MicrobesOnline Operon Predictions for Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5716062 5716063 CLK_3133 CLK_3134 dnaA dnaN TRUE 0.557 263.000 0.328 1.000 Y NA
 5716063 5716064 CLK_3134 CLK_3135 dnaN   TRUE 0.968 20.000 0.103 1.000   NA
 5716064 5716065 CLK_3135 CLK_3136   recF TRUE 0.814 69.000 0.209 1.000   NA
 5716065 5716066 CLK_3136 CLK_3137 recF   TRUE 0.941 21.000 0.024 NA   NA
 5716066 5716067 CLK_3137 CLK_3138   gyrB TRUE 0.946 18.000 0.017 NA   NA
 5716067 5716068 CLK_3138 CLK_3139 gyrB gyrA TRUE 0.994 26.000 0.306 0.002 Y NA
 5716068 5716069 CLK_3139 CLK_3816 gyrA rrsA FALSE 0.006 416.000 0.000 NA   NA
 5716069 5716070 CLK_3816 CLK_3817 rrsA rrlA FALSE 0.068 222.000 0.000 NA   NA
 5716070 5716071 CLK_3817 CLK_3818 rrlA rrfA FALSE 0.319 94.000 0.000 NA   NA
 5716071 5716072 CLK_3818 CLK_3819 rrfA   TRUE 0.906 8.000 0.000 NA   NA
 5716072 5716073 CLK_3819 CLK_3820     TRUE 0.923 2.000 0.000 NA   NA
 5716073 5716074 CLK_3820 CLK_3149     FALSE 0.130 194.000 0.000 NA   NA
 5716074 5716075 CLK_3149 CLK_3150     TRUE 0.958 16.000 0.029 NA   NA
 5716075 5716076 CLK_3150 CLK_3151     TRUE 0.968 2.000 0.014 NA   NA
 5716076 5716077 CLK_3151 CLK_3152     TRUE 0.961 5.000 0.011 NA   NA
 5716077 5716078 CLK_3152 CLK_3153     TRUE 0.554 137.000 0.016 NA   NA
 5716078 5716079 CLK_3153 CLK_3154     TRUE 0.969 25.000 0.214 NA   NA
 5716079 5716080 CLK_3154 CLK_3155     TRUE 0.985 17.000 0.370 NA   NA
 5716080 5716081 CLK_3155 CLK_3156   serS FALSE 0.008 370.000 0.000 NA   NA
 5716081 5716082 CLK_3156 CLK_3822 serS   FALSE 0.029 275.000 0.000 NA   NA
 5716082 5716083 CLK_3822 CLK_3823     TRUE 0.861 19.000 0.000 NA   NA
 5716083 5716084 CLK_3823 CLK_3824     FALSE 0.017 305.000 0.000 NA   NA
 5716084 5716085 CLK_3824 CLK_3825     TRUE 0.861 19.000 0.000 NA   NA
 5716085 5716086 CLK_3825 CLK_3826     FALSE 0.338 83.000 0.000 NA   NA
 5716087 5716088 CLK_3158 CLK_3159 psd   TRUE 0.618 112.000 0.026 NA   NA
 5716088 5716089 CLK_3159 CLK_3160     FALSE 0.354 76.000 0.000 NA   NA
 5716090 5716091 CLK_3827 CLK_3162     FALSE 0.328 134.000 0.000 NA   NA
 5716091 5716092 CLK_3162 CLK_3163   megL FALSE 0.516 160.000 0.034 1.000 N NA
 5716092 5716093 CLK_3163 CLK_3164 megL   FALSE 0.327 124.000 0.000 1.000 N NA
 5716093 5716094 CLK_3164 CLK_3828     FALSE 0.224 165.000 0.000 NA   NA
 5716094 10253779 CLK_3828 CLK_3975   srpB FALSE 0.341 123.000 0.000 NA   NA
 10253779 5716095 CLK_3975 CLK_3165 srpB dnaX FALSE 0.230 164.000 0.000 NA   NA
 5716095 5716096 CLK_3165 CLK_3166 dnaX   TRUE 0.772 65.000 0.100 NA   NA
 5716096 5716097 CLK_3166 CLK_3167   recR TRUE 0.974 33.000 0.604 NA   NA
 5716097 5716098 CLK_3167 CLK_3168 recR   TRUE 0.803 57.000 0.071 NA   NA
 5716098 5716099 CLK_3168 CLK_3169   bofA TRUE 0.803 150.000 0.417 NA   NA
 5716099 5716100 CLK_3169 CLK_3170 bofA sfsA FALSE 0.453 151.000 0.005 NA   NA
 5716100 5716101 CLK_3170 CLK_3171 sfsA   TRUE 0.715 56.000 0.015 NA   NA
 5716101 5716102 CLK_3171 CLK_3172     FALSE 0.372 118.000 0.000 1.000   NA
 5716102 5716103 CLK_3172 CLK_3173     FALSE 0.348 134.000 0.000 1.000   NA
 5716103 5716104 CLK_3173 CLK_3174     TRUE 0.978 19.000 0.222 NA   NA
 5716104 5716105 CLK_3174 CLK_3175     FALSE 0.008 383.000 0.000 NA   NA
 5716105 5716106 CLK_3175 CLK_3176     FALSE 0.507 83.000 0.007 NA N NA
 5716106 5716107 CLK_3176 CLK_3177     TRUE 0.920 29.000 0.035 NA N NA
 5716107 5716108 CLK_3177 CLK_3830   rrsB FALSE 0.007 387.000 0.000 NA   NA
 5716108 5716109 CLK_3830 CLK_3831 rrsB rrlB FALSE 0.068 222.000 0.000 NA   NA
 5716109 5716110 CLK_3831 CLK_3832 rrlB rrfB FALSE 0.533 52.000 0.000 NA   NA
 5716110 5716111 CLK_3832 CLK_3833 rrfB   TRUE 0.910 6.000 0.000 NA   NA
 5716113 5716114 CLK_3834 CLK_3835 rrsC rrlC FALSE 0.068 222.000 0.000 NA   NA
 5716114 5716115 CLK_3835 CLK_3836 rrlC rrfC FALSE 0.533 52.000 0.000 NA   NA
 5716115 5716116 CLK_3836 CLK_3837 rrfC   TRUE 0.910 6.000 0.000 NA   NA
 5716116 5716117 CLK_3837 CLK_3193     FALSE 0.010 355.000 0.000 NA   NA
 5716117 5716118 CLK_3193 CLK_3194     TRUE 0.995 -3.000 0.800 NA   NA
 5716118 5716119 CLK_3194 CLK_3838   rrsD FALSE 0.003 645.000 0.000 NA   NA
 5716119 5716120 CLK_3838 CLK_3839 rrsD rrlD FALSE 0.068 222.000 0.000 NA   NA
 5716120 5716121 CLK_3839 CLK_3840 rrlD rrfD TRUE 0.543 51.000 0.000 NA   NA
 5716121 5716122 CLK_3840 CLK_3841 rrfD   TRUE 0.908 7.000 0.000 NA   NA
 5716122 5716123 CLK_3841 CLK_3203     FALSE 0.038 261.000 0.000 NA   NA
 5716123 5716124 CLK_3203 CLK_3204     FALSE 0.012 332.000 0.000 NA   NA
 5716124 5716125 CLK_3204 CLK_3205     FALSE 0.311 142.000 0.000 NA   NA
 5716125 5716126 CLK_3205 CLK_3842   rrsE FALSE 0.003 719.000 0.000 NA   NA
 5716126 5716127 CLK_3842 CLK_3843 rrsE rrlE FALSE 0.068 222.000 0.000 NA   NA
 5716127 5716128 CLK_3843 CLK_3844 rrlE rrfE TRUE 0.543 51.000 0.000 NA   NA
 5716128 5716129 CLK_3844 CLK_3845 rrfE   TRUE 0.908 7.000 0.000 NA   NA
 5716129 5716130 CLK_3845 CLK_3214     FALSE 0.316 140.000 0.000 NA   NA
 5716130 5716131 CLK_3214 CLK_3846   rrsF FALSE 0.004 522.000 0.000 NA   NA
 5716131 5716132 CLK_3846 CLK_3847 rrsF rrlF FALSE 0.068 222.000 0.000 NA   NA
 5716132 5716133 CLK_3847 CLK_3848 rrlF rrfF FALSE 0.533 52.000 0.000 NA   NA
 5716133 5716134 CLK_3848 CLK_3222 rrfF   FALSE 0.329 133.000 0.000 NA   NA
 5716134 5716135 CLK_3222 CLK_3223     FALSE 0.456 59.000 0.000 NA   NA
 5716135 5716136 CLK_3223 CLK_3849     FALSE 0.341 82.000 0.000 NA   NA
 5716137 5716138 CLK_3225 CLK_3226     TRUE 0.884 36.000 0.039 NA N NA
 5716141 5716142 CLK_3229 CLK_3230     TRUE 0.989 -21.000 0.120 NA   NA
 5716142 5716143 CLK_3230 CLK_3231     TRUE 0.939 24.000 0.034 1.000 N NA
 5716143 5716144 CLK_3231 CLK_3232     TRUE 0.640 81.000 0.034 NA   NA
 5716144 5716145 CLK_3232 CLK_3233     TRUE 0.946 18.000 0.018 NA   NA
 5716145 5716146 CLK_3233 CLK_3234     TRUE 0.991 2.000 0.372 NA   NA
 5716146 5716147 CLK_3234 CLK_3235     TRUE 0.955 12.000 0.011 NA   NA
 5716147 5716148 CLK_3235 CLK_3236     TRUE 0.826 82.000 0.333 1.000   NA
 5716148 5716149 CLK_3236 CLK_3237     TRUE 0.550 121.000 0.006 1.000   NA
 5716149 5716150 CLK_3237 CLK_3238     TRUE 0.971 20.000 0.078 0.007   NA
 5716150 5716151 CLK_3238 CLK_3239     FALSE 0.409 156.000 0.002 NA   NA
 5716153 5716154 CLK_3241 CLK_3242   arcA FALSE 0.006 422.000 0.000 1.000   NA
 5716158 5716159 CLK_3246 CLK_3247 spmA   TRUE 0.993 13.000 0.655 0.003   NA
 5716161 5716162 CLK_3249 CLK_3250 udgA   TRUE 0.901 29.000 0.016 1.000 N NA
 5716162 5716163 CLK_3250 CLK_3251   metG FALSE 0.008 381.000 0.000 1.000 N NA
 5716163 5716164 CLK_3251 CLK_3252 metG   FALSE 0.369 165.000 0.003 NA   NA
 5716164 5716165 CLK_3252 CLK_3253     FALSE 0.447 151.000 0.004 NA   NA
 5716165 5716166 CLK_3253 CLK_3254     FALSE 0.060 227.000 0.000 NA   NA
 5716166 5716167 CLK_3254 CLK_3255     TRUE 0.629 73.000 0.020 1.000   NA
 5716167 5716168 CLK_3255 CLK_3256   ksgA TRUE 0.983 2.000 0.093 1.000 N NA
 5716168 5716169 CLK_3256 CLK_3257 ksgA   TRUE 0.555 79.000 0.010 NA   NA
 5716169 5716170 CLK_3257 CLK_3258     TRUE 0.735 157.000 0.278 NA   NA
 5716170 5716171 CLK_3258 CLK_3259     TRUE 0.638 168.000 0.188 NA   NA
 5716171 5716172 CLK_3259 CLK_3260     TRUE 0.625 168.000 0.167 NA   NA
 5716172 5716173 CLK_3260 CLK_3261     TRUE 0.988 11.000 0.350 1.000 N NA
 5716173 5716174 CLK_3261 CLK_3262     TRUE 0.998 -3.000 0.349 NA Y NA
 5716174 5716175 CLK_3262 CLK_3263     TRUE 0.567 82.000 0.019 NA N NA
 5716175 5716176 CLK_3263 CLK_3264     FALSE 0.336 140.000 0.000 1.000   NA
 5716178 5716179 CLK_3266 CLK_3267     TRUE 0.764 57.000 0.037 NA   NA
 5716179 5716180 CLK_3267 CLK_3268   nrdD FALSE 0.022 290.000 0.000 NA   NA
 5716180 5716181 CLK_3268 CLK_3269 nrdD nrdG TRUE 0.986 17.000 0.315 0.001 N NA
 5716182 5716183 CLK_3270 CLK_3271     FALSE 0.328 134.000 0.000 NA   NA
 5716183 5716184 CLK_3271 CLK_3272     TRUE 0.984 2.000 0.111 NA   NA
 5716184 5716185 CLK_3272 CLK_3273     FALSE 0.345 121.000 0.000 NA   NA
 5716186 5716187 CLK_3274 CLK_3275 ileS   FALSE 0.464 151.000 0.009 1.000 N NA
 5716187 5716188 CLK_3275 CLK_3276     FALSE 0.181 216.000 0.017 1.000 N NA
 5716188 5716189 CLK_3276 CLK_3277     TRUE 0.766 75.000 0.160 1.000 N NA
 5716189 5716190 CLK_3277 CLK_3278     FALSE 0.012 336.000 0.000 NA   NA
 5716190 5716191 CLK_3278 CLK_3279     TRUE 0.978 5.000 0.066 NA   NA
 5716191 5716192 CLK_3279 CLK_3280     TRUE 0.976 20.000 0.210 1.000   NA
 5716192 5716193 CLK_3280 CLK_3281     FALSE 0.068 225.000 0.000 1.000   NA
 5716193 5716194 CLK_3281 CLK_3282     TRUE 0.614 187.000 0.333 1.000   NA
 5716196 5716197 CLK_3284 CLK_3285     TRUE 0.978 15.000 0.143 NA   NA
 5716197 5716198 CLK_3285 CLK_3286     TRUE 0.968 27.000 0.250 NA   NA
 5716198 5716199 CLK_3286 CLK_3287     TRUE 0.992 13.000 0.800 NA   NA
 5716201 5716202 CLK_3289 CLK_3290 cotS   TRUE 0.736 124.000 0.119 NA   NA
 5716202 5716203 CLK_3290 CLK_3291     TRUE 0.938 -7.000 0.000 NA   NA
 5716203 5716204 CLK_3291 CLK_3292     TRUE 0.699 36.000 0.000 NA   NA
 5716204 5716205 CLK_3292 CLK_3293     TRUE 0.694 104.000 0.082 NA   NA
 5716205 5716206 CLK_3293 CLK_3294   cphB FALSE 0.425 198.000 0.109 1.000   NA
 5716206 5716207 CLK_3294 CLK_3295 cphB cphA TRUE 0.950 44.000 0.605 1.000 N NA
 5716207 5716208 CLK_3295 CLK_3296 cphA ispE TRUE 0.543 93.000 0.016 1.000 N NA
 5716208 5716209 CLK_3296 CLK_3297 ispE   FALSE 0.043 296.000 0.005 NA   NA
 5716209 5716210 CLK_3297 CLK_3298     TRUE 0.813 61.000 0.133 NA   NA
 5716210 5716211 CLK_3298 CLK_3299     TRUE 0.984 20.000 0.333 0.006   NA
 5716211 5716212 CLK_3299 CLK_3300     TRUE 0.946 50.000 0.500 0.006   NA
 5716212 5716213 CLK_3300 CLK_3301     TRUE 0.744 74.000 0.109 NA   NA
 5716215 5716216 CLK_3303 CLK_3304 ypeB   FALSE 0.510 103.000 0.003 1.000   NA
 5716216 5716217 CLK_3304 CLK_3305     TRUE 0.913 25.000 0.011 NA   NA
 5716217 5716218 CLK_3305 CLK_3306     TRUE 0.634 132.000 0.039 NA   NA
 5716218 5716219 CLK_3306 CLK_3307   pyrG FALSE 0.103 234.000 0.004 NA   NA
 5716219 5716220 CLK_3307 CLK_3308 pyrG   FALSE 0.034 267.000 0.000 NA   NA
 5716220 5716221 CLK_3308 CLK_3309   rho FALSE 0.348 172.000 0.006 NA   NA
 5716223 5716224 CLK_3311 CLK_3312 tdk   TRUE 0.942 17.000 0.010 NA   NA
 5716224 5716225 CLK_3312 CLK_3313     TRUE 0.980 8.000 0.098 NA   NA
 5716225 5716226 CLK_3313 CLK_3314   prfA TRUE 0.913 82.000 0.081 1.000 Y NA
 5716226 5716227 CLK_3314 CLK_3315 prfA   TRUE 0.898 28.000 0.009 NA   NA
 5716227 5716228 CLK_3315 CLK_3316     TRUE 0.817 59.000 0.116 NA   NA
 5716228 5716229 CLK_3316 CLK_3317     TRUE 0.952 21.000 0.052 NA N NA
 5716229 5716230 CLK_3317 CLK_3318     TRUE 0.973 9.000 0.056 NA N NA
 5716230 5716231 CLK_3318 CLK_3319   rpiB TRUE 0.770 60.000 0.065 1.000 N NA
 5716231 5716232 CLK_3319 CLK_3320 rpiB upp TRUE 0.901 30.000 0.019 1.000 N NA
 5716232 5716233 CLK_3320 CLK_3321 upp   FALSE 0.062 514.000 0.041 1.000 Y NA
 5716233 5716234 CLK_3321 CLK_3322   tagO TRUE 0.611 108.000 0.029 1.000 N NA
 5716234 5716235 CLK_3322 CLK_3323 tagO mnaA TRUE 0.996 14.000 0.346 1.000 Y NA
 5716235 5716236 CLK_3323 CLK_3324 mnaA   FALSE 0.005 492.000 0.000 1.000   NA
 5716236 5716237 CLK_3324 CLK_3325   atpB TRUE 0.985 15.000 0.330 1.000   NA
 5716237 5716238 CLK_3325 CLK_3326 atpB atpE TRUE 0.851 40.000 0.009 0.007   NA
 5716238 5716239 CLK_3326 CLK_3327 atpE atpF TRUE 0.773 76.000 0.095 0.007   NA
 5716239 5716240 CLK_3327 CLK_3328 atpF atpH TRUE 0.996 3.000 0.040 0.007 Y NA
 5716240 5716241 CLK_3328 CLK_3329 atpH atpA TRUE 0.998 11.000 0.864 0.007 Y NA
 5716241 5716242 CLK_3329 CLK_3330 atpA atpG TRUE 0.997 22.000 0.846 0.007 Y NA
 5716242 5716243 CLK_3330 CLK_3331 atpG atpD TRUE 0.998 14.000 0.724 0.007 Y NA
 5716243 5716244 CLK_3331 CLK_3332 atpD atpC TRUE 0.997 25.000 0.837 0.007 Y NA
 5716244 5716245 CLK_3332 CLK_3333 atpC   FALSE 0.245 195.000 0.007 NA   NA
 5716245 5716246 CLK_3333 CLK_3334   murA TRUE 0.977 24.000 0.346 NA   NA
 5716246 5716247 CLK_3334 CLK_3335 murA spoIID FALSE 0.256 246.000 0.243 1.000 N NA
 5716247 5716248 CLK_3335 CLK_3336 spoIID   FALSE 0.028 405.000 0.090 1.000 N NA
 5716248 5716249 CLK_3336 CLK_3337   spoIIID TRUE 0.720 108.000 0.093 1.000   NA
 5716249 5716250 CLK_3337 CLK_3338 spoIIID   TRUE 0.801 100.000 0.284 1.000   NA
 5716251 5716252 CLK_3339 CLK_3340     TRUE 0.752 49.000 0.010 NA   NA
 5716253 5716254 CLK_3852 CLK_3853     TRUE 0.912 5.000 0.000 NA   NA
 5716254 5716255 CLK_3853 CLK_3854     TRUE 0.898 12.000 0.000 NA   NA
 5716255 5716256 CLK_3854 CLK_3855     TRUE 0.873 17.000 0.000 NA   NA
 5716256 5716257 CLK_3855 CLK_3856     TRUE 0.912 5.000 0.000 NA   NA
 5716257 5716258 CLK_3856 CLK_3345     FALSE 0.325 101.000 0.000 NA   NA
 5716258 5716259 CLK_3345 CLK_3346   metK FALSE 0.335 84.000 0.000 NA   NA
 5716259 5716260 CLK_3346 CLK_3347 metK   FALSE 0.376 191.000 0.052 1.000 N NA
 5716260 5716261 CLK_3347 CLK_3348     TRUE 0.942 26.000 0.051 NA   NA
 5716261 5716262 CLK_3348 CLK_3349     TRUE 0.990 -27.000 0.130 NA   NA
 5716262 5716263 CLK_3349 CLK_3350   yfiA FALSE 0.024 425.000 0.080 NA   NA
 5716263 5716264 CLK_3350 CLK_3351 yfiA secA FALSE 0.184 228.000 0.050 NA N NA
 5716264 5716265 CLK_3351 CLK_3352 secA prfB FALSE 0.033 364.000 0.048 1.000 N NA
 5716267 5716268 CLK_3354 CLK_3355     FALSE 0.024 285.000 0.000 NA   NA
 5716268 5716269 CLK_3355 CLK_3356     FALSE 0.024 362.000 0.016 NA   NA
 5716269 5716270 CLK_3356 CLK_3357     TRUE 0.984 21.000 0.500 NA   NA
 5716270 5716271 CLK_3357 CLK_3358     TRUE 0.974 14.000 0.077 1.000   NA
 5716271 5716272 CLK_3358 CLK_3359     TRUE 0.601 84.000 0.022 1.000   NA
 5716272 5716273 CLK_3359 CLK_3360     TRUE 0.907 40.000 0.109 1.000   NA
 5716275 5716276 CLK_3362 CLK_3363     FALSE 0.281 151.000 0.000 NA   NA
 5716277 5716278 CLK_3364 CLK_3365 leuS   FALSE 0.006 401.000 0.000 NA N NA
 5716278 5716279 CLK_3365 CLK_3860     FALSE 0.219 166.000 0.000 NA   NA
 5716279 5716280 CLK_3860 CLK_3367     FALSE 0.522 53.000 0.000 NA   NA
 5716280 5716281 CLK_3367 CLK_3368     TRUE 0.816 25.000 0.000 NA   NA
 5716281 5716282 CLK_3368 CLK_3369     TRUE 0.942 -13.000 0.000 NA   NA
 5716282 5716283 CLK_3369 CLK_3370     TRUE 0.982 4.000 0.098 NA   NA
 5716285 5716286 CLK_3372 CLK_3373 fba   FALSE 0.061 226.000 0.000 NA   NA
 5716286 5716287 CLK_3373 CLK_3374     TRUE 0.714 117.000 0.082 NA   NA
 5716288 5716289 CLK_3375 CLK_3376     FALSE 0.003 665.000 0.000 NA   NA
 5716291 5716292 CLK_3378 CLK_3379     TRUE 0.718 106.000 0.094 1.000   NA
 5716292 5716293 CLK_3379 CLK_3380     TRUE 0.821 74.000 0.281 NA   NA
 5716295 5716296 CLK_3382 CLK_3383   sleB FALSE 0.228 225.000 0.041 0.068   NA
 5716296 5716297 CLK_3383 CLK_3384 sleB cysK FALSE 0.010 364.000 0.000 1.000   NA
 5716297 5716298 CLK_3384 CLK_3385 cysK cysE TRUE 0.995 15.000 0.101 0.002 Y NA
 5716298 5716299 CLK_3385 CLK_3386 cysE   TRUE 0.955 22.000 0.064 1.000 N NA
 5716299 5716300 CLK_3386 CLK_3387     TRUE 0.629 148.000 0.064 1.000 N NA
 5716300 5716301 CLK_3387 CLK_3388   nth FALSE 0.519 93.000 0.011 1.000 N NA
 5716301 5716302 CLK_3388 CLK_3389 nth   FALSE 0.007 384.000 0.000 1.000 N NA
 5716303 5716304 CLK_3390 CLK_3391     FALSE 0.292 148.000 0.000 NA   NA
 5716306 5716307 CLK_3393 CLK_3394     TRUE 0.901 26.000 0.004 1.000   NA
 5716307 5716308 CLK_3394 CLK_3395     TRUE 0.583 110.000 0.018 NA   NA
 5716309 5716310 CLK_3396 CLK_3397     FALSE 0.472 206.000 0.000 NA Y NA
 5716310 5716311 CLK_3397 CLK_3398   splB TRUE 0.558 147.000 0.027 1.000 N NA
 5716311 5716312 CLK_3398 CLK_3399 splB   FALSE 0.035 309.000 0.008 1.000 N NA
 5716312 5716313 CLK_3399 CLK_3400     TRUE 0.956 13.000 0.016 NA   NA
 5716313 5716314 CLK_3400 CLK_3401     FALSE 0.021 294.000 0.000 NA   NA
 5716314 5716315 CLK_3401 CLK_3402     FALSE 0.495 183.000 0.097 1.000   NA
 5716315 5716316 CLK_3402 CLK_3403     TRUE 0.992 2.000 0.438 1.000   NA
 5716316 5716317 CLK_3403 CLK_3404     TRUE 0.996 -7.000 0.720 0.038   NA
 5716317 5716318 CLK_3404 CLK_3405     TRUE 0.555 112.000 0.007 1.000   NA
 5716318 5716319 CLK_3405 CLK_3406   rpoN FALSE 0.064 330.000 0.125 1.000 N NA
 5716319 5716320 CLK_3406 CLK_3407 rpoN cggR FALSE 0.274 288.000 0.034 1.000 Y NA
 5716320 5716321 CLK_3407 CLK_3408 cggR gap TRUE 0.826 78.000 0.348 1.000 N NA
 5716321 5716322 CLK_3408 CLK_3409 gap pgk FALSE 0.311 297.000 0.063 0.004 Y NA
 5716322 5716323 CLK_3409 CLK_3410 pgk tpiA TRUE 0.947 62.000 0.141 1.000 Y NA
 5716323 5716324 CLK_3410 CLK_3411 tpiA gpmI TRUE 0.922 87.000 0.138 1.000 Y NA
 5716324 5716325 CLK_3411 CLK_3412 gpmI eno TRUE 0.931 56.000 0.016 1.000 Y NA
 5716325 5716326 CLK_3412 CLK_3413 eno secG FALSE 0.126 224.000 0.006 1.000 N NA
 5716326 5716327 CLK_3413 CLK_3414 secG rnr FALSE 0.288 210.000 0.064 1.000 N NA
 5716327 5716328 CLK_3414 CLK_3415 rnr surE FALSE 0.007 401.000 0.000 1.000   NA
 5716328 5716329 CLK_3415 CLK_3416 surE smpB FALSE 0.044 257.000 0.000 1.000   NA
 5716331 5716332 CLK_3418 CLK_3419     FALSE 0.003 728.000 0.000 NA   NA
 5716336 5716337 CLK_3423 CLK_3424     FALSE 0.160 187.000 0.000 1.000   NA
 5716337 5716338 CLK_3424 CLK_3425     FALSE 0.010 360.000 0.000 1.000   NA
 5716338 5716339 CLK_3425 CLK_3426     FALSE 0.004 490.000 0.000 NA   NA
 5716339 5716340 CLK_3426 CLK_3427     FALSE 0.003 665.000 0.000 NA   NA
 5716340 5716341 CLK_3427 CLK_3428   lysP FALSE 0.004 547.000 0.000 NA   NA
 5716341 5716342 CLK_3428 CLK_3429 lysP   FALSE 0.004 542.000 0.000 1.000   NA
 5716342 5716343 CLK_3429 CLK_3430     FALSE 0.336 140.000 0.000 1.000   NA
 5716343 5716344 CLK_3430 CLK_3431     TRUE 0.681 39.000 0.000 1.000   NA
 5716344 5716345 CLK_3431 CLK_3432     TRUE 0.942 28.000 0.033 0.017   NA
 5716345 5716346 CLK_3432 CLK_3433     FALSE 0.153 189.000 0.000 1.000   NA
 5716346 5716347 CLK_3433 CLK_3434     FALSE 0.046 263.000 0.000 0.069 N NA
 5716347 5716348 CLK_3434 CLK_3435     TRUE 0.913 50.000 0.000 1.000 Y NA
 5716348 5716349 CLK_3435 CLK_3436     FALSE 0.311 100.000 0.000 1.000 N NA
 5716349 5716350 CLK_3436 CLK_3437     TRUE 0.986 3.000 0.182 NA   NA
 5716350 5716351 CLK_3437 CLK_3438     TRUE 0.992 8.000 0.667 NA   NA
 5716353 5716354 CLK_3440 CLK_3441     TRUE 0.999 0.000 0.800 0.038 Y NA
 5716354 5716355 CLK_3441 CLK_3442     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.050 Y NA
 5716355 5716356 CLK_3442 CLK_3443     FALSE 0.007 400.000 0.000 NA   NA
 5716356 5716357 CLK_3443 CLK_3444     TRUE 0.983 11.000 0.167 NA   NA
 5716357 5716358 CLK_3444 CLK_3445     TRUE 0.994 22.000 0.318 1.000 Y NA
 5716358 5716359 CLK_3445 CLK_3446     TRUE 0.954 25.000 0.091 1.000 N NA
 5716359 5716360 CLK_3446 CLK_3447     TRUE 0.938 137.000 0.278 1.000 Y NA
 5716361 5716362 CLK_3448 CLK_3449     FALSE 0.308 92.000 0.000 1.000 N NA
 5716363 5716364 CLK_3450 CLK_3451     TRUE 0.855 74.000 0.455 1.000 N NA
 5716364 5716365 CLK_3451 CLK_3452     TRUE 0.999 -22.000 0.455 1.000 Y NA
 5716367 5716368 CLK_3454 CLK_3455 glvA   TRUE 0.897 168.000 0.294 1.000 Y NA
 5716369 5716370 CLK_3456 CLK_3457     TRUE 0.997 16.000 0.500 0.004 Y NA
 5716371 5716372 CLK_3458 CLK_3459     TRUE 0.901 8.000 0.000 1.000 N NA
 5716372 5716373 CLK_3459 CLK_3460     TRUE 0.996 10.000 0.235 1.000 Y NA
 5716373 5716374 CLK_3460 CLK_3461     TRUE 0.827 120.000 0.353 1.000 N NA
 5716374 5716375 CLK_3461 CLK_3462     TRUE 0.985 14.000 0.286 NA   NA
 5716375 5716376 CLK_3462 CLK_3463   alr FALSE 0.048 240.000 0.000 NA   NA
 5716376 5716377 CLK_3463 CLK_3464 alr   FALSE 0.004 519.000 0.000 1.000 N NA
 5716377 5716378 CLK_3464 CLK_3465   glvA FALSE 0.115 316.000 0.000 1.000 Y NA
 5716378 5716379 CLK_3465 CLK_3466 glvA   TRUE 0.617 183.000 0.000 1.000 Y NA
 5716379 5716380 CLK_3466 CLK_3467     FALSE 0.023 285.000 0.000 1.000 N NA
 5716382 5716383 CLK_3469 CLK_3470     FALSE 0.298 146.000 0.000 NA   NA
 5716383 5716384 CLK_3470 CLK_3471     FALSE 0.343 81.000 0.000 NA   NA
 5716384 5716385 CLK_3471 CLK_3472     FALSE 0.005 436.000 0.000 NA   NA
 5716385 5716386 CLK_3472 CLK_3473     TRUE 0.668 156.000 0.158 NA N NA
 5716386 5716387 CLK_3473 CLK_3474     TRUE 0.935 27.000 0.035 1.000   NA
 5716387 5716388 CLK_3474 CLK_3475     FALSE 0.008 386.000 0.000 1.000   NA
 5716388 5716389 CLK_3475 CLK_3476     TRUE 0.827 104.000 0.000 0.038 Y NA
 5716389 5716390 CLK_3476 CLK_3477     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.038 Y NA
 5716390 5716391 CLK_3477 CLK_3478     TRUE 0.923 1.000 0.000 1.000 N NA
 5716391 5716392 CLK_3478 CLK_3479     TRUE 0.919 2.000 0.000 1.000 N NA
 5716392 5716393 CLK_3479 CLK_3480     FALSE 0.004 468.000 0.000 1.000 N NA
 5716393 5716394 CLK_3480 CLK_3481     TRUE 0.833 119.000 0.385 1.000 N NA
 5716394 5716395 CLK_3481 CLK_3482   glvA TRUE 0.561 266.000 0.385 1.000 Y NA
 5716395 5716396 CLK_3482 CLK_3483 glvA   TRUE 0.997 13.000 0.375 1.000 Y NA
 5716396 5716397 CLK_3483 CLK_3484   ilvD TRUE 0.938 138.000 0.286 1.000 Y NA
 5716397 5716398 CLK_3484 CLK_3485 ilvD eda TRUE 0.964 52.000 0.091 0.067 Y NA
 5716398 5716399 CLK_3485 CLK_3486 eda   TRUE 0.996 2.000 0.091 1.000 Y NA
 5716401 5716402 CLK_3488 CLK_3489 ade   FALSE 0.006 403.000 0.000 1.000 N NA
 5716402 5716403 CLK_3489 CLK_3490     TRUE 0.999 0.000 0.889 1.000 Y NA
 5716403 5716404 CLK_3490 CLK_3491     FALSE 0.006 397.000 0.000 NA N NA
 5716404 5716405 CLK_3491 CLK_3492     TRUE 0.944 -16.000 0.000 NA   NA
 5716405 5716406 CLK_3492 CLK_3493     TRUE 0.889 118.000 0.750 NA   NA
 5716406 5716407 CLK_3493 CLK_3494     FALSE 0.012 341.000 0.000 NA   NA
 5716407 5716408 CLK_3494 CLK_3495     FALSE 0.034 263.000 0.000 1.000 N NA
 5716408 5716409 CLK_3495 CLK_3496     TRUE 0.997 3.000 0.167 1.000 Y NA
 5716409 5716410 CLK_3496 CLK_3497     TRUE 0.998 2.000 0.750 1.000 Y NA
 5716410 5716411 CLK_3497 CLK_3498     TRUE 0.705 35.000 0.000 1.000 N NA
 5716413 5716414 CLK_3500 CLK_3501     FALSE 0.515 202.000 0.000 1.000 Y NA
 5716414 5716415 CLK_3501 CLK_3502     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.037 Y NA
 5716415 5716416 CLK_3502 CLK_3503     TRUE 0.958 34.000 0.000 1.000 Y NA
 5716416 5716417 CLK_3503 CLK_3504     TRUE 0.988 -3.000 0.150 1.000 N NA
 5716417 5716418 CLK_3504 CLK_3505     FALSE 0.005 502.000 0.000 0.050 N NA
 5716418 5716419 CLK_3505 CLK_3506   xpt TRUE 0.987 23.000 0.032 1.000 Y NA
 5716419 5716420 CLK_3506 CLK_3507 xpt   FALSE 0.003 587.000 0.000 1.000 N NA
 5716420 5716421 CLK_3507 CLK_3508     TRUE 0.998 13.000 1.000 1.000 Y NA
 5716421 5716422 CLK_3508 CLK_3509     FALSE 0.074 342.000 0.222 1.000 N NA
 5716422 5716423 CLK_3509 CLK_3510     TRUE 0.996 14.000 0.333 1.000 Y NA
 5716423 5716424 CLK_3510 CLK_3511     TRUE 0.995 0.000 0.750 NA   NA
 5716424 5716425 CLK_3511 CLK_3512     FALSE 0.006 418.000 0.000 NA   NA
 5716425 5716426 CLK_3512 CLK_3513     TRUE 0.995 3.000 0.869 NA   NA
 5716426 5716427 CLK_3513 CLK_3514     FALSE 0.020 296.000 0.000 NA   NA
 5716427 5716428 CLK_3514 CLK_3515     FALSE 0.008 369.000 0.000 NA   NA
 5716428 5716429 CLK_3515 CLK_3516     FALSE 0.513 135.000 0.006 NA   NA
 5716429 5716430 CLK_3516 CLK_3517     FALSE 0.014 323.000 0.000 NA   NA
 5716430 5716431 CLK_3517 CLK_3518     TRUE 0.793 178.000 1.000 NA   NA
 5716431 5716432 CLK_3518 CLK_3519     TRUE 0.995 -7.000 0.556 NA   NA
 5716432 5716433 CLK_3519 CLK_3520     TRUE 0.995 -16.000 0.556 NA   NA
 5716433 5716434 CLK_3520 CLK_3521     TRUE 0.788 72.000 0.179 NA   NA
 5716434 5716435 CLK_3521 CLK_3522     FALSE 0.053 231.000 0.000 1.000 N NA
 5716435 5716436 CLK_3522 CLK_3523     FALSE 0.007 398.000 0.000 NA   NA
 5716436 5716437 CLK_3523 CLK_3524     TRUE 0.982 27.000 0.667 NA   NA
 5716437 5716438 CLK_3524 CLK_3525     FALSE 0.040 256.000 0.000 NA   NA
 5716438 5716439 CLK_3525 CLK_3526     TRUE 0.997 -13.000 1.000 NA   NA
 5716439 5716440 CLK_3526 CLK_3527     TRUE 0.892 95.000 1.000 NA   NA
 5716440 5716441 CLK_3527 CLK_3528     TRUE 0.900 83.000 1.000 NA   NA
 5716441 5716442 CLK_3528 CLK_3529     FALSE 0.046 233.000 0.000 NA N NA
 5716444 5716445 CLK_3531 CLK_3532     TRUE 0.964 113.000 0.667 1.000 Y NA
 5716445 5716446 CLK_3532 CLK_3533   adhE FALSE 0.005 428.000 0.000 1.000 N NA
 5716446 5716447 CLK_3533 CLK_3534 adhE   FALSE 0.015 319.000 0.000 NA   NA
 5716447 5716448 CLK_3534 CLK_3535     TRUE 0.662 63.000 0.019 NA   NA
 5716449 5716450 CLK_3536 CLK_3537     FALSE 0.011 343.000 0.000 NA   NA
 5716451 5716452 CLK_3538 CLK_3539     FALSE 0.008 396.000 0.000 1.000   NA
 5716452 5716453 CLK_3539 CLK_3540     TRUE 0.634 108.000 0.038 1.000 N NA
 5716453 5716454 CLK_3540 CLK_3541     TRUE 0.994 10.000 0.038 1.000 Y NA
 5716454 5716455 CLK_3541 CLK_3542     TRUE 0.775 63.000 0.091 NA   NA
 5716455 5716456 CLK_3542 CLK_3543     TRUE 0.877 44.000 0.087 NA   NA
 5716456 5716457 CLK_3543 CLK_3544     TRUE 0.952 26.000 0.087 NA   NA
 5716458 5716459 CLK_3545 CLK_3546     FALSE 0.023 288.000 0.000 NA   NA
 5716460 5716461 CLK_3547 CLK_3548     FALSE 0.141 194.000 0.000 1.000   NA
 5716461 5716462 CLK_3548 CLK_3549     FALSE 0.017 312.000 0.000 1.000   NA
 5716464 5716465 CLK_3551 CLK_3552     TRUE 0.548 132.000 0.013 NA   NA
 5716465 5716466 CLK_3552 CLK_3553     TRUE 0.990 -54.000 0.105 1.000   NA
 5716466 5716467 CLK_3553 CLK_3554     TRUE 0.998 -10.000 0.429 1.000 Y NA
 5716467 5716468 CLK_3554 CLK_3555     FALSE 0.325 108.000 0.000 1.000 N NA
 5716468 5716469 CLK_3555 CLK_3556     FALSE 0.002 1230.000 0.000 1.000 N NA
 5716469 5716470 CLK_3556 CLK_3557     TRUE 0.995 23.000 0.431 0.050 Y NA
 5716470 5716471 CLK_3557 CLK_3558     TRUE 0.999 0.000 0.678 0.050 Y NA
 5716471 5716472 CLK_3558 CLK_3559     TRUE 0.995 11.000 0.091 0.050 Y NA
 5716472 5716473 CLK_3559 CLK_3560     TRUE 0.972 54.000 0.237 0.050 Y NA
 5716473 5716474 CLK_3560 CLK_3561     TRUE 0.996 14.000 0.221 0.050 Y NA
 5716474 5716475 CLK_3561 CLK_3562     FALSE 0.010 354.000 0.000 NA   NA
 5716476 5716477 CLK_3563 CLK_3564     TRUE 0.964 18.000 0.059 NA   NA
 5716477 5716478 CLK_3564 CLK_3565     TRUE 0.797 113.000 0.231 NA   NA
 5716479 5716480 CLK_3566 CLK_3567     FALSE 0.007 400.000 0.000 NA   NA
 5716480 5716481 CLK_3567 CLK_3568     TRUE 0.870 87.000 0.667 NA   NA
 5716481 5716482 CLK_3568 CLK_3569     FALSE 0.016 312.000 0.000 NA   NA
 5716486 5716487 CLK_3573 CLK_3574     FALSE 0.007 396.000 0.000 NA   NA
 5716487 5716488 CLK_3574 CLK_3575     TRUE 0.600 204.000 0.014 NA Y NA
 5716488 5716489 CLK_3575 CLK_3576     TRUE 0.979 36.000 0.040 0.002 Y NA
 5716489 5716490 CLK_3576 CLK_3577     TRUE 0.998 2.000 0.270 0.002 Y NA
 5716490 5716491 CLK_3577 CLK_3578     TRUE 0.820 121.000 0.294 1.000   NA
 5716491 5716492 CLK_3578 CLK_3579     FALSE 0.005 486.000 0.000 1.000   NA
 5716494 5716495 CLK_3581 CLK_3582     TRUE 0.815 78.000 0.286 NA   NA
 5716495 5716496 CLK_3582 CLK_3583     TRUE 0.791 87.000 0.250 NA   NA
 5716496 5716497 CLK_3583 CLK_3584     FALSE 0.042 253.000 0.000 NA   NA
 5716497 5716498 CLK_3584 CLK_3586     TRUE 0.700 64.000 0.034 NA   NA
 5716500 5716501 CLK_3587 CLK_3588     TRUE 0.693 137.000 0.079 1.000   NA
 5716505 5716506 CLK_3592 CLK_3593   rnhA TRUE 0.972 -25.000 0.003 NA   NA
 5716506 5716507 CLK_3593 CLK_3594 rnhA   TRUE 0.591 63.000 0.003 NA   NA
 5716507 5716508 CLK_3594 CLK_3595     FALSE 0.167 181.000 0.000 NA   NA
 5716508 5716509 CLK_3595 CLK_3596     TRUE 0.974 32.000 0.429 0.029   NA
 5716509 5716510 CLK_3596 CLK_3597     FALSE 0.010 351.000 0.000 NA   NA
 5716510 5716511 CLK_3597 CLK_3598     TRUE 0.882 15.000 0.000 NA   NA
 5716511 5716512 CLK_3598 CLK_3599     FALSE 0.031 271.000 0.000 NA   NA
 5716512 5716513 CLK_3599 CLK_3600   clpB FALSE 0.005 456.000 0.000 NA   NA
 5716514 5716515 CLK_3601 CLK_3602     TRUE 0.933 58.000 0.796 1.000   NA
 5716516 5716517 CLK_3603 CLK_3604 manA   FALSE 0.011 348.000 0.000 NA   NA
 5716517 5716518 CLK_3604 CLK_3605     TRUE 0.853 108.000 0.500 NA   NA
 5716518 5716519 CLK_3605 CLK_3867   rrsG FALSE 0.006 410.000 0.000 NA   NA
 5716519 5716520 CLK_3867 CLK_3868 rrsG   FALSE 0.307 143.000 0.000 NA   NA
 5716520 5716521 CLK_3868 CLK_3869     TRUE 0.912 5.000 0.000 NA   NA
 5716521 5716522 CLK_3869 CLK_3870   rrlG FALSE 0.361 74.000 0.000 NA   NA
 5716522 5716523 CLK_3870 CLK_3871 rrlG rrfG FALSE 0.330 132.000 0.000 NA   NA
 5716523 5716524 CLK_3871 CLK_3872 rrfG   TRUE 0.906 8.000 0.000 NA   NA
 5716526 5716527 CLK_3618 CLK_3619     FALSE 0.003 746.000 0.000 1.000 N NA
 5716527 5716528 CLK_3619 CLK_3620     TRUE 0.611 143.000 0.027 0.066 N NA
 5716528 5716529 CLK_3620 CLK_3621     FALSE 0.516 238.000 0.054 0.066 Y NA
 5716529 5716530 CLK_3621 CLK_3622     FALSE 0.082 350.000 0.000 1.000 Y NA
 5716530 5716531 CLK_3622 CLK_3623     FALSE 0.003 519.000 0.000 NA N NA
 5716532 5716533 CLK_3624 CLK_3625   panD FALSE 0.500 88.000 0.004 NA   NA
 5716533 5716534 CLK_3625 CLK_3626 panD panC TRUE 0.782 208.000 0.342 1.000 Y NA
 5716534 5716535 CLK_3626 CLK_3627 panC panB TRUE 0.842 203.000 0.395 0.001 Y NA
 5716538 5716539 CLK_3630 CLK_3631     TRUE 0.994 3.000 0.667 NA   NA
 5716539 5716540 CLK_3631 CLK_3632     FALSE 0.016 313.000 0.000 NA   NA
 5716541 5716542 CLK_3633 CLK_3634     FALSE 0.003 625.000 0.000 NA N NA
 5716543 5716544 CLK_3635 CLK_3636 hypB   FALSE 0.009 359.000 0.000 NA   NA
 5716544 5716545 CLK_3636 CLK_3637     FALSE 0.373 71.000 0.000 NA   NA
 5716545 5716546 CLK_3637 CLK_3638   addA FALSE 0.005 437.000 0.000 NA   NA
 5716546 5716547 CLK_3638 CLK_3639 addA   FALSE 0.511 140.000 0.010 1.000 N NA
 5716547 5716548 CLK_3639 CLK_3640   pepT TRUE 0.681 77.000 0.056 1.000 N NA
 5716550 5716551 CLK_3642 CLK_3643     FALSE 0.345 121.000 0.000 NA   NA
 5716551 5716552 CLK_3643 CLK_3644     TRUE 0.837 122.000 0.400 NA   NA
 5716552 5716553 CLK_3644 CLK_3645     FALSE 0.145 188.000 0.000 NA   NA
 5716553 5716554 CLK_3645 CLK_3646     TRUE 0.861 19.000 0.000 NA   NA
 5716554 5716555 CLK_3646 CLK_3647     FALSE 0.288 138.000 0.000 NA N NA
 5716556 5716557 CLK_3648 CLK_3649     TRUE 0.997 13.000 0.461 0.049 Y NA
 5716559 5716560 CLK_3651 CLK_3652   thiE FALSE 0.030 265.000 0.000 NA N NA
 5716560 5716561 CLK_3652 CLK_3653 thiE thiM TRUE 0.998 -9.000 0.190 0.004 Y NA
 5716561 5716562 CLK_3653 CLK_3654 thiM thiD TRUE 0.539 231.000 0.039 0.004 Y NA
 5716563 5716564 CLK_3655 CLK_3656   ddlB FALSE 0.347 112.000 0.000 NA   NA
 5716564 5716565 CLK_3656 CLK_3657 ddlB   FALSE 0.411 156.000 0.004 1.000 N NA
 5716565 5716566 CLK_3657 CLK_3658     TRUE 0.996 4.000 0.182 1.000 Y NA
 5716566 5716567 CLK_3658 CLK_3659     TRUE 0.998 1.000 0.241 0.037 Y NA
 5716567 5716568 CLK_3659 CLK_3660     TRUE 0.996 12.000 0.167 1.000 Y NA
 5716568 5716569 CLK_3660 CLK_3661     TRUE 0.996 2.000 0.048 0.035 Y NA
 5716569 5716570 CLK_3661 CLK_3662     TRUE 0.963 29.000 0.222 NA   NA
 5716570 5716571 CLK_3662 CLK_3663     FALSE 0.006 418.000 0.000 NA   NA
 5716571 5716572 CLK_3663 CLK_3664     TRUE 0.994 -6.000 0.500 NA   NA
 5716572 5716573 CLK_3664 CLK_3665     FALSE 0.307 143.000 0.000 NA   NA
 5716573 5716574 CLK_3665 CLK_3666     TRUE 0.628 61.000 0.007 NA   NA
 5716574 5716575 CLK_3666 CLK_3667     FALSE 0.435 61.000 0.000 NA   NA
 5716575 5716576 CLK_3667 CLK_3668     FALSE 0.004 519.000 0.000 NA   NA
 5716576 5716577 CLK_3668 CLK_3669     FALSE 0.064 276.000 0.010 NA   NA
 5716577 5716578 CLK_3669 CLK_3670     FALSE 0.532 134.000 0.010 NA   NA
 5716578 5716579 CLK_3670 CLK_3671     FALSE 0.466 176.000 0.050 NA   NA
 5716579 5716580 CLK_3671 CLK_3672     TRUE 0.973 2.000 0.025 NA   NA
 5716581 5716582 CLK_3673 CLK_3674     TRUE 0.845 21.000 0.000 NA   NA
 5716583 5716584 CLK_3675 CLK_3676   sbcC TRUE 0.996 -25.000 0.669 NA N NA
 5716584 5716585 CLK_3676 CLK_3677 sbcC   TRUE 0.841 35.000 0.005 NA   NA
 5716585 5716586 CLK_3677 CLK_3678     TRUE 0.944 -16.000 0.000 NA   NA
 5716586 5716587 CLK_3678 CLK_3679     FALSE 0.002 1119.000 0.000 NA   NA
 5716587 5716588 CLK_3679 CLK_3680     FALSE 0.288 149.000 0.000 NA   NA
 5716588 5716589 CLK_3680 CLK_3681     FALSE 0.018 302.000 0.000 NA   NA
 5716589 5716590 CLK_3681 CLK_3682     FALSE 0.099 206.000 0.000 NA   NA
 5716590 5716591 CLK_3682 CLK_3683     TRUE 0.936 0.000 0.000 1.000   NA
 5716591 5716592 CLK_3683 CLK_3684     FALSE 0.003 787.000 0.000 NA   NA
 5716592 5716593 CLK_3684 CLK_3685     FALSE 0.005 466.000 0.000 NA   NA
 5716593 5716594 CLK_3685 CLK_3686   cadA TRUE 0.678 76.000 0.053 1.000 N NA
 5716594 5716595 CLK_3686 CLK_3875 cadA   FALSE 0.006 411.000 0.000 NA   NA
 5716595 5716596 CLK_3875 CLK_3688     TRUE 0.799 27.000 0.000 NA   NA
 5716596 5716597 CLK_3688 CLK_3689     FALSE 0.004 516.000 0.000 NA   NA
 5716598 5716599 CLK_3690 CLK_3691     FALSE 0.022 290.000 0.000 NA   NA
 5716599 5716600 CLK_3691 CLK_3692     TRUE 0.987 3.000 0.192 NA   NA
 5716600 5716601 CLK_3692 CLK_3693     TRUE 0.554 50.000 0.000 NA   NA
 5716602 5716603 CLK_3694 CLK_3695     FALSE 0.006 386.000 0.000 NA N NA
 5716603 5716604 CLK_3695 CLK_3696     TRUE 0.992 10.000 0.667 NA   NA
 5716604 5716605 CLK_3696 CLK_3697     FALSE 0.014 321.000 0.000 NA   NA
 5716605 5716606 CLK_3697 CLK_3698   sagB TRUE 0.673 165.000 0.222 NA   NA
 5716606 5716607 CLK_3698 CLK_3699 sagB sagC TRUE 0.987 4.000 0.222 NA   NA
 5716607 5716608 CLK_3699 CLK_3700 sagC sagD TRUE 0.984 16.000 0.318 NA   NA
 5716608 5716609 CLK_3700 CLK_3701 sagD   TRUE 0.988 -25.000 0.091 NA   NA
 5716609 5716610 CLK_3701 CLK_3702     TRUE 0.994 8.000 1.000 NA   NA
 5716610 5716611 CLK_3702 CLK_3703   sagG FALSE 0.022 293.000 0.000 NA   NA
 5716611 5716612 CLK_3703 CLK_3704 sagG sagH TRUE 0.990 12.000 0.500 NA N NA
 5716612 5716613 CLK_3704 CLK_3705 sagH sagI TRUE 0.986 2.000 0.160 NA N NA
 5716613 5716614 CLK_3705 CLK_3706 sagI   FALSE 0.009 375.000 0.000 1.000   NA
 5716615 5716616 CLK_3707 CLK_3708     TRUE 0.846 118.000 0.409 NA   NA
 5716616 5716617 CLK_3708 CLK_3709     TRUE 0.708 127.000 0.091 NA   NA
 5716618 5716619 CLK_3710 CLK_3711 trmB   FALSE 0.084 213.000 0.000 NA   NA
 5716621 5716622 CLK_3713 CLK_3714 fabG   TRUE 0.695 63.000 0.032 1.000 N NA
 5716624 5716625 CLK_3716 CLK_3717     FALSE 0.032 262.000 0.000 NA N NA
 5716625 5716626 CLK_3717 CLK_3718     FALSE 0.022 297.000 0.000 1.000   NA
 5716626 5716627 CLK_3718 CLK_3719     TRUE 0.960 36.000 0.400 1.000   NA
 5716627 5716628 CLK_3719 CLK_3720     FALSE 0.486 205.000 0.000 1.000 Y NA
 5716630 5716631 CLK_3722 CLK_3723 serS   FALSE 0.003 598.000 0.000 1.000 N NA
 5716632 5716633 CLK_3724 CLK_3725     FALSE 0.004 499.000 0.000 1.000   NA
 5716636 5716637 CLK_3728 CLK_3729     FALSE 0.125 196.000 0.000 NA   NA
 5716642 5716643 CLK_3734 CLK_3735     FALSE 0.292 148.000 0.000 NA   NA
 5716643 5716644 CLK_3735 CLK_3736     FALSE 0.002 1194.000 0.000 1.000 N NA
 5716645 5716646 CLK_3737 CLK_3738     FALSE 0.003 624.000 0.000 NA   NA
 5716646 5716647 CLK_3738 CLK_3739     FALSE 0.031 617.000 0.000 0.005 Y NA
 5716647 5716648 CLK_3739 CLK_3740     FALSE 0.012 347.000 0.000 1.000   NA
 5716648 5716649 CLK_3740 CLK_3741     TRUE 0.777 45.000 0.008 1.000   NA
 5716650 5716651 CLK_3742 CLK_3743     FALSE 0.154 294.000 0.000 1.000 Y NA
 5716651 5716652 CLK_3743 CLK_3744     TRUE 0.998 0.000 0.455 0.001 Y NA
 5716653 5716654 CLK_3745 CLK_3746     FALSE 0.005 432.000 0.000 NA   NA
 5716656 5716657 CLK_3748 CLK_3749     TRUE 0.997 3.000 0.313 NA Y NA
 5716657 5716658 CLK_3749 CLK_3750     TRUE 0.742 33.000 0.000 NA   NA
 5716658 5716659 CLK_3750 CLK_3751     FALSE 0.141 189.000 0.000 NA   NA
 5716659 5716660 CLK_3751 CLK_3752   pepP FALSE 0.072 220.000 0.000 NA   NA
 5716661 5716662 CLK_3753 CLK_3754     FALSE 0.380 69.000 0.000 NA   NA
 5716662 5716663 CLK_3754 CLK_3755     FALSE 0.502 67.000 0.000 0.016   NA
 5716664 5716665 CLK_3756 CLK_3757     FALSE 0.003 622.000 0.000 NA   NA
 5716665 5716666 CLK_3757 CLK_3758     FALSE 0.010 355.000 0.000 NA   NA
 5716666 5716667 CLK_3758 CLK_3759     FALSE 0.005 428.000 0.000 NA   NA
 5716667 5716668 CLK_3759 CLK_3760     TRUE 0.983 12.000 0.184 NA   NA
 5716668 5716669 CLK_3760 CLK_3761     FALSE 0.004 540.000 0.000 NA   NA
 5716669 5716670 CLK_3761 CLK_3762     FALSE 0.003 917.000 0.000 NA   NA
 5716672 5716673 CLK_3764 CLK_3765 mscL   FALSE 0.009 366.000 0.000 NA   NA
 5716675 5716676 CLK_3767 CLK_3768     FALSE 0.003 582.000 0.000 NA   NA
 5716676 5716677 CLK_3768 CLK_3769     TRUE 0.989 -7.000 0.165 1.000 N NA
 5716677 5716678 CLK_3769 CLK_3770     TRUE 0.979 0.000 0.035 NA   NA
 5716678 5716679 CLK_3770 CLK_3771   potA FALSE 0.002 1249.000 0.000 NA   NA
 5716679 5716680 CLK_3771 CLK_3772 potA potB TRUE 0.999 0.000 0.789 1.000 Y NA
 5716680 5716681 CLK_3772 CLK_3773 potB   TRUE 0.995 3.000 0.022 0.036 Y NA
 5716683 5716684 CLK_3775 CLK_3776     FALSE 0.176 179.000 0.000 NA   NA
 5716684 5716685 CLK_3776 CLK_3777     FALSE 0.005 426.000 0.000 NA   NA
 5716685 5716686 CLK_3777 CLK_3778     FALSE 0.256 157.000 0.000 NA   NA
 5716688 5716689 CLK_3780 CLK_3781     FALSE 0.070 221.000 0.000 NA   NA
 5716689 5716690 CLK_3781 CLK_3782     TRUE 0.991 -10.000 0.208 NA   NA
 5716690 5716691 CLK_3782 CLK_3783   lepB TRUE 0.848 68.000 0.333 NA   NA
 5716691 5716692 CLK_3783 CLK_3784 lepB   FALSE 0.002 810.000 0.000 1.000 N NA
 5716692 5716693 CLK_3784 CLK_3785     FALSE 0.003 594.000 0.000 NA   NA
 5716693 5716694 CLK_3785 CLK_3786     TRUE 0.970 40.000 1.000 NA   NA
 5716694 5716695 CLK_3786 CLK_3787     FALSE 0.003 694.000 0.000 NA   NA
 5716695 5716696 CLK_3787 CLK_3788     FALSE 0.003 788.000 0.000 NA   NA
 5716696 5716697 CLK_3788 CLK_3789     TRUE 0.986 -7.000 0.080 NA   NA
 5716697 5716698 CLK_3789 CLK_3790     TRUE 0.974 37.000 1.000 NA   NA
 5716698 5716699 CLK_3790 CLK_3791     TRUE 0.947 35.000 0.222 NA   NA
 5716699 5716700 CLK_3791 CLK_3792     TRUE 0.951 34.000 0.222 NA   NA
 5716700 5716701 CLK_3792 CLK_3793     TRUE 0.980 23.000 0.400 NA   NA
 5716701 5716702 CLK_3793 CLK_3794     TRUE 0.986 -3.000 0.095 NA   NA
 5716702 5716703 CLK_3794 CLK_3795     TRUE 0.981 15.000 0.238 NA N NA
 5716703 5716704 CLK_3795 CLK_3796     FALSE 0.004 522.000 0.000 NA   NA
 5716704 5716705 CLK_3796 CLK_3797     FALSE 0.012 338.000 0.000 NA   NA
 5716705 5716706 CLK_3797 CLK_3798     FALSE 0.007 397.000 0.000 NA   NA
 5716709 5716710 CLK_3801 CLK_3802     FALSE 0.005 448.000 0.000 1.000 N NA
 5716713 5716714 CLK_3805 CLK_3806     FALSE 0.025 620.000 0.000 NA Y NA
 5716714 5716715 CLK_3806 CLK_3807     TRUE 0.977 16.000 0.143 NA   NA
 5716715 5716716 CLK_3807 CLK_3808     FALSE 0.019 299.000 0.000 NA   NA
 5716716 5716717 CLK_3808 CLK_3809     FALSE 0.060 227.000 0.000 NA   NA
 5716717 5716718 CLK_3809 CLK_3810     FALSE 0.010 353.000 0.000 NA   NA
 5716718 5716719 CLK_3810 CLK_3811     TRUE 0.994 2.000 0.714 NA   NA
 5716719 5716720 CLK_3811 CLK_3812     FALSE 0.326 135.000 0.000 NA   NA
 5716720 5716721 CLK_3812 CLK_3813     FALSE 0.084 213.000 0.000 NA   NA
 5716721 5716722 CLK_3813 CLK_3814     FALSE 0.005 429.000 0.000 NA   NA
 5716722 5716723 CLK_3814 CLK_3815     TRUE 0.991 13.000 0.667 NA   NA
 5716723 5716724 CLK_3815 CLK_0001     FALSE 0.004 598.000 0.000 1.000   NA
 5716724 5716725 CLK_0001 CLK_0002     FALSE 0.182 197.000 0.000 0.011   NA
 5716725 5716726 CLK_0002 CLK_0003     FALSE 0.202 175.000 0.000 1.000   NA
 5716726 5716727 CLK_0003 CLK_0004     TRUE 0.998 5.000 0.692 1.000 Y NA
 5716727 5716728 CLK_0004 CLK_0005     TRUE 0.651 41.000 0.000 1.000   NA
 5716728 5716729 CLK_0005 CLK_0006     FALSE 0.366 73.000 0.000 NA   NA
 5716729 5716730 CLK_0006 CLK_0007     FALSE 0.351 116.000 0.000 NA   NA
 5716730 5716731 CLK_0007 CLK_0008     TRUE 0.961 21.000 0.085 1.000 N NA
 5716731 5716732 CLK_0008 CLK_0009     TRUE 0.995 29.000 0.932 1.000 Y NA
 5716733 5716734 CLK_0010 CLK_0011     FALSE 0.274 143.000 0.000 NA N NA
 5716734 5716735 CLK_0011 CLK_0012     TRUE 0.992 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5716736 5716737 CLK_0013 CLK_0014 rodA   TRUE 0.878 16.000 0.000 NA   NA
 5716739 5716740 CLK_0016 CLK_0017     TRUE 0.672 171.000 0.286 1.000 N NA
 5716740 5716741 CLK_0017 CLK_0018     FALSE 0.019 305.000 0.000 1.000   NA
 5716743 5716744 CLK_0020 CLK_0021     TRUE 0.703 103.000 0.083 1.000   NA
 5716745 5716746 CLK_0022 CLK_0023 csaA   FALSE 0.238 208.000 0.023 1.000   NA
 5716746 5716747 CLK_0023 CLK_0024     FALSE 0.028 300.000 0.000 0.028   NA
 5716748 5716749 CLK_0025 CLK_0026     FALSE 0.009 367.000 0.000 NA   NA
 5716749 5716750 CLK_0026 CLK_0027     FALSE 0.004 520.000 0.000 NA   NA
 5716752 5716753 CLK_0029 CLK_0030     FALSE 0.330 132.000 0.000 NA   NA
 5716754 5716755 CLK_0031 CLK_0032     TRUE 0.926 23.000 0.015 NA   NA
 5716757 5716758 CLK_0034 CLK_0035     FALSE 0.012 337.000 0.000 NA   NA
 5716759 5716760 CLK_0036 CLK_0037 rhlE   FALSE 0.004 576.000 0.000 1.000   NA
 5716760 5716761 CLK_0037 CLK_0038     TRUE 0.684 171.000 0.286 1.000   NA
 5716761 5716762 CLK_0038 CLK_0039     TRUE 0.966 28.000 0.250 1.000 N NA
 5716763 5716764 CLK_0040 CLK_0041     FALSE 0.012 336.000 0.000 NA   NA
 5716764 5716765 CLK_0041 CLK_0042     TRUE 0.996 -16.000 0.625 0.034   NA
 5716765 5716766 CLK_0042 CLK_0043     TRUE 0.934 79.000 0.185 1.000 Y NA
 5716766 5716767 CLK_0043 CLK_0044     TRUE 0.997 2.000 0.185 0.035 Y NA
 5716767 5716768 CLK_0044 CLK_0045     TRUE 0.999 1.000 0.625 0.035 Y NA
 5716769 5716770 CLK_0046 CLK_0047     TRUE 0.995 -3.000 0.713 1.000 N NA
 5716770 5716771 CLK_0047 CLK_0048     FALSE 0.351 116.000 0.000 NA   NA
 5716773 5716774 CLK_0050 CLK_0051     FALSE 0.351 118.000 0.000 NA   NA
 5716774 5716775 CLK_0051 CLK_0052     FALSE 0.013 331.000 0.000 NA   NA
 5716775 5716776 CLK_0052 CLK_0053     FALSE 0.333 129.000 0.000 NA   NA
 5716778 5716779 CLK_0055 CLK_0056     FALSE 0.522 208.000 0.409 1.000   NA
 5716779 5716780 CLK_0056 CLK_0057     TRUE 0.976 12.000 0.074 1.000   NA
 5716780 5716781 CLK_0057 CLK_0058     FALSE 0.003 631.000 0.000 1.000   NA
 5716781 5716782 CLK_0058 CLK_0059     TRUE 0.683 158.000 0.190 1.000 N NA
 5716782 5716783 CLK_0059 CLK_0060     FALSE 0.087 292.000 0.071 1.000 N NA
 5716783 5716784 CLK_0060 CLK_0061     TRUE 0.952 26.000 0.089 NA   NA
 5716784 5716785 CLK_0061 CLK_0062     FALSE 0.011 343.000 0.000 NA   NA
 5716785 5716786 CLK_0062 CLK_0063   gltS FALSE 0.003 771.000 0.000 1.000 N NA
 5716786 5716787 CLK_0063 CLK_0064 gltS   FALSE 0.030 272.000 0.000 NA   NA
 5716789 5716790 CLK_0066 CLK_0067     TRUE 0.962 70.000 0.500 1.000 Y NA
 5716790 5716791 CLK_0067 CLK_0068     TRUE 0.997 7.000 0.250 1.000 Y NA
 5716791 5716792 CLK_0068 CLK_0069     TRUE 0.958 21.000 0.062 NA   NA
 5716792 5716793 CLK_0069 CLK_0070     FALSE 0.008 381.000 0.000 NA   NA
 5716793 5716794 CLK_0070 CLK_0071     TRUE 0.980 7.000 0.100 NA   NA
 5716796 5716797 CLK_0073 CLK_0074     FALSE 0.012 342.000 0.000 1.000   NA
 5716797 5716798 CLK_0074 CLK_0075     TRUE 0.990 -37.000 0.118 1.000   NA
 5716798 5716799 CLK_0075 CLK_0076     TRUE 0.983 31.000 1.000 NA   NA
 5716799 5716800 CLK_0076 CLK_0077   blaI FALSE 0.003 731.000 0.000 NA   NA
 5716800 5716801 CLK_0077 CLK_0078 blaI   TRUE 0.979 40.000 0.182 NA Y NA
 5716802 5716803 CLK_0079 CLK_0080     TRUE 0.994 -3.000 0.571 NA   NA
 5716804 5716805 CLK_0081 CLK_0082     FALSE 0.435 61.000 0.000 NA   NA
 5716805 5716806 CLK_0082 CLK_0083   greA FALSE 0.431 157.000 0.008 1.000 N NA
 5716806 5716807 CLK_0083 CLK_0084 greA   FALSE 0.464 168.000 0.031 NA   NA
 5716807 5716808 CLK_0084 CLK_0085     FALSE 0.048 240.000 0.000 NA   NA
 5716808 5716809 CLK_0085 CLK_0086     FALSE 0.134 192.000 0.000 NA   NA
 5716809 5716810 CLK_0086 CLK_0087     FALSE 0.003 551.000 0.000 1.000 N NA
 5716810 5716811 CLK_0087 CLK_0088   fhuB TRUE 0.952 96.000 0.500 1.000 Y NA
 5716811 5716812 CLK_0088 CLK_0089 fhuB fhuG TRUE 0.999 -3.000 0.750 0.035 Y NA
 5716812 5716813 CLK_0089 CLK_0090 fhuG   TRUE 0.829 176.000 0.100 1.000 Y NA
 5716813 5716814 CLK_0090 CLK_0091   nifH TRUE 0.994 17.000 0.150 1.000 Y NA
 5716814 5716815 CLK_0091 CLK_0092 nifH   TRUE 0.994 3.000 0.571 0.047 N NA
 5716815 5716816 CLK_0092 CLK_0093     TRUE 0.992 40.000 1.000 0.036 Y NA
 5716816 5716817 CLK_0093 CLK_0094     FALSE 0.013 324.000 0.000 1.000 N NA
 5716817 5716818 CLK_0094 CLK_0095     FALSE 0.037 262.000 0.000 NA   NA
 5716820 5716821 CLK_0097 CLK_0098 gcvT gcvH TRUE 0.843 125.000 0.000 0.001 Y NA
 5716821 5716822 CLK_0098 CLK_0099 gcvH gcvPA TRUE 0.993 3.000 0.005 1.000 Y NA
 5716822 5716823 CLK_0099 CLK_0100 gcvPA gcvPB TRUE 0.998 0.000 0.316 0.001 Y NA
 5716823 5716824 CLK_0100 CLK_0101 gcvPB lpdA FALSE 0.272 189.000 0.010 1.000 N NA
 5716824 5716825 CLK_0101 CLK_0102 lpdA   TRUE 0.973 17.000 0.118 1.000 N NA
 5716825 5716826 CLK_0102 CLK_0103     FALSE 0.004 494.000 0.000 NA   NA
 5716826 5716827 CLK_0103 CLK_0104     FALSE 0.007 393.000 0.000 NA   NA
 5716827 5716828 CLK_0104 CLK_0105     FALSE 0.008 387.000 0.000 1.000   NA
 5716828 5716829 CLK_0105 CLK_0106     TRUE 0.953 -3.000 0.000 0.064   NA
 5716829 5716830 CLK_0106 CLK_0107     TRUE 0.999 -3.000 0.875 1.000 Y NA
 5716830 5716831 CLK_0107 CLK_0108     TRUE 0.904 73.000 0.875 1.000 N NA
 5716833 5716834 CLK_0110 CLK_0111     FALSE 0.003 754.000 0.000 NA   NA
 5716834 5716835 CLK_0111 CLK_0112     FALSE 0.059 232.000 0.000 1.000   NA
 5716835 5716836 CLK_0112 CLK_0113     FALSE 0.334 85.000 0.000 NA   NA
 5716836 5716837 CLK_0113 CLK_0114     FALSE 0.029 274.000 0.000 NA   NA
 5716837 5716838 CLK_0114 CLK_0115     TRUE 0.814 94.000 0.375 NA   NA
 5716838 5716839 CLK_0115 CLK_0116     FALSE 0.157 184.000 0.000 NA   NA
 5716839 5716840 CLK_0116 CLK_0117     TRUE 0.979 2.000 0.051 NA   NA
 5716842 5716843 CLK_0119 CLK_0120     TRUE 0.887 14.000 0.000 NA   NA
 5716843 5716844 CLK_0120 CLK_0121     FALSE 0.026 281.000 0.000 NA   NA
 5716844 5716845 CLK_0121 CLK_0122     TRUE 0.731 34.000 0.000 NA   NA
 5716845 5716846 CLK_0122 CLK_0123     TRUE 0.585 46.000 0.000 NA   NA
 5716846 5716847 CLK_0123 CLK_0124     FALSE 0.009 363.000 0.000 NA   NA
 5716847 5716848 CLK_0124 CLK_0125     FALSE 0.017 306.000 0.000 NA   NA
 5716848 5716849 CLK_0125 CLK_0126     TRUE 0.899 52.000 0.273 1.000 N NA
 5716849 5716850 CLK_0126 CLK_0127     TRUE 0.997 -13.000 0.094 1.000 Y NA
 5716850 5716851 CLK_0127 CLK_0128     FALSE 0.003 694.000 0.000 NA   NA
 5716851 5716852 CLK_0128 CLK_0129     FALSE 0.032 270.000 0.000 NA   NA
 5716852 5716853 CLK_0129 CLK_0130     FALSE 0.007 400.000 0.000 NA   NA
 5716853 5716854 CLK_0130 CLK_0131     FALSE 0.496 56.000 0.000 NA   NA
 5716856 5716857 CLK_0133 CLK_0134     FALSE 0.003 770.000 0.000 NA   NA
 5716857 5716858 CLK_0134 CLK_0135     FALSE 0.290 199.000 0.027 NA   NA
 5716858 5716859 CLK_0135 CLK_0136     FALSE 0.322 99.000 0.000 NA   NA
 5716859 5716860 CLK_0136 CLK_0137     FALSE 0.327 102.000 0.000 NA   NA
 5716860 5716861 CLK_0137 CLK_0138     FALSE 0.028 277.000 0.000 NA   NA
 5716861 5716862 CLK_0138 CLK_0139     FALSE 0.117 199.000 0.000 NA   NA
 5716863 5716864 CLK_0140 CLK_0141   luxS TRUE 0.974 -16.000 0.010 1.000 N NA
 5716864 5716865 CLK_0141 CLK_0142 luxS metC TRUE 0.978 2.000 0.048 1.000 N NA
 5716865 5716866 CLK_0142 CLK_0143 metC   FALSE 0.066 282.000 0.021 1.000 N NA
 5716867 5716868 CLK_0144 CLK_0145     FALSE 0.008 366.000 0.000 1.000 N NA
 5716869 5716870 CLK_0146 CLK_0147     TRUE 0.671 88.000 0.061 NA   NA
 5716870 5716871 CLK_0147 CLK_0148     FALSE 0.004 534.000 0.000 NA   NA
 5716871 5716872 CLK_0148 CLK_0149     FALSE 0.334 128.000 0.000 NA   NA
 5716872 5716873 CLK_0149 CLK_0150     FALSE 0.008 382.000 0.000 NA   NA
 5716874 5716875 CLK_0151 CLK_0152     FALSE 0.246 160.000 0.000 NA   NA
 5716875 5716876 CLK_0152 CLK_0153     TRUE 0.841 19.000 0.000 NA N NA
 5716876 5716877 CLK_0153 CLK_0154     FALSE 0.042 252.000 0.000 NA   NA
 5716877 5716878 CLK_0154 CLK_0155     FALSE 0.281 151.000 0.000 NA   NA
 5716878 5716879 CLK_0155 CLK_0156     FALSE 0.009 368.000 0.000 NA   NA
 5716879 5716880 CLK_0156 CLK_0157     TRUE 0.853 20.000 0.000 NA   NA
 5716882 5716883 CLK_0159 CLK_0160     TRUE 0.947 -45.000 0.000 NA   NA
 5716883 5716884 CLK_0160 CLK_0161     FALSE 0.006 410.000 0.000 NA   NA
 5716884 5716885 CLK_0161 CLK_0162     TRUE 0.991 0.000 0.278 1.000 N NA
 5716885 5716886 CLK_0162 CLK_0163     FALSE 0.250 158.000 0.000 NA   NA
 5716888 5716889 CLK_0165 CLK_0166 arsC   FALSE 0.010 365.000 0.000 1.000   NA
 5716889 5716890 CLK_0166 CLK_0167     FALSE 0.304 144.000 0.000 NA   NA
 5716890 5716891 CLK_0167 CLK_0169     FALSE 0.003 566.000 0.000 NA   NA
 5716891 5716892 CLK_0169 CLK_0170     FALSE 0.006 402.000 0.000 NA   NA
 5716892 5716893 CLK_0170 CLK_0171     FALSE 0.005 436.000 0.000 NA   NA
 5716893 5716894 CLK_0171 CLK_0172     TRUE 0.994 10.000 1.000 NA   NA
 5716894 5716895 CLK_0172 CLK_0173     FALSE 0.004 551.000 0.000 NA   NA
 5716895 5716896 CLK_0173 CLK_0174     TRUE 0.993 -7.000 0.400 NA   NA
 5716896 5716897 CLK_0174 CLK_0175     FALSE 0.003 637.000 0.000 NA   NA
 5716897 5716898 CLK_0175 CLK_0176   thyA TRUE 0.977 -10.000 0.017 NA   NA
 5716898 5716899 CLK_0176 CLK_0177 thyA   TRUE 0.958 12.000 0.017 1.000 N NA
 5716899 5716900 CLK_0177 CLK_0178     TRUE 0.838 46.000 0.047 1.000 N NA
 5716900 5716901 CLK_0178 CLK_0179   thiD TRUE 0.658 78.000 0.043 1.000 N NA
 5716901 5716902 CLK_0179 CLK_0180 thiD   FALSE 0.477 172.000 0.043 NA   NA
 5716904 5716905 CLK_0182 CLK_0183     TRUE 0.994 3.000 0.833 NA   NA
 5716905 5716906 CLK_0183 CLK_0184     TRUE 0.947 -36.000 0.000 NA   NA
 5716906 5716907 CLK_0184 CLK_0185     FALSE 0.003 696.000 0.000 NA   NA
 5716907 5716908 CLK_0185 CLK_0186     FALSE 0.031 271.000 0.000 NA   NA
 5716908 5716909 CLK_0186 CLK_0187     FALSE 0.483 184.000 0.100 NA   NA
 5716909 5716910 CLK_0187 CLK_0188     TRUE 0.999 -13.000 0.750 NA Y NA
 5716910 5716911 CLK_0188 CLK_0189     FALSE 0.004 512.000 0.000 NA   NA
 5716911 5716912 CLK_0189 CLK_0190     FALSE 0.316 140.000 0.000 NA   NA
 5716912 5716913 CLK_0190 CLK_0191     TRUE 0.947 154.000 0.636 1.000 Y NA
 5716913 5716914 CLK_0191 CLK_0192     FALSE 0.150 190.000 0.000 1.000   NA
 5716916 5716917 CLK_0194 CLK_0195     FALSE 0.003 673.000 0.000 NA   NA
 5716917 5716918 CLK_0195 CLK_0196   hypB FALSE 0.079 269.000 0.015 NA   NA
 5716918 5716919 CLK_0196 CLK_0197 hypB   TRUE 0.914 38.000 0.115 1.000 N NA
 5716919 5716920 CLK_0197 CLK_0198     TRUE 0.824 83.000 0.333 1.000   NA
 5716920 5716921 CLK_0198 CLK_0199     FALSE 0.328 134.000 0.000 NA   NA
 5716921 5716922 CLK_0199 CLK_0200   dapB FALSE 0.002 681.000 0.000 NA N NA
 5716922 5716923 CLK_0200 CLK_0201 dapB   TRUE 0.815 22.000 0.000 NA N NA
 5716923 5716924 CLK_0201 CLK_0202     FALSE 0.004 555.000 0.000 NA   NA
 5716924 5716925 CLK_0202 CLK_0203     FALSE 0.320 97.000 0.000 NA   NA
 5716925 5716926 CLK_0203 CLK_0204     FALSE 0.005 426.000 0.000 NA   NA
 5716926 5716927 CLK_0204 CLK_0205     FALSE 0.011 343.000 0.000 NA   NA
 5716927 5716928 CLK_0205 CLK_0206     FALSE 0.023 287.000 0.000 NA   NA
 5716928 5716929 CLK_0206 CLK_0207     FALSE 0.446 60.000 0.000 NA   NA
 5716929 5716930 CLK_0207 CLK_0208     FALSE 0.347 112.000 0.000 NA   NA
 5716930 5716931 CLK_0208 CLK_0209     FALSE 0.126 193.000 0.000 1.000 N NA
 5716931 5716932 CLK_0209 CLK_0210     FALSE 0.003 617.000 0.000 NA   NA
 5716932 5716933 CLK_0210 CLK_0211     TRUE 0.872 128.000 0.667 NA   NA
 5716933 5716934 CLK_0211 CLK_0212     FALSE 0.006 421.000 0.000 NA   NA
 5716934 5716935 CLK_0212 CLK_0213     FALSE 0.012 336.000 0.000 NA   NA
 5716935 5716936 CLK_0213 CLK_0214   brnQ FALSE 0.003 566.000 0.000 1.000 N NA
 5716938 5716939 CLK_0216 CLK_0217 feoA feoB TRUE 0.605 144.000 0.033 1.000   NA
 5716939 5716940 CLK_0217 CLK_0218 feoB feoB-1 TRUE 0.989 -3.000 0.105 0.005   NA
 5716940 5716941 CLK_0218 CLK_0220 feoB-1 cobC FALSE 0.003 674.000 0.000 1.000 N NA
 5716943 5716944 CLK_0221 CLK_0222   cobS FALSE 0.030 270.000 0.000 1.000 N NA
 5716944 5716945 CLK_0222 CLK_0223 cobS   FALSE 0.028 276.000 0.000 NA   NA
 5716945 5716946 CLK_0223 CLK_0224     FALSE 0.467 58.000 0.000 NA   NA
 5716946 5716947 CLK_0224 CLK_0225     TRUE 0.669 125.000 0.053 NA   NA
 5716947 5716948 CLK_0225 CLK_0226     TRUE 0.990 18.000 0.828 NA   NA
 5716948 5716949 CLK_0226 CLK_0227     FALSE 0.004 527.000 0.000 NA   NA
 5716951 5716952 CLK_0229 CLK_0230   folP TRUE 0.848 92.000 0.003 1.000 Y NA
 5716952 5716953 CLK_0230 CLK_0231 folP   FALSE 0.376 164.000 0.003 NA   NA
 5716953 5716954 CLK_0231 CLK_0232   folK FALSE 0.488 100.000 0.003 NA   NA
 5716954 5716955 CLK_0232 CLK_0233 folK   FALSE 0.315 119.000 0.000 NA N NA
 5716955 5716956 CLK_0233 CLK_0234     FALSE 0.021 284.000 0.000 NA N NA
 5716956 5716957 CLK_0234 CLK_0235     TRUE 0.780 55.000 0.039 1.000 N NA
 5716957 5716958 CLK_0235 CLK_0236     FALSE 0.369 262.000 0.012 0.019 Y NA
 5716958 5716959 CLK_0236 CLK_0237     FALSE 0.003 572.000 0.000 NA N NA
 5716959 5716960 CLK_0237 CLK_0238     FALSE 0.010 354.000 0.000 NA   NA
 5716960 5716961 CLK_0238 CLK_0239   uppS FALSE 0.005 470.000 0.000 NA   NA
 5716961 5716962 CLK_0239 CLK_0240 uppS   FALSE 0.145 188.000 0.000 NA   NA
 5716962 5716963 CLK_0240 CLK_0241     FALSE 0.011 344.000 0.000 NA   NA
 5716963 5716964 CLK_0241 CLK_0242     TRUE 0.992 5.000 0.500 NA   NA
 5716964 5716965 CLK_0242 CLK_0243     FALSE 0.004 557.000 0.000 NA   NA
 5716965 5716966 CLK_0243 CLK_0244     FALSE 0.319 93.000 0.000 NA   NA
 5716968 5716969 CLK_0246 CLK_0247   cadD FALSE 0.018 302.000 0.000 NA   NA
 5716969 5716970 CLK_0247 CLK_0248 cadD   FALSE 0.288 149.000 0.000 NA   NA
 5716970 5716971 CLK_0248 CLK_0249     FALSE 0.336 127.000 0.000 NA   NA
 5716973 5716974 CLK_0251 CLK_0252   nimA FALSE 0.005 487.000 0.000 1.000   NA
 5716976 5716977 CLK_0254 CLK_0255     FALSE 0.003 910.000 0.000 NA   NA
 5716977 5716978 CLK_0255 CLK_0256     FALSE 0.446 60.000 0.000 NA   NA
 5716983 5716984 CLK_0261 CLK_0262     TRUE 0.977 19.000 0.200 NA   NA
 5716984 5716985 CLK_0262 CLK_0263     TRUE 0.989 -28.000 0.100 1.000   NA
 5716986 5716987 CLK_0264 CLK_0265     FALSE 0.121 198.000 0.000 NA   NA
 5716987 5716988 CLK_0265 CLK_0266     FALSE 0.321 92.000 0.000 NA   NA
 5716988 5716989 CLK_0266 CLK_0267     FALSE 0.014 322.000 0.000 NA   NA
 5716989 5716990 CLK_0267 CLK_0268     FALSE 0.028 687.000 0.000 0.015 Y NA
 5716990 5716991 CLK_0268 CLK_0269     FALSE 0.320 97.000 0.000 NA   NA
 5716992 5716993 CLK_0270 CLK_0271     TRUE 0.868 18.000 0.000 NA   NA
 5716994 5716995 CLK_0272 CLK_0273     TRUE 0.938 -7.000 0.000 NA   NA
 5716995 5716996 CLK_0273 CLK_0274     FALSE 0.467 58.000 0.000 NA   NA
 5716996 5716997 CLK_0274 CLK_0275     TRUE 0.554 50.000 0.000 NA   NA
 5716997 5716998 CLK_0275 CLK_0276     FALSE 0.019 300.000 0.000 NA   NA
 5716999 5717000 CLK_0277 CLK_0278     FALSE 0.028 277.000 0.000 NA   NA
 5717001 5717002 CLK_0279 CLK_0280     FALSE 0.009 364.000 0.000 NA   NA
 5717005 5717006 CLK_0283 CLK_0284     TRUE 0.674 58.000 0.010 NA   NA
 5717007 5717008 CLK_0285 CLK_0286     FALSE 0.007 398.000 0.000 1.000   NA
 5717009 5717010 CLK_0287 CLK_0288     FALSE 0.132 193.000 0.000 NA   NA
 5717010 5717011 CLK_0288 CLK_0289     TRUE 0.990 5.000 0.386 NA   NA
 5717014 5717015 CLK_0292 CLK_0293     TRUE 0.568 58.000 0.000 0.034   NA
 5717015 5717016 CLK_0293 CLK_0294     FALSE 0.334 85.000 0.000 NA   NA
 5717016 5717017 CLK_0294 CLK_0295     TRUE 0.893 13.000 0.000 NA   NA
 5717017 5717018 CLK_0295 CLK_0296     FALSE 0.337 126.000 0.000 NA   NA
 5717019 5717020 CLK_0297 CLK_0298     TRUE 0.992 0.000 0.400 NA   NA
 5717020 5717021 CLK_0298 CLK_0299     FALSE 0.003 595.000 0.000 NA   NA
 5717022 5717023 CLK_0300 CLK_0301     TRUE 0.834 81.000 0.000 0.055 Y NA
 5717024 5717025 CLK_0302 CLK_0303     FALSE 0.283 243.000 0.000 NA Y NA
 5717025 5717026 CLK_0303 CLK_0304   mraY FALSE 0.009 354.000 0.000 NA N NA
 5717027 5717028 CLK_0305 CLK_0306     FALSE 0.072 220.000 0.000 NA   NA
 5717028 5717029 CLK_0306 CLK_0307     FALSE 0.328 134.000 0.000 NA   NA
 5717029 5717030 CLK_0307 CLK_0308     FALSE 0.037 267.000 0.000 1.000   NA
 5717030 5717031 CLK_0308 CLK_0309     TRUE 0.964 23.000 0.111 1.000   NA
 5717032 5717033 CLK_0310 CLK_0311     TRUE 0.903 112.000 1.000 NA   NA
 5717034 5717035 CLK_0312 CLK_0313     FALSE 0.030 273.000 0.000 NA   NA
 5717035 5717036 CLK_0313 CLK_0314     FALSE 0.012 335.000 0.000 NA   NA
 5717036 5717037 CLK_0314 CLK_0315     FALSE 0.004 510.000 0.000 NA   NA
 5717037 5717038 CLK_0315 CLK_0316     TRUE 0.785 73.000 0.162 1.000   NA
 5717038 5717039 CLK_0316 CLK_0317     FALSE 0.095 211.000 0.000 1.000   NA
 5717041 5717042 CLK_0319 CLK_0320     FALSE 0.533 52.000 0.000 NA   NA
 5717044 5717045 CLK_0322 CLK_0323     TRUE 0.775 30.000 0.000 NA   NA
 5717045 5717046 CLK_0323 CLK_0324     FALSE 0.010 357.000 0.000 NA   NA
 5717047 5717048 CLK_0325 CLK_0326     FALSE 0.190 174.000 0.000 NA   NA
 5717050 5717051 CLK_0328 CLK_0329     FALSE 0.059 228.000 0.000 NA   NA
 5717052 5717053 CLK_0330 CLK_0331     FALSE 0.325 90.000 0.000 NA   NA
 5717053 5717054 CLK_0331 CLK_0332     FALSE 0.004 490.000 0.000 NA   NA
 5717055 5717056 CLK_0333 CLK_0334     FALSE 0.003 602.000 0.000 NA   NA
 5717057 5717058 CLK_0335 CLK_0336     FALSE 0.045 246.000 0.000 NA   NA
 5717058 5717059 CLK_0336 CLK_0337     FALSE 0.024 286.000 0.000 NA   NA
 5717059 5717060 CLK_0337 CLK_0338     TRUE 0.981 3.000 0.087 NA   NA
 5717060 5717061 CLK_0338 CLK_0339     FALSE 0.127 195.000 0.000 NA   NA
 5717063 5717064 CLK_0341 CLK_0342     TRUE 0.998 0.000 0.333 1.000 Y NA
 5717064 5717065 CLK_0342 CLK_0343     FALSE 0.022 292.000 0.000 NA   NA
 5717065 5717066 CLK_0343 CLK_0344     FALSE 0.007 395.000 0.000 NA   NA
 5717066 5717067 CLK_0344 CLK_0345     FALSE 0.012 342.000 0.000 1.000   NA
 5717067 5717068 CLK_0345 CLK_0346     TRUE 0.722 79.000 0.100 1.000 N NA
 5717068 5717069 CLK_0346 CLK_0347   cobU FALSE 0.026 278.000 0.000 1.000 N NA
 5717069 5717070 CLK_0347 CLK_0348 cobU   TRUE 0.655 89.000 0.051 NA   NA
 5717070 5717071 CLK_0348 CLK_0349     TRUE 0.992 9.000 0.667 NA   NA
 5717073 5717074 CLK_0351 CLK_0352 cobQ cobD TRUE 0.997 2.000 0.092 0.011 Y NA
 5717074 5717075 CLK_0352 CLK_0353 cobD   TRUE 0.566 143.000 0.026 1.000 N NA
 5717075 5717076 CLK_0353 CLK_0354   cbiM FALSE 0.305 184.000 0.013 1.000 N NA
 5717076 5717077 CLK_0354 CLK_0355 cbiM cbiN TRUE 0.999 4.000 0.861 0.011 Y NA
 5717077 5717078 CLK_0355 CLK_0356 cbiN cbiQ TRUE 0.999 -37.000 0.804 0.002 Y NA
 5717078 5717079 CLK_0356 CLK_0357 cbiQ   FALSE 0.005 416.000 0.000 NA N NA
 5717079 5717080 CLK_0357 CLK_0358   hemC TRUE 0.995 -31.000 0.009 NA Y NA
 5717080 5717081 CLK_0358 CLK_0359 hemC   FALSE 0.222 303.000 0.031 1.000 Y NA
 5717081 5717082 CLK_0359 CLK_0360   hemB TRUE 0.896 130.000 0.044 1.000 Y NA
 5717082 5717083 CLK_0360 CLK_0361 hemB cobB TRUE 0.850 93.000 0.005 1.000 Y NA
 5717083 5717084 CLK_0361 CLK_0362 cobB   FALSE 0.222 158.000 0.000 NA N NA
 5717084 5717085 CLK_0362 CLK_0363   cobH FALSE 0.388 62.000 0.000 NA N NA
 5717087 5717088 CLK_0365 CLK_0366     FALSE 0.029 279.000 0.000 1.000   NA
 5717088 5717089 CLK_0366 CLK_0367     FALSE 0.011 352.000 0.000 1.000   NA
 5717089 5717090 CLK_0367 CLK_0368     FALSE 0.219 166.000 0.000 NA   NA
 5717090 5717091 CLK_0368 CLK_0369     FALSE 0.387 68.000 0.000 NA   NA
 5717091 5717092 CLK_0369 CLK_0370     FALSE 0.047 250.000 0.000 1.000   NA
 5717092 5717093 CLK_0370 CLK_0371     FALSE 0.078 217.000 0.000 NA   NA
 5717093 5717094 CLK_0371 CLK_0372     TRUE 0.788 102.000 0.250 NA   NA
 5717094 5717095 CLK_0372 CLK_0373   cbiD TRUE 0.947 13.000 0.005 NA   NA
 5717095 5717096 CLK_0373 CLK_0374 cbiD cbiE TRUE 0.858 176.000 0.126 0.011 Y NA
 5717096 5717097 CLK_0374 CLK_0375 cbiE   FALSE 0.088 211.000 0.000 NA   NA
 5717097 5717098 CLK_0375 CLK_0376   cbiT FALSE 0.298 146.000 0.000 NA   NA
 5717098 5717099 CLK_0376 CLK_0377 cbiT   TRUE 0.930 0.000 0.000 NA   NA
 5717101 5717102 CLK_0379 CLK_0380     TRUE 0.767 158.000 0.400 NA   NA
 5717102 5717103 CLK_0380 CLK_0381     FALSE 0.483 57.000 0.000 NA   NA
 5717103 5717104 CLK_0381 CLK_0382     FALSE 0.409 68.000 0.000 1.000   NA
 5717104 5717105 CLK_0382 CLK_0383     TRUE 0.554 50.000 0.000 NA   NA
 5717105 5717106 CLK_0383 CLK_0384   cobI FALSE 0.323 91.000 0.000 NA   NA
 5717106 5717107 CLK_0384 CLK_0385 cobI cobM FALSE 0.467 288.000 0.291 0.011 Y NA
 5717107 5717108 CLK_0385 CLK_0386 cobM   TRUE 0.992 5.000 0.397 0.011   NA
 5717108 5717109 CLK_0386 CLK_0387   cobJ TRUE 0.845 134.000 0.352 0.011   NA
 5717109 5717110 CLK_0387 CLK_0388 cobJ cobK TRUE 0.909 177.000 0.423 0.011 Y NA
 5717110 5717111 CLK_0388 CLK_0389 cobK   FALSE 0.524 85.000 0.006 NA   NA
 5717111 5717112 CLK_0389 CLK_0390   cbiK TRUE 0.547 164.000 0.056 NA   NA
 5717112 5717113 CLK_0390 CLK_0391 cbiK   TRUE 0.967 13.000 0.040 1.000 N NA
 5717113 5717114 CLK_0391 CLK_0392   cobO FALSE 0.096 205.000 0.000 1.000 N NA
 5717114 5717115 CLK_0392 CLK_0393 cobO   FALSE 0.040 253.000 0.000 1.000 N NA
 5717115 5717116 CLK_0393 CLK_0394     TRUE 0.737 90.000 0.152 1.000 N NA
 5717116 5717117 CLK_0394 CLK_0395   asrA TRUE 0.974 20.000 0.174 1.000   NA
 5717117 5717118 CLK_0395 CLK_0396 asrA asrB TRUE 0.996 -13.000 0.750 0.034   NA
 5717118 5717119 CLK_0396 CLK_0397 asrB arsC TRUE 0.998 13.000 0.720 0.034 Y NA
 5717119 5717120 CLK_0397 CLK_0398 arsC   FALSE 0.240 158.000 0.000 1.000 N NA
 5717120 5717121 CLK_0398 CLK_0399     TRUE 0.942 -13.000 0.000 NA   NA
 5717121 5717122 CLK_0399 CLK_0400     TRUE 0.577 47.000 0.000 NA   NA
 5717122 5717123 CLK_0400 CLK_0401     TRUE 0.999 -16.000 0.750 1.000 Y NA
 5717123 5717124 CLK_0401 CLK_0402     FALSE 0.004 564.000 0.000 1.000   NA
 5717124 5717125 CLK_0402 CLK_0403     FALSE 0.017 312.000 0.000 1.000   NA
 5717125 5717126 CLK_0403 CLK_0404     TRUE 0.986 20.000 0.556 1.000 N NA
 5717126 5717127 CLK_0404 CLK_0405     TRUE 0.987 15.000 0.444 1.000 N NA
 5717127 5717128 CLK_0405 CLK_0406     TRUE 0.986 -16.000 0.067 NA   NA
 5717130 5717131 CLK_0408 CLK_0409     TRUE 0.989 21.000 0.833 NA   NA
 5717131 5717132 CLK_0409 CLK_0410     TRUE 0.994 4.000 0.833 NA   NA
 5717132 5717133 CLK_0410 CLK_0411     FALSE 0.017 651.000 0.154 NA   NA
 5717133 5717134 CLK_0411 CLK_0412     TRUE 0.999 -10.000 0.765 1.000 Y NA
 5717135 5717136 CLK_0413 CLK_0414     TRUE 0.998 1.000 0.625 1.000 Y NA
 5717143 5717144 CLK_0421 CLK_0422     FALSE 0.018 310.000 0.000 1.000   NA
 5717145 5717146 CLK_0423 CLK_0424 dhaKL dhaD TRUE 0.972 11.000 0.053 1.000 N NA
 5717146 5717147 CLK_0424 CLK_0425 dhaD   FALSE 0.025 564.000 0.250 1.000 N NA
 5717148 5717149 CLK_0426 CLK_0427     TRUE 0.716 35.000 0.000 NA   NA
 5717149 5717150 CLK_0427 CLK_0428     FALSE 0.153 204.000 0.000 0.015   NA
 5717150 5717151 CLK_0428 CLK_0429     FALSE 0.267 155.000 0.000 NA   NA
 5717151 5717152 CLK_0429 CLK_0430     FALSE 0.058 229.000 0.000 NA   NA
 5717152 5717153 CLK_0430 CLK_0431     TRUE 0.765 101.000 0.200 NA   NA
 5717153 5717154 CLK_0431 CLK_0432     TRUE 0.872 42.000 0.061 NA   NA
 5717154 5717155 CLK_0432 CLK_0433     FALSE 0.083 214.000 0.000 NA   NA
 5717155 5717156 CLK_0433 CLK_0434     TRUE 0.860 74.000 0.486 NA   NA
 5717156 5717157 CLK_0434 CLK_0435     FALSE 0.311 142.000 0.000 NA   NA
 5717159 5717160 CLK_0437 CLK_0438     TRUE 0.622 208.000 0.833 NA   NA
 5717160 5717161 CLK_0438 CLK_0439     FALSE 0.002 955.000 0.000 NA   NA
 5717161 5717162 CLK_0439 CLK_0440   recQ FALSE 0.045 244.000 0.000 NA   NA
 5717162 5717163 CLK_0440 CLK_0441 recQ   FALSE 0.332 111.000 0.000 1.000 N NA
 5717165 5717166 CLK_0443 CLK_0444     TRUE 0.832 115.000 0.333 1.000   NA
 5717166 5717167 CLK_0444 CLK_0445   lctP FALSE 0.004 530.000 0.000 1.000   NA
 5717167 5717168 CLK_0445 CLK_0446 lctP   TRUE 0.947 29.000 0.098 NA   NA
 5717168 5717169 CLK_0446 CLK_0447     TRUE 0.886 43.000 0.098 NA   NA
 5717169 5717170 CLK_0447 CLK_0448     TRUE 0.995 32.000 0.875 0.011 Y NA
 5717170 5717171 CLK_0448 CLK_0449     TRUE 0.981 61.000 0.875 0.009 Y NA
 5717171 5717172 CLK_0449 CLK_0450     FALSE 0.032 266.000 0.000 1.000 N NA
 5717172 5717173 CLK_0450 CLK_0451     TRUE 0.998 4.000 0.643 NA Y NA
 5717173 5717174 CLK_0451 CLK_0452     FALSE 0.167 181.000 0.000 NA   NA
 5717174 5717175 CLK_0452 CLK_0453     TRUE 0.993 0.000 0.500 NA   NA
 5717175 5717176 CLK_0453 CLK_0454     TRUE 0.709 172.000 0.400 NA   NA
 5717176 5717177 CLK_0454 CLK_0455     FALSE 0.094 208.000 0.000 NA   NA
 5717177 5717178 CLK_0455 CLK_0456     TRUE 0.979 2.000 0.051 NA   NA
 5717179 5717180 CLK_0457 CLK_0458     FALSE 0.003 948.000 0.000 NA   NA
 5717181 5717182 CLK_0459 CLK_0460     FALSE 0.140 307.000 0.000 0.062 Y NA
 5717182 5717183 CLK_0460 CLK_0461     FALSE 0.070 221.000 0.000 NA   NA
 5717185 5717186 CLK_0463 CLK_0464     TRUE 0.922 4.000 0.000 1.000   NA
 5717186 5717187 CLK_0464 CLK_0465     FALSE 0.028 274.000 0.000 1.000 N NA
 5717187 5717188 CLK_0465 CLK_0466     TRUE 0.872 16.000 0.000 1.000 N NA
 5717192 5717193 CLK_0470 CLK_0471     FALSE 0.328 134.000 0.000 NA   NA
 5717193 5717194 CLK_0471 CLK_0472     FALSE 0.004 525.000 0.000 NA   NA
 5717194 5717195 CLK_0472 CLK_0473     TRUE 0.998 17.000 0.791 0.008 Y NA
 5717195 5717196 CLK_0473 CLK_0474   feoB TRUE 0.994 32.000 0.871 1.000 Y NA
 5717196 5717197 CLK_0474 CLK_0475 feoB   TRUE 0.945 21.000 0.029 NA   NA
 5717197 5717198 CLK_0475 CLK_0476     FALSE 0.080 216.000 0.000 NA   NA
 5717200 5717201 CLK_0478 CLK_0479   tlp FALSE 0.019 299.000 0.000 NA   NA
 5717203 5717204 CLK_0481 CLK_0482     FALSE 0.004 515.000 0.000 1.000 N NA
 5717204 5717205 CLK_0482 CLK_0483     TRUE 0.998 1.000 0.462 1.000 Y NA
 5717205 5717206 CLK_0483 CLK_0484     FALSE 0.330 104.000 0.000 NA   NA
 5717206 5717207 CLK_0484 CLK_0485     FALSE 0.020 297.000 0.000 NA   NA
 5717209 5717210 CLK_0487 CLK_0488     FALSE 0.032 270.000 0.000 NA   NA
 5717210 5717211 CLK_0488 CLK_0489     TRUE 0.999 0.000 0.833 1.000 Y NA
 5717212 5717213 CLK_0490 CLK_0491     FALSE 0.044 236.000 0.000 NA N NA
 5717214 5717215 CLK_0492 CLK_0493     TRUE 0.999 -10.000 0.870 0.033 Y NA
 5717215 5717216 CLK_0493 CLK_0494     TRUE 0.999 -3.000 0.870 1.000 Y NA
 5717216 5717217 CLK_0494 CLK_0495     TRUE 0.938 74.000 0.196 1.000 Y NA
 5717217 5717218 CLK_0495 CLK_0496     FALSE 0.103 203.000 0.000 1.000 N NA
 5717218 5717219 CLK_0496 CLK_0497     FALSE 0.012 332.000 0.000 1.000 N NA
 5717219 5717220 CLK_0497 CLK_0498     TRUE 0.998 2.000 0.389 0.007 Y NA
 5717221 5717222 CLK_0499 CLK_0500     TRUE 0.999 3.000 1.000 NA Y NA
 5717222 5717223 CLK_0500 CLK_0501     FALSE 0.014 324.000 0.000 NA   NA
 5717224 5717225 CLK_0502 CLK_0503     FALSE 0.003 603.000 0.000 NA   NA
 5717225 5717226 CLK_0503 CLK_0504     FALSE 0.017 311.000 0.000 1.000   NA
 5717226 5717227 CLK_0504 CLK_0505     FALSE 0.039 323.000 0.023 NA   NA
 5717227 5717228 CLK_0505 CLK_0506     FALSE 0.453 165.000 0.023 NA   NA
 5717229 5717230 CLK_0507 CLK_0508     TRUE 0.581 116.000 0.015 NA   NA
 5717230 5717231 CLK_0508 CLK_0509     FALSE 0.008 385.000 0.000 1.000   NA
 5717232 5717233 CLK_0510 CLK_0511     FALSE 0.009 374.000 0.000 1.000   NA
 5717233 5717234 CLK_0511 CLK_0512     FALSE 0.082 218.000 0.000 1.000   NA
 5717234 5717235 CLK_0512 CLK_0513     FALSE 0.099 209.000 0.000 1.000   NA
 5717235 5717236 CLK_0513 CLK_0514     TRUE 0.854 57.000 0.107 0.034   NA
 5717236 5717237 CLK_0514 CLK_0515     TRUE 0.991 3.000 0.300 0.034   NA
 5717237 5717238 CLK_0515 CLK_0516   glpT TRUE 0.590 89.000 0.021 1.000   NA
 5717238 5717239 CLK_0516 CLK_0517 glpT argS FALSE 0.003 620.000 0.000 1.000 N NA
 5717239 5717240 CLK_0517 CLK_0518 argS   FALSE 0.006 404.000 0.000 1.000 N NA
 5717240 5717241 CLK_0518 CLK_0519     FALSE 0.022 297.000 0.000 1.000   NA
 5717242 5717243 CLK_0520 CLK_0521   feoB TRUE 0.934 26.000 0.034 NA   NA
 5717243 5717244 CLK_0521 CLK_0522 feoB feoA TRUE 0.996 15.000 0.308 1.000 Y NA
 5717245 5717246 CLK_0523 CLK_0524     FALSE 0.084 213.000 0.000 NA   NA
 5717246 5717247 CLK_0524 CLK_0525     FALSE 0.006 435.000 0.000 1.000   NA
 5717247 5717248 CLK_0525 CLK_0526     FALSE 0.007 412.000 0.000 1.000   NA
 5717248 5717249 CLK_0526 CLK_0527     FALSE 0.030 278.000 0.000 1.000   NA
 5717249 5717250 CLK_0527 CLK_0528     TRUE 0.998 2.000 0.511 1.000 Y NA
 5717250 5717251 CLK_0528 CLK_0529     TRUE 0.959 56.000 0.154 NA Y NA
 5717251 5717252 CLK_0529 CLK_0530     TRUE 0.833 188.000 0.250 NA Y NA
 5717252 5717253 CLK_0530 CLK_0531     FALSE 0.058 229.000 0.000 NA   NA
 5717253 5717254 CLK_0531 CLK_0532     FALSE 0.004 572.000 0.000 1.000   NA
 5717256 5717257 CLK_0534 CLK_0535     FALSE 0.051 236.000 0.000 NA   NA
 5717257 5717258 CLK_0535 CLK_0536     FALSE 0.089 210.000 0.000 NA   NA
 5717262 5717263 CLK_0540 CLK_0541     FALSE 0.498 143.000 0.008 NA   NA
 5717263 5717264 CLK_0541 CLK_0542     TRUE 0.700 56.000 0.008 1.000   NA
 5717265 5717266 CLK_0543 CLK_0544     FALSE 0.032 598.000 0.000 0.003 Y NA
 5717267 5717268 CLK_0545 CLK_0546     TRUE 0.983 18.000 0.333 1.000 N NA
 5717268 5717269 CLK_0546 CLK_0547     FALSE 0.006 422.000 0.000 1.000   NA
 5717269 5717270 CLK_0547 CLK_0548     FALSE 0.322 99.000 0.000 NA   NA
 5717270 5717271 CLK_0548 CLK_0549     FALSE 0.003 806.000 0.000 NA   NA
 5717271 5717272 CLK_0549 CLK_0550     TRUE 0.988 2.000 0.217 NA   NA
 5717272 5717273 CLK_0550 CLK_0551     TRUE 0.993 19.000 0.084 0.033 Y NA
 5717273 5717274 CLK_0551 CLK_0552     TRUE 0.988 12.000 0.308 0.033 N NA
 5717274 5717275 CLK_0552 CLK_0553     FALSE 0.018 303.000 0.000 NA   NA
 5717275 5717276 CLK_0553 CLK_0554     TRUE 0.577 104.000 0.020 NA   NA
 5717276 5717277 CLK_0554 CLK_0555     TRUE 0.910 10.000 0.000 1.000   NA
 5717277 5717278 CLK_0555 CLK_0556     FALSE 0.354 76.000 0.000 NA   NA
 5717278 5717279 CLK_0556 CLK_0557     TRUE 0.980 1.000 0.050 NA   NA
 5717279 5717280 CLK_0557 CLK_0558   maa FALSE 0.023 289.000 0.000 NA   NA
 5717282 5717283 CLK_0560 CLK_0561     FALSE 0.031 276.000 0.000 1.000   NA
 5717283 5717284 CLK_0561 CLK_0562     FALSE 0.478 160.000 0.017 1.000   NA
 5717286 5717287 CLK_0564 CLK_0565   mgtE FALSE 0.003 631.000 0.000 NA   NA
 5717287 5717288 CLK_0565 CLK_0566 mgtE   FALSE 0.003 1001.000 0.000 0.059 N NA
 5717288 5717289 CLK_0566 CLK_0567   serA TRUE 0.623 225.000 0.110 0.059 Y NA
 5717289 5717290 CLK_0567 CLK_0568 serA   TRUE 0.987 -22.000 0.072 NA   NA
 5717290 5717291 CLK_0568 CLK_0569     FALSE 0.002 1037.000 0.000 NA   NA
 5717291 5717292 CLK_0569 CLK_0570     FALSE 0.533 168.000 0.056 1.000   NA
 5717294 5717295 CLK_0572 CLK_0573     TRUE 0.746 111.000 0.118 1.000   NA
 5717295 5717296 CLK_0573 CLK_0574     FALSE 0.021 299.000 0.000 1.000   NA
 5717296 5717297 CLK_0574 CLK_0575     FALSE 0.382 158.000 0.004 NA N NA
 5717297 5717298 CLK_0575 CLK_0576     FALSE 0.354 76.000 0.000 NA   NA
 5717298 5717299 CLK_0576 CLK_0577     FALSE 0.028 277.000 0.000 NA   NA
 5717299 5717300 CLK_0577 CLK_0578     FALSE 0.511 178.000 0.091 NA   NA
 5717300 5717301 CLK_0578 CLK_0579   xpt FALSE 0.416 161.000 0.009 1.000 N NA
 5717301 5717302 CLK_0579 CLK_0580 xpt   FALSE 0.018 301.000 0.000 NA   NA
 5717302 5717303 CLK_0580 CLK_0581     FALSE 0.016 310.000 0.000 NA   NA
 5717303 5717304 CLK_0581 CLK_0582     TRUE 0.660 196.000 0.667 NA   NA
 5717304 5717305 CLK_0582 CLK_0583     FALSE 0.011 344.000 0.000 NA   NA
 5717305 5717306 CLK_0583 CLK_0584     FALSE 0.167 181.000 0.000 NA   NA
 5717306 5717307 CLK_0584 CLK_0585     TRUE 0.684 126.000 0.065 NA   NA
 5717307 5717308 CLK_0585 CLK_0586     FALSE 0.026 280.000 0.000 NA   NA
 5717308 5717309 CLK_0586 CLK_0587     TRUE 0.774 182.000 1.000 NA   NA
 5717309 5717310 CLK_0587 CLK_0588     FALSE 0.008 380.000 0.000 NA   NA
 5717310 5717311 CLK_0588 CLK_0589     TRUE 0.999 2.000 0.667 0.033 Y NA
 5717311 5717312 CLK_0589 CLK_0590     TRUE 0.997 -37.000 0.900 0.033 N NA
 5717314 5717315 CLK_0592 CLK_0593     TRUE 0.980 14.000 0.167 NA   NA
 5717315 5717316 CLK_0593 CLK_0594   rpsA FALSE 0.007 399.000 0.000 NA   NA
 5717316 5717317 CLK_0594 CLK_0595 rpsA   FALSE 0.312 183.000 0.008 1.000   NA
 5717317 5717318 CLK_0595 CLK_0596     FALSE 0.514 172.000 0.067 NA   NA
 5717318 5717319 CLK_0596 CLK_0597     FALSE 0.003 869.000 0.000 NA   NA
 5717319 5717320 CLK_0597 CLK_0598     TRUE 0.995 0.000 0.857 NA   NA
 5717320 5717321 CLK_0598 CLK_0599     TRUE 0.993 -37.000 0.231 1.000   NA
 5717321 5717322 CLK_0599 CLK_0600     FALSE 0.015 318.000 0.000 NA   NA
 5717322 5717323 CLK_0600 CLK_0601   asdA FALSE 0.006 422.000 0.000 NA   NA
 5717325 5717326 CLK_0603 CLK_0604     TRUE 0.970 -6.000 0.012 NA N NA
 5717326 5717327 CLK_0604 CLK_0605   panE FALSE 0.004 494.000 0.000 NA N NA
 5717327 5717328 CLK_0605 CLK_0606 panE fchA FALSE 0.017 302.000 0.000 1.000 N NA
 5717328 5717329 CLK_0606 CLK_0607 fchA folD TRUE 0.987 0.000 0.082 0.001 N NA
 5717329 5717330 CLK_0607 CLK_0608 folD   FALSE 0.016 320.000 0.000 1.000   NA
 5717332 5717333 CLK_0610 CLK_0611     TRUE 0.816 115.000 0.286 NA   NA
 5717333 5717334 CLK_0611 CLK_0612     TRUE 0.563 112.000 0.012 NA   NA
 5717334 5717335 CLK_0612 CLK_0613     FALSE 0.002 672.000 0.000 NA N NA
 5717335 5717336 CLK_0613 CLK_0614   cysK FALSE 0.053 330.000 0.083 NA N NA
 5717336 5717337 CLK_0614 CLK_0615 cysK   TRUE 0.982 45.000 0.400 1.000 Y NA
 5717337 5717338 CLK_0615 CLK_0616     TRUE 0.991 35.000 0.400 0.033 Y NA
 5717338 5717339 CLK_0616 CLK_0617   iscS TRUE 0.940 104.000 0.286 1.000 Y NA
 5717339 5717340 CLK_0617 CLK_0618 iscS   FALSE 0.012 346.000 0.000 1.000   NA
 5717340 5717341 CLK_0618 CLK_0619     FALSE 0.447 156.000 0.008 NA   NA
 5717341 5717342 CLK_0619 CLK_0620   trmU-1 FALSE 0.528 116.000 0.004 NA   NA
 5717342 5717343 CLK_0620 CLK_0621 trmU-1   FALSE 0.027 279.000 0.000 NA   NA
 5717343 5717344 CLK_0621 CLK_0622     FALSE 0.446 60.000 0.000 NA   NA
 5717344 5717345 CLK_0622 CLK_0623     TRUE 0.946 -30.000 0.000 NA   NA
 5717345 5717346 CLK_0623 CLK_0624     FALSE 0.134 192.000 0.000 NA   NA
 5717346 5717347 CLK_0624 CLK_0626     TRUE 0.999 -3.000 0.875 NA Y NA
 5717349 5717350 CLK_0627 CLK_0628 bcrA   TRUE 0.993 -7.000 0.333 NA   NA
 5717350 5717351 CLK_0628 CLK_0629     FALSE 0.018 303.000 0.000 NA   NA
 5717351 5717352 CLK_0629 CLK_0630     FALSE 0.010 353.000 0.000 NA   NA
 5717354 5717355 CLK_0632 CLK_0633     TRUE 0.992 6.000 0.556 1.000 N NA
 5717355 5717356 CLK_0633 CLK_0634     FALSE 0.020 296.000 0.000 NA   NA
 5717356 5717357 CLK_0634 CLK_0635     FALSE 0.003 586.000 0.000 NA   NA
 5717359 5717360 CLK_0637 CLK_0638     TRUE 0.881 14.000 0.000 1.000 N NA
 5717360 5717361 CLK_0638 CLK_0639     FALSE 0.372 64.000 0.000 NA N NA
 5717361 5717362 CLK_0639 CLK_0640     TRUE 0.989 3.000 0.000 NA Y NA
 5717362 5717363 CLK_0640 CLK_0641     TRUE 0.947 -46.000 0.000 NA   NA
 5717363 5717364 CLK_0641 CLK_0642     FALSE 0.335 84.000 0.000 NA   NA
 5717366 5717367 CLK_0644 CLK_0645     TRUE 0.876 15.000 0.000 1.000 N NA
 5717367 5717368 CLK_0645 CLK_0646   amyB FALSE 0.003 639.000 0.000 1.000   NA
 5717368 10253780 CLK_0646 CLK_3992 amyB   FALSE 0.328 134.000 0.000 NA   NA
 10253780 5717369 CLK_3992 CLK_0647   tyrS FALSE 0.003 558.000 0.000 NA   NA
 5717369 5717370 CLK_0647 CLK_0648 tyrS   FALSE 0.025 280.000 0.000 1.000 N NA
 5717370 5717371 CLK_0648 CLK_0649     TRUE 0.996 -7.000 0.833 1.000 N NA
 5717371 5717372 CLK_0649 CLK_0650     TRUE 0.990 1.000 0.278 NA   NA
 5717374 5717375 CLK_0652 CLK_0653     FALSE 0.323 91.000 0.000 NA   NA
 5717375 5717376 CLK_0653 CLK_0654     FALSE 0.150 186.000 0.000 NA   NA
 5717376 5717377 CLK_0654 CLK_0655     FALSE 0.349 78.000 0.000 NA   NA
 5717377 5717378 CLK_0655 CLK_0656     TRUE 0.541 175.000 0.095 1.000   NA
 5717378 5717379 CLK_0656 CLK_0657   sdhB FALSE 0.006 401.000 0.000 1.000 N NA
 5717379 5717380 CLK_0657 CLK_0658 sdhB sdhA TRUE 0.996 13.000 0.146 0.001 Y NA
 5717384 5717385 CLK_0662 CLK_0663     FALSE 0.377 70.000 0.000 NA   NA
 5717386 5717387 CLK_0664 CLK_0665     FALSE 0.008 369.000 0.000 NA   NA
 5717387 5717388 CLK_0665 CLK_0666     FALSE 0.340 109.000 0.000 NA   NA
 5717388 5717389 CLK_0666 CLK_0667     TRUE 0.998 6.000 0.786 0.033 Y NA
 5717389 5717390 CLK_0667 CLK_0668     TRUE 0.907 188.000 0.688 0.033 Y NA
 5717391 5717392 CLK_0669 CLK_0670   cotJB TRUE 0.937 34.000 0.125 NA   NA
 5717392 5717393 CLK_0670 CLK_0671 cotJB cotJC TRUE 0.924 31.000 0.047 NA   NA
 5717393 5717394 CLK_0671 CLK_0672 cotJC   FALSE 0.090 204.000 0.000 NA N NA
 5717394 5717395 CLK_0672 CLK_0673     TRUE 0.989 17.000 0.667 NA   NA
 5717395 5717396 CLK_0673 CLK_0674     FALSE 0.006 423.000 0.000 NA   NA
 5717399 5717400 CLK_0677 CLK_0678     FALSE 0.004 516.000 0.000 NA   NA
 5717403 5717404 CLK_0681 CLK_0682     FALSE 0.003 670.000 0.000 NA   NA
 5717404 5717405 CLK_0682 CLK_0683     FALSE 0.008 369.000 0.000 NA   NA
 5717407 5717408 CLK_0685 CLK_0686     FALSE 0.002 995.000 0.000 NA   NA
 5717408 5717409 CLK_0686 CLK_0687     FALSE 0.003 586.000 0.000 NA   NA
 5717409 5717410 CLK_0687 CLK_0688     FALSE 0.024 290.000 0.000 1.000   NA
 5717410 5717411 CLK_0688 CLK_0689     FALSE 0.350 119.000 0.000 NA   NA
 5717411 5717412 CLK_0689 CLK_0690     FALSE 0.003 797.000 0.000 NA   NA
 5717412 5717413 CLK_0690 CLK_0691     FALSE 0.025 284.000 0.000 NA   NA
 5717413 5717414 CLK_0691 CLK_0692     FALSE 0.015 318.000 0.000 NA   NA
 5717415 5717416 CLK_0693 CLK_0694     TRUE 0.814 40.000 0.014 1.000 N NA
 5717417 5717418 CLK_0695 CLK_0696 grdX grdE TRUE 0.825 91.000 0.400 NA   NA
 5717418 5717419 CLK_0696 CLK_0697 grdE grdB TRUE 0.963 33.000 0.222 0.003   NA
 5717419 5717420 CLK_0697 CLK_0699 grdB trxB FALSE 0.240 165.000 0.000 1.000   NA
 5717420 5717421 CLK_0699 CLK_0700 trxB   TRUE 0.987 35.000 0.226 1.000 Y NA
 5717421 5717422 CLK_0700 CLK_0701   grdA FALSE 0.354 85.000 0.000 1.000   NA
 5717422 5717423 CLK_0701 CLK_0702 grdA   TRUE 0.897 22.000 0.000 0.002   NA
 5717423 5717424 CLK_0702 CLK_0703   grdC TRUE 0.712 95.000 0.054 0.003   NA
 5717424 5717425 CLK_0703 CLK_0704 grdC grdD TRUE 0.991 16.000 0.622 0.003   NA
 5717425 5717426 CLK_0704 CLK_0705 grdD   FALSE 0.003 525.000 0.000 1.000 N NA
 5717426 5717427 CLK_0705 CLK_0706     TRUE 0.642 67.000 0.005 0.059   NA
 5717427 5717428 CLK_0706 CLK_0707   mtnK FALSE 0.006 430.000 0.000 1.000   NA
 5717428 5717429 CLK_0707 CLK_0708 mtnK mtnA TRUE 0.710 140.000 0.104 1.000   NA
 5717429 5717430 CLK_0708 CLK_0709 mtnA   TRUE 0.815 24.000 0.000 1.000 N NA
 5717430 5717431 CLK_0709 CLK_0710     TRUE 0.990 2.000 0.000 1.000 Y NA
 5717431 5717432 CLK_0710 CLK_0711     TRUE 0.987 15.000 0.000 0.032 Y NA
 5717432 5717433 CLK_0711 CLK_0712     TRUE 0.978 21.000 0.000 NA Y NA
 5717433 5717434 CLK_0712 CLK_0713     TRUE 0.919 58.000 0.014 NA Y NA
 5717434 5717435 CLK_0713 CLK_0714     TRUE 0.897 175.000 0.400 1.000 Y NA
 5717435 5717436 CLK_0714 CLK_0715     FALSE 0.016 309.000 0.000 NA   NA
 5717438 5717439 CLK_0717 CLK_0718     TRUE 0.576 163.000 0.074 NA   NA
 5717439 5717440 CLK_0718 CLK_0719     TRUE 0.613 142.000 0.038 NA   NA
 5717440 5717441 CLK_0719 CLK_0720     TRUE 0.988 -3.000 0.135 NA   NA
 5717441 5717442 CLK_0720 CLK_0721     FALSE 0.003 690.000 0.000 NA   NA
 5717442 5717443 CLK_0721 CLK_0722     TRUE 0.859 48.000 0.080 NA   NA
 5717444 5717445 CLK_0723 CLK_0724     FALSE 0.009 361.000 0.000 NA   NA
 5717446 5717447 CLK_0725 CLK_0726     TRUE 0.981 28.000 0.667 NA   NA
 5717447 5717448 CLK_0726 CLK_0727     TRUE 0.863 57.000 0.200 NA   NA
 5717448 5717449 CLK_0727 CLK_0728     TRUE 0.997 14.000 0.500 0.001 Y NA
 5717449 5717450 CLK_0728 CLK_0729     TRUE 0.994 32.000 0.667 0.043 Y NA
 5717450 5717451 CLK_0729 CLK_0730     TRUE 0.727 116.000 0.100 1.000 N NA
 5717451 5717452 CLK_0730 CLK_0731   topB FALSE 0.007 392.000 0.000 1.000 N NA
 5717452 5717453 CLK_0731 CLK_0732 topB   TRUE 0.851 39.000 0.024 NA   NA
 5717453 5717454 CLK_0732 CLK_0733     FALSE 0.027 279.000 0.000 NA   NA
 5717454 5717455 CLK_0733 CLK_0734     TRUE 0.613 64.000 0.008 NA   NA
 5717455 5717456 CLK_0734 CLK_0735     FALSE 0.003 692.000 0.000 NA   NA
 5717456 5717457 CLK_0735 CLK_0736     FALSE 0.008 397.000 0.000 1.000   NA
 5717457 5717458 CLK_0736 CLK_0737     FALSE 0.019 304.000 0.000 1.000   NA
 5717458 5717459 CLK_0737 CLK_0738     FALSE 0.013 322.000 0.000 1.000 N NA
 5717459 5717460 CLK_0738 CLK_0739     TRUE 0.985 -7.000 0.067 NA   NA
 5717460 5717461 CLK_0739 CLK_0740     TRUE 0.971 6.000 0.033 NA   NA
 5717461 5717462 CLK_0740 CLK_0741     FALSE 0.138 293.000 0.230 NA   NA
 5717462 5717463 CLK_0741 CLK_0742     FALSE 0.006 414.000 0.000 NA   NA
 5717463 5717464 CLK_0742 CLK_0743     FALSE 0.059 228.000 0.000 NA   NA
 5717464 5717465 CLK_0743 CLK_0744     FALSE 0.012 335.000 0.000 NA   NA
 5717465 5717466 CLK_0744 CLK_0745     FALSE 0.078 217.000 0.000 NA   NA
 5717466 5717467 CLK_0745 CLK_0746     TRUE 0.947 37.000 0.287 NA   NA
 5717467 5717468 CLK_0746 CLK_0747   copZ TRUE 0.903 123.000 0.024 0.001 Y NA
 5717468 5717469 CLK_0747 CLK_0748 copZ   FALSE 0.169 287.000 0.000 1.000 Y NA
 5717469 5717470 CLK_0748 CLK_0749     FALSE 0.019 297.000 0.000 1.000 N NA
 5717470 5717471 CLK_0749 CLK_0750     FALSE 0.022 293.000 0.000 NA   NA
 5717471 5717472 CLK_0750 CLK_0751     FALSE 0.517 164.000 0.040 NA   NA
 5717472 5717473 CLK_0751 CLK_0752     FALSE 0.011 344.000 0.000 NA   NA
 5717475 5717476 CLK_0754 CLK_0755     TRUE 0.842 42.000 0.032 NA   NA
 5717478 5717479 CLK_0757 CLK_0758     FALSE 0.003 615.000 0.000 NA   NA
 5717479 5717480 CLK_0758 CLK_0759   trkA FALSE 0.003 788.000 0.000 NA   NA
 5717480 5717481 CLK_0759 CLK_0760 trkA trkH TRUE 0.998 -3.000 0.163 0.004 Y NA
 5717482 5717483 CLK_0761 CLK_0762     FALSE 0.007 390.000 0.000 NA   NA
 5717484 5717485 CLK_0763 CLK_0764     FALSE 0.002 1288.000 0.000 NA   NA
 5717486 5717487 CLK_0765 CLK_0766     TRUE 0.978 15.000 0.158 NA   NA
 5717487 5717488 CLK_0766 CLK_0767     FALSE 0.004 509.000 0.000 1.000   NA
 5717489 5717490 CLK_0768 CLK_0769 rbr   FALSE 0.005 425.000 0.000 NA N NA
 5717492 5717493 CLK_0771 CLK_0772     FALSE 0.302 145.000 0.000 NA   NA
 5717493 5717494 CLK_0772 CLK_0773     FALSE 0.320 97.000 0.000 NA   NA
 5717494 5717495 CLK_0773 CLK_0774     FALSE 0.025 282.000 0.000 NA   NA
 5717495 5717496 CLK_0774 CLK_0775     FALSE 0.447 209.000 0.312 NA N NA
 5717496 5717497 CLK_0775 CLK_0776     TRUE 0.889 147.000 0.077 NA Y NA
 5717497 5717498 CLK_0776 CLK_0777   noxA FALSE 0.410 199.000 0.111 NA   NA
 5717499 5717500 CLK_0778 CLK_0779     FALSE 0.171 178.000 0.000 1.000 N NA
 5717501 5717502 CLK_0780 CLK_0781     FALSE 0.017 302.000 0.000 1.000 N NA
 5717502 5717503 CLK_0781 CLK_0782     TRUE 0.993 22.000 0.214 1.000 Y NA
 5717503 5717504 CLK_0782 CLK_0783     TRUE 0.997 3.000 0.255 1.000 Y NA
 5717505 5717506 CLK_0784 CLK_0785     TRUE 0.761 74.000 0.133 NA   NA
 5717507 5717508 CLK_0786 CLK_0787     FALSE 0.043 280.000 0.000 0.003   NA
 5717508 5717509 CLK_0787 CLK_0788     TRUE 0.743 114.000 0.107 1.000   NA
 5717509 5717510 CLK_0788 CLK_0789     FALSE 0.027 422.000 0.089 1.000   NA
 5717510 5717511 CLK_0789 CLK_0790     FALSE 0.372 118.000 0.000 1.000   NA
 5717511 5717512 CLK_0790 CLK_0791     TRUE 0.823 24.000 0.000 NA   NA
 5717512 5717513 CLK_0791 CLK_0792     FALSE 0.007 391.000 0.000 NA   NA
 5717513 5717514 CLK_0792 CLK_0793     FALSE 0.026 280.000 0.000 NA   NA
 5717514 5717515 CLK_0793 CLK_0794     FALSE 0.004 519.000 0.000 NA   NA
 5717515 5717516 CLK_0794 CLK_0795     TRUE 0.925 53.000 0.500 NA   NA
 5717516 5717517 CLK_0795 CLK_0796     TRUE 0.990 0.000 0.250 NA   NA
 5717519 5717520 CLK_0798 CLK_0799     FALSE 0.005 460.000 0.000 1.000 N NA
 5717520 5717521 CLK_0799 CLK_0800     TRUE 0.998 -3.000 0.235 0.032 Y NA
 5717521 5717522 CLK_0800 CLK_0801     TRUE 0.997 9.000 0.353 0.032 Y NA
 5717522 5717523 CLK_0801 CLK_0802     TRUE 0.915 99.000 0.118 1.000 Y NA
 5717523 5717524 CLK_0802 CLK_0803     TRUE 0.987 -6.000 0.059 0.031   NA
 5717524 5717525 CLK_0803 CLK_0804     FALSE 0.005 446.000 0.000 NA   NA
 5717526 5717527 CLK_0805 CLK_0806     TRUE 0.997 0.000 0.231 1.000 Y NA
 5717530 5717531 CLK_0809 CLK_0810     TRUE 0.583 135.000 0.025 1.000 N NA
 5717531 5717532 CLK_0810 CLK_0811     FALSE 0.002 873.000 0.000 NA N NA
 5717532 5717533 CLK_0811 CLK_0812     TRUE 0.999 -28.000 0.646 NA Y NA
 5717533 5717534 CLK_0812 CLK_0813     TRUE 0.934 141.000 0.270 1.000 Y NA
 5717534 5717535 CLK_0813 CLK_0814     TRUE 0.809 85.000 0.000 1.000 Y NA
 5717535 5717536 CLK_0814 CLK_0815     TRUE 0.987 -30.000 0.035 0.059   NA
 5717536 5717537 CLK_0815 CLK_0816     TRUE 0.645 127.000 0.035 1.000   NA
 5717537 5717538 CLK_0816 CLK_0817   rnz FALSE 0.026 287.000 0.000 1.000   NA
 5717538 5717539 CLK_0817 CLK_0818 rnz   FALSE 0.005 459.000 0.000 1.000   NA
 5717539 5717540 CLK_0818 CLK_0819     FALSE 0.302 145.000 0.000 NA   NA
 5717540 5717541 CLK_0819 CLK_0820     FALSE 0.389 172.000 0.015 NA   NA
 5717541 5717542 CLK_0820 CLK_0821     TRUE 0.608 286.000 0.800 0.020 Y NA
 5717542 5717543 CLK_0821 CLK_0822     TRUE 0.678 188.000 0.600 1.000 N NA
 5717543 5717544 CLK_0822 CLK_0823     TRUE 0.969 109.000 1.000 NA Y NA
 5717544 5717545 CLK_0823 CLK_0824     TRUE 0.994 2.000 0.600 NA   NA
 5717545 5717546 CLK_0824 CLK_0825     TRUE 0.986 19.000 0.500 NA   NA
 5717547 5717548 CLK_0826 CLK_0827     FALSE 0.003 558.000 0.000 NA   NA
 5717548 5717549 CLK_0827 CLK_0828     TRUE 0.673 168.000 0.250 NA   NA
 5717550 5717551 CLK_0829 CLK_0830 pepD   TRUE 0.749 34.000 0.000 1.000   NA
 5717551 5717552 CLK_0830 CLK_0831   pdxK FALSE 0.004 498.000 0.000 1.000   NA
 5717554 5717555 CLK_0833 CLK_0834     TRUE 0.995 -13.000 0.500 1.000   NA
 5717555 5717556 CLK_0834 CLK_0835     TRUE 0.732 173.000 0.500 NA   NA
 5717556 5717557 CLK_0835 CLK_0836     FALSE 0.005 439.000 0.000 NA   NA
 5717557 5717558 CLK_0836 CLK_0837     TRUE 0.999 2.000 1.000 1.000 Y NA
 5717558 5717559 CLK_0837 CLK_0838     TRUE 0.863 74.000 0.500 1.000 N NA
 5717559 5717560 CLK_0838 CLK_0839     TRUE 0.992 -10.000 0.222 1.000   NA
 5717560 5717561 CLK_0839 CLK_0840     FALSE 0.380 69.000 0.000 NA   NA
 5717561 5717562 CLK_0840 CLK_0841     FALSE 0.013 326.000 0.000 NA   NA
 5717562 5717563 CLK_0841 CLK_0842     FALSE 0.006 402.000 0.000 NA   NA
 5717563 5717564 CLK_0842 CLK_0843     TRUE 0.895 73.000 0.024 1.000 Y NA
 5717564 5717565 CLK_0843 CLK_0844     TRUE 0.998 13.000 0.833 0.032 Y NA
 5717565 5717566 CLK_0844 CLK_0845     TRUE 0.996 19.000 0.400 1.000 Y NA
 5717566 5717567 CLK_0845 CLK_0846     FALSE 0.343 137.000 0.000 1.000   NA
 5717571 5717572 CLK_0850 CLK_0851     FALSE 0.008 384.000 0.000 NA   NA
 5717572 5717573 CLK_0851 CLK_0852     TRUE 0.732 173.000 0.500 NA   NA
 5717575 5717576 CLK_0854 CLK_0855     TRUE 0.998 2.000 0.643 0.032 Y NA
 5717576 5717577 CLK_0855 CLK_0856     TRUE 0.643 131.000 0.041 NA   NA
 5717577 5717578 CLK_0856 CLK_0857     FALSE 0.319 95.000 0.000 NA   NA
 5717578 5717579 CLK_0857 CLK_0858     TRUE 0.911 54.000 0.000 0.058 Y NA
 5717579 5717580 CLK_0858 CLK_0859     FALSE 0.212 168.000 0.000 NA   NA
 5717580 5717581 CLK_0859 CLK_0860     FALSE 0.005 474.000 0.000 NA   NA
 5717582 5717583 CLK_0861 CLK_0862     FALSE 0.429 123.000 0.000 0.058   NA
 5717584 5717585 CLK_0863 CLK_0864     TRUE 0.938 -7.000 0.000 NA   NA
 5717585 5717586 CLK_0864 CLK_0865     FALSE 0.329 133.000 0.000 NA   NA
 5717586 5717587 CLK_0865 CLK_0866     FALSE 0.005 466.000 0.000 NA   NA
 5717587 5717588 CLK_0866 CLK_0867     TRUE 0.577 47.000 0.000 NA   NA
 5717588 5717589 CLK_0867 CLK_0868     FALSE 0.320 97.000 0.000 NA   NA
 5717589 5717590 CLK_0868 CLK_0869     FALSE 0.351 115.000 0.000 NA   NA
 5717590 5717591 CLK_0869 CLK_0870     TRUE 0.816 25.000 0.000 NA   NA
 5717591 5717592 CLK_0870 CLK_0871     FALSE 0.018 303.000 0.000 NA   NA
 5717592 5717593 CLK_0871 CLK_0872     FALSE 0.370 72.000 0.000 NA   NA
 5717593 5717594 CLK_0872 CLK_0873     FALSE 0.020 296.000 0.000 NA   NA
 5717594 5717595 CLK_0873 CLK_0874     FALSE 0.446 60.000 0.000 NA   NA
 5717595 5717596 CLK_0874 CLK_0875     TRUE 0.792 28.000 0.000 NA   NA
 5717596 5717597 CLK_0875 CLK_0876     FALSE 0.366 73.000 0.000 NA   NA
 5717597 5717598 CLK_0876 CLK_0877     FALSE 0.380 69.000 0.000 NA   NA
 5717598 5717599 CLK_0877 CLK_0878     FALSE 0.338 125.000 0.000 NA   NA
 5717599 5717600 CLK_0878 CLK_0879     FALSE 0.348 120.000 0.000 NA   NA
 5717600 5717601 CLK_0879 CLK_0880     TRUE 0.566 49.000 0.000 NA   NA
 5717601 5717602 CLK_0880 CLK_0881     FALSE 0.052 234.000 0.000 NA   NA
 5717602 5717603 CLK_0881 CLK_0882     FALSE 0.298 146.000 0.000 NA   NA
 5717603 5717604 CLK_0882 CLK_0883     TRUE 0.934 -3.000 0.000 NA   NA
 5717604 5717605 CLK_0883 CLK_0884     TRUE 0.823 24.000 0.000 NA   NA
 5717605 5717606 CLK_0884 CLK_0885     TRUE 0.602 44.000 0.000 NA   NA
 5717606 5717607 CLK_0885 CLK_0886     FALSE 0.267 155.000 0.000 NA   NA
 5717607 5717608 CLK_0886 CLK_0887     FALSE 0.361 74.000 0.000 NA   NA
 5717608 5717609 CLK_0887 CLK_0888     FALSE 0.335 84.000 0.000 NA   NA
 5717609 5717610 CLK_0888 CLK_0889     TRUE 0.941 -10.000 0.000 NA   NA
 5717610 5717611 CLK_0889 CLK_0890     TRUE 0.986 1.000 0.125 NA   NA
 5717611 5717612 CLK_0890 CLK_0891     TRUE 0.968 16.000 0.062 NA   NA
 5717612 5717613 CLK_0891 CLK_0892     TRUE 0.917 63.000 0.800 NA   NA
 5717613 5717614 CLK_0892 CLK_0893     TRUE 0.918 58.000 0.600 NA   NA
 5717614 5717615 CLK_0893 CLK_0894     TRUE 0.880 114.000 0.667 NA   NA
 5717615 5717616 CLK_0894 CLK_0895     FALSE 0.483 57.000 0.000 NA   NA
 5717616 5717617 CLK_0895 CLK_0898     TRUE 0.878 16.000 0.000 NA   NA
 5717617 5717618 CLK_0898 CLK_0899     TRUE 0.915 4.000 0.000 NA   NA
 5717618 5717619 CLK_0899 CLK_0900     TRUE 0.906 8.000 0.000 NA   NA
 5717619 5717620 CLK_0900 CLK_0901     TRUE 0.901 11.000 0.000 NA   NA
 5717620 5717621 CLK_0901 CLK_0902     TRUE 0.930 0.000 0.000 NA   NA
 5717621 5717622 CLK_0902 CLK_0903     FALSE 0.203 171.000 0.000 NA   NA
 5717622 5717623 CLK_0903 CLK_0904     FALSE 0.276 153.000 0.000 NA   NA
 5717623 5717624 CLK_0904 CLK_0905     FALSE 0.328 134.000 0.000 NA   NA
 5717624 5717625 CLK_0905 CLK_0906     TRUE 0.994 2.000 0.667 NA   NA
 5717625 5717626 CLK_0906 CLK_0907     TRUE 0.930 0.000 0.000 NA   NA
 5717626 5717627 CLK_0907 CLK_0908     FALSE 0.333 129.000 0.000 NA   NA
 5717627 5717628 CLK_0908 CLK_0909     FALSE 0.321 98.000 0.000 NA   NA
 5717628 5717629 CLK_0909 CLK_0910     FALSE 0.004 509.000 0.000 NA   NA
 5717629 5717630 CLK_0910 CLK_0911     FALSE 0.108 203.000 0.000 NA   NA
 5717630 5717631 CLK_0911 CLK_0912     FALSE 0.269 220.000 0.079 1.000   NA
 5717631 5717632 CLK_0912 CLK_0913     FALSE 0.519 56.000 0.000 1.000   NA
 5717632 5717633 CLK_0913 CLK_0914     FALSE 0.004 480.000 0.000 1.000 N NA
 5717633 5717634 CLK_0914 CLK_0915   spoVB TRUE 0.948 32.000 0.137 1.000   NA
 5717638 5717639 CLK_0919 CLK_0920     FALSE 0.009 360.000 0.000 1.000 N NA
 5717640 5717641 CLK_0921 CLK_0923   npr FALSE 0.179 178.000 0.000 NA   NA
 5717641 5717642 CLK_0923 CLK_0924 npr npr TRUE 0.972 137.000 1.000 0.004 Y NA
 5717642 5717643 CLK_0924 CLK_0925 npr npr TRUE 0.847 116.000 0.000 0.004 Y NA
 5717643 5717644 CLK_0925 CLK_0926 npr npr TRUE 0.975 119.000 1.000 0.004 Y NA
 5717644 5717645 CLK_0926 CLK_0927 npr   TRUE 0.843 121.000 0.000 0.004 Y NA
 5717645 5717646 CLK_0927 CLK_0928   nadC FALSE 0.003 603.000 0.000 1.000 N NA
 5717646 5717647 CLK_0928 CLK_0929 nadC nadB TRUE 0.997 -19.000 0.046 1.000 Y NA
 5717647 5717648 CLK_0929 CLK_0930 nadB nadA TRUE 0.995 3.000 0.042 1.000 Y NA
 5717650 5717651 CLK_0932 CLK_0933 hlyIII ychF TRUE 0.573 121.000 0.002 0.043   NA
 5717652 5717653 CLK_0934 CLK_0935 mraZ mraW TRUE 0.873 80.000 0.635 NA   NA
 5717653 5717654 CLK_0935 CLK_0936 mraW   TRUE 0.553 82.000 0.008 1.000   NA
 5717654 5717655 CLK_0936 CLK_0937     TRUE 0.974 16.000 0.096 1.000   NA
 5717655 5717656 CLK_0937 CLK_0938   murE TRUE 0.646 231.000 0.265 1.000 Y NA
 5717656 5717657 CLK_0938 CLK_0939 murE murF TRUE 0.994 26.000 0.328 0.003 Y NA
 5717657 5717658 CLK_0939 CLK_0940 murF mraY TRUE 0.976 36.000 0.024 0.004 Y NA
 5717658 5717659 CLK_0940 CLK_0941 mraY   TRUE 0.626 79.000 0.014 0.004 N NA
 5717659 5717660 CLK_0941 CLK_0942     FALSE 0.032 323.000 0.015 NA N NA
 5717660 5717661 CLK_0942 CLK_0943     TRUE 0.958 11.000 0.014 NA   NA
 5717661 5717662 CLK_0943 CLK_0944   sbp TRUE 0.915 34.000 0.053 NA   NA
 5717662 5717663 CLK_0944 CLK_0945 sbp   TRUE 0.980 1.000 0.053 NA   NA
 5717663 5717664 CLK_0945 CLK_0946     TRUE 0.556 93.000 0.017 NA   NA
 5717664 5717665 CLK_0946 CLK_0947     TRUE 0.947 21.000 0.032 NA   NA
 5717665 5717666 CLK_0947 CLK_0948     TRUE 0.981 17.000 0.246 NA   NA
 5717666 5717667 CLK_0948 CLK_0949     TRUE 0.986 1.000 0.118 1.000   NA
 5717667 5717668 CLK_0949 CLK_0950   divIVA TRUE 0.989 16.000 0.579 NA   NA
 5717668 5717669 CLK_0950 CLK_0951 divIVA aroB FALSE 0.012 406.000 0.006 NA N NA
 5717669 5717670 CLK_0951 CLK_0952 aroB mtnN TRUE 0.961 1.000 0.003 1.000 N NA
 5717670 5717671 CLK_0952 CLK_0953 mtnN aroF TRUE 0.658 121.000 0.046 1.000 N NA
 5717671 5717672 CLK_0953 CLK_0954 aroF aroA TRUE 0.764 167.000 0.003 1.000 Y NA
 5717672 5717673 CLK_0954 CLK_0955 aroA   FALSE 0.074 217.000 0.000 1.000 N NA
 5717673 5717674 CLK_0955 CLK_0956   lspA FALSE 0.208 223.000 0.050 1.000 N NA
 5717674 5717675 CLK_0956 CLK_0957 lspA   TRUE 0.980 4.000 0.082 1.000 N NA
 5717675 5717676 CLK_0957 CLK_0958   pyrR FALSE 0.015 497.000 0.048 1.000 N NA
 5717676 5717677 CLK_0958 CLK_0959 pyrR   TRUE 0.973 44.000 0.140 1.000 Y NA
 5717679 5717680 CLK_0961 CLK_0962 xth   FALSE 0.351 227.000 0.000 1.000 Y NA
 5717680 5717681 CLK_0962 CLK_0963     FALSE 0.010 358.000 0.000 1.000   NA
 5717681 5717682 CLK_0963 CLK_0964   modA FALSE 0.357 180.000 0.015 1.000   NA
 5717682 5717683 CLK_0964 CLK_0965 modA modB TRUE 0.998 10.000 0.430 0.001 Y NA
 5717683 5717684 CLK_0965 CLK_0966 modB   FALSE 0.328 323.000 0.342 1.000 Y NA
 5717684 5717685 CLK_0966 CLK_0967     TRUE 0.724 54.000 0.013 NA   NA
 5717685 5717686 CLK_0967 CLK_0968     FALSE 0.010 352.000 0.000 NA   NA
 5717686 5717687 CLK_0968 CLK_0969     FALSE 0.007 401.000 0.000 NA   NA
 5717687 5717688 CLK_0969 CLK_0970     FALSE 0.022 291.000 0.000 NA   NA
 5717688 5717689 CLK_0970 CLK_0971     TRUE 0.915 48.000 0.308 NA N NA
 5717689 5717690 CLK_0971 CLK_0972     FALSE 0.311 142.000 0.000 NA   NA
 5717690 5717691 CLK_0972 CLK_0973     TRUE 0.739 90.000 0.147 NA   NA
 5717691 5717692 CLK_0973 CLK_0974     TRUE 0.972 24.000 0.235 NA   NA
 5717692 5717693 CLK_0974 CLK_0975   mtbC TRUE 0.959 26.000 0.118 1.000   NA
 5717693 5717694 CLK_0975 CLK_0976 mtbC   TRUE 0.746 80.000 0.118 1.000   NA
 5717694 5717695 CLK_0976 CLK_0977     FALSE 0.029 689.000 0.000 0.002 Y NA
 5717695 5717696 CLK_0977 CLK_0978     TRUE 0.947 23.000 0.044 1.000 N NA
 5717696 5717697 CLK_0978 CLK_0979     TRUE 0.998 -31.000 0.178 1.000 Y NA
 5717697 5717698 CLK_0979 CLK_0980     TRUE 0.950 131.000 0.444 NA Y NA
 5717700 5717701 CLK_0982 CLK_0983   asnA FALSE 0.012 328.000 0.000 1.000 N NA
 5717703 5717704 CLK_0985 CLK_0986     TRUE 0.983 27.000 0.024 1.000 Y NA
 5717704 5717705 CLK_0986 CLK_0987     FALSE 0.016 317.000 0.000 1.000   NA
 5717707 5717708 CLK_0989 CLK_0990     TRUE 0.994 1.000 0.636 1.000 N NA
 5717708 5717709 CLK_0990 CLK_0991     TRUE 0.983 12.000 0.182 1.000   NA
 5717709 5717710 CLK_0991 CLK_0992     FALSE 0.009 362.000 0.000 NA   NA
 5717710 5717711 CLK_0992 CLK_0993     TRUE 0.968 13.000 0.041 NA   NA
 5717711 5717712 CLK_0993 CLK_0994     TRUE 0.995 -7.000 0.611 0.031 N NA
 5717712 5717713 CLK_0994 CLK_0995     TRUE 0.988 36.000 0.278 0.031 Y NA
 5717713 5717714 CLK_0995 CLK_0996     TRUE 0.974 46.000 0.121 0.031 Y NA
 5717720 5717721 CLK_1002 CLK_1003     FALSE 0.337 108.000 0.000 NA   NA
 5717721 5717722 CLK_1003 CLK_1004     FALSE 0.009 366.000 0.000 NA   NA
 5717722 5717723 CLK_1004 CLK_1005     FALSE 0.032 270.000 0.000 NA   NA
 5717724 5717725 CLK_1006 CLK_1007     TRUE 0.912 5.000 0.000 NA   NA
 5717728 5717729 CLK_1010 CLK_1011     FALSE 0.281 151.000 0.000 NA   NA
 5717729 5717730 CLK_1011 CLK_1012   ogt TRUE 0.900 29.000 0.014 NA   NA
 5717730 5717731 CLK_1012 CLK_1013 ogt   TRUE 0.709 57.000 0.014 1.000   NA
 5717731 5717732 CLK_1013 CLK_1014     TRUE 0.694 165.000 0.263 NA   NA
 5717732 5717733 CLK_1014 CLK_1015     TRUE 0.965 25.000 0.168 NA   NA
 5717733 5717734 CLK_1015 CLK_1016     TRUE 0.812 45.000 0.021 1.000   NA
 5717734 5717735 CLK_1016 CLK_1017     FALSE 0.008 397.000 0.000 1.000   NA
 5717735 5717736 CLK_1017 CLK_1018     FALSE 0.009 381.000 0.000 1.000   NA
 5717736 5717737 CLK_1018 CLK_1019     TRUE 0.899 57.000 0.000 0.094 Y NA
 5717737 5717738 CLK_1019 CLK_1020     FALSE 0.028 289.000 0.000 0.094 N NA
 5717738 5717739 CLK_1020 CLK_1021     FALSE 0.005 436.000 0.000 1.000 N NA
 5717739 5717740 CLK_1021 CLK_1022     FALSE 0.321 98.000 0.000 NA   NA
 5717740 5717741 CLK_1022 CLK_1023     FALSE 0.057 383.000 0.250 NA   NA
 5717741 5717742 CLK_1023 CLK_1024     FALSE 0.342 110.000 0.000 NA   NA
 5717747 5717748 CLK_1029 CLK_1030     TRUE 0.774 58.000 0.051 NA   NA
 5717749 5717750 CLK_1031 CLK_1032   hgdC TRUE 0.874 127.000 0.722 NA N NA
 5717750 5717751 CLK_1032 CLK_1033 hgdC   TRUE 0.972 18.000 0.135 NA N NA
 5717751 5717752 CLK_1033 CLK_1034     TRUE 0.992 2.000 0.405 1.000 N NA
 5717752 5717753 CLK_1034 CLK_1035   folE TRUE 0.991 4.000 0.429 1.000 N NA
 5717753 5717754 CLK_1035 CLK_1036 folE   FALSE 0.331 184.000 0.015 1.000   NA
 5717754 5717755 CLK_1036 CLK_1037     FALSE 0.524 104.000 0.005 1.000   NA
 5717755 5717756 CLK_1037 CLK_1038     FALSE 0.208 169.000 0.000 NA   NA
 5717756 5717757 CLK_1038 CLK_1039   deoC FALSE 0.014 324.000 0.000 NA   NA
 5717757 5717758 CLK_1039 CLK_1040 deoC rbsK FALSE 0.029 352.000 0.026 1.000 N NA
 5717758 5717759 CLK_1040 CLK_1041 rbsK   FALSE 0.008 384.000 0.000 NA   NA
 5717759 5717760 CLK_1041 CLK_1042     FALSE 0.351 118.000 0.000 NA   NA
 5717760 5717761 CLK_1042 CLK_1043     TRUE 0.983 14.000 0.231 NA   NA
 5717761 5717762 CLK_1043 CLK_1044     TRUE 0.981 18.000 0.267 NA   NA
 5717764 5717765 CLK_1046 CLK_1047     TRUE 0.703 81.000 0.070 1.000   NA
 5717765 5717766 CLK_1047 CLK_1048     TRUE 0.589 153.000 0.047 NA   NA
 5717766 5717767 CLK_1048 CLK_1049     FALSE 0.017 307.000 0.000 NA   NA
 5717767 5717768 CLK_1049 CLK_1050     TRUE 0.976 3.000 0.041 NA   NA
 5717768 5717769 CLK_1050 CLK_1051     TRUE 0.992 3.000 0.490 NA   NA
 5717769 5717770 CLK_1051 CLK_1052     TRUE 0.832 117.000 0.352 NA   NA
 5717770 5717771 CLK_1052 CLK_1053     TRUE 0.999 -9.000 0.741 0.020 Y NA
 5717771 5717772 CLK_1053 CLK_1054   arcA FALSE 0.003 564.000 0.000 1.000 N NA
 5717772 5717773 CLK_1054 CLK_1055 arcA arcD TRUE 0.881 125.000 0.022 1.000 Y NA
 5717775 5717776 CLK_1057 CLK_1058     FALSE 0.012 339.000 0.000 NA   NA
 5717776 5717777 CLK_1058 CLK_1059     FALSE 0.418 190.000 0.067 1.000   NA
 5717777 5717778 CLK_1059 CLK_1060     FALSE 0.006 425.000 0.000 1.000   NA
 5717778 5717779 CLK_1060 CLK_1061     FALSE 0.008 386.000 0.000 1.000   NA
 5717779 5717780 CLK_1061 CLK_1062     FALSE 0.292 148.000 0.000 NA   NA
 5717780 5717781 CLK_1062 CLK_1064     TRUE 0.923 2.000 0.000 NA   NA
 5717781 5717782 CLK_1064 CLK_1065     FALSE 0.007 392.000 0.000 1.000 N NA
 5717782 5717783 CLK_1065 CLK_1066     FALSE 0.157 293.000 0.000 1.000 Y NA
 5717783 5717784 CLK_1066 CLK_1067     FALSE 0.278 248.000 0.000 1.000 Y NA
 5717784 5717785 CLK_1067 CLK_1068     TRUE 0.976 42.000 0.167 1.000 Y NA
 5717785 5717786 CLK_1068 CLK_1069     TRUE 0.993 4.000 0.610 NA   NA
 5717786 5717787 CLK_1069 CLK_1070     FALSE 0.061 226.000 0.000 NA   NA
 5717789 5717790 CLK_1072 CLK_1073     TRUE 0.859 101.000 0.600 NA   NA
 5717791 5717792 CLK_1074 CLK_1075     TRUE 0.998 -22.000 0.261 1.000 Y NA
 5717796 5717797 CLK_1079 CLK_1080     TRUE 0.984 9.000 0.171 1.000   NA
 5717797 5717798 CLK_1080 CLK_1081     FALSE 0.036 263.000 0.000 NA   NA
 5717799 5717800 CLK_1082 CLK_1083     TRUE 0.739 190.000 1.000 NA   NA
 5717802 5717803 CLK_1085 CLK_1086 metF   TRUE 0.545 173.000 0.045 0.002   NA
 5717803 5717804 CLK_1086 CLK_1087     TRUE 0.990 -10.000 0.075 0.001   NA
 5717806 5717807 CLK_1089 CLK_1090     FALSE 0.003 672.000 0.000 NA   NA
 5717807 5717808 CLK_1090 CLK_1091     TRUE 0.995 -7.000 0.667 NA   NA
 5717808 5717809 CLK_1091 CLK_1092   acoR FALSE 0.013 331.000 0.000 NA   NA
 5717809 5717810 CLK_1092 CLK_1093 acoR   TRUE 0.592 176.000 0.182 NA   NA
 5717810 5717811 CLK_1093 CLK_1094   acoA TRUE 0.959 21.000 0.065 NA   NA
 5717811 5717812 CLK_1094 CLK_1095 acoA acoB TRUE 0.996 3.000 0.076 0.001 Y NA
 5717812 5717813 CLK_1095 CLK_1096 acoB acoX TRUE 0.892 52.000 0.162 0.055   NA
 5717813 5717814 CLK_1096 CLK_1097 acoX acoC TRUE 0.928 36.000 0.081 0.055   NA
 5717814 5717815 CLK_1097 CLK_1098 acoC acoL TRUE 0.995 13.000 0.148 1.000 Y NA
 5717815 5717816 CLK_1098 CLK_1099 acoL   TRUE 0.950 25.000 0.074 1.000 N NA
 5717816 5717817 CLK_1099 CLK_1100     FALSE 0.007 388.000 0.000 1.000 N NA
 5717817 5717818 CLK_1100 CLK_1101     TRUE 0.996 -7.000 0.793 0.093 N NA
 5717818 5717819 CLK_1101 CLK_1102   thrC FALSE 0.019 297.000 0.000 1.000 N NA
 5717819 5717820 CLK_1102 CLK_1103 thrC thrB TRUE 0.996 10.000 0.233 1.000 Y NA
 5717820 5717821 CLK_1103 CLK_1104 thrB   TRUE 0.864 127.000 0.008 1.000 Y NA
 5717821 5717822 CLK_1104 CLK_1105   hom FALSE 0.517 223.000 0.010 0.003 Y NA
 5717822 5717823 CLK_1105 CLK_1106 hom   FALSE 0.003 632.000 0.000 1.000 N NA
 5717823 5717824 CLK_1106 CLK_1107     FALSE 0.004 510.000 0.000 1.000 N NA
 5717824 5717825 CLK_1107 CLK_1108     FALSE 0.099 329.000 0.000 1.000 Y NA
 5717825 5717826 CLK_1108 CLK_1109   gltA TRUE 0.995 0.000 0.667 0.041 N NA
 5717826 5717827 CLK_1109 CLK_1110 gltA   FALSE 0.055 229.000 0.000 1.000 N NA
 5717827 5717828 CLK_1110 CLK_1111     TRUE 0.908 7.000 0.000 NA   NA
 5717828 5717829 CLK_1111 CLK_1112     FALSE 0.006 424.000 0.000 NA   NA
 5717829 5717830 CLK_1112 CLK_1113     FALSE 0.319 94.000 0.000 NA   NA
 5717830 5717831 CLK_1113 CLK_1114     FALSE 0.108 203.000 0.000 NA   NA
 5717831 5717832 CLK_1114 CLK_1115     FALSE 0.010 350.000 0.000 NA   NA
 5717832 5717833 CLK_1115 CLK_1116     FALSE 0.337 108.000 0.000 NA   NA
 5717833 5717834 CLK_1116 CLK_1117     FALSE 0.022 291.000 0.000 NA   NA
 5717834 5717835 CLK_1117 CLK_1118     FALSE 0.004 496.000 0.000 NA   NA
 5717835 5717836 CLK_1118 CLK_1119     FALSE 0.262 156.000 0.000 NA   NA
 5717836 5717837 CLK_1119 CLK_1120     TRUE 0.692 38.000 0.000 1.000   NA
 5717837 5717838 CLK_1120 CLK_1121     FALSE 0.004 501.000 0.000 NA   NA
 5717838 5717839 CLK_1121 CLK_1122     TRUE 0.964 33.000 0.379 NA   NA
 5717839 5717840 CLK_1122 CLK_1123   alr FALSE 0.005 438.000 0.000 NA   NA
 5717840 5717841 CLK_1123 CLK_1124 alr   FALSE 0.005 459.000 0.000 1.000 N NA
 5717841 5717842 CLK_1124 CLK_1125     TRUE 0.741 58.000 0.016 0.093   NA
 5717842 5717843 CLK_1125 CLK_1126     FALSE 0.050 238.000 0.000 NA   NA
 5717845 5717846 CLK_1128 CLK_1129     FALSE 0.003 911.000 0.000 NA   NA
 5717850 5717851 CLK_1133 CLK_1134     TRUE 0.587 137.000 0.027 1.000 N NA
 5717851 5717852 CLK_1134 CLK_1135     TRUE 0.998 14.000 0.667 0.031 Y NA
 5717852 5717853 CLK_1135 CLK_1136     TRUE 0.999 4.000 1.000 0.031 Y NA
 5717853 5717854 CLK_1136 CLK_1137     TRUE 0.963 31.000 0.265 1.000   NA
 5717856 5717857 CLK_1139 CLK_1140     FALSE 0.030 272.000 0.000 NA   NA
 5717859 5717860 CLK_1142 CLK_1143     FALSE 0.489 148.000 0.011 1.000 N NA
 5717860 5717861 CLK_1143 CLK_1144     TRUE 0.938 -7.000 0.000 NA   NA
 5717861 5717862 CLK_1144 CLK_1145   fruK TRUE 0.807 26.000 0.000 NA   NA
 5717864 5717865 CLK_1147 CLK_1148     TRUE 0.842 151.000 0.667 NA   NA
 5717867 5717868 CLK_1150 CLK_1151     TRUE 0.685 37.000 0.000 NA   NA
 5717869 5717870 CLK_1152 CLK_1153 safA   FALSE 0.006 402.000 0.000 NA   NA
 5717871 5717872 CLK_1154 CLK_1155     FALSE 0.008 371.000 0.000 1.000 N NA
 5717874 5717875 CLK_1157 CLK_1158     FALSE 0.004 538.000 0.000 NA   NA
 5717877 5717878 CLK_1160 CLK_1161     FALSE 0.015 323.000 0.000 1.000   NA
 5717878 5717879 CLK_1161 CLK_1162   deaD FALSE 0.281 188.000 0.006 1.000   NA
 5717879 5717880 CLK_1162 CLK_1163 deaD   FALSE 0.526 154.000 0.025 NA   NA
 5717880 5717881 CLK_1163 CLK_1164     FALSE 0.007 394.000 0.000 NA   NA
 5717881 5717882 CLK_1164 CLK_1165     FALSE 0.005 456.000 0.000 1.000   NA
 5717884 5717885 CLK_1167 CLK_1168   cheX TRUE 0.996 0.000 0.100 NA Y NA
 5717887 5717888 CLK_1170 CLK_1171     TRUE 0.565 61.000 0.000 0.002   NA
 5717893 5717894 CLK_1176 CLK_1177     TRUE 0.947 -40.000 0.000 NA   NA
 5717894 5717895 CLK_1177 CLK_1178   hfq TRUE 0.816 25.000 0.000 NA   NA
 5717895 5717896 CLK_1178 CLK_1179 hfq miaA TRUE 0.774 86.000 0.192 1.000   NA
 5717896 5717897 CLK_1179 CLK_1180 miaA   TRUE 0.971 17.000 0.097 1.000 N NA
 5717897 5717898 CLK_1180 CLK_1181   mutS TRUE 0.934 146.000 0.220 0.002 Y NA
 5717898 5717899 CLK_1181 CLK_1182 mutS miaB TRUE 0.653 80.000 0.041 1.000 N NA
 5717900 5717901 CLK_1183 CLK_1184     TRUE 0.702 85.000 0.087 NA   NA
 5717901 5717902 CLK_1184 CLK_1185   aspB TRUE 0.699 55.000 0.008 NA   NA
 5717903 5717904 CLK_1186 CLK_1187     FALSE 0.341 82.000 0.000 NA   NA
 5717904 5717905 CLK_1187 CLK_1188     FALSE 0.044 247.000 0.000 NA   NA
 5717905 5717906 CLK_1188 CLK_1189   cmk TRUE 0.714 65.000 0.047 1.000 N NA
 5717906 5717907 CLK_1189 CLK_1190 cmk aroH TRUE 0.595 76.000 0.020 1.000 N NA
 5717907 5717908 CLK_1190 CLK_1191 aroH   TRUE 0.976 0.000 0.024 1.000   NA
 5717908 5717909 CLK_1191 CLK_1192   gluD FALSE 0.023 294.000 0.000 1.000   NA
 5717909 5717910 CLK_1192 CLK_1193 gluD   FALSE 0.188 234.000 0.068 1.000 N NA
 5717910 5717911 CLK_1193 CLK_1194   rluB FALSE 0.019 382.000 0.013 1.000 N NA
 5717913 5717914 CLK_1196 CLK_1197     FALSE 0.321 98.000 0.000 NA   NA
 5717914 5717915 CLK_1197 CLK_1198     FALSE 0.021 295.000 0.000 NA   NA
 5717916 5717917 CLK_1199 CLK_1200     FALSE 0.008 388.000 0.000 1.000   NA
 5717918 5717919 CLK_1201 CLK_1202     TRUE 0.995 2.000 0.034 1.000 Y NA
 5717919 5717920 CLK_1202 CLK_1203     TRUE 0.747 115.000 0.111 1.000   NA
 5717920 5717921 CLK_1203 CLK_1204     TRUE 0.738 119.000 0.111 NA   NA
 5717923 5717924 CLK_1206 CLK_1207 pcaC   FALSE 0.009 368.000 0.000 1.000   NA
 5717924 5717925 CLK_1207 CLK_1208     FALSE 0.153 185.000 0.000 NA   NA
 5717925 5717926 CLK_1208 CLK_1209     FALSE 0.052 234.000 0.000 NA   NA
 5717926 5717927 CLK_1209 CLK_1210     TRUE 0.640 67.000 0.019 NA   NA
 5717928 5717929 CLK_1211 CLK_1212     TRUE 0.987 3.000 0.200 1.000   NA
 5717929 5717930 CLK_1212 CLK_1213     TRUE 0.987 -3.000 0.111 1.000   NA
 5717930 5717931 CLK_1213 CLK_1214     TRUE 0.674 134.000 0.056 1.000   NA
 5717932 5717933 CLK_1215 CLK_1216 hypE hypD TRUE 0.906 167.000 0.353 1.000 Y NA
 5717933 5717934 CLK_1216 CLK_1217 hypD   TRUE 0.998 -7.000 0.363 NA Y NA
 5717934 5717935 CLK_1217 CLK_1218   hypF TRUE 0.998 -37.000 0.181 NA Y NA
 5717935 5717936 CLK_1218 CLK_1219 hypF   TRUE 0.974 -16.000 0.008 NA   NA
 5717936 5717937 CLK_1219 CLK_1220     FALSE 0.338 83.000 0.000 NA   NA
 5717937 5717938 CLK_1220 CLK_1221     FALSE 0.348 120.000 0.000 NA   NA
 5717938 5717939 CLK_1221 CLK_1222     FALSE 0.508 157.000 0.022 1.000   NA
 5717939 5717940 CLK_1222 CLK_1223   hupL TRUE 0.983 33.000 0.079 1.000 Y NA
 5717940 5717941 CLK_1223 CLK_1224 hupL hupS TRUE 0.969 102.000 0.778 0.001 Y NA
 5717942 5717943 CLK_1225 CLK_1226     FALSE 0.006 421.000 0.000 NA   NA
 5717944 5717945 CLK_1227 CLK_1228 carB carA TRUE 0.988 28.000 0.054 0.001 Y NA
 5717946 5717947 CLK_1229 CLK_1230     FALSE 0.004 490.000 0.000 NA   NA
 5717948 5717949 CLK_1231 CLK_1232     FALSE 0.011 350.000 0.000 1.000   NA
 5717949 5717950 CLK_1232 CLK_1233     TRUE 0.968 20.000 0.048 0.001   NA
 5717950 5717951 CLK_1233 CLK_1234     TRUE 0.996 12.000 0.154 0.001 Y NA
 5717951 5717952 CLK_1234 CLK_1235     FALSE 0.039 259.000 0.000 NA   NA
 5717952 5717953 CLK_1235 CLK_1236     FALSE 0.058 229.000 0.000 NA   NA
 5717953 5717954 CLK_1236 CLK_1237     FALSE 0.032 262.000 0.000 NA N NA
 5717957 5717958 CLK_1240 CLK_1241   ytfJ FALSE 0.387 68.000 0.000 NA   NA
 5717959 5717960 CLK_1242 CLK_1243 scpB scpA TRUE 0.995 -7.000 0.570 NA   NA
 5717960 5717961 CLK_1243 CLK_1244 scpA   FALSE 0.328 134.000 0.000 NA   NA
 5717961 5717962 CLK_1244 CLK_1245   dacF FALSE 0.062 225.000 0.000 NA   NA
 5717962 5717963 CLK_1245 CLK_1246 dacF   TRUE 0.583 123.000 0.018 NA   NA
 5717963 5717964 CLK_1246 CLK_1247     FALSE 0.298 146.000 0.000 NA   NA
 5717964 5717965 CLK_1247 CLK_1248     TRUE 0.568 142.000 0.024 NA   NA
 5717965 5717966 CLK_1248 CLK_1249   pdp TRUE 0.677 107.000 0.061 NA   NA
 5717966 5717967 CLK_1249 CLK_1250 pdp punA FALSE 0.172 286.000 0.000 1.000 Y NA
 5717967 5717968 CLK_1250 CLK_1251 punA xerD TRUE 0.805 38.000 0.004 1.000 N NA
 5717968 5717969 CLK_1251 CLK_1252 xerD   TRUE 0.598 63.000 0.004 NA   NA
 5717969 5717970 CLK_1252 CLK_1253     TRUE 0.981 -9.000 0.034 NA   NA
 5717972 5717973 CLK_1255 CLK_1256     FALSE 0.004 493.000 0.000 1.000 N NA
 5717975 5717976 CLK_1258 CLK_1259     FALSE 0.002 1698.000 0.000 NA   NA
 5717976 5717977 CLK_1259 CLK_1260     FALSE 0.325 136.000 0.000 NA   NA
 5717977 5717978 CLK_1260 CLK_1262   spo0A FALSE 0.246 160.000 0.000 NA   NA
 5717978 5717979 CLK_1262 CLK_1263 spo0A spoIVB FALSE 0.050 429.000 0.393 1.000   NA
 5717979 5717980 CLK_1263 CLK_1264 spoIVB metA FALSE 0.006 422.000 0.000 1.000   NA
 5717980 5717981 CLK_1264 CLK_1265 metA hom TRUE 0.980 27.000 0.005 1.000 Y NA
 5717981 5717982 CLK_1265 CLK_1266 hom   TRUE 0.962 40.000 0.017 1.000 Y NA
 5717982 5717983 CLK_1266 CLK_1267   recN FALSE 0.018 299.000 0.000 1.000 N NA
 5717983 5717984 CLK_1267 CLK_1268 recN argR TRUE 0.974 13.000 0.086 1.000 N NA
 5717984 5717985 CLK_1268 CLK_1269 argR ppnK TRUE 0.984 2.000 0.117 1.000 N NA
 5717985 5717986 CLK_1269 CLK_1270 ppnK   TRUE 0.986 0.000 0.120 1.000 N NA
 5717986 5717987 CLK_1270 CLK_1271   dxs TRUE 0.971 22.000 0.189 1.000 N NA
 5717987 5717988 CLK_1271 CLK_1272 dxs   TRUE 0.978 1.000 0.037 NA   NA
 5717988 5717989 CLK_1272 CLK_1273   ispA FALSE 0.003 803.000 0.000 NA   NA
 5717989 5717990 CLK_1273 CLK_1274 ispA xseB TRUE 0.665 125.000 0.053 1.000 N NA
 5717990 5717991 CLK_1274 CLK_1275 xseB xseA TRUE 0.956 94.000 0.412 0.001 Y NA
 5717991 5717992 CLK_1275 CLK_1276 xseA nusB TRUE 0.681 71.000 0.043 1.000 N NA
 5717992 5717993 CLK_1276 CLK_1277 nusB asp TRUE 0.773 139.000 0.223 NA   NA
 5717993 5717994 CLK_1277 CLK_1278 asp   TRUE 0.727 82.000 0.108 NA   NA
 5717994 5717995 CLK_1278 CLK_1279     TRUE 0.883 62.000 0.407 NA   NA
 5717995 5717996 CLK_1279 CLK_1280   spoIIIAF TRUE 0.888 139.000 0.907 NA   NA
 5717996 5717997 CLK_1280 CLK_1281 spoIIIAF   TRUE 0.975 36.000 0.918 NA   NA
 5717997 5717998 CLK_1281 CLK_1282     TRUE 0.994 9.000 0.864 NA   NA
 5717998 5717999 CLK_1282 CLK_1283     TRUE 0.985 27.000 0.895 NA   NA
 5717999 5718000 CLK_1283 CLK_1284     TRUE 0.964 43.000 0.926 NA   NA
 5718000 5718001 CLK_1284 CLK_1285     TRUE 0.965 37.000 0.604 NA   NA
 5718001 5718002 CLK_1285 CLK_1286     FALSE 0.436 195.000 0.112 NA   NA
 5718002 5718003 CLK_1286 CLK_1287   efp TRUE 0.855 41.000 0.037 NA   NA
 5718003 5718004 CLK_1287 CLK_1288 efp aroQ FALSE 0.527 89.000 0.010 1.000 N NA
 5718004 5718005 CLK_1288 CLK_1289 aroQ aroK TRUE 0.832 155.000 0.015 1.000 Y NA
 5718005 5718006 CLK_1289 CLK_1290 aroK   TRUE 0.573 134.000 0.020 NA   NA
 5718006 5718007 CLK_1290 CLK_1291     TRUE 0.994 6.000 1.000 NA   NA
 5718007 5718008 CLK_1291 CLK_1292     TRUE 0.984 16.000 0.333 NA   NA
 5718008 5718009 CLK_1292 CLK_1293     TRUE 0.978 28.000 0.500 NA   NA
 5718009 5718010 CLK_1293 CLK_1294     TRUE 0.995 -21.000 0.500 NA   NA
 5718010 5718011 CLK_1294 CLK_1295     TRUE 0.994 -3.000 0.500 NA   NA
 5718011 5718012 CLK_1295 CLK_1296     TRUE 0.996 -19.000 0.667 NA   NA
 5718012 5718013 CLK_1296 CLK_1297     FALSE 0.365 221.000 0.250 NA   NA
 5718013 5718014 CLK_1297 CLK_1298     FALSE 0.150 186.000 0.000 NA   NA
 5718014 5718015 CLK_1298 CLK_1299     FALSE 0.127 195.000 0.000 NA   NA
 5718015 5718016 CLK_1299 CLK_1300     TRUE 0.987 -6.000 0.100 NA   NA
 5718016 5718017 CLK_1300 CLK_1301     TRUE 0.910 6.000 0.000 NA   NA
 5718017 5718018 CLK_1301 CLK_1302     TRUE 0.941 -10.000 0.000 NA   NA
 5718018 5718019 CLK_1302 CLK_1303     FALSE 0.056 231.000 0.000 NA   NA
 5718019 5718020 CLK_1303 CLK_1304     FALSE 0.373 71.000 0.000 NA   NA
 5718020 5718021 CLK_1304 CLK_1305     TRUE 0.942 -12.000 0.000 NA   NA
 5718021 5718022 CLK_1305 CLK_1306     TRUE 0.942 -13.000 0.000 NA   NA
 5718022 5718023 CLK_1306 CLK_1307     FALSE 0.330 87.000 0.000 NA   NA
 5718023 5718024 CLK_1307 CLK_1308     TRUE 0.995 0.000 0.714 NA   NA
 5718024 5718025 CLK_1308 CLK_1309     TRUE 0.998 0.000 0.333 0.003 Y NA
 5718025 5718026 CLK_1309 CLK_1310     FALSE 0.245 153.000 0.000 NA N NA
 5718026 5718027 CLK_1310 CLK_1311     TRUE 0.712 145.000 0.135 NA   NA
 5718027 5718028 CLK_1311 CLK_1312     FALSE 0.003 662.000 0.000 NA   NA
 5718028 5718029 CLK_1312 CLK_1313     TRUE 0.993 -31.000 0.286 NA   NA
 5718029 5718030 CLK_1313 CLK_1314     FALSE 0.057 230.000 0.000 NA   NA
 5718030 5718031 CLK_1314 CLK_1315     TRUE 0.645 40.000 0.000 NA   NA
 5718031 5718032 CLK_1315 CLK_1316     FALSE 0.343 81.000 0.000 NA   NA
 5718032 5718033 CLK_1316 CLK_1317     TRUE 0.923 2.000 0.000 NA   NA
 5718033 5718034 CLK_1317 CLK_1318     TRUE 0.853 20.000 0.000 NA   NA
 5718034 5718035 CLK_1318 CLK_1319     TRUE 0.923 2.000 0.000 NA   NA
 5718035 5718036 CLK_1319 CLK_1320     TRUE 0.979 16.000 0.182 NA   NA
 5718036 5718037 CLK_1320 CLK_1321     TRUE 0.992 -15.000 0.273 NA   NA
 5718037 5718038 CLK_1321 CLK_1322     TRUE 0.930 0.000 0.000 NA   NA
 5718038 5718039 CLK_1322 CLK_1323     TRUE 0.554 50.000 0.000 NA   NA
 5718039 5718040 CLK_1323 CLK_1324     TRUE 0.775 30.000 0.000 NA   NA
 5718040 5718041 CLK_1324 CLK_1325     TRUE 0.824 57.000 0.100 NA   NA
 5718041 5718042 CLK_1325 CLK_1326     TRUE 0.991 0.000 0.300 NA   NA
 5718042 5718043 CLK_1326 CLK_1327     TRUE 0.994 0.000 0.583 NA   NA
 5718043 5718044 CLK_1327 CLK_1328     TRUE 0.995 1.000 0.750 NA   NA
 5718044 5718045 CLK_1328 CLK_1329     TRUE 0.934 -3.000 0.000 NA   NA
 5718045 5718046 CLK_1329 CLK_1330     TRUE 0.994 0.000 0.667 NA   NA
 5718046 5718047 CLK_1330 CLK_1331     TRUE 0.994 2.000 0.667 NA   NA
 5718047 5718048 CLK_1331 CLK_1332     TRUE 0.585 46.000 0.000 NA   NA
 5718048 5718049 CLK_1332 CLK_1333     TRUE 0.853 20.000 0.000 NA   NA
 5718049 5718050 CLK_1333 CLK_1334     FALSE 0.033 269.000 0.000 NA   NA
 5718050 5718051 CLK_1334 CLK_1335     FALSE 0.091 209.000 0.000 NA   NA
 5718051 5718052 CLK_1335 CLK_1336     TRUE 0.992 0.000 0.333 NA   NA
 5718052 5718053 CLK_1336 CLK_1337     TRUE 0.985 4.000 0.167 NA   NA
 5718053 5718054 CLK_1337 CLK_1338     FALSE 0.338 83.000 0.000 NA   NA
 5718054 5718055 CLK_1338 CLK_1339     FALSE 0.441 87.000 0.000 0.008   NA
 5718055 5718056 CLK_1339 CLK_1340     FALSE 0.074 247.000 0.000 0.001   NA
 5718056 5718057 CLK_1340 CLK_1341     FALSE 0.309 163.000 0.000 0.055   NA
 5718057 5718058 CLK_1341 CLK_1342     FALSE 0.033 288.000 0.000 0.077   NA
 5718058 5718059 CLK_1342 CLK_1343     TRUE 0.967 30.000 0.222 0.054   NA
 5718059 5718060 CLK_1343 CLK_1344     TRUE 0.594 48.000 0.000 1.000   NA
 5718060 5718061 CLK_1344 CLK_1345     TRUE 0.784 29.000 0.000 NA   NA
 5718061 5718062 CLK_1345 CLK_1346     FALSE 0.446 60.000 0.000 NA   NA
 5718062 5718063 CLK_1346 CLK_1347     FALSE 0.496 56.000 0.000 NA   NA
 5718063 5718064 CLK_1347 CLK_1348     TRUE 0.775 30.000 0.000 NA   NA
 5718064 5718065 CLK_1348 CLK_1349     FALSE 0.416 67.000 0.000 1.000   NA
 5718065 5718066 CLK_1349 CLK_1350     TRUE 0.915 4.000 0.000 NA   NA
 5718066 5718067 CLK_1350 CLK_1351     TRUE 0.887 14.000 0.000 NA   NA
 5718067 5718068 CLK_1351 CLK_1352     TRUE 0.936 0.000 0.000 1.000   NA
 5718068 5718069 CLK_1352 CLK_1353     TRUE 0.991 2.000 0.000 0.054 Y NA
 5718069 5718070 CLK_1353 CLK_1354     TRUE 0.918 3.000 0.000 NA   NA
 5718070 5718071 CLK_1354 CLK_1355     TRUE 0.905 9.000 0.000 NA   NA
 5718071 5718072 CLK_1355 CLK_1356     TRUE 0.554 50.000 0.000 NA   NA
 5718072 5718073 CLK_1356 CLK_1357     TRUE 0.873 17.000 0.000 NA   NA
 5718073 5718074 CLK_1357 CLK_1358     TRUE 0.887 14.000 0.000 NA   NA
 5718074 5718075 CLK_1358 CLK_1359     TRUE 0.853 20.000 0.000 NA   NA
 5718075 5718076 CLK_1359 CLK_1360     TRUE 0.753 32.000 0.000 NA   NA
 5718077 5718078 CLK_1361 CLK_1362     TRUE 0.554 50.000 0.000 NA   NA
 5718078 5718079 CLK_1362 CLK_1363     FALSE 0.003 559.000 0.000 NA   NA
 5718080 5718081 CLK_1364 CLK_1365     FALSE 0.288 149.000 0.000 NA   NA
 5718081 5718082 CLK_1365 CLK_1366     FALSE 0.319 96.000 0.000 NA   NA
 5718082 5718083 CLK_1366 CLK_1367   dapF TRUE 0.961 1.000 0.002 NA   NA
 5718084 5718085 CLK_1368 CLK_1369   truA TRUE 0.542 69.000 0.005 NA N NA
 5718086 5718087 CLK_1370 CLK_1371     TRUE 0.716 35.000 0.000 NA   NA
 5718089 5718090 CLK_1373 CLK_1374     FALSE 0.004 505.000 0.000 NA   NA
 5718090 5718091 CLK_1374 CLK_1375   cloSI FALSE 0.005 470.000 0.000 1.000   NA
 5718092 5718093 CLK_1376 CLK_1377     TRUE 0.991 2.000 0.333 NA   NA
 5718093 5718094 CLK_1377 CLK_1378     TRUE 0.999 -10.000 0.857 1.000 Y NA
 5718097 5718098 CLK_1381 CLK_1382     TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 5718098 5718099 CLK_1382 CLK_1383     FALSE 0.155 283.000 0.222 NA   NA
 5718099 5718100 CLK_1383 CLK_1384     TRUE 0.836 156.000 0.714 NA   NA
 5718100 5718101 CLK_1384 CLK_1385     TRUE 0.994 0.000 0.625 NA   NA
 5718103 5718104 CLK_1387 CLK_1388     TRUE 0.999 -3.000 0.933 0.006 Y NA
 5718105 5718106 CLK_1389 CLK_1390   bltD FALSE 0.368 112.000 0.000 1.000   NA
 5718107 5718108 CLK_1391 CLK_1392 moeB moaD TRUE 0.994 2.000 0.571 1.000   NA
 5718108 5718109 CLK_1392 CLK_1393 moaD aor FALSE 0.027 383.000 0.033 1.000   NA
 5718109 5718110 CLK_1393 CLK_1394 aor aorR FALSE 0.006 407.000 0.000 1.000 N NA
 5718110 5718111 CLK_1394 CLK_1395 aorR   TRUE 0.939 49.000 0.500 1.000   NA
 5718111 5718112 CLK_1395 CLK_1396   moaC TRUE 0.965 2.000 0.006 1.000   NA
 5718112 5718113 CLK_1396 CLK_1397 moaC moaA TRUE 0.996 4.000 0.071 0.002 Y NA
 5718113 5718114 CLK_1397 CLK_1398 moaA   TRUE 0.948 59.000 0.053 0.002 Y NA
 5718114 5718115 CLK_1398 CLK_1399   moeA TRUE 0.998 12.000 0.481 0.002 Y NA
 5718115 5718116 CLK_1399 CLK_1400 moeA mog TRUE 0.987 24.000 0.017 0.002 Y NA
 5718116 5718117 CLK_1400 CLK_1401 mog tupC FALSE 0.177 208.000 0.006 1.000 N NA
 5718117 5718118 CLK_1401 CLK_1402 tupC tupB TRUE 0.993 -3.000 0.389 1.000 N NA
 5718118 5718119 CLK_1402 CLK_1403 tupB   TRUE 0.998 9.000 0.524 NA Y NA
 5718119 5718120 CLK_1403 CLK_1404     FALSE 0.064 219.000 0.000 NA N NA
 5718120 5718121 CLK_1404 CLK_1405     TRUE 0.985 -7.000 0.071 NA   NA
 5718121 5718122 CLK_1405 CLK_1406     FALSE 0.047 241.000 0.000 NA   NA
 5718122 5718123 CLK_1406 CLK_1407     FALSE 0.014 323.000 0.000 NA   NA
 5718123 5718124 CLK_1407 CLK_1408     TRUE 0.991 15.000 0.667 1.000   NA
 5718126 5718127 CLK_1409 CLK_1411     FALSE 0.031 271.000 0.000 NA   NA
 5718127 5718128 CLK_1411 CLK_1412     TRUE 0.999 -3.000 0.846 0.006 Y NA
 5718129 5718130 CLK_1413 CLK_1414     FALSE 0.006 403.000 0.000 NA   NA
 5718130 5718131 CLK_1414 CLK_1415     FALSE 0.002 1354.000 0.000 NA   NA
 5718131 5718132 CLK_1415 CLK_1416     TRUE 0.850 22.000 0.000 1.000   NA
 5718134 5718135 CLK_1418 CLK_1419     FALSE 0.030 272.000 0.000 NA   NA
 5718135 5718136 CLK_1419 CLK_1420     FALSE 0.203 171.000 0.000 NA   NA
 5718136 5718137 CLK_1420 CLK_1421     TRUE 0.990 21.000 1.000 1.000   NA
 5718138 5718139 CLK_1422 CLK_1423     TRUE 0.999 -10.000 0.750 0.019 Y NA
 5718139 5718140 CLK_1423 CLK_1424     FALSE 0.015 314.000 0.000 NA   NA
 5718140 5718141 CLK_1424 CLK_1425     TRUE 0.946 26.000 0.061 NA   NA
 5718141 5718142 CLK_1425 CLK_1426     TRUE 0.988 16.000 0.469 1.000   NA
 5718142 5718143 CLK_1426 CLK_1427     TRUE 0.983 3.000 0.103 NA   NA
 5718143 5718144 CLK_1427 CLK_1428     TRUE 0.710 161.000 0.250 NA   NA
 5718145 5718146 CLK_1429 CLK_1430     TRUE 0.996 -10.000 0.500 0.005   NA
 5718146 5718147 CLK_1430 CLK_1431     TRUE 0.995 -10.000 0.400 0.005   NA
 5718147 5718148 CLK_1431 CLK_1432     TRUE 0.952 42.000 0.400 0.005   NA
 5718150 5718151 CLK_1434 CLK_1435 pcaC   TRUE 0.981 13.000 0.144 1.000   NA
 5718151 5718152 CLK_1435 CLK_1436     FALSE 0.181 181.000 0.000 1.000   NA
 5718153 5718154 CLK_1437 CLK_1438   hsp90 FALSE 0.003 623.000 0.000 1.000 N NA
 5718155 5718156 CLK_1439 CLK_1440   treP FALSE 0.004 481.000 0.000 1.000 N NA
 5718156 5718157 CLK_1440 CLK_1441 treP treC FALSE 0.421 318.000 0.650 1.000 Y NA
 5718157 5718158 CLK_1441 CLK_1442 treC treR TRUE 0.962 33.000 0.336 1.000 N NA
 5718159 5718160 CLK_1443 CLK_1444     FALSE 0.327 273.000 0.015 0.008 Y NA
 5718160 5718161 CLK_1444 CLK_1445     TRUE 0.997 1.000 0.217 1.000 Y NA
 5718161 5718162 CLK_1445 CLK_1446     TRUE 0.995 20.000 0.400 1.000 Y NA
 5718162 5718163 CLK_1446 CLK_1447     FALSE 0.475 200.000 0.222 1.000 N NA
 5718163 5718164 CLK_1447 CLK_1448     FALSE 0.335 84.000 0.000 NA   NA
 5718166 5718167 CLK_1450 CLK_1451     FALSE 0.008 407.000 0.000 0.052 N NA
 5718169 5718170 CLK_1453 CLK_1454     FALSE 0.332 130.000 0.000 NA   NA
 5718170 5718171 CLK_1454 CLK_1455     TRUE 0.936 -6.000 0.000 NA   NA
 5718171 5718172 CLK_1455 CLK_1456     FALSE 0.404 65.000 0.000 NA   NA
 5718172 5718173 CLK_1456 CLK_1457     FALSE 0.010 356.000 0.000 NA   NA
 5718175 5718176 CLK_1459 CLK_1460     TRUE 0.983 16.000 0.273 1.000   NA
 5718176 5718177 CLK_1460 CLK_1461     FALSE 0.010 364.000 0.000 1.000   NA
 5718177 5718178 CLK_1461 CLK_1462     FALSE 0.054 232.000 0.000 NA   NA
 5718178 5718179 CLK_1462 CLK_1463     FALSE 0.039 260.000 0.000 NA   NA
 5718180 5718181 CLK_1464 CLK_1465     FALSE 0.014 320.000 0.000 NA   NA
 5718184 5718185 CLK_1468 CLK_1469 aspB   TRUE 0.992 20.000 0.088 1.000 Y NA
 5718185 5718186 CLK_1469 CLK_1470     TRUE 0.999 -13.000 0.640 1.000 Y NA
 5718186 5718187 CLK_1470 CLK_1471     TRUE 0.901 147.000 0.066 0.029 Y NA
 5718187 5718188 CLK_1471 CLK_1472     TRUE 0.745 92.000 0.167 NA   NA
 5718188 5718189 CLK_1472 CLK_1473     FALSE 0.009 364.000 0.000 NA   NA
 5718189 5718190 CLK_1473 CLK_1474     FALSE 0.077 215.000 0.000 1.000 N NA
 5718190 5718191 CLK_1474 CLK_1475     FALSE 0.017 306.000 0.000 NA   NA
 5718191 5718192 CLK_1475 CLK_1476     FALSE 0.012 335.000 0.000 NA   NA
 5718192 5718193 CLK_1476 CLK_1477     FALSE 0.020 297.000 0.000 NA   NA
 5718193 5718194 CLK_1477 CLK_1478     FALSE 0.086 212.000 0.000 NA   NA
 5718194 5718195 CLK_1478 CLK_1479     FALSE 0.132 193.000 0.000 NA   NA
 5718195 5718196 CLK_1479 CLK_1480     FALSE 0.002 835.000 0.000 1.000 N NA
 5718198 5718199 CLK_1482 CLK_1483     FALSE 0.087 340.000 0.000 NA Y NA
 5718200 5718201 CLK_1484 CLK_1485 pepQ pepIP TRUE 0.722 82.000 0.054 0.026   NA
 5718202 5718203 CLK_1486 CLK_1487     TRUE 0.950 17.000 0.019 NA   NA
 5718203 5718204 CLK_1487 CLK_1488     FALSE 0.007 399.000 0.000 NA   NA
 5718204 5718205 CLK_1488 CLK_1489     FALSE 0.320 97.000 0.000 NA   NA
 5718206 5718207 CLK_1490 CLK_1491     TRUE 0.799 86.000 0.273 NA   NA
 5718208 5718209 CLK_1492 CLK_1493     FALSE 0.153 185.000 0.000 NA   NA
 5718209 5718210 CLK_1493 CLK_1494     FALSE 0.065 223.000 0.000 NA   NA
 5718210 5718211 CLK_1494 CLK_1495     FALSE 0.006 415.000 0.000 NA   NA
 5718211 5718212 CLK_1495 CLK_1496     FALSE 0.330 104.000 0.000 NA   NA
 5718212 5718213 CLK_1496 CLK_1497     TRUE 0.990 15.000 0.600 NA   NA
 5718213 5718214 CLK_1497 CLK_1498     TRUE 0.994 -3.000 0.600 NA   NA
 5718214 5718215 CLK_1498 CLK_1499     TRUE 0.856 122.000 0.500 NA   NA
 5718215 5718216 CLK_1499 CLK_1500     FALSE 0.114 305.000 0.231 NA   NA
 5718216 5718217 CLK_1500 CLK_1501     FALSE 0.238 162.000 0.000 NA   NA
 5718217 5718218 CLK_1501 CLK_1502     FALSE 0.344 111.000 0.000 NA   NA
 5718218 5718219 CLK_1502 CLK_1503     FALSE 0.014 320.000 0.000 NA   NA
 5718219 5718220 CLK_1503 CLK_1504     FALSE 0.311 259.000 0.315 0.001   NA
 5718220 5718221 CLK_1504 CLK_1505     TRUE 0.901 11.000 0.000 NA   NA
 5718223 5718224 CLK_1507 CLK_1508     TRUE 0.824 44.000 0.027 NA   NA
 5718224 5718225 CLK_1508 CLK_1509     TRUE 0.606 92.000 0.027 1.000   NA
 5718225 5718226 CLK_1509 CLK_1510     TRUE 0.585 46.000 0.000 NA   NA
 5718227 5718228 CLK_1511 CLK_1512   rfbB TRUE 0.971 42.000 0.087 1.000 Y NA
 5718228 5718229 CLK_1512 CLK_1513 rfbB   FALSE 0.028 276.000 0.000 NA   NA
 5718229 5718230 CLK_1513 CLK_1514     FALSE 0.041 254.000 0.000 NA   NA
 5718231 5718232 CLK_1515 CLK_1516     FALSE 0.002 1060.000 0.000 NA   NA
 5718232 5718233 CLK_1516 CLK_1517     TRUE 0.915 4.000 0.000 NA   NA
 5718233 5718234 CLK_1517 CLK_1518     TRUE 0.995 -6.000 0.600 NA   NA
 5718234 5718235 CLK_1518 CLK_1519     TRUE 0.990 0.000 0.250 1.000 N NA
 5718235 5718236 CLK_1519 CLK_1520     FALSE 0.004 507.000 0.000 1.000 N NA
 5718236 5718237 CLK_1520 CLK_1521     TRUE 0.992 -7.000 0.312 NA   NA
 5718237 5718238 CLK_1521 CLK_1522     FALSE 0.006 420.000 0.000 NA   NA
 5718238 5718239 CLK_1522 CLK_1523     FALSE 0.148 187.000 0.000 NA   NA
 5718239 5718240 CLK_1523 CLK_1524     FALSE 0.135 232.000 0.018 NA   NA
 5718240 5718241 CLK_1524 CLK_1525     FALSE 0.086 212.000 0.000 NA   NA
 5718241 5718242 CLK_1525 CLK_1526     FALSE 0.004 495.000 0.000 NA   NA
 5718242 5718243 CLK_1526 CLK_1527     TRUE 0.992 14.000 0.750 1.000   NA
 5718243 5718244 CLK_1527 CLK_1528     TRUE 0.996 -3.000 0.917 NA   NA
 5718246 5718247 CLK_1530 CLK_1531     TRUE 0.590 80.000 0.019 NA   NA
 5718247 5718248 CLK_1531 CLK_1532     FALSE 0.005 425.000 0.000 NA   NA
 5718248 5718249 CLK_1532 CLK_1533     FALSE 0.208 169.000 0.000 NA   NA
 5718249 5718250 CLK_1533 CLK_1534     FALSE 0.003 596.000 0.000 NA   NA
 5718250 5718251 CLK_1534 CLK_1535     FALSE 0.409 64.000 0.000 NA   NA
 5718251 5718252 CLK_1535 CLK_1536     FALSE 0.006 414.000 0.000 NA   NA
 5718252 5718253 CLK_1536 CLK_1537     FALSE 0.003 840.000 0.000 NA   NA
 5718253 5718254 CLK_1537 CLK_1538   hsdM TRUE 0.992 13.000 0.017 0.053 Y NA
 5718254 5718255 CLK_1538 CLK_1539 hsdM   FALSE 0.203 344.000 0.083 0.053 Y NA
 5718255 5718256 CLK_1539 CLK_1540     FALSE 0.004 521.000 0.000 NA   NA
 5718256 5718257 CLK_1540 CLK_1541     FALSE 0.025 283.000 0.000 NA   NA
 5718257 5718258 CLK_1541 CLK_1542     FALSE 0.002 1604.000 0.000 NA   NA
 5718258 5718259 CLK_1542 CLK_1543     TRUE 0.938 -7.000 0.000 NA   NA
 5718259 5718260 CLK_1543 CLK_1544     FALSE 0.010 356.000 0.000 NA   NA
 5718260 5718261 CLK_1544 CLK_1545     FALSE 0.013 328.000 0.000 NA   NA
 5718261 5718262 CLK_1545 CLK_1546     TRUE 0.588 49.000 0.000 1.000   NA
 5718262 5718263 CLK_1546 CLK_1547     FALSE 0.345 121.000 0.000 NA   NA
 5718263 5718264 CLK_1547 CLK_1548     FALSE 0.153 185.000 0.000 NA   NA
 5718265 5718266 CLK_1549 CLK_1550     TRUE 0.823 24.000 0.000 NA   NA
 5718267 5718268 CLK_1551 CLK_1552     FALSE 0.004 589.000 0.000 0.047 N NA
 5718269 5718270 CLK_1553 CLK_1554     FALSE 0.290 154.000 0.000 1.000   NA
 5718271 5718272 CLK_1555 CLK_1556   cadA-2 FALSE 0.036 269.000 0.000 1.000   NA
 5718272 5718273 CLK_1556 CLK_1557 cadA-2   TRUE 0.673 181.000 0.417 NA   NA
 5718273 5718274 CLK_1557 CLK_1558     FALSE 0.045 244.000 0.000 NA   NA
 5718274 5718275 CLK_1558 CLK_1559     FALSE 0.028 268.000 0.000 NA N NA
 5718275 5718276 CLK_1559 CLK_1560     TRUE 0.958 75.000 0.500 NA Y NA
 5718276 5718277 CLK_1560 CLK_1561   eutE TRUE 0.995 0.000 0.769 1.000 N NA
 5718277 5718278 CLK_1561 CLK_1562 eutE   TRUE 0.992 35.000 0.692 NA Y NA
 5718278 5718279 CLK_1562 CLK_1563     TRUE 0.987 21.000 0.750 NA N NA
 5718279 5718280 CLK_1563 CLK_1564     TRUE 0.917 45.000 0.273 NA N NA
 5718280 5718281 CLK_1564 CLK_1565     TRUE 0.993 -3.000 0.389 NA   NA
 5718281 5718282 CLK_1565 CLK_1566     TRUE 0.850 78.000 0.444 NA   NA
 5718282 5718283 CLK_1566 CLK_1567     TRUE 0.999 -18.000 0.615 NA Y NA
 5718283 5718284 CLK_1567 CLK_1568     TRUE 0.996 7.000 0.222 NA Y NA
 5718284 5718285 CLK_1568 CLK_1569     TRUE 0.997 -3.000 0.118 1.000 Y NA
 5718285 5718286 CLK_1569 CLK_1570     TRUE 0.943 40.000 0.375 1.000 N NA
 5718286 5718287 CLK_1570 CLK_1571     TRUE 0.845 164.000 0.815 0.003 N NA
 5718287 5718288 CLK_1571 CLK_1572     TRUE 0.978 50.000 0.370 1.000 Y NA
 5718288 5718289 CLK_1572 CLK_1573     TRUE 0.959 38.000 0.500 NA   NA
 5718289 5718290 CLK_1573 CLK_1574     TRUE 0.983 24.000 0.571 NA   NA
 5718290 5718291 CLK_1574 CLK_1575     TRUE 0.873 17.000 0.000 NA   NA
 5718291 5718292 CLK_1575 CLK_1576     FALSE 0.346 79.000 0.000 NA   NA
 5718292 5718293 CLK_1576 CLK_1577     TRUE 0.996 -13.000 0.810 NA   NA
 5718293 5718294 CLK_1577 CLK_1578     FALSE 0.004 486.000 0.000 NA   NA
 5718294 5718295 CLK_1578 CLK_1579     TRUE 0.698 103.000 0.094 1.000 N NA
 5718297 5718298 CLK_1581 CLK_1582     TRUE 0.854 41.000 0.044 NA N NA
 5718299 5718300 CLK_1583 CLK_1584     FALSE 0.314 141.000 0.000 NA   NA
 5718301 5718302 CLK_1585 CLK_1586     TRUE 0.609 97.000 0.033 NA   NA
 5718302 5718303 CLK_1586 CLK_1587     FALSE 0.004 526.000 0.000 NA   NA
 5718303 5718304 CLK_1587 CLK_1588     TRUE 0.965 20.000 0.088 NA   NA
 5718304 5718305 CLK_1588 CLK_1589     TRUE 0.970 13.000 0.053 NA   NA
 5718305 5718306 CLK_1589 CLK_1590     FALSE 0.005 449.000 0.000 NA   NA
 5718306 5718307 CLK_1590 CLK_1591     TRUE 0.946 -25.000 0.000 NA   NA
 5718307 5718308 CLK_1591 CLK_1592     FALSE 0.003 616.000 0.000 1.000   NA
 5718308 5718309 CLK_1592 CLK_1593     TRUE 0.993 -7.000 0.400 1.000 N NA
 5718309 5718310 CLK_1593 CLK_1594     TRUE 0.984 18.000 0.375 NA   NA
 5718310 5718311 CLK_1594 CLK_1595     FALSE 0.004 480.000 0.000 NA   NA
 5718311 5718312 CLK_1595 CLK_1596     TRUE 0.745 67.000 0.091 NA N NA
 5718312 5718313 CLK_1596 CLK_1597     TRUE 0.772 84.000 0.222 NA N NA
 5718313 5718314 CLK_1597 CLK_1598     FALSE 0.005 442.000 0.000 1.000 N NA
 5718314 5718315 CLK_1598 CLK_1599     TRUE 0.999 -3.000 0.700 1.000 Y NA
 5718315 5718316 CLK_1599 CLK_1600     TRUE 0.541 197.000 0.300 NA   NA
 5718316 5718317 CLK_1600 CLK_1601     TRUE 0.994 -7.000 0.500 NA   NA
 5718317 5718318 CLK_1601 CLK_1602     TRUE 0.874 72.000 0.500 1.000   NA
 5718318 5718319 CLK_1602 CLK_1603     FALSE 0.469 60.000 0.000 1.000   NA
 5718319 5718320 CLK_1603 CLK_1604     FALSE 0.050 264.000 0.000 0.087   NA
 5718320 5718321 CLK_1604 CLK_1605     TRUE 0.994 -10.000 0.429 1.000   NA
 5718321 5718322 CLK_1605 CLK_1606     FALSE 0.003 788.000 0.000 NA   NA
 5718322 5718323 CLK_1606 CLK_1607     FALSE 0.013 326.000 0.000 NA   NA
 5718323 5718324 CLK_1607 CLK_1608     FALSE 0.130 212.000 0.000 0.010   NA
 5718324 5718325 CLK_1608 CLK_1609     TRUE 0.987 13.000 0.241 0.010   NA
 5718325 5718326 CLK_1609 CLK_1610     TRUE 0.990 29.000 0.119 0.008 Y NA
 5718326 5718327 CLK_1610 CLK_1611     TRUE 0.989 24.000 0.081 1.000 Y NA
 5718327 5718328 CLK_1611 CLK_1612     FALSE 0.031 271.000 0.000 NA   NA
 5718329 5718330 CLK_1613 CLK_1614     TRUE 0.600 74.000 0.015 1.000   NA
 5718331 5718332 CLK_1615 CLK_1616     TRUE 0.986 7.000 0.222 1.000   NA
 5718334 5718335 CLK_1618 CLK_1619 enr   TRUE 0.653 95.000 0.059 1.000 N NA
 5718335 5718336 CLK_1619 CLK_1620     FALSE 0.003 714.000 0.000 NA   NA
 5718336 5718337 CLK_1620 CLK_1621     FALSE 0.139 190.000 0.000 NA   NA
 5718341 5718342 CLK_1625 CLK_1626     FALSE 0.003 862.000 0.000 NA   NA
 5718343 5718344 CLK_1627 CLK_1628     FALSE 0.321 138.000 0.000 NA   NA
 5718344 5718345 CLK_1628 CLK_1629     FALSE 0.004 491.000 0.000 NA   NA
 5718346 5718347 CLK_1630 CLK_1631 hgdC   TRUE 0.823 80.000 0.333 NA   NA
 5718347 5718348 CLK_1631 CLK_1632     FALSE 0.018 301.000 0.000 NA   NA
 5718348 5718349 CLK_1632 CLK_1633     TRUE 0.997 19.000 0.750 0.010 Y NA
 5718349 5718350 CLK_1633 CLK_1634     TRUE 0.970 39.000 0.750 0.038 N NA
 5718350 5718351 CLK_1634 CLK_1635     FALSE 0.048 240.000 0.000 NA   NA
 5718351 5718352 CLK_1635 CLK_1636     FALSE 0.336 127.000 0.000 NA   NA
 5718352 5718353 CLK_1636 CLK_1637     TRUE 0.999 0.000 0.750 NA Y NA
 5718353 5718354 CLK_1637 CLK_1638     TRUE 0.902 63.000 0.667 NA N NA
 5718354 5718355 CLK_1638 CLK_1639     FALSE 0.003 744.000 0.000 1.000   NA
 5718356 5718357 CLK_1640 CLK_1641     TRUE 0.998 3.000 0.759 NA Y NA
 5718358 5718359 CLK_1642 CLK_1643     FALSE 0.004 584.000 0.000 1.000   NA
 5718359 5718360 CLK_1643 CLK_1644     FALSE 0.007 414.000 0.000 1.000   NA
 5718362 5718363 CLK_1646 CLK_1647 gntP pdxA FALSE 0.332 227.000 0.271 1.000 N NA
 5718363 5718364 CLK_1647 CLK_1648 pdxA   TRUE 0.985 13.000 0.283 NA   NA
 5718364 5718365 CLK_1648 CLK_1649     TRUE 0.814 65.000 0.182 NA   NA
 5718365 5718366 CLK_1649 CLK_1650     FALSE 0.003 628.000 0.000 NA   NA
 5718368 5718369 CLK_1652 CLK_1653     FALSE 0.372 118.000 0.000 1.000   NA
 5718370 5718371 CLK_1654 CLK_1655     TRUE 0.677 142.000 0.083 NA   NA
 5718371 5718372 CLK_1655 CLK_1656     FALSE 0.262 156.000 0.000 NA   NA
 5718373 5718374 CLK_1657 CLK_1658     FALSE 0.005 434.000 0.000 1.000 N NA
 5718375 5718376 CLK_1659 CLK_1660 hypA hypB TRUE 0.990 3.000 0.215 0.002   NA
 5718377 5718378 CLK_1661 CLK_1662     TRUE 0.669 96.000 0.068 NA   NA
 5718378 5718379 CLK_1662 CLK_1663     TRUE 0.999 -9.000 0.838 0.004 Y NA
 5718379 5718380 CLK_1663 CLK_1664     TRUE 0.967 25.000 0.193 NA   NA
 5718380 5718381 CLK_1664 CLK_1665     FALSE 0.006 403.000 0.000 NA   NA
 5718381 5718382 CLK_1665 CLK_1666   motB FALSE 0.021 295.000 0.000 NA   NA
 5718382 5718383 CLK_1666 CLK_1667 motB motA TRUE 0.996 18.000 0.257 0.004 Y NA
 5718385 5718386 CLK_1669 CLK_1670     FALSE 0.005 464.000 0.000 NA   NA
 5718386 5718387 CLK_1670 CLK_1671     TRUE 0.984 6.000 0.153 NA   NA
 5718387 5718388 CLK_1671 CLK_1672   pepD FALSE 0.351 118.000 0.000 NA   NA
 5718388 5718389 CLK_1672 CLK_1673 pepD   FALSE 0.029 558.000 0.000 1.000 Y NA
 5718393 5718394 CLK_1678 CLK_1679     TRUE 0.997 14.000 0.448 NA Y NA
 5718394 5718395 CLK_1679 CLK_1680     FALSE 0.005 466.000 0.000 1.000   NA
 5718395 5718396 CLK_1680 CLK_1681     TRUE 0.896 14.000 0.000 1.000   NA
 5718398 5718399 CLK_1683 CLK_1684     FALSE 0.007 391.000 0.000 NA   NA
 5718399 5718400 CLK_1684 CLK_1685     FALSE 0.005 490.000 0.000 1.000   NA
 5718402 5718403 CLK_1687 CLK_1688     FALSE 0.005 435.000 0.000 NA   NA
 5718403 5718404 CLK_1688 CLK_1689     TRUE 0.958 13.000 0.018 NA   NA
 5718404 5718405 CLK_1689 CLK_1690     FALSE 0.041 255.000 0.000 NA   NA
 5718406 5718407 CLK_1691 CLK_1692     TRUE 0.970 18.000 0.095 NA   NA
 5718407 5718408 CLK_1692 CLK_1693     TRUE 0.985 3.000 0.148 NA   NA
 5718409 5718410 CLK_1694 CLK_1695   thiM FALSE 0.005 462.000 0.000 1.000   NA
 5718410 5718411 CLK_1695 CLK_1696 thiM thiW TRUE 0.986 -22.000 0.059 NA   NA
 5718411 5718412 CLK_1696 CLK_1697 thiW   FALSE 0.005 443.000 0.000 NA   NA
 5718412 5718413 CLK_1697 CLK_1698     TRUE 0.710 136.000 0.095 1.000   NA
 5718413 5718414 CLK_1698 CLK_1699     FALSE 0.476 184.000 0.095 NA   NA
 5718414 5718415 CLK_1699 CLK_1700     FALSE 0.417 63.000 0.000 NA   NA
 5718415 5718416 CLK_1700 CLK_1701   bioD FALSE 0.329 88.000 0.000 NA   NA
 5718416 5718417 CLK_1701 CLK_1702 bioD bioB TRUE 0.995 3.000 0.025 0.001 Y NA
 5718417 5718418 CLK_1702 CLK_1703 bioB   TRUE 0.976 -7.000 0.018 NA   NA
 5718418 5718419 CLK_1703 CLK_1704     FALSE 0.316 140.000 0.000 NA   NA
 5718419 5718420 CLK_1704 CLK_1705     TRUE 0.992 -12.000 0.247 NA   NA
 5718420 5718421 CLK_1705 CLK_1706     FALSE 0.311 142.000 0.000 NA   NA
 5718422 5718423 CLK_1707 CLK_1708     TRUE 0.977 31.000 0.015 1.000 Y NA
 5718424 5718425 CLK_1709 CLK_1710     FALSE 0.193 173.000 0.000 NA   NA
 5718425 5718426 CLK_1710 CLK_1711     FALSE 0.014 321.000 0.000 NA   NA
 5718428 5718429 CLK_1713 CLK_1714     FALSE 0.131 198.000 0.000 1.000   NA
 5718429 5718430 CLK_1714 CLK_1715     FALSE 0.005 467.000 0.000 NA   NA
 5718430 5718431 CLK_1715 CLK_1716     FALSE 0.023 287.000 0.000 NA   NA
 5718431 5718432 CLK_1716 CLK_1717     FALSE 0.467 58.000 0.000 NA   NA
 5718432 5718433 CLK_1717 CLK_1718     FALSE 0.015 319.000 0.000 NA   NA
 5718433 5718434 CLK_1718 CLK_1719     FALSE 0.104 204.000 0.000 NA   NA
 5718438 5718439 CLK_1723 CLK_1724     FALSE 0.019 299.000 0.000 NA   NA
 5718439 5718440 CLK_1724 CLK_1725     FALSE 0.104 204.000 0.000 NA   NA
 5718440 5718441 CLK_1725 CLK_1726   msrB TRUE 0.654 166.000 0.200 NA   NA
 5718441 5718442 CLK_1726 CLK_1727 msrB sodF FALSE 0.052 232.000 0.000 1.000 N NA
 5718442 5718443 CLK_1727 CLK_1728 sodF   FALSE 0.334 112.000 0.000 1.000 N NA
 5718443 5718444 CLK_1728 CLK_1729     TRUE 0.999 -7.000 0.867 0.006 Y NA
 5718444 5718445 CLK_1729 CLK_1730     FALSE 0.220 280.000 0.462 1.000 N NA
 5718445 5718446 CLK_1730 CLK_1731     FALSE 0.004 485.000 0.000 NA   NA
 5718446 5718447 CLK_1731 CLK_1732     TRUE 0.964 36.000 0.500 NA   NA
 5718447 5718448 CLK_1732 CLK_1733     TRUE 0.989 -7.000 0.167 NA   NA
 5718448 5718449 CLK_1733 CLK_1734     TRUE 0.599 202.000 0.556 1.000 N NA
 5718449 5718450 CLK_1734 CLK_1735     TRUE 0.997 -3.000 0.125 0.018 Y NA
 5718450 5718451 CLK_1735 CLK_1736     FALSE 0.003 619.000 0.000 1.000   NA
 5718453 5718454 CLK_1738 CLK_1739     FALSE 0.052 240.000 0.000 1.000   NA
 5718454 5718455 CLK_1739 CLK_1740     TRUE 0.985 -3.000 0.077 NA   NA
 5718455 5718456 CLK_1740 CLK_1741     FALSE 0.003 871.000 0.000 NA   NA
 5718456 5718457 CLK_1741 CLK_1742     TRUE 0.912 5.000 0.000 NA   NA
 5718457 5718458 CLK_1742 CLK_1743     TRUE 0.912 5.000 0.000 NA   NA
 5718459 5718460 CLK_1744 CLK_1745     TRUE 0.944 -16.000 0.000 NA   NA
 5718461 5718462 CLK_1746 CLK_1747     FALSE 0.338 83.000 0.000 NA   NA
 5718462 5718463 CLK_1747 CLK_1748     TRUE 0.990 -7.000 0.179 NA   NA
 5718463 5718464 CLK_1748 CLK_1749     TRUE 0.990 -19.000 0.143 NA   NA
 5718464 5718465 CLK_1749 CLK_1750     TRUE 0.989 -3.000 0.182 NA   NA
 5718465 5718466 CLK_1750 CLK_1751     FALSE 0.005 454.000 0.000 1.000   NA
 5718466 5718467 CLK_1751 CLK_1752     FALSE 0.003 679.000 0.000 NA   NA
 5718467 5718468 CLK_1752 CLK_1753     FALSE 0.020 296.000 0.000 NA   NA
 5718468 5718469 CLK_1753 CLK_1754     TRUE 0.972 -10.000 0.006 NA   NA
 5718469 5718470 CLK_1754 CLK_1755     FALSE 0.167 181.000 0.000 NA   NA
 5718470 5718471 CLK_1755 CLK_1756     TRUE 0.735 191.000 1.000 NA   NA
 5718472 5718473 CLK_1757 CLK_1758     FALSE 0.361 74.000 0.000 NA   NA
 5718474 5718475 CLK_1759 CLK_1760     TRUE 0.997 -7.000 0.138 1.000 Y NA
 5718475 5718476 CLK_1760 CLK_1761     TRUE 0.978 -7.000 0.023 NA   NA
 5718476 5718477 CLK_1761 CLK_1762     FALSE 0.285 150.000 0.000 NA   NA
 5718477 5718478 CLK_1762 CLK_1763     FALSE 0.319 94.000 0.000 NA   NA
 5718478 5718479 CLK_1763 CLK_1764     FALSE 0.343 122.000 0.000 NA   NA
 5718479 5718480 CLK_1764 CLK_1765     TRUE 0.985 1.000 0.118 1.000 N NA
 5718480 5718481 CLK_1765 CLK_1766     TRUE 0.990 20.000 0.041 1.000 Y NA
 5718481 5718482 CLK_1766 CLK_1767     FALSE 0.003 755.000 0.000 1.000 N NA
 5718482 5718483 CLK_1767 CLK_1768     FALSE 0.003 594.000 0.000 NA   NA
 5718483 5718484 CLK_1768 CLK_1769     FALSE 0.006 409.000 0.000 NA   NA
 5718488 5718489 CLK_1773 CLK_1774 ptsH aspB TRUE 0.658 111.000 0.047 1.000 N NA
 5718489 5718490 CLK_1774 CLK_1775 aspB   FALSE 0.003 688.000 0.000 1.000   NA
 5718490 5718491 CLK_1775 CLK_1776     TRUE 0.934 -3.000 0.000 NA   NA
 5718491 5718492 CLK_1776 CLK_1777     TRUE 0.945 19.000 0.020 NA   NA
 5718492 5718493 CLK_1777 CLK_1778   spoVS FALSE 0.461 163.000 0.020 NA   NA
 5718493 5718494 CLK_1778 CLK_1779 spoVS   TRUE 0.550 139.000 0.016 NA   NA
 5718494 5718495 CLK_1779 CLK_1780   recA FALSE 0.136 234.000 0.018 1.000   NA
 5718495 5718496 CLK_1780 CLK_1781 recA pgsA TRUE 0.563 139.000 0.022 1.000 N NA
 5718496 5718497 CLK_1781 CLK_1782 pgsA   TRUE 0.989 -16.000 0.132 1.000 N NA
 5718497 5718498 CLK_1782 CLK_1783   ftsK TRUE 0.596 95.000 0.031 1.000 N NA
 5718498 5718499 CLK_1783 CLK_1784 ftsK clpP FALSE 0.016 481.000 0.047 1.000 N NA
 5718499 5718500 CLK_1784 CLK_1785 clpP dapG FALSE 0.141 249.000 0.045 1.000 N NA
 5718500 5718501 CLK_1785 CLK_1786 dapG   TRUE 0.977 16.000 0.148 NA   NA
 5718501 5718502 CLK_1786 CLK_1787     TRUE 0.733 77.000 0.104 NA   NA
 5718502 5718503 CLK_1787 CLK_1788   pnpA FALSE 0.496 175.000 0.057 1.000   NA
 5718503 5718504 CLK_1788 CLK_1789 pnpA rpsO TRUE 0.557 264.000 0.335 1.000 Y NA
 5718504 5718505 CLK_1789 CLK_1790 rpsO ribF TRUE 0.732 82.000 0.119 1.000 N NA
 5718505 5718506 CLK_1790 CLK_1791 ribF truB TRUE 0.986 13.000 0.308 1.000 N NA
 5718506 5718507 CLK_1791 CLK_1792 truB   TRUE 0.989 1.000 0.221 1.000   NA
 5718507 5718508 CLK_1792 CLK_1793   rbfA TRUE 0.991 -10.000 0.173 1.000   NA
 5718508 5718509 CLK_1793 CLK_1794 rbfA infB TRUE 0.993 30.000 0.530 1.000 Y NA
 5718509 5718510 CLK_1794 CLK_1795 infB   TRUE 0.995 18.000 0.223 NA Y NA
 5718510 5718511 CLK_1795 CLK_1796     TRUE 0.994 -10.000 0.408 NA N NA
 5718511 5718512 CLK_1796 CLK_1797   nusA TRUE 0.963 60.000 0.323 NA Y NA
 5718512 5718513 CLK_1797 CLK_1798 nusA   TRUE 0.990 17.000 0.759 NA   NA
 5718513 5718514 CLK_1798 CLK_1799   polC FALSE 0.068 305.000 0.059 NA   NA
 5718514 5718515 CLK_1799 CLK_1800 polC gcpE FALSE 0.087 279.000 0.040 1.000 N NA
 5718515 5718516 CLK_1800 CLK_1801 gcpE   TRUE 0.694 136.000 0.092 1.000 N NA
 5718516 5718517 CLK_1801 CLK_1802   dxr TRUE 0.946 45.000 0.568 1.000 N NA
 5718517 5718518 CLK_1802 CLK_1803 dxr   TRUE 0.887 30.000 0.008 NA   NA
 5718518 5718519 CLK_1803 CLK_1804     TRUE 0.786 100.000 0.250 NA   NA
 5718519 5718520 CLK_1804 CLK_1805     FALSE 0.380 69.000 0.000 NA   NA
 5718520 5718521 CLK_1805 CLK_1806   cdsA FALSE 0.307 143.000 0.000 NA   NA
 5718521 5718522 CLK_1806 CLK_1807 cdsA uppS TRUE 0.988 25.000 0.055 1.000 Y NA
 5718522 5718523 CLK_1807 CLK_1808 uppS frr TRUE 0.867 67.000 0.409 1.000 N NA
 5718523 5718524 CLK_1808 CLK_1809 frr pyrH TRUE 0.989 16.000 0.626 1.000 N NA
 5718526 5718527 CLK_1811 CLK_1812 tsf rpsB TRUE 0.963 88.000 0.748 1.000 Y NA
 5718527 5718528 CLK_1812 CLK_1813 rpsB codY FALSE 0.100 237.000 0.006 1.000 N NA
 5718528 5718529 CLK_1813 CLK_1814 codY topA FALSE 0.239 207.000 0.025 1.000 N NA
 5718529 5718530 CLK_1814 CLK_1815 topA dprA FALSE 0.198 372.000 0.238 1.000 Y NA
 5718531 5718532 CLK_1816 CLK_1817     TRUE 0.932 16.000 0.003 1.000 N NA
 5718533 5718534 CLK_1818 CLK_1819 rnhB   FALSE 0.110 297.000 0.148 1.000   NA
 5718534 5718535 CLK_1819 CLK_1820   lepB FALSE 0.039 305.000 0.007 1.000   NA
 5718535 5718536 CLK_1820 CLK_1821 lepB rplS TRUE 0.637 59.000 0.006 1.000 N NA
 5718536 5718537 CLK_1821 CLK_1822 rplS trmD TRUE 0.945 152.000 0.567 1.000 Y NA
 5718537 5718538 CLK_1822 CLK_1823 trmD rimM TRUE 0.999 -9.000 0.672 1.000 Y NA
 5718538 5718539 CLK_1823 CLK_1824 rimM   TRUE 0.828 113.000 0.324 1.000   NA
 5718539 5718540 CLK_1824 CLK_1825   rpsP TRUE 0.982 21.000 0.385 1.000   NA
 5718540 5718541 CLK_1825 CLK_1826 rpsP ffh TRUE 0.967 31.000 0.361 1.000 N NA
 5718541 5718542 CLK_1826 CLK_1827 ffh   TRUE 0.981 13.000 0.151 1.000   NA
 5718542 5718543 CLK_1827 CLK_1828   ftsY FALSE 0.245 224.000 0.081 1.000   NA
 5718543 5718544 CLK_1828 CLK_1829 ftsY smc TRUE 0.685 163.000 0.165 0.017 N NA
 5718544 5718545 CLK_1829 CLK_1830 smc   FALSE 0.109 259.000 0.027 1.000 N NA
 5718545 5718546 CLK_1830 CLK_1831   rnc TRUE 0.997 -7.000 0.064 1.000 Y NA
 5718546 5718547 CLK_1831 CLK_1832 rnc acpP TRUE 0.681 126.000 0.068 1.000 N NA
 5718547 5718548 CLK_1832 CLK_1833 acpP plsX TRUE 0.912 78.000 0.034 0.004 Y NA
 5718548 5718549 CLK_1833 CLK_1834 plsX   TRUE 0.829 90.000 0.418 1.000 N NA
 5718549 5718550 CLK_1834 CLK_1835     TRUE 0.990 14.000 0.599 NA   NA
 5718550 5718551 CLK_1835 CLK_1836   ackA TRUE 0.693 118.000 0.061 NA   NA
 5718551 5718552 CLK_1836 CLK_1837 ackA pta TRUE 0.917 140.000 0.137 1.000 Y NA
 5718552 5718553 CLK_1837 CLK_1838 pta   FALSE 0.013 335.000 0.000 1.000   NA
 5718553 5718554 CLK_1838 CLK_1839     FALSE 0.065 223.000 0.000 NA   NA
 5718554 5718555 CLK_1839 CLK_1840     TRUE 0.838 22.000 0.000 NA   NA
 5718555 5718556 CLK_1840 CLK_1842     TRUE 0.775 30.000 0.000 NA   NA
 5718556 5718557 CLK_1842 CLK_1843   prdA TRUE 0.994 9.000 1.000 NA   NA
 5718557 5718558 CLK_1843 CLK_1844 prdA   TRUE 0.981 33.000 1.000 NA   NA
 5718558 5718559 CLK_1844 CLK_1845     TRUE 0.986 22.000 0.667 NA   NA
 5718559 5718560 CLK_1845 CLK_1846     FALSE 0.003 761.000 0.000 1.000   NA
 5718560 5718561 CLK_1846 CLK_1847     TRUE 0.905 9.000 0.000 NA   NA
 5718561 5718562 CLK_1847 CLK_1848     FALSE 0.203 171.000 0.000 NA   NA
 5718562 5718563 CLK_1848 CLK_1849     FALSE 0.417 63.000 0.000 NA   NA
 5718563 5718564 CLK_1849 CLK_1850     FALSE 0.172 180.000 0.000 NA   NA
 5718564 5718565 CLK_1850 CLK_1851     FALSE 0.004 480.000 0.000 NA   NA
 5718565 5718566 CLK_1851 CLK_1852     FALSE 0.387 68.000 0.000 NA   NA
 5718568 5718569 CLK_1854 CLK_1855     FALSE 0.004 523.000 0.000 1.000   NA
 5718569 5718570 CLK_1855 CLK_1856   prdE TRUE 0.980 14.000 0.154 1.000   NA
 5718570 5718571 CLK_1856 CLK_1857 prdE prdD TRUE 0.994 14.000 1.000 0.002   NA
 5718571 5718572 CLK_1857 CLK_1858 prdD prdB FALSE 0.019 341.000 0.000 0.002   NA
 5718572 5718573 CLK_1858 CLK_1860 prdB   FALSE 0.354 76.000 0.000 NA   NA
 5718573 5718574 CLK_1860 CLK_1861     TRUE 0.905 9.000 0.000 NA   NA
 5718574 5718575 CLK_1861 CLK_1862     TRUE 0.989 22.000 1.000 NA   NA
 5718575 5718576 CLK_1862 CLK_1863     TRUE 0.989 22.000 1.000 NA   NA
 5718576 5718577 CLK_1863 CLK_1864     FALSE 0.003 641.000 0.000 NA   NA
 5718577 5718578 CLK_1864 CLK_1865     TRUE 0.970 40.000 1.000 NA   NA
 5718580 5718581 CLK_1867 CLK_1868     TRUE 0.982 5.000 0.118 NA   NA
 5718581 5718582 CLK_1868 CLK_1869     FALSE 0.004 477.000 0.000 NA   NA
 5718582 5718583 CLK_1869 CLK_1870     TRUE 0.962 32.000 0.286 NA   NA
 5718583 5718584 CLK_1870 CLK_1871     FALSE 0.175 176.000 0.000 1.000 N NA
 5718585 5718586 CLK_1872 CLK_1873     TRUE 0.736 60.000 0.036 NA   NA
 5718587 5718588 CLK_1874 CLK_1875   coaD TRUE 0.971 13.000 0.055 NA   NA
 5718588 5718589 CLK_1875 CLK_1876 coaD   TRUE 0.991 2.000 0.367 1.000 N NA
 5718589 5718590 CLK_1876 CLK_1877   recG FALSE 0.345 262.000 0.016 1.000 Y NA
 5718590 5718591 CLK_1877 CLK_1878 recG   FALSE 0.513 169.000 0.048 1.000   NA
 5718591 5718592 CLK_1878 CLK_1879     TRUE 0.989 15.000 0.567 NA   NA
 5718594 5718595 CLK_1881 CLK_1882     TRUE 0.841 78.000 0.400 NA   NA
 5718595 5718596 CLK_1882 CLK_1883     FALSE 0.010 444.000 0.005 NA   NA
 5718596 5718597 CLK_1883 CLK_1884   rpe TRUE 0.986 2.000 0.166 1.000 N NA
 5718597 5718598 CLK_1884 CLK_1885 rpe rsgA TRUE 0.991 -6.000 0.213 1.000   NA
 5718598 5718599 CLK_1885 CLK_1886 rsgA   FALSE 0.426 207.000 0.196 1.000   NA
 5718599 5718600 CLK_1886 CLK_1887     TRUE 0.999 -22.000 0.704 1.000 Y NA
 5718600 5718601 CLK_1887 CLK_1888     TRUE 0.971 19.000 0.105 1.000   NA
 5718601 5718602 CLK_1888 CLK_1889   sun TRUE 0.981 12.000 0.135 1.000   NA
 5718602 5718603 CLK_1889 CLK_1890 sun   TRUE 0.961 21.000 0.076 NA   NA
 5718603 5718604 CLK_1890 CLK_1891   fmt TRUE 0.568 153.000 0.035 NA   NA
 5718604 5718605 CLK_1891 CLK_1892 fmt def TRUE 0.990 17.000 0.009 0.021 Y NA
 5718605 5718606 CLK_1892 CLK_1893 def priA TRUE 0.897 28.000 0.010 1.000 N NA
 5718606 5718607 CLK_1893 CLK_1894 priA coaBC FALSE 0.035 388.000 0.099 1.000 N NA
 5718607 5718608 CLK_1894 CLK_1895 coaBC rpoZ TRUE 0.987 2.000 0.192 1.000 N NA
 5718608 5718609 CLK_1895 CLK_1896 rpoZ gmk TRUE 0.994 -19.000 0.471 1.000 N NA
 5718609 5718610 CLK_1896 CLK_1897 gmk   TRUE 0.987 0.000 0.143 NA   NA
 5718610 5718611 CLK_1897 CLK_1898     TRUE 0.979 16.000 0.189 NA   NA
 5718611 5718612 CLK_1898 CLK_1899   ansA FALSE 0.232 194.000 0.003 NA   NA
 5718612 5718613 CLK_1899 CLK_1900 ansA spoIVA FALSE 0.003 927.000 0.000 NA   NA
 5718615 5718616 CLK_1902 CLK_1903     TRUE 0.533 171.000 0.068 1.000   NA
 5718616 5718617 CLK_1903 CLK_1904     TRUE 0.980 3.000 0.061 1.000   NA
 5718617 5718618 CLK_1904 CLK_1905   phoU FALSE 0.017 417.000 0.028 NA N NA
 5718618 5718619 CLK_1905 CLK_1906 phoU pstB TRUE 0.989 30.000 0.182 NA Y NA
 5718619 5718620 CLK_1906 CLK_1907 pstB pstA TRUE 0.996 13.000 0.112 0.002 Y NA
 5718620 5718621 CLK_1907 CLK_1908 pstA pstC TRUE 0.999 0.000 0.907 0.002 Y NA
 5718621 5718622 CLK_1908 CLK_1909 pstC pstS TRUE 0.739 208.000 0.206 1.000 Y NA
 5718622 5718623 CLK_1909 CLK_1910 pstS   FALSE 0.121 248.000 0.028 1.000 N NA
 5718623 5718624 CLK_1910 CLK_1911     TRUE 0.995 12.000 0.110 1.000 Y NA
 5718624 5718625 CLK_1911 CLK_1912     TRUE 0.961 11.000 0.018 NA   NA
 5718625 5718626 CLK_1912 CLK_1913   nrdR FALSE 0.171 217.000 0.013 NA   NA
 5718626 5718627 CLK_1913 CLK_1914 nrdR   FALSE 0.514 131.000 0.005 NA   NA
 5718627 5718628 CLK_1914 CLK_1915   sigG TRUE 0.564 146.000 0.026 NA   NA
 5718628 5718629 CLK_1915 CLK_1916 sigG sigE TRUE 0.968 75.000 0.602 0.007 Y NA
 5718629 5718630 CLK_1916 CLK_1917 sigE spoIIGA TRUE 0.993 12.000 0.856 1.000   NA
 5718630 5718631 CLK_1917 CLK_1918 spoIIGA ftsZ FALSE 0.047 313.000 0.024 1.000   NA
 5718631 5718632 CLK_1918 CLK_1919 ftsZ ftsA TRUE 0.995 23.000 0.460 1.000 Y NA
 5718632 5718633 CLK_1919 CLK_1920 ftsA   FALSE 0.415 157.000 0.008 NA N NA
 5718635 5718636 CLK_1922 CLK_1923 pilT aroE TRUE 0.973 2.000 0.028 1.000 N NA
 5718636 5718637 CLK_1923 CLK_1924 aroE   TRUE 0.577 139.000 0.025 1.000 N NA
 5718637 5718638 CLK_1924 CLK_1925     FALSE 0.006 424.000 0.000 NA   NA
 5718638 5718639 CLK_1925 CLK_1926     FALSE 0.005 444.000 0.000 NA   NA
 5718639 5718640 CLK_1926 CLK_1927     FALSE 0.003 850.000 0.000 NA   NA
 5718640 5718641 CLK_1927 CLK_1928     FALSE 0.003 787.000 0.000 NA   NA
 5718641 5718642 CLK_1928 CLK_1929     TRUE 0.824 79.000 0.333 NA   NA
 5718642 5718643 CLK_1929 CLK_1930     FALSE 0.015 314.000 0.000 NA   NA
 5718643 5718644 CLK_1930 CLK_1931     FALSE 0.051 236.000 0.000 NA   NA
 5718644 5718645 CLK_1931 CLK_1932     FALSE 0.064 224.000 0.000 NA   NA
 5718645 5718646 CLK_1932 CLK_1933     TRUE 0.901 11.000 0.000 NA   NA
 5718646 5718647 CLK_1933 CLK_1934     TRUE 0.995 -19.000 0.500 NA   NA
 5718647 5718648 CLK_1934 CLK_1935     FALSE 0.230 164.000 0.000 NA   NA
 5718648 5718649 CLK_1935 CLK_1936     TRUE 0.927 1.000 0.000 NA   NA
 5718651 5718652 CLK_1938 CLK_1939   udk TRUE 0.539 86.000 0.012 1.000 N NA
 5718652 5718653 CLK_1939 CLK_1940 udk   TRUE 0.669 148.000 0.100 1.000 N NA
 5718653 5718654 CLK_1940 CLK_1941     TRUE 0.989 -7.000 0.146 1.000   NA
 5718654 5718655 CLK_1941 CLK_1942     TRUE 0.687 83.000 0.067 NA   NA
 5718655 5718656 CLK_1942 CLK_1943   typA TRUE 0.566 78.000 0.012 NA   NA
 5718656 5718657 CLK_1943 CLK_1944 typA   FALSE 0.007 646.000 0.004 1.000   NA
 5718657 5718658 CLK_1944 CLK_1945     TRUE 0.920 48.000 0.289 1.000   NA
 5718658 5718659 CLK_1945 CLK_1946     TRUE 0.787 119.000 0.211 NA   NA
 5718659 5718660 CLK_1946 CLK_1947     TRUE 0.967 14.000 0.047 NA   NA
 5718660 5718661 CLK_1947 CLK_1948     TRUE 0.560 207.000 0.537 NA   NA
 5718661 5718662 CLK_1948 CLK_1949   alaS TRUE 0.737 114.000 0.110 NA   NA
 5718662 5718663 CLK_1949 CLK_1950 alaS   FALSE 0.010 498.000 0.015 NA   NA
 5718663 5718664 CLK_1950 CLK_1951     TRUE 0.983 13.000 0.209 NA   NA
 5718664 5718665 CLK_1951 CLK_1952     FALSE 0.304 182.000 0.008 NA   NA
 5718665 5718666 CLK_1952 CLK_1953   iscS TRUE 0.976 2.000 0.035 1.000 N NA
 5718666 5718667 CLK_1953 CLK_1954 iscS   TRUE 0.987 -7.000 0.125 NA N NA
 5718667 5718668 CLK_1954 CLK_1955     FALSE 0.177 220.000 0.025 NA N NA
 5718668 5718669 CLK_1955 CLK_1956   hisK FALSE 0.045 347.000 0.041 0.009 N NA
 5718669 5718670 CLK_1956 CLK_1957 hisK   FALSE 0.056 315.000 0.041 1.000   NA
 5718670 5718671 CLK_1957 CLK_1958     TRUE 0.747 108.000 0.143 NA   NA
 5718673 5718674 CLK_1960 CLK_1961     TRUE 0.892 122.000 0.031 1.000 Y NA
 5718674 5718675 CLK_1961 CLK_1962     FALSE 0.027 746.000 0.000 0.002 Y NA
 5718677 5718678 CLK_1964 CLK_1965     FALSE 0.009 364.000 0.000 NA   NA
 5718678 5718679 CLK_1965 CLK_1966     FALSE 0.115 198.000 0.000 1.000 N NA
 5718679 5718680 CLK_1966 CLK_1967     TRUE 0.989 -3.000 0.182 1.000 N NA
 5718680 5718681 CLK_1967 CLK_1968     TRUE 0.991 5.000 0.400 1.000   NA
 5718681 5718682 CLK_1968 CLK_1969     TRUE 0.966 3.000 0.011 1.000   NA
 5718682 5718683 CLK_1969 CLK_1970     TRUE 0.989 17.000 0.011 NA Y NA
 5718683 5718684 CLK_1970 CLK_1971     TRUE 0.963 10.000 0.026 NA N NA
 5718684 5718685 CLK_1971 CLK_1972     TRUE 0.981 41.000 0.250 1.000 Y NA
 5718685 5718686 CLK_1972 CLK_1973     TRUE 0.927 40.000 0.143 0.049   NA
 5718686 5718687 CLK_1973 CLK_1974     TRUE 0.985 4.000 0.143 1.000   NA
 5718687 5718688 CLK_1974 CLK_1975     TRUE 0.974 9.000 0.044 1.000   NA
 5718688 5718689 CLK_1975 CLK_1976     TRUE 0.973 -3.000 0.011 1.000   NA
 5718689 5718690 CLK_1976 CLK_1977     TRUE 0.940 19.000 0.011 1.000   NA
 5718690 5718691 CLK_1977 CLK_1978   argF FALSE 0.004 467.000 0.000 1.000 N NA
 5718691 5718692 CLK_1978 CLK_1979 argF arcC TRUE 0.952 95.000 0.500 1.000 Y NA
 5718692 5718693 CLK_1979 CLK_1980 arcC glyA FALSE 0.028 564.000 0.000 1.000 Y NA
 5718694 5718695 CLK_1981 CLK_1982     TRUE 0.988 -3.000 0.154 NA   NA
 5718696 5718697 CLK_1983 CLK_1984     FALSE 0.394 199.000 0.095 NA   NA
 5718698 5718699 CLK_1985 CLK_1986     FALSE 0.006 412.000 0.000 NA   NA
 5718699 5718700 CLK_1986 CLK_1987     TRUE 0.780 75.000 0.185 1.000 N NA
 5718700 5718701 CLK_1987 CLK_1988     TRUE 0.666 153.000 0.111 NA   NA
 5718701 5718702 CLK_1988 CLK_1989     FALSE 0.013 329.000 0.000 NA   NA
 5718703 5718704 CLK_1990 CLK_1991     TRUE 0.981 -9.000 0.034 1.000 N NA
 5718704 5718705 CLK_1991 CLK_1992     FALSE 0.004 476.000 0.000 1.000 N NA
 5718705 5718706 CLK_1992 CLK_1993   hprK TRUE 0.969 -7.000 0.006 1.000 N NA
 5718706 5718707 CLK_1993 CLK_1994 hprK   TRUE 0.891 32.000 0.018 NA   NA
 5718707 5718708 CLK_1994 CLK_1995     FALSE 0.198 172.000 0.000 NA   NA
 5718708 5718709 CLK_1995 CLK_1996     TRUE 0.990 -34.000 0.130 NA   NA
 5718709 5718710 CLK_1996 CLK_1997     TRUE 0.787 110.000 0.222 NA   NA
 5718710 5718711 CLK_1997 CLK_1998     TRUE 0.981 0.000 0.049 NA   NA
 5718711 5718712 CLK_1998 CLK_1999     TRUE 0.987 -22.000 0.073 NA   NA
 5718712 5718713 CLK_1999 CLK_2000     TRUE 0.991 -3.000 0.273 NA   NA
 5718717 5718718 CLK_2004 CLK_2005     FALSE 0.003 585.000 0.000 NA   NA
 5718718 5718719 CLK_2005 CLK_2006     FALSE 0.015 314.000 0.000 NA   NA
 5718719 5718720 CLK_2006 CLK_2007     FALSE 0.002 1042.000 0.000 NA   NA
 5718720 5718721 CLK_2007 CLK_2008   def TRUE 0.965 18.000 0.065 1.000 N NA
 5718721 5718722 CLK_2008 CLK_2009 def   FALSE 0.074 217.000 0.000 1.000 N NA
 5718722 5718723 CLK_2009 CLK_2010     TRUE 0.992 29.000 0.238 0.005 Y NA
 5718723 5718724 CLK_2010 CLK_2011     TRUE 0.999 -7.000 0.776 0.005 Y NA
 5718724 5718725 CLK_2011 CLK_2012     TRUE 0.997 14.000 0.462 0.005 Y NA
 5718725 5718726 CLK_2012 CLK_2013     TRUE 0.999 -7.000 0.487 0.005 Y NA
 5718726 5718727 CLK_2013 CLK_2014     TRUE 0.996 15.000 0.258 0.005 Y NA
 5718727 5718728 CLK_2014 CLK_2015     TRUE 0.963 39.000 0.489 0.005   NA
 5718728 5718729 CLK_2015 CLK_2016     TRUE 0.994 13.000 0.848 0.005   NA
 5718729 5718730 CLK_2016 CLK_2017     TRUE 0.991 -13.000 0.132 0.005   NA
 5718730 5718731 CLK_2017 CLK_2018     FALSE 0.015 323.000 0.000 1.000   NA
 5718731 5718732 CLK_2018 CLK_2019     TRUE 0.978 -25.000 0.002 0.049   NA
 5718732 5718733 CLK_2019 CLK_2020     FALSE 0.202 203.000 0.002 1.000   NA
 5718733 5718734 CLK_2020 CLK_2021     TRUE 0.979 22.000 0.312 1.000   NA
 5718734 5718735 CLK_2021 CLK_2022     TRUE 0.862 39.000 0.026 1.000   NA
 5718737 5718738 CLK_2024 CLK_2025     FALSE 0.009 360.000 0.000 NA   NA
 5718738 5718739 CLK_2025 CLK_2026     TRUE 0.963 54.000 0.088 0.003 Y NA
 5718739 5718740 CLK_2026 CLK_2027     TRUE 0.671 66.000 0.027 NA   NA
 5718740 5718741 CLK_2027 CLK_2028     TRUE 0.792 78.000 0.222 NA   NA
 5718741 5718742 CLK_2028 CLK_2029   fliA TRUE 0.924 29.000 0.029 1.000   NA
 5718742 5718743 CLK_2029 CLK_2030 fliA   TRUE 0.968 14.000 0.062 NA N NA
 5718743 5718744 CLK_2030 CLK_2031   flhG TRUE 0.972 15.000 0.094 NA N NA
 5718744 5718745 CLK_2031 CLK_2032 flhG flhF TRUE 0.993 -6.000 0.382 1.000 N NA
 5718745 5718746 CLK_2032 CLK_2033 flhF flhA TRUE 0.998 -3.000 0.440 1.000 Y NA
 5718746 5718747 CLK_2033 CLK_2034 flhA   TRUE 0.992 28.000 0.207 0.002 Y NA
 5718747 5718748 CLK_2034 CLK_2035   fliQ TRUE 0.986 34.000 0.114 0.002 Y NA
 5718748 5718749 CLK_2035 CLK_2036 fliQ fliP TRUE 0.996 12.000 0.162 0.003 Y NA
 5718749 5718750 CLK_2036 CLK_2037 fliP   TRUE 0.998 -16.000 0.386 1.000 Y NA
 5718750 5718751 CLK_2037 CLK_2038   fliL TRUE 0.894 73.000 0.023 1.000 Y NA
 5718751 5718752 CLK_2038 CLK_2039 fliL motB TRUE 0.998 -3.000 0.314 1.000 Y NA
 5718752 5718753 CLK_2039 CLK_2040 motB motA TRUE 0.998 -7.000 0.350 1.000 Y NA
 5718753 5718754 CLK_2040 CLK_2041 motA   TRUE 0.998 -3.000 0.301 NA Y NA
 5718754 5718755 CLK_2041 CLK_2042   flgE FALSE 0.515 234.000 0.077 NA Y NA
 5718755 5718756 CLK_2042 CLK_2043 flgE   TRUE 0.722 82.000 0.100 NA   NA
 5718756 5718757 CLK_2043 CLK_2044   flgD TRUE 0.970 15.000 0.064 NA   NA
 5718757 5718758 CLK_2044 CLK_2045 flgD fliK TRUE 0.893 30.000 0.012 NA   NA
 5718758 5718759 CLK_2045 CLK_2046 fliK   TRUE 0.969 6.000 0.006 0.004   NA
 5718759 5718760 CLK_2046 CLK_2047   fliI TRUE 0.937 106.000 0.241 1.000 Y NA
 5718760 5718761 CLK_2047 CLK_2048 fliI fliH TRUE 0.984 40.000 0.379 NA Y NA
 5718761 5718762 CLK_2048 CLK_2049 fliH fliG TRUE 0.998 -16.000 0.308 NA Y NA
 5718762 5718763 CLK_2049 CLK_2050 fliG fliF TRUE 0.998 7.000 0.477 0.004 Y NA
 5718763 5718764 CLK_2050 CLK_2051 fliF fliE TRUE 0.995 16.000 0.112 0.004 Y NA
 5718764 5718765 CLK_2051 CLK_2052 fliE flgC TRUE 0.898 12.000 0.000 NA   NA
 5718765 5718766 CLK_2052 CLK_2054 flgC flgB FALSE 0.321 98.000 0.000 NA   NA
 5718766 5718767 CLK_2054 CLK_2055 flgB   FALSE 0.006 573.000 0.000 0.004   NA
 5718767 5718768 CLK_2055 CLK_2056     TRUE 0.736 145.000 0.182 NA   NA
 5718768 5718769 CLK_2056 CLK_2057   argH FALSE 0.004 540.000 0.000 NA   NA
 5718769 5718770 CLK_2057 CLK_2058 argH argG TRUE 0.994 22.000 0.278 1.000 Y NA
 5718770 5718771 CLK_2058 CLK_2059 argG   FALSE 0.021 294.000 0.000 NA   NA
 5718771 5718772 CLK_2059 CLK_2060     TRUE 0.985 23.000 0.667 NA   NA
 5718772 5718773 CLK_2060 CLK_2061   cls FALSE 0.104 204.000 0.000 NA   NA
 5718775 5718776 CLK_2063 CLK_2064     FALSE 0.028 277.000 0.000 NA   NA
 5718776 5718777 CLK_2064 CLK_2065     FALSE 0.045 246.000 0.000 NA   NA
 5718777 5718778 CLK_2065 CLK_2066     TRUE 0.665 40.000 0.000 1.000   NA
 5718778 5718779 CLK_2066 CLK_2067     TRUE 0.968 29.000 0.000 1.000 Y NA
 5718779 5718780 CLK_2067 CLK_2068     TRUE 0.981 33.000 0.051 1.000 Y NA
 5718780 5718781 CLK_2068 CLK_2069     TRUE 0.973 15.000 0.091 NA   NA
 5718781 5718782 CLK_2069 CLK_2070     TRUE 0.731 34.000 0.000 NA   NA
 5718782 5718783 CLK_2070 CLK_2071     TRUE 0.799 27.000 0.000 NA   NA
 5718783 5718784 CLK_2071 CLK_2072   glf TRUE 0.970 0.000 0.012 NA   NA
 5718784 5718785 CLK_2072 CLK_2073 glf   TRUE 0.863 105.000 0.012 NA Y NA
 5718785 5718786 CLK_2073 CLK_2074     FALSE 0.062 220.000 0.000 NA N NA
 5718786 5718787 CLK_2074 CLK_2075     TRUE 0.854 19.000 0.000 1.000 N NA
 5718787 5718788 CLK_2075 CLK_2076     TRUE 0.991 16.000 0.027 1.000 Y NA
 5718788 5718789 CLK_2076 CLK_2077     TRUE 0.959 35.000 0.400 NA N NA
 5718789 5718790 CLK_2077 CLK_2078     FALSE 0.005 461.000 0.000 NA   NA
 5718790 5718791 CLK_2078 CLK_2079     TRUE 0.763 129.000 0.182 NA   NA
 5718791 5718792 CLK_2079 CLK_2080     TRUE 0.903 121.000 1.000 NA   NA
 5718792 5718793 CLK_2080 CLK_2081     FALSE 0.004 483.000 0.000 NA   NA
 5718793 5718794 CLK_2081 CLK_2082   fliC TRUE 0.812 77.000 0.250 1.000   NA
 5718794 5718795 CLK_2082 CLK_2083 fliC   TRUE 0.581 185.000 0.250 NA   NA
 5718795 5718796 CLK_2083 CLK_2084     FALSE 0.332 86.000 0.000 NA   NA
 5718796 5718797 CLK_2084 CLK_2085     FALSE 0.069 224.000 0.000 1.000   NA
 5718797 5718798 CLK_2085 CLK_2086     FALSE 0.004 494.000 0.000 1.000 N NA
 5718798 5718799 CLK_2086 CLK_2087     FALSE 0.348 89.000 0.000 1.000   NA
 5718799 5718800 CLK_2087 CLK_2088     TRUE 0.864 20.000 0.000 1.000   NA
 5718800 5718801 CLK_2088 CLK_2089     TRUE 0.807 28.000 0.000 1.000   NA
 5718801 5718802 CLK_2089 CLK_2090     FALSE 0.330 104.000 0.000 NA   NA
 5718802 5718803 CLK_2090 CLK_2091     TRUE 0.908 7.000 0.000 NA   NA
 5718803 5718804 CLK_2091 CLK_2092     TRUE 0.807 26.000 0.000 NA   NA
 5718804 5718805 CLK_2092 CLK_2093     TRUE 0.699 36.000 0.000 NA   NA
 5718805 5718806 CLK_2093 CLK_2094     TRUE 0.901 13.000 0.000 1.000   NA
 5718806 5718807 CLK_2094 CLK_2095     TRUE 0.857 21.000 0.000 1.000   NA
 5718807 5718808 CLK_2095 CLK_2096     TRUE 0.896 14.000 0.000 1.000   NA
 5718808 5718809 CLK_2096 CLK_2097     TRUE 0.821 26.000 0.000 1.000   NA
 5718809 5718810 CLK_2097 CLK_2098     TRUE 0.908 127.000 0.071 1.000 Y NA
 5718810 5718811 CLK_2098 CLK_2099     TRUE 0.576 106.000 0.020 1.000 N NA
 5718811 5718812 CLK_2099 CLK_2100     TRUE 0.838 21.000 0.000 1.000 N NA
 5718812 5718813 CLK_2100 CLK_2101     TRUE 0.998 9.000 0.549 1.000 Y NA
 5718813 5718814 CLK_2101 CLK_2102     TRUE 0.997 -7.000 0.105 1.000 Y NA
 5718814 5718815 CLK_2102 CLK_2103     TRUE 0.887 16.000 0.000 1.000   NA
 5718815 5718816 CLK_2103 CLK_2104     FALSE 0.421 66.000 0.000 1.000   NA
 5718816 5718817 CLK_2104 CLK_2105     TRUE 0.830 73.000 0.000 1.000 Y NA
 5718817 5718818 CLK_2105 CLK_2106     TRUE 0.882 142.000 0.037 1.000 Y NA
 5718818 5718819 CLK_2106 CLK_2107     TRUE 0.708 113.000 0.069 1.000   NA
 5718819 5718820 CLK_2107 CLK_2108     TRUE 0.946 43.000 0.468 1.000   NA
 5718820 5718821 CLK_2108 CLK_2109     FALSE 0.066 221.000 0.000 1.000 N NA
 5718821 5718822 CLK_2109 CLK_2110     TRUE 0.842 120.000 0.267 0.002   NA
 5718822 5718823 CLK_2110 CLK_2111     TRUE 0.651 41.000 0.000 1.000   NA
 5718823 5718824 CLK_2111 CLK_2112     TRUE 0.905 9.000 0.000 NA   NA
 5718824 5718825 CLK_2112 CLK_2113     TRUE 0.981 4.000 0.095 NA   NA
 5718825 5718826 CLK_2113 CLK_2114     TRUE 0.816 25.000 0.000 NA   NA
 5718826 5718827 CLK_2114 CLK_2115     FALSE 0.119 284.000 0.105 1.000   NA
 5718827 5718828 CLK_2115 CLK_2116     TRUE 0.714 215.000 0.133 0.002 Y NA
 5718828 5718829 CLK_2116 CLK_2117     TRUE 0.729 150.000 0.200 NA   NA
 5718829 5718830 CLK_2117 CLK_2118   fliD TRUE 0.936 27.000 0.043 NA   NA
 5718830 5718831 CLK_2118 CLK_2119 fliD fliS TRUE 0.978 54.000 0.370 0.001 Y NA
 5718831 5718832 CLK_2119 CLK_2120 fliS   TRUE 0.913 37.000 0.093 NA   NA
 5718832 5718833 CLK_2120 CLK_2121     TRUE 0.746 57.000 0.028 NA   NA
 5718833 5718834 CLK_2121 CLK_2122   csrA TRUE 0.954 16.000 0.028 NA N NA
 5718834 5718835 CLK_2122 CLK_2123 csrA   TRUE 0.985 0.000 0.096 NA   NA
 5718835 5718836 CLK_2123 CLK_2124   flgL TRUE 0.857 68.000 0.385 NA   NA
 5718836 5718837 CLK_2124 CLK_2125 flgL flgK TRUE 0.994 18.000 0.071 0.001 Y NA
 5718837 5718838 CLK_2125 CLK_2126 flgK   FALSE 0.139 281.000 0.082 0.001   NA
 5718838 5718839 CLK_2126 CLK_2127     TRUE 0.994 0.000 0.421 0.002   NA
 5718839 5718840 CLK_2127 CLK_2128   fliN FALSE 0.004 590.000 0.000 1.000   NA
 5718840 5718841 CLK_2128 CLK_2129 fliN fliM TRUE 0.999 -7.000 0.508 0.001 Y NA
 5718841 5718842 CLK_2129 CLK_2130 fliM   TRUE 0.987 28.000 0.039 0.011 Y NA
 5718842 5718843 CLK_2130 CLK_2131   cheY TRUE 0.949 100.000 0.417 1.000 Y NA
 5718843 5718844 CLK_2131 CLK_2132 cheY cheC TRUE 0.987 28.000 0.082 NA Y NA
 5718844 5718845 CLK_2132 CLK_2133 cheC cheA TRUE 0.991 26.000 0.176 NA Y NA
 5718845 5718846 CLK_2133 CLK_2134 cheA cheR TRUE 0.994 13.000 0.081 1.000 Y NA
 5718846 5718847 CLK_2134 CLK_2135 cheR cheB TRUE 0.994 15.000 0.107 1.000 Y NA
 5718847 5718848 CLK_2135 CLK_2136 cheB cheD TRUE 0.990 23.000 0.070 1.000 Y NA
 5718848 5718849 CLK_2136 CLK_2137 cheD cheW TRUE 0.992 17.000 0.063 1.000 Y NA
 5718849 5718850 CLK_2137 CLK_2138 cheW   TRUE 0.980 16.000 0.231 NA N NA
 5718850 5718851 CLK_2138 CLK_2139     FALSE 0.036 253.000 0.000 NA N NA
 5718851 5718852 CLK_2139 CLK_2140     TRUE 0.809 83.000 0.273 1.000   NA
 5718852 5718853 CLK_2140 CLK_2141     FALSE 0.047 249.000 0.000 1.000   NA
 5718853 5718854 CLK_2141 CLK_2142     TRUE 0.920 127.000 0.082 0.049 Y NA
 5718854 5718855 CLK_2142 CLK_2143     FALSE 0.040 257.000 0.000 NA   NA
 5718855 5718856 CLK_2143 CLK_2144     FALSE 0.038 261.000 0.000 NA   NA
 5718856 5718857 CLK_2144 CLK_2145     FALSE 0.034 266.000 0.000 NA   NA
 5718857 5718858 CLK_2145 CLK_2146   murG FALSE 0.003 631.000 0.000 1.000 N NA
 5718860 5718861 CLK_2148 CLK_2149   recJ FALSE 0.003 701.000 0.000 1.000 N NA
 5718863 5718864 CLK_2151 CLK_2152     FALSE 0.003 1006.000 0.000 1.000   NA
 5718865 5718866 CLK_2153 CLK_2154     TRUE 0.602 68.000 0.008 1.000   NA
 5718867 5718868 CLK_2155 CLK_2156 glpP   TRUE 0.772 49.000 0.018 1.000 N NA
 5718868 5718869 CLK_2156 CLK_2157     TRUE 0.968 74.000 0.552 0.001 Y NA
 5718869 5718870 CLK_2157 CLK_2158     FALSE 0.009 366.000 0.000 NA   NA
 5718871 5718872 CLK_2159 CLK_2160     TRUE 0.987 13.000 0.333 NA   NA
 5718872 5718873 CLK_2160 CLK_2161     FALSE 0.005 461.000 0.000 NA   NA
 5718873 5718874 CLK_2161 CLK_2162     TRUE 0.853 20.000 0.000 NA   NA
 5718875 5718876 CLK_2163 CLK_2164   galE TRUE 0.906 38.000 0.087 NA   NA
 5718876 5718877 CLK_2164 CLK_2165 galE   FALSE 0.010 352.000 0.000 1.000 N NA
 5718877 5718878 CLK_2165 CLK_2166     FALSE 0.031 268.000 0.000 1.000 N NA
 5718878 5718879 CLK_2166 CLK_2167     FALSE 0.003 590.000 0.000 1.000 N NA
 5718881 5718882 CLK_2169 CLK_2170 glpK   FALSE 0.194 252.000 0.131 1.000 N NA
 5718884 5718885 CLK_2172 CLK_2173     TRUE 0.830 132.000 0.400 NA   NA
 5718885 5718886 CLK_2173 CLK_2174     TRUE 0.983 -16.000 0.038 NA   NA
 5718886 5718887 CLK_2174 CLK_2175     TRUE 0.990 6.000 0.419 1.000 N NA
 5718887 5718888 CLK_2175 CLK_2176     FALSE 0.406 173.000 0.027 NA N NA
 5718894 5718895 CLK_2182 CLK_2183 gerAC   TRUE 0.966 -34.000 0.000 0.005   NA
 5718895 5718896 CLK_2183 CLK_2184   gerAA TRUE 0.963 -10.000 0.000 0.005   NA
 5718896 5718897 CLK_2184 CLK_2185 gerAA   FALSE 0.038 261.000 0.000 NA   NA
 5718897 5718898 CLK_2185 CLK_2186     FALSE 0.039 260.000 0.000 NA   NA
 5718898 5718899 CLK_2186 CLK_2187     TRUE 0.998 2.000 0.488 0.027 Y NA
 5718899 5718900 CLK_2187 CLK_2188     FALSE 0.008 367.000 0.000 1.000 N NA
 5718900 5718901 CLK_2188 CLK_2189     FALSE 0.068 220.000 0.000 1.000 N NA
 5718901 5718902 CLK_2189 CLK_2190     FALSE 0.527 77.000 0.004 NA   NA
 5718904 5718905 CLK_2192 CLK_2193     TRUE 0.543 197.000 0.000 1.000 Y NA
 5718907 5718908 CLK_2195 CLK_2196     FALSE 0.007 402.000 0.000 1.000   NA
 5718908 5718909 CLK_2196 CLK_2197     FALSE 0.034 267.000 0.000 NA   NA
 5718909 5718910 CLK_2197 CLK_2198     TRUE 0.849 131.000 0.500 NA   NA
 5718910 5718911 CLK_2198 CLK_2199     FALSE 0.004 517.000 0.000 NA   NA
 5718911 5718912 CLK_2199 CLK_2200   nrdB FALSE 0.011 344.000 0.000 NA   NA
 5718912 5718913 CLK_2200 CLK_2201 nrdB nrdA TRUE 0.865 195.000 0.393 0.001 Y NA
 5718913 5718914 CLK_2201 CLK_2202 nrdA   FALSE 0.007 396.000 0.000 NA   NA
 5718915 5718916 CLK_2203 CLK_2204     FALSE 0.105 300.000 0.167 NA   NA
 5718917 5718918 CLK_2205 CLK_2206 dinB   FALSE 0.004 465.000 0.000 1.000 N NA
 5718918 5718919 CLK_2206 CLK_2207     TRUE 0.982 0.000 0.062 1.000 N NA
 5718919 5718920 CLK_2207 CLK_2208   pyrR FALSE 0.005 447.000 0.000 1.000 N NA
 5718920 5718921 CLK_2208 CLK_2209 pyrR   FALSE 0.013 327.000 0.000 NA   NA
 5718921 5718922 CLK_2209 CLK_2210     FALSE 0.004 490.000 0.000 NA   NA
 5718922 5718923 CLK_2210 CLK_2211     FALSE 0.250 158.000 0.000 NA   NA
 5718923 5718924 CLK_2211 CLK_2212     TRUE 0.988 18.000 0.571 1.000 N NA
 5718926 5718927 CLK_2215 CLK_2216 ligT   FALSE 0.380 185.000 0.034 NA   NA
 5718927 5718928 CLK_2216 CLK_2217     FALSE 0.003 575.000 0.000 NA   NA
 5718928 5718929 CLK_2217 CLK_2218     FALSE 0.003 710.000 0.000 1.000 N NA
 5718931 5718932 CLK_2220 CLK_2221   nagB FALSE 0.351 227.000 0.000 1.000 Y NA
 5718932 5718933 CLK_2221 CLK_2222 nagB nagA TRUE 0.951 83.000 0.273 0.001 Y NA
 5718933 5718934 CLK_2222 CLK_2223 nagA   TRUE 0.789 161.000 0.545 1.000 N NA
 5718937 5718938 CLK_2226 CLK_2227 nagE   FALSE 0.004 483.000 0.000 1.000 N NA
 5718939 5718940 CLK_2228 CLK_2229     TRUE 0.998 2.000 0.465 1.000 Y NA
 5718940 5718941 CLK_2229 CLK_2230     TRUE 0.594 90.000 0.028 1.000 N NA
 5718943 5718944 CLK_2232 CLK_2233     FALSE 0.048 236.000 0.000 1.000 N NA
 5718944 5718945 CLK_2233 CLK_2234     TRUE 0.914 58.000 0.571 1.000 N NA
 5718945 5718946 CLK_2234 CLK_2235     FALSE 0.009 357.000 0.000 1.000 N NA
 5718946 5718947 CLK_2235 CLK_2236     FALSE 0.096 222.000 0.000 0.049   NA
 5718948 5718949 CLK_2237 CLK_2238     FALSE 0.013 339.000 0.000 1.000   NA
 5718949 5718950 CLK_2238 CLK_2239     TRUE 0.998 9.000 0.909 0.048 Y NA
 5718951 5718952 CLK_2240 CLK_2241     FALSE 0.004 514.000 0.000 NA   NA
 5718952 5718953 CLK_2241 CLK_2242     TRUE 0.998 5.000 0.800 0.036 Y NA
 5718953 5718954 CLK_2242 CLK_2243     TRUE 0.999 -13.000 0.800 0.027 Y NA
 5718955 5718956 CLK_2244 CLK_2245     TRUE 0.883 50.000 0.143 1.000   NA
 5718957 5718958 CLK_2246 CLK_2247     FALSE 0.003 1006.000 0.000 1.000   NA
 5718958 5718959 CLK_2247 CLK_2248     TRUE 0.775 30.000 0.000 NA   NA
 5718959 5718960 CLK_2248 CLK_2249     FALSE 0.003 612.000 0.000 NA   NA
 5718960 5718961 CLK_2249 CLK_2250     TRUE 0.838 22.000 0.000 NA   NA
 5718961 5718962 CLK_2250 CLK_2251     FALSE 0.006 413.000 0.000 NA   NA
 5718962 5718963 CLK_2251 CLK_2252     FALSE 0.383 165.000 0.003 1.000   NA
 5718963 5718964 CLK_2252 CLK_2253     FALSE 0.005 471.000 0.000 NA   NA
 5718964 5718965 CLK_2253 CLK_2254     FALSE 0.010 357.000 0.000 NA   NA
 5718967 5718968 CLK_2256 CLK_2257 rumA-1   FALSE 0.023 287.000 0.000 NA   NA
 5718969 5718970 CLK_2258 CLK_2259     TRUE 0.968 26.000 0.214 1.000   NA
 5718971 5718972 CLK_2260 CLK_2261 ribH ribAB TRUE 0.985 32.000 0.054 0.001 Y NA
 5718972 5718973 CLK_2261 CLK_2262 ribAB ribE FALSE 0.231 308.000 0.051 1.000 Y NA
 5718973 5718974 CLK_2262 CLK_2263 ribE ribD TRUE 0.999 -19.000 0.456 1.000 Y NA
 5718974 5718975 CLK_2263 CLK_2264 ribD pepD FALSE 0.006 402.000 0.000 1.000 N NA
 5718977 5718978 CLK_2266 CLK_2267 mgtA   FALSE 0.003 787.000 0.000 NA   NA
 5718978 5718979 CLK_2267 CLK_2268   purD FALSE 0.013 329.000 0.000 NA   NA
 5718979 5718980 CLK_2268 CLK_2269 purD purH TRUE 0.971 52.000 0.238 1.000 Y NA
 5718980 5718981 CLK_2269 CLK_2270 purH purN TRUE 0.732 212.000 0.225 1.000 Y NA
 5718981 5718982 CLK_2270 CLK_2271 purN purM TRUE 0.947 127.000 0.238 0.001 Y NA
 5718982 5718983 CLK_2271 CLK_2272 purM purF TRUE 0.958 61.000 0.248 1.000 Y NA
 5718983 5718984 CLK_2272 CLK_2273 purF purC TRUE 0.905 92.000 0.082 1.000 Y NA
 5718984 5718985 CLK_2273 CLK_2274 purC purE TRUE 0.995 0.000 0.035 1.000 Y NA
 5718985 5718986 CLK_2274 CLK_2275 purE   FALSE 0.003 642.000 0.000 1.000 N NA
 5718986 5718987 CLK_2275 CLK_2276     FALSE 0.009 357.000 0.000 1.000 N NA
 5718987 5718988 CLK_2276 CLK_2277     TRUE 0.931 26.000 0.033 1.000 N NA
 5718988 5718989 CLK_2277 CLK_2278     TRUE 0.971 31.000 0.443 1.000 N NA
 5718989 5718990 CLK_2278 CLK_2279     TRUE 0.976 36.000 0.049 1.000 Y NA
 5718990 5718991 CLK_2279 CLK_2280   hydA FALSE 0.011 342.000 0.000 1.000 N NA
 5718991 5718992 CLK_2280 CLK_2281 hydA   TRUE 0.942 50.000 0.012 1.000 Y NA
 5718992 5718993 CLK_2281 CLK_2282   dpaL TRUE 0.966 22.000 0.133 1.000 N NA
 5718993 5718994 CLK_2282 CLK_2283 dpaL   FALSE 0.023 285.000 0.000 1.000 N NA
 5718995 5718996 CLK_2284 CLK_2285     TRUE 0.974 15.000 0.104 NA   NA
 5718996 5718997 CLK_2285 CLK_2286     TRUE 0.989 -19.000 0.109 NA   NA
 5718997 5718998 CLK_2286 CLK_2287     TRUE 0.989 -18.000 0.109 NA   NA
 5718998 5718999 CLK_2287 CLK_2288     TRUE 0.927 26.000 0.032 NA N NA
 5718999 5719000 CLK_2288 CLK_2289     TRUE 0.981 -3.000 0.047 1.000 N NA
 5719000 5719001 CLK_2289 CLK_2290     TRUE 0.999 -3.000 0.862 1.000 Y NA
 5719001 5719002 CLK_2290 CLK_2291     TRUE 0.947 52.000 0.031 1.000 Y NA
 5719002 5719003 CLK_2291 CLK_2292     TRUE 0.843 138.000 0.500 NA   NA
 5719003 5719004 CLK_2292 CLK_2293     TRUE 0.665 128.000 0.053 NA   NA
 5719005 5719006 CLK_2294 CLK_2295     FALSE 0.007 399.000 0.000 NA   NA
 5719006 5719007 CLK_2295 CLK_2296     FALSE 0.005 590.000 0.000 0.081   NA
 5719007 5719008 CLK_2296 CLK_2297     FALSE 0.003 950.000 0.000 1.000   NA
 5719008 5719009 CLK_2297 CLK_2298   trmU FALSE 0.004 504.000 0.000 1.000   NA
 5719009 5719010 CLK_2298 CLK_2299 trmU   FALSE 0.327 109.000 0.000 1.000 N NA
 5719010 5719011 CLK_2299 CLK_2300     TRUE 0.962 0.000 0.005 NA N NA
 5719013 5719014 CLK_2302 CLK_2303   thiC TRUE 0.926 19.000 0.003 NA   NA
 5719014 5719015 CLK_2303 CLK_2304 thiC purF FALSE 0.157 211.000 0.003 1.000 N NA
 5719015 5719016 CLK_2304 CLK_2305 purF   FALSE 0.036 263.000 0.000 NA   NA
 5719016 5719017 CLK_2305 CLK_2306     FALSE 0.134 192.000 0.000 NA   NA
 5719020 5719021 CLK_2309 CLK_2310     FALSE 0.348 89.000 0.000 1.000   NA
 5719021 5719022 CLK_2310 CLK_2311     TRUE 0.988 23.000 0.917 NA   NA
 5719023 5719024 CLK_2312 CLK_2313     TRUE 0.770 117.000 0.167 NA   NA
 5719024 5719025 CLK_2313 CLK_2314     FALSE 0.016 308.000 0.000 NA   NA
 5719025 5719026 CLK_2314 CLK_2315     FALSE 0.009 379.000 0.000 1.000   NA
 5719028 10253781 CLK_2317 CLK_4008     FALSE 0.050 238.000 0.000 NA   NA
 10253781 5719029 CLK_4008 CLK_2318     FALSE 0.344 111.000 0.000 NA   NA
 5719029 5719030 CLK_2318 CLK_2319     TRUE 0.809 139.000 0.342 NA   NA
 5719030 5719031 CLK_2319 CLK_2320     TRUE 0.992 -9.000 0.283 NA   NA
 5719031 5719032 CLK_2320 CLK_2321     TRUE 0.632 76.000 0.028 NA   NA
 5719032 5719033 CLK_2321 CLK_2322   rpoD TRUE 0.629 75.000 0.026 NA   NA
 5719033 5719034 CLK_2322 CLK_2323 rpoD dnaG TRUE 0.967 25.000 0.209 1.000 N NA
 5719034 5719035 CLK_2323 CLK_2324 dnaG   FALSE 0.092 283.000 0.056 1.000 N NA
 5719037 5719038 CLK_2326 CLK_2327 ppdK   TRUE 0.601 81.000 0.019 1.000   NA
 5719038 5719039 CLK_2327 CLK_2328     FALSE 0.004 510.000 0.000 NA   NA
 5719039 5719040 CLK_2328 CLK_2329     TRUE 0.918 3.000 0.000 NA   NA
 5719040 5719041 CLK_2329 CLK_2330   era FALSE 0.007 399.000 0.000 NA   NA
 5719041 5719042 CLK_2330 CLK_2331 era cdd TRUE 0.971 16.000 0.077 1.000   NA
 5719042 5719043 CLK_2331 CLK_2332 cdd   TRUE 0.638 84.000 0.040 1.000 N NA
 5719043 5719044 CLK_2332 CLK_2333     TRUE 0.831 41.000 0.023 NA   NA
 5719044 5719045 CLK_2333 CLK_2334     TRUE 0.989 -3.000 0.182 NA   NA
 5719045 5719046 CLK_2334 CLK_2335     TRUE 0.941 23.000 0.032 NA   NA
 5719046 5719047 CLK_2335 CLK_2336   yqfC TRUE 0.996 -10.000 0.851 NA   NA
 5719047 5719048 CLK_2336 CLK_2337 yqfC   TRUE 0.632 114.000 0.029 NA   NA
 5719048 5719049 CLK_2337 CLK_2338   rpsU TRUE 0.919 43.000 0.150 0.021   NA
 5719049 5719050 CLK_2338 CLK_2339 rpsU   TRUE 0.685 137.000 0.071 1.000   NA
 5719050 5719051 CLK_2339 CLK_2340     TRUE 0.811 57.000 0.051 0.027 N NA
 5719051 5719052 CLK_2340 CLK_2341     TRUE 0.988 0.000 0.163 NA   NA
 5719052 5719053 CLK_2341 CLK_2342   prmA TRUE 0.775 98.000 0.227 NA   NA
 5719053 5719054 CLK_2342 CLK_2343 prmA dnaJ FALSE 0.084 308.000 0.133 1.000 N NA
 5719054 5719055 CLK_2343 CLK_2344 dnaJ dnaK TRUE 0.934 143.000 0.196 0.002 Y NA
 5719055 5719056 CLK_2344 CLK_2345 dnaK grpE TRUE 0.972 55.000 0.224 0.004 Y NA
 5719056 5719057 CLK_2345 CLK_2346 grpE hrcA TRUE 0.970 27.000 0.286 1.000 N NA
 5719057 5719058 CLK_2346 CLK_2347 hrcA   FALSE 0.344 201.000 0.062 1.000 N NA
 5719058 5719059 CLK_2347 CLK_2348   lepA TRUE 0.950 26.000 0.083 1.000 N NA
 5719059 5719060 CLK_2348 CLK_2349 lepA   FALSE 0.485 141.000 0.004 NA   NA
 5719060 5719061 CLK_2349 CLK_2350     TRUE 0.728 71.000 0.077 NA   NA
 5719061 5719062 CLK_2350 CLK_2351   gpr TRUE 0.688 184.000 0.521 NA   NA
 5719064 5719065 CLK_2353 CLK_2354 holA   TRUE 0.949 32.000 0.163 NA   NA
 5719065 5719066 CLK_2354 CLK_2355     TRUE 0.945 12.000 0.002 NA   NA
 5719066 5719067 CLK_2355 CLK_2356     TRUE 0.691 105.000 0.077 NA   NA
 5719067 5719068 CLK_2356 CLK_2357     FALSE 0.004 508.000 0.000 NA   NA
 5719070 5719071 CLK_3901 CLK_2359   selB FALSE 0.003 907.000 0.000 NA   NA
 5719071 5719072 CLK_2359 CLK_2360 selB selA TRUE 0.989 19.000 0.569 0.001 N NA
 5719072 5719073 CLK_2360 CLK_2361 selA selD TRUE 0.923 67.000 0.055 1.000 Y NA
 5719073 5719074 CLK_2361 CLK_2362 selD   FALSE 0.068 220.000 0.000 1.000 N NA
 5719076 5719077 CLK_2364 CLK_2365     FALSE 0.187 326.000 0.047 NA Y NA
 5719077 5719078 CLK_2365 CLK_2366     TRUE 0.980 16.000 0.231 NA N NA
 5719078 5719079 CLK_2366 CLK_2367     TRUE 0.965 11.000 0.033 NA N NA
 5719079 5719080 CLK_2367 CLK_2368   nadD TRUE 0.933 83.000 0.199 1.000 Y NA
 5719080 5719081 CLK_2368 CLK_2369 nadD   FALSE 0.212 243.000 0.150 NA N NA
 5719081 5719082 CLK_2369 CLK_2370   obg TRUE 0.937 27.000 0.046 NA   NA
 5719082 5719083 CLK_2370 CLK_2371 obg rpmA FALSE 0.071 379.000 0.335 1.000   NA
 5719083 5719084 CLK_2371 CLK_2372 rpmA   TRUE 0.997 3.000 0.203 NA Y NA
 5719084 5719085 CLK_2372 CLK_2373   rplU TRUE 0.997 3.000 0.208 NA Y NA
 5719085 5719086 CLK_2373 CLK_2374 rplU   TRUE 0.893 124.000 0.018 0.017 Y NA
 5719086 5719087 CLK_2374 CLK_2375     TRUE 0.926 39.000 0.180 NA   NA
 5719087 5719088 CLK_2375 CLK_2376     TRUE 0.994 -22.000 0.420 NA   NA
 5719088 5719089 CLK_2376 CLK_2377     TRUE 0.735 113.000 0.098 1.000   NA
 5719089 5719090 CLK_2377 CLK_2378     TRUE 0.882 55.000 0.135 0.005   NA
 5719090 5719091 CLK_2378 CLK_2379   rodA FALSE 0.014 318.000 0.000 1.000 N NA
 5719091 5719092 CLK_2379 CLK_2380 rodA minE TRUE 0.851 99.000 0.008 NA Y NA
 5719092 5719093 CLK_2380 CLK_2381 minE minD TRUE 0.996 14.000 0.347 NA Y NA
 5719093 5719094 CLK_2381 CLK_2382 minD minC TRUE 0.996 18.000 0.368 1.000 Y NA
 5719094 5719095 CLK_2382 CLK_2383 minC   FALSE 0.500 175.000 0.060 1.000   NA
 5719095 5719096 CLK_2383 CLK_2384   mreD TRUE 0.966 20.000 0.089 1.000   NA
 5719096 5719097 CLK_2384 CLK_2385 mreD mreC TRUE 0.993 11.000 0.550 0.002   NA
 5719097 5719098 CLK_2385 CLK_2386 mreC   TRUE 0.993 7.000 0.689 1.000 N NA
 5719098 5719099 CLK_2386 CLK_2387     TRUE 0.926 29.000 0.040 1.000 N NA
 5719099 5719100 CLK_2387 CLK_2388   maf TRUE 0.969 15.000 0.074 NA N NA
 5719100 5719101 CLK_2388 CLK_2389 maf   TRUE 0.956 16.000 0.026 NA   NA
 5719101 5719102 CLK_2389 CLK_2390     TRUE 0.827 110.000 0.357 NA   NA
 5719102 5719103 CLK_2390 CLK_2391     FALSE 0.377 226.000 0.364 NA   NA
 5719103 5719104 CLK_2391 CLK_2392     TRUE 0.764 31.000 0.000 NA   NA
 5719106 10253782 CLK_2394 CLK_4010 pheB   FALSE 0.009 362.000 0.000 NA   NA
 10253782 5719107 CLK_4010 CLK_3902     FALSE 0.160 183.000 0.000 NA   NA
 5719107 5719108 CLK_3902 CLK_2395     FALSE 0.319 95.000 0.000 NA   NA
 5719108 5719109 CLK_2395 CLK_2396   coaE TRUE 0.964 18.000 0.058 NA   NA
 5719109 5719110 CLK_2396 CLK_2397 coaE polA TRUE 0.974 12.000 0.068 1.000 N NA
 5719110 5719111 CLK_2397 CLK_2398 polA aroC TRUE 0.927 18.000 0.003 1.000 N NA
 5719111 5719112 CLK_2398 CLK_2399 aroC   FALSE 0.459 141.000 0.002 1.000 N NA
 5719112 5719113 CLK_2399 CLK_2400     TRUE 0.880 147.000 1.000 NA   NA
 5719113 5719114 CLK_2400 CLK_2401     TRUE 0.991 19.000 1.000 NA   NA
 5719114 5719115 CLK_2401 CLK_2402     TRUE 0.794 151.000 0.400 NA   NA
 5719115 5719116 CLK_2402 CLK_2403     FALSE 0.533 52.000 0.000 NA   NA
 5719116 5719117 CLK_2403 CLK_2404     TRUE 0.887 14.000 0.000 NA   NA
 5719117 5719118 CLK_2404 CLK_2405     TRUE 0.923 2.000 0.000 NA   NA
 5719118 5719119 CLK_2405 CLK_2406     FALSE 0.032 270.000 0.000 NA   NA
 5719119 5719120 CLK_2406 CLK_2407     TRUE 0.673 38.000 0.000 NA   NA
 5719120 5719121 CLK_2407 CLK_2408     TRUE 0.887 14.000 0.000 NA   NA
 5719121 5719122 CLK_2408 CLK_2409     TRUE 0.918 3.000 0.000 NA   NA
 5719122 5719123 CLK_2409 CLK_2410     FALSE 0.323 91.000 0.000 NA   NA
 5719123 5719124 CLK_2410 CLK_2411     TRUE 0.990 12.000 0.500 NA   NA
 5719124 5719125 CLK_2411 CLK_2412     TRUE 0.898 12.000 0.000 NA   NA
 5719125 5719126 CLK_2412 CLK_2413     TRUE 0.910 6.000 0.000 NA   NA
 5719126 5719127 CLK_2413 CLK_2414     TRUE 0.990 15.000 0.600 NA   NA
 5719127 5719128 CLK_2414 CLK_2415     TRUE 0.984 23.000 0.600 NA   NA
 5719128 5719129 CLK_2415 CLK_2416     TRUE 0.993 2.000 0.500 NA   NA
 5719129 5719130 CLK_2416 CLK_2417     TRUE 0.988 15.000 0.500 NA   NA
 5719130 5719131 CLK_2417 CLK_2418     TRUE 0.991 13.000 0.600 NA   NA
 5719131 5719132 CLK_2418 CLK_2419     TRUE 0.994 -13.000 0.400 NA   NA
 5719132 5719133 CLK_2419 CLK_2420     TRUE 0.893 13.000 0.000 NA   NA
 5719133 5719134 CLK_2420 CLK_2421     FALSE 0.295 147.000 0.000 NA   NA
 5719134 5719135 CLK_2421 CLK_2422     TRUE 0.995 -22.000 0.500 NA   NA
 5719135 5719136 CLK_2422 CLK_2423     TRUE 0.991 15.000 0.750 NA   NA
 5719136 5719137 CLK_2423 CLK_2424     TRUE 0.994 5.000 0.750 NA   NA
 5719137 5719138 CLK_2424 CLK_2425     TRUE 0.993 6.000 0.750 NA   NA
 5719138 5719139 CLK_2425 CLK_2426     TRUE 0.994 5.000 0.750 NA   NA
 5719139 5719140 CLK_2426 CLK_2427     TRUE 0.993 0.000 0.500 NA   NA
 5719140 5719141 CLK_2427 CLK_2428     TRUE 0.910 6.000 0.000 NA   NA
 5719141 5719142 CLK_2428 CLK_2429     FALSE 0.163 182.000 0.000 NA   NA
 5719142 5719143 CLK_2429 CLK_2430     FALSE 0.533 52.000 0.000 NA   NA
 5719143 5719144 CLK_2430 CLK_2431     TRUE 0.842 119.000 0.400 NA   NA
 5719144 5719145 CLK_2431 CLK_2432     TRUE 0.943 57.000 1.000 NA   NA
 5719145 5719146 CLK_2432 CLK_2433     TRUE 0.997 -37.000 1.000 NA   NA
 5719146 5719147 CLK_2433 CLK_2434     TRUE 0.864 94.000 0.667 NA   NA
 5719147 5719148 CLK_2434 CLK_2435     TRUE 0.949 52.000 0.667 0.020   NA
 5719149 5719150 CLK_2436 CLK_2437     FALSE 0.019 300.000 0.000 NA   NA
 5719152 5719153 CLK_2439 CLK_2440     TRUE 0.982 13.000 0.200 NA   NA
 5719154 5719155 CLK_2441 CLK_2442     TRUE 0.760 185.000 1.000 NA   NA
 5719155 5719156 CLK_2442 CLK_2443     FALSE 0.049 239.000 0.000 NA   NA
 5719156 5719157 CLK_2443 CLK_2444     TRUE 0.902 57.000 0.400 NA   NA
 5719157 5719158 CLK_2444 CLK_2445     TRUE 0.801 141.000 0.333 NA   NA
 5719160 5719161 CLK_2447 CLK_2448 aspS hisS TRUE 0.968 41.000 0.028 0.029 Y NA
 5719161 5719162 CLK_2448 CLK_2449 hisS   TRUE 0.969 19.000 0.111 1.000 N NA
 5719162 5719163 CLK_2449 CLK_2450     TRUE 0.881 38.000 0.035 1.000   NA
 5719163 5719164 CLK_2450 CLK_2451   dtd TRUE 0.755 61.000 0.048 1.000   NA
 5719164 5719165 CLK_2451 CLK_2452 dtd relA TRUE 0.907 43.000 0.177 1.000 N NA
 5719165 5719166 CLK_2452 CLK_2453 relA apt TRUE 0.683 125.000 0.068 1.000 N NA
 5719166 5719167 CLK_2453 CLK_2454 apt   TRUE 0.558 109.000 0.010 1.000   NA
 5719167 5719168 CLK_2454 CLK_2455   secF FALSE 0.167 229.000 0.028 1.000   NA
 5719168 5719169 CLK_2455 CLK_2456 secF secD TRUE 0.998 2.000 0.516 0.001 Y NA
 5719169 5719170 CLK_2456 CLK_2457 secD   TRUE 0.651 94.000 0.048 1.000   NA
 5719170 5719171 CLK_2457 CLK_2458     TRUE 0.804 157.000 0.540 NA   NA
 5719171 5719172 CLK_2458 CLK_2459     TRUE 0.769 90.000 0.212 NA   NA
 5719172 5719173 CLK_2459 CLK_2460   yajC TRUE 0.806 55.000 0.055 NA   NA
 5719173 5719174 CLK_2460 CLK_2461 yajC tgt FALSE 0.388 181.000 0.035 NA N NA
 5719174 5719175 CLK_2461 CLK_2462 tgt queA TRUE 0.941 56.000 0.014 0.001 Y NA
 5719175 5719176 CLK_2462 CLK_2463 queA ruvB TRUE 0.920 34.000 0.069 1.000 N NA
 5719176 5719177 CLK_2463 CLK_2464 ruvB ruvA TRUE 0.997 20.000 0.549 0.002 Y NA
 5719177 5719178 CLK_2464 CLK_2465 ruvA   FALSE 0.300 182.000 0.007 NA   NA
 5719178 5719179 CLK_2465 CLK_2466     FALSE 0.006 698.000 0.003 NA   NA
 5719179 5719180 CLK_2466 CLK_2467     TRUE 0.543 139.000 0.015 NA   NA
 5719180 5719181 CLK_2467 CLK_2468     TRUE 0.887 16.000 0.000 1.000   NA
 5719181 5719182 CLK_2468 CLK_2469     FALSE 0.351 87.000 0.000 1.000   NA
 5719182 5719183 CLK_2469 CLK_2470     FALSE 0.136 287.000 0.176 1.000   NA
 5719183 5719184 CLK_2470 CLK_2471     TRUE 0.636 150.000 0.071 NA   NA
 5719184 5719185 CLK_2471 CLK_2472     FALSE 0.467 176.000 0.051 NA   NA
 5719185 5719186 CLK_2472 CLK_2473     FALSE 0.510 130.000 0.002 1.000   NA
 5719190 5719191 CLK_2477 CLK_2478     TRUE 0.985 17.000 0.386 NA   NA
 5719191 5719192 CLK_2478 CLK_2479     TRUE 0.979 23.000 0.386 NA   NA
 5719192 5719193 CLK_2479 CLK_2480   sigF FALSE 0.331 206.000 0.078 NA   NA
 5719193 5719194 CLK_2480 CLK_2481 sigF spoIIAB TRUE 0.990 19.000 0.842 1.000 N NA
 5719194 5719195 CLK_2481 CLK_2482 spoIIAB spoIIAA TRUE 0.998 17.000 0.669 0.001 Y NA
 5719199 5719200 CLK_2486 CLK_2487     FALSE 0.163 326.000 0.024 NA Y NA
 5719200 5719201 CLK_2487 CLK_2488     TRUE 0.961 21.000 0.079 NA   NA
 5719201 5719202 CLK_2488 CLK_2489   mviN FALSE 0.036 394.000 0.053 0.003   NA
 5719202 5719203 CLK_2489 CLK_2490 mviN   TRUE 0.966 19.000 0.075 1.000   NA
 5719203 5719204 CLK_2490 CLK_2491     TRUE 0.826 91.000 0.000 0.013 Y NA
 5719204 5719205 CLK_2491 CLK_2492     TRUE 0.815 115.000 0.000 NA Y NA
 5719205 5719206 CLK_2492 CLK_2493     TRUE 0.877 78.000 0.016 NA Y NA
 5719206 5719207 CLK_2493 CLK_2494     TRUE 0.993 19.000 0.146 1.000 Y NA
 5719207 5719208 CLK_2494 CLK_2495     TRUE 0.996 0.000 0.077 1.000 Y NA
 5719208 5719209 CLK_2495 CLK_2496     TRUE 0.974 23.000 0.176 0.013   NA
 5719209 5719210 CLK_2496 CLK_2497     TRUE 0.993 -10.000 0.375 NA   NA
 5719210 5719211 CLK_2497 CLK_2498     TRUE 0.882 15.000 0.000 NA   NA
 5719211 5719212 CLK_2498 CLK_2499     TRUE 0.704 37.000 0.000 1.000   NA
 5719212 5719213 CLK_2499 CLK_2500     TRUE 0.780 31.000 0.000 1.000   NA
 5719213 5719214 CLK_2500 CLK_2501     FALSE 0.344 100.000 0.000 1.000   NA
 5719214 5719215 CLK_2501 CLK_2502     TRUE 0.839 63.000 0.154 0.035   NA
 5719215 5719216 CLK_2502 CLK_2503     TRUE 0.890 130.000 0.035 1.000 Y NA
 5719216 5719217 CLK_2503 CLK_2504     TRUE 0.769 181.000 0.037 1.000 Y NA
 5719217 5719218 CLK_2504 CLK_2505     TRUE 0.939 180.000 1.000 0.002 Y NA
 5719218 5719219 CLK_2505 CLK_2506     FALSE 0.193 190.000 0.000 0.003 N NA
 5719219 5719220 CLK_2506 CLK_2507   galU FALSE 0.310 99.000 0.000 1.000 N NA
 5719220 5719221 CLK_2507 CLK_2508 galU   TRUE 0.936 50.000 0.500 1.000   NA
 5719221 5719222 CLK_2508 CLK_2509     TRUE 0.821 145.000 0.417 1.000   NA
 5719222 5719223 CLK_2509 CLK_2510     FALSE 0.006 631.000 0.002 1.000 N NA
 5719225 5719226 CLK_2512 CLK_2513     FALSE 0.008 386.000 0.000 NA   NA
 5719226 5719227 CLK_2513 CLK_2514     FALSE 0.026 607.000 0.000 1.000 Y NA
 5719227 5719228 CLK_2514 CLK_2515     FALSE 0.051 236.000 0.000 NA   NA
 5719228 5719229 CLK_2515 CLK_2516     FALSE 0.353 188.000 0.031 NA   NA
 5719229 5719230 CLK_2516 CLK_2517     FALSE 0.138 264.000 0.078 1.000 N NA
 5719230 5719231 CLK_2517 CLK_2518     FALSE 0.003 724.000 0.000 NA   NA
 5719233 5719234 CLK_2520 CLK_2521     FALSE 0.003 799.000 0.000 NA   NA
 5719234 5719235 CLK_2521 CLK_2522   pheT FALSE 0.282 205.000 0.038 NA   NA
 5719235 5719236 CLK_2522 CLK_2523 pheT pheS TRUE 0.946 161.000 0.574 0.001 Y NA
 5719236 5719237 CLK_2523 CLK_2524 pheS   FALSE 0.117 347.000 0.006 1.000 Y NA
 5719237 5719238 CLK_2524 CLK_2525     TRUE 0.588 109.000 0.022 1.000 N NA
 5719238 5719239 CLK_2525 CLK_2526     TRUE 0.996 11.000 0.137 0.003 Y NA
 5719239 5719240 CLK_2526 CLK_2527   rplT FALSE 0.508 124.000 0.004 1.000 N NA
 5719240 5719241 CLK_2527 CLK_2528 rplT rpmI TRUE 0.996 30.000 0.928 0.012 Y NA
 5719241 5719242 CLK_2528 CLK_2529 rpmI infC TRUE 0.996 22.000 0.652 1.000 Y NA
 5719242 5719243 CLK_2529 CLK_2530 infC thrS FALSE 0.345 255.000 0.007 1.000 Y NA
 5719243 5719244 CLK_2530 CLK_2531 thrS   FALSE 0.011 348.000 0.000 NA   NA
 5719246 5719247 CLK_2533 CLK_2534     TRUE 0.995 2.000 0.952 NA   NA
 5719247 5719248 CLK_2534 CLK_3906     FALSE 0.015 315.000 0.000 NA   NA
 5719248 5719249 CLK_3906 CLK_3907     TRUE 0.903 10.000 0.000 NA   NA
 5719249 5719250 CLK_3907 CLK_3908     TRUE 0.915 4.000 0.000 NA   NA
 5719250 5719251 CLK_3908 CLK_3909     TRUE 0.923 2.000 0.000 NA   NA
 5719251 5719252 CLK_3909 CLK_3910     TRUE 0.912 5.000 0.000 NA   NA
 5719252 5719253 CLK_3910 CLK_2540   hsp33 FALSE 0.404 65.000 0.000 NA   NA
 5719253 5719254 CLK_2540 CLK_2541 hsp33   TRUE 0.900 38.000 0.063 1.000   NA
 5719254 5719255 CLK_2541 CLK_2542     TRUE 0.678 86.000 0.056 1.000   NA
 5719255 5719256 CLK_2542 CLK_2543     FALSE 0.017 311.000 0.000 1.000   NA
 5719256 5719257 CLK_2543 CLK_2544     TRUE 0.998 0.000 0.444 0.001 Y NA
 5719257 5719258 CLK_2544 CLK_2545     TRUE 0.997 15.000 0.571 1.000 Y NA
 5719258 5719259 CLK_2545 CLK_2546     TRUE 0.995 16.000 0.124 0.026 Y NA
 5719259 5719260 CLK_2546 CLK_2547     TRUE 0.926 81.000 0.093 0.026 Y NA
 5719261 5719262 CLK_2548 CLK_2549 asd dapA TRUE 0.987 23.000 0.029 1.000 Y NA
 5719262 5719263 CLK_2549 CLK_2550 dapA dapB FALSE 0.465 230.000 0.022 1.000 Y NA
 5719266 5719267 CLK_2553 CLK_2554     TRUE 0.702 78.000 0.071 NA   NA
 5719267 5719268 CLK_2554 CLK_2555     FALSE 0.308 199.000 0.034 NA   NA
 5719272 5719273 CLK_2559 CLK_2560 folC valS FALSE 0.011 427.000 0.006 1.000 N NA
 5719273 5719274 CLK_2560 CLK_2561 valS   TRUE 0.984 21.000 0.002 1.000 Y NA
 5719274 5719275 CLK_2561 CLK_2562     FALSE 0.011 345.000 0.000 NA   NA
 5719275 5719276 CLK_2562 CLK_2563     FALSE 0.267 155.000 0.000 NA   NA
 5719276 5719277 CLK_2563 CLK_2564     TRUE 0.995 3.000 1.000 1.000   NA
 5719277 5719278 CLK_2564 CLK_2565     FALSE 0.003 834.000 0.000 1.000   NA
 5719278 5719279 CLK_2565 CLK_2566     TRUE 0.872 16.000 0.000 1.000 N NA
 5719282 5719283 CLK_2569 CLK_2570     TRUE 0.999 -3.000 0.876 1.000 Y NA
 5719283 5719284 CLK_2570 CLK_2571     TRUE 0.604 145.000 0.034 1.000   NA
 5719285 5719286 CLK_2572 CLK_2573   recX TRUE 0.915 25.000 0.012 NA   NA
 5719286 5719287 CLK_2573 CLK_2574 recX   TRUE 0.932 22.000 0.015 1.000   NA
 5719288 5719289 CLK_2575 CLK_2576     TRUE 0.867 38.000 0.029 NA   NA
 5719289 5719290 CLK_2576 CLK_2577     TRUE 0.746 58.000 0.029 1.000   NA
 5719291 5719292 CLK_2578 CLK_2579     TRUE 0.795 42.000 0.011 NA   NA
 5719292 5719293 CLK_2579 CLK_2580   proC TRUE 0.543 129.000 0.011 NA   NA
 5719293 5719294 CLK_2580 CLK_2581 proC   TRUE 0.809 111.000 0.286 1.000 N NA
 5719294 5719295 CLK_2581 CLK_2582     TRUE 0.993 7.000 0.583 0.003 N NA
 5719295 5719296 CLK_2582 CLK_2583     TRUE 0.885 51.000 0.167 1.000   NA
 5719296 5719297 CLK_2583 CLK_2584     FALSE 0.003 644.000 0.000 1.000   NA
 5719297 5719298 CLK_2584 CLK_2585     TRUE 0.809 37.000 0.002 NA   NA
 5719298 5719299 CLK_2585 CLK_2586     TRUE 0.983 12.000 0.182 NA   NA
 5719299 5719300 CLK_2586 CLK_2587     TRUE 0.969 23.000 0.182 NA   NA
 5719301 5719302 CLK_2588 CLK_2589     FALSE 0.387 68.000 0.000 NA   NA
 5719304 5719305 CLK_2591 CLK_2592     TRUE 0.993 3.000 0.583 NA   NA
 5719305 5719306 CLK_2592 CLK_2593     TRUE 0.995 -19.000 0.600 NA   NA
 5719307 5719308 CLK_2594 CLK_2595     FALSE 0.009 356.000 0.000 1.000 N NA
 5719308 5719309 CLK_2595 CLK_2596     TRUE 0.998 13.000 0.714 0.009 Y NA
 5719309 5719310 CLK_2596 CLK_2597   bcd TRUE 0.989 12.000 0.364 0.035 N NA
 5719310 5719311 CLK_2597 CLK_2598 bcd   TRUE 0.866 193.000 0.500 1.000 Y NA
 5719311 5719312 CLK_2598 CLK_2599   hbd TRUE 0.988 25.000 0.054 1.000 Y NA
 5719312 5719313 CLK_2599 CLK_2600 hbd crt TRUE 0.992 31.000 0.486 1.000 Y NA
 5719313 5719314 CLK_2600 CLK_2601 crt   FALSE 0.006 415.000 0.000 NA   NA
 5719314 5719315 CLK_2601 CLK_2602     TRUE 0.901 44.000 0.154 NA   NA
 5719315 5719316 CLK_2602 CLK_2603     FALSE 0.031 276.000 0.000 1.000   NA
 5719316 5719317 CLK_2603 CLK_2604     FALSE 0.007 402.000 0.000 1.000   NA
 5719317 5719318 CLK_2604 CLK_2605     TRUE 0.763 69.000 0.100 1.000   NA
 5719318 5719319 CLK_2605 CLK_2606   lgt FALSE 0.003 842.000 0.000 1.000   NA
 5719319 5719320 CLK_2606 CLK_2607 lgt   FALSE 0.102 208.000 0.000 1.000   NA
 5719320 5719321 CLK_2607 CLK_2608     TRUE 0.792 43.000 0.012 NA   NA
 5719323 5719324 CLK_2610 CLK_2611     FALSE 0.388 196.000 0.080 1.000 N NA
 5719324 5719325 CLK_2611 CLK_2612   pflA FALSE 0.003 619.000 0.000 1.000 N NA
 5719325 5719326 CLK_2612 CLK_2613 pflA pfl TRUE 0.554 180.000 0.163 1.000 N NA
 5719326 5719327 CLK_2613 CLK_2614 pfl   FALSE 0.004 513.000 0.000 NA   NA
 5719327 5719328 CLK_2614 CLK_2615     FALSE 0.127 195.000 0.000 NA   NA
 5719328 5719329 CLK_2615 CLK_2616     FALSE 0.354 167.000 0.002 NA   NA
 5719333 5719334 CLK_2620 CLK_2621     FALSE 0.081 215.000 0.000 NA   NA
 5719334 5719335 CLK_2621 CLK_2622     FALSE 0.507 55.000 0.000 NA   NA
 5719335 5719336 CLK_2622 CLK_2623     FALSE 0.533 52.000 0.000 NA   NA
 5719336 5719337 CLK_2623 CLK_2624     FALSE 0.074 219.000 0.000 NA   NA
 5719337 5719338 CLK_2624 CLK_2625     TRUE 0.908 24.000 0.005 NA   NA
 5719338 5719339 CLK_2625 CLK_2626   lon TRUE 0.968 15.000 0.048 1.000   NA
 5719339 5719340 CLK_2626 CLK_2627 lon lonB TRUE 0.918 138.000 0.072 0.001 Y NA
 5719340 5719341 CLK_2627 CLK_2628 lonB clpX TRUE 0.912 128.000 0.042 0.002 Y NA
 5719341 5719342 CLK_2628 CLK_2629 clpX clpP TRUE 0.988 20.000 0.022 1.000 Y NA
 5719342 5719343 CLK_2629 CLK_2630 clpP tig TRUE 0.882 126.000 0.024 1.000 Y NA
 5719343 5719344 CLK_2630 CLK_2631 tig   FALSE 0.296 178.000 0.005 NA N NA
 5719344 5719345 CLK_2631 CLK_2632     TRUE 0.783 111.000 0.211 NA   NA
 5719345 5719346 CLK_2632 CLK_2633   pyrE FALSE 0.081 215.000 0.000 NA   NA
 5719346 5719347 CLK_2633 CLK_2634 pyrE pyrD TRUE 0.981 34.000 0.060 1.000 Y NA
 5719347 5719348 CLK_2634 CLK_2635 pyrD pyrK TRUE 0.994 0.000 0.592 1.000 N NA
 5719348 5719349 CLK_2635 CLK_2636 pyrK pyrF TRUE 0.736 145.000 0.112 0.002 N NA
 5719349 5719350 CLK_2636 CLK_2637 pyrF pyrC TRUE 0.989 23.000 0.064 1.000 Y NA
 5719350 5719351 CLK_2637 CLK_2638 pyrC pyrI TRUE 0.988 22.000 0.032 1.000 Y NA
 5719351 5719352 CLK_2638 CLK_2639 pyrI pyrB TRUE 0.997 2.000 0.197 0.002 Y NA
 5719352 5719353 CLK_2639 CLK_2640 pyrB   FALSE 0.035 255.000 0.000 NA N NA
 5719353 5719354 CLK_2640 CLK_2641     TRUE 0.945 23.000 0.039 NA   NA
 5719354 5719355 CLK_2641 CLK_2642     FALSE 0.013 328.000 0.000 NA   NA
 5719355 5719356 CLK_2642 CLK_2643     TRUE 0.892 129.000 0.041 NA Y NA
 5719356 5719357 CLK_2643 CLK_2644     TRUE 0.678 112.000 0.053 NA   NA
 5719357 5719358 CLK_2644 CLK_2645     TRUE 0.878 46.000 0.105 NA   NA
 5719358 5719359 CLK_2645 CLK_2646     TRUE 0.987 0.000 0.135 NA   NA
 5719359 5719360 CLK_2646 CLK_2647     TRUE 0.924 40.000 0.200 NA   NA
 5719360 5719361 CLK_2647 CLK_2648     TRUE 0.909 48.000 0.240 NA   NA
 5719361 5719362 CLK_2648 CLK_2649     TRUE 0.929 52.000 0.500 NA   NA
 5719362 5719363 CLK_2649 CLK_2650     TRUE 0.983 7.000 0.158 NA   NA
 5719363 5719364 CLK_2650 CLK_2651     TRUE 0.981 18.000 0.263 NA   NA
 5719364 5719365 CLK_2651 CLK_2652     TRUE 0.967 16.000 0.056 NA   NA
 5719365 5719366 CLK_2652 CLK_2653     TRUE 0.984 0.000 0.078 NA   NA
 5719366 5719367 CLK_2653 CLK_2654     FALSE 0.262 156.000 0.000 NA   NA
 5719367 5719368 CLK_2654 CLK_3912     FALSE 0.272 154.000 0.000 NA   NA
 5719368 5719369 CLK_3912 CLK_3913     TRUE 0.807 26.000 0.000 NA   NA
 5719369 5719370 CLK_3913 CLK_3914     TRUE 0.784 29.000 0.000 NA   NA
 5719370 5719371 CLK_3914 CLK_3915     TRUE 0.807 26.000 0.000 NA   NA
 5719371 5719372 CLK_3915 CLK_3916     TRUE 0.912 5.000 0.000 NA   NA
 5719372 5719373 CLK_3916 CLK_3917     TRUE 0.910 6.000 0.000 NA   NA
 5719373 5719374 CLK_3917 CLK_3918     TRUE 0.905 9.000 0.000 NA   NA
 5719374 5719375 CLK_3918 CLK_3919     FALSE 0.361 74.000 0.000 NA   NA
 5719375 5719376 CLK_3919 CLK_3920     TRUE 0.887 14.000 0.000 NA   NA
 5719376 5719377 CLK_3920 CLK_3921     TRUE 0.923 2.000 0.000 NA   NA
 5719377 5719378 CLK_3921 CLK_3922     TRUE 0.918 3.000 0.000 NA   NA
 5719378 5719379 CLK_3922 CLK_3923     TRUE 0.882 15.000 0.000 NA   NA
 5719379 5719380 CLK_3923 CLK_3924     TRUE 0.912 5.000 0.000 NA   NA
 5719380 5719381 CLK_3924 CLK_3925     TRUE 0.910 6.000 0.000 NA   NA
 5719381 5719382 CLK_3925 CLK_3926     TRUE 0.905 9.000 0.000 NA   NA
 5719382 5719383 CLK_3926 CLK_3927     FALSE 0.361 74.000 0.000 NA   NA
 5719383 5719384 CLK_3927 CLK_3928     TRUE 0.887 14.000 0.000 NA   NA
 5719384 5719385 CLK_3928 CLK_3929     TRUE 0.923 2.000 0.000 NA   NA
 5719385 5719386 CLK_3929 CLK_3930     TRUE 0.918 3.000 0.000 NA   NA
 5719386 5719387 CLK_3930 CLK_3931     TRUE 0.910 6.000 0.000 NA   NA
 5719387 5719388 CLK_3931 CLK_3932     TRUE 0.910 6.000 0.000 NA   NA
 5719388 5719389 CLK_3932 CLK_3933     TRUE 0.908 7.000 0.000 NA   NA
 5719389 5719390 CLK_3933 CLK_2677     FALSE 0.302 145.000 0.000 NA   NA
 5719390 5719391 CLK_2677 CLK_2678     TRUE 0.970 18.000 0.085 1.000   NA
 5719392 5719393 CLK_2679 CLK_2680     TRUE 0.818 113.000 0.300 NA   NA
 5719394 5719395 CLK_2681 CLK_2682   gatB FALSE 0.412 154.000 0.002 1.000 N NA
 5719395 5719396 CLK_2682 CLK_2683 gatB gatA TRUE 0.991 37.000 0.492 0.001 Y NA
 5719396 5719397 CLK_2683 CLK_2684 gatA gatC TRUE 0.992 37.000 0.643 0.001 Y NA
 5719397 5719398 CLK_2684 CLK_2685 gatC   FALSE 0.478 136.000 0.002 1.000 N NA
 5719398 5719399 CLK_2685 CLK_2686     FALSE 0.008 375.000 0.000 NA   NA
 5719399 5719400 CLK_2686 CLK_2687   ligA TRUE 0.757 101.000 0.182 NA   NA
 5719400 5719401 CLK_2687 CLK_2688 ligA pcrA TRUE 0.994 12.000 0.039 0.012 Y NA
 5719401 5719402 CLK_2688 CLK_2689 pcrA   TRUE 0.612 127.000 0.025 1.000   NA
 5719402 5719403 CLK_2689 CLK_2690     FALSE 0.021 298.000 0.000 1.000   NA
 5719403 5719404 CLK_2690 CLK_2691     TRUE 0.647 84.000 0.041 NA   NA
 5719404 5719405 CLK_2691 CLK_2692     TRUE 0.796 59.000 0.083 NA   NA
 5719407 5719408 CLK_2694 CLK_2695   pgi TRUE 0.961 11.000 0.018 NA   NA
 5719408 5719409 CLK_2695 CLK_2696 pgi   FALSE 0.335 84.000 0.000 NA   NA
 5719409 5719410 CLK_2696 CLK_2697     FALSE 0.016 310.000 0.000 NA   NA
 5719411 5719412 CLK_2698 CLK_2699   ldhA FALSE 0.005 544.000 0.000 0.046 N NA
 5719413 5719414 CLK_2700 CLK_2701 ldhA   FALSE 0.002 1082.000 0.000 NA   NA
 5719414 5719415 CLK_2701 CLK_2702     FALSE 0.078 217.000 0.000 NA   NA
 5719415 5719416 CLK_2702 CLK_2703     TRUE 0.997 18.000 0.400 0.009 Y NA
 5719416 5719417 CLK_2703 CLK_2704     TRUE 0.993 13.000 0.800 0.034 N NA
 5719417 5719418 CLK_2704 CLK_2705   fldC TRUE 0.720 167.000 0.400 NA N NA
 5719418 5719419 CLK_2705 CLK_2706 fldC fldB TRUE 0.998 2.000 0.500 NA Y NA
 5719419 5719420 CLK_2706 CLK_2707 fldB fldI TRUE 0.994 5.000 0.875 NA N NA
 5719420 5719421 CLK_2707 CLK_2708 fldI fldA TRUE 0.992 0.000 0.429 NA N NA
 5719421 5719422 CLK_2708 CLK_2709 fldA   TRUE 0.931 54.000 0.500 0.046 N NA
 5719422 5719423 CLK_2709 CLK_2710   brnQ FALSE 0.004 466.000 0.000 1.000 N NA
 5719423 5719424 CLK_2710 CLK_2711 brnQ guaA FALSE 0.005 455.000 0.000 1.000 N NA
 5719424 5719425 CLK_2711 CLK_2712 guaA guaB TRUE 0.996 13.000 0.190 0.001 Y NA
 5719427 5719428 CLK_2714 CLK_2715 groL groES TRUE 0.994 30.000 0.674 1.000 Y NA
 5719430 5719431 CLK_2716 CLK_2718     FALSE 0.017 306.000 0.000 NA   NA
 5719431 5719432 CLK_2718 CLK_2719     FALSE 0.425 173.000 0.024 1.000   NA
 5719432 5719433 CLK_2719 CLK_2720   gltA FALSE 0.505 151.000 0.018 1.000 N NA
 5719433 5719434 CLK_2720 CLK_2721 gltA   TRUE 0.995 0.000 0.667 0.034 N NA
 5719434 5719435 CLK_2721 CLK_2722     FALSE 0.061 231.000 0.000 1.000   NA
 5719437 5719438 CLK_2724 CLK_2725     TRUE 0.998 1.000 0.444 0.016 Y NA
 5719440 5719441 CLK_2727 CLK_2728   pyc FALSE 0.009 381.000 0.000 1.000   NA
 5719441 5719442 CLK_2728 CLK_2729 pyc   FALSE 0.005 460.000 0.000 1.000 N NA
 5719444 5719445 CLK_2731 CLK_3935     FALSE 0.047 241.000 0.000 NA   NA
 5719445 5719446 CLK_3935 CLK_2733     TRUE 0.543 51.000 0.000 NA   NA
 5719446 5719447 CLK_2733 CLK_2734     TRUE 0.730 63.000 0.047 NA   NA
 5719447 5719448 CLK_2734 CLK_2735     TRUE 0.963 16.000 0.041 NA   NA
 5719449 5719450 CLK_2736 CLK_2737     FALSE 0.511 138.000 0.007 NA   NA
 5719450 5719451 CLK_2737 CLK_2738     TRUE 0.990 -3.000 0.217 NA   NA
 5719451 5719452 CLK_2738 CLK_2739   rimI TRUE 0.989 -7.000 0.127 1.000   NA
 5719453 5719454 CLK_2740 CLK_2741 tyrS   FALSE 0.053 233.000 0.000 NA   NA
 5719454 5719455 CLK_2741 CLK_2742     TRUE 0.669 136.000 0.062 NA   NA
 5719455 5719456 CLK_2742 CLK_2743     TRUE 0.553 148.000 0.025 NA   NA
 5719456 5719457 CLK_2743 CLK_2744     FALSE 0.343 81.000 0.000 NA   NA
 5719461 5719462 CLK_2748 CLK_2749 trpS   FALSE 0.176 179.000 0.000 NA   NA
 5719462 5719463 CLK_2749 CLK_2750     FALSE 0.006 408.000 0.000 NA   NA
 5719465 5719466 CLK_2752 CLK_2753 cgs lysA FALSE 0.066 265.000 0.003 1.000 N NA
 5719466 5719467 CLK_2753 CLK_2754 lysA lysC TRUE 0.974 34.000 0.016 1.000 Y NA
 5719467 5719468 CLK_2754 CLK_2755 lysC   FALSE 0.057 396.000 0.000 1.000 Y NA
 5719469 5719470 CLK_2756 CLK_2757     TRUE 0.683 137.000 0.069 1.000   NA
 5719471 5719472 CLK_2758 CLK_2759   ftsH TRUE 0.986 21.000 0.583 1.000   NA
 5719472 5719473 CLK_2759 CLK_2760 ftsH   FALSE 0.005 558.000 0.000 0.011 N NA
 5719473 5719474 CLK_2760 CLK_2761   proS FALSE 0.106 202.000 0.000 1.000 N NA
 5719474 5719475 CLK_2761 CLK_2762 proS   FALSE 0.005 424.000 0.000 1.000 N NA
 5719475 5719476 CLK_2762 CLK_2763     FALSE 0.005 438.000 0.000 1.000 N NA
 5719476 5719477 CLK_2763 CLK_2764     FALSE 0.079 214.000 0.000 1.000 N NA
 5719477 5719478 CLK_2764 CLK_2765     TRUE 0.999 -16.000 1.000 0.016 Y NA
 5719478 5719479 CLK_2765 CLK_2766     TRUE 0.779 170.000 0.667 NA   NA
 5719479 5719480 CLK_2766 CLK_2767     TRUE 0.993 5.000 0.667 NA   NA
 5719482 5719483 CLK_2769 CLK_2770     FALSE 0.011 349.000 0.000 NA   NA
 5719483 5719484 CLK_2770 CLK_2771     FALSE 0.142 308.000 0.400 NA   NA
 5719484 5719485 CLK_2771 CLK_2772     TRUE 0.967 60.000 0.400 NA Y NA
 5719485 5719486 CLK_2772 CLK_2773     FALSE 0.331 242.000 0.000 0.007 Y NA
 5719486 5719487 CLK_2773 CLK_2774     TRUE 0.865 120.000 0.429 0.009 N NA
 5719487 5719488 CLK_2774 CLK_2775     TRUE 0.730 124.000 0.071 0.009 N NA
 5719488 5719489 CLK_2775 CLK_2776     TRUE 0.911 81.000 0.071 1.000 Y NA
 5719489 5719490 CLK_2776 CLK_2777     FALSE 0.009 356.000 0.000 1.000 N NA
 5719492 5719493 CLK_2779 CLK_2780 speD   FALSE 0.272 154.000 0.000 NA   NA
 5719493 5719494 CLK_2780 CLK_2781     FALSE 0.004 522.000 0.000 NA   NA
 5719494 5719495 CLK_2781 CLK_2782     FALSE 0.003 728.000 0.000 NA   NA
 5719496 5719497 CLK_2783 CLK_2785     FALSE 0.002 1377.000 0.000 NA   NA
 5719498 5719499 CLK_2784 CLK_2787     FALSE 0.351 115.000 0.000 NA   NA
 5719499 5719500 CLK_2787 CLK_2788     FALSE 0.019 300.000 0.000 NA   NA
 5719500 5719501 CLK_2788 CLK_2789     FALSE 0.006 419.000 0.000 NA   NA
 5719501 5719502 CLK_2789 CLK_2790     TRUE 0.577 47.000 0.000 NA   NA
 5719502 5719503 CLK_2790 CLK_2791     TRUE 0.945 -21.000 0.000 NA   NA
 5719503 5719504 CLK_2791 CLK_2792     FALSE 0.132 193.000 0.000 NA   NA
 5719504 5719505 CLK_2792 CLK_2793     FALSE 0.369 120.000 0.000 1.000   NA
 5719505 5719506 CLK_2793 CLK_2794     FALSE 0.274 150.000 0.000 1.000 N NA
 5719506 5719507 CLK_2794 CLK_2795     FALSE 0.003 536.000 0.000 1.000 N NA
 5719507 5719508 CLK_2795 CLK_2796   uvrA TRUE 0.930 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5719508 5719509 CLK_2796 CLK_2797 uvrA   TRUE 0.922 4.000 0.000 1.000   NA
 5719509 5719510 CLK_2797 CLK_2798     FALSE 0.009 366.000 0.000 NA   NA
 5719510 5719511 CLK_2798 CLK_2799     FALSE 0.104 204.000 0.000 NA   NA
 5719511 5719512 CLK_2799 CLK_2800     FALSE 0.078 220.000 0.000 1.000   NA
 5719512 5719513 CLK_2800 CLK_2801   rumA FALSE 0.006 426.000 0.000 1.000   NA
 5719513 5719514 CLK_2801 CLK_2802 rumA   FALSE 0.053 233.000 0.000 NA   NA
 5719514 5719515 CLK_2802 CLK_2803     FALSE 0.013 328.000 0.000 NA   NA
 5719515 5719516 CLK_2803 CLK_2804   pykA TRUE 0.654 143.000 0.057 1.000   NA
 5719516 5719517 CLK_2804 CLK_2805 pykA pfkA TRUE 0.978 34.000 0.015 0.002 Y NA
 5719517 5719518 CLK_2805 CLK_2806 pfkA dnaE FALSE 0.130 243.000 0.029 1.000 N NA
 5719518 5719519 CLK_2806 CLK_2807 dnaE   FALSE 0.433 163.000 0.010 1.000   NA
 5719519 5719520 CLK_2807 CLK_2808     TRUE 0.991 7.000 0.470 NA   NA
 5719520 5719521 CLK_2808 CLK_2809     TRUE 0.991 -3.000 0.259 NA   NA
 5719521 5719522 CLK_2809 CLK_2810   murB TRUE 0.709 120.000 0.080 NA   NA
 5719522 5719523 CLK_2810 CLK_2811 murB   TRUE 0.578 69.000 0.009 1.000 N NA
 5719523 5719524 CLK_2811 CLK_2812   uvrC TRUE 0.666 60.000 0.004 0.046 N NA
 5719524 5719525 CLK_2812 CLK_2813 uvrC   TRUE 0.943 14.000 0.005 NA   NA
 5719525 5719526 CLK_2813 CLK_2814     FALSE 0.317 187.000 0.017 NA   NA
 5719526 5719527 CLK_2814 CLK_2815     TRUE 0.940 28.000 0.053 1.000   NA
 5719527 5719528 CLK_2815 CLK_2816     TRUE 0.988 5.000 0.285 1.000 N NA
 5719528 5719529 CLK_2816 CLK_2817     TRUE 0.905 35.000 0.047 NA   NA
 5719529 5719530 CLK_2817 CLK_2818   uvrA FALSE 0.501 99.000 0.005 NA   NA
 5719530 5719531 CLK_2818 CLK_2819 uvrA uvrB TRUE 0.995 19.000 0.154 0.001 Y NA
 5719531 5719532 CLK_2819 CLK_2820 uvrB   TRUE 0.969 2.000 0.013 1.000   NA
 5719532 5719533 CLK_2820 CLK_2821     TRUE 0.722 89.000 0.060 0.007   NA
 5719533 5719534 CLK_2821 CLK_2822     FALSE 0.194 210.000 0.015 1.000 N NA
 5719534 5719535 CLK_2822 CLK_2823     TRUE 0.998 -10.000 0.431 1.000 Y NA
 5719535 5719536 CLK_2823 CLK_2824     FALSE 0.453 156.000 0.010 NA   NA
 5719536 5719537 CLK_2824 CLK_2825     TRUE 0.770 93.000 0.222 NA   NA
 5719537 5719538 CLK_2825 CLK_2826     FALSE 0.359 214.000 0.167 NA   NA
 5719538 5719539 CLK_2826 CLK_2827     TRUE 0.998 0.000 0.180 0.001 Y NA
 5719539 5719540 CLK_2827 CLK_2828     FALSE 0.091 263.000 0.019 1.000 N NA
 5719540 5719541 CLK_2828 CLK_2829     TRUE 0.984 -43.000 0.039 1.000 N NA
 5719541 5719542 CLK_2829 CLK_2830   alr TRUE 0.850 139.000 0.571 1.000 N NA
 5719542 5719543 CLK_2830 CLK_2831 alr   TRUE 0.986 28.000 0.068 NA Y NA
 5719543 5719544 CLK_2831 CLK_2832     FALSE 0.338 200.000 0.064 NA N NA
 5719544 5719545 CLK_2832 CLK_2833   acpS TRUE 0.973 -3.000 0.020 NA N NA
 5719545 5719546 CLK_2833 CLK_2834 acpS   TRUE 0.600 115.000 0.020 NA   NA
 5719546 5719547 CLK_2834 CLK_2835     FALSE 0.007 396.000 0.000 NA   NA
 5719547 5719548 CLK_2835 CLK_2836     FALSE 0.019 304.000 0.000 1.000   NA
 5719548 5719549 CLK_2836 CLK_2837     FALSE 0.242 161.000 0.000 NA   NA
 5719549 5719550 CLK_2837 CLK_2838   rpsD FALSE 0.498 109.000 0.002 NA   NA
 5719552 5719553 CLK_2840 CLK_2841     FALSE 0.338 83.000 0.000 NA   NA
 5719553 5719554 CLK_2841 CLK_2842     FALSE 0.022 293.000 0.000 NA   NA
 5719554 5719555 CLK_2842 CLK_2843     TRUE 0.996 -19.000 0.023 1.000 Y NA
 5719557 5719558 CLK_2845 CLK_2846     TRUE 0.982 9.000 0.133 NA   NA
 5719558 5719559 CLK_2846 CLK_2847     FALSE 0.005 459.000 0.000 NA   NA
 5719559 5719560 CLK_2847 CLK_2848     TRUE 0.990 -10.000 0.176 NA   NA
 5719560 5719561 CLK_2848 CLK_2849     FALSE 0.004 557.000 0.000 NA   NA
 5719561 5719562 CLK_2849 CLK_2850     FALSE 0.026 281.000 0.000 NA   NA
 5719562 5719563 CLK_2850 CLK_2851     FALSE 0.004 495.000 0.000 NA   NA
 5719563 5719564 CLK_2851 CLK_2852     FALSE 0.121 198.000 0.000 NA   NA
 5719564 5719565 CLK_2852 CLK_2853   glmS FALSE 0.042 260.000 0.000 1.000   NA
 5719565 5719566 CLK_2853 CLK_2854 glmS   FALSE 0.003 665.000 0.000 1.000 N NA
 5719566 5719567 CLK_2854 CLK_2855     TRUE 0.932 19.000 0.005 1.000   NA
 5719567 5719568 CLK_2855 CLK_2856   srlD TRUE 0.954 24.000 0.040 0.045   NA
 5719568 5719569 CLK_2856 CLK_2857 srlD   TRUE 0.963 20.000 0.080 1.000 N NA
 5719569 5719570 CLK_2857 CLK_2858     TRUE 0.886 166.000 0.133 0.007 Y NA
 5719570 5719571 CLK_2858 CLK_2859     TRUE 0.997 13.000 0.349 0.007 Y NA
 5719571 5719572 CLK_2859 CLK_2860   gutM TRUE 0.879 45.000 0.116 NA N NA
 5719572 5719573 CLK_2860 CLK_2861 gutM   TRUE 0.985 14.000 0.333 NA N NA
 5719573 5719574 CLK_2861 CLK_2862     TRUE 0.922 35.000 0.091 1.000 N NA
 5719574 5719575 CLK_2862 CLK_2863   glmM FALSE 0.009 356.000 0.000 1.000 N NA
 5719575 5719576 CLK_2863 CLK_2864 glmM   FALSE 0.490 135.000 0.004 1.000 N NA
 5719576 5719577 CLK_2864 CLK_2865     TRUE 0.999 2.000 0.797 0.001 Y NA
 5719577 5719578 CLK_2865 CLK_2866     TRUE 0.999 0.000 0.822 0.001 Y NA
 5719578 5719579 CLK_2866 CLK_2867     TRUE 0.977 16.000 0.075 0.001   NA
 5719579 5719580 CLK_2867 CLK_2868     TRUE 0.772 102.000 0.200 1.000   NA
 5719580 5719581 CLK_2868 CLK_2869   buk FALSE 0.192 263.000 0.163 1.000   NA
 5719581 5719582 CLK_2869 CLK_2870 buk ptb TRUE 0.991 29.000 0.275 1.000 Y NA
 5719582 5719583 CLK_2870 CLK_2871 ptb buk TRUE 0.997 -7.000 0.118 1.000 Y NA
 5719583 5719584 CLK_2871 CLK_2872 buk   FALSE 0.515 101.000 0.007 NA   NA
 5719584 5719585 CLK_2872 CLK_2873     TRUE 0.982 2.000 0.083 NA   NA
 5719585 5719586 CLK_2873 CLK_2874     TRUE 0.995 -30.000 0.502 NA   NA
 5719588 5719589 CLK_2876 CLK_2877   trx TRUE 0.877 66.000 0.429 1.000   NA
 5719589 5719590 CLK_2877 CLK_2878 trx iadA TRUE 0.619 109.000 0.025 1.000   NA
 5719590 5719591 CLK_2878 CLK_2879 iadA   TRUE 0.636 75.000 0.025 1.000   NA
 5719591 5719592 CLK_2879 CLK_2880     TRUE 0.971 28.000 0.333 NA   NA
 5719592 5719593 CLK_2880 CLK_2881   ptsI TRUE 0.683 105.000 0.069 NA   NA
 5719595 5719596 CLK_2883 CLK_2884     TRUE 0.582 70.000 0.006 1.000   NA
 5719596 5719597 CLK_2884 CLK_2885     TRUE 0.946 92.000 0.262 0.001 Y NA
 5719597 5719598 CLK_2885 CLK_2886     TRUE 0.575 141.000 0.026 1.000 N NA
 5719598 5719599 CLK_2886 CLK_2887     FALSE 0.037 260.000 0.000 1.000 N NA
 5719599 5719600 CLK_2887 CLK_2888   rpsI FALSE 0.016 306.000 0.000 1.000 N NA
 5719600 5719601 CLK_2888 CLK_2889 rpsI rplM TRUE 0.996 26.000 0.601 0.012 Y NA
 5719601 5719602 CLK_2889 CLK_2890 rplM truA TRUE 0.890 124.000 0.031 1.000 Y NA
 5719602 5719603 CLK_2890 CLK_2891 truA   TRUE 0.992 0.000 0.404 1.000 N NA
 5719603 5719604 CLK_2891 CLK_2892     TRUE 0.998 -3.000 0.304 1.000 Y NA
 5719604 5719605 CLK_2892 CLK_2893     TRUE 0.999 -15.000 0.713 0.024 Y NA
 5719605 5719606 CLK_2893 CLK_2894   rplQ TRUE 0.673 91.000 0.074 1.000 N NA
 5719606 5719607 CLK_2894 CLK_2895 rplQ rpoA TRUE 0.961 44.000 0.873 1.000 N NA
 5719607 5719608 CLK_2895 CLK_2896 rpoA rpsD TRUE 0.881 68.000 0.549 1.000 N NA
 5719608 5719609 CLK_2896 CLK_2897 rpsD rpsK TRUE 0.992 35.000 0.509 0.016 Y NA
 5719609 5719610 CLK_2897 CLK_2898 rpsK rpsM TRUE 0.998 18.000 0.810 0.012 Y NA
 5719610 5719611 CLK_2898 CLK_2899 rpsM rpmJ TRUE 0.814 113.000 0.194 0.012   NA
 5719611 5719612 CLK_2899 CLK_2900 rpmJ infA TRUE 0.982 17.000 0.257 1.000   NA
 5719612 5719613 CLK_2900 CLK_2901 infA   TRUE 0.979 8.000 0.090 NA   NA
 5719613 5719614 CLK_2901 CLK_2902   map TRUE 0.980 15.000 0.185 NA   NA
 5719614 5719615 CLK_2902 CLK_2903 map adk TRUE 0.991 0.000 0.290 1.000 N NA
 5719615 5719616 CLK_2903 CLK_2904 adk secY TRUE 0.972 24.000 0.241 1.000 N NA
 5719616 5719617 CLK_2904 CLK_2905 secY rplO TRUE 0.994 1.000 0.730 1.000 N NA
 5719617 5719618 CLK_2905 CLK_2906 rplO rpmD TRUE 0.997 20.000 0.653 0.002 Y NA
 5719618 5719619 CLK_2906 CLK_2907 rpmD rpsE TRUE 0.998 14.000 0.789 0.016 Y NA
 5719619 5719620 CLK_2907 CLK_2908 rpsE rplR TRUE 0.998 18.000 0.814 0.016 Y NA
 5719620 5719621 CLK_2908 CLK_2909 rplR rplF TRUE 0.998 19.000 0.815 0.012 Y NA
 5719621 5719622 CLK_2909 CLK_2910 rplF rpsH TRUE 0.997 24.000 0.808 0.012 Y NA
 5719622 5719623 CLK_2910 CLK_2911 rpsH rpsN TRUE 0.994 30.000 0.473 0.012 Y NA
 5719623 5719624 CLK_2911 CLK_2912 rpsN rplE TRUE 0.997 17.000 0.496 0.012 Y NA
 5719624 5719625 CLK_2912 CLK_2913 rplE rplX TRUE 0.991 23.000 0.057 0.012 Y NA
 5719625 5719626 CLK_2913 CLK_2914 rplX rplN TRUE 0.990 24.000 0.071 0.016 Y NA
 5719626 5719627 CLK_2914 CLK_2915 rplN rpsQ TRUE 0.994 35.000 0.791 0.016 Y NA
 5719627 5719628 CLK_2915 CLK_2916 rpsQ rpmC TRUE 0.997 22.000 0.828 0.012 Y NA
 5719628 5719629 CLK_2916 CLK_2917 rpmC rplP TRUE 0.999 -10.000 0.802 0.012 Y NA
 5719629 5719630 CLK_2917 CLK_2918 rplP rpsC TRUE 0.998 18.000 0.828 0.016 Y NA
 5719630 5719631 CLK_2918 CLK_2919 rpsC rplV TRUE 0.997 18.000 0.719 0.016 Y NA
 5719631 5719632 CLK_2919 CLK_2920 rplV rpsS TRUE 0.997 22.000 0.769 0.016 Y NA
 5719632 5719633 CLK_2920 CLK_2921 rpsS rplB TRUE 0.975 70.000 0.820 0.016 Y NA
 5719633 5719634 CLK_2921 CLK_2922 rplB rplW TRUE 0.986 55.000 0.849 0.016 Y NA
 5719634 5719635 CLK_2922 CLK_2923 rplW rplD TRUE 0.998 0.000 0.307 0.012 Y NA
 5719635 5719636 CLK_2923 CLK_2924 rplD rplC TRUE 0.996 25.000 0.544 0.012 Y NA
 5719636 5719637 CLK_2924 CLK_2925 rplC rpsJ TRUE 0.957 90.000 0.467 0.016 Y NA
 5719637 5719638 CLK_2925 CLK_2926 rpsJ tuf FALSE 0.189 397.000 0.318 1.000 Y NA
 5719638 5719639 CLK_2926 CLK_2927 tuf fusA TRUE 0.988 40.000 0.400 0.001 Y NA
 5719639 5719640 CLK_2927 CLK_2928 fusA rpsG TRUE 0.964 72.000 0.579 1.000 Y NA
 5719640 5719641 CLK_2928 CLK_2929 rpsG rpsL TRUE 0.917 161.000 0.224 0.002 Y NA
 5719641 5719642 CLK_2929 CLK_2930 rpsL   TRUE 0.949 76.000 0.239 0.016 Y NA
 5719642 5719643 CLK_2930 CLK_2931   rpoC TRUE 0.684 122.000 0.065 1.000 N NA
 5719643 5719644 CLK_2931 CLK_2932 rpoC rpoB TRUE 0.997 21.000 0.851 0.001 Y NA
 5719644 5719645 CLK_2932 CLK_2933 rpoB rplL FALSE 0.175 275.000 0.223 1.000 N NA
 5719645 5719646 CLK_2933 CLK_2934 rplL rplJ TRUE 0.988 47.000 0.884 1.000 Y NA
 5719646 5719647 CLK_2934 CLK_2935 rplJ rplA TRUE 0.805 202.000 0.302 1.000 Y NA
 5719647 5719648 CLK_2935 CLK_2936 rplA rplK TRUE 0.984 57.000 0.838 0.016 Y NA
 5719648 5719649 CLK_2936 CLK_2937 rplK nusG TRUE 0.892 71.000 0.681 1.000 N NA
 5719649 5719650 CLK_2937 CLK_2938 nusG secE TRUE 0.956 47.000 0.843 1.000 N NA
 5719650 5719651 CLK_2938 CLK_2939 secE rpmG TRUE 0.858 50.000 0.100 1.000 N NA
 5719651 5719652 CLK_2939 CLK_2940 rpmG tuf TRUE 0.729 202.000 0.099 1.000 Y NA
 5719652 5719653 CLK_2940 CLK_3942 tuf   FALSE 0.338 83.000 0.000 NA   NA
 5719653 5719654 CLK_3942 CLK_3943     TRUE 0.868 18.000 0.000 NA   NA
 5719654 5719655 CLK_3943 CLK_2943   sigH FALSE 0.409 64.000 0.000 NA   NA
 5719655 5719656 CLK_2943 CLK_2944 sigH   TRUE 0.839 74.000 0.361 NA   NA
 5719656 5719657 CLK_2944 CLK_2945     TRUE 0.983 3.000 0.109 NA   NA
 5719657 5719658 CLK_2945 CLK_2946   thyX TRUE 0.973 3.000 0.032 1.000 N NA
 5719658 5719659 CLK_2946 CLK_2947 thyX   TRUE 0.985 -10.000 0.055 1.000   NA
 5719659 5719660 CLK_2947 CLK_2948   cysS TRUE 0.883 49.000 0.129 1.000   NA
 5719660 5719661 CLK_2948 CLK_2949 cysS ilvA TRUE 0.875 29.000 0.003 1.000 N NA
 5719661 5719662 CLK_2949 CLK_2950 ilvA   TRUE 0.537 72.000 0.004 1.000 N NA
 5719662 5719663 CLK_2950 CLK_2951   ispD FALSE 0.501 111.000 0.002 1.000 N NA
 5719663 5719664 CLK_2951 CLK_2952 ispD   TRUE 0.986 2.000 0.134 NA   NA
 5719666 5719667 CLK_2954 CLK_2955   radA TRUE 0.972 19.000 0.126 NA   NA
 5719667 5719668 CLK_2955 CLK_2956 radA clpC TRUE 0.886 121.000 0.009 0.015 Y NA
 5719668 5719669 CLK_2956 CLK_2957 clpC   TRUE 0.985 2.000 0.129 1.000 N NA
 5719669 5719670 CLK_2957 CLK_2958     TRUE 0.994 5.000 0.848 1.000   NA
 5719670 5719671 CLK_2958 CLK_2959   ctsR TRUE 0.986 23.000 0.681 NA   NA
 5719671 5719672 CLK_2959 CLK_2960 ctsR   FALSE 0.007 396.000 0.000 NA   NA
 5719672 5719673 CLK_2960 CLK_2961   fusA FALSE 0.030 346.000 0.021 NA   NA
 5719673 5719674 CLK_2961 CLK_3944 fusA   FALSE 0.150 186.000 0.000 NA   NA
 5719674 5719675 CLK_3944 CLK_3945     TRUE 0.807 26.000 0.000 NA   NA
 5719675 5719676 CLK_3945 CLK_3946   rrfH TRUE 0.906 8.000 0.000 NA   NA
 5719676 5719677 CLK_3946 CLK_3947 rrfH rrlH FALSE 0.323 91.000 0.000 NA   NA
 5719677 5719678 CLK_3947 CLK_3948 rrlH   FALSE 0.361 74.000 0.000 NA   NA
 5719678 5719679 CLK_3948 CLK_3949   rrsH FALSE 0.330 87.000 0.000 NA   NA
 5719679 5719680 CLK_3949 CLK_3950 rrsH   FALSE 0.078 217.000 0.000 NA   NA
 5719680 5719681 CLK_3950 CLK_3951     TRUE 0.923 2.000 0.000 NA   NA
 5719681 5719682 CLK_3951 CLK_3952   rrfI TRUE 0.908 7.000 0.000 NA   NA
 5719682 5719683 CLK_3952 CLK_3953 rrfI rrlI FALSE 0.319 93.000 0.000 NA   NA
 5719683 5719684 CLK_3953 CLK_3954 rrlI rrsI FALSE 0.068 222.000 0.000 NA   NA
 5719684 5719685 CLK_3954 CLK_2981 rrsI murD FALSE 0.003 572.000 0.000 NA   NA
 5719685 5719686 CLK_2981 CLK_2982 murD glyS FALSE 0.006 835.000 0.002 0.099 N NA
 5719686 5719687 CLK_2982 CLK_2983 glyS lysS FALSE 0.123 320.000 0.000 0.099 Y NA
 5719687 5719688 CLK_2983 CLK_2984 lysS greA TRUE 0.968 19.000 0.098 1.000 N NA
 5719688 5719689 CLK_2984 CLK_2985 greA   TRUE 0.589 131.000 0.023 NA   NA
 5719689 5719690 CLK_2985 CLK_2986     TRUE 0.726 50.000 0.005 NA   NA
 5719690 5719691 CLK_2986 CLK_2987     TRUE 0.973 10.000 0.054 1.000 N NA
 5719691 5719692 CLK_2987 CLK_2988   fhs FALSE 0.458 155.000 0.011 1.000 N NA
 5719692 5719693 CLK_2988 CLK_2989 fhs ftsH FALSE 0.133 203.000 0.000 0.099 N NA
 5719693 5719694 CLK_2989 CLK_2990 ftsH hpt TRUE 0.763 82.000 0.180 1.000 N NA
 5719694 5719695 CLK_2990 CLK_2991 hpt tilS TRUE 0.991 -16.000 0.137 0.028 N NA
 5719695 5719696 CLK_2991 CLK_2992 tilS spoIIE TRUE 0.587 149.000 0.041 1.000 N NA
 5719696 5719697 CLK_2992 CLK_3956 spoIIE   FALSE 0.013 329.000 0.000 NA   NA
 5719697 5719698 CLK_3956 CLK_3957     TRUE 0.905 9.000 0.000 NA   NA
 5719698 5719699 CLK_3957 CLK_3958     FALSE 0.533 52.000 0.000 NA   NA
 5719699 5719700 CLK_3958 CLK_3959     TRUE 0.918 3.000 0.000 NA   NA
 5719700 5719701 CLK_3959 CLK_3960     TRUE 0.775 30.000 0.000 NA   NA
 5719701 5719702 CLK_3960 CLK_3961     TRUE 0.918 3.000 0.000 NA   NA
 5719702 5719703 CLK_3961 CLK_3962     TRUE 0.918 3.000 0.000 NA   NA
 5719703 5719704 CLK_3962 CLK_2998     FALSE 0.314 141.000 0.000 NA   NA
 5719704 5719705 CLK_2998 CLK_2999     TRUE 0.831 62.000 0.179 1.000   NA
 5719705 5719706 CLK_2999 CLK_3000     TRUE 0.798 95.000 0.303 NA   NA
 5719706 5719707 CLK_3000 CLK_3001   yabP TRUE 0.991 15.000 0.774 NA   NA
 5719707 5719708 CLK_3001 CLK_3002 yabP   TRUE 0.735 119.000 0.108 NA   NA
 5719708 5719709 CLK_3002 CLK_3003   hup TRUE 0.618 74.000 0.024 1.000 N NA
 5719709 5719710 CLK_3003 CLK_3004 hup   TRUE 0.569 128.000 0.014 1.000   NA
 5719710 5719711 CLK_3004 CLK_3005   spoVB TRUE 0.953 15.000 0.015 1.000   NA
 5719711 5719712 CLK_3005 CLK_3006 spoVB   TRUE 0.717 133.000 0.108 NA   NA
 5719712 5719713 CLK_3006 CLK_3007     FALSE 0.369 199.000 0.088 NA N NA
 5719713 5719714 CLK_3007 CLK_3008   mfd TRUE 0.560 84.000 0.016 1.000 N NA
 5719714 5719715 CLK_3008 CLK_3009 mfd pth TRUE 0.955 28.000 0.137 1.000 N NA
 5719715 5719716 CLK_3009 CLK_3010 pth   TRUE 0.534 110.000 0.009 1.000 N NA
 5719716 5719717 CLK_3010 CLK_3011     TRUE 0.923 35.000 0.095 1.000 N NA
 5719717 5719718 CLK_3011 CLK_3012     TRUE 0.998 1.000 0.653 1.000 Y NA
 5719718 5719719 CLK_3012 CLK_3013   prsA FALSE 0.526 180.000 0.123 1.000 N NA
 5719719 5719720 CLK_3013 CLK_3014 prsA glmU TRUE 0.958 21.000 0.069 1.000 N NA
 5719720 5719721 CLK_3014 CLK_3015 glmU spoVG TRUE 0.803 162.000 0.011 1.000 Y NA
 5719721 5719722 CLK_3015 CLK_3016 spoVG purR TRUE 0.703 103.000 0.099 1.000 N NA
 5719723 5719724 CLK_3017 CLK_3018 murC   TRUE 0.585 65.000 0.004 NA   NA
 5719724 5719725 CLK_3018 CLK_3963     FALSE 0.349 78.000 0.000 NA   NA
 5719725 5719726 CLK_3963 CLK_3020     FALSE 0.321 92.000 0.000 NA   NA
 5719726 5719727 CLK_3020 CLK_3021     TRUE 0.757 86.000 0.156 1.000   NA
 5719727 5719728 CLK_3021 CLK_3022     FALSE 0.102 274.000 0.044 NA   NA
 5719729 5719730 CLK_3023 CLK_3024     TRUE 0.867 45.000 0.067 1.000   NA
 5719730 5719731 CLK_3024 CLK_3025     TRUE 0.722 68.000 0.058 NA   NA
 5719732 5719733 CLK_3026 CLK_3027     TRUE 0.942 33.000 0.133 NA   NA
 5719734 5719735 CLK_3028 CLK_3029     FALSE 0.019 303.000 0.000 1.000   NA
 5719735 5719736 CLK_3029 CLK_3030     TRUE 0.959 15.000 0.028 NA   NA
 5719736 5719737 CLK_3030 CLK_3031     TRUE 0.955 18.000 0.030 NA   NA
 5719737 5719738 CLK_3031 CLK_3032   murI FALSE 0.477 146.000 0.007 1.000 N NA
 5719741 5719742 CLK_3035 CLK_3036 murA   TRUE 0.947 26.000 0.058 1.000   NA
 5719742 5719743 CLK_3036 CLK_3037     TRUE 0.948 17.000 0.016 NA   NA
 5719743 5719744 CLK_3037 CLK_3038     TRUE 0.986 15.000 0.357 NA   NA
 5719744 5719745 CLK_3038 CLK_3039     FALSE 0.314 179.000 0.005 NA   NA
 5719747 5719748 CLK_3041 CLK_3042     TRUE 0.998 3.000 0.571 0.016 Y NA
 5719748 5719749 CLK_3042 CLK_3043     FALSE 0.103 341.000 0.000 0.019 Y NA
 5719749 5719750 CLK_3043 CLK_3044   map TRUE 0.924 32.000 0.059 1.000 N NA
 5719751 5719752 CLK_3045 CLK_3046     FALSE 0.045 244.000 0.000 NA   NA
 5719752 5719753 CLK_3046 CLK_3047     TRUE 0.809 75.000 0.250 NA   NA
 5719753 5719754 CLK_3047 CLK_3048   prdB-2 TRUE 0.670 180.000 0.250 0.002   NA
 5719754 5719755 CLK_3048 CLK_3049 prdB-2   TRUE 0.978 27.000 0.500 NA   NA
 5719755 5719756 CLK_3049 CLK_3050     TRUE 0.994 3.000 0.667 NA   NA
 5719756 5719757 CLK_3050 CLK_3051     TRUE 0.757 107.000 0.167 NA   NA
 5719758 5719759 CLK_3052 CLK_3053     TRUE 0.996 -7.000 0.810 NA N NA
 5719759 5719760 CLK_3053 CLK_3054     FALSE 0.012 336.000 0.000 NA   NA
 5719760 5719761 CLK_3054 CLK_3055     TRUE 0.978 3.000 0.053 NA   NA
 5719761 5719762 CLK_3055 CLK_3056     TRUE 0.998 1.000 0.237 0.001 Y NA
 5719762 5719763 CLK_3056 CLK_3057     TRUE 0.987 9.000 0.260 1.000   NA
 5719763 5719764 CLK_3057 CLK_3058     FALSE 0.009 368.000 0.000 1.000   NA
 5719764 5719765 CLK_3058 CLK_3059     FALSE 0.018 300.000 0.000 1.000 N NA
 5719767 5719768 CLK_3061 CLK_3062     TRUE 0.779 107.000 0.220 NA   NA
 5719768 5719769 CLK_3062 CLK_3063     FALSE 0.393 181.000 0.031 NA   NA
 5719769 5719770 CLK_3063 CLK_3064     TRUE 0.623 88.000 0.031 1.000   NA
 5719771 5719772 CLK_3065 CLK_3066     TRUE 0.914 29.000 0.025 1.000 N NA
 5719772 5719773 CLK_3066 CLK_3067   accA FALSE 0.143 216.000 0.003 1.000 N NA
 5719773 5719774 CLK_3067 CLK_3068 accA accD TRUE 0.980 47.000 0.234 0.001 Y NA
 5719774 5719775 CLK_3068 CLK_3069 accD accC TRUE 0.992 20.000 0.090 1.000 Y NA
 5719775 5719776 CLK_3069 CLK_3070 accC fabZ TRUE 0.984 32.000 0.077 1.000 Y NA
 5719776 5719777 CLK_3070 CLK_3071 fabZ accB TRUE 0.989 20.000 0.014 0.003 Y NA
 5719777 5719778 CLK_3071 CLK_3072 accB fabF TRUE 0.995 4.000 0.074 1.000 Y NA
 5719778 5719779 CLK_3072 CLK_3073 fabF fabG TRUE 0.994 20.000 0.236 1.000 Y NA
 5719779 5719780 CLK_3073 CLK_3074 fabG fabD TRUE 0.995 18.000 0.149 0.003 Y NA
 5719780 5719781 CLK_3074 CLK_3075 fabD   TRUE 0.966 21.000 0.099 1.000   NA
 5719781 5719782 CLK_3075 CLK_3076   acpP TRUE 0.786 126.000 0.216 1.000   NA
 5719782 5719783 CLK_3076 CLK_3077 acpP fabH TRUE 0.923 41.000 0.121 0.003   NA
 5719783 5719784 CLK_3077 CLK_3078 fabH   TRUE 0.987 -7.000 0.098 1.000 N NA
 5719784 5719785 CLK_3078 CLK_3079     TRUE 0.961 16.000 0.032 1.000   NA
 5719785 5719786 CLK_3079 CLK_3080     FALSE 0.527 98.000 0.007 1.000   NA
 5719787 5719788 CLK_3081 CLK_3082     TRUE 0.997 -7.000 0.083 NA Y NA
 5719789 5719790 CLK_3964 CLK_3965     TRUE 0.915 4.000 0.000 NA   NA
 5719790 5719791 CLK_3965 CLK_3966     TRUE 0.906 8.000 0.000 NA   NA
 5719791 5719792 CLK_3966 CLK_3967     TRUE 0.878 16.000 0.000 NA   NA
 5719792 5719793 CLK_3967 CLK_3968     FALSE 0.496 56.000 0.000 NA   NA
 5719793 5719794 CLK_3968 CLK_3969     TRUE 0.910 6.000 0.000 NA   NA
 5719794 5719795 CLK_3969 CLK_3970     TRUE 0.873 17.000 0.000 NA   NA
 5719795 5719796 CLK_3970 CLK_3971     TRUE 0.912 5.000 0.000 NA   NA
 5719796 5719797 CLK_3971 CLK_3972     TRUE 0.915 4.000 0.000 NA   NA
 5719797 5719798 CLK_3972 CLK_3973     TRUE 0.906 8.000 0.000 NA   NA
 5719798 5719799 CLK_3973 CLK_3974     TRUE 0.873 17.000 0.000 NA   NA
 5719799 5719800 CLK_3974 CLK_3095     FALSE 0.203 171.000 0.000 NA   NA
 5719800 5719801 CLK_3095 CLK_3096     TRUE 0.947 13.000 0.006 NA   NA
 5719803 5719804 CLK_3098 CLK_3099     TRUE 0.777 103.000 0.222 NA   NA
 5719804 5719805 CLK_3099 CLK_3100   purA FALSE 0.501 125.000 0.002 NA   NA
 5719805 5719806 CLK_3100 CLK_3101 purA   FALSE 0.161 232.000 0.033 NA   NA
 5719806 5719807 CLK_3101 CLK_3102     FALSE 0.377 170.000 0.010 NA   NA
 5719807 5719808 CLK_3102 CLK_3103     FALSE 0.370 205.000 0.111 NA   NA
 5719808 5719809 CLK_3103 CLK_3104   dnaB FALSE 0.044 242.000 0.000 1.000 N NA
 5719809 5719810 CLK_3104 CLK_3105 dnaB   TRUE 0.936 31.000 0.053 0.098 N NA
 5719810 5719811 CLK_3105 CLK_3106   rplI TRUE 0.963 11.000 0.024 1.000 N NA
 5719811 5719812 CLK_3106 CLK_3107 rplI   TRUE 0.986 0.000 0.119 1.000 N NA
 5719812 5719813 CLK_3107 CLK_3108     TRUE 0.989 1.000 0.210 NA   NA
 5719813 5719814 CLK_3108 CLK_3109     TRUE 0.979 12.000 0.116 NA   NA
 5719814 5719815 CLK_3109 CLK_3110   rpsR FALSE 0.506 149.000 0.015 NA   NA
 5719815 5719816 CLK_3110 CLK_3111 rpsR ssb TRUE 0.920 19.000 0.002 1.000 N NA
 5719816 5719817 CLK_3111 CLK_3112 ssb rpsF TRUE 0.930 16.000 0.002 1.000 N NA
 5719817 5719818 CLK_3112 CLK_3113 rpsF   FALSE 0.465 105.000 0.002 NA N NA
 5719818 5719819 CLK_3113 CLK_3114     FALSE 0.029 274.000 0.000 NA   NA
 5719819 5719820 CLK_3114 CLK_3115     TRUE 0.975 16.000 0.121 NA   NA
 5719820 5719821 CLK_3115 CLK_3116     TRUE 0.981 7.000 0.105 NA   NA
 5719822 5719823 CLK_3117 CLK_3118   ytvI TRUE 0.976 14.000 0.111 NA   NA
 5719823 5719824 CLK_3118 CLK_3119 ytvI   TRUE 0.783 58.000 0.058 NA   NA
 5719825 5719826 CLK_3120 CLK_3121     TRUE 0.760 53.000 0.024 NA   NA
 5719826 5719827 CLK_3121 CLK_3122     TRUE 0.886 38.000 0.047 NA   NA
 5719827 5719828 CLK_3122 CLK_3123   soj TRUE 0.991 16.000 0.827 1.000 N NA
 5719828 5719829 CLK_3123 CLK_3124 soj   TRUE 0.684 124.000 0.069 1.000 N NA
 5719829 5719830 CLK_3124 CLK_3125   gidB TRUE 0.689 100.000 0.089 1.000 N NA
 5719830 5719831 CLK_3125 CLK_3126 gidB gidA TRUE 0.980 24.000 0.466 1.000 N NA
 5719831 5719832 CLK_3126 CLK_3127 gidA trmE TRUE 0.987 9.000 0.266 1.000   NA
 5719832 5719833 CLK_3127 CLK_3128 trmE jag TRUE 0.881 48.000 0.116 1.000   NA
 5719833 5719834 CLK_3128 CLK_3129 jag oxaA TRUE 0.981 18.000 0.254 1.000   NA
 5719834 5719835 CLK_3129 CLK_3130 oxaA   TRUE 0.978 26.000 0.461 NA   NA
 5719835 5719836 CLK_3130 CLK_3131   rnpA TRUE 0.994 -3.000 0.540 NA   NA
 5719836 5719837 CLK_3131 CLK_3132 rnpA rpmH TRUE 0.942 55.000 0.787 1.000   NA
 5715733 5715734 CLK_A0001 CLK_A0002   recG TRUE 0.798 94.000 0.000 1.000 Y NA
 5715734 5715735 CLK_A0002 CLK_A0003 recG   FALSE 0.361 74.000 0.000 NA   NA
 5715735 5715736 CLK_A0003 CLK_A0004     FALSE 0.467 58.000 0.000 NA   NA
 5715738 5715739 CLK_A0006 CLK_A0007     FALSE 0.274 157.000 0.000 1.000   NA
 5715739 5715740 CLK_A0007 CLK_A0008     TRUE 0.554 50.000 0.000 NA   NA
 5715740 5715741 CLK_A0008 CLK_A0009     TRUE 0.946 -25.000 0.000 NA   NA
 5715741 5715742 CLK_A0009 CLK_A0010     FALSE 0.184 176.000 0.000 NA   NA
 5715742 5715743 CLK_A0010 CLK_A0011     FALSE 0.399 66.000 0.000 NA   NA
 5715743 5715744 CLK_A0011 CLK_A0012     FALSE 0.456 59.000 0.000 NA   NA
 5715744 5715745 CLK_A0012 CLK_A0013     TRUE 0.611 43.000 0.000 NA   NA
 5715745 5715746 CLK_A0013 CLK_A0014     FALSE 0.341 82.000 0.000 NA   NA
 5715748 5715749 CLK_A0016 CLK_A0017     FALSE 0.242 161.000 0.000 NA   NA
 5715749 5715750 CLK_A0017 CLK_A0018     TRUE 0.896 11.000 0.000 1.000 N NA
 5715750 5715751 CLK_A0018 CLK_A0019     TRUE 0.999 -31.000 0.431 1.000 Y NA
 5715751 5715752 CLK_A0019 CLK_A0020     TRUE 0.872 19.000 0.000 1.000   NA
 5715752 5715753 CLK_A0020 CLK_A0021     FALSE 0.372 115.000 0.000 1.000   NA
 5715753 10253777 CLK_A0021 CLK_A0330     TRUE 0.947 -123.000 0.000 NA   NA
 10253777 5715754 CLK_A0330 CLK_A0022     FALSE 0.345 80.000 0.000 NA   NA
 5715754 5715755 CLK_A0022 CLK_A0023     FALSE 0.004 486.000 0.000 NA   NA
 5715755 5715756 CLK_A0023 CLK_A0024     FALSE 0.351 115.000 0.000 NA   NA
 5715756 5715757 CLK_A0024 CLK_A0025     FALSE 0.496 56.000 0.000 NA   NA
 5715757 5715758 CLK_A0025 CLK_A0026     FALSE 0.076 218.000 0.000 NA   NA
 5715758 5715759 CLK_A0026 CLK_A0027     FALSE 0.321 138.000 0.000 NA   NA
 5715759 5715760 CLK_A0027 CLK_A0028     TRUE 0.823 24.000 0.000 NA   NA
 5715760 5715761 CLK_A0028 CLK_A0029     FALSE 0.030 272.000 0.000 NA   NA
 5715761 5715762 CLK_A0029 CLK_A0030     FALSE 0.005 428.000 0.000 NA   NA
 5715762 5715763 CLK_A0030 CLK_A0031     FALSE 0.349 78.000 0.000 NA   NA
 5715763 5715764 CLK_A0031 CLK_A0032     FALSE 0.052 235.000 0.000 NA   NA
 5715764 5715765 CLK_A0032 CLK_A0033     FALSE 0.013 327.000 0.000 NA   NA
 5715765 5715766 CLK_A0033 CLK_A0034     FALSE 0.338 83.000 0.000 NA   NA
 5715766 5715767 CLK_A0034 CLK_A0035     TRUE 0.775 30.000 0.000 NA   NA
 5715767 5715768 CLK_A0035 CLK_A0036     FALSE 0.496 56.000 0.000 NA   NA
 5715768 5715769 CLK_A0036 CLK_A0037     FALSE 0.387 68.000 0.000 NA   NA
 5715769 5715770 CLK_A0037 CLK_A0038     FALSE 0.321 98.000 0.000 NA   NA
 5715770 5715771 CLK_A0038 CLK_A0039     TRUE 0.868 18.000 0.000 NA   NA
 5715771 5715772 CLK_A0039 CLK_A0040     TRUE 0.947 -40.000 0.000 NA   NA
 5715772 5715773 CLK_A0040 CLK_A0041     FALSE 0.344 111.000 0.000 NA   NA
 5715773 5715774 CLK_A0041 CLK_A0042     FALSE 0.141 189.000 0.000 NA   NA
 5715774 5715775 CLK_A0042 CLK_A0043     FALSE 0.399 66.000 0.000 NA   NA
 5715775 5715776 CLK_A0043 CLK_A0044     TRUE 0.936 -6.000 0.000 NA   NA
 5715776 5715777 CLK_A0044 CLK_A0045     FALSE 0.176 179.000 0.000 NA   NA
 5715777 5715778 CLK_A0045 CLK_A0046     FALSE 0.136 191.000 0.000 NA   NA
 5715778 5715779 CLK_A0046 CLK_A0047     FALSE 0.446 60.000 0.000 NA   NA
 5715779 5715780 CLK_A0047 CLK_A0048     FALSE 0.316 140.000 0.000 NA   NA
 5715780 5715781 CLK_A0048 CLK_A0049     FALSE 0.321 92.000 0.000 NA   NA
 5715781 5715782 CLK_A0049 CLK_A0050     TRUE 0.753 32.000 0.000 NA   NA
 5715782 5715783 CLK_A0050 CLK_A0051     FALSE 0.467 58.000 0.000 NA   NA
 5715783 5715784 CLK_A0051 CLK_A0052     FALSE 0.330 104.000 0.000 NA   NA
 5715784 5715785 CLK_A0052 CLK_A0053     FALSE 0.230 164.000 0.000 NA   NA
 5715785 5715786 CLK_A0053 CLK_A0054     FALSE 0.377 70.000 0.000 NA   NA
 5715786 5715787 CLK_A0054 CLK_A0055     FALSE 0.334 128.000 0.000 NA   NA
 5715787 5715788 CLK_A0055 CLK_A0056     TRUE 0.585 46.000 0.000 NA   NA
 5715788 5715789 CLK_A0056 CLK_A0057     FALSE 0.507 55.000 0.000 NA   NA
 5715789 5715790 CLK_A0057 CLK_A0058     TRUE 0.908 7.000 0.000 NA   NA
 5715790 5715791 CLK_A0058 CLK_A0059     FALSE 0.370 72.000 0.000 NA   NA
 5715791 5715792 CLK_A0059 CLK_A0060     FALSE 0.267 155.000 0.000 NA   NA
 5715792 5715793 CLK_A0060 CLK_A0061     FALSE 0.058 229.000 0.000 NA   NA
 5715793 5715794 CLK_A0061 CLK_A0062     FALSE 0.319 95.000 0.000 NA   NA
 5715794 5715795 CLK_A0062 CLK_A0063     TRUE 0.699 36.000 0.000 NA   NA
 5715795 5715796 CLK_A0063 CLK_A0064     FALSE 0.212 168.000 0.000 NA   NA
 5715796 5715797 CLK_A0064 CLK_A0065     TRUE 0.934 -3.000 0.000 NA   NA
 5715797 5715798 CLK_A0065 CLK_A0066     FALSE 0.006 418.000 0.000 NA   NA
 5715798 5715799 CLK_A0066 CLK_A0067     FALSE 0.190 174.000 0.000 NA   NA
 5715800 5715801 CLK_A0068 CLK_A0069     FALSE 0.053 239.000 0.000 1.000   NA
 5715802 5715803 CLK_A0070 CLK_A0071     TRUE 0.957 39.000 0.500 NA   NA
 5715803 5715804 CLK_A0071 CLK_A0072     TRUE 0.989 14.000 0.500 NA   NA
 5715804 5715805 CLK_A0072 CLK_A0073   botR FALSE 0.002 1230.000 0.000 NA   NA
 5715806 5715807 CLK_A0074 CLK_A0075   ntnh TRUE 0.991 16.000 0.750 NA   NA
 5715807 5715808 CLK_A0075 CLK_A0076 ntnh boNT/A3 TRUE 0.724 44.000 0.000 0.001   NA
 5715809 5715810 CLK_A0077 CLK_A0078     FALSE 0.072 220.000 0.000 NA   NA
 5715810 5715811 CLK_A0078 CLK_A0079     FALSE 0.006 402.000 0.000 NA   NA
 5715811 5715812 CLK_A0079 CLK_A0080     FALSE 0.404 65.000 0.000 NA   NA
 5715812 5715813 CLK_A0080 CLK_A0081     FALSE 0.157 184.000 0.000 NA   NA
 5715813 5715814 CLK_A0081 CLK_A0082     TRUE 0.620 42.000 0.000 NA   NA
 5715814 5715815 CLK_A0082 CLK_A0083     FALSE 0.373 71.000 0.000 NA   NA
 5715815 5715816 CLK_A0083 CLK_A0084     FALSE 0.145 188.000 0.000 NA   NA
 5715816 5715817 CLK_A0084 CLK_A0085     FALSE 0.009 361.000 0.000 NA   NA
 5715817 5715818 CLK_A0085 CLK_A0086     TRUE 0.988 11.000 0.333 NA   NA
 5715818 5715819 CLK_A0086 CLK_A0087     FALSE 0.009 364.000 0.000 NA   NA
 5715819 5715820 CLK_A0087 CLK_A0088     FALSE 0.304 144.000 0.000 NA   NA
 5715820 5715821 CLK_A0088 CLK_A0089     TRUE 0.585 46.000 0.000 NA   NA
 5715821 5715822 CLK_A0089 CLK_A0090     FALSE 0.088 211.000 0.000 NA   NA
 5715822 5715823 CLK_A0090 CLK_A0091     TRUE 0.645 40.000 0.000 NA   NA
 5715823 5715824 CLK_A0091 CLK_A0092     FALSE 0.350 114.000 0.000 NA   NA
 5715824 5715825 CLK_A0092 CLK_A0093     TRUE 0.873 17.000 0.000 NA   NA
 5715825 5715826 CLK_A0093 CLK_A0094     FALSE 0.097 207.000 0.000 NA   NA
 5715826 5715827 CLK_A0094 CLK_A0095     FALSE 0.346 79.000 0.000 NA   NA
 5715827 5715828 CLK_A0095 CLK_A0096     FALSE 0.380 69.000 0.000 NA   NA
 5715828 5715829 CLK_A0096 CLK_A0097     TRUE 0.731 34.000 0.000 NA   NA
 5715829 10253778 CLK_A0097 CLK_A0331     TRUE 0.543 51.000 0.000 NA   NA
 10253778 5715830 CLK_A0331 CLK_A0098     TRUE 0.887 14.000 0.000 NA   NA
 5715830 5715831 CLK_A0098 CLK_A0099     FALSE 0.003 603.000 0.000 NA   NA
 5715831 5715832 CLK_A0099 CLK_A0100     FALSE 0.456 59.000 0.000 NA   NA
 5715832 5715833 CLK_A0100 CLK_A0101     FALSE 0.522 53.000 0.000 NA   NA
 5715833 5715834 CLK_A0101 CLK_A0102     FALSE 0.426 62.000 0.000 NA   NA
 5715834 5715835 CLK_A0102 CLK_A0103     TRUE 0.543 51.000 0.000 NA   NA
 5715835 5715836 CLK_A0103 CLK_A0104     FALSE 0.350 119.000 0.000 NA   NA
 5715836 5715837 CLK_A0104 CLK_A0105     FALSE 0.522 53.000 0.000 NA   NA
 5715837 5715838 CLK_A0105 CLK_A0106     FALSE 0.314 141.000 0.000 NA   NA
 5715838 5715839 CLK_A0106 CLK_A0107     FALSE 0.003 813.000 0.000 NA   NA
 5715839 5715840 CLK_A0107 CLK_A0108     TRUE 0.830 23.000 0.000 NA   NA
 5715840 5715841 CLK_A0108 CLK_A0109     FALSE 0.338 83.000 0.000 NA   NA
 5715841 5715842 CLK_A0109 CLK_A0110     FALSE 0.370 72.000 0.000 NA   NA
 5715842 5715843 CLK_A0110 CLK_A0111     FALSE 0.330 104.000 0.000 NA   NA
 5715843 5715844 CLK_A0111 CLK_A0112     FALSE 0.008 370.000 0.000 NA   NA
 5715844 5715845 CLK_A0112 CLK_A0113     TRUE 0.816 25.000 0.000 NA   NA
 5715846 5715847 CLK_A0114 CLK_A0115   dnaN TRUE 0.828 100.000 0.000 0.008 Y NA
 5715847 5715848 CLK_A0115 CLK_A0116 dnaN   FALSE 0.048 409.000 0.000 NA Y NA
 5715849 5715850 CLK_A0117 CLK_A0118     TRUE 0.918 3.000 0.000 NA   NA
 5715850 5715851 CLK_A0118 CLK_A0119     FALSE 0.027 278.000 0.000 NA   NA
 5715851 5715852 CLK_A0119 CLK_A0120     FALSE 0.013 330.000 0.000 NA   NA
 5715852 5715853 CLK_A0120 CLK_A0121     TRUE 0.775 30.000 0.000 NA   NA
 5715853 5715854 CLK_A0121 CLK_A0122     FALSE 0.049 239.000 0.000 NA   NA
 5715854 5715855 CLK_A0122 CLK_A0123     FALSE 0.319 96.000 0.000 NA   NA
 5715855 5715856 CLK_A0123 CLK_A0124     TRUE 0.661 39.000 0.000 NA   NA
 5715857 5715858 CLK_A0125 CLK_A0126     TRUE 0.934 -3.000 0.000 NA   NA
 5715858 5715859 CLK_A0126 CLK_A0127     FALSE 0.145 188.000 0.000 NA   NA
 5715859 5715860 CLK_A0127 CLK_A0128     FALSE 0.041 255.000 0.000 NA   NA
 5715860 5715861 CLK_A0128 CLK_A0129     TRUE 0.945 -22.000 0.000 NA   NA
 5715862 5715863 CLK_A0130 CLK_A0131     FALSE 0.104 204.000 0.000 NA   NA
 5715864 5715865 CLK_A0132 CLK_A0133     TRUE 0.861 19.000 0.000 NA   NA
 5715866 5715867 CLK_A0134 CLK_A0135     FALSE 0.409 64.000 0.000 NA   NA
 5715867 5715868 CLK_A0135 CLK_A0136     TRUE 0.898 12.000 0.000 NA   NA
 5715868 5715869 CLK_A0136 CLK_A0137     FALSE 0.242 161.000 0.000 NA   NA
 5715869 5715870 CLK_A0137 CLK_A0138     FALSE 0.035 265.000 0.000 NA   NA
 5715870 5715871 CLK_A0138 CLK_A0139     FALSE 0.005 425.000 0.000 NA   NA
 5715871 5715872 CLK_A0139 CLK_A0140     FALSE 0.351 118.000 0.000 NA   NA
 5715872 5715873 CLK_A0140 CLK_A0141     FALSE 0.354 76.000 0.000 NA   NA
 5715874 5715875 CLK_A0142 CLK_A0143 cas   TRUE 0.799 27.000 0.000 NA   NA
 5715875 5715876 CLK_A0143 CLK_A0144     TRUE 0.988 21.000 0.778 NA   NA
 5715876 5715877 CLK_A0144 CLK_A0145   cas5h TRUE 0.801 90.000 0.295 NA   NA
 5715877 5715878 CLK_A0145 CLK_A0146 cas5h   FALSE 0.002 1136.000 0.000 NA   NA
 11405666 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 1329.000 0.000 NA   NA
 11548029 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 1329.000 0.000 NA   NA
 11690421 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 1329.000 0.000 NA   NA
 11405667 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 1299.000 0.000 NA   NA
 11548030 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 1299.000 0.000 NA   NA
 11690422 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 1299.000 0.000 NA   NA
 11405668 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 1269.000 0.000 NA   NA
 11548031 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 1269.000 0.000 NA   NA
 11690423 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 1269.000 0.000 NA   NA
 11405669 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 1228.000 0.000 NA   NA
 11548032 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 1228.000 0.000 NA   NA
 11690424 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 1228.000 0.000 NA   NA
 11405670 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 1198.000 0.000 NA   NA
 11548033 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 1198.000 0.000 NA   NA
 11690425 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 1198.000 0.000 NA   NA
 11405671 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 1163.000 0.000 NA   NA
 11548034 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 1163.000 0.000 NA   NA
 11690426 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 1163.000 0.000 NA   NA
 11405672 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 1133.000 0.000 NA   NA
 11548035 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 1133.000 0.000 NA   NA
 11690427 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 1133.000 0.000 NA   NA
 5715878 5715879 CLK_A0146 CLK_A0147     FALSE 0.003 806.000 0.000 NA   NA
 11405696 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 766.000 0.000 NA   NA
 11548059 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 766.000 0.000 NA   NA
 11690451 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 766.000 0.000 NA   NA
 11405673 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 766.000 0.000 NA   NA
 11548036 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 766.000 0.000 NA   NA
 11690428 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 766.000 0.000 NA   NA
 11405674 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 719.000 0.000 NA   NA
 11405697 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 729.000 0.000 NA   NA
 11548037 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 719.000 0.000 NA   NA
 11548060 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 729.000 0.000 NA   NA
 11690429 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 719.000 0.000 NA   NA
 11690452 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 729.000 0.000 NA   NA
 11405698 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 700.000 0.000 NA   NA
 11548061 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 700.000 0.000 NA   NA
 11690453 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 700.000 0.000 NA   NA
 11405675 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 700.000 0.000 NA   NA
 11548038 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 700.000 0.000 NA   NA
 11690430 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 700.000 0.000 NA   NA
 11405676 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 668.000 0.000 NA   NA
 11405699 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 678.000 0.000 NA   NA
 11548039 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 668.000 0.000 NA   NA
 11548062 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 678.000 0.000 NA   NA
 11690431 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 668.000 0.000 NA   NA
 11690454 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 678.000 0.000 NA   NA
 11405700 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 649.000 0.000 NA   NA
 11548063 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 649.000 0.000 NA   NA
 11690455 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 649.000 0.000 NA   NA
 11405677 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 649.000 0.000 NA   NA
 11548040 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 649.000 0.000 NA   NA
 11690432 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 649.000 0.000 NA   NA
 11405678 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 605.000 0.000 NA   NA
 11405701 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 615.000 0.000 NA   NA
 11548041 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 605.000 0.000 NA   NA
 11548064 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 615.000 0.000 NA   NA
 11690433 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 605.000 0.000 NA   NA
 11690456 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 615.000 0.000 NA   NA
 11405702 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 586.000 0.000 NA   NA
 11548065 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 586.000 0.000 NA   NA
 11690457 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 586.000 0.000 NA   NA
 11405679 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 586.000 0.000 NA   NA
 11548042 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 586.000 0.000 NA   NA
 11690434 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 586.000 0.000 NA   NA
 11405680 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 538.000 0.000 NA   NA
 11405703 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 548.000 0.000 NA   NA
 11548043 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 538.000 0.000 NA   NA
 11548066 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 548.000 0.000 NA   NA
 11690435 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 538.000 0.000 NA   NA
 11690458 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 548.000 0.000 NA   NA
 11405704 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 519.000 0.000 NA   NA
 11548067 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 519.000 0.000 NA   NA
 11690459 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 519.000 0.000 NA   NA
 11405681 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 519.000 0.000 NA   NA
 11548044 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 519.000 0.000 NA   NA
 11690436 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 519.000 0.000 NA   NA
 11405682 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 472.000 0.000 NA   NA
 11405705 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 482.000 0.000 NA   NA
 11548045 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 472.000 0.000 NA   NA
 11548068 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 482.000 0.000 NA   NA
 11690437 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 472.000 0.000 NA   NA
 11690460 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 482.000 0.000 NA   NA
 11405706 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 453.000 0.000 NA   NA
 11548069 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 453.000 0.000 NA   NA
 11690461 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 453.000 0.000 NA   NA
 11405683 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 453.000 0.000 NA   NA
 11548046 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 453.000 0.000 NA   NA
 11690438 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 453.000 0.000 NA   NA
 11405684 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 412.000 0.000 NA   NA
 11405707 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 422.000 0.000 NA   NA
 11548047 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 412.000 0.000 NA   NA
 11548070 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 422.000 0.000 NA   NA
 11690439 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 412.000 0.000 NA   NA
 11690462 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 422.000 0.000 NA   NA
 11405708 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 393.000 0.000 NA   NA
 11548071 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 393.000 0.000 NA   NA
 11690463 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 393.000 0.000 NA   NA
 11405685 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 393.000 0.000 NA   NA
 11548048 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 393.000 0.000 NA   NA
 11690440 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 393.000 0.000 NA   NA
 11405686 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 346.000 0.000 NA   NA
 11405709 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 356.000 0.000 NA   NA
 11548049 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 346.000 0.000 NA   NA
 11548072 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 356.000 0.000 NA   NA
 11690441 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 346.000 0.000 NA   NA
 11690464 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 356.000 0.000 NA   NA
 11405710 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 327.000 0.000 NA   NA
 11548073 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 327.000 0.000 NA   NA
 11690465 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 327.000 0.000 NA   NA
 11405687 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 327.000 0.000 NA   NA
 11548050 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 327.000 0.000 NA   NA
 11690442 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 327.000 0.000 NA   NA
 11405688 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 281.000 0.000 NA   NA
 11405711 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 291.000 0.000 NA   NA
 11548051 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 281.000 0.000 NA   NA
 11548074 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 291.000 0.000 NA   NA
 11690443 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 281.000 0.000 NA   NA
 11690466 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 291.000 0.000 NA   NA
 11405712 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 262.000 0.000 NA   NA
 11548075 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 262.000 0.000 NA   NA
 11690467 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 262.000 0.000 NA   NA
 11405689 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 262.000 0.000 NA   NA
 11548052 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 262.000 0.000 NA   NA
 11690444 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 262.000 0.000 NA   NA
 11405690 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 222.000 0.000 NA   NA
 11405713 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 232.000 0.000 NA   NA
 11548053 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 222.000 0.000 NA   NA
 11548076 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 232.000 0.000 NA   NA
 11690445 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 222.000 0.000 NA   NA
 11690468 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 232.000 0.000 NA   NA
 11405714 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 203.000 0.000 NA   NA
 11548077 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 203.000 0.000 NA   NA
 11690469 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 203.000 0.000 NA   NA
 11405691 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 203.000 0.000 NA   NA
 11548054 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 203.000 0.000 NA   NA
 11690446 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 203.000 0.000 NA   NA
 11405692 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 157.000 0.000 NA   NA
 11405715 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 167.000 0.000 NA   NA
 11548055 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 157.000 0.000 NA   NA
 11548078 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 167.000 0.000 NA   NA
 11690447 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 157.000 0.000 NA   NA
 11690470 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 167.000 0.000 NA   NA
 11405716 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 138.000 0.000 NA   NA
 11548079 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 138.000 0.000 NA   NA
 11690471 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 138.000 0.000 NA   NA
 11405693 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 138.000 0.000 NA   NA
 11548056 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 138.000 0.000 NA   NA
 11690448 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 138.000 0.000 NA   NA
 11405694 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 106.000 0.000 NA   NA
 11405717 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 116.000 0.000 NA   NA
 11548057 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 106.000 0.000 NA   NA
 11548080 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 116.000 0.000 NA   NA
 11690449 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 106.000 0.000 NA   NA
 11690472 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 116.000 0.000 NA   NA
 11405718 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 87.000 0.000 NA   NA
 11548081 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 87.000 0.000 NA   NA
 11690473 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 87.000 0.000 NA   NA
 11405695 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 87.000 0.000 NA   NA
 11548058 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 87.000 0.000 NA   NA
 11690450 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 87.000 0.000 NA   NA
 11405719 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 55.000 0.000 NA   NA
 11548082 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 55.000 0.000 NA   NA
 11690474 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 55.000 0.000 NA   NA
 11405720 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 26.000 0.000 NA   NA
 11548083 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 26.000 0.000 NA   NA
 11690475 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 26.000 0.000 NA   NA
 11405721 5715879   CLK_A0147     FALSE NA -3.000 0.000 NA   NA
 11548084 5715879   CLK_A0147     FALSE NA -3.000 0.000 NA   NA
 11690476 5715879   CLK_A0147     FALSE NA -3.000 0.000 NA   NA
 5715879 5715880 CLK_A0147 CLK_A0148     FALSE 0.002 1117.000 0.000 NA   NA
 11405722 5715879   CLK_A0147     FALSE NA -32.000 0.000 NA   NA
 11548085 5715879   CLK_A0147     FALSE NA -32.000 0.000 NA   NA
 11690477 5715879   CLK_A0147     FALSE NA -32.000 0.000 NA   NA
 11405723 5715879   CLK_A0147     FALSE NA -66.000 0.000 NA   NA
 11548086 5715879   CLK_A0147     FALSE NA -66.000 0.000 NA   NA
 11690478 5715879   CLK_A0147     FALSE NA -66.000 0.000 NA   NA
 11405724 5715879   CLK_A0147     FALSE NA -70.000 0.000 NA   NA
 11548087 5715879   CLK_A0147     FALSE NA -70.000 0.000 NA   NA
 11690479 5715879   CLK_A0147     FALSE NA -70.000 0.000 NA   NA
 11405725 5715879   CLK_A0147     FALSE NA -41.000 0.000 NA   NA
 11548088 5715879   CLK_A0147     FALSE NA -41.000 0.000 NA   NA
 11690480 5715879   CLK_A0147     FALSE NA -41.000 0.000 NA   NA
 11405726 5715879   CLK_A0147     FALSE NA -5.000 0.000 NA   NA
 11548089 5715879   CLK_A0147     FALSE NA -5.000 0.000 NA   NA
 11690481 5715879   CLK_A0147     FALSE NA -5.000 0.000 NA   NA
 11405727 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 24.000 0.000 NA   NA
 11548090 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 24.000 0.000 NA   NA
 11690482 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 24.000 0.000 NA   NA
 11405728 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 59.000 0.000 NA   NA
 11548091 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 59.000 0.000 NA   NA
 11690483 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 59.000 0.000 NA   NA
 11405729 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 88.000 0.000 NA   NA
 11548092 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 88.000 0.000 NA   NA
 11690484 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 88.000 0.000 NA   NA
 11405730 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 119.000 0.000 NA   NA
 11548093 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 119.000 0.000 NA   NA
 11690485 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 119.000 0.000 NA   NA
 11405731 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 148.000 0.000 NA   NA
 11548094 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 148.000 0.000 NA   NA
 11690486 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 148.000 0.000 NA   NA
 11405732 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 181.000 0.000 NA   NA
 11548095 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 181.000 0.000 NA   NA
 11690487 5715879   CLK_A0147     FALSE NA 181.000 0.000 NA   NA
 5715881 5715882 CLK_A0149 CLK_A0150     TRUE 0.861 19.000 0.000 NA   NA
 5715882 5715883 CLK_A0150 CLK_A0151   ssb FALSE 0.325 136.000 0.000 NA   NA
 5715883 5715884 CLK_A0151 CLK_A0152 ssb   FALSE 0.332 86.000 0.000 NA   NA
 5715886 5715887 CLK_A0154 CLK_A0155     TRUE 0.838 22.000 0.000 NA   NA
 5715887 5715888 CLK_A0155 CLK_A0156     FALSE 0.325 90.000 0.000 NA   NA
 5715890 5715891 CLK_A0158 CLK_A0159 dnaX   FALSE 0.335 84.000 0.000 NA   NA
 5715891 5715892 CLK_A0159 CLK_A0160     TRUE 0.882 15.000 0.000 NA   NA
 5715892 5715893 CLK_A0160 CLK_A0161   holA TRUE 0.554 50.000 0.000 NA   NA
 5715893 5715894 CLK_A0161 CLK_A0162 holA   TRUE 0.861 19.000 0.000 NA   NA
 5715894 5715895 CLK_A0162 CLK_A0163     FALSE 0.298 146.000 0.000 NA   NA
 5715897 5715898 CLK_A0165 CLK_A0166     FALSE 0.033 268.000 0.000 NA   NA
 5715898 5715899 CLK_A0166 CLK_A0167     FALSE 0.333 129.000 0.000 NA   NA
 5715899 5715900 CLK_A0167 CLK_A0168     FALSE 0.112 202.000 0.000 NA   NA
 5715900 5715901 CLK_A0168 CLK_A0169     FALSE 0.507 55.000 0.000 NA   NA
 5715901 5715902 CLK_A0169 CLK_A0170     TRUE 0.554 50.000 0.000 NA   NA
 5715902 5715903 CLK_A0170 CLK_A0171     FALSE 0.354 76.000 0.000 NA   NA
 5715903 5715904 CLK_A0171 CLK_A0172     TRUE 0.554 50.000 0.000 NA   NA
 5715904 5715905 CLK_A0172 CLK_A0173     FALSE 0.139 190.000 0.000 NA   NA
 5715905 5715906 CLK_A0173 CLK_A0174     FALSE 0.230 164.000 0.000 NA   NA
 5715906 5715907 CLK_A0174 CLK_A0175     FALSE 0.325 90.000 0.000 NA   NA
 5715907 5715908 CLK_A0175 CLK_A0176     FALSE 0.347 112.000 0.000 NA   NA
 5715908 5715909 CLK_A0176 CLK_A0177     FALSE 0.316 140.000 0.000 NA   NA
 5715909 5715910 CLK_A0177 CLK_A0178     FALSE 0.350 114.000 0.000 NA   NA
 5715910 5715911 CLK_A0178 CLK_A0179     FALSE 0.043 251.000 0.000 NA   NA
 5715911 5715912 CLK_A0179 CLK_A0180     TRUE 0.944 -19.000 0.000 NA   NA
 5715912 5715913 CLK_A0180 CLK_A0181     TRUE 0.853 20.000 0.000 NA   NA
 5715913 5715914 CLK_A0181 CLK_A0182     FALSE 0.012 332.000 0.000 NA   NA
 5715914 5715915 CLK_A0182 CLK_A0183     FALSE 0.365 111.000 0.000 1.000   NA
 5715915 5715916 CLK_A0183 CLK_A0184     FALSE 0.307 143.000 0.000 NA   NA
 5715916 5715917 CLK_A0184 CLK_A0185     FALSE 0.426 62.000 0.000 NA   NA
 5715917 5715918 CLK_A0185 CLK_A0186     TRUE 0.845 21.000 0.000 NA   NA
 5715918 5715919 CLK_A0186 CLK_A0187     FALSE 0.008 385.000 0.000 NA   NA
 5715919 5715920 CLK_A0187 CLK_A0188     FALSE 0.446 60.000 0.000 NA   NA
 5715920 5715921 CLK_A0188 CLK_A0189     FALSE 0.172 180.000 0.000 NA   NA
 5715921 5715922 CLK_A0189 CLK_A0190     FALSE 0.076 218.000 0.000 NA   NA
 5715922 5715923 CLK_A0190 CLK_A0191     FALSE 0.445 118.000 0.000 0.041   NA
 5715924 5715925 CLK_A0192 CLK_A0193     TRUE 0.923 2.000 0.000 NA   NA
 5715926 5715927 CLK_A0194 CLK_A0195     FALSE 0.041 254.000 0.000 NA   NA
 5715927 5715928 CLK_A0195 CLK_A0196     FALSE 0.435 61.000 0.000 NA   NA
 5715928 5715929 CLK_A0196 CLK_A0197     FALSE 0.338 83.000 0.000 NA   NA
 5715929 5715930 CLK_A0197 CLK_A0198     FALSE 0.346 79.000 0.000 NA   NA
 5715930 5715931 CLK_A0198 CLK_A0199     FALSE 0.099 206.000 0.000 NA   NA
 5715931 5715932 CLK_A0199 CLK_A0200     FALSE 0.004 514.000 0.000 NA   NA
 5715932 5715933 CLK_A0200 CLK_A0201     FALSE 0.345 121.000 0.000 NA   NA
 5715933 5715934 CLK_A0201 CLK_A0202     FALSE 0.049 239.000 0.000 NA   NA
 5715934 5715935 CLK_A0202 CLK_A0203     FALSE 0.330 87.000 0.000 NA   NA
 5715935 5715936 CLK_A0203 CLK_A0204     TRUE 0.912 5.000 0.000 NA   NA
 5715936 5715937 CLK_A0204 CLK_A0205     FALSE 0.065 223.000 0.000 NA   NA
 5715937 5715938 CLK_A0205 CLK_A0206     FALSE 0.332 86.000 0.000 NA   NA
 5715938 5715939 CLK_A0206 CLK_A0207     FALSE 0.288 149.000 0.000 NA   NA
 5715939 5715940 CLK_A0207 CLK_A0208     FALSE 0.108 203.000 0.000 NA   NA
 5715940 5715941 CLK_A0208 CLK_A0209     FALSE 0.330 87.000 0.000 NA   NA
 5715941 5715942 CLK_A0209 CLK_A0210     TRUE 0.792 28.000 0.000 NA   NA
 5715942 5715943 CLK_A0210 CLK_A0211     TRUE 0.901 11.000 0.000 NA   NA
 5715943 5715944 CLK_A0211 CLK_A0212     FALSE 0.467 58.000 0.000 NA   NA
 5715944 5715945 CLK_A0212 CLK_A0213     TRUE 0.764 31.000 0.000 NA   NA
 5715945 5715946 CLK_A0213 CLK_A0214     FALSE 0.417 63.000 0.000 NA   NA
 5715946 5715947 CLK_A0214 CLK_A0215     FALSE 0.435 61.000 0.000 NA   NA
 5715947 5715948 CLK_A0215 CLK_A0216     TRUE 0.873 17.000 0.000 NA   NA
 5715948 5715949 CLK_A0216 CLK_A0217     TRUE 0.699 36.000 0.000 NA   NA
 5715949 5715950 CLK_A0217 CLK_A0218     FALSE 0.003 646.000 0.000 NA   NA
 5715950 5715951 CLK_A0218 CLK_A0219     FALSE 0.344 111.000 0.000 NA   NA
 5715952 5715953 CLK_A0220 CLK_A0221     FALSE 0.003 673.000 0.000 NA   NA
 5715954 5715955 CLK_A0222 CLK_A0223   spoIIID TRUE 0.890 21.000 0.000 0.041   NA
 5715955 5715956 CLK_A0223 CLK_A0224 spoIIID   FALSE 0.344 111.000 0.000 NA   NA
 5715958 5715959 CLK_A0226 CLK_A0227     TRUE 0.945 -22.000 0.000 NA   NA
 5715959 5715960 CLK_A0227 CLK_A0228     FALSE 0.008 385.000 0.000 NA   NA
 5715960 5715961 CLK_A0228 CLK_A0229     FALSE 0.005 439.000 0.000 NA   NA
 5715961 5715962 CLK_A0229 CLK_A0230     FALSE 0.256 157.000 0.000 NA   NA
 5715962 5715963 CLK_A0230 CLK_A0231     FALSE 0.351 77.000 0.000 NA   NA
 5715963 5715964 CLK_A0231 CLK_A0232     FALSE 0.341 123.000 0.000 NA   NA
 5715964 5715965 CLK_A0232 CLK_A0233     FALSE 0.015 316.000 0.000 NA   NA
 5715965 5715966 CLK_A0233 CLK_A0234     TRUE 0.566 49.000 0.000 NA   NA
 5715966 5715967 CLK_A0234 CLK_A0235     FALSE 0.163 182.000 0.000 NA   NA
 5715967 5715968 CLK_A0235 CLK_A0236     TRUE 0.593 45.000 0.000 NA   NA
 5715970 5715971 CLK_A0238 CLK_A0239     FALSE 0.533 52.000 0.000 NA   NA
 5715971 5715972 CLK_A0239 CLK_A0240     FALSE 0.007 398.000 0.000 NA   NA
 5715972 5715973 CLK_A0240 CLK_A0241     FALSE 0.028 276.000 0.000 NA   NA
 5715973 5715974 CLK_A0241 CLK_A0242     FALSE 0.006 409.000 0.000 NA   NA
 5715974 5715975 CLK_A0242 CLK_A0243     FALSE 0.387 68.000 0.000 NA   NA
 5715975 5715976 CLK_A0243 CLK_A0244     TRUE 0.816 25.000 0.000 NA   NA
 5715976 5715977 CLK_A0244 CLK_A0245     FALSE 0.435 61.000 0.000 NA   NA
 5715977 5715978 CLK_A0245 CLK_A0246     TRUE 0.764 31.000 0.000 NA   NA
 5715978 5715979 CLK_A0246 CLK_A0247     TRUE 0.934 -3.000 0.000 NA   NA
 5715979 5715980 CLK_A0247 CLK_A0248     FALSE 0.426 62.000 0.000 NA   NA
 5715980 5715981 CLK_A0248 CLK_A0249     TRUE 0.699 36.000 0.000 NA   NA
 5715981 5715982 CLK_A0249 CLK_A0250     TRUE 0.661 39.000 0.000 NA   NA
 5715982 5715983 CLK_A0250 CLK_A0251     FALSE 0.399 66.000 0.000 NA   NA
 5715983 5715984 CLK_A0251 CLK_A0252     FALSE 0.496 56.000 0.000 NA   NA
 5715984 5715985 CLK_A0252 CLK_A0253     FALSE 0.121 198.000 0.000 NA   NA
 5715985 5715986 CLK_A0253 CLK_A0254     FALSE 0.009 358.000 0.000 NA   NA
 5715986 5715987 CLK_A0254 CLK_A0255     FALSE 0.343 81.000 0.000 NA   NA
 5715987 5715988 CLK_A0255 CLK_A0256     FALSE 0.343 122.000 0.000 NA   NA
 5715988 5715989 CLK_A0256 CLK_A0257     FALSE 0.272 154.000 0.000 NA   NA
 5715989 5715990 CLK_A0257 CLK_A0258     FALSE 0.153 185.000 0.000 NA   NA
 5715990 5715991 CLK_A0258 CLK_A0259     FALSE 0.333 105.000 0.000 NA   NA
 5715991 5715992 CLK_A0259 CLK_A0260     FALSE 0.333 129.000 0.000 NA   NA
 5715992 5715993 CLK_A0260 CLK_A0261     FALSE 0.522 53.000 0.000 NA   NA
 5715993 5715994 CLK_A0261 CLK_A0262     FALSE 0.394 67.000 0.000 NA   NA
 5715994 5715995 CLK_A0262 CLK_A0263     FALSE 0.373 71.000 0.000 NA   NA
 5715995 5715996 CLK_A0263 CLK_A0264     TRUE 0.554 50.000 0.000 NA   NA
 5715996 5715997 CLK_A0264 CLK_A0265     FALSE 0.337 108.000 0.000 NA   NA
 5715997 5715998 CLK_A0265 CLK_A0266     FALSE 0.417 63.000 0.000 NA   NA
 5715998 5715999 CLK_A0266 CLK_A0267     FALSE 0.333 105.000 0.000 NA   NA
 5715999 5716000 CLK_A0267 CLK_A0268     FALSE 0.324 100.000 0.000 NA   NA
 5716000 5716001 CLK_A0268 CLK_A0269     FALSE 0.008 384.000 0.000 NA   NA
 5716001 5716002 CLK_A0269 CLK_A0270     TRUE 0.816 25.000 0.000 NA   NA
 5716002 5716003 CLK_A0270 CLK_A0271     FALSE 0.031 271.000 0.000 NA   NA
 5716005 5716006 CLK_A0273 CLK_A0274     FALSE 0.325 90.000 0.000 NA   NA
 5716006 5716007 CLK_A0274 CLK_A0275     FALSE 0.021 295.000 0.000 NA   NA
 5716007 5716008 CLK_A0275 CLK_A0276     TRUE 0.887 14.000 0.000 NA   NA
 5716008 5716009 CLK_A0276 CLK_A0277     FALSE 0.351 115.000 0.000 NA   NA
 5716009 5716010 CLK_A0277 CLK_A0278     FALSE 0.335 84.000 0.000 NA   NA
 5716010 5716011 CLK_A0278 CLK_A0279     FALSE 0.005 466.000 0.000 NA   NA
 5716011 5716012 CLK_A0279 CLK_A0280     TRUE 0.845 21.000 0.000 NA   NA
 5716012 5716013 CLK_A0280 CLK_A0281     TRUE 0.853 20.000 0.000 NA   NA
 5716013 5716014 CLK_A0281 CLK_A0282     TRUE 0.823 24.000 0.000 NA   NA
 5716014 5716015 CLK_A0282 CLK_A0283     TRUE 0.764 31.000 0.000 NA   NA
 5716015 5716016 CLK_A0283 CLK_A0284     FALSE 0.114 201.000 0.000 NA   NA
 5716016 5716017 CLK_A0284 CLK_A0285     FALSE 0.045 244.000 0.000 NA   NA
 5716017 5716018 CLK_A0285 CLK_A0286     TRUE 0.994 -10.000 0.000 0.014 Y NA
 5716018 5716019 CLK_A0286 CLK_A0287     TRUE 0.942 -13.000 0.000 NA   NA
 5716019 5716020 CLK_A0287 CLK_A0288     TRUE 0.620 42.000 0.000 NA   NA
 5716020 5716021 CLK_A0288 CLK_A0289     TRUE 0.938 -7.000 0.000 NA   NA
 5716021 5716022 CLK_A0289 CLK_A0290     FALSE 0.318 165.000 0.000 0.006   NA
 5716022 5716023 CLK_A0290 CLK_A0291     FALSE 0.343 91.000 0.000 1.000   NA
 5716023 5716024 CLK_A0291 CLK_A0292     FALSE 0.023 294.000 0.000 1.000   NA
 5716024 5716025 CLK_A0292 CLK_A0293     FALSE 0.013 337.000 0.000 1.000   NA
 5716025 5716026 CLK_A0293 CLK_A0294     FALSE 0.480 111.000 0.000 0.000   NA
 5716026 5716027 CLK_A0294 CLK_A0295     TRUE 0.930 0.000 0.000 NA   NA
 5716027 5716028 CLK_A0295 CLK_A0296     FALSE 0.003 608.000 0.000 NA   NA
 5716028 5716029 CLK_A0296 CLK_A0297     TRUE 0.566 49.000 0.000 NA   NA
 5716029 5716030 CLK_A0297 CLK_A0298     FALSE 0.004 475.000 0.000 NA   NA
 5716030 5716031 CLK_A0298 CLK_A0299     FALSE 0.331 131.000 0.000 NA   NA
 5716031 5716032 CLK_A0299 CLK_A0300     TRUE 0.918 3.000 0.000 NA   NA
 5716032 5716033 CLK_A0300 CLK_A0301     FALSE 0.351 77.000 0.000 NA   NA
 5716033 5716034 CLK_A0301 CLK_A0302     FALSE 0.311 142.000 0.000 NA   NA
 5716034 5716035 CLK_A0302 CLK_A0303     TRUE 0.912 5.000 0.000 NA   NA
 5716035 5716036 CLK_A0303 CLK_A0304     TRUE 0.882 15.000 0.000 NA   NA
 5716036 5716037 CLK_A0304 CLK_A0305     TRUE 0.947 -39.000 0.000 NA   NA
 5716037 5716038 CLK_A0305 CLK_A0306     FALSE 0.238 162.000 0.000 NA   NA
 5716038 5716039 CLK_A0306 CLK_A0307     FALSE 0.193 173.000 0.000 NA   NA
 5716039 5716040 CLK_A0307 CLK_A0308     FALSE 0.319 96.000 0.000 NA   NA
 5716040 5716041 CLK_A0308 CLK_A0309     TRUE 0.990 18.000 0.750 NA   NA
 5716041 5716042 CLK_A0309 CLK_A0310     FALSE 0.348 120.000 0.000 NA   NA
 5716042 5716043 CLK_A0310 CLK_A0311     TRUE 0.816 25.000 0.000 NA   NA
 5716043 5716044 CLK_A0311 CLK_A0312     TRUE 0.876 68.000 0.500 1.000 N NA
 5716044 5716045 CLK_A0312 CLK_A0313     FALSE 0.361 74.000 0.000 NA   NA
 5716045 5716046 CLK_A0313 CLK_A0314     FALSE 0.335 107.000 0.000 NA   NA
 5716046 5716047 CLK_A0314 CLK_A0315     FALSE 0.345 121.000 0.000 NA   NA
 5716047 5716048 CLK_A0315 CLK_A0316     TRUE 0.699 36.000 0.000 NA   NA
 5716048 5716049 CLK_A0316 CLK_A0317     FALSE 0.366 73.000 0.000 NA   NA
 5716049 5716050 CLK_A0317 CLK_A0318     FALSE 0.076 218.000 0.000 NA   NA
 5716050 5716051 CLK_A0318 CLK_A0319     TRUE 0.995 -10.000 0.583 NA   NA
 5716051 5716052 CLK_A0319 CLK_A0320     TRUE 0.863 83.000 0.571 NA   NA
 5716052 5716053 CLK_A0320 CLK_A0321     TRUE 0.883 71.000 0.600 NA   NA
 5716053 5716054 CLK_A0321 CLK_A0322     TRUE 0.685 183.000 0.500 NA   NA
 5716054 5716055 CLK_A0322 CLK_A0323     FALSE 0.522 53.000 0.000 NA   NA
 5716055 5716056 CLK_A0323 CLK_A0324     TRUE 0.947 -45.000 0.000 NA   NA
 5716056 5716057 CLK_A0324 CLK_A0325     FALSE 0.341 123.000 0.000 NA   NA
 5716057 5716058 CLK_A0325 CLK_A0326     TRUE 0.577 47.000 0.000 NA   NA
 5716058 5716059 CLK_A0326 CLK_A0327     FALSE 0.325 136.000 0.000 NA   NA
 5716059 5716060 CLK_A0327 CLK_A0328     TRUE 0.873 17.000 0.000 NA   NA
 5716060 5716061 CLK_A0328 CLK_A0329     FALSE 0.330 132.000 0.000 NA   NA
 5716061 5715733 CLK_A0329 CLK_A0001     FALSE 0.004 538.000 0.000 NA   NA