.000 0.098 1.000 N NA
 7508011 7508012 CLJ_B3843 CLJ_B3844 greA_2   TRUE 0.627 131.000 0.023 NA   NA
 7508012 7508013 CLJ_B3844 CLJ_B3845     TRUE 0.692 50.000 0.005 NA   NA
 7508013 7508014 CLJ_B3845 CLJ_B3846   coaX TRUE 0.960 10.000 0.054 1.000 N NA
 7508014 7508015 CLJ_B3846 CLJ_B3847 coaX fhs TRUE 0.543 155.000 0.011 1.000 N NA
 7508015 7508016 CLJ_B3847 CLJ_B3848 fhs ftsH_2 FALSE 0.232 203.000 0.000 0.089 N NA
 7508016 7508017 CLJ_B3848 CLJ_B3849 ftsH_2 hpt_2 TRUE 0.800 82.000 0.180 1.000 N NA
 7508017 7508018 CLJ_B3849 CLJ_B3850 hpt_2 tilS TRUE 0.990 -16.000 0.137 0.026 N NA
 7508018 7508019 CLJ_B3850 CLJ_B3851 tilS spoIIE TRUE 0.642 149.000 0.041 1.000 N NA
 7508019 7508020 CLJ_B3851 CLJ_B3852 spoIIE   FALSE 0.024 328.000 0.000 NA   NA
 7508020 7508021 CLJ_B3852 CLJ_B3853     TRUE 0.875 9.000 0.000 NA   NA
 7508021 7508022 CLJ_B3853 CLJ_B3854     TRUE 0.527 52.000 0.000 NA   NA
 7508022 7508023 CLJ_B3854 CLJ_B3855     TRUE 0.894 3.000 0.000 NA   NA
 7508023 7508024 CLJ_B3855 CLJ_B3856     TRUE 0.709 30.000 0.000 NA   NA
 7508024 7508025 CLJ_B3856 CLJ_B3857     TRUE 0.894 3.000 0.000 NA   NA
 7508025 7508026 CLJ_B3857 CLJ_B3858     TRUE 0.894 3.000 0.000 NA   NA
 7508026 7508027 CLJ_B3858 CLJ_B3859     FALSE 0.379 142.000 0.000 NA   NA
 7508027 7508028 CLJ_B3859 CLJ_B3860     TRUE 0.820 62.000 0.179 1.000   NA
 7508028 7508029 CLJ_B3860 CLJ_B3861     TRUE 0.823 95.000 0.303 NA   NA
 7508029 7508030 CLJ_B3861 CLJ_B3862   yabP TRUE 0.983 15.000 0.774 NA   NA
 7508030 7508031 CLJ_B3862 CLJ_B3863 yabP   TRUE 0.742 118.000 0.108 NA   NA
 7508031 7508032 CLJ_B3863 CLJ_B3864   hup TRUE 0.696 69.000 0.024 1.000 N NA
 7508032 7508033 CLJ_B3864 CLJ_B3865 hup   TRUE 0.620 128.000 0.014 1.000   NA
 7508033 7508034 CLJ_B3865 CLJ_B3866   spoVB_3 TRUE 0.926 15.000 0.015 1.000   NA
 7508034 7508035 CLJ_B3866 CLJ_B3867 spoVB_3   TRUE 0.737 133.000 0.108 NA   NA
 7508035 7508036 CLJ_B3867 CLJ_B3868     FALSE 0.450 199.000 0.088 NA N NA
 7508036 7508037 CLJ_B3868 CLJ_B3869   mfd TRUE 0.647 85.000 0.016 1.000 N NA
 7508037 7508038 CLJ_B3869 CLJ_B3870 mfd pth TRUE 0.933 28.000 0.137 1.000 N NA
 7508038 7508039 CLJ_B3870 CLJ_B3871 pth   TRUE 0.630 110.000 0.009 1.000 N NA
 7508039 7508040 CLJ_B3871 CLJ_B3872     TRUE 0.896 35.000 0.095 1.000 N NA
 7508040 7508041 CLJ_B3872 CLJ_B3873     TRUE 0.996 1.000 0.653 1.000 Y NA
 7508041 7508042 CLJ_B3873 CLJ_B3874   prsA TRUE 0.579 181.000 0.123 1.000 N NA
 7508042 7508043 CLJ_B3874 CLJ_B3875 prsA glmU TRUE 0.941 21.000 0.069 1.000 N NA
 7508043 7508044 CLJ_B3875 CLJ_B3876 glmU spoVG TRUE 0.779 162.000 0.011 1.000 Y NA
 7508044 7508045 CLJ_B3876 CLJ_B3877 spoVG purR TRUE 0.767 103.000 0.099 1.000 N NA
 7508046 7508047 CLJ_B3878 CLJ_B3879 murC   TRUE 0.614 65.000 0.004 NA   NA
 7508047 7508048 CLJ_B3879 CLJ_B3880     FALSE 0.430 77.000 0.000 NA   NA
 7508048 7508049 CLJ_B3880 CLJ_B3881     FALSE 0.417 92.000 0.000 NA   NA
 7508049 7508050 CLJ_B3881 CLJ_B3882     TRUE 0.779 90.000 0.156 1.000   NA
 7508050 7508051 CLJ_B3882 CLJ_B3883     FALSE 0.133 274.000 0.044 NA   NA
 7508052 7508053 CLJ_B3884 CLJ_B3885     TRUE 0.825 45.000 0.067 1.000   NA
 7508053 7508054 CLJ_B3885 CLJ_B3886     TRUE 0.725 68.000 0.058 NA   NA
 7508055 7508056 CLJ_B3887 CLJ_B3888     TRUE 0.905 33.000 0.133 NA   NA
 7508057 7508058 CLJ_B3889 CLJ_B3890     FALSE 0.036 303.000 0.000 1.000   NA
 7508058 7508059 CLJ_B3890 CLJ_B3891     TRUE 0.932 15.000 0.028 NA   NA
 7508059 7508060 CLJ_B3891 CLJ_B3892     TRUE 0.923 18.000 0.030 NA   NA
 7508060 7508061 CLJ_B3892 CLJ_B3893   murI TRUE 0.564 147.000 0.007 1.000 N NA
 7508064 7508065 CLJ_B3896 CLJ_B3897 murA_2   TRUE 0.915 26.000 0.058 1.000   NA
 7508065 7508066 CLJ_B3897 CLJ_B3898     TRUE 0.915 17.000 0.016 NA   NA
 7508066 7508067 CLJ_B3898 CLJ_B3899     TRUE 0.973 15.000 0.357 NA   NA
 7508067 7508068 CLJ_B3899 CLJ_B3900     FALSE 0.367 179.000 0.005 NA   NA
 7508069 7508070 CLJ_B3901 CLJ_B3902     FALSE 0.007 469.000 0.000 NA   NA
 7508070 7508071 CLJ_B3902 CLJ_B3903     TRUE 0.941 36.000 0.500 NA   NA
 7508072 7508073 CLJ_B3904 CLJ_B3905     FALSE 0.334 247.000 0.000 0.039 Y NA
 7508073 7508074 CLJ_B3905 CLJ_B3906   map_2 TRUE 0.940 20.000 0.059 1.000 N NA
 7508076 7508077 CLJ_B3908 CLJ_B3909     TRUE 0.993 -7.000 0.810 NA   NA
 7508077 7508078 CLJ_B3909 CLJ_B3910     FALSE 0.020 346.000 0.000 NA   NA
 7508078 7508079 CLJ_B3910 CLJ_B3911     TRUE 0.963 3.000 0.053 NA   NA
 7508079 7508080 CLJ_B3911 CLJ_B3912     TRUE 0.995 1.000 0.237 0.001 Y NA
 7508080 7508081 CLJ_B3912 CLJ_B3913     TRUE 0.978 9.000 0.260 1.000   NA
 7508081 7508082 CLJ_B3913 CLJ_B3914     FALSE 0.030 315.000 0.000 1.000   NA
 7508082 7508083 CLJ_B3914 CLJ_B3915     FALSE 0.042 300.000 0.000 1.000 N NA
 7508085 7508086 CLJ_B3917 CLJ_B3918     TRUE 0.797 107.000 0.220 NA   NA
 7508086 7508087 CLJ_B3918 CLJ_B3919     FALSE 0.428 181.000 0.031 NA   NA
 7508087 7508088 CLJ_B3919 CLJ_B3920     TRUE 0.666 88.000 0.031 1.000   NA
 7508089 7508090 CLJ_B3921 CLJ_B3922     TRUE 0.882 29.000 0.025 1.000 N NA
 7508090 7508091 CLJ_B3922 CLJ_B3923   accA FALSE 0.239 216.000 0.003 1.000 N NA
 7508091 7508092 CLJ_B3923 CLJ_B3924 accA accD TRUE 0.965 47.000 0.234 0.001 Y NA
 7508092 7508093 CLJ_B3924 CLJ_B3925 accD accC TRUE 0.982 20.000 0.090 1.000 Y NA
 7508093 7508094 CLJ_B3925 CLJ_B3926 accC fabZ TRUE 0.963 32.000 0.077 1.000 Y NA
 7508094 7508095 CLJ_B3926 CLJ_B3927 fabZ accB TRUE 0.983 20.000 0.058 0.003 Y NA
 7508095 7508096 CLJ_B3927 CLJ_B3928 accB fabF TRUE 0.989 4.000 0.074 1.000 Y NA
 7508096 7508097 CLJ_B3928 CLJ_B3929 fabF fabG TRUE 0.987 20.000 0.236 1.000 Y NA
 7508097 7508098 CLJ_B3929 CLJ_B3930 fabG fabD TRUE 0.988 18.000 0.149 0.003 Y NA
 7508098 7508099 CLJ_B3930 CLJ_B3931 fabD   TRUE 0.945 21.000 0.099 1.000   NA
 7508099 7508100 CLJ_B3931 CLJ_B3932   acpP_2 TRUE 0.798 127.000 0.216 1.000   NA
 7508100 7508101 CLJ_B3932 CLJ_B3933 acpP_2 fabH TRUE 0.902 41.000 0.121 0.003   NA
 7508101 7508102 CLJ_B3933 CLJ_B3934 fabH   TRUE 0.983 -7.000 0.098 1.000 N NA
 7508102 7508103 CLJ_B3934 CLJ_B3935     TRUE 0.935 16.000 0.032 1.000   NA
 7508103 7508104 CLJ_B3935 CLJ_B3936     TRUE 0.610 98.000 0.007 1.000   NA
 7508105 7508106 CLJ_B3937 CLJ_B3938     TRUE 0.994 -7.000 0.083 NA Y NA
 7508107 7508108 CLJ_B3939 CLJ_B3940     TRUE 0.889 4.000 0.000 NA   NA
 7508108 7508109 CLJ_B3940 CLJ_B3941     TRUE 0.877 8.000 0.000 NA   NA
 7508109 7508110 CLJ_B3941 CLJ_B3942     TRUE 0.833 16.000 0.000 NA   NA
 7508110 7508111 CLJ_B3942 CLJ_B3943     FALSE 0.499 56.000 0.000 NA   NA
 7508111 7508112 CLJ_B3943 CLJ_B3944     TRUE 0.882 6.000 0.000 NA   NA
 7508112 7508113 CLJ_B3944 CLJ_B3945     TRUE 0.826 17.000 0.000 NA   NA
 7508113 7508114 CLJ_B3945 CLJ_B3946     TRUE 0.885 5.000 0.000 NA   NA
 7508114 7508115 CLJ_B3946 CLJ_B3947     TRUE 0.889 4.000 0.000 NA   NA
 7508115 7508116 CLJ_B3947 CLJ_B3948     TRUE 0.877 8.000 0.000 NA   NA
 7508116 7508117 CLJ_B3948 CLJ_B3949     TRUE 0.826 17.000 0.000 NA   NA
 7508117 7508118 CLJ_B3949 CLJ_B3950     FALSE 0.254 173.000 0.000 NA   NA
 7508118 7508119 CLJ_B3950 CLJ_B3951     TRUE 0.920 13.000 0.006 NA   NA
 7508121 7508122 CLJ_B3953 CLJ_B3954     TRUE 0.802 103.000 0.222 NA   NA
 7508122 7508123 CLJ_B3954 CLJ_B3955   purA TRUE 0.558 125.000 0.002 NA   NA
 7508123 7508124 CLJ_B3955 CLJ_B3956 purA   FALSE 0.217 232.000 0.033 NA   NA
 7508124 7508125 CLJ_B3956 CLJ_B3957     FALSE 0.428 170.000 0.010 NA   NA
 7508125 7508126 CLJ_B3957 CLJ_B3958     FALSE 0.490 193.000 0.111 NA   NA
 7508126 7508127 CLJ_B3958 CLJ_B3959   dnaB FALSE 0.094 242.000 0.000 1.000 N NA
 7508127 7508128 CLJ_B3959 CLJ_B3960 dnaB   TRUE 0.907 31.000 0.053 0.088 N NA
 7508128 7508129 CLJ_B3960 CLJ_B3961   rplI TRUE 0.949 11.000 0.024 1.000 N NA
 7508129 7508130 CLJ_B3961 CLJ_B3962 rplI   TRUE 0.981 0.000 0.119 1.000 N NA
 7508130 7508131 CLJ_B3962 CLJ_B3963     TRUE 0.981 1.000 0.210 NA   NA
 7508131 7508132 CLJ_B3963 CLJ_B3964     TRUE 0.964 12.000 0.116 NA   NA
 7508132 7508133 CLJ_B3964 CLJ_B3965   rpsR TRUE 0.549 148.000 0.015 NA   NA
 7508133 7508134 CLJ_B3965 CLJ_B3966 rpsR ssb_1 TRUE 0.846 19.000 0.000 1.000 N NA
 7508134 7508135 CLJ_B3966 CLJ_B3967 ssb_1 rpsF TRUE 0.861 16.000 0.000 1.000 N NA
 7508135 7508136 CLJ_B3967 CLJ_B3968 rpsF   TRUE 0.586 106.000 0.002 NA N NA
 7508136 7508137 CLJ_B3968 CLJ_B3969     FALSE 0.056 266.000 0.000 NA   NA
 7508137 7508138 CLJ_B3969 CLJ_B3970     TRUE 0.955 16.000 0.121 NA   NA
 7508138 7508139 CLJ_B3970 CLJ_B3971     TRUE 0.967 7.000 0.105 NA   NA
 7508140 7508141 CLJ_B3972 CLJ_B3973   ytvI TRUE 0.958 14.000 0.111 NA   NA
 7508141 7508142 CLJ_B3973 CLJ_B3974 ytvI   TRUE 0.750 58.000 0.058 NA   NA
 7508143 7508144 CLJ_B3975 CLJ_B3976     TRUE 0.724 53.000 0.024 NA   NA
 7508144 7508145 CLJ_B3976 CLJ_B3977     TRUE 0.842 38.000 0.047 NA   NA
 7508145 7508146 CLJ_B3977 CLJ_B3978   soj TRUE 0.984 16.000 0.827 1.000 N NA
 7508146 7508147 CLJ_B3978 CLJ_B3979 soj   TRUE 0.730 124.000 0.069 1.000 N NA
 7508147 7508148 CLJ_B3979 CLJ_B3980   gidB TRUE 0.757 100.000 0.089 1.000 N NA
 7508148 7508149 CLJ_B3980 CLJ_B3981 gidB gidA_3 TRUE 0.970 24.000 0.466 1.000 N NA
 7508149 7508150 CLJ_B3981 CLJ_B3982 gidA_3 trmE TRUE 0.978 9.000 0.266 1.000   NA
 7508150 7508151 CLJ_B3982 CLJ_B3983 trmE jag TRUE 0.846 48.000 0.116 1.000   NA
 7508151 7508152 CLJ_B3983 CLJ_B3984 jag oxaA TRUE 0.966 18.000 0.254 1.000   NA
 7508152 7508153 CLJ_B3984 CLJ_B3985 oxaA   TRUE 0.962 26.000 0.461 NA   NA
 7508153 7508154 CLJ_B3985 CLJ_B3986   rnpA TRUE 0.991 -3.000 0.540 NA   NA
 7508154 7508155 CLJ_B3986 CLJ_B3987 rnpA rpmH TRUE 0.921 55.000 0.787 1.000   NA
 7503901 7503902 CLJ_0001 CLJ_0002     FALSE 0.010 418.000 0.000 NA   NA
 7503902 7503903 CLJ_0002 CLJ_0003     FALSE 0.249 174.000 0.000 NA   NA
 7503903 7503904 CLJ_0003 CLJ_0004   boNT/BvA4 FALSE 0.003 1183.000 0.000 NA   NA
 7503904 7503905 CLJ_0004 CLJ_0005 boNT/BvA4 ntnH_1 TRUE 0.709 44.000 0.000 0.001   NA
 7503905 7503906 CLJ_0005 CLJ_0006 ntnH_1 p47 TRUE 0.981 16.000 0.750 NA   NA
 7503907 7503908 CLJ_0007 CLJ_0008 botR_1   FALSE 0.003 1313.000 0.000 NA   NA
 7503908 7503909 CLJ_0008 CLJ_0009     TRUE 0.979 14.000 0.500 NA   NA
 7503909 7503910 CLJ_0009 CLJ_0010     TRUE 0.935 39.000 0.500 NA   NA
 7503911 7503912 CLJ_0011 CLJ_0012     FALSE 0.129 216.000 0.000 NA   NA
 7503912 7503913 CLJ_0012 CLJ_0013     FALSE 0.152 206.000 0.000 NA   NA
 7503913 7503914 CLJ_0013 CLJ_0014     TRUE 0.923 -3.000 0.000 NA   NA
 7503914 7503915 CLJ_0014 CLJ_0015     TRUE 0.623 40.000 0.000 NA   NA
 7503917 7503918 CLJ_0017 CLJ_0018 metK_2   TRUE 0.951 -3.000 0.000 0.088 N NA
 7503918 7503919 CLJ_0018 CLJ_0019     TRUE 0.937 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7503919 7503920 CLJ_0019 CLJ_0020     TRUE 0.673 34.000 0.000 NA   NA
 7503920 7503921 CLJ_0020 CLJ_0021     TRUE 0.810 20.000 0.000 NA   NA
 7503921 7503922 CLJ_0021 CLJ_0022     TRUE 0.810 20.000 0.000 NA   NA
 7503922 7503923 CLJ_0022 CLJ_0023     TRUE 0.759 26.000 0.000 NA   NA
 7503923 7503924 CLJ_0023 CLJ_0024     TRUE 0.856 13.000 0.000 NA   NA
 7503924 7503925 CLJ_0024 CLJ_0025     FALSE 0.470 61.000 0.000 NA   NA
 7503925 7503926 CLJ_0025 CLJ_0026     TRUE 0.861 14.000 0.000 1.000   NA
 7503926 7503927 CLJ_0026 CLJ_0027     TRUE 0.978 3.000 0.000 1.000 Y NA
 7503927 7503928 CLJ_0027 CLJ_0028     TRUE 0.602 42.000 0.000 NA   NA
 7503928 7503929 CLJ_0028 CLJ_0029     TRUE 0.892 23.000 0.014 NA   NA
 7503929 7503930 CLJ_0029 CLJ_0030     TRUE 0.856 13.000 0.000 NA   NA
 7503930 7503931 CLJ_0030 CLJ_0031     TRUE 0.791 23.000 0.000 NA   NA
 7503931 7503932 CLJ_0031 CLJ_0032     FALSE 0.424 100.000 0.000 NA   NA
 7503932 7503933 CLJ_0032 CLJ_0033     FALSE 0.004 626.000 0.000 NA   NA
 7503935 7503936 CLJ_0035 CLJ_0036     FALSE 0.350 150.000 0.000 NA   NA
 7503936 7503937 CLJ_0036 CLJ_0037     TRUE 0.772 25.000 0.000 NA   NA
 7503938 7503939 CLJ_0038 CLJ_0039   dnaN_2 TRUE 0.829 104.000 0.000 0.007 Y NA
 7503939 7503940 CLJ_0039 CLJ_0040 dnaN_2   FALSE 0.258 257.000 0.000 NA Y NA
 7503941 7503942 CLJ_0041 CLJ_0042     FALSE 0.040 293.000 0.000 NA   NA
 7503942 7503943 CLJ_0042 CLJ_0043     FALSE 0.051 272.000 0.000 NA   NA
 7503943 7503944 CLJ_0043 CLJ_0044     FALSE 0.330 154.000 0.000 NA   NA
 7503944 7503945 CLJ_0044 CLJ_0045     FALSE 0.415 88.000 0.000 NA   NA
 7503945 7503946 CLJ_0045 CLJ_0046     TRUE 0.664 35.000 0.000 NA   NA
 7503947 7503948 CLJ_0047 CLJ_0048     TRUE 0.938 -13.000 0.000 NA   NA
 7503948 7503949 CLJ_0048 CLJ_0049     TRUE 0.946 -49.000 0.000 NA   NA
 7503949 7503950 CLJ_0049 CLJ_0050     TRUE 0.971 10.000 0.000 NA Y NA
 7503952 7503953 CLJ_0052 CLJ_0053     TRUE 0.923 -3.000 0.000 NA   NA
 7503953 7503954 CLJ_0053 CLJ_0054     FALSE 0.031 305.000 0.000 NA   NA
 7503955 7503956 CLJ_0055 CLJ_0056     FALSE 0.301 162.000 0.000 NA   NA
 7503956 7503957 CLJ_0056 CLJ_0057     FALSE 0.413 122.000 0.000 NA   NA
 7503957 7503958 CLJ_0057 CLJ_0058     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 7503958 7503959 CLJ_0058 CLJ_0059     TRUE 0.826 17.000 0.000 NA   NA
 7503959 7503960 CLJ_0059 CLJ_0060     TRUE 0.772 25.000 0.000 NA   NA
 7503960 7503961 CLJ_0060 CLJ_0061     TRUE 0.923 -3.000 0.000 NA   NA
 7503961 7503962 CLJ_0061 CLJ_0062     FALSE 0.022 334.000 0.000 NA   NA
 7503962 7503963 CLJ_0062 CLJ_0063     TRUE 0.872 10.000 0.000 NA   NA
 7503963 7503964 CLJ_0063 CLJ_0064     TRUE 0.735 28.000 0.000 NA   NA
 7503964 7503965 CLJ_0064 CLJ_0065     FALSE 0.204 186.000 0.000 NA   NA
 7503965 7503966 CLJ_0065 CLJ_0066     FALSE 0.317 164.000 0.000 NA N NA
 7503966 7503967 CLJ_0066 CLJ_0067     FALSE 0.411 128.000 0.000 NA   NA
 7503967 7503968 CLJ_0067 CLJ_0068     FALSE 0.053 270.000 0.000 NA   NA
 7503968 7503969 CLJ_0068 CLJ_0069     FALSE 0.182 195.000 0.000 NA   NA
 7503969 7503970 CLJ_0069 CLJ_0070     FALSE 0.258 172.000 0.000 NA   NA
 7503970 7503971 CLJ_0070 CLJ_0071     FALSE 0.058 264.000 0.000 NA   NA
 7503972 7503973 CLJ_0072 CLJ_0073     TRUE 0.984 -6.000 0.000 NA Y NA
 7503974 7503975 CLJ_0074 CLJ_0075     TRUE 0.950 -31.000 0.000 1.000   NA
 7503977 7503978 CLJ_0077 CLJ_0078     FALSE 0.414 118.000 0.000 NA   NA
 7503979 7503980 CLJ_0079 CLJ_0080     TRUE 0.984 -16.000 0.095 NA   NA
 7503980 7503981 CLJ_0080 CLJ_0081     TRUE 0.985 -9.000 0.150 NA   NA
 7503981 7503982 CLJ_0081 CLJ_0082     FALSE 0.140 210.000 0.000 NA   NA
 7503983 7503984 CLJ_0083 CLJ_0084     TRUE 0.580 44.000 0.000 NA   NA
 7503984 7503985 CLJ_0084 CLJ_0085     FALSE 0.448 69.000 0.000 NA   NA
 7503985 7503986 CLJ_0085 CLJ_0086     FALSE 0.071 249.000 0.000 NA   NA
 7503988 7503989 CLJ_0088 CLJ_0089 ssb_2   TRUE 0.531 194.000 0.000 NA Y NA
 7503989 7503990 CLJ_0089 CLJ_0090     FALSE 0.312 159.000 0.000 NA   NA
 7503992 7503993 CLJ_0092 CLJ_0093     TRUE 0.799 22.000 0.000 NA   NA
 7503993 7503994 CLJ_0093 CLJ_0094     FALSE 0.416 90.000 0.000 NA   NA
 7503996 7503997 CLJ_0096 CLJ_0097 dnaX_2   FALSE 0.415 84.000 0.000 NA   NA
 7503997 7503998 CLJ_0097 CLJ_0098     TRUE 0.841 15.000 0.000 NA   NA
 7503998 7503999 CLJ_0098 CLJ_0099     TRUE 0.539 50.000 0.000 NA   NA
 7503999 7504000 CLJ_0099 CLJ_0100     TRUE 0.816 19.000 0.000 NA   NA
 7504000 7504001 CLJ_0100 CLJ_0101     FALSE 0.362 146.000 0.000 NA   NA
 7504001 7504002 CLJ_0101 CLJ_0102     FALSE 0.231 179.000 0.000 NA   NA
 7504002 7504003 CLJ_0102 CLJ_0103     FALSE 0.411 129.000 0.000 NA   NA
 7504003 7504004 CLJ_0103 CLJ_0104     FALSE 0.237 177.000 0.000 NA   NA
 7504004 7504005 CLJ_0104 CLJ_0105     FALSE 0.458 65.000 0.000 NA   NA
 7504005 7504006 CLJ_0105 CLJ_0106     FALSE 0.374 143.000 0.000 NA   NA
 7504006 7504007 CLJ_0106 CLJ_0107     FALSE 0.442 72.000 0.000 NA   NA
 7504007 7504008 CLJ_0107 CLJ_0108     FALSE 0.444 71.000 0.000 NA   NA
 7504008 7504009 CLJ_0108 CLJ_0109     FALSE 0.415 115.000 0.000 NA   NA
 7504009 7504010 CLJ_0109 CLJ_0110     FALSE 0.073 248.000 0.000 NA   NA
 7504010 7504011 CLJ_0110 CLJ_0111     FALSE 0.262 171.000 0.000 NA   NA
 7504011 7504012 CLJ_0111 CLJ_0112     TRUE 0.810 20.000 0.000 NA   NA
 7504012 7504013 CLJ_0112 CLJ_0113     FALSE 0.023 333.000 0.000 NA   NA
 7504013 7504014 CLJ_0113 CLJ_0114     FALSE 0.441 90.000 0.000 1.000   NA
 7504014 7504015 CLJ_0114 CLJ_0115     FALSE 0.023 342.000 0.000 1.000   NA
 7504015 7504016 CLJ_0115 CLJ_0116     TRUE 0.805 21.000 0.000 NA   NA
 7504016 7504017 CLJ_0116 CLJ_0117     FALSE 0.107 225.000 0.000 NA   NA
 7504017 7504018 CLJ_0117 CLJ_0118     FALSE 0.262 171.000 0.000 NA   NA
 7504018 7504019 CLJ_0118 CLJ_0119     FALSE 0.123 219.000 0.000 NA   NA
 7504019 7504020 CLJ_0119 CLJ_0120     FALSE 0.513 118.000 0.000 0.045   NA
 7504020 7504021 CLJ_0120 CLJ_0121     FALSE 0.204 186.000 0.000 NA   NA
 7504021 7504022 CLJ_0121 CLJ_0122     TRUE 0.945 -31.000 0.000 NA   NA
 7504022 7504023 CLJ_0122 CLJ_0123     FALSE 0.436 75.000 0.000 NA   NA
 7504023 7504024 CLJ_0123 CLJ_0124     FALSE 0.423 98.000 0.000 NA   NA
 7504024 7504025 CLJ_0124 CLJ_0125     TRUE 0.735 28.000 0.000 NA   NA
 7504025 7504026 CLJ_0125 CLJ_0126     TRUE 0.869 11.000 0.000 NA   NA
 7504026 7504027 CLJ_0126 CLJ_0127     FALSE 0.484 58.000 0.000 NA   NA
 7504027 7504028 CLJ_0127 CLJ_0128     TRUE 0.697 31.000 0.000 NA   NA
 7504028 7504029 CLJ_0128 CLJ_0129     FALSE 0.442 72.000 0.000 NA   NA
 7504029 7504030 CLJ_0129 CLJ_0130     FALSE 0.470 61.000 0.000 NA   NA
 7504030 7504031 CLJ_0130 CLJ_0131     TRUE 0.826 17.000 0.000 NA   NA
 7504031 7504032 CLJ_0131 CLJ_0132     TRUE 0.655 36.000 0.000 NA   NA
 7504032 7504033 CLJ_0132 CLJ_0133   boNT/BvB FALSE 0.003 1685.000 0.000 NA   NA
 7504033 7504034 CLJ_0133 CLJ_0134 boNT/BvB ntnH_2 TRUE 0.977 26.000 0.667 0.001   NA
 7504034 7504035 CLJ_0134 CLJ_0135 ntnH_2 botR_2 TRUE 0.817 162.000 0.667 1.000   NA
 7504036 7504037 CLJ_0136 CLJ_0137 ha33 ha17 TRUE 0.844 63.000 0.286 NA   NA
 7504037 7504038 CLJ_0137 CLJ_0138 ha17 ha70 TRUE 0.977 14.000 0.429 NA   NA
 7504040 7504041 CLJ_0140 CLJ_0141     FALSE 0.003 672.000 0.000 NA   NA
 7504042 7504043 CLJ_0142 CLJ_0143     TRUE 0.894 3.000 0.000 NA   NA
 7504043 7504044 CLJ_0143 CLJ_0144   spoIIID_2 TRUE 0.861 21.000 0.000 0.044   NA
 7504044 7504045 CLJ_0144 CLJ_0145 spoIIID_2   FALSE 0.417 111.000 0.000 NA   NA
 7504047 7504048 CLJ_0147 CLJ_0148     TRUE 0.942 -22.000 0.000 NA   NA
 7504048 7504049 CLJ_0148 CLJ_0149     FALSE 0.013 385.000 0.000 NA   NA
 7504049 7504050 CLJ_0149 CLJ_0150     FALSE 0.423 106.000 0.000 NA   NA
 7504050 7504051 CLJ_0150 CLJ_0151     FALSE 0.319 157.000 0.000 NA   NA
 7504051 7504052 CLJ_0151 CLJ_0152     FALSE 0.430 77.000 0.000 NA   NA
 7504052 7504053 CLJ_0152 CLJ_0153     FALSE 0.414 121.000 0.000 NA   NA
 7504053 7504054 CLJ_0153 CLJ_0154     FALSE 0.027 316.000 0.000 NA   NA
 7504054 7504055 CLJ_0154 CLJ_0155     TRUE 0.877 8.000 0.000 NA   NA
 7504055 7504056 CLJ_0155 CLJ_0156     FALSE 0.110 224.000 0.000 NA   NA
 7504056 7504057 CLJ_0156 CLJ_0157     TRUE 0.547 49.000 0.000 NA   NA
 7504057 7504058 CLJ_0157 CLJ_0158     FALSE 0.414 87.000 0.000 NA   NA
 7504058 7504059 CLJ_0158 CLJ_0159     FALSE 0.422 97.000 0.000 NA   NA
 7504059 7504060 CLJ_0159 CLJ_0160     FALSE 0.460 64.000 0.000 NA   NA
 7504060 7504061 CLJ_0160 CLJ_0161     TRUE 0.782 24.000 0.000 NA   NA
 7504061 7504062 CLJ_0161 CLJ_0162     FALSE 0.460 64.000 0.000 NA   NA
 7504062 7504063 CLJ_0162 CLJ_0163     TRUE 0.930 -7.000 0.000 NA   NA
 7504063 7504064 CLJ_0163 CLJ_0164     FALSE 0.478 59.000 0.000 NA   NA
 7504064 7504065 CLJ_0164 CLJ_0165     TRUE 0.673 34.000 0.000 NA   NA
 7504065 7504066 CLJ_0165 CLJ_0166     FALSE 0.499 56.000 0.000 NA   NA
 7504066 7504067 CLJ_0166 CLJ_0167     TRUE 0.709 30.000 0.000 NA   NA
 7504067 7504068 CLJ_0167 CLJ_0168     TRUE 0.735 28.000 0.000 NA   NA
 7504068 7504069 CLJ_0168 CLJ_0169     FALSE 0.127 217.000 0.000 NA   NA
 7504069 7504070 CLJ_0169 CLJ_0170     TRUE 0.580 44.000 0.000 NA   NA
 7504070 7504071 CLJ_0170 CLJ_0171     FALSE 0.010 410.000 0.000 NA   NA
 7504071 7504072 CLJ_0171 CLJ_0172     FALSE 0.421 81.000 0.000 NA   NA
 7504072 7504073 CLJ_0172 CLJ_0173     FALSE 0.444 71.000 0.000 NA   NA
 7504073 7504074 CLJ_0173 CLJ_0174     FALSE 0.007 469.000 0.000 NA   NA
 7504074 7504075 CLJ_0174 CLJ_0175     FALSE 0.330 154.000 0.000 NA   NA
 7504075 7504076 CLJ_0175 CLJ_0176     FALSE 0.209 184.000 0.000 NA   NA
 7504076 7504077 CLJ_0176 CLJ_0177     FALSE 0.417 92.000 0.000 NA   NA
 7504077 7504078 CLJ_0177 CLJ_0178     FALSE 0.411 129.000 0.000 NA   NA
 7504078 7504079 CLJ_0178 CLJ_0179     FALSE 0.470 61.000 0.000 NA   NA
 7504079 7504080 CLJ_0179 CLJ_0180     TRUE 0.673 34.000 0.000 NA   NA
 7504080 7504081 CLJ_0180 CLJ_0181     TRUE 0.923 -3.000 0.000 NA   NA
 7504081 7504082 CLJ_0181 CLJ_0182     FALSE 0.484 58.000 0.000 NA   NA
 7504082 7504083 CLJ_0182 CLJ_0183     FALSE 0.415 115.000 0.000 NA   NA
 7504083 7504084 CLJ_0183 CLJ_0184     FALSE 0.424 100.000 0.000 NA   NA
 7504084 7504085 CLJ_0184 CLJ_0185     FALSE 0.025 325.000 0.000 NA   NA
 7504085 7504086 CLJ_0185 CLJ_0186     FALSE 0.075 246.000 0.000 NA   NA
 7504086 7504087 CLJ_0186 CLJ_0187     TRUE 0.902 2.000 0.000 NA   NA
 7504087 7504088 CLJ_0187 CLJ_0188     FALSE 0.413 123.000 0.000 NA   NA
 7504090 7504091 CLJ_0190 CLJ_0191     FALSE 0.054 268.000 0.000 NA   NA
 7504091 7504092 CLJ_0191 CLJ_0192   ftsH_3 FALSE 0.451 68.000 0.000 NA   NA
 7504092 7504093 CLJ_0192 CLJ_0193 ftsH_3   FALSE 0.416 90.000 0.000 NA   NA
 7504093 7504094 CLJ_0193 CLJ_0194     FALSE 0.037 295.000 0.000 NA   NA
 7504094 7504095 CLJ_0194 CLJ_0195     TRUE 0.848 14.000 0.000 NA   NA
 7504095 7504096 CLJ_0195 CLJ_0196     FALSE 0.413 123.000 0.000 NA   NA
 7504096 7504097 CLJ_0196 CLJ_0197     FALSE 0.415 84.000 0.000 NA   NA
 7504097 7504098 CLJ_0197 CLJ_0198     FALSE 0.013 389.000 0.000 NA   NA
 7504098 7504099 CLJ_0198 CLJ_0199     TRUE 0.805 21.000 0.000 NA   NA
 7504099 7504100 CLJ_0199 CLJ_0200     TRUE 0.810 20.000 0.000 NA   NA
 7504100 7504101 CLJ_0200 CLJ_0201     TRUE 0.782 24.000 0.000 NA   NA
 7504101 7504102 CLJ_0201 CLJ_0202     TRUE 0.709 30.000 0.000 NA   NA
 7504102 7504103 CLJ_0202 CLJ_0203     FALSE 0.164 201.000 0.000 NA   NA
 7504103 7504104 CLJ_0203 CLJ_0204     FALSE 0.076 244.000 0.000 NA   NA
 7504104 7504105 CLJ_0204 CLJ_0205     TRUE 0.989 -10.000 0.000 0.014 Y NA
 7504105 7504106 CLJ_0205 CLJ_0206     TRUE 0.938 -13.000 0.000 NA   NA
 7504106 7504107 CLJ_0206 CLJ_0207     TRUE 0.602 42.000 0.000 NA   NA
 7504107 7504108 CLJ_0207 CLJ_0208     TRUE 0.930 -7.000 0.000 NA   NA
 7504108 7504109 CLJ_0208 CLJ_0209     FALSE 0.395 166.000 0.000 0.006   NA
 7504109 7504110 CLJ_0209 CLJ_0210     FALSE 0.442 91.000 0.000 1.000   NA
 7504110 7504111 CLJ_0210 CLJ_0211     FALSE 0.044 293.000 0.000 1.000   NA
 7504111 7504112 CLJ_0211 CLJ_0212     FALSE 0.022 338.000 0.000 NA   NA
 7504112 7504113 CLJ_0212 CLJ_0213     FALSE 0.417 111.000 0.000 NA   NA
 7504113 7504114 CLJ_0213 CLJ_0214     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 7504114 7504115 CLJ_0214 CLJ_0215     FALSE 0.004 608.000 0.000 NA   NA
 7504115 7504116 CLJ_0215 CLJ_0216     TRUE 0.673 34.000 0.000 NA   NA
 7504116 7504117 CLJ_0216 CLJ_0217     FALSE 0.006 474.000 0.000 NA   NA
 7504117 7504118 CLJ_0217 CLJ_0218     FALSE 0.410 131.000 0.000 NA   NA
 7504118 7504119 CLJ_0218 CLJ_0219     TRUE 0.894 3.000 0.000 NA   NA
 7504119 7504120 CLJ_0219 CLJ_0220     FALSE 0.430 77.000 0.000 NA   NA
 7504120 7504121 CLJ_0220 CLJ_0221     FALSE 0.379 142.000 0.000 NA   NA
 7504121 7504122 CLJ_0221 CLJ_0222     TRUE 0.885 5.000 0.000 NA   NA
 7504122 7504123 CLJ_0222 CLJ_0223     TRUE 0.821 18.000 0.000 NA   NA
 7504123 7504124 CLJ_0223 CLJ_0224     TRUE 0.946 -39.000 0.000 NA   NA
 7504124 7504125 CLJ_0224 CLJ_0225     FALSE 0.277 168.000 0.000 NA   NA
 7504125 7504126 CLJ_0225 CLJ_0226     FALSE 0.249 174.000 0.000 NA   NA
 7504126 7504127 CLJ_0226 CLJ_0227     FALSE 0.422 97.000 0.000 NA   NA
 7504129 7504130 CLJ_0228 CLJ_0230     FALSE 0.414 120.000 0.000 NA   NA
 7504130 7504131 CLJ_0230 CLJ_0231     TRUE 0.799 22.000 0.000 NA   NA
 7504131 7504132 CLJ_0231 CLJ_0232     TRUE 0.885 68.000 0.500 1.000 N NA
 7504132 7504133 CLJ_0232 CLJ_0233     TRUE 0.892 74.000 0.750 NA   NA
 7504133 7504134 CLJ_0233 CLJ_0234     TRUE 0.820 107.000 0.286 NA   NA
 7504134 7504135 CLJ_0234 CLJ_0235     FALSE 0.414 121.000 0.000 NA   NA
 7504135 7504136 CLJ_0235 CLJ_0236     TRUE 0.655 36.000 0.000 NA   NA
 7504136 7504137 CLJ_0236 CLJ_0237     FALSE 0.441 73.000 0.000 NA   NA
 7504137 7504138 CLJ_0237 CLJ_0238     FALSE 0.123 219.000 0.000 NA   NA
 7504138 7504139 CLJ_0238 CLJ_0239     TRUE 0.992 -10.000 0.583 NA   NA
 7504139 7504140 CLJ_0239 CLJ_0240     TRUE 0.966 26.000 0.571 NA   NA
 7504140 7504141 CLJ_0240 CLJ_0241     TRUE 0.881 71.000 0.600 NA   NA
 7504141 7504142 CLJ_0241 CLJ_0242     TRUE 0.735 28.000 0.000 NA   NA
 7504142 7504143 CLJ_0242 CLJ_0243     TRUE 0.746 27.000 0.000 NA   NA
 7504143 7504144 CLJ_0243 CLJ_0244     FALSE 0.520 53.000 0.000 NA   NA
 7504144 7504145 CLJ_0244 CLJ_0245     TRUE 0.946 -45.000 0.000 NA   NA
 7504145 7504146 CLJ_0245 CLJ_0246     FALSE 0.413 123.000 0.000 NA   NA
 7504146 7504147 CLJ_0246 CLJ_0247     TRUE 0.558 47.000 0.000 NA   NA
 7504147 7504148 CLJ_0247 CLJ_0248     FALSE 0.403 136.000 0.000 NA   NA
 7504148 7504149 CLJ_0248 CLJ_0249     TRUE 0.826 17.000 0.000 NA   NA
 7504149 7504150 CLJ_0249 CLJ_0250     FALSE 0.409 132.000 0.000 NA   NA
 7504150 7504151 CLJ_0250 CLJ_0251     TRUE 0.816 19.000 0.000 NA   NA
 7504151 7504152 CLJ_0251 CLJ_0252     FALSE 0.391 145.000 0.000 1.000   NA
 7504152 7504153 CLJ_0252 CLJ_0253     FALSE 0.419 94.000 0.000 NA   NA
 7504153 7504154 CLJ_0253 CLJ_0254     FALSE 0.438 74.000 0.000 NA   NA
 7504154 7504155 CLJ_0254 CLJ_0255     FALSE 0.484 58.000 0.000 NA   NA
 7504157 7504158 CLJ_0257 CLJ_0258     FALSE 0.310 165.000 0.000 1.000   NA
 7504158 7504159 CLJ_0258 CLJ_0259     TRUE 0.527 52.000 0.000 NA   NA
 7504159 7504160 CLJ_0259 CLJ_0260     TRUE 0.943 -25.000 0.000 NA   NA
 7504160 7504161 CLJ_0260 CLJ_0261     FALSE 0.140 210.000 0.000 NA   NA
 7504161 7504162 CLJ_0261 CLJ_0262     FALSE 0.438 74.000 0.000 NA   NA
 7504162 7504163 CLJ_0262 CLJ_0263     TRUE 0.869 11.000 0.000 NA   NA
 7504163 7504164 CLJ_0263 CLJ_0264     TRUE 0.722 29.000 0.000 NA   NA
 7504164 7504165 CLJ_0264 CLJ_0265     TRUE 0.592 43.000 0.000 NA   NA
 7504165 7504166 CLJ_0265 CLJ_0266     FALSE 0.514 54.000 0.000 NA   NA
 7504166 7504167 CLJ_0266 CLJ_0267     FALSE 0.419 82.000 0.000 NA   NA
 7504169 7504170 CLJ_0269 CLJ_0270     FALSE 0.306 161.000 0.000 NA   NA
 7504170 7504171 CLJ_0270 CLJ_0271     TRUE 0.891 11.000 0.000 1.000 N NA
 7504171 7504172 CLJ_0271 CLJ_0272     TRUE 0.997 -31.000 0.431 1.000 Y NA
 7504172 7504173 CLJ_0272 CLJ_0273     TRUE 0.816 19.000 0.000 NA   NA
 7504173 7504174 CLJ_0273 CLJ_0274     FALSE 0.041 291.000 0.000 NA   NA
 7504174 7504175 CLJ_0274 CLJ_0275     TRUE 0.923 -3.000 0.000 NA   NA
 7504175 7504176 CLJ_0275 CLJ_0276     FALSE 0.037 295.000 0.000 NA   NA
 7504176 7504177 CLJ_0276 CLJ_0277     FALSE 0.436 75.000 0.000 NA   NA
 7504177 7504178 CLJ_0277 CLJ_0278     TRUE 0.816 19.000 0.000 NA   NA
 7504178 7504179 CLJ_0278 CLJ_0279     FALSE 0.017 707.000 0.000 1.000 Y NA
 7504179 7504180 CLJ_0279 CLJ_0280     FALSE 0.415 115.000 0.000 NA   NA
 7504180 7504181 CLJ_0280 CLJ_0281     TRUE 0.580 44.000 0.000 NA   NA
 7504181 7504182 CLJ_0281 CLJ_0282     FALSE 0.039 294.000 0.000 NA   NA
 7504182 7504183 CLJ_0282 CLJ_0283     TRUE 0.782 24.000 0.000 NA   NA
 7504185 7504186 CLJ_0285 CLJ_0286     FALSE 0.096 230.000 0.000 NA   NA
 7504186 7504187 CLJ_0286 CLJ_0287     FALSE 0.015 373.000 0.000 NA   NA
 7504187 7504188 CLJ_0287 CLJ_0288     TRUE 0.709 30.000 0.000 NA   NA
 7504188 7504189 CLJ_0288 CLJ_0289     FALSE 0.374 143.000 0.000 NA   NA
 7504189 7504190 CLJ_0289 CLJ_0290     FALSE 0.520 53.000 0.000 NA   NA
 7504190 7504191 CLJ_0290 CLJ_0291     FALSE 0.133 214.000 0.000 NA   NA
 7504191 7504192 CLJ_0291 CLJ_0292     FALSE 0.131 215.000 0.000 NA   NA
 7504192 7504193 CLJ_0292 CLJ_0293     FALSE 0.033 303.000 0.000 NA   NA
 7504193 7504194 CLJ_0293 CLJ_0294     FALSE 0.455 66.000 0.000 NA   NA
 7504194 7504195 CLJ_0294 CLJ_0295     TRUE 0.927 -6.000 0.000 NA   NA
 7504195 7504196 CLJ_0295 CLJ_0296     FALSE 0.037 295.000 0.000 NA   NA
 7504196 7504197 CLJ_0296 CLJ_0297     FALSE 0.422 97.000 0.000 NA   NA
 7504197 7504198 CLJ_0297 CLJ_0298     FALSE 0.310 160.000 0.000 NA   NA
 7504198 7504199 CLJ_0298 CLJ_0299     FALSE 0.446 70.000 0.000 NA   NA
 7504199 7504200 CLJ_0299 CLJ_0300     FALSE 0.411 128.000 0.000 NA   NA
 7504200 7504201 CLJ_0300 CLJ_0301     TRUE 0.564 46.000 0.000 NA   NA
 7504201 7504202 CLJ_0301 CLJ_0302     TRUE 0.623 40.000 0.000 NA   NA
 7504202 7504203 CLJ_0302 CLJ_0303     TRUE 0.841 15.000 0.000 NA   NA
 7504203 7504204 CLJ_0303 CLJ_0304     FALSE 0.442 72.000 0.000 NA   NA
 7504204 7504205 CLJ_0304 CLJ_0305     FALSE 0.327 155.000 0.000 NA   NA
 7504205 7504206 CLJ_0305 CLJ_0306     FALSE 0.129 216.000 0.000 NA   NA
 7504206 7504207 CLJ_0306 CLJ_0307     FALSE 0.395 138.000 0.000 NA   NA
 7504207 7504208 CLJ_0307 CLJ_0308     FALSE 0.420 95.000 0.000 NA   NA
 7504208 7504209 CLJ_0308 CLJ_0309     TRUE 0.655 36.000 0.000 NA   NA
 7504209 7504210 CLJ_0309 CLJ_0310     FALSE 0.277 168.000 0.000 NA   NA
 7504210 7503901 CLJ_0310 CLJ_0001     FALSE 0.107 225.000 0.000 NA   NA
 7504211 7504212 CLJ_A0001 CLJ_A0002     TRUE 0.664 35.000 0.000 NA   NA
 7504212 7504213 CLJ_A0002 CLJ_A0003     FALSE 0.004 1775.000 0.000 0.007   NA
 7504213 7504214 CLJ_A0003 CLJ_A0004     FALSE 0.019 386.000 0.000 0.043   NA
 7504216 7504211 CLJ_A0006 CLJ_A0001     FALSE 0.002 2632.000 0.000 NA   NA