MicrobesOnline Operon Predictions for Streptococcus pneumoniae Taiwan19F-14

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
7473758	7473759	SPT_0001	SPT_0002	dnaA	dnaN	TRUE	0.772	159.000	0.328	1.000	Y	NA
7473759	7473760	SPT_0002	SPT_0003	dnaN		TRUE	0.543	65.000	0.009	NA		NA
7473763	7473764	SPT_0006	SPT_0007			TRUE	0.901	-13.000	0.000	NA		NA
7473764	7473765	SPT_0007	SPT_0008			TRUE	0.494	51.000	0.000	NA		NA
7473765	7473766	SPT_0008	SPT_0009			FALSE	0.054	204.000	0.000	NA		NA
7473766	7473767	SPT_0009	SPT_0010			FALSE	0.183	93.000	0.000	NA		NA
7473767	7473768	SPT_0010	SPT_0011			FALSE	0.020	320.000	0.000	NA		NA
7473768	7473769	SPT_0011	SPT_0012			TRUE	0.891	-31.000	0.000	NA		NA
7473769	7473770	SPT_0012	SPT_0013			TRUE	0.909	-3.000	0.000	NA		NA
7473770	7473771	SPT_0013	SPT_0014			TRUE	0.908	-7.000	0.000	NA		NA
7473771	7473772	SPT_0014	SPT_0015			TRUE	0.896	-19.000	0.000	NA		NA
7473772	7473773	SPT_0015	SPT_0016			FALSE	0.137	114.000	0.000	NA		NA
7473773	7473774	SPT_0016	SPT_0017			TRUE	0.908	-7.000	0.000	NA		NA
7473774	7473775	SPT_0017	SPT_0018			TRUE	0.781	18.000	0.000	NA		NA
7473775	7473776	SPT_0018	SPT_0019			TRUE	0.845	12.000	0.000	NA		NA
7473776	7473777	SPT_0019	SPT_0020			TRUE	0.909	-3.000	0.000	NA		NA
7473777	7473778	SPT_0020	SPT_0021			FALSE	0.015	401.000	0.000	NA		NA
7473778	7473779	SPT_0021	SPT_0022			TRUE	0.879	4.000	0.000	NA		NA
7473779	7473780	SPT_0022	SPT_0023			FALSE	0.084	154.000	0.000	NA		NA
7473780	7473781	SPT_0023	SPT_0024			FALSE	0.040	239.000	0.000	NA		NA
7473781	7473782	SPT_0024	SPT_0025			TRUE	0.845	12.000	0.000	NA		NA
7473782	7473783	SPT_0025	SPT_0026			TRUE	0.733	22.000	0.000	NA		NA
7473786	7473787	SPT_0029	SPT_0030			TRUE	0.765	19.000	0.000	NA		NA
7473787	7473788	SPT_0030	SPT_0031			FALSE	0.101	139.000	0.000	NA		NA
7473790	7473791	SPT_0033	SPT_0034			FALSE	0.013	424.000	0.000	NA		NA
7473791	7473792	SPT_0034	SPT_0035			FALSE	0.027	283.000	0.000	NA		NA
7473792	7473793	SPT_0035	SPT_0036			FALSE	0.149	105.000	0.000	NA		NA
7473793	7473794	SPT_0036	SPT_0037			FALSE	0.012	436.000	0.000	NA		NA
7473794	7473795	SPT_0037	SPT_0038		ychF	FALSE	0.180	120.000	0.000	1.000	N	NA
7473795	7473796	SPT_0038	SPT_0039	ychF	pth	TRUE	0.907	71.000	0.184	1.000	Y	NA
7473796	7473797	SPT_0039	SPT_0040	pth	mfd	TRUE	0.987	1.000	0.137	1.000	N	NA
7473797	7473798	SPT_0040	SPT_0041	mfd		TRUE	0.733	58.000	0.024	1.000	N	NA
7473798	7473799	SPT_0041	SPT_0042			TRUE	0.980	-7.000	0.053	1.000	N	NA
7473799	7473800	SPT_0042	SPT_0043			TRUE	0.939	5.000	0.009	NA		NA
7473800	7473801	SPT_0043	SPT_0044			TRUE	0.982	-7.000	0.105	NA		NA
7473801	7473802	SPT_0044	SPT_0045			TRUE	0.971	-3.000	0.014	NA	N	NA
7473802	7473803	SPT_0045	SPT_0046		hpt	TRUE	0.977	4.000	0.067	0.065	N	NA
7473803	7473804	SPT_0046	SPT_0047	hpt		TRUE	0.978	16.000	0.192	1.000	N	NA
7473804	7473805	SPT_0047	SPT_0048			FALSE	0.221	122.000	0.006	1.000		NA
7473805	7473806	SPT_0048	SPT_0049			FALSE	0.180	94.000	0.000	NA		NA
7473806	7473807	SPT_0049	SPT_0050		rrs1	FALSE	0.033	263.000	0.000	NA		NA
7473807	7473808	SPT_0050	SPT_0051	rrs1		FALSE	0.115	126.000	0.000	NA		NA
7473808	7473809	SPT_0051	SPT_0053		rrl1	FALSE	0.122	121.000	0.000	NA		NA
7473809	7473810	SPT_0053	SPT_0054	rrl1	rrf_1	FALSE	0.258	77.000	0.000	NA		NA
7473810	7473811	SPT_0054	SPT_0055	rrf_1		TRUE	0.871	6.000	0.000	NA		NA
7473812	7473813	SPT_0056	SPT_0057			TRUE	0.521	48.000	0.000	NA		NA
7473814	7473815	SPT_0058	SPT_0059		purA	FALSE	0.061	189.000	0.000	NA		NA
7473815	7473816	SPT_0059	SPT_0060	purA		FALSE	0.216	201.000	0.000	1.000	Y	NA
7473816	7473817	SPT_0060	SPT_2262		srpB	TRUE	0.608	36.000	0.000	NA		NA
7473817	7473818	SPT_2262	SPT_0061	srpB		TRUE	0.379	61.000	0.000	NA		NA
7473818	7473819	SPT_0061	SPT_0062			TRUE	0.956	-40.000	0.005	NA	N	NA
7473819	7473820	SPT_0062	SPT_0063		radA	FALSE	0.289	113.000	0.003	NA	N	NA
7473820	7473821	SPT_0063	SPT_0064	radA		TRUE	0.547	73.000	0.009	1.000	N	NA
7473821	7473822	SPT_0064	SPT_0065			TRUE	0.931	25.000	0.111	NA		NA
7473822	7473823	SPT_0065	SPT_0066			FALSE	0.094	145.000	0.000	NA		NA
7473824	7473825	SPT_0067	SPT_0068			TRUE	0.890	-42.000	0.000	NA		NA
7473825	7473826	SPT_0068	SPT_0069			TRUE	0.578	40.000	0.000	NA		NA
7473827	7473828	SPT_0070	SPT_0071			TRUE	0.341	85.000	0.005	NA		NA
7473830	7473831	SPT_0073	SPT_0074		recO	TRUE	0.970	-3.000	0.012	1.000	N	NA
7473831	7473832	SPT_0074	SPT_0075	recO	plsX	TRUE	0.970	-3.000	0.011	1.000	N	NA
7473832	7473833	SPT_0075	SPT_0076	plsX		TRUE	0.985	6.000	0.017	0.009	Y	NA
7473833	7473834	SPT_0076	SPT_0077			TRUE	0.652	43.000	0.000	NA	N	NA
7473834	7473835	SPT_0077	SPT_0078			FALSE	0.054	203.000	0.000	NA		NA
7473835	7473836	SPT_0078	SPT_0079			TRUE	0.884	3.000	0.000	NA		NA
7473836	7473837	SPT_0079	SPT_0080			FALSE	0.009	587.000	0.000	NA		NA
7473837	7473838	SPT_0080	SPT_0081			TRUE	0.990	13.000	0.444	0.068		NA
7473838	7473839	SPT_0081	SPT_0082		purC	FALSE	0.128	170.000	0.004	1.000		NA
7473839	7473840	SPT_0082	SPT_0083	purC		TRUE	0.866	11.000	0.000	0.001		NA
7473840	7473841	SPT_0083	SPT_0084			TRUE	0.434	57.000	0.000	1.000		NA
7473841	7473842	SPT_0084	SPT_0085		purF	TRUE	0.687	93.000	0.024	1.000	Y	NA
7473842	7473843	SPT_0085	SPT_0086	purF	purM	TRUE	0.979	37.000	0.248	1.000	Y	NA
7473843	7473844	SPT_0086	SPT_0087	purM	purN	TRUE	0.997	-3.000	0.238	0.003	Y	NA
7473844	7473845	SPT_0087	SPT_0088	purN		TRUE	0.407	84.000	0.003	NA	N	NA
7473845	7473846	SPT_0088	SPT_0089		purH	TRUE	0.846	25.000	0.002	NA	N	NA
7473846	7473847	SPT_0089	SPT_0090	purH	purD	TRUE	0.804	122.000	0.238	1.000	Y	NA
7473847	7473848	SPT_0090	SPT_0091	purD	purE	FALSE	0.142	403.000	0.044	1.000	Y	NA
7473848	7473849	SPT_0091	SPT_0092	purE	purK	TRUE	0.987	-13.000	0.008	0.001	Y	NA
7473849	7473850	SPT_0092	SPT_0093	purK		TRUE	0.857	10.000	0.000	NA		NA
7473850	7473851	SPT_0093	SPT_0094		purB	TRUE	0.478	63.000	0.002	NA		NA
7473852	7473853	SPT_0095	SPT_0096			FALSE	0.031	316.000	0.000	1.000	N	NA
7473854	7473855	SPT_0097	SPT_0098			TRUE	0.996	-3.000	0.190	1.000	Y	NA
7473855	7473856	SPT_0098	SPT_0099			TRUE	0.995	28.000	0.810	0.040	Y	NA
7473856	7473857	SPT_0099	SPT_0100			TRUE	0.978	-13.000	0.000	0.040	Y	NA
7473857	7473858	SPT_0100	SPT_0101			TRUE	0.970	7.000	0.000	0.040	Y	NA
7473858	7473859	SPT_0101	SPT_0102			FALSE	0.090	294.000	0.022	1.000	N	NA
7473859	7473860	SPT_0102	SPT_0103			FALSE	0.198	116.000	0.000	0.030	N	NA
7473860	7473861	SPT_0103	SPT_0104			FALSE	0.053	207.000	0.000	NA		NA
7473861	7473862	SPT_0104	SPT_0105			FALSE	0.089	150.000	0.000	NA		NA
7473863	7473864	SPT_0106	SPT_0107			TRUE	0.458	54.000	0.000	NA		NA
7473864	7473865	SPT_0107	SPT_0108			TRUE	0.905	-10.000	0.000	NA		NA
7473868	7473869	SPT_0111	SPT_0112			TRUE	0.996	14.000	0.490	0.005	Y	NA
7473869	7473870	SPT_0112	SPT_0113			FALSE	0.105	135.000	0.000	NA		NA
7473870	7473871	SPT_0113	SPT_0115			TRUE	0.369	62.000	0.000	NA		NA
7473871	7473872	SPT_0115	SPT_0116			FALSE	0.131	116.000	0.000	NA		NA
7473872	7473873	SPT_0116	SPT_0117			TRUE	0.536	167.000	0.333	1.000		NA
7473873	7473874	SPT_0117	SPT_0118			TRUE	0.998	-3.000	0.500	1.000	Y	NA
7473874	7473875	SPT_0118	SPT_0119		rpsD	FALSE	0.125	195.000	0.002	1.000	N	NA
7473875	7473876	SPT_0119	SPT_0120	rpsD		FALSE	0.008	766.000	0.000	NA		NA
7473876	7473877	SPT_0120	SPT_0121			TRUE	0.889	-46.000	0.000	NA		NA
7473877	7473878	SPT_0121	SPT_0122			FALSE	0.026	289.000	0.000	NA		NA
7473878	7473879	SPT_0122	SPT_0123			TRUE	0.998	14.000	0.917	0.050	Y	NA
7473879	7473880	SPT_0123	SPT_0124			TRUE	0.542	258.000	0.250	0.050	Y	NA
7473880	7473881	SPT_0124	SPT_0125			FALSE	0.030	272.000	0.000	NA		NA
7473881	7473882	SPT_0125	SPT_0126			FALSE	0.029	275.000	0.000	NA		NA
7473882	7473883	SPT_0126	SPT_0127			FALSE	0.016	387.000	0.000	NA		NA
7473883	7473884	SPT_0127	SPT_0128			FALSE	0.008	726.000	0.000	NA		NA
7473884	7473885	SPT_0128	SPT_0129			FALSE	0.007	922.000	0.000	NA		NA
7473885	7473886	SPT_0129	SPT_0130			TRUE	0.701	25.000	0.000	NA		NA
7473887	7473888	SPT_0131	SPT_0132			TRUE	0.924	63.000	0.500	NA		NA
7473888	7473889	SPT_0132	SPT_0133			TRUE	0.986	-7.000	0.150	NA		NA
7473889	7473890	SPT_0133	SPT_0134			TRUE	0.990	-13.000	0.250	NA		NA
7473890	7473891	SPT_0134	SPT_0135			TRUE	0.433	139.000	0.100	NA	N	NA
7473892	7473893	SPT_0136	SPT_0137			TRUE	0.859	42.000	0.000	NA	Y	NA
7473894	7473895	SPT_0138	SPT_0139		sdaAA	TRUE	0.899	22.000	0.033	1.000		NA
7473895	7473896	SPT_0139	SPT_0140	sdaAA	sdaAB	TRUE	0.995	9.000	0.221	0.001	Y	NA
7473899	7473900	SPT_0143	SPT_0144			TRUE	0.925	55.000	0.353	NA		NA
7473900	7473901	SPT_0144	SPT_0145			TRUE	0.996	-3.000	0.520	NA		NA
7473901	7473902	SPT_0145	SPT_0146			FALSE	0.079	207.000	0.000	1.000	N	NA
7473902	7473903	SPT_0146	SPT_0147			TRUE	0.867	17.000	0.002	1.000		NA
7473907	7473908	SPT_0151	SPT_0152			FALSE	0.024	298.000	0.000	NA		NA
7473908	7473909	SPT_0152	SPT_0153			FALSE	0.084	154.000	0.000	NA		NA
7473909	7473910	SPT_0153	SPT_0154			FALSE	0.013	416.000	0.000	NA		NA
7473910	7473911	SPT_0154	SPT_0155			FALSE	0.016	383.000	0.000	NA		NA
7473911	7473912	SPT_0155	SPT_0156			FALSE	0.021	316.000	0.000	NA		NA
7473912	7473913	SPT_0156	SPT_0157			FALSE	0.017	377.000	0.000	NA		NA
7473913	7473914	SPT_0157	SPT_0158			TRUE	0.869	7.000	0.000	NA		NA
7473914	7473915	SPT_0158	SPT_0159			TRUE	0.765	19.000	0.000	NA		NA
7473915	7473916	SPT_0159	SPT_0160			TRUE	0.438	56.000	0.000	NA		NA
7473916	7473917	SPT_0160	SPT_0161			TRUE	0.909	-3.000	0.000	NA		NA
7473917	7473918	SPT_0161	SPT_0162			FALSE	0.007	1135.000	0.000	NA		NA
7473918	7473919	SPT_0162	SPT_0163			FALSE	0.010	550.000	0.000	NA		NA
7473919	7473920	SPT_0163	SPT_0164			FALSE	0.037	253.000	0.000	NA		NA
7473920	7473921	SPT_0164	SPT_0165		trmU	TRUE	0.720	23.000	0.000	NA		NA
7473921	7473922	SPT_0165	SPT_0166	trmU		FALSE	0.217	141.000	0.003	1.000	N	NA
7473922	7473923	SPT_0166	SPT_0167		gidA	TRUE	0.944	10.000	0.005	1.000	N	NA
7473924	7473925	SPT_0168	SPT_0169			FALSE	0.286	72.000	0.000	NA		NA
7473925	7473926	SPT_0169	SPT_0170			TRUE	0.995	2.000	0.576	NA		NA
7473926	7473927	SPT_0170	SPT_0171			FALSE	0.020	326.000	0.000	NA		NA
7473927	7473928	SPT_0171	SPT_0172			FALSE	0.038	247.000	0.000	NA		NA
7473928	7473929	SPT_0172	SPT_0173			TRUE	0.994	2.000	0.500	NA		NA
7473930	7473931	SPT_0174	SPT_0175		rimI	TRUE	0.989	-3.000	0.209	1.000		NA
7473931	7473932	SPT_0175	SPT_0176	rimI		TRUE	0.968	-10.000	0.030	1.000		NA
7473933	7473934	SPT_0177	SPT_0178			TRUE	0.906	-9.000	0.000	NA		NA
7473935	7473936	SPT_0179	SPT_0181			TRUE	0.679	27.000	0.000	NA		NA
7473936	7473937	SPT_0181	SPT_0182			FALSE	0.201	87.000	0.000	NA		NA
7473937	7473938	SPT_0182	SPT_0183			TRUE	0.751	20.000	0.000	NA		NA
7473938	7473939	SPT_0183	SPT_0184			FALSE	0.017	377.000	0.000	NA		NA
7473939	7473940	SPT_0184	SPT_0185			FALSE	0.010	551.000	0.000	NA		NA
7473940	7473941	SPT_0185	SPT_0187			TRUE	0.837	13.000	0.000	NA		NA
7473941	7473942	SPT_0187	SPT_0188			FALSE	0.015	395.000	0.000	NA		NA
7473942	7473943	SPT_0188	SPT_0189			FALSE	0.026	291.000	0.000	NA		NA
7473943	7473944	SPT_0189	SPT_0190			FALSE	0.317	68.000	0.000	NA		NA
7473944	7473945	SPT_0190	SPT_0191			FALSE	0.286	72.000	0.000	NA		NA
7473947	7473948	SPT_0193	SPT_0194			TRUE	0.993	-10.000	0.338	NA		NA
7473948	7473949	SPT_0194	SPT_0195			FALSE	0.304	104.000	0.013	NA		NA
7473949	7473950	SPT_0195	SPT_0196			FALSE	0.121	154.000	0.000	NA	N	NA
7473950	7473951	SPT_0196	SPT_0197			TRUE	0.838	100.000	0.500	NA	N	NA
7473951	7473952	SPT_0197	SPT_0198			TRUE	0.978	-7.000	0.042	1.000	N	NA
7473952	7473953	SPT_0198	SPT_0199			TRUE	0.999	2.000	0.938	1.000	Y	NA
7473955	7473956	SPT_0201	SPT_0202			TRUE	0.969	50.000	0.667	NA		NA
7473956	7473957	SPT_0202	SPT_0203			TRUE	0.994	12.000	0.227	0.014	Y	NA
7473957	7473958	SPT_0203	SPT_0204			TRUE	0.822	52.000	0.091	NA		NA
7473958	7473959	SPT_0204	SPT_0205			TRUE	0.807	78.000	0.286	NA		NA
7473960	7473961	SPT_0206	SPT_0207			FALSE	0.019	349.000	0.000	1.000		NA
7473961	7473962	SPT_0207	SPT_0208			FALSE	0.022	310.000	0.000	NA		NA
7473962	7473963	SPT_0208	SPT_0209			TRUE	0.994	-3.000	0.392	NA		NA
7473963	7473964	SPT_0209	SPT_0210			FALSE	0.199	88.000	0.000	NA		NA
7473966	7473967	SPT_0212	SPT_0213	ribH		TRUE	0.991	1.000	0.054	0.003	Y	NA
7473967	7473968	SPT_0213	SPT_0214		ribE	TRUE	0.973	20.000	0.051	1.000	Y	NA
7473968	7473969	SPT_0214	SPT_0215	ribE	ribD	TRUE	0.998	-15.000	0.456	1.000	Y	NA
7473970	7473971	SPT_0216	SPT_0217	ruvA		TRUE	0.981	10.000	0.012	1.000	Y	NA
7473971	7473972	SPT_0217	SPT_0218			TRUE	0.949	-3.000	0.004	NA		NA
7473973	7473974	SPT_0219	SPT_0220			FALSE	0.036	255.000	0.000	NA		NA
7473974	7473975	SPT_0220	SPT_0221			TRUE	0.960	12.000	0.072	NA		NA
7473975	7473976	SPT_0221	SPT_0222			FALSE	0.115	161.000	0.000	1.000	N	NA
7473976	7473977	SPT_0222	SPT_0223			FALSE	0.298	85.000	0.000	0.075	N	NA
7473977	7473978	SPT_0223	SPT_0224			FALSE	0.080	161.000	0.000	1.000		NA
7473979	7473980	SPT_0225	SPT_0226			TRUE	0.808	16.000	0.000	NA		NA
7473980	7473981	SPT_0226	SPT_0227			FALSE	0.013	429.000	0.000	NA		NA
7473981	7473982	SPT_0227	SPT_0228			TRUE	0.909	-3.000	0.000	NA		NA
7473982	7473983	SPT_0228	SPT_0229			TRUE	0.998	2.000	1.000	NA		NA
7473983	7473984	SPT_0229	SPT_0230			TRUE	0.909	-3.000	0.000	NA		NA
7473984	7473985	SPT_0230	SPT_0231			TRUE	0.994	-7.000	0.400	NA		NA
7473985	7473986	SPT_0231	SPT_0232			TRUE	0.796	135.000	0.714	NA		NA
7473986	7473987	SPT_0232	SPT_0233			TRUE	0.957	53.000	0.571	NA		NA
7473987	7473988	SPT_0233	SPT_0234			FALSE	0.018	353.000	0.000	NA		NA
7473988	7473989	SPT_0234	SPT_0235			FALSE	0.216	84.000	0.000	NA		NA
7473989	7473990	SPT_0235	SPT_0236			FALSE	0.012	449.000	0.000	NA		NA
7473990	7473991	SPT_0236	SPT_0237			FALSE	0.007	1196.000	0.000	NA		NA
7473991	7473992	SPT_0237	SPT_0238		uvrA	FALSE	0.011	489.000	0.000	1.000		NA
7473992	7473993	SPT_0238	SPT_0239	uvrA		TRUE	0.967	-7.000	0.008	1.000	N	NA
7473993	7473994	SPT_0239	SPT_0240			FALSE	0.156	132.000	0.000	1.000	N	NA
7473994	7473995	SPT_0240	SPT_0241			TRUE	0.857	66.000	0.267	NA		NA
7473995	7473996	SPT_0241	SPT_0242			TRUE	0.398	87.000	0.016	NA		NA
7473996	7473997	SPT_0242	SPT_0243			TRUE	0.994	4.000	0.537	NA		NA
7473997	7473998	SPT_0243	SPT_0244			TRUE	0.992	16.000	0.651	NA		NA
7473998	7473999	SPT_0244	SPT_0245			FALSE	0.058	308.000	0.019	NA		NA
7473999	7474000	SPT_0245	SPT_0246			FALSE	0.216	84.000	0.000	NA		NA
7474000	7474001	SPT_0246	SPT_0247			FALSE	0.092	146.000	0.000	NA		NA
7474001	7474002	SPT_0247	SPT_0248			FALSE	0.035	258.000	0.000	NA		NA
7474002	7474003	SPT_0248	SPT_0249		nrdD	TRUE	0.361	120.000	0.057	NA		NA
7474003	7474004	SPT_0249	SPT_0250	nrdD		TRUE	0.851	32.000	0.031	0.054		NA
7474004	7474005	SPT_0250	SPT_0251			TRUE	0.958	12.000	0.062	NA		NA
7474005	7474006	SPT_0251	SPT_0252			TRUE	0.938	44.000	0.292	NA		NA
7474006	7474007	SPT_0252	SPT_0253		nrdG	TRUE	0.987	-7.000	0.159	1.000		NA
7474007	7474008	SPT_0253	SPT_0254	nrdG		TRUE	0.976	-3.000	0.029	1.000	N	NA
7474008	7474009	SPT_0254	SPT_0255		rpsJ	FALSE	0.048	266.000	0.000	1.000	N	NA
7474009	7474010	SPT_0255	SPT_0256	rpsJ	rplC	TRUE	0.734	217.000	0.467	0.038	Y	NA
7474010	7474011	SPT_0256	SPT_0257	rplC	rplD	TRUE	0.994	25.000	0.544	0.028	Y	NA
7474011	7474012	SPT_0257	SPT_0258	rplD	rplW	TRUE	0.997	0.000	0.307	0.028	Y	NA
7474012	7474013	SPT_0258	SPT_0259	rplW	rplB	TRUE	0.998	18.000	0.849	0.033	Y	NA
7474013	7474014	SPT_0259	SPT_0260	rplB	rpsS	TRUE	0.952	104.000	0.820	0.038	Y	NA
7474014	7474015	SPT_0260	SPT_0261	rpsS	rplV	TRUE	0.998	12.000	0.769	0.038	Y	NA
7474015	7474016	SPT_0261	SPT_0262	rplV	rpsC	TRUE	0.998	13.000	0.719	0.038	Y	NA
7474016	7474017	SPT_0262	SPT_0263	rpsC	rplP	TRUE	0.999	4.000	0.828	0.038	Y	NA
7474017	7474018	SPT_0263	SPT_0264	rplP	rpmC	TRUE	0.998	10.000	0.802	0.028	Y	NA
7474018	7474019	SPT_0264	SPT_0265	rpmC	rpsQ	TRUE	0.996	25.000	0.828	0.028	Y	NA
7474019	7474020	SPT_0265	SPT_0266	rpsQ	rplN	TRUE	0.996	26.000	0.791	0.038	Y	NA
7474020	7474021	SPT_0266	SPT_0267	rplN	rplX	TRUE	0.973	78.000	0.810	0.038	Y	NA
7474021	7474022	SPT_0267	SPT_0268	rplX		TRUE	0.996	24.000	0.758	0.028	Y	NA
7474022	7474023	SPT_0268	SPT_0269			TRUE	0.993	18.000	0.309	0.028	Y	NA
7474023	7474024	SPT_0269	SPT_0270		rpsH	TRUE	0.507	285.000	0.295	0.028	Y	NA
7474024	7474025	SPT_0270	SPT_0271	rpsH		TRUE	0.871	192.000	0.808	0.028	Y	NA
7474025	7474026	SPT_0271	SPT_0272		rplR	TRUE	0.968	84.000	0.815	0.028	Y	NA
7474026	7474027	SPT_0272	SPT_0273	rplR	rpsE	TRUE	0.997	18.000	0.814	0.038	Y	NA
7474027	7474028	SPT_0273	SPT_0274	rpsE	rpmD	TRUE	0.998	14.000	0.789	0.038	Y	NA
7474028	7474029	SPT_0274	SPT_0275	rpmD	rplO	TRUE	0.896	145.000	0.653	0.005	Y	NA
7474029	7474030	SPT_0275	SPT_0276	rplO		TRUE	0.995	13.000	0.730	1.000	N	NA
7474030	7474031	SPT_0276	SPT_0277			TRUE	0.567	151.000	0.241	1.000	N	NA
7474031	7474032	SPT_0277	SPT_0278		infA	TRUE	0.442	117.000	0.059	1.000	N	NA
7474032	7474033	SPT_0278	SPT_0279	infA	rpmJ	TRUE	0.969	25.000	0.067	1.000	Y	NA
7474033	7474034	SPT_0279	SPT_0280	rpmJ		TRUE	0.982	18.000	0.086	0.028	Y	NA
7474034	7474035	SPT_0280	SPT_0281		rpsK	TRUE	0.989	55.000	0.810	0.028	Y	NA
7474035	7474036	SPT_0281	SPT_0282	rpsK	rpoA	TRUE	0.955	43.000	0.308	1.000	N	NA
7474036	7474037	SPT_0282	SPT_0283	rpoA	rplQ	TRUE	0.997	12.000	0.873	1.000	N	NA
7474037	7474038	SPT_0283	SPT_0284	rplQ		FALSE	0.071	265.000	0.002	1.000	N	NA
7474038	7474039	SPT_0284	SPT_0285			TRUE	0.993	10.000	0.569	NA		NA
7474039	7474040	SPT_0285	SPT_0286			FALSE	0.128	187.000	0.008	NA		NA
7474041	7474042	SPT_0287	SPT_0289			TRUE	0.905	-10.000	0.000	NA		NA
7474042	7474043	SPT_0289	SPT_0290			TRUE	0.837	13.000	0.000	NA		NA
7474043	7474044	SPT_0290	SPT_0292			FALSE	0.042	232.000	0.000	NA		NA
7474044	7474045	SPT_0292	SPT_0293			FALSE	0.278	75.000	0.000	1.000		NA
7474046	7474047	SPT_0294	SPT_0295			TRUE	0.992	13.000	0.188	0.040	Y	NA
7474047	7474048	SPT_0295	SPT_0296			FALSE	0.285	195.000	0.091	1.000	N	NA
7474048	7474049	SPT_0296	SPT_0297			TRUE	0.993	46.000	0.889	0.025	Y	NA
7474049	7474050	SPT_0297	SPT_0298			TRUE	0.998	17.000	0.889	0.025	Y	NA
7474050	7474051	SPT_0298	SPT_0299			TRUE	0.440	151.000	0.132	1.000	N	NA
7474051	7474052	SPT_0299	SPT_0300			TRUE	0.985	19.000	0.368	1.000	N	NA
7474052	7474053	SPT_0300	SPT_0301			TRUE	0.977	18.000	0.211	1.000	N	NA
7474053	7474054	SPT_0301	SPT_0302		leuS	FALSE	0.018	455.000	0.000	1.000	N	NA
7474054	7474055	SPT_0302	SPT_0303	leuS		FALSE	0.101	139.000	0.000	NA		NA
7474055	7474056	SPT_0303	SPT_0304			TRUE	0.438	56.000	0.000	NA		NA
7474056	7474057	SPT_0304	SPT_0305			TRUE	0.951	12.000	0.037	0.015		NA
7474057	7474058	SPT_0305	SPT_0306		ruvB	FALSE	0.007	1041.000	0.000	1.000		NA
7474058	7474059	SPT_0306	SPT_0307	ruvB		TRUE	0.896	-19.000	0.000	NA		NA
7474059	7474060	SPT_0307	SPT_0308		uppS	FALSE	0.042	231.000	0.000	NA		NA
7474060	7474061	SPT_0308	SPT_0309	uppS	cdsA	TRUE	0.991	9.000	0.113	1.000	Y	NA
7474061	7474062	SPT_0309	SPT_0310	cdsA	rseP	TRUE	0.925	22.000	0.040	1.000	N	NA
7474062	7474063	SPT_0310	SPT_0311	rseP	proS	TRUE	0.971	13.000	0.095	1.000	N	NA
7474063	7474064	SPT_0311	SPT_0312	proS		TRUE	0.322	100.000	0.002	1.000	N	NA
7474064	7474065	SPT_0312	SPT_0313		glmS	FALSE	0.140	192.000	0.003	1.000	N	NA
7474065	7474066	SPT_0313	SPT_0314	glmS		FALSE	0.178	119.000	0.000	NA	N	NA
7474068	7474069	SPT_0316	SPT_0317	rpsL	rpsG	TRUE	0.989	20.000	0.224	0.005	Y	NA
7474069	7474070	SPT_0317	SPT_0318	rpsG	fusA	TRUE	0.480	425.000	0.579	1.000	Y	NA
7474070	7474071	SPT_0318	SPT_0319	fusA	polC	FALSE	0.314	104.000	0.003	1.000	N	NA
7474071	7474072	SPT_0319	SPT_0320	polC		TRUE	0.465	102.000	0.000	NA	Y	NA
7474072	7474073	SPT_0320	SPT_0321			TRUE	0.994	-7.000	0.400	NA		NA
7474073	7474074	SPT_0321	SPT_0322			TRUE	0.744	21.000	0.000	NA		NA
7474074	7474075	SPT_0322	SPT_0323			TRUE	0.934	22.000	0.095	NA		NA
7474075	7474076	SPT_0323	SPT_0324			TRUE	0.981	10.000	0.190	1.000		NA
7474076	7474077	SPT_0324	SPT_0325			FALSE	0.047	223.000	0.000	1.000		NA
7474077	7474078	SPT_0325	SPT_0326			FALSE	0.184	217.000	0.041	1.000	N	NA
7474079	7474080	SPT_0327	SPT_0328			TRUE	0.996	24.000	0.812	0.037	Y	NA
7474080	7474081	SPT_0328	SPT_0329			TRUE	0.997	28.000	0.943	0.037	Y	NA
7474081	7474082	SPT_0329	SPT_0330			FALSE	0.042	233.000	0.000	1.000		NA
7474082	7474083	SPT_0330	SPT_0331			FALSE	0.146	109.000	0.000	NA		NA
7474083	7474084	SPT_0331	SPT_0332			FALSE	0.216	84.000	0.000	NA		NA
7474085	7474086	SPT_0333	SPT_0334			TRUE	0.740	53.000	0.034	NA		NA
7474086	7474087	SPT_0334	SPT_0335		folP	FALSE	0.180	94.000	0.000	NA		NA
7474087	7474088	SPT_0335	SPT_0336	folP		TRUE	0.985	2.000	0.006	0.005	Y	NA
7474088	7474089	SPT_0336	SPT_0337		folE	TRUE	0.988	-19.000	0.024	1.000	Y	NA
7474089	7474090	SPT_0337	SPT_0338	folE		TRUE	0.901	43.000	0.005	1.000	Y	NA
7474092	7474093	SPT_0340	SPT_0341	rplM	rpsI	TRUE	0.996	19.000	0.601	0.028	Y	NA
7474094	7474095	SPT_0342	SPT_0343			TRUE	0.957	42.000	0.375	0.074		NA
7474095	7474096	SPT_0343	SPT_0344			TRUE	0.991	8.000	0.375	NA		NA
7474096	7474097	SPT_0344	SPT_0345			FALSE	0.070	172.000	0.000	NA		NA
7474097	7474098	SPT_0345	SPT_0346			FALSE	0.294	75.000	0.000	0.022		NA
7474098	7474099	SPT_0346	SPT_0347			FALSE	0.013	427.000	0.000	1.000		NA
7474099	7474100	SPT_0347	SPT_0348			TRUE	0.914	77.000	0.667	NA		NA
7474100	7474101	SPT_0348	SPT_0349			TRUE	0.987	13.000	0.333	NA		NA
7474101	7474102	SPT_0349	SPT_0350			FALSE	0.009	558.000	0.000	NA		NA
7474102	7474103	SPT_0350	SPT_0351			TRUE	0.527	47.000	0.000	NA		NA
7474104	7474105	SPT_0352	SPT_0353			FALSE	0.085	156.000	0.000	1.000		NA
7474105	7474106	SPT_0353	SPT_0354			FALSE	0.062	190.000	0.000	1.000		NA
7474106	7474107	SPT_0354	SPT_0355			TRUE	0.798	52.000	0.066	NA		NA
7474107	7474108	SPT_0355	SPT_0356			FALSE	0.283	130.000	0.033	NA		NA
7474108	7474109	SPT_0356	SPT_0357			TRUE	0.525	124.000	0.128	0.024	N	NA
7474109	7474110	SPT_0357	SPT_0358			TRUE	0.967	10.000	0.043	0.024	N	NA
7474110	7474111	SPT_0358	SPT_0359			TRUE	0.909	31.000	0.105	NA		NA
7474111	7474112	SPT_0359	SPT_0360			TRUE	0.928	80.000	0.842	NA		NA
7474112	7474113	SPT_0360	SPT_0361			FALSE	0.017	381.000	0.000	NA		NA
7474113	7474114	SPT_0361	SPT_0362			FALSE	0.015	401.000	0.000	NA		NA
7474116	7474117	SPT_0364	SPT_0365			FALSE	0.016	383.000	0.000	NA		NA
7474118	7474119	SPT_0366	SPT_0367			TRUE	0.993	10.000	0.167	1.000	Y	NA
7474119	7474120	SPT_0367	SPT_0368			TRUE	0.965	31.000	0.094	1.000	Y	NA
7474120	7474121	SPT_0368	SPT_0369			TRUE	0.973	19.000	0.197	1.000	N	NA
7474122	7474123	SPT_0370	SPT_0371			TRUE	0.977	12.000	0.160	1.000		NA
7474123	7474124	SPT_0371	SPT_0372			TRUE	0.986	11.000	0.267	1.000		NA
7474124	7474125	SPT_0372	SPT_0373			TRUE	0.998	15.000	0.933	0.037	Y	NA
7474125	7474126	SPT_0373	SPT_0374			TRUE	0.999	-13.000	0.933	0.037	Y	NA
7474126	7474127	SPT_0374	SPT_0375			TRUE	0.957	0.000	0.002	NA	N	NA
7474127	7474128	SPT_0375	SPT_0376			TRUE	0.848	22.000	0.006	NA		NA
7474128	7474129	SPT_0376	SPT_0377			TRUE	0.940	60.000	0.562	NA		NA
7474129	7474130	SPT_0377	SPT_0378			TRUE	0.428	57.000	0.000	NA		NA
7474131	7474132	SPT_0379	SPT_0380			TRUE	0.679	27.000	0.000	NA		NA
7474132	7474133	SPT_0380	SPT_0381			FALSE	0.317	68.000	0.000	NA		NA
7474133	7474134	SPT_0381	SPT_0382			TRUE	0.879	4.000	0.000	NA		NA
7474134	7474135	SPT_0382	SPT_0383			TRUE	0.959	16.000	0.105	NA		NA
7474136	7474137	SPT_0384	SPT_0385	mraW	ftsL	TRUE	0.968	13.000	0.077	1.000	N	NA
7474137	7474138	SPT_0385	SPT_0386	ftsL		TRUE	0.994	4.000	0.456	1.000	N	NA
7474138	7474139	SPT_0386	SPT_0387		mraY	TRUE	0.989	2.000	0.038	1.000	Y	NA
7474139	7474140	SPT_0387	SPT_0388	mraY		FALSE	0.014	564.000	0.000	1.000	N	NA
7474140	7474141	SPT_0388	SPT_2268			FALSE	0.043	228.000	0.000	NA		NA
7474142	7474143	SPT_0389	SPT_0390	luxS		FALSE	0.309	95.000	0.006	NA		NA
7474144	7474145	SPT_0391	SPT_0392			FALSE	0.010	1420.000	0.000	1.000	N	NA
7474145	7474146	SPT_0392	SPT_0393			TRUE	0.996	2.000	0.583	1.000	N	NA
7474146	7474147	SPT_0393	SPT_0394			TRUE	0.998	9.000	0.636	1.000	Y	NA
7474147	7474148	SPT_0394	SPT_0395			TRUE	0.996	10.000	0.800	1.000	N	NA
7474148	7474149	SPT_0395	SPT_0396			FALSE	0.083	385.000	0.067	NA	N	NA
7474149	7474150	SPT_0396	SPT_0397			TRUE	0.987	4.000	0.032	NA	Y	NA
7474150	7474151	SPT_0397	SPT_0398			TRUE	0.979	-3.000	0.000	NA	Y	NA
7474151	7474152	SPT_0398	SPT_0399			TRUE	0.893	2.000	0.000	NA		NA
7474152	7474153	SPT_0399	SPT_0400			TRUE	0.900	1.000	0.000	NA		NA
7474153	7474154	SPT_0400	SPT_0401			TRUE	0.950	23.000	0.154	NA		NA
7474154	7474155	SPT_0401	SPT_0402			TRUE	0.801	64.000	0.154	NA		NA
7474155	7474156	SPT_0402	SPT_0403		rfbA	TRUE	0.868	39.000	0.000	1.000	Y	NA
7474156	7474157	SPT_0403	SPT_0404	rfbA		TRUE	0.995	1.000	0.149	1.000	Y	NA
7474157	7474158	SPT_0404	SPT_0405		rfbB	TRUE	0.996	10.000	0.350	1.000	Y	NA
7474158	7474159	SPT_0405	SPT_0406	rfbB	rfbD	TRUE	0.947	66.000	0.273	0.003	Y	NA
7474159	7474160	SPT_0406	SPT_0409	rfbD		TRUE	0.574	41.000	0.000	NA		NA
7474162	7474163	SPT_0410	SPT_0411			FALSE	0.024	301.000	0.000	1.000		NA
7474164	7474165	SPT_0412	SPT_0413		recU	TRUE	0.993	-3.000	0.319	1.000		NA
7474166	7474167	SPT_0414	SPT_0415			TRUE	0.917	70.000	0.579	NA		NA
7474167	7474168	SPT_0415	SPT_2269			TRUE	0.413	58.000	0.000	NA		NA
7474168	7474169	SPT_2269	SPT_0416			FALSE	0.194	90.000	0.000	NA		NA
7474169	7474170	SPT_0416	SPT_0417			TRUE	0.940	13.000	0.029	NA		NA
7474170	7474171	SPT_0417	SPT_0418		gnd	TRUE	0.415	76.000	0.005	NA		NA
7474171	7474172	SPT_0418	SPT_0419	gnd		TRUE	0.946	12.000	0.012	1.000	N	NA
7474172	7474173	SPT_0419	SPT_0420			FALSE	0.167	98.000	0.000	NA		NA
7474173	7474174	SPT_0420	SPT_0421			TRUE	0.765	19.000	0.000	NA		NA
7474175	7474176	SPT_0422	SPT_0423			TRUE	0.554	43.000	0.000	NA		NA
7474176	7474177	SPT_0423	SPT_0424			FALSE	0.317	68.000	0.000	NA		NA
7474178	7474179	SPT_0425	SPT_0426		mvk	FALSE	0.120	122.000	0.000	NA		NA
7474179	7474180	SPT_0426	SPT_0427	mvk	mvaD	TRUE	0.997	-18.000	0.281	0.005	Y	NA
7474180	7474181	SPT_0427	SPT_0428	mvaD		TRUE	0.997	-13.000	0.312	0.005	Y	NA
7474181	7474182	SPT_0428	SPT_0429		fni	TRUE	0.983	-16.000	0.097	1.000	N	NA
7474182	7474183	SPT_0429	SPT_0430	fni		TRUE	0.398	78.000	0.005	NA		NA
7474183	7474184	SPT_0430	SPT_0431			TRUE	0.997	-3.000	0.679	NA		NA
7474184	7474185	SPT_0431	SPT_0432			TRUE	0.998	14.000	0.853	0.013	Y	NA
7474185	7474186	SPT_0432	SPT_0433			TRUE	0.900	1.000	0.000	NA		NA
7474186	7474187	SPT_0433	SPT_0434			FALSE	0.248	78.000	0.000	NA		NA
7474187	7474188	SPT_0434	SPT_0435			FALSE	0.134	115.000	0.000	NA		NA
7474188	7474189	SPT_0435	SPT_0436			FALSE	0.089	150.000	0.000	NA		NA
7474189	7474190	SPT_0436	SPT_0437			FALSE	0.026	293.000	0.000	1.000		NA
7474190	7474191	SPT_0437	SPT_0438		tig	FALSE	0.060	194.000	0.000	1.000		NA
7474192	7474193	SPT_0439	SPT_0440		lepB1	TRUE	0.462	128.000	0.099	1.000	N	NA
7474193	7474194	SPT_0440	SPT_0441	lepB1	rnhC	TRUE	0.978	4.000	0.080	1.000	N	NA
7474195	7474196	SPT_0442	SPT_0443		cvpA	TRUE	0.965	-3.000	0.019	NA		NA
7474196	7474197	SPT_0443	SPT_0444	cvpA		TRUE	0.446	104.000	0.070	1.000		NA
7474197	7474198	SPT_0444	SPT_0445			FALSE	0.029	343.000	0.000	1.000	N	NA
7474198	7474199	SPT_0445	SPT_0446			FALSE	0.047	218.000	0.000	NA		NA
7474199	7474200	SPT_0446	SPT_0447			FALSE	0.145	110.000	0.000	NA		NA
7474201	7474202	SPT_0448	SPT_0449	serS		FALSE	0.083	214.000	0.003	NA		NA
7474202	7474203	SPT_0449	SPT_0450			TRUE	0.946	3.000	0.010	NA		NA
7474203	7474204	SPT_0450	SPT_0451			FALSE	0.067	178.000	0.000	NA		NA
7474205	7474206	SPT_0452	SPT_0453			TRUE	0.598	94.000	0.098	1.000	N	NA
7474206	7474207	SPT_0453	SPT_0454			TRUE	0.982	0.000	0.070	1.000	N	NA
7474207	7474208	SPT_0454	SPT_0455			TRUE	0.741	60.000	0.065	0.008		NA
7474208	7474209	SPT_0455	SPT_0456			TRUE	0.586	119.000	0.216	1.000		NA
7474209	7474210	SPT_0456	SPT_0457		fabD	TRUE	0.981	-7.000	0.099	1.000		NA
7474210	7474211	SPT_0457	SPT_0458	fabD	fabG	TRUE	0.988	34.000	0.432	0.008	Y	NA
7474211	7474212	SPT_0458	SPT_0459	fabG	fabF	TRUE	0.971	22.000	0.056	1.000	Y	NA
7474212	7474213	SPT_0459	SPT_0460	fabF	accB	TRUE	0.991	3.000	0.074	1.000	Y	NA
7474213	7474214	SPT_0460	SPT_0461	accB	fabZ	TRUE	0.992	-3.000	0.047	0.008	Y	NA
7474214	7474215	SPT_0461	SPT_0462	fabZ	accC	TRUE	0.984	12.000	0.045	1.000	Y	NA
7474215	7474216	SPT_0462	SPT_0463	accC	accD	TRUE	0.960	37.000	0.090	0.003	Y	NA
7474216	7474217	SPT_0463	SPT_0464	accD	accA	TRUE	0.997	-3.000	0.234	0.002	Y	NA
7474217	7474218	SPT_0464	SPT_0465	accA		FALSE	0.058	263.000	0.003	NA		NA
7474218	7474219	SPT_0465	SPT_0466			TRUE	0.976	57.000	1.000	NA		NA
7474219	7474220	SPT_0466	SPT_0467			FALSE	0.089	150.000	0.000	NA		NA
7474221	7474222	SPT_0468	SPT_0469	nusB		TRUE	0.991	-7.000	0.265	NA		NA
7474222	7474223	SPT_0469	SPT_0470		efp	TRUE	0.897	22.000	0.031	NA		NA
7474225	7474226	SPT_0472	SPT_0473			FALSE	0.170	124.000	0.000	1.000	N	NA
7474226	7474227	SPT_0473	SPT_0474			TRUE	0.998	0.000	0.492	0.002	Y	NA
7474227	7474228	SPT_0474	SPT_0475		gatC	TRUE	0.999	0.000	0.643	0.002	Y	NA
7474229	7474230	SPT_0476	SPT_0477	prfC		FALSE	0.007	784.000	0.000	NA		NA
7474230	7474231	SPT_0477	SPT_0478		rpmB	FALSE	0.131	116.000	0.000	NA		NA
7474231	7474232	SPT_0478	SPT_0479	rpmB		FALSE	0.239	157.000	0.044	NA		NA
7474232	7474233	SPT_0479	SPT_0480			TRUE	0.995	3.000	0.567	NA		NA
7474233	7474234	SPT_0480	SPT_0481		ilvB	FALSE	0.104	200.000	0.004	1.000		NA
7474234	7474235	SPT_0481	SPT_0482	ilvB	ilvN	TRUE	0.997	-7.000	0.249	0.001	Y	NA
7474235	7474236	SPT_0482	SPT_0483	ilvN	ilvC	TRUE	0.907	66.000	0.130	0.003	Y	NA
7474236	7474237	SPT_0483	SPT_0484	ilvC		FALSE	0.148	107.000	0.000	NA		NA
7474237	7474238	SPT_0484	SPT_0485			FALSE	0.040	238.000	0.000	NA		NA
7474238	7474239	SPT_0485	SPT_0486		ilvA	TRUE	0.507	50.000	0.000	NA		NA
7474239	7474240	SPT_0486	SPT_0487	ilvA		FALSE	0.097	142.000	0.000	NA		NA
7474240	7474241	SPT_0487	SPT_0488			FALSE	0.010	541.000	0.000	NA		NA
7474242	7474243	SPT_0489	SPT_0490	gltL		TRUE	0.999	0.000	0.758	1.000	Y	NA
7474245	7474246	SPT_0491	SPT_0493			FALSE	0.106	134.000	0.000	NA		NA
7474246	7474247	SPT_0493	SPT_0494			FALSE	0.057	198.000	0.000	NA		NA
7474248	7474249	SPT_0495	SPT_0496			TRUE	0.908	-7.000	0.000	NA		NA
7474252	7474253	SPT_0499	SPT_0500			FALSE	0.032	265.000	0.000	NA		NA
7474254	7474255	SPT_0501	SPT_0503			FALSE	0.051	223.000	0.000	0.007		NA
7474257	7474258	SPT_0504	SPT_0505			FALSE	0.019	339.000	0.000	NA		NA
7474258	7474259	SPT_0505	SPT_0506			TRUE	0.982	69.000	0.909	NA	Y	NA
7474259	7474260	SPT_0506	SPT_0507			TRUE	0.995	29.000	0.800	NA	Y	NA
7474261	7474262	SPT_0508	SPT_0511			FALSE	0.134	115.000	0.000	NA		NA
7474262	7474263	SPT_0511	SPT_0512			TRUE	0.908	-7.000	0.000	NA		NA
7474263	7474264	SPT_0512	SPT_0513			FALSE	0.009	597.000	0.000	NA		NA
7474264	7474265	SPT_0513	SPT_0514			FALSE	0.009	654.000	0.000	NA		NA
7474266	7474267	SPT_0515	SPT_0516			TRUE	0.990	2.000	0.250	NA		NA
7474267	7474268	SPT_0516	SPT_0517			FALSE	0.072	168.000	0.000	NA		NA
7474268	7474269	SPT_0517	SPT_0518		lacG1	TRUE	0.966	10.000	0.000	1.000	Y	NA
7474269	7474270	SPT_0518	SPT_0519	lacG1		TRUE	0.676	69.000	0.000	1.000	Y	NA
7474271	7474272	SPT_0520	SPT_0521			TRUE	0.986	4.000	0.017	0.005	Y	NA
7474273	7474274	SPT_0522	SPT_0523			TRUE	0.952	15.000	0.068	NA		NA
7474274	7474275	SPT_0523	SPT_0524			TRUE	0.869	7.000	0.000	NA		NA
7474275	7474276	SPT_0524	SPT_0525			FALSE	0.158	102.000	0.000	NA		NA
7474276	7474277	SPT_0525	SPT_0526			TRUE	0.995	-15.000	0.530	1.000		NA
7474277	7474278	SPT_0526	SPT_0527			FALSE	0.145	193.000	0.005	1.000	N	NA
7474278	7474279	SPT_0527	SPT_0528			FALSE	0.012	453.000	0.000	NA		NA
7474279	7474280	SPT_0528	SPT_0529			TRUE	0.992	14.000	0.600	NA		NA
7474280	7474281	SPT_0529	SPT_0530			TRUE	0.922	27.000	0.105	1.000		NA
7474281	7474282	SPT_0530	SPT_0531			TRUE	0.877	5.000	0.000	1.000		NA
7474282	7474283	SPT_0531	SPT_0532		rpoE	FALSE	0.162	128.000	0.000	1.000	N	NA
7474283	7474284	SPT_0532	SPT_0533	rpoE	pyrG	FALSE	0.060	390.000	0.029	1.000	N	NA
7474286	7474287	SPT_0535	SPT_0536		pgk	TRUE	0.604	90.000	0.002	1.000	Y	NA
7474287	7474288	SPT_0536	SPT_0537	pgk		FALSE	0.159	136.000	0.002	NA		NA
7474288	7474289	SPT_0537	SPT_0538			TRUE	0.719	77.000	0.154	NA		NA
7474289	7474290	SPT_0538	SPT_0539		glnA	TRUE	0.939	37.000	0.179	1.000	N	NA
7474292	7474293	SPT_0541	SPT_0543			FALSE	0.012	453.000	0.000	NA		NA
7474294	7474295	SPT_0542	SPT_0544			TRUE	0.979	0.000	0.000	0.070	Y	NA
7474295	7474296	SPT_0544	SPT_0545			TRUE	0.997	13.000	0.564	0.070	Y	NA
7474296	7474297	SPT_0545	SPT_0546			FALSE	0.018	351.000	0.000	NA		NA
7474298	7474299	SPT_0547	SPT_0548			FALSE	0.130	164.000	0.003	NA		NA
7474299	7474300	SPT_0548	SPT_0549		grpE	TRUE	0.912	27.000	0.051	1.000	N	NA
7474300	7474301	SPT_0549	SPT_0550	grpE		FALSE	0.104	480.000	0.026	0.006	Y	NA
7474301	7474302	SPT_0550	SPT_0551			TRUE	0.841	13.000	0.000	1.000		NA
7474302	7474303	SPT_0551	SPT_0552		dnaJ	FALSE	0.055	205.000	0.000	1.000		NA
7474304	7474305	SPT_0553	SPT_0554			FALSE	0.077	162.000	0.000	NA		NA
7474305	7474306	SPT_0554	SPT_0555			TRUE	0.962	10.000	0.063	NA		NA
7474307	7474308	SPT_0556	SPT_0557			TRUE	0.990	-3.000	0.167	NA	N	NA
7474309	7474310	SPT_0558	SPT_0559			FALSE	0.024	296.000	0.000	NA		NA
7474311	7474312	SPT_0560	SPT_0561			TRUE	0.993	5.000	0.500	NA		NA
7474312	7474313	SPT_0561	SPT_0562			TRUE	0.996	13.000	0.444	NA	Y	NA
7474314	7474315	SPT_0563	SPT_0564			FALSE	0.075	167.000	0.000	1.000		NA
7474315	7474316	SPT_0564	SPT_0565			TRUE	0.896	57.000	0.250	1.000		NA
7474316	7474317	SPT_0565	SPT_0566			TRUE	0.850	11.000	0.000	NA		NA
7474318	7474319	SPT_0568	SPT_0569			TRUE	0.808	16.000	0.000	NA		NA
7474319	7474320	SPT_0569	SPT_0570			FALSE	0.007	1202.000	0.000	NA		NA
7474320	7474321	SPT_0570	SPT_0571			FALSE	0.044	227.000	0.000	NA		NA
7474321	7474322	SPT_0571	SPT_0572			FALSE	0.172	96.000	0.000	NA		NA
7474322	7474323	SPT_0572	SPT_0574			FALSE	0.054	203.000	0.000	NA		NA
7474323	7474324	SPT_0574	SPT_0576			FALSE	0.089	150.000	0.000	NA		NA
7474324	7474325	SPT_0576	SPT_0577			FALSE	0.010	509.000	0.000	NA		NA
7474325	7474326	SPT_0577	SPT_0578			TRUE	0.567	42.000	0.000	NA		NA
7474326	7474327	SPT_0578	SPT_0579			FALSE	0.087	151.000	0.000	NA		NA
7474327	7474328	SPT_0579	SPT_0580			FALSE	0.078	161.000	0.000	NA		NA
7474328	7474329	SPT_0580	SPT_0581		trmB	TRUE	0.987	-3.000	0.154	NA		NA
7474329	7474330	SPT_0581	SPT_0582	trmB		FALSE	0.199	126.000	0.004	NA		NA
7474330	7474331	SPT_0582	SPT_0583		nusA	TRUE	0.977	44.000	0.759	NA		NA
7474331	7474332	SPT_0583	SPT_0584	nusA		TRUE	0.990	22.000	0.323	NA	Y	NA
7474332	7474333	SPT_0584	SPT_0585			TRUE	0.995	-7.000	0.408	NA	N	NA
7474333	7474334	SPT_0585	SPT_0586			TRUE	0.991	17.000	0.223	NA	Y	NA
7474334	7474335	SPT_0586	SPT_0587		rbfA	TRUE	0.706	251.000	0.530	1.000	Y	NA
7474335	7474336	SPT_0587	SPT_0588	rbfA		FALSE	0.028	279.000	0.000	NA		NA
7474336	7474337	SPT_0588	SPT_0589			TRUE	0.893	2.000	0.000	NA		NA
7474337	7474338	SPT_0589	SPT_0590			TRUE	0.909	-3.000	0.000	NA		NA
7474340	7474341	SPT_0592	SPT_0593			TRUE	0.990	0.000	0.229	NA		NA
7474341	7474342	SPT_0593	SPT_0594			TRUE	0.973	10.000	0.114	NA		NA
7474342	7474343	SPT_0594	SPT_0595			TRUE	0.585	96.000	0.143	NA		NA
7474343	7474344	SPT_0595	SPT_0596			FALSE	0.014	413.000	0.000	1.000		NA
7474344	7474345	SPT_0596	SPT_0597			TRUE	0.985	-13.000	0.150	1.000		NA
7474345	7474346	SPT_0597	SPT_0598			TRUE	0.973	0.000	0.053	NA		NA
7474346	7474347	SPT_0598	SPT_0599		valS	TRUE	0.956	-7.000	0.008	NA		NA
7474347	7474348	SPT_0599	SPT_0600	valS		FALSE	0.235	81.000	0.000	1.000		NA
7474348	7474349	SPT_0600	SPT_0601			TRUE	0.494	51.000	0.000	NA		NA
7474349	7474350	SPT_0601	SPT_0602			FALSE	0.009	603.000	0.000	NA		NA
7474351	7474352	SPT_0603	SPT_0604			FALSE	0.044	226.000	0.000	NA		NA
7474353	7474354	SPT_0605	SPT_0606			FALSE	0.023	300.000	0.000	NA		NA
7474354	7474355	SPT_0606	SPT_0607			TRUE	0.977	18.000	0.259	1.000		NA
7474355	7474356	SPT_0607	SPT_0608			TRUE	0.995	13.000	0.318	1.000	Y	NA
7474356	7474357	SPT_0608	SPT_0609		pheS	FALSE	0.015	550.000	0.000	1.000	N	NA
7474357	7474358	SPT_0609	SPT_0610	pheS		TRUE	0.956	0.000	0.009	1.000		NA
7474358	7474359	SPT_0610	SPT_0611		pheT	TRUE	0.434	77.000	0.007	1.000		NA
7474361	7474362	SPT_0613	SPT_0614			FALSE	0.023	305.000	0.000	NA		NA
7474362	7474363	SPT_0614	SPT_0615		metE	FALSE	0.035	261.000	0.000	1.000		NA
7474363	7474364	SPT_0615	SPT_0616	metE	metF	TRUE	0.871	64.000	0.050	0.002	Y	NA
7474364	7474365	SPT_0616	SPT_0617	metF		FALSE	0.013	685.000	0.000	1.000	N	NA
7474365	7474366	SPT_0617	SPT_0618		cysE	TRUE	0.922	16.000	0.006	1.000	N	NA
7474366	7474367	SPT_0618	SPT_0619	cysE		TRUE	0.937	12.000	0.017	1.000		NA
7474367	7474368	SPT_0619	SPT_0620		cysS	FALSE	0.296	87.000	0.002	1.000		NA
7474368	7474369	SPT_0620	SPT_0621	cysS		TRUE	0.984	-7.000	0.129	1.000		NA
7474369	7474370	SPT_0621	SPT_0622			TRUE	0.951	4.000	0.017	NA		NA
7474370	7474371	SPT_0622	SPT_0623			TRUE	0.521	48.000	0.000	NA		NA
7474371	7474372	SPT_0623	SPT_0624			TRUE	0.892	-27.000	0.000	NA		NA
7474372	7474373	SPT_0624	SPT_0625			FALSE	0.092	146.000	0.000	NA		NA
7474373	7474374	SPT_0625	SPT_2271			FALSE	0.049	213.000	0.000	NA		NA
7474374	7474375	SPT_2271	SPT_0626			FALSE	0.282	73.000	0.000	NA		NA
7474375	7474376	SPT_0626	SPT_0627			TRUE	0.998	13.000	0.917	1.000	Y	NA
7474376	7474377	SPT_0627	SPT_0628			TRUE	0.983	52.000	0.542	1.000	Y	NA
7474377	7474378	SPT_0628	SPT_0629			TRUE	0.329	311.000	0.409	1.000	N	NA
7474378	7474379	SPT_0629	SPT_0630			TRUE	0.999	-3.000	1.000	1.000	Y	NA
7474379	7474380	SPT_0630	SPT_0631			FALSE	0.144	141.000	0.000	1.000	N	NA
7474381	7474382	SPT_0632	SPT_0633			FALSE	0.145	144.000	0.000	0.061	N	NA
7474382	7474383	SPT_0633	SPT_0634			TRUE	0.999	10.000	0.947	0.012	Y	NA
7474383	7474384	SPT_0634	SPT_0635			TRUE	0.996	13.000	0.400	0.043	Y	NA
7474384	7474385	SPT_0635	SPT_0636			TRUE	0.993	11.000	0.185	1.000	Y	NA
7474386	7474387	SPT_0637	SPT_0638	recJ		FALSE	0.069	175.000	0.000	1.000		NA
7474387	7474388	SPT_0638	SPT_0639			TRUE	0.750	69.000	0.143	NA		NA
7474388	7474389	SPT_0639	SPT_0640			TRUE	0.466	112.000	0.100	NA		NA
7474389	7474390	SPT_0640	SPT_0641			TRUE	0.997	5.000	0.467	0.008	Y	NA
7474390	7474391	SPT_0641	SPT_0642			TRUE	0.669	79.000	0.087	1.000	N	NA
7474391	7474392	SPT_0642	SPT_0643		uvrC	TRUE	0.763	40.000	0.002	1.000	N	NA
7474392	7474393	SPT_0643	SPT_0644	uvrC		TRUE	0.631	32.000	0.000	NA		NA
7474395	7474396	SPT_0646	SPT_0647		pepV	TRUE	0.888	13.000	0.000	1.000	N	NA
7474396	7474397	SPT_0647	SPT_0648	pepV		TRUE	0.777	54.000	0.031	NA	N	NA
7474397	7474398	SPT_0648	SPT_0649			FALSE	0.079	160.000	0.000	NA		NA
7474398	7474399	SPT_0649	SPT_0650			TRUE	0.808	16.000	0.000	NA		NA
7474399	7474400	SPT_0650	SPT_0651			FALSE	0.071	171.000	0.000	NA		NA
7474400	7474401	SPT_0651	SPT_0652			FALSE	0.236	98.000	0.000	1.000	N	NA
7474401	7474402	SPT_0652	SPT_0653			TRUE	0.985	2.000	0.007	1.000	Y	NA
7474402	7474403	SPT_0653	SPT_0654			TRUE	0.913	18.000	0.007	1.000	N	NA
7474405	7474406	SPT_0656	SPT_0657	rplK	rplA	TRUE	0.864	208.000	0.838	0.034	Y	NA
7474406	7474407	SPT_0657	SPT_2272	rplA		FALSE	0.011	482.000	0.000	NA		NA
7474409	7474410	SPT_0659	SPT_0660			FALSE	0.015	399.000	0.000	NA		NA
7474410	7474411	SPT_0660	SPT_0661			FALSE	0.014	410.000	0.000	NA		NA
7474411	7474412	SPT_0661	SPT_0662			TRUE	0.978	2.000	0.098	NA		NA
7474412	7474413	SPT_0662	SPT_0663			TRUE	0.976	2.000	0.083	NA		NA
7474413	7474414	SPT_0663	SPT_0664			FALSE	0.055	201.000	0.000	NA		NA
7474414	7474415	SPT_0664	SPT_0665			TRUE	0.899	-15.000	0.000	NA		NA
7474415	7474416	SPT_0665	SPT_0666			FALSE	0.008	733.000	0.000	NA		NA
7474416	7474417	SPT_0666	SPT_0667			FALSE	0.009	632.000	0.000	1.000		NA
7474417	7474418	SPT_0667	SPT_0668			TRUE	0.876	38.000	0.000	0.022	Y	NA
7474418	7474419	SPT_0668	SPT_0669			TRUE	0.842	48.000	0.000	0.034	Y	NA
7474419	7474420	SPT_0669	SPT_0670			FALSE	0.067	395.000	0.000	1.000	Y	NA
7474421	7474422	SPT_0671	SPT_0672			TRUE	0.891	-31.000	0.000	NA		NA
7474422	7474423	SPT_0672	SPT_0673			TRUE	0.904	0.000	0.000	NA		NA
7474423	7474424	SPT_0673	SPT_0674			FALSE	0.050	211.000	0.000	NA		NA
7474425	7474426	SPT_0676	SPT_0677			TRUE	0.900	-14.000	0.000	NA		NA
7474426	7474427	SPT_0677	SPT_0678			TRUE	0.981	-7.000	0.100	NA		NA
7474427	7474428	SPT_0678	SPT_0679			TRUE	0.973	12.000	0.136	NA		NA
7474428	7474429	SPT_0679	SPT_0680			FALSE	0.203	179.000	0.044	1.000		NA
7474429	7474430	SPT_0680	SPT_0682			FALSE	0.052	211.000	0.000	1.000		NA
7474430	7474431	SPT_0682	SPT_0683			TRUE	0.990	20.000	0.250	1.000	Y	NA
7474431	7474432	SPT_0683	SPT_0684			TRUE	0.999	11.000	0.875	1.000	Y	NA
7474432	7474433	SPT_0684	SPT_0685			TRUE	0.342	223.000	0.240	1.000		NA
7474433	7474434	SPT_0685	SPT_0686			TRUE	0.995	-3.000	0.480	0.012		NA
7474434	7474435	SPT_0686	SPT_0687			FALSE	0.296	116.000	0.020	NA		NA
7474435	7474436	SPT_0687	SPT_0688		zmpB	TRUE	0.884	22.000	0.020	NA		NA
7474436	7474437	SPT_0688	SPT_0689	zmpB		TRUE	0.563	61.000	0.006	1.000		NA
7474437	7474438	SPT_0689	SPT_0690			TRUE	0.949	1.000	0.006	NA		NA
7474438	7474439	SPT_0690	SPT_0691			TRUE	0.681	50.000	0.006	NA		NA
7474439	7474440	SPT_0691	SPT_0692			FALSE	0.246	127.000	0.015	NA		NA
7474440	7474441	SPT_0692	SPT_0693		thyA	TRUE	0.365	97.000	0.006	1.000	N	NA
7474443	7474444	SPT_0695	SPT_0696	miaA	hflX	TRUE	0.968	-7.000	0.027	1.000		NA
7474444	7474445	SPT_0696	SPT_0697	hflX		TRUE	0.961	-7.000	0.014	NA		NA
7474445	7474446	SPT_0697	SPT_0698		rnz	TRUE	0.928	15.000	0.022	NA		NA
7474446	7474447	SPT_0698	SPT_0699	rnz		TRUE	0.930	21.000	0.074	1.000		NA
7474449	7474450	SPT_0701	SPT_0702			TRUE	0.969	0.000	0.035	NA		NA
7474450	7474451	SPT_0702	SPT_0703			FALSE	0.197	89.000	0.000	NA		NA
7474453	7474454	SPT_0705	SPT_0706	typA		TRUE	0.885	20.000	0.015	NA		NA
7474454	7474455	SPT_0706	SPT_0707			FALSE	0.018	365.000	0.000	NA		NA
7474455	7474456	SPT_0707	SPT_0708			FALSE	0.292	71.000	0.000	NA		NA
7474456	7474457	SPT_0708	SPT_0709			TRUE	0.998	2.000	1.000	NA		NA
7474457	7474458	SPT_0709	SPT_0710		murD	FALSE	0.216	104.000	0.000	1.000	N	NA
7474458	7474459	SPT_0710	SPT_0711	murD		TRUE	0.991	2.000	0.060	1.000	Y	NA
7474459	7474460	SPT_0711	SPT_0712			TRUE	0.988	10.000	0.072	NA	Y	NA
7474460	7474461	SPT_0712	SPT_0713		pyrF	FALSE	0.061	233.000	0.000	NA	N	NA
7474461	7474462	SPT_0713	SPT_0714	pyrF	pyrE	TRUE	0.923	34.000	0.006	1.000	Y	NA
7474462	7474463	SPT_0714	SPT_0715	pyrE		FALSE	0.011	461.000	0.000	NA		NA
7474463	7474464	SPT_0715	SPT_0716			TRUE	0.864	96.000	0.667	NA		NA
7474464	7474465	SPT_0716	SPT_0717			TRUE	0.996	-51.000	0.667	NA		NA
7474465	7474466	SPT_0717	SPT_0718			TRUE	0.623	273.000	1.000	NA		NA
7474466	7474467	SPT_0718	SPT_0719			TRUE	0.998	-3.000	1.000	NA		NA
7474468	7474469	SPT_0721	SPT_0722			TRUE	0.845	12.000	0.000	NA		NA
7474469	7474470	SPT_0722	SPT_0723			TRUE	0.900	1.000	0.000	NA		NA
7474472	7474473	SPT_0726	SPT_0727			TRUE	0.999	-40.000	0.841	0.012	Y	NA
7474474	7474475	SPT_0728	SPT_0729		lysS	FALSE	0.115	128.000	0.000	1.000		NA
7474475	7474476	SPT_0729	SPT_0730	lysS		FALSE	0.014	420.000	0.000	1.000		NA
7474476	7474477	SPT_0730	SPT_0731		lctO	FALSE	0.010	567.000	0.000	1.000		NA
7474477	7474478	SPT_0731	SPT_0732	lctO		FALSE	0.014	556.000	0.000	NA	N	NA
7474478	7474479	SPT_0732	SPT_0733		thiM	FALSE	0.060	237.000	0.000	NA	N	NA
7474479	7474480	SPT_0733	SPT_0734	thiM	thiE1	TRUE	0.991	2.000	0.061	0.005	Y	NA
7474480	7474481	SPT_0734	SPT_0735	thiE1		FALSE	0.009	559.000	0.000	NA		NA
7474481	7474482	SPT_0735	SPT_0736			TRUE	0.900	1.000	0.000	NA		NA
7474482	7474483	SPT_0736	SPT_0737			TRUE	0.893	2.000	0.000	NA		NA
7474483	7474484	SPT_0737	SPT_0738			TRUE	0.954	11.000	0.050	NA		NA
7474484	7474485	SPT_0738	SPT_0739		thiW	TRUE	0.963	5.000	0.052	NA		NA
7474485	7474486	SPT_0739	SPT_0740	thiW		TRUE	0.974	0.000	0.059	NA		NA
7474486	7474487	SPT_0740	SPT_0741		thiE2	TRUE	0.996	-7.000	0.190	0.005	Y	NA
7474489	7474490	SPT_0743	SPT_0744			TRUE	0.985	11.000	0.250	NA		NA
7474490	7474491	SPT_0744	SPT_0745			TRUE	0.979	10.000	0.167	NA		NA
7474491	7474492	SPT_0745	SPT_0746		spxB	FALSE	0.079	207.000	0.000	1.000	N	NA
7474492	7474493	SPT_0746	SPT_0747	spxB		TRUE	0.444	111.000	0.083	NA		NA
7474494	7474495	SPT_0748	SPT_0749			TRUE	0.888	-112.000	0.000	NA		NA
7474495	7474496	SPT_0749	SPT_0750			TRUE	0.909	-3.000	0.000	NA		NA
7474497	7474498	SPT_0751	SPT_0752		manA	FALSE	0.134	121.000	0.000	0.025		NA
7474501	7474502	SPT_0755	SPT_0756			TRUE	0.751	20.000	0.000	NA		NA
7474502	7474503	SPT_0756	SPT_0757			TRUE	0.615	59.000	0.012	NA		NA
7474504	7474505	SPT_0758	SPT_0759			TRUE	0.834	19.000	0.000	1.000	N	NA
7474505	7474506	SPT_0759	SPT_0760		upp	TRUE	0.837	68.000	0.041	1.000	Y	NA
7474506	7474507	SPT_0760	SPT_0761	upp	clpP	FALSE	0.186	174.000	0.010	1.000	N	NA
7474507	7474508	SPT_0761	SPT_0762	clpP		TRUE	0.575	79.000	0.065	NA		NA
7474508	7474509	SPT_0762	SPT_0763			TRUE	0.516	102.000	0.109	NA		NA
7474509	7474510	SPT_0763	SPT_0764			TRUE	0.400	268.000	0.150	1.000	Y	NA
7474510	7474511	SPT_0764	SPT_0765			TRUE	0.997	4.000	0.363	0.042	Y	NA
7474511	7474512	SPT_0765	SPT_0766			TRUE	0.997	0.000	0.349	1.000	Y	NA
7474512	7474513	SPT_0766	SPT_0767			TRUE	0.994	0.000	0.128	0.035	Y	NA
7474513	7474514	SPT_0767	SPT_0768			FALSE	0.118	414.000	0.214	1.000		NA
7474514	7474515	SPT_0768	SPT_0769		prfB	FALSE	0.050	214.000	0.000	1.000		NA
7474515	7474516	SPT_0769	SPT_0770	prfB	ftsE	TRUE	0.947	18.000	0.053	1.000	N	NA
7474516	7474517	SPT_0770	SPT_0771	ftsE		TRUE	0.998	-7.000	0.431	1.000	Y	NA
7474517	7474518	SPT_0771	SPT_0772			FALSE	0.042	286.000	0.000	0.076	N	NA
7474518	7474519	SPT_0772	SPT_0773			TRUE	0.963	52.000	0.610	NA		NA
7474519	7474520	SPT_0773	SPT_0774			FALSE	0.099	140.000	0.000	NA		NA
7474520	7474521	SPT_0774	SPT_0775		metK	FALSE	0.026	377.000	0.000	1.000	N	NA
7474523	7474524	SPT_0777	SPT_0778		holA	TRUE	0.792	34.000	0.002	1.000	N	NA
7474524	7474525	SPT_0778	SPT_0779	holA		FALSE	0.197	173.000	0.012	1.000	N	NA
7474525	7474526	SPT_0779	SPT_0780			FALSE	0.200	157.000	0.021	NA		NA
7474526	7474527	SPT_0780	SPT_0781			TRUE	0.883	21.000	0.016	NA		NA
7474527	7474528	SPT_0781	SPT_0782			TRUE	0.958	0.000	0.012	NA		NA
7474528	7474529	SPT_0782	SPT_0783			TRUE	0.962	2.000	0.027	NA		NA
7474530	7474531	SPT_0784	SPT_0785			FALSE	0.216	84.000	0.000	NA		NA
7474531	7474532	SPT_0785	SPT_0786			FALSE	0.011	479.000	0.000	NA		NA
7474533	7474534	SPT_0787	SPT_0788	rpsP		TRUE	0.981	20.000	0.385	1.000		NA
7474537	7474538	SPT_0794	SPT_0795			TRUE	0.909	-3.000	0.000	NA		NA
7474539	7474540	SPT_0796	SPT_0797			FALSE	0.063	184.000	0.000	NA		NA
7474540	7474541	SPT_0797	SPT_0798			FALSE	0.140	114.000	0.000	1.000		NA
7474541	7474542	SPT_0798	SPT_0799			FALSE	0.030	273.000	0.000	NA		NA
7474542	7474543	SPT_0799	SPT_0800			FALSE	0.103	193.000	0.003	NA		NA
7474543	7474544	SPT_0800	SPT_0801			TRUE	0.745	260.000	0.651	0.001	Y	NA
7474544	7474545	SPT_0801	SPT_0802			TRUE	0.786	42.000	0.020	NA		NA
7474546	7474547	SPT_0803	SPT_0804			TRUE	0.989	19.000	0.588	NA		NA
7474547	7474548	SPT_0804	SPT_0805			TRUE	0.873	60.000	0.243	NA		NA
7474549	7474550	SPT_0806	SPT_0807			FALSE	0.158	152.000	0.005	1.000		NA
7474550	7474551	SPT_0807	SPT_0808			TRUE	0.998	1.000	0.488	NA	Y	NA
7474552	7474553	SPT_0809	SPT_0810			TRUE	0.986	-3.000	0.146	1.000		NA
7474554	7474555	SPT_0811	SPT_0812			TRUE	0.963	0.000	0.019	1.000		NA
7474555	7474556	SPT_0812	SPT_0813			TRUE	0.980	-6.000	0.050	1.000	N	NA
7474556	7474557	SPT_0813	SPT_0814			FALSE	0.215	158.000	0.010	1.000	N	NA
7474557	7474558	SPT_0814	SPT_0815			TRUE	0.997	0.000	0.310	1.000	Y	NA
7474558	7474559	SPT_0815	SPT_0816			TRUE	0.838	78.000	0.364	NA		NA
7474559	7474560	SPT_0816	SPT_0817		trxB	TRUE	0.750	66.000	0.117	NA		NA
7474561	7474562	SPT_0818	SPT_0819		def1	TRUE	0.880	45.000	0.002	1.000	Y	NA
7474562	7474563	SPT_0819	SPT_0820	def1		FALSE	0.020	324.000	0.000	NA		NA
7474564	7474565	SPT_0822	SPT_0823			TRUE	0.733	22.000	0.000	NA		NA
7474565	7474566	SPT_0823	SPT_0824			TRUE	0.983	2.000	0.143	1.000		NA
7474566	7474567	SPT_0824	SPT_0825			FALSE	0.216	84.000	0.000	NA		NA
7474567	7474568	SPT_0825	SPT_0826			TRUE	0.993	-3.000	0.326	NA		NA
7474568	7474569	SPT_0826	SPT_0827			TRUE	0.959	9.000	0.047	1.000		NA
7474575	7474576	SPT_0835	SPT_0836			TRUE	0.997	-16.000	0.294	0.008	Y	NA
7474576	7474577	SPT_0836	SPT_0837			TRUE	0.850	11.000	0.000	NA		NA
7474577	7474578	SPT_0837	SPT_0838			TRUE	0.998	0.000	1.000	NA		NA
7474578	7474579	SPT_0838	SPT_0839			TRUE	0.993	-12.000	0.357	1.000		NA
7474580	7474581	SPT_0842	SPT_0843			FALSE	0.084	154.000	0.000	NA		NA
7474581	7474582	SPT_0843	SPT_0845			TRUE	0.909	-3.000	0.000	NA		NA
7474585	7474586	SPT_0848	SPT_0849			FALSE	0.011	505.000	0.000	1.000		NA
7474586	7474587	SPT_0849	SPT_0850			TRUE	0.969	16.000	0.154	NA		NA
7474587	7474588	SPT_0850	SPT_0851			FALSE	0.016	386.000	0.000	NA		NA
7474588	7474589	SPT_0851	SPT_0852			TRUE	0.981	-10.000	0.103	NA		NA
7474589	7474590	SPT_0852	SPT_0853		pncB	FALSE	0.300	116.000	0.021	NA		NA
7474590	7474591	SPT_0853	SPT_0854	pncB	nadE	TRUE	0.996	-3.000	0.194	0.004	Y	NA
7474591	7474592	SPT_0854	SPT_0855	nadE		FALSE	0.052	350.000	0.007	1.000	N	NA
7474592	7474593	SPT_0855	SPT_0856			FALSE	0.007	1462.000	0.000	NA		NA
7474593	7474594	SPT_0856	SPT_0857			FALSE	0.045	224.000	0.000	NA		NA
7474596	7474597	SPT_0859	SPT_0860		rpsU	FALSE	0.208	140.000	0.011	1.000		NA
7474597	7474598	SPT_0860	SPT_0861	rpsU	hprK	FALSE	0.226	130.000	0.011	1.000		NA
7474598	7474599	SPT_0861	SPT_0862	hprK	lgt	TRUE	0.996	-7.000	0.494	1.000	N	NA
7474599	7474600	SPT_0862	SPT_0863	lgt		TRUE	0.976	1.000	0.079	NA		NA
7474600	7474601	SPT_0863	SPT_0864			TRUE	0.974	16.000	0.206	NA		NA
7474601	7474602	SPT_0864	SPT_0865			TRUE	0.438	84.000	0.021	NA		NA
7474602	7474603	SPT_0865	SPT_0866			TRUE	0.974	5.000	0.060	1.000	N	NA
7474603	7474604	SPT_0866	SPT_0867			TRUE	0.967	11.000	0.055	1.000	N	NA
7474604	7474605	SPT_0867	SPT_0868			TRUE	0.993	-10.000	0.330	NA		NA
7474605	7474606	SPT_0868	SPT_0869			FALSE	0.051	210.000	0.000	NA		NA
7474606	7474607	SPT_0869	SPT_0870			TRUE	0.987	0.000	0.169	NA		NA
7474607	7474608	SPT_0870	SPT_0871			TRUE	0.993	-10.000	0.337	NA		NA
7474608	7474609	SPT_0871	SPT_0872			TRUE	0.991	1.000	0.229	NA	N	NA
7474611	7474612	SPT_0874	SPT_0875		pstC1	TRUE	0.996	0.000	0.206	1.000	Y	NA
7474612	7474613	SPT_0875	SPT_0876	pstC1	pstA1	TRUE	0.999	-10.000	0.907	0.004	Y	NA
7474613	7474614	SPT_0876	SPT_0877	pstA1	pstB1	TRUE	0.997	11.000	0.490	0.004	Y	NA
7474614	7474615	SPT_0877	SPT_0878	pstB1	pstB2	TRUE	0.997	13.000	0.542	0.002	Y	NA
7474615	7474616	SPT_0878	SPT_0879	pstB2	phoU1	TRUE	0.996	12.000	0.413	NA	Y	NA
7474616	7474617	SPT_0879	SPT_0880	phoU1		FALSE	0.118	157.000	0.000	NA	N	NA
7474619	7474620	SPT_0882	SPT_0884			TRUE	0.954	10.000	0.042	NA		NA
7474620	7474621	SPT_0884	SPT_0885		murB	FALSE	0.239	112.000	0.005	NA		NA
7474621	7474622	SPT_0885	SPT_0886	murB		TRUE	0.749	59.000	0.041	1.000	N	NA
7474622	7474623	SPT_0886	SPT_0887			TRUE	0.999	-19.000	0.928	0.041	Y	NA
7474623	7474624	SPT_0887	SPT_0888			TRUE	0.998	-3.000	0.492	0.041	Y	NA
7474624	7474625	SPT_0888	SPT_0889			TRUE	0.997	-3.000	0.253	0.041	Y	NA
7474625	7474626	SPT_0889	SPT_0890			FALSE	0.008	759.000	0.000	NA		NA
7474626	7474627	SPT_0890	SPT_0891		alaS	TRUE	0.851	22.000	0.006	NA		NA
7474629	7474630	SPT_0893	SPT_0894			TRUE	0.992	-19.000	0.341	NA		NA
7474630	7474631	SPT_0894	SPT_0895			FALSE	0.008	685.000	0.000	NA		NA
7474631	7474632	SPT_0895	SPT_0896		aroD	TRUE	0.984	-3.000	0.125	NA		NA
7474632	7474633	SPT_0896	SPT_0897	aroD	aroE	TRUE	0.998	-10.000	0.500	1.000	Y	NA
7474633	7474634	SPT_0897	SPT_0898	aroE	aroB	TRUE	0.964	19.000	0.010	1.000	Y	NA
7474634	7474635	SPT_0898	SPT_0899	aroB	aroC	TRUE	0.991	10.000	0.110	0.004	Y	NA
7474635	7474636	SPT_0899	SPT_0900	aroC		TRUE	0.980	10.000	0.010	1.000	Y	NA
7474636	7474637	SPT_0900	SPT_0901			TRUE	0.958	11.000	0.058	NA		NA
7474637	7474638	SPT_0901	SPT_0902		aroA	FALSE	0.293	92.000	0.003	NA		NA
7474638	7474639	SPT_0902	SPT_0903	aroA	aroK	TRUE	0.988	-7.000	0.012	1.000	Y	NA
7474639	7474640	SPT_0903	SPT_0904	aroK		TRUE	0.990	-3.000	0.025	1.000	Y	NA
7474640	7474641	SPT_0904	SPT_0905			TRUE	0.975	-3.000	0.025	NA	N	NA
7474641	7474642	SPT_0905	SPT_0906			FALSE	0.042	279.000	0.000	NA	N	NA
7474642	7474643	SPT_0906	SPT_0907			TRUE	0.999	-10.000	0.667	NA	Y	NA
7474643	7474644	SPT_0907	SPT_0908			TRUE	0.990	2.000	0.250	1.000		NA
7474644	7474645	SPT_0908	SPT_0909			TRUE	0.977	16.000	0.222	NA		NA
7474645	7474646	SPT_0909	SPT_0910			TRUE	0.966	29.000	0.333	NA		NA
7474646	7474647	SPT_0910	SPT_0911			FALSE	0.056	200.000	0.000	NA		NA
7474647	7474648	SPT_0911	SPT_0912			FALSE	0.087	151.000	0.000	NA		NA
7474648	7474649	SPT_0912	SPT_0914		thrB	TRUE	0.879	4.000	0.000	NA		NA
7474649	7474650	SPT_0914	SPT_0915	thrB		TRUE	0.808	16.000	0.000	NA		NA
7474650	7474651	SPT_0915	SPT_0916			TRUE	0.663	29.000	0.000	NA		NA
7474651	7474652	SPT_0916	SPT_0917			TRUE	0.754	58.000	0.035	1.000	N	NA
7474652	7474653	SPT_0917	SPT_0918			TRUE	0.999	2.000	0.895	0.008	Y	NA
7474653	7474654	SPT_0918	SPT_0919			FALSE	0.053	257.000	0.000	1.000	N	NA
7474654	7474655	SPT_0919	SPT_0920			FALSE	0.057	250.000	0.000	1.000	N	NA
7474655	7474656	SPT_0920	SPT_0921		rplL	TRUE	0.979	76.000	0.884	0.024	Y	NA
7474656	7474657	SPT_0921	SPT_0922	rplL		FALSE	0.038	247.000	0.000	NA		NA
7474659	7474660	SPT_0924	SPT_0925			TRUE	0.631	32.000	0.000	NA		NA
7474660	7474661	SPT_0925	SPT_0926			TRUE	0.909	-3.000	0.000	NA		NA
7474662	7474663	SPT_0927	SPT_0928	rpmE		TRUE	0.371	96.000	0.020	1.000		NA
7474664	7474665	SPT_0929	SPT_0930			TRUE	0.601	116.000	0.167	1.000	N	NA
7474665	7474666	SPT_0930	SPT_0931			TRUE	0.975	-3.000	0.023	1.000	N	NA
7474666	7474667	SPT_0931	SPT_0932			TRUE	0.996	-6.000	0.160	0.074	Y	NA
7474667	7474668	SPT_0932	SPT_0933		rplS	FALSE	0.275	119.000	0.004	1.000	N	NA
7474668	7474669	SPT_0933	SPT_0934	rplS		TRUE	0.567	42.000	0.000	NA		NA
7474670	7474671	SPT_0935	SPT_0936			TRUE	0.561	43.000	0.000	1.000		NA
7474671	7474672	SPT_0936	SPT_0937			TRUE	0.945	13.000	0.035	1.000		NA
7474673	7474674	SPT_0938	SPT_0939			TRUE	0.346	91.000	0.009	NA		NA
7474674	7474675	SPT_0939	SPT_0940		ffh	TRUE	0.975	12.000	0.151	1.000		NA
7474676	7474677	SPT_0941	SPT_0942		gidB	FALSE	0.055	254.000	0.000	1.000	N	NA
7474678	7474679	SPT_0943	SPT_0944			TRUE	0.988	2.000	0.222	NA		NA
7474680	7474681	SPT_0945	SPT_0946			FALSE	0.012	449.000	0.000	NA		NA
7474682	7474683	SPT_0947	SPT_0948		nth	TRUE	0.941	0.000	0.002	NA		NA
7474683	7474684	SPT_0948	SPT_0949	nth		FALSE	0.075	211.000	0.000	1.000	N	NA
7474684	7474685	SPT_0949	SPT_0950		pyrB	TRUE	0.990	19.000	0.247	1.000	Y	NA
7474685	7474686	SPT_0950	SPT_0951	pyrB	carA	TRUE	0.900	50.000	0.014	1.000	Y	NA
7474686	7474687	SPT_0951	SPT_0952	carA	carB	FALSE	0.290	313.000	0.117	0.001	Y	NA
7474688	7474689	SPT_0953	SPT_0954			TRUE	0.999	2.000	1.000	NA	Y	NA
7474689	7474690	SPT_0954	SPT_0956			TRUE	0.992	10.000	0.500	NA		NA
7474691	7474692	SPT_0957	SPT_0958			TRUE	0.993	5.000	0.367	1.000	N	NA
7474692	7474693	SPT_0958	SPT_0959			TRUE	0.957	17.000	0.074	NA	N	NA
7474693	7474694	SPT_0959	SPT_0960			TRUE	0.997	-10.000	0.667	NA		NA
7474694	7474695	SPT_0960	SPT_0961			TRUE	0.973	12.000	0.133	1.000		NA
7474695	7474696	SPT_0961	SPT_0962		dprA	TRUE	0.335	96.000	0.002	1.000	N	NA
7474698	7474699	SPT_0964	SPT_0965		topA	FALSE	0.073	167.000	0.000	NA		NA
7474699	7474700	SPT_0965	SPT_0966	topA		FALSE	0.149	106.000	0.000	NA		NA
7474700	7474701	SPT_0966	SPT_0967			TRUE	0.368	93.000	0.015	NA		NA
7474701	7474702	SPT_0967	SPT_0968			TRUE	0.801	44.000	0.040	NA		NA
7474702	7474703	SPT_0968	SPT_0970			TRUE	0.765	19.000	0.000	NA		NA
7474703	7474704	SPT_0970	SPT_0971		leuB	TRUE	0.845	12.000	0.000	NA		NA
7474704	7474705	SPT_0971	SPT_0972	leuB		TRUE	0.956	-3.000	0.007	NA		NA
7474705	7474706	SPT_0972	SPT_0973			TRUE	0.879	4.000	0.000	NA		NA
7474706	7474707	SPT_0973	SPT_0974			FALSE	0.047	219.000	0.000	NA		NA
7474707	7474708	SPT_0974	SPT_0975			TRUE	0.871	6.000	0.000	NA		NA
7474708	7474709	SPT_0975	SPT_0976			TRUE	0.896	-19.000	0.000	NA		NA
7474709	7474710	SPT_0976	SPT_0977			FALSE	0.074	166.000	0.000	NA		NA
7474710	7474711	SPT_0977	SPT_0978			TRUE	0.998	-16.000	0.467	NA	Y	NA
7474711	7474712	SPT_0978	SPT_0979		guaC	FALSE	0.098	175.000	0.000	NA	N	NA
7474712	7474713	SPT_0979	SPT_0980	guaC		TRUE	0.360	63.000	0.000	NA		NA
7474713	7474714	SPT_0980	SPT_0981		rnc	FALSE	0.066	179.000	0.000	NA		NA
7474714	7474715	SPT_0981	SPT_0982	rnc	smc	TRUE	0.987	-9.000	0.120	1.000	N	NA
7474715	7474716	SPT_0982	SPT_0983	smc		TRUE	0.954	-3.000	0.006	1.000		NA
7474716	7474717	SPT_0983	SPT_0984			TRUE	0.982	0.000	0.103	0.019		NA
7474717	7474718	SPT_0984	SPT_0985			TRUE	0.940	4.000	0.005	0.073		NA
7474719	7474720	SPT_0986	SPT_0987	zwf		FALSE	0.273	149.000	0.021	1.000	N	NA
7474720	7474721	SPT_0987	SPT_0988			TRUE	0.997	0.000	0.326	1.000	Y	NA
7474722	7474723	SPT_0989	SPT_0990		uvrB	TRUE	0.364	77.000	0.002	NA		NA
7474723	7474724	SPT_0990	SPT_0991	uvrB		TRUE	0.934	10.000	0.002	1.000	N	NA
7474724	7474725	SPT_0991	SPT_0992			TRUE	0.957	-34.000	0.014	0.013		NA
7474725	7474726	SPT_0992	SPT_0994			TRUE	0.529	73.000	0.021	1.000		NA
7474727	7474728	SPT_0993	SPT_0995			TRUE	0.969	12.000	0.107	NA		NA
7474728	7474729	SPT_0995	SPT_0996			FALSE	0.069	296.000	0.026	NA		NA
7474729	7474730	SPT_0996	SPT_0997		coaC	TRUE	0.960	-16.000	0.019	NA		NA
7474730	7474731	SPT_0997	SPT_0998	coaC	coaB	TRUE	0.933	12.000	0.013	1.000		NA
7474732	7474733	SPT_0999	SPT_1000	fhs	mutY	FALSE	0.030	329.000	0.000	1.000	N	NA
7474733	7474734	SPT_1000	SPT_1001	mutY		TRUE	0.664	55.000	0.002	1.000	N	NA
7474734	7474735	SPT_1001	SPT_1002			TRUE	0.999	-7.000	0.597	0.012	Y	NA
7474735	7474736	SPT_1002	SPT_1003			TRUE	0.966	2.000	0.038	1.000		NA
7474736	7474737	SPT_1003	SPT_1004			FALSE	0.190	91.000	0.000	NA		NA
7474737	7474738	SPT_1004	SPT_1005			TRUE	0.993	2.000	0.400	NA		NA
7474738	7474739	SPT_1005	SPT_1006			TRUE	0.527	47.000	0.000	NA		NA
7474740	7474741	SPT_1007	SPT_1008			FALSE	0.022	309.000	0.000	1.000		NA
7474742	7474743	SPT_1010	SPT_1011	gyrA		TRUE	0.969	0.000	0.013	NA	N	NA
7474743	7474744	SPT_1011	SPT_1012			FALSE	0.058	244.000	0.000	NA	N	NA
7474744	7474745	SPT_1012	SPT_1014			FALSE	0.091	148.000	0.000	NA		NA
7474745	7474746	SPT_1014	SPT_1015			FALSE	0.071	171.000	0.000	NA		NA
7474746	7474747	SPT_1015	SPT_1016		truB	TRUE	0.939	10.000	0.014	NA		NA
7474747	7474748	SPT_1016	SPT_1017	truB		FALSE	0.039	241.000	0.000	NA		NA
7474748	7474749	SPT_1017	SPT_1018		udk	TRUE	0.344	65.000	0.000	NA		NA
7474749	7474750	SPT_1018	SPT_1019	udk	xseA	FALSE	0.236	128.000	0.002	1.000	N	NA
7474750	7474751	SPT_1019	SPT_1020	xseA		TRUE	0.998	-22.000	0.412	0.001	Y	NA
7474751	7474752	SPT_1020	SPT_1021			TRUE	0.986	-3.000	0.100	1.000	N	NA
7474752	7474753	SPT_1021	SPT_1022		tylA	TRUE	0.981	-7.000	0.058	1.000	N	NA
7474753	7474754	SPT_1022	SPT_1023	tylA		TRUE	0.979	-7.000	0.048	1.000	N	NA
7474754	7474755	SPT_1023	SPT_1024		recN	TRUE	0.967	7.000	0.037	1.000	N	NA
7474755	7474756	SPT_1024	SPT_1025	recN		TRUE	0.944	2.000	0.005	1.000		NA
7474756	7474757	SPT_1025	SPT_1026		lepA	TRUE	0.345	79.000	0.002	1.000		NA
7474759	7474760	SPT_1028	SPT_1029			TRUE	0.876	38.000	0.000	0.021	Y	NA
7474760	7474761	SPT_1029	SPT_1030			TRUE	0.867	8.000	0.000	NA		NA
7474761	7474762	SPT_1030	SPT_1031			FALSE	0.083	156.000	0.000	NA		NA
7474762	7474763	SPT_1031	SPT_1032			TRUE	0.606	37.000	0.000	1.000		NA
7474763	7474764	SPT_1032	SPT_1033		lacA	FALSE	0.084	157.000	0.000	1.000		NA
7474764	7474765	SPT_1033	SPT_1034	lacA	lacB	TRUE	0.987	31.000	0.333	0.001	Y	NA
7474765	7474766	SPT_1034	SPT_1035	lacB	lacC	TRUE	0.997	11.000	0.500	1.000	Y	NA
7474766	7474767	SPT_1035	SPT_1036	lacC	lacD	TRUE	0.999	2.000	0.800	0.001	Y	NA
7474767	7474768	SPT_1036	SPT_1037	lacD		FALSE	0.042	233.000	0.000	1.000		NA
7474768	7474769	SPT_1037	SPT_1038			TRUE	0.971	36.000	0.500	1.000		NA
7474769	7474770	SPT_1038	SPT_1039			TRUE	0.999	0.000	0.600	0.021	Y	NA
7474770	7474771	SPT_1039	SPT_1040		lacG2	TRUE	0.560	215.000	0.200	1.000	Y	NA
7474771	7474772	SPT_1040	SPT_1041	lacG2		TRUE	0.751	121.000	0.500	NA		NA
7474773	7474774	SPT_1042	SPT_1043			FALSE	0.260	182.000	0.056	1.000	N	NA
7474774	7474775	SPT_1043	SPT_1044			TRUE	0.802	188.000	0.500	0.001	Y	NA
7474775	7474776	SPT_1044	SPT_1045			TRUE	0.902	81.000	0.562	1.000	N	NA
7474777	7474778	SPT_1046	SPT_1047		ptsP	TRUE	0.995	6.000	0.240	0.021	Y	NA
7474780	7474781	SPT_1049	SPT_1050			FALSE	0.051	210.000	0.000	NA		NA
7474782	7474783	SPT_1051	SPT_1052			TRUE	0.909	-3.000	0.000	NA		NA
7474784	7474785	SPT_1053	SPT_1054			FALSE	0.025	295.000	0.000	NA		NA
7474787	7474788	SPT_1056	SPT_1057			FALSE	0.020	322.000	0.000	NA		NA
7474788	7474789	SPT_1057	SPT_1058		lepB2	TRUE	0.904	0.000	0.000	NA		NA
7474789	7474790	SPT_1058	SPT_1059	lepB2		TRUE	0.989	0.000	0.212	NA		NA
7474790	7474791	SPT_1059	SPT_1060		srtB	TRUE	0.989	18.000	0.571	NA		NA
7474791	7474792	SPT_1060	SPT_1061	srtB		FALSE	0.039	241.000	0.000	NA		NA
7474792	7474793	SPT_1061	SPT_1062		hemH	FALSE	0.155	103.000	0.000	NA		NA
7474794	7474795	SPT_1063	SPT_1064	mscL		TRUE	0.367	82.000	0.003	0.054		NA
7474796	7474797	SPT_1065	SPT_1066			FALSE	0.162	100.000	0.000	NA		NA
7474797	7474798	SPT_1066	SPT_1067		asd	FALSE	0.019	340.000	0.000	NA		NA
7474798	7474799	SPT_1067	SPT_1068	asd	dapA	TRUE	0.911	56.000	0.063	1.000	Y	NA
7474800	7474801	SPT_1069	SPT_1070	trmE		FALSE	0.173	136.000	0.003	1.000		NA
7474802	7474803	SPT_1071	SPT_1072	tdk	prfA	TRUE	0.982	-3.000	0.062	1.000	N	NA
7474803	7474804	SPT_1072	SPT_1073	prfA	hemK	TRUE	0.993	0.000	0.084	1.000	Y	NA
7474804	7474805	SPT_1073	SPT_1074	hemK		TRUE	0.989	-16.000	0.029	NA	Y	NA
7474805	7474806	SPT_1074	SPT_1075			TRUE	0.953	2.000	0.012	NA		NA
7474806	7474807	SPT_1075	SPT_1076		glyA	TRUE	0.702	62.000	0.056	1.000		NA
7474807	7474808	SPT_1076	SPT_1077	glyA		TRUE	0.973	8.000	0.103	NA		NA
7474808	7474809	SPT_1077	SPT_1078			TRUE	0.983	0.000	0.128	NA		NA
7474809	7474810	SPT_1078	SPT_1079			TRUE	0.512	74.000	0.019	NA		NA
7474810	7474811	SPT_1079	SPT_1080		rumA1	TRUE	0.511	74.000	0.019	NA		NA
7474811	7474812	SPT_1080	SPT_1081	rumA1		FALSE	0.012	738.000	0.000	1.000	N	NA
7474812	7474813	SPT_1081	SPT_1082			FALSE	0.023	393.000	0.000	1.000	N	NA
7474813	7474814	SPT_1082	SPT_1083			TRUE	0.999	-10.000	0.778	1.000	Y	NA
7474814	7474815	SPT_1083	SPT_1084			TRUE	0.999	0.000	0.800	0.040	Y	NA
7474815	7474816	SPT_1084	SPT_1085			TRUE	0.997	0.000	0.250	1.000	Y	NA
7474816	7474817	SPT_1085	SPT_1086			FALSE	0.008	688.000	0.000	NA		NA
7474817	7474818	SPT_1086	SPT_1087			FALSE	0.021	314.000	0.000	NA		NA
7474818	7474819	SPT_1087	SPT_1088			TRUE	0.921	74.000	0.667	NA		NA
7474819	7474820	SPT_1088	SPT_1089			FALSE	0.074	166.000	0.000	NA		NA
7474820	7474821	SPT_1089	SPT_1091			FALSE	0.016	382.000	0.000	NA		NA
7474821	7474822	SPT_1091	SPT_1092			TRUE	0.734	127.000	0.500	NA		NA
7474822	7474823	SPT_1092	SPT_1093			FALSE	0.008	684.000	0.000	NA		NA
7474823	7474824	SPT_1093	SPT_1094			FALSE	0.187	92.000	0.000	NA		NA
7474824	7474825	SPT_1094	SPT_1096			FALSE	0.031	268.000	0.000	NA		NA
7474825	7474826	SPT_1096	SPT_1097			FALSE	0.020	321.000	0.000	NA		NA
7474826	7474827	SPT_1097	SPT_1098			TRUE	0.783	62.000	0.125	NA		NA
7474827	7474828	SPT_1098	SPT_1099			TRUE	0.413	58.000	0.000	NA		NA
7474828	7474829	SPT_1099	SPT_1100			TRUE	0.487	112.000	0.077	NA	N	NA
7474829	7474830	SPT_1100	SPT_1101			FALSE	0.077	163.000	0.000	NA		NA
7474830	7474831	SPT_1101	SPT_1104			FALSE	0.029	275.000	0.000	NA		NA
7474831	7474832	SPT_1104	SPT_1105			TRUE	0.438	56.000	0.000	NA		NA
7474832	7474833	SPT_1105	SPT_1106			FALSE	0.169	97.000	0.000	NA		NA
7474833	7474834	SPT_1106	SPT_1107			TRUE	0.663	29.000	0.000	NA		NA
7474834	7474835	SPT_1107	SPT_1108			FALSE	0.028	282.000	0.000	NA		NA
7474835	7474836	SPT_1108	SPT_1109			FALSE	0.096	143.000	0.000	NA		NA
7474836	7474837	SPT_1109	SPT_1110			FALSE	0.032	264.000	0.000	NA		NA
7474837	7474838	SPT_1110	SPT_1111		ppc	TRUE	0.924	20.000	0.028	1.000	N	NA
7474838	7474839	SPT_1111	SPT_1112	ppc		FALSE	0.014	413.000	0.000	NA		NA
7474839	7474840	SPT_1112	SPT_1113			TRUE	0.877	69.000	0.368	NA		NA
7474840	7474841	SPT_1113	SPT_1114			TRUE	0.998	-3.000	0.895	1.000		NA
7474841	7474842	SPT_1114	SPT_1115		dnaG	FALSE	0.296	90.000	0.002	1.000		NA
7474842	7474843	SPT_1115	SPT_1116	dnaG		TRUE	0.989	3.000	0.209	1.000	N	NA
7474843	7474844	SPT_1116	SPT_1117			TRUE	0.944	14.000	0.044	NA		NA
7474844	7474845	SPT_1117	SPT_1118			FALSE	0.297	115.000	0.019	NA		NA
7474845	7474846	SPT_1118	SPT_1119			TRUE	0.995	16.000	0.413	0.010	Y	NA
7474846	7474847	SPT_1119	SPT_1120			TRUE	0.863	31.000	0.016	NA	N	NA
7474847	7474848	SPT_1120	SPT_1121			TRUE	0.837	59.000	0.167	NA		NA
7474848	7474849	SPT_1121	SPT_1122			TRUE	0.501	70.000	0.011	NA		NA
7474849	7474850	SPT_1122	SPT_1123			TRUE	0.931	10.000	0.009	NA		NA
7474851	7474852	SPT_1124	SPT_1125			TRUE	0.909	-3.000	0.000	NA		NA
7474852	7474853	SPT_1125	SPT_1126			TRUE	0.909	-3.000	0.000	NA		NA
7474854	7474855	SPT_1127	SPT_1128			TRUE	0.954	16.000	0.052	1.000	N	NA
7474855	7474856	SPT_1128	SPT_1129			TRUE	0.995	-7.000	0.342	1.000	N	NA
7474856	7474857	SPT_1129	SPT_1130		map	TRUE	0.982	16.000	0.235	1.000	N	NA
7474857	7474858	SPT_1130	SPT_1131	map		FALSE	0.165	99.000	0.000	NA		NA
7474858	7474859	SPT_1131	SPT_1132			TRUE	0.793	17.000	0.000	NA		NA
7474859	7474860	SPT_1132	SPT_1133		pcrA	FALSE	0.236	192.000	0.000	0.062	Y	NA
7474860	7474861	SPT_1133	SPT_1135	pcrA		TRUE	0.904	43.000	0.005	0.015	Y	NA
7474862	7474863	SPT_1134	SPT_1136			TRUE	0.992	18.000	0.714	1.000		NA
7474863	7474864	SPT_1136	SPT_1137			TRUE	0.660	83.000	0.143	NA		NA
7474864	7474865	SPT_1137	SPT_1138			TRUE	0.545	80.000	0.056	NA		NA
7474865	7474866	SPT_1138	SPT_1139			TRUE	0.982	5.000	0.166	NA		NA
7474866	7474867	SPT_1139	SPT_1140			TRUE	0.989	10.000	0.089	1.000	Y	NA
7474867	7474868	SPT_1140	SPT_1141			TRUE	0.528	113.000	0.145	1.000		NA
7474869	7474870	SPT_1142	SPT_1143			TRUE	0.997	-16.000	0.725	1.000		NA
7474870	7474871	SPT_1143	SPT_1144			TRUE	0.989	-3.000	0.150	1.000	N	NA
7474871	7474872	SPT_1144	SPT_1145		pta	TRUE	0.870	44.000	0.067	1.000	N	NA
7474873	7474874	SPT_1148	SPT_1149			FALSE	0.048	216.000	0.000	NA		NA
7474875	7474876	SPT_1150	SPT_1151		rplU	FALSE	0.062	188.000	0.000	NA		NA
7474876	7474877	SPT_1151	SPT_1152	rplU		TRUE	0.991	16.000	0.208	NA	Y	NA
7474877	7474878	SPT_1152	SPT_1153		rpmA	TRUE	0.990	17.000	0.203	NA	Y	NA
7474879	7474880	SPT_1154	SPT_1155			TRUE	0.892	-28.000	0.000	NA		NA
7474883	7474884	SPT_1158	SPT_1159			TRUE	0.475	107.000	0.098	NA		NA
7474884	7474885	SPT_1159	SPT_1160			FALSE	0.013	427.000	0.000	1.000		NA
7474885	7474886	SPT_1160	SPT_1161			TRUE	0.955	3.000	0.019	1.000		NA
7474886	7474887	SPT_1161	SPT_1162			TRUE	0.892	80.000	0.600	NA		NA
7474887	7474888	SPT_1162	SPT_1163		ligA	FALSE	0.275	93.000	0.002	NA		NA
7474888	7474889	SPT_1163	SPT_1164	ligA	pulA	FALSE	0.280	112.000	0.002	1.000	N	NA
7474889	7474890	SPT_1164	SPT_1165	pulA		FALSE	0.015	544.000	0.000	1.000	N	NA
7474890	7474891	SPT_1165	SPT_1166		glgB	FALSE	0.017	484.000	0.000	1.000	N	NA
7474891	7474892	SPT_1166	SPT_1167	glgB	glgC	TRUE	0.997	-10.000	0.317	0.002	Y	NA
7474892	7474893	SPT_1167	SPT_1168	glgC	glgD	TRUE	0.999	-10.000	0.810	0.001	Y	NA
7474893	7474894	SPT_1168	SPT_1169	glgD		TRUE	0.998	-3.000	0.395	1.000	Y	NA
7474894	7474895	SPT_1169	SPT_1170			TRUE	0.397	59.000	0.000	NA		NA
7474895	7474896	SPT_1170	SPT_1172			FALSE	0.027	283.000	0.000	NA		NA
7474899	7474900	SPT_1175	SPT_1176			FALSE	0.134	115.000	0.000	NA		NA
7474900	7474901	SPT_1176	SPT_1177			FALSE	0.245	179.000	0.000	NA	Y	NA
7474902	7474903	SPT_1178	SPT_1179	rexB	addA	TRUE	0.993	-3.000	0.070	0.061	Y	NA
7474903	7474904	SPT_1179	SPT_1180	addA		FALSE	0.104	215.000	0.010	NA		NA
7474904	7474905	SPT_1180	SPT_1181			FALSE	0.052	209.000	0.000	NA		NA
7474905	7474906	SPT_1181	SPT_1182			FALSE	0.013	448.000	0.000	1.000		NA
7474906	7474907	SPT_1182	SPT_1183			TRUE	0.985	-13.000	0.148	1.000		NA
7474907	7474908	SPT_1183	SPT_1184			TRUE	0.910	16.000	0.002	1.000	N	NA
7474908	7474909	SPT_1184	SPT_1185			FALSE	0.016	494.000	0.000	1.000	N	NA
7474910	7474911	SPT_1186	SPT_1187		lpdA	TRUE	0.859	64.000	0.200	1.000	N	NA
7474911	7474912	SPT_1187	SPT_1188	lpdA		TRUE	0.940	64.000	0.227	1.000	Y	NA
7474912	7474913	SPT_1188	SPT_1189			TRUE	0.453	218.000	0.103	0.044	Y	NA
7474913	7474914	SPT_1189	SPT_1190			TRUE	0.998	16.000	0.769	0.001	Y	NA
7474914	7474915	SPT_1190	SPT_1191			FALSE	0.124	154.000	0.000	1.000	N	NA
7474915	7474916	SPT_1191	SPT_1192			FALSE	0.041	285.000	0.000	1.000	N	NA
7474916	7474917	SPT_1192	SPT_1193			TRUE	0.935	13.000	0.005	1.000	N	NA
7474917	7474918	SPT_1193	SPT_1194		ung	TRUE	0.985	10.000	0.043	1.000	Y	NA
7474918	7474919	SPT_1194	SPT_1195	ung		FALSE	0.023	305.000	0.000	NA		NA
7474919	7474920	SPT_1195	SPT_1196			TRUE	0.827	14.000	0.000	NA		NA
7474920	7474921	SPT_1196	SPT_1197			FALSE	0.012	459.000	0.000	1.000		NA
7474921	7474922	SPT_1197	SPT_1198			FALSE	0.013	422.000	0.000	NA		NA
7474922	7474923	SPT_1198	SPT_1199			TRUE	0.993	8.000	0.500	NA		NA
7474923	7474924	SPT_1199	SPT_1200			FALSE	0.140	143.000	0.000	1.000	N	NA
7474924	7474925	SPT_1200	SPT_1201			FALSE	0.026	374.000	0.000	1.000	N	NA
7474925	7474926	SPT_1201	SPT_1202			TRUE	0.997	11.000	0.500	1.000	Y	NA
7474926	7474927	SPT_1202	SPT_1203			FALSE	0.042	231.000	0.000	NA		NA
7474927	7474928	SPT_1203	SPT_1204			TRUE	0.701	25.000	0.000	NA		NA
7474931	7474932	SPT_1207	SPT_1208			TRUE	0.909	-3.000	0.000	NA		NA
7474932	7474933	SPT_1208	SPT_1209			TRUE	0.909	-3.000	0.000	NA		NA
7474934	7474935	SPT_1210	SPT_1211			TRUE	0.979	9.000	0.105	1.000	N	NA
7474935	7474936	SPT_1211	SPT_1212			TRUE	0.444	98.000	0.057	NA		NA
7474936	7474937	SPT_1212	SPT_1213		mtnN	FALSE	0.197	89.000	0.000	NA		NA
7474937	7474938	SPT_1213	SPT_1214	mtnN		TRUE	0.930	17.000	0.041	NA		NA
7474938	7474939	SPT_1214	SPT_1215			TRUE	0.941	12.000	0.025	NA		NA
7474939	7474940	SPT_1215	SPT_1216		glmU	TRUE	0.955	10.000	0.015	1.000	N	NA
7474941	7474942	SPT_1217	SPT_1218			TRUE	0.472	95.000	0.062	NA		NA
7474942	7474943	SPT_1218	SPT_1219			TRUE	0.812	31.000	0.012	NA		NA
7474943	7474944	SPT_1219	SPT_1220			TRUE	0.962	0.000	0.018	NA		NA
7474944	7474945	SPT_1220	SPT_1221			FALSE	0.008	761.000	0.000	NA		NA
7474946	7474947	SPT_1222	SPT_1223			TRUE	0.564	67.000	0.016	1.000		NA
7474947	7474948	SPT_1223	SPT_1224		pepF1	TRUE	0.809	38.000	0.024	1.000		NA
7474948	7474949	SPT_1224	SPT_1225	pepF1		TRUE	0.967	19.000	0.204	NA		NA
7474949	7474950	SPT_1225	SPT_1226		tehB	FALSE	0.282	73.000	0.000	NA		NA
7474950	7474951	SPT_1226	SPT_1227	tehB	smpB	TRUE	0.908	16.000	0.002	1.000	N	NA
7474951	7474952	SPT_1227	SPT_1228	smpB	rnr	TRUE	0.987	-37.000	0.143	0.027	N	NA
7474952	7474953	SPT_1228	SPT_1229	rnr	secG	TRUE	0.508	102.000	0.064	1.000	N	NA
7474953	7474954	SPT_1229	SPT_1230	secG	rpmG1	TRUE	0.815	40.000	0.012	1.000	N	NA
7474954	7474955	SPT_1230	SPT_1231	rpmG1		TRUE	0.969	0.000	0.012	1.000	N	NA
7474955	7474956	SPT_1231	SPT_1232		coaE	TRUE	0.964	-13.000	0.007	1.000	N	NA
7474956	7474957	SPT_1232	SPT_1233	coaE	mutM	TRUE	0.981	0.000	0.066	1.000	N	NA
7474957	7474958	SPT_1233	SPT_1234	mutM	era	TRUE	0.675	49.000	0.004	1.000		NA
7474958	7474959	SPT_1234	SPT_1235	era		TRUE	0.943	17.000	0.063	1.000		NA
7474959	7474960	SPT_1235	SPT_1236			TRUE	0.966	-19.000	0.035	NA		NA
7474962	7474963	SPT_1238	SPT_1239			FALSE	0.281	99.000	0.005	1.000		NA
7474963	7474964	SPT_1239	SPT_1240			TRUE	0.995	11.000	0.592	1.000	N	NA
7474964	7474965	SPT_1240	SPT_1241			FALSE	0.057	250.000	0.000	1.000	N	NA
7474965	7474966	SPT_1241	SPT_1242		rplT	TRUE	0.643	58.000	0.003	1.000	N	NA
7474966	7474967	SPT_1242	SPT_1243	rplT	rpmI	TRUE	0.992	52.000	0.928	0.023	Y	NA
7474967	7474968	SPT_1243	SPT_1244	rpmI	infC	TRUE	0.992	33.000	0.652	1.000	Y	NA
7474968	7474969	SPT_1244	SPT_1245	infC		FALSE	0.027	284.000	0.000	NA		NA
7474969	7474970	SPT_1245	SPT_1246			TRUE	0.994	4.000	0.500	NA		NA
7474970	7474971	SPT_1246	SPT_1247			FALSE	0.015	399.000	0.000	1.000		NA
7474971	7474972	SPT_1247	SPT_1248			TRUE	0.939	-16.000	0.002	1.000		NA
7474972	7474973	SPT_1248	SPT_1249			TRUE	0.786	68.000	0.125	1.000	N	NA
7474975	7474976	SPT_1253	SPT_1254			TRUE	0.970	3.000	0.065	NA		NA
7474978	7474979	SPT_1255	SPT_1257			TRUE	0.370	86.000	0.010	NA		NA
7474979	7474980	SPT_1257	SPT_1258			TRUE	0.940	9.000	0.013	NA		NA
7474980	7474981	SPT_1258	SPT_1259		frr	TRUE	0.872	21.000	0.012	NA		NA
7474981	7474982	SPT_1259	SPT_1260	frr	pyrH	TRUE	0.996	9.000	0.626	1.000	N	NA
7474982	7474983	SPT_1260	SPT_1261	pyrH	trmFO	TRUE	0.399	84.000	0.002	1.000	N	NA
7474983	7474984	SPT_1261	SPT_1262	trmFO		FALSE	0.064	187.000	0.000	1.000		NA
7474984	7474985	SPT_1262	SPT_1263			TRUE	0.964	3.000	0.043	NA		NA
7474985	7474986	SPT_1263	SPT_1264			TRUE	0.822	40.000	0.038	NA		NA
7474986	7474987	SPT_1264	SPT_1265		tmk	TRUE	0.993	-3.000	0.254	1.000	N	NA
7474987	7474988	SPT_1265	SPT_1266	tmk	proC	FALSE	0.069	220.000	0.000	1.000	N	NA
7474988	7474989	SPT_1266	SPT_1267	proC	proA	TRUE	0.984	4.000	0.009	0.002	Y	NA
7474989	7474990	SPT_1267	SPT_1268	proA	proB	TRUE	0.995	10.000	0.281	0.002	Y	NA
7474990	7474991	SPT_1268	SPT_1269	proB		FALSE	0.164	101.000	0.000	1.000		NA
7474991	7474992	SPT_1269	SPT_1270			TRUE	0.887	3.000	0.000	1.000		NA
7474992	7474993	SPT_1270	SPT_1271		lspA	TRUE	0.983	-10.000	0.082	1.000	N	NA
7474993	7474994	SPT_1271	SPT_1272	lspA		TRUE	0.987	-3.000	0.119	1.000	N	NA
7474996	7474997	SPT_1274	SPT_1275			TRUE	0.458	54.000	0.000	NA		NA
7474999	7475000	SPT_1277	SPT_1278	aguB	aguA	TRUE	0.967	10.000	0.084	1.000		NA
7475000	7475001	SPT_1278	SPT_1279	aguA	nspC	TRUE	0.990	-3.000	0.025	1.000	Y	NA
7475001	7475002	SPT_1279	SPT_1280	nspC	lys	TRUE	0.998	0.000	0.444	1.000	Y	NA
7475002	7475003	SPT_1280	SPT_1281	lys	speE	TRUE	0.991	-3.000	0.036	1.000	Y	NA
7475003	7475004	SPT_1281	SPT_1282	speE		TRUE	0.644	31.000	0.000	NA		NA
7475005	7475006	SPT_1283	SPT_1285			TRUE	0.889	-48.000	0.000	NA		NA
7475008	7475009	SPT_1286	SPT_1287			FALSE	0.092	146.000	0.000	NA		NA
7475010	7475011	SPT_1288	SPT_1289			TRUE	0.997	2.000	0.855	1.000		NA
7475013	7475014	SPT_1291	SPT_1292			TRUE	0.711	59.000	0.051	NA		NA
7475014	7475015	SPT_1292	SPT_1293			TRUE	0.989	-13.000	0.215	NA		NA
7475016	7475017	SPT_1294	SPT_1295			TRUE	0.978	1.000	0.091	NA		NA
7475017	7475018	SPT_1295	SPT_1296			TRUE	0.998	-3.000	0.841	NA		NA
7475019	7475020	SPT_1297	SPT_1298			TRUE	0.612	35.000	0.000	NA		NA
7475024	7475025	SPT_1302	SPT_1303	pyk	pfkA	TRUE	0.958	59.000	0.261	0.005	Y	NA
7475025	7475026	SPT_1303	SPT_1304	pfkA		TRUE	0.662	83.000	0.098	1.000	N	NA
7475027	7475028	SPT_1305	SPT_1306			TRUE	0.798	17.000	0.000	1.000		NA
7475029	7475030	SPT_1307	SPT_1308			FALSE	0.030	271.000	0.000	NA		NA
7475030	7475031	SPT_1308	SPT_1309			TRUE	0.959	30.000	0.048	0.003	Y	NA
7475031	7475032	SPT_1309	SPT_1310			TRUE	0.723	34.000	0.000	0.060	N	NA
7475032	7475033	SPT_1310	SPT_1311			FALSE	0.131	118.000	0.000	1.000		NA
7475033	7475034	SPT_1311	SPT_1312			TRUE	0.957	-3.000	0.009	NA		NA
7475034	7475035	SPT_1312	SPT_1313			TRUE	0.386	60.000	0.000	NA		NA
7475035	7475036	SPT_1313	SPT_1314			TRUE	0.988	13.000	0.092	0.060	Y	NA
7475036	7475037	SPT_1314	SPT_1315			FALSE	0.119	123.000	0.000	NA		NA
7475037	7475038	SPT_1315	SPT_1316			FALSE	0.034	260.000	0.000	NA		NA
7475038	7475039	SPT_1316	SPT_1317			TRUE	0.970	13.000	0.130	NA		NA
7475039	7475040	SPT_1317	SPT_1318			TRUE	0.909	-3.000	0.000	NA		NA
7475040	7475041	SPT_1318	SPT_1319			TRUE	0.733	22.000	0.000	NA		NA
7475041	7475042	SPT_1319	SPT_1320		thiI	FALSE	0.181	137.000	0.005	NA		NA
7475042	7475043	SPT_1320	SPT_1321	thiI		TRUE	0.992	9.000	0.349	1.000	N	NA
7475045	7475046	SPT_1323	SPT_1324		fruA	FALSE	0.214	164.000	0.010	0.053	N	NA
7475046	7475047	SPT_1324	SPT_1325	fruA	pfkB	TRUE	0.999	-3.000	0.816	1.000	Y	NA
7475047	7475048	SPT_1325	SPT_1326	pfkB		TRUE	0.999	-3.000	0.721	1.000	Y	NA
7475050	7475051	SPT_2263	SPT_1328			FALSE	0.009	646.000	0.000	NA		NA
7475053	7475054	SPT_1330	SPT_1331	sufB		TRUE	0.892	54.000	0.152	0.002	N	NA
7475054	7475055	SPT_1331	SPT_1332			TRUE	0.993	-13.000	0.292	1.000	N	NA
7475055	7475056	SPT_1332	SPT_1333		sufD	TRUE	0.995	11.000	0.606	1.000	N	NA
7475056	7475057	SPT_1333	SPT_1334	sufD	sufC	TRUE	0.975	28.000	0.139	1.000	Y	NA
7475057	7475058	SPT_1334	SPT_1335	sufC		FALSE	0.148	150.000	0.003	NA		NA
7475058	7475059	SPT_1335	SPT_1336			TRUE	0.456	100.000	0.067	NA		NA
7475059	7475060	SPT_1336	SPT_1337			TRUE	0.975	0.000	0.030	NA	N	NA
7475062	7475063	SPT_1340	SPT_1341			FALSE	0.079	159.000	0.000	NA		NA
7475063	7475064	SPT_1341	SPT_1342			TRUE	0.869	7.000	0.000	NA		NA
7475064	7475065	SPT_1342	SPT_1343			TRUE	0.507	50.000	0.000	NA		NA
7475065	7475066	SPT_1343	SPT_1344		pcp1	FALSE	0.072	168.000	0.000	NA		NA
7475066	7475067	SPT_1344	SPT_1345	pcp1		TRUE	0.984	15.000	0.300	NA		NA
7475067	7475068	SPT_1345	SPT_1346			TRUE	0.998	-3.000	0.939	NA		NA
7475068	7475069	SPT_1346	SPT_1347			TRUE	0.344	65.000	0.000	NA		NA
7475069	7475070	SPT_1347	SPT_1348		ilvE	TRUE	0.438	56.000	0.000	NA		NA
7475070	7475071	SPT_1348	SPT_1349	ilvE	parC	TRUE	0.434	132.000	0.086	1.000	N	NA
7475071	7475072	SPT_1349	SPT_1350	parC		FALSE	0.075	165.000	0.000	NA		NA
7475072	7475073	SPT_1350	SPT_1351		parE	FALSE	0.122	121.000	0.000	NA		NA
7475075	7475076	SPT_1353	SPT_1354			FALSE	0.044	226.000	0.000	NA		NA
7475076	7475077	SPT_1354	SPT_1355			FALSE	0.208	85.000	0.000	NA		NA
7475077	7475078	SPT_1355	SPT_1356			TRUE	0.996	3.000	0.720	0.037		NA
7475078	7475079	SPT_1356	SPT_1357			TRUE	0.995	-7.000	0.438	1.000		NA
7475079	7475080	SPT_1357	SPT_1358			FALSE	0.236	144.000	0.024	1.000		NA
7475080	7475081	SPT_1358	SPT_1359		cdd	TRUE	0.676	91.000	0.200	1.000		NA
7475081	7475082	SPT_1359	SPT_1360	cdd	deoC	TRUE	0.991	-13.000	0.051	1.000	Y	NA
7475082	7475083	SPT_1360	SPT_1361	deoC		TRUE	0.984	18.000	0.106	1.000	Y	NA
7475083	7475084	SPT_1361	SPT_1362			TRUE	0.979	-3.000	0.044	1.000	N	NA
7475084	7475085	SPT_1362	SPT_1363			FALSE	0.016	383.000	0.000	NA		NA
7475086	7475087	SPT_1364	SPT_1365	coaA	rpsT	TRUE	0.613	68.000	0.014	1.000	N	NA
7475087	7475088	SPT_1365	SPT_1366	rpsT		TRUE	0.676	53.000	0.002	1.000	N	NA
7475089	7475090	SPT_1367	SPT_1368	deoD		FALSE	0.009	658.000	0.000	1.000		NA
7475090	7475091	SPT_1368	SPT_1369			TRUE	0.706	25.000	0.000	1.000		NA
7475091	7475092	SPT_1369	SPT_1370			TRUE	0.861	10.000	0.000	1.000		NA
7475092	7475093	SPT_1370	SPT_1371			FALSE	0.012	464.000	0.000	1.000		NA
7475093	7475094	SPT_1371	SPT_1372			TRUE	0.953	16.000	0.083	NA		NA
7475094	7475095	SPT_1372	SPT_1373		deoB	TRUE	0.975	2.000	0.080	NA		NA
7475095	7475096	SPT_1373	SPT_1374	deoB	rpiA	TRUE	0.978	14.000	0.018	1.000	Y	NA
7475096	7475097	SPT_1374	SPT_1375	rpiA		FALSE	0.117	282.000	0.000	NA	Y	NA
7475097	7475098	SPT_1375	SPT_1376			FALSE	0.305	142.000	0.030	NA	N	NA
7475098	7475099	SPT_1376	SPT_1377			FALSE	0.299	133.000	0.017	1.000	N	NA
7475099	7475100	SPT_1377	SPT_1378			TRUE	0.999	0.000	0.640	1.000	Y	NA
7475101	7475102	SPT_1379	SPT_1380			FALSE	0.043	229.000	0.000	NA		NA
7475102	7475103	SPT_1380	SPT_1381			FALSE	0.012	459.000	0.000	NA		NA
7475105	7475106	SPT_1383	SPT_1384			TRUE	0.323	165.000	0.114	NA		NA
7475107	7475108	SPT_1385	SPT_1386			TRUE	0.904	0.000	0.000	NA		NA
7475108	7475109	SPT_1386	SPT_1387			FALSE	0.152	104.000	0.000	NA		NA
7475111	7475112	SPT_1389	SPT_1392		ezrA	FALSE	0.007	981.000	0.000	NA		NA
7475112	7475113	SPT_1392	SPT_1393	ezrA	gyrB	TRUE	0.483	82.000	0.011	1.000	N	NA
7475113	7475114	SPT_1393	SPT_1394	gyrB		TRUE	0.919	15.000	0.013	1.000		NA
7475114	7475115	SPT_1394	SPT_1395			FALSE	0.208	85.000	0.000	NA		NA
7475115	7475116	SPT_1395	SPT_1396			TRUE	0.925	11.000	0.008	NA		NA
7475116	7475117	SPT_1396	SPT_1397			TRUE	0.846	37.000	0.019	1.000	N	NA
7475117	7475118	SPT_1397	SPT_1398			FALSE	0.084	200.000	0.000	1.000	N	NA
7475120	7475121	SPT_1400	SPT_1401			TRUE	0.999	-10.000	0.606	1.000	Y	NA
7475121	7475122	SPT_1401	SPT_1402			TRUE	0.480	109.000	0.061	1.000	N	NA
7475122	7475123	SPT_1402	SPT_1403			FALSE	0.119	123.000	0.000	NA		NA
7475123	7475124	SPT_1403	SPT_1404			TRUE	0.893	-25.000	0.000	NA		NA
7475124	7475125	SPT_1404	SPT_1405			TRUE	0.897	-22.000	0.000	1.000		NA
7475125	7475126	SPT_1405	SPT_1406			TRUE	0.970	11.000	0.067	1.000	N	NA
7475126	7475127	SPT_1406	SPT_1407			TRUE	0.997	-7.000	0.710	NA		NA
7475127	7475128	SPT_1407	SPT_1408			FALSE	0.315	96.000	0.008	NA		NA
7475128	7475129	SPT_1408	SPT_1409			FALSE	0.272	75.000	0.000	NA		NA
7475129	7475130	SPT_1409	SPT_1410			TRUE	0.992	4.000	0.429	NA		NA
7475130	7475131	SPT_1410	SPT_1411			FALSE	0.194	90.000	0.000	NA		NA
7475131	7475132	SPT_1411	SPT_1412		metG	TRUE	0.507	50.000	0.000	NA		NA
7475132	7475133	SPT_1412	SPT_1413	metG		FALSE	0.255	124.000	0.003	1.000	N	NA
7475133	7475134	SPT_1413	SPT_1414			TRUE	0.999	2.000	0.923	1.000	Y	NA
7475134	7475135	SPT_1414	SPT_1415			TRUE	0.998	-16.000	0.923	1.000	N	NA
7475136	7475137	SPT_1416	SPT_1417	gor		FALSE	0.058	197.000	0.000	NA		NA
7475137	7475138	SPT_1417	SPT_1419			TRUE	0.360	63.000	0.000	NA		NA
7475141	7475142	SPT_1421	SPT_1422		trmD	TRUE	0.901	12.000	0.002	1.000		NA
7475142	7475143	SPT_1422	SPT_1423	trmD	rimM	TRUE	0.999	-10.000	0.672	1.000	Y	NA
7475143	7475144	SPT_1423	SPT_1424	rimM		TRUE	0.756	31.000	0.002	NA		NA
7475146	7475147	SPT_1426	SPT_1427	tuf		FALSE	0.019	343.000	0.000	NA		NA
7475147	7475148	SPT_1427	SPT_1428			FALSE	0.012	446.000	0.000	NA		NA
7475148	7475149	SPT_1428	SPT_1429			FALSE	0.047	223.000	0.000	1.000		NA
7475149	7475150	SPT_1429	SPT_1430			TRUE	0.892	-28.000	0.000	NA		NA
7475150	7475151	SPT_1430	SPT_1431			FALSE	0.143	111.000	0.000	NA		NA
7475151	7475152	SPT_1431	SPT_1432			FALSE	0.019	340.000	0.000	NA		NA
7475152	7475153	SPT_1432	SPT_1433			TRUE	0.901	-13.000	0.000	NA		NA
7475153	7475154	SPT_1433	SPT_1434			TRUE	0.521	48.000	0.000	NA		NA
7475155	7475156	SPT_1435	SPT_1436			TRUE	0.380	111.000	0.049	NA		NA
7475157	7475158	SPT_1437	SPT_1438			TRUE	0.991	13.000	0.154	1.000	Y	NA
7475158	7475159	SPT_1438	SPT_1439			TRUE	0.991	10.000	0.130	1.000	Y	NA
7475159	7475160	SPT_1439	SPT_1440			FALSE	0.204	146.000	0.013	1.000		NA
7475160	7475161	SPT_1440	SPT_1441			TRUE	0.993	-10.000	0.324	NA		NA
7475163	7475164	SPT_1443	SPT_1444	atpC	atpD	TRUE	0.998	11.000	0.837	0.004	Y	NA
7475164	7475165	SPT_1444	SPT_1445	atpD	atpG	TRUE	0.961	86.000	0.724	0.004	Y	NA
7475165	7475166	SPT_1445	SPT_1446	atpG	atpA	TRUE	0.998	16.000	0.846	0.004	Y	NA
7475166	7475167	SPT_1446	SPT_1447	atpA	atpH	TRUE	0.998	15.000	0.864	0.004	Y	NA
7475167	7475168	SPT_1447	SPT_1448	atpH	atpF	TRUE	0.996	0.000	0.222	0.004	Y	NA
7475168	7475169	SPT_1448	SPT_1449	atpF	atpB	TRUE	0.981	14.000	0.032	0.004	Y	NA
7475169	7475170	SPT_1449	SPT_1450	atpB		TRUE	0.991	35.000	0.557	0.004	Y	NA
7475170	7475171	SPT_1450	SPT_1451			FALSE	0.258	77.000	0.000	NA		NA
7475171	7475172	SPT_1451	SPT_1453			FALSE	0.012	458.000	0.000	NA		NA
7475174	7475175	SPT_1455	SPT_1456			TRUE	0.656	71.000	0.079	NA		NA
7475175	7475176	SPT_1456	SPT_1457			TRUE	0.646	81.000	0.120	NA		NA
7475176	7475177	SPT_1457	SPT_1458			TRUE	0.973	-3.000	0.037	0.012		NA
7475177	7475178	SPT_1458	SPT_1459		murC	TRUE	0.939	10.000	0.014	1.000		NA
7475178	7475179	SPT_1459	SPT_1460	murC		TRUE	0.933	11.000	0.013	NA		NA
7475179	7475180	SPT_1460	SPT_1461			TRUE	0.887	48.000	0.151	NA		NA
7475180	7475181	SPT_1461	SPT_1462			FALSE	0.257	93.000	0.000	1.000	N	NA
7475181	7475182	SPT_1462	SPT_1463			TRUE	0.990	8.000	0.082	0.009	Y	NA
7475182	7475183	SPT_1463	SPT_1464			FALSE	0.080	158.000	0.000	NA		NA
7475183	7475184	SPT_1464	SPT_1466			FALSE	0.070	172.000	0.000	NA		NA
7475184	7475185	SPT_1466	SPT_1467			FALSE	0.057	201.000	0.000	1.000		NA
7475187	7475188	SPT_1469	SPT_1470			TRUE	0.663	101.000	0.231	NA		NA
7475188	7475189	SPT_1470	SPT_1471			TRUE	0.932	37.000	0.208	NA		NA
7475189	7475190	SPT_1471	SPT_1472			TRUE	0.334	87.000	0.005	NA		NA
7475190	7475191	SPT_1472	SPT_1473			TRUE	0.533	71.000	0.005	1.000	N	NA
7475191	7475192	SPT_1473	SPT_1474			TRUE	0.989	-10.000	0.209	1.000		NA
7475192	7475193	SPT_1474	SPT_1475			TRUE	0.643	54.000	0.006	1.000		NA
7475193	7475194	SPT_1475	SPT_1476			TRUE	0.984	-25.000	0.151	1.000		NA
7475194	7475195	SPT_1476	SPT_1477		rpsR	FALSE	0.025	295.000	0.000	1.000		NA
7475195	7475196	SPT_1477	SPT_1478	rpsR		TRUE	0.848	32.000	0.012	1.000	N	NA
7475196	7475197	SPT_1478	SPT_1479		rpsF	TRUE	0.946	12.000	0.012	1.000	N	NA
7475197	7475198	SPT_1479	SPT_1480	rpsF	asnS	FALSE	0.305	153.000	0.000	1.000	Y	NA
7475198	7475199	SPT_1480	SPT_1481	asnS		FALSE	0.079	160.000	0.000	NA		NA
7475199	7475200	SPT_1481	SPT_1482			TRUE	0.908	-7.000	0.000	NA		NA
7475200	7475201	SPT_1482	SPT_1483			TRUE	0.989	-3.000	0.205	NA		NA
7475201	7475202	SPT_1483	SPT_1484			TRUE	0.327	67.000	0.000	NA		NA
7475206	7475207	SPT_1488	SPT_1489			TRUE	0.376	79.000	0.004	NA		NA
7475207	7475208	SPT_1489	SPT_1490			TRUE	0.610	66.000	0.030	NA		NA
7475208	7475209	SPT_1490	SPT_1491		def2	TRUE	0.943	12.000	0.028	NA		NA
7475209	7475210	SPT_1491	SPT_1492	def2		FALSE	0.185	116.000	0.000	NA	N	NA
7475210	7475211	SPT_1492	SPT_1493			TRUE	0.885	13.000	0.000	NA	N	NA
7475213	7475214	SPT_1495	SPT_1496			TRUE	0.976	-3.000	0.056	1.000		NA
7475214	7475215	SPT_1496	SPT_1497		dapB	TRUE	0.950	12.000	0.015	1.000	N	NA
7475215	7475216	SPT_1497	SPT_1498	dapB		FALSE	0.053	277.000	0.004	NA		NA
7475216	7475217	SPT_1498	SPT_1499			TRUE	0.982	2.000	0.139	NA		NA
7475217	7475218	SPT_1499	SPT_1500		glmM	TRUE	0.409	74.000	0.003	1.000		NA
7475218	7475219	SPT_1500	SPT_1501	glmM		TRUE	0.946	24.000	0.150	NA		NA
7475219	7475220	SPT_1501	SPT_1502			TRUE	0.995	-13.000	0.502	NA		NA
7475222	7475223	SPT_1504	SPT_1505			TRUE	0.995	-3.000	0.470	NA		NA
7475223	7475224	SPT_1505	SPT_1506			TRUE	0.989	-3.000	0.214	NA		NA
7475224	7475225	SPT_1506	SPT_1507			TRUE	0.774	52.000	0.051	NA		NA
7475225	7475226	SPT_1507	SPT_1508			TRUE	0.907	11.000	0.002	NA		NA
7475226	7475227	SPT_1508	SPT_1509		clpX	TRUE	0.958	9.000	0.043	1.000		NA
7475227	7475228	SPT_1509	SPT_1510	clpX		TRUE	0.594	61.000	0.012	NA		NA
7475228	7475229	SPT_1510	SPT_1511		folA	TRUE	0.967	0.000	0.030	NA		NA
7475229	7475230	SPT_1511	SPT_1512	folA		FALSE	0.251	130.000	0.005	1.000	N	NA
7475230	7475231	SPT_1512	SPT_1513			FALSE	0.011	500.000	0.000	1.000		NA
7475231	7475232	SPT_1513	SPT_1514		tpiA	FALSE	0.298	71.000	0.000	1.000		NA
7475232	7475233	SPT_1514	SPT_1515	tpiA		TRUE	0.369	98.000	0.007	NA	N	NA
7475233	7475234	SPT_1515	SPT_1516		metA	TRUE	0.960	9.000	0.021	NA	N	NA
7475236	7475237	SPT_1517	SPT_1519	apt		TRUE	0.387	86.000	0.002	1.000	N	NA
7475237	7475238	SPT_1519	SPT_1520			FALSE	0.016	501.000	0.000	1.000	N	NA
7475238	7475239	SPT_1520	SPT_1521			FALSE	0.028	281.000	0.000	NA		NA
7475239	7475240	SPT_1521	SPT_1522			FALSE	0.226	82.000	0.000	NA		NA
7475240	7475241	SPT_1522	SPT_1523		codY	TRUE	0.983	0.000	0.083	1.000	N	NA
7475241	7475242	SPT_1523	SPT_1524	codY		FALSE	0.135	265.000	0.000	1.000	Y	NA
7475242	7475243	SPT_1524	SPT_1525			FALSE	0.083	199.000	0.000	NA	N	NA
7475244	7475245	SPT_1526	SPT_1527			TRUE	0.380	99.000	0.010	1.000	N	NA
7475245	7475246	SPT_1527	SPT_1528			TRUE	0.997	0.000	0.796	1.000		NA
7475246	7475247	SPT_1528	SPT_1529			FALSE	0.118	126.000	0.000	1.000		NA
7475247	7475248	SPT_1529	SPT_1530			TRUE	0.514	50.000	0.000	1.000		NA
7475249	7475250	SPT_1531	SPT_1532			TRUE	0.369	62.000	0.000	NA		NA
7475250	7475251	SPT_1532	SPT_1533			TRUE	0.904	0.000	0.000	NA		NA
7475251	7475252	SPT_1533	SPT_1534			FALSE	0.104	136.000	0.000	NA		NA
7475252	7475253	SPT_1534	SPT_1535			FALSE	0.042	231.000	0.000	NA		NA
7475253	7475254	SPT_1535	SPT_1536			TRUE	0.990	-22.000	0.276	NA		NA
7475254	7475255	SPT_1536	SPT_1537		truA	TRUE	0.980	-10.000	0.058	1.000	N	NA
7475259	7475260	SPT_1541	SPT_1542		phnA	TRUE	0.947	3.000	0.011	NA		NA
7475260	7475261	SPT_1542	SPT_1543	phnA	cmk	FALSE	0.228	131.000	0.002	1.000	N	NA
7475261	7475262	SPT_1543	SPT_1544	cmk		TRUE	0.938	9.000	0.012	NA		NA
7475264	7475265	SPT_1546	SPT_1547		galE1	TRUE	0.988	2.000	0.030	NA	Y	NA
7475265	7475266	SPT_1547	SPT_1548	galE1		FALSE	0.155	103.000	0.000	NA		NA
7475266	7475267	SPT_1548	SPT_1549			FALSE	0.300	70.000	0.000	NA		NA
7475267	7475268	SPT_1549	SPT_1550			TRUE	0.916	17.000	0.021	NA		NA
7475268	7475269	SPT_1550	SPT_1551			TRUE	0.991	-13.000	0.283	NA		NA
7475270	7475271	SPT_1552	SPT_1553			FALSE	0.055	201.000	0.000	NA		NA
7475272	7475273	SPT_1554	SPT_1555		tkt1	FALSE	0.026	373.000	0.000	1.000	N	NA
7475273	7475274	SPT_1555	SPT_1556	tkt1		TRUE	0.876	37.000	0.000	1.000	Y	NA
7475274	7475275	SPT_1556	SPT_1557			TRUE	0.995	11.000	0.273	1.000	Y	NA
7475275	7475276	SPT_1557	SPT_1558			TRUE	0.687	26.000	0.000	NA		NA
7475276	7475277	SPT_1558	SPT_1559			TRUE	0.671	28.000	0.000	NA		NA
7475277	7475278	SPT_1559	SPT_1560			TRUE	0.987	-22.000	0.015	0.019	Y	NA
7475278	7475279	SPT_1560	SPT_1561			TRUE	0.977	-7.000	0.029	0.019	N	NA
7475279	7475280	SPT_1561	SPT_1562			FALSE	0.015	529.000	0.000	1.000	N	NA
7475282	7475283	SPT_1564	SPT_1565		rpsO	FALSE	0.011	817.000	0.000	NA	N	NA
7475283	7475284	SPT_1565	SPT_1566	rpsO		FALSE	0.101	141.000	0.000	1.000		NA
7475285	7475286	SPT_1567	SPT_1568			FALSE	0.008	684.000	0.000	NA		NA
7475286	7475287	SPT_1568	SPT_1569			TRUE	0.869	7.000	0.000	NA		NA
7475287	7475288	SPT_1569	SPT_1570		thrS	TRUE	0.654	58.000	0.018	NA		NA
7475289	7475290	SPT_1571	SPT_1572			TRUE	0.999	-7.000	0.812	1.000	Y	NA
7475292	7475293	SPT_1574	SPT_1575			FALSE	0.317	68.000	0.000	NA		NA
7475293	7475294	SPT_1575	SPT_1576			TRUE	0.917	76.000	0.667	NA		NA
7475295	7475296	SPT_1577	SPT_1578			TRUE	0.896	-19.000	0.000	NA		NA
7475296	7475297	SPT_1578	SPT_1579			TRUE	0.687	26.000	0.000	NA		NA
7475297	7475298	SPT_1579	SPT_1580			TRUE	0.909	-3.000	0.000	NA		NA
7475300	7475301	SPT_1582	SPT_1583			FALSE	0.029	274.000	0.000	NA		NA
7475302	7475303	SPT_1584	SPT_1585	dtd	spoT	TRUE	0.951	30.000	0.177	1.000	N	NA
7475306	7475307	SPT_1588	SPT_1589			TRUE	0.991	-3.000	0.043	1.000	Y	NA
7475307	7475308	SPT_1589	SPT_1590			TRUE	0.949	32.000	0.038	1.000	Y	NA
7475308	7475309	SPT_1590	SPT_1591			FALSE	0.282	123.000	0.007	1.000	N	NA
7475310	7475311	SPT_1592	SPT_1593			TRUE	0.995	2.000	0.438	1.000	N	NA
7475311	7475312	SPT_1593	SPT_1594			FALSE	0.039	250.000	0.000	1.000		NA
7475312	7475313	SPT_1594	SPT_1595			TRUE	0.647	53.000	0.006	1.000		NA
7475313	7475314	SPT_1595	SPT_1596			TRUE	0.494	51.000	0.000	NA		NA
7475314	7475315	SPT_1596	SPT_1597			FALSE	0.024	296.000	0.000	NA		NA
7475315	7475316	SPT_1597	SPT_1598		ileS	FALSE	0.015	408.000	0.000	1.000		NA
7475316	7475317	SPT_1598	SPT_1599	ileS		FALSE	0.037	253.000	0.000	NA		NA
7475317	7475318	SPT_1599	SPT_1600			TRUE	0.895	-21.000	0.000	NA		NA
7475318	7475319	SPT_1600	SPT_1601			TRUE	0.994	9.000	0.579	NA		NA
7475319	7475320	SPT_1601	SPT_1602			TRUE	0.992	-3.000	0.287	1.000		NA
7475320	7475321	SPT_1602	SPT_1603			TRUE	0.993	0.000	0.370	NA		NA
7475321	7475322	SPT_1603	SPT_1604			TRUE	0.981	10.000	0.194	NA		NA
7475322	7475323	SPT_1604	SPT_1605		ftsZ	TRUE	0.955	5.000	0.030	NA		NA
7475323	7475324	SPT_1605	SPT_1606	ftsZ	ftsA	TRUE	0.995	17.000	0.460	1.000	Y	NA
7475324	7475325	SPT_1606	SPT_1607	ftsA		FALSE	0.046	220.000	0.000	NA		NA
7475325	7475326	SPT_1607	SPT_1608			TRUE	0.380	91.000	0.016	NA		NA
7475326	7475327	SPT_1608	SPT_1609			TRUE	0.970	-13.000	0.016	1.000	N	NA
7475327	7475328	SPT_1609	SPT_1610			TRUE	0.769	84.000	0.046	0.007	Y	NA
7475328	7475329	SPT_1610	SPT_1611		recR	FALSE	0.186	176.000	0.010	1.000	N	NA
7475329	7475330	SPT_1611	SPT_1612	recR		TRUE	0.949	11.000	0.013	1.000	N	NA
7475332	7475333	SPT_1614	SPT_1615			TRUE	0.948	18.000	0.054	1.000	N	NA
7475333	7475334	SPT_1615	SPT_1616			FALSE	0.068	174.000	0.000	NA		NA
7475334	7475335	SPT_1616	SPT_1617			FALSE	0.026	287.000	0.000	NA		NA
7475335	7475336	SPT_1617	SPT_1618			FALSE	0.097	142.000	0.000	NA		NA
7475336	7475337	SPT_1618	SPT_1619			TRUE	0.490	273.000	0.250	NA	Y	NA
7475337	7475338	SPT_1619	SPT_1620			TRUE	0.998	16.000	1.000	0.036	Y	NA
7475338	7475339	SPT_1620	SPT_1621			FALSE	0.176	232.000	0.000	0.036	Y	NA
7475339	7475340	SPT_1621	SPT_1622			TRUE	0.382	125.000	0.000	1.000	Y	NA
7475340	7475341	SPT_1622	SPT_1623			TRUE	0.984	19.000	0.132	1.000	Y	NA
7475341	7475342	SPT_1623	SPT_1624			FALSE	0.070	174.000	0.000	1.000		NA
7475342	7475343	SPT_1624	SPT_1625			TRUE	0.984	13.000	0.273	1.000		NA
7475343	7475344	SPT_1625	SPT_1626			TRUE	0.944	18.000	0.000	1.000	Y	NA
7475344	7475345	SPT_1626	SPT_1627			TRUE	0.997	0.000	0.300	0.036	Y	NA
7475345	7475346	SPT_1627	SPT_1628			TRUE	0.883	79.000	0.180	0.036	Y	NA
7475346	7475347	SPT_1628	SPT_1629			TRUE	0.976	19.000	0.060	NA	Y	NA
7475347	7475348	SPT_1629	SPT_1630			FALSE	0.031	1014.000	0.000	NA	Y	NA
7475348	7475349	SPT_1630	SPT_1631			FALSE	0.018	357.000	0.000	NA		NA
7475351	7475352	SPT_1633	SPT_1635		recG	FALSE	0.021	316.000	0.000	NA		NA
7475352	7475353	SPT_1635	SPT_1636	recG	alr	TRUE	0.951	19.000	0.078	1.000	N	NA
7475353	7475354	SPT_1636	SPT_1637	alr	acpS	TRUE	0.984	-10.000	0.093	1.000	N	NA
7475354	7475355	SPT_1637	SPT_1638	acpS		TRUE	0.769	45.000	0.007	1.000	N	NA
7475355	7475356	SPT_1638	SPT_1639			TRUE	0.999	2.000	0.750	0.001	Y	NA
7475356	7475357	SPT_1639	SPT_1640		secA	TRUE	0.541	81.000	0.025	1.000	N	NA
7475357	7475358	SPT_1640	SPT_1641	secA		FALSE	0.211	146.000	0.017	NA		NA
7475358	7475359	SPT_1641	SPT_1642			TRUE	0.850	11.000	0.000	NA		NA
7475359	7475360	SPT_1642	SPT_1643			TRUE	0.879	4.000	0.000	NA		NA
7475360	7475361	SPT_1643	SPT_1644			TRUE	0.908	-7.000	0.000	NA		NA
7475361	7475362	SPT_1644	SPT_1645			FALSE	0.063	185.000	0.000	NA		NA
7475362	7475363	SPT_1645	SPT_1646			FALSE	0.103	137.000	0.000	NA		NA
7475363	7475364	SPT_1646	SPT_1647		engA	TRUE	0.345	79.000	0.002	NA		NA
7475364	7475365	SPT_1647	SPT_1648	engA		TRUE	0.906	14.000	0.005	1.000		NA
7475365	7475366	SPT_1648	SPT_1649			TRUE	0.980	-3.000	0.048	1.000	N	NA
7475366	7475367	SPT_1649	SPT_1650			TRUE	0.999	1.000	0.817	NA	Y	NA
7475367	7475368	SPT_1650	SPT_1651		nrdR	TRUE	0.985	1.000	0.109	NA	N	NA
7475369	7475370	SPT_1652	SPT_1653			TRUE	0.994	5.000	0.412	1.000	N	NA
7475370	7475371	SPT_1653	SPT_1654			TRUE	0.987	17.000	0.471	NA		NA
7475372	7475373	SPT_1655	SPT_1656			TRUE	0.976	-3.000	0.059	NA		NA
7475374	7475375	SPT_1657	SPT_1658			FALSE	0.007	1002.000	0.000	NA		NA
7475376	7475377	SPT_1659	SPT_1660			TRUE	0.747	149.000	0.235	1.000	Y	NA
7475378	7475379	SPT_1661	SPT_1662			FALSE	0.307	69.000	0.000	NA		NA
7475379	7475380	SPT_1662	SPT_1663			TRUE	0.996	-19.000	0.571	1.000	N	NA
7475381	7475382	SPT_1664	SPT_1665			TRUE	0.996	0.000	0.183	1.000	Y	NA
7475382	7475383	SPT_1665	SPT_1666			FALSE	0.148	107.000	0.000	NA		NA
7475383	7475384	SPT_1666	SPT_1668			FALSE	0.024	298.000	0.000	NA		NA
7475384	7475385	SPT_1668	SPT_1669			TRUE	0.993	2.000	0.400	NA		NA
7475385	7475386	SPT_1669	SPT_1670			FALSE	0.261	115.000	0.010	NA		NA
7475386	7475387	SPT_1670	SPT_1671			TRUE	0.999	-3.000	0.704	1.000	Y	NA
7475387	7475388	SPT_1671	SPT_1672		sun	TRUE	0.964	15.000	0.074	1.000	N	NA
7475388	7475389	SPT_1672	SPT_1673	sun	fmt	TRUE	0.997	-7.000	0.305	1.000	Y	NA
7475389	7475390	SPT_1673	SPT_1674	fmt		TRUE	0.962	13.000	0.052	1.000	N	NA
7475390	7475391	SPT_1674	SPT_1675			TRUE	0.688	66.000	0.032	0.056	N	NA
7475391	7475392	SPT_1675	SPT_1676		gmk	TRUE	0.983	25.000	0.471	1.000	N	NA
7475392	7475393	SPT_1676	SPT_1677	gmk		FALSE	0.222	130.000	0.010	1.000		NA
7475393	7475394	SPT_1677	SPT_1678			FALSE	0.031	269.000	0.000	NA		NA
7475396	7475397	SPT_1680	SPT_1681			TRUE	0.968	10.000	0.094	NA		NA
7475397	7475398	SPT_1681	SPT_1682			TRUE	0.473	103.000	0.085	NA		NA
7475398	7475399	SPT_1682	SPT_1683			TRUE	0.918	13.000	0.008	NA		NA
7475399	7475400	SPT_1683	SPT_1684			TRUE	0.972	1.000	0.024	1.000	N	NA
7475400	7475401	SPT_1684	SPT_1685		nadD	TRUE	0.996	0.000	0.199	1.000	Y	NA
7475401	7475402	SPT_1685	SPT_1686	nadD		TRUE	0.892	52.000	0.150	NA	N	NA
7475402	7475403	SPT_1686	SPT_1687			FALSE	0.185	214.000	0.068	NA		NA
7475403	7475404	SPT_1687	SPT_1688		yqeG	TRUE	0.995	3.000	0.555	NA		NA
7475404	7475405	SPT_1688	SPT_1689	yqeG		TRUE	0.921	15.000	0.015	NA		NA
7475405	7475406	SPT_1689	SPT_1690			TRUE	0.804	57.000	0.059	0.064	N	NA
7475407	7475408	SPT_1691	SPT_1693			FALSE	0.317	68.000	0.000	NA		NA
7475408	7475409	SPT_1693	SPT_1694			FALSE	0.096	143.000	0.000	NA		NA
7475409	7475410	SPT_1694	SPT_1695			TRUE	0.571	99.000	0.143	NA		NA
7475410	7475411	SPT_1695	SPT_1696		trx	TRUE	0.984	17.000	0.364	NA		NA
7475411	7475412	SPT_1696	SPT_1697	trx		FALSE	0.023	305.000	0.000	1.000		NA
7475412	7475413	SPT_1697	SPT_1698			TRUE	0.507	50.000	0.000	NA		NA
7475414	7475415	SPT_1699	SPT_1700			FALSE	0.143	111.000	0.000	NA		NA
7475415	7475416	SPT_1700	SPT_1701			TRUE	0.869	7.000	0.000	NA		NA
7475416	7475417	SPT_1701	SPT_1702			TRUE	0.369	62.000	0.000	NA		NA
7475417	7475418	SPT_1702	SPT_1703		pepF2	TRUE	0.720	23.000	0.000	NA		NA
7475418	7475419	SPT_1703	SPT_1704	pepF2		TRUE	0.915	11.000	0.004	NA		NA
7475419	7475420	SPT_1704	SPT_1705		prmA	TRUE	0.988	2.000	0.227	NA		NA
7475420	7475421	SPT_1705	SPT_1707	prmA		TRUE	0.837	13.000	0.000	NA		NA
7475421	7475422	SPT_1707	SPT_1708			TRUE	0.494	51.000	0.000	NA		NA
7475422	7475423	SPT_1708	SPT_1709			TRUE	0.640	110.000	0.231	1.000		NA
7475423	7475424	SPT_1709	SPT_1710			FALSE	0.031	272.000	0.000	1.000		NA
7475424	7475425	SPT_1710	SPT_1711			TRUE	0.898	-19.000	0.000	1.000		NA
7475425	7475426	SPT_1711	SPT_1712			TRUE	0.765	19.000	0.000	NA		NA
7475426	7475427	SPT_1712	SPT_1713			FALSE	0.026	291.000	0.000	NA		NA
7475427	7475428	SPT_1713	SPT_1714			TRUE	0.952	37.000	0.308	NA		NA
7475428	7475429	SPT_1714	SPT_1715			FALSE	0.103	137.000	0.000	NA		NA
7475429	7475430	SPT_1715	SPT_1716			FALSE	0.075	165.000	0.000	NA		NA
7475431	7475432	SPT_1717	SPT_1718			FALSE	0.032	264.000	0.000	NA		NA
7475433	7475434	SPT_1719	SPT_1720			TRUE	0.993	10.000	0.182	1.000	Y	NA
7475434	7475435	SPT_1720	SPT_1721			TRUE	0.995	29.000	0.733	0.035	Y	NA
7475435	7475436	SPT_1721	SPT_1722			TRUE	0.999	11.000	0.933	0.035	Y	NA
7475436	7475437	SPT_1722	SPT_1723			TRUE	0.541	150.000	0.214	1.000	N	NA
7475437	7475438	SPT_1723	SPT_1724			FALSE	0.018	362.000	0.000	NA		NA
7475439	7475440	SPT_1725	SPT_1726			TRUE	0.724	84.000	0.214	NA		NA
7475440	7475441	SPT_1726	SPT_1727			TRUE	0.974	12.000	0.143	NA		NA
7475441	7475442	SPT_1727	SPT_1728			TRUE	0.822	39.000	0.036	NA		NA
7475442	7475443	SPT_1728	SPT_1729			TRUE	0.990	31.000	1.000	NA		NA
7475446	7475447	SPT_1732	SPT_1733			TRUE	0.974	15.000	0.182	NA		NA
7475447	7475448	SPT_1733	SPT_1734		trpA	FALSE	0.023	302.000	0.000	NA		NA
7475448	7475449	SPT_1734	SPT_1735	trpA	trpB	TRUE	0.997	-7.000	0.248	0.001	Y	NA
7475449	7475450	SPT_1735	SPT_1736	trpB	trpF	TRUE	0.998	-22.000	0.375	0.002	Y	NA
7475450	7475451	SPT_1736	SPT_1737	trpF	trpC	TRUE	0.997	-13.000	0.264	0.002	Y	NA
7475451	7475452	SPT_1737	SPT_1738	trpC	trpD	TRUE	0.996	-3.000	0.216	1.000	Y	NA
7475452	7475453	SPT_1738	SPT_1739	trpD	pabA	TRUE	0.981	11.000	0.018	1.000	Y	NA
7475453	7475454	SPT_1739	SPT_1740	pabA	trpE	TRUE	0.998	-3.000	0.321	0.001	Y	NA
7475454	7475455	SPT_1740	SPT_1741	trpE		FALSE	0.017	372.000	0.000	NA		NA
7475455	7475456	SPT_1741	SPT_1742			FALSE	0.009	608.000	0.000	NA		NA
7475456	7475457	SPT_1742	SPT_1743			FALSE	0.009	571.000	0.000	1.000		NA
7475457	7475458	SPT_1743	SPT_1744			TRUE	0.893	3.000	0.000	0.063		NA
7475458	7475459	SPT_1744	SPT_1745			TRUE	0.994	12.000	0.545	0.035	N	NA
7475459	7475460	SPT_1745	SPT_1746			TRUE	0.789	103.000	0.364	0.035	N	NA
7475460	7475461	SPT_1746	SPT_1747			TRUE	0.706	25.000	0.000	1.000		NA
7475461	7475462	SPT_1747	SPT_1748		galE2	FALSE	0.075	167.000	0.000	1.000		NA
7475462	7475463	SPT_1748	SPT_1749	galE2	galT1	TRUE	0.895	13.000	0.000	0.003	N	NA
7475463	7475464	SPT_1749	SPT_1750	galT1		TRUE	0.885	13.000	0.000	NA	N	NA
7475464	7475465	SPT_1750	SPT_1751			TRUE	0.413	58.000	0.000	NA		NA
7475465	7475466	SPT_1751	SPT_1752			TRUE	0.901	-16.000	0.000	1.000		NA
7475466	7475467	SPT_1752	SPT_1753			FALSE	0.010	508.000	0.000	NA		NA
7475467	7475468	SPT_1753	SPT_1754			FALSE	0.025	294.000	0.000	NA		NA
7475468	7475469	SPT_1754	SPT_1755			TRUE	0.983	43.000	0.382	NA	Y	NA
7475469	7475470	SPT_1755	SPT_1756			FALSE	0.195	184.000	0.018	NA	N	NA
7475470	7475471	SPT_1756	SPT_1757			TRUE	0.999	-10.000	0.911	0.007	Y	NA
7475471	7475472	SPT_1757	SPT_1758			FALSE	0.132	206.000	0.018	NA		NA
7475472	7475473	SPT_1758	SPT_1759			FALSE	0.085	153.000	0.000	NA		NA
7475473	7475474	SPT_1759	SPT_1760			TRUE	0.644	31.000	0.000	NA		NA
7475475	7475476	SPT_1761	SPT_1762	xth		TRUE	0.845	12.000	0.000	NA		NA
7475476	7475477	SPT_1762	SPT_1764		xpt	FALSE	0.007	878.000	0.000	NA		NA
7475477	7475478	SPT_1764	SPT_1765	xpt		TRUE	0.991	0.000	0.046	1.000	Y	NA
7475479	7475480	SPT_1766	SPT_1767			TRUE	0.909	-3.000	0.000	NA		NA
7475480	7475481	SPT_1767	SPT_1768			FALSE	0.064	181.000	0.000	NA		NA
7475481	7475482	SPT_1768	SPT_1769		galT2	TRUE	0.621	70.000	0.024	NA	N	NA
7475482	7475483	SPT_1769	SPT_1770	galT2	galK	TRUE	0.983	19.000	0.107	0.003	Y	NA
7475485	7475486	SPT_1772	SPT_1773			TRUE	0.932	1.000	0.000	1.000	N	NA
7475486	7475487	SPT_1773	SPT_1774			FALSE	0.059	244.000	0.000	1.000	N	NA
7475489	7475490	SPT_1776	SPT_1777			FALSE	0.071	171.000	0.000	NA		NA
7475490	7475491	SPT_1777	SPT_1778			TRUE	0.413	58.000	0.000	NA		NA
7475491	7475492	SPT_1778	SPT_1779			TRUE	0.995	-7.000	0.382	1.000	N	NA
7475492	7475493	SPT_1779	SPT_1780			TRUE	0.935	15.000	0.031	NA		NA
7475493	7475494	SPT_1780	SPT_1781			TRUE	0.986	4.000	0.222	NA		NA
7475494	7475495	SPT_1781	SPT_1782			FALSE	0.008	682.000	0.000	NA		NA
7475495	7475496	SPT_1782	SPT_1783		pepA	TRUE	0.733	22.000	0.000	NA		NA
7475497	7475498	SPT_1784	SPT_1785			TRUE	0.909	-3.000	0.000	NA		NA
7475498	7475499	SPT_1785	SPT_1786			FALSE	0.024	297.000	0.000	NA		NA
7475499	7475500	SPT_1786	SPT_1787			TRUE	0.999	-10.000	0.870	0.035	Y	NA
7475500	7475501	SPT_1787	SPT_1788			TRUE	0.999	-3.000	0.870	1.000	Y	NA
7475501	7475502	SPT_1788	SPT_1789			TRUE	0.719	96.000	0.055	1.000	Y	NA
7475503	7475504	SPT_1790	SPT_1791		rluB	TRUE	0.960	0.000	0.014	NA		NA
7475504	7475505	SPT_1791	SPT_1792	rluB	scpB	TRUE	0.991	-13.000	0.224	NA	N	NA
7475505	7475506	SPT_1792	SPT_1793	scpB		TRUE	0.988	19.000	0.570	NA		NA
7475506	7475507	SPT_1793	SPT_1794			TRUE	0.943	0.000	0.003	NA		NA
7475507	7475508	SPT_1794	SPT_1795			TRUE	0.963	-9.000	0.017	1.000		NA
7475508	7475509	SPT_1795	SPT_1796			TRUE	0.977	-3.000	0.065	NA		NA
7475509	7475510	SPT_1796	SPT_1797			TRUE	0.976	-24.000	0.085	NA		NA
7475510	7475511	SPT_1797	SPT_1798		murI	TRUE	0.977	-3.000	0.034	1.000	N	NA
7475511	7475512	SPT_1798	SPT_1799	murI		FALSE	0.124	207.000	0.014	NA		NA
7475512	7475513	SPT_1799	SPT_1800			FALSE	0.036	256.000	0.000	NA		NA
7475513	7475514	SPT_1800	SPT_1802		treP	TRUE	0.848	178.000	0.650	1.000	Y	NA
7475515	7475516	SPT_1803	SPT_1804	treR		FALSE	0.081	157.000	0.000	NA		NA
7475517	7475518	SPT_1809	SPT_1810			TRUE	0.996	11.000	0.333	0.001	Y	NA
7475518	7475519	SPT_1810	SPT_1811			TRUE	0.998	9.000	0.650	1.000	Y	NA
7475519	7475520	SPT_1811	SPT_1812			TRUE	0.992	0.000	0.278	0.034		NA
7475520	7475521	SPT_1812	SPT_1813			TRUE	0.933	67.000	0.600	0.034		NA
7475521	7475522	SPT_1813	SPT_1814			FALSE	0.012	686.000	0.000	NA	N	NA
7475522	7475523	SPT_1814	SPT_1815			FALSE	0.145	138.000	0.000	NA	N	NA
7475523	7475524	SPT_1815	SPT_1816			FALSE	0.050	211.000	0.000	NA		NA
7475524	7475525	SPT_1816	SPT_1817			TRUE	0.869	7.000	0.000	NA		NA
7475525	7475526	SPT_1817	SPT_1818			TRUE	0.998	14.000	0.925	0.034	Y	NA
7475526	7475527	SPT_1818	SPT_1819			TRUE	0.994	14.000	0.275	0.034	Y	NA
7475527	7475528	SPT_1819	SPT_1821			TRUE	0.890	92.000	0.286	1.000	Y	NA
7475529	7475530	SPT_1822	SPT_1823			TRUE	0.939	-3.000	0.000	1.000	N	NA
7475531	7475532	SPT_1824	SPT_1825			TRUE	0.893	2.000	0.000	NA		NA
7475532	7475533	SPT_1825	SPT_1826			TRUE	0.631	32.000	0.000	NA		NA
7475533	7475534	SPT_1826	SPT_1827			TRUE	0.793	17.000	0.000	NA		NA
7475534	7475535	SPT_1827	SPT_1828			TRUE	0.900	1.000	0.000	NA		NA
7475535	7475536	SPT_1828	SPT_1829			TRUE	0.867	8.000	0.000	NA		NA
7475536	7475537	SPT_1829	SPT_1830			TRUE	0.867	8.000	0.000	NA		NA
7475537	7475538	SPT_1830	SPT_1831			TRUE	0.857	10.000	0.000	NA		NA
7475538	7475539	SPT_1831	SPT_1832			TRUE	0.900	1.000	0.000	NA		NA
7475539	7475540	SPT_1832	SPT_1833			TRUE	0.845	12.000	0.000	NA		NA
7475540	7475541	SPT_1833	SPT_1834			TRUE	0.869	7.000	0.000	NA		NA
7475541	7475542	SPT_1834	SPT_1835			TRUE	0.874	5.000	0.000	NA		NA
7475542	7475543	SPT_1835	SPT_1836			TRUE	0.751	20.000	0.000	NA		NA
7475543	7475544	SPT_1836	SPT_1837			TRUE	0.819	15.000	0.000	NA		NA
7475544	7475545	SPT_1837	SPT_1838			TRUE	0.893	2.000	0.000	NA		NA
7475545	7475546	SPT_1838	SPT_1839			TRUE	0.701	25.000	0.000	NA		NA
7475546	7475547	SPT_1839	SPT_2264			TRUE	0.884	3.000	0.000	NA		NA
7475547	7475548	SPT_2264	SPT_1840		rrf_2	TRUE	0.874	5.000	0.000	NA		NA
7475548	7475549	SPT_1840	SPT_1841	rrf_2	rrl2	FALSE	0.258	77.000	0.000	NA		NA
7475549	7475550	SPT_1841	SPT_1843	rrl2		FALSE	0.122	121.000	0.000	NA		NA
7475550	7475551	SPT_1843	SPT_1844		rrs2	FALSE	0.115	126.000	0.000	NA		NA
7475551	7475552	SPT_1844	SPT_1845	rrs2		FALSE	0.034	262.000	0.000	NA		NA
7475552	7475553	SPT_1845	SPT_1846		rumA2	TRUE	0.369	62.000	0.000	NA		NA
7475554	7475555	SPT_1847	SPT_1848			TRUE	0.419	89.000	0.025	NA		NA
7475556	7475557	SPT_1849	SPT_1850			FALSE	0.020	317.000	0.000	NA		NA
7475557	7475558	SPT_1850	SPT_1851			TRUE	0.837	13.000	0.000	NA		NA
7475560	7475561	SPT_1854	SPT_1855		groL	FALSE	0.035	258.000	0.000	NA		NA
7475561	7475562	SPT_1855	SPT_1856	groL	groS	TRUE	0.989	16.000	0.160	1.000	Y	NA
7475562	7475563	SPT_1856	SPT_1857	groS		TRUE	0.359	156.000	0.083	1.000	N	NA
7475563	7475564	SPT_1857	SPT_1858			FALSE	0.254	78.000	0.000	1.000		NA
7475564	7475565	SPT_1858	SPT_1859			TRUE	0.825	33.000	0.020	1.000		NA
7475565	7475566	SPT_1859	SPT_1860			TRUE	0.979	16.000	0.239	1.000		NA
7475566	7475567	SPT_1860	SPT_1861			TRUE	0.985	-3.000	0.140	NA		NA
7475569	7475570	SPT_1863	SPT_1864			FALSE	0.021	315.000	0.000	NA		NA
7475570	7475571	SPT_1864	SPT_1865			TRUE	0.996	5.000	0.714	NA		NA
7475571	7475572	SPT_1865	SPT_1866			TRUE	0.377	114.000	0.053	NA		NA
7475572	7475573	SPT_1866	SPT_1867			TRUE	0.909	-3.000	0.000	NA		NA
7475573	7475574	SPT_1867	SPT_1868			TRUE	0.335	66.000	0.000	NA		NA
7475574	7475575	SPT_1868	SPT_1869			TRUE	0.997	7.000	1.000	1.000		NA
7475575	7475576	SPT_1869	SPT_1870			TRUE	0.660	118.000	0.296	1.000		NA
7475576	7475577	SPT_1870	SPT_1871			FALSE	0.187	124.000	0.002	NA		NA
7475577	7475578	SPT_1871	SPT_1872			FALSE	0.007	881.000	0.000	NA		NA
7475578	7475579	SPT_1872	SPT_1873			TRUE	0.850	11.000	0.000	NA		NA
7475579	7475580	SPT_1873	SPT_1874			FALSE	0.292	71.000	0.000	NA		NA
7475580	7475581	SPT_1874	SPT_1875			TRUE	0.837	13.000	0.000	NA		NA
7475582	7475583	SPT_1876	SPT_1877			TRUE	0.874	5.000	0.000	NA		NA
7475583	7475584	SPT_1877	SPT_1878			FALSE	0.017	477.000	0.000	NA	N	NA
7475584	7475585	SPT_1878	SPT_1879			TRUE	0.765	27.000	0.000	1.000	N	NA
7475585	7475586	SPT_1879	SPT_1880			TRUE	0.987	17.000	0.364	0.034	N	NA
7475586	7475587	SPT_1880	SPT_1881			TRUE	0.845	12.000	0.000	NA		NA
7475587	7475588	SPT_1881	SPT_1884			FALSE	0.008	752.000	0.000	NA		NA
7475588	7475589	SPT_1884	SPT_1885			TRUE	0.861	10.000	0.000	1.000		NA
7475589	7475590	SPT_1885	SPT_1886			FALSE	0.079	159.000	0.000	NA		NA
7475590	7475591	SPT_1886	SPT_1887			TRUE	0.874	5.000	0.000	NA		NA
7475592	7475593	SPT_1888	SPT_1889			TRUE	0.397	59.000	0.000	NA		NA
7475593	7475594	SPT_1889	SPT_1890			TRUE	0.905	-10.000	0.000	NA		NA
7475594	7475595	SPT_1890	SPT_1891			TRUE	0.879	4.000	0.000	NA		NA
7475595	7475596	SPT_1891	SPT_1892			FALSE	0.014	408.000	0.000	NA		NA
7475596	7475597	SPT_1892	SPT_1893			FALSE	0.110	129.000	0.000	NA		NA
7475597	7475598	SPT_1893	SPT_1894			FALSE	0.040	239.000	0.000	NA		NA
7475598	7475599	SPT_1894	SPT_1895			FALSE	0.018	359.000	0.000	1.000		NA
7475599	7475600	SPT_1895	SPT_1896			FALSE	0.112	128.000	0.000	NA		NA
7475600	7475601	SPT_1896	SPT_1897			FALSE	0.105	135.000	0.000	NA		NA
7475601	7475602	SPT_1897	SPT_1898		recA	FALSE	0.034	307.000	0.000	1.000	N	NA
7475602	7475603	SPT_1898	SPT_1899	recA		TRUE	0.797	55.000	0.083	1.000		NA
7475603	7475604	SPT_1899	SPT_1900			TRUE	0.329	85.000	0.004	NA		NA
7475604	7475605	SPT_1900	SPT_1901			TRUE	0.990	8.000	0.283	NA	N	NA
7475605	7475606	SPT_1901	SPT_1902			TRUE	0.968	-10.000	0.033	NA		NA
7475606	7475607	SPT_1902	SPT_1903			FALSE	0.315	86.000	0.003	NA		NA
7475607	7475608	SPT_1903	SPT_1904			FALSE	0.022	306.000	0.000	NA		NA
7475609	7475610	SPT_1905	SPT_1906			FALSE	0.034	260.000	0.000	NA		NA
7475610	7475611	SPT_1906	SPT_1907			TRUE	0.720	23.000	0.000	NA		NA
7475611	7475612	SPT_1907	SPT_1908			TRUE	0.765	19.000	0.000	NA		NA
7475612	7475613	SPT_1908	SPT_1909			TRUE	0.663	29.000	0.000	NA		NA
7475613	7475614	SPT_1909	SPT_1910			FALSE	0.068	178.000	0.000	1.000		NA
7475614	7475615	SPT_1910	SPT_1911			TRUE	0.554	43.000	0.000	NA		NA
7475615	7475616	SPT_1911	SPT_1912			FALSE	0.129	117.000	0.000	NA		NA
7475616	7475617	SPT_1912	SPT_1913			TRUE	0.893	-25.000	0.000	NA		NA
7475617	7475618	SPT_1913	SPT_1914			TRUE	0.898	-16.000	0.000	NA		NA
7475618	7475619	SPT_1914	SPT_1915			TRUE	0.884	3.000	0.000	NA		NA
7475619	7475620	SPT_1915	SPT_1916			TRUE	0.909	-3.000	0.000	NA		NA
7475620	7475621	SPT_1916	SPT_1917			TRUE	0.909	-3.000	0.000	NA		NA
7475621	7475622	SPT_1917	SPT_1918			FALSE	0.029	275.000	0.000	NA		NA
7475622	7475623	SPT_1918	SPT_1919			TRUE	0.990	16.000	0.545	NA		NA
7475623	7475624	SPT_1919	SPT_1921			FALSE	0.066	179.000	0.000	NA		NA
7475624	7475625	SPT_1921	SPT_1922			TRUE	0.909	-3.000	0.000	NA		NA
7475625	7475626	SPT_1922	SPT_1923			FALSE	0.300	70.000	0.000	NA		NA
7475626	7475627	SPT_1923	SPT_1924			TRUE	0.995	-13.000	0.500	NA		NA
7475628	7475629	SPT_1925	SPT_1926			TRUE	0.333	120.000	0.042	1.000		NA
7475629	7475630	SPT_1926	SPT_1927			FALSE	0.016	386.000	0.000	NA		NA
7475630	7475631	SPT_1927	SPT_1928			FALSE	0.007	773.000	0.000	NA		NA
7475632	7475633	SPT_1929	SPT_1930			FALSE	0.008	688.000	0.000	NA		NA
7475633	7475634	SPT_1930	SPT_1931			FALSE	0.226	82.000	0.000	NA		NA
7475634	7475635	SPT_1931	SPT_1932			FALSE	0.018	350.000	0.000	NA		NA
7475635	7475636	SPT_1932	SPT_1933			FALSE	0.015	401.000	0.000	NA		NA
7475636	7475637	SPT_1933	SPT_1934			TRUE	0.998	2.000	1.000	NA		NA
7475637	7475638	SPT_1934	SPT_1935			FALSE	0.098	141.000	0.000	NA		NA
7475639	7475640	SPT_1936	SPT_1937		rpoC	FALSE	0.282	111.000	0.002	1.000	N	NA
7475640	7475641	SPT_1937	SPT_1938	rpoC	rpoB	TRUE	0.995	33.000	0.851	0.001	Y	NA
7475642	7475643	SPT_1939	SPT_1940			FALSE	0.071	170.000	0.000	NA		NA
7475644	7475645	SPT_1941	SPT_1942			TRUE	0.369	62.000	0.000	NA		NA
7475645	7475646	SPT_1942	SPT_1943			FALSE	0.026	291.000	0.000	NA		NA
7475646	7475647	SPT_1943	SPT_1944			TRUE	0.937	39.000	0.237	NA		NA
7475647	7475648	SPT_1944	SPT_1945		murA	TRUE	0.983	-7.000	0.110	NA		NA
7475648	7475649	SPT_1945	SPT_1946	murA		TRUE	0.968	24.000	0.279	NA		NA
7475649	7475650	SPT_1946	SPT_1947			FALSE	0.081	157.000	0.000	NA		NA
7475650	7475651	SPT_1947	SPT_1948		coaD	TRUE	0.958	-16.000	0.003	1.000	N	NA
7475651	7475652	SPT_1948	SPT_1949	coaD	rsmD	TRUE	0.966	-10.000	0.008	1.000	N	NA
7475652	7475653	SPT_1949	SPT_1950	rsmD	asnA	TRUE	0.603	65.000	0.006	1.000	N	NA
7475655	7475656	SPT_1952	SPT_1953			TRUE	0.607	56.000	0.005	NA		NA
7475657	7475658	SPT_1954	SPT_1955			TRUE	0.757	78.000	0.154	1.000	N	NA
7475659	7475660	SPT_1956	SPT_1957	pflA		FALSE	0.276	126.000	0.007	1.000	N	NA
7475660	7475661	SPT_1957	SPT_1958		purR	TRUE	0.612	67.000	0.012	1.000	N	NA
7475661	7475662	SPT_1958	SPT_1959	purR		FALSE	0.111	267.000	0.052	1.000		NA
7475662	7475663	SPT_1959	SPT_1960			TRUE	0.967	-10.000	0.030	NA		NA
7475663	7475664	SPT_1960	SPT_1961			TRUE	0.963	2.000	0.030	NA		NA
7475664	7475665	SPT_1961	SPT_1962		rpe	TRUE	0.988	-37.000	0.166	1.000	N	NA
7475665	7475666	SPT_1962	SPT_1963	rpe	rsgA	TRUE	0.982	11.000	0.213	1.000		NA
7475666	7475667	SPT_1963	SPT_1964	rsgA	ksgA	TRUE	0.938	2.000	0.003	1.000		NA
7475667	7475668	SPT_1964	SPT_1965	ksgA		FALSE	0.037	251.000	0.000	NA		NA
7475668	7475669	SPT_1965	SPT_1966			TRUE	0.765	19.000	0.000	NA		NA
7475669	7475670	SPT_1966	SPT_1967			TRUE	0.908	-7.000	0.000	NA		NA
7475670	7475671	SPT_1967	SPT_1968			TRUE	0.893	2.000	0.000	NA		NA
7475671	7475672	SPT_1968	SPT_1969			FALSE	0.031	268.000	0.000	NA		NA
7475672	7475673	SPT_1969	SPT_1970			FALSE	0.292	72.000	0.000	1.000		NA
7475673	7475674	SPT_1970	SPT_1971			TRUE	0.992	0.000	0.058	NA	Y	NA
7475674	7475675	SPT_1971	SPT_1972			FALSE	0.023	305.000	0.000	NA		NA
7475675	7475676	SPT_1972	SPT_1973		rpmH	FALSE	0.071	173.000	0.000	1.000		NA
7475676	7475677	SPT_1973	SPT_1974	rpmH		FALSE	0.152	145.000	0.002	1.000		NA
7475677	7475678	SPT_1974	SPT_1975			FALSE	0.113	191.000	0.005	NA		NA
7475682	7475683	SPT_1979	SPT_1980		ccpA	TRUE	0.353	64.000	0.000	NA		NA
7475683	7475684	SPT_1980	SPT_1981	ccpA		FALSE	0.061	425.000	0.000	0.028	Y	NA
7475684	7475685	SPT_1981	SPT_1982			TRUE	0.999	2.000	0.857	0.010	Y	NA
7475685	7475686	SPT_1982	SPT_1983			TRUE	0.985	0.000	0.107	NA	N	NA
7475686	7475687	SPT_1983	SPT_1984			TRUE	0.995	-28.000	0.193	NA	Y	NA
7475687	7475688	SPT_1984	SPT_1985			TRUE	0.963	-13.000	0.023	NA		NA
7475688	7475689	SPT_1985	SPT_1986			TRUE	0.998	-3.000	1.000	NA		NA
7475691	7475692	SPT_1988	SPT_1989			TRUE	0.845	12.000	0.000	NA		NA
7475692	7475693	SPT_1989	SPT_1990			TRUE	0.869	7.000	0.000	NA		NA
7475693	7475694	SPT_1990	SPT_1991			TRUE	0.874	5.000	0.000	NA		NA
7475694	7475695	SPT_1991	SPT_1992			TRUE	0.751	20.000	0.000	NA		NA
7475695	7475696	SPT_1992	SPT_1993			TRUE	0.819	15.000	0.000	NA		NA
7475696	7475697	SPT_1993	SPT_1994			TRUE	0.893	2.000	0.000	NA		NA
7475697	7475698	SPT_1994	SPT_1995			TRUE	0.701	25.000	0.000	NA		NA
7475698	7475699	SPT_1995	SPT_2266			TRUE	0.884	3.000	0.000	NA		NA
7475699	7475700	SPT_2266	SPT_1996		rrf	TRUE	0.874	5.000	0.000	NA		NA
7475700	7475701	SPT_1996	SPT_1997	rrf	rrl3	FALSE	0.258	77.000	0.000	NA		NA
7475701	7475702	SPT_1997	SPT_1999	rrl3		FALSE	0.122	121.000	0.000	NA		NA
7475702	7475703	SPT_1999	SPT_2000		rrs3	FALSE	0.115	126.000	0.000	NA		NA
7475703	7475704	SPT_2000	SPT_2001	rrs3		FALSE	0.033	263.000	0.000	NA		NA
7475704	7475705	SPT_2001	SPT_2002			FALSE	0.180	94.000	0.000	NA		NA
7475705	7475706	SPT_2002	SPT_2003		nusG	FALSE	0.198	122.000	0.002	0.037		NA
7475706	7475707	SPT_2003	SPT_2004	nusG	secE	TRUE	0.977	55.000	0.843	1.000	N	NA
7475707	7475708	SPT_2004	SPT_2005	secE	rpmG2	TRUE	0.973	10.000	0.080	1.000	N	NA
7475708	7475709	SPT_2005	SPT_2006	rpmG2		TRUE	0.868	53.000	0.111	1.000	N	NA
7475711	7475712	SPT_2008	SPT_2009	gap		FALSE	0.066	180.000	0.000	1.000		NA
7475712	7475713	SPT_2009	SPT_2010			TRUE	0.720	23.000	0.000	NA		NA
7475715	7475716	SPT_2012	SPT_2013		nadC	FALSE	0.154	131.000	0.000	NA	N	NA
7475718	7475719	SPT_2015	SPT_2016			FALSE	0.010	523.000	0.000	1.000		NA
7475720	7475721	SPT_2017	SPT_2018			TRUE	0.944	18.000	0.000	1.000	Y	NA
7475721	7475722	SPT_2018	SPT_2019			TRUE	0.972	5.000	0.000	0.017	Y	NA
7475722	7475723	SPT_2019	SPT_2020			TRUE	0.980	-3.000	0.000	0.017	Y	NA
7475724	7475725	SPT_2021	SPT_2022			FALSE	0.023	300.000	0.000	NA		NA
7475725	7475726	SPT_2022	SPT_2023			TRUE	0.959	2.000	0.019	NA		NA
7475726	7475727	SPT_2023	SPT_2024		yajC	TRUE	0.730	46.000	0.002	NA	N	NA
7475727	7475728	SPT_2024	SPT_2025	yajC	tkt2	FALSE	0.182	117.000	0.000	NA	N	NA
7475728	7475729	SPT_2025	SPT_2026	tkt2		FALSE	0.137	114.000	0.000	NA		NA
7475729	7475730	SPT_2026	SPT_2027			TRUE	0.627	112.000	0.231	NA		NA
7475730	7475731	SPT_2027	SPT_2028			TRUE	0.434	181.000	0.200	1.000	N	NA
7475731	7475732	SPT_2028	SPT_2029			TRUE	0.999	2.000	0.700	1.000	Y	NA
7475732	7475733	SPT_2029	SPT_2030			TRUE	0.998	4.000	0.536	1.000	Y	NA
7475733	7475734	SPT_2030	SPT_2031			TRUE	0.993	17.000	0.328	1.000	Y	NA
7475734	7475735	SPT_2031	SPT_2032			TRUE	0.928	76.000	0.279	0.017	Y	NA
7475735	7475736	SPT_2032	SPT_2033			TRUE	0.980	23.000	0.431	0.026		NA
7475736	7475737	SPT_2033	SPT_2034			FALSE	0.296	129.000	0.039	NA		NA
7475737	7475738	SPT_2034	SPT_2035			TRUE	0.681	51.000	0.008	NA		NA
7475738	7475739	SPT_2035	SPT_2036			TRUE	0.949	19.000	0.106	1.000		NA
7475739	7475740	SPT_2036	SPT_2037		rnpA	TRUE	0.916	26.000	0.052	1.000	N	NA
7475740	7475741	SPT_2037	SPT_2038	rnpA		TRUE	0.793	17.000	0.000	NA		NA
7475741	7475742	SPT_2038	SPT_2039		ackA	TRUE	0.900	1.000	0.000	NA		NA
7475742	7475743	SPT_2039	SPT_2040	ackA		TRUE	0.888	51.000	0.130	1.000	N	NA
7475743	7475744	SPT_2040	SPT_2041			TRUE	0.385	61.000	0.000	1.000		NA
7475744	7475745	SPT_2041	SPT_2042			FALSE	0.103	137.000	0.000	NA		NA
7475745	7475746	SPT_2042	SPT_2043			TRUE	0.989	-22.000	0.232	NA		NA
7475746	7475747	SPT_2043	SPT_2044			TRUE	0.989	-37.000	0.250	NA		NA
7475747	7475748	SPT_2044	SPT_2045			TRUE	0.996	5.000	0.786	NA		NA
7475748	7475749	SPT_2045	SPT_2046			TRUE	0.994	-7.000	0.110	NA	Y	NA
7475749	7475750	SPT_2046	SPT_2047			TRUE	0.999	2.000	0.861	0.001	Y	NA
7475750	7475751	SPT_2047	SPT_2048			TRUE	0.946	92.000	0.639	1.000	Y	NA
7475751	7475752	SPT_2048	SPT_2049			TRUE	0.632	76.000	0.083	NA		NA
7475752	7475753	SPT_2049	SPT_2050			FALSE	0.268	151.000	0.053	NA		NA
7475753	7475754	SPT_2050	SPT_2051		nagA	FALSE	0.255	163.000	0.030	1.000	N	NA
7475754	7475755	SPT_2051	SPT_2052	nagA		FALSE	0.125	153.000	0.000	1.000	N	NA
7475755	7475756	SPT_2052	SPT_2053		tgt	TRUE	0.322	101.000	0.003	1.000	N	NA
7475758	7475759	SPT_2055	SPT_2056	pcp2		FALSE	0.272	75.000	0.000	NA		NA
7475759	7475760	SPT_2056	SPT_2057			TRUE	0.931	11.000	0.012	NA		NA
7475760	7475761	SPT_2057	SPT_2058			FALSE	0.020	323.000	0.000	1.000		NA
7475761	7475762	SPT_2058	SPT_2059			TRUE	0.344	166.000	0.133	1.000		NA
7475762	7475763	SPT_2059	SPT_2060			TRUE	0.991	4.000	0.364	1.000		NA
7475763	7475764	SPT_2060	SPT_2061		thrC	TRUE	0.637	61.000	0.006	1.000	N	NA
7475764	7475765	SPT_2061	SPT_2062	thrC		TRUE	0.478	76.000	0.003	NA	N	NA
7475765	7475766	SPT_2062	SPT_2063			FALSE	0.155	103.000	0.000	NA		NA
7475766	7475767	SPT_2063	SPT_2064			TRUE	0.874	5.000	0.000	NA		NA
7475767	7475768	SPT_2064	SPT_2065			TRUE	0.871	6.000	0.000	NA		NA
7475768	7475769	SPT_2065	SPT_2066			TRUE	0.827	14.000	0.000	NA		NA
7475769	7475770	SPT_2066	SPT_2265			TRUE	0.884	3.000	0.000	NA		NA
7475770	7475771	SPT_2265	SPT_2067			TRUE	0.857	10.000	0.000	NA		NA
7475771	7475772	SPT_2067	SPT_2068			TRUE	0.900	1.000	0.000	NA		NA
7475772	7475773	SPT_2068	SPT_2069			TRUE	0.867	8.000	0.000	NA		NA
7475773	7475774	SPT_2069	SPT_2070			FALSE	0.240	79.000	0.000	NA		NA
7475774	7475775	SPT_2070	SPT_2071			TRUE	0.655	30.000	0.000	NA		NA
7475775	7475776	SPT_2071	SPT_2072			TRUE	0.893	2.000	0.000	NA		NA
7475776	7475777	SPT_2072	SPT_2073		rrf_3	TRUE	0.874	5.000	0.000	NA		NA
7475777	7475778	SPT_2073	SPT_2074	rrf_3	rrl4	FALSE	0.258	77.000	0.000	NA		NA
7475778	7475779	SPT_2074	SPT_2076	rrl4		FALSE	0.122	121.000	0.000	NA		NA
7475779	7475780	SPT_2076	SPT_2077		rrs4	FALSE	0.115	126.000	0.000	NA		NA
7475780	7475781	SPT_2077	SPT_2078	rrs4		FALSE	0.033	263.000	0.000	NA		NA
7475781	7475782	SPT_2078	SPT_2079			FALSE	0.122	121.000	0.000	NA		NA
7475782	7475783	SPT_2079	SPT_2080		gltX	TRUE	0.936	14.000	0.008	1.000	N	NA
7475783	7475784	SPT_2080	SPT_2081	gltX	pgi	FALSE	0.263	124.000	0.005	1.000	N	NA
7475784	7475785	SPT_2081	SPT_2082	pgi		TRUE	0.901	-13.000	0.000	NA		NA
7475785	7475786	SPT_2082	SPT_2083			TRUE	0.879	4.000	0.000	NA		NA
7475786	7475787	SPT_2083	SPT_2084			FALSE	0.303	139.000	0.053	1.000		NA
7475789	7475790	SPT_2086	SPT_2087		mutS	FALSE	0.209	146.000	0.003	0.099	N	NA
7475790	7475791	SPT_2087	SPT_2088	mutS	argR	TRUE	0.744	51.000	0.008	1.000	N	NA
7475794	7475795	SPT_2091	SPT_2092			TRUE	0.455	84.000	0.027	NA		NA
7475795	7475796	SPT_2092	SPT_2093			TRUE	0.995	1.000	0.164	1.000	Y	NA
7475796	7475797	SPT_2093	SPT_2094			TRUE	0.384	167.000	0.176	NA		NA
7475797	7475798	SPT_2094	SPT_2095		pstC2	FALSE	0.238	118.000	0.007	NA		NA
7475798	7475799	SPT_2095	SPT_2096	pstC2	pstA2	TRUE	0.996	-7.000	0.219	0.003	Y	NA
7475799	7475800	SPT_2096	SPT_2097	pstA2	pstB3	TRUE	0.998	2.000	0.428	0.003	Y	NA
7475800	7475801	SPT_2097	SPT_2098	pstB3	phoU2	TRUE	0.991	15.000	0.182	NA	Y	NA
7475801	7475802	SPT_2098	SPT_2099	phoU2		FALSE	0.317	68.000	0.000	NA		NA
7475804	7475805	SPT_2101	SPT_2102		galU	TRUE	0.920	22.000	0.032	1.000	N	NA
7475806	7475807	SPT_2103	SPT_2104			TRUE	0.967	-16.000	0.037	1.000		NA
7475807	7475808	SPT_2104	SPT_2105			TRUE	0.920	12.000	0.006	1.000		NA
7475808	7475809	SPT_2105	SPT_2106			TRUE	0.885	68.000	0.372	1.000		NA
7475809	7475810	SPT_2106	SPT_2107			FALSE	0.044	230.000	0.000	1.000		NA
7475810	7475811	SPT_2107	SPT_2108			TRUE	0.350	65.000	0.000	1.000		NA
7475813	7475814	SPT_2110	SPT_2111			TRUE	0.992	2.000	0.363	NA		NA
7475816	7475817	SPT_2113	SPT_2114			FALSE	0.007	955.000	0.000	NA		NA
7475817	7475818	SPT_2114	SPT_2115		malQ	TRUE	0.974	26.000	0.105	0.019	Y	NA
7475819	7475820	SPT_2116	SPT_2117			TRUE	0.927	111.000	0.621	1.000	Y	NA
7475820	7475821	SPT_2117	SPT_2118			TRUE	0.999	2.000	0.714	0.032	Y	NA
7475821	7475822	SPT_2118	SPT_2119			FALSE	0.251	253.000	0.200	NA		NA
7475822	7475823	SPT_2119	SPT_2120			TRUE	0.990	10.000	0.364	NA		NA
7475824	7475825	SPT_2121	SPT_2122		aspS	TRUE	0.957	-22.000	0.016	NA		NA
7475825	7475826	SPT_2122	SPT_2123	aspS		FALSE	0.126	119.000	0.000	NA		NA
7475826	7475827	SPT_2123	SPT_2124			TRUE	0.567	42.000	0.000	NA		NA
7475827	7475828	SPT_2124	SPT_2125			TRUE	0.984	18.000	0.400	NA		NA
7475828	7475829	SPT_2125	SPT_2126			TRUE	0.845	12.000	0.000	NA		NA
7475829	7475830	SPT_2126	SPT_2127			TRUE	0.972	3.000	0.077	NA		NA
7475830	7475831	SPT_2127	SPT_2128			TRUE	0.904	0.000	0.000	NA		NA
7475831	7475832	SPT_2128	SPT_2129			TRUE	0.857	10.000	0.000	NA		NA
7475832	7475833	SPT_2129	SPT_2130			TRUE	0.889	-46.000	0.000	NA		NA
7475833	7475834	SPT_2130	SPT_2131			TRUE	0.542	44.000	0.000	NA		NA
7475834	7475835	SPT_2131	SPT_2132		hisS	TRUE	0.909	-3.000	0.000	NA		NA
7475835	7475836	SPT_2132	SPT_2133	hisS		TRUE	0.372	78.000	0.003	NA		NA
7475836	7475837	SPT_2133	SPT_2134			FALSE	0.060	191.000	0.000	NA		NA
7475837	7475838	SPT_2134	SPT_2135			TRUE	0.344	65.000	0.000	NA		NA
7475839	7475840	SPT_2136	SPT_2137			TRUE	0.353	64.000	0.000	NA		NA
7475841	7475842	SPT_2138	SPT_2139	ilvD		FALSE	0.168	233.000	0.000	1.000	Y	NA
7475842	7475843	SPT_2139	SPT_2140			TRUE	0.999	-3.000	0.742	0.002	Y	NA
7475843	7475844	SPT_2140	SPT_2141			TRUE	0.991	4.000	0.333	1.000		NA
7475844	7475845	SPT_2141	SPT_2142			TRUE	0.978	13.000	0.182	0.025		NA
7475845	7475846	SPT_2142	SPT_2143			TRUE	0.986	4.000	0.156	0.017	N	NA
7475847	7475848	SPT_2144	SPT_2145			TRUE	0.995	3.000	0.549	1.000		NA
7475848	7475849	SPT_2145	SPT_2146		rpmF	FALSE	0.088	152.000	0.000	1.000		NA
7475849	7475850	SPT_2146	SPT_2147	rpmF	rpmG3	TRUE	0.974	16.000	0.012	0.025	Y	NA
7475852	7475853	SPT_2150	SPT_2151			TRUE	0.889	-43.000	0.000	NA		NA
7475853	7475854	SPT_2151	SPT_2152			FALSE	0.044	227.000	0.000	NA		NA
7475855	7475856	SPT_2153	SPT_2154			FALSE	0.017	378.000	0.000	NA		NA
7475856	7475857	SPT_2154	SPT_2155			TRUE	0.995	-6.000	0.500	NA		NA
7475857	7475858	SPT_2155	SPT_2156			TRUE	0.561	84.000	0.000	NA	Y	NA
7475858	7475859	SPT_2156	SPT_2157			FALSE	0.194	91.000	0.000	1.000		NA
7475862	7475863	SPT_2160	SPT_2161	arcA	argF	TRUE	0.934	58.000	0.146	1.000	Y	NA
7475863	7475864	SPT_2161	SPT_2162	argF	arcC	TRUE	0.621	165.000	0.146	1.000	Y	NA
7475864	7475865	SPT_2162	SPT_2163	arcC		FALSE	0.050	211.000	0.000	NA		NA
7475865	7475866	SPT_2163	SPT_2164			TRUE	0.948	22.000	0.140	NA		NA
7475866	7475867	SPT_2164	SPT_2165			FALSE	0.180	95.000	0.000	1.000		NA
7475868	7475869	SPT_2166	SPT_2167			TRUE	0.905	-12.000	0.000	1.000		NA
7475871	7475872	SPT_2169	SPT_2170			FALSE	0.159	130.000	0.000	1.000	N	NA
7475872	7475873	SPT_2170	SPT_2171		fucI	FALSE	0.135	146.000	0.000	1.000	N	NA
7475873	7475874	SPT_2171	SPT_2172	fucI		TRUE	0.434	57.000	0.000	1.000		NA
7475874	7475875	SPT_2172	SPT_2173			FALSE	0.053	208.000	0.000	1.000		NA
7475875	7475876	SPT_2173	SPT_2174			TRUE	0.403	59.000	0.000	1.000		NA
7475876	7475877	SPT_2174	SPT_2175			TRUE	0.999	-3.000	0.714	0.025	Y	NA
7475877	7475878	SPT_2175	SPT_2176			TRUE	0.996	25.000	0.833	0.025	Y	NA
7475878	7475879	SPT_2176	SPT_2177			TRUE	0.997	-9.000	0.286	0.017	Y	NA
7475879	7475880	SPT_2177	SPT_2178			TRUE	0.976	-19.000	0.000	1.000	Y	NA
7475880	7475881	SPT_2178	SPT_2179			TRUE	0.962	12.000	0.000	1.000	Y	NA
7475881	7475882	SPT_2179	SPT_2180			TRUE	0.422	115.000	0.000	1.000	Y	NA
7475884	7475885	SPT_2182	SPT_2183			TRUE	0.990	10.000	0.111	1.000	Y	NA
7475885	7475886	SPT_2183	SPT_2184			TRUE	0.999	-7.000	0.673	0.098	Y	NA
7475886	7475887	SPT_2184	SPT_2185			TRUE	0.990	0.000	0.192	1.000	N	NA
7475889	7475890	SPT_2187	SPT_2189		dltC	TRUE	0.908	-7.000	0.000	NA		NA
7475890	7475891	SPT_2189	SPT_2190	dltC		TRUE	0.988	14.000	0.387	NA		NA
7475891	7475892	SPT_2190	SPT_2191		dltA	TRUE	0.996	-3.000	0.435	NA	N	NA
7475892	7475893	SPT_2191	SPT_2192	dltA		TRUE	0.986	21.000	0.549	NA		NA
7475893	7475894	SPT_2192	SPT_2193			FALSE	0.021	314.000	0.000	NA		NA
7475894	7475895	SPT_2193	SPT_2282			FALSE	0.015	395.000	0.000	NA		NA
7475895	7475896	SPT_2282	SPT_2195			TRUE	0.904	0.000	0.000	NA		NA
7475900	7475901	SPT_2199	SPT_2200			TRUE	0.920	70.000	0.500	1.000	N	NA
7475901	7475902	SPT_2200	SPT_2201		glpK	TRUE	0.988	42.000	0.500	0.001	Y	NA
7475902	7475903	SPT_2201	SPT_2202	glpK		TRUE	0.626	159.000	0.462	NA		NA
7475904	7475905	SPT_2203	SPT_2204	hslO		TRUE	0.975	-13.000	0.034	1.000	N	NA
7475907	7475908	SPT_2206	SPT_2207			TRUE	0.909	-3.000	0.000	NA		NA
7475909	7475910	SPT_2208	SPT_2209			FALSE	0.014	415.000	0.000	NA		NA
7475910	7475911	SPT_2209	SPT_2210			TRUE	0.869	95.000	0.667	1.000		NA
7475911	7475912	SPT_2210	SPT_2211			TRUE	0.999	-3.000	1.000	1.000	Y	NA
7475914	7475915	SPT_2213	SPT_2214			TRUE	0.989	2.000	0.188	NA	N	NA
7475915	7475916	SPT_2214	SPT_2215			TRUE	0.323	119.000	0.013	NA	N	NA
7475916	7475917	SPT_2215	SPT_2216			TRUE	0.998	0.000	0.554	NA	Y	NA
7475917	7475918	SPT_2216	SPT_2217			TRUE	0.990	38.000	0.584	NA	Y	NA
7475918	7475919	SPT_2217	SPT_2218			TRUE	0.992	-40.000	0.364	NA		NA
7475919	7475920	SPT_2218	SPT_2219			FALSE	0.036	256.000	0.000	NA		NA
7475920	7475921	SPT_2219	SPT_2220			TRUE	0.381	89.000	0.014	NA		NA
7475921	7475922	SPT_2220	SPT_2221		dnaB	TRUE	0.970	2.000	0.053	NA		NA
7475922	7475923	SPT_2221	SPT_2222	dnaB	rplI	TRUE	0.891	44.000	0.100	1.000	N	NA
7475923	7475924	SPT_2222	SPT_2223	rplI		TRUE	0.987	-3.000	0.119	1.000	N	NA
7475924	7475925	SPT_2223	SPT_2224			FALSE	0.242	136.000	0.006	NA	N	NA
7475925	7475926	SPT_2224	SPT_2225			TRUE	0.585	80.000	0.080	NA		NA
7475926	7475927	SPT_2225	SPT_2226			TRUE	0.985	-3.000	0.130	1.000		NA
7475928	7475929	SPT_2227	SPT_2228		cysK	FALSE	0.083	285.000	0.033	1.000		NA
7475932	7475933	SPT_2231	SPT_2232		tsf	FALSE	0.057	246.000	0.000	NA	N	NA
7475933	7475934	SPT_2232	SPT_2233	tsf	rpsB	TRUE	0.967	79.000	0.748	1.000	Y	NA
7475934	7475935	SPT_2233	SPT_2234	rpsB		FALSE	0.045	224.000	0.000	NA		NA
7475935	7475936	SPT_2234	SPT_2235		mreD	TRUE	0.383	94.000	0.021	NA		NA
7475936	7475937	SPT_2235	SPT_2236	mreD	mreC	TRUE	0.998	0.000	0.550	0.003	Y	NA
7475937	7475938	SPT_2236	SPT_2237	mreC		TRUE	0.619	59.000	0.003	1.000	N	NA
7475938	7475939	SPT_2237	SPT_2238			TRUE	0.995	-7.000	0.136	1.000	Y	NA
7475939	7475940	SPT_2238	SPT_2239			TRUE	0.999	-15.000	0.713	0.026	Y	NA
7475940	7475941	SPT_2239	SPT_2240		pgsA	TRUE	0.972	-3.000	0.015	1.000	N	NA
7475941	7475942	SPT_2240	SPT_2241	pgsA		TRUE	0.963	11.000	0.077	1.000		NA
7475942	7475943	SPT_2241	SPT_2242			TRUE	0.909	42.000	0.156	1.000		NA
7475943	7475944	SPT_2242	SPT_2243			TRUE	0.998	-3.000	0.872	0.005		NA
7475945	7475946	SPT_2244	SPT_2245			TRUE	0.986	3.000	0.209	1.000		NA
7475947	7475948	SPT_2246	SPT_2247	guaB	trpS	FALSE	0.274	152.000	0.026	1.000	N	NA
7475949	7475950	SPT_2248	SPT_2249			TRUE	0.666	62.000	0.040	NA		NA
7475951	7475952	SPT_2250	SPT_2251			TRUE	0.909	-3.000	0.000	NA		NA
7475954	7475955	SPT_2253	SPT_2254			TRUE	0.884	3.000	0.000	NA		NA
7475955	7475956	SPT_2254	SPT_2255			TRUE	0.480	52.000	0.000	NA		NA
7475956	7475957	SPT_2255	SPT_2256			TRUE	0.999	-3.000	1.000	1.000	Y	NA
7475957	7475958	SPT_2256	SPT_2257			TRUE	0.990	21.000	0.750	1.000		NA
7475958	7475959	SPT_2257	SPT_2258			FALSE	0.077	162.000	0.000	NA		NA
7475959	7475960	SPT_2258	SPT_2259			TRUE	0.542	44.000	0.000	NA		NA
7475961	7475962	SPT_2260	SPT_2261			TRUE	0.709	58.000	0.015	1.000	N	NA