MicrobesOnline Operon Predictions for Clostridium botulinum E3 str. Alaska E43

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
5740844	5740845	CLH_0001	CLH_0002	dnaA	dnaN	TRUE	0.698	261.000	0.328	1.000	Y	NA
5740845	5740846	CLH_0002	CLH_0003	dnaN	yaaA	TRUE	0.896	39.000	0.103	1.000		NA
5740846	5740847	CLH_0003	CLH_0004	yaaA		TRUE	0.871	72.000	0.209	1.000		NA
5740847	5740848	CLH_0004	CLH_0005			TRUE	0.929	15.000	0.024	NA		NA
5740848	5740849	CLH_0005	CLH_0006		gyrB	TRUE	0.787	36.000	0.017	NA		NA
5740849	5740850	CLH_0006	CLH_0007	gyrB	gyrA	TRUE	0.993	23.000	0.306	0.002	Y	NA
5740850	5740851	CLH_0007	CLH_0008	gyrA	rrsI	FALSE	0.005	519.000	0.000	NA		NA
5740851	5740852	CLH_0008	CLH_0010	rrsI	rrlI	FALSE	0.029	229.000	0.000	NA		NA
5740852	5740853	CLH_0010	CLH_0011	rrlI	rrfI	FALSE	0.258	60.000	0.000	NA		NA
5740853	5740854	CLH_0011	CLH_0012	rrfI		TRUE	0.677	4.000	0.000	NA		NA
5740854	5740855	CLH_0012	CLH_0013			TRUE	0.677	4.000	0.000	NA		NA
5740855	5740856	CLH_0013	CLH_0014			FALSE	0.216	83.000	0.000	NA		NA
5740856	5740857	CLH_0014	CLH_0015			FALSE	0.328	39.000	0.000	1.000		NA
5740857	5740858	CLH_0015	CLH_0016			TRUE	0.927	13.000	0.021	1.000		NA
5740858	5740859	CLH_0016	CLH_0017			TRUE	0.982	19.000	0.370	NA		NA
5740859	5740860	CLH_0017	CLH_0018		serS	FALSE	0.010	316.000	0.000	NA		NA
5740860	5740861	CLH_0018	CLH_0019	serS		FALSE	0.020	252.000	0.000	NA		NA
5740861	5740862	CLH_0019	CLH_0020			FALSE	0.414	34.000	0.000	NA		NA
5740862	5740863	CLH_0020	CLH_0021			FALSE	0.016	272.000	0.000	NA		NA
5740863	5740864	CLH_0021	CLH_0022			FALSE	0.414	34.000	0.000	NA		NA
5740864	5740865	CLH_0022	CLH_0023			FALSE	0.008	354.000	0.000	NA		NA
5740865	5740866	CLH_0023	CLH_0024		addB	TRUE	0.792	39.000	0.029	1.000	N	NA
5740866	5740867	CLH_0024	CLH_0025	addB	addA	TRUE	0.993	26.000	0.408	0.005	Y	NA
5740871	5740872	CLH_0029	CLH_0030			FALSE	0.175	131.000	0.000	NA		NA
5740872	5740873	CLH_0030	CLH_0031			FALSE	0.024	240.000	0.000	NA		NA
5740875	5740876	CLH_0033	CLH_0034			FALSE	0.009	313.000	0.000	1.000		NA
5740876	5740877	CLH_0034	CLH_0035			FALSE	0.013	277.000	0.000	1.000		NA
5740879	5740880	CLH_0037	CLH_0038			FALSE	0.088	175.000	0.000	NA		NA
5740880	5740881	CLH_0038	CLH_0039			FALSE	0.063	189.000	0.000	NA		NA
5740883	5740884	CLH_0041	CLH_0042			TRUE	0.917	1.000	0.017	NA		NA
5740884	5740885	CLH_0042	CLH_0043			FALSE	0.005	466.000	0.000	NA		NA
5740887	5740888	CLH_0045	CLH_0046		proB	FALSE	0.066	173.000	0.000	1.000	N	NA
5740888	5740889	CLH_0046	CLH_0047	proB	proA	TRUE	0.995	17.000	0.281	0.002	Y	NA
5740889	5740890	CLH_0047	CLH_0048	proA		FALSE	0.155	130.000	0.000	1.000		NA
5740890	5740891	CLH_0048	CLH_0049			FALSE	0.008	346.000	0.000	NA		NA
5740891	5740892	CLH_0049	CLH_0050			TRUE	0.936	-22.000	0.078	NA		NA
5740892	5740893	CLH_0050	CLH_0051			FALSE	0.030	227.000	0.000	NA		NA
5740893	5740894	CLH_0051	CLH_0052			FALSE	0.004	384.000	0.000	0.074		NA
5740894	5740895	CLH_0052	CLH_0053			FALSE	0.183	96.000	0.000	1.000		NA
5740895	5740896	CLH_0053	CLH_0054		carA	FALSE	0.005	373.000	0.000	1.000	N	NA
5740896	5740897	CLH_0054	CLH_0055	carA	carB	TRUE	0.988	15.000	0.054	0.001	Y	NA
5740898	5740899	CLH_0056	CLH_0057			FALSE	0.010	283.000	0.000	1.000	N	NA
5740900	5740901	CLH_0058	CLH_0059	murI		FALSE	0.432	141.000	0.007	1.000	N	NA
5740901	5740902	CLH_0059	CLH_0060			FALSE	0.445	179.000	0.045	NA		NA
5740902	5740903	CLH_0060	CLH_0061			TRUE	0.981	2.000	0.231	NA		NA
5740903	5740904	CLH_0061	CLH_0062			TRUE	0.702	164.000	0.154	1.000		NA
5740904	5740905	CLH_0062	CLH_0063			TRUE	0.888	90.000	0.286	1.000		NA
5740906	5740907	CLH_0064	CLH_0065			TRUE	0.741	152.000	0.133	NA		NA
5740908	5740909	CLH_0066	CLH_0067			TRUE	0.745	93.000	0.058	NA		NA
5740909	5740910	CLH_0067	CLH_0068			TRUE	0.955	1.000	0.067	1.000		NA
5740911	5740912	CLH_0069	CLH_0070			FALSE	0.004	548.000	0.000	NA		NA
5740913	5740914	CLH_0071	CLH_0072			TRUE	0.998	6.000	0.606	1.000	Y	NA
5740914	5740915	CLH_0072	CLH_0073			FALSE	0.012	295.000	0.000	NA		NA
5740915	5740916	CLH_0073	CLH_0074			TRUE	0.977	35.000	0.750	NA		NA
5740916	5740917	CLH_0074	CLH_0075			TRUE	0.894	117.000	0.333	NA		NA
5740917	5740918	CLH_0075	CLH_0076			FALSE	0.014	282.000	0.000	NA		NA
5740918	5740919	CLH_0076	CLH_0077			FALSE	0.049	203.000	0.000	NA		NA
5740919	5740920	CLH_0077	CLH_0078		ileS	FALSE	0.005	478.000	0.000	NA		NA
5740920	5740921	CLH_0078	CLH_0079	ileS		FALSE	0.518	107.000	0.009	1.000	N	NA
5740921	5740922	CLH_0079	CLH_0080			FALSE	0.012	295.000	0.000	NA		NA
5740922	5740923	CLH_0080	CLH_0081			FALSE	0.186	126.000	0.000	NA		NA
5740925	5740926	CLH_0083	CLH_0084			TRUE	0.991	16.000	0.655	NA		NA
5740926	5740927	CLH_0084	CLH_0085			FALSE	0.202	105.000	0.000	NA		NA
5740927	5740928	CLH_0085	CLH_0086			TRUE	0.707	174.000	0.205	NA		NA
5740928	5740929	CLH_0086	CLH_0087			FALSE	0.004	561.000	0.000	NA		NA
5740929	5740930	CLH_0087	CLH_0088			FALSE	0.005	411.000	0.000	NA	N	NA
5740932	5740933	CLH_0090	CLH_0091			FALSE	0.155	127.000	0.000	NA	N	NA
5740933	5740934	CLH_0091	CLH_0092			FALSE	0.004	457.000	0.000	NA	N	NA
5740934	5740935	CLH_0092	CLH_0093		dhaK	TRUE	0.902	113.000	0.026	1.000	Y	NA
5740935	5740936	CLH_0093	CLH_0094	dhaK		TRUE	0.989	28.000	0.226	0.001	Y	NA
5740936	5740937	CLH_0094	CLH_0095			TRUE	0.971	3.000	0.118	1.000		NA
5740937	5740938	CLH_0095	CLH_0096		metG	FALSE	0.004	584.000	0.000	1.000		NA
5740938	5740939	CLH_0096	CLH_0097	metG		FALSE	0.212	304.000	0.221	NA	N	NA
5740939	5740940	CLH_0097	CLH_0098			FALSE	0.014	283.000	0.000	NA		NA
5740940	5740941	CLH_0098	CLH_0099			FALSE	0.365	168.000	0.013	1.000		NA
5740941	5740942	CLH_0099	CLH_0100		ksgA	TRUE	0.966	4.000	0.093	1.000	N	NA
5740942	5740943	CLH_0100	CLH_0101	ksgA		FALSE	0.214	193.000	0.006	NA		NA
5740943	5740944	CLH_0101	CLH_0102			TRUE	0.986	11.000	0.312	NA		NA
5740944	5740945	CLH_0102	CLH_0103		lgt	FALSE	0.525	98.000	0.005	NA		NA
5740945	5740946	CLH_0103	CLH_0104	lgt		TRUE	0.895	1.000	0.006	NA		NA
5740946	5740947	CLH_0104	CLH_0105			TRUE	0.956	16.000	0.067	NA		NA
5740947	5740948	CLH_0105	CLH_0106			TRUE	0.673	67.000	0.029	1.000	N	NA
5740949	5740950	CLH_0107	CLH_0108			FALSE	0.019	256.000	0.000	NA		NA
5740950	5740951	CLH_0108	CLH_0109			FALSE	0.094	173.000	0.000	NA		NA
5740951	5740952	CLH_0109	CLH_0110			TRUE	0.663	2.000	0.000	NA		NA
5740953	5740954	CLH_0111	CLH_0112	nrdD	nifV	FALSE	0.004	428.000	0.000	1.000	N	NA
5740954	5740955	CLH_0112	CLH_0113	nifV		FALSE	0.512	178.000	0.074	1.000	N	NA
5740955	5740956	CLH_0113	CLH_0114			FALSE	0.024	220.000	0.000	1.000	N	NA
5740956	5740957	CLH_0114	CLH_0115		nrdG	FALSE	0.022	224.000	0.000	1.000	N	NA
5740957	5740958	CLH_0115	CLH_0116	nrdG		FALSE	0.519	77.000	0.005	1.000	N	NA
5740958	5740959	CLH_0116	CLH_0117			FALSE	0.003	473.000	0.000	1.000	N	NA
5740959	5740960	CLH_0117	CLH_0118			TRUE	0.721	80.000	0.053	1.000	N	NA
5740960	5740961	CLH_0118	CLH_0119			TRUE	0.807	92.000	0.000	1.000	Y	NA
5740961	5740962	CLH_0119	CLH_0120			TRUE	0.995	25.000	0.650	0.032	Y	NA
5740962	5740963	CLH_0120	CLH_0121			TRUE	0.998	0.000	0.925	0.032	Y	NA
5740965	5740966	CLH_0123	CLH_0124			FALSE	0.004	1126.000	0.000	NA		NA
5740966	5740967	CLH_0124	CLH_0125			TRUE	0.981	19.000	0.333	NA		NA
5740967	5740968	CLH_0125	CLH_0126			FALSE	0.241	65.000	0.000	NA		NA
5740968	5740969	CLH_0126	CLH_0127			TRUE	0.663	2.000	0.000	NA		NA
5740971	5740972	CLH_0129	CLH_0130			TRUE	0.627	18.000	0.000	NA		NA
5740972	5740973	CLH_0130	CLH_0131			FALSE	0.533	24.000	0.000	NA		NA
5740973	5740974	CLH_0131	CLH_0132			FALSE	0.042	210.000	0.000	NA		NA
5740974	5740975	CLH_0132	CLH_0133			FALSE	0.201	115.000	0.000	NA		NA
5740976	5740977	CLH_0134	CLH_0135	asnS		FALSE	0.005	407.000	0.000	1.000		NA
5740980	5740981	CLH_0138	CLH_0139	purR		TRUE	0.774	121.000	0.099	1.000	N	NA
5740981	5740982	CLH_0139	CLH_0140		glmU	TRUE	0.676	188.000	0.011	1.000	Y	NA
5740982	5740983	CLH_0140	CLH_0141	glmU	prs	TRUE	0.845	46.000	0.069	1.000	N	NA
5740983	5740984	CLH_0141	CLH_0142	prs		TRUE	0.803	115.000	0.123	1.000	N	NA
5740984	5740985	CLH_0142	CLH_0143		pth	FALSE	0.157	81.000	0.000	1.000	N	NA
5740985	5740986	CLH_0143	CLH_0144	pth	mfd	TRUE	0.971	15.000	0.137	1.000	N	NA
5740986	5740987	CLH_0144	CLH_0145	mfd		FALSE	0.406	136.000	0.002	1.000	N	NA
5740987	5740988	CLH_0145	CLH_0146		spoVT	FALSE	0.049	192.000	0.000	NA	N	NA
5740988	5740989	CLH_0146	CLH_0147	spoVT		TRUE	0.803	102.000	0.108	NA		NA
5740989	5740990	CLH_0147	CLH_0148			TRUE	0.912	15.000	0.015	1.000		NA
5740990	5740991	CLH_0148	CLH_0149		hup	FALSE	0.216	202.000	0.014	1.000		NA
5740991	5740992	CLH_0149	CLH_0150	hup		TRUE	0.718	52.000	0.024	1.000	N	NA
5740992	5740993	CLH_0150	CLH_0151		yabP	TRUE	0.769	133.000	0.108	NA		NA
5740993	5740994	CLH_0151	CLH_0152	yabP	yabQ	TRUE	0.963	54.000	0.774	NA		NA
5740994	5740995	CLH_0152	CLH_0153	yabQ		TRUE	0.779	79.000	0.074	NA		NA
5740995	5740996	CLH_0153	CLH_0154			TRUE	0.868	56.000	0.134	1.000	N	NA
5740996	5740997	CLH_0154	CLH_0155			FALSE	0.026	235.000	0.000	NA		NA
5740997	5740998	CLH_0155	CLH_0156			TRUE	0.606	19.000	0.000	NA		NA
5740998	5740999	CLH_0156	CLH_0157			TRUE	0.682	10.000	0.000	NA		NA
5740999	5741000	CLH_0157	CLH_0158			TRUE	0.680	5.000	0.000	NA		NA
5741000	5741001	CLH_0158	CLH_0159			TRUE	0.587	20.000	0.000	NA		NA
5741001	5741002	CLH_0159	CLH_0160			TRUE	0.682	10.000	0.000	NA		NA
5741002	5741003	CLH_0160	CLH_0161			TRUE	0.680	5.000	0.000	NA		NA
5741003	5741004	CLH_0161	CLH_0162		spoIIE	FALSE	0.004	584.000	0.000	NA		NA
5741004	5741005	CLH_0162	CLH_0163	spoIIE		TRUE	0.610	139.000	0.041	1.000	N	NA
5741005	5741006	CLH_0163	CLH_0164		hpt	TRUE	0.972	6.000	0.137	0.053	N	NA
5741006	5741007	CLH_0164	CLH_0165	hpt		TRUE	0.851	74.000	0.180	1.000	N	NA
5741007	5741008	CLH_0165	CLH_0166		fhs	FALSE	0.023	222.000	0.000	1.000	N	NA
5741008	5741009	CLH_0166	CLH_0167	fhs		FALSE	0.523	122.000	0.011	1.000	N	NA
5741009	5741010	CLH_0167	CLH_0168			TRUE	0.953	6.000	0.054	1.000	N	NA
5741010	5741011	CLH_0168	CLH_0169			FALSE	0.233	188.000	0.005	NA		NA
5741011	5741012	CLH_0169	CLH_0170		greA	TRUE	0.626	115.000	0.023	NA		NA
5741012	5741013	CLH_0170	CLH_0171	greA	lysS	TRUE	0.876	45.000	0.098	1.000	N	NA
5741013	5741014	CLH_0171	CLH_0172	lysS		FALSE	0.024	240.000	0.000	NA		NA
5741014	5741015	CLH_0172	CLH_0173			FALSE	0.009	334.000	0.000	NA		NA
5741015	5741016	CLH_0173	CLH_0174			FALSE	0.009	334.000	0.000	NA		NA
5741018	5741019	CLH_0176	CLH_0177			FALSE	0.424	33.000	0.000	NA		NA
5741019	5741020	CLH_0177	CLH_0178			FALSE	0.557	22.000	0.000	NA		NA
5741020	5741021	CLH_0178	CLH_0179			FALSE	0.079	179.000	0.000	NA		NA
5741021	5741022	CLH_0179	CLH_0180		glyS	FALSE	0.234	67.000	0.000	NA		NA
5741022	5741023	CLH_0180	CLH_0181	glyS	murD	FALSE	0.192	188.000	0.002	1.000	N	NA
5741025	5741026	CLH_0183	CLH_0184	rrsJ		FALSE	0.190	124.000	0.000	NA		NA
5741026	5741027	CLH_0184	CLH_0185			TRUE	0.671	3.000	0.000	NA		NA
5741027	5741028	CLH_0185	CLH_0187		rrlJ	FALSE	0.201	108.000	0.000	NA		NA
5741028	5741029	CLH_0187	CLH_0188	rrlJ	rrfJ	FALSE	0.261	59.000	0.000	NA		NA
5741029	5741030	CLH_0188	CLH_0189	rrfJ		TRUE	0.682	6.000	0.000	NA		NA
5741030	5741031	CLH_0189	CLH_0190			TRUE	0.654	1.000	0.000	NA		NA
5741035	5741036	CLH_0194	CLH_0195			TRUE	0.575	-10.000	0.000	NA		NA
5741036	5741037	CLH_0195	CLH_0196			FALSE	0.133	153.000	0.000	NA		NA
5741037	5741038	CLH_0196	CLH_0197			TRUE	0.668	115.000	0.034	NA		NA
5741038	5741039	CLH_0197	CLH_0198			TRUE	0.926	12.000	0.018	NA		NA
5741039	5741040	CLH_0198	CLH_0199			TRUE	0.987	4.000	0.372	NA		NA
5741040	5741041	CLH_0199	CLH_0200			FALSE	0.421	145.000	0.005	NA		NA
5741043	5741044	CLH_0202	CLH_0203			TRUE	0.991	15.000	0.681	NA		NA
5741044	5741045	CLH_0203	CLH_0204			TRUE	0.988	-16.000	0.848	1.000		NA
5741045	5741046	CLH_0204	CLH_0205			TRUE	0.932	31.000	0.129	1.000	N	NA
5741046	5741047	CLH_0205	CLH_0206			FALSE	0.078	429.000	0.000	1.000	Y	NA
5741047	5741048	CLH_0206	CLH_0207			TRUE	0.986	2.000	0.027	1.000	Y	NA
5741049	5741050	CLH_0208	CLH_0209			FALSE	0.232	68.000	0.000	NA		NA
5741051	5741052	CLH_0210	CLH_0211	radA		TRUE	0.968	18.000	0.126	NA		NA
5741054	5741055	CLH_0213	CLH_0214		ispD	TRUE	0.966	19.000	0.134	NA		NA
5741055	5741056	CLH_0214	CLH_0215	ispD	proS	FALSE	0.032	323.000	0.002	1.000	N	NA
5741056	5741057	CLH_0215	CLH_0216	proS	cysS	TRUE	0.973	20.000	0.005	0.052	Y	NA
5741057	5741058	CLH_0216	CLH_0217	cysS		TRUE	0.886	50.000	0.129	1.000		NA
5741058	5741059	CLH_0217	CLH_0218			TRUE	0.974	6.000	0.150	0.005		NA
5741059	5741060	CLH_0218	CLH_0219			TRUE	0.950	23.000	0.109	NA		NA
5741060	5741061	CLH_0219	CLH_0220		sigH	TRUE	0.907	87.000	0.361	NA		NA
5741061	5741062	CLH_0220	CLH_0221	sigH		FALSE	0.218	78.000	0.000	NA		NA
5741062	5741063	CLH_0221	CLH_0222		tuf	FALSE	0.261	59.000	0.000	NA		NA
5741063	5741064	CLH_0222	CLH_0223	tuf	rpmG	TRUE	0.891	163.000	0.099	1.000	Y	NA
5741064	5741065	CLH_0223	CLH_0224	rpmG	secE	TRUE	0.867	50.000	0.100	1.000		NA
5741065	5741066	CLH_0224	CLH_0225	secE	nusG	TRUE	0.976	38.000	0.843	1.000		NA
5741066	5741067	CLH_0225	CLH_0226	nusG	rplK	TRUE	0.939	78.000	0.681	1.000	N	NA
5741067	5741068	CLH_0226	CLH_0227	rplK	rplA	TRUE	0.990	55.000	0.838	0.026	Y	NA
5741068	5741069	CLH_0227	CLH_0228	rplA	rplJ	TRUE	0.839	211.000	0.302	1.000	Y	NA
5741069	5741070	CLH_0228	CLH_0229	rplJ	rplL	TRUE	0.990	58.000	0.884	1.000	Y	NA
5741070	5741071	CLH_0229	CLH_0230	rplL	rpoB	FALSE	0.145	366.000	0.223	1.000	N	NA
5741071	5741072	CLH_0230	CLH_0231	rpoB	rpoC	TRUE	0.997	22.000	0.851	0.001	Y	NA
5741072	5741073	CLH_0231	CLH_0232	rpoC	rpsL	FALSE	0.082	297.000	0.035	1.000	N	NA
5741073	5741074	CLH_0232	CLH_0233	rpsL	rpsG	TRUE	0.940	146.000	0.224	0.004	Y	NA
5741074	5741075	CLH_0233	CLH_0234	rpsG	fusA	TRUE	0.981	79.000	0.579	1.000	Y	NA
5741075	5741076	CLH_0234	CLH_0235	fusA	tuf	TRUE	0.973	93.000	0.400	0.002	Y	NA
5741076	5741077	CLH_0235	CLH_0236	tuf	rpsJ	FALSE	0.377	482.000	0.318	1.000	Y	NA
5741077	5741078	CLH_0236	CLH_0237	rpsJ	rplC	TRUE	0.977	73.000	0.467	0.026	Y	NA
5741078	5741079	CLH_0237	CLH_0238	rplC	rplD	TRUE	0.994	26.000	0.544	0.020	Y	NA
5741079	5741080	CLH_0238	CLH_0239	rplD	rplW	TRUE	0.995	0.000	0.307	0.020	Y	NA
5741080	5741081	CLH_0239	CLH_0240	rplW	rplB	TRUE	0.988	60.000	0.849	0.026	Y	NA
5741081	5741082	CLH_0240	CLH_0241	rplB	rpsS	TRUE	0.986	68.000	0.820	0.026	Y	NA
5741082	5741083	CLH_0241	CLH_0242	rpsS	rplV	TRUE	0.997	21.000	0.769	0.026	Y	NA
5741083	5741084	CLH_0242	CLH_0243	rplV	rpsC	TRUE	0.997	19.000	0.719	0.026	Y	NA
5741084	5741085	CLH_0243	CLH_0244	rpsC	rplP	TRUE	0.998	18.000	0.828	0.026	Y	NA
5741085	5741086	CLH_0244	CLH_0245	rplP	rpmC	TRUE	0.998	0.000	0.802	0.020	Y	NA
5741086	5741087	CLH_0245	CLH_0246	rpmC	rpsQ	TRUE	0.996	24.000	0.828	0.020	Y	NA
5741087	5741088	CLH_0246	CLH_0247	rpsQ	rplN	TRUE	0.995	29.000	0.791	0.026	Y	NA
5741088	5741089	CLH_0247	CLH_0248	rplN	rplX	TRUE	0.998	16.000	0.810	0.026	Y	NA
5741089	5741090	CLH_0248	CLH_0249	rplX	rplE	TRUE	0.996	24.000	0.758	0.020	Y	NA
5741090	5741091	CLH_0249	CLH_0250	rplE	rpsN	TRUE	0.996	17.000	0.496	0.020	Y	NA
5741091	5741092	CLH_0250	CLH_0251	rpsN	rpsH	TRUE	0.992	31.000	0.473	0.020	Y	NA
5741092	5741093	CLH_0251	CLH_0252	rpsH		TRUE	0.985	73.000	0.808	0.020	Y	NA
5741093	5741094	CLH_0252	CLH_0253		rplR	TRUE	0.997	19.000	0.815	0.020	Y	NA
5741094	5741095	CLH_0253	CLH_0254	rplR	rpsE	TRUE	0.997	20.000	0.814	0.026	Y	NA
5741095	5741096	CLH_0254	CLH_0255	rpsE	rpmD	TRUE	0.998	12.000	0.789	0.026	Y	NA
5741096	5741097	CLH_0255	CLH_0256	rpmD	rplO	TRUE	0.995	24.000	0.653	0.003	Y	NA
5741097	5741098	CLH_0256	CLH_0257	rplO		TRUE	0.991	2.000	0.730	1.000	N	NA
5741098	5741099	CLH_0257	CLH_0258		adk	TRUE	0.965	25.000	0.241	1.000	N	NA
5741099	5741100	CLH_0258	CLH_0259	adk	map	TRUE	0.984	4.000	0.290	1.000	N	NA
5741100	5741101	CLH_0259	CLH_0260	map		TRUE	0.860	89.000	0.185	NA		NA
5741101	5741102	CLH_0260	CLH_0261		infA	TRUE	0.968	8.000	0.090	NA		NA
5741102	5741103	CLH_0261	CLH_0262	infA	rpmJ	TRUE	0.916	54.000	0.257	1.000		NA
5741103	5741104	CLH_0262	CLH_0263	rpmJ	rpsM	FALSE	0.503	206.000	0.194	0.020		NA
5741104	5741105	CLH_0263	CLH_0264	rpsM	rpsK	TRUE	0.997	20.000	0.810	0.020	Y	NA
5741105	5741106	CLH_0264	CLH_0265	rpsK	rpsD	TRUE	0.994	28.000	0.509	0.026	Y	NA
5741106	5741107	CLH_0265	CLH_0266	rpsD	rpoA	TRUE	0.921	112.000	0.549	1.000	N	NA
5741107	5741108	CLH_0266	CLH_0267	rpoA	rplQ	TRUE	0.993	13.000	0.873	1.000	N	NA
5741108	5741109	CLH_0267	CLH_0268	rplQ		FALSE	0.192	253.000	0.074	1.000	N	NA
5741109	5741110	CLH_0268	CLH_0269			TRUE	0.996	-15.000	0.713	0.023	Y	NA
5741110	5741111	CLH_0269	CLH_0270			TRUE	0.970	92.000	0.304	1.000	Y	NA
5741111	5741112	CLH_0270	CLH_0271		truA	TRUE	0.985	17.000	0.404	1.000	N	NA
5741112	5741113	CLH_0271	CLH_0272	truA	rplM	TRUE	0.839	160.000	0.031	1.000	Y	NA
5741113	5741114	CLH_0272	CLH_0273	rplM	rpsI	TRUE	0.994	28.000	0.601	0.020	Y	NA
5741114	5741115	CLH_0273	CLH_0274	rpsI		FALSE	0.006	332.000	0.000	1.000	N	NA
5741115	5741116	CLH_0274	CLH_0275		cwlD	FALSE	0.029	423.000	0.018	1.000	N	NA
5741118	5741119	CLH_0277	CLH_0278		fumB	FALSE	0.410	373.000	0.262	0.001	Y	NA
5741119	5741120	CLH_0278	CLH_0279	fumB		TRUE	0.674	13.000	0.000	NA		NA
5741122	5741123	CLH_0281	CLH_0282			FALSE	0.192	78.000	0.000	1.000		NA
5741123	5741124	CLH_0282	CLH_0283			TRUE	0.997	-28.000	0.857	1.000	Y	NA
5741124	5741125	CLH_0283	CLH_0284			FALSE	0.239	202.000	0.022	1.000	N	NA
5741125	5741126	CLH_0284	CLH_0285			TRUE	0.838	215.000	0.393	0.001	Y	NA
5741126	5741127	CLH_0285	CLH_0286		ptsP	FALSE	0.043	190.000	0.000	1.000	N	NA
5741127	5741128	CLH_0286	CLH_0287	ptsP	chrA	FALSE	0.004	405.000	0.000	1.000	N	NA
5741128	5741129	CLH_0287	CLH_0288	chrA		TRUE	0.997	4.000	0.455	0.001	Y	NA
5741129	5741130	CLH_0288	CLH_0289			FALSE	0.098	163.000	0.000	1.000		NA
5741130	5741131	CLH_0289	CLH_0290		iadA	FALSE	0.303	44.000	0.000	1.000		NA
5741132	5741133	CLH_0291	CLH_0292			TRUE	0.860	70.000	0.167	NA		NA
5741134	5741135	CLH_0293	CLH_0294			TRUE	0.981	-30.000	0.502	NA		NA
5741135	5741136	CLH_0294	CLH_0295			TRUE	0.777	104.000	0.083	NA		NA
5741136	5741137	CLH_0295	CLH_0296		ptb	FALSE	0.350	174.000	0.013	NA		NA
5741137	5741138	CLH_0296	CLH_0297	ptb	buk	TRUE	0.992	24.000	0.275	1.000	Y	NA
5741138	5741139	CLH_0297	CLH_0298	buk		FALSE	0.006	386.000	0.000	NA		NA
5741139	5741140	CLH_0298	CLH_0299			TRUE	0.654	83.000	0.025	NA		NA
5741140	5741141	CLH_0299	CLH_0300		glmM	FALSE	0.011	290.000	0.000	1.000		NA
5741141	5741142	CLH_0300	CLH_0301	glmM		FALSE	0.008	356.000	0.000	NA		NA
5741142	5741143	CLH_0301	CLH_0302		ilvN	FALSE	0.004	535.000	0.000	NA		NA
5741143	5741144	CLH_0302	CLH_0303	ilvN	leuC	TRUE	0.753	174.000	0.012	1.000	Y	NA
5741144	5741145	CLH_0303	CLH_0304	leuC	leuD	TRUE	0.997	16.000	0.615	0.001	Y	NA
5741145	5741146	CLH_0304	CLH_0305	leuD	leuB	TRUE	0.901	170.000	0.191	0.002	Y	NA
5741146	5741147	CLH_0305	CLH_0306	leuB	ilvD	TRUE	0.989	7.000	0.044	1.000	Y	NA
5741147	5741148	CLH_0306	CLH_0307	ilvD	ilvB	TRUE	0.963	40.000	0.062	0.003	Y	NA
5741148	5741149	CLH_0307	CLH_0308	ilvB	ilvC	TRUE	0.971	21.000	0.006	0.003	Y	NA
5741149	5741150	CLH_0308	CLH_0309	ilvC		FALSE	0.216	86.000	0.000	NA		NA
5741151	5741152	CLH_0310	CLH_0311			TRUE	0.997	-7.000	0.784	0.005	Y	NA
5741152	5741153	CLH_0311	CLH_0312			TRUE	0.811	54.000	0.065	1.000	N	NA
5741154	5741155	CLH_0313	CLH_0314			FALSE	0.172	44.000	0.000	0.056	N	NA
5741155	5741156	CLH_0314	CLH_0315			FALSE	0.007	314.000	0.000	1.000	N	NA
5741156	5741157	CLH_0315	CLH_0316			TRUE	0.958	92.000	0.167	1.000	Y	NA
5741157	5741158	CLH_0316	CLH_0317			TRUE	0.991	5.000	0.610	NA		NA
5741160	5741161	CLH_0319	CLH_0320			TRUE	0.986	5.000	0.333	NA	N	NA
5741161	5741162	CLH_0320	CLH_0321			TRUE	0.955	27.000	0.182	NA	N	NA
5741162	5741163	CLH_0321	CLH_0322			FALSE	0.005	511.000	0.000	NA		NA
5741163	5741164	CLH_0322	CLH_3409			FALSE	0.005	508.000	0.000	NA		NA
5741164	5741165	CLH_3409	CLH_0323		glmS	FALSE	0.196	121.000	0.000	NA		NA
5741165	5741166	CLH_0323	CLH_0324	glmS		FALSE	0.054	188.000	0.000	NA	N	NA
5741166	5741167	CLH_0324	CLH_0325			FALSE	0.016	254.000	0.000	NA	N	NA
5741167	5741168	CLH_0325	CLH_0326			FALSE	0.003	481.000	0.000	1.000	N	NA
5741168	5741169	CLH_0326	CLH_0327			FALSE	0.007	320.000	0.000	1.000	N	NA
5741169	5741170	CLH_0327	CLH_0328			FALSE	0.061	606.000	0.000	1.000	Y	NA
5741170	5741171	CLH_0328	CLH_0329			FALSE	0.122	159.000	0.000	NA		NA
5741173	5741174	CLH_0331	CLH_0332			FALSE	0.006	330.000	0.000	1.000	N	NA
5741175	5741176	CLH_0333	CLH_0334	thrS		FALSE	0.006	395.000	0.000	NA		NA
5741177	5741178	CLH_0335	CLH_0336			FALSE	0.145	112.000	0.000	1.000	N	NA
5741178	5741179	CLH_0336	CLH_0337			FALSE	0.005	430.000	0.000	NA		NA
5741181	5741182	CLH_0339	CLH_0340			FALSE	0.371	38.000	0.000	NA		NA
5741184	5741185	CLH_0342	CLH_0343			FALSE	0.234	67.000	0.000	NA		NA
5741186	5741187	CLH_0344	CLH_0345			FALSE	0.146	108.000	0.000	1.000	N	NA
5741188	5741189	CLH_0346	CLH_0347		lctP	FALSE	0.005	400.000	0.000	1.000		NA
5741189	5741190	CLH_0347	CLH_0348	lctP		TRUE	0.682	166.000	0.148	1.000		NA
5741190	5741191	CLH_0348	CLH_0349			TRUE	0.985	103.000	0.875	0.017	Y	NA
5741191	5741192	CLH_0349	CLH_0350			TRUE	0.998	5.000	0.875	0.012	Y	NA
5741192	5741193	CLH_0350	CLH_0351			FALSE	0.007	364.000	0.000	NA		NA
5741193	5741194	CLH_0351	CLH_0353		lctP	FALSE	0.203	100.000	0.000	NA		NA
5741194	5741195	CLH_0353	CLH_0354	lctP		FALSE	0.022	237.000	0.000	1.000		NA
5741195	5741196	CLH_0354	CLH_0355			FALSE	0.099	169.000	0.000	NA		NA
5741196	5741197	CLH_0355	CLH_0356			FALSE	0.038	215.000	0.000	NA		NA
5741197	5741198	CLH_0356	CLH_0357			FALSE	0.013	274.000	0.000	1.000		NA
5741198	5741199	CLH_0357	CLH_0358			TRUE	0.850	125.000	0.222	1.000		NA
5741199	5741200	CLH_0358	CLH_0359		cadA	TRUE	0.983	18.000	0.364	1.000	N	NA
5741200	5741201	CLH_0359	CLH_0360	cadA		FALSE	0.005	433.000	0.000	1.000		NA
5741201	5741202	CLH_0360	CLH_0361		crt	FALSE	0.007	349.000	0.000	1.000		NA
5741202	5741203	CLH_0361	CLH_0362	crt		TRUE	0.958	81.000	0.162	1.000	Y	NA
5741203	5741204	CLH_0362	CLH_0363			TRUE	0.986	18.000	0.545	0.045	N	NA
5741204	5741205	CLH_0363	CLH_0364		etfA	TRUE	0.996	23.000	0.714	0.017	Y	NA
5741205	5741206	CLH_0364	CLH_0365	etfA		TRUE	0.853	104.000	0.216	1.000	N	NA
5741206	5741207	CLH_0365	CLH_0366			FALSE	0.119	160.000	0.000	NA		NA
5741207	5741208	CLH_0366	CLH_0367			TRUE	0.587	90.000	0.012	NA		NA
5741208	5741209	CLH_0367	CLH_0368			FALSE	0.458	162.000	0.024	1.000		NA
5741209	5741210	CLH_0368	CLH_0369			FALSE	0.046	199.000	0.000	1.000		NA
5741210	5741211	CLH_0369	CLH_0370			TRUE	0.970	4.000	0.000	1.000	Y	NA
5741211	5741212	CLH_0370	CLH_0371			FALSE	0.521	25.000	0.000	NA		NA
5741212	5741213	CLH_0371	CLH_0372			TRUE	0.991	21.000	1.000	NA		NA
5741213	5741214	CLH_0372	CLH_0373		groS	FALSE	0.004	404.000	0.000	1.000	N	NA
5741214	5741215	CLH_0373	CLH_0374	groS	groL	TRUE	0.998	14.000	0.674	1.000	Y	NA
5741215	5741216	CLH_0374	CLH_0375	groL		FALSE	0.027	213.000	0.000	1.000	N	NA
5741216	5741217	CLH_0375	CLH_0376		guaB	FALSE	0.006	335.000	0.000	1.000	N	NA
5741217	5741218	CLH_0376	CLH_0377	guaB	guaA	TRUE	0.958	87.000	0.190	0.001	Y	NA
5741218	5741219	CLH_0377	CLH_0378	guaA		FALSE	0.010	313.000	0.000	NA		NA
5741219	5741220	CLH_0378	CLH_0379			FALSE	0.223	72.000	0.000	NA		NA
5741220	5741221	CLH_0379	CLH_0380			FALSE	0.032	225.000	0.000	NA		NA
5741221	5741222	CLH_0380	CLH_0381			FALSE	0.010	314.000	0.000	NA		NA
5741222	5741223	CLH_0381	CLH_0382			TRUE	0.971	4.000	0.000	NA	Y	NA
5741223	5741224	CLH_0382	CLH_0383			TRUE	0.926	32.000	0.116	NA	N	NA
5741224	5741225	CLH_0383	CLH_0384			TRUE	0.737	97.000	0.070	0.011		NA
5741225	5741226	CLH_0384	CLH_0385			TRUE	0.959	49.000	0.667	0.011		NA
5741226	5741227	CLH_0385	CLH_0386			TRUE	0.927	47.000	0.286	0.011		NA
5741227	5741228	CLH_0386	CLH_0387			FALSE	0.012	267.000	0.000	1.000	N	NA
5741228	5741229	CLH_0387	CLH_0388			FALSE	0.083	160.000	0.000	1.000	N	NA
5741229	5741230	CLH_0388	CLH_0389		pgi	FALSE	0.451	202.000	0.000	1.000	Y	NA
5741230	5741231	CLH_0389	CLH_0390	pgi		TRUE	0.927	4.000	0.018	NA		NA
5741231	5741232	CLH_0390	CLH_0391			FALSE	0.143	148.000	0.000	NA		NA
5741232	5741233	CLH_0391	CLH_0392			FALSE	0.544	179.000	0.083	NA		NA
5741233	5741234	CLH_0392	CLH_0393			FALSE	0.255	216.000	0.041	NA		NA
5741234	5741235	CLH_0393	CLH_0394			FALSE	0.003	534.000	0.000	1.000	N	NA
5741235	5741236	CLH_0394	CLH_0395		ligA	TRUE	0.915	83.000	0.039	0.016	Y	NA
5741236	5741237	CLH_0395	CLH_0396	ligA		FALSE	0.140	150.000	0.000	NA		NA
5741237	5741238	CLH_0396	CLH_0397		gatC	FALSE	0.205	98.000	0.000	NA		NA
5741238	5741239	CLH_0397	CLH_0398	gatC		TRUE	0.997	19.000	0.643	0.001	Y	NA
5741239	5741240	CLH_0398	CLH_0399		gatB	TRUE	0.995	21.000	0.492	0.001	Y	NA
5741244	5741245	CLH_0403	CLH_0404	rph	rdgB	TRUE	0.982	4.000	0.262	1.000	N	NA
5741245	5741246	CLH_0404	CLH_0405	rdgB		TRUE	0.966	12.000	0.085	1.000		NA
5741246	5741247	CLH_0405	CLH_0406			FALSE	0.179	129.000	0.000	NA		NA
5741247	5741248	CLH_0406	CLH_0407			TRUE	0.606	19.000	0.000	NA		NA
5741248	5741249	CLH_0407	CLH_0408			FALSE	0.484	28.000	0.000	NA		NA
5741249	5741250	CLH_0408	CLH_0409			FALSE	0.217	80.000	0.000	NA		NA
5741250	5741251	CLH_0409	CLH_0410			TRUE	0.680	5.000	0.000	NA		NA
5741251	5741252	CLH_0410	CLH_0411			FALSE	0.557	22.000	0.000	NA		NA
5741252	5741253	CLH_0411	CLH_0412			TRUE	0.668	14.000	0.000	NA		NA
5741253	5741254	CLH_0412	CLH_0413			TRUE	0.677	4.000	0.000	NA		NA
5741254	5741255	CLH_0413	CLH_0414			TRUE	0.663	2.000	0.000	NA		NA
5741255	5741256	CLH_0414	CLH_0415			TRUE	0.680	5.000	0.000	NA		NA
5741256	5741257	CLH_0415	CLH_0416			TRUE	0.682	7.000	0.000	NA		NA
5741257	5741258	CLH_0416	CLH_0417			TRUE	0.677	4.000	0.000	NA		NA
5741258	5741259	CLH_0417	CLH_0418			TRUE	0.639	17.000	0.000	NA		NA
5741259	5741260	CLH_0418	CLH_0419			TRUE	0.679	12.000	0.000	NA		NA
5741260	5741261	CLH_0419	CLH_0420			TRUE	0.682	7.000	0.000	NA		NA
5741261	5741262	CLH_0420	CLH_0421			TRUE	0.680	5.000	0.000	NA		NA
5741262	5741263	CLH_0421	CLH_0422			TRUE	0.574	21.000	0.000	NA		NA
5741263	5741264	CLH_0422	CLH_0423			TRUE	0.680	5.000	0.000	NA		NA
5741264	5741265	CLH_0423	CLH_0424			TRUE	0.677	4.000	0.000	NA		NA
5741265	5741266	CLH_0424	CLH_0425			TRUE	0.668	14.000	0.000	NA		NA
5741266	5741267	CLH_0425	CLH_0426			FALSE	0.329	46.000	0.000	NA		NA
5741267	5741268	CLH_0426	CLH_0427			FALSE	0.005	486.000	0.000	NA		NA
5741268	5741269	CLH_0427	CLH_0428			FALSE	0.008	338.000	0.000	NA		NA
5741269	5741270	CLH_0428	CLH_0429			FALSE	0.438	1.000	0.000	0.002		NA
5741270	5741271	CLH_0429	CLH_0430		rrsK	FALSE	0.006	415.000	0.000	NA		NA
5741271	5741272	CLH_0430	CLH_0431	rrsK		FALSE	0.190	124.000	0.000	NA		NA
5741272	5741273	CLH_0431	CLH_0433		rrlK	FALSE	0.079	179.000	0.000	NA		NA
5741273	5741274	CLH_0433	CLH_0434	rrlK		FALSE	0.258	60.000	0.000	NA		NA
5741274	5741275	CLH_0434	CLH_0435			FALSE	0.069	185.000	0.000	NA		NA
5741275	5741276	CLH_0435	CLH_0436			FALSE	0.146	102.000	0.000	1.000	N	NA
5741276	5741277	CLH_0436	CLH_0437			TRUE	0.997	5.000	0.472	1.000	Y	NA
5741277	5741278	CLH_0437	CLH_0438			TRUE	0.982	-3.000	0.323	NA		NA
5741278	5741279	CLH_0438	CLH_0439			FALSE	0.013	288.000	0.000	NA		NA
5741279	5741280	CLH_0439	CLH_0440			TRUE	0.972	4.000	0.114	NA		NA
5741282	5741283	CLH_0442	CLH_0444		gidA	FALSE	0.409	31.000	0.000	1.000		NA
5741284	5741285	CLH_0443	CLH_0445			TRUE	0.576	14.000	0.000	1.000	N	NA
5741286	5741287	CLH_0446	CLH_0447			TRUE	0.894	3.000	0.004	NA		NA
5741287	5741288	CLH_0447	CLH_0448			TRUE	0.741	164.000	0.200	NA		NA
5741288	5741289	CLH_0448	CLH_0449			FALSE	0.094	164.000	0.000	1.000		NA
5741289	5741290	CLH_0449	CLH_0450			FALSE	0.008	325.000	0.000	1.000		NA
5741290	5741291	CLH_0450	CLH_0451			FALSE	0.291	26.000	0.000	0.042	N	NA
5741293	5741294	CLH_0453	CLH_0454			TRUE	0.975	-25.000	0.357	NA		NA
5741294	5741295	CLH_0454	CLH_0455			TRUE	0.948	89.000	0.800	NA		NA
5741297	5741298	CLH_0457	CLH_0458			FALSE	0.140	325.000	0.119	NA		NA
5741298	5741299	CLH_0458	CLH_0459			FALSE	0.541	188.000	0.116	NA		NA
5741299	5741300	CLH_0459	CLH_0460			FALSE	0.074	414.000	0.082	NA		NA
5741300	5741301	CLH_0460	CLH_0461			TRUE	0.677	160.000	0.109	1.000		NA
5741301	5741302	CLH_0461	CLH_0462		cphA	TRUE	0.982	-28.000	0.605	1.000	N	NA
5741302	5741303	CLH_0462	CLH_0463	cphA	ispE	FALSE	0.300	180.000	0.016	1.000	N	NA
5741303	5741304	CLH_0463	CLH_0464	ispE	spoIIR	TRUE	0.620	62.000	0.009	NA		NA
5741304	5741305	CLH_0464	CLH_0465	spoIIR		TRUE	0.713	38.000	0.005	NA		NA
5741305	5741306	CLH_0465	CLH_0466			TRUE	0.597	70.000	0.011	NA		NA
5741306	5741307	CLH_0466	CLH_0467			FALSE	0.186	235.000	0.039	NA		NA
5741307	5741308	CLH_0467	CLH_0468		pyrG	FALSE	0.242	184.000	0.004	NA		NA
5741308	5741309	CLH_0468	CLH_0469	pyrG	rho	FALSE	0.004	379.000	0.000	1.000	N	NA
5741310	5741311	CLH_0470	CLH_0471		rpmE	FALSE	0.395	142.000	0.004	1.000	N	NA
5741312	5741313	CLH_0472	CLH_0473	tdk		TRUE	0.856	30.000	0.026	NA		NA
5741313	5741314	CLH_0473	CLH_0474		hemK	TRUE	0.953	-10.000	0.098	NA		NA
5741314	5741315	CLH_0474	CLH_0475	hemK	prfA	FALSE	0.500	269.000	0.081	1.000	Y	NA
5741315	5741316	CLH_0475	CLH_0476	prfA		TRUE	0.573	83.000	0.009	NA		NA
5741316	5741317	CLH_0476	CLH_0477			TRUE	0.906	19.000	0.020	NA		NA
5741317	5741318	CLH_0477	CLH_0478		rpiB	TRUE	0.585	123.000	0.020	NA	N	NA
5741318	5741319	CLH_0478	CLH_0479	rpiB	upp	TRUE	0.732	46.000	0.019	1.000	N	NA
5741319	5741320	CLH_0479	CLH_0480	upp		TRUE	0.915	110.000	0.041	1.000	Y	NA
5741320	5741321	CLH_0480	CLH_0481			FALSE	0.498	129.000	0.011	1.000	N	NA
5741321	5741322	CLH_0481	CLH_0482			TRUE	0.734	130.000	0.083	1.000	N	NA
5741322	5741323	CLH_0482	CLH_0483			FALSE	0.004	880.000	0.000	NA		NA
5741323	5741324	CLH_0483	CLH_0484		atpB	TRUE	0.893	2.000	0.005	NA		NA
5741324	5741325	CLH_0484	CLH_0485	atpB	atpE	TRUE	0.891	32.000	0.069	0.009		NA
5741325	5741326	CLH_0485	CLH_0486	atpE	atpF	TRUE	0.955	51.000	0.643	0.007		NA
5741326	5741327	CLH_0486	CLH_0487	atpF	atpH	TRUE	0.988	3.000	0.040	0.007	Y	NA
5741327	5741328	CLH_0487	CLH_0488	atpH	atpA	TRUE	0.998	11.000	0.864	0.007	Y	NA
5741328	5741329	CLH_0488	CLH_0489	atpA	atpG	TRUE	0.992	41.000	0.846	0.007	Y	NA
5741329	5741330	CLH_0489	CLH_0490	atpG	atpD	TRUE	0.997	16.000	0.724	0.007	Y	NA
5741330	5741331	CLH_0490	CLH_0491	atpD	atpC	TRUE	0.998	14.000	0.837	0.007	Y	NA
5741331	5741332	CLH_0491	CLH_0492	atpC		FALSE	0.382	160.000	0.007	NA		NA
5741332	5741333	CLH_0492	CLH_0493		murA	TRUE	0.927	58.000	0.346	NA		NA
5741333	5741334	CLH_0493	CLH_0494	murA	spoIID	TRUE	0.864	118.000	0.243	1.000	N	NA
5741334	5741335	CLH_0494	CLH_0495	spoIID		TRUE	0.664	159.000	0.090	NA		NA
5741335	5741336	CLH_0495	CLH_0496		spoIIID	TRUE	0.797	91.000	0.093	NA		NA
5741336	5741337	CLH_0496	CLH_0497	spoIIID		TRUE	0.888	80.000	0.284	1.000		NA
5741339	5741340	CLH_0499	CLH_0500			FALSE	0.116	162.000	0.000	NA		NA
5741340	5741341	CLH_0500	CLH_0501			TRUE	0.680	5.000	0.000	NA		NA
5741341	5741342	CLH_0501	CLH_0502			TRUE	0.587	20.000	0.000	NA		NA
5741342	5741343	CLH_0502	CLH_0503			TRUE	0.682	9.000	0.000	NA		NA
5741343	5741344	CLH_0503	CLH_0504			TRUE	0.682	7.000	0.000	NA		NA
5741344	5741345	CLH_0504	CLH_0505			TRUE	0.574	21.000	0.000	NA		NA
5741345	5741346	CLH_0505	CLH_0506			TRUE	0.682	7.000	0.000	NA		NA
5741346	5741347	CLH_0506	CLH_0507		metK	FALSE	0.007	364.000	0.000	NA		NA
5741347	5741348	CLH_0507	CLH_0508	metK		FALSE	0.044	471.000	0.052	1.000	N	NA
5741348	5741349	CLH_0508	CLH_0509			TRUE	0.890	35.000	0.069	NA		NA
5741349	5741350	CLH_0509	CLH_0510			TRUE	0.829	-24.000	0.005	NA		NA
5741350	5741351	CLH_0510	CLH_0511			FALSE	0.076	396.000	0.080	NA		NA
5741351	5741352	CLH_0511	CLH_0512		secA	FALSE	0.076	333.000	0.050	NA	N	NA
5741352	5741353	CLH_0512	CLH_0513	secA		FALSE	0.096	171.000	0.000	NA		NA
5741353	5741354	CLH_0513	CLH_0514		prfB	FALSE	0.557	-13.000	0.000	NA		NA
5741358	5741359	CLH_0518	CLH_0519			FALSE	0.024	229.000	0.000	NA	N	NA
5741359	5741360	CLH_0519	CLH_0520			FALSE	0.065	188.000	0.000	NA		NA
5741360	5741361	CLH_0520	CLH_0521			TRUE	0.986	25.000	0.750	NA		NA
5741361	5741362	CLH_0521	CLH_0522			FALSE	0.004	716.000	0.000	NA		NA
5741363	5741364	CLH_0523	CLH_0524	rimI		TRUE	0.954	-16.000	0.127	1.000		NA
5741364	5741365	CLH_0524	CLH_0525			TRUE	0.976	-3.000	0.217	NA		NA
5741366	5741367	CLH_0526	CLH_0527			FALSE	0.299	51.000	0.000	NA		NA
5741367	5741368	CLH_0527	CLH_0529			FALSE	0.006	424.000	0.000	NA		NA
5741370	5741371	CLH_0531	CLH_0532			FALSE	0.018	248.000	0.000	1.000		NA
5741371	5741372	CLH_0532	CLH_0533			FALSE	0.203	356.000	0.330	NA		NA
5741372	5741373	CLH_0533	CLH_0534			TRUE	0.638	86.000	0.021	NA		NA
5741373	5741374	CLH_0534	CLH_0535			FALSE	0.006	333.000	0.000	1.000	N	NA
5741374	5741375	CLH_0535	CLH_0536			TRUE	0.666	118.000	0.037	1.000		NA
5741375	5741376	CLH_0536	CLH_0537			FALSE	0.189	89.000	0.000	1.000		NA
5741377	5741378	CLH_0538	CLH_0539			TRUE	0.977	11.000	0.160	NA		NA
5741378	5741379	CLH_0539	CLH_0540			TRUE	0.900	35.000	0.080	NA		NA
5741382	5741383	CLH_0543	CLH_0544			FALSE	0.008	317.000	0.000	1.000		NA
5741383	5741384	CLH_0544	CLH_0545			TRUE	0.894	124.000	0.364	NA		NA
5741384	5741385	CLH_0545	CLH_0546		maf	FALSE	0.025	237.000	0.000	NA		NA
5741385	5741386	CLH_0546	CLH_0547	maf		TRUE	0.860	45.000	0.074	NA	N	NA
5741386	5741387	CLH_0547	CLH_0548			TRUE	0.925	19.000	0.040	1.000	N	NA
5741387	5741388	CLH_0548	CLH_0549		mreC	TRUE	0.992	4.000	0.689	1.000	N	NA
5741388	5741389	CLH_0549	CLH_0550	mreC	mreD	TRUE	0.990	11.000	0.550	0.003		NA
5741389	5741390	CLH_0550	CLH_0551	mreD		TRUE	0.957	-3.000	0.089	1.000		NA
5741390	5741391	CLH_0551	CLH_0552		minC	FALSE	0.069	372.000	0.060	1.000		NA
5741391	5741392	CLH_0552	CLH_0553	minC	minD	TRUE	0.995	19.000	0.368	1.000	Y	NA
5741392	5741393	CLH_0553	CLH_0554	minD	minE	TRUE	0.996	13.000	0.347	NA	Y	NA
5741393	5741394	CLH_0554	CLH_0555	minE		TRUE	0.783	127.000	0.000	NA	Y	NA
5741394	5741395	CLH_0555	CLH_0556		mgsA	FALSE	0.253	45.000	0.000	1.000	N	NA
5741395	5741396	CLH_0556	CLH_0557	mgsA		FALSE	0.007	355.000	0.000	1.000		NA
5741396	5741397	CLH_0557	CLH_0558			FALSE	0.289	29.000	0.000	0.005		NA
5741397	5741398	CLH_0558	CLH_0559			FALSE	0.393	210.000	0.098	1.000		NA
5741398	5741399	CLH_0559	CLH_0560			TRUE	0.980	-16.000	0.420	NA		NA
5741399	5741400	CLH_0560	CLH_0561			TRUE	0.858	80.000	0.180	NA		NA
5741400	5741401	CLH_0561	CLH_0562		rplU	TRUE	0.650	195.000	0.018	0.026	Y	NA
5741401	5741402	CLH_0562	CLH_0563	rplU		TRUE	0.995	5.000	0.208	NA	Y	NA
5741402	5741403	CLH_0563	CLH_0564		rpmA	TRUE	0.995	5.000	0.203	NA	Y	NA
5741403	5741404	CLH_0564	CLH_0565	rpmA		FALSE	0.136	497.000	0.335	1.000		NA
5741404	5741405	CLH_0565	CLH_0566			TRUE	0.923	22.000	0.046	NA		NA
5741405	5741406	CLH_0566	CLH_0567		nadD	FALSE	0.111	381.000	0.150	NA	N	NA
5741406	5741407	CLH_0567	CLH_0568	nadD		TRUE	0.995	5.000	0.199	1.000	Y	NA
5741407	5741408	CLH_0568	CLH_0569			TRUE	0.675	76.000	0.033	NA	N	NA
5741408	5741409	CLH_0569	CLH_0570			TRUE	0.755	128.000	0.093	NA	N	NA
5741411	5741412	CLH_0572	CLH_0573			FALSE	0.075	181.000	0.000	NA		NA
5741412	5741413	CLH_0573	CLH_0574			FALSE	0.508	26.000	0.000	NA		NA
5741413	5741414	CLH_0574	CLH_0575		rumA	TRUE	0.639	17.000	0.000	NA		NA
5741414	5741415	CLH_0575	CLH_0576	rumA		FALSE	0.003	643.000	0.000	1.000	N	NA
5741415	5741416	CLH_0576	CLH_0577			TRUE	0.995	23.000	0.500	1.000	Y	NA
5741416	5741417	CLH_0577	CLH_0578			TRUE	0.996	0.000	0.429	1.000	Y	NA
5741417	5741418	CLH_0578	CLH_0579			FALSE	0.015	245.000	0.000	1.000	N	NA
5741418	5741419	CLH_0579	CLH_0580			FALSE	0.007	316.000	0.000	1.000	N	NA
5741419	5741420	CLH_0580	CLH_0581			FALSE	0.213	91.000	0.000	NA		NA
5741420	5741421	CLH_0581	CLH_0582			FALSE	0.342	43.000	0.000	NA		NA
5741421	5741422	CLH_0582	CLH_0583			FALSE	0.004	381.000	0.000	1.000	N	NA
5741422	5741423	CLH_0583	CLH_0584		ygeW	TRUE	0.981	51.000	0.312	1.000	Y	NA
5741423	5741424	CLH_0584	CLH_0585	ygeW	arcC	TRUE	0.772	200.000	0.088	1.000	Y	NA
5741424	5741425	CLH_0585	CLH_0586	arcC	dpaL	TRUE	0.771	129.000	0.000	1.000	Y	NA
5741425	5741426	CLH_0586	CLH_0587	dpaL		FALSE	0.388	28.000	0.000	1.000	N	NA
5741426	5741427	CLH_0587	CLH_0588			FALSE	0.043	209.000	0.000	NA		NA
5741427	5741428	CLH_0588	CLH_0589			FALSE	0.218	78.000	0.000	NA		NA
5741428	5741429	CLH_0589	CLH_0590			TRUE	0.899	39.000	0.000	1.000	Y	NA
5741429	5741430	CLH_0590	CLH_0591			FALSE	0.139	138.000	0.000	NA	N	NA
5741430	5741431	CLH_0591	CLH_0592			FALSE	0.303	42.000	0.000	NA	N	NA
5741431	5741432	CLH_0592	CLH_0593		hydA	TRUE	0.844	60.000	0.000	1.000	Y	NA
5741432	5741433	CLH_0593	CLH_0594	hydA		FALSE	0.106	887.000	0.012	1.000	Y	NA
5741433	5741434	CLH_0594	CLH_0595			TRUE	0.725	106.000	0.062	1.000	N	NA
5741436	5741437	CLH_0597	CLH_0598			TRUE	0.996	18.000	0.500	0.001	Y	NA
5741437	5741438	CLH_0598	CLH_0599			TRUE	0.966	2.000	0.000	0.043	Y	NA
5741438	5741439	CLH_0599	CLH_0600			FALSE	0.010	278.000	0.000	1.000	N	NA
5741439	5741440	CLH_0600	CLH_0601			FALSE	0.018	234.000	0.000	1.000	N	NA
5741440	5741441	CLH_0601	CLH_0602			TRUE	0.995	-3.000	0.273	1.000	Y	NA
5741441	5741442	CLH_0602	CLH_0603			TRUE	0.998	-3.000	1.000	1.000	Y	NA
5741442	5741443	CLH_0603	CLH_0604			FALSE	0.221	73.000	0.000	NA		NA
5741443	5741444	CLH_0604	CLH_0605			FALSE	0.149	144.000	0.000	NA		NA
5741444	5741445	CLH_0605	CLH_0606			TRUE	0.687	97.000	0.038	NA		NA
5741445	5741446	CLH_0606	CLH_0607		selD	TRUE	0.758	133.000	0.104	1.000		NA
5741446	5741447	CLH_0607	CLH_0608	selD		FALSE	0.265	244.000	0.000	NA	Y	NA
5741447	5741448	CLH_0608	CLH_0609		hgdC	FALSE	0.287	46.000	0.000	NA	N	NA
5741448	5741449	CLH_0609	CLH_0610	hgdC		FALSE	0.261	59.000	0.000	NA		NA
5741449	5741450	CLH_0610	CLH_0611			TRUE	0.620	-3.000	0.000	NA		NA
5741450	5741451	CLH_0611	CLH_0612		cbiQ	FALSE	0.020	251.000	0.000	NA		NA
5741451	5741452	CLH_0612	CLH_0613	cbiQ		TRUE	0.996	12.000	0.335	0.002	Y	NA
5741452	5741453	CLH_0613	CLH_0614		cbiM	FALSE	0.078	427.000	0.000	1.000	Y	NA
5741453	5741454	CLH_0614	CLH_0615	cbiM		TRUE	0.998	3.000	0.861	0.015	Y	NA
5741454	5741455	CLH_0615	CLH_0616			FALSE	0.016	271.000	0.000	NA		NA
5741455	5741456	CLH_0616	CLH_0617			FALSE	0.216	81.000	0.000	NA		NA
5741456	5741457	CLH_0617	CLH_0618			FALSE	0.219	75.000	0.000	NA		NA
5741459	5741460	CLH_0620	CLH_0621			FALSE	0.217	79.000	0.000	NA		NA
5741460	5741461	CLH_0621	CLH_0622			TRUE	0.954	3.000	0.059	1.000	N	NA
5741461	5741462	CLH_0622	CLH_0623			FALSE	0.194	122.000	0.000	NA		NA
5741462	5741463	CLH_0623	CLH_0624			FALSE	0.049	203.000	0.000	NA		NA
5741463	5741464	CLH_0624	CLH_0625			FALSE	0.013	254.000	0.000	1.000	N	NA
5741464	5741465	CLH_0625	CLH_0626			FALSE	0.476	21.000	0.000	1.000	N	NA
5741465	5741466	CLH_0626	CLH_0627		gltA	TRUE	0.990	3.000	0.667	0.043	N	NA
5741466	5741467	CLH_0627	CLH_0628	gltA		FALSE	0.006	338.000	0.000	1.000	N	NA
5741467	5741468	CLH_0628	CLH_0629			FALSE	0.032	206.000	0.000	1.000	N	NA
5741468	5741469	CLH_0629	CLH_0630			FALSE	0.216	82.000	0.000	NA		NA
5741469	5741470	CLH_0630	CLH_0631			FALSE	0.010	314.000	0.000	NA		NA
5741470	5741471	CLH_0631	CLH_0632			FALSE	0.021	203.000	0.000	0.067	N	NA
5741471	5741472	CLH_0632	CLH_0633			FALSE	0.010	302.000	0.000	1.000		NA
5741472	5741473	CLH_0633	CLH_0634			FALSE	0.011	303.000	0.000	NA		NA
5741473	5741474	CLH_0634	CLH_0635			FALSE	0.186	126.000	0.000	NA		NA
5741475	5741476	CLH_0636	CLH_0637			FALSE	0.201	112.000	0.000	NA		NA
5741478	5741479	CLH_0639	CLH_0640			FALSE	0.005	438.000	0.000	NA		NA
5741481	5741482	CLH_0642	CLH_0643			TRUE	0.986	-6.000	0.471	NA		NA
5741482	5741483	CLH_0643	CLH_0644			TRUE	0.985	0.000	0.412	1.000	N	NA
5741484	5741485	CLH_0645	CLH_0646			FALSE	0.009	303.000	0.000	NA	N	NA
5741485	5741486	CLH_0646	CLH_0647			TRUE	0.980	-31.000	0.500	NA		NA
5741486	5741487	CLH_0647	CLH_0648			TRUE	0.916	18.000	0.022	NA		NA
5741487	5741488	CLH_0648	CLH_0649			TRUE	0.986	0.000	0.435	NA	N	NA
5741488	5741489	CLH_0649	CLH_0650		dltC	TRUE	0.913	78.000	0.387	NA		NA
5741489	5741490	CLH_0650	CLH_0651	dltC	ssrA	FALSE	0.073	183.000	0.000	NA		NA
5741490	5741491	CLH_0651	CLH_0652	ssrA		FALSE	0.015	275.000	0.000	NA		NA
5741497	5741498	CLH_0659	CLH_0660		asrA	FALSE	0.021	239.000	0.000	1.000		NA
5741498	5741499	CLH_0660	CLH_0661	asrA	asrB	TRUE	0.982	1.000	0.318	0.033		NA
5741499	5741500	CLH_0661	CLH_0662	asrB	asrC	TRUE	0.997	14.000	0.636	0.033	Y	NA
5741503	5741504	CLH_0665	CLH_0666			FALSE	0.041	192.000	0.000	1.000	N	NA
5741505	5741506	CLH_0667	CLH_0668	aroD	aroE	TRUE	0.911	136.000	0.061	1.000	Y	NA
5741506	5741507	CLH_0668	CLH_0669	aroE		TRUE	0.935	24.000	0.082	1.000	N	NA
5741507	5741508	CLH_0669	CLH_0670			FALSE	0.016	241.000	0.000	1.000	N	NA
5741508	5741509	CLH_0670	CLH_0671			FALSE	0.202	265.000	0.000	0.006	Y	NA
5741509	5741510	CLH_0671	CLH_0672			TRUE	0.954	11.000	0.048	NA		NA
5741512	5741513	CLH_0674	CLH_0675			TRUE	0.574	21.000	0.000	NA		NA
5741513	5741514	CLH_0675	CLH_0676			FALSE	0.031	226.000	0.000	NA		NA
5741514	5741515	CLH_0676	CLH_0677			FALSE	0.009	293.000	0.000	1.000	N	NA
5741515	5741516	CLH_0677	CLH_0678			FALSE	0.007	376.000	0.000	NA		NA
5741516	5741517	CLH_0678	CLH_0679			FALSE	0.013	291.000	0.000	NA		NA
5741517	5741518	CLH_0679	CLH_0680		nagA	TRUE	0.981	24.000	0.545	1.000	N	NA
5741518	5741519	CLH_0680	CLH_0681	nagA	nagB	TRUE	0.963	111.000	0.273	0.001	Y	NA
5741519	5741520	CLH_0681	CLH_0682	nagB	nagE	TRUE	0.880	47.000	0.000	1.000	Y	NA
5741520	5741521	CLH_0682	CLH_0683	nagE		FALSE	0.146	108.000	0.000	1.000	N	NA
5741521	5741522	CLH_0683	CLH_0684			FALSE	0.009	333.000	0.000	NA		NA
5741522	5741523	CLH_0684	CLH_0685		bioB	TRUE	0.879	-16.000	0.018	NA		NA
5741523	5741524	CLH_0685	CLH_0686	bioB	bioD	TRUE	0.985	3.000	0.025	0.002	Y	NA
5741526	5741527	CLH_0688	CLH_0689			TRUE	0.998	0.000	0.846	0.005	Y	NA
5741527	5741528	CLH_0689	CLH_0690			FALSE	0.243	64.000	0.000	NA		NA
5741529	5741530	CLH_0691	CLH_0692	ilvN	ilvB	TRUE	0.967	-7.000	0.189	0.002		NA
5741531	5741532	CLH_0693	CLH_0694			FALSE	0.050	202.000	0.000	NA		NA
5741533	5741534	CLH_0695	CLH_0696			TRUE	0.627	18.000	0.000	NA		NA
5741535	5741536	CLH_0697	CLH_0698			FALSE	0.005	461.000	0.000	NA		NA
5741536	5741537	CLH_0698	CLH_0699		brnQ	FALSE	0.004	612.000	0.000	NA		NA
5741537	5741538	CLH_0699	CLH_0700	brnQ		FALSE	0.030	209.000	0.000	1.000	N	NA
5741540	5741541	CLH_0702	CLH_0703	deoC		FALSE	0.231	310.000	0.009	1.000	Y	NA
5741541	5741542	CLH_0703	CLH_0704		hcp	FALSE	0.004	427.000	0.000	1.000	N	NA
5741542	5741543	CLH_0704	CLH_0705	hcp		FALSE	0.158	141.000	0.000	NA		NA
5741543	5741544	CLH_0705	CLH_0706			FALSE	0.048	204.000	0.000	NA		NA
5741544	5741545	CLH_0706	CLH_0707			FALSE	0.020	254.000	0.000	NA		NA
5741545	5741546	CLH_0707	CLH_0708			FALSE	0.329	46.000	0.000	NA		NA
5741546	5741547	CLH_0708	CLH_0709			FALSE	0.484	28.000	0.000	NA		NA
5741547	5741548	CLH_0709	CLH_0710			FALSE	0.202	104.000	0.000	NA		NA
5741550	5741551	CLH_0712	CLH_0713			FALSE	0.387	36.000	0.000	NA		NA
5741551	5741552	CLH_0713	CLH_0714			FALSE	0.210	94.000	0.000	NA		NA
5741552	5741553	CLH_0714	CLH_0715			FALSE	0.015	279.000	0.000	NA		NA
5741553	5741554	CLH_0715	CLH_0716			FALSE	0.185	50.000	0.000	0.017		NA
5741554	5741555	CLH_0716	CLH_0717			FALSE	0.039	213.000	0.000	NA		NA
5741555	5741556	CLH_0717	CLH_0718		clpB	FALSE	0.137	151.000	0.000	NA		NA
5741557	5741558	CLH_0719	CLH_0720			FALSE	0.071	184.000	0.000	NA		NA
5741558	5741559	CLH_0720	CLH_0721			FALSE	0.441	179.000	0.044	NA		NA
5741560	5741561	CLH_0722	CLH_0723			FALSE	0.171	134.000	0.000	NA		NA
5741561	5741562	CLH_0723	CLH_0724			FALSE	0.062	190.000	0.000	NA		NA
5741562	5741563	CLH_0724	CLH_0725			FALSE	0.005	454.000	0.000	NA		NA
5741565	5741566	CLH_0727	CLH_0728			FALSE	0.099	127.000	0.000	0.010		NA
5741566	5741567	CLH_0728	CLH_0729		dut	FALSE	0.138	141.000	0.000	1.000		NA
5741570	5741571	CLH_0732	CLH_0733			TRUE	0.955	11.000	0.050	NA		NA
5741574	5741575	CLH_0736	CLH_0737			TRUE	0.723	63.000	0.034	NA		NA
5741576	5741577	CLH_0738	CLH_0739			TRUE	0.987	33.000	0.231	1.000	Y	NA
5741577	5741578	CLH_0739	CLH_0740			TRUE	0.686	98.000	0.038	NA		NA
5741579	5741580	CLH_0741	CLH_0742		pepF	TRUE	0.858	46.000	0.070	NA		NA
5741580	5741581	CLH_0742	CLH_0743	pepF		FALSE	0.048	363.000	0.028	1.000		NA
5741581	5741582	CLH_0743	CLH_0744			TRUE	0.865	36.000	0.053	NA		NA
5741582	5741583	CLH_0744	CLH_0745		gluD	FALSE	0.465	174.000	0.039	NA		NA
5741583	5741584	CLH_0745	CLH_0746	gluD		FALSE	0.004	550.000	0.000	NA	N	NA
5741584	5741585	CLH_0746	CLH_0747			FALSE	0.005	414.000	0.000	NA	N	NA
5741585	5741586	CLH_0747	CLH_0748			TRUE	0.996	21.000	0.552	0.002	Y	NA
5741586	5741587	CLH_0748	CLH_0749			TRUE	0.907	19.000	0.020	NA		NA
5741587	5741588	CLH_0749	CLH_0750		recJ	FALSE	0.478	127.000	0.004	NA		NA
5741589	5741590	CLH_0751	CLH_0752			FALSE	0.459	30.000	0.000	NA		NA
5741590	5741591	CLH_0752	CLH_0753			FALSE	0.004	491.000	0.000	1.000		NA
5741592	5741593	CLH_0754	CLH_0755	murG		FALSE	0.223	187.000	0.006	1.000	N	NA
5741593	5741594	CLH_0755	CLH_0756		nifJ	TRUE	0.878	127.000	0.016	1.000	Y	NA
5741594	5741595	CLH_0756	CLH_0757	nifJ		FALSE	0.035	500.000	0.032	NA		NA
5741595	5741596	CLH_0757	CLH_0758			FALSE	0.011	304.000	0.000	NA		NA
5741596	5741597	CLH_0758	CLH_0759			FALSE	0.325	227.000	0.000	1.000	Y	NA
5741597	5741598	CLH_0759	CLH_0760			TRUE	0.983	26.000	0.082	0.066	Y	NA
5741598	5741599	CLH_0760	CLH_0761			TRUE	0.735	81.000	0.056	NA	N	NA
5741599	5741600	CLH_0761	CLH_0762			TRUE	0.969	15.000	0.115	NA	N	NA
5741600	5741601	CLH_0762	CLH_0763			TRUE	0.991	9.000	0.063	1.000	Y	NA
5741601	5741602	CLH_0763	CLH_0764			TRUE	0.991	14.000	0.070	1.000	Y	NA
5741602	5741603	CLH_0764	CLH_0765		cheR	TRUE	0.993	10.000	0.107	1.000	Y	NA
5741603	5741604	CLH_0765	CLH_0766	cheR		TRUE	0.992	12.000	0.081	1.000	Y	NA
5741604	5741605	CLH_0766	CLH_0767			TRUE	0.990	24.000	0.176	NA	Y	NA
5741605	5741606	CLH_0767	CLH_0768			TRUE	0.989	19.000	0.082	NA	Y	NA
5741606	5741607	CLH_0768	CLH_0769			TRUE	0.994	25.000	0.417	1.000	Y	NA
5741607	5741608	CLH_0769	CLH_0770		fliM	TRUE	0.980	22.000	0.039	0.021	Y	NA
5741608	5741609	CLH_0770	CLH_0771	fliM	fliN	TRUE	0.996	-7.000	0.508	0.001	Y	NA
5741609	5741610	CLH_0771	CLH_0772	fliN		FALSE	0.104	359.000	0.000	1.000	Y	NA
5741610	5741611	CLH_0772	CLH_0773			TRUE	0.968	4.000	0.113	0.003		NA
5741611	5741612	CLH_0773	CLH_0774		flgK	TRUE	0.761	92.000	0.082	0.002		NA
5741612	5741613	CLH_0774	CLH_0775	flgK	flgL	TRUE	0.961	46.000	0.071	0.001	Y	NA
5741613	5741614	CLH_0775	CLH_0776	flgL		TRUE	0.984	18.000	0.385	NA		NA
5741614	5741615	CLH_0776	CLH_0777		csrA	TRUE	0.969	5.000	0.096	NA		NA
5741615	5741616	CLH_0777	CLH_0778	csrA		FALSE	0.335	187.000	0.028	NA	N	NA
5741616	5741617	CLH_0778	CLH_0779			TRUE	0.907	21.000	0.028	NA		NA
5741617	5741618	CLH_0779	CLH_0780		fliS	TRUE	0.968	12.000	0.093	NA		NA
5741618	5741619	CLH_0780	CLH_0781	fliS		TRUE	0.994	20.000	0.370	0.002	Y	NA
5741619	5741620	CLH_0781	CLH_0782			TRUE	0.680	5.000	0.000	NA		NA
5741620	5741621	CLH_0782	CLH_0783			FALSE	0.201	109.000	0.000	NA		NA
5741621	5741622	CLH_0783	CLH_0784			FALSE	0.006	417.000	0.000	NA		NA
5741622	5741623	CLH_0784	CLH_0785			TRUE	0.724	145.000	0.105	1.000		NA
5741623	5741624	CLH_0785	CLH_0786			FALSE	0.398	211.000	0.105	1.000		NA
5741624	5741625	CLH_0786	CLH_0787			TRUE	0.741	164.000	0.200	NA		NA
5741625	5741626	CLH_0787	CLH_0788			TRUE	0.979	29.000	0.600	NA		NA
5741626	5741627	CLH_0788	CLH_0789			FALSE	0.224	71.000	0.000	NA		NA
5741627	5741628	CLH_0789	CLH_0790			FALSE	0.188	125.000	0.000	NA		NA
5741628	5741629	CLH_0790	CLH_0791			TRUE	0.986	-3.000	0.468	1.000		NA
5741629	5741630	CLH_0791	CLH_0792			TRUE	0.814	57.000	0.069	1.000		NA
5741630	5741631	CLH_0792	CLH_0793			FALSE	0.387	36.000	0.000	NA		NA
5741631	5741632	CLH_0793	CLH_0794			FALSE	0.221	73.000	0.000	NA		NA
5741632	5741633	CLH_0794	CLH_0795			FALSE	0.227	70.000	0.000	NA		NA
5741633	5741634	CLH_0795	CLH_0796			FALSE	0.010	315.000	0.000	NA		NA
5741634	5741635	CLH_0796	CLH_0797			FALSE	0.152	143.000	0.000	NA		NA
5741635	5741636	CLH_0797	CLH_0798			TRUE	0.941	26.000	0.000	1.000	Y	NA
5741636	5741637	CLH_0798	CLH_0799			FALSE	0.375	34.000	0.000	1.000		NA
5741637	5741638	CLH_0799	CLH_0800			FALSE	0.011	308.000	0.000	NA		NA
5741638	5741639	CLH_0800	CLH_0801			FALSE	0.387	36.000	0.000	NA		NA
5741639	5741640	CLH_0801	CLH_0802			FALSE	0.481	25.000	0.000	1.000		NA
5741640	5741641	CLH_0802	CLH_0803			FALSE	0.004	466.000	0.000	1.000		NA
5741641	5741642	CLH_0803	CLH_0804		flgB	FALSE	0.053	788.000	0.000	0.005	Y	NA
5741642	5741643	CLH_0804	CLH_0805	flgB	flgC	TRUE	0.998	15.000	0.804	0.004	Y	NA
5741643	5741644	CLH_0805	CLH_0806	flgC	fliE	TRUE	0.992	14.000	0.095	0.004	Y	NA
5741644	5741645	CLH_0806	CLH_0807	fliE	fliF	TRUE	0.986	25.000	0.112	0.007	Y	NA
5741645	5741646	CLH_0807	CLH_0808	fliF	fliG	TRUE	0.997	7.000	0.477	0.007	Y	NA
5741646	5741647	CLH_0808	CLH_0809	fliG		TRUE	0.993	-16.000	0.308	NA	Y	NA
5741647	5741648	CLH_0809	CLH_0810		fliI	TRUE	0.997	12.000	0.379	NA	Y	NA
5741648	5741649	CLH_0810	CLH_0811	fliI	fliJ	TRUE	0.986	35.000	0.241	1.000	Y	NA
5741649	5741650	CLH_0811	CLH_0812	fliJ		TRUE	0.985	7.000	0.019	0.006	Y	NA
5741650	5741651	CLH_0812	CLH_0813			TRUE	0.985	12.000	0.304	NA		NA
5741651	5741652	CLH_0813	CLH_0814			TRUE	0.971	4.000	0.105	NA		NA
5741652	5741653	CLH_0814	CLH_0815			TRUE	0.777	143.000	0.150	NA		NA
5741653	5741654	CLH_0815	CLH_0816			TRUE	0.629	197.000	0.016	0.004	Y	NA
5741654	5741655	CLH_0816	CLH_0817			TRUE	0.980	96.000	0.545	NA	Y	NA
5741655	5741656	CLH_0817	CLH_0818			TRUE	0.996	16.000	0.301	NA	Y	NA
5741656	5741657	CLH_0818	CLH_0819			TRUE	0.996	3.000	0.350	1.000	Y	NA
5741657	5741658	CLH_0819	CLH_0820		fliL	TRUE	0.996	6.000	0.314	1.000	Y	NA
5741658	5741659	CLH_0820	CLH_0821	fliL		TRUE	0.986	14.000	0.023	1.000	Y	NA
5741659	5741660	CLH_0821	CLH_0822		fliP	TRUE	0.997	3.000	0.386	1.000	Y	NA
5741660	5741661	CLH_0822	CLH_0823	fliP	fliQ	TRUE	0.994	12.000	0.162	0.005	Y	NA
5741661	5741662	CLH_0823	CLH_0824	fliQ		TRUE	0.991	18.000	0.114	0.005	Y	NA
5741662	5741663	CLH_0824	CLH_0825		flhA	TRUE	0.987	30.000	0.207	0.005	Y	NA
5741663	5741664	CLH_0825	CLH_0826	flhA	flhF	TRUE	0.996	0.000	0.440	1.000	Y	NA
5741664	5741665	CLH_0826	CLH_0827	flhF		TRUE	0.982	-6.000	0.382	1.000	N	NA
5741665	5741666	CLH_0827	CLH_0828			TRUE	0.968	11.000	0.094	NA	N	NA
5741666	5741667	CLH_0828	CLH_0829			TRUE	0.730	108.000	0.062	NA	N	NA
5741667	5741668	CLH_0829	CLH_0830			TRUE	0.939	13.000	0.029	NA		NA
5741668	5741669	CLH_0830	CLH_0831			FALSE	0.218	78.000	0.000	NA		NA
5741669	5741670	CLH_0831	CLH_0832			TRUE	0.654	1.000	0.000	NA		NA
5741670	5741671	CLH_0832	CLH_0833			TRUE	0.992	14.000	0.088	1.000	Y	NA
5741675	5741676	CLH_0837	CLH_0838	botR		TRUE	0.597	-7.000	0.000	NA		NA
5741676	5741677	CLH_0838	CLH_0839			FALSE	0.035	221.000	0.000	NA		NA
5741677	5741678	CLH_0839	CLH_0840			FALSE	0.079	179.000	0.000	NA		NA
5741678	5741679	CLH_0840	CLH_0841		spoIIAA	FALSE	0.037	353.000	0.014	1.000	N	NA
5741679	5741680	CLH_0841	CLH_0842	spoIIAA	spoIIAB	TRUE	0.997	17.000	0.669	0.002	Y	NA
5741680	5741681	CLH_0842	CLH_0843	spoIIAB	sigF	TRUE	0.993	10.000	0.842	1.000	N	NA
5741681	5741682	CLH_0843	CLH_0844	sigF	spoVAC	FALSE	0.052	592.000	0.078	NA		NA
5741682	5741683	CLH_0844	CLH_0845	spoVAC	spoVAD	TRUE	0.843	156.000	0.386	NA		NA
5741683	5741684	CLH_0845	CLH_0846	spoVAD	spoVAE	TRUE	0.977	24.000	0.386	NA		NA
5741684	5741685	CLH_0846	CLH_0847	spoVAE		FALSE	0.201	114.000	0.000	NA		NA
5741685	5741686	CLH_0847	CLH_0848			TRUE	0.907	6.000	0.006	NA		NA
5741686	5741687	CLH_0848	CLH_0849		holA	TRUE	0.945	30.000	0.163	NA		NA
5741689	5741690	CLH_0851	CLH_0852	gpr		FALSE	0.218	415.000	0.521	NA		NA
5741690	5741691	CLH_0852	CLH_0853			TRUE	0.662	125.000	0.038	NA		NA
5741691	5741692	CLH_0853	CLH_0854		lepA	FALSE	0.401	144.000	0.002	NA		NA
5741692	5741693	CLH_0854	CLH_0855	lepA		TRUE	0.763	111.000	0.083	1.000	N	NA
5741693	5741694	CLH_0855	CLH_0856		hrcA	FALSE	0.436	185.000	0.062	1.000	N	NA
5741694	5741695	CLH_0856	CLH_0857	hrcA	grpE	TRUE	0.941	39.000	0.286	1.000	N	NA
5741695	5741696	CLH_0857	CLH_0858	grpE	dnaK	TRUE	0.963	80.000	0.224	0.006	Y	NA
5741696	5741697	CLH_0858	CLH_0859	dnaK	dnaJ	TRUE	0.956	104.000	0.196	0.003	Y	NA
5741697	5741698	CLH_0859	CLH_0860	dnaJ		FALSE	0.009	291.000	0.000	1.000	N	NA
5741698	5741699	CLH_0860	CLH_0861		trmB	FALSE	0.016	260.000	0.000	1.000		NA
5741699	5741700	CLH_0861	CLH_0862	trmB	prmA	FALSE	0.298	168.000	0.003	1.000		NA
5741700	5741701	CLH_0862	CLH_0863	prmA		TRUE	0.874	93.000	0.227	NA		NA
5741701	5741702	CLH_0863	CLH_0864			TRUE	0.973	0.000	0.163	NA		NA
5741702	5741703	CLH_0864	CLH_0865			FALSE	0.303	203.000	0.051	0.036	N	NA
5741703	5741704	CLH_0865	CLH_0866		rpsU	TRUE	0.704	137.000	0.071	1.000		NA
5741704	5741705	CLH_0866	CLH_0867	rpsU		TRUE	0.937	30.000	0.150	0.029		NA
5741705	5741706	CLH_0867	CLH_0868		yqfC	FALSE	0.131	253.000	0.029	NA		NA
5741706	5741707	CLH_0868	CLH_0869	yqfC	yqfD	TRUE	0.993	3.000	0.851	NA		NA
5741707	5741708	CLH_0869	CLH_0870	yqfD		TRUE	0.838	35.000	0.032	NA		NA
5741708	5741709	CLH_0870	CLH_0871			TRUE	0.979	13.000	0.182	NA		NA
5741709	5741710	CLH_0871	CLH_0872			TRUE	0.879	25.000	0.023	NA		NA
5741710	5741711	CLH_0872	CLH_0873		era	FALSE	0.020	473.000	0.005	1.000		NA
5741711	5741712	CLH_0873	CLH_0874	era	recO	TRUE	0.944	25.000	0.108	1.000		NA
5741712	5741713	CLH_0874	CLH_0875	recO		TRUE	0.908	7.000	0.007	NA		NA
5741713	5741714	CLH_0875	CLH_0876			TRUE	0.938	43.000	0.273	NA		NA
5741714	5741715	CLH_0876	CLH_0877		ppdK	TRUE	0.614	90.000	0.019	1.000		NA
5741717	5741718	CLH_0879	CLH_0880			FALSE	0.172	249.000	0.056	1.000	N	NA
5741718	5741719	CLH_0880	CLH_0881		rpoD	TRUE	0.980	6.000	0.209	1.000	N	NA
5741719	5741720	CLH_0881	CLH_0882	rpoD		TRUE	0.878	93.000	0.239	NA		NA
5741720	5741721	CLH_0882	CLH_0883			TRUE	0.879	118.000	0.283	NA		NA
5741721	5741722	CLH_0883	CLH_0884			FALSE	0.273	57.000	0.000	NA		NA
5741722	5741723	CLH_0884	CLH_3420			FALSE	0.162	139.000	0.000	NA		NA
5741724	5741725	CLH_0885	CLH_0886			TRUE	0.627	18.000	0.000	NA		NA
5741726	5741727	CLH_0887	CLH_0888			FALSE	0.004	761.000	0.000	NA		NA
5741727	5741728	CLH_0888	CLH_0889			TRUE	0.575	-10.000	0.000	NA		NA
5741728	5741729	CLH_0889	CLH_0890			TRUE	0.654	1.000	0.000	NA		NA
5741729	5741730	CLH_0890	CLH_0891			TRUE	0.992	19.000	1.000	NA		NA
5741730	5741731	CLH_0891	CLH_0892			FALSE	0.351	300.000	0.500	NA		NA
5741731	5741732	CLH_0892	CLH_0893			FALSE	0.055	196.000	0.000	NA		NA
5741732	5741733	CLH_0893	CLH_0894			TRUE	0.640	0.000	0.000	NA		NA
5741733	5741734	CLH_0894	CLH_0895			TRUE	0.679	12.000	0.000	NA		NA
5741734	5741735	CLH_0895	CLH_0896			TRUE	0.990	4.000	0.500	NA		NA
5741735	5741736	CLH_0896	CLH_0897			TRUE	0.968	-7.000	0.160	NA		NA
5741736	5741737	CLH_0897	CLH_0898			TRUE	0.992	3.000	0.720	NA		NA
5741737	5741738	CLH_0898	CLH_0899			TRUE	0.963	1.000	0.083	NA		NA
5741738	5741739	CLH_0899	CLH_0900			TRUE	0.982	2.000	0.250	NA		NA
5741739	5741740	CLH_0900	CLH_0901			TRUE	0.659	15.000	0.000	NA		NA
5741740	5741741	CLH_0901	CLH_0902			TRUE	0.639	17.000	0.000	NA		NA
5741741	5741742	CLH_0902	CLH_0903			TRUE	0.597	-7.000	0.000	NA		NA
5741742	5741743	CLH_0903	CLH_0904			FALSE	0.201	114.000	0.000	NA		NA
5741743	5741744	CLH_0904	CLH_0905			FALSE	0.162	139.000	0.000	NA		NA
5741744	5741745	CLH_0905	CLH_0906			FALSE	0.143	148.000	0.000	NA		NA
5741747	5741748	CLH_0908	CLH_0909			TRUE	0.606	19.000	0.000	NA		NA
5741748	5741749	CLH_0909	CLH_0910			FALSE	0.140	150.000	0.000	NA		NA
5741749	5741750	CLH_0910	CLH_0911			TRUE	0.956	22.000	0.122	NA		NA
5741750	5741751	CLH_0911	CLH_0912			FALSE	0.116	162.000	0.000	NA		NA
5741751	5741752	CLH_0912	CLH_0913		malQ	TRUE	0.595	175.000	0.111	1.000	N	NA
5741752	5741753	CLH_0913	CLH_0914	malQ		TRUE	0.988	0.000	0.058	0.019	Y	NA
5741753	5741754	CLH_0914	CLH_0915		kdpA	FALSE	0.003	517.000	0.000	1.000	N	NA
5741754	5741755	CLH_0915	CLH_0916	kdpA	kdpB	TRUE	0.992	16.000	0.112	0.001	Y	NA
5741755	5741756	CLH_0916	CLH_0917	kdpB	kdpC	TRUE	0.998	18.000	0.877	0.001	Y	NA
5741756	5741757	CLH_0917	CLH_0918	kdpC		FALSE	0.368	163.000	0.011	1.000	N	NA
5741757	5741758	CLH_0918	CLH_0919			TRUE	0.994	-7.000	0.243	1.000	Y	NA
5741762	5741763	CLH_0923	CLH_0924			FALSE	0.200	70.000	0.000	1.000		NA
5741763	5741764	CLH_0924	CLH_0925			FALSE	0.004	506.000	0.000	1.000		NA
5741767	5741768	CLH_0928	CLH_0929			TRUE	0.989	-13.000	0.131	0.028	Y	NA
5741768	5741769	CLH_0929	CLH_0930			TRUE	0.996	-6.000	0.492	0.028	Y	NA
5741769	5741770	CLH_0930	CLH_0931			TRUE	0.998	-7.000	0.928	1.000	Y	NA
5741770	5741771	CLH_0931	CLH_0932			TRUE	0.973	23.000	0.326	1.000	N	NA
5741772	5741773	CLH_0933	CLH_0934			FALSE	0.221	73.000	0.000	NA		NA
5741774	5741775	CLH_0935	CLH_0936			FALSE	0.006	322.000	0.000	1.000	N	NA
5741778	5741779	CLH_0939	CLH_0940			FALSE	0.021	239.000	0.000	1.000		NA
5741779	5741780	CLH_0940	CLH_0941			TRUE	0.966	21.000	0.176	1.000		NA
5741780	5741781	CLH_0941	CLH_0942			TRUE	0.873	-12.000	0.015	1.000		NA
5741781	5741782	CLH_0942	CLH_0943			FALSE	0.289	187.000	0.015	NA		NA
5741784	5741785	CLH_0945	CLH_0946	speD		TRUE	0.991	16.000	0.091	1.000	Y	NA
5741785	5741786	CLH_0946	CLH_0947		speE	TRUE	0.995	0.000	0.237	1.000	Y	NA
5741786	5741787	CLH_0947	CLH_0948	speE		TRUE	0.942	54.000	0.036	1.000	Y	NA
5741787	5741788	CLH_0948	CLH_0949		nspC	TRUE	0.977	94.000	0.444	1.000	Y	NA
5741792	5741793	CLH_0953	CLH_0954			FALSE	0.036	210.000	0.000	1.000		NA
5741793	5741794	CLH_0954	CLH_0955			FALSE	0.034	222.000	0.000	NA		NA
5741794	5741795	CLH_0955	CLH_0956		ruvA	FALSE	0.067	274.000	0.007	NA		NA
5741795	5741796	CLH_0956	CLH_0957	ruvA	ruvB	TRUE	0.991	36.000	0.549	0.003	Y	NA
5741796	5741797	CLH_0957	CLH_0958	ruvB	queA	TRUE	0.945	19.000	0.069	1.000	N	NA
5741797	5741798	CLH_0958	CLH_0959	queA	tgt	TRUE	0.831	144.000	0.014	0.001	Y	NA
5741798	5741799	CLH_0959	CLH_0960	tgt	yajC	TRUE	0.658	109.000	0.035	NA	N	NA
5741799	5741800	CLH_0960	CLH_0961	yajC		TRUE	0.777	62.000	0.055	NA		NA
5741800	5741801	CLH_0961	CLH_0962			FALSE	0.021	247.000	0.000	NA		NA
5741801	5741802	CLH_0962	CLH_0963			FALSE	0.138	141.000	0.000	1.000		NA
5741802	5741803	CLH_0963	CLH_0964		apt	TRUE	0.718	41.000	0.010	1.000		NA
5741803	5741804	CLH_0964	CLH_0965	apt	relA	TRUE	0.735	107.000	0.068	1.000	N	NA
5741804	5741805	CLH_0965	CLH_0966	relA	dtd	TRUE	0.977	12.000	0.177	1.000	N	NA
5741805	5741806	CLH_0966	CLH_0967	dtd		TRUE	0.883	31.000	0.048	1.000		NA
5741806	5741807	CLH_0967	CLH_0968			TRUE	0.944	10.000	0.035	1.000		NA
5741807	5741808	CLH_0968	CLH_0969		hisS	TRUE	0.826	66.000	0.111	1.000	N	NA
5741808	5741809	CLH_0969	CLH_0970	hisS	aspS	FALSE	0.525	226.000	0.028	0.047	Y	NA
5741811	5741812	CLH_0972	CLH_0973			FALSE	0.149	144.000	0.000	NA		NA
5741812	5741813	CLH_0973	CLH_0974			FALSE	0.174	132.000	0.000	NA		NA
5741813	5741814	CLH_0974	CLH_0975		hom	FALSE	0.007	333.000	0.000	1.000		NA
5741814	5741815	CLH_0975	CLH_0976	hom		FALSE	0.005	367.000	0.000	1.000	N	NA
5741815	5741816	CLH_0976	CLH_0977		glpK	FALSE	0.480	99.000	0.004	1.000	N	NA
5741816	5741817	CLH_0977	CLH_0978	glpK		FALSE	0.373	156.000	0.006	1.000		NA
5741817	5741818	CLH_0978	CLH_0979			TRUE	0.988	13.000	0.476	0.032		NA
5741818	5741819	CLH_0979	CLH_0980			TRUE	0.988	2.000	0.417	NA		NA
5741821	5741822	CLH_0982	CLH_0983	glnA		TRUE	0.947	23.000	0.103	NA	N	NA
5741822	5741823	CLH_0983	CLH_0984			FALSE	0.547	129.000	0.017	NA	N	NA
5741823	5741824	CLH_0984	CLH_0985			TRUE	0.995	12.000	0.222	0.001	Y	NA
5741824	5741825	CLH_0985	CLH_0986			FALSE	0.330	226.000	0.000	1.000	Y	NA
5741825	5741826	CLH_0986	CLH_0987			FALSE	0.197	120.000	0.000	NA		NA
5741826	5741827	CLH_0987	CLH_0988			FALSE	0.007	363.000	0.000	NA		NA
5741829	5741830	CLH_0990	CLH_0991			FALSE	0.162	139.000	0.000	NA		NA
5741830	5741831	CLH_0991	CLH_0992		udk	FALSE	0.006	344.000	0.000	1.000	N	NA
5741834	5741835	CLH_0995	CLH_0996		rnz	FALSE	0.170	122.000	0.000	1.000		NA
5741836	5741837	CLH_0997	CLH_0998			FALSE	0.108	164.000	0.000	NA		NA
5741837	5741838	CLH_0998	CLH_0999			FALSE	0.209	95.000	0.000	NA		NA
5741838	5741839	CLH_0999	CLH_1000			TRUE	0.987	-10.000	0.667	NA		NA
5741839	5741840	CLH_1000	CLH_1001			TRUE	0.990	0.000	0.667	NA		NA
5741840	5741841	CLH_1001	CLH_1002			TRUE	0.974	21.000	0.250	NA		NA
5741841	5741842	CLH_1002	CLH_1003			TRUE	0.910	58.000	0.250	NA		NA
5741842	5741843	CLH_1003	CLH_1004			FALSE	0.008	348.000	0.000	NA		NA
5741843	5741844	CLH_1004	CLH_1005			FALSE	0.138	141.000	0.000	1.000		NA
5741844	5741845	CLH_1005	CLH_1006			FALSE	0.016	271.000	0.000	NA		NA
5741847	5741848	CLH_1008	CLH_1009			TRUE	0.980	1.000	0.231	NA		NA
5741848	5741849	CLH_1009	CLH_1010			FALSE	0.022	244.000	0.000	NA		NA
5741851	5741852	CLH_1012	CLH_1013		brnQ	FALSE	0.006	376.000	0.000	1.000		NA
5741854	5741855	CLH_1015	CLH_1016			FALSE	0.220	74.000	0.000	NA		NA
5741857	5741858	CLH_1018	CLH_1019	glyA		FALSE	0.013	291.000	0.000	NA		NA
5741858	5741859	CLH_1019	CLH_1020			TRUE	0.778	48.000	0.031	NA		NA
5741859	5741860	CLH_1020	CLH_1021		fabG	FALSE	0.004	392.000	0.000	1.000	N	NA
5741861	5741862	CLH_1022	CLH_1023	ilvE	nadE	TRUE	0.704	153.000	0.000	1.000	Y	NA
5741863	5741864	CLH_1024	CLH_1025			TRUE	0.995	-7.000	0.313	NA	Y	NA
5741864	5741865	CLH_1025	CLH_1026			FALSE	0.004	426.000	0.000	NA	N	NA
5741865	5741866	CLH_1026	CLH_1027			FALSE	0.014	281.000	0.000	NA		NA
5741868	5741869	CLH_1029	CLH_1030			TRUE	0.620	-3.000	0.000	NA		NA
5741869	5741870	CLH_1030	CLH_1031			FALSE	0.004	426.000	0.000	1.000	N	NA
5741870	5741871	CLH_1031	CLH_1032			TRUE	0.996	16.000	0.461	0.028	Y	NA
5741871	5741872	CLH_1032	CLH_1033			TRUE	0.987	17.000	0.039	1.000	Y	NA
5741872	5741873	CLH_1033	CLH_1034			FALSE	0.137	151.000	0.000	NA		NA
5741873	5741874	CLH_1034	CLH_1035			FALSE	0.202	105.000	0.000	NA		NA
5741874	5741875	CLH_1035	CLH_1036			FALSE	0.177	104.000	0.000	1.000		NA
5741875	5741876	CLH_1036	CLH_1037			FALSE	0.016	260.000	0.000	1.000		NA
5741876	5741877	CLH_1037	CLH_1038		purE	FALSE	0.152	409.000	0.012	1.000	Y	NA
5741877	5741878	CLH_1038	CLH_1039	purE	purC	TRUE	0.986	0.000	0.035	1.000	Y	NA
5741878	5741879	CLH_1039	CLH_1040	purC	purF	TRUE	0.913	143.000	0.082	1.000	Y	NA
5741879	5741880	CLH_1040	CLH_1041	purF	purM	TRUE	0.996	10.000	0.248	1.000	Y	NA
5741880	5741881	CLH_1041	CLH_1042	purM	purN	TRUE	0.992	-12.000	0.238	0.001	Y	NA
5741881	5741882	CLH_1042	CLH_1043	purN	purH	TRUE	0.943	150.000	0.225	1.000	Y	NA
5741882	5741883	CLH_1043	CLH_1044	purH	purD	TRUE	0.683	252.000	0.238	1.000	Y	NA
5741884	5741885	CLH_1045	CLH_1046			FALSE	0.024	240.000	0.000	NA		NA
5741885	5741886	CLH_1046	CLH_1047			FALSE	0.023	243.000	0.000	NA		NA
5741887	5741888	CLH_1048	CLH_1049			FALSE	0.005	478.000	0.000	NA		NA
5741888	5741889	CLH_1049	CLH_1050			TRUE	0.959	1.000	0.071	NA		NA
5741889	5741890	CLH_1050	CLH_1051			FALSE	0.008	339.000	0.000	NA		NA
5741890	5741891	CLH_1051	CLH_1052			TRUE	0.992	2.000	0.714	NA		NA
5741894	5741895	CLH_1055	CLH_1056			TRUE	0.663	2.000	0.000	NA		NA
5741895	5741896	CLH_1056	CLH_1057			FALSE	0.177	130.000	0.000	NA		NA
5741896	5741897	CLH_1057	CLH_1058			TRUE	0.575	-10.000	0.000	NA		NA
5741897	5741898	CLH_1058	CLH_1059			TRUE	0.592	10.000	0.000	1.000	N	NA
5741898	5741899	CLH_1059	CLH_1060			TRUE	0.962	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
5741900	5741901	CLH_1061	CLH_1062			FALSE	0.012	294.000	0.000	NA		NA
5741901	5741902	CLH_1062	CLH_1063			FALSE	0.047	205.000	0.000	NA		NA
5741902	5741903	CLH_1063	CLH_1064			FALSE	0.007	369.000	0.000	NA		NA
5741903	5741904	CLH_1064	CLH_1065			TRUE	0.951	100.000	0.133	1.000	Y	NA
5741904	5741905	CLH_1065	CLH_1066			TRUE	0.833	91.000	0.133	NA		NA
5741905	5741906	CLH_1066	CLH_1067			TRUE	0.984	32.000	1.000	NA		NA
5741906	5741907	CLH_1067	CLH_1068			FALSE	0.025	227.000	0.000	NA	N	NA
5741907	5741908	CLH_1068	CLH_1069			FALSE	0.006	388.000	0.000	NA		NA
5741908	5741909	CLH_1069	CLH_1070			FALSE	0.004	719.000	0.000	NA		NA
5741909	5741910	CLH_1070	CLH_1071		panE	TRUE	0.947	36.000	0.267	NA		NA
5741910	5741911	CLH_1071	CLH_1072	panE		FALSE	0.023	222.000	0.000	1.000	N	NA
5741911	5741912	CLH_1072	CLH_1073			FALSE	0.180	278.000	0.000	0.052	Y	NA
5741912	5741913	CLH_1073	CLH_1074			TRUE	0.983	-7.000	0.400	NA		NA
5741913	5741914	CLH_1074	CLH_1075			FALSE	0.006	411.000	0.000	NA		NA
5741914	5741915	CLH_1075	CLH_1076			FALSE	0.122	159.000	0.000	NA		NA
5741915	5741916	CLH_1076	CLH_1077			FALSE	0.061	184.000	0.000	1.000		NA
5741918	5741919	CLH_1079	CLH_1080		fabH	TRUE	0.964	15.000	0.098	1.000	N	NA
5741919	5741920	CLH_1080	CLH_1081	fabH		TRUE	0.960	115.000	0.235	0.005	Y	NA
5741920	5741921	CLH_1081	CLH_1082			TRUE	0.753	110.000	0.072	1.000		NA
5741921	5741922	CLH_1082	CLH_1083		fabD	TRUE	0.956	-7.000	0.099	1.000		NA
5741922	5741923	CLH_1083	CLH_1084	fabD	fabG	TRUE	0.990	21.000	0.149	0.005	Y	NA
5741923	5741924	CLH_1084	CLH_1085	fabG	fabF	TRUE	0.994	18.000	0.236	1.000	Y	NA
5741924	5741925	CLH_1085	CLH_1086	fabF	accB	TRUE	0.992	12.000	0.074	1.000	Y	NA
5741925	5741926	CLH_1086	CLH_1087	accB	fabZ	TRUE	0.989	6.000	0.047	0.005	Y	NA
5741926	5741927	CLH_1087	CLH_1088	fabZ	accC	TRUE	0.990	10.000	0.045	1.000	Y	NA
5741927	5741928	CLH_1088	CLH_1089	accC	accD	TRUE	0.988	-7.000	0.090	0.002	Y	NA
5741928	5741929	CLH_1089	CLH_1090	accD	accA	TRUE	0.993	-7.000	0.234	0.001	Y	NA
5741929	5741930	CLH_1090	CLH_1091	accA		FALSE	0.074	182.000	0.000	NA		NA
5741930	5741931	CLH_1091	CLH_1092			FALSE	0.414	34.000	0.000	NA		NA
5741931	5741932	CLH_1092	CLH_1093			FALSE	0.006	421.000	0.000	NA		NA
5741932	5741933	CLH_1093	CLH_1094			FALSE	0.006	391.000	0.000	NA		NA
5741933	5741934	CLH_1094	CLH_1095			TRUE	0.993	3.000	0.857	NA		NA
5741934	5741935	CLH_1095	CLH_1096			TRUE	0.964	-34.000	0.231	1.000		NA
5741935	5741936	CLH_1096	CLH_1097			FALSE	0.005	388.000	0.000	1.000		NA
5741936	5741937	CLH_1097	CLH_1098			TRUE	0.757	86.000	0.062	NA		NA
5741937	5741938	CLH_1098	CLH_1099			TRUE	0.640	0.000	0.000	NA		NA
5741938	5741939	CLH_1099	CLH_1100		moaC	FALSE	0.461	13.000	0.000	0.002		NA
5741939	5741940	CLH_1100	CLH_1101	moaC	moaA	TRUE	0.826	61.000	0.000	0.002	Y	NA
5741940	5741941	CLH_1101	CLH_1102	moaA		TRUE	0.943	3.000	0.042	0.035		NA
5741941	5741942	CLH_1102	CLH_1103			FALSE	0.074	176.000	0.000	1.000		NA
5741942	5741943	CLH_1103	CLH_1104			TRUE	0.898	109.000	0.400	0.011		NA
5741943	5741944	CLH_1104	CLH_1105			TRUE	0.681	11.000	0.000	NA		NA
5741944	5741945	CLH_1105	CLH_1106			FALSE	0.267	58.000	0.000	NA		NA
5741945	5741946	CLH_1106	CLH_1107			TRUE	0.987	1.000	0.400	NA		NA
5741946	5741947	CLH_1107	CLH_1108			TRUE	0.966	33.000	0.400	NA		NA
5741948	5741949	CLH_1109	CLH_1110		boNT/E3	FALSE	0.003	1060.000	0.000	1.000		NA
5741949	5741950	CLH_1110	CLH_1111	boNT/E3	ntnH	TRUE	0.987	25.000	1.000	0.001		NA
5741950	5741951	CLH_1111	CLH_1112	ntnH	p47	TRUE	0.992	16.000	0.750	NA		NA
5741952	5741953	CLH_1113	CLH_1114			TRUE	0.989	14.000	0.500	NA		NA
5741953	5741954	CLH_1114	CLH_1115			TRUE	0.973	32.000	0.500	NA		NA
5741954	5741955	CLH_1115	CLH_1116			FALSE	0.005	464.000	0.000	NA		NA
5741955	5741956	CLH_1116	CLH_1117			TRUE	0.994	1.000	1.000	NA		NA
5741956	5741957	CLH_1117	CLH_1118			FALSE	0.004	1223.000	0.000	NA		NA
5741957	5741958	CLH_1118	CLH_1119			TRUE	0.807	37.000	0.025	NA		NA
5741958	5741959	CLH_1119	CLH_1120		nifS	TRUE	0.973	4.000	0.125	NA	N	NA
5741959	5741960	CLH_1120	CLH_1121	nifS	nifU	TRUE	0.936	2.000	0.035	1.000	N	NA
5741960	5741961	CLH_1121	CLH_1122	nifU	trmU	TRUE	0.956	1.000	0.073	1.000	N	NA
5741961	5741962	CLH_1122	CLH_1123	trmU		FALSE	0.024	425.000	0.006	NA		NA
5741962	5741963	CLH_1123	CLH_1124			TRUE	0.965	-22.000	0.209	NA		NA
5741963	5741964	CLH_1124	CLH_1125		alaS	FALSE	0.037	375.000	0.015	NA		NA
5741964	5741965	CLH_1125	CLH_1126	alaS		FALSE	0.540	187.000	0.110	NA		NA
5741965	5741966	CLH_1126	CLH_1127			TRUE	0.956	49.000	0.537	NA		NA
5741966	5741967	CLH_1127	CLH_1128			FALSE	0.281	213.000	0.047	NA		NA
5741967	5741968	CLH_1128	CLH_1129			TRUE	0.926	44.000	0.211	NA		NA
5741968	5741969	CLH_1129	CLH_1130			TRUE	0.906	63.000	0.289	1.000		NA
5741969	5741970	CLH_1130	CLH_1131		typA	FALSE	0.191	195.000	0.004	1.000		NA
5741970	5741971	CLH_1131	CLH_1132	typA		TRUE	0.577	97.000	0.012	NA		NA
5741971	5741972	CLH_1132	CLH_1133			TRUE	0.944	20.000	0.067	NA		NA
5741972	5741973	CLH_1133	CLH_1134			TRUE	0.976	7.000	0.146	1.000		NA
5741973	5741974	CLH_1134	CLH_1135			FALSE	0.320	166.000	0.008	1.000	N	NA
5741974	5741975	CLH_1135	CLH_1136		sigK	TRUE	0.781	83.000	0.087	1.000	N	NA
5741975	5741976	CLH_1136	CLH_1137	sigK		FALSE	0.408	169.000	0.025	1.000	N	NA
5741976	5741977	CLH_1137	CLH_1138		ftsA	FALSE	0.454	93.000	0.004	0.007	N	NA
5741977	5741978	CLH_1138	CLH_1139	ftsA	ftsZ	TRUE	0.997	14.000	0.460	1.000	Y	NA
5741978	5741979	CLH_1139	CLH_1140	ftsZ	spoIIGA	FALSE	0.108	260.000	0.024	1.000		NA
5741979	5741980	CLH_1140	CLH_1141	spoIIGA	sigE	TRUE	0.993	12.000	0.856	1.000		NA
5741980	5741981	CLH_1141	CLH_1142	sigE	sigG	TRUE	0.981	82.000	0.602	0.009	Y	NA
5741981	5741982	CLH_1142	CLH_1143	sigG		FALSE	0.142	279.000	0.060	NA		NA
5741982	5741983	CLH_1143	CLH_1144		nrdR	TRUE	0.612	70.000	0.013	NA		NA
5741983	5741984	CLH_1144	CLH_1145	nrdR		FALSE	0.127	233.000	0.013	NA		NA
5741984	5741985	CLH_1145	CLH_1146			TRUE	0.927	12.000	0.018	NA		NA
5741985	5741986	CLH_1146	CLH_1147			TRUE	0.985	27.000	0.110	0.071	Y	NA
5741986	5741987	CLH_1147	CLH_1148			FALSE	0.084	284.000	0.028	1.000	N	NA
5741987	5741988	CLH_1148	CLH_1149		pstC	TRUE	0.991	23.000	0.206	1.000	Y	NA
5741988	5741989	CLH_1149	CLH_1150	pstC	pstA	TRUE	0.998	0.000	0.907	0.002	Y	NA
5741989	5741990	CLH_1150	CLH_1151	pstA	pstB	TRUE	0.992	14.000	0.112	0.002	Y	NA
5741990	5741991	CLH_1151	CLH_1152	pstB	phoU	TRUE	0.993	19.000	0.182	NA	Y	NA
5741991	5741992	CLH_1152	CLH_1153	phoU		FALSE	0.194	222.000	0.028	NA	N	NA
5741992	5741993	CLH_1153	CLH_1154		engA	TRUE	0.950	0.000	0.061	1.000		NA
5741993	5741994	CLH_1154	CLH_1155	engA		TRUE	0.959	3.000	0.068	1.000		NA
5741994	5741995	CLH_1155	CLH_1156		spoIVA	TRUE	0.645	149.000	0.060	NA		NA
5741995	5741996	CLH_1156	CLH_1157	spoIVA		FALSE	0.119	160.000	0.000	NA		NA
5741996	5741997	CLH_1157	CLH_1158		ansA	FALSE	0.137	151.000	0.000	NA		NA
5741997	5741998	CLH_1158	CLH_1159	ansA		FALSE	0.010	295.000	0.000	1.000		NA
5741998	5741999	CLH_1159	CLH_1160			FALSE	0.006	402.000	0.000	NA		NA
5741999	5742000	CLH_1160	CLH_1161			TRUE	0.979	14.000	0.189	NA		NA
5742000	5742001	CLH_1161	CLH_1162		gmk	TRUE	0.971	0.000	0.143	NA		NA
5742001	5742002	CLH_1162	CLH_1163	gmk	rpoZ	TRUE	0.979	-19.000	0.471	1.000	N	NA
5742002	5742003	CLH_1163	CLH_1164	rpoZ	coaBC	TRUE	0.967	21.000	0.192	1.000	N	NA
5742003	5742004	CLH_1164	CLH_1165	coaBC	priA	TRUE	0.819	64.000	0.099	1.000	N	NA
5742004	5742005	CLH_1165	CLH_1166	priA	def	TRUE	0.902	13.000	0.010	1.000	N	NA
5742005	5742006	CLH_1166	CLH_1167	def	fmt	TRUE	0.982	14.000	0.009	0.028	Y	NA
5742006	5742007	CLH_1167	CLH_1168	fmt		TRUE	0.817	41.000	0.035	NA		NA
5742007	5742008	CLH_1168	CLH_1169		sun	TRUE	0.956	18.000	0.076	NA		NA
5742008	5742009	CLH_1169	CLH_1170	sun		TRUE	0.972	15.000	0.135	1.000		NA
5742009	5742010	CLH_1170	CLH_1171			TRUE	0.967	2.000	0.105	1.000		NA
5742010	5742011	CLH_1171	CLH_1172			TRUE	0.998	2.000	0.704	1.000	Y	NA
5742011	5742012	CLH_1172	CLH_1173		rsgA	TRUE	0.809	141.000	0.196	1.000		NA
5742012	5742013	CLH_1173	CLH_1174	rsgA	rpe	TRUE	0.974	-6.000	0.213	1.000		NA
5742013	5742014	CLH_1174	CLH_1175	rpe		TRUE	0.976	9.000	0.166	1.000	N	NA
5742016	5742017	CLH_1177	CLH_1178			TRUE	0.990	14.000	0.567	NA		NA
5742017	5742018	CLH_1178	CLH_1179		recG	TRUE	0.745	66.000	0.048	1.000		NA
5742018	5742019	CLH_1179	CLH_1180	recG	rsmD	TRUE	0.912	63.000	0.016	1.000	Y	NA
5742019	5742020	CLH_1180	CLH_1181	rsmD	coaD	TRUE	0.986	3.000	0.367	1.000	N	NA
5742020	5742021	CLH_1181	CLH_1183	coaD		TRUE	0.956	12.000	0.055	NA		NA
5742022	5742023	CLH_1182	CLH_1184	ylbJ		TRUE	0.663	123.000	0.036	NA		NA
5742024	5742025	CLH_1185	CLH_1186	pta	ackA	TRUE	0.988	26.000	0.137	1.000	Y	NA
5742025	5742026	CLH_1186	CLH_1187	ackA		TRUE	0.703	131.000	0.061	NA		NA
5742026	5742027	CLH_1187	CLH_1188		rpmF	TRUE	0.991	3.000	0.599	NA		NA
5742027	5742028	CLH_1188	CLH_1189	rpmF	plsX	TRUE	0.786	175.000	0.418	1.000	N	NA
5742028	5742029	CLH_1189	CLH_1190	plsX	acpP	TRUE	0.909	89.000	0.034	0.005	Y	NA
5742029	5742030	CLH_1190	CLH_1191	acpP	rnc	TRUE	0.730	119.000	0.068	1.000	N	NA
5742030	5742031	CLH_1191	CLH_1192	rnc		TRUE	0.987	-7.000	0.064	1.000	Y	NA
5742031	5742032	CLH_1192	CLH_1193		smc	FALSE	0.079	288.000	0.027	1.000	N	NA
5742032	5742033	CLH_1193	CLH_1194	smc	ftsY	FALSE	0.511	196.000	0.165	0.018	N	NA
5742033	5742034	CLH_1194	CLH_1195	ftsY		FALSE	0.416	201.000	0.081	1.000		NA
5742034	5742035	CLH_1195	CLH_1196		ffh	TRUE	0.974	15.000	0.151	1.000		NA
5742035	5742036	CLH_1196	CLH_1197	ffh	rpsP	TRUE	0.957	35.000	0.361	1.000	N	NA
5742036	5742037	CLH_1197	CLH_1198	rpsP		TRUE	0.941	50.000	0.385	1.000		NA
5742037	5742038	CLH_1198	CLH_1199		rimM	TRUE	0.899	76.000	0.324	1.000		NA
5742038	5742039	CLH_1199	CLH_1200	rimM	trmD	TRUE	0.997	-10.000	0.672	1.000	Y	NA
5742039	5742040	CLH_1200	CLH_1201	trmD	rplS	TRUE	0.978	123.000	0.567	1.000	Y	NA
5742040	5742041	CLH_1201	CLH_1202	rplS		TRUE	0.633	114.000	0.027	1.000		NA
5742041	5742042	CLH_1202	CLH_1203			TRUE	0.965	-7.000	0.148	1.000		NA
5742044	5742045	CLH_1205	CLH_1206		dprA	TRUE	0.927	21.000	0.053	1.000	N	NA
5742045	5742046	CLH_1206	CLH_1207	dprA	topA	TRUE	0.978	51.000	0.238	1.000	Y	NA
5742046	5742047	CLH_1207	CLH_1208	topA	codY	FALSE	0.290	191.000	0.025	1.000	N	NA
5742047	5742048	CLH_1208	CLH_1209	codY	rpsB	FALSE	0.098	232.000	0.006	1.000	N	NA
5742048	5742049	CLH_1209	CLH_1210	rpsB	tsf	TRUE	0.947	183.000	0.748	1.000	Y	NA
5742049	5742050	CLH_1210	CLH_1211	tsf	pyrH	TRUE	0.905	109.000	0.416	1.000	N	NA
5742050	5742051	CLH_1211	CLH_1212	pyrH	frr	TRUE	0.991	11.000	0.626	1.000	N	NA
5742051	5742052	CLH_1212	CLH_1213	frr	uppS	TRUE	0.905	99.000	0.409	1.000	N	NA
5742052	5742053	CLH_1213	CLH_1214	uppS	cdsA	TRUE	0.989	15.000	0.055	1.000	Y	NA
5742053	5742054	CLH_1214	CLH_1215	cdsA		TRUE	0.634	155.000	0.068	NA		NA
5742054	5742055	CLH_1215	CLH_1216		dxr	TRUE	0.668	51.000	0.008	NA		NA
5742055	5742056	CLH_1216	CLH_1217	dxr	rseP	TRUE	0.935	7.000	0.029	1.000	N	NA
5742056	5742057	CLH_1217	CLH_1218	rseP	ispG	TRUE	0.935	12.000	0.029	1.000	N	NA
5742057	5742058	CLH_1218	CLH_1219	ispG	polC	TRUE	0.669	107.000	0.040	1.000	N	NA
5742058	5742059	CLH_1219	CLH_1220	polC		FALSE	0.129	286.000	0.059	NA		NA
5742059	5742060	CLH_1220	CLH_1221		nusA	TRUE	0.991	18.000	0.759	NA		NA
5742060	5742061	CLH_1221	CLH_1222	nusA		TRUE	0.996	15.000	0.323	NA	Y	NA
5742061	5742062	CLH_1222	CLH_1223			TRUE	0.983	-7.000	0.408	NA	N	NA
5742062	5742063	CLH_1223	CLH_1224		infB	TRUE	0.993	20.000	0.223	NA	Y	NA
5742063	5742064	CLH_1224	CLH_1225	infB	rbfA	TRUE	0.997	14.000	0.530	1.000	Y	NA
5742064	5742065	CLH_1225	CLH_1226	rbfA		TRUE	0.973	0.000	0.173	1.000		NA
5742065	5742066	CLH_1226	CLH_1227		truB	TRUE	0.975	-3.000	0.221	1.000		NA
5742066	5742067	CLH_1227	CLH_1228	truB	ribF	TRUE	0.982	17.000	0.308	1.000	N	NA
5742067	5742068	CLH_1228	CLH_1229	ribF	rpsO	TRUE	0.799	117.000	0.119	1.000	N	NA
5742068	5742069	CLH_1229	CLH_1230	rpsO		TRUE	0.973	81.000	0.335	1.000	Y	NA
5742069	5742070	CLH_1230	CLH_1231			FALSE	0.133	279.000	0.057	1.000		NA
5742070	5742071	CLH_1231	CLH_1232			TRUE	0.818	71.000	0.104	NA		NA
5742071	5742072	CLH_1232	CLH_1233			TRUE	0.820	123.000	0.148	NA		NA
5742072	5742073	CLH_1233	CLH_1234		clpP	TRUE	0.794	66.000	0.080	1.000	N	NA
5742073	5742074	CLH_1234	CLH_1235	clpP	ftsK	TRUE	0.671	119.000	0.042	1.000	N	NA
5742074	5742075	CLH_1235	CLH_1236	ftsK		TRUE	0.639	102.000	0.031	1.000	N	NA
5742075	5742076	CLH_1236	CLH_1237		pgsA	TRUE	0.953	-16.000	0.132	1.000	N	NA
5742076	5742077	CLH_1237	CLH_1238	pgsA	recA	FALSE	0.443	160.000	0.022	1.000	N	NA
5742077	5742078	CLH_1238	CLH_1239	recA		FALSE	0.055	315.000	0.018	1.000		NA
5742078	5742079	CLH_1239	CLH_1240		spoVS	FALSE	0.035	389.000	0.016	NA		NA
5742079	5742080	CLH_1240	CLH_1241	spoVS		TRUE	0.565	126.000	0.015	NA		NA
5742084	5742085	CLH_1245	CLH_1246		ribD	FALSE	0.004	467.000	0.000	1.000		NA
5742085	5742086	CLH_1246	CLH_1247	ribD	ribE	TRUE	0.997	15.000	0.456	1.000	Y	NA
5742086	5742087	CLH_1247	CLH_1248	ribE		TRUE	0.841	167.000	0.051	1.000	Y	NA
5742087	5742088	CLH_1248	CLH_1249		ribH	TRUE	0.922	92.000	0.054	0.002	Y	NA
5742090	5742091	CLH_1251	CLH_1252			TRUE	0.987	6.000	0.375	1.000	N	NA
5742091	5742092	CLH_1252	CLH_1253			TRUE	0.971	67.000	0.250	1.000	Y	NA
5742092	5742093	CLH_1253	CLH_1254			TRUE	0.995	16.000	0.241	1.000	Y	NA
5742093	5742094	CLH_1254	CLH_1255			TRUE	0.693	160.000	0.128	1.000	N	NA
5742094	5742095	CLH_1255	CLH_1256			TRUE	0.970	17.000	0.140	1.000		NA
5742095	5742096	CLH_1256	CLH_1257			TRUE	0.818	96.000	0.125	1.000		NA
5742096	5742097	CLH_1257	CLH_1258			TRUE	0.723	118.000	0.059	1.000		NA
5742098	5742099	CLH_1259	CLH_1260			FALSE	0.105	165.000	0.000	NA		NA
5742100	5742101	CLH_1261	CLH_1262			FALSE	0.215	87.000	0.000	NA		NA
5742103	5742104	CLH_1264	CLH_1265			FALSE	0.183	127.000	0.000	NA		NA
5742106	5742107	CLH_1267	CLH_1268			FALSE	0.216	86.000	0.000	NA		NA
5742111	5742112	CLH_1272	CLH_1273			FALSE	0.172	121.000	0.000	1.000		NA
5742112	5742113	CLH_1273	CLH_1274			FALSE	0.016	259.000	0.000	1.000		NA
5742113	5742114	CLH_1274	CLH_1275			FALSE	0.008	344.000	0.000	NA		NA
5742118	5742119	CLH_1279	CLH_1280			TRUE	0.972	15.000	0.132	NA		NA
5742119	5742120	CLH_1280	CLH_1281			TRUE	0.882	71.000	0.227	NA		NA
5742121	5742122	CLH_1282	CLH_1283			FALSE	0.006	384.000	0.000	NA		NA
5742122	5742123	CLH_1283	CLH_1284			FALSE	0.175	131.000	0.000	NA		NA
5742126	5742127	CLH_1287	CLH_1288		map	FALSE	0.153	300.000	0.000	1.000	Y	NA
5742127	5742128	CLH_1288	CLH_1289	map		FALSE	0.019	255.000	0.000	NA		NA
5742128	5742129	CLH_1289	CLH_1290			FALSE	0.091	174.000	0.000	NA		NA
5742129	5742130	CLH_1290	CLH_1291			TRUE	0.988	-7.000	0.667	NA		NA
5742130	5742131	CLH_1291	CLH_1292			TRUE	0.963	2.000	0.080	NA		NA
5742131	5742132	CLH_1292	CLH_1293			FALSE	0.113	163.000	0.000	NA		NA
5742132	5742133	CLH_1293	CLH_1294			FALSE	0.011	309.000	0.000	NA		NA
5742133	5742134	CLH_1294	CLH_1295			FALSE	0.216	84.000	0.000	NA		NA
5742134	5742135	CLH_1295	CLH_1296			FALSE	0.004	658.000	0.000	NA		NA
5742135	5742136	CLH_1296	CLH_1297			FALSE	0.493	-21.000	0.000	1.000		NA
5742136	5742137	CLH_1297	CLH_1298			TRUE	0.993	4.000	0.800	NA		NA
5742137	5742138	CLH_1298	CLH_1299			TRUE	0.663	2.000	0.000	NA		NA
5742138	5742139	CLH_1299	CLH_1300			FALSE	0.005	485.000	0.000	NA		NA
5742139	5742140	CLH_1300	CLH_1301		moaF	FALSE	0.006	421.000	0.000	NA		NA
5742140	5742141	CLH_1301	CLH_1302	moaF		FALSE	0.086	176.000	0.000	NA		NA
5742141	5742142	CLH_1302	CLH_1303			FALSE	0.174	132.000	0.000	NA		NA
5742142	5742143	CLH_1303	CLH_1304			FALSE	0.009	328.000	0.000	NA		NA
5742143	5742144	CLH_1304	CLH_1305			FALSE	0.201	115.000	0.000	NA		NA
5742144	5742145	CLH_1305	CLH_1306			FALSE	0.162	139.000	0.000	NA		NA
5742145	5742146	CLH_1306	CLH_1307			FALSE	0.004	822.000	0.000	NA		NA
5742146	5742147	CLH_1307	CLH_1308			TRUE	0.995	22.000	0.429	0.015	Y	NA
5742147	5742148	CLH_1308	CLH_1309		lctP	FALSE	0.181	283.000	0.000	1.000	Y	NA
5742148	5742149	CLH_1309	CLH_1310	lctP		TRUE	0.909	155.000	0.111	1.000	Y	NA
5742149	5742150	CLH_1310	CLH_1311			TRUE	0.649	175.000	0.182	0.010	N	NA
5742152	5742153	CLH_1313	CLH_1314	katG		FALSE	0.003	655.000	0.000	1.000	N	NA
5742153	5742154	CLH_1314	CLH_1315			TRUE	0.994	36.000	0.943	0.015	Y	NA
5742154	5742155	CLH_1315	CLH_1316			TRUE	0.997	-13.000	0.812	0.015	Y	NA
5742155	5742156	CLH_1316	CLH_1317			TRUE	0.707	207.000	0.583	NA		NA
5742156	5742157	CLH_1317	CLH_1318		modA	FALSE	0.005	461.000	0.000	NA		NA
5742157	5742158	CLH_1318	CLH_1319	modA		TRUE	0.954	50.000	0.556	1.000	N	NA
5742158	5742159	CLH_1319	CLH_1320			FALSE	0.339	21.000	0.000	0.027	N	NA
5742159	5742160	CLH_1320	CLH_1321			FALSE	0.557	22.000	0.000	NA		NA
5742160	5742161	CLH_1321	CLH_1322			FALSE	0.010	311.000	0.000	NA		NA
5742161	5742162	CLH_1322	CLH_1323		ade	FALSE	0.011	307.000	0.000	NA		NA
5742163	5742164	CLH_1324	CLH_1325	asnB		FALSE	0.004	676.000	0.000	NA		NA
5742165	5742166	CLH_1326	CLH_1327			FALSE	0.053	200.000	0.000	NA		NA
5742166	5742167	CLH_1327	CLH_1328			FALSE	0.006	386.000	0.000	NA		NA
5742167	5742168	CLH_1328	CLH_1329			FALSE	0.130	154.000	0.000	NA		NA
5742168	5742169	CLH_1329	CLH_1330			FALSE	0.051	192.000	0.000	1.000		NA
5742169	5742170	CLH_1330	CLH_1331			TRUE	0.986	0.000	0.429	1.000	N	NA
5742170	5742171	CLH_1331	CLH_1332			FALSE	0.004	402.000	0.000	1.000	N	NA
5742171	5742172	CLH_1332	CLH_1333			FALSE	0.018	260.000	0.000	NA		NA
5742172	5742173	CLH_1333	CLH_1334			FALSE	0.016	272.000	0.000	NA		NA
5742173	5742174	CLH_1334	CLH_1335			FALSE	0.071	184.000	0.000	NA		NA
5742174	5742175	CLH_1335	CLH_1336			FALSE	0.009	322.000	0.000	NA		NA
5742175	5742176	CLH_1336	CLH_1337			TRUE	0.894	-28.000	0.032	NA		NA
5742176	5742177	CLH_1337	CLH_1338			FALSE	0.006	393.000	0.000	NA		NA
5742177	5742178	CLH_1338	CLH_1339			FALSE	0.230	69.000	0.000	NA		NA
5742178	5742179	CLH_1339	CLH_1340			FALSE	0.006	376.000	0.000	1.000		NA
5742179	5742180	CLH_1340	CLH_1341			TRUE	0.772	120.000	0.000	0.001	Y	NA
5742180	5742181	CLH_1341	CLH_1342			FALSE	0.239	66.000	0.000	NA		NA
5742181	5742182	CLH_1342	CLH_1344			FALSE	0.280	55.000	0.000	NA		NA
5742182	5742183	CLH_1344	CLH_1345			FALSE	0.003	475.000	0.000	1.000	N	NA
5742183	5742184	CLH_1345	CLH_1346		mgtA	FALSE	0.053	746.000	0.000	0.004	Y	NA
5742184	5742185	CLH_1346	CLH_1347	mgtA		FALSE	0.004	481.000	0.000	1.000		NA
5742185	5742186	CLH_1347	CLH_1348			FALSE	0.219	75.000	0.000	NA		NA
5742186	5742187	CLH_1348	CLH_1349			FALSE	0.004	556.000	0.000	NA		NA
5742187	5742188	CLH_1349	CLH_1350			FALSE	0.009	284.000	0.000	1.000	N	NA
5742188	5742189	CLH_1350	CLH_1351		fprA	TRUE	0.964	37.000	0.571	0.039	N	NA
5742189	5742190	CLH_1351	CLH_1352	fprA		FALSE	0.010	320.000	0.000	NA		NA
5742190	5742191	CLH_1352	CLH_1353			TRUE	0.989	-22.000	1.000	NA		NA
5742191	5742192	CLH_1353	CLH_1354			TRUE	0.990	3.000	0.556	NA		NA
5742192	5742193	CLH_1354	CLH_1355			TRUE	0.969	36.000	0.556	NA		NA
5742193	5742194	CLH_1355	CLH_1356			TRUE	0.892	56.000	0.179	NA		NA
5742194	5742195	CLH_1356	CLH_1357			FALSE	0.004	438.000	0.000	1.000	N	NA
5742196	5742197	CLH_1358	CLH_1359			FALSE	0.188	125.000	0.000	NA		NA
5742198	5742199	CLH_1360	CLH_1361			FALSE	0.120	123.000	0.000	0.061		NA
5742199	5742200	CLH_1361	CLH_1362			FALSE	0.011	308.000	0.000	NA		NA
5742200	5742201	CLH_1362	CLH_1363			FALSE	0.012	295.000	0.000	NA		NA
5742201	5742202	CLH_1363	CLH_1364			FALSE	0.006	326.000	0.000	1.000	N	NA
5742202	5742203	CLH_1364	CLH_1365			TRUE	0.923	32.000	0.000	1.000	Y	NA
5742203	5742204	CLH_1365	CLH_1366			TRUE	0.970	61.000	0.200	1.000	Y	NA
5742204	5742205	CLH_1366	CLH_1367			FALSE	0.004	471.000	0.000	1.000		NA
5742205	5742206	CLH_1367	CLH_1368			FALSE	0.005	411.000	0.000	1.000		NA
5742206	5742207	CLH_1368	CLH_1369			FALSE	0.008	297.000	0.000	1.000	N	NA
5742207	5742208	CLH_1369	CLH_1370			FALSE	0.189	268.000	0.094	1.000	N	NA
5742208	5742209	CLH_1370	CLH_1371			FALSE	0.004	573.000	0.000	NA		NA
5742209	5742210	CLH_1371	CLH_1372			TRUE	0.992	0.000	0.810	NA		NA
5742210	5742211	CLH_1372	CLH_1373			TRUE	0.970	25.000	0.286	NA		NA
5742211	5742212	CLH_1373	CLH_1374			TRUE	0.980	27.000	0.571	NA		NA
5742212	5742213	CLH_1374	CLH_1375			TRUE	0.928	76.000	0.500	NA		NA
5742213	5742214	CLH_1375	CLH_1376			TRUE	0.981	56.000	0.370	1.000	Y	NA
5742214	5742215	CLH_1376	CLH_1377			TRUE	0.870	168.000	0.815	0.003	N	NA
5742215	5742216	CLH_1377	CLH_1378			TRUE	0.951	40.000	0.375	1.000	N	NA
5742216	5742217	CLH_1378	CLH_1379			TRUE	0.977	-3.000	0.003	1.000	Y	NA
5742217	5742218	CLH_1379	CLH_1380			TRUE	0.964	18.000	0.000	NA	Y	NA
5742218	5742219	CLH_1380	CLH_1381			TRUE	0.996	-18.000	0.615	NA	Y	NA
5742219	5742220	CLH_1381	CLH_1382			TRUE	0.987	16.000	0.444	NA		NA
5742220	5742221	CLH_1382	CLH_1383			TRUE	0.984	-3.000	0.389	NA		NA
5742221	5742222	CLH_1383	CLH_1384			TRUE	0.997	18.000	0.500	NA	Y	NA
5742222	5742223	CLH_1384	CLH_1385			TRUE	0.998	2.000	0.833	NA	Y	NA
5742223	5742224	CLH_1385	CLH_1386			TRUE	0.938	58.000	0.455	NA	N	NA
5742224	5742225	CLH_1386	CLH_1387			TRUE	0.986	23.000	0.750	NA	N	NA
5742225	5742226	CLH_1387	CLH_1388			TRUE	0.992	39.000	0.692	NA	Y	NA
5742226	5742227	CLH_1388	CLH_1389			TRUE	0.992	1.000	0.769	NA	N	NA
5742227	5742228	CLH_1389	CLH_1390			TRUE	0.985	57.000	0.500	NA	Y	NA
5742228	5742229	CLH_1390	CLH_1391			FALSE	0.005	386.000	0.000	NA	N	NA
5742229	5742230	CLH_1391	CLH_1392			FALSE	0.004	502.000	0.000	1.000		NA
5742230	5742231	CLH_1392	CLH_1393			FALSE	0.005	417.000	0.000	1.000		NA
5742231	5742232	CLH_1393	CLH_1394			TRUE	0.965	0.000	0.000	1.000	Y	NA
5742232	5742233	CLH_1394	CLH_1395			TRUE	0.997	0.000	0.625	1.000	Y	NA
5742233	5742234	CLH_1395	CLH_1396			FALSE	0.214	90.000	0.000	NA		NA
5742236	5742237	CLH_1398	CLH_1399			FALSE	0.164	138.000	0.000	NA		NA
5742241	5742242	CLH_1403	CLH_1404			FALSE	0.018	260.000	0.000	NA		NA
5742242	5742243	CLH_1404	CLH_1405			FALSE	0.005	515.000	0.000	NA		NA
5742243	5742244	CLH_1405	CLH_1406			FALSE	0.011	307.000	0.000	NA		NA
5742244	5742245	CLH_1406	CLH_1407			FALSE	0.065	188.000	0.000	NA		NA
5742247	5742248	CLH_1409	CLH_1410			FALSE	0.011	301.000	0.000	NA		NA
5742248	5742249	CLH_1410	CLH_1411			FALSE	0.280	55.000	0.000	NA		NA
5742249	5742250	CLH_1411	CLH_1412			FALSE	0.214	90.000	0.000	NA		NA
5742250	5742251	CLH_1412	CLH_1413			FALSE	0.312	49.000	0.000	NA		NA
5742251	5742252	CLH_1413	CLH_1414			FALSE	0.167	137.000	0.000	NA		NA
5742252	5742253	CLH_1414	CLH_1415			FALSE	0.007	319.000	0.000	1.000	N	NA
5742253	5742254	CLH_1415	CLH_1416			FALSE	0.259	287.000	0.286	0.014	N	NA
5742254	5742255	CLH_1416	CLH_1417			TRUE	0.995	23.000	0.600	0.008	Y	NA
5742255	5742256	CLH_1417	CLH_1418			TRUE	0.982	82.000	0.600	NA	Y	NA
5742256	5742257	CLH_1418	CLH_1419			TRUE	0.879	141.000	0.400	NA		NA
5742257	5742258	CLH_1419	CLH_1420			TRUE	0.851	47.000	0.071	1.000		NA
5742258	5742259	CLH_1420	CLH_1421			FALSE	0.006	391.000	0.000	NA		NA
5742259	5742260	CLH_1421	CLH_1422			FALSE	0.243	64.000	0.000	NA		NA
5742260	5742261	CLH_1422	CLH_1423			TRUE	0.993	-10.000	0.256	1.000	Y	NA
5742261	5742262	CLH_1423	CLH_1424			FALSE	0.387	36.000	0.000	NA		NA
5742262	5742263	CLH_1424	CLH_1425			FALSE	0.005	476.000	0.000	NA		NA
5742263	5742264	CLH_1425	CLH_1426			FALSE	0.010	268.000	0.000	0.060		NA
5742265	5742266	CLH_1427	CLH_1428			FALSE	0.007	364.000	0.000	NA		NA
5742267	5742268	CLH_1429	CLH_1430			TRUE	0.809	89.000	0.000	1.000	Y	NA
5742268	5742269	CLH_1430	CLH_1431			FALSE	0.322	40.000	0.000	1.000		NA
5742269	5742270	CLH_1431	CLH_1432			FALSE	0.005	481.000	0.000	NA		NA
5742270	5742271	CLH_1432	CLH_1433			FALSE	0.096	171.000	0.000	NA		NA
5742271	5742272	CLH_1433	CLH_1434			FALSE	0.011	291.000	0.000	1.000		NA
5742272	5742273	CLH_1434	CLH_1435			FALSE	0.535	-19.000	0.000	NA		NA
5742273	5742274	CLH_1435	CLH_1436			FALSE	0.018	261.000	0.000	NA		NA
5742274	5742275	CLH_1436	CLH_1437			FALSE	0.009	304.000	0.000	1.000		NA
5742277	5742278	CLH_1439	CLH_1440	rbsK		TRUE	0.986	6.000	0.020	1.000	Y	NA
5742278	5742279	CLH_1440	CLH_1441			TRUE	0.996	15.000	0.337	1.000	Y	NA
5742279	5742280	CLH_1441	CLH_1442			TRUE	0.997	17.000	0.504	1.000	Y	NA
5742280	5742281	CLH_1442	CLH_1443			TRUE	0.946	25.000	0.000	NA	Y	NA
5742281	5742282	CLH_1443	CLH_1444			FALSE	0.253	52.000	0.000	NA	N	NA
5742283	5742284	CLH_1445	CLH_1446		pcp	TRUE	0.930	0.000	0.029	NA		NA
5742284	5742285	CLH_1446	CLH_1447	pcp		FALSE	0.132	475.000	0.300	NA		NA
5742285	5742286	CLH_1447	CLH_1448			TRUE	0.992	19.000	0.939	NA		NA
5742287	5742288	CLH_1449	CLH_1450			TRUE	0.754	200.000	0.071	1.000	Y	NA
5742288	5742289	CLH_1450	CLH_1451			FALSE	0.213	267.000	0.000	1.000	Y	NA
5742289	5742290	CLH_1451	CLH_1452			TRUE	0.558	-7.000	0.000	1.000		NA
5742290	5742291	CLH_1452	CLH_1453			FALSE	0.016	259.000	0.000	1.000		NA
5742291	5742292	CLH_1453	CLH_1454			FALSE	0.167	137.000	0.000	NA		NA
5742292	5742293	CLH_1454	CLH_1455			FALSE	0.044	208.000	0.000	NA		NA
5742293	5742294	CLH_1455	CLH_1456			TRUE	0.954	99.000	1.000	NA		NA
5742294	5742295	CLH_1456	CLH_1457			FALSE	0.215	89.000	0.000	NA		NA
5742295	5742296	CLH_1457	CLH_1458			TRUE	0.679	12.000	0.000	NA		NA
5742296	5742297	CLH_1458	CLH_1459			FALSE	0.371	19.000	0.000	0.001		NA
5742297	5742298	CLH_1459	CLH_1460			FALSE	0.371	38.000	0.000	NA		NA
5742298	5742299	CLH_1460	CLH_1461			FALSE	0.223	72.000	0.000	NA		NA
5742301	5742302	CLH_1463	CLH_1464			TRUE	0.927	-10.000	0.046	NA		NA
5742302	5742303	CLH_1464	CLH_1465			TRUE	0.674	13.000	0.000	NA		NA
5742303	5742304	CLH_1465	CLH_1466			FALSE	0.364	39.000	0.000	NA		NA
5742305	5742306	CLH_1467	CLH_1468			TRUE	0.983	19.000	0.386	NA		NA
5742307	5742308	CLH_1469	CLH_1470			FALSE	0.014	284.000	0.000	NA		NA
5742310	5742311	CLH_1472	CLH_1473			FALSE	0.457	27.000	0.000	1.000		NA
5742311	5742312	CLH_1473	CLH_1474			FALSE	0.007	332.000	0.000	1.000		NA
5742312	5742313	CLH_1474	CLH_1475			FALSE	0.009	331.000	0.000	NA		NA
5742313	5742314	CLH_1475	CLH_1476			FALSE	0.053	199.000	0.000	NA		NA
5742315	5742316	CLH_1477	CLH_1478			FALSE	0.210	94.000	0.000	NA		NA
5742317	5742318	CLH_1479	CLH_1480			FALSE	0.230	69.000	0.000	NA		NA
5742318	5742319	CLH_1480	CLH_1481			FALSE	0.153	131.000	0.000	1.000		NA
5742319	5742320	CLH_1481	CLH_1482			FALSE	0.025	228.000	0.000	1.000		NA
5742320	5742321	CLH_1482	CLH_1483			FALSE	0.015	246.000	0.000	1.000	N	NA
5742324	5742325	CLH_1486	CLH_1487	alr		TRUE	0.913	122.000	0.500	1.000	N	NA
5742326	5742327	CLH_1488	CLH_1489			FALSE	0.171	134.000	0.000	NA		NA
5742327	5742328	CLH_1489	CLH_1490			TRUE	0.650	16.000	0.000	NA		NA
5742328	5742329	CLH_1490	CLH_1491			FALSE	0.152	143.000	0.000	NA		NA
5742331	5742332	CLH_1493	CLH_1494	udp		FALSE	0.534	186.000	0.000	1.000	Y	NA
5742332	5742333	CLH_1494	CLH_1495		deoB	FALSE	0.515	183.000	0.093	1.000	N	NA
5742333	5742334	CLH_1495	CLH_1496	deoB		FALSE	0.336	225.000	0.000	1.000	Y	NA
5742334	5742335	CLH_1496	CLH_1497			TRUE	0.984	13.000	0.018	0.002	Y	NA
5742335	5742336	CLH_1497	CLH_1498		deoD	FALSE	0.161	73.000	0.000	1.000	N	NA
5742336	5742337	CLH_1498	CLH_1499	deoD		FALSE	0.058	177.000	0.000	1.000	N	NA
5742337	5742338	CLH_1499	CLH_1500			FALSE	0.004	526.000	0.000	NA		NA
5742338	5742339	CLH_1500	CLH_1501			FALSE	0.007	369.000	0.000	NA		NA
5742341	5742342	CLH_1503	CLH_1504			FALSE	0.004	490.000	0.000	1.000		NA
5742342	5742343	CLH_1504	CLH_1505			FALSE	0.484	28.000	0.000	NA		NA
5742343	5742344	CLH_1505	CLH_1506			TRUE	0.993	7.000	0.750	NA		NA
5742344	5742345	CLH_1506	CLH_1507			TRUE	0.810	37.000	0.036	0.010		NA
5742345	5742346	CLH_1507	CLH_1508			FALSE	0.004	513.000	0.000	1.000		NA
5742346	5742347	CLH_1508	CLH_1509			FALSE	0.032	610.000	0.039	1.000	N	NA
5742347	5742348	CLH_1509	CLH_1510			FALSE	0.058	193.000	0.000	NA		NA
5742348	5742349	CLH_1510	CLH_1511			FALSE	0.201	115.000	0.000	NA		NA
5742349	5742350	CLH_1511	CLH_1512			FALSE	0.054	198.000	0.000	NA		NA
5742352	5742353	CLH_1514	CLH_1515			FALSE	0.341	-13.000	0.000	0.002		NA
5742353	5742354	CLH_1515	CLH_1516			FALSE	0.100	162.000	0.000	1.000		NA
5742354	5742355	CLH_1516	CLH_1517			FALSE	0.005	356.000	0.000	1.000	N	NA
5742355	5742356	CLH_1517	CLH_1518		gshAB	TRUE	0.933	-16.000	0.074	1.000	N	NA
5742356	5742357	CLH_1518	CLH_1519	gshAB		FALSE	0.011	268.000	0.000	1.000	N	NA
5742358	5742359	CLH_1520	CLH_1521			FALSE	0.050	202.000	0.000	NA		NA
5742360	5742361	CLH_1522	CLH_1523			FALSE	0.005	458.000	0.000	NA		NA
5742361	5742362	CLH_1523	CLH_1524			TRUE	0.917	-13.000	0.041	NA		NA
5742362	5742363	CLH_1524	CLH_1525			TRUE	0.978	-16.000	0.419	1.000	N	NA
5742363	5742364	CLH_1525	CLH_1526			TRUE	0.925	-19.000	0.058	NA		NA
5742366	5742367	CLH_1528	CLH_1529		rluB	FALSE	0.008	357.000	0.000	NA		NA
5742367	5742368	CLH_1529	CLH_1530	rluB		FALSE	0.315	175.000	0.013	1.000	N	NA
5742368	5742369	CLH_1530	CLH_1531			FALSE	0.441	141.000	0.009	1.000	N	NA
5742369	5742370	CLH_1531	CLH_1532			TRUE	0.871	19.000	0.006	NA		NA
5742370	5742371	CLH_1532	CLH_1533			FALSE	0.012	297.000	0.000	NA		NA
5742371	5742372	CLH_1533	CLH_1534			FALSE	0.022	235.000	0.000	1.000		NA
5742372	5742373	CLH_1534	CLH_1535			FALSE	0.221	73.000	0.000	NA		NA
5742373	5742374	CLH_1535	CLH_1536			FALSE	0.016	270.000	0.000	NA		NA
5742374	5742375	CLH_1536	CLH_1537			FALSE	0.017	266.000	0.000	NA		NA
5742375	5742376	CLH_1537	CLH_1538		topB	FALSE	0.009	331.000	0.000	NA		NA
5742376	5742377	CLH_1538	CLH_1539	topB		FALSE	0.006	415.000	0.000	NA		NA
5742377	5742378	CLH_1539	CLH_1540			FALSE	0.125	156.000	0.000	NA		NA
5742378	5742379	CLH_1540	CLH_1541			FALSE	0.023	243.000	0.000	NA		NA
5742379	5742380	CLH_1541	CLH_1542		mutT	FALSE	0.200	117.000	0.000	NA		NA
5742380	5742381	CLH_1542	CLH_1543	mutT		FALSE	0.006	361.000	0.000	NA	N	NA
5742381	5742382	CLH_1543	CLH_1544			TRUE	0.986	67.000	0.733	NA	Y	NA
5742382	5742383	CLH_1544	CLH_1545			TRUE	0.995	27.000	0.711	0.026	Y	NA
5742383	5742384	CLH_1545	CLH_1546			TRUE	0.970	14.000	0.000	NA	Y	NA
5742384	5742385	CLH_1546	CLH_1547			FALSE	0.197	69.000	0.000	NA	N	NA
5742385	5742386	CLH_1547	CLH_1548			TRUE	0.668	14.000	0.000	NA		NA
5742386	5742387	CLH_1548	CLH_1549			TRUE	0.659	15.000	0.000	NA		NA
5742387	5742388	CLH_1549	CLH_1550		manA	TRUE	0.562	178.000	0.000	0.017	Y	NA
5742388	5742389	CLH_1550	CLH_1551	manA		TRUE	0.645	11.000	0.000	1.000		NA
5742389	5742390	CLH_1551	CLH_1552			FALSE	0.177	105.000	0.000	1.000		NA
5742390	5742391	CLH_1552	CLH_1553			FALSE	0.011	306.000	0.000	NA		NA
5742391	5742392	CLH_1553	CLH_1554			TRUE	0.663	2.000	0.000	NA		NA
5742392	5742393	CLH_1554	CLH_1555			FALSE	0.006	417.000	0.000	NA		NA
5742393	5742394	CLH_1555	CLH_1556			FALSE	0.009	328.000	0.000	NA		NA
5742394	5742395	CLH_1556	CLH_1557			TRUE	0.663	2.000	0.000	NA		NA
5742395	5742396	CLH_1557	CLH_1558			FALSE	0.004	898.000	0.000	NA		NA
11427499	5742388		CLH_1550		manA	FALSE	NA	4535.000	0.000	NA		NA
11569862	5742388		CLH_1550		manA	FALSE	NA	4535.000	0.000	NA		NA
11712254	5742388		CLH_1550		manA	FALSE	NA	4535.000	0.000	NA		NA
11427500	5742388		CLH_1550		manA	FALSE	NA	4565.000	0.000	NA		NA
11569863	5742388		CLH_1550		manA	FALSE	NA	4565.000	0.000	NA		NA
11712255	5742388		CLH_1550		manA	FALSE	NA	4565.000	0.000	NA		NA
11427501	5742388		CLH_1550		manA	FALSE	NA	4599.000	0.000	NA		NA
11569864	5742388		CLH_1550		manA	FALSE	NA	4599.000	0.000	NA		NA
11712256	5742388		CLH_1550		manA	FALSE	NA	4599.000	0.000	NA		NA
11427502	5742388		CLH_1550		manA	FALSE	NA	4629.000	0.000	NA		NA
11569865	5742388		CLH_1550		manA	FALSE	NA	4629.000	0.000	NA		NA
11712257	5742388		CLH_1550		manA	FALSE	NA	4629.000	0.000	NA		NA
11427503	5742388		CLH_1550		manA	FALSE	NA	4664.000	0.000	NA		NA
11569866	5742388		CLH_1550		manA	FALSE	NA	4664.000	0.000	NA		NA
11712258	5742388		CLH_1550		manA	FALSE	NA	4664.000	0.000	NA		NA
11427504	5742388		CLH_1550		manA	FALSE	NA	4694.000	0.000	NA		NA
11569867	5742388		CLH_1550		manA	FALSE	NA	4694.000	0.000	NA		NA
11712259	5742388		CLH_1550		manA	FALSE	NA	4694.000	0.000	NA		NA
11427505	5742388		CLH_1550		manA	FALSE	NA	4729.000	0.000	NA		NA
11569868	5742388		CLH_1550		manA	FALSE	NA	4729.000	0.000	NA		NA
11712260	5742388		CLH_1550		manA	FALSE	NA	4729.000	0.000	NA		NA
11427506	5742388		CLH_1550		manA	FALSE	NA	4759.000	0.000	NA		NA
11569869	5742388		CLH_1550		manA	FALSE	NA	4759.000	0.000	NA		NA
11712261	5742388		CLH_1550		manA	FALSE	NA	4759.000	0.000	NA		NA
11427507	5742388		CLH_1550		manA	FALSE	NA	4794.000	0.000	NA		NA
11569870	5742388		CLH_1550		manA	FALSE	NA	4794.000	0.000	NA		NA
11712262	5742388		CLH_1550		manA	FALSE	NA	4794.000	0.000	NA		NA
5742396	5742397	CLH_1558	CLH_1559			FALSE	0.015	279.000	0.000	NA		NA
5742397	5742398	CLH_1559	CLH_1560			TRUE	0.820	101.000	0.127	NA		NA
5742398	5742399	CLH_1560	CLH_1561			FALSE	0.158	141.000	0.000	NA		NA
5742399	5742400	CLH_1561	CLH_1562			FALSE	0.004	693.000	0.000	NA		NA
11427508	5742400		CLH_1562			FALSE	NA	305.000	0.000	NA		NA
11569871	5742400		CLH_1562			FALSE	NA	305.000	0.000	NA		NA
11712263	5742400		CLH_1562			FALSE	NA	305.000	0.000	NA		NA
11427509	5742400		CLH_1562			FALSE	NA	270.000	0.000	NA		NA
11569872	5742400		CLH_1562			FALSE	NA	270.000	0.000	NA		NA
11712264	5742400		CLH_1562			FALSE	NA	270.000	0.000	NA		NA
11427510	5742400		CLH_1562			FALSE	NA	239.000	0.000	NA		NA
11569873	5742400		CLH_1562			FALSE	NA	239.000	0.000	NA		NA
11712265	5742400		CLH_1562			FALSE	NA	239.000	0.000	NA		NA
11427511	5742400		CLH_1562			FALSE	NA	204.000	0.000	NA		NA
11569874	5742400		CLH_1562			FALSE	NA	204.000	0.000	NA		NA
11712266	5742400		CLH_1562			FALSE	NA	204.000	0.000	NA		NA
11427512	5742400		CLH_1562			FALSE	NA	173.000	0.000	NA		NA
11569875	5742400		CLH_1562			FALSE	NA	173.000	0.000	NA		NA
11712267	5742400		CLH_1562			FALSE	NA	173.000	0.000	NA		NA
11427513	5742400		CLH_1562			FALSE	NA	139.000	0.000	NA		NA
11569876	5742400		CLH_1562			FALSE	NA	139.000	0.000	NA		NA
11712268	5742400		CLH_1562			FALSE	NA	139.000	0.000	NA		NA
11427514	5742400		CLH_1562			FALSE	NA	108.000	0.000	NA		NA
11569877	5742400		CLH_1562			FALSE	NA	108.000	0.000	NA		NA
11712269	5742400		CLH_1562			FALSE	NA	108.000	0.000	NA		NA
5742401	5742402	CLH_1563	CLH_1564			FALSE	0.526	-10.000	0.000	NA	N	NA
5742402	5742403	CLH_1564	CLH_1565			FALSE	0.186	126.000	0.000	NA		NA
5742404	5742405	CLH_1566	CLH_1567			FALSE	0.035	221.000	0.000	NA		NA
5742405	5742406	CLH_1567	CLH_1568			FALSE	0.299	51.000	0.000	NA		NA
5742406	5742407	CLH_1568	CLH_1569			FALSE	0.203	100.000	0.000	NA		NA
5742407	5742408	CLH_1569	CLH_1570			TRUE	0.830	145.000	0.263	NA		NA
5742408	5742409	CLH_1570	CLH_1571			TRUE	0.842	105.000	0.168	NA		NA
5742409	5742410	CLH_1571	CLH_1572		mscL	FALSE	0.004	461.000	0.000	1.000		NA
5742410	5742411	CLH_1572	CLH_1573	mscL	hypB	FALSE	0.003	545.000	0.000	1.000	N	NA
5742411	5742412	CLH_1573	CLH_1574	hypB		TRUE	0.923	32.000	0.115	1.000	N	NA
5742412	5742413	CLH_1574	CLH_1575			TRUE	0.892	109.000	0.333	1.000		NA
5742413	5742414	CLH_1575	CLH_1576			FALSE	0.017	251.000	0.000	1.000		NA
5742414	5742415	CLH_1576	CLH_1577		cbiQ	TRUE	0.992	22.000	0.236	0.013	Y	NA
5742415	5742416	CLH_1577	CLH_1578	cbiQ		TRUE	0.997	1.000	0.489	1.000	Y	NA
5742417	5742418	CLH_1579	CLH_1580			FALSE	0.004	582.000	0.000	NA		NA
5742419	5742420	CLH_1581	CLH_1582			FALSE	0.370	20.000	0.000	0.002		NA
5742420	5742421	CLH_1582	CLH_1583			FALSE	0.049	194.000	0.000	1.000		NA
5742425	5742426	CLH_1587	CLH_1588			FALSE	0.179	129.000	0.000	NA		NA
5742426	5742427	CLH_1588	CLH_1589			FALSE	0.014	284.000	0.000	NA		NA
5742427	5742428	CLH_1589	CLH_1590			FALSE	0.004	533.000	0.000	NA		NA
5742428	5742429	CLH_1590	CLH_1591			FALSE	0.016	271.000	0.000	NA		NA
5742429	5742430	CLH_1591	CLH_1592			FALSE	0.024	240.000	0.000	NA		NA
5742432	5742433	CLH_1594	CLH_1595		hupS	FALSE	0.003	507.000	0.000	1.000	N	NA
5742433	5742434	CLH_1595	CLH_1596	hupS	hupL	TRUE	0.998	5.000	0.778	0.001	Y	NA
5742434	5742435	CLH_1596	CLH_1597	hupL		TRUE	0.989	-3.000	0.079	1.000	Y	NA
5742435	5742436	CLH_1597	CLH_1598			TRUE	0.588	116.000	0.018	1.000		NA
5742436	5742437	CLH_1598	CLH_1599		hypF	TRUE	0.873	15.000	0.005	0.013		NA
5742437	5742438	CLH_1599	CLH_1600	hypF	hypC	TRUE	0.993	18.000	0.181	NA	Y	NA
5742438	5742439	CLH_1600	CLH_1601	hypC	hypE	TRUE	0.810	165.000	0.024	NA	Y	NA
5742439	5742440	CLH_1601	CLH_1602	hypE		TRUE	0.963	139.000	0.353	1.000	Y	NA
5742440	5742441	CLH_1602	CLH_1603			FALSE	0.050	202.000	0.000	NA		NA
5742441	5742442	CLH_1603	CLH_1604			FALSE	0.013	288.000	0.000	NA		NA
5742442	5742443	CLH_1604	CLH_1605			FALSE	0.010	314.000	0.000	NA		NA
5742443	5742444	CLH_1605	CLH_1607			FALSE	0.005	469.000	0.000	NA		NA
5742444	5742445	CLH_1607	CLH_1608			FALSE	0.004	854.000	0.000	NA		NA
5742445	5742446	CLH_1608	CLH_1609			FALSE	0.014	282.000	0.000	NA		NA
5742446	5742447	CLH_1609	CLH_1610			FALSE	0.010	270.000	0.000	0.092		NA
5742447	5742448	CLH_1610	CLH_1611			FALSE	0.006	423.000	0.000	NA		NA
5742448	5742449	CLH_1611	CLH_1612			FALSE	0.045	207.000	0.000	NA		NA
5742449	5742450	CLH_1612	CLH_1613			FALSE	0.015	275.000	0.000	NA		NA
5742450	5742451	CLH_1613	CLH_1614			TRUE	0.994	15.000	1.000	NA		NA
5742451	5742452	CLH_1614	CLH_1615			TRUE	0.622	183.000	0.167	NA		NA
5742452	5742453	CLH_1615	CLH_1616			TRUE	0.992	3.000	0.750	1.000		NA
5742453	5742454	CLH_1616	CLH_1617			TRUE	0.969	29.000	0.364	1.000		NA
5742454	5742455	CLH_1617	CLH_1618			TRUE	0.997	0.000	0.636	1.000	Y	NA
5742461	5742462	CLH_1624	CLH_1625			FALSE	0.032	225.000	0.000	NA		NA
5742462	5742463	CLH_1625	CLH_1626			FALSE	0.009	327.000	0.000	NA		NA
5742463	5742464	CLH_1626	CLH_1627			FALSE	0.039	214.000	0.000	NA		NA
5742464	5742465	CLH_1627	CLH_1628			FALSE	0.113	163.000	0.000	NA		NA
5742467	5742468	CLH_1630	CLH_1631		hcp	FALSE	0.083	171.000	0.000	1.000		NA
5742468	5742469	CLH_1631	CLH_1632	hcp		FALSE	0.011	294.000	0.000	1.000		NA
5742469	5742470	CLH_1632	CLH_1633			FALSE	0.005	423.000	0.000	1.000		NA
5742470	5742471	CLH_1633	CLH_1634			FALSE	0.031	207.000	0.000	1.000	N	NA
5742471	5742472	CLH_1634	CLH_1635			FALSE	0.306	50.000	0.000	NA		NA
5742472	5742473	CLH_1635	CLH_1636			FALSE	0.004	890.000	0.000	NA		NA
5742473	5742474	CLH_1636	CLH_1637			FALSE	0.004	597.000	0.000	NA		NA
5742474	5742475	CLH_1637	CLH_1638		mch	TRUE	0.620	-3.000	0.000	NA		NA
5742475	5742476	CLH_1638	CLH_1639	mch		TRUE	0.663	63.000	0.023	1.000	N	NA
5742476	5742477	CLH_1639	CLH_1640			TRUE	0.956	27.000	0.200	1.000	N	NA
5742477	5742478	CLH_1640	CLH_1641			FALSE	0.216	81.000	0.000	NA		NA
5742481	5742482	CLH_1644	CLH_1645			TRUE	0.978	-6.000	0.308	0.020		NA
5742483	5742484	CLH_1646	CLH_1647			FALSE	0.094	173.000	0.000	NA		NA
5742486	5742487	CLH_1649	CLH_1650			TRUE	0.798	80.000	0.000	0.012	Y	NA
5742487	5742488	CLH_1650	CLH_1651			TRUE	0.905	35.000	0.000	0.012	Y	NA
5742488	5742489	CLH_1651	CLH_1652			FALSE	0.095	172.000	0.000	NA		NA
5742491	5742492	CLH_1654	CLH_1655			FALSE	0.006	382.000	0.000	1.000		NA
5742492	5742493	CLH_1655	CLH_1656			FALSE	0.004	387.000	0.000	1.000	N	NA
5742493	5742494	CLH_1656	CLH_1657			FALSE	0.076	164.000	0.000	1.000	N	NA
5742494	5742495	CLH_1657	CLH_1658			FALSE	0.040	206.000	0.000	1.000		NA
5742495	5742496	CLH_1658	CLH_1659			FALSE	0.011	294.000	0.000	1.000		NA
5742496	5742497	CLH_1659	CLH_1660			TRUE	0.943	194.000	1.000	0.014	Y	NA
5742497	5742498	CLH_1660	CLH_1661			FALSE	0.015	244.000	0.000	1.000	N	NA
5742498	5742499	CLH_1661	CLH_1662			TRUE	0.958	64.000	1.000	0.003	N	NA
5742499	5742500	CLH_1662	CLH_1663			FALSE	0.181	128.000	0.000	NA		NA
5742500	5742501	CLH_1663	CLH_1664			FALSE	0.010	320.000	0.000	NA		NA
5742506	5742507	CLH_1669	CLH_1670			TRUE	0.949	29.000	0.167	NA		NA
5742507	5742508	CLH_1670	CLH_1671			FALSE	0.011	307.000	0.000	NA		NA
5742509	5742510	CLH_1672	CLH_1673			FALSE	0.019	258.000	0.000	NA		NA
5742510	5742511	CLH_1673	CLH_1674			TRUE	0.904	14.000	0.008	NA		NA
5742511	5742512	CLH_1674	CLH_1675			TRUE	0.982	21.000	0.429	NA		NA
5742512	5742513	CLH_1675	CLH_1676			FALSE	0.147	272.000	0.061	1.000		NA
5742513	5742514	CLH_1676	CLH_1677			FALSE	0.143	138.000	0.000	1.000		NA
5742514	5742515	CLH_1677	CLH_1678			FALSE	0.126	146.000	0.000	1.000		NA
5742515	5742516	CLH_1678	CLH_1679			FALSE	0.006	379.000	0.000	1.000		NA
5742516	5742517	CLH_1679	CLH_1680		panB	TRUE	0.947	0.000	0.055	1.000		NA
5742517	5742518	CLH_1680	CLH_1681	panB	panC	TRUE	0.995	19.000	0.395	0.001	Y	NA
5742518	5742519	CLH_1681	CLH_1682	panC	panD	TRUE	0.957	146.000	0.342	1.000	Y	NA
5742519	5742520	CLH_1682	CLH_1683	panD		FALSE	0.004	401.000	0.000	1.000	N	NA
5742520	5742521	CLH_1683	CLH_1684		mutS	FALSE	0.122	331.000	0.000	1.000	Y	NA
5742521	5742522	CLH_1684	CLH_1685	mutS		FALSE	0.521	25.000	0.000	NA		NA
5742522	5742523	CLH_1685	CLH_1686		treP	FALSE	0.012	294.000	0.000	NA		NA
5742523	5742524	CLH_1686	CLH_1687	treP	treC	TRUE	0.993	35.000	0.650	1.000	Y	NA
5742524	5742525	CLH_1687	CLH_1688	treC	treR	TRUE	0.951	37.000	0.336	1.000	N	NA
5742525	5742526	CLH_1688	CLH_1689	treR		FALSE	0.016	240.000	0.000	1.000	N	NA
5742526	5742527	CLH_1689	CLH_1690		miaA	TRUE	0.967	4.000	0.097	1.000	N	NA
5742527	5742528	CLH_1690	CLH_1691	miaA	hfq	TRUE	0.908	50.000	0.192	1.000		NA
5742528	5742529	CLH_1691	CLH_1692	hfq		TRUE	0.757	76.000	0.064	1.000		NA
5742531	5742532	CLH_1694	CLH_1695			FALSE	0.227	70.000	0.000	NA		NA
5742532	5742533	CLH_1695	CLH_1696			FALSE	0.073	183.000	0.000	NA		NA
5742536	5742537	CLH_1699	CLH_1700	miaB		FALSE	0.022	237.000	0.000	1.000		NA
5742537	5742538	CLH_1700	CLH_1701			FALSE	0.004	510.000	0.000	1.000		NA
5742538	5742539	CLH_1701	CLH_1702			FALSE	0.267	58.000	0.000	NA		NA
5742539	5742540	CLH_1702	CLH_1703			TRUE	0.674	13.000	0.000	NA		NA
5742540	5742541	CLH_1703	CLH_1704			FALSE	0.221	73.000	0.000	NA		NA
5742541	5742542	CLH_1704	CLH_1705			FALSE	0.322	47.000	0.000	NA		NA
5742542	5742543	CLH_1705	CLH_1706			FALSE	0.005	473.000	0.000	NA		NA
5742543	5742544	CLH_1706	CLH_1707			TRUE	0.674	13.000	0.000	NA		NA
5742544	5742545	CLH_1707	CLH_1708			TRUE	0.650	16.000	0.000	NA		NA
5742545	5742546	CLH_1708	CLH_1709			TRUE	0.640	0.000	0.000	NA		NA
5742546	5742547	CLH_1709	CLH_1710			TRUE	0.975	0.000	0.182	NA		NA
5742547	5742548	CLH_1710	CLH_1711			TRUE	0.597	-7.000	0.000	NA		NA
5742548	5742549	CLH_1711	CLH_1712			TRUE	0.980	3.000	0.200	NA		NA
5742549	5742550	CLH_1712	CLH_1713			TRUE	0.680	5.000	0.000	NA		NA
5742550	5742551	CLH_1713	CLH_1714			TRUE	0.640	0.000	0.000	NA		NA
5742551	5742552	CLH_1714	CLH_1715			TRUE	0.984	16.000	0.333	NA		NA
5742552	5742553	CLH_1715	CLH_1716			TRUE	0.597	-7.000	0.000	NA		NA
5742553	5742554	CLH_1716	CLH_1717			FALSE	0.103	166.000	0.000	NA		NA
5742554	5742555	CLH_1717	CLH_1718			FALSE	0.227	70.000	0.000	NA		NA
5742555	5742556	CLH_1718	CLH_1719			TRUE	0.640	0.000	0.000	NA		NA
5742556	5742557	CLH_1719	CLH_1720			TRUE	0.674	13.000	0.000	NA		NA
5742557	5742558	CLH_1720	CLH_1721			TRUE	0.682	10.000	0.000	NA		NA
5742558	5742559	CLH_1721	CLH_1722			TRUE	0.640	0.000	0.000	NA		NA
5742559	5742560	CLH_1722	CLH_1723			TRUE	0.575	-10.000	0.000	NA		NA
5742560	5742561	CLH_1723	CLH_1724			FALSE	0.448	31.000	0.000	NA		NA
5742561	5742562	CLH_1724	CLH_1725			TRUE	0.650	16.000	0.000	NA		NA
5742562	5742563	CLH_1725	CLH_1726			TRUE	0.602	0.000	0.000	1.000		NA
5742563	5742564	CLH_1726	CLH_1727			FALSE	0.191	80.000	0.000	1.000		NA
5742564	5742565	CLH_1727	CLH_1728			TRUE	0.681	11.000	0.000	NA		NA
5742565	5742566	CLH_1728	CLH_1729			TRUE	0.650	16.000	0.000	NA		NA
5742566	5742567	CLH_1729	CLH_1730			FALSE	0.050	202.000	0.000	NA		NA
5742567	5742568	CLH_1730	CLH_1731			FALSE	0.529	-22.000	0.000	NA		NA
5742568	5742569	CLH_1731	CLH_1732			FALSE	0.017	267.000	0.000	NA		NA
5742569	5742570	CLH_1732	CLH_1733			FALSE	0.069	185.000	0.000	NA		NA
5742570	5742571	CLH_1733	CLH_1734			TRUE	0.620	-3.000	0.000	NA		NA
5742571	5742572	CLH_1734	CLH_1735			TRUE	0.815	55.000	0.062	NA		NA
5742572	5742573	CLH_1735	CLH_1736			FALSE	0.181	128.000	0.000	NA		NA
5742573	5742574	CLH_1736	CLH_1737			FALSE	0.227	70.000	0.000	NA		NA
5742574	5742575	CLH_1737	CLH_1738			FALSE	0.024	240.000	0.000	NA		NA
5742575	5742576	CLH_1738	CLH_1739			FALSE	0.033	224.000	0.000	NA		NA
5742576	5742577	CLH_1739	CLH_1740			FALSE	0.137	151.000	0.000	NA		NA
5742577	5742578	CLH_1740	CLH_1741			FALSE	0.017	269.000	0.000	NA		NA
5742578	5742579	CLH_1741	CLH_1742			FALSE	0.010	321.000	0.000	NA		NA
5742579	5742580	CLH_1742	CLH_1743			TRUE	0.993	13.000	0.828	NA		NA
5742582	5742583	CLH_1746	CLH_1747			TRUE	0.587	20.000	0.000	NA		NA
5742583	5742584	CLH_1747	CLH_1748			FALSE	0.198	119.000	0.000	NA		NA
5742586	5742587	CLH_1750	CLH_1751			TRUE	0.620	-3.000	0.000	NA		NA
5742587	5742588	CLH_1751	CLH_1752			TRUE	0.663	2.000	0.000	NA		NA
5742588	5742589	CLH_1752	CLH_1753			FALSE	0.201	113.000	0.000	NA		NA
5742589	5742590	CLH_1753	CLH_1754			TRUE	0.958	-15.000	0.154	1.000	N	NA
5742590	5742591	CLH_1754	CLH_1755			FALSE	0.039	213.000	0.000	NA		NA
5742591	5742592	CLH_1755	CLH_1756			FALSE	0.470	29.000	0.000	NA		NA
5742592	5742593	CLH_1756	CLH_1757			FALSE	0.194	122.000	0.000	NA		NA
5742594	5742595	CLH_1758	CLH_1759			FALSE	0.183	127.000	0.000	NA		NA
5742595	5742596	CLH_1759	CLH_1760			FALSE	0.201	114.000	0.000	NA		NA
5742598	5742599	CLH_1762	CLH_1763			FALSE	0.194	51.000	0.000	0.043		NA
5742600	5742601	CLH_1764	CLH_1765			FALSE	0.006	414.000	0.000	NA		NA
5742601	5742602	CLH_1765	CLH_1766			FALSE	0.484	28.000	0.000	NA		NA
5742602	5742603	CLH_1766	CLH_1767			FALSE	0.119	151.000	0.000	1.000		NA
5742603	5742604	CLH_1767	CLH_1768		cmk	TRUE	0.886	29.000	0.047	1.000	N	NA
5742604	5742605	CLH_1768	CLH_1769	cmk		TRUE	0.678	98.000	0.039	1.000		NA
5742605	5742606	CLH_1769	CLH_1770			FALSE	0.152	143.000	0.000	NA		NA
5742606	5742607	CLH_1770	CLH_1771			FALSE	0.258	60.000	0.000	NA		NA
5742607	5742608	CLH_1771	CLH_1772		cytX	FALSE	0.105	165.000	0.000	NA		NA
5742608	5742609	CLH_1772	CLH_1773	cytX		FALSE	0.008	343.000	0.000	NA		NA
5742609	5742610	CLH_1773	CLH_1774			FALSE	0.557	22.000	0.000	NA		NA
5742610	5742611	CLH_1774	CLH_1775			FALSE	0.147	145.000	0.000	NA		NA
5742611	5742612	CLH_1775	CLH_1776		adh	FALSE	0.387	36.000	0.000	NA		NA
5742612	5742613	CLH_1776	CLH_1778	adh		FALSE	0.006	397.000	0.000	NA		NA
5742613	5742614	CLH_1778	CLH_1779			FALSE	0.004	457.000	0.000	1.000		NA
5742614	5742615	CLH_1779	CLH_1780			FALSE	0.008	322.000	0.000	1.000		NA
5742615	5742616	CLH_1780	CLH_1781			FALSE	0.023	242.000	0.000	NA		NA
5742616	5742617	CLH_1781	CLH_1782			FALSE	0.215	87.000	0.000	NA		NA
5742621	5742622	CLH_1786	CLH_1787			FALSE	0.039	213.000	0.000	NA		NA
5742622	5742623	CLH_1787	CLH_1788			FALSE	0.026	236.000	0.000	NA		NA
5742623	5742624	CLH_1788	CLH_1789			TRUE	0.985	4.000	0.300	NA		NA
5742624	5742625	CLH_1789	CLH_1790			TRUE	0.984	6.000	0.300	1.000	N	NA
5742625	5742626	CLH_1790	CLH_1791			FALSE	0.055	197.000	0.000	NA		NA
5742626	5742627	CLH_1791	CLH_1792			FALSE	0.036	217.000	0.000	NA		NA
5742628	5742629	CLH_1793	CLH_1794			TRUE	0.928	75.000	0.050	1.000	Y	NA
5742629	5742630	CLH_1794	CLH_1795			FALSE	0.003	526.000	0.000	1.000	N	NA
5742631	5742632	CLH_1796	CLH_1797			TRUE	0.812	103.000	0.118	NA		NA
5742632	5742633	CLH_1797	CLH_1798			TRUE	0.998	2.000	0.765	1.000	Y	NA
5742633	5742634	CLH_1798	CLH_1799			TRUE	0.840	96.000	0.154	NA		NA
5742634	5742635	CLH_1799	CLH_1800			TRUE	0.993	6.000	0.833	NA		NA
5742635	5742636	CLH_1800	CLH_1801			TRUE	0.992	16.000	0.833	NA		NA
5742636	5742637	CLH_1801	CLH_1802			FALSE	0.014	282.000	0.000	NA		NA
5742637	5742638	CLH_1802	CLH_1803			FALSE	0.021	250.000	0.000	NA		NA
5742638	5742639	CLH_1803	CLH_1804			FALSE	0.004	637.000	0.000	NA		NA
5742639	5742640	CLH_1804	CLH_1805		trpB	FALSE	0.039	213.000	0.000	NA		NA
5742640	5742641	CLH_1805	CLH_1806	trpB	lexA	FALSE	0.190	81.000	0.000	1.000		NA
5742641	5742642	CLH_1806	CLH_1807	lexA	phnA	FALSE	0.020	241.000	0.000	1.000		NA
5742642	5742643	CLH_1807	CLH_1808	phnA		FALSE	0.007	306.000	0.000	1.000	N	NA
5742645	5742646	CLH_1810	CLH_1811			TRUE	0.723	85.000	0.047	NA		NA
5742646	5742647	CLH_1811	CLH_1812			FALSE	0.007	366.000	0.000	NA		NA
5742647	5742648	CLH_1812	CLH_1813			FALSE	0.005	440.000	0.000	NA		NA
5742648	5742649	CLH_1813	CLH_1814			FALSE	0.005	352.000	0.000	1.000	N	NA
5742649	5742650	CLH_1814	CLH_1815			TRUE	0.927	180.000	0.429	1.000	Y	NA
5742650	5742651	CLH_1815	CLH_1816			TRUE	0.983	71.000	0.667	0.054	Y	NA
5742651	5742652	CLH_1816	CLH_1817			FALSE	0.005	395.000	0.000	1.000		NA
5742652	5742653	CLH_1817	CLH_1818			FALSE	0.005	424.000	0.000	1.000		NA
5742653	5742654	CLH_1818	CLH_1819			FALSE	0.051	192.000	0.000	1.000		NA
5742657	5742658	CLH_1822	CLH_1823			TRUE	0.766	67.000	0.058	NA		NA
5742660	5742661	CLH_1825	CLH_1826			TRUE	0.899	77.000	0.021	0.024	Y	NA
5742661	5742662	CLH_1826	CLH_1827			TRUE	0.978	22.000	0.031	0.024	Y	NA
5742662	5742663	CLH_1827	CLH_1828			TRUE	0.966	16.000	0.000	1.000	Y	NA
5742663	5742664	CLH_1828	CLH_1829			TRUE	0.963	1.000	0.000	0.001	Y	NA
5742664	5742665	CLH_1829	CLH_1830			FALSE	0.050	202.000	0.000	NA		NA
5742666	5742667	CLH_1831	CLH_1832			FALSE	0.119	160.000	0.000	NA		NA
5742667	5742668	CLH_1832	CLH_1833			FALSE	0.017	267.000	0.000	NA		NA
5742670	5742671	CLH_1835	CLH_1836			FALSE	0.016	271.000	0.000	NA		NA
5742671	5742672	CLH_1836	CLH_1837			FALSE	0.003	823.000	0.000	NA	N	NA
5742672	5742673	CLH_1837	CLH_1838			TRUE	0.991	-16.000	0.200	1.000	Y	NA
5742673	5742674	CLH_1838	CLH_1839			FALSE	0.006	386.000	0.000	NA		NA
5742674	5742675	CLH_1839	CLH_1840			FALSE	0.214	90.000	0.000	NA		NA
5742679	5742680	CLH_1844	CLH_1845			TRUE	0.987	25.000	0.105	NA	Y	NA
5742680	5742681	CLH_1845	CLH_1846			TRUE	0.963	18.000	0.000	1.000	Y	NA
5742681	5742682	CLH_1846	CLH_1847			TRUE	0.961	19.000	0.000	NA	Y	NA
5742682	5742683	CLH_1847	CLH_1848			TRUE	0.986	10.000	0.333	NA		NA
5742683	5742684	CLH_1848	CLH_1849			TRUE	0.973	11.000	0.120	1.000		NA
5742684	5742685	CLH_1849	CLH_1850			TRUE	0.979	3.000	0.200	NA	N	NA
5742685	5742686	CLH_1850	CLH_1851			TRUE	0.943	26.000	0.000	NA	Y	NA
5742686	5742687	CLH_1851	CLH_1852			FALSE	0.202	105.000	0.000	NA		NA
5742687	5742688	CLH_1852	CLH_1853			TRUE	0.650	16.000	0.000	NA		NA
5742688	5742689	CLH_1853	CLH_1854			FALSE	0.208	64.000	0.000	NA	N	NA
5742689	5742690	CLH_1854	CLH_1855			FALSE	0.005	352.000	0.000	1.000	N	NA
5742690	5742691	CLH_1855	CLH_1856			FALSE	0.004	544.000	0.000	NA		NA
5742693	5742694	CLH_1858	CLH_1859			FALSE	0.005	432.000	0.000	NA		NA
5742696	5742697	CLH_1861	CLH_1862			FALSE	0.010	294.000	0.000	NA	N	NA
5742697	5742698	CLH_1862	CLH_1863			FALSE	0.299	51.000	0.000	NA		NA
5742698	5742699	CLH_1863	CLH_1864		xth	FALSE	0.436	32.000	0.000	NA		NA
5742699	5742700	CLH_1864	CLH_1865	xth		FALSE	0.012	297.000	0.000	NA		NA
5742700	5742701	CLH_1865	CLH_1866			FALSE	0.005	425.000	0.000	NA		NA
5742701	5742702	CLH_1866	CLH_1867			FALSE	0.017	238.000	0.000	1.000	N	NA
5742702	5742703	CLH_1867	CLH_1868			FALSE	0.018	262.000	0.000	NA		NA
5742703	5742704	CLH_1868	CLH_1869			FALSE	0.005	497.000	0.000	NA		NA
5742704	5742705	CLH_1869	CLH_1870			FALSE	0.341	36.000	0.000	NA	N	NA
5742705	5742706	CLH_1870	CLH_1871			TRUE	0.823	152.000	0.286	NA		NA
5742706	5742707	CLH_1871	CLH_1872			TRUE	0.988	7.000	0.400	NA		NA
5742707	5742708	CLH_1872	CLH_1873			FALSE	0.010	281.000	0.000	1.000	N	NA
5742708	5742709	CLH_1873	CLH_1874			TRUE	0.932	29.000	0.000	1.000	Y	NA
5742709	5742710	CLH_1874	CLH_1875			TRUE	0.971	11.000	0.000	1.000	Y	NA
5742710	5742711	CLH_1875	CLH_1876			FALSE	0.169	290.000	0.000	1.000	Y	NA
5742711	5742712	CLH_1876	CLH_1877			FALSE	0.146	102.000	0.000	1.000	N	NA
5742712	5742713	CLH_1877	CLH_1878			FALSE	0.004	419.000	0.000	1.000	N	NA
5742713	5742714	CLH_1878	CLH_1879			FALSE	0.023	241.000	0.000	NA		NA
5742714	5742715	CLH_1879	CLH_1880			TRUE	0.990	15.000	0.569	NA		NA
5742715	5742716	CLH_1880	CLH_1881			FALSE	0.099	169.000	0.000	NA		NA
5742716	5742717	CLH_1881	CLH_1882			TRUE	0.970	22.000	0.230	NA		NA
5742717	5742718	CLH_1882	CLH_1883			TRUE	0.979	12.000	0.180	NA		NA
5742718	5742719	CLH_1883	CLH_1884			TRUE	0.951	-16.000	0.111	NA		NA
5742719	5742720	CLH_1884	CLH_1885			TRUE	0.659	15.000	0.000	NA		NA
5742720	5742721	CLH_1885	CLH_1886			FALSE	0.007	360.000	0.000	NA		NA
5742721	5742722	CLH_1886	CLH_1887			FALSE	0.216	83.000	0.000	NA		NA
5742722	5742723	CLH_1887	CLH_1888			FALSE	0.172	133.000	0.000	NA		NA
5742723	5742724	CLH_1888	CLH_1889		galE	FALSE	0.004	588.000	0.000	NA		NA
5742724	5742725	CLH_1889	CLH_1890	galE		FALSE	0.125	147.000	0.000	1.000		NA
5742726	5742727	CLH_1891	CLH_1892			FALSE	0.008	347.000	0.000	NA		NA
5742728	5742729	CLH_1893	CLH_1894			FALSE	0.299	36.000	0.000	1.000	N	NA
5742729	5742730	CLH_1894	CLH_1895		tyrS	FALSE	0.163	71.000	0.000	1.000	N	NA
5742730	5742731	CLH_1895	CLH_1896	tyrS		FALSE	0.003	1099.000	0.000	1.000	N	NA
5742731	5742732	CLH_1896	CLH_1897		pyc	FALSE	0.004	405.000	0.000	1.000	N	NA
5742732	5742733	CLH_1897	CLH_1898	pyc		FALSE	0.003	793.000	0.000	1.000	N	NA
5742733	5742734	CLH_1898	CLH_1899		xpt	FALSE	0.005	366.000	0.000	1.000	N	NA
5742734	5742735	CLH_1899	CLH_1900	xpt		TRUE	0.988	3.000	0.032	1.000	Y	NA
5742735	5742736	CLH_1900	CLH_1901			FALSE	0.007	336.000	0.000	NA	N	NA
5742736	5742737	CLH_1901	CLH_1902			FALSE	0.004	521.000	0.000	NA	N	NA
5742737	5742738	CLH_1902	CLH_1903			FALSE	0.011	270.000	0.000	1.000	N	NA
5742738	5742739	CLH_1903	CLH_1904			TRUE	0.682	10.000	0.000	NA		NA
5742739	5742740	CLH_1904	CLH_1905			FALSE	0.008	349.000	0.000	NA		NA
5742740	5742741	CLH_1905	CLH_1906			FALSE	0.209	95.000	0.000	NA		NA
5742741	5742742	CLH_1906	CLH_1907			FALSE	0.312	49.000	0.000	NA		NA
5742742	5742743	CLH_1907	CLH_1908			FALSE	0.202	104.000	0.000	NA		NA
5742743	5742744	CLH_1908	CLH_1909			FALSE	0.005	460.000	0.000	NA		NA
5742745	5742746	CLH_1910	CLH_1911			FALSE	0.015	277.000	0.000	NA		NA
5742747	5742748	CLH_1912	CLH_1913			FALSE	0.201	114.000	0.000	NA		NA
5742748	5742749	CLH_1913	CLH_1914			FALSE	0.079	179.000	0.000	NA		NA
5742749	5742750	CLH_1914	CLH_1915			TRUE	0.991	9.000	0.069	1.000	Y	NA
5742750	5742751	CLH_1915	CLH_1916			FALSE	0.007	312.000	0.000	1.000	N	NA
5742751	5742752	CLH_1916	CLH_1917			TRUE	0.998	14.000	0.909	0.053	Y	NA
5742752	5742753	CLH_1917	CLH_1918			FALSE	0.004	534.000	0.000	NA		NA
5742753	5742754	CLH_1918	CLH_1919			FALSE	0.201	113.000	0.000	NA		NA
5742754	5742755	CLH_1919	CLH_1920			FALSE	0.526	-24.000	0.000	NA		NA
5742755	5742756	CLH_1920	CLH_1921			FALSE	0.019	255.000	0.000	NA		NA
5742756	5742757	CLH_1921	CLH_1922			TRUE	0.679	12.000	0.000	NA		NA
5742758	5742759	CLH_1923	CLH_1924	dndB	dndC	TRUE	0.984	0.000	0.344	NA		NA
5742759	5742760	CLH_1924	CLH_1925	dndC	dndD	TRUE	0.924	-10.000	0.042	NA		NA
5742760	5742761	CLH_1925	CLH_1926	dndD		TRUE	0.963	3.000	0.075	NA		NA
5742761	5742762	CLH_1926	CLH_1927			TRUE	0.952	-3.000	0.069	NA		NA
5742763	5742764	CLH_1928	CLH_1929			FALSE	0.316	48.000	0.000	NA		NA
5742764	5742765	CLH_1929	CLH_1930			FALSE	0.169	135.000	0.000	NA		NA
5742765	5742766	CLH_1930	CLH_1931			TRUE	0.989	-19.000	0.957	NA		NA
5742766	5742767	CLH_1931	CLH_1932			TRUE	0.993	0.000	0.917	NA		NA
5742767	5742768	CLH_1932	CLH_1933			FALSE	0.011	308.000	0.000	NA		NA
5742768	5742769	CLH_1933	CLH_1934			FALSE	0.018	248.000	0.000	1.000		NA
5742769	5742770	CLH_1934	CLH_1935		dhaT	FALSE	0.122	134.000	0.000	1.000	N	NA
5742770	5742771	CLH_1935	CLH_1936	dhaT		TRUE	0.630	135.000	0.037	NA		NA
5742771	5742772	CLH_1936	CLH_1937			TRUE	0.949	18.000	0.061	NA		NA
5742772	5742773	CLH_1937	CLH_1938			TRUE	0.925	22.000	0.049	NA		NA
5742773	5742774	CLH_1938	CLH_1939			TRUE	0.988	0.000	0.500	NA		NA
5742774	5742775	CLH_1939	CLH_1940			TRUE	0.983	28.000	0.714	NA		NA
5742775	5742776	CLH_1940	CLH_1941			TRUE	0.983	22.000	0.600	0.001		NA
5742776	5742777	CLH_1941	CLH_1942			TRUE	0.992	18.000	1.000	0.001		NA
5742777	5742778	CLH_1942	CLH_1943			FALSE	0.008	315.000	0.000	1.000		NA
5742778	5742779	CLH_1943	CLH_1944			TRUE	0.987	16.000	0.500	0.013		NA
5742781	5742782	CLH_1946	CLH_1947			FALSE	0.113	163.000	0.000	NA		NA
5742782	5742783	CLH_1947	CLH_1948			TRUE	0.982	6.000	0.222	NA		NA
5742785	5742786	CLH_1950	CLH_1951			TRUE	0.980	35.000	0.121	1.000	Y	NA
5742786	5742787	CLH_1951	CLH_1952			TRUE	0.994	1.000	0.217	0.085	Y	NA
5742787	5742788	CLH_1952	CLH_1953			TRUE	0.987	89.000	0.889	1.000	Y	NA
5742788	5742789	CLH_1953	CLH_1954			FALSE	0.086	176.000	0.000	NA		NA
5742789	5742790	CLH_1954	CLH_1955			FALSE	0.017	266.000	0.000	NA		NA
5742790	5742791	CLH_1955	CLH_1956			TRUE	0.993	19.000	0.176	1.000	Y	NA
5742791	5742792	CLH_1956	CLH_1957			TRUE	0.978	11.000	0.188	0.029		NA
5742792	5742793	CLH_1957	CLH_1958			TRUE	0.928	107.000	0.600	1.000		NA
5742793	5742794	CLH_1958	CLH_1959			TRUE	0.997	-3.000	0.600	0.002	Y	NA
5742794	5742795	CLH_1959	CLH_1960			FALSE	0.470	29.000	0.000	NA		NA
5742796	5742797	CLH_1961	CLH_1962			FALSE	0.122	159.000	0.000	NA		NA
5742798	5742799	CLH_1963	CLH_1964			FALSE	0.533	24.000	0.000	NA		NA
5742801	5742802	CLH_1966	CLH_1967			TRUE	0.643	12.000	0.000	1.000		NA
5742802	5742803	CLH_1967	CLH_1968			FALSE	0.103	166.000	0.000	NA		NA
5742803	5742804	CLH_1968	CLH_1969			FALSE	0.045	207.000	0.000	NA		NA
5742804	5742805	CLH_1969	CLH_1970			FALSE	0.285	54.000	0.000	NA		NA
5742805	5742806	CLH_1970	CLH_1971			FALSE	0.358	40.000	0.000	NA		NA
5742806	5742807	CLH_1971	CLH_1972			FALSE	0.217	80.000	0.000	NA		NA
5742807	5742808	CLH_1972	CLH_1973			FALSE	0.230	69.000	0.000	NA		NA
5742808	5742809	CLH_1973	CLH_1974			FALSE	0.218	78.000	0.000	NA		NA
5742809	5742810	CLH_1974	CLH_1975			FALSE	0.152	143.000	0.000	NA		NA
5742810	5742811	CLH_1975	CLH_1976			FALSE	0.048	204.000	0.000	NA		NA
5742811	5742812	CLH_1976	CLH_1977			TRUE	0.963	-3.000	0.000	NA	Y	NA
5742812	5742813	CLH_1977	CLH_1978			FALSE	0.014	284.000	0.000	NA		NA
5742813	5742814	CLH_1978	CLH_1979			FALSE	0.215	87.000	0.000	NA		NA
5742815	5742816	CLH_1980	CLH_1981			TRUE	0.967	-7.000	0.154	NA		NA
5742817	5742818	CLH_1982	CLH_1983			FALSE	0.322	47.000	0.000	NA		NA
5742818	5742819	CLH_1983	CLH_1984			FALSE	0.016	273.000	0.000	NA		NA
5742819	5742820	CLH_1984	CLH_1985			FALSE	0.239	66.000	0.000	NA		NA
5742820	5742821	CLH_1985	CLH_1986			FALSE	0.280	55.000	0.000	NA		NA
5742821	5742822	CLH_1986	CLH_1987			FALSE	0.005	484.000	0.000	NA		NA
5742824	5742825	CLH_1989	CLH_1990			FALSE	0.020	251.000	0.000	NA		NA
5742826	5742827	CLH_1991	CLH_1992			TRUE	0.957	5.000	0.056	NA		NA
5742827	5742828	CLH_1992	CLH_1993			FALSE	0.010	310.000	0.000	NA		NA
5742829	5742830	CLH_1994	CLH_1995			FALSE	0.216	84.000	0.000	NA		NA
5742830	5742831	CLH_1995	CLH_1996			TRUE	0.597	-7.000	0.000	NA		NA
5742831	5742832	CLH_1996	CLH_1997			FALSE	0.008	316.000	0.000	1.000		NA
5742832	5742833	CLH_1997	CLH_1998			FALSE	0.010	275.000	0.000	1.000	N	NA
5742833	5742834	CLH_1998	CLH_1999			FALSE	0.035	221.000	0.000	NA		NA
5742834	5742835	CLH_1999	CLH_2000			TRUE	0.992	5.000	0.667	NA		NA
5742837	5742838	CLH_2002	CLH_2003			TRUE	0.968	42.000	0.667	NA		NA
5742839	5742840	CLH_2004	CLH_2005			FALSE	0.557	-13.000	0.000	NA		NA
5742841	5742842	CLH_2006	CLH_2007			FALSE	0.155	90.000	0.000	1.000	N	NA
5742842	5742843	CLH_2007	CLH_2008			TRUE	0.997	-12.000	0.741	1.000	Y	NA
5742843	5742844	CLH_2008	CLH_2009			TRUE	0.971	28.000	0.352	NA		NA
5742844	5742845	CLH_2009	CLH_2010			TRUE	0.990	7.000	0.490	NA		NA
5742845	5742846	CLH_2010	CLH_2011			TRUE	0.977	4.000	0.163	NA		NA
5742846	5742847	CLH_2011	CLH_2012			FALSE	0.215	89.000	0.000	NA		NA
5742847	5742848	CLH_2012	CLH_2013			FALSE	0.216	82.000	0.000	NA		NA
5742848	5742849	CLH_2013	CLH_2014			FALSE	0.006	423.000	0.000	NA		NA
5742851	5742852	CLH_2016	CLH_2017			FALSE	0.005	453.000	0.000	NA		NA
5742853	5742854	CLH_2018	CLH_2019			FALSE	0.015	276.000	0.000	NA		NA
5742855	5742856	CLH_2020	CLH_2021			FALSE	0.058	193.000	0.000	NA		NA
5742856	5742857	CLH_2021	CLH_2022			FALSE	0.544	-16.000	0.000	NA		NA
5742857	5742858	CLH_2022	CLH_2023			FALSE	0.008	299.000	0.000	1.000	N	NA
5742859	5742860	CLH_2024	CLH_2025			FALSE	0.363	240.000	0.002	0.001	Y	NA
5742863	5742864	CLH_2028	CLH_2029	aroD		FALSE	0.306	50.000	0.000	NA		NA
5742864	5742865	CLH_2029	CLH_2030		pepT	FALSE	0.347	42.000	0.000	NA		NA
5742865	5742866	CLH_2030	CLH_2031	pepT		FALSE	0.113	238.000	0.013	NA	N	NA
5742869	5742870	CLH_2034	CLH_2035			FALSE	0.072	425.000	0.000	0.005	Y	NA
5742870	5742871	CLH_2035	CLH_2036			FALSE	0.030	217.000	0.000	NA	N	NA
5742873	5742874	CLH_2038	CLH_2039		sfsA	FALSE	0.436	32.000	0.000	NA		NA
5742875	5742876	CLH_2040	CLH_2041			FALSE	0.434	28.000	0.000	NA	N	NA
5742878	5742879	CLH_2043	CLH_2044			FALSE	0.050	202.000	0.000	NA		NA
5742879	5742880	CLH_2044	CLH_2045		pfkB	TRUE	0.997	22.000	0.816	1.000	Y	NA
5742880	5742881	CLH_2045	CLH_2046	pfkB		TRUE	0.997	-7.000	0.721	1.000	Y	NA
5742881	5742882	CLH_2046	CLH_2047			FALSE	0.003	686.000	0.000	1.000		NA
5742882	5742883	CLH_2047	CLH_2048			FALSE	0.152	132.000	0.000	1.000		NA
5742883	5742884	CLH_2048	CLH_2049			FALSE	0.030	218.000	0.000	NA	N	NA
5742884	5742885	CLH_2049	CLH_2050			FALSE	0.005	510.000	0.000	NA		NA
5742885	5742886	CLH_2050	CLH_2051			TRUE	0.966	43.000	0.733	0.002		NA
5742886	5742887	CLH_2051	CLH_2052			TRUE	0.996	-10.000	0.576	0.002	Y	NA
5742887	5742888	CLH_2052	CLH_2053			FALSE	0.007	373.000	0.000	NA		NA
5742889	5742890	CLH_2054	CLH_2055			FALSE	0.201	107.000	0.000	NA		NA
5742891	5742892	CLH_2056	CLH_2057			FALSE	0.005	454.000	0.000	NA		NA
5742892	5742893	CLH_2057	CLH_2058			FALSE	0.014	268.000	0.000	1.000		NA
5742893	5742894	CLH_2058	CLH_2059			FALSE	0.012	299.000	0.000	NA		NA
5742894	5742895	CLH_2059	CLH_2060			FALSE	0.109	239.000	0.010	NA		NA
5742895	5742896	CLH_2060	CLH_2061			TRUE	0.948	0.000	0.062	1.000	N	NA
5742896	5742897	CLH_2061	CLH_2062			FALSE	0.004	1090.000	0.000	NA		NA
5742897	5742898	CLH_2062	CLH_2063			TRUE	0.991	7.000	0.605	NA		NA
5742898	5742899	CLH_2063	CLH_2064			FALSE	0.007	364.000	0.000	NA		NA
5742900	5742901	CLH_2065	CLH_2066			FALSE	0.322	47.000	0.000	NA		NA
5742902	5742903	CLH_2067	CLH_2068			FALSE	0.016	272.000	0.000	NA		NA
5742903	5742904	CLH_2068	CLH_2069			FALSE	0.038	215.000	0.000	NA		NA
5742904	5742905	CLH_2069	CLH_2070			FALSE	0.039	207.000	0.000	1.000		NA
5742905	5742906	CLH_2070	CLH_2071		recQ	FALSE	0.052	191.000	0.000	1.000		NA
5742906	5742907	CLH_2071	CLH_2072	recQ		FALSE	0.004	399.000	0.000	1.000	N	NA
5742907	5742908	CLH_2072	CLH_2073			FALSE	0.273	57.000	0.000	NA		NA
5742908	5742909	CLH_2073	CLH_2074			FALSE	0.342	43.000	0.000	NA		NA
5742909	5742910	CLH_2074	CLH_2075			FALSE	0.036	218.000	0.000	NA		NA
5742910	5742911	CLH_2075	CLH_2076			FALSE	0.009	324.000	0.000	NA		NA
5742911	5742912	CLH_2076	CLH_2077		nifJ	FALSE	0.006	385.000	0.000	NA		NA
5742914	5742915	CLH_2079	CLH_2080			TRUE	0.961	51.000	0.078	1.000	Y	NA
5742915	5742916	CLH_2080	CLH_2081			TRUE	0.772	166.000	0.290	NA	N	NA
5742916	5742917	CLH_2081	CLH_2082			FALSE	0.004	604.000	0.000	NA		NA
5742917	5742918	CLH_2082	CLH_2083			FALSE	0.082	178.000	0.000	NA		NA
5742918	5742919	CLH_2083	CLH_2084			TRUE	0.896	55.000	0.182	NA		NA
5742919	5742920	CLH_2084	CLH_2085			TRUE	0.640	0.000	0.000	NA		NA
5742920	5742921	CLH_2085	CLH_2086			TRUE	0.681	11.000	0.000	NA		NA
5742921	5742922	CLH_2086	CLH_2087			TRUE	0.948	28.000	0.167	1.000	N	NA
5742922	5742923	CLH_2087	CLH_2088			FALSE	0.005	451.000	0.000	NA		NA
5742924	5742925	CLH_2089	CLH_2090			TRUE	0.978	-3.000	0.010	0.033	Y	NA
5742927	5742928	CLH_2092	CLH_2093		ytfJ	TRUE	0.575	-10.000	0.000	NA		NA
5742929	5742930	CLH_2094	CLH_2095	scpB		TRUE	0.984	-16.000	0.570	NA		NA
5742930	5742931	CLH_2095	CLH_2096			FALSE	0.105	230.000	0.004	NA		NA
5742931	5742932	CLH_2096	CLH_2097			FALSE	0.003	738.000	0.000	1.000		NA
5742932	5742933	CLH_2097	CLH_2098			FALSE	0.035	212.000	0.000	1.000		NA
5742933	5742934	CLH_2098	CLH_2099			FALSE	0.011	286.000	0.000	1.000		NA
5742934	5742935	CLH_2099	CLH_2100			TRUE	0.833	62.000	0.100	1.000		NA
5742935	5742936	CLH_2100	CLH_2101			FALSE	0.017	253.000	0.000	1.000		NA
5742936	5742937	CLH_2101	CLH_2102			TRUE	0.888	62.000	0.200	NA		NA
5742937	5742938	CLH_2102	CLH_2103			FALSE	0.203	100.000	0.000	NA		NA
5742938	5742939	CLH_2103	CLH_2104			FALSE	0.215	88.000	0.000	NA		NA
5742939	5742940	CLH_2104	CLH_2105			TRUE	0.668	14.000	0.000	NA		NA
5742940	5742941	CLH_2105	CLH_2106			TRUE	0.972	19.000	0.182	NA		NA
5742941	5742942	CLH_2106	CLH_2107			TRUE	0.979	-3.000	0.273	NA		NA
5742942	5742943	CLH_2107	CLH_2108			TRUE	0.650	16.000	0.000	NA		NA
5742943	5742944	CLH_2108	CLH_2109			FALSE	0.306	50.000	0.000	NA		NA
5742944	5742945	CLH_2109	CLH_2110			TRUE	0.988	3.000	0.400	NA		NA
5742945	5742946	CLH_2110	CLH_2111			TRUE	0.990	3.000	0.500	NA		NA
5742946	5742947	CLH_2111	CLH_2112			TRUE	0.986	3.000	0.333	NA		NA
5742947	5742948	CLH_2112	CLH_2113			TRUE	0.980	-7.000	0.333	NA		NA
5742948	5742949	CLH_2113	CLH_2114			TRUE	0.988	0.000	0.500	NA		NA
5742949	5742950	CLH_2114	CLH_2115			FALSE	0.523	-25.000	0.000	NA		NA
5742950	5742951	CLH_2115	CLH_2116			TRUE	0.659	15.000	0.000	NA		NA
5742951	5742952	CLH_2116	CLH_2117			TRUE	0.984	0.000	0.333	NA		NA
5742952	5742953	CLH_2117	CLH_2118			TRUE	0.986	2.000	0.375	NA		NA
5742953	5742954	CLH_2118	CLH_2119			TRUE	0.943	49.000	0.375	NA		NA
5742954	5742955	CLH_2119	CLH_2120			TRUE	0.980	-19.000	0.444	NA		NA
5742955	5742956	CLH_2120	CLH_2121			TRUE	0.861	103.000	0.222	1.000		NA
5742956	5742957	CLH_2121	CLH_2122			TRUE	0.564	-12.000	0.000	NA		NA
5742957	5742958	CLH_2122	CLH_2123			FALSE	0.130	154.000	0.000	NA		NA
5742958	5742959	CLH_2123	CLH_2124			TRUE	0.620	-3.000	0.000	NA		NA
5742959	5742960	CLH_2124	CLH_2125			FALSE	0.338	44.000	0.000	NA		NA
5742960	5742961	CLH_2125	CLH_2126			TRUE	0.610	-6.000	0.000	NA		NA
5742961	5742962	CLH_2126	CLH_2127			FALSE	0.004	925.000	0.000	NA		NA
5742962	5742963	CLH_2127	CLH_2128			FALSE	0.508	26.000	0.000	NA		NA
5742963	5742964	CLH_2128	CLH_2129			TRUE	0.587	20.000	0.000	NA		NA
5742964	5742965	CLH_2129	CLH_2130			FALSE	0.175	131.000	0.000	NA		NA
5742965	5742966	CLH_2130	CLH_2131			FALSE	0.521	25.000	0.000	NA		NA
5742966	5742967	CLH_2131	CLH_2132			TRUE	0.682	6.000	0.000	NA		NA
5742967	5742968	CLH_2132	CLH_2133			FALSE	0.251	62.000	0.000	NA		NA
5742968	5742969	CLH_2133	CLH_2134			FALSE	0.200	116.000	0.000	NA		NA
5742969	5742970	CLH_2134	CLH_2135		soj	TRUE	0.958	-15.000	0.154	1.000	N	NA
5742970	5742971	CLH_2135	CLH_2136	soj		FALSE	0.213	91.000	0.000	NA		NA
5742971	5742972	CLH_2136	CLH_2137			TRUE	0.564	-12.000	0.000	NA		NA
5742972	5742973	CLH_2137	CLH_2138			TRUE	0.638	13.000	0.000	1.000		NA
5742973	5742974	CLH_2138	CLH_2139			FALSE	0.518	-30.000	0.000	NA		NA
5742974	5742975	CLH_2139	CLH_2140			FALSE	0.285	54.000	0.000	NA		NA
5742977	5742978	CLH_2142	CLH_2143			FALSE	0.125	156.000	0.000	NA		NA
5742979	5742980	CLH_2144	CLH_2145			FALSE	0.219	76.000	0.000	NA		NA
5742981	5742982	CLH_2146	CLH_2147			TRUE	0.681	11.000	0.000	NA		NA
5742983	5742984	CLH_2148	CLH_2149			FALSE	0.202	105.000	0.000	NA		NA
5742985	5742986	CLH_2150	CLH_2151		spoIIM	TRUE	0.607	121.000	0.021	NA		NA
5742986	5742987	CLH_2151	CLH_2152	spoIIM		FALSE	0.052	201.000	0.000	NA		NA
5742987	5742988	CLH_2152	CLH_2153			FALSE	0.201	109.000	0.000	NA		NA
5742989	5742990	CLH_2154	CLH_2155			FALSE	0.007	377.000	0.000	NA		NA
5742991	5742992	CLH_2156	CLH_2157			FALSE	0.202	101.000	0.000	NA		NA
5742992	5742993	CLH_2157	CLH_2158			FALSE	0.065	188.000	0.000	NA		NA
5742995	5742996	CLH_2160	CLH_2161	spo0A	spoIVB	FALSE	0.191	387.000	0.393	1.000		NA
5742996	5742997	CLH_2161	CLH_2162	spoIVB	recN	FALSE	0.141	293.000	0.079	1.000		NA
5742997	5742998	CLH_2162	CLH_2163	recN	argR	TRUE	0.928	27.000	0.086	1.000	N	NA
5742998	5742999	CLH_2163	CLH_2164	argR		TRUE	0.963	-3.000	0.117	1.000	N	NA
5742999	5743000	CLH_2164	CLH_2165			TRUE	0.964	18.000	0.120	1.000	N	NA
5743000	5743001	CLH_2165	CLH_2166		dxs	TRUE	0.974	17.000	0.189	1.000	N	NA
5743001	5743002	CLH_2166	CLH_2167	dxs		TRUE	0.987	18.000	0.048	1.000	Y	NA
5743002	5743003	CLH_2167	CLH_2168			TRUE	0.925	-13.000	0.053	1.000		NA
5743003	5743004	CLH_2168	CLH_2169		xseA	TRUE	0.986	13.000	0.412	0.001		NA
5743004	5743005	CLH_2169	CLH_2170	xseA		TRUE	0.920	-10.000	0.045	1.000	N	NA
5743005	5743006	CLH_2170	CLH_2171		nusB	TRUE	0.902	23.000	0.039	1.000	N	NA
5743006	5743007	CLH_2171	CLH_2172	nusB		TRUE	0.863	119.000	0.223	NA		NA
5743007	5743008	CLH_2172	CLH_2173			TRUE	0.800	117.000	0.108	NA		NA
5743008	5743009	CLH_2173	CLH_2174		spoIIIAG	TRUE	0.956	41.000	0.407	NA		NA
5743009	5743010	CLH_2174	CLH_2175	spoIIIAG		TRUE	0.994	12.000	0.907	NA		NA
5743010	5743011	CLH_2175	CLH_2176		spoIIIAE	TRUE	0.994	4.000	0.918	NA		NA
5743011	5743012	CLH_2176	CLH_2177	spoIIIAE	spoIIIAD	TRUE	0.994	12.000	0.864	NA		NA
5743012	5743013	CLH_2177	CLH_2178	spoIIIAD	spoIIIAC	TRUE	0.994	9.000	0.895	NA		NA
5743013	5743014	CLH_2178	CLH_2179	spoIIIAC	spoIIIAB	TRUE	0.993	15.000	0.926	NA		NA
5743014	5743015	CLH_2179	CLH_2180	spoIIIAB	spoIIIAA	TRUE	0.986	-12.000	0.604	NA		NA
5743015	5743016	CLH_2180	CLH_2181	spoIIIAA		TRUE	0.668	164.000	0.112	NA		NA
5743016	5743017	CLH_2181	CLH_2182		efp	TRUE	0.697	87.000	0.037	NA		NA
5743017	5743018	CLH_2182	CLH_2183	efp		FALSE	0.198	191.000	0.002	NA		NA
5743018	5743019	CLH_2183	CLH_2184			TRUE	0.986	-13.000	0.667	NA		NA
5743019	5743020	CLH_2184	CLH_2185			TRUE	0.988	-49.000	1.000	NA		NA
5743020	5743021	CLH_2185	CLH_2186			TRUE	0.937	98.000	0.667	NA		NA
5743021	5743022	CLH_2186	CLH_2187			TRUE	0.991	-9.000	1.000	NA		NA
5743022	5743023	CLH_2187	CLH_2188			TRUE	0.867	182.000	1.000	NA		NA
5743023	5743024	CLH_2188	CLH_2189			FALSE	0.448	31.000	0.000	NA		NA
5743024	5743025	CLH_2189	CLH_2190			TRUE	0.620	-3.000	0.000	NA		NA
5743025	5743026	CLH_2190	CLH_2191			TRUE	0.990	-13.000	0.135	1.000	Y	NA
5743026	5743027	CLH_2191	CLH_2192			FALSE	0.028	230.000	0.000	NA		NA
5743027	5743028	CLH_2192	CLH_2193		dapF	TRUE	0.794	27.000	0.002	NA		NA
5743030	5743031	CLH_2195	CLH_2196			TRUE	0.744	34.000	0.008	1.000	N	NA
5743031	5743032	CLH_2196	CLH_2197			TRUE	0.897	27.000	0.048	1.000	N	NA
5743032	5743033	CLH_2197	CLH_2198			FALSE	0.052	277.000	0.002	NA	N	NA
5743033	5743034	CLH_2198	CLH_2199			TRUE	0.990	14.000	0.579	NA		NA
5743034	5743035	CLH_2199	CLH_2200			TRUE	0.971	3.000	0.118	1.000		NA
5743035	5743036	CLH_2200	CLH_2201			TRUE	0.983	9.000	0.246	NA		NA
5743036	5743037	CLH_2201	CLH_2202			TRUE	0.932	0.000	0.032	NA		NA
5743037	5743038	CLH_2202	CLH_2203			TRUE	0.599	103.000	0.017	NA		NA
5743038	5743039	CLH_2203	CLH_2204			TRUE	0.961	14.000	0.070	NA		NA
5743039	5743040	CLH_2204	CLH_2205			TRUE	0.942	21.000	0.070	NA		NA
5743040	5743041	CLH_2205	CLH_2206			TRUE	0.910	16.000	0.014	NA		NA
5743041	5743042	CLH_2206	CLH_2207		ftsW	FALSE	0.032	392.000	0.015	NA	N	NA
5743042	5743043	CLH_2207	CLH_2208	ftsW	mraY	FALSE	0.432	142.000	0.014	0.004	N	NA
5743043	5743044	CLH_2208	CLH_2209	mraY		TRUE	0.947	41.000	0.024	0.004	Y	NA
5743044	5743045	CLH_2209	CLH_2210		murE	TRUE	0.994	20.000	0.328	0.002	Y	NA
5743045	5743046	CLH_2210	CLH_2211	murE		TRUE	0.962	125.000	0.265	1.000	Y	NA
5743046	5743047	CLH_2211	CLH_2212			TRUE	0.690	154.000	0.096	NA		NA
5743047	5743048	CLH_2212	CLH_2213		mraW	TRUE	0.684	48.000	0.008	NA		NA
5743048	5743049	CLH_2213	CLH_2214	mraW	mraZ	TRUE	0.991	13.000	0.635	NA		NA
5743049	5743050	CLH_2214	CLH_2215	mraZ		FALSE	0.098	170.000	0.000	NA		NA
5743051	5743052	CLH_2216	CLH_2217			TRUE	0.981	1.000	0.250	NA		NA
5743053	5743054	CLH_2218	CLH_2219			FALSE	0.520	-28.000	0.000	NA		NA
5743054	5743055	CLH_2219	CLH_2220			FALSE	0.058	152.000	0.000	0.036	N	NA
5743057	5743058	CLH_2222	CLH_2223			TRUE	0.674	13.000	0.000	NA		NA
5743058	5743059	CLH_2223	CLH_2224			FALSE	0.013	287.000	0.000	NA		NA
5743059	5743060	CLH_2224	CLH_2225			TRUE	0.682	6.000	0.000	NA		NA
5743060	5743061	CLH_2225	CLH_2226		mviN	TRUE	0.679	12.000	0.000	NA		NA
5743061	5743062	CLH_2226	CLH_2227	mviN		TRUE	0.919	6.000	0.015	1.000		NA
5743062	5743063	CLH_2227	CLH_2228			FALSE	0.038	359.000	0.015	1.000		NA
5743063	5743064	CLH_2228	CLH_2229			TRUE	0.909	99.000	0.417	1.000		NA
5743064	5743065	CLH_2229	CLH_2230			FALSE	0.108	164.000	0.000	NA		NA
5743065	5743066	CLH_2230	CLH_2231			TRUE	0.627	128.000	0.031	NA		NA
5743066	5743067	CLH_2231	CLH_2232			TRUE	0.960	14.000	0.078	1.000	N	NA
5743067	5743068	CLH_2232	CLH_2233			FALSE	0.128	155.000	0.000	NA		NA
5743068	5743069	CLH_2233	CLH_2234			FALSE	0.010	313.000	0.000	NA		NA
5743071	5743072	CLH_2236	CLH_2237			FALSE	0.054	722.000	0.000	0.005	Y	NA
5743072	5743073	CLH_2237	CLH_2238			FALSE	0.007	353.000	0.000	1.000		NA
5743073	5743074	CLH_2238	CLH_2239			FALSE	0.006	364.000	0.000	1.000		NA
5743074	5743075	CLH_2239	CLH_2240			FALSE	0.171	108.000	0.000	NA	N	NA
5743075	5743076	CLH_2240	CLH_2241		pheT	FALSE	0.019	243.000	0.000	NA	N	NA
5743076	5743077	CLH_2241	CLH_2242	pheT	pheS	TRUE	0.977	120.000	0.574	0.001	Y	NA
5743077	5743078	CLH_2242	CLH_2243	pheS		FALSE	0.003	528.000	0.000	1.000	N	NA
5743078	5743079	CLH_2243	CLH_2244			FALSE	0.017	236.000	0.000	1.000	N	NA
5743079	5743080	CLH_2244	CLH_2245			TRUE	0.920	15.000	0.022	1.000	N	NA
5743080	5743081	CLH_2245	CLH_2246			TRUE	0.993	14.000	0.137	0.002	Y	NA
5743081	5743082	CLH_2246	CLH_2247		rplT	FALSE	0.399	142.000	0.004	1.000	N	NA
5743082	5743083	CLH_2247	CLH_2248	rplT	rpmI	TRUE	0.996	29.000	0.928	0.014	Y	NA
5743083	5743084	CLH_2248	CLH_2249	rpmI	infC	TRUE	0.996	22.000	0.652	1.000	Y	NA
5743084	5743085	CLH_2249	CLH_2250	infC		FALSE	0.351	157.000	0.002	NA		NA
5743087	5743088	CLH_2252	CLH_2253	hslO		TRUE	0.946	18.000	0.063	1.000	N	NA
5743088	5743089	CLH_2253	CLH_2254			FALSE	0.122	285.000	0.056	1.000		NA
5743090	5743091	CLH_2255	CLH_2256	asd	dapA	TRUE	0.985	17.000	0.029	1.000	Y	NA
5743091	5743092	CLH_2256	CLH_2257	dapA	dapB	TRUE	0.987	10.000	0.022	1.000	Y	NA
5743093	5743094	CLH_2258	CLH_2259			TRUE	0.846	192.000	0.179	1.000	Y	NA
5743094	5743095	CLH_2259	CLH_2260			TRUE	0.996	0.000	0.436	0.001	Y	NA
5743095	5743096	CLH_2260	CLH_2261			TRUE	0.996	13.000	0.300	1.000	Y	NA
5743096	5743097	CLH_2261	CLH_2262			TRUE	0.997	19.000	0.806	0.022	Y	NA
5743097	5743098	CLH_2262	CLH_2263		oppA	FALSE	0.059	545.000	0.000	0.022	Y	NA
5743098	5743099	CLH_2263	CLH_2264	oppA		FALSE	0.066	518.000	0.000	1.000	Y	NA
5743101	5743102	CLH_2266	CLH_2267			TRUE	0.757	99.000	0.079	1.000	N	NA
5743106	5743107	CLH_2271	CLH_2272			TRUE	0.838	47.000	0.059	NA		NA
5743107	5743108	CLH_2272	CLH_2273			FALSE	0.194	122.000	0.000	NA		NA
5743108	5743109	CLH_2273	CLH_2274		valS	FALSE	0.005	515.000	0.000	NA		NA
5743109	5743110	CLH_2274	CLH_2275	valS		FALSE	0.004	555.000	0.000	NA	N	NA
5743111	5743112	CLH_2276	CLH_2277			TRUE	0.974	10.000	0.125	NA		NA
5743113	5743114	CLH_2278	CLH_2279			FALSE	0.019	231.000	0.000	1.000	N	NA
5743114	5743115	CLH_2279	CLH_2280			FALSE	0.152	94.000	0.000	1.000	N	NA
5743115	5743116	CLH_2280	CLH_2281		uvdE	FALSE	0.007	306.000	0.000	1.000	N	NA
5743116	5743117	CLH_2281	CLH_2282	uvdE		FALSE	0.023	233.000	0.000	1.000		NA
5743117	5743118	CLH_2282	CLH_2283			FALSE	0.459	30.000	0.000	NA		NA
5743118	5743119	CLH_2283	CLH_2284			FALSE	0.135	152.000	0.000	NA		NA
5743121	5743122	CLH_2286	CLH_2287			FALSE	0.133	153.000	0.000	NA		NA
5743124	5743125	CLH_2289	CLH_2290			FALSE	0.299	51.000	0.000	NA		NA
5743125	5743126	CLH_2290	CLH_2291			FALSE	0.215	87.000	0.000	NA		NA
5743126	5743127	CLH_2291	CLH_2292			FALSE	0.020	253.000	0.000	NA		NA
5743127	5743128	CLH_2292	CLH_2293			FALSE	0.140	150.000	0.000	NA		NA
5743130	5743131	CLH_2295	CLH_2296			TRUE	0.911	13.000	0.012	1.000		NA
5743131	5743132	CLH_2296	CLH_2297			TRUE	0.572	100.000	0.015	1.000		NA
5743133	5743134	CLH_2298	CLH_2299			TRUE	0.998	0.000	0.750	1.000	Y	NA
5743135	5743136	CLH_2300	CLH_2301	fbp	gidA	FALSE	0.004	383.000	0.000	1.000	N	NA
5743136	5743137	CLH_2301	CLH_2302	gidA	trx	TRUE	0.978	18.000	0.250	1.000		NA
5743139	5743140	CLH_2304	CLH_2305			FALSE	0.228	34.000	0.000	0.090	N	NA
5743140	5743141	CLH_2305	CLH_2306			TRUE	0.993	-16.000	0.270	1.000	Y	NA
5743141	5743142	CLH_2306	CLH_2307			TRUE	0.996	-25.000	0.646	NA	Y	NA
5743142	5743143	CLH_2307	CLH_2308			FALSE	0.010	321.000	0.000	NA		NA
5743147	5743148	CLH_2312	CLH_2313			TRUE	0.847	24.000	0.009	NA		NA
5743150	5743151	CLH_2315	CLH_2316			FALSE	0.258	60.000	0.000	NA		NA
5743152	5743153	CLH_2317	CLH_2318			TRUE	0.717	79.000	0.043	NA		NA
5743153	5743154	CLH_2318	CLH_2319			FALSE	0.147	145.000	0.000	NA		NA
5743156	5743157	CLH_2321	CLH_2322		gltX	FALSE	0.111	155.000	0.000	1.000		NA
5743158	5743159	CLH_2323	CLH_2324			TRUE	0.953	15.000	0.058	1.000		NA
5743160	5743161	CLH_2325	CLH_2326		feoB	TRUE	0.996	15.000	0.308	1.000	Y	NA
5743162	5743163	CLH_2327	CLH_2328		argS	FALSE	0.014	282.000	0.000	NA		NA
5743165	5743166	CLH_2330	CLH_2331			FALSE	0.023	242.000	0.000	NA		NA
5743166	5743167	CLH_2331	CLH_2332			TRUE	0.989	19.000	0.667	NA		NA
5743169	5743170	CLH_2334	CLH_2335	asnA		FALSE	0.052	159.000	0.000	0.036	N	NA
5743171	5743172	CLH_2336	CLH_2337			FALSE	0.441	190.000	0.077	1.000	N	NA
5743173	5743174	CLH_2338	CLH_2339	pflA	pflB	TRUE	0.708	163.000	0.163	1.000	N	NA
5743176	5743177	CLH_2341	CLH_2342	pyrE	pyrD	TRUE	0.951	49.000	0.041	1.000	Y	NA
5743177	5743178	CLH_2342	CLH_2343	pyrD		TRUE	0.984	22.000	0.592	1.000	N	NA
5743178	5743179	CLH_2343	CLH_2344		pyrF	TRUE	0.965	14.000	0.112	0.003	N	NA
5743179	5743180	CLH_2344	CLH_2345	pyrF		TRUE	0.929	112.000	0.064	1.000	Y	NA
5743180	5743181	CLH_2345	CLH_2346			TRUE	0.977	25.000	0.032	NA	Y	NA
5743181	5743182	CLH_2346	CLH_2347		pyrB	TRUE	0.995	2.000	0.197	NA	Y	NA
5743182	5743183	CLH_2347	CLH_2348	pyrB	uppP	FALSE	0.003	563.000	0.000	1.000	N	NA
5743183	5743184	CLH_2348	CLH_2349	uppP		TRUE	0.912	67.000	0.333	NA		NA
5743184	5743185	CLH_2349	CLH_2350			FALSE	0.495	164.000	0.035	NA		NA
5743186	5743187	CLH_2351	CLH_2352			TRUE	0.990	19.000	0.796	1.000		NA
5743189	5743190	CLH_2354	CLH_2355			TRUE	0.712	60.000	0.029	1.000		NA
5743193	5743194	CLH_2358	CLH_2359			FALSE	0.200	117.000	0.000	NA		NA
5743194	5743195	CLH_2359	CLH_2360			FALSE	0.008	352.000	0.000	NA		NA
5743200	5743201	CLH_2365	CLH_2366			FALSE	0.008	337.000	0.000	NA		NA
5743202	5743203	CLH_2367	CLH_2368			FALSE	0.033	223.000	0.000	NA		NA
5743203	5743204	CLH_2368	CLH_2369			FALSE	0.276	56.000	0.000	NA		NA
5743204	5743205	CLH_2369	CLH_2370			FALSE	0.140	150.000	0.000	NA		NA
5743205	5743206	CLH_2370	CLH_2371			FALSE	0.037	209.000	0.000	1.000		NA
5743206	5743207	CLH_2371	CLH_2372			FALSE	0.031	226.000	0.000	NA		NA
5743207	5743208	CLH_2372	CLH_2373			FALSE	0.342	43.000	0.000	NA		NA
5743209	5743210	CLH_2374	CLH_2375			TRUE	0.587	20.000	0.000	NA		NA
5743213	5743214	CLH_2378	CLH_2379			FALSE	0.004	599.000	0.000	NA		NA
5743214	5743215	CLH_2379	CLH_2380			TRUE	0.990	2.000	0.600	NA		NA
5743215	5743216	CLH_2380	CLH_2381			TRUE	0.984	-3.000	0.400	NA		NA
5743217	5743218	CLH_2382	CLH_2383			TRUE	0.996	20.000	0.528	NA	Y	NA
5743218	5743219	CLH_2383	CLH_2384			TRUE	0.998	-7.000	0.876	1.000	Y	NA
5743219	5743220	CLH_2384	CLH_2385			FALSE	0.020	242.000	0.000	1.000		NA
5743220	5743221	CLH_2385	CLH_2386			TRUE	0.988	-16.000	0.869	1.000		NA
5743222	5743223	CLH_2387	CLH_2388			FALSE	0.469	150.000	0.018	1.000	N	NA
5743223	5743224	CLH_2388	CLH_2389			FALSE	0.203	100.000	0.000	NA		NA
5743224	5743225	CLH_2389	CLH_2390			FALSE	0.239	66.000	0.000	NA		NA
5743225	5743226	CLH_2390	CLH_2391			TRUE	0.965	2.000	0.000	0.010	Y	NA
5743226	5743227	CLH_2391	CLH_2392			FALSE	0.004	877.000	0.000	NA		NA
5743227	5743228	CLH_2392	CLH_2393			TRUE	0.992	12.000	0.667	NA		NA
5743228	5743229	CLH_2393	CLH_2394			FALSE	0.004	559.000	0.000	NA		NA
5743229	5743230	CLH_2394	CLH_2395			FALSE	0.352	41.000	0.000	NA		NA
5743230	5743231	CLH_2395	CLH_2396		coaE	FALSE	0.189	244.000	0.058	NA	N	NA
5743231	5743232	CLH_2396	CLH_2397	coaE	polA	TRUE	0.929	23.000	0.068	1.000	N	NA
5743234	5743235	CLH_2399	CLH_2400		dcd	FALSE	0.210	94.000	0.000	NA		NA
5743235	5743236	CLH_2400	CLH_2401	dcd		FALSE	0.009	293.000	0.000	1.000	N	NA
5743236	5743237	CLH_2401	CLH_2402			FALSE	0.481	137.000	0.008	NA		NA
5743237	5743238	CLH_2402	CLH_2403			TRUE	0.567	126.000	0.016	NA		NA
5743238	5743239	CLH_2403	CLH_2404			FALSE	0.008	301.000	0.000	1.000	N	NA
5743239	5743240	CLH_2404	CLH_2405			FALSE	0.008	358.000	0.000	NA		NA
5743240	5743241	CLH_2405	CLH_2406			FALSE	0.329	46.000	0.000	NA		NA
5743241	5743242	CLH_2406	CLH_2407			FALSE	0.004	713.000	0.000	NA		NA
5743242	5743243	CLH_2407	CLH_2408			FALSE	0.030	227.000	0.000	NA		NA
5743243	5743244	CLH_2408	CLH_2409			FALSE	0.201	112.000	0.000	NA		NA
5743245	5743246	CLH_2410	CLH_2411		arsA	TRUE	0.848	61.000	0.116	1.000		NA
5743247	5743248	CLH_2412	CLH_2413			FALSE	0.005	430.000	0.000	NA		NA
5743248	5743249	CLH_2413	CLH_2414			FALSE	0.007	359.000	0.000	NA		NA
5743249	5743250	CLH_2414	CLH_2415			FALSE	0.006	390.000	0.000	NA		NA
5743251	5743252	CLH_2416	CLH_2417			TRUE	0.850	252.000	1.000	0.022	Y	NA
5743252	5743253	CLH_2417	CLH_2418			TRUE	0.998	0.000	1.000	0.022	Y	NA
5743254	5743255	CLH_2419	CLH_2420			TRUE	0.627	18.000	0.000	NA		NA
5743255	5743256	CLH_2420	CLH_2421			FALSE	0.038	206.000	0.000	NA	N	NA
5743256	5743257	CLH_2421	CLH_2422			FALSE	0.006	348.000	0.000	1.000	N	NA
5743257	5743258	CLH_2422	CLH_2423			FALSE	0.011	309.000	0.000	NA		NA
5743260	5743261	CLH_2425	CLH_2426			FALSE	0.130	154.000	0.000	NA		NA
5743261	5743262	CLH_2426	CLH_2427			TRUE	0.982	0.000	0.294	NA		NA
5743264	5743265	CLH_2429	CLH_2430			FALSE	0.204	99.000	0.000	NA		NA
5743265	5743266	CLH_2430	CLH_2431			FALSE	0.448	31.000	0.000	NA		NA
5743266	5743267	CLH_2431	CLH_2432			FALSE	0.251	62.000	0.000	NA		NA
5743267	5743268	CLH_2432	CLH_2433			FALSE	0.152	143.000	0.000	NA		NA
5743268	5743269	CLH_2433	CLH_2434			TRUE	0.575	-10.000	0.000	NA		NA
5743269	5743270	CLH_2434	CLH_2435			FALSE	0.056	195.000	0.000	NA		NA
5743270	5743271	CLH_2435	CLH_2436			FALSE	0.167	137.000	0.000	NA		NA
5743273	5743274	CLH_2437	CLH_2439			FALSE	0.197	120.000	0.000	NA		NA
5743274	5743275	CLH_2439	CLH_2440			TRUE	0.979	-7.000	0.300	NA		NA
5743275	5743276	CLH_2440	CLH_2441			FALSE	0.005	350.000	0.000	1.000	N	NA
5743276	5743277	CLH_2441	CLH_2442			FALSE	0.037	209.000	0.000	1.000		NA
5743277	5743278	CLH_2442	CLH_2443			FALSE	0.012	284.000	0.000	1.000		NA
5743278	5743279	CLH_2443	CLH_2444			FALSE	0.016	218.000	0.000	0.003		NA
5743279	5743280	CLH_2444	CLH_2445			FALSE	0.005	425.000	0.000	NA	N	NA
5743280	5743281	CLH_2445	CLH_2446			FALSE	0.472	25.000	0.000	NA	N	NA
5743281	5743282	CLH_2446	CLH_2447			FALSE	0.227	70.000	0.000	NA		NA
5743282	5743283	CLH_2447	CLH_2448			FALSE	0.224	71.000	0.000	NA		NA
5743283	5743284	CLH_2448	CLH_2449			FALSE	0.267	58.000	0.000	NA		NA
5743284	5743285	CLH_2449	CLH_2450			FALSE	0.022	245.000	0.000	NA		NA
5743285	5743286	CLH_2450	CLH_2451			FALSE	0.338	44.000	0.000	NA		NA
5743286	5743287	CLH_2451	CLH_2452			FALSE	0.521	25.000	0.000	NA		NA
5743287	5743288	CLH_2452	CLH_2453			FALSE	0.424	33.000	0.000	NA		NA
5743288	5743289	CLH_2453	CLH_2454			FALSE	0.402	35.000	0.000	NA		NA
5743289	5743290	CLH_2454	CLH_2455			FALSE	0.005	495.000	0.000	NA		NA
5743290	5743291	CLH_2455	CLH_2456			FALSE	0.210	94.000	0.000	NA		NA
5743291	5743292	CLH_2456	CLH_2457			FALSE	0.035	220.000	0.000	NA		NA
5743292	5743293	CLH_2457	CLH_2458			FALSE	0.088	175.000	0.000	NA		NA
5743295	5743296	CLH_2460	CLH_2461			TRUE	0.962	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
5743296	5743297	CLH_2461	CLH_2462			TRUE	0.984	14.000	0.308	1.000	N	NA
5743297	5743298	CLH_2462	CLH_2463			FALSE	0.004	764.000	0.000	NA		NA
5743298	5743299	CLH_2463	CLH_2464			TRUE	0.639	17.000	0.000	NA		NA
5743299	5743300	CLH_2464	CLH_2465			TRUE	0.961	-16.000	0.167	NA		NA
5743300	5743301	CLH_2465	CLH_2466			FALSE	0.133	153.000	0.000	NA		NA
5743301	5743302	CLH_2466	CLH_2467			FALSE	0.329	46.000	0.000	NA		NA
5743304	5743305	CLH_2469	CLH_2470			FALSE	0.011	301.000	0.000	NA		NA
5743305	5743306	CLH_2470	CLH_2471			FALSE	0.019	259.000	0.000	NA		NA
5743306	5743307	CLH_2471	CLH_2472			FALSE	0.021	247.000	0.000	NA		NA
5743307	5743308	CLH_2472	CLH_2473			TRUE	0.967	-22.000	0.235	NA		NA
5743308	5743309	CLH_2473	CLH_2474			FALSE	0.079	179.000	0.000	NA		NA
5743309	5743310	CLH_2474	CLH_2475			FALSE	0.293	52.000	0.000	NA		NA
5743310	5743311	CLH_2475	CLH_2476			FALSE	0.029	229.000	0.000	NA		NA
5743311	5743312	CLH_2476	CLH_2477			FALSE	0.012	295.000	0.000	NA		NA
5743312	5743313	CLH_2477	CLH_2478			TRUE	0.650	16.000	0.000	NA		NA
5743313	5743314	CLH_2478	CLH_2479			FALSE	0.254	61.000	0.000	NA		NA
5743314	5743315	CLH_2479	CLH_2480			FALSE	0.017	266.000	0.000	NA		NA
5743315	5743316	CLH_2480	CLH_2481			FALSE	0.008	344.000	0.000	NA		NA
5743316	5743317	CLH_2481	CLH_2482			TRUE	0.663	2.000	0.000	NA		NA
5743317	5743318	CLH_2482	CLH_2483			FALSE	0.164	138.000	0.000	NA		NA
5743318	5743319	CLH_2483	CLH_2484			TRUE	0.639	17.000	0.000	NA		NA
5743319	5743320	CLH_2484	CLH_2485			TRUE	0.991	12.000	0.600	NA		NA
5743320	5743321	CLH_2485	CLH_2486			FALSE	0.234	67.000	0.000	NA		NA
5743321	5743322	CLH_2486	CLH_2487		dcm	FALSE	0.227	70.000	0.000	NA		NA
5743322	5743323	CLH_2487	CLH_2488	dcm		TRUE	0.969	22.000	0.222	1.000		NA
5743323	5743324	CLH_2488	CLH_2489			FALSE	0.016	270.000	0.000	NA		NA
5743324	5743325	CLH_2489	CLH_2490			FALSE	0.164	138.000	0.000	NA		NA
5743325	5743326	CLH_2490	CLH_2491			FALSE	0.016	274.000	0.000	NA		NA
5743326	5743327	CLH_2491	CLH_2492			TRUE	0.677	4.000	0.000	NA		NA
5743327	5743328	CLH_2492	CLH_2493			FALSE	0.544	-16.000	0.000	NA		NA
5743328	5743329	CLH_2493	CLH_2494			TRUE	0.597	-7.000	0.000	NA		NA
5743329	5743330	CLH_2494	CLH_2495			FALSE	0.010	312.000	0.000	NA		NA
5743330	5743331	CLH_2495	CLH_2496			FALSE	0.005	444.000	0.000	NA		NA
5743333	5743334	CLH_2498	CLH_2499			FALSE	0.202	104.000	0.000	NA		NA
5743334	5743335	CLH_2499	CLH_2500			FALSE	0.038	215.000	0.000	NA		NA
5743335	5743336	CLH_2500	CLH_2501			FALSE	0.312	49.000	0.000	NA		NA
5743336	5743337	CLH_2501	CLH_2502			FALSE	0.011	287.000	0.000	1.000		NA
5743337	5743338	CLH_2502	CLH_2503			FALSE	0.178	102.000	0.000	1.000		NA
5743338	5743339	CLH_2503	CLH_2504			FALSE	0.183	96.000	0.000	1.000		NA
5743339	5743340	CLH_2504	CLH_2505			FALSE	0.091	174.000	0.000	NA		NA
5743340	5743341	CLH_2505	CLH_2506			FALSE	0.008	358.000	0.000	NA		NA
5743341	5743342	CLH_2506	CLH_2507			FALSE	0.293	33.000	0.000	0.038		NA
5743343	5743344	CLH_2508	CLH_2509			FALSE	0.053	199.000	0.000	NA		NA
5743347	5743348	CLH_2511	CLH_2513			FALSE	0.008	351.000	0.000	NA		NA
5743348	5743349	CLH_2513	CLH_2514			FALSE	0.015	280.000	0.000	NA		NA
5743349	5743350	CLH_2514	CLH_2515			FALSE	0.014	284.000	0.000	NA		NA
5743350	5743351	CLH_2515	CLH_2516			FALSE	0.004	628.000	0.000	NA		NA
5743351	5743352	CLH_2516	CLH_2517			FALSE	0.021	249.000	0.000	NA		NA
5743352	5743353	CLH_2517	CLH_2518			FALSE	0.027	233.000	0.000	NA		NA
5743353	5743354	CLH_2518	CLH_2519			TRUE	0.671	3.000	0.000	NA		NA
5743354	5743355	CLH_2519	CLH_2520			FALSE	0.529	-22.000	0.000	NA		NA
5743355	5743356	CLH_2520	CLH_2521			TRUE	0.575	-10.000	0.000	NA		NA
5743356	5743357	CLH_2521	CLH_2522			FALSE	0.063	189.000	0.000	NA		NA
5743357	5743358	CLH_2522	CLH_2523			TRUE	0.988	26.000	0.933	NA		NA
5743361	5743362	CLH_2526	CLH_2527			FALSE	0.122	159.000	0.000	NA		NA
5743363	5743364	CLH_2528	CLH_2529			FALSE	0.299	51.000	0.000	NA		NA
5743365	5743366	CLH_2530	CLH_2531			TRUE	0.852	100.000	0.188	NA		NA
5743367	5743368	CLH_2532	CLH_2533			FALSE	0.557	-13.000	0.000	NA		NA
5743368	5743369	CLH_2533	CLH_2534			FALSE	0.006	400.000	0.000	NA		NA
5743369	5743370	CLH_2534	CLH_2535			FALSE	0.005	493.000	0.000	NA		NA
5743370	5743371	CLH_2535	CLH_2536			FALSE	0.041	212.000	0.000	NA		NA
5743371	5743372	CLH_2536	CLH_2537		trx	TRUE	0.965	2.000	0.000	0.002	Y	NA
5743374	5743375	CLH_2539	CLH_2540			FALSE	0.091	174.000	0.000	NA		NA
5743375	5743376	CLH_2540	CLH_2541			TRUE	0.627	18.000	0.000	NA		NA
5743376	5743377	CLH_2541	CLH_2542			TRUE	0.671	3.000	0.000	NA		NA
5743377	5743378	CLH_2542	CLH_2543			TRUE	0.627	18.000	0.000	NA		NA
5743378	5743379	CLH_2543	CLH_2544			FALSE	0.224	71.000	0.000	NA		NA
5743379	5743380	CLH_2544	CLH_2545			FALSE	0.167	137.000	0.000	NA		NA
5743380	5743381	CLH_2545	CLH_2546			TRUE	0.620	-3.000	0.000	NA		NA
5743381	5743382	CLH_2546	CLH_2547			FALSE	0.006	414.000	0.000	NA		NA
5743382	5743383	CLH_2547	CLH_2548			FALSE	0.082	178.000	0.000	NA		NA
5743383	5743384	CLH_2548	CLH_2549			FALSE	0.198	119.000	0.000	NA		NA
5743384	5743385	CLH_2549	CLH_2550			FALSE	0.147	145.000	0.000	NA		NA
5743385	5743386	CLH_2550	CLH_2551			FALSE	0.202	104.000	0.000	NA		NA
5743388	5743389	CLH_2553	CLH_2554			FALSE	0.004	704.000	0.000	NA		NA
5743391	5743392	CLH_2556	CLH_2557			FALSE	0.009	328.000	0.000	NA		NA
5743394	5743395	CLH_2559	CLH_2560			TRUE	0.956	-9.000	0.000	1.000	Y	NA
5743395	5743396	CLH_2560	CLH_2561			FALSE	0.478	-10.000	0.000	1.000	N	NA
5743396	5743397	CLH_2561	CLH_2562			TRUE	0.606	19.000	0.000	NA		NA
5743397	5743398	CLH_2562	CLH_2563			FALSE	0.008	353.000	0.000	NA		NA
5743398	5743399	CLH_2563	CLH_2564			FALSE	0.005	473.000	0.000	NA		NA
5743399	5743400	CLH_2564	CLH_2565			FALSE	0.195	519.000	0.080	0.001	Y	NA
5743402	5743403	CLH_2567	CLH_2568			FALSE	0.005	469.000	0.000	NA		NA
5743403	5743404	CLH_2568	CLH_2569			TRUE	0.597	-7.000	0.000	NA		NA
5743405	5743406	CLH_2570	CLH_2571			FALSE	0.009	327.000	0.000	NA		NA
5743407	5743408	CLH_2572	CLH_2573			FALSE	0.029	229.000	0.000	NA		NA
5743408	5743409	CLH_2573	CLH_2574		hprK	FALSE	0.291	177.000	0.011	1.000	N	NA
5743409	5743410	CLH_2574	CLH_2575	hprK		TRUE	0.914	17.000	0.018	NA		NA
5743412	5743413	CLH_2577	CLH_2578			TRUE	0.965	14.000	0.083	NA		NA
5743413	5743414	CLH_2578	CLH_2579			TRUE	0.696	100.000	0.042	NA		NA
5743414	5743415	CLH_2579	CLH_2580			FALSE	0.005	514.000	0.000	NA		NA
5743415	5743416	CLH_2580	CLH_2581			FALSE	0.005	486.000	0.000	NA		NA
5743416	5743417	CLH_2581	CLH_2582			TRUE	0.937	-10.000	0.075	0.001		NA
5743417	5743418	CLH_2582	CLH_2583		luxS	TRUE	0.896	2.000	0.008	1.000		NA
5743418	5743419	CLH_2583	CLH_2584	luxS	metF	FALSE	0.264	42.000	0.000	1.000	N	NA
5743419	5743420	CLH_2584	CLH_2585	metF	tagO	FALSE	0.011	270.000	0.000	1.000	N	NA
5743420	5743421	CLH_2585	CLH_2586	tagO		FALSE	0.005	358.000	0.000	1.000	N	NA
5743421	5743422	CLH_2586	CLH_2587			FALSE	0.006	347.000	0.000	1.000	N	NA
5743422	5743423	CLH_2587	CLH_2588			TRUE	0.995	4.000	0.238	0.005	Y	NA
5743423	5743424	CLH_2588	CLH_2589			TRUE	0.997	-7.000	0.776	0.005	Y	NA
5743424	5743425	CLH_2589	CLH_2590			TRUE	0.996	18.000	0.462	0.005	Y	NA
5743425	5743426	CLH_2590	CLH_2591			TRUE	0.996	-7.000	0.487	0.005	Y	NA
5743426	5743427	CLH_2591	CLH_2592			TRUE	0.995	13.000	0.258	0.005	Y	NA
5743427	5743428	CLH_2592	CLH_2593			TRUE	0.964	35.000	0.489	0.005		NA
5743428	5743429	CLH_2593	CLH_2594			TRUE	0.992	14.000	0.848	0.006		NA
5743429	5743430	CLH_2594	CLH_2595			TRUE	0.873	17.000	0.009	0.006		NA
5743430	5743431	CLH_2595	CLH_2596			FALSE	0.031	217.000	0.000	1.000		NA
5743431	5743432	CLH_2596	CLH_2597			TRUE	0.926	-25.000	0.063	NA		NA
5743432	5743433	CLH_2597	CLH_2598			TRUE	0.666	191.000	0.300	NA		NA
5743435	5743436	CLH_2600	CLH_2601			TRUE	0.975	10.000	0.137	1.000		NA
5743436	5743437	CLH_2601	CLH_2602			TRUE	0.903	33.000	0.078	1.000		NA
5743437	5743438	CLH_2602	CLH_2603			TRUE	0.926	27.000	0.079	1.000		NA
5743438	5743439	CLH_2603	CLH_2604			FALSE	0.026	236.000	0.000	NA		NA
5743439	5743440	CLH_2604	CLH_2605			FALSE	0.091	174.000	0.000	NA		NA
5743442	5743443	CLH_2607	CLH_2608			FALSE	0.021	250.000	0.000	NA		NA
5743443	5743444	CLH_2608	CLH_2609			FALSE	0.021	247.000	0.000	NA		NA
5743445	5743446	CLH_2610	CLH_2611			TRUE	0.678	123.000	0.041	NA		NA
5743447	5743448	CLH_2612	CLH_2613			TRUE	0.935	115.000	0.667	NA		NA
5743448	5743449	CLH_2613	CLH_2614			TRUE	0.984	33.000	1.000	NA		NA
5743449	5743450	CLH_2614	CLH_2615			FALSE	0.071	184.000	0.000	NA		NA
5743450	5743451	CLH_2615	CLH_2616		lon	TRUE	0.926	-10.000	0.048	1.000		NA
5743451	5743452	CLH_2616	CLH_2617	lon	clpX	FALSE	0.245	331.000	0.030	0.086	Y	NA
5743452	5743453	CLH_2617	CLH_2618	clpX	clpP	TRUE	0.951	40.000	0.022	1.000	Y	NA
5743453	5743454	CLH_2618	CLH_2619	clpP	tig	TRUE	0.844	153.000	0.024	1.000	Y	NA
5743454	5743455	CLH_2619	CLH_2620	tig		FALSE	0.509	93.000	0.002	NA		NA
5743455	5743456	CLH_2620	CLH_2621			TRUE	0.876	100.000	0.250	NA		NA
5743458	5743459	CLH_2623	CLH_2624	hisE		TRUE	0.989	22.000	0.152	0.001	Y	NA
5743459	5743460	CLH_2624	CLH_2625		hisF	TRUE	0.973	118.000	0.430	0.004	Y	NA
5743460	5743461	CLH_2625	CLH_2626	hisF	hisA	TRUE	0.988	38.000	0.433	0.004	Y	NA
5743461	5743462	CLH_2626	CLH_2627	hisA	hisH	TRUE	0.991	-3.000	0.124	0.004	Y	NA
5743462	5743463	CLH_2627	CLH_2628	hisH	hisB	TRUE	0.988	22.000	0.125	0.004	Y	NA
5743463	5743464	CLH_2628	CLH_2629	hisB		TRUE	0.994	-10.000	0.341	0.004	Y	NA
5743464	5743465	CLH_2629	CLH_2630		hisD	TRUE	0.993	1.000	0.165	0.004	Y	NA
5743465	5743466	CLH_2630	CLH_2631	hisD	hisG	TRUE	0.971	62.000	0.254	0.004	Y	NA
5743466	5743467	CLH_2631	CLH_2632	hisG	hisZ	TRUE	0.995	3.000	0.239	0.004	Y	NA
5743467	5743468	CLH_2632	CLH_2633	hisZ		FALSE	0.005	362.000	0.000	1.000	N	NA
5743468	5743469	CLH_2633	CLH_2634		thiI	FALSE	0.014	247.000	0.000	1.000	N	NA
5743469	5743470	CLH_2634	CLH_2635	thiI		TRUE	0.983	0.000	0.349	1.000	N	NA
5743470	5743471	CLH_2635	CLH_2636			FALSE	0.005	510.000	0.000	NA		NA
5743471	5743472	CLH_2636	CLH_2637			FALSE	0.008	358.000	0.000	NA		NA
5743472	5743473	CLH_2637	CLH_2638		thrB	TRUE	0.896	0.000	0.011	1.000		NA
5743473	5743474	CLH_2638	CLH_2639	thrB	thrC	TRUE	0.995	4.000	0.233	1.000	Y	NA
5743474	5743475	CLH_2639	CLH_2640	thrC		FALSE	0.500	119.000	0.003	NA		NA
5743477	5743478	CLH_2642	CLH_2643			FALSE	0.227	70.000	0.000	NA		NA
5743480	5743481	CLH_2645	CLH_2646		hemL	TRUE	0.956	-10.000	0.000	NA	Y	NA
5743481	5743482	CLH_2646	CLH_2647	hemL	hemB	TRUE	0.931	52.000	0.026	0.001	Y	NA
5743482	5743483	CLH_2647	CLH_2648	hemB		TRUE	0.989	3.000	0.044	1.000	Y	NA
5743483	5743484	CLH_2648	CLH_2649		hemC	TRUE	0.602	215.000	0.031	1.000	Y	NA
5743484	5743485	CLH_2649	CLH_2650	hemC		TRUE	0.925	52.000	0.009	NA	Y	NA
5743485	5743486	CLH_2650	CLH_2651		hemA	TRUE	0.973	-42.000	0.018	NA	Y	NA
5743486	5743487	CLH_2651	CLH_2652	hemA		FALSE	0.004	421.000	0.000	1.000	N	NA
5743489	5743490	CLH_2654	CLH_2655		metA	FALSE	0.007	333.000	0.000	1.000		NA
5743494	5743495	CLH_2659	CLH_2660	cobQ		TRUE	0.642	52.000	0.005	NA		NA
5743495	5743496	CLH_2660	CLH_2661			FALSE	0.251	62.000	0.000	NA		NA
5743496	5743497	CLH_2661	CLH_2662		cobD	TRUE	0.874	-7.000	0.017	0.010	N	NA
5743497	5743498	CLH_2662	CLH_2663	cobD		TRUE	0.771	119.000	0.094	1.000	N	NA
5743498	5743499	CLH_2663	CLH_2664			TRUE	0.597	-7.000	0.000	NA		NA
5743499	5743500	CLH_2664	CLH_2665		cobS	FALSE	0.200	116.000	0.000	NA		NA
5743500	5743501	CLH_2665	CLH_2666	cobS		TRUE	0.993	9.000	0.092	1.000	Y	NA
5743501	5743502	CLH_2666	CLH_2667			TRUE	0.982	2.000	0.006	1.000	Y	NA
5743502	5743503	CLH_2667	CLH_2668			FALSE	0.011	273.000	0.000	1.000	N	NA
5743503	5743504	CLH_2668	CLH_2669			TRUE	0.991	2.000	0.793	0.076	N	NA
5743504	5743505	CLH_2669	CLH_2670			TRUE	0.751	103.000	0.077	1.000	N	NA
5743505	5743506	CLH_2670	CLH_2671			FALSE	0.033	203.000	0.000	1.000	N	NA
5743508	5743509	CLH_2673	CLH_2674		cobT	FALSE	0.050	202.000	0.000	NA		NA
5743509	5743510	CLH_2674	CLH_2675	cobT	cobK	FALSE	0.110	485.000	0.006	0.010	Y	NA
5743510	5743511	CLH_2675	CLH_2676	cobK	cobJ	TRUE	0.996	0.000	0.423	0.010	Y	NA
5743511	5743512	CLH_2676	CLH_2677	cobJ		TRUE	0.995	19.000	0.352	0.010	Y	NA
5743512	5743513	CLH_2677	CLH_2678		cobM	TRUE	0.995	-3.000	0.397	0.010	Y	NA
5743513	5743514	CLH_2678	CLH_2679	cobM	cobI	TRUE	0.885	188.000	0.291	0.010	Y	NA
5743514	5743515	CLH_2679	CLH_2680	cobI		TRUE	0.981	2.000	0.010	0.010	Y	NA
5743515	5743516	CLH_2680	CLH_2681		cbiE	TRUE	0.998	13.000	0.750	0.001	Y	NA
5743516	5743517	CLH_2681	CLH_2682	cbiE	cbiD	TRUE	0.982	8.000	0.008	0.010	Y	NA
5743517	5743518	CLH_2682	CLH_2683	cbiD	cobH	TRUE	0.930	148.000	0.168	0.010	Y	NA
5743518	5743519	CLH_2683	CLH_2684	cobH	cobB	TRUE	0.908	148.000	0.097	0.010	Y	NA
5743519	5743520	CLH_2684	CLH_2685	cobB		TRUE	0.736	190.000	0.039	1.000	Y	NA
5743522	5743523	CLH_2687	CLH_2688			FALSE	0.017	269.000	0.000	NA		NA
5743524	5743525	CLH_2689	CLH_2690			FALSE	0.007	376.000	0.000	NA		NA
5743526	5743527	CLH_2691	CLH_2692			FALSE	0.208	96.000	0.000	NA		NA
5743527	5743528	CLH_2692	CLH_2693			FALSE	0.347	42.000	0.000	NA		NA
5743528	5743529	CLH_2693	CLH_2694			FALSE	0.053	180.000	0.000	1.000	N	NA
5743529	5743530	CLH_2694	CLH_2695			FALSE	0.140	310.000	0.000	1.000	Y	NA
5743532	5743533	CLH_2697	CLH_2698			TRUE	0.973	-18.000	0.312	NA	N	NA
5743533	5743534	CLH_2698	CLH_2699			FALSE	0.082	178.000	0.000	NA		NA
5743534	5743535	CLH_2699	CLH_2700			FALSE	0.011	309.000	0.000	NA		NA
5743535	5743536	CLH_2700	CLH_2701			FALSE	0.005	420.000	0.000	1.000		NA
5743536	5743537	CLH_2701	CLH_2702			FALSE	0.013	273.000	0.000	1.000		NA
5743537	5743538	CLH_2702	CLH_2703			TRUE	0.918	17.000	0.023	1.000		NA
5743538	5743539	CLH_2703	CLH_2704			FALSE	0.005	386.000	0.000	1.000		NA
5743539	5743540	CLH_2704	CLH_2705			TRUE	0.997	-7.000	0.933	0.003	Y	NA
5743542	10274104	CLH_2707	CLH_2708			FALSE	0.511	-962.000	0.000	NA		NA
10274104	5743543	CLH_2708	CLH_2709			FALSE	0.028	224.000	0.000	1.000		NA
5743544	5743545	CLH_2710	CLH_2711			FALSE	0.003	560.000	0.000	1.000	N	NA
5743547	5743548	CLH_2713	CLH_2714			FALSE	0.198	119.000	0.000	NA		NA
5743549	5743550	CLH_2715	CLH_2716			TRUE	0.756	33.000	0.010	0.030		NA
5743550	5743551	CLH_2716	CLH_2717			FALSE	0.033	224.000	0.000	NA		NA
5743551	5743552	CLH_2717	CLH_2718			FALSE	0.007	375.000	0.000	NA		NA
5743552	5743553	CLH_2718	CLH_2719			FALSE	0.014	282.000	0.000	NA		NA
5743555	5743556	CLH_2721	CLH_2722	deoD	cdd	TRUE	0.858	55.000	0.000	1.000	Y	NA
5743556	5743557	CLH_2722	CLH_2723	cdd		FALSE	0.196	214.000	0.021	1.000		NA
5743557	5743558	CLH_2723	CLH_2724			TRUE	0.991	2.000	0.720	0.021		NA
5743558	5743559	CLH_2724	CLH_2725			TRUE	0.985	-3.000	0.438	1.000		NA
5743559	5743560	CLH_2725	CLH_2726			FALSE	0.142	243.000	0.030	1.000		NA
5743560	5743561	CLH_2726	CLH_2727			TRUE	0.691	173.000	0.182	1.000		NA
5743561	5743562	CLH_2727	CLH_2728			FALSE	0.003	735.000	0.000	1.000	N	NA
5743562	5743563	CLH_2728	CLH_2729			TRUE	0.992	-3.000	0.894	NA	N	NA
5743563	5743564	CLH_2729	CLH_2730		pulA	FALSE	0.003	753.000	0.000	NA	N	NA
5743564	5743565	CLH_2730	CLH_2731	pulA		FALSE	0.008	358.000	0.000	NA		NA
5743565	5743566	CLH_2731	CLH_2732			FALSE	0.497	27.000	0.000	NA		NA
5743568	5743569	CLH_2734	CLH_2735			FALSE	0.018	249.000	0.000	1.000		NA
5743569	5743570	CLH_2735	CLH_2736			FALSE	0.006	363.000	0.000	1.000		NA
5743570	5743571	CLH_2736	CLH_2737			FALSE	0.008	328.000	0.000	1.000		NA
5743571	5743572	CLH_2737	CLH_2738			TRUE	0.933	72.000	0.540	NA		NA
5743572	5743573	CLH_2738	CLH_2739			FALSE	0.011	308.000	0.000	NA		NA
5743573	5743574	CLH_2739	CLH_2740			FALSE	0.036	201.000	0.000	1.000	N	NA
5743574	5743575	CLH_2740	CLH_2741			TRUE	0.986	-13.000	0.669	1.000	N	NA
5743575	5743576	CLH_2741	CLH_2742			TRUE	0.632	14.000	0.000	1.000		NA
5743582	5743583	CLH_2748	CLH_2749			FALSE	0.113	154.000	0.000	1.000		NA
5743583	5743584	CLH_2749	CLH_2750			FALSE	0.018	265.000	0.000	NA		NA
5743586	5743587	CLH_2752	CLH_2753		trpF	FALSE	0.155	91.000	0.000	1.000	N	NA
5743587	5743588	CLH_2753	CLH_2754	trpF		TRUE	0.635	5.000	0.000	NA	N	NA
5743588	5743589	CLH_2754	CLH_2755			FALSE	0.006	421.000	0.000	NA		NA
5743589	5743590	CLH_2755	CLH_2756			TRUE	0.965	37.000	0.500	NA		NA
5743590	5743591	CLH_2756	CLH_2757			FALSE	0.009	306.000	0.000	1.000		NA
5743591	5743592	CLH_2757	CLH_2758			TRUE	0.890	50.000	0.133	NA		NA
5743592	5743593	CLH_2758	CLH_2759			FALSE	0.033	224.000	0.000	NA		NA
5743593	5743594	CLH_2759	CLH_2760			FALSE	0.041	212.000	0.000	NA		NA
5743594	5743595	CLH_2760	CLH_2761			TRUE	0.998	6.000	0.833	1.000	Y	NA
5743595	5743596	CLH_2761	CLH_2762			FALSE	0.012	265.000	0.000	1.000	N	NA
5743596	5743597	CLH_2762	CLH_2763			FALSE	0.008	299.000	0.000	1.000	N	NA
5743597	5743598	CLH_2763	CLH_2764			TRUE	0.879	48.000	0.105	NA		NA
5743598	5743599	CLH_2764	CLH_2765			TRUE	0.789	123.000	0.105	NA		NA
5743599	5743600	CLH_2765	CLH_2766			FALSE	0.009	326.000	0.000	NA		NA
5743600	5743601	CLH_2766	CLH_2767			FALSE	0.514	-43.000	0.000	NA		NA
5743601	5743602	CLH_2767	CLH_2768			FALSE	0.557	-13.000	0.000	NA		NA
5743602	5743603	CLH_2768	CLH_2769			FALSE	0.125	156.000	0.000	NA		NA
5743603	5743604	CLH_2769	CLH_2770			FALSE	0.004	538.000	0.000	NA		NA
5743604	5743605	CLH_2770	CLH_2771		nadC	FALSE	0.003	812.000	0.000	1.000		NA
5743605	5743606	CLH_2771	CLH_2772	nadC		TRUE	0.980	-22.000	0.046	1.000	Y	NA
5743606	5743607	CLH_2772	CLH_2773		nadA	TRUE	0.989	6.000	0.042	1.000	Y	NA
5743608	5743609	CLH_2774	CLH_2775			TRUE	0.791	141.000	0.160	NA		NA
5743609	5743610	CLH_2775	CLH_2776			FALSE	0.011	302.000	0.000	NA		NA
5743611	5743612	CLH_2777	CLH_2778		feoB	TRUE	0.677	72.000	0.029	NA		NA
5743612	5743613	CLH_2778	CLH_2779	feoB		TRUE	0.987	73.000	0.871	1.000	Y	NA
5743613	5743614	CLH_2779	CLH_2780			TRUE	0.998	14.000	0.791	0.006	Y	NA
5743614	5743615	CLH_2780	CLH_2781			FALSE	0.005	424.000	0.000	1.000		NA
5743615	5743616	CLH_2781	CLH_2782			FALSE	0.004	616.000	0.000	1.000		NA
5743617	5743618	CLH_2783	CLH_2784			TRUE	0.992	3.000	0.748	NA		NA
5743619	5743620	CLH_2785	CLH_2786			FALSE	0.010	238.000	0.000	0.075	N	NA
5743621	5743622	CLH_2787	CLH_2788			TRUE	0.989	16.000	0.516	NA		NA
5743622	5743623	CLH_2788	CLH_2789			TRUE	0.956	15.000	0.062	NA		NA
5743624	5743625	CLH_2790	CLH_2791	asrC	asrB	TRUE	0.998	13.000	0.720	0.023	Y	NA
5743625	5743626	CLH_2791	CLH_2792	asrB	asrA	TRUE	0.988	-7.000	0.750	0.023		NA
5743626	5743627	CLH_2792	CLH_2793	asrA		TRUE	0.976	15.000	0.174	1.000		NA
5743627	5743628	CLH_2793	CLH_2794			TRUE	0.831	94.000	0.152	1.000	N	NA
5743631	5743632	CLH_2797	CLH_2798	modA	modB	TRUE	0.994	23.000	0.430	0.001	Y	NA
5743632	5743633	CLH_2798	CLH_2799	modB		TRUE	0.985	2.000	0.342	1.000	N	NA
5743634	5743635	CLH_2800	CLH_2801	gltA	gltD	FALSE	0.307	0.000	0.000	0.002	N	NA
5743635	5743636	CLH_2801	CLH_2802	gltD	smpB	FALSE	0.007	312.000	0.000	1.000	N	NA
5743636	5743637	CLH_2802	CLH_2803	smpB	rnr	TRUE	0.607	176.000	0.143	0.017	N	NA
5743637	5743638	CLH_2803	CLH_2804	rnr		FALSE	0.105	224.000	0.003	1.000	N	NA
5743638	5743639	CLH_2804	CLH_2805		secG	FALSE	0.029	470.000	0.019	1.000		NA
5743639	5743640	CLH_2805	CLH_2806	secG	eno	FALSE	0.059	281.000	0.006	1.000		NA
5743640	5743641	CLH_2806	CLH_2807	eno		FALSE	0.011	308.000	0.000	NA		NA
5743641	5743642	CLH_2807	CLH_2808		gpmI	FALSE	0.020	254.000	0.000	NA		NA
5743642	5743643	CLH_2808	CLH_2809	gpmI		FALSE	0.007	367.000	0.000	NA		NA
5743643	5743644	CLH_2809	CLH_2810			FALSE	0.204	99.000	0.000	NA		NA
5743646	5743647	CLH_2812	CLH_2813	tpiA	pgk	TRUE	0.948	124.000	0.141	1.000	Y	NA
5743647	5743648	CLH_2813	CLH_2814	pgk	gap	TRUE	0.902	117.000	0.035	0.004	Y	NA
5743648	5743649	CLH_2814	CLH_2815	gap		TRUE	0.641	73.000	0.025	1.000	N	NA
5743649	5743650	CLH_2815	CLH_2816		rpoN	FALSE	0.491	240.000	0.034	1.000	Y	NA
5743650	5743651	CLH_2816	CLH_2817	rpoN		FALSE	0.023	242.000	0.000	NA		NA
5743651	5743652	CLH_2817	CLH_2818			TRUE	0.899	19.000	0.016	NA		NA
5743652	5743653	CLH_2818	CLH_2819			FALSE	0.015	246.000	0.000	1.000	N	NA
5743653	5743654	CLH_2819	CLH_2820			FALSE	0.507	225.000	0.333	1.000	N	NA
5743654	5743655	CLH_2820	CLH_2821			TRUE	0.885	85.000	0.286	1.000	N	NA
5743655	5743656	CLH_2821	CLH_2822			TRUE	0.994	-10.000	0.286	1.000	Y	NA
5743656	5743657	CLH_2822	CLH_2823		ddlB	FALSE	0.004	448.000	0.000	1.000	N	NA
5743657	5743658	CLH_2823	CLH_2824	ddlB	nth	FALSE	0.036	308.000	0.002	1.000	N	NA
5743658	5743659	CLH_2824	CLH_2825	nth		TRUE	0.881	19.000	0.011	1.000		NA
5743659	5743660	CLH_2825	CLH_2826			TRUE	0.841	47.000	0.064	1.000		NA
5743660	5743661	CLH_2826	CLH_2827		cysE	TRUE	0.957	12.000	0.064	1.000	N	NA
5743661	5743662	CLH_2827	CLH_2828	cysE	cysK	TRUE	0.938	114.000	0.101	0.001	Y	NA
5743662	5743663	CLH_2828	CLH_2829	cysK		FALSE	0.003	654.000	0.000	1.000		NA
5743665	5743666	CLH_2831	CLH_2832			TRUE	0.889	87.000	0.281	NA		NA
5743668	5743669	CLH_2834	CLH_2835			FALSE	0.012	299.000	0.000	NA		NA
5743669	5743670	CLH_2835	CLH_2836			TRUE	0.659	15.000	0.000	NA		NA
5743670	5743671	CLH_2836	CLH_2837			FALSE	0.242	196.000	0.014	NA		NA
5743671	5743672	CLH_2837	CLH_2838		yhbH	TRUE	0.993	5.000	0.761	NA		NA
5743672	5743673	CLH_2838	CLH_2839	yhbH		TRUE	0.992	9.000	0.683	NA		NA
5743673	5743674	CLH_2839	CLH_2840			FALSE	0.186	126.000	0.000	NA		NA
5743674	5743675	CLH_2840	CLH_2841		recQ	FALSE	0.470	29.000	0.000	NA		NA
5743675	5743676	CLH_2841	CLH_2842	recQ		FALSE	0.508	26.000	0.000	NA		NA
5743676	5743677	CLH_2842	CLH_2843			TRUE	0.988	4.000	0.400	NA		NA
5743679	5743680	CLH_2845	CLH_2846			TRUE	0.991	-7.000	0.855	1.000		NA
5743680	5743681	CLH_2846	CLH_2847			FALSE	0.414	266.000	0.492	0.084	N	NA
5743681	5743682	CLH_2847	CLH_2848			TRUE	0.998	3.000	0.812	1.000	Y	NA
5743682	5743683	CLH_2848	CLH_2849			FALSE	0.037	216.000	0.000	NA		NA
5743687	5743688	CLH_2853	CLH_2854			FALSE	0.041	204.000	0.000	1.000		NA
5743688	5743689	CLH_2854	CLH_2855		thiE	FALSE	0.028	223.000	0.000	1.000		NA
5743689	5743690	CLH_2855	CLH_2856	thiE	thiM	TRUE	0.874	180.000	0.190	0.003	Y	NA
5743690	5743691	CLH_2856	CLH_2857	thiM	thiD	TRUE	0.702	193.000	0.039	0.003	Y	NA
5743691	5743692	CLH_2857	CLH_2858	thiD		FALSE	0.289	53.000	0.000	NA		NA
5743692	5743693	CLH_2858	CLH_2859		sdaAA	FALSE	0.014	283.000	0.000	NA		NA
5743693	5743694	CLH_2859	CLH_2860	sdaAA	sdaAB	TRUE	0.991	2.000	0.098	0.001	Y	NA
5743694	5743695	CLH_2860	CLH_2861	sdaAB		FALSE	0.009	285.000	0.000	1.000	N	NA
5743696	5743697	CLH_2862	CLH_2863			TRUE	0.961	0.000	0.082	NA		NA
5743697	5743698	CLH_2863	CLH_2864		fba	FALSE	0.057	194.000	0.000	NA		NA
5743698	5743699	CLH_2864	CLH_2865	fba	argG	FALSE	0.003	722.000	0.000	1.000	N	NA
5743699	5743700	CLH_2865	CLH_2866	argG	argH	TRUE	0.996	3.000	0.278	1.000	Y	NA
5743700	5743701	CLH_2866	CLH_2867	argH	argC	TRUE	0.980	-7.000	0.020	1.000	Y	NA
5743701	5743702	CLH_2867	CLH_2868	argC	argJ	TRUE	0.994	20.000	0.303	0.002	Y	NA
5743702	5743703	CLH_2868	CLH_2869	argJ	argB	TRUE	0.986	33.000	0.239	0.002	Y	NA
5743703	5743704	CLH_2869	CLH_2870	argB		TRUE	0.986	14.000	0.022	1.000	Y	NA
5743704	5743705	CLH_2870	CLH_2871		argF	TRUE	0.896	94.000	0.017	1.000	Y	NA
5743705	5743706	CLH_2871	CLH_2872	argF		FALSE	0.005	377.000	0.000	1.000	N	NA
5743709	5743710	CLH_2875	CLH_2876	manA	pfkB	FALSE	0.112	350.000	0.000	1.000	Y	NA
5743710	5743711	CLH_2876	CLH_2877	pfkB		FALSE	0.096	374.000	0.000	1.000	Y	NA
5743711	5743712	CLH_2877	CLH_2878			TRUE	0.967	45.000	0.080	1.000	Y	NA
5743712	5743713	CLH_2878	CLH_2879			TRUE	0.644	108.000	0.033	1.000	N	NA
5743713	5743714	CLH_2879	CLH_2880			FALSE	0.216	53.000	0.000	1.000	N	NA
5743714	5743715	CLH_2880	CLH_2881			FALSE	0.012	263.000	0.000	1.000	N	NA
5743715	5743716	CLH_2881	CLH_2882			TRUE	0.988	-10.000	0.095	0.011	Y	NA
5743716	5743717	CLH_2882	CLH_2883			TRUE	0.989	60.000	0.905	0.011	Y	NA
5743717	5743718	CLH_2883	CLH_2884			FALSE	0.158	141.000	0.000	NA		NA
5743720	5743721	CLH_2886	CLH_2887		aroF	TRUE	0.980	18.000	0.009	1.000	Y	NA
5743721	5743722	CLH_2887	CLH_2888	aroF	aroK	TRUE	0.810	83.000	0.000	1.000	Y	NA
5743722	5743723	CLH_2888	CLH_2889	aroK	aroE	TRUE	0.991	14.000	0.069	1.000	Y	NA
5743723	5743724	CLH_2889	CLH_2890	aroE		TRUE	0.969	24.000	0.009	0.034	Y	NA
5743724	5743725	CLH_2890	CLH_2891		aroC	TRUE	0.632	207.000	0.026	1.000	Y	NA
5743725	5743726	CLH_2891	CLH_2892	aroC	aroA	TRUE	0.982	-22.000	0.057	1.000	Y	NA
5743726	5743727	CLH_2892	CLH_2893	aroA	aroB	TRUE	0.927	88.000	0.051	1.000	Y	NA
5743727	5743728	CLH_2893	CLH_2894	aroB	aroF	TRUE	0.870	97.000	0.008	0.002	Y	NA
5743728	5743729	CLH_2894	CLH_2895	aroF		FALSE	0.004	378.000	0.000	1.000	N	NA
5743729	5743730	CLH_2895	CLH_2896		putP	FALSE	0.003	823.000	0.000	1.000	N	NA
5743732	5743733	CLH_2898	CLH_2899			FALSE	0.218	63.000	0.000	1.000		NA
5743733	5743734	CLH_2899	CLH_2900			FALSE	0.003	693.000	0.000	1.000		NA
5743736	5743737	CLH_2902	CLH_2903			TRUE	0.804	54.000	0.054	NA		NA
5743737	5743738	CLH_2903	CLH_2904			TRUE	0.717	116.000	0.052	NA		NA
5743738	5743739	CLH_2904	CLH_2905			FALSE	0.152	255.000	0.043	NA		NA
5743739	5743740	CLH_2905	CLH_2906			TRUE	0.618	79.000	0.017	NA		NA
5743741	5743742	CLH_2907	CLH_2908			TRUE	0.781	47.000	0.033	1.000		NA
5743743	5743744	CLH_2909	CLH_2910			FALSE	0.010	296.000	0.000	1.000		NA
5743744	5743745	CLH_2910	CLH_2911			TRUE	0.910	31.000	0.077	1.000		NA
5743745	5743746	CLH_2911	CLH_2912			TRUE	0.955	48.000	0.500	NA		NA
5743746	5743747	CLH_2912	CLH_2913		tyrS	FALSE	0.005	461.000	0.000	NA		NA
5743747	5743748	CLH_2913	CLH_2914	tyrS		FALSE	0.008	329.000	0.000	1.000		NA
5743748	5743749	CLH_2914	CLH_2915			TRUE	0.990	-10.000	1.000	0.002		NA
5743753	5743754	CLH_2919	CLH_2920			TRUE	0.575	-10.000	0.000	NA		NA
5743754	5743755	CLH_2920	CLH_2921		galU	FALSE	0.140	150.000	0.000	NA		NA
5743757	5743758	CLH_2923	CLH_2924		pglB	FALSE	0.030	228.000	0.000	NA		NA
5743758	5743759	CLH_2924	CLH_2925	pglB		TRUE	0.872	146.000	0.033	NA	Y	NA
5743759	5743760	CLH_2925	CLH_2926			FALSE	0.106	345.000	0.000	0.008	Y	NA
5743762	5743763	CLH_2928	CLH_2929			TRUE	0.671	3.000	0.000	NA		NA
5743763	5743764	CLH_2929	CLH_2930			TRUE	0.770	65.000	0.056	NA		NA
5743764	5743765	CLH_2930	CLH_2931			FALSE	0.026	235.000	0.000	NA		NA
5743767	5743768	CLH_2933	CLH_2934			TRUE	0.809	260.000	0.800	0.020	Y	NA
5743768	5743769	CLH_2934	CLH_2935			FALSE	0.207	262.000	0.000	0.020	Y	NA
5743769	5743770	CLH_2935	CLH_2936			FALSE	0.054	189.000	0.000	1.000		NA
5743770	5743771	CLH_2936	CLH_2937			FALSE	0.254	54.000	0.000	1.000		NA
5743771	5743772	CLH_2937	CLH_2938			FALSE	0.002	563.000	0.000	0.074		NA
5743772	5743773	CLH_2938	CLH_2939			FALSE	0.004	542.000	0.000	NA		NA
5743773	5743774	CLH_2939	CLH_2940			FALSE	0.006	386.000	0.000	NA		NA
5743774	5743775	CLH_2940	CLH_2941			FALSE	0.061	184.000	0.000	1.000		NA
5743775	5743776	CLH_2941	CLH_2942			TRUE	0.995	15.000	0.267	1.000	Y	NA
5743776	5743777	CLH_2942	CLH_2943			FALSE	0.004	708.000	0.000	NA		NA
5743777	5743778	CLH_2943	CLH_2944			FALSE	0.007	368.000	0.000	NA		NA
5743778	5743779	CLH_2944	CLH_2945			FALSE	0.012	296.000	0.000	NA		NA
5743779	5743780	CLH_2945	CLH_2946			FALSE	0.005	449.000	0.000	NA		NA
5743780	5743781	CLH_2946	CLH_2947			FALSE	0.004	301.000	0.000	0.001		NA
5743782	5743783	CLH_2948	CLH_2949			FALSE	0.019	255.000	0.000	NA		NA
5743783	5743784	CLH_2949	CLH_2950			FALSE	0.010	303.000	0.000	1.000		NA
5743785	5743786	CLH_2951	CLH_2952	trx		FALSE	0.177	111.000	0.000	1.000		NA
5743788	5743789	CLH_2954	CLH_2955			FALSE	0.093	366.000	0.000	0.013	Y	NA
5743789	5743790	CLH_2955	CLH_2956		gltA	FALSE	0.003	623.000	0.000	1.000	N	NA
5743790	5743791	CLH_2956	CLH_2957	gltA		TRUE	0.989	0.000	0.667	0.029	N	NA
5743791	5743792	CLH_2957	CLH_2958			FALSE	0.233	255.000	0.000	1.000	Y	NA
5743792	5743793	CLH_2958	CLH_2959			FALSE	0.004	419.000	0.000	1.000	N	NA
5743793	5743794	CLH_2959	CLH_2960			FALSE	0.005	417.000	0.000	1.000		NA
5743794	5743795	CLH_2960	CLH_2961			FALSE	0.014	283.000	0.000	NA		NA
5743795	5743796	CLH_2961	CLH_2962		prfC	FALSE	0.005	432.000	0.000	NA		NA
5743796	5743797	CLH_2962	CLH_2963	prfC		FALSE	0.004	543.000	0.000	NA		NA
5743797	5743798	CLH_2963	CLH_2964			FALSE	0.206	97.000	0.000	NA		NA
5743798	5743799	CLH_2964	CLH_2965			FALSE	0.007	371.000	0.000	NA		NA
5743799	5743800	CLH_2965	CLH_2966			FALSE	0.338	44.000	0.000	NA		NA
5743800	5743801	CLH_2966	CLH_2967			FALSE	0.004	557.000	0.000	NA		NA
5743801	5743802	CLH_2967	CLH_2968			FALSE	0.137	151.000	0.000	NA		NA
5743802	5743803	CLH_2968	CLH_2969			FALSE	0.117	161.000	0.000	NA		NA
5743803	5743804	CLH_2969	CLH_2970			FALSE	0.013	286.000	0.000	NA		NA
5743804	5743805	CLH_2970	CLH_2971			FALSE	0.009	335.000	0.000	NA		NA
5743805	5743806	CLH_2971	CLH_2972			FALSE	0.004	580.000	0.000	NA		NA
5743806	5743807	CLH_2972	CLH_2973			FALSE	0.009	329.000	0.000	NA		NA
5743807	5743808	CLH_2973	CLH_2974			FALSE	0.206	97.000	0.000	NA		NA
5743808	5743809	CLH_2974	CLH_2975			FALSE	0.004	584.000	0.000	NA		NA
5743809	5743810	CLH_2975	CLH_2976			FALSE	0.018	261.000	0.000	NA		NA
5743810	5743811	CLH_2976	CLH_2977			FALSE	0.006	388.000	0.000	NA		NA
5743811	5743812	CLH_2977	CLH_2978			FALSE	0.022	244.000	0.000	NA		NA
5743814	5743815	CLH_2980	CLH_2981			FALSE	0.005	452.000	0.000	NA		NA
5743815	5743816	CLH_2981	CLH_2982			TRUE	0.597	-7.000	0.000	NA		NA
5743818	5743819	CLH_2984	CLH_2985			FALSE	0.023	242.000	0.000	NA		NA
5743821	5743822	CLH_2987	CLH_2988			TRUE	0.733	47.000	0.018	1.000		NA
5743822	5743823	CLH_2988	CLH_2989			TRUE	0.915	21.000	0.037	1.000		NA
5743823	5743824	CLH_2989	CLH_2990			TRUE	0.985	-13.000	0.600	NA		NA
5743824	5743825	CLH_2990	CLH_2991			FALSE	0.004	1012.000	0.000	NA		NA
5743825	5743826	CLH_2991	CLH_2992			FALSE	0.515	-36.000	0.000	NA		NA
5743826	5743827	CLH_2992	CLH_2993			FALSE	0.019	259.000	0.000	NA		NA
5743827	5743828	CLH_2993	CLH_2994			TRUE	0.972	5.000	0.000	NA	Y	NA
5743828	5743829	CLH_2994	CLH_2995			TRUE	0.560	1.000	0.000	1.000	N	NA
5743829	5743830	CLH_2995	CLH_2996			TRUE	0.979	-10.000	0.367	1.000	N	NA
5743830	5743831	CLH_2996	CLH_2997			TRUE	0.918	26.000	0.067	1.000	N	NA
5743831	5743832	CLH_2997	CLH_2998			TRUE	0.880	47.000	0.000	1.000	Y	NA
5743832	5743833	CLH_2998	CLH_2999			TRUE	0.969	12.000	0.000	0.083	Y	NA
5743833	5743834	CLH_2999	CLH_3000		rfbD	TRUE	0.957	20.000	0.000	1.000	Y	NA
5743834	5743835	CLH_3000	CLH_3001	rfbD		TRUE	0.934	21.000	0.056	NA		NA
5743835	5743836	CLH_3001	CLH_3002		rfbB	TRUE	0.732	95.000	0.054	NA		NA
5743836	5743837	CLH_3002	CLH_3003	rfbB	rfbC	TRUE	0.944	114.000	0.106	1.000	Y	NA
5743837	5743838	CLH_3003	CLH_3004	rfbC	rfbA	TRUE	0.982	32.000	0.115	1.000	Y	NA
5743842	5743843	CLH_3008	CLH_3009			TRUE	0.987	-10.000	0.614	NA		NA
5743843	5743844	CLH_3009	CLH_3010			FALSE	0.065	188.000	0.000	NA		NA
5743844	5743845	CLH_3010	CLH_3011			FALSE	0.004	702.000	0.000	NA		NA
5743847	5743848	CLH_3013	CLH_3014			FALSE	0.007	334.000	0.000	1.000		NA
5743848	5743849	CLH_3014	CLH_3015		araD	TRUE	0.875	198.000	0.308	1.000	Y	NA
5743849	5743850	CLH_3015	CLH_3016	araD		FALSE	0.133	357.000	0.154	NA		NA
5743850	5743851	CLH_3016	CLH_3017			TRUE	0.764	139.000	0.115	NA		NA
5743851	5743852	CLH_3017	CLH_3018			TRUE	0.913	79.000	0.431	0.011		NA
5743852	5743853	CLH_3018	CLH_3019			TRUE	0.864	93.000	0.235	0.011		NA
5743853	5743854	CLH_3019	CLH_3020			TRUE	0.817	141.000	0.214	1.000		NA
5743857	5743858	CLH_3023	CLH_3024			FALSE	0.014	285.000	0.000	NA		NA
5743859	5743860	CLH_3025	CLH_3026			TRUE	0.969	-13.000	0.222	NA		NA
5743860	5743861	CLH_3026	CLH_3027			FALSE	0.005	455.000	0.000	NA		NA
5743861	5743862	CLH_3027	CLH_3028			FALSE	0.055	196.000	0.000	NA		NA
5743864	5743865	CLH_3030	CLH_3031			FALSE	0.005	362.000	0.000	1.000	N	NA
5743865	5743866	CLH_3031	CLH_3032			TRUE	0.996	-13.000	0.640	1.000	Y	NA
5743866	5743867	CLH_3032	CLH_3033			TRUE	0.798	82.000	0.000	0.020	Y	NA
5743867	5743868	CLH_3033	CLH_3034			FALSE	0.003	680.000	0.000	1.000		NA
5743868	5743869	CLH_3034	CLH_3035			FALSE	0.276	351.000	0.583	0.083		NA
5743869	5743870	CLH_3035	CLH_3036			TRUE	0.918	45.000	0.182	NA		NA
5743870	5743871	CLH_3036	CLH_3037		lepB	TRUE	0.819	135.000	0.182	NA		NA
5743871	5743872	CLH_3037	CLH_3038	lepB	lepB	TRUE	0.809	67.000	0.000	0.001	Y	NA
5743872	5743873	CLH_3038	CLH_3039	lepB	lysA	FALSE	0.009	286.000	0.000	1.000	N	NA
5743873	5743874	CLH_3039	CLH_3040	lysA		FALSE	0.010	317.000	0.000	NA		NA
5743874	5743875	CLH_3040	CLH_3041			FALSE	0.137	151.000	0.000	NA		NA
5743875	5743876	CLH_3041	CLH_3042			FALSE	0.206	97.000	0.000	NA		NA
5743876	5743877	CLH_3042	CLH_3043			FALSE	0.004	605.000	0.000	NA		NA
5743877	5743878	CLH_3043	CLH_3044			FALSE	0.115	153.000	0.000	1.000		NA
5743880	5743881	CLH_3046	CLH_3047			FALSE	0.218	77.000	0.000	NA		NA
5743881	5743882	CLH_3047	CLH_3048			TRUE	0.986	17.000	0.400	NA		NA
5743882	5743883	CLH_3048	CLH_3049			TRUE	0.985	12.000	0.300	NA		NA
5743883	5743884	CLH_3049	CLH_3050			TRUE	0.986	11.000	0.333	NA		NA
5743884	5743885	CLH_3050	CLH_3051			TRUE	0.989	-3.000	0.667	NA		NA
5743885	5743886	CLH_3051	CLH_3052			TRUE	0.968	16.000	0.111	NA		NA
5743886	5743887	CLH_3052	CLH_3053			FALSE	0.239	255.000	0.000	NA	Y	NA
5743887	5743888	CLH_3053	CLH_3054			TRUE	0.950	23.000	0.000	NA	Y	NA
5743888	5743889	CLH_3054	CLH_3055			TRUE	0.951	109.000	0.141	1.000	Y	NA
5743889	5743890	CLH_3055	CLH_3056			TRUE	0.921	63.000	0.025	1.000	Y	NA
5743890	5743891	CLH_3056	CLH_3057			FALSE	0.004	539.000	0.000	NA		NA
5743891	5743892	CLH_3057	CLH_3058			FALSE	0.008	340.000	0.000	NA		NA
5743894	5743895	CLH_3060	CLH_3061			TRUE	0.876	163.000	0.088	0.001	Y	NA
5743895	5743896	CLH_3061	CLH_3062			TRUE	0.919	57.000	0.287	NA		NA
5743896	5743897	CLH_3062	CLH_3063			FALSE	0.008	351.000	0.000	NA		NA
5743899	5743900	CLH_3065	CLH_3066			FALSE	0.197	120.000	0.000	NA		NA
5743900	5743901	CLH_3066	CLH_3067			TRUE	0.844	67.000	0.125	NA		NA
5743901	5743902	CLH_3067	CLH_3068			TRUE	0.854	26.000	0.015	NA		NA
5743902	5743903	CLH_3068	CLH_3069			TRUE	0.871	43.000	0.077	NA		NA
5743903	5743904	CLH_3069	CLH_3070			FALSE	0.210	258.000	0.083	NA		NA
5743904	5743905	CLH_3070	CLH_3071			TRUE	0.989	4.000	0.576	0.003	N	NA
5743905	5743906	CLH_3071	CLH_3072			FALSE	0.012	296.000	0.000	NA		NA
5743906	5743907	CLH_3072	CLH_3073			FALSE	0.203	100.000	0.000	NA		NA
5743907	5743908	CLH_3073	CLH_3074			FALSE	0.004	1088.000	0.000	NA		NA
5743908	5743909	CLH_3074	CLH_3075			FALSE	0.004	880.000	0.000	NA		NA
5743909	5743910	CLH_3075	CLH_3076			FALSE	0.009	331.000	0.000	NA		NA
5743910	5743911	CLH_3076	CLH_3077			FALSE	0.154	93.000	0.000	1.000	N	NA
5743911	5743912	CLH_3077	CLH_3078			TRUE	0.977	19.000	0.250	NA		NA
5743912	5743913	CLH_3078	CLH_3079			FALSE	0.108	164.000	0.000	NA		NA
5743913	5743914	CLH_3079	CLH_3080			FALSE	0.006	399.000	0.000	NA		NA
5743914	5743915	CLH_3080	CLH_3081			TRUE	0.996	-6.000	0.471	0.029	Y	NA
5743915	5743916	CLH_3081	CLH_3082			TRUE	0.997	2.000	0.500	0.029	Y	NA
5743916	5743917	CLH_3082	CLH_3083			FALSE	0.471	122.000	0.002	1.000		NA
5743917	5743918	CLH_3083	CLH_3084		rumA	FALSE	0.036	210.000	0.000	1.000		NA
5743918	5743919	CLH_3084	CLH_3085	rumA		FALSE	0.027	231.000	0.000	NA		NA
5743919	5743920	CLH_3085	CLH_3086		pyk	FALSE	0.008	355.000	0.000	NA		NA
5743920	5743921	CLH_3086	CLH_3087	pyk	pfkA	TRUE	0.905	60.000	0.011	0.004	Y	NA
5743921	5743922	CLH_3087	CLH_3088	pfkA		FALSE	0.029	526.000	0.029	1.000	N	NA
5743922	5743923	CLH_3088	CLH_3089			FALSE	0.016	612.000	0.002	NA		NA
5743923	5743924	CLH_3089	CLH_3090			TRUE	0.895	17.000	0.009	NA		NA
5743924	5743925	CLH_3090	CLH_3091			TRUE	0.988	16.000	0.470	NA		NA
5743925	5743926	CLH_3091	CLH_3092			TRUE	0.979	-3.000	0.259	NA		NA
5743926	5743927	CLH_3092	CLH_3093		murB	FALSE	0.068	431.000	0.080	NA		NA
5743927	5743928	CLH_3093	CLH_3094	murB	uvrC	FALSE	0.500	73.000	0.003	1.000	N	NA
5743928	5743929	CLH_3094	CLH_3095	uvrC		FALSE	0.127	216.000	0.005	1.000	N	NA
5743929	5743930	CLH_3095	CLH_3096			TRUE	0.983	3.000	0.285	1.000	N	NA
5743930	5743931	CLH_3096	CLH_3097			TRUE	0.835	52.000	0.070	NA		NA
5743931	5743932	CLH_3097	CLH_3098		uvrA	FALSE	0.026	374.000	0.002	NA		NA
5743932	5743933	CLH_3098	CLH_3099	uvrA	uvrB	TRUE	0.994	5.000	0.154	0.001	Y	NA
5743933	5743934	CLH_3099	CLH_3100	uvrB		FALSE	0.022	536.000	0.013	1.000		NA
5743934	5743935	CLH_3100	CLH_3101			TRUE	0.953	11.000	0.060	0.006		NA
5743935	5743936	CLH_3101	CLH_3102			FALSE	0.033	376.000	0.015	1.000	N	NA
5743936	5743937	CLH_3102	CLH_3103		ftsE	TRUE	0.995	-10.000	0.431	1.000	Y	NA
5743937	5743938	CLH_3103	CLH_3104	ftsE		FALSE	0.551	118.000	0.010	NA		NA
5743940	5743941	CLH_3106	CLH_3107			TRUE	0.993	0.000	0.180	0.002	Y	NA
5743941	5743942	CLH_3107	CLH_3108			FALSE	0.080	275.000	0.019	1.000	N	NA
5743942	5743943	CLH_3108	CLH_3109			TRUE	0.982	10.000	0.221	NA		NA
5743943	5743944	CLH_3109	CLH_3110			FALSE	0.007	368.000	0.000	NA		NA
5743944	5743945	CLH_3110	CLH_3111			TRUE	0.783	66.000	0.064	NA		NA
5743945	5743946	CLH_3111	CLH_3112		acpS	TRUE	0.921	2.000	0.020	NA	N	NA
5743946	5743947	CLH_3112	CLH_3113	acpS		TRUE	0.637	75.000	0.020	NA		NA
5743947	5743948	CLH_3113	CLH_3114			FALSE	0.004	946.000	0.000	NA		NA
5743948	5743949	CLH_3114	CLH_3115			TRUE	0.845	72.000	0.150	1.000		NA
5743949	5743950	CLH_3115	CLH_3116			FALSE	0.007	353.000	0.000	1.000		NA
5743950	5743951	CLH_3116	CLH_3117			TRUE	0.923	1.000	0.023	1.000		NA
5743951	5743952	CLH_3117	CLH_3118			TRUE	0.947	14.000	0.045	1.000		NA
5743952	5743953	CLH_3118	CLH_3119			FALSE	0.006	395.000	0.000	NA		NA
5743955	5743956	CLH_3121	CLH_3122			TRUE	0.961	2.000	0.078	1.000		NA
5743956	5743957	CLH_3122	CLH_3123			FALSE	0.022	244.000	0.000	NA		NA
5743963	5743964	CLH_3129	CLH_3130		rrfM	TRUE	0.682	6.000	0.000	NA		NA
5743964	5743965	CLH_3130	CLH_3131	rrfM		FALSE	0.026	235.000	0.000	NA		NA
5743965	5743966	CLH_3131	CLH_3132			FALSE	0.005	437.000	0.000	NA		NA
5743966	5743967	CLH_3132	CLH_3133			FALSE	0.232	68.000	0.000	NA		NA
5743967	5743968	CLH_3133	CLH_3134			FALSE	0.109	156.000	0.000	1.000		NA
5743968	5743969	CLH_3134	CLH_3135			FALSE	0.026	226.000	0.000	1.000		NA
5743971	5743972	CLH_3137	CLH_3138		lpdA	TRUE	0.967	-7.000	0.167	1.000	N	NA
5743972	5743973	CLH_3138	CLH_3139	lpdA		TRUE	0.850	92.000	0.167	NA		NA
5743973	5743974	CLH_3139	CLH_3140			TRUE	0.883	104.000	0.286	NA		NA
5743974	5743975	CLH_3140	CLH_3141			FALSE	0.006	398.000	0.000	NA		NA
5743977	5743978	CLH_3143	CLH_3144			FALSE	0.025	239.000	0.000	NA		NA
5743978	5743979	CLH_3144	CLH_3145			FALSE	0.533	24.000	0.000	NA		NA
5743979	5743980	CLH_3145	CLH_3146			FALSE	0.267	242.000	0.000	1.000	Y	NA
5743980	5743981	CLH_3146	CLH_3147			TRUE	0.578	119.000	0.015	NA		NA
5743981	5743982	CLH_3147	CLH_3148		fusA	FALSE	0.438	164.000	0.021	NA		NA
5743983	5743984	CLH_3149	CLH_3150			FALSE	0.032	225.000	0.000	NA		NA
5743984	5743985	CLH_3150	CLH_3151			FALSE	0.097	355.000	0.000	0.001	Y	NA
5743986	5743987	CLH_3152	CLH_3153			FALSE	0.025	239.000	0.000	NA		NA
5743987	5743988	CLH_3153	CLH_3154			TRUE	0.782	171.000	0.333	NA		NA
5743990	5743991	CLH_3156	CLH_3157			TRUE	0.680	5.000	0.000	NA		NA
5743991	5743992	CLH_3157	CLH_3158		rrfA	TRUE	0.682	9.000	0.000	NA		NA
5743992	5743993	CLH_3158	CLH_3159	rrfA	rrlA	FALSE	0.267	58.000	0.000	NA		NA
5743993	5743994	CLH_3159	CLH_3161	rrlA	rrsA	FALSE	0.029	229.000	0.000	NA		NA
5743994	5743995	CLH_3161	CLH_3162	rrsA	glgD	FALSE	0.004	626.000	0.000	NA		NA
5743995	5743996	CLH_3162	CLH_3163	glgD	glgC	TRUE	0.993	22.000	0.309	0.001	Y	NA
5743996	5743997	CLH_3163	CLH_3164	glgC		TRUE	0.922	98.000	0.049	1.000	Y	NA
5743997	5743998	CLH_3164	CLH_3165			TRUE	0.903	169.000	0.186	0.013	Y	NA
5743998	5743999	CLH_3165	CLH_3166			TRUE	0.984	31.000	0.143	1.000	Y	NA
5743999	5744000	CLH_3166	CLH_3167		glgB	TRUE	0.892	143.000	0.050	1.000	Y	NA
5744000	5744001	CLH_3167	CLH_3168	glgB		FALSE	0.004	646.000	0.000	NA		NA
5744001	5744002	CLH_3168	CLH_3169		rrfB	TRUE	0.585	-8.000	0.000	NA		NA
5744002	5744003	CLH_3169	CLH_3170	rrfB	rrlB	FALSE	0.267	58.000	0.000	NA		NA
5744003	5744004	CLH_3170	CLH_3172	rrlB	rrsB	FALSE	0.029	229.000	0.000	NA		NA
5744006	5744007	CLH_3174	CLH_3175			FALSE	0.019	244.000	0.000	1.000		NA
5744007	5744008	CLH_3175	CLH_3176			FALSE	0.030	221.000	0.000	1.000		NA
5744008	5744009	CLH_3176	CLH_3177			FALSE	0.194	122.000	0.000	NA		NA
5744009	5744010	CLH_3177	CLH_3178			FALSE	0.289	53.000	0.000	NA		NA
5744010	5744011	CLH_3178	CLH_3179			FALSE	0.004	559.000	0.000	NA		NA
5744011	5744012	CLH_3179	CLH_3180			FALSE	0.003	461.000	0.000	1.000	N	NA
5744012	5744013	CLH_3180	CLH_3181			FALSE	0.005	510.000	0.000	NA		NA
5744013	5744014	CLH_3181	CLH_3182			FALSE	0.005	510.000	0.000	NA		NA
5744016	5744017	CLH_3184	CLH_3185			FALSE	0.082	178.000	0.000	NA		NA
5744017	5744018	CLH_3185	CLH_3186			TRUE	0.628	199.000	0.286	NA		NA
5744018	5744019	CLH_3186	CLH_3187			FALSE	0.007	362.000	0.000	NA		NA
5744019	5744020	CLH_3187	CLH_3188			FALSE	0.243	64.000	0.000	NA		NA
5744020	5744021	CLH_3188	CLH_3189			TRUE	0.970	54.000	1.000	NA		NA
5744021	5744022	CLH_3189	CLH_3190			FALSE	0.154	142.000	0.000	NA		NA
5744024	5744025	CLH_3192	CLH_3193			FALSE	0.130	154.000	0.000	NA		NA
5744025	5744026	CLH_3193	CLH_3194		galU	FALSE	0.010	310.000	0.000	NA		NA
5744026	5744027	CLH_3194	CLH_3195	galU	rfbB	TRUE	0.838	154.000	0.022	1.000	Y	NA
5744027	5744028	CLH_3195	CLH_3196	rfbB	rfbD	TRUE	0.939	83.000	0.088	0.003	Y	NA
5744028	5744029	CLH_3196	CLH_3197	rfbD	rfbC	TRUE	0.934	87.000	0.062	1.000	Y	NA
5744029	5744030	CLH_3197	CLH_3198	rfbC	rfbA	TRUE	0.989	23.000	0.139	1.000	Y	NA
5744030	5744031	CLH_3198	CLH_3199	rfbA		FALSE	0.004	408.000	0.000	1.000	N	NA
5744031	5744032	CLH_3199	CLH_3200			TRUE	0.957	19.000	0.091	NA		NA
5744032	5744033	CLH_3200	CLH_3201			FALSE	0.183	127.000	0.000	NA		NA
5744033	5744034	CLH_3201	CLH_3202			FALSE	0.005	496.000	0.000	NA		NA
5744034	5744035	CLH_3202	CLH_3203			FALSE	0.005	480.000	0.000	NA		NA
5744035	5744036	CLH_3203	CLH_3204			FALSE	0.557	-13.000	0.000	NA		NA
5744036	5744037	CLH_3204	CLH_3205			TRUE	0.668	14.000	0.000	NA		NA
5744037	5744038	CLH_3205	CLH_3206			TRUE	0.654	1.000	0.000	NA		NA
5744038	5744039	CLH_3206	CLH_3207			FALSE	0.329	46.000	0.000	NA		NA
5744039	5744040	CLH_3207	CLH_3208			FALSE	0.156	129.000	0.000	1.000		NA
5744040	5744041	CLH_3208	CLH_3209			TRUE	0.951	22.000	0.000	1.000	Y	NA
5744041	5744042	CLH_3209	CLH_3210			TRUE	0.970	14.000	0.000	NA	Y	NA
5744042	5744043	CLH_3210	CLH_3211			FALSE	0.088	402.000	0.000	NA	Y	NA
5744043	5744044	CLH_3211	CLH_3212			FALSE	0.347	180.000	0.027	1.000	N	NA
5744044	5744045	CLH_3212	CLH_3213			TRUE	0.989	13.000	0.500	1.000	N	NA
5744045	5744046	CLH_3213	CLH_3214		rfbC	FALSE	0.060	520.000	0.000	0.003	Y	NA
5744046	5744047	CLH_3214	CLH_3215	rfbC		FALSE	0.177	110.000	0.000	1.000		NA
5744047	5744048	CLH_3215	CLH_3216			FALSE	0.007	356.000	0.000	1.000		NA
5744048	5744049	CLH_3216	CLH_3217			FALSE	0.074	383.000	0.072	1.000		NA
5744049	5744050	CLH_3217	CLH_3218			FALSE	0.144	298.000	0.110	0.044	N	NA
5744050	5744051	CLH_3218	CLH_3219			FALSE	0.004	698.000	0.000	NA		NA
5744051	5744052	CLH_3219	CLH_3220			FALSE	0.214	90.000	0.000	NA		NA
5744052	5744053	CLH_3220	CLH_3221			TRUE	0.947	1.000	0.047	NA		NA
5744053	5744054	CLH_3221	CLH_3222			FALSE	0.008	349.000	0.000	NA		NA
5744054	5744055	CLH_3222	CLH_3223			TRUE	0.985	18.000	0.417	NA		NA
5744055	5744056	CLH_3223	CLH_3224		recR	FALSE	0.068	408.000	0.071	NA		NA
5744056	5744057	CLH_3224	CLH_3225	recR		FALSE	0.527	251.000	0.604	NA		NA
5744057	5744058	CLH_3225	CLH_3226		dnaX	TRUE	0.810	79.000	0.100	NA		NA
5744059	5744060	CLH_3227	CLH_3228	thyA	folA	TRUE	0.684	112.000	0.046	1.000	N	NA
5744061	5744062	CLH_3455	CLH_3229	srpB		FALSE	0.005	520.000	0.000	NA		NA
5744062	5744063	CLH_3229	CLH_3230			FALSE	0.079	179.000	0.000	NA		NA
5744063	5744064	CLH_3230	CLH_3231			FALSE	0.019	255.000	0.000	NA		NA
5744064	5744065	CLH_3231	CLH_3232			FALSE	0.087	79.000	0.000	0.015	N	NA
5744065	5744066	CLH_3232	CLH_3233			FALSE	0.037	328.000	0.005	1.000		NA
5744066	5744067	CLH_3233	CLH_3234			FALSE	0.006	359.000	0.000	1.000		NA
5744067	5744068	CLH_3234	CLH_3235			TRUE	0.992	-7.000	0.174	1.000	Y	NA
5744068	5744069	CLH_3235	CLH_3236			TRUE	0.946	19.000	0.070	1.000	N	NA
5744069	5744070	CLH_3236	CLH_3237			FALSE	0.438	176.000	0.042	1.000	N	NA
5744070	5744071	CLH_3237	CLH_3238			FALSE	0.005	503.000	0.000	NA		NA
5744071	5744072	CLH_3238	CLH_3239			FALSE	0.123	157.000	0.000	NA		NA
5744072	5744073	CLH_3239	CLH_3240			FALSE	0.042	211.000	0.000	NA		NA
5744073	5744074	CLH_3240	CLH_3241		trpA	FALSE	0.005	438.000	0.000	NA		NA
5744074	5744075	CLH_3241	CLH_3242	trpA		TRUE	0.817	-46.000	0.009	1.000	N	NA
5744075	5744076	CLH_3242	CLH_3243			TRUE	0.645	111.000	0.035	0.044		NA
5744078	5744079	CLH_3244	CLH_3246			TRUE	0.894	0.000	0.011	NA	N	NA
5744079	5744080	CLH_3246	CLH_3247			TRUE	0.898	16.000	0.011	NA	N	NA
5744080	5744081	CLH_3247	CLH_3248			TRUE	0.965	20.000	0.154	1.000		NA
5744081	5744082	CLH_3248	CLH_3249			TRUE	0.992	0.000	0.893	0.019		NA
5744082	5744083	CLH_3249	CLH_3250			TRUE	0.985	-3.000	0.429	1.000		NA
5744083	5744084	CLH_3250	CLH_3251			TRUE	0.968	22.000	0.214	1.000		NA
5744084	5744085	CLH_3251	CLH_3252			TRUE	0.918	66.000	0.375	1.000		NA
5744085	5744086	CLH_3252	CLH_3253			FALSE	0.068	468.000	0.000	0.035	Y	NA
5744086	5744087	CLH_3253	CLH_3254			FALSE	0.012	295.000	0.000	NA		NA
5744087	5744088	CLH_3254	CLH_3255			FALSE	0.010	321.000	0.000	NA		NA
5744088	5744089	CLH_3255	CLH_3256			FALSE	0.533	24.000	0.000	NA		NA
5744090	5744091	CLH_3257	CLH_3258			FALSE	0.088	156.000	0.000	1.000	N	NA
5744092	5744093	CLH_3259	CLH_3260			FALSE	0.203	100.000	0.000	NA		NA
5744093	5744094	CLH_3260	CLH_3261			FALSE	0.005	444.000	0.000	NA		NA
5744094	5744095	CLH_3261	CLH_3262			FALSE	0.058	193.000	0.000	NA		NA
5744097	5744098	CLH_3264	CLH_3265			TRUE	0.599	272.000	0.196	1.000	Y	NA
5744098	5744099	CLH_3265	CLH_3266			TRUE	0.998	-3.000	0.870	1.000	Y	NA
5744099	5744100	CLH_3266	CLH_3267			TRUE	0.997	-10.000	0.870	0.019	Y	NA
5744102	5744103	CLH_3269	CLH_3270		dapA	FALSE	0.003	597.000	0.000	1.000	N	NA
5744103	5744104	CLH_3270	CLH_3271	dapA		TRUE	0.864	109.000	0.222	NA		NA
5744106	5744107	CLH_3273	CLH_3274			FALSE	0.216	84.000	0.000	NA		NA
5744107	5744108	CLH_3274	CLH_3275		rrfC	FALSE	0.059	192.000	0.000	NA		NA
5744108	5744109	CLH_3275	CLH_3276	rrfC	rrlC	FALSE	0.267	58.000	0.000	NA		NA
5744109	5744110	CLH_3276	CLH_3278	rrlC	rrsC	FALSE	0.029	229.000	0.000	NA		NA
5744110	5744111	CLH_3278	CLH_3279	rrsC	rrfD	FALSE	0.004	1075.000	0.000	NA		NA
5744111	5744112	CLH_3279	CLH_3280	rrfD	rrlD	FALSE	0.267	58.000	0.000	NA		NA
5744112	5744113	CLH_3280	CLH_3282	rrlD	rrsD	FALSE	0.029	229.000	0.000	NA		NA
5744113	5744114	CLH_3282	CLH_3283	rrsD		FALSE	0.004	1193.000	0.000	NA		NA
5744114	10274105	CLH_3283	CLH_3284			FALSE	0.511	-128.000	0.000	NA		NA
10274105	5744115	CLH_3284	CLH_3285		rrfE	FALSE	0.012	297.000	0.000	NA		NA
5744115	5744116	CLH_3285	CLH_3286	rrfE	rrlE	FALSE	0.267	58.000	0.000	NA		NA
5744116	5744117	CLH_3286	CLH_3288	rrlE	rrsE	FALSE	0.029	229.000	0.000	NA		NA
5744117	5744118	CLH_3288	CLH_3289	rrsE	rrfF	FALSE	0.004	1075.000	0.000	NA		NA
5744118	5744119	CLH_3289	CLH_3290	rrfF	rrlF	FALSE	0.267	58.000	0.000	NA		NA
5744119	5744120	CLH_3290	CLH_3292	rrlF	rrsF	FALSE	0.029	229.000	0.000	NA		NA
5744120	5744121	CLH_3292	CLH_3293	rrsF	rrfG	FALSE	0.004	1134.000	0.000	NA		NA
5744121	5744122	CLH_3293	CLH_3294	rrfG	rrlG	FALSE	0.267	58.000	0.000	NA		NA
5744122	5744123	CLH_3294	CLH_3296	rrlG	rrsG	FALSE	0.029	229.000	0.000	NA		NA
5744123	5744124	CLH_3296	CLH_3297	rrsG		FALSE	0.015	279.000	0.000	NA		NA
5744124	5744125	CLH_3297	CLH_3298			FALSE	0.414	34.000	0.000	NA		NA
5744126	5744127	CLH_3299	CLH_3300			FALSE	0.029	222.000	0.000	1.000		NA
5744128	5744129	CLH_3301	CLH_3302		rrfN	TRUE	0.682	6.000	0.000	NA		NA
5744129	5744130	CLH_3302	CLH_3303	rrfN	motB	FALSE	0.015	275.000	0.000	NA		NA
5744130	5744131	CLH_3303	CLH_3304	motB		TRUE	0.994	5.000	0.144	1.000	Y	NA
5744131	5744132	CLH_3304	CLH_3305			FALSE	0.007	316.000	0.000	1.000	N	NA
5744132	5744133	CLH_3305	CLH_3306			FALSE	0.006	421.000	0.000	NA		NA
5744133	5744134	CLH_3306	CLH_3307		rrfH	TRUE	0.682	6.000	0.000	NA		NA
5744134	5744135	CLH_3307	CLH_3308	rrfH	rrlH	FALSE	0.181	128.000	0.000	NA		NA
5744135	5744136	CLH_3308	CLH_3310	rrlH	rrsH	FALSE	0.029	229.000	0.000	NA		NA
5744138	5744139	CLH_3312	CLH_3313			TRUE	0.995	-3.000	0.300	1.000	Y	NA
5744139	5744140	CLH_3313	CLH_3314			FALSE	0.165	125.000	0.000	1.000		NA
5744140	5744141	CLH_3314	CLH_3315			TRUE	0.989	-10.000	0.800	1.000		NA
5744141	5744142	CLH_3315	CLH_3316			FALSE	0.005	371.000	0.000	1.000	N	NA
5744142	5744143	CLH_3316	CLH_3317			FALSE	0.009	308.000	0.000	1.000		NA
5744143	5744144	CLH_3317	CLH_3318			FALSE	0.041	204.000	0.000	1.000		NA
5744144	5744145	CLH_3318	CLH_3319			FALSE	0.005	477.000	0.000	NA		NA
5744145	5744146	CLH_3319	CLH_3320			FALSE	0.041	212.000	0.000	NA		NA
5744146	5744147	CLH_3320	CLH_3321			TRUE	0.973	2.000	0.148	1.000		NA
5744147	5744148	CLH_3321	CLH_3322			TRUE	0.958	19.000	0.095	NA		NA
5744148	5744149	CLH_3322	CLH_3323			FALSE	0.007	382.000	0.000	NA		NA
5744149	5744150	CLH_3323	CLH_3324			TRUE	0.961	17.000	0.000	0.002	Y	NA
5744150	5744151	CLH_3324	CLH_3325			FALSE	0.191	80.000	0.000	1.000		NA
5744151	5744152	CLH_3325	CLH_3326			TRUE	0.717	71.000	0.052	0.010		NA
5744152	5744153	CLH_3326	CLH_3327			TRUE	0.986	3.000	0.026	0.006	Y	NA
5744153	5744154	CLH_3327	CLH_3328			TRUE	0.987	15.000	0.500	0.006	N	NA
5744154	5744155	CLH_3328	CLH_3329			FALSE	0.003	603.000	0.000	1.000	N	NA
5744155	5744156	CLH_3329	CLH_3330			FALSE	0.027	213.000	0.000	1.000	N	NA
5744156	5744157	CLH_3330	CLH_3331			TRUE	0.831	155.000	0.364	1.000	N	NA
5744157	5744158	CLH_3331	CLH_3332			FALSE	0.003	472.000	0.000	1.000	N	NA
5744158	5744159	CLH_3332	CLH_3333			TRUE	0.985	-7.000	0.041	NA	Y	NA
5744160	5744161	CLH_3334	CLH_3335			FALSE	0.005	502.000	0.000	NA		NA
5744162	5744163	CLH_3336	CLH_3337			TRUE	0.944	57.000	0.056	0.004	Y	NA
5744163	5744164	CLH_3337	CLH_3338			TRUE	0.980	16.000	0.267	1.000	N	NA
5744164	5744165	CLH_3338	CLH_3339			FALSE	0.397	212.000	0.000	1.000	Y	NA
5744165	5744166	CLH_3339	CLH_3340			FALSE	0.009	331.000	0.000	NA		NA
5744166	5744167	CLH_3340	CLH_3341			FALSE	0.016	272.000	0.000	NA		NA
5744167	5744168	CLH_3341	CLH_3342			FALSE	0.113	163.000	0.000	NA		NA
5744168	5744169	CLH_3342	CLH_3343			FALSE	0.013	290.000	0.000	NA		NA
5744169	5744170	CLH_3343	CLH_3344			FALSE	0.008	356.000	0.000	NA		NA
5744170	5744171	CLH_3344	CLH_3345			TRUE	0.606	63.000	0.008	NA		NA
5744171	5744172	CLH_3345	CLH_3346		murA	TRUE	0.875	35.000	0.058	1.000		NA
5744173	5744174	CLH_3347	CLH_3348			FALSE	0.473	177.000	0.049	NA		NA
5744174	5744175	CLH_3348	CLH_3349			TRUE	0.621	190.000	0.220	NA		NA
5744175	5744176	CLH_3349	CLH_3350			TRUE	0.845	58.000	0.097	NA		NA
5744176	5744177	CLH_3350	CLH_3351			TRUE	0.779	134.000	0.125	1.000		NA
5744179	5744180	CLH_3353	CLH_3354			TRUE	0.997	-7.000	0.600	NA	Y	NA
5744181	5744182	CLH_3355	CLH_3356			TRUE	0.606	19.000	0.000	NA		NA
5744182	5744183	CLH_3356	CLH_3357			TRUE	0.679	12.000	0.000	NA		NA
5744183	5744184	CLH_3357	CLH_3358			FALSE	0.448	31.000	0.000	NA		NA
5744184	5744185	CLH_3358	CLH_3359			TRUE	0.683	8.000	0.000	NA		NA
5744185	5744186	CLH_3359	CLH_3360			TRUE	0.680	5.000	0.000	NA		NA
5744186	5744187	CLH_3360	CLH_3361			TRUE	0.679	12.000	0.000	NA		NA
5744187	5744188	CLH_3361	CLH_3362			FALSE	0.459	30.000	0.000	NA		NA
5744188	5744189	CLH_3362	CLH_3363			TRUE	0.683	8.000	0.000	NA		NA
5744189	5744190	CLH_3363	CLH_3364			TRUE	0.680	5.000	0.000	NA		NA
5744190	5744191	CLH_3364	CLH_3365			TRUE	0.674	13.000	0.000	NA		NA
5744191	5744192	CLH_3365	CLH_3366			FALSE	0.201	115.000	0.000	NA		NA
5744194	5744195	CLH_3368	CLH_3369			FALSE	0.045	207.000	0.000	NA		NA
5744195	5744196	CLH_3369	CLH_3370		purA	FALSE	0.507	103.000	0.003	NA		NA
5744200	5744201	CLH_3374	CLH_3375	dnaB	lonC	TRUE	0.705	87.000	0.053	0.079	N	NA
5744201	5744202	CLH_3375	CLH_3376	lonC	rplI	TRUE	0.920	16.000	0.024	1.000	N	NA
5744202	5744203	CLH_3376	CLH_3377	rplI		TRUE	0.970	3.000	0.119	1.000	N	NA
5744203	5744204	CLH_3377	CLH_3378			TRUE	0.908	25.000	0.043	NA		NA
5744204	5744205	CLH_3378	CLH_3379		rpsR	FALSE	0.280	188.000	0.015	NA		NA
5744205	5744206	CLH_3379	CLH_3380	rpsR		TRUE	0.817	22.000	0.003	1.000	N	NA
5744206	5744207	CLH_3380	CLH_3381		rpsF	TRUE	0.876	14.000	0.003	1.000	N	NA
5744207	5744208	CLH_3381	CLH_3382	rpsF		TRUE	0.646	107.000	0.028	NA		NA
5744208	5744209	CLH_3382	CLH_3383			TRUE	0.969	0.000	0.121	NA		NA
5744209	5744210	CLH_3383	CLH_3384			TRUE	0.937	28.000	0.105	NA		NA
5744211	5744212	CLH_3385	CLH_3386			TRUE	0.993	16.000	0.148	1.000	Y	NA
5744212	5744213	CLH_3386	CLH_3387			FALSE	0.087	299.000	0.035	NA		NA
5744214	5744215	CLH_3388	CLH_3389			TRUE	0.839	41.000	0.047	NA		NA
5744215	5744216	CLH_3389	CLH_3390			TRUE	0.992	14.000	0.827	1.000	N	NA
5744216	5744217	CLH_3390	CLH_3391			FALSE	0.486	179.000	0.069	1.000	N	NA
5744217	5744218	CLH_3391	CLH_3392		gidB	FALSE	0.269	231.000	0.089	1.000	N	NA
5744218	5744219	CLH_3392	CLH_3393	gidB	gidA	TRUE	0.986	17.000	0.466	1.000	N	NA
5744219	5744220	CLH_3393	CLH_3394	gidA	trmE	TRUE	0.983	10.000	0.266	1.000		NA
5744220	5744221	CLH_3394	CLH_3395	trmE		FALSE	0.127	332.000	0.116	1.000		NA
5744221	5744222	CLH_3395	CLH_3396			FALSE	0.282	48.000	0.000	1.000		NA
5744222	5744223	CLH_3396	CLH_3397		rnpA	FALSE	0.031	207.000	0.000	1.000	N	NA
5744223	5744224	CLH_3397	CLH_3398	rnpA	rpmH	TRUE	0.954	63.000	0.787	1.000		NA