MicrobesOnline Operon Predictions for Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. E01-6750

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 6454380 6454381 Salmonentericaenterica_010100t00047 Salmonentericaenterica_010100t00049     TRUE 0.496 9.000 0.000 NA   NA
 6454381 6454382 Salmonentericaenterica_010100t00049 Salmonentericaenterica_010100t00051     FALSE 0.171 117.000 0.000 NA   NA
 6454382 6454383 Salmonentericaenterica_010100t00051 Salmonentericaenterica_010100t00053     TRUE 0.499 7.000 0.000 NA   NA
 6454383 6454384 Salmonentericaenterica_010100t00053 Salmonentericaenterica_010100000040     FALSE 0.174 116.000 0.000 NA   NA
 6454385 6454386 Salmonentericaenterica_010100000053 Salmonentericaenterica_010100000058     FALSE 0.004 185.000 0.007 NA N NA
 6454386 6454387 Salmonentericaenterica_010100000058 Salmonentericaenterica_010100000063     TRUE 0.614 73.000 0.033 NA Y NA
 6454389 6454390 Salmonentericaenterica_010100000073 Salmonentericaenterica_010100000078   rplC TRUE 0.955 33.000 0.307 0.014   NA
 6454391 6454392 Salmonentericaenterica_010100000083 Salmonentericaenterica_010100000088     TRUE 0.965 72.000 0.400 0.001   NA
 6454393 6454394 Salmonentericaenterica_010100000093 Salmonentericaenterica_010100000098     FALSE 0.159 104.000 0.051 NA   NA
 6454398 6454399 Salmonentericaenterica_010100000115 Salmonentericaenterica_010100000120 metN   TRUE 0.978 -7.000 0.584 1.000 Y NA
 6454401 6454402 Salmonentericaenterica_010100000127 Salmonentericaenterica_010100000132     FALSE 0.276 150.000 0.143 NA   NA
 6454402 6454403 Salmonentericaenterica_010100000132 Salmonentericaenterica_010100000137     TRUE 0.950 7.000 0.576 NA   NA
 6454403 6454404 Salmonentericaenterica_010100000137 Salmonentericaenterica_010100000142     FALSE 0.107 190.000 0.125 1.000 N NA
 6454404 6454405 Salmonentericaenterica_010100000142 Salmonentericaenterica_010100000147     FALSE 0.115 0.000 0.045 1.000 N NA
 6454408 6454409 Salmonentericaenterica_010100000162 Salmonentericaenterica_010100000167     FALSE 0.111 320.000 0.310 NA   NA
 6454409 6454410 Salmonentericaenterica_010100000167 Salmonentericaenterica_010100000172     TRUE 0.830 0.000 0.220 NA   NA
 6454412 6454413 Salmonentericaenterica_010100000182 Salmonentericaenterica_010100000187     FALSE 0.196 103.000 0.000 NA   NA
 6454414 6454415 Salmonentericaenterica_010100000202 Salmonentericaenterica_010100000207     FALSE 0.177 115.000 0.005 1.000   NA
 6454419 6454420 Salmonentericaenterica_010100000227 Salmonentericaenterica_010100000232   mltC FALSE 0.040 217.000 0.056 NA   NA
 6454420 6454421 Salmonentericaenterica_010100000232 Salmonentericaenterica_010100000237 mltC   FALSE 0.132 116.000 0.128 NA N NA
 6454421 6454422 Salmonentericaenterica_010100000237 Salmonentericaenterica_010100000242     TRUE 0.772 28.000 0.150 1.000   NA
 6454422 6454423 Salmonentericaenterica_010100000242 Salmonentericaenterica_010100000247     TRUE 0.865 -31.000 0.007 0.005   NA
 6454429 6454430 Salmonentericaenterica_010100000277 Salmonentericaenterica_010100000282     TRUE 0.564 120.000 0.257 NA   NA
 6454431 6454432 Salmonentericaenterica_010100000287 Salmonentericaenterica_010100000292   glk FALSE 0.012 724.000 0.000 1.000   NA
 6454435 6454436 Salmonentericaenterica_010100000314 Salmonentericaenterica_010100000319     FALSE 0.294 77.000 0.071 NA   NA
 6454438 6454439 Salmonentericaenterica_010100000329 Salmonentericaenterica_010100000334     TRUE 0.960 0.000 0.122 0.001   NA
 6454439 6454440 Salmonentericaenterica_010100000334 Salmonentericaenterica_010100000339     FALSE 0.024 272.000 0.000 NA   NA
 6454441 6454442 Salmonentericaenterica_010100000344 Salmonentericaenterica_010100000349 lolB ipk TRUE 0.523 -3.000 0.024 1.000   NA
 6454444 6454445 Salmonentericaenterica_010100000359 Salmonentericaenterica_010100000364     TRUE 0.943 -3.000 0.605 NA   NA
 6454445 6454446 Salmonentericaenterica_010100000364 Salmonentericaenterica_010100000379     FALSE 0.008 1351.000 0.000 1.000   NA
 6454446 6454447 Salmonentericaenterica_010100000379 Salmonentericaenterica_010100000384     FALSE 0.105 207.000 0.000 1.000   NA
 6454448 6454449 Salmonentericaenterica_010100000389 Salmonentericaenterica_010100000394     FALSE 0.017 306.000 0.000 NA   NA
 6454449 6454450 Salmonentericaenterica_010100000394 Salmonentericaenterica_010100000399     FALSE 0.343 375.000 1.000 1.000   NA
 6454451 6454452 Salmonentericaenterica_010100000404 Salmonentericaenterica_010100000409     TRUE 0.874 20.000 0.333 NA   NA
 6454455 6454456 Salmonentericaenterica_010100000426 Salmonentericaenterica_010100000431     FALSE 0.091 162.000 0.000 NA   NA
 6454460 6454461 Salmonentericaenterica_010100000451 Salmonentericaenterica_010100000456     FALSE 0.213 96.000 0.000 NA   NA
 6454466 6454467 Salmonentericaenterica_010100000481 Salmonentericaenterica_010100000486     FALSE 0.022 284.000 0.000 NA   NA
 6454474 6454475 Salmonentericaenterica_010100000546 Salmonentericaenterica_010100000551     FALSE 0.454 -3.000 0.000 NA   NA
 6454476 6454477 Salmonentericaenterica_010100000566 Salmonentericaenterica_010100000571     FALSE 0.420 92.000 0.122 NA   NA
 6454477 6454478 Salmonentericaenterica_010100000571 Salmonentericaenterica_010100000576   hslU TRUE 0.987 10.000 0.752 1.000 Y NA
 6454478 6454479 Salmonentericaenterica_010100000576 Salmonentericaenterica_010100000581 hslU   FALSE 0.438 67.000 0.051 1.000   NA
 6454479 6454480 Salmonentericaenterica_010100000581 Salmonentericaenterica_010100000586     TRUE 0.919 -3.000 0.015 0.001   NA
 6454483 6454484 Salmonentericaenterica_010100000601 Salmonentericaenterica_010100000606     FALSE 0.336 110.000 0.000 1.000   NA
 6454485 6454486 Salmonentericaenterica_010100000611 Salmonentericaenterica_010100000616     FALSE 0.146 182.000 0.000 1.000   NA
 6454486 6454487 Salmonentericaenterica_010100000616 Salmonentericaenterica_010100000621     TRUE 0.969 4.000 0.318 0.050   NA
 6454489 6454490 Salmonentericaenterica_010100000631 Salmonentericaenterica_010100000646     FALSE 0.006 582.000 0.000 NA   NA
 6454491 6454492 Salmonentericaenterica_010100000651 Salmonentericaenterica_010100000656     FALSE 0.164 120.000 0.000 NA   NA
 6454494 6454495 Salmonentericaenterica_010100000676 Salmonentericaenterica_010100000681     FALSE 0.037 288.000 0.095 NA   NA
 6454496 6454497 Salmonentericaenterica_010100000686 Salmonentericaenterica_010100000691     FALSE 0.260 32.000 0.040 NA   NA
 6454498 6454499 Salmonentericaenterica_010100000696 Salmonentericaenterica_010100000701     FALSE 0.394 28.000 0.000 NA   NA
 6454500 6454501 Salmonentericaenterica_010100000706 Salmonentericaenterica_010100000711     TRUE 0.603 125.000 0.024 0.017   NA
 6454502 6454503 Salmonentericaenterica_010100000716 Salmonentericaenterica_010100000721     FALSE 0.330 13.000 0.038 NA   NA
 6454504 6454505 Salmonentericaenterica_010100000726 Salmonentericaenterica_010100000731     TRUE 0.497 145.000 0.282 NA   NA
 6454505 6454506 Salmonentericaenterica_010100000731 Salmonentericaenterica_010100000736     TRUE 0.963 10.000 0.780 NA   NA
 6454506 6454507 Salmonentericaenterica_010100000736 Salmonentericaenterica_010100000741     TRUE 0.836 23.000 0.276 NA   NA
 6454507 6454508 Salmonentericaenterica_010100000741 Salmonentericaenterica_010100000746     TRUE 0.885 17.000 0.336 NA   NA
 6454510 6454511 Salmonentericaenterica_010100000781 Salmonentericaenterica_010100000786     FALSE 0.438 56.000 0.039 1.000   NA
 6454520 6454521 Salmonentericaenterica_010100000831 Salmonentericaenterica_010100000836   ansB FALSE 0.436 19.000 0.000 NA   NA
 6454529 6454530 Salmonentericaenterica_010100000878 Salmonentericaenterica_010100000883     FALSE 0.417 -13.000 0.000 NA   NA
 6454530 6454531 Salmonentericaenterica_010100000883 Salmonentericaenterica_010100000888     FALSE 0.157 156.000 0.088 NA   NA
 6454531 6454532 Salmonentericaenterica_010100000888 Salmonentericaenterica_010100000903     FALSE 0.004 1322.000 0.000 NA   NA
 6454534 6454535 Salmonentericaenterica_010100000913 Salmonentericaenterica_010100000918     FALSE 0.014 211.000 0.023 NA   NA
 6454535 6454536 Salmonentericaenterica_010100000918 Salmonentericaenterica_010100000923     TRUE 0.850 -3.000 0.265 NA   NA
 6454536 6454537 Salmonentericaenterica_010100000923 Salmonentericaenterica_010100000928     FALSE 0.018 158.000 0.016 NA   NA
 6454539 6454540 Salmonentericaenterica_010100000938 Salmonentericaenterica_010100000943     TRUE 0.885 -7.000 0.273 1.000   NA
 6454540 6454541 Salmonentericaenterica_010100000943 Salmonentericaenterica_010100000948     FALSE 0.454 521.000 0.444 0.016 Y NA
 6454541 6454542 Salmonentericaenterica_010100000948 Salmonentericaenterica_010100000953     TRUE 0.955 90.000 0.231 0.006 Y NA
 6454542 6454543 Salmonentericaenterica_010100000953 Salmonentericaenterica_010100000958     TRUE 0.648 18.000 0.150 1.000 N NA
 6454546 6454547 Salmonentericaenterica_010100000973 Salmonentericaenterica_010100000978     FALSE 0.092 177.000 0.071 NA   NA
 6454552 6454553 Salmonentericaenterica_010100001003 Salmonentericaenterica_010100001008     FALSE 0.005 778.000 0.000 NA   NA
 6454553 6454554 Salmonentericaenterica_010100001008 Salmonentericaenterica_010100001013     FALSE 0.008 450.000 0.000 NA   NA
 6454554 6454555 Salmonentericaenterica_010100001013 Salmonentericaenterica_010100001018     FALSE 0.408 -22.000 0.000 NA   NA
 6454558 6454559 Salmonentericaenterica_010100001033 Salmonentericaenterica_010100001038     FALSE 0.012 119.000 0.037 1.000 N NA
 6454561 6454562 Salmonentericaenterica_010100001048 Salmonentericaenterica_010100001053     TRUE 0.703 -19.000 0.154 NA   NA
 6454562 6454563 Salmonentericaenterica_010100001053 Salmonentericaenterica_010100001058     TRUE 0.854 68.000 0.154 1.000 Y NA
 6454563 6454564 Salmonentericaenterica_010100001058 Salmonentericaenterica_010100001063     TRUE 0.965 -3.000 0.091 0.012 Y NA
 6454564 6454565 Salmonentericaenterica_010100001063 Salmonentericaenterica_010100001078     FALSE 0.117 819.000 0.000 0.012 Y NA
 6454566 6454567 Salmonentericaenterica_010100t01085 Salmonentericaenterica_010100t01087     TRUE 0.488 11.000 0.000 NA   NA
 6454569 6454570 Salmonentericaenterica_010100001092 Salmonentericaenterica_010100001097     FALSE 0.305 187.000 0.245 NA   NA
 6454570 6454571 Salmonentericaenterica_010100001097 Salmonentericaenterica_010100001102     FALSE 0.111 155.000 0.013 1.000   NA
 6454573 6454574 Salmonentericaenterica_010100001112 Salmonentericaenterica_010100001117 glpC   TRUE 0.988 13.000 0.547 0.002   NA
 6454579 6454580 Salmonentericaenterica_010100001162 Salmonentericaenterica_010100001167     TRUE 0.899 -31.000 0.003 0.001   NA
 6454580 6454581 Salmonentericaenterica_010100001167 Salmonentericaenterica_010100001172     TRUE 0.799 3.000 0.117 1.000   NA
 6454582 6454583 Salmonentericaenterica_010100001177 Salmonentericaenterica_010100001182     FALSE 0.009 497.000 0.022 1.000   NA
 6454586 6454587 Salmonentericaenterica_010100001197 Salmonentericaenterica_010100001202     TRUE 0.750 -3.000 0.100 1.000   NA
 6454588 6454589 Salmonentericaenterica_010100001207 Salmonentericaenterica_010100001212     FALSE 0.033 320.000 0.000 1.000   NA
 6454589 6454590 Salmonentericaenterica_010100001212 Salmonentericaenterica_010100001217     FALSE 0.051 206.000 0.000 NA   NA
 6454590 6454591 Salmonentericaenterica_010100001217 Salmonentericaenterica_010100001222     FALSE 0.063 189.000 0.000 NA   NA
 6454592 6454593 Salmonentericaenterica_010100001227 Salmonentericaenterica_010100001232     FALSE 0.190 106.000 0.000 NA   NA
 6454594 6454595 Salmonentericaenterica_010100001237 Salmonentericaenterica_010100001242     FALSE 0.007 501.000 0.000 NA   NA
 6454595 6454596 Salmonentericaenterica_010100001242 Salmonentericaenterica_010100001247     TRUE 0.661 13.000 0.105 NA   NA
 6454596 6454597 Salmonentericaenterica_010100001247 Salmonentericaenterica_010100001252     TRUE 0.939 12.000 0.158 0.046   NA
 6454598 6454599 Salmonentericaenterica_010100001257 Salmonentericaenterica_010100001262     FALSE 0.258 76.000 0.000 NA   NA
 6454599 6454600 Salmonentericaenterica_010100001262 Salmonentericaenterica_010100001267   dcd TRUE 0.504 91.000 0.098 1.000   NA
 6454601 6454602 Salmonentericaenterica_010100001272 Salmonentericaenterica_010100001277 ribD nrdR TRUE 0.782 4.000 0.277 NA N NA
 6454603 6454604 Salmonentericaenterica_010100001282 Salmonentericaenterica_010100001287     FALSE 0.018 300.000 0.000 NA   NA
 6454607 6454608 Salmonentericaenterica_010100001302 Salmonentericaenterica_010100001307   oppB TRUE 0.964 15.000 0.870 NA   NA
 6454610 6454611 Salmonentericaenterica_010100001317 Salmonentericaenterica_010100001322     TRUE 0.920 -180.000 0.100 0.005   NA
 6454614 6454615 Salmonentericaenterica_010100001337 Salmonentericaenterica_010100001342 tsf pyrH TRUE 0.573 145.000 0.416 1.000 N NA
 6454615 6454616 Salmonentericaenterica_010100001342 Salmonentericaenterica_010100001347 pyrH   FALSE 0.454 -3.000 0.000 NA   NA
 6454616 6454617 Salmonentericaenterica_010100001347 Salmonentericaenterica_010100001352   frr FALSE 0.115 147.000 0.000 NA   NA
 6454617 6454618 Salmonentericaenterica_010100001352 Salmonentericaenterica_010100001357 frr   FALSE 0.416 55.000 0.032 1.000   NA
 6454620 6454621 Salmonentericaenterica_010100001367 Salmonentericaenterica_010100001372     FALSE 0.023 278.000 0.000 NA   NA
 6454621 6454622 Salmonentericaenterica_010100001372 Salmonentericaenterica_010100001377     FALSE 0.426 -9.000 0.000 NA   NA
 6454622 6454623 Salmonentericaenterica_010100001377 Salmonentericaenterica_010100001382     FALSE 0.473 0.000 0.000 NA   NA
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 6454626 6454627 Salmonentericaenterica_010100001397 Salmonentericaenterica_010100001402     FALSE 0.430 20.000 0.000 NA   NA
 6454628 6454629 Salmonentericaenterica_010100001407 Salmonentericaenterica_010100001412     FALSE 0.473 0.000 0.000 NA   NA
 6454631 6454632 Salmonentericaenterica_010100001422 Salmonentericaenterica_010100001427     FALSE 0.157 125.000 0.000 NA   NA
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 6454640 6454641 Salmonentericaenterica_010100001467 Salmonentericaenterica_010100001472     FALSE 0.401 -40.000 0.000 NA   NA
 6454647 6454648 Salmonentericaenterica_010100001522 Salmonentericaenterica_010100001527   prfH TRUE 0.869 -3.000 0.303 NA   NA
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 6454652 6454653 Salmonentericaenterica_010100001562 Salmonentericaenterica_010100001567   hemC FALSE 0.036 235.000 0.000 NA   NA
 6454653 6454654 Salmonentericaenterica_010100001567 Salmonentericaenterica_010100001572 hemC hemD TRUE 0.986 -3.000 0.205 0.001 Y NA
 6454654 6454655 Salmonentericaenterica_010100001572 Salmonentericaenterica_010100001577 hemD   TRUE 0.971 22.000 0.600 NA Y NA
 6454657 6454658 Salmonentericaenterica_010100001597 Salmonentericaenterica_010100001602     FALSE 0.294 63.000 0.000 NA   NA
 6454659 6454660 Salmonentericaenterica_010100001607 Salmonentericaenterica_010100001612     TRUE 0.978 0.000 0.485 0.046   NA
 6454660 6454661 Salmonentericaenterica_010100001612 Salmonentericaenterica_010100001617     TRUE 0.913 15.000 0.118 0.070   NA
 6454663 6454664 Salmonentericaenterica_010100001627 Salmonentericaenterica_010100001632 glpQ glpT TRUE 0.917 5.000 0.396 NA   NA
 6454667 6454668 Salmonentericaenterica_010100001647 Salmonentericaenterica_010100001652     FALSE 0.078 144.000 0.043 NA   NA
 6454669 6454670 Salmonentericaenterica_010100001657 Salmonentericaenterica_010100001662     TRUE 0.850 38.000 0.262 1.000   NA
 6454670 6454671 Salmonentericaenterica_010100001662 Salmonentericaenterica_010100001667     FALSE 0.453 16.000 0.000 NA   NA
 6454671 6454672 Salmonentericaenterica_010100001667 Salmonentericaenterica_010100001672     FALSE 0.131 140.000 0.000 NA   NA
 6454673 6454674 Salmonentericaenterica_010100001677 Salmonentericaenterica_010100001682     TRUE 0.974 -6.000 1.000 1.000   NA
 6454675 6454676 Salmonentericaenterica_010100001697 Salmonentericaenterica_010100001702   mraW TRUE 0.952 2.000 0.635 NA   NA
 6454678 6454679 Salmonentericaenterica_010100001712 Salmonentericaenterica_010100001717     TRUE 0.677 126.000 0.455 1.000 N NA
 6454681 6454682 Salmonentericaenterica_010100001737 Salmonentericaenterica_010100001742     FALSE 0.014 334.000 0.000 NA   NA
 6454683 6454684 Salmonentericaenterica_010100001747 Salmonentericaenterica_010100001752     TRUE 0.498 8.000 0.000 NA   NA
 6454685 6454686 Salmonentericaenterica_010100001757 Salmonentericaenterica_010100001762     FALSE 0.231 71.000 0.052 NA   NA
 6454687 6454688 Salmonentericaenterica_010100001767 Salmonentericaenterica_010100001772     TRUE 0.962 -13.000 1.000 NA   NA
 6454688 6454689 Salmonentericaenterica_010100001772 Salmonentericaenterica_010100001777     FALSE 0.210 124.000 0.078 NA   NA
 6454690 6454691 Salmonentericaenterica_010100001782 Salmonentericaenterica_010100001787     TRUE 0.994 13.000 0.810 0.065 Y NA
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 6454695 6454696 Salmonentericaenterica_010100001807 Salmonentericaenterica_010100001812     FALSE 0.354 44.000 0.000 NA   NA
 6454699 6454700 Salmonentericaenterica_010100001827 Salmonentericaenterica_010100001832     TRUE 0.911 11.000 0.375 NA   NA
 6454703 6454704 Salmonentericaenterica_010100001847 Salmonentericaenterica_010100001852 aroB aroK TRUE 0.898 57.000 0.208 1.000 Y NA
 6454704 6454705 Salmonentericaenterica_010100001852 Salmonentericaenterica_010100001857 aroK hofQ FALSE 0.052 464.000 0.319 1.000 N NA
 6454705 6454706 Salmonentericaenterica_010100001857 Salmonentericaenterica_010100001862 hofQ   FALSE 0.452 -85.000 0.072 NA   NA
 6454706 6454707 Salmonentericaenterica_010100001862 Salmonentericaenterica_010100001867     TRUE 0.908 -10.000 0.444 NA   NA
 6454707 6454708 Salmonentericaenterica_010100001867 Salmonentericaenterica_010100001872     TRUE 0.874 -16.000 0.348 NA   NA
 6454708 6454709 Salmonentericaenterica_010100001872 Salmonentericaenterica_010100001877     TRUE 0.966 0.000 0.870 NA   NA
 6454712 6454713 Salmonentericaenterica_010100001892 Salmonentericaenterica_010100001897     TRUE 0.515 90.000 0.165 NA   NA
 6454715 6454716 Salmonentericaenterica_010100001907 Salmonentericaenterica_010100001912     TRUE 0.679 103.000 0.022 0.011   NA
 6454719 6454720 Salmonentericaenterica_010100001927 Salmonentericaenterica_010100001932     FALSE 0.319 56.000 0.060 NA   NA
 6454723 6454724 Salmonentericaenterica_010100001947 Salmonentericaenterica_010100001952     TRUE 0.930 -7.000 0.547 NA   NA
 6454727 6454728 Salmonentericaenterica_010100001967 Salmonentericaenterica_010100001972     TRUE 0.654 -10.000 0.124 NA   NA
 6454730 6454731 Salmonentericaenterica_010100001982 Salmonentericaenterica_010100001987     TRUE 0.966 19.000 0.355 0.045   NA
 6454731 6454732 Salmonentericaenterica_010100001987 Salmonentericaenterica_010100001992     FALSE 0.454 -3.000 0.000 NA   NA
 6454734 6454735 Salmonentericaenterica_010100002012 Salmonentericaenterica_010100002017 cobD   TRUE 0.684 -3.000 0.124 NA   NA
 6454738 6454739 Salmonentericaenterica_010100002032 Salmonentericaenterica_010100002037     TRUE 0.849 21.000 0.290 NA   NA
 6454740 6454741 Salmonentericaenterica_010100002042 Salmonentericaenterica_010100002047     FALSE 0.044 150.000 0.028 NA   NA
 6454742 6454743 Salmonentericaenterica_010100002052 Salmonentericaenterica_010100002057   putA FALSE 0.447 59.000 0.094 NA   NA
 6454747 6454748 Salmonentericaenterica_010100002077 Salmonentericaenterica_010100002082     TRUE 0.773 64.000 0.222 1.000   NA
 6454748 6454749 Salmonentericaenterica_010100002082 Salmonentericaenterica_010100002087     FALSE 0.234 -10.000 0.000 1.000 N NA
 6454750 6454751 Salmonentericaenterica_010100002092 Salmonentericaenterica_010100002097     TRUE 0.943 -6.000 0.500 1.000   NA
 6454753 6454754 Salmonentericaenterica_010100002107 Salmonentericaenterica_010100002112     FALSE 0.210 153.000 0.000 1.000   NA
 6454754 6454755 Salmonentericaenterica_010100002112 Salmonentericaenterica_010100002117     TRUE 0.988 0.000 0.833 1.000 Y NA
 6454756 6454757 Salmonentericaenterica_010100002122 Salmonentericaenterica_010100002127 carB   FALSE 0.024 274.000 0.000 NA   NA
 6454760 6454761 Salmonentericaenterica_010100002142 Salmonentericaenterica_010100002147   cysG FALSE 0.472 12.000 0.087 1.000 N NA
 6454765 6454766 Salmonentericaenterica_010100002197 Salmonentericaenterica_010100002202     FALSE 0.203 100.000 0.000 NA   NA
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 6454770 6454771 Salmonentericaenterica_010100002232 Salmonentericaenterica_010100002237     TRUE 0.845 10.000 0.000 NA Y NA
 6454771 6454772 Salmonentericaenterica_010100002237 Salmonentericaenterica_010100002242     FALSE 0.404 26.000 0.000 NA   NA
 6454773 6454774 Salmonentericaenterica_010100002257 Salmonentericaenterica_010100002262     FALSE 0.007 505.000 0.000 NA   NA
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 6454777 6454778 Salmonentericaenterica_010100002277 Salmonentericaenterica_010100002282     FALSE 0.228 205.000 0.220 NA   NA
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 6454783 6454784 Salmonentericaenterica_010100t02314 Salmonentericaenterica_010100002307     FALSE 0.091 161.000 0.000 NA   NA
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 6454786 6454787 Salmonentericaenterica_010100t02326 Salmonentericaenterica_010100002319     FALSE 0.093 160.000 0.000 NA   NA
 6454788 6454789 Salmonentericaenterica_010100002326 Salmonentericaenterica_010100002331     TRUE 0.827 37.000 0.000 0.069   NA
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 6454796 6454797 Salmonentericaenterica_010100002366 Salmonentericaenterica_010100002371     FALSE 0.218 94.000 0.000 NA   NA
 6454797 6454798 Salmonentericaenterica_010100002371 Salmonentericaenterica_010100002376     TRUE 0.936 -22.000 0.650 NA   NA
 6454799 6454800 Salmonentericaenterica_010100002381 Salmonentericaenterica_010100002386     TRUE 0.977 11.000 0.439 0.052   NA
 6454802 6454803 Salmonentericaenterica_010100002396 Salmonentericaenterica_010100002401     FALSE 0.016 308.000 0.000 NA   NA
 6454807 6454808 Salmonentericaenterica_010100002431 Salmonentericaenterica_010100002436 psd   TRUE 0.712 19.000 0.148 NA   NA
 6454810 6454811 Salmonentericaenterica_010100002446 Salmonentericaenterica_010100002451 thiG thiH FALSE 0.454 -3.000 0.000 NA   NA
 6454814 6454815 Salmonentericaenterica_010100002476 Salmonentericaenterica_010100002481     FALSE 0.035 236.000 0.000 NA   NA
 6454816 6454817 Salmonentericaenterica_010100002486 Salmonentericaenterica_010100002501 potC potB FALSE 0.004 1657.000 0.000 NA   NA
 6454817 6454818 Salmonentericaenterica_010100002501 Salmonentericaenterica_010100002506 potB potA TRUE 0.983 -16.000 0.789 1.000 Y NA
 6454820 6454821 Salmonentericaenterica_010100002516 Salmonentericaenterica_010100002521     TRUE 0.874 -3.000 0.315 NA   NA
 6454821 6454822 Salmonentericaenterica_010100002521 Salmonentericaenterica_010100002526     TRUE 0.493 41.000 0.089 NA   NA
 6454822 6454823 Salmonentericaenterica_010100002526 Salmonentericaenterica_010100002531     TRUE 0.571 53.000 0.126 NA   NA
 6454823 6454824 Salmonentericaenterica_010100002531 Salmonentericaenterica_010100002536     TRUE 0.588 -3.000 0.089 NA   NA
 6454825 6454826 Salmonentericaenterica_010100002541 Salmonentericaenterica_010100002546 eutD   TRUE 0.610 -3.000 0.048 1.000   NA
 6454826 6454827 Salmonentericaenterica_010100002546 Salmonentericaenterica_010100002551     TRUE 0.812 -3.000 0.214 NA   NA
 6454833 6454834 Salmonentericaenterica_010100002591 Salmonentericaenterica_010100002596     FALSE 0.151 129.000 0.000 NA   NA
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 6454835 6454836 Salmonentericaenterica_010100002601 Salmonentericaenterica_010100002606     TRUE 0.855 57.000 0.429 NA   NA
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 6455063 6455064 Salmonentericaenterica_010100003952 Salmonentericaenterica_010100003957 napB napH TRUE 0.723 202.000 0.316 0.003   NA
 6455064 6455065 Salmonentericaenterica_010100003957 Salmonentericaenterica_010100003962 napH napG TRUE 0.964 -13.000 0.795 1.000   NA
 6455066 6455067 Salmonentericaenterica_010100003967 Salmonentericaenterica_010100003972     TRUE 0.570 68.000 0.154 NA   NA
 6455070 6455071 Salmonentericaenterica_010100003997 Salmonentericaenterica_010100004002     FALSE 0.463 -3.000 0.063 NA   NA
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 6455075 6455076 Salmonentericaenterica_010100004032 Salmonentericaenterica_010100004037     TRUE 0.934 -3.000 0.531 NA   NA
 6455077 6455078 Salmonentericaenterica_010100004042 Salmonentericaenterica_010100004047     FALSE 0.473 0.000 0.000 NA   NA
 6455078 6455079 Salmonentericaenterica_010100004047 Salmonentericaenterica_010100004052     FALSE 0.042 158.000 0.000 1.000 N NA
 6455079 6455080 Salmonentericaenterica_010100004052 Salmonentericaenterica_010100004057     FALSE 0.020 288.000 0.000 NA   NA
 6455082 6455083 Salmonentericaenterica_010100004077 Salmonentericaenterica_010100004082     FALSE 0.072 181.000 0.000 NA   NA
 6455083 6455084 Salmonentericaenterica_010100004082 Salmonentericaenterica_010100004087     FALSE 0.025 367.000 0.000 1.000   NA
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 6455091 6455092 Salmonentericaenterica_010100004122 Salmonentericaenterica_010100004127     FALSE 0.032 243.000 0.000 NA   NA
 6455092 6455093 Salmonentericaenterica_010100004127 Salmonentericaenterica_010100004132     FALSE 0.139 136.000 0.000 NA   NA
 6455093 6455094 Salmonentericaenterica_010100004132 Salmonentericaenterica_010100004137     FALSE 0.052 204.000 0.000 NA   NA
 6455094 6455095 Salmonentericaenterica_010100004137 Salmonentericaenterica_010100004152     FALSE 0.008 479.000 0.000 NA   NA
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 6455099 6455100 Salmonentericaenterica_010100004172 Salmonentericaenterica_010100004177     TRUE 0.936 2.000 0.500 NA   NA
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 6455102 6455103 Salmonentericaenterica_010100004187 Salmonentericaenterica_010100004202     FALSE 0.004 1284.000 0.000 NA   NA
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 6455120 6455121 Salmonentericaenterica_010100004307 Salmonentericaenterica_010100004312 fliR fliQ TRUE 0.968 9.000 0.028 0.002 Y NA
 6455121 6455122 Salmonentericaenterica_010100004312 Salmonentericaenterica_010100004317 fliQ fliP TRUE 0.996 10.000 0.827 0.012 Y NA
 6455122 6455123 Salmonentericaenterica_010100004317 Salmonentericaenterica_010100004322 fliP   FALSE 0.473 0.000 0.000 NA   NA
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 6455131 6455132 Salmonentericaenterica_010100004382 Salmonentericaenterica_010100004387   lnt TRUE 0.918 20.000 0.557 1.000 N NA
 6455133 6455134 Salmonentericaenterica_010100004392 Salmonentericaenterica_010100004397     FALSE 0.463 15.000 0.000 NA   NA
 6455134 6455135 Salmonentericaenterica_010100004397 Salmonentericaenterica_010100004402     FALSE 0.139 136.000 0.000 NA   NA
 6455141 6455142 Salmonentericaenterica_010100004457 Salmonentericaenterica_010100004462 mraY murD TRUE 0.990 3.000 0.647 0.004   NA
 6455142 6455143 Salmonentericaenterica_010100004462 Salmonentericaenterica_010100004477 murD murG FALSE 0.004 1242.000 0.002 1.000   NA
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 6455155 6455156 Salmonentericaenterica_010100004537 Salmonentericaenterica_010100004542     TRUE 0.961 5.000 0.265 1.000 Y NA
 6455158 6455159 Salmonentericaenterica_010100004552 Salmonentericaenterica_010100004557   gabD TRUE 0.621 22.000 0.000 1.000   NA
 6455159 6455160 Salmonentericaenterica_010100004557 Salmonentericaenterica_010100004562 gabD   TRUE 0.908 15.000 0.303 1.000   NA
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 6455163 6455164 Salmonentericaenterica_010100004587 Salmonentericaenterica_010100004592     FALSE 0.454 -3.000 0.000 NA   NA
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 6455166 6455167 Salmonentericaenterica_010100004602 Salmonentericaenterica_010100004607     TRUE 0.943 0.000 0.000 0.001   NA
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 6455172 6455173 Salmonentericaenterica_010100004652 Salmonentericaenterica_010100004657   aroE FALSE 0.056 5.000 0.087 NA N NA
 6455173 6455174 Salmonentericaenterica_010100004657 Salmonentericaenterica_010100004662 aroE   FALSE 0.336 -3.000 0.043 NA   NA
 6455174 6455175 Salmonentericaenterica_010100004662 Salmonentericaenterica_010100004667     FALSE 0.395 -114.000 0.000 NA   NA
 6455177 6455178 Salmonentericaenterica_010100004677 Salmonentericaenterica_010100004682     TRUE 0.642 3.000 0.046 1.000   NA
 6455182 6455183 Salmonentericaenterica_010100004702 Salmonentericaenterica_010100004707   alr FALSE 0.314 186.000 0.181 1.000   NA
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 6455191 6455192 Salmonentericaenterica_010100004767 Salmonentericaenterica_010100004772     FALSE 0.000 776.000 0.000 NA N NA
 6455197 6455198 Salmonentericaenterica_010100004797 Salmonentericaenterica_010100004802 rpsC rplV TRUE 0.994 18.000 0.719 0.013 Y NA
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 6455199 6455200 Salmonentericaenterica_010100004807 Salmonentericaenterica_010100004812 rpsS rplB TRUE 0.989 17.000 0.820 0.013   NA
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 6455270 6455271 Salmonentericaenterica_010100005192 Salmonentericaenterica_010100005197     FALSE 0.237 72.000 0.053 NA   NA
 6455272 6455273 Salmonentericaenterica_010100005202 Salmonentericaenterica_010100005207 malF malG TRUE 0.962 15.000 0.814 NA   NA
 6455275 6455276 Salmonentericaenterica_010100005227 Salmonentericaenterica_010100005232   dsbG FALSE 0.015 319.000 0.000 NA   NA
 6455278 6455279 Salmonentericaenterica_010100005252 Salmonentericaenterica_010100005257     FALSE 0.409 20.000 0.057 NA   NA
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 6455534 6455535 Salmonentericaenterica_010100006814 Salmonentericaenterica_010100006819 glpK   FALSE 0.236 21.000 0.000 1.000 N NA
 6455536 6455537 Salmonentericaenterica_010100006824 Salmonentericaenterica_010100006829   ulaD TRUE 0.964 14.000 0.328 1.000 Y NA
 6455537 6455538 Salmonentericaenterica_010100006829 Salmonentericaenterica_010100006834 ulaD   TRUE 0.862 10.000 0.250 NA   NA
 6455539 6455540 Salmonentericaenterica_010100006839 Salmonentericaenterica_010100006844     TRUE 0.911 -28.000 0.003 0.000   NA
 6455540 6455541 Salmonentericaenterica_010100006844 Salmonentericaenterica_010100006849     FALSE 0.005 180.000 0.002 NA   NA
 6455547 6455548 Salmonentericaenterica_010100006889 Salmonentericaenterica_010100006894     FALSE 0.017 304.000 0.000 NA   NA
 6455548 6455549 Salmonentericaenterica_010100006894 Salmonentericaenterica_010100006899     FALSE 0.006 613.000 0.000 NA   NA
 6455552 6455553 Salmonentericaenterica_010100006914 Salmonentericaenterica_010100006919     FALSE 0.127 142.000 0.000 NA   NA
 6455554 6455555 Salmonentericaenterica_010100006924 Salmonentericaenterica_010100006929     FALSE 0.470 14.000 0.000 NA   NA
 6455556 6455557 Salmonentericaenterica_010100006934 Salmonentericaenterica_010100006939     TRUE 0.901 4.000 0.333 NA   NA
 6455558 6455559 Salmonentericaenterica_010100006944 Salmonentericaenterica_010100006949   rpsO FALSE 0.101 212.000 0.000 1.000   NA
 6455559 6455560 Salmonentericaenterica_010100006949 Salmonentericaenterica_010100006954 rpsO truB TRUE 0.482 151.000 0.211 1.000   NA
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 6455565 6455566 Salmonentericaenterica_010100006979 Salmonentericaenterica_010100006984     FALSE 0.047 -3.000 0.004 NA   NA
 6455570 6455571 Salmonentericaenterica_010100007014 Salmonentericaenterica_010100007019     FALSE 0.442 18.000 0.000 NA   NA
 6455572 6455573 Salmonentericaenterica_010100007024 Salmonentericaenterica_010100007029     FALSE 0.016 310.000 0.000 NA   NA
 6455574 6455575 Salmonentericaenterica_010100007034 Salmonentericaenterica_010100007039     TRUE 0.957 7.000 0.667 NA   NA
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 6455578 6455579 Salmonentericaenterica_010100007054 Salmonentericaenterica_010100007059     FALSE 0.421 22.000 0.000 NA   NA
 6455586 6455587 Salmonentericaenterica_010100007109 Salmonentericaenterica_010100007114     TRUE 0.939 25.000 0.667 NA   NA
 6455587 6455588 Salmonentericaenterica_010100007114 Salmonentericaenterica_010100007119     TRUE 0.724 153.000 0.667 NA   NA
 6455588 6455589 Salmonentericaenterica_010100007119 Salmonentericaenterica_010100007124     TRUE 0.861 -3.000 0.286 NA   NA
 6455589 6455590 Salmonentericaenterica_010100007124 Salmonentericaenterica_010100007129     TRUE 0.871 -7.000 0.238 1.000   NA
 6455590 6455591 Salmonentericaenterica_010100007129 Salmonentericaenterica_010100007134     TRUE 0.959 -43.000 1.000 NA   NA
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 6455594 6455595 Salmonentericaenterica_010100007159 Salmonentericaenterica_010100007164     FALSE 0.028 257.000 0.000 NA   NA
 6455596 6455597 Salmonentericaenterica_010100007169 Salmonentericaenterica_010100007174     TRUE 0.979 -9.000 0.625 1.000 Y NA
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 6455605 6455606 Salmonentericaenterica_010100007224 Salmonentericaenterica_010100007229     FALSE 0.454 -3.000 0.000 NA   NA
 6455606 6455607 Salmonentericaenterica_010100007229 Salmonentericaenterica_010100007234     FALSE 0.009 427.000 0.000 NA   NA
 6455608 6455609 Salmonentericaenterica_010100007239 Salmonentericaenterica_010100007244     FALSE 0.015 317.000 0.000 NA   NA
 6455609 6455610 Salmonentericaenterica_010100007244 Salmonentericaenterica_010100007249     TRUE 0.716 -3.000 0.086 1.000   NA
 6455612 6455613 Salmonentericaenterica_010100007259 Salmonentericaenterica_010100007264     FALSE 0.100 99.000 0.032 NA   NA
 6455613 6455614 Salmonentericaenterica_010100007264 Salmonentericaenterica_010100007269     FALSE 0.386 -3.000 0.129 NA N NA
 6455615 6455616 Salmonentericaenterica_010100007274 Salmonentericaenterica_010100007279 flgI flgH TRUE 0.931 12.000 0.073 0.005   NA
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 6455618 6455619 Salmonentericaenterica_010100007289 Salmonentericaenterica_010100007294     TRUE 0.819 -3.000 0.220 NA   NA
 6455620 6455621 Salmonentericaenterica_010100007299 Salmonentericaenterica_010100007304     FALSE 0.032 324.000 0.000 1.000   NA
 6455622 6455623 Salmonentericaenterica_010100007309 Salmonentericaenterica_010100007314     FALSE 0.425 21.000 0.000 NA   NA
 6455624 6455625 Salmonentericaenterica_010100007319 Salmonentericaenterica_010100007324   fruK TRUE 0.915 0.000 0.112 1.000 Y NA
 6455625 6455626 Salmonentericaenterica_010100007324 Salmonentericaenterica_010100007329 fruK   TRUE 0.979 17.000 0.562 1.000 Y NA
 6455627 6455628 Salmonentericaenterica_010100007334 Salmonentericaenterica_010100007339     FALSE 0.159 79.000 0.040 NA   NA
 6455630 6455631 Salmonentericaenterica_010100007349 Salmonentericaenterica_010100007354     FALSE 0.463 15.000 0.000 NA   NA
 6455631 6455632 Salmonentericaenterica_010100007354 Salmonentericaenterica_010100007364     FALSE 0.006 582.000 0.000 NA   NA
 6455632 6455633 Salmonentericaenterica_010100007364 Salmonentericaenterica_010100007374     FALSE 0.005 877.000 0.000 NA   NA
 6455634 6455635 Salmonentericaenterica_010100007379 Salmonentericaenterica_010100007384     TRUE 0.840 91.000 0.147 0.014   NA
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 6455636 6455637 Salmonentericaenterica_010100007389 Salmonentericaenterica_010100007394     TRUE 0.966 15.000 0.911 NA   NA
 6455637 6455638 Salmonentericaenterica_010100007394 Salmonentericaenterica_010100007399     FALSE 0.115 147.000 0.000 NA   NA
 6455638 6455639 Salmonentericaenterica_010100007399 Salmonentericaenterica_010100007404     FALSE 0.129 141.000 0.000 NA   NA
 6455640 6455641 Salmonentericaenterica_010100007409 Salmonentericaenterica_010100007414   fabG TRUE 0.943 13.000 0.432 1.000   NA
 6455641 6455642 Salmonentericaenterica_010100007414 Salmonentericaenterica_010100007419 fabG   TRUE 0.921 156.000 0.321 0.003 Y NA
 6455642 6455643 Salmonentericaenterica_010100007419 Salmonentericaenterica_010100007424     TRUE 0.910 86.000 0.346 1.000 Y NA
 6455643 6455644 Salmonentericaenterica_010100007424 Salmonentericaenterica_010100007429     FALSE 0.387 124.000 0.187 1.000 N NA
 6455649 6455650 Salmonentericaenterica_010100007484 Salmonentericaenterica_010100007489 secE nusG FALSE 0.054 2.000 0.037 1.000 N NA
 6455650 6455651 Salmonentericaenterica_010100007489 Salmonentericaenterica_010100007494 nusG rplK TRUE 0.671 158.000 0.681 1.000 N NA
 6455651 6455652 Salmonentericaenterica_010100007494 Salmonentericaenterica_010100007499 rplK rplA TRUE 0.992 4.000 0.838 0.010   NA
 6455654 6455655 Salmonentericaenterica_010100007509 Salmonentericaenterica_010100007514 xni   FALSE 0.011 171.000 0.044 1.000 N NA
 6455655 6455656 Salmonentericaenterica_010100007514 Salmonentericaenterica_010100007519     TRUE 0.728 59.000 0.238 NA   NA
 6455658 6455659 Salmonentericaenterica_010100007529 Salmonentericaenterica_010100007534     TRUE 0.987 35.000 0.361 0.002 Y NA
 6455659 6455660 Salmonentericaenterica_010100007534 Salmonentericaenterica_010100007539   flgA TRUE 0.865 92.000 0.330 NA Y NA
 6455665 6455666 Salmonentericaenterica_010100007579 Salmonentericaenterica_010100007584   fixB TRUE 0.822 16.000 0.000 NA Y NA
 6455666 6455667 Salmonentericaenterica_010100007584 Salmonentericaenterica_010100007589 fixB fixB FALSE 0.402 -36.000 0.000 NA   NA
 6455668 6455669 Salmonentericaenterica_010100007604 Salmonentericaenterica_010100007609     TRUE 0.952 -13.000 0.037 0.005 Y NA
 6455669 6455670 Salmonentericaenterica_010100007609 Salmonentericaenterica_010100007614     FALSE 0.104 36.000 0.049 1.000 N NA
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 6455675 6455676 Salmonentericaenterica_010100007636 Salmonentericaenterica_010100007641     FALSE 0.061 190.000 0.000 NA   NA
 6455679 6455680 Salmonentericaenterica_010100007656 Salmonentericaenterica_010100007661     TRUE 0.931 16.000 0.508 NA   NA
 6455683 6455684 Salmonentericaenterica_010100007676 Salmonentericaenterica_010100007681     TRUE 0.917 -13.000 0.500 NA   NA
 6455690 6455691 Salmonentericaenterica_010100007721 Salmonentericaenterica_010100007726     FALSE 0.004 227.000 0.043 1.000 N NA
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 6455697 6455698 Salmonentericaenterica_010100007766 Salmonentericaenterica_010100007771     TRUE 0.980 -3.000 0.186 0.006 Y NA
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 6455705 6455706 Salmonentericaenterica_010100007816 Salmonentericaenterica_010100007821     FALSE 0.262 86.000 0.016 1.000   NA
 6455708 6455709 Salmonentericaenterica_010100007831 Salmonentericaenterica_010100007836     TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA Y NA
 6455710 6455711 Salmonentericaenterica_010100007851 Salmonentericaenterica_010100007856   gidB FALSE 0.210 97.000 0.000 NA   NA
 6455712 6455713 Salmonentericaenterica_010100007861 Salmonentericaenterica_010100007866 dnaG   TRUE 0.780 150.000 0.299 0.052   NA
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 6455719 6455720 Salmonentericaenterica_010100007896 Salmonentericaenterica_010100007901 wcaM   FALSE 0.347 178.000 0.259 NA   NA
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 6455727 6455728 Salmonentericaenterica_010100007956 Salmonentericaenterica_010100007961     TRUE 0.551 28.000 0.095 NA   NA
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 6455731 6455732 Salmonentericaenterica_010100007986 Salmonentericaenterica_010100007991     FALSE 0.005 807.000 0.000 NA   NA
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 6455734 6455735 Salmonentericaenterica_010100008001 Salmonentericaenterica_010100008006     FALSE 0.378 33.000 0.000 NA   NA
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 6455738 6455739 Salmonentericaenterica_010100008021 Salmonentericaenterica_010100008026     FALSE 0.014 335.000 0.000 NA   NA
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 6455742 6455743 Salmonentericaenterica_010100008041 Salmonentericaenterica_010100008056     FALSE 0.003 1832.000 0.000 NA   NA
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 6456010 6456011 Salmonentericaenterica_010100009613 Salmonentericaenterica_010100009618     FALSE 0.020 288.000 0.000 NA   NA
 6456017 6456018 Salmonentericaenterica_010100009642 Salmonentericaenterica_010100009647     TRUE 0.645 17.000 0.000 1.000   NA
 6456020 6456021 Salmonentericaenterica_010100009657 Salmonentericaenterica_010100009662     FALSE 0.306 59.000 0.000 NA   NA
 6456022 6456023 Salmonentericaenterica_010100009667 Salmonentericaenterica_010100009672     FALSE 0.240 38.000 0.038 NA   NA
 6456023 6456024 Salmonentericaenterica_010100009672 Salmonentericaenterica_010100009677     FALSE 0.004 220.000 0.010 NA   NA
 6456026 6456027 Salmonentericaenterica_010100009687 Salmonentericaenterica_010100009692     FALSE 0.080 172.000 0.000 NA   NA
 6456028 6456029 Salmonentericaenterica_010100009707 Salmonentericaenterica_010100009712     TRUE 0.843 51.000 0.364 NA   NA
 6456029 6456030 Salmonentericaenterica_010100009712 Salmonentericaenterica_010100009717     TRUE 0.845 -10.000 0.286 NA   NA
 6456030 6456031 Salmonentericaenterica_010100009717 Salmonentericaenterica_010100009722     FALSE 0.393 32.000 0.008 1.000   NA
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 6456036 6456037 Salmonentericaenterica_010100009754 Salmonentericaenterica_010100009759 ubiA ubiC TRUE 0.847 14.000 0.248 NA   NA
 6456040 6456041 Salmonentericaenterica_010100009774 Salmonentericaenterica_010100009779     TRUE 0.651 242.000 0.551 1.000 Y NA
 6456044 6456045 Salmonentericaenterica_010100009804 Salmonentericaenterica_010100009809     FALSE 0.338 122.000 0.125 NA   NA
 6456045 6456046 Salmonentericaenterica_010100009809 Salmonentericaenterica_010100009814     FALSE 0.072 209.000 0.083 NA   NA
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 6456051 6456052 Salmonentericaenterica_010100009839 Salmonentericaenterica_010100009844     FALSE 0.263 74.000 0.000 NA   NA
 6456052 6456053 Salmonentericaenterica_010100009844 Salmonentericaenterica_010100009849     FALSE 0.454 -3.000 0.000 NA   NA
 6456054 6456055 Salmonentericaenterica_010100009854 Salmonentericaenterica_010100009859     FALSE 0.051 206.000 0.000 NA   NA
 6456055 6456056 Salmonentericaenterica_010100009859 Salmonentericaenterica_010100009864     TRUE 0.907 8.000 0.069 0.044   NA
 6456057 6456058 Salmonentericaenterica_010100009869 Salmonentericaenterica_010100009874     FALSE 0.343 107.000 0.000 1.000   NA
 6456058 6456059 Salmonentericaenterica_010100009874 Salmonentericaenterica_010100009879     FALSE 0.238 85.000 0.000 NA   NA
 6456059 6456060 Salmonentericaenterica_010100009879 Salmonentericaenterica_010100009884     FALSE 0.189 107.000 0.000 NA   NA
 6456067 6456068 Salmonentericaenterica_010100009919 Salmonentericaenterica_010100009924     TRUE 0.494 10.000 0.000 NA   NA
 6456070 6456071 Salmonentericaenterica_010100009934 Salmonentericaenterica_010100009939     FALSE 0.205 240.000 0.333 1.000 N NA
 6456071 6456072 Salmonentericaenterica_010100009939 Salmonentericaenterica_010100009944     TRUE 0.984 37.000 0.429 0.038 Y NA
 6456072 6456073 Salmonentericaenterica_010100009944 Salmonentericaenterica_010100009949     FALSE 0.198 120.000 0.020 1.000   NA
 6456075 6456076 Salmonentericaenterica_010100009979 Salmonentericaenterica_010100009984   rfaD TRUE 0.752 3.000 0.146 NA   NA
 6456076 6456077 Salmonentericaenterica_010100009984 Salmonentericaenterica_010100009989 rfaD rfaD TRUE 0.932 0.000 0.006 0.000   NA
 6456078 6456079 Salmonentericaenterica_010100009994 Salmonentericaenterica_010100009999     TRUE 0.822 -3.000 0.222 NA   NA
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 6456084 6456085 Salmonentericaenterica_010100010034 Salmonentericaenterica_010100010039     TRUE 0.608 3.000 0.086 NA   NA
 6456087 6456088 Salmonentericaenterica_010100010049 Salmonentericaenterica_010100010054 livF   FALSE 0.065 188.000 0.000 NA   NA
 6456088 6456089 Salmonentericaenterica_010100010054 Salmonentericaenterica_010100010059     FALSE 0.038 232.000 0.000 NA   NA
 6456092 6456093 Salmonentericaenterica_010100010084 Salmonentericaenterica_010100010089     FALSE 0.071 241.000 0.000 1.000   NA
 6456094 6456095 Salmonentericaenterica_010100010094 Salmonentericaenterica_010100010099 pdxA   TRUE 0.957 0.000 0.561 1.000   NA
 6456097 6456098 Salmonentericaenterica_010100010109 Salmonentericaenterica_010100010114     FALSE 0.210 97.000 0.000 NA   NA
 6456098 6456099 Salmonentericaenterica_010100010114 Salmonentericaenterica_010100010119     TRUE 0.492 3.000 0.000 NA   NA
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 6456104 6456105 Salmonentericaenterica_010100010144 Salmonentericaenterica_010100010149     FALSE 0.010 387.000 0.000 NA   NA
 6456105 6456106 Salmonentericaenterica_010100010149 Salmonentericaenterica_010100010154     FALSE 0.155 177.000 0.000 1.000   NA
 6456108 6456109 Salmonentericaenterica_010100010164 Salmonentericaenterica_010100010169     FALSE 0.005 730.000 0.000 NA   NA
 6456110 6456111 Salmonentericaenterica_010100010184 Salmonentericaenterica_010100010189     FALSE 0.010 388.000 0.000 NA   NA
 6456121 6456122 Salmonentericaenterica_010100010239 Salmonentericaenterica_010100010244 glnL glnG TRUE 0.983 9.000 0.587 0.083   NA
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 6456129 6456130 Salmonentericaenterica_010100010279 Salmonentericaenterica_010100010284   rpsT FALSE 0.332 53.000 0.000 NA   NA
 6456131 6456132 Salmonentericaenterica_010100010289 Salmonentericaenterica_010100010294     FALSE 0.287 155.000 0.161 NA   NA
 6456132 6456133 Salmonentericaenterica_010100010294 Salmonentericaenterica_010100010299     TRUE 0.782 -3.000 0.185 NA   NA
 6456133 6456134 Salmonentericaenterica_010100010299 Salmonentericaenterica_010100010304     TRUE 0.807 3.000 0.185 NA   NA
 6456134 6456135 Salmonentericaenterica_010100010304 Salmonentericaenterica_010100010309     TRUE 0.935 -13.000 0.609 NA   NA
 6456135 6456136 Salmonentericaenterica_010100010309 Salmonentericaenterica_010100010314     TRUE 0.759 145.000 0.684 NA   NA
 6456136 6456137 Salmonentericaenterica_010100010314 Salmonentericaenterica_010100010319     TRUE 0.943 4.000 0.529 NA   NA
 6456137 6456138 Salmonentericaenterica_010100010319 Salmonentericaenterica_010100010324     FALSE 0.008 450.000 0.000 NA   NA
 6456139 6456140 Salmonentericaenterica_010100010329 Salmonentericaenterica_010100010334 rbsC   TRUE 0.979 25.000 0.847 NA Y NA
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 6456146 6456147 Salmonentericaenterica_010100010379 Salmonentericaenterica_010100010384     FALSE 0.315 165.000 0.208 NA   NA
 6456151 6456152 Salmonentericaenterica_010100010404 Salmonentericaenterica_010100010409     FALSE 0.009 416.000 0.000 NA   NA
 6456153 6456154 Salmonentericaenterica_010100010414 Salmonentericaenterica_010100010419     TRUE 0.939 27.000 0.247 1.000 Y NA
 6456154 6456155 Salmonentericaenterica_010100010419 Salmonentericaenterica_010100010424     TRUE 0.965 5.000 0.624 1.000   NA
 6456156 6456157 Salmonentericaenterica_010100010429 Salmonentericaenterica_010100010434     TRUE 0.765 19.000 0.119 1.000   NA
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 6456161 6456162 Salmonentericaenterica_010100010454 Salmonentericaenterica_010100010459     TRUE 0.688 85.000 0.200 1.000   NA
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 6456175 6456176 Salmonentericaenterica_010100010544 Salmonentericaenterica_010100010549     TRUE 0.791 1.000 0.023 NA Y NA
 6456178 6456179 Salmonentericaenterica_010100010569 Salmonentericaenterica_010100010574 mglC   TRUE 0.964 16.000 0.905 NA   NA
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 6456182 6456183 Salmonentericaenterica_010100010589 Salmonentericaenterica_010100010594     FALSE 0.436 41.000 0.025 1.000   NA
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 6456195 6456196 Salmonentericaenterica_010100010674 Salmonentericaenterica_010100010679 leuO leuO FALSE 0.396 -106.000 0.000 NA   NA
 6456196 6456197 Salmonentericaenterica_010100010679 Salmonentericaenterica_010100010684 leuO   FALSE 0.013 346.000 0.000 NA   NA
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 6456203 6456204 Salmonentericaenterica_010100010711 Salmonentericaenterica_010100010716     FALSE 0.264 142.000 0.119 NA   NA
 6456207 6456208 Salmonentericaenterica_010100010731 Salmonentericaenterica_010100010736     TRUE 0.579 169.000 0.385 1.000   NA
 6456212 6456213 Salmonentericaenterica_010100010756 Salmonentericaenterica_010100010761 aceF   TRUE 0.523 202.000 0.463 1.000   NA
 6456213 6456214 Salmonentericaenterica_010100010761 Salmonentericaenterica_010100010766     FALSE 0.020 288.000 0.000 NA   NA
 6456215 6456216 Salmonentericaenterica_010100010771 Salmonentericaenterica_010100010776     TRUE 0.921 13.000 0.429 NA   NA
 6456217 6456218 Salmonentericaenterica_010100010781 Salmonentericaenterica_010100010786     TRUE 0.894 54.000 0.538 NA   NA
 6456219 6456220 Salmonentericaenterica_010100010791 Salmonentericaenterica_010100010806     FALSE 0.008 486.000 0.000 NA   NA
 6456220 6456221 Salmonentericaenterica_010100010806 Salmonentericaenterica_010100010811     FALSE 0.399 -7.000 0.055 NA   NA
 6456221 6456222 Salmonentericaenterica_010100010811 Salmonentericaenterica_010100010816     TRUE 0.935 28.000 0.667 NA   NA
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 6456232 6456233 Salmonentericaenterica_010100010876 Salmonentericaenterica_010100010881     FALSE 0.006 664.000 0.000 NA   NA
 6456234 6456235 Salmonentericaenterica_010100010886 Salmonentericaenterica_010100t10893     FALSE 0.009 405.000 0.000 NA   NA
 6456237 6456238 Salmonentericaenterica_010100010908 Salmonentericaenterica_010100010913 tatE   FALSE 0.431 -7.000 0.000 NA   NA
 6456239 6456240 Salmonentericaenterica_010100010918 Salmonentericaenterica_010100010923     FALSE 0.403 88.000 0.000 1.000   NA
 6456241 6456242 Salmonentericaenterica_010100010928 Salmonentericaenterica_010100010933 metL   TRUE 0.944 3.000 0.428 1.000   NA
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 6456251 6456252 Salmonentericaenterica_010100011003 Salmonentericaenterica_010100011008     TRUE 0.947 -3.000 0.313 NA Y NA
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 6456268 6456269 Salmonentericaenterica_010100011108 Salmonentericaenterica_010100011113   btuE FALSE 0.461 92.000 0.084 1.000   NA
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 6456525 6456526 Salmonentericaenterica_010100012587 Salmonentericaenterica_010100012592     FALSE 0.099 156.000 0.000 NA   NA
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 6456541 6456542 Salmonentericaenterica_010100012677 Salmonentericaenterica_010100012682     FALSE 0.010 186.000 0.014 NA   NA
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 6456547 6456548 Salmonentericaenterica_010100012707 Salmonentericaenterica_010100012712 mdoG   TRUE 0.915 -7.000 0.469 NA   NA
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 6456577 6456578 Salmonentericaenterica_010100012887 Salmonentericaenterica_010100012892     TRUE 0.863 -27.000 0.333 NA   NA
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 6456598 6456599 Salmonentericaenterica_010100013009 Salmonentericaenterica_010100013014     TRUE 0.943 20.000 0.115 0.002   NA
 6456602 6456603 Salmonentericaenterica_010100013029 Salmonentericaenterica_010100013034   fliN TRUE 0.975 0.000 0.443 1.000 Y NA
 6456603 6456604 Salmonentericaenterica_010100013034 Salmonentericaenterica_010100013039 fliN fliM TRUE 0.708 -3.000 0.137 NA   NA
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 6456610 6456611 Salmonentericaenterica_010100013119 Salmonentericaenterica_010100013124 fmt def TRUE 0.956 16.000 0.058 0.014 Y NA
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 6456618 6456619 Salmonentericaenterica_010100013159 Salmonentericaenterica_010100013164     TRUE 0.972 -3.000 0.875 1.000   NA
 6456622 6456623 Salmonentericaenterica_010100013189 Salmonentericaenterica_010100013194 artP   TRUE 0.960 18.000 0.323 1.000 Y NA
 6456624 6456625 Salmonentericaenterica_010100013199 Salmonentericaenterica_010100013204     TRUE 0.949 165.000 0.474 0.001 Y NA
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 6456626 6456627 Salmonentericaenterica_010100013209 Salmonentericaenterica_010100013214     FALSE 0.404 26.000 0.000 NA   NA
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 6456641 6456642 Salmonentericaenterica_010100013284 Salmonentericaenterica_010100013289     FALSE 0.408 -22.000 0.000 NA   NA
 6456642 6456643 Salmonentericaenterica_010100013289 Salmonentericaenterica_010100013294     TRUE 0.939 33.000 0.739 NA   NA
 6456647 6456648 Salmonentericaenterica_010100013314 Salmonentericaenterica_010100013319 znuC znuB TRUE 0.993 -3.000 0.755 0.080 Y NA
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 6456651 6456652 Salmonentericaenterica_010100013334 Salmonentericaenterica_010100013339     TRUE 0.870 96.000 0.022 0.006 Y NA
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 6456654 6456655 Salmonentericaenterica_010100013349 Salmonentericaenterica_010100013354 rplL rpoB FALSE 0.114 319.000 0.223 1.000   NA
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 6456658 6456659 Salmonentericaenterica_010100013369 Salmonentericaenterica_010100013374 ilvH   TRUE 0.918 0.000 0.026 0.002   NA
 6456663 6456664 Salmonentericaenterica_010100013394 Salmonentericaenterica_010100013399   deoA TRUE 0.888 52.000 0.398 1.000   NA
 6456664 6456665 Salmonentericaenterica_010100013399 Salmonentericaenterica_010100013404 deoA   TRUE 0.691 175.000 0.286 1.000 Y NA
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 6456667 6456668 Salmonentericaenterica_010100013414 Salmonentericaenterica_010100013419     TRUE 0.931 -10.000 0.571 NA   NA
 6456668 6456669 Salmonentericaenterica_010100013419 Salmonentericaenterica_010100013424     FALSE 0.266 73.000 0.000 NA   NA
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 6456684 6456685 Salmonentericaenterica_010100013499 Salmonentericaenterica_010100013504     FALSE 0.068 185.000 0.000 NA   NA
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 6456750 6456751 Salmonentericaenterica_010100013879 Salmonentericaenterica_010100013884   proX FALSE 0.284 163.000 0.174 NA   NA
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 6457017 6457018 Salmonentericaenterica_010100015479 Salmonentericaenterica_010100015484     FALSE 0.409 -21.000 0.000 NA   NA
 6457021 6457022 Salmonentericaenterica_010100015499 Salmonentericaenterica_010100015504     TRUE 0.928 -3.000 0.222 NA Y NA
 6457022 6457023 Salmonentericaenterica_010100015504 Salmonentericaenterica_010100015509     TRUE 0.881 -3.000 0.238 1.000   NA
 6457023 6457024 Salmonentericaenterica_010100015509 Salmonentericaenterica_010100015514     TRUE 0.962 15.000 0.143 0.001   NA
 6457024 6457025 Salmonentericaenterica_010100015514 Salmonentericaenterica_010100015519     TRUE 0.618 47.000 0.143 NA   NA
 6457026 6457027 Salmonentericaenterica_010100015524 Salmonentericaenterica_010100015529     FALSE 0.102 141.000 0.050 NA   NA
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 6457033 6457034 Salmonentericaenterica_010100015559 Salmonentericaenterica_010100015564     TRUE 0.933 11.000 0.023 0.001   NA
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 6457035 6457036 Salmonentericaenterica_010100015569 Salmonentericaenterica_010100015574   panF TRUE 0.944 -10.000 0.682 NA   NA
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 6457039 6457040 Salmonentericaenterica_010100015589 Salmonentericaenterica_010100015594 rpsR rplI TRUE 0.987 42.000 0.499 0.009 Y NA
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 6457314 6457315 Salmonentericaenterica_010100017176 Salmonentericaenterica_010100017181     TRUE 0.834 0.000 0.000 NA Y NA
 6457315 6457316 Salmonentericaenterica_010100017181 Salmonentericaenterica_010100017186     TRUE 0.805 -9.000 0.000 NA Y NA
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 6457864 6457865 Salmonentericaenterica_010100020370 Salmonentericaenterica_010100020375 sgbH   TRUE 0.963 -7.000 0.360 1.000 Y NA
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 6458107 6458108 Salmonentericaenterica_010100021725 Salmonentericaenterica_010100021730   umuC TRUE 0.685 3.000 0.000 1.000   NA
 6458112 6458113 Salmonentericaenterica_010100021750 Salmonentericaenterica_010100021755 gyrB recF FALSE 0.037 29.000 0.002 NA   NA
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 6458143 6458144 Salmonentericaenterica_010100021905 Salmonentericaenterica_010100021910     FALSE 0.127 74.000 0.031 NA   NA
 6458147 6458148 Salmonentericaenterica_010100021935 Salmonentericaenterica_010100021940     TRUE 0.857 -3.000 0.278 NA   NA
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 6458170 6458171 Salmonentericaenterica_010100022060 Salmonentericaenterica_010100022065     FALSE 0.454 -3.000 0.000 NA   NA
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 6458199 6458200 Salmonentericaenterica_010100022245 Salmonentericaenterica_010100022250   fliS TRUE 0.917 0.000 0.324 1.000   NA
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 6458220 6458221 Salmonentericaenterica_010100022360 Salmonentericaenterica_010100022365   aspA FALSE 0.089 33.000 0.015 NA   NA
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 6458240 6458241 Salmonentericaenterica_010100022470 Salmonentericaenterica_010100022475 yajC secD FALSE 0.046 61.000 0.012 NA   NA
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 6458281 6458282 Salmonentericaenterica_010100t22729 Salmonentericaenterica_010100t22731     FALSE 0.332 53.000 0.000 NA   NA
 6458282 6458283 Salmonentericaenterica_010100t22731 Salmonentericaenterica_010100022720     FALSE 0.107 152.000 0.000 NA   NA
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 6458446 6458447 Salmonentericaenterica_010100023590 Salmonentericaenterica_010100023595 glnA glnL FALSE 0.047 275.000 0.053 1.000   NA
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 6458550 6458551 Salmonentericaenterica_010100024177 Salmonentericaenterica_010100024182   dipZ TRUE 0.822 37.000 0.217 1.000   NA
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 6458562 6458563 Salmonentericaenterica_010100024237 Salmonentericaenterica_010100024242 recA recX TRUE 0.615 117.000 0.296 NA   NA
 6458563 6458564 Salmonentericaenterica_010100024242 Salmonentericaenterica_010100024247 recX   FALSE 0.454 -3.000 0.000 NA   NA
 6458564 6458565 Salmonentericaenterica_010100024247 Salmonentericaenterica_010100024252   alaS FALSE 0.378 33.000 0.000 NA   NA
 6458565 6458566 Salmonentericaenterica_010100024252 Salmonentericaenterica_010100024257 alaS alaS TRUE 0.924 0.000 0.010 0.001   NA
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 6458610 6458611 Salmonentericaenterica_010100024487 Salmonentericaenterica_010100024492 livM livG TRUE 0.980 -3.000 0.574 1.000 Y NA
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 6458624 6458625 Salmonentericaenterica_010100024557 Salmonentericaenterica_010100024562     TRUE 0.955 -3.000 0.750 NA   NA
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 6458633 6458634 Salmonentericaenterica_010100024602 Salmonentericaenterica_010100024607     TRUE 0.938 3.000 0.500 NA   NA
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 6458646 6458647 Salmonentericaenterica_010100024677 Salmonentericaenterica_010100024682     FALSE 0.375 -3.000 0.048 NA   NA
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 6458664 6458665 Salmonentericaenterica_010100024777 Salmonentericaenterica_010100024782     TRUE 0.817 34.000 0.286 NA   NA
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 6458683 6458684 Salmonentericaenterica_010100024882 Salmonentericaenterica_010100024887     TRUE 0.756 -3.000 0.167 NA   NA
 6458684 6458685 Salmonentericaenterica_010100024887 Salmonentericaenterica_010100024892     FALSE 0.423 -10.000 0.000 NA   NA
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 6461243 6461244 Salmonentericaenterica_010100038637 Salmonentericaenterica_010100038642 surE truD TRUE 0.859 -19.000 0.235 1.000   NA
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