MicrobesOnline Operon Predictions for Cellvibrio japonicus Ueda107

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
5707942	5707943	CJA_0001	CJA_0002	dnaA	dnaN	TRUE	0.971	71.000	0.328	1.000	Y	NA
5707943	5707944	CJA_0002	CJA_0003	dnaN	recF	TRUE	0.982	34.000	0.318	1.000	Y	NA
5707944	5707945	CJA_0003	CJA_0004	recF	gyrB	TRUE	0.978	70.000	0.249	0.004	Y	NA
5707945	5707946	CJA_0004	CJA_0005	gyrB		FALSE	0.120	130.000	0.000	NA		NA
5707950	5707951	CJA_0009	CJA_0010	nrtA		TRUE	0.999	3.000	0.703	NA	Y	NA
5707951	5707952	CJA_0010	CJA_0011		nrtC	TRUE	1.000	5.000	0.730	0.002	Y	NA
5707952	5707953	CJA_0011	CJA_0012	nrtC	cynS	TRUE	0.988	12.000	0.128	1.000	Y	NA
5707953	5707954	CJA_0012	CJA_0013	cynS		TRUE	0.917	9.000	0.011	NA		NA
5707954	5707955	CJA_0013	CJA_0014			FALSE	0.038	202.000	0.000	NA		NA
5707955	5707956	CJA_0014	CJA_0015			TRUE	0.871	-13.000	0.015	NA		NA
5707956	5707957	CJA_0015	CJA_0016			TRUE	0.734	12.000	0.000	NA		NA
5707957	5707958	CJA_0016	CJA_0017			FALSE	0.301	69.000	0.000	NA		NA
5707958	5707959	CJA_0017	CJA_0018			FALSE	0.005	700.000	0.000	NA		NA
5707959	5707960	CJA_0018	CJA_0020		cbp35A	FALSE	0.006	558.000	0.000	NA		NA
5707961	5707962	CJA_0019	CJA_0021			TRUE	0.587	-28.000	0.000	NA		NA
5707962	5707963	CJA_0021	CJA_0022			TRUE	0.998	0.000	0.763	NA		NA
5707963	5707964	CJA_0022	CJA_0023			TRUE	0.626	62.000	0.000	0.021		NA
5707965	5707966	CJA_0024	CJA_0025	leuA		FALSE	0.010	515.000	0.000	1.000	N	NA
5707968	5707969	CJA_0027	CJA_0028			TRUE	0.998	12.000	0.800	NA	Y	NA
5707969	5707970	CJA_0028	CJA_0029			FALSE	0.036	425.000	0.000	NA	Y	NA
5707970	5707971	CJA_0029	CJA_0030			TRUE	0.985	7.000	0.059	NA	Y	NA
5707971	5707972	CJA_0030	CJA_0031			TRUE	0.999	-3.000	0.800	NA	Y	NA
5707972	5707973	CJA_0031	CJA_0032			TRUE	0.780	52.000	0.069	NA	N	NA
5707974	5707975	CJA_0033	CJA_0034			TRUE	0.828	-3.000	0.000	NA		NA
5707976	5707977	CJA_0035	CJA_0036			TRUE	0.908	92.000	0.353	NA		NA
5707977	5707978	CJA_0036	CJA_0037		rstA	TRUE	0.876	25.000	0.072	NA		NA
5707978	5707979	CJA_0037	CJA_0038	rstA		TRUE	0.983	10.000	0.048	1.000	Y	NA
5707979	5707980	CJA_0038	CJA_0039			FALSE	0.007	619.000	0.000	1.000		NA
5707980	5707981	CJA_0039	CJA_0040			TRUE	0.986	51.000	1.000	NA		NA
5707981	5707982	CJA_0040	CJA_0041		pme8A	FALSE	0.212	97.000	0.000	NA		NA
5707982	5707983	CJA_0041	CJA_0042	pme8A	pel1D	FALSE	0.089	386.000	0.000	0.006	Y	NA
5707983	5707984	CJA_0042	CJA_0043	pel1D		FALSE	0.070	165.000	0.000	NA		NA
5707984	5707985	CJA_0043	CJA_0044		pel1C	FALSE	0.219	95.000	0.000	NA		NA
5707985	5707986	CJA_0044	CJA_0045	pel1C	pel1F	FALSE	0.033	367.000	0.000	0.006		NA
5707986	5707987	CJA_0045	CJA_0046	pel1F		FALSE	0.007	835.000	0.000	1.000	N	NA
5707987	5707988	CJA_0046	CJA_0047			TRUE	1.000	0.000	0.881	0.001	Y	NA
5707988	5707989	CJA_0047	CJA_0048			TRUE	1.000	-3.000	0.976	0.001	Y	NA
5707989	5707990	CJA_0048	CJA_0049			TRUE	0.996	34.000	0.944	1.000	Y	NA
5707990	5707991	CJA_0049	CJA_0050			TRUE	0.999	-18.000	0.937	0.066	Y	NA
5707991	5707992	CJA_0050	CJA_0051			TRUE	0.999	10.000	0.937	1.000	Y	NA
5707995	5707996	CJA_0054	CJA_0055	uvs118	uvs117	TRUE	0.753	16.000	0.000	1.000	N	NA
5707996	5707997	CJA_0055	CJA_0056	uvs117	glyS	TRUE	0.864	52.000	0.123	1.000	N	NA
5707997	5707998	CJA_0056	CJA_0057	glyS	glyQ	TRUE	1.000	0.000	0.651	0.001	Y	NA
5708001	5708002	CJA_0060	CJA_0061	uvs111	uvs110	FALSE	0.081	184.000	0.000	1.000	N	NA
5708002	5708003	CJA_0061	CJA_0062	uvs110		TRUE	0.851	33.000	0.090	NA		NA
5708003	5708004	CJA_0062	CJA_0063			TRUE	0.998	-3.000	0.923	NA		NA
5708004	5708005	CJA_0063	CJA_0064			FALSE	0.223	110.000	0.000	1.000		NA
5708005	5708006	CJA_0064	CJA_0065			TRUE	0.857	0.000	0.000	NA		NA
5708006	5708007	CJA_0065	CJA_0066		gt4G	FALSE	0.278	78.000	0.000	NA		NA
5708007	5708008	CJA_0066	CJA_0067	gt4G		TRUE	0.960	-13.000	0.106	1.000	N	NA
5708008	5708009	CJA_0067	CJA_0068			TRUE	0.977	-3.000	0.085	1.000		NA
5708009	5708010	CJA_0068	CJA_0070			TRUE	0.854	3.000	0.000	NA		NA
5708011	5708012	CJA_0069	CJA_0071			FALSE	0.264	82.000	0.000	NA		NA
5708012	5708013	CJA_0071	CJA_0072			FALSE	0.384	38.000	0.000	NA		NA
5708013	5708014	CJA_0072	CJA_0073		cheB	TRUE	0.958	22.000	0.103	0.015		NA
5708014	5708015	CJA_0073	CJA_0074	cheB	pilL	TRUE	0.981	20.000	0.217	0.015		NA
5708015	5708016	CJA_0074	CJA_0075	pilL	pilK	TRUE	0.994	10.000	0.217	1.000	Y	NA
5708016	5708017	CJA_0075	CJA_0076	pilK	pilJ	TRUE	0.965	54.000	0.241	1.000	Y	NA
5708017	5708018	CJA_0076	CJA_0077	pilJ	pilI	TRUE	0.990	106.000	0.795	0.015	Y	NA
5708018	5708019	CJA_0077	CJA_0078	pilI	pilH	TRUE	0.799	90.000	0.025	1.000	Y	NA
5708019	5708020	CJA_0078	CJA_0079	pilH		TRUE	0.662	-15.000	0.000	NA		NA
5708020	5708021	CJA_0079	CJA_0080		pilG	TRUE	0.796	8.000	0.000	NA		NA
5708022	5708023	CJA_0081	CJA_0082	gshB		TRUE	0.920	23.000	0.089	1.000	N	NA
5708023	5708024	CJA_0082	CJA_0083			TRUE	0.915	18.000	0.064	NA	N	NA
5708024	5708025	CJA_0083	CJA_0084			TRUE	0.993	4.000	0.263	NA	N	NA
5708026	5708027	CJA_0085	CJA_0086		pilU	FALSE	0.422	33.000	0.000	NA		NA
5708027	5708028	CJA_0086	CJA_0087	pilU	pilT	TRUE	0.995	22.000	0.436	0.020	Y	NA
5708029	5708030	CJA_0088	CJA_0089		proC	TRUE	0.864	50.000	0.158	NA		NA
5708030	5708031	CJA_0089	CJA_0090	proC		TRUE	0.930	24.000	0.152	NA		NA
5708031	5708032	CJA_0090	CJA_0091			TRUE	0.991	1.000	0.220	NA		NA
5708032	5708033	CJA_0091	CJA_0092			FALSE	0.164	168.000	0.010	NA		NA
5708034	5708035	CJA_0093	CJA_0094			FALSE	0.228	92.000	0.000	NA		NA
5708035	5708036	CJA_0094	CJA_0095			FALSE	0.345	47.000	0.000	NA		NA
5708036	5708037	CJA_0095	CJA_0096			TRUE	0.988	-3.000	0.206	NA		NA
5708037	5708038	CJA_0096	CJA_0097			TRUE	0.994	0.000	0.303	NA		NA
5708038	5708039	CJA_0097	CJA_0098			TRUE	0.810	-37.000	0.014	1.000		NA
5708039	5708040	CJA_0098	CJA_0099		pigH	FALSE	0.116	294.000	0.094	1.000		NA
5708040	5708041	CJA_0099	CJA_0100	pigH		TRUE	0.996	12.000	0.758	NA		NA
5708041	5708042	CJA_0100	CJA_0101		acpC	TRUE	0.974	-7.000	0.158	NA		NA
5708042	5708043	CJA_0101	CJA_0102	acpC		TRUE	0.525	79.000	0.002	1.000		NA
5708044	5708045	CJA_0103	CJA_0104		fkbO	TRUE	0.805	7.000	0.000	NA		NA
5708045	5708046	CJA_0104	CJA_0105	fkbO		TRUE	0.908	-18.000	0.057	NA		NA
5708048	5708049	CJA_0107	CJA_0108			FALSE	0.283	102.000	0.000	1.000	N	NA
5708049	5708050	CJA_0108	CJA_0109			TRUE	0.761	27.000	0.019	NA		NA
5708050	5708051	CJA_0109	CJA_0110		gt2J	TRUE	0.940	11.000	0.045	NA		NA
5708051	5708052	CJA_0110	CJA_0111	gt2J		TRUE	0.816	21.000	0.018	NA		NA
5708052	5708053	CJA_0111	CJA_0112			TRUE	0.997	2.000	0.532	1.000		NA
5708053	5708054	CJA_0112	CJA_0113			TRUE	0.994	17.000	0.732	NA		NA
5708054	5708055	CJA_0113	CJA_0114			TRUE	0.988	-7.000	0.305	NA		NA
5708055	5708056	CJA_0114	CJA_0115			TRUE	0.796	8.000	0.000	NA		NA
5708056	5708057	CJA_0115	CJA_0116			TRUE	0.998	3.000	0.397	NA	Y	NA
5708057	5708058	CJA_0116	CJA_0117		fabF-2	TRUE	0.999	0.000	0.486	1.000	Y	NA
5708058	5708059	CJA_0117	CJA_0118	fabF-2		TRUE	0.486	36.000	0.000	1.000		NA
5708059	5708060	CJA_0118	CJA_0119		metX	FALSE	0.136	142.000	0.000	1.000		NA
5708060	5708061	CJA_0119	CJA_0120	metX	metW	TRUE	0.996	5.000	0.509	NA	N	NA
5708061	5708062	CJA_0120	CJA_0121	metW		TRUE	0.947	14.000	0.100	NA		NA
5708062	5708063	CJA_0121	CJA_0122		rdgB	TRUE	0.969	3.000	0.050	NA		NA
5708063	5708064	CJA_0122	CJA_0123	rdgB		TRUE	0.993	0.000	0.218	1.000	N	NA
5708064	5708065	CJA_0123	CJA_0124			FALSE	0.295	72.000	0.000	NA		NA
5708065	5708066	CJA_0124	CJA_0125		recQ	TRUE	0.681	-13.000	0.000	NA		NA
5708066	5708067	CJA_0125	CJA_0126	recQ		FALSE	0.015	281.000	0.000	NA		NA
5708067	5708068	CJA_0126	CJA_0127			FALSE	0.152	115.000	0.000	NA		NA
5708070	5708071	CJA_0129	CJA_0130			FALSE	0.301	69.000	0.000	NA		NA
5708071	5708072	CJA_0130	CJA_0131			TRUE	0.997	-3.000	0.600	NA		NA
5708072	5708073	CJA_0131	CJA_0132			FALSE	0.422	33.000	0.000	NA		NA
5708073	5708074	CJA_0132	CJA_0133			FALSE	0.329	55.000	0.000	NA		NA
5708074	5708075	CJA_0133	CJA_0134			TRUE	0.787	9.000	0.000	NA		NA
5708076	5708077	CJA_0135	CJA_0136			FALSE	0.004	976.000	0.000	NA		NA
5708078	5708079	CJA_0137	CJA_0138			TRUE	0.995	21.000	0.619	0.002		NA
5708079	5708080	CJA_0138	CJA_0139			TRUE	0.999	0.000	0.762	1.000		NA
5708080	5708081	CJA_0139	CJA_0140			TRUE	0.999	-3.000	0.882	1.000	Y	NA
5708081	5708082	CJA_0140	CJA_0141			TRUE	0.508	38.000	0.000	1.000	N	NA
5708083	5708084	CJA_0142	CJA_0143			FALSE	0.440	59.000	0.000	1.000	N	NA
5708086	5708087	CJA_0145	CJA_0146			TRUE	0.811	31.000	0.053	NA		NA
5708087	5708088	CJA_0146	CJA_0147			FALSE	0.028	220.000	0.000	NA		NA
5708088	5708089	CJA_0147	CJA_0148			FALSE	0.005	679.000	0.000	NA		NA
5708089	5708090	CJA_0148	CJA_0149			FALSE	0.010	327.000	0.000	NA		NA
5708090	5708091	CJA_0149	CJA_0150		phoB	TRUE	0.991	37.000	0.453	0.033	Y	NA
5708091	5708092	CJA_0150	CJA_0151	phoB	ubiA	TRUE	0.677	86.000	0.043	1.000	N	NA
5708092	5708093	CJA_0151	CJA_0152	ubiA	ubiC	TRUE	0.986	21.000	0.248	NA	Y	NA
5708094	5708095	CJA_0153	CJA_0154	hup		FALSE	0.469	46.000	0.000	1.000	N	NA
5708097	5708098	CJA_0156	CJA_0157	hisB	hisH	TRUE	0.984	22.000	0.111	0.005	Y	NA
5708098	5708099	CJA_0157	CJA_0158	hisH	hisA	TRUE	0.960	58.000	0.120	0.005	Y	NA
5708099	5708100	CJA_0158	CJA_0159	hisA	hisF	TRUE	0.997	14.000	0.433	0.005	Y	NA
5708103	5708104	CJA_0162	CJA_0163	algQ	dsbH	TRUE	0.787	96.000	0.133	1.000	N	NA
5708106	5708107	CJA_0164	CJA_0166	gshA		TRUE	0.507	85.000	0.012	NA		NA
5708107	5708108	CJA_0166	CJA_0167			FALSE	0.422	33.000	0.000	NA		NA
5708108	5708109	CJA_0167	CJA_0168			FALSE	0.087	161.000	0.000	NA	N	NA
5708109	5708110	CJA_0168	CJA_0169			TRUE	0.983	13.000	0.231	1.000	N	NA
5708110	5708111	CJA_0169	CJA_0170		urh105A	TRUE	0.607	128.000	0.115	1.000		NA
5708111	5708112	CJA_0170	CJA_0171	urh105A		TRUE	0.967	96.000	0.750	1.000		NA
5708112	5708113	CJA_0171	CJA_0172		pga28A	FALSE	0.034	243.000	0.000	1.000	N	NA
5708113	5708114	CJA_0172	CJA_0173	pga28A		FALSE	0.071	163.000	0.000	NA		NA
5708115	5708116	CJA_0174	CJA_0175			FALSE	0.155	187.000	0.007	1.000	N	NA
5708116	5708117	CJA_0175	CJA_0176		pntA	TRUE	0.998	15.000	0.829	0.001		NA
5708117	5708118	CJA_0176	CJA_0177	pntA		TRUE	0.966	16.000	0.058	0.001		NA
5708118	5708119	CJA_0177	CJA_0178			FALSE	0.278	78.000	0.000	NA		NA
5708121	5708122	CJA_0180	CJA_0181		pme8C	TRUE	0.664	87.000	0.000	1.000	Y	NA
5708122	5708123	CJA_0181	CJA_0182	pme8C		FALSE	0.130	153.000	0.000	1.000	N	NA
5708124	5708125	CJA_0183	CJA_0184	fbp	fbaA	TRUE	0.954	16.000	0.014	1.000	Y	NA
5708125	5708126	CJA_0184	CJA_0185	fbaA		TRUE	0.564	106.000	0.000	1.000	Y	NA
5708126	5708127	CJA_0185	CJA_0186			TRUE	0.681	-13.000	0.000	NA		NA
5708127	5708128	CJA_0186	CJA_0187			FALSE	0.013	299.000	0.000	NA		NA
5708128	5708129	CJA_0187	CJA_0188			TRUE	0.854	3.000	0.000	NA		NA
5708129	5708130	CJA_0188	CJA_0189			FALSE	0.397	36.000	0.000	NA		NA
5708130	5708131	CJA_0189	CJA_0190			FALSE	0.119	131.000	0.000	NA		NA
5708131	5708132	CJA_0190	CJA_0191			TRUE	0.495	79.000	0.007	NA		NA
5708132	5708133	CJA_0191	CJA_0192			TRUE	0.555	52.000	0.004	NA		NA
5708134	5708135	CJA_0193	CJA_0194			FALSE	0.484	27.000	0.000	NA		NA
5708135	5708136	CJA_0194	CJA_0195			FALSE	0.060	171.000	0.000	NA		NA
5708136	5708137	CJA_0195	CJA_0196			TRUE	0.997	-6.000	0.524	NA	Y	NA
5708137	5708138	CJA_0196	CJA_0197			TRUE	0.748	78.000	0.080	NA	N	NA
5708138	5708139	CJA_0197	CJA_0198			FALSE	0.053	192.000	0.000	NA	N	NA
5708139	5708140	CJA_0198	CJA_0199		ycel3	TRUE	0.971	72.000	0.676	NA		NA
5708140	5708141	CJA_0199	CJA_0200	ycel3		FALSE	0.010	333.000	0.000	NA		NA
5708141	5708142	CJA_0200	CJA_0201			TRUE	0.989	-3.000	0.230	NA		NA
5708144	5708145	CJA_0203	CJA_0204	rph	cel3A	FALSE	0.025	274.000	0.000	1.000	N	NA
5708146	5708147	CJA_0205	CJA_0206	metF	ahcY	TRUE	0.736	81.000	0.061	1.000	N	NA
5708147	5708148	CJA_0206	CJA_0207	ahcY	metK	TRUE	0.914	111.000	0.114	0.001	Y	NA
5708148	5708149	CJA_0207	CJA_0208	metK		TRUE	0.703	72.000	0.036	1.000	N	NA
5708149	5708150	CJA_0208	CJA_0209			FALSE	0.208	98.000	0.000	NA		NA
5708151	5708152	CJA_0210	CJA_0211	tkt	pgk	TRUE	0.522	138.000	0.002	1.000	Y	NA
5708152	5708153	CJA_0211	CJA_0212	pgk	pel3A	FALSE	0.010	436.000	0.000	1.000		NA
5708155	5708156	CJA_0214	CJA_0215	glu81A		FALSE	0.015	351.000	0.000	1.000	N	NA
5708156	5708157	CJA_0215	CJA_0216			FALSE	0.219	95.000	0.000	NA		NA
5708157	5708158	CJA_0216	CJA_0217			TRUE	0.705	13.000	0.000	NA		NA
5708158	5708159	CJA_0217	CJA_0218			FALSE	0.390	37.000	0.000	NA		NA
5708163	5708164	CJA_0222	CJA_0223		cel3C	FALSE	0.015	282.000	0.000	NA		NA
5708164	5708165	CJA_0223	CJA_0224	cel3C	glu16B	TRUE	0.819	71.000	0.000	0.027	Y	NA
5708165	5708166	CJA_0224	CJA_0225	glu16B	glu16A	TRUE	0.841	53.000	0.000	0.027	Y	NA
5708167	5708168	CJA_0226	CJA_0227			TRUE	0.662	-15.000	0.000	NA		NA
5708168	5708169	CJA_0227	CJA_0228			TRUE	0.947	18.000	0.133	NA		NA
5708169	5708170	CJA_0228	CJA_0229			FALSE	0.010	334.000	0.000	NA		NA
5708171	5708172	CJA_0230	CJA_0231			FALSE	0.292	73.000	0.000	NA		NA
5708175	5708176	CJA_0234	CJA_0235			TRUE	0.587	20.000	0.000	NA		NA
5708177	5708178	CJA_0236	CJA_0237	man26C		FALSE	0.015	280.000	0.000	NA		NA
5708182	5708183	CJA_0241	CJA_0242		unk1	TRUE	0.711	173.000	0.400	NA	N	NA
5708183	5708184	CJA_0242	CJA_0243	unk1	unk2	TRUE	0.991	3.000	0.077	NA	Y	NA
5708184	5708185	CJA_0243	CJA_0244	unk2	man5D	TRUE	0.977	11.000	0.031	1.000	Y	NA
5708188	5708189	CJA_0247	CJA_0248	plt103B		FALSE	0.004	1671.000	0.000	NA	N	NA
5708189	5708190	CJA_0248	CJA_0249		algR	TRUE	0.878	20.000	0.000	NA	Y	NA
5708190	5708191	CJA_0249	CJA_0250	algR	algZ	TRUE	0.999	7.000	0.775	0.033	Y	NA
5708192	5708193	CJA_0251	CJA_0252	argH		FALSE	0.032	213.000	0.000	NA		NA
5708193	5708194	CJA_0252	CJA_0253			FALSE	0.121	129.000	0.000	NA		NA
5708194	5708195	CJA_0253	CJA_0254			TRUE	0.731	18.000	0.000	1.000	N	NA
5708195	5708196	CJA_0254	CJA_0255			FALSE	0.370	74.000	0.000	1.000		NA
5708196	5708197	CJA_0255	CJA_0256			TRUE	0.787	9.000	0.000	NA		NA
5708198	5708199	CJA_0257	CJA_0258	glc13A		FALSE	0.007	424.000	0.000	NA		NA
5708199	5708200	CJA_0258	CJA_0259			FALSE	0.366	41.000	0.000	NA		NA
5708200	5708201	CJA_0259	CJA_0260		phnL	TRUE	0.750	-7.000	0.000	NA		NA
5708201	5708202	CJA_0260	CJA_0261	phnL		TRUE	0.857	1.000	0.000	NA		NA
5708202	5708203	CJA_0261	CJA_0262			TRUE	0.857	2.000	0.000	NA		NA
5708203	5708204	CJA_0262	CJA_0263			FALSE	0.035	207.000	0.000	NA		NA
5708204	5708205	CJA_0263	CJA_0264			FALSE	0.338	50.000	0.000	NA		NA
5708206	5708207	CJA_0265	CJA_0266			TRUE	0.937	-3.000	0.000	0.061		NA
5708208	5708209	CJA_0267	CJA_0268			TRUE	0.677	14.000	0.000	NA		NA
5708213	5708214	CJA_0272	CJA_0273	gt1B		FALSE	0.265	100.000	0.000	1.000		NA
5708214	5708215	CJA_0273	CJA_0274			FALSE	0.013	935.000	0.000	0.064		NA
5708215	5708216	CJA_0274	CJA_0275			TRUE	0.973	0.000	0.000	1.000	Y	NA
5708217	5708218	CJA_0276	CJA_0277	cbp6B		TRUE	0.998	1.000	0.667	NA		NA
5708219	5708220	CJA_0278	CJA_0279			FALSE	0.152	115.000	0.000	NA		NA
5708220	5708221	CJA_0279	CJA_0280		cebR	FALSE	0.185	104.000	0.000	NA		NA
5708221	5708222	CJA_0280	CJA_0281	cebR		TRUE	0.946	25.000	0.190	NA	N	NA
5708222	5708223	CJA_0281	CJA_0282			FALSE	0.067	167.000	0.000	NA		NA
5708224	5708225	CJA_0283	CJA_0284		tre37A	FALSE	0.128	154.000	0.000	1.000	N	NA
5708226	5708227	CJA_0285	CJA_0286		cbbY	TRUE	0.677	14.000	0.000	NA		NA
5708228	5708229	CJA_0287	CJA_0288	hex20B		FALSE	0.012	304.000	0.000	NA		NA
5708232	5708233	CJA_0291	CJA_0292			TRUE	0.932	-10.000	0.053	NA		NA
5708234	5708235	CJA_0293	CJA_0294		pepP	TRUE	0.959	32.000	0.329	NA		NA
5708235	5708236	CJA_0294	CJA_0295	pepP	ubiF	TRUE	0.944	7.000	0.012	1.000	N	NA
5708236	5708237	CJA_0295	CJA_0296	ubiF		TRUE	0.528	24.000	0.000	NA		NA
5708237	5708238	CJA_0296	CJA_0297			FALSE	0.338	50.000	0.000	NA		NA
5708238	5708239	CJA_0297	CJA_0298			FALSE	0.016	269.000	0.000	NA		NA
5708239	5708240	CJA_0298	CJA_0299			FALSE	0.044	193.000	0.000	NA		NA
5708240	5708241	CJA_0299	CJA_0300			TRUE	0.854	3.000	0.000	NA		NA
5708241	5708242	CJA_0300	CJA_0301			TRUE	0.896	0.000	0.000	1.000		NA
5708243	5708244	CJA_0302	CJA_0303			FALSE	0.206	115.000	0.000	1.000		NA
5708248	5708249	CJA_0307	CJA_0308	hslO		TRUE	0.699	-12.000	0.000	NA		NA
5708249	5708250	CJA_0308	CJA_0309		hslR	TRUE	0.622	18.000	0.000	NA		NA
5708250	5708251	CJA_0309	CJA_0310	hslR		TRUE	0.929	-15.000	0.056	1.000		NA
5708252	5708253	CJA_0311	CJA_0312	nudE	cysQ	TRUE	0.965	35.000	0.373	1.000		NA
5708253	5708254	CJA_0312	CJA_0313	cysQ		FALSE	0.067	167.000	0.000	NA		NA
5708256	5708257	CJA_0315	CJA_0316		modA	FALSE	0.037	203.000	0.000	NA		NA
5708257	5708258	CJA_0316	CJA_0317	modA	modB	TRUE	0.997	27.000	0.627	0.001	Y	NA
5708258	5708259	CJA_0317	CJA_0318	modB	modC	TRUE	0.924	-7.000	0.018	1.000		NA
5708260	5708261	CJA_0319	CJA_0320	modE	moaB1	TRUE	0.626	-36.000	0.000	1.000		NA
5708261	5708262	CJA_0320	CJA_0321	moaB1	moaA	TRUE	0.840	72.000	0.000	0.003	Y	NA
5708263	5708264	CJA_0322	CJA_0323			FALSE	0.097	143.000	0.000	NA		NA
5708264	5708265	CJA_0323	CJA_0324		nirB	TRUE	0.953	55.000	0.364	1.000	N	NA
5708265	5708266	CJA_0324	CJA_0325	nirB	nirD	TRUE	0.988	22.000	0.294	0.001	N	NA
5708267	5708268	CJA_0326	CJA_0327			TRUE	0.832	-7.000	0.000	1.000	N	NA
5708268	5708269	CJA_0327	CJA_0328			FALSE	0.086	180.000	0.000	1.000	N	NA
5708269	5708270	CJA_0328	CJA_0329			TRUE	0.656	89.000	0.000	1.000	Y	NA
5708270	5708271	CJA_0329	CJA_0330			TRUE	0.991	17.000	0.600	NA		NA
5708274	5708275	CJA_0333	CJA_0334			FALSE	0.228	178.000	0.000	NA	Y	NA
5708275	5708276	CJA_0334	CJA_0335			TRUE	0.998	-3.000	0.286	0.061	Y	NA
5708277	5708278	CJA_0336	CJA_0337			FALSE	0.422	33.000	0.000	NA		NA
5708278	5708279	CJA_0337	CJA_0338			TRUE	0.997	-3.000	0.600	NA		NA
5708279	5708280	CJA_0338	CJA_0339			FALSE	0.060	171.000	0.000	NA		NA
5708280	5708281	CJA_0339	CJA_0340			TRUE	0.510	-45.000	0.000	NA		NA
5708281	5708282	CJA_0340	CJA_0341			TRUE	0.513	25.000	0.000	NA		NA
5708282	5708283	CJA_0341	CJA_0342			TRUE	0.604	19.000	0.000	NA		NA
5708283	5708284	CJA_0342	CJA_0343			TRUE	0.513	25.000	0.000	NA		NA
5708285	5708286	CJA_0344	CJA_0345		dsd	FALSE	0.022	254.000	0.000	NA	N	NA
5708286	5708287	CJA_0345	CJA_0346	dsd		TRUE	0.957	9.000	0.000	1.000	Y	NA
5708287	5708288	CJA_0346	CJA_0347			TRUE	0.980	-3.000	0.093	1.000	N	NA
5708288	5708289	CJA_0347	CJA_0348		ndeD	TRUE	0.986	-43.000	0.558	1.000	N	NA
5708289	5708290	CJA_0348	CJA_0349	ndeD		TRUE	0.997	9.000	0.654	NA	N	NA
5708290	5708291	CJA_0349	CJA_0350		hex20A	TRUE	0.851	-3.000	0.000	NA	N	NA
5708291	5708292	CJA_0350	CJA_0351	hex20A		FALSE	0.459	29.000	0.000	NA		NA
5708292	5708293	CJA_0351	CJA_0352			FALSE	0.459	29.000	0.000	NA		NA
5708293	5708294	CJA_0352	CJA_0353			FALSE	0.026	273.000	0.000	1.000	N	NA
5708294	5708295	CJA_0353	CJA_0354			FALSE	0.390	37.000	0.000	NA		NA
5708295	5708296	CJA_0354	CJA_0355			FALSE	0.404	35.000	0.000	NA		NA
5708296	5708297	CJA_0355	CJA_0356			TRUE	0.705	13.000	0.000	NA		NA
5708298	5708299	CJA_0357	CJA_0358	gt2K	mdoG	TRUE	0.986	-25.000	0.469	NA	N	NA
5708300	5708301	CJA_0359	CJA_0360	mmoS	trx	TRUE	0.501	34.000	0.000	1.000		NA
5708301	5708302	CJA_0360	CJA_0361	trx	rho	FALSE	0.076	355.000	0.087	1.000		NA
5708302	5708303	CJA_0361	CJA_0362	rho	ubiD	FALSE	0.296	144.000	0.025	NA	N	NA
5708306	5708307	CJA_0364	CJA_0366			FALSE	0.010	456.000	0.000	1.000		NA
5708307	5708308	CJA_0366	CJA_0367			FALSE	0.005	692.000	0.000	NA		NA
5708309	5708310	CJA_0368	CJA_0369			TRUE	0.856	7.000	0.000	1.000		NA
5708311	5708312	CJA_0370	CJA_0371			FALSE	0.185	104.000	0.000	NA		NA
5708312	5708313	CJA_0371	CJA_0372			TRUE	0.999	-3.000	0.741	NA	Y	NA
5708313	5708314	CJA_0372	CJA_0373			TRUE	0.976	16.000	0.238	NA	N	NA
5708315	5708316	CJA_0374	CJA_0375	cel45A	ahpC	FALSE	0.024	264.000	0.000	1.000		NA
5708316	5708317	CJA_0375	CJA_0376	ahpC	ahpF	TRUE	0.974	98.000	0.551	1.000	Y	NA
5708318	5708319	CJA_0377	CJA_0378			FALSE	0.021	240.000	0.000	NA		NA
5708319	5708320	CJA_0378	CJA_0379			FALSE	0.078	157.000	0.000	NA		NA
5708323	5708324	CJA_0382	CJA_0383			FALSE	0.378	39.000	0.000	NA		NA
5708325	5708326	CJA_0384	CJA_0385	pel10C	panB	FALSE	0.076	180.000	0.000	1.000		NA
5708326	5708327	CJA_0385	CJA_0386	panB		TRUE	0.878	26.000	0.055	1.000	N	NA
5708327	5708328	CJA_0386	CJA_0387		folK	TRUE	0.942	14.000	0.063	1.000	N	NA
5708328	5708329	CJA_0387	CJA_0388	folK	pcnB	TRUE	0.992	-3.000	0.234	1.000	N	NA
5708329	5708330	CJA_0388	CJA_0389	pcnB		FALSE	0.007	837.000	0.000	1.000	N	NA
5708330	5708331	CJA_0389	CJA_0390		galS	TRUE	0.901	115.000	0.453	1.000	N	NA
5708331	5708332	CJA_0390	CJA_0391	galS		TRUE	0.939	46.000	0.312	NA		NA
5708332	5708333	CJA_0391	CJA_0392			TRUE	0.791	31.000	0.042	NA		NA
5708333	5708334	CJA_0392	CJA_0393			TRUE	0.933	42.000	0.231	1.000	N	NA
5708336	5708337	CJA_0394	CJA_0396			FALSE	0.261	83.000	0.000	NA		NA
5708338	5708339	CJA_0397	CJA_0398	uppP	amy13F	FALSE	0.240	112.000	0.000	1.000	N	NA
5708339	5708340	CJA_0398	CJA_0399	amy13F		FALSE	0.027	223.000	0.000	NA		NA
5708340	5708341	CJA_0399	CJA_0400			TRUE	0.997	0.000	0.562	NA		NA
5708342	5708343	CJA_0401	CJA_0402			FALSE	0.019	249.000	0.000	NA		NA
5708345	5708346	CJA_0404	CJA_0405	hslU		TRUE	0.992	50.000	0.752	1.000	Y	NA
5708346	5708347	CJA_0405	CJA_0406			TRUE	0.756	90.000	0.122	NA		NA
5708347	5708348	CJA_0406	CJA_0407		priA	TRUE	0.609	60.000	0.018	NA		NA
5708349	5708350	CJA_0408	CJA_0409	hip	rpmE	FALSE	0.223	110.000	0.000	1.000		NA
5708350	5708351	CJA_0409	CJA_0410	rpmE		TRUE	0.958	5.000	0.023	1.000	N	NA
5708353	5708354	CJA_0412	CJA_0413	pilM	pilN	TRUE	0.999	0.000	0.616	NA	Y	NA
5708354	5708355	CJA_0413	CJA_0414	pilN	pilO	TRUE	0.999	0.000	0.770	NA	Y	NA
5708355	5708356	CJA_0414	CJA_0415	pilO	pilP	TRUE	0.999	-3.000	0.680	NA	Y	NA
5708356	5708357	CJA_0415	CJA_0416	pilP		TRUE	0.991	37.000	0.668	NA	Y	NA
5708357	5708358	CJA_0416	CJA_0417			TRUE	0.995	1.000	0.319	1.000	N	NA
5708358	5708359	CJA_0417	CJA_0418		aroB	TRUE	0.832	144.000	0.208	1.000	Y	NA
5708359	5708360	CJA_0418	CJA_0419	aroB		FALSE	0.236	144.000	0.007	NA	N	NA
5708361	5708362	CJA_0420	CJA_0421	gcvH	gcvT	TRUE	0.988	43.000	0.317	0.001	Y	NA
5708362	5708363	CJA_0421	CJA_0422	gcvT		FALSE	0.141	120.000	0.000	NA		NA
5708363	5708364	CJA_0422	CJA_0423			FALSE	0.468	28.000	0.000	NA		NA
5708364	5708365	CJA_0423	CJA_0424			TRUE	0.994	-3.000	0.400	NA		NA
5708365	5708366	CJA_0424	CJA_0425			FALSE	0.291	94.000	0.000	1.000		NA
5708367	5708368	CJA_0426	CJA_0427	bioB	bioF	TRUE	0.981	33.000	0.168	0.002	Y	NA
5708368	5708369	CJA_0427	CJA_0428	bioF	bioC	TRUE	0.983	-7.000	0.092	0.002		NA
5708369	5708370	CJA_0428	CJA_0429	bioC	bioD	TRUE	0.919	20.000	0.007	0.002		NA
5708370	5708371	CJA_0429	CJA_0430	bioD		TRUE	0.854	3.000	0.000	NA		NA
5708371	5708372	CJA_0430	CJA_0431			FALSE	0.059	173.000	0.000	NA		NA
5708372	5708373	CJA_0431	CJA_0432			TRUE	0.932	14.000	0.069	NA		NA
5708373	5708374	CJA_0432	CJA_3844			FALSE	0.177	106.000	0.000	NA		NA
5708374	5708375	CJA_3844	CJA_0434			FALSE	0.092	146.000	0.000	NA		NA
5708375	5708376	CJA_0434	CJA_0435		nusA	TRUE	0.960	101.000	0.759	NA		NA
5708376	5708377	CJA_0435	CJA_0436	nusA	infB	TRUE	0.951	54.000	0.342	1.000	N	NA
5708377	5708378	CJA_0436	CJA_0437	infB	rbfA	TRUE	0.970	102.000	0.530	1.000	Y	NA
5708378	5708379	CJA_0437	CJA_0438	rbfA	truB	TRUE	0.998	0.000	0.318	1.000	Y	NA
5708379	5708380	CJA_0438	CJA_0439	truB	rpsO	TRUE	0.809	155.000	0.211	1.000	Y	NA
5708380	5708381	CJA_0439	CJA_0440	rpsO		TRUE	0.658	237.000	0.335	1.000	Y	NA
5708382	5708383	CJA_0441	CJA_0442			FALSE	0.237	90.000	0.000	NA		NA
5708383	5708384	CJA_0442	CJA_0443		ppa	FALSE	0.014	302.000	0.000	NA	N	NA
5708384	5708385	CJA_0443	CJA_0444	ppa		FALSE	0.224	93.000	0.000	NA		NA
5708386	5708387	CJA_0445	CJA_0446			FALSE	0.133	143.000	0.000	1.000		NA
5708388	5708389	CJA_0447	CJA_0448			FALSE	0.112	134.000	0.000	NA		NA
5708391	5708392	CJA_0450	CJA_0451	axe2C		TRUE	0.638	71.000	0.000	0.005		NA
5708392	5708393	CJA_0451	CJA_0452		holA	FALSE	0.027	265.000	0.000	1.000	N	NA
5708393	5708394	CJA_0452	CJA_0453	holA		TRUE	0.987	6.000	0.199	NA	N	NA
5708394	5708395	CJA_0453	CJA_0454		leuS	TRUE	0.893	45.000	0.182	NA	N	NA
5708396	5708397	CJA_0455	CJA_0456			FALSE	0.056	177.000	0.000	NA		NA
5708399	5708400	CJA_0458	CJA_0459	rplU	rpmA	TRUE	0.998	15.000	0.667	0.016	Y	NA
5708400	5708401	CJA_0459	CJA_0460	rpmA		TRUE	0.808	138.000	0.335	1.000		NA
5708401	5708402	CJA_0460	CJA_0461		proB	TRUE	0.961	22.000	0.206	1.000		NA
5708406	5708407	CJA_0465	CJA_0466			TRUE	0.860	40.000	0.097	1.000	N	NA
5708407	5708408	CJA_0466	CJA_0467		lgt	TRUE	0.639	67.000	0.011	1.000	N	NA
5708408	5708409	CJA_0467	CJA_0468	lgt	thyA	TRUE	0.911	36.000	0.164	1.000	N	NA
5708409	5708410	CJA_0468	CJA_0469	thyA	folA	TRUE	0.945	22.000	0.134	1.000	N	NA
5708410	5708411	CJA_0469	CJA_0470	folA		FALSE	0.022	237.000	0.000	NA		NA
5708411	5708412	CJA_0470	CJA_0471			TRUE	0.796	8.000	0.000	NA		NA
5708412	5708413	CJA_0471	CJA_0472			TRUE	0.998	-3.000	0.933	NA		NA
5708413	5708414	CJA_0472	CJA_0473			TRUE	0.998	13.000	0.455	0.020	Y	NA
5708414	5708415	CJA_0473	CJA_0474			TRUE	0.950	45.000	0.091	0.070	Y	NA
5708415	5708416	CJA_0474	CJA_0475			TRUE	0.989	6.000	0.214	1.000		NA
5708416	5708417	CJA_0475	CJA_0476			TRUE	0.799	12.000	0.000	1.000		NA
5708418	5708419	CJA_0477	CJA_0478	ilvD		FALSE	0.157	133.000	0.000	1.000		NA
5708419	5708420	CJA_0478	CJA_0479		argA	TRUE	0.874	-3.000	0.000	1.000		NA
5708420	5708421	CJA_0479	CJA_0480	argA	argE	TRUE	0.975	27.000	0.087	0.003	Y	NA
5708421	5708422	CJA_0480	CJA_0481	argE		FALSE	0.438	138.000	0.048	1.000	N	NA
5708422	5708423	CJA_0481	CJA_0482			TRUE	0.997	26.000	0.937	NA	Y	NA
5708424	5708425	CJA_0483	CJA_0484			FALSE	0.348	88.000	0.000	1.000	N	NA
5708425	5708426	CJA_0484	CJA_0485			FALSE	0.429	63.000	0.000	1.000	N	NA
5708427	5708428	CJA_0486	CJA_0487			FALSE	0.484	27.000	0.000	NA		NA
5708428	5708429	CJA_0487	CJA_0488			FALSE	0.296	125.000	0.009	NA		NA
5708429	5708430	CJA_0488	CJA_0489			TRUE	0.998	5.000	0.535	NA	Y	NA
5708430	5708431	CJA_0489	CJA_0490			FALSE	0.381	70.000	0.000	1.000		NA
5708432	5708433	CJA_0491	CJA_0492	gal53A-1	gal53B	TRUE	0.962	34.000	0.056	0.001	Y	NA
5708433	5708434	CJA_0492	CJA_0493	gal53B		TRUE	0.648	16.000	0.000	NA		NA
5708434	5708435	CJA_0493	CJA_0494		cbp35C	FALSE	0.125	127.000	0.000	NA		NA
5708436	5708437	CJA_0495	CJA_0496		bgl2A	FALSE	0.037	226.000	0.000	1.000		NA
5708437	5708438	CJA_0496	CJA_0497	bgl2A	gal53A-2	TRUE	0.938	55.000	0.200	0.023		NA
5708438	5708439	CJA_0497	CJA_0498	gal53A-2		TRUE	0.939	96.000	0.500	1.000		NA
5708440	5708441	CJA_0499	CJA_0500		glnE	FALSE	0.327	56.000	0.000	NA		NA
5708441	5708442	CJA_0500	CJA_0501	glnE	ilvE	TRUE	0.894	27.000	0.078	1.000	N	NA
5708442	5708443	CJA_0501	CJA_0502	ilvE	gt9A	TRUE	0.668	81.000	0.034	1.000	N	NA
5708443	5708444	CJA_0502	CJA_0503	gt9A	waaP	TRUE	0.848	21.000	0.000	0.005		NA
5708444	5708445	CJA_0503	CJA_0504	waaP	gt4E	TRUE	0.984	-3.000	0.138	1.000		NA
5708445	5708446	CJA_0504	CJA_0505	gt4E		TRUE	0.774	10.000	0.000	NA		NA
5708446	5708447	CJA_0505	CJA_0506		gt4D	TRUE	0.662	-15.000	0.000	NA		NA
5708447	5708448	CJA_0506	CJA_0507	gt4D		TRUE	0.750	-7.000	0.000	NA		NA
5708448	5708449	CJA_0507	CJA_0508		msbA	TRUE	0.715	-10.000	0.000	NA		NA
5708449	5708450	CJA_0508	CJA_0509	msbA	rfaE	TRUE	0.697	56.000	0.023	1.000	N	NA
5708450	5708451	CJA_0509	CJA_0510	rfaE		TRUE	0.527	-37.000	0.000	NA		NA
5708451	5708452	CJA_0510	CJA_0511			TRUE	0.818	6.000	0.000	NA		NA
5708452	5708453	CJA_0511	CJA_0512			TRUE	0.488	-69.000	0.000	NA		NA
5708454	5708455	CJA_0513	CJA_0514			TRUE	0.566	-31.000	0.000	NA		NA
5708455	5708456	CJA_0514	CJA_0515			TRUE	0.587	20.000	0.000	NA		NA
5708456	5708457	CJA_0515	CJA_0516			TRUE	0.851	-3.000	0.000	NA	N	NA
5708457	5708458	CJA_0516	CJA_0517		htpX	TRUE	0.890	32.000	0.000	0.029	Y	NA
5708458	5708459	CJA_0517	CJA_0518	htpX		FALSE	0.012	413.000	0.000	1.000	N	NA
5708459	5708460	CJA_0518	CJA_0519			FALSE	0.155	114.000	0.000	NA		NA
5708461	5708462	CJA_0520	CJA_0521			TRUE	0.556	22.000	0.000	NA		NA
5708462	5708463	CJA_0521	CJA_0522			TRUE	0.818	6.000	0.000	NA		NA
5708465	5708466	CJA_0524	CJA_0525			FALSE	0.378	39.000	0.000	NA		NA
5708466	5708467	CJA_0525	CJA_0527			FALSE	0.212	97.000	0.000	NA		NA
5708468	5708469	CJA_0526	CJA_0528			FALSE	0.004	1082.000	0.000	NA		NA
5708469	5708470	CJA_0528	CJA_0529			TRUE	0.999	13.000	0.915	NA	Y	NA
5708471	5708472	CJA_0530	CJA_0531	mutY		TRUE	0.986	4.000	0.150	NA	N	NA
5708472	5708473	CJA_0531	CJA_0532		bgl2B	FALSE	0.134	123.000	0.000	NA		NA
5708473	5708474	CJA_0532	CJA_0533	bgl2B	pel1B	FALSE	0.027	252.000	0.000	1.000		NA
5708476	5708477	CJA_0535	CJA_0536			TRUE	0.779	-13.000	0.000	1.000	N	NA
5708478	5708479	CJA_0537	CJA_0538	choB		FALSE	0.171	108.000	0.000	NA		NA
5708481	5708482	CJA_0540	CJA_0541			TRUE	0.978	-3.000	0.081	1.000	N	NA
5708482	5708483	CJA_0541	CJA_0542			FALSE	0.123	149.000	0.000	1.000		NA
5708483	5708484	CJA_0542	CJA_0543			TRUE	0.933	27.000	0.167	1.000		NA
5708484	5708485	CJA_0543	CJA_0544			TRUE	0.992	4.000	0.154	0.052		NA
5708485	5708486	CJA_0544	CJA_0545			TRUE	0.994	-10.000	0.590	1.000		NA
5708487	5708488	CJA_0546	CJA_0547	xdhA	xdhB	TRUE	0.990	-7.000	0.045	0.001	Y	NA
5708488	5708489	CJA_0547	CJA_0548	xdhB		TRUE	0.982	-34.000	0.463	NA	N	NA
5708489	5708490	CJA_0548	CJA_0549			TRUE	0.734	46.000	0.047	NA		NA
5708490	5708491	CJA_0549	CJA_0550			TRUE	0.953	12.000	0.083	NA		NA
5708491	5708492	CJA_0550	CJA_0551			TRUE	0.819	27.000	0.029	1.000		NA
5708492	5708493	CJA_0551	CJA_0552			TRUE	0.932	-12.000	0.044	1.000		NA
5708493	5708494	CJA_0552	CJA_0553			TRUE	0.857	2.000	0.000	NA		NA
5708494	5708495	CJA_0553	CJA_0554			FALSE	0.070	165.000	0.000	NA		NA
5708496	5708497	CJA_0555	CJA_0556			TRUE	0.997	-3.000	0.500	0.059		NA
5708497	5708498	CJA_0556	CJA_0557			FALSE	0.006	478.000	0.000	NA		NA
5708498	5708499	CJA_0557	CJA_0558			FALSE	0.004	1379.000	0.000	NA		NA
5708499	5708500	CJA_0558	CJA_0559		cbp35B	TRUE	0.805	7.000	0.000	NA		NA
5708500	5708501	CJA_0559	CJA_0560	cbp35B		FALSE	0.022	293.000	0.000	1.000	N	NA
5708501	5708502	CJA_0560	CJA_0561		pda4B	FALSE	0.034	242.000	0.000	1.000	N	NA
5708502	5708503	CJA_0561	CJA_0562	pda4B		TRUE	0.774	10.000	0.000	NA		NA
5708504	5708505	CJA_0563	CJA_0564			TRUE	0.756	11.000	0.000	NA		NA
5708505	5708506	CJA_0564	CJA_0565			FALSE	0.130	125.000	0.000	NA		NA
5708506	5708507	CJA_0565	CJA_0566			TRUE	0.841	73.000	0.167	NA		NA
5708507	5708508	CJA_0566	CJA_0567			TRUE	0.968	13.000	0.167	NA		NA
5708508	5708509	CJA_0567	CJA_0568			TRUE	0.998	18.000	0.667	0.020	Y	NA
5708509	5708510	CJA_0568	CJA_0569			TRUE	0.990	84.000	0.667	0.069	Y	NA
5708510	5708511	CJA_0569	CJA_0570			TRUE	0.985	0.000	0.118	1.000		NA
5708511	5708512	CJA_0570	CJA_0571			TRUE	0.952	36.000	0.294	1.000		NA
5708512	5708513	CJA_0571	CJA_0572			TRUE	0.494	35.000	0.000	1.000		NA
5708513	5708514	CJA_0572	CJA_0573			TRUE	0.968	0.000	0.000	NA	Y	NA
5708514	5708515	CJA_0573	CJA_0574			FALSE	0.321	76.000	0.000	NA	N	NA
5708515	5708516	CJA_0574	CJA_0575			TRUE	0.980	0.000	0.069	1.000	N	NA
5708516	5708517	CJA_0575	CJA_0576			TRUE	0.979	-7.000	0.172	1.000		NA
5708517	5708518	CJA_0576	CJA_0577		pucG	TRUE	0.795	40.000	0.054	1.000		NA
5708518	5708519	CJA_0577	CJA_0578	pucG		TRUE	0.820	12.000	0.000	1.000	N	NA
5708519	5708520	CJA_0578	CJA_0579		amaB	FALSE	0.365	84.000	0.000	1.000	N	NA
5708520	5708521	CJA_0579	CJA_0580	amaB	hpt-1	TRUE	0.644	22.000	0.000	1.000		NA
5708522	5708523	CJA_0581	CJA_0582			FALSE	0.204	99.000	0.000	NA		NA
5708523	5708524	CJA_0582	CJA_0583			TRUE	0.857	0.000	0.000	NA		NA
5708524	5708525	CJA_0583	CJA_0584			FALSE	0.312	153.000	0.000	NA	Y	NA
5708526	5708527	CJA_0585	CJA_3849			FALSE	0.021	243.000	0.000	NA		NA
5708527	5708528	CJA_3849	CJA_0587			FALSE	0.032	213.000	0.000	NA		NA
5708528	5708529	CJA_0587	CJA_0588			FALSE	0.018	254.000	0.000	NA		NA
5708530	5708531	CJA_0589	CJA_0590			TRUE	0.897	1.000	0.000	1.000		NA
5708533	5708534	CJA_0592	CJA_0593			TRUE	0.994	11.000	0.571	NA		NA
5708534	5708535	CJA_0593	CJA_0594			TRUE	0.945	13.000	0.081	NA		NA
5708535	5708536	CJA_0594	CJA_0595			FALSE	0.481	-127.000	0.000	NA		NA
5708536	5708537	CJA_0595	CJA_0596			FALSE	0.026	225.000	0.000	NA		NA
5708538	5708539	CJA_0597	CJA_0598			FALSE	0.029	217.000	0.000	NA		NA
5708539	5708540	CJA_0598	CJA_0599			TRUE	0.587	20.000	0.000	NA		NA
5708540	5708541	CJA_0599	CJA_0600			TRUE	0.828	-3.000	0.000	NA		NA
5708541	5708542	CJA_0600	CJA_0601			TRUE	0.854	3.000	0.000	NA		NA
5708542	5708543	CJA_0601	CJA_0602			TRUE	0.722	107.000	0.130	1.000		NA
5708543	5708544	CJA_0602	CJA_0603		natA	TRUE	0.993	-3.000	0.292	1.000		NA
5708544	5708545	CJA_0603	CJA_0604	natA		TRUE	0.992	-13.000	0.271	NA	Y	NA
5708546	5708547	CJA_0605	CJA_0606			FALSE	0.484	27.000	0.000	NA		NA
5708548	5708549	CJA_0607	CJA_0608			FALSE	0.273	79.000	0.000	NA		NA
5708551	5708552	CJA_0610	CJA_0611	cpsA		FALSE	0.360	43.000	0.000	NA		NA
5708552	5708553	CJA_0611	CJA_0612			FALSE	0.334	52.000	0.000	NA		NA
5708553	5708554	CJA_0612	CJA_0613			FALSE	0.216	96.000	0.000	NA		NA
5708554	5708555	CJA_0613	CJA_0614		gt25A	FALSE	0.332	53.000	0.000	NA		NA
5708556	5708557	CJA_0615	CJA_0616		gt4J-1	TRUE	0.574	-102.000	0.000	1.000		NA
5708557	5708558	CJA_0616	CJA_0617	gt4J-1	gt26A	TRUE	0.985	3.000	0.000	0.019	Y	NA
5708558	5708559	CJA_0617	CJA_0618	gt26A	gt70A	TRUE	0.985	-3.000	0.043	NA	Y	NA
5708559	5708560	CJA_0618	CJA_0619	gt70A	cel5H	TRUE	0.921	32.000	0.182	NA	N	NA
5708560	5708561	CJA_0619	CJA_0620	cel5H	gt4J-2	TRUE	0.982	-3.000	0.111	1.000	N	NA
5708561	5708562	CJA_0620	CJA_0621	gt4J-2		TRUE	0.982	3.000	0.111	NA		NA
5708562	5708563	CJA_0621	CJA_0622		epsG	TRUE	0.501	26.000	0.000	NA		NA
5708563	5708564	CJA_0622	CJA_0623	epsG		FALSE	0.412	40.000	0.000	NA	N	NA
5708564	5708565	CJA_0623	CJA_0624		epsE	TRUE	0.763	46.000	0.000	1.000	Y	NA
5708568	5708569	CJA_0627	CJA_0628	aroA		TRUE	0.857	0.000	0.000	NA		NA
5708569	5708570	CJA_0628	CJA_0629			FALSE	0.013	294.000	0.000	NA		NA
5708571	5708572	CJA_0630	CJA_0631			FALSE	0.097	153.000	0.000	NA	N	NA
5708573	5708574	CJA_0632	CJA_0634			FALSE	0.013	976.000	0.000	0.058		NA
5708575	5708576	CJA_0633	CJA_0635			TRUE	0.990	-3.000	0.237	NA		NA
5708576	5708577	CJA_0635	CJA_0636			FALSE	0.329	55.000	0.000	NA		NA
5708577	5708578	CJA_0636	CJA_0637		rhuM	TRUE	0.925	-7.000	0.032	NA		NA
5708578	5708579	CJA_0637	CJA_0638	rhuM	hsdM	TRUE	0.944	-3.000	0.023	NA		NA
5708579	5708580	CJA_0638	CJA_0639	hsdM		TRUE	0.998	13.000	0.564	0.058	Y	NA
5708580	5708581	CJA_0639	CJA_0640			FALSE	0.373	73.000	0.000	1.000		NA
5708581	5708582	CJA_0640	CJA_0641		ychF	FALSE	0.056	199.000	0.000	1.000		NA
5708582	5708583	CJA_0641	CJA_0642	ychF	pth	TRUE	0.946	68.000	0.184	1.000	Y	NA
5708583	5708584	CJA_0642	CJA_0643	pth		TRUE	0.997	-25.000	0.496	0.024	Y	NA
5708584	5708585	CJA_0643	CJA_0644		prs	TRUE	0.763	99.000	0.122	1.000	N	NA
5708585	5708586	CJA_0644	CJA_3857	prs		FALSE	0.030	216.000	0.000	NA		NA
5708586	5708587	CJA_3857	CJA_0646		ispE	FALSE	0.371	40.000	0.000	NA		NA
5708587	5708588	CJA_0646	CJA_0647	ispE	lolB	TRUE	0.958	3.000	0.010	1.000	N	NA
5708588	5708589	CJA_0647	CJA_0648	lolB		TRUE	0.981	0.000	0.072	1.000	N	NA
5708592	5708593	CJA_0651	CJA_0652	hemA	prfA	TRUE	0.992	-3.000	0.171	0.040	N	NA
5708593	5708594	CJA_0652	CJA_0653	prfA		TRUE	0.962	57.000	0.229	1.000	Y	NA
5708594	5708595	CJA_0653	CJA_0654		moeB	TRUE	0.979	3.000	0.068	1.000	N	NA
5708595	5708596	CJA_0654	CJA_0655	moeB		FALSE	0.085	151.000	0.000	NA		NA
5708596	5708597	CJA_0655	CJA_0656			TRUE	0.987	25.000	0.637	NA		NA
5708599	5708600	CJA_0658	CJA_0659		gt51C	TRUE	0.541	23.000	0.000	NA		NA
5708600	5708601	CJA_0659	CJA_0660	gt51C		FALSE	0.062	170.000	0.000	NA		NA
5708601	5708602	CJA_0660	CJA_0661		algT	TRUE	0.830	5.000	0.000	NA		NA
5708602	5708603	CJA_0661	CJA_0662	algT		TRUE	0.993	27.000	1.000	NA		NA
5708605	5708606	CJA_0664	CJA_0665	ilvB	ilvN	TRUE	0.999	2.000	0.371	0.001	Y	NA
5708606	5708607	CJA_0665	CJA_0666	ilvN		FALSE	0.426	64.000	0.000	1.000	N	NA
5708609	5708610	CJA_0668	CJA_0669	ilvC	pssA	TRUE	0.689	82.000	0.041	1.000	N	NA
5708610	5708611	CJA_0669	CJA_3859	pssA	rrsA	FALSE	0.006	501.000	0.000	NA		NA
5708611	5708612	CJA_3859	CJA_3860	rrsA		FALSE	0.087	150.000	0.000	NA		NA
5708612	5708613	CJA_3860	CJA_3861			FALSE	0.378	39.000	0.000	NA		NA
5708613	5708614	CJA_3861	CJA_3862			TRUE	0.604	19.000	0.000	NA		NA
5708614	5708615	CJA_3862	CJA_3863		rrlA	FALSE	0.017	260.000	0.000	NA		NA
5708615	5708616	CJA_3863	CJA_3864	rrlA	rrfA	FALSE	0.067	167.000	0.000	NA		NA
5708616	5708617	CJA_3864	CJA_0676	rrfA	alr	FALSE	0.087	150.000	0.000	NA		NA
5708617	5708618	CJA_0676	CJA_0677	alr		TRUE	0.953	4.000	0.008	1.000	N	NA
5708618	5708619	CJA_0677	CJA_0678			TRUE	0.986	-3.000	0.147	1.000	N	NA
5708619	5708620	CJA_0678	CJA_0679			TRUE	0.923	6.000	0.007	NA		NA
5708620	5708621	CJA_0679	CJA_3865			FALSE	0.348	46.000	0.000	NA		NA
5708621	5708622	CJA_3865	CJA_3866			FALSE	0.219	95.000	0.000	NA		NA
5708622	5708623	CJA_3866	CJA_3867			FALSE	0.267	81.000	0.000	NA		NA
5708623	5708624	CJA_3867	CJA_3868			TRUE	0.635	17.000	0.000	NA		NA
5708624	5708625	CJA_3868	CJA_0684			FALSE	0.285	76.000	0.000	NA		NA
5708625	5708626	CJA_0684	CJA_3870			FALSE	0.355	44.000	0.000	NA		NA
5708626	5708627	CJA_3870	CJA_0686		secE	TRUE	0.587	20.000	0.000	NA		NA
5708627	5708628	CJA_0686	CJA_0687	secE	nusG	TRUE	0.998	8.000	0.843	1.000	N	NA
5708628	5708629	CJA_0687	CJA_0688	nusG	rplK	TRUE	0.892	157.000	0.681	1.000	N	NA
5708629	5708630	CJA_0688	CJA_0689	rplK	rplA	TRUE	1.000	3.000	0.838	0.021	Y	NA
5708630	5708631	CJA_0689	CJA_0690	rplA		TRUE	0.761	224.000	0.302	0.021	Y	NA
5708631	5708632	CJA_0690	CJA_0691		rplL	TRUE	0.996	67.000	0.884	0.015	Y	NA
5708632	5708633	CJA_0691	CJA_0692	rplL	rpoB	FALSE	0.287	256.000	0.223	1.000		NA
5708633	5708634	CJA_0692	CJA_0693	rpoB	rpoC	TRUE	0.996	27.000	0.851	0.001		NA
5708634	5708635	CJA_0693	CJA_0694	rpoC	rpsL	FALSE	0.169	268.000	0.122	1.000	N	NA
5708635	5708636	CJA_0694	CJA_0695	rpsL	rpsG	TRUE	0.979	125.000	0.620	0.003	Y	NA
5708636	5708637	CJA_0695	CJA_0696	rpsG		TRUE	0.792	78.000	0.005	1.000	Y	NA
5708637	5708638	CJA_0696	CJA_0697			TRUE	0.928	37.000	0.005	0.002	Y	NA
5708638	5708639	CJA_0697	CJA_0698		rpsJ	TRUE	0.693	219.000	0.318	1.000	Y	NA
5708639	5708640	CJA_0698	CJA_0699	rpsJ	rplC	TRUE	0.968	99.000	0.307	0.021	Y	NA
5708640	5708641	CJA_0699	CJA_0700	rplC	rplD	TRUE	0.996	21.000	0.486	0.015	Y	NA
5708641	5708642	CJA_0700	CJA_0701	rplD	rplW	TRUE	0.998	-3.000	0.513	1.000	Y	NA
5708642	5708643	CJA_0701	CJA_0702	rplW	rplB	TRUE	0.998	14.000	0.849	1.000	Y	NA
5708643	5708644	CJA_0702	CJA_0703	rplB	rpsS	TRUE	0.997	35.000	0.820	0.021	Y	NA
5708644	5708645	CJA_0703	CJA_0704	rpsS	rplV	TRUE	0.999	13.000	0.769	0.021	Y	NA
5708645	5708646	CJA_0704	CJA_0705	rplV	rpsC	TRUE	0.999	12.000	0.719	0.021	Y	NA
5708646	5708647	CJA_0705	CJA_0706	rpsC	rplP	TRUE	0.999	13.000	0.828	0.021	Y	NA
5708647	5708648	CJA_0706	CJA_0707	rplP	rpmC	TRUE	1.000	-3.000	0.802	0.015	Y	NA
5708648	5708649	CJA_0707	CJA_0708	rpmC	rpsQ	TRUE	1.000	2.000	0.828	0.015	Y	NA
5708649	5708650	CJA_0708	CJA_0709	rpsQ	rplN	TRUE	0.996	38.000	0.791	0.021	Y	NA
5708650	5708651	CJA_0709	CJA_0710	rplN	rplX	TRUE	0.997	35.000	0.810	0.021	Y	NA
5708651	5708652	CJA_0710	CJA_0711	rplX	rplE	TRUE	0.999	7.000	0.758	0.015	Y	NA
5708652	5708653	CJA_0711	CJA_0712	rplE	rpsN	TRUE	0.997	11.000	0.309	0.015	Y	NA
5708653	5708654	CJA_0712	CJA_0713	rpsN	rpsH	TRUE	0.989	31.000	0.295	0.015	Y	NA
5708654	5708655	CJA_0713	CJA_0714	rpsH	rplF	TRUE	0.999	14.000	0.808	0.015	Y	NA
5708655	5708656	CJA_0714	CJA_0715	rplF	rplR	TRUE	0.999	10.000	0.815	0.015	Y	NA
5708656	5708657	CJA_0715	CJA_0716	rplR	rpsE	TRUE	0.999	10.000	0.814	0.021	Y	NA
5708657	5708658	CJA_0716	CJA_0717	rpsE	rpmD	TRUE	0.997	30.000	0.789	0.021	Y	NA
5708658	5708659	CJA_0717	CJA_0718	rpmD	rplO	TRUE	1.000	2.000	0.653	0.003	Y	NA
5708659	5708660	CJA_0718	CJA_0719	rplO		TRUE	0.997	11.000	0.730	1.000	N	NA
5708660	5708661	CJA_0719	CJA_0720			TRUE	0.915	23.000	0.089	1.000		NA
5708661	5708662	CJA_0720	CJA_0721		rpsM	FALSE	0.465	222.000	0.194	0.015		NA
5708662	5708663	CJA_0721	CJA_0722	rpsM	rpsK	TRUE	0.996	52.000	0.810	0.015	Y	NA
5708663	5708664	CJA_0722	CJA_0723	rpsK	rpsD	TRUE	0.997	16.000	0.509	0.021	Y	NA
5708664	5708665	CJA_0723	CJA_0724	rpsD	rpoA	TRUE	0.984	27.000	0.549	1.000	N	NA
5708665	5708666	CJA_0724	CJA_0725	rpoA	rplQ	TRUE	0.976	97.000	0.873	1.000	N	NA
5708668	5708669	CJA_0727	CJA_0728		ssb	TRUE	0.925	18.000	0.075	NA	N	NA
5708669	5708670	CJA_0728	CJA_0729	ssb		FALSE	0.073	191.000	0.000	1.000	N	NA
5708671	5708672	CJA_0730	CJA_0731		gla15	TRUE	0.724	48.000	0.000	NA	Y	NA
5708673	5708674	CJA_0732	CJA_0733	glu13A		FALSE	0.013	406.000	0.000	1.000	N	NA
5708674	5708675	CJA_0733	CJA_0734			TRUE	0.829	76.000	0.154	NA		NA
5708675	5708676	CJA_0734	CJA_0735		amy13E	TRUE	0.967	24.000	0.296	NA		NA
5708676	5708677	CJA_0735	CJA_0736	amy13E	adg97B	FALSE	0.396	63.000	0.000	1.000		NA
5708677	5708678	CJA_0736	CJA_0737	adg97B	amy13D	FALSE	0.304	91.000	0.000	1.000		NA
5708678	5708679	CJA_0737	CJA_0738	amy13D		FALSE	0.060	171.000	0.000	NA		NA
5708679	5708680	CJA_0738	CJA_0739			FALSE	0.295	72.000	0.000	NA		NA
5708680	5708681	CJA_0739	CJA_0740			FALSE	0.295	72.000	0.000	NA		NA
5708682	5708683	CJA_0741	CJA_0742			TRUE	0.997	-3.000	0.314	NA	Y	NA
5708683	5708684	CJA_0742	CJA_0743			TRUE	0.978	14.000	0.020	0.012	Y	NA
5708684	5708685	CJA_0743	CJA_0744			TRUE	0.803	23.000	0.005	1.000	N	NA
5708685	5708686	CJA_0744	CJA_0745		hisIE	TRUE	0.997	3.000	0.152	0.001	Y	NA
5708686	5708687	CJA_0745	CJA_0746	hisIE		TRUE	0.636	25.000	0.000	1.000	N	NA
5708687	5708688	CJA_0746	CJA_0747			TRUE	0.999	0.000	0.441	0.028	Y	NA
5708690	5708691	CJA_0749	CJA_0750	fabB	fabA	TRUE	0.948	119.000	0.451	1.000	Y	NA
5708691	5708692	CJA_0750	CJA_0751	fabA	ispB	FALSE	0.248	110.000	0.000	1.000	N	NA
5708692	5708693	CJA_0751	CJA_0752	ispB	mtaA	FALSE	0.210	196.000	0.000	1.000	Y	NA
5708694	5708695	CJA_0753	CJA_0754			FALSE	0.136	150.000	0.000	1.000	N	NA
5708695	5708696	CJA_0754	CJA_0755			TRUE	0.764	-15.000	0.000	1.000	N	NA
5708696	5708697	CJA_0755	CJA_0756			FALSE	0.090	168.000	0.000	1.000		NA
5708697	5708698	CJA_0756	CJA_0758			TRUE	0.911	14.000	0.000	0.001		NA
5708699	5708700	CJA_0757	CJA_0759			FALSE	0.303	98.000	0.000	1.000	N	NA
5708701	5708702	CJA_0760	CJA_0761			FALSE	0.126	155.000	0.000	1.000	N	NA
5708703	5708704	CJA_0762	CJA_3872			FALSE	0.337	51.000	0.000	NA		NA
5708704	5708705	CJA_3872	CJA_0764		rpoD	FALSE	0.067	167.000	0.000	NA		NA
5708705	5708706	CJA_0764	CJA_0765	rpoD	dnaG	TRUE	0.935	66.000	0.299	1.000	N	NA
5708706	5708707	CJA_0765	CJA_0766	dnaG		TRUE	0.848	68.000	0.137	1.000		NA
5708707	5708708	CJA_0766	CJA_0767		rpsU	TRUE	0.921	65.000	0.173	0.024		NA
5708709	5708710	CJA_0768	CJA_0769	gcp	folB	TRUE	0.928	11.000	0.014	1.000	N	NA
5708710	5708711	CJA_0769	CJA_0770	folB	folK-2	TRUE	0.998	-3.000	0.500	1.000	Y	NA
5708712	5708713	CJA_0771	CJA_0772			TRUE	0.742	17.000	0.000	1.000	N	NA
5708713	5708714	CJA_0772	CJA_0773		cca	TRUE	0.871	23.000	0.038	1.000	N	NA
5708715	5708716	CJA_0774	CJA_0775			FALSE	0.024	230.000	0.000	NA		NA
5708716	5708717	CJA_0775	CJA_0776			FALSE	0.222	94.000	0.000	NA		NA
5708717	5708718	CJA_0776	CJA_0777			FALSE	0.005	769.000	0.000	NA		NA
5708718	5708719	CJA_0777	CJA_0778		cbp32A	FALSE	0.013	398.000	0.000	1.000	N	NA
5708722	5708723	CJA_0781	CJA_0782	phoQ	phoP	TRUE	0.995	3.000	0.143	1.000	Y	NA
5708723	5708724	CJA_0782	CJA_0783	phoP		TRUE	0.853	24.000	0.048	NA		NA
5708724	5708725	CJA_0783	CJA_0784			FALSE	0.298	71.000	0.000	NA		NA
5708726	5708727	CJA_0785	CJA_0786	proA	nadD	TRUE	0.961	19.000	0.170	1.000	N	NA
5708727	5708728	CJA_0786	CJA_0787	nadD		TRUE	0.942	28.000	0.221	NA		NA
5708728	5708729	CJA_0787	CJA_0788			TRUE	0.900	88.000	0.307	NA		NA
5708729	5708730	CJA_0788	CJA_0789		mrdA-2	TRUE	0.692	36.000	0.020	NA		NA
5708730	5708731	CJA_0789	CJA_0790	mrdA-2	rodA	TRUE	0.959	-3.000	0.026	1.000	N	NA
5708731	5708732	CJA_0790	CJA_0791	rodA	plt103A	TRUE	0.913	23.000	0.096	NA	N	NA
5708732	5708733	CJA_0791	CJA_0792	plt103A		TRUE	0.975	38.000	0.298	NA	Y	NA
5708733	5708734	CJA_0792	CJA_0793			TRUE	0.919	104.000	0.241	NA	Y	NA
5708736	5708737	CJA_0795	CJA_0796		lipB	TRUE	0.991	1.000	0.219	NA		NA
5708737	5708738	CJA_0796	CJA_0797	lipB	lipA	TRUE	0.986	61.000	0.319	0.001	Y	NA
5708738	5708739	CJA_0797	CJA_0798	lipA		FALSE	0.136	142.000	0.000	1.000		NA
5708739	5708740	CJA_0798	CJA_0799		gly43E	FALSE	0.012	386.000	0.000	1.000		NA
5708740	5708741	CJA_0799	CJA_0800	gly43E		TRUE	0.800	133.000	0.286	1.000	N	NA
5708741	5708742	CJA_0800	CJA_0801			FALSE	0.018	321.000	0.000	1.000	N	NA
5708742	5708743	CJA_0801	CJA_0802			TRUE	0.604	19.000	0.000	NA		NA
5708743	5708744	CJA_0802	CJA_0803			FALSE	0.009	354.000	0.000	NA		NA
5708745	5708746	CJA_0804	CJA_0805		arb43A	FALSE	0.177	106.000	0.000	NA		NA
5708747	5708748	CJA_0806	CJA_0807	abf43L		TRUE	0.995	-3.000	0.250	0.051		NA
5708749	5708750	CJA_0808	CJA_0809			FALSE	0.004	2162.000	0.000	NA		NA
5708750	5708751	CJA_0809	CJA_0810			FALSE	0.004	1053.000	0.000	NA		NA
5708753	5708754	CJA_0812	CJA_0813			FALSE	0.005	668.000	0.000	NA		NA
5708754	5708755	CJA_0813	CJA_0814			FALSE	0.005	752.000	0.000	NA		NA
5708755	5708756	CJA_0814	CJA_0815			FALSE	0.130	125.000	0.000	NA		NA
5708757	5708758	CJA_0816	CJA_0817	gly43C	agd97A	FALSE	0.242	105.000	0.000	1.000		NA
5708758	5708759	CJA_0817	CJA_0818	agd97A	gly43D	TRUE	0.942	63.000	0.333	1.000		NA
5708759	5708760	CJA_0818	CJA_0819	gly43D	abf43M	TRUE	0.712	197.000	0.333	0.024		NA
5708760	5708761	CJA_0819	CJA_0820	abf43M		FALSE	0.378	39.000	0.000	NA		NA
5708761	5708762	CJA_0820	CJA_0821			TRUE	0.948	18.000	0.136	NA		NA
5708763	5708764	CJA_0822	CJA_0823			TRUE	0.997	-3.000	0.500	0.057		NA
5708764	5708765	CJA_0823	CJA_0824			FALSE	0.006	513.000	0.000	NA		NA
5708765	5708766	CJA_0824	CJA_0825			TRUE	0.857	0.000	0.000	NA		NA
5708766	5708767	CJA_0825	CJA_0826			FALSE	0.008	398.000	0.000	NA		NA
5708767	5708768	CJA_0826	CJA_0827			FALSE	0.011	320.000	0.000	NA		NA
5708768	5708769	CJA_0827	CJA_0828			FALSE	0.005	756.000	0.000	NA		NA
5708769	5708770	CJA_0828	CJA_0829			TRUE	0.677	14.000	0.000	NA		NA
5708770	5708771	CJA_0829	CJA_0830			FALSE	0.322	59.000	0.000	NA		NA
5708772	5708773	CJA_0831	CJA_0832			FALSE	0.018	254.000	0.000	NA		NA
5708774	5708775	CJA_0833	CJA_0834			FALSE	0.155	182.000	0.000	0.075	N	NA
5708775	5708776	CJA_0834	CJA_0835		ndh	FALSE	0.019	309.000	0.000	1.000	N	NA
5708776	5708777	CJA_0835	CJA_0836	ndh		FALSE	0.393	64.000	0.000	1.000		NA
5708777	5708778	CJA_0836	CJA_0837			TRUE	0.778	27.000	0.000	0.017		NA
5708778	5708779	CJA_0837	CJA_0838			FALSE	0.399	62.000	0.000	1.000		NA
5708779	5708780	CJA_0838	CJA_0839			FALSE	0.468	100.000	0.000	0.028		NA
5708780	5708781	CJA_0839	CJA_0840		oruR	FALSE	0.084	171.000	0.000	1.000		NA
5708781	5708782	CJA_0840	CJA_0841	oruR		TRUE	0.776	14.000	0.000	1.000	N	NA
5708783	5708784	CJA_0842	CJA_0843	cirA		TRUE	0.993	0.000	0.220	1.000	N	NA
5708784	5708785	CJA_0843	CJA_0844			FALSE	0.141	120.000	0.000	NA		NA
5708786	5708787	CJA_0845	CJA_0846		idnK	FALSE	0.241	89.000	0.000	NA		NA
5708788	5708789	CJA_0847	CJA_0848			TRUE	0.939	28.000	0.182	1.000	N	NA
5708789	5708790	CJA_0848	CJA_0849		cgs94A	TRUE	0.905	141.000	0.344	1.000	Y	NA
5708791	5708792	CJA_0850	CJA_0851			FALSE	0.031	214.000	0.000	NA		NA
5708792	5708793	CJA_0851	CJA_0852		rpsT	FALSE	0.009	361.000	0.000	NA		NA
5708793	5708794	CJA_0852	CJA_0853	rpsT		TRUE	0.750	-7.000	0.000	NA		NA
5708795	5708796	CJA_0854	CJA_0855			FALSE	0.371	40.000	0.000	NA		NA
5708797	5708798	CJA_0856	CJA_0857			TRUE	0.997	-3.000	0.642	NA		NA
5708799	5708800	CJA_0858	CJA_0859		surA	TRUE	0.946	14.000	0.070	1.000	N	NA
5708800	5708801	CJA_0859	CJA_0860	surA	pdxA	TRUE	0.956	88.000	0.561	1.000	N	NA
5708801	5708802	CJA_0860	CJA_0861	pdxA	ksgA	TRUE	0.991	1.000	0.197	1.000	N	NA
5708802	5708803	CJA_0861	CJA_0862	ksgA		TRUE	0.973	-3.000	0.078	NA	N	NA
5708803	5708804	CJA_0862	CJA_0863			TRUE	0.989	9.000	0.267	NA		NA
5708806	5708807	CJA_0865	CJA_0866			TRUE	1.000	0.000	0.741	0.003	Y	NA
5708807	5708808	CJA_0866	CJA_0867		coxG	TRUE	0.976	20.000	0.268	1.000	N	NA
5708808	5708809	CJA_0867	CJA_0868	coxG		TRUE	0.987	23.000	0.536	1.000	N	NA
5708811	5708812	CJA_0870	CJA_0871			TRUE	0.966	86.000	0.722	NA		NA
5708812	5708813	CJA_0871	CJA_0872			TRUE	0.993	3.000	0.255	NA		NA
5708813	5708814	CJA_0872	CJA_0873		cyoE	TRUE	0.995	-10.000	0.321	1.000	Y	NA
5708814	5708815	CJA_0873	CJA_0874	cyoE		TRUE	0.527	-37.000	0.000	NA		NA
5708815	5708816	CJA_0874	CJA_0875			TRUE	0.854	3.000	0.000	NA		NA
5708816	5708817	CJA_0875	CJA_0876			FALSE	0.022	238.000	0.000	NA		NA
5708817	5708818	CJA_0876	CJA_0877			FALSE	0.222	94.000	0.000	NA		NA
5708818	5708819	CJA_0877	CJA_0878			FALSE	0.185	104.000	0.000	NA		NA
5708819	5708820	CJA_0878	CJA_0879			FALSE	0.154	134.000	0.000	1.000		NA
5708821	5708822	CJA_0880	CJA_0881	hemL	thiE	TRUE	0.969	30.000	0.173	1.000	Y	NA
5708822	5708823	CJA_0881	CJA_0882	thiE		TRUE	0.566	-31.000	0.000	NA		NA
5708823	5708824	CJA_0882	CJA_0883			TRUE	0.854	3.000	0.000	NA		NA
5708824	5708825	CJA_0883	CJA_0884			FALSE	0.385	68.000	0.000	1.000		NA
5708826	5708827	CJA_0885	CJA_0886	argC		FALSE	0.291	125.000	0.008	NA		NA
5708827	5708828	CJA_0886	CJA_0887			TRUE	0.910	23.000	0.103	NA		NA
5708828	5708829	CJA_0887	CJA_0888			TRUE	0.754	69.000	0.079	NA		NA
5708830	5708831	CJA_0889	CJA_0890		trg3	TRUE	0.983	9.000	0.184	NA	N	NA
5708832	5708833	CJA_0891	CJA_0893	tyrS		TRUE	0.681	-13.000	0.000	NA		NA
5708833	5708834	CJA_0893	CJA_3881		rrsB	FALSE	0.012	302.000	0.000	NA		NA
5708834	5708835	CJA_3881	CJA_3882	rrsB		FALSE	0.087	150.000	0.000	NA		NA
5708835	5708836	CJA_3882	CJA_3883			FALSE	0.378	39.000	0.000	NA		NA
5708836	5708837	CJA_3883	CJA_3884			TRUE	0.604	19.000	0.000	NA		NA
5708837	5708838	CJA_3884	CJA_3885		rrlB	FALSE	0.017	260.000	0.000	NA		NA
5708838	5708839	CJA_3885	CJA_3886	rrlB	rrfB	FALSE	0.067	167.000	0.000	NA		NA
5708839	5708840	CJA_3886	CJA_3888	rrfB	rrsC	FALSE	0.008	411.000	0.000	NA		NA
5708840	5708841	CJA_3888	CJA_3889	rrsC		FALSE	0.090	148.000	0.000	NA		NA
5708841	5708842	CJA_3889	CJA_3890			TRUE	0.604	19.000	0.000	NA		NA
5708842	5708843	CJA_3890	CJA_3891		rrlC	FALSE	0.017	260.000	0.000	NA		NA
5708843	5708844	CJA_3891	CJA_3892	rrlC	rrfC	FALSE	0.067	167.000	0.000	NA		NA
5708844	5708845	CJA_3892	CJA_0905	rrfC		FALSE	0.051	184.000	0.000	NA		NA
5708845	5708846	CJA_0905	CJA_0906		rimI	TRUE	0.922	11.000	0.027	NA		NA
5708847	5708848	CJA_0907	CJA_0908			TRUE	0.998	-7.000	0.682	1.000	Y	NA
5708849	5708850	CJA_0909	CJA_0910		prfC	FALSE	0.403	74.000	0.000	1.000	N	NA
5708850	5708851	CJA_0910	CJA_0911	prfC		TRUE	0.844	4.000	0.000	NA		NA
5708851	5708852	CJA_0911	CJA_0912			FALSE	0.241	89.000	0.000	NA		NA
5708854	5708855	CJA_0914	CJA_0915			FALSE	0.278	78.000	0.000	NA		NA
5708856	5708857	CJA_0916	CJA_0917			FALSE	0.251	86.000	0.000	NA		NA
5708858	5708859	CJA_0918	CJA_0919			FALSE	0.004	960.000	0.000	NA		NA
5708860	5708861	CJA_0920	CJA_0921		aspC	FALSE	0.020	247.000	0.000	NA		NA
5708861	5708862	CJA_0921	CJA_0922	aspC		FALSE	0.423	66.000	0.000	1.000	N	NA
5708862	5708863	CJA_0922	CJA_0923			TRUE	0.948	36.000	0.307	NA		NA
5708863	5708864	CJA_0923	CJA_0924			FALSE	0.302	122.000	0.008	NA		NA
5708864	5708865	CJA_0924	CJA_0925		gmhA	TRUE	0.997	0.000	0.613	NA		NA
5708865	5708866	CJA_0925	CJA_0926	gmhA		TRUE	0.780	112.000	0.187	1.000	N	NA
5708866	5708867	CJA_0926	CJA_0927			TRUE	0.988	3.000	0.172	NA		NA
5708871	5708872	CJA_0931	CJA_0932			TRUE	0.857	83.000	0.206	NA		NA
5708872	5708873	CJA_0932	CJA_0933			TRUE	0.828	-3.000	0.000	NA		NA
5708874	5708875	CJA_0934	CJA_0935			FALSE	0.107	137.000	0.000	NA		NA
5708875	5708876	CJA_0935	CJA_0936			FALSE	0.366	41.000	0.000	NA		NA
5708876	5708877	CJA_0936	CJA_0937			TRUE	0.542	30.000	0.000	1.000		NA
5708877	5708878	CJA_0937	CJA_0938			FALSE	0.054	202.000	0.000	1.000		NA
5708880	5708881	CJA_0940	CJA_0941			FALSE	0.012	304.000	0.000	NA		NA
5708881	5708882	CJA_0941	CJA_0942			FALSE	0.019	251.000	0.000	NA		NA
5708882	5708883	CJA_0942	CJA_0943			FALSE	0.334	52.000	0.000	NA		NA
5708883	5708884	CJA_0943	CJA_0944			TRUE	0.524	32.000	0.000	1.000		NA
5708884	5708885	CJA_0944	CJA_0945			FALSE	0.420	52.000	0.000	1.000		NA
5708885	5708886	CJA_0945	CJA_0946			TRUE	0.755	-13.000	0.000	1.000		NA
5708887	5708888	CJA_0947	CJA_0948			TRUE	0.836	53.000	0.125	NA		NA
5708888	5708889	CJA_0948	CJA_0949			FALSE	0.261	83.000	0.000	NA		NA
5708889	5708890	CJA_0949	CJA_0950			FALSE	0.029	218.000	0.000	NA		NA
5708892	5708893	CJA_0951	CJA_0953	lpxO		FALSE	0.328	92.000	0.000	1.000	N	NA
5708893	5708894	CJA_0953	CJA_0954			TRUE	0.996	-3.000	0.310	0.025	N	NA
5708894	5708895	CJA_0954	CJA_0955			FALSE	0.069	166.000	0.000	NA		NA
5708896	5708897	CJA_0956	CJA_0957			TRUE	0.938	119.000	0.367	1.000	Y	NA
5708897	5708898	CJA_0957	CJA_0958		fmdF	TRUE	0.999	17.000	0.888	0.049	Y	NA
5708898	5708899	CJA_0958	CJA_0959	fmdF		TRUE	0.994	-13.000	0.639	1.000		NA
5708899	5708900	CJA_0959	CJA_0960			TRUE	0.993	23.000	0.600	0.015		NA
5708902	5708903	CJA_0962	CJA_0963		fmdA	FALSE	0.404	35.000	0.000	NA		NA
5708903	5708904	CJA_0963	CJA_0964	fmdA		TRUE	0.893	114.000	0.478	NA		NA
5708907	5708908	CJA_0967	CJA_0968			FALSE	0.054	179.000	0.000	NA		NA
5708909	5708910	CJA_0969	CJA_0970			FALSE	0.345	47.000	0.000	NA		NA
5708910	5708911	CJA_0970	CJA_0971			FALSE	0.484	27.000	0.000	NA		NA
5708911	5708912	CJA_0971	CJA_0973		rrpX	FALSE	0.387	67.000	0.000	1.000		NA
5708913	5708914	CJA_0972	CJA_0974			TRUE	0.896	12.000	0.000	0.058		NA
5708915	5708916	CJA_0975	CJA_0976			TRUE	0.906	67.000	0.250	NA		NA
5708916	5708917	CJA_0976	CJA_0977			FALSE	0.039	201.000	0.000	NA		NA
5708917	5708918	CJA_0977	CJA_0978			FALSE	0.004	882.000	0.000	NA		NA
5708918	5708919	CJA_0978	CJA_0979			FALSE	0.004	2524.000	0.000	NA		NA
5708919	5708920	CJA_0979	CJA_0980			FALSE	0.013	296.000	0.000	NA		NA
5708920	5708921	CJA_0980	CJA_0981			TRUE	0.988	28.000	0.375	1.000	Y	NA
5708921	5708922	CJA_0981	CJA_0982			FALSE	0.458	114.000	0.000	0.004	N	NA
5708922	5708923	CJA_0982	CJA_0983			FALSE	0.189	103.000	0.000	NA		NA
5708925	5708926	CJA_0985	CJA_0986			FALSE	0.208	98.000	0.000	NA		NA
5708926	5708927	CJA_0986	CJA_0987			TRUE	0.998	2.000	0.805	NA		NA
5708927	5708928	CJA_0987	CJA_0988		chi18B	FALSE	0.005	598.000	0.000	NA		NA
5708929	5708930	CJA_0989	CJA_0990			TRUE	0.715	-10.000	0.000	NA		NA
5708930	5708931	CJA_0990	CJA_0991			FALSE	0.422	33.000	0.000	NA		NA
5708931	5708932	CJA_0991	CJA_0992			FALSE	0.360	43.000	0.000	NA		NA
5708934	5708935	CJA_0994	CJA_0995			TRUE	0.998	-3.000	0.734	NA		NA
5708941	5708942	CJA_1001	CJA_1002			FALSE	0.131	134.000	0.000	NA	N	NA
5708942	5708943	CJA_1002	CJA_1003			TRUE	0.527	27.000	0.000	NA	N	NA
5708943	5708944	CJA_1003	CJA_1004			TRUE	1.000	-3.000	0.908	0.043	Y	NA
5708944	5708945	CJA_1004	CJA_1005			TRUE	0.999	15.000	0.924	0.043	Y	NA
5708945	5708946	CJA_1005	CJA_1006			TRUE	1.000	1.000	0.814	0.043	Y	NA
5708946	5708947	CJA_1006	CJA_1007			TRUE	0.999	1.000	0.537	0.043	Y	NA
5708947	5708948	CJA_1007	CJA_1008			TRUE	0.996	25.000	0.564	0.043	Y	NA
5708948	5708949	CJA_1008	CJA_1009		metG	FALSE	0.291	179.000	0.055	1.000	N	NA
5708950	5708951	CJA_1010	CJA_1011		greB	FALSE	0.237	90.000	0.000	NA		NA
5708951	5708952	CJA_1011	CJA_1012	greB		FALSE	0.083	164.000	0.000	NA	N	NA
5708952	5708953	CJA_1012	CJA_1013			TRUE	0.995	-19.000	0.875	NA		NA
5708954	5708955	CJA_1014	CJA_1015			FALSE	0.009	358.000	0.000	NA		NA
5708957	5708958	CJA_1017	CJA_1018			FALSE	0.015	280.000	0.000	NA		NA
5708960	5708961	CJA_1019	CJA_1021			FALSE	0.013	300.000	0.000	NA		NA
5708961	5708962	CJA_1021	CJA_1022			TRUE	0.648	16.000	0.000	NA		NA
5708963	5708964	CJA_1023	CJA_1024			FALSE	0.484	27.000	0.000	NA		NA
5708964	5708965	CJA_1024	CJA_1025		gt51A	TRUE	0.610	-22.000	0.000	NA		NA
5708965	5708966	CJA_1025	CJA_1026	gt51A		FALSE	0.085	151.000	0.000	NA		NA
5708966	5708967	CJA_1026	CJA_1027		aspS	TRUE	0.667	40.000	0.020	NA		NA
5708967	5708968	CJA_1027	CJA_1028	aspS		TRUE	0.519	102.000	0.039	NA		NA
5708968	5708969	CJA_1028	CJA_1029		ruvC	TRUE	0.938	38.000	0.277	NA		NA
5708969	5708970	CJA_1029	CJA_1030	ruvC	ruvA	TRUE	0.996	23.000	0.451	0.007	Y	NA
5708970	5708971	CJA_1030	CJA_1031	ruvA	ruvB	TRUE	0.993	52.000	0.549	0.002	Y	NA
5708971	5708972	CJA_1031	CJA_1032	ruvB	tolQ-2	FALSE	0.036	337.000	0.007	1.000	N	NA
5708972	5708973	CJA_1032	CJA_1033	tolQ-2	tolR	TRUE	0.994	32.000	0.556	0.065	Y	NA
5708973	5708974	CJA_1033	CJA_1034	tolR		TRUE	0.855	18.000	0.010	1.000		NA
5708974	5708975	CJA_1034	CJA_1035		tolB	TRUE	0.970	-3.000	0.005	0.012		NA
5708975	5708976	CJA_1035	CJA_1036	tolB		TRUE	0.973	52.000	0.592	1.000	N	NA
5708976	5708977	CJA_1036	CJA_1037			TRUE	0.981	16.000	0.278	1.000		NA
5708977	5708978	CJA_1037	CJA_1038			FALSE	0.005	620.000	0.000	NA		NA
5708979	5708980	CJA_1039	CJA_1040			FALSE	0.079	156.000	0.000	NA		NA
5708980	5708981	CJA_1040	CJA_1041		ndpA	FALSE	0.185	104.000	0.000	NA		NA
5708982	5708983	CJA_1042	CJA_1044			FALSE	0.143	128.000	0.000	NA	N	NA
5708985	5708986	CJA_1045	CJA_1046			FALSE	0.370	74.000	0.000	1.000		NA
5708986	5708987	CJA_1046	CJA_1047			FALSE	0.228	92.000	0.000	NA		NA
5708987	5708988	CJA_1047	CJA_1048			FALSE	0.340	49.000	0.000	NA		NA
5708989	5708990	CJA_1049	CJA_1050	rebH		TRUE	0.966	95.000	0.750	NA	N	NA
5708990	5708991	CJA_1050	CJA_1051			FALSE	0.023	284.000	0.000	1.000	N	NA
5708991	5708992	CJA_1051	CJA_1052			FALSE	0.016	313.000	0.000	1.000		NA
5708992	5708993	CJA_1052	CJA_1053			FALSE	0.028	221.000	0.000	NA		NA
5708994	5708995	CJA_1054	CJA_1055			TRUE	0.995	-28.000	1.000	NA		NA
5708995	5708996	CJA_1055	CJA_1056			FALSE	0.285	76.000	0.000	NA		NA
5708996	5708997	CJA_1056	CJA_1057		cycP	TRUE	0.828	-3.000	0.000	NA		NA
5708997	5708998	CJA_1057	CJA_1058	cycP	cybP	TRUE	0.995	4.000	0.093	0.042	Y	NA
5708998	5708999	CJA_1058	CJA_1059	cybP		TRUE	0.753	16.000	0.000	1.000	N	NA
5709000	5709001	CJA_1060	CJA_1061		gcvP	FALSE	0.036	238.000	0.000	1.000	N	NA
5709002	5709003	CJA_1062	CJA_1063		gspA	FALSE	0.384	38.000	0.000	NA		NA
5709003	5709004	CJA_1063	CJA_1064	gspA		TRUE	0.985	0.000	0.133	NA		NA
5709005	5709006	CJA_1065	CJA_1066	bfr		TRUE	0.633	154.000	0.086	NA	Y	NA
5709007	5709008	CJA_1067	CJA_1068		ung	FALSE	0.085	181.000	0.000	1.000	N	NA
5709008	5709009	CJA_1068	CJA_1069	ung		FALSE	0.018	321.000	0.000	1.000	N	NA
5709009	5709010	CJA_1069	CJA_1070			FALSE	0.251	86.000	0.000	NA		NA
5709010	5709011	CJA_1070	CJA_1071			FALSE	0.006	499.000	0.000	NA		NA
5709011	5709012	CJA_1071	CJA_1072			TRUE	0.686	106.000	0.007	1.000	Y	NA
5709012	5709013	CJA_1072	CJA_1073			TRUE	0.830	5.000	0.000	NA		NA
5709013	5709014	CJA_1073	CJA_1074			TRUE	0.587	-28.000	0.000	NA		NA
5709014	5709015	CJA_1074	CJA_1075		fadD1	FALSE	0.015	331.000	0.000	1.000		NA
5709015	5709016	CJA_1075	CJA_1076	fadD1		FALSE	0.285	86.000	0.000	NA	N	NA
5709016	5709017	CJA_1076	CJA_1077			TRUE	0.975	9.000	0.023	NA	Y	NA
5709017	5709018	CJA_1077	CJA_1078		uvs083	TRUE	0.705	13.000	0.000	NA		NA
5709019	5709020	CJA_1079	CJA_1080		cysI	TRUE	0.958	-16.000	0.165	NA		NA
5709021	5709022	CJA_1081	CJA_1082			FALSE	0.352	45.000	0.000	NA		NA
5709022	5709023	CJA_1082	CJA_1083			FALSE	0.315	62.000	0.000	NA		NA
5709024	5709025	CJA_1084	CJA_1085			FALSE	0.023	233.000	0.000	NA		NA
5709025	5709026	CJA_1085	CJA_1086			TRUE	0.979	0.000	0.087	NA		NA
5709026	5709027	CJA_1086	CJA_1087			FALSE	0.051	184.000	0.000	NA		NA
5709027	5709028	CJA_1087	CJA_1088			TRUE	0.998	10.000	0.378	0.029	Y	NA
5709030	5709031	CJA_1090	CJA_1091		dapE	FALSE	0.055	201.000	0.000	1.000		NA
5709031	5709032	CJA_1091	CJA_1092	dapE	hspC2	FALSE	0.107	146.000	0.000	NA	N	NA
5709032	5709033	CJA_1092	CJA_1093	hspC2		TRUE	0.853	100.000	0.111	NA	Y	NA
5709034	5709035	CJA_1094	CJA_1095			TRUE	0.984	-10.000	0.279	NA		NA
5709035	5709036	CJA_1095	CJA_1096			TRUE	0.906	16.000	0.048	NA		NA
5709037	5709038	CJA_1097	CJA_1098			TRUE	0.993	-3.000	0.333	NA		NA
5709038	5709039	CJA_1098	CJA_1099			FALSE	0.049	185.000	0.000	NA		NA
5709039	5709040	CJA_1099	CJA_1100		dapD	FALSE	0.308	65.000	0.000	NA		NA
5709040	5709041	CJA_1100	CJA_1101	dapD		TRUE	0.833	39.000	0.069	1.000	N	NA
5709041	5709042	CJA_1101	CJA_1102			TRUE	0.943	-3.000	0.004	1.000	N	NA
5709042	5709043	CJA_1102	CJA_1103			TRUE	0.770	-48.000	0.004	1.000	N	NA
5709043	5709044	CJA_1103	CJA_1104		glnD	TRUE	0.956	31.000	0.257	1.000	N	NA
5709044	5709045	CJA_1104	CJA_1105	glnD	map	TRUE	0.974	73.000	0.651	1.000	N	NA
5709046	5709047	CJA_1106	CJA_1107			FALSE	0.420	52.000	0.000	1.000		NA
5709047	5709048	CJA_1107	CJA_1108			TRUE	0.999	0.000	0.464	1.000	Y	NA
5709050	5709051	CJA_1110	CJA_1111	rpsB	tsf	TRUE	0.973	125.000	0.748	1.000	Y	NA
5709051	5709052	CJA_1111	CJA_1112	tsf		FALSE	0.110	135.000	0.000	NA		NA
5709052	5709053	CJA_1112	CJA_1113			FALSE	0.325	57.000	0.000	NA		NA
5709053	5709054	CJA_1113	CJA_1114		pyrH	FALSE	0.134	123.000	0.000	NA		NA
5709054	5709055	CJA_1114	CJA_1115	pyrH	frr	TRUE	0.538	105.000	0.030	1.000	N	NA
5709055	5709056	CJA_1115	CJA_1116	frr	uppS	TRUE	0.886	119.000	0.409	1.000	N	NA
5709056	5709057	CJA_1116	CJA_1117	uppS	cdsA	TRUE	0.997	-7.000	0.400	1.000	Y	NA
5709057	5709058	CJA_1117	CJA_1118	cdsA	dxr	TRUE	0.997	9.000	0.372	1.000	Y	NA
5709058	5709059	CJA_1118	CJA_1119	dxr		TRUE	0.985	27.000	0.568	1.000	N	NA
5709059	5709060	CJA_1119	CJA_1120			TRUE	0.951	71.000	0.204	1.000	Y	NA
5709060	5709061	CJA_1120	CJA_1121			TRUE	0.939	117.000	0.354	1.000	Y	NA
5709061	5709062	CJA_1121	CJA_1122		lpxD	TRUE	0.998	19.000	0.814	1.000	Y	NA
5709062	5709063	CJA_1122	CJA_1123	lpxD	fabZ	TRUE	0.988	35.000	0.796	1.000	N	NA
5709063	5709064	CJA_1123	CJA_1124	fabZ	lpxA	TRUE	0.983	75.000	0.850	1.000	N	NA
5709064	5709065	CJA_1124	CJA_1125	lpxA	lpx19A	TRUE	0.967	68.000	0.289	1.000	Y	NA
5709065	5709066	CJA_1125	CJA_1126	lpx19A	rnhB	TRUE	0.989	-3.000	0.186	1.000	N	NA
5709066	5709067	CJA_1126	CJA_1127	rnhB	dnaE	TRUE	0.960	27.000	0.104	1.000	Y	NA
5709067	5709068	CJA_1127	CJA_1128	dnaE		FALSE	0.102	168.000	0.000	1.000	N	NA
5709068	5709069	CJA_1128	CJA_1129		accA	FALSE	0.014	367.000	0.000	1.000	N	NA
5709069	5709070	CJA_1129	CJA_1130	accA		FALSE	0.023	234.000	0.000	NA		NA
5709072	5709073	CJA_1132	CJA_1133	fucP		TRUE	0.984	-3.000	0.167	NA		NA
5709073	5709074	CJA_1133	CJA_1134		kdgR	TRUE	0.894	98.000	0.308	1.000		NA
5709074	5709075	CJA_1134	CJA_1135	kdgR		TRUE	0.659	196.000	0.385	1.000	N	NA
5709075	5709076	CJA_1135	CJA_1136			TRUE	0.874	-3.000	0.000	1.000		NA
5709076	5709077	CJA_1136	CJA_1137		uxaA	TRUE	0.959	-3.000	0.000	0.001		NA
5709077	5709078	CJA_1137	CJA_1138	uxaA		TRUE	0.857	74.000	0.152	1.000	N	NA
5709078	5709079	CJA_1138	CJA_1139			TRUE	0.968	25.000	0.061	0.043	Y	NA
5709079	5709080	CJA_1139	CJA_1140		cel3D	FALSE	0.469	46.000	0.000	1.000	N	NA
5709080	5709081	CJA_1140	CJA_1141	cel3D		FALSE	0.014	284.000	0.000	NA		NA
5709081	5709082	CJA_1141	CJA_1142			FALSE	0.100	141.000	0.000	NA		NA
5709083	5709084	CJA_1143	CJA_1144		purK	FALSE	0.371	40.000	0.000	NA		NA
5709084	5709085	CJA_1144	CJA_1145	purK	purE	TRUE	0.983	27.000	0.136	0.001	Y	NA
5709085	5709086	CJA_1145	CJA_1146	purE		FALSE	0.125	182.000	0.006	NA		NA
5709090	5709091	CJA_1150	CJA_1151	rdgC	fklB	FALSE	0.381	139.000	0.033	1.000	N	NA
5709091	5709092	CJA_1151	CJA_1152	fklB		FALSE	0.318	61.000	0.000	NA		NA
5709094	5709095	CJA_1154	CJA_1155	feoB		TRUE	0.985	49.000	0.500	1.000	Y	NA
5709096	5709097	CJA_1156	CJA_1157			FALSE	0.010	338.000	0.000	NA		NA
5709097	5709098	CJA_1157	CJA_1159			TRUE	0.981	80.000	1.000	NA		NA
5709100	5709101	CJA_1160	CJA_1161		gluP	TRUE	0.747	102.000	0.035	NA	Y	NA
5709101	5709102	CJA_1161	CJA_1162	gluP		TRUE	0.880	-37.000	0.070	NA		NA
5709102	5709103	CJA_1162	CJA_1163		nag9A	TRUE	0.801	31.000	0.046	NA		NA
5709103	5709104	CJA_1163	CJA_1164	nag9A	nagB	TRUE	0.903	35.000	0.000	0.001	Y	NA
5709107	5709108	CJA_1167	CJA_1168			TRUE	0.622	18.000	0.000	NA		NA
5709108	5709109	CJA_1168	CJA_1169		hscC	TRUE	0.997	1.000	0.500	1.000		NA
5709110	5709111	CJA_1170	CJA_1171	motA1	motB	TRUE	0.978	14.000	0.077	1.000	Y	NA
5709111	5709112	CJA_1171	CJA_1172	motB		FALSE	0.110	135.000	0.000	NA		NA
5709113	5709114	CJA_1173	CJA_1174			FALSE	0.025	228.000	0.000	NA		NA
5709114	5709115	CJA_1174	CJA_1175			TRUE	0.983	-3.000	0.147	NA		NA
5709115	5709116	CJA_1175	CJA_1176			FALSE	0.302	81.000	0.000	NA	N	NA
5709116	5709117	CJA_1176	CJA_1177			TRUE	0.998	-3.000	0.727	NA		NA
5709117	5709118	CJA_1177	CJA_1178			TRUE	0.998	5.000	0.739	NA		NA
5709118	5709119	CJA_1178	CJA_1179			FALSE	0.420	52.000	0.000	1.000		NA
5709119	5709120	CJA_1179	CJA_1180			FALSE	0.201	124.000	0.000	1.000	N	NA
5709120	5709121	CJA_1180	CJA_3894			FALSE	0.019	249.000	0.000	NA		NA
5709126	5709127	CJA_1186	CJA_1187			FALSE	0.069	302.000	0.000	1.000	Y	NA
5709127	5709128	CJA_1187	CJA_1188			TRUE	0.769	44.000	0.000	1.000	Y	NA
5709128	5709129	CJA_1188	CJA_1189			TRUE	0.927	14.000	0.000	1.000	Y	NA
5709129	5709130	CJA_1189	CJA_1190			TRUE	0.918	-45.000	0.000	0.024	Y	NA
5709131	5709132	CJA_1191	CJA_1192	cbp6A		FALSE	0.015	326.000	0.000	1.000		NA
5709135	5709136	CJA_1195	CJA_1196			TRUE	0.844	4.000	0.000	NA		NA
5709136	5709137	CJA_1196	CJA_1197		hupA	FALSE	0.081	174.000	0.000	1.000		NA
5709138	5709139	CJA_1198	CJA_1199	azu		FALSE	0.027	364.000	0.000	0.042		NA
5709139	5709140	CJA_1199	CJA_1200			TRUE	0.774	10.000	0.000	NA		NA
5709141	5709142	CJA_1201	CJA_1202			FALSE	0.047	189.000	0.000	NA		NA
5709142	5709143	CJA_1202	CJA_1203			FALSE	0.089	149.000	0.000	NA		NA
5709143	5709144	CJA_1203	CJA_1204			FALSE	0.012	302.000	0.000	NA		NA
5709144	5709145	CJA_1204	CJA_1205			TRUE	0.787	9.000	0.000	NA		NA
5709145	5709146	CJA_1205	CJA_1206			TRUE	0.899	102.000	0.400	NA		NA
5709147	5709148	CJA_1207	CJA_1208		sinR	TRUE	0.989	-18.000	0.520	NA	N	NA
5709148	5709149	CJA_1208	CJA_1209	sinR		FALSE	0.005	713.000	0.000	NA		NA
5709149	5709150	CJA_1209	CJA_1210			TRUE	0.857	0.000	0.000	NA		NA
5709150	5709151	CJA_1210	CJA_1211			FALSE	0.006	542.000	0.000	NA		NA
5709151	5709152	CJA_1211	CJA_1212			TRUE	0.993	0.000	0.250	1.000		NA
5709153	5709154	CJA_1213	CJA_1214			TRUE	0.996	-3.000	0.500	NA		NA
5709154	5709155	CJA_1214	CJA_1216			FALSE	0.265	100.000	0.000	1.000		NA
5709156	5709157	CJA_1215	CJA_1217			FALSE	0.004	1564.000	0.000	NA		NA
5709158	5709159	CJA_1218	CJA_1221			FALSE	0.125	127.000	0.000	NA		NA
5709159	5709160	CJA_1221	CJA_1222			FALSE	0.004	1924.000	0.000	NA		NA
5709161	5709162	CJA_1223	CJA_1224			TRUE	0.978	60.000	0.750	NA		NA
5709162	5709163	CJA_1224	CJA_1225			FALSE	0.025	228.000	0.000	NA		NA
5709166	5709167	CJA_1228	CJA_1229			FALSE	0.009	352.000	0.000	NA		NA
5709168	5709169	CJA_1230	CJA_1231			FALSE	0.237	90.000	0.000	NA		NA
5709170	5709171	CJA_1232	CJA_1233			TRUE	0.648	16.000	0.000	NA		NA
5709171	5709172	CJA_1233	CJA_1234			FALSE	0.049	186.000	0.000	NA		NA
5709172	5709173	CJA_1234	CJA_1236		ccrB	TRUE	0.992	-3.000	0.300	NA		NA
5709174	5709175	CJA_3895	CJA_1237			FALSE	0.108	136.000	0.000	NA		NA
5709175	5709176	CJA_1237	CJA_1238			TRUE	0.999	4.000	0.731	0.014		NA
5709176	5709177	CJA_1238	CJA_1239			TRUE	0.999	4.000	0.823	1.000		NA
5709177	5709178	CJA_1239	CJA_1240			TRUE	0.998	21.000	0.758	0.047	Y	NA
5709178	5709179	CJA_1240	CJA_1241			TRUE	0.981	91.000	0.654	NA	Y	NA
5709179	5709180	CJA_1241	CJA_1242		gntR	FALSE	0.227	167.000	0.026	NA	N	NA
5709180	5709181	CJA_1242	CJA_1243	gntR		TRUE	0.906	30.000	0.114	1.000	N	NA
5709181	5709182	CJA_1243	CJA_1244			TRUE	0.869	118.000	0.343	1.000	N	NA
5709183	5709184	CJA_1245	CJA_1246			TRUE	0.703	18.000	0.000	1.000		NA
5709184	5709185	CJA_1246	CJA_1248			FALSE	0.267	81.000	0.000	NA		NA
5709187	5709188	CJA_1250	CJA_1251			TRUE	0.784	32.000	0.023	1.000	N	NA
5709188	5709189	CJA_1251	CJA_1252			FALSE	0.008	373.000	0.000	NA		NA
5709189	5709190	CJA_1252	CJA_1253			FALSE	0.459	29.000	0.000	NA		NA
5709190	5709191	CJA_1253	CJA_1254			FALSE	0.422	33.000	0.000	NA		NA
5709191	5709192	CJA_1254	CJA_1255			TRUE	0.501	26.000	0.000	NA		NA
5709192	5709193	CJA_1255	CJA_1256			TRUE	0.939	-3.000	0.000	0.053		NA
5709193	5709194	CJA_1256	CJA_1257			TRUE	0.750	-7.000	0.000	NA		NA
5709195	5709196	CJA_1258	CJA_1259			FALSE	0.009	358.000	0.000	NA		NA
5709196	5709197	CJA_1259	CJA_1260			FALSE	0.038	202.000	0.000	NA		NA
5709197	5709198	CJA_1260	CJA_1261			FALSE	0.422	33.000	0.000	NA		NA
5709198	5709199	CJA_1261	CJA_1262			TRUE	0.997	-3.000	0.600	NA		NA
5709199	5709200	CJA_1262	CJA_1263			FALSE	0.442	31.000	0.000	NA		NA
5709200	5709201	CJA_1263	CJA_1264			TRUE	0.635	17.000	0.000	NA		NA
5709201	5709202	CJA_1264	CJA_1265			FALSE	0.004	994.000	0.000	NA		NA
5709203	5709204	CJA_1266	CJA_1267			FALSE	0.208	98.000	0.000	NA		NA
5709204	5709205	CJA_1267	CJA_1269		radA	TRUE	0.828	-3.000	0.000	NA		NA
5709206	5709207	CJA_1268	CJA_1270			TRUE	0.677	14.000	0.000	NA		NA
5709207	5709208	CJA_1270	CJA_1271			TRUE	0.648	16.000	0.000	NA		NA
5709209	5709210	CJA_1272	CJA_1273			FALSE	0.302	68.000	0.000	NA		NA
5709210	5709211	CJA_1273	CJA_1274			TRUE	0.771	-6.000	0.000	NA		NA
5709211	5709212	CJA_1274	CJA_1276			FALSE	0.281	77.000	0.000	NA		NA
5709213	5709214	CJA_1275	CJA_1277		pelC	TRUE	0.805	7.000	0.000	NA		NA
5709215	5709216	CJA_1278	CJA_1279			FALSE	0.051	292.000	0.000	0.026	N	NA
5709216	5709217	CJA_1279	CJA_1280			FALSE	0.216	96.000	0.000	NA		NA
5709217	5709218	CJA_1280	CJA_1281			FALSE	0.119	131.000	0.000	NA		NA
5709218	5709219	CJA_1281	CJA_1282			TRUE	0.648	16.000	0.000	NA		NA
5709219	5709220	CJA_1282	CJA_1283			FALSE	0.062	170.000	0.000	NA		NA
5709220	5709221	CJA_1283	CJA_1284			FALSE	0.011	315.000	0.000	NA		NA
5709221	5709222	CJA_1284	CJA_1285			TRUE	0.886	24.000	0.077	NA		NA
5709222	5709223	CJA_1285	CJA_1286		fimC	TRUE	0.930	33.000	0.219	NA		NA
5709223	5709224	CJA_1286	CJA_1287	fimC	fimD	TRUE	0.998	-13.000	0.879	NA	Y	NA
5709224	5709225	CJA_1287	CJA_1288	fimD		TRUE	0.996	14.000	0.848	NA		NA
5709227	5709228	CJA_1290	CJA_1291		uvs045	FALSE	0.134	123.000	0.000	NA		NA
5709229	5709230	CJA_1292	CJA_1293		ompA	TRUE	0.559	28.000	0.000	1.000		NA
5709230	5709231	CJA_1293	CJA_1294	ompA		FALSE	0.009	497.000	0.000	1.000		NA
5709231	5709232	CJA_1294	CJA_1295			FALSE	0.005	722.000	0.000	NA		NA
5709232	5709233	CJA_1295	CJA_1296			TRUE	0.828	-3.000	0.000	NA		NA
5709233	5709234	CJA_1296	CJA_1297			TRUE	0.828	-3.000	0.000	NA		NA
5709234	5709235	CJA_1297	CJA_1298			FALSE	0.056	177.000	0.000	NA		NA
5709235	5709236	CJA_1298	CJA_1299		exbD	FALSE	0.044	222.000	0.000	1.000	N	NA
5709236	5709237	CJA_1299	CJA_1300	exbD	exbB	TRUE	0.997	4.000	0.200	0.062	Y	NA
5709237	5709238	CJA_1300	CJA_1301	exbB	uvs044	TRUE	0.866	37.000	0.033	0.018	N	NA
5709240	5709241	CJA_1303	CJA_1304			FALSE	0.134	123.000	0.000	NA		NA
5709241	5709242	CJA_1304	CJA_1305			FALSE	0.011	320.000	0.000	NA		NA
5709242	5709243	CJA_1305	CJA_1306			TRUE	0.787	9.000	0.000	NA		NA
5709243	5709244	CJA_1306	CJA_1307		chrA	FALSE	0.220	192.000	0.000	1.000	Y	NA
5709244	5709245	CJA_1307	CJA_1308	chrA		FALSE	0.406	139.000	0.000	1.000	Y	NA
5709245	5709246	CJA_1308	CJA_1309			FALSE	0.044	193.000	0.000	NA		NA
5709247	5709248	CJA_1310	CJA_1311			FALSE	0.281	77.000	0.000	NA		NA
5709248	5709249	CJA_1311	CJA_1312			TRUE	0.997	-3.000	0.600	NA		NA
5709249	5709250	CJA_1312	CJA_1313			FALSE	0.378	39.000	0.000	NA		NA
5709252	5709253	CJA_1315	CJA_1316		gly43F	TRUE	0.970	36.000	0.455	1.000		NA
5709255	5709256	CJA_1318	CJA_1319	minC	minD	TRUE	0.989	32.000	0.466	1.000	Y	NA
5709256	5709257	CJA_1319	CJA_1320	minD	minE	TRUE	0.999	0.000	0.618	NA	Y	NA
5709257	5709258	CJA_1320	CJA_1321	minE	ycel4	TRUE	0.818	6.000	0.000	NA		NA
5709258	5709259	CJA_1321	CJA_1322	ycel4		TRUE	0.604	19.000	0.000	NA		NA
5709260	5709261	CJA_1323	CJA_1324			FALSE	0.200	100.000	0.000	NA		NA
5709261	5709262	CJA_1324	CJA_1325			TRUE	0.828	-3.000	0.000	NA		NA
5709262	5709263	CJA_1325	CJA_1326			FALSE	0.237	90.000	0.000	NA		NA
5709263	5709264	CJA_1326	CJA_1327			FALSE	0.014	285.000	0.000	NA		NA
5709264	5709265	CJA_1327	CJA_1328			TRUE	0.950	3.000	0.017	NA		NA
5709266	5709267	CJA_1329	CJA_1330			TRUE	0.857	0.000	0.000	NA		NA
5709267	5709268	CJA_1330	CJA_1331			FALSE	0.045	192.000	0.000	NA		NA
5709270	5709271	CJA_1333	CJA_1334			TRUE	0.618	97.000	0.000	1.000	Y	NA
5709271	5709272	CJA_1334	CJA_1335			TRUE	0.541	23.000	0.000	NA		NA
5709272	5709273	CJA_1335	CJA_1336		aceE	FALSE	0.014	283.000	0.000	NA		NA
5709273	5709274	CJA_1336	CJA_1337	aceE	gt4H	TRUE	0.923	87.000	0.167	1.000	Y	NA
5709275	5709276	CJA_1338	CJA_1339			TRUE	0.501	26.000	0.000	NA		NA
5709276	5709277	CJA_1339	CJA_1340		mobA	FALSE	0.301	69.000	0.000	NA		NA
5709278	5709279	CJA_1341	CJA_1342	pdxH		TRUE	0.850	10.000	0.000	1.000	N	NA
5709279	5709280	CJA_1342	CJA_1343			TRUE	0.967	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
5709280	5709281	CJA_1343	CJA_1344			TRUE	0.828	-3.000	0.000	NA		NA
5709281	5709282	CJA_1344	CJA_1345			TRUE	0.646	-16.000	0.000	NA		NA
5709283	5709284	CJA_1346	CJA_1347		hyl84	FALSE	0.102	139.000	0.000	NA		NA
5709285	5709286	CJA_1348	CJA_1349	pgi	edd	FALSE	0.444	132.000	0.000	1.000	Y	NA
5709286	5709287	CJA_1349	CJA_1350	edd	zwf	TRUE	0.684	108.000	0.008	1.000	Y	NA
5709287	5709288	CJA_1350	CJA_1351	zwf	pgl	TRUE	0.974	-6.000	0.014	1.000	Y	NA
5709288	5709289	CJA_1351	CJA_1352	pgl	kdgA	TRUE	0.937	31.000	0.064	1.000	Y	NA
5709289	5709290	CJA_1352	CJA_1353	kdgA	gap	TRUE	0.796	86.000	0.017	1.000	Y	NA
5709290	5709291	CJA_1353	CJA_1354	gap	pyk	TRUE	0.980	18.000	0.044	0.004	Y	NA
5709291	5709292	CJA_1354	CJA_1355	pyk		TRUE	0.646	-16.000	0.000	NA		NA
5709292	5709293	CJA_1355	CJA_1356			TRUE	0.705	13.000	0.000	NA		NA
5709293	5709294	CJA_1356	CJA_1357			FALSE	0.459	29.000	0.000	NA		NA
5709294	5709295	CJA_1357	CJA_1358			FALSE	0.285	76.000	0.000	NA		NA
5709295	5709296	CJA_1358	CJA_1359		alaS	FALSE	0.247	87.000	0.000	NA		NA
5709296	5709297	CJA_1359	CJA_1360	alaS	lysC	FALSE	0.409	154.000	0.065	1.000	N	NA
5709297	5709298	CJA_1360	CJA_1361	lysC	csrA	FALSE	0.211	218.000	0.079	1.000	N	NA
5709298	5709299	CJA_1361	CJA_3902	csrA		FALSE	0.026	226.000	0.000	NA		NA
5709302	5709303	CJA_1365	CJA_1366		gt4F	FALSE	0.270	99.000	0.000	1.000		NA
5709303	5709304	CJA_1366	CJA_1367	gt4F	gt2F	FALSE	0.484	27.000	0.000	NA		NA
5709304	5709305	CJA_1367	CJA_1368	gt2F		TRUE	0.546	-34.000	0.000	NA		NA
5709305	5709306	CJA_1368	CJA_1369		gt9B	TRUE	0.644	22.000	0.000	1.000		NA
5709306	5709307	CJA_1369	CJA_1370	gt9B		TRUE	0.566	-31.000	0.000	NA		NA
5709307	5709308	CJA_1370	CJA_1371			FALSE	0.067	167.000	0.000	NA		NA
5709308	5709309	CJA_1371	CJA_1372			TRUE	0.610	83.000	0.025	1.000		NA
5709309	5709310	CJA_1372	CJA_1373			TRUE	0.975	19.000	0.286	NA		NA
5709310	5709311	CJA_1373	CJA_1374			TRUE	0.587	20.000	0.000	NA		NA
5709312	5709313	CJA_1375	CJA_1376			FALSE	0.212	97.000	0.000	NA		NA
5709313	5709314	CJA_1376	CJA_1377			FALSE	0.228	92.000	0.000	NA		NA
5709314	5709315	CJA_1377	CJA_1378			FALSE	0.345	47.000	0.000	NA		NA
5709315	5709316	CJA_1378	CJA_1379		gltX	FALSE	0.265	100.000	0.000	1.000		NA
5709316	5709317	CJA_1379	CJA_3903	gltX		FALSE	0.160	112.000	0.000	NA		NA
5709318	5709319	CJA_1381	CJA_1382			FALSE	0.152	115.000	0.000	NA		NA
5709320	5709321	CJA_1383	CJA_1384			FALSE	0.150	116.000	0.000	NA		NA
5709321	5709322	CJA_1384	CJA_1385			FALSE	0.329	55.000	0.000	NA		NA
5709324	5709325	CJA_1387	CJA_1388			FALSE	0.011	311.000	0.000	NA		NA
5709325	5709326	CJA_1388	CJA_1389		phoH	TRUE	0.587	-28.000	0.000	NA		NA
5709326	5709327	CJA_1389	CJA_1390	phoH		TRUE	0.646	-16.000	0.000	NA		NA
5709327	5709328	CJA_1390	CJA_1391		rrmA	FALSE	0.334	52.000	0.000	NA		NA
5709328	5709329	CJA_1391	CJA_1392	rrmA		FALSE	0.032	249.000	0.000	1.000	N	NA
5709329	5709330	CJA_1392	CJA_1393			TRUE	0.693	110.000	0.053	0.054	N	NA
5709330	5709331	CJA_1393	CJA_1394			TRUE	0.995	0.000	0.223	0.054	N	NA
5709331	5709332	CJA_1394	CJA_1395			TRUE	0.996	-3.000	0.455	1.000	N	NA
5709332	5709333	CJA_1395	CJA_1396			FALSE	0.044	214.000	0.000	1.000		NA
5709333	5709334	CJA_1396	CJA_1397			TRUE	0.604	19.000	0.000	NA		NA
5709335	5709336	CJA_1398	CJA_1399			TRUE	0.993	3.000	0.273	NA		NA
5709336	5709337	CJA_1399	CJA_1400			FALSE	0.130	125.000	0.000	NA		NA
5709337	5709338	CJA_1400	CJA_1401			TRUE	0.927	23.000	0.103	1.000	N	NA
5709339	5709340	CJA_1402	CJA_1403	amy13C		FALSE	0.177	133.000	0.000	1.000	N	NA
5709342	5709343	CJA_1405	CJA_1406			FALSE	0.295	72.000	0.000	NA		NA
5709343	5709344	CJA_1406	CJA_1407		creC	TRUE	0.999	-3.000	0.776	1.000	Y	NA
5709344	5709345	CJA_1407	CJA_1408	creC	creD	TRUE	0.924	75.000	0.311	NA	N	NA
5709346	5709347	CJA_1409	CJA_1410			FALSE	0.196	101.000	0.000	NA		NA
5709348	5709349	CJA_1411	CJA_1412			FALSE	0.308	65.000	0.000	NA		NA
5709349	5709350	CJA_1412	CJA_1413			FALSE	0.163	111.000	0.000	NA		NA
5709350	5709351	CJA_1413	CJA_1414			FALSE	0.025	227.000	0.000	NA		NA
5709351	5709352	CJA_1414	CJA_1415			TRUE	0.670	75.000	0.000	NA	Y	NA
5709354	5709355	CJA_1417	CJA_1418			FALSE	0.312	63.000	0.000	NA		NA
5709355	5709356	CJA_1418	CJA_1419			FALSE	0.422	33.000	0.000	NA		NA
5709356	5709357	CJA_1419	CJA_1420			FALSE	0.063	169.000	0.000	NA		NA
5709358	5709359	CJA_1421	CJA_1422			FALSE	0.028	260.000	0.000	1.000	N	NA
5709359	5709360	CJA_1422	CJA_1423			TRUE	0.705	13.000	0.000	NA		NA
5709361	5709362	CJA_1424	CJA_1425			TRUE	0.818	6.000	0.000	NA		NA
5709363	5709364	CJA_1426	CJA_1427			FALSE	0.033	211.000	0.000	NA		NA
5709364	5709365	CJA_1427	CJA_1428			TRUE	0.998	-3.000	0.286	0.052	Y	NA
5709366	5709367	CJA_1429	CJA_1430			FALSE	0.090	148.000	0.000	NA		NA
5709369	5709370	CJA_1432	CJA_1433		rpsP	FALSE	0.173	134.000	0.000	1.000	N	NA
5709370	5709371	CJA_1433	CJA_1434	rpsP	rimM	TRUE	0.996	15.000	0.342	0.014	Y	NA
5709371	5709372	CJA_1434	CJA_1435	rimM	trmD	TRUE	0.999	-3.000	0.672	1.000	Y	NA
5709372	5709373	CJA_1435	CJA_1436	trmD	rplS	TRUE	0.991	33.000	0.567	1.000	Y	NA
5709373	5709374	CJA_1436	CJA_1437	rplS	xerD	TRUE	0.627	76.000	0.015	1.000	N	NA
5709374	5709375	CJA_1437	CJA_1438	xerD	dsbC	TRUE	0.856	36.000	0.079	1.000	N	NA
5709375	5709376	CJA_1438	CJA_1439	dsbC	hom	FALSE	0.136	150.000	0.000	1.000	N	NA
5709376	5709377	CJA_1439	CJA_1440	hom	thrC	TRUE	0.974	22.000	0.125	1.000	Y	NA
5709377	5709378	CJA_1440	CJA_1441	thrC		FALSE	0.357	86.000	0.000	1.000	N	NA
5709378	5709379	CJA_1441	CJA_1442			FALSE	0.015	278.000	0.000	NA		NA
5709380	5709381	CJA_1443	CJA_1444			TRUE	0.805	7.000	0.000	NA		NA
5709383	5709384	CJA_1445	CJA_1447		holC	TRUE	0.810	18.000	0.006	NA		NA
5709384	5709385	CJA_1447	CJA_1448	holC		TRUE	0.985	24.000	0.494	1.000	N	NA
5709386	5709387	CJA_1449	CJA_1450			TRUE	0.997	-7.000	0.631	0.054		NA
5709388	5709389	CJA_1451	CJA_1452			TRUE	0.648	16.000	0.000	NA		NA
5709389	5709390	CJA_1452	CJA_1453			TRUE	0.828	-3.000	0.000	NA		NA
5709390	5709391	CJA_1453	CJA_3912			FALSE	0.340	49.000	0.000	NA		NA
5709392	5709393	CJA_1456	CJA_1457	queA	tgt	TRUE	0.990	43.000	0.360	0.001	Y	NA
5709393	5709394	CJA_1457	CJA_1458	tgt	secD	FALSE	0.149	185.000	0.004	1.000	N	NA
5709394	5709395	CJA_1458	CJA_1459	secD	secF	TRUE	0.994	13.000	0.171	0.001	Y	NA
5709395	5709396	CJA_1459	CJA_1460	secF		TRUE	0.681	-13.000	0.000	NA		NA
5709396	5709397	CJA_1460	CJA_1461			TRUE	0.604	19.000	0.000	NA		NA
5709397	5709398	CJA_1461	CJA_1462		cel5A	FALSE	0.012	435.000	0.000	1.000	N	NA
5709400	5709401	CJA_1464	CJA_1465		iscR	FALSE	0.347	199.000	0.126	1.000	N	NA
5709401	5709402	CJA_1465	CJA_1466	iscR		TRUE	0.985	21.000	0.424	1.000	N	NA
5709402	5709403	CJA_1466	CJA_1467		sufB	TRUE	0.766	28.000	0.007	1.000	N	NA
5709403	5709404	CJA_1467	CJA_1468	sufB	sufC	TRUE	0.983	52.000	0.466	1.000	Y	NA
5709404	5709405	CJA_1468	CJA_1469	sufC	sufD	TRUE	0.998	4.000	0.482	1.000	Y	NA
5709405	5709406	CJA_1469	CJA_1470	sufD		TRUE	0.968	-3.000	0.041	1.000	N	NA
5709406	5709407	CJA_1470	CJA_1471			TRUE	0.969	15.000	0.200	NA		NA
5709407	5709408	CJA_1471	CJA_1472			TRUE	0.894	73.000	0.235	NA		NA
5709409	5709410	CJA_1473	CJA_1474		acrB	FALSE	0.237	113.000	0.000	1.000	N	NA
5709410	5709411	CJA_1474	CJA_1475	acrB	acrA	TRUE	0.986	4.000	0.130	1.000	N	NA
5709412	5709413	CJA_1476	CJA_1477		ndk	FALSE	0.031	214.000	0.000	NA		NA
5709413	5709414	CJA_1477	CJA_1478	ndk		TRUE	0.896	39.000	0.156	1.000		NA
5709414	5709415	CJA_1478	CJA_1479		pilF	TRUE	0.886	28.000	0.086	1.000		NA
5709415	5709416	CJA_1479	CJA_1480	pilF		TRUE	0.903	56.000	0.204	1.000		NA
5709416	5709417	CJA_1480	CJA_1481		ispG	TRUE	0.906	72.000	0.233	1.000		NA
5709417	5709418	CJA_1481	CJA_1482	ispG	hisS	TRUE	0.961	23.000	0.207	1.000	N	NA
5709418	5709419	CJA_1482	CJA_1483	hisS		TRUE	0.921	66.000	0.259	1.000		NA
5709419	5709420	CJA_1483	CJA_1484			TRUE	0.996	-3.000	0.492	1.000		NA
5709420	5709421	CJA_1484	CJA_1485			TRUE	0.735	126.000	0.203	1.000		NA
5709421	5709422	CJA_1485	CJA_1486			FALSE	0.304	91.000	0.000	1.000		NA
5709422	5709423	CJA_1486	CJA_1487			TRUE	0.961	-3.000	0.048	NA		NA
5709424	5709425	CJA_1488	CJA_1489		tal	TRUE	0.925	-10.000	0.043	NA		NA
5709425	5709426	CJA_1489	CJA_1490	tal		FALSE	0.287	169.000	0.039	1.000	N	NA
5709427	5709428	CJA_1491	CJA_1492	moaC	moaDE	TRUE	0.997	-3.000	0.175	0.002	Y	NA
5709428	5709429	CJA_1492	CJA_1493	moaDE		TRUE	0.999	3.000	0.501	0.002	Y	NA
5709433	5709434	CJA_1497	CJA_1498	cel3B		FALSE	0.007	456.000	0.000	NA		NA
5709436	5709437	CJA_1500	CJA_1501			FALSE	0.016	270.000	0.000	NA		NA
5709437	5709438	CJA_1501	CJA_1502			TRUE	0.999	-6.000	0.453	0.001	Y	NA
5709438	5709439	CJA_1502	CJA_1503		sdhA	TRUE	1.000	0.000	0.705	0.001	Y	NA
5709439	5709440	CJA_1503	CJA_1504	sdhA	sdhB	TRUE	0.998	15.000	0.604	0.001	Y	NA
5709440	5709441	CJA_1504	CJA_1505	sdhB	sucA	FALSE	0.444	199.000	0.067	1.000	Y	NA
5709441	5709442	CJA_1505	CJA_1506	sucA	sucB	TRUE	0.989	60.000	0.667	1.000	Y	NA
5709442	5709443	CJA_1506	CJA_1507	sucB		TRUE	0.932	104.000	0.253	1.000	Y	NA
5709443	5709444	CJA_1507	CJA_1508		sucC	TRUE	0.890	75.000	0.069	1.000	Y	NA
5709444	5709445	CJA_1508	CJA_1510	sucC		TRUE	0.999	11.000	0.806	0.001	Y	NA
5709447	5709448	CJA_1511	CJA_1512	speA		TRUE	0.926	33.000	0.052	1.000	Y	NA
5709448	5709449	CJA_1512	CJA_1513		nspC	TRUE	0.994	-22.000	0.444	1.000	Y	NA
5709451	5709452	CJA_1515	CJA_1516			TRUE	0.908	0.000	0.000	1.000	N	NA
5709452	5709453	CJA_1516	CJA_1517			FALSE	0.045	192.000	0.000	NA		NA
5709453	5709454	CJA_1517	CJA_1518			FALSE	0.273	79.000	0.000	NA		NA
5709454	5709455	CJA_1518	CJA_1519			TRUE	0.694	48.000	0.000	0.003		NA
5709455	5709456	CJA_1519	CJA_1520			TRUE	0.694	48.000	0.000	0.003		NA
5709456	5709457	CJA_1520	CJA_1521			TRUE	0.546	-34.000	0.000	NA		NA
5709457	5709458	CJA_1521	CJA_1522		amy13B	FALSE	0.006	476.000	0.000	NA		NA
5709460	5709461	CJA_1524	CJA_1525			TRUE	0.734	12.000	0.000	NA		NA
5709462	5709463	CJA_1526	CJA_1527			TRUE	0.897	111.000	0.471	NA		NA
5709468	5709469	CJA_3913	CJA_3914			TRUE	0.844	4.000	0.000	NA		NA
5709469	5709470	CJA_3914	CJA_3915			FALSE	0.181	105.000	0.000	NA		NA
5709470	5709471	CJA_3915	CJA_3916			TRUE	0.830	5.000	0.000	NA		NA
5709472	5709473	CJA_1536	CJA_1537			TRUE	0.556	22.000	0.000	NA		NA
5709473	5709474	CJA_1537	CJA_1538			FALSE	0.366	41.000	0.000	NA		NA
5709474	5709475	CJA_1538	CJA_1539			TRUE	0.756	11.000	0.000	NA		NA
5709475	5709476	CJA_1539	CJA_1540			TRUE	0.857	0.000	0.000	NA		NA
5709476	5709477	CJA_1540	CJA_1541			FALSE	0.163	111.000	0.000	NA		NA
5709477	5709478	CJA_1541	CJA_1542			TRUE	0.978	-3.000	0.111	NA		NA
5709478	5709479	CJA_1542	CJA_1543			FALSE	0.007	448.000	0.000	NA		NA
5709479	5709480	CJA_1543	CJA_1544			TRUE	0.513	25.000	0.000	NA		NA
5709483	5709484	CJA_1547	CJA_1548			FALSE	0.299	70.000	0.000	NA		NA
5709484	5709485	CJA_1548	CJA_1549			TRUE	0.921	-16.000	0.061	NA	N	NA
5709486	5709487	CJA_1550	CJA_1551			TRUE	0.815	-9.000	0.000	1.000	N	NA
5709488	5709489	CJA_1552	CJA_1553			TRUE	0.999	-3.000	0.688	0.096	Y	NA
5709489	5709490	CJA_1553	CJA_1554			TRUE	0.877	35.000	0.110	1.000		NA
5709493	5709494	CJA_1556	CJA_1558			FALSE	0.384	38.000	0.000	NA		NA
5709495	5709496	CJA_1559	CJA_3917			FALSE	0.052	183.000	0.000	NA		NA
5709496	5709497	CJA_3917	CJA_3918			FALSE	0.062	170.000	0.000	NA		NA
5709498	5709499	CJA_1562	CJA_1563			FALSE	0.320	60.000	0.000	NA		NA
5709499	5709500	CJA_1563	CJA_1564			FALSE	0.047	189.000	0.000	NA		NA
5709502	5709503	CJA_1566	CJA_1567			FALSE	0.043	195.000	0.000	NA		NA
5709503	5709504	CJA_1567	CJA_1568		nrdB	FALSE	0.023	265.000	0.000	1.000		NA
5709504	5709505	CJA_1568	CJA_1569	nrdB	nrdA	TRUE	0.964	152.000	0.564	0.001	Y	NA
5709505	5709506	CJA_1569	CJA_1570	nrdA		FALSE	0.004	841.000	0.000	NA		NA
5709507	5709508	CJA_1571	CJA_1572			FALSE	0.009	360.000	0.000	NA		NA
5709508	5709509	CJA_1572	CJA_1573			FALSE	0.379	71.000	0.000	1.000		NA
5709509	5709510	CJA_1573	CJA_1574			FALSE	0.147	137.000	0.000	1.000		NA
5709512	5709513	CJA_1576	CJA_1577			FALSE	0.110	135.000	0.000	NA		NA
5709513	5709514	CJA_1577	CJA_1578			FALSE	0.035	207.000	0.000	NA		NA
5709514	5709515	CJA_1578	CJA_1579			TRUE	0.976	-3.000	0.091	NA	N	NA
5709515	5709516	CJA_1579	CJA_1580			FALSE	0.011	404.000	0.000	1.000		NA
5709516	5709517	CJA_1580	CJA_1581		mod	FALSE	0.333	189.000	0.025	0.002		NA
5709517	5709518	CJA_1581	CJA_1582	mod	res	TRUE	0.997	0.000	0.418	0.051		NA
5709519	5709520	CJA_1583	CJA_1584	csm2	rloA	TRUE	0.972	13.000	0.184	NA		NA
5709521	5709522	CJA_1585	CJA_1586			TRUE	0.980	3.000	0.098	NA		NA
5709522	5709523	CJA_1586	CJA_1587			TRUE	0.996	-3.000	0.500	NA		NA
5709523	5709524	CJA_1587	CJA_1588			TRUE	0.920	-16.000	0.068	NA		NA
5709524	5709525	CJA_1588	CJA_1589			FALSE	0.247	87.000	0.000	NA		NA
5709526	5709527	CJA_1590	CJA_1591	afuB_2		TRUE	0.994	67.000	0.750	0.045	Y	NA
5709527	5709528	CJA_1591	CJA_1592			FALSE	0.193	334.000	0.226	1.000	N	NA
5709528	5709529	CJA_1592	CJA_1593			FALSE	0.108	136.000	0.000	NA		NA
5709531	5709532	CJA_1595	CJA_1596			FALSE	0.196	101.000	0.000	NA		NA
5709532	5709533	CJA_1596	CJA_1597			TRUE	0.648	16.000	0.000	NA		NA
5709536	5709537	CJA_1600	CJA_1601			TRUE	0.898	45.000	0.200	NA		NA
5709537	5709538	CJA_1601	CJA_1602		purU	FALSE	0.013	294.000	0.000	NA		NA
5709541	5709542	CJA_1605	CJA_1606	gt35A		FALSE	0.435	61.000	0.000	1.000	N	NA
5709542	5709543	CJA_1606	CJA_1607			FALSE	0.192	102.000	0.000	NA		NA
5709543	5709544	CJA_1607	CJA_1608			TRUE	0.934	-31.000	0.133	NA		NA
5709544	5709545	CJA_1608	CJA_1609			TRUE	0.999	12.000	0.854	NA	Y	NA
5709545	5709546	CJA_1609	CJA_1610			TRUE	0.999	3.000	0.875	NA	Y	NA
5709549	5709550	CJA_1613	CJA_1614		recJ	TRUE	0.840	-28.000	0.011	1.000		NA
5709552	5709553	CJA_1616	CJA_1617			TRUE	0.998	4.000	0.535	NA	Y	NA
5709553	5709554	CJA_1617	CJA_1618			TRUE	0.739	13.000	0.000	NA	N	NA
5709554	5709555	CJA_1618	CJA_1619			FALSE	0.010	455.000	0.000	1.000		NA
5709555	5709556	CJA_1619	CJA_1620			TRUE	0.575	27.000	0.000	1.000		NA
5709556	5709557	CJA_1620	CJA_1621			TRUE	0.502	119.000	0.062	NA		NA
5709558	5709559	CJA_1622	CJA_1623	gt2H		FALSE	0.006	528.000	0.000	NA		NA
5709560	5709561	CJA_1624	CJA_1625	hmrR	dcd	FALSE	0.201	124.000	0.000	1.000	N	NA
5709561	5709562	CJA_1625	CJA_1626	dcd		TRUE	0.818	6.000	0.000	NA		NA
5709563	5709564	CJA_1627	CJA_1628			FALSE	0.325	57.000	0.000	NA		NA
5709564	5709565	CJA_1628	CJA_1629		purN	TRUE	0.792	38.000	0.065	NA		NA
5709565	5709566	CJA_1629	CJA_1630	purN	purM	TRUE	0.998	4.000	0.230	0.002	Y	NA
5709567	5709568	CJA_1631	CJA_1632			TRUE	0.981	9.000	0.174	NA		NA
5709568	5709569	CJA_1632	CJA_1633		cel9B	FALSE	0.023	233.000	0.000	NA		NA
5709570	5709571	CJA_1634	CJA_1635		cutE	FALSE	0.262	106.000	0.000	1.000	N	NA
5709571	5709572	CJA_1635	CJA_1636	cutE		TRUE	0.963	67.000	0.557	NA	N	NA
5709572	5709573	CJA_1636	CJA_1637			TRUE	0.944	20.000	0.150	NA		NA
5709573	5709574	CJA_1637	CJA_1638			TRUE	0.992	12.000	0.457	NA		NA
5709574	5709575	CJA_1638	CJA_1639			FALSE	0.092	146.000	0.000	NA		NA
5709575	5709576	CJA_1639	CJA_1640		miaB	FALSE	0.338	50.000	0.000	NA		NA
5709576	5709577	CJA_1640	CJA_1641	miaB		FALSE	0.094	262.000	0.000	1.000	Y	NA
5709577	5709578	CJA_1641	CJA_1642			FALSE	0.390	37.000	0.000	NA		NA
5709579	5709580	CJA_1643	CJA_1644			FALSE	0.136	122.000	0.000	NA		NA
5709581	5709582	CJA_1645	CJA_1646	ppkA		TRUE	0.775	42.000	0.000	1.000	Y	NA
5709582	5709583	CJA_1646	CJA_1647			FALSE	0.378	39.000	0.000	NA		NA
5709583	5709584	CJA_1647	CJA_1648			FALSE	0.355	44.000	0.000	NA		NA
5709584	5709585	CJA_1648	CJA_1649			TRUE	0.502	-46.000	0.000	NA		NA
5709585	5709586	CJA_1649	CJA_1650			TRUE	0.828	-3.000	0.000	NA		NA
5709589	5709590	CJA_1653	CJA_1654			TRUE	0.774	10.000	0.000	NA		NA
5709590	5709591	CJA_1654	CJA_1655			FALSE	0.062	170.000	0.000	NA		NA
5709591	5709592	CJA_1655	CJA_1656			TRUE	0.987	-13.000	0.364	NA		NA
5709592	5709593	CJA_1656	CJA_1657			FALSE	0.160	132.000	0.000	1.000		NA
5709593	5709594	CJA_1657	CJA_1658		bcp	FALSE	0.423	66.000	0.000	1.000	N	NA
5709594	5709595	CJA_1658	CJA_1659	bcp		FALSE	0.046	219.000	0.000	1.000	N	NA
5709595	5709596	CJA_1659	CJA_1660			FALSE	0.229	100.000	0.000	NA	N	NA
5709597	5709598	CJA_1661	CJA_1662		dsrH	TRUE	0.954	-31.000	0.060	NA	Y	NA
5709598	5709599	CJA_1662	CJA_1663	dsrH		TRUE	0.991	2.000	0.077	NA	Y	NA
5709599	5709600	CJA_1663	CJA_1664		dsrE	TRUE	0.999	10.000	0.790	NA	Y	NA
5709600	5709601	CJA_1664	CJA_1665	dsrE		TRUE	0.850	68.000	0.167	NA		NA
5709601	5709602	CJA_1665	CJA_3919			FALSE	0.032	213.000	0.000	NA		NA
5709602	5709603	CJA_3919	CJA_1667			FALSE	0.064	168.000	0.000	NA		NA
5709604	5709605	CJA_1668	CJA_1669			FALSE	0.264	82.000	0.000	NA		NA
5709605	5709606	CJA_1669	CJA_1670			TRUE	0.982	21.000	0.389	1.000		NA
5709608	5709609	CJA_1672	CJA_1673		rpmF	TRUE	0.971	44.000	0.599	NA		NA
5709609	5709610	CJA_1673	CJA_1674	rpmF	plsX	TRUE	0.981	24.000	0.418	1.000	N	NA
5709610	5709611	CJA_1674	CJA_1675	plsX	fabD	TRUE	0.983	22.000	0.106	0.004	Y	NA
5709611	5709612	CJA_1675	CJA_1676	fabD	fabG	TRUE	0.995	25.000	0.432	0.004	Y	NA
5709612	5709613	CJA_1676	CJA_1677	fabG	acpP	TRUE	0.876	187.000	0.321	0.004	Y	NA
5709613	5709614	CJA_1677	CJA_1678	acpP		TRUE	0.782	199.000	0.346	1.000	Y	NA
5709614	5709615	CJA_1678	CJA_1679		pabC	TRUE	0.865	84.000	0.187	1.000	N	NA
5709615	5709616	CJA_1679	CJA_1680	pabC		TRUE	0.976	13.000	0.204	NA		NA
5709616	5709617	CJA_1680	CJA_1681		glnS	FALSE	0.259	126.000	0.003	NA		NA
5709617	5709618	CJA_1681	CJA_1682	glnS	cysS	TRUE	0.990	6.000	0.032	0.035	Y	NA
5709618	5709619	CJA_1682	CJA_1683	cysS		TRUE	0.677	14.000	0.000	NA		NA
5709622	5709623	CJA_1686	CJA_1687			FALSE	0.010	336.000	0.000	NA		NA
5709624	5709625	CJA_1688	CJA_1689	sfcA1		TRUE	0.734	12.000	0.000	NA		NA
5709625	5709626	CJA_1689	CJA_1690			FALSE	0.051	184.000	0.000	NA		NA
5709626	5709627	CJA_1690	CJA_1691			FALSE	0.177	106.000	0.000	NA		NA
5709627	5709628	CJA_1691	CJA_1693		fadA	FALSE	0.006	2357.000	0.000	1.000	N	NA
5709628	5709629	CJA_1693	CJA_1694	fadA		FALSE	0.139	121.000	0.000	NA		NA
5709629	5709630	CJA_1694	CJA_1695			FALSE	0.295	72.000	0.000	NA		NA
5709631	5709632	CJA_1696	CJA_1697		lexA	TRUE	0.968	-7.000	0.122	NA		NA
5709634	5709635	CJA_1698	CJA_1700			FALSE	0.163	111.000	0.000	NA		NA
5709636	5709637	CJA_1701	CJA_1702			TRUE	0.994	10.000	0.478	NA		NA
5709637	5709638	CJA_1702	CJA_1703			TRUE	0.876	123.000	0.478	NA		NA
5709638	5709639	CJA_1703	CJA_1704		fleQ	FALSE	0.029	258.000	0.000	1.000	N	NA
5709639	5709640	CJA_1704	CJA_1705	fleQ		FALSE	0.131	144.000	0.000	1.000		NA
5709641	5709642	CJA_1706	CJA_1707			FALSE	0.091	175.000	0.000	1.000	N	NA
5709643	5709644	CJA_1708	CJA_1709	fleS	fleR	TRUE	0.998	16.000	0.679	0.066	Y	NA
5709645	5709646	CJA_1710	CJA_1711			TRUE	0.796	8.000	0.000	NA		NA
5709647	5709648	CJA_1712	CJA_1713	fliE	fliF	TRUE	0.995	79.000	0.910	0.006	Y	NA
5709648	5709649	CJA_1713	CJA_1714	fliF	fliG	TRUE	0.984	29.000	0.189	0.006	Y	NA
5709649	5709650	CJA_1714	CJA_1715	fliG	fliH	TRUE	0.995	19.000	0.320	0.004	Y	NA
5709650	5709651	CJA_1715	CJA_1716	fliH	fliI	TRUE	0.968	-37.000	0.115	1.000	Y	NA
5709651	5709652	CJA_1716	CJA_1717	fliI		TRUE	0.987	9.000	0.070	1.000	Y	NA
5709652	5709653	CJA_1717	CJA_1718			FALSE	0.106	216.000	0.022	NA	N	NA
5709653	5709654	CJA_1718	CJA_1719			TRUE	0.968	62.000	0.308	NA	Y	NA
5709654	5709655	CJA_1719	CJA_1720			TRUE	0.993	16.000	0.381	NA	Y	NA
5709655	5709656	CJA_1720	CJA_1721			FALSE	0.288	173.000	0.069	NA		NA
5709656	5709657	CJA_1721	CJA_1722			FALSE	0.282	191.000	0.075	1.000		NA
5709657	5709658	CJA_1722	CJA_1723		fliM	TRUE	0.995	12.000	0.171	0.001	Y	NA
5709658	5709659	CJA_1723	CJA_1724	fliM	fliN	TRUE	0.999	-10.000	0.741	0.001	Y	NA
5709659	5709660	CJA_1724	CJA_1725	fliN		TRUE	0.758	48.000	0.000	1.000	Y	NA
5709660	5709661	CJA_1725	CJA_1726		fliP	TRUE	0.949	11.000	0.000	1.000	Y	NA
5709661	5709662	CJA_1726	CJA_1727	fliP	fliQ	TRUE	0.999	13.000	1.000	0.009	Y	NA
5709662	5709663	CJA_1727	CJA_1728	fliQ	fliR	TRUE	1.000	8.000	1.000	0.003	Y	NA
5709663	5709664	CJA_1728	CJA_1729	fliR	flhB	TRUE	0.994	0.000	0.129	1.000	Y	NA
5709664	5709665	CJA_1729	CJA_1730	flhB		FALSE	0.181	105.000	0.000	NA		NA
5709667	5709668	CJA_1732	CJA_1733			FALSE	0.343	48.000	0.000	NA		NA
5709669	5709670	CJA_1734	CJA_1735	xth	prc	TRUE	0.636	70.000	0.013	1.000	N	NA
5709670	5709671	CJA_1735	CJA_1736	prc		FALSE	0.028	248.000	0.000	1.000		NA
5709671	5709672	CJA_1736	CJA_1737			FALSE	0.158	113.000	0.000	NA		NA
5709674	5709675	CJA_1739	CJA_1740			FALSE	0.433	32.000	0.000	NA		NA
5709677	5709678	CJA_1742	CJA_1743			TRUE	0.674	44.000	0.026	NA		NA
5709679	5709680	CJA_1744	CJA_1745	leuC	leuD	TRUE	0.998	13.000	0.463	0.001	Y	NA
5709680	5709681	CJA_1745	CJA_1746	leuD	leuB	TRUE	0.987	24.000	0.159	0.001	Y	NA
5709681	5709682	CJA_1746	CJA_1747	leuB	asd	TRUE	0.980	33.000	0.196	0.034	Y	NA
5709682	5709683	CJA_1747	CJA_1748	asd		FALSE	0.033	362.000	0.010	1.000	N	NA
5709683	5709684	CJA_1748	CJA_1749		truA	TRUE	0.689	76.000	0.035	1.000	N	NA
5709684	5709685	CJA_1749	CJA_1750	truA	trpF	TRUE	0.827	85.000	0.139	1.000	N	NA
5709685	5709686	CJA_1750	CJA_1751	trpF	trpB	TRUE	0.999	4.000	0.375	0.001	Y	NA
5709686	5709687	CJA_1751	CJA_1752	trpB	trpA	TRUE	0.987	67.000	0.344	0.001	Y	NA
5709687	5709688	CJA_1752	CJA_1753	trpA	accD	TRUE	0.833	109.000	0.232	1.000	N	NA
5709688	5709689	CJA_1753	CJA_1754	accD	folC	TRUE	0.994	9.000	0.383	1.000	N	NA
5709689	5709690	CJA_1754	CJA_1755	folC		TRUE	0.967	18.000	0.216	NA		NA
5709690	5709691	CJA_1755	CJA_1756		cvpA	TRUE	0.562	131.000	0.116	NA		NA
5709691	5709692	CJA_1756	CJA_1757	cvpA	purF	TRUE	0.930	52.000	0.262	1.000		NA
5709692	5709693	CJA_1757	CJA_1758	purF	metZ	TRUE	0.892	44.000	0.153	1.000	N	NA
5709693	5709694	CJA_1758	CJA_3922	metZ		FALSE	0.112	134.000	0.000	NA		NA
5709694	5709695	CJA_3922	CJA_1760			FALSE	0.030	216.000	0.000	NA		NA
5709695	5709696	CJA_1760	CJA_1761		mgsA	FALSE	0.223	117.000	0.000	1.000	N	NA
5709696	5709697	CJA_1761	CJA_1762	mgsA		FALSE	0.020	303.000	0.000	1.000	N	NA
5709698	5709699	CJA_1763	CJA_1764		mfd	TRUE	0.758	60.000	0.071	NA		NA
5709700	5709701	CJA_1765	CJA_1766	nqrA	nqrB	TRUE	0.999	4.000	0.618	0.002	Y	NA
5709701	5709702	CJA_1766	CJA_1767	nqrB	nqrC	TRUE	0.999	-7.000	0.538	0.002	Y	NA
5709702	5709703	CJA_1767	CJA_1768	nqrC	nqrD	TRUE	0.998	3.000	0.188	0.002	Y	NA
5709703	5709704	CJA_1768	CJA_1769	nqrD	nqrE	TRUE	0.998	0.000	0.240	0.002	Y	NA
5709704	5709705	CJA_1769	CJA_1770	nqrE	nqrF	TRUE	0.998	22.000	0.700	0.002	Y	NA
5709705	5709706	CJA_1770	CJA_1771	nqrF		TRUE	0.580	91.000	0.039	NA		NA
5709706	5709707	CJA_1771	CJA_1772			TRUE	0.653	112.000	0.121	NA		NA
5709708	5709709	CJA_1773	CJA_1774			TRUE	0.587	20.000	0.000	NA		NA
5709710	5709711	CJA_1775	CJA_1776			TRUE	0.998	10.000	0.620	0.059	N	NA
5709711	5709712	CJA_1776	CJA_1777			TRUE	0.998	-3.000	0.620	0.059	N	NA
5709712	5709713	CJA_1777	CJA_1778			TRUE	0.675	78.000	0.002	0.052		NA
5709713	5709714	CJA_1778	CJA_1779			TRUE	0.669	86.000	0.045	1.000		NA
5709714	5709715	CJA_1779	CJA_1780			TRUE	0.999	13.000	0.746	0.059	Y	NA
5709715	5709716	CJA_1780	CJA_1781			TRUE	0.977	7.000	0.096	1.000	N	NA
5709716	5709717	CJA_1781	CJA_1782		kdsB	TRUE	0.907	43.000	0.054	1.000	Y	NA
5709717	5709718	CJA_1782	CJA_1783	kdsB		TRUE	0.971	-3.000	0.050	1.000	N	NA
5709718	5709719	CJA_1783	CJA_1784		murB	TRUE	0.950	12.000	0.050	1.000	N	NA
5709719	5709720	CJA_1784	CJA_1785	murB	gacA	FALSE	0.033	246.000	0.000	1.000	N	NA
5709720	5709721	CJA_1785	CJA_1786	gacA	uvrC	TRUE	0.922	34.000	0.086	0.016	N	NA
5709721	5709722	CJA_1786	CJA_1787	uvrC	pgsA	TRUE	0.880	90.000	0.227	1.000	N	NA
5709722	5709723	CJA_1787	CJA_3923	pgsA		FALSE	0.123	128.000	0.000	NA		NA
5709723	5709724	CJA_3923	CJA_3924			FALSE	0.442	31.000	0.000	NA		NA
5709725	5709726	CJA_1790	CJA_1791		pdxJ	TRUE	0.936	6.000	0.002	1.000	N	NA
5709726	5709727	CJA_1791	CJA_1792	pdxJ		TRUE	0.947	-3.000	0.007	1.000	N	NA
5709727	5709728	CJA_1792	CJA_1793			TRUE	0.786	28.000	0.027	NA	N	NA
5709728	5709729	CJA_1793	CJA_1794			TRUE	0.806	27.000	0.038	NA		NA
5709729	5709730	CJA_1794	CJA_1795			TRUE	0.813	-34.000	0.024	NA		NA
5709731	5709732	CJA_1796	CJA_1797			TRUE	0.974	19.000	0.281	NA		NA
5709732	5709733	CJA_1797	CJA_1798		scpA	FALSE	0.116	222.000	0.040	NA		NA
5709733	5709734	CJA_1798	CJA_1799	scpA		TRUE	0.696	90.000	0.083	NA		NA
5709734	5709735	CJA_1799	CJA_1800			TRUE	0.970	17.000	0.210	NA	N	NA
5709736	5709737	CJA_1801	CJA_1802	abfX	abfS	FALSE	0.072	299.000	0.000	1.000	Y	NA
5709737	5709738	CJA_1802	CJA_1803	abfS	abfR	TRUE	0.970	4.000	0.000	1.000	Y	NA
5709739	5709740	CJA_1804	CJA_1806			FALSE	0.110	144.000	0.000	NA	N	NA
5709741	5709742	CJA_1805	CJA_1807			TRUE	0.968	25.000	0.315	NA		NA
5709743	5709744	CJA_1808	CJA_1809			TRUE	0.640	92.000	0.000	1.000	Y	NA
5709744	5709745	CJA_1809	CJA_1810			TRUE	0.961	12.000	0.087	1.000		NA
5709745	5709746	CJA_1810	CJA_1811			FALSE	0.034	208.000	0.000	NA		NA
5709746	5709747	CJA_1811	CJA_1812			FALSE	0.216	96.000	0.000	NA		NA
5709747	5709748	CJA_1812	CJA_1813			FALSE	0.324	126.000	0.018	NA		NA
5709750	5709751	CJA_1815	CJA_1816			FALSE	0.076	159.000	0.000	NA		NA
5709752	5709753	CJA_1817	CJA_1818			FALSE	0.278	78.000	0.000	NA		NA
5709753	5709754	CJA_1818	CJA_1819			FALSE	0.451	30.000	0.000	NA		NA
5709754	5709755	CJA_1819	CJA_1820			FALSE	0.270	80.000	0.000	NA		NA
5709755	5709756	CJA_1820	CJA_1821			TRUE	0.960	28.000	0.300	NA		NA
5709756	5709757	CJA_1821	CJA_1822		tnpT	FALSE	0.298	71.000	0.000	NA		NA
5709758	5709759	CJA_1823	CJA_1824			FALSE	0.155	114.000	0.000	NA		NA
5709759	5709760	CJA_1824	CJA_1825			TRUE	0.983	13.000	0.273	NA		NA
5709760	5709761	CJA_1825	CJA_1826		copB	TRUE	0.999	11.000	0.800	0.003	N	NA
5709761	5709762	CJA_1826	CJA_1827	copB		FALSE	0.390	37.000	0.000	NA		NA
5709762	5709763	CJA_1827	CJA_1828			TRUE	0.970	58.000	0.625	NA		NA
5709763	5709764	CJA_1828	CJA_1829		copF	FALSE	0.274	98.000	0.000	1.000		NA
5709764	5709765	CJA_1829	CJA_1830	copF		FALSE	0.010	522.000	0.000	1.000	N	NA
5709765	5709766	CJA_1830	CJA_1831			TRUE	0.997	-7.000	0.750	1.000	N	NA
5709768	5709769	CJA_1833	CJA_1834			FALSE	0.101	140.000	0.000	NA		NA
5709771	5709772	CJA_1836	CJA_1837	cueA	cueR	TRUE	0.936	11.000	0.000	0.003	N	NA
5709774	5709775	CJA_1839	CJA_1840			FALSE	0.257	84.000	0.000	NA		NA
5709775	5709776	CJA_1840	CJA_1841		czcC	FALSE	0.254	85.000	0.000	NA		NA
5709776	5709777	CJA_1841	CJA_1842	czcC		TRUE	0.960	-3.000	0.000	NA	Y	NA
5709777	5709778	CJA_1842	CJA_1843			TRUE	0.982	46.000	0.750	NA	N	NA
5709778	5709779	CJA_1843	CJA_1844			TRUE	0.947	88.000	0.500	1.000		NA
5709779	5709780	CJA_1844	CJA_1845		pbrT	FALSE	0.166	129.000	0.000	1.000		NA
5709782	5709783	CJA_1847	CJA_1848			TRUE	0.983	-3.000	0.157	NA		NA
5709783	5709784	CJA_1848	CJA_1849		tnpS	TRUE	0.717	52.000	0.000	NA	Y	NA
5709784	5709785	CJA_1849	CJA_1850	tnpS	mpr	FALSE	0.014	288.000	0.000	NA		NA
5709785	5709786	CJA_1850	CJA_1851	mpr		TRUE	0.885	74.000	0.222	NA		NA
5709786	5709787	CJA_1851	CJA_1852			FALSE	0.329	55.000	0.000	NA		NA
5709787	5709788	CJA_1852	CJA_1853		cheV-2	FALSE	0.039	201.000	0.000	NA		NA
5709788	5709789	CJA_1853	CJA_1854	cheV-2		FALSE	0.102	139.000	0.000	NA		NA
5709790	5709791	CJA_1855	CJA_1856	kdpE	kdpD	TRUE	0.972	63.000	0.621	1.000		NA
5709791	5709792	CJA_1856	CJA_1857	kdpD	trkH-2	TRUE	0.874	-3.000	0.000	1.000		NA
5709792	5709793	CJA_1857	CJA_1858	trkH-2		FALSE	0.229	108.000	0.000	1.000		NA
5709793	5709794	CJA_1858	CJA_1859			FALSE	0.005	606.000	0.000	NA		NA
5709794	5709795	CJA_1859	CJA_1860			TRUE	0.828	-3.000	0.000	NA		NA
5709799	5709800	CJA_1864	CJA_1865			FALSE	0.063	169.000	0.000	NA		NA
5709801	5709802	CJA_1866	CJA_1867		pvdE	TRUE	0.850	10.000	0.000	1.000	N	NA
5709802	5709803	CJA_1867	CJA_1868	pvdE		FALSE	0.341	156.000	0.000	1.000	Y	NA
5709804	5709805	CJA_1869	CJA_1870			FALSE	0.451	53.000	0.000	1.000	N	NA
5709805	5709806	CJA_1870	CJA_1871			TRUE	0.999	3.000	0.286	0.002	Y	NA
5709806	5709807	CJA_1871	CJA_1872			FALSE	0.025	259.000	0.000	1.000		NA
5709807	5709808	CJA_1872	CJA_1873			TRUE	0.644	22.000	0.000	1.000		NA
5709808	5709809	CJA_1873	CJA_1874			TRUE	0.787	9.000	0.000	NA		NA
5709809	5709810	CJA_1874	CJA_1875			TRUE	0.828	87.000	0.184	NA		NA
5709810	5709811	CJA_1875	CJA_1876			FALSE	0.422	33.000	0.000	NA		NA
5709813	5709814	CJA_1878	CJA_1879			FALSE	0.024	231.000	0.000	NA		NA
5709816	5709817	CJA_1881	CJA_1882		mal77Q	TRUE	0.761	41.000	0.054	NA		NA
5709817	5709818	CJA_1882	CJA_1883	mal77Q	gly57A	TRUE	0.958	55.000	0.130	0.044	Y	NA
5709818	5709819	CJA_1883	CJA_1884	gly57A	glgC	TRUE	0.992	-7.000	0.181	1.000	Y	NA
5709820	5709821	CJA_1885	CJA_1886	gbe13A	gt5A	TRUE	0.934	84.000	0.185	1.000	Y	NA
5709821	5709822	CJA_1886	CJA_1887	gt5A	pgm	FALSE	0.317	163.000	0.000	1.000	Y	NA
5709823	5709824	CJA_1888	CJA_1889	uvs037		FALSE	0.325	57.000	0.000	NA		NA
5709824	5709825	CJA_1889	CJA_1890			FALSE	0.307	66.000	0.000	NA		NA
5709825	5709826	CJA_1890	CJA_1891			TRUE	0.959	8.000	0.000	1.000	Y	NA
5709826	5709827	CJA_1891	CJA_1892			TRUE	0.770	-12.000	0.000	1.000		NA
5709827	5709828	CJA_1892	CJA_1893			TRUE	0.693	-22.000	0.000	1.000		NA
5709828	5709829	CJA_1893	CJA_1894			TRUE	0.600	64.000	0.000	0.039		NA
5709829	5709830	CJA_1894	CJA_1895			FALSE	0.169	109.000	0.000	NA		NA
5709830	5709831	CJA_1895	CJA_1896		patB	FALSE	0.049	186.000	0.000	NA		NA
5709831	5709832	CJA_1896	CJA_1897	patB		FALSE	0.440	59.000	0.000	1.000	N	NA
5709832	5709833	CJA_1897	CJA_1898			TRUE	1.000	0.000	0.833	0.022	Y	NA
5709833	5709834	CJA_1898	CJA_1899			FALSE	0.279	97.000	0.000	1.000		NA
5709834	5709835	CJA_1899	CJA_1900			FALSE	0.454	41.000	0.000	1.000		NA
5709837	5709838	CJA_1902	CJA_1903			TRUE	0.990	3.000	0.200	NA		NA
5709838	5709839	CJA_1903	CJA_1904			TRUE	0.997	-3.000	0.600	NA		NA
5709839	5709840	CJA_1904	CJA_1905			FALSE	0.228	92.000	0.000	NA		NA
5709840	5709841	CJA_1905	CJA_1906		hemB	TRUE	0.727	-9.000	0.000	NA		NA
5709841	5709842	CJA_1906	CJA_1907	hemB		TRUE	0.587	20.000	0.000	NA		NA
5709842	5709843	CJA_1907	CJA_1908		slt23E	TRUE	0.878	19.000	0.041	NA		NA
5709843	5709844	CJA_1908	CJA_1909	slt23E	ligA	TRUE	0.931	-3.000	0.009	NA		NA
5709844	5709845	CJA_1909	CJA_1910	ligA	zipA	TRUE	0.820	74.000	0.106	1.000	N	NA
5709845	5709846	CJA_1910	CJA_1911	zipA	smc	TRUE	0.978	27.000	0.115	0.010	Y	NA
5709846	5709847	CJA_1911	CJA_1912	smc	ccmI	FALSE	0.028	363.000	0.003	1.000	N	NA
5709847	5709848	CJA_1912	CJA_1913	ccmI		TRUE	0.968	0.000	0.000	NA	Y	NA
5709849	5709850	CJA_3931	CJA_3932			FALSE	0.384	38.000	0.000	NA		NA
5709851	5709852	CJA_1916	CJA_1917	fliD	flaA	FALSE	0.147	220.000	0.000	1.000	Y	NA
5709852	5709853	CJA_1917	CJA_1918	flaA		FALSE	0.019	445.000	0.007	NA		NA
5709853	5709854	CJA_1918	CJA_1919			TRUE	0.553	62.000	0.007	NA		NA
5709854	5709855	CJA_1919	CJA_1920			FALSE	0.042	217.000	0.000	1.000		NA
5709855	5709856	CJA_1920	CJA_1921		flgL	TRUE	0.630	23.000	0.000	1.000		NA
5709856	5709857	CJA_1921	CJA_1922	flgL	flgK	TRUE	0.904	97.000	0.051	0.001	Y	NA
5709857	5709858	CJA_1922	CJA_1923	flgK	acm73B	TRUE	0.999	5.000	0.705	0.003	Y	NA
5709858	5709859	CJA_1923	CJA_1924	acm73B	flgI	TRUE	0.999	1.000	0.405	0.008	Y	NA
5709859	5709860	CJA_1924	CJA_1925	flgI	flgH	TRUE	0.966	13.000	0.000	0.008	Y	NA
5709860	5709861	CJA_1925	CJA_1926	flgH	flgG	TRUE	0.985	15.000	0.059	0.006	Y	NA
5709861	5709862	CJA_1926	CJA_1927	flgG	flgF	TRUE	0.980	45.000	0.207	0.001	Y	NA
5709862	5709863	CJA_1927	CJA_1928	flgF	flgE	TRUE	0.977	97.000	0.594	1.000	Y	NA
5709863	5709864	CJA_1928	CJA_1929	flgE	flgD	TRUE	0.994	37.000	0.875	NA	Y	NA
5709864	5709865	CJA_1929	CJA_1930	flgD	flgC	TRUE	0.986	17.000	0.207	NA	Y	NA
5709865	5709866	CJA_1930	CJA_1931	flgC	flgB	TRUE	0.997	35.000	0.800	0.004	Y	NA
5709868	5709869	CJA_1933	CJA_1934			TRUE	0.992	75.000	0.838	1.000	Y	NA
5709870	5709871	CJA_1935	CJA_1936			TRUE	0.677	175.000	0.371	NA		NA
5709871	5709872	CJA_1936	CJA_1937			TRUE	0.962	83.000	0.361	0.003		NA
5709872	5709873	CJA_1937	CJA_3933			FALSE	0.136	122.000	0.000	NA		NA
5709873	5709874	CJA_3933	CJA_1939			FALSE	0.343	48.000	0.000	NA		NA
5709874	5709875	CJA_1939	CJA_1940			FALSE	0.148	117.000	0.000	NA		NA
5709876	5709877	CJA_1941	CJA_1942		phrB	FALSE	0.035	207.000	0.000	NA		NA
5709877	5709878	CJA_1942	CJA_1943	phrB		FALSE	0.200	185.000	0.042	NA		NA
5709880	5709881	CJA_1945	CJA_1946	cysB	ushA	FALSE	0.022	274.000	0.000	1.000		NA
5709881	5709882	CJA_1946	CJA_1947	ushA		FALSE	0.459	40.000	0.000	1.000		NA
5709882	5709883	CJA_1947	CJA_1948			TRUE	0.812	-7.000	0.000	1.000		NA
5709883	5709884	CJA_1948	CJA_1949		aroC	TRUE	0.748	64.000	0.055	1.000		NA
5709884	5709885	CJA_1949	CJA_1950	aroC		TRUE	0.685	102.000	0.081	1.000	N	NA
5709887	5709888	CJA_1952	CJA_1953			FALSE	0.406	59.000	0.000	1.000		NA
5709888	5709889	CJA_1953	CJA_1954			TRUE	0.973	9.000	0.118	NA		NA
5709889	5709890	CJA_1954	CJA_1955		sixA	TRUE	0.690	43.000	0.029	NA		NA
5709890	5709891	CJA_1955	CJA_1956	sixA		TRUE	0.962	0.000	0.034	NA		NA
5709891	5709892	CJA_1956	CJA_1957			TRUE	0.840	30.000	0.068	NA		NA
5709892	5709893	CJA_1957	CJA_1958			FALSE	0.008	536.000	0.000	1.000		NA
5709894	5709895	CJA_3934	CJA_3935			FALSE	0.411	34.000	0.000	NA		NA
5709895	5709896	CJA_3935	CJA_3936			FALSE	0.325	57.000	0.000	NA		NA
5709896	5709897	CJA_3936	CJA_1963			FALSE	0.041	197.000	0.000	NA		NA
5709897	5709898	CJA_1963	CJA_1964		folD	FALSE	0.098	170.000	0.000	1.000	N	NA
5709898	5709899	CJA_1964	CJA_1965	folD		TRUE	0.529	35.000	0.000	1.000	N	NA
5709899	5709900	CJA_1965	CJA_1966		rsuA1	TRUE	0.984	-3.000	0.000	0.003	Y	NA
5709900	5709901	CJA_1966	CJA_1967	rsuA1		TRUE	0.949	-19.000	0.013	1.000	Y	NA
5709901	5709902	CJA_1967	CJA_3937			FALSE	0.029	217.000	0.000	NA		NA
5709902	5709903	CJA_3937	CJA_1969			FALSE	0.029	218.000	0.000	NA		NA
5709904	5709905	CJA_1970	CJA_1971			FALSE	0.484	27.000	0.000	NA		NA
5709906	5709907	CJA_1972	CJA_1973	lacA		TRUE	0.536	34.000	0.000	1.000	N	NA
5709907	5709908	CJA_1973	CJA_1974			FALSE	0.468	28.000	0.000	NA		NA
5709908	5709909	CJA_1974	CJA_1975			FALSE	0.023	235.000	0.000	NA		NA
5709910	5709911	CJA_1976	CJA_1977		mal77A	TRUE	0.575	27.000	0.000	1.000		NA
5709912	5709913	CJA_1978	CJA_1979		deaD-1	FALSE	0.008	364.000	0.000	NA		NA
5709914	5709915	CJA_1980	CJA_1981		hepA	TRUE	0.677	14.000	0.000	NA		NA
5709919	5709920	CJA_1984	CJA_1986	dut		TRUE	0.587	39.000	0.003	NA		NA
5709920	5709921	CJA_1986	CJA_1987			TRUE	0.830	5.000	0.000	NA		NA
5709921	5709922	CJA_1987	CJA_1988		pilZ	TRUE	0.572	21.000	0.000	NA		NA
5709922	5709923	CJA_1988	CJA_1989	pilZ	holB	TRUE	0.835	132.000	0.382	NA	N	NA
5709923	5709924	CJA_1989	CJA_1990	holB		TRUE	0.844	4.000	0.000	NA		NA
5709925	5709926	CJA_1991	CJA_1992			FALSE	0.053	181.000	0.000	NA		NA
5709928	5709929	CJA_1994	CJA_1995	ppiB-1	lpxH	TRUE	0.992	4.000	0.237	1.000		NA
5709930	5709931	CJA_1996	CJA_1997		miaE	FALSE	0.304	67.000	0.000	NA		NA
5709931	5709932	CJA_1997	CJA_1998	miaE		TRUE	0.916	12.000	0.029	NA		NA
5709932	5709933	CJA_1998	CJA_1999		tre37B	TRUE	0.805	7.000	0.000	NA		NA
5709933	5709934	CJA_1999	CJA_2000	tre37B	gnl	TRUE	0.949	11.000	0.000	1.000	Y	NA
5709936	5709937	CJA_2002	CJA_2003			FALSE	0.090	231.000	0.017	1.000		NA
5709937	5709938	CJA_2003	CJA_2004		lon	FALSE	0.112	245.000	0.040	1.000	N	NA
5709938	5709939	CJA_2004	CJA_2005	lon	clpX	TRUE	0.881	139.000	0.201	0.091	Y	NA
5709939	5709940	CJA_2005	CJA_2006	clpX	clpP	TRUE	0.929	125.000	0.352	1.000	Y	NA
5709940	5709941	CJA_2006	CJA_2007	clpP	tig	TRUE	0.853	170.000	0.351	1.000	Y	NA
5709941	5709942	CJA_2007	CJA_3938	tig		FALSE	0.290	74.000	0.000	NA		NA
5709942	5709943	CJA_3938	CJA_2009			FALSE	0.097	143.000	0.000	NA		NA
5709943	5709944	CJA_2009	CJA_2010			TRUE	0.757	23.000	0.007	NA		NA
5709946	5709947	CJA_2011	CJA_2012			FALSE	0.005	593.000	0.000	NA		NA
5709949	5709950	CJA_2015	CJA_2016			FALSE	0.237	90.000	0.000	NA		NA
5709952	5709953	CJA_2018	CJA_2019			FALSE	0.098	142.000	0.000	NA		NA
5709953	5709954	CJA_2019	CJA_2020			FALSE	0.292	73.000	0.000	NA		NA
5709954	5709955	CJA_2020	CJA_2021			FALSE	0.363	42.000	0.000	NA		NA
5709956	5709957	CJA_2022	CJA_2023			FALSE	0.312	63.000	0.000	NA		NA
5709957	5709958	CJA_2023	CJA_2024			TRUE	0.947	-28.000	0.000	0.003	Y	NA
5709958	5709959	CJA_2024	CJA_2025		hmrR2	TRUE	0.776	14.000	0.000	1.000	N	NA
5709959	5709960	CJA_2025	CJA_2026	hmrR2		FALSE	0.010	524.000	0.000	1.000	N	NA
5709960	5709961	CJA_2026	CJA_2027			TRUE	0.812	-7.000	0.000	1.000		NA
5709962	5709963	CJA_2028	CJA_2029			FALSE	0.468	28.000	0.000	NA		NA
5709964	5709965	CJA_2030	CJA_2031	narB	prrA	FALSE	0.410	57.000	0.000	1.000		NA
5709965	5709966	CJA_2031	CJA_2032	prrA		TRUE	0.984	10.000	0.111	0.042	N	NA
5709966	5709967	CJA_2032	CJA_2033			TRUE	0.998	-3.000	0.778	1.000	N	NA
5709967	5709968	CJA_2033	CJA_2034			FALSE	0.345	47.000	0.000	NA		NA
5709969	5709970	CJA_2035	CJA_2036			TRUE	0.993	0.000	0.283	NA		NA
5709970	5709971	CJA_2036	CJA_2037			FALSE	0.371	40.000	0.000	NA		NA
5709972	5709973	CJA_2038	CJA_2039	pabB		FALSE	0.426	64.000	0.000	1.000	N	NA
5709974	5709975	CJA_2040	CJA_2041	pel10B		FALSE	0.065	191.000	0.000	1.000		NA
5709977	5709978	CJA_2043	CJA_2044			TRUE	0.727	66.000	0.000	1.000	Y	NA
5709978	5709979	CJA_2044	CJA_2045			TRUE	0.746	35.000	0.036	NA		NA
5709979	5709980	CJA_2045	CJA_2046			TRUE	0.650	50.000	0.025	NA		NA
5709980	5709981	CJA_2046	CJA_2047			TRUE	0.705	30.000	0.010	NA		NA
5709981	5709982	CJA_2047	CJA_2048		dnaQ	FALSE	0.022	237.000	0.000	NA		NA
5709982	5709983	CJA_2048	CJA_2049	dnaQ	rnhA	TRUE	0.959	75.000	0.248	1.000	Y	NA
5709983	5709984	CJA_2049	CJA_2050	rnhA		TRUE	0.683	-25.000	0.000	1.000		NA
5709984	5709985	CJA_2050	CJA_2051			FALSE	0.244	88.000	0.000	NA		NA
5709986	5709987	CJA_2052	CJA_2053		lmt23B	FALSE	0.444	210.000	0.233	1.000		NA
5709988	5709989	CJA_2054	CJA_2055		oppC	TRUE	0.959	5.000	0.029	1.000		NA
5709989	5709990	CJA_2055	CJA_2056	oppC	oppB	TRUE	1.000	0.000	0.870	0.042	Y	NA
5709990	5709991	CJA_2056	CJA_2057	oppB		TRUE	0.949	12.000	0.014	0.042		NA
5709991	5709992	CJA_2057	CJA_2058			TRUE	0.817	-30.000	0.000	0.042		NA
5709992	5709993	CJA_2058	CJA_2059			FALSE	0.345	81.000	0.000	1.000		NA
5709994	5709995	CJA_2060	CJA_2061			TRUE	0.998	14.000	0.902	NA	Y	NA
5709996	5709997	CJA_2062	CJA_2063		uvs015	FALSE	0.292	73.000	0.000	NA		NA
5709997	5709998	CJA_2063	CJA_2064	uvs015	ccmF	TRUE	0.999	-7.000	0.804	0.003	Y	NA
5709998	5709999	CJA_2064	CJA_2065	ccmF		TRUE	0.995	-10.000	0.211	0.003	Y	NA
5709999	5710000	CJA_2065	CJA_2066		ccmD	TRUE	0.946	66.000	0.344	1.000	N	NA
5710000	5710001	CJA_2066	CJA_2067	ccmD		TRUE	0.997	4.000	0.501	1.000	N	NA
5710001	5710002	CJA_2067	CJA_2068		ccmB	TRUE	0.921	72.000	0.028	0.001	Y	NA
5710002	5710003	CJA_2068	CJA_2069	ccmB	ccmA	TRUE	0.994	0.000	0.039	0.003	Y	NA
5710004	5710005	CJA_2070	CJA_2071			TRUE	0.931	13.000	0.041	1.000		NA
5710006	5710007	CJA_2072	CJA_2073		ald	FALSE	0.442	58.000	0.000	1.000	N	NA
5710010	5710011	CJA_2076	CJA_2077			FALSE	0.132	124.000	0.000	NA		NA
5710011	5710012	CJA_2077	CJA_2078		aer-2	FALSE	0.097	153.000	0.000	NA	N	NA
5710012	5710013	CJA_2078	CJA_2079	aer-2	bioA	TRUE	0.567	76.000	0.003	1.000	N	NA
5710014	5710015	CJA_2080	CJA_2081	trpS		FALSE	0.334	91.000	0.000	1.000	N	NA
5710015	5710016	CJA_2081	CJA_2082			FALSE	0.068	196.000	0.000	1.000	N	NA
5710016	5710017	CJA_2082	CJA_2083			TRUE	0.654	57.000	0.000	0.023	N	NA
5710017	5710018	CJA_2083	CJA_2084		adk	TRUE	0.683	57.000	0.019	1.000	N	NA
5710020	5710021	CJA_2086	CJA_2087		gabD	FALSE	0.423	66.000	0.000	1.000	N	NA
5710021	5710022	CJA_2087	CJA_2088	gabD		TRUE	0.900	4.000	0.000	1.000	N	NA
5710023	5710024	CJA_2089	CJA_2090	rnb		TRUE	0.513	25.000	0.000	NA		NA
5710025	5710026	CJA_2091	CJA_2092			TRUE	0.715	-10.000	0.000	NA		NA
5710026	5710027	CJA_2092	CJA_2093			FALSE	0.006	535.000	0.000	NA		NA
5710028	5710029	CJA_2094	CJA_2095			TRUE	0.997	-3.000	0.600	NA		NA
5710029	5710030	CJA_2095	CJA_2097			FALSE	0.422	33.000	0.000	NA		NA
5710031	5710032	CJA_2096	CJA_2098			TRUE	0.490	-64.000	0.000	NA		NA
5710032	5710033	CJA_2098	CJA_2099			FALSE	0.378	39.000	0.000	NA		NA
5710033	5710034	CJA_2099	CJA_2100			TRUE	0.997	-3.000	0.600	NA		NA
5710034	5710035	CJA_2100	CJA_2101			FALSE	0.301	69.000	0.000	NA		NA
5710035	5710036	CJA_2101	CJA_2102			FALSE	0.005	662.000	0.000	NA		NA
5710036	5710037	CJA_2102	CJA_2103		guaA	FALSE	0.373	73.000	0.000	1.000		NA
5710037	5710038	CJA_2103	CJA_2104	guaA	guaB	TRUE	0.915	92.000	0.190	0.001		NA
5710039	5710040	CJA_2105	CJA_2106	xseA	thiO	FALSE	0.188	128.000	0.000	1.000	N	NA
5710040	5710041	CJA_2106	CJA_2107	thiO	thiS	TRUE	0.915	13.000	0.019	1.000	N	NA
5710041	5710042	CJA_2107	CJA_2108	thiS	thiG	TRUE	0.983	2.000	0.005	1.000	Y	NA
5710043	5710044	CJA_2109	CJA_2110			FALSE	0.442	31.000	0.000	NA		NA
5710044	5710045	CJA_2110	CJA_2111			FALSE	0.459	40.000	0.000	1.000		NA
5710045	5710046	CJA_2111	CJA_2112			FALSE	0.071	184.000	0.000	1.000		NA
5710046	5710047	CJA_2112	CJA_2113		himD	FALSE	0.011	449.000	0.000	1.000	N	NA
5710047	5710048	CJA_2113	CJA_2114	himD	rpsA	TRUE	0.916	84.000	0.292	1.000	N	NA
5710048	5710049	CJA_2114	CJA_2115	rpsA		FALSE	0.039	232.000	0.000	1.000	N	NA
5710049	5710050	CJA_2115	CJA_2116		galU	TRUE	0.785	39.000	0.000	1.000	Y	NA
5710050	5710051	CJA_2116	CJA_2117	galU		FALSE	0.435	61.000	0.000	1.000	N	NA
5710051	5710052	CJA_2117	CJA_2118		cmk	FALSE	0.059	203.000	0.000	1.000	N	NA
5710052	5710053	CJA_2118	CJA_2119	cmk		TRUE	0.842	45.000	0.005	1.000	Y	NA
5710053	5710054	CJA_2119	CJA_2120		comEA	TRUE	0.613	82.000	0.024	1.000		NA
5710054	5710055	CJA_2120	CJA_2121	comEA	cysNC	FALSE	0.050	206.000	0.000	1.000		NA
5710055	5710056	CJA_2121	CJA_2122	cysNC	cysD	TRUE	0.739	46.000	0.000	0.001	N	NA
5710056	5710057	CJA_2122	CJA_2123	cysD		TRUE	0.558	107.000	0.000	1.000	Y	NA
5710057	5710058	CJA_2123	CJA_2124		pheA	TRUE	0.991	0.000	0.057	1.000	Y	NA
5710058	5710059	CJA_2124	CJA_2125	pheA	gyrA	TRUE	0.660	41.000	0.004	1.000	N	NA
5710059	5710060	CJA_2125	CJA_2126	gyrA		FALSE	0.150	116.000	0.000	NA		NA
5710061	5710062	CJA_2127	CJA_2128		ubiG	TRUE	0.888	33.000	0.104	1.000	N	NA
5710062	5710063	CJA_2128	CJA_2129	ubiG		TRUE	0.991	7.000	0.259	1.000		NA
5710063	5710064	CJA_2129	CJA_2130			TRUE	0.951	-34.000	0.098	0.038		NA
5710065	5710066	CJA_2131	CJA_2132			TRUE	0.979	53.000	0.743	NA		NA
5710066	5710067	CJA_2132	CJA_2133			TRUE	0.953	158.000	0.886	0.011		NA
5710067	5710068	CJA_2133	CJA_2134			TRUE	0.997	0.000	0.454	1.000		NA
5710068	5710069	CJA_2134	CJA_2135			FALSE	0.349	224.000	0.199	1.000	N	NA
5710069	5710070	CJA_2135	CJA_2136			TRUE	0.994	11.000	0.248	1.000	Y	NA
5710070	5710071	CJA_2136	CJA_2137		cheB	TRUE	0.995	0.000	0.153	1.000	Y	NA
5710071	5710072	CJA_2137	CJA_2138	cheB	cheA	TRUE	0.984	62.000	0.327	0.011	Y	NA
5710072	5710073	CJA_2138	CJA_2139	cheA	cheZ	TRUE	0.971	77.000	0.341	1.000	Y	NA
5710073	5710074	CJA_2139	CJA_2140	cheZ		TRUE	0.989	36.000	0.516	1.000	Y	NA
5710074	5710075	CJA_2140	CJA_2141			TRUE	0.565	219.000	0.283	0.063	N	NA
5710075	5710076	CJA_2141	CJA_2142		fleN	TRUE	0.966	50.000	0.482	1.000	N	NA
5710076	5710077	CJA_2142	CJA_2143	fleN	flhF	TRUE	0.693	185.000	0.241	0.015	N	NA
5710077	5710078	CJA_2143	CJA_2144	flhF	flhA	TRUE	0.954	46.000	0.178	1.000	Y	NA
5710078	5710079	CJA_2144	CJA_2145	flhA		FALSE	0.160	112.000	0.000	NA		NA
5710079	5710080	CJA_2145	CJA_2146			TRUE	0.771	-6.000	0.000	NA		NA
5710081	5710082	CJA_2147	CJA_2148	cfa1		FALSE	0.285	76.000	0.000	NA		NA
5710082	5710083	CJA_2148	CJA_2149		efp	FALSE	0.452	137.000	0.074	NA		NA
5710084	5710085	CJA_2150	CJA_2151			TRUE	0.787	9.000	0.000	NA		NA
5710085	5710086	CJA_2151	CJA_2152		gdhA	TRUE	0.604	19.000	0.000	NA		NA
5710086	5710087	CJA_2152	CJA_2153	gdhA		FALSE	0.010	487.000	0.000	1.000	N	NA
5710087	5710088	CJA_2153	CJA_2154			FALSE	0.007	457.000	0.000	NA		NA
5710092	5710093	CJA_2158	CJA_2159	pyrD		TRUE	0.537	84.000	0.019	NA		NA
5710093	5710094	CJA_2159	CJA_2160		pul13A	FALSE	0.371	40.000	0.000	NA		NA
5710094	5710095	CJA_2160	CJA_2161	pul13A		FALSE	0.057	206.000	0.000	1.000	N	NA
5710096	5710097	CJA_2162	CJA_2163			TRUE	0.986	5.000	0.179	NA		NA
5710097	5710098	CJA_2163	CJA_2164			TRUE	0.915	47.000	0.235	NA		NA
5710098	5710099	CJA_2164	CJA_2165			TRUE	0.951	-7.000	0.068	NA		NA
5710099	5710100	CJA_2165	CJA_2166			TRUE	0.828	-3.000	0.000	NA		NA
5710100	5710101	CJA_2166	CJA_2167			TRUE	0.513	25.000	0.000	NA		NA
5710102	5710103	CJA_2168	CJA_2169			FALSE	0.337	51.000	0.000	NA		NA
5710103	5710104	CJA_2169	CJA_2170		pepN	FALSE	0.005	602.000	0.000	NA		NA
5710104	5710105	CJA_2170	CJA_2171	pepN		TRUE	0.811	19.000	0.009	NA		NA
5710105	5710106	CJA_2171	CJA_2172			TRUE	0.923	23.000	0.124	NA		NA
5710106	5710107	CJA_2172	CJA_2173			TRUE	0.891	36.000	0.131	1.000		NA
5710107	5710108	CJA_2173	CJA_2174			TRUE	0.973	2.000	0.045	1.000		NA
5710110	5710111	CJA_2176	CJA_2177			TRUE	0.681	-13.000	0.000	NA		NA
5710111	5710112	CJA_2177	CJA_2178			FALSE	0.312	63.000	0.000	NA		NA
5710112	5710113	CJA_2178	CJA_2179			TRUE	0.750	-7.000	0.000	NA		NA
5710113	5710114	CJA_2179	CJA_2180			TRUE	0.857	1.000	0.000	NA		NA
5710114	5710115	CJA_2180	CJA_2181			FALSE	0.031	214.000	0.000	NA		NA
5710115	5710116	CJA_2181	CJA_3944			FALSE	0.015	275.000	0.000	NA		NA
5710116	5710117	CJA_3944	CJA_3945			FALSE	0.301	69.000	0.000	NA		NA
5710118	5710119	CJA_2184	CJA_2185			TRUE	0.572	21.000	0.000	NA		NA
5710119	5710120	CJA_2185	CJA_2186		trmA	FALSE	0.422	33.000	0.000	NA		NA
5710121	5710122	CJA_2187	CJA_2188			TRUE	0.857	0.000	0.000	NA		NA
5710122	5710123	CJA_2188	CJA_2189			TRUE	0.786	30.000	0.038	NA		NA
5710125	5710126	CJA_2191	CJA_2192	cbp33A	exuT	FALSE	0.011	410.000	0.000	1.000		NA
5710127	5710128	CJA_2193	CJA_2194			TRUE	0.976	-3.000	0.098	NA		NA
5710130	5710131	CJA_2196	CJA_2197	anr		TRUE	0.740	33.000	0.029	NA		NA
5710131	5710132	CJA_2197	CJA_2198			TRUE	0.767	35.000	0.043	NA		NA
5710132	5710133	CJA_2198	CJA_2199			FALSE	0.094	144.000	0.000	NA		NA
5710136	5710137	CJA_2201	CJA_2203			TRUE	0.926	13.000	0.049	NA		NA
5710137	5710138	CJA_2203	CJA_2204		galK	FALSE	0.008	478.000	0.000	NA	N	NA
5710138	5710139	CJA_2204	CJA_2205	galK	galT	TRUE	0.983	5.000	0.026	0.001	N	NA
5710139	5710140	CJA_2205	CJA_2206	galT		FALSE	0.122	157.000	0.000	1.000	N	NA
5710141	5710142	CJA_2207	CJA_2208		gt1A	TRUE	0.910	89.000	0.336	NA		NA
5710143	5710144	CJA_2209	CJA_2210		mucC	TRUE	0.705	13.000	0.000	NA		NA
5710144	5710145	CJA_2210	CJA_2211	mucC	mucB	TRUE	0.988	42.000	0.609	NA	Y	NA
5710145	5710146	CJA_2211	CJA_2212	mucB	mucA	TRUE	0.986	99.000	0.856	NA	Y	NA
5710146	5710147	CJA_2212	CJA_2213	mucA		TRUE	0.646	246.000	0.705	NA	N	NA
5710150	5710151	CJA_2216	CJA_2217			TRUE	0.849	21.000	0.034	NA		NA
5710152	5710153	CJA_2218	CJA_2219	rpoS	nlpD	TRUE	0.506	140.000	0.081	1.000	N	NA
5710153	5710154	CJA_2219	CJA_2220	nlpD	pcm	FALSE	0.194	170.000	0.007	1.000	N	NA
5710154	5710155	CJA_2220	CJA_2221	pcm	truD	TRUE	0.533	99.000	0.025	1.000		NA
5710155	5710156	CJA_2221	CJA_2222	truD	ispF	TRUE	0.793	101.000	0.173	1.000		NA
5710156	5710157	CJA_2222	CJA_2223	ispF	ispD	TRUE	0.998	4.000	0.419	1.000	Y	NA
5710157	5710158	CJA_2223	CJA_2224	ispD		TRUE	0.965	19.000	0.185	1.000	N	NA
5710158	5710159	CJA_2224	CJA_2225		eno	TRUE	0.922	61.000	0.241	1.000	N	NA
5710159	5710160	CJA_2225	CJA_2226	eno	kdsA	TRUE	0.910	31.000	0.125	1.000	N	NA
5710160	5710161	CJA_2226	CJA_2227	kdsA	pyrG	TRUE	0.881	46.000	0.138	1.000	N	NA
5710161	5710162	CJA_2227	CJA_2228	pyrG		FALSE	0.035	230.000	0.000	1.000		NA
5710162	5710163	CJA_2228	CJA_2229			TRUE	0.492	-58.000	0.000	NA		NA
5710163	5710164	CJA_2229	CJA_2230		recA	FALSE	0.093	145.000	0.000	NA		NA
5710164	5710165	CJA_2230	CJA_2231	recA		TRUE	0.559	117.000	0.082	NA		NA
5710167	5710168	CJA_2232	CJA_2234			FALSE	0.117	132.000	0.000	NA		NA
5710168	5710169	CJA_2234	CJA_2235		srpI	TRUE	0.816	107.000	0.242	NA		NA
5710169	5710170	CJA_2235	CJA_2236	srpI		TRUE	0.550	202.000	0.333	NA		NA
5710170	5710171	CJA_2236	CJA_2237		srpH	TRUE	0.995	-3.000	0.389	1.000		NA
5710171	5710172	CJA_2237	CJA_2238	srpH		TRUE	0.973	39.000	0.562	NA	N	NA
5710174	5710175	CJA_2240	CJA_2241	cysA-2		TRUE	0.983	78.000	0.587	1.000	Y	NA
5710175	5710176	CJA_2241	CJA_2242			TRUE	0.999	2.000	0.935	0.001	N	NA
5710178	5710179	CJA_2243	CJA_2245			FALSE	0.030	216.000	0.000	NA		NA
5710179	5710180	CJA_2245	CJA_2246			FALSE	0.058	174.000	0.000	NA		NA
5710180	5710181	CJA_2246	CJA_2247			FALSE	0.038	317.000	0.000	0.055	N	NA
5710181	5710182	CJA_2247	CJA_2248			TRUE	0.889	-3.000	0.000	1.000	N	NA
5710182	5710183	CJA_2248	CJA_2249			FALSE	0.420	67.000	0.000	1.000	N	NA
5710183	5710184	CJA_2249	CJA_2250			TRUE	0.799	12.000	0.000	1.000		NA
5710184	5710185	CJA_2250	CJA_2251			TRUE	0.981	-3.000	0.111	1.000		NA
5710185	5710186	CJA_2251	CJA_2252			TRUE	0.988	-3.000	0.111	0.041		NA
5710187	5710188	CJA_2253	CJA_2254			TRUE	0.994	-3.000	0.310	1.000	N	NA
5710188	5710189	CJA_2254	CJA_2255			TRUE	0.996	17.000	0.595	1.000	Y	NA
5710189	5710190	CJA_2255	CJA_2256			TRUE	0.888	121.000	0.439	1.000	N	NA
5710190	5710191	CJA_2256	CJA_2257			TRUE	0.999	10.000	0.732	0.041	Y	NA
5710191	5710192	CJA_2257	CJA_2258			TRUE	0.998	0.000	0.424	1.000	Y	NA
5710192	5710193	CJA_2258	CJA_2259			TRUE	0.624	26.000	0.000	1.000	N	NA
5710193	5710194	CJA_2259	CJA_2260			TRUE	0.974	-3.000	0.091	NA		NA
5710195	5710196	CJA_2261	CJA_2262			FALSE	0.406	73.000	0.000	1.000	N	NA
5710196	5710197	CJA_2262	CJA_2263			TRUE	0.921	76.000	0.275	1.000	N	NA
5710197	5710198	CJA_2263	CJA_2264			FALSE	0.015	332.000	0.000	1.000		NA
5710198	5710199	CJA_2264	CJA_2265			FALSE	0.229	108.000	0.000	1.000		NA
5710199	5710200	CJA_2265	CJA_2266			TRUE	0.488	41.000	0.000	1.000	N	NA
5710200	5710201	CJA_2266	CJA_2267			TRUE	0.820	12.000	0.000	1.000	N	NA
5710204	5710205	CJA_2270	CJA_2271			FALSE	0.448	55.000	0.000	1.000	N	NA
5710205	5710206	CJA_2271	CJA_2272			FALSE	0.422	51.000	0.000	1.000		NA
5710206	5710207	CJA_2272	CJA_2273			FALSE	0.041	299.000	0.000	0.041		NA
5710207	5710208	CJA_2273	CJA_2274		mgtC	FALSE	0.377	109.000	0.000	0.099		NA
5710208	5710209	CJA_2274	CJA_2275	mgtC		FALSE	0.339	128.000	0.011	1.000		NA
5710210	5710211	CJA_2276	CJA_2277			FALSE	0.373	73.000	0.000	1.000		NA
5710211	5710212	CJA_2277	CJA_2278			FALSE	0.162	138.000	0.000	1.000	N	NA
5710212	5710213	CJA_2278	CJA_2279			FALSE	0.022	239.000	0.000	NA		NA
5710213	5710214	CJA_2279	CJA_2280		avtA	FALSE	0.032	213.000	0.000	NA		NA
5710214	5710215	CJA_2280	CJA_2281	avtA		TRUE	0.657	70.000	0.019	1.000	N	NA
5710215	5710216	CJA_2281	CJA_2282			FALSE	0.372	114.000	0.006	1.000		NA
5710217	5710218	CJA_2283	CJA_2284	arsC		TRUE	0.977	13.000	0.112	0.036		NA
5710218	5710219	CJA_2284	CJA_2285			TRUE	0.984	30.000	0.657	NA		NA
5710219	5710220	CJA_2285	CJA_2286		sppA	TRUE	0.539	72.000	0.009	NA		NA
5710224	5710225	CJA_2290	CJA_2291			FALSE	0.331	125.000	0.000	0.041		NA
5710226	5710227	CJA_2292	CJA_2293		fecR	TRUE	0.592	93.000	0.000	NA	Y	NA
5710227	5710228	CJA_2293	CJA_2294	fecR		TRUE	0.995	7.000	0.500	NA	N	NA
5710228	5710229	CJA_2294	CJA_2295			FALSE	0.216	119.000	0.000	1.000	N	NA
5710229	5710230	CJA_2295	CJA_2296			TRUE	0.509	108.000	0.000	NA	Y	NA
5710230	5710231	CJA_2296	CJA_2297		fecI	TRUE	0.988	-13.000	0.400	NA	N	NA
5710231	5710232	CJA_2297	CJA_2298	fecI		FALSE	0.067	197.000	0.000	1.000	N	NA
5710233	5710234	CJA_2299	CJA_2300	fagA	fumC	FALSE	0.329	55.000	0.000	NA		NA
5710235	5710236	CJA_2301	CJA_2302			FALSE	0.033	247.000	0.000	1.000	N	NA
5710237	5710238	CJA_2303	CJA_2304			TRUE	0.915	71.000	0.250	1.000		NA
5710238	5710239	CJA_2304	CJA_2305			TRUE	0.622	18.000	0.000	NA		NA
5710239	5710240	CJA_2305	CJA_2306			FALSE	0.323	58.000	0.000	NA		NA
5710240	5710241	CJA_2306	CJA_2307			TRUE	0.715	-10.000	0.000	NA		NA
5710242	5710243	CJA_2309	CJA_2310			TRUE	0.980	-7.000	0.200	NA		NA
5710243	5710244	CJA_2310	CJA_2311			TRUE	0.996	11.000	0.667	NA		NA
5710246	5710247	CJA_2313	CJA_2314			TRUE	0.999	-3.000	0.500	0.006	Y	NA
5710247	5710248	CJA_2314	CJA_2315			FALSE	0.385	47.000	0.000	NA	N	NA
5710248	5710249	CJA_2315	CJA_2316			TRUE	0.976	55.000	0.667	NA	N	NA
5710249	5710250	CJA_2316	CJA_2317			TRUE	0.966	56.000	0.500	1.000	N	NA
5710250	5710251	CJA_2317	CJA_2318			FALSE	0.013	295.000	0.000	NA		NA
5710252	5710253	CJA_2319	CJA_2320			TRUE	0.566	-31.000	0.000	NA		NA
5710253	5710254	CJA_2320	CJA_2322			TRUE	0.734	12.000	0.000	NA		NA
5710255	5710256	CJA_2321	CJA_2323	atsB		TRUE	0.999	18.000	0.889	0.041	Y	NA
5710256	5710257	CJA_2323	CJA_2324			TRUE	0.980	-3.000	0.000	0.041	Y	NA
5710257	5710258	CJA_2324	CJA_2325			FALSE	0.043	194.000	0.000	NA		NA
5710259	5710260	CJA_2326	CJA_2327		tonB-2	FALSE	0.390	37.000	0.000	NA		NA
5710260	5710261	CJA_2327	CJA_2328	tonB-2	exbB1	TRUE	0.678	49.000	0.000	0.016	N	NA
5710261	5710262	CJA_2328	CJA_2329	exbB1	exbD1	TRUE	0.983	0.000	0.000	0.055	Y	NA
5710262	5710263	CJA_2329	CJA_2330	exbD1		FALSE	0.433	32.000	0.000	NA		NA
5710264	5710265	CJA_2331	CJA_2332		sfnR	FALSE	0.052	193.000	0.000	NA	N	NA
5710266	5710267	CJA_2333	CJA_2334			FALSE	0.383	135.000	0.000	NA	Y	NA
5710268	5710269	CJA_2335	CJA_2336			TRUE	0.998	22.000	0.643	0.002	Y	NA
5710269	5710270	CJA_2336	CJA_2337			FALSE	0.392	233.000	0.286	NA	N	NA
5710271	5710272	CJA_2338	CJA_2339			TRUE	0.501	26.000	0.000	NA		NA
5710272	5710273	CJA_2339	CJA_2340			TRUE	0.750	-7.000	0.000	NA		NA
5710273	5710274	CJA_2340	CJA_2341			TRUE	0.968	-10.000	0.000	0.006	Y	NA
5710275	5710276	CJA_2342	CJA_2343			TRUE	0.786	24.000	0.000	0.088	N	NA
5710276	5710277	CJA_2343	CJA_2344		msuE	TRUE	0.896	0.000	0.000	1.000		NA
5710278	5710279	CJA_2345	CJA_2346			TRUE	0.762	71.000	0.086	NA		NA
5710280	5710281	CJA_2347	CJA_2348			TRUE	0.998	6.000	0.583	0.001	N	NA
5710281	5710282	CJA_2348	CJA_2349		cysP	TRUE	0.986	34.000	0.479	0.003	N	NA
5710282	5710283	CJA_2349	CJA_2350	cysP		FALSE	0.112	134.000	0.000	NA		NA
5710283	5710284	CJA_2350	CJA_2351			TRUE	0.715	-10.000	0.000	NA		NA
5710284	5710285	CJA_2351	CJA_2352			FALSE	0.355	44.000	0.000	NA		NA
5710287	5710288	CJA_2353	CJA_2355			TRUE	0.828	-3.000	0.000	NA		NA
5710289	5710290	CJA_2356	CJA_2357	mutS	fdxA	FALSE	0.227	163.000	0.009	1.000	N	NA
5710290	5710291	CJA_2357	CJA_2358	fdxA		FALSE	0.015	275.000	0.000	NA		NA
5710293	5710294	CJA_2360	CJA_2361			TRUE	0.935	74.000	0.373	NA		NA
5710294	5710295	CJA_2361	CJA_2362			FALSE	0.013	297.000	0.000	NA		NA
5710296	5710297	CJA_2363	CJA_2364		ifcO	FALSE	0.087	150.000	0.000	NA		NA
5710297	5710298	CJA_2364	CJA_2365	ifcO		FALSE	0.020	248.000	0.000	NA		NA
5710298	5710299	CJA_2365	CJA_2366			TRUE	0.998	-3.000	0.914	NA		NA
5710299	5710300	CJA_2366	CJA_2367		hrpA	FALSE	0.007	425.000	0.000	NA		NA
5710300	5710301	CJA_2367	CJA_2368	hrpA		FALSE	0.337	51.000	0.000	NA		NA
5710301	5710302	CJA_2368	CJA_2369			FALSE	0.110	135.000	0.000	NA		NA
5710302	5710303	CJA_2369	CJA_2370			TRUE	0.995	13.000	0.680	NA	N	NA
5710303	5710304	CJA_2370	CJA_2371			FALSE	0.200	100.000	0.000	NA		NA
5710304	5710305	CJA_2371	CJA_2372		msrB	FALSE	0.422	33.000	0.000	NA		NA
5710307	5710308	CJA_2374	CJA_2375			TRUE	0.646	-16.000	0.000	NA		NA
5710308	5710309	CJA_2375	CJA_2376		pdxB	TRUE	0.957	-7.000	0.019	0.037		NA
5710311	5710312	CJA_2378	CJA_2379			FALSE	0.169	109.000	0.000	NA		NA
5710314	5710315	CJA_2381	CJA_2382			TRUE	0.648	16.000	0.000	NA		NA
5710317	5710318	CJA_2384	CJA_2385			TRUE	0.622	18.000	0.000	NA		NA
5710318	5710319	CJA_2385	CJA_2386			TRUE	0.995	1.000	0.343	NA		NA
5710319	5710320	CJA_2386	CJA_2387			TRUE	0.987	20.000	0.548	NA		NA
5710320	5710321	CJA_2387	CJA_2388		mshD	TRUE	0.999	0.000	0.871	NA		NA
5710321	5710322	CJA_2388	CJA_2389	mshD		TRUE	0.964	-19.000	0.200	NA		NA
5710322	5710323	CJA_2389	CJA_2390			TRUE	0.949	27.000	0.231	NA		NA
5710323	5710324	CJA_2390	CJA_2391			TRUE	0.857	91.000	0.231	NA		NA
5710326	5710327	CJA_2392	CJA_2394	mshG	mshE	TRUE	0.998	17.000	0.740	1.000	Y	NA
5710327	5710328	CJA_2394	CJA_2395	mshE		TRUE	0.923	18.000	0.066	1.000		NA
5710328	5710329	CJA_2395	CJA_2396		mshM	TRUE	0.933	15.000	0.062	1.000		NA
5710329	5710330	CJA_2396	CJA_2397	mshM	mshL	TRUE	0.994	48.000	0.846	1.000	Y	NA
5710330	5710331	CJA_2397	CJA_2398	mshL		TRUE	0.887	25.000	0.085	NA		NA
5710331	5710332	CJA_2398	CJA_2399			TRUE	0.956	-7.000	0.082	NA		NA
5710332	5710333	CJA_2399	CJA_2400			TRUE	0.995	-3.000	0.475	NA		NA
5710333	5710334	CJA_2400	CJA_2401			TRUE	0.986	2.000	0.143	NA		NA
5710335	5710336	CJA_2402	CJA_2403			TRUE	0.673	-33.000	0.000	1.000	N	NA
5710336	5710337	CJA_2403	CJA_2404			TRUE	0.918	66.000	0.030	0.005	Y	NA
5710337	5710338	CJA_2404	CJA_2405			TRUE	0.971	-3.000	0.007	0.023	N	NA
5710338	5710339	CJA_2405	CJA_2407			TRUE	0.538	60.000	0.004	NA		NA
5710342	5710343	CJA_2409	CJA_2410			TRUE	0.932	40.000	0.036	0.036	Y	NA
5710344	5710345	CJA_2411	CJA_2412			FALSE	0.029	217.000	0.000	NA		NA
5710347	5710348	CJA_2414	CJA_2415		pae12A	TRUE	0.528	24.000	0.000	NA		NA
5710349	5710350	CJA_2416	CJA_2417			TRUE	0.558	72.000	0.011	NA		NA
5710350	5710351	CJA_2417	CJA_2418			TRUE	0.916	-10.000	0.023	1.000		NA
5710353	5710354	CJA_2419	CJA_2421	pyrB	eryB	FALSE	0.223	117.000	0.000	1.000	N	NA
5710354	5710355	CJA_2421	CJA_2422	eryB		FALSE	0.161	121.000	0.000	NA	N	NA
5710355	5710356	CJA_2422	CJA_2423			TRUE	0.572	21.000	0.000	NA		NA
5710361	5710362	CJA_2428	CJA_2429			TRUE	0.720	37.000	0.030	NA		NA
5710362	5710363	CJA_2429	CJA_2430			FALSE	0.251	86.000	0.000	NA		NA
5710364	5710365	CJA_2431	CJA_2432			FALSE	0.112	155.000	0.000	1.000		NA
5710365	5710366	CJA_2432	CJA_2433			FALSE	0.160	132.000	0.000	1.000		NA
5710366	5710367	CJA_2433	CJA_2434			TRUE	0.857	0.000	0.000	NA		NA
5710367	5710368	CJA_2434	CJA_2435			FALSE	0.105	138.000	0.000	NA		NA
5710368	5710369	CJA_2435	CJA_2436			TRUE	0.572	21.000	0.000	NA		NA
5710369	5710370	CJA_2436	CJA_2437			TRUE	0.931	14.000	0.069	NA		NA
5710370	5710371	CJA_2437	CJA_2438		rnd	TRUE	0.804	39.000	0.073	NA		NA
5710371	5710372	CJA_2438	CJA_2439	rnd	recR	TRUE	0.805	27.000	0.018	1.000	N	NA
5710372	5710373	CJA_2439	CJA_2440	recR		TRUE	0.989	21.000	0.604	NA		NA
5710373	5710374	CJA_2440	CJA_2441		dnaX	TRUE	0.962	36.000	0.411	NA		NA
5710374	5710375	CJA_2441	CJA_2442	dnaX		FALSE	0.017	264.000	0.000	NA		NA
5710376	5710377	CJA_2443	CJA_2444			FALSE	0.043	225.000	0.000	1.000	N	NA
5710377	5710378	CJA_2444	CJA_2445			TRUE	0.974	10.000	0.000	0.024	Y	NA
5710378	5710379	CJA_2445	CJA_2447			TRUE	0.985	1.000	0.000	0.020	Y	NA
5710381	5710382	CJA_2448	CJA_2449	metE		FALSE	0.004	1232.000	0.000	NA		NA
11502159	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	2391.000	0.000	NA		NA
11644522	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	2391.000	0.000	NA		NA
11786914	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	2391.000	0.000	NA		NA
11502160	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	2359.000	0.000	NA		NA
11644523	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	2359.000	0.000	NA		NA
11786915	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	2359.000	0.000	NA		NA
11502161	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	2325.000	0.000	NA		NA
11644524	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	2325.000	0.000	NA		NA
11786916	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	2325.000	0.000	NA		NA
11502162	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	2293.000	0.000	NA		NA
11644525	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	2293.000	0.000	NA		NA
11786917	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	2293.000	0.000	NA		NA
11502163	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	2259.000	0.000	NA		NA
11644526	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	2259.000	0.000	NA		NA
11786918	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	2259.000	0.000	NA		NA
11502164	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	2227.000	0.000	NA		NA
11644527	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	2227.000	0.000	NA		NA
11786919	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	2227.000	0.000	NA		NA
11502165	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	2194.000	0.000	NA		NA
11644528	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	2194.000	0.000	NA		NA
11786920	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	2194.000	0.000	NA		NA
11502166	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	2162.000	0.000	NA		NA
11644529	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	2162.000	0.000	NA		NA
11786921	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	2162.000	0.000	NA		NA
11502167	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	2128.000	0.000	NA		NA
11644530	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	2128.000	0.000	NA		NA
11786922	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	2128.000	0.000	NA		NA
11502168	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	2096.000	0.000	NA		NA
11644531	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	2096.000	0.000	NA		NA
11786923	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	2096.000	0.000	NA		NA
11502169	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	2061.000	0.000	NA		NA
11644532	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	2061.000	0.000	NA		NA
11786924	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	2061.000	0.000	NA		NA
11502170	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	2029.000	0.000	NA		NA
11644533	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	2029.000	0.000	NA		NA
11786925	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	2029.000	0.000	NA		NA
11502171	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1996.000	0.000	NA		NA
11644534	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1996.000	0.000	NA		NA
11786926	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1996.000	0.000	NA		NA
11502172	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1964.000	0.000	NA		NA
11644535	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1964.000	0.000	NA		NA
11786927	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1964.000	0.000	NA		NA
11502173	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1931.000	0.000	NA		NA
11644536	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1931.000	0.000	NA		NA
11786928	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1931.000	0.000	NA		NA
11502174	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1899.000	0.000	NA		NA
11644537	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1899.000	0.000	NA		NA
11786929	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1899.000	0.000	NA		NA
11502175	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1866.000	0.000	NA		NA
11644538	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1866.000	0.000	NA		NA
11786930	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1866.000	0.000	NA		NA
5710383	5710384	CJA_2450	CJA_2451		cas2	FALSE	0.004	1792.000	0.000	NA		NA
11502176	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1834.000	0.000	NA		NA
11644539	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1834.000	0.000	NA		NA
11786931	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1834.000	0.000	NA		NA
11502177	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1799.000	0.000	NA		NA
11644540	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1799.000	0.000	NA		NA
11786932	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1799.000	0.000	NA		NA
11502178	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1767.000	0.000	NA		NA
11644541	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1767.000	0.000	NA		NA
11786933	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1767.000	0.000	NA		NA
11502179	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1732.000	0.000	NA		NA
11644542	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1732.000	0.000	NA		NA
11786934	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1732.000	0.000	NA		NA
11502180	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1700.000	0.000	NA		NA
11644543	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1700.000	0.000	NA		NA
11786935	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1700.000	0.000	NA		NA
11502181	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1665.000	0.000	NA		NA
11644544	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1665.000	0.000	NA		NA
11786936	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1665.000	0.000	NA		NA
11502182	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1633.000	0.000	NA		NA
11644545	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1633.000	0.000	NA		NA
11786937	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1633.000	0.000	NA		NA
11502183	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1599.000	0.000	NA		NA
11644546	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1599.000	0.000	NA		NA
11786938	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1599.000	0.000	NA		NA
11502184	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1567.000	0.000	NA		NA
11644547	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1567.000	0.000	NA		NA
11786939	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1567.000	0.000	NA		NA
11502185	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1533.000	0.000	NA		NA
11644548	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1533.000	0.000	NA		NA
11786940	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1533.000	0.000	NA		NA
11502186	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1501.000	0.000	NA		NA
11644549	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1501.000	0.000	NA		NA
11786941	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1501.000	0.000	NA		NA
11502187	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1467.000	0.000	NA		NA
11644550	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1467.000	0.000	NA		NA
11786942	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1467.000	0.000	NA		NA
11502188	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1435.000	0.000	NA		NA
11644551	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1435.000	0.000	NA		NA
11786943	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1435.000	0.000	NA		NA
11502189	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1401.000	0.000	NA		NA
11644552	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1401.000	0.000	NA		NA
11786944	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1401.000	0.000	NA		NA
11502190	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1369.000	0.000	NA		NA
11644553	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1369.000	0.000	NA		NA
11786945	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1369.000	0.000	NA		NA
11502191	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1335.000	0.000	NA		NA
11644554	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1335.000	0.000	NA		NA
11786946	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1335.000	0.000	NA		NA
11502192	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1303.000	0.000	NA		NA
11644555	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1303.000	0.000	NA		NA
11786947	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1303.000	0.000	NA		NA
11502193	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1269.000	0.000	NA		NA
11644556	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1269.000	0.000	NA		NA
11786948	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1269.000	0.000	NA		NA
11502194	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1237.000	0.000	NA		NA
11644557	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1237.000	0.000	NA		NA
11786949	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1237.000	0.000	NA		NA
11502195	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1202.000	0.000	NA		NA
11644558	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1202.000	0.000	NA		NA
11786950	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1202.000	0.000	NA		NA
11502196	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1170.000	0.000	NA		NA
11644559	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1170.000	0.000	NA		NA
11786951	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1170.000	0.000	NA		NA
11502197	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1135.000	0.000	NA		NA
11644560	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1135.000	0.000	NA		NA
11786952	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1135.000	0.000	NA		NA
11502198	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1103.000	0.000	NA		NA
11644561	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1103.000	0.000	NA		NA
11786953	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1103.000	0.000	NA		NA
11502199	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1069.000	0.000	NA		NA
11644562	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1069.000	0.000	NA		NA
11786954	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1069.000	0.000	NA		NA
11502200	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1037.000	0.000	NA		NA
11644563	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1037.000	0.000	NA		NA
11786955	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1037.000	0.000	NA		NA
11502201	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1002.000	0.000	NA		NA
11644564	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1002.000	0.000	NA		NA
11786956	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	1002.000	0.000	NA		NA
11502202	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	970.000	0.000	NA		NA
11644565	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	970.000	0.000	NA		NA
11786957	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	970.000	0.000	NA		NA
11502203	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	935.000	0.000	NA		NA
11644566	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	935.000	0.000	NA		NA
11786958	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	935.000	0.000	NA		NA
11502204	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	903.000	0.000	NA		NA
11644567	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	903.000	0.000	NA		NA
11786959	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	903.000	0.000	NA		NA
11502205	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	869.000	0.000	NA		NA
11644568	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	869.000	0.000	NA		NA
11786960	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	869.000	0.000	NA		NA
11502206	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	837.000	0.000	NA		NA
11644569	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	837.000	0.000	NA		NA
11786961	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	837.000	0.000	NA		NA
11502207	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	803.000	0.000	NA		NA
11644570	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	803.000	0.000	NA		NA
11786962	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	803.000	0.000	NA		NA
11502208	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	771.000	0.000	NA		NA
11644571	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	771.000	0.000	NA		NA
11786963	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	771.000	0.000	NA		NA
11502209	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	737.000	0.000	NA		NA
11644572	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	737.000	0.000	NA		NA
11786964	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	737.000	0.000	NA		NA
11502210	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	705.000	0.000	NA		NA
11644573	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	705.000	0.000	NA		NA
11786965	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	705.000	0.000	NA		NA
11502211	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	671.000	0.000	NA		NA
11644574	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	671.000	0.000	NA		NA
11786966	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	671.000	0.000	NA		NA
11502212	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	639.000	0.000	NA		NA
11644575	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	639.000	0.000	NA		NA
11786967	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	639.000	0.000	NA		NA
11502213	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	605.000	0.000	NA		NA
11644576	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	605.000	0.000	NA		NA
11786968	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	605.000	0.000	NA		NA
11502214	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	573.000	0.000	NA		NA
11644577	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	573.000	0.000	NA		NA
11786969	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	573.000	0.000	NA		NA
11502215	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	538.000	0.000	NA		NA
11644578	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	538.000	0.000	NA		NA
11786970	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	538.000	0.000	NA		NA
11502216	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	506.000	0.000	NA		NA
11644579	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	506.000	0.000	NA		NA
11786971	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	506.000	0.000	NA		NA
11502217	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	473.000	0.000	NA		NA
11644580	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	473.000	0.000	NA		NA
11786972	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	473.000	0.000	NA		NA
11502218	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	441.000	0.000	NA		NA
11644581	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	441.000	0.000	NA		NA
11786973	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	441.000	0.000	NA		NA
11502219	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	408.000	0.000	NA		NA
11644582	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	408.000	0.000	NA		NA
11786974	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	408.000	0.000	NA		NA
11502220	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	376.000	0.000	NA		NA
11644583	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	376.000	0.000	NA		NA
11786975	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	376.000	0.000	NA		NA
11502221	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	342.000	0.000	NA		NA
11644584	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	342.000	0.000	NA		NA
11786976	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	342.000	0.000	NA		NA
11502222	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	310.000	0.000	NA		NA
11644585	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	310.000	0.000	NA		NA
11786977	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	310.000	0.000	NA		NA
11502223	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	276.000	0.000	NA		NA
11644586	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	276.000	0.000	NA		NA
11786978	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	276.000	0.000	NA		NA
11502224	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	244.000	0.000	NA		NA
11644587	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	244.000	0.000	NA		NA
11786979	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	244.000	0.000	NA		NA
11502225	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	209.000	0.000	NA		NA
11644588	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	209.000	0.000	NA		NA
11786980	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	209.000	0.000	NA		NA
11502226	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	177.000	0.000	NA		NA
11644589	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	177.000	0.000	NA		NA
11786981	5710384		CJA_2451		cas2	FALSE	NA	177.000	0.000	NA		NA
5710384	5710385	CJA_2451	CJA_2452	cas2	cas1	TRUE	0.999	9.000	0.882	NA	Y	NA
5710385	5710386	CJA_2452	CJA_2453	cas1	cas4	TRUE	0.999	-3.000	0.773	NA	Y	NA
5710386	5710387	CJA_2453	CJA_2454	cas4	csd2	TRUE	0.998	-13.000	0.711	NA	Y	NA
5710387	5710388	CJA_2454	CJA_2455	csd2	csd1	TRUE	0.999	-3.000	0.948	NA		NA
5710388	5710389	CJA_2455	CJA_2456	csd1		TRUE	0.998	-3.000	0.891	NA		NA
5710389	5710390	CJA_2456	CJA_2457		cas3	TRUE	0.996	9.000	0.664	NA		NA
5710390	5710391	CJA_2457	CJA_2458	cas3		FALSE	0.035	207.000	0.000	NA		NA
5710391	5710392	CJA_2458	CJA_2459			FALSE	0.208	98.000	0.000	NA		NA
5710392	5710393	CJA_2459	CJA_2460			TRUE	0.672	-28.000	0.000	1.000		NA
5710393	5710394	CJA_2460	CJA_2461			TRUE	0.840	63.000	0.000	0.011	Y	NA
5710394	5710395	CJA_2461	CJA_2462			TRUE	0.750	-7.000	0.000	NA		NA
5710400	5710401	CJA_2467	CJA_2468	proS		FALSE	0.312	63.000	0.000	NA		NA
5710402	5710403	CJA_2469	CJA_2470	cbp2F		FALSE	0.264	82.000	0.000	NA		NA
5710403	5710404	CJA_2470	CJA_2471		xyn10A	TRUE	0.715	-10.000	0.000	NA		NA
5710404	5710405	CJA_2471	CJA_2472	xyn10A	cel9A	FALSE	0.254	158.000	0.000	0.006		NA
5710405	5710406	CJA_2472	CJA_2473	cel9A	cel6A	FALSE	0.067	260.000	0.000	0.006		NA
5710409	5710410	CJA_2476	CJA_2477		gly74A	FALSE	0.005	680.000	0.000	NA		NA
5710411	5710412	CJA_2478	CJA_2479	lysS	prfB	TRUE	0.982	-49.000	0.162	0.028	Y	NA
5710414	5710415	CJA_2481	CJA_2482			FALSE	0.155	123.000	0.000	NA	N	NA
5710415	5710416	CJA_2482	CJA_2483		acrE	TRUE	0.960	72.000	0.538	NA	N	NA
5710418	5710419	CJA_2485	CJA_2486			TRUE	0.857	0.000	0.000	NA		NA
5710420	5710421	CJA_2487	CJA_2488			TRUE	0.969	4.000	0.057	NA		NA
5710421	5710422	CJA_2488	CJA_2489			TRUE	0.990	0.000	0.207	NA		NA
5710422	5710423	CJA_2489	CJA_2490		trmU	FALSE	0.189	103.000	0.000	NA		NA
5710423	5710424	CJA_2490	CJA_2491	trmU		TRUE	0.893	40.000	0.180	NA		NA
5710424	5710425	CJA_2491	CJA_2492		purB	FALSE	0.368	167.000	0.093	NA		NA
5710425	5710426	CJA_2492	CJA_2493	purB		TRUE	0.726	35.000	0.029	NA		NA
5710426	5710427	CJA_2493	CJA_2494			FALSE	0.132	306.000	0.167	NA		NA
5710427	5710428	CJA_2494	CJA_2495			TRUE	0.970	14.000	0.191	NA		NA
5710429	5710430	CJA_2496	CJA_2497			FALSE	0.017	261.000	0.000	NA		NA
5710432	5710433	CJA_2498	CJA_2500			FALSE	0.299	70.000	0.000	NA		NA
5710433	5710434	CJA_2500	CJA_2501			TRUE	0.818	6.000	0.000	NA		NA
5710434	5710435	CJA_2501	CJA_2502			TRUE	0.787	9.000	0.000	NA		NA
5710437	5710438	CJA_2504	CJA_2505			TRUE	0.572	21.000	0.000	NA		NA
5710438	5710439	CJA_2505	CJA_2506			FALSE	0.021	242.000	0.000	NA		NA
5710439	5710440	CJA_2506	CJA_2507			TRUE	0.622	18.000	0.000	NA		NA
5710440	5710441	CJA_2507	CJA_2508			FALSE	0.125	127.000	0.000	NA		NA
5710441	5710442	CJA_2508	CJA_2509			TRUE	0.572	21.000	0.000	NA		NA
5710442	5710443	CJA_2509	CJA_2510			FALSE	0.422	33.000	0.000	NA		NA
5710445	5710446	CJA_2511	CJA_2513			FALSE	0.060	171.000	0.000	NA		NA
5710446	5710447	CJA_2513	CJA_2514			FALSE	0.108	136.000	0.000	NA		NA
5710447	5710448	CJA_2514	CJA_2515			FALSE	0.085	151.000	0.000	NA		NA
5710448	5710449	CJA_2515	CJA_2516			TRUE	0.828	-3.000	0.000	NA		NA
5710449	5710450	CJA_2516	CJA_2517			FALSE	0.301	69.000	0.000	NA		NA
5710450	5710451	CJA_2517	CJA_2518			FALSE	0.147	137.000	0.000	1.000		NA
5710451	5710452	CJA_2518	CJA_2519			TRUE	0.996	1.000	0.250	0.006		NA
5710452	5710453	CJA_2519	CJA_2520			TRUE	0.933	70.000	0.300	1.000	N	NA
5710453	5710454	CJA_2520	CJA_2521		fadL	FALSE	0.008	725.000	0.000	1.000	N	NA
5710454	5710455	CJA_2521	CJA_4117	fadL		FALSE	0.007	424.000	0.000	NA		NA
5710455	5710456	CJA_4117	CJA_2523			FALSE	0.083	153.000	0.000	NA		NA
5710456	5710457	CJA_2523	CJA_2524		ihfA	TRUE	0.991	-19.000	0.535	1.000	N	NA
5710457	5710458	CJA_2524	CJA_2525	ihfA	pheT	TRUE	0.981	13.000	0.208	1.000	N	NA
5710458	5710459	CJA_2525	CJA_2526	pheT	pheS	TRUE	0.982	114.000	0.574	0.001	Y	NA
5710459	5710460	CJA_2526	CJA_2527	pheS	rplT	TRUE	0.601	213.000	0.202	1.000	Y	NA
5710460	5710461	CJA_2527	CJA_2528	rplT	rpmI	TRUE	0.997	36.000	0.928	0.011	Y	NA
5710461	5710462	CJA_2528	CJA_2529	rpmI	infC	TRUE	0.989	61.000	0.652	1.000	Y	NA
5710462	5710463	CJA_2529	CJA_2530	infC	thrS	TRUE	0.763	162.000	0.186	1.000	Y	NA
5710463	5710464	CJA_2530	CJA_2531	thrS		FALSE	0.061	202.000	0.000	1.000	N	NA
5710464	5710465	CJA_2531	CJA_2532			FALSE	0.361	85.000	0.000	1.000	N	NA
5710465	5710466	CJA_2532	CJA_2533			TRUE	0.995	5.000	0.286	0.085	N	NA
5710466	5710467	CJA_2533	CJA_2534			TRUE	0.999	0.000	0.943	0.085	N	NA
5710467	5710468	CJA_2534	CJA_2535		cysJ	TRUE	0.508	38.000	0.000	1.000	N	NA
5710468	5710469	CJA_2535	CJA_2536	cysJ		TRUE	0.719	130.000	0.062	1.000	Y	NA
5710469	5710470	CJA_2536	CJA_2537			TRUE	0.988	32.000	0.808	NA		NA
5710470	5710471	CJA_2537	CJA_2538			TRUE	0.998	10.000	0.848	NA		NA
5710471	5710472	CJA_2538	CJA_2539		cirA2	TRUE	0.572	91.000	0.038	NA		NA
5710475	5710476	CJA_2542	CJA_2543	metH		FALSE	0.254	85.000	0.000	NA		NA
5710476	5710477	CJA_2543	CJA_2544			FALSE	0.371	40.000	0.000	NA		NA
5710477	5710478	CJA_2544	CJA_2545			FALSE	0.053	181.000	0.000	NA		NA
5710478	5710479	CJA_2545	CJA_2546			TRUE	0.967	2.000	0.043	NA		NA
5710479	5710480	CJA_2546	CJA_2547			FALSE	0.484	27.000	0.000	NA		NA
5710482	5710483	CJA_2549	CJA_2550			FALSE	0.008	685.000	0.000	1.000	N	NA
5710484	5710485	CJA_2551	CJA_2552		serS	TRUE	0.918	14.000	0.031	1.000	N	NA
5710485	5710486	CJA_2552	CJA_2553	serS	crcB	TRUE	0.780	34.000	0.028	1.000	N	NA
5710486	5710487	CJA_2553	CJA_2554	crcB		TRUE	0.884	19.000	0.027	1.000	N	NA
5710487	5710488	CJA_2554	CJA_2555		lolA	TRUE	0.985	7.000	0.167	1.000	N	NA
5710488	5710489	CJA_2555	CJA_2556	lolA	ftsK	TRUE	0.933	73.000	0.305	1.000	N	NA
5710489	5710490	CJA_2556	CJA_2557	ftsK		FALSE	0.270	80.000	0.000	NA		NA
5710491	5710492	CJA_2558	CJA_2559			TRUE	0.972	3.000	0.000	1.000	Y	NA
5710492	5710493	CJA_2559	CJA_2560			TRUE	0.983	26.000	0.167	0.018	Y	NA
5710493	5710494	CJA_2560	CJA_2561		trxB	FALSE	0.130	153.000	0.000	1.000	N	NA
5710495	5710496	CJA_2562	CJA_2563			TRUE	0.998	-3.000	0.761	NA		NA
5710496	5710497	CJA_2563	CJA_2564			TRUE	0.973	67.000	0.683	NA		NA
5710498	5710499	CJA_2565	CJA_2566	aat		TRUE	0.986	25.000	0.285	1.000	Y	NA
5710499	5710500	CJA_2566	CJA_2567		infA	TRUE	0.511	138.000	0.078	1.000	N	NA
5710501	5710502	CJA_2568	CJA_2569	clpA		TRUE	0.969	49.000	0.596	NA		NA
5710506	5710507	CJA_2573	CJA_2574			FALSE	0.157	133.000	0.000	1.000		NA
5710507	5710508	CJA_2574	CJA_2575			TRUE	0.946	10.000	0.035	1.000		NA
5710508	5710509	CJA_2575	CJA_2576		rumA	TRUE	0.655	93.000	0.047	1.000	N	NA
5710509	5710510	CJA_2576	CJA_2577	rumA	cysM	TRUE	0.783	39.000	0.039	1.000	N	NA
5710512	5710513	CJA_2578	CJA_2580	recO	era	TRUE	0.896	30.000	0.109	1.000		NA
5710513	5710514	CJA_2580	CJA_2581	era	rnc	TRUE	0.936	33.000	0.127	0.028		NA
5710514	5710515	CJA_2581	CJA_2582	rnc		TRUE	0.926	-7.000	0.033	NA		NA
5710515	5710516	CJA_2582	CJA_2583		lepB	TRUE	0.694	107.000	0.133	NA		NA
5710516	5710517	CJA_2583	CJA_2584	lepB	lepA	TRUE	0.968	18.000	0.187	1.000	N	NA
5710522	5710523	CJA_2589	CJA_2590	pyrC	rnt	TRUE	0.975	-3.000	0.068	1.000	N	NA
5710523	5710524	CJA_2590	CJA_2591	rnt		FALSE	0.422	33.000	0.000	NA		NA
5710532	5710533	CJA_2599	CJA_2600			TRUE	0.556	22.000	0.000	NA		NA
5710533	5710534	CJA_2600	CJA_2601			FALSE	0.006	519.000	0.000	NA		NA
5710534	5710535	CJA_2601	CJA_2602			FALSE	0.034	209.000	0.000	NA		NA
5710535	5710536	CJA_2602	CJA_2603			TRUE	0.587	20.000	0.000	NA		NA
5710537	5710538	CJA_2604	CJA_2605	fpr	etfA	TRUE	0.970	24.000	0.056	0.031	Y	NA
5710538	5710539	CJA_2605	CJA_2606	etfA		TRUE	0.997	-3.000	0.211	0.010	Y	NA
5710540	5710541	CJA_2607	CJA_2608		etf-QO	TRUE	0.838	-31.000	0.010	1.000	N	NA
5710541	5710542	CJA_2608	CJA_2609	etf-QO		FALSE	0.181	105.000	0.000	NA		NA
5710543	5710544	CJA_2610	CJA_2611	bgl2C	chi18D	FALSE	0.466	162.000	0.000	0.016	Y	NA
5710544	5710545	CJA_2611	CJA_2612	chi18D		FALSE	0.008	656.000	0.000	1.000	N	NA
5710545	5710546	CJA_2612	CJA_2613			FALSE	0.329	55.000	0.000	NA		NA
5710547	5710548	CJA_2614	CJA_2615		cbp2E	FALSE	0.083	153.000	0.000	NA		NA
5710548	5710549	CJA_2615	CJA_2616	cbp2E	cbp2D	TRUE	0.996	27.000	1.000	0.006		NA
5710549	5710550	CJA_2616	CJA_2617	cbp2D		TRUE	0.976	48.000	0.667	NA		NA
5710550	5710551	CJA_2617	CJA_2618		amy13A	FALSE	0.007	452.000	0.000	NA		NA
5710552	5710553	CJA_2619	CJA_2620	wapA		FALSE	0.005	633.000	0.000	NA		NA
5710554	5710555	CJA_2621	CJA_2622			FALSE	0.422	33.000	0.000	NA		NA
5710556	5710557	CJA_2623	CJA_2624		gloA	FALSE	0.030	227.000	0.000	NA	N	NA
5710557	5710558	CJA_2624	CJA_2625	gloA		FALSE	0.191	120.000	0.000	1.000		NA
5710558	5710559	CJA_2625	CJA_2626			FALSE	0.100	141.000	0.000	NA		NA
5710559	5710560	CJA_2626	CJA_2627		ccoS	TRUE	0.991	-3.000	0.266	NA		NA
5710560	5710561	CJA_2627	CJA_2628	ccoS		TRUE	0.997	19.000	0.713	NA	Y	NA
5710561	5710562	CJA_2628	CJA_2629			TRUE	0.990	1.000	0.197	NA		NA
5710562	5710563	CJA_2629	CJA_2630			TRUE	0.780	72.000	0.101	NA		NA
5710563	5710564	CJA_2630	CJA_2631		ccoP	TRUE	0.905	132.000	0.300	1.000	Y	NA
5710564	5710565	CJA_2631	CJA_2632	ccoP		TRUE	0.962	19.000	0.074	0.002		NA
5710565	5710566	CJA_2632	CJA_2633		ccoO	TRUE	0.993	0.000	0.133	0.002		NA
5710566	5710567	CJA_2633	CJA_2634	ccoO	ccoN	TRUE	0.992	11.000	0.200	0.002	N	NA
5710567	5710568	CJA_2634	CJA_2635	ccoN	argG	FALSE	0.022	296.000	0.000	1.000	N	NA
5710568	5710569	CJA_2635	CJA_2636	argG		FALSE	0.015	352.000	0.000	1.000	N	NA
5710569	5710570	CJA_2636	CJA_2637		sbcB	FALSE	0.077	187.000	0.000	1.000	N	NA
5710571	5710572	CJA_2638	CJA_2639			TRUE	0.687	19.000	0.000	1.000		NA
5710573	5710574	CJA_2640	CJA_2641			TRUE	0.528	24.000	0.000	NA		NA
5710574	5710575	CJA_2641	CJA_2642			FALSE	0.024	232.000	0.000	NA		NA
5710577	5710578	CJA_2643	CJA_2645			FALSE	0.142	172.000	0.007	NA		NA
5710578	5710579	CJA_2645	CJA_2646		groL	FALSE	0.035	239.000	0.000	1.000	N	NA
5710579	5710580	CJA_2646	CJA_2647	groL	groES	TRUE	0.962	63.000	0.177	0.075	Y	NA
5710580	5710581	CJA_2647	CJA_2648	groES	fsxA	TRUE	0.741	39.000	0.028	1.000		NA
5710581	5710582	CJA_2648	CJA_2649	fsxA		FALSE	0.411	34.000	0.000	NA		NA
5710584	5710585	CJA_2650	CJA_2652			TRUE	0.781	20.000	0.005	NA		NA
5710585	5710586	CJA_2652	CJA_2653			FALSE	0.371	40.000	0.000	NA		NA
5710586	5710587	CJA_2653	CJA_2654		ampD	TRUE	0.995	11.000	0.249	1.000	Y	NA
5710587	5710588	CJA_2654	CJA_2655	ampD		TRUE	0.882	6.000	0.000	1.000	N	NA
5710589	5710590	CJA_2656	CJA_2657		cbp32B	FALSE	0.016	342.000	0.000	1.000	N	NA
5710593	5710594	CJA_2660	CJA_2661	trpC	trpD	TRUE	0.986	-46.000	0.293	1.000	Y	NA
5710594	5710595	CJA_2661	CJA_2662	trpD	trpG	TRUE	0.857	103.000	0.105	1.000	Y	NA
5710595	5710596	CJA_2662	CJA_2663	trpG	trpE	TRUE	0.998	-3.000	0.230	0.001	Y	NA
5710596	5710597	CJA_2663	CJA_2664	trpE		FALSE	0.021	300.000	0.000	1.000	N	NA
5710597	5710598	CJA_2664	CJA_2665			TRUE	0.877	14.000	0.007	1.000		NA
5710598	5710599	CJA_2665	CJA_2666		rpe	FALSE	0.410	57.000	0.000	1.000		NA
5710601	5710602	CJA_2668	CJA_4119			TRUE	0.546	-34.000	0.000	NA		NA
5710602	5710603	CJA_4119	CJA_2670			TRUE	0.635	17.000	0.000	NA		NA
5710603	5710604	CJA_2670	CJA_2671			TRUE	0.894	61.000	0.184	1.000	N	NA
5710604	5710605	CJA_2671	CJA_2672		glmM	FALSE	0.365	227.000	0.082	1.000	Y	NA
5710605	5710606	CJA_2672	CJA_2673	glmM	folP	TRUE	0.934	52.000	0.260	1.000	N	NA
5710606	5710607	CJA_2673	CJA_2674	folP	ftsH	TRUE	0.938	72.000	0.325	1.000	N	NA
5710607	5710608	CJA_2674	CJA_2675	ftsH	rrmJ	TRUE	0.777	48.000	0.066	NA	N	NA
5710610	5710611	CJA_2677	CJA_2678			TRUE	0.646	-16.000	0.000	NA		NA
5710611	5710612	CJA_2678	CJA_2679		hasR	FALSE	0.384	38.000	0.000	NA		NA
5710612	5710613	CJA_2679	CJA_2680	hasR		FALSE	0.198	189.000	0.000	NA	Y	NA
5710613	5710614	CJA_2680	CJA_2681			FALSE	0.047	199.000	0.000	NA	N	NA
5710615	5710616	CJA_2682	CJA_2683			TRUE	0.857	0.000	0.000	NA		NA
5710616	5710617	CJA_2683	CJA_2684			TRUE	0.828	-3.000	0.000	NA		NA
5710618	5710619	CJA_2685	CJA_2686	greA	carB	TRUE	0.979	16.000	0.241	1.000	N	NA
5710619	5710620	CJA_2686	CJA_2687	carB	carA	TRUE	0.998	12.000	0.345	0.001	Y	NA
5710620	5710621	CJA_2687	CJA_2688	carA	dapB	FALSE	0.077	527.000	0.034	1.000	Y	NA
5710621	5710622	CJA_2688	CJA_2689	dapB	ribA	TRUE	0.832	-7.000	0.000	1.000	N	NA
5710622	5710623	CJA_2689	CJA_2690	ribA		TRUE	0.749	41.000	0.035	1.000		NA
5710623	5710624	CJA_2690	CJA_2691			TRUE	0.666	50.000	0.016	1.000		NA
5710624	5710625	CJA_2691	CJA_2692		thiL	TRUE	0.992	3.000	0.206	1.000	N	NA
5710625	5710626	CJA_2692	CJA_2693	thiL	nusB	TRUE	0.956	27.000	0.225	1.000	N	NA
5710626	5710627	CJA_2693	CJA_2694	nusB	ribH	TRUE	0.920	94.000	0.347	1.000	N	NA
5710627	5710628	CJA_2694	CJA_2695	ribH	ribB/A	TRUE	0.967	20.000	0.003	0.001	Y	NA
5710628	5710629	CJA_2695	CJA_2696	ribB/A	ribE	TRUE	0.859	37.000	0.003	1.000	Y	NA
5710629	5710630	CJA_2696	CJA_2697	ribE		TRUE	0.787	9.000	0.000	NA		NA
5710630	5710631	CJA_2697	CJA_2698		ribD	FALSE	0.254	85.000	0.000	NA		NA
5710631	5710632	CJA_2698	CJA_2699	ribD		TRUE	0.993	4.000	0.277	NA	N	NA
5710632	5710633	CJA_2699	CJA_2700			FALSE	0.343	48.000	0.000	NA		NA
5710633	5710634	CJA_2700	CJA_2701			TRUE	0.896	0.000	0.000	1.000		NA
5710634	5710635	CJA_2701	CJA_2702			FALSE	0.332	53.000	0.000	NA		NA
5710635	5710636	CJA_2702	CJA_2703		glyA	FALSE	0.018	259.000	0.000	NA		NA
5710636	5710637	CJA_2703	CJA_2704	glyA		FALSE	0.345	47.000	0.000	NA		NA
5710639	5710640	CJA_2706	CJA_2707	xyl31A	bgl35A	TRUE	0.981	41.000	0.250	0.036	Y	NA
5710642	5710643	CJA_2709	CJA_2710		afc95A	TRUE	0.932	88.000	0.400	1.000		NA
5710645	5710646	CJA_2712	CJA_2713			FALSE	0.348	46.000	0.000	NA		NA
5710647	5710648	CJA_2714	CJA_2715			FALSE	0.304	67.000	0.000	NA		NA
5710649	5710650	CJA_2716	CJA_2717			TRUE	0.991	2.000	0.222	NA		NA
5710651	5710652	CJA_2718	CJA_2719			TRUE	0.987	78.000	0.719	NA	Y	NA
5710652	5710653	CJA_2719	CJA_2720			TRUE	0.991	73.000	0.797	1.000	Y	NA
5710653	5710654	CJA_2720	CJA_2721			TRUE	0.958	31.000	0.314	NA		NA
5710654	5710655	CJA_2721	CJA_2722			TRUE	0.996	18.000	0.931	NA		NA
5710655	5710656	CJA_2722	CJA_2723			TRUE	0.974	88.000	0.835	NA		NA
5710659	5710660	CJA_2726	CJA_2727		tfpZ	FALSE	0.192	102.000	0.000	NA		NA
5710660	5710661	CJA_2727	CJA_2728	tfpZ	pilA	TRUE	0.501	26.000	0.000	NA		NA
5710661	5710662	CJA_2728	CJA_2729	pilA		TRUE	0.519	106.000	0.000	NA	Y	NA
5710663	5710664	CJA_2730	CJA_2731	pilB	pilC	TRUE	0.998	7.000	0.362	0.013	Y	NA
5710664	5710665	CJA_2731	CJA_2732	pilC	pilD	TRUE	0.982	54.000	0.454	1.000	Y	NA
5710665	5710666	CJA_2732	CJA_2733	pilD	coaE	TRUE	0.972	12.000	0.122	1.000	N	NA
5710666	5710667	CJA_2733	CJA_2734	coaE		TRUE	0.968	0.000	0.033	1.000		NA
5710668	5710669	CJA_2735	CJA_2736			TRUE	0.696	36.000	0.022	NA		NA
5710669	5710670	CJA_2736	CJA_2737			FALSE	0.390	37.000	0.000	NA		NA
5710671	5710672	CJA_2738	CJA_2739	dsbD	aroQ	FALSE	0.017	327.000	0.000	1.000	N	NA
5710672	5710673	CJA_2739	CJA_2740	aroQ	accB	TRUE	0.980	-16.000	0.254	1.000	N	NA
5710673	5710674	CJA_2740	CJA_2741	accB	accC	TRUE	0.984	59.000	0.275	0.001	Y	NA
5710674	5710675	CJA_2741	CJA_2742	accC	prmA	TRUE	0.854	76.000	0.152	1.000	N	NA
5710675	5710676	CJA_2742	CJA_2743	prmA		FALSE	0.038	202.000	0.000	NA		NA
5710676	5710677	CJA_2743	CJA_2744			FALSE	0.024	230.000	0.000	NA		NA
5710677	5710678	CJA_2744	CJA_2745			FALSE	0.022	238.000	0.000	NA		NA
5710678	5710679	CJA_2745	CJA_2746		fis	TRUE	0.987	-3.000	0.161	1.000	N	NA
5710679	5710680	CJA_2746	CJA_2747	fis	purH	TRUE	0.713	103.000	0.101	1.000	N	NA
5710680	5710681	CJA_2747	CJA_2748	purH	purD	TRUE	0.995	10.000	0.238	1.000	Y	NA
5710681	5710682	CJA_2748	CJA_2749	purD		FALSE	0.261	83.000	0.000	NA		NA
5710684	5710685	CJA_2751	CJA_2753			TRUE	0.844	4.000	0.000	NA		NA
5710686	5710687	CJA_2752	CJA_2754			TRUE	0.513	25.000	0.000	NA		NA
5710688	5710689	CJA_2755	CJA_2756			FALSE	0.015	321.000	0.000	1.000		NA
5710689	5710690	CJA_2756	CJA_2757		oadA	TRUE	0.999	14.000	0.720	0.001	Y	NA
5710690	5710691	CJA_2757	CJA_2758	oadA		TRUE	0.999	11.000	0.886	0.001	Y	NA
5710692	5710693	CJA_2759	CJA_2760	glu16F	cel5G	FALSE	0.026	474.000	0.000	0.010		NA
5710693	5710694	CJA_2760	CJA_2761	cel5G		FALSE	0.036	205.000	0.000	NA		NA
5710696	5710697	CJA_2763	CJA_2764	glu16E		FALSE	0.016	292.000	0.000	NA	N	NA
5710697	5710698	CJA_2764	CJA_2765			TRUE	0.991	4.000	0.244	NA		NA
5710698	5710699	CJA_2765	CJA_2766			TRUE	0.978	26.000	0.470	NA		NA
5710700	5710701	CJA_2767	CJA_2768		cysK	FALSE	0.112	134.000	0.000	NA		NA
5710702	5710703	CJA_2769	CJA_2770	abf51A	man26A	FALSE	0.071	184.000	0.000	1.000		NA
5710703	5710704	CJA_2770	CJA_2771	man26A		FALSE	0.025	229.000	0.000	NA		NA
5710705	5710706	CJA_2772	CJA_2774	uxaC		FALSE	0.364	76.000	0.000	1.000		NA
5710707	5710708	CJA_2773	CJA_2775			FALSE	0.295	72.000	0.000	NA		NA
5710708	5710709	CJA_2775	CJA_2776			FALSE	0.118	151.000	0.000	1.000		NA
5710709	5710710	CJA_2776	CJA_2777			TRUE	0.946	62.000	0.333	1.000	N	NA
5710710	5710711	CJA_2777	CJA_2778		phoU	FALSE	0.038	213.000	0.000	NA	N	NA
5710711	5710712	CJA_2778	CJA_2779	phoU	pstB	TRUE	0.990	21.000	0.330	NA	Y	NA
5710712	5710713	CJA_2779	CJA_2780	pstB	pstA	TRUE	0.997	24.000	0.511	0.001	Y	NA
5710713	5710714	CJA_2780	CJA_2781	pstA	pstC	TRUE	0.984	30.000	0.489	0.083		NA
5710714	5710715	CJA_2781	CJA_2782	pstC	pstS	TRUE	0.703	164.000	0.211	0.046		NA
5710715	5710716	CJA_2782	CJA_2783	pstS	sspB	FALSE	0.016	265.000	0.000	NA		NA
5710716	5710717	CJA_2783	CJA_2784	sspB	petB	FALSE	0.189	103.000	0.000	NA		NA
5710717	5710718	CJA_2784	CJA_2785	petB	petA	TRUE	0.998	2.000	0.233	0.001	Y	NA
5710718	5710719	CJA_2785	CJA_2786	petA	rpsI	FALSE	0.065	250.000	0.006	1.000	N	NA
5710719	5710720	CJA_2786	CJA_2787	rpsI	rplM	TRUE	0.998	14.000	0.601	0.010	Y	NA
5710720	5710721	CJA_2787	CJA_2788	rplM		FALSE	0.444	90.000	0.006	NA		NA
5710724	5710725	CJA_2791	CJA_2792		algW	TRUE	0.539	98.000	0.038	NA		NA
5710726	5710727	CJA_2793	CJA_2794		hisD	FALSE	0.360	77.000	0.000	1.000		NA
5710727	5710728	CJA_2794	CJA_2795	hisD	hisG	TRUE	0.803	205.000	0.254	0.003	Y	NA
5710728	5710729	CJA_2795	CJA_2796	hisG	murA	TRUE	0.947	-28.000	0.123	1.000	N	NA
5710729	5710730	CJA_2796	CJA_2797	murA		TRUE	0.926	49.000	0.258	NA	N	NA
5710730	5710731	CJA_2797	CJA_2798			FALSE	0.214	192.000	0.052	NA	N	NA
5710731	5710732	CJA_2798	CJA_2799			FALSE	0.034	208.000	0.000	NA		NA
5710733	5710734	CJA_2800	CJA_2801			TRUE	0.987	25.000	0.598	1.000		NA
5710734	5710735	CJA_2801	CJA_2802			TRUE	0.997	3.000	0.617	NA		NA
5710735	5710736	CJA_2802	CJA_2803			TRUE	0.984	-28.000	0.459	NA		NA
5710736	5710737	CJA_2803	CJA_2804			TRUE	0.983	-43.000	0.543	NA		NA
5710739	5710740	CJA_2806	CJA_2807	rpoN	yfiA	TRUE	0.948	124.000	0.820	NA	N	NA
5710740	5710741	CJA_2807	CJA_2808	yfiA	ptsN	TRUE	0.973	78.000	0.728	NA	N	NA
5710741	5710742	CJA_2808	CJA_2809	ptsN		TRUE	0.976	12.000	0.186	NA		NA
5710742	5710743	CJA_2809	CJA_2810		pstH	TRUE	0.960	-19.000	0.182	NA		NA
5710743	5710744	CJA_2810	CJA_2812	pstH		TRUE	0.584	67.000	0.016	NA		NA
5710745	5710746	CJA_2811	CJA_2813			TRUE	0.932	49.000	0.296	NA		NA
5710746	5710747	CJA_2813	CJA_2814			TRUE	0.995	-3.000	0.417	NA	N	NA
5710747	5710748	CJA_2814	CJA_2815			TRUE	0.949	-45.000	0.206	NA	N	NA
5710748	5710749	CJA_2815	CJA_2816		mreC	TRUE	0.999	0.000	0.550	0.002	Y	NA
5710749	5710750	CJA_2816	CJA_2817	mreC	mreB	TRUE	0.940	122.000	0.689	1.000	N	NA
5710751	5710752	CJA_2818	CJA_2819	gatC	gatA	TRUE	0.992	83.000	0.643	0.001	Y	NA
5710752	5710753	CJA_2819	CJA_2820	gatA	gatB	TRUE	0.998	12.000	0.492	0.001	Y	NA
5710753	5710754	CJA_2820	CJA_2821	gatB		TRUE	0.871	12.000	0.004	NA		NA
5710754	5710755	CJA_2821	CJA_2822			FALSE	0.108	136.000	0.000	NA		NA
5710758	5710759	CJA_2825	CJA_2826			TRUE	0.705	13.000	0.000	NA		NA
5710759	5710760	CJA_2826	CJA_2827		purC	FALSE	0.041	198.000	0.000	NA		NA
5710760	5710761	CJA_2827	CJA_2828	purC		TRUE	0.729	37.000	0.021	1.000		NA
5710761	5710762	CJA_2828	CJA_2829			TRUE	0.954	1.000	0.022	NA		NA
5710762	5710763	CJA_2829	CJA_2830		dapA	TRUE	0.959	23.000	0.088	NA	Y	NA
5710763	5710764	CJA_2830	CJA_2831	dapA	nadA	FALSE	0.210	121.000	0.000	1.000	N	NA
5710764	5710765	CJA_2831	CJA_4122	nadA		FALSE	0.075	160.000	0.000	NA		NA
5710765	5710766	CJA_4122	CJA_4123			FALSE	0.261	83.000	0.000	NA		NA
5710768	5710769	CJA_2835	CJA_2836			TRUE	0.945	37.000	0.270	1.000		NA
5710771	5710772	CJA_2837	CJA_2839	adrA	corA	FALSE	0.034	243.000	0.000	1.000	N	NA
5710772	5710773	CJA_2839	CJA_2840	corA	htrB	FALSE	0.223	117.000	0.000	1.000	N	NA
5710773	5710774	CJA_2840	CJA_2841	htrB		FALSE	0.112	134.000	0.000	NA		NA
5710776	5710777	CJA_2843	CJA_2844			FALSE	0.233	91.000	0.000	NA		NA
5710778	5710779	CJA_2845	CJA_2846	baeS	baeR	TRUE	0.995	22.000	0.591	1.000	Y	NA
5710779	5710780	CJA_2846	CJA_2848	baeR		FALSE	0.262	106.000	0.000	1.000	N	NA
5710781	5710782	CJA_2847	CJA_2849			TRUE	0.486	42.000	0.000	1.000	N	NA
5710782	5710783	CJA_2849	CJA_2850			FALSE	0.196	101.000	0.000	NA		NA
5710783	5710784	CJA_2850	CJA_2851			TRUE	0.787	9.000	0.000	NA		NA
5710785	5710786	CJA_2852	CJA_2853			FALSE	0.468	28.000	0.000	NA		NA
5710786	5710787	CJA_2853	CJA_2854			FALSE	0.301	69.000	0.000	NA		NA
5710787	5710788	CJA_2854	CJA_2855			TRUE	0.828	-3.000	0.000	NA		NA
5710788	5710789	CJA_2855	CJA_2856			FALSE	0.422	33.000	0.000	NA		NA
5710789	5710790	CJA_2856	CJA_2857			FALSE	0.069	166.000	0.000	NA		NA
5710790	5710791	CJA_2857	CJA_2859			FALSE	0.009	498.000	0.000	1.000		NA
5710794	5710795	CJA_2860	CJA_2862			FALSE	0.041	197.000	0.000	NA		NA
5710795	5710796	CJA_2862	CJA_2863			FALSE	0.378	39.000	0.000	NA		NA
5710796	5710797	CJA_2863	CJA_2864			TRUE	0.997	-3.000	0.600	NA		NA
5710797	5710798	CJA_2864	CJA_2865			FALSE	0.219	95.000	0.000	NA		NA
5710800	5710801	CJA_2867	CJA_2868			FALSE	0.257	84.000	0.000	NA		NA
5710801	5710802	CJA_2868	CJA_2869		cbp26A	TRUE	0.963	29.000	0.333	NA		NA
5710804	5710805	CJA_2870	CJA_2872		agd31A	FALSE	0.007	425.000	0.000	NA		NA
5710805	5710806	CJA_2872	CJA_2873	agd31A		FALSE	0.042	226.000	0.000	1.000	N	NA
5710806	5710807	CJA_2873	CJA_2874			FALSE	0.274	104.000	0.000	1.000	N	NA
5710808	5710809	CJA_2875	CJA_2876			FALSE	0.047	189.000	0.000	NA		NA
5710809	5710810	CJA_2876	CJA_2877			FALSE	0.025	274.000	0.000	1.000	N	NA
5710810	5710811	CJA_2877	CJA_2878		argF	TRUE	0.916	48.000	0.074	1.000	Y	NA
5710811	5710812	CJA_2878	CJA_2879	argF		FALSE	0.006	523.000	0.000	NA		NA
5710813	5710814	CJA_2880	CJA_2881			FALSE	0.060	171.000	0.000	NA		NA
5710814	5710815	CJA_2881	CJA_2882			FALSE	0.148	117.000	0.000	NA		NA
5710817	5710818	CJA_2884	CJA_2885	lmt23D		FALSE	0.036	204.000	0.000	NA		NA
5710818	5710819	CJA_2885	CJA_2886			FALSE	0.150	116.000	0.000	NA		NA
5710819	5710820	CJA_2886	CJA_2887		gla67A	FALSE	0.133	151.000	0.000	1.000	N	NA
5710822	5710823	CJA_2889	CJA_2890	axe2B		TRUE	0.828	-3.000	0.000	NA		NA
5710823	5710824	CJA_2890	CJA_2891			TRUE	0.528	24.000	0.000	NA		NA
5710824	5710825	CJA_2891	CJA_2892		ugpQ	FALSE	0.037	236.000	0.000	1.000	N	NA
5710826	5710827	CJA_2893	CJA_2894			TRUE	0.750	-7.000	0.000	NA		NA
5710829	5710830	CJA_2896	CJA_2897	cobT	cobS	TRUE	0.967	27.000	0.049	0.004	Y	NA
5710830	5710831	CJA_2897	CJA_2898	cobS		TRUE	0.851	-3.000	0.000	NA	N	NA
5710831	5710832	CJA_2898	CJA_2900			FALSE	0.446	35.000	0.000	NA	N	NA
5710835	5710836	CJA_2902	CJA_2903		parE	FALSE	0.021	240.000	0.000	NA		NA
5710836	5710837	CJA_2903	CJA_2904	parE		TRUE	0.915	40.000	0.217	NA		NA
5710837	5710838	CJA_2904	CJA_2905		uvs099	TRUE	0.992	11.000	0.427	NA		NA
5710838	5710839	CJA_2905	CJA_2906	uvs099		FALSE	0.152	115.000	0.000	NA		NA
5710839	5710840	CJA_2906	CJA_2907		uvs098	TRUE	0.818	6.000	0.000	NA		NA
5710840	5710841	CJA_2907	CJA_2908	uvs098		TRUE	0.917	97.000	0.443	NA		NA
5710841	5710842	CJA_2908	CJA_2909		thiC	TRUE	0.890	14.000	0.015	1.000		NA
5710842	5710843	CJA_2909	CJA_2910	thiC	thiD	TRUE	0.874	44.000	0.000	0.003	Y	NA
5710843	5710844	CJA_2910	CJA_2911	thiD		FALSE	0.043	225.000	0.000	1.000	N	NA
5710844	5710845	CJA_2911	CJA_2912			FALSE	0.445	162.000	0.000	0.040	Y	NA
5710846	5710847	CJA_2913	CJA_2914	opmH	pel3C	FALSE	0.012	369.000	0.000	1.000		NA
5710848	5710849	CJA_2915	CJA_2916		kdt30A	FALSE	0.051	204.000	0.000	1.000		NA
5710849	5710850	CJA_2916	CJA_2917	kdt30A		TRUE	0.900	4.000	0.000	1.000	N	NA
5710850	5710851	CJA_2917	CJA_2918		argJ	TRUE	0.584	29.000	0.000	1.000	N	NA
5710851	5710852	CJA_2918	CJA_2919	argJ	secA	TRUE	0.742	97.000	0.102	1.000	N	NA
5710852	5710853	CJA_2919	CJA_2920	secA		FALSE	0.332	174.000	0.068	1.000	N	NA
5710853	5710854	CJA_2920	CJA_2921		lpx11A	FALSE	0.115	298.000	0.005	1.000	Y	NA
5710854	5710855	CJA_2921	CJA_2922	lpx11A		FALSE	0.171	108.000	0.000	NA		NA
5710857	5710858	CJA_2923	CJA_2925	ftsZ	ftsA	TRUE	0.982	54.000	0.460	1.000	Y	NA
5710858	5710859	CJA_2925	CJA_2926	ftsA	ftsQ	TRUE	0.956	43.000	0.389	NA	N	NA
5710859	5710860	CJA_2926	CJA_2927	ftsQ		TRUE	0.998	4.000	0.372	NA	Y	NA
5710860	5710861	CJA_2927	CJA_2928		murC	TRUE	0.976	37.000	0.153	0.003	Y	NA
5710861	5710862	CJA_2928	CJA_2929	murC	mur28A	TRUE	0.995	-7.000	0.283	1.000	Y	NA
5710862	5710863	CJA_2929	CJA_2930	mur28A	ftsW	TRUE	0.998	-3.000	0.647	1.000	N	NA
5710863	5710864	CJA_2930	CJA_2931	ftsW	murD	TRUE	0.997	-3.000	0.297	0.003	N	NA
5710864	5710865	CJA_2931	CJA_2932	murD	mraY	TRUE	0.999	5.000	0.647	0.003	Y	NA
5710865	5710866	CJA_2932	CJA_2933	mraY	murF	TRUE	0.999	0.000	0.309	0.003	Y	NA
5710866	5710867	CJA_2933	CJA_2934	murF	murE	TRUE	0.999	-3.000	0.569	0.002	Y	NA
5710867	5710868	CJA_2934	CJA_2935	murE	ftsI	TRUE	0.992	0.000	0.073	1.000	Y	NA
5710868	5710869	CJA_2935	CJA_2936	ftsI		TRUE	0.989	0.000	0.153	1.000	N	NA
5710869	5710870	CJA_2936	CJA_2937		mraW	TRUE	0.913	66.000	0.227	1.000	N	NA
5710870	5710871	CJA_2937	CJA_2938	mraW	mraZ	TRUE	0.996	10.000	0.635	NA		NA
5710871	5710872	CJA_2938	CJA_2939	mraZ		FALSE	0.007	442.000	0.000	NA		NA
5710872	5710873	CJA_2939	CJA_2940		cheB-1	TRUE	0.982	-3.000	0.000	0.017	Y	NA
5710873	5710874	CJA_2940	CJA_2941	cheB-1		TRUE	0.989	16.000	0.211	1.000	Y	NA
5710874	5710875	CJA_2941	CJA_2942			TRUE	0.996	10.000	0.289	1.000	Y	NA
5710875	5710876	CJA_2942	CJA_2943			TRUE	0.744	57.000	0.000	1.000	Y	NA
5710876	5710877	CJA_2943	CJA_2944			TRUE	0.993	46.000	0.600	0.009	Y	NA
5710877	5710878	CJA_2944	CJA_2945		cheA-1	TRUE	0.995	-3.000	0.091	0.009	Y	NA
5710878	5710879	CJA_2945	CJA_2946	cheA-1		TRUE	0.950	13.000	0.091	NA		NA
5710879	5710880	CJA_2946	CJA_2947		cheY-1	TRUE	0.756	11.000	0.000	NA		NA
5710880	5710881	CJA_2947	CJA_2948	cheY-1		TRUE	0.866	72.000	0.041	1.000	Y	NA
5710881	5710882	CJA_2948	CJA_2949			FALSE	0.292	73.000	0.000	NA		NA
5710882	5710883	CJA_2949	CJA_2950		ppc	FALSE	0.150	116.000	0.000	NA		NA
5710883	5710884	CJA_2950	CJA_2951	ppc		FALSE	0.005	998.000	0.000	NA	N	NA
5710884	5710885	CJA_2951	CJA_2952			FALSE	0.422	33.000	0.000	NA		NA
5710885	5710886	CJA_2952	CJA_2953			TRUE	0.828	-3.000	0.000	NA		NA
5710886	5710887	CJA_2953	CJA_2954			FALSE	0.005	586.000	0.000	NA		NA
5710887	5710888	CJA_2954	CJA_2955			FALSE	0.043	224.000	0.000	1.000	N	NA
5710889	5710890	CJA_2956	CJA_2957			TRUE	0.799	143.000	0.400	NA		NA
5710890	5710891	CJA_2957	CJA_2958			FALSE	0.459	29.000	0.000	NA		NA
5710891	5710892	CJA_2958	CJA_2959		cel5F	FALSE	0.019	251.000	0.000	NA		NA
5710894	5710895	CJA_2961	CJA_2962			FALSE	0.073	162.000	0.000	NA		NA
5710897	5710898	CJA_2964	CJA_2965	mpl	rpiB2	FALSE	0.065	198.000	0.000	1.000	N	NA
5710898	5710899	CJA_2965	CJA_2966	rpiB2		FALSE	0.051	214.000	0.000	1.000	N	NA
5710899	5710900	CJA_2966	CJA_2967			TRUE	0.716	19.000	0.000	1.000	N	NA
5710900	5710901	CJA_2967	CJA_2968			FALSE	0.360	43.000	0.000	NA		NA
5710901	5710902	CJA_2968	CJA_2969			TRUE	0.854	3.000	0.000	NA		NA
5710902	5710903	CJA_2969	CJA_2970			TRUE	0.572	21.000	0.000	NA		NA
5710904	5710905	CJA_2971	CJA_2972		acsA	TRUE	0.610	-22.000	0.000	NA		NA
5710905	5710906	CJA_2972	CJA_2973	acsA		FALSE	0.047	189.000	0.000	NA		NA
5710906	5710907	CJA_2973	CJA_2974		panD	FALSE	0.233	91.000	0.000	NA		NA
5710907	5710908	CJA_2974	CJA_2975	panD	panC	TRUE	0.984	33.000	0.342	1.000	Y	NA
5710908	5710909	CJA_2975	CJA_2976	panC		FALSE	0.170	127.000	0.000	1.000		NA
5710910	5710911	CJA_2977	CJA_2979			TRUE	0.989	-7.000	0.326	NA		NA
5710912	5710913	CJA_2978	CJA_2980	dnaB	rplI	TRUE	0.505	138.000	0.074	1.000	N	NA
5710913	5710914	CJA_2980	CJA_2981	rplI	rpsR	TRUE	0.998	15.000	0.499	0.010	Y	NA
5710914	5710915	CJA_2981	CJA_2982	rpsR	rpsF	TRUE	0.999	4.000	0.319	0.010	Y	NA
5710916	5710917	CJA_2983	CJA_2984	cel5B	glu16D	FALSE	0.048	283.000	0.000	0.035		NA
5710917	5710918	CJA_2984	CJA_2985	glu16D	gly16A	FALSE	0.259	161.000	0.000	0.003		NA
5710918	5710919	CJA_2985	CJA_2986	gly16A		FALSE	0.244	88.000	0.000	NA		NA
5710920	5710921	CJA_2987	CJA_2988			FALSE	0.090	147.000	0.000	NA		NA
5710922	5710923	CJA_2989	CJA_2990			TRUE	0.635	17.000	0.000	NA		NA
5710924	5710925	CJA_2991	CJA_2992			FALSE	0.371	40.000	0.000	NA		NA
5710925	5710926	CJA_2992	CJA_2993		chi18C	FALSE	0.070	165.000	0.000	NA		NA
5710926	5710927	CJA_2993	CJA_2994	chi18C		FALSE	0.013	375.000	0.000	1.000	N	NA
5710927	5710928	CJA_2994	CJA_2995			TRUE	0.712	149.000	0.147	0.013	N	NA
5710930	5710931	CJA_2997	CJA_2998	pchC	pksE	TRUE	0.567	31.000	0.000	1.000	N	NA
5710931	5710932	CJA_2998	CJA_2999	pksE	halA	TRUE	0.875	17.000	0.000	0.019	N	NA
5710932	5710933	CJA_2999	CJA_3000	halA		FALSE	0.391	65.000	0.000	1.000		NA
5710933	5710934	CJA_3000	CJA_3001			TRUE	0.955	-3.000	0.000	0.003		NA
5710934	5710935	CJA_3001	CJA_3002			TRUE	0.960	-3.000	0.000	0.002	N	NA
5710935	5710936	CJA_3002	CJA_3003			TRUE	0.934	-7.000	0.000	0.003	N	NA
5710936	5710937	CJA_3003	CJA_3004			TRUE	0.641	127.000	0.000	0.003	Y	NA
5710937	5710938	CJA_3004	CJA_3005			FALSE	0.004	859.000	0.000	NA		NA
5710938	5710939	CJA_3005	CJA_3006			TRUE	0.857	0.000	0.000	NA		NA
5710939	5710940	CJA_3006	CJA_3007		gly43H	FALSE	0.166	110.000	0.000	NA		NA
5710940	5710941	CJA_3007	CJA_3008	gly43H	xyl39A	TRUE	0.818	69.000	0.000	0.035	Y	NA
5710941	5710942	CJA_3008	CJA_3009	xyl39A		TRUE	0.528	24.000	0.000	NA		NA
5710942	5710943	CJA_3009	CJA_3010		cel5D	TRUE	0.857	1.000	0.000	NA		NA
5710943	5710944	CJA_3010	CJA_3011	cel5D		FALSE	0.143	146.000	0.000	1.000	N	NA
5710944	5710945	CJA_3011	CJA_3012		abf43K	FALSE	0.014	348.000	0.000	1.000		NA
5710945	5710946	CJA_3012	CJA_3013	abf43K		TRUE	0.958	25.000	0.222	1.000		NA
5710946	5710947	CJA_3013	CJA_3014			FALSE	0.138	141.000	0.000	1.000		NA
5710947	5710948	CJA_3014	CJA_3015			TRUE	0.789	52.000	0.017	0.030		NA
5710948	5710949	CJA_3015	CJA_3016			TRUE	0.979	19.000	0.132	1.000	Y	NA
5710949	5710950	CJA_3016	CJA_3017		araB	TRUE	0.987	-3.000	0.169	1.000	N	NA
5710950	5710951	CJA_3017	CJA_3018	araB	gly43N	FALSE	0.210	114.000	0.000	1.000		NA
5710952	5710953	CJA_3019	CJA_3020			TRUE	0.979	113.000	0.804	NA	Y	NA
5710953	5710954	CJA_3020	CJA_3021			TRUE	0.996	15.000	0.506	1.000	Y	NA
5710954	5710955	CJA_3021	CJA_3022			TRUE	0.999	-7.000	0.865	0.034	Y	NA
5710955	5710956	CJA_3022	CJA_3023			FALSE	0.097	143.000	0.000	NA		NA
5710956	5710957	CJA_3023	CJA_3024			FALSE	0.055	178.000	0.000	NA		NA
5710959	5710960	CJA_3026	CJA_3027			TRUE	0.688	52.000	0.037	NA		NA
5710960	5710961	CJA_3027	CJA_3028			FALSE	0.433	32.000	0.000	NA		NA
5710961	5710962	CJA_3028	CJA_3029			TRUE	0.587	-28.000	0.000	NA		NA
5710963	5710964	CJA_3030	CJA_3031			FALSE	0.127	126.000	0.000	NA		NA
5710966	5710967	CJA_3033	CJA_3034			FALSE	0.005	1370.000	0.000	1.000		NA
5710968	5710969	CJA_3035	CJA_3037			FALSE	0.003	8878.000	0.000	NA		NA
5710970	5710971	CJA_3036	CJA_3038			FALSE	0.406	59.000	0.000	1.000		NA
5710971	5710972	CJA_3038	CJA_3039			TRUE	0.828	-3.000	0.000	NA		NA
5710972	5710973	CJA_3039	CJA_3040			TRUE	0.995	14.000	0.750	NA		NA
5710973	5710974	CJA_3040	CJA_3041			FALSE	0.233	91.000	0.000	NA		NA
5710974	5710975	CJA_3041	CJA_3042			TRUE	0.962	39.000	0.444	NA		NA
5710975	5710976	CJA_3042	CJA_3043			TRUE	0.972	29.000	0.444	NA		NA
5710976	5710977	CJA_3043	CJA_3044			TRUE	0.987	13.000	0.333	NA		NA
5710977	5710978	CJA_3044	CJA_3045			TRUE	0.980	28.000	0.556	NA		NA
5710978	5710979	CJA_3045	CJA_3046			TRUE	0.998	6.000	1.000	NA		NA
5710979	5710980	CJA_3046	CJA_3047			TRUE	0.993	0.000	0.286	NA		NA
5710980	5710981	CJA_3047	CJA_3048			TRUE	0.699	-12.000	0.000	NA		NA
5710981	5710982	CJA_3048	CJA_3049			TRUE	0.774	10.000	0.000	NA		NA
5710982	5710983	CJA_3049	CJA_3050			TRUE	0.572	21.000	0.000	NA		NA
5710983	5710984	CJA_3050	CJA_3051			TRUE	0.941	104.000	0.636	NA		NA
5710984	5710985	CJA_3051	CJA_3052			TRUE	0.986	-7.000	0.273	NA		NA
5710985	5710986	CJA_3052	CJA_3053			TRUE	0.960	39.000	0.429	NA		NA
5710986	5710987	CJA_3053	CJA_3054			TRUE	0.955	44.000	0.412	NA		NA
5710987	5710988	CJA_3054	CJA_3055			TRUE	0.844	43.000	0.118	NA		NA
5710988	5710989	CJA_3055	CJA_3056			TRUE	0.961	50.000	0.500	NA		NA
5710989	5710990	CJA_3056	CJA_3057			TRUE	0.844	4.000	0.000	NA		NA
5710990	5710991	CJA_3057	CJA_3058			TRUE	0.805	7.000	0.000	NA		NA
5710991	5710992	CJA_3058	CJA_3059			FALSE	0.343	48.000	0.000	NA		NA
5710994	5710995	CJA_3061	CJA_3062	xylA		TRUE	0.966	43.000	0.138	0.034	Y	NA
5710996	5710997	CJA_3063	CJA_3064	nuhA	xylE	FALSE	0.200	117.000	0.000	1.000		NA
5710999	5711000	CJA_3066	CJA_3067	xyn10C	gly43J	TRUE	0.904	29.000	0.000	0.016	Y	NA
5711000	5711001	CJA_3067	CJA_3068	gly43J		TRUE	0.623	-19.000	0.000	NA		NA
5711001	5711002	CJA_3068	CJA_3069		rspA	FALSE	0.459	29.000	0.000	NA		NA
5711002	5711003	CJA_3069	CJA_3070	rspA	gly43G	FALSE	0.404	60.000	0.000	1.000		NA
5711003	5711004	CJA_3070	CJA_3071	gly43G		FALSE	0.033	210.000	0.000	NA		NA
5711005	5711006	CJA_3072	CJA_3073		purA	FALSE	0.017	306.000	0.000	1.000		NA
5711006	5711007	CJA_3073	CJA_3074	purA	hisZ	TRUE	0.984	8.000	0.161	1.000	N	NA
5711007	5711008	CJA_3074	CJA_3075	hisZ		TRUE	0.977	6.000	0.117	NA		NA
5711008	5711009	CJA_3075	CJA_3076		hflC	TRUE	0.886	103.000	0.348	NA		NA
5711009	5711010	CJA_3076	CJA_3077	hflC	hflK	TRUE	1.000	0.000	0.947	0.008	Y	NA
5711010	5711011	CJA_3077	CJA_3078	hflK		TRUE	0.959	28.000	0.184	0.040		NA
5711011	5711012	CJA_3078	CJA_3079		hfq	TRUE	0.902	34.000	0.141	1.000		NA
5711012	5711013	CJA_3079	CJA_3080	hfq	miaA	TRUE	0.902	123.000	0.531	1.000		NA
5711013	5711014	CJA_3080	CJA_3081	miaA	mutL	TRUE	0.993	4.000	0.188	0.072	N	NA
5711014	5711015	CJA_3081	CJA_3082	mutL		TRUE	0.962	-3.000	0.030	1.000	N	NA
5711015	5711016	CJA_3082	CJA_3083			FALSE	0.233	91.000	0.000	NA		NA
5711016	5711017	CJA_3083	CJA_3084			FALSE	0.301	69.000	0.000	NA		NA
5711017	5711018	CJA_3084	CJA_3085			TRUE	0.830	5.000	0.000	NA		NA
5711018	5711019	CJA_3085	CJA_3086			FALSE	0.043	195.000	0.000	NA		NA
5711019	5711020	CJA_3086	CJA_3087			TRUE	0.971	10.000	0.118	NA		NA
5711021	5711022	CJA_3088	CJA_3089			TRUE	0.998	-3.000	0.833	NA		NA
5711022	5711023	CJA_3089	CJA_3091			TRUE	0.527	-37.000	0.000	NA		NA
5711024	5711025	CJA_3090	CJA_3092			FALSE	0.200	100.000	0.000	NA		NA
5711026	5711027	CJA_3093	CJA_3094			FALSE	0.098	142.000	0.000	NA		NA
5711027	5711028	CJA_3094	CJA_3095			TRUE	0.946	31.000	0.250	NA		NA
5711028	5711029	CJA_3095	CJA_3096			TRUE	0.989	11.000	0.312	NA		NA
5711029	5711030	CJA_3096	CJA_3097			FALSE	0.004	834.000	0.000	NA		NA
5711030	5711031	CJA_3097	CJA_3098			FALSE	0.177	106.000	0.000	NA		NA
5711031	5711032	CJA_3098	CJA_3099		gnd	FALSE	0.018	299.000	0.000	1.000		NA
5711032	5711033	CJA_3099	CJA_3100	gnd		FALSE	0.004	1352.000	0.000	NA		NA
5711033	5711034	CJA_3100	CJA_3101			FALSE	0.384	38.000	0.000	NA		NA
5711034	5711035	CJA_3101	CJA_3102			TRUE	0.885	36.000	0.133	NA	N	NA
5711035	5711036	CJA_3102	CJA_3103		ce2C	FALSE	0.360	43.000	0.000	NA		NA
5711037	5711038	CJA_3104	CJA_3105	pel10A		FALSE	0.006	553.000	0.000	NA		NA
5711039	5711040	CJA_3106	CJA_3107	cbp2B	cbp2C	FALSE	0.292	146.000	0.000	0.006		NA
5711041	5711042	CJA_3108	CJA_3109			TRUE	0.646	-16.000	0.000	NA		NA
5711046	5711047	CJA_3113	CJA_3114			FALSE	0.192	102.000	0.000	NA		NA
5711047	5711048	CJA_3114	CJA_3115			FALSE	0.332	53.000	0.000	NA		NA
5711048	5711049	CJA_3115	CJA_3116		pme8B	TRUE	0.854	67.000	0.143	1.000		NA
5711049	5711050	CJA_3116	CJA_3117	pme8B	orn	FALSE	0.022	276.000	0.000	1.000		NA
5711051	5711052	CJA_3118	CJA_3119		rhdA	TRUE	0.734	31.000	0.009	1.000		NA
5711053	5711054	CJA_3120	CJA_3121	pel1G		FALSE	0.029	217.000	0.000	NA		NA
5711054	5711055	CJA_3121	CJA_3122			TRUE	0.646	-16.000	0.000	NA		NA
5711056	5711057	CJA_3123	CJA_3124			TRUE	0.987	-37.000	0.625	NA		NA
5711057	5711058	CJA_3124	CJA_3125		acm73A	TRUE	0.778	34.000	0.045	NA		NA
5711058	5711059	CJA_3125	CJA_3126	acm73A	amy13I	FALSE	0.014	347.000	0.000	1.000		NA
5711060	5711061	CJA_3127	CJA_3128	pda4D		FALSE	0.285	76.000	0.000	NA		NA
5711062	5711063	CJA_3129	CJA_3130			TRUE	0.486	-97.000	0.000	NA		NA
5711064	5711065	CJA_3131	CJA_3132		parC	FALSE	0.177	106.000	0.000	NA		NA
5711065	5711066	CJA_3132	CJA_3133	parC		FALSE	0.373	73.000	0.000	1.000		NA
5711068	5711069	CJA_3134	CJA_3136			FALSE	0.338	50.000	0.000	NA		NA
5711069	5711070	CJA_3136	CJA_3137		glob1	TRUE	0.750	-7.000	0.000	NA		NA
5711070	5711071	CJA_3137	CJA_3138	glob1		FALSE	0.323	58.000	0.000	NA		NA
5711071	5711072	CJA_3138	CJA_3139		cbp33/10B	FALSE	0.254	85.000	0.000	NA		NA
5711074	5711075	CJA_3141	CJA_3142			TRUE	0.705	13.000	0.000	NA		NA
5711075	5711076	CJA_3142	CJA_3143			TRUE	0.513	25.000	0.000	NA		NA
5711076	5711077	CJA_3143	CJA_3144		hemE	FALSE	0.039	211.000	0.000	NA	N	NA
5711077	5711078	CJA_3144	CJA_3145	hemE		FALSE	0.317	95.000	0.000	1.000	N	NA
5711078	5711079	CJA_3145	CJA_3146		gltD	FALSE	0.451	53.000	0.000	1.000	N	NA
5711079	5711080	CJA_3146	CJA_3147	gltD		TRUE	0.991	23.000	0.214	0.001	Y	NA
5711080	5711081	CJA_3147	CJA_3148			FALSE	0.018	257.000	0.000	NA		NA
5711083	5711084	CJA_3150	CJA_3151			TRUE	0.513	25.000	0.000	NA		NA
5711085	5711086	CJA_3152	CJA_3153			TRUE	0.502	-46.000	0.000	NA		NA
5711088	5711089	CJA_3155	CJA_3156		gt39A	FALSE	0.442	31.000	0.000	NA		NA
5711089	5711090	CJA_3156	CJA_3157	gt39A		TRUE	0.854	3.000	0.000	NA		NA
5711091	5711092	CJA_3158	CJA_3159			TRUE	0.944	47.000	0.139	1.000	Y	NA
5711092	5711093	CJA_3159	CJA_3160			FALSE	0.199	165.000	0.000	0.080	N	NA
5711093	5711094	CJA_3160	CJA_3161		pul13B	FALSE	0.397	76.000	0.000	1.000	N	NA
5711094	5711095	CJA_3161	CJA_3162	pul13B		FALSE	0.007	452.000	0.000	NA		NA
5711095	5711096	CJA_3162	CJA_3163			TRUE	0.828	-3.000	0.000	NA		NA
5711096	5711097	CJA_3163	CJA_3164			FALSE	0.383	69.000	0.000	1.000		NA
5711097	5711098	CJA_3164	CJA_3165			FALSE	0.148	117.000	0.000	NA		NA
5711098	5711099	CJA_3165	CJA_3166			FALSE	0.224	93.000	0.000	NA		NA
5711099	5711100	CJA_3166	CJA_3167			FALSE	0.163	111.000	0.000	NA		NA
5711101	5711102	CJA_3168	CJA_3169			FALSE	0.304	67.000	0.000	NA		NA
5711102	5711103	CJA_3169	CJA_3170			FALSE	0.119	160.000	0.000	1.000	N	NA
5711103	5711104	CJA_3170	CJA_3171		phnA	FALSE	0.244	111.000	0.000	1.000	N	NA
5711105	5711106	CJA_3172	CJA_3173			TRUE	0.857	1.000	0.000	NA		NA
5711106	5711107	CJA_3173	CJA_3174			TRUE	0.575	92.000	0.000	0.002		NA
5711109	5711110	CJA_3176	CJA_3177			FALSE	0.066	189.000	0.000	1.000		NA
5711110	5711111	CJA_3177	CJA_3178			TRUE	0.973	0.000	0.000	1.000	Y	NA
5711111	5711112	CJA_3178	CJA_3179			FALSE	0.074	161.000	0.000	NA		NA
5711112	5711113	CJA_3179	CJA_3180			FALSE	0.320	60.000	0.000	NA		NA
5711113	5711114	CJA_3180	CJA_3181			FALSE	0.030	216.000	0.000	NA		NA
5711114	5711115	CJA_3181	CJA_3182			FALSE	0.018	256.000	0.000	NA		NA
5711117	5711118	CJA_3184	CJA_3185			FALSE	0.026	784.000	0.000	1.000	Y	NA
5711119	5711120	CJA_3186	CJA_3187	int		FALSE	0.268	105.000	0.000	1.000	N	NA
5711120	5711121	CJA_3187	CJA_3188			TRUE	0.974	-3.000	0.062	1.000	N	NA
5711121	5711122	CJA_3188	CJA_3189			TRUE	0.980	-15.000	0.119	NA	Y	NA
5711122	5711123	CJA_3189	CJA_3190			TRUE	0.999	-3.000	0.743	NA	Y	NA
5711123	5711124	CJA_3190	CJA_3191			TRUE	0.828	-3.000	0.000	NA		NA
5711124	5711125	CJA_3191	CJA_3192		qacG	FALSE	0.387	67.000	0.000	1.000		NA
5711125	5711126	CJA_3192	CJA_3193	qacG		FALSE	0.061	195.000	0.000	1.000		NA
5711127	5711128	CJA_3194	CJA_3195	clpB		FALSE	0.264	82.000	0.000	NA		NA
5711128	5711129	CJA_3195	CJA_3196			FALSE	0.459	29.000	0.000	NA		NA
5711129	5711130	CJA_3196	CJA_3197		gt1C	TRUE	0.907	3.000	0.000	1.000	N	NA
5711130	5711131	CJA_3197	CJA_3198	gt1C	mxaD	TRUE	0.649	24.000	0.000	1.000	N	NA
5711134	5711135	CJA_3201	CJA_3202			FALSE	0.105	138.000	0.000	NA		NA
5711135	5711136	CJA_3202	CJA_3203			FALSE	0.079	156.000	0.000	NA		NA
5711137	5711138	CJA_3204	CJA_3205			TRUE	0.983	6.000	0.168	NA		NA
5711141	5711142	CJA_3208	CJA_3209	pilS	pilR	TRUE	0.996	24.000	0.556	0.071	Y	NA
5711143	5711144	CJA_3210	CJA_3211			TRUE	0.968	1.000	0.000	NA	Y	NA
5711144	5711145	CJA_3211	CJA_3212		pilW	FALSE	0.005	622.000	0.000	NA		NA
5711147	5711148	CJA_3214	CJA_3215	ispH		TRUE	0.958	3.000	0.009	1.000	N	NA
5711148	5711149	CJA_3215	CJA_3216		lspA	TRUE	0.872	-22.000	0.017	1.000	N	NA
5711149	5711150	CJA_3216	CJA_3217	lspA	ileS	TRUE	0.978	11.000	0.147	1.000	N	NA
5711150	5711151	CJA_3217	CJA_3218	ileS	ribF	TRUE	0.992	-3.000	0.254	1.000	N	NA
5711151	5711152	CJA_3218	CJA_3219	ribF	mviN	TRUE	0.865	72.000	0.169	1.000		NA
5711153	5711154	CJA_3220	CJA_3221			FALSE	0.008	399.000	0.000	NA		NA
5711155	5711156	CJA_3222	CJA_3223			FALSE	0.384	38.000	0.000	NA		NA
5711157	5711158	CJA_3224	CJA_3225			FALSE	0.173	134.000	0.000	1.000	N	NA
5711158	5711159	CJA_3225	CJA_3226		qxtA	TRUE	0.954	54.000	0.364	1.000	N	NA
5711159	5711160	CJA_3226	CJA_3227	qxtA		TRUE	0.999	10.000	0.886	0.029	Y	NA
5711161	5711162	CJA_3228	CJA_3229			FALSE	0.004	1041.000	0.000	NA		NA
5711162	5711163	CJA_3229	CJA_3230			FALSE	0.278	78.000	0.000	NA		NA
5711165	5711166	CJA_3231	CJA_3233			TRUE	0.745	80.000	0.071	1.000		NA
5711166	5711167	CJA_3233	CJA_3234			FALSE	0.218	166.000	0.000	0.033	N	NA
5711167	5711168	CJA_3234	CJA_3235			TRUE	0.572	21.000	0.000	NA		NA
5711168	5711169	CJA_3235	CJA_3236		ectC	FALSE	0.200	100.000	0.000	NA		NA
5711169	5711170	CJA_3236	CJA_3237	ectC	ectB	TRUE	0.990	19.000	0.572	1.000		NA
5711170	5711171	CJA_3237	CJA_3238	ectB		TRUE	0.970	130.000	0.793	0.000		NA
5711172	5711173	CJA_3239	CJA_3240			FALSE	0.340	49.000	0.000	NA		NA
5711174	5711175	CJA_3241	CJA_3242			FALSE	0.247	87.000	0.000	NA		NA
5711175	5711176	CJA_3242	CJA_3243			FALSE	0.108	157.000	0.000	1.000		NA
5711176	5711177	CJA_3243	CJA_3244			TRUE	0.916	52.000	0.222	1.000		NA
5711177	5711178	CJA_3244	CJA_3245			FALSE	0.273	79.000	0.000	NA		NA
5711178	5711179	CJA_3245	CJA_3246			FALSE	0.009	359.000	0.000	NA		NA
5711179	5711180	CJA_3246	CJA_3247		amy13H	FALSE	0.009	545.000	0.000	1.000	N	NA
5711182	5711183	CJA_3249	CJA_3250	cgl13A		FALSE	0.393	77.000	0.000	1.000	N	NA
5711183	5711184	CJA_3250	CJA_3251			TRUE	0.962	7.000	0.056	NA	N	NA
5711184	5711185	CJA_3251	CJA_3252		pbg4A	TRUE	0.918	33.000	0.182	NA	N	NA
5711185	5711186	CJA_3252	CJA_3253	pbg4A		TRUE	0.938	-7.000	0.000	NA	Y	NA
5711186	5711187	CJA_3253	CJA_3254		glgC	TRUE	0.923	13.000	0.000	NA	Y	NA
5711187	5711188	CJA_3254	CJA_3255	glgC	gt5B	TRUE	0.965	13.000	0.000	0.012	Y	NA
5711188	5711189	CJA_3255	CJA_3256	gt5B		FALSE	0.405	138.000	0.059	NA		NA
5711189	5711190	CJA_3256	CJA_3257			TRUE	0.966	-3.000	0.061	NA		NA
5711190	5711191	CJA_3257	CJA_3258			TRUE	0.851	-3.000	0.000	NA	N	NA
5711191	5711192	CJA_3258	CJA_3259			TRUE	0.528	24.000	0.000	NA		NA
5711192	5711193	CJA_3259	CJA_3260			FALSE	0.228	92.000	0.000	NA		NA
5711193	5711194	CJA_3260	CJA_3261			TRUE	0.991	-3.000	0.021	0.005	Y	NA
5711194	5711195	CJA_3261	CJA_3262			TRUE	0.851	-3.000	0.000	NA	N	NA
5711197	5711198	CJA_3264	CJA_3265			FALSE	0.196	118.000	0.000	1.000		NA
5711198	5711199	CJA_3265	CJA_3266			TRUE	0.981	-13.000	0.270	NA		NA
5711199	5711200	CJA_3266	CJA_3267			TRUE	0.987	-3.000	0.189	NA		NA
5711204	5711205	CJA_3270	CJA_3272			TRUE	0.541	23.000	0.000	NA		NA
5711205	5711206	CJA_3272	CJA_3273			FALSE	0.005	718.000	0.000	NA		NA
5711207	5711208	CJA_3274	CJA_3275			TRUE	0.998	2.000	0.643	NA		NA
5711208	5711209	CJA_3275	CJA_3276			TRUE	0.990	21.000	0.643	NA		NA
5711209	5711210	CJA_3276	CJA_3277			FALSE	0.105	138.000	0.000	NA		NA
5711210	5711211	CJA_3277	CJA_3278			FALSE	0.024	231.000	0.000	NA		NA
5711211	5711212	CJA_3278	CJA_3279		xyn5A	FALSE	0.019	308.000	0.000	1.000	N	NA
5711212	5711213	CJA_3279	CJA_3280	xyn5A	xyn10B	FALSE	0.160	203.000	0.000	0.002	N	NA
5711213	5711214	CJA_3280	CJA_3281	xyn10B	abf62A	FALSE	0.373	126.000	0.000	0.006		NA
5711214	5711215	CJA_3281	CJA_3282	abf62A	fee1B	FALSE	0.285	149.000	0.000	0.006		NA
5711215	5711216	CJA_3282	CJA_3283	fee1B		FALSE	0.273	79.000	0.000	NA		NA
5711216	5711217	CJA_3283	CJA_3284			FALSE	0.079	156.000	0.000	NA		NA
5711217	5711218	CJA_3284	CJA_3285			FALSE	0.021	241.000	0.000	NA		NA
5711218	5711219	CJA_3285	CJA_3286		ebg98	FALSE	0.073	162.000	0.000	NA		NA
5711219	5711220	CJA_3286	CJA_3287	ebg98	fee1A	TRUE	0.565	89.000	0.000	0.006		NA
5711221	5711222	CJA_3288	CJA_3289	xerC		TRUE	0.991	22.000	0.714	NA		NA
5711222	5711223	CJA_3289	CJA_3290		dapF	TRUE	0.977	11.000	0.175	NA		NA
5711223	5711224	CJA_3290	CJA_3291	dapF	lysA	TRUE	0.987	20.000	0.104	0.001	Y	NA
5711224	5711225	CJA_3291	CJA_3292	lysA		TRUE	0.783	45.000	0.071	NA		NA
5711225	5711226	CJA_3292	CJA_3293			FALSE	0.371	40.000	0.000	NA		NA
5711227	5711228	CJA_3294	CJA_3295			TRUE	0.985	-3.000	0.176	NA		NA
5711231	5711232	CJA_3298	CJA_3299			TRUE	0.837	11.000	0.000	1.000	N	NA
5711234	5711235	CJA_3301	CJA_3302			TRUE	0.828	-3.000	0.000	NA		NA
5711235	5711236	CJA_3302	CJA_3303			TRUE	0.828	-3.000	0.000	NA		NA
5711237	5711238	CJA_3304	CJA_3305		glu5A	FALSE	0.236	106.000	0.000	1.000		NA
5711238	5711239	CJA_3305	CJA_3306	glu5A	gly30A	FALSE	0.214	167.000	0.000	0.015		NA
5711242	5711243	CJA_3309	CJA_3310			FALSE	0.004	1433.000	0.000	NA	N	NA
5711243	5711244	CJA_3310	CJA_3311			FALSE	0.185	104.000	0.000	NA		NA
5711244	5711245	CJA_3311	CJA_3312			FALSE	0.115	133.000	0.000	NA		NA
5711245	5711246	CJA_3312	CJA_3313			TRUE	0.999	2.000	0.667	0.078		NA
5711246	5711247	CJA_3313	CJA_3314			TRUE	0.998	-3.000	0.500	0.033		NA
5711247	5711248	CJA_3314	CJA_3315		aglR	TRUE	0.972	57.000	0.444	0.044		NA
5711248	5711249	CJA_3315	CJA_3316	aglR		FALSE	0.422	33.000	0.000	NA		NA
5711249	5711250	CJA_3316	CJA_3317			TRUE	0.715	-10.000	0.000	NA		NA
5711250	5711251	CJA_3317	CJA_3318			TRUE	0.894	-13.000	0.000	0.011		NA
5711251	5711252	CJA_3318	CJA_3319			TRUE	0.950	-3.000	0.000	0.011		NA
5711252	5711253	CJA_3319	CJA_3320			TRUE	0.857	0.000	0.000	NA		NA
5711253	5711254	CJA_3320	CJA_3321			FALSE	0.011	326.000	0.000	NA		NA
5711254	5711255	CJA_3321	CJA_3322			TRUE	0.690	53.000	0.025	1.000		NA
5711255	5711256	CJA_3322	CJA_3323		gspM	TRUE	0.559	279.000	0.649	1.000		NA
5711256	5711257	CJA_3323	CJA_3324	gspM	gspL	TRUE	0.999	11.000	0.811	1.000	Y	NA
5711257	5711258	CJA_3324	CJA_3325	gspL	gspK	TRUE	0.983	95.000	0.537	0.039	Y	NA
5711258	5711259	CJA_3325	CJA_3326	gspK	gspJ	TRUE	0.993	-31.000	0.461	1.000	Y	NA
5711259	5711260	CJA_3326	CJA_3327	gspJ	gspI	TRUE	0.980	-19.000	0.042	0.003	Y	NA
5711260	5711261	CJA_3327	CJA_3328	gspI	gspH	TRUE	0.967	0.000	0.044	NA		NA
5711261	5711262	CJA_3328	CJA_3329	gspH	gspG	TRUE	0.976	-46.000	0.425	NA		NA
5711262	5711263	CJA_3329	CJA_3330	gspG	gspF	TRUE	0.995	37.000	0.599	0.003	Y	NA
5711263	5711264	CJA_3330	CJA_3331	gspF	gspE	TRUE	0.998	16.000	0.653	0.003	Y	NA
5711264	5711265	CJA_3331	CJA_3332	gspE	gspD	TRUE	1.000	4.000	0.776	0.003	Y	NA
5711265	5711266	CJA_3332	CJA_3333	gspD	gspC	TRUE	0.998	16.000	0.575	0.003	Y	NA
5711267	5711268	CJA_3334	CJA_3335	xseB	ispA	TRUE	0.988	-3.000	0.177	1.000	N	NA
5711268	5711269	CJA_3335	CJA_3336	ispA	dxs	TRUE	0.927	105.000	0.246	1.000	Y	NA
5711272	5711273	CJA_3339	CJA_3340	cae1C	adhC	TRUE	0.965	16.000	0.167	1.000		NA
5711275	5711276	CJA_3342	CJA_3343	nupG		FALSE	0.090	168.000	0.000	1.000		NA
5711276	5711277	CJA_3343	CJA_3344			TRUE	0.979	3.000	0.093	NA		NA
5711277	5711278	CJA_3344	CJA_3345			FALSE	0.052	182.000	0.000	NA		NA
5711278	5711279	CJA_3345	CJA_3346		dnaJ	FALSE	0.055	178.000	0.000	NA		NA
5711279	5711280	CJA_3346	CJA_3347	dnaJ	dnaK	TRUE	0.945	120.000	0.236	0.002	Y	NA
5711280	5711281	CJA_3347	CJA_3348	dnaK	grpE	TRUE	0.640	178.000	0.049	0.006	Y	NA
5711282	5711283	CJA_3349	CJA_3350			FALSE	0.200	100.000	0.000	NA		NA
5711283	5711284	CJA_3350	CJA_3351		recN	FALSE	0.380	80.000	0.000	1.000	N	NA
5711288	5711289	CJA_3355	CJA_3357			TRUE	0.564	106.000	0.000	1.000	Y	NA
5711290	5711291	CJA_3356	CJA_3358			TRUE	0.982	-3.000	0.000	0.020	Y	NA
5711291	5711292	CJA_3358	CJA_3359			TRUE	0.684	114.000	0.000	0.009	Y	NA
5711292	5711293	CJA_3359	CJA_3360			FALSE	0.097	143.000	0.000	NA		NA
5711293	5711294	CJA_3360	CJA_3361			TRUE	0.876	27.000	0.086	NA		NA
5711296	5711297	CJA_3363	CJA_3364			FALSE	0.145	118.000	0.000	NA		NA
5711298	5711299	CJA_3365	CJA_3366			FALSE	0.356	78.000	0.000	1.000		NA
5711299	5711300	CJA_3366	CJA_3367			FALSE	0.041	198.000	0.000	NA		NA
5711300	5711301	CJA_3367	CJA_3368			FALSE	0.299	70.000	0.000	NA		NA
5711302	5711303	CJA_3369	CJA_3370	cel5C		FALSE	0.163	111.000	0.000	NA		NA
5711303	5711304	CJA_3370	CJA_3371			TRUE	0.986	-36.000	0.575	NA		NA
5711305	5711306	CJA_3372	CJA_3373			TRUE	0.572	21.000	0.000	NA		NA
5711306	5711307	CJA_3373	CJA_3374			TRUE	0.830	5.000	0.000	NA		NA
5711307	5711308	CJA_3374	CJA_3375			FALSE	0.181	105.000	0.000	NA		NA
5711308	5711309	CJA_3375	CJA_3376			FALSE	0.067	197.000	0.000	1.000	N	NA
5711310	5711311	CJA_3377	CJA_3378	rnk		FALSE	0.076	159.000	0.000	NA		NA
5711311	5711312	CJA_3378	CJA_3379			FALSE	0.397	36.000	0.000	NA		NA
5711312	5711313	CJA_3379	CJA_3380			TRUE	0.698	34.000	0.000	0.078	N	NA
5711313	5711314	CJA_3380	CJA_3381			TRUE	0.854	3.000	0.000	NA		NA
5711314	5711315	CJA_3381	CJA_3382		gt51B	FALSE	0.196	101.000	0.000	NA		NA
5711315	5711316	CJA_3382	CJA_3383	gt51B		TRUE	0.900	4.000	0.000	1.000	N	NA
5711316	5711317	CJA_3383	CJA_3384			TRUE	0.999	0.000	0.765	1.000	Y	NA
5711317	5711318	CJA_3384	CJA_3385		hemD	TRUE	0.998	-6.000	0.600	1.000	Y	NA
5711318	5711319	CJA_3385	CJA_3386	hemD	hemC	TRUE	0.998	-3.000	0.205	0.001	Y	NA
5711319	5711320	CJA_3386	CJA_3387	hemC		FALSE	0.219	118.000	0.000	1.000	N	NA
5711320	5711321	CJA_3387	CJA_3388			FALSE	0.155	114.000	0.000	NA		NA
5711321	5711322	CJA_3388	CJA_3389			TRUE	0.805	7.000	0.000	NA		NA
5711322	5711323	CJA_3389	CJA_3390			FALSE	0.008	401.000	0.000	NA		NA
5711323	5711324	CJA_3390	CJA_3391			FALSE	0.257	183.000	0.043	1.000	N	NA
5711324	5711325	CJA_3391	CJA_3392			TRUE	0.915	32.000	0.139	1.000	N	NA
5711326	5711327	CJA_3393	CJA_3394			TRUE	0.930	15.000	0.074	NA		NA
5711331	5711332	CJA_3398	CJA_3399	prsK	prsR	TRUE	0.999	-3.000	0.693	0.070	Y	NA
5711336	5711337	CJA_3403	CJA_3404			FALSE	0.034	209.000	0.000	NA		NA
5711337	5711338	CJA_3404	CJA_3405		gt2M	TRUE	0.756	11.000	0.000	NA		NA
5711338	5711339	CJA_3405	CJA_3406	gt2M	cAPK	TRUE	0.906	12.000	0.016	NA	N	NA
5711339	5711340	CJA_3406	CJA_3407	cAPK	gt2I	TRUE	0.950	-12.000	0.095	NA		NA
5711340	5711341	CJA_3407	CJA_3408	gt2I	pda4E	TRUE	0.857	1.000	0.000	NA		NA
5711341	5711342	CJA_3408	CJA_3409	pda4E		FALSE	0.424	50.000	0.000	1.000		NA
5711342	5711343	CJA_3409	CJA_3410		gt4B	TRUE	0.874	-3.000	0.000	1.000		NA
5711343	5711344	CJA_3410	CJA_3411	gt4B	gt4A	TRUE	0.948	79.000	0.120	0.012	Y	NA
5711344	5711345	CJA_3411	CJA_3412	gt4A		TRUE	0.828	-3.000	0.000	NA		NA
5711345	5711346	CJA_3412	CJA_3413			FALSE	0.312	63.000	0.000	NA		NA
5711346	5711347	CJA_3413	CJA_3414			FALSE	0.139	121.000	0.000	NA		NA
5711348	5711349	CJA_3415	CJA_3416		gt2L	TRUE	0.715	-10.000	0.000	NA		NA
5711349	5711350	CJA_3416	CJA_3417	gt2L		TRUE	0.844	4.000	0.000	NA		NA
5711350	5711351	CJA_3417	CJA_3418			TRUE	0.828	-3.000	0.000	NA		NA
5711351	5711352	CJA_3418	CJA_3419			TRUE	0.705	13.000	0.000	NA		NA
5711352	5711353	CJA_3419	CJA_3420			FALSE	0.443	44.000	0.000	1.000		NA
5711355	5711356	CJA_3422	CJA_3423			TRUE	0.965	10.000	0.083	NA	N	NA
5711356	5711357	CJA_3423	CJA_3424			TRUE	0.991	63.000	0.633	0.078	Y	NA
5711357	5711358	CJA_3424	CJA_3425		lthA	TRUE	0.943	61.000	0.185	NA	Y	NA
5711359	5711360	CJA_3426	CJA_3427			TRUE	0.962	19.000	0.046	1.000	Y	NA
5711360	5711361	CJA_3427	CJA_3428		pda4C	FALSE	0.408	58.000	0.000	1.000		NA
5711361	5711362	CJA_3428	CJA_4146	pda4C		FALSE	0.267	81.000	0.000	NA		NA
5711362	5711363	CJA_4146	CJA_3430			FALSE	0.004	812.000	0.000	NA		NA
5711365	5711366	CJA_3432	CJA_3433			TRUE	0.995	2.000	0.357	NA		NA
5711366	5711367	CJA_3433	CJA_3434			FALSE	0.006	1458.000	0.000	1.000	N	NA
5711367	5711368	CJA_3434	CJA_3435		rfbB	TRUE	0.827	31.000	0.000	1.000	Y	NA
5711368	5711369	CJA_3435	CJA_3436	rfbB	rfbA	TRUE	0.939	23.000	0.000	0.002	Y	NA
5711369	5711370	CJA_3436	CJA_3437	rfbA	rfbD	TRUE	0.984	-3.000	0.000	0.002	Y	NA
5711370	5711371	CJA_3437	CJA_3438	rfbD	rfbC	TRUE	0.986	9.000	0.067	1.000	Y	NA
5711371	5711372	CJA_3438	CJA_3439	rfbC	wzm	TRUE	0.902	19.000	0.000	1.000	Y	NA
5711372	5711373	CJA_3439	CJA_3440	wzm	wzt	TRUE	0.999	-3.000	0.667	0.069	Y	NA
5711373	5711374	CJA_3440	CJA_3441	wzt	gt2G	FALSE	0.261	83.000	0.000	NA		NA
5711374	5711375	CJA_3441	CJA_3442	gt2G	gt4C	TRUE	0.988	7.000	0.231	NA		NA
5711375	5711376	CJA_3442	CJA_3443	gt4C		TRUE	0.677	14.000	0.000	NA		NA
5711376	5711377	CJA_3443	CJA_3444			FALSE	0.037	203.000	0.000	NA		NA
5711377	5711378	CJA_3444	CJA_3445			TRUE	0.828	-3.000	0.000	NA		NA
5711378	5711379	CJA_3445	CJA_3447			TRUE	0.771	-6.000	0.000	NA		NA
5711381	5711382	CJA_3448	CJA_3449			FALSE	0.397	36.000	0.000	NA		NA
5711382	5711383	CJA_3449	CJA_3450		gt2E	FALSE	0.384	38.000	0.000	NA		NA
5711383	5711384	CJA_3450	CJA_3451	gt2E	gt2D	TRUE	0.715	-10.000	0.000	NA		NA
5711385	5711386	CJA_3452	CJA_3453	gt2C		TRUE	0.854	3.000	0.000	NA		NA
5711386	5711387	CJA_3453	CJA_3454		gt2B	TRUE	0.818	6.000	0.000	NA		NA
5711387	5711388	CJA_3454	CJA_3455	gt2B		TRUE	0.844	4.000	0.000	NA		NA
5711388	5711389	CJA_3455	CJA_3456		wbjF	TRUE	0.531	113.000	0.000	1.000	Y	NA
5711389	5711390	CJA_3456	CJA_3457	wbjF	wbpL	TRUE	0.997	-3.000	0.250	1.000	Y	NA
5711390	5711391	CJA_3457	CJA_3458	wbpL		FALSE	0.267	81.000	0.000	NA		NA
5711393	5711394	CJA_3460	CJA_3461			FALSE	0.026	268.000	0.000	1.000	N	NA
5711394	5711395	CJA_3461	CJA_3462			TRUE	0.995	0.000	0.145	1.000	Y	NA
5711397	5711398	CJA_3464	CJA_3465			FALSE	0.273	79.000	0.000	NA		NA
5711399	5711400	CJA_3466	CJA_3467			TRUE	0.975	96.000	1.000	NA		NA
5711400	5711401	CJA_3467	CJA_3468			FALSE	0.298	71.000	0.000	NA		NA
5711401	5711402	CJA_3468	CJA_3469			TRUE	0.636	25.000	0.000	1.000	N	NA
5711403	5711404	CJA_3470	CJA_3471	man5C		FALSE	0.010	348.000	0.000	NA		NA
5711404	5711405	CJA_3471	CJA_3472			FALSE	0.247	87.000	0.000	NA		NA
5711405	5711406	CJA_3472	CJA_3473			FALSE	0.067	167.000	0.000	NA		NA
5711406	5711407	CJA_3473	CJA_3474		dsbA	TRUE	0.828	-3.000	0.000	NA		NA
5711412	5711413	CJA_3479	CJA_3481			FALSE	0.011	319.000	0.000	NA		NA
5711415	5711416	CJA_3482	CJA_3483	np20	znuC	TRUE	0.989	-33.000	0.309	1.000	Y	NA
5711416	5711417	CJA_3483	CJA_3484	znuC	znuB	TRUE	0.998	-28.000	0.755	0.069	Y	NA
5711417	5711418	CJA_3484	CJA_3485	znuB		FALSE	0.143	119.000	0.000	NA		NA
5711418	5711419	CJA_3485	CJA_3486			FALSE	0.304	67.000	0.000	NA		NA
5711420	5711421	CJA_3487	CJA_3488			TRUE	0.828	-3.000	0.000	NA		NA
5711421	5711422	CJA_3488	CJA_3489			TRUE	0.672	20.000	0.000	1.000		NA
5711422	5711423	CJA_3489	CJA_3490			FALSE	0.246	96.000	0.000	NA	N	NA
5711423	5711424	CJA_3490	CJA_3491			FALSE	0.217	179.000	0.038	NA	N	NA
5711424	5711425	CJA_3491	CJA_3492			TRUE	0.977	-24.000	0.117	1.000	Y	NA
5711427	5711428	CJA_3494	CJA_3495	oprF	trmB	FALSE	0.107	158.000	0.000	1.000		NA
5711428	5711429	CJA_3495	CJA_3496	trmB		TRUE	0.503	89.000	0.016	NA		NA
5711429	5711430	CJA_3496	CJA_3497		rpoH	TRUE	0.600	83.000	0.034	NA		NA
5711430	5711431	CJA_3497	CJA_3498	rpoH	ftsX	TRUE	0.639	100.000	0.054	1.000	N	NA
5711431	5711432	CJA_3498	CJA_3499	ftsX	ftsE	TRUE	0.986	-3.000	0.035	1.000	Y	NA
5711432	5711433	CJA_3499	CJA_3500	ftsE	ftsY	TRUE	0.977	13.000	0.117	0.069	N	NA
5711437	5711438	CJA_3504	CJA_3505		mutM	TRUE	0.608	-40.000	0.000	1.000		NA
5711438	5711439	CJA_3505	CJA_3506	mutM		FALSE	0.045	192.000	0.000	NA		NA
5711441	5711442	CJA_3508	CJA_3509			TRUE	0.981	2.000	0.100	NA		NA
5711442	5711443	CJA_3509	CJA_3510			TRUE	0.972	-7.000	0.143	NA		NA
5711443	5711444	CJA_3510	CJA_3511			TRUE	0.999	-3.000	0.875	1.000	Y	NA
5711446	5711447	CJA_3513	CJA_3514	kefB	rpmG	FALSE	0.145	145.000	0.000	1.000	N	NA
5711447	5711448	CJA_3514	CJA_3515	rpmG		TRUE	0.996	18.000	0.332	0.010	Y	NA
5711449	5711450	CJA_3516	CJA_3518			FALSE	0.340	49.000	0.000	NA		NA
5711451	5711452	CJA_3517	CJA_3519			TRUE	0.572	21.000	0.000	NA		NA
5711453	5711454	CJA_3520	CJA_3521			TRUE	0.501	26.000	0.000	NA		NA
5711456	5711457	CJA_3523	CJA_3524	coaBC	algC	TRUE	0.795	24.000	0.005	1.000	N	NA
5711457	5711458	CJA_3524	CJA_3525	algC	argB	TRUE	0.883	23.000	0.044	1.000	N	NA
5711458	5711459	CJA_3525	CJA_3526	argB		TRUE	0.688	50.000	0.017	1.000	N	NA
5711460	5711461	CJA_3527	CJA_3528		pyrE	TRUE	0.898	14.000	0.034	NA		NA
5711463	5711464	CJA_3530	CJA_3531		thiI	FALSE	0.228	92.000	0.000	NA		NA
5711464	5711465	CJA_3531	CJA_3532	thiI		FALSE	0.015	353.000	0.000	1.000	N	NA
5711465	5711466	CJA_3532	CJA_3533			TRUE	0.854	3.000	0.000	NA		NA
5711467	5711468	CJA_3534	CJA_3535	glnA		FALSE	0.391	133.000	0.044	NA		NA
5711468	5711469	CJA_3535	CJA_3536			TRUE	0.587	151.000	0.188	NA		NA
5711469	5711470	CJA_3536	CJA_3537		ntrC	TRUE	0.998	-16.000	0.587	0.048	Y	NA
5711470	5711471	CJA_3537	CJA_3538	ntrC		FALSE	0.054	349.000	0.000	1.000	Y	NA
5711473	5711474	CJA_3540	CJA_3541	exoD		TRUE	0.604	19.000	0.000	NA		NA
5711474	5711475	CJA_3541	CJA_3542			FALSE	0.320	60.000	0.000	NA		NA
5711475	5711476	CJA_3542	CJA_3543			FALSE	0.278	78.000	0.000	NA		NA
5711476	5711477	CJA_3543	CJA_3544			FALSE	0.181	105.000	0.000	NA		NA
5711477	5711478	CJA_3544	CJA_3545			TRUE	0.996	-3.000	0.556	NA		NA
5711479	5711480	CJA_3546	CJA_3547			TRUE	0.734	12.000	0.000	NA		NA
5711482	5711483	CJA_3549	CJA_3550			FALSE	0.051	184.000	0.000	NA		NA
5711483	5711484	CJA_3550	CJA_3551			TRUE	0.963	-31.000	0.210	1.000		NA
5711484	5711485	CJA_3551	CJA_3552			TRUE	0.957	92.000	0.408	0.018	N	NA
5711485	5711486	CJA_3552	CJA_3553		gpmI	TRUE	0.904	41.000	0.170	1.000	N	NA
5711486	5711487	CJA_3553	CJA_3554	gpmI		FALSE	0.285	76.000	0.000	NA		NA
5711488	5711489	CJA_3555	CJA_3556		grxC	TRUE	0.931	26.000	0.166	NA	N	NA
5711489	5711490	CJA_3556	CJA_3557	grxC	secB	TRUE	0.919	53.000	0.221	1.000	N	NA
5711490	5711491	CJA_3557	CJA_3558	secB		FALSE	0.162	138.000	0.000	1.000	N	NA
5711492	5711493	CJA_3559	CJA_3560	rgl11A	ppk	FALSE	0.028	247.000	0.000	1.000		NA
5711493	5711494	CJA_3560	CJA_3561	ppk		FALSE	0.074	161.000	0.000	NA		NA
5711494	5711495	CJA_3561	CJA_3562			FALSE	0.360	43.000	0.000	NA		NA
5711496	5711497	CJA_3563	CJA_3564		bla	FALSE	0.127	146.000	0.000	1.000		NA
5711497	5711498	CJA_3564	CJA_3565	bla		FALSE	0.074	161.000	0.000	NA		NA
5711498	5711499	CJA_3565	CJA_3566		uvrD	FALSE	0.310	64.000	0.000	NA		NA
5711499	5711500	CJA_3566	CJA_3567	uvrD		FALSE	0.340	121.000	0.010	NA	N	NA
5711502	5711503	CJA_3569	CJA_3570		rpoZ	TRUE	0.916	110.000	0.471	1.000	N	NA
5711503	5711504	CJA_3570	CJA_3571	rpoZ	spoT	TRUE	0.971	56.000	0.291	1.000	Y	NA
5711504	5711505	CJA_3571	CJA_3572	spoT		FALSE	0.404	208.000	0.215	NA	N	NA
5711506	5711507	CJA_3573	CJA_3574			FALSE	0.011	312.000	0.000	NA		NA
5711508	5711509	CJA_3575	CJA_3577			TRUE	0.705	13.000	0.000	NA		NA
5711512	5711513	CJA_3579	CJA_3580	trkA	sun	TRUE	0.874	43.000	0.122	1.000	N	NA
5711513	5711514	CJA_3580	CJA_3581	sun	fmt	TRUE	0.997	-3.000	0.305	1.000	Y	NA
5711514	5711515	CJA_3581	CJA_3582	fmt	def	TRUE	0.983	21.000	0.105	0.015	Y	NA
5711516	5711517	CJA_3583	CJA_3585		smf	TRUE	0.656	87.000	0.043	1.000		NA
5711519	5711520	CJA_3586	CJA_3587		hemF	TRUE	0.609	100.000	0.058	NA	N	NA
5711520	5711521	CJA_3587	CJA_3588	hemF	aroE	TRUE	0.798	77.000	0.093	1.000	N	NA
5711521	5711522	CJA_3588	CJA_3589	aroE		FALSE	0.397	36.000	0.000	NA		NA
5711522	5711523	CJA_3589	CJA_3590			FALSE	0.019	250.000	0.000	NA		NA
5711523	5711524	CJA_3590	CJA_3591		pldB3	FALSE	0.397	36.000	0.000	NA		NA
5711524	5711525	CJA_3591	CJA_3592	pldB3		FALSE	0.468	28.000	0.000	NA		NA
5711526	5711527	CJA_3593	CJA_3594	afc95B	gly43B	FALSE	0.054	202.000	0.000	1.000		NA
5711527	5711528	CJA_3594	CJA_3595	gly43B		FALSE	0.376	81.000	0.000	1.000	N	NA
5711529	5711530	CJA_3596	CJA_3597			TRUE	0.734	12.000	0.000	NA		NA
5711530	5711531	CJA_3597	CJA_3598		estA1	FALSE	0.196	101.000	0.000	NA		NA
5711531	5711532	CJA_3598	CJA_3599	estA1		FALSE	0.352	45.000	0.000	NA		NA
5711532	5711533	CJA_3599	CJA_3600			FALSE	0.192	102.000	0.000	NA		NA
5711533	5711534	CJA_3600	CJA_3601		gly43I	TRUE	0.661	15.000	0.000	NA		NA
5711536	5711537	CJA_3603	CJA_3604			FALSE	0.022	238.000	0.000	NA		NA
5711537	5711538	CJA_3604	CJA_3605			TRUE	0.967	5.000	0.000	1.000	Y	NA
5711538	5711539	CJA_3605	CJA_3606			FALSE	0.451	30.000	0.000	NA		NA
5711540	5711541	CJA_3607	CJA_3608			TRUE	0.998	-3.000	0.727	NA		NA
5711541	5711542	CJA_3608	CJA_3609			FALSE	0.298	71.000	0.000	NA		NA
5711543	5711544	CJA_3610	CJA_3611			FALSE	0.327	56.000	0.000	NA		NA
5711544	5711545	CJA_3611	CJA_3612			FALSE	0.484	27.000	0.000	NA		NA
5711545	5711546	CJA_3612	CJA_3613			TRUE	0.997	10.000	0.727	NA		NA
5711547	5711548	CJA_3614	CJA_3615			TRUE	0.996	-16.000	0.671	0.068	N	NA
5711548	5711549	CJA_3615	CJA_3616			TRUE	0.999	-3.000	0.752	1.000	Y	NA
5711549	5711550	CJA_3616	CJA_3617			TRUE	0.967	7.000	0.053	1.000	N	NA
5711550	5711551	CJA_3617	CJA_3618			FALSE	0.244	111.000	0.000	1.000	N	NA
5711551	5711552	CJA_3618	CJA_3619			TRUE	0.875	16.000	0.000	0.032	N	NA
5711552	5711553	CJA_3619	CJA_3620			TRUE	0.980	23.000	0.104	0.032	Y	NA
5711553	5711554	CJA_3620	CJA_3621			FALSE	0.189	103.000	0.000	NA		NA
5711554	5711555	CJA_3621	CJA_3622			FALSE	0.397	36.000	0.000	NA		NA
5711555	5711556	CJA_3622	CJA_3623			TRUE	0.832	-7.000	0.000	1.000	N	NA
5711556	5711557	CJA_3623	CJA_3624			TRUE	0.897	1.000	0.000	1.000		NA
5711558	5711559	CJA_3625	CJA_3626	prlC		TRUE	0.988	0.000	0.173	NA		NA
5711559	5711560	CJA_3626	CJA_3627			FALSE	0.005	580.000	0.000	NA		NA
5711560	5711561	CJA_3627	CJA_3628			FALSE	0.158	113.000	0.000	NA		NA
5711561	5711562	CJA_3628	CJA_3629			TRUE	0.909	129.000	0.647	NA		NA
5711562	5711563	CJA_3629	CJA_3630			TRUE	0.996	8.000	0.647	NA		NA
5711564	5711565	CJA_3631	CJA_3632			FALSE	0.443	44.000	0.000	1.000		NA
5711566	5711567	CJA_3633	CJA_3634			TRUE	0.927	-13.000	0.061	NA		NA
5711567	5711568	CJA_3634	CJA_3635			TRUE	0.610	-22.000	0.000	NA		NA
5711569	5711570	CJA_3636	CJA_3637			TRUE	0.998	-3.000	0.750	NA		NA
5711570	5711571	CJA_3637	CJA_3638		hsdS-1	TRUE	0.661	15.000	0.000	NA		NA
5711571	5711572	CJA_3638	CJA_3639	hsdS-1		TRUE	0.781	-7.000	0.000	NA	N	NA
5711572	5711573	CJA_3639	CJA_3640			TRUE	0.975	-3.000	0.087	NA	N	NA
5711573	5711574	CJA_3640	CJA_3641			FALSE	0.274	104.000	0.000	1.000	N	NA
5711574	5711575	CJA_3641	CJA_3642			FALSE	0.008	405.000	0.000	NA		NA
5711576	5711577	CJA_3643	CJA_3644			TRUE	0.988	0.000	0.145	1.000		NA
5711577	5711578	CJA_3644	CJA_3645		ubiB	TRUE	0.995	-3.000	0.432	1.000		NA
5711579	5711580	CJA_3646	CJA_3647			TRUE	0.556	22.000	0.000	NA		NA
5711580	5711581	CJA_3647	CJA_3648			TRUE	0.677	14.000	0.000	NA		NA
5711581	5711582	CJA_3648	CJA_3649			TRUE	0.857	0.000	0.000	NA		NA
5711582	5711583	CJA_3649	CJA_3650			TRUE	0.502	-46.000	0.000	NA		NA
5711583	5711584	CJA_3650	CJA_3651			FALSE	0.017	264.000	0.000	NA		NA
5711585	5711586	CJA_3653	CJA_3654			TRUE	0.946	-22.000	0.000	0.016	Y	NA
5711587	5711588	CJA_3655	CJA_3656	dtd	pip	TRUE	0.980	0.000	0.026	0.025		NA
5711589	5711590	CJA_3657	CJA_3658		tag	TRUE	0.889	-3.000	0.000	1.000	N	NA
5711590	5711591	CJA_3658	CJA_3659	tag		TRUE	0.589	70.000	0.004	1.000	N	NA
5711591	5711592	CJA_3659	CJA_3660			TRUE	0.857	1.000	0.000	NA		NA
5711592	5711593	CJA_3660	CJA_3661		hemH	FALSE	0.139	121.000	0.000	NA		NA
5711593	5711594	CJA_3661	CJA_3662	hemH		FALSE	0.173	126.000	0.000	1.000		NA
5711595	5711596	CJA_3663	CJA_3664		typA	FALSE	0.081	174.000	0.000	1.000		NA
5711597	5711598	CJA_3665	CJA_3666			FALSE	0.200	117.000	0.000	1.000		NA
5711598	5711599	CJA_3666	CJA_3667			FALSE	0.090	147.000	0.000	NA		NA
5711599	5711600	CJA_3667	CJA_3668			FALSE	0.030	216.000	0.000	NA		NA
5711600	5711601	CJA_3668	CJA_3669			TRUE	0.857	2.000	0.000	NA		NA
5711601	5711602	CJA_3669	CJA_3670			TRUE	0.933	18.000	0.100	NA		NA
5711602	5711603	CJA_3670	CJA_3671			TRUE	0.929	108.000	0.600	NA		NA
5711603	5711604	CJA_3671	CJA_3672			TRUE	0.983	23.000	0.263	0.003		NA
5711604	5711605	CJA_3672	CJA_3673			FALSE	0.397	36.000	0.000	NA		NA
5711605	5711606	CJA_3673	CJA_3674			TRUE	0.854	3.000	0.000	NA		NA
5711606	5711607	CJA_3674	CJA_3675			TRUE	0.830	5.000	0.000	NA		NA
5711607	5711608	CJA_3675	CJA_3676			TRUE	0.961	13.000	0.125	NA		NA
5711608	5711609	CJA_3676	CJA_3677			TRUE	0.987	11.000	0.276	NA		NA
5711609	5711610	CJA_3677	CJA_3678			TRUE	0.857	34.000	0.103	NA		NA
5711610	5711611	CJA_3678	CJA_3679			TRUE	0.987	9.000	0.231	NA		NA
5711611	5711612	CJA_3679	CJA_3680			TRUE	0.705	13.000	0.000	NA		NA
5711612	5711613	CJA_3680	CJA_3681			TRUE	0.828	-3.000	0.000	NA		NA
5711613	5711614	CJA_3681	CJA_3684			TRUE	0.916	96.000	0.429	NA		NA
5711615	5711616	CJA_3682	CJA_3683			TRUE	0.566	-31.000	0.000	NA		NA
5711617	5711618	CJA_3685	CJA_3686			TRUE	0.994	7.000	0.400	NA		NA
5711618	5711619	CJA_3686	CJA_3688			FALSE	0.166	110.000	0.000	NA		NA
5711619	5711620	CJA_3688	CJA_3689			TRUE	0.513	25.000	0.000	NA		NA
5711620	5711621	CJA_3689	CJA_3690			FALSE	0.404	35.000	0.000	NA		NA
5711621	5711622	CJA_3690	CJA_3691			FALSE	0.034	208.000	0.000	NA		NA
5711624	5711625	CJA_3693	CJA_3694			TRUE	0.997	12.000	1.000	NA		NA
5711626	5711627	CJA_3695	CJA_3696			TRUE	0.766	12.000	0.000	NA	N	NA
5711627	5711628	CJA_3696	CJA_3697			TRUE	0.960	-3.000	0.000	NA	Y	NA
5711628	5711629	CJA_3697	CJA_3698			FALSE	0.273	79.000	0.000	NA		NA
5711629	5711630	CJA_3698	CJA_3699			FALSE	0.345	47.000	0.000	NA		NA
5711630	5711631	CJA_3699	CJA_3700		arsR	FALSE	0.224	93.000	0.000	NA		NA
5711632	5711633	CJA_3701	CJA_3702			TRUE	0.993	-15.000	0.625	NA		NA
5711633	5711634	CJA_3702	CJA_3703			TRUE	0.591	26.000	0.000	1.000		NA
5711634	5711635	CJA_3703	CJA_3705			FALSE	0.391	65.000	0.000	1.000		NA
5711636	5711637	CJA_3704	CJA_3706	glu16C	glu16G	FALSE	0.458	105.000	0.000	0.015		NA
5711637	5711638	CJA_3706	CJA_3707	glu16G		FALSE	0.079	177.000	0.000	1.000		NA
5711639	5711640	CJA_3708	CJA_3709			FALSE	0.432	47.000	0.000	1.000		NA
5711640	5711641	CJA_3709	CJA_3710			TRUE	0.932	17.000	0.091	NA		NA
5711642	5711643	CJA_3711	CJA_3712			TRUE	0.988	15.000	0.385	1.000	N	NA
5711644	5711645	CJA_3713	CJA_3714			TRUE	0.699	-12.000	0.000	NA		NA
5711651	5711652	CJA_3720	CJA_3721	mrfJ		TRUE	0.842	9.000	0.000	1.000		NA
5711653	5711654	CJA_3722	CJA_3723			FALSE	0.169	109.000	0.000	NA		NA
5711656	5711657	CJA_3725	CJA_3726			TRUE	0.991	-12.000	0.500	NA		NA
5711657	5711658	CJA_3726	CJA_3727			FALSE	0.327	56.000	0.000	NA		NA
5711658	5711659	CJA_3727	CJA_3728			FALSE	0.004	829.000	0.000	NA		NA
5711659	5711660	CJA_3728	CJA_3729			FALSE	0.117	132.000	0.000	NA		NA
5711660	5711661	CJA_3729	CJA_3730			TRUE	0.998	-13.000	0.649	1.000	Y	NA
5711661	5711662	CJA_3730	CJA_3731			FALSE	0.224	93.000	0.000	NA		NA
5711664	5711665	CJA_3732	CJA_3734			FALSE	0.007	475.000	0.000	NA		NA
5711665	5711666	CJA_3734	CJA_3735			TRUE	0.942	-3.000	0.000	0.036		NA
5711668	5711669	CJA_3737	CJA_3738			TRUE	0.987	6.000	0.195	NA	N	NA
5711670	5711671	CJA_3739	CJA_3740			TRUE	0.997	-3.000	0.636	NA		NA
5711672	5711673	CJA_3741	CJA_3742			TRUE	0.966	63.000	0.600	NA		NA
5711678	5711679	CJA_3747	CJA_3748			TRUE	0.623	-19.000	0.000	NA		NA
5711679	5711680	CJA_3748	CJA_3749			FALSE	0.005	614.000	0.000	NA		NA
5711680	5711681	CJA_3749	CJA_3750			TRUE	0.607	99.000	0.040	1.000	N	NA
5711681	5711682	CJA_3750	CJA_3751			TRUE	0.744	87.000	0.105	NA		NA
5711682	5711683	CJA_3751	CJA_3752			TRUE	0.882	39.000	0.158	NA		NA
5711683	5711684	CJA_3752	CJA_3753			FALSE	0.376	72.000	0.000	1.000		NA
5711684	5711685	CJA_3753	CJA_3754			FALSE	0.435	46.000	0.000	1.000		NA
5711685	5711686	CJA_3754	CJA_3755			TRUE	0.874	-3.000	0.000	1.000		NA
5711686	5711687	CJA_3755	CJA_3756			TRUE	0.973	1.000	0.000	1.000	Y	NA
5711687	5711688	CJA_3756	CJA_3757			TRUE	0.886	4.000	0.000	1.000		NA
5711688	5711689	CJA_3757	CJA_3758			TRUE	0.756	11.000	0.000	NA		NA
5711689	5711690	CJA_3758	CJA_3759			TRUE	0.990	23.000	0.724	NA		NA
5711691	5711692	CJA_3760	CJA_3761			FALSE	0.364	76.000	0.000	1.000		NA
5711692	5711693	CJA_3761	CJA_3762		xyn11B	FALSE	0.139	140.000	0.000	1.000		NA
5711693	5711694	CJA_3762	CJA_3763	xyn11B	xyn11A	FALSE	0.040	357.000	0.000	0.002		NA
5711696	5711697	CJA_3764	CJA_3766			FALSE	0.315	62.000	0.000	NA		NA
5711697	5711698	CJA_3766	CJA_3767			FALSE	0.460	49.000	0.000	1.000	N	NA
5711698	5711699	CJA_3767	CJA_3768		cobC	TRUE	0.838	32.000	0.049	1.000	N	NA
5711699	5711700	CJA_3768	CJA_3769	cobC	cobD	TRUE	0.979	-3.000	0.088	1.000	N	NA
5711700	5711701	CJA_3769	CJA_3770	cobD	cobP	TRUE	0.994	7.000	0.191	1.000	Y	NA
5711701	5711702	CJA_3770	CJA_3771	cobP		TRUE	0.536	34.000	0.000	1.000	N	NA
5711702	5711703	CJA_3771	CJA_3772			TRUE	0.981	-3.000	0.010	1.000	Y	NA
5711703	5711704	CJA_3772	CJA_3773		cobQ	TRUE	0.889	-3.000	0.000	1.000	N	NA
5711704	5711705	CJA_3773	CJA_3774	cobQ	cobO	TRUE	0.996	3.000	0.078	0.004	Y	NA
5711705	5711706	CJA_3774	CJA_3775	cobO		TRUE	0.817	69.000	0.007	1.000	Y	NA
5711708	5711709	CJA_3777	CJA_3778			TRUE	0.997	2.000	0.600	NA		NA
5711709	5711710	CJA_3778	CJA_3779			FALSE	0.285	76.000	0.000	NA		NA
5711710	5711711	CJA_3779	CJA_3780			TRUE	0.998	4.000	0.750	NA		NA
5711712	5711713	CJA_3781	CJA_3782			TRUE	0.997	-3.000	0.600	NA		NA
5711713	5711714	CJA_3782	CJA_3783			FALSE	0.378	39.000	0.000	NA		NA
5711714	5711715	CJA_3783	CJA_3784		man5E	FALSE	0.117	132.000	0.000	NA		NA
5711716	5711717	CJA_3785	CJA_3786			TRUE	0.942	-3.000	0.000	0.036		NA
5711717	5711718	CJA_3786	CJA_3787			FALSE	0.006	919.000	0.000	1.000		NA
5711718	5711719	CJA_3787	CJA_3788			FALSE	0.010	343.000	0.000	NA		NA
5711719	5711720	CJA_3788	CJA_3789			TRUE	0.556	22.000	0.000	NA		NA
5711720	5711721	CJA_3789	CJA_3790			TRUE	0.755	-13.000	0.000	1.000		NA
5711721	5711722	CJA_3790	CJA_3791			TRUE	0.818	6.000	0.000	NA		NA
5711722	5711723	CJA_3791	CJA_3792			FALSE	0.022	237.000	0.000	NA		NA
5711723	5711724	CJA_3792	CJA_3793			TRUE	0.942	-3.000	0.000	0.036		NA
5711724	5711725	CJA_3793	CJA_3794			FALSE	0.265	143.000	0.000	0.036		NA
5711725	5711726	CJA_3794	CJA_3795			TRUE	0.994	-3.000	0.346	NA		NA
5711726	5711727	CJA_3795	CJA_3796			TRUE	0.635	17.000	0.000	NA		NA
5711727	5711728	CJA_3796	CJA_3797		tnsE	FALSE	0.014	284.000	0.000	NA		NA
5711728	5711729	CJA_3797	CJA_3798	tnsE	tnsD	TRUE	0.546	-34.000	0.000	NA		NA
5711729	5711730	CJA_3798	CJA_3799	tnsD	tnsC	TRUE	0.857	1.000	0.000	NA		NA
5711730	5711731	CJA_3799	CJA_3800	tnsC	tnsB	TRUE	0.715	-10.000	0.000	NA		NA
5711731	5711732	CJA_3800	CJA_3801	tnsB	tnsA	TRUE	0.973	-16.000	0.130	0.036		NA
5711732	5711733	CJA_3801	CJA_3802	tnsA	glmS	FALSE	0.433	145.000	0.068	1.000		NA
5711733	5711734	CJA_3802	CJA_3803	glmS	srlR	TRUE	0.963	43.000	0.412	1.000	N	NA
5711734	5711735	CJA_3803	CJA_3804	srlR	cel9C	FALSE	0.370	74.000	0.000	1.000		NA
5711735	5711736	CJA_3804	CJA_3805	cel9C		FALSE	0.163	131.000	0.000	1.000		NA
5711736	5711737	CJA_3805	CJA_3806		glmU	FALSE	0.170	127.000	0.000	1.000		NA
5711739	5711740	CJA_3808	CJA_3809	atpC	atpD	TRUE	0.996	64.000	0.837	0.002	Y	NA
5711740	5711741	CJA_3809	CJA_3810	atpD	atpG	TRUE	0.985	121.000	0.724	0.002	Y	NA
5711741	5711742	CJA_3810	CJA_3811	atpG	atpA	TRUE	0.996	52.000	0.846	0.002	Y	NA
5711742	5711743	CJA_3811	CJA_3812	atpA	atpH	TRUE	0.998	25.000	0.864	0.002	Y	NA
5711743	5711744	CJA_3812	CJA_3813	atpH	atpF	TRUE	0.997	12.000	0.242	0.002	Y	NA
5711744	5711745	CJA_3813	CJA_3814	atpF	atpE	TRUE	0.988	55.000	0.666	0.002		NA
5711745	5711746	CJA_3814	CJA_3815	atpE	atpB	TRUE	0.985	45.000	0.557	0.002		NA
5711746	5711747	CJA_3815	CJA_3816	atpB		TRUE	0.954	40.000	0.330	1.000		NA
5711747	5711748	CJA_3816	CJA_3817			FALSE	0.047	301.000	0.016	1.000		NA
5711748	5711749	CJA_3817	CJA_3818		soj	TRUE	0.994	22.000	0.827	1.000	N	NA
5711749	5711750	CJA_3818	CJA_3819	soj	gidB	TRUE	0.954	46.000	0.339	1.000	N	NA
5711750	5711751	CJA_3819	CJA_3820	gidB	gidA	TRUE	0.993	12.000	0.466	1.000	N	NA
5711751	5711752	CJA_3820	CJA_3821	gidA		FALSE	0.006	484.000	0.000	NA		NA
5711752	5711753	CJA_3821	CJA_3822		trmE	TRUE	0.527	-37.000	0.000	NA		NA
5711753	5711754	CJA_3822	CJA_3823	trmE		TRUE	0.992	0.000	0.221	1.000		NA
5711754	5711755	CJA_3823	CJA_3824			TRUE	0.996	2.000	0.461	NA		NA
5711755	5711756	CJA_3824	CJA_3825		rnpA	TRUE	0.995	8.000	0.540	NA		NA
5711756	5711757	CJA_3825	CJA_3826	rnpA	rpmH	TRUE	0.993	22.000	0.787	1.000		NA