MicrobesOnline Operon Predictions for Helicobacter pylori Shi470

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5753622 5753623 HPSH_00005 HPSH_00010 nusB ribH TRUE 0.947 2.000 0.045 1.000 N NA
 5753623 5753624 HPSH_00010 HPSH_00015 ribH   TRUE 0.931 10.000 0.027 1.000 N NA
 5753624 5753625 HPSH_00015 HPSH_00020     TRUE 0.913 -13.000 0.025 1.000 N NA
 5753626 5753627 HPSH_00025 HPSH_00030   panC TRUE 0.933 1.000 0.012 1.000 N NA
 5753628 5753629 HPSH_t08282 HPSH_t08284     FALSE 0.128 64.000 0.000 NA   NA
 5753629 5753630 HPSH_t08284 HPSH_t08286     FALSE 0.239 41.000 0.000 NA   NA
 5753630 5753631 HPSH_t08286 HPSH_t08288     FALSE 0.229 42.000 0.000 NA   NA
 5753631 5753632 HPSH_t08288 HPSH_t08290     TRUE 0.629 11.000 0.000 NA   NA
 5753632 5753633 HPSH_t08290 HPSH_00035   hopZ FALSE 0.026 501.000 0.000 NA   NA
 5753633 5753634 HPSH_00035 HPSH_00045 hopZ   FALSE 0.032 262.000 0.000 NA   NA
 5753634 5753635 HPSH_00045 HPSH_00050   groEL FALSE 0.213 44.000 0.000 NA   NA
 5753635 5753636 HPSH_00050 HPSH_00055 groEL groES TRUE 0.932 25.000 0.356 1.000 Y NA
 5753637 5753638 HPSH_00060 HPSH_00065 dnaG   TRUE 0.955 -3.000 0.035 1.000 N NA
 5753638 5753639 HPSH_00065 HPSH_00070     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 5753639 5753640 HPSH_00070 HPSH_00075     TRUE 0.544 -15.000 0.000 NA   NA
 5753640 5753641 HPSH_00075 HPSH_00080     FALSE 0.259 146.000 0.235 NA   NA
 5753641 5753642 HPSH_00080 HPSH_00085     TRUE 0.975 0.000 1.000 NA   NA
 5753642 5753643 HPSH_00085 HPSH_00090     TRUE 0.968 2.000 1.000 NA   NA
 5753643 5753644 HPSH_00090 HPSH_00095     FALSE 0.030 321.000 0.000 NA   NA
 5753644 5753645 HPSH_00095 HPSH_00100     FALSE 0.294 95.000 0.071 NA   NA
 5753645 5753646 HPSH_00100 HPSH_00105     TRUE 0.957 -3.000 0.042 1.000 N NA
 5753647 5753648 HPSH_00110 HPSH_00115     TRUE 0.959 11.000 0.429 1.000   NA
 5753648 5753649 HPSH_00115 HPSH_00120     FALSE 0.029 337.000 0.000 NA   NA
 5753652 5753653 HPSH_00135 HPSH_00140     FALSE 0.281 72.000 0.021 NA   NA
 5753654 5753655 HPSH_00145 HPSH_00150     TRUE 0.607 4.000 0.000 NA   NA
 5753656 5753657 HPSH_00155 HPSH_00160     TRUE 0.834 8.000 0.021 NA   NA
 5753657 5753658 HPSH_00160 HPSH_00165     TRUE 0.965 0.000 0.596 NA   NA
 5753658 5753659 HPSH_00165 HPSH_00170     TRUE 0.911 -10.000 0.014 1.000 N NA
 5753659 5753660 HPSH_00170 HPSH_00175     TRUE 0.861 11.000 0.029 NA   NA
 5753660 5753661 HPSH_00175 HPSH_00180     TRUE 0.881 0.000 0.017 NA   NA
 5753661 5753662 HPSH_00180 HPSH_00185     TRUE 0.958 6.000 0.533 1.000   NA
 5753662 5753663 HPSH_00185 HPSH_00190     TRUE 0.917 16.000 0.375 NA   NA
 5753663 5753664 HPSH_00190 HPSH_00195     TRUE 0.954 -3.000 0.375 NA   NA
 5753664 5753665 HPSH_00195 HPSH_00200     TRUE 0.986 0.000 1.000 NA Y NA
 5753665 5753666 HPSH_00200 HPSH_00205     TRUE 0.970 -7.000 0.500 NA Y NA
 5753666 5753667 HPSH_00205 HPSH_00210     FALSE 0.483 71.000 0.020 1.000 N NA
 5753667 5753668 HPSH_00210 HPSH_00215     TRUE 0.871 28.000 0.054 1.000 Y NA
 5753668 5753669 HPSH_00215 HPSH_00220     TRUE 0.988 -7.000 0.381 0.006 Y NA
 5753670 5753671 HPSH_00225 HPSH_00230     FALSE 0.072 101.000 0.000 NA   NA
 5753671 5753672 HPSH_00230 HPSH_00235     TRUE 0.962 3.000 0.079 1.000 Y NA
 5753672 5753673 HPSH_00235 HPSH_00240     TRUE 0.949 -3.000 0.023 1.000 N NA
 5753673 5753674 HPSH_00240 HPSH_00245     TRUE 0.635 59.000 0.061 1.000 N NA
 5753674 5753675 HPSH_00245 HPSH_00250     TRUE 0.987 -3.000 0.192 0.026 Y NA
 5753675 5753676 HPSH_00250 HPSH_00255     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 5753676 5753677 HPSH_00255 HPSH_00260     FALSE 0.337 28.000 0.000 NA   NA
 5753677 5753678 HPSH_00260 HPSH_00265     FALSE 0.239 41.000 0.000 NA   NA
 5753678 5753679 HPSH_00265 HPSH_00270     TRUE 0.521 -19.000 0.000 NA   NA
 5753679 5753680 HPSH_00270 HPSH_00275     TRUE 0.870 27.000 0.141 1.000 N NA
 5753681 5753682 HPSH_00280 HPSH_00285     FALSE 0.062 111.000 0.000 NA   NA
 5753684 5753685 HPSH_00295 HPSH_00300     TRUE 0.862 -30.000 0.182 NA   NA
 5753685 5753686 HPSH_00300 HPSH_00305     TRUE 0.956 2.000 0.636 NA   NA
 5753686 5753687 HPSH_00305 HPSH_00310     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 5753688 5753689 HPSH_00320 HPSH_00325     TRUE 0.991 0.000 0.337 0.009 Y NA
 5753689 5753690 HPSH_00325 HPSH_00330     TRUE 0.958 29.000 0.439 0.009 Y NA
 5753690 5753691 HPSH_00330 HPSH_00335   ureE TRUE 0.959 29.000 0.460 0.009 Y NA
 5753691 5753692 HPSH_00335 HPSH_00340 ureE   TRUE 0.938 2.000 0.096 1.000   NA
 5753692 5753693 HPSH_00340 HPSH_00345     FALSE 0.116 68.000 0.000 NA   NA
 5753693 5753694 HPSH_00345 HPSH_00350   ureC TRUE 0.584 15.000 0.000 NA   NA
 5753694 5753695 HPSH_00350 HPSH_00355 ureC   TRUE 0.978 4.000 0.045 0.002 Y NA
 5753695 5753696 HPSH_00355 HPSH_t08292     FALSE 0.031 267.000 0.000 NA   NA
 5753696 5753697 HPSH_t08292 HPSH_00360   lspA FALSE 0.460 21.000 0.000 NA   NA
 5753697 5753698 HPSH_00360 HPSH_00365 lspA   TRUE 0.948 -6.000 0.042 1.000 N NA
 5753699 5753700 HPSH_00370 HPSH_00375 rpsT prfA FALSE 0.415 117.000 0.029 1.000 Y NA
 5753700 5753701 HPSH_00375 HPSH_00380 prfA   FALSE 0.027 391.000 0.000 NA   NA
 5753701 5753702 HPSH_00380 HPSH_00385     FALSE 0.098 78.000 0.000 NA   NA
 5753702 5753703 HPSH_00385 HPSH_00390     FALSE 0.032 255.000 0.000 NA   NA
 5753703 5753704 HPSH_00390 HPSH_00395     FALSE 0.030 295.000 0.000 NA   NA
 5753705 5753706 HPSH_00400 HPSH_00405   rpsI FALSE 0.247 148.000 0.012 1.000 N NA
 5753706 5753707 HPSH_00405 HPSH_00410 rpsI rplM TRUE 0.987 -3.000 0.231 0.038 Y NA
 5753707 5753708 HPSH_00410 HPSH_00415 rplM   FALSE 0.067 106.000 0.000 NA   NA
 5753708 5753709 HPSH_00415 HPSH_00420     TRUE 0.521 -19.000 0.000 NA   NA
 5753709 5753710 HPSH_00420 HPSH_00425     TRUE 0.910 7.000 0.216 NA   NA
 5753710 5753711 HPSH_00425 HPSH_00430     FALSE 0.461 60.000 0.096 NA   NA
 5753711 5753712 HPSH_00430 HPSH_00435     TRUE 0.738 20.000 0.017 NA   NA
 5753712 5753713 HPSH_00435 HPSH_00440     FALSE 0.202 191.000 0.011 1.000 N NA
 5753713 5753714 HPSH_00440 HPSH_00445     TRUE 0.939 11.000 0.037 1.000 N NA
 5753715 5753716 HPSH_t08294 HPSH_00450   hsdR FALSE 0.037 204.000 0.000 NA   NA
 5753716 5753717 HPSH_00450 HPSH_00465 hsdR   TRUE 0.660 -6.000 0.000 NA   NA
 5753718 5753719 HPSH_00470 HPSH_00475     FALSE 0.412 99.000 0.364 NA   NA
 5753721 5753722 HPSH_00485 HPSH_00490     FALSE 0.164 105.000 0.012 NA   NA
 5753723 5753724 HPSH_00495 HPSH_00500     TRUE 0.893 0.000 0.024 NA   NA
 5753724 5753725 HPSH_00500 HPSH_00505     FALSE 0.137 116.000 0.010 NA   NA
 5753726 5753727 HPSH_00510 HPSH_00515     TRUE 0.880 31.000 0.700 NA N NA
 5753727 5753728 HPSH_00515 HPSH_00520     FALSE 0.115 209.000 0.000 1.000 N NA
 5753728 5753729 HPSH_00520 HPSH_00525     FALSE 0.241 140.000 0.010 1.000 N NA
 5753729 5753730 HPSH_00525 HPSH_00530     TRUE 0.788 35.000 0.048 1.000 N NA
 5753730 5753731 HPSH_00530 HPSH_00535     TRUE 0.980 21.000 0.690 0.014 Y NA
 5753733 5753734 HPSH_00550 HPSH_00555 dnaK   TRUE 0.905 31.000 0.029 0.012 Y NA
 5753734 5753735 HPSH_00555 HPSH_00560     TRUE 0.957 0.000 0.038 1.000 N NA
 5753736 5753737 HPSH_00565 HPSH_00570     TRUE 0.761 22.000 0.047 NA   NA
 5753738 5753739 HPSH_00575 HPSH_00580     TRUE 0.647 63.000 0.700 NA   NA
 5753740 5753741 HPSH_00585 HPSH_00590     TRUE 0.902 -10.000 0.010 1.000 N NA
 5753742 5753743 HPSH_00595 HPSH_00600     FALSE 0.030 284.000 0.000 NA   NA
 5753743 5753744 HPSH_00600 HPSH_00605     FALSE 0.073 100.000 0.000 NA   NA
 5753745 5753746 HPSH_00610 HPSH_00615   thrS TRUE 0.608 41.000 0.076 NA   NA
 5753746 5753747 HPSH_00615 HPSH_00620 thrS infC TRUE 0.970 -3.000 0.060 1.000 Y NA
 5753747 5753748 HPSH_00620 HPSH_00625 infC rpmI TRUE 0.971 -19.000 0.652 1.000 Y NA
 5753748 5753749 HPSH_00625 HPSH_00630 rpmI rplT TRUE 0.850 95.000 0.928 0.037 Y NA
 5753749 5753750 HPSH_00630 HPSH_00635 rplT   FALSE 0.071 211.000 0.007 NA   NA
 5753750 5753751 HPSH_00635 HPSH_00640     TRUE 0.683 52.000 0.500 NA   NA
 5753751 5753752 HPSH_00640 HPSH_00645     FALSE 0.320 178.000 0.600 NA   NA
 5753752 5753753 HPSH_00645 HPSH_00650     FALSE 0.027 404.000 0.000 NA   NA
 5753753 5753754 HPSH_00650 HPSH_00655     FALSE 0.027 430.000 0.000 NA   NA
 5753755 5753756 HPSH_00660 HPSH_00665     TRUE 0.982 0.000 0.350 1.000 Y NA
 5753757 5753758 HPSH_00670 HPSH_00675     FALSE 0.344 27.000 0.000 NA   NA
 5753758 5753759 HPSH_00675 HPSH_00680     FALSE 0.222 79.000 0.012 NA   NA
 5753760 5753761 HPSH_00685 HPSH_00690     TRUE 0.870 10.000 0.009 1.000   NA
 5753761 5753762 HPSH_00690 HPSH_00695     TRUE 0.975 -7.000 0.209 0.003   NA
 5753762 5753763 HPSH_00695 HPSH_00700     TRUE 0.936 29.000 0.657 1.000 Y NA
 5753764 5753765 HPSH_00705 HPSH_00710     TRUE 0.937 49.000 0.625 0.002 Y NA
 5753766 5753767 HPSH_00715 HPSH_00720     FALSE 0.261 118.000 0.008 1.000 N NA
 5753768 5753769 HPSH_00725 HPSH_00730     TRUE 0.981 13.000 0.283 0.004 N NA
 5753769 5753770 HPSH_00730 HPSH_00735     TRUE 0.989 11.000 0.738 0.004 N NA
 5753770 5753771 HPSH_00735 HPSH_00740     TRUE 0.984 2.000 0.262 0.004 N NA
 5753771 5753772 HPSH_00740 HPSH_00745     TRUE 0.916 11.000 0.182 NA   NA
 5753772 5753773 HPSH_00745 HPSH_00750     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 5753773 5753774 HPSH_00750 HPSH_00755     TRUE 0.704 36.000 0.188 NA   NA
 5753774 5753775 HPSH_00755 HPSH_00760     TRUE 0.941 12.000 0.438 NA   NA
 5753775 5753776 HPSH_00760 HPSH_00765     FALSE 0.463 89.000 0.429 NA   NA
 5753778 5753779 HPSH_00775 HPSH_00780 recA eno TRUE 0.938 12.000 0.033 1.000 N NA
 5753779 5753780 HPSH_00780 HPSH_00785 eno   TRUE 0.898 -7.000 0.080 NA   NA
 5753780 5753781 HPSH_00785 HPSH_00790     TRUE 0.945 16.000 0.788 NA   NA
 5753781 5753782 HPSH_00790 HPSH_00795   aroK TRUE 0.894 5.000 0.127 NA   NA
 5753782 5753783 HPSH_00795 HPSH_00800 aroK   TRUE 0.809 21.000 0.078 NA   NA
 5753786 5753787 HPSH_00815 HPSH_00820     FALSE 0.040 179.000 0.000 NA   NA
 5753787 5753788 HPSH_00820 HPSH_00825     TRUE 0.839 1.000 0.010 NA   NA
 5753788 5753789 HPSH_00825 HPSH_00830     TRUE 0.846 23.000 0.028 1.000 N NA
 5753789 5753790 HPSH_00830 HPSH_00835     TRUE 0.934 26.000 0.448 1.000 Y NA
 5753790 5753791 HPSH_00835 HPSH_00840     FALSE 0.033 234.000 0.000 NA   NA
 5753791 5753792 HPSH_00840 HPSH_00845     TRUE 0.917 -9.000 0.233 NA   NA
 5753792 5753793 HPSH_00845 HPSH_00850     TRUE 0.677 33.000 0.018 1.000   NA
 5753793 5753794 HPSH_00850 HPSH_00855     TRUE 0.893 3.000 0.068 NA   NA
 5753794 5753795 HPSH_00855 HPSH_00860   prfB FALSE 0.223 75.000 0.011 NA   NA
 5753795 5753796 HPSH_00860 HPSH_00865 prfB   FALSE 0.468 61.000 0.007 1.000 N NA
 5753796 5753797 HPSH_00865 HPSH_00870   fliR TRUE 0.946 10.000 0.069 1.000 N NA
 5753797 5753798 HPSH_00870 HPSH_00875 fliR   TRUE 0.929 -25.000 0.069 0.060   NA
 5753799 5753800 HPSH_00880 HPSH_00885     TRUE 0.934 17.000 0.121 1.000 N NA
 5753800 5753801 HPSH_00885 HPSH_00890     TRUE 0.832 22.000 0.012 1.000 N NA
 5753801 5753802 HPSH_00890 HPSH_00895     FALSE 0.034 222.000 0.000 NA   NA
 5753803 5753804 HPSH_00900 HPSH_00905     TRUE 0.921 4.000 0.018 1.000 N NA
 5753804 5753805 HPSH_00905 HPSH_00910     TRUE 0.950 0.000 0.020 1.000 N NA
 5753806 5753807 HPSH_00915 HPSH_00920     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 5753807 5753808 HPSH_00920 HPSH_00925   lysS TRUE 0.899 10.000 0.023 1.000   NA
 5753808 5753809 HPSH_00925 HPSH_00930 lysS glyA TRUE 0.958 0.000 0.044 1.000 N NA
 5753809 5753810 HPSH_00930 HPSH_00935 glyA   TRUE 0.927 11.000 0.271 NA   NA
 5753810 5753811 HPSH_00935 HPSH_00940     TRUE 0.845 22.000 0.258 NA   NA
 5753812 5753813 HPSH_00945 HPSH_00955     TRUE 0.633 3.000 0.000 NA   NA
 5753813 5753814 HPSH_00955 HPSH_00965     FALSE 0.136 61.000 0.000 NA   NA
 5753816 5753817 HPSH_00975 HPSH_00980   frdB TRUE 0.849 22.000 0.019 1.000 N NA
 5753817 5753818 HPSH_00980 HPSH_00985 frdB   TRUE 0.977 -7.000 0.025 0.003 Y NA
 5753818 5753819 HPSH_00985 HPSH_00990     TRUE 0.986 10.000 0.276 0.003 Y NA
 5753820 5753821 HPSH_00995 HPSH_01000 tpiA   TRUE 0.968 10.000 0.071 0.036 N NA
 5753821 5753822 HPSH_01000 HPSH_01005   lpxD TRUE 0.924 10.000 0.018 1.000 N NA
 5753822 5753823 HPSH_01005 HPSH_01010 lpxD   FALSE 0.482 65.000 0.011 1.000 N NA
 5753823 5753824 HPSH_01010 HPSH_01015     FALSE 0.461 67.000 0.010 1.000 N NA
 5753824 5753825 HPSH_01015 HPSH_01020     TRUE 0.694 25.000 0.033 NA   NA
 5753825 5753826 HPSH_01020 HPSH_01025   rpmF TRUE 0.827 16.000 0.032 NA   NA
 5753826 5753827 HPSH_01025 HPSH_01030 rpmF   TRUE 0.639 68.000 0.418 1.000   NA
 5753827 5753828 HPSH_01030 HPSH_01035     TRUE 0.942 24.000 0.058 0.009 Y NA
 5753828 5753829 HPSH_01035 HPSH_01040     TRUE 0.819 22.000 0.154 NA   NA
 5753830 5753831 HPSH_01045 HPSH_01055     FALSE 0.140 60.000 0.000 NA   NA
 5753833 5753834 HPSH_01070 HPSH_01075     TRUE 0.837 24.000 0.333 NA   NA
 5753835 5753836 HPSH_01080 HPSH_01085     FALSE 0.240 103.000 0.010 1.000   NA
 5753837 5753838 HPSH_01090 HPSH_01095     FALSE 0.306 86.000 0.013 1.000   NA
 5753838 5753839 HPSH_01095 HPSH_01100     TRUE 0.913 11.000 0.010 1.000 N NA
 5753840 5753841 HPSH_01105 HPSH_01110     TRUE 0.940 13.000 0.008 0.085 N NA
 5753841 5753842 HPSH_01110 HPSH_01115     TRUE 0.980 1.000 0.372 1.000 Y NA
 5753842 5753843 HPSH_01115 HPSH_01120     FALSE 0.295 51.000 0.002 NA   NA
 5753843 5753844 HPSH_01120 HPSH_01125     TRUE 0.665 48.000 0.333 NA   NA
 5753846 5753847 HPSH_01135 HPSH_01140     FALSE 0.262 173.000 0.103 1.000   NA
 5753847 5753848 HPSH_01140 HPSH_01145     TRUE 0.882 22.000 0.056 1.000 N NA
 5753848 5753849 HPSH_01145 HPSH_01150     FALSE 0.170 175.000 0.015 1.000   NA
 5753849 5753850 HPSH_01150 HPSH_01155     FALSE 0.189 113.000 0.007 1.000   NA
 5753850 5753851 HPSH_01155 HPSH_01160     FALSE 0.292 137.000 0.008 1.000 Y NA
 5753851 5753852 HPSH_01160 HPSH_01165     FALSE 0.032 247.000 0.000 NA   NA
 5753853 5753854 HPSH_01170 HPSH_01175     FALSE 0.356 26.000 0.000 NA   NA
 5753854 5753855 HPSH_01175 HPSH_01180     FALSE 0.426 22.000 0.000 NA   NA
 5753857 5753858 HPSH_t08296 HPSH_01190     FALSE 0.052 131.000 0.000 NA   NA
 5753858 5753859 HPSH_01190 HPSH_01195     FALSE 0.094 225.000 0.016 NA   NA
 5753860 5753861 HPSH_01200 HPSH_01205     TRUE 0.903 16.000 0.258 NA   NA
 5753861 5753862 HPSH_01205 HPSH_01210     TRUE 0.886 25.000 0.763 NA   NA
 5753862 5753863 HPSH_01210 HPSH_01215     TRUE 0.919 12.000 0.211 NA   NA
 5753863 5753864 HPSH_01215 HPSH_01220     FALSE 0.077 96.000 0.000 NA   NA
 5753865 5753866 HPSH_01225 HPSH_01230     FALSE 0.454 94.000 0.167 1.000   NA
 5753866 5753867 HPSH_01230 HPSH_01235   hemC TRUE 0.905 0.000 0.008 1.000   NA
 5753867 5753868 HPSH_01235 HPSH_01240 hemC   TRUE 0.915 11.000 0.010 1.000 N NA
 5753868 5753869 HPSH_01240 HPSH_01245   hemA TRUE 0.961 4.000 0.040 0.053 N NA
 5753869 5753870 HPSH_01245 HPSH_01250 hemA   TRUE 0.970 0.000 0.051 1.000 Y NA
 5753870 5753871 HPSH_01250 HPSH_01255     TRUE 0.833 10.000 0.017 NA   NA
 5753871 5753872 HPSH_01255 HPSH_01260     TRUE 0.932 -7.000 0.286 NA   NA
 5753872 5753873 HPSH_01260 HPSH_01265     TRUE 0.828 21.000 0.121 NA   NA
 5753873 5753874 HPSH_01265 HPSH_01270     FALSE 0.117 205.000 0.000 1.000 N NA
 5753874 5753875 HPSH_01270 HPSH_01275     TRUE 0.955 -3.000 0.406 NA   NA
 5753875 5753876 HPSH_01275 HPSH_01280   flgI TRUE 0.962 -3.000 0.569 NA   NA
 5753877 5753878 HPSH_01285 HPSH_01290     TRUE 0.912 21.000 0.119 1.000 N NA
 5753878 5753879 HPSH_01290 HPSH_01295     TRUE 0.893 7.000 0.119 NA   NA
 5753880 5753881 HPSH_01300 HPSH_01305     TRUE 0.777 10.000 0.000 1.000   NA
 5753881 5753882 HPSH_01305 HPSH_t08298     FALSE 0.070 103.000 0.000 NA   NA
 5753883 5753884 HPSH_01310 HPSH_01315     TRUE 0.521 -19.000 0.000 NA   NA
 5753884 5753885 HPSH_01315 HPSH_01320     TRUE 0.683 52.000 0.500 NA   NA
 5753885 5753886 HPSH_01320 HPSH_01325     FALSE 0.159 99.000 0.009 NA   NA
 5753886 5753887 HPSH_01325 HPSH_01330     TRUE 0.847 -3.000 0.009 NA   NA
 5753887 5753888 HPSH_01330 HPSH_01335     TRUE 0.901 -7.000 0.093 NA   NA
 5753888 5753889 HPSH_01335 HPSH_01340     TRUE 0.909 -3.000 0.010 1.000   NA
 5753889 5753890 HPSH_01340 HPSH_01345   xseA TRUE 0.911 13.000 0.011 1.000 N NA
 5753891 5753892 HPSH_01350 HPSH_01355     TRUE 0.637 -7.000 0.000 NA   NA
 5753893 5753894 HPSH_01365 HPSH_01370     TRUE 0.936 -3.000 0.156 NA   NA
 5753894 5753895 HPSH_01370 HPSH_01375     TRUE 0.625 73.000 0.216 1.000 N NA
 5753895 5753896 HPSH_01375 HPSH_01380     TRUE 0.772 57.000 0.216 1.000 Y NA
 5753896 5753897 HPSH_01380 HPSH_01385     TRUE 0.919 10.000 0.014 1.000 N NA
 5753897 5753898 HPSH_01385 HPSH_01390     TRUE 0.912 -15.000 0.011 1.000 Y NA
 5753898 5753899 HPSH_01390 HPSH_01395     FALSE 0.429 61.000 0.066 NA   NA
 5753899 5753900 HPSH_01395 HPSH_01400     TRUE 0.522 43.000 0.033 NA   NA
 5753900 5753901 HPSH_01400 HPSH_01405     TRUE 0.548 40.000 0.029 NA   NA
 5753901 5753902 HPSH_01405 HPSH_01410     TRUE 0.945 -7.000 0.462 NA   NA
 5753902 5753903 HPSH_01410 HPSH_01415     TRUE 0.946 -19.000 1.000 NA   NA
 5753903 5753904 HPSH_01415 HPSH_01420     TRUE 0.947 -3.000 0.276 NA   NA
 5753904 5753905 HPSH_01420 HPSH_01425     TRUE 0.866 16.000 0.087 NA   NA
 5753905 5753906 HPSH_01425 HPSH_01430     TRUE 0.596 37.000 0.043 NA   NA
 5753906 5753907 HPSH_01430 HPSH_01435     TRUE 0.948 -12.000 0.400 1.000   NA
 5753907 5753908 HPSH_01435 HPSH_01440     FALSE 0.516 57.000 0.139 NA   NA
 5753908 5753909 HPSH_01440 HPSH_01445     TRUE 0.958 10.000 0.806 NA   NA
 5753909 5753910 HPSH_01445 HPSH_01450     TRUE 0.978 -3.000 0.429 1.000 N NA
 5753910 5753911 HPSH_01450 HPSH_01455     TRUE 0.979 -3.000 0.231 1.000 Y NA
 5753913 5753914 HPSH_01465 HPSH_01470   aroB TRUE 0.897 5.000 0.031 1.000   NA
 5753914 5753915 HPSH_01470 HPSH_01475 aroB   TRUE 0.936 -9.000 0.041 1.000 N NA
 5753915 5753916 HPSH_01475 HPSH_01480     TRUE 0.961 -3.000 0.063 1.000 N NA
 5753916 5753917 HPSH_01480 HPSH_01485     TRUE 0.932 -13.000 0.067 1.000 N NA
 5753917 5753918 HPSH_01485 HPSH_01490     TRUE 0.924 3.000 0.237 NA   NA
 5753918 5753919 HPSH_01490 HPSH_01495     TRUE 0.894 13.000 0.100 NA   NA
 5753919 5753920 HPSH_01495 HPSH_01500     FALSE 0.125 65.000 0.000 NA   NA
 5753920 5753921 HPSH_01500 HPSH_01505     FALSE 0.339 48.000 0.000 1.000   NA
 5753921 5753922 HPSH_01505 HPSH_01510     TRUE 0.924 5.000 0.009 1.000 Y NA
 5753922 5753923 HPSH_01510 HPSH_01515     TRUE 0.875 13.000 0.053 NA   NA
 5753923 5753924 HPSH_01515 HPSH_01520     TRUE 0.873 1.000 0.021 NA   NA
 5753924 5753925 HPSH_01520 HPSH_01525   amiE FALSE 0.183 186.000 0.024 1.000   NA
 5753927 5753928 HPSH_01535 HPSH_01540 rplU rpmA TRUE 0.987 15.000 0.667 0.035 Y NA
 5753928 5753929 HPSH_01540 HPSH_01545 rpmA   FALSE 0.250 117.000 0.006 1.000 N NA
 5753929 5753930 HPSH_01545 HPSH_01550     TRUE 0.974 11.000 0.041 0.027 Y NA
 5753930 5753931 HPSH_01550 HPSH_01555     TRUE 0.993 0.000 0.779 0.027 Y NA
 5753931 5753932 HPSH_01555 HPSH_01560     TRUE 0.958 12.000 0.060 1.000 Y NA
 5753932 5753933 HPSH_01560 HPSH_01565     TRUE 0.977 -3.000 0.087 0.003   NA
 5753933 5753934 HPSH_01565 HPSH_01570   obgE TRUE 0.779 20.000 0.008 1.000   NA
 5753934 5753935 HPSH_01570 HPSH_01575 obgE   FALSE 0.519 42.000 0.007 1.000   NA
 5753935 5753936 HPSH_01575 HPSH_01580     FALSE 0.032 248.000 0.000 NA   NA
 5753936 5753937 HPSH_01580 HPSH_01585     TRUE 0.908 10.000 0.154 NA   NA
 5753937 5753938 HPSH_01585 HPSH_01590     TRUE 0.934 5.000 0.462 NA   NA
 5753938 5753939 HPSH_01590 HPSH_01595     TRUE 0.911 16.000 0.308 NA   NA
 5753939 5753940 HPSH_01595 HPSH_01600     TRUE 0.584 84.000 0.800 NA   NA
 5753940 5753941 HPSH_01600 HPSH_01605     TRUE 0.613 13.000 0.000 NA   NA
 5753942 5753943 HPSH_01615 HPSH_01620     TRUE 0.942 11.000 0.444 NA   NA
 5753944 5753945 HPSH_01625 HPSH_01630     TRUE 0.971 0.000 0.788 NA   NA
 5753948 5753949 HPSH_01645 HPSH_01650   argS FALSE 0.453 61.000 0.004 1.000 N NA
 5753949 5753950 HPSH_01650 HPSH_01655 argS   TRUE 0.929 3.000 0.020 1.000 N NA
 5753950 5753951 HPSH_01655 HPSH_01660   gmk FALSE 0.444 70.000 0.011 1.000 N NA
 5753951 5753952 HPSH_01660 HPSH_01665 gmk   TRUE 0.776 -7.000 0.005 NA   NA
 5753952 5753953 HPSH_01665 HPSH_01670     TRUE 0.613 13.000 0.000 NA   NA
 5753956 5753957 HPSH_01685 HPSH_01690 flgH   TRUE 0.927 18.000 0.109 1.000 N NA
 5753957 5753958 HPSH_01690 HPSH_01695     TRUE 0.987 -9.000 0.355 0.002 Y NA
 5753958 5753959 HPSH_01695 HPSH_01700     TRUE 0.968 -3.000 0.137 1.000 N NA
 5753960 5753961 HPSH_01705 HPSH_01710 lpxK   TRUE 0.950 -3.000 0.024 1.000 N NA
 5753962 5753963 HPSH_t08300 HPSH_01715     FALSE 0.088 86.000 0.000 NA   NA
 5753963 5753964 HPSH_01715 HPSH_01720     TRUE 0.868 19.000 0.012 1.000 N NA
 5753964 5753965 HPSH_01720 HPSH_01725   minE TRUE 0.980 -3.000 0.618 NA Y NA
 5753965 5753966 HPSH_01725 HPSH_01730 minE   TRUE 0.869 12.000 0.010 NA N NA
 5753966 5753967 HPSH_01730 HPSH_01735     TRUE 0.963 -3.000 0.026 1.000 Y NA
 5753967 5753968 HPSH_01735 HPSH_01740     FALSE 0.153 57.000 0.000 NA   NA
 5753968 5753969 HPSH_01740 HPSH_01745     TRUE 0.710 0.000 0.000 NA   NA
 5753969 5753970 HPSH_01745 HPSH_01750     FALSE 0.288 190.000 0.500 NA   NA
 5753970 5753971 HPSH_01750 HPSH_01755     TRUE 0.949 -16.000 1.000 NA   NA
 5753971 5753972 HPSH_01755 HPSH_01760     TRUE 0.902 12.000 0.108 NA   NA
 5753972 5753973 HPSH_01760 HPSH_01765     TRUE 0.594 6.000 0.000 NA   NA
 5753973 5753974 HPSH_01765 HPSH_01770     FALSE 0.083 91.000 0.000 NA   NA
 5753974 5753975 HPSH_01770 HPSH_01775     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 5753975 5753976 HPSH_01775 HPSH_01780     TRUE 0.612 -9.000 0.000 NA   NA
 5753976 5753977 HPSH_01780 HPSH_01785     TRUE 0.785 16.000 0.014 NA   NA
 5753977 5753978 HPSH_01785 HPSH_01790     TRUE 0.596 -10.000 0.000 NA   NA
 5753979 5753980 HPSH_01795 HPSH_01800     TRUE 0.938 0.000 0.010 1.000 N NA
 5753980 5753981 HPSH_01800 HPSH_01805     TRUE 0.927 9.000 0.026 1.000 N NA
 5753982 5753983 HPSH_01810 HPSH_01815   fliF TRUE 0.620 44.000 0.032 1.000   NA
 5753983 5753984 HPSH_01815 HPSH_01820 fliF fliG TRUE 0.980 19.000 0.477 0.012 Y NA
 5753984 5753985 HPSH_01820 HPSH_01825 fliG fliH TRUE 0.963 -7.000 0.308 NA Y NA
 5753985 5753986 HPSH_01825 HPSH_01830 fliH   TRUE 0.918 3.000 0.052 NA N NA
 5753986 5753987 HPSH_01830 HPSH_01835     TRUE 0.930 -3.000 0.008 1.000 N NA
 5753987 5753988 HPSH_01835 HPSH_01840     TRUE 0.890 9.000 0.002 1.000 N NA
 5753988 5753989 HPSH_01840 HPSH_01845     TRUE 0.893 -7.000 0.065 NA   NA
 5753990 5753991 HPSH_01850 HPSH_01855     TRUE 0.631 55.000 0.033 1.000 N NA
 5753991 5753992 HPSH_01855 HPSH_01860     FALSE 0.385 163.000 0.024 0.056 N NA
 5753992 5753993 HPSH_01860 HPSH_01865     TRUE 0.978 -3.000 0.096 0.075 N NA
 5753993 5753994 HPSH_01865 HPSH_01870     TRUE 0.969 -3.000 0.169 1.000 N NA
 5753994 5753995 HPSH_01870 HPSH_01875     TRUE 0.630 47.000 0.013 1.000 N NA
 5753995 5753996 HPSH_01875 HPSH_01880     TRUE 0.876 -34.000 0.018 1.000 N NA
 5753996 5753997 HPSH_01880 HPSH_01885     TRUE 0.879 0.000 0.016 NA   NA
 5754000 5754001 HPSH_01900 HPSH_01905     FALSE 0.321 92.000 0.020 1.000   NA
 5754001 5754002 HPSH_01905 HPSH_01910     TRUE 0.862 -6.000 0.020 NA   NA
 5754002 5754003 HPSH_01910 HPSH_01915     TRUE 0.884 4.000 0.072 NA   NA
 5754003 5754004 HPSH_01915 HPSH_01920     FALSE 0.229 111.000 0.054 NA   NA
 5754004 5754005 HPSH_01920 HPSH_01925     TRUE 0.637 -7.000 0.000 NA   NA
 5754005 5754006 HPSH_01925 HPSH_01930     FALSE 0.094 81.000 0.000 NA   NA
 5754008 5754009 HPSH_01940 HPSH_01945     FALSE 0.028 348.000 0.000 NA   NA
 5754009 5754010 HPSH_01945 HPSH_01950     TRUE 0.596 -10.000 0.000 NA   NA
 5754010 5754011 HPSH_01950 HPSH_01955     FALSE 0.090 85.000 0.000 NA   NA
 5754012 5754013 HPSH_01960 HPSH_01965     TRUE 0.994 1.000 0.875 0.002 Y NA
 5754013 5754014 HPSH_01965 HPSH_01970     TRUE 0.941 -3.000 0.013 1.000 N NA
 5754014 5754015 HPSH_01970 HPSH_01975     FALSE 0.244 246.000 0.007 0.080 N NA
 5754015 5754016 HPSH_01975 HPSH_01980   prmA TRUE 0.932 9.000 0.032 1.000 N NA
 5754016 5754017 HPSH_01980 HPSH_01985 prmA   TRUE 0.946 1.000 0.029 1.000 N NA
 5754019 5754020 HPSH_t08302 HPSH_01995     FALSE 0.221 43.000 0.000 NA   NA
 5754020 5754021 HPSH_01995 HPSH_02000     TRUE 0.932 3.000 0.304 NA   NA
 5754021 5754022 HPSH_02000 HPSH_02005   gidB TRUE 0.903 -6.000 0.015 1.000   NA
 5754022 5754023 HPSH_02005 HPSH_02010 gidB queA TRUE 0.943 -3.000 0.015 1.000 N NA
 5754023 5754024 HPSH_02010 HPSH_02015 queA   TRUE 0.925 1.000 0.036 NA N NA
 5754024 5754025 HPSH_02015 HPSH_02020     TRUE 0.971 -7.000 0.535 NA Y NA
 5754025 5754026 HPSH_02020 HPSH_02025   ruvB FALSE 0.432 68.000 0.008 1.000 N NA
 5754026 5754027 HPSH_02025 HPSH_02030 ruvB panB TRUE 0.945 1.000 0.027 1.000 N NA
 5754028 5754029 HPSH_02035 HPSH_02040     TRUE 0.952 -10.000 0.778 NA   NA
 5754029 5754030 HPSH_02040 HPSH_02045     TRUE 0.965 12.000 1.000 NA   NA
 5754030 5754031 HPSH_02045 HPSH_02050     TRUE 0.924 10.000 0.273 NA   NA
 5754031 5754032 HPSH_02050 HPSH_02055   minC TRUE 0.905 3.000 0.030 NA N NA
 5754032 5754033 HPSH_02055 HPSH_02060 minC lpxC TRUE 0.951 -3.000 0.027 1.000 N NA
 5754033 5754034 HPSH_02060 HPSH_02065 lpxC   TRUE 0.834 21.000 0.035 NA N NA
 5754034 5754035 HPSH_02065 HPSH_02070     TRUE 0.525 55.000 0.032 NA N NA
 5754035 5754036 HPSH_02070 HPSH_02075     TRUE 0.889 -13.000 0.044 NA N NA
 5754036 5754037 HPSH_02075 HPSH_02080   infB TRUE 0.955 -3.000 0.171 NA N NA
 5754037 5754038 HPSH_02080 HPSH_02085 infB rbfA TRUE 0.985 0.000 0.530 1.000 Y NA
 5754038 5754039 HPSH_02085 HPSH_02090 rbfA   TRUE 0.870 -7.000 0.033 NA   NA
 5754039 5754040 HPSH_02090 HPSH_02095     FALSE 0.077 170.000 0.002 NA   NA
 5754040 5754041 HPSH_02095 HPSH_02100     FALSE 0.059 341.000 0.000 1.000   NA
 5754042 5754043 HPSH_02105 HPSH_02110   flhA TRUE 0.809 28.000 0.106 1.000   NA
 5754044 5754045 HPSH_02115 HPSH_02120 rpsO   TRUE 0.603 30.000 0.007 NA N NA
 5754045 5754046 HPSH_02120 HPSH_02125     FALSE 0.196 129.000 0.014 NA N NA
 5754046 5754047 HPSH_02125 HPSH_02130     TRUE 0.963 14.000 0.168 1.000 Y NA
 5754047 5754048 HPSH_02130 HPSH_02135     TRUE 0.956 0.000 0.033 1.000 N NA
 5754048 5754049 HPSH_02135 HPSH_02140   flhF TRUE 0.945 -6.000 0.035 1.000 N NA
 5754049 5754050 HPSH_02140 HPSH_02145 flhF   TRUE 0.977 -3.000 0.382 1.000 N NA
 5754050 5754051 HPSH_02145 HPSH_02150     TRUE 0.901 5.000 0.159 NA   NA
 5754051 5754052 HPSH_02150 HPSH_02155   fliA TRUE 0.911 2.000 0.112 NA   NA
 5754052 5754053 HPSH_02155 HPSH_02160 fliA fliM TRUE 0.955 -7.000 0.118 1.000 N NA
 5754053 5754054 HPSH_02160 HPSH_02165 fliM   TRUE 0.982 4.000 0.142 0.003 Y NA
 5754054 5754055 HPSH_02165 HPSH_02170     TRUE 0.812 29.000 0.170 NA N NA
 5754055 5754056 HPSH_02170 HPSH_02175     TRUE 0.956 -3.000 0.421 NA   NA
 5754057 5754058 HPSH_02180 HPSH_02185     FALSE 0.221 160.000 0.009 1.000 N NA
 5754058 5754059 HPSH_02185 HPSH_02190     TRUE 0.972 -3.000 0.013 0.007 N NA
 5754059 5754060 HPSH_02190 HPSH_02195     TRUE 0.958 10.000 0.211 1.000 N NA
 5754062 5754063 HPSH_02205 HPSH_02210     FALSE 0.162 326.000 0.000 0.073 N NA
 5754063 5754064 HPSH_02210 HPSH_02215   ispDF TRUE 0.777 32.000 0.027 1.000 N NA
 5754064 5754065 HPSH_02215 HPSH_02220 ispDF   TRUE 0.829 22.000 0.011 1.000 N NA
 5754065 5754066 HPSH_02220 HPSH_02225     TRUE 0.785 45.000 0.206 1.000 N NA
 5754066 5754067 HPSH_02225 HPSH_02230     FALSE 0.270 195.000 0.003 0.055 N NA
 5754067 5754068 HPSH_02230 HPSH_02235     TRUE 0.850 -3.000 0.009 NA   NA
 5754068 5754069 HPSH_02235 HPSH_02240     TRUE 0.905 10.000 0.132 NA   NA
 5754069 5754070 HPSH_02240 HPSH_02245     TRUE 0.972 -3.000 0.238 1.000 N NA
 5754070 5754071 HPSH_02245 HPSH_02250     TRUE 0.935 15.000 0.217 1.000   NA
 5754071 5754072 HPSH_02250 HPSH_02255     TRUE 0.941 -3.000 0.048 1.000   NA
 5754072 5754073 HPSH_02255 HPSH_02260     TRUE 0.703 37.000 0.013 1.000 N NA
 5754073 5754074 HPSH_02260 HPSH_t08304     FALSE 0.104 73.000 0.000 NA   NA
 5754074 5754075 HPSH_t08304 HPSH_02265     FALSE 0.026 489.000 0.000 NA   NA
 5754075 5754076 HPSH_02265 HPSH_02270     TRUE 0.980 -7.000 0.150 0.073 Y NA
 5754076 5754077 HPSH_02270 HPSH_02275     TRUE 0.939 -7.000 0.000 0.073 Y NA
 5754077 5754078 HPSH_02275 HPSH_02280     FALSE 0.193 48.000 0.000 NA   NA
 5754078 5754079 HPSH_02280 HPSH_02285     TRUE 0.658 26.000 0.025 NA   NA
 5754079 5754080 HPSH_02285 HPSH_02290     TRUE 0.868 10.000 0.040 NA   NA
 5754080 5754081 HPSH_02290 HPSH_02295     TRUE 0.950 2.000 0.500 NA   NA
 5754081 5754082 HPSH_02295 HPSH_02300     TRUE 0.931 12.000 0.294 NA   NA
 5754082 5754083 HPSH_02300 HPSH_02305     TRUE 0.868 -15.000 0.115 NA   NA
 5754083 5754084 HPSH_02305 HPSH_02310     FALSE 0.407 97.000 0.028 1.000 N NA
 5754084 5754085 HPSH_02310 HPSH_02315     FALSE 0.287 153.000 0.333 NA   NA
 5754085 5754086 HPSH_02315 HPSH_02320     TRUE 0.893 -16.000 0.250 NA   NA
 5754086 5754087 HPSH_02320 HPSH_02325     TRUE 0.662 44.000 0.250 NA   NA
 5754088 5754089 HPSH_02330 HPSH_02335     TRUE 0.980 22.000 0.660 0.002 Y NA
 5754089 5754090 HPSH_02335 HPSH_02340     TRUE 0.980 -3.000 0.286 1.000 Y NA
 5754092 5754093 HPSH_02350 HPSH_02355     TRUE 0.960 9.000 0.875 NA   NA
 5754093 5754094 HPSH_02355 HPSH_02360     TRUE 0.569 46.000 0.002 1.000 N NA
 5754094 5754095 HPSH_02360 HPSH_02365     TRUE 0.878 16.000 0.008 1.000 N NA
 5754095 5754096 HPSH_02365 HPSH_02370     TRUE 0.899 3.000 0.091 NA   NA
 5754096 5754097 HPSH_02370 HPSH_02375     FALSE 0.395 91.000 0.250 NA   NA
 5754097 5754098 HPSH_02375 HPSH_02380     TRUE 0.946 3.000 0.500 NA   NA
 5754098 5754099 HPSH_02380 HPSH_02385     FALSE 0.199 47.000 0.000 NA   NA
 5754100 5754101 HPSH_02390 HPSH_02395     FALSE 0.184 50.000 0.000 NA   NA
 5754102 5754103 HPSH_02400 HPSH_02405     FALSE 0.396 70.000 0.000 0.014   NA
 5754109 5754110 HPSH_02435 HPSH_02440     FALSE 0.318 151.000 0.444 NA   NA
 5754110 5754111 HPSH_02440 HPSH_02445     TRUE 0.615 81.000 0.889 NA   NA
 5754113 5754114 HPSH_02455 HPSH_02460   flgE FALSE 0.076 204.000 0.000 1.000   NA
 5754114 5754115 HPSH_02460 HPSH_02465 flgE hypA TRUE 0.569 58.000 0.071 1.000   NA
 5754115 5754116 HPSH_02465 HPSH_02470 hypA   TRUE 0.874 7.000 0.062 NA   NA
 5754116 5754117 HPSH_02470 HPSH_02475   lpxB TRUE 0.872 0.000 0.013 NA   NA
 5754117 5754118 HPSH_02475 HPSH_02480 lpxB greA TRUE 0.745 41.000 0.042 1.000 N NA
 5754118 5754119 HPSH_02480 HPSH_02485 greA dut TRUE 0.918 -10.000 0.019 1.000 N NA
 5754119 5754120 HPSH_02485 HPSH_02490 dut   TRUE 0.877 -3.000 0.017 NA   NA
 5754120 5754121 HPSH_02490 HPSH_02495     TRUE 0.906 5.000 0.200 NA   NA
 5754121 5754122 HPSH_02495 HPSH_02500     TRUE 0.766 5.000 0.008 NA   NA
 5754122 5754123 HPSH_02500 HPSH_02505     TRUE 0.804 -9.000 0.011 NA   NA
 5754123 5754124 HPSH_02505 HPSH_02510     TRUE 0.837 -13.000 0.036 NA   NA
 5754124 5754125 HPSH_02510 HPSH_02515     TRUE 0.947 9.000 0.093 1.000 N NA
 5754125 5754126 HPSH_02515 HPSH_02520     TRUE 0.973 -3.000 0.096 1.000 Y NA
 5754126 5754127 HPSH_02520 HPSH_02525     TRUE 0.957 -7.000 0.142 1.000 N NA
 5754129 5754130 HPSH_02535 HPSH_02540     TRUE 0.884 -3.000 0.020 NA   NA
 5754131 5754132 HPSH_02545 HPSH_02550     FALSE 0.222 167.000 0.182 NA   NA
 5754132 5754133 HPSH_02550 HPSH_02555     TRUE 0.962 -3.000 0.545 NA   NA
 5754134 5754135 HPSH_02560 HPSH_02565     TRUE 0.976 -7.000 0.067 0.072 Y NA
 5754135 5754136 HPSH_02565 HPSH_02570     TRUE 0.978 4.000 0.068 0.007 Y NA
 5754136 5754137 HPSH_02570 HPSH_02575     FALSE 0.403 87.000 0.015 1.000 N NA
 5754137 5754138 HPSH_02575 HPSH_02580     TRUE 0.981 -3.000 0.017 0.003 Y NA
 5754138 5754139 HPSH_02580 HPSH_02585     TRUE 0.981 -7.000 0.063 0.003 Y NA
 5754140 5754141 HPSH_02590 HPSH_02595     TRUE 0.893 0.000 0.024 NA   NA
 5754141 5754142 HPSH_02595 HPSH_02600     TRUE 0.904 -3.000 0.009 1.000   NA
 5754142 5754143 HPSH_02600 HPSH_02605     TRUE 0.878 4.000 0.061 NA   NA
 5754143 5754144 HPSH_02605 HPSH_02610     TRUE 0.956 -3.000 0.421 NA   NA
 5754144 5754145 HPSH_02610 HPSH_02615     TRUE 0.859 19.000 0.156 NA   NA
 5754145 5754146 HPSH_02615 HPSH_02620     FALSE 0.028 340.000 0.000 NA   NA
 5754146 5754147 HPSH_02620 HPSH_t08306     FALSE 0.079 95.000 0.000 NA   NA
 5754147 5754148 HPSH_t08306 HPSH_02625     FALSE 0.148 58.000 0.000 NA   NA
 5754148 5754149 HPSH_02625 HPSH_02630   engA FALSE 0.162 142.000 0.008 1.000   NA
 5754150 5754151 HPSH_02635 HPSH_02640   speE FALSE 0.324 85.000 0.068 NA   NA
 5754151 5754152 HPSH_02640 HPSH_02645 speE coaE TRUE 0.931 2.000 0.016 1.000 N NA
 5754152 5754153 HPSH_02645 HPSH_02650 coaE gatA FALSE 0.476 59.000 0.006 1.000 N NA
 5754153 5754154 HPSH_02650 HPSH_02655 gatA   TRUE 0.933 10.000 0.032 1.000 N NA
 5754154 5754155 HPSH_02655 HPSH_02660     FALSE 0.305 122.000 0.018 1.000 N NA
 5754158 5754159 HPSH_02675 HPSH_02680     FALSE 0.135 167.000 0.000 1.000 N NA
 5754159 5754160 HPSH_02680 HPSH_02685     TRUE 0.902 6.000 0.035 1.000   NA
 5754160 5754161 HPSH_02685 HPSH_02690     FALSE 0.346 89.000 0.027 1.000   NA
 5754161 5754162 HPSH_02690 HPSH_02695     TRUE 0.943 1.000 0.023 1.000 N NA
 5754162 5754163 HPSH_02695 HPSH_02700   uvrC TRUE 0.906 11.000 0.008 1.000 N NA
 5754163 5754164 HPSH_02700 HPSH_02705 uvrC   TRUE 0.830 1.000 0.009 NA   NA
 5754166 5754167 HPSH_02715 HPSH_02720     TRUE 0.968 2.000 0.292 1.000 N NA
 5754167 5754168 HPSH_02720 HPSH_02725     FALSE 0.202 180.000 0.156 NA   NA
 5754168 5754169 HPSH_02725 HPSH_02730   motB TRUE 0.926 4.000 0.320 NA   NA
 5754169 5754170 HPSH_02730 HPSH_02735 motB   TRUE 0.965 3.000 0.119 1.000 Y NA
 5754170 5754171 HPSH_02735 HPSH_02740     TRUE 0.907 16.000 0.020 1.000 N NA
 5754171 5754172 HPSH_02740 HPSH_02745     TRUE 0.923 1.000 0.028 1.000   NA
 5754173 5754174 HPSH_02750 HPSH_02755     FALSE 0.038 190.000 0.000 NA   NA
 5754174 5754175 HPSH_02755 HPSH_02760     FALSE 0.140 60.000 0.000 NA   NA
 5754175 5754176 HPSH_02760 HPSH_02765     TRUE 0.529 42.000 0.032 NA   NA
 5754176 5754177 HPSH_02765 HPSH_02770   fliL TRUE 0.874 9.000 0.014 NA N NA
 5754177 5754178 HPSH_02770 HPSH_02775 fliL acpS TRUE 0.567 67.000 0.047 1.000 N NA
 5754178 5754179 HPSH_02775 HPSH_02780 acpS   FALSE 0.067 106.000 0.000 NA   NA
 5754181 5754182 HPSH_02790 HPSH_02795     TRUE 0.551 83.000 0.118 1.000 N NA
 5754182 5754183 HPSH_02795 HPSH_02800     FALSE 0.181 180.000 0.103 NA   NA
 5754183 5754184 HPSH_02800 HPSH_02805   ribA FALSE 0.192 119.000 0.035 NA   NA
 5754184 5754185 HPSH_02805 HPSH_02810 ribA   FALSE 0.508 74.000 0.012 1.000 Y NA
 5754185 5754186 HPSH_02810 HPSH_02815     TRUE 0.983 1.000 0.501 1.000 Y NA
 5754186 5754187 HPSH_02815 HPSH_02820   mogA TRUE 0.974 13.000 0.026 0.004 Y NA
 5754187 5754188 HPSH_02820 HPSH_02825 mogA moaC TRUE 0.974 9.000 0.028 0.004 Y NA
 5754188 5754189 HPSH_02825 HPSH_02830 moaC   FALSE 0.341 119.000 0.118 1.000   NA
 5754189 5754190 HPSH_02830 HPSH_02835     TRUE 0.822 26.000 0.333 NA   NA
 5754190 5754191 HPSH_02835 HPSH_02840   tig FALSE 0.126 113.000 0.008 NA   NA
 5754191 5754192 HPSH_02840 HPSH_02845 tig clpP TRUE 0.951 21.000 0.351 1.000 Y NA
 5754192 5754193 HPSH_02845 HPSH_02850 clpP def TRUE 0.926 5.000 0.030 1.000 N NA
 5754193 5754194 HPSH_02850 HPSH_02855 def   TRUE 0.945 3.000 0.054 1.000 N NA
 5754194 5754195 HPSH_02855 HPSH_02860     TRUE 0.805 25.000 0.014 1.000 N NA
 5754195 5754196 HPSH_02860 HPSH_02865     TRUE 0.812 36.000 0.107 1.000 N NA
 5754197 5754198 HPSH_02870 HPSH_02875     FALSE 0.064 280.000 0.000 1.000   NA
 5754198 5754199 HPSH_02875 HPSH_02880     TRUE 0.952 -64.000 0.201 0.076 N NA
 5754203 5754204 HPSH_02900 HPSH_02905     FALSE 0.080 94.000 0.000 NA   NA
 5754204 5754205 HPSH_02905 HPSH_02910     FALSE 0.027 400.000 0.000 NA   NA
 5754205 5754206 HPSH_02910 HPSH_02915     FALSE 0.270 77.000 0.023 NA   NA
 5754207 5754208 HPSH_02920 HPSH_02925   pyrH FALSE 0.128 110.000 0.008 NA   NA
 5754208 5754209 HPSH_02925 HPSH_02930 pyrH   TRUE 0.712 43.000 0.033 1.000 N NA
 5754209 5754210 HPSH_02930 HPSH_02935     TRUE 0.940 -13.000 0.039 1.000 Y NA
 5754210 5754211 HPSH_02935 HPSH_02940     TRUE 0.925 21.000 0.222 1.000 N NA
 5754211 5754212 HPSH_02940 HPSH_02945     TRUE 0.908 11.000 0.029 1.000   NA
 5754212 5754213 HPSH_02945 HPSH_02950     TRUE 0.918 7.000 0.068 1.000   NA
 5754213 5754214 HPSH_02950 HPSH_02955     TRUE 0.834 19.000 0.084 NA   NA
 5754215 5754216 HPSH_02960 HPSH_02970 flhB   TRUE 0.637 -7.000 0.000 NA   NA
 5754219 5754220 HPSH_02985 HPSH_02990     FALSE 0.469 -118.000 0.000 NA   NA
 5754220 5754221 HPSH_02990 HPSH_02995     TRUE 0.536 17.000 0.000 NA   NA
 5754221 5754222 HPSH_02995 HPSH_03000     TRUE 0.630 12.000 0.000 NA   NA
 5754222 5754223 HPSH_03000 HPSH_03005     TRUE 0.657 40.000 0.129 NA   NA
 5754224 5754225 HPSH_03010 HPSH_03015     TRUE 0.794 7.000 0.011 NA   NA
 5754226 5754227 HPSH_03020 HPSH_03025     TRUE 0.881 -22.000 0.059 1.000   NA
 5754228 5754229 HPSH_03030 HPSH_03035     FALSE 0.442 63.000 0.098 NA   NA
 5754229 5754230 HPSH_03035 HPSH_03040     TRUE 0.660 -6.000 0.000 NA   NA
 5754230 5754231 HPSH_03040 HPSH_03045     FALSE 0.184 50.000 0.000 NA   NA
 5754231 5754232 HPSH_03045 HPSH_03050     TRUE 0.607 4.000 0.000 NA   NA
 5754232 5754233 HPSH_03050 HPSH_03055     FALSE 0.324 29.000 0.000 NA   NA
 5754233 5754234 HPSH_03055 HPSH_03060     FALSE 0.394 53.000 0.018 NA   NA
 5754234 5754235 HPSH_03060 HPSH_03065   fliS TRUE 0.873 -13.000 0.101 NA   NA
 5754235 5754236 HPSH_03065 HPSH_03070 fliS fliD TRUE 0.936 48.000 0.608 0.003 Y NA
 5754236 5754237 HPSH_03070 HPSH_03075 fliD   TRUE 0.921 17.000 0.092 NA Y NA
 5754237 5754238 HPSH_03075 HPSH_03080     FALSE 0.344 95.000 0.043 NA N NA
 5754238 5754239 HPSH_03080 HPSH_03085     TRUE 0.937 -7.000 0.045 NA Y NA
 5754239 5754240 HPSH_03085 HPSH_03090     TRUE 0.961 -13.000 0.431 1.000 N NA
 5754240 5754241 HPSH_03090 HPSH_03095   trmB TRUE 0.940 -3.000 0.044 1.000   NA
 5754241 5754242 HPSH_03095 HPSH_03100 trmB   TRUE 0.886 11.000 0.060 NA   NA
 5754242 5754243 HPSH_03100 HPSH_03105     TRUE 0.777 -37.000 0.031 NA   NA
 5754244 5754245 HPSH_03110 HPSH_03120     FALSE 0.199 47.000 0.000 NA   NA
 5754245 5754246 HPSH_03120 HPSH_t08308     FALSE 0.481 -38.000 0.000 NA   NA
 5754247 5754248 HPSH_03125 HPSH_03130     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 5754248 5754249 HPSH_03130 HPSH_03135     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 5754249 5754250 HPSH_03135 HPSH_03140     TRUE 0.943 10.000 0.061 1.000 N NA
 5754250 5754251 HPSH_03140 HPSH_03145     FALSE 0.518 56.000 0.129 NA   NA
 5754251 5754252 HPSH_03145 HPSH_03150   ddl TRUE 0.912 0.000 0.046 NA   NA
 5754252 5754253 HPSH_03150 HPSH_03155 ddl   FALSE 0.447 78.000 0.018 1.000 N NA
 5754254 5754255 HPSH_03160 HPSH_03165     TRUE 0.904 9.000 0.032 1.000   NA
 5754255 5754256 HPSH_03165 HPSH_03170     TRUE 0.903 2.000 0.017 1.000   NA
 5754256 5754257 HPSH_03170 HPSH_03175     TRUE 0.677 18.000 0.004 NA   NA
 5754257 5754258 HPSH_03175 HPSH_03180     FALSE 0.062 111.000 0.000 NA   NA
 5754258 5754259 HPSH_03180 HPSH_03190     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 5754259 5754260 HPSH_03190 HPSH_03200     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 5754260 5754261 HPSH_03200 HPSH_03210     FALSE 0.067 106.000 0.000 NA   NA
 5754261 5754262 HPSH_03210 HPSH_03215     TRUE 0.611 9.000 0.000 NA   NA
 5754262 5754263 HPSH_03215 HPSH_03220     FALSE 0.397 23.000 0.000 NA   NA
 5754263 5754264 HPSH_03220 HPSH_03225     FALSE 0.505 94.000 0.005 0.007 N NA
 5754264 5754265 HPSH_03225 HPSH_03230     TRUE 0.702 -30.000 0.009 NA   NA
 5754265 5754266 HPSH_03230 HPSH_03235   sabA FALSE 0.035 212.000 0.000 NA   NA
 5754269 5754270 HPSH_03255 HPSH_03260     FALSE 0.051 134.000 0.000 NA   NA
 5754270 5754271 HPSH_03260 HPSH_03265     FALSE 0.090 85.000 0.000 NA   NA
 5754271 5754272 HPSH_03265 HPSH_03270     TRUE 0.823 29.000 0.462 NA   NA
 5754273 5754274 HPSH_03275 HPSH_03280     FALSE 0.354 69.000 0.011 1.000   NA
 5754274 5754275 HPSH_03280 HPSH_03285     TRUE 0.948 -3.000 0.006 0.018   NA
 5754275 5754276 HPSH_03285 HPSH_03290     TRUE 0.849 13.000 0.006 1.000   NA
 5754276 5754277 HPSH_03290 HPSH_03295     TRUE 0.919 3.000 0.044 1.000   NA
 5754277 5754278 HPSH_03295 HPSH_03300     FALSE 0.030 321.000 0.000 NA   NA
 5754279 5754280 HPSH_03305 HPSH_03310     FALSE 0.026 445.000 0.000 NA   NA
 5754280 5754281 HPSH_03310 HPSH_03315     FALSE 0.078 245.000 0.010 NA   NA
 5754281 5754282 HPSH_03315 HPSH_03320   mraW TRUE 0.776 20.000 0.031 NA   NA
 5754282 5754283 HPSH_03320 HPSH_03325 mraW   FALSE 0.079 200.000 0.008 NA   NA
 5754285 5754286 HPSH_03335 HPSH_03340     FALSE 0.266 105.000 0.077 NA   NA
 5754286 5754287 HPSH_03340 HPSH_03345     TRUE 0.948 -3.000 0.282 NA   NA
 5754287 5754288 HPSH_03345 HPSH_03350     TRUE 0.740 18.000 0.012 NA   NA
 5754288 5754289 HPSH_03350 HPSH_03355     TRUE 0.847 20.000 0.009 1.000 N NA
 5754289 5754290 HPSH_03355 HPSH_03360     TRUE 0.950 -7.000 0.562 NA   NA
 5754290 5754291 HPSH_03360 HPSH_03365     FALSE 0.029 323.000 0.000 NA   NA
 5754291 5754292 HPSH_03365 HPSH_03370     TRUE 0.969 17.000 0.882 NA Y NA
 5754292 5754293 HPSH_03370 HPSH_03375     TRUE 0.966 12.000 0.133 1.000 Y NA
 5754293 5754294 HPSH_03375 HPSH_03380     FALSE 0.035 219.000 0.000 NA   NA
 5754294 5754295 HPSH_03380 HPSH_03385     FALSE 0.325 127.000 0.348 NA   NA
 5754297 5754298 HPSH_03395 HPSH_03400     TRUE 0.987 -3.000 0.083 0.002 Y NA
 5754298 5754299 HPSH_03400 HPSH_03405     TRUE 0.977 11.000 0.429 1.000 Y NA
 5754299 5754300 HPSH_03405 HPSH_03410     FALSE 0.103 257.000 0.000 1.000 N NA
 5754300 5754301 HPSH_03410 HPSH_03415     FALSE 0.213 90.000 0.016 NA   NA
 5754301 5754302 HPSH_03415 HPSH_03420     TRUE 0.935 3.000 0.333 NA   NA
 5754302 5754303 HPSH_03420 HPSH_03425     TRUE 0.676 55.000 0.024 1.000 Y NA
 5754304 5754305 HPSH_03430 HPSH_03435     FALSE 0.145 243.000 0.000 1.000 Y NA
 5754306 5754307 HPSH_03440 HPSH_03445 fliP   FALSE 0.513 -21.000 0.000 NA   NA
 5754308 5754309 HPSH_03450 HPSH_03455     FALSE 0.031 265.000 0.000 NA   NA
 5754309 5754310 HPSH_03455 HPSH_03460     FALSE 0.075 99.000 0.000 NA   NA
 5754310 5754311 HPSH_03460 HPSH_03465     FALSE 0.041 172.000 0.000 NA   NA
 5754311 5754312 HPSH_03465 HPSH_03470     FALSE 0.516 62.000 0.054 1.000   NA
 5754312 5754313 HPSH_03470 HPSH_03475     FALSE 0.153 57.000 0.000 NA   NA
 5754313 5754314 HPSH_03475 HPSH_03485     TRUE 0.607 4.000 0.000 NA   NA
 5754315 5754316 HPSH_03490 HPSH_03495     TRUE 0.598 7.000 0.000 NA   NA
 5754316 5754317 HPSH_03495 HPSH_03500     FALSE 0.055 124.000 0.000 NA   NA
 5754317 5754318 HPSH_03500 HPSH_03505     FALSE 0.191 159.000 0.082 NA   NA
 5754318 5754319 HPSH_03505 HPSH_03510     FALSE 0.070 103.000 0.000 NA   NA
 5754319 5754320 HPSH_03510 HPSH_03515     FALSE 0.221 43.000 0.000 NA   NA
 5754320 5754321 HPSH_03515 HPSH_03520     TRUE 0.806 -36.000 0.000 0.067   NA
 5754321 5754322 HPSH_03520 HPSH_03525     FALSE 0.190 78.000 0.000 1.000   NA
 5754322 5754323 HPSH_03525 HPSH_03530     TRUE 0.988 -3.000 0.419 0.017 N NA
 5754323 5754324 HPSH_03530 HPSH_03535     TRUE 0.957 0.000 0.419 NA   NA
 5754324 5754325 HPSH_03535 HPSH_03540     FALSE 0.423 38.000 0.008 NA   NA
 5754325 5754326 HPSH_03540 HPSH_03545   rnc TRUE 0.953 -3.000 0.030 1.000 N NA
 5754326 5754327 HPSH_03545 HPSH_03550 rnc rnhA TRUE 0.897 -25.000 0.032 1.000 N NA
 5754327 5754328 HPSH_03550 HPSH_03555 rnhA   TRUE 0.821 -13.000 0.006 1.000   NA
 5754328 5754329 HPSH_03555 HPSH_03560     TRUE 0.953 11.000 0.308 1.000   NA
 5754329 5754330 HPSH_03560 HPSH_03565   gatB TRUE 0.906 0.000 0.008 1.000   NA
 5754330 5754331 HPSH_03565 HPSH_03570 gatB   TRUE 0.910 0.000 0.010 1.000   NA
 5754331 5754332 HPSH_03570 HPSH_03575     TRUE 0.939 3.000 0.130 1.000   NA
 5754332 5754333 HPSH_03575 HPSH_03580     TRUE 0.943 2.000 0.033 1.000 N NA
 5754333 5754334 HPSH_03580 HPSH_03585     FALSE 0.241 173.000 0.018 1.000 N NA
 5754335 5754336 HPSH_03590 HPSH_03595     TRUE 0.897 16.000 0.014 1.000 N NA
 5754336 5754337 HPSH_03595 HPSH_03600     FALSE 0.199 47.000 0.000 NA   NA
 5754337 5754338 HPSH_03600 HPSH_03605     TRUE 0.611 9.000 0.000 NA   NA
 5754339 5754340 HPSH_03610 HPSH_03615   aspA TRUE 0.660 57.000 0.071 1.000 N NA
 5754340 5754341 HPSH_03615 HPSH_03620 aspA   TRUE 0.598 55.000 0.020 1.000 N NA
 5754341 5754342 HPSH_03620 HPSH_03625     TRUE 0.841 3.000 0.017 NA   NA
 5754342 5754343 HPSH_03625 HPSH_03630     TRUE 0.947 12.000 0.533 NA   NA
 5754343 5754344 HPSH_03630 HPSH_03635     TRUE 0.973 -3.000 0.323 NA Y NA
 5754344 5754345 HPSH_03635 HPSH_03640     TRUE 0.887 9.000 0.080 NA   NA
 5754345 5754346 HPSH_03640 HPSH_03645     TRUE 0.949 -3.000 0.088 1.000   NA
 5754346 5754347 HPSH_03645 HPSH_03650   frxA FALSE 0.043 166.000 0.000 NA   NA
 5754347 5754348 HPSH_03650 HPSH_03660 frxA   FALSE 0.100 76.000 0.000 NA   NA
 5754348 5754349 HPSH_03660 HPSH_03665     FALSE 0.144 59.000 0.000 NA   NA
 5754352 5754353 HPSH_03680 HPSH_03685     FALSE 0.507 115.000 1.000 NA   NA
 5754354 5754355 HPSH_03690 HPSH_03695     TRUE 0.922 2.000 0.171 NA   NA
 5754355 5754356 HPSH_03695 HPSH_03700     TRUE 0.980 -3.000 0.277 1.000 Y NA
 5754356 5754357 HPSH_03700 HPSH_03705     TRUE 0.983 13.000 0.270 0.031 Y NA
 5754357 5754358 HPSH_03705 HPSH_03710     TRUE 0.990 17.000 0.951 0.002 Y NA
 5754360 5754361 HPSH_03720 HPSH_03725     FALSE 0.234 125.000 0.100 NA   NA
 5754361 5754362 HPSH_03725 HPSH_03730     TRUE 0.941 12.000 0.164 1.000   NA
 5754362 5754363 HPSH_03730 HPSH_03735   ispG TRUE 0.914 3.000 0.009 1.000 N NA
 5754364 5754365 HPSH_03740 HPSH_03745   murC TRUE 0.927 -7.000 0.016 1.000 N NA
 5754365 5754366 HPSH_03745 HPSH_03750 murC   TRUE 0.870 0.000 0.013 NA   NA
 5754366 5754367 HPSH_03750 HPSH_03755     TRUE 0.830 7.000 0.021 NA   NA
 5754368 5754369 HPSH_03760 HPSH_03765     FALSE 0.463 56.000 0.013 1.000   NA
 5754369 5754370 HPSH_03765 HPSH_03770     TRUE 0.957 -54.000 0.333 0.009   NA
 5754370 5754371 HPSH_03770 HPSH_03775     TRUE 0.893 7.000 0.000 0.009   NA
 5754371 5754372 HPSH_03775 HPSH_03780   adk TRUE 0.876 25.000 0.114 1.000 N NA
 5754372 5754373 HPSH_03780 HPSH_03785 adk aspS TRUE 0.903 17.000 0.025 1.000 N NA
 5754373 5754374 HPSH_03785 HPSH_03790 aspS   TRUE 0.710 35.000 0.010 1.000 N NA
 5754375 5754376 HPSH_03795 HPSH_03800 ligA   FALSE 0.224 101.000 0.008 1.000   NA
 5754376 5754377 HPSH_03800 HPSH_03805     FALSE 0.053 572.000 0.000 1.000   NA
 5754377 5754378 HPSH_03805 HPSH_03810     TRUE 0.913 0.000 0.047 NA   NA
 5754379 5754380 HPSH_03815 HPSH_03820     TRUE 0.618 139.000 0.600 0.013   NA
 5754380 5754381 HPSH_03820 HPSH_03825     TRUE 0.979 -3.000 0.281 0.050   NA
 5754381 5754382 HPSH_03825 HPSH_03830     TRUE 0.979 13.000 0.844 1.000 N NA
 5754382 5754383 HPSH_03830 HPSH_03835     TRUE 0.980 10.000 0.655 1.000 Y NA
 5754383 5754384 HPSH_03835 HPSH_03840   hemE TRUE 0.913 11.000 0.010 1.000 N NA
 5754384 5754385 HPSH_03840 HPSH_03845 hemE   FALSE 0.255 66.000 0.010 NA   NA
 5754385 5754386 HPSH_03845 HPSH_03850     FALSE 0.517 45.000 0.042 NA   NA
 5754386 5754387 HPSH_03850 HPSH_03855     FALSE 0.364 118.000 0.042 1.000 N NA
 5754388 5754389 HPSH_03860 HPSH_03865     FALSE 0.210 70.000 0.000 1.000   NA
 5754389 5754390 HPSH_03865 HPSH_03870     FALSE 0.204 72.000 0.000 1.000   NA
 5754390 5754391 HPSH_03870 HPSH_03875     TRUE 0.854 23.000 0.033 1.000 N NA
 5754391 5754392 HPSH_03875 HPSH_03880     TRUE 0.960 0.000 0.050 1.000 N NA
 5754395 5754396 HPSH_03895 HPSH_03900     TRUE 0.949 9.000 0.667 NA   NA
 5754396 5754397 HPSH_03900 HPSH_03905     FALSE 0.049 140.000 0.000 NA   NA
 5754397 5754398 HPSH_03905 HPSH_03910   oorC FALSE 0.330 108.000 0.056 1.000   NA
 5754398 5754399 HPSH_03910 HPSH_03915 oorC oorB TRUE 0.991 0.000 0.324 0.003 Y NA
 5754399 5754400 HPSH_03915 HPSH_03920 oorB oorA TRUE 0.993 2.000 0.771 0.003 Y NA
 5754400 5754401 HPSH_03920 HPSH_03925 oorA oorD TRUE 0.991 0.000 0.316 0.003 Y NA
 5754401 5754402 HPSH_03925 HPSH_03930 oorD   TRUE 0.581 -12.000 0.000 NA   NA
 5754402 5754403 HPSH_03930 HPSH_03935     FALSE 0.077 96.000 0.000 NA   NA
 5754404 5754405 HPSH_03940 HPSH_03945     TRUE 0.937 2.000 0.303 NA   NA
 5754405 5754406 HPSH_03945 HPSH_03950     TRUE 0.938 -3.000 0.011 1.000 N NA
 5754406 5754407 HPSH_03950 HPSH_03955     FALSE 0.377 82.000 0.009 1.000 N NA
 5754407 5754408 HPSH_03955 HPSH_03960     TRUE 0.929 12.000 0.281 NA   NA
 5754408 5754409 HPSH_03960 HPSH_03965     TRUE 0.905 -16.000 0.333 NA   NA
 5754409 5754410 HPSH_03965 HPSH_03970     TRUE 0.916 4.000 0.015 1.000 N NA
 5754410 5754411 HPSH_03970 HPSH_03975     TRUE 0.830 -24.000 0.018 NA N NA
 5754411 5754412 HPSH_03975 HPSH_03980     TRUE 0.910 7.000 0.216 NA   NA
 5754412 5754413 HPSH_03980 HPSH_03985     TRUE 0.948 6.000 0.727 NA   NA
 5754413 5754414 HPSH_03985 HPSH_03990     FALSE 0.471 77.000 0.025 1.000 N NA
 5754414 5754415 HPSH_03990 HPSH_03995     TRUE 0.961 1.000 0.117 1.000 N NA
 5754415 5754416 HPSH_03995 HPSH_04000     TRUE 0.956 9.000 0.055 0.018   NA
 5754416 5754417 HPSH_04000 HPSH_04005     TRUE 0.847 21.000 0.042 1.000   NA
 5754417 5754418 HPSH_04005 HPSH_04010     TRUE 0.609 53.000 0.277 NA   NA
 5754418 5754419 HPSH_04010 HPSH_04015     FALSE 0.385 58.000 0.028 NA   NA
 5754419 5754420 HPSH_04015 HPSH_04020     TRUE 0.830 15.000 0.026 NA   NA
 5754420 5754421 HPSH_04020 HPSH_04025     TRUE 0.525 62.000 0.250 NA   NA
 5754421 5754422 HPSH_04025 HPSH_04030     TRUE 0.939 2.000 0.026 1.000 N NA
 5754422 5754423 HPSH_04030 HPSH_04035     TRUE 0.614 34.000 0.009 1.000   NA
 5754425 5754426 HPSH_04045 HPSH_04050 dapF   FALSE 0.143 107.000 0.009 NA   NA
 5754428 5754429 HPSH_04060 HPSH_04065   rpsU FALSE 0.318 102.000 0.154 NA   NA
 5754429 5754430 HPSH_04065 HPSH_04070 rpsU fabG TRUE 0.639 37.000 0.017 1.000   NA
 5754430 5754431 HPSH_04070 HPSH_04075 fabG   TRUE 0.599 230.000 0.321 0.008 Y NA
 5754431 5754432 HPSH_04075 HPSH_04080     FALSE 0.038 190.000 0.000 NA   NA
 5754432 5754433 HPSH_04080 HPSH_04085     TRUE 0.560 16.000 0.000 NA   NA
 5754433 5754434 HPSH_04085 HPSH_04090     TRUE 0.894 23.000 0.046 1.000 Y NA
 5754434 5754435 HPSH_04090 HPSH_04095     FALSE 0.061 113.000 0.000 NA   NA
 5754438 5754439 HPSH_04110 HPSH_04115     TRUE 0.973 -3.000 0.882 NA   NA
 5754439 5754440 HPSH_04115 HPSH_04120     TRUE 0.858 13.000 0.033 NA   NA
 5754440 5754441 HPSH_04120 HPSH_04125     TRUE 0.904 13.000 0.031 1.000   NA
 5754441 5754442 HPSH_04125 HPSH_04130   rpmE TRUE 0.779 25.000 0.031 1.000   NA
 5754443 5754444 HPSH_04135 HPSH_04140 rho   TRUE 0.744 36.000 0.023 1.000 N NA
 5754446 5754447 HPSH_04150 HPSH_04155     FALSE 0.356 167.000 0.714 NA   NA
 5754447 5754448 HPSH_04155 HPSH_04160     TRUE 0.968 2.000 1.000 NA   NA
 5754448 5754449 HPSH_04160 HPSH_04165     TRUE 0.907 15.000 0.231 NA   NA
 5754449 5754450 HPSH_04165 HPSH_04170     TRUE 0.929 2.000 0.231 NA   NA
 5754450 5754451 HPSH_04170 HPSH_04175     FALSE 0.163 55.000 0.000 NA   NA
 5754453 5754454 HPSH_04185 HPSH_04190     TRUE 0.929 11.000 0.286 NA   NA
 5754454 5754455 HPSH_04190 HPSH_04195     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 5754456 5754457 HPSH_04200 HPSH_04205     TRUE 0.958 15.000 1.000 NA   NA
 5754460 5754461 HPSH_04220 HPSH_04225     FALSE 0.460 21.000 0.000 NA   NA
 5754461 5754462 HPSH_04225 HPSH_04230     FALSE 0.353 168.000 0.714 NA   NA
 5754462 5754463 HPSH_04230 HPSH_04235     FALSE 0.110 70.000 0.000 NA   NA
 5754464 5754465 HPSH_04240 HPSH_04245     TRUE 0.816 29.000 0.429 NA   NA
 5754466 5754467 HPSH_04250 HPSH_04255     FALSE 0.027 434.000 0.000 NA   NA
 5754468 5754469 HPSH_04260 HPSH_04265     TRUE 0.908 16.000 0.286 NA   NA
 5754470 5754471 HPSH_04270 HPSH_04275     TRUE 0.595 5.000 0.000 NA   NA
 5754471 5754472 HPSH_04275 HPSH_04280     FALSE 0.175 52.000 0.000 NA   NA
 5754472 5754473 HPSH_04280 HPSH_04285     TRUE 0.948 15.000 0.150 1.000 N NA
 5754473 5754474 HPSH_04285 HPSH_04290     TRUE 0.596 -10.000 0.000 NA   NA
 5754474 5754475 HPSH_04290 HPSH_04295     TRUE 0.613 13.000 0.000 NA   NA
 5754475 5754476 HPSH_04295 HPSH_04300     TRUE 0.942 5.000 0.583 NA   NA
 5754476 5754477 HPSH_04300 HPSH_04305     TRUE 0.975 9.000 0.429 1.000 Y NA
 5754478 5754479 HPSH_04310 HPSH_04315     FALSE 0.412 139.000 0.778 NA   NA
 5754479 5754480 HPSH_04315 HPSH_04320     TRUE 0.597 14.000 0.000 NA   NA
 5754480 5754481 HPSH_04320 HPSH_04325     TRUE 0.560 16.000 0.000 NA   NA
 5754483 5754484 HPSH_04335 HPSH_04340   era TRUE 0.931 -3.000 0.125 NA   NA
 5754484 5754485 HPSH_04340 HPSH_04345 era hslU TRUE 0.944 0.000 0.051 1.000   NA
 5754485 5754486 HPSH_04345 HPSH_04350 hslU   TRUE 0.988 0.000 0.752 1.000 Y NA
 5754486 5754487 HPSH_04350 HPSH_04355   rplI TRUE 0.932 4.000 0.034 1.000 N NA
 5754487 5754488 HPSH_04355 HPSH_04360 rplI   FALSE 0.228 63.000 0.005 NA   NA
 5754490 5754491 HPSH_04370 HPSH_04375     FALSE 0.029 334.000 0.000 NA   NA
 5754491 5754492 HPSH_04375 HPSH_04380     TRUE 0.794 23.000 0.009 1.000 N NA
 5754492 5754493 HPSH_04380 HPSH_04385     TRUE 0.652 2.000 0.000 NA   NA
 5754493 5754494 HPSH_04385 HPSH_04390     TRUE 0.629 11.000 0.000 NA   NA
 5754494 5754495 HPSH_04390 HPSH_04395     TRUE 0.974 0.000 0.269 1.000 N NA
 5754497 5754498 HPSH_04405 HPSH_04410   gyrB TRUE 0.598 7.000 0.000 NA   NA
 5754498 5754499 HPSH_04410 HPSH_04415 gyrB   TRUE 0.964 12.000 0.114 1.000 Y NA
 5754499 5754500 HPSH_04415 HPSH_04420     FALSE 0.492 58.000 0.007 1.000 N NA
 5754500 5754501 HPSH_04420 HPSH_04425     TRUE 0.932 15.000 0.184 1.000   NA
 5754501 5754502 HPSH_04425 HPSH_04430     TRUE 0.987 11.000 0.800 0.001   NA
 5754503 5754504 HPSH_04435 HPSH_04440     TRUE 0.747 -10.000 0.006 NA   NA
 5754505 5754506 HPSH_04445 HPSH_04450 murD mraY TRUE 0.991 2.000 0.647 0.007 Y NA
 5754507 5754508 HPSH_04455 HPSH_04460   rpmB FALSE 0.233 100.000 0.008 1.000   NA
 5754508 5754509 HPSH_04460 HPSH_04465 rpmB   FALSE 0.285 150.000 0.025 1.000 N NA
 5754510 5754511 HPSH_04470 HPSH_04475     TRUE 0.560 16.000 0.000 NA   NA
 5754513 5754514 HPSH_04485 HPSH_04490     TRUE 0.961 0.000 0.500 NA   NA
 5754514 5754515 HPSH_04490 HPSH_04495     TRUE 0.957 4.000 0.833 NA   NA
 5754515 5754516 HPSH_04495 HPSH_04500     TRUE 0.708 44.000 0.400 NA   NA
 5754516 5754517 HPSH_04500 HPSH_04505     TRUE 0.945 1.000 0.333 NA   NA
 5754518 5754519 HPSH_04510 HPSH_04515     FALSE 0.100 267.000 0.000 1.000 N NA
 5754519 5754520 HPSH_04515 HPSH_04520     TRUE 0.562 85.000 0.750 NA   NA
 5754520 5754521 HPSH_04520 HPSH_04525     TRUE 0.864 32.000 0.875 NA   NA
 5754523 5754524 HPSH_04535 HPSH_04540     TRUE 0.940 -7.000 0.400 NA   NA
 5754525 5754526 HPSH_04545 HPSH_04550     TRUE 0.955 1.000 0.500 NA   NA
 5754526 5754527 HPSH_04550 HPSH_04555     TRUE 0.966 1.000 0.800 NA   NA
 5754527 5754528 HPSH_04555 HPSH_04560     TRUE 0.974 -3.000 1.000 NA   NA
 5754528 5754529 HPSH_04560 HPSH_04565     TRUE 0.964 -3.000 0.600 NA   NA
 5754529 5754530 HPSH_04565 HPSH_04570     TRUE 0.971 0.000 0.800 NA   NA
 5754530 5754531 HPSH_04570 HPSH_04575     TRUE 0.955 -3.000 0.400 NA   NA
 5754531 5754532 HPSH_04575 HPSH_04580     FALSE 0.398 122.000 0.600 NA   NA
 5754532 5754533 HPSH_04580 HPSH_04585     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 5754533 5754534 HPSH_04585 HPSH_04590     TRUE 0.563 -13.000 0.000 NA   NA
 5754534 5754535 HPSH_04590 HPSH_04595     TRUE 0.963 -3.000 0.571 NA   NA
 5754535 5754536 HPSH_04595 HPSH_04600     TRUE 0.983 0.000 0.750 NA Y NA
 5754536 5754537 HPSH_04600 HPSH_04605     TRUE 0.652 2.000 0.000 NA   NA
 5754537 5754538 HPSH_04605 HPSH_04610     TRUE 0.710 0.000 0.000 NA   NA
 5754538 5754539 HPSH_04610 HPSH_04615     TRUE 0.901 -7.000 0.002 1.000 N NA
 5754539 5754540 HPSH_04615 HPSH_04620     TRUE 0.930 13.000 0.333 NA   NA
 5754540 5754541 HPSH_04620 HPSH_04625     TRUE 0.945 1.000 0.333 NA   NA
 5754541 5754542 HPSH_04625 HPSH_04630     TRUE 0.596 -10.000 0.000 NA   NA
 5754542 5754543 HPSH_04630 HPSH_04635     FALSE 0.043 165.000 0.000 NA   NA
 5754543 5754544 HPSH_04635 HPSH_04640     TRUE 0.629 11.000 0.000 NA   NA
 5754544 5754545 HPSH_04640 HPSH_04645     FALSE 0.426 22.000 0.000 NA   NA
 5754547 5754548 HPSH_04655 HPSH_04660 ruvA   TRUE 0.559 25.000 0.008 NA   NA
 5754549 5754550 HPSH_04665 HPSH_04670   cysS TRUE 0.922 1.000 0.027 1.000   NA
 5754550 5754551 HPSH_04670 HPSH_04675 cysS   FALSE 0.070 233.000 0.000 1.000   NA
 5754552 5754553 HPSH_04680 HPSH_04685     FALSE 0.046 152.000 0.000 NA   NA
 5754553 5754554 HPSH_04685 HPSH_04690     TRUE 0.990 0.000 1.000 1.000 Y NA
 5754554 5754555 HPSH_04690 HPSH_04695     TRUE 0.791 -7.000 0.000 1.000   NA
 5754557 5754558 HPSH_04705 HPSH_04710     TRUE 0.942 -19.000 0.857 NA   NA
 5754558 5754559 HPSH_04710 HPSH_04715     FALSE 0.140 60.000 0.000 NA   NA
 5754559 5754560 HPSH_04715 HPSH_04720     TRUE 0.607 4.000 0.000 NA   NA
 5754564 5754565 HPSH_t08312 HPSH_04735     FALSE 0.026 535.000 0.000 NA   NA
 5754565 5754566 HPSH_04735 HPSH_04740     TRUE 0.751 19.000 0.000 NA Y NA
 5754566 5754567 HPSH_04740 HPSH_04745     TRUE 0.978 0.000 0.463 NA Y NA
 5754567 5754568 HPSH_04745 HPSH_04750     TRUE 0.536 17.000 0.000 NA   NA
 5754568 5754569 HPSH_04750 HPSH_04755     FALSE 0.049 140.000 0.000 NA   NA
 5754569 5754570 HPSH_04755 HPSH_04760     TRUE 0.877 11.000 0.045 NA   NA
 5754570 5754571 HPSH_04760 HPSH_04765     TRUE 0.943 18.000 0.103 1.000 Y NA
 5754572 5754573 HPSH_04770 HPSH_04775   flgD TRUE 0.576 51.000 0.158 NA   NA
 5754573 5754574 HPSH_04775 HPSH_04780 flgD flgE TRUE 0.974 -3.000 0.368 NA Y NA
 5754574 5754575 HPSH_04780 HPSH_04785 flgE   TRUE 0.648 59.000 0.571 NA   NA
 5754575 5754576 HPSH_04785 HPSH_04790     TRUE 0.862 -19.000 0.127 NA   NA
 5754576 5754577 HPSH_04790 HPSH_04795     TRUE 0.976 -6.000 0.048 0.062 Y NA
 5754577 5754578 HPSH_04795 HPSH_04800     FALSE 0.030 316.000 0.000 NA   NA
 5754578 5754579 HPSH_04800 HPSH_04805     FALSE 0.064 110.000 0.000 NA   NA
 5754579 5754580 HPSH_04805 HPSH_04810     FALSE 0.426 22.000 0.000 NA   NA
 5754581 5754582 HPSH_04815 HPSH_04820   hopG FALSE 0.030 320.000 0.000 NA   NA
 5754582 5754583 HPSH_04820 HPSH_04830 hopG   FALSE 0.033 238.000 0.000 NA   NA
 5754583 5754584 HPSH_04830 HPSH_04835     FALSE 0.124 175.000 0.022 NA   NA
 5754584 5754585 HPSH_04835 HPSH_04840   carB TRUE 0.826 5.000 0.020 NA   NA
 5754585 5754586 HPSH_04840 HPSH_04845 carB   FALSE 0.183 95.000 0.011 NA   NA
 5754587 5754588 HPSH_04850 HPSH_04855   vacA FALSE 0.096 79.000 0.000 NA   NA
 5754588 5754589 HPSH_04855 HPSH_04865 vacA   FALSE 0.170 53.000 0.000 NA   NA
 5754591 5754592 HPSH_04875 HPSH_04880 recR truD TRUE 0.902 -3.000 0.008 1.000   NA
 5754592 5754593 HPSH_04880 HPSH_04885 truD   TRUE 0.888 -13.000 0.034 1.000   NA
 5754593 5754594 HPSH_04885 HPSH_04890   folE TRUE 0.960 1.000 0.102 1.000 N NA
 5754594 5754595 HPSH_04890 HPSH_04895 folE   TRUE 0.957 16.000 0.167 1.000 Y NA
 5754595 5754596 HPSH_04895 HPSH_04900   surE TRUE 0.938 -3.000 0.041 1.000   NA
 5754596 5754597 HPSH_04900 HPSH_04905 surE   TRUE 0.824 -3.000 0.006 NA   NA
 5754597 5754598 HPSH_04905 HPSH_04910     TRUE 0.768 4.000 0.008 NA   NA
 5754598 5754599 HPSH_04910 HPSH_04915     TRUE 0.968 -3.000 0.139 1.000 N NA
 5754599 5754600 HPSH_04915 HPSH_04920     TRUE 0.891 11.000 0.015 1.000   NA
 5754600 5754601 HPSH_04920 HPSH_04925     FALSE 0.035 221.000 0.000 NA   NA
 5754602 5754603 HPSH_04930 HPSH_04935     FALSE 0.027 433.000 0.000 NA   NA
 5754603 5754604 HPSH_04935 HPSH_04940     FALSE 0.329 68.000 0.031 NA   NA
 5754604 5754605 HPSH_04940 HPSH_04945     TRUE 0.982 -25.000 0.594 0.022 Y NA
 5754605 5754606 HPSH_04945 HPSH_04950     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 5754606 5754607 HPSH_04950 HPSH_04955     TRUE 0.619 10.000 0.000 NA   NA
 5754607 5754608 HPSH_04955 HPSH_04960     TRUE 0.958 7.000 0.267 1.000 N NA
 5754608 5754609 HPSH_04960 HPSH_04965     TRUE 0.864 41.000 0.267 1.000 Y NA
 5754609 5754610 HPSH_04965 HPSH_04970     TRUE 0.916 23.000 0.667 NA N NA
 5754613 5754614 HPSH_t08316 HPSH_t08318     FALSE 0.101 75.000 0.000 NA   NA
 5754614 5754615 HPSH_t08318 HPSH_t08320     FALSE 0.193 48.000 0.000 NA   NA
 5754615 5754616 HPSH_t08320 HPSH_04980     FALSE 0.054 127.000 0.000 NA   NA
 5754616 5754617 HPSH_04980 HPSH_04990     FALSE 0.031 280.000 0.000 NA   NA
 5754618 5754619 HPSH_04995 HPSH_05000     TRUE 0.819 10.000 0.013 NA   NA
 5754619 5754620 HPSH_05000 HPSH_05005     TRUE 0.853 14.000 0.035 NA   NA
 5754621 5754622 HPSH_05010 HPSH_05015     TRUE 0.879 11.000 0.047 NA   NA
 5754623 5754624 HPSH_05020 HPSH_05025   rdxA FALSE 0.125 65.000 0.000 NA   NA
 5754624 5754625 HPSH_05025 HPSH_05035 rdxA   TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 5754625 5754626 HPSH_05035 HPSH_05040     TRUE 0.916 10.000 0.013 1.000 N NA
 5754626 5754627 HPSH_05040 HPSH_05045     TRUE 0.931 18.000 0.133 1.000 N NA
 5754627 5754628 HPSH_05045 HPSH_05050     TRUE 0.922 1.000 0.122 NA   NA
 5754628 5754629 HPSH_05050 HPSH_05055     TRUE 0.932 10.000 0.342 NA   NA
 5754629 5754630 HPSH_05055 HPSH_05060   glyQ TRUE 0.884 2.000 0.041 NA   NA
 5754630 5754631 HPSH_05060 HPSH_05065 glyQ gpsA TRUE 0.909 14.000 0.013 1.000 N NA
 5754631 5754632 HPSH_05065 HPSH_05070 gpsA   FALSE 0.311 30.000 0.000 NA   NA
 5754632 5754633 HPSH_05070 HPSH_05075     FALSE 0.426 22.000 0.000 NA   NA
 5754633 5754634 HPSH_05075 HPSH_05085     TRUE 0.710 0.000 0.000 NA   NA
 5754634 5754635 HPSH_05085 HPSH_05095     TRUE 0.710 0.000 0.000 NA   NA
 5754635 5754636 HPSH_05095 HPSH_05105     FALSE 0.229 42.000 0.000 NA   NA
 5754636 5754637 HPSH_05105 HPSH_05110     FALSE 0.036 207.000 0.000 NA   NA
 5754637 5754638 HPSH_05110 HPSH_05115     FALSE 0.417 68.000 0.108 NA   NA
 5754638 5754639 HPSH_05115 HPSH_05120     TRUE 0.946 11.000 0.514 NA   NA
 5754639 5754640 HPSH_05120 HPSH_05125     TRUE 0.971 0.000 0.464 NA N NA
 5754640 5754641 HPSH_05125 HPSH_05130     TRUE 0.984 -3.000 0.857 NA Y NA
 5754641 5754642 HPSH_05130 HPSH_05135   glyS TRUE 0.869 -28.000 0.013 1.000 N NA
 5754643 5754644 HPSH_05140 HPSH_05145     TRUE 0.816 13.000 0.013 NA   NA
 5754644 5754645 HPSH_05145 HPSH_05150   gatC TRUE 0.896 15.000 0.009 1.000 N NA
 5754647 5754648 HPSH_05160 HPSH_05165     TRUE 0.932 15.000 0.184 1.000   NA
 5754648 5754649 HPSH_05165 HPSH_05170     FALSE 0.457 135.000 0.114 1.000 Y NA
 5754650 5754651 HPSH_05175 HPSH_05185     FALSE 0.489 -34.000 0.000 NA   NA
 5754651 5754652 HPSH_05185 HPSH_05200     FALSE 0.029 322.000 0.000 NA   NA
 5754652 5754653 HPSH_05200 HPSH_05205     TRUE 0.613 13.000 0.000 NA   NA
 5754653 5754654 HPSH_05205 HPSH_05210   xseA FALSE 0.031 266.000 0.000 NA   NA
 5754654 5754655 HPSH_05210 HPSH_05215 xseA   TRUE 0.594 6.000 0.000 NA   NA
 5754655 5754656 HPSH_05215 HPSH_05220     FALSE 0.036 209.000 0.000 NA   NA
 5754656 5754657 HPSH_05220 HPSH_05225     TRUE 0.619 10.000 0.000 NA   NA
 5754657 5754658 HPSH_05225 HPSH_05230     TRUE 0.710 0.000 0.000 NA   NA
 5754658 5754659 HPSH_05230 HPSH_05235     TRUE 0.563 -13.000 0.000 NA   NA
 5754659 5754660 HPSH_05235 HPSH_05240     FALSE 0.050 139.000 0.000 NA   NA
 5754660 5754661 HPSH_05240 HPSH_05245     TRUE 0.619 10.000 0.000 NA   NA
 5754661 5754662 HPSH_05245 HPSH_05250     TRUE 0.891 13.000 0.091 NA   NA
 5754662 5754663 HPSH_05250 HPSH_r08354     FALSE 0.025 1073.000 0.000 NA   NA
 5754663 5754664 HPSH_r08354 HPSH_r08362     FALSE 0.033 237.000 0.000 NA   NA
 5754664 5754665 HPSH_r08362 HPSH_05255     FALSE 0.045 157.000 0.000 NA   NA
 5754666 5754667 HPSH_05260 HPSH_05270     FALSE 0.239 41.000 0.000 NA   NA
 5754667 5754668 HPSH_05270 HPSH_05280     FALSE 0.184 50.000 0.000 NA   NA
 5754668 5754669 HPSH_05280 HPSH_05290     FALSE 0.073 100.000 0.000 NA   NA
 5754669 5754670 HPSH_05290 HPSH_05295     TRUE 0.598 7.000 0.000 NA   NA
 5754671 5754672 HPSH_05300 HPSH_05305     TRUE 0.919 15.000 0.024 1.000 N NA
 5754672 5754673 HPSH_05305 HPSH_05310     TRUE 0.921 4.000 0.093 NA N NA
 5754673 5754674 HPSH_05310 HPSH_05315     TRUE 0.849 16.000 0.053 NA   NA
 5754674 5754675 HPSH_05315 HPSH_05320     TRUE 0.855 4.000 0.033 NA   NA
 5754675 5754676 HPSH_05320 HPSH_05325     TRUE 0.894 1.000 0.009 1.000   NA
 5754678 5754679 HPSH_05335 HPSH_t08322     FALSE 0.026 477.000 0.000 NA   NA
 5754679 5754680 HPSH_t08322 HPSH_t08324     FALSE 0.519 18.000 0.000 NA   NA
 5754680 5754681 HPSH_t08324 HPSH_t08326     FALSE 0.136 61.000 0.000 NA   NA
 5754681 5754682 HPSH_t08326 HPSH_t08328     FALSE 0.116 68.000 0.000 NA   NA
 5754682 5754683 HPSH_t08328 HPSH_05345     TRUE 0.612 -9.000 0.000 NA   NA
 5754683 5754684 HPSH_05345 HPSH_05350     FALSE 0.082 93.000 0.000 NA   NA
 5754684 5754685 HPSH_05350 HPSH_05355     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 5754685 5754686 HPSH_05355 HPSH_05360   guaA TRUE 0.612 -9.000 0.000 NA   NA
 5754686 5754687 HPSH_05360 HPSH_05365 guaA   TRUE 0.780 11.000 0.007 NA   NA
 5754687 5754688 HPSH_05365 HPSH_05370     FALSE 0.410 161.000 0.875 NA   NA
 5754688 5754689 HPSH_05370 HPSH_05375     FALSE 0.359 100.000 0.241 NA   NA
 5754689 5754690 HPSH_05375 HPSH_05380     TRUE 0.749 26.000 0.105 NA   NA
 5754690 5754691 HPSH_05380 HPSH_05385     TRUE 0.874 19.000 0.014 1.000 N NA
 5754692 5754693 HPSH_05390 HPSH_05395 pheS pheT TRUE 0.994 0.000 0.574 0.001 Y NA
 5754693 5754694 HPSH_05395 HPSH_05400 pheT   TRUE 0.914 16.000 0.028 1.000 N NA
 5754694 5754695 HPSH_05400 HPSH_05405   ispH TRUE 0.927 -10.000 0.032 1.000 N NA
 5754695 5754696 HPSH_05405 HPSH_05410 ispH rpsA FALSE 0.376 121.000 0.058 1.000 N NA
 5754696 5754697 HPSH_05410 HPSH_05415 rpsA   FALSE 0.479 29.000 0.003 NA   NA
 5754697 5754698 HPSH_05415 HPSH_05420     FALSE 0.073 189.000 0.004 NA   NA
 5754698 5754699 HPSH_05420 HPSH_05425     TRUE 0.913 10.000 0.016 NA Y NA
 5754699 5754700 HPSH_05425 HPSH_05430     TRUE 0.832 10.000 0.017 NA   NA
 5754700 5754701 HPSH_05430 HPSH_05435     TRUE 0.845 2.000 0.015 NA   NA
 5754701 5754702 HPSH_05435 HPSH_05440     TRUE 0.920 4.000 0.065 1.000   NA
 5754702 5754703 HPSH_05440 HPSH_05445     TRUE 0.854 58.000 0.147 0.007 Y NA
 5754703 5754704 HPSH_05445 HPSH_05450     TRUE 0.987 -3.000 0.137 0.010 Y NA
 5754706 5754707 HPSH_05460 HPSH_05465     TRUE 0.612 52.000 0.018 1.000 N NA
 5754708 5754709 HPSH_05470 HPSH_05475     TRUE 0.697 -15.000 0.003 NA   NA
 5754709 5754710 HPSH_05475 HPSH_05480     TRUE 0.926 13.000 0.300 NA   NA
 5754713 5754714 HPSH_05495 HPSH_05500     FALSE 0.116 68.000 0.000 NA   NA
 5754714 5754715 HPSH_05500 HPSH_05510     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 5754715 5754716 HPSH_05510 HPSH_05515     FALSE 0.512 67.000 0.020 1.000 N NA
 5754717 5754718 HPSH_05520 HPSH_05525     TRUE 0.963 10.000 0.176 0.063   NA
 5754718 5754719 HPSH_05525 HPSH_05530     TRUE 0.981 9.000 0.750 1.000 Y NA
 5754719 5754720 HPSH_05530 HPSH_05535   hemH FALSE 0.481 73.000 0.024 1.000 N NA
 5754721 5754722 HPSH_05540 HPSH_05545     TRUE 0.916 1.000 0.098 NA   NA
 5754723 5754724 HPSH_05550 HPSH_05555   dcd FALSE 0.089 159.000 0.007 NA   NA
 5754725 5754726 HPSH_05560 HPSH_05565     TRUE 0.954 6.000 0.071 1.000 Y NA
 5754726 5754727 HPSH_05565 HPSH_05570     FALSE 0.301 93.000 0.015 1.000   NA
 5754727 5754728 HPSH_05570 HPSH_05575     TRUE 0.959 0.000 0.444 NA   NA
 5754728 5754729 HPSH_05575 HPSH_05580     TRUE 0.755 49.000 0.778 NA   NA
 5754729 5754730 HPSH_05580 HPSH_05585     TRUE 0.913 -3.000 0.053 NA   NA
 5754732 5754733 HPSH_05595 HPSH_05600 nrdF pcm TRUE 0.959 10.000 0.227 1.000 N NA
 5754733 5754734 HPSH_05600 HPSH_05605 pcm   TRUE 0.885 11.000 0.012 1.000   NA
 5754734 5754735 HPSH_05605 HPSH_05610   truA TRUE 0.937 1.000 0.059 1.000   NA
 5754737 5754738 HPSH_t08332 HPSH_t08334     TRUE 0.584 15.000 0.000 NA   NA
 5754738 5754739 HPSH_t08334 HPSH_05630     FALSE 0.032 249.000 0.000 NA   NA
 5754739 5754740 HPSH_05630 HPSH_05635     TRUE 0.745 22.000 0.035 NA   NA
 5754741 5754742 HPSH_05640 HPSH_05645     FALSE 0.435 70.000 0.034 1.000   NA
 5754742 5754743 HPSH_05645 HPSH_05650     TRUE 0.965 19.000 0.523 1.000 Y NA
 5754744 5754745 HPSH_05655 HPSH_05660     TRUE 0.950 11.000 0.028 1.000 Y NA
 5754745 5754746 HPSH_05660 HPSH_05665   glk TRUE 0.953 -13.000 0.117 1.000 Y NA
 5754746 5754747 HPSH_05665 HPSH_05670 glk   FALSE 0.249 162.000 0.061 1.000   NA
 5754748 5754749 HPSH_05675 HPSH_05680     TRUE 0.745 133.000 0.429 0.002 Y NA
 5754752 5754753 HPSH_05695 HPSH_05700   porD TRUE 0.980 16.000 0.205 0.003 Y NA
 5754753 5754754 HPSH_05700 HPSH_05705 porD porA TRUE 0.990 10.000 0.625 0.003 Y NA
 5754754 5754755 HPSH_05705 HPSH_05710 porA   TRUE 0.985 13.000 0.268 0.003 Y NA
 5754755 5754756 HPSH_05710 HPSH_05715     FALSE 0.276 110.000 0.007 1.000 N NA
 5754756 5754757 HPSH_05715 HPSH_05720     FALSE 0.212 69.000 0.007 NA   NA
 5754758 5754759 HPSH_05725 HPSH_05730     FALSE 0.048 141.000 0.000 NA   NA
 5754759 5754760 HPSH_05730 HPSH_05735     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 5754760 5754761 HPSH_05735 HPSH_05740     FALSE 0.028 353.000 0.000 NA   NA
 5754761 5754762 HPSH_05740 HPSH_05745     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 5754762 5754763 HPSH_05745 HPSH_05750     TRUE 0.633 3.000 0.000 NA   NA
 5754763 5754764 HPSH_05750 HPSH_05755     FALSE 0.040 177.000 0.000 NA   NA
 5754764 5754765 HPSH_05755 HPSH_05760   flgK FALSE 0.117 205.000 0.000 1.000 N NA
 5754765 5754766 HPSH_05760 HPSH_05765 flgK   TRUE 0.953 2.000 0.558 NA   NA
 5754766 5754767 HPSH_05765 HPSH_05770     FALSE 0.268 130.000 0.207 NA   NA
 5754769 5754770 HPSH_05780 HPSH_05785     TRUE 0.536 64.000 0.290 NA   NA
 5754770 5754771 HPSH_05785 HPSH_05790     TRUE 0.734 32.000 0.200 NA   NA
 5754771 5754772 HPSH_05790 HPSH_05795     TRUE 0.953 -13.000 0.543 1.000   NA
 5754772 5754773 HPSH_05795 HPSH_05800     TRUE 0.968 8.000 0.794 1.000   NA
 5754773 5754774 HPSH_05800 HPSH_05805   tolB TRUE 0.770 67.000 0.702 1.000 N NA
 5754774 5754775 HPSH_05805 HPSH_05810 tolB   TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 5754775 5754776 HPSH_05810 HPSH_05815     FALSE 0.499 19.000 0.000 NA   NA
 5754776 5754777 HPSH_05815 HPSH_05820     TRUE 0.934 53.000 0.944 0.028 Y NA
 5754777 5754778 HPSH_05820 HPSH_05825   atpC TRUE 0.938 11.000 0.036 1.000 N NA
 5754778 5754779 HPSH_05825 HPSH_05830 atpC   TRUE 0.992 11.000 0.837 0.007 Y NA
 5754779 5754780 HPSH_05830 HPSH_05835     TRUE 0.983 20.000 0.724 0.007 Y NA
 5754780 5754781 HPSH_05835 HPSH_05840     TRUE 0.990 15.000 0.846 0.007 Y NA
 5754781 5754782 HPSH_05840 HPSH_05845     TRUE 0.980 23.000 0.864 0.007 Y NA
 5754782 5754783 HPSH_05845 HPSH_05850     TRUE 0.986 1.000 0.132 0.007 Y NA
 5754783 5754784 HPSH_05850 HPSH_05855     TRUE 0.980 4.000 0.110 0.007 Y NA
 5754784 5754785 HPSH_05855 HPSH_05860     FALSE 0.377 111.000 0.037 1.000 N NA
 5754785 5754786 HPSH_05860 HPSH_05865     TRUE 0.980 3.000 0.827 1.000 N NA
 5754786 5754787 HPSH_05865 HPSH_05870     TRUE 0.940 3.000 0.040 1.000 N NA
 5754787 5754788 HPSH_05870 HPSH_05875   fmt TRUE 0.952 -3.000 0.029 1.000 N NA
 5754788 5754789 HPSH_05875 HPSH_05880 fmt   TRUE 0.536 17.000 0.000 NA   NA
 5754789 5754790 HPSH_05880 HPSH_05890     FALSE 0.136 61.000 0.000 NA   NA
 5754792 5754793 HPSH_05900 HPSH_r08358     FALSE 0.125 65.000 0.000 NA   NA
 5754797 5754798 HPSH_05920 HPSH_05925 rplS trmD TRUE 0.955 22.000 0.567 1.000 Y NA
 5754798 5754799 HPSH_05925 HPSH_05930 trmD   TRUE 0.985 1.000 0.672 1.000 Y NA
 5754799 5754800 HPSH_05930 HPSH_05935     TRUE 0.962 1.000 0.324 1.000   NA
 5754800 5754801 HPSH_05935 HPSH_05940   rpsP TRUE 0.938 17.000 0.385 1.000   NA
 5754801 5754802 HPSH_05940 HPSH_05945 rpsP   TRUE 0.669 74.000 0.361 1.000 N NA
 5754802 5754803 HPSH_05945 HPSH_05950   valS TRUE 0.928 15.000 0.006 0.091 N NA
 5754804 5754805 HPSH_05955 HPSH_05960   murG TRUE 0.850 12.000 0.022 NA   NA
 5754805 5754806 HPSH_05960 HPSH_05965 murG   FALSE 0.183 108.000 0.020 NA   NA
 5754806 5754807 HPSH_05965 HPSH_05970     FALSE 0.397 23.000 0.000 NA   NA
 5754807 5754808 HPSH_05970 HPSH_05975     TRUE 0.597 14.000 0.000 NA   NA
 5754808 5754809 HPSH_05975 HPSH_05980     TRUE 0.778 44.000 0.151 1.000 N NA
 5754810 5754811 HPSH_05985 HPSH_05990     FALSE 0.299 53.000 0.007 NA   NA
 5754811 5754812 HPSH_05990 HPSH_05995     FALSE 0.415 89.000 0.281 NA   NA
 5754813 5754814 HPSH_06000 HPSH_06005     TRUE 0.774 26.000 0.043 NA N NA
 5754819 5754820 HPSH_06035 HPSH_06040     FALSE 0.095 80.000 0.000 NA   NA
 5754821 5754822 HPSH_06045 HPSH_06050     TRUE 0.992 3.000 0.841 0.010 Y NA
 5754822 5754823 HPSH_06050 HPSH_06055     TRUE 0.985 2.000 0.773 1.000 Y NA
 5754823 5754824 HPSH_06055 HPSH_06060     TRUE 0.878 49.000 0.671 1.000 Y NA
 5754824 5754825 HPSH_06060 HPSH_06065     TRUE 0.637 -7.000 0.000 NA   NA
 5754825 5754826 HPSH_06065 HPSH_06070     FALSE 0.140 60.000 0.000 NA   NA
 5754827 5754828 HPSH_06075 HPSH_06080     FALSE 0.106 130.000 0.000 1.000   NA
 5754828 5754829 HPSH_06080 HPSH_06085     FALSE 0.061 113.000 0.000 NA   NA
 5754833 5754834 HPSH_06105 HPSH_06110     TRUE 0.944 -3.000 0.016 1.000 N NA
 5754834 5754835 HPSH_06110 HPSH_06115     TRUE 0.946 12.000 0.062 1.000 N NA
 5754835 5754836 HPSH_06115 HPSH_t08336     FALSE 0.068 105.000 0.000 NA   NA
 5754837 5754838 HPSH_06120 HPSH_06125     TRUE 0.856 18.000 0.029 NA N NA
 5754839 5754840 HPSH_06130 HPSH_06135     TRUE 0.815 26.000 0.023 1.000 N NA
 5754840 5754841 HPSH_06135 HPSH_06140     FALSE 0.199 160.000 0.027 NA N NA
 5754842 5754843 HPSH_06145 HPSH_06150     FALSE 0.030 287.000 0.000 NA   NA
 5754844 5754845 HPSH_06155 HPSH_06160   hisS TRUE 0.937 -13.000 0.011 0.039 N NA
 5754849 5754850 HPSH_06180 HPSH_06185     TRUE 0.980 12.000 0.579 1.000 Y NA
 5754850 5754851 HPSH_06185 HPSH_06190   rpsL TRUE 0.987 16.000 0.620 0.005 Y NA
 5754851 5754852 HPSH_06190 HPSH_06195 rpsL   TRUE 0.537 88.000 0.122 1.000 N NA
 5754854 5754855 HPSH_06205 HPSH_06210 rplL rplJ TRUE 0.946 46.000 0.884 0.026 Y NA
 5754855 5754856 HPSH_06210 HPSH_06215 rplJ rplA TRUE 0.717 109.000 0.302 0.035 Y NA
 5754856 5754857 HPSH_06215 HPSH_06220 rplA rplK TRUE 0.942 45.000 0.838 0.035 Y NA
 5754857 5754858 HPSH_06220 HPSH_06225 rplK nusG TRUE 0.963 18.000 0.681 1.000 N NA
 5754858 5754859 HPSH_06225 HPSH_06230 nusG secE TRUE 0.905 30.000 0.843 1.000   NA
 5754859 5754860 HPSH_06230 HPSH_t08338 secE   FALSE 0.050 139.000 0.000 NA   NA
 5754860 5754861 HPSH_t08338 HPSH_06235   rpmG FALSE 0.249 40.000 0.000 NA   NA
 5754861 5754862 HPSH_06235 HPSH_06240 rpmG   TRUE 0.859 34.000 0.099 1.000 Y NA
 5754862 5754863 HPSH_06240 HPSH_t08340     FALSE 0.054 127.000 0.000 NA   NA
 5754863 5754864 HPSH_t08340 HPSH_t08342     FALSE 0.303 31.000 0.000 NA   NA
 5754864 5754865 HPSH_t08342 HPSH_t08344     TRUE 0.560 16.000 0.000 NA   NA
 5754865 5754866 HPSH_t08344 HPSH_t08346     FALSE 0.337 28.000 0.000 NA   NA
 5754868 5754869 HPSH_06250 HPSH_06255     FALSE 0.306 104.000 0.030 1.000   NA
 5754869 5754870 HPSH_06255 HPSH_06260     FALSE 0.028 355.000 0.000 NA   NA
 5754870 5754871 HPSH_06260 HPSH_06265     FALSE 0.034 222.000 0.000 NA   NA
 5754871 5754872 HPSH_06265 HPSH_06270     FALSE 0.239 41.000 0.000 NA   NA
 5754872 5754873 HPSH_06270 HPSH_t08348     FALSE 0.038 197.000 0.000 NA   NA
 5754873 5754874 HPSH_t08348 HPSH_t08350     FALSE 0.157 56.000 0.000 NA   NA
 5754874 5754875 HPSH_t08350 HPSH_06275     FALSE 0.113 69.000 0.000 NA   NA
 5754875 5754876 HPSH_06275 HPSH_06280     FALSE 0.206 137.000 0.016 1.000   NA
 5754876 5754877 HPSH_06280 HPSH_06285     TRUE 0.862 3.000 0.028 NA   NA
 5754877 5754878 HPSH_06285 HPSH_06290     TRUE 0.898 15.000 0.165 NA   NA
 5754878 5754879 HPSH_06290 HPSH_06295     TRUE 0.905 3.000 0.116 NA   NA
 5754879 5754880 HPSH_06295 HPSH_06300     FALSE 0.452 42.000 0.013 NA   NA
 5754882 5754883 HPSH_06310 HPSH_06315     TRUE 0.919 -6.000 0.008 1.000 N NA
 5754883 5754884 HPSH_06315 HPSH_06320     TRUE 0.659 40.000 0.008 1.000 N NA
 5754885 5754886 HPSH_06325 HPSH_06330   hemD TRUE 0.933 3.000 0.026 1.000 N NA
 5754886 5754887 HPSH_06330 HPSH_06335 hemD   TRUE 0.709 47.000 0.051 1.000 N NA
 5754889 5754890 HPSH_06345 HPSH_06350     FALSE 0.263 159.000 0.019 1.000 N NA
 5754890 5754891 HPSH_06350 HPSH_06355     TRUE 0.950 -6.000 0.051 1.000 N NA
 5754891 5754892 HPSH_06355 HPSH_06360     TRUE 0.911 -3.000 0.050 NA   NA
 5754892 5754893 HPSH_06360 HPSH_06365     TRUE 0.913 -3.000 0.053 NA   NA
 5754893 5754894 HPSH_06365 HPSH_06370     TRUE 0.943 -3.000 0.054 1.000   NA
 5754896 5754897 HPSH_06380 HPSH_06385     TRUE 0.912 4.000 0.211 NA   NA
 5754899 5754900 HPSH_06395 HPSH_06400     TRUE 0.908 0.000 0.041 NA   NA
 5754900 5754901 HPSH_06400 HPSH_06405   amiF FALSE 0.146 168.000 0.008 1.000   NA
 5754902 5754903 HPSH_06410 HPSH_06415     FALSE 0.057 119.000 0.000 NA   NA
 5754903 5754904 HPSH_06415 HPSH_06420   alaS TRUE 0.895 2.000 0.015 NA N NA
 5754906 5754907 HPSH_06430 HPSH_06435     TRUE 0.710 0.000 0.000 NA   NA
 5754907 5754908 HPSH_06435 HPSH_06440     TRUE 0.607 4.000 0.000 NA   NA
 5754908 5754909 HPSH_06440 HPSH_06445   rpsR FALSE 0.026 495.000 0.000 NA   NA
 5754909 5754910 HPSH_06445 HPSH_06450 rpsR   TRUE 0.854 23.000 0.034 1.000 N NA
 5754910 5754911 HPSH_06450 HPSH_06455   rpsF TRUE 0.934 10.000 0.033 1.000 N NA
 5754911 5754912 HPSH_06455 HPSH_06460 rpsF   FALSE 0.280 143.000 0.020 1.000 N NA
 5754912 5754913 HPSH_06460 HPSH_06465     TRUE 0.922 -10.000 0.024 1.000 N NA
 5754913 5754914 HPSH_06465 HPSH_06470   aroE TRUE 0.950 0.000 0.020 1.000 N NA
 5754914 5754915 HPSH_06470 HPSH_06475 aroE   TRUE 0.826 8.000 0.018 NA   NA
 5754915 5754916 HPSH_06475 HPSH_06480     FALSE 0.460 21.000 0.000 NA   NA
 5754916 5754917 HPSH_06480 HPSH_06490     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 5754917 5754918 HPSH_06490 HPSH_06495     TRUE 0.879 1.000 0.000 1.000 N NA
 5754918 5754919 HPSH_06495 HPSH_06500     FALSE 0.462 72.000 0.016 1.000 N NA
 5754920 5754921 HPSH_06505 HPSH_06510 secG frr TRUE 0.933 0.000 0.008 1.000 N NA
 5754921 5754922 HPSH_06510 HPSH_06515 frr pyrE TRUE 0.926 4.000 0.026 1.000 N NA
 5754922 5754923 HPSH_06515 HPSH_06520 pyrE   TRUE 0.878 -10.000 0.071 NA   NA
 5754923 5754924 HPSH_06520 HPSH_06525     TRUE 0.920 -3.000 0.070 NA   NA
 5754924 5754925 HPSH_06525 HPSH_06530     FALSE 0.440 102.000 0.061 1.000 N NA
 5754925 5754926 HPSH_06530 HPSH_06535     TRUE 0.993 0.000 0.571 0.004 Y NA
 5754926 5754927 HPSH_06535 HPSH_06540     TRUE 0.994 0.000 0.703 0.004 Y NA
 5754927 5754928 HPSH_06540 HPSH_06545     TRUE 0.991 2.000 0.650 0.010 Y NA
 5754928 5754929 HPSH_06545 HPSH_06550     TRUE 0.987 -3.000 0.650 0.010   NA
 5754929 5754930 HPSH_06550 HPSH_06555     TRUE 0.979 -3.000 0.214 0.010   NA
 5754930 5754931 HPSH_06555 HPSH_06560     TRUE 0.980 -3.000 0.222 0.010   NA
 5754931 5754932 HPSH_06560 HPSH_06565     TRUE 0.984 -3.000 0.065 0.010 Y NA
 5754932 5754933 HPSH_06565 HPSH_06570     TRUE 0.988 11.000 0.500 0.010 Y NA
 5754933 5754934 HPSH_06570 HPSH_06575     TRUE 0.988 -7.000 0.442 0.010 Y NA
 5754934 5754935 HPSH_06575 HPSH_06580     TRUE 0.986 -3.000 0.064 0.004 Y NA
 5754935 5754936 HPSH_06580 HPSH_06585     TRUE 0.978 3.000 0.056 0.010 Y NA
 5754936 5754937 HPSH_06585 HPSH_06590     TRUE 0.979 4.000 0.056 0.002 Y NA
 5754937 5754938 HPSH_06590 HPSH_06595     TRUE 0.985 -13.000 0.389 0.002 Y NA
 5754938 5754939 HPSH_06595 HPSH_06600     TRUE 0.960 -10.000 0.586 1.000   NA
 5754939 5754940 HPSH_06600 HPSH_06605     TRUE 0.917 2.000 0.030 1.000   NA
 5754940 5754941 HPSH_06605 HPSH_06610     FALSE 0.120 111.000 0.007 NA   NA
 5754942 5754943 HPSH_06615 HPSH_06620 trpA   TRUE 0.995 -3.000 0.947 0.001 Y NA
 5754943 5754944 HPSH_06620 HPSH_06625     TRUE 0.987 2.000 0.221 0.002 Y NA
 5754944 5754945 HPSH_06625 HPSH_06630   trpD TRUE 0.974 -7.000 0.293 1.000 Y NA
 5754945 5754946 HPSH_06630 HPSH_06635 trpD   TRUE 0.972 -3.000 0.083 1.000 Y NA
 5754946 5754947 HPSH_06635 HPSH_06640     TRUE 0.994 -3.000 0.703 0.001 Y NA
 5754947 5754948 HPSH_06640 HPSH_06645     TRUE 0.865 -46.000 0.016 1.000 N NA
 5754948 5754949 HPSH_06645 HPSH_06650     FALSE 0.496 68.000 0.068 1.000   NA
 5754952 5754953 HPSH_06665 HPSH_06670     FALSE 0.328 122.000 0.027 1.000 N NA
 5754953 5754954 HPSH_06670 HPSH_06675     TRUE 0.936 -12.000 0.021 1.000 Y NA
 5754954 5754955 HPSH_06675 HPSH_06680     FALSE 0.030 312.000 0.000 NA   NA
 5754956 5754957 HPSH_06685 HPSH_06690 rplQ   TRUE 0.986 0.000 0.873 1.000 N NA
 5754957 5754958 HPSH_06690 HPSH_06695   rpsD TRUE 0.973 12.000 0.549 1.000 N NA
 5754958 5754959 HPSH_06695 HPSH_06700 rpsD   TRUE 0.987 10.000 0.509 0.034 Y NA
 5754959 5754960 HPSH_06700 HPSH_06705   rpsM TRUE 0.977 23.000 0.810 0.025 Y NA
 5754960 5754961 HPSH_06705 HPSH_06710 rpsM   TRUE 0.966 4.000 0.194 0.025   NA
 5754961 5754962 HPSH_06710 HPSH_06715   infA FALSE 0.469 79.000 0.104 1.000   NA
 5754962 5754963 HPSH_06715 HPSH_06720 infA   TRUE 0.970 0.000 0.051 1.000 Y NA
 5754963 5754964 HPSH_06720 HPSH_06725   secY TRUE 0.952 0.000 0.026 1.000 N NA
 5754964 5754965 HPSH_06725 HPSH_06730 secY rplO TRUE 0.897 38.000 0.730 1.000 N NA
 5754965 5754966 HPSH_06730 HPSH_06735 rplO rpsE TRUE 0.970 18.000 0.148 0.034 Y NA
 5754966 5754967 HPSH_06735 HPSH_06740 rpsE rplR TRUE 0.993 -3.000 0.814 0.034 Y NA
 5754967 5754968 HPSH_06740 HPSH_06745 rplR rplF TRUE 0.990 14.000 0.815 0.025 Y NA
 5754968 5754969 HPSH_06745 HPSH_06750 rplF rpsH TRUE 0.991 11.000 0.808 0.025 Y NA
 5754969 5754970 HPSH_06750 HPSH_06755 rpsH rpsN TRUE 0.987 10.000 0.473 0.025 Y NA
 5754970 5754971 HPSH_06755 HPSH_06760 rpsN rplE TRUE 0.987 10.000 0.496 0.025 Y NA
 5754971 5754972 HPSH_06760 HPSH_06765 rplE rplX TRUE 0.990 13.000 0.758 0.025 Y NA
 5754972 5754973 HPSH_06765 HPSH_06770 rplX rplN TRUE 0.993 0.000 0.810 0.034 Y NA
 5754973 5754974 HPSH_06770 HPSH_06775 rplN rpsQ TRUE 0.990 3.000 0.791 0.034 Y NA
 5754974 5754975 HPSH_06775 HPSH_06780 rpsQ   TRUE 0.990 14.000 0.828 0.025 Y NA
 5754975 5754976 HPSH_06780 HPSH_06785   rplP TRUE 0.988 -13.000 0.802 0.025 Y NA
 5754976 5754977 HPSH_06785 HPSH_06790 rplP rpsC TRUE 0.991 3.000 0.828 0.034 Y NA
 5754977 5754978 HPSH_06790 HPSH_06795 rpsC rplV TRUE 0.988 4.000 0.719 0.034 Y NA
 5754978 5754979 HPSH_06795 HPSH_06800 rplV rpsS TRUE 0.989 10.000 0.769 0.034 Y NA
 5754979 5754980 HPSH_06800 HPSH_06805 rpsS rplB TRUE 0.990 4.000 0.820 0.034 Y NA
 5754980 5754981 HPSH_06805 HPSH_06810 rplB rplW TRUE 0.980 16.000 0.849 1.000 Y NA
 5754981 5754982 HPSH_06810 HPSH_06815 rplW rplD TRUE 0.977 4.000 0.513 1.000 Y NA
 5754982 5754983 HPSH_06815 HPSH_06820 rplD rplC TRUE 0.941 35.000 0.361 0.025 Y NA
 5754983 5754984 HPSH_06820 HPSH_06825 rplC rpsJ TRUE 0.941 37.000 0.467 0.034 Y NA
 5754985 5754986 HPSH_06830 HPSH_06835     FALSE 0.035 220.000 0.000 NA   NA
 5754987 5754988 HPSH_06840 HPSH_06845     FALSE 0.469 31.000 0.007 NA   NA
 5754988 5754989 HPSH_06845 HPSH_06850   fumC TRUE 0.625 23.000 0.010 NA   NA
 5754990 5754991 HPSH_06855 HPSH_06860     TRUE 0.681 56.000 0.625 NA   NA
 5754991 5754992 HPSH_06860 HPSH_06865     TRUE 0.979 -3.000 0.562 NA Y NA
 5754992 5754993 HPSH_06865 HPSH_06870     TRUE 0.968 1.000 0.526 NA N NA
 5754994 5754995 HPSH_06875 HPSH_06880     TRUE 0.982 -6.000 0.915 NA Y NA
 5754995 5754996 HPSH_06880 HPSH_06885     TRUE 0.921 11.000 0.014 1.000 N NA
 5754997 5754998 HPSH_06890 HPSH_06895     FALSE 0.037 202.000 0.000 NA   NA
 5754998 5754999 HPSH_06895 HPSH_06900     FALSE 0.035 210.000 0.000 NA   NA
 5755002 5755003 HPSH_06915 HPSH_06920     TRUE 0.924 -7.000 0.014 1.000 N NA
 5755004 5755005 HPSH_06925 HPSH_06930     TRUE 0.993 -3.000 0.815 0.027 Y NA
 5755005 5755006 HPSH_06930 HPSH_06935     TRUE 0.967 -34.000 0.407 0.060 N NA
 5755006 5755007 HPSH_06935 HPSH_06940   omp5 FALSE 0.042 171.000 0.000 NA   NA
 5755008 5755009 HPSH_06950 HPSH_06955     TRUE 0.961 7.000 0.134 1.000 Y NA
 5755009 5755010 HPSH_06955 HPSH_06960   pgk TRUE 0.890 16.000 0.011 1.000 N NA
 5755010 5755011 HPSH_06960 HPSH_06965 pgk   TRUE 0.965 16.000 0.020 0.005 Y NA
 5755011 5755012 HPSH_06965 HPSH_06970     FALSE 0.509 89.000 0.088 1.000 N NA
 5755012 5755013 HPSH_06970 HPSH_06975     TRUE 0.964 -3.000 0.088 1.000 N NA
 5755013 5755014 HPSH_06975 HPSH_06980     TRUE 0.950 -13.000 0.846 NA   NA
 5755014 5755015 HPSH_06980 HPSH_06985     TRUE 0.820 7.000 0.017 NA   NA
 5755015 5755016 HPSH_06985 HPSH_06990     FALSE 0.062 111.000 0.000 NA   NA
 5755016 5755017 HPSH_06990 HPSH_06995     FALSE 0.125 65.000 0.000 NA   NA
 5755017 5755018 HPSH_06995 HPSH_07000     TRUE 0.965 0.000 0.042 0.055   NA
 5755018 5755019 HPSH_07000 HPSH_07005     FALSE 0.056 120.000 0.000 NA   NA
 5755019 5755020 HPSH_07005 HPSH_07010     FALSE 0.207 45.000 0.000 NA   NA
 5755020 5755021 HPSH_07010 HPSH_07015     TRUE 0.571 24.000 0.000 1.000   NA
 5755021 5755022 HPSH_07015 HPSH_07020     TRUE 0.990 0.000 0.198 0.003 Y NA
 5755022 5755023 HPSH_07020 HPSH_07025     TRUE 0.917 -10.000 0.018 1.000 N NA
 5755023 5755024 HPSH_07025 HPSH_07030     TRUE 0.948 -3.000 0.079 1.000   NA
 5755024 5755025 HPSH_07030 HPSH_07035     TRUE 0.952 13.000 0.727 NA   NA
 5755025 5755026 HPSH_07035 HPSH_07040   ubiA TRUE 0.876 -7.000 0.038 NA   NA
 5755026 5755027 HPSH_07040 HPSH_07045 ubiA   TRUE 0.524 29.000 0.009 NA   NA
 5755027 5755028 HPSH_07045 HPSH_07050     TRUE 0.888 -3.000 0.023 NA   NA
 5755028 5755029 HPSH_07050 HPSH_07055     TRUE 0.870 11.000 0.010 NA N NA
 5755029 5755030 HPSH_07055 HPSH_07060     TRUE 0.872 3.000 0.010 NA N NA
 5755030 5755031 HPSH_07060 HPSH_07065     TRUE 0.929 35.000 0.769 1.000 Y NA
 5755031 5755032 HPSH_07065 HPSH_07070     FALSE 0.500 88.000 0.231 1.000   NA
 5755033 5755034 HPSH_07075 HPSH_07080     TRUE 0.985 0.000 0.615 0.055   NA
 5755034 5755035 HPSH_07080 HPSH_07085     TRUE 0.839 -28.000 0.000 0.017   NA
 5755035 5755036 HPSH_07085 HPSH_07090     TRUE 0.956 -42.000 0.333 0.012   NA
 5755036 5755037 HPSH_07090 HPSH_07095     TRUE 0.948 10.000 0.037 0.055   NA
 5755038 5755039 HPSH_07100 HPSH_07105     TRUE 0.974 4.000 0.689 1.000 N NA
 5755039 5755040 HPSH_07105 HPSH_07110   clpX TRUE 0.805 43.000 0.034 0.087 N NA
 5755040 5755041 HPSH_07110 HPSH_07115 clpX   TRUE 0.939 2.000 0.027 1.000 N NA
 5755041 5755042 HPSH_07115 HPSH_07120   fabZ TRUE 0.964 3.000 0.264 1.000 N NA
 5755042 5755043 HPSH_07120 HPSH_07125 fabZ   FALSE 0.111 183.000 0.017 NA   NA
 5755044 5755045 HPSH_07130 HPSH_07135     FALSE 0.359 43.000 0.005 NA   NA
 5755045 5755046 HPSH_07135 HPSH_07140     TRUE 0.595 41.000 0.062 NA   NA
 5755046 5755047 HPSH_07140 HPSH_07145     TRUE 0.911 9.000 0.011 1.000 N NA
 5755048 5755049 HPSH_07150 HPSH_07155     FALSE 0.168 125.000 0.000 1.000 N NA
 5755049 5755050 HPSH_07155 HPSH_07160     TRUE 0.660 -6.000 0.000 NA   NA
 5755051 5755052 HPSH_07170 HPSH_07175     TRUE 0.925 0.000 0.017 1.000   NA
 5755053 5755054 HPSH_r08356 HPSH_r08364     FALSE 0.033 237.000 0.000 NA   NA
 5755054 5755055 HPSH_r08364 HPSH_07180     FALSE 0.045 157.000 0.000 NA   NA
 5755055 5755056 HPSH_07180 HPSH_07185     FALSE 0.029 331.000 0.000 NA   NA
 5755056 5755057 HPSH_07185 HPSH_07190     TRUE 0.560 16.000 0.000 NA   NA
 5755057 5755058 HPSH_07190 HPSH_07195     FALSE 0.460 21.000 0.000 NA   NA
 5755058 5755059 HPSH_07195 HPSH_07200     FALSE 0.031 263.000 0.000 NA   NA
 5755060 5755061 HPSH_07205 HPSH_07210   miaA FALSE 0.220 71.000 0.009 NA   NA
 5755061 5755062 HPSH_07210 HPSH_07215 miaA   TRUE 0.837 5.000 0.000 1.000 N NA
 5755062 5755063 HPSH_07215 HPSH_07225     TRUE 0.619 10.000 0.000 NA   NA
 5755064 5755065 HPSH_07235 HPSH_07240 murB fliQ TRUE 0.942 4.000 0.066 1.000 N NA
 5755065 5755066 HPSH_07240 HPSH_07245 fliQ fliI TRUE 0.904 26.000 0.145 1.000 Y NA
 5755066 5755067 HPSH_07245 HPSH_07250 fliI   TRUE 0.984 1.000 0.216 0.086 Y NA
 5755067 5755068 HPSH_07250 HPSH_07255   ileS TRUE 0.965 17.000 0.242 0.086 N NA
 5755068 5755069 HPSH_07255 HPSH_07260 ileS   TRUE 0.779 35.000 0.013 1.000 Y NA
 5755071 5755072 HPSH_07270 HPSH_07275     FALSE 0.073 187.000 0.004 NA   NA
 5755072 5755073 HPSH_07275 HPSH_07280     TRUE 0.905 -3.000 0.009 1.000   NA
 5755073 5755074 HPSH_07280 HPSH_07285     TRUE 0.923 -16.000 0.222 1.000   NA
 5755074 5755075 HPSH_07285 HPSH_07290   ksgA TRUE 0.698 34.000 0.028 1.000   NA
 5755077 5755078 HPSH_07300 HPSH_07305     TRUE 0.847 13.000 0.000 1.000 N NA
 5755078 5755079 HPSH_07305 HPSH_07310     TRUE 0.935 3.000 0.028 1.000 N NA
 5755082 5755083 HPSH_07325 HPSH_07330     TRUE 0.927 9.000 0.308 NA   NA
 5755083 5755084 HPSH_07330 HPSH_07335     TRUE 0.596 -10.000 0.000 NA   NA
 5755086 5755087 HPSH_07345 HPSH_07350     FALSE 0.028 346.000 0.000 NA   NA
 5755087 5755088 HPSH_07350 HPSH_07355     FALSE 0.499 19.000 0.000 NA   NA
 5755088 5755089 HPSH_07355 HPSH_07360     TRUE 0.535 -16.000 0.000 NA   NA
 5755090 5755091 HPSH_07365 HPSH_r08360     FALSE 0.125 65.000 0.000 NA   NA
 5755091 5755092 HPSH_r08360 HPSH_07370     FALSE 0.026 490.000 0.000 NA   NA
 5755093 5755094 HPSH_07375 HPSH_07380     TRUE 0.917 18.000 0.060 1.000 N NA
 5755094 5755095 HPSH_07380 HPSH_07385     TRUE 0.957 0.000 0.036 1.000 N NA
 5755095 5755096 HPSH_07385 HPSH_07390   smpB TRUE 0.952 -3.000 0.028 1.000 N NA
 5755096 5755097 HPSH_07390 HPSH_07395 smpB   TRUE 0.923 3.000 0.014 1.000 N NA
 5755097 5755098 HPSH_07395 HPSH_07400     TRUE 0.987 11.000 0.452 0.027 Y NA
 5755098 5755099 HPSH_07400 HPSH_07405   rpmH FALSE 0.286 74.000 0.005 1.000   NA
 5755099 5755100 HPSH_07405 HPSH_07410 rpmH   TRUE 0.948 -40.000 0.787 1.000   NA
 5755100 5755101 HPSH_07410 HPSH_07415     TRUE 0.932 -13.000 0.540 NA   NA
 5755101 5755102 HPSH_07415 HPSH_07420     TRUE 0.934 6.000 0.461 NA   NA
 5755102 5755103 HPSH_07420 HPSH_07425     TRUE 0.919 0.000 0.061 NA   NA
 5755103 5755104 HPSH_07425 HPSH_07430   trmE TRUE 0.884 -7.000 0.049 NA   NA
 5755104 5755105 HPSH_07430 HPSH_07435 trmE   FALSE 0.037 204.000 0.000 NA   NA
 5755106 5755107 HPSH_07440 HPSH_07445     FALSE 0.028 380.000 0.000 NA   NA
 5755107 5755108 HPSH_07445 HPSH_07450     TRUE 0.961 10.000 0.889 NA   NA
 5755108 5755109 HPSH_07450 HPSH_07455     TRUE 0.961 8.000 1.000 NA   NA
 5755109 5755110 HPSH_07455 HPSH_07460     TRUE 0.745 24.000 0.063 NA   NA
 5755110 5755111 HPSH_07460 HPSH_07465     FALSE 0.028 357.000 0.000 NA   NA
 5755111 5755112 HPSH_07465 HPSH_07470     TRUE 0.731 55.000 0.206 1.000 N NA
 5755112 5755113 HPSH_07470 HPSH_07475   dnaE TRUE 0.937 -3.000 0.010 1.000 N NA
 5755115 5755116 HPSH_07485 HPSH_07490     FALSE 0.090 85.000 0.000 NA   NA
 5755116 5755117 HPSH_07490 HPSH_07495     TRUE 0.878 19.000 0.250 NA   NA
 5755117 5755118 HPSH_07495 HPSH_07500     TRUE 0.927 3.000 0.258 NA   NA
 5755118 5755119 HPSH_07500 HPSH_07505     TRUE 0.971 -15.000 0.912 NA Y NA
 5755119 5755120 HPSH_07505 HPSH_07510     TRUE 0.985 -3.000 0.912 NA Y NA
 5755122 5755123 HPSH_07520 HPSH_07525     FALSE 0.504 51.000 0.060 NA   NA
 5755123 5755124 HPSH_07525 HPSH_07530     FALSE 0.122 115.000 0.008 NA   NA
 5755124 5755125 HPSH_07530 HPSH_07535     FALSE 0.122 66.000 0.000 NA   NA
 5755125 5755126 HPSH_07535 HPSH_07540     FALSE 0.344 27.000 0.000 NA   NA
 5755126 5755127 HPSH_07540 HPSH_07545     TRUE 0.714 33.000 0.152 NA   NA
 5755127 5755128 HPSH_07545 HPSH_07550   tdk TRUE 0.795 -12.000 0.014 NA   NA
 5755128 5755129 HPSH_07550 HPSH_07555 tdk coaD TRUE 0.943 2.000 0.034 1.000 N NA
 5755129 5755130 HPSH_07555 HPSH_07560 coaD   TRUE 0.966 0.000 0.032 1.000 Y NA
 5755132 5755133 HPSH_07570 HPSH_07575 flgA   TRUE 0.933 -3.000 0.036 NA N NA
 5755133 5755134 HPSH_07575 HPSH_07580     TRUE 0.924 0.000 0.017 1.000   NA
 5755134 5755135 HPSH_07580 HPSH_07585     TRUE 0.889 10.000 0.016 1.000   NA
 5755135 5755136 HPSH_07585 HPSH_07590     TRUE 0.898 1.000 0.010 1.000   NA
 5755136 5755137 HPSH_07590 HPSH_07595     TRUE 0.903 4.000 0.032 1.000   NA
 5755137 5755138 HPSH_07595 HPSH_07600   ubiE TRUE 0.902 10.000 0.008 1.000 N NA
 5755138 5755139 HPSH_07600 HPSH_07605 ubiE   TRUE 0.793 10.000 0.009 NA   NA
 5755139 5755140 HPSH_07605 HPSH_07610     TRUE 0.853 11.000 0.024 NA   NA
 5755140 5755141 HPSH_07610 HPSH_07615     TRUE 0.816 -13.000 0.024 NA   NA
 5755141 5755142 HPSH_07615 HPSH_07620     TRUE 0.968 -3.000 0.743 NA   NA
 5755142 5755143 HPSH_07620 HPSH_07625     TRUE 0.915 21.000 0.729 NA   NA
 5755143 5755144 HPSH_07625 HPSH_07630     TRUE 0.971 12.000 0.464 1.000 N NA
 5755144 5755145 HPSH_07630 HPSH_07635     TRUE 0.949 -3.000 0.082 1.000   NA
 5755145 5755146 HPSH_07635 HPSH_07640     FALSE 0.398 99.000 0.099 1.000   NA
 5755147 5755148 HPSH_07645 HPSH_07650     TRUE 0.929 13.000 0.107 1.000   NA
 5755148 5755149 HPSH_07650 HPSH_07655   murE TRUE 0.916 4.000 0.057 1.000   NA
 5755149 5755150 HPSH_07655 HPSH_07660 murE   TRUE 0.952 4.000 0.016 0.036 N NA
 5755150 5755151 HPSH_07660 HPSH_07665     TRUE 0.586 55.000 0.017 1.000 N NA
 5755151 5755152 HPSH_07665 HPSH_07670     TRUE 0.986 10.000 0.496 0.038 Y NA
 5755152 5755153 HPSH_07670 HPSH_07675     TRUE 0.537 55.000 0.031 1.000   NA
 5755153 5755154 HPSH_07675 HPSH_07680     FALSE 0.065 109.000 0.000 NA   NA
 5755154 5755155 HPSH_07680 HPSH_07690     FALSE 0.095 80.000 0.000 NA   NA
 5755156 5755157 HPSH_07695 HPSH_07705 omp32   TRUE 0.652 2.000 0.000 NA   NA
 5755159 5755160 HPSH_07715 HPSH_07720     TRUE 0.752 26.000 0.023 1.000   NA
 5755160 5755161 HPSH_07720 HPSH_07725     TRUE 0.863 -18.000 0.026 1.000   NA
 5755161 5755162 HPSH_07725 HPSH_07730     TRUE 0.971 -3.000 0.219 1.000 N NA
 5755165 5755166 HPSH_07745 HPSH_07750     TRUE 0.950 -3.000 0.096 1.000   NA
 5755166 5755167 HPSH_07750 HPSH_07755     TRUE 0.833 -16.000 0.049 NA   NA
 5755167 5755168 HPSH_07755 HPSH_07760   frpB FALSE 0.046 153.000 0.000 NA   NA
 5755168 5755169 HPSH_07760 HPSH_07770 frpB   FALSE 0.034 227.000 0.000 NA   NA
 5755169 5755170 HPSH_07770 HPSH_07775   nusA FALSE 0.347 88.000 0.007 1.000 N NA
 5755170 5755171 HPSH_07775 HPSH_07780 nusA   FALSE 0.051 134.000 0.000 NA   NA
 5755172 5755173 HPSH_07785 HPSH_07790     TRUE 0.596 -10.000 0.000 NA   NA
 5755173 5755174 HPSH_07790 HPSH_07795     FALSE 0.036 209.000 0.000 NA   NA
 5755174 5755175 HPSH_07795 HPSH_07800     TRUE 0.536 17.000 0.000 NA   NA
 5755175 5755176 HPSH_07800 HPSH_07805     TRUE 0.675 1.000 0.000 NA   NA
 5755176 5755177 HPSH_07805 HPSH_07810     FALSE 0.396 106.000 0.000 0.053 Y NA
 5755177 5755178 HPSH_07810 HPSH_07815     TRUE 0.921 3.000 0.000 0.053 N NA
 5755178 5755179 HPSH_07815 HPSH_07820     TRUE 0.875 43.000 0.087 0.053 Y NA
 5755180 5755181 HPSH_07825 HPSH_07830     TRUE 0.961 4.000 1.000 NA   NA
 5755185 5755186 HPSH_07845 HPSH_07850     FALSE 0.180 51.000 0.000 NA   NA
 5755188 5755189 HPSH_07860 HPSH_07865     FALSE 0.269 36.000 0.000 NA   NA
 5755189 5755190 HPSH_07865 HPSH_07870     TRUE 0.929 1.000 0.167 NA   NA
 5755190 5755191 HPSH_07870 HPSH_07875   thyX TRUE 0.865 21.000 0.018 1.000 N NA
 5755191 5755192 HPSH_07875 HPSH_07880 thyX   FALSE 0.027 423.000 0.000 NA   NA
 5755193 5755194 HPSH_07885 HPSH_07890     TRUE 0.980 -3.000 0.037 0.053 Y NA
 5755195 5755196 HPSH_07895 HPSH_07900     TRUE 0.957 0.000 0.411 NA   NA
 5755200 5755201 HPSH_07920 HPSH_07925     FALSE 0.375 118.000 0.462 NA   NA
 5755203 5755204 HPSH_07935 HPSH_07940     TRUE 0.943 13.000 0.066 1.000 N NA
 5755204 5755205 HPSH_07940 HPSH_07945     TRUE 0.933 -3.000 0.035 NA N NA
 5755205 5755206 HPSH_07945 HPSH_07950     TRUE 0.781 19.000 0.028 NA   NA
 5755206 5755207 HPSH_07950 HPSH_07955     FALSE 0.029 331.000 0.000 NA   NA
 5755207 5755208 HPSH_07955 HPSH_07960     FALSE 0.253 39.000 0.000 NA   NA
 5755208 5755209 HPSH_07960 HPSH_07965     FALSE 0.075 99.000 0.000 NA   NA
 5755210 5755211 HPSH_07970 HPSH_07975     TRUE 0.943 -22.000 0.279 1.000 N NA
 5755212 5755213 HPSH_07980 HPSH_07985     TRUE 0.970 0.000 0.778 NA   NA
 5755213 5755214 HPSH_07985 HPSH_07990     TRUE 0.918 13.000 0.241 NA   NA
 5755214 5755215 HPSH_07990 HPSH_07995     TRUE 0.953 -7.000 0.625 NA   NA
 5755216 5755217 HPSH_08000 HPSH_08005   tsf FALSE 0.286 52.000 0.002 NA   NA
 5755217 5755218 HPSH_08005 HPSH_08010 tsf rpsB TRUE 0.988 0.000 0.748 1.000 Y NA
 5755219 5755220 HPSH_08015 HPSH_08020     FALSE 0.106 72.000 0.000 NA   NA
 5755220 5755221 HPSH_08020 HPSH_08025     TRUE 0.928 -9.000 0.026 1.000 N NA
 5755221 5755222 HPSH_08025 HPSH_08030   yajC FALSE 0.477 48.000 0.009 NA N NA
 5755222 5755223 HPSH_08030 HPSH_08035 yajC secD TRUE 0.959 0.000 0.068 NA Y NA
 5755223 5755224 HPSH_08035 HPSH_08040 secD secF TRUE 0.989 9.000 0.436 0.001 Y NA
 5755224 5755225 HPSH_08040 HPSH_08045 secF   TRUE 0.951 10.000 0.667 NA   NA
 5755225 5755226 HPSH_08045 HPSH_08050   leuS TRUE 0.842 10.000 0.021 NA   NA
 5755226 5755227 HPSH_08050 HPSH_08055 leuS   TRUE 0.898 -3.000 0.031 NA   NA
 5755227 5755228 HPSH_08055 HPSH_08060     TRUE 0.882 -10.000 0.084 NA   NA
 5755228 5755229 HPSH_08060 HPSH_08065     TRUE 0.949 0.000 0.071 1.000   NA
 5755229 5755230 HPSH_08065 HPSH_08075     TRUE 0.986 9.000 0.909 0.006   NA
 5755230 5755231 HPSH_08075 HPSH_08080     TRUE 0.909 15.000 0.244 NA   NA
 5755231 5755232 HPSH_08080 HPSH_08085     TRUE 0.888 4.000 0.023 NA N NA
 5755232 5755233 HPSH_08085 HPSH_08090     FALSE 0.252 125.000 0.008 1.000 N NA
 5755233 5755234 HPSH_08090 HPSH_08095     TRUE 0.982 11.000 0.093 0.002 Y NA
 5755234 5755235 HPSH_08095 HPSH_08100     TRUE 0.988 -3.000 0.103 0.002 Y NA
 5755236 5755237 HPSH_08105 HPSH_08110     FALSE 0.027 442.000 0.000 NA   NA
 5755237 5755238 HPSH_08110 HPSH_08115   fliE FALSE 0.442 156.000 0.303 1.000 N NA
 5755238 5755239 HPSH_08115 HPSH_08120 fliE flgC TRUE 0.698 128.000 0.271 0.005 Y NA
 5755239 5755240 HPSH_08120 HPSH_08125 flgC flgB TRUE 0.991 13.000 0.804 0.005 Y NA
 5755242 5755243 HPSH_08135 HPSH_08140     TRUE 0.670 199.000 0.375 0.001 Y NA
 5755244 5755245 HPSH_08145 HPSH_08150     FALSE 0.188 145.000 0.016 NA N NA
 5755246 5755247 HPSH_08155 HPSH_08160     TRUE 0.795 -19.000 0.027 NA   NA
 5755247 5755248 HPSH_08160 HPSH_08165   engB TRUE 0.794 13.000 0.010 NA   NA
 5755248 5755249 HPSH_08165 HPSH_08170 engB   TRUE 0.906 -3.000 0.041 NA   NA
 5755249 5755250 HPSH_08170 HPSH_08175     TRUE 0.907 0.000 0.038 NA   NA
 5755250 5755251 HPSH_08175 HPSH_08180     TRUE 0.909 -25.000 0.471 NA   NA
 5755251 5755252 HPSH_08180 HPSH_08185     TRUE 0.906 -3.000 0.042 NA   NA
 5755252 5755253 HPSH_08185 HPSH_08190     TRUE 0.920 0.000 0.062 NA   NA
 5755253 5755254 HPSH_08190 HPSH_08195     FALSE 0.183 101.000 0.015 NA   NA
 5755255 5755256 HPSH_08200 HPSH_08205     TRUE 0.891 1.000 0.009 1.000   NA
 5755256 5755257 HPSH_08205 HPSH_08210     TRUE 0.846 22.000 0.066 1.000   NA
 5755257 5755258 HPSH_08210 HPSH_08215     TRUE 0.975 2.000 0.274 1.000 Y NA
 5755259 5755260 HPSH_08220 HPSH_08225     TRUE 0.952 10.000 0.700 NA   NA
 5755260 5755261 HPSH_08225 HPSH_08230     TRUE 0.981 0.000 0.538 1.000 N NA
 5755262 5755263 HPSH_08235 HPSH_08240   pdxA TRUE 0.982 2.000 0.048 0.001 Y NA
 5755263 5755264 HPSH_08240 HPSH_08245 pdxA   FALSE 0.446 64.000 0.007 1.000 N NA
 5755264 5755265 HPSH_08245 HPSH_08250   flgG FALSE 0.180 179.000 0.004 1.000 N NA
 5755266 5755267 HPSH_08255 HPSH_08265     FALSE 0.163 55.000 0.000 NA   NA
 5755267 5755268 HPSH_08265 HPSH_08270     FALSE 0.026 446.000 0.000 NA   NA
 5755268 5755269 HPSH_08270 HPSH_08275     TRUE 0.552 85.000 0.714 NA   NA
 5755269 5753622 HPSH_08275 HPSH_00005   nusB FALSE 0.032 254.000 0.000 NA   NA