MicrobesOnline Operon Predictions for Anoxybacillus flavithermus WK1

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5698782 5698783 Aflv_0001 Aflv_0002 dnaA dnaN TRUE 0.633 157.000 0.328 1.000 Y NA
 5698783 5698784 Aflv_0002 Aflv_0003 dnaN   FALSE 0.315 99.000 0.103 1.000   NA
 5698784 5698785 Aflv_0003 Aflv_0004   recF TRUE 0.892 -9.000 0.209 1.000   NA
 5698785 5698786 Aflv_0004 Aflv_0005 recF gyrB TRUE 0.935 55.000 0.249 0.006 Y NA
 5698786 5698787 Aflv_0005 Aflv_0006 gyrB gyrA TRUE 0.922 73.000 0.306 0.003 Y NA
 5698787 5698788 Aflv_0006 Aflv_0007 gyrA   TRUE 0.807 17.000 0.019 1.000 N NA
 5698788 5698789 Aflv_0007 Aflv_R001     FALSE 0.005 168.000 0.000 NA   NA
 5698789 5698790 Aflv_R001 Aflv_R002   trnI FALSE 0.001 412.000 0.000 NA   NA
 5698790 5698791 Aflv_R002 Aflv_R003 trnI trnA FALSE 0.105 11.000 0.000 NA   NA
 5698791 5698792 Aflv_R003 Aflv_R004 trnA   FALSE 0.008 136.000 0.000 NA   NA
 5698792 5698793 Aflv_R004 Aflv_R005     FALSE 0.001 328.000 0.000 NA   NA
 5698795 5698796 Aflv_0009 Aflv_0010 guaB dacA TRUE 0.688 85.000 0.267 1.000 N NA
 5698796 5698797 Aflv_0010 Aflv_0011 dacA pdxS FALSE 0.082 213.000 0.024 1.000 N NA
 5698797 5698798 Aflv_0011 Aflv_0012 pdxS pdxT TRUE 0.978 19.000 0.488 NA Y NA
 5698798 5698799 Aflv_0012 Aflv_0013 pdxT serS FALSE 0.038 321.000 0.010 NA N NA
 5698799 5698800 Aflv_0013 Aflv_R007 serS trnS FALSE 0.025 79.000 0.000 NA   NA
 5698801 5698802 Aflv_0014 Aflv_0015 dck dgk TRUE 0.989 -3.000 0.255 0.001 Y NA
 5698803 5698804 Aflv_0016 Aflv_R008     FALSE 0.027 71.000 0.000 NA   NA
 5698804 5698805 Aflv_R008 Aflv_0017   dnaX FALSE 0.014 109.000 0.000 NA   NA
 5698805 5698806 Aflv_0017 Aflv_0018 dnaX yaaK TRUE 0.680 8.000 0.071 NA   NA
 5698806 5698807 Aflv_0018 Aflv_0019 yaaK recR TRUE 0.903 10.000 0.604 NA   NA
 5698807 5698808 Aflv_0019 Aflv_0020 recR yaaL TRUE 0.742 0.000 0.071 NA   NA
 5698808 5698809 Aflv_0020 Aflv_0021 yaaL bofA TRUE 0.923 -3.000 0.417 NA   NA
 5698809 5698810 Aflv_0021 Aflv_0022 bofA   FALSE 0.170 -13.000 0.000 NA   NA
 5698810 5698811 Aflv_0022 Aflv_R009     FALSE 0.029 66.000 0.000 NA   NA
 5698811 5698812 Aflv_R009 Aflv_R010   trnI FALSE 0.001 391.000 0.000 NA   NA
 5698812 5698813 Aflv_R010 Aflv_R011 trnI trnA FALSE 0.105 11.000 0.000 NA   NA
 5698813 5698814 Aflv_R011 Aflv_R012 trnA   FALSE 0.008 136.000 0.000 NA   NA
 5698814 5698815 Aflv_R012 Aflv_R013     FALSE 0.025 75.000 0.000 NA   NA
 5698815 5698816 Aflv_R013 Aflv_0023   csfB FALSE 0.032 61.000 0.000 NA   NA
 5698816 5698817 Aflv_0023 Aflv_0024 csfB   TRUE 0.615 82.000 0.400 1.000   NA
 5698817 5698818 Aflv_0024 Aflv_0025   tmk TRUE 0.845 2.000 0.045 1.000 N NA
 5698818 5698819 Aflv_0025 Aflv_0026 tmk holB TRUE 0.914 11.000 0.254 1.000 N NA
 5698819 5698820 Aflv_0026 Aflv_0027 holB yaaT TRUE 0.919 -7.000 0.372 NA   NA
 5698820 5698821 Aflv_0027 Aflv_0028 yaaT yabA TRUE 0.809 16.000 0.183 NA   NA
 5698821 5698822 Aflv_0028 Aflv_0029 yabA yabB TRUE 0.663 55.000 0.193 0.078   NA
 5698822 5698823 Aflv_0029 Aflv_0030 yabB yabC TRUE 0.728 7.000 0.078 1.000   NA
 5698825 5698826 Aflv_0032 Aflv_0033 metS yabD FALSE 0.470 117.000 0.221 NA N NA
 5698826 5698827 Aflv_0033 Aflv_0034 yabD yabE FALSE 0.020 205.000 0.007 NA   NA
 5698827 5698828 Aflv_0034 Aflv_0035 yabE rnmV FALSE 0.286 62.000 0.024 1.000   NA
 5698828 5698829 Aflv_0035 Aflv_0036 rnmV ksgA TRUE 0.857 -7.000 0.003 1.000 N NA
 5698829 5698830 Aflv_0036 Aflv_0037 ksgA yabG TRUE 0.661 -13.000 0.022 NA   NA
 5698830 5698831 Aflv_0037 Aflv_0038 yabG veg FALSE 0.122 156.000 0.116 NA   NA
 5698831 5698832 Aflv_0038 Aflv_0039 veg ispE FALSE 0.133 119.000 0.046 NA   NA
 5698832 5698833 Aflv_0039 Aflv_0040 ispE purR TRUE 0.859 16.000 0.062 1.000 N NA
 5698833 5698834 Aflv_0040 Aflv_0041 purR yabJ TRUE 0.850 34.000 0.227 NA N NA
 5698834 5698835 Aflv_0041 Aflv_0042 yabJ spoVG TRUE 0.730 77.000 0.377 NA N NA
 5698835 5698836 Aflv_0042 Aflv_0043 spoVG gcaD FALSE 0.391 156.000 0.014 1.000 Y NA
 5698836 5698837 Aflv_0043 Aflv_0044 gcaD prs TRUE 0.858 18.000 0.069 1.000 N NA
 5698837 5698838 Aflv_0044 Aflv_0045 prs ctc TRUE 0.557 57.000 0.027 1.000 N NA
 5698838 5698839 Aflv_0045 Aflv_0046 ctc spoVC TRUE 0.991 -3.000 0.496 0.036 Y NA
 5698839 5698840 Aflv_0046 Aflv_0047 spoVC yabK TRUE 0.577 19.000 0.033 NA   NA
 5698840 5698841 Aflv_0047 Aflv_0048 yabK mfd TRUE 0.626 1.000 0.035 NA   NA
 5698841 5698842 Aflv_0048 Aflv_0049 mfd spoVT FALSE 0.260 195.000 0.026 NA Y NA
 5698842 5698843 Aflv_0049 Aflv_0050 spoVT yabM TRUE 0.558 49.000 0.147 NA   NA
 5698843 5698844 Aflv_0050 Aflv_0051 yabM yabN TRUE 0.703 3.000 0.058 1.000   NA
 5698844 5698845 Aflv_0051 Aflv_0052 yabN yabO TRUE 0.707 2.000 0.054 1.000   NA
 5698845 5698846 Aflv_0052 Aflv_0053 yabO yabP FALSE 0.421 64.000 0.108 NA   NA
 5698846 5698847 Aflv_0053 Aflv_0054 yabP yabQ TRUE 0.949 -3.000 0.774 NA   NA
 5698847 5698848 Aflv_0054 Aflv_0055 yabQ divIC FALSE 0.101 22.000 0.000 NA   NA
 5698848 5698849 Aflv_0055 Aflv_0056 divIC yabR TRUE 0.607 29.000 0.000 1.000 N NA
 5698849 5698850 Aflv_0056 Aflv_R014 yabR trnM FALSE 0.008 134.000 0.000 NA   NA
 5698850 5698851 Aflv_R014 Aflv_R015 trnM trnE FALSE 0.110 12.000 0.000 NA   NA
 5698851 5698852 Aflv_R015 Aflv_0057 trnE spoIIE FALSE 0.004 172.000 0.000 NA   NA
 5698852 5698853 Aflv_0057 Aflv_0058 spoIIE yabS FALSE 0.432 67.000 0.132 NA   NA
 5698853 5698854 Aflv_0058 Aflv_0059 yabS yabT TRUE 0.812 -40.000 0.133 NA   NA
 5698854 5698855 Aflv_0059 Aflv_0060 yabT yacA FALSE 0.451 78.000 0.018 1.000 N NA
 5698855 5698856 Aflv_0060 Aflv_0061 yacA hprT TRUE 0.903 1.000 0.067 0.059 N NA
 5698856 5698857 Aflv_0061 Aflv_0062 hprT ftsH TRUE 0.634 87.000 0.192 1.000 N NA
 5698857 5698858 Aflv_0062 Aflv_0063 ftsH coaX FALSE 0.387 98.000 0.029 1.000 N NA
 5698858 5698859 Aflv_0063 Aflv_0064 coaX yacC TRUE 0.901 -3.000 0.060 1.000 N NA
 5698859 5698860 Aflv_0064 Aflv_0065 yacC cysK TRUE 0.583 61.000 0.053 1.000 N NA
 5698860 5698861 Aflv_0065 Aflv_0066 cysK pabB TRUE 0.670 97.000 0.012 1.000 Y NA
 5698861 5698862 Aflv_0066 Aflv_0067 pabB pabA TRUE 0.983 -3.000 0.097 0.002 Y NA
 5698862 5698863 Aflv_0067 Aflv_0068 pabA pabC TRUE 0.980 7.000 0.532 1.000 Y NA
 5698863 5698864 Aflv_0068 Aflv_0069 pabC sul TRUE 0.989 -3.000 0.519 1.000 Y NA
 5698864 5698865 Aflv_0069 Aflv_0070 sul folB TRUE 0.974 -37.000 0.176 1.000 Y NA
 5698865 5698866 Aflv_0070 Aflv_0071 folB folK TRUE 0.961 4.000 0.142 1.000 Y NA
 5698866 5698867 Aflv_0071 Aflv_0072 folK   TRUE 0.844 -54.000 0.025 1.000 N NA
 5698867 5698868 Aflv_0072 Aflv_0073   lysS TRUE 0.776 67.000 0.021 1.000 Y NA
 5698868 5698869 Aflv_0073 Aflv_R016 lysS   FALSE 0.002 290.000 0.000 NA   NA
 5698869 5698870 Aflv_R016 Aflv_R017     FALSE 0.001 356.000 0.000 NA   NA
 5698870 5698871 Aflv_R017 Aflv_R018     FALSE 0.025 75.000 0.000 NA   NA
 5698871 5698872 Aflv_R018 Aflv_0074   ctsR FALSE 0.005 169.000 0.000 NA   NA
 5698872 5698873 Aflv_0074 Aflv_0075 ctsR mcsA TRUE 0.910 6.000 0.681 NA   NA
 5698873 5698874 Aflv_0075 Aflv_0076 mcsA mcsB TRUE 0.946 -52.000 0.848 1.000   NA
 5698874 5698875 Aflv_0076 Aflv_0077 mcsB clpC TRUE 0.939 12.000 0.425 1.000 N NA
 5698875 5698876 Aflv_0077 Aflv_0078 clpC radA TRUE 0.879 59.000 0.062 0.020 Y NA
 5698876 5698877 Aflv_0078 Aflv_0079 radA   FALSE 0.394 51.000 0.056 NA   NA
 5698877 5698878 Aflv_0079 Aflv_0080   ispD TRUE 0.825 -16.000 0.108 NA   NA
 5698878 5698879 Aflv_0080 Aflv_0081 ispD ispF TRUE 0.986 -3.000 0.419 1.000 Y NA
 5698879 5698880 Aflv_0081 Aflv_0082 ispF gltX TRUE 0.608 64.000 0.076 1.000 N NA
 5698880 5698881 Aflv_0082 Aflv_0083 gltX cysE FALSE 0.049 288.000 0.008 1.000 N NA
 5698881 5698882 Aflv_0083 Aflv_0084 cysE cysS TRUE 0.912 -19.000 0.039 0.059 N NA
 5698882 5698883 Aflv_0084 Aflv_0085 cysS   TRUE 0.778 5.000 0.129 1.000   NA
 5698883 5698884 Aflv_0085 Aflv_0086   yacO TRUE 0.894 0.000 0.150 0.005   NA
 5698884 5698885 Aflv_0086 Aflv_0087 yacO yacP TRUE 0.833 -7.000 0.109 NA   NA
 5698885 5698886 Aflv_0087 Aflv_0088 yacP sigH TRUE 0.724 47.000 0.361 NA   NA
 5698886 5698887 Aflv_0088 Aflv_0089 sigH rpmGB TRUE 0.748 64.000 0.282 1.000 N NA
 5698887 5698888 Aflv_0089 Aflv_0090 rpmGB secE TRUE 0.804 32.000 0.080 1.000 N NA
 5698888 5698889 Aflv_0090 Aflv_0091 secE nusG TRUE 0.686 120.000 0.843 1.000 N NA
 5698889 5698890 Aflv_0091 Aflv_0092 nusG rplK TRUE 0.808 83.000 0.681 1.000 N NA
 5698890 5698891 Aflv_0092 Aflv_0093 rplK rplA TRUE 0.918 104.000 0.838 0.030 Y NA
 5698891 5698892 Aflv_0093 Aflv_0094 rplA rplJ TRUE 0.573 188.000 0.302 0.030 Y NA
 5698892 5698893 Aflv_0094 Aflv_0095 rplJ rplL TRUE 0.976 46.000 0.884 0.023 Y NA
 5698893 5698894 Aflv_0095 Aflv_0096 rplL rsmC TRUE 0.783 79.000 0.050 1.000 Y NA
 5698894 5698895 Aflv_0096 Aflv_0097 rsmC rpoB FALSE 0.082 199.000 0.008 1.000 N NA
 5698895 5698896 Aflv_0097 Aflv_0098 rpoB rpoC TRUE 0.973 50.000 0.851 0.003 Y NA
 5698896 5698897 Aflv_0098 Aflv_0099 rpoC   FALSE 0.318 126.000 0.065 1.000 N NA
 5698897 5698898 Aflv_0099 Aflv_0100   rpsL TRUE 0.921 60.000 0.239 0.030 Y NA
 5698898 5698899 Aflv_0100 Aflv_0101 rpsL rpsG TRUE 0.953 45.000 0.224 0.004 Y NA
 5698899 5698900 Aflv_0101 Aflv_0102 rpsG fusA TRUE 0.787 135.000 0.579 1.000 Y NA
 5698900 5698901 Aflv_0102 Aflv_0103 fusA tufA TRUE 0.838 130.000 0.400 0.001 Y NA
 5698901 5698902 Aflv_0103 Aflv_0104 tufA rpsJ FALSE 0.409 236.000 0.318 1.000 Y NA
 5698902 5698903 Aflv_0104 Aflv_0105 rpsJ rplC TRUE 0.982 24.000 0.467 0.030 Y NA
 5698903 5698904 Aflv_0105 Aflv_0106 rplC rplD TRUE 0.981 28.000 0.544 0.023 Y NA
 5698904 5698905 Aflv_0106 Aflv_0107 rplD rplW TRUE 0.985 0.000 0.307 0.023 Y NA
 5698905 5698906 Aflv_0107 Aflv_0108 rplW rplB TRUE 0.988 22.000 0.849 0.029 Y NA
 5698906 5698907 Aflv_0108 Aflv_0109 rplB rpsS TRUE 0.962 58.000 0.820 0.030 Y NA
 5698907 5698908 Aflv_0109 Aflv_0110 rpsS rplV TRUE 0.987 21.000 0.769 0.030 Y NA
 5698908 5698909 Aflv_0110 Aflv_0111 rplV rpsC TRUE 0.988 4.000 0.719 0.030 Y NA
 5698909 5698910 Aflv_0111 Aflv_0112 rpsC rplP TRUE 0.989 3.000 0.828 0.030 Y NA
 5698910 5698911 Aflv_0112 Aflv_0113 rplP rpmC TRUE 0.992 -25.000 0.802 0.023 Y NA
 5698911 5698912 Aflv_0113 Aflv_0114 rpmC rpsQ TRUE 0.986 26.000 0.828 0.023 Y NA
 5698912 5698913 Aflv_0114 Aflv_0115 rpsQ rplN TRUE 0.970 49.000 0.791 0.030 Y NA
 5698913 5698914 Aflv_0115 Aflv_0116 rplN rplX TRUE 0.980 37.000 0.810 0.030 Y NA
 5698914 5698915 Aflv_0116 Aflv_0117 rplX rplE TRUE 0.983 30.000 0.758 0.023 Y NA
 5698915 5698916 Aflv_0117 Aflv_0118 rplE rpsN TRUE 0.975 35.000 0.496 0.023 Y NA
 5698916 5698917 Aflv_0118 Aflv_0119 rpsN rpsH TRUE 0.975 34.000 0.473 0.023 Y NA
 5698917 5698918 Aflv_0119 Aflv_0120 rpsH rplF TRUE 0.984 30.000 0.808 0.023 Y NA
 5698918 5698919 Aflv_0120 Aflv_0121 rplF rplR TRUE 0.990 15.000 0.815 0.023 Y NA
 5698919 5698920 Aflv_0121 Aflv_0122 rplR rpsE TRUE 0.988 20.000 0.814 0.030 Y NA
 5698920 5698921 Aflv_0122 Aflv_0123 rpsE rpmD TRUE 0.988 12.000 0.789 0.030 Y NA
 5698921 5698922 Aflv_0123 Aflv_0124 rpmD rplO TRUE 0.989 15.000 0.653 0.004 Y NA
 5698922 5698923 Aflv_0124 Aflv_0125 rplO secY TRUE 0.966 0.000 0.730 1.000 N NA
 5698923 5698924 Aflv_0125 Aflv_0126 secY adk TRUE 0.758 57.000 0.241 1.000 N NA
 5698924 5698925 Aflv_0126 Aflv_0127 adk map TRUE 0.940 0.000 0.290 1.000 N NA
 5698925 5698926 Aflv_0127 Aflv_0128 map infA TRUE 0.785 99.000 0.160 1.000 Y NA
 5698926 5698927 Aflv_0128 Aflv_0129 infA rpmJ TRUE 0.792 31.000 0.257 1.000   NA
 5698927 5698928 Aflv_0129 Aflv_0130 rpmJ rpsM TRUE 0.860 23.000 0.194 0.023   NA
 5698928 5698929 Aflv_0130 Aflv_0131 rpsM rpsK TRUE 0.986 26.000 0.810 0.023 Y NA
 5698929 5698930 Aflv_0131 Aflv_0132 rpsK rpoA FALSE 0.321 169.000 0.308 1.000 N NA
 5698930 5698931 Aflv_0132 Aflv_0133 rpoA rplQ TRUE 0.870 61.000 0.873 1.000 N NA
 5698931 5698932 Aflv_0133 Aflv_0134 rplQ   FALSE 0.393 114.000 0.074 1.000 N NA
 5698932 5698933 Aflv_0134 Aflv_0135     TRUE 0.991 -42.000 0.713 0.023 Y NA
 5698933 5698934 Aflv_0135 Aflv_0136     TRUE 0.976 -3.000 0.139 1.000 Y NA
 5698934 5698935 Aflv_0136 Aflv_0137   truA TRUE 0.904 16.000 0.170 1.000 N NA
 5698935 5698936 Aflv_0137 Aflv_0138 truA rplM FALSE 0.478 147.000 0.052 1.000 Y NA
 5698936 5698937 Aflv_0138 Aflv_0139 rplM rpsI TRUE 0.985 23.000 0.601 0.023 Y NA
 5698937 5698938 Aflv_0139 Aflv_0140 rpsI ybaK FALSE 0.371 40.000 0.021 NA   NA
 5698938 5698939 Aflv_0140 Aflv_0141 ybaK cwlD TRUE 0.564 56.000 0.211 NA   NA
 5698939 5698940 Aflv_0141 Aflv_0142 cwlD mrp TRUE 0.670 80.000 0.211 1.000 N NA
 5698944 5698945 Aflv_R019 Aflv_R020     FALSE 0.001 476.000 0.000 NA   NA
 5698945 5698946 Aflv_R020 Aflv_R021     FALSE 0.001 369.000 0.000 NA   NA
 5698946 5698947 Aflv_R021 Aflv_R022   trnN FALSE 0.005 167.000 0.000 NA   NA
 5698947 5698948 Aflv_R022 Aflv_R023 trnN trnT FALSE 0.113 3.000 0.000 NA   NA
 5698948 5698949 Aflv_R023 Aflv_R024 trnT trnE FALSE 0.118 16.000 0.000 NA   NA
 5698949 5698950 Aflv_R024 Aflv_R025 trnE trnV FALSE 0.105 11.000 0.000 NA   NA
 5698950 5698951 Aflv_R025 Aflv_R026 trnV trnT FALSE 0.033 60.000 0.000 NA   NA
 5698951 5698952 Aflv_R026 Aflv_R027 trnT trnY FALSE 0.106 6.000 0.000 NA   NA
 5698952 5698953 Aflv_R027 Aflv_R028 trnY trnQ FALSE 0.112 18.000 0.000 NA   NA
 5698953 5698954 Aflv_R028 Aflv_R029 trnQ trnK FALSE 0.091 25.000 0.000 NA   NA
 5698954 5698955 Aflv_R029 Aflv_R030 trnK trnG FALSE 0.106 7.000 0.000 NA   NA
 5698955 5698956 Aflv_R030 Aflv_R031 trnG trnA FALSE 0.119 2.000 0.000 NA   NA
 5698956 5698957 Aflv_R031 Aflv_0146 trnA rocF FALSE 0.008 136.000 0.000 NA   NA
 5698957 5698958 Aflv_0146 Aflv_0147 rocF sigW FALSE 0.412 126.000 0.167 1.000 N NA
 5698958 5698959 Aflv_0147 Aflv_0148 sigW rsiW TRUE 0.981 11.000 0.583 1.000 Y NA
 5698959 5698960 Aflv_0148 Aflv_0149 rsiW   TRUE 0.550 10.000 0.028 NA   NA
 5698960 5698961 Aflv_0149 Aflv_0150     TRUE 0.937 -7.000 0.502 NA   NA
 5698961 5698962 Aflv_0150 Aflv_0151     TRUE 0.777 18.000 0.150 NA   NA
 5698962 5698963 Aflv_0151 Aflv_R032     FALSE 0.005 160.000 0.000 NA   NA
 5698963 5698964 Aflv_R032 Aflv_0152   glmS FALSE 0.031 63.000 0.000 NA   NA
 5698966 5698967 Aflv_0154 Aflv_0155     TRUE 0.932 -18.000 0.000 NA Y NA
 5698968 5698969 Aflv_0156 Aflv_0157     TRUE 0.897 12.000 0.000 NA Y NA
 5698969 5698970 Aflv_0157 Aflv_0158     FALSE 0.026 279.000 0.000 NA N NA
 5698970 5698971 Aflv_0158 Aflv_0159     FALSE 0.011 678.000 0.000 NA N NA
 5698972 5698973 Aflv_0160 Aflv_0161 acpS   FALSE 0.001 2504.000 0.000 NA   NA
 5698973 5698974 Aflv_0161 Aflv_0162     FALSE 0.122 15.000 0.000 NA   NA
 5698974 5698975 Aflv_0162 Aflv_0163     FALSE 0.001 707.000 0.000 NA   NA
 5698975 5698976 Aflv_0163 Aflv_0164     FALSE 0.020 346.000 0.000 NA N NA
 5698976 5698977 Aflv_0164 Aflv_0165     FALSE 0.001 1167.000 0.000 NA   NA
 5698977 5698978 Aflv_0165 Aflv_0166   mazE FALSE 0.003 215.000 0.000 NA   NA
 5698978 5698979 Aflv_0166 Aflv_0167 mazE mazF TRUE 0.969 0.000 0.163 NA Y NA
 5698979 5698980 Aflv_0167 Aflv_0168 mazF   FALSE 0.001 773.000 0.000 NA   NA
 5698980 5698981 Aflv_0168 Aflv_0169   pspA TRUE 0.930 -27.000 0.514 NA   NA
 5698981 5698982 Aflv_0169 Aflv_0170 pspA   FALSE 0.030 604.000 0.210 NA   NA
 5698982 5698983 Aflv_0170 Aflv_0171   yvqE TRUE 0.945 -3.000 0.679 NA   NA
 5698983 5698984 Aflv_0171 Aflv_0172 yvqE yvqC TRUE 0.990 13.000 0.853 0.022 Y NA
 5698984 5698985 Aflv_0172 Aflv_0173 yvqC mta TRUE 0.786 58.000 0.000 0.052 Y NA
 5698985 5698986 Aflv_0173 Aflv_0174 mta   FALSE 0.303 83.000 0.000 1.000 N NA
 5698986 5698987 Aflv_0174 Aflv_0175     FALSE 0.036 55.000 0.000 NA   NA
 5698988 5698989 Aflv_0176 Aflv_0177 cstA   TRUE 0.867 -3.000 0.184 NA   NA
 5698990 5698991 Aflv_0178 Aflv_0179     FALSE 0.396 99.000 0.037 1.000 N NA
 5698991 5698992 Aflv_0179 Aflv_0180     TRUE 0.957 13.000 0.074 1.000 Y NA
 5698992 5698993 Aflv_0180 Aflv_0181     TRUE 0.982 -39.000 0.237 0.063 Y NA
 5698993 5698994 Aflv_0181 Aflv_0182     TRUE 0.940 -7.000 0.553 NA   NA
 5698994 5698995 Aflv_0182 Aflv_0183     TRUE 0.915 11.000 0.778 NA   NA
 5698995 5698996 Aflv_0183 Aflv_0184     TRUE 0.978 -3.000 0.690 0.063 N NA
 5698996 5698997 Aflv_0184 Aflv_0185     TRUE 0.977 6.000 0.426 1.000 Y NA
 5698997 5698998 Aflv_0185 Aflv_0186     FALSE 0.011 177.000 0.000 1.000   NA
 5698998 5698999 Aflv_0186 Aflv_0187     TRUE 0.924 15.000 0.714 NA   NA
 5698999 5699000 Aflv_0187 Aflv_0188     TRUE 0.921 16.000 0.714 NA   NA
 5699001 5699002 Aflv_0189 Aflv_0190 gerKC gerKA TRUE 0.959 -3.000 0.500 0.010   NA
 5699002 5699003 Aflv_0190 Aflv_0191 gerKA gerKB TRUE 0.954 -102.000 0.750 0.010   NA
 5699004 5699005 Aflv_0192 Aflv_0193 ddl murF TRUE 0.959 10.000 0.044 0.007 Y NA
 5699005 5699006 Aflv_0193 Aflv_0194 murF   FALSE 0.181 137.000 0.004 1.000 N NA
 5699006 5699007 Aflv_0194 Aflv_0195   acpS TRUE 0.622 48.000 0.025 1.000 N NA
 5699007 5699008 Aflv_0195 Aflv_0196 acpS   FALSE 0.465 75.000 0.038 NA N NA
 5699008 5699009 Aflv_0196 Aflv_0197   alr TRUE 0.800 96.000 0.194 NA Y NA
 5699009 5699010 Aflv_0197 Aflv_0198 alr   FALSE 0.274 147.000 0.108 1.000 N NA
 5699010 5699011 Aflv_0198 Aflv_0199   mazF TRUE 0.916 5.000 0.260 1.000 N NA
 5699011 5699012 Aflv_0199 Aflv_0200 mazF   TRUE 0.819 22.000 0.045 1.000 N NA
 5699014 5699015 Aflv_0202 Aflv_R033   trnN FALSE 0.008 135.000 0.000 NA   NA
 5699015 5699016 Aflv_R033 Aflv_R034 trnN trnS FALSE 0.113 3.000 0.000 NA   NA
 5699016 5699017 Aflv_R034 Aflv_R035 trnS trnE FALSE 0.115 17.000 0.000 NA   NA
 5699017 5699018 Aflv_R035 Aflv_R036 trnE trnV FALSE 0.059 40.000 0.000 NA   NA
 5699018 5699019 Aflv_R036 Aflv_R037 trnV trnD FALSE 0.106 9.000 0.000 NA   NA
 5699019 5699020 Aflv_R037 Aflv_R038 trnD trnQ FALSE 0.066 36.000 0.000 NA   NA
 5699020 5699021 Aflv_R038 Aflv_R039 trnQ trnK FALSE 0.105 11.000 0.000 NA   NA
 5699021 5699022 Aflv_R039 Aflv_R040 trnK trnL FALSE 0.106 6.000 0.000 NA   NA
 5699022 5699023 Aflv_R040 Aflv_R041 trnL trnL FALSE 0.098 23.000 0.000 NA   NA
 5699023 5699024 Aflv_R041 Aflv_R042 trnL trnR FALSE 0.033 60.000 0.000 NA   NA
 5699024 5699025 Aflv_R042 Aflv_R043 trnR trnP FALSE 0.104 21.000 0.000 NA   NA
 5699025 5699026 Aflv_R043 Aflv_R044 trnP trnG FALSE 0.115 17.000 0.000 NA   NA
 5699026 5699027 Aflv_R044 Aflv_R045 trnG   FALSE 0.024 83.000 0.000 NA   NA
 5699027 5699028 Aflv_R045 Aflv_R046     FALSE 0.001 342.000 0.000 NA   NA
 5699028 5699029 Aflv_R046 Aflv_R047     FALSE 0.001 351.000 0.000 NA   NA
 5699029 5699030 Aflv_R047 Aflv_R048   trnM FALSE 0.004 176.000 0.000 NA   NA
 5699030 5699031 Aflv_R048 Aflv_0203 trnM   FALSE 0.004 177.000 0.000 NA   NA
 5699031 5699032 Aflv_0203 Aflv_0204     TRUE 0.858 -37.000 0.217 NA   NA
 5699032 5699033 Aflv_0204 Aflv_0205     TRUE 0.809 1.000 0.127 1.000   NA
 5699033 5699034 Aflv_0205 Aflv_0206   gcp TRUE 0.832 -15.000 0.090 1.000   NA
 5699037 5699038 Aflv_0209 Aflv_0210     TRUE 0.929 -18.000 0.480 NA   NA
 5699039 5699040 Aflv_0211 Aflv_0212 groES groEL TRUE 0.927 73.000 0.674 1.000 Y NA
 5699040 5699041 Aflv_0212 Aflv_0213 groEL   FALSE 0.001 453.000 0.000 NA   NA
 5699042 5699043 Aflv_0214 Aflv_0215   bls FALSE 0.064 38.000 0.000 NA   NA
 5699043 5699044 Aflv_0215 Aflv_0216 bls argJ TRUE 0.854 34.000 0.000 1.000 Y NA
 5699044 5699045 Aflv_0216 Aflv_0217 argJ   TRUE 0.623 27.000 0.000 1.000 N NA
 5699046 5699047 Aflv_0218 Aflv_0219 speB   FALSE 0.111 134.000 0.000 NA N NA
 5699047 5699048 Aflv_0219 Aflv_0220     FALSE 0.132 -63.000 0.000 NA   NA
 5699048 5699049 Aflv_0220 Aflv_0221     FALSE 0.043 166.000 0.000 0.039   NA
 5699049 5699050 Aflv_0221 Aflv_0222     TRUE 0.677 7.000 0.000 1.000 N NA
 5699050 5699051 Aflv_0222 Aflv_0223     FALSE 0.061 184.000 0.000 1.000 N NA
 5699053 5699054 Aflv_0225 Aflv_0226 guaA pbuG FALSE 0.011 175.000 0.000 1.000   NA
 5699054 5699055 Aflv_0226 Aflv_R050 pbuG   FALSE 0.001 395.000 0.000 NA   NA
 5699055 5699056 Aflv_R050 Aflv_R051     FALSE 0.001 356.000 0.000 NA   NA
 5699056 5699057 Aflv_R051 Aflv_R052     FALSE 0.001 351.000 0.000 NA   NA
 5699059 5699060 Aflv_0228 Aflv_0229 purE purK TRUE 0.977 -16.000 0.038 0.001 Y NA
 5699060 5699061 Aflv_0229 Aflv_0230 purK purB TRUE 0.959 -27.000 0.033 1.000 Y NA
 5699061 5699062 Aflv_0230 Aflv_0231 purB purC TRUE 0.828 66.000 0.072 1.000 Y NA
 5699062 5699063 Aflv_0231 Aflv_0232 purC purS TRUE 0.987 -12.000 0.460 1.000 Y NA
 5699063 5699064 Aflv_0232 Aflv_0233 purS purQ TRUE 0.993 -3.000 0.656 0.002 Y NA
 5699064 5699065 Aflv_0233 Aflv_0234 purQ purL TRUE 0.990 -16.000 0.346 0.002 Y NA
 5699065 5699066 Aflv_0234 Aflv_0235 purL purF TRUE 0.973 -81.000 0.223 1.000 Y NA
 5699066 5699067 Aflv_0235 Aflv_0236 purF purM TRUE 0.978 -37.000 0.248 1.000 Y NA
 5699067 5699068 Aflv_0236 Aflv_0237 purM purN TRUE 0.987 -3.000 0.238 0.004 Y NA
 5699068 5699069 Aflv_0237 Aflv_0238 purN purH TRUE 0.979 -22.000 0.225 1.000 Y NA
 5699069 5699070 Aflv_0238 Aflv_0239 purH purD TRUE 0.972 16.000 0.238 1.000 Y NA
 5699071 5699072 Aflv_0240 Aflv_0241     TRUE 0.557 46.000 0.111 NA   NA
 5699073 5699074 Aflv_0242 Aflv_0243     TRUE 0.713 35.000 0.200 NA   NA
 5699074 5699075 Aflv_0243 Aflv_0244     TRUE 0.829 -7.000 0.106 NA   NA
 5699075 5699076 Aflv_0244 Aflv_0245   pcrB FALSE 0.206 64.000 0.015 NA   NA
 5699076 5699077 Aflv_0245 Aflv_0246 pcrB pcrA FALSE 0.543 30.000 0.049 NA   NA
 5699077 5699078 Aflv_0246 Aflv_0247 pcrA ligA TRUE 0.968 6.000 0.103 0.015 Y NA
 5699078 5699079 Aflv_0247 Aflv_0248 ligA   FALSE 0.465 4.000 0.004 NA   NA
 5699079 5699080 Aflv_0248 Aflv_0249   rocA FALSE 0.022 87.000 0.000 NA   NA
 5699080 5699081 Aflv_0249 Aflv_0250 rocA   FALSE 0.060 87.000 0.000 1.000   NA
 5699082 5699083 Aflv_0251 Aflv_0252     TRUE 0.930 -22.000 0.000 NA Y NA
 5699084 5699085 Aflv_0253 Aflv_0254     FALSE 0.002 262.000 0.000 NA   NA
 5699085 5699086 Aflv_0254 Aflv_0255     FALSE 0.086 27.000 0.000 NA   NA
 5699087 5699088 Aflv_0256 Aflv_0257   adeC FALSE 0.072 33.000 0.000 NA   NA
 5699089 5699090 Aflv_0258 Aflv_0259 gatC gatA TRUE 0.990 13.000 0.643 0.002 Y NA
 5699090 5699091 Aflv_0259 Aflv_0260 gatA gatB TRUE 0.987 12.000 0.492 0.002 Y NA
 5699093 5699094 Aflv_0262 Aflv_0263   azlC FALSE 0.001 513.000 0.000 NA   NA
 5699094 5699095 Aflv_0263 Aflv_0264 azlC   TRUE 0.568 8.000 0.032 NA   NA
 5699095 5699096 Aflv_0264 Aflv_0265     FALSE 0.001 2647.000 0.000 NA   NA
 5699098 5699099 Aflv_0267 Aflv_0268     TRUE 0.883 14.000 0.370 NA   NA
 5699099 5699100 Aflv_0268 Aflv_0269     TRUE 0.910 -13.000 0.326 NA   NA
 5699100 5699101 Aflv_0269 Aflv_0270     TRUE 0.928 -25.000 0.500 NA   NA
 5699101 5699102 Aflv_0270 Aflv_0271     FALSE 0.248 5.000 0.000 1.000   NA
 5699102 5699103 Aflv_0271 Aflv_0272   qoxA FALSE 0.092 358.000 0.000 1.000 Y NA
 5699103 5699104 Aflv_0272 Aflv_0273 qoxA qoxB TRUE 0.972 -31.000 0.043 0.010 Y NA
 5699104 5699105 Aflv_0273 Aflv_0274 qoxB qoxC TRUE 0.994 -10.000 0.957 0.046 Y NA
 5699105 5699106 Aflv_0274 Aflv_0275 qoxC qoxD TRUE 0.989 1.000 0.959 1.000 Y NA
 5699106 5699107 Aflv_0275 Aflv_0276 qoxD   FALSE 0.043 102.000 0.000 1.000   NA
 5699107 5699108 Aflv_0276 Aflv_0277     FALSE 0.293 -69.000 0.000 1.000   NA
 5699109 5699110 Aflv_0278 Aflv_0279 pspA   TRUE 0.943 -37.000 0.833 NA   NA
 5699110 5699111 Aflv_0279 Aflv_0280   resE FALSE 0.549 65.000 0.250 NA   NA
 5699111 5699112 Aflv_0280 Aflv_0281 resE   TRUE 0.978 -64.000 0.304 1.000 Y NA
 5699113 5699114 Aflv_0282 Aflv_0283     TRUE 0.693 13.000 0.062 NA   NA
 5699114 5699115 Aflv_0283 Aflv_0284     TRUE 0.736 2.000 0.087 NA   NA
 5699115 5699116 Aflv_0284 Aflv_0285     FALSE 0.341 67.000 0.000 1.000 N NA
 5699116 5699117 Aflv_0285 Aflv_0286   yvqC TRUE 0.986 -28.000 0.300 0.022 Y NA
 5699117 5699118 Aflv_0286 Aflv_0287 yvqC   FALSE 0.276 13.000 0.000 1.000   NA
 5699118 5699119 Aflv_0287 Aflv_0288     FALSE 0.054 92.000 0.000 1.000   NA
 5699119 5699120 Aflv_0288 Aflv_0289     TRUE 0.752 65.000 0.299 1.000 N NA
 5699120 5699121 Aflv_0289 Aflv_0290     FALSE 0.058 173.000 0.000 NA N NA
 5699121 5699122 Aflv_0290 Aflv_0291     FALSE 0.064 37.000 0.000 NA   NA
 5699124 5699125 Aflv_0293 Aflv_0294 padR   TRUE 0.940 -22.000 0.667 NA   NA
 5699125 5699126 Aflv_0294 Aflv_0295   sigV FALSE 0.001 372.000 0.000 NA   NA
 5699126 5699127 Aflv_0295 Aflv_0296 sigV   FALSE 0.170 -13.000 0.000 NA   NA
 5699129 5699130 Aflv_0298 Aflv_0299   tlpB FALSE 0.165 120.000 0.000 1.000 N NA
 5699131 5699132 Aflv_0300 Aflv_0301     FALSE 0.005 167.000 0.000 NA   NA
 5699135 5699136 Aflv_0304 Aflv_0305     FALSE 0.240 98.000 0.000 1.000 N NA
 5699136 5699137 Aflv_0305 Aflv_0306     TRUE 0.984 -3.000 0.308 1.000 Y NA
 5699137 5699138 Aflv_0306 Aflv_0307     TRUE 0.909 15.000 0.517 NA   NA
 5699141 5699142 Aflv_0310 Aflv_0311     TRUE 0.870 5.000 0.333 1.000   NA
 5699142 5699143 Aflv_0311 Aflv_0312     TRUE 0.891 5.000 0.438 1.000   NA
 5699143 5699144 Aflv_0312 Aflv_0313     TRUE 0.857 1.000 0.049 1.000 N NA
 5699144 5699145 Aflv_0313 Aflv_0314     TRUE 0.983 -3.000 0.101 0.002 Y NA
 5699145 5699146 Aflv_0314 Aflv_0315   cysP TRUE 0.858 45.000 0.009 1.000 Y NA
 5699146 5699147 Aflv_0315 Aflv_0316 cysP cysH TRUE 0.800 13.000 0.005 1.000 N NA
 5699150 5699151 Aflv_0319 Aflv_0320     FALSE 0.517 11.000 0.019 NA   NA
 5699151 5699152 Aflv_0320 Aflv_0321     TRUE 0.840 19.000 0.273 NA   NA
 5699153 5699154 Aflv_0322 Aflv_0323     FALSE 0.363 66.000 0.077 NA   NA
 5699155 5699156 Aflv_0324 Aflv_0325     TRUE 0.814 12.000 0.212 NA   NA
 5699158 5699159 Aflv_0327 Aflv_0328     FALSE 0.220 113.000 0.093 NA   NA
 5699159 5699160 Aflv_0328 Aflv_0329     TRUE 0.939 -10.000 0.185 1.000 N NA
 5699160 5699161 Aflv_0329 Aflv_0330     TRUE 0.891 5.000 0.160 1.000 N NA
 5699161 5699162 Aflv_0330 Aflv_0331     TRUE 0.905 13.000 0.164 1.000 N NA
 5699162 5699163 Aflv_0331 Aflv_0332     TRUE 0.674 10.000 0.000 1.000 N NA
 5699165 5699166 Aflv_0334 Aflv_0335     FALSE 0.004 185.000 0.000 NA   NA
 5699166 5699167 Aflv_0335 Aflv_0336     FALSE 0.004 185.000 0.000 NA   NA
 5699167 5699168 Aflv_0336 Aflv_0337     FALSE 0.072 33.000 0.000 NA   NA
 5699171 5699172 Aflv_0340 Aflv_0341     TRUE 0.568 74.000 0.333 NA   NA
 5699172 5699173 Aflv_0341 Aflv_0342     TRUE 0.581 94.000 0.500 NA   NA
 5699173 5699174 Aflv_0342 Aflv_0343   hutI FALSE 0.035 222.000 0.000 NA N NA
 5699174 5699175 Aflv_0343 Aflv_0344 hutI   TRUE 0.701 41.000 0.200 1.000   NA
 5699178 5699179 Aflv_0347 Aflv_0348     FALSE 0.052 45.000 0.000 NA   NA
 5699180 5699181 Aflv_0349 Aflv_0350   sspK TRUE 0.900 2.000 0.480 NA   NA
 5699181 5699182 Aflv_0350 Aflv_0351 sspK   FALSE 0.289 84.000 0.066 NA   NA
 5699185 5699186 Aflv_0354 Aflv_0355 sspE   FALSE 0.123 100.000 0.015 NA   NA
 5699186 5699187 Aflv_0355 Aflv_0356   appD FALSE 0.126 127.000 0.000 NA N NA
 5699187 5699188 Aflv_0356 Aflv_0357 appD appF TRUE 0.993 -49.000 1.000 0.001 Y NA
 5699188 5699189 Aflv_0357 Aflv_0358 appF oppA TRUE 0.960 48.000 0.750 1.000 Y NA
 5699189 5699190 Aflv_0358 Aflv_0359 oppA appB TRUE 0.962 6.000 0.067 0.027 Y NA
 5699190 5699191 Aflv_0359 Aflv_0360 appB appC TRUE 0.990 15.000 0.779 0.027 Y NA
 5699192 5699193 Aflv_0361 Aflv_0362   gltA-2 FALSE 0.136 130.000 0.066 NA   NA
 5699193 5699194 Aflv_0362 Aflv_0363 gltA-2 gsaB FALSE 0.068 263.000 0.036 1.000 N NA
 5699195 5699196 Aflv_0364 Aflv_0365     TRUE 0.912 -61.000 0.488 NA   NA
 5699196 5699197 Aflv_0365 Aflv_0366     TRUE 0.893 5.000 0.500 NA   NA
 5699197 5699198 Aflv_0366 Aflv_0367     FALSE 0.141 -42.000 0.000 NA   NA
 5699198 5699199 Aflv_0367 Aflv_0368     FALSE 0.484 13.000 0.002 NA   NA
 5699199 5699200 Aflv_0368 Aflv_0369   perR FALSE 0.116 170.000 0.005 1.000 N NA
 5699202 5699203 Aflv_0371 Aflv_R054     FALSE 0.002 222.000 0.000 NA   NA
 5699203 5699204 Aflv_R054 Aflv_R055     FALSE 0.001 359.000 0.000 NA   NA
 5699204 5699205 Aflv_R055 Aflv_R056     FALSE 0.006 151.000 0.000 NA   NA
 5699205 5699206 Aflv_R056 Aflv_R057   trnV FALSE 0.121 13.000 0.000 NA   NA
 5699206 5699207 Aflv_R057 Aflv_R058 trnV trnM FALSE 0.083 28.000 0.000 NA   NA
 5699207 5699208 Aflv_R058 Aflv_R059 trnM trnD FALSE 0.107 5.000 0.000 NA   NA
 5699208 5699209 Aflv_R059 Aflv_R060 trnD trnF FALSE 0.005 161.000 0.000 NA   NA
 5699209 5699210 Aflv_R060 Aflv_R061 trnF trnT FALSE 0.110 12.000 0.000 NA   NA
 5699210 5699211 Aflv_R061 Aflv_R062 trnT trnK FALSE 0.110 12.000 0.000 NA   NA
 5699211 5699212 Aflv_R062 Aflv_R063 trnK trnL FALSE 0.107 5.000 0.000 NA   NA
 5699212 5699213 Aflv_R063 Aflv_R064 trnL trnG FALSE 0.107 5.000 0.000 NA   NA
 5699213 5699214 Aflv_R064 Aflv_R065 trnG trnL FALSE 0.105 11.000 0.000 NA   NA
 5699214 5699215 Aflv_R065 Aflv_R066 trnL trnR FALSE 0.106 9.000 0.000 NA   NA
 5699215 5699216 Aflv_R066 Aflv_R067 trnR trnP FALSE 0.109 4.000 0.000 NA   NA
 5699216 5699217 Aflv_R067 Aflv_R068 trnP trnA FALSE 0.106 8.000 0.000 NA   NA
 5699217 5699218 Aflv_R068 Aflv_R069 trnA trnM FALSE 0.115 17.000 0.000 NA   NA
 5699218 5699219 Aflv_R069 Aflv_R070 trnM trnM FALSE 0.106 6.000 0.000 NA   NA
 5699219 5699220 Aflv_R070 Aflv_R071 trnM trnS FALSE 0.122 15.000 0.000 NA   NA
 5699220 5699221 Aflv_R071 Aflv_R072 trnS trnT FALSE 0.094 24.000 0.000 NA   NA
 5699221 5699222 Aflv_R072 Aflv_R073 trnT trnH FALSE 0.106 6.000 0.000 NA   NA
 5699222 5699223 Aflv_R073 Aflv_R074 trnH trnG FALSE 0.004 182.000 0.000 NA   NA
 5699223 5699224 Aflv_R074 Aflv_R075 trnG trnI FALSE 0.106 6.000 0.000 NA   NA
 5699224 5699225 Aflv_R075 Aflv_R076 trnI trnN FALSE 0.081 29.000 0.000 NA   NA
 5699225 5699226 Aflv_R076 Aflv_R077 trnN trnS FALSE 0.109 4.000 0.000 NA   NA
 5699226 5699227 Aflv_R077 Aflv_R078 trnS trnE FALSE 0.110 12.000 0.000 NA   NA
 5699229 5699230 Aflv_0373 Aflv_0374 glgB glgC TRUE 0.985 -103.000 0.296 0.001 Y NA
 5699230 5699231 Aflv_0374 Aflv_0375 glgC glgD TRUE 0.988 -12.000 0.210 0.001 Y NA
 5699231 5699232 Aflv_0375 Aflv_0376 glgD glgA TRUE 0.989 -3.000 0.630 1.000 Y NA
 5699232 5699233 Aflv_0376 Aflv_0377 glgA glgP TRUE 0.983 -22.000 0.314 1.000 Y NA
 5699234 5699235 Aflv_0378 Aflv_0379 dksA menA TRUE 0.657 90.000 0.250 1.000 N NA
 5699236 5699237 Aflv_0380 Aflv_0381 menF menD TRUE 0.977 -9.000 0.142 1.000 Y NA
 5699237 5699238 Aflv_0381 Aflv_0382 menD   TRUE 0.922 -3.000 0.355 1.000   NA
 5699238 5699239 Aflv_0382 Aflv_0383   menB TRUE 0.912 -10.000 0.280 1.000   NA
 5699239 5699240 Aflv_0383 Aflv_0384 menB menE TRUE 0.937 19.000 0.193 0.002 N NA
 5699241 5699242 Aflv_0385 Aflv_0386 cydB cydA TRUE 0.991 -64.000 0.939 0.045 Y NA
 5699242 5699243 Aflv_0386 Aflv_0387 cydA   FALSE 0.010 125.000 0.000 NA   NA
 5699244 5699245 Aflv_0388 Aflv_0389     FALSE 0.106 8.000 0.000 NA   NA
 5699246 5699247 Aflv_0390 Aflv_0391 nrdF   TRUE 0.741 -46.000 0.000 1.000 N NA
 5699247 5699248 Aflv_0391 Aflv_0392     FALSE 0.069 163.000 0.000 NA N NA
 5699248 5699249 Aflv_0392 Aflv_0393   nrdE FALSE 0.217 96.000 0.000 NA N NA
 5699249 5699250 Aflv_0393 Aflv_0394 nrdE   FALSE 0.019 409.000 0.000 1.000 N NA
 5699250 5699251 Aflv_0394 Aflv_0395     TRUE 0.989 12.000 0.880 0.044 Y NA
 5699251 5699252 Aflv_0395 Aflv_0396     FALSE 0.319 73.000 0.000 1.000 N NA
 5699252 5699253 Aflv_0396 Aflv_0397     TRUE 0.690 39.000 0.200 NA   NA
 5699253 5699254 Aflv_0397 Aflv_0398     FALSE 0.149 78.000 0.002 NA   NA
 5699257 5699258 Aflv_0401 Aflv_0402 dps   FALSE 0.150 -31.000 0.000 NA   NA
 5699258 5699259 Aflv_0402 Aflv_0403     TRUE 0.598 61.000 0.292 NA   NA
 5699260 5699261 Aflv_0404 Aflv_0405     TRUE 0.991 -13.000 0.876 1.000 Y NA
 5699261 5699262 Aflv_0405 Aflv_0406     TRUE 0.982 1.000 0.528 NA Y NA
 5699262 5699263 Aflv_0406 Aflv_0407     FALSE 0.017 100.000 0.000 NA   NA
 5699265 5699266 Aflv_0409 Aflv_0410     TRUE 0.983 -75.000 0.489 1.000 Y NA
 5699266 5699267 Aflv_0410 Aflv_0411     TRUE 0.986 -18.000 0.236 0.015 Y NA
 5699267 5699268 Aflv_0411 Aflv_0412     FALSE 0.102 52.000 0.000 1.000   NA
 5699268 5699269 Aflv_0412 Aflv_0413   pckA FALSE 0.283 -103.000 0.000 1.000   NA
 5699271 5699272 Aflv_0415 Aflv_0416     FALSE 0.220 68.000 0.008 1.000   NA
 5699273 5699274 Aflv_0417 Aflv_0418     TRUE 0.896 -34.000 0.333 NA   NA
 5699274 5699275 Aflv_0418 Aflv_0419     FALSE 0.141 -43.000 0.000 NA   NA
 5699276 5699277 Aflv_0420 Aflv_0421     TRUE 0.930 -3.000 0.408 1.000   NA
 5699278 5699279 Aflv_0422 Aflv_0423     FALSE 0.105 11.000 0.000 NA   NA
 5699281 5699282 Aflv_0425 Aflv_0426 leuS   TRUE 0.751 -13.000 0.000 NA N NA
 5699288 5699289 Aflv_0432 Aflv_0433     TRUE 0.583 87.000 0.122 1.000 N NA
 5699289 5699290 Aflv_0433 Aflv_0434     TRUE 0.921 -3.000 0.103 1.000 N NA
 5699290 5699291 Aflv_0434 Aflv_0435   lrgA TRUE 0.606 23.000 0.034 1.000   NA
 5699291 5699292 Aflv_0435 Aflv_0436 lrgA lrgB TRUE 0.953 -3.000 0.727 1.000   NA
 5699292 5699293 Aflv_0436 Aflv_0437 lrgB   TRUE 0.646 36.000 0.130 NA   NA
 5699293 5699294 Aflv_0437 Aflv_0438     FALSE 0.072 211.000 0.162 NA   NA
 5699294 5699295 Aflv_0438 Aflv_0439     FALSE 0.530 82.000 0.078 NA N NA
 5699297 5699298 Aflv_0441 Aflv_0442     TRUE 0.587 47.000 0.117 1.000   NA
 5699300 5699301 Aflv_0444 Aflv_0445     TRUE 0.736 13.000 0.084 NA   NA
 5699301 5699302 Aflv_0445 Aflv_0446     TRUE 0.766 -15.000 0.062 NA   NA
 5699302 5699303 Aflv_0446 Aflv_0447     TRUE 0.933 -16.000 0.500 NA   NA
 5699303 5699304 Aflv_0447 Aflv_0448     TRUE 0.936 -3.000 0.511 NA   NA
 5699304 5699305 Aflv_0448 Aflv_0449     FALSE 0.108 178.000 0.143 1.000   NA
 5699305 5699306 Aflv_0449 Aflv_0450     TRUE 0.759 42.000 0.084 1.000 N NA
 5699306 5699307 Aflv_0450 Aflv_0451   murC FALSE 0.131 161.000 0.002 1.000 N NA
 5699308 5699309 Aflv_0452 Aflv_0453     TRUE 0.732 -19.000 0.050 NA   NA
 5699309 5699310 Aflv_0453 Aflv_0454     TRUE 0.847 13.000 0.250 NA   NA
 5699313 5699314 Aflv_0457 Aflv_0458 aroA ccpA FALSE 0.308 81.000 0.000 1.000 N NA
 5699315 5699316 Aflv_0459 Aflv_0460 acuC acuB TRUE 0.944 -30.000 0.271 1.000 N NA
 5699316 5699317 Aflv_0460 Aflv_0461 acuB   TRUE 0.873 35.000 0.446 0.058   NA
 5699323 5699324 Aflv_0467 Aflv_0468   hisJ TRUE 0.766 5.000 0.016 NA N NA
 5699327 5699328 Aflv_0471 Aflv_0472 nifZ   TRUE 0.957 -3.000 0.349 1.000 N NA
 5699328 5699329 Aflv_0472 Aflv_0473   sspD FALSE 0.092 56.000 0.000 1.000   NA
 5699329 5699330 Aflv_0473 Aflv_0474 sspD   FALSE 0.247 8.000 0.000 1.000   NA
 5699332 5699333 Aflv_0476 Aflv_0477     TRUE 0.923 -25.000 0.467 NA   NA
 5699333 5699334 Aflv_0477 Aflv_0478   tpx FALSE 0.198 78.000 0.022 NA   NA
 5699334 5699335 Aflv_0478 Aflv_0479 tpx   TRUE 0.555 86.000 0.089 1.000 N NA
 5699335 5699336 Aflv_0479 Aflv_0480   ackA FALSE 0.309 158.000 0.217 1.000 N NA
 5699338 5699339 Aflv_0482 Aflv_0483 argG argH TRUE 0.983 -3.000 0.278 1.000 Y NA
 5699341 5699342 Aflv_0485 Aflv_0486     FALSE 0.019 94.000 0.000 NA   NA
 5699344 5699345 Aflv_0488 Aflv_0489     FALSE 0.236 75.000 0.021 1.000   NA
 5699348 5699349 Aflv_0492 Aflv_0493     TRUE 0.931 -3.000 0.481 NA   NA
 5699350 5699351 Aflv_0494 Aflv_0495 dnaE   TRUE 0.565 91.000 0.127 1.000 N NA
 5699351 5699352 Aflv_0495 Aflv_0496     TRUE 0.963 -31.000 0.514 1.000 N NA
 5699352 5699353 Aflv_0496 Aflv_0497   accD FALSE 0.503 70.000 0.032 1.000 N NA
 5699353 5699354 Aflv_0497 Aflv_0498 accD accA TRUE 0.988 -15.000 0.234 0.002 Y NA
 5699354 5699355 Aflv_0498 Aflv_0499 accA pfkA FALSE 0.118 190.000 0.047 1.000 N NA
 5699355 5699356 Aflv_0499 Aflv_0500 pfkA   TRUE 0.979 10.000 0.261 0.005 Y NA
 5699356 5699357 Aflv_0500 Aflv_0501     TRUE 0.791 -46.000 0.082 1.000   NA
 5699359 5699360 Aflv_0503 Aflv_0504   citZ FALSE 0.024 262.000 0.039 NA   NA
 5699360 5699361 Aflv_0504 Aflv_0505 citZ icd TRUE 0.859 65.000 0.140 1.000 Y NA
 5699361 5699362 Aflv_0505 Aflv_0506 icd mdh TRUE 0.952 24.000 0.115 1.000 Y NA
 5699362 5699363 Aflv_0506 Aflv_0507 mdh   TRUE 0.557 55.000 0.022 1.000 N NA
 5699363 5699364 Aflv_0507 Aflv_0508   phoP TRUE 0.854 22.000 0.082 1.000 N NA
 5699364 5699365 Aflv_0508 Aflv_0509 phoP phoR TRUE 0.989 -7.000 0.384 0.066 Y NA
 5699365 5699366 Aflv_0509 Aflv_0510 phoR polA FALSE 0.084 194.000 0.004 1.000 N NA
 5699366 5699367 Aflv_0510 Aflv_0511 polA mutM TRUE 0.958 18.000 0.101 1.000 Y NA
 5699367 5699368 Aflv_0511 Aflv_0512 mutM   FALSE 0.296 67.000 0.050 NA   NA
 5699368 5699369 Aflv_0512 Aflv_0513     TRUE 0.606 3.000 0.038 NA   NA
 5699369 5699370 Aflv_0513 Aflv_0514   gapB FALSE 0.323 108.000 0.020 1.000 N NA
 5699370 5699371 Aflv_0514 Aflv_0515 gapB speD FALSE 0.038 241.000 0.000 1.000 N NA
 5699371 5699372 Aflv_0515 Aflv_0516 speD   FALSE 0.400 72.000 0.119 NA   NA
 5699372 5699373 Aflv_0516 Aflv_0517     FALSE 0.221 63.000 0.019 NA   NA
 5699373 5699374 Aflv_0517 Aflv_0518   dnaB TRUE 0.876 16.000 0.109 NA N NA
 5699374 5699375 Aflv_0518 Aflv_0519 dnaB dnaI TRUE 0.983 8.000 0.817 NA Y NA
 5699375 5699376 Aflv_0519 Aflv_0520 dnaI   FALSE 0.302 63.000 0.048 NA   NA
 5699376 5699377 Aflv_0520 Aflv_0521   thrS FALSE 0.002 295.000 0.000 NA   NA
 5699377 5699378 Aflv_0521 Aflv_0522 thrS infC FALSE 0.128 267.000 0.000 1.000 Y NA
 5699378 5699379 Aflv_0522 Aflv_0523 infC rpmI TRUE 0.982 20.000 0.652 1.000 Y NA
 5699379 5699380 Aflv_0523 Aflv_0524 rpmI rplT TRUE 0.990 19.000 0.928 0.021 Y NA
 5699382 5699383 Aflv_0526 Aflv_0527 dutB   TRUE 0.764 47.000 0.463 NA   NA
 5699383 5699384 Aflv_0527 Aflv_0528   araR FALSE 0.175 117.000 0.000 1.000 N NA
 5699384 5699385 Aflv_0528 Aflv_0529 araR araD TRUE 0.554 88.000 0.095 1.000 N NA
 5699385 5699386 Aflv_0529 Aflv_0530 araD araB TRUE 0.932 16.000 0.108 0.001 N NA
 5699386 5699387 Aflv_0530 Aflv_0531 araB araA TRUE 0.893 17.000 0.138 1.000 N NA
 5699387 5699388 Aflv_0531 Aflv_0532 araA   FALSE 0.065 82.000 0.000 1.000   NA
 5699388 5699389 Aflv_0532 Aflv_0533   abfA FALSE 0.231 23.000 0.000 1.000   NA
 5699389 5699390 Aflv_0533 Aflv_0534 abfA   FALSE 0.003 220.000 0.000 NA   NA
 5699390 5699391 Aflv_0534 Aflv_0535     FALSE 0.121 13.000 0.000 NA   NA
 5699391 5699392 Aflv_0535 Aflv_0537   msmR FALSE 0.159 -22.000 0.000 NA   NA
 5699392 5699393 Aflv_0537 Aflv_0538 msmR galM TRUE 0.676 9.000 0.000 1.000 N NA
 5699395 5699396 Aflv_0540 Aflv_0541 msrA   TRUE 0.855 -18.000 0.010 1.000 N NA
 5699396 5699397 Aflv_0541 Aflv_0542   pheS FALSE 0.133 338.000 0.006 1.000 Y NA
 5699397 5699398 Aflv_0542 Aflv_0543 pheS pheT TRUE 0.989 16.000 0.574 0.001 Y NA
 5699402 5699403 Aflv_0547 Aflv_0548 comQ comX TRUE 0.910 19.000 0.667 NA   NA
 5699403 5699404 Aflv_0548 Aflv_0549 comX   TRUE 0.817 4.000 0.222 NA   NA
 5699404 5699405 Aflv_0549 Aflv_0550   comA TRUE 0.981 -60.000 0.222 0.021 Y NA
 5699405 5699406 Aflv_0550 Aflv_0551 comA   FALSE 0.004 174.000 0.000 NA   NA
 5699406 5699407 Aflv_0551 Aflv_0552     FALSE 0.001 1802.000 0.000 NA   NA
 5699407 5699408 Aflv_0552 Aflv_0553     TRUE 0.680 1.000 0.000 NA N NA
 5699408 5699409 Aflv_0553 Aflv_0554     FALSE 0.007 140.000 0.000 NA   NA
 5699411 5699412 Aflv_0556 Aflv_0557     TRUE 0.900 -3.000 0.243 1.000   NA
 5699412 5699413 Aflv_0557 Aflv_0558   zapA FALSE 0.001 655.000 0.000 NA   NA
 5699413 5699414 Aflv_0558 Aflv_0559 zapA   TRUE 0.803 -19.000 0.091 NA   NA
 5699414 5699415 Aflv_0559 Aflv_0560     FALSE 0.473 50.000 0.066 1.000   NA
 5699415 5699416 Aflv_0560 Aflv_0561   mutSB TRUE 0.964 -145.000 0.114 1.000 Y NA
 5699416 5699417 Aflv_0561 Aflv_0562 mutSB   TRUE 0.675 12.000 0.065 NA   NA
 5699417 5699418 Aflv_0562 Aflv_0563     FALSE 0.121 13.000 0.000 NA   NA
 5699418 5699419 Aflv_0563 Aflv_0564   lcfA FALSE 0.019 96.000 0.000 NA   NA
 5699419 5699420 Aflv_0564 Aflv_0565 lcfA   TRUE 0.684 98.000 0.406 1.000 N NA
 5699420 5699421 Aflv_0565 Aflv_0566     TRUE 0.867 39.000 0.294 1.000 N NA
 5699421 5699422 Aflv_0566 Aflv_0567   etfB TRUE 0.927 16.000 0.275 1.000 N NA
 5699422 5699423 Aflv_0567 Aflv_0568 etfB etfA TRUE 0.982 8.000 0.373 0.011 Y NA
 5699423 5699424 Aflv_0568 Aflv_0569 etfA trxA FALSE 0.170 147.000 0.055 0.011   NA
 5699424 5699425 Aflv_0569 Aflv_0570 trxA   FALSE 0.010 126.000 0.000 NA   NA
 5699425 5699426 Aflv_0570 Aflv_0571     TRUE 0.768 53.000 0.667 NA   NA
 5699426 5699427 Aflv_0571 Aflv_0572     TRUE 0.784 -28.000 0.083 NA   NA
 5699427 5699428 Aflv_0572 Aflv_0573     TRUE 0.681 -54.000 0.047 NA   NA
 5699428 5699429 Aflv_0573 Aflv_0574     TRUE 0.753 -3.000 0.055 NA   NA
 5699429 5699430 Aflv_0574 Aflv_0575     FALSE 0.410 59.000 0.083 NA   NA
 5699430 5699431 Aflv_0575 Aflv_0576     TRUE 0.885 16.000 0.400 NA   NA
 5699431 5699432 Aflv_0576 Aflv_0577     TRUE 0.723 45.000 0.308 NA   NA
 5699432 5699433 Aflv_0577 Aflv_0578   uvrC FALSE 0.529 -49.000 0.004 NA   NA
 5699435 5699436 Aflv_0580 Aflv_0581 sdhC sdhA TRUE 0.974 24.000 0.184 0.001 Y NA
 5699436 5699437 Aflv_0581 Aflv_0582 sdhA sdhB TRUE 0.988 -3.000 0.231 0.001 Y NA
 5699437 5699438 Aflv_0582 Aflv_0583 sdhB   FALSE 0.392 58.000 0.072 NA   NA
 5699438 5699439 Aflv_0583 Aflv_0584   gerE TRUE 0.802 27.000 0.275 NA   NA
 5699439 5699440 Aflv_0584 Aflv_0585 gerE racE FALSE 0.327 71.000 0.000 1.000 N NA
 5699440 5699441 Aflv_0585 Aflv_0586 racE gerM FALSE 0.174 92.000 0.026 NA   NA
 5699441 5699442 Aflv_0586 Aflv_0587 gerM rph FALSE 0.199 94.000 0.040 NA   NA
 5699442 5699443 Aflv_0587 Aflv_0588 rph   TRUE 0.944 -27.000 0.262 1.000 N NA
 5699443 5699444 Aflv_0588 Aflv_0589     FALSE 0.170 -3.000 0.000 NA   NA
 5699444 5699445 Aflv_0589 Aflv_R081   trnR FALSE 0.020 92.000 0.000 NA   NA
 5699445 5699446 Aflv_R081 Aflv_0590 trnR dat FALSE 0.001 450.000 0.000 NA   NA
 5699446 5699447 Aflv_0590 Aflv_0591 dat ilvB FALSE 0.144 247.000 0.000 1.000 Y NA
 5699447 5699448 Aflv_0591 Aflv_0592 ilvB ilvH TRUE 0.989 -6.000 0.249 0.001 Y NA
 5699448 5699449 Aflv_0592 Aflv_0593 ilvH ilvC TRUE 0.974 18.000 0.130 0.002 Y NA
 5699449 5699450 Aflv_0593 Aflv_0594 ilvC leuA TRUE 0.974 -13.000 0.103 1.000 Y NA
 5699450 5699451 Aflv_0594 Aflv_0595 leuA leuB TRUE 0.962 18.000 0.033 0.002 Y NA
 5699451 5699452 Aflv_0595 Aflv_0596 leuB leuC TRUE 0.969 12.000 0.076 0.002 Y NA
 5699452 5699453 Aflv_0596 Aflv_0597 leuC leuD TRUE 0.973 12.000 0.103 0.001 Y NA
 5699453 5699454 Aflv_0597 Aflv_0598 leuD   FALSE 0.344 84.000 0.074 1.000   NA
 5699454 5699455 Aflv_0598 Aflv_0599   tig FALSE 0.168 95.000 0.012 1.000   NA
 5699455 5699456 Aflv_0599 Aflv_0600 tig clpX FALSE 0.385 194.000 0.033 0.003 Y NA
 5699456 5699457 Aflv_0600 Aflv_0601 clpX lonB TRUE 0.923 43.000 0.042 0.003 Y NA
 5699457 5699458 Aflv_0601 Aflv_0602 lonB lonA TRUE 0.879 114.000 0.435 0.002 Y NA
 5699458 5699459 Aflv_0602 Aflv_0603 lonA ysxC TRUE 0.786 -3.000 0.055 1.000   NA
 5699461 5699462 Aflv_0605 Aflv_0606 hemA hemX TRUE 0.957 13.000 0.613 1.000 N NA
 5699462 5699463 Aflv_0606 Aflv_0607 hemX hemC TRUE 0.820 7.000 0.040 1.000 N NA
 5699463 5699464 Aflv_0607 Aflv_0608 hemC hemD TRUE 0.965 1.000 0.028 0.003 Y NA
 5699464 5699465 Aflv_0608 Aflv_0609 hemD hemB TRUE 0.969 2.000 0.061 0.003 Y NA
 5699465 5699466 Aflv_0609 Aflv_0610 hemB hemL TRUE 0.982 -21.000 0.126 0.003 Y NA
 5699466 5699467 Aflv_0610 Aflv_0611 hemL spoVID TRUE 0.610 64.000 0.288 1.000   NA
 5699467 5699468 Aflv_0611 Aflv_0612 spoVID   TRUE 0.891 10.000 0.500 NA   NA
 5699470 5699471 Aflv_0614 Aflv_0615   folC FALSE 0.545 64.000 0.041 1.000 N NA
 5699471 5699472 Aflv_0615 Aflv_0616 folC   FALSE 0.375 59.000 0.068 NA   NA
 5699472 5699473 Aflv_0616 Aflv_0617     FALSE 0.006 148.000 0.000 NA   NA
 5699474 5699475 Aflv_0618 Aflv_0619     TRUE 0.891 13.000 0.417 NA   NA
 5699475 5699476 Aflv_0619 Aflv_0620     TRUE 0.940 -16.000 0.583 NA   NA
 5699477 5699478 Aflv_0621 Aflv_0622     TRUE 0.908 -12.000 0.316 NA   NA
 5699478 5699479 Aflv_0622 Aflv_0623     TRUE 0.917 -10.000 0.368 NA   NA
 5699479 5699480 Aflv_0623 Aflv_0624   pilB TRUE 0.941 -3.000 0.500 1.000   NA
 5699480 5699481 Aflv_0624 Aflv_0625 pilB pilT TRUE 0.979 2.000 0.225 0.018 Y NA
 5699481 5699482 Aflv_0625 Aflv_0626 pilT pulF TRUE 0.979 7.000 0.493 1.000 Y NA
 5699482 5699483 Aflv_0626 Aflv_0627 pulF pulG TRUE 0.748 76.000 0.031 NA Y NA
 5699483 5699484 Aflv_0627 Aflv_0628 pulG pulO TRUE 0.810 41.000 0.000 NA Y NA
 5699484 5699485 Aflv_0628 Aflv_0629 pulO   TRUE 0.942 13.000 0.038 NA Y NA
 5699485 5699486 Aflv_0629 Aflv_0630     TRUE 0.864 -22.000 0.196 NA   NA
 5699486 5699487 Aflv_0630 Aflv_0631     TRUE 0.945 -33.000 0.846 NA   NA
 5699487 5699488 Aflv_0631 Aflv_0632   pulE FALSE 0.124 14.000 0.000 NA   NA
 5699488 5699489 Aflv_0632 Aflv_0633 pulE spoIIB FALSE 0.009 133.000 0.000 NA   NA
 5699489 5699490 Aflv_0633 Aflv_0634 spoIIB maf FALSE 0.128 103.000 0.020 NA   NA
 5699490 5699491 Aflv_0634 Aflv_0635 maf   FALSE 0.081 29.000 0.000 NA   NA
 5699492 5699493 Aflv_0636 Aflv_0637 spoIVCA lexA TRUE 0.686 58.000 0.125 1.000 N NA
 5699493 5699494 Aflv_0637 Aflv_0638 lexA   FALSE 0.159 -22.000 0.000 NA   NA
 5699495 5699496 Aflv_0639 Aflv_0640     FALSE 0.006 150.000 0.000 NA   NA
 5699496 5699497 Aflv_0640 Aflv_0641     FALSE 0.150 -31.000 0.000 NA   NA
 5699497 5699498 Aflv_0641 Aflv_0642     FALSE 0.106 6.000 0.000 NA   NA
 5699498 5699499 Aflv_0642 Aflv_0643     FALSE 0.170 -3.000 0.000 NA   NA
 5699499 5699500 Aflv_0643 Aflv_0644     FALSE 0.002 233.000 0.000 NA   NA
 5699500 5699501 Aflv_0644 Aflv_0645     FALSE 0.170 -3.000 0.000 NA   NA
 5699501 5699502 Aflv_0645 Aflv_0646     FALSE 0.170 -3.000 0.000 NA   NA
 5699502 5699503 Aflv_0646 Aflv_0647     FALSE 0.016 101.000 0.000 NA   NA
 5699503 5699504 Aflv_0647 Aflv_0648     FALSE 0.027 71.000 0.000 NA   NA
 5699504 5699505 Aflv_0648 Aflv_0649     FALSE 0.364 116.000 0.158 0.068   NA
 5699505 5699506 Aflv_0649 Aflv_0650     TRUE 0.872 5.000 0.222 0.068   NA
 5699506 5699507 Aflv_0650 Aflv_0651     FALSE 0.119 2.000 0.000 NA   NA
 5699507 5699508 Aflv_0651 Aflv_0652     FALSE 0.402 52.000 0.062 NA   NA
 5699508 5699509 Aflv_0652 Aflv_0653     FALSE 0.110 12.000 0.000 NA   NA
 5699509 5699510 Aflv_0653 Aflv_0654     FALSE 0.121 13.000 0.000 NA   NA
 5699510 5699511 Aflv_0654 Aflv_0655     FALSE 0.113 3.000 0.000 NA   NA
 5699511 5699512 Aflv_0655 Aflv_0656     FALSE 0.138 0.000 0.000 NA   NA
 5699512 5699513 Aflv_0656 Aflv_0657     FALSE 0.107 5.000 0.000 NA   NA
 5699513 5699514 Aflv_0657 Aflv_0658   xpf FALSE 0.001 350.000 0.000 NA   NA
 5699514 5699515 Aflv_0658 Aflv_0659 xpf   FALSE 0.006 236.000 0.000 1.000   NA
 5699515 5699516 Aflv_0659 Aflv_0660     TRUE 0.750 51.000 0.500 NA   NA
 5699516 5699517 Aflv_0660 Aflv_0661     TRUE 0.927 -3.000 0.444 NA   NA
 5699517 5699518 Aflv_0661 Aflv_0662     TRUE 0.939 -10.000 0.538 NA   NA
 5699518 5699519 Aflv_0662 Aflv_0663     TRUE 0.930 -28.000 0.538 NA   NA
 5699519 5699520 Aflv_0663 Aflv_0664     FALSE 0.144 -37.000 0.000 NA   NA
 5699520 5699521 Aflv_0664 Aflv_0665     FALSE 0.106 8.000 0.000 NA   NA
 5699521 5699522 Aflv_0665 Aflv_0666     TRUE 0.865 0.000 0.250 NA   NA
 5699522 5699523 Aflv_0666 Aflv_0667     FALSE 0.162 -19.000 0.000 NA   NA
 5699523 5699524 Aflv_0667 Aflv_0668     FALSE 0.110 12.000 0.000 NA   NA
 5699524 5699525 Aflv_0668 Aflv_0669     TRUE 0.890 -46.000 0.333 NA   NA
 5699525 5699526 Aflv_0669 Aflv_0670     TRUE 0.933 -16.000 0.500 NA   NA
 5699526 5699527 Aflv_0670 Aflv_0671     TRUE 0.687 5.000 0.074 NA   NA
 5699527 5699528 Aflv_0671 Aflv_0672     TRUE 0.692 4.000 0.074 NA   NA
 5699528 5699529 Aflv_0672 Aflv_0673     FALSE 0.005 168.000 0.000 NA   NA
 5699529 5699530 Aflv_0673 Aflv_0674     FALSE 0.119 2.000 0.000 NA   NA
 5699530 5699531 Aflv_0674 Aflv_0675     TRUE 0.901 5.000 0.571 NA   NA
 5699531 5699532 Aflv_0675 Aflv_0676     FALSE 0.110 12.000 0.000 NA   NA
 5699532 5699533 Aflv_0676 Aflv_0677     FALSE 0.003 208.000 0.000 NA   NA
 5699533 5699534 Aflv_0677 Aflv_0678     FALSE 0.064 38.000 0.000 NA   NA
 5699534 5699535 Aflv_0678 Aflv_0679     FALSE 0.170 -3.000 0.000 NA   NA
 5699535 5699536 Aflv_0679 Aflv_0680   ycdD FALSE 0.170 -3.000 0.000 NA   NA
 5699537 5699538 Aflv_0681 Aflv_0682     FALSE 0.170 -3.000 0.000 NA   NA
 5699539 5699540 Aflv_0683 Aflv_0684     FALSE 0.048 47.000 0.000 NA   NA
 5699540 5699541 Aflv_0684 Aflv_0685   ftsK FALSE 0.380 133.000 0.500 NA   NA
 5699541 5699542 Aflv_0685 Aflv_0686 ftsK   FALSE 0.001 763.000 0.000 NA   NA
 5699542 5699543 Aflv_0686 Aflv_0687   mreB FALSE 0.101 22.000 0.000 NA   NA
 5699543 5699544 Aflv_0687 Aflv_0688 mreB mreC TRUE 0.953 20.000 0.689 1.000 N NA
 5699544 5699545 Aflv_0688 Aflv_0689 mreC mreD TRUE 0.992 -3.000 0.550 0.003 Y NA
 5699545 5699546 Aflv_0689 Aflv_0690 mreD minC TRUE 0.911 -31.000 0.106 1.000 N NA
 5699546 5699547 Aflv_0690 Aflv_0691 minC minD TRUE 0.985 -3.000 0.368 1.000 Y NA
 5699547 5699548 Aflv_0691 Aflv_0692 minD spoIVFA FALSE 0.262 88.000 0.060 NA   NA
 5699548 5699549 Aflv_0692 Aflv_0693 spoIVFA spoIVFB TRUE 0.883 -7.000 0.219 NA   NA
 5699549 5699550 Aflv_0693 Aflv_0694 spoIVFB rplU FALSE 0.177 87.000 0.004 1.000   NA
 5699550 5699551 Aflv_0694 Aflv_0695 rplU   TRUE 0.963 11.000 0.208 NA Y NA
 5699551 5699552 Aflv_0695 Aflv_0696   rpmA TRUE 0.968 14.000 0.203 NA Y NA
 5699552 5699553 Aflv_0696 Aflv_0697 rpmA spo0B FALSE 0.153 89.000 0.013 NA   NA
 5699553 5699554 Aflv_0697 Aflv_0698 spo0B obg FALSE 0.432 31.000 0.021 NA   NA
 5699554 5699555 Aflv_0698 Aflv_0699 obg pheB TRUE 0.711 -16.000 0.024 1.000   NA
 5699555 5699556 Aflv_0699 Aflv_0700 pheB pheA TRUE 0.842 15.000 0.054 0.001   NA
 5699557 5699558 Aflv_0701 Aflv_0702     TRUE 0.900 -3.000 0.243 1.000   NA
 5699559 5699560 Aflv_0703 Aflv_0704 nadB nadC TRUE 0.963 -63.000 0.014 0.004 Y NA
 5699560 5699561 Aflv_0704 Aflv_0705 nadC nadA TRUE 0.979 13.000 0.198 0.004 Y NA
 5699561 5699562 Aflv_0705 Aflv_0706 nadA   FALSE 0.022 136.000 0.000 1.000   NA
 5699562 5699563 Aflv_0706 Aflv_0707   nadE FALSE 0.067 75.000 0.000 1.000   NA
 5699563 5699564 Aflv_0707 Aflv_0708 nadE   FALSE 0.278 46.000 0.006 NA   NA
 5699564 5699565 Aflv_0708 Aflv_0709     FALSE 0.151 85.000 0.008 NA   NA
 5699565 5699566 Aflv_0709 Aflv_0710     FALSE 0.242 50.000 0.005 NA   NA
 5699566 5699567 Aflv_0710 Aflv_0711   ruvA FALSE 0.133 94.000 0.010 NA   NA
 5699567 5699568 Aflv_0711 Aflv_0712 ruvA ruvB TRUE 0.987 10.000 0.549 0.003 Y NA
 5699568 5699569 Aflv_0712 Aflv_0713 ruvB   TRUE 0.654 72.000 0.000 NA Y NA
 5699569 5699570 Aflv_0713 Aflv_0714     FALSE 0.005 162.000 0.000 NA   NA
 5699570 5699571 Aflv_0714 Aflv_0715   queA TRUE 0.599 19.000 0.039 NA   NA
 5699571 5699572 Aflv_0715 Aflv_0716 queA tgt TRUE 0.983 21.000 0.360 0.001 Y NA
 5699572 5699573 Aflv_0716 Aflv_0717 tgt   TRUE 0.930 15.000 0.325 NA N NA
 5699577 5699578 Aflv_0721 Aflv_0722     FALSE 0.376 96.000 0.185 NA   NA
 5699578 5699579 Aflv_0722 Aflv_0723     FALSE 0.315 83.000 0.060 1.000   NA
 5699579 5699580 Aflv_0723 Aflv_0724     TRUE 0.631 45.000 0.015 1.000 N NA
 5699580 5699581 Aflv_0724 Aflv_0725   apt TRUE 0.908 -52.000 0.128 1.000 N NA
 5699581 5699582 Aflv_0725 Aflv_0726 apt relA FALSE 0.420 105.000 0.068 1.000 N NA
 5699582 5699583 Aflv_0726 Aflv_0727 relA   TRUE 0.908 15.000 0.177 1.000 N NA
 5699585 5699586 Aflv_0729 Aflv_0730   hisS FALSE 0.025 336.000 0.000 1.000 N NA
 5699586 5699587 Aflv_0730 Aflv_0731 hisS aspS TRUE 0.971 12.000 0.161 0.051 Y NA
 5699587 5699588 Aflv_0731 Aflv_0732 aspS   FALSE 0.044 311.000 0.008 1.000 N NA
 5699588 5699589 Aflv_0732 Aflv_0733     FALSE 0.092 144.000 0.000 NA N NA
 5699589 5699590 Aflv_0733 Aflv_0734     TRUE 0.768 80.000 0.500 NA N NA
 5699590 5699591 Aflv_0734 Aflv_0735     TRUE 0.836 13.000 0.035 1.000 N NA
 5699591 5699592 Aflv_0735 Aflv_0736     TRUE 0.832 38.000 0.217 NA N NA
 5699592 5699593 Aflv_0736 Aflv_0737     TRUE 0.891 10.000 0.201 NA N NA
 5699593 5699594 Aflv_0737 Aflv_0738   trmU TRUE 0.909 -3.000 0.072 1.000 N NA
 5699594 5699595 Aflv_0738 Aflv_0739 trmU   TRUE 0.552 54.000 0.017 1.000 N NA
 5699595 5699596 Aflv_0739 Aflv_0740     TRUE 0.898 12.000 0.174 1.000 N NA
 5699596 5699597 Aflv_0740 Aflv_0741     FALSE 0.447 59.000 0.107 NA   NA
 5699597 5699598 Aflv_0741 Aflv_0742     FALSE 0.105 11.000 0.000 NA   NA
 5699598 5699599 Aflv_0742 Aflv_0743     FALSE 0.024 82.000 0.000 NA   NA
 5699599 5699600 Aflv_0743 Aflv_0744   alaS FALSE 0.002 309.000 0.000 NA   NA
 5699600 5699601 Aflv_0744 Aflv_0745 alaS   FALSE 0.445 60.000 0.110 NA   NA
 5699601 5699602 Aflv_0745 Aflv_0746     TRUE 0.938 -10.000 0.537 NA   NA
 5699602 5699603 Aflv_0746 Aflv_0747     TRUE 0.944 -3.000 0.651 NA   NA
 5699603 5699604 Aflv_0747 Aflv_0748     FALSE 0.393 86.000 0.151 NA   NA
 5699604 5699605 Aflv_0748 Aflv_0749     FALSE 0.419 77.000 0.154 NA   NA
 5699605 5699606 Aflv_0749 Aflv_0750     TRUE 0.826 -61.000 0.142 1.000   NA
 5699606 5699607 Aflv_0750 Aflv_0751     TRUE 0.973 21.000 0.156 0.004 Y NA
 5699607 5699608 Aflv_0751 Aflv_0752   udk TRUE 0.884 2.000 0.100 1.000 N NA
 5699608 5699609 Aflv_0752 Aflv_0753 udk greA TRUE 0.566 85.000 0.095 1.000 N NA
 5699609 5699610 Aflv_0753 Aflv_0754 greA   TRUE 0.760 39.000 0.070 1.000 N NA
 5699610 5699611 Aflv_0754 Aflv_0755     TRUE 0.875 -3.000 0.203 NA   NA
 5699611 5699612 Aflv_0755 Aflv_0756     FALSE 0.006 150.000 0.000 NA   NA
 5699614 5699615 Aflv_0758 Aflv_0759   mtn TRUE 0.841 19.000 0.057 1.000 N NA
 5699615 5699616 Aflv_0759 Aflv_0760 mtn   TRUE 0.711 31.000 0.010 1.000 N NA
 5699616 5699617 Aflv_0760 Aflv_0761     TRUE 0.971 2.000 0.101 0.017 Y NA
 5699617 5699618 Aflv_0761 Aflv_0762     TRUE 0.571 36.000 0.076 NA   NA
 5699620 5699621 Aflv_0764 Aflv_0765     TRUE 0.911 -3.000 0.333 NA   NA
 5699621 5699622 Aflv_0765 Aflv_0766     TRUE 0.822 -3.000 0.103 NA   NA
 5699622 5699623 Aflv_0766 Aflv_0767     TRUE 0.884 3.000 0.423 NA   NA
 5699623 5699624 Aflv_0767 Aflv_0768     TRUE 0.826 9.000 0.250 NA   NA
 5699624 5699625 Aflv_0768 Aflv_0769     TRUE 0.832 15.000 0.216 NA   NA
 5699625 5699626 Aflv_0769 Aflv_0770     TRUE 0.977 0.000 0.286 NA Y NA
 5699626 5699627 Aflv_0770 Aflv_0771     TRUE 0.967 2.000 0.207 NA Y NA
 5699627 5699628 Aflv_0771 Aflv_0772     FALSE 0.001 6002.000 0.000 NA   NA
 11540145 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 1950.000 0.000 NA   NA
 11682508 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 1950.000 0.000 NA   NA
 11824900 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 1950.000 0.000 NA   NA
 11540146 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 1979.000 0.000 NA   NA
 11682509 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 1979.000 0.000 NA   NA
 11824901 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 1979.000 0.000 NA   NA
 11540147 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2014.000 0.000 NA   NA
 11682510 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2014.000 0.000 NA   NA
 11824902 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2014.000 0.000 NA   NA
 11540148 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2043.000 0.000 NA   NA
 11682511 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2043.000 0.000 NA   NA
 11824903 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2043.000 0.000 NA   NA
 11540149 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2081.000 0.000 NA   NA
 11682512 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2081.000 0.000 NA   NA
 11824904 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2081.000 0.000 NA   NA
 11540150 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2110.000 0.000 NA   NA
 11682513 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2110.000 0.000 NA   NA
 11824905 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2110.000 0.000 NA   NA
 11540151 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2147.000 0.000 NA   NA
 11682514 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2147.000 0.000 NA   NA
 11824906 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2147.000 0.000 NA   NA
 11540152 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2176.000 0.000 NA   NA
 11682515 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2176.000 0.000 NA   NA
 11824907 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2176.000 0.000 NA   NA
 11540153 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2213.000 0.000 NA   NA
 11682516 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2213.000 0.000 NA   NA
 11824908 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2213.000 0.000 NA   NA
 11540154 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2242.000 0.000 NA   NA
 11682517 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2242.000 0.000 NA   NA
 11824909 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2242.000 0.000 NA   NA
 11540155 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2277.000 0.000 NA   NA
 11682518 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2277.000 0.000 NA   NA
 11824910 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2277.000 0.000 NA   NA
 11540156 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2306.000 0.000 NA   NA
 11682519 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2306.000 0.000 NA   NA
 11824911 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2306.000 0.000 NA   NA
 11540157 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2344.000 0.000 NA   NA
 11682520 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2344.000 0.000 NA   NA
 11824912 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2344.000 0.000 NA   NA
 11540158 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2373.000 0.000 NA   NA
 11682521 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2373.000 0.000 NA   NA
 11824913 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2373.000 0.000 NA   NA
 11540159 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2411.000 0.000 NA   NA
 11682522 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2411.000 0.000 NA   NA
 11824914 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2411.000 0.000 NA   NA
 11540160 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2440.000 0.000 NA   NA
 11682523 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2440.000 0.000 NA   NA
 11824915 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2440.000 0.000 NA   NA
 11540161 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2477.000 0.000 NA   NA
 11682524 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2477.000 0.000 NA   NA
 11824916 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2477.000 0.000 NA   NA
 11540162 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2506.000 0.000 NA   NA
 11682525 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2506.000 0.000 NA   NA
 11824917 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2506.000 0.000 NA   NA
 11540163 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2542.000 0.000 NA   NA
 11682526 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2542.000 0.000 NA   NA
 11824918 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2542.000 0.000 NA   NA
 11540164 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2571.000 0.000 NA   NA
 11682527 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2571.000 0.000 NA   NA
 11824919 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2571.000 0.000 NA   NA
 11540165 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2608.000 0.000 NA   NA
 11682528 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2608.000 0.000 NA   NA
 11824920 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2608.000 0.000 NA   NA
 11540166 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2637.000 0.000 NA   NA
 11682529 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2637.000 0.000 NA   NA
 11824921 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2637.000 0.000 NA   NA
 11540167 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2675.000 0.000 NA   NA
 11682530 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2675.000 0.000 NA   NA
 11824922 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2675.000 0.000 NA   NA
 11540168 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2704.000 0.000 NA   NA
 11682531 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2704.000 0.000 NA   NA
 11824923 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2704.000 0.000 NA   NA
 11540169 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2740.000 0.000 NA   NA
 11682532 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2740.000 0.000 NA   NA
 11824924 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2740.000 0.000 NA   NA
 11540170 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2769.000 0.000 NA   NA
 11682533 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2769.000 0.000 NA   NA
 11824925 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2769.000 0.000 NA   NA
 11540171 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2805.000 0.000 NA   NA
 11682534 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2805.000 0.000 NA   NA
 11824926 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2805.000 0.000 NA   NA
 11540172 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2834.000 0.000 NA   NA
 11682535 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2834.000 0.000 NA   NA
 11824927 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2834.000 0.000 NA   NA
 11540173 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2869.000 0.000 NA   NA
 11682536 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2869.000 0.000 NA   NA
 11824928 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2869.000 0.000 NA   NA
 11540174 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2898.000 0.000 NA   NA
 11682537 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2898.000 0.000 NA   NA
 11824929 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2898.000 0.000 NA   NA
 11540175 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2933.000 0.000 NA   NA
 11682538 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2933.000 0.000 NA   NA
 11824930 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2933.000 0.000 NA   NA
 11540176 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2962.000 0.000 NA   NA
 11682539 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2962.000 0.000 NA   NA
 11824931 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2962.000 0.000 NA   NA
 11540177 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2999.000 0.000 NA   NA
 11682540 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2999.000 0.000 NA   NA
 11824932 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 2999.000 0.000 NA   NA
 11540178 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3028.000 0.000 NA   NA
 11682541 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3028.000 0.000 NA   NA
 11824933 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3028.000 0.000 NA   NA
 11540179 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3064.000 0.000 NA   NA
 11682542 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3064.000 0.000 NA   NA
 11824934 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3064.000 0.000 NA   NA
 11540180 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3093.000 0.000 NA   NA
 11682543 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3093.000 0.000 NA   NA
 11824935 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3093.000 0.000 NA   NA
 11540181 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3129.000 0.000 NA   NA
 11682544 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3129.000 0.000 NA   NA
 11824936 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3129.000 0.000 NA   NA
 11540182 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3158.000 0.000 NA   NA
 11682545 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3158.000 0.000 NA   NA
 11824937 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3158.000 0.000 NA   NA
 11540183 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3195.000 0.000 NA   NA
 11682546 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3195.000 0.000 NA   NA
 11824938 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3195.000 0.000 NA   NA
 11540184 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3224.000 0.000 NA   NA
 11682547 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3224.000 0.000 NA   NA
 11824939 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3224.000 0.000 NA   NA
 11540185 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3260.000 0.000 NA   NA
 11682548 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3260.000 0.000 NA   NA
 11824940 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3260.000 0.000 NA   NA
 11540186 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3289.000 0.000 NA   NA
 11682549 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3289.000 0.000 NA   NA
 11824941 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3289.000 0.000 NA   NA
 11540187 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3326.000 0.000 NA   NA
 11682550 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3326.000 0.000 NA   NA
 11824942 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3326.000 0.000 NA   NA
 11540188 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3355.000 0.000 NA   NA
 11682551 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3355.000 0.000 NA   NA
 11824943 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3355.000 0.000 NA   NA
 11540189 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3391.000 0.000 NA   NA
 11682552 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3391.000 0.000 NA   NA
 11824944 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3391.000 0.000 NA   NA
 11540190 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3420.000 0.000 NA   NA
 11682553 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3420.000 0.000 NA   NA
 11824945 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3420.000 0.000 NA   NA
 11540191 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3458.000 0.000 NA   NA
 11682554 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3458.000 0.000 NA   NA
 11824946 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3458.000 0.000 NA   NA
 11540192 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3487.000 0.000 NA   NA
 11682555 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3487.000 0.000 NA   NA
 11824947 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3487.000 0.000 NA   NA
 11540193 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3524.000 0.000 NA   NA
 11682556 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3524.000 0.000 NA   NA
 11824948 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3524.000 0.000 NA   NA
 11540194 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3553.000 0.000 NA   NA
 11682557 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3553.000 0.000 NA   NA
 11824949 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3553.000 0.000 NA   NA
 11540195 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3591.000 0.000 NA   NA
 11682558 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3591.000 0.000 NA   NA
 11824950 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3591.000 0.000 NA   NA
 11540196 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3620.000 0.000 NA   NA
 11682559 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3620.000 0.000 NA   NA
 11824951 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3620.000 0.000 NA   NA
 11540197 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3656.000 0.000 NA   NA
 11682560 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3656.000 0.000 NA   NA
 11824952 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3656.000 0.000 NA   NA
 11540198 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3685.000 0.000 NA   NA
 11682561 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3685.000 0.000 NA   NA
 11824953 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3685.000 0.000 NA   NA
 11540199 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3722.000 0.000 NA   NA
 11682562 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3722.000 0.000 NA   NA
 11824954 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3722.000 0.000 NA   NA
 11540200 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3751.000 0.000 NA   NA
 11682563 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3751.000 0.000 NA   NA
 11824955 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3751.000 0.000 NA   NA
 11540201 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3786.000 0.000 NA   NA
 11682564 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3786.000 0.000 NA   NA
 11824956 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3786.000 0.000 NA   NA
 11540202 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3815.000 0.000 NA   NA
 11682565 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3815.000 0.000 NA   NA
 11824957 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3815.000 0.000 NA   NA
 11540203 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3853.000 0.000 NA   NA
 11682566 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3853.000 0.000 NA   NA
 11824958 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3853.000 0.000 NA   NA
 11540204 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3882.000 0.000 NA   NA
 11682567 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3882.000 0.000 NA   NA
 11824959 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3882.000 0.000 NA   NA
 11540205 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3918.000 0.000 NA   NA
 11682568 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3918.000 0.000 NA   NA
 11824960 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3918.000 0.000 NA   NA
 11540206 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3947.000 0.000 NA   NA
 11682569 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3947.000 0.000 NA   NA
 11824961 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3947.000 0.000 NA   NA
 11540207 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3984.000 0.000 NA   NA
 11682570 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3984.000 0.000 NA   NA
 11824962 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 3984.000 0.000 NA   NA
 11540208 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4013.000 0.000 NA   NA
 11682571 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4013.000 0.000 NA   NA
 11824963 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4013.000 0.000 NA   NA
 11540209 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4053.000 0.000 NA   NA
 11682572 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4053.000 0.000 NA   NA
 11824964 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4053.000 0.000 NA   NA
 11540210 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4082.000 0.000 NA   NA
 11682573 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4082.000 0.000 NA   NA
 11824965 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4082.000 0.000 NA   NA
 11540211 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4119.000 0.000 NA   NA
 11682574 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4119.000 0.000 NA   NA
 11824966 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4119.000 0.000 NA   NA
 11540212 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4148.000 0.000 NA   NA
 11682575 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4148.000 0.000 NA   NA
 11824967 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4148.000 0.000 NA   NA
 11540213 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4186.000 0.000 NA   NA
 11682576 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4186.000 0.000 NA   NA
 11824968 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4186.000 0.000 NA   NA
 11540214 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4215.000 0.000 NA   NA
 11682577 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4215.000 0.000 NA   NA
 11824969 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4215.000 0.000 NA   NA
 11540215 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4253.000 0.000 NA   NA
 11682578 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4253.000 0.000 NA   NA
 11824970 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4253.000 0.000 NA   NA
 11540216 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4282.000 0.000 NA   NA
 11682579 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4282.000 0.000 NA   NA
 11824971 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4282.000 0.000 NA   NA
 11540217 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4318.000 0.000 NA   NA
 11682580 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4318.000 0.000 NA   NA
 11824972 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4318.000 0.000 NA   NA
 11540218 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4347.000 0.000 NA   NA
 11682581 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4347.000 0.000 NA   NA
 11824973 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4347.000 0.000 NA   NA
 11540219 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4385.000 0.000 NA   NA
 11682582 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4385.000 0.000 NA   NA
 11824974 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4385.000 0.000 NA   NA
 11540220 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4414.000 0.000 NA   NA
 11682583 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4414.000 0.000 NA   NA
 11824975 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4414.000 0.000 NA   NA
 11540221 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4450.000 0.000 NA   NA
 11682584 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4450.000 0.000 NA   NA
 11824976 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4450.000 0.000 NA   NA
 11540222 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4479.000 0.000 NA   NA
 11682585 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4479.000 0.000 NA   NA
 11824977 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4479.000 0.000 NA   NA
 11540223 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4515.000 0.000 NA   NA
 11682586 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4515.000 0.000 NA   NA
 11824978 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4515.000 0.000 NA   NA
 11540224 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4544.000 0.000 NA   NA
 11682587 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4544.000 0.000 NA   NA
 11824979 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4544.000 0.000 NA   NA
 11540225 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4582.000 0.000 NA   NA
 11682588 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4582.000 0.000 NA   NA
 11824980 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4582.000 0.000 NA   NA
 11540226 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4611.000 0.000 NA   NA
 11682589 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4611.000 0.000 NA   NA
 11824981 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4611.000 0.000 NA   NA
 11540227 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4645.000 0.000 NA   NA
 11682590 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4645.000 0.000 NA   NA
 11824982 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4645.000 0.000 NA   NA
 11540228 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4674.000 0.000 NA   NA
 11682591 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4674.000 0.000 NA   NA
 11824983 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4674.000 0.000 NA   NA
 11540229 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4713.000 0.000 NA   NA
 11682592 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4713.000 0.000 NA   NA
 11824984 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4713.000 0.000 NA   NA
 11540230 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4742.000 0.000 NA   NA
 11682593 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4742.000 0.000 NA   NA
 11824985 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4742.000 0.000 NA   NA
 11540231 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4780.000 0.000 NA   NA
 11682594 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4780.000 0.000 NA   NA
 11824986 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4780.000 0.000 NA   NA
 11540232 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4809.000 0.000 NA   NA
 11682595 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4809.000 0.000 NA   NA
 11824987 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4809.000 0.000 NA   NA
 11540233 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4845.000 0.000 NA   NA
 11682596 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4845.000 0.000 NA   NA
 11824988 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4845.000 0.000 NA   NA
 11540234 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4874.000 0.000 NA   NA
 11682597 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4874.000 0.000 NA   NA
 11824989 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4874.000 0.000 NA   NA
 11540235 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4913.000 0.000 NA   NA
 11682598 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4913.000 0.000 NA   NA
 11824990 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4913.000 0.000 NA   NA
 11540236 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4942.000 0.000 NA   NA
 11682599 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4942.000 0.000 NA   NA
 11824991 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4942.000 0.000 NA   NA
 11540237 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4980.000 0.000 NA   NA
 11682600 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4980.000 0.000 NA   NA
 11824992 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 4980.000 0.000 NA   NA
 11540238 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5009.000 0.000 NA   NA
 11682601 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5009.000 0.000 NA   NA
 11824993 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5009.000 0.000 NA   NA
 11540239 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5048.000 0.000 NA   NA
 11682602 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5048.000 0.000 NA   NA
 11824994 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5048.000 0.000 NA   NA
 11540240 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5077.000 0.000 NA   NA
 11682603 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5077.000 0.000 NA   NA
 11824995 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5077.000 0.000 NA   NA
 11540241 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5115.000 0.000 NA   NA
 11682604 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5115.000 0.000 NA   NA
 11824996 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5115.000 0.000 NA   NA
 11540242 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5144.000 0.000 NA   NA
 11682605 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5144.000 0.000 NA   NA
 11824997 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5144.000 0.000 NA   NA
 11540243 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5178.000 0.000 NA   NA
 11682606 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5178.000 0.000 NA   NA
 11824998 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5178.000 0.000 NA   NA
 11540244 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5207.000 0.000 NA   NA
 11682607 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5207.000 0.000 NA   NA
 11824999 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5207.000 0.000 NA   NA
 11540245 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5244.000 0.000 NA   NA
 11682608 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5244.000 0.000 NA   NA
 11825000 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5244.000 0.000 NA   NA
 11540246 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5273.000 0.000 NA   NA
 11682609 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5273.000 0.000 NA   NA
 11825001 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5273.000 0.000 NA   NA
 11540247 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5309.000 0.000 NA   NA
 11682610 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5309.000 0.000 NA   NA
 11825002 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5309.000 0.000 NA   NA
 11540248 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5338.000 0.000 NA   NA
 11682611 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5338.000 0.000 NA   NA
 11825003 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5338.000 0.000 NA   NA
 11540249 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5373.000 0.000 NA   NA
 11682612 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5373.000 0.000 NA   NA
 11825004 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5373.000 0.000 NA   NA
 11540250 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5402.000 0.000 NA   NA
 11682613 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5402.000 0.000 NA   NA
 11825005 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5402.000 0.000 NA   NA
 11540251 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5441.000 0.000 NA   NA
 11682614 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5441.000 0.000 NA   NA
 11825006 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5441.000 0.000 NA   NA
 11540252 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5470.000 0.000 NA   NA
 11682615 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5470.000 0.000 NA   NA
 11825007 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5470.000 0.000 NA   NA
 11540253 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5508.000 0.000 NA   NA
 11682616 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5508.000 0.000 NA   NA
 11825008 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5508.000 0.000 NA   NA
 11540254 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5537.000 0.000 NA   NA
 11682617 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5537.000 0.000 NA   NA
 11825009 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5537.000 0.000 NA   NA
 11540255 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5573.000 0.000 NA   NA
 11682618 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5573.000 0.000 NA   NA
 11825010 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5573.000 0.000 NA   NA
 11540256 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5602.000 0.000 NA   NA
 11682619 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5602.000 0.000 NA   NA
 11825011 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5602.000 0.000 NA   NA
 11540257 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5638.000 0.000 NA   NA
 11682620 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5638.000 0.000 NA   NA
 11825012 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5638.000 0.000 NA   NA
 11540258 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5667.000 0.000 NA   NA
 11682621 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5667.000 0.000 NA   NA
 11825013 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5667.000 0.000 NA   NA
 11540259 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5702.000 0.000 NA   NA
 11682622 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5702.000 0.000 NA   NA
 11825014 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5702.000 0.000 NA   NA
 11540260 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5731.000 0.000 NA   NA
 11682623 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5731.000 0.000 NA   NA
 11825015 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5731.000 0.000 NA   NA
 11540261 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5767.000 0.000 NA   NA
 11682624 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5767.000 0.000 NA   NA
 11825016 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5767.000 0.000 NA   NA
 11540262 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5796.000 0.000 NA   NA
 11682625 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5796.000 0.000 NA   NA
 11825017 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5796.000 0.000 NA   NA
 11540263 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5834.000 0.000 NA   NA
 11682626 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5834.000 0.000 NA   NA
 11825018 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5834.000 0.000 NA   NA
 11540264 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5863.000 0.000 NA   NA
 11682627 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5863.000 0.000 NA   NA
 11825019 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5863.000 0.000 NA   NA
 11540265 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5902.000 0.000 NA   NA
 11682628 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5902.000 0.000 NA   NA
 11825020 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5902.000 0.000 NA   NA
 11540266 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5931.000 0.000 NA   NA
 11682629 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5931.000 0.000 NA   NA
 11825021 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5931.000 0.000 NA   NA
 11540267 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5967.000 0.000 NA   NA
 11682630 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5967.000 0.000 NA   NA
 11825022 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5967.000 0.000 NA   NA
 11540268 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5996.000 0.000 NA   NA
 11682631 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5996.000 0.000 NA   NA
 11825023 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 5996.000 0.000 NA   NA
 11540269 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6036.000 0.000 NA   NA
 11682632 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6036.000 0.000 NA   NA
 11825024 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6036.000 0.000 NA   NA
 11540270 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6065.000 0.000 NA   NA
 11682633 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6065.000 0.000 NA   NA
 11825025 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6065.000 0.000 NA   NA
 11540271 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6100.000 0.000 NA   NA
 11682634 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6100.000 0.000 NA   NA
 11825026 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6100.000 0.000 NA   NA
 11540272 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6129.000 0.000 NA   NA
 11682635 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6129.000 0.000 NA   NA
 11825027 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6129.000 0.000 NA   NA
 11540273 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6169.000 0.000 NA   NA
 11682636 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6169.000 0.000 NA   NA
 11825028 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6169.000 0.000 NA   NA
 11540274 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6198.000 0.000 NA   NA
 11682637 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6198.000 0.000 NA   NA
 11825029 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6198.000 0.000 NA   NA
 11540275 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6238.000 0.000 NA   NA
 11682638 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6238.000 0.000 NA   NA
 11825030 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6238.000 0.000 NA   NA
 11540276 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6267.000 0.000 NA   NA
 11682639 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6267.000 0.000 NA   NA
 11825031 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6267.000 0.000 NA   NA
 11540277 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6306.000 0.000 NA   NA
 11682640 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6306.000 0.000 NA   NA
 11825032 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6306.000 0.000 NA   NA
 11540278 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6335.000 0.000 NA   NA
 11682641 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6335.000 0.000 NA   NA
 11825033 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6335.000 0.000 NA   NA
 11540279 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6376.000 0.000 NA   NA
 11682642 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6376.000 0.000 NA   NA
 11825034 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6376.000 0.000 NA   NA
 11540280 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6405.000 0.000 NA   NA
 11682643 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6405.000 0.000 NA   NA
 11825035 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6405.000 0.000 NA   NA
 11540281 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6443.000 0.000 NA   NA
 11682644 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6443.000 0.000 NA   NA
 11825036 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6443.000 0.000 NA   NA
 11540282 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6472.000 0.000 NA   NA
 11682645 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6472.000 0.000 NA   NA
 11825037 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6472.000 0.000 NA   NA
 11540283 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6509.000 0.000 NA   NA
 11682646 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6509.000 0.000 NA   NA
 11825038 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6509.000 0.000 NA   NA
 11540284 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6538.000 0.000 NA   NA
 11682647 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6538.000 0.000 NA   NA
 11825039 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6538.000 0.000 NA   NA
 11540285 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6575.000 0.000 NA   NA
 11682648 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6575.000 0.000 NA   NA
 11825040 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6575.000 0.000 NA   NA
 11540286 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6604.000 0.000 NA   NA
 11682649 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6604.000 0.000 NA   NA
 11825041 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6604.000 0.000 NA   NA
 11540287 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6640.000 0.000 NA   NA
 11682650 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6640.000 0.000 NA   NA
 11825042 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6640.000 0.000 NA   NA
 11540288 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6669.000 0.000 NA   NA
 11682651 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6669.000 0.000 NA   NA
 11825043 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6669.000 0.000 NA   NA
 11540289 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6707.000 0.000 NA   NA
 11682652 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6707.000 0.000 NA   NA
 11825044 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6707.000 0.000 NA   NA
 11540290 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6736.000 0.000 NA   NA
 11682653 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6736.000 0.000 NA   NA
 11825045 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6736.000 0.000 NA   NA
 11540291 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6772.000 0.000 NA   NA
 11682654 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6772.000 0.000 NA   NA
 11825046 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6772.000 0.000 NA   NA
 11540292 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6801.000 0.000 NA   NA
 11682655 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6801.000 0.000 NA   NA
 11825047 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6801.000 0.000 NA   NA
 11540293 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6836.000 0.000 NA   NA
 11682656 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6836.000 0.000 NA   NA
 11825048 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6836.000 0.000 NA   NA
 11540294 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6865.000 0.000 NA   NA
 11682657 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6865.000 0.000 NA   NA
 11825049 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6865.000 0.000 NA   NA
 11540295 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6905.000 0.000 NA   NA
 11682658 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6905.000 0.000 NA   NA
 11825050 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6905.000 0.000 NA   NA
 11540296 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6934.000 0.000 NA   NA
 11682659 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6934.000 0.000 NA   NA
 11825051 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6934.000 0.000 NA   NA
 11540297 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6971.000 0.000 NA   NA
 11682660 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6971.000 0.000 NA   NA
 11825052 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 6971.000 0.000 NA   NA
 11540298 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7000.000 0.000 NA   NA
 11682661 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7000.000 0.000 NA   NA
 11825053 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7000.000 0.000 NA   NA
 11540299 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7039.000 0.000 NA   NA
 11682662 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7039.000 0.000 NA   NA
 11825054 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7039.000 0.000 NA   NA
 11540300 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7068.000 0.000 NA   NA
 11682663 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7068.000 0.000 NA   NA
 11825055 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7068.000 0.000 NA   NA
 11540301 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7105.000 0.000 NA   NA
 11682664 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7105.000 0.000 NA   NA
 11825056 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7105.000 0.000 NA   NA
 11540302 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7134.000 0.000 NA   NA
 11682665 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7134.000 0.000 NA   NA
 11825057 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7134.000 0.000 NA   NA
 11540303 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7168.000 0.000 NA   NA
 11682666 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7168.000 0.000 NA   NA
 11825058 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7168.000 0.000 NA   NA
 11540304 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7197.000 0.000 NA   NA
 11682667 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7197.000 0.000 NA   NA
 11825059 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7197.000 0.000 NA   NA
 11540305 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7233.000 0.000 NA   NA
 11682668 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7233.000 0.000 NA   NA
 11825060 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7233.000 0.000 NA   NA
 11540306 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7262.000 0.000 NA   NA
 11682669 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7262.000 0.000 NA   NA
 11825061 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7262.000 0.000 NA   NA
 11540307 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7298.000 0.000 NA   NA
 11682670 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7298.000 0.000 NA   NA
 11825062 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7298.000 0.000 NA   NA
 11540308 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7327.000 0.000 NA   NA
 11682671 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7327.000 0.000 NA   NA
 11825063 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7327.000 0.000 NA   NA
 11540309 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7367.000 0.000 NA   NA
 11682672 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7367.000 0.000 NA   NA
 11825064 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7367.000 0.000 NA   NA
 11540310 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7396.000 0.000 NA   NA
 11682673 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7396.000 0.000 NA   NA
 11825065 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7396.000 0.000 NA   NA
 11540311 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7433.000 0.000 NA   NA
 11682674 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7433.000 0.000 NA   NA
 11825066 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7433.000 0.000 NA   NA
 11540312 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7462.000 0.000 NA   NA
 11682675 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7462.000 0.000 NA   NA
 11825067 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7462.000 0.000 NA   NA
 11540313 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7499.000 0.000 NA   NA
 11682676 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7499.000 0.000 NA   NA
 11825068 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7499.000 0.000 NA   NA
 11540314 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7528.000 0.000 NA   NA
 11682677 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7528.000 0.000 NA   NA
 11825069 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7528.000 0.000 NA   NA
 11540315 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7563.000 0.000 NA   NA
 11682678 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7563.000 0.000 NA   NA
 11825070 5699624   Aflv_0768     FALSE NA 7563.000 0.000 NA   NA
 5699628 5699629 Aflv_0772 Aflv_0773     FALSE 0.001 1382.000 0.000 NA   NA
 5699629 5699630 Aflv_0773 Aflv_0774     FALSE 0.001 4257.000 0.000 NA   NA
 11540316 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 181.000 0.000 NA   NA
 11682679 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 181.000 0.000 NA   NA
 11825071 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 181.000 0.000 NA   NA
 11540317 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 210.000 0.000 NA   NA
 11682680 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 210.000 0.000 NA   NA
 11825072 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 210.000 0.000 NA   NA
 11540318 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 247.000 0.000 NA   NA
 11682681 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 247.000 0.000 NA   NA
 11825073 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 247.000 0.000 NA   NA
 11540319 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 276.000 0.000 NA   NA
 11682682 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 276.000 0.000 NA   NA
 11825074 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 276.000 0.000 NA   NA
 11540320 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 314.000 0.000 NA   NA
 11682683 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 314.000 0.000 NA   NA
 11825075 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 314.000 0.000 NA   NA
 11540321 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 343.000 0.000 NA   NA
 11682684 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 343.000 0.000 NA   NA
 11825076 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 343.000 0.000 NA   NA
 11540322 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 378.000 0.000 NA   NA
 11682685 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 378.000 0.000 NA   NA
 11825077 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 378.000 0.000 NA   NA
 11540323 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 407.000 0.000 NA   NA
 11682686 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 407.000 0.000 NA   NA
 11825078 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 407.000 0.000 NA   NA
 11540324 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 445.000 0.000 NA   NA
 11682687 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 445.000 0.000 NA   NA
 11825079 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 445.000 0.000 NA   NA
 11540325 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 474.000 0.000 NA   NA
 11682688 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 474.000 0.000 NA   NA
 11825080 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 474.000 0.000 NA   NA
 11540326 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 513.000 0.000 NA   NA
 11682689 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 513.000 0.000 NA   NA
 11825081 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 513.000 0.000 NA   NA
 11540327 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 542.000 0.000 NA   NA
 11682690 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 542.000 0.000 NA   NA
 11825082 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 542.000 0.000 NA   NA
 11540328 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 578.000 0.000 NA   NA
 11682691 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 578.000 0.000 NA   NA
 11825083 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 578.000 0.000 NA   NA
 11540329 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 607.000 0.000 NA   NA
 11682692 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 607.000 0.000 NA   NA
 11825084 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 607.000 0.000 NA   NA
 11540330 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 644.000 0.000 NA   NA
 11682693 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 644.000 0.000 NA   NA
 11825085 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 644.000 0.000 NA   NA
 11540331 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 673.000 0.000 NA   NA
 11682694 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 673.000 0.000 NA   NA
 11825086 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 673.000 0.000 NA   NA
 11540332 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 712.000 0.000 NA   NA
 11682695 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 712.000 0.000 NA   NA
 11825087 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 712.000 0.000 NA   NA
 11540333 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 741.000 0.000 NA   NA
 11682696 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 741.000 0.000 NA   NA
 11825088 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 741.000 0.000 NA   NA
 11540334 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 777.000 0.000 NA   NA
 11682697 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 777.000 0.000 NA   NA
 11825089 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 777.000 0.000 NA   NA
 11540335 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 806.000 0.000 NA   NA
 11682698 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 806.000 0.000 NA   NA
 11825090 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 806.000 0.000 NA   NA
 11540336 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 843.000 0.000 NA   NA
 11682699 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 843.000 0.000 NA   NA
 11825091 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 843.000 0.000 NA   NA
 11540337 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 872.000 0.000 NA   NA
 11682700 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 872.000 0.000 NA   NA
 11825092 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 872.000 0.000 NA   NA
 11540338 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 909.000 0.000 NA   NA
 11682701 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 909.000 0.000 NA   NA
 11825093 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 909.000 0.000 NA   NA
 11540339 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 938.000 0.000 NA   NA
 11682702 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 938.000 0.000 NA   NA
 11825094 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 938.000 0.000 NA   NA
 11540340 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 973.000 0.000 NA   NA
 11682703 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 973.000 0.000 NA   NA
 11825095 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 973.000 0.000 NA   NA
 11540341 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1002.000 0.000 NA   NA
 11682704 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1002.000 0.000 NA   NA
 11825096 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1002.000 0.000 NA   NA
 11540342 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1038.000 0.000 NA   NA
 11682705 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1038.000 0.000 NA   NA
 11825097 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1038.000 0.000 NA   NA
 11540343 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1067.000 0.000 NA   NA
 11682706 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1067.000 0.000 NA   NA
 11825098 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1067.000 0.000 NA   NA
 11540344 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1103.000 0.000 NA   NA
 11682707 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1103.000 0.000 NA   NA
 11825099 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1103.000 0.000 NA   NA
 11540345 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1132.000 0.000 NA   NA
 11682708 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1132.000 0.000 NA   NA
 11825100 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1132.000 0.000 NA   NA
 11540346 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1169.000 0.000 NA   NA
 11682709 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1169.000 0.000 NA   NA
 11825101 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1169.000 0.000 NA   NA
 11540347 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1198.000 0.000 NA   NA
 11682710 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1198.000 0.000 NA   NA
 11825102 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1198.000 0.000 NA   NA
 11540348 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1233.000 0.000 NA   NA
 11682711 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1233.000 0.000 NA   NA
 11825103 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1233.000 0.000 NA   NA
 11540349 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1262.000 0.000 NA   NA
 11682712 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1262.000 0.000 NA   NA
 11825104 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1262.000 0.000 NA   NA
 11540350 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1300.000 0.000 NA   NA
 11682713 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1300.000 0.000 NA   NA
 11825105 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1300.000 0.000 NA   NA
 11540351 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1329.000 0.000 NA   NA
 11682714 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1329.000 0.000 NA   NA
 11825106 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1329.000 0.000 NA   NA
 11540352 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1365.000 0.000 NA   NA
 11682715 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1365.000 0.000 NA   NA
 11825107 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1365.000 0.000 NA   NA
 11540353 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1394.000 0.000 NA   NA
 11682716 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1394.000 0.000 NA   NA
 11825108 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1394.000 0.000 NA   NA
 11540354 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1432.000 0.000 NA   NA
 11682717 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1432.000 0.000 NA   NA
 11825109 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1432.000 0.000 NA   NA
 11540355 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1461.000 0.000 NA   NA
 11682718 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1461.000 0.000 NA   NA
 11825110 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1461.000 0.000 NA   NA
 11540356 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1498.000 0.000 NA   NA
 11682719 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1498.000 0.000 NA   NA
 11825111 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1498.000 0.000 NA   NA
 11540357 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1527.000 0.000 NA   NA
 11682720 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1527.000 0.000 NA   NA
 11825112 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1527.000 0.000 NA   NA
 11540358 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1568.000 0.000 NA   NA
 11682721 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1568.000 0.000 NA   NA
 11825113 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1568.000 0.000 NA   NA
 11540359 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1597.000 0.000 NA   NA
 11682722 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1597.000 0.000 NA   NA
 11825114 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1597.000 0.000 NA   NA
 11540360 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1632.000 0.000 NA   NA
 11682723 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1632.000 0.000 NA   NA
 11825115 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1632.000 0.000 NA   NA
 11540361 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1661.000 0.000 NA   NA
 11682724 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1661.000 0.000 NA   NA
 11825116 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1661.000 0.000 NA   NA
 11540362 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1696.000 0.000 NA   NA
 11682725 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1696.000 0.000 NA   NA
 11825117 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1696.000 0.000 NA   NA
 11540363 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1725.000 0.000 NA   NA
 11682726 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1725.000 0.000 NA   NA
 11825118 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1725.000 0.000 NA   NA
 11540364 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1762.000 0.000 NA   NA
 11682727 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1762.000 0.000 NA   NA
 11825119 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1762.000 0.000 NA   NA
 11540365 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1791.000 0.000 NA   NA
 11682728 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1791.000 0.000 NA   NA
 11825120 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1791.000 0.000 NA   NA
 11540366 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1829.000 0.000 NA   NA
 11682729 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1829.000 0.000 NA   NA
 11825121 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1829.000 0.000 NA   NA
 11540367 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1858.000 0.000 NA   NA
 11682730 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1858.000 0.000 NA   NA
 11825122 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1858.000 0.000 NA   NA
 11540368 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1892.000 0.000 NA   NA
 11682731 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1892.000 0.000 NA   NA
 11825123 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1892.000 0.000 NA   NA
 11540369 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1921.000 0.000 NA   NA
 11682732 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1921.000 0.000 NA   NA
 11825124 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1921.000 0.000 NA   NA
 11540370 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1960.000 0.000 NA   NA
 11682733 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1960.000 0.000 NA   NA
 11825125 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1960.000 0.000 NA   NA
 11540371 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1989.000 0.000 NA   NA
 11682734 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1989.000 0.000 NA   NA
 11825126 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 1989.000 0.000 NA   NA
 11540372 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2029.000 0.000 NA   NA
 11682735 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2029.000 0.000 NA   NA
 11825127 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2029.000 0.000 NA   NA
 11540373 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2058.000 0.000 NA   NA
 11682736 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2058.000 0.000 NA   NA
 11825128 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2058.000 0.000 NA   NA
 11540374 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2093.000 0.000 NA   NA
 11682737 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2093.000 0.000 NA   NA
 11825129 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2093.000 0.000 NA   NA
 11540375 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2122.000 0.000 NA   NA
 11682738 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2122.000 0.000 NA   NA
 11825130 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2122.000 0.000 NA   NA
 11540376 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2157.000 0.000 NA   NA
 11682739 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2157.000 0.000 NA   NA
 11825131 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2157.000 0.000 NA   NA
 11540377 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2186.000 0.000 NA   NA
 11682740 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2186.000 0.000 NA   NA
 11825132 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2186.000 0.000 NA   NA
 11540378 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2225.000 0.000 NA   NA
 11682741 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2225.000 0.000 NA   NA
 11825133 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2225.000 0.000 NA   NA
 11540379 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2254.000 0.000 NA   NA
 11682742 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2254.000 0.000 NA   NA
 11825134 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2254.000 0.000 NA   NA
 11540380 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2291.000 0.000 NA   NA
 11682743 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2291.000 0.000 NA   NA
 11825135 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2291.000 0.000 NA   NA
 11540381 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2320.000 0.000 NA   NA
 11682744 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2320.000 0.000 NA   NA
 11825136 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2320.000 0.000 NA   NA
 11540382 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2361.000 0.000 NA   NA
 11682745 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2361.000 0.000 NA   NA
 11825137 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2361.000 0.000 NA   NA
 11540383 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2390.000 0.000 NA   NA
 11682746 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2390.000 0.000 NA   NA
 11825138 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2390.000 0.000 NA   NA
 11540384 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2426.000 0.000 NA   NA
 11682747 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2426.000 0.000 NA   NA
 11825139 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2426.000 0.000 NA   NA
 11540385 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2455.000 0.000 NA   NA
 11682748 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2455.000 0.000 NA   NA
 11825140 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2455.000 0.000 NA   NA
 11540386 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2492.000 0.000 NA   NA
 11682749 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2492.000 0.000 NA   NA
 11825141 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2492.000 0.000 NA   NA
 11540387 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2521.000 0.000 NA   NA
 11682750 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2521.000 0.000 NA   NA
 11825142 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2521.000 0.000 NA   NA
 11540388 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2557.000 0.000 NA   NA
 11682751 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2557.000 0.000 NA   NA
 11825143 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2557.000 0.000 NA   NA
 11540389 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2586.000 0.000 NA   NA
 11682752 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2586.000 0.000 NA   NA
 11825144 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2586.000 0.000 NA   NA
 11540390 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2622.000 0.000 NA   NA
 11682753 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2622.000 0.000 NA   NA
 11825145 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2622.000 0.000 NA   NA
 11540391 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2651.000 0.000 NA   NA
 11682754 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2651.000 0.000 NA   NA
 11825146 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2651.000 0.000 NA   NA
 11540392 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2687.000 0.000 NA   NA
 11682755 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2687.000 0.000 NA   NA
 11825147 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2687.000 0.000 NA   NA
 11540393 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2716.000 0.000 NA   NA
 11682756 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2716.000 0.000 NA   NA
 11825148 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2716.000 0.000 NA   NA
 11540394 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2752.000 0.000 NA   NA
 11682757 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2752.000 0.000 NA   NA
 11825149 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2752.000 0.000 NA   NA
 11540395 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2781.000 0.000 NA   NA
 11682758 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2781.000 0.000 NA   NA
 11825150 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2781.000 0.000 NA   NA
 11540396 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2821.000 0.000 NA   NA
 11682759 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2821.000 0.000 NA   NA
 11825151 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2821.000 0.000 NA   NA
 11540397 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2850.000 0.000 NA   NA
 11682760 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2850.000 0.000 NA   NA
 11825152 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2850.000 0.000 NA   NA
 11540398 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2889.000 0.000 NA   NA
 11682761 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2889.000 0.000 NA   NA
 11825153 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2889.000 0.000 NA   NA
 11540399 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2918.000 0.000 NA   NA
 11682762 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2918.000 0.000 NA   NA
 11825154 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2918.000 0.000 NA   NA
 11540400 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2957.000 0.000 NA   NA
 11682763 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2957.000 0.000 NA   NA
 11825155 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2957.000 0.000 NA   NA
 11540401 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2986.000 0.000 NA   NA
 11682764 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2986.000 0.000 NA   NA
 11825156 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 2986.000 0.000 NA   NA
 11540402 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3024.000 0.000 NA   NA
 11682765 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3024.000 0.000 NA   NA
 11825157 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3024.000 0.000 NA   NA
 11540403 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3053.000 0.000 NA   NA
 11682766 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3053.000 0.000 NA   NA
 11825158 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3053.000 0.000 NA   NA
 11540404 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3092.000 0.000 NA   NA
 11682767 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3092.000 0.000 NA   NA
 11825159 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3092.000 0.000 NA   NA
 11540405 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3121.000 0.000 NA   NA
 11682768 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3121.000 0.000 NA   NA
 11825160 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3121.000 0.000 NA   NA
 11540406 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3156.000 0.000 NA   NA
 11682769 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3156.000 0.000 NA   NA
 11825161 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3156.000 0.000 NA   NA
 11540407 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3185.000 0.000 NA   NA
 11682770 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3185.000 0.000 NA   NA
 11825162 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3185.000 0.000 NA   NA
 11540408 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3220.000 0.000 NA   NA
 11682771 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3220.000 0.000 NA   NA
 11825163 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3220.000 0.000 NA   NA
 11540409 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3249.000 0.000 NA   NA
 11682772 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3249.000 0.000 NA   NA
 11825164 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3249.000 0.000 NA   NA
 11540410 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3285.000 0.000 NA   NA
 11682773 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3285.000 0.000 NA   NA
 11825165 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3285.000 0.000 NA   NA
 11540411 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3314.000 0.000 NA   NA
 11682774 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3314.000 0.000 NA   NA
 11825166 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3314.000 0.000 NA   NA
 11540412 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3352.000 0.000 NA   NA
 11682775 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3352.000 0.000 NA   NA
 11825167 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3352.000 0.000 NA   NA
 11540413 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3381.000 0.000 NA   NA
 11682776 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3381.000 0.000 NA   NA
 11825168 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3381.000 0.000 NA   NA
 11540414 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3418.000 0.000 NA   NA
 11682777 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3418.000 0.000 NA   NA
 11825169 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3418.000 0.000 NA   NA
 11540415 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3447.000 0.000 NA   NA
 11682778 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3447.000 0.000 NA   NA
 11825170 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3447.000 0.000 NA   NA
 11540416 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3483.000 0.000 NA   NA
 11682779 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3483.000 0.000 NA   NA
 11825171 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3483.000 0.000 NA   NA
 11540417 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3512.000 0.000 NA   NA
 11682780 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3512.000 0.000 NA   NA
 11825172 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3512.000 0.000 NA   NA
 11540418 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3549.000 0.000 NA   NA
 11682781 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3549.000 0.000 NA   NA
 11825173 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3549.000 0.000 NA   NA
 11540419 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3578.000 0.000 NA   NA
 11682782 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3578.000 0.000 NA   NA
 11825174 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3578.000 0.000 NA   NA
 11540420 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3616.000 0.000 NA   NA
 11682783 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3616.000 0.000 NA   NA
 11825175 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3616.000 0.000 NA   NA
 11540421 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3645.000 0.000 NA   NA
 11682784 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3645.000 0.000 NA   NA
 11825176 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3645.000 0.000 NA   NA
 11540422 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3681.000 0.000 NA   NA
 11682785 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3681.000 0.000 NA   NA
 11825177 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3681.000 0.000 NA   NA
 11540423 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3710.000 0.000 NA   NA
 11682786 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3710.000 0.000 NA   NA
 11825178 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3710.000 0.000 NA   NA
 11540424 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3749.000 0.000 NA   NA
 11682787 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3749.000 0.000 NA   NA
 11825179 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3749.000 0.000 NA   NA
 11540425 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3778.000 0.000 NA   NA
 11682788 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3778.000 0.000 NA   NA
 11825180 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3778.000 0.000 NA   NA
 11540426 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3818.000 0.000 NA   NA
 11682789 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3818.000 0.000 NA   NA
 11825181 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3818.000 0.000 NA   NA
 11540427 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3847.000 0.000 NA   NA
 11682790 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3847.000 0.000 NA   NA
 11825182 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3847.000 0.000 NA   NA
 11540428 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3883.000 0.000 NA   NA
 11682791 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3883.000 0.000 NA   NA
 11825183 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3883.000 0.000 NA   NA
 11540429 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3912.000 0.000 NA   NA
 11682792 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3912.000 0.000 NA   NA
 11825184 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3912.000 0.000 NA   NA
 11540430 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3951.000 0.000 NA   NA
 11682793 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3951.000 0.000 NA   NA
 11825185 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3951.000 0.000 NA   NA
 11540431 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3980.000 0.000 NA   NA
 11682794 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3980.000 0.000 NA   NA
 11825186 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 3980.000 0.000 NA   NA
 11540432 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 4017.000 0.000 NA   NA
 11682795 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 4017.000 0.000 NA   NA
 11825187 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 4017.000 0.000 NA   NA
 11540433 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 4046.000 0.000 NA   NA
 11682796 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 4046.000 0.000 NA   NA
 11825188 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 4046.000 0.000 NA   NA
 11540434 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 4083.000 0.000 NA   NA
 11682797 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 4083.000 0.000 NA   NA
 11825189 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 4083.000 0.000 NA   NA
 11540435 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 4112.000 0.000 NA   NA
 11682798 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 4112.000 0.000 NA   NA
 11825190 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 4112.000 0.000 NA   NA
 11540436 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 4147.000 0.000 NA   NA
 11682799 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 4147.000 0.000 NA   NA
 11825191 5699629   Aflv_0773     FALSE NA 4147.000 0.000 NA   NA
 5699631 5699632 Aflv_0775 Aflv_0776     FALSE 0.048 47.000 0.000 NA   NA
 5699632 5699633 Aflv_0776 Aflv_0777     FALSE 0.017 100.000 0.000 NA   NA
 5699633 5699634 Aflv_0777 Aflv_0778   xre FALSE 0.273 2.000 0.000 1.000   NA
 5699635 5699636 Aflv_0779 Aflv_0780     FALSE 0.110 12.000 0.000 NA   NA
 5699636 5699637 Aflv_0780 Aflv_0781     FALSE 0.101 22.000 0.000 NA   NA
 5699637 5699638 Aflv_0781 Aflv_0782     FALSE 0.105 11.000 0.000 NA   NA
 5699638 5699639 Aflv_0782 Aflv_0783     FALSE 0.009 133.000 0.000 NA   NA
 5699639 5699640 Aflv_0783 Aflv_0784     FALSE 0.105 10.000 0.000 NA   NA
 5699640 5699641 Aflv_0784 Aflv_0785     FALSE 0.012 118.000 0.000 NA   NA
 5699641 5699642 Aflv_0785 Aflv_0786     FALSE 0.004 175.000 0.000 NA   NA
 5699642 5699643 Aflv_0786 Aflv_0787     FALSE 0.012 116.000 0.000 NA   NA
 5699643 5699644 Aflv_0787 Aflv_0788     FALSE 0.006 154.000 0.000 NA   NA
 5699644 5699645 Aflv_0788 Aflv_0789     FALSE 0.003 187.000 0.000 NA   NA
 5699645 5699646 Aflv_0789 Aflv_0790     FALSE 0.009 133.000 0.000 NA   NA
 5699646 5699647 Aflv_0790 Aflv_0791     FALSE 0.113 3.000 0.000 NA   NA
 5699647 5699648 Aflv_0791 Aflv_0792     FALSE 0.002 277.000 0.000 NA   NA
 5699648 5699649 Aflv_0792 Aflv_0793     FALSE 0.035 57.000 0.000 NA   NA
 5699649 5699650 Aflv_0793 Aflv_0794     FALSE 0.170 -3.000 0.000 NA   NA
 5699650 5699651 Aflv_0794 Aflv_0795     FALSE 0.007 143.000 0.000 NA   NA
 5699651 5699652 Aflv_0795 Aflv_0796     FALSE 0.138 0.000 0.000 NA   NA
 5699652 5699653 Aflv_0796 Aflv_0797     FALSE 0.009 131.000 0.000 NA   NA
 5699653 5699654 Aflv_0797 Aflv_0798     FALSE 0.164 -18.000 0.000 NA   NA
 5699654 5699655 Aflv_0798 Aflv_0799     FALSE 0.106 7.000 0.000 NA   NA
 5699655 5699656 Aflv_0799 Aflv_0800     FALSE 0.138 0.000 0.000 NA   NA
 5699656 5699657 Aflv_0800 Aflv_0801     FALSE 0.150 -31.000 0.000 NA   NA
 5699657 5699658 Aflv_0801 Aflv_0802     FALSE 0.170 -13.000 0.000 NA   NA
 5699658 5699659 Aflv_0802 Aflv_0803   spoIVCA FALSE 0.001 338.000 0.000 NA   NA
 5699662 5699663 Aflv_0806 Aflv_0807 motB motA TRUE 0.982 -16.000 0.257 1.000 Y NA
 5699663 5699664 Aflv_0807 Aflv_0808 motA pssA TRUE 0.838 4.000 0.007 0.055 N NA
 5699667 5699668 Aflv_0811 Aflv_0812     TRUE 0.946 -9.000 0.555 1.000   NA
 5699668 5699669 Aflv_0812 Aflv_0813   aroD TRUE 0.900 -52.000 0.336 1.000   NA
 5699669 5699670 Aflv_0813 Aflv_0814 aroD   TRUE 0.909 -6.000 0.089 NA N NA
 5699670 5699671 Aflv_0814 Aflv_0815     TRUE 0.913 -31.000 0.150 NA N NA
 5699671 5699672 Aflv_0815 Aflv_0816     TRUE 0.980 -10.000 0.199 1.000 Y NA
 5699672 5699673 Aflv_0816 Aflv_0817     TRUE 0.848 -3.000 0.149 NA   NA
 5699673 5699674 Aflv_0817 Aflv_0818     TRUE 0.806 -3.000 0.085 NA   NA
 5699676 5699677 Aflv_0820 Aflv_0821 comEA comEB TRUE 0.743 46.000 0.095 1.000 N NA
 5699677 5699678 Aflv_0821 Aflv_0822 comEB   FALSE 0.031 62.000 0.000 NA   NA
 5699678 5699679 Aflv_0822 Aflv_0823   comEC FALSE 0.164 -18.000 0.000 NA   NA
 5699682 5699683 Aflv_0826 Aflv_0827   rpsT TRUE 0.709 13.000 0.000 1.000 N NA
 5699684 5699685 Aflv_0828 Aflv_0829 gpr spoIIP FALSE 0.485 66.000 0.147 1.000   NA
 5699685 5699686 Aflv_0829 Aflv_0830 spoIIP   TRUE 0.875 1.000 0.318 NA   NA
 5699686 5699687 Aflv_0830 Aflv_0831   lepA FALSE 0.126 95.000 0.008 NA   NA
 5699687 5699688 Aflv_0831 Aflv_0832 lepA hemN TRUE 0.705 39.000 0.032 1.000 N NA
 5699688 5699689 Aflv_0832 Aflv_0833 hemN hrcA TRUE 0.572 78.000 0.082 1.000 N NA
 5699689 5699690 Aflv_0833 Aflv_0834 hrcA grpE TRUE 0.836 46.000 0.286 1.000 N NA
 5699690 5699691 Aflv_0834 Aflv_0835 grpE dnaK TRUE 0.981 14.000 0.224 0.004 Y NA
 5699691 5699692 Aflv_0835 Aflv_0836 dnaK dnaJ TRUE 0.783 126.000 0.196 0.002 Y NA
 5699692 5699693 Aflv_0836 Aflv_0837 dnaJ   TRUE 0.868 24.000 0.133 1.000 N NA
 5699693 5699694 Aflv_0837 Aflv_0838     TRUE 0.816 6.000 0.227 NA   NA
 5699694 5699695 Aflv_0838 Aflv_0839     TRUE 0.828 -40.000 0.163 NA   NA
 5699695 5699696 Aflv_0839 Aflv_0840   rpsU FALSE 0.275 59.000 0.016 1.000   NA
 5699696 5699697 Aflv_0840 Aflv_0841 rpsU   TRUE 0.872 15.000 0.150 0.022   NA
 5699697 5699698 Aflv_0841 Aflv_0842     FALSE 0.231 71.000 0.031 NA   NA
 5699698 5699699 Aflv_0842 Aflv_0843     TRUE 0.915 -3.000 0.367 NA   NA
 5699699 5699700 Aflv_0843 Aflv_0844     TRUE 0.802 8.000 0.203 NA   NA
 5699700 5699701 Aflv_0844 Aflv_0845     FALSE 0.544 48.000 0.121 NA   NA
 5699701 5699702 Aflv_0845 Aflv_0846     TRUE 0.925 12.000 0.851 NA   NA
 5699702 5699703 Aflv_0846 Aflv_0847   phoH TRUE 0.747 4.000 0.114 NA   NA
 5699703 5699704 Aflv_0847 Aflv_0848 phoH   TRUE 0.908 -58.000 0.457 NA   NA
 5699704 5699705 Aflv_0848 Aflv_0849   dgkA TRUE 0.747 7.000 0.123 NA   NA
 5699705 5699706 Aflv_0849 Aflv_0850 dgkA era FALSE 0.326 56.000 0.028 1.000   NA
 5699706 5699707 Aflv_0850 Aflv_0851 era   TRUE 0.555 25.000 0.040 NA   NA
 5699707 5699708 Aflv_0851 Aflv_0852   recO TRUE 0.629 -25.000 0.020 NA   NA
 5699708 5699709 Aflv_0852 Aflv_0853 recO   FALSE 0.101 122.000 0.013 1.000   NA
 5699709 5699710 Aflv_0853 Aflv_0854     TRUE 0.917 13.000 0.621 NA   NA
 5699710 5699711 Aflv_0854 Aflv_0855   dnaG FALSE 0.013 297.000 0.011 NA   NA
 5699711 5699712 Aflv_0855 Aflv_0856 dnaG sigA TRUE 0.943 -7.000 0.209 1.000 N NA
 5699712 5699713 Aflv_0856 Aflv_0857 sigA   FALSE 0.276 75.000 0.053 NA   NA
 5699713 5699714 Aflv_0857 Aflv_0858   cccA FALSE 0.312 110.000 0.188 NA   NA
 5699714 5699715 Aflv_0858 Aflv_0859 cccA   FALSE 0.213 79.000 0.028 NA   NA
 5699715 5699716 Aflv_0859 Aflv_0860     TRUE 0.843 -3.000 0.138 NA   NA
 5699717 5699718 Aflv_0861 Aflv_0862 ispH   FALSE 0.520 68.000 0.231 NA   NA
 5699719 5699720 Aflv_0863 Aflv_0864     TRUE 0.963 14.000 0.104 1.000 Y NA
 5699722 5699723 Aflv_0866 Aflv_0867     TRUE 0.681 59.000 0.440 NA   NA
 5699723 5699724 Aflv_0867 Aflv_0868     TRUE 0.984 15.000 0.389 0.080 Y NA
 5699724 5699725 Aflv_0868 Aflv_0869   zur TRUE 0.979 7.000 0.480 1.000 Y NA
 5699728 5699729 Aflv_0872 Aflv_0873 ispG   FALSE 0.187 80.000 0.002 1.000   NA
 5699732 5699733 Aflv_R082 Aflv_0876 trnM sodA FALSE 0.004 170.000 0.000 NA   NA
 5699733 5699734 Aflv_0876 Aflv_0877 sodA   TRUE 0.867 -49.000 0.255 NA   NA
 5699734 5699735 Aflv_0877 Aflv_0878   pbpA FALSE 0.382 62.000 0.078 NA   NA
 5699735 5699736 Aflv_0878 Aflv_0879 pbpA pstS TRUE 0.600 30.000 0.000 1.000 N NA
 5699736 5699737 Aflv_0879 Aflv_0880 pstS pstC TRUE 0.958 13.000 0.077 1.000 Y NA
 5699737 5699738 Aflv_0880 Aflv_0881 pstC pstA TRUE 0.988 3.000 0.485 0.001 Y NA
 5699738 5699739 Aflv_0881 Aflv_0882 pstA pstBB TRUE 0.967 27.000 0.125 0.001 Y NA
 5699739 5699740 Aflv_0882 Aflv_0883 pstBB   TRUE 0.872 54.000 0.118 NA Y NA
 5699741 5699742 Aflv_0884 Aflv_0885     TRUE 0.586 -3.000 0.003 NA   NA
 5699743 5699744 Aflv_0886 Aflv_0887   rpmGA TRUE 0.805 15.000 0.009 1.000 N NA
 5699744 5699745 Aflv_0887 Aflv_0888 rpmGA   TRUE 0.610 54.000 0.045 1.000 N NA
 5699745 5699746 Aflv_0888 Aflv_0889   ldh FALSE 0.131 134.000 0.000 1.000 N NA
 5699746 5699747 Aflv_0889 Aflv_0890 ldh   FALSE 0.028 68.000 0.000 NA   NA
 5699747 5699748 Aflv_0890 Aflv_0891     FALSE 0.066 36.000 0.000 NA   NA
 5699750 5699751 Aflv_0893 Aflv_0894 spoVAF   FALSE 0.202 101.000 0.058 NA   NA
 5699751 5699752 Aflv_0894 Aflv_0895   glcK TRUE 0.933 -15.000 0.496 NA   NA
 5699752 5699753 Aflv_0895 Aflv_0896 glcK   FALSE 0.065 239.000 0.015 1.000 N NA
 5699753 5699754 Aflv_0896 Aflv_0897   yqgT TRUE 0.771 39.000 0.080 1.000 N NA
 5699756 5699757 Aflv_0899 Aflv_0900     FALSE 0.106 115.000 0.021 NA   NA
 5699758 5699759 Aflv_0901 Aflv_0902     TRUE 0.628 70.000 0.432 NA   NA
 5699760 5699761 Aflv_0903 Aflv_0904   comGA FALSE 0.342 104.000 0.023 1.000 N NA
 5699761 5699762 Aflv_0904 Aflv_0905 comGA comGB TRUE 0.988 -16.000 0.639 NA Y NA
 5699762 5699763 Aflv_0905 Aflv_0906 comGB comGC TRUE 0.984 8.000 0.861 NA Y NA
 5699763 5699764 Aflv_0906 Aflv_0907 comGC comGD TRUE 0.724 -7.000 0.040 NA   NA
 5699764 5699765 Aflv_0907 Aflv_0908 comGD comGE FALSE 0.167 -16.000 0.000 NA   NA
 5699765 5699766 Aflv_0908 Aflv_0909 comGE comGF FALSE 0.170 -3.000 0.000 NA   NA
 5699766 5699767 Aflv_0909 Aflv_0910 comGF comGG TRUE 0.668 -34.000 0.036 NA   NA
 5699767 5699768 Aflv_0910 Aflv_0911 comGG aroK FALSE 0.164 -18.000 0.000 NA   NA
 5699768 5699769 Aflv_0911 Aflv_0912 aroK   TRUE 0.836 27.000 0.375 NA   NA
 5699770 5699771 Aflv_0913 Aflv_0914     TRUE 0.863 -19.000 0.190 NA   NA
 5699772 5699773 Aflv_0915 Aflv_0916 gcvT gcvPA TRUE 0.973 18.000 0.092 0.001 Y NA
 5699773 5699774 Aflv_0916 Aflv_0917 gcvPA gcvPB TRUE 0.990 -7.000 0.316 0.001 Y NA
 5699776 5699777 Aflv_0919 Aflv_0920     FALSE 0.005 161.000 0.000 NA   NA
 5699777 5699778 Aflv_0920 Aflv_0922   splB FALSE 0.013 112.000 0.000 NA   NA
 5699778 5699779 Aflv_0922 Aflv_0923 splB mntR TRUE 0.874 10.000 0.110 1.000 N NA
 5699779 5699780 Aflv_0923 Aflv_0924 mntR   TRUE 0.805 -49.000 0.101 1.000   NA
 5699781 5699782 Aflv_0925 Aflv_0926     TRUE 0.810 0.000 0.140 NA   NA
 5699783 5699784 Aflv_0927 Aflv_0928     FALSE 0.466 39.000 0.044 NA   NA
 5699784 5699785 Aflv_0928 Aflv_0929     TRUE 0.965 3.000 0.168 1.000 Y NA
 5699785 5699786 Aflv_0929 Aflv_0930   efp TRUE 0.892 19.000 0.160 1.000 N NA
 5699786 5699787 Aflv_0930 Aflv_0931 efp   FALSE 0.005 1022.000 0.009 NA   NA
 5699787 5699788 Aflv_0931 Aflv_0932   spoIIIAA TRUE 0.848 -3.000 0.148 NA   NA
 5699788 5699789 Aflv_0932 Aflv_0933 spoIIIAA spoIIIAB TRUE 0.920 1.000 0.604 NA   NA
 5699789 5699790 Aflv_0933 Aflv_0934 spoIIIAB spoIIIAC TRUE 0.935 16.000 0.926 NA   NA
 5699790 5699791 Aflv_0934 Aflv_0935 spoIIIAC spoIIIAD TRUE 0.859 43.000 0.895 NA   NA
 5699791 5699792 Aflv_0935 Aflv_0936 spoIIIAD spoIIIAE TRUE 0.924 5.000 0.864 NA   NA
 5699792 5699793 Aflv_0936 Aflv_0937 spoIIIAE spoIIIAF TRUE 0.926 8.000 0.918 NA   NA
 5699793 5699794 Aflv_0937 Aflv_0938 spoIIIAF spoIIIAG TRUE 0.926 7.000 0.907 NA   NA
 5699794 5699795 Aflv_0938 Aflv_0939 spoIIIAG spoIIIAH TRUE 0.908 13.000 0.509 NA   NA
 5699795 5699796 Aflv_0939 Aflv_0940 spoIIIAH accB FALSE 0.029 190.000 0.020 NA   NA
 5699796 5699797 Aflv_0940 Aflv_0941 accB accC TRUE 0.975 14.000 0.086 0.001 Y NA
 5699797 5699798 Aflv_0941 Aflv_0942 accC   TRUE 0.859 22.000 0.373 NA   NA
 5699798 5699799 Aflv_0942 Aflv_0943   nusB FALSE 0.311 49.000 0.023 NA   NA
 5699799 5699800 Aflv_0943 Aflv_0944 nusB folD TRUE 0.820 24.000 0.056 1.000 N NA
 5699800 5699801 Aflv_0944 Aflv_0945 folD   TRUE 0.859 15.000 0.058 1.000 N NA
 5699801 5699802 Aflv_0945 Aflv_0946     TRUE 0.991 -3.000 0.412 0.001 Y NA
 5699802 5699803 Aflv_0946 Aflv_0947     TRUE 0.877 3.000 0.100 1.000 N NA
 5699803 5699804 Aflv_0947 Aflv_0948   dxs FALSE 0.377 163.000 0.024 1.000 Y NA
 5699804 5699805 Aflv_0948 Aflv_0949 dxs   TRUE 0.902 4.000 0.189 1.000 N NA
 5699805 5699806 Aflv_0949 Aflv_0950   ahrC FALSE 0.521 85.000 0.064 1.000 N NA
 5699806 5699807 Aflv_0950 Aflv_0951 ahrC recN TRUE 0.841 19.000 0.056 1.000 N NA
 5699807 5699808 Aflv_0951 Aflv_0952 recN spoIVB FALSE 0.387 116.000 0.079 1.000 N NA
 5699808 5699809 Aflv_0952 Aflv_0953 spoIVB spo0A FALSE 0.236 218.000 0.393 1.000 N NA
 5699813 5699814 Aflv_0957 Aflv_0958   ptb FALSE 0.507 129.000 0.333 1.000 N NA
 5699814 5699815 Aflv_0958 Aflv_0959 ptb bcd TRUE 0.942 17.000 0.431 1.000 N NA
 5699815 5699816 Aflv_0959 Aflv_0960 bcd buk TRUE 0.851 52.000 0.490 1.000 N NA
 5699816 5699817 Aflv_0960 Aflv_0961 buk lpdV TRUE 0.971 10.000 0.172 0.035 Y NA
 5699817 5699818 Aflv_0961 Aflv_0962 lpdV bkdAA TRUE 0.978 12.000 0.414 1.000 Y NA
 5699818 5699819 Aflv_0962 Aflv_0963 bkdAA bkdAB TRUE 0.990 3.000 0.897 0.038 Y NA
 5699819 5699820 Aflv_0963 Aflv_0964 bkdAB bkdB TRUE 0.990 13.000 0.882 0.038 Y NA
 5699820 5699821 Aflv_0964 Aflv_0965 bkdB   FALSE 0.231 156.000 0.032 0.038 N NA
 5699821 5699822 Aflv_0965 Aflv_0966     TRUE 0.988 -13.000 0.220 0.001 Y NA
 5699822 5699823 Aflv_0966 Aflv_0967     TRUE 0.958 -3.000 0.366 1.000 N NA
 5699823 5699824 Aflv_0967 Aflv_0968     FALSE 0.035 56.000 0.000 NA   NA
 5699824 5699825 Aflv_0968 Aflv_0969     TRUE 0.633 51.000 0.250 NA   NA
 5699825 5699826 Aflv_0969 Aflv_0970     FALSE 0.011 121.000 0.000 NA   NA
 5699826 5699827 Aflv_0970 Aflv_0971     TRUE 0.923 -3.000 0.108 1.000 N NA
 5699829 5699830 Aflv_0973 Aflv_0974   cheW TRUE 0.886 -34.000 0.062 1.000 N NA
 5699830 5699831 Aflv_0974 Aflv_0975 cheW   FALSE 0.101 22.000 0.000 NA   NA
 5699831 5699832 Aflv_0975 Aflv_0976     FALSE 0.159 -22.000 0.000 NA   NA
 5699833 5699834 Aflv_0977 Aflv_0978   zwf TRUE 0.741 14.000 0.084 NA   NA
 5699835 5699836 Aflv_0979 Aflv_0980     FALSE 0.361 -3.000 0.000 1.000   NA
 5699837 5699838 Aflv_0981 Aflv_0982   proI TRUE 0.622 73.000 0.128 1.000 N NA
 5699839 5699840 Aflv_0983 Aflv_0984     TRUE 0.883 -3.000 0.188 1.000   NA
 5699840 5699841 Aflv_0984 Aflv_0985     FALSE 0.520 12.000 0.017 NA   NA
 5699847 5699848 Aflv_0991 Aflv_0992 nudF spoIIM FALSE 0.214 84.000 0.033 NA   NA
 5699848 5699849 Aflv_0992 Aflv_0993 spoIIM   FALSE 0.002 228.000 0.000 NA   NA
 5699849 5699850 Aflv_0993 Aflv_0994     TRUE 0.760 27.000 0.200 NA   NA
 5699850 5699851 Aflv_0994 Aflv_0995   fur FALSE 0.106 9.000 0.000 NA   NA
 5699851 5699852 Aflv_0995 Aflv_0996 fur   FALSE 0.447 97.000 0.284 NA   NA
 5699852 5699853 Aflv_0996 Aflv_0997   ripX TRUE 0.899 2.000 0.476 NA   NA
 5699853 5699854 Aflv_0997 Aflv_0998 ripX drm FALSE 0.342 157.000 0.267 1.000 N NA
 5699854 5699855 Aflv_0998 Aflv_0999 drm punA TRUE 0.958 14.000 0.609 1.000 N NA
 5699855 5699856 Aflv_0999 Aflv_1000 punA   TRUE 0.954 19.000 0.084 1.000 Y NA
 5699856 5699857 Aflv_1000 Aflv_1001   dacF FALSE 0.472 84.000 0.035 1.000 N NA
 5699857 5699858 Aflv_1001 Aflv_1002 dacF spoIIAA TRUE 0.648 95.000 0.276 1.000 N NA
 5699858 5699859 Aflv_1002 Aflv_1003 spoIIAA spoIIAB TRUE 0.991 1.000 0.669 0.002 Y NA
 5699859 5699860 Aflv_1003 Aflv_1004 spoIIAB sigF TRUE 0.958 8.000 0.842 1.000 N NA
 5699860 5699861 Aflv_1004 Aflv_1005 sigF spoVAA FALSE 0.428 79.000 0.165 NA   NA
 5699861 5699862 Aflv_1005 Aflv_1006 spoVAA spoVAB TRUE 0.956 -13.000 0.923 NA   NA
 5699862 5699863 Aflv_1006 Aflv_1007 spoVAB spoVAC TRUE 0.802 -10.000 0.080 NA   NA
 5699863 5699864 Aflv_1007 Aflv_1008 spoVAC spoVAD TRUE 0.769 9.000 0.154 NA   NA
 5699864 5699865 Aflv_1008 Aflv_1009 spoVAD spoVAE FALSE 0.113 3.000 0.000 NA   NA
 5699865 5699866 Aflv_1009 Aflv_1010 spoVAE spoVAE FALSE 0.170 -3.000 0.000 NA   NA
 5699866 5699867 Aflv_1010 Aflv_1011 spoVAE spoVAF TRUE 0.926 -61.000 0.650 NA   NA
 5699867 5699868 Aflv_1011 Aflv_1012 spoVAF lysA TRUE 0.561 6.000 0.015 1.000   NA
 5699870 5699871 Aflv_1014 Aflv_1015 ppiB ribD FALSE 0.019 424.000 0.000 1.000 N NA
 5699871 5699872 Aflv_1015 Aflv_1016 ribD ribE TRUE 0.987 -3.000 0.456 1.000 Y NA
 5699872 5699873 Aflv_1016 Aflv_1017 ribE ribA TRUE 0.964 -3.000 0.040 1.000 Y NA
 5699873 5699874 Aflv_1017 Aflv_1018 ribA ribH TRUE 0.967 13.000 0.034 0.001 Y NA
 5699874 5699875 Aflv_1018 Aflv_1019 ribH ribT FALSE 0.195 83.000 0.008 1.000   NA
 5699877 5699878 Aflv_1021 Aflv_1022     TRUE 0.920 -64.000 0.570 NA   NA
 5699878 5699879 Aflv_1022 Aflv_1023     FALSE 0.112 18.000 0.000 NA   NA
 5699879 5699880 Aflv_1023 Aflv_1024     FALSE 0.003 208.000 0.000 NA   NA
 5699880 5699881 Aflv_1024 Aflv_1025     TRUE 0.861 -10.000 0.167 NA   NA
 5699881 5699882 Aflv_1025 Aflv_1026     FALSE 0.170 -3.000 0.000 NA   NA
 5699882 5699883 Aflv_1026 Aflv_1027     TRUE 0.671 -13.000 0.000 0.024   NA
 5699883 5699884 Aflv_1027 Aflv_1028     FALSE 0.256 12.000 0.000 1.000   NA
 5699884 5699885 Aflv_1028 Aflv_1029     FALSE 0.001 1763.000 0.000 NA   NA
 5699885 5699886 Aflv_1029 Aflv_1030     TRUE 0.878 7.000 0.435 NA   NA
 5699886 5699887 Aflv_1030 Aflv_1031   sodF TRUE 0.724 11.000 0.101 NA   NA
 5699887 5699888 Aflv_1031 Aflv_1032 sodF dacB FALSE 0.277 145.000 0.101 1.000 N NA
 5699888 5699889 Aflv_1032 Aflv_1033 dacB spmA TRUE 0.906 -7.000 0.252 1.000   NA
 5699889 5699890 Aflv_1033 Aflv_1034 spmA spmB TRUE 0.688 0.000 0.000 0.002   NA
 5699890 5699891 Aflv_1034 Aflv_1035 spmB rluB FALSE 0.110 50.000 0.000 1.000   NA
 5699891 5699892 Aflv_1035 Aflv_1036 rluB resA FALSE 0.516 88.000 0.069 1.000 N NA
 5699892 5699893 Aflv_1036 Aflv_1037 resA resB TRUE 0.974 13.000 0.306 NA Y NA
 5699893 5699894 Aflv_1037 Aflv_1038 resB resC TRUE 0.970 12.000 0.278 NA Y NA
 5699894 5699895 Aflv_1038 Aflv_1039 resC resD TRUE 0.656 73.000 0.178 1.000 N NA
 5699895 5699896 Aflv_1039 Aflv_1040 resD resE TRUE 0.991 -3.000 0.511 0.043 Y NA
 5699896 5699897 Aflv_1040 Aflv_1041 resE   FALSE 0.018 465.000 0.000 1.000 N NA
 5699897 5699898 Aflv_1041 Aflv_1042     TRUE 0.975 -34.000 0.183 1.000 Y NA
 5699898 5699899 Aflv_1042 Aflv_1043     TRUE 0.985 -3.000 0.373 1.000 Y NA
 5699899 5699900 Aflv_1043 Aflv_1044     TRUE 0.964 -3.000 0.039 1.000 Y NA
 5699900 5699901 Aflv_1044 Aflv_1045   cobD TRUE 0.943 -25.000 0.112 0.010 N NA
 5699901 5699902 Aflv_1045 Aflv_1046 cobD cobU TRUE 0.882 -12.000 0.031 1.000 N NA
 5699902 5699903 Aflv_1046 Aflv_1047 cobU cobS TRUE 0.970 -27.000 0.092 1.000 Y NA
 5699903 5699904 Aflv_1047 Aflv_1048 cobS cobC TRUE 0.852 -42.000 0.028 1.000 N NA
 5699904 5699905 Aflv_1048 Aflv_1049 cobC   FALSE 0.188 180.000 0.434 NA   NA
 5699905 5699906 Aflv_1049 Aflv_1050     TRUE 0.760 3.000 0.123 NA   NA
 5699906 5699907 Aflv_1050 Aflv_1051     TRUE 0.827 -3.000 0.108 NA   NA
 5699907 5699908 Aflv_1051 Aflv_1052     TRUE 0.945 -7.000 0.639 NA   NA
 5699908 5699909 Aflv_1052 Aflv_1053     FALSE 0.172 -10.000 0.000 NA   NA
 5699909 5699910 Aflv_1053 Aflv_1054   hisJ FALSE 0.162 -19.000 0.000 NA   NA
 5699911 5699912 Aflv_1055 Aflv_1056 serA   FALSE 0.105 175.000 0.004 1.000 N NA
 5699912 5699913 Aflv_1056 Aflv_1057   fer FALSE 0.477 118.000 0.000 1.000 Y NA
 5699914 5699915 Aflv_1058 Aflv_1059   recQ TRUE 0.921 -46.000 0.508 NA   NA
 5699915 5699916 Aflv_1059 Aflv_1060 recQ   TRUE 0.900 -7.000 0.270 NA   NA
 5699916 5699917 Aflv_1060 Aflv_1061     TRUE 0.858 -7.000 0.160 NA   NA
 5699917 5699918 Aflv_1061 Aflv_1062     FALSE 0.481 55.000 0.118 NA   NA
 5699918 5699919 Aflv_1062 Aflv_1063     FALSE 0.101 22.000 0.000 NA   NA
 5699919 5699920 Aflv_1063 Aflv_1064     TRUE 0.804 -25.000 0.100 NA   NA
 5699920 5699921 Aflv_1064 Aflv_1065     TRUE 0.625 83.000 0.433 1.000   NA
 5699921 5699922 Aflv_1065 Aflv_1066     TRUE 0.605 76.000 0.417 NA   NA
 5699924 5699925 Aflv_1068 Aflv_1069 gudB   TRUE 0.894 -46.000 0.083 1.000 N NA
 5699925 5699926 Aflv_1069 Aflv_1070   bioD FALSE 0.306 82.000 0.000 1.000 N NA
 5699926 5699927 Aflv_1070 Aflv_1071 bioD bioA TRUE 0.959 -24.000 0.000 0.002 Y NA
 5699928 5699929 Aflv_1072 Aflv_1073 ypeB sleB TRUE 0.889 13.000 0.408 NA   NA
 5699929 5699930 Aflv_1073 Aflv_1074 sleB   TRUE 0.727 27.000 0.157 NA   NA
 5699931 5699932 Aflv_1075 Aflv_1076     TRUE 0.636 33.000 0.103 NA   NA
 5699932 5699933 Aflv_1076 Aflv_1077   cmk FALSE 0.183 76.000 0.016 NA   NA
 5699933 5699934 Aflv_1077 Aflv_1078 cmk   TRUE 0.874 -30.000 0.041 1.000 N NA
 5699934 5699935 Aflv_1078 Aflv_1079     FALSE 0.363 125.000 0.095 1.000 N NA
 5699935 5699936 Aflv_1079 Aflv_1080     TRUE 0.858 2.000 0.061 1.000 N NA
 5699938 5699939 Aflv_1082 Aflv_1083   seaA TRUE 0.939 -3.000 0.567 NA   NA
 5699939 5699940 Aflv_1083 Aflv_1084 seaA   TRUE 0.943 -3.000 0.633 NA   NA
 5699940 5699941 Aflv_1084 Aflv_1085     FALSE 0.253 52.000 0.014 NA   NA
 5699941 5699942 Aflv_1085 Aflv_1086   gpsA TRUE 0.717 12.000 0.068 1.000   NA
 5699942 5699943 Aflv_1086 Aflv_1087 gpsA   FALSE 0.035 179.000 0.021 NA   NA
 5699943 5699944 Aflv_1087 Aflv_1088     TRUE 0.925 16.000 0.771 NA   NA
 5699944 5699945 Aflv_1088 Aflv_1089   spoIVA FALSE 0.337 77.000 0.081 NA   NA
 5699945 5699946 Aflv_1089 Aflv_1090 spoIVA hbs FALSE 0.002 227.000 0.000 NA   NA
 5699946 5699947 Aflv_1090 Aflv_1091 hbs mtrA TRUE 0.645 72.000 0.154 1.000 N NA
 5699947 5699948 Aflv_1091 Aflv_1092 mtrA mtrB TRUE 0.777 11.000 0.130 1.000   NA
 5699948 5699949 Aflv_1092 Aflv_1093 mtrB   TRUE 0.594 61.000 0.245 1.000   NA
 5699949 5699950 Aflv_1093 Aflv_1094   menH TRUE 0.906 25.000 0.708 1.000   NA
 5699950 5699951 Aflv_1094 Aflv_1095 menH hepT TRUE 0.980 12.000 0.476 1.000 Y NA
 5699951 5699952 Aflv_1095 Aflv_1096 hepT ndk FALSE 0.376 110.000 0.054 1.000 N NA
 5699952 5699953 Aflv_1096 Aflv_1097 ndk cheR TRUE 0.874 -12.000 0.023 1.000 N NA
 5699953 5699954 Aflv_1097 Aflv_1098 cheR   TRUE 0.821 1.000 0.017 1.000 N NA
 5699954 5699955 Aflv_1098 Aflv_1099   aroB TRUE 0.977 -102.000 0.110 0.002 Y NA
 5699955 5699956 Aflv_1099 Aflv_1100 aroB aroH TRUE 0.951 -91.000 0.041 1.000 Y NA
 5699956 5699957 Aflv_1100 Aflv_1101 aroH trpE TRUE 0.572 116.000 0.006 1.000 Y NA
 5699957 5699958 Aflv_1101 Aflv_1102 trpE trpD TRUE 0.970 -52.000 0.032 0.001 Y NA
 5699958 5699959 Aflv_1102 Aflv_1103 trpD trpC TRUE 0.981 -7.000 0.216 1.000 Y NA
 5699959 5699960 Aflv_1103 Aflv_1104 trpC trpF TRUE 0.989 -3.000 0.264 0.001 Y NA
 5699960 5699961 Aflv_1104 Aflv_1105 trpF trpB TRUE 0.991 -6.000 0.375 0.001 Y NA
 5699961 5699962 Aflv_1105 Aflv_1106 trpB trpA TRUE 0.988 -3.000 0.248 0.001 Y NA
 5699962 5699963 Aflv_1106 Aflv_1107 trpA hisC TRUE 0.947 -58.000 0.017 1.000 Y NA
 5699963 5699964 Aflv_1107 Aflv_1108 hisC tyrA TRUE 0.970 -18.000 0.080 1.000 Y NA
 5699964 5699965 Aflv_1108 Aflv_1109 tyrA aroE TRUE 0.956 15.000 0.069 1.000 Y NA
 5699965 5699966 Aflv_1109 Aflv_1110 aroE   FALSE 0.234 60.000 0.002 1.000   NA
 5699966 5699967 Aflv_1110 Aflv_1111     TRUE 0.920 -7.000 0.375 NA   NA
 5699967 5699968 Aflv_1111 Aflv_1112     FALSE 0.537 107.000 0.583 NA   NA
 5699968 5699969 Aflv_1112 Aflv_1113   qcrA TRUE 0.574 97.000 0.540 NA   NA
 5699969 5699970 Aflv_1113 Aflv_1114 qcrA qcrB TRUE 0.885 4.000 0.447 NA   NA
 5699970 5699971 Aflv_1114 Aflv_1115 qcrB qcrC TRUE 0.793 26.000 0.095 0.028   NA
 5699971 5699972 Aflv_1115 Aflv_1116 qcrC   FALSE 0.504 43.000 0.069 NA   NA
 5699972 5699973 Aflv_1116 Aflv_1117     TRUE 0.582 67.000 0.309 NA   NA
 5699975 5699976 Aflv_1119 Aflv_1120   dapB TRUE 0.705 -27.000 0.044 NA   NA
 5699976 5699977 Aflv_1120 Aflv_1121 dapB mgsA TRUE 0.924 -7.000 0.044 0.035 N NA
 5699977 5699978 Aflv_1121 Aflv_1122 mgsA   TRUE 0.773 -33.000 0.081 NA   NA
 5699978 5699979 Aflv_1122 Aflv_1123     TRUE 0.877 -3.000 0.210 NA   NA
 5699979 5699980 Aflv_1123 Aflv_1124   cca TRUE 0.927 -3.000 0.126 1.000 N NA
 5699980 5699981 Aflv_1124 Aflv_1125 cca birA TRUE 0.914 -39.000 0.134 1.000 N NA
 5699981 5699982 Aflv_1125 Aflv_1126 birA panB FALSE 0.339 165.000 0.002 1.000 Y NA
 5699982 5699983 Aflv_1126 Aflv_1127 panB panC TRUE 0.990 -27.000 0.395 0.001 Y NA
 5699983 5699984 Aflv_1127 Aflv_1128 panC panD TRUE 0.978 13.000 0.342 1.000 Y NA
 5699984 5699985 Aflv_1128 Aflv_1129 panD dnaQ TRUE 0.617 55.000 0.053 1.000 N NA
 5699985 5699986 Aflv_1129 Aflv_1130 dnaQ   FALSE 0.525 35.000 0.056 NA   NA
 5699986 5699987 Aflv_1130 Aflv_1131     FALSE 0.066 163.000 0.049 NA   NA
 5699987 5699988 Aflv_1131 Aflv_1132     TRUE 0.842 7.000 0.289 NA   NA
 5699988 5699989 Aflv_1132 Aflv_1133   aspB TRUE 0.915 -3.000 0.367 NA   NA
 5699989 5699990 Aflv_1133 Aflv_1134 aspB asnS TRUE 0.832 28.000 0.094 1.000 N NA
 5699990 5699991 Aflv_1134 Aflv_1135 asnS dnaD TRUE 0.919 -76.000 0.234 NA N NA
 5699991 5699992 Aflv_1135 Aflv_1136 dnaD nth TRUE 0.968 -13.000 0.075 NA Y NA
 5699995 5699996 Aflv_1139 Aflv_1140 ponA recU TRUE 0.724 16.000 0.062 1.000   NA
 5699997 5699998 Aflv_1141 Aflv_1142     TRUE 0.866 -3.000 0.017 1.000 N NA
 5699998 5699999 Aflv_1142 Aflv_1143     FALSE 0.002 255.000 0.000 NA   NA
 5700000 5700001 Aflv_1144 Aflv_1145     TRUE 0.581 61.000 0.263 NA   NA
 5700003 5700004 Aflv_1147 Aflv_1148     FALSE 0.028 68.000 0.000 NA   NA
 5700006 5700007 Aflv_1150 Aflv_1151     FALSE 0.147 -34.000 0.000 NA   NA
 5700007 5700008 Aflv_1151 Aflv_1152     FALSE 0.513 74.000 0.250 NA   NA
 5700008 5700009 Aflv_1152 Aflv_1153     FALSE 0.110 12.000 0.000 NA   NA
 5700009 5700010 Aflv_1153 Aflv_1154     FALSE 0.050 46.000 0.000 NA   NA
 5700010 5700011 Aflv_1154 Aflv_1155   ampS FALSE 0.323 72.000 0.000 1.000 N NA
 5700012 5700013 Aflv_1156 Aflv_1157     FALSE 0.170 -3.000 0.000 NA   NA
 5700013 5700014 Aflv_1157 Aflv_1158     FALSE 0.099 149.000 0.000 1.000 N NA
 5700014 5700015 Aflv_1158 Aflv_1159   fhuC FALSE 0.172 118.000 0.000 1.000 N NA
 5700015 5700016 Aflv_1159 Aflv_1160 fhuC fhuD TRUE 0.982 -73.000 0.455 1.000 Y NA
 5700016 5700017 Aflv_1160 Aflv_1161 fhuD fhuB TRUE 0.988 -7.000 0.487 1.000 Y NA
 5700017 5700018 Aflv_1161 Aflv_1162 fhuB fhuG TRUE 0.994 -3.000 0.857 0.017 Y NA
 5700018 5700019 Aflv_1162 Aflv_1163 fhuG kbl FALSE 0.362 62.000 0.000 1.000 N NA
 5700019 5700020 Aflv_1163 Aflv_1164 kbl   TRUE 0.838 -3.000 0.128 NA   NA
 5700020 5700021 Aflv_1164 Aflv_1165     TRUE 0.849 -19.000 0.163 NA   NA
 5700023 5700024 Aflv_1167 Aflv_1168     FALSE 0.013 112.000 0.000 NA   NA
 5700024 5700025 Aflv_1168 Aflv_1169     TRUE 0.878 -19.000 0.226 NA   NA
 5700027 5700028 Aflv_1171 Aflv_1172     FALSE 0.031 63.000 0.000 NA   NA
 5700028 5700029 Aflv_1172 Aflv_1173   pcrA FALSE 0.045 1136.000 0.000 NA Y NA
 5700029 5700030 Aflv_1173 Aflv_1174 pcrA   TRUE 0.956 -13.000 0.000 0.045 Y NA
 5700030 5700031 Aflv_1174 Aflv_1175     TRUE 0.653 -7.000 0.000 0.045   NA
 5700031 5700032 Aflv_1175 Aflv_1176     FALSE 0.029 187.000 0.000 0.077   NA
 5700032 5700033 Aflv_1176 Aflv_1177   htrA FALSE 0.002 527.000 0.000 1.000   NA
 5700033 5700034 Aflv_1177 Aflv_1178 htrA   FALSE 0.061 85.000 0.000 1.000   NA
 5700034 5700035 Aflv_1178 Aflv_1179     FALSE 0.371 39.000 0.000 0.045   NA
 5700037 5700038 Aflv_1181 Aflv_1182   gabD TRUE 0.757 23.000 0.000 0.037 N NA
 5700038 5700039 Aflv_1182 Aflv_1183 gabD ansB TRUE 0.632 26.000 0.000 1.000 N NA
 5700039 5700040 Aflv_1183 Aflv_1184 ansB dhaS TRUE 0.962 -31.000 0.500 1.000 N NA
 5700040 5700041 Aflv_1184 Aflv_1185 dhaS gutB TRUE 0.921 46.000 0.182 1.000 Y NA
 5700041 5700042 Aflv_1185 Aflv_1186 gutB gbsB TRUE 0.725 60.000 0.000 1.000 Y NA
 5700042 5700043 Aflv_1186 Aflv_1187 gbsB opuD FALSE 0.270 91.000 0.000 1.000 N NA
 5700043 5700044 Aflv_1187 Aflv_1188 opuD   FALSE 0.001 810.000 0.000 NA   NA
 5700044 5700045 Aflv_1188 Aflv_1189     FALSE 0.001 1149.000 0.000 NA   NA
 5700047 5700048 Aflv_1191 Aflv_1192     TRUE 0.940 39.000 0.058 0.001 Y NA
 5700048 5700049 Aflv_1192 Aflv_1193     TRUE 0.786 3.000 0.161 NA   NA
 5700049 5700050 Aflv_1193 Aflv_1194     FALSE 0.003 214.000 0.000 NA   NA
 5700050 5700051 Aflv_1194 Aflv_1195     FALSE 0.153 -28.000 0.000 NA   NA
 5700051 5700052 Aflv_1195 Aflv_1197     FALSE 0.170 -13.000 0.000 NA   NA
 5700052 5700053 Aflv_1197 Aflv_1198     FALSE 0.127 46.000 0.000 1.000   NA
 5700053 5700054 Aflv_1198 Aflv_1199     FALSE 0.005 274.000 0.000 1.000   NA
 5700055 5700056 Aflv_1200 Aflv_1201     FALSE 0.006 156.000 0.000 NA   NA
 5700059 5700060 Aflv_1204 Aflv_1205   gerKA FALSE 0.004 315.000 0.000 1.000   NA
 5700060 5700061 Aflv_1205 Aflv_1206 gerKA gerKC TRUE 0.622 128.000 0.889 0.006   NA
 5700061 5700062 Aflv_1206 Aflv_1207 gerKC gerKB TRUE 0.956 18.000 0.900 0.006   NA
 5700063 5700064 Aflv_1208 Aflv_1209     FALSE 0.038 109.000 0.000 1.000   NA
 5700065 5700066 Aflv_1210 Aflv_1211     FALSE 0.159 -22.000 0.000 NA   NA
 5700066 5700067 Aflv_1211 Aflv_1213   sacA FALSE 0.089 26.000 0.000 NA   NA
 5700067 5700068 Aflv_1213 Aflv_1214 sacA   FALSE 0.016 101.000 0.000 NA   NA
 5700068 5700069 Aflv_1214 Aflv_1215     FALSE 0.001 414.000 0.000 NA   NA
 5700069 5700070 Aflv_1215 Aflv_1216     FALSE 0.009 130.000 0.000 NA   NA
 5700070 5700071 Aflv_1216 Aflv_1217     FALSE 0.001 4247.000 0.000 NA   NA
 5700071 5700072 Aflv_1217 Aflv_1218     TRUE 0.862 -3.000 0.176 NA   NA
 5700072 5700073 Aflv_1218 Aflv_1219     TRUE 0.977 19.000 0.176 0.001 Y NA
 5700073 5700074 Aflv_1219 Aflv_1220     FALSE 0.073 2335.000 0.000 0.001 Y NA
 5700078 5700079 Aflv_1225 Aflv_1226 asnB   FALSE 0.022 89.000 0.000 NA   NA
 5700081 5700082 Aflv_1228 Aflv_1229   aldY FALSE 0.165 120.000 0.000 1.000 N NA
 5700082 5700083 Aflv_1229 Aflv_1230 aldY   FALSE 0.025 81.000 0.000 NA   NA
 5700085 5700086 Aflv_1232 Aflv_1233     FALSE 0.061 86.000 0.000 1.000   NA
 5700088 5700089 Aflv_1235 Aflv_1236 gltA gltB TRUE 0.968 34.000 0.222 0.001 Y NA
 5700089 5700090 Aflv_1236 Aflv_1237 gltB   FALSE 0.035 57.000 0.000 NA   NA
 5700090 5700091 Aflv_1237 Aflv_1238   ilvD FALSE 0.023 85.000 0.000 NA   NA
 5700091 5700092 Aflv_1238 Aflv_1239 ilvD   FALSE 0.027 70.000 0.000 NA   NA
 5700093 5700094 Aflv_1240 Aflv_1241 acdA   TRUE 0.942 -31.000 0.259 1.000 N NA
 5700095 5700096 Aflv_1242 Aflv_1243 gabT   TRUE 0.783 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5700096 5700097 Aflv_1243 Aflv_1244     TRUE 0.734 -55.000 0.000 1.000 N NA
 5700097 5700098 Aflv_1244 Aflv_1245   ilvB TRUE 0.626 90.000 0.000 1.000 Y NA
 5700098 5700099 Aflv_1245 Aflv_1246 ilvB   TRUE 0.914 -3.000 0.082 1.000 N NA
 5700099 5700100 Aflv_1246 Aflv_1247     TRUE 0.892 -130.000 0.107 1.000 N NA
 5700100 5700101 Aflv_1247 Aflv_1248   etfB FALSE 0.235 99.000 0.000 1.000 N NA
 5700101 5700102 Aflv_1248 Aflv_1249 etfB etfA TRUE 0.963 13.000 0.036 0.007 Y NA
 5700102 5700103 Aflv_1249 Aflv_1250 etfA   TRUE 0.991 -7.000 0.491 0.028 Y NA
 5700103 5700104 Aflv_1250 Aflv_1251     TRUE 0.976 -18.000 0.062 0.028 Y NA
 5700104 5700105 Aflv_1251 Aflv_1252     FALSE 0.001 730.000 0.000 NA   NA
 5700105 5700106 Aflv_1252 Aflv_1253     FALSE 0.052 45.000 0.000 NA   NA
 5700106 5700107 Aflv_1253 Aflv_1254     FALSE 0.001 395.000 0.000 NA   NA
 5700109 5700110 Aflv_1256 Aflv_1257     FALSE 0.007 138.000 0.000 NA   NA
 5700110 5700111 Aflv_1257 Aflv_1258     FALSE 0.020 92.000 0.000 NA   NA
 5700111 5700112 Aflv_1258 Aflv_1259     FALSE 0.002 235.000 0.000 NA   NA
 5700112 5700113 Aflv_1259 Aflv_1260     FALSE 0.001 395.000 0.000 NA   NA
 5700113 5700114 Aflv_1260 Aflv_1261     FALSE 0.007 143.000 0.000 NA   NA
 5700114 5700115 Aflv_1261 Aflv_1262     FALSE 0.001 1519.000 0.000 NA   NA
 5700117 5700118 Aflv_1264 Aflv_1265     TRUE 0.714 14.000 0.000 1.000 N NA
 5700120 5700121 Aflv_1267 Aflv_1268     TRUE 0.987 -3.000 0.273 0.017 Y NA
 5700121 5700122 Aflv_1268 Aflv_1269     TRUE 0.975 13.000 0.273 1.000 Y NA
 5700122 5700123 Aflv_1269 Aflv_1270     TRUE 0.911 -3.000 0.333 NA   NA
 5700124 5700125 Aflv_1271 Aflv_1272 proA proB TRUE 0.980 22.000 0.281 0.002 Y NA
 5700125 5700126 Aflv_1272 Aflv_1273 proB   FALSE 0.002 291.000 0.000 NA   NA
 5700127 5700128 Aflv_1274 Aflv_1275     TRUE 0.917 -16.000 0.382 NA   NA
 5700130 5700131 Aflv_1277 Aflv_1278   acsA FALSE 0.012 116.000 0.000 NA   NA
 5700131 5700132 Aflv_1278 Aflv_1279 acsA   FALSE 0.206 108.000 0.000 1.000 N NA
 5700132 5700133 Aflv_1279 Aflv_1280     TRUE 0.955 -3.000 0.321 1.000 N NA
 5700133 5700134 Aflv_1280 Aflv_1281     TRUE 0.967 -22.000 0.065 1.000 Y NA
 5700137 5700138 Aflv_1284 Aflv_1285     FALSE 0.018 147.000 0.000 1.000   NA
 5700138 5700139 Aflv_1285 Aflv_1286     FALSE 0.059 88.000 0.000 1.000   NA
 5700142 5700143 Aflv_1289 Aflv_1290 mntA mntB TRUE 0.992 -3.000 0.898 1.000 Y NA
 5700143 5700144 Aflv_1290 Aflv_1291 mntB mntC TRUE 0.862 112.000 0.432 0.076 Y NA
 5700144 5700145 Aflv_1291 Aflv_1292 mntC mntD TRUE 0.991 -3.000 0.443 0.002 Y NA
 5700147 5700148 Aflv_1294 Aflv_1295     FALSE 0.004 185.000 0.000 NA   NA
 5700148 5700149 Aflv_1295 Aflv_1296   xpaC FALSE 0.008 137.000 0.000 NA   NA
 5700149 5700150 Aflv_1296 Aflv_1297 xpaC   TRUE 0.915 -16.000 0.373 NA   NA
 5700150 5700151 Aflv_1297 Aflv_1298     FALSE 0.029 67.000 0.000 NA   NA
 5700151 5700152 Aflv_1298 Aflv_1299     FALSE 0.026 73.000 0.000 NA   NA
 5700152 5700153 Aflv_1299 Aflv_1300     FALSE 0.106 6.000 0.000 NA   NA
 5700153 5700154 Aflv_1300 Aflv_1301     FALSE 0.017 99.000 0.000 NA   NA
 5700156 5700157 Aflv_1303 Aflv_1304   tlpC FALSE 0.218 62.000 0.000 0.052   NA
 5700158 5700159 Aflv_1305 Aflv_1306     FALSE 0.152 -30.000 0.000 NA   NA
 5700160 5700161 Aflv_1307 Aflv_1308 rbsB yesM TRUE 0.976 -3.000 1.000 NA N NA
 5700161 5700162 Aflv_1308 Aflv_1309 yesM yesN TRUE 0.944 -76.000 0.000 0.013 Y NA
 5700162 5700163 Aflv_1309 Aflv_1310 yesN rbsB FALSE 0.110 181.000 0.036 NA N NA
 5700163 5700164 Aflv_1310 Aflv_1311 rbsB rbsA TRUE 0.939 17.000 0.036 NA Y NA
 5700164 5700165 Aflv_1311 Aflv_1312 rbsA rbsC TRUE 0.955 4.000 0.094 1.000 Y NA
 5700165 5700166 Aflv_1312 Aflv_1313 rbsC menC FALSE 0.506 43.000 0.000 1.000 N NA
 5700166 5700167 Aflv_1313 Aflv_1314 menC   FALSE 0.107 5.000 0.000 NA   NA
 5700167 5700168 Aflv_1314 Aflv_1315     FALSE 0.030 65.000 0.000 NA   NA
 5700168 5700169 Aflv_1315 Aflv_1316     FALSE 0.038 54.000 0.000 NA   NA
 5700172 5700173 Aflv_1319 Aflv_1320     FALSE 0.031 62.000 0.000 NA   NA
 5700173 5700174 Aflv_1320 Aflv_1321     TRUE 0.683 11.000 0.057 1.000   NA
 5700175 5700176 Aflv_1322 Aflv_1323 bsaA cotS FALSE 0.024 83.000 0.000 NA   NA
 5700176 5700177 Aflv_1323 Aflv_1324 cotS   TRUE 0.923 -24.000 0.462 NA   NA
 5700179 5700180 Aflv_1326 Aflv_1327     TRUE 0.993 -66.000 0.911 0.002 Y NA
 5700182 5700183 Aflv_1329 Aflv_1330     FALSE 0.029 67.000 0.000 NA   NA
 5700183 5700184 Aflv_1330 Aflv_1332   nrgA FALSE 0.003 204.000 0.000 NA   NA
 5700184 5700185 Aflv_1332 Aflv_1333 nrgA   TRUE 0.908 14.000 0.500 NA   NA
 5700185 5700186 Aflv_1333 Aflv_1334     TRUE 0.904 1.000 0.471 NA   NA
 5700186 5700187 Aflv_1334 Aflv_1335     FALSE 0.398 88.000 0.000 0.029 N NA
 5700187 5700188 Aflv_1335 Aflv_1336     TRUE 0.843 12.000 0.056 1.000 N NA
 5700188 5700189 Aflv_1336 Aflv_1337     FALSE 0.199 110.000 0.000 1.000 N NA
 5700189 5700190 Aflv_1337 Aflv_1338   nosD FALSE 0.263 93.000 0.000 1.000 N NA
 5700190 5700191 Aflv_1338 Aflv_1339 nosD nosL TRUE 0.866 -16.000 0.188 NA   NA
 5700191 5700192 Aflv_1339 Aflv_1340 nosL nosY TRUE 0.864 -3.000 0.179 NA   NA
 5700192 5700193 Aflv_1340 Aflv_1341 nosY nosF TRUE 0.855 -7.000 0.154 NA   NA
 5700193 5700194 Aflv_1341 Aflv_1342 nosF   TRUE 0.757 -31.000 0.000 1.000 N NA
 5700194 5700195 Aflv_1342 Aflv_1343     TRUE 0.783 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5700197 5700198 Aflv_1345 Aflv_1346 thiM thiE TRUE 0.964 1.000 0.029 0.004 Y NA
 5700198 5700199 Aflv_1346 Aflv_1347 thiE   FALSE 0.506 43.000 0.000 1.000 N NA
 5700199 5700200 Aflv_1347 Aflv_1348   rsbU FALSE 0.244 97.000 0.000 1.000 N NA
 5700201 5700202 Aflv_1349 Aflv_1350 rsbV rsbW FALSE 0.170 -3.000 0.000 NA   NA
 5700202 5700203 Aflv_1350 Aflv_1351 rsbW   FALSE 0.159 -22.000 0.000 NA   NA
 5700203 5700204 Aflv_1351 Aflv_1352   hemAT FALSE 0.025 78.000 0.000 NA   NA
 5700205 5700206 Aflv_1353 Aflv_1354     FALSE 0.010 125.000 0.000 NA   NA
 5700208 5700209 Aflv_1355 Aflv_1356     TRUE 0.811 1.000 0.008 1.000 N NA
 5700209 5700210 Aflv_1356 Aflv_1357     TRUE 0.665 116.000 0.012 0.011 Y NA
 5700210 5700211 Aflv_1357 Aflv_1358     TRUE 0.707 53.000 0.118 1.000 N NA
 5700212 5700213 Aflv_1359 Aflv_1360 ctaD   TRUE 0.971 -3.000 0.786 0.002   NA
 5700216 5700217 Aflv_1363 Aflv_1364 bcsA   TRUE 0.907 -18.000 0.279 1.000   NA
 5700217 5700218 Aflv_1364 Aflv_1365     FALSE 0.317 59.000 0.029 1.000   NA
 5700218 5700219 Aflv_1365 Aflv_1366     TRUE 0.831 -7.000 0.107 NA   NA
 5700219 5700220 Aflv_1366 Aflv_1367     FALSE 0.119 2.000 0.000 NA   NA
 5700220 5700221 Aflv_1367 Aflv_1368     FALSE 0.078 30.000 0.000 NA   NA
 5700221 5700222 Aflv_1368 Aflv_1369     FALSE 0.171 -12.000 0.000 NA   NA
 5700222 5700223 Aflv_1369 Aflv_1370   sspN TRUE 0.867 36.000 0.773 NA   NA
 5700223 5700224 Aflv_1370 Aflv_1371 sspN   FALSE 0.407 127.000 0.500 NA   NA
 5700224 5700225 Aflv_1371 Aflv_1372     FALSE 0.339 92.000 0.125 NA   NA
 5700227 5700228 Aflv_1374 Aflv_1375     FALSE 0.007 145.000 0.000 NA   NA
 5700228 5700229 Aflv_1375 Aflv_1376   bioB FALSE 0.153 77.000 0.004 NA   NA
 5700229 5700230 Aflv_1376 Aflv_1377 bioB   FALSE 0.001 511.000 0.000 NA   NA
 5700230 5700231 Aflv_1377 Aflv_1378   spo0M FALSE 0.066 36.000 0.000 NA   NA
 5700231 5700232 Aflv_1378 Aflv_1379 spo0M   FALSE 0.223 114.000 0.100 NA   NA
 5700234 5700235 Aflv_1381 Aflv_1382   deoD FALSE 0.015 106.000 0.000 NA   NA
 5700235 5700236 Aflv_1382 Aflv_1383 deoD   TRUE 0.705 73.000 0.253 1.000 N NA
 5700237 5700238 Aflv_1384 Aflv_1385     FALSE 0.025 80.000 0.000 NA   NA
 5700239 5700240 Aflv_1386 Aflv_1387     FALSE 0.468 25.000 0.000 0.051   NA
 5700244 5700245 Aflv_1391 Aflv_1392     TRUE 0.893 -18.000 0.267 NA   NA
 5700245 5700246 Aflv_1392 Aflv_1393   ilvA FALSE 0.072 171.000 0.000 1.000 N NA
 5700246 5700247 Aflv_1393 Aflv_1394 ilvA   FALSE 0.017 100.000 0.000 NA   NA
 5700247 5700248 Aflv_1394 Aflv_1395     FALSE 0.122 15.000 0.000 NA   NA
 5700248 5700249 Aflv_1395 Aflv_1396     FALSE 0.138 0.000 0.000 NA   NA
 5700249 5700250 Aflv_1396 Aflv_1397     FALSE 0.003 190.000 0.000 NA   NA
 5700250 5700251 Aflv_1397 Aflv_1398     TRUE 0.918 -13.000 0.093 1.000 N NA
 5700251 5700252 Aflv_1398 Aflv_1399     TRUE 0.859 -46.000 0.231 NA   NA
 5700252 5700253 Aflv_1399 Aflv_1400     FALSE 0.017 100.000 0.000 NA   NA
 5700253 5700254 Aflv_1400 Aflv_1401     TRUE 0.890 24.000 0.000 1.000 Y NA
 5700254 5700255 Aflv_1401 Aflv_1402   cspB FALSE 0.105 146.000 0.000 1.000 N NA
 5700255 5700256 Aflv_1402 Aflv_1403 cspB glnA FALSE 0.016 517.000 0.000 1.000 N NA
 5700256 5700257 Aflv_1403 Aflv_1404 glnA   TRUE 0.711 63.000 0.000 1.000 Y NA
 5700257 5700258 Aflv_1404 Aflv_1405     TRUE 0.969 0.000 0.850 1.000 N NA
 5700258 5700259 Aflv_1405 Aflv_1406     TRUE 0.951 -7.000 0.791 NA   NA
 5700259 5700260 Aflv_1406 Aflv_1407     FALSE 0.134 -60.000 0.000 NA   NA
 5700260 5700261 Aflv_1407 Aflv_1408     TRUE 0.678 -21.000 0.000 0.013   NA
 5700261 5700262 Aflv_1408 Aflv_R086   trnS FALSE 0.039 52.000 0.000 NA   NA
 5700262 5700263 Aflv_R086 Aflv_1409 trnS   FALSE 0.142 -41.000 0.000 NA   NA
 5700265 5700266 Aflv_1411 Aflv_1412     FALSE 0.003 205.000 0.000 NA   NA
 5700266 5700267 Aflv_1412 Aflv_1413     TRUE 0.682 19.000 0.000 1.000 N NA
 5700267 5700268 Aflv_1413 Aflv_1414     TRUE 0.703 16.000 0.000 1.000 N NA
 5700270 5700271 Aflv_1416 Aflv_1417     FALSE 0.365 39.000 0.000 0.051   NA
 5700271 5700272 Aflv_1417 Aflv_1418     FALSE 0.361 -3.000 0.000 1.000   NA
 5700272 5700273 Aflv_1418 Aflv_1419     FALSE 0.072 70.000 0.000 1.000   NA
 5700273 5700274 Aflv_1419 Aflv_1420     FALSE 0.091 25.000 0.000 NA   NA
 5700274 5700275 Aflv_1420 Aflv_1421     FALSE 0.105 11.000 0.000 NA   NA
 5700277 5700278 Aflv_1423 Aflv_1424   merA TRUE 0.887 -3.000 0.000 0.001 N NA
 5700279 5700280 Aflv_1425 Aflv_1426     FALSE 0.147 -34.000 0.000 NA   NA
 5700280 5700281 Aflv_1426 Aflv_1427     TRUE 0.898 18.000 0.000 NA Y NA
 5700281 5700282 Aflv_1427 Aflv_1428     FALSE 0.026 73.000 0.000 NA   NA
 5700282 5700283 Aflv_1428 Aflv_1429     FALSE 0.001 496.000 0.000 NA   NA
 5700283 5700284 Aflv_1429 Aflv_1430   alsT FALSE 0.005 166.000 0.000 NA   NA
 5700284 5700285 Aflv_1430 Aflv_1431 alsT   FALSE 0.024 304.000 0.000 NA N NA
 5700285 5700286 Aflv_1431 Aflv_1432     TRUE 0.952 -10.000 0.822 NA   NA
 5700286 5700287 Aflv_1432 Aflv_1433     FALSE 0.048 47.000 0.000 NA   NA
 5700287 5700288 Aflv_1433 Aflv_1434     FALSE 0.038 53.000 0.000 NA   NA
 5700288 5700289 Aflv_1434 Aflv_1435     FALSE 0.097 134.000 0.025 1.000   NA
 5700289 5700290 Aflv_1435 Aflv_1436     TRUE 0.710 15.000 0.000 1.000 N NA
 5700291 5700292 Aflv_1437 Aflv_1438 speE rpmGA FALSE 0.270 91.000 0.000 1.000 N NA
 5700293 5700294 Aflv_1439 Aflv_1440 treR treA TRUE 0.907 28.000 0.336 1.000 N NA
 5700294 5700295 Aflv_1440 Aflv_1441 treA treP TRUE 0.955 2.000 0.070 1.000 Y NA
 5700295 5700296 Aflv_1441 Aflv_1442 treP   FALSE 0.003 196.000 0.000 NA   NA
 5700296 5700297 Aflv_1442 Aflv_1443   parC FALSE 0.029 66.000 0.000 NA   NA
 5700297 5700298 Aflv_1443 Aflv_1444 parC parE TRUE 0.956 5.000 0.019 0.002 Y NA
 5700298 5700299 Aflv_1444 Aflv_1445 parE   FALSE 0.103 123.000 0.030 NA   NA
 5700300 5700301 Aflv_1446 Aflv_1447     TRUE 0.642 -9.000 0.016 NA   NA
 5700302 5700303 Aflv_1448 Aflv_1449     TRUE 0.922 4.000 0.828 NA   NA
 5700303 5700304 Aflv_1449 Aflv_1450     FALSE 0.380 66.000 0.068 1.000   NA
 5700304 5700305 Aflv_1450 Aflv_1451     TRUE 0.771 13.000 0.115 NA   NA
 5700305 5700306 Aflv_1451 Aflv_1452     FALSE 0.343 145.000 0.577 NA   NA
 5700306 5700307 Aflv_1452 Aflv_1453   ilvA FALSE 0.203 98.000 0.050 NA   NA
 5700307 5700308 Aflv_1453 Aflv_1454 ilvA dfrA FALSE 0.154 125.000 0.000 1.000 N NA
 5700308 5700309 Aflv_1454 Aflv_1455 dfrA thyB TRUE 0.933 14.000 0.295 1.000 N NA
 5700309 5700310 Aflv_1455 Aflv_1456 thyB tatC FALSE 0.147 118.000 0.000 NA N NA
 5700310 5700311 Aflv_1456 Aflv_1457 tatC tatA TRUE 0.649 73.000 0.500 NA   NA
 5700313 5700314 Aflv_1459 Aflv_1460 gltT   FALSE 0.003 190.000 0.000 NA   NA
 5700316 5700317 Aflv_1462 Aflv_1463     FALSE 0.545 41.000 0.081 NA   NA
 5700318 5700319 Aflv_1464 Aflv_1465 metA mdr TRUE 0.614 28.000 0.000 1.000 N NA
 5700319 5700320 Aflv_1465 Aflv_1466 mdr padR TRUE 0.899 2.000 0.182 NA N NA
 5700323 5700324 Aflv_1469 Aflv_1470     FALSE 0.033 60.000 0.000 NA   NA
 5700325 5700326 Aflv_1471 Aflv_1472   tlpA FALSE 0.080 63.000 0.000 1.000   NA
 5700329 5700330 Aflv_1475 Aflv_1476   fruA FALSE 0.141 130.000 0.000 1.000 N NA
 5700330 5700331 Aflv_1476 Aflv_1477 fruA fruK TRUE 0.991 -9.000 0.816 1.000 Y NA
 5700331 5700332 Aflv_1477 Aflv_1478 fruK fruR TRUE 0.990 -3.000 0.721 1.000 Y NA
 5700332 5700333 Aflv_1478 Aflv_1479 fruR   FALSE 0.173 146.000 0.016 1.000 N NA
 5700333 5700334 Aflv_1479 Aflv_1480     FALSE 0.090 187.000 0.154 NA   NA
 5700334 5700335 Aflv_1480 Aflv_1481   glpK FALSE 0.002 252.000 0.000 NA   NA
 5700335 5700336 Aflv_1481 Aflv_1482 glpK glpP FALSE 0.255 95.000 0.000 1.000 N NA
 5700336 5700337 Aflv_1482 Aflv_1483 glpP   FALSE 0.170 -3.000 0.000 NA   NA
 5700337 5700338 Aflv_1483 Aflv_1484     FALSE 0.012 118.000 0.000 NA   NA
 5700339 5700340 Aflv_1485 Aflv_1486 cspD   FALSE 0.530 110.000 0.619 NA   NA
 5700342 5700343 Aflv_1488 Aflv_1489     FALSE 0.032 61.000 0.000 NA   NA
 5700347 5700348 Aflv_1493 Aflv_1494 sspO   FALSE 0.034 115.000 0.000 1.000   NA
 5700350 5700351 Aflv_1496 Aflv_1497 sspP   FALSE 0.076 31.000 0.000 NA   NA
 5700352 5700353 Aflv_1498 Aflv_1499   yneI TRUE 0.933 16.000 0.375 NA N NA
 5700353 5700354 Aflv_1499 Aflv_1500 yneI ccdA TRUE 0.953 12.000 0.625 1.000 N NA
 5700354 5700355 Aflv_1500 Aflv_1501 ccdA   FALSE 0.022 87.000 0.000 NA   NA
 5700355 5700356 Aflv_1501 Aflv_1502   tkt FALSE 0.011 120.000 0.000 NA   NA
 5700356 5700357 Aflv_1502 Aflv_1503 tkt   FALSE 0.307 113.000 0.196 NA   NA
 5700357 5700358 Aflv_1503 Aflv_1504     TRUE 0.830 21.000 0.264 NA   NA
 5700358 5700359 Aflv_1504 Aflv_1505     TRUE 0.790 16.000 0.113 1.000   NA
 5700361 5700362 Aflv_1507 Aflv_1508 glnA glnR TRUE 0.838 55.000 0.481 1.000 N NA
 5700362 5700363 Aflv_1508 Aflv_1509 glnR   FALSE 0.513 101.000 0.138 1.000 N NA
 5700363 5700364 Aflv_1509 Aflv_1510     TRUE 0.739 14.000 0.065 1.000   NA
 5700366 5700367 Aflv_1512 Aflv_1513   mmgB TRUE 0.976 -3.000 0.167 NA Y NA
 5700367 5700368 Aflv_1513 Aflv_1514 mmgB mmgC FALSE 0.058 676.000 0.000 1.000 Y NA
 5700368 5700369 Aflv_1514 Aflv_1515 mmgC   TRUE 0.981 13.000 0.444 1.000 Y NA
 5700369 5700370 Aflv_1515 Aflv_1516   spoVK FALSE 0.199 128.000 0.100 1.000   NA
 5700370 5700371 Aflv_1516 Aflv_1517 spoVK   FALSE 0.150 117.000 0.037 1.000   NA
 5700371 5700372 Aflv_1517 Aflv_1518   miaA TRUE 0.727 36.000 0.192 1.000   NA
 5700372 5700373 Aflv_1518 Aflv_1519 miaA mutL FALSE 0.538 104.000 0.097 0.074 N NA
 5700373 5700374 Aflv_1519 Aflv_1520 mutL mutS TRUE 0.982 14.000 0.220 0.001 Y NA
 5700374 5700375 Aflv_1520 Aflv_1521 mutS cotE FALSE 0.212 76.000 0.027 NA   NA
 5700375 5700376 Aflv_1521 Aflv_1522 cotE   FALSE 0.255 127.000 0.209 NA   NA
 5700376 5700377 Aflv_1522 Aflv_1523     TRUE 0.633 2.000 0.041 NA   NA
 5700377 5700378 Aflv_1523 Aflv_1524     FALSE 0.267 115.000 0.004 1.000 N NA
 5700378 5700379 Aflv_1524 Aflv_1525     TRUE 0.991 -18.000 0.437 0.001 Y NA
 5700379 5700380 Aflv_1525 Aflv_1526     FALSE 0.103 203.000 0.041 1.000 N NA
 5700380 5700381 Aflv_1526 Aflv_1527   spoVS TRUE 0.646 49.000 0.247 NA   NA
 5700381 5700382 Aflv_1527 Aflv_1528 spoVS   FALSE 0.198 130.000 0.139 NA   NA
 5700382 5700383 Aflv_1528 Aflv_1529     TRUE 0.780 32.000 0.245 1.000   NA
 5700383 5700384 Aflv_1529 Aflv_1530   recA FALSE 0.033 201.000 0.018 1.000   NA
 5700384 5700385 Aflv_1530 Aflv_1531 recA   TRUE 0.807 -30.000 0.083 1.000   NA
 5700385 5700386 Aflv_1531 Aflv_1532   pgsA TRUE 0.776 23.000 0.151 1.000   NA
 5700386 5700387 Aflv_1532 Aflv_1533 pgsA ymfM TRUE 0.782 0.000 0.077 1.000   NA
 5700387 5700388 Aflv_1533 Aflv_1534 ymfM   TRUE 0.875 10.000 0.371 1.000   NA
 5700388 5700389 Aflv_1534 Aflv_1535     FALSE 0.170 184.000 0.388 NA   NA
 5700389 5700390 Aflv_1535 Aflv_1536     TRUE 0.654 60.000 0.386 NA   NA
 5700390 5700391 Aflv_1536 Aflv_1537     TRUE 0.883 7.000 0.397 1.000   NA
 5700391 5700392 Aflv_1537 Aflv_1538     TRUE 0.973 -3.000 0.872 0.003   NA
 5700392 5700393 Aflv_1538 Aflv_1539     FALSE 0.296 -64.000 0.000 1.000   NA
 5700395 5700396 Aflv_1541 Aflv_1542 topB spoIIIJ FALSE 0.469 47.000 0.000 1.000 N NA
 5700396 5700397 Aflv_1542 Aflv_1543 spoIIIJ   TRUE 0.892 -12.000 0.250 NA   NA
 5700397 5700398 Aflv_1543 Aflv_1544   tnrA FALSE 0.059 40.000 0.000 NA   NA
 5700399 5700400 Aflv_1545 Aflv_1546     TRUE 0.913 -67.000 0.500 NA   NA
 5700400 5700401 Aflv_1546 Aflv_1547     FALSE 0.001 629.000 0.000 NA   NA
 5700401 5700402 Aflv_1547 Aflv_1548     FALSE 0.146 120.000 0.057 NA   NA
 5700404 5700405 Aflv_1550 Aflv_1551     TRUE 0.861 32.000 0.000 1.000 Y NA
 5700405 5700406 Aflv_1551 Aflv_1552     TRUE 0.930 -3.000 0.062 0.036 N NA
 5700406 5700407 Aflv_1552 Aflv_1553   csgA FALSE 0.050 46.000 0.000 NA   NA
 5700408 5700409 Aflv_1554 Aflv_1555     FALSE 0.005 164.000 0.000 NA   NA
 5700409 5700410 Aflv_1555 Aflv_1556     FALSE 0.072 33.000 0.000 NA   NA
 5700410 5700411 Aflv_1556 Aflv_1557     FALSE 0.018 257.000 0.000 0.050   NA
 5700411 5700412 Aflv_1557 Aflv_1558     FALSE 0.001 472.000 0.000 NA   NA
 5700412 5700413 Aflv_1558 Aflv_1559     TRUE 0.742 13.000 0.090 NA   NA
 5700413 5700414 Aflv_1559 Aflv_1560     FALSE 0.174 -7.000 0.000 NA   NA
 5700416 5700417 Aflv_1562 Aflv_1563 mtlD mtlA TRUE 0.948 2.000 0.043 1.000 Y NA
 5700417 5700418 Aflv_1563 Aflv_1564 mtlA mtlR TRUE 0.935 1.000 0.115 0.002 N NA
 5700418 5700419 Aflv_1564 Aflv_1565 mtlR   FALSE 0.071 172.000 0.000 1.000 N NA
 5700419 5700420 Aflv_1565 Aflv_1566   mtlA TRUE 0.788 -7.000 0.000 1.000 N NA
 5700422 5700423 Aflv_1568 Aflv_1569   kipR FALSE 0.029 67.000 0.000 NA   NA
 5700423 5700424 Aflv_1569 Aflv_1570 kipR   FALSE 0.537 39.000 0.000 1.000 N NA
 5700424 5700425 Aflv_1570 Aflv_1571     FALSE 0.024 131.000 0.000 1.000   NA
 5700425 5700426 Aflv_1571 Aflv_1572     TRUE 0.777 12.000 0.154 NA   NA
 5700426 5700427 Aflv_1572 Aflv_1573     TRUE 0.748 -88.000 0.086 NA   NA
 5700428 5700429 Aflv_1574 Aflv_1575     TRUE 0.941 -19.000 0.549 1.000   NA
 5700431 5700432 Aflv_1577 Aflv_1578     FALSE 0.131 125.000 0.000 NA N NA
 5700432 5700433 Aflv_1578 Aflv_1579     FALSE 0.094 24.000 0.000 NA   NA
 5700433 5700434 Aflv_1579 Aflv_1580     FALSE 0.110 12.000 0.000 NA   NA
 5700435 5700436 Aflv_1581 Aflv_1582     FALSE 0.136 132.000 0.000 1.000 N NA
 5700436 5700437 Aflv_1582 Aflv_1583     FALSE 0.035 56.000 0.000 NA   NA
 5700437 5700438 Aflv_1583 Aflv_1584     FALSE 0.115 17.000 0.000 NA   NA
 5700438 5700439 Aflv_1584 Aflv_1585     FALSE 0.004 173.000 0.000 NA   NA
 5700439 5700440 Aflv_1585 Aflv_1586     TRUE 0.770 -3.000 0.062 NA   NA
 5700440 5700441 Aflv_1586 Aflv_1587     TRUE 0.754 -3.000 0.056 NA   NA
 5700441 5700442 Aflv_1587 Aflv_1588     FALSE 0.007 144.000 0.000 NA   NA
 5700442 5700443 Aflv_1588 Aflv_1589     FALSE 0.101 22.000 0.000 NA   NA
 5700443 5700444 Aflv_1589 Aflv_1590     TRUE 0.783 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5700444 5700445 Aflv_1590 Aflv_1591     TRUE 0.871 10.000 0.104 1.000 N NA
 5700445 5700446 Aflv_1591 Aflv_1592     TRUE 0.989 17.000 0.708 0.016 Y NA
 5700446 5700447 Aflv_1592 Aflv_1593     TRUE 0.994 -3.000 0.848 0.016 Y NA
 5700447 5700448 Aflv_1593 Aflv_1594   msmX TRUE 0.988 -28.000 0.391 0.016 Y NA
 5700448 5700449 Aflv_1594 Aflv_1595 msmX glpP TRUE 0.950 -3.000 0.262 1.000 N NA
 5700449 5700450 Aflv_1595 Aflv_1596 glpP   FALSE 0.046 210.000 0.000 1.000 N NA
 5700450 5700451 Aflv_1596 Aflv_1597     TRUE 0.990 12.000 0.791 0.001 Y NA
 5700453 5700454 Aflv_1599 Aflv_1600 sspH   FALSE 0.113 3.000 0.000 NA   NA
 5700456 5700457 Aflv_1602 Aflv_1603     TRUE 0.940 -16.000 0.600 NA   NA
 5700458 5700459 Aflv_1604 Aflv_1605 dhaS   FALSE 0.448 43.000 0.049 NA   NA
 5700459 5700460 Aflv_1605 Aflv_1606     FALSE 0.016 101.000 0.000 NA   NA
 5700461 5700462 Aflv_1607 Aflv_1608     FALSE 0.118 16.000 0.000 NA   NA
 5700462 5700463 Aflv_1608 Aflv_1609     FALSE 0.119 2.000 0.000 NA   NA
 5700465 5700466 Aflv_1611 Aflv_1612     FALSE 0.174 -6.000 0.000 NA   NA
 5700466 5700467 Aflv_1612 Aflv_1613     FALSE 0.170 -3.000 0.000 NA   NA
 5700467 5700468 Aflv_1613 Aflv_1614     FALSE 0.003 203.000 0.000 NA   NA
 5700469 5700470 Aflv_1615 Aflv_1616     TRUE 0.921 -3.000 0.400 NA   NA
 5700471 5700472 Aflv_1617 Aflv_1618     FALSE 0.009 130.000 0.000 NA   NA
 5700472 5700473 Aflv_1618 Aflv_1619     FALSE 0.078 30.000 0.000 NA   NA
 5700473 5700474 Aflv_1619 Aflv_1620     FALSE 0.033 60.000 0.000 NA   NA
 5700476 5700477 Aflv_1622 Aflv_1623     FALSE 0.002 253.000 0.000 NA   NA
 5700477 5700478 Aflv_1623 Aflv_1624     FALSE 0.017 99.000 0.000 NA   NA
 5700478 5700479 Aflv_1624 Aflv_1625     FALSE 0.021 137.000 0.000 1.000   NA
 5700479 5700480 Aflv_1625 Aflv_1626     TRUE 0.960 -10.000 0.000 0.012 Y NA
 5700480 5700481 Aflv_1626 Aflv_1627     FALSE 0.245 10.000 0.000 1.000   NA
 5700481 5700482 Aflv_1627 Aflv_1628     FALSE 0.030 64.000 0.000 NA   NA
 5700482 5700483 Aflv_1628 Aflv_1629     FALSE 0.094 24.000 0.000 NA   NA
 5700483 5700484 Aflv_1629 Aflv_1630     FALSE 0.001 413.000 0.000 NA   NA
 5700485 5700486 Aflv_1631 Aflv_1632     FALSE 0.001 346.000 0.000 NA   NA
 5700486 5700487 Aflv_1632 Aflv_1633     FALSE 0.001 368.000 0.000 NA   NA
 5700487 5700488 Aflv_1633 Aflv_1634     TRUE 0.726 81.000 0.000 0.043 Y NA
 5700489 5700490 Aflv_1635 Aflv_1636     FALSE 0.002 229.000 0.000 NA   NA
 5700490 5700491 Aflv_1636 Aflv_1637     FALSE 0.024 83.000 0.000 NA   NA
 5700491 5700492 Aflv_1637 Aflv_1638     FALSE 0.003 188.000 0.000 NA   NA
 5700492 5700493 Aflv_1638 Aflv_1639     FALSE 0.010 651.000 0.000 0.006   NA
 5700493 5700494 Aflv_1639 Aflv_1640     FALSE 0.527 36.000 0.060 NA   NA
 5700494 5700495 Aflv_1640 Aflv_1641     FALSE 0.170 -13.000 0.000 NA   NA
 5700495 5700496 Aflv_1641 Aflv_1642     FALSE 0.004 172.000 0.000 NA   NA
 5700496 5700497 Aflv_1642 Aflv_1643     FALSE 0.002 309.000 0.000 NA   NA
 5700497 5700498 Aflv_1643 Aflv_1644     FALSE 0.001 407.000 0.000 NA   NA
 5700498 5700499 Aflv_1644 Aflv_1645     TRUE 0.898 18.000 0.000 NA Y NA
 5700499 5700500 Aflv_1645 Aflv_1646     FALSE 0.001 1628.000 0.000 NA   NA
 5700500 5700501 Aflv_1646 Aflv_1648     FALSE 0.074 32.000 0.000 NA   NA
 5700501 5700502 Aflv_1648 Aflv_1649     FALSE 0.054 44.000 0.000 NA   NA
 5700505 5700506 Aflv_1652 Aflv_1653     FALSE 0.014 497.000 0.000 NA N NA
 5700507 5700508 Aflv_1654 Aflv_1655     FALSE 0.002 255.000 0.000 NA   NA
 5700512 5700513 Aflv_1659 Aflv_1660     FALSE 0.110 12.000 0.000 NA   NA
 5700513 5700514 Aflv_1660 Aflv_1661     FALSE 0.240 90.000 0.000 NA N NA
 5700514 5700515 Aflv_1661 Aflv_1662     FALSE 0.002 542.000 0.000 1.000   NA
 5700515 5700516 Aflv_1662 Aflv_1663     FALSE 0.219 83.000 0.000 0.009   NA
 5700518 5700519 Aflv_1665 Aflv_1666     FALSE 0.054 44.000 0.000 NA   NA
 5700519 5700520 Aflv_1666 Aflv_1667     FALSE 0.022 87.000 0.000 NA   NA
 5700520 5700521 Aflv_1667 Aflv_1669     FALSE 0.174 -7.000 0.000 NA   NA
 5700521 5700522 Aflv_1669 Aflv_1670     FALSE 0.007 141.000 0.000 NA   NA
 5700522 5700523 Aflv_1670 Aflv_1671     FALSE 0.002 287.000 0.000 NA   NA
 5700523 5700524 Aflv_1671 Aflv_1672     FALSE 0.002 527.000 0.000 1.000   NA
 5700524 5700525 Aflv_1672 Aflv_1673     TRUE 0.953 1.000 0.720 0.016   NA
 5700525 5700526 Aflv_1673 Aflv_1674     TRUE 0.933 -3.000 0.438 1.000   NA
 5700526 5700527 Aflv_1674 Aflv_1675     FALSE 0.155 121.000 0.048 1.000   NA
 5700527 5700528 Aflv_1675 Aflv_1676     FALSE 0.258 109.000 0.087 1.000   NA
 5700528 5700529 Aflv_1676 Aflv_1677   spoIIIE FALSE 0.150 203.000 0.115 1.000 N NA
 5700529 5700530 Aflv_1677 Aflv_1678 spoIIIE   TRUE 0.723 -28.000 0.052 NA   NA
 5700530 5700531 Aflv_1678 Aflv_1679   tepA FALSE 0.170 -3.000 0.000 NA   NA
 5700531 5700532 Aflv_1679 Aflv_1680 tepA   FALSE 0.037 111.000 0.000 1.000   NA
 5700532 5700533 Aflv_1680 Aflv_1681   dapA FALSE 0.370 82.000 0.083 1.000   NA
 5700533 5700534 Aflv_1681 Aflv_1682 dapA dapG TRUE 0.950 13.000 0.045 1.000 Y NA
 5700534 5700535 Aflv_1682 Aflv_1683 dapG asd TRUE 0.956 14.000 0.065 1.000 Y NA
 5700535 5700536 Aflv_1683 Aflv_1684 asd spoVFB FALSE 0.422 43.000 0.025 1.000   NA
 5700536 5700537 Aflv_1684 Aflv_1685 spoVFB spoVFA TRUE 0.935 -3.000 0.450 1.000   NA
 5700537 5700538 Aflv_1685 Aflv_1686 spoVFA   FALSE 0.488 91.000 0.292 NA   NA
 5700538 5700539 Aflv_1686 Aflv_1687   mlpA FALSE 0.441 59.000 0.104 NA   NA
 5700539 5700540 Aflv_1687 Aflv_1688 mlpA   TRUE 0.860 -7.000 0.127 1.000   NA
 5700540 5700541 Aflv_1688 Aflv_1689   pnpA TRUE 0.839 3.000 0.048 1.000 N NA
 5700541 5700542 Aflv_1689 Aflv_1690 pnpA rpsO TRUE 0.816 110.000 0.335 1.000 Y NA
 5700542 5700543 Aflv_1690 Aflv_1691 rpsO ribC TRUE 0.599 83.000 0.119 1.000 N NA
 5700543 5700544 Aflv_1691 Aflv_1692 ribC truB TRUE 0.937 1.000 0.308 1.000 N NA
 5700544 5700545 Aflv_1692 Aflv_1693 truB rbfA TRUE 0.968 0.000 0.111 1.000 Y NA
 5700545 5700546 Aflv_1693 Aflv_1694 rbfA   TRUE 0.835 -9.000 0.113 NA   NA
 5700546 5700547 Aflv_1694 Aflv_1695   infB TRUE 0.821 -3.000 0.102 NA   NA
 5700547 5700548 Aflv_1695 Aflv_1696 infB   TRUE 0.965 19.000 0.223 NA Y NA
 5700548 5700549 Aflv_1696 Aflv_1697     TRUE 0.958 -10.000 0.408 NA N NA
 5700549 5700550 Aflv_1697 Aflv_1698   nusA TRUE 0.980 -31.000 0.323 NA Y NA
 5700550 5700551 Aflv_1698 Aflv_1699 nusA   TRUE 0.891 28.000 0.759 NA   NA
 5700551 5700552 Aflv_1699 Aflv_1700   polC TRUE 0.670 17.000 0.059 NA   NA
 5700552 5700553 Aflv_1700 Aflv_1701 polC proS TRUE 0.626 84.000 0.070 0.033 N NA
 5700553 5700554 Aflv_1701 Aflv_1702 proS   TRUE 0.877 17.000 0.095 1.000 N NA
 5700554 5700555 Aflv_1702 Aflv_1703   dxr TRUE 0.950 4.000 0.568 1.000 N NA
 5700555 5700556 Aflv_1703 Aflv_1704 dxr cdsA TRUE 0.950 7.000 0.071 1.000 Y NA
 5700556 5700557 Aflv_1704 Aflv_1705 cdsA uppS TRUE 0.957 7.000 0.113 1.000 Y NA
 5700557 5700558 Aflv_1705 Aflv_1706 uppS frr TRUE 0.708 94.000 0.409 1.000 N NA
 5700558 5700559 Aflv_1706 Aflv_1707 frr pyrH TRUE 0.957 2.000 0.626 1.000 N NA
 5700559 5700560 Aflv_1707 Aflv_1708 pyrH tsf TRUE 0.795 63.000 0.416 1.000 N NA
 5700560 5700561 Aflv_1708 Aflv_1709 tsf rpsB TRUE 0.851 119.000 0.748 1.000 Y NA
 5700561 5700562 Aflv_1709 Aflv_1710 rpsB   FALSE 0.056 140.000 0.012 NA   NA
 5700562 5700563 Aflv_1710 Aflv_1711     FALSE 0.167 -16.000 0.000 NA   NA
 5700563 5700564 Aflv_1711 Aflv_1712   sigD FALSE 0.167 -16.000 0.000 NA   NA
 5700564 5700565 Aflv_1712 Aflv_1713 sigD   FALSE 0.437 33.000 0.025 NA   NA
 5700565 5700566 Aflv_1713 Aflv_1714   cheD TRUE 0.673 0.000 0.042 NA   NA
 5700566 5700567 Aflv_1714 Aflv_1715 cheD cheC TRUE 0.988 -19.000 0.606 NA Y NA
 5700567 5700568 Aflv_1715 Aflv_1716 cheC cheW TRUE 0.960 8.000 0.180 NA Y NA
 5700568 5700569 Aflv_1716 Aflv_1717 cheW cheA TRUE 0.969 26.000 0.184 0.008 Y NA
 5700569 5700570 Aflv_1717 Aflv_1718 cheA cheB TRUE 0.990 -3.000 0.390 0.008 Y NA
 5700570 5700571 Aflv_1718 Aflv_1719 cheB   TRUE 0.902 13.000 0.153 1.000 N NA
 5700571 5700572 Aflv_1719 Aflv_1720   flhF TRUE 0.960 -3.000 0.382 1.000 N NA
 5700572 5700573 Aflv_1720 Aflv_1721 flhF flhA TRUE 0.987 -3.000 0.440 1.000 Y NA
 5700573 5700574 Aflv_1721 Aflv_1722 flhA flhB TRUE 0.966 31.000 0.203 0.004 Y NA
 5700574 5700575 Aflv_1722 Aflv_1723 flhB fliR TRUE 0.986 2.000 0.750 1.000 Y NA
 5700575 5700576 Aflv_1723 Aflv_1724 fliR fliQ TRUE 0.994 -3.000 0.817 0.002 Y NA
 5700576 5700577 Aflv_1724 Aflv_1725 fliQ fliP TRUE 0.976 6.000 0.206 0.004 Y NA
 5700577 5700578 Aflv_1725 Aflv_1726 fliP fliZ TRUE 0.986 -7.000 0.386 1.000 Y NA
 5700578 5700579 Aflv_1726 Aflv_1727 fliZ cheY TRUE 0.887 13.000 0.101 1.000 N NA
 5700579 5700580 Aflv_1727 Aflv_1728 cheY fliY TRUE 0.965 20.000 0.203 1.000 Y NA
 5700580 5700581 Aflv_1728 Aflv_1729 fliY fliM TRUE 0.993 -10.000 0.508 0.001 Y NA
 5700581 5700582 Aflv_1729 Aflv_1730 fliM fliL TRUE 0.982 23.000 0.323 0.001 Y NA
 5700582 5700583 Aflv_1730 Aflv_1731 fliL   TRUE 0.970 -31.000 0.149 NA Y NA
 5700583 5700584 Aflv_1731 Aflv_1732     TRUE 0.956 45.000 0.545 NA Y NA
 5700584 5700585 Aflv_1732 Aflv_1733     FALSE 0.415 77.000 0.150 NA   NA
 5700585 5700586 Aflv_1733 Aflv_1734     TRUE 0.766 14.000 0.105 NA   NA
 5700586 5700587 Aflv_1734 Aflv_1735   fliK TRUE 0.905 -13.000 0.304 NA   NA
 5700587 5700588 Aflv_1735 Aflv_1736 fliK   TRUE 0.907 -3.000 0.267 1.000   NA
 5700588 5700589 Aflv_1736 Aflv_1737   fliJ TRUE 0.755 4.000 0.095 1.000   NA
 5700589 5700590 Aflv_1737 Aflv_1738 fliJ fliI TRUE 0.968 8.000 0.241 1.000 Y NA
 5700590 5700591 Aflv_1738 Aflv_1739 fliI fliH TRUE 0.977 -3.000 0.152 1.000 Y NA
 5700591 5700592 Aflv_1739 Aflv_1740 fliH fliG TRUE 0.953 -79.000 0.048 1.000 Y NA
 5700592 5700593 Aflv_1740 Aflv_1741 fliG fliF TRUE 0.991 -13.000 0.477 0.004 Y NA
 5700593 5700594 Aflv_1741 Aflv_1742 fliF fliE TRUE 0.967 27.000 0.164 0.004 Y NA
 5700594 5700595 Aflv_1742 Aflv_1743 fliE flgC TRUE 0.977 13.000 0.156 0.003 Y NA
 5700595 5700596 Aflv_1743 Aflv_1744 flgC flgB TRUE 0.990 4.000 0.804 0.003 Y NA
 5700596 5700597 Aflv_1744 Aflv_1745 flgB codY FALSE 0.194 147.000 0.037 1.000 N NA
 5700597 5700598 Aflv_1745 Aflv_1746 codY clpY TRUE 0.896 13.000 0.131 1.000 N NA
 5700598 5700599 Aflv_1746 Aflv_1747 clpY clpQ TRUE 0.990 -16.000 0.752 1.000 Y NA
 5700599 5700600 Aflv_1747 Aflv_1748 clpQ codV TRUE 0.876 9.000 0.113 1.000 N NA
 5700600 5700601 Aflv_1748 Aflv_1749 codV gid TRUE 0.656 61.000 0.105 1.000 N NA
 5700601 5700602 Aflv_1749 Aflv_1750 gid topA TRUE 0.770 46.000 0.137 1.000 N NA
 5700602 5700603 Aflv_1750 Aflv_1751 topA   TRUE 0.796 105.000 0.238 1.000 Y NA
 5700603 5700604 Aflv_1751 Aflv_1752   sucD FALSE 0.548 62.000 0.037 1.000 N NA
 5700604 5700605 Aflv_1752 Aflv_1753 sucD sucC TRUE 0.976 20.000 0.173 0.001 Y NA
 5700605 5700606 Aflv_1753 Aflv_1754 sucC   FALSE 0.276 77.000 0.038 1.000   NA
 5700606 5700607 Aflv_1754 Aflv_1755     TRUE 0.832 -3.000 0.115 NA   NA
 5700607 5700608 Aflv_1755 Aflv_1756   rnhB FALSE 0.538 2.000 0.016 NA   NA
 5700608 5700609 Aflv_1756 Aflv_1757 rnhB   FALSE 0.527 58.000 0.148 1.000   NA
 5700609 5700610 Aflv_1757 Aflv_1758     TRUE 0.693 16.000 0.049 1.000   NA
 5700610 5700611 Aflv_1758 Aflv_1759   rplS FALSE 0.463 73.000 0.020 1.000 N NA
 5700611 5700612 Aflv_1759 Aflv_1760 rplS trmD TRUE 0.892 96.000 0.567 1.000 Y NA
 5700612 5700613 Aflv_1760 Aflv_1761 trmD rimM TRUE 0.990 -3.000 0.672 1.000 Y NA
 5700613 5700614 Aflv_1761 Aflv_1762 rimM   TRUE 0.723 -3.000 0.041 NA   NA
 5700614 5700615 Aflv_1762 Aflv_1763     FALSE 0.417 50.000 0.061 NA   NA
 5700615 5700616 Aflv_1763 Aflv_1764   rpsP TRUE 0.884 4.000 0.385 1.000   NA
 5700616 5700617 Aflv_1764 Aflv_1765 rpsP ffh TRUE 0.678 96.000 0.361 1.000 N NA
 5700617 5700618 Aflv_1765 Aflv_1766 ffh   TRUE 0.815 13.000 0.151 1.000   NA
 5700618 5700619 Aflv_1766 Aflv_1767   ftsY FALSE 0.383 72.000 0.081 1.000   NA
 5700619 5700620 Aflv_1767 Aflv_1768 ftsY smc TRUE 0.924 7.000 0.165 0.011 N NA
 5700620 5700621 Aflv_1768 Aflv_1769 smc   FALSE 0.103 137.000 0.000 NA N NA
 5700621 5700622 Aflv_1769 Aflv_1770   rnc FALSE 0.092 144.000 0.000 NA N NA
 5700622 5700623 Aflv_1770 Aflv_1771 rnc acpA TRUE 0.569 70.000 0.068 1.000 N NA
 5700623 5700624 Aflv_1771 Aflv_1772 acpA fabG TRUE 0.922 50.000 0.100 0.004 Y NA
 5700624 5700625 Aflv_1772 Aflv_1773 fabG fabD TRUE 0.974 4.000 0.149 0.004 Y NA
 5700625 5700626 Aflv_1773 Aflv_1774 fabD plsX TRUE 0.970 9.000 0.106 0.004 Y NA
 5700626 5700627 Aflv_1774 Aflv_1775 plsX   TRUE 0.883 -3.000 0.035 1.000 N NA
 5700627 5700628 Aflv_1775 Aflv_1776   recG TRUE 0.911 4.000 0.225 1.000 N NA
 5700628 5700629 Aflv_1776 Aflv_1777 recG sdaAA TRUE 0.889 -7.000 0.039 1.000 N NA
 5700629 5700630 Aflv_1777 Aflv_1778 sdaAA sdaAB TRUE 0.982 24.000 0.353 0.001 Y NA
 5700630 5700631 Aflv_1778 Aflv_1779 sdaAB   TRUE 0.655 10.000 0.045 1.000   NA
 5700631 5700632 Aflv_1779 Aflv_1780     TRUE 0.905 18.000 0.567 NA   NA
 5700634 5700635 Aflv_1782 Aflv_1783 spoVM   FALSE 0.319 50.000 0.028 NA   NA
 5700635 5700636 Aflv_1783 Aflv_1784   rpe TRUE 0.887 22.000 0.166 1.000 N NA
 5700636 5700637 Aflv_1784 Aflv_1785 rpe   TRUE 0.837 3.000 0.213 1.000   NA
 5700637 5700638 Aflv_1785 Aflv_1786   prkC TRUE 0.846 -94.000 0.196 1.000   NA
 5700638 5700639 Aflv_1786 Aflv_1787 prkC prpC TRUE 0.983 7.000 0.704 1.000 Y NA
 5700639 5700640 Aflv_1787 Aflv_1788 prpC   FALSE 0.480 59.000 0.105 1.000   NA
 5700640 5700641 Aflv_1788 Aflv_1789     TRUE 0.860 -3.000 0.135 1.000   NA
 5700641 5700642 Aflv_1789 Aflv_1790   fmt TRUE 0.984 -7.000 0.305 1.000 Y NA
 5700642 5700643 Aflv_1790 Aflv_1791 fmt def TRUE 0.973 -3.000 0.031 0.020 Y NA
 5700643 5700644 Aflv_1791 Aflv_1792 def priA TRUE 0.715 36.000 0.029 1.000 N NA
 5700644 5700645 Aflv_1792 Aflv_1793 priA   TRUE 0.919 -3.000 0.099 1.000 N NA
 5700645 5700646 Aflv_1793 Aflv_1794     TRUE 0.678 70.000 0.192 1.000 N NA
 5700646 5700647 Aflv_1794 Aflv_1795     TRUE 0.966 -7.000 0.471 1.000 N NA
 5700647 5700648 Aflv_1795 Aflv_1796     TRUE 0.782 31.000 0.276 NA   NA
 5700648 5700649 Aflv_1796 Aflv_1797     FALSE 0.156 104.000 0.037 NA   NA
 5700651 5700652 Aflv_1799 Aflv_1800 pyrE pyrF TRUE 0.975 -18.000 0.133 1.000 Y NA
 5700652 5700653 Aflv_1800 Aflv_1801 pyrF pyrD TRUE 0.980 -73.000 0.154 0.001 Y NA
 5700653 5700654 Aflv_1801 Aflv_1802 pyrD pyrK TRUE 0.970 -3.000 0.592 1.000 N NA
 5700654 5700655 Aflv_1802 Aflv_1803 pyrK pyrAB TRUE 0.930 -3.000 0.147 1.000 N NA
 5700655 5700656 Aflv_1803 Aflv_1804 pyrAB pyrAA TRUE 0.981 -40.000 0.117 0.001 Y NA
 5700656 5700657 Aflv_1804 Aflv_1805 pyrAA pyrC TRUE 0.970 -60.000 0.155 1.000 Y NA
 5700657 5700658 Aflv_1805 Aflv_1806 pyrC pyrB TRUE 0.985 -34.000 0.452 1.000 Y NA
 5700658 5700659 Aflv_1806 Aflv_1807 pyrB pyrP FALSE 0.522 143.000 0.064 1.000 Y NA
 5700659 5700660 Aflv_1807 Aflv_1808 pyrP pyrR TRUE 0.682 122.000 0.140 1.000 Y NA
 5700660 5700661 Aflv_1808 Aflv_1809 pyrR   FALSE 0.242 137.000 0.048 1.000 N NA
 5700661 5700662 Aflv_1809 Aflv_1810   lspA TRUE 0.860 -25.000 0.022 1.000 N NA
 5700662 5700663 Aflv_1810 Aflv_1811 lspA   FALSE 0.023 309.000 0.000 NA N NA
 5700663 5700664 Aflv_1811 Aflv_1812   ileS FALSE 0.147 118.000 0.000 NA N NA
 5700664 5700665 Aflv_1812 Aflv_1813 ileS divIVA FALSE 0.041 307.000 0.012 NA N NA
 5700665 5700666 Aflv_1813 Aflv_1814 divIVA   TRUE 0.782 49.000 0.579 NA   NA
 5700666 5700667 Aflv_1814 Aflv_1815     TRUE 0.829 0.000 0.138 1.000   NA
 5700667 5700668 Aflv_1815 Aflv_1816     TRUE 0.857 -6.000 0.158 NA   NA
 5700668 5700669 Aflv_1816 Aflv_1817     TRUE 0.871 -3.000 0.194 NA   NA
 5700669 5700670 Aflv_1817 Aflv_1818     TRUE 0.762 -16.000 0.061 NA   NA
 5700670 5700671 Aflv_1818 Aflv_1819     FALSE 0.437 40.000 0.039 NA   NA
 5700671 5700672 Aflv_1819 Aflv_1820   sigG FALSE 0.399 105.000 0.276 NA   NA
 5700672 5700673 Aflv_1820 Aflv_1821 sigG sigE TRUE 0.952 66.000 0.602 0.004 Y NA
 5700673 5700674 Aflv_1821 Aflv_1822 sigE spoIIGA TRUE 0.838 49.000 0.856 1.000   NA
 5700674 5700675 Aflv_1822 Aflv_1823 spoIIGA ftsZ TRUE 0.661 -55.000 0.024 1.000   NA
 5700675 5700676 Aflv_1823 Aflv_1824 ftsZ ftsA TRUE 0.978 9.000 0.460 1.000 Y NA
 5700676 5700677 Aflv_1824 Aflv_1825 ftsA sbp FALSE 0.289 81.000 0.062 NA   NA
 5700677 5700678 Aflv_1825 Aflv_1826 sbp   TRUE 0.857 -3.000 0.165 NA   NA
 5700678 5700679 Aflv_1826 Aflv_1827     TRUE 0.908 11.000 0.667 NA   NA
 5700679 5700680 Aflv_1827 Aflv_1828   divIB TRUE 0.615 -37.000 0.022 NA   NA
 5700680 5700681 Aflv_1828 Aflv_1829 divIB murB TRUE 0.565 131.000 0.070 NA Y NA
 5700681 5700682 Aflv_1829 Aflv_1830 murB murG TRUE 0.901 41.000 0.061 1.000 Y NA
 5700682 5700683 Aflv_1830 Aflv_1831 murG spoVE TRUE 0.773 57.000 0.120 0.005 N NA
 5700683 5700684 Aflv_1831 Aflv_1832 spoVE murD TRUE 0.910 18.000 0.067 0.002 N NA
 5700684 5700685 Aflv_1832 Aflv_1833 murD mraY TRUE 0.993 -9.000 0.647 0.004 Y NA
 5700685 5700686 Aflv_1833 Aflv_1834 mraY murE TRUE 0.950 24.000 0.025 0.004 Y NA
 5700686 5700687 Aflv_1834 Aflv_1835 murE spoVD TRUE 0.863 69.000 0.181 1.000 Y NA
 5700687 5700688 Aflv_1835 Aflv_1836 spoVD pbpB TRUE 0.832 108.000 0.157 0.001 Y NA
 5700688 5700689 Aflv_1836 Aflv_1837 pbpB ftsL TRUE 0.925 7.000 0.316 1.000 N NA
 5700689 5700690 Aflv_1837 Aflv_1838 ftsL   TRUE 0.871 16.000 0.077 1.000 N NA
 5700690 5700691 Aflv_1838 Aflv_1839     FALSE 0.046 144.000 0.003 NA   NA
 5700691 5700692 Aflv_1839 Aflv_1840     TRUE 0.721 20.000 0.099 NA   NA
 5700692 5700693 Aflv_1840 Aflv_1841     TRUE 0.811 -3.000 0.091 NA   NA
 5700693 5700694 Aflv_1841 Aflv_1842     FALSE 0.073 69.000 0.000 1.000   NA
 5700694 5700695 Aflv_1842 Aflv_1843     FALSE 0.084 61.000 0.000 1.000   NA
 5700695 5700696 Aflv_1843 Aflv_1844   rpmF TRUE 0.766 23.000 0.010 1.000 N NA
 5700696 5700697 Aflv_1844 Aflv_1845 rpmF   TRUE 0.748 55.000 0.599 NA   NA
 5700699 5700700 Aflv_1847 Aflv_1848     TRUE 0.837 -3.000 0.095 1.000   NA
 5700702 5700703 Aflv_1850 Aflv_1851     TRUE 0.928 3.000 0.367 NA N NA
 5700703 5700704 Aflv_1851 Aflv_1852     FALSE 0.013 264.000 0.003 NA   NA
 5700706 5700707 Aflv_1854 Aflv_1855     TRUE 0.931 -21.000 0.500 NA   NA
 5700707 5700708 Aflv_1855 Aflv_1856     TRUE 0.689 27.000 0.110 NA   NA
 5700708 5700709 Aflv_1856 Aflv_1857     TRUE 0.814 36.000 0.440 NA   NA
 5700709 5700710 Aflv_1857 Aflv_1858     TRUE 0.922 9.000 0.852 NA   NA
 5700710 5700711 Aflv_1858 Aflv_1859     TRUE 0.567 66.000 0.276 NA   NA
 5700711 5700712 Aflv_1859 Aflv_1860     FALSE 0.313 102.000 0.155 NA   NA
 5700713 5700714 Aflv_1861 Aflv_1862     FALSE 0.034 254.000 0.062 NA   NA
 5700715 5700716 Aflv_1863 Aflv_1864   ctaG TRUE 0.869 22.000 0.415 NA   NA
 5700716 5700717 Aflv_1864 Aflv_1865 ctaG ctaF TRUE 0.689 78.000 0.707 NA   NA
 5700717 5700718 Aflv_1865 Aflv_1866 ctaF ctaE TRUE 0.991 5.000 0.950 0.003 Y NA
 5700718 5700719 Aflv_1866 Aflv_1867 ctaE ctaD TRUE 0.993 0.000 0.925 0.003 Y NA
 5700719 5700720 Aflv_1867 Aflv_1868 ctaD ctaC TRUE 0.985 30.000 0.755 0.002 Y NA
 5700720 5700721 Aflv_1868 Aflv_1869 ctaC ctaB FALSE 0.461 119.000 0.084 0.035 N NA
 5700723 5700724 Aflv_1871 Aflv_1872 pycA ftsW TRUE 0.556 64.000 0.046 1.000 N NA
 5700724 5700725 Aflv_1872 Aflv_1873 ftsW   FALSE 0.546 75.000 0.300 NA   NA
 5700731 5700732 Aflv_1879 Aflv_1880     TRUE 0.924 -3.000 0.429 NA   NA
 5700732 5700733 Aflv_1880 Aflv_1881   bipA TRUE 0.608 13.000 0.032 NA   NA
 5700733 5700734 Aflv_1881 Aflv_1882 bipA   FALSE 0.022 360.000 0.000 1.000 N NA
 5700734 5700735 Aflv_1882 Aflv_1883     FALSE 0.526 51.000 0.132 NA   NA
 5700735 5700736 Aflv_1883 Aflv_1884     FALSE 0.025 80.000 0.000 NA   NA
 5700736 5700737 Aflv_1884 Aflv_1885     TRUE 0.830 -12.000 0.108 NA   NA
 5700739 5700740 Aflv_1887 Aflv_1888     FALSE 0.091 25.000 0.000 NA   NA
 5700742 5700743 Aflv_1890 Aflv_1891   pdhD FALSE 0.106 7.000 0.000 NA   NA
 5700743 5700744 Aflv_1891 Aflv_1892 pdhD pdhC TRUE 0.986 5.000 0.948 1.000 Y NA
 5700744 5700745 Aflv_1892 Aflv_1893 pdhC pdhB TRUE 0.979 40.000 0.883 0.035 Y NA
 5700745 5700746 Aflv_1893 Aflv_1894 pdhB pdhA TRUE 0.987 4.000 0.484 0.001 Y NA
 5700749 5700750 Aflv_1897 Aflv_1898     FALSE 0.004 180.000 0.000 NA   NA
 5700750 5700751 Aflv_1898 Aflv_1899     TRUE 0.940 -3.000 0.576 NA   NA
 5700751 5700752 Aflv_1899 Aflv_1900     FALSE 0.001 371.000 0.000 NA   NA
 5700753 5700754 Aflv_1901 Aflv_1902     TRUE 0.711 0.000 0.041 1.000   NA
 5700754 5700755 Aflv_1902 Aflv_1903     FALSE 0.361 -3.000 0.000 1.000   NA
 5700755 5700756 Aflv_1903 Aflv_1904     TRUE 0.880 4.000 0.372 1.000   NA
 5700756 5700757 Aflv_1904 Aflv_1905     FALSE 0.242 63.000 0.025 NA   NA
 5700757 5700758 Aflv_1905 Aflv_1906     FALSE 0.223 61.000 0.017 NA   NA
 5700758 5700759 Aflv_1906 Aflv_1907     FALSE 0.025 76.000 0.000 NA   NA
 5700759 5700760 Aflv_1907 Aflv_1908     TRUE 0.650 40.000 0.167 NA   NA
 5700760 5700761 Aflv_1908 Aflv_1909     FALSE 0.370 100.000 0.043 NA N NA
 5700763 5700764 Aflv_1911 Aflv_1912     TRUE 0.982 -3.000 0.160 0.049 Y NA
 5700764 5700765 Aflv_1912 Aflv_1913     TRUE 0.687 12.000 0.000 1.000 N NA
 5700765 5700766 Aflv_1913 Aflv_1914     TRUE 0.964 -3.000 0.056 NA Y NA
 5700768 5700769 Aflv_1916 Aflv_1917     FALSE 0.173 34.000 0.000 1.000   NA
 5700769 5700770 Aflv_1917 Aflv_1918   gerAB TRUE 0.690 -24.000 0.000 0.005   NA
 5700772 5700773 Aflv_1920 Aflv_1921     FALSE 0.066 79.000 0.000 1.000   NA
 5700773 5700774 Aflv_1921 Aflv_1922   cheY TRUE 0.993 -16.000 0.667 0.007 Y NA
 5700774 5700775 Aflv_1922 Aflv_1923 cheY   TRUE 0.822 0.000 0.125 1.000   NA
 5700775 5700776 Aflv_1923 Aflv_1924     TRUE 0.835 -36.000 0.131 1.000   NA
 5700776 5700777 Aflv_1924 Aflv_1925     TRUE 0.747 -7.000 0.033 1.000   NA
 5700777 5700778 Aflv_1925 Aflv_1926     FALSE 0.261 3.000 0.000 1.000   NA
 5700778 5700779 Aflv_1926 Aflv_1927   cheV TRUE 0.938 17.000 0.000 0.007 Y NA
 5700779 5700780 Aflv_1927 Aflv_1928 cheV   FALSE 0.279 71.000 0.033 1.000   NA
 5700783 5700784 Aflv_1931 Aflv_1932     FALSE 0.001 330.000 0.000 NA   NA
 5700784 5700785 Aflv_1932 Aflv_1933   patA FALSE 0.013 113.000 0.000 NA   NA
 5700786 5700787 Aflv_1934 Aflv_1935   fabG TRUE 0.950 16.000 0.050 1.000 Y NA
 5700787 5700788 Aflv_1935 Aflv_1936 fabG pleD TRUE 0.632 26.000 0.000 1.000 N NA
 5700788 5700789 Aflv_1936 Aflv_1937 pleD   TRUE 0.941 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5700789 5700790 Aflv_1937 Aflv_1938   mcpC TRUE 0.596 115.000 0.000 0.009 Y NA
 5700790 5700791 Aflv_1938 Aflv_1939 mcpC ptsI FALSE 0.112 143.000 0.000 1.000 N NA
 5700791 5700792 Aflv_1939 Aflv_1940 ptsI ptsH TRUE 0.979 0.000 0.132 0.003 Y NA
 5700792 5700793 Aflv_1940 Aflv_1941 ptsH ptsG TRUE 0.823 84.000 0.031 0.003 Y NA
 5700793 5700794 Aflv_1941 Aflv_1942 ptsG glcT FALSE 0.005 266.000 0.000 1.000   NA
 5700798 5700799 Aflv_1946 Aflv_1947 mrpG mrpF TRUE 0.978 -28.000 0.220 1.000 Y NA
 5700799 5700800 Aflv_1947 Aflv_1948 mrpF mrpE TRUE 0.993 -3.000 0.829 0.035 Y NA
 5700800 5700801 Aflv_1948 Aflv_1949 mrpE mrpD TRUE 0.985 6.000 0.842 1.000 Y NA
 5700801 5700802 Aflv_1949 Aflv_1950 mrpD mrpC TRUE 0.990 -7.000 0.368 0.004 Y NA
 5700802 5700803 Aflv_1950 Aflv_1951 mrpC mrpB TRUE 0.979 0.000 0.341 NA Y NA
 5700803 5700804 Aflv_1951 Aflv_1952 mrpB mrpA TRUE 0.986 -3.000 0.439 NA Y NA
 5700804 5700805 Aflv_1952 Aflv_1953 mrpA hemAT FALSE 0.051 199.000 0.000 1.000 N NA
 5700805 5700806 Aflv_1953 Aflv_1954 hemAT   FALSE 0.127 1.000 0.000 NA   NA
 5700806 5700807 Aflv_1954 Aflv_1955     FALSE 0.105 10.000 0.000 NA   NA
 5700809 5700810 Aflv_1957 Aflv_1958     FALSE 0.034 58.000 0.000 NA   NA
 5700812 5700813 Aflv_1960 Aflv_1961     TRUE 0.770 19.000 0.150 NA   NA
 5700816 5700817 Aflv_1964 Aflv_1965     FALSE 0.022 89.000 0.000 NA   NA
 5700818 5700819 Aflv_1966 Aflv_1967     FALSE 0.014 108.000 0.000 NA   NA
 5700819 5700820 Aflv_1967 Aflv_1969     FALSE 0.108 19.000 0.000 NA   NA
 5700820 5700821 Aflv_1969 Aflv_1970     TRUE 0.942 0.000 0.307 1.000 N NA
 5700821 5700822 Aflv_1970 Aflv_1971     TRUE 0.758 -3.000 0.041 1.000   NA
 5700823 5700824 Aflv_1972 Aflv_1973 yddK   FALSE 0.019 94.000 0.000 NA   NA
 5700825 5700826 Aflv_1974 Aflv_1975     FALSE 0.001 400.000 0.000 NA   NA
 5700826 5700827 Aflv_1975 Aflv_1976     FALSE 0.104 21.000 0.000 NA   NA
 5700827 5700828 Aflv_1976 Aflv_1977     FALSE 0.388 72.000 0.108 NA   NA
 5700829 5700830 Aflv_1978 Aflv_1979     TRUE 0.904 3.000 0.543 NA   NA
 5700830 5700831 Aflv_1979 Aflv_1980     TRUE 0.970 -16.000 0.077 1.000 Y NA
 5700831 5700832 Aflv_1980 Aflv_1981     FALSE 0.390 45.000 0.000 0.008   NA
 5700832 5700833 Aflv_1981 Aflv_1982   mtbP FALSE 0.102 52.000 0.000 1.000   NA
 5700833 5700834 Aflv_1982 Aflv_1983 mtbP   TRUE 0.575 83.000 0.200 0.041   NA
 5700835 5700836 Aflv_1984 Aflv_1985 clpE   TRUE 0.588 47.000 0.000 0.039 N NA
 5700836 5700837 Aflv_1985 Aflv_1986     TRUE 0.885 -3.000 0.037 1.000 N NA
 5700837 5700838 Aflv_1986 Aflv_1987     TRUE 0.992 -3.000 0.713 0.071 Y NA
 5700838 5700839 Aflv_1987 Aflv_1988     FALSE 0.025 77.000 0.000 NA   NA
 5700840 5700841 Aflv_1989 Aflv_1990     FALSE 0.015 104.000 0.000 NA   NA
 5700841 5700842 Aflv_1990 Aflv_1991   mazF FALSE 0.004 172.000 0.000 NA   NA
 5700842 5700843 Aflv_1991 Aflv_1992 mazF kinD FALSE 0.086 391.000 0.000 1.000 Y NA
 5700843 5700844 Aflv_1992 Aflv_1993 kinD   TRUE 0.850 -3.000 0.000 0.048 N NA
 5700845 5700846 Aflv_1994 Aflv_1995     TRUE 0.769 13.000 0.087 1.000   NA
 5700846 5700847 Aflv_1995 Aflv_1996     TRUE 0.948 -3.000 0.253 1.000 N NA
 5700847 5700848 Aflv_1996 Aflv_1997     TRUE 0.971 -15.000 0.304 0.001 N NA
 5700848 5700849 Aflv_1997 Aflv_1998     FALSE 0.074 258.000 0.043 1.000 N NA
 5700850 5700851 Aflv_1999 Aflv_2000     FALSE 0.009 188.000 0.000 1.000   NA
 5700851 5700852 Aflv_2000 Aflv_2001     TRUE 0.758 8.000 0.104 1.000   NA
 5700852 5700853 Aflv_2001 Aflv_2002   rbsB TRUE 0.847 -3.000 0.015 NA N NA
 5700853 5700854 Aflv_2002 Aflv_2003 rbsB rbsA TRUE 0.985 -3.000 0.403 NA Y NA
 5700854 5700855 Aflv_2003 Aflv_2004 rbsA rbsC TRUE 0.992 -3.000 0.952 1.000 Y NA
 5700856 5700857 Aflv_2005 Aflv_2006 tlpA kinE TRUE 0.864 45.000 0.000 0.009 Y NA
 5700857 5700858 Aflv_2006 Aflv_2007 kinE   FALSE 0.073 130.000 0.000 0.071   NA
 5700858 5700859 Aflv_2007 Aflv_2008     TRUE 0.950 0.000 0.447 0.001   NA
 5700859 5700860 Aflv_2008 Aflv_2009     TRUE 0.985 12.000 0.947 NA Y NA
 5700860 5700861 Aflv_2009 Aflv_2010     FALSE 0.172 265.000 0.395 NA N NA
 5700863 5700864 Aflv_2012 Aflv_2013     FALSE 0.018 97.000 0.000 NA   NA
 5700864 5700865 Aflv_2013 Aflv_2014     FALSE 0.001 495.000 0.000 NA   NA
 5700865 5700866 Aflv_2014 Aflv_2015     FALSE 0.162 -19.000 0.000 NA   NA
 5700868 5700869 Aflv_2017 Aflv_2018     FALSE 0.170 -3.000 0.000 NA   NA
 5700869 5700870 Aflv_2018 Aflv_2019     TRUE 0.927 -3.000 0.444 NA   NA
 5700872 5700873 Aflv_2021 Aflv_2022 araQ   TRUE 0.990 13.000 0.825 0.015 Y NA
 5700873 5700874 Aflv_2022 Aflv_2023     TRUE 0.911 104.000 0.677 0.015 Y NA
 5700874 5700875 Aflv_2023 Aflv_2024   pgcM FALSE 0.095 55.000 0.000 1.000   NA
 5700875 5700876 Aflv_2024 Aflv_2025 pgcM   FALSE 0.361 -3.000 0.000 1.000   NA
 5700876 5700877 Aflv_2025 Aflv_2026   degA TRUE 0.585 32.000 0.000 1.000 N NA
 5700878 5700879 Aflv_2027 Aflv_2028 mcpB   TRUE 0.670 75.000 0.000 1.000 Y NA
 5700879 5700880 Aflv_2028 Aflv_2029     TRUE 0.623 96.000 0.247 1.000 N NA
 5700880 5700881 Aflv_2029 Aflv_2030     TRUE 0.985 -3.000 0.342 1.000 Y NA
 5700882 5700883 Aflv_2031 Aflv_2032     FALSE 0.030 64.000 0.000 NA   NA
 5700883 5700884 Aflv_2032 Aflv_2033     TRUE 0.861 32.000 0.000 1.000 Y NA
 5700884 5700885 Aflv_2033 Aflv_2034     FALSE 0.295 85.000 0.000 1.000 N NA
 5700885 5700886 Aflv_2034 Aflv_2035   kinB FALSE 0.263 93.000 0.000 1.000 N NA
 5700888 5700889 Aflv_2037 Aflv_2038     TRUE 0.728 -45.000 0.062 NA   NA
 5700889 5700890 Aflv_2038 Aflv_2039     FALSE 0.039 52.000 0.000 NA   NA
 5700891 5700892 Aflv_2040 Aflv_2041     FALSE 0.016 151.000 0.000 1.000   NA
 5700893 5700894 Aflv_2042 Aflv_2043     FALSE 0.005 162.000 0.000 NA   NA
 5700894 5700895 Aflv_2043 Aflv_2044     TRUE 0.862 -3.000 0.176 NA   NA
 5700895 5700896 Aflv_2044 Aflv_2045     FALSE 0.002 231.000 0.000 NA   NA
 5700896 5700897 Aflv_2045 Aflv_2046   ansB TRUE 0.577 33.000 0.000 1.000 N NA
 5700897 5700898 Aflv_2046 Aflv_2047 ansB ansA TRUE 0.918 1.000 0.000 1.000 Y NA
 5700900 5700901 Aflv_2049 Aflv_2050     FALSE 0.138 0.000 0.000 NA   NA
 5700902 5700903 Aflv_2051 Aflv_2052 azlC   TRUE 0.784 -10.000 0.069 NA   NA
 5700904 5700905 Aflv_2053 Aflv_2054     FALSE 0.001 675.000 0.000 NA   NA
 5700907 5700908 Aflv_2056 Aflv_2057     FALSE 0.026 72.000 0.000 NA   NA
 5700908 5700909 Aflv_2057 Aflv_2058     TRUE 0.904 36.000 0.000 0.001 Y NA
 5700909 5700910 Aflv_2058 Aflv_2059     TRUE 0.956 -3.000 0.000 0.041 Y NA
 5700911 5700912 Aflv_2060 Aflv_2061     FALSE 0.019 96.000 0.000 NA   NA
 5700912 5700913 Aflv_2061 Aflv_2062     FALSE 0.031 63.000 0.000 NA   NA
 5700913 5700914 Aflv_2062 Aflv_2063     FALSE 0.025 76.000 0.000 NA   NA
 5700915 5700916 Aflv_R093 Aflv_2064 trnV   FALSE 0.016 103.000 0.000 NA   NA
 5700918 5700919 Aflv_2066 Aflv_2067     TRUE 0.988 4.000 0.600 0.004 Y NA
 5700919 5700920 Aflv_2067 Aflv_2068     FALSE 0.026 285.000 0.000 NA N NA
 5700921 5700922 Aflv_2069 Aflv_2070   mscL FALSE 0.004 334.000 0.000 1.000   NA
 5700924 5700925 Aflv_2072 Aflv_2073     TRUE 0.853 39.000 0.287 NA N NA
 5700925 5700926 Aflv_2073 Aflv_2074     TRUE 0.827 5.000 0.213 1.000   NA
 5700926 5700927 Aflv_2074 Aflv_2075     FALSE 0.366 68.000 0.083 NA   NA
 5700927 5700928 Aflv_2075 Aflv_2076     FALSE 0.025 79.000 0.000 NA   NA
 5700928 5700929 Aflv_2076 Aflv_2077     FALSE 0.109 4.000 0.000 NA   NA
 5700930 5700931 Aflv_2078 Aflv_2079     FALSE 0.002 297.000 0.000 NA   NA
 5700932 5700933 Aflv_2080 Aflv_2081     FALSE 0.002 307.000 0.000 NA   NA
 5700934 5700935 Aflv_2082 Aflv_2083     TRUE 0.899 3.000 0.500 NA   NA
 5700935 5700936 Aflv_2083 Aflv_2084   spoVAE TRUE 0.901 7.000 0.571 NA   NA
 5700936 5700937 Aflv_2084 Aflv_2085 spoVAE spoVAD TRUE 0.940 -3.000 0.571 NA   NA
 5700937 5700938 Aflv_2085 Aflv_2086 spoVAD spoVAC TRUE 0.925 -18.000 0.444 NA   NA
 5700938 5700939 Aflv_2086 Aflv_2087 spoVAC   TRUE 0.912 13.000 0.556 NA   NA
 5700939 5700940 Aflv_2087 Aflv_2088     TRUE 0.943 -31.000 0.800 NA   NA
 5700940 5700941 Aflv_2088 Aflv_2089     TRUE 0.700 82.000 0.800 NA   NA
 5700941 5700942 Aflv_2089 Aflv_2090     FALSE 0.003 207.000 0.000 NA   NA
 5700943 5700944 Aflv_2091 Aflv_2092     TRUE 0.685 90.000 0.857 NA   NA
 5700946 5700947 Aflv_2094 Aflv_2095     FALSE 0.124 14.000 0.000 NA   NA
 5700947 5700948 Aflv_2095 Aflv_2096     TRUE 0.978 -3.000 0.167 1.000 Y NA
 5700948 5700949 Aflv_2096 Aflv_2097     TRUE 0.972 0.000 0.167 1.000 Y NA
 5700950 5700951 Aflv_2098 Aflv_2099     FALSE 0.124 14.000 0.000 NA   NA
 5700951 5700952 Aflv_2099 Aflv_2100     FALSE 0.170 -3.000 0.000 NA   NA
 5700952 5700953 Aflv_2100 Aflv_2101     FALSE 0.170 -13.000 0.000 NA   NA
 5700953 5700954 Aflv_2101 Aflv_2102     FALSE 0.167 -16.000 0.000 NA   NA
 5700957 5700958 Aflv_2105 Aflv_2106     FALSE 0.024 83.000 0.000 NA   NA
 5700959 5700960 Aflv_2107 Aflv_2108 fabI   FALSE 0.378 91.000 0.000 0.034 N NA
 5700961 5700962 Aflv_2109 Aflv_2110 rodA   FALSE 0.004 172.000 0.000 NA   NA
 5700962 5700963 Aflv_2110 Aflv_2111     FALSE 0.089 26.000 0.000 NA   NA
 5700963 5700964 Aflv_2111 Aflv_2112     FALSE 0.028 68.000 0.000 NA   NA
 5700965 5700966 Aflv_2113 Aflv_2114     TRUE 0.950 13.000 0.480 1.000 N NA
 5700966 5700967 Aflv_2114 Aflv_2115     TRUE 0.921 7.000 0.725 1.000   NA
 5700967 5700968 Aflv_2115 Aflv_2116     TRUE 0.859 13.000 0.283 NA   NA
 5700969 5700970 Aflv_2117 Aflv_2118     TRUE 0.801 12.000 0.188 NA   NA
 5700970 5700971 Aflv_2118 Aflv_2119     FALSE 0.262 57.000 0.024 NA   NA
 5700971 5700972 Aflv_2119 Aflv_2120     TRUE 0.859 -16.000 0.138 1.000   NA
 5700972 5700973 Aflv_2120 Aflv_2121     FALSE 0.005 160.000 0.000 NA   NA
 5700974 5700975 Aflv_2122 Aflv_2123     TRUE 0.833 29.000 0.398 NA   NA
 5700976 5700977 Aflv_2124 Aflv_2125   mecA FALSE 0.095 143.000 0.000 NA N NA
 5700977 5700978 Aflv_2125 Aflv_2126 mecA   TRUE 0.928 13.000 0.314 NA N NA
 5700981 5700982 Aflv_2129 Aflv_2130 oppF oppD TRUE 0.991 -3.000 0.375 0.001 Y NA
 5700982 5700983 Aflv_2130 Aflv_2131 oppD oppC TRUE 0.984 18.000 0.706 1.000 Y NA
 5700983 5700984 Aflv_2131 Aflv_2132 oppC oppB TRUE 0.979 0.000 0.165 0.015 Y NA
 5700984 5700985 Aflv_2132 Aflv_2133 oppB dppE TRUE 0.791 96.000 0.052 0.015 Y NA
 5700986 5700987 Aflv_2134 Aflv_2135   trpS FALSE 0.002 311.000 0.000 NA   NA
 5700988 5700989 Aflv_2136 Aflv_2137     TRUE 0.556 77.000 0.320 NA   NA
 5700989 5700990 Aflv_2137 Aflv_2138     FALSE 0.539 55.000 0.179 NA   NA
 5700990 5700991 Aflv_2138 Aflv_2139   fabF FALSE 0.475 72.000 0.039 NA N NA
 5700991 5700992 Aflv_2139 Aflv_2140 fabF fabHA TRUE 0.931 31.000 0.076 1.000 Y NA
 5700992 5700993 Aflv_2140 Aflv_2141 fabHA med FALSE 0.245 81.000 0.027 1.000   NA
 5700993 5700994 Aflv_2141 Aflv_2142 med   FALSE 0.032 61.000 0.000 NA   NA
 5700996 5700997 Aflv_2144 Aflv_2145 clpC   FALSE 0.153 85.000 0.009 NA   NA
 5700997 5700998 Aflv_2145 Aflv_2146   argF FALSE 0.146 90.000 0.011 NA   NA
 5700998 5700999 Aflv_2146 Aflv_2147 argF carB TRUE 0.962 -3.000 0.027 1.000 Y NA
 5700999 5701000 Aflv_2147 Aflv_2148 carB carA TRUE 0.994 -7.000 0.714 0.001 Y NA
 5701000 5701001 Aflv_2148 Aflv_2149 carA argD TRUE 0.928 50.000 0.286 1.000 Y NA
 5701001 5701002 Aflv_2149 Aflv_2150 argD argB TRUE 0.981 -39.000 0.322 1.000 Y NA
 5701002 5701003 Aflv_2150 Aflv_2151 argB argJ TRUE 0.970 13.000 0.067 0.003 Y NA
 5701003 5701004 Aflv_2151 Aflv_2152 argJ argC TRUE 0.984 15.000 0.303 0.003 Y NA
 5701006 5701007 Aflv_2154 Aflv_2155     FALSE 0.028 68.000 0.000 NA   NA
 5701008 5701009 Aflv_2156 Aflv_2157     TRUE 0.791 30.000 0.286 NA   NA
 5701009 5701010 Aflv_2157 Aflv_2158     TRUE 0.929 2.000 0.826 NA   NA
 5701012 5701013 Aflv_2160 Aflv_2161     TRUE 0.855 -3.000 0.161 NA   NA
 5701014 5701015 Aflv_2162 Aflv_2163 mcpC   TRUE 0.939 13.000 0.857 1.000   NA
 5701016 5701017 Aflv_2164 Aflv_2165     FALSE 0.002 256.000 0.000 NA   NA
 5701017 5701018 Aflv_2165 Aflv_2166     TRUE 0.973 -46.000 0.045 0.001 Y NA
 5701019 5701020 Aflv_2167 Aflv_2168     TRUE 0.955 -21.000 0.009 1.000 Y NA
 5701020 5701021 Aflv_2168 Aflv_2169     TRUE 0.948 -82.000 0.031 1.000 Y NA
 5701021 5701022 Aflv_2169 Aflv_2170     TRUE 0.970 -19.000 0.016 0.009 Y NA
 5701022 5701023 Aflv_2170 Aflv_2171     TRUE 0.974 -7.000 0.010 0.002 Y NA
 5701023 5701024 Aflv_2171 Aflv_2172     TRUE 0.973 -18.000 0.032 0.009 Y NA
 5701024 5701025 Aflv_2172 Aflv_2173     TRUE 0.986 -76.000 0.397 0.009 Y NA
 5701025 5701026 Aflv_2173 Aflv_2174     TRUE 0.988 -3.000 0.291 0.009 Y NA
 5701026 5701027 Aflv_2174 Aflv_2175     TRUE 0.982 -21.000 0.128 0.009 Y NA
 5701027 5701028 Aflv_2175 Aflv_2176     TRUE 0.978 -34.000 0.107 0.009 Y NA
 5701028 5701029 Aflv_2176 Aflv_2177     TRUE 0.971 3.000 0.102 0.009 Y NA
 5701029 5701030 Aflv_2177 Aflv_2178     TRUE 0.963 1.000 0.026 0.009 Y NA
 5701030 5701031 Aflv_2178 Aflv_2179     TRUE 0.792 -67.000 0.026 0.009   NA
 5701031 5701032 Aflv_2179 Aflv_2180     TRUE 0.839 -12.000 0.025 0.009   NA
 5701032 5701033 Aflv_2180 Aflv_2181     TRUE 0.852 -22.000 0.011 1.000 N NA
 5701033 5701034 Aflv_2181 Aflv_2182     TRUE 0.981 -46.000 0.335 1.000 Y NA
 5701034 5701035 Aflv_2182 Aflv_2183     TRUE 0.994 -7.000 0.804 0.001 Y NA
 5701035 5701036 Aflv_2183 Aflv_2184     TRUE 0.994 -3.000 0.861 0.009 Y NA
 5701036 5701037 Aflv_2184 Aflv_2185   cbiW TRUE 0.868 -3.000 0.019 1.000 N NA
 5701037 5701038 Aflv_2185 Aflv_2186 cbiW ccpA FALSE 0.020 401.000 0.000 1.000 N NA
 5701038 5701039 Aflv_2186 Aflv_2187 ccpA   TRUE 0.836 18.000 0.045 1.000 N NA
 5701039 5701040 Aflv_2187 Aflv_2188     TRUE 0.982 -3.000 0.111 0.008 Y NA
 5701040 5701041 Aflv_2188 Aflv_2189     TRUE 0.801 99.000 0.192 1.000 Y NA
 5701041 5701042 Aflv_2189 Aflv_2190     TRUE 0.991 2.000 0.885 0.015 Y NA
 5701042 5701043 Aflv_2190 Aflv_2191     TRUE 0.933 73.000 0.815 1.000 Y NA
 5701047 5701048 Aflv_2195 Aflv_2196     TRUE 0.917 -24.000 0.149 NA N NA
 5701048 5701049 Aflv_2196 Aflv_2197     TRUE 0.947 -21.000 0.315 NA N NA
 5701049 5701050 Aflv_2197 Aflv_2198     TRUE 0.824 -18.000 0.111 NA   NA
 5701050 5701051 Aflv_2198 Aflv_2199     FALSE 0.153 -28.000 0.000 NA   NA
 5701051 5701052 Aflv_2199 Aflv_2200     TRUE 0.974 -3.000 0.800 1.000 N NA
 5701052 5701053 Aflv_2200 Aflv_2201     TRUE 0.982 0.000 0.229 0.017 Y NA
 5701053 5701054 Aflv_2201 Aflv_2202   asnO TRUE 0.569 61.000 0.045 1.000 N NA
 5701056 5701057 Aflv_2204 Aflv_2205     FALSE 0.242 115.000 0.125 NA   NA
 5701061 5701062 Aflv_2209 Aflv_2210     FALSE 0.006 154.000 0.000 NA   NA
 5701062 5701063 Aflv_2210 Aflv_2211     TRUE 0.969 -3.000 0.080 NA Y NA
 5701064 5701065 Aflv_2212 Aflv_2213     FALSE 0.115 17.000 0.000 NA   NA
 5701065 5701066 Aflv_2213 Aflv_2214     FALSE 0.030 64.000 0.000 NA   NA
 5701066 5701067 Aflv_2214 Aflv_2215     TRUE 0.906 15.000 0.000 NA Y NA
 5701069 5701070 Aflv_2217 Aflv_2218     FALSE 0.306 0.000 0.000 1.000   NA
 5701072 5701073 Aflv_2220 Aflv_2221 gerPF gerPA FALSE 0.109 4.000 0.000 NA   NA
 5701073 5701074 Aflv_2221 Aflv_2222 gerPA gerPB TRUE 0.935 13.000 0.889 NA   NA
 5701074 5701075 Aflv_2222 Aflv_2223 gerPB gerPC TRUE 0.708 73.000 0.769 NA   NA
 5701075 5701076 Aflv_2223 Aflv_2224 gerPC gerPD TRUE 0.897 -3.000 0.269 NA   NA
 5701076 5701077 Aflv_2224 Aflv_2225 gerPD gerPE TRUE 0.828 21.000 0.259 NA   NA
 5701077 5701078 Aflv_2225 Aflv_2226 gerPE gerPF FALSE 0.156 -25.000 0.000 NA   NA
 5701079 5701080 Aflv_2227 Aflv_2228     FALSE 0.497 13.000 0.005 NA   NA
 5701080 5701081 Aflv_2228 Aflv_2229   sbcD TRUE 0.989 -3.000 0.669 NA Y NA
 5701081 5701082 Aflv_2229 Aflv_2230 sbcD addA TRUE 0.957 -37.000 0.041 1.000 Y NA
 5701082 5701083 Aflv_2230 Aflv_2231 addA addB TRUE 0.985 5.000 0.408 0.002 Y NA
 5701083 5701084 Aflv_2231 Aflv_2232 addB   FALSE 0.159 -22.000 0.000 NA   NA
 5701084 5701085 Aflv_2232 Aflv_2233   comK FALSE 0.029 66.000 0.000 NA   NA
 5701086 5701087 Aflv_2234 Aflv_2236     FALSE 0.057 609.000 0.000 NA Y NA
 5701087 5701088 Aflv_2236 Aflv_2237   pcrA TRUE 0.978 1.000 0.390 NA Y NA
 5701090 5701091 Aflv_2239 Aflv_2240     FALSE 0.109 4.000 0.000 NA   NA
 5701092 5701093 Aflv_2241 Aflv_2242     FALSE 0.043 219.000 0.000 1.000 N NA
 5701094 5701095 Aflv_2243 Aflv_2244   tlpB FALSE 0.060 87.000 0.000 1.000   NA
 5701097 5701098 Aflv_2246 Aflv_2247     TRUE 0.565 35.000 0.000 1.000 N NA
 5701098 5701099 Aflv_2247 Aflv_2248     TRUE 0.663 16.000 0.000 NA N NA
 5701099 5701100 Aflv_2248 Aflv_2249     TRUE 0.856 30.000 0.000 NA Y NA
 5701101 5701102 Aflv_2250 Aflv_2251   rbsC TRUE 0.710 -76.000 0.048 1.000   NA
 5701102 5701103 Aflv_2251 Aflv_2252 rbsC rbsB TRUE 0.668 9.000 0.067 NA   NA
 5701103 5701104 Aflv_2252 Aflv_2253 rbsB   TRUE 0.564 100.000 0.571 NA   NA
 5701104 5701105 Aflv_2253 Aflv_2254     FALSE 0.012 651.000 0.000 NA N NA
 5701105 5701106 Aflv_2254 Aflv_2255     FALSE 0.001 1856.000 0.000 NA   NA
 5701106 5701107 Aflv_2255 Aflv_2256     FALSE 0.001 720.000 0.000 NA   NA
 5701107 5701108 Aflv_2256 Aflv_2257     FALSE 0.001 1123.000 0.000 NA   NA
 5701110 5701111 Aflv_2259 Aflv_2260     FALSE 0.011 121.000 0.000 NA   NA
 5701111 5701112 Aflv_2260 Aflv_2261     FALSE 0.024 83.000 0.000 NA   NA
 5701112 5701113 Aflv_2261 Aflv_2262     FALSE 0.025 81.000 0.000 NA   NA
 5701113 5701114 Aflv_2262 Aflv_2263     TRUE 0.948 6.000 0.571 1.000 N NA
 5701114 5701115 Aflv_2263 Aflv_2264     FALSE 0.316 52.000 0.018 1.000   NA
 5701115 5701116 Aflv_2264 Aflv_2265     TRUE 0.908 27.000 0.916 NA   NA
 5701116 5701117 Aflv_2265 Aflv_2266     TRUE 0.627 -13.000 0.013 NA   NA
 5701117 5701118 Aflv_2266 Aflv_2267     FALSE 0.005 163.000 0.000 NA   NA
 5701118 5701119 Aflv_2267 Aflv_2268     TRUE 0.779 24.000 0.200 NA   NA
 5701119 5701120 Aflv_2268 Aflv_2269     FALSE 0.001 560.000 0.000 NA   NA
 5701122 5701123 Aflv_2271 Aflv_2272 malL   TRUE 0.934 18.000 0.014 1.000 Y NA
 5701123 5701124 Aflv_2272 Aflv_2273     TRUE 0.988 12.000 0.723 0.015 Y NA
 5701124 5701125 Aflv_2273 Aflv_2274     TRUE 0.897 69.000 0.178 0.015 Y NA
 5701125 5701126 Aflv_2274 Aflv_2275     TRUE 0.913 -3.000 0.080 1.000 N NA
 5701126 5701127 Aflv_2275 Aflv_2276     FALSE 0.008 137.000 0.000 NA   NA
 5701127 5701128 Aflv_2276 Aflv_2277     FALSE 0.367 74.000 0.100 NA   NA
 5701128 5701129 Aflv_2277 Aflv_2278   hemY FALSE 0.225 101.000 0.000 1.000 N NA
 5701129 5701130 Aflv_2278 Aflv_2279 hemY hemH TRUE 0.970 -3.000 0.069 1.000 Y NA
 5701130 5701131 Aflv_2279 Aflv_2280 hemH hemE TRUE 0.959 8.000 0.131 1.000 Y NA
 5701135 5701136 Aflv_2284 Aflv_2285 ecsB ecsA TRUE 0.947 -7.000 0.271 NA N NA
 5701138 5701139 Aflv_2287 Aflv_2288 prsA   FALSE 0.002 260.000 0.000 NA   NA
 5701143 5701144 Aflv_2292 Aflv_2293   serC FALSE 0.138 99.000 0.020 NA   NA
 5701144 5701145 Aflv_2293 Aflv_2294 serC   FALSE 0.106 103.000 0.008 NA   NA
 5701147 5701148 Aflv_2296 Aflv_2297 hemZ yhaX FALSE 0.515 70.000 0.091 0.033   NA
 5701148 5701149 Aflv_2297 Aflv_2298 yhaX   FALSE 0.414 42.000 0.036 NA   NA
 5701149 5701150 Aflv_2298 Aflv_2299     TRUE 0.729 45.000 0.321 NA   NA
 5701150 5701151 Aflv_2299 Aflv_2300     FALSE 0.109 4.000 0.000 NA   NA
 5701152 5701153 Aflv_2301 Aflv_2302     FALSE 0.398 69.000 0.107 NA   NA
 5701153 5701154 Aflv_2302 Aflv_2303   msmX TRUE 0.563 112.000 0.321 NA N NA
 5701155 5701156 Aflv_2304 Aflv_2305     FALSE 0.028 68.000 0.000 NA   NA
 5701158 5701159 Aflv_2307 Aflv_2308     TRUE 0.988 -10.000 0.481 1.000 Y NA
 5701159 5701160 Aflv_2308 Aflv_2309     TRUE 0.992 -22.000 0.594 0.015 Y NA
 5701160 5701161 Aflv_2309 Aflv_2310     FALSE 0.063 84.000 0.000 1.000   NA
 5701161 5701162 Aflv_2310 Aflv_2311     FALSE 0.005 277.000 0.000 1.000   NA
 5701162 5701163 Aflv_2311 Aflv_2312   moeB TRUE 0.918 -88.000 0.000 1.000 Y NA
 5701163 5701164 Aflv_2312 Aflv_2313 moeB thiG TRUE 0.925 0.000 0.000 1.000 Y NA
 5701164 5701165 Aflv_2313 Aflv_2314 thiG thiS TRUE 0.951 2.000 0.054 1.000 Y NA
 5701165 5701166 Aflv_2314 Aflv_2315 thiS goxB TRUE 0.945 -16.000 0.239 1.000 N NA
 5701166 5701167 Aflv_2315 Aflv_2316 goxB tenI TRUE 0.940 -12.000 0.194 1.000 N NA
 5701167 5701168 Aflv_2316 Aflv_2317 tenI   TRUE 0.820 3.000 0.031 1.000 N NA
 5701168 5701169 Aflv_2317 Aflv_2318     TRUE 0.937 -3.000 0.469 1.000   NA
 5701169 5701170 Aflv_2318 Aflv_2319     TRUE 0.763 4.000 0.138 NA   NA
 5701170 5701171 Aflv_2319 Aflv_2320   tenA TRUE 0.725 -25.000 0.050 NA   NA
 5701172 5701173 Aflv_2321 Aflv_2322     FALSE 0.066 80.000 0.000 1.000   NA
 5701174 5701175 Aflv_2323 Aflv_2324     FALSE 0.015 104.000 0.000 NA   NA
 5701175 5701176 Aflv_2324 Aflv_2325     FALSE 0.194 197.000 0.000 1.000 Y NA
 5701176 5701177 Aflv_2325 Aflv_2326     TRUE 0.957 -3.000 0.351 1.000 N NA
 5701178 5701179 Aflv_2327 Aflv_2328 spoVR   FALSE 0.022 89.000 0.000 NA   NA
 5701179 5701180 Aflv_2328 Aflv_2329     TRUE 0.994 -3.000 0.947 0.008 Y NA
 5701183 5701184 Aflv_2332 Aflv_2333     TRUE 0.666 0.000 0.024 1.000   NA
 5701184 5701185 Aflv_2333 Aflv_2334     FALSE 0.026 285.000 0.037 1.000   NA
 5701186 5701187 Aflv_2335 Aflv_2336 bdbC bdbA TRUE 0.935 -3.000 0.236 0.004   NA
 5701189 5701190 Aflv_2338 Aflv_2339     FALSE 0.311 79.000 0.000 1.000 N NA
 5701191 5701192 Aflv_2340 Aflv_2341     FALSE 0.490 11.000 0.013 NA   NA
 5701192 5701193 Aflv_2341 Aflv_2342     FALSE 0.006 155.000 0.000 NA   NA
 5701193 5701194 Aflv_2342 Aflv_2343     FALSE 0.098 54.000 0.000 1.000   NA
 5701194 5701195 Aflv_2343 Aflv_2344     FALSE 0.064 83.000 0.000 1.000   NA
 5701195 5701196 Aflv_2344 Aflv_2345     FALSE 0.114 49.000 0.000 1.000   NA
 5701196 5701197 Aflv_2345 Aflv_2346     FALSE 0.110 12.000 0.000 NA   NA
 5701197 5701198 Aflv_2346 Aflv_2347     TRUE 0.737 -3.000 0.048 NA   NA
 5701198 5701199 Aflv_2347 Aflv_2348     TRUE 0.961 12.000 0.175 NA Y NA
 5701199 5701200 Aflv_2348 Aflv_2349     FALSE 0.008 136.000 0.000 NA   NA
 5701200 5701201 Aflv_2349 Aflv_2350   prkA FALSE 0.300 163.000 0.683 NA   NA
 5701203 5701204 Aflv_2352 Aflv_2353 cspR   TRUE 0.736 3.000 0.097 NA   NA
 5701204 5701205 Aflv_2353 Aflv_2354     TRUE 0.603 47.000 0.174 NA   NA
 5701207 5701208 Aflv_R098 Aflv_2356 trnG exuR FALSE 0.001 632.000 0.000 NA   NA
 5701208 5701209 Aflv_2356 Aflv_2357 exuR araQ TRUE 0.707 91.000 0.375 1.000 N NA
 5701209 5701210 Aflv_2357 Aflv_2358 araQ araP TRUE 0.991 15.000 0.875 0.015 Y NA
 5701210 5701211 Aflv_2358 Aflv_2359 araP araN TRUE 0.958 61.000 0.750 0.015 Y NA
 5701211 5701212 Aflv_2359 Aflv_2360 araN   TRUE 0.645 124.000 0.091 1.000 Y NA
 5701212 5701213 Aflv_2360 Aflv_2361     FALSE 0.003 400.000 0.000 1.000   NA
 5701213 5701214 Aflv_2361 Aflv_R099   trnL FALSE 0.044 49.000 0.000 NA   NA
 5701214 5701215 Aflv_R099 Aflv_R100 trnL trnL FALSE 0.039 52.000 0.000 NA   NA
 5701215 5701216 Aflv_R100 Aflv_R101 trnL trnC FALSE 0.105 10.000 0.000 NA   NA
 5701216 5701217 Aflv_R101 Aflv_R102 trnC trnG FALSE 0.110 12.000 0.000 NA   NA
 5701217 5701218 Aflv_R102 Aflv_R103 trnG trnQ FALSE 0.106 6.000 0.000 NA   NA
 5701218 5701219 Aflv_R103 Aflv_R104 trnQ trnH FALSE 0.112 18.000 0.000 NA   NA
 5701219 5701220 Aflv_R104 Aflv_R105 trnH trnW FALSE 0.106 9.000 0.000 NA   NA
 5701220 5701221 Aflv_R105 Aflv_R106 trnW trnY FALSE 0.107 5.000 0.000 NA   NA
 5701221 5701222 Aflv_R106 Aflv_R107 trnY trnT FALSE 0.106 6.000 0.000 NA   NA
 5701222 5701223 Aflv_R107 Aflv_R108 trnT trnF FALSE 0.057 41.000 0.000 NA   NA
 5701223 5701224 Aflv_R108 Aflv_R109 trnF trnD FALSE 0.106 6.000 0.000 NA   NA
 5701224 5701225 Aflv_R109 Aflv_R110 trnD trnM FALSE 0.106 6.000 0.000 NA   NA
 5701225 5701226 Aflv_R110 Aflv_R111 trnM trnV FALSE 0.083 28.000 0.000 NA   NA
 5701226 5701227 Aflv_R111 Aflv_R112 trnV trnE FALSE 0.105 10.000 0.000 NA   NA
 5701227 5701228 Aflv_R112 Aflv_R113 trnE trnS FALSE 0.098 23.000 0.000 NA   NA
 5701228 5701229 Aflv_R113 Aflv_R114 trnS trnN FALSE 0.106 6.000 0.000 NA   NA
 5701229 5701230 Aflv_R114 Aflv_R115 trnN   FALSE 0.070 34.000 0.000 NA   NA
 5701230 5701231 Aflv_R115 Aflv_R116     FALSE 0.011 119.000 0.000 NA   NA
 5701231 5701232 Aflv_R116 Aflv_R117     FALSE 0.001 476.000 0.000 NA   NA
 5701232 5701233 Aflv_R117 Aflv_2362     FALSE 0.004 170.000 0.000 NA   NA
 5701234 5701235 Aflv_2363 Aflv_2364 sapB   FALSE 0.080 63.000 0.000 1.000   NA
 5701236 5701237 Aflv_2365 Aflv_2366     FALSE 0.009 196.000 0.000 1.000   NA
 5701237 5701238 Aflv_2366 Aflv_2367     FALSE 0.066 79.000 0.000 1.000   NA
 5701238 5701239 Aflv_2367 Aflv_2368     FALSE 0.001 3465.000 0.000 NA   NA
 5701240 5701241 Aflv_2369 Aflv_2370     TRUE 0.709 13.000 0.000 1.000 N NA
 5701241 5701242 Aflv_2370 Aflv_2371     TRUE 0.904 9.000 0.615 NA   NA
 5701243 5701244 Aflv_2372 Aflv_2373     TRUE 0.954 39.000 0.333 1.000 Y NA
 5701245 5701246 Aflv_2374 Aflv_2375 xre   FALSE 0.010 875.000 0.000 NA N NA
 5701246 5701247 Aflv_2375 Aflv_2376     TRUE 0.906 15.000 0.000 NA Y NA
 5701247 5701248 Aflv_2376 Aflv_2377     FALSE 0.010 452.000 0.000 0.040   NA
 5701249 5701250 Aflv_2378 Aflv_2379     TRUE 0.964 39.000 0.333 0.040 Y NA
 5701251 5701252 Aflv_2380 Aflv_2381     FALSE 0.003 221.000 0.000 NA   NA
 5701252 5701253 Aflv_2381 Aflv_R118   trnA FALSE 0.003 209.000 0.000 NA   NA
 5701256 5701257 Aflv_2384 Aflv_2385   pgi FALSE 0.376 43.000 0.027 NA   NA
 5701257 5701258 Aflv_2385 Aflv_2386 pgi   TRUE 0.672 36.000 0.005 1.000 N NA
 5701262 5701263 Aflv_2390 Aflv_2391   alaR TRUE 0.971 0.000 0.894 1.000 N NA
 5701263 5701264 Aflv_2391 Aflv_2392 alaR   FALSE 0.280 89.000 0.000 1.000 N NA
 5701264 5701265 Aflv_2392 Aflv_2393     FALSE 0.531 54.000 0.163 NA   NA
 5701266 5701267 Aflv_2394 Aflv_2395     TRUE 0.932 22.000 1.000 1.000   NA
 5701267 5701268 Aflv_2395 Aflv_2396     TRUE 0.747 20.000 0.125 NA   NA
 5701271 5701272 Aflv_2399 Aflv_2400     FALSE 0.185 91.000 0.030 NA   NA
 5701272 5701273 Aflv_2400 Aflv_2401     FALSE 0.545 42.000 0.083 NA   NA
 5701273 5701274 Aflv_2401 Aflv_2402     FALSE 0.048 97.000 0.000 1.000   NA
 5701276 5701277 Aflv_2404 Aflv_2405     FALSE 0.174 -6.000 0.000 NA   NA
 5701277 5701278 Aflv_2405 Aflv_2406   dapF FALSE 0.546 17.000 0.020 NA   NA
 5701284 5701285 Aflv_2412 Aflv_2413 thrB thrC TRUE 0.981 -3.000 0.221 1.000 Y NA
 5701285 5701286 Aflv_2413 Aflv_2414 thrC hom TRUE 0.958 0.000 0.052 1.000 Y NA
 5701286 5701287 Aflv_2414 Aflv_2415 hom   FALSE 0.467 110.000 0.129 1.000 N NA
 5701287 5701288 Aflv_2415 Aflv_2416     TRUE 0.727 48.000 0.385 NA   NA
 5701290 5701291 Aflv_2418 Aflv_2419     FALSE 0.544 72.000 0.059 1.000 N NA
 5701291 5701292 Aflv_2419 Aflv_2420     FALSE 0.469 48.000 0.074 NA   NA
 5701293 5701294 Aflv_2421 Aflv_2422     TRUE 0.681 38.000 0.182 NA   NA
 5701299 5701300 Aflv_2427 Aflv_2428     TRUE 0.630 0.000 0.029 NA   NA
 5701300 5701301 Aflv_2428 Aflv_2429     FALSE 0.032 184.000 0.019 NA   NA
 5701301 5701302 Aflv_2429 Aflv_2430     TRUE 0.598 52.000 0.221 NA   NA
 5701302 5701303 Aflv_2430 Aflv_2431     TRUE 0.874 -30.000 0.241 NA   NA
 5701303 5701304 Aflv_2431 Aflv_2432     TRUE 0.915 -10.000 0.299 1.000   NA
 5701304 5701305 Aflv_2432 Aflv_2433     TRUE 0.846 7.000 0.303 NA   NA
 5701306 5701307 Aflv_2434 Aflv_2435     TRUE 0.875 39.000 0.000 0.039 Y NA
 5701308 5701309 Aflv_2436 Aflv_2437     TRUE 0.928 20.000 1.000 NA   NA
 5701309 5701310 Aflv_2437 Aflv_2438     FALSE 0.004 184.000 0.000 NA   NA
 5701310 5701311 Aflv_2438 Aflv_2439   ripX FALSE 0.110 12.000 0.000 NA   NA
 5701311 5701312 Aflv_2439 Aflv_2440 ripX spaB FALSE 0.001 517.000 0.000 NA   NA
 5701313 5701314 Aflv_2441 Aflv_2442     FALSE 0.170 -3.000 0.000 NA   NA
 5701314 5701315 Aflv_2442 Aflv_2443     FALSE 0.109 4.000 0.000 NA   NA
 5701315 5701316 Aflv_2443 Aflv_2444     FALSE 0.106 7.000 0.000 NA   NA
 5701316 5701317 Aflv_2444 Aflv_2445     FALSE 0.112 18.000 0.000 NA   NA
 5701317 5701318 Aflv_2445 Aflv_2446   trpS TRUE 0.755 -7.000 0.000 NA N NA
 5701318 5701319 Aflv_2446 Aflv_2447 trpS   FALSE 0.016 155.000 0.000 1.000   NA
 5701319 5701320 Aflv_2447 Aflv_2448     FALSE 0.312 54.000 0.000 0.008   NA
 5701320 5701321 Aflv_2448 Aflv_2449     TRUE 0.875 39.000 0.000 0.039 Y NA
 5701323 5701324 Aflv_2451 Aflv_2452     FALSE 0.452 138.000 1.000 NA   NA
 5701324 5701325 Aflv_2452 Aflv_2453     TRUE 0.951 -7.000 0.667 1.000   NA
 5701325 5701326 Aflv_2453 Aflv_2454     FALSE 0.012 1092.000 0.000 1.000 N NA
 5701326 5701327 Aflv_2454 Aflv_2455     FALSE 0.074 32.000 0.000 NA   NA
 5701328 5701329 Aflv_2456 Aflv_2457     TRUE 0.954 39.000 0.333 1.000 Y NA
 5701330 5701331 Aflv_2458 Aflv_2459     TRUE 0.712 -9.000 0.000 0.006   NA
 5701332 5701333 Aflv_2460 Aflv_2461     TRUE 0.958 -16.000 0.152 0.001 N NA
 5701333 5701334 Aflv_2461 Aflv_2462   csd TRUE 0.954 -10.000 0.292 1.000 N NA
 5701334 5701335 Aflv_2462 Aflv_2463 csd   TRUE 0.971 -3.000 0.606 1.000 N NA
 5701335 5701336 Aflv_2463 Aflv_2464     TRUE 0.964 16.000 0.139 1.000 Y NA
 5701336 5701337 Aflv_2464 Aflv_2465     FALSE 0.009 130.000 0.000 NA   NA
 5701337 5701338 Aflv_2465 Aflv_2466     TRUE 0.665 3.000 0.059 NA   NA
 5701338 5701339 Aflv_2466 Aflv_2467     TRUE 0.957 19.000 0.138 NA Y NA
 5701339 5701340 Aflv_2467 Aflv_2468     TRUE 0.986 -67.000 0.642 1.000 Y NA
 5701340 5701341 Aflv_2468 Aflv_2469     FALSE 0.001 511.000 0.000 NA   NA
 5701345 5701346 Aflv_2473 Aflv_2474     FALSE 0.031 62.000 0.000 NA   NA
 5701346 5701347 Aflv_2474 Aflv_2475     FALSE 0.116 130.000 0.049 NA   NA
 5701347 5701348 Aflv_2475 Aflv_2476     TRUE 0.880 9.000 0.443 NA   NA
 5701348 5701349 Aflv_2476 Aflv_2477     FALSE 0.466 80.000 0.205 NA   NA
 5701349 5701350 Aflv_2477 Aflv_2478   gcvH TRUE 0.751 35.000 0.255 NA   NA
 5701350 5701351 Aflv_2478 Aflv_2479 gcvH   TRUE 0.714 58.000 0.170 1.000 N NA
 5701351 5701352 Aflv_2479 Aflv_2480     TRUE 0.646 70.000 0.060 0.025 N NA
 5701352 5701353 Aflv_2480 Aflv_2481     TRUE 0.964 13.000 0.124 1.000 Y NA
 5701353 5701354 Aflv_2481 Aflv_2482     FALSE 0.121 13.000 0.000 NA   NA
 5701355 5701356 Aflv_2483 Aflv_2485     FALSE 0.001 954.000 0.000 NA   NA
 5701358 5701359 Aflv_2487 Aflv_2488     TRUE 0.928 14.000 0.762 NA   NA
 5701359 5701360 Aflv_2488 Aflv_2489     FALSE 0.026 72.000 0.000 NA   NA
 5701360 5701361 Aflv_2489 Aflv_2490     FALSE 0.050 46.000 0.000 NA   NA
 5701362 5701363 Aflv_2491 Aflv_2492     FALSE 0.115 17.000 0.000 NA   NA
 5701363 5701364 Aflv_2492 Aflv_2493     FALSE 0.170 -3.000 0.000 NA   NA
 5701364 5701365 Aflv_2493 Aflv_2494   fhuC TRUE 0.910 17.000 0.000 1.000 Y NA
 5701365 5701366 Aflv_2494 Aflv_2495 fhuC   TRUE 0.980 -58.000 0.360 1.000 Y NA
 5701366 5701367 Aflv_2495 Aflv_2496     TRUE 0.988 14.000 0.889 1.000 Y NA
 5701367 5701368 Aflv_2496 Aflv_R120     FALSE 0.008 136.000 0.000 NA   NA
 5701368 5701369 Aflv_R120 Aflv_2497   smpB FALSE 0.016 101.000 0.000 NA   NA
 5701369 5701370 Aflv_2497 Aflv_2498 smpB rnr TRUE 0.709 79.000 0.143 0.015 N NA
 5701370 5701371 Aflv_2498 Aflv_2499 rnr   TRUE 0.684 21.000 0.060 1.000   NA
 5701371 5701372 Aflv_2499 Aflv_2500   secG FALSE 0.288 67.000 0.032 1.000   NA
 5701372 5701373 Aflv_2500 Aflv_2501 secG   FALSE 0.001 334.000 0.000 NA   NA
 5701373 5701374 Aflv_2501 Aflv_2502     FALSE 0.001 421.000 0.000 NA   NA
 5701374 5701375 Aflv_2502 Aflv_2503     TRUE 0.908 14.000 0.500 NA   NA
 5701375 5701376 Aflv_2503 Aflv_2504     FALSE 0.039 52.000 0.000 NA   NA
 5701376 5701377 Aflv_2504 Aflv_2505     FALSE 0.019 94.000 0.000 NA   NA
 5701377 5701378 Aflv_2505 Aflv_2506     FALSE 0.006 147.000 0.000 NA   NA
 5701378 5701379 Aflv_2506 Aflv_2507     FALSE 0.127 1.000 0.000 NA   NA
 5701379 5701380 Aflv_2507 Aflv_2508     FALSE 0.001 1057.000 0.000 NA   NA
 5701380 5701381 Aflv_2508 Aflv_2509     FALSE 0.003 205.000 0.000 NA   NA
 5701381 5701382 Aflv_2509 Aflv_2510     FALSE 0.174 -6.000 0.000 NA   NA
 5701382 5701383 Aflv_2510 Aflv_2511     FALSE 0.022 89.000 0.000 NA   NA
 5701383 5701384 Aflv_2511 Aflv_2512     FALSE 0.034 58.000 0.000 NA   NA
 5701384 5701385 Aflv_2512 Aflv_2513     FALSE 0.106 9.000 0.000 NA   NA
 5701385 5701386 Aflv_2513 Aflv_2514   eno FALSE 0.002 764.000 0.000 1.000   NA
 5701386 5701387 Aflv_2514 Aflv_2515 eno pgm TRUE 0.959 20.000 0.136 1.000 Y NA
 5701387 5701388 Aflv_2515 Aflv_2516 pgm tpiA TRUE 0.976 -3.000 0.138 1.000 Y NA
 5701388 5701389 Aflv_2516 Aflv_2517 tpiA pgk TRUE 0.962 18.000 0.141 1.000 Y NA
 5701389 5701390 Aflv_2517 Aflv_2518 pgk gapA TRUE 0.741 116.000 0.063 0.003 Y NA
 5701390 5701391 Aflv_2518 Aflv_2519 gapA cggR TRUE 0.883 37.000 0.348 1.000 N NA
 5701391 5701392 Aflv_2519 Aflv_2520 cggR   FALSE 0.085 137.000 0.022 1.000   NA
 5701392 5701393 Aflv_2520 Aflv_2521   sigL TRUE 0.636 13.000 0.025 1.000   NA
 5701393 5701394 Aflv_2521 Aflv_R121 sigL trnR FALSE 0.002 226.000 0.000 NA   NA
 5701396 5701397 Aflv_2523 Aflv_2524 crh   TRUE 0.809 -22.000 0.101 NA   NA
 5701397 5701398 Aflv_2524 Aflv_2525     TRUE 0.888 4.000 0.470 NA   NA
 5701398 5701399 Aflv_2525 Aflv_2526     TRUE 0.879 -3.000 0.214 NA   NA
 5701399 5701400 Aflv_2526 Aflv_2527     TRUE 0.841 18.000 0.263 NA   NA
 5701400 5701401 Aflv_2527 Aflv_2528   trxB FALSE 0.040 230.000 0.000 1.000 N NA
 5701401 5701402 Aflv_2528 Aflv_2529 trxB   TRUE 0.556 59.000 0.183 1.000   NA
 5701402 5701403 Aflv_2529 Aflv_2530   hisI FALSE 0.390 39.000 0.007 1.000   NA
 5701403 5701404 Aflv_2530 Aflv_2531 hisI hisF TRUE 0.991 -3.000 0.430 0.003 Y NA
 5701404 5701405 Aflv_2531 Aflv_2532 hisF hisA TRUE 0.991 -3.000 0.433 0.003 Y NA
 5701405 5701406 Aflv_2532 Aflv_2533 hisA hisH TRUE 0.979 0.000 0.124 0.003 Y NA
 5701406 5701407 Aflv_2533 Aflv_2534 hisH hisB TRUE 0.977 1.000 0.125 0.003 Y NA
 5701407 5701408 Aflv_2534 Aflv_2535 hisB hisD TRUE 0.977 0.000 0.096 0.003 Y NA
 5701408 5701409 Aflv_2535 Aflv_2536 hisD hisG TRUE 0.988 -10.000 0.254 0.003 Y NA
 5701409 5701410 Aflv_2536 Aflv_2537 hisG hisZ TRUE 0.988 -6.000 0.239 0.003 Y NA
 5701410 5701411 Aflv_2537 Aflv_2538 hisZ   FALSE 0.058 154.000 0.012 1.000   NA
 5701411 5701412 Aflv_2538 Aflv_2539   hprP TRUE 0.931 -3.000 0.417 1.000   NA
 5701412 5701413 Aflv_2539 Aflv_2540 hprP   TRUE 0.866 -10.000 0.146 1.000   NA
 5701413 5701414 Aflv_2540 Aflv_2541   lgt TRUE 0.779 1.000 0.090 1.000   NA
 5701414 5701415 Aflv_2541 Aflv_2542 lgt hprK TRUE 0.943 9.000 0.494 1.000 N NA
 5701415 5701416 Aflv_2542 Aflv_2543 hprK   TRUE 0.593 52.000 0.215 NA   NA
 5701416 5701417 Aflv_2543 Aflv_2544   pspC TRUE 0.869 -3.000 0.190 NA   NA
 5701417 5701418 Aflv_2544 Aflv_2545 pspC   FALSE 0.001 1434.000 0.000 NA   NA
 5701418 5701419 Aflv_2545 Aflv_2546   uvrA FALSE 0.154 81.000 0.005 NA   NA
 5701419 5701420 Aflv_2546 Aflv_2547 uvrA uvrB TRUE 0.976 4.000 0.154 0.001 Y NA
 5701420 5701421 Aflv_2547 Aflv_2548 uvrB csbA FALSE 0.096 109.000 0.007 NA   NA
 5701421 5701422 Aflv_2548 Aflv_2549 csbA   TRUE 0.733 3.000 0.094 NA   NA
 5701424 5701425 Aflv_2551 Aflv_2552     FALSE 0.003 188.000 0.000 NA   NA
 5701425 5701426 Aflv_2552 Aflv_2553     FALSE 0.118 16.000 0.000 NA   NA
 5701426 5701427 Aflv_2553 Aflv_2554     FALSE 0.105 20.000 0.000 NA   NA
 5701429 5701430 Aflv_2556 Aflv_2557     FALSE 0.014 108.000 0.000 NA   NA
 5701430 5701431 Aflv_2557 Aflv_2558   ftsX TRUE 0.803 20.000 0.026 1.000 N NA
 5701431 5701432 Aflv_2558 Aflv_2559 ftsX ftsE TRUE 0.986 -16.000 0.431 1.000 Y NA
 5701432 5701433 Aflv_2559 Aflv_2560 ftsE cccB FALSE 0.331 99.000 0.003 1.000 N NA
 5701433 5701434 Aflv_2560 Aflv_2561 cccB   FALSE 0.349 59.000 0.059 NA   NA
 5701434 5701435 Aflv_2561 Aflv_2562   prfB FALSE 0.119 112.000 0.024 NA   NA
 5701435 5701436 Aflv_2562 Aflv_2563 prfB secA FALSE 0.113 199.000 0.052 1.000 N NA
 5701436 5701437 Aflv_2563 Aflv_2564 secA   FALSE 0.106 51.000 0.000 1.000   NA
 5701437 5701438 Aflv_2564 Aflv_2565     FALSE 0.055 43.000 0.000 NA   NA
 5701440 5701441 Aflv_2567 Aflv_2568     FALSE 0.105 10.000 0.000 NA   NA
 5701441 5701442 Aflv_2568 Aflv_2569   fliS FALSE 0.138 0.000 0.000 NA   NA
 5701442 5701443 Aflv_2569 Aflv_2570 fliS fliD TRUE 0.985 17.000 0.370 0.002 Y NA
 5701443 5701444 Aflv_2570 Aflv_2571 fliD   TRUE 0.971 18.000 0.298 NA Y NA
 5701444 5701445 Aflv_2571 Aflv_2572     FALSE 0.147 118.000 0.000 NA N NA
 5701445 5701446 Aflv_2572 Aflv_2573   tagD TRUE 0.677 72.000 0.000 1.000 Y NA
 5701446 5701447 Aflv_2573 Aflv_2574 tagD tagB TRUE 0.833 55.000 0.000 0.001 Y NA
 5701447 5701448 Aflv_2574 Aflv_2575 tagB   FALSE 0.040 106.000 0.000 1.000   NA
 5701450 5701451 Aflv_2577 Aflv_2579     FALSE 0.007 140.000 0.000 NA   NA
 5701451 5701452 Aflv_2579 Aflv_2580   csrA TRUE 0.809 -13.000 0.089 NA   NA
 5701452 5701453 Aflv_2580 Aflv_2581 csrA   TRUE 0.903 13.000 0.489 NA   NA
 5701453 5701454 Aflv_2581 Aflv_2582     TRUE 0.885 14.000 0.375 NA   NA
 5701454 5701455 Aflv_2582 Aflv_2583   flgL TRUE 0.827 15.000 0.207 NA   NA
 5701455 5701456 Aflv_2583 Aflv_2584 flgL flgK TRUE 0.982 12.000 0.257 0.001 Y NA
 5701456 5701457 Aflv_2584 Aflv_2585 flgK   TRUE 0.911 13.000 0.233 0.002   NA
 5701457 5701458 Aflv_2585 Aflv_2586   flgM TRUE 0.938 15.000 0.421 0.002   NA
 5701458 5701459 Aflv_2586 Aflv_2587 flgM   FALSE 0.502 67.000 0.204 NA   NA
 5701459 5701460 Aflv_2587 Aflv_2588     TRUE 0.551 10.000 0.028 NA   NA
 5701460 5701461 Aflv_2588 Aflv_2589     FALSE 0.312 78.000 0.069 NA   NA
 5701461 5701462 Aflv_2589 Aflv_2590   fliS TRUE 0.986 -25.000 0.440 1.000 Y NA
 5701462 5701463 Aflv_2590 Aflv_2591 fliS   TRUE 0.753 33.000 0.208 1.000   NA
 5701463 5701464 Aflv_2591 Aflv_2592     TRUE 0.885 -3.000 0.229 NA   NA
 5701464 5701465 Aflv_2592 Aflv_2593   comFC FALSE 0.537 -49.000 0.005 NA   NA
 5701465 5701466 Aflv_2593 Aflv_2594 comFC comFA TRUE 0.858 -3.000 0.130 1.000   NA
 5701466 5701467 Aflv_2594 Aflv_2595 comFA   FALSE 0.510 67.000 0.214 NA   NA
 5701467 5701468 Aflv_2595 Aflv_2596     FALSE 0.003 197.000 0.000 NA   NA
 5701468 5701469 Aflv_2596 Aflv_2597     FALSE 0.057 41.000 0.000 NA   NA
 5701469 5701470 Aflv_2597 Aflv_2598   degU FALSE 0.025 75.000 0.000 NA   NA
 5701470 5701471 Aflv_2598 Aflv_2599 degU degS TRUE 0.946 -78.000 0.519 0.011   NA
 5701472 5701473 Aflv_2600 Aflv_2601     FALSE 0.132 94.000 0.009 NA   NA
 5701476 5701477 Aflv_2604 Aflv_2605     FALSE 0.105 11.000 0.000 NA   NA
 5701477 5701478 Aflv_2605 Aflv_2606     FALSE 0.033 264.000 0.000 1.000 N NA
 5701479 5701480 Aflv_2607 Aflv_2608     FALSE 0.022 88.000 0.000 NA   NA
 5701481 5701482 Aflv_2609 Aflv_2610     FALSE 0.002 315.000 0.000 NA   NA
 5701482 5701483 Aflv_2610 Aflv_2611     FALSE 0.139 -46.000 0.000 NA   NA
 5701483 5701484 Aflv_2611 Aflv_2612     FALSE 0.105 11.000 0.000 NA   NA
 5701484 5701485 Aflv_2612 Aflv_2613   sunT FALSE 0.276 13.000 0.000 1.000   NA
 5701485 5701486 Aflv_2613 Aflv_2614 sunT   FALSE 0.041 51.000 0.000 NA   NA
 5701486 5701487 Aflv_2614 Aflv_2615     FALSE 0.025 81.000 0.000 NA   NA
 5701487 5701488 Aflv_2615 Aflv_2616     FALSE 0.046 48.000 0.000 NA   NA
 5701488 5701489 Aflv_2616 Aflv_2617     FALSE 0.002 227.000 0.000 NA   NA
 5701489 5701490 Aflv_2617 Aflv_2618     FALSE 0.046 48.000 0.000 NA   NA
 5701491 5701492 Aflv_2619 Aflv_2620   kinA FALSE 0.170 -3.000 0.000 NA   NA
 5701492 5701493 Aflv_2620 Aflv_2621 kinA yvqC TRUE 0.961 14.000 0.093 1.000 Y NA
 5701493 5701494 Aflv_2621 Aflv_2622 yvqC   FALSE 0.001 853.000 0.000 NA   NA
 5701494 5701495 Aflv_2622 Aflv_2623     FALSE 0.002 245.000 0.000 NA   NA
 5701496 5701497 Aflv_2624 Aflv_2625     TRUE 0.862 -13.000 0.176 NA   NA
 5701497 5701498 Aflv_2625 Aflv_2626     FALSE 0.001 1619.000 0.000 NA   NA
 5701499 5701500 Aflv_2627 Aflv_2628     TRUE 0.729 81.000 0.000 0.038 Y NA
 5701501 5701502 Aflv_2629 Aflv_2630     FALSE 0.032 61.000 0.000 NA   NA
 5701503 5701504 Aflv_2631 Aflv_2632     TRUE 0.990 -3.000 0.750 1.000 Y NA
 5701505 5701506 Aflv_2633 Aflv_2634     FALSE 0.010 126.000 0.000 NA   NA
 5701508 5701509 Aflv_2636 Aflv_2637     FALSE 0.016 102.000 0.000 NA   NA
 5701510 5701511 Aflv_2638 Aflv_2639   secA FALSE 0.154 -27.000 0.000 NA   NA
 5701511 5701512 Aflv_2639 Aflv_2640 secA   TRUE 0.925 -37.000 0.519 NA   NA
 5701517 5701518 Aflv_2645 Aflv_2646     FALSE 0.146 -36.000 0.000 NA   NA
 5701518 5701519 Aflv_2646 Aflv_2647     FALSE 0.205 61.000 0.010 NA   NA
 5701519 5701520 Aflv_2647 Aflv_2648     FALSE 0.360 83.000 0.010 0.004   NA
 5701520 5701521 Aflv_2648 Aflv_2649     FALSE 0.368 37.000 0.015 NA   NA
 5701521 5701522 Aflv_2649 Aflv_2650   comK FALSE 0.057 41.000 0.000 NA   NA
 5701522 5701523 Aflv_2650 Aflv_2651 comK tlpB FALSE 0.244 89.000 0.000 NA N NA
 5701523 5701524 Aflv_2651 Aflv_2652 tlpB   FALSE 0.019 94.000 0.000 NA   NA
 5701524 5701525 Aflv_2652 Aflv_2653     FALSE 0.154 -27.000 0.000 NA   NA
 5701525 5701526 Aflv_2653 Aflv_2654     FALSE 0.124 -141.000 0.000 NA   NA
 5701526 5701527 Aflv_2654 Aflv_2655   tagA FALSE 0.321 -36.000 0.000 1.000   NA
 5701530 5701531 Aflv_2658 Aflv_2659     FALSE 0.170 -3.000 0.000 NA   NA
 5701531 5701532 Aflv_2659 Aflv_2660     FALSE 0.048 97.000 0.000 1.000   NA
 5701533 5701534 Aflv_2661 Aflv_2662     FALSE 0.004 172.000 0.000 NA   NA
 5701535 5701536 Aflv_2663 Aflv_2664     TRUE 0.936 -3.000 0.458 1.000   NA
 5701537 5701538 Aflv_2665 Aflv_2666   galE FALSE 0.232 92.000 0.000 NA N NA
 5701538 5701539 Aflv_2666 Aflv_2667 galE   TRUE 0.872 29.000 0.000 1.000 Y NA
 5701539 5701540 Aflv_2667 Aflv_2668   rbsB FALSE 0.015 649.000 0.000 1.000 N NA
 5701540 5701541 Aflv_2668 Aflv_2669 rbsB rbsC TRUE 0.980 28.000 0.847 1.000 Y NA
 5701541 5701542 Aflv_2669 Aflv_2670 rbsC rbsA TRUE 0.981 0.000 0.358 1.000 Y NA
 5701542 5701543 Aflv_2670 Aflv_2671 rbsA rbsD TRUE 0.974 14.000 0.243 1.000 Y NA
 5701543 5701544 Aflv_2671 Aflv_2672 rbsD rbsK TRUE 0.979 -3.000 0.183 1.000 Y NA
 5701544 5701545 Aflv_2672 Aflv_2673 rbsK rbsR TRUE 0.918 -3.000 0.094 1.000 N NA
 5701545 5701546 Aflv_2673 Aflv_2674 rbsR gtaB FALSE 0.134 133.000 0.000 1.000 N NA
 5701546 5701547 Aflv_2674 Aflv_2675 gtaB   FALSE 0.101 22.000 0.000 NA   NA
 5701547 5701548 Aflv_2675 Aflv_2676     FALSE 0.001 488.000 0.000 NA   NA
 5701548 5701549 Aflv_2676 Aflv_2677     FALSE 0.008 134.000 0.000 NA   NA
 5701549 5701550 Aflv_2677 Aflv_2678     FALSE 0.178 67.000 0.006 NA   NA
 5701550 5701551 Aflv_2678 Aflv_2679     FALSE 0.179 84.000 0.019 NA   NA
 5701551 5701552 Aflv_2679 Aflv_2680   flhP TRUE 0.889 14.000 0.395 NA   NA
 5701552 5701553 Aflv_2680 Aflv_2681 flhP flhO TRUE 0.979 11.000 0.248 0.002 Y NA
 5701553 5701554 Aflv_2681 Aflv_2682 flhO   FALSE 0.069 163.000 0.000 NA N NA
 5701554 5701555 Aflv_2682 Aflv_2683   mbl FALSE 0.062 170.000 0.000 NA N NA
 5701555 5701556 Aflv_2683 Aflv_2684 mbl spoIIID FALSE 0.473 93.000 0.284 NA   NA
 5701556 5701557 Aflv_2684 Aflv_2685 spoIIID spoIIQ FALSE 0.002 223.000 0.000 NA   NA
 5701557 5701558 Aflv_2685 Aflv_2686 spoIIQ spoIID TRUE 0.831 33.000 0.135 1.000 N NA
 5701558 5701559 Aflv_2686 Aflv_2687 spoIID murAA TRUE 0.948 -7.000 0.243 1.000 N NA
 5701559 5701560 Aflv_2687 Aflv_2688 murAA   TRUE 0.858 11.000 0.346 NA   NA
 5701560 5701561 Aflv_2688 Aflv_2689     TRUE 0.814 10.000 0.228 NA   NA
 5701561 5701562 Aflv_2689 Aflv_2690   nuoN FALSE 0.461 40.000 0.047 NA   NA
 5701562 5701563 Aflv_2690 Aflv_2691 nuoN nuoM TRUE 0.973 5.000 0.128 0.002 Y NA
 5701563 5701564 Aflv_2691 Aflv_2692 nuoM nuoL TRUE 0.971 0.000 0.041 0.002 Y NA
 5701564 5701565 Aflv_2692 Aflv_2693 nuoL nuoK TRUE 0.928 61.000 0.253 0.004 Y NA
 5701565 5701566 Aflv_2693 Aflv_2694 nuoK nuoJ TRUE 0.992 -3.000 0.506 0.002 Y NA
 5701566 5701567 Aflv_2694 Aflv_2695 nuoJ nuoI TRUE 0.987 -3.000 0.223 0.004 Y NA
 5701567 5701568 Aflv_2695 Aflv_2696 nuoI nuoH TRUE 0.954 23.000 0.035 0.004 Y NA
 5701568 5701569 Aflv_2696 Aflv_2697 nuoH nuoD TRUE 0.984 0.000 0.258 0.004 Y NA
 5701569 5701570 Aflv_2697 Aflv_2698 nuoD nuoC TRUE 0.936 4.000 0.000 0.004 Y NA
 5701570 5701571 Aflv_2698 Aflv_2699 nuoC nuoB TRUE 0.939 4.000 0.000 0.002 Y NA
 5701571 5701572 Aflv_2699 Aflv_2700 nuoB nuoA TRUE 0.980 -30.000 0.091 0.002 Y NA
 5701572 5701573 Aflv_2700 Aflv_2701 nuoA atpC FALSE 0.531 122.000 0.003 1.000 Y NA
 5701573 5701574 Aflv_2701 Aflv_2702 atpC atpD TRUE 0.988 25.000 0.837 0.002 Y NA
 5701574 5701575 Aflv_2702 Aflv_2703 atpD atpG TRUE 0.985 29.000 0.724 0.002 Y NA
 5701575 5701576 Aflv_2703 Aflv_2704 atpG atpA TRUE 0.966 60.000 0.846 0.002 Y NA
 5701576 5701577 Aflv_2704 Aflv_2705 atpA atpH TRUE 0.991 16.000 0.864 0.002 Y NA
 5701577 5701578 Aflv_2705 Aflv_2706 atpH atpF TRUE 0.987 -3.000 0.222 0.002 Y NA
 5701578 5701579 Aflv_2706 Aflv_2707 atpF atpE FALSE 0.444 138.000 0.402 0.002   NA
 5701579 5701580 Aflv_2707 Aflv_2708 atpE atpB TRUE 0.737 51.000 0.189 0.002   NA
 5701580 5701581 Aflv_2708 Aflv_2709 atpB atpI TRUE 0.868 7.000 0.330 1.000   NA
 5701581 5701582 Aflv_2709 Aflv_2710 atpI   TRUE 0.868 -3.000 0.187 NA   NA
 5701582 5701583 Aflv_2710 Aflv_2711     FALSE 0.006 149.000 0.000 NA   NA
 5701583 5701584 Aflv_2711 Aflv_2712   upp TRUE 0.749 -37.000 0.000 1.000 N NA
 5701584 5701585 Aflv_2712 Aflv_2713 upp glyA FALSE 0.385 107.000 0.051 1.000 N NA
 5701585 5701586 Aflv_2713 Aflv_2714 glyA   FALSE 0.443 67.000 0.145 NA   NA
 5701586 5701587 Aflv_2714 Aflv_2715   rpiB TRUE 0.878 -16.000 0.218 NA   NA
 5701587 5701588 Aflv_2715 Aflv_2716 rpiB tlpA TRUE 0.886 10.000 0.150 1.000 N NA
 5701588 5701589 Aflv_2716 Aflv_2717 tlpA   TRUE 0.962 15.000 0.105 1.000 Y NA
 5701589 5701590 Aflv_2717 Aflv_2718     FALSE 0.350 102.000 0.196 NA   NA
 5701590 5701591 Aflv_2718 Aflv_2719     FALSE 0.543 63.000 0.230 NA   NA
 5701591 5701592 Aflv_2719 Aflv_2720   spoIIR FALSE 0.104 143.000 0.062 NA   NA
 5701592 5701593 Aflv_2720 Aflv_2721 spoIIR hemK FALSE 0.393 91.000 0.178 NA   NA
 5701593 5701594 Aflv_2721 Aflv_2722 hemK prfA TRUE 0.973 -10.000 0.084 1.000 Y NA
 5701594 5701595 Aflv_2722 Aflv_2723 prfA tdk TRUE 0.685 48.000 0.062 1.000 N NA
 5701595 5701596 Aflv_2723 Aflv_2724 tdk rpmE FALSE 0.065 303.000 0.052 1.000 N NA
 5701596 5701597 Aflv_2724 Aflv_2725 rpmE rho FALSE 0.453 111.000 0.115 1.000 N NA
 5701597 5701598 Aflv_2725 Aflv_2726 rho glpX FALSE 0.115 170.000 0.005 1.000 N NA
 5701598 5701599 Aflv_2726 Aflv_2727 glpX murAB TRUE 0.918 -51.000 0.170 1.000 N NA
 5701599 5701600 Aflv_2727 Aflv_2728 murAB   TRUE 0.805 25.000 0.049 1.000 N NA
 5701600 5701601 Aflv_2728 Aflv_2729   fbaA TRUE 0.844 57.000 0.061 1.000 Y NA
 5701601 5701602 Aflv_2729 Aflv_2730 fbaA spoF FALSE 0.216 178.000 0.170 1.000 N NA
 5701604 5701605 Aflv_2732 Aflv_2733 pyrG rpoE FALSE 0.165 157.000 0.029 1.000 N NA
 5701605 5701606 Aflv_2733 Aflv_2734 rpoE   FALSE 0.475 72.000 0.023 1.000 N NA
 5701606 5701607 Aflv_2734 Aflv_2735     TRUE 0.885 10.000 0.146 1.000 N NA
 5701607 5701608 Aflv_2735 Aflv_2736   acdA TRUE 0.937 8.000 0.432 1.000 N NA
 5701608 5701609 Aflv_2736 Aflv_2737 acdA mmgC TRUE 0.989 -3.000 0.270 0.002 Y NA
 5701609 5701610 Aflv_2737 Aflv_2738 mmgC mmgB TRUE 0.964 14.000 0.110 1.000 Y NA
 5701610 5701611 Aflv_2738 Aflv_2739 mmgB mmgA TRUE 0.968 0.000 0.118 1.000 Y NA
 5701611 5701612 Aflv_2739 Aflv_2740 mmgA   FALSE 0.343 146.000 0.205 1.000 N NA
 5701614 5701615 Aflv_2742 Aflv_2743 argS   TRUE 0.797 -3.000 0.079 NA   NA
 5701615 5701616 Aflv_2743 Aflv_2744     FALSE 0.015 105.000 0.000 NA   NA
 5701616 5701617 Aflv_2744 Aflv_2745     TRUE 0.982 -3.000 0.300 NA Y NA
 5701618 5701619 Aflv_2746 Aflv_2747     TRUE 0.683 51.000 0.333 NA   NA
 5701619 5701620 Aflv_2747 Aflv_2748     FALSE 0.019 96.000 0.000 NA   NA
 5701621 5701622 Aflv_2749 Aflv_2750 speB speE TRUE 0.965 13.000 0.141 1.000 Y NA
 5701624 5701625 Aflv_2752 Aflv_2753     TRUE 0.623 18.000 0.044 NA   NA
 5701627 5701628 Aflv_2755 Aflv_2756     TRUE 0.688 4.000 0.071 NA   NA
 5701628 5701629 Aflv_2756 Aflv_2757     FALSE 0.179 98.000 0.039 NA   NA
 5701631 5701632 Aflv_2759 Aflv_2760   pta TRUE 0.901 -69.000 0.123 1.000 N NA
 5701633 5701634 Aflv_2761 Aflv_2762     FALSE 0.033 59.000 0.000 NA   NA
 5701634 5701635 Aflv_2762 Aflv_2763   cwlJ FALSE 0.093 122.000 0.023 NA   NA
 5701635 5701636 Aflv_2763 Aflv_2764 cwlJ gerQ TRUE 0.924 15.000 0.722 NA   NA
 5701637 5701638 Aflv_2765 Aflv_2766     TRUE 0.615 12.000 0.042 NA   NA
 5701640 5701641 Aflv_2768 Aflv_2769     TRUE 0.621 36.000 0.105 NA   NA
 5701641 5701642 Aflv_2769 Aflv_2770   ung TRUE 0.709 -25.000 0.044 NA   NA
 5701642 5701643 Aflv_2770 Aflv_2771 ung   FALSE 0.394 56.000 0.000 1.000 N NA
 5701643 5701644 Aflv_2771 Aflv_2772   ahpF FALSE 0.029 300.000 0.000 1.000 N NA
 5701644 5701645 Aflv_2772 Aflv_2773 ahpF ahpC TRUE 0.984 14.000 0.551 1.000 Y NA
 5701645 5701646 Aflv_2773 Aflv_2774 ahpC   FALSE 0.002 237.000 0.000 NA   NA
 5701646 5701647 Aflv_2774 Aflv_2775     FALSE 0.110 12.000 0.000 NA   NA
 5701647 5701648 Aflv_2775 Aflv_2776     TRUE 0.657 -85.000 0.044 NA   NA
 5701648 5701649 Aflv_2776 Aflv_2777     FALSE 0.071 162.000 0.000 NA N NA
 5701649 5701650 Aflv_2777 Aflv_2778   cdd FALSE 0.071 162.000 0.000 NA N NA
 5701650 5701651 Aflv_2778 Aflv_2779 cdd   FALSE 0.516 26.000 0.031 NA   NA
 5701651 5701652 Aflv_2779 Aflv_2780   dra FALSE 0.521 16.000 0.013 NA   NA
 5701652 5701653 Aflv_2780 Aflv_2781 dra   TRUE 0.818 52.000 0.009 1.000 Y NA
 5701653 5701654 Aflv_2781 Aflv_2782   deoR FALSE 0.295 85.000 0.000 1.000 N NA
 5701654 5701655 Aflv_2782 Aflv_2783 deoR sacA FALSE 0.187 114.000 0.000 1.000 N NA
 5701655 5701656 Aflv_2783 Aflv_2784 sacA sacK TRUE 0.974 -12.000 0.104 1.000 Y NA
 5701656 5701657 Aflv_2784 Aflv_2785 sacK sacP TRUE 0.915 36.000 0.062 1.000 Y NA
 5701657 5701658 Aflv_2785 Aflv_2786 sacP sacT FALSE 0.068 190.000 0.075 1.000   NA
 5701658 5701659 Aflv_2786 Aflv_2787 sacT crr TRUE 0.584 40.000 0.077 1.000   NA
 5701660 5701661 Aflv_2788 Aflv_2789 yukF ald FALSE 0.547 121.000 0.360 1.000 N NA
 5701662 5701663 Aflv_2790 Aflv_2791 glnQ   TRUE 0.986 -3.000 0.392 1.000 Y NA
 5701663 5701664 Aflv_2791 Aflv_2792     TRUE 0.904 64.000 0.179 0.019 Y NA
 5701665 5701666 Aflv_2793 Aflv_2794     TRUE 0.739 50.000 0.135 1.000 N NA
 5701667 5701668 Aflv_2795 Aflv_2796 pgcM   FALSE 0.368 -7.000 0.000 1.000   NA
 5701668 5701669 Aflv_2796 Aflv_2797     FALSE 0.247 6.000 0.000 1.000   NA
 5701669 5701670 Aflv_2797 Aflv_2798     FALSE 0.110 12.000 0.000 NA   NA
 5701670 5701671 Aflv_2798 Aflv_2799     FALSE 0.170 -3.000 0.000 NA   NA
 5701671 5701672 Aflv_2799 Aflv_2800     TRUE 0.786 10.000 0.182 NA   NA
 5701672 5701673 Aflv_2800 Aflv_2801     FALSE 0.168 147.000 0.182 NA   NA
 5701673 5701674 Aflv_2801 Aflv_2802     TRUE 0.951 -31.000 1.000 NA   NA
 5701674 5701675 Aflv_2802 Aflv_2803   yybN FALSE 0.477 82.000 0.222 NA   NA
 5701676 5701677 Aflv_2804 Aflv_2805     FALSE 0.173 -9.000 0.000 NA   NA
 5701677 5701678 Aflv_2805 Aflv_2806     FALSE 0.107 5.000 0.000 NA   NA
 5701680 5701681 Aflv_2808 Aflv_2809   degU TRUE 0.988 -43.000 0.704 1.000 Y NA
 5701682 5701683 Aflv_2810 Aflv_2811     TRUE 0.907 -57.000 0.444 NA   NA
 5701683 5701684 Aflv_2811 Aflv_2812     TRUE 0.899 -16.000 0.286 NA   NA
 5701684 5701685 Aflv_2812 Aflv_2813     TRUE 0.759 55.000 0.667 NA   NA
 5701685 5701686 Aflv_2813 Aflv_2814     FALSE 0.003 203.000 0.000 NA   NA
 5701686 5701687 Aflv_2814 Aflv_2815     FALSE 0.008 137.000 0.000 NA   NA
 5701687 5701688 Aflv_2815 Aflv_2816     FALSE 0.021 91.000 0.000 NA   NA
 5701689 5701690 Aflv_2817 Aflv_2818   gerSA FALSE 0.361 -3.000 0.000 1.000   NA
 5701690 5701691 Aflv_2818 Aflv_2819 gerSA   TRUE 0.933 1.000 0.385 0.005   NA
 5701691 5701692 Aflv_2819 Aflv_2820     TRUE 0.962 -102.000 0.923 0.005   NA
 5701692 5701693 Aflv_2820 Aflv_2821   msmX FALSE 0.023 135.000 0.000 1.000   NA
 5701693 5701694 Aflv_2821 Aflv_2822 msmX   TRUE 0.992 -13.000 0.928 1.000 Y NA
 5701694 5701695 Aflv_2822 Aflv_2823     TRUE 0.991 -18.000 0.492 0.014 Y NA
 5701695 5701696 Aflv_2823 Aflv_2824     TRUE 0.987 -3.000 0.253 0.014 Y NA
 5701696 5701697 Aflv_2824 Aflv_2825     FALSE 0.308 178.000 0.000 0.014 Y NA
 5701698 5701699 Aflv_2826 Aflv_2827     FALSE 0.106 6.000 0.000 NA   NA
 5701699 5701700 Aflv_2827 Aflv_2828     TRUE 0.897 5.000 0.182 1.000 N NA
 5701700 5701701 Aflv_2828 Aflv_2829     FALSE 0.056 90.000 0.000 1.000   NA
 5701701 5701702 Aflv_2829 Aflv_2830     FALSE 0.001 525.000 0.000 NA   NA
 5701702 5701703 Aflv_2830 Aflv_2831     FALSE 0.001 681.000 0.000 NA   NA
 5701703 5701704 Aflv_2831 Aflv_2832     FALSE 0.001 1189.000 0.000 NA   NA
 5701704 5701705 Aflv_2832 Aflv_2833     TRUE 0.619 0.000 0.025 NA   NA
 5701705 5701706 Aflv_2833 Aflv_2834     TRUE 0.705 55.000 0.452 NA   NA
 5701706 5701707 Aflv_2834 Aflv_2835     FALSE 0.200 113.000 0.060 1.000   NA
 5701707 5701708 Aflv_2835 Aflv_2836     TRUE 0.861 -3.000 0.176 NA   NA
 5701708 5701709 Aflv_2836 Aflv_2837     TRUE 0.947 -34.000 0.890 NA   NA
 5701709 5701710 Aflv_2837 Aflv_2838     FALSE 0.006 149.000 0.000 NA   NA
 5701710 5701711 Aflv_2838 Aflv_2839     FALSE 0.159 -22.000 0.000 NA   NA
 5701711 5701712 Aflv_2839 Aflv_2840   yycF TRUE 0.987 5.000 0.597 0.011 Y NA
 5701712 5701713 Aflv_2840 Aflv_R122 yycF trnF FALSE 0.019 94.000 0.000 NA   NA
 5701713 5701714 Aflv_R122 Aflv_R123 trnF trnD FALSE 0.039 52.000 0.000 NA   NA
 5701714 5701715 Aflv_R123 Aflv_2841 trnD purA FALSE 0.018 97.000 0.000 NA   NA
 5701715 5701716 Aflv_2841 Aflv_2842 purA dnaC FALSE 0.440 83.000 0.018 1.000 N NA
 5701716 5701717 Aflv_2842 Aflv_2843 dnaC rplI TRUE 0.559 71.000 0.064 1.000 N NA
 5701717 5701718 Aflv_2843 Aflv_2844 rplI   TRUE 0.870 -3.000 0.020 1.000 N NA
 5701718 5701719 Aflv_2844 Aflv_2845     TRUE 0.747 19.000 0.116 NA   NA
 5701719 5701720 Aflv_2845 Aflv_2846   rpsR FALSE 0.361 62.000 0.069 NA   NA
 5701720 5701721 Aflv_2846 Aflv_2847 rpsR ssb TRUE 0.812 15.000 0.015 1.000 N NA
 5701721 5701722 Aflv_2847 Aflv_2848 ssb rpsF TRUE 0.796 18.000 0.015 1.000 N NA
 5701722 5701723 Aflv_2848 Aflv_2849 rpsF   TRUE 0.701 96.000 0.029 1.000 Y NA
 5701723 5701724 Aflv_2849 Aflv_2850     TRUE 0.659 21.000 0.064 NA   NA
 5701724 5701725 Aflv_2850 Aflv_2851     TRUE 0.758 24.000 0.171 NA   NA
 5701727 5701728 Aflv_2853 Aflv_2854   spo0J FALSE 0.522 18.000 0.017 NA   NA
 5701728 5701729 Aflv_2854 Aflv_2855 spo0J soj TRUE 0.976 -7.000 0.827 1.000 N NA
 5701729 5701730 Aflv_2855 Aflv_2856 soj   FALSE 0.506 90.000 0.069 1.000 N NA
 5701730 5701731 Aflv_2856 Aflv_2857   gidB TRUE 0.916 -3.000 0.089 1.000 N NA
 5701731 5701732 Aflv_2857 Aflv_2858 gidB gidA TRUE 0.940 11.000 0.466 1.000 N NA
 5701732 5701733 Aflv_2858 Aflv_2859 gidA trmE TRUE 0.906 -15.000 0.266 1.000   NA
 5701733 5701734 Aflv_2859 Aflv_2860 trmE jag FALSE 0.131 161.000 0.116 1.000   NA
 5701734 5701735 Aflv_2860 Aflv_2861 jag spoIIIJ TRUE 0.813 -3.000 0.071 1.000   NA
 5701735 5701736 Aflv_2861 Aflv_2862 spoIIIJ rnpA FALSE 0.513 64.000 0.025 1.000 N NA
 5701736 5701737 Aflv_2862 Aflv_2863 rnpA rpmH TRUE 0.760 64.000 0.787 1.000   NA