MicrobesOnline Operon Predictions for Clostridium perfringens D str. JGS1721

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
6088824	6088825	CJD_2803	CJD_2802	tdk		FALSE	0.446	26.000	0.000	NA		NA
6088825	6088826	CJD_2802	CJD_2801		prfA	TRUE	0.792	57.000	0.060	1.000		NA
6088826	6088827	CJD_2801	CJD_2800	prfA		TRUE	0.632	79.000	0.009	NA		NA
6088827	6088828	CJD_2800	CJD_2799			TRUE	0.860	23.000	0.020	NA		NA
6088828	6088829	CJD_2799	CJD_2798		rpiB	FALSE	0.190	264.000	0.020	NA	N	NA
6088829	6088830	CJD_2798	CJD_2797	rpiB	upp	TRUE	0.692	45.000	0.019	1.000	N	NA
6088830	6088831	CJD_2797	CJD_2796	upp	mnaA	FALSE	0.116	64.000	0.000	1.000	N	NA
6088831	6088832	CJD_2796	CJD_2795	mnaA		FALSE	0.305	268.000	0.083	1.000	N	NA
6088832	6088833	CJD_2795	CJD_2794			FALSE	0.005	682.000	0.000	NA		NA
6088833	6088834	CJD_2794	CJD_2793		atpB	FALSE	0.257	66.000	0.000	NA		NA
6088834	6088835	CJD_2793	CJD_2792	atpB	atpE	TRUE	0.747	61.000	0.069	0.009		NA
6088835	6088836	CJD_2792	CJD_2791	atpE	atpF	TRUE	0.880	100.000	0.643	0.008		NA
6088836	6088837	CJD_2791	CJD_2790	atpF	atpH	TRUE	0.985	3.000	0.040	0.008	Y	NA
6088837	6088838	CJD_2790	CJD_2789	atpH	atpA	TRUE	0.996	11.000	0.864	0.008	Y	NA
6088838	6088839	CJD_2789	CJD_2788	atpA	atpG	TRUE	0.978	65.000	0.846	0.008	Y	NA
6088839	6088840	CJD_2788	CJD_2787	atpG	atpD	TRUE	0.995	14.000	0.724	0.008	Y	NA
6088840	6088841	CJD_2787	CJD_2786	atpD	atpC	TRUE	0.995	16.000	0.837	0.008	Y	NA
6088841	6088842	CJD_2786	CJD_2785	atpC		FALSE	0.122	182.000	0.000	NA		NA
6088842	6088843	CJD_2785	CJD_2784		murA	FALSE	0.483	23.000	0.000	NA		NA
6088843	6088844	CJD_2784	CJD_2783	murA	spoIID	TRUE	0.856	112.000	0.243	1.000	N	NA
6088844	6088845	CJD_2783	CJD_2782	spoIID		FALSE	0.103	111.000	0.000	1.000	N	NA
6088845	6088846	CJD_2782	CJD_2781		spoIIID	FALSE	0.188	77.000	0.000	1.000		NA
6088846	6088847	CJD_2781	CJD_2780	spoIIID	mbl	TRUE	0.879	91.000	0.284	1.000		NA
6088849	6088850	CJD_2778	CJD_2777			TRUE	0.642	2.000	0.000	NA		NA
6088850	6088851	CJD_2777	CJD_2776			FALSE	0.146	165.000	0.000	NA		NA
6088851	6088852	CJD_2776	CJD_2775			TRUE	0.641	5.000	0.000	NA		NA
6088852	6088853	CJD_2775	CJD_2774			TRUE	0.643	4.000	0.000	NA		NA
6088853	6088854	CJD_2774	CJD_2773			TRUE	0.543	19.000	0.000	NA		NA
6088854	6088855	CJD_2773	CJD_2772			TRUE	0.641	5.000	0.000	NA		NA
6088855	6088856	CJD_2772	CJD_2771			FALSE	0.460	25.000	0.000	NA		NA
6088856	6088857	CJD_2771	CJD_2770			TRUE	0.641	5.000	0.000	NA		NA
6088857	6088858	CJD_2770	CJD_2769		metK	FALSE	0.010	430.000	0.000	NA		NA
6088860	6088861	CJD_2767	CJD_2766			TRUE	0.941	18.000	0.069	NA		NA
6088861	6088862	CJD_2766	CJD_2765			TRUE	0.875	-24.000	0.005	NA		NA
6088862	6088863	CJD_2765	CJD_2764		yfiA	FALSE	0.111	452.000	0.080	NA		NA
6088863	6088864	CJD_2764	CJD_2763	yfiA	secA	FALSE	0.371	235.000	0.050	NA	N	NA
6088864	6088865	CJD_2763	CJD_2762	secA	prfB	FALSE	0.094	377.000	0.048	1.000	N	NA
6088867	6088868	CJD_2760	CJD_2759			FALSE	0.017	346.000	0.000	NA		NA
6088869	6088870	CJD_2758	CJD_2757	rimI		TRUE	0.965	0.000	0.127	1.000		NA
6088870	6088871	CJD_2757	CJD_2756			TRUE	0.974	-6.000	0.217	NA		NA
6088872	6088873	CJD_2755	CJD_2754			FALSE	0.039	262.000	0.000	NA		NA
6088873	6088874	CJD_2754	CJD_2753			FALSE	0.431	27.000	0.000	NA		NA
6088874	6088875	CJD_2753	CJD_2752			FALSE	0.158	157.000	0.000	NA		NA
6088875	6088876	CJD_2752	CJD_2751			FALSE	0.134	140.000	0.000	1.000		NA
6088876	6088877	CJD_2751	CJD_2750			FALSE	0.024	278.000	0.000	1.000		NA
6088877	6088878	CJD_2750	CJD_2749			TRUE	0.977	-10.000	0.330	NA		NA
6088878	6088879	CJD_2749	CJD_2748			FALSE	0.382	212.000	0.021	NA		NA
6088879	6088880	CJD_2748	CJD_2747		ptsG	FALSE	0.056	171.000	0.000	1.000	N	NA
6088880	6088881	CJD_2747	CJD_2746	ptsG		FALSE	0.008	324.000	0.000	1.000	N	NA
6088881	6088882	CJD_2746	CJD_2745			FALSE	0.122	182.000	0.000	NA		NA
6088882	6088883	CJD_2745	CJD_2744			FALSE	0.044	255.000	0.000	NA		NA
6088883	6088884	CJD_2744	CJD_2743			TRUE	0.640	86.000	0.017	1.000		NA
6088884	6088885	CJD_2743	CJD_2742			FALSE	0.144	166.000	0.000	NA		NA
6088885	6088886	CJD_2742	CJD_2741			FALSE	0.238	105.000	0.000	NA		NA
6088886	6088887	CJD_2741	CJD_2740			FALSE	0.127	146.000	0.000	1.000		NA
6088889	6088890	CJD_2738	CJD_2737	pepD		FALSE	0.015	314.000	0.000	1.000		NA
6088890	6088891	CJD_2737	CJD_2736			FALSE	0.039	262.000	0.000	NA		NA
6088891	6088892	CJD_2736	CJD_2735		maf	FALSE	0.069	226.000	0.000	NA		NA
6088892	6088893	CJD_2735	CJD_2734	maf		TRUE	0.836	47.000	0.074	NA	N	NA
6088893	6088894	CJD_2734	CJD_2733		mreB	TRUE	0.887	20.000	0.040	1.000	N	NA
6088894	6088895	CJD_2733	CJD_2732	mreB	mreC	TRUE	0.981	4.000	0.689	1.000	N	NA
6088895	6088896	CJD_2732	CJD_2731	mreC	mreD	TRUE	0.970	16.000	0.550	0.004		NA
6088896	6088897	CJD_2731	CJD_2730	mreD		TRUE	0.958	9.000	0.089	1.000		NA
6088897	6088898	CJD_2730	CJD_2729		minC	FALSE	0.319	247.000	0.060	1.000	N	NA
6088898	6088899	CJD_2729	CJD_2728	minC	minD	TRUE	0.989	29.000	0.368	1.000	Y	NA
6088899	6088900	CJD_2728	CJD_2727	minD	minE	TRUE	0.996	11.000	0.347	NA	Y	NA
6088900	6088901	CJD_2727	CJD_2726	minE		TRUE	0.768	148.000	0.000	NA	Y	NA
6088901	6088902	CJD_2726	CJD_2725			FALSE	0.161	153.000	0.000	NA		NA
6088902	6088903	CJD_2725	CJD_2724			TRUE	0.631	-3.000	0.000	NA		NA
6088903	6088904	CJD_2724	CJD_2723			TRUE	0.769	132.000	0.098	1.000		NA
6088904	6088905	CJD_2723	CJD_2722			TRUE	0.978	-16.000	0.420	NA		NA
6088905	6088906	CJD_2722	CJD_2721			TRUE	0.967	17.000	0.180	NA		NA
6088906	6088907	CJD_2721	CJD_2720		rplU	TRUE	0.891	126.000	0.018	0.027	Y	NA
6088907	6088908	CJD_2720	CJD_2719	rplU		TRUE	0.882	76.000	0.208	NA		NA
6088908	6088909	CJD_2719	CJD_2718		rpmA	TRUE	0.975	4.000	0.203	NA		NA
6088909	6088910	CJD_2718	CJD_2717	rpmA	obg	TRUE	0.802	168.000	0.335	1.000		NA
6088910	6088911	CJD_2717	CJD_2716	obg		TRUE	0.925	18.000	0.046	NA		NA
6088911	6088912	CJD_2716	CJD_2715		nadD	TRUE	0.969	2.000	0.150	NA	N	NA
6088912	6088913	CJD_2715	CJD_2714	nadD		TRUE	0.995	3.000	0.199	1.000	Y	NA
6088913	6088914	CJD_2714	CJD_2713			TRUE	0.855	23.000	0.033	1.000	N	NA
6088914	6088915	CJD_2713	CJD_2712			TRUE	0.953	-3.000	0.093	1.000	N	NA
6088917	6088918	CJD_2710	CJD_2709		selD	FALSE	0.177	144.000	0.000	NA		NA
6088918	6088919	CJD_2709	CJD_2708	selD	selA	TRUE	0.584	17.000	0.000	NA		NA
6088919	6088920	CJD_2708	CJD_2707	selA	selB	TRUE	0.972	1.000	0.569	0.001	N	NA
6088920	6088921	CJD_2707	CJD_2706	selB		FALSE	0.114	187.000	0.000	NA		NA
6088921	6088922	CJD_2706	CJD_2705		rumA	FALSE	0.419	28.000	0.000	NA		NA
6088922	6088923	CJD_2705	CJD_2704	rumA		FALSE	0.006	458.000	0.000	1.000		NA
6088923	6088924	CJD_2704	CJD_2703			FALSE	0.087	2.000	0.000	0.004		NA
6088926	6088927	CJD_2701	CJD_2700			FALSE	0.096	202.000	0.000	NA		NA
6088927	6088928	CJD_2700	CJD_2699			TRUE	0.623	13.000	0.000	NA		NA
6088928	6088929	CJD_2699	CJD_2698			FALSE	0.136	172.000	0.000	NA		NA
6088929	6088930	CJD_2698	CJD_2697			TRUE	0.640	1.000	0.000	NA		NA
6088930	6088931	CJD_2697	CJD_2696			TRUE	0.959	18.000	0.131	NA		NA
6088933	6088934	CJD_2694	CJD_2693			TRUE	0.629	12.000	0.000	NA		NA
6088934	6088935	CJD_2693	CJD_2692			FALSE	0.193	133.000	0.000	NA		NA
6088935	6088936	CJD_2692	CJD_2691		virI	FALSE	0.095	203.000	0.000	NA		NA
6088936	6088937	CJD_2691	CJD_2690	virI	virJ	TRUE	0.996	-10.000	0.692	1.000	Y	NA
6088937	6088938	CJD_2690	CJD_2689	virJ		FALSE	0.221	117.000	0.000	NA		NA
6088938	6088939	CJD_2689	CJD_2688			TRUE	0.543	19.000	0.000	NA		NA
6088939	6088940	CJD_2688	CJD_2687			FALSE	0.007	507.000	0.000	NA		NA
6088942	6088943	CJD_2685	CJD_2684			TRUE	0.946	19.000	0.000	1.000	Y	NA
6088946	6088947	CJD_2682	CJD_2680			FALSE	0.038	267.000	0.000	NA		NA
6088948	6088949	CJD_2679	CJD_2678			TRUE	0.953	5.000	0.000	0.019	Y	NA
6088949	6088950	CJD_2678	CJD_2677			FALSE	0.007	341.000	0.000	1.000	N	NA
6088950	6088951	CJD_2677	CJD_2676		modA	FALSE	0.371	-15.000	0.000	1.000	N	NA
6088951	6088952	CJD_2676	CJD_2675	modA	modB	TRUE	0.995	4.000	0.430	0.001	Y	NA
6088952	6088953	CJD_2675	CJD_2674	modB	moaC	FALSE	0.159	39.000	0.000	1.000	N	NA
6088953	6088954	CJD_2674	CJD_2673	moaC		FALSE	0.179	94.000	0.000	1.000		NA
6088954	6088955	CJD_2673	CJD_2672			TRUE	0.978	-3.000	0.667	0.090		NA
6088955	6088956	CJD_2672	CJD_2671			FALSE	0.012	285.000	0.000	1.000	N	NA
6088956	6088957	CJD_2671	CJD_2670			TRUE	0.938	18.000	0.000	0.031	Y	NA
6088957	6088958	CJD_2670	CJD_2669			FALSE	0.241	319.000	0.000	1.000	Y	NA
6088960	6088961	CJD_2667	CJD_2666			TRUE	0.781	141.000	0.000	NA	Y	NA
6088961	6088962	CJD_2666	CJD_2665			TRUE	0.873	49.000	0.000	NA	Y	NA
6088962	6088963	CJD_2665	CJD_2664			FALSE	0.006	349.000	0.000	1.000	N	NA
6088963	6088964	CJD_2664	CJD_2663			FALSE	0.056	238.000	0.000	NA		NA
6088965	6088966	CJD_2662	CJD_2661	ytaF	uvdE	FALSE	0.245	85.000	0.000	NA		NA
6088967	6088968	CJD_2660	CJD_2659		ybbB	FALSE	0.050	246.000	0.000	NA		NA
6088968	6088969	CJD_2659	CJD_2658	ybbB		TRUE	0.618	-10.000	0.000	NA		NA
6088969	6088970	CJD_2658	CJD_2657		gyrA	TRUE	0.995	14.000	0.552	0.003	Y	NA
6088970	6088971	CJD_2657	CJD_2656	gyrA		TRUE	0.918	12.000	0.020	NA		NA
6088971	6088972	CJD_2656	CJD_2655			FALSE	0.321	214.000	0.012	NA		NA
6088972	6088973	CJD_2655	CJD_2654		recJ	TRUE	0.860	12.000	0.002	1.000		NA
6088975	6088976	CJD_2652	CJD_2651	murG		FALSE	0.257	207.000	0.006	1.000	N	NA
6088976	6088977	CJD_2651	CJD_2650		nifJ	TRUE	0.905	105.000	0.016	0.035	Y	NA
6088977	6088978	CJD_2650	CJD_2649	nifJ		FALSE	0.002	727.000	0.000	1.000	N	NA
6088978	6088979	CJD_2649	CJD_2648			FALSE	0.215	120.000	0.000	NA		NA
6088979	6088980	CJD_2648	CJD_2647			FALSE	0.006	586.000	0.000	NA		NA
6088980	6088981	CJD_2647	CJD_2646			FALSE	0.087	210.000	0.000	NA		NA
6088981	6088982	CJD_2646	CJD_2645			TRUE	0.777	84.000	0.055	NA		NA
6088986	6088987	CJD_2641	CJD_2640	deoC		FALSE	0.039	201.000	0.000	1.000	N	NA
6088987	6088988	CJD_2640	CJD_2639		spoIIAA	FALSE	0.502	134.000	0.014	1.000	N	NA
6088988	6088989	CJD_2639	CJD_2638	spoIIAA	spoIIAB	TRUE	0.995	14.000	0.669	0.002	Y	NA
6088989	6088990	CJD_2638	CJD_2637	spoIIAB	sigF	TRUE	0.975	18.000	0.842	1.000	N	NA
6088990	6088991	CJD_2637	CJD_2636	sigF	spoVAC	TRUE	0.753	138.000	0.078	NA		NA
6088991	6088992	CJD_2636	CJD_2635	spoVAC	spoVAD	TRUE	0.980	6.000	0.386	NA		NA
6088992	6088993	CJD_2635	CJD_2634	spoVAD	spoVAE	TRUE	0.906	65.000	0.386	NA		NA
6088993	6088994	CJD_2634	CJD_2633	spoVAE		FALSE	0.285	52.000	0.000	NA		NA
6088994	6088995	CJD_2633	CJD_2632		holA	TRUE	0.901	44.000	0.163	NA		NA
6088997	6088998	CJD_0916	CJD_0915			FALSE	0.001	401.000	0.000	0.032		NA
6088998	6088999	CJD_0915	CJD_0914			FALSE	0.100	170.000	0.000	1.000		NA
6088999	6089000	CJD_0914	CJD_0913		def	FALSE	0.011	292.000	0.000	1.000	N	NA
6089000	6089001	CJD_0913	CJD_0912	def		FALSE	0.042	235.000	0.000	NA	N	NA
6089003	6089004	CJD_0910	CJD_0909			TRUE	0.773	49.000	0.040	1.000		NA
6089006	6089007	CJD_0907	CJD_0906			FALSE	0.101	169.000	0.000	1.000		NA
6089009	6089010	CJD_0904	CJD_0903			FALSE	0.285	52.000	0.000	NA		NA
6089010	6089011	CJD_0903	CJD_0902			FALSE	0.048	249.000	0.000	NA		NA
6089011	6089012	CJD_0902	CJD_0901			FALSE	0.023	237.000	0.000	1.000	N	NA
6089012	6089013	CJD_0901	CJD_0900			FALSE	0.345	17.000	0.000	1.000	N	NA
6089015	6089016	CJD_0898	CJD_0897			FALSE	0.094	204.000	0.000	NA		NA
6089016	6089017	CJD_0897	CJD_0896		cstA	FALSE	0.197	131.000	0.000	NA		NA
6089017	6089018	CJD_0896	CJD_0895	cstA		FALSE	0.003	457.000	0.000	1.000	N	NA
6089018	6089019	CJD_0895	CJD_0894			FALSE	0.003	527.000	0.000	1.000	N	NA
6089019	6089020	CJD_0894	CJD_0893			TRUE	0.960	26.000	0.600	NA	N	NA
6089020	6089021	CJD_0893	CJD_0892		trx	FALSE	0.016	308.000	0.000	NA	N	NA
6089021	6089022	CJD_0892	CJD_0891	trx		FALSE	0.009	309.000	0.000	1.000	N	NA
6089022	6089023	CJD_0891	CJD_0890			TRUE	0.874	89.000	0.200	NA		NA
6089023	6089024	CJD_0890	CJD_0889			TRUE	0.795	106.000	0.070	NA		NA
6089026	6089027	CJD_0887	CJD_0886			FALSE	0.203	128.000	0.000	NA		NA
6089027	6089028	CJD_0886	CJD_0885			FALSE	0.009	374.000	0.000	1.000		NA
6089028	6089029	CJD_0885	CJD_0884			FALSE	0.032	104.000	0.000	0.061		NA
6089029	6089030	CJD_0884	CJD_0883			FALSE	0.010	426.000	0.000	NA		NA
6089030	6089031	CJD_0883	CJD_0882			FALSE	0.302	48.000	0.000	NA		NA
6089031	6089032	CJD_0882	CJD_0881		splB	FALSE	0.002	666.000	0.000	1.000	N	NA
6089032	6089033	CJD_0881	CJD_0880	splB		FALSE	0.066	204.000	0.000	1.000		NA
6089033	6089034	CJD_0880	CJD_0879			FALSE	0.144	131.000	0.000	1.000		NA
6089034	6089035	CJD_0879	CJD_0878			FALSE	0.045	188.000	0.000	1.000	N	NA
6089035	6089036	CJD_0878	CJD_0877			FALSE	0.009	455.000	0.000	NA		NA
6089036	6089037	CJD_0877	CJD_0876			FALSE	0.163	152.000	0.000	NA		NA
6089037	6089038	CJD_0876	CJD_0875			FALSE	0.278	55.000	0.000	NA		NA
6089038	6089039	CJD_0875	CJD_0874			FALSE	0.116	186.000	0.000	NA		NA
6089039	6089040	CJD_0874	CJD_0873			FALSE	0.073	221.000	0.000	NA		NA
6089040	6089041	CJD_0873	CJD_0872			FALSE	0.252	77.000	0.000	NA		NA
6089041	6089042	CJD_0872	CJD_0871			FALSE	0.041	259.000	0.000	NA		NA
6089043	6089044	CJD_0870	CJD_0869			FALSE	0.270	59.000	0.000	NA		NA
6089045	6089046	CJD_0868	CJD_0867			FALSE	0.167	115.000	0.000	1.000		NA
6089046	6089047	CJD_0867	CJD_0866			TRUE	0.983	-3.000	0.894	NA	N	NA
6089047	6089048	CJD_0866	CJD_0865			FALSE	0.004	574.000	0.000	NA	N	NA
6089048	6089049	CJD_0865	CJD_0864			FALSE	0.162	115.000	0.000	NA	N	NA
6089049	6089050	CJD_0864	CJD_0863			TRUE	0.642	2.000	0.000	NA		NA
6089050	6089051	CJD_0863	CJD_0862			FALSE	0.207	126.000	0.000	NA		NA
6089051	6089052	CJD_0862	CJD_0861			FALSE	0.084	212.000	0.000	NA		NA
6089052	6089053	CJD_0861	CJD_0860			TRUE	0.642	2.000	0.000	NA		NA
6089053	6089054	CJD_0860	CJD_0859			FALSE	0.209	125.000	0.000	NA		NA
6089054	6089055	CJD_0859	CJD_0858			FALSE	0.004	736.000	0.000	NA		NA
6089057	6089058	CJD_0856	CJD_0855	aroQ	aroK	TRUE	0.834	67.000	0.000	1.000	Y	NA
6089058	6089059	CJD_0855	CJD_0854	aroK	aroE	TRUE	0.557	255.000	0.002	1.000	Y	NA
6089059	6089060	CJD_0854	CJD_0853	aroE		FALSE	0.058	824.000	0.000	1.000	Y	NA
6089060	6089061	CJD_0853	CJD_0852		aroC	TRUE	0.776	170.000	0.004	0.003	Y	NA
6089061	6089062	CJD_0852	CJD_0851	aroC	aroA	TRUE	0.953	64.000	0.057	1.000	Y	NA
6089062	6089063	CJD_0851	CJD_0850	aroA	aroB	TRUE	0.732	249.000	0.051	1.000	Y	NA
6089063	6089064	CJD_0850	CJD_0849	aroB	aroF	TRUE	0.865	121.000	0.008	0.003	Y	NA
6089064	6089065	CJD_0849	CJD_0848	aroF		FALSE	0.144	166.000	0.000	NA		NA
6089065	6089066	CJD_0848	CJD_0847			FALSE	0.131	175.000	0.000	NA		NA
6089066	6089067	CJD_0847	CJD_0846			FALSE	0.011	400.000	0.000	NA		NA
6089068	6089069	CJD_0845	CJD_0844	argG	argH	TRUE	0.974	94.000	0.278	1.000	Y	NA
6089070	6089071	CJD_0843	CJD_0842			FALSE	0.007	534.000	0.000	NA		NA
6089073	6089074	CJD_0840	CJD_0839	purD	purH	TRUE	0.970	116.000	0.238	1.000	Y	NA
6089074	6089075	CJD_0839	CJD_0838	purH	purN	TRUE	0.960	13.000	0.000	1.000	Y	NA
6089075	6089076	CJD_0838	CJD_0837	purN	purM	TRUE	0.943	-12.000	0.000	0.002	Y	NA
6089076	6089077	CJD_0837	CJD_0836	purM	purF	TRUE	0.995	1.000	0.248	1.000	Y	NA
6089077	6089078	CJD_0836	CJD_0835	purF	purC	TRUE	0.776	250.000	0.082	1.000	Y	NA
6089078	6089079	CJD_0835	CJD_0834	purC	purE	TRUE	0.988	0.000	0.035	1.000	Y	NA
6089079	6089080	CJD_0834	CJD_0833	purE		FALSE	0.438	311.000	0.012	1.000	Y	NA
6089080	6089081	CJD_0833	CJD_0832		thiC	FALSE	0.022	238.000	0.000	1.000	N	NA
6089081	6089082	CJD_0832	CJD_0831	thiC	dut	FALSE	0.003	502.000	0.000	1.000	N	NA
6089082	6089083	CJD_0831	CJD_0830	dut		FALSE	0.060	236.000	0.000	NA		NA
6089083	6089084	CJD_0830	CJD_0829			FALSE	0.110	190.000	0.000	NA		NA
6089084	6089085	CJD_0829	CJD_0828			FALSE	0.037	270.000	0.000	NA		NA
6089085	6089086	CJD_0828	CJD_0827			TRUE	0.564	18.000	0.000	NA		NA
6089086	6089087	CJD_0827	CJD_0826		birA	FALSE	0.160	155.000	0.000	NA		NA
6089087	6089088	CJD_0826	CJD_0825	birA		FALSE	0.101	198.000	0.000	NA		NA
6089090	6089091	CJD_0823	CJD_0822			FALSE	0.323	42.000	0.000	NA		NA
6089091	6089092	CJD_0822	CJD_0821			FALSE	0.354	35.000	0.000	NA		NA
6089092	6089093	CJD_0821	CJD_0820			FALSE	0.119	185.000	0.000	NA		NA
6089095	6089096	CJD_0818	CJD_0817			FALSE	0.007	511.000	0.000	NA		NA
6089097	6089098	CJD_0816	CJD_0815			FALSE	0.005	719.000	0.000	NA		NA
6089098	6089099	CJD_0815	CJD_0814			FALSE	0.014	322.000	0.000	1.000		NA
6089100	6089101	CJD_0813	CJD_0812			TRUE	0.993	19.000	0.308	1.000	Y	NA
6089101	6089102	CJD_0812	CJD_0811			TRUE	0.816	139.000	0.154	NA		NA
6089102	6089103	CJD_0811	CJD_0810			TRUE	0.835	108.000	0.115	NA		NA
6089103	6089104	CJD_0810	CJD_0809			TRUE	0.870	97.000	0.431	0.015		NA
6089104	6089105	CJD_0809	CJD_0808			TRUE	0.691	185.000	0.235	0.015		NA
6089105	6089106	CJD_0808	CJD_0807			TRUE	0.946	25.000	0.214	1.000		NA
6089108	6089109	CJD_0805	CJD_0804			TRUE	0.983	9.000	0.810	NA	N	NA
6089109	6089110	CJD_0804	CJD_0803			FALSE	0.016	349.000	0.000	NA		NA
6089110	6089111	CJD_0803	CJD_0802			FALSE	0.158	157.000	0.000	NA		NA
6089111	6089112	CJD_0802	CJD_0801			TRUE	0.943	14.000	0.052	NA		NA
6089112	6089113	CJD_0801	CJD_0800			TRUE	0.722	118.000	0.043	NA		NA
6089113	6089114	CJD_0800	CJD_0799			FALSE	0.024	308.000	0.000	NA		NA
6089115	6089116	CJD_1651	CJD_1652			FALSE	0.243	88.000	0.000	NA		NA
6089116	6089117	CJD_1652	CJD_1653		cobK	FALSE	0.383	13.000	0.000	1.000	N	NA
6089117	6089118	CJD_1653	CJD_1654	cobK	cobJ	TRUE	0.992	19.000	0.423	0.016	Y	NA
6089118	6089119	CJD_1654	CJD_1655	cobJ	cbiG	TRUE	0.951	155.000	0.352	0.016	Y	NA
6089119	6089120	CJD_1655	CJD_1656	cbiG	cobM	TRUE	0.995	3.000	0.397	0.016	Y	NA
6089120	6089121	CJD_1656	CJD_1657	cobM	cobI	TRUE	0.975	51.000	0.291	0.016	Y	NA
6089121	6089122	CJD_1657	CJD_1658	cobI	cbiT	TRUE	0.952	0.000	0.000	0.016	Y	NA
6089122	6089123	CJD_1658	CJD_1659	cbiT	cbiE	TRUE	0.919	20.000	0.000	0.001	Y	NA
6089123	6089124	CJD_1659	CJD_1660	cbiE	cbiD	TRUE	0.948	28.000	0.008	0.016	Y	NA
6089124	6089125	CJD_1660	CJD_1661	cbiD	cobH	TRUE	0.990	18.000	0.168	0.016	Y	NA
6089125	6089126	CJD_1661	CJD_1662	cobH	cbiK	TRUE	0.962	0.000	0.000	1.000	Y	NA
6089128	6089129	CJD_1664	CJD_1665		entD	FALSE	0.035	276.000	0.000	NA		NA
6089129	6089130	CJD_1665	CJD_1666	entD		FALSE	0.013	382.000	0.000	NA		NA
6089130	6089131	CJD_1666	CJD_1667			TRUE	0.954	34.000	0.933	NA		NA
6089131	6089132	CJD_1667	CJD_1668			FALSE	0.005	508.000	0.000	1.000		NA
6089132	6089133	CJD_1668	CJD_1669			FALSE	0.012	135.000	0.000	0.010		NA
6089133	6089134	CJD_1669	CJD_1670		sodF	FALSE	0.043	235.000	0.000	1.000		NA
6089134	6089135	CJD_1670	CJD_1671	sodF		FALSE	0.261	63.000	0.000	NA		NA
6089137	6089138	CJD_1673	CJD_1674		mgtE	FALSE	0.390	31.000	0.000	NA		NA
6089138	6089139	CJD_1674	CJD_1675	mgtE		TRUE	0.603	-28.000	0.000	NA		NA
6089139	6089140	CJD_1675	CJD_1676			FALSE	0.006	561.000	0.000	NA		NA
6089142	6089143	CJD_1678	CJD_1679			FALSE	0.305	47.000	0.000	NA		NA
6089143	6089144	CJD_1679	CJD_1680			FALSE	0.217	119.000	0.000	NA		NA
6089144	6089145	CJD_1680	CJD_1681			FALSE	0.111	189.000	0.000	NA		NA
6089145	6089146	CJD_1681	CJD_1682			TRUE	0.641	5.000	0.000	NA		NA
6089146	6089147	CJD_1682	CJD_1683			FALSE	0.006	576.000	0.000	NA		NA
6089147	6089148	CJD_1683	CJD_1684			FALSE	0.032	284.000	0.000	NA		NA
6089148	6089149	CJD_1684	CJD_1685			FALSE	0.241	92.000	0.000	NA		NA
6089149	6089150	CJD_1685	CJD_1686			FALSE	0.079	215.000	0.000	NA		NA
6089150	6089151	CJD_1686	CJD_1687			TRUE	0.635	10.000	0.000	NA		NA
6089151	6089152	CJD_1687	CJD_1688			FALSE	0.007	524.000	0.000	NA		NA
6089152	6089153	CJD_1688	CJD_1689			FALSE	0.125	180.000	0.000	NA		NA
6089153	6089154	CJD_1689	CJD_1690		gltA	FALSE	0.471	24.000	0.000	NA		NA
6089154	6089155	CJD_1690	CJD_1691	gltA		FALSE	0.081	-7.000	0.000	0.034	N	NA
6089155	6089156	CJD_1691	CJD_1692		adh1	TRUE	0.745	150.000	0.000	1.000	Y	NA
6089156	6089157	CJD_1692	CJD_1693	adh1		FALSE	0.007	329.000	0.000	1.000	N	NA
6089158	6089159	CJD_1694	CJD_1696			FALSE	0.264	62.000	0.000	NA		NA
6089160	6089161	CJD_1697	CJD_1698			TRUE	0.903	115.000	0.564	NA		NA
6089163	6089164	CJD_1700	CJD_1701	cas	csn	TRUE	0.983	1.000	0.546	NA		NA
6089164	6089165	CJD_1701	CJD_1702	csn		FALSE	0.040	261.000	0.000	NA		NA
6089165	6089166	CJD_1702	CJD_1703			TRUE	0.642	2.000	0.000	NA		NA
6089166	6089167	CJD_1703	CJD_1704			FALSE	0.483	23.000	0.000	NA		NA
6089167	6089168	CJD_1704	CJD_1705			TRUE	0.623	13.000	0.000	NA		NA
6089168	6089169	CJD_1705	CJD_1706			TRUE	0.633	11.000	0.000	NA		NA
6089169	6089170	CJD_1706	CJD_1707			FALSE	0.211	122.000	0.000	NA		NA
6089170	6089171	CJD_1707	CJD_1708			TRUE	0.584	17.000	0.000	NA		NA
6089171	6089172	CJD_1708	CJD_1709			FALSE	0.446	26.000	0.000	NA		NA
6089172	6089173	CJD_1709	CJD_1710			TRUE	0.777	76.000	0.052	NA		NA
6089173	6089174	CJD_1710	CJD_1711			TRUE	0.835	178.000	0.740	NA		NA
6089174	6089175	CJD_1711	CJD_1712			FALSE	0.122	182.000	0.000	NA		NA
6089175	6089176	CJD_1712	CJD_1713			FALSE	0.026	298.000	0.000	NA		NA
6089176	6089177	CJD_1713	CJD_1714			FALSE	0.045	253.000	0.000	NA		NA
6089181	6089182	CJD_1718	CJD_1719	lacZ		FALSE	0.011	413.000	0.000	NA		NA
6089182	6089183	CJD_1719	CJD_1720			FALSE	0.010	437.000	0.000	NA		NA
6089183	6089184	CJD_1720	CJD_1721			FALSE	0.105	104.000	0.000	1.000	N	NA
6089184	6089185	CJD_1721	CJD_1722			FALSE	0.009	383.000	0.000	1.000		NA
6089185	6089186	CJD_1722	CJD_1723			TRUE	0.962	12.000	0.094	NA		NA
6089186	6089187	CJD_1723	CJD_1724			FALSE	0.005	647.000	0.000	NA		NA
6089187	6089188	CJD_1724	CJD_1725			FALSE	0.063	232.000	0.000	NA		NA
6089188	6089189	CJD_1725	CJD_1726			FALSE	0.038	267.000	0.000	NA		NA
6089189	6089190	CJD_1726	CJD_1727			FALSE	0.006	558.000	0.000	NA		NA
6089192	6089193	CJD_1729	CJD_1730			FALSE	0.012	387.000	0.000	NA		NA
6089193	6089194	CJD_1730	CJD_1731			FALSE	0.308	46.000	0.000	NA		NA
6089194	6089195	CJD_1731	CJD_1732			FALSE	0.017	302.000	0.000	1.000		NA
6089197	6089198	CJD_1734	CJD_1735			FALSE	0.507	16.000	0.000	1.000		NA
6089198	6089199	CJD_1735	CJD_1736			FALSE	0.343	27.000	0.000	1.000		NA
6089201	6089202	CJD_1738	CJD_1739			TRUE	0.928	26.000	0.000	NA	Y	NA
6089202	6089203	CJD_1739	CJD_1740			FALSE	0.483	23.000	0.000	NA		NA
6089203	6089204	CJD_1740	CJD_3339			FALSE	0.256	68.000	0.000	NA		NA
6089204	6089205	CJD_3339	CJD_1741		xpt	FALSE	0.019	328.000	0.000	NA		NA
6089207	6089208	CJD_1743	CJD_1744		smpB	FALSE	0.009	444.000	0.000	NA		NA
6089208	6089209	CJD_1744	CJD_1745	smpB	rnr	FALSE	0.005	659.000	0.000	NA		NA
6089211	6089212	CJD_3229	CJD_3228			FALSE	0.241	91.000	0.000	NA		NA
6089213	6089214	CJD_3227	CJD_3226			FALSE	0.022	64.000	0.000	0.028		NA
6089214	6089215	CJD_3226	CJD_3225		proB	FALSE	0.108	87.000	0.000	1.000	N	NA
6089215	6089216	CJD_3225	CJD_3224	proB	proA	TRUE	0.994	3.000	0.281	0.002	Y	NA
6089216	6089217	CJD_3224	CJD_3223	proA		FALSE	0.106	102.000	0.000	1.000	N	NA
6089217	6089218	CJD_3223	CJD_3222			FALSE	0.008	313.000	0.000	1.000	N	NA
6089218	6089219	CJD_3222	CJD_3221			FALSE	0.191	69.000	0.000	1.000		NA
6089221	6089222	CJD_3219	CJD_3218		carA	FALSE	0.203	128.000	0.000	NA		NA
6089222	6089223	CJD_3218	CJD_3217	carA	carB	TRUE	0.986	13.000	0.054	0.001	Y	NA
6089223	6089224	CJD_3217	CJD_3216	carB		FALSE	0.005	611.000	0.000	NA		NA
6089224	6089225	CJD_3216	CJD_3215			FALSE	0.054	240.000	0.000	NA		NA
6089227	6089228	CJD_3213	CJD_3212	murI		FALSE	0.060	236.000	0.000	NA		NA
6089228	6089229	CJD_3212	CJD_3211			FALSE	0.053	241.000	0.000	NA		NA
6089229	6089230	CJD_3211	CJD_3210			FALSE	0.410	29.000	0.000	NA		NA
6089230	6089231	CJD_3210	CJD_3209			TRUE	0.642	2.000	0.000	NA		NA
6089232	6089233	CJD_3208	CJD_3207			TRUE	0.978	-3.000	0.667	0.079		NA
6089234	6089235	CJD_3206	CJD_3205	cspA	cspB	FALSE	0.074	16.000	0.000	0.003		NA
6089235	6089236	CJD_3205	CJD_3204	cspB	cspC	FALSE	0.088	3.000	0.000	0.003		NA
6089236	6089237	CJD_3204	CJD_3203	cspC	sleC	FALSE	0.155	123.000	0.000	1.000		NA
6089239	6089240	CJD_3201	CJD_3200			TRUE	0.778	93.000	0.058	NA		NA
6089240	6089241	CJD_3200	CJD_3199		comB	TRUE	0.891	27.000	0.067	1.000		NA
6089241	6089242	CJD_3199	CJD_3198	comB		FALSE	0.040	261.000	0.000	NA		NA
6089242	6089243	CJD_3198	CJD_3197			FALSE	0.253	75.000	0.000	NA		NA
6089243	6089244	CJD_3197	CJD_3196		glpF	FALSE	0.253	76.000	0.000	NA		NA
6089244	6089245	CJD_3196	CJD_3195	glpF	glpP	FALSE	0.152	42.000	0.000	1.000	N	NA
6089245	6089246	CJD_3195	CJD_3194	glpP	glpK	FALSE	0.294	20.000	0.000	1.000	N	NA
6089246	6089247	CJD_3194	CJD_3193	glpK		FALSE	0.404	166.000	0.006	1.000		NA
6089247	6089248	CJD_3193	CJD_3192			TRUE	0.947	13.000	0.095	0.028		NA
6089248	6089249	CJD_3192	CJD_3191			TRUE	0.643	3.000	0.000	NA		NA
6089251	6089252	CJD_3189	CJD_3188		tenA	FALSE	0.010	425.000	0.000	NA		NA
6089252	6089253	CJD_3188	CJD_3187	tenA		TRUE	0.933	0.000	0.032	NA		NA
6089253	6089254	CJD_3187	CJD_3186			FALSE	0.197	131.000	0.000	NA		NA
6089254	6089255	CJD_3186	CJD_3185			FALSE	0.148	164.000	0.000	NA		NA
6089259	6089260	CJD_3181	CJD_3180			FALSE	0.105	105.000	0.000	1.000	N	NA
6089260	6089261	CJD_3180	CJD_3179			TRUE	0.963	4.000	0.000	1.000	Y	NA
6089261	6089262	CJD_3179	CJD_3178			FALSE	0.230	113.000	0.000	NA		NA
6089262	6089263	CJD_3178	CJD_3177			FALSE	0.111	189.000	0.000	NA		NA
6089265	6089266	CJD_3175	CJD_3174			TRUE	0.629	12.000	0.000	NA		NA
6089266	6089267	CJD_3174	CJD_3173		adhE	FALSE	0.010	429.000	0.000	NA		NA
6089267	6089268	CJD_3173	CJD_3172	adhE	pepP	FALSE	0.073	147.000	0.000	1.000	N	NA
6089268	6089269	CJD_3172	CJD_3171	pepP		FALSE	0.236	108.000	0.000	NA		NA
6089269	6089270	CJD_3171	CJD_3170			TRUE	0.842	132.000	0.205	NA		NA
6089270	6089271	CJD_3170	CJD_3169			FALSE	0.010	427.000	0.000	NA		NA
6089272	6089273	CJD_3168	CJD_3167			FALSE	0.354	35.000	0.000	NA		NA
6089274	6089275	CJD_3166	CJD_3165	metG	metG	TRUE	0.871	101.000	0.005	0.001	Y	NA
6089277	6089278	CJD_3163	CJD_3162			TRUE	0.837	19.000	0.004	NA		NA
6089278	6089279	CJD_3162	CJD_3161			FALSE	0.051	244.000	0.000	NA		NA
6089279	6089280	CJD_3161	CJD_3160			FALSE	0.132	141.000	0.000	1.000		NA
6089280	6089281	CJD_3160	CJD_3159		ksgA	TRUE	0.953	12.000	0.093	1.000	N	NA
6089281	6089282	CJD_3159	CJD_3158	ksgA		TRUE	0.595	100.000	0.006	NA		NA
6089282	6089283	CJD_3158	CJD_3157			TRUE	0.840	149.000	0.312	NA		NA
6089283	6089284	CJD_3157	CJD_3156		lgt	TRUE	0.585	94.000	0.005	NA		NA
6089284	6089285	CJD_3156	CJD_3155	lgt		TRUE	0.885	-10.000	0.006	NA		NA
6089285	6089286	CJD_3155	CJD_3154			TRUE	0.926	21.000	0.067	NA		NA
6089286	6089287	CJD_3154	CJD_3153			TRUE	0.558	147.000	0.029	1.000	N	NA
6089288	6089289	CJD_3152	CJD_3151			TRUE	0.643	3.000	0.000	NA		NA
6089289	6089290	CJD_3151	CJD_3150			FALSE	0.041	260.000	0.000	NA		NA
6089291	6089292	CJD_3149	CJD_3148	nrdD	add	FALSE	0.150	391.000	0.000	1.000	Y	NA
6089292	6089293	CJD_3148	CJD_3147	add		FALSE	0.005	383.000	0.000	1.000	N	NA
6089295	6089296	CJD_3145	CJD_3144	nrdG		FALSE	0.199	130.000	0.000	NA		NA
6089296	6089297	CJD_3144	CJD_3143			FALSE	0.168	149.000	0.000	NA		NA
6089302	6089303	CJD_3138	CJD_3137		punA	TRUE	0.831	80.000	0.000	1.000	Y	NA
6089303	6089304	CJD_3137	CJD_3136	punA		FALSE	0.098	116.000	0.000	1.000	N	NA
6089304	6089305	CJD_3136	CJD_3135		murC	FALSE	0.033	212.000	0.000	1.000	N	NA
6089306	6089307	CJD_3134	CJD_3133	purR		TRUE	0.791	111.000	0.099	1.000	N	NA
6089307	6089308	CJD_3133	CJD_3132		glmU	TRUE	0.760	210.000	0.011	1.000	Y	NA
6089308	6089309	CJD_3132	CJD_3131	glmU	prsA	TRUE	0.789	57.000	0.069	1.000	N	NA
6089309	6089310	CJD_3131	CJD_3130	prsA		FALSE	0.344	272.000	0.123	1.000	N	NA
6089310	6089311	CJD_3130	CJD_3129			TRUE	0.996	0.000	0.653	1.000	Y	NA
6089311	6089312	CJD_3129	CJD_3128			FALSE	0.282	21.000	0.000	1.000	N	NA
6089312	6089313	CJD_3128	CJD_3127		pth	FALSE	0.089	126.000	0.000	1.000	N	NA
6089313	6089314	CJD_3127	CJD_3126	pth	mfd	TRUE	0.906	31.000	0.137	1.000	N	NA
6089314	6089315	CJD_3126	CJD_3125	mfd		FALSE	0.484	149.000	0.016	1.000	N	NA
6089315	6089316	CJD_3125	CJD_3124		spoVT	TRUE	0.600	195.000	0.088	NA	N	NA
6089316	6089317	CJD_3124	CJD_3123	spoVT	spoVB	TRUE	0.685	183.000	0.108	NA		NA
6089317	6089318	CJD_3123	CJD_3122	spoVB		TRUE	0.778	30.000	0.015	1.000		NA
6089318	6089319	CJD_3122	CJD_3121			FALSE	0.077	217.000	0.000	NA		NA
6089323	6089324	CJD_2500	CJD_2501		folC	FALSE	0.103	111.000	0.000	1.000	N	NA
6089324	6089325	CJD_2501	CJD_2502	folC	valS	FALSE	0.088	297.000	0.006	1.000	N	NA
6089327	6089328	CJD_2504	CJD_2505		recX	TRUE	0.549	6.000	0.000	1.000		NA
6089328	6089329	CJD_2505	CJD_2506	recX		TRUE	0.899	6.000	0.015	1.000		NA
6089330	6089331	CJD_2507	CJD_2508			TRUE	0.996	0.000	0.750	1.000	Y	NA
6089332	6089333	CJD_2509	CJD_2510	fabG		FALSE	0.105	106.000	0.000	1.000	N	NA
6089333	6089334	CJD_2510	CJD_2511		glyA	FALSE	0.419	250.000	0.000	1.000	Y	NA
6089335	6089336	CJD_2512	CJD_2513			TRUE	0.640	1.000	0.000	NA		NA
6089337	6089338	CJD_2514	CJD_2515		aspS	FALSE	0.113	286.000	0.002	NA		NA
6089338	6089339	CJD_2515	CJD_2516	aspS	hisS	TRUE	0.974	21.000	0.028	0.039	Y	NA
6089339	6089340	CJD_2516	CJD_2517	hisS		TRUE	0.889	32.000	0.111	1.000	N	NA
6089340	6089341	CJD_2517	CJD_2518			TRUE	0.924	-10.000	0.035	1.000		NA
6089341	6089342	CJD_2518	CJD_2519		dtd	TRUE	0.616	160.000	0.048	1.000		NA
6089342	6089343	CJD_2519	CJD_2520	dtd	relA	TRUE	0.964	15.000	0.177	1.000	N	NA
6089343	6089344	CJD_2520	CJD_2521	relA	apt	TRUE	0.658	152.000	0.068	1.000	N	NA
6089344	6089345	CJD_2521	CJD_2522	apt		TRUE	0.678	44.000	0.010	1.000		NA
6089345	6089346	CJD_2522	CJD_2523		secF	FALSE	0.425	200.000	0.028	1.000		NA
6089346	6089347	CJD_2523	CJD_2524	secF	secD	TRUE	0.995	-7.000	0.516	0.002	Y	NA
6089347	6089348	CJD_2524	CJD_2525	secD		TRUE	0.736	98.000	0.048	1.000		NA
6089348	6089349	CJD_2525	CJD_2526			TRUE	0.915	70.000	0.540	NA		NA
6089349	6089350	CJD_2526	CJD_2527		yajC	FALSE	0.320	196.000	0.002	NA		NA
6089350	6089351	CJD_2527	CJD_2528	yajC	tgt	TRUE	0.788	39.000	0.035	NA	N	NA
6089351	6089352	CJD_2528	CJD_2529	tgt	queA	TRUE	0.958	24.000	0.014	0.001	Y	NA
6089352	6089353	CJD_2529	CJD_2530	queA	ruvB	TRUE	0.908	22.000	0.069	1.000	N	NA
6089353	6089354	CJD_2530	CJD_2531	ruvB	ruvA	TRUE	0.995	14.000	0.549	0.003	Y	NA
6089354	6089355	CJD_2531	CJD_2532	ruvA		FALSE	0.255	228.000	0.007	NA		NA
6089355	6089356	CJD_2532	CJD_2533			FALSE	0.026	299.000	0.000	NA		NA
6089356	6089357	CJD_2533	CJD_2534			FALSE	0.339	249.000	0.000	0.001	Y	NA
6089357	6089358	CJD_2534	CJD_2535			FALSE	0.018	249.000	0.000	1.000	N	NA
6089358	6089359	CJD_2535	CJD_2536		vhb	FALSE	0.003	476.000	0.000	1.000	N	NA
6089359	6089360	CJD_2536	CJD_2537	vhb		FALSE	0.010	425.000	0.000	NA		NA
6089360	6089361	CJD_2537	CJD_2538			TRUE	0.603	126.000	0.015	NA		NA
6089361	6089362	CJD_2538	CJD_2539			TRUE	0.901	6.000	0.015	1.000		NA
6089362	6089363	CJD_2539	CJD_2540			TRUE	0.967	15.000	0.176	1.000		NA
6089363	6089364	CJD_2540	CJD_2541			FALSE	0.323	42.000	0.000	NA		NA
6089364	6089365	CJD_2541	CJD_2542			FALSE	0.499	132.000	0.002	NA		NA
6089368	6089369	CJD_2545	CJD_2546			FALSE	0.127	178.000	0.000	NA		NA
6089369	6089370	CJD_2546	CJD_2547			FALSE	0.028	294.000	0.000	NA		NA
6089371	6089372	CJD_2548	CJD_2549			FALSE	0.302	48.000	0.000	NA		NA
6089373	6089374	CJD_2550	CJD_2551		potA	TRUE	0.930	32.000	0.326	1.000	N	NA
6089374	6089375	CJD_2551	CJD_2552	potA	potB	TRUE	0.997	3.000	0.928	1.000	Y	NA
6089375	6089376	CJD_2552	CJD_2553	potB	potC	TRUE	0.995	-6.000	0.492	0.027	Y	NA
6089376	6089377	CJD_2553	CJD_2554	potC	potD	TRUE	0.992	2.000	0.131	0.027	Y	NA
6089380	6089381	CJD_2557	CJD_2558			FALSE	0.142	168.000	0.000	NA		NA
6089384	6089385	CJD_2561	CJD_2562	asnA		FALSE	0.152	126.000	0.000	1.000		NA
6089385	6089386	CJD_2562	CJD_2563			FALSE	0.172	112.000	0.000	1.000		NA
6089386	6089387	CJD_2563	CJD_2564			TRUE	0.982	-7.000	0.869	1.000		NA
6089387	6089388	CJD_2564	CJD_2565			FALSE	0.240	98.000	0.000	NA		NA
6089389	6089390	CJD_2566	CJD_2567			FALSE	0.026	228.000	0.000	1.000	N	NA
6089390	6089391	CJD_2567	CJD_2568			FALSE	0.062	163.000	0.000	1.000	N	NA
6089391	6089392	CJD_2568	CJD_2569			TRUE	0.950	46.000	0.027	1.000	Y	NA
6089392	6089393	CJD_2569	CJD_2570			TRUE	0.995	-10.000	0.500	0.010	Y	NA
6089393	6089394	CJD_2570	CJD_2571			FALSE	0.092	121.000	0.000	1.000	N	NA
6089394	6089395	CJD_2571	CJD_2572			FALSE	0.152	121.000	0.000	NA	N	NA
6089395	6089396	CJD_2572	CJD_2573			FALSE	0.210	123.000	0.000	NA		NA
6089396	6089397	CJD_2573	CJD_2574			FALSE	0.183	140.000	0.000	NA		NA
6089397	6089398	CJD_2574	CJD_2575			FALSE	0.270	59.000	0.000	NA		NA
6089398	6089399	CJD_2575	CJD_2576			FALSE	0.285	52.000	0.000	NA		NA
6089399	6089400	CJD_2576	CJD_2577		coaE	TRUE	0.950	10.000	0.058	NA		NA
6089400	6089401	CJD_2577	CJD_2578	coaE	polA	TRUE	0.932	17.000	0.068	1.000	N	NA
6089401	6089402	CJD_2578	CJD_2579	polA		FALSE	0.076	142.000	0.000	1.000	N	NA
6089403	6089404	CJD_2580	CJD_2581			FALSE	0.248	83.000	0.000	NA		NA
6089405	6089406	CJD_2582	CJD_2583			TRUE	0.584	17.000	0.000	NA		NA
6089406	6089407	CJD_2583	CJD_2584			FALSE	0.088	209.000	0.000	NA		NA
6089407	6089408	CJD_2584	CJD_3352			FALSE	0.084	212.000	0.000	NA		NA
6089408	6089409	CJD_3352	CJD_2585			FALSE	0.243	88.000	0.000	NA		NA
6089409	6089410	CJD_2585	CJD_2586			FALSE	0.150	163.000	0.000	NA		NA
6089410	6089411	CJD_2586	CJD_2587			TRUE	0.951	18.000	0.095	NA		NA
6089411	6089412	CJD_2587	CJD_2588			TRUE	0.967	19.000	0.262	NA		NA
6089412	6089413	CJD_2588	CJD_2589			FALSE	0.007	511.000	0.000	NA		NA
6089413	6089414	CJD_2589	CJD_2590			TRUE	0.978	0.000	0.283	NA		NA
6089414	6089415	CJD_2590	CJD_2591			TRUE	0.925	14.000	0.028	NA		NA
6089415	6089416	CJD_2591	CJD_2592		rpoD	FALSE	0.316	237.000	0.026	NA		NA
6089416	6089417	CJD_2592	CJD_2593	rpoD	dnaG	TRUE	0.933	27.000	0.209	1.000	N	NA
6089417	6089418	CJD_2593	CJD_2594	dnaG		TRUE	0.586	169.000	0.056	1.000	N	NA
6089419	6089420	CJD_2595	CJD_2596			FALSE	0.316	44.000	0.000	NA		NA
6089421	6089422	CJD_2597	CJD_2598	ppdK		TRUE	0.642	101.000	0.019	1.000		NA
6089422	6089423	CJD_2598	CJD_2599			TRUE	0.714	205.000	0.273	NA		NA
6089423	6089424	CJD_2599	CJD_2600		recO	TRUE	0.895	6.000	0.007	NA		NA
6089424	6089425	CJD_2600	CJD_2601	recO	era	TRUE	0.829	76.000	0.108	1.000		NA
6089425	6089426	CJD_2601	CJD_2602	era	cdd	TRUE	0.954	9.000	0.077	1.000		NA
6089426	6089427	CJD_2602	CJD_2603	cdd		TRUE	0.634	44.000	0.008	1.000	N	NA
6089427	6089428	CJD_2603	CJD_2604			TRUE	0.783	28.000	0.009	NA		NA
6089428	6089429	CJD_2604	CJD_2605			TRUE	0.974	2.000	0.182	NA		NA
6089429	6089430	CJD_2605	CJD_2606			FALSE	0.342	37.000	0.000	NA		NA
6089431	6089432	CJD_0463	CJD_0462			FALSE	0.126	179.000	0.000	NA		NA
6089432	6089433	CJD_0462	CJD_0461			FALSE	0.372	33.000	0.000	NA		NA
6089433	6089434	CJD_0461	CJD_0460			FALSE	0.187	138.000	0.000	NA		NA
6089434	6089435	CJD_0460	CJD_0459			TRUE	0.643	3.000	0.000	NA		NA
6089435	6089436	CJD_0459	CJD_0458			FALSE	0.045	254.000	0.000	NA		NA
6089436	6089437	CJD_0458	CJD_0456			FALSE	0.042	258.000	0.000	NA		NA
6089437	6089438	CJD_0456	CJD_0455			FALSE	0.028	225.000	0.000	1.000	N	NA
6089438	6089439	CJD_0455	CJD_0454			TRUE	0.978	-3.000	0.667	0.077		NA
6089441	6089442	CJD_0452	CJD_0451			TRUE	0.995	-7.000	0.846	0.007	Y	NA
6089442	6089443	CJD_0451	CJD_0450			FALSE	0.012	393.000	0.000	NA		NA
6089443	6089444	CJD_0450	CJD_0449			FALSE	0.277	350.000	0.231	NA		NA
6089444	6089445	CJD_0449	CJD_0448			FALSE	0.007	520.000	0.000	NA		NA
6089445	6089446	CJD_0448	CJD_0446			FALSE	0.005	666.000	0.000	NA		NA
6089446	6089447	CJD_0446	CJD_0445			FALSE	0.014	369.000	0.000	NA		NA
6089447	6089448	CJD_0445	CJD_0444			TRUE	0.601	-31.000	0.000	NA		NA
6089448	6089449	CJD_0444	CJD_0443			FALSE	0.004	779.000	0.000	NA		NA
6089449	6089450	CJD_0443	CJD_0442			FALSE	0.255	69.000	0.000	NA		NA
6089450	6089451	CJD_0442	CJD_0441			FALSE	0.005	620.000	0.000	NA		NA
6089451	6089452	CJD_0441	CJD_0440			FALSE	0.254	71.000	0.000	NA		NA
6089452	6089453	CJD_0440	CJD_0439			TRUE	0.996	-22.000	0.704	NA	Y	NA
6089453	6089454	CJD_0439	CJD_0438			TRUE	0.618	-10.000	0.000	NA		NA
6089454	6089455	CJD_0438	CJD_0437			TRUE	0.599	16.000	0.000	NA		NA
6089455	6089456	CJD_0437	CJD_0436			TRUE	0.983	0.000	0.667	NA		NA
6089456	6089457	CJD_0436	CJD_0435			TRUE	0.633	11.000	0.000	NA		NA
6089457	6089458	CJD_0435	CJD_0434			TRUE	0.623	13.000	0.000	NA		NA
6089458	6089459	CJD_0434	CJD_0433			FALSE	0.241	91.000	0.000	NA		NA
6089459	6089460	CJD_0433	CJD_0432			FALSE	0.076	193.000	0.000	1.000		NA
6089460	6089461	CJD_0432	CJD_0431			FALSE	0.016	310.000	0.000	1.000		NA
6089461	6089462	CJD_0431	CJD_0430			FALSE	0.256	68.000	0.000	NA		NA
6089462	6089463	CJD_0430	CJD_0429			FALSE	0.230	113.000	0.000	NA		NA
6089463	6089464	CJD_0429	CJD_0428			TRUE	0.609	15.000	0.000	NA		NA
6089464	6089465	CJD_0428	CJD_0427			FALSE	0.137	171.000	0.000	NA		NA
6089465	6089466	CJD_0427	CJD_0426			FALSE	0.241	94.000	0.000	NA		NA
6089466	6089467	CJD_0426	CJD_0425			FALSE	0.013	375.000	0.000	NA		NA
6089467	6089468	CJD_0425	CJD_0424		rumA	FALSE	0.005	731.000	0.000	NA		NA
6089468	6089469	CJD_0424	CJD_0423	rumA		FALSE	0.010	300.000	0.000	1.000	N	NA
6089469	6089470	CJD_0423	CJD_0422		cls	FALSE	0.002	627.000	0.000	1.000	N	NA
6089470	6089471	CJD_0422	CJD_0421	cls		FALSE	0.014	175.000	0.000	0.053		NA
6089471	6089472	CJD_0421	CJD_0420			FALSE	0.024	307.000	0.000	NA		NA
6089472	6089473	CJD_0420	CJD_0419		pyk	FALSE	0.006	581.000	0.000	NA		NA
6089473	6089474	CJD_0419	CJD_0418	pyk	pfkA	TRUE	0.889	94.000	0.011	0.006	Y	NA
6089474	6089475	CJD_0418	CJD_0417	pfkA		FALSE	0.027	711.000	0.029	1.000	N	NA
6089476	6089477	CJD_0416	CJD_0415			TRUE	0.617	14.000	0.000	NA		NA
6089478	6089479	CJD_0414	CJD_0413			FALSE	0.135	173.000	0.000	NA		NA
6089479	6089480	CJD_0413	CJD_0412			TRUE	0.979	-21.000	0.470	NA		NA
6089480	6089481	CJD_0412	CJD_0411			TRUE	0.977	-3.000	0.259	NA		NA
6089481	6089482	CJD_0411	CJD_0410		murB	FALSE	0.439	240.000	0.080	NA		NA
6089482	6089483	CJD_0410	CJD_0409	murB	uvrC	FALSE	0.384	149.000	0.003	1.000	N	NA
6089483	6089484	CJD_0409	CJD_0408	uvrC		FALSE	0.385	157.000	0.005	1.000	N	NA
6089484	6089485	CJD_0408	CJD_0407			TRUE	0.974	1.000	0.285	1.000	N	NA
6089485	6089486	CJD_0407	CJD_0406			TRUE	0.953	14.000	0.070	NA		NA
6089486	6089487	CJD_0406	CJD_0405		uvrA	FALSE	0.070	335.000	0.002	NA		NA
6089489	6089490	CJD_0403	CJD_0402			TRUE	0.636	9.000	0.000	NA		NA
6089490	6089491	CJD_0402	CJD_0401			TRUE	0.624	-7.000	0.000	NA		NA
6089491	6089492	CJD_0401	CJD_0400			TRUE	0.942	15.000	0.053	NA		NA
6089492	6089493	CJD_0400	CJD_0399			FALSE	0.176	145.000	0.000	NA		NA
6089493	6089494	CJD_0399	CJD_0398			FALSE	0.059	166.000	0.000	1.000	N	NA
6089494	6089495	CJD_0398	CJD_0397			FALSE	0.083	132.000	0.000	1.000	N	NA
6089495	6089496	CJD_0397	CJD_0396			TRUE	0.609	15.000	0.000	NA		NA
6089496	6089497	CJD_0396	CJD_0395		recQ	FALSE	0.248	83.000	0.000	NA		NA
6089497	6089498	CJD_0395	CJD_0394	recQ	ogt	TRUE	0.862	49.000	0.000	1.000	Y	NA
6089498	6089499	CJD_0394	CJD_0393	ogt		FALSE	0.009	306.000	0.000	1.000	N	NA
6089499	6089500	CJD_0393	CJD_0392			FALSE	0.023	311.000	0.000	NA		NA
6089500	6089501	CJD_0392	CJD_0391			TRUE	0.960	16.000	0.114	NA		NA
6089503	6089504	CJD_0389	CJD_0388			TRUE	0.594	191.000	0.000	0.079	Y	NA
6089506	6089507	CJD_0386	CJD_0385	xpt		FALSE	0.006	557.000	0.000	NA		NA
6089508	6089509	CJD_0384	CJD_0383			FALSE	0.240	97.000	0.000	NA		NA
6089512	6089513	CJD_0379	CJD_0378			FALSE	0.471	24.000	0.000	NA		NA
6089515	6089516	CJD_0376	CJD_0375			TRUE	0.996	2.000	0.875	0.008	Y	NA
6089516	6089517	CJD_0375	CJD_0374			TRUE	0.995	13.000	0.875	0.010	Y	NA
6089517	6089518	CJD_0374	CJD_0373		lctP	TRUE	0.967	95.000	0.148	1.000	Y	NA
6089518	6089519	CJD_0373	CJD_0372	lctP		FALSE	0.023	237.000	0.000	1.000	N	NA
6089519	6089520	CJD_0372	CJD_0371			FALSE	0.369	15.000	0.000	1.000	N	NA
6089520	6089521	CJD_0371	CJD_0370			FALSE	0.069	151.000	0.000	1.000	N	NA
6089521	6089522	CJD_0370	CJD_0369			FALSE	0.073	221.000	0.000	NA		NA
6089522	6089523	CJD_0369	CJD_0368			TRUE	0.980	-7.000	0.426	NA		NA
6089523	6089524	CJD_0368	CJD_0367			FALSE	0.056	238.000	0.000	NA		NA
6089524	6089525	CJD_0367	CJD_0366		uvrB	FALSE	0.038	266.000	0.000	NA		NA
6089525	6089526	CJD_0366	CJD_0365	uvrB		FALSE	0.243	88.000	0.000	NA		NA
6089527	6089528	CJD_0586	CJD_0585			FALSE	0.248	83.000	0.000	NA		NA
6089528	6089529	CJD_0585	CJD_0584			FALSE	0.241	94.000	0.000	NA		NA
6089529	6089530	CJD_0584	CJD_0583			FALSE	0.144	166.000	0.000	NA		NA
6089530	6089531	CJD_0583	CJD_0582			TRUE	0.603	-28.000	0.000	NA		NA
6089531	6089532	CJD_0582	CJD_0581			FALSE	0.163	152.000	0.000	NA		NA
6089532	6089533	CJD_0581	CJD_0580			TRUE	0.636	9.000	0.000	NA		NA
6089533	6089534	CJD_0580	CJD_0579			TRUE	0.609	15.000	0.000	NA		NA
6089534	6089535	CJD_0579	CJD_0578			FALSE	0.348	36.000	0.000	NA		NA
6089535	6089536	CJD_0578	CJD_0577			TRUE	0.564	18.000	0.000	NA		NA
6089536	6089537	CJD_0577	CJD_0576			FALSE	0.004	944.000	0.000	NA		NA
6089537	6089538	CJD_0576	CJD_0575			TRUE	0.623	13.000	0.000	NA		NA
6089538	6089539	CJD_0575	CJD_0574			FALSE	0.491	17.000	0.000	1.000		NA
6089539	6089540	CJD_0574	CJD_0573			TRUE	0.543	19.000	0.000	NA		NA
6089540	6089541	CJD_0573	CJD_0572			TRUE	0.635	10.000	0.000	NA		NA
6089541	6089542	CJD_0572	CJD_0571			TRUE	0.993	21.000	0.667	0.017	Y	NA
6089542	6089543	CJD_0571	CJD_0570			TRUE	0.543	19.000	0.000	NA		NA
6089543	6089544	CJD_0570	CJD_0569			FALSE	0.023	310.000	0.000	NA		NA
6089544	6089545	CJD_0569	CJD_0568			TRUE	0.838	63.000	0.000	1.000	Y	NA
6089545	6089546	CJD_0568	CJD_0567			TRUE	0.564	18.000	0.000	NA		NA
6089546	6089547	CJD_0567	CJD_0566			FALSE	0.272	58.000	0.000	NA		NA
6089547	6089548	CJD_0566	CJD_0565			TRUE	0.982	18.000	0.047	0.017	Y	NA
6089548	6089549	CJD_0565	CJD_0564			TRUE	0.957	19.000	0.140	NA		NA
6089549	6089550	CJD_0564	CJD_0563			TRUE	0.921	26.000	0.091	NA		NA
6089550	6089551	CJD_0563	CJD_0562			TRUE	0.526	20.000	0.000	NA		NA
6089551	6089552	CJD_0562	CJD_0561			TRUE	0.945	-34.000	0.000	0.017	Y	NA
6089552	6089553	CJD_0561	CJD_0560			FALSE	0.418	21.000	0.000	1.000		NA
6089553	6089554	CJD_0560	CJD_0559			TRUE	0.966	3.000	0.104	NA		NA
6089556	6089557	CJD_0557	CJD_0556			FALSE	0.213	121.000	0.000	NA		NA
6089557	6089558	CJD_0556	CJD_0555			FALSE	0.197	131.000	0.000	NA		NA
6089558	6089559	CJD_0555	CJD_0554			TRUE	0.605	-25.000	0.000	NA		NA
6089559	6089560	CJD_0554	CJD_0553			FALSE	0.316	30.000	0.000	1.000		NA
6089560	6089561	CJD_0553	CJD_0552			FALSE	0.261	63.000	0.000	NA		NA
6089561	6089562	CJD_0552	CJD_0551			TRUE	0.564	18.000	0.000	NA		NA
6089562	6089563	CJD_0551	CJD_0550			FALSE	0.342	37.000	0.000	NA		NA
6089563	6089564	CJD_0550	CJD_0549			TRUE	0.909	131.000	0.023	1.000	Y	NA
6089564	6089565	CJD_0549	CJD_0548			FALSE	0.242	25.000	0.000	1.000	N	NA
6089565	6089566	CJD_0548	CJD_0547			FALSE	0.327	18.000	0.000	1.000	N	NA
6089566	6089567	CJD_0547	CJD_0546			FALSE	0.005	671.000	0.000	NA		NA
6089569	6089570	CJD_0544	CJD_0543			TRUE	0.994	-25.000	0.200	1.000	Y	NA
6089570	6089571	CJD_0543	CJD_0542			FALSE	0.064	230.000	0.000	NA		NA
6089571	6089572	CJD_0542	CJD_0541			FALSE	0.272	58.000	0.000	NA		NA
6089572	6089573	CJD_0541	CJD_0540			FALSE	0.025	306.000	0.000	NA		NA
6089575	6089576	CJD_0538	CJD_0537			FALSE	0.019	331.000	0.000	NA		NA
6089576	6089577	CJD_0537	CJD_0536			FALSE	0.230	113.000	0.000	NA		NA
6089577	6089578	CJD_0536	CJD_0535			FALSE	0.136	172.000	0.000	NA		NA
6089580	6089581	CJD_0533	CJD_0532			FALSE	0.056	238.000	0.000	NA		NA
6089581	6089582	CJD_0532	CJD_0531			TRUE	0.642	2.000	0.000	NA		NA
6089582	6089583	CJD_0531	CJD_0530			TRUE	0.642	2.000	0.000	NA		NA
6089583	6089584	CJD_0530	CJD_0529			FALSE	0.176	34.000	0.000	1.000	N	NA
6089584	6089585	CJD_0529	CJD_0528			FALSE	0.037	268.000	0.000	NA		NA
6089585	6089586	CJD_0528	CJD_0527			FALSE	0.110	190.000	0.000	NA		NA
6089586	6089587	CJD_0527	CJD_0526			FALSE	0.020	290.000	0.000	1.000		NA
6089587	6089588	CJD_0526	CJD_0525			TRUE	0.979	3.000	0.529	1.000	N	NA
6089588	6089589	CJD_0525	CJD_0524			TRUE	0.996	0.000	0.618	0.026	Y	NA
6089589	6089590	CJD_0524	CJD_0523			FALSE	0.035	277.000	0.000	NA		NA
6089591	6089592	CJD_0522	CJD_0521			TRUE	0.639	6.000	0.000	NA		NA
6089593	6089594	CJD_0520	CJD_0519			FALSE	0.013	377.000	0.000	NA		NA
6089594	6089595	CJD_0519	CJD_0518			FALSE	0.246	84.000	0.000	NA		NA
6089595	6089596	CJD_0518	CJD_0517			FALSE	0.032	283.000	0.000	NA		NA
6089598	6089599	CJD_0515	CJD_0514			FALSE	0.012	393.000	0.000	NA		NA
6089599	6089600	CJD_0514	CJD_0513			FALSE	0.085	211.000	0.000	NA		NA
6089600	6089601	CJD_0513	CJD_0512			FALSE	0.008	466.000	0.000	NA		NA
6089603	6089604	CJD_0510	CJD_0509	trmB		FALSE	0.178	103.000	0.000	1.000		NA
6089604	6089605	CJD_0509	CJD_0508			FALSE	0.054	215.000	0.000	NA	N	NA
6089605	6089606	CJD_0508	CJD_0507			FALSE	0.173	97.000	0.000	NA	N	NA
6089606	6089607	CJD_0507	CJD_0506			FALSE	0.005	647.000	0.000	NA		NA
6089607	6089608	CJD_0506	CJD_0505			TRUE	0.983	11.000	0.610	NA		NA
6089608	6089609	CJD_0505	CJD_0504			TRUE	0.809	259.000	0.167	1.000	Y	NA
6089609	6089610	CJD_0504	CJD_0503			FALSE	0.004	436.000	0.000	1.000	N	NA
6089610	6089611	CJD_0503	CJD_0502		hsp90	FALSE	0.061	164.000	0.000	1.000	N	NA
6089611	6089612	CJD_0502	CJD_0501	hsp90		FALSE	0.018	334.000	0.000	NA		NA
6089612	6089613	CJD_0501	CJD_0500			FALSE	0.460	25.000	0.000	NA		NA
6089613	6089614	CJD_0500	CJD_0499			FALSE	0.177	144.000	0.000	NA		NA
6089614	6089615	CJD_0499	CJD_0498			FALSE	0.078	216.000	0.000	NA		NA
6089615	6089616	CJD_0498	CJD_0497			FALSE	0.053	241.000	0.000	NA		NA
6089616	6089617	CJD_0497	CJD_0496			TRUE	0.641	5.000	0.000	NA		NA
6089617	6089618	CJD_0496	CJD_0495			FALSE	0.124	148.000	0.000	1.000		NA
6089618	6089619	CJD_0495	CJD_0494			FALSE	0.105	195.000	0.000	NA		NA
6089619	6089620	CJD_0494	CJD_0493			FALSE	0.026	300.000	0.000	NA		NA
6089620	6089621	CJD_0493	CJD_0492			FALSE	0.195	132.000	0.000	NA		NA
6089621	6089622	CJD_0492	CJD_0491		brnQ	FALSE	0.043	256.000	0.000	NA		NA
6089622	6089623	CJD_0491	CJD_0490	brnQ		FALSE	0.005	734.000	0.000	NA		NA
6089623	6089624	CJD_0490	CJD_0489			FALSE	0.089	208.000	0.000	NA		NA
6089624	6089625	CJD_0489	CJD_0488			TRUE	0.623	13.000	0.000	NA		NA
6089625	6089626	CJD_0488	CJD_0487			FALSE	0.069	226.000	0.000	NA		NA
6089626	6089627	CJD_0487	CJD_0486			FALSE	0.274	34.000	0.000	NA	N	NA
6089627	6089628	CJD_0486	CJD_0485			FALSE	0.107	90.000	0.000	1.000	N	NA
6089630	6089631	CJD_0483	CJD_0482	nadC	nadB	TRUE	0.987	-43.000	0.046	1.000	Y	NA
6089631	6089632	CJD_0482	CJD_0481	nadB	nadA	TRUE	0.989	5.000	0.042	1.000	Y	NA
6089632	6089633	CJD_0481	CJD_0480	nadA	garR	FALSE	0.009	307.000	0.000	1.000	N	NA
6089633	6089634	CJD_0480	CJD_0479	garR		FALSE	0.240	101.000	0.000	NA		NA
6089634	6089635	CJD_0479	CJD_0478			FALSE	0.209	125.000	0.000	NA		NA
6089636	6089637	CJD_0477	CJD_0476			FALSE	0.308	46.000	0.000	NA		NA
6089638	6089639	CJD_0475	CJD_0474	deoB	udp	FALSE	0.272	178.000	0.007	0.037	N	NA
6089641	6089642	CJD_2017	CJD_2018			TRUE	0.543	19.000	0.000	NA		NA
6089643	6089644	CJD_2019	CJD_2020			FALSE	0.023	279.000	0.000	1.000		NA
6089644	6089645	CJD_2020	CJD_2021			FALSE	0.026	268.000	0.000	1.000		NA
6089645	6089646	CJD_2021	CJD_2022			FALSE	0.011	294.000	0.000	1.000	N	NA
6089646	6089647	CJD_2022	CJD_2023			TRUE	0.996	0.000	0.778	0.013	Y	NA
6089647	6089648	CJD_2023	CJD_2024			TRUE	0.960	158.000	0.778	0.013	Y	NA
6089648	6089649	CJD_2024	CJD_2025			TRUE	0.960	156.000	0.786	0.008	Y	NA
6089651	6089652	CJD_2027	CJD_2028			FALSE	0.129	177.000	0.000	NA		NA
6089654	6089655	CJD_2030	CJD_2031	dut		FALSE	0.191	135.000	0.000	NA		NA
6089655	6089656	CJD_2031	CJD_2032			FALSE	0.245	85.000	0.000	NA		NA
6089658	6089659	CJD_2034	CJD_2035			TRUE	0.629	12.000	0.000	NA		NA
6089661	6089662	CJD_2037	CJD_2038			FALSE	0.217	119.000	0.000	NA		NA
6089664	6089665	CJD_2040	CJD_2041			FALSE	0.252	77.000	0.000	NA		NA
6089665	6089666	CJD_2041	CJD_2042			FALSE	0.330	40.000	0.000	NA		NA
6089666	6089667	CJD_2042	CJD_2043			FALSE	0.042	258.000	0.000	NA		NA
6089667	6089668	CJD_2043	CJD_2045			TRUE	0.511	21.000	0.000	NA		NA
6089668	6089669	CJD_2045	CJD_2046			TRUE	0.995	2.000	0.270	1.000	Y	NA
6089669	6089670	CJD_2046	CJD_2047			TRUE	0.996	-25.000	0.646	NA	Y	NA
6089670	6089671	CJD_2047	CJD_2048			FALSE	0.049	247.000	0.000	NA		NA
6089671	6089672	CJD_2048	CJD_2049			FALSE	0.092	205.000	0.000	NA		NA
6089672	6089673	CJD_2049	CJD_2050			FALSE	0.239	104.000	0.000	NA		NA
6089675	6089676	CJD_2052	CJD_2053			FALSE	0.254	71.000	0.000	NA		NA
6089676	6089677	CJD_2053	CJD_2054			FALSE	0.033	280.000	0.000	NA		NA
6089678	6089679	CJD_2055	CJD_2056			TRUE	0.978	17.000	0.569	NA		NA
6089680	6089681	CJD_2057	CJD_2058			FALSE	0.020	325.000	0.000	NA		NA
6089681	6089682	CJD_2058	CJD_2059		virS	FALSE	0.137	171.000	0.000	NA		NA
6089682	6089683	CJD_2059	CJD_2060	virS		TRUE	0.965	-6.000	0.000	NA	Y	NA
6089683	6089684	CJD_2060	CJD_2061			FALSE	0.079	139.000	0.000	1.000	N	NA
6089684	6089685	CJD_2061	CJD_2062			FALSE	0.240	97.000	0.000	NA		NA
6089685	6089686	CJD_2062	CJD_2063			FALSE	0.071	224.000	0.000	NA		NA
6089689	6089690	CJD_2066	CJD_2068			FALSE	0.085	211.000	0.000	NA		NA
6089691	6089692	CJD_2069	CJD_2070			FALSE	0.002	292.000	0.000	0.026		NA
6089692	6089693	CJD_2070	CJD_2071		topB	FALSE	0.015	313.000	0.000	1.000		NA
6089693	6089694	CJD_2071	CJD_2072	topB		FALSE	0.240	97.000	0.000	NA		NA
6089694	6089695	CJD_2072	CJD_2073			TRUE	0.974	10.000	0.196	NA		NA
6089695	6089696	CJD_2073	CJD_2074			FALSE	0.177	144.000	0.000	NA		NA
6089696	6089697	CJD_2074	CJD_2075			FALSE	0.089	208.000	0.000	NA		NA
6089697	6089698	CJD_2075	CJD_2076			FALSE	0.250	82.000	0.000	NA		NA
6089698	6089699	CJD_2076	CJD_2077			TRUE	0.965	15.000	0.130	NA		NA
6089699	6089700	CJD_2077	CJD_2078			FALSE	0.073	221.000	0.000	NA		NA
6089700	6089701	CJD_2078	CJD_2079			FALSE	0.053	241.000	0.000	NA		NA
6089701	6089702	CJD_2079	CJD_2080			FALSE	0.471	24.000	0.000	NA		NA
6089702	6089703	CJD_2080	CJD_2081		gdhA	FALSE	0.023	310.000	0.000	NA		NA
6089703	6089704	CJD_2081	CJD_2082	gdhA		FALSE	0.008	483.000	0.000	NA		NA
6089706	6089707	CJD_2084	CJD_2085			FALSE	0.483	23.000	0.000	NA		NA
6089709	6089710	CJD_2087	CJD_2088			FALSE	0.354	35.000	0.000	NA		NA
6089710	6089711	CJD_2088	CJD_2090			FALSE	0.005	620.000	0.000	NA		NA
6089711	6089712	CJD_2090	CJD_2091			FALSE	0.074	220.000	0.000	NA		NA
6089714	6089715	CJD_2093	CJD_2094			FALSE	0.068	227.000	0.000	NA		NA
6089715	6089716	CJD_2094	CJD_2095			TRUE	0.994	-7.000	0.174	1.000	Y	NA
6089716	6089717	CJD_2095	CJD_2096		scrR	TRUE	0.834	40.000	0.070	1.000	N	NA
6089717	6089718	CJD_2096	CJD_2097	scrR		TRUE	0.637	132.000	0.042	1.000	N	NA
6089718	6089719	CJD_2097	CJD_2098			FALSE	0.020	324.000	0.000	NA		NA
6089719	6089720	CJD_2098	CJD_2099			FALSE	0.007	512.000	0.000	NA		NA
6089720	6089721	CJD_2099	CJD_2100			TRUE	0.993	13.000	0.200	0.026	Y	NA
6089721	6089722	CJD_2100	CJD_2101			TRUE	0.975	1.000	0.455	0.026		NA
6089724	6089725	CJD_2103	CJD_2104			TRUE	0.613	-13.000	0.000	NA		NA
6089725	6089726	CJD_2104	CJD_2105			TRUE	0.624	-7.000	0.000	NA		NA
6089726	6089727	CJD_2105	CJD_2106		bioD	FALSE	0.027	227.000	0.000	1.000	N	NA
6089727	6089728	CJD_2106	CJD_2107	bioD	bioB	TRUE	0.983	3.000	0.025	0.002	Y	NA
6089728	6089729	CJD_2107	CJD_2108	bioB		TRUE	0.892	18.000	0.018	NA		NA
6089729	6089730	CJD_2108	CJD_2109			FALSE	0.013	386.000	0.000	NA		NA
6089730	6089731	CJD_2109	CJD_2110			FALSE	0.015	356.000	0.000	NA		NA
6089731	6089732	CJD_2110	CJD_2111			FALSE	0.327	18.000	0.000	1.000	N	NA
6089734	6089735	CJD_2113	CJD_2114			FALSE	0.060	211.000	0.000	1.000		NA
6089735	6089736	CJD_2114	CJD_2115		pulA	FALSE	0.073	221.000	0.000	NA		NA
6089738	6089739	CJD_2118	CJD_2119			FALSE	0.235	109.000	0.000	NA		NA
6089739	6089740	CJD_2119	CJD_2120			FALSE	0.105	195.000	0.000	NA		NA
6089741	6089742	CJD_0243	CJD_0242			TRUE	0.631	-3.000	0.000	NA		NA
6089742	6089743	CJD_0242	CJD_0241			FALSE	0.248	83.000	0.000	NA		NA
6089743	6089744	CJD_0241	CJD_0240			FALSE	0.241	94.000	0.000	NA		NA
6089744	6089745	CJD_0240	CJD_0239			TRUE	0.603	-28.000	0.000	NA		NA
6089745	6089746	CJD_0239	CJD_0238			FALSE	0.163	152.000	0.000	NA		NA
6089746	6089747	CJD_0238	CJD_0237			TRUE	0.609	15.000	0.000	NA		NA
6089747	6089748	CJD_0237	CJD_0236			FALSE	0.348	36.000	0.000	NA		NA
6089748	6089749	CJD_0236	CJD_0235			TRUE	0.564	18.000	0.000	NA		NA
6089750	6089751	CJD_0234	CJD_0233			FALSE	0.031	253.000	0.000	1.000		NA
6089752	6089753	CJD_0232	CJD_0231			FALSE	0.007	546.000	0.000	NA		NA
6089753	6089754	CJD_0231	CJD_0230			FALSE	0.002	256.000	0.000	0.025		NA
6089754	6089755	CJD_0230	CJD_0229			FALSE	0.000	527.000	0.000	0.003		NA
6089755	6089756	CJD_0229	CJD_0228			FALSE	0.017	255.000	0.000	1.000	N	NA
6089756	6089757	CJD_0228	CJD_0227		cbiO	FALSE	0.003	467.000	0.000	1.000	N	NA
6089757	6089758	CJD_0227	CJD_0226	cbiO	cbiQ	TRUE	0.988	15.000	0.082	0.002	Y	NA
6089758	6089759	CJD_0226	CJD_0225	cbiQ	cbiN	TRUE	0.995	-16.000	0.804	0.002	Y	NA
6089759	6089760	CJD_0225	CJD_0224	cbiN	cbiM	TRUE	0.996	0.000	0.861	0.013	Y	NA
6089760	6089761	CJD_0224	CJD_0223	cbiM	nagH	FALSE	0.003	879.000	0.000	1.000		NA
6089763	6089764	CJD_0221	CJD_0220			TRUE	0.902	191.000	0.081	NA	Y	NA
6089764	6089765	CJD_0220	CJD_0219			TRUE	0.955	156.000	0.189	NA	Y	NA
6089765	6089766	CJD_0219	CJD_0218			TRUE	0.841	110.000	0.148	NA	N	NA
6089766	6089767	CJD_0218	CJD_0217		nanA	TRUE	0.954	103.000	0.074	1.000	Y	NA
6089767	6089768	CJD_0217	CJD_0216	nanA	nanE	FALSE	0.163	37.000	0.000	1.000	N	NA
6089768	6089769	CJD_0216	CJD_0215	nanE		FALSE	0.012	286.000	0.000	1.000	N	NA
6089770	6089771	CJD_0214	CJD_0213			TRUE	0.948	3.000	0.049	NA		NA
6089771	6089772	CJD_0213	CJD_0212			TRUE	0.942	5.000	0.042	NA		NA
6089773	6089774	CJD_0211	CJD_0210		luxS	FALSE	0.006	348.000	0.000	1.000	N	NA
6089774	6089775	CJD_0210	CJD_0209	luxS		TRUE	0.557	85.000	0.010	1.000	N	NA
6089775	6089776	CJD_0209	CJD_0208		metC	TRUE	0.990	-13.000	0.101	0.012	Y	NA
6089776	6089777	CJD_0208	CJD_0207	metC		TRUE	0.645	64.000	0.021	1.000	N	NA
6089779	6089780	CJD_0205	CJD_0204	colA	argR	FALSE	0.005	545.000	0.000	1.000		NA
6089780	6089781	CJD_0204	CJD_0203	argR	arcC	FALSE	0.113	73.000	0.000	1.000	N	NA
6089781	6089782	CJD_0203	CJD_0202	arcC	arcD	TRUE	0.841	61.000	0.000	1.000	Y	NA
6089782	6089783	CJD_0202	CJD_0201	arcD	argF	TRUE	0.757	145.000	0.000	1.000	Y	NA
6089783	6089784	CJD_0201	CJD_0200	argF	arcA	TRUE	0.926	108.000	0.022	1.000	Y	NA
6089784	6089785	CJD_0200	CJD_0199	arcA		FALSE	0.002	552.000	0.000	1.000	N	NA
6089785	6089786	CJD_0199	CJD_0198			FALSE	0.064	159.000	0.000	1.000	N	NA
6089786	6089787	CJD_0198	CJD_0197			FALSE	0.004	1059.000	0.000	NA		NA
6089787	6089788	CJD_0197	CJD_0196			FALSE	0.103	196.000	0.000	NA		NA
6089788	6089789	CJD_0196	CJD_0195			FALSE	0.005	593.000	0.000	NA		NA
6089791	6089792	CJD_0193	CJD_0192			FALSE	0.253	76.000	0.000	NA		NA
6089792	6089793	CJD_0192	CJD_0191			FALSE	0.032	284.000	0.000	NA		NA
6089793	6089794	CJD_0191	CJD_0190			FALSE	0.008	475.000	0.000	NA		NA
6089794	6089795	CJD_0190	CJD_0189			FALSE	0.255	69.000	0.000	NA		NA
6089795	6089796	CJD_0189	CJD_0188			FALSE	0.163	152.000	0.000	NA		NA
6089796	6089797	CJD_0188	CJD_0187			TRUE	0.553	4.000	0.000	1.000		NA
6089797	6089798	CJD_0187	CJD_0186			FALSE	0.004	631.000	0.000	1.000		NA
6089798	6089799	CJD_0186	CJD_0185			TRUE	0.841	61.000	0.000	1.000	Y	NA
6089799	6089800	CJD_0185	CJD_0184		uxaC	TRUE	0.798	121.000	0.000	1.000	Y	NA
6089800	6089801	CJD_0184	CJD_0183	uxaC	uxuA	TRUE	0.877	29.000	0.000	0.001	Y	NA
6089801	6089802	CJD_0183	CJD_0182	uxuA		TRUE	0.823	91.000	0.000	1.000	Y	NA
6089802	6089803	CJD_0182	CJD_0181			FALSE	0.077	15.000	0.000	0.049	N	NA
6089803	6089804	CJD_0181	CJD_0180			FALSE	0.044	190.000	0.000	1.000	N	NA
6089804	6089805	CJD_0180	CJD_0179			FALSE	0.075	143.000	0.000	1.000	N	NA
6089805	6089806	CJD_0179	CJD_0178			TRUE	0.837	64.000	0.000	1.000	Y	NA
6089806	6089807	CJD_0178	CJD_0177			FALSE	0.410	29.000	0.000	NA		NA
6089807	6089808	CJD_0177	CJD_0176			FALSE	0.029	291.000	0.000	NA		NA
6089808	6089809	CJD_0176	CJD_0175			FALSE	0.012	396.000	0.000	NA		NA
6089809	6089810	CJD_0175	CJD_0174			FALSE	0.006	566.000	0.000	NA		NA
6089813	6089814	CJD_0171	CJD_0170			TRUE	0.962	21.000	0.250	NA		NA
6089815	6089816	CJD_0321	CJD_0326			FALSE	0.037	269.000	0.000	NA		NA
6089820	6089821	CJD_0333	CJD_0334			FALSE	0.005	651.000	0.000	NA		NA
6089823	6089824	CJD_0336	CJD_1224			FALSE	0.097	201.000	0.000	NA		NA
6089824	6089825	CJD_1224	CJD_1225			FALSE	0.007	514.000	0.000	NA		NA
6089827	6089828	CJD_1227	CJD_1228			FALSE	0.030	287.000	0.000	NA		NA
6089831	6089832	CJD_1835	CJD_1836			FALSE	0.006	555.000	0.000	NA		NA
6089832	6089833	CJD_1836	CJD_1837			TRUE	0.905	81.000	0.400	NA		NA
6089833	6089834	CJD_1837	CJD_1838			TRUE	0.985	2.000	1.000	NA		NA
6089834	6089835	CJD_1838	CJD_1839			FALSE	0.172	147.000	0.000	NA		NA
6089835	6089836	CJD_1839	CJD_1840			TRUE	0.601	-31.000	0.000	NA		NA
6089836	6089837	CJD_1840	CJD_1841			TRUE	0.609	15.000	0.000	NA		NA
6089837	6089838	CJD_1841	CJD_1842			TRUE	0.617	14.000	0.000	NA		NA
6089840	6089841	CJD_1844	CJD_1845			TRUE	0.624	-7.000	0.000	NA		NA
6089841	6089842	CJD_1845	CJD_1846			FALSE	0.446	26.000	0.000	NA		NA
6089842	6089843	CJD_1846	CJD_1847			TRUE	0.543	19.000	0.000	NA		NA
6089845	6089846	CJD_1849	CJD_1850			TRUE	0.935	53.000	1.000	NA		NA
6089846	6089847	CJD_1850	CJD_1851			TRUE	0.979	0.000	0.333	NA		NA
6089847	6089848	CJD_1851	CJD_1852			TRUE	0.984	2.000	0.667	NA		NA
6089848	6089849	CJD_1852	CJD_1853			FALSE	0.299	49.000	0.000	NA		NA
6089849	6089850	CJD_1853	CJD_1854			FALSE	0.342	37.000	0.000	NA		NA
6089850	6089851	CJD_1854	CJD_1855			FALSE	0.274	57.000	0.000	NA		NA
6089851	6089852	CJD_1855	CJD_1856			FALSE	0.253	72.000	0.000	NA		NA
6089852	6089853	CJD_1856	CJD_1857			FALSE	0.266	61.000	0.000	NA		NA
6089853	6089854	CJD_1857	CJD_1858			FALSE	0.252	78.000	0.000	NA		NA
6089854	6089855	CJD_1858	CJD_1859			FALSE	0.241	93.000	0.000	NA		NA
6089855	6089856	CJD_1859	CJD_1860			FALSE	0.007	520.000	0.000	NA		NA
6089856	6089857	CJD_1860	CJD_1861			FALSE	0.025	301.000	0.000	NA		NA
6089857	6089858	CJD_1861	CJD_1862			TRUE	0.643	3.000	0.000	NA		NA
6089858	6089859	CJD_1862	CJD_1863			TRUE	0.643	4.000	0.000	NA		NA
6089859	6089860	CJD_1863	CJD_1864			TRUE	0.618	-10.000	0.000	NA		NA
6089860	6089861	CJD_1864	CJD_1865			FALSE	0.419	28.000	0.000	NA		NA
6089861	6089862	CJD_1865	CJD_1866			FALSE	0.483	23.000	0.000	NA		NA
6089862	6089863	CJD_1866	CJD_1867			FALSE	0.193	133.000	0.000	NA		NA
6089863	6089864	CJD_1867	CJD_1868			TRUE	0.636	0.000	0.000	NA		NA
6089864	6089865	CJD_1868	CJD_1869			TRUE	0.623	13.000	0.000	NA		NA
6089865	6089866	CJD_1869	CJD_1870			TRUE	0.617	14.000	0.000	NA		NA
6089866	6089867	CJD_1870	CJD_1871			FALSE	0.089	208.000	0.000	NA		NA
6089867	6089868	CJD_1871	CJD_1872			FALSE	0.099	200.000	0.000	NA		NA
6089868	6089869	CJD_1872	CJD_1873			FALSE	0.243	88.000	0.000	NA		NA
6089869	6089870	CJD_1873	CJD_1874			FALSE	0.201	129.000	0.000	NA		NA
6089870	6089871	CJD_1874	CJD_1875			FALSE	0.217	119.000	0.000	NA		NA
6089874	6089875	CJD_1878	CJD_1879			FALSE	0.006	568.000	0.000	NA		NA
6089875	6089876	CJD_1879	CJD_1880			FALSE	0.446	26.000	0.000	NA		NA
6089876	6089877	CJD_1880	CJD_1881			FALSE	0.245	85.000	0.000	NA		NA
6089877	6089878	CJD_1881	CJD_1882			FALSE	0.172	147.000	0.000	NA		NA
6089880	6089881	CJD_1884	CJD_1885			FALSE	0.241	94.000	0.000	NA		NA
6089881	6089882	CJD_1885	CJD_1886			TRUE	0.643	3.000	0.000	NA		NA
6089882	6089883	CJD_1886	CJD_1887			TRUE	0.584	17.000	0.000	NA		NA
6089883	6089884	CJD_1887	CJD_1888			FALSE	0.248	83.000	0.000	NA		NA
6089884	6089885	CJD_1888	CJD_1889			TRUE	0.978	-3.000	0.667	0.070		NA
6089886	6089887	CJD_1890	CJD_1891			FALSE	0.246	84.000	0.000	NA		NA
6089887	6089888	CJD_1891	CJD_1892			FALSE	0.004	1155.000	0.000	NA		NA
6089888	6089889	CJD_1892	CJD_1893			FALSE	0.007	542.000	0.000	NA		NA
6089889	6089890	CJD_1893	CJD_1894			FALSE	0.000	921.000	0.000	0.039		NA
6089890	6089891	CJD_1894	CJD_1895			TRUE	0.979	-16.000	0.429	NA		NA
6089891	6089892	CJD_1895	CJD_1896			FALSE	0.004	755.000	0.000	NA		NA
6089892	6089893	CJD_1896	CJD_1897			FALSE	0.259	64.000	0.000	NA		NA
6089894	6089895	CJD_1898	CJD_1899			FALSE	0.460	25.000	0.000	NA		NA
6089896	6089897	CJD_1900	CJD_1901			FALSE	0.240	98.000	0.000	NA		NA
6089897	6089898	CJD_1901	CJD_1902			FALSE	0.006	588.000	0.000	NA		NA
6089900	6089901	CJD_1904	CJD_1905			FALSE	0.156	158.000	0.000	NA		NA
6089901	6089902	CJD_1905	CJD_1906			FALSE	0.006	555.000	0.000	NA		NA
6089902	6089903	CJD_1906	CJD_1907			FALSE	0.032	284.000	0.000	NA		NA
6089903	6089904	CJD_1907	CJD_1908			TRUE	0.995	-28.000	0.240	NA	Y	NA
6089904	6089905	CJD_1908	CJD_1909			TRUE	0.958	-21.000	0.000	1.000	Y	NA
6089905	6089906	CJD_1909	CJD_1910			FALSE	0.004	930.000	0.000	NA		NA
6089906	6089907	CJD_1910	CJD_1911			FALSE	0.066	228.000	0.000	NA		NA
6089907	6089908	CJD_1911	CJD_1912			TRUE	0.526	20.000	0.000	NA		NA
6089908	6089909	CJD_1912	CJD_1913			FALSE	0.099	200.000	0.000	NA		NA
6089911	6089912	CJD_1915	CJD_1916			FALSE	0.254	70.000	0.000	NA		NA
6089912	6089913	CJD_1916	CJD_1917			FALSE	0.213	121.000	0.000	NA		NA
6089913	6089914	CJD_1917	CJD_1918			FALSE	0.410	29.000	0.000	NA		NA
6089915	6089916	CJD_1919	CJD_1920			TRUE	0.631	-3.000	0.000	NA		NA
6089916	6089917	CJD_1920	CJD_1921			FALSE	0.242	90.000	0.000	NA		NA
6089918	6089919	CJD_1922	CJD_1923			FALSE	0.088	209.000	0.000	NA		NA
6089919	6089920	CJD_1923	CJD_1924			TRUE	0.762	159.000	0.235	0.070		NA
6089920	6089921	CJD_1924	CJD_1925			FALSE	0.008	493.000	0.000	NA		NA
6089921	6089922	CJD_1925	CJD_1926			FALSE	0.431	27.000	0.000	NA		NA
6089924	6089925	CJD_1928	CJD_1929			FALSE	0.060	236.000	0.000	NA		NA
6089925	6089926	CJD_1929	CJD_1930			TRUE	0.639	6.000	0.000	NA		NA
6089926	6089927	CJD_1930	CJD_1931			FALSE	0.005	652.000	0.000	NA		NA
6089927	6089928	CJD_1931	CJD_1932			FALSE	0.232	112.000	0.000	NA		NA
6089928	6089929	CJD_1932	CJD_1933			TRUE	0.584	17.000	0.000	NA		NA
6089929	6089930	CJD_1933	CJD_1934			FALSE	0.199	130.000	0.000	NA		NA
6089930	6089931	CJD_1934	CJD_1935			FALSE	0.497	22.000	0.000	NA		NA
6089931	6089932	CJD_1935	CJD_1936			FALSE	0.040	261.000	0.000	NA		NA
6089932	6089933	CJD_1936	CJD_1937			TRUE	0.623	13.000	0.000	NA		NA
6089933	6089934	CJD_1937	CJD_1938			FALSE	0.293	50.000	0.000	NA		NA
6089934	6089935	CJD_1938	CJD_1939			TRUE	0.564	18.000	0.000	NA		NA
6089935	6089936	CJD_1939	CJD_1940			FALSE	0.288	51.000	0.000	NA		NA
6089936	6089937	CJD_1940	CJD_1941			FALSE	0.299	49.000	0.000	NA		NA
6089937	6089938	CJD_1941	CJD_1942			TRUE	0.643	3.000	0.000	NA		NA
6089938	6089939	CJD_1942	CJD_1943			TRUE	0.640	1.000	0.000	NA		NA
6089939	6089940	CJD_1943	CJD_1944			FALSE	0.015	364.000	0.000	NA		NA
6089940	6089941	CJD_1944	CJD_1945			FALSE	0.243	88.000	0.000	NA		NA
6089941	6089942	CJD_1945	CJD_1946			FALSE	0.402	30.000	0.000	NA		NA
6089942	6089943	CJD_1946	CJD_1947			FALSE	0.053	242.000	0.000	NA		NA
6089945	6089946	CJD_1099	CJD_1098			FALSE	0.012	387.000	0.000	NA		NA
6089946	6089947	CJD_1098	CJD_1097			FALSE	0.293	50.000	0.000	NA		NA
6089948	6089949	CJD_1096	CJD_1095			FALSE	0.311	45.000	0.000	NA		NA
6089950	6089951	CJD_1094	CJD_1093			FALSE	0.446	26.000	0.000	NA		NA
6089951	6089952	CJD_1093	CJD_1092			TRUE	0.984	4.000	0.759	NA		NA
6089952	6089953	CJD_1092	CJD_1091			FALSE	0.020	326.000	0.000	NA		NA
6089953	6089954	CJD_1091	CJD_1090			FALSE	0.158	157.000	0.000	NA		NA
6089954	6089955	CJD_1090	CJD_1089			FALSE	0.019	330.000	0.000	NA		NA
6089955	6089956	CJD_1089	CJD_1088			FALSE	0.004	959.000	0.000	NA		NA
6089957	6089958	CJD_1087	CJD_1086			FALSE	0.012	392.000	0.000	NA		NA
6089962	6089963	CJD_1082	CJD_1081			FALSE	0.378	32.000	0.000	NA		NA
6089964	6089965	CJD_1080	CJD_1079			FALSE	0.483	23.000	0.000	NA		NA
6089965	6089966	CJD_1079	CJD_1078			FALSE	0.342	37.000	0.000	NA		NA
6089966	6089967	CJD_1078	CJD_1077			FALSE	0.100	199.000	0.000	NA		NA
6089970	6089971	CJD_1074	CJD_1073			FALSE	0.004	791.000	0.000	NA		NA
6089972	6089973	CJD_1072	CJD_1071			TRUE	0.631	-3.000	0.000	NA		NA
6089973	6089974	CJD_1071	CJD_1070			FALSE	0.053	241.000	0.000	NA		NA
6089974	6089975	CJD_1070	CJD_1069			FALSE	0.125	180.000	0.000	NA		NA
6089975	6089976	CJD_1069	CJD_1068			FALSE	0.009	442.000	0.000	NA		NA
6089976	6089977	CJD_1068	CJD_1067			FALSE	0.250	82.000	0.000	NA		NA
6089977	6089978	CJD_1067	CJD_1066			FALSE	0.241	94.000	0.000	NA		NA
6089978	6089979	CJD_1066	CJD_1065			FALSE	0.242	89.000	0.000	NA		NA
6089979	6089980	CJD_1065	CJD_1064			FALSE	0.029	292.000	0.000	NA		NA
6089980	6089981	CJD_1064	CJD_1063			FALSE	0.010	367.000	0.000	1.000		NA
6089981	6089982	CJD_1063	CJD_1062			FALSE	0.009	368.000	0.000	NA	N	NA
6089982	6089983	CJD_1062	CJD_1061			TRUE	0.997	3.000	0.759	NA	Y	NA
6089983	6089984	CJD_1061	CJD_1060			TRUE	0.921	51.000	0.552	NA	N	NA
6089984	6089985	CJD_1060	CJD_1059			TRUE	0.996	2.000	0.385	NA	Y	NA
6089985	6089986	CJD_1059	CJD_1058			TRUE	0.863	147.000	0.487	NA		NA
6089986	6089987	CJD_1058	CJD_1057			TRUE	0.744	208.000	0.459	NA		NA
6089987	6089988	CJD_1057	CJD_1056		eutT	TRUE	0.979	10.000	0.452	NA	N	NA
6089988	6089989	CJD_1056	CJD_1055	eutT	eutM	TRUE	0.892	78.000	0.357	NA	N	NA
6089989	6089990	CJD_1055	CJD_1054	eutM		FALSE	0.015	355.000	0.000	NA		NA
6089990	6089991	CJD_1054	CJD_1052			TRUE	0.636	0.000	0.000	NA		NA
6089991	6089992	CJD_1052	CJD_1051		eutL	TRUE	0.978	13.000	0.468	NA	N	NA
6089992	6089993	CJD_1051	CJD_1050	eutL		TRUE	0.993	22.000	0.617	1.000	Y	NA
6089993	6089994	CJD_1050	CJD_1049			TRUE	0.989	17.000	0.119	0.001	Y	NA
6089994	6089995	CJD_1049	CJD_1048		eutA	TRUE	0.995	19.000	0.600	NA	Y	NA
6089995	6089996	CJD_1048	CJD_1047	eutA		FALSE	0.053	216.000	0.000	NA	N	NA
6089996	6089997	CJD_1047	CJD_1046			TRUE	0.996	4.000	0.388	NA	Y	NA
6089997	6089998	CJD_1046	CJD_1045		eutP	TRUE	0.831	18.000	0.009	1.000	N	NA
6089998	6089999	CJD_1045	CJD_1044	eutP	eutS	TRUE	0.963	4.000	0.000	1.000	Y	NA
6089999	6090000	CJD_1044	CJD_1043	eutS		FALSE	0.006	354.000	0.000	1.000	N	NA
6090000	6090001	CJD_1043	CJD_1042			FALSE	0.037	268.000	0.000	NA		NA
6090001	6090002	CJD_1042	CJD_1041			FALSE	0.014	368.000	0.000	NA		NA
6090002	6090003	CJD_1041	CJD_1040			FALSE	0.241	91.000	0.000	NA		NA
6090004	6090005	CJD_1039	CJD_1038			FALSE	0.014	323.000	0.000	1.000		NA
6090006	6090007	CJD_1037	CJD_1036			TRUE	0.984	-3.000	0.833	NA		NA
6090007	6090008	CJD_1036	CJD_1035			FALSE	0.282	53.000	0.000	NA		NA
6090009	6090010	CJD_1034	CJD_1033			TRUE	0.599	16.000	0.000	NA		NA
6090015	6090016	CJD_1028	CJD_1027			FALSE	0.178	104.000	0.000	1.000		NA
6090016	6090017	CJD_1027	CJD_1026			FALSE	0.239	102.000	0.000	NA		NA
6090017	6090018	CJD_1026	CJD_1025			FALSE	0.175	146.000	0.000	NA		NA
6090019	6090020	CJD_1024	CJD_1023			TRUE	0.642	2.000	0.000	NA		NA
6090024	6090025	CJD_1019	CJD_1018		alr	FALSE	0.245	85.000	0.000	NA		NA
6090026	6090027	CJD_1017	CJD_1016			FALSE	0.041	260.000	0.000	NA		NA
6090027	6090028	CJD_1016	CJD_1015			FALSE	0.012	341.000	0.000	1.000		NA
6090028	6090029	CJD_1015	CJD_1014			FALSE	0.176	107.000	0.000	1.000		NA
6090029	6090030	CJD_1014	CJD_1013			FALSE	0.111	189.000	0.000	NA		NA
6090030	6090031	CJD_1013	CJD_1012			FALSE	0.044	255.000	0.000	NA		NA
6090031	6090032	CJD_1012	CJD_1011		glxK	FALSE	0.002	660.000	0.000	1.000	N	NA
6090032	6090033	CJD_1011	CJD_1010	glxK		TRUE	0.839	224.000	0.078	1.000	Y	NA
6090033	6090034	CJD_1010	CJD_1009			TRUE	0.825	148.000	0.290	NA	N	NA
6090034	6090035	CJD_1009	CJD_1008			FALSE	0.015	314.000	0.000	NA	N	NA
6090037	6090038	CJD_1006	CJD_1005			FALSE	0.007	526.000	0.000	NA		NA
6090039	6090040	CJD_0587	CJD_0588			FALSE	0.256	67.000	0.000	NA		NA
6090040	6090041	CJD_0588	CJD_0589			TRUE	0.629	12.000	0.000	NA		NA
6090041	6090042	CJD_0589	CJD_0590			FALSE	0.012	389.000	0.000	NA		NA
6090043	6090044	CJD_0591	CJD_0592			TRUE	0.618	-10.000	0.000	NA		NA
6090044	6090045	CJD_0592	CJD_0593			FALSE	0.020	322.000	0.000	NA		NA
6090045	6090046	CJD_0593	CJD_0594			FALSE	0.003	542.000	0.000	1.000	N	NA
6090046	6090047	CJD_0594	CJD_0595			FALSE	0.377	14.000	0.000	1.000	N	NA
6090047	6090048	CJD_0595	CJD_0596			FALSE	0.069	198.000	0.000	NA	N	NA
6090048	6090049	CJD_0596	CJD_0597			FALSE	0.293	50.000	0.000	NA		NA
6090049	6090050	CJD_0597	CJD_0598			FALSE	0.054	217.000	0.000	1.000		NA
6090050	6090051	CJD_0598	CJD_0599			TRUE	0.959	14.000	0.000	1.000	Y	NA
6090051	6090052	CJD_0599	CJD_0600			FALSE	0.064	230.000	0.000	NA		NA
6090052	6090053	CJD_0600	CJD_0601			TRUE	0.623	13.000	0.000	NA		NA
6090053	6090054	CJD_0601	CJD_0602		mviN	TRUE	0.928	9.000	0.034	1.000		NA
6090054	6090055	CJD_0602	CJD_0603	mviN		TRUE	0.635	10.000	0.000	NA		NA
6090055	6090056	CJD_0603	CJD_0604			TRUE	0.543	19.000	0.000	NA		NA
6090056	6090057	CJD_0604	CJD_0605			TRUE	0.631	-3.000	0.000	NA		NA
6090057	6090058	CJD_0605	CJD_0606			TRUE	0.643	4.000	0.000	NA		NA
6090058	6090059	CJD_0606	CJD_0607			TRUE	0.613	-13.000	0.000	NA		NA
6090059	6090060	CJD_0607	CJD_0608			FALSE	0.358	221.000	0.032	NA	N	NA
6090060	6090061	CJD_0608	CJD_0609		galU	FALSE	0.003	856.000	0.000	NA	N	NA
6090061	6090062	CJD_0609	CJD_0610	galU		FALSE	0.010	369.000	0.000	1.000		NA
6090062	6090063	CJD_0610	CJD_0611			FALSE	0.010	420.000	0.000	NA		NA
6090063	6090064	CJD_0611	CJD_0612		galE	FALSE	0.252	78.000	0.000	NA		NA
6090064	6090065	CJD_0612	CJD_0613	galE	galU	FALSE	0.330	282.000	0.000	1.000	Y	NA
6090065	6090066	CJD_0613	CJD_0614	galU		FALSE	0.019	328.000	0.000	NA		NA
6090066	6090067	CJD_0614	CJD_0615			FALSE	0.019	333.000	0.000	NA		NA
6090067	6090068	CJD_0615	CJD_0616			FALSE	0.029	291.000	0.000	NA		NA
6090070	6090071	CJD_0618	CJD_0619	sipW		FALSE	0.281	54.000	0.000	NA		NA
6090071	6090072	CJD_0619	CJD_0620			FALSE	0.302	48.000	0.000	NA		NA
6090072	6090073	CJD_0620	CJD_0621			TRUE	0.981	3.000	0.400	NA		NA
6090073	6090074	CJD_0621	CJD_0622			TRUE	0.584	17.000	0.000	NA		NA
6090074	6090075	CJD_0622	CJD_0623			FALSE	0.033	280.000	0.000	NA		NA
6090075	6090076	CJD_0623	CJD_0625			TRUE	0.963	5.000	0.000	1.000	Y	NA
6090076	6090077	CJD_0625	CJD_0626			FALSE	0.091	178.000	0.000	1.000		NA
6090077	6090078	CJD_0626	CJD_0627			FALSE	0.010	369.000	0.000	1.000		NA
6090078	6090079	CJD_0627	CJD_0628			TRUE	0.619	175.000	0.000	0.007	Y	NA
6090079	6090080	CJD_0628	CJD_0629			TRUE	0.791	169.000	0.595	0.012		NA
6090080	6090081	CJD_0629	CJD_0630			FALSE	0.010	356.000	0.000	1.000		NA
6090083	6090084	CJD_0632	CJD_0633			TRUE	0.995	-7.000	0.933	0.006	Y	NA
6090084	6090085	CJD_0633	CJD_0634			FALSE	0.007	511.000	0.000	NA		NA
6090085	6090086	CJD_0634	CJD_0635			FALSE	0.044	255.000	0.000	NA		NA
6090086	6090087	CJD_0635	CJD_0636			FALSE	0.381	309.000	0.385	1.000		NA
6090087	6090088	CJD_0636	CJD_0637			FALSE	0.010	297.000	0.000	1.000	N	NA
6090088	6090089	CJD_0637	CJD_0638			TRUE	0.997	0.000	1.000	1.000	Y	NA
6090089	6090090	CJD_0638	CJD_0639			FALSE	0.251	81.000	0.000	NA		NA
6090090	6090091	CJD_0639	CJD_0640			FALSE	0.156	158.000	0.000	NA		NA
6090091	6090092	CJD_0640	CJD_0641			FALSE	0.008	465.000	0.000	NA		NA
6090092	6090093	CJD_0641	CJD_0642			FALSE	0.007	527.000	0.000	NA		NA
6090093	6090094	CJD_0642	CJD_0643			FALSE	0.330	40.000	0.000	NA		NA
6090094	6090095	CJD_0643	CJD_0644			FALSE	0.251	80.000	0.000	NA		NA
6090095	6090096	CJD_0644	CJD_0645			FALSE	0.052	243.000	0.000	NA		NA
6090096	6090097	CJD_0645	CJD_0646			FALSE	0.085	211.000	0.000	NA		NA
6090097	6090098	CJD_0646	CJD_0647			FALSE	0.023	311.000	0.000	NA		NA
6090098	6090099	CJD_0647	CJD_0648			TRUE	0.636	9.000	0.000	NA		NA
6090099	6090100	CJD_0648	CJD_0649			FALSE	0.348	36.000	0.000	NA		NA
6090102	6090103	CJD_0651	CJD_0652			FALSE	0.011	405.000	0.000	NA		NA
6090103	6090104	CJD_0652	CJD_0653			FALSE	0.015	313.000	0.000	NA	N	NA
6090105	6090106	CJD_0654	CJD_0655			TRUE	0.617	14.000	0.000	NA		NA
6090107	6090108	CJD_0656	CJD_0657		speD	FALSE	0.008	322.000	0.000	1.000	N	NA
6090108	6090109	CJD_0657	CJD_0658	speD		TRUE	0.989	18.000	0.091	1.000	Y	NA
6090109	6090110	CJD_0658	CJD_0659		speE	TRUE	0.994	15.000	0.237	1.000	Y	NA
6090110	6090111	CJD_0659	CJD_0660	speE	speB	TRUE	0.991	-13.000	0.077	1.000	Y	NA
6090113	6090114	CJD_0662	CJD_0663			FALSE	0.175	146.000	0.000	NA		NA
6090116	6090117	CJD_0666	CJD_0667			FALSE	0.148	164.000	0.000	NA		NA
6090117	6090118	CJD_0667	CJD_0668			FALSE	0.004	1003.000	0.000	NA		NA
6090118	6090119	CJD_0668	CJD_0669			TRUE	0.976	-7.000	0.793	0.069	N	NA
6090119	6090120	CJD_0669	CJD_0670			FALSE	0.020	243.000	0.000	1.000	N	NA
6090120	6090121	CJD_0670	CJD_0671			TRUE	0.979	-7.000	0.400	NA		NA
6090123	6090124	CJD_1207	CJD_1208			FALSE	0.156	158.000	0.000	NA		NA
6090124	6090125	CJD_1208	CJD_1209			FALSE	0.390	31.000	0.000	NA		NA
6090125	6090126	CJD_1209	CJD_1210			FALSE	0.009	450.000	0.000	NA		NA
6090126	6090127	CJD_1210	CJD_1211			TRUE	0.744	152.000	0.095	NA		NA
6090127	6090128	CJD_1211	CJD_1212			FALSE	0.142	168.000	0.000	NA		NA
6090128	6090129	CJD_1212	CJD_1213			FALSE	0.131	175.000	0.000	NA		NA
6090129	6090130	CJD_1213	CJD_1214			FALSE	0.020	326.000	0.000	NA		NA
6090132	6090133	CJD_1216	CJD_0063			FALSE	0.152	161.000	0.000	NA		NA
6090133	6090134	CJD_0063	CJD_0064			TRUE	0.600	-39.000	0.000	NA		NA
6090134	6090135	CJD_0064	CJD_0065			TRUE	0.564	18.000	0.000	NA		NA
6090135	6090136	CJD_0065	CJD_0066			FALSE	0.012	282.000	0.000	1.000	N	NA
6090136	6090137	CJD_0066	CJD_0067			TRUE	0.787	88.000	0.000	0.023	Y	NA
6090137	6090138	CJD_0067	CJD_0068			TRUE	0.952	-3.000	0.000	0.023	Y	NA
6090138	6090139	CJD_0068	CJD_0069		plc	FALSE	0.433	20.000	0.000	1.000		NA
6090139	6090140	CJD_0069	CJD_0070	plc		TRUE	0.532	13.000	0.000	1.000		NA
6090140	6090141	CJD_0070	CJD_0071			TRUE	0.919	81.000	0.667	NA		NA
6090141	6090142	CJD_0071	CJD_0072			FALSE	0.254	70.000	0.000	NA		NA
6090144	6090145	CJD_0074	CJD_1229	lgt		FALSE	0.030	290.000	0.000	NA		NA
6090145	6090146	CJD_1229	CJD_1230			FALSE	0.008	478.000	0.000	NA		NA
6090146	6090147	CJD_1230	CJD_0078		brnQ	FALSE	0.005	591.000	0.000	NA		NA
6090148	6090149	CJD_0079	CJD_0080	folA	dnaX	TRUE	0.891	216.000	0.164	1.000	Y	NA
6090149	6090150	CJD_0080	CJD_0081	dnaX		TRUE	0.981	31.000	0.195	0.007	Y	NA
6090150	6090151	CJD_0081	CJD_0082		recR	FALSE	0.293	50.000	0.000	NA		NA
6090151	6090152	CJD_0082	CJD_0083	recR		FALSE	0.004	1170.000	0.000	NA		NA
6090153	6090154	CJD_0084	CJD_0085	bofA		FALSE	0.124	181.000	0.000	NA		NA
6090154	6090155	CJD_0085	CJD_0086			FALSE	0.005	726.000	0.000	NA		NA
6090155	6090156	CJD_0086	CJD_0087			FALSE	0.062	235.000	0.000	NA		NA
6090158	6090159	CJD_0089	CJD_0090			FALSE	0.044	255.000	0.000	NA		NA
6090159	6090160	CJD_0090	CJD_1244			FALSE	0.161	154.000	0.000	NA		NA
6090160	6090161	CJD_1244	CJD_1245			FALSE	0.033	281.000	0.000	NA		NA
6090161	6090162	CJD_1245	CJD_0093		mtnN	TRUE	0.996	4.000	0.606	1.000	Y	NA
6090162	6090163	CJD_0093	CJD_0094	mtnN		FALSE	0.048	248.000	0.000	NA		NA
6090163	6090164	CJD_0094	CJD_0095			TRUE	0.917	97.000	0.750	NA		NA
6090164	6090165	CJD_0095	CJD_1249			TRUE	0.894	96.000	0.333	NA		NA
6090165	6090166	CJD_1249	CJD_0097			FALSE	0.103	196.000	0.000	NA		NA
6090166	6090167	CJD_0097	CJD_0098			FALSE	0.029	220.000	0.000	1.000	N	NA
6090169	6090170	CJD_1255	CJD_1256			FALSE	0.008	497.000	0.000	NA		NA
6090170	6090171	CJD_1256	CJD_1257			FALSE	0.017	346.000	0.000	NA		NA
6090171	6090172	CJD_1257	CJD_1258			FALSE	0.060	236.000	0.000	NA		NA
6090172	6090173	CJD_1258	CJD_1259			FALSE	0.006	582.000	0.000	NA		NA
6090173	6090174	CJD_1259	CJD_1260			TRUE	0.609	15.000	0.000	NA		NA
6090174	6090175	CJD_1260	CJD_1261		mgtA	FALSE	0.005	591.000	0.000	NA		NA
6090175	6090176	CJD_1261	CJD_1262	mgtA		FALSE	0.016	110.000	0.000	0.045	N	NA
6090176	6090177	CJD_1262	CJD_1263			FALSE	0.025	273.000	0.000	1.000		NA
6090179	6090180	CJD_1265	CJD_1266			FALSE	0.091	178.000	0.000	1.000		NA
6090182	6090183	CJD_1268	CJD_1269			FALSE	0.342	37.000	0.000	NA		NA
6090183	6090184	CJD_1269	CJD_1270			TRUE	0.599	16.000	0.000	NA		NA
6090184	6090185	CJD_1270	CJD_1271			FALSE	0.245	85.000	0.000	NA		NA
6090185	6090186	CJD_1271	CJD_1272			FALSE	0.054	217.000	0.000	1.000		NA
6090186	6090187	CJD_1272	CJD_1273			FALSE	0.113	70.000	0.000	1.000	N	NA
6090187	6090188	CJD_1273	CJD_1274			FALSE	0.033	280.000	0.000	NA		NA
6090188	6090189	CJD_1274	CJD_1275			FALSE	0.431	27.000	0.000	NA		NA
6090189	6090190	CJD_1275	CJD_1276			FALSE	0.252	78.000	0.000	NA		NA
6090190	6090191	CJD_1276	CJD_1277			FALSE	0.129	177.000	0.000	NA		NA
6090191	6090192	CJD_1277	CJD_1278			FALSE	0.065	229.000	0.000	NA		NA
6090192	6090193	CJD_1278	CJD_1279			FALSE	0.007	187.000	0.000	0.045	N	NA
6090193	6090194	CJD_1279	CJD_1280			TRUE	0.992	20.000	0.500	0.013	Y	NA
6090194	6090195	CJD_1280	CJD_1281			FALSE	0.007	338.000	0.000	1.000	N	NA
6090195	6090196	CJD_1281	CJD_1282			TRUE	0.975	14.000	1.000	0.001		NA
6090196	6090197	CJD_1282	CJD_1283			TRUE	0.960	20.000	0.600	0.001		NA
6090197	6090198	CJD_1283	CJD_1284			TRUE	0.980	17.000	0.714	NA		NA
6090198	6090199	CJD_1284	CJD_1285			TRUE	0.981	-7.000	0.500	NA		NA
6090199	6090200	CJD_1285	CJD_1287			TRUE	0.543	19.000	0.000	NA		NA
6090200	6090201	CJD_1287	CJD_1289			FALSE	0.471	24.000	0.000	NA		NA
6090201	6090202	CJD_1289	CJD_1949			TRUE	0.742	79.000	0.037	NA		NA
6090202	6090203	CJD_1949	CJD_1950			FALSE	0.002	584.000	0.000	1.000	N	NA
6090204	6090205	CJD_0245	CJD_0246	rrl	rrf	FALSE	0.220	118.000	0.000	NA		NA
6090205	6090206	CJD_0246	CJD_0247	rrf		TRUE	0.633	11.000	0.000	NA		NA
6090206	6090207	CJD_0247	CJD_0248			FALSE	0.007	514.000	0.000	NA		NA
6090207	6090208	CJD_0248	CJD_0249			FALSE	0.008	490.000	0.000	NA		NA
6090208	6090209	CJD_0249	CJD_0250			FALSE	0.004	1582.000	0.000	NA		NA
6090211	6090212	CJD_0252	CJD_0253			FALSE	0.240	101.000	0.000	NA		NA
6090212	6090213	CJD_0253	CJD_0254			FALSE	0.183	140.000	0.000	NA		NA
6090213	6090214	CJD_0254	CJD_0255			FALSE	0.419	28.000	0.000	NA		NA
6090214	6090215	CJD_0255	CJD_0256			FALSE	0.008	483.000	0.000	NA		NA
6090216	6090217	CJD_0257	CJD_0258			FALSE	0.006	574.000	0.000	NA		NA
6090217	6090218	CJD_0258	CJD_0259			TRUE	0.613	-13.000	0.000	NA		NA
6090219	6090220	CJD_0260	CJD_0261		sbcC	TRUE	0.980	-13.000	0.669	NA	N	NA
6090220	6090221	CJD_0261	CJD_0262	sbcC	ackA	FALSE	0.007	405.000	0.000	NA	N	NA
6090223	6090224	CJD_0264	CJD_0265			FALSE	0.261	63.000	0.000	NA		NA
6090224	6090225	CJD_0265	CJD_0266			TRUE	0.981	2.000	0.400	NA		NA
6090225	6090226	CJD_0266	CJD_0267			TRUE	0.924	14.000	0.036	NA	N	NA
6090226	6090227	CJD_0267	CJD_0268			TRUE	0.996	-13.000	0.877	1.000	Y	NA
6090227	6090228	CJD_0268	CJD_0269			TRUE	0.996	1.000	0.657	1.000	Y	NA
6090228	6090229	CJD_0269	CJD_0270			TRUE	0.913	-6.000	0.047	0.097	N	NA
6090229	6090230	CJD_0270	CJD_0271			TRUE	0.995	1.000	0.576	0.006	Y	NA
6090230	6090231	CJD_0271	CJD_0272			TRUE	0.904	-13.000	0.015	NA		NA
6090231	6090232	CJD_0272	CJD_0273			TRUE	0.954	-16.000	0.077	NA		NA
6090232	6090233	CJD_0273	CJD_0274			FALSE	0.205	127.000	0.000	NA		NA
6090233	6090234	CJD_0274	CJD_0275			FALSE	0.311	45.000	0.000	NA		NA
6090234	6090235	CJD_0275	CJD_0276			FALSE	0.003	519.000	0.000	1.000	N	NA
6090236	6090237	CJD_0277	CJD_0278			TRUE	0.688	201.000	0.500	0.023	N	NA
6090237	6090238	CJD_0278	CJD_0279			TRUE	0.979	-19.000	0.500	NA		NA
6090238	6090239	CJD_0279	CJD_0280			TRUE	0.624	-7.000	0.000	NA		NA
6090239	6090240	CJD_0280	CJD_0281			TRUE	0.959	-10.000	0.000	1.000	Y	NA
6090241	6090242	CJD_0282	CJD_0283			FALSE	0.045	253.000	0.000	NA		NA
6090244	6090245	CJD_0285	CJD_0286			FALSE	0.011	418.000	0.000	NA		NA
6090245	6090246	CJD_0286	CJD_0287			TRUE	0.643	3.000	0.000	NA		NA
6090247	6090248	CJD_0288	CJD_0289			FALSE	0.104	163.000	0.000	NA	N	NA
6090248	6090249	CJD_0289	CJD_0290			TRUE	0.995	-28.000	0.240	NA	Y	NA
6090249	6090250	CJD_0290	CJD_0291			FALSE	0.264	62.000	0.000	NA		NA
6090250	6090251	CJD_0291	CJD_0292			FALSE	0.010	432.000	0.000	NA		NA
6090251	6090252	CJD_0292	CJD_0293			TRUE	0.972	-7.000	0.375	0.068		NA
6090252	6090253	CJD_0293	CJD_0294			FALSE	0.108	163.000	0.000	1.000		NA
6090253	6090254	CJD_0294	CJD_0295			FALSE	0.030	288.000	0.000	NA		NA
6090254	6090255	CJD_0295	CJD_0296			FALSE	0.039	265.000	0.000	NA		NA
6090256	6090257	CJD_0297	CJD_0298			FALSE	0.471	18.000	0.000	1.000		NA
6090257	6090258	CJD_0298	CJD_0299			TRUE	0.996	-12.000	0.625	1.000	Y	NA
6090258	6090259	CJD_0299	CJD_0300			FALSE	0.471	18.000	0.000	1.000		NA
6090259	6090260	CJD_0300	CJD_0301			FALSE	0.036	272.000	0.000	NA		NA
6090260	6090261	CJD_0301	CJD_0302			FALSE	0.022	316.000	0.000	NA		NA
6090263	6090264	CJD_0304	CJD_0305			TRUE	0.983	13.000	0.828	NA		NA
6090266	6090267	CJD_0307	CJD_0308			FALSE	0.049	184.000	0.000	1.000	N	NA
6090267	6090268	CJD_0308	CJD_0309			FALSE	0.391	-3.000	0.000	1.000	N	NA
6090268	6090269	CJD_0309	CJD_0310			FALSE	0.015	364.000	0.000	NA		NA
6090270	6090271	CJD_0311	CJD_0312			FALSE	0.075	219.000	0.000	NA		NA
6090271	6090272	CJD_0312	CJD_0313		ung	FALSE	0.180	142.000	0.000	NA		NA
6090275	6090276	CJD_0316	CJD_0317		rrs	FALSE	0.011	411.000	0.000	NA		NA
6090276	6090277	CJD_0317	CJD_0319	rrs	rrl	FALSE	0.116	186.000	0.000	NA		NA
6090279	6090280	CJD_1335	CJD_1336	lacZ		FALSE	0.009	375.000	0.000	1.000		NA
6090280	6090281	CJD_1336	CJD_1337			FALSE	0.005	537.000	0.000	1.000		NA
6090282	6090283	CJD_1338	CJD_1339			FALSE	0.007	420.000	0.000	1.000		NA
6090284	6090285	CJD_1340	CJD_1341			FALSE	0.213	121.000	0.000	NA		NA
6090285	6090286	CJD_1341	CJD_1342			FALSE	0.497	22.000	0.000	NA		NA
6090286	6090287	CJD_1342	CJD_1343			FALSE	0.348	36.000	0.000	NA		NA
6090287	6090288	CJD_1343	CJD_1344			FALSE	0.324	41.000	0.000	NA		NA
6090290	6090291	CJD_1346	CJD_1347			TRUE	0.609	15.000	0.000	NA		NA
6090291	6090292	CJD_1347	CJD_1348			FALSE	0.253	76.000	0.000	NA		NA
6090292	6090293	CJD_1348	CJD_1349			FALSE	0.045	254.000	0.000	NA		NA
6090293	6090294	CJD_1349	CJD_1350			FALSE	0.130	176.000	0.000	NA		NA
6090294	6090295	CJD_1350	CJD_1351			TRUE	0.623	13.000	0.000	NA		NA
6090295	6090296	CJD_1351	CJD_1352			TRUE	0.609	15.000	0.000	NA		NA
6090296	6090297	CJD_1352	CJD_1353			TRUE	0.613	-13.000	0.000	NA		NA
6090297	6090298	CJD_1353	CJD_1354			FALSE	0.431	27.000	0.000	NA		NA
6090298	6090299	CJD_1354	CJD_1355			TRUE	0.624	-7.000	0.000	NA		NA
6090299	6090300	CJD_1355	CJD_1356			TRUE	0.636	0.000	0.000	NA		NA
6090300	6090301	CJD_1356	CJD_1357			TRUE	0.642	2.000	0.000	NA		NA
6090301	6090302	CJD_1357	CJD_1358			TRUE	0.624	-7.000	0.000	NA		NA
6090302	6090303	CJD_1358	CJD_1359			TRUE	0.643	3.000	0.000	NA		NA
6090303	6090304	CJD_1359	CJD_1360			TRUE	0.599	16.000	0.000	NA		NA
6090304	6090305	CJD_1360	CJD_1361			FALSE	0.311	45.000	0.000	NA		NA
6090305	6090306	CJD_1361	CJD_1362			FALSE	0.006	590.000	0.000	NA		NA
6090306	6090307	CJD_1362	CJD_1363			FALSE	0.017	347.000	0.000	NA		NA
6090307	6090308	CJD_1363	CJD_1364			TRUE	0.636	0.000	0.000	NA		NA
6090308	6090309	CJD_1364	CJD_1365			TRUE	0.636	0.000	0.000	NA		NA
6090309	6090310	CJD_1365	CJD_1366			FALSE	0.226	115.000	0.000	NA		NA
6090310	6090311	CJD_1366	CJD_1367			TRUE	0.905	62.000	0.333	NA		NA
6090311	6090312	CJD_1367	CJD_1368			TRUE	0.971	17.000	0.250	NA		NA
6090312	6090313	CJD_1368	CJD_1369			TRUE	0.982	-7.000	0.615	NA		NA
6090313	6090314	CJD_1369	CJD_1370			TRUE	0.983	3.000	0.533	NA		NA
6090314	6090315	CJD_1370	CJD_1371			TRUE	0.618	-10.000	0.000	NA		NA
6090315	6090316	CJD_1371	CJD_1372			TRUE	0.610	-16.000	0.000	NA		NA
6090316	6090317	CJD_1372	CJD_1373			TRUE	0.636	0.000	0.000	NA		NA
6090317	6090318	CJD_1373	CJD_1374			TRUE	0.636	0.000	0.000	NA		NA
6090318	6090319	CJD_1374	CJD_1375			TRUE	0.624	-7.000	0.000	NA		NA
6090319	6090320	CJD_1375	CJD_1376			FALSE	0.305	47.000	0.000	NA		NA
6090320	6090321	CJD_1376	CJD_1377			TRUE	0.564	18.000	0.000	NA		NA
6090321	6090322	CJD_1377	CJD_1378			TRUE	0.624	-7.000	0.000	NA		NA
6090322	6090323	CJD_1378	CJD_1379			TRUE	0.636	9.000	0.000	NA		NA
6090323	6090324	CJD_1379	CJD_1380			TRUE	0.599	-40.000	0.000	NA		NA
6090324	6090325	CJD_1380	CJD_1381			TRUE	0.642	2.000	0.000	NA		NA
6090325	6090326	CJD_1381	CJD_1382			FALSE	0.410	29.000	0.000	NA		NA
6090326	6090327	CJD_1382	CJD_1383			TRUE	0.643	3.000	0.000	NA		NA
6090327	6090328	CJD_1383	CJD_1384			FALSE	0.026	300.000	0.000	NA		NA
6090328	6090329	CJD_1384	CJD_1385			FALSE	0.240	100.000	0.000	NA		NA
6090329	6090330	CJD_1385	CJD_1386			FALSE	0.022	313.000	0.000	NA		NA
6090332	6090333	CJD_1388	CJD_1389			TRUE	0.631	-3.000	0.000	NA		NA
6090333	6090334	CJD_1389	CJD_1390			FALSE	0.308	46.000	0.000	NA		NA
6090334	6090335	CJD_1390	CJD_1391			FALSE	0.018	334.000	0.000	NA		NA
6090335	6090336	CJD_1391	CJD_1392			TRUE	0.599	16.000	0.000	NA		NA
6090336	6090337	CJD_1392	CJD_1393			FALSE	0.156	158.000	0.000	NA		NA
6090338	6090339	CJD_1394	CJD_1395			FALSE	0.410	29.000	0.000	NA		NA
6090341	6090342	CJD_1397	CJD_1398			TRUE	0.629	12.000	0.000	NA		NA
6090342	6090343	CJD_1398	CJD_1399			FALSE	0.022	317.000	0.000	NA		NA
6090344	6090345	CJD_1400	CJD_1401			FALSE	0.148	164.000	0.000	NA		NA
6090346	6090347	CJD_1402	CJD_1404			FALSE	0.021	321.000	0.000	NA		NA
6090347	6090348	CJD_1404	CJD_1405			FALSE	0.070	150.000	0.000	1.000	N	NA
6090349	6090350	CJD_1406	CJD_1407			FALSE	0.220	118.000	0.000	NA		NA
6090351	6090352	CJD_1408	CJD_1409		spoVAF	FALSE	0.144	131.000	0.000	1.000		NA
6090352	6090353	CJD_1409	CJD_1410	spoVAF		FALSE	0.064	230.000	0.000	NA		NA
6090354	6090355	CJD_1411	CJD_1412			FALSE	0.048	224.000	0.000	NA	N	NA
6090355	6090356	CJD_1412	CJD_1413		sdhB	FALSE	0.287	32.000	0.000	NA	N	NA
6090356	6090357	CJD_1413	CJD_1414	sdhB	sdhA	TRUE	0.990	4.000	0.098	0.001	Y	NA
6090363	6090364	CJD_1421	CJD_1422			FALSE	0.021	320.000	0.000	NA		NA
6090364	6090365	CJD_1422	CJD_1423			TRUE	0.599	16.000	0.000	NA		NA
6090365	6090366	CJD_1423	CJD_1424		gltX	FALSE	0.005	668.000	0.000	NA		NA
6090366	6090367	CJD_1424	CJD_1425	gltX		TRUE	0.643	4.000	0.000	NA		NA
6090368	6090369	CJD_0011	CJD_0013	rrs	rrl	FALSE	0.116	186.000	0.000	NA		NA
6090369	6090370	CJD_0013	CJD_0014	rrl	rrf	FALSE	0.240	95.000	0.000	NA		NA
6090370	6090371	CJD_0014	CJD_0015	rrf		TRUE	0.641	5.000	0.000	NA		NA
6090371	6090372	CJD_0015	CJD_0016			TRUE	0.643	4.000	0.000	NA		NA
6090372	6090373	CJD_0016	CJD_A0682			FALSE	0.036	272.000	0.000	NA		NA
6090373	6090374	CJD_A0682	CJD_A0683			FALSE	0.038	267.000	0.000	NA		NA
6090374	6090375	CJD_A0683	CJD_A0684			FALSE	0.036	243.000	0.000	1.000		NA
6090375	6090376	CJD_A0684	CJD_A0685			TRUE	0.978	13.000	0.370	NA		NA
6090376	6090377	CJD_A0685	CJD_A0686		serS	FALSE	0.016	352.000	0.000	NA		NA
6090377	6090378	CJD_A0686	CJD_A0687	serS		FALSE	0.129	177.000	0.000	NA		NA
6090378	6090379	CJD_A0687	CJD_0023			FALSE	0.182	141.000	0.000	NA		NA
6090379	6090380	CJD_0023	CJD_0024			FALSE	0.378	32.000	0.000	NA		NA
6090380	6090381	CJD_0024	CJD_A0688			FALSE	0.041	260.000	0.000	NA		NA
6090381	6090382	CJD_A0688	CJD_0026			FALSE	0.236	108.000	0.000	NA		NA
6090382	6090383	CJD_0026	CJD_0027			TRUE	0.643	4.000	0.000	NA		NA
6090383	6090384	CJD_0027	CJD_A0689			FALSE	0.015	363.000	0.000	NA		NA
6090386	6090387	CJD_A0691	CJD_A0692	addB	addA	TRUE	0.994	-10.000	0.408	0.004	Y	NA
6090393	6090394	CJD_0037	CJD_A0698			FALSE	0.139	170.000	0.000	NA		NA
6090396	6090397	CJD_A0700	CJD_0041			FALSE	0.278	55.000	0.000	NA		NA
6090398	6090399	CJD_A0701	CJD_A0702			FALSE	0.137	171.000	0.000	NA		NA
6090399	6090400	CJD_A0702	CJD_A0703			FALSE	0.004	1020.000	0.000	NA		NA
6090401	6090402	CJD_A0704	CJD_A0705			FALSE	0.087	210.000	0.000	NA		NA
6090402	6090403	CJD_A0705	CJD_A0706			FALSE	0.201	129.000	0.000	NA		NA
6090403	6090404	CJD_A0706	CJD_A0707			TRUE	0.543	19.000	0.000	NA		NA
6090404	6090405	CJD_A0707	CJD_A0708			TRUE	0.624	-7.000	0.000	NA		NA
6090405	6090406	CJD_A0708	CJD_A0709			TRUE	0.623	13.000	0.000	NA		NA
6090406	6090407	CJD_A0709	CJD_A0710			FALSE	0.031	285.000	0.000	NA		NA
6090407	6090408	CJD_A0710	CJD_A0711			TRUE	0.584	17.000	0.000	NA		NA
6090408	6090409	CJD_A0711	CJD_A0712			FALSE	0.012	395.000	0.000	NA		NA
6090409	6090410	CJD_A0712	CJD_A0713			FALSE	0.073	221.000	0.000	NA		NA
6090410	6090411	CJD_A0713	CJD_A0714			TRUE	0.639	6.000	0.000	NA		NA
6090411	6090412	CJD_A0714	CJD_A0715			FALSE	0.239	104.000	0.000	NA		NA
6090412	6090413	CJD_A0715	CJD_A0716			TRUE	0.613	-13.000	0.000	NA		NA
6090413	6090414	CJD_A0716	CJD_A0717			TRUE	0.606	-22.000	0.000	NA		NA
6090414	6090415	CJD_A0717	CJD_A0718			FALSE	0.342	37.000	0.000	NA		NA
6090415	6090416	CJD_A0718	CJD_A0719			FALSE	0.305	47.000	0.000	NA		NA
6090416	6090417	CJD_A0719	CJD_A0720			FALSE	0.230	113.000	0.000	NA		NA
6090417	6090418	CJD_A0720	CJD_A0721			TRUE	0.643	4.000	0.000	NA		NA
6090418	6090419	CJD_A0721	CJD_A0722			FALSE	0.007	540.000	0.000	NA		NA
6090419	6090420	CJD_A0722	CJD_A0723			TRUE	0.879	3.000	0.005	1.000		NA
6090420	6090421	CJD_A0723	CJD_A0724			FALSE	0.261	63.000	0.000	NA		NA
6090421	6090422	CJD_A0724	CJD_A0725			FALSE	0.230	113.000	0.000	NA		NA
6090422	6090423	CJD_A0725	CJD_A0726			FALSE	0.235	110.000	0.000	NA		NA
6090425	6090426	CJD_A0728	CJD_A0729			FALSE	0.095	203.000	0.000	NA		NA
6090426	6090427	CJD_A0729	CJD_A0730			TRUE	0.952	20.000	0.132	NA		NA
6090427	6090428	CJD_A0730	CJD_A0731			TRUE	0.977	3.000	0.227	NA		NA
6090428	6090429	CJD_A0731	CJD_A0732			TRUE	0.960	13.000	0.091	NA		NA
6090429	6090430	CJD_A0732	CJD_A0733		lgt	FALSE	0.038	267.000	0.000	NA		NA
6090430	6090431	CJD_A0733	CJD_0075	lgt		FALSE	0.047	250.000	0.000	NA		NA
6090431	6090432	CJD_0075	CJD_3320		srpB	FALSE	0.226	115.000	0.000	NA		NA
6090432	6090433	CJD_3320	CJD_A0734	srpB		FALSE	0.079	215.000	0.000	NA		NA
6090437	6090438	CJD_A0738	CJD_A0739			TRUE	0.822	112.000	0.100	NA		NA
6090438	6090439	CJD_A0739	CJD_A0740		recR	TRUE	0.912	98.000	0.604	NA		NA
6090439	6090440	CJD_A0740	CJD_A0741	recR		FALSE	0.486	226.000	0.071	NA		NA
6090440	6090441	CJD_A0741	CJD_A0742			TRUE	0.977	16.000	0.417	NA		NA
6090441	6090442	CJD_A0742	CJD_A0743			FALSE	0.035	275.000	0.000	NA		NA
6090442	6090443	CJD_A0743	CJD_A0744			FALSE	0.165	151.000	0.000	NA		NA
6090443	6090444	CJD_A0744	CJD_A0745			FALSE	0.255	69.000	0.000	NA		NA
6090444	6090445	CJD_A0745	CJD_A0746			FALSE	0.148	164.000	0.000	NA		NA
6090445	6090446	CJD_A0746	CJD_A0747			TRUE	0.958	69.000	0.110	0.043	Y	NA
6090446	6090447	CJD_A0747	CJD_A0748			TRUE	0.703	148.000	0.072	1.000		NA
6090447	6090448	CJD_A0748	CJD_A0749			FALSE	0.014	368.000	0.000	NA		NA
6090448	6090449	CJD_A0749	CJD_A0750			FALSE	0.254	71.000	0.000	NA		NA
6090451	6090452	CJD_A0752	CJD_A0753			FALSE	0.112	291.000	0.007	NA	N	NA
6090452	6090453	CJD_A0753	CJD_A0754			FALSE	0.460	25.000	0.000	NA		NA
6090453	6090454	CJD_A0754	CJD_A0755			FALSE	0.140	169.000	0.000	NA		NA
6090454	6090455	CJD_A0755	CJD_A0756			TRUE	0.526	20.000	0.000	NA		NA
6090455	6090456	CJD_A0756	CJD_A0757			FALSE	0.014	372.000	0.000	NA		NA
6090456	6090457	CJD_A0757	CJD_0100		rrs	FALSE	0.266	61.000	0.000	NA		NA
6090457	6090458	CJD_0100	CJD_0102	rrs	rrl	FALSE	0.116	186.000	0.000	NA		NA
6090460	6090461	CJD_A0439	CJD_A0440			FALSE	0.255	69.000	0.000	NA		NA
6090461	6090462	CJD_A0440	CJD_A0441			FALSE	0.330	40.000	0.000	NA		NA
6090463	6090464	CJD_A0443	CJD_A0444			FALSE	0.062	235.000	0.000	NA		NA
6090465	6090466	CJD_A0445	CJD_A0446			FALSE	0.011	417.000	0.000	NA		NA
6090466	6090467	CJD_A0446	CJD_A0448			FALSE	0.017	345.000	0.000	NA		NA
6090467	6090468	CJD_A0448	CJD_A0449			FALSE	0.033	282.000	0.000	NA		NA
6090469	6090470	CJD_A0450	CJD_A0451			FALSE	0.250	82.000	0.000	NA		NA
6090471	6090472	CJD_A0452	CJD_A0453			FALSE	0.008	488.000	0.000	NA		NA
6090472	6090473	CJD_A0453	CJD_A0454			FALSE	0.240	101.000	0.000	NA		NA
6090473	6090474	CJD_A0454	CJD_A0455			FALSE	0.348	36.000	0.000	NA		NA
6090474	6090475	CJD_A0455	CJD_A0456			TRUE	0.584	17.000	0.000	NA		NA
6090475	6090476	CJD_A0456	CJD_A0457			TRUE	0.609	15.000	0.000	NA		NA
6090476	6090477	CJD_A0457	CJD_A0458			FALSE	0.004	1008.000	0.000	NA		NA
6090477	6090478	CJD_A0458	CJD_A0459			TRUE	0.636	9.000	0.000	NA		NA
6090478	6090479	CJD_A0459	CJD_A0460			TRUE	0.643	3.000	0.000	NA		NA
6090479	6090480	CJD_A0460	CJD_A0461			FALSE	0.019	329.000	0.000	NA		NA
6090480	6090481	CJD_A0461	CJD_A0462			FALSE	0.002	555.000	0.000	1.000	N	NA
6090481	6090482	CJD_A0462	CJD_A0463			TRUE	0.636	0.000	0.000	NA		NA
6090482	6090483	CJD_A0463	CJD_A0464			FALSE	0.203	128.000	0.000	NA		NA
6090483	6090484	CJD_A0464	CJD_A0465			FALSE	0.005	675.000	0.000	NA		NA
6090484	6090485	CJD_A0465	CJD_A0466			TRUE	0.926	58.000	0.667	NA		NA
6090485	6090486	CJD_A0466	CJD_A0467			TRUE	0.629	12.000	0.000	NA		NA
6090486	6090487	CJD_A0467	CJD_A0468			TRUE	0.629	12.000	0.000	NA		NA
6090487	6090488	CJD_A0468	CJD_A0469			FALSE	0.266	61.000	0.000	NA		NA
6090488	6090489	CJD_A0469	CJD_A0470			TRUE	0.624	-7.000	0.000	NA		NA
6090489	6090490	CJD_A0470	CJD_A0471			TRUE	0.618	-10.000	0.000	NA		NA
6090490	6090491	CJD_A0471	CJD_A0472			FALSE	0.077	15.000	0.000	0.002		NA
6090491	6090492	CJD_A0472	CJD_A0473			TRUE	0.565	63.000	0.014	0.062		NA
6090494	6090495	CJD_A0475	CJD_A0476			TRUE	0.640	1.000	0.000	NA		NA
6090495	6090496	CJD_A0476	CJD_A0477			FALSE	0.431	27.000	0.000	NA		NA
6090496	6090497	CJD_A0477	CJD_A0478			FALSE	0.259	64.000	0.000	NA		NA
6090497	6090498	CJD_A0478	CJD_A0479			TRUE	0.643	4.000	0.000	NA		NA
6090498	6090499	CJD_A0479	CJD_A0480			TRUE	0.633	11.000	0.000	NA		NA
6090499	6090500	CJD_A0480	CJD_A0481			TRUE	0.642	2.000	0.000	NA		NA
6090500	6090501	CJD_A0481	CJD_A0482			TRUE	0.643	3.000	0.000	NA		NA
6090501	6090502	CJD_A0482	CJD_A0483			TRUE	0.599	16.000	0.000	NA		NA
6090502	6090503	CJD_A0483	CJD_A0484			FALSE	0.253	72.000	0.000	NA		NA
6090503	6090504	CJD_A0484	CJD_A0485			FALSE	0.009	441.000	0.000	NA		NA
6090504	6090505	CJD_A0485	CJD_A0486			FALSE	0.004	640.000	0.000	1.000		NA
6090505	6090506	CJD_A0486	CJD_A0487			FALSE	0.070	200.000	0.000	1.000		NA
6090506	6090507	CJD_A0487	CJD_A0488			FALSE	0.256	68.000	0.000	NA		NA
6090507	6090508	CJD_A0488	CJD_A0489			FALSE	0.316	44.000	0.000	NA		NA
6090510	6090511	CJD_A0491	CJD_A0492			FALSE	0.179	97.000	0.000	1.000		NA
6090514	6090515	CJD_A0495	CJD_A0496			TRUE	0.608	-21.000	0.000	NA		NA
6090516	6090517	CJD_A0497	CJD_A0498			FALSE	0.030	287.000	0.000	NA		NA
6090517	6090518	CJD_A0498	CJD_A0499			FALSE	0.256	67.000	0.000	NA		NA
6090519	6090520	CJD_A0500	CJD_A0501			TRUE	0.599	16.000	0.000	NA		NA
6090521	6090522	CJD_A0502	CJD_A0503			FALSE	0.002	993.000	0.000	1.000	N	NA
6090522	6090523	CJD_A0503	CJD_A0504			FALSE	0.321	43.000	0.000	NA		NA
6090524	6090525	CJD_A0505	CJD_A0506			FALSE	0.103	196.000	0.000	NA		NA
6090526	6090527	CJD_A0507	CJD_A0508			FALSE	0.082	213.000	0.000	NA		NA
6090527	6090528	CJD_A0508	CJD_A0509			FALSE	0.254	71.000	0.000	NA		NA
6090528	6090529	CJD_A0509	CJD_A0510			FALSE	0.008	477.000	0.000	NA		NA
6090529	6090530	CJD_A0510	CJD_A0511			TRUE	0.546	0.000	0.000	1.000		NA
6090530	6090531	CJD_A0511	CJD_A0512			FALSE	0.067	203.000	0.000	1.000		NA
6090531	6090532	CJD_A0512	CJD_A0513			FALSE	0.029	291.000	0.000	NA		NA
6090532	6090533	CJD_A0513	CJD_A0514			TRUE	0.601	-31.000	0.000	NA		NA
6090534	6090535	CJD_A0515	CJD_A0516			TRUE	0.599	16.000	0.000	NA		NA
6090535	6090536	CJD_A0516	CJD_A0517			FALSE	0.239	103.000	0.000	NA		NA
6090536	6090537	CJD_A0517	CJD_A0518			FALSE	0.006	585.000	0.000	NA		NA
6090538	6090539	CJD_A0519	CJD_A0520			FALSE	0.004	1765.000	0.000	NA		NA
6090539	6090540	CJD_A0520	CJD_A0521			FALSE	0.082	213.000	0.000	NA		NA
6090540	6090541	CJD_A0521	CJD_A0522			FALSE	0.254	71.000	0.000	NA		NA
6090542	6090543	CJD_A0523	CJD_A0524			TRUE	0.985	0.000	1.000	NA		NA
6090543	6090544	CJD_A0524	CJD_A0525			FALSE	0.168	149.000	0.000	NA		NA
6090545	6090546	CJD_2933	CJD_2932			TRUE	0.643	3.000	0.000	NA		NA
6090546	6090547	CJD_2932	CJD_2931			FALSE	0.259	64.000	0.000	NA		NA
6090547	6090548	CJD_2931	CJD_2930			FALSE	0.321	43.000	0.000	NA		NA
6090548	6090549	CJD_2930	CJD_2929			FALSE	0.192	134.000	0.000	NA		NA
6090549	6090550	CJD_2929	CJD_2927			FALSE	0.018	337.000	0.000	NA		NA
6090552	6090553	CJD_2925	CJD_2924			FALSE	0.266	61.000	0.000	NA		NA
6090553	6090554	CJD_2924	CJD_2923			FALSE	0.497	22.000	0.000	NA		NA
6090556	6090557	CJD_2921	CJD_2920			FALSE	0.165	151.000	0.000	NA		NA
6090557	6090558	CJD_2920	CJD_2919			FALSE	0.002	697.000	0.000	1.000	N	NA
6090558	6090559	CJD_2919	CJD_2918			FALSE	0.022	238.000	0.000	1.000	N	NA
6090559	6090560	CJD_2918	CJD_2917			FALSE	0.065	229.000	0.000	NA		NA
6090560	6090561	CJD_2917	CJD_2916			FALSE	0.012	390.000	0.000	NA		NA
6090561	6090562	CJD_2916	CJD_2915			FALSE	0.181	88.000	0.000	1.000		NA
6090562	6090563	CJD_2915	CJD_2914			TRUE	0.733	136.000	0.000	0.034	Y	NA
6090563	6090564	CJD_2914	CJD_2913		cadA	TRUE	0.971	16.000	0.364	1.000	N	NA
6090564	6090565	CJD_2913	CJD_2912	cadA		FALSE	0.006	466.000	0.000	1.000		NA
6090565	6090566	CJD_2912	CJD_2911		crt	FALSE	0.027	263.000	0.000	1.000		NA
6090566	6090567	CJD_2911	CJD_2910	crt	bcd	TRUE	0.977	47.000	0.162	1.000	Y	NA
6090567	6090568	CJD_2910	CJD_2909	bcd		TRUE	0.962	19.000	0.545	0.024	N	NA
6090568	6090569	CJD_2909	CJD_2908			TRUE	0.992	22.000	0.714	0.008	Y	NA
6090569	6090570	CJD_2908	CJD_2907		hbd	TRUE	0.846	114.000	0.216	1.000	N	NA
6090570	6090571	CJD_2907	CJD_2906	hbd		FALSE	0.018	251.000	0.000	1.000	N	NA
6090571	6090572	CJD_2906	CJD_2905			FALSE	0.131	142.000	0.000	1.000		NA
6090572	6090573	CJD_2905	CJD_2904			FALSE	0.053	242.000	0.000	NA		NA
6090573	6090574	CJD_2904	CJD_2903			TRUE	0.903	10.000	0.012	NA		NA
6090575	6090576	CJD_2902	CJD_2901			FALSE	0.151	162.000	0.000	NA		NA
6090577	6090578	CJD_2900	CJD_2899	groS	groEL	TRUE	0.981	55.000	0.674	0.089	Y	NA
6090578	6090579	CJD_2899	CJD_2898	groEL		FALSE	0.005	665.000	0.000	NA		NA
6090579	6090580	CJD_2898	CJD_2897			FALSE	0.035	277.000	0.000	NA		NA
6090580	6090581	CJD_2897	CJD_2896			TRUE	0.934	70.000	0.025	1.000	Y	NA
6090581	6090582	CJD_2896	CJD_2895			TRUE	0.986	27.000	0.141	1.000	Y	NA
6090582	6090583	CJD_2895	CJD_2894			TRUE	0.892	25.000	0.047	NA		NA
6090583	6090584	CJD_2894	CJD_2893			FALSE	0.270	59.000	0.000	NA		NA
6090584	6090585	CJD_2893	CJD_2892			TRUE	0.960	16.000	0.000	NA	Y	NA
6090585	6090586	CJD_2892	CJD_2891			TRUE	0.841	83.000	0.000	NA	Y	NA
6090586	6090587	CJD_2891	CJD_2890			TRUE	0.962	15.000	0.111	NA		NA
6090587	6090588	CJD_2890	CJD_2889			TRUE	0.982	-10.000	0.667	NA		NA
6090588	6090589	CJD_2889	CJD_2888			TRUE	0.511	21.000	0.000	NA		NA
6090589	6090590	CJD_2888	CJD_2887			TRUE	0.641	5.000	0.000	NA		NA
6090590	6090591	CJD_2887	CJD_2886			FALSE	0.446	26.000	0.000	NA		NA
6090591	6090592	CJD_2886	CJD_2885			FALSE	0.471	24.000	0.000	NA		NA
6090592	6090593	CJD_2885	CJD_2884		guaB	FALSE	0.005	711.000	0.000	NA		NA
6090593	6090594	CJD_2884	CJD_2883	guaB	guaA	TRUE	0.960	106.000	0.190	0.001	Y	NA
6090596	6090597	CJD_2881	CJD_2880			TRUE	0.796	75.000	0.000	0.021	Y	NA
6090597	6090598	CJD_2880	CJD_2879			TRUE	0.995	15.000	0.667	0.021	Y	NA
6090598	6090599	CJD_2879	CJD_2878			TRUE	0.959	14.000	0.000	1.000	Y	NA
6090599	6090600	CJD_2878	CJD_2877			TRUE	0.948	1.000	0.000	0.001	Y	NA
6090600	6090601	CJD_2877	CJD_2876			FALSE	0.096	202.000	0.000	NA		NA
6090601	6090602	CJD_2876	CJD_2875		pgi	FALSE	0.402	30.000	0.000	NA		NA
6090602	6090603	CJD_2875	CJD_2874	pgi		FALSE	0.417	198.000	0.018	NA		NA
6090603	6090604	CJD_2874	CJD_2873			FALSE	0.014	373.000	0.000	NA		NA
6090604	6090605	CJD_2873	CJD_2872			FALSE	0.013	374.000	0.000	NA		NA
6090605	6090606	CJD_2872	CJD_2871			FALSE	0.004	553.000	0.000	1.000		NA
6090606	6090607	CJD_2871	CJD_2870			TRUE	0.642	2.000	0.000	NA		NA
6090607	6090608	CJD_2870	CJD_2869			TRUE	0.584	17.000	0.000	NA		NA
6090608	6090609	CJD_2869	CJD_2868		pcrA	FALSE	0.084	212.000	0.000	NA		NA
6090609	6090610	CJD_2868	CJD_2867	pcrA	ligA	TRUE	0.951	38.000	0.039	0.012	Y	NA
6090612	6090613	CJD_2865	CJD_2864			FALSE	0.004	1406.000	0.000	NA		NA
6090615	6090616	CJD_2862	CJD_2861	rph		TRUE	0.973	2.000	0.262	1.000	N	NA
6090616	6090617	CJD_2861	CJD_2860			TRUE	0.539	12.000	0.000	1.000		NA
6090618	6090619	CJD_1004	CJD_1003			FALSE	0.146	165.000	0.000	NA		NA
6090619	6090620	CJD_1003	CJD_1002			FALSE	0.063	208.000	0.000	1.000		NA
6090622	6090623	CJD_1000	CJD_0999			FALSE	0.045	24.000	0.000	0.003		NA
6090623	6090624	CJD_0999	CJD_0998			FALSE	0.331	28.000	0.000	1.000		NA
6090624	6090625	CJD_0998	CJD_0997			TRUE	0.995	16.000	1.000	0.021	Y	NA
6090625	6090626	CJD_0997	CJD_0996			TRUE	0.977	90.000	0.750	0.021	Y	NA
6090626	6090627	CJD_0996	CJD_0995			FALSE	0.112	79.000	0.000	1.000	N	NA
6090627	6090628	CJD_0995	CJD_0994			TRUE	0.894	27.000	0.000	0.012	Y	NA
6090628	6090629	CJD_0994	CJD_0993			FALSE	0.111	159.000	0.000	1.000		NA
6090629	6090630	CJD_0993	CJD_0992			TRUE	0.527	-10.000	0.000	1.000		NA
6090630	6090631	CJD_0992	CJD_0991		cloSI	FALSE	0.025	272.000	0.000	1.000		NA
6090631	6090632	CJD_0991	CJD_0990	cloSI		FALSE	0.039	262.000	0.000	NA		NA
6090632	6090633	CJD_0990	CJD_0989			FALSE	0.137	171.000	0.000	NA		NA
6090633	6090634	CJD_0989	CJD_0988			TRUE	0.962	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
6090634	6090635	CJD_0988	CJD_0987			FALSE	0.045	188.000	0.000	1.000	N	NA
6090635	6090636	CJD_0987	CJD_0986		arsC	FALSE	0.345	17.000	0.000	1.000	N	NA
6090636	6090637	CJD_0986	CJD_0985	arsC	arsR	FALSE	0.094	119.000	0.000	1.000	N	NA
6090637	6090638	CJD_0985	CJD_0984	arsR		FALSE	0.014	368.000	0.000	NA		NA
6090638	6090639	CJD_0984	CJD_0982			TRUE	0.636	9.000	0.000	NA		NA
6090639	6090640	CJD_0982	CJD_0981			FALSE	0.029	292.000	0.000	NA		NA
6090640	6090641	CJD_0981	CJD_0980			TRUE	0.994	0.000	0.375	0.005	Y	NA
6090641	6090642	CJD_0980	CJD_0979			FALSE	0.285	52.000	0.000	NA		NA
6090642	6090643	CJD_0979	CJD_0978			FALSE	0.201	129.000	0.000	NA		NA
6090643	6090644	CJD_0978	CJD_0977			FALSE	0.004	794.000	0.000	NA		NA
6090644	6090645	CJD_0977	CJD_0976			FALSE	0.035	275.000	0.000	NA		NA
6090645	6090646	CJD_0976	CJD_0975			FALSE	0.043	256.000	0.000	NA		NA
6090646	6090647	CJD_0975	CJD_0974			FALSE	0.009	458.000	0.000	NA		NA
6090647	6090648	CJD_0974	CJD_0973			FALSE	0.069	226.000	0.000	NA		NA
6090648	6090649	CJD_0973	CJD_0972			FALSE	0.013	385.000	0.000	NA		NA
6090649	6090650	CJD_0972	CJD_0971			TRUE	0.836	172.000	0.583	NA		NA
6090650	6090651	CJD_0971	CJD_0970			TRUE	0.993	20.000	0.812	0.011	Y	NA
6090651	6090652	CJD_0970	CJD_0969			TRUE	0.982	51.000	0.943	0.011	Y	NA
6090652	6090653	CJD_0969	CJD_0968			FALSE	0.014	326.000	0.000	1.000		NA
6090653	6090654	CJD_0968	CJD_0967		ddl	FALSE	0.125	147.000	0.000	1.000		NA
6090654	6090655	CJD_0967	CJD_0966	ddl		FALSE	0.039	201.000	0.000	1.000	N	NA
6090657	6090658	CJD_0964	CJD_0963			FALSE	0.009	312.000	0.000	1.000	N	NA
6090658	6090659	CJD_0963	CJD_0962			TRUE	0.936	164.000	0.121	1.000	Y	NA
6090659	6090660	CJD_0962	CJD_0961			TRUE	0.994	4.000	0.217	0.021	Y	NA
6090660	6090661	CJD_0961	CJD_0960			TRUE	0.981	99.000	0.889	1.000	Y	NA
6090665	6090666	CJD_0956	CJD_0955			FALSE	0.051	245.000	0.000	NA		NA
6090666	6090667	CJD_0955	CJD_0954			FALSE	0.010	295.000	0.000	1.000	N	NA
6090667	6090668	CJD_0954	CJD_0953			FALSE	0.120	184.000	0.000	NA		NA
6090668	6090669	CJD_0953	CJD_0952			FALSE	0.203	128.000	0.000	NA		NA
6090671	6090672	CJD_0950	CJD_0949			FALSE	0.122	182.000	0.000	NA		NA
6090674	6090675	CJD_0947	CJD_0946			FALSE	0.019	247.000	0.000	1.000	N	NA
6090675	6090676	CJD_0946	CJD_0945			FALSE	0.363	34.000	0.000	NA		NA
6090676	6090677	CJD_0945	CJD_0944			FALSE	0.244	86.000	0.000	NA		NA
6090677	6090678	CJD_0944	CJD_0943			FALSE	0.239	103.000	0.000	NA		NA
6090678	6090679	CJD_0943	CJD_0942			FALSE	0.185	139.000	0.000	NA		NA
6090679	6090680	CJD_0942	CJD_0941			FALSE	0.076	218.000	0.000	NA		NA
6090680	6090681	CJD_0941	CJD_0940			FALSE	0.321	43.000	0.000	NA		NA
6090681	6090682	CJD_0940	CJD_0939		panE	FALSE	0.330	40.000	0.000	NA		NA
6090682	6090683	CJD_0939	CJD_0938	panE		FALSE	0.348	36.000	0.000	NA		NA
6090683	6090684	CJD_0938	CJD_0936			FALSE	0.008	490.000	0.000	NA		NA
6090685	6090686	CJD_2344	CJD_2345		pilT	FALSE	0.252	78.000	0.000	NA		NA
6090686	6090687	CJD_2345	CJD_2346	pilT		FALSE	0.447	181.000	0.025	1.000	N	NA
6090687	6090688	CJD_2346	CJD_2347			TRUE	0.802	63.000	0.087	1.000	N	NA
6090688	6090689	CJD_2347	CJD_2348		udk	TRUE	0.551	113.000	0.012	1.000	N	NA
6090689	6090690	CJD_2348	CJD_2349	udk		TRUE	0.956	0.000	0.100	1.000	N	NA
6090690	6090691	CJD_2349	CJD_2350			TRUE	0.968	6.000	0.146	1.000		NA
6090691	6090692	CJD_2350	CJD_2351			TRUE	0.942	16.000	0.067	1.000		NA
6090692	6090693	CJD_2351	CJD_2352		typA	TRUE	0.509	143.000	0.012	1.000		NA
6090693	6090694	CJD_2352	CJD_2353	typA		FALSE	0.415	157.000	0.004	1.000		NA
6090694	6090695	CJD_2353	CJD_2354			TRUE	0.887	71.000	0.289	1.000		NA
6090695	6090696	CJD_2354	CJD_2355			TRUE	0.959	21.000	0.211	NA		NA
6090696	6090697	CJD_2355	CJD_2356			TRUE	0.935	16.000	0.047	NA		NA
6090697	6090698	CJD_2356	CJD_2357		alaS	FALSE	0.003	449.000	0.000	1.000	N	NA
6090698	6090699	CJD_2357	CJD_2358	alaS		FALSE	0.032	592.000	0.015	NA		NA
6090699	6090700	CJD_2358	CJD_2359			TRUE	0.947	26.000	0.209	NA		NA
6090700	6090701	CJD_2359	CJD_2360		trmU	FALSE	0.137	280.000	0.006	NA		NA
6090701	6090702	CJD_2360	CJD_2361	trmU		TRUE	0.898	25.000	0.073	1.000	N	NA
6090702	6090703	CJD_2361	CJD_2362		iscS	TRUE	0.923	3.000	0.035	1.000	N	NA
6090703	6090704	CJD_2362	CJD_2363	iscS		TRUE	0.963	-7.000	0.125	NA	N	NA
6090704	6090705	CJD_2363	CJD_2364			FALSE	0.141	130.000	0.000	NA	N	NA
6090705	6090706	CJD_2364	CJD_2365			FALSE	0.043	193.000	0.000	1.000	N	NA
6090706	6090707	CJD_2365	CJD_2366			FALSE	0.083	186.000	0.000	1.000		NA
6090707	6090708	CJD_2366	CJD_2367		moaA	TRUE	0.919	3.000	0.042	0.022		NA
6090708	6090709	CJD_2367	CJD_2368	moaA		FALSE	0.203	226.000	0.016	0.003		NA
6090709	6090710	CJD_2368	CJD_2369			FALSE	0.015	118.000	0.000	0.003		NA
6090710	6090711	CJD_2369	CJD_2370		moeA	TRUE	0.826	45.000	0.000	0.003	Y	NA
6090711	6090712	CJD_2370	CJD_2371	moeA	mobB	FALSE	0.159	339.000	0.000	0.003	Y	NA
6090712	6090713	CJD_2371	CJD_2372	mobB	noxA	FALSE	0.241	91.000	0.000	NA		NA
6090713	6090714	CJD_2372	CJD_2373	noxA	narB	TRUE	0.976	2.000	0.222	NA		NA
6090714	6090715	CJD_2373	CJD_2374	narB	narA	TRUE	0.989	13.000	0.039	NA	Y	NA
6090715	6090716	CJD_2374	CJD_2375	narA		FALSE	0.030	287.000	0.000	NA		NA
6090716	6090717	CJD_2375	CJD_2376			FALSE	0.072	222.000	0.000	NA		NA
6090717	6090718	CJD_2376	CJD_2377			TRUE	0.939	32.000	0.381	1.000		NA
6090718	6090719	CJD_2377	CJD_2378			FALSE	0.246	247.000	0.032	1.000	N	NA
6090720	6090721	CJD_2379	CJD_2380			FALSE	0.305	47.000	0.000	NA		NA
6090722	6090723	CJD_2381	CJD_2382	scpB	scpA	TRUE	0.982	-7.000	0.570	NA		NA
6090723	6090724	CJD_2382	CJD_2383	scpA	dacF	FALSE	0.130	279.000	0.004	NA		NA
6090724	6090725	CJD_2383	CJD_2384	dacF	pdp	FALSE	0.018	252.000	0.000	1.000	N	NA
6090725	6090726	CJD_2384	CJD_2385	pdp	xerD	FALSE	0.019	247.000	0.000	1.000	N	NA
6090726	6090727	CJD_2385	CJD_2386	xerD		TRUE	0.737	50.000	0.021	NA		NA
6090727	6090728	CJD_2386	CJD_2387			TRUE	0.658	134.000	0.033	NA		NA
6090728	6090729	CJD_2387	CJD_2388			FALSE	0.264	62.000	0.000	NA		NA
6090729	6090730	CJD_2388	CJD_2389		spo0A	FALSE	0.252	77.000	0.000	NA		NA
6090730	6090731	CJD_2389	CJD_2390	spo0A		TRUE	0.798	174.000	0.393	1.000		NA
6090731	6090732	CJD_2390	CJD_2391		recN	TRUE	0.645	177.000	0.079	1.000		NA
6090732	6090733	CJD_2391	CJD_2392	recN	argR	TRUE	0.944	16.000	0.086	1.000	N	NA
6090733	6090734	CJD_2392	CJD_2393	argR		TRUE	0.927	23.000	0.117	1.000	N	NA
6090734	6090735	CJD_2393	CJD_2394			TRUE	0.817	85.000	0.120	1.000	N	NA
6090735	6090736	CJD_2394	CJD_2395		dxs	TRUE	0.967	12.000	0.189	1.000	N	NA
6090736	6090737	CJD_2395	CJD_2396	dxs	ispA	TRUE	0.982	21.000	0.048	1.000	Y	NA
6090737	6090738	CJD_2396	CJD_2397	ispA	xseB	TRUE	0.931	-10.000	0.053	1.000	N	NA
6090738	6090739	CJD_2397	CJD_2398	xseB	xseA	TRUE	0.992	19.000	0.412	0.001	Y	NA
6090739	6090740	CJD_2398	CJD_2399	xseA	folD	TRUE	0.931	2.000	0.045	1.000	N	NA
6090740	6090741	CJD_2399	CJD_2400	folD	nusB	TRUE	0.745	49.000	0.039	1.000	N	NA
6090741	6090742	CJD_2400	CJD_2401	nusB	asp	FALSE	0.217	119.000	0.000	NA		NA
6090742	6090743	CJD_2401	CJD_2403	asp	spoIIIAH	FALSE	0.245	85.000	0.000	NA		NA
6090743	6090744	CJD_2403	CJD_2404	spoIIIAH		TRUE	0.958	26.000	0.407	NA		NA
6090744	6090745	CJD_2404	CJD_2405		spoIIIAF	TRUE	0.983	15.000	0.907	NA		NA
6090745	6090746	CJD_2405	CJD_2406	spoIIIAF		TRUE	0.985	8.000	0.918	NA		NA
6090746	6090747	CJD_2406	CJD_2407			TRUE	0.984	11.000	0.864	NA		NA
6090747	6090748	CJD_2407	CJD_2408			FALSE	0.243	88.000	0.000	NA		NA
6090748	6090749	CJD_2408	CJD_2409			FALSE	0.253	76.000	0.000	NA		NA
6090749	6090750	CJD_2409	CJD_2410			TRUE	0.873	147.000	0.604	NA		NA
6090750	6090751	CJD_2410	CJD_2411			FALSE	0.071	199.000	0.000	1.000		NA
6090751	6090752	CJD_2411	CJD_2412		efp	FALSE	0.169	114.000	0.000	1.000		NA
6090752	6090753	CJD_2412	CJD_2413	efp		FALSE	0.137	171.000	0.000	NA		NA
6090753	6090754	CJD_2413	CJD_2414			TRUE	0.631	-3.000	0.000	NA		NA
6090754	6090755	CJD_2414	CJD_2415			TRUE	0.599	-40.000	0.000	NA		NA
6090755	6090756	CJD_2415	CJD_2416			TRUE	0.605	-25.000	0.000	NA		NA
6090756	6090757	CJD_2416	CJD_2417			FALSE	0.305	47.000	0.000	NA		NA
6090757	6090758	CJD_2417	CJD_2418			FALSE	0.268	60.000	0.000	NA		NA
6090758	6090759	CJD_2418	CJD_2419			TRUE	0.526	20.000	0.000	NA		NA
6090759	6090760	CJD_2419	CJD_2420			TRUE	0.624	-7.000	0.000	NA		NA
6090760	6090761	CJD_2420	CJD_2421			TRUE	0.993	-13.000	0.135	1.000	Y	NA
6090761	6090762	CJD_2421	CJD_2422			FALSE	0.240	100.000	0.000	NA		NA
6090762	6090763	CJD_2422	CJD_2423		dapF	TRUE	0.855	17.000	0.003	NA		NA
6090765	6090766	CJD_2425	CJD_2426		pyrR	TRUE	0.804	20.000	0.008	1.000	N	NA
6090766	6090767	CJD_2426	CJD_2427	pyrR		TRUE	0.934	4.000	0.048	1.000	N	NA
6090767	6090768	CJD_2427	CJD_2428			FALSE	0.442	138.000	0.002	NA	N	NA
6090768	6090769	CJD_2428	CJD_2429			TRUE	0.982	13.000	0.579	NA		NA
6090769	6090770	CJD_2429	CJD_2430			TRUE	0.642	2.000	0.000	NA		NA
6090771	6090772	CJD_0732	CJD_0734	rrs	rrl	FALSE	0.116	186.000	0.000	NA		NA
6090772	6090773	CJD_0734	CJD_0735	rrl	rrf	FALSE	0.220	118.000	0.000	NA		NA
6090773	6090774	CJD_0735	CJD_0736	rrf		TRUE	0.639	6.000	0.000	NA		NA
6090774	6090775	CJD_0736	CJD_0737		sfsA	FALSE	0.004	1023.000	0.000	NA		NA
6090775	6090776	CJD_0737	CJD_0738	sfsA		FALSE	0.012	394.000	0.000	NA		NA
6090776	6090777	CJD_0738	CJD_0739		lysA	FALSE	0.008	410.000	0.000	1.000		NA
6090777	6090778	CJD_0739	CJD_0740	lysA		FALSE	0.009	457.000	0.000	NA		NA
6090778	6090779	CJD_0740	CJD_0741			TRUE	0.643	3.000	0.000	NA		NA
6090779	6090780	CJD_0741	CJD_0742		ftsH	FALSE	0.043	25.000	0.000	0.027	N	NA
6090780	6090781	CJD_0742	CJD_0743	ftsH		TRUE	0.650	226.000	0.583	0.087		NA
6090781	6090782	CJD_0743	CJD_0744			FALSE	0.006	456.000	0.000	1.000		NA
6090782	6090783	CJD_0744	CJD_0745			FALSE	0.390	31.000	0.000	NA		NA
6090783	6090784	CJD_0745	CJD_0746			TRUE	0.631	-3.000	0.000	NA		NA
6090784	6090785	CJD_0746	CJD_0747			FALSE	0.076	218.000	0.000	NA		NA
6090785	6090786	CJD_0747	CJD_0748			TRUE	0.511	21.000	0.000	NA		NA
6090786	6090787	CJD_0748	CJD_0749			FALSE	0.046	252.000	0.000	NA		NA
6090789	6090790	CJD_0751	CJD_0752			FALSE	0.076	142.000	0.000	1.000	N	NA
6090793	6090794	CJD_0755	CJD_0756		prfC	FALSE	0.015	261.000	0.000	1.000	N	NA
6090794	6090795	CJD_0756	CJD_0757	prfC		FALSE	0.080	214.000	0.000	NA		NA
6090796	6090797	CJD_0758	CJD_0759			FALSE	0.342	37.000	0.000	NA		NA
6090797	6090798	CJD_0759	CJD_0760			TRUE	0.926	1.000	0.023	NA		NA
6090798	6090799	CJD_0760	CJD_0761		rfbA	FALSE	0.288	51.000	0.000	NA		NA
6090799	6090800	CJD_0761	CJD_0762	rfbA	rfbC	TRUE	0.993	13.000	0.139	1.000	Y	NA
6090800	6090801	CJD_0762	CJD_0763	rfbC	rfbD	TRUE	0.990	14.000	0.062	1.000	Y	NA
6090801	6090802	CJD_0763	CJD_0764	rfbD	rfbB	TRUE	0.914	150.000	0.088	0.001	Y	NA
6090802	6090803	CJD_0764	CJD_0765	rfbB		TRUE	0.629	12.000	0.000	NA		NA
6090803	6090804	CJD_0765	CJD_0766			TRUE	0.624	-7.000	0.000	NA		NA
6090804	6090805	CJD_0766	CJD_0767			FALSE	0.483	23.000	0.000	NA		NA
6090805	6090806	CJD_0767	CJD_0768			FALSE	0.431	27.000	0.000	NA		NA
6090806	6090807	CJD_0768	CJD_0769			FALSE	0.268	60.000	0.000	NA		NA
6090807	6090808	CJD_0769	CJD_0770			FALSE	0.405	22.000	0.000	1.000		NA
6090808	6090809	CJD_0770	CJD_0771			FALSE	0.378	32.000	0.000	NA		NA
6090809	6090810	CJD_0771	CJD_0772			FALSE	0.051	245.000	0.000	NA		NA
6090810	6090811	CJD_0772	CJD_0773			FALSE	0.092	205.000	0.000	NA		NA
6090811	6090812	CJD_0773	CJD_0774			TRUE	0.937	26.000	0.167	1.000		NA
6090812	6090813	CJD_0774	CJD_0775			TRUE	0.775	147.000	0.133	1.000		NA
6090814	6090815	CJD_0776	CJD_0777			FALSE	0.220	118.000	0.000	NA		NA
6090815	6090816	CJD_0777	CJD_0778		brnQ	FALSE	0.020	289.000	0.000	NA	N	NA
6090817	6090818	CJD_0779	CJD_0780	trpS		FALSE	0.018	338.000	0.000	NA		NA
6090818	6090819	CJD_0780	CJD_0781			FALSE	0.240	99.000	0.000	NA		NA
6090819	6090820	CJD_0781	CJD_0782		pstS	FALSE	0.060	211.000	0.000	1.000		NA
6090820	6090821	CJD_0782	CJD_0783	pstS	pstS	FALSE	0.472	224.000	0.000	0.030	Y	NA
6090821	6090822	CJD_0783	CJD_0784	pstS	pstC	TRUE	0.908	82.000	0.005	1.000	Y	NA
6090822	6090823	CJD_0784	CJD_0785	pstC	pstA	TRUE	0.993	3.000	0.219	0.001	Y	NA
6090823	6090824	CJD_0785	CJD_0786	pstA	pstB	TRUE	0.992	18.000	0.428	0.001	Y	NA
6090824	6090825	CJD_0786	CJD_0787	pstB	phoU	TRUE	0.971	25.000	0.016	NA	Y	NA
6090825	6090826	CJD_0787	CJD_0788	phoU		FALSE	0.107	160.000	0.000	NA	N	NA
6090827	6090828	CJD_0789	CJD_0790			FALSE	0.363	34.000	0.000	NA		NA
6090829	6090830	CJD_2989	CJD_2988		rplM	FALSE	0.172	147.000	0.000	NA		NA
6090830	6090831	CJD_2988	CJD_2987	rplM	rpsI	TRUE	0.989	27.000	0.601	0.012	Y	NA
6090831	6090832	CJD_2987	CJD_2986	rpsI		FALSE	0.005	365.000	0.000	1.000	N	NA
6090832	6090833	CJD_2986	CJD_2985		cwlD	FALSE	0.371	191.000	0.018	1.000	N	NA
6090835	6090836	CJD_2983	CJD_2982	drrA		TRUE	0.996	-22.000	0.857	1.000	Y	NA
6090836	6090837	CJD_2982	CJD_2981			FALSE	0.056	172.000	0.000	1.000	N	NA
6090837	6090838	CJD_2981	CJD_2980		nrdA	FALSE	0.012	284.000	0.000	1.000	N	NA
6090838	6090839	CJD_2980	CJD_2979	nrdA	nrdB	TRUE	0.969	96.000	0.393	0.001	Y	NA
6090839	6090840	CJD_2979	CJD_2978	nrdB	rpsD	FALSE	0.004	402.000	0.000	1.000	N	NA
6090842	6090843	CJD_2976	CJD_2975	ptsI	iadA	FALSE	0.060	165.000	0.000	1.000	N	NA
6090843	6090844	CJD_2975	CJD_2974	iadA	trx	FALSE	0.164	117.000	0.000	1.000		NA
6090844	6090845	CJD_2974	CJD_2973	trx		FALSE	0.343	27.000	0.000	1.000		NA
6090846	6090847	CJD_2972	CJD_2971			TRUE	0.873	71.000	0.167	NA		NA
6090848	6090849	CJD_2970	CJD_2969			TRUE	0.979	-33.000	0.502	NA		NA
6090849	6090850	CJD_2969	CJD_2968			TRUE	0.824	76.000	0.083	NA		NA
6090850	6090851	CJD_2968	CJD_2967		ptb	FALSE	0.430	183.000	0.013	NA		NA
6090851	6090852	CJD_2967	CJD_2966	ptb	buk	TRUE	0.990	25.000	0.275	1.000	Y	NA
6090852	6090853	CJD_2966	CJD_2965	buk	hydA	FALSE	0.049	226.000	0.000	1.000		NA
6090853	6090854	CJD_2965	CJD_2964	hydA		FALSE	0.053	219.000	0.000	1.000		NA
6090854	6090855	CJD_2964	CJD_2963			TRUE	0.903	35.000	0.122	NA		NA
6090855	6090856	CJD_2963	CJD_2962			FALSE	0.009	457.000	0.000	NA		NA
6090856	6090857	CJD_2962	CJD_2961			TRUE	0.974	87.000	0.273	1.000	Y	NA
6090857	6090858	CJD_2961	CJD_2960			TRUE	0.996	2.000	0.818	0.020	Y	NA
6090858	6090859	CJD_2960	CJD_2959			FALSE	0.010	295.000	0.000	1.000	N	NA
6090859	6090860	CJD_2959	CJD_2958			FALSE	0.251	24.000	0.000	1.000	N	NA
6090860	6090861	CJD_2958	CJD_2957		malQ	TRUE	0.919	22.000	0.000	0.021	Y	NA
6090861	6090862	CJD_2957	CJD_2956	malQ	glgP	TRUE	0.950	-7.000	0.000	0.021	Y	NA
6090862	6090863	CJD_2956	CJD_2955	glgP		FALSE	0.192	351.000	0.000	1.000	Y	NA
6090863	6090864	CJD_2955	CJD_2954			FALSE	0.221	117.000	0.000	NA		NA
6090864	6090865	CJD_2954	CJD_2953			TRUE	0.620	140.000	0.025	NA		NA
6090865	6090866	CJD_2953	CJD_2952			FALSE	0.257	66.000	0.000	NA		NA
6090866	6090867	CJD_2952	CJD_2951			FALSE	0.139	170.000	0.000	NA		NA
6090867	6090868	CJD_2951	CJD_2950			TRUE	0.956	-37.000	0.000	1.000	Y	NA
6090868	6090869	CJD_2950	CJD_2949			FALSE	0.009	310.000	0.000	1.000	N	NA
6090873	6090874	CJD_3358	CJD_2945		glmS	FALSE	0.246	84.000	0.000	NA		NA
6090874	6090875	CJD_2945	CJD_2944	glmS		TRUE	0.526	20.000	0.000	NA		NA
6090875	6090876	CJD_2944	CJD_2943			FALSE	0.082	213.000	0.000	NA		NA
6090876	6090877	CJD_2943	CJD_2942			FALSE	0.049	226.000	0.000	1.000		NA
6090877	6090878	CJD_2942	CJD_2941			FALSE	0.173	96.000	0.000	NA	N	NA
6090880	6090881	CJD_2939	CJD_2938			TRUE	0.641	5.000	0.000	NA		NA
6090881	6090882	CJD_2938	CJD_2937			TRUE	0.564	18.000	0.000	NA		NA
6090882	6090883	CJD_2937	CJD_2936			FALSE	0.026	300.000	0.000	NA		NA
6090886	6090887	CJD_2277	CJD_2278	rpsB	codY	FALSE	0.013	383.000	0.000	NA		NA
6090887	6090888	CJD_2278	CJD_2279	codY	topA	TRUE	0.557	142.000	0.025	1.000	N	NA
6090888	6090889	CJD_2279	CJD_2280	topA	dprA	TRUE	0.981	45.000	0.238	1.000	Y	NA
6090889	6090890	CJD_2280	CJD_2281	dprA		TRUE	0.937	1.000	0.053	1.000	N	NA
6090892	6090893	CJD_2283	CJD_2284	rnhB		TRUE	0.963	16.000	0.148	1.000		NA
6090895	6090896	CJD_2286	CJD_2287	rplS	trmD	TRUE	0.976	121.000	0.567	1.000	Y	NA
6090896	6090897	CJD_2287	CJD_2288	trmD	rimM	TRUE	0.996	-10.000	0.672	1.000	Y	NA
6090897	6090898	CJD_2288	CJD_2289	rimM		TRUE	0.901	56.000	0.324	1.000		NA
6090898	6090899	CJD_2289	CJD_2290		rpsP	TRUE	0.922	44.000	0.385	1.000		NA
6090899	6090900	CJD_2290	CJD_2291	rpsP	ffh	TRUE	0.928	34.000	0.361	1.000	N	NA
6090900	6090901	CJD_2291	CJD_2292	ffh		TRUE	0.968	12.000	0.151	1.000		NA
6090901	6090902	CJD_2292	CJD_2293		ftsY	TRUE	0.647	177.000	0.081	1.000		NA
6090902	6090903	CJD_2293	CJD_2294	ftsY	smc	TRUE	0.953	14.000	0.165	0.013	N	NA
6090903	6090904	CJD_2294	CJD_2295	smc		FALSE	0.374	205.000	0.027	1.000	N	NA
6090904	6090905	CJD_2295	CJD_2296		rnc	TRUE	0.990	-21.000	0.064	1.000	Y	NA
6090905	6090906	CJD_2296	CJD_2297	rnc	acpP	TRUE	0.756	99.000	0.068	1.000	N	NA
6090906	6090907	CJD_2297	CJD_2298	acpP	plsX	TRUE	0.921	77.000	0.034	0.003	Y	NA
6090907	6090908	CJD_2298	CJD_2299	plsX	rpmF	TRUE	0.901	57.000	0.418	1.000	N	NA
6090908	6090909	CJD_2299	CJD_2300	rpmF		TRUE	0.980	16.000	0.599	NA		NA
6090909	6090910	CJD_2300	CJD_2301		ackA	TRUE	0.771	114.000	0.061	NA		NA
6090910	6090911	CJD_2301	CJD_2302	ackA	pta	TRUE	0.966	91.000	0.137	1.000	Y	NA
6090912	6090913	CJD_2303	CJD_2305		ylbJ	TRUE	0.745	65.000	0.036	NA		NA
6090914	6090915	CJD_2304	CJD_2306		coaD	TRUE	0.911	9.000	0.015	NA		NA
6090915	6090916	CJD_2306	CJD_2307	coaD		TRUE	0.920	2.000	0.034	1.000	N	NA
6090916	6090917	CJD_2307	CJD_2308		recG	TRUE	0.927	65.000	0.016	1.000	Y	NA
6090917	6090918	CJD_2308	CJD_2309	recG		TRUE	0.636	152.000	0.048	1.000		NA
6090918	6090919	CJD_2309	CJD_2310			TRUE	0.981	14.000	0.567	NA		NA
6090921	6090922	CJD_2312	CJD_2313		rpe	TRUE	0.967	2.000	0.166	1.000	N	NA
6090922	6090923	CJD_2313	CJD_2314	rpe	rsgA	TRUE	0.973	0.000	0.213	1.000		NA
6090923	6090924	CJD_2314	CJD_2315	rsgA		TRUE	0.549	237.000	0.196	1.000		NA
6090924	6090925	CJD_2315	CJD_2316			TRUE	0.997	2.000	0.704	1.000	Y	NA
6090925	6090926	CJD_2316	CJD_2317			TRUE	0.959	13.000	0.105	1.000		NA
6090926	6090927	CJD_2317	CJD_2318		sun	TRUE	0.910	32.000	0.135	1.000		NA
6090927	6090928	CJD_2318	CJD_2319	sun		TRUE	0.957	11.000	0.076	NA		NA
6090928	6090929	CJD_2319	CJD_2320		fmt	TRUE	0.916	18.000	0.035	NA		NA
6090929	6090930	CJD_2320	CJD_2321	fmt	def	TRUE	0.976	20.000	0.033	0.020	Y	NA
6090930	6090931	CJD_2321	CJD_2322	def	priA	TRUE	0.834	14.000	0.003	1.000	N	NA
6090931	6090932	CJD_2322	CJD_2323	priA	coaBC	TRUE	0.863	39.000	0.099	1.000	N	NA
6090932	6090933	CJD_2323	CJD_2324	coaBC	rpoZ	TRUE	0.881	6.000	0.013	1.000	N	NA
6090933	6090934	CJD_2324	CJD_2325	rpoZ	gmk	TRUE	0.911	-19.000	0.035	1.000	N	NA
6090934	6090935	CJD_2325	CJD_2326	gmk		TRUE	0.969	-7.000	0.143	NA		NA
6090935	6090936	CJD_2326	CJD_2327			TRUE	0.971	14.000	0.189	NA		NA
6090936	6090937	CJD_2327	CJD_2328			FALSE	0.073	221.000	0.000	NA		NA
6090937	6090938	CJD_2328	CJD_2329			FALSE	0.030	257.000	0.000	1.000		NA
6090938	6090939	CJD_2329	CJD_2330		spoIVA	FALSE	0.016	351.000	0.000	NA		NA
6090939	6090940	CJD_2330	CJD_2331	spoIVA		FALSE	0.177	329.000	0.060	NA		NA
6090940	6090941	CJD_2331	CJD_2332			TRUE	0.951	5.000	0.068	1.000		NA
6090941	6090942	CJD_2332	CJD_2333			TRUE	0.949	3.000	0.061	1.000		NA
6090942	6090943	CJD_2333	CJD_2334			FALSE	0.007	326.000	0.000	1.000	N	NA
6090943	6090944	CJD_2334	CJD_2335			TRUE	0.617	14.000	0.000	NA		NA
6090944	6090945	CJD_2335	CJD_2336		nrdR	FALSE	0.478	166.000	0.013	NA		NA
6090945	6090946	CJD_2336	CJD_2337	nrdR		TRUE	0.656	50.000	0.005	NA		NA
6090946	6090947	CJD_2337	CJD_2338		sigG	TRUE	0.622	141.000	0.026	NA		NA
6090947	6090948	CJD_2338	CJD_2339	sigG	sigE	TRUE	0.976	75.000	0.602	0.008	Y	NA
6090948	6090949	CJD_2339	CJD_2340	sigE	spoIIGA	TRUE	0.982	14.000	0.856	1.000		NA
6090949	6090950	CJD_2340	CJD_2341	spoIIGA		FALSE	0.339	38.000	0.000	NA		NA
6090950	6090951	CJD_2341	CJD_2342		ftsZ	FALSE	0.048	248.000	0.000	NA		NA
6090951	6090952	CJD_2342	CJD_2343	ftsZ		TRUE	0.617	14.000	0.000	NA		NA
6090953	6090954	CJD_1148	CJD_1150			FALSE	0.133	174.000	0.000	NA		NA
6090957	6090958	CJD_1152	CJD_1153			FALSE	0.096	202.000	0.000	NA		NA
6090958	6090959	CJD_1153	CJD_1154			TRUE	0.868	22.000	0.021	NA		NA
6090962	6090963	CJD_1157	CJD_1158			FALSE	0.253	74.000	0.000	NA		NA
6090963	6090964	CJD_1158	CJD_1159			FALSE	0.012	388.000	0.000	NA		NA
6090964	6090965	CJD_1159	CJD_1160			FALSE	0.092	205.000	0.000	NA		NA
6090965	6090966	CJD_1160	CJD_1161			FALSE	0.007	528.000	0.000	NA		NA
6090966	6090967	CJD_1161	CJD_1162			TRUE	0.825	30.000	0.023	NA		NA
6090967	6090968	CJD_1162	CJD_1163			TRUE	0.984	-7.000	0.015	1.000	Y	NA
6090968	6090969	CJD_1163	CJD_1164			FALSE	0.141	134.000	0.000	1.000		NA
6090970	6090971	CJD_1165	CJD_1166			FALSE	0.215	120.000	0.000	NA		NA
6090974	6090975	CJD_1169	CJD_1170			FALSE	0.020	325.000	0.000	NA		NA
6090975	6090976	CJD_1170	CJD_1171			FALSE	0.217	119.000	0.000	NA		NA
6090976	6090977	CJD_1171	CJD_1172			FALSE	0.007	505.000	0.000	NA		NA
6090977	6090978	CJD_1172	CJD_1173		cotJB	TRUE	0.966	13.000	0.125	NA		NA
6090978	6090979	CJD_1173	CJD_1174	cotJB	cotJC	TRUE	0.950	13.000	0.062	NA		NA
6090981	6090982	CJD_1176	CJD_1177			FALSE	0.035	276.000	0.000	NA		NA
6090982	6090983	CJD_1177	CJD_1178			FALSE	0.378	32.000	0.000	NA		NA
6090983	6090984	CJD_1178	CJD_1179			FALSE	0.004	580.000	0.000	1.000		NA
6090984	6090985	CJD_1179	CJD_1180			FALSE	0.084	212.000	0.000	NA		NA
6090985	6090986	CJD_1180	CJD_1181			FALSE	0.015	354.000	0.000	NA		NA
6090986	6090987	CJD_1181	CJD_1182			FALSE	0.008	485.000	0.000	NA		NA
6090987	6090988	CJD_1182	CJD_1183			FALSE	0.007	428.000	0.000	1.000		NA
6090991	6090992	CJD_1186	CJD_1187			TRUE	0.614	240.000	0.625	1.000	N	NA
6090993	6090994	CJD_1188	CJD_1189			FALSE	0.324	41.000	0.000	NA		NA
6090997	6090998	CJD_1192	CJD_1193			FALSE	0.483	23.000	0.000	NA		NA
6090998	6090999	CJD_1193	CJD_1194			FALSE	0.158	157.000	0.000	NA		NA
6091000	6091001	CJD_1195	CJD_1196			FALSE	0.009	443.000	0.000	NA		NA
6091001	6091002	CJD_1196	CJD_1197			TRUE	0.981	-7.000	0.500	NA		NA
6091002	6091003	CJD_1197	CJD_1198			TRUE	0.984	-6.000	1.000	NA		NA
6091003	6091004	CJD_1198	CJD_1199			TRUE	0.982	5.000	0.500	NA		NA
6091004	6091005	CJD_1199	CJD_1200			TRUE	0.944	35.000	0.500	NA		NA
6091008	6091009	CJD_0104	CJD_0105	rrl	rrf	FALSE	0.282	53.000	0.000	NA		NA
6091009	6091010	CJD_0105	CJD_0106	rrf		TRUE	0.636	9.000	0.000	NA		NA
6091010	6091011	CJD_0106	CJD_0107		fusA	FALSE	0.005	656.000	0.000	NA		NA
6091011	6091012	CJD_0107	CJD_0108	fusA		FALSE	0.070	410.000	0.021	NA		NA
6091012	6091013	CJD_0108	CJD_0109			FALSE	0.046	252.000	0.000	NA		NA
6091013	6091014	CJD_0109	CJD_0110			FALSE	0.003	542.000	0.000	1.000	N	NA
6091014	6091015	CJD_0110	CJD_0111			FALSE	0.007	333.000	0.000	1.000	N	NA
6091017	6091018	CJD_0113	CJD_0114			TRUE	0.976	7.000	0.375	1.000	N	NA
6091018	6091019	CJD_0114	CJD_0115			TRUE	0.995	14.000	0.250	1.000	Y	NA
6091019	6091020	CJD_0115	CJD_0116			TRUE	0.995	14.000	0.241	1.000	Y	NA
6091020	6091021	CJD_0116	CJD_0117		iolD	TRUE	0.953	17.000	0.128	1.000	N	NA
6091021	6091022	CJD_0117	CJD_0118	iolD		TRUE	0.852	76.000	0.140	1.000		NA
6091022	6091023	CJD_0118	CJD_0119		iolE	TRUE	0.814	119.000	0.125	1.000		NA
6091023	6091024	CJD_0119	CJD_0120	iolE		TRUE	0.769	82.000	0.059	1.000		NA
6091024	6091025	CJD_0120	CJD_0121			TRUE	0.828	88.000	0.118	1.000		NA
6091025	6091026	CJD_0121	CJD_0122			FALSE	0.009	372.000	0.000	1.000		NA
6091026	6091027	CJD_0122	CJD_0123			FALSE	0.025	231.000	0.000	1.000	N	NA
6091027	6091028	CJD_0123	CJD_0124			TRUE	0.976	103.000	0.667	0.039	Y	NA
6091028	6091029	CJD_0124	CJD_0125			TRUE	0.821	104.000	0.000	1.000	Y	NA
6091031	6091032	CJD_0127	CJD_0128	gldA		TRUE	0.870	26.000	0.053	1.000	N	NA
6091032	6091033	CJD_0128	CJD_0129			FALSE	0.180	361.000	0.000	1.000	Y	NA
6091033	6091034	CJD_0129	CJD_0130			FALSE	0.035	277.000	0.000	NA		NA
6091036	6091037	CJD_0132	CJD_0133			FALSE	0.178	143.000	0.000	NA		NA
6091037	6091038	CJD_0133	CJD_0134			FALSE	0.089	208.000	0.000	NA		NA
6091038	6091039	CJD_0134	CJD_0135			TRUE	0.833	112.000	0.118	NA		NA
6091040	6091041	CJD_0136	CJD_0137			FALSE	0.004	770.000	0.000	NA		NA
6091043	6091044	CJD_0139	CJD_0140			TRUE	0.861	106.000	0.165	NA		NA
6091045	6091046	CJD_0141	CJD_0142			FALSE	0.170	148.000	0.000	NA		NA
6091046	6091047	CJD_0142	CJD_0143			FALSE	0.032	284.000	0.000	NA		NA
6091048	6091049	CJD_0144	CJD_0145			TRUE	0.623	13.000	0.000	NA		NA
6091049	6091050	CJD_0145	CJD_0146			TRUE	0.972	12.000	0.167	NA		NA
6091051	6091052	CJD_0147	CJD_0148			FALSE	0.183	140.000	0.000	NA		NA
6091052	6091053	CJD_0148	CJD_0149			TRUE	0.962	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
6091053	6091054	CJD_0149	CJD_0150			FALSE	0.000	797.000	0.000	0.084	N	NA
6091054	6091055	CJD_0150	CJD_0151			TRUE	0.527	-10.000	0.000	1.000		NA
6091058	6091059	CJD_3053	CJD_3054			FALSE	0.248	83.000	0.000	NA		NA
6091059	6091060	CJD_3054	CJD_3055			FALSE	0.241	94.000	0.000	NA		NA
6091060	6091061	CJD_3055	CJD_3056			FALSE	0.011	404.000	0.000	NA		NA
6091061	6091062	CJD_3056	CJD_3057			TRUE	0.603	-28.000	0.000	NA		NA
6091062	6091063	CJD_3057	CJD_3058			FALSE	0.163	152.000	0.000	NA		NA
6091063	6091064	CJD_3058	CJD_3059			TRUE	0.609	15.000	0.000	NA		NA
6091064	6091065	CJD_3059	CJD_3060			FALSE	0.348	36.000	0.000	NA		NA
6091065	6091066	CJD_3060	CJD_3061			TRUE	0.564	18.000	0.000	NA		NA
6091066	6091067	CJD_3061	CJD_3062		nagB	FALSE	0.080	214.000	0.000	NA		NA
6091067	6091068	CJD_3062	CJD_3063	nagB		FALSE	0.391	-3.000	0.000	1.000	N	NA
6091069	6091070	CJD_3064	CJD_3065			FALSE	0.241	94.000	0.000	NA		NA
6091071	6091072	CJD_3066	CJD_3067	gapN		FALSE	0.345	17.000	0.000	1.000	N	NA
6091072	6091073	CJD_3067	CJD_3068		trxB	TRUE	0.963	3.000	0.000	1.000	Y	NA
6091073	6091074	CJD_3068	CJD_3069	trxB	clpC	FALSE	0.343	277.000	0.000	1.000	Y	NA
6091074	6091075	CJD_3069	CJD_3070	clpC		TRUE	0.925	25.000	0.129	1.000	N	NA
6091075	6091076	CJD_3070	CJD_3071			TRUE	0.982	-16.000	0.848	NA		NA
6091076	6091077	CJD_3071	CJD_3072			TRUE	0.974	20.000	0.681	NA		NA
6091079	6091080	CJD_3074	CJD_3075			FALSE	0.162	118.000	0.000	1.000		NA
6091080	6091081	CJD_3075	CJD_3076			FALSE	0.442	169.000	0.007	NA		NA
6091081	6091082	CJD_3076	CJD_3077			TRUE	0.980	3.000	0.372	NA		NA
6091082	6091083	CJD_3077	CJD_3078			TRUE	0.862	22.000	0.018	NA		NA
6091083	6091084	CJD_3078	CJD_3079			FALSE	0.158	157.000	0.000	NA		NA
6091084	6091085	CJD_3079	CJD_3080			TRUE	0.584	17.000	0.000	NA		NA
6091085	6091086	CJD_3080	CJD_3081			FALSE	0.034	246.000	0.000	NA	N	NA
6091086	6091087	CJD_3081	CJD_3082			TRUE	0.956	18.000	0.120	NA		NA
6091090	6091091	CJD_3085	CJD_3086			TRUE	0.713	92.000	0.039	NA	N	NA
6091092	6091093	CJD_3087	CJD_3088			TRUE	0.641	5.000	0.000	NA		NA
6091093	6091094	CJD_3088	CJD_3089			FALSE	0.015	360.000	0.000	NA		NA
6091094	6091095	CJD_3089	CJD_3090		rrf	FALSE	0.006	580.000	0.000	NA		NA
6091095	6091096	CJD_3090	CJD_3091	rrf		TRUE	0.642	2.000	0.000	NA		NA
6091096	6091097	CJD_3091	CJD_3092		rrf	TRUE	0.639	6.000	0.000	NA		NA
6091097	6091098	CJD_3092	CJD_3093	rrf	rrl	FALSE	0.288	51.000	0.000	NA		NA
6091098	6091099	CJD_3093	CJD_3096	rrl		FALSE	0.240	100.000	0.000	NA		NA
6091099	6091100	CJD_3096	CJD_3097			TRUE	0.643	4.000	0.000	NA		NA
6091100	6091101	CJD_3097	CJD_3098		rrs	FALSE	0.153	160.000	0.000	NA		NA
6091101	6091102	CJD_3098	CJD_3099	rrs	murD	FALSE	0.008	502.000	0.000	NA		NA
6091104	6091105	CJD_3101	CJD_3102			FALSE	0.173	92.000	0.000	NA	N	NA
6091105	6091106	CJD_3102	CJD_3103			FALSE	0.092	174.000	0.000	NA	N	NA
6091106	6091107	CJD_3103	CJD_3104		glyS	FALSE	0.045	188.000	0.000	1.000	N	NA
6091107	6091108	CJD_3104	CJD_3105	glyS		FALSE	0.009	458.000	0.000	NA		NA
6091108	6091109	CJD_3105	CJD_3106		lysS	FALSE	0.089	208.000	0.000	NA		NA
6091109	6091110	CJD_3106	CJD_3107	lysS	greA	TRUE	0.909	26.000	0.098	1.000	N	NA
6091110	6091111	CJD_3107	CJD_3108	greA		FALSE	0.157	279.000	0.022	1.000	N	NA
6091111	6091112	CJD_3108	CJD_3109			TRUE	0.937	7.000	0.054	1.000	N	NA
6091112	6091113	CJD_3109	CJD_3110		fhs	FALSE	0.293	203.000	0.011	1.000	N	NA
6091113	6091114	CJD_3110	CJD_3111	fhs	ftsH	FALSE	0.006	202.000	0.000	0.083	N	NA
6091114	6091115	CJD_3111	CJD_3112	ftsH	hpt	TRUE	0.853	75.000	0.180	1.000	N	NA
6091115	6091116	CJD_3112	CJD_3113	hpt	tilS	TRUE	0.956	3.000	0.137	0.028	N	NA
6091116	6091117	CJD_3113	CJD_3114	tilS	spoIIE	FALSE	0.372	217.000	0.041	1.000	N	NA
6091117	6091118	CJD_3114	CJD_3115	spoIIE		FALSE	0.020	323.000	0.000	NA		NA
6091118	6091119	CJD_3115	CJD_3116			TRUE	0.609	15.000	0.000	NA		NA
6091119	6091120	CJD_3116	CJD_3117			TRUE	0.642	2.000	0.000	NA		NA
6091120	6091121	CJD_3117	CJD_3118			TRUE	0.639	6.000	0.000	NA		NA
6091122	6091123	CJD_2133	CJD_2134			FALSE	0.129	177.000	0.000	NA		NA
6091123	6091124	CJD_2134	CJD_2135			FALSE	0.221	117.000	0.000	NA		NA
6091124	6091125	CJD_2135	CJD_2136		pspA	FALSE	0.027	296.000	0.000	NA		NA
6091125	6091126	CJD_2136	CJD_2137	pspA		FALSE	0.244	86.000	0.000	NA		NA
6091126	6091127	CJD_2137	CJD_2138			FALSE	0.088	209.000	0.000	NA		NA
6091128	6091129	CJD_2139	CJD_2140			FALSE	0.207	126.000	0.000	NA		NA
6091130	6091131	CJD_2142	CJD_2143			FALSE	0.008	397.000	0.000	1.000		NA
6091131	6091132	CJD_2143	CJD_2144			FALSE	0.125	147.000	0.000	1.000		NA
6091132	6091133	CJD_2144	CJD_2145			FALSE	0.000	821.000	0.000	0.019		NA
6091133	6091134	CJD_2145	CJD_2146			TRUE	0.978	0.000	0.720	0.019		NA
6091134	6091135	CJD_2146	CJD_2147			TRUE	0.978	-10.000	0.438	1.000		NA
6091135	6091136	CJD_2147	CJD_2148			TRUE	0.608	141.000	0.030	1.000		NA
6091136	6091137	CJD_2148	CJD_2149			FALSE	0.004	556.000	0.000	1.000		NA
6091137	6091138	CJD_2149	CJD_2150			FALSE	0.016	258.000	0.000	1.000	N	NA
6091138	6091139	CJD_2150	CJD_2151			TRUE	0.980	0.000	0.530	1.000		NA
6091139	6091140	CJD_2151	CJD_2152			TRUE	0.851	146.000	0.435	1.000		NA
6091142	6091143	CJD_2154	CJD_2155			FALSE	0.250	82.000	0.000	NA		NA
6091143	6091144	CJD_2155	CJD_2156			FALSE	0.180	142.000	0.000	NA		NA
6091144	6091145	CJD_2156	CJD_2157		glgB	TRUE	0.977	100.000	1.000	0.009	Y	NA
6091145	6091146	CJD_2157	CJD_2158	glgB		FALSE	0.251	80.000	0.000	NA		NA
6091147	6091148	CJD_2159	CJD_2160			TRUE	0.631	-3.000	0.000	NA		NA
6091149	6091150	CJD_2161	CJD_2162			FALSE	0.017	348.000	0.000	NA		NA
6091150	6091151	CJD_2162	CJD_2163			FALSE	0.009	456.000	0.000	NA		NA
6091151	6091152	CJD_2163	CJD_2164		axe1	FALSE	0.240	96.000	0.000	NA		NA
6091153	6091154	CJD_2165	CJD_2166			FALSE	0.148	164.000	0.000	NA		NA
6091155	6091156	CJD_2167	CJD_2168			TRUE	0.640	1.000	0.000	NA		NA
6091156	6091157	CJD_2168	CJD_2169			FALSE	0.136	172.000	0.000	NA		NA
6091157	6091158	CJD_2169	CJD_2170			FALSE	0.232	112.000	0.000	NA		NA
6091158	6091159	CJD_2170	CJD_2171		thiH	TRUE	0.954	30.000	0.023	0.004	Y	NA
6091159	6091160	CJD_2171	CJD_2172	thiH	thiG	TRUE	0.993	13.000	0.277	0.004	Y	NA
6091160	6091161	CJD_2172	CJD_2173	thiG	thiF	TRUE	0.920	129.000	0.054	0.021	Y	NA
6091161	6091162	CJD_2173	CJD_2174	thiF	thiS	TRUE	0.965	76.000	0.115	1.000	Y	NA
6091162	6091163	CJD_2174	CJD_2175	thiS		FALSE	0.013	277.000	0.000	1.000	N	NA
6091163	6091164	CJD_2175	CJD_2176			FALSE	0.013	334.000	0.000	1.000		NA
6091164	6091165	CJD_2176	CJD_2177			FALSE	0.321	43.000	0.000	NA		NA
6091165	6091166	CJD_2177	CJD_2178		msrB	FALSE	0.272	58.000	0.000	NA		NA
6091166	6091167	CJD_2178	CJD_2179	msrB		FALSE	0.253	76.000	0.000	NA		NA
6091170	6091171	CJD_2182	CJD_2183			FALSE	0.053	241.000	0.000	NA		NA
6091173	6091174	CJD_2185	CJD_2186			FALSE	0.201	129.000	0.000	NA		NA
6091174	6091175	CJD_2186	CJD_2187			FALSE	0.090	207.000	0.000	NA		NA
6091177	6091178	CJD_2189	CJD_2190			TRUE	0.954	16.000	0.083	NA		NA
6091178	6091179	CJD_2190	CJD_2191			TRUE	0.927	17.000	0.042	NA		NA
6091179	6091180	CJD_2191	CJD_2192			FALSE	0.006	564.000	0.000	NA		NA
6091182	6091183	CJD_2194	CJD_2195			FALSE	0.037	269.000	0.000	NA		NA
6091184	6091185	CJD_2196	CJD_2197			FALSE	0.012	390.000	0.000	NA		NA
6091186	6091187	CJD_2198	CJD_2199			FALSE	0.164	375.000	0.000	1.000	Y	NA
6091187	6091188	CJD_2199	CJD_2200			TRUE	0.573	139.000	0.021	NA	N	NA
6091188	6091189	CJD_2200	CJD_2201		rbsC	TRUE	0.994	22.000	0.847	NA	Y	NA
6091189	6091190	CJD_2201	CJD_2202	rbsC	rbsA	TRUE	0.996	14.000	0.504	1.000	Y	NA
6091190	6091191	CJD_2202	CJD_2203	rbsA	rbsD	TRUE	0.976	87.000	0.337	1.000	Y	NA
6091191	6091192	CJD_2203	CJD_2204	rbsD	rbsK	TRUE	0.986	3.000	0.020	1.000	Y	NA
6091192	6091193	CJD_2204	CJD_2205	rbsK	def	FALSE	0.078	140.000	0.000	1.000	N	NA
6091193	6091194	CJD_2205	CJD_2206	def		FALSE	0.159	156.000	0.000	NA		NA
6091194	6091195	CJD_2206	CJD_2207			FALSE	0.048	248.000	0.000	NA		NA
6091195	6091196	CJD_2207	CJD_2208			FALSE	0.175	146.000	0.000	NA		NA
6091196	6091197	CJD_2208	CJD_2209			FALSE	0.056	215.000	0.000	1.000		NA
6091197	6091198	CJD_2209	CJD_2210			TRUE	0.994	3.000	0.238	0.005	Y	NA
6091198	6091199	CJD_2210	CJD_2211			TRUE	0.995	-7.000	0.776	0.005	Y	NA
6091199	6091200	CJD_2211	CJD_2212			TRUE	0.993	17.000	0.462	0.005	Y	NA
6091200	6091201	CJD_2212	CJD_2213			TRUE	0.994	-13.000	0.487	0.005	Y	NA
6091201	6091202	CJD_2213	CJD_2214			TRUE	0.993	13.000	0.258	0.005	Y	NA
6091202	6091203	CJD_2214	CJD_2215			TRUE	0.930	31.000	0.489	0.005		NA
6091203	6091204	CJD_2215	CJD_2216			TRUE	0.906	55.000	0.848	0.005		NA
6091204	6091205	CJD_2216	CJD_2217			TRUE	0.951	-13.000	0.132	0.005		NA
6091205	6091206	CJD_2217	CJD_2218			FALSE	0.024	277.000	0.000	1.000		NA
6091206	6091207	CJD_2218	CJD_2219			TRUE	0.945	-100.000	0.063	NA		NA
6091207	6091208	CJD_2219	CJD_2220			TRUE	0.842	147.000	0.300	NA		NA
6091210	6091211	CJD_2223	CJD_2224			FALSE	0.235	110.000	0.000	NA		NA
6091211	6091212	CJD_2224	CJD_2225			TRUE	0.883	12.000	0.009	1.000		NA
6091215	6091216	CJD_2228	CJD_2229			TRUE	0.741	107.000	0.043	NA		NA
6091220	6091221	CJD_2233	CJD_2234		feoB	FALSE	0.339	38.000	0.000	NA		NA
6091222	6091223	CJD_2431	CJD_2432			TRUE	0.543	19.000	0.000	NA		NA
6091223	6091224	CJD_2432	CJD_2433			TRUE	0.663	100.000	0.017	NA		NA
6091224	6091225	CJD_2433	CJD_2434		sbp	TRUE	0.953	13.000	0.070	NA		NA
6091225	6091226	CJD_2434	CJD_2435	sbp		TRUE	0.953	13.000	0.070	NA		NA
6091226	6091227	CJD_2435	CJD_2436			TRUE	0.901	14.000	0.014	NA		NA
6091227	6091228	CJD_2436	CJD_2437		spoVE	FALSE	0.487	158.000	0.015	NA	N	NA
6091228	6091229	CJD_2437	CJD_2438	spoVE	mraY	TRUE	0.650	28.000	0.014	0.003	N	NA
6091229	6091230	CJD_2438	CJD_2439	mraY	murF	TRUE	0.928	50.000	0.024	0.003	Y	NA
6091230	6091231	CJD_2439	CJD_2440	murF	murE	TRUE	0.994	13.000	0.328	0.002	Y	NA
6091231	6091232	CJD_2440	CJD_2441	murE	spoVD	TRUE	0.974	95.000	0.265	1.000	Y	NA
6091232	6091233	CJD_2441	CJD_2442	spoVD		TRUE	0.632	188.000	0.096	1.000		NA
6091233	6091234	CJD_2442	CJD_2443		mraW	TRUE	0.597	72.000	0.008	1.000		NA
6091238	6091239	CJD_2447	CJD_2448			FALSE	0.315	29.000	0.000	NA	N	NA
6091239	6091240	CJD_2448	CJD_2449			TRUE	0.966	0.000	0.000	NA	Y	NA
6091240	6091241	CJD_2449	CJD_2450			TRUE	0.883	16.000	0.015	1.000		NA
6091241	6091242	CJD_2450	CJD_2451			FALSE	0.021	321.000	0.000	NA		NA
6091242	6091243	CJD_2451	CJD_2452			FALSE	0.159	156.000	0.000	NA		NA
6091243	6091244	CJD_2452	CJD_2453			FALSE	0.008	403.000	0.000	1.000		NA
6091244	6091245	CJD_2453	CJD_2454			FALSE	0.156	158.000	0.000	NA		NA
6091245	6091246	CJD_2454	CJD_2455			FALSE	0.363	34.000	0.000	NA		NA
6091246	6091247	CJD_2455	CJD_2456			FALSE	0.060	236.000	0.000	NA		NA
6091247	6091248	CJD_2456	CJD_2457			TRUE	0.963	4.000	0.000	1.000	Y	NA
6091248	6091249	CJD_2457	CJD_2458			TRUE	0.617	14.000	0.000	NA		NA
6091249	6091250	CJD_2458	CJD_2459		spoVD	FALSE	0.055	239.000	0.000	NA		NA
6091250	6091251	CJD_2459	CJD_2460	spoVD		FALSE	0.015	263.000	0.000	1.000	N	NA
6091251	6091252	CJD_2460	CJD_2461			TRUE	0.945	14.000	0.078	1.000	N	NA
6091252	6091253	CJD_2461	CJD_2462			FALSE	0.242	89.000	0.000	NA		NA
6091255	6091256	CJD_2464	CJD_2465		pheT	FALSE	0.251	81.000	0.000	NA		NA
6091256	6091257	CJD_2465	CJD_2466	pheT	pheS	TRUE	0.990	24.000	0.574	0.001	Y	NA
6091257	6091258	CJD_2466	CJD_2467	pheS		FALSE	0.140	614.000	0.006	1.000	Y	NA
6091258	6091259	CJD_2467	CJD_2468			TRUE	0.813	26.000	0.022	1.000	N	NA
6091259	6091260	CJD_2468	CJD_2469			FALSE	0.483	23.000	0.000	NA		NA
6091260	6091261	CJD_2469	CJD_2471		rplT	FALSE	0.065	229.000	0.000	NA		NA
6091261	6091262	CJD_2471	CJD_2472	rplT	rpmI	TRUE	0.989	30.000	0.928	0.011	Y	NA
6091262	6091263	CJD_2472	CJD_2473	rpmI		FALSE	0.497	22.000	0.000	NA		NA
6091264	6091265	CJD_1593	CJD_1594			TRUE	0.641	5.000	0.000	NA		NA
6091265	6091266	CJD_1594	CJD_1595			TRUE	0.599	16.000	0.000	NA		NA
6091266	6091267	CJD_1595	CJD_1596			FALSE	0.330	40.000	0.000	NA		NA
6091267	6091268	CJD_1596	CJD_1597			TRUE	0.643	3.000	0.000	NA		NA
6091268	6091269	CJD_1597	CJD_1598			FALSE	0.024	307.000	0.000	NA		NA
6091269	6091270	CJD_1598	CJD_1599			FALSE	0.288	51.000	0.000	NA		NA
6091270	6091271	CJD_1599	CJD_1600			TRUE	0.543	19.000	0.000	NA		NA
6091271	6091272	CJD_1600	CJD_1601			FALSE	0.199	130.000	0.000	NA		NA
6091272	6091273	CJD_1601	CJD_1602			FALSE	0.088	209.000	0.000	NA		NA
6091275	6091276	CJD_1604	CJD_1605			TRUE	0.643	3.000	0.000	NA		NA
6091276	6091277	CJD_1605	CJD_1606			FALSE	0.026	40.000	0.000	0.019		NA
6091277	6091278	CJD_1606	CJD_1607			FALSE	0.241	44.000	0.000	1.000		NA
6091278	6091279	CJD_1607	CJD_1608			TRUE	0.624	-7.000	0.000	NA		NA
6091281	6091282	CJD_1609	CJD_1611			TRUE	0.636	9.000	0.000	NA		NA
6091282	6091283	CJD_1611	CJD_1612			FALSE	0.018	337.000	0.000	NA		NA
6091283	6091284	CJD_1612	CJD_1613			FALSE	0.079	215.000	0.000	NA		NA
6091284	6091285	CJD_1613	CJD_1614			FALSE	0.251	80.000	0.000	NA		NA
6091285	6091286	CJD_1614	CJD_1615			FALSE	0.240	101.000	0.000	NA		NA
6091286	6091287	CJD_1615	CJD_1616			FALSE	0.281	54.000	0.000	NA		NA
6091287	6091288	CJD_1616	CJD_1617			FALSE	0.238	105.000	0.000	NA		NA
6091288	6091289	CJD_1617	CJD_1618			FALSE	0.330	40.000	0.000	NA		NA
6091289	6091290	CJD_1618	CJD_1619			FALSE	0.348	36.000	0.000	NA		NA
6091290	6091291	CJD_1619	CJD_1620			FALSE	0.354	35.000	0.000	NA		NA
6091291	6091292	CJD_1620	CJD_1621			TRUE	0.564	18.000	0.000	NA		NA
6091292	6091293	CJD_1621	CJD_1622			FALSE	0.030	287.000	0.000	NA		NA
6091295	6091296	CJD_1625	CJD_1626			FALSE	0.311	45.000	0.000	NA		NA
6091296	6091297	CJD_1626	CJD_1627			TRUE	0.608	-19.000	0.000	NA		NA
6091297	6091298	CJD_1627	CJD_1628			FALSE	0.233	111.000	0.000	NA		NA
6091298	6091299	CJD_1628	CJD_1629			TRUE	0.636	9.000	0.000	NA		NA
6091299	6091300	CJD_1629	CJD_1630			FALSE	0.029	292.000	0.000	NA		NA
6091300	6091301	CJD_1630	CJD_1631			FALSE	0.100	199.000	0.000	NA		NA
6091301	6091302	CJD_1631	CJD_1633			FALSE	0.224	116.000	0.000	NA		NA
6091302	6091303	CJD_1633	CJD_1634			FALSE	0.151	162.000	0.000	NA		NA
6091303	6091304	CJD_1634	CJD_1635			TRUE	0.642	2.000	0.000	NA		NA
6091304	6091305	CJD_1635	CJD_1636			FALSE	0.240	98.000	0.000	NA		NA
6091305	6091306	CJD_1636	CJD_1637			TRUE	0.978	-3.000	0.667	0.055		NA
6091306	6091307	CJD_1637	CJD_1638		spoVB	FALSE	0.182	85.000	0.000	1.000		NA
6091307	6091308	CJD_1638	CJD_1639	spoVB		TRUE	0.943	22.000	0.137	1.000		NA
6091308	6091309	CJD_1639	CJD_1640			TRUE	0.813	62.000	0.078	1.000		NA
6091309	6091310	CJD_1640	CJD_1641			FALSE	0.064	206.000	0.000	1.000		NA
6091312	6091313	CJD_1643	CJD_1644			FALSE	0.241	93.000	0.000	NA		NA
6091316	6091317	CJD_1461	CJD_1462	cobT		TRUE	0.975	38.000	0.104	1.000	Y	NA
6091317	6091318	CJD_1462	CJD_1463		cobS	TRUE	0.991	-16.000	0.092	1.000	Y	NA
6091318	6091319	CJD_1463	CJD_1464	cobS		TRUE	0.923	14.000	0.026	NA		NA
6091319	6091320	CJD_1464	CJD_1465			TRUE	0.981	5.000	0.434	NA		NA
6091320	6091321	CJD_1465	CJD_1466		cobB	TRUE	0.956	3.000	0.094	1.000	N	NA
6091321	6091322	CJD_1466	CJD_1467	cobB		TRUE	0.845	-3.000	0.017	0.010	N	NA
6091324	6091325	CJD_1469	CJD_1470			TRUE	0.989	-13.000	0.061	1.000	Y	NA
6091325	6091326	CJD_1470	CJD_1471			TRUE	0.993	5.000	0.119	1.000	Y	NA
6091326	6091327	CJD_1471	CJD_1472			TRUE	0.931	10.000	0.030	NA		NA
6091327	6091328	CJD_1472	CJD_1473		cobQ	TRUE	0.887	10.000	0.005	NA		NA
6091328	6091329	CJD_1473	CJD_1474	cobQ		FALSE	0.013	276.000	0.000	1.000	N	NA
6091329	6091330	CJD_1474	CJD_1475			FALSE	0.179	93.000	0.000	1.000		NA
6091330	6091331	CJD_1475	CJD_1476			FALSE	0.065	229.000	0.000	NA		NA
6091331	6091332	CJD_1476	CJD_1477			FALSE	0.072	222.000	0.000	NA		NA
6091332	6091333	CJD_1477	CJD_1478		mtnN	FALSE	0.028	294.000	0.000	NA		NA
6091334	6091335	CJD_1479	CJD_1480		cfa	FALSE	0.152	161.000	0.000	NA		NA
6091336	6091337	CJD_1481	CJD_1482			TRUE	0.643	4.000	0.000	NA		NA
6091337	6091338	CJD_1482	CJD_1483			FALSE	0.023	311.000	0.000	NA		NA
6091338	6091339	CJD_1483	CJD_1484			FALSE	0.109	191.000	0.000	NA		NA
6091339	6091340	CJD_1484	CJD_1485		hisK	FALSE	0.120	184.000	0.000	NA		NA
6091341	6091342	CJD_1486	CJD_1487		nadE	FALSE	0.010	360.000	0.000	1.000		NA
6091343	6091344	CJD_1488	CJD_1489			TRUE	0.993	20.000	0.313	NA	Y	NA
6091344	6091345	CJD_1489	CJD_1490			FALSE	0.051	180.000	0.000	1.000	N	NA
6091345	6091346	CJD_1490	CJD_1491		rnfG	FALSE	0.025	231.000	0.000	1.000	N	NA
6091346	6091347	CJD_1491	CJD_1492	rnfG	rnfE	TRUE	0.987	18.000	0.091	0.021	Y	NA
6091347	6091348	CJD_1492	CJD_1493	rnfE	rnfA	TRUE	0.983	31.000	0.237	0.021	Y	NA
6091348	6091349	CJD_1493	CJD_1494	rnfA	rnfB	TRUE	0.992	17.000	0.221	0.021	Y	NA
6091349	6091350	CJD_1494	CJD_1495	rnfB		FALSE	0.116	64.000	0.000	1.000	N	NA
6091350	6091351	CJD_1495	CJD_1496			FALSE	0.003	460.000	0.000	1.000	N	NA
6091351	6091352	CJD_1496	CJD_1497		fabH	TRUE	0.957	2.000	0.098	1.000	N	NA
6091352	6091353	CJD_1497	CJD_1498	fabH	fabD	TRUE	0.769	97.000	0.000	0.003	Y	NA
6091353	6091354	CJD_1498	CJD_1499	fabD	fabG	TRUE	0.992	4.000	0.149	0.003	Y	NA
6091354	6091355	CJD_1499	CJD_1500	fabG	fabF	TRUE	0.994	15.000	0.236	1.000	Y	NA
6091355	6091356	CJD_1500	CJD_1501	fabF	accB	TRUE	0.991	12.000	0.074	1.000	Y	NA
6091356	6091357	CJD_1501	CJD_1502	accB	fabZ	TRUE	0.986	3.000	0.047	0.003	Y	NA
6091357	6091358	CJD_1502	CJD_1503	fabZ	accC	TRUE	0.989	12.000	0.045	1.000	Y	NA
6091358	6091359	CJD_1503	CJD_1504	accC	accD	TRUE	0.989	-7.000	0.090	0.001	Y	NA
6091359	6091360	CJD_1504	CJD_1505	accD	accA	TRUE	0.624	-7.000	0.000	NA		NA
6091361	6091362	CJD_2845	CJD_2844			TRUE	0.643	4.000	0.000	NA		NA
6091362	6091363	CJD_2844	CJD_2842		rrl	FALSE	0.240	100.000	0.000	NA		NA
6091363	6091364	CJD_2842	CJD_2841	rrl		FALSE	0.281	54.000	0.000	NA		NA
6091364	6091365	CJD_2841	CJD_2840			FALSE	0.021	321.000	0.000	NA		NA
6091365	6091366	CJD_2840	CJD_2839			TRUE	0.952	181.000	0.472	1.000	Y	NA
6091366	6091367	CJD_2839	CJD_2838			TRUE	0.973	17.000	0.323	NA		NA
6091369	6091370	CJD_2836	CJD_2835			TRUE	0.961	32.000	0.023	1.000	Y	NA
6091371	6091372	CJD_2834	CJD_2833			TRUE	0.955	9.000	0.079	1.000		NA
6091373	6091374	CJD_2832	CJD_2831	gcp		TRUE	0.870	15.000	0.004	NA		NA
6091374	6091375	CJD_2831	CJD_2830			TRUE	0.861	117.000	0.200	NA		NA
6091375	6091376	CJD_2830	CJD_2829			FALSE	0.025	230.000	0.000	1.000	N	NA
6091376	6091377	CJD_2829	CJD_2828			FALSE	0.062	163.000	0.000	1.000	N	NA
6091378	6091379	CJD_2827	CJD_2826			FALSE	0.274	35.000	0.000	1.000		NA
6091380	6091381	CJD_2825	CJD_2824			TRUE	0.681	193.000	0.131	NA		NA
6091383	6091384	CJD_2822	CJD_2821			TRUE	0.979	8.000	0.357	NA		NA
6091384	6091385	CJD_2821	CJD_2820			TRUE	0.981	16.000	0.800	NA		NA
6091388	6091389	CJD_2817	CJD_2816			TRUE	0.541	-3.000	0.000	1.000		NA
6091390	6091391	CJD_2815	CJD_2814			FALSE	0.004	759.000	0.000	NA		NA
6091391	6091392	CJD_2814	CJD_2813		cphB	TRUE	0.820	100.000	0.109	1.000		NA
6091392	6091393	CJD_2813	CJD_2812	cphB	cphA	TRUE	0.977	-13.000	0.605	1.000	N	NA
6091393	6091394	CJD_2812	CJD_2811	cphA	ispE	FALSE	0.457	136.000	0.016	0.080	N	NA
6091394	6091395	CJD_2811	CJD_2810	ispE		TRUE	0.635	70.000	0.009	NA		NA
6091395	6091396	CJD_2810	CJD_2809			TRUE	0.660	46.000	0.005	NA		NA
6091396	6091397	CJD_2809	CJD_2808			TRUE	0.829	23.000	0.011	NA		NA
6091397	6091398	CJD_2808	CJD_2807		pyrG	FALSE	0.008	495.000	0.000	NA		NA
6091398	6091399	CJD_2807	CJD_2806	pyrG	rho	FALSE	0.039	265.000	0.000	NA		NA
6091400	6091401	CJD_2805	CJD_2804		rpmE	FALSE	0.235	109.000	0.000	NA		NA
6091402	6091403	CJD_1101	CJD_1102			FALSE	0.185	139.000	0.000	NA		NA
6091403	6091404	CJD_1102	CJD_1103			FALSE	0.274	57.000	0.000	NA		NA
6091406	6091407	CJD_1105	CJD_1106			FALSE	0.483	23.000	0.000	NA		NA
6091408	6091409	CJD_1107	CJD_1108	fmt		FALSE	0.082	213.000	0.000	NA		NA
6091409	6091410	CJD_1108	CJD_1109			FALSE	0.240	95.000	0.000	NA		NA
6091410	6091411	CJD_1109	CJD_1110			FALSE	0.011	404.000	0.000	NA		NA
6091411	6091412	CJD_1110	CJD_1111		feoB	FALSE	0.025	306.000	0.000	NA		NA
6091412	6091413	CJD_1111	CJD_1112	feoB	feoA	TRUE	0.986	18.000	0.050	1.000	Y	NA
6091414	6091415	CJD_1113	CJD_1114			TRUE	0.636	0.000	0.000	NA		NA
6091415	6091416	CJD_1114	CJD_1115			FALSE	0.433	20.000	0.000	1.000		NA
6091416	6091417	CJD_1115	CJD_1116			FALSE	0.110	160.000	0.000	1.000		NA
6091417	6091418	CJD_1116	CJD_1117			FALSE	0.044	255.000	0.000	NA		NA
6091418	6091419	CJD_1117	CJD_1118			FALSE	0.078	216.000	0.000	NA		NA
6091419	6091420	CJD_1118	CJD_1119			FALSE	0.019	327.000	0.000	NA		NA
6091420	6091421	CJD_1119	CJD_1120			FALSE	0.002	282.000	0.000	0.054	N	NA
6091421	6091422	CJD_1120	CJD_1121			TRUE	0.992	5.000	0.122	0.054	Y	NA
6091422	6091423	CJD_1121	CJD_1122			FALSE	0.483	23.000	0.000	NA		NA
6091423	6091424	CJD_1122	CJD_1123			FALSE	0.243	88.000	0.000	NA		NA
6091424	6091425	CJD_1123	CJD_1124			FALSE	0.073	221.000	0.000	NA		NA
6091425	6091426	CJD_1124	CJD_1125			FALSE	0.483	23.000	0.000	NA		NA
6091426	6091427	CJD_1125	CJD_1126			FALSE	0.105	195.000	0.000	NA		NA
6091427	6091428	CJD_1126	CJD_1127			FALSE	0.179	97.000	0.000	1.000		NA
6091429	6091430	CJD_1128	CJD_1129			FALSE	0.224	116.000	0.000	NA		NA
6091431	6091432	CJD_1130	CJD_1131			FALSE	0.018	338.000	0.000	NA		NA
6091432	6091433	CJD_1131	CJD_1132			FALSE	0.009	442.000	0.000	NA		NA
6091433	6091434	CJD_1132	CJD_1133			FALSE	0.021	320.000	0.000	NA		NA
6091434	6091435	CJD_1133	CJD_1134			FALSE	0.213	121.000	0.000	NA		NA
6091438	6091439	CJD_1137	CJD_1138			TRUE	0.524	257.000	0.462	1.000	N	NA
6091443	6091444	CJD_1141	CJD_1143			FALSE	0.022	317.000	0.000	NA		NA
6091445	6091446	CJD_1144	CJD_1145			TRUE	0.641	5.000	0.000	NA		NA
6091446	6091447	CJD_1145	CJD_1146			FALSE	0.009	456.000	0.000	NA		NA
6091447	6091448	CJD_1146	CJD_1147			FALSE	0.009	457.000	0.000	NA		NA
6091449	6091450	CJD_1545	CJD_1544			FALSE	0.041	259.000	0.000	NA		NA
6091450	6091451	CJD_1544	CJD_1543			TRUE	0.768	105.000	0.064	1.000		NA
6091451	6091452	CJD_1543	CJD_1542		miaA	TRUE	0.900	44.000	0.192	1.000		NA
6091452	6091453	CJD_1542	CJD_1541	miaA	mutL	TRUE	0.928	18.000	0.097	0.079	N	NA
6091453	6091454	CJD_1541	CJD_1540	mutL	mutS	TRUE	0.984	27.000	0.220	0.002	Y	NA
6091454	6091455	CJD_1540	CJD_1539	mutS	pflA	FALSE	0.015	262.000	0.000	1.000	N	NA
6091455	6091456	CJD_1539	CJD_1538	pflA	pflB	FALSE	0.030	287.000	0.000	NA		NA
6091456	6091457	CJD_1538	CJD_1536	pflB		FALSE	0.014	369.000	0.000	NA		NA
6091457	6091458	CJD_1536	CJD_1535			TRUE	0.950	18.000	0.000	1.000	Y	NA
6091458	6091459	CJD_1535	CJD_1534		citX	FALSE	0.153	41.000	0.000	1.000	N	NA
6091459	6091460	CJD_1534	CJD_1533	citX	citF	FALSE	0.309	19.000	0.000	1.000	N	NA
6091460	6091461	CJD_1533	CJD_1532	citF	citE	FALSE	0.087	4.000	0.000	0.001	N	NA
6091461	6091462	CJD_1532	CJD_1531	citE	citD	TRUE	0.968	-12.000	0.537	0.001	N	NA
6091462	6091463	CJD_1531	CJD_1530	citD	citC	TRUE	0.984	24.000	0.077	1.000	Y	NA
6091464	6091465	CJD_1529	CJD_1528	citG		FALSE	0.138	49.000	0.000	1.000	N	NA
6091466	6091467	CJD_1527	CJD_1526			FALSE	0.230	113.000	0.000	NA		NA
6091467	6091468	CJD_1526	CJD_1525			FALSE	0.009	449.000	0.000	NA		NA
6091468	6091469	CJD_1525	CJD_1524			FALSE	0.007	528.000	0.000	NA		NA
6091471	6091472	CJD_1522	CJD_1521	ppcA	miaB	FALSE	0.006	456.000	0.000	1.000		NA
6091473	6091474	CJD_1520	CJD_1519			FALSE	0.120	184.000	0.000	NA		NA
6091475	6091476	CJD_1518	CJD_1517			FALSE	0.016	351.000	0.000	NA		NA
6091478	6091479	CJD_1515	CJD_1514		ispH	FALSE	0.103	110.000	0.000	1.000	N	NA
6091479	6091480	CJD_1514	CJD_1513	ispH	cmk	TRUE	0.948	2.000	0.070	1.000	N	NA
6091480	6091481	CJD_1513	CJD_1512	cmk		TRUE	0.698	122.000	0.039	NA		NA
6091481	6091482	CJD_1512	CJD_1511			TRUE	0.588	217.000	0.124	NA		NA
6091482	6091483	CJD_1511	CJD_1510			FALSE	0.378	32.000	0.000	NA		NA
6091483	6091484	CJD_1510	CJD_1509		rluB	TRUE	0.897	6.000	0.008	NA		NA
6091487	6091488	CJD_2267	CJD_2266			FALSE	0.426	233.000	0.059	NA		NA
6091488	6091489	CJD_2266	CJD_2265		nusA	TRUE	0.975	20.000	0.759	NA		NA
6091489	6091490	CJD_2265	CJD_2264	nusA		TRUE	0.990	28.000	0.323	NA	Y	NA
6091490	6091491	CJD_2264	CJD_2263			TRUE	0.977	-7.000	0.408	NA	N	NA
6091491	6091492	CJD_2263	CJD_2262		infB	TRUE	0.987	31.000	0.223	NA	Y	NA
6091492	6091493	CJD_2262	CJD_2261	infB	rbfA	TRUE	0.993	22.000	0.530	1.000	Y	NA
6091493	6091494	CJD_2261	CJD_2260	rbfA		TRUE	0.971	4.000	0.173	1.000		NA
6091494	6091495	CJD_2260	CJD_2259		truB	TRUE	0.974	4.000	0.221	1.000		NA
6091495	6091496	CJD_2259	CJD_2258	truB	ribF	TRUE	0.975	4.000	0.308	1.000	N	NA
6091496	6091497	CJD_2258	CJD_2257	ribF	rpsO	TRUE	0.797	116.000	0.119	1.000	N	NA
6091497	6091498	CJD_2257	CJD_2256	rpsO	pnpA	TRUE	0.976	92.000	0.335	1.000	Y	NA
6091498	6091499	CJD_2256	CJD_2255	pnpA		FALSE	0.500	135.000	0.003	NA		NA
6091499	6091500	CJD_2255	CJD_2254			TRUE	0.968	14.000	0.148	NA		NA
6091500	6091501	CJD_2254	CJD_2253		clpP	TRUE	0.746	54.000	0.045	1.000	N	NA
6091501	6091502	CJD_2253	CJD_2252	clpP	ftsK	TRUE	0.653	132.000	0.047	1.000	N	NA
6091502	6091503	CJD_2252	CJD_2251	ftsK		TRUE	0.680	69.000	0.031	1.000	N	NA
6091503	6091504	CJD_2251	CJD_2250		pgsA	TRUE	0.959	-16.000	0.132	1.000	N	NA
6091504	6091505	CJD_2250	CJD_2249	pgsA	recA	FALSE	0.190	136.000	0.000	NA		NA
6091505	6091506	CJD_2249	CJD_2248	recA		FALSE	0.006	550.000	0.000	NA		NA
6091506	6091507	CJD_2248	CJD_2247		spoVS	FALSE	0.334	218.000	0.016	NA		NA
6091507	6091508	CJD_2247	CJD_2246	spoVS	aspB	FALSE	0.161	153.000	0.000	NA		NA
6091508	6091509	CJD_2246	CJD_2245	aspB		TRUE	0.708	95.000	0.047	1.000	N	NA
6091509	6091510	CJD_2245	CJD_2244		purB	FALSE	0.137	243.000	0.002	1.000	N	NA
6091510	6091511	CJD_2244	CJD_2243	purB		FALSE	0.012	283.000	0.000	1.000	N	NA
6091513	6091514	CJD_2241	CJD_2240			FALSE	0.066	204.000	0.000	1.000		NA
6091514	6091515	CJD_2240	CJD_2239			FALSE	0.104	166.000	0.000	1.000		NA
6091518	6091519	CJD_2236	CJD_2235			TRUE	0.609	15.000	0.000	NA		NA
6091520	6091521	CJD_3318	CJD_3317	rpmH	rnpA	TRUE	0.921	61.000	0.787	1.000		NA
6091521	6091522	CJD_3317	CJD_3316	rnpA		TRUE	0.980	-28.000	0.540	NA		NA
6091522	6091523	CJD_3316	CJD_3315		oxaA	TRUE	0.944	34.000	0.461	NA		NA
6091523	6091524	CJD_3315	CJD_3314	oxaA		TRUE	0.913	42.000	0.254	1.000		NA
6091524	6091525	CJD_3314	CJD_3313		trmE	FALSE	0.208	342.000	0.116	1.000		NA
6091525	6091526	CJD_3313	CJD_3312	trmE	gidA	TRUE	0.972	15.000	0.266	1.000		NA
6091526	6091527	CJD_3312	CJD_3311	gidA	gidB	TRUE	0.786	177.000	0.466	1.000	N	NA
6091527	6091528	CJD_3311	CJD_3310	gidB	soj	TRUE	0.520	251.000	0.339	1.000	N	NA
6091528	6091529	CJD_3310	CJD_3309	soj		TRUE	0.981	1.000	0.827	1.000	N	NA
6091529	6091530	CJD_3309	CJD_3308			TRUE	0.806	49.000	0.047	NA		NA
6091531	6091532	CJD_3307	CJD_3306	yyaC		TRUE	0.820	50.000	0.058	NA		NA
6091534	6091535	CJD_3304	CJD_3303	ytvI		TRUE	0.629	12.000	0.000	NA		NA
6091535	6091536	CJD_3303	CJD_3302			TRUE	0.994	12.000	0.148	1.000	Y	NA
6091537	6091538	CJD_3301	CJD_3300			TRUE	0.903	33.000	0.105	NA		NA
6091538	6091539	CJD_3300	CJD_3299			TRUE	0.898	37.000	0.121	NA		NA
6091539	6091540	CJD_3299	CJD_3298		rpsF	TRUE	0.628	141.000	0.028	NA		NA
6091540	6091541	CJD_3298	CJD_3297	rpsF	ssb	FALSE	0.377	14.000	0.000	1.000	N	NA
6091541	6091542	CJD_3297	CJD_3296	ssb	rpsR	FALSE	0.194	31.000	0.000	1.000	N	NA
6091542	6091543	CJD_3296	CJD_3295	rpsR		FALSE	0.160	283.000	0.015	NA		NA
6091543	6091544	CJD_3295	CJD_3294			TRUE	0.955	18.000	0.116	NA		NA
6091544	6091545	CJD_3294	CJD_3293			TRUE	0.929	33.000	0.210	NA		NA
6091545	6091546	CJD_3293	CJD_3292		rplI	TRUE	0.961	2.000	0.119	1.000	N	NA
6091546	6091547	CJD_3292	CJD_3291	rplI		TRUE	0.893	16.000	0.024	1.000	N	NA
6091547	6091548	CJD_3291	CJD_3290		dnaB	FALSE	0.067	416.000	0.053	0.078	N	NA
6091548	6091549	CJD_3290	CJD_3289	dnaB	proC	FALSE	0.052	178.000	0.000	1.000	N	NA
6091549	6091550	CJD_3289	CJD_3288	proC		FALSE	0.011	288.000	0.000	1.000	N	NA
6091550	6091551	CJD_3288	CJD_3287			TRUE	0.827	47.000	0.000	0.009	Y	NA
6091551	6091552	CJD_3287	CJD_3286			TRUE	0.950	0.000	0.000	0.009	Y	NA
6091552	6091553	CJD_3286	CJD_3285			TRUE	0.629	173.000	0.000	0.009	Y	NA
6091553	6091554	CJD_3285	CJD_3284			FALSE	0.481	17.000	0.000	NA	N	NA
6091554	6091555	CJD_3284	CJD_3283			FALSE	0.133	137.000	0.000	NA	N	NA
6091556	6091557	CJD_3282	CJD_3281			FALSE	0.294	20.000	0.000	1.000	N	NA
6091557	6091558	CJD_3281	CJD_3280		sdhA	FALSE	0.023	236.000	0.000	1.000	N	NA
6091558	6091559	CJD_3280	CJD_3279	sdhA	sdhB	TRUE	0.948	1.000	0.000	0.001	Y	NA
6091560	6091561	CJD_3278	CJD_3277	purA		FALSE	0.087	128.000	0.000	1.000	N	NA
6091561	6091562	CJD_3277	CJD_3276			FALSE	0.235	110.000	0.000	NA		NA
6091566	6091567	CJD_0019	CJD_0020			TRUE	0.633	11.000	0.000	NA		NA
6091567	6091568	CJD_0020	CJD_0021		serS	FALSE	0.120	184.000	0.000	NA		NA
6091568	6091569	CJD_0021	CJD_0022	serS		FALSE	0.034	247.000	0.000	1.000		NA
6091569	6091570	CJD_0022	CJD_0025			FALSE	0.013	377.000	0.000	NA		NA
6091575	6091576	CJD_0032	CJD_0033		yhaM	TRUE	0.995	14.000	0.431	0.021	Y	NA
6091577	6091578	CJD_0034	CJD_0035		pepT	FALSE	0.203	128.000	0.000	NA		NA
6091578	6091579	CJD_0035	CJD_0036	pepT		TRUE	0.975	-3.000	0.349	1.000	N	NA
6091579	6091580	CJD_0036	CJD_0038			FALSE	0.096	174.000	0.000	1.000		NA
6091580	6091581	CJD_0038	CJD_0039		psd	FALSE	0.009	380.000	0.000	1.000		NA
6091581	6091582	CJD_0039	CJD_0040	psd		FALSE	0.023	237.000	0.000	1.000	N	NA
6091584	6091585	CJD_1979	CJD_1980			FALSE	0.017	307.000	0.000	1.000		NA
6091586	6091587	CJD_1981	CJD_1982			FALSE	0.486	205.000	0.044	NA		NA
6091587	6091588	CJD_1982	CJD_1983			FALSE	0.053	241.000	0.000	NA		NA
6091589	6091590	CJD_1984	CJD_1985		pcp	TRUE	0.931	0.000	0.029	NA		NA
6091590	6091591	CJD_1985	CJD_1986	pcp		TRUE	0.931	36.000	0.300	NA		NA
6091591	6091592	CJD_1986	CJD_1987			TRUE	0.984	13.000	0.939	NA		NA
6091592	6091593	CJD_1987	CJD_1988		clpB	FALSE	0.056	238.000	0.000	NA		NA
6091594	6091595	CJD_1816	CJD_1815			FALSE	0.058	237.000	0.000	NA		NA
6091595	6091596	CJD_1815	CJD_1814			TRUE	0.894	81.000	0.286	NA		NA
6091596	6091597	CJD_1814	CJD_1813			FALSE	0.241	92.000	0.000	NA		NA
6091599	6091600	CJD_1811	CJD_1810		rnz	FALSE	0.170	113.000	0.000	1.000		NA
6091600	6091601	CJD_1810	CJD_1809	rnz		FALSE	0.184	84.000	0.000	1.000		NA
6091601	6091602	CJD_1809	CJD_1808			FALSE	0.004	1012.000	0.000	NA		NA
6091602	6091603	CJD_1808	CJD_1807			FALSE	0.011	402.000	0.000	NA		NA
6091605	6091606	CJD_1805	CJD_1804			FALSE	0.144	166.000	0.000	NA		NA
6091606	6091607	CJD_1804	CJD_1803			FALSE	0.187	138.000	0.000	NA		NA
6091610	6091611	CJD_1800	CJD_1799	fba		FALSE	0.240	95.000	0.000	NA		NA
6091611	6091612	CJD_1799	CJD_1798			TRUE	0.969	-3.000	0.137	NA		NA
6091614	6091615	CJD_1796	CJD_1795	galT	galK	TRUE	0.767	87.000	0.000	0.001	Y	NA
6091617	6091618	CJD_1793	CJD_1792	mglC	mglA	TRUE	0.996	-28.000	0.905	1.000	Y	NA
6091618	6091619	CJD_1792	CJD_1791	mglA		FALSE	0.253	75.000	0.000	NA		NA
6091620	6091621	CJD_3235	CJD_3236			FALSE	0.201	129.000	0.000	NA		NA
6091621	6091622	CJD_3236	CJD_3237			TRUE	0.971	23.000	0.833	NA		NA
6091622	6091623	CJD_3237	CJD_3238			FALSE	0.016	353.000	0.000	NA		NA
6091623	6091624	CJD_3238	CJD_3239			FALSE	0.080	214.000	0.000	NA		NA
6091624	6091625	CJD_3239	CJD_3240			FALSE	0.189	137.000	0.000	NA		NA
6091625	6091626	CJD_3240	CJD_3241			FALSE	0.210	124.000	0.000	NA		NA
6091626	6091627	CJD_3241	CJD_3242			FALSE	0.045	253.000	0.000	NA		NA
6091629	6091630	CJD_3244	CJD_3245			FALSE	0.051	244.000	0.000	NA		NA
6091632	6091633	CJD_3247	CJD_3248			FALSE	0.133	174.000	0.000	NA		NA
6091633	6091634	CJD_3248	CJD_3249			FALSE	0.014	365.000	0.000	NA		NA
6091634	6091635	CJD_3249	CJD_3250			FALSE	0.051	245.000	0.000	NA		NA
6091635	6091636	CJD_3250	CJD_3251			FALSE	0.063	231.000	0.000	NA		NA
6091636	6091637	CJD_3251	CJD_3252			FALSE	0.237	106.000	0.000	NA		NA
6091637	6091638	CJD_3252	CJD_3253			TRUE	0.854	144.000	0.357	NA		NA
6091638	6091639	CJD_3253	CJD_3254			TRUE	0.902	16.000	0.016	NA		NA
6091639	6091640	CJD_3254	CJD_3255		murA	TRUE	0.902	23.000	0.058	1.000		NA
6091641	6091642	CJD_3256	CJD_3257			TRUE	0.541	195.000	0.049	NA		NA
6091642	6091643	CJD_3257	CJD_3258			TRUE	0.897	56.000	0.220	NA		NA
6091643	6091644	CJD_3258	CJD_3259			TRUE	0.749	166.000	0.129	NA		NA
6091646	6091647	CJD_3261	CJD_3262			TRUE	0.988	-3.000	0.033	NA	Y	NA
6091648	6091649	CJD_3263	CJD_3264			TRUE	0.643	3.000	0.000	NA		NA
6091649	6091650	CJD_3264	CJD_3265			TRUE	0.633	11.000	0.000	NA		NA
6091650	6091651	CJD_3265	CJD_3266			TRUE	0.639	6.000	0.000	NA		NA
6091651	6091652	CJD_3266	CJD_3267			TRUE	0.643	4.000	0.000	NA		NA
6091652	6091653	CJD_3267	CJD_3268			TRUE	0.617	14.000	0.000	NA		NA
6091653	6091654	CJD_3268	CJD_3269			TRUE	0.639	6.000	0.000	NA		NA
6091654	6091655	CJD_3269	CJD_3270			TRUE	0.639	6.000	0.000	NA		NA
6091655	6091656	CJD_3270	CJD_3271			TRUE	0.629	12.000	0.000	NA		NA
6091656	6091657	CJD_3271	CJD_3272			TRUE	0.643	3.000	0.000	NA		NA
6091657	6091658	CJD_3272	CJD_3273			FALSE	0.101	198.000	0.000	NA		NA
6091661	6091662	CJD_A0549	CJD_A0550			FALSE	0.082	213.000	0.000	NA		NA
6091662	6091663	CJD_A0550	CJD_A0551			FALSE	0.254	71.000	0.000	NA		NA
6091664	6091665	CJD_A0552	CJD_A0553			TRUE	0.985	0.000	1.000	NA		NA
6091665	6091666	CJD_A0553	CJD_A0554			FALSE	0.168	149.000	0.000	NA		NA
6091667	6091668	CJD_A0555	CJD_A0556			FALSE	0.257	66.000	0.000	NA		NA
6091668	6091669	CJD_A0556	CJD_A0557			FALSE	0.010	432.000	0.000	NA		NA
6091669	6091670	CJD_A0557	CJD_A0558			FALSE	0.256	68.000	0.000	NA		NA
6091670	6091671	CJD_A0558	CJD_A0560			FALSE	0.259	64.000	0.000	NA		NA
6091671	6091672	CJD_A0560	CJD_A0561			FALSE	0.137	171.000	0.000	NA		NA
6091672	6091673	CJD_A0561	CJD_A0562			FALSE	0.146	165.000	0.000	NA		NA
6091673	6091674	CJD_A0562	CJD_A0563			TRUE	0.639	6.000	0.000	NA		NA
6091674	6091675	CJD_A0563	CJD_A0564			FALSE	0.004	914.000	0.000	NA		NA
6091676	6091677	CJD_A0565	CJD_A0566			FALSE	0.202	345.000	0.000	1.000	Y	NA
6091679	6091680	CJD_A0568	CJD_A0569			FALSE	0.272	58.000	0.000	NA		NA
6091680	6091681	CJD_A0569	CJD_A0570			FALSE	0.378	32.000	0.000	NA		NA
6091683	6091684	CJD_A0572	CJD_A0573			FALSE	0.191	135.000	0.000	NA		NA
6091684	6091685	CJD_A0573	CJD_A0574			FALSE	0.080	214.000	0.000	NA		NA
6091685	6091686	CJD_A0574	CJD_A0575			FALSE	0.107	192.000	0.000	NA		NA
6091687	6091688	CJD_A0576	CJD_A0577			FALSE	0.017	341.000	0.000	NA		NA
6091688	6091689	CJD_A0577	CJD_A0578			FALSE	0.293	50.000	0.000	NA		NA
6091689	6091690	CJD_A0578	CJD_A0579			FALSE	0.015	354.000	0.000	NA		NA
6091690	6091691	CJD_A0579	CJD_A0580			FALSE	0.124	181.000	0.000	NA		NA
6091693	6091694	CJD_0731	CJD_0729	rrl	rrs	FALSE	0.116	186.000	0.000	NA		NA
6091694	6091695	CJD_0729	CJD_0728	rrs		FALSE	0.008	459.000	0.000	NA		NA
6091695	6091696	CJD_0728	CJD_0727			FALSE	0.020	290.000	0.000	1.000		NA
6091696	6091697	CJD_0727	CJD_0726			FALSE	0.010	305.000	0.000	1.000	N	NA
6091697	6091698	CJD_0726	CJD_0725			FALSE	0.005	378.000	0.000	1.000	N	NA
6091701	6091702	CJD_0722	CJD_0721		fruK	TRUE	0.996	0.000	0.721	1.000	Y	NA
6091702	6091703	CJD_0721	CJD_0720	fruK	fruA	TRUE	0.997	4.000	0.816	1.000	Y	NA
6091704	6091705	CJD_0719	CJD_0718			TRUE	0.989	-7.000	0.041	NA	Y	NA
6091705	6091706	CJD_0718	CJD_0717			FALSE	0.021	286.000	0.000	NA	N	NA
6091706	6091707	CJD_0717	CJD_0716			FALSE	0.062	163.000	0.000	1.000	N	NA
6091707	6091708	CJD_0716	CJD_0715			TRUE	0.958	-10.000	0.087	NA		NA
6091708	6091709	CJD_0715	CJD_0714			FALSE	0.060	236.000	0.000	NA		NA
6091709	6091710	CJD_0714	CJD_0713			TRUE	0.995	2.000	0.512	0.018	Y	NA
6091710	6091711	CJD_0713	CJD_0712			TRUE	0.972	79.000	0.366	0.018	Y	NA
6091711	6091712	CJD_0712	CJD_0711			FALSE	0.067	153.000	0.000	1.000	N	NA
6091712	6091713	CJD_0711	CJD_0710			TRUE	0.948	13.000	0.000	0.011	Y	NA
6091713	6091714	CJD_0710	CJD_0709			FALSE	0.008	392.000	0.000	1.000		NA
6091714	6091715	CJD_0709	CJD_0708			FALSE	0.028	293.000	0.000	NA		NA
6091715	6091716	CJD_0708	CJD_0707			FALSE	0.005	662.000	0.000	NA		NA
6091717	6091718	CJD_1304	CJD_1305		hpkA	TRUE	0.617	14.000	0.000	NA		NA
6091720	6091721	CJD_1307	CJD_1308			TRUE	0.642	2.000	0.000	NA		NA
6091721	6091722	CJD_1308	CJD_1309			FALSE	0.133	174.000	0.000	NA		NA
6091722	6091723	CJD_1309	CJD_1310			FALSE	0.054	217.000	0.000	1.000		NA
6091723	6091724	CJD_1310	CJD_1311			FALSE	0.034	211.000	0.000	1.000	N	NA
6091724	6091725	CJD_1311	CJD_1312			TRUE	0.906	56.000	0.286	NA		NA
6091725	6091726	CJD_1312	CJD_1313			TRUE	0.976	11.000	0.231	NA		NA
6091727	6091728	CJD_1314	CJD_1315			FALSE	0.239	102.000	0.000	NA		NA
6091728	6091729	CJD_1315	CJD_1316			FALSE	0.107	192.000	0.000	NA		NA
6091732	6091733	CJD_1319	CJD_1320			FALSE	0.065	229.000	0.000	NA		NA
6091733	6091734	CJD_1320	CJD_1321			FALSE	0.185	83.000	0.000	1.000		NA
6091734	6091735	CJD_1321	CJD_1322			TRUE	0.978	-3.000	0.667	0.052		NA
6091735	6091736	CJD_1322	CJD_1323		kdpA	FALSE	0.004	422.000	0.000	1.000	N	NA
6091736	6091737	CJD_1323	CJD_1324	kdpA	kdpB	TRUE	0.990	14.000	0.112	0.001	Y	NA
6091737	6091738	CJD_1324	CJD_1325	kdpB	kdpC	TRUE	0.995	15.000	0.877	0.001	Y	NA
6091738	6091739	CJD_1325	CJD_1326	kdpC	kdpD	FALSE	0.083	12.000	0.000	0.054	N	NA
6091739	6091740	CJD_1326	CJD_1327	kdpD	kdpE	TRUE	0.991	-25.000	0.081	1.000	Y	NA
6091740	6091741	CJD_1327	CJD_1328	kdpE		TRUE	0.552	2.000	0.000	1.000		NA
6091741	6091742	CJD_1328	CJD_1329			FALSE	0.052	243.000	0.000	NA		NA
6091744	6091745	CJD_1331	CJD_1332			FALSE	0.233	111.000	0.000	NA		NA
6091747	6091748	CJD_1770	CJD_1769		plsD	FALSE	0.339	38.000	0.000	NA		NA
6091748	6091749	CJD_1769	CJD_1768	plsD	nth	TRUE	0.870	12.000	0.011	1.000	N	NA
6091751	6091752	CJD_1766	CJD_1765		ddl	FALSE	0.014	120.000	0.000	0.076	N	NA
6091752	6091753	CJD_1765	CJD_1764	ddl		TRUE	0.832	74.000	0.000	1.000	Y	NA
6091753	6091754	CJD_1764	CJD_1763			TRUE	0.790	165.000	0.333	1.000	N	NA
6091754	6091755	CJD_1763	CJD_1762			FALSE	0.010	158.000	0.000	0.016		NA
6091755	6091756	CJD_1762	CJD_1761			FALSE	0.180	89.000	0.000	1.000		NA
6091756	6091757	CJD_1761	CJD_1760			TRUE	0.904	15.000	0.016	NA		NA
6091757	6091758	CJD_1760	CJD_1759			FALSE	0.241	91.000	0.000	NA		NA
6091758	6091759	CJD_1759	CJD_1757			FALSE	0.005	602.000	0.000	NA		NA
6091759	6091760	CJD_1757	CJD_1756			TRUE	0.981	-19.000	0.639	NA		NA
6091760	6091761	CJD_1756	CJD_1755		rpoN	FALSE	0.046	252.000	0.000	NA		NA
6091761	6091762	CJD_1755	CJD_1754	rpoN		TRUE	0.768	227.000	0.034	1.000	Y	NA
6091762	6091763	CJD_1754	CJD_1753		gap	TRUE	0.755	92.000	0.067	1.000	N	NA
6091763	6091764	CJD_1753	CJD_1752	gap	pgk	TRUE	0.829	144.000	0.005	0.004	Y	NA
6091764	6091765	CJD_1752	CJD_1751	pgk	tpiA	TRUE	0.832	244.000	0.141	1.000	Y	NA
6091765	6091766	CJD_1751	CJD_1750	tpiA	gpmI	TRUE	0.960	125.000	0.138	1.000	Y	NA
6091766	6091767	CJD_1750	CJD_1749	gpmI		FALSE	0.002	572.000	0.000	1.000	N	NA
6091767	6091768	CJD_1749	CJD_1748			FALSE	0.099	200.000	0.000	NA		NA
6091768	6091769	CJD_1748	CJD_1747		eno	FALSE	0.014	367.000	0.000	NA		NA
6091769	6091770	CJD_1747	CJD_1746	eno		FALSE	0.004	1450.000	0.000	NA		NA
6091771	6091772	CJD_A0365	CJD_A0369	rrs	rrl	FALSE	0.116	186.000	0.000	NA		NA
6091772	6091773	CJD_A0369	CJD_A0370	rrl	rrf	FALSE	0.240	95.000	0.000	NA		NA
6091773	6091774	CJD_A0370	CJD_A0371	rrf		TRUE	0.641	5.000	0.000	NA		NA
6091774	6091775	CJD_A0371	CJD_A0372			TRUE	0.643	4.000	0.000	NA		NA
6091775	6091776	CJD_A0372	CJD_A0373			FALSE	0.004	772.000	0.000	NA		NA
6091776	6091777	CJD_A0373	CJD_A0374			FALSE	0.205	127.000	0.000	NA		NA
6091777	6091778	CJD_A0374	CJD_A0375		glgB	FALSE	0.018	335.000	0.000	NA		NA
6091778	6091779	CJD_A0375	CJD_A0376	glgB		TRUE	0.873	43.000	0.000	1.000	Y	NA
6091779	6091780	CJD_A0376	CJD_A0377			TRUE	0.984	30.000	0.143	1.000	Y	NA
6091780	6091781	CJD_A0377	CJD_A0378			TRUE	0.963	96.000	0.186	0.018	Y	NA
6091781	6091782	CJD_A0378	CJD_A0379			FALSE	0.278	55.000	0.000	NA		NA
6091782	6091783	CJD_A0379	CJD_A0380		glgC	FALSE	0.066	228.000	0.000	NA		NA
6091783	6091784	CJD_A0380	CJD_A0381	glgC	glgD	TRUE	0.984	30.000	0.309	0.001	Y	NA
6091784	6091785	CJD_A0381	CJD_A0382	glgD		FALSE	0.261	63.000	0.000	NA		NA
6091787	6091788	CJD_A0384	CJD_A0386		rrs	FALSE	0.004	771.000	0.000	NA		NA
6091788	6091789	CJD_A0386	CJD_A0390	rrs	rrl	FALSE	0.116	186.000	0.000	NA		NA
6091790	6091791	CJD_1561	CJD_1562			FALSE	0.011	352.000	0.000	1.000		NA
6091795	6091796	CJD_1566	CJD_1567			FALSE	0.299	49.000	0.000	NA		NA
6091796	6091797	CJD_1567	CJD_1568		pyrE	FALSE	0.156	158.000	0.000	NA		NA
6091797	6091798	CJD_1568	CJD_1569	pyrE	pyrD	TRUE	0.922	150.000	0.060	1.000	Y	NA
6091798	6091799	CJD_1569	CJD_1570	pyrD	pyrK	TRUE	0.968	20.000	0.592	1.000	N	NA
6091799	6091800	CJD_1570	CJD_1571	pyrK	pyrF	TRUE	0.889	25.000	0.112	0.002	N	NA
6091800	6091801	CJD_1571	CJD_1572	pyrF	pyrC	TRUE	0.991	10.000	0.064	1.000	Y	NA
6091801	6091802	CJD_1572	CJD_1573	pyrC		TRUE	0.887	22.000	0.032	NA		NA
6091802	6091803	CJD_1573	CJD_1574		pyrB	TRUE	0.975	5.000	0.197	NA		NA
6091803	6091804	CJD_1574	CJD_1575	pyrB		FALSE	0.004	410.000	0.000	1.000	N	NA
6091804	6091805	CJD_1575	CJD_1576			FALSE	0.306	235.000	0.036	1.000	N	NA
6091805	6091806	CJD_1576	CJD_1577			FALSE	0.013	279.000	0.000	1.000	N	NA
6091806	6091807	CJD_1577	CJD_1578			TRUE	0.978	-3.000	0.667	0.051		NA
6091807	6091808	CJD_1578	CJD_1579			FALSE	0.186	82.000	0.000	1.000		NA
6091808	6091809	CJD_1579	CJD_1580		manA	FALSE	0.016	260.000	0.000	1.000	N	NA
6091810	6091811	CJD_1581	CJD_1582			TRUE	0.977	18.000	0.796	1.000		NA
6091811	6091812	CJD_1582	CJD_1583			FALSE	0.046	251.000	0.000	NA		NA
6091812	6091813	CJD_1583	CJD_1584			TRUE	0.543	19.000	0.000	NA		NA
6091816	6091817	CJD_1587	CJD_1588			FALSE	0.293	50.000	0.000	NA		NA
6091817	6091818	CJD_1588	CJD_1589			TRUE	0.643	4.000	0.000	NA		NA
6091818	6091819	CJD_1589	CJD_1590			FALSE	0.009	456.000	0.000	NA		NA
6091820	6091821	CJD_1591	CJD_1592			FALSE	0.012	391.000	0.000	NA		NA
6091823	6091824	CJD_1427	CJD_1428	aspD		FALSE	0.195	132.000	0.000	NA		NA
6091825	6091826	CJD_1429	CJD_1430		hprK	TRUE	0.629	12.000	0.000	NA		NA
6091826	6091827	CJD_1430	CJD_1431	hprK		FALSE	0.311	45.000	0.000	NA		NA
6091827	6091828	CJD_1431	CJD_1432			FALSE	0.005	612.000	0.000	NA		NA
6091828	6091829	CJD_1432	CJD_1433			FALSE	0.256	67.000	0.000	NA		NA
6091829	6091830	CJD_1433	CJD_1434			FALSE	0.107	193.000	0.000	NA		NA
6091830	6091831	CJD_1434	CJD_1435		mgsA	FALSE	0.058	169.000	0.000	1.000	N	NA
6091831	6091832	CJD_1435	CJD_1436	mgsA		FALSE	0.056	238.000	0.000	NA		NA
6091832	6091833	CJD_1436	CJD_1437			FALSE	0.207	126.000	0.000	NA		NA
6091833	6091834	CJD_1437	CJD_1438			FALSE	0.246	84.000	0.000	NA		NA
6091834	6091835	CJD_1438	CJD_1439			FALSE	0.316	44.000	0.000	NA		NA
6091836	6091837	CJD_1440	CJD_1441			FALSE	0.092	205.000	0.000	NA		NA
6091838	6091839	CJD_1442	CJD_1443	pabA	pabB	TRUE	0.995	6.000	0.250	1.000	Y	NA
6091839	6091840	CJD_1443	CJD_1444	pabB		TRUE	0.982	18.000	0.027	1.000	Y	NA
6091840	6091841	CJD_1444	CJD_1445		folE	TRUE	0.981	15.000	0.011	1.000	Y	NA
6091841	6091842	CJD_1445	CJD_1446	folE		TRUE	0.914	25.000	0.081	1.000		NA
6091842	6091843	CJD_1446	CJD_1447		folP	TRUE	0.979	13.000	0.533	1.000		NA
6091843	6091844	CJD_1447	CJD_1448	folP	folBK	TRUE	0.979	13.000	0.019	0.002	Y	NA
6091846	6091847	CJD_1450	CJD_1452			FALSE	0.016	353.000	0.000	NA		NA
6091850	6091851	CJD_1453	CJD_1455		crcB	TRUE	0.905	20.000	0.038	NA		NA
6091853	6091854	CJD_A0391	CJD_A0392			FALSE	0.151	162.000	0.000	NA		NA
6091854	6091855	CJD_A0392	CJD_A0393			TRUE	0.604	-27.000	0.000	NA		NA
6091856	6091857	CJD_A0394	CJD_A0395			TRUE	0.629	12.000	0.000	NA		NA
6091857	6091858	CJD_A0395	CJD_A0396			FALSE	0.258	65.000	0.000	NA		NA
6091858	6091859	CJD_A0396	CJD_A0397			FALSE	0.255	69.000	0.000	NA		NA
6091860	6091861	CJD_A0398	CJD_A0399			FALSE	0.140	169.000	0.000	NA		NA
6091861	6091862	CJD_A0399	CJD_A0400			FALSE	0.176	145.000	0.000	NA		NA
6091863	6091864	CJD_A0401	CJD_A0402			TRUE	0.623	13.000	0.000	NA		NA
6091864	6091865	CJD_A0402	CJD_A0403			FALSE	0.240	97.000	0.000	NA		NA
6091865	6091866	CJD_A0403	CJD_A0404			FALSE	0.255	69.000	0.000	NA		NA
6091866	6091867	CJD_A0404	CJD_A0405			FALSE	0.148	164.000	0.000	NA		NA
6091868	6091869	CJD_A0406	CJD_A0407			FALSE	0.078	216.000	0.000	NA		NA
6091869	6091870	CJD_A0407	CJD_A0408			FALSE	0.066	228.000	0.000	NA		NA
6091870	6091871	CJD_A0408	CJD_A0409			TRUE	0.624	-7.000	0.000	NA		NA
6091871	6091872	CJD_A0409	CJD_A0410			TRUE	0.624	-7.000	0.000	NA		NA
6091872	6091873	CJD_A0410	CJD_A0411			FALSE	0.016	351.000	0.000	NA		NA
6091873	6091874	CJD_A0411	CJD_A0412			FALSE	0.471	24.000	0.000	NA		NA
6091874	6091875	CJD_A0412	CJD_A0413			TRUE	0.617	14.000	0.000	NA		NA
6091875	6091876	CJD_A0413	CJD_A0414			TRUE	0.609	15.000	0.000	NA		NA
6091876	6091877	CJD_A0414	CJD_A0415			TRUE	0.511	21.000	0.000	NA		NA
6091877	6091878	CJD_A0415	CJD_A0416			TRUE	0.641	5.000	0.000	NA		NA
6091878	6091879	CJD_A0416	CJD_A0417			FALSE	0.109	191.000	0.000	NA		NA
6091879	6091880	CJD_A0417	CJD_A0418			FALSE	0.330	40.000	0.000	NA		NA
6091880	6091881	CJD_A0418	CJD_A0419			TRUE	0.643	3.000	0.000	NA		NA
6091881	6091882	CJD_A0419	CJD_A0420			TRUE	0.643	3.000	0.000	NA		NA
6091883	6091884	CJD_A0526	CJD_A0527			FALSE	0.048	248.000	0.000	NA		NA
6091884	6091885	CJD_A0527	CJD_A0528			TRUE	0.526	20.000	0.000	NA		NA
6091885	6091886	CJD_A0528	CJD_A0529			FALSE	0.190	70.000	0.000	1.000		NA
6091886	6091887	CJD_A0529	CJD_A0530			FALSE	0.180	89.000	0.000	1.000		NA
6091887	6091888	CJD_A0530	CJD_A0531			FALSE	0.130	143.000	0.000	1.000		NA
6091888	6091889	CJD_A0531	CJD_A0532			FALSE	0.016	160.000	0.000	0.050		NA
6091890	6091891	CJD_A0533	CJD_A0534			FALSE	0.074	220.000	0.000	NA		NA
6091891	6091892	CJD_A0534	CJD_A0535			TRUE	0.984	4.000	0.889	1.000		NA
6091892	6091893	CJD_A0535	CJD_A0536			FALSE	0.014	368.000	0.000	NA		NA
6091893	6091894	CJD_A0536	CJD_A0537			FALSE	0.008	484.000	0.000	NA		NA
6091894	6091895	CJD_A0537	CJD_A0538			FALSE	0.245	85.000	0.000	NA		NA
6091895	6091896	CJD_A0538	CJD_A0539			FALSE	0.261	63.000	0.000	NA		NA
6091897	6091898	CJD_A0540	CJD_A0541			FALSE	0.471	24.000	0.000	NA		NA
6091898	6091899	CJD_A0541	CJD_A0542			FALSE	0.187	138.000	0.000	NA		NA
6091900	6091901	CJD_A0543	CJD_A0544			FALSE	0.255	69.000	0.000	NA		NA
6091901	6091902	CJD_A0544	CJD_A0545			FALSE	0.330	40.000	0.000	NA		NA
6091903	6091904	CJD_A0546	CJD_A0547			FALSE	0.062	235.000	0.000	NA		NA
6091906	6091907	CJD_0674	CJD_0675		treR	FALSE	0.039	265.000	0.000	NA		NA
6091909	6091910	CJD_0677	CJD_0678		ribD	FALSE	0.004	567.000	0.000	1.000		NA
6091910	6091911	CJD_0678	CJD_0679	ribD	ribE	TRUE	0.994	19.000	0.456	1.000	Y	NA
6091911	6091912	CJD_0679	CJD_0680	ribE	ribA	TRUE	0.913	153.000	0.051	1.000	Y	NA
6091912	6091913	CJD_0680	CJD_0681	ribA	ribE	TRUE	0.915	127.000	0.054	0.001	Y	NA
6091914	6091915	CJD_0682	CJD_0683			FALSE	0.239	104.000	0.000	NA		NA
6091916	6091917	CJD_0684	CJD_0685			TRUE	0.564	18.000	0.000	NA		NA
6091917	6091918	CJD_0685	CJD_0686			FALSE	0.354	35.000	0.000	NA		NA
6091918	6091919	CJD_0686	CJD_0687			TRUE	0.609	15.000	0.000	NA		NA
6091919	6091920	CJD_0687	CJD_0688			FALSE	0.363	34.000	0.000	NA		NA
6091920	6091921	CJD_0688	CJD_0689			TRUE	0.603	-28.000	0.000	NA		NA
6091921	6091922	CJD_0689	CJD_0690			FALSE	0.241	94.000	0.000	NA		NA
6091922	6091923	CJD_0690	CJD_0691			FALSE	0.248	83.000	0.000	NA		NA
6091923	6091924	CJD_0691	CJD_0692			FALSE	0.103	196.000	0.000	NA		NA
6091924	6091925	CJD_0692	CJD_0693			FALSE	0.256	67.000	0.000	NA		NA
6091925	6091926	CJD_0693	CJD_0694			FALSE	0.299	49.000	0.000	NA		NA
6091926	6091927	CJD_0694	CJD_0695			TRUE	0.643	3.000	0.000	NA		NA
6091927	6091928	CJD_0695	CJD_0696			FALSE	0.027	297.000	0.000	NA		NA
6091928	6091929	CJD_0696	CJD_0697			FALSE	0.224	116.000	0.000	NA		NA
6091929	6091930	CJD_0697	CJD_0698			TRUE	0.636	9.000	0.000	NA		NA
6091930	6091931	CJD_0698	CJD_0699			FALSE	0.168	149.000	0.000	NA		NA
6091931	6091932	CJD_0699	CJD_0700			FALSE	0.363	34.000	0.000	NA		NA
6091932	6091933	CJD_0700	CJD_0701			FALSE	0.236	108.000	0.000	NA		NA
6091933	6091934	CJD_0701	CJD_0702			FALSE	0.497	22.000	0.000	NA		NA
6091934	6091935	CJD_0702	CJD_0703			TRUE	0.624	-7.000	0.000	NA		NA
6091935	6091936	CJD_0703	CJD_0704			TRUE	0.624	-7.000	0.000	NA		NA
6091936	6091937	CJD_0704	CJD_0705			FALSE	0.241	44.000	0.000	1.000		NA
6091937	6091938	CJD_0705	CJD_0706			FALSE	0.330	40.000	0.000	NA		NA
6091939	6091940	CJD_A0328	CJD_A0329			FALSE	0.103	196.000	0.000	NA		NA
6091940	6091941	CJD_A0329	CJD_A0330			FALSE	0.056	238.000	0.000	NA		NA
6091941	6091942	CJD_A0330	CJD_A0331			TRUE	0.526	20.000	0.000	NA		NA
6091942	6091943	CJD_A0331	CJD_A0332			FALSE	0.026	298.000	0.000	NA		NA
6091943	6091944	CJD_A0332	CJD_A0333			FALSE	0.224	116.000	0.000	NA		NA
6091944	6091945	CJD_A0333	CJD_A0334			TRUE	0.636	0.000	0.000	NA		NA
6091945	6091946	CJD_A0334	CJD_A0335			FALSE	0.363	34.000	0.000	NA		NA
6091946	6091947	CJD_A0335	CJD_A0336			FALSE	0.236	108.000	0.000	NA		NA
6091947	6091948	CJD_A0336	CJD_A0337			FALSE	0.497	22.000	0.000	NA		NA
6091948	6091949	CJD_A0337	CJD_A0338			FALSE	0.213	121.000	0.000	NA		NA
6091949	6091950	CJD_A0338	CJD_A0339			TRUE	0.624	-7.000	0.000	NA		NA
6091950	6091951	CJD_A0339	CJD_A0340			FALSE	0.241	44.000	0.000	1.000		NA
6091951	6091952	CJD_A0340	CJD_A0341			FALSE	0.026	40.000	0.000	0.018		NA
6091952	6091953	CJD_A0341	CJD_A0342			TRUE	0.643	3.000	0.000	NA		NA
6091953	6091954	CJD_A0342	CJD_A0343			FALSE	0.084	212.000	0.000	NA		NA
6091954	6091955	CJD_A0343	CJD_A0344			TRUE	0.511	21.000	0.000	NA		NA
6091955	6091956	CJD_A0344	CJD_A0345			FALSE	0.348	36.000	0.000	NA		NA
6091956	6091957	CJD_A0345	CJD_A0346			FALSE	0.131	175.000	0.000	NA		NA
6091957	6091958	CJD_A0346	CJD_A0347			FALSE	0.390	31.000	0.000	NA		NA
6091958	6091959	CJD_A0347	CJD_A0348			FALSE	0.241	93.000	0.000	NA		NA
6091959	6091960	CJD_A0348	CJD_A0349			FALSE	0.261	63.000	0.000	NA		NA
6091960	6091961	CJD_A0349	CJD_A0350			TRUE	0.618	-10.000	0.000	NA		NA
6091961	6091962	CJD_A0350	CJD_A0351			FALSE	0.047	250.000	0.000	NA		NA
6091962	6091963	CJD_A0351	CJD_A0352			FALSE	0.250	82.000	0.000	NA		NA
6091963	6091964	CJD_A0352	CJD_A0353			FALSE	0.237	106.000	0.000	NA		NA
6091964	6091965	CJD_A0353	CJD_A0354			FALSE	0.203	128.000	0.000	NA		NA
6091965	6091966	CJD_A0354	CJD_A0355			TRUE	0.543	19.000	0.000	NA		NA
6091966	6091967	CJD_A0355	CJD_A0356			FALSE	0.288	51.000	0.000	NA		NA
6091967	6091968	CJD_A0356	CJD_A0357			TRUE	0.643	3.000	0.000	NA		NA
6091968	6091969	CJD_A0357	CJD_A0358			TRUE	0.643	3.000	0.000	NA		NA
6091969	6091970	CJD_A0358	CJD_A0359			FALSE	0.244	86.000	0.000	NA		NA
6091970	6091971	CJD_A0359	CJD_A0360			FALSE	0.311	45.000	0.000	NA		NA
6091971	6091972	CJD_A0360	CJD_A0361			TRUE	0.599	16.000	0.000	NA		NA
6091972	6091973	CJD_A0361	CJD_A0362			TRUE	0.641	5.000	0.000	NA		NA
6091973	6091974	CJD_A0362	CJD_A0363			TRUE	0.511	21.000	0.000	NA		NA
6091976	6091977	CJD_0339	CJD_0340			TRUE	0.939	3.000	0.078	0.003		NA
6091977	6091978	CJD_0340	CJD_0341			FALSE	0.424	174.000	0.006	NA		NA
6091978	6091979	CJD_0341	CJD_0342			FALSE	0.019	331.000	0.000	NA		NA
6091982	6091983	CJD_1218	CJD_1219			TRUE	0.855	83.000	0.156	1.000		NA
6091984	6091985	CJD_1220	CJD_1221			TRUE	0.810	115.000	0.000	1.000	Y	NA
6091985	6091986	CJD_1221	CJD_1222			TRUE	0.526	14.000	0.000	1.000		NA
6091986	6091987	CJD_1222	CJD_1223			FALSE	0.060	19.000	0.000	0.011		NA
6091987	6091988	CJD_1223	CJD_0329			TRUE	0.526	14.000	0.000	1.000		NA
6091988	6091989	CJD_0329	CJD_0328			FALSE	0.064	18.000	0.000	0.073	N	NA
6091989	6091990	CJD_0328	CJD_0327			FALSE	0.003	455.000	0.000	1.000	N	NA
6091992	6091993	CJD_0325	CJD_0324		rrf	TRUE	0.633	11.000	0.000	NA		NA
6091993	6091994	CJD_0324	CJD_0323	rrf	rrl	FALSE	0.285	52.000	0.000	NA		NA
6091994	6091995	CJD_0323	CJD_0320	rrl	rrs	FALSE	0.116	186.000	0.000	NA		NA
6091996	6091997	CJD_0364	CJD_0363			FALSE	0.483	23.000	0.000	NA		NA
6091997	6091998	CJD_0363	CJD_0362			TRUE	0.586	89.000	0.015	1.000	N	NA
6091998	6091999	CJD_0362	CJD_0361			TRUE	0.996	-10.000	0.431	1.000	Y	NA
6091999	6092000	CJD_0361	CJD_0360			FALSE	0.091	206.000	0.000	NA		NA
6092000	6092001	CJD_0360	CJD_0358			FALSE	0.068	227.000	0.000	NA		NA
6092001	6092002	CJD_0358	CJD_0357			TRUE	0.992	0.000	0.180	0.001	Y	NA
6092002	6092003	CJD_0357	CJD_0356			FALSE	0.046	438.000	0.019	1.000	N	NA
6092003	6092004	CJD_0356	CJD_0355			TRUE	0.920	6.000	0.019	NA		NA
6092004	6092005	CJD_0355	CJD_0354			FALSE	0.050	246.000	0.000	NA		NA
6092005	6092006	CJD_0354	CJD_0353			TRUE	0.809	61.000	0.064	NA		NA
6092006	6092007	CJD_0353	CJD_0352		acpS	TRUE	0.901	-13.000	0.020	NA	N	NA
6092007	6092008	CJD_0352	CJD_0351	acpS		TRUE	0.736	49.000	0.020	NA		NA
6092009	6092010	CJD_0350	CJD_0349			FALSE	0.003	504.000	0.000	1.000	N	NA
6092014	6092015	CJD_0345	CJD_0344			FALSE	0.168	111.000	0.000	NA	N	NA
6092017	6092018	CJD_A0248	CJD_A0249			TRUE	0.615	-12.000	0.000	NA		NA
6092018	6092019	CJD_A0249	CJD_A0250			FALSE	0.027	295.000	0.000	NA		NA
6092019	6092020	CJD_A0250	CJD_A0251			FALSE	0.336	39.000	0.000	NA		NA
6092020	6092021	CJD_A0251	CJD_A0252			FALSE	0.497	22.000	0.000	NA		NA
6092021	6092022	CJD_A0252	CJD_A0253			TRUE	0.909	63.000	0.400	NA		NA
6092022	6092023	CJD_A0253	CJD_A0254			TRUE	0.985	2.000	1.000	NA		NA
6092023	6092024	CJD_A0254	CJD_A0255			TRUE	0.983	15.000	1.000	NA		NA
6092024	6092025	CJD_A0255	CJD_A0256			TRUE	0.924	83.000	1.000	NA		NA
6092025	6092026	CJD_A0256	CJD_A0257			TRUE	0.980	3.000	0.333	NA		NA
6092026	6092027	CJD_A0257	CJD_A0258			TRUE	0.984	5.000	0.667	NA		NA
6092027	6092028	CJD_A0258	CJD_A0259			TRUE	0.919	59.000	0.500	NA		NA
6092028	6092029	CJD_A0259	CJD_A0260			TRUE	0.642	2.000	0.000	NA		NA
6092029	6092030	CJD_A0260	CJD_A0261			FALSE	0.010	432.000	0.000	NA		NA
6092030	6092031	CJD_A0261	CJD_A0262			FALSE	0.250	82.000	0.000	NA		NA
6092031	6092032	CJD_A0262	CJD_A0263			FALSE	0.082	213.000	0.000	NA		NA
6092032	6092033	CJD_A0263	CJD_A0264			TRUE	0.618	-10.000	0.000	NA		NA
6092033	6092034	CJD_A0264	CJD_A0265			FALSE	0.246	84.000	0.000	NA		NA
6092034	6092035	CJD_A0265	CJD_A0266			TRUE	0.643	3.000	0.000	NA		NA
6092035	6092036	CJD_A0266	CJD_A0267			FALSE	0.026	40.000	0.000	0.017		NA
6092036	6092037	CJD_A0267	CJD_A0268			FALSE	0.241	44.000	0.000	1.000		NA
6092037	6092038	CJD_A0268	CJD_A0269			TRUE	0.624	-7.000	0.000	NA		NA
6092038	6092039	CJD_A0269	CJD_A0270			TRUE	0.624	-7.000	0.000	NA		NA
6092039	6092040	CJD_A0270	CJD_A0271			FALSE	0.497	22.000	0.000	NA		NA
6092040	6092041	CJD_A0271	CJD_A0272			FALSE	0.040	261.000	0.000	NA		NA
6092041	6092042	CJD_A0272	CJD_A0273			FALSE	0.363	34.000	0.000	NA		NA
6092042	6092043	CJD_A0273	CJD_A0274			TRUE	0.636	0.000	0.000	NA		NA
6092043	6092044	CJD_A0274	CJD_A0275			FALSE	0.224	116.000	0.000	NA		NA
6092044	6092045	CJD_A0275	CJD_A0276			FALSE	0.027	297.000	0.000	NA		NA
6092045	6092046	CJD_A0276	CJD_A0277			FALSE	0.114	187.000	0.000	NA		NA
6092046	6092047	CJD_A0277	CJD_A0278			FALSE	0.056	238.000	0.000	NA		NA
6092047	6092048	CJD_A0278	CJD_A0279			FALSE	0.103	196.000	0.000	NA		NA
6092051	6092052	CJD_A0223	CJD_A0224			FALSE	0.023	311.000	0.000	NA		NA
6092052	6092053	CJD_A0224	CJD_A0225			TRUE	0.623	13.000	0.000	NA		NA
6092053	6092054	CJD_A0225	CJD_A0226			FALSE	0.240	98.000	0.000	NA		NA
6092055	6092056	CJD_A0227	CJD_A0228			FALSE	0.228	114.000	0.000	NA		NA
6092056	6092057	CJD_A0228	CJD_A0229			FALSE	0.111	189.000	0.000	NA		NA
6092057	6092058	CJD_A0229	CJD_A0230			FALSE	0.288	51.000	0.000	NA		NA
6092058	6092059	CJD_A0230	CJD_A0231			FALSE	0.299	49.000	0.000	NA		NA
6092059	6092060	CJD_A0231	CJD_A0232			FALSE	0.235	109.000	0.000	NA		NA
6092060	6092061	CJD_A0232	CJD_A0233			FALSE	0.419	28.000	0.000	NA		NA
6092061	6092062	CJD_A0233	CJD_A0234			TRUE	0.615	-12.000	0.000	NA		NA
6092062	6092063	CJD_A0234	CJD_A0235			FALSE	0.027	295.000	0.000	NA		NA
6092063	6092064	CJD_A0235	CJD_A0236			FALSE	0.336	39.000	0.000	NA		NA
6092064	6092065	CJD_A0236	CJD_A0237			FALSE	0.497	22.000	0.000	NA		NA
6092065	6092066	CJD_A0237	CJD_A0238			FALSE	0.238	105.000	0.000	NA		NA
6092066	6092067	CJD_A0238	CJD_A0239			FALSE	0.261	63.000	0.000	NA		NA
6092067	6092068	CJD_A0239	CJD_A0240			TRUE	0.985	2.000	1.000	NA		NA
6092068	6092069	CJD_A0240	CJD_A0241			TRUE	0.983	15.000	1.000	NA		NA
6092069	6092070	CJD_A0241	CJD_A0242			TRUE	0.924	83.000	1.000	NA		NA
6092070	6092071	CJD_A0242	CJD_A0243			TRUE	0.980	3.000	0.333	NA		NA
6092071	6092072	CJD_A0243	CJD_A0244			TRUE	0.984	5.000	0.667	NA		NA
6092072	6092073	CJD_A0244	CJD_A0245			TRUE	0.919	59.000	0.500	NA		NA
6092073	6092074	CJD_A0245	CJD_A0246			TRUE	0.642	2.000	0.000	NA		NA
6092074	6092075	CJD_A0246	CJD_A0247			FALSE	0.203	128.000	0.000	NA		NA
6092076	6092077	CJD_2607	CJD_2608		yqfC	TRUE	0.642	2.000	0.000	NA		NA
6092077	6092078	CJD_2608	CJD_2609	yqfC		FALSE	0.331	236.000	0.029	NA		NA
6092078	6092079	CJD_2609	CJD_2610		rpsU	TRUE	0.851	50.000	0.150	0.017		NA
6092079	6092080	CJD_2610	CJD_2611	rpsU		TRUE	0.759	120.000	0.071	1.000		NA
6092080	6092081	CJD_2611	CJD_2612			TRUE	0.678	69.000	0.051	0.018	N	NA
6092081	6092082	CJD_2612	CJD_2613			TRUE	0.972	0.000	0.163	NA		NA
6092082	6092083	CJD_2613	CJD_2614		prmA	TRUE	0.956	23.000	0.227	NA		NA
6092083	6092084	CJD_2614	CJD_2615	prmA		FALSE	0.027	226.000	0.000	1.000	N	NA
6092084	6092085	CJD_2615	CJD_2616			TRUE	0.642	2.000	0.000	NA		NA
6092085	6092086	CJD_2616	CJD_2617			TRUE	0.599	16.000	0.000	NA		NA
6092086	6092087	CJD_2617	CJD_2618			TRUE	0.624	-7.000	0.000	NA		NA
6092087	6092088	CJD_2618	CJD_2619		dnaJ	FALSE	0.008	179.000	0.000	0.072	N	NA
6092088	6092089	CJD_2619	CJD_2620	dnaJ	dnaK	FALSE	0.035	114.000	0.000	0.072		NA
6092089	6092090	CJD_2620	CJD_2621	dnaK		FALSE	0.054	240.000	0.000	NA		NA
6092090	6092091	CJD_2621	CJD_2622		grpE	FALSE	0.274	57.000	0.000	NA		NA
6092091	6092092	CJD_2622	CJD_2623	grpE	hrcA	TRUE	0.930	31.000	0.286	1.000	N	NA
6092092	6092093	CJD_2623	CJD_2624	hrcA		TRUE	0.512	197.000	0.062	1.000	N	NA
6092093	6092094	CJD_2624	CJD_2625			FALSE	0.014	270.000	0.000	1.000	N	NA
6092094	6092095	CJD_2625	CJD_2626		lepA	FALSE	0.002	259.000	0.000	0.017	N	NA
6092095	6092096	CJD_2626	CJD_2627	lepA		TRUE	0.520	121.000	0.002	NA		NA
6092096	6092097	CJD_2627	CJD_2628			TRUE	0.769	55.000	0.038	NA		NA
6092097	6092098	CJD_2628	CJD_2629		gpr	TRUE	0.863	149.000	0.521	NA		NA
6092100	6092101	CJD_3025	CJD_3024		rpsJ	FALSE	0.005	696.000	0.000	NA		NA
6092101	6092102	CJD_3024	CJD_3023	rpsJ	rplC	TRUE	0.974	83.000	0.467	0.013	Y	NA
6092102	6092103	CJD_3023	CJD_3022	rplC	rplD	TRUE	0.990	25.000	0.544	0.010	Y	NA
6092103	6092104	CJD_3022	CJD_3021	rplD	rplW	TRUE	0.994	0.000	0.307	0.010	Y	NA
6092104	6092105	CJD_3021	CJD_3020	rplW	rplB	TRUE	0.981	55.000	0.849	0.013	Y	NA
6092105	6092106	CJD_3020	CJD_3019	rplB	rpsS	TRUE	0.978	71.000	0.820	0.013	Y	NA
6092106	6092107	CJD_3019	CJD_3018	rpsS	rplV	TRUE	0.989	28.000	0.769	0.013	Y	NA
6092107	6092108	CJD_3018	CJD_3017	rplV	rpsC	TRUE	0.993	21.000	0.719	0.013	Y	NA
6092108	6092109	CJD_3017	CJD_3016	rpsC	rplP	TRUE	0.988	31.000	0.828	0.013	Y	NA
6092109	6092110	CJD_3016	CJD_3015	rplP	rpmC	TRUE	0.996	0.000	0.802	0.010	Y	NA
6092110	6092111	CJD_3015	CJD_3014	rpmC	rpsQ	TRUE	0.992	22.000	0.828	0.010	Y	NA
6092111	6092112	CJD_3014	CJD_3013	rpsQ	rplN	TRUE	0.988	31.000	0.791	0.013	Y	NA
6092112	6092113	CJD_3013	CJD_3012	rplN	rplX	TRUE	0.979	24.000	0.071	0.013	Y	NA
6092113	6092114	CJD_3012	CJD_3011	rplX	rplE	TRUE	0.977	23.000	0.057	0.010	Y	NA
6092114	6092115	CJD_3011	CJD_3010	rplE	rpsN	TRUE	0.994	17.000	0.496	0.010	Y	NA
6092115	6092116	CJD_3010	CJD_3009	rpsN	rpsH	TRUE	0.984	34.000	0.473	0.010	Y	NA
6092116	6092117	CJD_3009	CJD_3008	rpsH	rplF	TRUE	0.976	97.000	0.808	0.010	Y	NA
6092117	6092118	CJD_3008	CJD_3007	rplF	rplR	TRUE	0.988	31.000	0.815	0.010	Y	NA
6092118	6092119	CJD_3007	CJD_3006	rplR	rpsE	TRUE	0.993	21.000	0.814	0.013	Y	NA
6092119	6092120	CJD_3006	CJD_3005	rpsE	rpmD	TRUE	0.995	12.000	0.789	0.013	Y	NA
6092120	6092121	CJD_3005	CJD_3004	rpmD	rplO	TRUE	0.985	34.000	0.653	0.002	Y	NA
6092121	6092122	CJD_3004	CJD_3003	rplO	secY	TRUE	0.981	3.000	0.730	1.000	N	NA
6092122	6092123	CJD_3003	CJD_3002	secY	adk	TRUE	0.937	27.000	0.241	1.000	N	NA
6092123	6092124	CJD_3002	CJD_3001	adk	map	TRUE	0.973	0.000	0.290	1.000	N	NA
6092124	6092125	CJD_3001	CJD_3000	map		TRUE	0.870	89.000	0.185	NA		NA
6092125	6092126	CJD_3000	CJD_2999		infA	TRUE	0.962	8.000	0.090	NA		NA
6092126	6092127	CJD_2999	CJD_2998	infA	rpmJ	TRUE	0.973	13.000	0.257	1.000		NA
6092127	6092128	CJD_2998	CJD_2997	rpmJ	rpsM	FALSE	0.478	237.000	0.194	0.010		NA
6092128	6092129	CJD_2997	CJD_2996	rpsM	rpsK	TRUE	0.995	17.000	0.810	0.010	Y	NA
6092129	6092130	CJD_2996	CJD_2995	rpsK	rpsD	TRUE	0.990	24.000	0.509	0.013	Y	NA
6092130	6092131	CJD_2995	CJD_2994	rpsD	rpoA	TRUE	0.895	85.000	0.549	1.000	N	NA
6092131	6092132	CJD_2994	CJD_2993	rpoA	rplQ	TRUE	0.977	17.000	0.873	1.000	N	NA
6092132	6092133	CJD_2993	CJD_2992	rplQ		FALSE	0.099	422.000	0.074	1.000	N	NA
6092133	6092134	CJD_2992	CJD_2991			TRUE	0.995	-15.000	0.713	0.011	Y	NA
6092134	6092135	CJD_2991	CJD_2990			TRUE	0.995	16.000	0.304	1.000	Y	NA
6092137	6092138	CJD_2005	CJD_2004			TRUE	0.606	-22.000	0.000	NA		NA
6092138	6092139	CJD_2004	CJD_2003		fnt	FALSE	0.089	208.000	0.000	NA		NA
6092139	6092140	CJD_2003	CJD_2002	fnt		FALSE	0.075	219.000	0.000	NA		NA
6092140	6092141	CJD_2002	CJD_2001			FALSE	0.363	34.000	0.000	NA		NA
6092141	6092142	CJD_2001	CJD_2000			FALSE	0.056	238.000	0.000	NA		NA
6092142	6092143	CJD_2000	CJD_1999		asrB	TRUE	0.977	-7.000	0.750	0.017		NA
6092143	6092144	CJD_1999	CJD_1998	asrB	arsC	TRUE	0.995	14.000	0.720	0.017	Y	NA
6092144	6092145	CJD_1998	CJD_1997	arsC	hemA	FALSE	0.004	416.000	0.000	1.000	N	NA
6092145	6092146	CJD_1997	CJD_1996	hemA		TRUE	0.983	-36.000	0.018	1.000	Y	NA
6092146	6092147	CJD_1996	CJD_1995		hemC	TRUE	0.923	58.000	0.009	1.000	Y	NA
6092147	6092148	CJD_1995	CJD_1994	hemC	hemD	TRUE	0.987	9.000	0.031	1.000	Y	NA
6092148	6092149	CJD_1994	CJD_1993	hemD	hemB	TRUE	0.951	57.000	0.044	1.000	Y	NA
6092149	6092150	CJD_1993	CJD_1992	hemB	hemL	TRUE	0.915	65.000	0.026	0.001	Y	NA
6092150	6092151	CJD_1992	CJD_1991	hemL		FALSE	0.039	201.000	0.000	1.000	N	NA
6092152	6092153	CJD_1990	CJD_1989	cls		FALSE	0.251	80.000	0.000	NA		NA
6092154	6092155	CJD_A0205	CJD_A0206			FALSE	0.264	62.000	0.000	NA		NA
6092155	6092156	CJD_A0206	CJD_A0207			FALSE	0.100	199.000	0.000	NA		NA
6092156	6092157	CJD_A0207	CJD_A0208			FALSE	0.066	228.000	0.000	NA		NA
6092157	6092158	CJD_A0208	CJD_A0209			TRUE	0.624	-7.000	0.000	NA		NA
6092158	6092159	CJD_A0209	CJD_A0210			TRUE	0.624	-7.000	0.000	NA		NA
6092159	6092160	CJD_A0210	CJD_A0211			FALSE	0.008	478.000	0.000	NA		NA
6092160	6092161	CJD_A0211	CJD_A0212			FALSE	0.101	198.000	0.000	NA		NA
6092161	6092162	CJD_A0212	CJD_A0213			FALSE	0.006	555.000	0.000	NA		NA
6092162	6092163	CJD_A0213	CJD_A0214			TRUE	0.511	21.000	0.000	NA		NA
6092163	6092164	CJD_A0214	CJD_A0215			FALSE	0.187	138.000	0.000	NA		NA
6092164	6092165	CJD_A0215	CJD_A0216			TRUE	0.641	5.000	0.000	NA		NA
6092165	6092166	CJD_A0216	CJD_A0217			TRUE	0.599	16.000	0.000	NA		NA
6092166	6092167	CJD_A0217	CJD_A0218			FALSE	0.330	40.000	0.000	NA		NA
6092167	6092168	CJD_A0218	CJD_A0219			TRUE	0.643	3.000	0.000	NA		NA
6092168	6092169	CJD_A0219	CJD_A0220			TRUE	0.643	3.000	0.000	NA		NA
6092170	6092171	CJD_3052	CJD_A0636			FALSE	0.354	35.000	0.000	NA		NA
6092171	6092172	CJD_A0636	CJD_3050			FALSE	0.256	67.000	0.000	NA		NA
6092172	6092173	CJD_3050	CJD_3049			TRUE	0.629	12.000	0.000	NA		NA
6092173	6092174	CJD_3049	CJD_3048			FALSE	0.012	389.000	0.000	NA		NA
6092175	6092176	CJD_3047	CJD_3046		radA	FALSE	0.003	780.000	0.000	1.000		NA
6092176	6092177	CJD_3046	CJD_3045	radA		TRUE	0.946	20.000	0.126	1.000		NA
6092179	6092180	CJD_3043	CJD_3042		ispD	TRUE	0.617	14.000	0.000	NA		NA
6092180	6092181	CJD_3042	CJD_3041	ispD	proS	FALSE	0.006	354.000	0.000	1.000	N	NA
6092181	6092182	CJD_3041	CJD_3040	proS	cysS	TRUE	0.883	105.000	0.005	0.024	Y	NA
6092182	6092183	CJD_3040	CJD_3039	cysS		TRUE	0.534	228.000	0.129	1.000		NA
6092183	6092184	CJD_3039	CJD_3038		thyX	TRUE	0.935	16.000	0.055	1.000		NA
6092184	6092185	CJD_3038	CJD_3037	thyX		TRUE	0.853	23.000	0.032	1.000	N	NA
6092185	6092186	CJD_3037	CJD_3036			TRUE	0.960	16.000	0.109	NA		NA
6092186	6092187	CJD_3036	CJD_3035		sigH	FALSE	0.250	82.000	0.000	NA		NA
6092188	6092189	CJD_1817	CJD_1818			FALSE	0.011	351.000	0.000	1.000		NA
6092189	6092190	CJD_1818	CJD_1819			FALSE	0.029	292.000	0.000	NA		NA
6092190	6092191	CJD_1819	CJD_1820			FALSE	0.235	109.000	0.000	NA		NA
6092192	6092193	CJD_1821	CJD_1822	cax		FALSE	0.006	581.000	0.000	NA		NA
6092193	6092194	CJD_1822	CJD_1823			FALSE	0.255	69.000	0.000	NA		NA
6092194	6092195	CJD_1823	CJD_1824			FALSE	0.187	138.000	0.000	NA		NA
6092195	6092196	CJD_1824	CJD_1825			FALSE	0.099	200.000	0.000	NA		NA
6092196	6092197	CJD_1825	CJD_1826			FALSE	0.363	34.000	0.000	NA		NA
6092197	6092198	CJD_1826	CJD_1827			FALSE	0.037	270.000	0.000	NA		NA
6092198	6092199	CJD_1827	CJD_1828			FALSE	0.094	204.000	0.000	NA		NA
6092201	6092202	CJD_1830	CJD_1831	map		FALSE	0.017	348.000	0.000	NA		NA
6092204	6092205	CJD_1833	CJD_1834			FALSE	0.014	365.000	0.000	NA		NA
6092206	6092207	CJD_2496	CJD_2495			FALSE	0.257	66.000	0.000	NA		NA
6092208	6092209	CJD_2494	CJD_2493			FALSE	0.224	116.000	0.000	NA		NA
6092211	6092212	CJD_2491	CJD_2490			FALSE	0.396	0.000	0.000	1.000	N	NA
6092213	6092214	CJD_2489	CJD_2488	dapB	dapA	TRUE	0.932	73.000	0.022	1.000	Y	NA
6092214	6092215	CJD_2488	CJD_2487	dapA	asd	TRUE	0.974	25.000	0.029	1.000	Y	NA
6092216	6092217	CJD_2486	CJD_2485			TRUE	0.794	52.000	0.056	1.000		NA
6092217	6092218	CJD_2485	CJD_2484			TRUE	0.940	16.000	0.063	1.000		NA
6092218	6092219	CJD_2484	CJD_2483			FALSE	0.268	60.000	0.000	NA		NA
6092219	6092220	CJD_2483	CJD_2482			TRUE	0.641	5.000	0.000	NA		NA
6092220	6092221	CJD_2482	CJD_2481			TRUE	0.643	4.000	0.000	NA		NA
6092221	6092222	CJD_2481	CJD_2480			TRUE	0.639	6.000	0.000	NA		NA
6092224	6092225	CJD_2478	CJD_2477			FALSE	0.146	165.000	0.000	NA		NA
6092226	6092227	CJD_2476	CJD_2475			FALSE	0.044	255.000	0.000	NA		NA
6092232	6092233	CJD_A0424	CJD_A0425			FALSE	0.187	138.000	0.000	NA		NA
6092233	6092234	CJD_A0425	CJD_A0426			FALSE	0.085	0.000	0.000	0.006		NA
6092234	6092235	CJD_A0426	CJD_A0427			FALSE	0.004	1485.000	0.000	NA		NA
6092235	6092236	CJD_A0427	CJD_A0428			FALSE	0.163	152.000	0.000	NA		NA
6092236	6092237	CJD_A0428	CJD_A0429			TRUE	0.643	4.000	0.000	NA		NA
6092237	6092238	CJD_A0429	CJD_A0430			FALSE	0.005	645.000	0.000	NA		NA
6092239	6092240	CJD_A0431	CJD_A0432			TRUE	0.629	12.000	0.000	NA		NA
6092240	6092241	CJD_A0432	CJD_A0433			FALSE	0.258	65.000	0.000	NA		NA
6092241	6092242	CJD_A0433	CJD_A0434			FALSE	0.191	69.000	0.000	1.000		NA
6092244	6092245	CJD_A0436	CJD_A0437			FALSE	0.024	309.000	0.000	NA		NA
6092246	6092247	CJD_A0280	CJD_A0284	rrl	rrs	FALSE	0.116	186.000	0.000	NA		NA
6092247	6092248	CJD_A0284	CJD_A0286	rrs		FALSE	0.006	554.000	0.000	NA		NA
6092248	6092249	CJD_A0286	CJD_A0287			FALSE	0.110	190.000	0.000	NA		NA
6092250	6092251	CJD_A0288	CJD_A0289			FALSE	0.217	119.000	0.000	NA		NA
6092252	6092253	CJD_A0290	CJD_A0291			FALSE	0.182	141.000	0.000	NA		NA
6092253	6092254	CJD_A0291	CJD_A0292		rrf	TRUE	0.641	5.000	0.000	NA		NA
6092254	6092255	CJD_A0292	CJD_A0293	rrf	rrl	FALSE	0.282	53.000	0.000	NA		NA
6092255	6092256	CJD_A0293	CJD_A0297	rrl	rrs	FALSE	0.116	186.000	0.000	NA		NA
6092257	6092258	CJD_0010	CJD_0008	rrl	rrs	FALSE	0.116	186.000	0.000	NA		NA
6092258	6092259	CJD_0008	CJD_0042	rrs	gyrA	FALSE	0.007	545.000	0.000	NA		NA
6092259	6092260	CJD_0042	CJD_0043	gyrA	gyrB	TRUE	0.989	22.000	0.306	0.002	Y	NA
6092260	6092261	CJD_0043	CJD_0044	gyrB		FALSE	0.277	237.000	0.017	NA		NA
6092261	6092262	CJD_0044	CJD_0045			TRUE	0.920	14.000	0.024	NA		NA
6092262	6092263	CJD_0045	CJD_0046		yaaA	TRUE	0.613	56.000	0.006	1.000		NA
6092263	6092264	CJD_0046	CJD_0047	yaaA	dnaN	TRUE	0.519	126.000	0.006	1.000		NA
6092264	6092265	CJD_0047	CJD_0048	dnaN	dnaA	TRUE	0.777	295.000	0.328	1.000	Y	NA
6092266	6092267	CJD_A0299	CJD_A0303	rrl	rrs	FALSE	0.116	186.000	0.000	NA		NA
6092271	6092272	CJD_A0308	CJD_A0309			FALSE	0.228	114.000	0.000	NA		NA
6092272	6092273	CJD_A0309	CJD_A0310		rrf	TRUE	0.641	5.000	0.000	NA		NA
6092273	6092274	CJD_A0310	CJD_A0311	rrf	rrl	FALSE	0.285	52.000	0.000	NA		NA
6092275	6092276	CJD_A0315	CJD_A0319	rrl	rrs	FALSE	0.116	186.000	0.000	NA		NA
6092276	6092277	CJD_A0319	CJD_A0321	rrs		FALSE	0.006	563.000	0.000	NA		NA
6092280	6092281	CJD_A0324	CJD_A0325			TRUE	0.618	-10.000	0.000	NA		NA
6092281	6092282	CJD_A0325	CJD_A0326			FALSE	0.258	65.000	0.000	NA		NA
6092282	6092283	CJD_A0326	CJD_A0327			FALSE	0.191	69.000	0.000	1.000		NA
6092285	6092286	CJD_1780	CJD_1781			FALSE	0.497	22.000	0.000	NA		NA
6092286	6092287	CJD_1781	CJD_1782		spoVR	TRUE	0.692	52.000	0.014	NA		NA
6092287	6092288	CJD_1782	CJD_1783	spoVR	yhbH	TRUE	0.964	27.000	0.761	NA		NA
6092288	6092289	CJD_1783	CJD_1784	yhbH	prkA	FALSE	0.133	174.000	0.000	NA		NA
6092289	6092290	CJD_1784	CJD_1785	prkA	recQ	FALSE	0.242	90.000	0.000	NA		NA
6092290	6092291	CJD_1785	CJD_1786	recQ	thiE	FALSE	0.025	230.000	0.000	1.000	N	NA
6092291	6092292	CJD_1786	CJD_1787	thiE	thiM	TRUE	0.976	-7.000	0.010	0.003	Y	NA
6092292	6092293	CJD_1787	CJD_1788	thiM	thiD	TRUE	0.984	12.000	0.039	0.003	Y	NA
6092296	6092297	CJD_A0606	CJD_A0607			FALSE	0.203	128.000	0.000	NA		NA
6092297	6092298	CJD_A0607	CJD_A0608			TRUE	0.642	2.000	0.000	NA		NA
6092298	6092299	CJD_A0608	CJD_A0609			TRUE	0.919	59.000	0.500	NA		NA
6092299	6092300	CJD_A0609	CJD_A0610			TRUE	0.984	5.000	0.667	NA		NA
6092300	6092301	CJD_A0610	CJD_A0611			TRUE	0.980	3.000	0.333	NA		NA
6092301	6092302	CJD_A0611	CJD_A0612			TRUE	0.924	83.000	1.000	NA		NA
6092302	6092303	CJD_A0612	CJD_A0613			TRUE	0.983	15.000	1.000	NA		NA
6092303	6092304	CJD_A0613	CJD_A0614			TRUE	0.985	2.000	1.000	NA		NA
6092304	6092305	CJD_A0614	CJD_A0615			TRUE	0.909	63.000	0.400	NA		NA
6092305	6092306	CJD_A0615	CJD_A0616			FALSE	0.497	22.000	0.000	NA		NA
6092306	6092307	CJD_A0616	CJD_A0617			FALSE	0.336	39.000	0.000	NA		NA
6092307	6092308	CJD_A0617	CJD_A0618			FALSE	0.027	295.000	0.000	NA		NA
6092308	6092309	CJD_A0618	CJD_A0619			TRUE	0.615	-12.000	0.000	NA		NA
6092314	6092315	CJD_0929	CJD_0930			FALSE	0.004	426.000	0.000	1.000	N	NA
6092318	6092319	CJD_2121	CJD_2122			FALSE	0.025	302.000	0.000	NA		NA
6092320	6092321	CJD_2123	CJD_2124			FALSE	0.401	5.000	0.000	1.000	N	NA
6092322	6092323	CJD_2125	CJD_2126			FALSE	0.268	60.000	0.000	NA		NA
6092323	6092324	CJD_2126	CJD_2127			TRUE	0.971	21.000	0.556	NA		NA
6092324	6092325	CJD_2127	CJD_2128			FALSE	0.250	82.000	0.000	NA		NA
6092325	6092326	CJD_2128	CJD_2129			TRUE	0.584	17.000	0.000	NA		NA
6092326	6092327	CJD_2129	CJD_2130			FALSE	0.163	152.000	0.000	NA		NA
6092327	6092328	CJD_2130	CJD_2131		cax	FALSE	0.021	318.000	0.000	NA		NA
6092328	6092329	CJD_2131	CJD_2132	cax	dinB	FALSE	0.199	130.000	0.000	NA		NA
6092331	6092332	CJD_0161	CJD_0162			FALSE	0.189	137.000	0.000	NA		NA
6092332	6092333	CJD_0162	CJD_0163			FALSE	0.241	91.000	0.000	NA		NA
6092333	6092334	CJD_0163	CJD_0164			TRUE	0.833	191.000	0.024	1.000	Y	NA
6092334	6092335	CJD_0164	CJD_0165			TRUE	0.952	40.000	0.022	1.000	Y	NA
6092335	6092336	CJD_0165	CJD_0166		rbr	TRUE	0.851	174.000	0.042	0.002	Y	NA
6092336	6092337	CJD_0166	CJD_0167	rbr		TRUE	0.930	122.000	0.072	0.002	Y	NA
6092337	6092338	CJD_0167	CJD_0168			TRUE	0.940	0.000	0.048	1.000		NA
6092344	6092345	CJD_0469	CJD_0468			TRUE	0.538	-6.000	0.000	1.000		NA
6092345	6092346	CJD_0468	CJD_0467			TRUE	0.545	10.000	0.000	1.000		NA
6092346	6092347	CJD_0467	CJD_0466			TRUE	0.970	14.000	0.167	NA		NA
6092347	6092348	CJD_0466	CJD_0465			TRUE	0.985	2.000	0.857	NA		NA
6092348	6092349	CJD_0465	CJD_0464			FALSE	0.446	26.000	0.000	NA		NA
6092350	6092351	CJD_1560	CJD_1559			FALSE	0.207	126.000	0.000	NA		NA
6092351	6092352	CJD_1559	CJD_1558			FALSE	0.255	69.000	0.000	NA		NA
6092352	6092353	CJD_1558	CJD_1557			TRUE	0.624	-7.000	0.000	NA		NA
6092353	6092354	CJD_1557	CJD_1556			TRUE	0.981	-7.000	0.500	NA		NA
6092354	6092355	CJD_1556	CJD_1555			TRUE	0.983	5.000	0.577	NA		NA
6092355	6092356	CJD_1555	CJD_1554			TRUE	0.966	4.000	0.105	NA		NA
6092357	6092358	CJD_1553	CJD_1552			FALSE	0.142	168.000	0.000	NA		NA
6092359	6092360	CJD_2268	CJD_2269		ispG	FALSE	0.252	78.000	0.000	NA		NA
6092360	6092361	CJD_2269	CJD_2270	ispG		TRUE	0.929	20.000	0.092	1.000	N	NA
6092361	6092362	CJD_2270	CJD_2271		dxr	TRUE	0.978	12.000	0.568	1.000	N	NA
6092362	6092363	CJD_2271	CJD_2272	dxr	cdsA	FALSE	0.438	359.000	0.044	1.000	Y	NA
6092363	6092364	CJD_2272	CJD_2273	cdsA	uppS	TRUE	0.987	18.000	0.055	1.000	Y	NA
6092364	6092365	CJD_2273	CJD_2274	uppS	frr	TRUE	0.892	65.000	0.409	1.000	N	NA
6092365	6092366	CJD_2274	CJD_2275	frr	pyrH	TRUE	0.978	14.000	0.626	1.000	N	NA
6092366	6092367	CJD_2275	CJD_2276	pyrH	tsf	FALSE	0.241	93.000	0.000	NA		NA
6092369	6092370	CJD_2008	CJD_2009			FALSE	0.069	17.000	0.000	0.016		NA
6092370	6092371	CJD_2009	CJD_2010			FALSE	0.026	298.000	0.000	NA		NA
6092371	6092372	CJD_2010	CJD_2011			FALSE	0.252	79.000	0.000	NA		NA
6092372	6092373	CJD_2011	CJD_2012			TRUE	0.599	16.000	0.000	NA		NA
6092373	6092374	CJD_2012	CJD_2013			FALSE	0.230	113.000	0.000	NA		NA
6092374	6092375	CJD_2013	CJD_2014		pepF	TRUE	0.898	18.000	0.028	1.000		NA
6092375	6092376	CJD_2014	CJD_2015	pepF		TRUE	0.929	21.000	0.070	NA		NA
6092378	6092379	CJD_3034	CJD_3033	rplL	rpoB	FALSE	0.025	305.000	0.000	NA		NA
6092379	6092380	CJD_3033	CJD_3032	rpoB	rpoC	TRUE	0.977	80.000	0.851	0.001	Y	NA
6092380	6092381	CJD_3032	CJD_3031	rpoC		TRUE	0.780	113.000	0.065	NA		NA
6092381	6092382	CJD_3031	CJD_3030		rpsL	FALSE	0.272	58.000	0.000	NA		NA
6092383	6092384	CJD_1290	CJD_1291			FALSE	0.017	348.000	0.000	NA		NA
6092385	6092386	CJD_1292	CJD_1293			FALSE	0.237	106.000	0.000	NA		NA
6092386	6092387	CJD_1293	CJD_1294			FALSE	0.232	112.000	0.000	NA		NA
6092387	6092388	CJD_1294	CJD_1295			TRUE	0.617	14.000	0.000	NA		NA
6092390	6092391	CJD_1297	CJD_1298			FALSE	0.020	325.000	0.000	NA		NA
6092393	6092394	CJD_0798	CJD_0797		tyrS	FALSE	0.010	419.000	0.000	NA		NA
6092394	6092395	CJD_0797	CJD_0796	tyrS		FALSE	0.027	295.000	0.000	NA		NA
6092395	6092396	CJD_0796	CJD_0795			TRUE	0.796	76.000	0.062	NA		NA
6092396	6092397	CJD_0795	CJD_0794			FALSE	0.105	195.000	0.000	NA		NA
6092397	6092398	CJD_0794	CJD_0793			TRUE	0.974	-25.000	1.000	0.002		NA
6092400	6092401	CJD_A0652	CJD_A0653			FALSE	0.103	196.000	0.000	NA		NA
6092401	6092402	CJD_A0653	CJD_A0654			FALSE	0.056	238.000	0.000	NA		NA
6092402	6092403	CJD_A0654	CJD_A0655			TRUE	0.526	20.000	0.000	NA		NA
6092403	6092404	CJD_A0655	CJD_A0656			FALSE	0.027	297.000	0.000	NA		NA
6092404	6092405	CJD_A0656	CJD_A0657			FALSE	0.224	116.000	0.000	NA		NA
6092405	6092406	CJD_A0657	CJD_A0658			TRUE	0.636	0.000	0.000	NA		NA
6092406	6092407	CJD_A0658	CJD_A0659			FALSE	0.363	34.000	0.000	NA		NA
6092407	6092408	CJD_A0659	CJD_A0660			FALSE	0.236	108.000	0.000	NA		NA
6092408	6092409	CJD_A0660	CJD_A0661			FALSE	0.497	22.000	0.000	NA		NA
6092409	6092410	CJD_A0661	CJD_A0662			TRUE	0.624	-7.000	0.000	NA		NA
6092410	6092411	CJD_A0662	CJD_A0663			TRUE	0.624	-7.000	0.000	NA		NA
6092411	6092412	CJD_A0663	CJD_A0664			FALSE	0.241	44.000	0.000	1.000		NA
6092412	6092413	CJD_A0664	CJD_A0665			FALSE	0.330	40.000	0.000	NA		NA
6092414	6092415	CJD_A0582	CJD_A0583			TRUE	0.643	3.000	0.000	NA		NA
6092415	6092416	CJD_A0583	CJD_A0584			TRUE	0.643	3.000	0.000	NA		NA
6092416	6092417	CJD_A0584	CJD_A0585			FALSE	0.330	40.000	0.000	NA		NA
6092417	6092418	CJD_A0585	CJD_A0586			TRUE	0.599	16.000	0.000	NA		NA
6092418	6092419	CJD_A0586	CJD_A0587			TRUE	0.641	5.000	0.000	NA		NA
6092419	6092420	CJD_A0587	CJD_A0588			TRUE	0.511	21.000	0.000	NA		NA
6092421	6092422	CJD_A0060	CJD_A0061			FALSE	0.252	78.000	0.000	NA		NA
6092422	6092423	CJD_A0061	CJD_A0062			FALSE	0.054	240.000	0.000	NA		NA
6092423	6092424	CJD_A0062	CJD_A0063			FALSE	0.251	81.000	0.000	NA		NA
6092426	6092427	CJD_A0065	CJD_A0066			TRUE	0.961	26.000	0.500	NA		NA
6092427	6092428	CJD_A0066	CJD_A0067			FALSE	0.124	181.000	0.000	NA		NA
6092429	6092430	CJD_2846	CJD_2847			TRUE	0.643	4.000	0.000	NA		NA
6092430	6092431	CJD_2847	CJD_2848		rrs	FALSE	0.153	160.000	0.000	NA		NA
6092431	6092432	CJD_2848	CJD_2849	rrs		FALSE	0.008	477.000	0.000	NA		NA
6092432	6092433	CJD_2849	CJD_2850			TRUE	0.995	-13.000	0.758	0.001	Y	NA
6092434	6092435	CJD_2851	CJD_2852			TRUE	0.610	-16.000	0.000	NA		NA
6092436	6092437	CJD_2853	CJD_2854	pepD		FALSE	0.122	182.000	0.000	NA		NA
6092437	6092438	CJD_2854	CJD_2855			FALSE	0.293	50.000	0.000	NA		NA
6092438	6092439	CJD_2855	CJD_2856			TRUE	0.643	4.000	0.000	NA		NA
6092439	6092440	CJD_2856	CJD_2857			FALSE	0.483	23.000	0.000	NA		NA
6092440	6092441	CJD_2857	CJD_2858			TRUE	0.636	9.000	0.000	NA		NA
6092441	6092442	CJD_2858	CJD_2859			TRUE	0.639	6.000	0.000	NA		NA
6092444	6092445	CJD_A0625	CJD_A0626			FALSE	0.255	69.000	0.000	NA		NA
6092445	6092446	CJD_A0626	CJD_A0627			FALSE	0.330	40.000	0.000	NA		NA
6092447	6092448	CJD_A0628	CJD_A0629			FALSE	0.062	235.000	0.000	NA		NA
6092451	6092452	CJD_A0196	CJD_A0197			FALSE	0.199	130.000	0.000	NA		NA
6092453	6092454	CJD_A0198	CJD_A0199			FALSE	0.025	306.000	0.000	NA		NA
6092454	6092455	CJD_A0199	CJD_A0200			TRUE	0.623	13.000	0.000	NA		NA
6092455	6092456	CJD_A0200	CJD_A0201			FALSE	0.240	96.000	0.000	NA		NA
6092457	6092458	CJD_A0202	CJD_A0203			FALSE	0.122	182.000	0.000	NA		NA
6092458	6092459	CJD_A0203	CJD_A0204			TRUE	0.636	9.000	0.000	NA		NA
6092460	6092461	CJD_A0004	CJD_A0005			FALSE	0.099	200.000	0.000	NA		NA
6092461	6092462	CJD_A0005	CJD_A0006			FALSE	0.119	185.000	0.000	NA		NA
6092462	6092463	CJD_A0006	CJD_A0007			TRUE	0.636	0.000	0.000	NA		NA
6092463	6092464	CJD_A0007	CJD_A0008			TRUE	0.640	1.000	0.000	NA		NA
6092464	6092465	CJD_A0008	CJD_A0009			FALSE	0.224	116.000	0.000	NA		NA
6092466	6092467	CJD_A0028	CJD_A0029			FALSE	0.005	701.000	0.000	NA		NA
6092467	6092468	CJD_A0029	CJD_A0030			TRUE	0.542	200.000	0.000	0.008	Y	NA
6092468	6092469	CJD_A0030	CJD_A0031			FALSE	0.497	22.000	0.000	NA		NA
6092469	6092470	CJD_A0031	CJD_A0032			TRUE	0.638	7.000	0.000	NA		NA
6092470	6092471	CJD_A0032	CJD_A0033			TRUE	0.643	3.000	0.000	NA		NA
6092473	6092474	CJD_0922	CJD_0921			FALSE	0.047	250.000	0.000	NA		NA
6092475	6092476	CJD_0920	CJD_0919			FALSE	0.431	27.000	0.000	NA		NA
6092478	6092479	CJD_0003	CJD_0004		recF	FALSE	0.254	70.000	0.000	NA		NA
6092479	6092480	CJD_0004	CJD_0005	recF		FALSE	0.173	93.000	0.000	NA	N	NA
6092481	6092482	CJD_1645	CJD_1647			FALSE	0.112	188.000	0.000	NA		NA
6092482	6092483	CJD_1647	CJD_1648			TRUE	0.643	4.000	0.000	NA		NA
6092483	6092484	CJD_1648	CJD_1649			FALSE	0.142	168.000	0.000	NA		NA
6092484	6092485	CJD_1649	CJD_1650			FALSE	0.109	191.000	0.000	NA		NA
6092486	6092487	CJD_A0637	CJD_A0638			TRUE	0.629	12.000	0.000	NA		NA
6092487	6092488	CJD_A0638	CJD_A0639			FALSE	0.012	389.000	0.000	NA		NA
6092490	6092491	CJD_A0103	CJD_A0104			FALSE	0.004	745.000	0.000	NA		NA
6092491	6092492	CJD_A0104	CJD_A0105			FALSE	0.024	309.000	0.000	NA		NA
6092492	6092493	CJD_A0105	CJD_A0106			TRUE	0.623	13.000	0.000	NA		NA
6092493	6092494	CJD_A0106	CJD_A0107			FALSE	0.240	98.000	0.000	NA		NA
6092494	6092495	CJD_A0107	CJD_A0108			FALSE	0.255	69.000	0.000	NA		NA
6092497	6092498	CJD_A0096	CJD_A0097			FALSE	0.004	1225.000	0.000	NA		NA
6092498	6092499	CJD_A0097	CJD_A0098			TRUE	0.642	2.000	0.000	NA		NA
6092499	6092500	CJD_A0098	CJD_A0099			FALSE	0.354	35.000	0.000	NA		NA
6092500	6092501	CJD_A0099	CJD_A0100			FALSE	0.124	181.000	0.000	NA		NA
6092502	6092503	CJD_A0596	CJD_A0597			FALSE	0.255	69.000	0.000	NA		NA
6092503	6092504	CJD_A0597	CJD_A0598			FALSE	0.258	65.000	0.000	NA		NA
6092504	6092505	CJD_A0598	CJD_A0599			TRUE	0.629	12.000	0.000	NA		NA
6092507	6092508	CJD_A0114	CJD_A0115			FALSE	0.197	131.000	0.000	NA		NA
6092508	6092509	CJD_A0115	CJD_A0116			FALSE	0.021	318.000	0.000	NA		NA
6092509	6092510	CJD_A0116	CJD_A0117			FALSE	0.042	258.000	0.000	NA		NA
6092510	6092511	CJD_A0117	CJD_A0118			TRUE	0.636	0.000	0.000	NA		NA
6092512	6092513	CJD_A0083	CJD_A0084			FALSE	0.390	31.000	0.000	NA		NA
6092513	6092514	CJD_A0084	CJD_A0085			FALSE	0.274	57.000	0.000	NA		NA
6092514	6092515	CJD_A0085	CJD_A0086			FALSE	0.163	152.000	0.000	NA		NA
6092515	6092516	CJD_A0086	CJD_A0087			TRUE	0.618	-10.000	0.000	NA		NA
6092516	6092517	CJD_A0087	CJD_A0088			FALSE	0.114	187.000	0.000	NA		NA
6092518	6092519	CJD_1457	CJD_1458			FALSE	0.075	219.000	0.000	NA		NA
6092519	6092520	CJD_1458	CJD_1459			FALSE	0.059	212.000	0.000	1.000		NA
6092521	6092522	CJD_A0038	CJD_A0039			FALSE	0.124	181.000	0.000	NA		NA
6092522	6092523	CJD_A0039	CJD_A0040			FALSE	0.004	1129.000	0.000	NA		NA
6092523	6092524	CJD_A0040	CJD_A0041			FALSE	0.021	320.000	0.000	NA		NA
6092529	6092530	CJD_A0011	CJD_A0012			FALSE	0.021	320.000	0.000	NA		NA
6092530	6092531	CJD_A0012	CJD_A0013			TRUE	0.599	16.000	0.000	NA		NA
6092531	6092532	CJD_A0013	CJD_A0014			FALSE	0.004	1936.000	0.000	NA		NA
6092533	6092534	CJD_1774	CJD_1775			TRUE	0.617	14.000	0.000	NA		NA
6092534	6092535	CJD_1775	CJD_1776			TRUE	0.988	12.000	0.039	1.000	Y	NA
6092536	6092537	CJD_1777	CJD_1778			FALSE	0.253	73.000	0.000	NA		NA
6092538	6092539	CJD_3234	CJD_3233	msrA	maa	FALSE	0.285	52.000	0.000	NA		NA
6092542	6092543	CJD_A0147	CJD_A0148			FALSE	0.372	33.000	0.000	NA		NA
6092543	6092544	CJD_A0148	CJD_A0149			FALSE	0.390	31.000	0.000	NA		NA
6092544	6092545	CJD_A0149	CJD_A0150			FALSE	0.339	38.000	0.000	NA		NA
6092545	6092546	CJD_A0150	CJD_A0151			FALSE	0.241	44.000	0.000	1.000		NA
6092546	6092547	CJD_A0151	CJD_A0152			FALSE	0.026	40.000	0.000	0.016		NA
6092547	6092548	CJD_A0152	CJD_A0153			TRUE	0.643	3.000	0.000	NA		NA
6092548	6092549	CJD_A0153	CJD_A0154			FALSE	0.055	239.000	0.000	NA		NA
6092550	6092551	CJD_A0641	CJD_A0642			TRUE	0.564	18.000	0.000	NA		NA
6092551	6092552	CJD_A0642	CJD_A0643			FALSE	0.348	36.000	0.000	NA		NA
6092552	6092553	CJD_A0643	CJD_A0644			TRUE	0.609	15.000	0.000	NA		NA
6092553	6092554	CJD_A0644	CJD_A0645			FALSE	0.163	152.000	0.000	NA		NA
6092554	6092555	CJD_A0645	CJD_A0647			TRUE	0.601	-31.000	0.000	NA		NA
6092556	6092557	CJD_0006	CJD_3027	gyrB	fusA	TRUE	0.971	73.000	0.400	0.001	Y	NA
6092558	6092559	CJD_1771	CJD_1772	cysE	cysK	TRUE	0.986	19.000	0.101	0.001	Y	NA
6092559	6092560	CJD_1772	CJD_1773	cysK		FALSE	0.018	339.000	0.000	NA		NA
6092562	6092563	CJD_A0648	CJD_A0649			TRUE	0.985	0.000	1.000	NA		NA
6092563	6092564	CJD_A0649	CJD_A0650			FALSE	0.168	149.000	0.000	NA		NA
6092565	6092566	CJD_1300	CJD_1302			FALSE	0.014	373.000	0.000	NA		NA
6092566	6092567	CJD_1302	CJD_1303			FALSE	0.087	210.000	0.000	NA		NA
6092569	6092570	CJD_A0054	CJD_A0055			FALSE	0.410	29.000	0.000	NA		NA
6092572	6092573	CJD_A0674	CJD_A0675			FALSE	0.248	83.000	0.000	NA		NA
6092573	6092574	CJD_A0675	CJD_A0676			FALSE	0.241	94.000	0.000	NA		NA
6092575	6092576	CJD_0672	CJD_0673			FALSE	0.094	204.000	0.000	NA		NA
6092577	6092578	CJD_1205	CJD_1204			FALSE	0.068	227.000	0.000	NA		NA
6092580	6092581	CJD_A0036	CJD_A0037			FALSE	0.006	584.000	0.000	NA		NA
6092582	6092583	CJD_A0593	CJD_A0594			FALSE	0.082	213.000	0.000	NA		NA
6092583	6092584	CJD_A0594	CJD_A0595			FALSE	0.254	71.000	0.000	NA		NA
6092586	6092587	CJD_0933	CJD_0935		ahpC	FALSE	0.017	345.000	0.000	NA		NA
6092588	6092589	CJD_A0620	CJD_A0621			FALSE	0.023	311.000	0.000	NA		NA
6092592	6092593	CJD_A0024	CJD_A0025			FALSE	0.010	426.000	0.000	NA		NA
6092593	6092594	CJD_A0025	CJD_A0026			FALSE	0.024	309.000	0.000	NA		NA
6092597	6092598	CJD_A0139	CJD_A0140			FALSE	0.293	50.000	0.000	NA		NA
6092598	6092599	CJD_A0140	CJD_A0141			TRUE	0.606	-22.000	0.000	NA		NA
6092601	6092602	CJD_A0604	CJD_A0605			FALSE	0.251	81.000	0.000	NA		NA
6092603	6092604	CJD_A0016	CJD_A0018			FALSE	0.166	150.000	0.000	NA		NA
6092605	6092606	CJD_A0051	CJD_A0052			TRUE	0.636	0.000	0.000	NA		NA
6092607	6092608	CJD_A0179	CJD_A0180			FALSE	0.124	181.000	0.000	NA		NA
6092611	6092612	CJD_A0125	CJD_A0126			TRUE	0.615	-12.000	0.000	NA		NA
6092613	6092614	CJD_A0601	CJD_A0602			TRUE	0.643	4.000	0.000	NA		NA
6092615	6092616	CJD_A0129	CJD_A0130			TRUE	0.643	3.000	0.000	NA		NA
6092616	6092617	CJD_A0130	CJD_A0131			TRUE	0.615	-12.000	0.000	NA		NA
6092618	6092619	CJD_A0589	CJD_A0590		soj	FALSE	0.254	71.000	0.000	NA		NA
6092620	6092621	CJD_A0177	CJD_A0178			FALSE	0.010	426.000	0.000	NA		NA
6092641	6092642	CJD_A0127	CJD_A0128			FALSE	0.293	50.000	0.000	NA		NA
6092653	6092654	CJD_A0183	CJD_A0184			TRUE	0.615	-12.000	0.000	NA		NA
6092661	6092662	CJD_A0142	CJD_A0143			TRUE	0.606	-22.000	0.000	NA		NA
6092663	6092664	CJD_A0161	CJD_A0162			TRUE	0.636	0.000	0.000	NA		NA
6092665	6092666	CJD_A0187	CJD_A0188			FALSE	0.250	82.000	0.000	NA		NA
6092670	6092671	CJD_A0134	CJD_A0135			FALSE	0.293	50.000	0.000	NA		NA
6092672	6092673	CJD_3120	CJD_3119			FALSE	0.268	60.000	0.000	NA		NA
6092676	6092677	CJD_A0068	CJD_A0069			FALSE	0.372	33.000	0.000	NA		NA
6092677	6092678	CJD_A0069	CJD_A0070			FALSE	0.224	116.000	0.000	NA		NA
6092690	6092691	CJD_A0175	CJD_A0176			FALSE	0.150	163.000	0.000	NA		NA
6092699	6092700	CJD_A0169	CJD_A0171			TRUE	0.636	0.000	0.000	NA		NA
6092703	6092704	CJD_A0166	CJD_A0167			TRUE	0.636	0.000	0.000	NA		NA
6092712	6092713	CJD_A0094	CJD_A0095			FALSE	0.471	24.000	0.000	NA		NA
6092715	6092716	CJD_A0185	CJD_A0186			TRUE	0.623	13.000	0.000	NA		NA
6092717	6092718	CJD_3029	CJD_3028	rpsL	rpsG	FALSE	0.153	160.000	0.000	NA		NA
6092720	6092721	CJD_A0071	CJD_A0072			TRUE	0.631	-3.000	0.000	NA		NA
6092722	6092723	CJD_A0123	CJD_A0124			FALSE	0.250	82.000	0.000	NA		NA
6092725	6092726	CJD_A0049	CJD_A0050			FALSE	0.250	82.000	0.000	NA		NA