MicrobesOnline Operon Predictions for Bacillus anthracis str. A0465

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
6053249	6053250	BAM_3064	BAM_3065			FALSE	0.044	276.000	0.000	NA		NA
6053250	6053251	BAM_3065	BAM_3066			FALSE	0.431	203.000	0.000	1.000	N	NA
6053252	6053253	BAM_3067	BAM_3068			TRUE	0.848	11.000	0.636	NA		NA
6053254	6053255	BAM_3069	BAM_3070			TRUE	0.732	107.000	0.286	NA		NA
6053255	6053256	BAM_3070	BAM_3071			TRUE	0.716	-3.000	0.364	NA		NA
6053256	6053257	BAM_3071	BAM_3072			FALSE	0.599	90.000	0.273	NA		NA
6053257	6053258	BAM_3072	BAM_3073			TRUE	0.957	96.000	0.375	NA	Y	NA
6053258	6053259	BAM_3073	BAM_3074			TRUE	0.748	163.000	0.133	1.000	N	NA
6053259	6053260	BAM_3074	BAM_3075			TRUE	0.923	0.000	0.533	1.000	N	NA
6053260	6053261	BAM_3075	BAM_3076			TRUE	0.886	15.000	0.333	1.000	N	NA
6053262	6053263	BAM_3077	BAM_3078			TRUE	0.641	3.000	0.000	NA		NA
6053264	6053265	BAM_3079	BAM_3080			FALSE	0.370	41.000	0.000	NA		NA
6053265	6053266	BAM_3080	BAM_3081			FALSE	0.628	1.000	0.000	NA		NA
6053267	6053268	BAM_3082	BAM_3083			TRUE	0.837	-3.000	0.700	NA		NA
6053268	6053269	BAM_3083	BAM_3084			FALSE	0.166	202.000	0.000	NA		NA
6053271	6053272	BAM_3086	BAM_3087			TRUE	0.705	84.000	0.500	NA		NA
6053273	6053274	BAM_3088	BAM_3089			FALSE	0.006	616.000	0.000	NA		NA
6053274	6053275	BAM_3089	BAM_3090			FALSE	0.589	15.000	0.000	NA		NA
6053275	6053276	BAM_3090	BAM_3091			FALSE	0.460	-7.000	0.000	NA		NA
6053276	6053277	BAM_3091	BAM_3092			FALSE	0.068	250.000	0.000	NA		NA
6053277	6053278	BAM_3092	BAM_3093			FALSE	0.032	298.000	0.000	NA		NA
6053280	6053281	BAM_3095	BAM_3096			TRUE	0.705	114.000	0.162	NA		NA
6053281	6053282	BAM_3096	BAM_3097		adP2	FALSE	0.055	370.000	0.000	1.000	N	NA
6053282	6053283	BAM_3097	BAM_3098	adP2		FALSE	0.059	259.000	0.000	NA		NA
6053283	6053284	BAM_3098	BAM_3099			FALSE	0.589	94.000	0.222	NA		NA
6053284	6053285	BAM_3099	BAM_3100			FALSE	0.326	-19.000	0.000	NA		NA
6053285	6053286	BAM_3100	BAM_3101			FALSE	0.530	22.000	0.000	NA		NA
6053286	6053287	BAM_3101	BAM_3102			FALSE	0.581	16.000	0.000	NA		NA
6053287	6053288	BAM_3102	BAM_3103			TRUE	0.841	-3.000	0.714	NA		NA
6053288	6053289	BAM_3103	BAM_3104			TRUE	0.654	148.000	0.176	1.000		NA
6053289	6053290	BAM_3104	BAM_3105			TRUE	0.738	39.000	0.588	0.030		NA
6053290	6053291	BAM_3105	BAM_3106			TRUE	0.933	19.000	0.882	1.000	N	NA
6053293	6053294	BAM_3108	BAM_3109			FALSE	0.568	22.000	0.087	NA		NA
6053294	6053295	BAM_3109	BAM_3110			FALSE	0.360	45.000	0.000	NA		NA
6053297	6053298	BAM_3112	BAM_3113			FALSE	0.583	30.000	0.286	NA		NA
6053298	6053299	BAM_3113	BAM_3114			TRUE	0.729	-12.000	0.714	NA		NA
6053299	6053300	BAM_3114	BAM_3115			TRUE	0.864	-12.000	0.750	1.000	N	NA
6053302	6053303	BAM_3117	BAM_3118			FALSE	0.572	186.000	0.182	1.000	N	NA
6053303	6053304	BAM_3118	BAM_3119			TRUE	0.761	0.000	0.364	NA		NA
6053304	6053305	BAM_3119	BAM_3120			TRUE	0.869	6.000	0.667	NA		NA
6053305	6053306	BAM_3120	BAM_3121			FALSE	0.579	66.000	0.500	NA		NA
6053306	6053307	BAM_3121	BAM_3122			FALSE	0.146	207.000	0.000	NA		NA
6053307	6053308	BAM_3122	BAM_3123			TRUE	0.816	25.000	0.096	1.000	N	NA
6053308	6053309	BAM_3123	BAM_3124			TRUE	0.695	49.000	0.082	1.000	N	NA
6053309	6053310	BAM_3124	BAM_3125			FALSE	0.619	18.000	0.194	NA		NA
6053313	6053314	BAM_3128	BAM_3129			FALSE	0.457	82.000	0.015	NA		NA
6053317	6053318	BAM_3132	BAM_3133			TRUE	0.969	-3.000	0.500	1.000	Y	NA
6053318	6053319	BAM_3133	BAM_3134			FALSE	0.611	35.000	0.421	NA		NA
6053319	6053320	BAM_3134	BAM_3135			TRUE	0.676	100.000	0.263	NA		NA
6053320	6053321	BAM_3135	BAM_3136			TRUE	0.718	129.000	0.172	NA		NA
6053321	6053322	BAM_3136	BAM_3137			FALSE	0.185	214.000	0.114	1.000		NA
6053322	6053323	BAM_3137	BAM_3138			TRUE	0.644	14.000	0.159	NA		NA
6053323	6053324	BAM_3138	BAM_3139			FALSE	0.607	15.000	0.047	NA		NA
6053327	6053328	BAM_3142	BAM_3143	lysP		TRUE	0.781	114.000	0.333	NA		NA
6053328	6053329	BAM_3143	BAM_3144			FALSE	0.440	34.000	0.057	NA		NA
6053332	6053333	BAM_3147	BAM_3148			FALSE	0.348	-16.000	0.000	NA		NA
6053333	6053334	BAM_3148	BAM_3149			FALSE	0.342	69.000	0.000	NA		NA
6053336	6053337	BAM_3151	BAM_3152	lepB		TRUE	0.895	83.000	0.778	1.000	N	NA
6053339	6053340	BAM_3154	BAM_3155		pcp	FALSE	0.398	76.000	0.000	NA		NA
6053340	6053341	BAM_3155	BAM_3156	pcp		FALSE	0.393	-12.000	0.000	NA		NA
6053341	6053342	BAM_3156	BAM_3157			FALSE	0.071	248.000	0.000	NA		NA
6053342	6053343	BAM_3157	BAM_3158			TRUE	0.683	121.000	0.000	NA		NA
6053343	6053344	BAM_3158	BAM_3159			TRUE	0.903	2.000	0.939	NA		NA
6053344	6053345	BAM_3159	BAM_3160			FALSE	0.614	15.000	0.064	NA		NA
6053345	6053346	BAM_3160	BAM_3161			FALSE	0.360	45.000	0.000	NA		NA
6053346	6053347	BAM_3161	BAM_3162			FALSE	0.314	-21.000	0.000	NA		NA
6053347	6053348	BAM_3162	BAM_3163			FALSE	0.430	-9.000	0.000	NA		NA
6053348	6053349	BAM_3163	BAM_3164			TRUE	0.875	15.000	0.267	1.000	N	NA
6053349	6053350	BAM_3164	BAM_3165		sipU	FALSE	0.220	259.000	0.231	1.000	N	NA
6053350	6053351	BAM_3165	BAM_3166	sipU		TRUE	0.812	24.000	0.038	1.000	N	NA
6053351	6053352	BAM_3166	BAM_3167			FALSE	0.026	315.000	0.000	NA		NA
6053352	6053353	BAM_3167	BAM_3168			FALSE	0.161	204.000	0.028	NA		NA
6053355	6053356	BAM_3170	BAM_3171			FALSE	0.531	153.000	0.083	NA		NA
6053356	6053357	BAM_3171	BAM_3172			FALSE	0.022	331.000	0.000	NA		NA
6053359	6053360	BAM_3174	BAM_3175			TRUE	0.704	114.000	0.125	NA		NA
6053360	6053361	BAM_3175	BAM_3176			TRUE	0.677	4.000	0.083	NA		NA
6053361	6053362	BAM_3176	BAM_3177			FALSE	0.516	161.000	0.033	1.000		NA
6053362	6053363	BAM_3177	BAM_3178			FALSE	0.468	162.000	0.154	NA		NA
6053366	6053367	BAM_3181	BAM_3182			FALSE	0.363	-15.000	0.000	NA		NA
6053368	6053369	BAM_3183	BAM_3184			FALSE	0.593	-10.000	0.383	NA		NA
6053369	6053370	BAM_3184	BAM_3185		cotF	FALSE	0.018	343.000	0.000	NA		NA
6053370	6053371	BAM_3185	BAM_3186	cotF		FALSE	0.581	148.000	0.105	NA		NA
6053372	6053373	BAM_3187	BAM_3188			FALSE	0.612	92.000	0.273	NA		NA
6053374	6053375	BAM_3189	BAM_3190			FALSE	0.370	73.000	0.000	NA		NA
6053375	6053376	BAM_3190	BAM_3191			FALSE	0.107	221.000	0.000	NA		NA
6053376	6053377	BAM_3191	BAM_3192			FALSE	0.196	195.000	0.000	NA		NA
6053379	6053380	BAM_3194	BAM_3195		sasP2	FALSE	0.042	295.000	0.143	NA		NA
6053384	6053385	BAM_3199	BAM_3200	aspA3	ansA2	TRUE	0.892	54.000	0.037	1.000	Y	NA
6053386	6053387	BAM_3201	BAM_3202	ansR		FALSE	0.026	314.000	0.000	NA		NA
6053388	6053389	BAM_3203	BAM_3204			FALSE	0.626	167.000	0.429	1.000		NA
6053389	6053390	BAM_3204	BAM_3205		brnQ5	FALSE	0.457	274.000	0.000	0.072	Y	NA
6053390	6053391	BAM_3205	BAM_3206	brnQ5	proC2	TRUE	0.780	198.000	0.000	1.000	Y	NA
6053391	6053392	BAM_3206	BAM_3207	proC2		FALSE	0.025	316.000	0.000	NA		NA
6053392	6053393	BAM_3207	BAM_3208			FALSE	0.478	165.000	0.250	NA		NA
6053393	6053394	BAM_3208	BAM_3209			TRUE	0.760	108.000	0.333	NA		NA
6053394	6053395	BAM_3209	BAM_3210		gerAC	FALSE	0.099	225.000	0.000	NA		NA
6053395	6053396	BAM_3210	BAM_3211	gerAC		FALSE	0.221	-1043.000	0.000	NA		NA
6053396	6053397	BAM_3211	BAM_3212		gerAB	FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6053397	6053398	BAM_3212	BAM_3213	gerAB	gerAA	FALSE	0.494	27.000	0.000	NA		NA
6053398	6053399	BAM_3213	BAM_3214	gerAA		FALSE	0.421	78.000	0.000	NA		NA
6053399	6053400	BAM_3214	BAM_3215			FALSE	0.547	147.000	0.000	NA		NA
6053400	6053401	BAM_3215	BAM_3216			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6053401	6053402	BAM_3216	BAM_3217			FALSE	0.007	545.000	0.000	NA		NA
6053402	6053403	BAM_3217	BAM_3218			TRUE	0.644	5.000	0.000	NA		NA
6053403	6053404	BAM_3218	BAM_3219			FALSE	0.337	54.000	0.000	NA		NA
6053404	6053405	BAM_3219	BAM_3220		glsA2	FALSE	0.008	488.000	0.000	NA		NA
6053405	6053406	BAM_3220	BAM_3221	glsA2		TRUE	0.973	125.000	0.095	1.000	Y	NA
6053409	6053410	BAM_3224	BAM_3225			FALSE	0.559	24.000	0.100	NA		NA
6053411	6053412	BAM_3226	BAM_3227			FALSE	0.107	221.000	0.000	NA		NA
6053412	6053413	BAM_3227	BAM_3228			FALSE	0.020	686.000	0.000	1.000	N	NA
6053413	6053414	BAM_3228	BAM_3229			TRUE	0.725	114.000	0.000	1.000		NA
6053415	6053416	BAM_3230	BAM_3231			TRUE	0.900	174.000	0.235	0.089	Y	NA
6053416	6053417	BAM_3231	BAM_3232			TRUE	0.681	-3.000	0.206	1.000		NA
6053417	6053418	BAM_3232	BAM_3233			TRUE	0.684	14.000	0.059	1.000		NA
6053419	6053420	BAM_3234	BAM_3235			FALSE	0.008	491.000	0.000	NA		NA
6053420	6053421	BAM_3235	BAM_3236			FALSE	0.009	443.000	0.000	NA		NA
6053421	6053422	BAM_3236	BAM_3237			FALSE	0.029	306.000	0.000	NA		NA
6053422	6053423	BAM_3237	BAM_3238			FALSE	0.399	36.000	0.000	NA		NA
6053427	6053428	BAM_3242	BAM_3243			TRUE	0.724	104.000	0.200	1.000		NA
6053428	6053429	BAM_3243	BAM_3244			TRUE	0.882	113.000	0.010	1.000	N	NA
6053429	6053430	BAM_3244	BAM_3245			TRUE	0.717	165.000	0.004	1.000	N	NA
6053430	6053431	BAM_3245	BAM_3246			FALSE	0.503	81.000	0.136	NA		NA
6053431	6053432	BAM_3246	BAM_3247			TRUE	0.735	0.000	0.303	NA		NA
6053432	6053433	BAM_3247	BAM_3248			FALSE	0.005	643.000	0.000	NA		NA
6053435	6053436	BAM_3250	BAM_3251			FALSE	0.191	196.000	0.000	NA		NA
6053438	6053439	BAM_3253	BAM_3254	mntA		TRUE	0.957	18.000	0.173	1.000	Y	NA
6053439	6053440	BAM_3254	BAM_3255			TRUE	0.957	-3.000	0.196	1.000	Y	NA
6053440	6053441	BAM_3255	BAM_3256			FALSE	0.014	373.000	0.000	NA		NA
6053441	6053442	BAM_3256	BAM_3257			FALSE	0.337	56.000	0.014	NA		NA
6053444	6053445	BAM_3259	BAM_3260		arsC	TRUE	0.749	154.000	0.556	NA		NA
6053445	6053446	BAM_3260	BAM_3261	arsC	acr3	TRUE	0.886	26.000	0.556	1.000	N	NA
6053446	6053447	BAM_3261	BAM_3262	acr3		TRUE	0.847	19.000	0.208	1.000	N	NA
6053447	6053448	BAM_3262	BAM_3263		arsR	TRUE	0.682	60.000	0.126	1.000	N	NA
6053448	6053449	BAM_3263	BAM_3264	arsR		FALSE	0.009	447.000	0.000	NA		NA
6053449	6053450	BAM_3264	BAM_3265			FALSE	0.598	13.000	0.000	NA		NA
6053450	6053451	BAM_3265	BAM_3266		hscC	TRUE	0.689	0.000	0.000	1.000		NA
6053451	6053452	BAM_3266	BAM_3267	hscC		FALSE	0.007	508.000	0.000	NA		NA
6053452	6053453	BAM_3267	BAM_3268			FALSE	0.030	305.000	0.000	NA		NA
6053455	6053456	BAM_3270	BAM_3271			FALSE	0.052	266.000	0.000	NA		NA
6053456	6053457	BAM_3271	BAM_3272			FALSE	0.593	14.000	0.000	NA		NA
6053458	6053459	BAM_3273	BAM_3274			TRUE	0.688	136.000	0.167	NA		NA
6053460	6053461	BAM_3275	BAM_3276			FALSE	0.636	140.000	0.056	NA		NA
6053461	6053462	BAM_3276	BAM_3277			FALSE	0.055	264.000	0.000	NA		NA
6053462	6053463	BAM_3277	BAM_3278			TRUE	0.754	-16.000	0.375	1.000	N	NA
6053463	6053464	BAM_3278	BAM_3279			FALSE	0.039	416.000	0.000	1.000	N	NA
6053464	6053465	BAM_3279	BAM_3280			FALSE	0.025	316.000	0.000	NA		NA
6053466	6053467	BAM_3281	BAM_3282			FALSE	0.230	-99.000	0.000	NA		NA
6053468	6053469	BAM_3283	BAM_3284			FALSE	0.125	218.000	0.065	NA		NA
6053469	6053470	BAM_3284	BAM_3285			FALSE	0.056	325.000	0.455	NA		NA
6053470	6053471	BAM_3285	BAM_3286		cypD	FALSE	0.140	283.000	0.000	1.000	N	NA
6053471	6053472	BAM_3286	BAM_3287	cypD		FALSE	0.370	41.000	0.000	NA		NA
6053472	6053473	BAM_3287	BAM_3288			FALSE	0.014	375.000	0.000	NA		NA
6053475	6053476	BAM_3290	BAM_3291			FALSE	0.018	346.000	0.000	NA		NA
6053476	6053477	BAM_3291	BAM_3292			TRUE	0.817	3.000	0.455	NA		NA
6053478	6053479	BAM_3293	BAM_3294			TRUE	0.968	-3.000	0.492	1.000	Y	NA
6053480	6053481	BAM_3295	BAM_3296			FALSE	0.023	325.000	0.000	NA		NA
6053481	6053482	BAM_3296	BAM_3297			FALSE	0.005	961.000	0.000	NA		NA
6053484	6053485	BAM_3299	BAM_3300			FALSE	0.017	353.000	0.000	NA		NA
6053485	6053486	BAM_3300	BAM_3301			FALSE	0.335	55.000	0.000	NA		NA
6053486	6053487	BAM_3301	BAM_3302			FALSE	0.185	197.000	0.000	NA		NA
6053487	6053488	BAM_3302	BAM_3303			FALSE	0.488	-6.000	0.000	NA		NA
6053488	6053489	BAM_3303	BAM_3304			FALSE	0.006	634.000	0.000	NA		NA
6053489	6053490	BAM_3304	BAM_3305			TRUE	0.869	6.000	0.667	NA		NA
6053490	6053491	BAM_3305	BAM_3306			FALSE	0.019	341.000	0.000	NA		NA
6053491	6053492	BAM_3306	BAM_3307			FALSE	0.613	-3.000	0.162	NA		NA
6053492	6053493	BAM_3307	BAM_3308			TRUE	0.724	-7.000	0.550	NA		NA
6053493	6053494	BAM_3308	BAM_3309			TRUE	0.692	-3.000	0.233	1.000		NA
6053494	6053495	BAM_3309	BAM_3310			FALSE	0.409	77.000	0.000	NA		NA
6053495	6053496	BAM_3310	BAM_3311			FALSE	0.413	-10.000	0.000	NA		NA
6053496	6053497	BAM_3311	BAM_3312			FALSE	0.031	432.000	0.000	NA	N	NA
6053498	6053499	BAM_3313	BAM_3314			FALSE	0.519	150.000	0.000	NA		NA
6053500	6053501	BAM_3315	BAM_3316			TRUE	0.889	0.000	0.852	NA		NA
6053502	6053503	BAM_3317	BAM_3318			FALSE	0.393	69.000	0.156	NA		NA
6053504	6053505	BAM_3319	BAM_3320			TRUE	0.984	2.000	0.833	1.000	Y	NA
6053505	6053506	BAM_3320	BAM_3321			FALSE	0.503	81.000	0.139	NA		NA
6053507	6053508	BAM_3322	BAM_3323			FALSE	0.503	26.000	0.000	NA		NA
6053508	6053509	BAM_3323	BAM_3324			FALSE	0.248	-42.000	0.000	NA		NA
6053509	6053510	BAM_3324	BAM_3325		paiB1	FALSE	0.523	23.000	0.000	NA		NA
6053511	6053512	BAM_3326	BAM_3327			FALSE	0.009	449.000	0.000	NA		NA
6053512	6053513	BAM_3327	BAM_3328			FALSE	0.427	38.000	0.103	NA		NA
6053513	6053514	BAM_3328	BAM_3329			TRUE	0.802	2.000	0.138	0.002		NA
6053514	6053515	BAM_3329	BAM_3330			TRUE	0.975	-3.000	0.800	NA	Y	NA
6053519	6053520	BAM_3334	BAM_3335			FALSE	0.058	260.000	0.000	NA		NA
6053520	6053521	BAM_3335	BAM_3336			TRUE	0.645	4.000	0.000	NA		NA
6053521	6053522	BAM_3336	BAM_3337			FALSE	0.006	568.000	0.000	NA		NA
6053522	6053523	BAM_3337	BAM_3338			FALSE	0.008	471.000	0.000	NA		NA
6053523	6053524	BAM_3338	BAM_3339			FALSE	0.387	75.000	0.000	NA		NA
6053524	6053525	BAM_3339	BAM_3340			TRUE	0.800	18.000	0.471	1.000		NA
6053525	6053526	BAM_3340	BAM_3341			FALSE	0.377	-13.000	0.000	NA		NA
6053526	6053527	BAM_3341	BAM_3342			FALSE	0.354	48.000	0.000	NA		NA
6053528	6053529	BAM_3343	BAM_3344			FALSE	0.110	237.000	0.000	1.000		NA
6053529	6053530	BAM_3344	BAM_3345			TRUE	0.898	0.000	1.000	NA		NA
6053531	6053532	BAM_3346	BAM_3347			FALSE	0.023	326.000	0.000	NA		NA
6053533	6053534	BAM_3348	BAM_3349			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6053534	6053535	BAM_3349	BAM_3350			FALSE	0.362	44.000	0.000	NA		NA
6053536	6053537	BAM_3351	BAM_3352			FALSE	0.005	713.000	0.000	NA		NA
6053538	6053539	BAM_3353	BAM_3354			FALSE	0.012	387.000	0.000	NA		NA
6053540	6053541	BAM_3355	BAM_3356			FALSE	0.005	697.000	0.000	NA		NA
6053541	6053542	BAM_3356	BAM_3357			FALSE	0.046	273.000	0.000	NA		NA
6053542	6053543	BAM_3357	BAM_3358			FALSE	0.047	271.000	0.000	NA		NA
6053543	6053544	BAM_3358	BAM_3359			FALSE	0.191	196.000	0.000	NA		NA
6053544	6053545	BAM_3359	BAM_3360			TRUE	0.638	110.000	0.000	NA		NA
6053545	6053546	BAM_3360	BAM_3361			FALSE	0.126	213.000	0.000	NA		NA
6053548	6053549	BAM_3363	BAM_3364			FALSE	0.630	108.000	0.000	NA		NA
6053549	6053550	BAM_3364	BAM_3365			FALSE	0.053	355.000	0.000	NA	N	NA
6053550	6053551	BAM_3365	BAM_3366		sdaAA1	FALSE	0.336	294.000	0.000	NA	Y	NA
6053551	6053552	BAM_3366	BAM_3367	sdaAA1	sdaAB1	FALSE	0.523	23.000	0.000	NA		NA
6053552	6053553	BAM_3367	BAM_3368	sdaAB1		FALSE	0.348	-16.000	0.000	NA		NA
6053553	6053554	BAM_3368	BAM_3369			FALSE	0.005	710.000	0.000	NA		NA
6053554	6053555	BAM_3369	BAM_3370			FALSE	0.174	200.000	0.000	NA		NA
6053555	6053556	BAM_3370	BAM_3371			FALSE	0.453	82.000	0.000	NA		NA
6053556	6053557	BAM_3371	BAM_3372		hypF	TRUE	0.749	79.000	0.000	1.000	N	NA
6053557	6053558	BAM_3372	BAM_3373	hypF		TRUE	0.935	30.000	0.079	1.000	Y	NA
6053558	6053559	BAM_3373	BAM_3374			FALSE	0.457	83.000	0.000	NA		NA
6053559	6053560	BAM_3374	BAM_3375			FALSE	0.494	27.000	0.000	NA		NA
6053560	6053561	BAM_3375	BAM_3376			FALSE	0.156	204.000	0.000	NA		NA
6053563	6053564	BAM_3378	BAM_3379			FALSE	0.583	144.000	0.010	NA		NA
6053564	6053565	BAM_3379	BAM_3380			TRUE	0.639	14.000	0.109	NA		NA
6053565	6053566	BAM_3380	BAM_3381		serC	TRUE	0.963	13.000	0.238	1.000	Y	NA
6053566	6053567	BAM_3381	BAM_3382	serC		FALSE	0.037	289.000	0.000	NA		NA
6053567	6053568	BAM_3382	BAM_3383			FALSE	0.337	-18.000	0.000	NA		NA
6053568	6053569	BAM_3383	BAM_3384			TRUE	0.750	-10.000	0.733	NA		NA
6053569	6053570	BAM_3384	BAM_3385			FALSE	0.029	306.000	0.000	NA		NA
6053570	6053571	BAM_3385	BAM_3386			FALSE	0.532	90.000	0.097	NA		NA
6053571	6053572	BAM_3386	BAM_3387			FALSE	0.407	76.000	0.023	NA		NA
6053572	6053573	BAM_3387	BAM_3388			FALSE	0.143	282.000	0.000	1.000	N	NA
6053575	6053576	BAM_3390	BAM_3391			FALSE	0.440	80.000	0.000	NA		NA
6053576	6053577	BAM_3391	BAM_3392			FALSE	0.035	291.000	0.000	NA		NA
6053577	6053578	BAM_3392	BAM_3393			FALSE	0.132	211.000	0.000	NA		NA
6053584	6053585	BAM_3399	BAM_3400			FALSE	0.399	-16.000	0.154	NA		NA
6053585	6053586	BAM_3400	BAM_3401			FALSE	0.614	141.000	0.025	NA		NA
6053587	6053588	BAM_3402	BAM_3403			TRUE	0.843	16.000	0.225	NA	N	NA
6053588	6053589	BAM_3403	BAM_3404			TRUE	0.884	101.000	0.412	NA	N	NA
6053590	6053591	BAM_3405	BAM_3406			FALSE	0.308	181.000	0.095	NA		NA
6053591	6053592	BAM_3406	BAM_3407			FALSE	0.572	-7.000	0.275	NA		NA
6053592	6053593	BAM_3407	BAM_3408			FALSE	0.613	-3.000	0.157	NA		NA
6053594	6053595	BAM_3409	BAM_3410			FALSE	0.615	10.000	0.000	NA		NA
6053596	6053597	BAM_3411	BAM_3412			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6053597	6053598	BAM_3412	BAM_3413			TRUE	0.860	15.000	0.098	1.000	N	NA
6053598	6053599	BAM_3413	BAM_3414		alo	FALSE	0.029	332.000	0.000	1.000		NA
6053601	6053602	BAM_3416	BAM_3417			TRUE	0.711	-3.000	0.350	NA		NA
6053602	6053603	BAM_3417	BAM_3418			TRUE	0.718	24.000	0.350	1.000		NA
6053603	6053604	BAM_3418	BAM_3419			FALSE	0.066	252.000	0.000	NA		NA
6053606	6053607	BAM_3421	BAM_3422			FALSE	0.483	28.000	0.000	NA		NA
6053607	6053608	BAM_3422	BAM_3423			FALSE	0.246	184.000	0.000	NA		NA
6053608	6053609	BAM_3423	BAM_3424			FALSE	0.524	66.000	0.412	NA		NA
6053609	6053610	BAM_3424	BAM_3425			TRUE	0.676	-21.000	0.673	1.000		NA
6053610	6053611	BAM_3425	BAM_3426			FALSE	0.576	23.000	0.145	NA		NA
6053611	6053612	BAM_3426	BAM_3427			FALSE	0.495	57.000	0.364	NA		NA
6053612	6053613	BAM_3427	BAM_3428			FALSE	0.020	337.000	0.000	NA		NA
6053613	6053614	BAM_3428	BAM_3429			FALSE	0.019	339.000	0.000	NA		NA
6053616	6053617	BAM_3431	BAM_3432			FALSE	0.010	428.000	0.000	NA		NA
6053617	6053618	BAM_3432	BAM_3433			FALSE	0.166	202.000	0.000	NA		NA
6053618	6053619	BAM_3433	BAM_3434			TRUE	0.854	11.000	0.133	NA	N	NA
6053619	6053620	BAM_3434	BAM_3435			FALSE	0.026	341.000	0.000	1.000		NA
6053620	6053621	BAM_3435	BAM_3436			FALSE	0.008	620.000	0.000	1.000		NA
6053622	6053623	BAM_3437	BAM_3438	hisS1		FALSE	0.023	327.000	0.008	NA		NA
6053623	6053624	BAM_3438	BAM_3439			FALSE	0.052	266.000	0.000	NA		NA
6053626	6053627	BAM_3441	BAM_3442			FALSE	0.541	154.000	0.125	NA		NA
6053628	6053629	BAM_3443	BAM_3444	pykA1		FALSE	0.521	93.000	0.028	NA		NA
6053629	6053630	BAM_3444	BAM_3445			TRUE	0.659	103.000	0.200	NA		NA
6053630	6053631	BAM_3445	BAM_3446			TRUE	0.704	113.000	0.200	NA		NA
6053631	6053632	BAM_3446	BAM_3447			FALSE	0.382	57.000	0.130	NA		NA
6053632	6053633	BAM_3447	BAM_3448			TRUE	0.662	-7.000	0.426	NA		NA
6053633	6053634	BAM_3448	BAM_3449			FALSE	0.526	87.000	0.159	NA		NA
6053635	6053636	BAM_3450	BAM_3451			FALSE	0.498	-12.000	0.269	NA		NA
6053637	6053638	BAM_3452	BAM_3453			FALSE	0.337	174.000	0.067	NA		NA
6053640	6053641	BAM_3455	BAM_3456			FALSE	0.390	180.000	0.136	1.000		NA
6053642	6053643	BAM_3457	BAM_3458			FALSE	0.564	18.000	0.000	NA		NA
6053644	6053645	BAM_3459	BAM_3460			FALSE	0.203	195.000	0.030	NA		NA
6053645	6053646	BAM_3460	BAM_3461			FALSE	0.631	62.000	0.050	NA	N	NA
6053646	6053647	BAM_3461	BAM_3462			TRUE	0.971	123.000	0.200	NA	Y	NA
6053647	6053648	BAM_3462	BAM_3463		maa	FALSE	0.345	57.000	0.038	NA		NA
6053648	6053649	BAM_3463	BAM_3464	maa		FALSE	0.029	307.000	0.000	NA		NA
6053649	6053650	BAM_3464	BAM_3465			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6053650	6053651	BAM_3465	BAM_3466			FALSE	0.460	-7.000	0.000	NA		NA
6053651	6053652	BAM_3466	BAM_3467			FALSE	0.409	77.000	0.000	NA		NA
6053654	6053655	BAM_3469	BAM_3470			FALSE	0.379	64.000	0.179	NA		NA
6053656	6053657	BAM_3471	BAM_3472			FALSE	0.043	278.000	0.000	NA		NA
6053658	6053659	BAM_3473	BAM_3474			FALSE	0.509	41.000	0.312	NA		NA
6053662	6053663	BAM_3477	BAM_3478			TRUE	0.712	77.000	0.636	NA		NA
6053664	6053665	BAM_3479	BAM_3480			FALSE	0.181	200.000	0.030	NA		NA
6053665	6053666	BAM_3480	BAM_3481			FALSE	0.426	53.000	0.039	1.000		NA
6053666	6053667	BAM_3481	BAM_3482			TRUE	0.791	120.000	0.235	1.000		NA
6053671	6053672	BAM_3486	BAM_3487		gntK	TRUE	0.977	122.000	0.316	1.000	Y	NA
6053672	6053673	BAM_3487	BAM_3488	gntK	gntP2	TRUE	0.902	56.000	0.263	1.000	Y	NA
6053673	6053674	BAM_3488	BAM_3489	gntP2		FALSE	0.163	390.000	0.000	1.000	Y	NA
6053674	6053675	BAM_3489	BAM_3490			TRUE	0.931	52.000	0.545	1.000	Y	NA
6053675	6053676	BAM_3490	BAM_3491		tkt1	TRUE	0.979	105.000	0.636	1.000	Y	NA
6053676	6053677	BAM_3491	BAM_3492	tkt1	zwf	TRUE	0.939	40.000	0.545	1.000	Y	NA
6053677	6053678	BAM_3492	BAM_3493	zwf		FALSE	0.034	351.000	0.000	0.001		NA
6053678	6053679	BAM_3493	BAM_3494			FALSE	0.597	90.000	0.083	1.000		NA
6053679	6053680	BAM_3494	BAM_3495			TRUE	0.957	14.000	0.111	NA	Y	NA
6053680	6053681	BAM_3495	BAM_3496			TRUE	0.717	126.000	0.094	NA		NA
6053683	6053684	BAM_3498	BAM_3499			FALSE	0.420	42.000	0.167	NA		NA
6053684	6053685	BAM_3499	BAM_3500			FALSE	0.024	588.000	0.000	1.000	N	NA
6053685	6053686	BAM_3500	BAM_3501			FALSE	0.548	156.000	0.000	1.000		NA
6053686	6053687	BAM_3501	BAM_3502			FALSE	0.025	343.000	0.000	1.000		NA
6053687	6053688	BAM_3502	BAM_3503			FALSE	0.017	383.000	0.000	1.000		NA
6053688	6053689	BAM_3503	BAM_3504			FALSE	0.014	412.000	0.000	1.000		NA
6053689	6053690	BAM_3504	BAM_3505			TRUE	0.835	17.000	0.571	1.000		NA
6053690	6053691	BAM_3505	BAM_3506			FALSE	0.009	580.000	0.000	1.000		NA
6053691	6053692	BAM_3506	BAM_3507			FALSE	0.419	43.000	0.190	NA		NA
6053694	6053695	BAM_3509	BAM_3510			FALSE	0.005	1153.000	0.000	NA		NA
6053695	6053696	BAM_3510	BAM_3511			TRUE	0.711	131.000	0.154	NA		NA
6053696	6053697	BAM_3511	BAM_3512			FALSE	0.450	164.000	0.128	NA		NA
6053697	6053698	BAM_3512	BAM_3513			TRUE	0.741	110.000	0.286	NA		NA
6053698	6053699	BAM_3513	BAM_3515			TRUE	0.738	12.000	0.333	NA		NA
6053701	6053702	BAM_3517	BAM_3518			FALSE	0.551	33.000	0.130	1.000		NA
6053702	6053703	BAM_3518	BAM_3519		cfa	FALSE	0.149	218.000	0.000	1.000		NA
6053703	6053704	BAM_3519	BAM_3520	cfa		FALSE	0.075	323.000	0.000	NA	N	NA
6053704	6053705	BAM_3520	BAM_3521			TRUE	0.877	191.000	0.667	NA	Y	NA
6053706	6053707	BAM_3522	BAM_3523			FALSE	0.532	79.000	0.262	NA		NA
6053708	6053709	BAM_3524	BAM_3525			FALSE	0.591	26.000	0.250	NA		NA
6053709	6053710	BAM_3525	BAM_3526			FALSE	0.572	28.000	0.250	NA		NA
6053712	6053713	BAM_3528	BAM_3529			TRUE	0.704	12.000	0.093	1.000		NA
6053713	6053714	BAM_3529	BAM_3530			TRUE	0.772	-3.000	0.300	0.084		NA
6053714	6053715	BAM_3530	BAM_3531			TRUE	0.741	-3.000	0.238	0.084		NA
6053715	6053716	BAM_3531	BAM_3532			TRUE	0.855	146.000	0.000	0.084	N	NA
6053716	6053717	BAM_3532	BAM_3533			TRUE	0.645	135.000	0.000	NA		NA
6053717	6053718	BAM_3533	BAM_3534			FALSE	0.399	36.000	0.000	NA		NA
6053720	6053721	BAM_3536	BAM_3537			FALSE	0.393	-12.000	0.000	NA		NA
6053723	6053724	BAM_3539	BAM_3540			FALSE	0.088	232.000	0.000	NA		NA
6053724	6053725	BAM_3540	BAM_3541			FALSE	0.356	47.000	0.000	NA		NA
6053725	6053726	BAM_3541	BAM_3542			FALSE	0.292	178.000	0.000	NA		NA
6053726	6053727	BAM_3542	BAM_3543		sigI	TRUE	0.746	-7.000	0.605	NA		NA
6053727	6053728	BAM_3543	BAM_3544	sigI		FALSE	0.006	570.000	0.000	NA		NA
6053728	6053729	BAM_3544	BAM_3545			FALSE	0.366	43.000	0.000	NA		NA
6053729	6053730	BAM_3545	BAM_3546			FALSE	0.018	343.000	0.000	NA		NA
6053732	6053733	BAM_3548	BAM_3549			FALSE	0.547	147.000	0.000	NA		NA
6053735	6053736	BAM_3551	BAM_3552			FALSE	0.067	269.000	0.000	1.000		NA
6053736	6053737	BAM_3552	BAM_3553			TRUE	0.949	1.000	0.860	1.000	N	NA
6053737	6053738	BAM_3553	BAM_3554			FALSE	0.534	155.000	0.186	NA		NA
6053738	6053739	BAM_3554	BAM_3555			FALSE	0.523	76.000	0.289	NA		NA
6053739	6053740	BAM_3555	BAM_3556			FALSE	0.035	291.000	0.000	NA		NA
6053740	6053741	BAM_3556	BAM_3557			FALSE	0.598	13.000	0.000	NA		NA
6053742	6053743	BAM_3558	BAM_3559			FALSE	0.056	261.000	0.000	NA		NA
6053744	6053745	BAM_3560	BAM_3561	bla2		TRUE	0.706	139.000	0.045	1.000		NA
6053745	6053746	BAM_3561	BAM_3562			FALSE	0.461	35.000	0.130	NA		NA
6053749	6053750	BAM_3565	BAM_3566			TRUE	0.720	111.000	0.250	NA		NA
6053751	6053752	BAM_3567	BAM_3568			FALSE	0.043	278.000	0.000	NA		NA
6053752	6053753	BAM_3568	BAM_3569			FALSE	0.353	171.000	0.056	NA		NA
6053753	6053754	BAM_3569	BAM_3570			FALSE	0.628	14.000	0.085	NA		NA
6053755	6053756	BAM_3571	BAM_3572			TRUE	0.752	14.000	0.386	NA		NA
6053756	6053757	BAM_3572	BAM_3573			FALSE	0.619	105.000	0.000	NA		NA
6053757	6053758	BAM_3573	BAM_3574			FALSE	0.564	18.000	0.000	NA		NA
6053761	6053762	BAM_3577	BAM_3578			FALSE	0.026	630.000	0.000	0.068	N	NA
6053764	6053765	BAM_3580	BAM_3581			TRUE	0.663	162.000	0.500	NA		NA
6053765	6053766	BAM_3581	BAM_3582			FALSE	0.479	58.000	0.333	NA		NA
6053769	6053770	BAM_2534	BAM_2535		gpm	TRUE	0.693	168.000	0.023	1.000	N	NA
6053772	6053773	BAM_2537	BAM_2538			TRUE	0.822	113.000	0.444	NA		NA
6053773	6053774	BAM_2538	BAM_2539			FALSE	0.497	77.000	0.250	NA		NA
6053775	6053776	BAM_2540	BAM_2541			FALSE	0.014	373.000	0.000	NA		NA
6053779	6053780	BAM_2544	BAM_2545		pepD	FALSE	0.631	144.000	0.125	NA		NA
6053781	6053782	BAM_2546	BAM_2547			FALSE	0.022	329.000	0.000	NA		NA
6053783	6053784	BAM_2548	BAM_2549			FALSE	0.314	222.000	0.000	1.000	N	NA
6053784	6053785	BAM_2549	BAM_2550			TRUE	0.716	-10.000	0.636	NA		NA
6053787	6053788	BAM_2552	BAM_2553			FALSE	0.497	77.000	0.250	NA		NA
6053788	6053789	BAM_2553	BAM_2554		bla1	FALSE	0.083	327.000	0.000	1.000	N	NA
6053792	6053793	BAM_2557	BAM_2558	csbX		FALSE	0.244	-46.000	0.000	NA		NA
6053794	6053795	BAM_2559	BAM_2560			TRUE	0.668	100.000	0.042	1.000		NA
6053795	6053796	BAM_2560	BAM_2561		mmsA2	TRUE	0.842	39.000	0.667	1.000	N	NA
6053796	6053797	BAM_2561	BAM_2562	mmsA2		FALSE	0.239	-49.000	0.000	NA		NA
6053797	6053798	BAM_2562	BAM_2563			FALSE	0.473	29.000	0.000	NA		NA
6053798	6053799	BAM_2563	BAM_2564			TRUE	0.896	123.000	0.000	1.000	N	NA
6053799	6053800	BAM_2564	BAM_2565		fba1	TRUE	0.970	129.000	0.000	1.000	Y	NA
6053800	6053801	BAM_2565	BAM_2566	fba1		FALSE	0.624	106.000	0.000	NA		NA
6053801	6053802	BAM_2566	BAM_2567			FALSE	0.466	85.000	0.000	NA		NA
6053804	6053805	BAM_2569	BAM_2570			FALSE	0.029	307.000	0.000	NA		NA
6053806	6053807	BAM_2571	BAM_2572			TRUE	0.818	0.000	0.500	NA		NA
6053808	6053809	BAM_2573	BAM_2574			TRUE	0.637	6.000	0.000	NA		NA
6053813	6053814	BAM_2578	BAM_2579			FALSE	0.030	305.000	0.000	NA		NA
6053814	6053815	BAM_2579	BAM_2580			TRUE	0.672	129.000	0.000	NA		NA
6053815	6053816	BAM_2580	BAM_2581			FALSE	0.007	531.000	0.000	NA		NA
6053817	6053818	BAM_2582	BAM_2583			FALSE	0.012	394.000	0.000	NA		NA
6053819	6053820	BAM_2584	BAM_2585			FALSE	0.034	445.000	0.000	1.000	N	NA
6053820	6053821	BAM_2585	BAM_2586			FALSE	0.571	145.000	0.000	NA		NA
6053823	6053824	BAM_2588	BAM_2589			FALSE	0.617	0.000	0.000	NA		NA
6053824	6053825	BAM_2589	BAM_2590			FALSE	0.334	67.000	0.000	NA		NA
6053825	6053826	BAM_2590	BAM_2591			TRUE	0.665	111.000	0.059	NA		NA
6053826	6053827	BAM_2591	BAM_2592			FALSE	0.137	210.000	0.000	NA		NA
6053827	6053828	BAM_2592	BAM_2593			FALSE	0.081	245.000	0.069	NA		NA
6053828	6053829	BAM_2593	BAM_2594			TRUE	0.923	-3.000	0.713	1.000	N	NA
6053829	6053830	BAM_2594	BAM_2596			TRUE	0.809	25.000	0.049	1.000	N	NA
6053831	6053832	BAM_2595	BAM_2597			FALSE	0.629	7.000	0.000	NA		NA
6053833	6053834	BAM_2598	BAM_2599			FALSE	0.116	217.000	0.000	NA		NA
6053834	6053835	BAM_2599	BAM_2600			TRUE	0.958	16.000	0.067	1.000	Y	NA
6053835	6053836	BAM_2600	BAM_2601			TRUE	0.782	27.000	0.553	1.000		NA
6053836	6053837	BAM_2601	BAM_2602		mvaB	TRUE	0.856	22.000	0.778	1.000		NA
6053837	6053838	BAM_2602	BAM_2603	mvaB		TRUE	0.949	5.000	0.690	0.082	N	NA
6053838	6053839	BAM_2603	BAM_2604			TRUE	0.975	3.000	0.426	1.000	Y	NA
6053839	6053840	BAM_2604	BAM_2605			TRUE	0.902	50.000	0.167	1.000	Y	NA
6053840	6053841	BAM_2605	BAM_2606			FALSE	0.360	170.000	0.045	NA		NA
6053841	6053842	BAM_2606	BAM_2607			TRUE	0.737	121.000	0.219	NA		NA
6053842	6053843	BAM_2607	BAM_2608			TRUE	0.704	49.000	0.188	1.000	N	NA
6053843	6053844	BAM_2608	BAM_2609			FALSE	0.528	-7.000	0.222	NA		NA
6053844	6053845	BAM_2609	BAM_2610			TRUE	0.697	3.000	0.214	NA		NA
6053846	6053847	BAM_2611	BAM_2612			FALSE	0.609	182.000	0.143	1.000	N	NA
6053847	6053848	BAM_2612	BAM_2613			TRUE	0.967	-10.000	0.932	0.022	Y	NA
6053849	6053850	BAM_2614	BAM_2615			FALSE	0.050	269.000	0.000	NA		NA
6053850	6053851	BAM_2615	BAM_2616			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6053851	6053852	BAM_2616	BAM_2617			TRUE	0.879	17.000	0.333	1.000	N	NA
6053852	6053853	BAM_2617	BAM_2618			FALSE	0.629	94.000	0.091	1.000		NA
6053853	6053854	BAM_2618	BAM_2619			TRUE	0.679	108.000	0.152	NA		NA
6053854	6053855	BAM_2619	BAM_2620			FALSE	0.343	170.000	0.000	NA		NA
6053855	6053856	BAM_2620	BAM_2621			FALSE	0.355	71.000	0.000	NA		NA
6053856	6053857	BAM_2621	BAM_2622			FALSE	0.016	355.000	0.000	NA		NA
6053857	6053858	BAM_2622	BAM_2623			TRUE	0.683	137.000	0.167	NA		NA
6053858	6053859	BAM_2623	BAM_2624			FALSE	0.491	88.000	0.036	NA		NA
6053859	6053860	BAM_2624	BAM_2625			FALSE	0.465	80.000	0.060	NA		NA
6053860	6053861	BAM_2625	BAM_2626			FALSE	0.013	382.000	0.000	NA		NA
6053861	6053862	BAM_2626	BAM_2627			TRUE	0.763	-3.000	0.462	NA		NA
6053862	6053863	BAM_2627	BAM_2628			FALSE	0.543	35.000	0.304	NA		NA
6053863	6053864	BAM_2628	BAM_2629			TRUE	0.906	122.000	0.208	1.000	N	NA
6053866	6053867	BAM_2631	BAM_2632			FALSE	0.262	182.000	0.000	NA		NA
6053867	6053868	BAM_2632	BAM_2633			FALSE	0.348	50.000	0.000	NA		NA
6053872	6053873	BAM_2637	BAM_2638			FALSE	0.421	78.000	0.000	NA		NA
6053873	6053874	BAM_2638	BAM_2639			FALSE	0.355	71.000	0.000	NA		NA
6053874	6053875	BAM_2639	BAM_2640			TRUE	0.683	137.000	0.125	NA		NA
6053876	6053877	BAM_2641	BAM_2642			FALSE	0.233	-70.000	0.000	NA		NA
6053878	6053879	BAM_2643	BAM_2644			FALSE	0.111	219.000	0.000	NA		NA
6053879	6053880	BAM_2644	BAM_2645			FALSE	0.013	376.000	0.000	NA		NA
6053880	6053881	BAM_2645	BAM_2646			FALSE	0.045	274.000	0.000	NA		NA
6053881	6053882	BAM_2646	BAM_2647			FALSE	0.288	-25.000	0.000	NA		NA
6053886	6053887	BAM_2651	BAM_2652			FALSE	0.417	34.000	0.000	NA		NA
6053887	6053888	BAM_2652	BAM_2653			TRUE	0.904	126.000	0.156	1.000	N	NA
6053888	6053889	BAM_2653	BAM_2654			TRUE	0.637	6.000	0.000	NA		NA
6053889	6053890	BAM_2654	BAM_2655			FALSE	0.227	-106.000	0.000	NA		NA
6053892	6053893	BAM_2657	BAM_2658			TRUE	0.792	10.000	0.350	1.000		NA
6053893	6053894	BAM_2658	BAM_2659			FALSE	0.013	385.000	0.000	NA		NA
6053894	6053895	BAM_2659	BAM_2660			FALSE	0.026	314.000	0.000	NA		NA
6053895	6053896	BAM_2660	BAM_2661			FALSE	0.288	-25.000	0.000	NA		NA
6053896	6053897	BAM_2661	BAM_2662			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6053897	6053898	BAM_2662	BAM_2663			FALSE	0.338	68.000	0.000	NA		NA
6053900	6053901	BAM_2665	BAM_2666			FALSE	0.477	88.000	0.000	NA		NA
6053901	6053902	BAM_2666	BAM_2667			TRUE	0.972	122.000	0.038	1.000	Y	NA
6053902	6053903	BAM_2667	BAM_2668		ddlB	TRUE	0.877	5.000	0.005	1.000	N	NA
6053903	6053904	BAM_2668	BAM_2669	ddlB	tenA	FALSE	0.154	275.000	0.000	1.000	N	NA
6053904	6053905	BAM_2669	BAM_2670	tenA		FALSE	0.199	194.000	0.000	NA		NA
6053905	6053906	BAM_2670	BAM_2671			FALSE	0.383	-39.000	0.333	NA		NA
6053906	6053907	BAM_2671	BAM_2672			FALSE	0.013	378.000	0.000	NA		NA
6053907	6053908	BAM_2672	BAM_2673			FALSE	0.462	84.000	0.000	NA		NA
6053910	6053911	BAM_2675	BAM_2676			TRUE	0.666	116.000	0.000	NA		NA
6053912	6053913	BAM_2677	BAM_2678			FALSE	0.634	109.000	0.000	NA		NA
6053914	6053915	BAM_2679	BAM_2680			FALSE	0.421	78.000	0.000	NA		NA
6053915	6053916	BAM_2680	BAM_2681			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6053916	6053917	BAM_2681	BAM_2682			TRUE	0.681	127.000	0.000	NA		NA
6053917	6053918	BAM_2682	BAM_2683			TRUE	0.827	141.000	0.556	NA		NA
6053920	6053921	BAM_2685	BAM_2686			FALSE	0.601	147.000	0.136	NA		NA
6053921	6053922	BAM_2686	BAM_2687		cypA	FALSE	0.493	160.000	0.188	NA		NA
6053922	6053923	BAM_2687	BAM_2688	cypA		FALSE	0.050	269.000	0.000	NA		NA
6053923	6053924	BAM_2688	BAM_2689			FALSE	0.435	-10.000	0.056	NA		NA
6053924	6053925	BAM_2689	BAM_2690			FALSE	0.373	71.000	0.048	NA		NA
6053927	6053928	BAM_2692	BAM_2693			TRUE	0.866	113.000	0.412	0.010		NA
6053928	6053929	BAM_2693	BAM_2694			FALSE	0.528	178.000	0.412	1.000		NA
6053929	6053930	BAM_2694	BAM_2695			FALSE	0.008	477.000	0.000	NA		NA
6053930	6053931	BAM_2695	BAM_2696			FALSE	0.490	90.000	0.000	NA		NA
6053931	6053932	BAM_2696	BAM_2697			FALSE	0.102	223.000	0.000	NA		NA
6053932	6053933	BAM_2697	BAM_2698			FALSE	0.075	336.000	0.000	1.000	N	NA
6053935	6053936	BAM_2700	BAM_2701			TRUE	0.788	11.000	0.435	NA		NA
6053936	6053937	BAM_2701	BAM_2702			TRUE	0.751	-7.000	0.530	1.000		NA
6053937	6053938	BAM_2702	BAM_2703			FALSE	0.525	91.000	0.065	NA		NA
6053939	6053940	BAM_2704	BAM_2705	kinB2		FALSE	0.610	88.000	0.222	1.000		NA
6053941	6053942	BAM_2706	BAM_2707			FALSE	0.356	171.000	0.062	NA		NA
6053942	6053943	BAM_2707	BAM_2708			FALSE	0.028	335.000	0.000	1.000		NA
6053943	6053944	BAM_2708	BAM_2709			FALSE	0.007	535.000	0.000	NA		NA
6053944	6053945	BAM_2709	BAM_2710			TRUE	0.671	112.000	0.063	NA		NA
6053945	6053946	BAM_2710	BAM_2711			TRUE	0.725	5.000	0.048	1.000		NA
6053946	6053947	BAM_2711	BAM_2712			FALSE	0.174	200.000	0.000	NA		NA
6053947	6053948	BAM_2712	BAM_2713			FALSE	0.207	200.000	0.125	NA		NA
6053949	6053950	BAM_2714	BAM_2715			FALSE	0.530	22.000	0.000	NA		NA
6053951	6053952	BAM_2716	BAM_2717			FALSE	0.329	64.000	0.000	NA		NA
6053952	6053953	BAM_2717	BAM_2718			FALSE	0.440	75.000	0.127	NA		NA
6053953	6053954	BAM_2718	BAM_2719			FALSE	0.016	358.000	0.000	NA		NA
6053956	6053957	BAM_2721	BAM_2722		adP1	FALSE	0.513	151.000	0.000	NA		NA
6053957	6053958	BAM_2722	BAM_2723	adP1		FALSE	0.104	222.000	0.000	NA		NA
6053958	6053959	BAM_2723	BAM_2724			FALSE	0.209	192.000	0.000	NA		NA
6053959	6053960	BAM_2724	BAM_2725			FALSE	0.581	16.000	0.000	NA		NA
6053961	6053962	BAM_2726	BAM_2727			FALSE	0.534	178.000	0.500	NA		NA
6053963	6053964	BAM_2728	BAM_2729			TRUE	0.746	46.000	0.778	1.000		NA
6053967	6053968	BAM_2732	BAM_2733			FALSE	0.334	67.000	0.000	NA		NA
6053969	6053970	BAM_2734	BAM_2735			FALSE	0.509	25.000	0.000	NA		NA
6053970	6053971	BAM_2735	BAM_2736			FALSE	0.623	139.000	0.000	NA		NA
6053971	6053972	BAM_2736	BAM_2737			FALSE	0.605	141.000	0.000	NA		NA
6053972	6053973	BAM_2737	BAM_2738			FALSE	0.398	76.000	0.000	NA		NA
6053973	6053974	BAM_2738	BAM_2739			FALSE	0.601	23.000	0.000	1.000		NA
6053974	6053975	BAM_2739	BAM_2740			FALSE	0.293	203.000	0.400	NA		NA
6053975	6053976	BAM_2740	BAM_2741			TRUE	0.680	102.000	0.250	NA		NA
6053976	6053977	BAM_2741	BAM_2742			FALSE	0.439	32.000	0.000	NA		NA
6053977	6053978	BAM_2742	BAM_2743			FALSE	0.039	285.000	0.000	NA		NA
6053978	6053979	BAM_2743	BAM_2744			FALSE	0.136	274.000	0.000	NA	N	NA
6053979	6053980	BAM_2744	BAM_2745			FALSE	0.018	634.000	0.000	NA	N	NA
6053980	6053981	BAM_2745	BAM_2746		dnaN2	TRUE	0.926	32.000	0.007	1.000	Y	NA
6053981	6053982	BAM_2746	BAM_2747	dnaN2		TRUE	0.946	23.000	0.004	1.000	Y	NA
6053982	6053983	BAM_2747	BAM_2748			FALSE	0.567	98.000	0.021	NA		NA
6053983	6053984	BAM_2748	BAM_2749			FALSE	0.370	73.000	0.000	NA		NA
6053986	6053987	BAM_2751	BAM_2752			TRUE	0.718	136.000	0.250	NA		NA
6053987	6053988	BAM_2752	BAM_2753			TRUE	0.720	119.000	0.111	NA		NA
6053989	6053990	BAM_2754	BAM_2755			FALSE	0.466	79.000	0.082	NA		NA
6053990	6053991	BAM_2755	BAM_2756			FALSE	0.503	26.000	0.000	NA		NA
6053991	6053992	BAM_2756	BAM_2757			FALSE	0.483	89.000	0.000	NA		NA
6053992	6053993	BAM_2757	BAM_2758			FALSE	0.052	266.000	0.000	NA		NA
6053993	6053994	BAM_2758	BAM_2759			FALSE	0.598	13.000	0.000	NA		NA
6053996	6053997	BAM_2761	BAM_2762			TRUE	0.678	2.000	0.108	NA		NA
6053997	6053998	BAM_2762	BAM_2763			FALSE	0.619	17.000	0.108	NA		NA
6053998	6053999	BAM_2763	BAM_2764			TRUE	0.647	64.000	0.171	NA	N	NA
6053999	6054000	BAM_2764	BAM_2765			TRUE	0.783	83.000	0.280	NA	N	NA
6054002	6054003	BAM_2767	BAM_2768			FALSE	0.421	78.000	0.000	NA		NA
6054003	6054004	BAM_2768	BAM_2769			FALSE	0.483	28.000	0.000	NA		NA
6054004	6054005	BAM_2769	BAM_2770			FALSE	0.320	181.000	0.179	NA		NA
6054006	6054007	BAM_2771	BAM_2772			TRUE	0.886	140.000	0.833	NA		NA
6054008	6054009	BAM_2773	BAM_2774			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6054009	6054010	BAM_2774	BAM_2775			FALSE	0.519	150.000	0.000	NA		NA
6054010	6054011	BAM_2775	BAM_2776			FALSE	0.623	139.000	0.000	NA		NA
6054011	6054012	BAM_2776	BAM_2777			FALSE	0.272	-31.000	0.000	NA		NA
6054012	6054013	BAM_2777	BAM_2778			TRUE	0.719	126.000	0.099	NA		NA
6054013	6054014	BAM_2778	BAM_2779			FALSE	0.588	148.000	0.167	NA		NA
6054014	6054015	BAM_2779	BAM_2780			TRUE	0.662	139.000	0.097	NA		NA
6054015	6054016	BAM_2780	BAM_2781			TRUE	0.665	109.000	0.081	NA		NA
6054016	6054017	BAM_2781	BAM_2782			TRUE	0.669	137.000	0.088	NA		NA
6054018	6054019	BAM_2783	BAM_2784			FALSE	0.222	202.000	0.250	NA		NA
6054019	6054020	BAM_2784	BAM_2785			FALSE	0.005	967.000	0.000	NA		NA
6054021	6054022	BAM_2786	BAM_2787			TRUE	0.686	56.000	0.143	1.000	N	NA
6054022	6054023	BAM_2787	BAM_2788			FALSE	0.606	33.000	0.286	1.000		NA
6054023	6054024	BAM_2788	BAM_2789			FALSE	0.360	45.000	0.000	NA		NA
6054024	6054025	BAM_2789	BAM_2790			FALSE	0.005	662.000	0.000	NA		NA
6054027	6054028	BAM_2792	BAM_2793			FALSE	0.009	460.000	0.000	NA		NA
6054028	6054029	BAM_2793	BAM_2794			TRUE	0.719	1.000	0.265	NA		NA
6054029	6054030	BAM_2794	BAM_2795			FALSE	0.194	251.000	0.000	NA	N	NA
6054032	6054033	BAM_2797	BAM_2798			TRUE	0.693	135.000	0.143	NA		NA
6054034	6054035	BAM_2799	BAM_2800			FALSE	0.021	360.000	0.000	1.000		NA
6054035	6054036	BAM_2800	BAM_2802			FALSE	0.494	27.000	0.000	NA		NA
6054037	6054038	BAM_2801	BAM_2803			FALSE	0.603	12.000	0.000	NA		NA
6054040	6054041	BAM_2805	BAM_2806			FALSE	0.573	17.000	0.000	NA		NA
6054041	6054042	BAM_2806	BAM_2807			FALSE	0.333	56.000	0.000	NA		NA
6054042	6054043	BAM_2807	BAM_2808			FALSE	0.630	108.000	0.000	NA		NA
6054043	6054044	BAM_2808	BAM_2809			FALSE	0.616	26.000	0.280	NA		NA
6054044	6054045	BAM_2809	BAM_2810			TRUE	0.701	113.000	0.143	NA		NA
6054045	6054046	BAM_2810	BAM_2811		ypeB	FALSE	0.541	27.000	0.105	NA		NA
6054046	6054047	BAM_2811	BAM_2812	ypeB	sleB	TRUE	0.754	16.000	0.408	NA		NA
6054049	6054050	BAM_2814	BAM_2815		kynA	TRUE	0.894	117.000	0.066	1.000	N	NA
6054050	6054051	BAM_2815	BAM_2816	kynA	kynB	FALSE	0.540	34.000	0.165	1.000		NA
6054051	6054052	BAM_2816	BAM_2817	kynB	kynU	TRUE	0.819	3.000	0.382	1.000		NA
6054056	6054057	BAM_2821	BAM_2822			TRUE	0.677	152.000	0.385	NA		NA
6054057	6054058	BAM_2822	BAM_2823			TRUE	0.884	137.000	0.750	NA		NA
6054058	6054059	BAM_2823	BAM_2824			TRUE	0.724	112.000	0.250	NA		NA
6054059	6054060	BAM_2824	BAM_2825			TRUE	0.735	125.000	0.208	NA		NA
6054060	6054061	BAM_2825	BAM_2826			TRUE	0.782	18.000	0.500	NA		NA
6054061	6054062	BAM_2826	BAM_2827			TRUE	0.670	151.000	0.350	NA		NA
6054062	6054063	BAM_2827	BAM_2828			TRUE	0.892	13.000	0.350	1.000	N	NA
6054065	6054066	BAM_2830	BAM_2831			FALSE	0.513	33.000	0.022	1.000		NA
6054066	6054067	BAM_2831	BAM_2832			TRUE	0.825	94.000	0.111	1.000	N	NA
6054067	6054068	BAM_2832	BAM_2833			FALSE	0.331	58.000	0.000	NA		NA
6054068	6054069	BAM_2833	BAM_2834			FALSE	0.530	22.000	0.000	NA		NA
6054071	6054072	BAM_2836	BAM_2837	acoL	acoC	TRUE	0.964	16.000	0.294	1.000	Y	NA
6054072	6054073	BAM_2837	BAM_2838	acoC	acoB	TRUE	0.953	28.000	0.295	0.079	Y	NA
6054073	6054074	BAM_2838	BAM_2839	acoB	acoA	TRUE	0.981	18.000	0.804	0.001	Y	NA
6054074	6054075	BAM_2839	BAM_2840	acoA		FALSE	0.360	-16.000	0.033	NA		NA
6054075	6054076	BAM_2840	BAM_2841			FALSE	0.505	31.000	0.150	NA		NA
6054077	6054078	BAM_2842	BAM_2843			FALSE	0.420	42.000	0.143	NA		NA
6054079	6054080	BAM_2844	BAM_2845			TRUE	0.737	20.000	0.429	NA		NA
6054080	6054081	BAM_2845	BAM_2846			FALSE	0.473	29.000	0.000	NA		NA
6054081	6054082	BAM_2846	BAM_2847			FALSE	0.511	93.000	0.000	NA		NA
6054082	6054083	BAM_2847	BAM_2848			FALSE	0.342	69.000	0.000	NA		NA
6054083	6054084	BAM_2848	BAM_2849			TRUE	0.662	115.000	0.000	NA		NA
6054084	6054085	BAM_2849	BAM_2850			FALSE	0.008	477.000	0.000	NA		NA
6054085	6054086	BAM_2850	BAM_2851		proV2	TRUE	0.941	-7.000	0.094	0.096	Y	NA
6054088	6054089	BAM_2853	BAM_2854	clpP1		TRUE	0.906	22.000	0.647	1.000	N	NA
6054090	6054091	BAM_2855	BAM_2856		rpiA	TRUE	0.878	5.000	0.011	1.000	N	NA
6054091	6054092	BAM_2856	BAM_2857	rpiA		TRUE	0.702	108.000	0.011	1.000		NA
6054093	6054094	BAM_2858	BAM_2859			FALSE	0.012	438.000	0.000	1.000		NA
6054094	6054095	BAM_2859	BAM_2860			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6054095	6054096	BAM_2860	BAM_2861			FALSE	0.391	37.000	0.000	NA		NA
6054096	6054097	BAM_2861	BAM_2862			FALSE	0.581	16.000	0.000	NA		NA
6054097	6054098	BAM_2862	BAM_2863			FALSE	0.351	66.000	0.055	NA		NA
6054098	6054099	BAM_2863	BAM_2864			FALSE	0.604	19.000	0.115	NA		NA
6054099	6054100	BAM_2864	BAM_2865			FALSE	0.624	106.000	0.000	NA		NA
6054100	6054101	BAM_2865	BAM_2866			FALSE	0.398	76.000	0.000	NA		NA
6054101	6054102	BAM_2866	BAM_2867			TRUE	0.649	13.000	0.135	NA		NA
6054103	6054104	BAM_2868	BAM_2869			TRUE	0.706	3.000	0.231	NA		NA
6054105	6054106	BAM_2870	BAM_2871			FALSE	0.190	207.000	0.000	1.000		NA
6054106	6054107	BAM_2871	BAM_2872			TRUE	0.833	27.000	0.875	NA		NA
6054107	6054108	BAM_2872	BAM_2873			TRUE	0.780	-3.000	0.500	NA		NA
6054108	6054109	BAM_2873	BAM_2874			FALSE	0.585	145.000	0.035	NA		NA
6054109	6054110	BAM_2874	BAM_2875			FALSE	0.427	35.000	0.049	NA		NA
6054110	6054111	BAM_2875	BAM_2876			FALSE	0.476	-13.000	0.262	NA		NA
6054111	6054112	BAM_2876	BAM_2877			FALSE	0.350	170.000	0.021	NA		NA
6054112	6054113	BAM_2877	BAM_2878			FALSE	0.331	63.000	0.011	NA		NA
6054115	6054116	BAM_2880	BAM_2881			FALSE	0.281	185.000	0.156	NA		NA
6054116	6054117	BAM_2881	BAM_2882		recQ2	FALSE	0.524	26.000	0.050	NA		NA
6054118	6054119	BAM_2883	BAM_2884			FALSE	0.006	618.000	0.000	NA		NA
6054120	6054121	BAM_2885	BAM_2886			FALSE	0.570	99.000	0.000	NA		NA
6054123	6054124	BAM_2888	BAM_2889			FALSE	0.242	-48.000	0.000	NA		NA
6054124	6054125	BAM_2889	BAM_2890		ppaC	FALSE	0.624	106.000	0.000	NA		NA
6054125	6054126	BAM_2890	BAM_2891	ppaC		FALSE	0.498	162.000	0.018	1.000		NA
6054126	6054127	BAM_2891	BAM_2892			FALSE	0.132	225.000	0.014	1.000		NA
6054127	6054128	BAM_2892	BAM_2893			FALSE	0.149	218.000	0.000	1.000		NA
6054128	6054129	BAM_2893	BAM_2894			TRUE	0.719	103.000	0.206	1.000		NA
6054129	6054130	BAM_2894	BAM_2895			TRUE	0.906	108.000	0.368	1.000	N	NA
6054130	6054131	BAM_2895	BAM_2896		dapA1	TRUE	0.893	19.000	0.474	1.000	N	NA
6054131	6054132	BAM_2896	BAM_2897	dapA1		TRUE	0.963	23.000	0.474	1.000	Y	NA
6054132	6054133	BAM_2897	BAM_2898			TRUE	0.980	-3.000	0.750	0.001	Y	NA
6054133	6054134	BAM_2898	BAM_2899			TRUE	0.960	-3.000	0.270	1.000	Y	NA
6054135	6054136	BAM_2900	BAM_2901			FALSE	0.166	202.000	0.000	NA		NA
6054136	6054137	BAM_2901	BAM_2902			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6054137	6054138	BAM_2902	BAM_2903		gidA1	FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6054139	6054140	BAM_2904	BAM_2905			TRUE	0.730	-12.000	0.722	NA		NA
6054141	6054142	BAM_2906	BAM_2907			FALSE	0.086	235.000	0.000	NA		NA
6054145	6054146	BAM_2910	BAM_2911	dltD2		FALSE	0.175	267.000	0.000	1.000	N	NA
6054146	6054147	BAM_2911	BAM_2912			TRUE	0.936	118.000	0.500	1.000	N	NA
6054147	6054148	BAM_2912	BAM_2913			TRUE	0.841	21.000	0.308	NA	N	NA
6054148	6054149	BAM_2913	BAM_2914			TRUE	0.902	40.000	0.147	NA	Y	NA
6054149	6054150	BAM_2914	BAM_2915			FALSE	0.503	152.000	0.000	NA		NA
6054150	6054151	BAM_2915	BAM_2916		divIC2	FALSE	0.058	260.000	0.000	NA		NA
6054151	6054152	BAM_2916	BAM_2917	divIC2		FALSE	0.007	500.000	0.000	NA		NA
6054154	6054155	BAM_2919	BAM_2920			FALSE	0.027	312.000	0.000	NA		NA
6054155	6054156	BAM_2920	BAM_2921			FALSE	0.166	202.000	0.000	NA		NA
6054158	6054159	BAM_2923	BAM_2924			FALSE	0.232	201.000	0.051	1.000		NA
6054159	6054160	BAM_2924	BAM_2925			TRUE	0.940	-7.000	0.256	1.000	Y	NA
6054162	6054163	BAM_2927	BAM_2928			FALSE	0.050	269.000	0.000	NA		NA
6054163	6054164	BAM_2928	BAM_2929			FALSE	0.340	53.000	0.000	NA		NA
6054164	6054165	BAM_2929	BAM_2930			FALSE	0.546	20.000	0.000	NA		NA
6054165	6054166	BAM_2930	BAM_2931			FALSE	0.581	16.000	0.000	NA		NA
6054166	6054167	BAM_2931	BAM_2932			FALSE	0.598	13.000	0.000	NA		NA
6054167	6054168	BAM_2932	BAM_2933			FALSE	0.383	38.000	0.000	NA		NA
6054168	6054169	BAM_2933	BAM_2934			FALSE	0.146	207.000	0.000	NA		NA
6054169	6054170	BAM_2934	BAM_2935			FALSE	0.598	13.000	0.000	NA		NA
6054171	6054172	BAM_2936	BAM_2937			FALSE	0.074	244.000	0.000	NA		NA
6054175	6054176	BAM_2940	BAM_2941			TRUE	0.714	25.000	0.438	NA		NA
6054176	6054177	BAM_2941	BAM_2942			TRUE	0.825	19.000	0.667	NA		NA
6054177	6054178	BAM_2942	BAM_2943			TRUE	0.825	14.000	0.577	NA		NA
6054178	6054179	BAM_2943	BAM_2944			FALSE	0.534	161.000	0.269	NA		NA
6054181	6054182	BAM_2946	BAM_2947			FALSE	0.572	28.000	0.250	NA		NA
6054182	6054183	BAM_2947	BAM_2948			FALSE	0.570	99.000	0.000	NA		NA
6054183	6054184	BAM_2948	BAM_2949			FALSE	0.305	-22.000	0.000	NA		NA
6054184	6054185	BAM_2949	BAM_2950			TRUE	0.703	78.000	0.583	NA		NA
6054185	6054186	BAM_2950	BAM_2951			FALSE	0.601	174.000	0.500	1.000		NA
6054186	6054187	BAM_2951	BAM_2952			TRUE	0.768	78.000	0.778	NA		NA
6054187	6054188	BAM_2952	BAM_2953			FALSE	0.431	79.000	0.000	NA		NA
6054188	6054189	BAM_2953	BAM_2954			FALSE	0.191	196.000	0.000	NA		NA
6054189	6054190	BAM_2954	BAM_2955			TRUE	0.816	152.000	0.750	NA		NA
6054191	6054192	BAM_2956	BAM_2957			FALSE	0.568	51.000	0.455	NA		NA
6054192	6054193	BAM_2957	BAM_2958			FALSE	0.054	265.000	0.000	NA		NA
6054193	6054194	BAM_2958	BAM_2959			FALSE	0.503	152.000	0.000	NA		NA
6054194	6054195	BAM_2959	BAM_2960			FALSE	0.259	-34.000	0.000	NA		NA
6054195	6054196	BAM_2960	BAM_2961			FALSE	0.332	171.000	0.000	NA		NA
6054196	6054197	BAM_2961	BAM_2962			FALSE	0.302	181.000	0.080	NA		NA
6054197	6054198	BAM_2962	BAM_2963			TRUE	0.650	57.000	0.120	NA	N	NA
6054198	6054199	BAM_2963	BAM_2964		coaA	TRUE	0.788	93.000	0.072	NA	N	NA
6054200	6054201	BAM_2965	BAM_2966			FALSE	0.222	188.000	0.000	NA		NA
6054201	6054202	BAM_2966	BAM_2967			FALSE	0.329	60.000	0.000	NA		NA
6054202	6054203	BAM_2967	BAM_2968			FALSE	0.428	33.000	0.000	NA		NA
6054203	6054204	BAM_2968	BAM_2969			TRUE	0.820	-3.000	0.636	NA		NA
6054204	6054205	BAM_2969	BAM_2970			FALSE	0.612	104.000	0.000	NA		NA
6054205	6054206	BAM_2970	BAM_2971			TRUE	0.685	124.000	0.000	NA		NA
6054207	6054208	BAM_2972	BAM_2973			FALSE	0.599	165.000	0.429	NA		NA
6054208	6054209	BAM_2973	BAM_2974			TRUE	0.836	28.000	1.000	NA		NA
6054209	6054210	BAM_2974	BAM_2975			FALSE	0.473	29.000	0.000	NA		NA
6054210	6054211	BAM_2975	BAM_2976			FALSE	0.494	27.000	0.000	NA		NA
6054211	6054212	BAM_2976	BAM_2977			FALSE	0.503	26.000	0.000	NA		NA
6054212	6054213	BAM_2977	BAM_2978			FALSE	0.571	26.000	0.222	NA		NA
6054216	6054217	BAM_2981	BAM_2982		ssuD	FALSE	0.600	144.000	0.051	NA		NA
6054217	6054218	BAM_2982	BAM_2983	ssuD		TRUE	0.737	77.000	0.034	1.000	N	NA
6054218	6054219	BAM_2983	BAM_2984			FALSE	0.573	17.000	0.000	NA		NA
6054219	6054220	BAM_2984	BAM_2985			FALSE	0.581	100.000	0.000	NA		NA
6054220	6054221	BAM_2985	BAM_2986			FALSE	0.564	18.000	0.000	NA		NA
6054221	6054222	BAM_2986	BAM_2987			FALSE	0.095	228.000	0.000	NA		NA
6054222	6054223	BAM_2987	BAM_2988			FALSE	0.356	47.000	0.000	NA		NA
6054223	6054224	BAM_2988	BAM_2989			FALSE	0.137	210.000	0.000	NA		NA
6054224	6054225	BAM_2989	BAM_2990			TRUE	0.692	104.000	0.250	NA		NA
6054225	6054226	BAM_2990	BAM_2991			FALSE	0.549	-7.000	0.250	NA		NA
6054226	6054227	BAM_2991	BAM_2992			FALSE	0.598	13.000	0.000	NA		NA
6054227	6054228	BAM_2992	BAM_2993			TRUE	0.684	124.000	0.002	NA		NA
6054228	6054229	BAM_2993	BAM_2994		aacC7	FALSE	0.583	16.000	0.008	NA		NA
6054231	6054232	BAM_2996	BAM_2997			TRUE	0.846	21.000	0.800	NA		NA
6054232	6054233	BAM_2997	BAM_2998			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6054233	6054234	BAM_2998	BAM_2999			FALSE	0.252	-37.000	0.000	NA		NA
6054234	6054235	BAM_2999	BAM_3000			FALSE	0.599	57.000	0.538	NA		NA
6054235	6054236	BAM_3000	BAM_3001			FALSE	0.498	70.000	0.333	NA		NA
6054236	6054237	BAM_3001	BAM_3002			TRUE	0.780	16.000	0.467	NA		NA
6054237	6054238	BAM_3002	BAM_3003			TRUE	0.950	35.000	0.500	0.022	Y	NA
6054238	6054239	BAM_3003	BAM_3004			TRUE	0.695	16.000	0.179	1.000		NA
6054239	6054240	BAM_3004	BAM_3005			FALSE	0.625	17.000	0.179	NA		NA
6054240	6054241	BAM_3005	BAM_3006			FALSE	0.015	366.000	0.000	NA		NA
6054241	6054242	BAM_3006	BAM_3007			FALSE	0.413	-10.000	0.000	NA		NA
6054243	6054244	BAM_3008	BAM_3009			FALSE	0.496	160.000	0.200	NA		NA
6054244	6054245	BAM_3009	BAM_3010			TRUE	0.668	111.000	0.067	NA		NA
6054246	6054247	BAM_3011	BAM_3012			FALSE	0.010	517.000	0.000	1.000		NA
6054247	6054248	BAM_3012	BAM_3013			FALSE	0.013	378.000	0.000	NA		NA
6054248	6054249	BAM_3013	BAM_3014			FALSE	0.038	287.000	0.000	NA		NA
6054249	6054250	BAM_3014	BAM_3015			FALSE	0.628	1.000	0.000	NA		NA
6054250	6054251	BAM_3015	BAM_3016			FALSE	0.064	254.000	0.000	NA		NA
6054251	6054252	BAM_3016	BAM_3017			FALSE	0.065	270.000	0.000	1.000		NA
6054252	6054253	BAM_3017	BAM_3018		aroA	FALSE	0.295	186.000	0.005	1.000		NA
6054253	6054254	BAM_3018	BAM_3019	aroA	tyrA	TRUE	0.957	17.000	0.069	1.000	Y	NA
6054254	6054255	BAM_3019	BAM_3020	tyrA	hisC2	TRUE	0.934	-7.000	0.062	1.000	Y	NA
6054255	6054256	BAM_3020	BAM_3021	hisC2	aroC2	TRUE	0.952	19.000	0.007	1.000	Y	NA
6054256	6054257	BAM_3021	BAM_3022	aroC2		TRUE	0.685	123.000	0.000	NA		NA
6054257	6054258	BAM_3022	BAM_3023			FALSE	0.329	64.000	0.000	NA		NA
6054258	6054259	BAM_3023	BAM_3024			FALSE	0.007	541.000	0.000	NA		NA
6054259	6054260	BAM_3024	BAM_3025			FALSE	0.354	48.000	0.000	NA		NA
6054262	6054263	BAM_3027	BAM_3028			TRUE	0.876	17.000	0.231	0.076	N	NA
6054263	6054264	BAM_3028	BAM_3029			FALSE	0.618	20.000	0.231	NA		NA
6054266	6054267	BAM_3031	BAM_3032			FALSE	0.227	187.000	0.000	NA		NA
6054267	6054268	BAM_3032	BAM_3033			FALSE	0.362	44.000	0.000	NA		NA
6054268	6054269	BAM_3033	BAM_3034			FALSE	0.345	51.000	0.000	NA		NA
6054269	6054270	BAM_3034	BAM_3035			FALSE	0.413	-10.000	0.000	NA		NA
6054271	6054272	BAM_3036	BAM_3037			TRUE	0.684	125.000	0.000	NA		NA
6054275	6054276	BAM_3040	BAM_3041			TRUE	0.976	-3.000	0.844	NA	Y	NA
6054278	6054279	BAM_3042	BAM_3044			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6054280	6054281	BAM_3045	BAM_3046			TRUE	0.883	0.000	0.250	1.000	N	NA
6054281	6054282	BAM_3046	BAM_3047			TRUE	0.944	26.000	0.062	1.000	Y	NA
6054282	6054283	BAM_3047	BAM_3048			TRUE	0.965	7.000	0.031	1.000	Y	NA
6054284	6054285	BAM_3049	BAM_3050			FALSE	0.027	337.000	0.000	1.000		NA
6054285	6054286	BAM_3050	BAM_3051			FALSE	0.525	83.000	0.222	NA		NA
6054286	6054287	BAM_3051	BAM_3052			FALSE	0.581	97.000	0.071	NA		NA
6054287	6054288	BAM_3052	BAM_3053			FALSE	0.612	97.000	0.214	NA		NA
6054288	6054289	BAM_3053	BAM_3054			FALSE	0.637	52.000	0.600	NA		NA
6054290	6054291	BAM_3055	BAM_3056			FALSE	0.156	204.000	0.000	NA		NA
6054292	6054293	BAM_3057	BAM_3058	proA	proB	TRUE	0.950	30.000	0.281	0.002	Y	NA
6054293	6054294	BAM_3058	BAM_3059	proB		FALSE	0.008	494.000	0.000	NA		NA
6054296	6054297	BAM_3061	BAM_3062	rocB		FALSE	0.398	76.000	0.000	NA		NA
6054298	6054299	BAM_4878	BAM_4879		gap1	FALSE	0.515	85.000	0.111	NA		NA
6054299	6054300	BAM_4879	BAM_4880	gap1		TRUE	0.876	110.000	0.020	1.000	N	NA
6054300	6054301	BAM_4880	BAM_4881			FALSE	0.356	52.000	0.038	NA		NA
6054301	6054302	BAM_4881	BAM_4882		mutM	FALSE	0.389	73.000	0.050	NA		NA
6054302	6054303	BAM_4882	BAM_4883	mutM	polA	TRUE	0.962	13.000	0.101	1.000	Y	NA
6054303	6054304	BAM_4883	BAM_4884	polA	phoR	FALSE	0.135	287.000	0.006	1.000	N	NA
6054304	6054305	BAM_4884	BAM_4885	phoR	phoP	TRUE	0.942	-7.000	0.159	0.082	Y	NA
6054305	6054306	BAM_4885	BAM_4886	phoP		FALSE	0.535	148.000	0.000	NA		NA
6054308	6054309	BAM_4888	BAM_4889		mdh	FALSE	0.345	217.000	0.022	1.000	N	NA
6054309	6054310	BAM_4889	BAM_4890	mdh	citC	TRUE	0.954	20.000	0.115	1.000	Y	NA
6054310	6054311	BAM_4890	BAM_4891	citC	citZ	TRUE	0.928	161.000	0.140	1.000	Y	NA
6054311	6054312	BAM_4891	BAM_4892	citZ		FALSE	0.013	388.000	0.039	NA		NA
6054314	6054315	BAM_4894	BAM_4895		pyk	FALSE	0.245	200.000	0.082	1.000		NA
6054315	6054316	BAM_4895	BAM_4896	pyk	pfkA	TRUE	0.915	54.000	0.261	0.004	Y	NA
6054316	6054317	BAM_4896	BAM_4897	pfkA	accA	TRUE	0.894	129.000	0.047	1.000	N	NA
6054317	6054318	BAM_4897	BAM_4898	accA	accD	TRUE	0.932	-12.000	0.234	0.001	Y	NA
6054318	6054319	BAM_4898	BAM_4899	accD		FALSE	0.552	186.000	0.032	1.000	N	NA
6054319	6054320	BAM_4899	BAM_4900			TRUE	0.913	15.000	0.514	1.000	N	NA
6054320	6054321	BAM_4900	BAM_4901		dnaE	TRUE	0.873	104.000	0.127	1.000	N	NA
6054322	6054323	BAM_4902	BAM_4903			TRUE	0.769	-3.000	0.481	NA		NA
6054324	6054325	BAM_4904	BAM_4905			FALSE	0.526	93.000	0.038	NA		NA
6054327	6054328	BAM_4907	BAM_4908			FALSE	0.274	181.000	0.000	NA		NA
6054328	6054329	BAM_4908	BAM_4909			FALSE	0.235	194.000	0.120	NA		NA
6054333	6054334	BAM_4913	BAM_4914			TRUE	0.666	21.000	0.300	NA		NA
6054336	6054337	BAM_4916	BAM_4917			FALSE	0.012	392.000	0.000	NA		NA
6054337	6054338	BAM_4917	BAM_4918			FALSE	0.422	73.000	0.160	NA		NA
6054338	6054339	BAM_4918	BAM_4919			TRUE	0.739	3.000	0.280	NA		NA
6054339	6054340	BAM_4919	BAM_4920			TRUE	0.718	-3.000	0.368	NA		NA
6054340	6054341	BAM_4920	BAM_4921			FALSE	0.499	45.000	0.316	NA		NA
6054342	6054343	BAM_4922	BAM_4923			TRUE	0.812	-3.000	0.600	NA		NA
6054344	6054345	BAM_4924	BAM_4925	ald2		FALSE	0.357	214.000	0.000	1.000	N	NA
6054349	6054350	BAM_4929	BAM_4930		argH2	FALSE	0.571	99.000	0.006	NA		NA
6054350	6054351	BAM_4930	BAM_4931	argH2	argG	TRUE	0.960	-3.000	0.278	1.000	Y	NA
6054352	6054353	BAM_4932	BAM_4933			FALSE	0.581	16.000	0.000	NA		NA
6054355	6054356	BAM_4935	BAM_4936			FALSE	0.006	632.000	0.000	NA		NA
6054358	6054359	BAM_4938	BAM_4939			FALSE	0.412	72.000	0.125	NA		NA
6054360	6054361	BAM_4940	BAM_4941	ackA		FALSE	0.128	299.000	0.217	1.000	N	NA
6054361	6054362	BAM_4941	BAM_4942			FALSE	0.472	200.000	0.089	1.000	N	NA
6054362	6054363	BAM_4942	BAM_4943			TRUE	0.650	135.000	0.018	NA		NA
6054363	6054364	BAM_4943	BAM_4944			TRUE	0.875	13.000	0.800	NA		NA
6054366	6054367	BAM_4946	BAM_4947			FALSE	0.399	70.000	0.146	NA		NA
6054367	6054368	BAM_4947	BAM_4948			TRUE	0.655	103.000	0.156	NA		NA
6054368	6054369	BAM_4948	BAM_4949		sspB	FALSE	0.067	278.000	0.111	1.000		NA
6054369	6054370	BAM_4949	BAM_4950	sspB	thiI	FALSE	0.532	81.000	0.018	1.000		NA
6054370	6054371	BAM_4950	BAM_4951	thiI		TRUE	0.904	7.000	0.349	1.000	N	NA
6054371	6054372	BAM_4951	BAM_4952		ezrA	TRUE	0.706	169.000	0.201	1.000	N	NA
6054376	6054377	BAM_4956	BAM_4957			FALSE	0.362	72.000	0.000	NA		NA
6054379	6054380	BAM_4959	BAM_4960	megL		FALSE	0.048	270.000	0.000	NA		NA
6054384	6054385	BAM_4964	BAM_4965	tyrS1		FALSE	0.013	377.000	0.000	NA		NA
6054385	6054386	BAM_4965	BAM_4966			FALSE	0.347	-19.000	0.059	NA		NA
6054386	6054387	BAM_4966	BAM_4967			FALSE	0.347	-19.000	0.059	NA		NA
6054387	6054388	BAM_4967	BAM_4968		acsA	FALSE	0.043	278.000	0.000	NA		NA
6054389	6054390	BAM_4969	BAM_4970	acuA	acuB	TRUE	0.731	18.000	0.143	0.075		NA
6054390	6054391	BAM_4970	BAM_4971	acuB	acuC	TRUE	0.843	-3.000	0.075	1.000	N	NA
6054392	6054393	BAM_4972	BAM_4973			FALSE	0.145	215.000	0.150	NA		NA
6054393	6054394	BAM_4973	BAM_4974			TRUE	0.982	2.000	0.725	1.000	Y	NA
6054395	6054396	BAM_4975	BAM_4976			FALSE	0.460	80.000	0.049	NA		NA
6054396	6054397	BAM_4976	BAM_4977		mscL	TRUE	0.740	129.000	0.012	1.000		NA
6054399	6054400	BAM_4979	BAM_4980			TRUE	0.805	82.000	0.857	NA		NA
6054400	6054401	BAM_4980	BAM_4981			TRUE	0.850	2.000	0.583	NA		NA
6054402	6054403	BAM_4982	BAM_4983	ccpA		FALSE	0.007	529.000	0.000	NA		NA
6054403	6054404	BAM_4983	BAM_4984			TRUE	0.702	118.000	0.069	NA		NA
6054404	6054405	BAM_4984	BAM_4985			TRUE	0.649	0.000	0.079	NA		NA
6054407	6054408	BAM_4987	BAM_4988			TRUE	0.764	16.000	0.429	NA		NA
6054408	6054409	BAM_4988	BAM_4989			TRUE	0.758	-3.000	0.444	NA		NA
6054409	6054410	BAM_4989	BAM_4990			FALSE	0.545	92.000	0.097	NA		NA
6054410	6054411	BAM_4990	BAM_4991		murC	FALSE	0.472	197.000	0.005	1.000	N	NA
6054411	6054412	BAM_4991	BAM_4992	murC		FALSE	0.215	253.000	0.002	1.000	N	NA
6054412	6054413	BAM_4992	BAM_4993			TRUE	0.674	62.000	0.084	1.000	N	NA
6054413	6054414	BAM_4993	BAM_4994			FALSE	0.104	222.000	0.000	NA		NA
6054414	6054415	BAM_4994	BAM_4995			FALSE	0.028	312.000	0.034	NA		NA
6054415	6054416	BAM_4995	BAM_4996			TRUE	0.790	-3.000	0.511	NA		NA
6054416	6054417	BAM_4996	BAM_4997			FALSE	0.578	59.000	0.500	NA		NA
6054417	6054418	BAM_4997	BAM_4998			FALSE	0.487	84.000	0.062	NA		NA
6054418	6054419	BAM_4998	BAM_4999			FALSE	0.087	242.000	0.084	NA		NA
6054421	6054422	BAM_5001	BAM_5002		trmB	FALSE	0.465	70.000	0.117	1.000		NA
6054424	6054425	BAM_5004	BAM_5005			FALSE	0.264	230.000	0.078	NA	N	NA
6054425	6054426	BAM_5005	BAM_5006			FALSE	0.288	-25.000	0.000	NA		NA
6054426	6054427	BAM_5006	BAM_5007			FALSE	0.635	2.000	0.000	NA		NA
6054427	6054428	BAM_5007	BAM_5008			TRUE	0.873	104.000	0.138	1.000	N	NA
6054430	6054431	BAM_5010	BAM_5011			FALSE	0.473	42.000	0.082	1.000		NA
6054432	6054433	BAM_5012	BAM_5013			FALSE	0.326	-19.000	0.000	NA		NA
6054433	6054434	BAM_5013	BAM_5014			FALSE	0.233	-70.000	0.000	NA		NA
6054435	6054436	BAM_5015	BAM_5016			TRUE	0.792	1.000	0.413	NA		NA
6054438	6054439	BAM_5018	BAM_5019			TRUE	0.719	2.000	0.258	NA		NA
6054440	6054441	BAM_5020	BAM_5021			FALSE	0.224	-440.000	0.000	NA		NA
6054442	6054443	BAM_5022	BAM_5023	gdH	glcU	TRUE	0.931	14.000	0.700	1.000	N	NA
6054443	6054444	BAM_5023	BAM_5024	glcU		TRUE	0.766	37.000	0.875	NA		NA
6054444	6054445	BAM_5024	BAM_5025		moaD3	FALSE	0.526	94.000	0.014	NA		NA
6054445	6054446	BAM_5025	BAM_5026	moaD3	moaE3	TRUE	0.981	3.000	0.501	0.005	Y	NA
6054446	6054447	BAM_5026	BAM_5027	moaE3	mobB	TRUE	0.960	-3.000	0.040	0.005	Y	NA
6054447	6054448	BAM_5027	BAM_5028	mobB	moeA3	TRUE	0.884	-30.000	0.200	0.005	Y	NA
6054450	6054451	BAM_5030	BAM_5031			TRUE	0.978	17.000	0.778	1.000	Y	NA
6054451	6054452	BAM_5031	BAM_5032			FALSE	0.376	175.000	0.000	1.000		NA
6054452	6054453	BAM_5032	BAM_5033			FALSE	0.312	174.000	0.000	NA		NA
6054453	6054454	BAM_5033	BAM_5034			TRUE	0.871	15.000	0.800	NA		NA
6054454	6054455	BAM_5034	BAM_5035			FALSE	0.599	78.000	0.381	NA		NA
6054458	6054459	BAM_5040	BAM_5041		gerHB	TRUE	0.829	18.000	0.450	0.008		NA
6054459	6054460	BAM_5041	BAM_5042	gerHB	gerHC	TRUE	0.733	-24.000	0.800	0.008		NA
6054460	6054461	BAM_5042	BAM_5043	gerHC		TRUE	0.824	91.000	0.800	NA		NA
6054461	6054462	BAM_5043	BAM_5044			FALSE	0.253	190.000	0.121	NA		NA
6054465	6054466	BAM_5047	BAM_5048	leuS		FALSE	0.027	475.000	0.000	NA	N	NA
6054466	6054467	BAM_5048	BAM_5049			FALSE	0.174	370.000	0.000	NA	Y	NA
6054467	6054468	BAM_5049	BAM_5050			TRUE	0.985	4.000	0.875	1.000	Y	NA
6054468	6054469	BAM_5050	BAM_5051			TRUE	0.742	35.000	0.636	1.000		NA
6054469	6054470	BAM_5051	BAM_5052			FALSE	0.023	350.000	0.000	1.000		NA
6054470	6054471	BAM_5052	BAM_5053			TRUE	0.742	19.000	0.333	1.000		NA
6054471	6054472	BAM_5053	BAM_5054			FALSE	0.019	339.000	0.000	NA		NA
6054472	6054473	BAM_5054	BAM_5055			TRUE	0.764	137.000	0.333	NA		NA
6054473	6054474	BAM_5055	BAM_5056			TRUE	0.819	16.000	0.583	NA		NA
6054475	6054476	BAM_5057	BAM_5058			TRUE	0.774	-3.000	0.408	1.000		NA
6054476	6054477	BAM_5058	BAM_5059			FALSE	0.240	198.000	0.031	1.000		NA
6054477	6054478	BAM_5059	BAM_5060			FALSE	0.614	19.000	0.208	NA		NA
6054478	6054479	BAM_5060	BAM_5061			FALSE	0.597	25.000	0.250	NA		NA
6054479	6054480	BAM_5061	BAM_5062			FALSE	0.630	156.000	0.263	1.000		NA
6054481	6054482	BAM_5063	BAM_5064			FALSE	0.360	62.000	0.080	NA		NA
6054485	6054486	BAM_5067	BAM_5068			TRUE	0.651	145.000	0.019	1.000		NA
6054486	6054487	BAM_5068	BAM_5069			TRUE	0.890	13.000	0.333	1.000	N	NA
6054488	6054489	BAM_5070	BAM_5071			TRUE	0.960	-3.000	0.056	0.005	Y	NA
6054490	6054491	BAM_5072	BAM_5073			TRUE	0.775	7.000	0.375	NA		NA
6054493	6054494	BAM_5075	BAM_5076		pckA	TRUE	0.641	3.000	0.005	NA		NA
6054494	6054495	BAM_5076	BAM_5077	pckA		FALSE	0.036	290.000	0.000	NA		NA
6054498	6054499	BAM_5080	BAM_5081			FALSE	0.032	299.000	0.000	NA		NA
6054500	6054501	BAM_5082	BAM_5083			FALSE	0.513	25.000	0.013	NA		NA
6054502	6054503	BAM_5084	BAM_5085			TRUE	0.973	-3.000	0.500	0.012	Y	NA
6054505	6054506	BAM_5087	BAM_5088			FALSE	0.226	-156.000	0.000	NA		NA
6054506	6054507	BAM_5088	BAM_5089			FALSE	0.116	217.000	0.000	NA		NA
6054507	6054508	BAM_5089	BAM_5090			TRUE	0.886	12.000	0.875	NA		NA
6054509	6054510	BAM_5091	BAM_5092			TRUE	0.972	12.000	0.528	NA	Y	NA
6054510	6054511	BAM_5092	BAM_5093			TRUE	0.968	-7.000	0.876	1.000	Y	NA
6054512	6054513	BAM_5094	BAM_5095			FALSE	0.083	237.000	0.000	NA		NA
6054515	6054516	BAM_5097	BAM_5098		mutTA	TRUE	0.688	112.000	0.101	NA		NA
6054516	6054517	BAM_5098	BAM_5099	mutTA		FALSE	0.592	85.000	0.292	NA		NA
6054518	6054519	BAM_5100	BAM_5101			FALSE	0.161	203.000	0.000	NA		NA
6054523	6054524	BAM_5105	BAM_5106	cydA2	cydB2	TRUE	0.967	-10.000	0.939	0.034	Y	NA
6054525	6054526	BAM_5107	BAM_5108			TRUE	0.653	15.000	0.222	NA		NA
6054526	6054527	BAM_5108	BAM_5109			FALSE	0.320	-31.000	0.200	NA		NA
6054528	6054529	BAM_5110	BAM_5111			FALSE	0.304	193.000	0.300	NA		NA
6054530	6054531	BAM_5112	BAM_5113			TRUE	0.657	98.000	0.263	NA		NA
6054531	6054532	BAM_5113	BAM_5114			TRUE	0.725	13.000	0.316	NA		NA
6054532	6054533	BAM_5114	BAM_5115			TRUE	0.655	22.000	0.294	NA		NA
6054533	6054534	BAM_5115	BAM_5116			TRUE	0.769	81.000	0.706	NA		NA
6054536	6054537	BAM_5118	BAM_5119		feoB	TRUE	0.798	17.000	0.517	NA		NA
6054537	6054538	BAM_5119	BAM_5120	feoB		TRUE	0.961	-3.000	0.308	1.000	Y	NA
6054540	6054541	BAM_5122	BAM_5123			TRUE	0.978	-3.000	0.875	1.000	Y	NA
6054541	6054542	BAM_5123	BAM_5124			TRUE	0.855	40.000	0.875	NA	N	NA
6054542	6054543	BAM_5124	BAM_5125			TRUE	0.831	90.000	0.875	NA		NA
6054543	6054544	BAM_5125	BAM_5126			FALSE	0.297	177.000	0.000	NA		NA
6054544	6054545	BAM_5126	BAM_5127			FALSE	0.246	184.000	0.000	NA		NA
6054546	6054547	BAM_5128	BAM_5129	hpt2		FALSE	0.198	259.000	0.015	1.000	N	NA
6054550	6054551	BAM_5132	BAM_5133			TRUE	0.660	18.000	0.262	NA		NA
6054551	6054552	BAM_5133	BAM_5134			FALSE	0.007	535.000	0.000	NA		NA
6054552	6054553	BAM_5134	BAM_5135			TRUE	0.705	75.000	0.667	NA		NA
6054553	6054554	BAM_5135	BAM_5136			FALSE	0.033	297.000	0.000	NA		NA
6054554	6054555	BAM_5136	BAM_5137			TRUE	0.859	0.000	0.667	NA		NA
6054555	6054556	BAM_5137	BAM_5138			TRUE	0.826	143.000	0.500	1.000		NA
6054556	6054557	BAM_5138	BAM_5139			TRUE	0.740	-13.000	0.700	1.000		NA
6054558	6054559	BAM_5140	BAM_5141			FALSE	0.270	202.000	0.000	0.040		NA
6054559	6054560	BAM_5141	BAM_5142			TRUE	0.982	3.000	0.727	1.000	Y	NA
6054560	6054561	BAM_5142	BAM_5143			TRUE	0.861	95.000	0.800	1.000		NA
6054561	6054562	BAM_5143	BAM_5144			TRUE	0.774	75.000	0.700	0.090		NA
6054562	6054563	BAM_5144	BAM_5145			TRUE	0.845	21.000	0.700	1.000		NA
6054563	6054564	BAM_5145	BAM_5146			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6054564	6054565	BAM_5146	BAM_5147			FALSE	0.619	105.000	0.000	NA		NA
6054566	6054567	BAM_5148	BAM_5149		gntP3	TRUE	0.673	169.000	0.667	NA		NA
6054567	6054568	BAM_5149	BAM_5150	gntP3		TRUE	0.734	49.000	0.292	1.000	N	NA
6054568	6054569	BAM_5150	BAM_5151			TRUE	0.898	0.000	0.333	1.000	N	NA
6054569	6054570	BAM_5151	BAM_5152			FALSE	0.577	-7.000	0.283	NA		NA
6054570	6054571	BAM_5152	BAM_5153			TRUE	0.872	2.000	0.679	NA		NA
6054571	6054572	BAM_5153	BAM_5154			TRUE	0.690	-22.000	0.750	1.000		NA
6054572	6054573	BAM_5154	BAM_5155			FALSE	0.020	336.000	0.000	NA		NA
6054573	6054574	BAM_5155	BAM_5156			TRUE	0.731	21.000	0.429	NA		NA
6054574	6054575	BAM_5156	BAM_5157			FALSE	0.007	534.000	0.000	NA		NA
6054575	6054576	BAM_5157	BAM_5158			TRUE	0.895	83.000	0.778	1.000	N	NA
6054576	6054577	BAM_5158	BAM_5159			TRUE	0.970	-7.000	0.778	0.019	Y	NA
6054577	6054578	BAM_5159	BAM_5160			FALSE	0.221	256.000	0.143	1.000	N	NA
6054578	6054579	BAM_5160	BAM_5161			TRUE	0.872	1.000	0.029	1.000	N	NA
6054579	6054580	BAM_5161	BAM_5162		menB	FALSE	0.503	204.000	0.193	0.002	N	NA
6054580	6054581	BAM_5162	BAM_5163	menB		FALSE	0.517	70.000	0.280	1.000		NA
6054581	6054582	BAM_5163	BAM_5164		menD	TRUE	0.755	-3.000	0.355	1.000		NA
6054582	6054583	BAM_5164	BAM_5165	menD	menF	TRUE	0.956	-3.000	0.142	1.000	Y	NA
6054584	6054585	BAM_5166	BAM_5167			TRUE	0.892	110.000	0.250	1.000	N	NA
6054587	6054588	BAM_5169	BAM_5170			FALSE	0.393	165.000	0.010	NA		NA
6054588	6054589	BAM_5170	BAM_5171			FALSE	0.542	77.000	0.300	NA		NA
6054590	6054591	BAM_5172	BAM_5173	glgP	glgA	TRUE	0.961	19.000	0.314	1.000	Y	NA
6054591	6054592	BAM_5173	BAM_5174	glgA	glgD	TRUE	0.940	47.000	0.630	1.000	Y	NA
6054592	6054593	BAM_5174	BAM_5175	glgD	glgC	TRUE	0.962	19.000	0.210	0.001	Y	NA
6054593	6054594	BAM_5175	BAM_5176	glgC	glgB	TRUE	0.903	-25.000	0.296	0.001	Y	NA
6054596	6054597	BAM_5178	BAM_5179	ldh2		FALSE	0.005	654.000	0.000	NA		NA
6054597	6054598	BAM_5179	BAM_5180			TRUE	0.644	5.000	0.000	NA		NA
6054598	6054599	BAM_5180	BAM_5181			TRUE	0.637	6.000	0.000	NA		NA
6054599	6054600	BAM_5181	BAM_5182			TRUE	0.637	6.000	0.000	NA		NA
6054600	6054601	BAM_5182	BAM_5183			FALSE	0.629	7.000	0.000	NA		NA
6054601	6054602	BAM_5183	BAM_5184			FALSE	0.598	13.000	0.000	NA		NA
6054602	6054603	BAM_5184	BAM_5185			FALSE	0.615	10.000	0.000	NA		NA
6054603	6054604	BAM_5185	BAM_5186			FALSE	0.589	15.000	0.000	NA		NA
6054604	6054605	BAM_5186	BAM_5187			FALSE	0.598	13.000	0.000	NA		NA
6054605	6054606	BAM_5187	BAM_5188			FALSE	0.628	1.000	0.000	NA		NA
6054606	6054607	BAM_5188	BAM_5189			FALSE	0.494	27.000	0.000	NA		NA
6054607	6054608	BAM_5189	BAM_5190			FALSE	0.564	18.000	0.000	NA		NA
6054608	6054609	BAM_5190	BAM_5191			TRUE	0.645	4.000	0.000	NA		NA
6054609	6054610	BAM_5191	BAM_5192			FALSE	0.581	16.000	0.000	NA		NA
6054610	6054611	BAM_5192	BAM_5193			FALSE	0.603	12.000	0.000	NA		NA
6054611	6054612	BAM_5193	BAM_5194			FALSE	0.629	7.000	0.000	NA		NA
6054612	6054613	BAM_5194	BAM_5195			FALSE	0.635	2.000	0.000	NA		NA
6054613	6054614	BAM_5195	BAM_5196			FALSE	0.581	16.000	0.000	NA		NA
6054614	6054615	BAM_5196	BAM_5197			FALSE	0.503	26.000	0.000	NA		NA
6054615	6054616	BAM_5197	BAM_5198			FALSE	0.538	21.000	0.000	NA		NA
6054616	6054617	BAM_5198	BAM_5199			FALSE	0.619	9.000	0.000	NA		NA
6054617	6054618	BAM_5199	BAM_5200			TRUE	0.645	4.000	0.000	NA		NA
6054618	6054619	BAM_5200	BAM_5201		rrfK	TRUE	0.645	4.000	0.000	NA		NA
6054621	6054622	BAM_5203	BAM_5204	rrsK		FALSE	0.488	-6.000	0.000	NA		NA
6054622	6054623	BAM_5204	BAM_5205			FALSE	0.391	37.000	0.000	NA		NA
6054624	6054625	BAM_5206	BAM_5208	sapB		TRUE	0.665	96.000	0.212	1.000		NA
6054626	6054627	BAM_5207	BAM_5209		pgi	TRUE	0.639	108.000	0.027	NA		NA
6054629	6054630	BAM_5211	BAM_5212	yugI		FALSE	0.215	254.000	0.033	1.000	N	NA
6054630	6054631	BAM_5212	BAM_5213			TRUE	0.936	-3.000	0.894	1.000	N	NA
6054632	6054633	BAM_5214	BAM_5215			TRUE	0.741	110.000	0.117	1.000		NA
6054636	6054637	BAM_5218	BAM_5219	sodC		FALSE	0.405	48.000	0.163	NA		NA
6054642	6054643	BAM_5224	BAM_5225			FALSE	0.340	171.000	0.024	NA		NA
6054643	6054644	BAM_5225	BAM_5226		glyS	FALSE	0.357	46.000	0.004	NA		NA
6054646	6054647	BAM_5228	BAM_5229			FALSE	0.479	51.000	0.308	NA		NA
6054647	6054648	BAM_5229	BAM_5230			FALSE	0.568	148.000	0.077	NA		NA
6054649	6054650	BAM_5231	BAM_5232	gtaB		TRUE	0.875	109.000	0.037	1.000	N	NA
6054652	6054653	BAM_5234	BAM_5235	pepA		TRUE	0.661	147.000	0.111	1.000		NA
6054653	6054654	BAM_5235	BAM_5236			FALSE	0.499	54.000	0.361	NA		NA
6054654	6054655	BAM_5236	BAM_5237			TRUE	0.646	-3.000	0.250	NA		NA
6054655	6054656	BAM_5237	BAM_5238			TRUE	0.906	124.000	0.208	1.000	N	NA
6054659	6054660	BAM_5241	BAM_5242			FALSE	0.316	176.000	0.043	NA		NA
6054663	6054664	BAM_5245	BAM_5246			FALSE	0.627	107.000	0.000	NA		NA
6054666	6054667	BAM_5248	BAM_5249		dapF	FALSE	0.375	42.000	0.020	NA		NA
6054667	6054668	BAM_5249	BAM_5250	dapF		FALSE	0.074	244.000	0.002	NA		NA
6054669	6054670	BAM_5251	BAM_5252			FALSE	0.101	231.000	0.075	NA		NA
6054670	6054671	BAM_5252	BAM_5253			FALSE	0.358	55.000	0.062	NA		NA
6054671	6054672	BAM_5253	BAM_5254			FALSE	0.368	-16.000	0.053	NA		NA
6054673	6054674	BAM_5255	BAM_5256	phnA		FALSE	0.085	236.000	0.000	NA		NA
6054674	6054675	BAM_5256	BAM_5257			FALSE	0.028	308.000	0.000	NA		NA
6054676	6054677	BAM_5258	BAM_5259			TRUE	0.768	25.000	0.571	NA		NA
6054678	6054679	BAM_5260	BAM_5261			TRUE	0.818	114.000	0.429	NA		NA
6054679	6054680	BAM_5261	BAM_5262			TRUE	0.741	99.000	0.400	NA		NA
6054680	6054681	BAM_5262	BAM_5263			FALSE	0.390	53.000	0.127	NA		NA
6054682	6054683	BAM_5264	BAM_5265			FALSE	0.010	435.000	0.019	NA		NA
6054688	6054689	BAM_5270	BAM_5271			TRUE	0.879	110.000	0.059	1.000	N	NA
6054689	6054690	BAM_5271	BAM_5272			FALSE	0.392	72.000	0.074	NA		NA
6054691	6054692	BAM_5273	BAM_5274	fbp1		TRUE	0.732	18.000	0.394	NA		NA
6054692	6054693	BAM_5274	BAM_5275			FALSE	0.014	373.000	0.000	NA		NA
6054699	6054700	BAM_5281	BAM_5282			FALSE	0.484	75.000	0.259	NA		NA
6054703	6054704	BAM_5285	BAM_5286			FALSE	0.396	55.000	0.221	NA		NA
6054704	6054705	BAM_5286	BAM_5287			FALSE	0.406	66.000	0.241	NA		NA
6054706	6054707	BAM_5288	BAM_5289			FALSE	0.055	264.000	0.000	NA		NA
6054707	6054708	BAM_5289	BAM_5290			TRUE	0.750	0.000	0.333	NA		NA
6054709	6054710	BAM_5291	BAM_5292	sufB	sufA	TRUE	0.750	49.000	0.152	0.001	N	NA
6054710	6054711	BAM_5292	BAM_5293	sufA	sufS	TRUE	0.783	-10.000	0.292	1.000	N	NA
6054711	6054712	BAM_5293	BAM_5294	sufS	sufD	TRUE	0.930	0.000	0.606	1.000	N	NA
6054712	6054713	BAM_5294	BAM_5295	sufD	sufC	TRUE	0.960	16.000	0.139	1.000	Y	NA
6054713	6054714	BAM_5295	BAM_5296	sufC		FALSE	0.222	240.000	0.000	NA	N	NA
6054714	6054715	BAM_5296	BAM_5297			TRUE	0.945	73.000	0.750	NA	Y	NA
6054715	6054716	BAM_5297	BAM_5298			TRUE	0.941	24.000	0.074	NA	Y	NA
6054716	6054717	BAM_5298	BAM_5299			TRUE	0.960	-7.000	0.642	1.000	Y	NA
6054719	6054720	BAM_5301	BAM_5302			FALSE	0.600	155.000	0.131	1.000		NA
6054720	6054721	BAM_5302	BAM_5303			TRUE	0.842	4.000	0.443	1.000		NA
6054723	6054724	BAM_5305	BAM_5306	gcvH		FALSE	0.368	42.000	0.000	NA		NA
6054724	6054725	BAM_5306	BAM_5307			FALSE	0.296	-24.000	0.000	NA		NA
6054725	6054726	BAM_5307	BAM_5308			FALSE	0.007	531.000	0.000	NA		NA
6054726	6054727	BAM_5308	BAM_5309			TRUE	0.771	11.000	0.400	NA		NA
6054727	6054728	BAM_5309	BAM_5310			FALSE	0.538	21.000	0.000	NA		NA
6054728	6054729	BAM_5310	BAM_5311			FALSE	0.368	42.000	0.000	NA		NA
6054729	6054730	BAM_5311	BAM_5312			FALSE	0.448	81.000	0.000	NA		NA
6054730	6054731	BAM_5312	BAM_5313			FALSE	0.589	15.000	0.000	NA		NA
6054731	6054732	BAM_5313	BAM_5314			FALSE	0.603	12.000	0.000	NA		NA
6054732	6054733	BAM_5314	BAM_5315			FALSE	0.340	53.000	0.000	NA		NA
6054735	6054736	BAM_5317	BAM_5318		ldh3	TRUE	0.670	23.000	0.333	NA		NA
6054736	6054737	BAM_5318	BAM_5319	ldh3		FALSE	0.072	246.000	0.000	NA		NA
6054737	6054738	BAM_5319	BAM_5320			TRUE	0.876	14.000	0.828	NA		NA
6054738	6054739	BAM_5320	BAM_5321			FALSE	0.602	147.000	0.185	NA		NA
6054739	6054740	BAM_5321	BAM_5322			FALSE	0.006	588.000	0.000	NA		NA
6054740	6054741	BAM_5322	BAM_5323			TRUE	0.791	4.000	0.289	1.000		NA
6054741	6054742	BAM_5323	BAM_5324			TRUE	0.730	139.000	0.156	1.000		NA
6054742	6054743	BAM_5324	BAM_5325			FALSE	0.520	153.000	0.061	NA		NA
6054743	6054744	BAM_5325	BAM_5326			TRUE	0.637	6.000	0.000	NA		NA
6054744	6054745	BAM_5326	BAM_5327			TRUE	0.968	22.000	0.588	1.000	Y	NA
6054745	6054746	BAM_5327	BAM_5328			FALSE	0.560	98.000	0.000	NA		NA
6054747	6054748	BAM_5329	BAM_5330			FALSE	0.477	88.000	0.000	NA		NA
6054749	6054750	BAM_5331	BAM_5332			FALSE	0.028	310.000	0.000	NA		NA
6054750	6054751	BAM_5332	BAM_5333			FALSE	0.358	49.000	0.021	NA		NA
6054751	6054752	BAM_5333	BAM_5334			FALSE	0.430	78.000	0.024	NA		NA
6054754	6054755	BAM_5336	BAM_5337			FALSE	0.061	256.000	0.000	NA		NA
6054755	6054756	BAM_5337	BAM_5338			FALSE	0.499	80.000	0.200	NA		NA
6054756	6054757	BAM_5338	BAM_5339			TRUE	0.907	120.000	0.233	1.000	N	NA
6054757	6054758	BAM_5339	BAM_5340			FALSE	0.008	596.000	0.000	1.000		NA
6054758	6054759	BAM_5340	BAM_5341		spoIIIJ1	TRUE	0.733	130.000	0.003	1.000		NA
6054759	6054760	BAM_5341	BAM_5342	spoIIIJ1		TRUE	0.824	29.000	0.889	NA		NA
6054761	6054762	BAM_5343	BAM_5344			FALSE	0.021	332.000	0.000	NA		NA
6054763	6054764	BAM_5345	BAM_5346			FALSE	0.603	97.000	0.167	NA		NA
6054764	6054765	BAM_5346	BAM_5347			TRUE	0.757	13.000	0.389	NA		NA
6054765	6054766	BAM_5347	BAM_5348			FALSE	0.467	-10.000	0.149	NA		NA
6054769	6054770	BAM_5351	BAM_5352			TRUE	0.777	31.000	0.727	NA		NA
6054770	6054771	BAM_5352	BAM_5353			FALSE	0.015	365.000	0.000	NA		NA
6054771	6054772	BAM_5353	BAM_5354			TRUE	0.921	-22.000	0.571	1.000	Y	NA
6054772	6054773	BAM_5354	BAM_5355			TRUE	0.862	140.000	0.500	0.087		NA
6054775	6054776	BAM_5357	BAM_5358			FALSE	0.014	414.000	0.000	1.000		NA
6054776	6054777	BAM_5358	BAM_5359			TRUE	0.721	118.000	0.167	NA		NA
6054778	6054779	BAM_5360	BAM_5361	nprB		FALSE	0.533	156.000	0.214	NA		NA
6054779	6054780	BAM_5361	BAM_5362			FALSE	0.458	52.000	0.286	NA		NA
6054780	6054781	BAM_5362	BAM_5363			TRUE	0.788	113.000	0.364	NA		NA
6054781	6054782	BAM_5363	BAM_5364			TRUE	0.673	164.000	0.556	NA		NA
6054782	6054783	BAM_5364	BAM_5365			TRUE	0.958	-12.000	0.875	1.000	Y	NA
6054783	6054784	BAM_5365	BAM_5366			FALSE	0.637	57.000	0.625	NA		NA
6054785	6054786	BAM_5367	BAM_5368			FALSE	0.363	213.000	0.000	1.000	N	NA
6054786	6054787	BAM_5368	BAM_5369			FALSE	0.024	319.000	0.000	NA		NA
6054788	6054789	BAM_5370	BAM_5371			FALSE	0.315	-34.000	0.222	NA		NA
6054789	6054790	BAM_5371	BAM_5372			FALSE	0.465	30.000	0.010	NA		NA
6054791	6054792	BAM_5373	BAM_5374			FALSE	0.347	54.000	0.029	NA		NA
6054792	6054793	BAM_5374	BAM_5375			FALSE	0.535	148.000	0.000	NA		NA
6054793	6054794	BAM_5375	BAM_5376			FALSE	0.570	99.000	0.000	NA		NA
6054797	6054798	BAM_1532	BAM_1533		recQ1	FALSE	0.457	-10.000	0.103	NA		NA
6054798	6054799	BAM_1533	BAM_1534	recQ1		TRUE	0.669	0.000	0.192	NA		NA
6054799	6054800	BAM_1534	BAM_1535			TRUE	0.662	23.000	0.320	NA		NA
6054800	6054801	BAM_1535	BAM_1536			FALSE	0.334	67.000	0.000	NA		NA
6054801	6054802	BAM_1536	BAM_1537			FALSE	0.266	-33.000	0.000	NA		NA
6054802	6054803	BAM_1537	BAM_1538			FALSE	0.617	0.000	0.000	NA		NA
6054803	6054804	BAM_1538	BAM_1539			TRUE	0.796	78.000	0.417	NA	N	NA
6054804	6054805	BAM_1539	BAM_1540		gudB	FALSE	0.170	268.000	0.222	NA	N	NA
6054805	6054806	BAM_1540	BAM_1541	gudB		FALSE	0.506	79.000	0.233	NA		NA
6054806	6054807	BAM_1541	BAM_1542			TRUE	0.808	93.000	0.700	NA		NA
6054807	6054808	BAM_1542	BAM_1543			FALSE	0.440	80.000	0.000	NA		NA
6054808	6054809	BAM_1543	BAM_1544			FALSE	0.343	170.000	0.000	NA		NA
6054811	6054812	BAM_1546	BAM_1547		cmk	TRUE	0.672	130.000	0.016	NA		NA
6054812	6054813	BAM_1547	BAM_1548	cmk	rpsA	FALSE	0.080	334.000	0.047	1.000	N	NA
6054813	6054814	BAM_1548	BAM_1549	rpsA		TRUE	0.860	13.000	0.061	1.000	N	NA
6054816	6054817	BAM_1551	BAM_1552			TRUE	0.729	-7.000	0.567	NA		NA
6054817	6054818	BAM_1552	BAM_1553			TRUE	0.819	-3.000	0.633	NA		NA
6054818	6054819	BAM_1553	BAM_1554			TRUE	0.688	125.000	0.014	NA		NA
6054819	6054820	BAM_1554	BAM_1555		gpsA	TRUE	0.652	19.000	0.068	1.000		NA
6054820	6054821	BAM_1555	BAM_1556	gpsA		TRUE	0.684	117.000	0.039	NA		NA
6054821	6054822	BAM_1556	BAM_1557			FALSE	0.051	267.000	0.000	NA		NA
6054822	6054823	BAM_1557	BAM_1558			TRUE	0.688	65.000	0.771	NA		NA
6054823	6054824	BAM_1558	BAM_1559		spoIVA	FALSE	0.085	243.000	0.081	NA		NA
6054824	6054825	BAM_1559	BAM_1560	spoIVA	hup1	FALSE	0.032	299.000	0.000	NA		NA
6054825	6054826	BAM_1560	BAM_1561	hup1	mtrA	TRUE	0.904	121.000	0.154	1.000	N	NA
6054826	6054827	BAM_1561	BAM_1562	mtrA		FALSE	0.093	258.000	0.114	1.000		NA
6054827	6054828	BAM_1562	BAM_1563		menG	TRUE	0.804	30.000	0.708	1.000		NA
6054828	6054829	BAM_1563	BAM_1564	menG	hepT	TRUE	0.949	32.000	0.476	1.000	Y	NA
6054829	6054830	BAM_1564	BAM_1565	hepT		TRUE	0.899	125.000	0.054	1.000	N	NA
6054830	6054831	BAM_1565	BAM_1566		aroC1	FALSE	0.164	271.000	0.002	1.000	N	NA
6054831	6054832	BAM_1566	BAM_1567	aroC1	aroB	TRUE	0.970	0.000	0.110	0.001	Y	NA
6054832	6054833	BAM_1567	BAM_1568	aroB	hisC1	TRUE	0.969	132.000	0.009	1.000	Y	NA
6054833	6054834	BAM_1568	BAM_1569	hisC1		FALSE	0.036	313.000	0.000	1.000		NA
6054834	6054835	BAM_1569	BAM_1570			FALSE	0.553	74.000	0.375	NA		NA
6054835	6054836	BAM_1570	BAM_1571			TRUE	0.756	154.000	0.583	NA		NA
6054836	6054837	BAM_1571	BAM_1572		qcrA	TRUE	0.807	144.000	0.540	NA		NA
6054837	6054838	BAM_1572	BAM_1573	qcrA	qcrB	TRUE	0.860	1.000	0.447	0.032		NA
6054838	6054839	BAM_1573	BAM_1574	qcrB	qcrC	FALSE	0.541	44.000	0.095	0.032		NA
6054839	6054840	BAM_1574	BAM_1575	qcrC		FALSE	0.366	43.000	0.005	NA		NA
6054840	6054841	BAM_1575	BAM_1576			FALSE	0.309	-24.000	0.036	NA		NA
6054841	6054842	BAM_1576	BAM_1577			FALSE	0.549	26.000	0.104	NA		NA
6054842	6054843	BAM_1577	BAM_1578			TRUE	0.671	108.000	0.104	NA		NA
6054843	6054844	BAM_1578	BAM_1579			FALSE	0.323	-22.000	0.050	NA		NA
6054844	6054845	BAM_1579	BAM_1580			FALSE	0.604	102.000	0.020	NA		NA
6054847	6054848	BAM_1582	BAM_1583		dapB	FALSE	0.634	0.000	0.044	NA		NA
6054848	6054849	BAM_1583	BAM_1584	dapB	mgsA	TRUE	0.874	15.000	0.044	0.036	N	NA
6054849	6054850	BAM_1584	BAM_1585	mgsA		FALSE	0.636	12.000	0.081	NA		NA
6054850	6054851	BAM_1585	BAM_1586			FALSE	0.620	-3.000	0.210	NA		NA
6054851	6054852	BAM_1586	BAM_1587			TRUE	0.726	-13.000	0.126	1.000	N	NA
6054852	6054853	BAM_1587	BAM_1588		birA	TRUE	0.714	-15.000	0.134	1.000	N	NA
6054855	6054856	BAM_1590	BAM_1591	panB	panC	TRUE	0.970	-3.000	0.395	0.001	Y	NA
6054856	6054857	BAM_1591	BAM_1592	panC	panD	TRUE	0.968	13.000	0.342	1.000	Y	NA
6054857	6054858	BAM_1592	BAM_1593	panD		TRUE	0.672	129.000	0.000	NA		NA
6054858	6054859	BAM_1593	BAM_1594			FALSE	0.252	-37.000	0.000	NA		NA
6054859	6054860	BAM_1594	BAM_1595			FALSE	0.067	251.000	0.000	NA		NA
6054860	6054861	BAM_1595	BAM_1596			TRUE	0.732	8.000	0.289	NA		NA
6054861	6054862	BAM_1596	BAM_1597		aspB	TRUE	0.712	19.000	0.367	NA		NA
6054862	6054863	BAM_1597	BAM_1598	aspB	dnaD	TRUE	0.885	122.000	0.072	NA	N	NA
6054863	6054864	BAM_1598	BAM_1599	dnaD	nth	TRUE	0.954	16.000	0.075	NA	Y	NA
6054864	6054865	BAM_1599	BAM_1600	nth		TRUE	0.657	4.000	0.034	NA		NA
6054866	6054867	BAM_1601	BAM_1602		recU	FALSE	0.422	66.000	0.056	1.000		NA
6054868	6054869	BAM_1603	BAM_1605			FALSE	0.068	250.000	0.000	NA		NA
6054871	6054872	BAM_1606	BAM_1607			FALSE	0.633	16.000	0.148	NA		NA
6054874	6054875	BAM_1609	BAM_1610			FALSE	0.620	155.000	0.318	NA		NA
6054875	6054876	BAM_1610	BAM_1611			FALSE	0.361	57.000	0.074	NA		NA
6054876	6054877	BAM_1611	BAM_1612			TRUE	0.804	98.000	0.579	NA		NA
6054877	6054878	BAM_1612	BAM_5813			TRUE	0.684	122.000	0.000	NA		NA
6054878	6054879	BAM_5813	BAM_1613			FALSE	0.234	186.000	0.000	NA		NA
6054879	6054880	BAM_1613	BAM_1614			FALSE	0.332	62.000	0.014	NA		NA
6054880	6054881	BAM_1614	BAM_1615			TRUE	0.707	138.000	0.250	NA		NA
6054881	6054882	BAM_1615	BAM_1616			TRUE	0.879	106.000	0.118	1.000	N	NA
6054882	6054883	BAM_1616	BAM_1617			FALSE	0.433	46.000	0.000	1.000		NA
6054885	6054886	BAM_1619	BAM_1620	maP2		FALSE	0.214	198.000	0.115	NA		NA
6054886	6054887	BAM_1620	BAM_1621		xpt	FALSE	0.593	15.000	0.014	NA		NA
6054887	6054888	BAM_1621	BAM_1622	xpt	pbuX	TRUE	0.968	4.000	0.056	1.000	Y	NA
6054889	6054890	BAM_1623	BAM_1624			FALSE	0.397	164.000	0.000	NA		NA
6054891	6054892	BAM_1625	BAM_1626			FALSE	0.196	195.000	0.000	NA		NA
6054894	6054895	BAM_1628	BAM_1629			FALSE	0.560	22.000	0.069	NA		NA
6054895	6054896	BAM_1629	BAM_1630			TRUE	0.658	3.000	0.046	NA		NA
6054898	6054899	BAM_1632	BAM_1633			FALSE	0.477	88.000	0.000	NA		NA
6054899	6054900	BAM_1633	BAM_1634			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6054900	6054901	BAM_1634	BAM_1635			FALSE	0.005	693.000	0.000	NA		NA
6054901	6054902	BAM_1635	BAM_1636			TRUE	0.764	131.000	0.157	1.000		NA
6054902	6054903	BAM_1636	BAM_1637			FALSE	0.017	357.000	0.039	NA		NA
6054903	6054904	BAM_1637	BAM_1638			FALSE	0.020	337.000	0.000	NA		NA
6054904	6054905	BAM_1638	BAM_1639			TRUE	0.943	1.000	0.750	1.000	N	NA
6054905	6054906	BAM_1639	BAM_1640			FALSE	0.460	-7.000	0.000	NA		NA
6054906	6054907	BAM_1640	BAM_1641			FALSE	0.337	54.000	0.000	NA		NA
6054907	6054908	BAM_1641	BAM_1642			FALSE	0.555	19.000	0.000	NA		NA
6054908	6054909	BAM_1642	BAM_1643			TRUE	0.670	43.000	0.625	NA		NA
6054909	6054910	BAM_1643	BAM_1644			TRUE	0.835	4.000	0.500	NA		NA
6054910	6054911	BAM_1644	BAM_1645			FALSE	0.304	-25.000	0.046	NA		NA
6054911	6054912	BAM_1645	BAM_1646			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6054912	6054913	BAM_1646	BAM_1647			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6054913	6054914	BAM_1647	BAM_1648			FALSE	0.430	-9.000	0.000	NA		NA
6054914	6054915	BAM_1648	BAM_1649			FALSE	0.511	93.000	0.000	NA		NA
6054920	6054921	BAM_1653	BAM_1655			FALSE	0.222	-906.000	0.000	NA		NA
6054921	6054922	BAM_1655	BAM_1656		rnhA	FALSE	0.623	8.000	0.000	NA		NA
6054922	6054923	BAM_1656	BAM_1657	rnhA		FALSE	0.428	33.000	0.000	NA		NA
6054924	6054925	BAM_1658	BAM_1659			FALSE	0.636	144.000	0.200	NA		NA
6054925	6054926	BAM_1659	BAM_1660			TRUE	0.853	13.000	0.680	NA		NA
6054927	6054928	BAM_1661	BAM_1662		cspB1	TRUE	0.882	120.000	0.619	NA		NA
6054929	6054930	BAM_1663	BAM_1664			FALSE	0.482	70.000	0.308	NA		NA
6054930	6054931	BAM_1664	BAM_1665			TRUE	0.769	20.000	0.500	NA		NA
6054931	6054932	BAM_1665	BAM_1666			FALSE	0.539	80.000	0.259	NA		NA
6054932	6054933	BAM_1666	BAM_1667			FALSE	0.101	224.000	0.000	NA		NA
6054933	6054934	BAM_1667	BAM_1668			TRUE	0.817	3.000	0.455	NA		NA
6054934	6054935	BAM_1668	BAM_1669			FALSE	0.417	187.000	0.364	1.000		NA
6054935	6054936	BAM_1669	BAM_1670			FALSE	0.617	0.000	0.000	NA		NA
6054936	6054937	BAM_1670	BAM_1671			FALSE	0.377	-13.000	0.000	NA		NA
6054939	6054940	BAM_1673	BAM_1674			TRUE	0.677	98.000	0.188	1.000		NA
6054940	6054941	BAM_1674	BAM_1675			TRUE	0.886	139.000	0.250	1.000	N	NA
6054943	6054944	BAM_1677	BAM_1678			FALSE	0.264	-79.000	0.100	NA		NA
6054944	6054945	BAM_1678	BAM_1679			TRUE	0.686	146.000	0.300	NA		NA
6054945	6054946	BAM_1679	BAM_1680			FALSE	0.055	274.000	0.143	NA		NA
6054946	6054947	BAM_1680	BAM_1681			FALSE	0.398	51.000	0.190	NA		NA
6054948	6054949	BAM_1682	BAM_1683			TRUE	0.694	125.000	0.031	NA		NA
6054949	6054950	BAM_1683	BAM_1684			TRUE	0.691	20.000	0.333	NA		NA
6054950	6054951	BAM_1684	BAM_1685			TRUE	0.717	129.000	0.118	NA		NA
6054951	6054952	BAM_1685	BAM_1686			TRUE	0.673	8.000	0.147	NA		NA
6054952	6054953	BAM_1686	BAM_1687			FALSE	0.591	167.000	0.444	NA		NA
6054954	6054955	BAM_1688	BAM_1689		hfq1	TRUE	0.699	54.000	0.778	NA		NA
6054957	6054958	BAM_1691	BAM_1692			FALSE	0.523	23.000	0.000	NA		NA
6054958	6054959	BAM_1692	BAM_1693			TRUE	0.821	151.000	0.143	1.000	N	NA
6054959	6054960	BAM_1693	BAM_1694			TRUE	0.667	130.000	0.000	NA		NA
6054960	6054961	BAM_1694	BAM_1695			FALSE	0.277	-30.000	0.000	NA		NA
6054961	6054962	BAM_1695	BAM_1696			FALSE	0.312	174.000	0.000	NA		NA
6054962	6054963	BAM_1696	BAM_1697			FALSE	0.462	30.000	0.000	NA		NA
6054963	6054964	BAM_1697	BAM_1698			TRUE	0.830	28.000	0.889	NA		NA
6054965	6054966	BAM_1699	BAM_1700	cheR		FALSE	0.360	45.000	0.000	NA		NA
6054967	6054968	BAM_1701	BAM_1702			FALSE	0.573	17.000	0.000	NA		NA
6054968	6054969	BAM_1702	BAM_1703			FALSE	0.515	24.000	0.000	NA		NA
6054969	6054970	BAM_1703	BAM_1704			FALSE	0.564	18.000	0.000	NA		NA
6054970	6054971	BAM_1704	BAM_1705			FALSE	0.152	205.000	0.000	NA		NA
6054971	6054972	BAM_1705	BAM_1706			FALSE	0.348	50.000	0.000	NA		NA
6054972	6054973	BAM_1706	BAM_1707			FALSE	0.546	20.000	0.000	NA		NA
6054973	6054974	BAM_1707	BAM_1708			TRUE	0.954	23.000	0.000	0.001	Y	NA
6054974	6054975	BAM_1708	BAM_1709			FALSE	0.413	-10.000	0.000	NA		NA
6054975	6054976	BAM_1709	BAM_1710		flgB	FALSE	0.014	370.000	0.000	NA		NA
6054976	6054977	BAM_1710	BAM_1711	flgB	flgC	TRUE	0.979	21.000	0.804	0.002	Y	NA
6054977	6054978	BAM_1711	BAM_1712	flgC		TRUE	0.963	17.000	0.068	0.002	Y	NA
6054978	6054979	BAM_1712	BAM_1713			FALSE	0.523	23.000	0.000	NA		NA
6054979	6054980	BAM_1713	BAM_1714			FALSE	0.399	36.000	0.000	NA		NA
6054980	6054981	BAM_1714	BAM_1715		fliG	FALSE	0.593	14.000	0.000	NA		NA
6054981	6054982	BAM_1715	BAM_1716	fliG		FALSE	0.609	-13.000	0.471	NA		NA
6054982	6054983	BAM_1716	BAM_1717			FALSE	0.613	-3.000	0.129	NA		NA
6054983	6054984	BAM_1717	BAM_1718			TRUE	0.693	117.000	0.061	NA		NA
6054984	6054985	BAM_1718	BAM_1719			FALSE	0.609	11.000	0.000	NA		NA
6054985	6054986	BAM_1719	BAM_1720			FALSE	0.337	54.000	0.000	NA		NA
6054986	6054987	BAM_1720	BAM_1721			TRUE	0.645	4.000	0.000	NA		NA
6054987	6054988	BAM_1721	BAM_1722			FALSE	0.581	22.000	0.117	NA		NA
6054988	6054989	BAM_1722	BAM_1723			FALSE	0.402	50.000	0.195	NA		NA
6054989	6054990	BAM_1723	BAM_1724			FALSE	0.028	308.000	0.000	NA		NA
6054990	6054991	BAM_1724	BAM_1725			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6054991	6054992	BAM_1725	BAM_1726			TRUE	0.684	125.000	0.000	NA		NA
6054992	6054993	BAM_1726	BAM_1727			FALSE	0.006	637.000	0.000	NA		NA
6054993	6054994	BAM_1727	BAM_1728			FALSE	0.005	1082.000	0.000	NA		NA
6054994	6054995	BAM_1728	BAM_1729			FALSE	0.363	-15.000	0.000	NA		NA
6054995	6054996	BAM_1729	BAM_1730			FALSE	0.326	-19.000	0.000	NA		NA
6054996	6054997	BAM_1730	BAM_1731			FALSE	0.235	-63.000	0.000	NA		NA
6054997	6054998	BAM_1731	BAM_1732			FALSE	0.488	154.000	0.000	NA		NA
6054998	6054999	BAM_1732	BAM_1733			TRUE	0.678	128.000	0.000	NA		NA
6054999	6055000	BAM_1733	BAM_1734			FALSE	0.087	233.000	0.000	NA		NA
6055000	6055001	BAM_1734	BAM_1735			FALSE	0.005	1252.000	0.000	NA		NA
6055001	6055002	BAM_1735	BAM_1736			FALSE	0.006	607.000	0.000	NA		NA
6055002	6055003	BAM_1736	BAM_1737			FALSE	0.027	311.000	0.000	NA		NA
6055003	6055004	BAM_1737	BAM_1738			FALSE	0.185	197.000	0.000	NA		NA
6055004	6055005	BAM_1738	BAM_1739			FALSE	0.589	101.000	0.000	NA		NA
6055005	6055006	BAM_1739	BAM_1740			FALSE	0.398	76.000	0.000	NA		NA
6055006	6055007	BAM_1740	BAM_1741			FALSE	0.222	188.000	0.000	NA		NA
6055009	6055010	BAM_1743	BAM_1744			TRUE	0.651	134.000	0.000	NA		NA
6055010	6055011	BAM_1744	BAM_1745			FALSE	0.589	15.000	0.000	NA		NA
6055011	6055012	BAM_1745	BAM_1746			FALSE	0.503	26.000	0.000	NA		NA
6055012	6055013	BAM_1746	BAM_1747			FALSE	0.609	11.000	0.000	NA		NA
6055013	6055014	BAM_1747	BAM_1748			TRUE	0.762	13.000	0.400	NA		NA
6055014	6055015	BAM_1748	BAM_1749			FALSE	0.592	-3.000	0.073	NA		NA
6055015	6055016	BAM_1749	BAM_1750			TRUE	0.935	34.000	0.162	0.003	Y	NA
6055016	6055017	BAM_1750	BAM_1751		fliR	FALSE	0.581	16.000	0.000	NA		NA
6055017	6055018	BAM_1751	BAM_1752	fliR		FALSE	0.330	59.000	0.000	NA		NA
6055018	6055019	BAM_1752	BAM_1753			FALSE	0.609	11.000	0.000	NA		NA
6055019	6055020	BAM_1753	BAM_1754		flhA	TRUE	0.955	24.000	0.207	0.003	Y	NA
6055020	6055021	BAM_1754	BAM_1755	flhA		TRUE	0.973	15.000	0.440	0.084	Y	NA
6055021	6055022	BAM_1755	BAM_1756			TRUE	0.904	43.000	0.045	1.000	Y	NA
6055022	6055023	BAM_1756	BAM_1757			TRUE	0.725	118.000	0.200	NA		NA
6055023	6055024	BAM_1757	BAM_1758			TRUE	0.814	18.000	0.600	NA		NA
6055024	6055025	BAM_1758	BAM_1759			TRUE	0.761	-7.000	0.133	NA	N	NA
6055025	6055026	BAM_1759	BAM_1760			FALSE	0.590	-9.000	0.338	NA		NA
6055026	6055027	BAM_1760	BAM_1761			FALSE	0.345	63.000	0.044	NA		NA
6055027	6055028	BAM_1761	BAM_1762			FALSE	0.609	88.000	0.300	NA		NA
6055028	6055029	BAM_1762	BAM_1763			TRUE	0.703	-7.000	0.500	NA		NA
6055030	6055031	BAM_1764	BAM_1765			TRUE	0.724	3.000	0.051	1.000		NA
6055031	6055032	BAM_1765	BAM_1766			FALSE	0.286	189.000	0.034	1.000		NA
6055032	6055033	BAM_1766	BAM_1767			FALSE	0.467	67.000	0.231	1.000		NA
6055034	6055035	BAM_1768	BAM_1769			TRUE	0.841	106.000	0.571	NA		NA
6055036	6055037	BAM_1770	BAM_1771			FALSE	0.473	29.000	0.000	NA		NA
6055038	6055039	BAM_1772	BAM_1773			TRUE	0.760	-22.000	0.419	0.029	N	NA
6055039	6055040	BAM_1773	BAM_1774			TRUE	0.982	13.000	0.750	0.029	Y	NA
6055040	6055041	BAM_1774	BAM_1775			TRUE	0.889	0.000	0.278	1.000	N	NA
6055041	6055042	BAM_1775	BAM_1776			FALSE	0.617	21.000	0.241	NA		NA
6055044	6055045	BAM_1778	BAM_1779			FALSE	0.613	160.000	0.375	NA		NA
6055045	6055046	BAM_1779	BAM_1780			TRUE	0.831	102.000	0.500	1.000		NA
6055046	6055047	BAM_1780	BAM_1781			FALSE	0.396	51.000	0.143	NA		NA
6055047	6055048	BAM_1781	BAM_1782			FALSE	0.501	159.000	0.143	NA		NA
6055048	6055049	BAM_1782	BAM_1783			TRUE	0.657	90.000	0.368	NA		NA
6055050	6055051	BAM_1784	BAM_1785			FALSE	0.593	14.000	0.000	NA		NA
6055051	6055052	BAM_1785	BAM_1786			FALSE	0.348	-16.000	0.000	NA		NA
6055052	6055053	BAM_1786	BAM_1787			FALSE	0.259	-34.000	0.000	NA		NA
6055056	6055057	BAM_1790	BAM_1791			TRUE	0.822	-3.000	0.643	NA		NA
6055059	6055060	BAM_1793	BAM_1794			FALSE	0.213	194.000	0.049	NA		NA
6055061	6055062	BAM_1795	BAM_1796			TRUE	0.855	17.000	0.194	1.000	N	NA
6055062	6055063	BAM_1796	BAM_1797			FALSE	0.286	183.000	0.097	NA		NA
6055064	6055065	BAM_1798	BAM_1799			TRUE	0.864	14.000	0.750	NA		NA
6055065	6055066	BAM_1799	BAM_1800			TRUE	0.700	113.000	0.125	NA		NA
6055066	6055067	BAM_1800	BAM_1801			FALSE	0.521	94.000	0.000	NA		NA
6055067	6055068	BAM_1801	BAM_1802		nhaC2	FALSE	0.598	102.000	0.000	NA		NA
6055068	6055069	BAM_1802	BAM_1803	nhaC2	fumC	FALSE	0.508	256.000	0.003	1.000	Y	NA
6055071	6055072	BAM_1805	BAM_1806			FALSE	0.015	364.000	0.000	NA		NA
6055072	6055073	BAM_1806	BAM_1807			FALSE	0.570	99.000	0.000	NA		NA
6055073	6055074	BAM_1807	BAM_1808			FALSE	0.494	27.000	0.000	NA		NA
6055074	6055075	BAM_1808	BAM_1810			FALSE	0.253	-36.000	0.000	NA		NA
6055077	6055078	BAM_1811	BAM_1812			TRUE	0.678	108.000	0.125	NA		NA
6055078	6055079	BAM_1812	BAM_1813			TRUE	0.879	5.000	0.250	NA	N	NA
6055079	6055080	BAM_1813	BAM_1814		ccdA1	TRUE	0.887	54.000	0.171	NA	Y	NA
6055080	6055081	BAM_1814	BAM_1815	ccdA1		TRUE	0.957	19.000	0.241	1.000	Y	NA
6055081	6055082	BAM_1815	BAM_1816			TRUE	0.642	18.000	0.011	1.000		NA
6055084	6055085	BAM_1818	BAM_1819			TRUE	0.641	3.000	0.000	NA		NA
6055085	6055086	BAM_1819	BAM_1820		dsdA	FALSE	0.203	193.000	0.000	NA		NA
6055086	6055087	BAM_1820	BAM_1821	dsdA		FALSE	0.588	146.000	0.065	NA		NA
6055088	6055089	BAM_1822	BAM_1823			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6055089	6055090	BAM_1823	BAM_1824			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6055090	6055091	BAM_1824	BAM_1825			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6055092	6055093	BAM_1826	BAM_1827			TRUE	0.986	5.000	0.857	0.018	Y	NA
6055093	6055094	BAM_1827	BAM_1828			TRUE	0.954	118.000	0.667	0.092	N	NA
6055094	6055095	BAM_1828	BAM_1829			TRUE	0.715	38.000	0.250	NA	N	NA
6055095	6055096	BAM_1829	BAM_1830			TRUE	0.965	2.000	0.227	NA	Y	NA
6055096	6055097	BAM_1830	BAM_1831			TRUE	0.684	125.000	0.000	NA		NA
6055099	6055100	BAM_1833	BAM_1834		aspA2	TRUE	0.905	25.000	0.700	1.000	N	NA
6055100	6055101	BAM_1834	BAM_1835	aspA2	malS	TRUE	0.839	76.000	0.583	1.000	N	NA
6055101	6055102	BAM_1835	BAM_1836	malS		TRUE	0.677	75.000	0.500	1.000		NA
6055102	6055103	BAM_1836	BAM_1837			TRUE	0.876	3.000	0.600	1.000		NA
6055103	6055104	BAM_1837	BAM_1838			TRUE	0.973	118.000	0.113	1.000	Y	NA
6055105	6055106	BAM_1839	BAM_1840			FALSE	0.007	523.000	0.000	NA		NA
6055107	6055108	BAM_1841	BAM_1842	asnA		FALSE	0.597	142.000	0.000	NA		NA
6055108	6055109	BAM_1842	BAM_1843			FALSE	0.421	78.000	0.000	NA		NA
6055110	6055111	BAM_1844	BAM_1845		dapG1	FALSE	0.017	350.000	0.000	NA		NA
6055111	6055112	BAM_1845	BAM_1846	dapG1		TRUE	0.683	121.000	0.005	NA		NA
6055113	6055114	BAM_1847	BAM_1848			TRUE	0.664	131.000	0.000	NA		NA
6055114	6055115	BAM_1848	BAM_1849			TRUE	0.645	4.000	0.000	NA		NA
6055115	6055116	BAM_1849	BAM_1850			TRUE	0.791	6.000	0.400	NA		NA
6055117	6055118	BAM_1851	BAM_1852			FALSE	0.407	35.000	0.000	NA		NA
6055119	6055120	BAM_1853	BAM_1854			FALSE	0.250	254.000	0.000	0.004	N	NA
6055120	6055121	BAM_1854	BAM_1855			TRUE	0.810	196.000	0.333	NA	Y	NA
6055121	6055122	BAM_1855	BAM_1856			FALSE	0.337	-28.000	0.222	NA		NA
6055124	6055125	BAM_1858	BAM_1859			FALSE	0.483	89.000	0.000	NA		NA
6055125	6055126	BAM_1859	BAM_1860			TRUE	0.684	125.000	0.000	NA		NA
6055126	6055127	BAM_1860	BAM_1861			FALSE	0.366	43.000	0.000	NA		NA
6055129	6055130	BAM_1863	BAM_1864			FALSE	0.011	484.000	0.000	1.000		NA
6055131	6055132	BAM_1865	BAM_1866			FALSE	0.253	183.000	0.000	NA		NA
6055133	6055134	BAM_1867	BAM_1869	fsR	cysK2	FALSE	0.609	11.000	0.000	NA		NA
6055134	6055135	BAM_1869	BAM_1870	cysK2		FALSE	0.532	77.000	0.143	1.000		NA
6055135	6055136	BAM_1870	BAM_1871			TRUE	0.827	93.000	0.778	NA		NA
6055140	6055141	BAM_1875	BAM_1876			FALSE	0.457	181.000	0.412	NA		NA
6055141	6055142	BAM_1876	BAM_1877			TRUE	0.727	11.000	0.300	NA		NA
6055142	6055143	BAM_1877	BAM_1878			FALSE	0.400	-16.000	0.188	NA		NA
6055143	6055144	BAM_1878	BAM_1879			FALSE	0.009	464.000	0.000	NA		NA
6055146	6055147	BAM_1881	BAM_1882			TRUE	0.685	123.000	0.000	NA		NA
6055147	6055148	BAM_1882	BAM_1883			TRUE	0.773	31.000	0.714	NA		NA
6055149	6055150	BAM_1884	BAM_1885	msrA1		TRUE	0.817	92.000	0.194	1.000	N	NA
6055151	6055152	BAM_1886	BAM_1887	ilvE2	ilvB2	TRUE	0.946	23.000	0.017	1.000	Y	NA
6055152	6055153	BAM_1887	BAM_1888	ilvB2		FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6055153	6055154	BAM_1888	BAM_1889		ilvC2	FALSE	0.589	15.000	0.000	NA		NA
6055154	6055155	BAM_1889	BAM_1890	ilvC2	ilvD	TRUE	0.913	47.000	0.022	0.002	Y	NA
6055155	6055156	BAM_1890	BAM_1891	ilvD	ilvA	TRUE	0.926	32.000	0.012	1.000	Y	NA
6055157	6055158	BAM_1892	BAM_1893			FALSE	0.314	-21.000	0.000	NA		NA
6055159	6055160	BAM_1894	BAM_1895			FALSE	0.322	173.000	0.000	NA		NA
6055160	6055161	BAM_1895	BAM_1896			FALSE	0.593	16.000	0.032	NA		NA
6055161	6055162	BAM_1896	BAM_1897			FALSE	0.360	168.000	0.000	NA		NA
6055162	6055163	BAM_1897	BAM_1898			FALSE	0.314	-21.000	0.000	NA		NA
6055165	6055166	BAM_1900	BAM_1901			FALSE	0.010	425.000	0.000	NA		NA
6055166	6055167	BAM_1901	BAM_1902			TRUE	0.874	128.000	0.588	NA		NA
6055167	6055168	BAM_1902	BAM_1903			FALSE	0.173	211.000	0.000	1.000		NA
6055168	6055169	BAM_1903	BAM_1904			FALSE	0.543	28.000	0.207	NA		NA
6055169	6055170	BAM_1904	BAM_1905			FALSE	0.389	72.000	0.069	NA		NA
6055171	6055172	BAM_1906	BAM_1907			FALSE	0.035	340.000	0.333	NA		NA
6055173	6055174	BAM_1908	BAM_1909			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6055174	6055175	BAM_1909	BAM_1910			FALSE	0.007	514.000	0.000	NA		NA
6055175	6055176	BAM_1910	BAM_1911			FALSE	0.413	-10.000	0.000	NA		NA
6055176	6055177	BAM_1911	BAM_1912			FALSE	0.532	95.000	0.000	NA		NA
6055177	6055178	BAM_1912	BAM_1913			FALSE	0.440	80.000	0.000	NA		NA
6055178	6055179	BAM_1913	BAM_1914			TRUE	0.772	135.000	0.333	NA		NA
6055179	6055180	BAM_1914	BAM_1915			FALSE	0.371	67.000	0.095	NA		NA
6055180	6055181	BAM_1915	BAM_1916			FALSE	0.066	288.000	0.000	0.067		NA
6055183	6055184	BAM_1918	BAM_1919			TRUE	0.890	-34.000	0.455	1.000	Y	NA
6055184	6055185	BAM_1919	BAM_1920			FALSE	0.580	83.000	0.174	1.000		NA
6055191	6055192	BAM_1926	BAM_1927			FALSE	0.370	73.000	0.000	NA		NA
6055192	6055193	BAM_1927	BAM_1928			FALSE	0.006	594.000	0.000	NA		NA
6055193	6055194	BAM_1928	BAM_1929			TRUE	0.767	32.000	0.500	0.003		NA
6055194	6055195	BAM_1929	BAM_1930			FALSE	0.630	108.000	0.000	NA		NA
6055195	6055196	BAM_1930	BAM_1931			FALSE	0.011	396.000	0.000	NA		NA
6055196	6055197	BAM_1931	BAM_1932			FALSE	0.061	358.000	0.000	1.000	N	NA
6055197	6055198	BAM_1932	BAM_1933		dra	FALSE	0.112	306.000	0.077	1.000	N	NA
6055198	6055199	BAM_1933	BAM_1934	dra		TRUE	0.961	103.000	0.026	1.000	Y	NA
6055199	6055200	BAM_1934	BAM_1935			FALSE	0.366	43.000	0.000	NA		NA
6055202	6055203	BAM_1937	BAM_1938			TRUE	0.724	52.000	0.750	1.000		NA
6055204	6055205	BAM_1939	BAM_1940			TRUE	0.893	118.000	0.027	1.000	N	NA
6055205	6055206	BAM_1940	BAM_1941			FALSE	0.023	606.000	0.000	1.000	N	NA
6055208	6055209	BAM_1943	BAM_1944	topB2		FALSE	0.054	270.000	0.065	NA		NA
6055211	6055212	BAM_1946	BAM_1947			FALSE	0.079	240.000	0.000	NA		NA
6055212	6055213	BAM_1947	BAM_1948		brnQ	FALSE	0.363	-15.000	0.000	NA		NA
6055213	6055214	BAM_1948	BAM_1949	brnQ		FALSE	0.462	84.000	0.000	NA		NA
6055214	6055215	BAM_1949	BAM_1950			FALSE	0.337	54.000	0.000	NA		NA
6055215	6055216	BAM_1950	BAM_1951			TRUE	0.648	112.000	0.000	NA		NA
6055216	6055217	BAM_1951	BAM_1952			TRUE	0.864	113.000	0.600	NA		NA
6055218	6055219	BAM_1953	BAM_1954			FALSE	0.306	182.000	0.158	NA		NA
6055220	6055221	BAM_1956	BAM_1957			TRUE	0.976	121.000	0.389	NA	Y	NA
6055221	6055222	BAM_1957	BAM_1958			TRUE	0.679	72.000	0.158	NA	N	NA
6055222	6055223	BAM_1958	BAM_1960			FALSE	0.515	58.000	0.123	0.030		NA
6055225	6055226	BAM_1961	BAM_1962			TRUE	0.695	112.000	0.128	NA		NA
6055226	6055227	BAM_1962	BAM_1963			FALSE	0.332	179.000	0.128	NA		NA
6055229	6055230	BAM_1965	BAM_1966			TRUE	0.710	104.000	0.273	NA		NA
6055232	6055233	BAM_1968	BAM_1969			TRUE	0.859	13.000	0.052	1.000	N	NA
6055233	6055234	BAM_1969	BAM_1970			TRUE	0.644	5.000	0.000	NA		NA
6055234	6055235	BAM_1970	BAM_1971			FALSE	0.589	15.000	0.000	NA		NA
6055235	6055236	BAM_1971	BAM_1972			FALSE	0.555	182.000	0.054	NA	N	NA
6055236	6055237	BAM_1972	BAM_1973			FALSE	0.593	14.000	0.000	NA		NA
6055237	6055238	BAM_1973	BAM_1974			FALSE	0.272	-31.000	0.000	NA		NA
6055238	6055239	BAM_1974	BAM_1975			TRUE	0.939	-22.000	0.708	0.024	Y	NA
6055239	6055240	BAM_1975	BAM_1976			TRUE	0.973	22.000	0.746	1.000	Y	NA
6055240	6055241	BAM_1976	BAM_1977			TRUE	0.948	50.000	0.687	0.028	Y	NA
6055243	6055244	BAM_1979	BAM_1980			FALSE	0.439	37.000	0.111	NA		NA
6055244	6055245	BAM_1980	BAM_1981			TRUE	0.881	2.000	0.647	1.000		NA
6055245	6055246	BAM_1981	BAM_1982			TRUE	0.692	94.000	0.286	1.000		NA
6055246	6055247	BAM_1982	BAM_1983			TRUE	0.896	118.000	0.259	NA	N	NA
6055247	6055248	BAM_1983	BAM_1984		cydA1	FALSE	0.076	618.000	0.000	NA	Y	NA
6055248	6055249	BAM_1984	BAM_1985	cydA1	cydB1	TRUE	0.918	-13.000	0.051	0.030	Y	NA
6055249	6055250	BAM_1985	BAM_1986	cydB1		TRUE	0.965	0.000	0.151	1.000	Y	NA
6055250	6055251	BAM_1986	BAM_1987			TRUE	0.973	3.000	0.168	0.004	Y	NA
6055251	6055252	BAM_1987	BAM_1988			FALSE	0.036	290.000	0.000	NA		NA
6055252	6055253	BAM_1988	BAM_1989			TRUE	0.658	91.000	0.353	NA		NA
6055255	6055256	BAM_1991	BAM_1992			FALSE	0.097	245.000	0.000	1.000		NA
6055256	6055257	BAM_1992	BAM_1993			FALSE	0.005	916.000	0.000	NA		NA
6055259	6055260	BAM_1995	BAM_1996			FALSE	0.530	22.000	0.000	NA		NA
6055260	6055261	BAM_1996	BAM_1997			FALSE	0.483	89.000	0.000	NA		NA
6055261	6055262	BAM_1997	BAM_1998			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6055262	6055263	BAM_1998	BAM_1999			FALSE	0.377	39.000	0.000	NA		NA
6055265	6055266	BAM_2001	BAM_2002			TRUE	0.671	117.000	0.000	NA		NA
6055266	6055267	BAM_2002	BAM_2003			FALSE	0.605	141.000	0.000	NA		NA
6055267	6055268	BAM_2003	BAM_2004			TRUE	0.722	118.000	0.136	NA		NA
6055268	6055269	BAM_2004	BAM_2005			FALSE	0.342	69.000	0.000	NA		NA
6055269	6055270	BAM_2005	BAM_2006			TRUE	0.645	4.000	0.000	NA		NA
6055272	6055273	BAM_2008	BAM_2009		hom1	FALSE	0.007	964.000	0.000	1.000		NA
6055273	6055274	BAM_2009	BAM_2010	hom1	thrC	TRUE	0.932	-7.000	0.021	1.000	Y	NA
6055274	6055275	BAM_2010	BAM_2011	thrC	thrB	TRUE	0.957	-3.000	0.221	1.000	Y	NA
6055275	6055276	BAM_2011	BAM_2012	thrB		TRUE	0.683	120.000	0.011	NA		NA
6055276	6055277	BAM_2012	BAM_2013			FALSE	0.116	217.000	0.000	NA		NA
6055277	6055278	BAM_2013	BAM_2014			FALSE	0.152	205.000	0.000	NA		NA
6055278	6055279	BAM_2014	BAM_2015			FALSE	0.506	160.000	0.222	NA		NA
6055279	6055280	BAM_2015	BAM_2016			FALSE	0.608	14.000	0.038	NA		NA
6055280	6055281	BAM_2016	BAM_2017			TRUE	0.915	-21.000	0.472	1.000	Y	NA
6055281	6055282	BAM_2017	BAM_2018			TRUE	0.862	101.000	0.129	1.000	N	NA
6055282	6055283	BAM_2018	BAM_2019			FALSE	0.636	15.000	0.111	NA		NA
6055283	6055284	BAM_2019	BAM_2020			FALSE	0.487	160.000	0.111	NA		NA
6055284	6055285	BAM_2020	BAM_2021			TRUE	0.650	98.000	0.049	1.000		NA
6055285	6055286	BAM_2021	BAM_2022		asbA	FALSE	0.053	284.000	0.000	1.000		NA
6055286	6055287	BAM_2022	BAM_2023	asbA	asbB	TRUE	0.909	65.000	0.163	0.001	Y	NA
6055287	6055288	BAM_2023	BAM_2024	asbB	asbC	TRUE	0.922	-13.000	0.310	1.000	Y	NA
6055288	6055289	BAM_2024	BAM_2025	asbC	asbD	FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6055289	6055290	BAM_2025	BAM_2026	asbD	asbE	FALSE	0.515	24.000	0.000	NA		NA
6055290	6055291	BAM_2026	BAM_2027	asbE	asbF	FALSE	0.581	38.000	0.412	NA		NA
6055291	6055292	BAM_2027	BAM_2028	asbF		TRUE	0.728	126.000	0.137	NA		NA
6055292	6055293	BAM_2028	BAM_2029			FALSE	0.480	168.000	0.167	1.000		NA
6055295	6055296	BAM_2031	BAM_2032			FALSE	0.598	13.000	0.000	NA		NA
6055297	6055298	BAM_2033	BAM_2034			TRUE	0.804	91.000	0.714	NA		NA
6055299	6055300	BAM_2035	BAM_2036			TRUE	0.722	146.000	0.375	NA		NA
6055300	6055301	BAM_2036	BAM_2037			FALSE	0.612	104.000	0.000	NA		NA
6055301	6055302	BAM_2037	BAM_2038			FALSE	0.439	32.000	0.000	NA		NA
6055304	6055305	BAM_2040	BAM_2041			FALSE	0.605	103.000	0.000	NA		NA
6055305	6055306	BAM_2041	BAM_2042			TRUE	0.768	117.000	0.286	NA		NA
6055306	6055307	BAM_2042	BAM_2043			FALSE	0.134	275.000	0.000	NA	N	NA
6055309	6055310	BAM_2045	BAM_2046			FALSE	0.161	203.000	0.000	NA		NA
6055310	6055311	BAM_2046	BAM_2047			FALSE	0.377	-13.000	0.000	NA		NA
6055312	6055313	BAM_2048	BAM_2049			TRUE	0.820	85.000	0.889	NA		NA
6055314	6055315	BAM_2050	BAM_2051			FALSE	0.313	180.000	0.091	NA		NA
6055315	6055316	BAM_2051	BAM_2052			FALSE	0.197	205.000	0.000	1.000		NA
6055316	6055317	BAM_2052	BAM_2053			FALSE	0.403	205.000	0.667	NA		NA
6055317	6055318	BAM_2053	BAM_2054			FALSE	0.050	269.000	0.000	NA		NA
6055320	6055321	BAM_2056	BAM_2057	dpS		TRUE	0.672	107.000	0.111	NA		NA
6055321	6055322	BAM_2057	BAM_2058			FALSE	0.099	225.000	0.000	NA		NA
6055323	6055324	BAM_2059	BAM_2060			TRUE	0.809	106.000	0.467	NA		NA
6055325	6055326	BAM_2061	BAM_2062			TRUE	0.880	85.000	0.636	1.000	N	NA
6055330	6055331	BAM_2066	BAM_2068			FALSE	0.250	-40.000	0.000	NA		NA
6055332	6055333	BAM_2067	BAM_2069			FALSE	0.332	171.000	0.000	NA		NA
6055333	6055334	BAM_2069	BAM_2070			FALSE	0.547	147.000	0.000	NA		NA
6055335	6055336	BAM_2071	BAM_2072			FALSE	0.387	75.000	0.000	NA		NA
6055336	6055337	BAM_2072	BAM_2073			FALSE	0.069	249.000	0.000	NA		NA
6055337	6055338	BAM_2073	BAM_2074			FALSE	0.005	2229.000	0.000	NA		NA
6055342	6055343	BAM_2078	BAM_2079			TRUE	0.822	116.000	0.333	1.000		NA
6055345	6055346	BAM_2081	BAM_2082	ogt1		FALSE	0.554	95.000	0.054	NA		NA
6055346	6055347	BAM_2082	BAM_2083			FALSE	0.540	77.000	0.296	NA		NA
6055347	6055348	BAM_2083	BAM_2084		fosB1	TRUE	0.884	59.000	0.129	NA	Y	NA
6055348	6055349	BAM_2084	BAM_2085	fosB1		FALSE	0.598	13.000	0.000	NA		NA
6055349	6055350	BAM_2085	BAM_2086			TRUE	0.671	13.000	0.000	1.000		NA
6055352	6055353	BAM_2088	BAM_2089	cotH		TRUE	0.854	106.000	0.062	NA	N	NA
6055353	6055354	BAM_2089	BAM_2090			TRUE	0.643	105.000	0.062	NA		NA
6055354	6055355	BAM_2090	BAM_2091			TRUE	0.805	102.000	0.500	NA		NA
6055355	6055356	BAM_2091	BAM_2092			FALSE	0.311	185.000	0.033	1.000		NA
6055356	6055357	BAM_2092	BAM_2093			FALSE	0.191	199.000	0.053	NA		NA
6055357	6055358	BAM_2093	BAM_2094			TRUE	0.899	4.000	0.841	NA		NA
6055358	6055359	BAM_2094	BAM_2095			FALSE	0.228	196.000	0.195	NA		NA
6055359	6055360	BAM_2095	BAM_2096			FALSE	0.182	374.000	0.000	1.000	Y	NA
6055360	6055361	BAM_2096	BAM_2097			FALSE	0.439	32.000	0.000	NA		NA
6055361	6055362	BAM_2097	BAM_2098			FALSE	0.417	34.000	0.000	NA		NA
6055362	6055363	BAM_2098	BAM_2099			FALSE	0.227	187.000	0.000	NA		NA
6055363	6055364	BAM_2099	BAM_2100			TRUE	0.656	101.000	0.227	NA		NA
6055365	6055366	BAM_2101	BAM_2102			TRUE	0.647	2.000	0.034	NA		NA
6055366	6055367	BAM_2102	BAM_2103			FALSE	0.140	209.000	0.000	NA		NA
6055367	6055368	BAM_2103	BAM_2104			FALSE	0.547	147.000	0.000	NA		NA
6055369	6055370	BAM_2105	BAM_2106		brnQ4	FALSE	0.010	424.000	0.000	NA		NA
6055370	6055371	BAM_2106	BAM_2107	brnQ4	csaA	FALSE	0.417	67.000	0.032	1.000		NA
6055371	6055372	BAM_2107	BAM_2109	csaA		FALSE	0.576	18.000	0.032	NA		NA
6055373	6055374	BAM_2108	BAM_2110			TRUE	0.695	5.000	0.200	NA		NA
6055375	6055376	BAM_2111	BAM_2112	spoIIP		FALSE	0.159	224.000	0.214	1.000		NA
6055376	6055377	BAM_2112	BAM_2113			TRUE	0.922	12.000	0.571	1.000	N	NA
6055377	6055378	BAM_2113	BAM_2114			TRUE	0.759	24.000	0.444	1.000		NA
6055378	6055379	BAM_2114	BAM_2115			FALSE	0.394	185.000	0.286	1.000		NA
6055381	6055382	BAM_2117	BAM_2118			TRUE	0.967	3.000	0.259	NA	Y	NA
6055382	6055383	BAM_2118	BAM_2119			TRUE	0.871	107.000	0.021	1.000	N	NA
6055383	6055384	BAM_2119	BAM_2120			TRUE	0.807	7.000	0.368	1.000		NA
6055387	6055388	BAM_2123	BAM_2124			FALSE	0.584	-7.000	0.185	1.000		NA
6055388	6055389	BAM_2124	BAM_2125			FALSE	0.583	24.000	0.222	NA		NA
6055390	6055391	BAM_2126	BAM_2127			TRUE	0.694	168.000	0.700	NA		NA
6055393	6055394	BAM_2129	BAM_2130			FALSE	0.535	148.000	0.000	NA		NA
6055394	6055395	BAM_2130	BAM_2131			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6055397	6055398	BAM_2133	BAM_2134			FALSE	0.314	-21.000	0.000	NA		NA
6055398	6055399	BAM_2134	BAM_2135			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6055399	6055400	BAM_2135	BAM_2136			FALSE	0.634	13.000	0.090	NA		NA
6055400	6055401	BAM_2136	BAM_2137			FALSE	0.538	21.000	0.000	NA		NA
6055401	6055402	BAM_2137	BAM_2138			FALSE	0.628	1.000	0.000	NA		NA
6055402	6055403	BAM_2138	BAM_2139			FALSE	0.409	77.000	0.000	NA		NA
6055403	6055404	BAM_2139	BAM_2140			FALSE	0.345	51.000	0.000	NA		NA
6055404	6055405	BAM_2140	BAM_2141			FALSE	0.597	142.000	0.000	NA		NA
6055406	6055407	BAM_2142	BAM_2143			FALSE	0.404	163.000	0.000	NA		NA
6055407	6055408	BAM_2143	BAM_2144			FALSE	0.046	272.000	0.000	NA		NA
6055409	6055410	BAM_2145	BAM_2146			FALSE	0.491	161.000	0.216	NA		NA
6055410	6055411	BAM_2146	BAM_2147			FALSE	0.402	52.000	0.216	NA		NA
6055411	6055412	BAM_2147	BAM_2148			TRUE	0.736	70.000	0.889	NA		NA
6055414	6055415	BAM_2150	BAM_2151		fhs	TRUE	0.684	64.000	0.200	1.000	N	NA
6055415	6055416	BAM_2151	BAM_2152	fhs		TRUE	0.658	91.000	0.355	NA		NA
6055416	6055417	BAM_2152	BAM_2153			FALSE	0.575	20.000	0.070	NA		NA
6055417	6055418	BAM_2153	BAM_2154			FALSE	0.599	143.000	0.026	NA		NA
6055418	6055419	BAM_2154	BAM_2155			FALSE	0.391	56.000	0.211	NA		NA
6055420	6055421	BAM_2156	BAM_2157			FALSE	0.538	30.000	0.233	NA		NA
6055422	6055423	BAM_2158	BAM_2159			FALSE	0.337	54.000	0.000	NA		NA
6055423	6055424	BAM_2159	BAM_2160			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6055425	6055426	BAM_2161	BAM_2162			FALSE	0.495	86.000	0.064	NA		NA
6055426	6055427	BAM_2162	BAM_2163			FALSE	0.586	98.000	0.064	NA		NA
6055429	6055430	BAM_2165	BAM_2166			FALSE	0.084	318.000	0.642	NA		NA
6055430	6055431	BAM_2166	BAM_2167			TRUE	0.870	0.000	0.714	NA		NA
6055431	6055432	BAM_2167	BAM_2168			FALSE	0.012	389.000	0.000	NA		NA
6055432	6055433	BAM_2168	BAM_2169			TRUE	0.766	93.000	0.556	NA		NA
6055434	6055435	BAM_2170	BAM_2171	narG	narH	TRUE	0.950	-10.000	0.429	0.000	Y	NA
6055435	6055436	BAM_2171	BAM_2172	narH	narJ	TRUE	0.978	20.000	0.750	0.001	Y	NA
6055436	6055437	BAM_2172	BAM_2173	narJ	narI	TRUE	0.967	18.000	0.294	0.001	Y	NA
6055437	6055438	BAM_2173	BAM_2174	narI		FALSE	0.079	332.000	0.000	1.000	N	NA
6055438	6055439	BAM_2174	BAM_2175			TRUE	0.857	-3.000	0.250	1.000	N	NA
6055439	6055440	BAM_2175	BAM_2176			FALSE	0.413	-10.000	0.000	NA		NA
6055442	6055443	BAM_2178	BAM_2179	narA1		TRUE	0.977	18.000	0.778	1.000	Y	NA
6055443	6055444	BAM_2179	BAM_2180		moeA1	TRUE	0.934	43.000	0.500	1.000	Y	NA
6055444	6055445	BAM_2180	BAM_2181	moeA1	moaE1	TRUE	0.913	45.000	0.006	0.004	Y	NA
6055445	6055446	BAM_2181	BAM_2182	moaE1	moaD1	TRUE	0.974	-3.000	0.501	0.004	Y	NA
6055446	6055447	BAM_2182	BAM_2183	moaD1	narK	TRUE	0.734	81.000	0.021	NA	N	NA
6055447	6055448	BAM_2183	BAM_2184	narK		FALSE	0.017	352.000	0.000	NA		NA
6055448	6055449	BAM_2184	BAM_2186			FALSE	0.008	480.000	0.000	NA		NA
6055450	6055451	BAM_2185	BAM_2187			TRUE	0.685	116.000	0.054	NA		NA
6055451	6055452	BAM_2187	BAM_2188			FALSE	0.583	-7.000	0.143	1.000		NA
6055452	6055453	BAM_2188	BAM_2189			TRUE	0.764	-3.000	0.381	1.000		NA
6055453	6055454	BAM_2189	BAM_2190		nirD	TRUE	0.669	63.000	0.061	1.000	N	NA
6055454	6055455	BAM_2190	BAM_2191	nirD	nirB	TRUE	0.884	16.000	0.091	0.000	N	NA
6055455	6055456	BAM_2191	BAM_2192	nirB	scdA	FALSE	0.331	212.000	0.000	NA	N	NA
6055459	6055460	BAM_2195	BAM_2196			FALSE	0.247	216.000	0.444	NA		NA
6055462	6055463	BAM_2198	BAM_2199			FALSE	0.329	61.000	0.000	NA		NA
6055463	6055464	BAM_2199	BAM_2200		spoVS1	FALSE	0.009	430.000	0.000	NA		NA
6055465	6055466	BAM_2201	BAM_2202			FALSE	0.025	317.000	0.000	NA		NA
6055467	6055468	BAM_2203	BAM_2204			FALSE	0.635	2.000	0.000	NA		NA
6055469	6055470	BAM_2205	BAM_2206			FALSE	0.142	208.000	0.000	NA		NA
6055471	6055472	BAM_2207	BAM_2208			FALSE	0.568	-3.000	0.020	NA		NA
6055472	6055473	BAM_2208	BAM_2209			TRUE	0.645	-3.000	0.031	1.000		NA
6055473	6055474	BAM_2209	BAM_2210			FALSE	0.406	76.000	0.022	NA		NA
6055474	6055475	BAM_2210	BAM_2211			TRUE	0.643	106.000	0.049	NA		NA
6055475	6055476	BAM_2211	BAM_2212		ssb2	TRUE	0.765	159.000	0.700	NA		NA
6055477	6055478	BAM_2213	BAM_2214			FALSE	0.598	102.000	0.000	NA		NA
6055478	6055479	BAM_2214	BAM_2215			FALSE	0.038	286.000	0.000	NA		NA
6055480	6055481	BAM_2216	BAM_2217			TRUE	0.655	4.000	0.028	NA		NA
6055481	6055482	BAM_2217	BAM_2218			FALSE	0.473	84.000	0.028	NA		NA
6055482	6055483	BAM_2218	BAM_2219			FALSE	0.381	50.000	0.081	NA		NA
6055483	6055484	BAM_2219	BAM_2220		argS1	FALSE	0.031	301.000	0.000	NA		NA
6055484	6055485	BAM_2220	BAM_2221	argS1		FALSE	0.121	217.000	0.032	NA		NA
6055485	6055486	BAM_2221	BAM_2222			FALSE	0.551	30.000	0.250	NA		NA
6055486	6055487	BAM_2222	BAM_2223			TRUE	0.682	137.000	0.118	NA		NA
6055487	6055488	BAM_2223	BAM_2224			FALSE	0.014	370.000	0.000	NA		NA
6055488	6055489	BAM_2224	BAM_2225			FALSE	0.398	76.000	0.000	NA		NA
6055489	6055490	BAM_2225	BAM_2227		ileS1	FALSE	0.012	393.000	0.000	NA		NA
6055494	6055495	BAM_2230	BAM_2231		aspS1	FALSE	0.110	220.000	0.000	NA		NA
6055495	6055496	BAM_2231	BAM_2232	aspS1		FALSE	0.170	201.000	0.000	NA		NA
6055496	6055497	BAM_2232	BAM_2233			TRUE	0.658	13.000	0.214	NA		NA
6055497	6055498	BAM_2233	BAM_2234			TRUE	0.645	29.000	0.375	NA		NA
6055498	6055499	BAM_2234	BAM_2235			FALSE	0.462	32.000	0.057	NA		NA
6055499	6055500	BAM_2235	BAM_2236			TRUE	0.706	128.000	0.075	NA		NA
6055500	6055501	BAM_2236	BAM_2237			FALSE	0.555	85.000	0.250	NA		NA
6055501	6055502	BAM_2237	BAM_2238			FALSE	0.515	24.000	0.000	NA		NA
6055502	6055503	BAM_2238	BAM_2239			FALSE	0.430	-9.000	0.000	NA		NA
6055503	6055504	BAM_2239	BAM_2240			FALSE	0.490	90.000	0.000	NA		NA
6055504	6055505	BAM_2240	BAM_2241			FALSE	0.355	71.000	0.000	NA		NA
6055505	6055506	BAM_2241	BAM_2242			FALSE	0.083	237.000	0.000	NA		NA
6055506	6055507	BAM_2242	BAM_2243			FALSE	0.494	27.000	0.000	NA		NA
6055507	6055508	BAM_2243	BAM_2244			FALSE	0.009	461.000	0.000	NA		NA
6055508	6055509	BAM_2244	BAM_2245			TRUE	0.713	-15.000	0.750	NA		NA
6055509	6055510	BAM_2245	BAM_2246			FALSE	0.447	159.000	0.000	NA		NA
6055510	6055511	BAM_2246	BAM_2247			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6055511	6055512	BAM_2247	BAM_2248			FALSE	0.059	258.000	0.000	NA		NA
6055512	6055513	BAM_2248	BAM_2249			FALSE	0.593	14.000	0.000	NA		NA
6055513	6055514	BAM_2249	BAM_2250			FALSE	0.006	560.000	0.000	NA		NA
6055514	6055515	BAM_2250	BAM_2251			FALSE	0.407	35.000	0.000	NA		NA
6055515	6055516	BAM_2251	BAM_2252			FALSE	0.007	513.000	0.000	NA		NA
6055516	6055517	BAM_2252	BAM_2253			FALSE	0.351	49.000	0.000	NA		NA
6055517	6055518	BAM_2253	BAM_2254			FALSE	0.007	547.000	0.000	NA		NA
6055518	6055519	BAM_2254	BAM_2255			TRUE	0.855	-3.000	0.240	1.000	N	NA
6055519	6055520	BAM_2255	BAM_2256			TRUE	0.891	129.000	0.015	1.000	N	NA
6055520	6055521	BAM_2256	BAM_2257			TRUE	0.968	4.000	0.100	1.000	Y	NA
6055521	6055522	BAM_2257	BAM_2258			TRUE	0.663	20.000	0.133	1.000		NA
6055522	6055523	BAM_2258	BAM_2259			TRUE	0.903	109.000	0.667	0.004		NA
6055523	6055524	BAM_2259	BAM_2260			FALSE	0.010	495.000	0.000	1.000		NA
6055524	6055525	BAM_2260	BAM_2261			FALSE	0.496	41.000	0.206	1.000		NA
6055526	6055527	BAM_2262	BAM_2263			FALSE	0.472	87.000	0.000	NA		NA
6055528	6055529	BAM_2264	BAM_2265			FALSE	0.179	210.000	0.000	1.000		NA
6055529	6055530	BAM_2265	BAM_2266			TRUE	0.802	53.000	0.583	1.000	N	NA
6055530	6055531	BAM_2266	BAM_2267			TRUE	0.823	148.000	0.032	1.000	N	NA
6055531	6055532	BAM_2267	BAM_2268			FALSE	0.399	75.000	0.032	NA		NA
6055532	6055533	BAM_2268	BAM_2269			FALSE	0.610	-3.000	0.113	NA		NA
6055534	6055535	BAM_2270	BAM_2271			FALSE	0.377	-13.000	0.000	NA		NA
6055535	6055536	BAM_2271	BAM_2272			FALSE	0.462	30.000	0.000	NA		NA
6055537	6055538	BAM_2273	BAM_2274			FALSE	0.598	-7.000	0.308	NA		NA
6055538	6055539	BAM_2274	BAM_2275			FALSE	0.039	283.000	0.000	NA		NA
6055539	6055540	BAM_2275	BAM_2276			TRUE	0.642	106.000	0.045	NA		NA
6055540	6055541	BAM_2276	BAM_2277			FALSE	0.455	80.000	0.038	NA		NA
6055541	6055542	BAM_2277	BAM_2278			FALSE	0.633	13.000	0.085	NA		NA
6055543	6055544	BAM_2279	BAM_2280			TRUE	0.767	128.000	0.094	1.000		NA
6055545	6055546	BAM_2281	BAM_2282	thyA	dfrA	TRUE	0.861	20.000	0.295	1.000	N	NA
6055546	6055547	BAM_2282	BAM_2283	dfrA	pbpC	TRUE	0.779	156.000	0.015	1.000	N	NA
6055547	6055548	BAM_2283	BAM_2284	pbpC		FALSE	0.076	242.000	0.000	NA		NA
6055550	6055551	BAM_1480	BAM_1479			FALSE	0.014	419.000	0.000	1.000		NA
6055551	6055552	BAM_1479	BAM_1478			FALSE	0.503	-25.000	0.375	1.000		NA
6055552	6055553	BAM_1478	BAM_1477		cysG	TRUE	0.779	2.000	0.281	1.000		NA
6055553	6055554	BAM_1477	BAM_1476	cysG		FALSE	0.588	87.000	0.281	NA		NA
6055554	6055555	BAM_1476	BAM_1475			TRUE	0.850	11.000	0.647	NA		NA
6055555	6055556	BAM_1475	BAM_1474		cysC	TRUE	0.962	12.000	0.067	1.000	Y	NA
6055556	6055557	BAM_1474	BAM_1473	cysC	sat	TRUE	0.968	13.000	0.101	0.000	Y	NA
6055557	6055558	BAM_1473	BAM_1472	sat	cysH	TRUE	0.716	39.000	0.065	1.000	N	NA
6055558	6055559	BAM_1472	BAM_1471	cysH		FALSE	0.475	87.000	0.011	NA		NA
6055559	6055560	BAM_1471	BAM_1470		lysA	FALSE	0.033	297.000	0.000	NA		NA
6055560	6055561	BAM_1470	BAM_1469	lysA		FALSE	0.009	457.000	0.000	NA		NA
6055562	6055563	BAM_1468	BAM_1467			FALSE	0.586	182.000	0.011	1.000	N	NA
6055564	6055565	BAM_1466	BAM_1465			FALSE	0.570	99.000	0.000	NA		NA
6055565	6055566	BAM_1465	BAM_1464			FALSE	0.338	68.000	0.000	NA		NA
6055566	6055567	BAM_1464	BAM_1463		hisI	FALSE	0.603	12.000	0.000	NA		NA
6055567	6055568	BAM_1463	BAM_1462	hisI	hisE	FALSE	0.609	11.000	0.000	NA		NA
6055568	6055569	BAM_1462	BAM_1461	hisE	hisF	FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6055569	6055570	BAM_1461	BAM_1460	hisF	hisA	TRUE	0.962	-6.000	0.433	0.003	Y	NA
6055570	6055571	BAM_1460	BAM_1459	hisA	hisH	TRUE	0.887	-27.000	0.124	0.003	Y	NA
6055571	6055572	BAM_1459	BAM_1458	hisH	hisB	TRUE	0.971	1.000	0.125	0.003	Y	NA
6055572	6055573	BAM_1458	BAM_1457	hisB	hisD	TRUE	0.969	0.000	0.096	0.003	Y	NA
6055573	6055574	BAM_1457	BAM_1456	hisD	hisG	TRUE	0.970	12.000	0.254	0.003	Y	NA
6055574	6055575	BAM_1456	BAM_1455	hisG	hisZ	TRUE	0.897	-24.000	0.239	0.003	Y	NA
6055575	6055576	BAM_1455	BAM_1454	hisZ	leuD	FALSE	0.309	311.000	0.000	1.000	Y	NA
6055576	6055577	BAM_1454	BAM_1453	leuD	leuC	TRUE	0.925	-22.000	0.477	0.000	Y	NA
6055577	6055578	BAM_1453	BAM_1452	leuC	leuB	TRUE	0.970	0.000	0.080	0.001	Y	NA
6055578	6055579	BAM_1452	BAM_1451	leuB	leuA	TRUE	0.934	78.000	0.041	0.001	Y	NA
6055579	6055580	BAM_1451	BAM_1450	leuA	ilvC1	TRUE	0.967	2.000	0.103	1.000	Y	NA
6055580	6055581	BAM_1450	BAM_1449	ilvC1	ilvN	TRUE	0.952	27.000	0.130	0.001	Y	NA
6055581	6055582	BAM_1449	BAM_1448	ilvN	ilvB	TRUE	0.964	-3.000	0.249	0.001	Y	NA
6055582	6055583	BAM_1448	BAM_1447	ilvB	ilvE1	FALSE	0.320	307.000	0.000	1.000	Y	NA
6055583	6055584	BAM_1447	BAM_1446	ilvE1		TRUE	0.726	120.000	0.150	NA		NA
6055585	6055586	BAM_1445	BAM_1444			TRUE	0.729	127.000	0.195	NA		NA
6055587	6055588	BAM_1443	BAM_1442			TRUE	0.792	85.000	0.750	NA		NA
6055592	6055593	BAM_1438	BAM_1437			FALSE	0.635	137.000	0.000	NA		NA
6055594	6055595	BAM_1436	BAM_1435			FALSE	0.341	67.000	0.022	NA		NA
6055599	6055600	BAM_1431	BAM_1430			TRUE	0.825	19.000	0.667	NA		NA
6055603	6055604	BAM_1427	BAM_1426			TRUE	0.730	100.000	0.357	NA		NA
6055604	6055605	BAM_1426	BAM_1425			TRUE	0.704	25.000	0.421	NA		NA
6055605	6055606	BAM_1425	BAM_1424			FALSE	0.602	-7.000	0.316	NA		NA
6055606	6055607	BAM_1424	BAM_1423		amaA	FALSE	0.097	227.000	0.000	NA		NA
6055608	6055609	BAM_1422	BAM_1421		dltA	TRUE	0.821	13.000	0.549	NA		NA
6055609	6055610	BAM_1421	BAM_1420	dltA	dltB	TRUE	0.876	-3.000	0.435	NA	N	NA
6055610	6055611	BAM_1420	BAM_1419	dltB	dltC	FALSE	0.520	69.000	0.387	NA		NA
6055611	6055612	BAM_1419	BAM_1418	dltC	dltD	TRUE	0.656	-3.000	0.064	1.000		NA
6055615	6055616	BAM_1415	BAM_1414			FALSE	0.526	87.000	0.127	NA		NA
6055616	6055617	BAM_1414	BAM_1413			FALSE	0.517	-7.000	0.194	NA		NA
6055618	6055619	BAM_1412	BAM_1411			TRUE	0.679	101.000	0.258	NA		NA
6055620	6055621	BAM_1410	BAM_1409			FALSE	0.170	203.000	0.040	NA		NA
6055621	6055622	BAM_1409	BAM_1408			TRUE	0.805	0.000	0.471	NA		NA
6055622	6055623	BAM_1408	BAM_1407			TRUE	0.858	15.000	0.727	NA		NA
6055623	6055624	BAM_1407	BAM_1406			TRUE	0.854	-3.000	0.778	NA		NA
6055624	6055625	BAM_1406	BAM_1405			TRUE	0.864	-3.000	0.280	1.000	N	NA
6055625	6055626	BAM_1405	BAM_1404		nrdF	FALSE	0.342	217.000	0.000	1.000	N	NA
6055626	6055627	BAM_1404	BAM_1403	nrdF	nrdE	TRUE	0.973	94.000	0.625	0.001	Y	NA
6055627	6055628	BAM_1403	BAM_1402	nrdE		FALSE	0.609	95.000	0.000	1.000		NA
6055628	6055629	BAM_1402	BAM_1401			FALSE	0.103	241.000	0.000	1.000		NA
6055629	6055630	BAM_1401	BAM_1400		nrdI	FALSE	0.523	23.000	0.000	NA		NA
6055630	6055631	BAM_1400	BAM_1399	nrdI		FALSE	0.008	477.000	0.000	NA		NA
6055631	6055632	BAM_1399	BAM_1398			FALSE	0.566	27.000	0.229	NA		NA
6055634	6055635	BAM_1396	BAM_1395			FALSE	0.537	89.000	0.140	NA		NA
6055637	6055638	BAM_1393	BAM_1392			TRUE	0.664	19.000	0.101	1.000		NA
6055638	6055639	BAM_1392	BAM_1391			TRUE	0.809	-7.000	0.280	1.000	N	NA
6055639	6055640	BAM_1391	BAM_1390			TRUE	0.706	0.000	0.062	1.000		NA
6055642	6055643	BAM_1388	BAM_1387			FALSE	0.605	103.000	0.000	NA		NA
6055643	6055644	BAM_1387	BAM_1386			TRUE	0.669	139.000	0.114	NA		NA
6055644	6055645	BAM_1386	BAM_1385			TRUE	0.736	161.000	0.129	NA	N	NA
6055649	6055650	BAM_1381	BAM_1380			TRUE	0.683	126.000	0.000	NA		NA
6055650	6055651	BAM_1380	BAM_1379			FALSE	0.488	-6.000	0.000	NA		NA
6055651	6055652	BAM_1379	BAM_1378			FALSE	0.071	248.000	0.000	NA		NA
6055652	6055653	BAM_1378	BAM_1377			FALSE	0.326	-19.000	0.000	NA		NA
6055653	6055654	BAM_1377	BAM_1376			FALSE	0.619	9.000	0.000	NA		NA
6055654	6055655	BAM_1376	BAM_1375			FALSE	0.390	165.000	0.000	NA		NA
6055655	6055656	BAM_1375	BAM_1374			FALSE	0.427	161.000	0.000	NA		NA
6055656	6055657	BAM_1374	BAM_1373			FALSE	0.370	41.000	0.000	NA		NA
6055657	6055658	BAM_1373	BAM_1372			FALSE	0.413	-10.000	0.000	NA		NA
6055658	6055659	BAM_1372	BAM_1371			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6055659	6055660	BAM_1371	BAM_1370		phnX	TRUE	0.793	16.000	0.315	0.063		NA
6055660	6055661	BAM_1370	BAM_1369	phnX		FALSE	0.530	22.000	0.000	NA		NA
6055661	6055662	BAM_1369	BAM_1368			FALSE	0.570	99.000	0.000	NA		NA
6055662	6055663	BAM_1368	BAM_1367			FALSE	0.377	-13.000	0.000	NA		NA
6055663	6055664	BAM_1367	BAM_1366			FALSE	0.478	155.000	0.000	NA		NA
6055664	6055665	BAM_1366	BAM_1365			FALSE	0.093	229.000	0.000	NA		NA
6055667	6055668	BAM_1363	BAM_1362			TRUE	0.819	24.000	0.096	1.000	N	NA
6055668	6055669	BAM_1362	BAM_1361		phaC	TRUE	0.836	96.000	0.113	1.000	N	NA
6055669	6055670	BAM_1361	BAM_1360	phaC	phbB	TRUE	0.946	83.000	0.161	0.000	Y	NA
6055670	6055671	BAM_1360	BAM_1359	phbB		TRUE	0.728	150.000	0.450	NA		NA
6055672	6055673	BAM_1358	BAM_1357			FALSE	0.472	43.000	0.273	NA		NA
6055673	6055674	BAM_1357	BAM_1356			TRUE	0.838	102.000	0.615	NA		NA
6055674	6055675	BAM_1356	BAM_1355			TRUE	0.825	148.000	0.615	1.000		NA
6055675	6055676	BAM_1355	BAM_1354			FALSE	0.327	172.000	0.000	NA		NA
6055676	6055677	BAM_1354	BAM_1353			FALSE	0.428	33.000	0.000	NA		NA
6055677	6055678	BAM_1353	BAM_1352			FALSE	0.034	295.000	0.000	NA		NA
6055678	6055679	BAM_1352	BAM_1351			TRUE	0.747	204.000	0.000	1.000	Y	NA
6055680	6055681	BAM_1350	BAM_1349		comC	FALSE	0.589	15.000	0.005	NA		NA
6055681	6055682	BAM_1349	BAM_1348	comC		TRUE	0.726	113.000	0.022	1.000		NA
6055682	6055683	BAM_1348	BAM_1347			TRUE	0.875	0.000	0.500	0.001		NA
6055683	6055684	BAM_1347	BAM_1346			TRUE	0.978	17.000	0.947	NA	Y	NA
6055684	6055685	BAM_1346	BAM_1345			TRUE	0.743	168.000	0.395	NA	N	NA
6055685	6055686	BAM_1345	BAM_1344			FALSE	0.191	261.000	0.000	1.000	N	NA
6055686	6055687	BAM_1344	BAM_1343			TRUE	0.981	4.000	0.621	1.000	Y	NA
6055687	6055688	BAM_1343	BAM_1342			TRUE	0.721	-7.000	0.543	NA		NA
6055689	6055690	BAM_1341	BAM_1340		glcD	TRUE	0.906	118.000	0.247	1.000	N	NA
6055690	6055691	BAM_1340	BAM_1339	glcD		TRUE	0.963	-3.000	0.342	1.000	Y	NA
6055691	6055692	BAM_1339	BAM_1338			FALSE	0.008	466.000	0.000	NA		NA
6055693	6055694	BAM_1337	BAM_1336			FALSE	0.542	92.000	0.089	NA		NA
6055694	6055695	BAM_1336	BAM_1335			FALSE	0.607	99.000	0.089	NA		NA
6055695	6055696	BAM_1335	BAM_1334			TRUE	0.727	101.000	0.333	NA		NA
6055696	6055697	BAM_1334	BAM_1333			TRUE	0.806	111.000	0.333	1.000		NA
6055697	6055698	BAM_1333	BAM_1332		potD	TRUE	0.705	60.000	0.267	1.000	N	NA
6055698	6055699	BAM_1332	BAM_1331	potD	potC	FALSE	0.377	39.000	0.000	NA		NA
6055699	6055700	BAM_1331	BAM_1330	potC	potB	FALSE	0.629	7.000	0.000	NA		NA
6055700	6055701	BAM_1330	BAM_1329	potB	potA	TRUE	0.980	-3.000	0.789	0.026	Y	NA
6055701	6055702	BAM_1329	BAM_1328	potA		FALSE	0.297	227.000	0.000	1.000	N	NA
6055702	6055703	BAM_1328	BAM_1327			FALSE	0.423	172.000	0.069	1.000		NA
6055704	6055705	BAM_1326	BAM_1325		sinR	TRUE	0.724	80.000	0.389	0.004		NA
6055706	6055707	BAM_1324	BAM_1323	calY		FALSE	0.011	398.000	0.000	NA		NA
6055707	6055708	BAM_1323	BAM_1322			TRUE	0.764	162.000	0.778	NA		NA
6055708	6055709	BAM_1322	BAM_1321		sipW	FALSE	0.467	63.000	0.320	NA		NA
6055709	6055710	BAM_1321	BAM_1320	sipW		FALSE	0.409	195.000	0.320	0.025		NA
6055710	6055711	BAM_1320	BAM_1319			TRUE	0.781	156.000	0.700	NA		NA
6055712	6055713	BAM_1318	BAM_1317			FALSE	0.343	170.000	0.000	NA		NA
6055713	6055714	BAM_1317	BAM_1316			FALSE	0.051	278.000	0.103	NA		NA
6055714	6055715	BAM_1316	BAM_1315			FALSE	0.218	189.000	0.000	NA		NA
6055716	6055717	BAM_1314	BAM_1313			FALSE	0.366	43.000	0.000	NA		NA
6055717	6055718	BAM_1313	BAM_1312			FALSE	0.383	38.000	0.000	NA		NA
6055718	6055719	BAM_1312	BAM_1311			FALSE	0.564	18.000	0.000	NA		NA
6055719	6055720	BAM_1311	BAM_1310			TRUE	0.645	135.000	0.000	NA		NA
6055720	6055721	BAM_1310	BAM_1309			FALSE	0.495	153.000	0.000	NA		NA
6055721	6055722	BAM_1309	BAM_1308			FALSE	0.331	58.000	0.000	NA		NA
6055722	6055723	BAM_1308	BAM_1307			TRUE	0.873	135.000	0.667	NA		NA
6055723	6055724	BAM_1307	BAM_1306			TRUE	0.772	29.000	0.667	NA		NA
6055724	6055725	BAM_1306	BAM_1305			TRUE	0.901	3.000	0.875	NA		NA
6055726	6055727	BAM_1304	BAM_1303	odhA	odhB	TRUE	0.981	136.000	0.667	1.000	Y	NA
6055727	6055728	BAM_1303	BAM_1302	odhB		TRUE	0.688	125.000	0.014	NA		NA
6055728	6055729	BAM_1302	BAM_1301			TRUE	0.845	-3.000	0.733	NA		NA
6055729	6055730	BAM_1301	BAM_1300			TRUE	0.861	17.000	0.786	NA		NA
6055731	6055732	BAM_1299	BAM_1298			FALSE	0.630	145.000	0.208	NA		NA
6055732	6055733	BAM_1298	BAM_1297			TRUE	0.701	102.000	0.098	1.000		NA
6055733	6055734	BAM_1297	BAM_1296			TRUE	0.647	2.000	0.033	NA		NA
6055734	6055735	BAM_1296	BAM_1295			FALSE	0.431	79.000	0.000	NA		NA
6055737	6055738	BAM_1294	BAM_1292			FALSE	0.011	398.000	0.000	NA		NA
6055740	6055741	BAM_1290	BAM_1289			FALSE	0.564	93.000	0.167	NA		NA
6055741	6055742	BAM_1289	BAM_1288			TRUE	0.707	115.000	0.119	NA		NA
6055742	6055743	BAM_1288	BAM_1287		trpA	FALSE	0.350	51.000	0.015	NA		NA
6055743	6055744	BAM_1287	BAM_1286	trpA	trpB	TRUE	0.975	4.000	0.248	0.000	Y	NA
6055744	6055745	BAM_1286	BAM_1285	trpB	trpF	TRUE	0.969	-3.000	0.375	0.001	Y	NA
6055745	6055746	BAM_1285	BAM_1284	trpF		TRUE	0.965	-3.000	0.264	0.001	Y	NA
6055746	6055747	BAM_1284	BAM_1283		trpD	TRUE	0.968	2.000	0.216	1.000	Y	NA
6055747	6055748	BAM_1283	BAM_1282	trpD		TRUE	0.955	-3.000	0.053	1.000	Y	NA
6055748	6055749	BAM_1282	BAM_1281		trpE	TRUE	0.967	-3.000	0.293	0.001	Y	NA
6055749	6055750	BAM_1281	BAM_1280	trpE		FALSE	0.014	370.000	0.000	NA		NA
6055750	6055751	BAM_1280	BAM_1279			FALSE	0.391	-103.000	0.400	NA		NA
6055752	6055753	BAM_1278	BAM_1277			FALSE	0.058	271.000	0.130	NA		NA
6055754	6055755	BAM_1276	BAM_1275			FALSE	0.629	149.000	0.267	NA		NA
6055756	6055757	BAM_1274	BAM_1273			TRUE	0.821	93.000	0.287	NA	N	NA
6055757	6055758	BAM_1273	BAM_1272			TRUE	0.746	2.000	0.213	1.000		NA
6055758	6055759	BAM_1272	BAM_1271			TRUE	0.704	100.000	0.222	1.000		NA
6055759	6055760	BAM_1271	BAM_1270		cotZ2	TRUE	0.852	143.000	0.700	NA		NA
6055760	6055761	BAM_1270	BAM_1269	cotZ2		FALSE	0.360	168.000	0.000	NA		NA
6055762	6055763	BAM_1268	BAM_1267			TRUE	0.643	111.000	0.000	NA		NA
6055765	6055766	BAM_1265	BAM_1264		fabI	FALSE	0.468	162.000	0.129	NA		NA
6055766	6055767	BAM_1264	BAM_1263	fabI	rfbD	TRUE	0.879	109.000	0.082	1.000	N	NA
6055767	6055768	BAM_1263	BAM_1262	rfbD		FALSE	0.603	12.000	0.000	NA		NA
6055768	6055769	BAM_1262	BAM_1261		rfbB	FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6055769	6055770	BAM_1261	BAM_1260	rfbB	rfbC	FALSE	0.573	17.000	0.000	NA		NA
6055770	6055771	BAM_1260	BAM_1259	rfbC		TRUE	0.965	9.000	0.096	1.000	Y	NA
6055771	6055772	BAM_1259	BAM_1258			FALSE	0.589	15.000	0.000	NA		NA
6055772	6055773	BAM_1258	BAM_1257			FALSE	0.448	81.000	0.000	NA		NA
6055773	6055774	BAM_1257	BAM_1256			FALSE	0.598	13.000	0.000	NA		NA
6055774	6055775	BAM_1256	BAM_1255			TRUE	0.758	-3.000	0.444	NA		NA
6055775	6055776	BAM_1255	BAM_1254			FALSE	0.044	276.000	0.000	NA		NA
6055777	6055778	BAM_1253	BAM_1252			TRUE	0.780	123.000	0.154	1.000		NA
6055778	6055779	BAM_1252	BAM_1251			TRUE	0.780	128.000	0.212	1.000		NA
6055779	6055780	BAM_1251	BAM_1250			TRUE	0.701	7.000	0.242	NA		NA
6055780	6055781	BAM_1250	BAM_1249			FALSE	0.589	143.000	0.000	NA		NA
6055781	6055782	BAM_1249	BAM_1248			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6055782	6055783	BAM_1248	BAM_1247			FALSE	0.387	75.000	0.000	NA		NA
6055783	6055784	BAM_1247	BAM_1246			TRUE	0.682	141.000	0.017	1.000		NA
6055785	6055786	BAM_1245	BAM_1244			TRUE	0.904	16.000	0.480	1.000	N	NA
6055786	6055787	BAM_1244	BAM_1243			TRUE	0.859	19.000	0.725	1.000		NA
6055787	6055788	BAM_1243	BAM_1242			FALSE	0.568	31.000	0.283	NA		NA
6055789	6055790	BAM_1241	BAM_1240			FALSE	0.361	181.000	0.063	1.000		NA
6055790	6055791	BAM_1240	BAM_1239			TRUE	0.667	0.000	0.138	NA		NA
6055791	6055792	BAM_1239	BAM_1238			FALSE	0.091	230.000	0.000	NA		NA
6055793	6055794	BAM_1237	BAM_1236	pepF1		FALSE	0.528	51.000	0.398	NA		NA
6055794	6055795	BAM_1236	BAM_1235		cls2	FALSE	0.508	82.000	0.189	NA		NA
6055795	6055796	BAM_1235	BAM_1234	cls2	mecA	TRUE	0.729	73.000	0.314	NA	N	NA
6055796	6055797	BAM_1234	BAM_1233	mecA		FALSE	0.285	-33.000	0.059	NA		NA
6055799	6055800	BAM_1231	BAM_1230			FALSE	0.008	478.000	0.000	NA		NA
6055804	6055805	BAM_1226	BAM_1225			TRUE	0.736	-7.000	0.375	0.003		NA
6055805	6055806	BAM_1225	BAM_1224			TRUE	0.975	19.000	0.706	1.000	Y	NA
6055806	6055807	BAM_1224	BAM_1223			TRUE	0.961	-3.000	0.165	0.026	Y	NA
6055807	6055808	BAM_1223	BAM_1222			TRUE	0.975	128.000	0.031	0.026	Y	NA
6055809	6055810	BAM_1221	BAM_1220		trpS	FALSE	0.011	398.000	0.000	NA		NA
6055811	6055812	BAM_1219	BAM_1218			TRUE	0.714	144.000	0.321	NA		NA
6055812	6055813	BAM_1218	BAM_1217		fabF	TRUE	0.853	107.000	0.039	NA	N	NA
6055813	6055814	BAM_1217	BAM_1216	fabF	fabH	TRUE	0.939	32.000	0.076	0.001	Y	NA
6055814	6055815	BAM_1216	BAM_1215	fabH		TRUE	0.671	117.000	0.000	NA		NA
6055815	6055816	BAM_1215	BAM_1214			FALSE	0.322	173.000	0.000	NA		NA
6055816	6055817	BAM_1214	BAM_1213			TRUE	0.662	6.000	0.065	NA		NA
6055817	6055818	BAM_1213	BAM_1212			FALSE	0.379	48.000	0.065	NA		NA
6055823	6055824	BAM_1207	BAM_1206			TRUE	0.795	106.000	0.429	NA		NA
6055824	6055825	BAM_1206	BAM_1205			TRUE	0.891	1.000	0.826	NA		NA
6055827	6055828	BAM_1203	BAM_1202		prsA2	TRUE	0.840	129.000	0.467	NA		NA
6055829	6055830	BAM_1201	BAM_1200			FALSE	0.309	184.000	0.000	1.000		NA
6055832	6055833	BAM_1197	BAM_1196			FALSE	0.067	251.000	0.000	NA		NA
6055834	6055835	BAM_2531	BAM_2530			TRUE	0.681	120.000	0.000	NA		NA
6055835	6055836	BAM_2530	BAM_2529			TRUE	0.853	99.000	0.182	1.000	N	NA
6055836	6055837	BAM_2529	BAM_2528			TRUE	0.902	12.000	0.412	1.000	N	NA
6055837	6055838	BAM_2528	BAM_2527			TRUE	0.861	139.000	0.167	NA	N	NA
6055838	6055839	BAM_2527	BAM_2526			TRUE	0.687	63.000	0.300	NA	N	NA
6055839	6055840	BAM_2526	BAM_2525			TRUE	0.687	110.000	0.143	NA		NA
6055842	6055843	BAM_2523	BAM_2522			FALSE	0.288	182.000	0.075	NA		NA
6055843	6055844	BAM_2522	BAM_2521			FALSE	0.431	74.000	0.150	NA		NA
6055847	6055848	BAM_2518	BAM_2517			FALSE	0.040	282.000	0.000	NA		NA
6055848	6055849	BAM_2517	BAM_2516			FALSE	0.019	341.000	0.000	NA		NA
6055850	6055851	BAM_2515	BAM_2514	tdcB		TRUE	0.943	87.000	0.017	0.014	Y	NA
6055851	6055852	BAM_2514	BAM_2513			FALSE	0.440	71.000	0.250	NA		NA
6055852	6055853	BAM_2513	BAM_2512			TRUE	0.750	112.000	0.286	NA		NA
6055853	6055854	BAM_2512	BAM_2511			TRUE	0.796	21.000	0.004	NA	N	NA
6055854	6055855	BAM_2511	BAM_2510			FALSE	0.527	23.000	0.015	NA		NA
6055855	6055856	BAM_2510	BAM_2509			FALSE	0.571	80.000	0.296	NA		NA
6055856	6055857	BAM_2509	BAM_2508			TRUE	0.981	12.000	0.667	0.004	Y	NA
6055857	6055858	BAM_2508	BAM_2507			FALSE	0.561	146.000	0.000	NA		NA
6055860	6055861	BAM_2505	BAM_2504			TRUE	0.768	25.000	0.571	NA		NA
6055861	6055862	BAM_2504	BAM_2503			FALSE	0.026	314.000	0.000	NA		NA
6055863	6055864	BAM_2502	BAM_2501			FALSE	0.203	193.000	0.000	NA		NA
6055865	6055866	BAM_2500	BAM_2499			TRUE	0.658	-22.000	0.145	1.000	N	NA
6055866	6055867	BAM_2499	BAM_2498			FALSE	0.585	95.000	0.127	NA		NA
6055875	6055876	BAM_2490	BAM_2489			TRUE	0.946	-7.000	0.240	0.004	Y	NA
6055876	6055877	BAM_2489	BAM_2488			FALSE	0.104	222.000	0.000	NA		NA
6055877	6055878	BAM_2488	BAM_2487			FALSE	0.460	34.000	0.100	NA		NA
6055878	6055879	BAM_2487	BAM_2486			FALSE	0.075	262.000	0.000	1.000		NA
6055881	6055882	BAM_2484	BAM_2483			FALSE	0.453	54.000	0.286	NA		NA
6055882	6055883	BAM_2483	BAM_2482		asd1	FALSE	0.478	166.000	0.058	1.000		NA
6055884	6055885	BAM_2481	BAM_2480			FALSE	0.010	423.000	0.000	NA		NA
6055885	6055886	BAM_2480	BAM_2479			FALSE	0.006	595.000	0.000	NA		NA
6055888	6055889	BAM_2477	BAM_2476			FALSE	0.011	408.000	0.000	NA		NA
6055890	6055891	BAM_2475	BAM_2474			FALSE	0.009	440.000	0.000	NA		NA
6055891	6055892	BAM_2474	BAM_2473			FALSE	0.613	98.000	0.143	NA		NA
6055894	6055895	BAM_2471	BAM_2470			FALSE	0.297	-36.000	0.188	NA		NA
6055896	6055897	BAM_2469	BAM_2468	cspA2		FALSE	0.624	87.000	0.333	NA		NA
6055900	6055901	BAM_2465	BAM_2464	hemY2		FALSE	0.577	61.000	0.500	NA		NA
6055901	6055902	BAM_2464	BAM_2463			TRUE	0.828	115.000	0.444	NA		NA
6055902	6055903	BAM_2463	BAM_2462			TRUE	0.676	158.000	0.455	NA		NA
6055903	6055904	BAM_2462	BAM_2461			FALSE	0.471	34.000	0.179	NA		NA
6055906	6055907	BAM_2459	BAM_2458			TRUE	0.717	148.000	0.171	0.017		NA
6055907	6055908	BAM_2458	BAM_2457			TRUE	0.654	56.000	0.462	0.017		NA
6055908	6055909	BAM_2457	BAM_2456			FALSE	0.186	208.000	0.000	1.000		NA
6055913	6055914	BAM_2452	BAM_2451			FALSE	0.552	67.000	0.368	1.000		NA
6055917	6055918	BAM_2448	BAM_2447			FALSE	0.471	34.000	0.137	NA		NA
6055919	6055920	BAM_2446	BAM_2445			FALSE	0.355	71.000	0.000	NA		NA
6055920	6055921	BAM_2445	BAM_2444			FALSE	0.561	146.000	0.000	NA		NA
6055921	6055922	BAM_2444	BAM_2443			FALSE	0.364	49.000	0.036	NA		NA
6055924	6055925	BAM_2441	BAM_2440			FALSE	0.635	2.000	0.000	NA		NA
6055925	6055926	BAM_2440	BAM_2439			FALSE	0.555	19.000	0.000	NA		NA
6055926	6055927	BAM_2439	BAM_2438			FALSE	0.335	55.000	0.000	NA		NA
6055927	6055928	BAM_2438	BAM_2437			FALSE	0.107	221.000	0.000	NA		NA
6055928	6055929	BAM_2437	BAM_2436			FALSE	0.337	54.000	0.000	NA		NA
6055929	6055930	BAM_2436	BAM_2435			TRUE	0.685	124.000	0.000	NA		NA
6055930	6055931	BAM_2435	BAM_2434			FALSE	0.603	12.000	0.000	NA		NA
6055931	6055932	BAM_2434	BAM_2433			FALSE	0.581	16.000	0.000	NA		NA
6055932	6055933	BAM_2433	BAM_2432		thrS1	FALSE	0.064	254.000	0.000	NA		NA
6055935	6055936	BAM_2430	BAM_2429			FALSE	0.333	186.000	0.148	1.000		NA
6055936	6055937	BAM_2429	BAM_2428			FALSE	0.225	205.000	0.286	NA		NA
6055938	6055939	BAM_2427	BAM_2426			FALSE	0.009	445.000	0.000	NA		NA
6055939	6055940	BAM_2426	BAM_2425			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6055940	6055941	BAM_2425	BAM_2424			FALSE	0.095	228.000	0.000	NA		NA
6055942	6055943	BAM_2423	BAM_2422			TRUE	0.651	15.000	0.219	NA		NA
6055945	6055946	BAM_2420	BAM_2419			FALSE	0.409	36.000	0.025	NA		NA
6055946	6055947	BAM_2419	BAM_2418			TRUE	0.765	34.000	0.229	1.000	N	NA
6055947	6055948	BAM_2418	BAM_2417			TRUE	0.777	0.000	0.400	NA		NA
6055948	6055949	BAM_2417	BAM_2416			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6055949	6055950	BAM_2416	BAM_2415		bacF	FALSE	0.329	63.000	0.000	NA		NA
6055950	6055951	BAM_2415	BAM_2414	bacF	bacB	FALSE	0.439	32.000	0.000	NA		NA
6055951	6055952	BAM_2414	BAM_2413	bacB	bacE	TRUE	0.954	32.000	0.581	1.000	Y	NA
6055952	6055953	BAM_2413	BAM_2412	bacE	bacC	TRUE	0.974	13.000	0.511	1.000	Y	NA
6055953	6055954	BAM_2412	BAM_2411	bacC	bacA	TRUE	0.944	27.000	0.210	1.000	Y	NA
6055954	6055955	BAM_2411	BAM_2410	bacA		FALSE	0.020	584.000	0.000	NA	N	NA
6055955	6055956	BAM_2410	BAM_2409			TRUE	0.861	-3.000	0.833	NA		NA
6055956	6055957	BAM_2409	BAM_2408			FALSE	0.288	199.000	0.333	NA		NA
6055960	6055961	BAM_2405	BAM_2404			FALSE	0.011	400.000	0.000	NA		NA
6055962	6055963	BAM_2403	BAM_2402			TRUE	0.972	-3.000	0.669	NA	Y	NA
6055963	6055964	BAM_2402	BAM_2401			FALSE	0.586	16.000	0.016	NA		NA
6055964	6055965	BAM_2401	BAM_2400			FALSE	0.318	184.000	0.250	NA		NA
6055966	6055967	BAM_2399	BAM_2398			FALSE	0.588	184.000	0.167	1.000	N	NA
6055968	6055969	BAM_2397	BAM_2396	mmsA1		TRUE	0.855	37.000	0.545	0.001	N	NA
6055969	6055970	BAM_2396	BAM_2395			TRUE	0.970	17.000	0.500	1.000	Y	NA
6055972	6055973	BAM_2393	BAM_2392	prpB	mmgE	TRUE	0.679	19.000	0.218	1.000		NA
6055973	6055974	BAM_2392	BAM_2391	mmgE	mmgD	TRUE	0.692	99.000	0.216	1.000		NA
6055974	6055975	BAM_2391	BAM_2390	mmgD		FALSE	0.011	400.000	0.000	NA		NA
6055975	6055976	BAM_2390	BAM_2389			TRUE	0.665	16.000	0.250	NA		NA
6055976	6055977	BAM_2389	BAM_2388			FALSE	0.023	615.000	0.000	1.000	N	NA
6055979	6055980	BAM_2386	BAM_2385			FALSE	0.033	296.000	0.000	NA		NA
6055982	6055983	BAM_2383	BAM_2382			FALSE	0.009	430.000	0.000	NA		NA
6055983	6055984	BAM_2382	BAM_2381			FALSE	0.240	185.000	0.000	NA		NA
6055984	6055985	BAM_2381	BAM_2380		prsA3	FALSE	0.007	505.000	0.000	NA		NA
6055987	6055988	BAM_2378	BAM_2377			TRUE	0.856	120.000	0.500	NA		NA
6055988	6055989	BAM_2377	BAM_2376			FALSE	0.024	322.000	0.000	NA		NA
6055991	6055992	BAM_2374	BAM_2373			FALSE	0.012	393.000	0.000	NA		NA
6055992	6055993	BAM_2373	BAM_2372			FALSE	0.008	468.000	0.000	NA		NA
6055996	6055997	BAM_2369	BAM_2368			FALSE	0.005	821.000	0.000	NA		NA
6055998	6055999	BAM_2367	BAM_2366			TRUE	0.775	32.000	0.667	1.000		NA
6055999	6056000	BAM_2366	BAM_2365			TRUE	0.889	119.000	0.667	NA		NA
6056000	6056001	BAM_2365	BAM_2364			TRUE	0.780	-3.000	0.500	NA		NA
6056002	6056003	BAM_2363	BAM_2362			FALSE	0.468	37.000	0.000	1.000		NA
6056005	6056006	BAM_2360	BAM_2359			FALSE	0.262	182.000	0.000	NA		NA
6056006	6056007	BAM_2359	BAM_2358			FALSE	0.617	22.000	0.250	NA		NA
6056007	6056008	BAM_2358	BAM_2357			FALSE	0.253	183.000	0.000	NA		NA
6056008	6056009	BAM_2357	BAM_2356			FALSE	0.194	206.000	0.000	1.000		NA
6056009	6056010	BAM_2356	BAM_2354			FALSE	0.056	280.000	0.000	1.000		NA
6056011	6056012	BAM_2355	BAM_2353			FALSE	0.403	57.000	0.233	NA		NA
6056012	6056013	BAM_2353	BAM_2352			FALSE	0.409	-18.000	0.237	NA		NA
6056013	6056014	BAM_2352	BAM_2351			TRUE	0.667	0.000	0.158	NA		NA
6056014	6056015	BAM_2351	BAM_2350			TRUE	0.745	111.000	0.286	NA		NA
6056017	6056018	BAM_2348	BAM_2347			FALSE	0.228	190.000	0.045	NA		NA
6056018	6056019	BAM_2347	BAM_2346			FALSE	0.413	73.000	0.102	NA		NA
6056019	6056020	BAM_2346	BAM_2345		kamA	FALSE	0.612	-3.000	0.124	NA		NA
6056020	6056021	BAM_2345	BAM_2344	kamA	rocR2	FALSE	0.376	211.000	0.000	1.000	N	NA
6056021	6056022	BAM_2344	BAM_2343	rocR2		TRUE	0.869	106.000	0.013	1.000	N	NA
6056022	6056023	BAM_2343	BAM_2342			TRUE	0.955	-3.000	0.084	1.000	Y	NA
6056023	6056024	BAM_2342	BAM_2341			FALSE	0.581	16.000	0.000	NA		NA
6056024	6056025	BAM_2341	BAM_2340		atoD	FALSE	0.363	-15.000	0.000	NA		NA
6056025	6056026	BAM_2340	BAM_2339	atoD		FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6056026	6056027	BAM_2339	BAM_2338			FALSE	0.404	163.000	0.000	NA		NA
6056031	6056032	BAM_2334	BAM_2333			TRUE	0.843	134.000	0.333	0.060		NA
6056034	6056035	BAM_2331	BAM_2330			FALSE	0.043	277.000	0.000	NA		NA
6056035	6056036	BAM_2330	BAM_2329			FALSE	0.603	-10.000	0.400	NA		NA
6056036	6056037	BAM_2329	BAM_2328			TRUE	0.782	106.000	0.400	NA		NA
6056037	6056038	BAM_2328	BAM_2327		arcD	TRUE	0.674	77.000	0.533	NA		NA
6056038	6056039	BAM_2327	BAM_2326	arcD		FALSE	0.357	214.000	0.000	1.000	N	NA
6056039	6056040	BAM_2326	BAM_2325		proV1	TRUE	0.905	4.000	0.218	0.073	N	NA
6056040	6056041	BAM_2325	BAM_2324	proV1		TRUE	0.701	103.000	0.269	NA		NA
6056041	6056042	BAM_2324	BAM_2323			TRUE	0.726	121.000	0.117	NA		NA
6056042	6056043	BAM_2323	BAM_2322			TRUE	0.740	2.000	0.150	1.000		NA
6056043	6056044	BAM_2322	BAM_2321			FALSE	0.561	146.000	0.000	NA		NA
6056044	6056045	BAM_2321	BAM_2320			FALSE	0.407	35.000	0.000	NA		NA
6056045	6056046	BAM_2320	BAM_2319			FALSE	0.503	152.000	0.000	NA		NA
6056046	6056047	BAM_2319	BAM_2318			FALSE	0.366	43.000	0.000	NA		NA
6056047	6056048	BAM_2318	BAM_2317			FALSE	0.008	493.000	0.000	NA		NA
6056048	6056049	BAM_2317	BAM_2316			FALSE	0.488	154.000	0.000	NA		NA
6056049	6056050	BAM_2316	BAM_2315			FALSE	0.488	154.000	0.000	NA		NA
6056051	6056052	BAM_2314	BAM_2313			TRUE	0.972	-3.000	0.500	0.025	Y	NA
6056053	6056054	BAM_2312	BAM_2311			FALSE	0.037	289.000	0.000	NA		NA
6056054	6056055	BAM_2311	BAM_2310			FALSE	0.615	10.000	0.000	NA		NA
6056055	6056056	BAM_2310	BAM_2309			TRUE	0.637	6.000	0.000	NA		NA
6056056	6056057	BAM_2309	BAM_2308			TRUE	0.968	14.000	0.250	0.016	Y	NA
6056057	6056058	BAM_2308	BAM_2307			TRUE	0.863	151.000	0.400	1.000	N	NA
6056058	6056059	BAM_2307	BAM_2306			FALSE	0.099	299.000	0.000	NA	N	NA
6056061	6056062	BAM_2304	BAM_2303			FALSE	0.017	351.000	0.000	NA		NA
6056062	6056063	BAM_2303	BAM_2302			TRUE	0.761	128.000	0.263	NA		NA
6056063	6056064	BAM_2302	BAM_2301			FALSE	0.058	260.000	0.000	NA		NA
6056064	6056065	BAM_2301	BAM_2300		dat1	TRUE	0.853	99.000	0.175	1.000	N	NA
6056065	6056066	BAM_2300	BAM_2299	dat1		TRUE	0.952	132.000	0.778	1.000	N	NA
6056066	6056067	BAM_2299	BAM_2298			FALSE	0.561	146.000	0.000	NA		NA
6056067	6056068	BAM_2298	BAM_2297			FALSE	0.404	163.000	0.000	NA		NA
6056068	6056069	BAM_2297	BAM_2296			TRUE	0.685	43.000	0.667	NA		NA
6056069	6056070	BAM_2296	BAM_2295		asnO3	FALSE	0.636	94.000	0.108	1.000		NA
6056074	6056075	BAM_2291	BAM_2290			TRUE	0.862	132.000	0.577	NA		NA
6056075	6056076	BAM_2290	BAM_2289			FALSE	0.386	-16.000	0.095	NA		NA
6056076	6056077	BAM_2289	BAM_2288			FALSE	0.083	237.000	0.000	NA		NA
6056077	6056078	BAM_2288	BAM_2287			TRUE	0.927	43.000	0.500	NA	Y	NA
6056081	6056082	BAM_4456	BAM_4455	recN	spoIVB	TRUE	0.678	128.000	0.000	NA		NA
6056082	6056083	BAM_4455	BAM_4454	spoIVB	spo0A	FALSE	0.292	252.000	0.393	1.000	N	NA
6056083	6056084	BAM_4454	BAM_4453	spo0A		FALSE	0.032	298.000	0.000	NA		NA
6056088	6056089	BAM_4449	BAM_4448		yqiS	FALSE	0.562	196.000	0.333	1.000	N	NA
6056089	6056090	BAM_4448	BAM_4447	yqiS		TRUE	0.813	35.000	0.431	1.000	N	NA
6056090	6056091	BAM_4447	BAM_4446		buk	TRUE	0.861	88.000	0.490	1.000	N	NA
6056091	6056092	BAM_4446	BAM_4445	buk	bfmbC	TRUE	0.972	5.000	0.172	0.031	Y	NA
6056092	6056093	BAM_4445	BAM_4444	bfmbC	bfmbAa	TRUE	0.954	28.000	0.414	1.000	Y	NA
6056093	6056094	BAM_4444	BAM_4443	bfmbAa	bfmbAb	TRUE	0.984	14.000	0.897	0.000	Y	NA
6056094	6056095	BAM_4443	BAM_4442	bfmbAb	bfmbB	TRUE	0.982	16.000	0.882	0.060	Y	NA
6056095	6056096	BAM_4442	BAM_4441	bfmbB		FALSE	0.070	342.000	0.000	1.000	N	NA
6056096	6056097	BAM_4441	BAM_4440			TRUE	0.700	167.000	0.000	1.000	N	NA
6056097	6056098	BAM_4440	BAM_4439			FALSE	0.461	35.000	0.182	NA		NA
6056098	6056099	BAM_4439	BAM_4438			TRUE	0.712	122.000	0.078	NA		NA
6056099	6056100	BAM_4438	BAM_4437			FALSE	0.498	89.000	0.039	NA		NA
6056100	6056101	BAM_4437	BAM_4436			TRUE	0.654	12.000	0.148	NA		NA
6056101	6056102	BAM_4436	BAM_4435			FALSE	0.391	37.000	0.000	NA		NA
6056102	6056103	BAM_4435	BAM_4434			FALSE	0.460	-7.000	0.000	NA		NA
6056103	6056104	BAM_4434	BAM_4433			FALSE	0.598	97.000	0.110	NA		NA
6056104	6056105	BAM_4433	BAM_4432			TRUE	0.657	17.000	0.250	NA		NA
6056105	6056106	BAM_4432	BAM_4431			FALSE	0.433	67.000	0.267	NA		NA
6056108	6056109	BAM_4429	BAM_4428			TRUE	0.897	128.000	0.062	1.000	N	NA
6056113	6056114	BAM_4424	BAM_4423	rnz		FALSE	0.007	551.000	0.000	NA		NA
6056114	6056115	BAM_4423	BAM_4422		sdaAB2	FALSE	0.433	38.000	0.118	NA		NA
6056115	6056116	BAM_4422	BAM_4421	sdaAB2	sdaAA2	TRUE	0.968	19.000	0.353	0.001	Y	NA
6056118	6056119	BAM_4419	BAM_4418			TRUE	0.724	10.000	0.188	1.000		NA
6056121	6056122	BAM_4416	BAM_4415	argC	argJ	TRUE	0.972	12.000	0.303	0.001	Y	NA
6056122	6056123	BAM_4415	BAM_4414	argJ	argB	TRUE	0.968	12.000	0.067	0.001	Y	NA
6056123	6056124	BAM_4414	BAM_4413	argB	argD	TRUE	0.962	-3.000	0.322	1.000	Y	NA
6056124	6056125	BAM_4413	BAM_4412	argD	argF	TRUE	0.960	13.000	0.037	1.000	Y	NA
6056125	6056126	BAM_4412	BAM_4411	argF		FALSE	0.282	180.000	0.008	NA		NA
6056126	6056127	BAM_4411	BAM_4410			FALSE	0.625	59.000	0.600	NA		NA
6056128	6056129	BAM_4409	BAM_4408			TRUE	0.784	73.000	0.421	1.000	N	NA
6056131	6056132	BAM_4406	BAM_4405	nhaC3		FALSE	0.071	248.000	0.000	NA		NA
6056133	6056134	BAM_4403	BAM_4404			FALSE	0.225	-350.000	0.000	NA		NA
6056134	6056135	BAM_4404	BAM_4402		bioA	FALSE	0.503	152.000	0.000	NA		NA
6056135	6056136	BAM_4402	BAM_4401	bioA	bioD	TRUE	0.969	0.000	0.053	0.001	Y	NA
6056136	6056137	BAM_4401	BAM_4400	bioD	bioF	TRUE	0.876	-34.000	0.107	0.001	Y	NA
6056137	6056138	BAM_4400	BAM_4399	bioF		FALSE	0.613	-3.000	0.128	NA		NA
6056138	6056139	BAM_4399	BAM_4398			FALSE	0.303	-34.000	0.163	NA		NA
6056139	6056140	BAM_4398	BAM_4397		bioB	TRUE	0.899	2.000	0.022	0.001	N	NA
6056140	6056141	BAM_4397	BAM_4395	bioB		FALSE	0.255	183.000	0.010	NA		NA
6056142	6056143	BAM_4396	BAM_4394	ribH	ribBA	TRUE	0.960	19.000	0.034	0.001	Y	NA
6056143	6056144	BAM_4394	BAM_4393	ribBA	ribE	TRUE	0.960	13.000	0.040	1.000	Y	NA
6056144	6056145	BAM_4393	BAM_4392	ribE	ribD	TRUE	0.922	-18.000	0.456	1.000	Y	NA
6056145	6056146	BAM_4392	BAM_4391	ribD		FALSE	0.005	645.000	0.000	NA		NA
6056149	6056150	BAM_4388	BAM_4387			TRUE	0.676	100.000	0.068	1.000		NA
6056151	6056152	BAM_4386	BAM_4385			TRUE	0.743	132.000	0.059	1.000		NA
6056155	6056156	BAM_4382	BAM_4381			FALSE	0.524	70.000	0.381	NA		NA
6056156	6056157	BAM_4381	BAM_4380			TRUE	0.834	129.000	0.444	NA		NA
6056158	6056159	BAM_4379	BAM_4378	lolS		FALSE	0.387	54.000	0.140	NA		NA
6056162	6056163	BAM_4375	BAM_4374	spoIIM		TRUE	0.763	107.000	0.341	NA		NA
6056163	6056164	BAM_4374	BAM_4373			TRUE	0.717	104.000	0.284	NA		NA
6056164	6056165	BAM_4373	BAM_4372			TRUE	0.815	7.000	0.476	NA		NA
6056165	6056166	BAM_4372	BAM_4371			FALSE	0.632	144.000	0.167	NA		NA
6056166	6056167	BAM_4371	BAM_4370		deoB	FALSE	0.011	406.000	0.000	NA		NA
6056167	6056168	BAM_4370	BAM_4369	deoB		TRUE	0.925	13.000	0.609	1.000	N	NA
6056168	6056169	BAM_4369	BAM_4368		pyn2	TRUE	0.965	8.000	0.084	1.000	Y	NA
6056169	6056170	BAM_4368	BAM_4367	pyn2	corA	TRUE	0.718	75.000	0.031	1.000	N	NA
6056171	6056172	BAM_4366	BAM_4365			TRUE	0.667	135.000	0.058	NA		NA
6056176	6056177	BAM_4361	BAM_4360			FALSE	0.467	-10.000	0.133	NA		NA
6056177	6056178	BAM_4360	BAM_4359			FALSE	0.605	-34.000	0.149	1.000	N	NA
6056179	6056180	BAM_4358	BAM_4357	dacF	spoIIAA	TRUE	0.711	171.000	0.276	1.000	N	NA
6056180	6056181	BAM_4357	BAM_4356	spoIIAA	spoIIAB	TRUE	0.983	1.000	0.669	0.001	Y	NA
6056181	6056182	BAM_4356	BAM_4355	spoIIAB	sigF	TRUE	0.941	13.000	0.842	1.000	N	NA
6056182	6056183	BAM_4355	BAM_4354	sigF		TRUE	0.718	138.000	0.067	1.000		NA
6056183	6056184	BAM_4354	BAM_4353			FALSE	0.296	-24.000	0.000	NA		NA
6056184	6056185	BAM_4353	BAM_4352		spoVAA	TRUE	0.666	116.000	0.000	NA		NA
6056185	6056186	BAM_4352	BAM_4351	spoVAA	spoVAB	TRUE	0.820	-7.000	0.923	NA		NA
6056186	6056187	BAM_4351	BAM_4350	spoVAB		TRUE	0.682	15.000	0.260	NA		NA
6056187	6056188	BAM_4350	BAM_4349			TRUE	0.836	14.000	0.615	NA		NA
6056188	6056189	BAM_4349	BAM_4348		spoVAE	TRUE	0.897	4.000	0.808	NA		NA
6056189	6056190	BAM_4348	BAM_4347	spoVAE		TRUE	0.697	24.000	0.400	NA		NA
6056190	6056191	BAM_4347	BAM_4346		spoVAF	TRUE	0.688	-13.000	0.650	NA		NA
6056191	6056192	BAM_4346	BAM_4345	spoVAF		TRUE	0.676	97.000	0.219	1.000		NA
6056194	6056195	BAM_4343	BAM_4342			FALSE	0.086	236.000	0.015	NA		NA
6056195	6056196	BAM_4342	BAM_4341		ribT	FALSE	0.361	69.000	0.051	NA		NA
6056197	6056198	BAM_4340	BAM_4339			FALSE	0.579	99.000	0.024	NA		NA
6056199	6056200	BAM_4338	BAM_4336	scpA	scpB	TRUE	0.719	159.000	0.570	NA		NA
6056200	6056201	BAM_4336	BAM_4335	scpB		FALSE	0.434	79.000	0.012	NA		NA
6056201	6056202	BAM_4335	BAM_4334		nagA	FALSE	0.188	209.000	0.028	1.000		NA
6056202	6056203	BAM_4334	BAM_4333	nagA	nagB	TRUE	0.974	5.000	0.194	0.000	Y	NA
6056203	6056204	BAM_4333	BAM_4332	nagB		TRUE	0.873	104.000	0.128	1.000	N	NA
6056206	6056207	BAM_4330	BAM_4329	glcT	ptsG	FALSE	0.027	339.000	0.000	1.000		NA
6056207	6056208	BAM_4329	BAM_4328	ptsG	ptsH1	TRUE	0.972	135.000	0.054	0.005	Y	NA
6056208	6056209	BAM_4328	BAM_4327	ptsH1	ptsI	TRUE	0.970	0.000	0.132	0.005	Y	NA
6056210	6056211	BAM_4326	BAM_4325			FALSE	0.517	197.000	0.800	NA		NA
6056211	6056212	BAM_4325	BAM_4324			FALSE	0.038	287.000	0.000	NA		NA
6056213	6056214	BAM_4323	BAM_4322			FALSE	0.329	61.000	0.000	NA		NA
6056214	6056215	BAM_4322	BAM_4321			FALSE	0.055	263.000	0.000	NA		NA
6056215	6056216	BAM_4321	BAM_4320			FALSE	0.337	54.000	0.000	NA		NA
6056216	6056217	BAM_4320	BAM_4319			FALSE	0.635	2.000	0.000	NA		NA
6056218	6056219	BAM_4318	BAM_4317			FALSE	0.029	307.000	0.000	NA		NA
6056219	6056220	BAM_4317	BAM_4316			FALSE	0.405	-22.000	0.087	1.000		NA
6056220	6056221	BAM_4316	BAM_4315		mtnX	TRUE	0.859	-3.000	0.253	1.000	N	NA
6056221	6056222	BAM_4315	BAM_4314	mtnX	mtnW	TRUE	0.894	-3.000	0.304	0.000	N	NA
6056222	6056223	BAM_4314	BAM_4313	mtnW		FALSE	0.269	237.000	0.043	1.000	N	NA
6056224	6056225	BAM_4312	BAM_4311			FALSE	0.040	305.000	0.000	1.000		NA
6056225	6056226	BAM_4311	BAM_4310			TRUE	0.670	-3.000	0.104	1.000		NA
6056226	6056227	BAM_4310	BAM_4309			FALSE	0.390	75.000	0.011	NA		NA
6056229	6056230	BAM_4307	BAM_4306			TRUE	0.668	0.000	0.185	NA		NA
6056230	6056231	BAM_4306	BAM_4305			TRUE	0.731	17.000	0.375	NA		NA
6056231	6056232	BAM_4305	BAM_4304			FALSE	0.523	23.000	0.000	NA		NA
6056232	6056233	BAM_4304	BAM_4303			TRUE	0.637	81.000	0.400	NA		NA
6056235	6056236	BAM_4301	BAM_4300			TRUE	0.804	110.000	0.429	NA		NA
6056236	6056237	BAM_4300	BAM_4299			TRUE	0.874	140.000	0.171	1.000	N	NA
6056239	6056240	BAM_4297	BAM_4295			FALSE	0.451	36.000	0.125	NA		NA
6056242	6056243	BAM_4294	BAM_4293			FALSE	0.390	178.000	0.273	NA		NA
6056243	6056244	BAM_4293	BAM_4292			FALSE	0.547	65.000	0.444	NA		NA
6056248	6056249	BAM_4288	BAM_4287		malC	TRUE	0.944	65.000	0.815	1.000	Y	NA
6056249	6056250	BAM_4287	BAM_4286	malC	malD	TRUE	0.986	1.000	0.885	0.025	Y	NA
6056250	6056251	BAM_4286	BAM_4285	malD		TRUE	0.675	4.000	0.077	NA		NA
6056251	6056252	BAM_4285	BAM_4284		malR	FALSE	0.415	164.000	0.045	NA		NA
6056253	6056254	BAM_4283	BAM_4282			TRUE	0.730	123.000	0.184	NA		NA
6056257	6056258	BAM_4279	BAM_4278		comI	FALSE	0.465	76.000	0.222	NA		NA
6056258	6056259	BAM_4278	BAM_4277	comI	comJ	TRUE	0.641	37.000	0.500	NA		NA
6056260	6056261	BAM_4276	BAM_4275	metE		FALSE	0.019	618.000	0.000	NA	N	NA
6056261	6056262	BAM_4275	BAM_4274			TRUE	0.863	92.000	0.500	NA	N	NA
6056265	6056266	BAM_4271	BAM_4270			FALSE	0.008	467.000	0.000	NA		NA
6056266	6056267	BAM_4270	BAM_4269			FALSE	0.329	60.000	0.000	NA		NA
6056269	6056270	BAM_4267	BAM_4266		ppk	FALSE	0.634	109.000	0.000	NA		NA
6056271	6056272	BAM_4264	BAM_4263			TRUE	0.723	98.000	0.381	NA		NA
6056273	6056274	BAM_4262	BAM_4261			FALSE	0.183	256.000	0.043	NA	N	NA
6056274	6056275	BAM_4261	BAM_4260			TRUE	0.667	0.000	0.139	NA		NA
6056275	6056276	BAM_4260	BAM_4259			TRUE	0.764	16.000	0.429	NA		NA
6056278	6056279	BAM_4257	BAM_4256			FALSE	0.129	212.000	0.000	NA		NA
6056279	6056280	BAM_4256	BAM_4255			FALSE	0.418	75.000	0.074	NA		NA
6056280	6056281	BAM_4255	BAM_4254			TRUE	0.683	109.000	0.176	NA		NA
6056281	6056282	BAM_4254	BAM_4253			FALSE	0.392	170.000	0.120	NA		NA
6056282	6056283	BAM_4253	BAM_4252			TRUE	0.959	142.000	0.214	NA	Y	NA
6056283	6056284	BAM_4252	BAM_4251			TRUE	0.712	72.000	0.121	1.000	N	NA
6056284	6056285	BAM_4251	BAM_4250			FALSE	0.548	62.000	0.372	1.000		NA
6056285	6056286	BAM_4250	BAM_4249			FALSE	0.062	255.000	0.000	NA		NA
6056286	6056287	BAM_4249	BAM_4248			FALSE	0.516	84.000	0.163	NA		NA
6056288	6056289	BAM_4247	BAM_4246			TRUE	0.853	5.000	0.576	NA		NA
6056291	6056292	BAM_4244	BAM_4243	def2		FALSE	0.571	147.000	0.059	NA		NA
6056293	6056294	BAM_4242	BAM_4241	pdhA	pdhB	TRUE	0.981	4.000	0.484	0.001	Y	NA
6056294	6056295	BAM_4241	BAM_4240	pdhB	pdhC	TRUE	0.977	93.000	0.883	0.058	Y	NA
6056295	6056296	BAM_4240	BAM_4239	pdhC	pdhD	TRUE	0.985	6.000	0.948	1.000	Y	NA
6056296	6056297	BAM_4239	BAM_4238	pdhD		FALSE	0.080	238.000	0.000	NA		NA
6056299	6056300	BAM_4236	BAM_4235			FALSE	0.362	196.000	0.438	NA		NA
6056300	6056301	BAM_4235	BAM_4233			TRUE	0.843	1.000	0.571	NA		NA
6056301	6056302	BAM_4233	BAM_4232			TRUE	0.758	36.000	0.800	NA		NA
6056303	6056304	BAM_4231	BAM_4230		speA	FALSE	0.379	74.000	0.000	NA		NA
6056307	6056308	BAM_4457	BAM_4458		dxs	TRUE	0.645	4.000	0.000	NA		NA
6056308	6056309	BAM_4458	BAM_4459	dxs	ispA	FALSE	0.338	302.000	0.024	1.000	Y	NA
6056309	6056310	BAM_4459	BAM_4460	ispA	xseB	TRUE	0.873	0.000	0.100	1.000	N	NA
6056310	6056311	BAM_4460	BAM_4461	xseB	xseA	TRUE	0.949	-10.000	0.412	0.000	Y	NA
6056311	6056312	BAM_4461	BAM_4462	xseA	folD	TRUE	0.801	27.000	0.058	1.000	N	NA
6056312	6056313	BAM_4462	BAM_4463	folD	nusB	TRUE	0.814	24.000	0.056	1.000	N	NA
6056313	6056314	BAM_4463	BAM_4464	nusB		FALSE	0.018	347.000	0.023	NA		NA
6056314	6056315	BAM_4464	BAM_4465		accC	TRUE	0.688	23.000	0.373	NA		NA
6056315	6056316	BAM_4465	BAM_4466	accC	accB	TRUE	0.964	17.000	0.086	0.001	Y	NA
6056316	6056317	BAM_4466	BAM_4467	accB		FALSE	0.005	758.000	0.020	NA		NA
6056317	6056318	BAM_4467	BAM_4468		spoIIIAG	TRUE	0.803	16.000	0.509	NA		NA
6056318	6056319	BAM_4468	BAM_4469	spoIIIAG	spoIIIAF	TRUE	0.789	-10.000	0.907	NA		NA
6056319	6056320	BAM_4469	BAM_4470	spoIIIAF	spoIIIAE	TRUE	0.888	13.000	0.918	NA		NA
6056320	6056321	BAM_4470	BAM_4471	spoIIIAE	spoIIIAD	TRUE	0.887	11.000	0.864	NA		NA
6056321	6056322	BAM_4471	BAM_4472	spoIIIAD	spoIIIAC	TRUE	0.905	111.000	0.895	NA		NA
6056322	6056323	BAM_4472	BAM_4473	spoIIIAC	spoIIIAB	TRUE	0.885	15.000	0.926	NA		NA
6056323	6056324	BAM_4473	BAM_4474	spoIIIAB	spoIIIAA	TRUE	0.767	-6.000	0.604	NA		NA
6056324	6056325	BAM_4474	BAM_4475	spoIIIAA		FALSE	0.527	29.000	0.148	NA		NA
6056326	6056327	BAM_4476	BAM_4477			FALSE	0.612	-19.000	0.583	NA		NA
6056328	6056329	BAM_4478	BAM_4479	efp	pepQ1	TRUE	0.827	23.000	0.160	1.000	N	NA
6056329	6056330	BAM_4479	BAM_4480	pepQ1	aroQ	TRUE	0.969	5.000	0.168	1.000	Y	NA
6056330	6056331	BAM_4480	BAM_4481	aroQ		FALSE	0.356	53.000	0.044	NA		NA
6056332	6056333	BAM_4482	BAM_4484			FALSE	0.495	80.000	0.140	NA		NA
6056334	6056335	BAM_4483	BAM_4485			FALSE	0.432	54.000	0.064	1.000		NA
6056335	6056336	BAM_4485	BAM_4486		splB	TRUE	0.852	145.000	0.110	1.000	N	NA
6056336	6056337	BAM_4486	BAM_4487	splB		FALSE	0.441	79.000	0.027	NA		NA
6056340	6056341	BAM_4490	BAM_4491			FALSE	0.197	250.000	0.000	NA	N	NA
6056341	6056342	BAM_4491	BAM_4492			TRUE	0.969	103.000	0.258	0.045	Y	NA
6056342	6056343	BAM_4492	BAM_4493		sugE1	TRUE	0.730	72.000	0.258	1.000	N	NA
6056343	6056344	BAM_4493	BAM_4494	sugE1	sugE2	TRUE	0.984	2.000	0.727	0.047	Y	NA
6056344	6056345	BAM_4494	BAM_4495	sugE2		TRUE	0.858	16.000	0.750	NA		NA
6056346	6056347	BAM_4496	BAM_4497			FALSE	0.069	249.000	0.000	NA		NA
6056347	6056348	BAM_4497	BAM_4498			TRUE	0.718	14.000	0.308	NA		NA
6056348	6056349	BAM_4498	BAM_4499			TRUE	0.716	33.000	0.600	NA		NA
6056349	6056350	BAM_4499	BAM_4500			FALSE	0.589	15.000	0.000	NA		NA
6056350	6056351	BAM_4500	BAM_4501			FALSE	0.326	-19.000	0.000	NA		NA
6056351	6056352	BAM_4501	BAM_4502			TRUE	0.903	4.000	0.292	1.000	N	NA
6056352	6056353	BAM_4502	BAM_4503			TRUE	0.903	117.000	0.778	NA		NA
6056353	6056354	BAM_4503	BAM_4504			TRUE	0.742	71.000	0.889	NA		NA
6056354	6056355	BAM_4504	BAM_4505		yqhK	FALSE	0.034	293.000	0.000	NA		NA
6056355	6056356	BAM_4505	BAM_4506	yqhK	yqhJ	TRUE	0.968	-3.000	0.316	0.000	Y	NA
6056356	6056357	BAM_4506	BAM_4507	yqhJ	gcvT	TRUE	0.959	21.000	0.092	0.001	Y	NA
6056358	6056359	BAM_4508	BAM_4509			FALSE	0.377	-13.000	0.000	NA		NA
6056360	6056361	BAM_4510	BAM_4511			TRUE	0.645	98.000	0.250	NA		NA
6056362	6056363	BAM_4512	BAM_4513			TRUE	0.779	130.000	0.312	NA		NA
6056364	6056365	BAM_4514	BAM_4515		aroK	FALSE	0.552	39.000	0.375	NA		NA
6056367	6056368	BAM_4516	BAM_4518			FALSE	0.093	229.000	0.000	NA		NA
6056368	6056369	BAM_4518	BAM_4519			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6056369	6056370	BAM_4519	BAM_4520			TRUE	0.685	90.000	0.417	NA		NA
6056370	6056371	BAM_4520	BAM_4521		comGD	FALSE	0.508	-7.000	0.109	NA		NA
6056371	6056372	BAM_4521	BAM_4522	comGD	comGC	TRUE	0.696	-3.000	0.320	NA		NA
6056372	6056373	BAM_4522	BAM_4523	comGC	comGB	TRUE	0.984	12.000	0.861	0.001	Y	NA
6056373	6056374	BAM_4523	BAM_4524	comGB	comGA	TRUE	0.960	-7.000	0.639	1.000	Y	NA
6056375	6056376	BAM_4525	BAM_4526			TRUE	0.837	126.000	0.432	NA		NA
6056376	6056377	BAM_4526	BAM_4527			TRUE	0.647	108.000	0.045	NA		NA
6056378	6056379	BAM_4528	BAM_4529			TRUE	0.799	88.000	0.750	NA		NA
6056381	6056382	BAM_4531	BAM_4532			FALSE	0.495	80.000	0.175	NA		NA
6056382	6056383	BAM_4532	BAM_4533			FALSE	0.594	96.000	0.175	NA		NA
6056383	6056384	BAM_4533	BAM_4534		murG2	FALSE	0.543	96.000	0.010	NA		NA
6056384	6056385	BAM_4534	BAM_4535	murG2	metH	FALSE	0.555	19.000	0.000	NA		NA
6056385	6056386	BAM_4535	BAM_4536	metH		FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6056386	6056387	BAM_4536	BAM_4537			TRUE	0.644	5.000	0.000	NA		NA
6056388	6056389	BAM_4538	BAM_4539	metI		TRUE	0.976	-3.000	0.600	0.004	Y	NA
6056389	6056390	BAM_4539	BAM_4540			TRUE	0.892	130.000	0.055	1.000	N	NA
6056390	6056391	BAM_4540	BAM_4541			FALSE	0.036	433.000	0.000	1.000	N	NA
6056392	6056393	BAM_4542	BAM_4543			FALSE	0.621	10.000	0.021	NA		NA
6056395	6056396	BAM_4545	BAM_4546	glcK		TRUE	0.761	20.000	0.496	NA		NA
6056396	6056397	BAM_4546	BAM_4547			FALSE	0.614	104.000	0.010	NA		NA
6056397	6056398	BAM_4547	BAM_4548		rpmG2	TRUE	0.869	105.000	0.045	1.000	N	NA
6056398	6056399	BAM_4548	BAM_4549	rpmG2		TRUE	0.679	70.000	0.009	1.000	N	NA
6056399	6056400	BAM_4549	BAM_4550			FALSE	0.044	376.000	0.000	NA	N	NA
6056400	6056401	BAM_4550	BAM_4551		pstB	TRUE	0.931	156.000	0.118	NA	Y	NA
6056401	6056402	BAM_4551	BAM_4552	pstB	pstA	TRUE	0.947	29.000	0.125	0.002	Y	NA
6056402	6056403	BAM_4552	BAM_4553	pstA	pstC	TRUE	0.980	2.000	0.485	0.002	Y	NA
6056403	6056404	BAM_4553	BAM_4554	pstC	phoX	TRUE	0.940	28.000	0.077	1.000	Y	NA
6056404	6056405	BAM_4554	BAM_4555	phoX		FALSE	0.079	332.000	0.000	1.000	N	NA
6056405	6056406	BAM_4555	BAM_4556			TRUE	0.686	110.000	0.157	NA		NA
6056406	6056407	BAM_4556	BAM_4557		sodA1	TRUE	0.712	116.000	0.157	NA		NA
6056407	6056408	BAM_4557	BAM_4558	sodA1		FALSE	0.113	218.000	0.000	NA		NA
6056409	6056410	BAM_4559	BAM_4560			FALSE	0.416	72.000	0.195	NA		NA
6056410	6056411	BAM_4560	BAM_4561		gcpE	FALSE	0.477	156.000	0.022	NA		NA
6056412	6056413	BAM_4562	BAM_4563			TRUE	0.975	9.000	0.480	1.000	Y	NA
6056413	6056414	BAM_4563	BAM_4564			TRUE	0.974	0.000	0.389	0.078	Y	NA
6056414	6056415	BAM_4564	BAM_4565			FALSE	0.166	242.000	0.440	NA		NA
6056417	6056418	BAM_4567	BAM_4568	nfo		FALSE	0.626	231.000	0.104	1.000	Y	NA
6056421	6056422	BAM_4570	BAM_4572		lytB	FALSE	0.371	167.000	0.000	NA		NA
6056423	6056424	BAM_4573	BAM_4574			FALSE	0.614	-3.000	0.138	NA		NA
6056424	6056425	BAM_4574	BAM_4575		cccA	FALSE	0.404	166.000	0.057	NA		NA
6056425	6056426	BAM_4575	BAM_4576	cccA	sigA	FALSE	0.017	386.000	0.009	1.000		NA
6056426	6056427	BAM_4576	BAM_4577	sigA	dnaG	FALSE	0.329	60.000	0.000	NA		NA
6056429	6056430	BAM_4578	BAM_4580			FALSE	0.218	189.000	0.000	NA		NA
6056430	6056431	BAM_4580	BAM_4581			FALSE	0.373	48.000	0.050	NA		NA
6056431	6056432	BAM_4581	BAM_4582			TRUE	0.751	30.000	0.621	NA		NA
6056432	6056433	BAM_4582	BAM_4583		recO	TRUE	0.703	108.000	0.013	1.000		NA
6056433	6056434	BAM_4583	BAM_4584	recO		FALSE	0.424	34.000	0.020	NA		NA
6056434	6056435	BAM_4584	BAM_4585		era	FALSE	0.311	177.000	0.040	NA		NA
6056435	6056436	BAM_4585	BAM_4586	era	cdd2	FALSE	0.573	-7.000	0.098	1.000		NA
6056436	6056437	BAM_4586	BAM_4587	cdd2	dgkA	TRUE	0.858	100.000	0.179	1.000	N	NA
6056437	6056438	BAM_4587	BAM_4588	dgkA		FALSE	0.612	-3.000	0.123	NA		NA
6056438	6056439	BAM_4588	BAM_4589			FALSE	0.614	-3.000	0.182	NA		NA
6056439	6056440	BAM_4589	BAM_4590			FALSE	0.290	194.000	0.172	1.000		NA
6056440	6056441	BAM_4590	BAM_4591			TRUE	0.690	4.000	0.114	NA		NA
6056441	6056442	BAM_4591	BAM_4592			FALSE	0.419	-10.000	0.018	NA		NA
6056442	6056443	BAM_4592	BAM_4593		yqfC	FALSE	0.415	77.000	0.019	NA		NA
6056443	6056444	BAM_4593	BAM_4594	yqfC		TRUE	0.644	109.000	0.029	NA		NA
6056444	6056445	BAM_4594	BAM_4595		rpsU	TRUE	0.755	16.000	0.150	0.010		NA
6056445	6056446	BAM_4595	BAM_4596	rpsU		FALSE	0.030	331.000	0.016	1.000		NA
6056446	6056447	BAM_4596	BAM_4597			TRUE	0.678	7.000	0.163	NA		NA
6056447	6056448	BAM_4597	BAM_4598		prmA	FALSE	0.630	146.000	0.227	NA		NA
6056448	6056449	BAM_4598	BAM_4599	prmA	dnaJ	TRUE	0.797	29.000	0.133	1.000	N	NA
6056449	6056450	BAM_4599	BAM_4600	dnaJ	dnaK	TRUE	0.786	205.000	0.196	0.001	Y	NA
6056450	6056451	BAM_4600	BAM_4601	dnaK	grpE	TRUE	0.952	27.000	0.224	0.003	Y	NA
6056451	6056452	BAM_4601	BAM_4602	grpE	hrcA	TRUE	0.907	115.000	0.286	1.000	N	NA
6056452	6056453	BAM_4602	BAM_4603	hrcA	hemN	TRUE	0.887	134.000	0.082	1.000	N	NA
6056453	6056454	BAM_4603	BAM_4604	hemN		TRUE	0.643	56.000	0.084	NA	N	NA
6056454	6056455	BAM_4604	BAM_4605		lepA	TRUE	0.867	132.000	0.007	NA	N	NA
6056455	6056456	BAM_4605	BAM_4606	lepA		FALSE	0.133	211.000	0.008	NA		NA
6056456	6056457	BAM_4606	BAM_4607		gpr	TRUE	0.710	0.000	0.265	NA		NA
6056461	6056462	BAM_4611	BAM_4612		comEC	FALSE	0.503	152.000	0.000	NA		NA
6056462	6056463	BAM_4612	BAM_4613	comEC	comEB	FALSE	0.589	15.000	0.000	NA		NA
6056463	6056464	BAM_4613	BAM_4614	comEB	comEA	TRUE	0.676	63.000	0.095	1.000	N	NA
6056466	6056467	BAM_4616	BAM_4617			FALSE	0.597	-3.000	0.085	NA		NA
6056467	6056468	BAM_4617	BAM_4618			FALSE	0.613	-3.000	0.149	NA		NA
6056468	6056469	BAM_4618	BAM_4619		nadD	TRUE	0.924	-10.000	0.199	1.000	Y	NA
6056469	6056470	BAM_4619	BAM_4620	nadD		FALSE	0.233	-70.000	0.000	NA		NA
6056470	6056471	BAM_4620	BAM_4621			FALSE	0.589	101.000	0.000	NA		NA
6056471	6056472	BAM_4621	BAM_4622		aroE	TRUE	0.864	6.000	0.089	NA	N	NA
6056472	6056473	BAM_4622	BAM_4623	aroE		TRUE	0.766	16.000	0.336	1.000		NA
6056473	6056474	BAM_4623	BAM_4624			TRUE	0.849	4.000	0.555	NA		NA
6056476	6056477	BAM_4626	BAM_4627	psd	sigK	FALSE	0.125	292.000	0.000	1.000	N	NA
6056479	6056480	BAM_4629	BAM_4630		rpmG3	FALSE	0.356	71.000	0.007	NA		NA
6056480	6056481	BAM_4630	BAM_4631	rpmG3		TRUE	0.840	145.000	0.006	1.000	N	NA
6056482	6056483	BAM_4632	BAM_4633			FALSE	0.322	173.000	0.000	NA		NA
6056484	6056485	BAM_4634	BAM_4635			FALSE	0.455	55.000	0.292	NA		NA
6056486	6056487	BAM_4636	BAM_4637			TRUE	0.840	16.000	0.667	NA		NA
6056488	6056489	BAM_4638	BAM_4639			FALSE	0.054	265.000	0.000	NA		NA
6056489	6056490	BAM_4639	BAM_4640			TRUE	0.729	19.000	0.400	NA		NA
6056491	6056492	BAM_4641	BAM_4642			TRUE	0.706	71.000	0.750	NA		NA
6056494	6056495	BAM_4644	BAM_4645	vpr		TRUE	0.815	125.000	0.375	NA		NA
6056495	6056496	BAM_4645	BAM_4646			FALSE	0.589	143.000	0.000	NA		NA
6056496	6056497	BAM_4646	BAM_4647			FALSE	0.126	213.000	0.000	NA		NA
6056497	6056498	BAM_4647	BAM_4648			TRUE	0.664	-19.000	0.044	1.000	N	NA
6056499	6056500	BAM_4649	BAM_4650			FALSE	0.557	22.000	0.064	NA		NA
6056502	6056503	BAM_4652	BAM_4653			TRUE	0.867	112.000	0.438	0.057		NA
6056503	6056504	BAM_4653	BAM_4654			FALSE	0.501	57.000	0.081	0.057		NA
6056504	6056505	BAM_4654	BAM_4655			FALSE	0.029	306.000	0.000	NA		NA
6056505	6056506	BAM_4655	BAM_4656			FALSE	0.382	-33.000	0.300	NA		NA
6056506	6056507	BAM_4656	BAM_4657			TRUE	0.926	-13.000	0.360	1.000	Y	NA
6056507	6056508	BAM_4657	BAM_4658			TRUE	0.984	6.000	0.889	1.000	Y	NA
6056508	6056509	BAM_4658	BAM_4659			FALSE	0.529	157.000	0.222	NA		NA
6056509	6056510	BAM_4659	BAM_4660			TRUE	0.833	127.000	0.429	NA		NA
6056510	6056511	BAM_4660	BAM_4661			FALSE	0.195	260.000	0.000	1.000	N	NA
6056511	6056512	BAM_4661	BAM_4662		cysM	TRUE	0.984	4.000	0.690	0.013	Y	NA
6056512	6056513	BAM_4662	BAM_4663	cysM		TRUE	0.775	83.000	0.048	1.000	N	NA
6056513	6056514	BAM_4663	BAM_4664			TRUE	0.855	15.000	0.057	1.000	N	NA
6056516	6056517	BAM_4666	BAM_4667			TRUE	0.715	117.000	0.119	NA		NA
6056517	6056518	BAM_4667	BAM_4668		greA	TRUE	0.813	93.000	0.070	1.000	N	NA
6056518	6056519	BAM_4668	BAM_4669	greA	udk	FALSE	0.156	279.000	0.095	1.000	N	NA
6056519	6056520	BAM_4669	BAM_4670	udk		TRUE	0.847	18.000	0.100	1.000	N	NA
6056520	6056521	BAM_4670	BAM_4671			TRUE	0.962	19.000	0.156	0.002	Y	NA
6056521	6056522	BAM_4671	BAM_4672			TRUE	0.731	8.000	0.142	1.000		NA
6056522	6056523	BAM_4672	BAM_4673			FALSE	0.161	203.000	0.000	NA		NA
6056524	6056525	BAM_1065	BAM_1064			FALSE	0.560	98.000	0.000	NA		NA
6056525	6056526	BAM_1064	BAM_1063			FALSE	0.277	-30.000	0.000	NA		NA
6056526	6056527	BAM_1063	BAM_1062			FALSE	0.015	360.000	0.000	NA		NA
6056527	6056528	BAM_1062	BAM_1061			FALSE	0.360	174.000	0.167	NA		NA
6056528	6056529	BAM_1061	BAM_1060			TRUE	0.718	141.000	0.292	NA		NA
6056529	6056530	BAM_1060	BAM_1059			FALSE	0.095	228.000	0.000	NA		NA
6056530	6056531	BAM_1059	BAM_1058			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6056531	6056532	BAM_1058	BAM_1057			FALSE	0.101	224.000	0.000	NA		NA
6056532	6056533	BAM_1057	BAM_1056			FALSE	0.531	44.000	0.368	NA		NA
6056533	6056534	BAM_1056	BAM_1055			FALSE	0.010	419.000	0.000	NA		NA
6056534	6056535	BAM_1055	BAM_1054			TRUE	0.649	58.000	0.133	NA	N	NA
6056535	6056536	BAM_1054	BAM_1053			FALSE	0.367	177.000	0.000	1.000		NA
6056536	6056537	BAM_1053	BAM_1052			FALSE	0.368	42.000	0.000	NA		NA
6056537	6056538	BAM_1052	BAM_1051			FALSE	0.360	168.000	0.000	NA		NA
6056538	6056539	BAM_1051	BAM_1050			FALSE	0.005	639.000	0.000	NA		NA
6056539	6056540	BAM_1050	BAM_1049			TRUE	0.698	-3.000	0.330	NA		NA
6056543	6056544	BAM_1046	BAM_1045			TRUE	0.672	129.000	0.000	NA		NA
6056544	6056545	BAM_1045	BAM_1044			TRUE	0.701	118.000	0.068	NA		NA
6056546	6056547	BAM_1043	BAM_1042			FALSE	0.021	334.000	0.000	NA		NA
6056547	6056548	BAM_1042	BAM_1041			FALSE	0.589	143.000	0.000	NA		NA
6056548	6056549	BAM_1041	BAM_1040			FALSE	0.623	61.000	0.600	NA		NA
6056549	6056550	BAM_1040	BAM_1039			TRUE	0.667	40.000	0.600	NA		NA
6056551	6056552	BAM_1038	BAM_1037			FALSE	0.194	206.000	0.000	1.000		NA
6056552	6056553	BAM_1037	BAM_1036			TRUE	0.958	17.000	0.169	1.000	Y	NA
6056554	6056555	BAM_1035	BAM_1034			FALSE	0.635	176.000	0.032	1.000	N	NA
6056555	6056556	BAM_1034	BAM_1033		sigB	TRUE	0.684	70.000	0.038	1.000	N	NA
6056556	6056557	BAM_1033	BAM_1032	sigB	rsbW	TRUE	0.789	-34.000	0.838	1.000	N	NA
6056557	6056558	BAM_1032	BAM_1031	rsbW	rsbV	TRUE	0.981	7.000	0.714	1.000	Y	NA
6056560	6056561	BAM_1029	BAM_1028			TRUE	0.648	76.000	0.500	NA		NA
6056561	6056562	BAM_1028	BAM_1027			TRUE	0.729	51.000	0.875	NA		NA
6056563	6056564	BAM_1026	BAM_1025			FALSE	0.088	232.000	0.000	NA		NA
6056565	6056566	BAM_1024	BAM_1023			TRUE	0.793	14.000	0.486	NA		NA
6056566	6056567	BAM_1023	BAM_1022			TRUE	0.653	141.000	0.114	NA		NA
6056567	6056568	BAM_1022	BAM_1021			FALSE	0.029	307.000	0.000	NA		NA
6056572	6056573	BAM_1017	BAM_1016			FALSE	0.007	555.000	0.000	NA		NA
6056573	6056574	BAM_1016	BAM_1015			FALSE	0.010	412.000	0.000	NA		NA
6056575	6056576	BAM_1014	BAM_1013			FALSE	0.132	211.000	0.000	NA		NA
6056576	6056577	BAM_1013	BAM_1012			TRUE	0.653	113.000	0.000	NA		NA
6056578	6056579	BAM_1011	BAM_1010			FALSE	0.156	204.000	0.000	NA		NA
6056582	6056583	BAM_1007	BAM_1006			TRUE	0.909	20.000	0.625	1.000	N	NA
6056584	6056585	BAM_1005	BAM_1004			FALSE	0.016	358.000	0.000	NA		NA
6056585	6056586	BAM_1004	BAM_1003			FALSE	0.035	292.000	0.000	NA		NA
6056586	6056587	BAM_1003	BAM_1002		pssA	FALSE	0.596	24.000	0.013	1.000		NA
6056587	6056588	BAM_1002	BAM_1001	pssA		TRUE	0.692	44.000	0.000	1.000	N	NA
6056588	6056589	BAM_1001	BAM_1000			FALSE	0.046	272.000	0.000	NA		NA
6056590	6056591	BAM_0999	BAM_0998			FALSE	0.010	418.000	0.000	NA		NA
6056591	6056592	BAM_0998	BAM_0997			FALSE	0.331	58.000	0.000	NA		NA
6056592	6056593	BAM_0997	BAM_0996			FALSE	0.589	15.000	0.000	NA		NA
6056594	6056595	BAM_0995	BAM_0994			TRUE	0.717	118.000	0.109	NA		NA
6056596	6056597	BAM_0993	BAM_0992			FALSE	0.434	181.000	0.375	NA		NA
6056599	6056600	BAM_0990	BAM_0989			FALSE	0.170	201.000	0.000	NA		NA
6056600	6056601	BAM_0989	BAM_0988			FALSE	0.469	-7.000	0.023	NA		NA
6056601	6056602	BAM_0988	BAM_0987			FALSE	0.572	-3.000	0.030	NA		NA
6056609	6056610	BAM_0980	BAM_0979			FALSE	0.530	22.000	0.000	NA		NA
6056610	6056611	BAM_0979	BAM_0978			TRUE	0.681	127.000	0.000	NA		NA
6056611	6056612	BAM_0978	BAM_0977			FALSE	0.428	33.000	0.000	NA		NA
6056612	6056613	BAM_0977	BAM_0976			FALSE	0.577	-3.000	0.041	NA		NA
6056613	6056614	BAM_0976	BAM_0975			FALSE	0.177	207.000	0.200	NA		NA
6056614	6056615	BAM_0975	BAM_0974			FALSE	0.437	54.000	0.267	NA		NA
6056615	6056616	BAM_0974	BAM_0973			TRUE	0.802	9.000	0.455	NA		NA
6056616	6056617	BAM_0973	BAM_0972			TRUE	0.898	4.000	0.833	NA		NA
6056619	6056620	BAM_0970	BAM_0969			FALSE	0.615	-25.000	0.684	NA		NA
6056620	6056621	BAM_0969	BAM_0968			TRUE	0.848	100.000	0.026	1.000	N	NA
6056621	6056622	BAM_0968	BAM_0967			FALSE	0.141	221.000	0.000	1.000		NA
6056622	6056623	BAM_0967	BAM_0966			TRUE	0.839	-3.000	0.611	1.000		NA
6056623	6056624	BAM_0966	BAM_0965			TRUE	0.979	19.000	0.833	0.061	Y	NA
6056625	6056626	BAM_0964	BAM_0963			FALSE	0.025	316.000	0.000	NA		NA
6056627	6056628	BAM_0962	BAM_0961			TRUE	0.729	19.000	0.400	NA		NA
6056628	6056629	BAM_0961	BAM_0960			FALSE	0.363	-15.000	0.000	NA		NA
6056629	6056630	BAM_0960	BAM_0959			FALSE	0.566	37.000	0.375	NA		NA
6056630	6056631	BAM_0959	BAM_0958			FALSE	0.343	170.000	0.000	NA		NA
6056631	6056632	BAM_0958	BAM_0957			FALSE	0.343	170.000	0.000	NA		NA
6056632	6056633	BAM_0957	BAM_0956			FALSE	0.107	221.000	0.000	NA		NA
6056633	6056634	BAM_0956	BAM_0955			FALSE	0.382	-15.000	0.051	NA		NA
6056634	6056635	BAM_0955	BAM_0954			FALSE	0.460	-7.000	0.000	NA		NA
6056635	6056636	BAM_0954	BAM_0953			FALSE	0.391	37.000	0.000	NA		NA
6056636	6056637	BAM_0953	BAM_0952			FALSE	0.494	27.000	0.000	NA		NA
6056637	6056638	BAM_0952	BAM_0951			TRUE	0.985	7.000	0.786	0.024	Y	NA
6056638	6056639	BAM_0951	BAM_0950			TRUE	0.943	60.000	0.688	0.024	Y	NA
6056641	6056642	BAM_0948	BAM_0947			FALSE	0.458	52.000	0.286	NA		NA
6056642	6056643	BAM_0947	BAM_0946			FALSE	0.010	411.000	0.000	NA		NA
6056643	6056644	BAM_0946	BAM_0945			FALSE	0.005	739.000	0.000	NA		NA
6056644	6056645	BAM_0945	BAM_0944			FALSE	0.012	386.000	0.000	NA		NA
6056645	6056646	BAM_0944	BAM_0943			TRUE	0.953	20.000	0.109	1.000	Y	NA
6056648	6056649	BAM_0941	BAM_0940			TRUE	0.897	133.000	0.318	NA	N	NA
6056649	6056650	BAM_0940	BAM_0939			FALSE	0.252	240.000	0.000	1.000	N	NA
6056650	6056651	BAM_0939	BAM_0937			FALSE	0.022	329.000	0.000	NA		NA
6056651	6056652	BAM_0937	BAM_0935			TRUE	0.812	15.000	0.538	NA		NA
6056652	6056653	BAM_0935	BAM_0934			TRUE	0.712	102.000	0.292	NA		NA
6056655	6056656	BAM_0933	BAM_0931			FALSE	0.340	53.000	0.000	NA		NA
6056656	6056657	BAM_0931	BAM_0930			TRUE	0.748	10.000	0.333	NA		NA
6056658	6056659	BAM_0929	BAM_0928			TRUE	0.691	25.000	0.400	NA		NA
6056660	6056661	BAM_0927	BAM_0926	eag	sap	FALSE	0.005	722.000	0.000	NA		NA
6056661	6056662	BAM_0926	BAM_0925	sap	csaB	FALSE	0.005	676.000	0.000	NA		NA
6056662	6056663	BAM_0925	BAM_0924	csaB		FALSE	0.612	142.000	0.040	NA		NA
6056664	6056665	BAM_0923	BAM_0922	secA1		TRUE	0.809	15.000	0.519	NA		NA
6056666	6056667	BAM_0921	BAM_0920			FALSE	0.016	359.000	0.000	NA		NA
6056667	6056668	BAM_0920	BAM_0919			FALSE	0.018	343.000	0.000	NA		NA
6056670	6056671	BAM_0917	BAM_0916			FALSE	0.110	315.000	0.000	0.056	N	NA
6056672	6056673	BAM_0915	BAM_0914			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6056674	6056675	BAM_0913	BAM_0912			FALSE	0.008	494.000	0.000	NA		NA
6056676	6056677	BAM_0911	BAM_0910			FALSE	0.531	22.000	0.005	NA		NA
6056678	6056679	BAM_0909	BAM_0908	alsD	alsS	TRUE	0.878	17.000	0.323	1.000	N	NA
6056680	6056681	BAM_0907	BAM_0906			TRUE	0.775	22.000	0.545	NA		NA
6056682	6056683	BAM_0905	BAM_0904			TRUE	0.727	142.000	0.321	NA		NA
6056684	6056685	BAM_0903	BAM_0902			TRUE	0.792	21.000	0.583	NA		NA
6056688	6056689	BAM_0899	BAM_0898			TRUE	0.955	29.000	0.481	1.000	Y	NA
6056689	6056690	BAM_0898	BAM_0897			TRUE	0.931	-22.000	0.594	0.024	Y	NA
6056690	6056691	BAM_0897	BAM_0896			FALSE	0.045	274.000	0.000	NA		NA
6056691	6056692	BAM_0896	BAM_0895			FALSE	0.603	12.000	0.000	NA		NA
6056692	6056693	BAM_0895	BAM_0894			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6056693	6056694	BAM_0894	BAM_0893			FALSE	0.075	243.000	0.000	NA		NA
6056696	6056697	BAM_0891	BAM_0890		racE1	TRUE	0.654	113.000	0.005	NA		NA
6056698	6056699	BAM_0889	BAM_0888			TRUE	0.693	61.000	0.320	NA	N	NA
6056699	6056700	BAM_0888	BAM_0887			FALSE	0.489	193.000	0.160	NA	N	NA
6056700	6056701	BAM_0887	BAM_0886			FALSE	0.636	24.000	0.176	1.000		NA
6056701	6056702	BAM_0886	BAM_0885			FALSE	0.080	238.000	0.000	NA		NA
6056705	6056706	BAM_0882	BAM_0881			TRUE	0.647	20.000	0.267	NA		NA
6056708	6056709	BAM_0879	BAM_0878	blT		FALSE	0.441	202.000	0.000	1.000	N	NA
6056709	6056710	BAM_0878	BAM_0877			TRUE	0.934	133.000	0.538	1.000	N	NA
6056710	6056711	BAM_0877	BAM_0876			TRUE	0.986	3.000	0.846	0.045	Y	NA
6056711	6056712	BAM_0876	BAM_0875			FALSE	0.016	359.000	0.000	NA		NA
6056713	6056714	BAM_0284	BAM_0283			TRUE	0.968	32.000	0.800	0.015	Y	NA
6056714	6056715	BAM_0283	BAM_0282			TRUE	0.686	145.000	0.146	1.000		NA
6056715	6056716	BAM_0282	BAM_0281		guaA	FALSE	0.017	385.000	0.000	1.000		NA
6056716	6056717	BAM_0281	BAM_0280	guaA	groL	FALSE	0.050	399.000	0.000	0.076	N	NA
6056717	6056718	BAM_0280	BAM_0279	groL	groES	TRUE	0.953	39.000	0.674	0.076	Y	NA
6056719	6056720	BAM_0278	BAM_0277			FALSE	0.594	-3.000	0.080	NA		NA
6056723	6056724	BAM_0274	BAM_0273		rimI	TRUE	0.715	0.000	0.090	1.000		NA
6056724	6056725	BAM_0273	BAM_0272	rimI		TRUE	0.705	14.000	0.127	1.000		NA
6056725	6056726	BAM_0272	BAM_0271			FALSE	0.385	-19.000	0.217	NA		NA
6056726	6056727	BAM_0271	BAM_0270			FALSE	0.312	174.000	0.000	NA		NA
6056727	6056728	BAM_0270	BAM_0269			FALSE	0.635	2.000	0.000	NA		NA
6056728	6056729	BAM_0269	BAM_0268		rrfE	FALSE	0.603	12.000	0.000	NA		NA
6056729	6056730	BAM_0268	BAM_0267	rrfE	rrlE	FALSE	0.345	51.000	0.000	NA		NA
6056732	6056733	BAM_0265	BAM_0264	rrsE		FALSE	0.570	99.000	0.000	NA		NA
6056733	6056734	BAM_0264	BAM_0263			FALSE	0.635	2.000	0.000	NA		NA
6056734	6056735	BAM_0263	BAM_0262			TRUE	0.644	5.000	0.000	NA		NA
6056735	6056736	BAM_0262	BAM_0261			FALSE	0.541	96.000	0.000	NA		NA
6056736	6056737	BAM_0261	BAM_0260			FALSE	0.593	14.000	0.000	NA		NA
6056737	6056738	BAM_0260	BAM_0259			TRUE	0.637	6.000	0.000	NA		NA
6056738	6056739	BAM_0259	BAM_0258			FALSE	0.477	88.000	0.000	NA		NA
6056739	6056740	BAM_0258	BAM_0257			FALSE	0.357	46.000	0.000	NA		NA
6056740	6056741	BAM_0257	BAM_0256			TRUE	0.645	4.000	0.000	NA		NA
6056741	6056742	BAM_0256	BAM_0255			FALSE	0.629	7.000	0.000	NA		NA
6056742	6056743	BAM_0255	BAM_0254			FALSE	0.635	2.000	0.000	NA		NA
6056743	6056744	BAM_0254	BAM_0253			TRUE	0.658	114.000	0.000	NA		NA
6056746	6056747	BAM_0251	BAM_0250			TRUE	0.676	68.000	0.045	1.000	N	NA
6056747	6056748	BAM_0250	BAM_0249			TRUE	0.882	5.000	0.260	NA	N	NA
6056748	6056749	BAM_0249	BAM_0248		dal1	FALSE	0.095	310.000	0.108	NA	N	NA
6056749	6056750	BAM_0248	BAM_0247	dal1		TRUE	0.970	119.000	0.194	NA	Y	NA
6056750	6056751	BAM_0247	BAM_0246		acpS	TRUE	0.790	94.000	0.038	NA	N	NA
6056753	6056754	BAM_0245	BAM_0243			TRUE	0.952	97.000	0.013	1.000	Y	NA
6056754	6056755	BAM_0243	BAM_0242		murF	FALSE	0.126	304.000	0.004	0.075	N	NA
6056755	6056756	BAM_0242	BAM_0241	murF		FALSE	0.505	61.000	0.044	0.003		NA
6056756	6056757	BAM_0241	BAM_0240			FALSE	0.021	335.000	0.000	NA		NA
6056757	6056758	BAM_0240	BAM_0239			FALSE	0.013	383.000	0.000	NA		NA
6056758	6056759	BAM_0239	BAM_0238			TRUE	0.643	111.000	0.000	NA		NA
6056759	6056760	BAM_0238	BAM_0237			FALSE	0.601	13.000	0.013	NA		NA
6056760	6056761	BAM_0237	BAM_0236			TRUE	0.855	-34.000	0.101	1.000	Y	NA
6056761	6056762	BAM_0236	BAM_0235		hppD	TRUE	0.681	64.000	0.118	1.000	N	NA
6056762	6056763	BAM_0235	BAM_0234	hppD		FALSE	0.027	311.000	0.000	NA		NA
6056763	6056764	BAM_0234	BAM_0233			FALSE	0.417	34.000	0.000	NA		NA
6056764	6056765	BAM_0233	BAM_0232			FALSE	0.399	36.000	0.000	NA		NA
6056765	6056766	BAM_0232	BAM_0231			FALSE	0.399	36.000	0.000	NA		NA
6056766	6056767	BAM_0231	BAM_0230			FALSE	0.526	149.000	0.000	NA		NA
6056768	6056769	BAM_0229	BAM_0228			FALSE	0.239	-49.000	0.000	NA		NA
6056770	6056771	BAM_0227	BAM_0226			TRUE	0.973	-3.000	0.500	0.002	Y	NA
6056771	6056772	BAM_0226	BAM_0225			TRUE	0.980	11.000	0.750	1.000	Y	NA
6056772	6056773	BAM_0225	BAM_0224			TRUE	0.983	13.000	0.850	0.023	Y	NA
6056773	6056774	BAM_0224	BAM_0223			TRUE	0.966	94.000	0.444	0.023	Y	NA
6056774	6056775	BAM_0223	BAM_0222			FALSE	0.032	298.000	0.000	NA		NA
6056779	6056780	BAM_0218	BAM_0217			FALSE	0.023	327.000	0.000	NA		NA
6056781	6056782	BAM_0216	BAM_0215			TRUE	0.645	135.000	0.000	NA		NA
6056785	6056786	BAM_0212	BAM_0211			FALSE	0.336	59.000	0.019	NA		NA
6056786	6056787	BAM_0211	BAM_0210			FALSE	0.006	572.000	0.000	NA		NA
6056787	6056788	BAM_0210	BAM_0209			TRUE	0.865	138.000	0.667	NA		NA
6056788	6056789	BAM_0209	BAM_0208			TRUE	0.906	119.000	0.778	NA		NA
6056789	6056790	BAM_0208	BAM_0207			TRUE	0.835	149.000	0.778	NA		NA
6056790	6056791	BAM_0207	BAM_0206			FALSE	0.222	188.000	0.000	NA		NA
6056791	6056792	BAM_0206	BAM_0205			FALSE	0.447	159.000	0.000	NA		NA
6056794	6056795	BAM_0203	BAM_0202			TRUE	0.779	22.000	0.556	NA		NA
6056796	6056797	BAM_0201	BAM_0200			TRUE	0.647	142.000	0.167	NA		NA
6056797	6056798	BAM_0200	BAM_0199			TRUE	0.849	13.000	0.667	NA		NA
6056800	6056801	BAM_0196	BAM_0194	modA	modB	TRUE	0.979	6.000	0.430	0.000	Y	NA
6056801	6056802	BAM_0194	BAM_0193	modB		FALSE	0.129	302.000	0.000	0.045	N	NA
6056803	6056804	BAM_0192	BAM_0191			FALSE	0.581	-7.000	0.286	NA		NA
6056805	6056806	BAM_0190	BAM_0189			FALSE	0.635	2.000	0.000	NA		NA
6056806	6056807	BAM_0189	BAM_0188			FALSE	0.016	392.000	0.000	1.000		NA
6056807	6056808	BAM_0188	BAM_0187			FALSE	0.184	388.000	0.000	0.023	Y	NA
6056809	6056810	BAM_0186	BAM_0185			FALSE	0.617	-3.000	0.200	NA		NA
6056810	6056811	BAM_0185	BAM_0184			FALSE	0.415	73.000	0.105	NA		NA
6056813	6056814	BAM_0182	BAM_0181			TRUE	0.965	14.000	0.292	1.000	Y	NA
6056814	6056815	BAM_0181	BAM_0180			TRUE	0.964	-3.000	0.233	0.002	Y	NA
6056815	6056816	BAM_0180	BAM_0179			TRUE	0.853	-43.000	0.233	1.000	Y	NA
6056816	6056817	BAM_0179	BAM_0178			TRUE	0.982	17.000	0.909	0.023	Y	NA
6056819	6056820	BAM_0176	BAM_0175			FALSE	0.067	251.000	0.000	NA		NA
6056820	6056821	BAM_0175	BAM_0174			FALSE	0.300	182.000	0.104	NA		NA
6056821	6056822	BAM_0174	BAM_0173			FALSE	0.441	79.000	0.026	NA		NA
6056822	6056823	BAM_0173	BAM_0172			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6056823	6056824	BAM_0172	BAM_0171			FALSE	0.451	31.000	0.000	NA		NA
6056824	6056825	BAM_0171	BAM_0170			TRUE	0.648	112.000	0.000	NA		NA
6056826	6056827	BAM_0169	BAM_0168			FALSE	0.126	280.000	0.000	NA	N	NA
6056827	6056828	BAM_0168	BAM_0167			TRUE	0.980	13.000	0.880	NA	Y	NA
6056828	6056829	BAM_0167	BAM_0166			TRUE	0.934	-25.000	0.846	1.000	Y	NA
6056830	6056831	BAM_0165	BAM_0164			FALSE	0.373	40.000	0.000	NA		NA
6056832	6056833	BAM_0163	BAM_0162			TRUE	0.810	141.000	0.500	NA		NA
6056833	6056834	BAM_0162	BAM_0161			TRUE	0.876	0.000	0.750	NA		NA
6056834	6056835	BAM_0161	BAM_0160			FALSE	0.077	241.000	0.000	NA		NA
6056836	6056837	BAM_0159	BAM_0158			TRUE	0.716	119.000	0.100	NA		NA
6056837	6056838	BAM_0158	BAM_0157		yqjI	FALSE	0.071	343.000	0.047	1.000	N	NA
6056838	6056839	BAM_0157	BAM_0156	yqjI	gntP1	FALSE	0.475	265.000	0.000	1.000	Y	NA
6056839	6056840	BAM_0156	BAM_0155	gntP1		TRUE	0.985	120.000	0.696	1.000	Y	NA
6056840	6056841	BAM_0155	BAM_0154		gntR	TRUE	0.885	-7.000	0.680	1.000	N	NA
6056841	6056842	BAM_0154	BAM_0153	gntR		FALSE	0.011	407.000	0.000	NA		NA
6056842	6056843	BAM_0153	BAM_0152		glmS	FALSE	0.015	364.000	0.000	NA		NA
6056843	6056844	BAM_0152	BAM_0151	glmS		FALSE	0.599	13.000	0.008	NA		NA
6056846	6056847	BAM_0150	BAM_0149	glmM		FALSE	0.514	-7.000	0.150	NA		NA
6056847	6056848	BAM_0149	BAM_0148			TRUE	0.714	-7.000	0.502	NA		NA
6056848	6056849	BAM_0148	BAM_0147		rocF	FALSE	0.069	249.000	0.000	NA		NA
6056849	6056850	BAM_0147	BAM_0146	rocF		FALSE	0.137	210.000	0.000	NA		NA
6056850	6056851	BAM_0146	BAM_0145			FALSE	0.239	-49.000	0.000	NA		NA
6056851	6056852	BAM_0145	BAM_0144			TRUE	0.648	112.000	0.000	NA		NA
6056852	6056853	BAM_0144	BAM_0143			FALSE	0.623	8.000	0.000	NA		NA
6056853	6056854	BAM_0143	BAM_0142			TRUE	0.637	6.000	0.000	NA		NA
6056854	6056855	BAM_0142	BAM_0141			TRUE	0.637	6.000	0.000	NA		NA
6056855	6056856	BAM_0141	BAM_0140			FALSE	0.331	66.000	0.000	NA		NA
6056856	6056857	BAM_0140	BAM_0139			FALSE	0.573	17.000	0.000	NA		NA
6056857	6056858	BAM_0139	BAM_0138			TRUE	0.645	4.000	0.000	NA		NA
6056858	6056859	BAM_0138	BAM_0137			FALSE	0.538	21.000	0.000	NA		NA
6056859	6056860	BAM_0137	BAM_0136			TRUE	0.645	4.000	0.000	NA		NA
6056860	6056861	BAM_0136	BAM_0135		rrfD	FALSE	0.619	9.000	0.000	NA		NA
6056863	6056864	BAM_3919	BAM_3920			FALSE	0.541	96.000	0.000	NA		NA
6056864	6056865	BAM_3920	BAM_3921			FALSE	0.222	188.000	0.000	NA		NA
6056865	6056866	BAM_3921	BAM_3922			FALSE	0.035	292.000	0.000	NA		NA
6056866	6056867	BAM_3922	BAM_3923			FALSE	0.021	332.000	0.000	NA		NA
6056867	6056868	BAM_3923	BAM_3924			TRUE	0.814	17.000	0.583	NA		NA
6056868	6056869	BAM_3924	BAM_3925			TRUE	0.974	15.000	0.545	1.000	Y	NA
6056869	6056870	BAM_3925	BAM_3926			TRUE	0.972	-7.000	0.909	0.023	Y	NA
6056870	6056871	BAM_3926	BAM_3927			FALSE	0.483	28.000	0.000	NA		NA
6056871	6056872	BAM_3927	BAM_3928			FALSE	0.589	15.000	0.000	NA		NA
6056872	6056873	BAM_3928	BAM_3929		exoA	FALSE	0.031	300.000	0.000	NA		NA
6056873	6056874	BAM_3929	BAM_3930	exoA	xth	FALSE	0.259	-34.000	0.000	NA		NA
6056875	6056876	BAM_3931	BAM_3932	adaA	ogt2	TRUE	0.747	-19.000	0.265	0.001	N	NA
6056876	6056877	BAM_3932	BAM_3933	ogt2	alkA	TRUE	0.960	-3.000	0.269	1.000	Y	NA
6056880	6056881	BAM_3936	BAM_3937			FALSE	0.023	324.000	0.000	NA		NA
6056881	6056882	BAM_3937	BAM_3938			FALSE	0.451	31.000	0.000	NA		NA
6056882	6056883	BAM_3938	BAM_3939			FALSE	0.239	-49.000	0.000	NA		NA
6056883	6056884	BAM_3939	BAM_3940			FALSE	0.227	187.000	0.000	NA		NA
6056885	6056886	BAM_3941	BAM_3943			FALSE	0.368	42.000	0.000	NA		NA
6056888	6056889	BAM_3944	BAM_3945			FALSE	0.475	-25.000	0.412	NA		NA
6056890	6056891	BAM_3946	BAM_3947			TRUE	0.858	16.000	0.750	NA		NA
6056891	6056892	BAM_3947	BAM_3948			FALSE	0.515	24.000	0.000	NA		NA
6056892	6056893	BAM_3948	BAM_3949			FALSE	0.417	34.000	0.000	NA		NA
6056893	6056894	BAM_3949	BAM_3950			FALSE	0.533	69.000	0.308	1.000		NA
6056894	6056895	BAM_3950	BAM_3951			FALSE	0.566	24.000	0.114	NA		NA
6056895	6056896	BAM_3951	BAM_3952			FALSE	0.378	44.000	0.042	NA		NA
6056896	6056897	BAM_3952	BAM_3953			FALSE	0.126	213.000	0.000	NA		NA
6056897	6056898	BAM_3953	BAM_3954			FALSE	0.589	53.000	0.500	NA		NA
6056901	6056902	BAM_3957	BAM_3958			FALSE	0.055	264.000	0.000	NA		NA
6056902	6056903	BAM_3958	BAM_3959			FALSE	0.012	391.000	0.000	NA		NA
6056906	6056907	BAM_3962	BAM_3963			FALSE	0.350	215.000	0.000	1.000	N	NA
6056907	6056908	BAM_3963	BAM_3964			TRUE	0.953	-12.000	0.741	1.000	Y	NA
6056908	6056909	BAM_3964	BAM_3965			FALSE	0.530	42.000	0.352	NA		NA
6056909	6056910	BAM_3965	BAM_3966			TRUE	0.821	2.000	0.490	NA		NA
6056910	6056911	BAM_3966	BAM_3967			TRUE	0.693	4.000	0.163	NA		NA
6056911	6056912	BAM_3967	BAM_3968		mutL	FALSE	0.287	239.000	0.000	0.074	N	NA
6056912	6056913	BAM_3968	BAM_3969	mutL	mutS	TRUE	0.971	9.000	0.220	0.001	Y	NA
6056913	6056914	BAM_3969	BAM_3970	mutS	cotE	FALSE	0.271	182.000	0.027	NA		NA
6056914	6056915	BAM_3970	BAM_3971	cotE		TRUE	0.734	126.000	0.209	NA		NA
6056915	6056916	BAM_3971	BAM_3972			TRUE	0.660	4.000	0.041	NA		NA
6056916	6056917	BAM_3972	BAM_3973			FALSE	0.037	428.000	0.004	1.000	N	NA
6056917	6056918	BAM_3973	BAM_3974			TRUE	0.943	-13.000	0.437	0.000	Y	NA
6056918	6056919	BAM_3974	BAM_3975			FALSE	0.299	228.000	0.041	1.000	N	NA
6056919	6056920	BAM_3975	BAM_3976		spoVS2	FALSE	0.407	60.000	0.247	NA		NA
6056920	6056921	BAM_3976	BAM_3977	spoVS2		FALSE	0.573	150.000	0.139	NA		NA
6056921	6056922	BAM_3977	BAM_3978			FALSE	0.462	166.000	0.245	NA		NA
6056922	6056923	BAM_3978	BAM_3979			FALSE	0.011	483.000	0.018	1.000		NA
6056923	6056924	BAM_3979	BAM_3980		recA	FALSE	0.057	307.000	0.007	0.001		NA
6056924	6056925	BAM_3980	BAM_3981	recA	cinA	TRUE	0.663	146.000	0.083	1.000		NA
6056925	6056926	BAM_3981	BAM_3982	cinA	pgsA	TRUE	0.656	21.000	0.151	1.000		NA
6056926	6056927	BAM_3982	BAM_3983	pgsA		FALSE	0.429	64.000	0.077	1.000		NA
6056927	6056928	BAM_3983	BAM_3984			TRUE	0.736	22.000	0.371	1.000		NA
6056928	6056929	BAM_3984	BAM_3985			TRUE	0.768	140.000	0.388	NA		NA
6056929	6056930	BAM_3985	BAM_3986			FALSE	0.579	76.000	0.386	NA		NA
6056930	6056931	BAM_3986	BAM_3987			TRUE	0.804	104.000	0.397	1.000		NA
6056931	6056932	BAM_3987	BAM_3988			TRUE	0.922	1.000	0.872	0.005		NA
6056932	6056933	BAM_3988	BAM_3989			FALSE	0.249	199.000	0.077	1.000		NA
6056933	6056934	BAM_3989	BAM_3990			FALSE	0.628	1.000	0.000	NA		NA
6056934	6056935	BAM_3990	BAM_3991			FALSE	0.483	28.000	0.000	NA		NA
6056935	6056936	BAM_3991	BAM_3992			FALSE	0.460	-7.000	0.000	NA		NA
6056936	6056937	BAM_3992	BAM_3993			TRUE	0.715	109.000	0.042	1.000		NA
6056937	6056938	BAM_3993	BAM_3994			FALSE	0.603	90.000	0.100	1.000		NA
6056938	6056939	BAM_3994	BAM_3995			FALSE	0.029	538.000	0.115	1.000	N	NA
6056939	6056940	BAM_3995	BAM_3996			FALSE	0.129	212.000	0.000	NA		NA
6056940	6056941	BAM_3996	BAM_3997		clpP	FALSE	0.563	-3.000	0.009	NA		NA
6056941	6056942	BAM_3997	BAM_3998	clpP		TRUE	0.685	104.000	0.009	1.000		NA
6056944	6056945	BAM_4000	BAM_4001	dapA2	dapG2	TRUE	0.962	12.000	0.085	1.000	Y	NA
6056945	6056946	BAM_4001	BAM_4002	dapG2	asd2	TRUE	0.946	24.000	0.065	1.000	Y	NA
6056946	6056947	BAM_4002	BAM_4003	asd2	spoVFB	FALSE	0.598	151.000	0.025	1.000		NA
6056947	6056948	BAM_4003	BAM_4004	spoVFB	spoVFA	TRUE	0.792	-3.000	0.450	1.000		NA
6056950	6056951	BAM_4006	BAM_4007			TRUE	0.720	127.000	0.104	NA		NA
6056951	6056952	BAM_4007	BAM_4008			FALSE	0.594	87.000	0.127	1.000		NA
6056952	6056953	BAM_4008	BAM_4009		pnp	TRUE	0.806	152.000	0.048	1.000	N	NA
6056953	6056954	BAM_4009	BAM_4010	pnp	rpsO	TRUE	0.938	161.000	0.335	1.000	Y	NA
6056954	6056955	BAM_4010	BAM_4011	rpsO	ribF	TRUE	0.862	101.000	0.119	1.000	N	NA
6056955	6056956	BAM_4011	BAM_4012	ribF	truB	TRUE	0.750	44.000	0.308	1.000	N	NA
6056956	6056957	BAM_4012	BAM_4013	truB	rbfA	TRUE	0.938	87.000	0.111	1.000	Y	NA
6056957	6056958	BAM_4013	BAM_4014	rbfA		FALSE	0.630	16.000	0.113	NA		NA
6056958	6056959	BAM_4014	BAM_4015		infB	FALSE	0.605	-3.000	0.102	NA		NA
6056959	6056960	BAM_4015	BAM_4016	infB		TRUE	0.969	5.000	0.223	1.000	Y	NA
6056960	6056961	BAM_4016	BAM_4017			TRUE	0.899	1.000	0.408	NA	N	NA
6056961	6056962	BAM_4017	BAM_4018		nusA	TRUE	0.964	12.000	0.323	NA	Y	NA
6056962	6056963	BAM_4018	BAM_4019	nusA		TRUE	0.852	18.000	0.759	NA		NA
6056963	6056964	BAM_4019	BAM_4020		polC	FALSE	0.023	333.000	0.059	NA		NA
6056966	6056967	BAM_4021	BAM_4023	proS2		TRUE	0.882	110.000	0.095	1.000	N	NA
6056967	6056968	BAM_4023	BAM_4024		dxr2	TRUE	0.912	17.000	0.568	1.000	N	NA
6056968	6056969	BAM_4024	BAM_4025	dxr2	cdsA	TRUE	0.946	24.000	0.071	1.000	Y	NA
6056969	6056970	BAM_4025	BAM_4026	cdsA	uppS	TRUE	0.957	18.000	0.113	1.000	Y	NA
6056970	6056971	BAM_4026	BAM_4027	uppS	frr	TRUE	0.843	86.000	0.409	1.000	N	NA
6056971	6056972	BAM_4027	BAM_4028	frr	pyrH2	TRUE	0.937	3.000	0.626	1.000	N	NA
6056972	6056973	BAM_4028	BAM_4029	pyrH2	tsf	TRUE	0.754	67.000	0.416	1.000	N	NA
6056973	6056974	BAM_4029	BAM_4030	tsf	rpsB	FALSE	0.612	104.000	0.000	NA		NA
6056975	6056976	BAM_5538	BAM_5537		thiC	FALSE	0.031	300.000	0.000	NA		NA
6056977	6056978	BAM_5536	BAM_5535			FALSE	0.045	391.000	0.000	1.000	N	NA
6056978	6056979	BAM_5535	BAM_5534		cydA3	TRUE	0.972	-7.000	0.880	0.025	Y	NA
6056980	6056981	BAM_5533	BAM_5532			FALSE	0.191	196.000	0.000	NA		NA
6056981	6056982	BAM_5532	BAM_5531			FALSE	0.071	248.000	0.000	NA		NA
6056985	6056986	BAM_5528	BAM_5527			FALSE	0.530	43.000	0.269	1.000		NA
6056986	6056987	BAM_5527	BAM_5526			TRUE	0.647	149.000	0.192	1.000		NA
6056988	6056989	BAM_5525	BAM_5524	celA3	celB3	TRUE	0.980	15.000	0.700	0.004	Y	NA
6056989	6056990	BAM_5524	BAM_5523	celB3	celC3	TRUE	0.967	10.000	0.000	0.004	Y	NA
6056991	6056992	BAM_5522	BAM_5521	speD2		FALSE	0.574	28.000	0.039	1.000		NA
6056993	6056994	BAM_5520	BAM_5519	celA2	celB2	TRUE	0.961	17.000	0.000	0.004	Y	NA
6056994	6056995	BAM_5519	BAM_5518	celB2	celC2	TRUE	0.913	184.000	0.615	0.004	Y	NA
6056995	6056996	BAM_5518	BAM_5517	celC2	celF	TRUE	0.975	4.000	0.400	1.000	Y	NA
6056996	6056997	BAM_5517	BAM_5516	celF		FALSE	0.622	50.000	0.350	0.008		NA
6057000	6057001	BAM_5513	BAM_5512			TRUE	0.910	105.000	0.421	1.000	N	NA
6057001	6057002	BAM_5512	BAM_5511			FALSE	0.498	201.000	0.263	1.000	N	NA
6057003	6057004	BAM_5510	BAM_5509	ugd		TRUE	0.910	75.000	0.000	1.000	Y	NA
6057005	6057006	BAM_5508	BAM_5507			FALSE	0.402	75.000	0.039	NA		NA
6057007	6057008	BAM_5506	BAM_5505			FALSE	0.340	-19.000	0.040	NA		NA
6057008	6057009	BAM_5505	BAM_5504			FALSE	0.364	71.000	0.024	NA		NA
6057009	6057010	BAM_5504	BAM_5503			FALSE	0.191	252.000	0.010	NA	N	NA
6057010	6057011	BAM_5503	BAM_5502		comFA	TRUE	0.877	128.000	0.014	NA	N	NA
6057011	6057012	BAM_5502	BAM_5501	comFA	comFC	TRUE	0.725	0.000	0.130	1.000		NA
6057012	6057013	BAM_5501	BAM_5500	comFC	cspC	TRUE	0.748	121.000	0.008	1.000		NA
6057015	6057016	BAM_5498	BAM_5497	yfiA	secA2	FALSE	0.135	277.000	0.041	NA	N	NA
6057016	6057017	BAM_5497	BAM_5496	secA2	prfB	FALSE	0.581	100.000	0.000	NA		NA
6057017	6057018	BAM_5496	BAM_5494	prfB		FALSE	0.617	0.000	0.000	NA		NA
6057018	6057019	BAM_5494	BAM_5493		cccB	FALSE	0.062	255.000	0.000	NA		NA
6057019	6057020	BAM_5493	BAM_5492	cccB	ftsE	FALSE	0.134	287.000	0.000	1.000	N	NA
6057020	6057021	BAM_5492	BAM_5491	ftsE	ftsX	TRUE	0.941	-10.000	0.431	1.000	Y	NA
6057021	6057022	BAM_5491	BAM_5490	ftsX		TRUE	0.894	119.000	0.021	1.000	N	NA
6057022	6057023	BAM_5490	BAM_5489			TRUE	0.805	110.000	0.224	0.006		NA
6057023	6057024	BAM_5489	BAM_5488			FALSE	0.036	313.000	0.000	1.000		NA
6057024	6057025	BAM_5488	BAM_5487			FALSE	0.359	65.000	0.075	NA		NA
6057026	6057027	BAM_5486	BAM_5485			FALSE	0.074	266.000	0.042	1.000		NA
6057027	6057028	BAM_5485	BAM_5484			TRUE	0.823	5.000	0.389	1.000		NA
6057028	6057029	BAM_5484	BAM_5483			TRUE	0.910	52.000	0.125	0.042	Y	NA
6057030	6057031	BAM_5482	BAM_5481			FALSE	0.021	335.000	0.023	NA		NA
6057031	6057032	BAM_5481	BAM_5480			TRUE	0.680	13.000	0.250	NA		NA
6057032	6057033	BAM_5480	BAM_5479			TRUE	0.858	-3.000	0.800	NA		NA
6057033	6057034	BAM_5479	BAM_5478			TRUE	0.653	113.000	0.000	NA		NA
6057034	6057035	BAM_5478	BAM_5477			FALSE	0.581	100.000	0.000	NA		NA
6057035	6057036	BAM_5477	BAM_5476			TRUE	0.682	-3.000	0.294	NA		NA
6057036	6057037	BAM_5476	BAM_5475			TRUE	0.647	94.000	0.294	NA		NA
6057037	6057038	BAM_5475	BAM_5474			FALSE	0.010	418.000	0.000	NA		NA
6057038	6057039	BAM_5474	BAM_5473		uvrB	TRUE	0.915	161.000	0.000	NA	Y	NA
6057039	6057040	BAM_5473	BAM_5472	uvrB	uvrA	TRUE	0.973	6.000	0.154	0.001	Y	NA
6057040	6057041	BAM_5472	BAM_5471	uvrA		FALSE	0.330	60.000	0.006	NA		NA
6057041	6057042	BAM_5471	BAM_5470			TRUE	0.701	115.000	0.103	NA		NA
6057042	6057043	BAM_5470	BAM_5469		hprK	FALSE	0.623	-3.000	0.215	NA		NA
6057043	6057044	BAM_5469	BAM_5468	hprK	lgT	TRUE	0.876	25.000	0.494	1.000	N	NA
6057044	6057045	BAM_5468	BAM_5467	lgT		FALSE	0.456	68.000	0.169	1.000		NA
6057045	6057046	BAM_5467	BAM_5466			TRUE	0.746	24.000	0.417	1.000		NA
6057046	6057047	BAM_5466	BAM_5465			TRUE	0.723	140.000	0.169	1.000		NA
6057047	6057048	BAM_5465	BAM_5464		trxB	FALSE	0.589	85.000	0.183	1.000		NA
6057048	6057049	BAM_5464	BAM_5463	trxB		FALSE	0.431	163.000	0.067	NA		NA
6057049	6057050	BAM_5463	BAM_5462			FALSE	0.093	229.000	0.000	NA		NA
6057050	6057051	BAM_5462	BAM_5461			FALSE	0.637	21.000	0.263	NA		NA
6057051	6057052	BAM_5461	BAM_5460			TRUE	0.701	4.000	0.214	NA		NA
6057052	6057053	BAM_5460	BAM_5459			TRUE	0.711	90.000	0.470	NA		NA
6057053	6057054	BAM_5459	BAM_5458		ptsH2	FALSE	0.560	24.000	0.101	NA		NA
6057055	6057056	BAM_5457	BAM_5456	clpP2		FALSE	0.076	242.000	0.000	NA		NA
6057056	6057057	BAM_5456	BAM_5455			TRUE	0.716	21.000	0.400	NA		NA
6057057	6057058	BAM_5455	BAM_5454			FALSE	0.603	12.000	0.000	NA		NA
6057058	6057059	BAM_5454	BAM_5453			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6057059	6057060	BAM_5453	BAM_5452			FALSE	0.628	1.000	0.000	NA		NA
6057060	6057061	BAM_5452	BAM_5451			TRUE	0.695	31.000	0.500	NA		NA
6057061	6057062	BAM_5451	BAM_5450			FALSE	0.391	37.000	0.000	NA		NA
6057063	6057064	BAM_5449	BAM_5448		sigL	FALSE	0.062	255.000	0.000	NA		NA
6057064	6057065	BAM_5448	BAM_5447	sigL		TRUE	0.723	10.000	0.145	1.000		NA
6057065	6057066	BAM_5447	BAM_5446		cggR	TRUE	0.734	137.000	0.101	1.000		NA
6057066	6057067	BAM_5446	BAM_5445	cggR	gap2	TRUE	0.844	27.000	0.348	1.000	N	NA
6057067	6057068	BAM_5445	BAM_5444	gap2	pgk	TRUE	0.968	140.000	0.063	0.003	Y	NA
6057068	6057069	BAM_5444	BAM_5443	pgk	tpi	TRUE	0.928	33.000	0.141	1.000	Y	NA
6057069	6057070	BAM_5443	BAM_5442	tpi	gpmI	TRUE	0.956	-3.000	0.138	1.000	Y	NA
6057070	6057071	BAM_5442	BAM_5441	gpmI	eno	TRUE	0.934	31.000	0.136	1.000	Y	NA
6057071	6057072	BAM_5441	BAM_5440	eno		TRUE	0.845	144.000	0.003	1.000	N	NA
6057072	6057073	BAM_5440	BAM_5439			TRUE	0.685	123.000	0.000	NA		NA
6057074	6057075	BAM_5438	BAM_5437			FALSE	0.472	87.000	0.000	NA		NA
6057075	6057076	BAM_5437	BAM_5436			FALSE	0.325	-28.000	0.167	NA		NA
6057076	6057077	BAM_5436	BAM_5435			FALSE	0.010	417.000	0.000	NA		NA
6057077	6057078	BAM_5435	BAM_5434			FALSE	0.413	-10.000	0.000	NA		NA
6057078	6057079	BAM_5434	BAM_5433			FALSE	0.460	-7.000	0.000	NA		NA
6057079	6057080	BAM_5433	BAM_5432			FALSE	0.246	184.000	0.000	NA		NA
6057080	6057081	BAM_5432	BAM_5431			FALSE	0.010	411.000	0.000	NA		NA
6057081	6057082	BAM_5431	BAM_5430			FALSE	0.555	19.000	0.000	NA		NA
6057083	6057084	BAM_5429	BAM_5428			TRUE	0.643	111.000	0.000	NA		NA
6057084	6057085	BAM_5428	BAM_5427			TRUE	0.637	6.000	0.000	NA		NA
6057085	6057086	BAM_5427	BAM_5426			FALSE	0.329	60.000	0.000	NA		NA
6057088	6057089	BAM_5424	BAM_5423			FALSE	0.282	-27.000	0.000	NA		NA
6057091	6057092	BAM_1194	BAM_1193	katB	hemH2	TRUE	0.661	60.000	0.013	1.000	N	NA
6057092	6057093	BAM_1193	BAM_1192	hemH2	asnO1	FALSE	0.526	189.000	0.011	1.000	N	NA
6057096	6057097	BAM_1189	BAM_1188	rocD		FALSE	0.632	106.000	0.023	NA		NA
6057099	6057100	BAM_1186	BAM_1185		gerPA	FALSE	0.550	97.000	0.000	NA		NA
6057100	6057101	BAM_1185	BAM_1184	gerPA	gerPB	TRUE	0.882	15.000	0.889	NA		NA
6057101	6057102	BAM_1184	BAM_1183	gerPB	gerPC	FALSE	0.333	67.000	0.003	NA		NA
6057102	6057103	BAM_1183	BAM_1182	gerPC	gerPD	FALSE	0.629	7.000	0.003	NA		NA
6057103	6057104	BAM_1182	BAM_1181	gerPD	gerPE	TRUE	0.702	16.000	0.296	NA		NA
6057104	6057105	BAM_1181	BAM_1180	gerPE	gerPF1	FALSE	0.431	43.000	0.222	NA		NA
6057106	6057107	BAM_1179	BAM_1178		addA	TRUE	0.742	13.000	0.035	0.029		NA
6057107	6057108	BAM_1178	BAM_1177	addA	addB	TRUE	0.970	-3.000	0.408	0.002	Y	NA
6057108	6057109	BAM_1177	BAM_1176	addB	sipT	TRUE	0.896	117.000	0.086	1.000	N	NA
6057109	6057110	BAM_1176	BAM_1175	sipT		FALSE	0.409	57.000	0.246	NA		NA
6057110	6057111	BAM_1175	BAM_1174			FALSE	0.047	274.000	0.033	NA		NA
6057113	6057114	BAM_1172	BAM_1171		cspA1	FALSE	0.598	102.000	0.000	NA		NA
6057116	6057117	BAM_1169	BAM_1168	aceA	aceB	TRUE	0.947	24.000	0.084	1.000	Y	NA
6057117	6057118	BAM_1168	BAM_1167	aceB		FALSE	0.259	184.000	0.044	NA		NA
6057118	6057119	BAM_1167	BAM_1166			FALSE	0.019	340.000	0.000	NA		NA
6057121	6057122	BAM_1164	BAM_1163			TRUE	0.669	78.000	0.500	NA		NA
6057122	6057123	BAM_1163	BAM_1162			FALSE	0.208	213.000	0.000	0.065		NA
6057123	6057124	BAM_1162	BAM_1161			TRUE	0.891	137.000	0.022	0.065	N	NA
6057124	6057125	BAM_1161	BAM_1160			TRUE	0.647	135.000	0.009	NA		NA
6057125	6057126	BAM_1160	BAM_1159			TRUE	0.766	12.000	0.400	NA		NA
6057126	6057127	BAM_1159	BAM_1158			FALSE	0.614	140.000	0.000	NA		NA
6057127	6057128	BAM_1158	BAM_1157			FALSE	0.589	15.000	0.000	NA		NA
6057129	6057130	BAM_1156	BAM_1155			TRUE	0.976	10.000	0.533	1.000	Y	NA
6057131	6057132	BAM_1154	BAM_1153			FALSE	0.441	183.000	0.429	NA		NA
6057132	6057133	BAM_1153	BAM_1152			FALSE	0.452	60.000	0.294	NA		NA
6057134	6057135	BAM_1151	BAM_1150			TRUE	0.765	6.000	0.333	NA		NA
6057136	6057137	BAM_1149	BAM_1148			FALSE	0.118	216.000	0.000	NA		NA
6057137	6057138	BAM_1148	BAM_1147			FALSE	0.629	7.000	0.000	NA		NA
6057138	6057139	BAM_1147	BAM_1146			FALSE	0.547	147.000	0.000	NA		NA
6057141	6057142	BAM_1144	BAM_1143			FALSE	0.615	10.000	0.000	NA		NA
6057142	6057143	BAM_1143	BAM_1142			FALSE	0.087	234.000	0.000	NA		NA
6057143	6057144	BAM_1142	BAM_1141			FALSE	0.342	69.000	0.000	NA		NA
6057144	6057145	BAM_1141	BAM_1140			FALSE	0.629	7.000	0.000	NA		NA
6057145	6057146	BAM_1140	BAM_1139			FALSE	0.348	-16.000	0.000	NA		NA
6057146	6057147	BAM_1139	BAM_1138			FALSE	0.023	327.000	0.000	NA		NA
6057147	6057148	BAM_1138	BAM_1137			FALSE	0.387	75.000	0.000	NA		NA
6057148	6057149	BAM_1137	BAM_1136			TRUE	0.763	-7.000	0.667	NA		NA
6057149	6057150	BAM_1136	BAM_1135			FALSE	0.231	-81.000	0.000	NA		NA
6057150	6057151	BAM_1135	BAM_1134			FALSE	0.564	18.000	0.000	NA		NA
6057151	6057152	BAM_1134	BAM_1133			FALSE	0.473	29.000	0.000	NA		NA
6057152	6057153	BAM_1133	BAM_1132			FALSE	0.623	8.000	0.000	NA		NA
6057153	6057154	BAM_1132	BAM_1131			FALSE	0.023	326.000	0.000	NA		NA
6057154	6057155	BAM_1131	BAM_1130			FALSE	0.355	71.000	0.000	NA		NA
6057155	6057156	BAM_1130	BAM_1129			FALSE	0.227	-106.000	0.000	NA		NA
6057156	6057157	BAM_1129	BAM_1128			TRUE	0.712	113.000	0.222	NA		NA
6057157	6057158	BAM_1128	BAM_1127			TRUE	0.764	162.000	0.778	NA		NA
6057158	6057159	BAM_1127	BAM_1126			FALSE	0.073	255.000	0.098	NA		NA
6057159	6057160	BAM_1126	BAM_1125			TRUE	0.726	10.000	0.200	1.000		NA
6057162	6057163	BAM_1123	BAM_1122			FALSE	0.080	238.000	0.000	NA		NA
6057165	6057166	BAM_1120	BAM_1119			TRUE	0.745	37.000	0.778	NA		NA
6057166	6057167	BAM_1119	BAM_1118			TRUE	0.703	144.000	0.300	NA		NA
6057167	6057168	BAM_1118	BAM_1117			FALSE	0.120	215.000	0.000	NA		NA
6057168	6057169	BAM_1117	BAM_1116			TRUE	0.669	214.000	0.000	NA	Y	NA
6057169	6057170	BAM_1116	BAM_1115		blaI	TRUE	0.976	-3.000	0.833	NA	Y	NA
6057172	6057173	BAM_1114	BAM_1112			FALSE	0.503	152.000	0.000	NA		NA
6057175	6057176	BAM_1110	BAM_1109	hemY1	hemH1	TRUE	0.952	20.000	0.069	1.000	Y	NA
6057176	6057177	BAM_1109	BAM_1108	hemH1	hemE	TRUE	0.961	15.000	0.131	1.000	Y	NA
6057177	6057178	BAM_1108	BAM_1107	hemE	pbpF	FALSE	0.609	180.000	0.020	1.000	N	NA
6057180	6057181	BAM_1105	BAM_1104			TRUE	0.709	50.000	0.778	NA		NA
6057181	6057182	BAM_1104	BAM_1103			FALSE	0.531	74.000	0.333	NA		NA
6057182	6057183	BAM_1103	BAM_1102			FALSE	0.030	303.000	0.000	NA		NA
6057185	6057186	BAM_1100	BAM_1099			FALSE	0.005	693.000	0.000	NA		NA
6057186	6057187	BAM_1099	BAM_1098			FALSE	0.373	40.000	0.000	NA		NA
6057187	6057188	BAM_1098	BAM_1097			FALSE	0.009	453.000	0.000	NA		NA
6057188	6057189	BAM_1097	BAM_1096			TRUE	0.665	10.000	0.150	NA		NA
6057189	6057190	BAM_1096	BAM_1095			FALSE	0.619	105.000	0.000	NA		NA
6057190	6057191	BAM_1095	BAM_1094			FALSE	0.288	-25.000	0.000	NA		NA
6057191	6057192	BAM_1094	BAM_1093			FALSE	0.503	26.000	0.000	NA		NA
6057192	6057193	BAM_1093	BAM_1092			TRUE	0.782	80.000	0.778	NA		NA
6057193	6057194	BAM_1092	BAM_1091			TRUE	0.891	3.000	0.778	NA		NA
6057196	6057197	BAM_1089	BAM_1088	ecsC	ecsB	TRUE	0.708	14.000	0.292	NA		NA
6057197	6057198	BAM_1088	BAM_1087	ecsB	ecsA	TRUE	0.783	-7.000	0.271	NA	N	NA
6057199	6057200	BAM_1086	BAM_1085			FALSE	0.339	178.000	0.137	NA		NA
6057200	6057201	BAM_1085	BAM_1084		hpr	FALSE	0.035	299.000	0.063	NA		NA
6057205	6057206	BAM_1080	BAM_1079	prsA1		FALSE	0.018	378.000	0.000	1.000		NA
6057206	6057207	BAM_1079	BAM_1078			TRUE	0.717	88.000	0.500	NA		NA
6057208	6057209	BAM_1077	BAM_1076			TRUE	0.879	23.000	0.333	0.003	N	NA
6057209	6057210	BAM_1076	BAM_1075			FALSE	0.568	162.000	0.333	NA		NA
6057214	6057215	BAM_5630	BAM_5631			FALSE	0.090	231.000	0.000	NA		NA
6057215	6057216	BAM_5631	BAM_5632			FALSE	0.493	78.000	0.230	NA		NA
6057216	6057217	BAM_5632	BAM_5633			TRUE	0.864	108.000	0.133	NA	N	NA
6057217	6057218	BAM_5633	BAM_5634			FALSE	0.399	50.000	0.158	NA		NA
6057218	6057219	BAM_5634	BAM_5635		hemK	TRUE	0.662	104.000	0.178	NA		NA
6057219	6057220	BAM_5635	BAM_5636	hemK	prfA	TRUE	0.968	0.000	0.084	0.027	Y	NA
6057220	6057221	BAM_5636	BAM_5637	prfA	tdk	FALSE	0.196	262.000	0.062	1.000	N	NA
6057221	6057222	BAM_5637	BAM_5638	tdk	rpmE	TRUE	0.874	109.000	0.028	1.000	N	NA
6057222	6057223	BAM_5638	BAM_5639	rpmE	rho	FALSE	0.043	404.000	0.049	1.000	N	NA
6057223	6057224	BAM_5639	BAM_5640	rho	fbp2	FALSE	0.068	343.000	0.005	1.000	N	NA
6057224	6057225	BAM_5640	BAM_5641	fbp2		FALSE	0.607	16.000	0.065	NA		NA
6057225	6057226	BAM_5641	BAM_5642		murA2	FALSE	0.632	1.000	0.013	NA		NA
6057226	6057227	BAM_5642	BAM_5643	murA2	fba2	FALSE	0.079	332.000	0.000	1.000	N	NA
6057227	6057228	BAM_5643	BAM_5644	fba2	spo0F	FALSE	0.200	211.000	0.170	1.000		NA
6057230	6057231	BAM_5646	BAM_5647	pyrG	rpoE	FALSE	0.203	258.000	0.029	1.000	N	NA
6057231	6057232	BAM_5647	BAM_5648	rpoE		TRUE	0.938	155.000	0.068	1.000	Y	NA
6057232	6057233	BAM_5648	BAM_5649			TRUE	0.757	65.000	0.432	1.000	N	NA
6057233	6057234	BAM_5649	BAM_5650			TRUE	0.961	22.000	0.270	0.001	Y	NA
6057234	6057235	BAM_5650	BAM_5651			TRUE	0.912	74.000	0.110	1.000	Y	NA
6057235	6057236	BAM_5651	BAM_5652			TRUE	0.901	50.000	0.118	1.000	Y	NA
6057236	6057237	BAM_5652	BAM_5653			TRUE	0.888	111.000	0.205	1.000	N	NA
6057238	6057239	BAM_5654	BAM_5655			TRUE	0.849	33.000	0.545	1.000	N	NA
6057239	6057240	BAM_5655	BAM_5656			FALSE	0.030	600.000	0.308	1.000	N	NA
6057241	6057242	BAM_5657	BAM_5658	papR		FALSE	0.490	90.000	0.000	NA		NA
6057242	6057243	BAM_5658	BAM_5659			FALSE	0.342	52.000	0.000	NA		NA
6057245	6057246	BAM_5661	BAM_5662			TRUE	0.981	-3.000	0.867	0.014	Y	NA
6057246	6057247	BAM_5662	BAM_5663			TRUE	0.940	1.000	0.800	NA	N	NA
6057247	6057248	BAM_5663	BAM_5664			TRUE	0.952	-3.000	0.136	NA	Y	NA
6057249	6057250	BAM_5665	BAM_5666	maP3		FALSE	0.005	828.000	0.000	NA		NA
6057250	6057251	BAM_5666	BAM_5667			FALSE	0.612	104.000	0.000	NA		NA
6057253	6057254	BAM_5669	BAM_5670			TRUE	0.817	149.000	0.700	NA		NA
6057255	6057256	BAM_5671	BAM_5672			TRUE	0.728	-16.000	0.857	NA		NA
6057256	6057257	BAM_5672	BAM_5673			FALSE	0.627	-13.000	0.500	NA		NA
6057257	6057258	BAM_5673	BAM_5674		argS2	FALSE	0.043	397.000	0.000	1.000	N	NA
6057258	6057259	BAM_5674	BAM_5675	argS2		TRUE	0.649	0.000	0.079	NA		NA
6057263	6057264	BAM_5679	BAM_5680			FALSE	0.395	-12.000	0.010	NA		NA
6057264	6057265	BAM_5680	BAM_5681		speE	TRUE	0.687	218.000	0.141	1.000	Y	NA
6057265	6057266	BAM_5681	BAM_5682	speE		FALSE	0.556	187.000	0.096	1.000	N	NA
6057266	6057267	BAM_5682	BAM_5683			TRUE	0.886	6.000	0.205	1.000	N	NA
6057267	6057268	BAM_5683	BAM_5684			FALSE	0.497	32.000	0.200	NA		NA
6057269	6057270	BAM_5685	BAM_5686			TRUE	0.850	100.000	0.051	1.000	N	NA
6057271	6057272	BAM_5687	BAM_5688			FALSE	0.521	26.000	0.044	NA		NA
6057274	6057275	BAM_5690	BAM_5691			FALSE	0.547	147.000	0.000	NA		NA
6057275	6057276	BAM_5691	BAM_5692			FALSE	0.209	192.000	0.000	NA		NA
6057276	6057277	BAM_5692	BAM_5693			TRUE	0.975	16.000	0.609	1.000	Y	NA
6057277	6057278	BAM_5693	BAM_5694			TRUE	0.962	-3.000	0.130	0.022	Y	NA
6057278	6057279	BAM_5694	BAM_5695			FALSE	0.027	312.000	0.000	NA		NA
6057284	6057285	BAM_5700	BAM_5701			FALSE	0.166	202.000	0.000	NA		NA
6057285	6057286	BAM_5701	BAM_5702		cwlJ2	FALSE	0.407	174.000	0.069	1.000		NA
6057286	6057287	BAM_5702	BAM_5703	cwlJ2	gerQ	TRUE	0.796	28.000	0.722	NA		NA
6057288	6057289	BAM_5704	BAM_5705			FALSE	0.345	65.000	0.042	NA		NA
6057289	6057290	BAM_5705	BAM_5706			TRUE	0.782	7.000	0.391	NA		NA
6057291	6057292	BAM_5707	BAM_5708			FALSE	0.486	173.000	0.062	0.030		NA
6057292	6057293	BAM_5708	BAM_5709			FALSE	0.137	210.000	0.000	NA		NA
6057294	6057295	BAM_5710	BAM_5711	ung		FALSE	0.583	20.000	0.088	NA		NA
6057295	6057296	BAM_5711	BAM_5712			TRUE	0.799	-7.000	0.791	NA		NA
6057296	6057297	BAM_5712	BAM_5713			TRUE	0.933	-3.000	0.850	1.000	N	NA
6057297	6057298	BAM_5713	BAM_5714			TRUE	0.786	83.000	0.175	1.000	N	NA
6057300	6057301	BAM_5716	BAM_5717	hom2	metA	TRUE	0.960	142.000	0.021	1.000	Y	NA
6057301	6057302	BAM_5717	BAM_5718	metA		TRUE	0.898	-16.000	0.051	1.000	Y	NA
6057306	6057307	BAM_5722	BAM_5723			TRUE	0.638	192.000	0.471	1.000	N	NA
6057307	6057308	BAM_5723	BAM_5724			FALSE	0.538	21.000	0.000	NA		NA
6057308	6057309	BAM_5724	BAM_5725			FALSE	0.581	16.000	0.000	NA		NA
6057311	6057312	BAM_5727	BAM_5728			FALSE	0.600	147.000	0.171	NA		NA
6057312	6057313	BAM_5728	BAM_5729		cstA	FALSE	0.532	-7.000	0.229	NA		NA
6057313	6057314	BAM_5729	BAM_5730	cstA		TRUE	0.980	122.000	0.421	1.000	Y	NA
6057314	6057315	BAM_5730	BAM_5731			FALSE	0.137	210.000	0.000	NA		NA
6057316	6057317	BAM_4770	BAM_4771			FALSE	0.593	14.000	0.000	NA		NA
6057317	6057318	BAM_4771	BAM_4772		rph	TRUE	0.880	12.000	0.262	1.000	N	NA
6057318	6057319	BAM_4772	BAM_4773	rph	gerM	TRUE	0.687	129.000	0.040	NA		NA
6057319	6057320	BAM_4773	BAM_4774	gerM	racE2	TRUE	0.673	131.000	0.026	NA		NA
6057320	6057321	BAM_4774	BAM_4775	racE2		FALSE	0.376	211.000	0.000	1.000	N	NA
6057322	6057323	BAM_4776	BAM_4777			FALSE	0.178	199.000	0.000	NA		NA
6057324	6057325	BAM_4778	BAM_4779			FALSE	0.481	161.000	0.154	NA		NA
6057325	6057326	BAM_4779	BAM_4780			FALSE	0.532	155.000	0.154	NA		NA
6057326	6057327	BAM_4780	BAM_4781		gerE	FALSE	0.341	174.000	0.075	NA		NA
6057327	6057328	BAM_4781	BAM_4782	gerE		TRUE	0.730	166.000	0.175	1.000	N	NA
6057328	6057329	BAM_4782	BAM_4783			TRUE	0.801	31.000	0.065	0.064	N	NA
6057329	6057330	BAM_4783	BAM_4784			TRUE	0.812	93.000	0.065	1.000	N	NA
6057330	6057331	BAM_4784	BAM_4785			TRUE	0.965	14.000	0.286	1.000	Y	NA
6057331	6057332	BAM_4785	BAM_4786			TRUE	0.934	110.000	0.600	1.000	N	NA
6057333	6057334	BAM_4787	BAM_4788			TRUE	0.981	16.000	0.765	0.022	Y	NA
6057334	6057335	BAM_4788	BAM_4789			TRUE	0.962	15.000	0.245	1.000	Y	NA
6057335	6057336	BAM_4789	BAM_4790			TRUE	0.974	2.000	0.265	0.002	Y	NA
6057336	6057337	BAM_4790	BAM_4791			FALSE	0.348	70.000	0.000	NA		NA
6057337	6057338	BAM_4791	BAM_4792			FALSE	0.071	248.000	0.000	NA		NA
6057338	6057339	BAM_4792	BAM_4793			TRUE	0.645	4.000	0.000	NA		NA
6057339	6057340	BAM_4793	BAM_4794			FALSE	0.337	-18.000	0.000	NA		NA
6057340	6057341	BAM_4794	BAM_4795			FALSE	0.091	230.000	0.000	NA		NA
6057343	6057344	BAM_4797	BAM_4798			FALSE	0.594	144.000	0.035	NA		NA
6057345	6057346	BAM_4799	BAM_4800			TRUE	0.945	119.000	0.700	NA	N	NA
6057346	6057347	BAM_4800	BAM_4801			TRUE	0.903	3.000	0.889	NA		NA
6057349	6057350	BAM_4803	BAM_4804			FALSE	0.393	-12.000	0.000	NA		NA
6057350	6057351	BAM_4804	BAM_4805			FALSE	0.413	-10.000	0.000	NA		NA
6057353	6057354	BAM_4807	BAM_4808		sdhB	FALSE	0.627	102.000	0.072	NA		NA
6057354	6057355	BAM_4808	BAM_4809	sdhB	sdhA	TRUE	0.947	-7.000	0.231	0.001	Y	NA
6057355	6057356	BAM_4809	BAM_4810	sdhA	sdhC	TRUE	0.968	14.000	0.184	0.001	Y	NA
6057358	6057359	BAM_4812	BAM_4813	uvrC	trx	TRUE	0.817	149.000	0.023	1.000	N	NA
6057359	6057360	BAM_4813	BAM_4814	trx	etfA	TRUE	0.737	212.000	0.055	0.005	Y	NA
6057360	6057361	BAM_4814	BAM_4815	etfA	etfB	TRUE	0.939	37.000	0.373	0.005	Y	NA
6057361	6057362	BAM_4815	BAM_4816	etfB		TRUE	0.789	79.000	0.275	1.000	N	NA
6057362	6057363	BAM_4816	BAM_4817			TRUE	0.886	12.000	0.294	1.000	N	NA
6057363	6057364	BAM_4817	BAM_4818		fadD	TRUE	0.910	107.000	0.406	1.000	N	NA
6057364	6057365	BAM_4818	BAM_4819	fadD		TRUE	0.764	127.000	0.071	1.000		NA
6057365	6057366	BAM_4819	BAM_4820			TRUE	0.679	119.000	0.000	NA		NA
6057367	6057368	BAM_4821	BAM_4822			FALSE	0.623	8.000	0.000	NA		NA
6057368	6057369	BAM_4822	BAM_4823			TRUE	0.674	112.000	0.069	NA		NA
6057369	6057370	BAM_4823	BAM_4824			TRUE	0.685	137.000	0.190	NA		NA
6057371	6057372	BAM_4825	BAM_4826			TRUE	0.689	27.000	0.417	NA		NA
6057372	6057373	BAM_4826	BAM_4827			FALSE	0.584	38.000	0.417	NA		NA
6057373	6057374	BAM_4827	BAM_4828			TRUE	0.740	35.000	0.714	NA		NA
6057374	6057375	BAM_4828	BAM_4829			FALSE	0.470	38.000	0.250	NA		NA
6057375	6057376	BAM_4829	BAM_4830			TRUE	0.957	126.000	0.680	0.071	N	NA
6057376	6057377	BAM_4830	BAM_4831			TRUE	0.984	2.000	0.750	0.014	Y	NA
6057378	6057379	BAM_4832	BAM_4833			FALSE	0.628	1.000	0.000	NA		NA
6057380	6057381	BAM_4834	BAM_4835			FALSE	0.574	90.000	0.020	1.000		NA
6057383	6057384	BAM_4837	BAM_4838			FALSE	0.611	32.000	0.373	NA		NA
6057384	6057385	BAM_4838	BAM_4839			TRUE	0.953	-10.000	0.657	1.000	Y	NA
6057385	6057386	BAM_4839	BAM_4840			TRUE	0.971	28.000	0.877	1.000	Y	NA
6057386	6057387	BAM_4840	BAM_4841			FALSE	0.348	70.000	0.000	NA		NA
6057387	6057388	BAM_4841	BAM_4842			FALSE	0.515	24.000	0.000	NA		NA
6057388	6057389	BAM_4842	BAM_4843			FALSE	0.509	25.000	0.000	NA		NA
6057389	6057390	BAM_4843	BAM_4844			FALSE	0.515	24.000	0.000	NA		NA
6057390	6057391	BAM_4844	BAM_4845		brnQ6	FALSE	0.008	488.000	0.000	NA		NA
6057391	6057392	BAM_4845	BAM_4846	brnQ6		FALSE	0.031	477.000	0.000	1.000	N	NA
6057392	6057393	BAM_4846	BAM_4847			FALSE	0.473	73.000	0.267	NA		NA
6057393	6057394	BAM_4847	BAM_4848			FALSE	0.454	31.000	0.010	NA		NA
6057394	6057395	BAM_4848	BAM_4849			TRUE	0.954	20.000	0.114	1.000	Y	NA
6057395	6057396	BAM_4849	BAM_4850			FALSE	0.436	53.000	0.066	1.000		NA
6057396	6057397	BAM_4850	BAM_4851			TRUE	0.670	2.000	0.091	NA		NA
6057398	6057399	BAM_4852	BAM_4853	rnh		TRUE	0.672	132.000	0.034	NA		NA
6057399	6057400	BAM_4853	BAM_4854			TRUE	0.828	-3.000	0.667	NA		NA
6057401	6057402	BAM_4855	BAM_4856		asnS	FALSE	0.521	94.000	0.000	NA		NA
6057402	6057403	BAM_4856	BAM_4857	asnS	pheT	FALSE	0.120	499.000	0.000	0.071	Y	NA
6057403	6057404	BAM_4857	BAM_4858	pheT	pheS	TRUE	0.975	19.000	0.574	0.000	Y	NA
6057404	6057405	BAM_4858	BAM_4859	pheS		FALSE	0.283	321.000	0.006	1.000	Y	NA
6057406	6057407	BAM_4860	BAM_4861	sspI		FALSE	0.468	162.000	0.175	NA		NA
6057407	6057408	BAM_4861	BAM_4862			TRUE	0.664	140.000	0.147	NA		NA
6057408	6057409	BAM_4862	BAM_4863			FALSE	0.373	40.000	0.000	NA		NA
6057409	6057410	BAM_4863	BAM_4864			FALSE	0.447	159.000	0.000	NA		NA
6057410	6057411	BAM_4864	BAM_4865			TRUE	0.720	38.000	0.714	NA		NA
6057412	6057413	BAM_4866	BAM_4867			TRUE	0.814	13.000	0.441	1.000		NA
6057415	6057416	BAM_4869	BAM_4870			FALSE	0.575	70.000	0.463	NA		NA
6057416	6057417	BAM_4870	BAM_4871		rplT	FALSE	0.008	471.000	0.000	NA		NA
6057417	6057418	BAM_4871	BAM_4872	rplT	rpmI	FALSE	0.383	38.000	0.000	NA		NA
6057419	6057420	BAM_0378	BAM_0377			FALSE	0.083	237.000	0.000	NA		NA
6057421	6057422	BAM_0376	BAM_0375			TRUE	0.695	170.000	0.133	1.000	N	NA
6057422	6057423	BAM_0375	BAM_0374			TRUE	0.978	122.000	0.348	1.000	Y	NA
6057423	6057424	BAM_0374	BAM_0373			TRUE	0.957	95.000	0.130	0.030	Y	NA
6057426	6057427	BAM_0371	BAM_0370			TRUE	0.850	144.000	0.053	1.000	N	NA
6057428	6057429	BAM_0369	BAM_0368			TRUE	0.709	123.000	0.068	NA		NA
6057431	6057432	BAM_0366	BAM_0365			FALSE	0.101	224.000	0.000	NA		NA
6057432	6057433	BAM_0365	BAM_0364			FALSE	0.329	62.000	0.000	NA		NA
6057433	6057434	BAM_0364	BAM_0363			FALSE	0.040	282.000	0.000	NA		NA
6057434	6057435	BAM_0363	BAM_0362			FALSE	0.083	237.000	0.000	NA		NA
6057435	6057436	BAM_0362	BAM_0361			FALSE	0.515	-7.000	0.133	NA		NA
6057436	6057437	BAM_0361	BAM_0360			FALSE	0.329	63.000	0.000	NA		NA
6057437	6057438	BAM_0360	BAM_0359			FALSE	0.538	21.000	0.000	NA		NA
6057438	6057439	BAM_0359	BAM_0358			FALSE	0.085	236.000	0.000	NA		NA
6057442	6057443	BAM_0355	BAM_0354			TRUE	0.928	49.000	0.487	1.000	Y	NA
6057443	6057444	BAM_0354	BAM_0353			TRUE	0.980	-3.000	0.857	0.063	Y	NA
6057445	6057446	BAM_0352	BAM_0351			TRUE	0.667	55.000	0.017	1.000	N	NA
6057446	6057447	BAM_0351	BAM_0350			TRUE	0.698	10.000	0.042	1.000		NA
6057448	6057449	BAM_0349	BAM_0348	ahpC	ahpF	TRUE	0.974	15.000	0.551	1.000	Y	NA
6057450	6057451	BAM_0347	BAM_0346		amhX	FALSE	0.605	152.000	0.263	NA		NA
6057454	6057455	BAM_0343	BAM_0342			TRUE	0.642	15.000	0.189	NA		NA
6057456	6057457	BAM_0341	BAM_0340			FALSE	0.549	95.000	0.043	NA		NA
6057457	6057458	BAM_0340	BAM_0339			FALSE	0.046	273.000	0.000	NA		NA
6057458	6057459	BAM_0339	BAM_0338			FALSE	0.056	261.000	0.000	NA		NA
6057459	6057460	BAM_0338	BAM_0337			TRUE	0.952	97.000	0.008	1.000	Y	NA
6057461	6057462	BAM_0336	BAM_0335			FALSE	0.252	240.000	0.000	1.000	N	NA
6057462	6057463	BAM_0335	BAM_0334			TRUE	0.958	152.000	0.300	0.004	Y	NA
6057463	6057464	BAM_0334	BAM_0333		ampS	TRUE	0.907	117.000	0.258	1.000	N	NA
6057465	6057466	BAM_0332	BAM_0331		gabD	TRUE	0.705	48.000	0.157	1.000	N	NA
6057466	6057467	BAM_0331	BAM_0330	gabD		TRUE	0.871	-7.000	0.583	1.000	N	NA
6057467	6057468	BAM_0330	BAM_0329		gabT	TRUE	0.919	113.000	0.409	1.000	N	NA
6057468	6057469	BAM_0329	BAM_0328	gabT		FALSE	0.551	83.000	0.045	1.000		NA
6057469	6057470	BAM_0328	BAM_0327			TRUE	0.694	140.000	0.028	1.000		NA
6057470	6057471	BAM_0327	BAM_0326		gatB	FALSE	0.033	471.000	0.034	1.000	N	NA
6057471	6057472	BAM_0326	BAM_0325	gatB	gatA	TRUE	0.976	15.000	0.492	0.001	Y	NA
6057472	6057473	BAM_0325	BAM_0324	gatA	gatC	TRUE	0.979	16.000	0.643	0.001	Y	NA
6057473	6057474	BAM_0324	BAM_0323	gatC		FALSE	0.185	197.000	0.000	NA		NA
6057475	6057476	BAM_0322	BAM_0321			FALSE	0.409	77.000	0.000	NA		NA
6057476	6057477	BAM_0321	BAM_0320			FALSE	0.564	18.000	0.000	NA		NA
6057477	6057478	BAM_0320	BAM_0319			FALSE	0.460	-7.000	0.000	NA		NA
6057478	6057479	BAM_0319	BAM_0318			TRUE	0.683	59.000	0.750	NA		NA
6057480	6057481	BAM_0317	BAM_0316			TRUE	0.947	22.000	0.233	NA	Y	NA
6057481	6057482	BAM_0316	BAM_0315			TRUE	0.926	-10.000	0.233	1.000	Y	NA
6057484	6057485	BAM_0313	BAM_0312			FALSE	0.249	186.000	0.051	NA		NA
6057485	6057486	BAM_0312	BAM_0311			FALSE	0.614	154.000	0.205	1.000		NA
6057486	6057487	BAM_0311	BAM_0310			TRUE	0.847	96.000	0.800	NA		NA
6057487	6057488	BAM_0310	BAM_0309		ligA	FALSE	0.574	17.000	0.009	NA		NA
6057488	6057489	BAM_0309	BAM_0308	ligA	pcrA	TRUE	0.964	16.000	0.103	0.007	Y	NA
6057489	6057490	BAM_0308	BAM_0307	pcrA		TRUE	0.647	1.000	0.049	NA		NA
6057491	6057492	BAM_0306	BAM_0305			FALSE	0.137	210.000	0.000	NA		NA
6057492	6057493	BAM_0305	BAM_0304			TRUE	0.830	17.000	0.549	1.000		NA
6057494	6057495	BAM_0303	BAM_0302	purD	purH	TRUE	0.975	122.000	0.238	1.000	Y	NA
6057495	6057496	BAM_0302	BAM_0301	purH	purN	TRUE	0.948	25.000	0.225	1.000	Y	NA
6057496	6057497	BAM_0301	BAM_0300	purN	purM	TRUE	0.964	-3.000	0.238	0.001	Y	NA
6057497	6057498	BAM_0300	BAM_0299	purM	purF	TRUE	0.968	107.000	0.248	1.000	Y	NA
6057498	6057499	BAM_0299	BAM_0298	purF	purL	TRUE	0.909	-15.000	0.223	1.000	Y	NA
6057499	6057500	BAM_0298	BAM_0297	purL	purQ	TRUE	0.928	-16.000	0.346	0.001	Y	NA
6057500	6057501	BAM_0297	BAM_0296	purQ		TRUE	0.977	-3.000	0.656	0.001	Y	NA
6057501	6057502	BAM_0296	BAM_0295		purC	TRUE	0.952	-7.000	0.460	1.000	Y	NA
6057502	6057503	BAM_0295	BAM_0294	purC	purB	TRUE	0.939	89.000	0.072	1.000	Y	NA
6057503	6057504	BAM_0294	BAM_0293	purB	purK	TRUE	0.954	-3.000	0.033	1.000	Y	NA
6057504	6057505	BAM_0293	BAM_0292	purK	purE	TRUE	0.962	-3.000	0.038	0.000	Y	NA
6057505	6057506	BAM_0292	BAM_0291	purE	rrfH	FALSE	0.005	700.000	0.000	NA		NA
6057507	6057508	BAM_3656	BAM_3657			FALSE	0.472	87.000	0.000	NA		NA
6057508	6057509	BAM_3657	BAM_3658			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6057513	6057514	BAM_3662	BAM_3663		argH1	FALSE	0.334	67.000	0.000	NA		NA
6057514	6057515	BAM_3663	BAM_3664	argH1		FALSE	0.617	0.000	0.000	NA		NA
6057515	6057516	BAM_3664	BAM_3665			FALSE	0.598	102.000	0.000	NA		NA
6057516	6057517	BAM_3665	BAM_3666			TRUE	0.924	147.000	0.889	NA	N	NA
6057517	6057518	BAM_3666	BAM_3667			TRUE	0.919	108.000	0.471	1.000	N	NA
6057518	6057519	BAM_3667	BAM_3668			TRUE	0.693	4.000	0.170	NA		NA
6057523	6057524	BAM_3672	BAM_3673			FALSE	0.596	100.000	0.040	NA		NA
6057524	6057525	BAM_3673	BAM_3674			FALSE	0.449	80.000	0.023	NA		NA
6057525	6057526	BAM_3674	BAM_3675			FALSE	0.506	91.000	0.023	NA		NA
6057526	6057527	BAM_3675	BAM_3676			FALSE	0.360	169.000	0.022	NA		NA
6057527	6057528	BAM_3676	BAM_3677			FALSE	0.574	43.000	0.429	NA		NA
6057528	6057529	BAM_3677	BAM_3678			TRUE	0.764	16.000	0.429	NA		NA
6057529	6057530	BAM_3678	BAM_3679		moaD2	TRUE	0.665	67.000	0.010	1.000	N	NA
6057530	6057531	BAM_3679	BAM_3680	moaD2	moaE2	TRUE	0.981	5.000	0.501	0.003	Y	NA
6057531	6057532	BAM_3680	BAM_3681	moaE2	moeA2	TRUE	0.900	-19.000	0.008	0.003	Y	NA
6057532	6057533	BAM_3681	BAM_3682	moeA2		TRUE	0.978	19.000	0.900	1.000	Y	NA
6057533	6057534	BAM_3682	BAM_3683			TRUE	0.867	25.000	0.429	1.000	N	NA
6057534	6057535	BAM_3683	BAM_3684			FALSE	0.430	-13.000	0.143	NA		NA
6057535	6057536	BAM_3684	BAM_3685		narA2	FALSE	0.584	96.000	0.100	NA		NA
6057536	6057537	BAM_3685	BAM_3686	narA2	fdhD2	TRUE	0.874	21.000	0.400	1.000	N	NA
6057537	6057538	BAM_3686	BAM_3687	fdhD2		TRUE	0.803	17.000	0.545	NA		NA
6057538	6057539	BAM_3687	BAM_3688			TRUE	0.823	116.000	0.429	NA		NA
6057539	6057540	BAM_3688	BAM_3689			TRUE	0.891	12.000	0.929	NA		NA
6057540	6057541	BAM_3689	BAM_3690			FALSE	0.317	-31.000	0.143	NA		NA
6057542	6057543	BAM_3691	BAM_3692	gerSA	gerSB	TRUE	0.751	-3.000	0.231	0.006		NA
6057543	6057544	BAM_3692	BAM_3693	gerSB	gerSC	FALSE	0.628	1.000	0.000	NA		NA
6057544	6057545	BAM_3693	BAM_3694	gerSC		FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6057546	6057547	BAM_3695	BAM_3696			FALSE	0.544	58.000	0.438	NA		NA
6057547	6057548	BAM_3696	BAM_3697			FALSE	0.629	74.000	0.500	NA		NA
6057548	6057549	BAM_3697	BAM_3698			FALSE	0.067	251.000	0.000	NA		NA
6057549	6057550	BAM_3698	BAM_3699			TRUE	0.646	-3.000	0.250	NA		NA
6057552	6057553	BAM_3701	BAM_3702			TRUE	0.883	113.000	0.026	1.000	N	NA
6057553	6057554	BAM_3702	BAM_3703			FALSE	0.422	286.000	0.000	0.022	Y	NA
6057554	6057555	BAM_3703	BAM_3704			FALSE	0.076	335.000	0.000	1.000	N	NA
6057555	6057556	BAM_3704	BAM_3705			FALSE	0.415	201.000	0.037	NA	N	NA
6057556	6057557	BAM_3705	BAM_3706			TRUE	0.864	16.000	0.778	NA		NA
6057557	6057558	BAM_3706	BAM_3707			TRUE	0.872	13.000	0.778	NA		NA
6057558	6057559	BAM_3707	BAM_3708			TRUE	0.678	128.000	0.000	NA		NA
6057559	6057560	BAM_3708	BAM_3709			FALSE	0.334	67.000	0.000	NA		NA
6057560	6057561	BAM_3709	BAM_3710			FALSE	0.345	51.000	0.000	NA		NA
6057561	6057562	BAM_3710	BAM_3711			FALSE	0.617	0.000	0.000	NA		NA
6057562	6057563	BAM_3711	BAM_3712			FALSE	0.460	-7.000	0.000	NA		NA
6057565	6057566	BAM_3714	BAM_3715		parC	FALSE	0.428	170.000	0.035	1.000		NA
6057566	6057567	BAM_3715	BAM_3716	parC	parE	TRUE	0.982	2.000	0.552	0.001	Y	NA
6057567	6057568	BAM_3716	BAM_3717	parE		FALSE	0.149	206.000	0.000	NA		NA
6057568	6057569	BAM_3717	BAM_3718			FALSE	0.332	57.000	0.000	NA		NA
6057569	6057570	BAM_3718	BAM_3719		htrA	FALSE	0.445	80.000	0.015	NA		NA
6057570	6057571	BAM_3719	BAM_3720	htrA		FALSE	0.463	203.000	0.222	1.000	N	NA
6057571	6057572	BAM_3720	BAM_3721			FALSE	0.546	20.000	0.000	NA		NA
6057572	6057573	BAM_3721	BAM_3722			FALSE	0.314	-21.000	0.000	NA		NA
6057573	6057574	BAM_3722	BAM_3723			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6057575	6057576	BAM_3724	BAM_3725			TRUE	0.652	109.000	0.048	NA		NA
6057579	6057580	BAM_3728	BAM_3729	tlp	sspN	TRUE	0.794	100.000	0.500	NA		NA
6057580	6057581	BAM_3729	BAM_3730	sspN		TRUE	0.718	44.000	0.773	NA		NA
6057581	6057582	BAM_3730	BAM_3731			TRUE	0.771	133.000	0.316	NA		NA
6057586	6057587	BAM_3735	BAM_3736		acnA	TRUE	0.890	117.000	0.013	1.000	N	NA
6057589	6057590	BAM_3738	BAM_3739			FALSE	0.532	47.000	0.381	NA		NA
6057592	6057593	BAM_3741	BAM_3742			FALSE	0.525	58.000	0.412	NA		NA
6057597	6057598	BAM_3746	BAM_3747			FALSE	0.460	-7.000	0.000	NA		NA
6057598	6057599	BAM_3747	BAM_3748			FALSE	0.331	66.000	0.000	NA		NA
6057601	6057602	BAM_0641	BAM_0640	aspA1		FALSE	0.530	84.000	0.222	NA		NA
6057602	6057603	BAM_0640	BAM_0639			FALSE	0.632	108.000	0.010	NA		NA
6057604	6057605	BAM_0638	BAM_0637			FALSE	0.220	261.000	0.333	NA	N	NA
6057605	6057606	BAM_0637	BAM_0636			FALSE	0.240	235.000	0.000	NA	N	NA
6057607	6057608	BAM_0635	BAM_0634			TRUE	0.855	16.000	0.727	NA		NA
6057610	6057611	BAM_0632	BAM_0631			FALSE	0.478	167.000	0.273	NA		NA
6057611	6057612	BAM_0631	BAM_0630			TRUE	0.706	3.000	0.231	NA		NA
6057614	6057615	BAM_0628	BAM_0627			TRUE	0.821	25.000	0.203	1.000	N	NA
6057615	6057616	BAM_0627	BAM_0626			FALSE	0.175	267.000	0.000	1.000	N	NA
6057616	6057617	BAM_0626	BAM_0625		ald1	TRUE	0.983	104.000	0.889	1.000	Y	NA
6057617	6057618	BAM_0625	BAM_0624	ald1		FALSE	0.056	368.000	0.000	1.000	N	NA
6057618	6057619	BAM_0624	BAM_0623			FALSE	0.461	157.000	0.000	NA		NA
6057619	6057620	BAM_0623	BAM_0622			FALSE	0.598	13.000	0.000	NA		NA
6057620	6057621	BAM_0622	BAM_0621			FALSE	0.598	13.000	0.000	NA		NA
6057622	6057623	BAM_0620	BAM_0619	fdhD1		FALSE	0.288	229.000	0.000	1.000	N	NA
6057625	6057626	BAM_0617	BAM_0616			TRUE	0.939	66.000	0.727	1.000	Y	NA
6057626	6057627	BAM_0616	BAM_0615			TRUE	0.835	147.000	0.636	1.000		NA
6057629	6057630	BAM_0613	BAM_0612			TRUE	0.823	116.000	0.429	NA		NA
6057631	6057632	BAM_0611	BAM_0610			TRUE	0.917	60.000	0.432	1.000	Y	NA
6057632	6057633	BAM_0610	BAM_0609			TRUE	0.909	123.000	0.243	1.000	N	NA
6057633	6057634	BAM_0609	BAM_0608			TRUE	0.962	-3.000	0.229	0.055	Y	NA
6057634	6057635	BAM_0608	BAM_0607			TRUE	0.974	125.000	0.229	1.000	Y	NA
6057635	6057636	BAM_0607	BAM_0606			FALSE	0.064	254.000	0.000	NA		NA
6057636	6057637	BAM_0606	BAM_0605			TRUE	0.657	44.000	0.600	NA		NA
6057637	6057638	BAM_0605	BAM_0604			FALSE	0.146	207.000	0.000	NA		NA
6057638	6057639	BAM_0604	BAM_0603			TRUE	0.973	-3.000	0.606	1.000	Y	NA
6057639	6057640	BAM_0603	BAM_0602			FALSE	0.627	150.000	0.091	1.000		NA
6057640	6057641	BAM_0602	BAM_0601			FALSE	0.014	416.000	0.000	1.000		NA
6057641	6057642	BAM_0601	BAM_0600			TRUE	0.975	22.000	0.708	0.022	Y	NA
6057642	6057643	BAM_0600	BAM_0599			TRUE	0.980	-3.000	0.848	0.022	Y	NA
6057643	6057644	BAM_0599	BAM_0598			TRUE	0.975	0.000	0.391	0.022	Y	NA
6057644	6057645	BAM_0598	BAM_0597			TRUE	0.860	-3.000	0.262	1.000	N	NA
6057645	6057646	BAM_0597	BAM_0596			FALSE	0.006	559.000	0.000	NA		NA
6057646	6057647	BAM_0596	BAM_0595			FALSE	0.036	290.000	0.000	NA		NA
6057647	6057648	BAM_0595	BAM_0594			TRUE	0.693	135.000	0.125	NA		NA
6057650	6057651	BAM_0592	BAM_0591			TRUE	0.984	0.000	0.818	0.055	Y	NA
6057651	6057652	BAM_0591	BAM_0590			TRUE	0.963	158.000	0.600	0.010	Y	NA
6057652	6057653	BAM_0590	BAM_0589			FALSE	0.083	237.000	0.000	NA		NA
6057653	6057654	BAM_0589	BAM_0588			TRUE	0.790	13.000	0.464	NA		NA
6057654	6057655	BAM_0588	BAM_0587			FALSE	0.067	251.000	0.000	NA		NA
6057657	6057658	BAM_0585	BAM_0584			TRUE	0.753	155.000	0.500	1.000		NA
6057658	6057659	BAM_0584	BAM_0583			TRUE	0.672	130.000	0.018	NA		NA
6057659	6057660	BAM_0583	BAM_0582			FALSE	0.034	446.000	0.683	NA		NA
6057662	6057663	BAM_0580	BAM_0579			TRUE	0.894	128.000	0.016	1.000	N	NA
6057663	6057664	BAM_0579	BAM_0578			FALSE	0.369	59.000	0.097	NA		NA
6057664	6057665	BAM_0578	BAM_0577			FALSE	0.411	45.000	0.174	NA		NA
6057665	6057666	BAM_0577	BAM_0576			FALSE	0.178	199.000	0.000	NA		NA
6057666	6057667	BAM_0576	BAM_0575			TRUE	0.662	115.000	0.000	NA		NA
6057667	6057668	BAM_0575	BAM_0574			FALSE	0.222	188.000	0.000	NA		NA
6057670	6057671	BAM_0552	BAM_0551	rrsI		FALSE	0.488	-6.000	0.000	NA		NA
6057673	6057674	BAM_0549	BAM_0548		bcP	FALSE	0.115	299.000	0.005	1.000	N	NA
6057674	6057675	BAM_0548	BAM_0547	bcP		FALSE	0.364	45.000	0.015	NA		NA
6057675	6057676	BAM_0547	BAM_0546			FALSE	0.423	73.000	0.188	NA		NA
6057676	6057677	BAM_0546	BAM_0545			TRUE	0.834	5.000	0.500	NA		NA
6057677	6057678	BAM_0545	BAM_0544			TRUE	0.691	-7.000	0.488	NA		NA
6057679	6057680	BAM_0543	BAM_0542	hemL1		FALSE	0.461	200.000	0.036	1.000	N	NA
6057680	6057681	BAM_0542	BAM_0541			FALSE	0.063	261.000	0.066	NA		NA
6057682	6057683	BAM_0540	BAM_0539			TRUE	0.643	55.000	0.077	NA	N	NA
6057692	6057693	BAM_0530	BAM_0529	sspK		FALSE	0.597	44.000	0.480	NA		NA
6057694	6057695	BAM_0528	BAM_0527			FALSE	0.632	10.000	0.045	NA		NA
6057696	6057697	BAM_0526	BAM_0525			FALSE	0.605	141.000	0.000	NA		NA
6057697	6057698	BAM_0525	BAM_0524			FALSE	0.216	242.000	0.000	NA	N	NA
6057698	6057699	BAM_0524	BAM_0523			TRUE	0.833	111.000	0.500	NA		NA
6057700	6057701	BAM_0522	BAM_0521		pflA	FALSE	0.039	413.000	0.000	1.000	N	NA
6057701	6057702	BAM_0521	BAM_0520	pflA	pfl	TRUE	0.700	70.000	0.135	1.000	N	NA
6057702	6057703	BAM_0520	BAM_0519	pfl		FALSE	0.019	340.000	0.000	NA		NA
6057703	6057704	BAM_0519	BAM_0518			FALSE	0.480	-7.000	0.050	NA		NA
6057704	6057705	BAM_0518	BAM_0516			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6057705	6057706	BAM_0516	BAM_0515			FALSE	0.413	-10.000	0.000	NA		NA
6057706	6057707	BAM_0515	BAM_0514			TRUE	0.646	-19.000	0.667	NA		NA
6057707	6057708	BAM_0514	BAM_0513			TRUE	0.842	17.000	0.692	NA		NA
6057708	6057709	BAM_0513	BAM_0512			TRUE	0.664	154.000	0.385	NA		NA
6057709	6057710	BAM_0512	BAM_0511			FALSE	0.208	255.000	0.000	1.000	N	NA
6057710	6057711	BAM_0511	BAM_0510			FALSE	0.608	142.000	0.032	NA		NA
6057712	6057713	BAM_0509	BAM_0508	glsA1		FALSE	0.363	-15.000	0.000	NA		NA
6057713	6057714	BAM_0508	BAM_0507			FALSE	0.377	39.000	0.000	NA		NA
6057715	6057716	BAM_0506	BAM_0505			TRUE	0.662	115.000	0.000	NA		NA
6057718	6057719	BAM_0503	BAM_0502			TRUE	0.956	96.000	0.259	1.000	Y	NA
6057719	6057720	BAM_0502	BAM_0501			TRUE	0.853	105.000	0.636	NA		NA
6057721	6057722	BAM_0500	BAM_0499			FALSE	0.598	84.000	0.304	NA		NA
6057725	6057726	BAM_0496	BAM_0495			FALSE	0.617	0.000	0.000	NA		NA
6057726	6057727	BAM_0495	BAM_0494			FALSE	0.370	73.000	0.000	NA		NA
6057727	6057728	BAM_0494	BAM_0493			FALSE	0.532	95.000	0.000	NA		NA
6057728	6057729	BAM_0493	BAM_0492			FALSE	0.391	37.000	0.000	NA		NA
6057729	6057730	BAM_0492	BAM_0491			FALSE	0.342	69.000	0.000	NA		NA
6057730	6057731	BAM_0491	BAM_0490			FALSE	0.331	66.000	0.000	NA		NA
6057731	6057732	BAM_0490	BAM_0489			FALSE	0.589	15.000	0.000	NA		NA
6057732	6057733	BAM_0489	BAM_0488			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6057733	6057734	BAM_0488	BAM_0487			FALSE	0.259	-34.000	0.000	NA		NA
6057734	6057735	BAM_0487	BAM_0486			FALSE	0.564	18.000	0.000	NA		NA
6057735	6057736	BAM_0486	BAM_0485			TRUE	0.644	5.000	0.000	NA		NA
6057736	6057737	BAM_0485	BAM_0484			FALSE	0.628	1.000	0.000	NA		NA
6057737	6057738	BAM_0484	BAM_0483			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6057738	6057739	BAM_0483	BAM_0482			FALSE	0.460	-7.000	0.000	NA		NA
6057739	6057740	BAM_0482	BAM_0481			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6057740	6057741	BAM_0481	BAM_0480			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6057741	6057742	BAM_0480	BAM_0479			FALSE	0.581	16.000	0.000	NA		NA
6057742	6057743	BAM_0479	BAM_0478			FALSE	0.574	19.000	0.048	NA		NA
6057743	6057744	BAM_0478	BAM_0477			FALSE	0.246	-43.000	0.000	NA		NA
6057744	6057745	BAM_0477	BAM_0476			FALSE	0.593	14.000	0.000	NA		NA
6057745	6057746	BAM_0476	BAM_0475			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6057746	6057747	BAM_0475	BAM_0474			FALSE	0.589	101.000	0.000	NA		NA
6057747	6057748	BAM_0474	BAM_0473			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6057748	6057749	BAM_0473	BAM_0472			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6057751	6057752	BAM_0470	BAM_0469			TRUE	0.655	133.000	0.000	NA		NA
6057752	6057753	BAM_0469	BAM_0468			FALSE	0.483	28.000	0.000	NA		NA
6057753	6057754	BAM_0468	BAM_0467			FALSE	0.617	0.000	0.000	NA		NA
6057754	6057755	BAM_0467	BAM_0466			FALSE	0.483	28.000	0.000	NA		NA
6057755	6057756	BAM_0466	BAM_0465			TRUE	0.666	116.000	0.000	NA		NA
6057756	6057757	BAM_0465	BAM_0464			FALSE	0.107	221.000	0.000	NA		NA
6057757	6057758	BAM_0464	BAM_0463			FALSE	0.624	106.000	0.000	NA		NA
6057758	6057759	BAM_0463	BAM_0462			FALSE	0.439	32.000	0.000	NA		NA
6057759	6057760	BAM_0462	BAM_0461			FALSE	0.370	41.000	0.000	NA		NA
6057760	6057761	BAM_0461	BAM_0460			FALSE	0.617	0.000	0.000	NA		NA
6057761	6057762	BAM_0460	BAM_0459			FALSE	0.362	44.000	0.000	NA		NA
6057762	6057763	BAM_0459	BAM_0458			FALSE	0.503	26.000	0.000	NA		NA
6057763	6057764	BAM_0458	BAM_0457			FALSE	0.598	13.000	0.000	NA		NA
6057764	6057765	BAM_0457	BAM_0456			FALSE	0.383	38.000	0.000	NA		NA
6057765	6057766	BAM_0456	BAM_0455			FALSE	0.174	200.000	0.000	NA		NA
6057766	6057767	BAM_0455	BAM_0454			FALSE	0.351	49.000	0.000	NA		NA
6057767	6057768	BAM_0454	BAM_0453			FALSE	0.383	38.000	0.000	NA		NA
6057768	6057769	BAM_0453	BAM_0452			FALSE	0.581	16.000	0.000	NA		NA
6057769	6057770	BAM_0452	BAM_0451			FALSE	0.603	12.000	0.000	NA		NA
6057770	6057771	BAM_0451	BAM_0450			FALSE	0.589	15.000	0.000	NA		NA
6057771	6057772	BAM_0450	BAM_0449			FALSE	0.509	25.000	0.000	NA		NA
6057772	6057773	BAM_0449	BAM_0448			FALSE	0.581	16.000	0.000	NA		NA
6057773	6057774	BAM_0448	BAM_0447			FALSE	0.317	-31.000	0.182	NA		NA
6057774	6057775	BAM_0447	BAM_0446			FALSE	0.614	-3.000	0.182	NA		NA
6057775	6057776	BAM_0446	BAM_0445			FALSE	0.462	30.000	0.000	NA		NA
6057776	6057777	BAM_0445	BAM_0444			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6057778	6057779	BAM_4691	BAM_4692	aspS	hisS2	FALSE	0.598	13.000	0.000	NA		NA
6057779	6057780	BAM_4692	BAM_4693	hisS2		FALSE	0.191	196.000	0.000	NA		NA
6057780	6057781	BAM_4693	BAM_4694			FALSE	0.497	39.000	0.286	NA		NA
6057781	6057782	BAM_4694	BAM_4695		dtD	FALSE	0.342	52.000	0.003	NA		NA
6057782	6057783	BAM_4695	BAM_4696	dtD	relA	TRUE	0.850	18.000	0.177	1.000	N	NA
6057783	6057784	BAM_4696	BAM_4697	relA	apt1	FALSE	0.388	211.000	0.068	1.000	N	NA
6057784	6057785	BAM_4697	BAM_4698	apt1	recJ	TRUE	0.705	48.000	0.128	1.000	N	NA
6057785	6057786	BAM_4698	BAM_4699	recJ		FALSE	0.107	221.000	0.000	NA		NA
6057786	6057787	BAM_4699	BAM_4700		secDF	FALSE	0.513	151.000	0.000	NA		NA
6057787	6057788	BAM_4700	BAM_4701	secDF		FALSE	0.059	271.000	0.185	NA		NA
6057792	6057793	BAM_4705	BAM_4706	yajC	tgt	TRUE	0.813	28.000	0.325	NA	N	NA
6057793	6057794	BAM_4706	BAM_4707	tgt	queA	TRUE	0.973	13.000	0.360	0.000	Y	NA
6057794	6057795	BAM_4707	BAM_4708	queA		FALSE	0.561	20.000	0.039	NA		NA
6057795	6057796	BAM_4708	BAM_4709		ruvB	FALSE	0.576	-3.000	0.040	NA		NA
6057796	6057797	BAM_4709	BAM_4710	ruvB	ruvA	TRUE	0.982	6.000	0.549	0.001	Y	NA
6057799	6057800	BAM_4712	BAM_4713			TRUE	0.683	121.000	0.000	NA		NA
6057800	6057801	BAM_4713	BAM_4714			TRUE	0.641	3.000	0.000	NA		NA
6057801	6057802	BAM_4714	BAM_4715			FALSE	0.334	67.000	0.000	NA		NA
6057804	6057805	BAM_4717	BAM_4718		safA	FALSE	0.417	179.000	0.320	NA		NA
6057805	6057806	BAM_4718	BAM_4719	safA	nadA	FALSE	0.019	375.000	0.000	1.000		NA
6057806	6057807	BAM_4719	BAM_4720	nadA	nadC	TRUE	0.943	31.000	0.198	0.002	Y	NA
6057807	6057808	BAM_4720	BAM_4721	nadC	nadB	TRUE	0.958	20.000	0.014	0.002	Y	NA
6057809	6057810	BAM_4722	BAM_4723			TRUE	0.762	3.000	0.243	1.000		NA
6057810	6057811	BAM_4723	BAM_4724			FALSE	0.550	82.000	0.057	1.000		NA
6057812	6057813	BAM_4725	BAM_4726	pheA		FALSE	0.634	97.000	0.025	1.000		NA
6057813	6057814	BAM_4726	BAM_4727			TRUE	0.787	50.000	0.889	0.061		NA
6057814	6057815	BAM_4727	BAM_4728			TRUE	0.708	-25.000	0.889	1.000		NA
6057815	6057816	BAM_4728	BAM_4729			FALSE	0.521	94.000	0.000	NA		NA
6057816	6057817	BAM_4729	BAM_4730			FALSE	0.430	-9.000	0.000	NA		NA
6057817	6057818	BAM_4730	BAM_4731			FALSE	0.609	11.000	0.000	NA		NA
6057818	6057819	BAM_4731	BAM_4732		obg	TRUE	0.687	140.000	0.008	1.000		NA
6057819	6057820	BAM_4732	BAM_4733	obg		FALSE	0.624	0.000	0.021	NA		NA
6057820	6057821	BAM_4733	BAM_4734		rpmA	FALSE	0.333	64.000	0.013	NA		NA
6057821	6057822	BAM_4734	BAM_4735	rpmA		TRUE	0.966	4.000	0.203	NA	Y	NA
6057822	6057823	BAM_4735	BAM_4736		rplU	TRUE	0.957	12.000	0.036	NA	Y	NA
6057823	6057824	BAM_4736	BAM_4737	rplU		TRUE	0.911	166.000	0.076	1.000	Y	NA
6057824	6057825	BAM_4737	BAM_4738		spoIVFB	FALSE	0.471	68.000	0.229	1.000		NA
6057825	6057826	BAM_4738	BAM_4739	spoIVFB	spoIVFA	FALSE	0.526	-7.000	0.219	NA		NA
6057826	6057827	BAM_4739	BAM_4740	spoIVFA	minD	TRUE	0.868	134.000	0.060	NA	N	NA
6057827	6057828	BAM_4740	BAM_4741	minD	minC	TRUE	0.974	3.000	0.368	1.000	Y	NA
6057828	6057829	BAM_4741	BAM_4742	minC	mreD	TRUE	0.741	36.000	0.106	1.000	N	NA
6057829	6057830	BAM_4742	BAM_4743	mreD	mreC	TRUE	0.978	15.000	0.550	0.001	Y	NA
6057830	6057831	BAM_4743	BAM_4744	mreC	mreB	TRUE	0.841	42.000	0.689	1.000	N	NA
6057831	6057832	BAM_4744	BAM_4745	mreB	radC	TRUE	0.762	159.000	0.011	1.000	N	NA
6057832	6057833	BAM_4745	BAM_4746	radC	maF	TRUE	0.653	47.000	0.023	NA	N	NA
6057833	6057834	BAM_4746	BAM_4747	maF		FALSE	0.110	221.000	0.020	NA		NA
6057834	6057835	BAM_4747	BAM_4748		folC	FALSE	0.434	166.000	0.159	NA		NA
6057835	6057836	BAM_4748	BAM_4749	folC	valS	TRUE	0.839	94.000	0.041	0.068	N	NA
6057836	6057837	BAM_4749	BAM_4750	valS	ysxE	FALSE	0.011	396.000	0.000	NA		NA
6057837	6057838	BAM_4750	BAM_4751	ysxE		FALSE	0.576	63.000	0.500	NA		NA
6057838	6057839	BAM_4751	BAM_4752		hemL2	TRUE	0.786	110.000	0.288	1.000		NA
6057839	6057840	BAM_4752	BAM_4753	hemL2	hemB	TRUE	0.970	0.000	0.126	0.001	Y	NA
6057840	6057841	BAM_4753	BAM_4754	hemB	hemD	TRUE	0.958	21.000	0.061	0.001	Y	NA
6057841	6057842	BAM_4754	BAM_4755	hemD	hemC	TRUE	0.971	2.000	0.028	0.001	Y	NA
6057842	6057843	BAM_4755	BAM_4756	hemC		TRUE	0.849	16.000	0.040	1.000	N	NA
6057843	6057844	BAM_4756	BAM_4757		hemA	TRUE	0.914	18.000	0.613	1.000	N	NA
6057845	6057846	BAM_4758	BAM_4759			TRUE	0.914	3.000	0.400	1.000	N	NA
6057847	6057848	BAM_4760	BAM_4761		loN	TRUE	0.654	-3.000	0.055	1.000		NA
6057848	6057849	BAM_4761	BAM_4762	loN	lonB	TRUE	0.897	184.000	0.435	0.001	Y	NA
6057849	6057850	BAM_4762	BAM_4763	lonB	clpX	TRUE	0.968	104.000	0.042	0.001	Y	NA
6057850	6057851	BAM_4763	BAM_4764	clpX	tig	FALSE	0.519	265.000	0.033	0.002	Y	NA
6057851	6057852	BAM_4764	BAM_4765	tig		FALSE	0.038	310.000	0.011	1.000		NA
6057852	6057853	BAM_4765	BAM_4766			FALSE	0.215	198.000	0.125	NA		NA
6057853	6057854	BAM_4766	BAM_4767			FALSE	0.037	288.000	0.000	NA		NA
6057858	6057859	BAM_4124	BAM_4125			FALSE	0.439	32.000	0.000	NA		NA
6057859	6057860	BAM_4125	BAM_4126			TRUE	0.666	116.000	0.000	NA		NA
6057860	6057861	BAM_4126	BAM_4127			TRUE	0.641	3.000	0.000	NA		NA
6057862	6057863	BAM_4128	BAM_4129			TRUE	0.645	4.000	0.000	NA		NA
6057863	6057864	BAM_4129	BAM_4130			TRUE	0.637	6.000	0.000	NA		NA
6057865	6057866	BAM_4131	BAM_4132			FALSE	0.617	0.000	0.000	NA		NA
6057866	6057867	BAM_4132	BAM_4133			TRUE	0.644	5.000	0.000	NA		NA
6057867	6057868	BAM_4133	BAM_4134			FALSE	0.469	156.000	0.000	NA		NA
6057868	6057869	BAM_4134	BAM_4135			FALSE	0.509	25.000	0.000	NA		NA
6057869	6057870	BAM_4135	BAM_4136			FALSE	0.515	24.000	0.000	NA		NA
6057870	6057871	BAM_4136	BAM_4137			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6057871	6057872	BAM_4137	BAM_4138			FALSE	0.397	164.000	0.000	NA		NA
6057872	6057873	BAM_4138	BAM_4139			FALSE	0.391	37.000	0.000	NA		NA
6057873	6057874	BAM_4139	BAM_4140			FALSE	0.331	66.000	0.000	NA		NA
6057874	6057875	BAM_4140	BAM_4141			FALSE	0.619	105.000	0.000	NA		NA
6057875	6057876	BAM_4141	BAM_4142			FALSE	0.581	16.000	0.000	NA		NA
6057876	6057877	BAM_4142	BAM_4143			FALSE	0.329	60.000	0.000	NA		NA
6057877	6057878	BAM_4143	BAM_4144			TRUE	0.888	14.000	1.000	NA		NA
6057878	6057879	BAM_4144	BAM_4145			TRUE	0.874	-3.000	1.000	NA		NA
6057879	6057880	BAM_4145	BAM_4146			FALSE	0.422	-12.000	0.071	NA		NA
6057880	6057881	BAM_4146	BAM_4147			FALSE	0.423	-13.000	0.107	NA		NA
6057881	6057882	BAM_4147	BAM_4148			FALSE	0.619	9.000	0.000	NA		NA
6057882	6057883	BAM_4148	BAM_4149			FALSE	0.409	77.000	0.000	NA		NA
6057883	6057884	BAM_4149	BAM_4150			TRUE	0.863	-3.000	0.846	NA		NA
6057884	6057885	BAM_4150	BAM_4151			TRUE	0.885	11.000	0.846	NA		NA
6057885	6057886	BAM_4151	BAM_4152			TRUE	0.660	61.000	0.692	NA		NA
6057886	6057887	BAM_4152	BAM_4153			FALSE	0.379	-19.000	0.200	NA		NA
6057887	6057888	BAM_4153	BAM_4154			TRUE	0.663	162.000	0.500	NA		NA
6057888	6057889	BAM_4154	BAM_4155			FALSE	0.614	140.000	0.000	NA		NA
6057889	6057890	BAM_4155	BAM_4156			FALSE	0.012	388.000	0.000	NA		NA
6057890	6057891	BAM_4156	BAM_4157			FALSE	0.045	274.000	0.000	NA		NA
6057891	6057892	BAM_4157	BAM_4158			FALSE	0.637	-3.000	0.000	1.000		NA
6057892	6057893	BAM_4158	BAM_4159			FALSE	0.538	21.000	0.000	NA		NA
6057893	6057894	BAM_4159	BAM_4160			TRUE	0.662	115.000	0.000	NA		NA
6057894	6057895	BAM_4160	BAM_4161			TRUE	0.787	27.000	0.667	NA		NA
6057895	6057896	BAM_4161	BAM_4162			FALSE	0.498	91.000	0.000	NA		NA
6057896	6057897	BAM_4162	BAM_4163			FALSE	0.564	18.000	0.000	NA		NA
6057897	6057898	BAM_4163	BAM_4164			TRUE	0.681	120.000	0.000	NA		NA
6057898	6057899	BAM_4164	BAM_4165			FALSE	0.391	37.000	0.000	NA		NA
6057899	6057900	BAM_4165	BAM_4166			FALSE	0.005	745.000	0.000	NA		NA
6057902	6057903	BAM_4168	BAM_4169			FALSE	0.371	167.000	0.000	NA		NA
6057903	6057904	BAM_4169	BAM_4170		dut	FALSE	0.503	26.000	0.000	NA		NA
6057904	6057905	BAM_4170	BAM_4171	dut		FALSE	0.334	67.000	0.000	NA		NA
6057905	6057906	BAM_4171	BAM_4172			FALSE	0.348	-16.000	0.000	NA		NA
6057906	6057907	BAM_4172	BAM_4173			FALSE	0.619	9.000	0.000	NA		NA
6057907	6057908	BAM_4173	BAM_4174			FALSE	0.434	39.000	0.200	NA		NA
6057908	6057909	BAM_4174	BAM_4175			FALSE	0.598	13.000	0.000	NA		NA
6057909	6057910	BAM_4175	BAM_4176			FALSE	0.589	15.000	0.000	NA		NA
6057910	6057911	BAM_4176	BAM_4177			FALSE	0.503	26.000	0.000	NA		NA
6057911	6057912	BAM_4177	BAM_4178			FALSE	0.581	16.000	0.000	NA		NA
6057912	6057913	BAM_4178	BAM_4179			FALSE	0.326	-19.000	0.000	NA		NA
6057913	6057914	BAM_4179	BAM_4180			TRUE	0.644	5.000	0.000	NA		NA
6057914	6057915	BAM_4180	BAM_4181			TRUE	0.764	30.000	0.667	NA		NA
6057915	6057916	BAM_4181	BAM_4182			FALSE	0.490	90.000	0.000	NA		NA
6057916	6057917	BAM_4182	BAM_4183			FALSE	0.491	52.000	0.333	NA		NA
6057919	6057920	BAM_4185	BAM_4186			TRUE	0.890	102.000	1.000	NA		NA
6057920	6057921	BAM_4186	BAM_4187			TRUE	0.762	13.000	0.400	NA		NA
6057923	6057924	BAM_4189	BAM_4190			TRUE	0.641	3.000	0.000	NA		NA
6057924	6057925	BAM_4190	BAM_4191			TRUE	0.758	22.000	0.500	NA		NA
6057926	6057927	BAM_4192	BAM_4193			FALSE	0.206	193.000	0.014	NA		NA
6057928	6057929	BAM_4194	BAM_4195			FALSE	0.572	-7.000	0.095	1.000		NA
6057931	6057932	BAM_4196	BAM_4198	coaD		TRUE	0.835	-3.000	0.009	1.000	N	NA
6057933	6057934	BAM_4199	BAM_4200			FALSE	0.337	-18.000	0.000	NA		NA
6057935	6057936	BAM_4201	BAM_4202		ylbF	FALSE	0.161	253.000	0.500	NA		NA
6057936	6057937	BAM_4202	BAM_4203	ylbF		TRUE	0.700	117.000	0.078	NA		NA
6057937	6057938	BAM_4203	BAM_4204			FALSE	0.442	77.000	0.078	NA		NA
6057938	6057939	BAM_4204	BAM_4205			TRUE	0.883	12.000	0.852	NA		NA
6057939	6057940	BAM_4205	BAM_4206			TRUE	0.667	146.000	0.276	NA		NA
6057942	6057943	BAM_4208	BAM_4209			FALSE	0.097	227.000	0.000	NA		NA
6057943	6057944	BAM_4209	BAM_4210		ctaF	TRUE	0.784	86.000	0.707	NA		NA
6057944	6057945	BAM_4210	BAM_4211	ctaF	ctaE	TRUE	0.987	4.000	0.950	0.001	Y	NA
6057945	6057946	BAM_4211	BAM_4212	ctaE	ctaD	TRUE	0.986	0.000	0.925	0.001	Y	NA
6057946	6057947	BAM_4212	BAM_4213	ctaD	ctaC	TRUE	0.965	34.000	0.755	0.001	Y	NA
6057947	6057948	BAM_4213	BAM_4214	ctaC		TRUE	0.845	94.000	0.084	0.040	N	NA
6057950	6057951	BAM_4216	BAM_4217	pyc		FALSE	0.087	323.000	0.000	1.000	N	NA
6057951	6057952	BAM_4217	BAM_4218			TRUE	0.728	126.000	0.133	NA		NA
6057954	6057955	BAM_4220	BAM_4221			FALSE	0.098	248.000	0.025	1.000		NA
6057957	6057958	BAM_4223	BAM_4224			TRUE	0.770	15.000	0.429	NA		NA
6057958	6057959	BAM_4224	BAM_4225		typA	FALSE	0.482	156.000	0.032	NA		NA
6057962	6057963	BAM_4056	BAM_4057		rpe	TRUE	0.878	139.000	0.166	1.000	N	NA
6057963	6057964	BAM_4057	BAM_4058	rpe		TRUE	0.751	3.000	0.213	1.000		NA
6057964	6057965	BAM_4058	BAM_4059			FALSE	0.080	269.000	0.196	1.000		NA
6057965	6057966	BAM_4059	BAM_4060			TRUE	0.980	9.000	0.704	1.000	Y	NA
6057966	6057967	BAM_4060	BAM_4061			TRUE	0.742	5.000	0.105	1.000		NA
6057967	6057968	BAM_4061	BAM_4062		sun	TRUE	0.748	5.000	0.135	1.000		NA
6057968	6057969	BAM_4062	BAM_4063	sun	fmt	TRUE	0.961	-3.000	0.305	1.000	Y	NA
6057969	6057970	BAM_4063	BAM_4064	fmt	def1	TRUE	0.952	24.000	0.031	0.008	Y	NA
6057970	6057971	BAM_4064	BAM_4065	def1	priA	TRUE	0.860	12.000	0.029	1.000	N	NA
6057971	6057972	BAM_4065	BAM_4066	priA	coaBC	TRUE	0.845	-3.000	0.099	1.000	N	NA
6057972	6057973	BAM_4066	BAM_4067	coaBC	rpoZ	TRUE	0.675	173.000	0.192	1.000	N	NA
6057973	6057974	BAM_4067	BAM_4068	rpoZ		TRUE	0.923	3.000	0.471	1.000	N	NA
6057974	6057975	BAM_4068	BAM_4069			TRUE	0.645	14.000	0.143	NA		NA
6057975	6057976	BAM_4069	BAM_4070			FALSE	0.390	68.000	0.189	NA		NA
6057976	6057977	BAM_4070	BAM_4071			FALSE	0.603	101.000	0.037	NA		NA
6057978	6057979	BAM_4072	BAM_4074			FALSE	0.014	371.000	0.000	NA		NA
6057980	6057981	BAM_4073	BAM_4075			TRUE	0.704	-3.000	0.333	NA		NA
6057981	6057982	BAM_4075	BAM_4076			TRUE	0.824	16.000	0.600	NA		NA
6057983	6057984	BAM_4077	BAM_4078			FALSE	0.413	167.000	0.100	NA		NA
6057984	6057985	BAM_4078	BAM_4079			FALSE	0.523	23.000	0.000	NA		NA
6057986	6057987	BAM_4080	BAM_4081	pyrE	pyrF	TRUE	0.956	-3.000	0.133	1.000	Y	NA
6057987	6057988	BAM_4081	BAM_4082	pyrF	pyrD	TRUE	0.921	-15.000	0.154	0.001	Y	NA
6057988	6057989	BAM_4082	BAM_4083	pyrD	pyrK	TRUE	0.910	-3.000	0.592	1.000	N	NA
6057989	6057990	BAM_4083	BAM_4084	pyrK	carB	TRUE	0.848	-3.000	0.147	1.000	N	NA
6057990	6057991	BAM_4084	BAM_4085	carB		TRUE	0.921	-15.000	0.117	0.000	Y	NA
6057991	6057992	BAM_4085	BAM_4086		pyrC	TRUE	0.956	-3.000	0.155	1.000	Y	NA
6057992	6057993	BAM_4086	BAM_4087	pyrC	pyrB	TRUE	0.925	-16.000	0.452	1.000	Y	NA
6057993	6057994	BAM_4087	BAM_4088	pyrB	uraA	TRUE	0.948	149.000	0.064	1.000	Y	NA
6057994	6057995	BAM_4088	BAM_4089	uraA	pyrR	TRUE	0.954	147.000	0.140	1.000	Y	NA
6057995	6057996	BAM_4089	BAM_4090	pyrR		FALSE	0.440	203.000	0.048	1.000	N	NA
6057996	6057997	BAM_4090	BAM_4091		lspA	TRUE	0.879	5.000	0.022	1.000	N	NA
6057997	6057998	BAM_4091	BAM_4092	lspA		TRUE	0.757	125.000	0.038	1.000		NA
6057998	6057999	BAM_4092	BAM_4093		ileS2	FALSE	0.631	156.000	0.010	0.011		NA
6057999	6058000	BAM_4093	BAM_4094	ileS2	divIVA	FALSE	0.056	348.000	0.012	NA	N	NA
6058000	6058001	BAM_4094	BAM_4095	divIVA		TRUE	0.756	90.000	0.579	NA		NA
6058001	6058002	BAM_4095	BAM_4096			TRUE	0.695	16.000	0.138	1.000		NA
6058002	6058003	BAM_4096	BAM_4097			TRUE	0.678	7.000	0.158	NA		NA
6058003	6058004	BAM_4097	BAM_4098			FALSE	0.601	20.000	0.194	NA		NA
6058004	6058005	BAM_4098	BAM_4099			FALSE	0.586	-3.000	0.061	NA		NA
6058005	6058006	BAM_4099	BAM_4100			TRUE	0.685	117.000	0.039	NA		NA
6058006	6058007	BAM_4100	BAM_4101		sigG	FALSE	0.461	169.000	0.276	NA		NA
6058007	6058008	BAM_4101	BAM_4102	sigG	sigE	TRUE	0.963	158.000	0.602	0.007	Y	NA
6058008	6058009	BAM_4102	BAM_4103	sigE	spoIIGA	TRUE	0.873	20.000	0.856	1.000		NA
6058009	6058010	BAM_4103	BAM_4104	spoIIGA	ftsZ	FALSE	0.074	265.000	0.024	1.000		NA
6058010	6058011	BAM_4104	BAM_4105	ftsZ	ftsA	TRUE	0.933	40.000	0.460	1.000	Y	NA
6058011	6058012	BAM_4105	BAM_4106	ftsA		FALSE	0.053	401.000	0.389	NA	N	NA
6058012	6058013	BAM_4106	BAM_4107		murB1	TRUE	0.952	99.000	0.070	NA	Y	NA
6058013	6058014	BAM_4107	BAM_4108	murB1	murG1	TRUE	0.890	62.000	0.061	1.000	Y	NA
6058014	6058015	BAM_4108	BAM_4109	murG1	spoVE	TRUE	0.702	49.000	0.120	1.000	N	NA
6058015	6058016	BAM_4109	BAM_4110	spoVE	murD	TRUE	0.837	91.000	0.067	0.003	N	NA
6058016	6058017	BAM_4110	BAM_4111	murD	mraY	TRUE	0.982	1.000	0.647	0.003	Y	NA
6058017	6058018	BAM_4111	BAM_4112	mraY	murE	TRUE	0.954	23.000	0.025	0.003	Y	NA
6058018	6058019	BAM_4112	BAM_4113	murE		TRUE	0.737	209.000	0.181	1.000	Y	NA
6058019	6058020	BAM_4113	BAM_4114			TRUE	0.942	82.000	0.096	0.002	Y	NA
6058020	6058021	BAM_4114	BAM_4115		ftsL	TRUE	0.829	22.000	0.101	1.000	N	NA
6058021	6058022	BAM_4115	BAM_4116	ftsL	mraW	TRUE	0.854	16.000	0.077	1.000	N	NA
6058022	6058023	BAM_4116	BAM_4117	mraW		FALSE	0.014	371.000	0.003	NA		NA
6058023	6058024	BAM_4117	BAM_4118		panE2	FALSE	0.462	80.000	0.053	NA		NA
6058026	6058027	BAM_4120	BAM_4121		rpmF	TRUE	0.734	130.000	0.007	1.000		NA
6058027	6058028	BAM_4121	BAM_4122	rpmF		FALSE	0.329	62.000	0.000	NA		NA
6058029	6058030	BAM_0079	BAM_0078	lysS		TRUE	0.926	160.000	0.021	1.000	Y	NA
6058030	6058031	BAM_0078	BAM_0077			TRUE	0.809	24.000	0.016	1.000	N	NA
6058031	6058032	BAM_0077	BAM_0076		folK	FALSE	0.562	-48.000	0.027	1.000	N	NA
6058032	6058033	BAM_0076	BAM_0075	folK	folB	TRUE	0.956	-3.000	0.142	1.000	Y	NA
6058033	6058034	BAM_0075	BAM_0074	folB	folP	TRUE	0.967	1.000	0.176	1.000	Y	NA
6058034	6058035	BAM_0074	BAM_0073	folP	pabC	TRUE	0.978	2.000	0.519	1.000	Y	NA
6058035	6058036	BAM_0073	BAM_0072	pabC	pabA	TRUE	0.960	-6.000	0.532	1.000	Y	NA
6058036	6058037	BAM_0072	BAM_0071	pabA	pabB	TRUE	0.979	6.000	0.452	0.009	Y	NA
6058037	6058038	BAM_0071	BAM_0070	pabB	cysK1	TRUE	0.671	221.000	0.107	1.000	Y	NA
6058038	6058039	BAM_0070	BAM_0069	cysK1	hslO	TRUE	0.870	105.000	0.053	1.000	N	NA
6058039	6058040	BAM_0069	BAM_0068	hslO		TRUE	0.875	7.000	0.060	1.000	N	NA
6058040	6058041	BAM_0068	BAM_0067		ftsH	FALSE	0.306	225.000	0.029	1.000	N	NA
6058041	6058042	BAM_0067	BAM_0066	ftsH	hpt	FALSE	0.469	86.000	0.000	NA		NA
6058042	6058043	BAM_0066	BAM_0065	hpt	tilS	FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6058043	6058044	BAM_0065	BAM_0064	tilS	spoIIE	FALSE	0.278	234.000	0.041	1.000	N	NA
6058044	6058045	BAM_0064	BAM_0063	spoIIE		FALSE	0.060	257.000	0.000	NA		NA
6058045	6058046	BAM_0063	BAM_0062			FALSE	0.615	10.000	0.000	NA		NA
6058046	6058047	BAM_0062	BAM_0061			FALSE	0.438	160.000	0.000	NA		NA
6058047	6058048	BAM_0061	BAM_0060		divIC1	TRUE	0.800	88.000	0.134	1.000	N	NA
6058048	6058049	BAM_0060	BAM_0059	divIC1	yabQ	FALSE	0.592	-3.000	0.074	NA		NA
6058049	6058050	BAM_0059	BAM_0058	yabQ	yabP	TRUE	0.851	-3.000	0.774	NA		NA
6058050	6058051	BAM_0058	BAM_0057	yabP		FALSE	0.374	59.000	0.108	NA		NA
6058051	6058052	BAM_0057	BAM_0056			TRUE	0.679	15.000	0.054	1.000		NA
6058052	6058053	BAM_0056	BAM_0055			TRUE	0.688	13.000	0.058	1.000		NA
6058053	6058054	BAM_0055	BAM_0054		spoVT	FALSE	0.109	231.000	0.147	NA		NA
6058054	6058055	BAM_0054	BAM_0053	spoVT	mfd	TRUE	0.962	137.000	0.026	NA	Y	NA
6058055	6058056	BAM_0053	BAM_0052	mfd		TRUE	0.637	106.000	0.035	NA		NA
6058056	6058057	BAM_0052	BAM_0051		spoVC	FALSE	0.367	71.000	0.033	NA		NA
6058057	6058058	BAM_0051	BAM_0050	spoVC	prsA	TRUE	0.863	10.000	0.010	1.000	N	NA
6058058	6058059	BAM_0050	BAM_0049	prsA	gcaD	TRUE	0.838	19.000	0.069	1.000	N	NA
6058059	6058060	BAM_0049	BAM_0048	gcaD	spoVG	FALSE	0.279	323.000	0.014	1.000	Y	NA
6058060	6058061	BAM_0048	BAM_0047	spoVG		TRUE	0.832	153.000	0.377	NA	N	NA
6058061	6058062	BAM_0047	BAM_0046			FALSE	0.573	17.000	0.000	NA		NA
6058062	6058063	BAM_0046	BAM_0045		purR	FALSE	0.377	-13.000	0.000	NA		NA
6058063	6058064	BAM_0045	BAM_0044	purR	ispE	TRUE	0.675	55.000	0.062	1.000	N	NA
6058064	6058065	BAM_0044	BAM_0043	ispE	sspF	FALSE	0.243	197.000	0.024	1.000		NA
6058065	6058066	BAM_0043	BAM_0042	sspF		FALSE	0.557	92.000	0.163	NA		NA
6058066	6058067	BAM_0042	BAM_0041			FALSE	0.096	239.000	0.116	NA		NA
6058067	6058068	BAM_0041	BAM_0040		ksgA	TRUE	0.650	111.000	0.022	NA		NA
6058068	6058069	BAM_0040	BAM_0039	ksgA		TRUE	0.844	-3.000	0.093	1.000	N	NA
6058069	6058070	BAM_0039	BAM_0038			TRUE	0.669	215.000	0.058	NA	Y	NA
6058070	6058071	BAM_0038	BAM_0037		metS	TRUE	0.703	166.000	0.221	NA	N	NA
6058073	6058074	BAM_0035	BAM_0034			FALSE	0.272	-31.000	0.000	NA		NA
6058074	6058075	BAM_0034	BAM_0033			FALSE	0.377	-13.000	0.000	NA		NA
6058075	6058076	BAM_0033	BAM_0032			TRUE	0.780	121.000	0.193	1.000		NA
6058076	6058077	BAM_0032	BAM_0031			TRUE	0.641	15.000	0.183	NA		NA
6058077	6058078	BAM_0031	BAM_0030		holB	TRUE	0.779	6.000	0.372	NA		NA
6058078	6058079	BAM_0030	BAM_0029	holB	tmk	TRUE	0.756	36.000	0.009	0.066	N	NA
6058079	6058080	BAM_0029	BAM_0028	tmk		TRUE	0.873	2.000	0.009	1.000	N	NA
6058080	6058081	BAM_0028	BAM_0027			FALSE	0.559	73.000	0.400	NA		NA
6058081	6058082	BAM_0027	BAM_0026		rrfB	FALSE	0.213	191.000	0.000	NA		NA
6058082	6058083	BAM_0026	BAM_0025	rrfB	rrlB	FALSE	0.351	49.000	0.000	NA		NA
6058085	6058086	BAM_0023	BAM_0022			FALSE	0.629	7.000	0.000	NA		NA
6058086	6058087	BAM_0022	BAM_0021		rrsB	FALSE	0.519	150.000	0.000	NA		NA
6058087	6058088	BAM_0021	BAM_0020	rrsB	bofA	FALSE	0.074	244.000	0.000	NA		NA
6058088	6058089	BAM_0020	BAM_0019	bofA		FALSE	0.236	215.000	0.417	NA		NA
6058089	6058090	BAM_0019	BAM_0018		recR	FALSE	0.618	15.000	0.071	NA		NA
6058090	6058091	BAM_0018	BAM_0017	recR		TRUE	0.832	15.000	0.604	NA		NA
6058091	6058092	BAM_0017	BAM_0016		dnaX	FALSE	0.553	23.000	0.071	NA		NA
6058092	6058093	BAM_0016	BAM_5816	dnaX	srpB	FALSE	0.262	182.000	0.000	NA		NA
6058093	6058094	BAM_5816	BAM_0015	srpB		FALSE	0.203	193.000	0.000	NA		NA
6058094	6058095	BAM_0015	BAM_0014			FALSE	0.413	-10.000	0.004	NA		NA
6058096	6058097	BAM_0013	BAM_0012			TRUE	0.899	126.000	0.058	1.000	N	NA
6058097	6058098	BAM_0012	BAM_0011			TRUE	0.975	3.000	0.255	0.001	Y	NA
6058099	6058100	BAM_0010	BAM_0009			FALSE	0.371	167.000	0.000	NA		NA
6058100	6058101	BAM_0009	BAM_0008		serS	FALSE	0.461	157.000	0.000	NA		NA
6058101	6058102	BAM_0008	BAM_0007	serS		FALSE	0.071	328.000	0.010	NA	N	NA
6058102	6058103	BAM_0007	BAM_0006			TRUE	0.964	19.000	0.488	NA	Y	NA
6058103	6058104	BAM_0006	BAM_0005		dacA	TRUE	0.748	161.000	0.017	1.000	N	NA
6058104	6058105	BAM_0005	BAM_0004	dacA	guaB	TRUE	0.895	105.000	0.304	1.000	N	NA
6058107	6058108	BAM_0002	BAM_0001	rrfA	rrlA	FALSE	0.351	49.000	0.000	NA		NA
6058111	6058112	BAM_0441	BAM_0440			FALSE	0.360	168.000	0.000	NA		NA
6058112	6058113	BAM_0440	BAM_0439			FALSE	0.370	41.000	0.000	NA		NA
6058114	6058115	BAM_0438	BAM_0437			FALSE	0.005	716.000	0.000	NA		NA
6058116	6058117	BAM_0436	BAM_0435			FALSE	0.609	11.000	0.000	NA		NA
6058117	6058118	BAM_0435	BAM_0434			FALSE	0.417	34.000	0.000	NA		NA
6058118	6058119	BAM_0434	BAM_0433			FALSE	0.329	60.000	0.000	NA		NA
6058119	6058120	BAM_0433	BAM_0432		fumA	TRUE	0.904	127.000	0.185	1.000	N	NA
6058120	6058121	BAM_0432	BAM_0431	fumA		FALSE	0.167	207.000	0.093	NA		NA
6058123	6058124	BAM_0429	BAM_0428		cax	FALSE	0.515	82.000	0.212	NA		NA
6058125	6058126	BAM_0427	BAM_0426			FALSE	0.537	154.000	0.111	NA		NA
6058126	6058127	BAM_0426	BAM_0425			TRUE	0.676	107.000	0.129	NA		NA
6058130	6058131	BAM_0422	BAM_0421	sipS1		FALSE	0.116	233.000	0.000	1.000		NA
6058131	6058132	BAM_0421	BAM_0420			TRUE	0.758	123.000	0.039	1.000		NA
6058134	6058135	BAM_0418	BAM_0417	yihY		FALSE	0.377	39.000	0.000	NA		NA
6058135	6058136	BAM_0417	BAM_0416			FALSE	0.337	54.000	0.000	NA		NA
6058137	6058138	BAM_0415	BAM_0414			FALSE	0.246	192.000	0.125	NA		NA
6058139	6058140	BAM_0413	BAM_0412			TRUE	0.840	19.000	0.727	NA		NA
6058140	6058141	BAM_0412	BAM_0411			TRUE	0.721	110.000	0.256	NA		NA
6058141	6058142	BAM_0411	BAM_0410			TRUE	0.762	74.000	0.308	1.000	N	NA
6058142	6058143	BAM_0410	BAM_0409			TRUE	0.962	81.000	0.571	0.002	Y	NA
6058143	6058144	BAM_0409	BAM_0408			TRUE	0.963	24.000	0.364	0.002	Y	NA
6058144	6058145	BAM_0408	BAM_0407			TRUE	0.900	129.000	0.145	1.000	N	NA
6058147	6058148	BAM_0405	BAM_0404	proS1		FALSE	0.017	348.000	0.000	NA		NA
6058149	6058150	BAM_0403	BAM_0402			TRUE	0.660	109.000	0.068	NA		NA
6058151	6058152	BAM_0401	BAM_0400			TRUE	0.649	13.000	0.143	NA		NA
6058152	6058153	BAM_0400	BAM_0399			TRUE	0.781	114.000	0.333	NA		NA
6058153	6058154	BAM_0399	BAM_0398			TRUE	0.675	67.000	0.714	NA		NA
6058154	6058155	BAM_0398	BAM_0397			FALSE	0.039	283.000	0.000	NA		NA
6058155	6058156	BAM_0397	BAM_0396			FALSE	0.607	14.000	0.037	NA		NA
6058156	6058157	BAM_0396	BAM_0395			FALSE	0.635	11.000	0.065	NA		NA
6058158	6058159	BAM_0394	BAM_0393			FALSE	0.509	25.000	0.000	NA		NA
6058160	6058161	BAM_0392	BAM_0391			FALSE	0.023	388.000	0.000	0.017		NA
6058161	6058162	BAM_0391	BAM_0390			TRUE	0.968	-3.000	0.554	NA	Y	NA
6058162	6058163	BAM_0390	BAM_0389			TRUE	0.969	-3.000	0.584	NA	Y	NA
6058163	6058164	BAM_0389	BAM_0388			FALSE	0.425	-31.000	0.364	NA		NA
6058164	6058165	BAM_0388	BAM_0387			FALSE	0.055	264.000	0.000	NA		NA
6058167	6058168	BAM_0385	BAM_0384	thiE	thiM	TRUE	0.963	17.000	0.061	0.003	Y	NA
6058170	6058171	BAM_0382	BAM_0381			TRUE	0.660	132.000	0.000	NA		NA
6058171	6058172	BAM_0381	BAM_0380			FALSE	0.555	19.000	0.000	NA		NA
6058172	6058173	BAM_0380	BAM_0379			TRUE	0.644	5.000	0.000	NA		NA
6058176	6058177	BAM_0702	BAM_0701		inhA	FALSE	0.024	319.000	0.000	NA		NA
6058177	6058178	BAM_0701	BAM_0700	inhA		FALSE	0.034	317.000	0.000	1.000		NA
6058178	6058179	BAM_0700	BAM_0699		rbsB	TRUE	0.909	35.000	0.032	NA	Y	NA
6058179	6058180	BAM_0699	BAM_0698	rbsB	rbsC	TRUE	0.978	15.000	0.847	NA	Y	NA
6058180	6058181	BAM_0698	BAM_0697	rbsC	rbsA	TRUE	0.977	3.000	0.358	0.001	Y	NA
6058181	6058182	BAM_0697	BAM_0696	rbsA	rbsD	TRUE	0.957	19.000	0.243	1.000	Y	NA
6058182	6058183	BAM_0696	BAM_0695	rbsD	rbsK	TRUE	0.956	-3.000	0.183	1.000	Y	NA
6058183	6058184	BAM_0695	BAM_0694	rbsK	rbsR	TRUE	0.863	14.000	0.109	1.000	N	NA
6058184	6058185	BAM_0694	BAM_0693	rbsR		FALSE	0.629	138.000	0.000	NA		NA
6058185	6058186	BAM_0693	BAM_0692			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6058186	6058187	BAM_0692	BAM_0691			FALSE	0.546	20.000	0.000	NA		NA
6058188	6058189	BAM_0690	BAM_0689	glpT		FALSE	0.138	285.000	0.000	1.000	N	NA
6058189	6058190	BAM_0689	BAM_0688			TRUE	0.709	-13.000	0.477	0.002		NA
6058190	6058191	BAM_0688	BAM_0687			TRUE	0.875	15.000	0.727	1.000		NA
6058191	6058192	BAM_0687	BAM_0686			TRUE	0.978	19.000	0.727	0.020	Y	NA
6058192	6058193	BAM_0686	BAM_0685			TRUE	0.966	15.000	0.195	0.020	Y	NA
6058194	6058195	BAM_0684	BAM_0683			FALSE	0.113	218.000	0.000	NA		NA
6058195	6058196	BAM_0683	BAM_0682			TRUE	0.804	66.000	0.615	1.000	N	NA
6058196	6058197	BAM_0682	BAM_0681			TRUE	0.792	158.000	0.778	NA		NA
6058198	6058199	BAM_0680	BAM_0679			TRUE	0.975	12.000	0.538	1.000	Y	NA
6058202	6058203	BAM_0676	BAM_0675			FALSE	0.259	-34.000	0.000	NA		NA
6058203	6058204	BAM_0675	BAM_0674			TRUE	0.640	177.000	0.079	1.000	N	NA
6058204	6058205	BAM_0674	BAM_0673			TRUE	0.680	62.000	0.111	1.000	N	NA
6058205	6058206	BAM_0673	BAM_0672			TRUE	0.652	-25.000	0.242	1.000	N	NA
6058206	6058207	BAM_0672	BAM_0671			TRUE	0.764	205.000	0.000	0.039	Y	NA
6058207	6058208	BAM_0671	BAM_0670			TRUE	0.986	1.000	0.947	0.004	Y	NA
6058208	6058209	BAM_0670	BAM_0669			TRUE	0.912	63.000	0.280	0.028	Y	NA
6058209	6058210	BAM_0669	BAM_0668			TRUE	0.969	13.000	0.389	1.000	Y	NA
6058210	6058211	BAM_0668	BAM_0667			TRUE	0.963	11.000	0.093	1.000	Y	NA
6058211	6058212	BAM_0667	BAM_0666			TRUE	0.678	158.000	0.462	NA		NA
6058212	6058213	BAM_0666	BAM_0665			TRUE	0.688	24.000	0.385	NA		NA
6058214	6058215	BAM_0664	BAM_0663	gerKA	gerKB	FALSE	0.625	-19.000	0.412	0.006		NA
6058215	6058216	BAM_0663	BAM_0662	gerKB	gerKC	TRUE	0.764	-19.000	0.833	0.006		NA
6058217	6058218	BAM_0661	BAM_0660	treC	treB	TRUE	0.977	14.000	0.650	1.000	Y	NA
6058218	6058219	BAM_0660	BAM_0659	treB	treR	TRUE	0.880	138.000	0.115	1.000	N	NA
6058221	6058222	BAM_0657	BAM_0656			FALSE	0.016	359.000	0.000	NA		NA
6058222	6058223	BAM_0656	BAM_0655			FALSE	0.451	31.000	0.000	NA		NA
6058224	6058225	BAM_0654	BAM_0653	cls1		TRUE	0.775	128.000	0.156	1.000		NA
6058225	6058226	BAM_0653	BAM_0652			TRUE	0.898	4.000	0.822	NA		NA
6058227	6058228	BAM_0651	BAM_0650			TRUE	0.669	55.000	0.025	1.000	N	NA
6058228	6058229	BAM_0650	BAM_0649			TRUE	0.710	45.000	0.165	1.000	N	NA
6058231	6058232	BAM_0647	BAM_0646			TRUE	0.965	13.000	0.273	1.000	Y	NA
6058232	6058233	BAM_0646	BAM_0645			TRUE	0.964	-3.000	0.273	0.020	Y	NA
6058234	6058235	BAM_0644	BAM_0643			FALSE	0.013	382.000	0.000	NA		NA
6058236	6058237	BAM_3655	BAM_3654			FALSE	0.526	149.000	0.000	NA		NA
6058237	6058238	BAM_3654	BAM_3653			TRUE	0.685	32.000	0.500	NA		NA
6058239	6058240	BAM_3652	BAM_3651			TRUE	0.718	117.000	0.182	NA		NA
6058241	6058242	BAM_3650	BAM_3649			FALSE	0.398	175.000	0.263	NA		NA
6058246	6058247	BAM_3645	BAM_3644			FALSE	0.027	339.000	0.000	1.000		NA
6058247	6058248	BAM_3644	BAM_3643			TRUE	0.850	154.000	0.750	0.048		NA
6058248	6058249	BAM_3643	BAM_3642			FALSE	0.628	20.000	0.021	1.000		NA
6058249	6058250	BAM_3642	BAM_3641			TRUE	0.936	-7.000	0.144	1.000	Y	NA
6058250	6058251	BAM_3641	BAM_3640			FALSE	0.337	54.000	0.000	NA		NA
6058251	6058252	BAM_3640	BAM_3639			FALSE	0.040	282.000	0.000	NA		NA
6058252	6058253	BAM_3639	BAM_3638			FALSE	0.095	228.000	0.000	NA		NA
6058253	6058254	BAM_3638	BAM_3637			FALSE	0.017	348.000	0.000	NA		NA
6058254	6058255	BAM_3637	BAM_3636			FALSE	0.510	170.000	0.368	NA		NA
6058255	6058256	BAM_3636	BAM_3635			TRUE	0.733	5.000	0.074	1.000		NA
6058256	6058257	BAM_3635	BAM_3634			FALSE	0.617	13.000	0.049	NA		NA
6058257	6058258	BAM_3634	BAM_3633			FALSE	0.515	24.000	0.000	NA		NA
6058258	6058259	BAM_3633	BAM_3632			TRUE	0.671	117.000	0.000	NA		NA
6058259	6058260	BAM_3632	BAM_3631		paiB2	TRUE	0.645	135.000	0.000	NA		NA
6058261	6058262	BAM_3630	BAM_3629			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6058262	6058263	BAM_3629	BAM_3628			FALSE	0.398	76.000	0.000	NA		NA
6058263	6058264	BAM_3628	BAM_3627			FALSE	0.061	256.000	0.000	NA		NA
6058264	6058265	BAM_3627	BAM_3626			FALSE	0.290	179.000	0.017	NA		NA
6058265	6058266	BAM_3626	BAM_3625			TRUE	0.860	19.000	0.276	1.000	N	NA
6058267	6058268	BAM_3624	BAM_3623			FALSE	0.006	616.000	0.000	NA		NA
6058268	6058269	BAM_3623	BAM_3622			FALSE	0.288	-25.000	0.000	NA		NA
6058269	6058270	BAM_3622	BAM_3621			FALSE	0.223	-494.000	0.000	NA		NA
6058270	6058271	BAM_3621	BAM_3620			FALSE	0.007	539.000	0.000	NA		NA
6058272	6058273	BAM_3619	BAM_3618			FALSE	0.528	94.000	0.020	NA		NA
6058273	6058274	BAM_3618	BAM_3617			TRUE	0.641	-7.000	0.389	NA		NA
6058275	6058276	BAM_3616	BAM_3615			FALSE	0.603	12.000	0.000	NA		NA
6058279	6058280	BAM_3612	BAM_3611	pepF2		TRUE	0.898	117.000	0.113	1.000	N	NA
6058281	6058282	BAM_3610	BAM_3609		amyS	FALSE	0.615	10.000	0.000	NA		NA
6058284	6058285	BAM_3607	BAM_3606			FALSE	0.011	399.000	0.000	NA		NA
6058285	6058286	BAM_3606	BAM_3605			TRUE	0.736	7.000	0.137	1.000		NA
6058286	6058287	BAM_3605	BAM_3604			TRUE	0.675	163.000	0.467	1.000		NA
6058289	6058290	BAM_3602	BAM_3601			FALSE	0.031	302.000	0.000	NA		NA
6058290	6058291	BAM_3601	BAM_3600			TRUE	0.798	18.000	0.545	NA		NA
6058293	6058294	BAM_3598	BAM_3597			FALSE	0.047	271.000	0.000	NA		NA
6058294	6058295	BAM_3597	BAM_3596			FALSE	0.069	249.000	0.000	NA		NA
6058297	6058298	BAM_3594	BAM_3593			TRUE	0.986	1.000	0.909	0.020	Y	NA
6058298	6058299	BAM_3593	BAM_3592			FALSE	0.530	22.000	0.000	NA		NA
6058299	6058300	BAM_3592	BAM_3591			FALSE	0.363	-15.000	0.000	NA		NA
6058300	6058301	BAM_3591	BAM_3590			FALSE	0.111	219.000	0.000	NA		NA
6058303	6058304	BAM_3588	BAM_3587			FALSE	0.005	1146.000	0.000	NA		NA
6058306	6058307	BAM_3585	BAM_3584			FALSE	0.633	16.000	0.178	NA		NA
6058307	6058308	BAM_3584	BAM_3583			FALSE	0.013	379.000	0.000	NA		NA
6058309	6058310	BAM_0749	BAM_0750			FALSE	0.623	8.000	0.000	NA		NA
6058310	6058311	BAM_0750	BAM_0751			FALSE	0.603	12.000	0.000	NA		NA
6058311	6058312	BAM_0751	BAM_0752			TRUE	0.644	5.000	0.000	NA		NA
6058312	6058313	BAM_0752	BAM_0753			FALSE	0.593	14.000	0.000	NA		NA
6058313	6058314	BAM_0753	BAM_0754			FALSE	0.503	26.000	0.000	NA		NA
6058314	6058315	BAM_0754	BAM_0755			FALSE	0.581	16.000	0.000	NA		NA
6058315	6058316	BAM_0755	BAM_0756			FALSE	0.635	2.000	0.000	NA		NA
6058316	6058317	BAM_0756	BAM_0757			FALSE	0.629	7.000	0.000	NA		NA
6058317	6058318	BAM_0757	BAM_0758			FALSE	0.598	13.000	0.000	NA		NA
6058318	6058319	BAM_0758	BAM_0759			FALSE	0.573	17.000	0.000	NA		NA
6058319	6058320	BAM_0759	BAM_0760			FALSE	0.335	55.000	0.000	NA		NA
6058320	6058321	BAM_0760	BAM_0761			FALSE	0.546	20.000	0.000	NA		NA
6058321	6058322	BAM_0761	BAM_0762			TRUE	0.641	3.000	0.000	NA		NA
6058322	6058323	BAM_0762	BAM_0763			FALSE	0.629	7.000	0.000	NA		NA
6058323	6058324	BAM_0763	BAM_0764			FALSE	0.623	8.000	0.000	NA		NA
6058324	6058325	BAM_0764	BAM_0765			FALSE	0.635	2.000	0.000	NA		NA
6058325	6058326	BAM_0765	BAM_0766			TRUE	0.637	6.000	0.000	NA		NA
6058326	6058327	BAM_0766	BAM_0768			FALSE	0.629	7.000	0.000	NA		NA
6058327	6058328	BAM_0768	BAM_0769			FALSE	0.623	139.000	0.000	NA		NA
6058328	6058329	BAM_0769	BAM_0770			FALSE	0.034	295.000	0.000	NA		NA
6058330	6058331	BAM_0771	BAM_0772			TRUE	0.799	15.000	0.500	NA		NA
6058331	6058332	BAM_0772	BAM_0773			TRUE	0.885	6.000	0.750	NA		NA
6058333	6058334	BAM_0774	BAM_0775			FALSE	0.620	-31.000	0.145	1.000	N	NA
6058334	6058335	BAM_0775	BAM_0776			TRUE	0.982	0.000	0.826	1.000	Y	NA
6058335	6058336	BAM_0776	BAM_0777			TRUE	0.962	-3.000	0.135	0.020	Y	NA
6058336	6058337	BAM_0777	BAM_0778		tenI	TRUE	0.865	11.000	0.054	1.000	N	NA
6058337	6058338	BAM_0778	BAM_0779	tenI	thiO	TRUE	0.789	-7.000	0.194	1.000	N	NA
6058338	6058339	BAM_0779	BAM_0780	thiO	thiS	TRUE	0.865	16.000	0.239	1.000	N	NA
6058339	6058340	BAM_0780	BAM_0781	thiS	thiG	TRUE	0.967	3.000	0.054	1.000	Y	NA
6058340	6058341	BAM_0781	BAM_0782	thiG		TRUE	0.940	-7.000	0.012	0.016	Y	NA
6058341	6058342	BAM_0782	BAM_0783		thiD1	TRUE	0.960	16.000	0.195	1.000	Y	NA
6058342	6058343	BAM_0783	BAM_0784	thiD1		FALSE	0.009	442.000	0.000	NA		NA
6058343	6058344	BAM_0784	BAM_0785			FALSE	0.523	23.000	0.000	NA		NA
6058344	6058345	BAM_0785	BAM_0786			FALSE	0.583	30.000	0.286	NA		NA
6058345	6058346	BAM_0786	BAM_0787			FALSE	0.018	347.000	0.000	NA		NA
6058346	6058347	BAM_0787	BAM_0788		kdpA	TRUE	0.666	97.000	0.286	NA		NA
6058347	6058348	BAM_0788	BAM_0789	kdpA	kdpB	TRUE	0.968	11.000	0.035	0.001	Y	NA
6058348	6058349	BAM_0789	BAM_0790	kdpB	kdpC	TRUE	0.983	17.000	0.877	0.001	Y	NA
6058349	6058350	BAM_0790	BAM_0791	kdpC	kdpD	FALSE	0.492	63.000	0.066	0.058		NA
6058352	6058353	BAM_0793	BAM_0794			TRUE	0.872	129.000	0.500	1.000		NA
6058353	6058354	BAM_0794	BAM_0795			FALSE	0.504	170.000	0.357	NA		NA
6058356	6058357	BAM_0797	BAM_0798			FALSE	0.547	67.000	0.438	NA		NA
6058357	6058358	BAM_0798	BAM_0799			FALSE	0.619	105.000	0.000	NA		NA
6058359	6058360	BAM_0800	BAM_0801	scrK	scrB	TRUE	0.956	-3.000	0.154	1.000	Y	NA
6058360	6058361	BAM_0801	BAM_0802	scrB	scrA	TRUE	0.956	18.000	0.100	1.000	Y	NA
6058361	6058362	BAM_0802	BAM_0803	scrA	scrR	TRUE	0.899	129.000	0.113	1.000	N	NA
6058362	6058363	BAM_0803	BAM_0804	scrR		TRUE	0.696	118.000	0.056	NA		NA
6058363	6058364	BAM_0804	BAM_0805			FALSE	0.422	73.000	0.148	NA		NA
6058364	6058365	BAM_0805	BAM_0806			TRUE	0.762	13.000	0.073	0.003		NA
6058365	6058366	BAM_0806	BAM_0807			FALSE	0.434	166.000	0.127	NA		NA
6058366	6058367	BAM_0807	BAM_0808			TRUE	0.804	118.000	0.364	NA		NA
6058367	6058368	BAM_0808	BAM_0809			FALSE	0.357	46.000	0.000	NA		NA
6058368	6058369	BAM_0809	BAM_0810			TRUE	0.681	120.000	0.000	NA		NA
6058369	6058370	BAM_0810	BAM_0811		gerYC	FALSE	0.598	13.000	0.000	NA		NA
6058370	6058371	BAM_0811	BAM_0812	gerYC	gerYA	TRUE	0.857	84.000	0.867	0.005		NA
6058371	6058372	BAM_0812	BAM_0813	gerYA		TRUE	0.846	125.000	0.462	NA		NA
6058373	6058374	BAM_0814	BAM_0815		spoVR	TRUE	0.672	116.000	0.019	NA		NA
6058374	6058375	BAM_0815	BAM_0816	spoVR		FALSE	0.461	-7.000	0.007	NA		NA
6058375	6058376	BAM_0816	BAM_0817			FALSE	0.305	-22.000	0.000	NA		NA
6058378	6058379	BAM_0819	BAM_0820			TRUE	0.898	134.000	0.800	NA		NA
6058379	6058380	BAM_0820	BAM_0821			FALSE	0.603	12.000	0.000	NA		NA
6058380	6058381	BAM_0821	BAM_0822			FALSE	0.598	102.000	0.000	NA		NA
6058381	6058382	BAM_0822	BAM_0823			FALSE	0.275	186.000	0.143	NA		NA
6058382	6058383	BAM_0823	BAM_0824			FALSE	0.536	89.000	0.127	NA		NA
6058383	6058384	BAM_0824	BAM_0825			FALSE	0.555	39.000	0.286	1.000		NA
6058384	6058385	BAM_0825	BAM_0826			FALSE	0.526	36.000	0.207	1.000		NA
6058385	6058386	BAM_0826	BAM_0827			FALSE	0.409	77.000	0.000	NA		NA
6058386	6058387	BAM_0827	BAM_0828			FALSE	0.589	15.000	0.000	NA		NA
6058387	6058388	BAM_0828	BAM_0829			FALSE	0.329	61.000	0.000	NA		NA
6058388	6058389	BAM_0829	BAM_0830			FALSE	0.417	34.000	0.000	NA		NA
6058390	6058391	BAM_0831	BAM_0832			TRUE	0.828	146.000	0.667	NA		NA
6058394	6058395	BAM_5783	BAM_5782	purA		FALSE	0.623	139.000	0.000	NA		NA
6058395	6058396	BAM_5782	BAM_5781			FALSE	0.603	12.000	0.000	NA		NA
6058396	6058397	BAM_5781	BAM_5780			FALSE	0.573	17.000	0.000	NA		NA
6058397	6058398	BAM_5780	BAM_5779			FALSE	0.373	40.000	0.000	NA		NA
6058398	6058399	BAM_5779	BAM_5778		yycF	FALSE	0.011	400.000	0.000	NA		NA
6058399	6058400	BAM_5778	BAM_5777	yycF	yycG	TRUE	0.982	4.000	0.597	0.013	Y	NA
6058400	6058401	BAM_5777	BAM_5776	yycG		TRUE	0.804	-3.000	0.575	NA		NA
6058401	6058402	BAM_5776	BAM_5775			TRUE	0.718	-19.000	0.890	NA		NA
6058402	6058403	BAM_5775	BAM_5774			FALSE	0.399	-16.000	0.176	NA		NA
6058403	6058404	BAM_5774	BAM_5773			FALSE	0.422	64.000	0.060	1.000		NA
6058404	6058405	BAM_5773	BAM_5772			FALSE	0.558	54.000	0.452	NA		NA
6058405	6058406	BAM_5772	BAM_5771			FALSE	0.338	60.000	0.025	NA		NA
6058406	6058407	BAM_5771	BAM_5770			FALSE	0.262	182.000	0.004	NA		NA
6058408	6058409	BAM_5769	BAM_5768		guaC	TRUE	0.882	135.000	0.049	1.000	N	NA
6058410	6058411	BAM_5767	BAM_5766			FALSE	0.297	187.000	0.037	1.000		NA
6058413	6058414	BAM_5764	BAM_5763		galE2	FALSE	0.131	225.000	0.000	1.000		NA
6058416	6058417	BAM_5761	BAM_5760			TRUE	0.725	109.000	0.073	1.000		NA
6058419	6058420	BAM_5758	BAM_5757			FALSE	0.058	363.000	0.000	1.000	N	NA
6058422	6058423	BAM_5755	BAM_5754			TRUE	0.928	-22.000	0.538	0.013	Y	NA
6058423	6058424	BAM_5754	BAM_5753			TRUE	0.757	133.000	0.178	1.000		NA
6058424	6058425	BAM_5753	BAM_5752			TRUE	0.799	35.000	0.869	1.000		NA
6058425	6058426	BAM_5752	BAM_5751			FALSE	0.023	327.000	0.000	NA		NA
6058426	6058427	BAM_5751	BAM_5750			FALSE	0.272	-31.000	0.000	NA		NA
6058427	6058428	BAM_5750	BAM_5749		msrAB	FALSE	0.609	11.000	0.000	NA		NA
6058431	6058432	BAM_5746	BAM_5745			FALSE	0.500	37.000	0.091	1.000		NA
6058434	6058435	BAM_5743	BAM_5742			FALSE	0.573	17.000	0.000	NA		NA
6058435	6058436	BAM_5742	BAM_5741			FALSE	0.503	92.000	0.000	NA		NA
6058436	6058437	BAM_5741	BAM_5740			FALSE	0.200	196.000	0.038	NA		NA
6058437	6058438	BAM_5740	BAM_5739			FALSE	0.487	29.000	0.038	NA		NA
6058438	6058439	BAM_5739	BAM_5738			FALSE	0.013	385.000	0.000	NA		NA
6058441	6058442	BAM_5736	BAM_5735			TRUE	0.759	130.000	0.276	NA		NA
6058443	6058444	BAM_5734	BAM_5733			FALSE	0.463	79.000	0.075	NA		NA
6058444	6058445	BAM_5733	BAM_5732			FALSE	0.581	16.000	0.000	NA		NA
6058446	6058447	BAM_1482	BAM_1483			FALSE	0.338	68.000	0.000	NA		NA
6058447	6058448	BAM_1483	BAM_1484			FALSE	0.024	322.000	0.000	NA		NA
6058448	6058449	BAM_1484	BAM_1485			FALSE	0.099	229.000	0.046	NA		NA
6058449	6058450	BAM_1485	BAM_1486			FALSE	0.608	51.000	0.514	NA		NA
6058450	6058451	BAM_1486	BAM_1487			TRUE	0.677	107.000	0.135	NA		NA
6058451	6058452	BAM_1487	BAM_1488			TRUE	0.649	0.000	0.080	NA		NA
6058452	6058453	BAM_1488	BAM_1489			TRUE	0.981	-3.000	0.853	0.013	Y	NA
6058453	6058454	BAM_1489	BAM_1490			TRUE	0.684	133.000	0.075	NA		NA
6058460	6058461	BAM_1496	BAM_1497			TRUE	0.696	115.000	0.092	NA		NA
6058461	6058462	BAM_1497	BAM_1498		hmp	FALSE	0.458	160.000	0.049	NA		NA
6058465	6058466	BAM_1501	BAM_1502			TRUE	0.774	118.000	0.136	1.000		NA
6058466	6058467	BAM_1502	BAM_1503			TRUE	0.959	12.000	0.100	NA	Y	NA
6058469	6058470	BAM_1505	BAM_1506			FALSE	0.252	196.000	0.250	NA		NA
6058470	6058471	BAM_1506	BAM_1507			FALSE	0.215	190.000	0.000	NA		NA
6058471	6058472	BAM_1507	BAM_1508			FALSE	0.430	-9.000	0.000	NA		NA
6058474	6058475	BAM_1510	BAM_1511			TRUE	0.856	120.000	0.500	NA		NA
6058475	6058476	BAM_1511	BAM_1512			TRUE	0.814	108.000	0.389	1.000		NA
6058476	6058477	BAM_1512	BAM_1513		deoD	TRUE	0.777	157.000	0.040	1.000	N	NA
6058478	6058479	BAM_1514	BAM_1515			FALSE	0.012	393.000	0.000	NA		NA
6058481	6058482	BAM_1517	BAM_1518			TRUE	0.729	22.000	0.435	NA		NA
6058482	6058483	BAM_1518	BAM_1519			TRUE	0.665	106.000	0.101	NA		NA
6058483	6058484	BAM_1519	BAM_1520			TRUE	0.653	113.000	0.000	NA		NA
6058484	6058485	BAM_1520	BAM_1521		spmA	FALSE	0.460	-7.000	0.000	NA		NA
6058485	6058486	BAM_1521	BAM_1522	spmA		TRUE	0.823	-3.000	0.655	NA		NA
6058486	6058487	BAM_1522	BAM_1523		rluB	FALSE	0.040	290.000	0.063	NA		NA
6058487	6058488	BAM_1523	BAM_1524	rluB	resA	TRUE	0.826	95.000	0.069	1.000	N	NA
6058488	6058489	BAM_1524	BAM_1525	resA	resB	TRUE	0.974	122.000	0.306	NA	Y	NA
6058489	6058490	BAM_1525	BAM_1526	resB	resC	TRUE	0.960	15.000	0.278	NA	Y	NA
6058490	6058491	BAM_1526	BAM_1527	resC	resD	FALSE	0.194	266.000	0.178	1.000	N	NA
6058491	6058492	BAM_1527	BAM_1528	resD	resE	TRUE	0.976	0.000	0.511	1.000	Y	NA
6058492	6058493	BAM_1528	BAM_1529	resE		TRUE	0.769	137.000	0.046	0.064		NA
6058493	6058494	BAM_1529	BAM_1531			FALSE	0.466	85.000	0.000	NA		NA
6058496	6058497	BAM_3856	BAM_3857			FALSE	0.342	69.000	0.000	NA		NA
6058497	6058498	BAM_3857	BAM_3858			TRUE	0.641	3.000	0.000	NA		NA
6058498	6058499	BAM_3858	BAM_3859			FALSE	0.526	149.000	0.000	NA		NA
6058499	6058500	BAM_3859	BAM_3860			FALSE	0.006	580.000	0.000	NA		NA
6058500	6058501	BAM_3860	BAM_3861			FALSE	0.538	21.000	0.000	NA		NA
6058501	6058502	BAM_3861	BAM_3862			FALSE	0.017	354.000	0.000	NA		NA
6058502	6058503	BAM_3862	BAM_3863			FALSE	0.262	182.000	0.000	NA		NA
6058503	6058504	BAM_3863	BAM_3864			FALSE	0.040	282.000	0.000	NA		NA
6058504	6058505	BAM_3864	BAM_3865			FALSE	0.329	62.000	0.000	NA		NA
6058505	6058506	BAM_3865	BAM_3866			FALSE	0.132	211.000	0.000	NA		NA
6058506	6058507	BAM_3866	BAM_3867			FALSE	0.628	32.000	0.400	NA		NA
6058509	6058510	BAM_3869	BAM_3870			FALSE	0.277	232.000	0.000	1.000	N	NA
6058510	6058511	BAM_3870	BAM_3871			FALSE	0.589	15.000	0.000	NA		NA
6058511	6058512	BAM_3871	BAM_3872			FALSE	0.532	95.000	0.000	NA		NA
6058512	6058513	BAM_3872	BAM_3873			TRUE	0.641	3.000	0.000	NA		NA
6058513	6058514	BAM_3873	BAM_3874			TRUE	0.780	-3.000	0.500	NA		NA
6058514	6058515	BAM_3874	BAM_3875			TRUE	0.830	18.000	0.667	NA		NA
6058515	6058516	BAM_3875	BAM_3876			FALSE	0.407	47.000	0.158	NA		NA
6058516	6058517	BAM_3876	BAM_3877			FALSE	0.613	-3.000	0.158	NA		NA
6058517	6058518	BAM_3877	BAM_3878			TRUE	0.676	14.000	0.250	NA		NA
6058518	6058519	BAM_3878	BAM_3879			TRUE	0.646	-3.000	0.250	NA		NA
6058519	6058520	BAM_3879	BAM_3880			TRUE	0.640	15.000	0.143	NA		NA
6058520	6058521	BAM_3880	BAM_3881			TRUE	0.675	71.000	0.667	NA		NA
6058521	6058522	BAM_3881	BAM_3882			TRUE	0.793	-10.000	1.000	NA		NA
6058522	6058523	BAM_3882	BAM_3883			TRUE	0.845	0.000	0.600	NA		NA
6058523	6058524	BAM_3883	BAM_3884			FALSE	0.634	109.000	0.000	NA		NA
6058524	6058525	BAM_3884	BAM_3885			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6058526	6058527	BAM_3886	BAM_3887			FALSE	0.523	23.000	0.000	NA		NA
6058527	6058528	BAM_3887	BAM_3888			TRUE	0.840	16.000	0.667	NA		NA
6058528	6058529	BAM_3888	BAM_3889			FALSE	0.368	42.000	0.000	NA		NA
6058529	6058530	BAM_3889	BAM_3890			FALSE	0.360	45.000	0.000	NA		NA
6058531	6058532	BAM_3891	BAM_3892	glnA	glnR	TRUE	0.785	49.000	0.481	1.000	N	NA
6058532	6058533	BAM_3892	BAM_3893	glnR		TRUE	0.654	176.000	0.138	1.000	N	NA
6058533	6058534	BAM_3893	BAM_3894			FALSE	0.561	-7.000	0.065	1.000		NA
6058535	6058536	BAM_3895	BAM_3896			FALSE	0.607	100.000	0.065	NA		NA
6058538	6058539	BAM_3898	BAM_3899			TRUE	0.709	114.000	0.200	NA		NA
6058540	6058541	BAM_3900	BAM_3901	hfq2	miaA	TRUE	0.651	22.000	0.192	1.000		NA
6058543	6058544	BAM_3903	BAM_3904			FALSE	0.065	348.000	0.000	1.000	N	NA
6058544	6058545	BAM_3904	BAM_3905		fruB	TRUE	0.980	14.000	0.816	1.000	Y	NA
6058545	6058546	BAM_3905	BAM_3906	fruB		TRUE	0.975	-3.000	0.721	1.000	Y	NA
6058546	6058547	BAM_3906	BAM_3907			FALSE	0.438	160.000	0.000	NA		NA
6058547	6058548	BAM_3907	BAM_3908			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6058548	6058549	BAM_3908	BAM_3909			TRUE	0.671	117.000	0.000	NA		NA
6058549	6058550	BAM_3909	BAM_3910			FALSE	0.312	179.000	0.072	NA		NA
6058550	6058551	BAM_3910	BAM_3911			TRUE	0.829	20.000	0.700	NA		NA
6058551	6058552	BAM_3911	BAM_3912		gabP	TRUE	0.799	112.000	0.400	NA		NA
6058553	6058554	BAM_3913	BAM_3914	chi36		FALSE	0.140	209.000	0.000	NA		NA
6058555	6058556	BAM_3915	BAM_3916			FALSE	0.617	0.000	0.000	NA		NA
6058560	6058561	BAM_5578	BAM_5579			TRUE	0.972	16.000	0.429	0.063	Y	NA
6058561	6058562	BAM_5579	BAM_5580			TRUE	0.956	-3.000	0.105	1.000	Y	NA
6058562	6058563	BAM_5580	BAM_5581			FALSE	0.387	75.000	0.000	NA		NA
6058563	6058564	BAM_5581	BAM_5582			FALSE	0.488	154.000	0.000	NA		NA
6058564	6058565	BAM_5582	BAM_5583			FALSE	0.348	50.000	0.000	NA		NA
6058565	6058566	BAM_5583	BAM_5584			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6058566	6058567	BAM_5584	BAM_5585			FALSE	0.065	253.000	0.000	NA		NA
6058567	6058568	BAM_5585	BAM_5586			TRUE	0.861	-49.000	0.171	0.008	Y	NA
6058568	6058569	BAM_5586	BAM_5587		mbl	FALSE	0.122	294.000	0.000	1.000	N	NA
6058569	6058570	BAM_5587	BAM_5588	mbl	spoIIID	FALSE	0.532	162.000	0.284	NA		NA
6058570	6058571	BAM_5588	BAM_5589	spoIIID		FALSE	0.042	279.000	0.000	NA		NA
6058571	6058572	BAM_5589	BAM_5590			FALSE	0.469	156.000	0.000	NA		NA
6058572	6058573	BAM_5590	BAM_5591			FALSE	0.597	142.000	0.000	NA		NA
6058573	6058574	BAM_5591	BAM_5592			FALSE	0.415	162.000	0.000	NA		NA
6058574	6058575	BAM_5592	BAM_5593			TRUE	0.852	0.000	0.636	NA		NA
6058575	6058576	BAM_5593	BAM_5594			FALSE	0.262	182.000	0.000	NA		NA
6058576	6058577	BAM_5594	BAM_5595			FALSE	0.466	85.000	0.000	NA		NA
6058577	6058578	BAM_5595	BAM_5596		spoIID	TRUE	0.678	128.000	0.000	NA		NA
6058578	6058579	BAM_5596	BAM_5597	spoIID	murA1	FALSE	0.434	208.000	0.243	1.000	N	NA
6058579	6058580	BAM_5597	BAM_5598	murA1		FALSE	0.533	40.000	0.346	NA		NA
6058580	6058581	BAM_5598	BAM_5599			FALSE	0.409	52.000	0.228	NA		NA
6058581	6058582	BAM_5599	BAM_5600		nuoN	FALSE	0.016	366.000	0.047	NA		NA
6058582	6058583	BAM_5600	BAM_5601	nuoN	nuoM	TRUE	0.973	2.000	0.128	0.001	Y	NA
6058583	6058584	BAM_5601	BAM_5602	nuoM	nuoL	TRUE	0.961	-3.000	0.041	0.001	Y	NA
6058584	6058585	BAM_5602	BAM_5603	nuoL	nuoK	TRUE	0.948	30.000	0.253	0.002	Y	NA
6058585	6058586	BAM_5603	BAM_5604	nuoK	nuoJ	TRUE	0.962	-7.000	0.506	0.001	Y	NA
6058586	6058587	BAM_5604	BAM_5605	nuoJ	nuoI	TRUE	0.963	-3.000	0.223	0.002	Y	NA
6058587	6058588	BAM_5605	BAM_5606	nuoI	nuoH	TRUE	0.951	26.000	0.035	0.002	Y	NA
6058588	6058589	BAM_5606	BAM_5607	nuoH	nuoD	TRUE	0.972	0.000	0.258	0.002	Y	NA
6058589	6058590	BAM_5607	BAM_5608	nuoD		TRUE	0.972	5.000	0.030	0.002	Y	NA
6058590	6058591	BAM_5608	BAM_5609		nuoB	TRUE	0.962	-3.000	0.095	0.001	Y	NA
6058591	6058592	BAM_5609	BAM_5610	nuoB	nuoA	TRUE	0.938	-9.000	0.091	0.001	Y	NA
6058594	6058595	BAM_5612	BAM_5613			FALSE	0.622	48.000	0.538	NA		NA
6058595	6058596	BAM_5613	BAM_5614			FALSE	0.334	67.000	0.000	NA		NA
6058596	6058597	BAM_5614	BAM_5615			FALSE	0.478	155.000	0.000	NA		NA
6058600	6058601	BAM_5379	BAM_5380			FALSE	0.345	51.000	0.000	NA		NA
6058601	6058602	BAM_5380	BAM_5381			FALSE	0.246	-43.000	0.000	NA		NA
6058602	6058603	BAM_5381	BAM_5382			FALSE	0.345	51.000	0.000	NA		NA
6058603	6058604	BAM_5382	BAM_5383			FALSE	0.010	429.000	0.000	NA		NA
6058604	6058605	BAM_5383	BAM_5384			TRUE	0.716	110.000	0.250	NA		NA
6058605	6058606	BAM_5384	BAM_5385			TRUE	0.712	17.000	0.250	1.000		NA
6058607	6058608	BAM_5386	BAM_5387			FALSE	0.009	436.000	0.000	NA		NA
6058608	6058609	BAM_5387	BAM_5388			FALSE	0.497	45.000	0.310	NA		NA
6058610	6058611	BAM_5389	BAM_5390	tyrS2	murB2	FALSE	0.057	365.000	0.000	1.000	N	NA
6058611	6058612	BAM_5390	BAM_5391	murB2		FALSE	0.017	389.000	0.000	1.000		NA
6058612	6058613	BAM_5391	BAM_5392			FALSE	0.486	167.000	0.107	1.000		NA
6058613	6058614	BAM_5392	BAM_5393			FALSE	0.539	26.000	0.083	NA		NA
6058615	6058616	BAM_5394	BAM_5395			TRUE	0.962	-3.000	0.229	0.057	Y	NA
6058617	6058618	BAM_5396	BAM_5397			TRUE	0.741	79.000	0.667	NA		NA
6058618	6058619	BAM_5397	BAM_5398		speG	FALSE	0.465	158.000	0.027	NA		NA
6058619	6058620	BAM_5398	BAM_5399	speG		TRUE	0.665	144.000	0.034	1.000		NA
6058620	6058621	BAM_5399	BAM_5400			FALSE	0.525	50.000	0.385	NA		NA
6058623	6058624	BAM_5402	BAM_5403			TRUE	0.978	-3.000	0.870	1.000	Y	NA
6058624	6058625	BAM_5403	BAM_5404			TRUE	0.981	-3.000	0.870	0.020	Y	NA
6058625	6058626	BAM_5404	BAM_5405			TRUE	0.954	20.000	0.150	1.000	Y	NA
6058626	6058627	BAM_5405	BAM_5406			FALSE	0.039	415.000	0.000	1.000	N	NA
6058627	6058628	BAM_5406	BAM_5815		ssrA	FALSE	0.011	408.000	0.000	NA		NA
6058628	6058629	BAM_5815	BAM_5408	ssrA	smpB	TRUE	0.681	127.000	0.000	NA		NA
6058631	6058632	BAM_5410	BAM_5411	vacB	estA	TRUE	0.680	143.000	0.060	1.000		NA
6058632	6058633	BAM_5411	BAM_5412	estA	secG	FALSE	0.536	159.000	0.032	1.000		NA
6058633	6058634	BAM_5412	BAM_5413	secG		FALSE	0.532	95.000	0.000	NA		NA
6058634	6058635	BAM_5413	BAM_5414			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6058637	6058638	BAM_5416	BAM_5417			FALSE	0.248	-42.000	0.000	NA		NA
6058638	6058639	BAM_5417	BAM_5418			FALSE	0.455	158.000	0.000	NA		NA
6058639	6058640	BAM_5418	BAM_5419			TRUE	0.643	111.000	0.000	NA		NA
6058640	6058641	BAM_5419	BAM_5420			FALSE	0.229	-105.000	0.000	NA		NA
6058641	6058642	BAM_5420	BAM_5421			FALSE	0.279	-28.000	0.000	NA		NA
6058642	6058643	BAM_5421	BAM_5422			FALSE	0.322	173.000	0.000	NA		NA
6058646	6058647	BAM_5541	BAM_5542	dat2		FALSE	0.132	211.000	0.000	NA		NA
6058647	6058648	BAM_5542	BAM_5544			FALSE	0.018	346.000	0.000	NA		NA
6058648	6058649	BAM_5544	BAM_5545			FALSE	0.007	530.000	0.000	NA		NA
6058649	6058650	BAM_5545	BAM_5546			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6058651	6058652	BAM_5547	BAM_5548		opuD2	FALSE	0.077	241.000	0.000	NA		NA
6058653	6058654	BAM_5549	BAM_5550			TRUE	0.804	80.000	0.889	NA		NA
6058655	6058656	BAM_5551	BAM_5552			TRUE	0.861	14.000	0.727	NA		NA
6058656	6058657	BAM_5552	BAM_5553			TRUE	0.885	6.000	0.750	NA		NA
6058658	6058659	BAM_5554	BAM_5555			FALSE	0.618	-16.000	0.458	1.000		NA
6058661	6058662	BAM_5557	BAM_5558			FALSE	0.495	56.000	0.361	NA		NA
6058665	6058666	BAM_5561	BAM_5562			FALSE	0.111	219.000	0.000	NA		NA
6058666	6058667	BAM_5562	BAM_5563			TRUE	0.894	114.000	0.750	NA		NA
6058667	6058668	BAM_5563	BAM_5564			TRUE	0.929	-12.000	0.333	1.000	Y	NA
6058668	6058669	BAM_5564	BAM_5565			TRUE	0.900	-3.000	0.500	1.000	N	NA
6058670	6058671	BAM_5566	BAM_5567			TRUE	0.684	1.000	0.211	NA		NA
6058672	6058673	BAM_5568	BAM_5569			TRUE	0.836	20.000	0.273	NA	N	NA
6058673	6058674	BAM_5569	BAM_5570			TRUE	0.860	-3.000	0.818	NA		NA
6058674	6058675	BAM_5570	BAM_5571			FALSE	0.628	67.000	0.600	NA		NA
6058675	6058676	BAM_5571	BAM_5572			TRUE	0.976	12.000	0.600	1.000	Y	NA
6058676	6058677	BAM_5572	BAM_5573		galE1	TRUE	0.945	128.000	0.600	1.000	N	NA
6058677	6058678	BAM_5573	BAM_5574	galE1	lytR	FALSE	0.609	178.000	0.200	NA	N	NA
6058678	6058679	BAM_5574	BAM_5575	lytR		FALSE	0.005	948.000	0.000	NA		NA
6058681	6058682	BAM_0719	BAM_0720			FALSE	0.306	182.000	0.171	NA		NA
6058683	6058684	BAM_0721	BAM_0722			TRUE	0.908	132.000	0.750	1.000		NA
6058684	6058685	BAM_0722	BAM_0723			TRUE	0.786	5.000	0.375	NA		NA
6058686	6058687	BAM_0724	BAM_0725			TRUE	0.639	15.000	0.125	NA		NA
6058687	6058688	BAM_0725	BAM_0726			FALSE	0.516	90.000	0.062	NA		NA
6058688	6058689	BAM_0726	BAM_0727		qoxD	FALSE	0.353	222.000	0.000	0.038	N	NA
6058689	6058690	BAM_0727	BAM_0728	qoxD	qoxC	TRUE	0.984	1.000	0.959	1.000	Y	NA
6058690	6058691	BAM_0728	BAM_0729	qoxC	qoxB	TRUE	0.984	14.000	0.957	0.021	Y	NA
6058691	6058692	BAM_0729	BAM_0730	qoxB	qoxA	TRUE	0.936	34.000	0.234	0.004	Y	NA
6058692	6058693	BAM_0730	BAM_0731	qoxA		FALSE	0.040	282.000	0.000	NA		NA
6058694	6058695	BAM_0732	BAM_0733			TRUE	0.889	133.000	0.727	NA		NA
6058695	6058696	BAM_0733	BAM_0734			TRUE	0.739	2.000	0.286	NA		NA
6058696	6058697	BAM_0734	BAM_0735			TRUE	0.780	-3.000	0.500	NA		NA
6058697	6058698	BAM_0735	BAM_0736		gerLA	TRUE	0.815	112.000	0.353	1.000		NA
6058698	6058699	BAM_0736	BAM_0737	gerLA	gerLB	TRUE	0.907	1.000	0.706	0.005		NA
6058699	6058700	BAM_0737	BAM_0738	gerLB	gerLC	FALSE	0.562	-16.000	0.235	0.005		NA
6058700	6058701	BAM_0738	BAM_0739	gerLC		TRUE	0.809	12.000	0.500	NA		NA
6058702	6058703	BAM_0740	BAM_0741			TRUE	0.673	-22.000	0.556	0.002		NA
6058703	6058704	BAM_0741	BAM_0742			TRUE	0.702	-3.000	0.250	1.000		NA
6058705	6058706	BAM_0743	BAM_0744			TRUE	0.898	68.000	0.206	1.000	Y	NA
6058706	6058707	BAM_0744	BAM_0745			TRUE	0.987	3.000	0.907	0.001	Y	NA
6058707	6058708	BAM_0745	BAM_0746			FALSE	0.248	186.000	0.048	NA		NA
6058711	6058712	BAM_5784	BAM_5785		rplI	TRUE	0.795	28.000	0.064	1.000	N	NA
6058712	6058713	BAM_5785	BAM_5786	rplI		TRUE	0.836	-3.000	0.020	1.000	N	NA
6058713	6058714	BAM_5786	BAM_5787			FALSE	0.482	79.000	0.116	NA		NA
6058714	6058715	BAM_5787	BAM_5788		rpsR	FALSE	0.450	78.000	0.069	NA		NA
6058715	6058716	BAM_5788	BAM_5789	rpsR	ssb1	TRUE	0.689	46.000	0.015	1.000	N	NA
6058716	6058717	BAM_5789	BAM_5790	ssb1	rpsF	TRUE	0.837	18.000	0.015	1.000	N	NA
6058717	6058718	BAM_5790	BAM_5791	rpsF	ychF	TRUE	0.811	192.000	0.029	1.000	Y	NA
6058718	6058719	BAM_5791	BAM_5792	ychF		TRUE	0.690	116.000	0.064	NA		NA
6058719	6058720	BAM_5792	BAM_5793			FALSE	0.591	21.000	0.171	NA		NA
6058722	6058723	BAM_5795	BAM_5796	spo0J	soj	TRUE	0.901	-7.000	0.827	1.000	N	NA
6058723	6058724	BAM_5796	BAM_5797	soj		FALSE	0.530	191.000	0.069	1.000	N	NA
6058724	6058725	BAM_5797	BAM_5798		gidB	TRUE	0.873	105.000	0.089	1.000	N	NA
6058725	6058726	BAM_5798	BAM_5799	gidB	gidA2	TRUE	0.882	22.000	0.466	1.000	N	NA
6058726	6058727	BAM_5799	BAM_5800	gidA2	trmE	FALSE	0.518	47.000	0.266	1.000		NA
6058727	6058728	BAM_5800	BAM_5801	trmE	jag	FALSE	0.148	227.000	0.116	1.000		NA
6058728	6058729	BAM_5801	BAM_5802	jag	spoIIIJ2	TRUE	0.660	-3.000	0.071	1.000		NA
6058729	6058730	BAM_5802	BAM_5803	spoIIIJ2	rnpA	TRUE	0.705	40.000	0.025	1.000	N	NA
6058730	6058731	BAM_5803	BAM_5804	rnpA	rpmH	TRUE	0.788	77.000	0.787	1.000		NA
6058732	6058733	BAM_5805	BAM_5806	dnaA	dnaN1	TRUE	0.888	179.000	0.328	1.000	Y	NA
6058733	6058734	BAM_5806	BAM_5807	dnaN1		TRUE	0.770	128.000	0.103	1.000		NA
6058734	6058735	BAM_5807	BAM_5808		recF	TRUE	0.714	13.000	0.209	1.000		NA
6058735	6058736	BAM_5808	BAM_5809	recF	gyrB	TRUE	0.927	39.000	0.249	0.002	Y	NA
6058736	6058737	BAM_5809	BAM_5810	gyrB	gyrA	TRUE	0.956	89.000	0.306	0.001	Y	NA
6058737	6058738	BAM_5810	BAM_5811	gyrA	rrsA	FALSE	0.050	269.000	0.000	NA		NA
6058741	6058742	BAM_3775	BAM_3776			TRUE	0.704	-3.000	0.333	NA		NA
6058742	6058743	BAM_3776	BAM_3777			FALSE	0.364	-58.000	0.333	NA		NA
6058744	6058745	BAM_3778	BAM_3779			TRUE	0.669	104.000	0.211	NA		NA
6058748	6058749	BAM_3782	BAM_3783			FALSE	0.142	208.000	0.000	NA		NA
6058751	6058752	BAM_3785	BAM_3786		ccdA2	TRUE	0.939	91.000	0.200	NA	Y	NA
6058752	6058753	BAM_3786	BAM_3787	ccdA2		FALSE	0.156	204.000	0.000	NA		NA
6058753	6058754	BAM_3787	BAM_3788			FALSE	0.033	297.000	0.000	NA		NA
6058755	6058756	BAM_3789	BAM_3790			TRUE	0.878	-3.000	0.840	1.000		NA
6058757	6058758	BAM_3791	BAM_3792			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6058760	6058761	BAM_3794	BAM_3795			FALSE	0.393	-12.000	0.000	NA		NA
6058761	6058762	BAM_3795	BAM_3796			FALSE	0.329	61.000	0.000	NA		NA
6058762	6058763	BAM_3796	BAM_3797			FALSE	0.543	165.000	0.333	NA		NA
6058763	6058764	BAM_3797	BAM_3798			FALSE	0.247	192.000	0.154	NA		NA
6058764	6058765	BAM_3798	BAM_3799			FALSE	0.528	70.000	0.389	NA		NA
6058765	6058766	BAM_3799	BAM_3800			TRUE	0.688	119.000	0.028	NA		NA
6058766	6058767	BAM_3800	BAM_3801			TRUE	0.986	0.000	0.911	0.003	Y	NA
6058767	6058768	BAM_3801	BAM_3802			TRUE	0.685	124.000	0.000	NA		NA
6058769	6058770	BAM_3826	BAM_3827			FALSE	0.617	0.000	0.000	NA		NA
6058770	6058771	BAM_3827	BAM_3828			TRUE	0.648	112.000	0.000	NA		NA
6058771	6058772	BAM_3828	BAM_3829			FALSE	0.564	18.000	0.000	NA		NA
6058772	6058773	BAM_3829	BAM_3830			FALSE	0.354	48.000	0.000	NA		NA
6058773	6058774	BAM_3830	BAM_3831			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6058774	6058775	BAM_3831	BAM_3832			FALSE	0.329	63.000	0.000	NA		NA
6058775	6058776	BAM_3832	BAM_3833			FALSE	0.368	42.000	0.000	NA		NA
6058776	6058777	BAM_3833	BAM_3834			FALSE	0.052	266.000	0.000	NA		NA
6058777	6058778	BAM_3834	BAM_3835			FALSE	0.581	16.000	0.000	NA		NA
6058778	6058779	BAM_3835	BAM_3836			TRUE	0.688	5.000	0.111	NA		NA
6058779	6058780	BAM_3836	BAM_3837			TRUE	0.673	1.000	0.111	NA		NA
6058780	6058781	BAM_3837	BAM_3838			TRUE	0.874	-3.000	1.000	NA		NA
6058781	6058782	BAM_3838	BAM_3839			TRUE	0.823	-7.000	1.000	NA		NA
6058782	6058783	BAM_3839	BAM_3840			TRUE	0.874	-3.000	1.000	NA		NA
6058783	6058784	BAM_3840	BAM_3841			TRUE	0.907	3.000	1.000	NA		NA
6058784	6058785	BAM_3841	BAM_3842			TRUE	0.778	37.000	1.000	NA		NA
6058785	6058786	BAM_3842	BAM_3843			FALSE	0.623	14.000	0.071	NA		NA
6058786	6058787	BAM_3843	BAM_3844			FALSE	0.283	-34.000	0.071	NA		NA
6058787	6058788	BAM_3844	BAM_3845			FALSE	0.581	16.000	0.000	NA		NA
6058788	6058789	BAM_3845	BAM_3846			FALSE	0.589	15.000	0.000	NA		NA
6058789	6058790	BAM_3846	BAM_3847			TRUE	0.771	166.000	1.000	NA		NA
6058791	6058792	BAM_3848	BAM_3849			FALSE	0.046	272.000	0.000	NA		NA
6058793	6058794	BAM_3850	BAM_3851			TRUE	0.683	121.000	0.000	NA		NA
6058794	6058795	BAM_3851	BAM_3852			FALSE	0.619	-31.000	0.750	NA		NA
6058795	6058796	BAM_3852	BAM_3853			FALSE	0.011	403.000	0.000	NA		NA
6058796	6058797	BAM_3853	BAM_3854			TRUE	0.662	115.000	0.000	NA		NA
6058798	6058799	BAM_3772	BAM_3771		hutH	FALSE	0.619	105.000	0.000	NA		NA
6058799	6058800	BAM_3771	BAM_3770	hutH	hutU	TRUE	0.961	24.000	0.315	0.001	Y	NA
6058800	6058801	BAM_3770	BAM_3769	hutU	hutI	TRUE	0.865	13.000	0.110	1.000	N	NA
6058801	6058802	BAM_3769	BAM_3768	hutI	hutG	TRUE	0.667	-21.000	0.171	1.000	N	NA
6058802	6058803	BAM_3768	BAM_3767	hutG		FALSE	0.235	247.000	0.000	1.000	N	NA
6058803	6058804	BAM_3767	BAM_3766			FALSE	0.024	582.000	0.000	1.000	N	NA
6058804	6058805	BAM_3766	BAM_3765			TRUE	0.757	68.000	0.412	1.000	N	NA
6058805	6058806	BAM_3765	BAM_3764			FALSE	0.382	288.000	0.000	1.000	Y	NA
6058806	6058807	BAM_3764	BAM_3763			FALSE	0.233	342.000	0.000	1.000	Y	NA
6058807	6058808	BAM_3763	BAM_3762			FALSE	0.630	25.000	0.175	1.000		NA
6058812	6058813	BAM_3758	BAM_3757			TRUE	0.741	16.000	0.286	1.000		NA
6058813	6058814	BAM_3757	BAM_3756			FALSE	0.595	18.000	0.073	NA		NA
6058817	6058818	BAM_3753	BAM_3752			FALSE	0.531	172.000	0.429	NA		NA
6058819	6058820	BAM_3751	BAM_3750			TRUE	0.662	115.000	0.000	NA		NA
6058820	6058821	BAM_3750	BAM_3749		alkK	FALSE	0.013	381.000	0.000	NA		NA
6058822	6058823	BAM_0100	BAM_0099	rplK	nusG	TRUE	0.836	168.000	0.681	1.000	N	NA
6058823	6058824	BAM_0099	BAM_0098	nusG	secE	TRUE	0.939	143.000	0.843	1.000	N	NA
6058824	6058825	BAM_0098	BAM_0097	secE	rpmG1	FALSE	0.534	33.000	0.080	1.000		NA
6058825	6058826	BAM_0097	BAM_0096	rpmG1	sigH	TRUE	0.798	132.000	0.282	1.000		NA
6058826	6058827	BAM_0096	BAM_0095	sigH		FALSE	0.500	68.000	0.361	NA		NA
6058827	6058828	BAM_0095	BAM_0094			TRUE	0.688	4.000	0.109	NA		NA
6058828	6058829	BAM_0094	BAM_0093			TRUE	0.748	-3.000	0.150	0.002		NA
6058829	6058830	BAM_0093	BAM_0092		cysS	TRUE	0.745	3.000	0.129	1.000		NA
6058830	6058831	BAM_0092	BAM_0091	cysS	cysE	TRUE	0.703	-19.000	0.039	0.023	N	NA
6058831	6058832	BAM_0091	BAM_0090	cysE	gltX	FALSE	0.036	433.000	0.008	1.000	N	NA
6058832	6058833	BAM_0090	BAM_0089	gltX	ispF	TRUE	0.704	72.000	0.076	1.000	N	NA
6058833	6058834	BAM_0089	BAM_0088	ispF	ispD	TRUE	0.977	115.000	0.419	1.000	Y	NA
6058834	6058835	BAM_0088	BAM_0087	ispD		FALSE	0.619	17.000	0.108	NA		NA
6058835	6058836	BAM_0087	BAM_0086			FALSE	0.465	161.000	0.088	NA		NA
6058836	6058837	BAM_0086	BAM_0085		radA	TRUE	0.692	4.000	0.126	NA		NA
6058837	6058838	BAM_0085	BAM_0084	radA		TRUE	0.959	97.000	0.062	0.006	Y	NA
6058838	6058839	BAM_0084	BAM_0083			TRUE	0.872	23.000	0.425	1.000	N	NA
6058839	6058840	BAM_0083	BAM_0082			TRUE	0.911	5.000	0.848	1.000		NA
6058840	6058841	BAM_0082	BAM_0081		ctsR	TRUE	0.640	174.000	0.681	NA		NA
6058841	6058842	BAM_0081	BAM_0080	ctsR	rrfC	FALSE	0.146	207.000	0.000	NA		NA
6058844	6058845	BAM_0836	BAM_0837			FALSE	0.491	73.000	0.149	1.000		NA
6058845	6058846	BAM_0837	BAM_0838		celC1	TRUE	0.909	112.000	0.149	0.003	N	NA
6058846	6058847	BAM_0838	BAM_0839	celC1	celA1	TRUE	0.985	2.000	0.778	0.003	Y	NA
6058847	6058848	BAM_0839	BAM_0840	celA1	celB1	TRUE	0.963	83.000	0.583	0.003	Y	NA
6058848	6058849	BAM_0840	BAM_0841	celB1		FALSE	0.579	-24.000	0.583	NA		NA
6058849	6058850	BAM_0841	BAM_0842			TRUE	0.739	-10.000	0.700	NA		NA
6058851	6058852	BAM_0843	BAM_0844			FALSE	0.024	571.000	0.000	1.000	N	NA
6058852	6058853	BAM_0844	BAM_0845			TRUE	0.959	-12.000	0.889	1.000	Y	NA
6058853	6058854	BAM_0845	BAM_0846			TRUE	0.935	-3.000	0.889	1.000	N	NA
6058855	6058856	BAM_0847	BAM_0848			TRUE	0.666	116.000	0.000	NA		NA
6058856	6058857	BAM_0848	BAM_0849			FALSE	0.462	30.000	0.000	NA		NA
6058857	6058858	BAM_0849	BAM_0850			FALSE	0.635	2.000	0.000	NA		NA
6058860	6058861	BAM_0874	BAM_0873			FALSE	0.351	49.000	0.000	NA		NA
6058861	6058862	BAM_0873	BAM_0872			TRUE	0.711	25.000	0.344	1.000		NA
6058862	6058863	BAM_0872	BAM_0871			TRUE	0.678	156.000	0.156	0.001		NA
6058863	6058864	BAM_0871	BAM_0870			FALSE	0.561	30.000	0.259	NA		NA
6058864	6058865	BAM_0870	BAM_0869			TRUE	0.908	126.000	0.778	NA		NA
6058867	6058868	BAM_0867	BAM_0866			TRUE	0.823	13.000	0.556	NA		NA
6058868	6058869	BAM_0866	BAM_0865			FALSE	0.630	80.000	0.400	NA		NA
6058869	6058870	BAM_0865	BAM_0864			FALSE	0.037	289.000	0.000	NA		NA
6058870	6058871	BAM_0864	BAM_0863			FALSE	0.226	-162.000	0.000	NA		NA
6058871	6058872	BAM_0863	BAM_0862			FALSE	0.348	70.000	0.000	NA		NA
6058872	6058873	BAM_0862	BAM_0861			FALSE	0.473	29.000	0.000	NA		NA
6058873	6058874	BAM_0861	BAM_0860			TRUE	0.815	21.000	0.667	NA		NA
6058874	6058875	BAM_0860	BAM_0859			TRUE	0.819	105.000	0.500	NA		NA
6058875	6058876	BAM_0859	BAM_0858			TRUE	0.757	11.000	0.368	NA		NA
6058878	6058879	BAM_0856	BAM_0855			TRUE	0.680	15.000	0.259	NA		NA
6058880	6058881	BAM_0854	BAM_0853	cotJA	cotJB	TRUE	0.828	9.000	0.516	NA		NA
6058881	6058882	BAM_0853	BAM_0852	cotJB	cotJC	FALSE	0.598	13.000	0.000	NA		NA
6058883	6058884	BAM_3803	BAM_3804			FALSE	0.016	358.000	0.000	NA		NA
6058884	6058885	BAM_3804	BAM_3805			FALSE	0.421	78.000	0.000	NA		NA
6058885	6058886	BAM_3805	BAM_3806			TRUE	0.654	6.000	0.044	NA		NA
6058886	6058887	BAM_3806	BAM_3807			FALSE	0.617	0.000	0.000	NA		NA
6058887	6058888	BAM_3807	BAM_3808			FALSE	0.469	86.000	0.000	NA		NA
6058888	6058889	BAM_3808	BAM_3809			TRUE	0.952	84.000	0.308	0.001	Y	NA
6058890	6058891	BAM_3810	BAM_3811			FALSE	0.603	12.000	0.000	NA		NA
6058892	6058893	BAM_3812	BAM_3813			FALSE	0.389	46.000	0.078	NA		NA
6058895	6058896	BAM_3815	BAM_3816			TRUE	0.864	1.000	0.667	NA		NA
6058896	6058897	BAM_3816	BAM_3817			TRUE	0.763	-7.000	0.667	NA		NA
6058897	6058898	BAM_3817	BAM_3818			TRUE	0.681	120.000	0.000	NA		NA
6058898	6058899	BAM_3818	BAM_3819			FALSE	0.008	483.000	0.000	NA		NA
6058899	6058900	BAM_3819	BAM_3820			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6058900	6058901	BAM_3820	BAM_3821			FALSE	0.021	365.000	0.000	1.000		NA
6058901	6058902	BAM_3821	BAM_3822			FALSE	0.007	506.000	0.000	NA		NA
6058904	6058905	BAM_3824	BAM_3825			FALSE	0.589	15.000	0.000	NA		NA
6058906	6058907	BAM_4674	BAM_4675			TRUE	0.645	4.000	0.000	NA		NA
6058907	6058908	BAM_4675	BAM_4676			TRUE	0.645	4.000	0.000	NA		NA
6058908	6058909	BAM_4676	BAM_4677		alaS	FALSE	0.457	77.000	0.110	NA		NA
6058913	6058914	BAM_4681	BAM_4682			FALSE	0.607	19.000	0.125	NA		NA
6058914	6058915	BAM_4682	BAM_4683			TRUE	0.718	128.000	0.107	NA		NA
6058915	6058916	BAM_4683	BAM_4684			TRUE	0.704	96.000	0.281	1.000		NA
6058916	6058917	BAM_4684	BAM_4685		trmU	TRUE	0.722	111.000	0.038	1.000		NA
6058917	6058918	BAM_4685	BAM_4686	trmU		TRUE	0.859	14.000	0.072	1.000	N	NA
6058918	6058919	BAM_4686	BAM_4687			TRUE	0.715	36.000	0.201	NA	N	NA
6058920	6058921	BAM_4688	BAM_4689			FALSE	0.569	38.000	0.106	0.025		NA
6058923	6058924	BAM_4044	BAM_4045	ffh		FALSE	0.598	13.000	0.000	NA		NA
6058924	6058925	BAM_4045	BAM_4046		ftsY	TRUE	0.742	134.000	0.081	1.000		NA
6058925	6058926	BAM_4046	BAM_4047	ftsY	smc	TRUE	0.881	16.000	0.165	0.006	N	NA
6058926	6058927	BAM_4047	BAM_4048	smc	rncS	TRUE	0.841	147.000	0.120	1.000	N	NA
6058927	6058928	BAM_4048	BAM_4049	rncS	acpP	TRUE	0.672	59.000	0.068	1.000	N	NA
6058928	6058929	BAM_4049	BAM_4050	acpP	fabG	TRUE	0.914	70.000	0.100	0.002	Y	NA
6058929	6058930	BAM_4050	BAM_4051	fabG	fabD	TRUE	0.970	0.000	0.149	0.002	Y	NA
6058930	6058931	BAM_4051	BAM_4052	fabD	plsX	TRUE	0.966	15.000	0.106	0.002	Y	NA
6058931	6058932	BAM_4052	BAM_4053	plsX		TRUE	0.815	-3.000	0.035	NA	N	NA
6058932	6058933	BAM_4053	BAM_4054		recG	TRUE	0.783	89.000	0.225	NA	N	NA
6058933	6058934	BAM_4054	BAM_4055	recG		FALSE	0.036	290.000	0.000	NA		NA
6058935	6058936	BAM_4031	BAM_4032	codY	hslU	FALSE	0.421	78.000	0.000	NA		NA
6058936	6058937	BAM_4032	BAM_4033	hslU	hslV	TRUE	0.973	23.000	0.752	1.000	Y	NA
6058937	6058938	BAM_4033	BAM_4034	hslV	xerC	TRUE	0.714	43.000	0.113	1.000	N	NA
6058938	6058939	BAM_4034	BAM_4035	xerC	gid	TRUE	0.680	66.000	0.105	1.000	N	NA
6058939	6058940	BAM_4035	BAM_4036	gid	topA	TRUE	0.697	51.000	0.137	1.000	N	NA
6058940	6058941	BAM_4036	BAM_4037	topA	smf	FALSE	0.017	348.000	0.000	NA		NA
6058941	6058942	BAM_4037	BAM_4038	smf	sucD	FALSE	0.477	88.000	0.000	NA		NA
6058942	6058943	BAM_4038	BAM_4039	sucD	sucC	TRUE	0.960	21.000	0.173	0.000	Y	NA
6058943	6058944	BAM_4039	BAM_4040	sucC	rnhB	FALSE	0.493	195.000	0.015	1.000	N	NA
6058944	6058945	BAM_4040	BAM_4041	rnhB		FALSE	0.460	52.000	0.148	1.000		NA
6058945	6058946	BAM_4041	BAM_4042		sipS2	FALSE	0.538	21.000	0.000	NA		NA
6058946	6058947	BAM_4042	BAM_4043	sipS2	rplS	FALSE	0.598	102.000	0.000	NA		NA
6058949	6058950	BAM_0716	BAM_0715			TRUE	0.831	117.000	0.438	NA		NA
6058950	6058951	BAM_0715	BAM_0714			TRUE	0.703	-7.000	0.500	NA		NA
6058951	6058952	BAM_0714	BAM_0713			TRUE	0.896	113.000	0.233	1.000	N	NA
6058953	6058954	BAM_0712	BAM_0711			TRUE	0.905	133.000	0.085	0.055	N	NA
6058957	6058958	BAM_0708	BAM_0707			TRUE	0.816	-12.000	0.571	NA	N	NA
6058958	6058959	BAM_0707	BAM_0706		sph	FALSE	0.630	108.000	0.000	NA		NA
6058959	6058960	BAM_0706	BAM_0705	sph	plc	FALSE	0.456	74.000	0.000	1.000		NA
6058961	6058962	BAM_0118	BAM_0119	rpsK	rpoA	FALSE	0.274	181.000	0.000	NA		NA
6058962	6058963	BAM_0119	BAM_0120	rpoA	rplQ	TRUE	0.880	36.000	0.873	1.000	N	NA
6058963	6058964	BAM_0120	BAM_0121	rplQ		TRUE	0.868	104.000	0.074	1.000	N	NA
6058964	6058965	BAM_0121	BAM_0122			TRUE	0.937	-24.000	0.713	0.016	Y	NA
6058965	6058966	BAM_0122	BAM_0123			TRUE	0.917	-12.000	0.139	1.000	Y	NA
6058966	6058967	BAM_0123	BAM_0124		truA1	TRUE	0.876	0.000	0.170	1.000	N	NA
6058967	6058968	BAM_0124	BAM_0125	truA1	rplM	TRUE	0.942	153.000	0.052	1.000	Y	NA
6058968	6058969	BAM_0125	BAM_0126	rplM	rpsI	TRUE	0.973	22.000	0.601	0.005	Y	NA
6058969	6058970	BAM_0126	BAM_0127	rpsI		FALSE	0.411	163.000	0.021	NA		NA
6058970	6058971	BAM_0127	BAM_0128		cwlD	FALSE	0.391	67.000	0.211	NA		NA
6058971	6058972	BAM_0128	BAM_0129	cwlD		TRUE	0.855	145.000	0.211	1.000	N	NA
6058976	6058977	BAM_0133	BAM_0134			FALSE	0.455	158.000	0.000	NA		NA
6058978	6058979	BAM_5616	BAM_5617	atpC	atpD	FALSE	0.538	21.000	0.000	NA		NA
6058979	6058980	BAM_5617	BAM_5618	atpD	atpG	TRUE	0.987	120.000	0.724	0.001	Y	NA
6058980	6058981	BAM_5618	BAM_5619	atpG	atpA	FALSE	0.455	336.000	0.846	0.001	Y	NA
6058981	6058982	BAM_5619	BAM_5620	atpA	atpH	TRUE	0.984	12.000	0.864	0.001	Y	NA
6058982	6058983	BAM_5620	BAM_5621	atpH	atpF	TRUE	0.964	-3.000	0.222	0.001	Y	NA
6058983	6058984	BAM_5621	BAM_5622	atpF	atpE	TRUE	0.881	129.000	0.402	0.001		NA
6058984	6058985	BAM_5622	BAM_5623	atpE	atpB	FALSE	0.543	57.000	0.189	0.001		NA
6058985	6058986	BAM_5623	BAM_5624	atpB	atpI	TRUE	0.789	8.000	0.330	1.000		NA
6058986	6058987	BAM_5624	BAM_5625	atpI		TRUE	0.668	0.000	0.187	NA		NA
6058987	6058988	BAM_5625	BAM_5626			FALSE	0.506	27.000	0.030	NA		NA
6058988	6058989	BAM_5626	BAM_5627		upp	FALSE	0.014	372.000	0.000	NA		NA
6058989	6058990	BAM_5627	BAM_5628	upp	glyA	FALSE	0.046	272.000	0.000	NA		NA
6058991	6058992	BAM_0105	BAM_0104	rpoC	rpoB	TRUE	0.962	38.000	0.851	0.001	Y	NA
6058992	6058993	BAM_0104	BAM_0103	rpoB		FALSE	0.124	293.000	0.008	1.000	N	NA
6058993	6058994	BAM_0103	BAM_0102		rplL	TRUE	0.912	75.000	0.050	1.000	Y	NA
6058994	6058995	BAM_0102	BAM_0101	rplL		FALSE	0.338	68.000	0.000	NA		NA
6058997	6058998	BAM_0286	BAM_0287	bacA1		TRUE	0.640	18.000	0.240	NA		NA
6058998	6058999	BAM_0287	BAM_0288			TRUE	0.648	-7.000	0.400	NA		NA
6058999	6059000	BAM_0288	BAM_0289			TRUE	0.820	69.000	0.556	0.061	N	NA
6059000	6059001	BAM_0289	BAM_0290			TRUE	0.947	-10.000	0.538	1.000	Y	NA
6059002	6059003	BAM_4873	BAM_4874	thrS2		FALSE	0.029	307.000	0.000	NA		NA
6059003	6059004	BAM_4874	BAM_4875		dnaI	FALSE	0.044	282.000	0.048	NA		NA
6059004	6059005	BAM_4875	BAM_4876	dnaI	dnaB	TRUE	0.957	34.000	0.817	NA	Y	NA
6059005	6059006	BAM_4876	BAM_4877	dnaB		TRUE	0.678	128.000	0.000	NA		NA
6059007	6059008	BAM_0117	BAM_0116	map	adk	FALSE	0.617	0.000	0.000	NA		NA
6059008	6059009	BAM_0116	BAM_0115	adk	secY1	TRUE	0.696	57.000	0.241	1.000	N	NA
6059009	6059010	BAM_0115	BAM_0114	secY1	rplO	TRUE	0.939	0.000	0.730	1.000	N	NA
6059010	6059011	BAM_0114	BAM_0113	rplO	rpmD	TRUE	0.960	34.000	0.653	0.001	Y	NA
6059011	6059012	BAM_0113	BAM_0112	rpmD	rpsE	TRUE	0.982	14.000	0.789	0.005	Y	NA
6059012	6059013	BAM_0112	BAM_0111	rpsE	rplR	TRUE	0.978	22.000	0.814	0.005	Y	NA
6059013	6059014	BAM_0111	BAM_0110	rplR	rplF	TRUE	0.968	32.000	0.815	0.005	Y	NA
6059014	6059015	BAM_0110	BAM_0109	rplF	rpsH	TRUE	0.967	33.000	0.808	0.005	Y	NA
6059015	6059016	BAM_0109	BAM_0108	rpsH	rpsN	TRUE	0.959	30.000	0.473	0.005	Y	NA
6059016	6059017	BAM_0108	BAM_0107	rpsN	rplE	TRUE	0.952	34.000	0.496	0.005	Y	NA
6059017	6059018	BAM_0107	BAM_0106	rplE		FALSE	0.494	27.000	0.000	NA		NA
6059019	6059020	BAM_0573	BAM_0572			FALSE	0.514	151.000	0.008	NA		NA
6059022	6059023	BAM_0570	BAM_0569			FALSE	0.629	7.000	0.000	NA		NA
6059023	6059024	BAM_0569	BAM_0568			FALSE	0.589	15.000	0.000	NA		NA
6059024	6059025	BAM_0568	BAM_0567			TRUE	0.637	6.000	0.000	NA		NA
6059025	6059026	BAM_0567	BAM_0566			FALSE	0.329	63.000	0.000	NA		NA
6059026	6059027	BAM_0566	BAM_0565			FALSE	0.564	18.000	0.000	NA		NA
6059027	6059028	BAM_0565	BAM_0564			FALSE	0.629	7.000	0.000	NA		NA
6059028	6059029	BAM_0564	BAM_0563			FALSE	0.609	11.000	0.000	NA		NA
6059029	6059030	BAM_0563	BAM_0562			FALSE	0.555	19.000	0.000	NA		NA
6059030	6059031	BAM_0562	BAM_0561			FALSE	0.619	9.000	0.000	NA		NA
6059031	6059032	BAM_0561	BAM_0560			FALSE	0.635	2.000	0.000	NA		NA
6059032	6059033	BAM_0560	BAM_0558			FALSE	0.523	23.000	0.000	NA		NA
6059033	6059034	BAM_0558	BAM_0557			TRUE	0.645	4.000	0.000	NA		NA
6059034	6059035	BAM_0557	BAM_0556			FALSE	0.581	16.000	0.000	NA		NA
6059035	6059036	BAM_0556	BAM_0555			FALSE	0.628	1.000	0.000	NA		NA
6059036	6059037	BAM_0555	BAM_0554		rrfI	FALSE	0.623	8.000	0.000	NA		NA
6059040	6059041	BAM_1068	BAM_1069			FALSE	0.523	-6.000	0.080	NA		NA
6059041	6059042	BAM_1069	BAM_1070			FALSE	0.543	154.000	0.182	NA		NA
6059042	6059043	BAM_1070	BAM_1071			TRUE	0.977	5.000	0.533	NA	Y	NA
6059043	6059044	BAM_1071	BAM_1072			FALSE	0.623	8.000	0.000	NA		NA
6059045	6059046	BAM_A0001	BAM_A0002			FALSE	0.461	157.000	0.000	NA		NA
6059046	6059047	BAM_A0002	BAM_A0003			TRUE	0.819	17.000	0.600	NA		NA
6059047	6059048	BAM_A0003	BAM_A0004			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6059048	6059049	BAM_A0004	BAM_A0005			FALSE	0.530	22.000	0.000	NA		NA
6059049	6059050	BAM_A0005	BAM_A0006			FALSE	0.451	31.000	0.000	NA		NA
6059050	6059051	BAM_A0006	BAM_A0007			TRUE	0.641	3.000	0.000	NA		NA
6059051	6059052	BAM_A0007	BAM_A0008			FALSE	0.628	1.000	0.000	NA		NA
6059052	6059053	BAM_A0008	BAM_A0009			TRUE	0.686	67.000	0.750	NA		NA
6059057	6059058	BAM_A0013	BAM_A0014			FALSE	0.617	0.000	0.000	NA		NA
6059058	6059059	BAM_A0014	BAM_A0015			FALSE	0.373	40.000	0.000	NA		NA
6059059	6059060	BAM_A0015	BAM_A0016			FALSE	0.042	279.000	0.000	NA		NA
6059060	6059061	BAM_A0016	BAM_A0017			FALSE	0.007	528.000	0.000	NA		NA
6059061	6059062	BAM_A0017	BAM_A0018			FALSE	0.457	83.000	0.000	NA		NA
6059062	6059063	BAM_A0018	BAM_A0019			TRUE	0.780	-3.000	0.500	NA		NA
6059063	6059064	BAM_A0019	BAM_A0020			FALSE	0.110	220.000	0.000	NA		NA
6059064	6059065	BAM_A0020	BAM_A0021			FALSE	0.451	31.000	0.000	NA		NA
6059065	6059066	BAM_A0021	BAM_A0022			FALSE	0.506	71.000	0.333	NA		NA
6059066	6059067	BAM_A0022	BAM_A0023			FALSE	0.591	69.000	0.500	NA		NA
6059067	6059068	BAM_A0023	BAM_A0024			FALSE	0.370	73.000	0.000	NA		NA
6059068	6059069	BAM_A0024	BAM_A0025			FALSE	0.334	67.000	0.000	NA		NA
6059069	6059070	BAM_A0025	BAM_A0026			FALSE	0.366	43.000	0.000	NA		NA
6059070	6059071	BAM_A0026	BAM_A0027			FALSE	0.635	2.000	0.000	NA		NA
6059071	6059072	BAM_A0027	BAM_A0028			FALSE	0.635	2.000	0.000	NA		NA
6059072	6059073	BAM_A0028	BAM_A0029			TRUE	0.788	-7.000	0.750	NA		NA
6059073	6059074	BAM_A0029	BAM_A0030			TRUE	0.929	17.000	0.750	1.000	N	NA
6059074	6059075	BAM_A0030	BAM_A0031		cpaB	FALSE	0.573	17.000	0.000	NA		NA
6059077	6059078	BAM_A0033	BAM_A0034			TRUE	0.868	132.000	0.600	NA		NA
6059078	6059079	BAM_A0034	BAM_A0035			TRUE	0.756	155.000	0.600	NA		NA
6059079	6059080	BAM_A0035	BAM_A0036			FALSE	0.101	224.000	0.000	NA		NA
6059080	6059081	BAM_A0036	BAM_A0037			TRUE	0.816	26.000	0.750	NA		NA
6059081	6059082	BAM_A0037	BAM_A0038			TRUE	0.854	17.000	0.750	NA		NA
6059082	6059083	BAM_A0038	BAM_A0039			TRUE	0.840	20.000	0.750	NA		NA
6059083	6059084	BAM_A0039	BAM_A0040			FALSE	0.006	572.000	0.000	NA		NA
6059084	6059085	BAM_A0040	BAM_A0041			FALSE	0.581	16.000	0.000	NA		NA
6059086	6059087	BAM_A0042	BAM_A0043			FALSE	0.009	447.000	0.000	NA		NA
6059087	6059088	BAM_A0043	BAM_A0044			FALSE	0.490	90.000	0.000	NA		NA
6059089	6059090	BAM_A0045	BAM_A0046			FALSE	0.209	192.000	0.000	NA		NA
6059091	6059092	BAM_A0047	BAM_A0048			FALSE	0.483	28.000	0.000	NA		NA
6059092	6059093	BAM_A0048	BAM_A0049			FALSE	0.009	437.000	0.000	NA		NA
6059093	6059094	BAM_A0049	BAM_A0050			TRUE	0.824	107.000	0.500	NA		NA
6059094	6059095	BAM_A0050	BAM_A0051			TRUE	0.850	18.000	0.750	NA		NA
6059095	6059096	BAM_A0051	BAM_A0052			FALSE	0.383	38.000	0.000	NA		NA
6059097	6059098	BAM_A0053	BAM_A0054			TRUE	0.685	123.000	0.000	NA		NA
6059098	6059099	BAM_A0054	BAM_A0055			TRUE	0.678	27.000	0.400	NA		NA
6059099	6059100	BAM_A0055	BAM_A0056			FALSE	0.503	152.000	0.000	NA		NA
6059101	6059102	BAM_A0057	BAM_A0058			FALSE	0.503	92.000	0.000	NA		NA
6059102	6059103	BAM_A0058	BAM_A0059			TRUE	0.684	122.000	0.000	NA		NA
6059104	6059105	BAM_A0060	BAM_A0061			FALSE	0.295	186.000	0.000	1.000		NA
6059106	6059107	BAM_A0062	BAM_A0063			FALSE	0.460	-7.000	0.000	NA		NA
6059107	6059108	BAM_A0063	BAM_A0064			FALSE	0.011	410.000	0.000	NA		NA
6059109	6059110	BAM_A0065	BAM_A0066			FALSE	0.451	31.000	0.000	NA		NA
6059111	6059112	BAM_A0067	BAM_A0068			TRUE	0.698	16.000	0.200	1.000		NA
6059112	6059113	BAM_A0068	BAM_A0069			FALSE	0.016	356.000	0.000	NA		NA
6059113	6059114	BAM_A0069	BAM_A0070			FALSE	0.603	12.000	0.000	NA		NA
6059114	6059115	BAM_A0070	BAM_A0071			FALSE	0.615	10.000	0.000	NA		NA
6059119	6059120	BAM_A0075	BAM_A0076			FALSE	0.016	359.000	0.000	NA		NA
6059120	6059121	BAM_A0076	BAM_A0077			FALSE	0.110	220.000	0.000	NA		NA
6059121	6059122	BAM_A0077	BAM_A0078			FALSE	0.360	45.000	0.000	NA		NA
6059122	6059123	BAM_A0078	BAM_A0079			FALSE	0.541	96.000	0.000	NA		NA
6059123	6059124	BAM_A0079	BAM_A0080			FALSE	0.461	197.000	0.667	NA		NA
6059126	6059127	BAM_A0082	BAM_A0083			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6059127	6059128	BAM_A0083	BAM_A0084			FALSE	0.561	146.000	0.000	NA		NA
6059128	6059129	BAM_A0084	BAM_A0085			TRUE	0.685	124.000	0.000	NA		NA
6059129	6059130	BAM_A0085	BAM_A0086			FALSE	0.362	72.000	0.000	NA		NA
6059130	6059131	BAM_A0086	BAM_A0087			TRUE	0.681	120.000	0.000	NA		NA
6059133	6059134	BAM_A0089	BAM_A0090			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6059135	6059136	BAM_A0091	BAM_A0092			FALSE	0.605	141.000	0.000	NA		NA
6059136	6059137	BAM_A0092	BAM_A0093			FALSE	0.006	594.000	0.000	NA		NA
6059137	6059138	BAM_A0093	BAM_A0094			FALSE	0.635	137.000	0.000	NA		NA
6059138	6059139	BAM_A0094	BAM_A0095			FALSE	0.006	608.000	0.000	NA		NA
6059140	6059141	BAM_A0096	BAM_A0097			FALSE	0.447	159.000	0.000	NA		NA
6059141	6059142	BAM_A0097	BAM_A0098			FALSE	0.329	64.000	0.000	NA		NA
6059142	6059143	BAM_A0098	BAM_A0099			TRUE	0.658	114.000	0.000	NA		NA
6059145	6059146	BAM_A0101	BAM_A0102			FALSE	0.008	488.000	0.000	NA		NA
6059146	6059147	BAM_A0102	BAM_A0103			TRUE	0.810	22.000	0.667	NA		NA
6059147	6059148	BAM_A0103	BAM_A0104			TRUE	0.686	103.000	0.250	NA		NA
6059148	6059149	BAM_A0104	BAM_A0105			TRUE	0.665	16.000	0.250	NA		NA
6059149	6059150	BAM_A0105	BAM_A0106			TRUE	0.801	24.000	0.667	NA		NA
6059150	6059151	BAM_A0106	BAM_A0107			FALSE	0.629	7.000	0.000	NA		NA
6059151	6059152	BAM_A0107	BAM_A0108			FALSE	0.007	505.000	0.000	NA		NA
6059152	6059153	BAM_A0108	BAM_A0109			FALSE	0.619	105.000	0.000	NA		NA
6059153	6059154	BAM_A0109	BAM_A0110			TRUE	0.671	117.000	0.000	NA		NA
6059154	6059155	BAM_A0110	BAM_A0111			TRUE	0.835	17.000	0.667	NA		NA
6059155	6059156	BAM_A0111	BAM_A0112			FALSE	0.020	336.000	0.000	NA		NA
6059156	6059157	BAM_A0112	BAM_A0113			TRUE	0.876	0.000	0.750	NA		NA
6059158	6059159	BAM_A0114	BAM_A0115			TRUE	0.668	-16.000	0.667	NA		NA
6059160	6059161	BAM_A0116	BAM_A0117			TRUE	0.819	17.000	0.600	NA		NA
6059161	6059162	BAM_A0117	BAM_A0118			TRUE	0.814	18.000	0.600	NA		NA
6059163	6059164	BAM_A0119	BAM_A0120			TRUE	0.638	110.000	0.000	NA		NA
6059164	6059165	BAM_A0120	BAM_A0121			FALSE	0.342	52.000	0.000	NA		NA
6059166	6059167	BAM_A0122	BAM_A0123			FALSE	0.605	141.000	0.000	NA		NA
6059167	6059168	BAM_A0123	BAM_A0124			FALSE	0.018	344.000	0.000	NA		NA
6059168	6059169	BAM_A0124	BAM_A0125			FALSE	0.354	48.000	0.000	NA		NA
6059169	6059170	BAM_A0125	BAM_A0126		topX	FALSE	0.237	-54.000	0.000	NA		NA
6059170	6059171	BAM_A0126	BAM_A0128	topX		FALSE	0.305	175.000	0.000	NA		NA
6059171	6059172	BAM_A0128	BAM_A0129			FALSE	0.360	45.000	0.000	NA		NA
6059172	6059173	BAM_A0129	BAM_A0130			TRUE	0.662	52.000	0.667	NA		NA
6059173	6059174	BAM_A0130	BAM_A0131			FALSE	0.629	74.000	0.500	NA		NA
6059174	6059175	BAM_A0131	BAM_A0132			FALSE	0.362	44.000	0.000	NA		NA
6059175	6059176	BAM_A0132	BAM_A0133			FALSE	0.477	88.000	0.000	NA		NA
6059177	6059178	BAM_A0134	BAM_A0135	hfq		FALSE	0.415	193.000	0.500	NA		NA
6059178	6059179	BAM_A0135	BAM_A0136			TRUE	0.704	-3.000	0.333	NA		NA
6059180	6059181	BAM_A0137	BAM_A0138			FALSE	0.451	31.000	0.000	NA		NA
6059181	6059182	BAM_A0138	BAM_A0139			FALSE	0.413	-10.000	0.000	NA		NA
6059182	6059183	BAM_A0139	BAM_A0140			FALSE	0.597	142.000	0.000	NA		NA
6059184	6059185	BAM_A0141	BAM_A0142			FALSE	0.099	244.000	0.000	1.000		NA
6059187	6059188	BAM_A0143	BAM_A0145			FALSE	0.051	267.000	0.000	NA		NA
6059188	6059189	BAM_A0145	BAM_A0146			FALSE	0.032	298.000	0.000	NA		NA
6059189	6059190	BAM_A0146	BAM_A0147			FALSE	0.460	-7.000	0.000	NA		NA
6059190	6059191	BAM_A0147	BAM_A0148			FALSE	0.581	16.000	0.000	NA		NA
6059191	6059192	BAM_A0148	BAM_A0150			FALSE	0.329	63.000	0.000	NA		NA
6059192	6059193	BAM_A0150	BAM_A0151			FALSE	0.266	-33.000	0.000	NA		NA
6059194	6059195	BAM_A0152	BAM_A0153			TRUE	0.687	21.000	0.000	0.024		NA
6059196	6059197	BAM_A0154	BAM_A0155			TRUE	0.805	13.000	0.500	NA		NA
6059197	6059198	BAM_A0155	BAM_A0156			TRUE	0.651	134.000	0.000	NA		NA
6059198	6059199	BAM_A0156	BAM_A0157			FALSE	0.123	214.000	0.000	NA		NA
6059199	6059200	BAM_A0157	BAM_A0158			FALSE	0.005	735.000	0.000	NA		NA
6059202	6059203	BAM_A0160	BAM_A0161			FALSE	0.530	22.000	0.000	NA		NA
6059203	6059204	BAM_A0161	BAM_A0162			TRUE	0.683	126.000	0.000	NA		NA
6059207	6059208	BAM_A0165	BAM_A0166			FALSE	0.451	31.000	0.000	NA		NA
6059209	6059210	BAM_A0167	BAM_A0168			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6059210	6059211	BAM_A0168	BAM_A0169			FALSE	0.483	28.000	0.000	NA		NA
6059211	6059212	BAM_A0169	BAM_A0170			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6059212	6059213	BAM_A0170	BAM_A0171			FALSE	0.008	469.000	0.000	NA		NA
6059213	6059214	BAM_A0171	BAM_A0172			FALSE	0.348	-16.000	0.000	NA		NA
6059214	6059215	BAM_A0172	BAM_A0173			FALSE	0.348	-16.000	0.000	NA		NA
6059216	6059217	BAM_A0174	BAM_A0175	lef		FALSE	0.571	145.000	0.000	NA		NA
6059218	6059219	BAM_A0176	BAM_A0177			FALSE	0.515	24.000	0.000	NA		NA
6059219	6059220	BAM_A0177	BAM_A0178			FALSE	0.244	-46.000	0.000	NA		NA
6059222	6059223	BAM_A0179	BAM_A0181		pagR	FALSE	0.007	518.000	0.000	NA		NA
6059223	6059224	BAM_A0181	BAM_A0182	pagR		FALSE	0.024	319.000	0.000	NA		NA
6059224	6059225	BAM_A0182	BAM_A0183		pagA	FALSE	0.007	500.000	0.000	NA		NA
6059225	6059226	BAM_A0183	BAM_A0184	pagA		FALSE	0.016	359.000	0.000	NA		NA
6059226	6059227	BAM_A0184	BAM_A0185			FALSE	0.031	302.000	0.000	NA		NA
6059227	6059228	BAM_A0185	BAM_A0186			FALSE	0.005	743.000	0.000	NA		NA
6059230	6059231	BAM_A0189	BAM_A0190			FALSE	0.282	-27.000	0.000	NA		NA
6059231	6059232	BAM_A0190	BAM_A0191		gerXC	TRUE	0.641	3.000	0.000	NA		NA
6059232	6059233	BAM_A0191	BAM_A0192	gerXC	gerXA	TRUE	0.716	-13.000	0.500	0.005		NA
6059233	6059234	BAM_A0192	BAM_A0193	gerXA	gerXB	TRUE	0.777	44.000	0.750	0.005		NA
6059234	6059235	BAM_A0193	BAM_A0194	gerXB		FALSE	0.030	329.000	0.000	1.000		NA
6059237	6059238	BAM_A0196	BAM_A0197			FALSE	0.161	203.000	0.000	NA		NA
6059238	6059239	BAM_A0197	BAM_A0198			FALSE	0.413	-10.000	0.000	NA		NA
6059239	6059240	BAM_A0198	BAM_A0199			FALSE	0.237	-54.000	0.000	NA		NA
6059240	6059241	BAM_A0199	BAM_A0200			FALSE	0.007	551.000	0.000	NA		NA
6059243	6059244	BAM_A0203	BAM_A0204			FALSE	0.363	-15.000	0.000	NA		NA
6059245	6059246	BAM_A0205	BAM_A0206		atxA	TRUE	0.662	115.000	0.000	NA		NA
6059246	6059247	BAM_A0206	BAM_A0207	atxA		FALSE	0.010	420.000	0.000	NA		NA
6059247	6059248	BAM_A0207	BAM_A0208			FALSE	0.473	29.000	0.000	NA		NA
6059248	6059249	BAM_A0208	BAM_A0209			FALSE	0.387	75.000	0.000	NA		NA
6059249	6059250	BAM_A0209	BAM_A0210			TRUE	0.637	6.000	0.000	NA		NA
6059250	6059251	BAM_A0210	BAM_A0211			FALSE	0.564	18.000	0.000	NA		NA
6059252	6059253	BAM_A0212	BAM_A0213	apt2	cya	FALSE	0.038	287.000	0.000	NA		NA
6059253	6059254	BAM_A0213	BAM_A0214	cya		FALSE	0.006	562.000	0.000	NA		NA
6059254	6059255	BAM_A0214	BAM_A0215			FALSE	0.026	313.000	0.000	NA		NA
6059256	6059257	BAM_A0216	BAM_A0217			TRUE	0.657	54.000	0.667	NA		NA
6059257	6059258	BAM_A0217	BAM_A0218			TRUE	0.883	130.000	0.667	NA		NA
6059258	6059259	BAM_A0218	BAM_A0219			FALSE	0.005	822.000	0.000	NA		NA
6059259	6059260	BAM_A0219	BAM_A0220			FALSE	0.603	12.000	0.000	NA		NA
6059260	6059261	BAM_A0220	BAM_A0221			FALSE	0.550	97.000	0.000	NA		NA
6059261	6059262	BAM_A0221	BAM_A0222			FALSE	0.360	45.000	0.000	NA		NA
6059263	6059264	BAM_A0224	BAM_A0225			FALSE	0.589	15.000	0.000	NA		NA
6059266	6059267	BAM_A0228	BAM_A0230			FALSE	0.603	12.000	0.000	NA		NA
6059267	6059268	BAM_A0230	BAM_A0231			FALSE	0.538	21.000	0.000	NA		NA
6059268	6059269	BAM_A0231	BAM_A0232			FALSE	0.012	395.000	0.000	NA		NA
6059269	6059270	BAM_A0232	BAM_A0233			FALSE	0.005	685.000	0.000	NA		NA
6059270	6059271	BAM_A0233	BAM_A0234			TRUE	0.945	27.000	0.222	1.000	Y	NA
6059271	6059272	BAM_A0234	BAM_A0235			FALSE	0.368	42.000	0.000	NA		NA
6059272	6059273	BAM_A0235	BAM_A0236			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6059274	6059275	BAM_A0237	BAM_A0238			FALSE	0.006	622.000	0.000	NA		NA
6059276	6059277	BAM_A0239	BAM_A0240			FALSE	0.048	270.000	0.000	NA		NA
6059277	6059278	BAM_A0240	BAM_A0241			FALSE	0.015	369.000	0.000	NA		NA
6059278	6059279	BAM_A0241	BAM_A0242			FALSE	0.348	-16.000	0.000	NA		NA
6059280	6059281	BAM_A0243	BAM_A0245			FALSE	0.338	68.000	0.000	NA		NA
6059281	6059282	BAM_A0245	BAM_A0246			FALSE	0.006	565.000	0.000	NA		NA
6059282	6059283	BAM_A0246	BAM_A0247			FALSE	0.440	80.000	0.000	NA		NA
6059285	6059286	BAM_A0249	BAM_A0250			TRUE	0.667	40.000	0.600	NA		NA
6059287	6059288	BAM_A0251	BAM_A0252			FALSE	0.589	101.000	0.000	NA		NA
6059288	6059289	BAM_A0252	BAM_A0253			FALSE	0.456	76.000	0.200	NA		NA
6059289	6059290	BAM_A0253	BAM_A0254			TRUE	0.812	130.000	0.400	NA		NA
6059290	6059291	BAM_A0254	BAM_A0255			TRUE	0.740	-9.000	0.667	NA		NA
6059293	6059294	BAM_B0002	BAM_B0005			TRUE	0.643	111.000	0.000	NA		NA
6059294	6059295	BAM_B0005	BAM_B0006			FALSE	0.036	290.000	0.000	NA		NA
6059297	6059298	BAM_B0008	BAM_B0009			FALSE	0.005	642.000	0.000	NA		NA
6059298	6059299	BAM_B0009	BAM_B0010			FALSE	0.007	530.000	0.000	NA		NA
6059299	6059300	BAM_B0010	BAM_B0011		acpA	FALSE	0.083	237.000	0.000	NA		NA
6059300	6059301	BAM_B0011	BAM_B0012	acpA		FALSE	0.007	515.000	0.000	NA		NA
6059303	6059304	BAM_B0014	BAM_B0015			FALSE	0.009	448.000	0.000	NA		NA
6059304	6059305	BAM_B0015	BAM_B0016			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6059306	6059307	BAM_B0017	BAM_B0018			FALSE	0.547	147.000	0.000	NA		NA
6059309	6059310	BAM_B0019	BAM_B0021			FALSE	0.014	371.000	0.000	NA		NA
6059311	6059312	BAM_B0022	BAM_B0023			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6059312	6059313	BAM_B0023	BAM_B0024			FALSE	0.370	73.000	0.000	NA		NA
6059314	6059315	BAM_B0025	BAM_B0026			FALSE	0.415	162.000	0.000	NA		NA
6059315	6059316	BAM_B0026	BAM_B0027			TRUE	0.648	112.000	0.000	NA		NA
6059317	6059318	BAM_B0028	BAM_B0029			FALSE	0.025	316.000	0.000	NA		NA
6059318	6059319	BAM_B0029	BAM_B0030			FALSE	0.362	72.000	0.000	NA		NA
6059320	6059321	BAM_B0031	BAM_B0032			FALSE	0.146	207.000	0.000	NA		NA
6059321	6059322	BAM_B0032	BAM_B0033		topB	FALSE	0.462	30.000	0.000	NA		NA
6059322	6059323	BAM_B0033	BAM_B0034	topB		FALSE	0.123	214.000	0.000	NA		NA
6059324	6059325	BAM_B0035	BAM_B0037			FALSE	0.634	109.000	0.000	NA		NA
6059326	6059327	BAM_B0036	BAM_B0038			FALSE	0.469	86.000	0.000	NA		NA
6059327	6059328	BAM_B0038	BAM_B0039			FALSE	0.530	22.000	0.000	NA		NA
6059328	6059329	BAM_B0039	BAM_B0040			FALSE	0.329	64.000	0.000	NA		NA
6059329	6059330	BAM_B0040	BAM_B0041			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6059330	6059331	BAM_B0041	BAM_B0042			FALSE	0.523	23.000	0.000	NA		NA
6059331	6059332	BAM_B0042	BAM_B0043			FALSE	0.362	44.000	0.000	NA		NA
6059332	6059333	BAM_B0043	BAM_B0044			FALSE	0.555	19.000	0.000	NA		NA
6059333	6059334	BAM_B0044	BAM_B0045			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6059334	6059335	BAM_B0045	BAM_B0046			FALSE	0.603	12.000	0.000	NA		NA
6059335	6059336	BAM_B0046	BAM_B0047			FALSE	0.123	214.000	0.000	NA		NA
6059336	6059337	BAM_B0047	BAM_B0048			FALSE	0.305	-22.000	0.000	NA		NA
6059337	6059338	BAM_B0048	BAM_B0049			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6059338	6059339	BAM_B0049	BAM_B0050			FALSE	0.483	89.000	0.000	NA		NA
6059339	6059340	BAM_B0050	BAM_B0051			FALSE	0.509	25.000	0.000	NA		NA
6059340	6059341	BAM_B0051	BAM_B0052			FALSE	0.370	73.000	0.000	NA		NA
6059341	6059342	BAM_B0052	BAM_B0053			FALSE	0.635	2.000	0.000	NA		NA
6059342	6059343	BAM_B0053	BAM_B0054			TRUE	0.819	17.000	0.600	NA		NA
6059343	6059344	BAM_B0054	BAM_B0055			FALSE	0.329	64.000	0.000	NA		NA
6059344	6059345	BAM_B0055	BAM_B0056			TRUE	0.641	3.000	0.000	NA		NA
6059345	6059346	BAM_B0056	BAM_B0057			FALSE	0.635	2.000	0.000	NA		NA
6059346	6059347	BAM_B0057	BAM_B0058			FALSE	0.564	18.000	0.000	NA		NA
6059347	6059348	BAM_B0058	BAM_B0059			FALSE	0.617	0.000	0.000	NA		NA
6059348	6059349	BAM_B0059	BAM_B0060			FALSE	0.635	2.000	0.000	NA		NA
6059349	6059350	BAM_B0060	BAM_B0061			FALSE	0.360	45.000	0.000	NA		NA
6059350	6059351	BAM_B0061	BAM_B0062			FALSE	0.469	86.000	0.000	NA		NA
6059351	6059352	BAM_B0062	BAM_B0063			FALSE	0.564	18.000	0.000	NA		NA
6059352	6059353	BAM_B0063	BAM_B0064			FALSE	0.555	19.000	0.000	NA		NA
6059353	6059354	BAM_B0064	BAM_B0065			FALSE	0.555	19.000	0.000	NA		NA
6059354	6059355	BAM_B0065	BAM_B0066			TRUE	0.737	40.000	0.800	NA		NA
6059355	6059356	BAM_B0066	BAM_B0067			TRUE	0.858	-3.000	0.800	NA		NA
6059356	6059357	BAM_B0067	BAM_B0068			FALSE	0.566	33.000	0.308	NA		NA
6059357	6059358	BAM_B0068	BAM_B0069			TRUE	0.700	17.000	0.308	NA		NA
6059358	6059359	BAM_B0069	BAM_B0070			FALSE	0.337	54.000	0.000	NA		NA
6059359	6059360	BAM_B0070	BAM_B0071			FALSE	0.387	75.000	0.000	NA		NA
6059360	6059361	BAM_B0071	BAM_B0072			FALSE	0.546	20.000	0.000	NA		NA
6059361	6059362	BAM_B0072	BAM_B0073			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6059362	6059363	BAM_B0073	BAM_B0074			TRUE	0.660	132.000	0.000	NA		NA
6059363	6059364	BAM_B0074	BAM_B0075			FALSE	0.345	51.000	0.000	NA		NA
6059366	6059367	BAM_B0077	BAM_B0078			FALSE	0.421	78.000	0.000	NA		NA
6059367	6059368	BAM_B0078	BAM_B0079			FALSE	0.550	97.000	0.000	NA		NA
6059368	6059369	BAM_B0079	BAM_B0080			FALSE	0.413	-10.000	0.000	NA		NA
6059369	6059370	BAM_B0080	BAM_B0081			FALSE	0.007	507.000	0.000	NA		NA
6059370	6059371	BAM_B0081	BAM_B0082			FALSE	0.005	878.000	0.000	NA		NA
6059371	6059372	BAM_B0082	BAM_B0083			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6059372	6059373	BAM_B0083	BAM_B0084			FALSE	0.061	256.000	0.000	NA		NA
6059373	6059374	BAM_B0084	BAM_B0085			FALSE	0.421	78.000	0.000	NA		NA
6059374	6059375	BAM_B0085	BAM_B0086			FALSE	0.161	203.000	0.000	NA		NA
6059375	6059376	BAM_B0086	BAM_B0087			FALSE	0.007	555.000	0.000	NA		NA
6059377	6059378	BAM_B0088	BAM_B0089			TRUE	0.703	-7.000	0.500	NA		NA
6059378	6059379	BAM_B0089	BAM_B0090			FALSE	0.102	223.000	0.000	NA		NA
6059379	6059380	BAM_B0090	BAM_B0091			FALSE	0.024	320.000	0.000	NA		NA
6059380	6059381	BAM_B0091	BAM_B0092			FALSE	0.617	0.000	0.000	NA		NA
6059384	6059385	BAM_B0095	BAM_B0096			FALSE	0.223	-558.000	0.000	NA		NA
6059385	6059386	BAM_B0096	BAM_B0097			FALSE	0.615	10.000	0.000	NA		NA
6059386	6059387	BAM_B0097	BAM_B0098			FALSE	0.015	366.000	0.000	NA		NA
6059387	6059388	BAM_B0098	BAM_B0100			FALSE	0.337	-18.000	0.000	NA		NA
6059388	6059389	BAM_B0100	BAM_B0101			TRUE	0.845	19.000	0.750	NA		NA
6059389	6059390	BAM_B0101	BAM_B0102			FALSE	0.244	-46.000	0.000	NA		NA
6059392	6059393	BAM_B0104	BAM_B0105			FALSE	0.601	49.000	0.500	NA		NA
6059394	6059395	BAM_B0106	BAM_B0107			FALSE	0.013	377.000	0.000	NA		NA
6059395	6059396	BAM_B0107	BAM_B0108			FALSE	0.009	437.000	0.000	NA		NA
6059396	6059397	BAM_B0108	BAM_B0109			FALSE	0.430	-9.000	0.000	NA		NA
6059398	6059399	BAM_B0110	BAM_B0111			FALSE	0.561	-3.000	0.000	NA		NA
6059399	6059400	BAM_B0111	BAM_B0112			FALSE	0.570	99.000	0.000	NA		NA
6059400	6059401	BAM_B0112	BAM_B0113			TRUE	0.671	117.000	0.000	NA		NA
6059401	6059402	BAM_B0113	BAM_B0114			FALSE	0.345	51.000	0.000	NA		NA
6059402	6059403	BAM_B0114	BAM_B0115		acpB	FALSE	0.005	1038.000	0.000	NA		NA
6059405	6059406	BAM_B0117	BAM_B0118	capE	capD	FALSE	0.589	15.000	0.000	NA		NA
6059406	6059407	BAM_B0118	BAM_B0119	capD	capA	TRUE	0.884	-3.000	0.400	1.000	N	NA
6059407	6059408	BAM_B0119	BAM_B0120	capA	capC	TRUE	0.676	12.000	0.000	1.000		NA
6059408	6059409	BAM_B0120	BAM_B0121	capC	capB	TRUE	0.753	15.000	0.000	0.000		NA
6059409	6059410	BAM_B0121	BAM_B0122	capB		FALSE	0.024	321.000	0.000	NA		NA
6059410	6059411	BAM_B0122	BAM_B0123			FALSE	0.005	679.000	0.000	NA		NA
6059413	6059414	BAM_B0125	BAM_B0126			FALSE	0.399	36.000	0.000	NA		NA
6059414	6059415	BAM_B0126	BAM_B0127			FALSE	0.014	373.000	0.000	NA		NA
6059415	6059416	BAM_B0127	BAM_B0128			FALSE	0.025	317.000	0.000	NA		NA
6059416	6059417	BAM_B0128	BAM_B0129			FALSE	0.513	151.000	0.000	NA		NA
6059417	6059418	BAM_B0129	BAM_B0130			FALSE	0.017	352.000	0.000	NA		NA
6059418	6059419	BAM_B0130	BAM_B0131			FALSE	0.547	147.000	0.000	NA		NA