MicrobesOnline Operon Predictions for Thermosipho africanus TCF52B

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 10253731 5692806 THA_2001 THA_1     FALSE 0.111 69.000 0.000 NA   NA
 5692806 5692807 THA_1 THA_2     TRUE 0.968 0.000 0.069 NA   NA
 5692807 5692808 THA_2 THA_3     TRUE 0.647 6.000 0.000 NA   NA
 5692808 5692809 THA_3 THA_4     TRUE 0.958 18.000 0.038 NA   NA
 5692809 5692810 THA_4 THA_5     FALSE 0.010 421.000 0.000 NA   NA
 5692810 5692811 THA_5 THA_6     TRUE 0.752 15.000 0.000 NA   NA
 5692811 5692812 THA_6 THA_7     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5692813 5692814 THA_8 THA_9     TRUE 0.678 -7.000 0.000 NA   NA
 5692814 5692815 THA_9 THA_10     FALSE 0.078 86.000 0.000 NA   NA
 5692816 5692817 THA_11 THA_12     TRUE 0.784 13.000 0.000 NA   NA
 5692817 5692818 THA_12 THA_13     FALSE 0.036 128.000 0.000 NA   NA
 5692818 5692819 THA_13 THA_14     FALSE 0.103 85.000 0.000 1.000   NA
 5692819 10253732 THA_14 THA_2002     TRUE 0.988 9.000 0.135 0.084   NA
 10253732 5692820 THA_2002 THA_15     TRUE 0.288 42.000 0.000 NA   NA
 5692820 5692821 THA_15 THA_16     FALSE 0.106 70.000 0.000 NA   NA
 5692825 5692826 THA_20 THA_21     FALSE 0.020 192.000 0.000 NA   NA
 5692826 5692827 THA_21 THA_22     FALSE 0.148 61.000 0.000 NA   NA
 5692827 5692828 THA_22 THA_23     TRUE 0.413 29.000 0.000 NA   NA
 5692828 5692829 THA_23 THA_24   mraW TRUE 0.752 15.000 0.000 NA   NA
 5692829 5692830 THA_24 THA_25 mraW   FALSE 0.122 172.000 0.002 1.000 N NA
 5692830 5692831 THA_25 THA_26     TRUE 0.974 11.000 0.025 1.000 N NA
 5692831 5692832 THA_26 THA_27     TRUE 0.983 -3.000 0.037 1.000 N NA
 5692832 5692833 THA_27 THA_28     TRUE 0.944 4.000 0.013 1.000 N NA
 5692833 5692834 THA_28 THA_29     FALSE 0.061 114.000 0.000 1.000 N NA
 5692834 5692835 THA_29 THA_30     FALSE 0.063 112.000 0.000 1.000 N NA
 5692835 5692836 THA_30 THA_31     TRUE 0.999 -3.000 0.245 0.007 Y NA
 5692836 5692837 THA_31 THA_32     TRUE 0.996 15.000 0.224 1.000 Y NA
 5692837 5692838 THA_32 THA_33     TRUE 0.999 15.000 0.535 0.051 Y NA
 5692838 5692839 THA_33 THA_34   uvrC FALSE 0.229 120.000 0.003 1.000 N NA
 5692839 5692840 THA_34 THA_35 uvrC   TRUE 0.428 63.000 0.002 NA   NA
 5692840 5692841 THA_35 THA_36   gcvH TRUE 0.958 0.000 0.015 NA   NA
 5692843 5692844 THA_38 THA_39 feoB   TRUE 0.988 2.000 0.069 1.000 Y NA
 5692846 5692847 THA_41 THA_42     TRUE 0.455 -13.000 0.000 NA   NA
 5692847 5692848 THA_42 THA_43     TRUE 0.960 0.000 0.017 NA   NA
 5692848 5692849 THA_43 THA_44     TRUE 0.980 -10.000 0.571 NA   NA
 5692849 5692850 THA_44 THA_45     TRUE 0.952 -13.000 0.286 NA   NA
 5692850 5692851 THA_45 THA_46     TRUE 0.994 -3.000 0.667 NA   NA
 5692851 5692852 THA_46 THA_47     TRUE 0.842 -28.000 0.429 NA   NA
 5692852 5692853 THA_47 THA_48     TRUE 0.986 15.000 0.286 NA   NA
 5692853 5692854 THA_48 THA_49     TRUE 0.928 2.000 0.007 NA   NA
 5692854 5692855 THA_49 THA_50     TRUE 0.960 17.000 0.010 1.000 N NA
 5692855 5692856 THA_50 THA_51     TRUE 0.978 -3.000 0.011 1.000 N NA
 5692856 5692857 THA_51 THA_52     TRUE 0.953 1.000 0.010 1.000   NA
 5692860 5692861 THA_55 THA_56 lpdA   TRUE 0.771 17.000 0.000 1.000 N NA
 5692861 5692862 THA_56 THA_57     TRUE 0.944 3.000 0.029 NA   NA
 5692863 5692864 THA_58 THA_59 lepB rplS TRUE 0.958 7.000 0.010 1.000 N NA
 5692864 5692865 THA_59 THA_60 rplS   TRUE 0.948 20.000 0.037 NA   NA
 5692865 5692866 THA_60 THA_61   trmD TRUE 0.938 -10.000 0.041 NA   NA
 5692866 5692867 THA_61 THA_62 trmD rimM TRUE 0.998 -3.000 0.672 1.000 Y NA
 5692867 5692868 THA_62 THA_63 rimM   TRUE 0.992 -3.000 0.324 1.000   NA
 5692868 5692869 THA_63 THA_64   rpsP TRUE 0.993 -3.000 0.385 1.000   NA
 5692869 5692870 THA_64 THA_65 rpsP   TRUE 0.974 24.000 0.361 1.000 N NA
 5692874 5692875 THA_69 THA_70     FALSE 0.143 69.000 0.000 1.000   NA
 5692875 5692876 THA_70 THA_71     FALSE 0.278 157.000 0.061 1.000 N NA
 5692877 5692878 THA_72 THA_73     TRUE 0.471 -15.000 0.000 1.000   NA
 5692878 5692879 THA_73 THA_74     TRUE 0.955 11.000 0.008 NA   NA
 5692879 5692880 THA_74 THA_75     TRUE 0.746 -19.000 0.006 NA   NA
 5692880 5692881 THA_75 THA_76     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5692881 5692882 THA_76 THA_77     TRUE 0.844 -3.000 0.000 1.000   NA
 5692882 5692883 THA_77 THA_78     TRUE 0.978 -3.000 0.014 1.000   NA
 5692883 5692884 THA_78 THA_79     TRUE 0.885 -12.000 0.007 NA   NA
 5692884 5692885 THA_79 THA_80     TRUE 0.975 5.000 0.333 NA   NA
 5692885 5692886 THA_80 THA_81     TRUE 0.983 -3.000 0.053 1.000   NA
 5692886 5692887 THA_81 THA_82     TRUE 0.978 -3.000 0.031 NA   NA
 5692887 5692888 THA_82 THA_83     TRUE 0.960 1.000 0.027 NA N NA
 5692888 5692889 THA_83 THA_84     TRUE 0.743 55.000 0.018 1.000 N NA
 5692889 5692890 THA_84 THA_85     TRUE 0.966 2.000 0.143 NA   NA
 5692890 5692891 THA_85 THA_86     TRUE 0.962 1.000 0.067 NA   NA
 5692891 5692892 THA_86 THA_87     TRUE 0.923 -13.000 0.067 1.000   NA
 5692892 5692893 THA_87 THA_88     TRUE 0.989 -3.000 0.250 NA   NA
 5692893 5692894 THA_88 THA_89     TRUE 0.984 3.000 0.667 NA   NA
 5692894 5692895 THA_89 THA_90     TRUE 0.978 -3.000 0.024 NA   NA
 5692895 5692896 THA_90 THA_91   hutH TRUE 0.944 19.000 0.008 1.000   NA
 5692896 5692897 THA_91 THA_92 hutH   TRUE 0.976 -3.000 0.008 1.000 N NA
 5692898 5692899 THA_93 THA_94     TRUE 0.519 24.000 0.000 NA   NA
 5692899 5692900 THA_94 THA_95     TRUE 0.888 -18.000 0.085 1.000 N NA
 5692900 5692901 THA_95 THA_96     TRUE 0.772 -37.000 0.200 1.000 N NA
 5692901 5692902 THA_96 THA_97     TRUE 0.995 4.000 0.105 0.007 Y NA
 5692902 5692903 THA_97 THA_98     TRUE 0.918 -13.000 0.022 1.000 N NA
 5692904 5692905 THA_99 THA_100 ahcY   TRUE 0.923 5.000 0.004 1.000 N NA
 5692905 5692906 THA_100 THA_101     TRUE 0.967 16.000 0.013 1.000 N NA
 5692906 5692907 THA_101 THA_102     TRUE 0.978 -3.000 0.032 NA   NA
 5692907 5692908 THA_102 THA_103     TRUE 0.988 -3.000 0.233 NA   NA
 5692908 5692909 THA_103 THA_104     TRUE 0.947 5.000 0.067 NA   NA
 5692909 5692910 THA_104 THA_105   hflX TRUE 0.722 53.000 0.010 1.000   NA
 5692910 5692911 THA_105 THA_106 hflX   TRUE 0.925 1.000 0.002 1.000   NA
 5692911 5692912 THA_106 THA_107     TRUE 0.943 3.000 0.025 NA   NA
 5692912 5692913 THA_107 THA_108   metK TRUE 0.973 -3.000 0.012 NA   NA
 5692913 5692914 THA_108 THA_109 metK rpsT TRUE 0.933 22.000 0.010 1.000 N NA
 5692914 5692915 THA_109 THA_110 rpsT   TRUE 0.937 16.000 0.003 NA   NA
 10253733 5692917 THA_2003 THA_112     TRUE 0.988 9.000 0.135 0.082   NA
 5692917 5692918 THA_112 THA_113     FALSE 0.015 349.000 0.000 1.000   NA
 5692918 5692919 THA_113 THA_114     TRUE 0.801 15.000 0.000 1.000   NA
 5692919 5692920 THA_114 THA_115     TRUE 0.857 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5692920 5692921 THA_115 THA_116     TRUE 0.987 15.000 0.227 1.000 N NA
 5692921 5692922 THA_116 THA_117     FALSE 0.162 128.000 0.000 NA Y NA
 5692923 5692924 THA_118 THA_119     TRUE 0.996 -7.000 0.375 1.000 Y NA
 5692924 5692925 THA_119 THA_120   phoU TRUE 0.911 -22.000 0.467 NA N NA
 5692925 5692926 THA_120 THA_121 phoU pstB TRUE 0.996 15.000 0.290 NA Y NA
 5692926 5692927 THA_121 THA_122 pstB pstA TRUE 0.990 -13.000 0.048 0.004 Y NA
 5692927 5692928 THA_122 THA_123 pstA   TRUE 0.996 -7.000 0.198 0.099 Y NA
 5692928 5692929 THA_123 THA_124     TRUE 0.997 12.000 0.093 0.062 Y NA
 5692929 5692930 THA_124 THA_125     FALSE 0.020 283.000 0.000 1.000 N NA
 5692930 5692931 THA_125 THA_126     TRUE 0.902 35.000 0.091 1.000 N NA
 5692932 5692933 THA_127 THA_128     TRUE 0.988 -3.000 0.154 1.000 N NA
 5692934 5692935 THA_129 THA_130 pfkB fabG TRUE 0.574 97.000 0.154 1.000 N NA
 5692935 5692936 THA_130 THA_131 fabG   TRUE 0.497 91.000 0.019 1.000 N NA
 5692936 5692937 THA_131 THA_132     TRUE 0.978 14.000 0.019 1.000 N NA
 5692937 5692938 THA_132 THA_133     TRUE 0.593 5.000 0.000 NA   NA
 5692939 5692940 THA_134 THA_135     TRUE 0.992 5.000 0.063 0.048 Y NA
 5692940 5692941 THA_135 THA_136     TRUE 0.923 -13.000 0.044 1.000 N NA
 5692941 5692942 THA_136 THA_137     TRUE 0.968 10.000 0.044 NA   NA
 5692942 5692943 THA_137 THA_138     TRUE 0.878 21.000 0.002 NA   NA
 5692943 5692944 THA_138 THA_139     TRUE 0.865 33.000 0.012 1.000 N NA
 5692944 5692945 THA_139 THA_140     TRUE 0.946 0.000 0.007 NA   NA
 5692945 5692946 THA_140 THA_141   coaE TRUE 0.955 -3.000 0.003 NA   NA
 5692947 5692948 THA_142 THA_143   uvrB TRUE 0.627 51.000 0.002 1.000 N NA
 5692948 5692949 THA_143 THA_144 uvrB   TRUE 0.924 -7.000 0.003 NA N NA
 5692949 5692950 THA_144 THA_145     TRUE 0.402 81.000 0.005 NA N NA
 5692950 5692951 THA_145 THA_146     TRUE 0.648 113.000 0.667 NA   NA
 5692952 5692953 THA_147 THA_148     FALSE 0.120 67.000 0.000 NA   NA
 5692953 5692954 THA_148 THA_149     TRUE 0.978 -3.000 0.023 NA   NA
 5692954 5692955 THA_149 THA_150     TRUE 0.910 2.000 0.003 NA   NA
 5692955 5692956 THA_150 THA_151     FALSE 0.223 56.000 0.000 1.000   NA
 5692957 10253734 THA_152 THA_2004     FALSE 0.067 93.000 0.000 NA   NA
 10253734 10253735 THA_2004 THA_2005     TRUE 0.435 33.000 0.000 1.000   NA
 10253735 5692958 THA_2005 THA_153     FALSE 0.025 177.000 0.000 NA N NA
 5692958 5692959 THA_153 THA_154     TRUE 0.981 4.000 0.024 NA Y NA
 5692959 5692960 THA_154 THA_155     TRUE 0.939 20.000 0.007 1.000 N NA
 5692960 5692961 THA_155 THA_156     TRUE 0.857 38.000 0.017 1.000 N NA
 5692961 5692962 THA_156 THA_157     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5692962 5692963 THA_157 THA_158     FALSE 0.262 -21.000 0.000 NA   NA
 5692963 5692964 THA_158 THA_159     TRUE 0.974 -3.000 0.006 1.000 N NA
 5692964 5692965 THA_159 THA_160   infB TRUE 0.897 3.000 0.002 1.000 N NA
 5692965 5692966 THA_160 THA_161 infB   TRUE 0.810 25.000 0.002 NA   NA
 5692966 5692967 THA_161 THA_162     TRUE 0.973 16.000 0.091 NA   NA
 5692967 5692968 THA_162 THA_163     TRUE 0.986 6.000 0.455 1.000 N NA
 5692968 5692969 THA_163 THA_164     TRUE 0.678 -7.000 0.000 NA   NA
 5692969 5692970 THA_164 THA_165     TRUE 0.678 -7.000 0.000 NA   NA
 5692971 5692972 THA_166 THA_167     FALSE 0.009 567.000 0.000 NA   NA
 5692972 5692973 THA_167 THA_168     TRUE 0.726 16.000 0.000 NA   NA
 5692973 5692974 THA_168 THA_169     TRUE 0.641 2.000 0.000 NA   NA
 5692974 5692975 THA_169 THA_170     FALSE 0.014 284.000 0.000 NA   NA
 5692975 5692976 THA_170 THA_171   dapF TRUE 0.993 -3.000 0.011 1.000 Y NA
 5692976 5692977 THA_171 THA_172 dapF dapA TRUE 0.985 -7.000 0.008 1.000 Y NA
 5692977 5692978 THA_172 THA_173 dapA dapB TRUE 0.994 -3.000 0.017 1.000 Y NA
 5692978 5692979 THA_173 THA_174 dapB   TRUE 0.997 -3.000 0.036 0.053 Y NA
 5692979 5692980 THA_174 THA_175     TRUE 0.979 5.000 0.010 1.000 Y NA
 5692980 5692981 THA_175 THA_176     TRUE 0.983 5.000 0.017 1.000 Y NA
 5692981 5692982 THA_176 THA_177     TRUE 0.751 37.000 0.000 1.000 Y NA
 5692982 5692983 THA_177 THA_178     FALSE 0.023 233.000 0.000 1.000 N NA
 5692983 5692984 THA_178 THA_179     TRUE 0.994 12.000 0.096 1.000 Y NA
 5692984 5692985 THA_179 THA_180     TRUE 0.968 16.000 0.013 1.000 N NA
 5692985 5692986 THA_180 THA_181   gcvT FALSE 0.060 118.000 0.000 1.000 N NA
 5692986 5692987 THA_181 THA_182 gcvT   TRUE 0.996 21.000 0.092 0.002 Y NA
 5692987 5692988 THA_182 THA_183     TRUE 0.998 20.000 0.316 0.001 Y NA
 5692988 5692989 THA_183 THA_184     TRUE 0.922 6.000 0.002 1.000 N NA
 5692989 5692990 THA_184 THA_185     TRUE 0.951 3.000 0.026 1.000   NA
 5692990 5692991 THA_185 THA_186     TRUE 0.641 2.000 0.000 NA   NA
 5692991 5692992 THA_186 THA_187     TRUE 0.726 16.000 0.000 NA   NA
 5692992 5692993 THA_187 THA_188     TRUE 0.976 -3.000 0.010 1.000   NA
 5692993 5692994 THA_188 THA_189     TRUE 0.986 20.000 0.027 1.000 Y NA
 5692995 5692996 THA_190 THA_191     TRUE 0.998 -7.000 0.469 0.007 Y NA
 5692996 5692997 THA_191 THA_192     TRUE 0.993 12.000 0.036 1.000 Y NA
 5692997 5692998 THA_192 THA_193     TRUE 0.328 96.000 0.003 1.000 N NA
 5692998 5692999 THA_193 THA_194     TRUE 0.884 -12.000 0.003 1.000 N NA
 5692999 5693000 THA_194 THA_195     TRUE 0.936 18.000 0.007 NA   NA
 5693000 5693001 THA_195 THA_196     FALSE 0.124 199.000 0.007 NA   NA
 5693001 5693002 THA_196 THA_197     TRUE 0.968 7.000 0.027 1.000 N NA
 5693002 5693003 THA_197 THA_198   secF TRUE 0.661 62.000 0.014 1.000 N NA
 5693003 5693004 THA_198 THA_199 secF secD TRUE 0.998 -3.000 0.046 0.001 Y NA
 5693004 5693005 THA_199 THA_200 secD   TRUE 0.981 19.000 0.012 NA Y NA
 5693005 5693006 THA_200 THA_201     TRUE 0.920 19.000 0.003 NA N NA
 5693006 5693007 THA_201 THA_202     TRUE 0.878 27.000 0.013 NA   NA
 5693007 5693008 THA_202 THA_203   thyX TRUE 0.957 0.000 0.014 NA   NA
 5693008 5693009 THA_203 THA_204 thyX rnhB TRUE 0.692 -22.000 0.003 1.000 N NA
 5693009 5693010 THA_204 THA_205 rnhB   TRUE 0.934 0.000 0.003 NA   NA
 5693010 5693011 THA_205 THA_206     TRUE 0.965 0.000 0.040 NA   NA
 5693011 5693012 THA_206 THA_207     TRUE 0.981 -3.000 0.027 1.000   NA
 5693012 5693013 THA_207 THA_208     TRUE 0.670 -37.000 0.034 1.000 N NA
 5693013 5693014 THA_208 THA_209     TRUE 0.395 68.000 0.002 NA   NA
 5693014 5693015 THA_209 THA_210     TRUE 0.676 -28.000 0.059 NA   NA
 5693015 5693016 THA_210 THA_211     TRUE 0.979 0.000 0.002 1.000 Y NA
 5693016 5693017 THA_211 THA_212     TRUE 0.707 -22.000 0.009 NA   NA
 5693017 5693018 THA_212 THA_213     TRUE 0.940 5.000 0.025 NA   NA
 5693018 5693019 THA_213 THA_214     TRUE 0.960 6.000 0.021 1.000 N NA
 5693019 5693020 THA_214 THA_215     TRUE 0.957 12.000 0.005 NA   NA
 5693020 5693021 THA_215 THA_216     TRUE 0.849 33.000 0.016 NA   NA
 5693021 5693022 THA_216 THA_217     TRUE 0.995 13.000 0.937 NA   NA
 5693022 5693023 THA_217 THA_218     TRUE 0.913 24.000 0.016 NA   NA
 5693025 5693026 THA_220 THA_221     TRUE 0.708 6.000 0.000 1.000   NA
 5693026 5693027 THA_221 THA_222     FALSE 0.069 102.000 0.000 1.000   NA
 5693027 5693028 THA_222 THA_223     TRUE 0.967 5.000 0.200 NA N NA
 5693029 5693030 THA_224 THA_225 dnaA   TRUE 0.711 42.000 0.002 1.000 N NA
 5693030 5693031 THA_225 THA_226     FALSE 0.016 229.000 0.000 NA   NA
 5693031 5693032 THA_226 THA_227     TRUE 0.969 33.000 0.900 NA   NA
 5693032 5693033 THA_227 THA_228     TRUE 0.443 101.000 0.055 1.000   NA
 5693033 5693034 THA_228 THA_229     TRUE 0.985 2.000 0.438 1.000   NA
 5693034 5693035 THA_229 THA_230     TRUE 0.998 -3.000 0.720 0.049   NA
 5693037 5693038 THA_232 THA_233     FALSE 0.093 78.000 0.000 NA   NA
 5693038 5693039 THA_233 THA_234     FALSE 0.067 93.000 0.000 NA   NA
 5693039 5693040 THA_234 THA_235     TRUE 0.490 25.000 0.000 NA   NA
 5693040 5693041 THA_235 THA_236     TRUE 0.700 8.000 0.000 NA   NA
 5693041 5693042 THA_236 THA_237   radA TRUE 0.960 -3.000 0.003 NA   NA
 5693042 5693043 THA_237 THA_238 radA   TRUE 0.994 -7.000 0.014 0.021 Y NA
 5693043 5693044 THA_238 THA_239     TRUE 0.686 82.000 0.027 0.080   NA
 5693045 5693046 THA_240 THA_241     TRUE 0.724 10.000 0.000 NA   NA
 5693046 5693047 THA_241 THA_242     FALSE 0.032 134.000 0.000 NA   NA
 5693047 5693048 THA_242 THA_243     TRUE 0.448 34.000 0.000 1.000 N NA
 5693049 5693050 THA_244 THA_245     FALSE 0.090 79.000 0.000 NA   NA
 5693050 5693051 THA_245 THA_246     TRUE 0.304 41.000 0.000 NA   NA
 5693051 5693052 THA_246 THA_247     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5693052 5693053 THA_247 THA_248     TRUE 0.966 -15.000 0.500 1.000 N NA
 5693053 5693054 THA_248 THA_249     TRUE 0.991 -3.000 0.036 0.048   NA
 5693054 5693055 THA_249 THA_250   recG TRUE 0.978 14.000 0.036 1.000   NA
 5693055 5693056 THA_250 THA_251 recG   TRUE 0.988 17.000 0.053 0.016 N NA
 5693057 5693058 THA_252 THA_253     TRUE 0.784 -21.000 0.010 1.000 N NA
 5693058 5693059 THA_253 THA_254     FALSE 0.022 251.000 0.000 1.000 N NA
 5693059 5693060 THA_254 THA_255     TRUE 0.992 0.000 0.084 1.000 Y NA
 5693060 5693061 THA_255 THA_256     TRUE 0.933 28.000 0.111 1.000 N NA
 5693061 5693062 THA_256 THA_257     TRUE 0.989 11.000 0.333 1.000 N NA
 5693063 5693064 THA_258 THA_259   ribH TRUE 0.339 36.000 0.000 NA   NA
 5693064 5693065 THA_259 THA_260 ribH ribB TRUE 0.997 0.000 0.054 0.003 Y NA
 5693065 5693066 THA_260 THA_261 ribB ribE TRUE 0.988 6.000 0.051 1.000 Y NA
 5693066 5693067 THA_261 THA_262 ribE ribD TRUE 0.980 -19.000 0.456 1.000 Y NA
 5693067 5693068 THA_262 THA_263 ribD   FALSE 0.012 1478.000 0.000 1.000 N NA
 5693068 5693069 THA_263 THA_264     FALSE 0.210 136.000 0.004 1.000 N NA
 5693069 5693070 THA_264 THA_265     TRUE 0.985 -7.000 0.292 1.000 N NA
 5693070 5693071 THA_265 THA_266     TRUE 0.787 -25.000 0.077 1.000 N NA
 5693071 5693072 THA_266 THA_267   sufB TRUE 0.999 11.000 0.266 0.003 Y NA
 5693072 5693073 THA_267 THA_268 sufB sufC TRUE 0.900 5.000 0.000 1.000 Y NA
 5693073 5693074 THA_268 THA_269 sufC groL FALSE 0.149 148.000 0.000 1.000 Y NA
 5693074 5693075 THA_269 THA_270 groL groS TRUE 0.992 17.000 0.111 1.000 Y NA
 5693075 5693076 THA_270 THA_271 groS   FALSE 0.018 207.000 0.000 NA   NA
 5693077 5693078 THA_272 THA_273     TRUE 0.977 -3.000 0.013 1.000   NA
 5693078 5693079 THA_273 THA_274     TRUE 0.906 5.000 0.005 NA   NA
 5693079 5693080 THA_274 THA_275     TRUE 0.984 -3.000 0.114 NA   NA
 5693080 5693081 THA_275 THA_276     TRUE 0.474 89.000 0.038 NA   NA
 5693082 5693083 THA_277 THA_278   queA FALSE 0.169 133.000 0.002 1.000   NA
 5693083 5693084 THA_278 THA_279 queA rpsO TRUE 0.826 56.000 0.003 1.000 Y NA
 5693084 5693085 THA_279 THA_280 rpsO proS FALSE 0.242 107.000 0.000 1.000 Y NA
 5693085 5693086 THA_280 THA_281 proS cysS TRUE 0.995 -3.000 0.004 0.052 Y NA
 5693086 5693087 THA_281 THA_282 cysS gltX1 TRUE 0.988 7.000 0.015 1.000 Y NA
 5693088 5693089 THA_283 THA_284 uraA   FALSE 0.015 237.000 0.000 NA   NA
 5693089 5693090 THA_284 THA_285     TRUE 0.591 21.000 0.000 NA   NA
 5693090 5693091 THA_285 THA_286     TRUE 0.668 18.000 0.000 NA   NA
 5693093 5693094 THA_288 THA_289 miaB   TRUE 0.941 14.000 0.002 NA   NA
 5693094 5693095 THA_289 THA_290     TRUE 0.962 10.000 0.016 NA   NA
 5693095 5693096 THA_290 THA_291     FALSE 0.195 193.000 0.016 1.000 N NA
 5693096 5693097 THA_291 THA_292     TRUE 0.949 -10.000 0.053 1.000   NA
 5693098 5693099 THA_293 THA_294 galT1   TRUE 0.976 15.000 0.021 1.000 N NA
 5693099 5693100 THA_294 THA_295     TRUE 0.952 6.000 0.014 1.000   NA
 5693100 5693101 THA_295 THA_296     TRUE 0.947 20.000 0.014 1.000   NA
 5693101 5693102 THA_296 THA_297     TRUE 0.941 3.000 0.021 NA   NA
 5693102 5693103 THA_297 THA_298     TRUE 0.974 -3.000 0.014 NA   NA
 5693103 5693104 THA_298 THA_299     TRUE 0.994 -3.000 0.500 1.000   NA
 5693104 5693105 THA_299 THA_300     TRUE 0.703 2.000 0.000 1.000   NA
 5693105 5693106 THA_300 THA_301     TRUE 0.736 36.000 0.000 0.003   NA
 5693106 5693107 THA_301 THA_302     TRUE 0.954 5.000 0.038 1.000 N NA
 5693107 5693108 THA_302 THA_303   nadE1 TRUE 0.951 -10.000 0.044 1.000 N NA
 5693108 5693109 THA_303 THA_304 nadE1 dnaJ TRUE 0.814 -16.000 0.004 1.000 N NA
 5693109 5693110 THA_304 THA_305 dnaJ grpE TRUE 0.995 6.000 0.018 0.007 Y NA
 5693110 5693111 THA_305 THA_306 grpE hrcA TRUE 0.973 15.000 0.015 1.000 N NA
 5693111 5693112 THA_306 THA_307 hrcA   FALSE 0.239 112.000 0.003 1.000 N NA
 5693112 5693113 THA_307 THA_308     TRUE 0.982 -3.000 0.050 1.000   NA
 5693113 5693114 THA_308 THA_309     FALSE 0.008 3163.000 0.000 NA   NA
 5693114 5693115 THA_309 THA_310     TRUE 0.966 18.000 0.103 NA   NA
 5693115 5693116 THA_310 THA_311     TRUE 0.968 -10.000 0.256 NA   NA
 5693116 5693117 THA_311 THA_312     TRUE 0.995 14.000 0.182 NA Y NA
 5693117 5693118 THA_312 THA_313     TRUE 0.963 -7.000 0.068 NA   NA
 5693118 5693119 THA_313 THA_314     TRUE 0.984 18.000 0.411 NA   NA
 5693119 5693120 THA_314 THA_315     TRUE 0.847 24.000 0.000 NA Y NA
 5693120 5693121 THA_315 THA_316     TRUE 0.934 11.000 0.000 NA Y NA
 5693121 5693122 THA_316 THA_317     TRUE 0.969 5.000 0.250 NA   NA
 5693122 5693123 THA_317 THA_318     TRUE 0.986 0.000 0.375 NA   NA
 5693123 5693124 THA_318 THA_319     TRUE 0.724 10.000 0.000 NA   NA
 5693124 5693125 THA_319 THA_320     TRUE 0.604 3.000 0.000 NA   NA
 5693125 5693126 THA_320 THA_321     FALSE 0.197 54.000 0.000 NA   NA
 5693126 5693127 THA_321 THA_322     TRUE 0.985 6.000 0.034 NA Y NA
 5693127 5693128 THA_322 THA_323     TRUE 0.997 15.000 0.500 NA Y NA
 5693128 5693129 THA_323 THA_324     FALSE 0.250 47.000 0.000 NA   NA
 5693129 10253737 THA_324 THA_2007     FALSE 0.008 3564.000 0.000 NA   NA
 11474958 5693122   THA_317     FALSE NA 4089.000 0.000 NA   NA
 11617321 5693122   THA_317     FALSE NA 4089.000 0.000 NA   NA
 11759713 5693122   THA_317     FALSE NA 4089.000 0.000 NA   NA
 11474959 5693122   THA_317     FALSE NA 4119.000 0.000 NA   NA
 11617322 5693122   THA_317     FALSE NA 4119.000 0.000 NA   NA
 11759714 5693122   THA_317     FALSE NA 4119.000 0.000 NA   NA
 11474960 5693122   THA_317     FALSE NA 4156.000 0.000 NA   NA
 11617323 5693122   THA_317     FALSE NA 4156.000 0.000 NA   NA
 11759715 5693122   THA_317     FALSE NA 4156.000 0.000 NA   NA
 11474961 5693122   THA_317     FALSE NA 4186.000 0.000 NA   NA
 11617324 5693122   THA_317     FALSE NA 4186.000 0.000 NA   NA
 11759716 5693122   THA_317     FALSE NA 4186.000 0.000 NA   NA
 11474962 5693122   THA_317     FALSE NA 4231.000 0.000 NA   NA
 11617325 5693122   THA_317     FALSE NA 4231.000 0.000 NA   NA
 11759717 5693122   THA_317     FALSE NA 4231.000 0.000 NA   NA
 11474963 5693122   THA_317     FALSE NA 4261.000 0.000 NA   NA
 11617326 5693122   THA_317     FALSE NA 4261.000 0.000 NA   NA
 11759718 5693122   THA_317     FALSE NA 4261.000 0.000 NA   NA
 11474964 5693122   THA_317     FALSE NA 4300.000 0.000 NA   NA
 11617327 5693122   THA_317     FALSE NA 4300.000 0.000 NA   NA
 11759719 5693122   THA_317     FALSE NA 4300.000 0.000 NA   NA
 11474965 5693122   THA_317     FALSE NA 4330.000 0.000 NA   NA
 11617328 5693122   THA_317     FALSE NA 4330.000 0.000 NA   NA
 11759720 5693122   THA_317     FALSE NA 4330.000 0.000 NA   NA
 11474966 5693122   THA_317     FALSE NA 4373.000 0.000 NA   NA
 11617329 5693122   THA_317     FALSE NA 4373.000 0.000 NA   NA
 11759721 5693122   THA_317     FALSE NA 4373.000 0.000 NA   NA
 11474967 5693122   THA_317     FALSE NA 4403.000 0.000 NA   NA
 11617330 5693122   THA_317     FALSE NA 4403.000 0.000 NA   NA
 11759722 5693122   THA_317     FALSE NA 4403.000 0.000 NA   NA
 11474968 5693122   THA_317     FALSE NA 4443.000 0.000 NA   NA
 11617331 5693122   THA_317     FALSE NA 4443.000 0.000 NA   NA
 11759723 5693122   THA_317     FALSE NA 4443.000 0.000 NA   NA
 11474969 5693122   THA_317     FALSE NA 4473.000 0.000 NA   NA
 11617332 5693122   THA_317     FALSE NA 4473.000 0.000 NA   NA
 11759724 5693122   THA_317     FALSE NA 4473.000 0.000 NA   NA
 11474970 5693122   THA_317     FALSE NA 4513.000 0.000 NA   NA
 11617333 5693122   THA_317     FALSE NA 4513.000 0.000 NA   NA
 11759725 5693122   THA_317     FALSE NA 4513.000 0.000 NA   NA
 11474971 5693122   THA_317     FALSE NA 4543.000 0.000 NA   NA
 11617334 5693122   THA_317     FALSE NA 4543.000 0.000 NA   NA
 11759726 5693122   THA_317     FALSE NA 4543.000 0.000 NA   NA
 11474972 5693122   THA_317     FALSE NA 4582.000 0.000 NA   NA
 11617335 5693122   THA_317     FALSE NA 4582.000 0.000 NA   NA
 11759727 5693122   THA_317     FALSE NA 4582.000 0.000 NA   NA
 11474973 5693122   THA_317     FALSE NA 4612.000 0.000 NA   NA
 11617336 5693122   THA_317     FALSE NA 4612.000 0.000 NA   NA
 11759728 5693122   THA_317     FALSE NA 4612.000 0.000 NA   NA
 11474974 5693122   THA_317     FALSE NA 4648.000 0.000 NA   NA
 11617337 5693122   THA_317     FALSE NA 4648.000 0.000 NA   NA
 11759729 5693122   THA_317     FALSE NA 4648.000 0.000 NA   NA
 11474975 5693122   THA_317     FALSE NA 4678.000 0.000 NA   NA
 11617338 5693122   THA_317     FALSE NA 4678.000 0.000 NA   NA
 11759730 5693122   THA_317     FALSE NA 4678.000 0.000 NA   NA
 11474976 5693122   THA_317     FALSE NA 4718.000 0.000 NA   NA
 11617339 5693122   THA_317     FALSE NA 4718.000 0.000 NA   NA
 11759731 5693122   THA_317     FALSE NA 4718.000 0.000 NA   NA
 11474977 5693122   THA_317     FALSE NA 4748.000 0.000 NA   NA
 11617340 5693122   THA_317     FALSE NA 4748.000 0.000 NA   NA
 11759732 5693122   THA_317     FALSE NA 4748.000 0.000 NA   NA
 11474978 5693122   THA_317     FALSE NA 4788.000 0.000 NA   NA
 11617341 5693122   THA_317     FALSE NA 4788.000 0.000 NA   NA
 11759733 5693122   THA_317     FALSE NA 4788.000 0.000 NA   NA
 11474979 5693122   THA_317     FALSE NA 4818.000 0.000 NA   NA
 11617342 5693122   THA_317     FALSE NA 4818.000 0.000 NA   NA
 11759734 5693122   THA_317     FALSE NA 4818.000 0.000 NA   NA
 11474980 5693122   THA_317     FALSE NA 4861.000 0.000 NA   NA
 11617343 5693122   THA_317     FALSE NA 4861.000 0.000 NA   NA
 11759735 5693122   THA_317     FALSE NA 4861.000 0.000 NA   NA
 11474981 5693122   THA_317     FALSE NA 4891.000 0.000 NA   NA
 11617344 5693122   THA_317     FALSE NA 4891.000 0.000 NA   NA
 11759736 5693122   THA_317     FALSE NA 4891.000 0.000 NA   NA
 11474982 5693122   THA_317     FALSE NA 4930.000 0.000 NA   NA
 11617345 5693122   THA_317     FALSE NA 4930.000 0.000 NA   NA
 11759737 5693122   THA_317     FALSE NA 4930.000 0.000 NA   NA
 11474983 5693122   THA_317     FALSE NA 4960.000 0.000 NA   NA
 11617346 5693122   THA_317     FALSE NA 4960.000 0.000 NA   NA
 11759738 5693122   THA_317     FALSE NA 4960.000 0.000 NA   NA
 11474984 5693122   THA_317     FALSE NA 4994.000 0.000 NA   NA
 11617347 5693122   THA_317     FALSE NA 4994.000 0.000 NA   NA
 11759739 5693122   THA_317     FALSE NA 4994.000 0.000 NA   NA
 11474985 5693122   THA_317     FALSE NA 5024.000 0.000 NA   NA
 11617348 5693122   THA_317     FALSE NA 5024.000 0.000 NA   NA
 11759740 5693122   THA_317     FALSE NA 5024.000 0.000 NA   NA
 11474986 5693122   THA_317     FALSE NA 5066.000 0.000 NA   NA
 11617349 5693122   THA_317     FALSE NA 5066.000 0.000 NA   NA
 11759741 5693122   THA_317     FALSE NA 5066.000 0.000 NA   NA
 11474987 5693122   THA_317     FALSE NA 5096.000 0.000 NA   NA
 11617350 5693122   THA_317     FALSE NA 5096.000 0.000 NA   NA
 11759742 5693122   THA_317     FALSE NA 5096.000 0.000 NA   NA
 11474988 5693122   THA_317     FALSE NA 5138.000 0.000 NA   NA
 11617351 5693122   THA_317     FALSE NA 5138.000 0.000 NA   NA
 11759743 5693122   THA_317     FALSE NA 5138.000 0.000 NA   NA
 11474989 5693122   THA_317     FALSE NA 5168.000 0.000 NA   NA
 11617352 5693122   THA_317     FALSE NA 5168.000 0.000 NA   NA
 11759744 5693122   THA_317     FALSE NA 5168.000 0.000 NA   NA
 11474990 5693122   THA_317     FALSE NA 5206.000 0.000 NA   NA
 11617353 5693122   THA_317     FALSE NA 5206.000 0.000 NA   NA
 11759745 5693122   THA_317     FALSE NA 5206.000 0.000 NA   NA
 11474991 5693122   THA_317     FALSE NA 5236.000 0.000 NA   NA
 11617354 5693122   THA_317     FALSE NA 5236.000 0.000 NA   NA
 11759746 5693122   THA_317     FALSE NA 5236.000 0.000 NA   NA
 11474992 5693122   THA_317     FALSE NA 5271.000 0.000 NA   NA
 11617355 5693122   THA_317     FALSE NA 5271.000 0.000 NA   NA
 11759747 5693122   THA_317     FALSE NA 5271.000 0.000 NA   NA
 11474993 5693122   THA_317     FALSE NA 5301.000 0.000 NA   NA
 11617356 5693122   THA_317     FALSE NA 5301.000 0.000 NA   NA
 11759748 5693122   THA_317     FALSE NA 5301.000 0.000 NA   NA
 11474994 5693122   THA_317     FALSE NA 5344.000 0.000 NA   NA
 11617357 5693122   THA_317     FALSE NA 5344.000 0.000 NA   NA
 11759749 5693122   THA_317     FALSE NA 5344.000 0.000 NA   NA
 11474995 5693122   THA_317     FALSE NA 5374.000 0.000 NA   NA
 11617358 5693122   THA_317     FALSE NA 5374.000 0.000 NA   NA
 11759750 5693122   THA_317     FALSE NA 5374.000 0.000 NA   NA
 11474996 5693122   THA_317     FALSE NA 5412.000 0.000 NA   NA
 11617359 5693122   THA_317     FALSE NA 5412.000 0.000 NA   NA
 11759751 5693122   THA_317     FALSE NA 5412.000 0.000 NA   NA
 11474997 5693122   THA_317     FALSE NA 5442.000 0.000 NA   NA
 11617360 5693122   THA_317     FALSE NA 5442.000 0.000 NA   NA
 11759752 5693122   THA_317     FALSE NA 5442.000 0.000 NA   NA
 11474998 5693122   THA_317     FALSE NA 5486.000 0.000 NA   NA
 11617361 5693122   THA_317     FALSE NA 5486.000 0.000 NA   NA
 11759753 5693122   THA_317     FALSE NA 5486.000 0.000 NA   NA
 11474999 5693122   THA_317     FALSE NA 5516.000 0.000 NA   NA
 11617362 5693122   THA_317     FALSE NA 5516.000 0.000 NA   NA
 11759754 5693122   THA_317     FALSE NA 5516.000 0.000 NA   NA
 11475000 5693122   THA_317     FALSE NA 5561.000 0.000 NA   NA
 11617363 5693122   THA_317     FALSE NA 5561.000 0.000 NA   NA
 11759755 5693122   THA_317     FALSE NA 5561.000 0.000 NA   NA
 11475001 5693122   THA_317     FALSE NA 5591.000 0.000 NA   NA
 11617364 5693122   THA_317     FALSE NA 5591.000 0.000 NA   NA
 11759756 5693122   THA_317     FALSE NA 5591.000 0.000 NA   NA
 11475002 5693122   THA_317     FALSE NA 5637.000 0.000 NA   NA
 11617365 5693122   THA_317     FALSE NA 5637.000 0.000 NA   NA
 11759757 5693122   THA_317     FALSE NA 5637.000 0.000 NA   NA
 11475003 5693122   THA_317     FALSE NA 5667.000 0.000 NA   NA
 11617366 5693122   THA_317     FALSE NA 5667.000 0.000 NA   NA
 11759758 5693122   THA_317     FALSE NA 5667.000 0.000 NA   NA
 11475004 5693122   THA_317     FALSE NA 5703.000 0.000 NA   NA
 11617367 5693122   THA_317     FALSE NA 5703.000 0.000 NA   NA
 11759759 5693122   THA_317     FALSE NA 5703.000 0.000 NA   NA
 11475005 5693122   THA_317     FALSE NA 5733.000 0.000 NA   NA
 11617368 5693122   THA_317     FALSE NA 5733.000 0.000 NA   NA
 11759760 5693122   THA_317     FALSE NA 5733.000 0.000 NA   NA
 11475006 5693122   THA_317     FALSE NA 5774.000 0.000 NA   NA
 11617369 5693122   THA_317     FALSE NA 5774.000 0.000 NA   NA
 11759761 5693122   THA_317     FALSE NA 5774.000 0.000 NA   NA
 11475007 5693122   THA_317     FALSE NA 5804.000 0.000 NA   NA
 11617370 5693122   THA_317     FALSE NA 5804.000 0.000 NA   NA
 11759762 5693122   THA_317     FALSE NA 5804.000 0.000 NA   NA
 11475008 5693122   THA_317     FALSE NA 5839.000 0.000 NA   NA
 11617371 5693122   THA_317     FALSE NA 5839.000 0.000 NA   NA
 11759763 5693122   THA_317     FALSE NA 5839.000 0.000 NA   NA
 11475009 5693122   THA_317     FALSE NA 5869.000 0.000 NA   NA
 11617372 5693122   THA_317     FALSE NA 5869.000 0.000 NA   NA
 11759764 5693122   THA_317     FALSE NA 5869.000 0.000 NA   NA
 11475010 5693122   THA_317     FALSE NA 5906.000 0.000 NA   NA
 11617373 5693122   THA_317     FALSE NA 5906.000 0.000 NA   NA
 11759765 5693122   THA_317     FALSE NA 5906.000 0.000 NA   NA
 11475011 5693122   THA_317     FALSE NA 5936.000 0.000 NA   NA
 11617374 5693122   THA_317     FALSE NA 5936.000 0.000 NA   NA
 11759766 5693122   THA_317     FALSE NA 5936.000 0.000 NA   NA
 11475012 5693122   THA_317     FALSE NA 5979.000 0.000 NA   NA
 11617375 5693122   THA_317     FALSE NA 5979.000 0.000 NA   NA
 11759767 5693122   THA_317     FALSE NA 5979.000 0.000 NA   NA
 11475013 5693122   THA_317     FALSE NA 6009.000 0.000 NA   NA
 11617376 5693122   THA_317     FALSE NA 6009.000 0.000 NA   NA
 11759768 5693122   THA_317     FALSE NA 6009.000 0.000 NA   NA
 11475014 5693122   THA_317     FALSE NA 6050.000 0.000 NA   NA
 11617377 5693122   THA_317     FALSE NA 6050.000 0.000 NA   NA
 11759769 5693122   THA_317     FALSE NA 6050.000 0.000 NA   NA
 11475015 5693122   THA_317     FALSE NA 6080.000 0.000 NA   NA
 11617378 5693122   THA_317     FALSE NA 6080.000 0.000 NA   NA
 11759770 5693122   THA_317     FALSE NA 6080.000 0.000 NA   NA
 11475016 5693122   THA_317     FALSE NA 6118.000 0.000 NA   NA
 11617379 5693122   THA_317     FALSE NA 6118.000 0.000 NA   NA
 11759771 5693122   THA_317     FALSE NA 6118.000 0.000 NA   NA
 11475017 5693122   THA_317     FALSE NA 6148.000 0.000 NA   NA
 11617380 5693122   THA_317     FALSE NA 6148.000 0.000 NA   NA
 11759772 5693122   THA_317     FALSE NA 6148.000 0.000 NA   NA
 11475018 5693122   THA_317     FALSE NA 6189.000 0.000 NA   NA
 11617381 5693122   THA_317     FALSE NA 6189.000 0.000 NA   NA
 11759773 5693122   THA_317     FALSE NA 6189.000 0.000 NA   NA
 11475019 5693122   THA_317     FALSE NA 6219.000 0.000 NA   NA
 11617382 5693122   THA_317     FALSE NA 6219.000 0.000 NA   NA
 11759774 5693122   THA_317     FALSE NA 6219.000 0.000 NA   NA
 11475020 5693122   THA_317     FALSE NA 6255.000 0.000 NA   NA
 11617383 5693122   THA_317     FALSE NA 6255.000 0.000 NA   NA
 11759775 5693122   THA_317     FALSE NA 6255.000 0.000 NA   NA
 11475021 5693122   THA_317     FALSE NA 6285.000 0.000 NA   NA
 11617384 5693122   THA_317     FALSE NA 6285.000 0.000 NA   NA
 11759776 5693122   THA_317     FALSE NA 6285.000 0.000 NA   NA
 11475022 5693122   THA_317     FALSE NA 6329.000 0.000 NA   NA
 11617385 5693122   THA_317     FALSE NA 6329.000 0.000 NA   NA
 11759777 5693122   THA_317     FALSE NA 6329.000 0.000 NA   NA
 11475023 5693122   THA_317     FALSE NA 6359.000 0.000 NA   NA
 11617386 5693122   THA_317     FALSE NA 6359.000 0.000 NA   NA
 11759778 5693122   THA_317     FALSE NA 6359.000 0.000 NA   NA
 11475024 5693122   THA_317     FALSE NA 6398.000 0.000 NA   NA
 11617387 5693122   THA_317     FALSE NA 6398.000 0.000 NA   NA
 11759779 5693122   THA_317     FALSE NA 6398.000 0.000 NA   NA
 11475025 5693122   THA_317     FALSE NA 6428.000 0.000 NA   NA
 11617388 5693122   THA_317     FALSE NA 6428.000 0.000 NA   NA
 11759780 5693122   THA_317     FALSE NA 6428.000 0.000 NA   NA
 11475026 5693122   THA_317     FALSE NA 6465.000 0.000 NA   NA
 11617389 5693122   THA_317     FALSE NA 6465.000 0.000 NA   NA
 11759781 5693122   THA_317     FALSE NA 6465.000 0.000 NA   NA
 10253737 5693130 THA_2007 THA_325     FALSE 0.044 138.000 0.000 1.000 N NA
 5693130 5693131 THA_325 THA_326     FALSE 0.178 63.000 0.000 1.000   NA
 5693131 5693132 THA_326 THA_327     TRUE 0.909 -16.000 0.125 1.000   NA
 5693133 5693134 THA_328 THA_329     TRUE 0.998 1.000 0.228 0.004 Y NA
 5693135 5693136 THA_330 THA_331 rpoZ   TRUE 0.958 -16.000 0.471 1.000 N NA
 5693136 5693137 THA_331 THA_332     TRUE 0.967 2.000 0.143 NA   NA
 5693137 5693138 THA_332 THA_333     TRUE 0.973 18.000 0.189 NA   NA
 5693138 5693139 THA_333 THA_334   porG FALSE 0.154 136.000 0.003 NA   NA
 5693139 5693140 THA_334 THA_335 porG   TRUE 0.999 -3.000 0.797 0.005 Y NA
 5693140 5693141 THA_335 THA_336   vorB TRUE 0.999 6.000 0.822 0.005 Y NA
 5693141 5693142 THA_336 THA_337 vorB   TRUE 0.998 14.000 0.041 0.005 Y NA
 5693142 5693143 THA_337 THA_338     TRUE 0.979 14.000 0.091 NA   NA
 5693143 5693144 THA_338 THA_339     TRUE 0.985 -7.000 0.455 NA   NA
 5693144 5693145 THA_339 THA_340     TRUE 0.996 -7.000 0.455 1.000 Y NA
 5693145 5693146 THA_340 THA_341     TRUE 0.997 -3.000 0.217 1.000 Y NA
 5693146 5693147 THA_341 THA_342     TRUE 0.971 3.000 0.174 1.000 N NA
 5693147 5693148 THA_342 THA_343     TRUE 0.368 33.000 0.000 NA   NA
 5693149 5693150 THA_344 THA_345   serA TRUE 0.996 0.000 0.060 0.037 Y NA
 5693152 5693153 THA_347 THA_348     TRUE 0.989 2.000 0.091 1.000 Y NA
 5693153 5693154 THA_348 THA_349     TRUE 0.955 3.000 0.030 1.000 N NA
 5693154 5693155 THA_349 THA_350     TRUE 0.985 5.000 0.049 1.000 Y NA
 5693155 5693156 THA_350 THA_351     TRUE 0.985 20.000 0.019 1.000 Y NA
 5693156 5693157 THA_351 THA_352     FALSE 0.071 91.000 0.000 NA   NA
 5693157 5693158 THA_352 THA_353     TRUE 0.595 4.000 0.000 NA   NA
 5693158 5693159 THA_353 THA_354     TRUE 0.784 13.000 0.000 NA   NA
 5693159 5693160 THA_354 THA_355     TRUE 0.490 25.000 0.000 NA   NA
 5693160 5693161 THA_355 THA_356     TRUE 0.697 17.000 0.000 NA   NA
 5693161 5693162 THA_356 THA_357     FALSE 0.111 69.000 0.000 NA   NA
 5693163 5693164 THA_358 THA_359     TRUE 0.941 28.000 0.154 1.000 N NA
 5693164 5693165 THA_359 THA_360     TRUE 0.688 7.000 0.000 NA   NA
 5693165 5693166 THA_360 THA_361     TRUE 0.784 13.000 0.000 NA   NA
 5693166 5693167 THA_361 THA_362     TRUE 0.989 13.000 0.300 NA   NA
 5693167 5693168 THA_362 THA_363     TRUE 0.949 0.000 0.008 NA   NA
 5693168 5693169 THA_363 THA_364     TRUE 0.807 -19.000 0.019 NA   NA
 5693169 5693170 THA_364 THA_365   thiI TRUE 0.979 -3.000 0.014 1.000 N NA
 5693172 5693173 THA_367 THA_368     TRUE 0.726 16.000 0.000 NA   NA
 5693173 5693174 THA_368 THA_369     FALSE 0.106 70.000 0.000 NA   NA
 5693174 5693175 THA_369 THA_370     TRUE 0.976 13.000 0.030 NA   NA
 5693175 5693176 THA_370 THA_371     FALSE 0.040 123.000 0.000 NA   NA
 5693176 5693177 THA_371 THA_372     TRUE 0.999 -3.000 0.135 0.004 Y NA
 5693177 5693178 THA_372 THA_373     TRUE 0.968 -16.000 0.714 1.000 N NA
 5693178 5693179 THA_373 THA_374     TRUE 0.408 109.000 0.031 1.000 N NA
 5693179 5693180 THA_374 THA_375     FALSE 0.017 352.000 0.000 1.000 N NA
 5693180 10253738 THA_375 THA_2008     TRUE 0.988 9.000 0.135 0.054   NA
 10253738 5693181 THA_2008 THA_376     FALSE 0.022 176.000 0.000 NA   NA
 5693182 5693183 THA_377 THA_378     FALSE 0.017 218.000 0.000 NA   NA
 5693184 5693185 THA_379 THA_380     TRUE 0.604 3.000 0.000 NA   NA
 5693185 5693186 THA_380 THA_381     FALSE 0.252 -25.000 0.000 1.000 N NA
 5693187 5693188 THA_382 THA_383     TRUE 0.328 37.000 0.000 NA   NA
 5693188 5693189 THA_383 THA_384     TRUE 0.977 2.000 0.200 1.000 N NA
 5693190 5693191 THA_385 THA_386     TRUE 0.902 2.000 0.000 NA Y NA
 5693191 5693192 THA_386 THA_387     TRUE 0.959 1.000 0.033 NA   NA
 5693192 5693193 THA_387 THA_388     TRUE 0.784 13.000 0.000 NA   NA
 5693193 5693194 THA_388 THA_389     TRUE 0.834 -13.000 0.003 NA   NA
 5693194 5693195 THA_389 THA_390     TRUE 0.634 -31.000 0.012 1.000 N NA
 5693195 5693196 THA_390 THA_391     TRUE 0.969 1.000 0.064 1.000 N NA
 5693196 5693197 THA_391 THA_392     TRUE 0.969 -7.000 0.055 1.000 N NA
 5693198 5693199 THA_393 THA_394 ppdK   TRUE 0.574 58.000 0.007 NA   NA
 5693199 5693200 THA_394 THA_395   glmU TRUE 0.961 -3.000 0.003 NA   NA
 5693200 5693201 THA_395 THA_396 glmU   TRUE 0.830 -19.000 0.015 1.000 N NA
 5693201 5693202 THA_396 THA_397     TRUE 0.861 36.000 0.015 1.000 N NA
 5693202 5693203 THA_397 THA_398     TRUE 0.967 71.000 0.496 0.028 Y NA
 5693203 5693204 THA_398 THA_399     TRUE 0.965 -3.000 0.005 NA   NA
 5693204 5693205 THA_399 THA_400     FALSE 0.013 301.000 0.000 NA   NA
 5693205 5693206 THA_400 THA_401     TRUE 0.947 21.000 0.069 NA   NA
 5693206 5693207 THA_401 THA_402     TRUE 0.678 -7.000 0.000 NA   NA
 5693207 5693208 THA_402 THA_403   uvrA TRUE 0.831 4.000 0.000 0.085 N NA
 5693208 5693209 THA_403 THA_404 uvrA   TRUE 0.979 -7.000 0.003 1.000 Y NA
 5693210 5693211 THA_405 THA_406     FALSE 0.023 169.000 0.000 NA   NA
 5693211 5693212 THA_406 THA_407     FALSE 0.208 53.000 0.000 NA   NA
 5693212 5693213 THA_407 THA_408   tyrS FALSE 0.254 101.000 0.003 NA   NA
 5693213 5693214 THA_408 THA_409 tyrS   TRUE 0.432 91.000 0.011 1.000   NA
 5693214 5693215 THA_409 THA_410     TRUE 0.492 62.000 0.002 1.000   NA
 5693215 5693216 THA_410 THA_411     TRUE 0.965 14.000 0.004 1.000 N NA
 5693216 5693217 THA_411 THA_412     TRUE 0.963 -3.000 0.004 NA   NA
 5693217 5693218 THA_412 THA_413     TRUE 0.979 -3.000 0.034 NA   NA
 5693218 5693219 THA_413 THA_414     TRUE 0.967 14.000 0.011 NA   NA
 5693219 5693220 THA_414 THA_415   rdgB TRUE 0.947 -3.000 0.002 NA   NA
 5693220 5693221 THA_415 THA_416 rdgB   TRUE 0.949 10.000 0.006 NA   NA
 5693221 5693222 THA_416 THA_417     TRUE 0.954 -3.000 0.003 NA   NA
 5693222 5693223 THA_417 THA_418   prmA TRUE 0.709 -27.000 0.070 NA   NA
 5693223 5693224 THA_418 THA_419 prmA   TRUE 0.953 3.000 0.021 1.000 N NA
 5693225 5693226 THA_420 THA_421     FALSE 0.046 110.000 0.000 NA   NA
 5693226 5693227 THA_421 THA_422     TRUE 0.982 5.000 0.583 NA   NA
 5693227 5693228 THA_422 THA_423     TRUE 0.974 5.000 0.250 1.000   NA
 5693228 5693229 THA_423 THA_424     TRUE 0.984 13.000 0.093 1.000 N NA
 5693229 5693230 THA_424 THA_425     TRUE 0.992 -3.000 0.052 0.032 N NA
 5693230 5693231 THA_425 THA_426     TRUE 0.988 -3.000 0.227 NA   NA
 5693231 5693232 THA_426 THA_427     TRUE 0.993 -3.000 0.591 NA   NA
 5693232 5693233 THA_427 THA_428     TRUE 0.900 -22.000 0.406 NA   NA
 5693233 5693234 THA_428 THA_429     TRUE 0.986 3.000 0.788 NA   NA
 5693234 5693235 THA_429 THA_430     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5693236 5693237 THA_431 THA_432     TRUE 0.998 -3.000 0.636 1.000 Y NA
 5693237 5693238 THA_432 THA_433     TRUE 0.986 17.000 0.304 1.000 N NA
 5693238 5693239 THA_433 THA_434     TRUE 0.992 -3.000 0.304 1.000   NA
 5693239 5693240 THA_434 THA_435     TRUE 0.843 3.000 0.000 0.032   NA
 5693240 5693241 THA_435 THA_436     FALSE 0.044 112.000 0.000 NA   NA
 5693241 5693242 THA_436 THA_437     TRUE 0.288 42.000 0.000 NA   NA
 5693242 5693243 THA_437 THA_438     FALSE 0.124 66.000 0.000 NA   NA
 5693243 5693244 THA_438 THA_439     TRUE 0.869 -16.000 0.055 NA   NA
 5693244 5693245 THA_439 THA_440     TRUE 0.629 -37.000 0.055 NA   NA
 5693245 5693246 THA_440 THA_441     TRUE 0.991 -3.000 0.051 0.085 N NA
 5693247 5693248 THA_442 THA_443     TRUE 0.589 77.000 0.091 NA   NA
 5693248 5693249 THA_443 THA_444     TRUE 0.764 12.000 0.000 NA   NA
 5693249 5693250 THA_444 THA_445   hutI TRUE 0.729 6.000 0.000 1.000 N NA
 5693250 5693251 THA_445 THA_446 hutI   TRUE 0.862 -13.000 0.008 NA   NA
 5693251 5693252 THA_446 THA_447     TRUE 0.898 33.000 0.131 NA   NA
 5693252 5693253 THA_447 THA_448     TRUE 0.611 -40.000 0.052 NA   NA
 5693253 5693254 THA_448 THA_449     TRUE 0.669 -28.000 0.026 NA N NA
 5693254 5693255 THA_449 THA_450     TRUE 0.987 12.000 0.286 NA   NA
 5693255 5693256 THA_450 THA_451     TRUE 0.987 -6.000 0.400 NA   NA
 5693256 5693257 THA_451 THA_452     TRUE 0.985 17.000 0.400 NA   NA
 5693257 5693258 THA_452 THA_453     TRUE 0.990 11.000 0.039 NA Y NA
 5693258 5693259 THA_453 THA_454     TRUE 0.938 -10.000 0.039 NA   NA
 5693260 5693261 THA_455 THA_456     TRUE 0.978 1.000 0.250 NA   NA
 5693261 5693262 THA_456 THA_457     TRUE 0.987 -10.000 1.000 NA   NA
 5693262 5693263 THA_457 THA_458     TRUE 0.964 -3.000 0.004 NA   NA
 5693263 5693264 THA_458 THA_459     TRUE 0.979 13.000 0.019 1.000 N NA
 5693264 5693265 THA_459 THA_460     TRUE 0.975 14.000 0.042 NA   NA
 5693265 5693266 THA_460 THA_461     TRUE 0.965 5.000 0.200 NA   NA
 5693266 5693267 THA_461 THA_462     TRUE 0.979 -3.000 0.037 NA   NA
 5693267 5693268 THA_462 THA_463     TRUE 0.979 -3.000 0.041 NA   NA
 5693268 5693269 THA_463 THA_464   hslV TRUE 0.916 2.000 0.004 NA   NA
 5693269 5693270 THA_464 THA_465 hslV   TRUE 0.964 -3.000 0.004 NA N NA
 5693270 5693271 THA_465 THA_466     TRUE 0.680 -25.000 0.012 NA N NA
 5693271 5693272 THA_466 THA_467   lepA TRUE 0.828 -13.000 0.002 1.000 N NA
 5693272 5693273 THA_467 THA_468 lepA murD TRUE 0.989 -3.000 0.003 1.000 Y NA
 5693273 5693274 THA_468 THA_469 murD trmF TRUE 0.943 18.000 0.004 1.000 N NA
 5693274 5693275 THA_469 THA_470 trmF   TRUE 0.962 -10.000 0.002 1.000 Y NA
 5693275 5693276 THA_470 THA_471   ksgA TRUE 0.928 29.000 0.002 1.000 Y NA
 5693276 5693277 THA_471 THA_472 ksgA   TRUE 0.954 -3.000 0.003 NA   NA
 5693277 5693278 THA_472 THA_473     TRUE 0.993 14.000 0.667 NA   NA
 5693278 5693279 THA_473 THA_474     TRUE 0.986 13.000 0.222 NA   NA
 5693279 5693280 THA_474 THA_475   glgC TRUE 0.994 13.000 0.818 NA   NA
 5693280 5693281 THA_475 THA_476 glgC glgD TRUE 1.000 12.000 1.000 0.001 Y NA
 5693281 5693282 THA_476 THA_477 glgD deoC TRUE 0.977 5.000 0.273 1.000 N NA
 5693282 5693283 THA_477 THA_478 deoC smpB TRUE 0.949 16.000 0.003 1.000 N NA
 5693283 5693284 THA_478 THA_479 smpB gatC TRUE 0.940 10.000 0.002 1.000 N NA
 5693284 5693285 THA_479 THA_480 gatC csrA TRUE 0.941 19.000 0.006 1.000 N NA
 5693285 5693286 THA_480 THA_481 csrA   TRUE 0.976 11.000 0.109 NA   NA
 5693286 5693287 THA_481 THA_482     TRUE 0.937 5.000 0.019 NA   NA
 5693287 5693288 THA_482 THA_483     TRUE 0.980 -3.000 0.048 NA N NA
 5693288 5693289 THA_483 THA_484     TRUE 0.955 10.000 0.010 NA   NA
 5693289 5693290 THA_484 THA_485     TRUE 0.962 17.000 0.032 NA   NA
 5693290 5693291 THA_485 THA_486     TRUE 0.893 -25.000 0.562 NA   NA
 5693291 5693292 THA_486 THA_487   serS TRUE 0.848 29.000 0.004 1.000 N NA
 5693292 5693293 THA_487 THA_488 serS mtnA TRUE 0.979 6.000 0.004 1.000 Y NA
 5693295 5693296 THA_490 THA_491   leuS TRUE 0.951 13.000 0.002 1.000   NA
 5693297 5693298 THA_492 THA_493     TRUE 0.977 13.000 0.049 NA   NA
 5693299 5693300 THA_494 THA_495     FALSE 0.009 694.000 0.000 NA   NA
 5693300 10253739 THA_495 THA_2009     TRUE 0.989 9.000 0.135 0.052   NA
 5693301 5693302 THA_496 THA_497     TRUE 0.455 -13.000 0.000 NA   NA
 5693302 5693303 THA_497 THA_498     FALSE 0.149 -28.000 0.000 NA   NA
 5693303 10253740 THA_498 THA_2010     FALSE 0.155 58.000 0.000 NA   NA
 10253740 5693304 THA_2010 THA_499     TRUE 0.989 9.000 0.135 0.052   NA
 5693304 5693305 THA_499 THA_500     FALSE 0.008 4023.000 0.000 NA   NA
 11475118 5693298   THA_493     FALSE NA 8017.000 0.000 NA   NA
 11617481 5693298   THA_493     FALSE NA 8017.000 0.000 NA   NA
 11759873 5693298   THA_493     FALSE NA 8017.000 0.000 NA   NA
 11475119 5693298   THA_493     FALSE NA 8042.000 0.000 NA   NA
 11617482 5693298   THA_493     FALSE NA 8042.000 0.000 NA   NA
 11759874 5693298   THA_493     FALSE NA 8042.000 0.000 NA   NA
 11475120 5693298   THA_493     FALSE NA 8081.000 0.000 NA   NA
 11617483 5693298   THA_493     FALSE NA 8081.000 0.000 NA   NA
 11759875 5693298   THA_493     FALSE NA 8081.000 0.000 NA   NA
 11475121 5693298   THA_493     FALSE NA 8111.000 0.000 NA   NA
 11617484 5693298   THA_493     FALSE NA 8111.000 0.000 NA   NA
 11759876 5693298   THA_493     FALSE NA 8111.000 0.000 NA   NA
 11475122 5693298   THA_493     FALSE NA 8150.000 0.000 NA   NA
 11617485 5693298   THA_493     FALSE NA 8150.000 0.000 NA   NA
 11759877 5693298   THA_493     FALSE NA 8150.000 0.000 NA   NA
 11475123 5693298   THA_493     FALSE NA 8180.000 0.000 NA   NA
 11617486 5693298   THA_493     FALSE NA 8180.000 0.000 NA   NA
 11759878 5693298   THA_493     FALSE NA 8180.000 0.000 NA   NA
 11475124 5693298   THA_493     FALSE NA 8222.000 0.000 NA   NA
 11617487 5693298   THA_493     FALSE NA 8222.000 0.000 NA   NA
 11759879 5693298   THA_493     FALSE NA 8222.000 0.000 NA   NA
 11475125 5693298   THA_493     FALSE NA 8252.000 0.000 NA   NA
 11617488 5693298   THA_493     FALSE NA 8252.000 0.000 NA   NA
 11759880 5693298   THA_493     FALSE NA 8252.000 0.000 NA   NA
 11475126 5693298   THA_493     FALSE NA 8291.000 0.000 NA   NA
 11617489 5693298   THA_493     FALSE NA 8291.000 0.000 NA   NA
 11759881 5693298   THA_493     FALSE NA 8291.000 0.000 NA   NA
 11475127 5693298   THA_493     FALSE NA 8321.000 0.000 NA   NA
 11617490 5693298   THA_493     FALSE NA 8321.000 0.000 NA   NA
 11759882 5693298   THA_493     FALSE NA 8321.000 0.000 NA   NA
 11475128 5693298   THA_493     FALSE NA 8364.000 0.000 NA   NA
 11617491 5693298   THA_493     FALSE NA 8364.000 0.000 NA   NA
 11759883 5693298   THA_493     FALSE NA 8364.000 0.000 NA   NA
 11475129 5693298   THA_493     FALSE NA 8394.000 0.000 NA   NA
 11617492 5693298   THA_493     FALSE NA 8394.000 0.000 NA   NA
 11759884 5693298   THA_493     FALSE NA 8394.000 0.000 NA   NA
 11475130 5693298   THA_493     FALSE NA 8432.000 0.000 NA   NA
 11617493 5693298   THA_493     FALSE NA 8432.000 0.000 NA   NA
 11759885 5693298   THA_493     FALSE NA 8432.000 0.000 NA   NA
 11475131 5693298   THA_493     FALSE NA 8462.000 0.000 NA   NA
 11617494 5693298   THA_493     FALSE NA 8462.000 0.000 NA   NA
 11759886 5693298   THA_493     FALSE NA 8462.000 0.000 NA   NA
 11475132 5693298   THA_493     FALSE NA 8507.000 0.000 NA   NA
 11617495 5693298   THA_493     FALSE NA 8507.000 0.000 NA   NA
 11759887 5693298   THA_493     FALSE NA 8507.000 0.000 NA   NA
 11475133 5693298   THA_493     FALSE NA 8537.000 0.000 NA   NA
 11617496 5693298   THA_493     FALSE NA 8537.000 0.000 NA   NA
 11759888 5693298   THA_493     FALSE NA 8537.000 0.000 NA   NA
 11475134 5693298   THA_493     FALSE NA 8581.000 0.000 NA   NA
 11617497 5693298   THA_493     FALSE NA 8581.000 0.000 NA   NA
 11759889 5693298   THA_493     FALSE NA 8581.000 0.000 NA   NA
 11475135 5693298   THA_493     FALSE NA 8611.000 0.000 NA   NA
 11617498 5693298   THA_493     FALSE NA 8611.000 0.000 NA   NA
 11759890 5693298   THA_493     FALSE NA 8611.000 0.000 NA   NA
 11475136 5693298   THA_493     FALSE NA 8648.000 0.000 NA   NA
 11617499 5693298   THA_493     FALSE NA 8648.000 0.000 NA   NA
 11759891 5693298   THA_493     FALSE NA 8648.000 0.000 NA   NA
 11475137 5693298   THA_493     FALSE NA 8678.000 0.000 NA   NA
 11617500 5693298   THA_493     FALSE NA 8678.000 0.000 NA   NA
 11759892 5693298   THA_493     FALSE NA 8678.000 0.000 NA   NA
 11475138 5693298   THA_493     FALSE NA 8717.000 0.000 NA   NA
 11617501 5693298   THA_493     FALSE NA 8717.000 0.000 NA   NA
 11759893 5693298   THA_493     FALSE NA 8717.000 0.000 NA   NA
 11475139 5693298   THA_493     FALSE NA 8747.000 0.000 NA   NA
 11617502 5693298   THA_493     FALSE NA 8747.000 0.000 NA   NA
 11759894 5693298   THA_493     FALSE NA 8747.000 0.000 NA   NA
 11475140 5693298   THA_493     FALSE NA 8789.000 0.000 NA   NA
 11617503 5693298   THA_493     FALSE NA 8789.000 0.000 NA   NA
 11759895 5693298   THA_493     FALSE NA 8789.000 0.000 NA   NA
 11475141 5693298   THA_493     FALSE NA 8819.000 0.000 NA   NA
 11617504 5693298   THA_493     FALSE NA 8819.000 0.000 NA   NA
 11759896 5693298   THA_493     FALSE NA 8819.000 0.000 NA   NA
 11475142 5693298   THA_493     FALSE NA 8858.000 0.000 NA   NA
 11617505 5693298   THA_493     FALSE NA 8858.000 0.000 NA   NA
 11759897 5693298   THA_493     FALSE NA 8858.000 0.000 NA   NA
 11475143 5693298   THA_493     FALSE NA 8888.000 0.000 NA   NA
 11617506 5693298   THA_493     FALSE NA 8888.000 0.000 NA   NA
 11759898 5693298   THA_493     FALSE NA 8888.000 0.000 NA   NA
 11475144 5693298   THA_493     FALSE NA 8930.000 0.000 NA   NA
 11617507 5693298   THA_493     FALSE NA 8930.000 0.000 NA   NA
 11759899 5693298   THA_493     FALSE NA 8930.000 0.000 NA   NA
 11475145 5693298   THA_493     FALSE NA 8960.000 0.000 NA   NA
 11617508 5693298   THA_493     FALSE NA 8960.000 0.000 NA   NA
 11759900 5693298   THA_493     FALSE NA 8960.000 0.000 NA   NA
 11475146 5693298   THA_493     FALSE NA 9002.000 0.000 NA   NA
 11617509 5693298   THA_493     FALSE NA 9002.000 0.000 NA   NA
 11759901 5693298   THA_493     FALSE NA 9002.000 0.000 NA   NA
 5693306 5693307 THA_501 THA_502     TRUE 0.619 74.000 0.054 1.000 N NA
 5693307 5693308 THA_502 THA_503     FALSE 0.226 57.000 0.000 1.000 N NA
 5693308 10253741 THA_503 THA_2011     TRUE 0.995 9.000 0.048 0.047 Y NA
 10253741 5693309 THA_2011 THA_504     FALSE 0.037 146.000 0.000 1.000   NA
 5693309 10253742 THA_504 THA_2012     TRUE 0.640 -10.000 0.000 1.000   NA
 10253742 5693310 THA_2012 THA_505     FALSE 0.099 74.000 0.000 NA   NA
 5693313 5693314 THA_508 THA_509     TRUE 0.790 -22.000 0.053 NA N NA
 5693314 5693315 THA_509 THA_510   pyrD TRUE 0.994 -3.000 0.592 NA N NA
 5693315 5693316 THA_510 THA_511 pyrD pyrF TRUE 0.999 -3.000 0.154 0.002 Y NA
 5693316 5693317 THA_511 THA_512 pyrF pyrE TRUE 0.987 -9.000 0.054 1.000 Y NA
 5693319 5693320 THA_514 THA_515     TRUE 0.877 29.000 0.009 1.000 N NA
 5693321 5693322 THA_516 THA_517     FALSE 0.026 169.000 0.000 NA N NA
 5693322 5693323 THA_517 THA_518     FALSE 0.195 56.000 0.000 NA N NA
 5693323 5693324 THA_518 THA_519     TRUE 0.999 14.000 0.500 0.002 Y NA
 5693324 5693325 THA_519 THA_520     TRUE 0.999 14.000 0.364 0.002 Y NA
 5693325 5693326 THA_520 THA_521     TRUE 0.997 -7.000 0.145 0.002 Y NA
 5693326 5693327 THA_521 THA_522     FALSE 0.227 180.000 0.044 1.000   NA
 5693327 5693328 THA_522 THA_523     TRUE 0.950 3.000 0.070 NA   NA
 5693328 5693329 THA_523 THA_524   sdaA1 FALSE 0.229 155.000 0.041 NA   NA
 5693329 5693330 THA_524 THA_525 sdaA1 sdaB TRUE 0.998 0.000 0.122 0.001 Y NA
 5693332 5693333 THA_527 THA_528     TRUE 0.593 5.000 0.000 NA   NA
 5693333 5693334 THA_528 THA_529     TRUE 0.980 -3.000 0.057 NA   NA
 5693334 5693335 THA_529 THA_530     TRUE 0.960 -7.000 0.038 NA   NA
 5693335 5693336 THA_530 THA_531     TRUE 0.979 -7.000 0.250 NA   NA
 5693336 5693337 THA_531 THA_532     TRUE 0.902 24.000 0.006 1.000   NA
 5693337 5693338 THA_532 THA_533   flgL TRUE 0.975 -3.000 0.010 1.000   NA
 5693338 5693339 THA_533 THA_534 flgL   TRUE 0.998 13.000 0.064 0.001 Y NA
 5693339 5693340 THA_534 THA_535     TRUE 0.995 18.000 0.333 0.002   NA
 5693340 5693341 THA_535 THA_536     TRUE 0.983 4.000 0.028 0.002   NA
 5693341 5693342 THA_536 THA_537     FALSE 0.079 97.000 0.000 1.000   NA
 5693342 5693343 THA_537 THA_538     FALSE 0.036 368.000 0.000 0.057 N NA
 5693343 5693344 THA_538 THA_539   trpS TRUE 0.957 5.000 0.062 1.000 N NA
 5693344 5693345 THA_539 THA_540 trpS   TRUE 0.971 0.000 0.024 1.000 N NA
 5693345 5693346 THA_540 THA_541   ispE TRUE 0.771 -19.000 0.004 1.000 N NA
 5693346 5693347 THA_541 THA_542 ispE   TRUE 0.569 -45.000 0.012 1.000   NA
 5693347 5693348 THA_542 THA_543     TRUE 0.946 4.000 0.061 NA   NA
 5693349 5693350 THA_544 THA_545     TRUE 0.926 2.000 0.006 NA   NA
 5693350 5693351 THA_545 THA_546   purA TRUE 0.726 16.000 0.000 NA   NA
 5693351 5693352 THA_546 THA_547 purA   TRUE 0.987 12.000 0.003 1.000 Y NA
 5693352 5693353 THA_547 THA_548     FALSE 0.063 108.000 0.000 1.000   NA
 5693353 5693354 THA_548 THA_549   acpP1 FALSE 0.052 124.000 0.000 1.000   NA
 5693355 5693356 THA_550 THA_551     FALSE 0.015 244.000 0.000 NA   NA
 5693356 5693357 THA_551 THA_552     TRUE 0.927 24.000 0.056 NA   NA
 10253743 5693358 THA_2013 THA_553     TRUE 0.989 9.000 0.135 0.047   NA
 5693358 5693359 THA_553 THA_554     TRUE 0.562 78.000 0.000 0.047 Y NA
 5693360 5693361 THA_555 THA_556     TRUE 0.981 -10.000 0.154 0.075 N NA
 5693361 5693362 THA_556 THA_557   hslO TRUE 0.969 -3.000 0.003 1.000 N NA
 5693362 5693363 THA_557 THA_558 hslO   TRUE 0.726 16.000 0.000 NA   NA
 5693364 5693365 THA_559 THA_560     TRUE 0.996 10.000 0.012 0.005 Y NA
 5693365 5693366 THA_560 THA_561     TRUE 0.593 5.000 0.000 NA   NA
 5693366 5693367 THA_561 THA_562     TRUE 0.467 26.000 0.000 NA   NA
 5693367 5693368 THA_562 THA_563     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5693368 5693369 THA_563 THA_564     TRUE 0.712 -22.000 0.010 NA   NA
 5693369 5693370 THA_564 THA_565   atpB TRUE 0.945 -16.000 0.330 1.000   NA
 5693370 5693371 THA_565 THA_566 atpB   TRUE 0.993 25.000 0.085 0.004 Y NA
 5693371 5693372 THA_566 THA_567   atpF TRUE 0.997 15.000 0.031 0.004 Y NA
 5693372 5693373 THA_567 THA_568 atpF atpH TRUE 0.999 -3.000 0.242 0.004 Y NA
 5693373 5693374 THA_568 THA_569 atpH atpA TRUE 0.999 5.000 0.864 0.004 Y NA
 5693374 5693375 THA_569 THA_570 atpA atpG TRUE 0.999 7.000 0.846 0.004 Y NA
 5693375 5693376 THA_570 THA_571 atpG atpD TRUE 0.998 23.000 0.724 0.004 Y NA
 5693376 5693377 THA_571 THA_572 atpD   TRUE 0.995 45.000 0.837 0.004 Y NA
 5693377 5693378 THA_572 THA_573     TRUE 0.911 5.000 0.006 NA   NA
 5693378 5693379 THA_573 THA_574     TRUE 0.975 4.000 0.333 NA   NA
 5693379 5693380 THA_574 THA_575     TRUE 0.957 12.000 0.006 NA   NA
 5693380 5693381 THA_575 THA_576     FALSE 0.062 100.000 0.000 NA N NA
 5693381 5693382 THA_576 THA_577   panD TRUE 0.933 2.000 0.004 1.000 N NA
 5693382 5693383 THA_577 THA_578 panD   TRUE 0.647 6.000 0.000 NA   NA
 5693383 5693384 THA_578 THA_579     TRUE 0.595 4.000 0.000 NA   NA
 5693384 5693385 THA_579 THA_580     TRUE 0.676 1.000 0.000 NA   NA
 5693385 5693386 THA_580 THA_581     TRUE 0.906 -12.000 0.008 1.000   NA
 5693386 5693387 THA_581 THA_582     FALSE 0.223 56.000 0.000 1.000   NA
 5693389 5693390 THA_584 THA_585     TRUE 0.644 19.000 0.000 NA   NA
 5693390 10253744 THA_585 THA_2014     TRUE 0.356 34.000 0.000 NA   NA
 10253744 10253745 THA_2014 THA_2015     FALSE 0.053 368.000 0.000 NA Y NA
 10253745 5693391 THA_2015 THA_586     FALSE 0.016 252.000 0.000 NA N NA
 5693391 5693392 THA_586 THA_587     TRUE 0.976 -3.000 0.018 NA   NA
 5693392 5693393 THA_587 THA_588   ribF FALSE 0.117 68.000 0.000 NA   NA
 5693393 5693394 THA_588 THA_589 ribF   TRUE 0.920 -10.000 0.005 1.000 N NA
 5693394 5693395 THA_589 THA_590     TRUE 0.973 -3.000 0.006 1.000 N NA
 5693395 5693396 THA_590 THA_591     TRUE 0.926 2.000 0.006 NA   NA
 5693396 5693397 THA_591 THA_592     TRUE 0.846 41.000 0.071 NA   NA
 5693398 10253746 THA_593 THA_2016     FALSE 0.026 155.000 0.000 NA   NA
 10253746 5693399 THA_2016 THA_594     FALSE 0.051 110.000 0.000 NA N NA
 10253747 5693400 THA_2017 THA_595     FALSE 0.010 415.000 0.000 NA   NA
 5693401 5693402 THA_596 THA_597     FALSE 0.051 389.000 0.000 0.004   NA
 5693403 5693404 THA_598 THA_599     FALSE 0.069 92.000 0.000 NA   NA
 5693404 5693405 THA_599 THA_600     TRUE 0.810 -22.000 0.097 NA   NA
 5693406 5693407 THA_601 THA_602     FALSE 0.054 101.000 0.000 NA   NA
 5693408 5693409 THA_603 THA_604     FALSE 0.010 380.000 0.000 NA   NA
 5693410 5693411 THA_605 THA_606     FALSE 0.046 265.000 0.000 0.047   NA
 5693411 5693412 THA_606 THA_607     FALSE 0.029 763.000 0.000 0.047   NA
 5693412 5693413 THA_607 THA_608     FALSE 0.021 181.000 0.000 NA   NA
 5693414 5693415 THA_609 THA_610     FALSE 0.166 57.000 0.000 NA   NA
 5693416 5693417 THA_611 THA_612     TRUE 0.622 139.000 0.093 1.000 Y NA
 5693417 5693418 THA_612 THA_613     TRUE 0.999 -3.000 0.364 0.007 Y NA
 5693418 5693419 THA_613 THA_614     TRUE 0.723 -6.000 0.000 NA   NA
 5693419 5693420 THA_614 THA_615     FALSE 0.018 209.000 0.000 NA   NA
 5693420 5693421 THA_615 THA_616     TRUE 0.999 11.000 1.000 0.028 Y NA
 5693421 5693422 THA_616 THA_617     TRUE 0.979 72.000 0.900 0.028 Y NA
 5693423 5693424 THA_618 THA_619     TRUE 0.978 8.000 0.200 NA   NA
 5693424 5693425 THA_619 THA_620     TRUE 0.723 -43.000 0.222 NA   NA
 5693426 5693427 THA_621 THA_622     FALSE 0.023 213.000 0.000 1.000   NA
 5693427 5693428 THA_622 THA_623     FALSE 0.038 143.000 0.000 1.000   NA
 5693428 5693429 THA_623 THA_624   folA FALSE 0.086 97.000 0.000 1.000 N NA
 5693430 5693431 THA_625 THA_626     FALSE 0.133 71.000 0.000 1.000   NA
 5693431 5693432 THA_626 THA_627     FALSE 0.082 83.000 0.000 NA   NA
 5693432 5693433 THA_627 THA_628     TRUE 0.647 6.000 0.000 NA   NA
 5693433 5693434 THA_628 THA_629     TRUE 0.784 13.000 0.000 NA   NA
 5693435 5693436 THA_630 THA_631 rplA rplK TRUE 0.997 26.000 0.838 0.021 Y NA
 5693436 5693437 THA_631 THA_632 rplK nusG TRUE 0.907 58.000 0.681 1.000 N NA
 5693437 5693438 THA_632 THA_633 nusG secE TRUE 0.992 18.000 0.843 1.000 N NA
 5693438 5693439 THA_633 THA_634 secE   TRUE 0.467 26.000 0.000 NA   NA
 5693439 5693440 THA_634 THA_635     FALSE 0.021 182.000 0.000 NA   NA
 5693440 5693441 THA_635 THA_636     TRUE 0.724 10.000 0.000 NA   NA
 5693441 5693442 THA_636 THA_637   rpsR TRUE 0.313 40.000 0.000 NA   NA
 5693442 5693443 THA_637 THA_638 rpsR   TRUE 0.897 25.000 0.008 1.000   NA
 5693443 5693444 THA_638 THA_639   rpsF FALSE 0.172 186.000 0.011 1.000   NA
 5693444 5693445 THA_639 THA_640 rpsF   FALSE 0.076 87.000 0.000 NA   NA
 5693445 5693446 THA_640 THA_641     TRUE 0.724 10.000 0.000 NA   NA
 5693447 5693448 THA_642 THA_643     TRUE 0.969 -3.000 0.008 NA   NA
 5693448 5693449 THA_643 THA_644   glyQ TRUE 0.937 16.000 0.003 NA   NA
 5693449 5693450 THA_644 THA_645 glyQ glyS TRUE 0.999 0.000 0.651 0.001 Y NA
 5693450 5693451 THA_645 THA_646 glyS   FALSE 0.273 106.000 0.003 1.000 N NA
 5693451 5693452 THA_646 THA_647   hflK TRUE 0.570 64.000 0.005 1.000 N NA
 5693452 5693453 THA_647 THA_648 hflK hflC TRUE 1.000 -3.000 0.947 0.008 Y NA
 5693453 5693454 THA_648 THA_649 hflC   FALSE 0.252 55.000 0.000 1.000 N NA
 5693455 5693456 THA_650 THA_651   clpX TRUE 0.995 1.000 0.011 0.006 Y NA
 5693458 5693459 THA_653 THA_654     TRUE 0.595 4.000 0.000 NA   NA
 5693459 5693460 THA_654 THA_655     TRUE 0.739 -25.000 0.068 NA   NA
 5693460 5693461 THA_655 THA_656     FALSE 0.010 376.000 0.000 NA   NA
 5693461 5693462 THA_656 THA_657     FALSE 0.044 112.000 0.000 NA   NA
 5693463 5693464 THA_658 THA_659     FALSE 0.046 130.000 0.000 1.000   NA
 5693464 5693465 THA_659 THA_660   gidA1 TRUE 0.996 -3.000 0.238 0.017   NA
 5693465 5693466 THA_660 THA_661 gidA1   TRUE 0.979 -7.000 0.259 NA   NA
 5693466 5693467 THA_661 THA_662   glpK TRUE 0.845 26.000 0.004 NA   NA
 5693467 5693468 THA_662 THA_663 glpK   TRUE 0.961 0.000 0.010 1.000 N NA
 5693468 5693469 THA_663 THA_664     FALSE 0.028 145.000 0.000 NA   NA
 5693469 5693470 THA_664 THA_665     FALSE 0.140 63.000 0.000 NA   NA
 5693470 5693471 THA_665 THA_666     TRUE 0.482 57.000 0.000 0.008   NA
 5693471 5693472 THA_666 THA_667     FALSE 0.016 232.000 0.000 NA   NA
 5693472 5693473 THA_667 THA_668     FALSE 0.276 43.000 0.000 NA   NA
 5693473 5693474 THA_668 THA_669     FALSE 0.009 1010.000 0.000 NA   NA
 5693474 5693475 THA_669 THA_670     TRUE 0.987 1.000 0.015 1.000 Y NA
 5693475 5693476 THA_670 THA_671     TRUE 0.994 -3.000 0.029 1.000 Y NA
 5693476 5693477 THA_671 THA_672     TRUE 0.998 13.000 0.847 NA Y NA
 5693477 5693478 THA_672 THA_673     FALSE 0.182 57.000 0.000 NA N NA
 5693478 5693479 THA_673 THA_674   rbsK TRUE 0.985 -3.000 0.071 1.000 N NA
 5693480 5693481 THA_675 THA_676     TRUE 0.955 18.000 0.010 1.000 N NA
 5693481 5693482 THA_676 THA_677   nrdD TRUE 0.966 2.000 0.071 1.000 N NA
 5693483 5693484 THA_678 THA_679     FALSE 0.013 315.000 0.000 NA   NA
 5693484 5693485 THA_679 THA_680     FALSE 0.020 188.000 0.000 NA   NA
 5693485 5693486 THA_680 THA_681     FALSE 0.026 154.000 0.000 NA   NA
 5693486 5693487 THA_681 THA_682     TRUE 0.994 -10.000 0.465 1.000 Y NA
 5693488 5693489 THA_683 THA_684     TRUE 0.864 44.000 0.167 NA   NA
 5693490 5693491 THA_685 THA_686 iadA   TRUE 0.971 0.000 0.025 1.000 N NA
 5693491 5693492 THA_686 THA_687     TRUE 0.647 92.000 0.222 1.000 N NA
 5693492 5693493 THA_687 THA_688     TRUE 0.965 63.000 0.750 1.000 Y NA
 5693493 5693494 THA_688 THA_689     TRUE 0.998 0.000 0.500 0.028 Y NA
 5693494 5693495 THA_689 THA_690     TRUE 0.483 88.000 0.016 1.000   NA
 5693495 5693496 THA_690 THA_691     FALSE 0.052 103.000 0.000 NA   NA
 5693497 5693498 THA_692 THA_693     FALSE 0.031 137.000 0.000 NA   NA
 5693498 5693499 THA_693 THA_694   nqrF TRUE 0.992 14.000 0.625 NA   NA
 5693499 5693500 THA_694 THA_695 nqrF   TRUE 0.999 11.000 0.875 0.029 Y NA
 5693500 5693501 THA_695 THA_696   nqrD TRUE 0.997 -3.000 0.067 0.029 Y NA
 5693501 5693502 THA_696 THA_697 nqrD   TRUE 0.993 2.000 0.058 0.056 Y NA
 5693502 5693503 THA_697 THA_698     TRUE 0.997 -3.000 0.250 1.000 Y NA
 5693503 5693504 THA_698 THA_699     FALSE 0.260 79.000 0.000 0.029   NA
 5693505 5693506 THA_700 THA_701   msrA TRUE 0.361 -16.000 0.000 NA   NA
 5693506 5693507 THA_701 THA_702 msrA   TRUE 0.748 16.000 0.000 NA N NA
 5693507 5693508 THA_702 THA_703     TRUE 0.678 -7.000 0.000 NA   NA
 5693508 5693509 THA_703 THA_704     TRUE 0.455 -13.000 0.000 NA   NA
 5693509 5693510 THA_704 THA_705     TRUE 0.953 1.000 0.017 NA   NA
 5693510 5693511 THA_705 THA_706     TRUE 0.983 -48.000 1.000 0.017 Y NA
 5693511 5693512 THA_706 THA_707     TRUE 0.999 5.000 1.000 0.017 Y NA
 5693512 5693513 THA_707 THA_708     TRUE 0.700 1.000 0.000 NA N NA
 5693513 5693514 THA_708 THA_709     TRUE 0.573 -10.000 0.000 NA   NA
 5693516 5693517 THA_711 THA_712     TRUE 0.395 77.000 0.000 1.000 Y NA
 5693517 5693518 THA_712 THA_713     FALSE 0.082 83.000 0.000 NA   NA
 5693520 5693521 THA_715 THA_716 rluB galE TRUE 0.947 1.000 0.005 1.000 N NA
 5693521 5693522 THA_716 THA_717 galE   TRUE 0.977 11.000 0.062 1.000 N NA
 5693522 5693523 THA_717 THA_718     TRUE 0.998 -3.000 0.016 0.002 Y NA
 5693523 5693524 THA_718 THA_719     FALSE 0.263 111.000 0.008 NA   NA
 5693524 5693525 THA_719 THA_720     TRUE 0.519 24.000 0.000 NA   NA
 5693525 10253748 THA_720 THA_2018     TRUE 0.567 22.000 0.000 NA   NA
 10253748 5693526 THA_2018 THA_721     FALSE 0.231 50.000 0.000 NA   NA
 5693527 5693528 THA_722 THA_723   aroK TRUE 0.294 136.000 0.020 1.000 N NA
 5693528 5693529 THA_723 THA_724 aroK   TRUE 0.952 12.000 0.004 NA   NA
 5693530 5693531 THA_725 THA_726     TRUE 0.996 -7.000 0.467 1.000 Y NA
 5693531 5693532 THA_726 THA_727     TRUE 0.976 -13.000 0.069 1.000 Y NA
 5693532 5693533 THA_727 THA_728     TRUE 0.987 -13.000 0.088 0.073 Y NA
 5693533 5693534 THA_728 THA_729     FALSE 0.197 54.000 0.000 NA   NA
 5693534 5693535 THA_729 THA_730     FALSE 0.010 502.000 0.000 NA   NA
 5693535 5693536 THA_730 THA_731     TRUE 0.933 13.000 0.000 0.029 N NA
 5693536 10253749 THA_731 THA_2019     FALSE 0.092 91.000 0.000 1.000   NA
 10253749 5693537 THA_2019 THA_732     FALSE 0.014 360.000 0.000 1.000   NA
 5693537 5693538 THA_732 THA_733     FALSE 0.086 97.000 0.000 1.000 N NA
 5693538 5693539 THA_733 THA_734     TRUE 0.567 22.000 0.000 NA   NA
 5693541 5693542 THA_736 THA_737 purF purN TRUE 0.843 -36.000 0.013 1.000 Y NA
 5693542 5693543 THA_737 THA_738 purN   TRUE 0.963 24.000 0.225 1.000   NA
 5693543 5693544 THA_738 THA_739   purD TRUE 0.985 10.000 0.238 1.000   NA
 5693544 5693545 THA_739 THA_740 purD purM TRUE 0.994 -3.000 0.027 1.000 Y NA
 5693545 5693546 THA_740 THA_741 purM   FALSE 0.022 178.000 0.000 NA   NA
 11475193 5693545   THA_740   purM FALSE NA 290.000 0.000 NA   NA
 11617556 5693545   THA_740   purM FALSE NA 290.000 0.000 NA   NA
 11759948 5693545   THA_740   purM FALSE NA 290.000 0.000 NA   NA
 11475194 5693545   THA_740   purM FALSE NA 320.000 0.000 NA   NA
 11617557 5693545   THA_740   purM FALSE NA 320.000 0.000 NA   NA
 11759949 5693545   THA_740   purM FALSE NA 320.000 0.000 NA   NA
 11475195 5693545   THA_740   purM FALSE NA 357.000 0.000 NA   NA
 11617558 5693545   THA_740   purM FALSE NA 357.000 0.000 NA   NA
 11759950 5693545   THA_740   purM FALSE NA 357.000 0.000 NA   NA
 11475196 5693545   THA_740   purM FALSE NA 387.000 0.000 NA   NA
 11617559 5693545   THA_740   purM FALSE NA 387.000 0.000 NA   NA
 11759951 5693545   THA_740   purM FALSE NA 387.000 0.000 NA   NA
 11475197 5693545   THA_740   purM FALSE NA 432.000 0.000 NA   NA
 11617560 5693545   THA_740   purM FALSE NA 432.000 0.000 NA   NA
 11759952 5693545   THA_740   purM FALSE NA 432.000 0.000 NA   NA
 11475198 5693545   THA_740   purM FALSE NA 462.000 0.000 NA   NA
 11617561 5693545   THA_740   purM FALSE NA 462.000 0.000 NA   NA
 11759953 5693545   THA_740   purM FALSE NA 462.000 0.000 NA   NA
 11475199 5693545   THA_740   purM FALSE NA 497.000 0.000 NA   NA
 11617562 5693545   THA_740   purM FALSE NA 497.000 0.000 NA   NA
 11759954 5693545   THA_740   purM FALSE NA 497.000 0.000 NA   NA
 11475200 5693545   THA_740   purM FALSE NA 527.000 0.000 NA   NA
 11617563 5693545   THA_740   purM FALSE NA 527.000 0.000 NA   NA
 11759955 5693545   THA_740   purM FALSE NA 527.000 0.000 NA   NA
 11475201 5693545   THA_740   purM FALSE NA 571.000 0.000 NA   NA
 11617564 5693545   THA_740   purM FALSE NA 571.000 0.000 NA   NA
 11759956 5693545   THA_740   purM FALSE NA 571.000 0.000 NA   NA
 11475202 5693545   THA_740   purM FALSE NA 601.000 0.000 NA   NA
 11617565 5693545   THA_740   purM FALSE NA 601.000 0.000 NA   NA
 11759957 5693545   THA_740   purM FALSE NA 601.000 0.000 NA   NA
 11475203 5693545   THA_740   purM FALSE NA 642.000 0.000 NA   NA
 11617566 5693545   THA_740   purM FALSE NA 642.000 0.000 NA   NA
 11759958 5693545   THA_740   purM FALSE NA 642.000 0.000 NA   NA
 11475204 5693545   THA_740   purM FALSE NA 672.000 0.000 NA   NA
 11617567 5693545   THA_740   purM FALSE NA 672.000 0.000 NA   NA
 11759959 5693545   THA_740   purM FALSE NA 672.000 0.000 NA   NA
 11475205 5693545   THA_740   purM FALSE NA 711.000 0.000 NA   NA
 11617568 5693545   THA_740   purM FALSE NA 711.000 0.000 NA   NA
 11759960 5693545   THA_740   purM FALSE NA 711.000 0.000 NA   NA
 11475206 5693545   THA_740   purM FALSE NA 741.000 0.000 NA   NA
 11617569 5693545   THA_740   purM FALSE NA 741.000 0.000 NA   NA
 11759961 5693545   THA_740   purM FALSE NA 741.000 0.000 NA   NA
 11475207 5693545   THA_740   purM FALSE NA 780.000 0.000 NA   NA
 11617570 5693545   THA_740   purM FALSE NA 780.000 0.000 NA   NA
 11759962 5693545   THA_740   purM FALSE NA 780.000 0.000 NA   NA
 11475208 5693545   THA_740   purM FALSE NA 810.000 0.000 NA   NA
 11617571 5693545   THA_740   purM FALSE NA 810.000 0.000 NA   NA
 11759963 5693545   THA_740   purM FALSE NA 810.000 0.000 NA   NA
 11475209 5693545   THA_740   purM FALSE NA 855.000 0.000 NA   NA
 11617572 5693545   THA_740   purM FALSE NA 855.000 0.000 NA   NA
 11759964 5693545   THA_740   purM FALSE NA 855.000 0.000 NA   NA
 11475210 5693545   THA_740   purM FALSE NA 885.000 0.000 NA   NA
 11617573 5693545   THA_740   purM FALSE NA 885.000 0.000 NA   NA
 11759965 5693545   THA_740   purM FALSE NA 885.000 0.000 NA   NA
 11475211 5693545   THA_740   purM FALSE NA 932.000 0.000 NA   NA
 11617574 5693545   THA_740   purM FALSE NA 932.000 0.000 NA   NA
 11759966 5693545   THA_740   purM FALSE NA 932.000 0.000 NA   NA
 11475212 5693545   THA_740   purM FALSE NA 962.000 0.000 NA   NA
 11617575 5693545   THA_740   purM FALSE NA 962.000 0.000 NA   NA
 11759967 5693545   THA_740   purM FALSE NA 962.000 0.000 NA   NA
 11475213 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1001.000 0.000 NA   NA
 11617576 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1001.000 0.000 NA   NA
 11759968 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1001.000 0.000 NA   NA
 11475214 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1031.000 0.000 NA   NA
 11617577 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1031.000 0.000 NA   NA
 11759969 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1031.000 0.000 NA   NA
 11475215 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1075.000 0.000 NA   NA
 11617578 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1075.000 0.000 NA   NA
 11759970 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1075.000 0.000 NA   NA
 11475216 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1105.000 0.000 NA   NA
 11617579 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1105.000 0.000 NA   NA
 11759971 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1105.000 0.000 NA   NA
 11475217 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1148.000 0.000 NA   NA
 11617580 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1148.000 0.000 NA   NA
 11759972 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1148.000 0.000 NA   NA
 11475218 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1178.000 0.000 NA   NA
 11617581 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1178.000 0.000 NA   NA
 11759973 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1178.000 0.000 NA   NA
 11475219 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1212.000 0.000 NA   NA
 11617582 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1212.000 0.000 NA   NA
 11759974 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1212.000 0.000 NA   NA
 11475220 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1242.000 0.000 NA   NA
 11617583 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1242.000 0.000 NA   NA
 11759975 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1242.000 0.000 NA   NA
 11475221 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1279.000 0.000 NA   NA
 11617584 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1279.000 0.000 NA   NA
 11759976 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1279.000 0.000 NA   NA
 11475222 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1309.000 0.000 NA   NA
 11617585 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1309.000 0.000 NA   NA
 11759977 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1309.000 0.000 NA   NA
 11475223 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1352.000 0.000 NA   NA
 11617586 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1352.000 0.000 NA   NA
 11759978 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1352.000 0.000 NA   NA
 11475224 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1382.000 0.000 NA   NA
 11617587 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1382.000 0.000 NA   NA
 11759979 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1382.000 0.000 NA   NA
 11475225 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1424.000 0.000 NA   NA
 11617588 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1424.000 0.000 NA   NA
 11759980 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1424.000 0.000 NA   NA
 11475226 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1454.000 0.000 NA   NA
 11617589 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1454.000 0.000 NA   NA
 11759981 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1454.000 0.000 NA   NA
 11475227 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1492.000 0.000 NA   NA
 11617590 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1492.000 0.000 NA   NA
 11759982 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1492.000 0.000 NA   NA
 11475228 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1522.000 0.000 NA   NA
 11617591 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1522.000 0.000 NA   NA
 11759983 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1522.000 0.000 NA   NA
 11475229 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1559.000 0.000 NA   NA
 11617592 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1559.000 0.000 NA   NA
 11759984 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1559.000 0.000 NA   NA
 11475230 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1589.000 0.000 NA   NA
 11617593 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1589.000 0.000 NA   NA
 11759985 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1589.000 0.000 NA   NA
 11475231 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1633.000 0.000 NA   NA
 11617594 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1633.000 0.000 NA   NA
 11759986 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1633.000 0.000 NA   NA
 11475232 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1663.000 0.000 NA   NA
 11617595 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1663.000 0.000 NA   NA
 11759987 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1663.000 0.000 NA   NA
 11475233 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1702.000 0.000 NA   NA
 11617596 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1702.000 0.000 NA   NA
 11759988 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1702.000 0.000 NA   NA
 11475234 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1732.000 0.000 NA   NA
 11617597 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1732.000 0.000 NA   NA
 11759989 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1732.000 0.000 NA   NA
 11475235 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1773.000 0.000 NA   NA
 11617598 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1773.000 0.000 NA   NA
 11759990 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1773.000 0.000 NA   NA
 11475236 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1803.000 0.000 NA   NA
 11617599 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1803.000 0.000 NA   NA
 11759991 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1803.000 0.000 NA   NA
 11475237 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1840.000 0.000 NA   NA
 11617600 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1840.000 0.000 NA   NA
 11759992 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1840.000 0.000 NA   NA
 11475238 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1870.000 0.000 NA   NA
 11617601 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1870.000 0.000 NA   NA
 11759993 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1870.000 0.000 NA   NA
 11475239 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1908.000 0.000 NA   NA
 11617602 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1908.000 0.000 NA   NA
 11759994 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1908.000 0.000 NA   NA
 11475240 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1938.000 0.000 NA   NA
 11617603 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1938.000 0.000 NA   NA
 11759995 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1938.000 0.000 NA   NA
 11475241 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1982.000 0.000 NA   NA
 11617604 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1982.000 0.000 NA   NA
 11759996 5693545   THA_740   purM FALSE NA 1982.000 0.000 NA   NA
 11475242 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2012.000 0.000 NA   NA
 11617605 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2012.000 0.000 NA   NA
 11759997 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2012.000 0.000 NA   NA
 11475243 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2056.000 0.000 NA   NA
 11617606 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2056.000 0.000 NA   NA
 11759998 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2056.000 0.000 NA   NA
 11475244 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2086.000 0.000 NA   NA
 11617607 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2086.000 0.000 NA   NA
 11759999 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2086.000 0.000 NA   NA
 11475245 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2123.000 0.000 NA   NA
 11617608 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2123.000 0.000 NA   NA
 11760000 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2123.000 0.000 NA   NA
 11475246 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2153.000 0.000 NA   NA
 11617609 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2153.000 0.000 NA   NA
 11760001 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2153.000 0.000 NA   NA
 11475247 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2191.000 0.000 NA   NA
 11617610 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2191.000 0.000 NA   NA
 11760002 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2191.000 0.000 NA   NA
 11475248 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2221.000 0.000 NA   NA
 11617611 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2221.000 0.000 NA   NA
 11760003 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2221.000 0.000 NA   NA
 11475249 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2263.000 0.000 NA   NA
 11617612 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2263.000 0.000 NA   NA
 11760004 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2263.000 0.000 NA   NA
 11475250 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2293.000 0.000 NA   NA
 11617613 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2293.000 0.000 NA   NA
 11760005 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2293.000 0.000 NA   NA
 11475251 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2335.000 0.000 NA   NA
 11617614 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2335.000 0.000 NA   NA
 11760006 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2335.000 0.000 NA   NA
 11475252 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2365.000 0.000 NA   NA
 11617615 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2365.000 0.000 NA   NA
 11760007 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2365.000 0.000 NA   NA
 11475253 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2408.000 0.000 NA   NA
 11617616 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2408.000 0.000 NA   NA
 11760008 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2408.000 0.000 NA   NA
 11475254 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2438.000 0.000 NA   NA
 11617617 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2438.000 0.000 NA   NA
 11760009 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2438.000 0.000 NA   NA
 11475255 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2476.000 0.000 NA   NA
 11617618 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2476.000 0.000 NA   NA
 11760010 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2476.000 0.000 NA   NA
 11475256 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2506.000 0.000 NA   NA
 11617619 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2506.000 0.000 NA   NA
 11760011 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2506.000 0.000 NA   NA
 11475257 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2552.000 0.000 NA   NA
 11617620 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2552.000 0.000 NA   NA
 11760012 5693545   THA_740   purM FALSE NA 2552.000 0.000 NA   NA
 5693547 5693548 THA_742 THA_743     TRUE 0.483 29.000 0.000 1.000   NA
 5693548 5693549 THA_743 THA_744     TRUE 0.350 35.000 0.000 NA   NA
 5693549 5693550 THA_744 THA_745     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5693550 5693551 THA_745 THA_746     TRUE 0.688 7.000 0.000 NA   NA
 5693551 10253750 THA_746 THA_2020     FALSE 0.042 134.000 0.000 1.000   NA
 10253750 5693552 THA_2020 THA_747     TRUE 0.317 39.000 0.000 NA   NA
 5693552 5693553 THA_747 THA_748     TRUE 0.604 3.000 0.000 NA   NA
 5693553 5693554 THA_748 THA_749     FALSE 0.155 58.000 0.000 NA   NA
 5693554 5693555 THA_749 THA_750     FALSE 0.008 1307.000 0.000 NA   NA
 5693555 5693556 THA_750 THA_751     FALSE 0.010 432.000 0.000 NA   NA
 5693556 5693557 THA_751 THA_752     TRUE 0.944 -13.000 0.227 NA   NA
 5693557 5693558 THA_752 THA_753     TRUE 0.550 -13.000 0.000 1.000 N NA
 5693558 5693559 THA_753 THA_754     TRUE 0.904 -25.000 0.667 NA   NA
 5693559 5693560 THA_754 THA_755     TRUE 0.960 -7.000 0.040 NA   NA
 5693561 5693562 THA_756 THA_757     FALSE 0.166 57.000 0.000 NA   NA
 5693562 5693563 THA_757 THA_758   nadD TRUE 0.531 -49.000 0.009 1.000   NA
 5693563 5693564 THA_758 THA_759 nadD nifR TRUE 0.930 -10.000 0.008 1.000 N NA
 5693564 5693565 THA_759 THA_760 nifR   TRUE 0.388 74.000 0.002 1.000   NA
 5693565 5693566 THA_760 THA_761     TRUE 0.978 14.000 0.028 1.000   NA
 5693566 5693567 THA_761 THA_762     TRUE 0.800 52.000 0.053 1.000 N NA
 5693567 5693568 THA_762 THA_763     TRUE 0.955 6.000 0.054 NA   NA
 5693568 5693569 THA_763 THA_764     TRUE 0.292 -19.000 0.000 NA   NA
 5693569 5693570 THA_764 THA_765     TRUE 0.661 4.000 0.000 1.000   NA
 5693570 5693571 THA_765 THA_766     TRUE 0.641 2.000 0.000 NA   NA
 5693571 5693572 THA_766 THA_767     FALSE 0.016 231.000 0.000 NA   NA
 5693573 10253751 THA_768 THA_2021     TRUE 0.995 9.000 0.048 0.042 Y NA
 5693574 5693575 THA_769 THA_770     TRUE 0.644 19.000 0.000 NA   NA
 5693575 5693576 THA_770 THA_771     TRUE 0.999 0.000 0.933 0.025 Y NA
 5693576 5693577 THA_771 THA_772     TRUE 0.995 23.000 0.700 1.000 Y NA
 5693577 5693578 THA_772 THA_773     TRUE 0.999 -7.000 0.900 0.004 Y NA
 5693578 5693579 THA_773 THA_774     TRUE 0.647 20.000 0.000 NA N NA
 5693579 5693580 THA_774 THA_775     TRUE 0.847 24.000 0.000 NA Y NA
 5693580 5693581 THA_775 THA_776     TRUE 0.988 20.000 0.667 1.000 N NA
 5693581 5693582 THA_776 THA_777     FALSE 0.269 44.000 0.000 NA   NA
 5693582 5693583 THA_777 THA_778     FALSE 0.069 92.000 0.000 NA   NA
 5693584 5693585 THA_779 THA_780     TRUE 0.963 17.000 0.036 NA   NA
 5693585 5693586 THA_780 THA_781     TRUE 0.940 -10.000 0.054 NA   NA
 5693587 5693588 THA_782 THA_783     TRUE 0.703 2.000 0.000 1.000   NA
 5693588 5693589 THA_783 THA_784     TRUE 0.967 -13.000 0.419 1.000   NA
 5693589 5693590 THA_784 THA_785     TRUE 0.978 12.000 0.051 1.000   NA
 5693590 5693591 THA_785 THA_786     TRUE 0.998 2.000 0.576 0.006 Y NA
 5693591 5693592 THA_786 THA_787     TRUE 0.997 16.000 0.733 0.006   NA
 5693592 5693593 THA_787 THA_788     TRUE 0.873 -22.000 0.217 1.000   NA
 5693594 10253752 THA_789 THA_2022     TRUE 0.573 -10.000 0.000 NA   NA
 10253752 5693595 THA_2022 THA_790     FALSE 0.083 99.000 0.000 1.000 N NA
 5693595 5693596 THA_790 THA_791     TRUE 0.953 -7.000 0.015 NA   NA
 5693596 5693597 THA_791 THA_792     TRUE 0.979 -3.000 0.046 NA   NA
 5693597 5693598 THA_792 THA_793     TRUE 0.968 13.000 0.004 1.000 N NA
 5693598 5693599 THA_793 THA_794     TRUE 0.967 0.000 0.046 NA N NA
 5693599 5693600 THA_794 THA_795     TRUE 0.831 -15.000 0.007 NA   NA
 5693600 5693601 THA_795 THA_796   pyrH TRUE 0.935 1.000 0.003 1.000   NA
 5693601 5693602 THA_796 THA_797 pyrH   TRUE 0.622 4.000 0.000 NA N NA
 5693602 5693603 THA_797 THA_798     TRUE 0.723 -6.000 0.000 NA   NA
 5693603 5693604 THA_798 THA_799     TRUE 0.985 16.000 0.300 NA   NA
 5693604 5693605 THA_799 THA_800     TRUE 0.993 0.000 0.800 1.000 N NA
 5693605 5693606 THA_800 THA_801   fliG TRUE 0.968 12.000 0.007 1.000 N NA
 5693606 5693607 THA_801 THA_802 fliG fliF TRUE 0.998 5.000 0.477 0.005 Y NA
 5693607 5693608 THA_802 THA_803 fliF   TRUE 0.955 11.000 0.008 NA   NA
 5693609 5693610 THA_804 THA_805   rpmF TRUE 0.970 26.000 0.599 NA   NA
 5693610 5693611 THA_805 THA_806 rpmF plsX TRUE 0.983 3.000 0.418 1.000 N NA
 5693611 5693612 THA_806 THA_807 plsX glmS TRUE 0.922 -12.000 0.013 1.000 N NA
 5693613 5693614 THA_808 THA_809     TRUE 0.993 13.000 0.059 0.004   NA
 5693614 5693615 THA_809 THA_810   flgG FALSE 0.019 261.000 0.000 1.000   NA
 5693615 5693616 THA_810 THA_811 flgG   TRUE 0.998 13.000 0.148 0.004 Y NA
 5693616 5693617 THA_811 THA_812   mreB TRUE 0.979 20.000 0.257 1.000 N NA
 5693617 5693618 THA_812 THA_813 mreB   TRUE 0.455 -13.000 0.000 NA   NA
 5693618 5693619 THA_813 THA_814     FALSE 0.015 251.000 0.000 NA   NA
 5693620 5693621 THA_815 THA_816     TRUE 0.641 2.000 0.000 NA   NA
 10253753 5693623 THA_2023 THA_818     TRUE 0.995 9.000 0.048 0.041 Y NA
 5693623 5693624 THA_818 THA_819     FALSE 0.009 573.000 0.000 NA   NA
 5693624 5693625 THA_819 THA_820     FALSE 0.018 210.000 0.000 NA   NA
 5693625 5693626 THA_820 THA_821     FALSE 0.021 182.000 0.000 NA   NA
 5693626 5693627 THA_821 THA_822     TRUE 0.911 -16.000 0.133 1.000   NA
 5693627 5693628 THA_822 THA_823     FALSE 0.111 69.000 0.000 NA   NA
 5693628 5693629 THA_823 THA_824     FALSE 0.009 571.000 0.000 NA   NA
 5693631 5693632 THA_826 THA_827 dnaB1 coaD1 TRUE 0.782 0.000 0.000 1.000 N NA
 5693632 5693633 THA_827 THA_828 coaD1   TRUE 0.647 6.000 0.000 NA   NA
 5693633 5693634 THA_828 THA_829     TRUE 0.773 14.000 0.000 NA   NA
 5693635 5693636 THA_830 THA_831     TRUE 0.709 0.000 0.000 NA   NA
 5693638 5693639 THA_833 THA_834 ileS   TRUE 0.359 97.000 0.005 1.000 N NA
 5693639 5693640 THA_834 THA_835   pulA TRUE 0.880 49.000 0.200 1.000 N NA
 5693640 5693641 THA_835 THA_836 pulA   TRUE 0.997 17.000 0.054 0.004 Y NA
 5693641 5693642 THA_836 THA_837     TRUE 0.627 72.000 0.054 1.000 N NA
 5693642 5693643 THA_837 THA_838     TRUE 0.964 1.000 0.080 NA   NA
 5693643 5693644 THA_838 THA_839     TRUE 0.726 16.000 0.000 NA   NA
 5693644 5693645 THA_839 THA_840     TRUE 0.764 12.000 0.000 NA   NA
 5693647 5693648 THA_842 THA_843     TRUE 0.994 -3.000 0.533 1.000 N NA
 5693649 5693650 THA_844 THA_845     TRUE 0.979 46.000 0.178 0.025 Y NA
 5693650 5693651 THA_845 THA_846     TRUE 0.999 15.000 0.723 0.025 Y NA
 5693651 5693652 THA_846 THA_847     TRUE 0.682 5.000 0.000 1.000 N NA
 5693653 5693654 THA_848 THA_849     TRUE 0.991 15.000 0.600 NA   NA
 5693654 5693655 THA_849 THA_850     TRUE 0.888 52.000 0.400 NA   NA
 5693655 5693656 THA_850 THA_851     TRUE 0.992 -6.000 0.750 NA   NA
 5693656 10253754 THA_851 THA_2024     FALSE 0.011 358.000 0.000 NA   NA
 10253754 5693657 THA_2024 THA_852     FALSE 0.090 79.000 0.000 NA   NA
 5693659 5693660 THA_854 THA_855     TRUE 0.985 2.000 0.556 NA   NA
 5693660 5693661 THA_855 THA_856     TRUE 0.968 -13.000 0.556 NA   NA
 5693661 5693662 THA_856 THA_857     TRUE 0.988 15.000 0.357 NA   NA
 5693662 5693663 THA_857 THA_858     TRUE 0.981 7.000 0.286 NA   NA
 5693663 5693664 THA_858 THA_859     TRUE 0.917 -22.000 0.571 NA   NA
 5693664 5693665 THA_859 THA_860     FALSE 0.009 678.000 0.000 NA   NA
 5693667 5693668 THA_862 THA_863     FALSE 0.014 263.000 0.000 NA   NA
 5693668 5693669 THA_863 THA_864     TRUE 0.904 6.000 0.000 NA Y NA
 5693669 5693670 THA_864 THA_865     TRUE 0.784 13.000 0.000 NA   NA
 5693670 5693671 THA_865 THA_866     TRUE 0.728 18.000 0.000 1.000   NA
 5693671 5693672 THA_866 THA_867   rfbB FALSE 0.208 57.000 0.000 1.000   NA
 5693672 5693673 THA_867 THA_868 rfbB   TRUE 0.659 5.000 0.000 1.000   NA
 5693673 5693674 THA_868 THA_869     TRUE 0.965 5.000 0.144 1.000   NA
 5693674 5693675 THA_869 THA_870   rfbA TRUE 0.994 -3.000 0.034 1.000 Y NA
 5693675 5693676 THA_870 THA_871 rfbA   TRUE 0.764 0.000 0.000 1.000   NA
 5693676 5693677 THA_871 THA_872     FALSE 0.275 51.000 0.000 1.000   NA
 5693677 5693678 THA_872 THA_873     TRUE 0.990 26.000 0.143 0.047 Y NA
 5693678 5693679 THA_873 THA_874     FALSE 0.036 152.000 0.000 1.000   NA
 5693679 5693680 THA_874 THA_875     FALSE 0.083 82.000 0.000 NA   NA
 5693680 5693681 THA_875 THA_876     TRUE 0.519 24.000 0.000 NA   NA
 5693681 5693682 THA_876 THA_877     TRUE 0.773 14.000 0.000 NA   NA
 5693682 5693683 THA_877 THA_878     FALSE 0.017 216.000 0.000 NA   NA
 5693683 5693684 THA_878 THA_879     FALSE 0.024 166.000 0.000 NA   NA
 5693684 5693685 THA_879 THA_880     TRUE 0.989 9.000 0.031 NA Y NA
 5693685 5693686 THA_880 THA_881     TRUE 0.960 5.000 0.000 0.010 Y NA
 10253755 5693687 THA_2025 THA_882     TRUE 0.995 9.000 0.048 0.039 Y NA
 5693688 5693689 THA_883 THA_884     TRUE 0.746 38.000 0.000 1.000 Y NA
 5693689 5693690 THA_884 THA_885     TRUE 0.356 34.000 0.000 NA   NA
 5693690 5693691 THA_885 THA_886     TRUE 0.788 56.000 0.167 NA   NA
 5693691 5693692 THA_886 THA_887     FALSE 0.025 159.000 0.000 NA   NA
 5693694 5693695 THA_889 THA_890     FALSE 0.012 360.000 0.000 NA N NA
 5693695 5693696 THA_890 THA_891     FALSE 0.026 154.000 0.000 NA   NA
 5693697 5693698 THA_892 THA_893     TRUE 0.413 29.000 0.000 NA   NA
 5693698 5693699 THA_893 THA_894     TRUE 0.735 11.000 0.000 NA   NA
 5693699 5693700 THA_894 THA_895     FALSE 0.065 94.000 0.000 NA   NA
 5693700 5693701 THA_895 THA_896   manC TRUE 0.844 -3.000 0.000 1.000   NA
 5693701 5693702 THA_896 THA_897 manC   FALSE 0.155 58.000 0.000 NA   NA
 5693702 5693703 THA_897 THA_898     TRUE 0.924 6.000 0.005 NA   NA
 5693703 5693704 THA_898 THA_899   murE TRUE 0.389 86.000 0.004 1.000   NA
 5693704 5693705 THA_899 THA_900 murE   TRUE 0.963 -3.000 0.004 NA   NA
 5693705 5693706 THA_900 THA_901   mraY TRUE 0.941 13.000 0.002 NA   NA
 5693706 5693707 THA_901 THA_902 mraY   TRUE 0.990 5.000 0.003 0.001 Y NA
 5693707 5693708 THA_902 THA_903     FALSE 0.250 47.000 0.000 NA   NA
 5693708 5693709 THA_903 THA_904     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5693709 5693710 THA_904 THA_905     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5693710 5693711 THA_905 THA_906     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5693712 5693713 THA_907 THA_908   flgI TRUE 0.959 19.000 0.078 NA   NA
 5693713 5693714 THA_908 THA_909 flgI flgH TRUE 0.998 12.000 0.235 0.006 Y NA
 5693714 5693715 THA_909 THA_910 flgH flgA TRUE 0.984 -3.000 0.133 NA   NA
 5693715 5693716 THA_910 THA_911 flgA gyrB TRUE 0.905 1.000 0.002 NA   NA
 5693716 5693717 THA_911 THA_912 gyrB   TRUE 0.936 -10.000 0.028 NA   NA
 5693717 5693718 THA_912 THA_913     TRUE 0.846 -16.000 0.016 NA   NA
 5693718 5693719 THA_913 THA_914     TRUE 0.865 -25.000 0.020 0.023 N NA
 5693719 5693720 THA_914 THA_915     TRUE 0.980 6.000 0.018 0.023 N NA
 5693720 5693721 THA_915 THA_916     TRUE 0.987 2.000 0.500 1.000 N NA
 5693721 5693722 THA_916 THA_917     TRUE 0.980 5.000 0.333 1.000 N NA
 5693722 5693723 THA_917 THA_918     FALSE 0.149 -28.000 0.000 NA   NA
 5693723 5693724 THA_918 THA_919     FALSE 0.014 261.000 0.000 NA   NA
 5693724 5693725 THA_919 THA_920     TRUE 0.995 14.000 1.000 NA   NA
 5693725 5693726 THA_920 THA_921     TRUE 0.985 21.000 0.750 NA   NA
 5693726 5693727 THA_921 THA_922     FALSE 0.111 69.000 0.000 NA   NA
 5693729 5693730 THA_924 THA_925     FALSE 0.086 93.000 0.000 1.000   NA
 5693730 5693731 THA_925 THA_926     TRUE 0.997 -6.000 0.065 0.006 Y NA
 5693731 5693732 THA_926 THA_927     TRUE 0.900 30.000 0.027 1.000 N NA
 5693732 10253756 THA_927 THA_2026     FALSE 0.106 83.000 0.000 1.000   NA
 10253756 10253757 THA_2026 THA_2027     FALSE 0.018 271.000 0.000 1.000   NA
 10253757 5693733 THA_2027 THA_928     FALSE 0.043 142.000 0.000 1.000 N NA
 5693733 5693734 THA_928 THA_929     TRUE 0.864 5.000 0.000 0.015   NA
 5693734 5693735 THA_929 THA_930     TRUE 0.669 3.000 0.000 1.000   NA
 5693735 5693736 THA_930 THA_931   pheT TRUE 0.911 2.000 0.002 1.000   NA
 5693736 5693737 THA_931 THA_932 pheT   TRUE 0.886 20.000 0.002 NA   NA
 5693737 5693738 THA_932 THA_933     TRUE 0.969 5.000 0.250 NA   NA
 5693738 5693739 THA_933 THA_934     FALSE 0.149 -28.000 0.000 NA   NA
 5693739 5693740 THA_934 THA_935     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5693740 5693741 THA_935 THA_936     TRUE 0.931 2.000 0.008 NA   NA
 5693741 5693742 THA_936 THA_937     TRUE 0.945 24.000 0.143 NA   NA
 5693742 5693743 THA_937 THA_938     TRUE 0.979 11.000 0.143 NA N NA
 5693744 5693745 THA_939 THA_940     TRUE 0.994 42.000 0.822 0.024 Y NA
 5693745 5693746 THA_940 THA_941     TRUE 0.999 -3.000 0.683 0.024 Y NA
 5693748 5693749 THA_943 THA_944     FALSE 0.009 915.000 0.000 NA   NA
 5693750 5693751 THA_945 THA_946 gidA2   FALSE 0.203 61.000 0.000 1.000 N NA
 5693751 5693752 THA_946 THA_947     TRUE 0.985 -10.000 0.083 1.000 Y NA
 5693752 5693753 THA_947 THA_948     TRUE 0.618 21.000 0.000 NA N NA
 5693753 5693754 THA_948 THA_949     TRUE 0.748 16.000 0.000 NA N NA
 5693754 5693755 THA_949 THA_950     TRUE 0.351 44.000 0.000 1.000 N NA
 5693755 5693756 THA_950 THA_951     TRUE 0.737 66.000 0.000 0.002 Y NA
 5693756 5693757 THA_951 THA_952   iorB FALSE 0.055 126.000 0.000 1.000 N NA
 5693757 5693758 THA_952 THA_953 iorB iorA TRUE 0.998 0.000 0.138 0.001 Y NA
 5693759 5693760 THA_954 THA_955     TRUE 0.974 3.000 0.015 0.023   NA
 5693760 5693761 THA_955 THA_956     TRUE 0.953 4.000 0.053 1.000   NA
 5693761 5693762 THA_956 THA_957     FALSE 0.278 53.000 0.000 1.000 N NA
 5693762 5693763 THA_957 THA_958     TRUE 0.978 18.000 0.182 1.000 N NA
 5693763 5693764 THA_958 THA_959   fliR TRUE 0.991 7.000 0.074 1.000 Y NA
 5693764 5693765 THA_959 THA_960 fliR flhB TRUE 0.669 129.000 0.105 1.000 Y NA
 5693766 5693767 THA_961 THA_962   nusB TRUE 0.960 -10.000 0.182 NA   NA
 5693767 5693768 THA_962 THA_963 nusB   TRUE 0.991 1.000 0.833 NA   NA
 5693768 5693769 THA_963 THA_964     TRUE 0.948 17.000 0.009 NA   NA
 5693769 5693770 THA_964 THA_965     TRUE 0.956 12.000 0.003 1.000 N NA
 5693770 5693771 THA_965 THA_966     TRUE 0.992 -7.000 0.151 1.000 Y NA
 5693771 5693772 THA_966 THA_967     TRUE 0.961 1.000 0.060 NA   NA
 5693772 5693773 THA_967 THA_968     TRUE 0.975 -3.000 0.015 NA   NA
 5693773 5693774 THA_968 THA_969     TRUE 0.893 3.000 0.003 NA   NA
 5693774 5693775 THA_969 THA_970     TRUE 0.964 9.000 0.014 1.000   NA
 5693775 5693776 THA_970 THA_971     TRUE 0.966 13.000 0.004 1.000 N NA
 5693776 5693777 THA_971 THA_972     TRUE 0.990 -3.000 0.004 1.000 Y NA
 5693777 5693778 THA_972 THA_973   surE TRUE 0.803 -22.000 0.043 1.000   NA
 5693778 5693779 THA_973 THA_974 surE   TRUE 0.919 21.000 0.009 NA   NA
 5693779 5693780 THA_974 THA_975     TRUE 0.956 1.000 0.021 NA   NA
 5693781 5693782 THA_976 THA_977     TRUE 0.975 8.000 0.154 NA   NA
 5693784 5693785 THA_979 THA_980     TRUE 0.475 80.000 0.015 NA   NA
 5693785 5693786 THA_980 THA_981     TRUE 0.978 13.000 0.061 NA   NA
 5693786 5693787 THA_981 THA_982     FALSE 0.165 132.000 0.000 0.002   NA
 5693788 5693789 THA_983 THA_984     TRUE 0.958 27.000 0.286 1.000   NA
 5693789 5693790 THA_984 THA_985     FALSE 0.029 177.000 0.000 1.000   NA
 5693790 10253758 THA_985 THA_2028     TRUE 0.995 9.000 0.048 0.039 Y NA
 5693791 5693792 THA_986 THA_987     FALSE 0.019 202.000 0.000 NA   NA
 5693793 10253759 THA_988 THA_2029     TRUE 0.940 -16.000 0.054 0.039   NA
 5693794 5693795 THA_989 THA_990     FALSE 0.013 304.000 0.000 NA   NA
 5693796 5693797 THA_991 THA_992     TRUE 0.560 25.000 0.000 1.000   NA
 5693797 5693798 THA_992 THA_993   pyrG TRUE 0.756 -7.000 0.000 1.000 N NA
 5693799 5693800 THA_994 THA_995     TRUE 0.971 -3.000 0.005 1.000   NA
 5693800 5693801 THA_995 THA_996     TRUE 0.958 22.000 0.118 1.000   NA
 5693801 5693802 THA_996 THA_997     TRUE 0.956 4.000 0.118 NA   NA
 5693802 5693803 THA_997 THA_998     FALSE 0.011 371.000 0.000 NA   NA
 5693803 5693804 THA_998 THA_999     TRUE 0.979 -3.000 0.036 NA   NA
 5693804 5693805 THA_999 THA_1000     TRUE 0.835 -16.000 0.013 NA   NA
 5693805 5693806 THA_1000 THA_1001     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5693806 5693807 THA_1001 THA_1002     TRUE 0.764 12.000 0.000 NA   NA
 5693807 5693808 THA_1002 THA_1003     TRUE 0.800 -22.000 0.086 NA   NA
 5693808 5693809 THA_1003 THA_1004     TRUE 0.637 68.000 0.022 1.000 N NA
 5693809 5693810 THA_1004 THA_1005     TRUE 0.641 2.000 0.000 NA   NA
 5693810 5693811 THA_1005 THA_1006     TRUE 0.668 18.000 0.000 NA   NA
 5693811 5693812 THA_1006 THA_1007     TRUE 0.604 3.000 0.000 NA   NA
 5693812 5693813 THA_1007 THA_1008     TRUE 0.920 2.000 0.002 1.000 N NA
 5693814 5693815 THA_1009 THA_1010     TRUE 0.796 16.000 0.000 1.000 N NA
 5693815 10253760 THA_1010 THA_2030     TRUE 0.995 9.000 0.048 0.039 Y NA
 10253760 5693816 THA_2030 THA_1011     TRUE 0.349 42.000 0.000 1.000   NA
 5693817 5693818 THA_1012 THA_1013     FALSE 0.111 69.000 0.000 NA   NA
 5693819 5693820 THA_1014 THA_1015     FALSE 0.087 80.000 0.000 NA   NA
 5693820 5693821 THA_1015 THA_1016     FALSE 0.067 93.000 0.000 NA   NA
 5693821 5693822 THA_1016 THA_1017     FALSE 0.024 218.000 0.000 1.000 N NA
 5693822 5693823 THA_1017 THA_1018     TRUE 1.000 -3.000 0.875 0.003 Y NA
 5693823 5693824 THA_1018 THA_1019     TRUE 0.991 5.000 0.228 1.000 Y NA
 5693824 5693825 THA_1019 THA_1020     TRUE 0.999 12.000 0.435 0.023 Y NA
 5693825 5693826 THA_1020 THA_1021     TRUE 0.960 64.000 0.222 0.023 Y NA
 5693827 5693828 THA_1022 THA_1023     TRUE 0.980 13.000 0.091 NA   NA
 5693829 5693830 THA_1024 THA_1025     TRUE 0.982 -3.000 0.038 1.000   NA
 5693831 5693832 THA_1026 THA_1027     TRUE 0.901 5.000 0.004 NA   NA
 5693836 5693837 THA_1031 THA_1032     TRUE 0.455 -13.000 0.000 NA   NA
 5693837 5693838 THA_1032 THA_1033     TRUE 0.361 -16.000 0.000 NA   NA
 5693838 5693839 THA_1033 THA_1034     TRUE 0.593 5.000 0.000 NA   NA
 5693839 5693840 THA_1034 THA_1035     TRUE 0.661 4.000 0.000 1.000   NA
 5693841 5693842 THA_1036 THA_1037     FALSE 0.087 80.000 0.000 NA   NA
 5693842 5693843 THA_1037 THA_1038     FALSE 0.019 203.000 0.000 NA   NA
 5693843 5693844 THA_1038 THA_1039   cobO FALSE 0.047 133.000 0.000 1.000 N NA
 5693844 5693845 THA_1039 THA_1040 cobO   TRUE 0.934 2.000 0.005 1.000   NA
 5693845 5693846 THA_1040 THA_1041   cobD FALSE 0.152 351.000 0.084 1.000   NA
 5693846 5693847 THA_1041 THA_1042 cobD cobQ TRUE 0.975 -19.000 0.016 0.008 Y NA
 5693847 5693848 THA_1042 THA_1043 cobQ cobS TRUE 0.996 1.000 0.036 0.008 Y NA
 5693848 5693849 THA_1043 THA_1044 cobS   TRUE 0.973 -3.000 0.013 NA   NA
 5693849 5693850 THA_1044 THA_1045     TRUE 0.979 -3.000 0.035 NA   NA
 5693850 5693851 THA_1045 THA_1046   cobT1 TRUE 0.996 -3.000 0.104 1.000 Y NA
 5693851 5693852 THA_1046 THA_1047 cobT1   TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5693852 5693853 THA_1047 THA_1048     FALSE 0.010 460.000 0.000 NA   NA
 5693855 5693856 THA_1050 THA_1051     TRUE 0.676 1.000 0.000 NA   NA
 5693857 5693858 THA_1052 THA_1053     TRUE 0.591 21.000 0.000 NA   NA
 5693860 5693861 THA_1055 THA_1056     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5693861 5693862 THA_1056 THA_1057     FALSE 0.244 48.000 0.000 NA   NA
 5693862 5693863 THA_1057 THA_1058     TRUE 0.379 32.000 0.000 NA   NA
 5693863 5693864 THA_1058 THA_1059     TRUE 0.992 -7.000 0.194 NA Y NA
 5693864 5693865 THA_1059 THA_1060     TRUE 0.995 -3.000 0.089 1.000 Y NA
 5693865 5693866 THA_1060 THA_1061     TRUE 0.982 36.000 0.089 0.023 Y NA
 5693866 5693867 THA_1061 THA_1062     TRUE 0.999 -3.000 0.286 0.023 Y NA
 5693867 5693868 THA_1062 THA_1063     TRUE 0.982 -3.000 0.022 1.000 N NA
 5693868 5693869 THA_1063 THA_1064     TRUE 0.977 11.000 0.067 1.000 N NA
 5693869 5693870 THA_1064 THA_1065   cobT2 FALSE 0.019 301.000 0.000 1.000 N NA
 5693870 5693871 THA_1065 THA_1066 cobT2 cbiX TRUE 0.991 -3.000 0.012 0.008   NA
 5693871 5693872 THA_1066 THA_1067 cbiX   TRUE 0.971 -13.000 0.090 0.008   NA
 5693872 5693873 THA_1067 THA_1068   cbiD TRUE 0.997 2.000 0.168 0.008 Y NA
 5693873 5693874 THA_1068 THA_1069 cbiD cbiE TRUE 0.998 -3.000 0.126 0.008 Y NA
 5693874 5693875 THA_1069 THA_1070 cbiE   TRUE 0.996 6.000 0.018 0.001 Y NA
 5693875 5693876 THA_1070 THA_1071     TRUE 0.948 49.000 0.128 1.000 Y NA
 5693876 5693877 THA_1071 THA_1072   cobM TRUE 0.995 1.000 0.291 1.000 Y NA
 5693877 5693878 THA_1072 THA_1073 cobM   TRUE 0.979 -28.000 0.397 0.008 Y NA
 5693878 5693879 THA_1073 THA_1074   cbiH TRUE 0.996 7.000 0.352 1.000 Y NA
 5693879 5693880 THA_1074 THA_1075 cbiH cobK TRUE 0.998 -3.000 0.423 1.000 Y NA
 5693880 5693881 THA_1075 THA_1076 cobK hemA TRUE 0.974 -10.000 0.006 1.000 Y NA
 5693881 5693882 THA_1076 THA_1077 hemA hemC TRUE 0.999 -3.000 0.178 0.001 Y NA
 5693882 5693883 THA_1077 THA_1078 hemC   TRUE 0.986 -9.000 0.031 1.000 Y NA
 5693883 5693884 THA_1078 THA_1079   hemB TRUE 0.985 4.000 0.044 1.000 Y NA
 5693884 5693885 THA_1079 THA_1080 hemB   TRUE 0.950 -18.000 0.019 1.000 Y NA
 5693885 5693886 THA_1080 THA_1081   hemL TRUE 0.989 -7.000 0.021 1.000 Y NA
 5693886 5693887 THA_1081 THA_1082 hemL cbiM TRUE 0.979 -3.000 0.013 1.000 N NA
 5693887 5693888 THA_1082 THA_1083 cbiM   TRUE 0.999 0.000 0.861 0.008 Y NA
 5693888 5693889 THA_1083 THA_1084     TRUE 0.992 -25.000 0.804 0.001 Y NA
 5693889 5693890 THA_1084 THA_1085     TRUE 0.988 -13.000 0.335 1.000 Y NA
 5693890 5693891 THA_1085 THA_1086     TRUE 0.952 2.000 0.034 NA   NA
 5693892 5693893 THA_1087 THA_1088   rnhA TRUE 0.844 -3.000 0.000 1.000   NA
 5693895 5693896 THA_1090 THA_1091     FALSE 0.093 78.000 0.000 NA   NA
 5693896 5693897 THA_1091 THA_1092     TRUE 0.931 23.000 0.035 NA   NA
 5693897 10253761 THA_1092 THA_2031     FALSE 0.037 127.000 0.000 NA   NA
 10253761 5693898 THA_2031 THA_1093     FALSE 0.070 108.000 0.000 1.000 N NA
 5693898 5693899 THA_1093 THA_1094     TRUE 0.960 6.000 0.021 1.000 N NA
 5693899 5693900 THA_1094 THA_1095     TRUE 0.979 4.000 0.009 0.001   NA
 5693900 5693901 THA_1095 THA_1096     TRUE 0.978 12.000 0.057 1.000   NA
 5693901 5693902 THA_1096 THA_1097     TRUE 0.952 5.000 0.051 1.000   NA
 5693902 5693903 THA_1097 THA_1098     TRUE 0.981 -3.000 0.068 NA   NA
 5693903 5693904 THA_1098 THA_1099     TRUE 0.977 -3.000 0.019 NA   NA
 5693904 5693905 THA_1099 THA_1100     FALSE 0.073 90.000 0.000 NA   NA
 5693906 5693907 THA_1101 THA_1102     FALSE 0.013 316.000 0.000 NA   NA
 5693907 5693908 THA_1102 THA_1103     FALSE 0.020 188.000 0.000 NA   NA
 5693909 5693910 THA_1104 THA_1105 arcC argF TRUE 0.990 20.000 0.154 1.000 Y NA
 5693912 10253762 THA_1107 THA_2032     TRUE 0.995 9.000 0.048 0.038 Y NA
 10253762 5693913 THA_2032 THA_1108     TRUE 0.372 42.000 0.000 1.000 N NA
 5693913 5693914 THA_1108 THA_1109     TRUE 0.924 26.000 0.000 0.022 Y NA
 5693915 5693916 THA_1112 THA_1113     TRUE 0.379 32.000 0.000 NA   NA
 5693916 5693917 THA_1113 THA_1114     TRUE 0.984 9.000 0.231 1.000   NA
 5693917 5693918 THA_1114 THA_1115     TRUE 0.703 2.000 0.000 1.000   NA
 5693918 5693919 THA_1115 THA_1116   hisS TRUE 0.471 -15.000 0.000 1.000   NA
 5693919 5693920 THA_1116 THA_1117 hisS   TRUE 0.949 5.000 0.077 NA   NA
 5693922 5693923 THA_1119 THA_1120     TRUE 0.709 0.000 0.000 NA   NA
 5693923 5693924 THA_1120 THA_1121     TRUE 0.774 -25.000 0.118 NA   NA
 5693924 5693925 THA_1121 THA_1122     TRUE 0.991 12.000 0.529 NA   NA
 5693926 5693927 THA_1123 THA_1124 glpX   TRUE 0.334 109.000 0.009 1.000 N NA
 5693927 5693928 THA_1124 THA_1125   folP TRUE 0.925 5.000 0.005 1.000 N NA
 5693929 5693930 THA_1126 THA_1127     TRUE 0.869 42.000 0.095 1.000   NA
 5693930 5693931 THA_1127 THA_1128     TRUE 0.990 -3.000 0.267 NA N NA
 5693931 5693932 THA_1128 THA_1129     TRUE 0.992 -3.000 0.400 NA   NA
 5693932 5693933 THA_1129 THA_1130     TRUE 0.993 -3.000 0.500 NA   NA
 5693934 5693935 THA_1131 THA_1132     TRUE 0.978 -3.000 0.025 NA   NA
 5693935 5693936 THA_1132 THA_1133     TRUE 0.926 3.000 0.010 NA   NA
 5693936 5693937 THA_1133 THA_1134   cysT TRUE 0.991 -10.000 0.270 1.000 Y NA
 5693937 5693938 THA_1134 THA_1135 cysT   TRUE 0.998 -3.000 0.646 NA Y NA
 5693938 5693939 THA_1135 THA_1136     TRUE 0.726 16.000 0.000 NA   NA
 5693939 5693940 THA_1136 THA_1137     FALSE 0.186 55.000 0.000 NA   NA
 5693940 5693941 THA_1137 THA_1138     TRUE 0.394 30.000 0.000 NA   NA
 5693941 5693942 THA_1138 THA_1139     TRUE 0.586 69.000 0.039 NA   NA
 5693942 5693943 THA_1139 THA_1140     TRUE 0.988 4.000 1.000 NA   NA
 5693943 5693944 THA_1140 THA_1141     TRUE 0.970 20.000 0.222 NA   NA
 5693944 5693945 THA_1141 THA_1142     TRUE 0.936 -10.000 0.028 NA   NA
 5693945 5693946 THA_1142 THA_1143     TRUE 0.980 -3.000 0.021 1.000   NA
 5693946 5693947 THA_1143 THA_1144     TRUE 0.294 130.000 0.050 NA   NA
 5693947 5693948 THA_1144 THA_1145     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5693948 5693949 THA_1145 THA_1146     TRUE 0.735 11.000 0.000 NA   NA
 5693949 5693950 THA_1146 THA_1147     TRUE 0.964 -3.000 0.004 NA   NA
 5693950 5693951 THA_1147 THA_1148   murC TRUE 0.983 -3.000 0.003 0.061 N NA
 5693951 5693952 THA_1148 THA_1149 murC   TRUE 0.993 -3.000 0.015 1.000 Y NA
 5693952 5693953 THA_1149 THA_1150     TRUE 0.983 -3.000 0.027 1.000 N NA
 5693954 5693955 THA_1151 THA_1152     TRUE 0.875 45.000 0.222 NA   NA
 5693955 5693956 THA_1152 THA_1153     TRUE 0.960 23.000 0.222 NA   NA
 5693956 5693957 THA_1153 THA_1154     TRUE 0.979 2.000 0.333 NA   NA
 5693957 5693958 THA_1154 THA_1155     TRUE 0.915 53.000 0.667 NA   NA
 5693958 5693959 THA_1155 THA_1156     TRUE 0.984 5.000 0.667 NA   NA
 5693959 5693960 THA_1156 THA_1157     TRUE 0.995 13.000 1.000 NA   NA
 5693961 5693962 THA_1158 THA_1159     FALSE 0.011 1963.000 0.000 1.000   NA
 11475318 5693958   THA_1155     FALSE NA 2303.000 0.000 NA   NA
 11617681 5693958   THA_1155     FALSE NA 2303.000 0.000 NA   NA
 11760073 5693958   THA_1155     FALSE NA 2303.000 0.000 NA   NA
 11475319 5693958   THA_1155     FALSE NA 2331.000 0.000 NA   NA
 11617682 5693958   THA_1155     FALSE NA 2331.000 0.000 NA   NA
 11760074 5693958   THA_1155     FALSE NA 2331.000 0.000 NA   NA
 11475320 5693958   THA_1155     FALSE NA 2368.000 0.000 NA   NA
 11617683 5693958   THA_1155     FALSE NA 2368.000 0.000 NA   NA
 11760075 5693958   THA_1155     FALSE NA 2368.000 0.000 NA   NA
 11475321 5693958   THA_1155     FALSE NA 2398.000 0.000 NA   NA
 11617684 5693958   THA_1155     FALSE NA 2398.000 0.000 NA   NA
 11760076 5693958   THA_1155     FALSE NA 2398.000 0.000 NA   NA
 11475322 5693958   THA_1155     FALSE NA 2435.000 0.000 NA   NA
 11617685 5693958   THA_1155     FALSE NA 2435.000 0.000 NA   NA
 11760077 5693958   THA_1155     FALSE NA 2435.000 0.000 NA   NA
 11475323 5693958   THA_1155     FALSE NA 2465.000 0.000 NA   NA
 11617686 5693958   THA_1155     FALSE NA 2465.000 0.000 NA   NA
 11760078 5693958   THA_1155     FALSE NA 2465.000 0.000 NA   NA
 11475324 5693958   THA_1155     FALSE NA 2502.000 0.000 NA   NA
 11617687 5693958   THA_1155     FALSE NA 2502.000 0.000 NA   NA
 11760079 5693958   THA_1155     FALSE NA 2502.000 0.000 NA   NA
 11475325 5693958   THA_1155     FALSE NA 2532.000 0.000 NA   NA
 11617688 5693958   THA_1155     FALSE NA 2532.000 0.000 NA   NA
 11760080 5693958   THA_1155     FALSE NA 2532.000 0.000 NA   NA
 11475326 5693958   THA_1155     FALSE NA 2568.000 0.000 NA   NA
 11617689 5693958   THA_1155     FALSE NA 2568.000 0.000 NA   NA
 11760081 5693958   THA_1155     FALSE NA 2568.000 0.000 NA   NA
 11475327 5693958   THA_1155     FALSE NA 2598.000 0.000 NA   NA
 11617690 5693958   THA_1155     FALSE NA 2598.000 0.000 NA   NA
 11760082 5693958   THA_1155     FALSE NA 2598.000 0.000 NA   NA
 11475328 5693958   THA_1155     FALSE NA 2635.000 0.000 NA   NA
 11617691 5693958   THA_1155     FALSE NA 2635.000 0.000 NA   NA
 11760083 5693958   THA_1155     FALSE NA 2635.000 0.000 NA   NA
 11475329 5693958   THA_1155     FALSE NA 2665.000 0.000 NA   NA
 11617692 5693958   THA_1155     FALSE NA 2665.000 0.000 NA   NA
 11760084 5693958   THA_1155     FALSE NA 2665.000 0.000 NA   NA
 11475330 5693958   THA_1155     FALSE NA 2702.000 0.000 NA   NA
 11617693 5693958   THA_1155     FALSE NA 2702.000 0.000 NA   NA
 11760085 5693958   THA_1155     FALSE NA 2702.000 0.000 NA   NA
 11475331 5693958   THA_1155     FALSE NA 2732.000 0.000 NA   NA
 11617694 5693958   THA_1155     FALSE NA 2732.000 0.000 NA   NA
 11760086 5693958   THA_1155     FALSE NA 2732.000 0.000 NA   NA
 11475332 5693958   THA_1155     FALSE NA 2769.000 0.000 NA   NA
 11617695 5693958   THA_1155     FALSE NA 2769.000 0.000 NA   NA
 11760087 5693958   THA_1155     FALSE NA 2769.000 0.000 NA   NA
 11475333 5693958   THA_1155     FALSE NA 2799.000 0.000 NA   NA
 11617696 5693958   THA_1155     FALSE NA 2799.000 0.000 NA   NA
 11760088 5693958   THA_1155     FALSE NA 2799.000 0.000 NA   NA
 11475334 5693958   THA_1155     FALSE NA 2838.000 0.000 NA   NA
 11617697 5693958   THA_1155     FALSE NA 2838.000 0.000 NA   NA
 11760089 5693958   THA_1155     FALSE NA 2838.000 0.000 NA   NA
 11475335 5693958   THA_1155     FALSE NA 2868.000 0.000 NA   NA
 11617698 5693958   THA_1155     FALSE NA 2868.000 0.000 NA   NA
 11760090 5693958   THA_1155     FALSE NA 2868.000 0.000 NA   NA
 11475336 5693958   THA_1155     FALSE NA 2905.000 0.000 NA   NA
 11617699 5693958   THA_1155     FALSE NA 2905.000 0.000 NA   NA
 11760091 5693958   THA_1155     FALSE NA 2905.000 0.000 NA   NA
 11475337 5693958   THA_1155     FALSE NA 2935.000 0.000 NA   NA
 11617700 5693958   THA_1155     FALSE NA 2935.000 0.000 NA   NA
 11760092 5693958   THA_1155     FALSE NA 2935.000 0.000 NA   NA
 11475338 5693958   THA_1155     FALSE NA 2971.000 0.000 NA   NA
 11617701 5693958   THA_1155     FALSE NA 2971.000 0.000 NA   NA
 11760093 5693958   THA_1155     FALSE NA 2971.000 0.000 NA   NA
 11475339 5693958   THA_1155     FALSE NA 3001.000 0.000 NA   NA
 11617702 5693958   THA_1155     FALSE NA 3001.000 0.000 NA   NA
 11760094 5693958   THA_1155     FALSE NA 3001.000 0.000 NA   NA
 11475340 5693958   THA_1155     FALSE NA 3036.000 0.000 NA   NA
 11617703 5693958   THA_1155     FALSE NA 3036.000 0.000 NA   NA
 11760095 5693958   THA_1155     FALSE NA 3036.000 0.000 NA   NA
 11475341 5693958   THA_1155     FALSE NA 3066.000 0.000 NA   NA
 11617704 5693958   THA_1155     FALSE NA 3066.000 0.000 NA   NA
 11760096 5693958   THA_1155     FALSE NA 3066.000 0.000 NA   NA
 11475342 5693958   THA_1155     FALSE NA 3103.000 0.000 NA   NA
 11617705 5693958   THA_1155     FALSE NA 3103.000 0.000 NA   NA
 11760097 5693958   THA_1155     FALSE NA 3103.000 0.000 NA   NA
 11475343 5693958   THA_1155     FALSE NA 3133.000 0.000 NA   NA
 11617706 5693958   THA_1155     FALSE NA 3133.000 0.000 NA   NA
 11760098 5693958   THA_1155     FALSE NA 3133.000 0.000 NA   NA
 11475344 5693958   THA_1155     FALSE NA 3169.000 0.000 NA   NA
 11617707 5693958   THA_1155     FALSE NA 3169.000 0.000 NA   NA
 11760099 5693958   THA_1155     FALSE NA 3169.000 0.000 NA   NA
 11475345 5693958   THA_1155     FALSE NA 3199.000 0.000 NA   NA
 11617708 5693958   THA_1155     FALSE NA 3199.000 0.000 NA   NA
 11760100 5693958   THA_1155     FALSE NA 3199.000 0.000 NA   NA
 11475346 5693958   THA_1155     FALSE NA 3236.000 0.000 NA   NA
 11617709 5693958   THA_1155     FALSE NA 3236.000 0.000 NA   NA
 11760101 5693958   THA_1155     FALSE NA 3236.000 0.000 NA   NA
 11475347 5693958   THA_1155     FALSE NA 3266.000 0.000 NA   NA
 11617710 5693958   THA_1155     FALSE NA 3266.000 0.000 NA   NA
 11760102 5693958   THA_1155     FALSE NA 3266.000 0.000 NA   NA
 11475348 5693958   THA_1155     FALSE NA 3303.000 0.000 NA   NA
 11617711 5693958   THA_1155     FALSE NA 3303.000 0.000 NA   NA
 11760103 5693958   THA_1155     FALSE NA 3303.000 0.000 NA   NA
 11475349 5693958   THA_1155     FALSE NA 3333.000 0.000 NA   NA
 11617712 5693958   THA_1155     FALSE NA 3333.000 0.000 NA   NA
 11760104 5693958   THA_1155     FALSE NA 3333.000 0.000 NA   NA
 11475350 5693958   THA_1155     FALSE NA 3369.000 0.000 NA   NA
 11617713 5693958   THA_1155     FALSE NA 3369.000 0.000 NA   NA
 11760105 5693958   THA_1155     FALSE NA 3369.000 0.000 NA   NA
 11475351 5693958   THA_1155     FALSE NA 3399.000 0.000 NA   NA
 11617714 5693958   THA_1155     FALSE NA 3399.000 0.000 NA   NA
 11760106 5693958   THA_1155     FALSE NA 3399.000 0.000 NA   NA
 11475352 5693958   THA_1155     FALSE NA 3435.000 0.000 NA   NA
 11617715 5693958   THA_1155     FALSE NA 3435.000 0.000 NA   NA
 11760107 5693958   THA_1155     FALSE NA 3435.000 0.000 NA   NA
 11475353 5693958   THA_1155     FALSE NA 3465.000 0.000 NA   NA
 11617716 5693958   THA_1155     FALSE NA 3465.000 0.000 NA   NA
 11760108 5693958   THA_1155     FALSE NA 3465.000 0.000 NA   NA
 11475354 5693958   THA_1155     FALSE NA 3500.000 0.000 NA   NA
 11617717 5693958   THA_1155     FALSE NA 3500.000 0.000 NA   NA
 11760109 5693958   THA_1155     FALSE NA 3500.000 0.000 NA   NA
 11475355 5693958   THA_1155     FALSE NA 3530.000 0.000 NA   NA
 11617718 5693958   THA_1155     FALSE NA 3530.000 0.000 NA   NA
 11760110 5693958   THA_1155     FALSE NA 3530.000 0.000 NA   NA
 11475356 5693958   THA_1155     FALSE NA 3567.000 0.000 NA   NA
 11617719 5693958   THA_1155     FALSE NA 3567.000 0.000 NA   NA
 11760111 5693958   THA_1155     FALSE NA 3567.000 0.000 NA   NA
 11475357 5693958   THA_1155     FALSE NA 3597.000 0.000 NA   NA
 11617720 5693958   THA_1155     FALSE NA 3597.000 0.000 NA   NA
 11760112 5693958   THA_1155     FALSE NA 3597.000 0.000 NA   NA
 11475358 5693958   THA_1155     FALSE NA 3634.000 0.000 NA   NA
 11617721 5693958   THA_1155     FALSE NA 3634.000 0.000 NA   NA
 11760113 5693958   THA_1155     FALSE NA 3634.000 0.000 NA   NA
 11475359 5693958   THA_1155     FALSE NA 3664.000 0.000 NA   NA
 11617722 5693958   THA_1155     FALSE NA 3664.000 0.000 NA   NA
 11760114 5693958   THA_1155     FALSE NA 3664.000 0.000 NA   NA
 11475360 5693958   THA_1155     FALSE NA 3701.000 0.000 NA   NA
 11617723 5693958   THA_1155     FALSE NA 3701.000 0.000 NA   NA
 11760115 5693958   THA_1155     FALSE NA 3701.000 0.000 NA   NA
 11475361 5693958   THA_1155     FALSE NA 3731.000 0.000 NA   NA
 11617724 5693958   THA_1155     FALSE NA 3731.000 0.000 NA   NA
 11760116 5693958   THA_1155     FALSE NA 3731.000 0.000 NA   NA
 11475362 5693958   THA_1155     FALSE NA 3768.000 0.000 NA   NA
 11617725 5693958   THA_1155     FALSE NA 3768.000 0.000 NA   NA
 11760117 5693958   THA_1155     FALSE NA 3768.000 0.000 NA   NA
 5693963 5693964 THA_1160 THA_1161     TRUE 0.964 17.000 0.052 NA   NA
 5693964 5693965 THA_1161 THA_1162     TRUE 0.980 -7.000 0.286 NA   NA
 5693965 5693966 THA_1162 THA_1163     TRUE 0.983 -10.000 0.714 NA   NA
 5693966 5693967 THA_1163 THA_1164     TRUE 0.991 -7.000 0.867 NA   NA
 5693967 5693968 THA_1164 THA_1165     TRUE 0.296 154.000 0.111 NA N NA
 5693968 5693969 THA_1165 THA_1166   ruvA TRUE 0.988 -3.000 0.003 NA Y NA
 5693969 5693970 THA_1166 THA_1167 ruvA   TRUE 0.379 32.000 0.000 NA   NA
 5693970 10253763 THA_1167 THA_2033     FALSE 0.223 51.000 0.000 NA   NA
 10253763 5693971 THA_2033 THA_1168     FALSE 0.056 100.000 0.000 NA   NA
 5693971 5693972 THA_1168 THA_1169     TRUE 0.547 23.000 0.000 NA   NA
 5693972 5693973 THA_1169 THA_1170     TRUE 0.928 51.000 0.739 NA   NA
 5693973 5693974 THA_1170 THA_1171     TRUE 0.942 -12.000 0.087 1.000   NA
 5693974 5693975 THA_1171 THA_1172     TRUE 0.955 4.000 0.067 1.000   NA
 5693975 5693976 THA_1172 THA_1173     TRUE 0.963 15.000 0.012 NA   NA
 5693976 5693977 THA_1173 THA_1174     TRUE 0.976 -3.000 0.017 NA   NA
 5693977 5693978 THA_1174 THA_1175     FALSE 0.050 105.000 0.000 NA   NA
 5693978 5693979 THA_1175 THA_1176     TRUE 0.999 -3.000 0.492 0.001 Y NA
 5693979 5693980 THA_1176 THA_1177     TRUE 0.647 6.000 0.000 NA   NA
 5693980 5693981 THA_1177 THA_1178     FALSE 0.233 -22.000 0.000 NA   NA
 5693981 5693982 THA_1178 THA_1179     TRUE 0.913 -10.000 0.004 1.000 N NA
 5693982 5693983 THA_1179 THA_1180     TRUE 0.955 21.000 0.118 NA   NA
 5693983 5693984 THA_1180 THA_1181     TRUE 0.677 64.000 0.091 NA   NA
 5693984 5693985 THA_1181 THA_1182     TRUE 0.979 1.000 0.258 NA   NA
 5693985 5693986 THA_1182 THA_1183     TRUE 0.942 -10.000 0.065 NA   NA
 5693988 5693989 THA_1185 THA_1186   truA TRUE 0.857 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5693989 5693990 THA_1186 THA_1187 truA   TRUE 0.837 39.000 0.031 NA   NA
 5693990 5693991 THA_1187 THA_1188     TRUE 0.973 -3.000 0.013 NA   NA
 5693991 5693992 THA_1188 THA_1189     TRUE 0.967 -3.000 0.006 NA   NA
 5693992 5693993 THA_1189 THA_1190     TRUE 0.975 13.000 0.022 NA   NA
 5693993 5693994 THA_1190 THA_1191     TRUE 0.997 11.000 0.066 0.007 Y NA
 5693994 5693995 THA_1191 THA_1192     TRUE 0.988 5.000 0.125 1.000 Y NA
 5693995 5693996 THA_1192 THA_1193     TRUE 0.724 64.000 0.107 1.000   NA
 5693996 5693997 THA_1193 THA_1194   fliP TRUE 0.982 -3.000 0.032 1.000   NA
 5693997 5693998 THA_1194 THA_1195 fliP fliQ TRUE 0.995 3.000 0.049 0.004 Y NA
 5693999 5694000 THA_1196 THA_1197   rpsB TRUE 0.644 48.000 0.002 1.000 N NA
 5694000 5694001 THA_1197 THA_1198 rpsB rplT TRUE 0.728 99.000 0.002 0.016 Y NA
 5694001 5694002 THA_1198 THA_1199 rplT rpmI TRUE 0.990 30.000 0.928 0.012   NA
 5694002 5694003 THA_1199 THA_1200 rpmI infC TRUE 0.993 12.000 0.652 1.000   NA
 5694003 5694004 THA_1200 THA_1201 infC   FALSE 0.015 237.000 0.000 NA   NA
 5694004 5694005 THA_1201 THA_1202     TRUE 0.715 9.000 0.000 NA   NA
 5694005 5694006 THA_1202 THA_1203     TRUE 0.688 7.000 0.000 NA   NA
 5694006 5694007 THA_1203 THA_1204     FALSE 0.120 67.000 0.000 NA   NA
 5694007 5694008 THA_1204 THA_1205     TRUE 0.571 -49.000 0.033 NA   NA
 5694008 5694009 THA_1205 THA_1206     TRUE 0.681 -37.000 0.115 NA   NA
 5694009 5694010 THA_1206 THA_1207     TRUE 0.966 2.000 0.137 NA   NA
 5694011 5694012 THA_1208 THA_1209     TRUE 0.433 28.000 0.000 NA   NA
 5694012 5694013 THA_1209 THA_1210   rpsL FALSE 0.021 185.000 0.000 NA   NA
 5694013 5694014 THA_1210 THA_1211 rpsL rpsG TRUE 0.997 19.000 0.224 0.003 Y NA
 5694014 5694015 THA_1211 THA_1212 rpsG fusA1 TRUE 0.992 14.000 0.015 1.000 Y NA
 5694015 5694016 THA_1212 THA_1213 fusA1   TRUE 0.987 31.000 0.015 0.001 Y NA
 5694016 5694017 THA_1213 THA_1214   rpsJ TRUE 0.940 63.000 0.318 1.000 Y NA
 5694017 5694018 THA_1214 THA_1215 rpsJ rplC TRUE 0.997 23.000 0.467 0.016 Y NA
 5694018 5694019 THA_1215 THA_1216 rplC rplD TRUE 0.993 38.000 0.544 0.012 Y NA
 5694019 5694020 THA_1216 THA_1217 rplD rplW TRUE 0.998 0.000 0.307 0.012 Y NA
 5694020 5694021 THA_1217 THA_1218 rplW rplB TRUE 0.999 16.000 0.849 0.014 Y NA
 5694021 5694022 THA_1218 THA_1219 rplB rpsS TRUE 0.999 16.000 0.820 0.016 Y NA
 5694022 5694023 THA_1219 THA_1220 rpsS   TRUE 0.999 15.000 0.769 0.016 Y NA
 5694023 5694024 THA_1220 THA_1221   rpsC TRUE 0.998 21.000 0.719 0.016 Y NA
 5694024 5694025 THA_1221 THA_1222 rpsC rplP TRUE 0.998 23.000 0.828 0.016 Y NA
 5694025 5694026 THA_1222 THA_1223 rplP rpmC TRUE 0.999 -3.000 0.802 0.012 Y NA
 5694026 5694027 THA_1223 THA_1224 rpmC   TRUE 0.999 6.000 0.828 0.012 Y NA
 5694027 5694028 THA_1224 THA_1225   rplN TRUE 0.998 -10.000 0.791 0.016 Y NA
 5694028 5694029 THA_1225 THA_1226 rplN rplX TRUE 0.999 14.000 0.810 0.016 Y NA
 5694029 5694030 THA_1226 THA_1227 rplX   TRUE 0.994 14.000 0.002 0.012 Y NA
 5694030 5694031 THA_1227 THA_1228   rpsN TRUE 0.993 16.000 0.003 0.012 Y NA
 5694031 5694032 THA_1228 THA_1229 rpsN rpsH TRUE 0.999 16.000 0.473 0.012 Y NA
 5694032 5694033 THA_1229 THA_1230 rpsH   TRUE 0.999 14.000 0.808 0.012 Y NA
 5694033 5694034 THA_1230 THA_1231   rplR TRUE 0.992 16.000 0.002 0.012 Y NA
 5694034 5694035 THA_1231 THA_1232 rplR rpsE TRUE 0.993 15.000 0.002 0.016 Y NA
 5694035 5694036 THA_1232 THA_1233 rpsE rpmD TRUE 0.998 4.000 0.789 0.016 Y NA
 5694036 5694037 THA_1233 THA_1234 rpmD rplO TRUE 0.999 15.000 0.653 0.002 Y NA
 5694037 5694038 THA_1234 THA_1235 rplO   TRUE 0.988 3.000 0.730 1.000 N NA
 5694038 5694039 THA_1235 THA_1236     TRUE 0.980 6.000 0.241 1.000 N NA
 5694039 5694040 THA_1236 THA_1237     TRUE 0.982 6.000 0.290 1.000 N NA
 5694040 5694041 THA_1237 THA_1238   infA TRUE 0.993 17.000 0.160 1.000 Y NA
 5694041 5694042 THA_1238 THA_1239 infA rpsM TRUE 0.766 150.000 0.075 0.014 Y NA
 5694042 5694043 THA_1239 THA_1240 rpsM rpsK TRUE 0.999 13.000 0.810 0.012 Y NA
 5694043 5694044 THA_1240 THA_1241 rpsK rpsD TRUE 0.999 14.000 0.509 0.016 Y NA
 5694044 5694045 THA_1241 THA_1242 rpsD rpoA TRUE 0.990 7.000 0.549 1.000 N NA
 5694045 5694046 THA_1242 THA_1243 rpoA rplQ TRUE 0.992 2.000 0.873 1.000 N NA
 5694046 5694047 THA_1243 THA_1244 rplQ   TRUE 0.756 40.000 0.003 1.000 N NA
 5694047 5694048 THA_1244 THA_1245   clpP TRUE 0.983 -16.000 0.351 1.000 Y NA
 5694048 5694049 THA_1245 THA_1246 clpP   TRUE 0.652 49.000 0.003 NA   NA
 5694049 5694050 THA_1246 THA_1247     TRUE 0.915 2.000 0.003 NA   NA
 5694050 5694051 THA_1247 THA_1248     TRUE 0.815 -19.000 0.023 NA   NA
 5694051 5694052 THA_1248 THA_1249   lspA TRUE 0.975 10.000 0.053 1.000 N NA
 5694052 5694053 THA_1249 THA_1250 lspA rluD TRUE 0.793 50.000 0.018 1.000 N NA
 5694053 5694054 THA_1250 THA_1251 rluD glnA1 TRUE 0.328 86.000 0.002 1.000 N NA
 5694055 5694056 THA_1252 THA_1253     TRUE 0.986 4.000 0.103 NA Y NA
 5694056 5694057 THA_1253 THA_1254     TRUE 0.991 16.000 0.070 NA Y NA
 5694058 5694059 THA_1255 THA_1256     FALSE 0.050 106.000 0.000 NA   NA
 5694060 5694061 THA_1257 THA_1258     TRUE 0.870 61.000 0.629 NA   NA
 5694061 5694062 THA_1258 THA_1259     TRUE 0.982 5.000 0.603 NA   NA
 5694062 5694063 THA_1259 THA_1260     TRUE 0.985 -7.000 0.441 NA   NA
 5694063 5694064 THA_1260 THA_1261     TRUE 0.941 22.000 0.065 NA   NA
 5694064 5694065 THA_1261 THA_1262     FALSE 0.009 2073.000 0.000 NA N NA
 5694065 5694066 THA_1262 THA_1263     TRUE 0.969 5.000 0.192 1.000   NA
 5694066 5694067 THA_1263 THA_1264     TRUE 0.455 31.000 0.000 1.000   NA
 5694067 5694068 THA_1264 THA_1265     FALSE 0.018 210.000 0.000 NA   NA
 5694068 5694069 THA_1265 THA_1266     TRUE 0.990 1.000 0.750 NA   NA
 10253764 5694070 THA_2034 THA_1267     TRUE 0.995 9.000 0.048 0.034 Y NA
 5694071 5694072 THA_1268 THA_1269     TRUE 0.985 -3.000 0.136 NA   NA
 5694072 5694073 THA_1269 THA_1270     FALSE 0.276 43.000 0.000 NA   NA
 5694074 5694075 THA_1271 THA_1272     FALSE 0.096 77.000 0.000 NA   NA
 5694075 5694076 THA_1272 THA_1273     TRUE 0.988 -3.000 0.222 NA   NA
 5694076 5694077 THA_1273 THA_1274     FALSE 0.242 96.000 0.002 NA   NA
 5694077 5694078 THA_1274 THA_1275   mutS TRUE 0.927 2.000 0.003 1.000 N NA
 5694078 5694079 THA_1275 THA_1276 mutS   TRUE 0.455 -13.000 0.000 NA   NA
 5694079 5694080 THA_1276 THA_1277     TRUE 0.622 -9.000 0.000 NA   NA
 5694080 10253765 THA_1277 THA_2035     TRUE 0.350 35.000 0.000 NA   NA
 10253765 5694081 THA_2035 THA_1278     TRUE 0.995 9.000 0.048 0.034 Y NA
 5694081 5694082 THA_1278 THA_1279     TRUE 0.351 44.000 0.000 1.000 N NA
 5694083 5694084 THA_1280 THA_1281     TRUE 0.726 16.000 0.000 NA   NA
 5694084 5694085 THA_1281 THA_1282     TRUE 0.764 12.000 0.000 NA   NA
 5694085 5694086 THA_1282 THA_1283     FALSE 0.027 153.000 0.000 NA   NA
 5694086 5694087 THA_1283 THA_1284     TRUE 0.984 0.000 0.300 NA   NA
 5694087 5694088 THA_1284 THA_1285     TRUE 0.959 17.000 0.020 NA   NA
 5694088 5694089 THA_1285 THA_1286     TRUE 0.969 15.000 0.020 NA   NA
 5694091 5694092 THA_1288 THA_1289     TRUE 0.360 126.000 0.038 1.000 N NA
 5694092 5694093 THA_1289 THA_1290     FALSE 0.021 255.000 0.000 1.000 N NA
 5694093 5694094 THA_1290 THA_1291     TRUE 0.853 -28.000 0.333 1.000 N NA
 5694094 5694095 THA_1291 THA_1292     TRUE 0.973 15.000 0.033 NA N NA
 5694095 5694096 THA_1292 THA_1293     TRUE 0.991 15.000 0.033 NA Y NA
 5694096 5694097 THA_1293 THA_1294     TRUE 0.999 13.000 0.545 0.021 Y NA
 5694097 5694098 THA_1294 THA_1295     TRUE 0.931 57.000 0.182 1.000 Y NA
 5694098 5694099 THA_1295 THA_1296     TRUE 0.994 0.000 0.182 1.000 Y NA
 5694100 5694101 THA_1297 THA_1298     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 5694101 5694102 THA_1298 THA_1299     TRUE 0.993 14.000 0.667 NA   NA
 5694102 5694103 THA_1299 THA_1300     TRUE 0.808 41.000 0.016 NA   NA
 5694103 5694104 THA_1300 THA_1301     FALSE 0.023 170.000 0.000 NA   NA
 5694104 5694105 THA_1301 THA_1302     TRUE 0.709 0.000 0.000 NA   NA
 5694106 5694107 THA_1303 THA_1304   topA TRUE 0.392 78.000 0.002 1.000 N NA
 5694107 5694108 THA_1304 THA_1305 topA   TRUE 0.941 2.000 0.008 1.000   NA
 5694108 5694109 THA_1305 THA_1306     TRUE 0.989 -3.000 0.217 1.000   NA
 5694109 5694110 THA_1306 THA_1307   rpmB FALSE 0.017 332.000 0.000 1.000 N NA
 5694110 5694111 THA_1307 THA_1308 rpmB   FALSE 0.204 120.000 0.002 1.000 N NA
 5694111 5694112 THA_1308 THA_1309     TRUE 0.838 47.000 0.068 1.000 N NA
 5694112 5694113 THA_1309 THA_1310     TRUE 0.982 8.000 0.205 1.000 N NA
 5694113 5694114 THA_1310 THA_1311   rpsI FALSE 0.125 314.000 0.012 1.000 N NA
 5694114 5694115 THA_1311 THA_1312 rpsI rplM TRUE 0.998 20.000 0.601 0.011 Y NA
 5694115 5694116 THA_1312 THA_1313 rplM   TRUE 0.943 17.000 0.007 NA   NA
 5694116 5694117 THA_1313 THA_1314   rpmA TRUE 0.959 12.000 0.007 NA   NA
 5694117 5694118 THA_1314 THA_1315 rpmA   TRUE 0.990 -10.000 0.203 1.000 Y NA
 5694118 5694119 THA_1315 THA_1316   rplU TRUE 0.997 -3.000 0.208 1.000 Y NA
 5694120 5694121 THA_1317 THA_1318   ruvC TRUE 0.891 20.000 0.002 NA   NA
 5694121 5694122 THA_1318 THA_1319 ruvC polC TRUE 0.992 13.000 0.012 1.000 Y NA
 5694122 5694123 THA_1319 THA_1320 polC   TRUE 0.305 164.000 0.182 NA   NA
 5694123 5694124 THA_1320 THA_1321     TRUE 0.988 8.000 0.545 NA   NA
 5694124 5694125 THA_1321 THA_1322     TRUE 0.808 36.000 0.010 NA   NA
 5694125 5694126 THA_1322 THA_1323     FALSE 0.037 127.000 0.000 NA   NA
 5694127 5694128 THA_1324 THA_1325   lysA TRUE 0.429 36.000 0.000 1.000 N NA
 5694128 5694129 THA_1325 THA_1326 lysA   TRUE 0.971 -3.000 0.006 1.000   NA
 5694130 5694131 THA_1327 THA_1328 pheS   TRUE 0.984 0.000 0.004 1.000 Y NA
 5694131 5694132 THA_1328 THA_1329     TRUE 0.989 -3.000 0.003 1.000 Y NA
 5694132 5694133 THA_1329 THA_1330     TRUE 0.936 11.000 0.003 NA   NA
 5694133 5694134 THA_1330 THA_1331     TRUE 0.736 54.000 0.044 NA   NA
 5694134 5694135 THA_1331 THA_1332     TRUE 0.784 -25.000 0.088 1.000   NA
 5694135 5694136 THA_1332 THA_1333     TRUE 0.982 -3.000 0.051 1.000   NA
 5694136 5694137 THA_1333 THA_1334     TRUE 0.972 12.000 0.013 1.000   NA
 5694137 5694138 THA_1334 THA_1335     TRUE 0.935 -10.000 0.013 1.000   NA
 5694139 5694140 THA_1336 THA_1337     FALSE 0.028 147.000 0.000 NA   NA
 5694140 5694141 THA_1337 THA_1338     TRUE 0.996 -7.000 0.500 1.000 Y NA
 5694143 5694144 THA_1340 THA_1341     FALSE 0.038 154.000 0.000 1.000 N NA
 5694144 5694145 THA_1341 THA_1342     TRUE 0.994 6.000 0.318 1.000 Y NA
 5694145 5694146 THA_1342 THA_1343     FALSE 0.052 128.000 0.000 1.000 N NA
 5694146 5694147 THA_1343 THA_1344     FALSE 0.262 100.000 0.002 1.000 N NA
 5694147 5694148 THA_1344 THA_1345   rpoB TRUE 0.999 23.000 0.851 0.001 Y NA
 5694148 5694149 THA_1345 THA_1346 rpoB rplL TRUE 0.452 135.000 0.223 1.000 N NA
 5694149 5694150 THA_1346 THA_1347 rplL   TRUE 0.998 25.000 0.884 0.011 Y NA
 5694150 5694151 THA_1347 THA_1348     FALSE 0.020 239.000 0.000 1.000   NA
 5694151 5694152 THA_1348 THA_1349     TRUE 0.931 20.000 0.006 1.000   NA
 5694152 5694153 THA_1349 THA_1350     FALSE 0.024 203.000 0.000 1.000   NA
 5694153 5694154 THA_1350 THA_1351     TRUE 0.626 81.000 0.105 1.000 N NA
 5694154 5694155 THA_1351 THA_1352   coaD2 TRUE 0.903 5.000 0.002 1.000 N NA
 5694155 5694156 THA_1352 THA_1353 coaD2 dnaB2 TRUE 0.921 6.000 0.002 1.000 N NA
 5694156 5694157 THA_1353 THA_1354 dnaB2   FALSE 0.016 319.000 0.000 1.000   NA
 5694158 5694159 THA_1355 THA_1356     TRUE 0.931 3.000 0.010 NA N NA
 5694161 5694162 THA_1358 THA_1359 mgsA   TRUE 0.952 0.000 0.006 1.000   NA
 5694162 5694163 THA_1359 THA_1360     TRUE 0.708 -40.000 0.182 NA   NA
 5694163 5694164 THA_1360 THA_1361     TRUE 0.644 19.000 0.000 NA   NA
 5694164 5694165 THA_1361 THA_1362   asnS TRUE 0.490 25.000 0.000 NA   NA
 5694166 5694167 THA_1363 THA_1364     TRUE 0.819 14.000 0.000 1.000   NA
 5694167 5694168 THA_1364 THA_1365     TRUE 0.641 2.000 0.000 NA   NA
 5694168 5694169 THA_1365 THA_1366     TRUE 0.926 3.000 0.010 NA   NA
 5694169 5694170 THA_1366 THA_1367     TRUE 0.916 3.000 0.007 NA   NA
 5694171 5694172 THA_1368 THA_1369 dnaN   TRUE 0.941 16.000 0.003 NA N NA
 5694172 5694173 THA_1369 THA_1370     TRUE 0.994 -3.000 0.600 NA N NA
 5694173 5694174 THA_1370 THA_1371     TRUE 0.942 -10.000 0.045 NA N NA
 5694174 5694175 THA_1371 THA_1372     FALSE 0.163 61.000 0.000 NA N NA
 5694175 5694176 THA_1372 THA_1373     TRUE 0.772 -27.000 0.092 1.000 N NA
 5694176 5694177 THA_1373 THA_1374     TRUE 0.955 13.000 0.003 NA   NA
 5694177 5694178 THA_1374 THA_1375     TRUE 0.939 10.000 0.003 NA   NA
 5694178 5694179 THA_1375 THA_1376     TRUE 0.981 -3.000 0.079 NA   NA
 5694181 5694182 THA_1378 THA_1379     TRUE 0.993 -3.000 0.400 1.000   NA
 5694183 5694184 THA_1380 THA_1381 glgX   TRUE 0.941 2.000 0.006 1.000 N NA
 5694184 5694185 THA_1381 THA_1382     TRUE 0.968 25.000 0.009 1.000 Y NA
 5694185 5694186 THA_1382 THA_1383     TRUE 0.998 12.000 0.714 1.000 Y NA
 5694186 5694187 THA_1383 THA_1384     TRUE 0.804 142.000 0.031 0.001 Y NA
 5694187 5694188 THA_1384 THA_1385   trxB TRUE 0.991 16.000 0.027 1.000 Y NA
 5694188 5694189 THA_1385 THA_1386 trxB   TRUE 0.981 15.000 0.111 1.000   NA
 5694190 5694191 THA_1387 THA_1388     FALSE 0.087 80.000 0.000 NA   NA
 5694191 5694192 THA_1388 THA_1389     TRUE 0.953 -7.000 0.015 NA   NA
 5694192 5694193 THA_1389 THA_1390   fliS TRUE 0.985 15.000 0.250 NA   NA
 5694193 5694194 THA_1390 THA_1391 fliS   TRUE 0.697 17.000 0.000 NA   NA
 5694195 5694196 THA_1392 THA_1393     FALSE 0.144 175.000 0.007 NA   NA
 5694196 5694197 THA_1393 THA_1394     TRUE 0.990 -19.000 0.278 0.003 Y NA
 5694197 5694198 THA_1394 THA_1395     TRUE 0.992 6.000 0.167 1.000 Y NA
 5694198 5694199 THA_1395 THA_1396     TRUE 0.997 14.000 0.051 0.020 Y NA
 5694199 5694200 THA_1396 THA_1397     TRUE 0.964 54.000 0.085 0.020 Y NA
 5694202 5694203 THA_1399 THA_1400     TRUE 0.999 -3.000 0.944 0.020 Y NA
 5694203 5694204 THA_1400 THA_1401     TRUE 0.990 3.000 0.156 1.000 Y NA
 5694204 5694205 THA_1401 THA_1402     TRUE 0.992 16.000 0.046 1.000 Y NA
 5694205 5694206 THA_1402 THA_1403   speE TRUE 0.764 86.000 0.017 1.000 Y NA
 5694206 5694207 THA_1403 THA_1404 speE speD TRUE 0.990 3.000 0.161 1.000 Y NA
 5694207 5694208 THA_1404 THA_1405 speD   TRUE 0.912 28.000 0.051 1.000   NA
 5694210 5694211 THA_1407 THA_1408     TRUE 0.954 11.000 0.008 NA   NA
 5694211 5694212 THA_1408 THA_1409     TRUE 0.925 4.000 0.011 NA   NA
 5694212 5694213 THA_1409 THA_1410     TRUE 0.726 -16.000 0.002 NA   NA
 5694213 5694214 THA_1410 THA_1411     TRUE 0.807 -25.000 0.182 NA   NA
 5694214 5694215 THA_1411 THA_1412     TRUE 0.988 -3.000 0.172 1.000   NA
 5694215 5694216 THA_1412 THA_1413     TRUE 0.777 10.000 0.000 1.000   NA
 5694216 5694217 THA_1413 THA_1414     TRUE 0.435 33.000 0.000 1.000   NA
 5694217 5694218 THA_1414 THA_1415     TRUE 0.956 3.000 0.037 1.000 N NA
 5694218 5694219 THA_1415 THA_1416     TRUE 0.952 12.000 0.000 1.000 Y NA
 5694219 5694220 THA_1416 THA_1417     TRUE 0.790 -27.000 0.145 1.000   NA
 5694220 5694221 THA_1417 THA_1418     TRUE 0.980 11.000 0.114 1.000   NA
 5694221 5694222 THA_1418 THA_1419     FALSE 0.203 212.000 0.108 NA   NA
 5694222 5694223 THA_1419 THA_1420     TRUE 0.521 65.000 0.007 NA   NA
 5694223 5694224 THA_1420 THA_1421     TRUE 0.938 -13.000 0.188 NA   NA
 5694224 5694225 THA_1421 THA_1422   secA TRUE 0.973 5.000 0.300 NA   NA
 5694225 5694226 THA_1422 THA_1423 secA   TRUE 0.857 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5694226 5694227 THA_1423 THA_1424     TRUE 0.937 17.000 0.004 NA   NA
 5694227 5694228 THA_1424 THA_1425     TRUE 0.304 41.000 0.000 NA   NA
 5694228 5694229 THA_1425 THA_1426     TRUE 0.985 0.000 0.333 NA   NA
 5694230 5694231 THA_1427 THA_1428     TRUE 0.844 -3.000 0.000 1.000   NA
 5694231 5694232 THA_1428 THA_1429   flgB TRUE 0.918 22.000 0.007 1.000   NA
 5694232 5694233 THA_1429 THA_1430 flgB flgC TRUE 0.999 12.000 0.804 0.002 Y NA
 5694233 5694234 THA_1430 THA_1431 flgC fliE TRUE 0.997 6.000 0.166 0.002 Y NA
 5694235 5694236 THA_1432 THA_1433   dnaK TRUE 0.954 27.000 0.008 NA Y NA
 5694236 5694237 THA_1433 THA_1434 dnaK   FALSE 0.103 156.000 0.002 NA   NA
 5694237 5694238 THA_1434 THA_1435     TRUE 0.948 2.000 0.019 NA   NA
 10253766 5694239 THA_2036 THA_1436     TRUE 0.995 9.000 0.048 0.033 Y NA
 5694240 5694241 THA_1437 THA_1438     TRUE 0.738 -2.000 0.000 NA   NA
 5694241 5694242 THA_1438 THA_1439     FALSE 0.187 -25.000 0.000 NA   NA
 5694242 5694243 THA_1439 THA_1440     FALSE 0.068 109.000 0.000 1.000 N NA
 5694243 5694244 THA_1440 THA_1441     TRUE 0.990 24.000 0.286 1.000 Y NA
 5694244 5694245 THA_1441 THA_1442     TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.020 Y NA
 5694245 5694246 THA_1442 THA_1443   gltA FALSE 0.019 305.000 0.000 1.000 N NA
 5694246 5694247 THA_1443 THA_1444 gltA gltD TRUE 0.991 -9.000 0.304 0.021 N NA
 5694247 5694248 THA_1444 THA_1445 gltD   TRUE 0.979 12.000 0.043 1.000 N NA
 5694248 5694249 THA_1445 THA_1446     TRUE 0.651 -22.000 0.000 1.000 Y NA
 5694249 5694250 THA_1446 THA_1447     TRUE 0.589 24.000 0.000 1.000   NA
 5694250 5694251 THA_1447 THA_1448     TRUE 0.990 -6.000 0.070 0.011   NA
 5694251 5694252 THA_1448 THA_1449     TRUE 0.786 11.000 0.000 1.000   NA
 5694252 5694253 THA_1449 THA_1450     TRUE 0.804 65.000 0.286 1.000   NA
 5694253 5694254 THA_1450 THA_1451     TRUE 0.975 5.000 0.273 1.000   NA
 5694254 5694255 THA_1451 THA_1452     TRUE 0.983 11.000 0.182 1.000   NA
 5694255 5694256 THA_1452 THA_1453     TRUE 0.972 6.000 0.200 NA   NA
 5694256 5694257 THA_1453 THA_1454     TRUE 0.972 15.000 0.051 NA   NA
 5694258 5694259 THA_1455 THA_1456     TRUE 0.896 3.000 0.002 1.000   NA
 5694259 5694260 THA_1456 THA_1457     TRUE 0.990 12.000 0.333 1.000   NA
 5694260 5694261 THA_1457 THA_1458     TRUE 0.922 -12.000 0.038 NA   NA
 5694261 5694262 THA_1458 THA_1459     TRUE 0.958 8.000 0.017 NA   NA
 5694262 5694263 THA_1459 THA_1460   pgsA TRUE 0.965 5.000 0.132 1.000 N NA
 5694263 5694264 THA_1460 THA_1461 pgsA   TRUE 0.962 8.000 0.012 1.000 N NA
 5694264 5694265 THA_1461 THA_1462   recA TRUE 0.984 -10.000 0.588 1.000 N NA
 5694265 5694266 THA_1462 THA_1463 recA recX TRUE 0.717 -25.000 0.015 1.000   NA
 5694266 5694267 THA_1463 THA_1464 recX   TRUE 0.963 2.000 0.067 1.000   NA
 5694268 5694269 THA_1465 THA_1466     TRUE 0.930 2.000 0.007 NA   NA
 5694269 5694270 THA_1466 THA_1467     TRUE 0.968 -3.000 0.007 NA   NA
 5694270 5694271 THA_1467 THA_1468     TRUE 0.301 101.000 0.008 NA   NA
 5694271 5694272 THA_1468 THA_1469     TRUE 0.967 14.000 0.012 NA   NA
 5694272 5694273 THA_1469 THA_1470     TRUE 0.485 64.000 0.004 NA   NA
 5694273 5694274 THA_1470 THA_1471   purL FALSE 0.016 326.000 0.000 1.000   NA
 5694274 5694275 THA_1471 THA_1472 purL purQ TRUE 0.999 -3.000 0.346 0.001 Y NA
 5694275 5694276 THA_1472 THA_1473 purQ purS TRUE 0.999 -3.000 0.656 0.001 Y NA
 5694276 5694277 THA_1473 THA_1474 purS purC TRUE 0.921 -24.000 0.049 1.000 Y NA
 5694277 5694278 THA_1474 THA_1475 purC purE TRUE 0.993 14.000 0.038 1.000 Y NA
 5694278 5694279 THA_1475 THA_1476 purE cysK FALSE 0.026 211.000 0.000 1.000 N NA
 5694279 5694280 THA_1476 THA_1477 cysK   TRUE 0.997 18.000 0.082 0.001 Y NA
 5694283 5694284 THA_1480 THA_1481     TRUE 0.893 26.000 0.015 NA   NA
 5694284 5694285 THA_1481 THA_1482     TRUE 0.304 41.000 0.000 NA   NA
 5694286 5694287 THA_1483 THA_1484     FALSE 0.151 59.000 0.000 NA   NA
 5694288 5694289 THA_1485 THA_1486     TRUE 0.726 16.000 0.000 NA   NA
 5694289 5694290 THA_1486 THA_1487     FALSE 0.039 125.000 0.000 NA   NA
 5694291 5694292 THA_1488 THA_1489     FALSE 0.114 -45.000 0.000 NA   NA
 5694293 5694294 THA_1490 THA_1491     TRUE 0.984 -7.000 0.381 NA   NA
 5694297 5694298 THA_1494 THA_1495 bioF   TRUE 0.982 12.000 0.085 1.000 N NA
 5694298 5694299 THA_1495 THA_1496     TRUE 0.515 133.000 0.008 1.000 Y NA
 5694299 5694300 THA_1496 THA_1497     TRUE 0.944 -19.000 0.667 NA   NA
 5694300 5694301 THA_1497 THA_1498     TRUE 0.567 22.000 0.000 NA   NA
 5694302 5694303 THA_1499 THA_1500     TRUE 0.976 14.000 0.065 NA   NA
 5694304 5694305 THA_1501 THA_1502     TRUE 0.976 -13.000 0.818 NA   NA
 5694305 5694306 THA_1502 THA_1503     TRUE 0.455 -13.000 0.000 NA   NA
 5694306 5694307 THA_1503 THA_1504     TRUE 0.726 16.000 0.000 NA   NA
 5694307 5694308 THA_1504 THA_1505     FALSE 0.051 104.000 0.000 NA   NA
 5694308 5694309 THA_1505 THA_1506     TRUE 0.988 -3.000 0.171 1.000   NA
 5694310 5694311 THA_1507 THA_1508     TRUE 0.669 3.000 0.000 1.000   NA
 5694311 5694312 THA_1508 THA_1509     TRUE 0.943 3.000 0.026 NA   NA
 5694312 5694313 THA_1509 THA_1510     TRUE 0.937 7.000 0.005 NA   NA
 5694313 5694314 THA_1510 THA_1511     TRUE 0.906 23.000 0.005 1.000   NA
 5694314 5694315 THA_1511 THA_1512     TRUE 0.932 2.000 0.004 1.000   NA
 5694315 5694316 THA_1512 THA_1513     TRUE 0.826 -19.000 0.014 1.000 N NA
 5694316 5694317 THA_1513 THA_1514     TRUE 0.815 -16.000 0.004 1.000   NA
 5694317 5694318 THA_1514 THA_1515     TRUE 0.593 5.000 0.000 NA   NA
 5694318 5694319 THA_1515 THA_1516     TRUE 0.292 -19.000 0.000 NA   NA
 5694319 5694320 THA_1516 THA_1517   murI TRUE 0.740 -19.000 0.006 NA   NA
 5694320 5694321 THA_1517 THA_1518 murI   TRUE 0.814 -16.000 0.008 NA   NA
 5694321 5694322 THA_1518 THA_1519     TRUE 0.982 0.000 0.259 NA   NA
 5694322 5694323 THA_1519 THA_1520     TRUE 0.979 5.000 0.470 NA   NA
 5694323 5694324 THA_1520 THA_1521   nrdR TRUE 0.943 6.000 0.013 NA   NA
 5694324 5694325 THA_1521 THA_1522 nrdR   TRUE 0.986 17.000 0.013 NA Y NA
 5694325 5694326 THA_1522 THA_1523   lysS TRUE 0.923 27.000 0.056 1.000 N NA
 5694326 5694327 THA_1523 THA_1524 lysS   TRUE 0.993 -3.000 0.421 1.000   NA
 5694327 5694328 THA_1524 THA_1525     TRUE 0.306 97.000 0.003 1.000   NA
 5694328 5694329 THA_1525 THA_1526     TRUE 0.962 -3.000 0.003 NA N NA
 5694329 5694330 THA_1526 THA_1527     TRUE 0.915 24.000 0.015 NA N NA
 5694330 5694331 THA_1527 THA_1528     FALSE 0.010 398.000 0.000 NA   NA
 5694331 5694332 THA_1528 THA_1529     TRUE 0.958 20.000 0.100 NA   NA
 5694332 5694333 THA_1529 THA_1530     TRUE 0.998 -7.000 0.300 0.003 Y NA
 5694333 5694334 THA_1530 THA_1531     TRUE 0.989 5.000 0.143 1.000 Y NA
 5694334 5694335 THA_1531 THA_1532     TRUE 0.951 70.000 0.222 0.020 Y NA
 5694335 5694336 THA_1532 THA_1533     TRUE 0.997 14.000 0.024 0.020 Y NA
 5694336 5694337 THA_1533 THA_1534     FALSE 0.008 1659.000 0.000 NA   NA
 5694337 5694338 THA_1534 THA_1535     FALSE 0.269 44.000 0.000 NA   NA
 5694338 5694339 THA_1535 THA_1536     FALSE 0.013 312.000 0.000 NA   NA
 5694339 5694340 THA_1536 THA_1537     FALSE 0.019 198.000 0.000 NA   NA
 5694340 5694341 THA_1537 THA_1538     TRUE 0.773 14.000 0.000 NA   NA
 5694341 5694342 THA_1538 THA_1539     FALSE 0.035 130.000 0.000 NA   NA
 5694342 5694343 THA_1539 THA_1540     FALSE 0.009 536.000 0.000 NA   NA
 5694343 5694344 THA_1540 THA_1541     FALSE 0.013 292.000 0.000 NA   NA
 5694346 5694347 THA_1543 THA_1544     FALSE 0.046 110.000 0.000 NA   NA
 5694347 5694348 THA_1544 THA_1545     TRUE 0.490 25.000 0.000 NA   NA
 5694348 5694349 THA_1545 THA_1546     TRUE 0.971 -7.000 0.071 1.000 N NA
 5694351 5694352 THA_1548 THA_1549     TRUE 0.979 13.000 0.081 NA   NA
 5694353 5694354 THA_1550 THA_1551     TRUE 0.959 42.000 0.818 1.000   NA
 5694354 5694355 THA_1551 THA_1552   rpmE TRUE 0.459 74.000 0.004 1.000 N NA
 5694355 5694356 THA_1552 THA_1553 rpmE   TRUE 0.826 69.000 0.016 1.000 Y NA
 5694357 5694358 THA_1554 THA_1555     TRUE 0.999 -3.000 0.606 0.005 Y NA
 5694358 5694359 THA_1555 THA_1556     TRUE 0.991 29.000 0.143 0.005 Y NA
 5694359 5694360 THA_1556 THA_1557     FALSE 0.120 67.000 0.000 NA   NA
 5694360 5694361 THA_1557 THA_1558     TRUE 0.773 14.000 0.000 NA   NA
 5694361 5694362 THA_1558 THA_1559     TRUE 0.992 3.000 0.286 NA Y NA
 5694362 5694363 THA_1559 THA_1560   ftcD FALSE 0.251 170.000 0.038 1.000 N NA
 5694363 5694364 THA_1560 THA_1561 ftcD   TRUE 0.984 -3.000 0.059 1.000 N NA
 5694364 5694365 THA_1561 THA_1562     TRUE 0.969 -7.000 0.053 1.000 N NA
 5694365 5694366 THA_1562 THA_1563   gltX2 TRUE 0.918 -10.000 0.004 1.000 N NA
 5694366 5694367 THA_1563 THA_1564 gltX2   TRUE 0.960 13.000 0.004 NA   NA
 5694367 5694368 THA_1564 THA_1565     TRUE 0.942 4.000 0.029 NA   NA
 5694368 5694369 THA_1565 THA_1566     TRUE 0.979 -3.000 0.016 1.000   NA
 5694369 5694370 THA_1566 THA_1567     TRUE 0.521 66.000 0.004 1.000   NA
 5694370 5694371 THA_1567 THA_1568   rpiB TRUE 0.828 13.000 0.000 1.000   NA
 5694371 5694372 THA_1568 THA_1569 rpiB   TRUE 0.833 14.000 0.000 1.000 N NA
 5694372 5694373 THA_1569 THA_1570   lexA TRUE 0.955 14.000 0.000 1.000 Y NA
 5694373 5694374 THA_1570 THA_1571 lexA   TRUE 0.979 -3.000 0.044 NA   NA
 5694374 5694375 THA_1571 THA_1572   gyrA TRUE 0.948 -7.000 0.012 NA   NA
 5694375 5694376 THA_1572 THA_1573 gyrA metG TRUE 0.985 14.000 0.010 0.052 N NA
 5694377 5694378 THA_1574 THA_1575     TRUE 0.981 57.000 0.463 0.020 Y NA
 5694378 5694379 THA_1575 THA_1576     TRUE 0.999 -3.000 0.926 0.020 Y NA
 5694379 5694380 THA_1576 THA_1577     TRUE 0.747 18.000 0.000 1.000 N NA
 5694380 5694381 THA_1577 THA_1578     TRUE 0.992 13.000 0.400 1.000 N NA
 5694381 5694382 THA_1578 THA_1579     TRUE 0.949 14.000 0.000 0.003   NA
 5694382 5694383 THA_1579 THA_1580   galT2 TRUE 0.764 0.000 0.000 1.000   NA
 5694383 5694384 THA_1580 THA_1581 galT2 galK TRUE 0.998 -3.000 0.370 0.001 N NA
 5694385 5694386 THA_1582 THA_1583 pyrBI   TRUE 0.465 65.000 0.002 1.000 N NA
 5694387 5694388 THA_1584 THA_1585     TRUE 0.956 3.000 0.035 1.000 N NA
 5694388 5694389 THA_1585 THA_1586     TRUE 0.504 85.000 0.014 1.000 N NA
 5694389 5694390 THA_1586 THA_1587     TRUE 0.985 4.000 0.045 1.000 Y NA
 5694390 5694391 THA_1587 THA_1588     TRUE 0.971 15.000 0.013 1.000 N NA
 5694391 5694392 THA_1588 THA_1589     TRUE 0.943 2.000 0.008 1.000   NA
 5694392 5694393 THA_1589 THA_1590     TRUE 0.947 3.000 0.017 1.000   NA
 5694394 5694395 THA_1591 THA_1592     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.001   NA
 5694395 5694396 THA_1592 THA_1593     TRUE 0.994 -3.000 0.667 NA   NA
 5694396 5694397 THA_1593 THA_1594     FALSE 0.029 143.000 0.000 NA   NA
 5694397 10253768 THA_1594 THA_2038     FALSE 0.011 358.000 0.000 NA   NA
 10253768 5694398 THA_2038 THA_1595     TRUE 0.709 0.000 0.000 NA   NA
 5694399 5694400 THA_1596 THA_1597     TRUE 0.447 27.000 0.000 NA   NA
 5694400 5694401 THA_1597 THA_1598     FALSE 0.075 88.000 0.000 NA   NA
 5694402 5694403 THA_1599 THA_1600   queD TRUE 0.591 21.000 0.000 NA   NA
 5694404 5694405 THA_1601 THA_1602     TRUE 0.998 3.000 0.444 0.002 Y NA
 5694405 5694406 THA_1602 THA_1603     TRUE 0.998 -3.000 0.056 0.001 Y NA
 5694406 5694407 THA_1603 THA_1604     TRUE 0.453 -16.000 0.000 1.000 N NA
 5694407 5694408 THA_1604 THA_1605   tpiA FALSE 0.265 54.000 0.000 1.000 N NA
 5694408 5694409 THA_1605 THA_1606 tpiA   TRUE 0.989 21.000 0.141 1.000 Y NA
 5694409 5694410 THA_1606 THA_1607     TRUE 0.909 74.000 0.009 0.003 Y NA
 5694410 5694411 THA_1607 THA_1608     TRUE 0.560 93.000 0.182 NA   NA
 5694411 5694412 THA_1608 THA_1609     TRUE 0.977 17.000 0.200 NA   NA
 5694412 5694413 THA_1609 THA_1610   fliI TRUE 0.884 27.000 0.015 NA   NA
 5694413 5694414 THA_1610 THA_1611 fliI   TRUE 0.988 -7.000 0.045 NA Y NA
 5694414 5694415 THA_1611 THA_1612   ackA TRUE 0.851 51.000 0.200 NA N NA
 5694415 5694416 THA_1612 THA_1613 ackA   TRUE 0.959 22.000 0.106 1.000 N NA
 5694417 5694418 THA_1614 THA_1615   ftsA TRUE 0.974 6.000 0.231 NA   NA
 5694418 5694419 THA_1615 THA_1616 ftsA ftsZ TRUE 0.981 4.000 0.013 1.000 Y NA
 5694419 5694420 THA_1616 THA_1617 ftsZ   TRUE 0.808 -19.000 0.009 1.000 N NA
 5694420 5694421 THA_1617 THA_1618     TRUE 0.974 -10.000 0.375 NA   NA
 5694421 5694422 THA_1618 THA_1619     TRUE 0.608 46.000 0.002 NA   NA
 5694422 5694423 THA_1619 THA_1620   uppS TRUE 0.983 3.000 0.409 1.000 N NA
 5694423 5694424 THA_1620 THA_1621 uppS cdsA TRUE 0.993 -3.000 0.012 1.000 Y NA
 5694424 5694425 THA_1621 THA_1622 cdsA alaS TRUE 0.953 18.000 0.009 1.000 N NA
 5694425 5694426 THA_1622 THA_1623 alaS   TRUE 0.961 2.000 0.003 0.052 N NA
 5694426 5694427 THA_1623 THA_1624     TRUE 0.980 -3.000 0.061 NA   NA
 5694427 5694428 THA_1624 THA_1625     TRUE 0.982 -7.000 0.333 NA   NA
 5694428 5694429 THA_1625 THA_1626   murA TRUE 0.994 12.000 0.700 1.000 N NA
 5694429 5694430 THA_1626 THA_1627 murA   TRUE 0.995 12.000 0.136 1.000 Y NA
 5694430 5694431 THA_1627 THA_1628     TRUE 0.982 -3.000 0.091 NA   NA
 5694431 5694432 THA_1628 THA_1629     TRUE 0.994 -3.000 0.667 NA   NA
 5694432 5694433 THA_1629 THA_1630   fusA2 FALSE 0.231 50.000 0.000 NA   NA
 5694433 5694434 THA_1630 THA_1631 fusA2   TRUE 0.354 114.000 0.021 1.000   NA
 5694434 5694435 THA_1631 THA_1632     TRUE 0.984 -3.000 0.077 1.000   NA
 5694435 5694436 THA_1632 THA_1633     TRUE 0.852 -25.000 0.304 NA   NA
 5694436 5694437 THA_1633 THA_1634     TRUE 0.993 6.000 0.298 NA Y NA
 5694437 5694438 THA_1634 THA_1635     TRUE 0.997 11.000 0.545 NA Y NA
 5694438 5694439 THA_1635 THA_1636     TRUE 0.995 0.000 0.301 NA Y NA
 5694439 5694440 THA_1636 THA_1637     TRUE 0.990 3.000 0.150 1.000 Y NA
 5694440 5694441 THA_1637 THA_1638   fliL TRUE 0.993 12.000 0.043 1.000 Y NA
 5694441 5694442 THA_1638 THA_1639 fliL fliM TRUE 0.999 14.000 0.323 0.001 Y NA
 5694442 5694443 THA_1639 THA_1640 fliM   TRUE 0.999 0.000 0.508 0.001 Y NA
 5694443 10253770 THA_1640 THA_2040     FALSE 0.091 95.000 0.000 1.000 N NA
 5694444 5694445 THA_1641 THA_1642     TRUE 0.847 -13.000 0.005 NA   NA
 5694445 5694446 THA_1642 THA_1643   scpA TRUE 0.982 4.000 0.570 NA   NA
 5694446 5694447 THA_1643 THA_1644 scpA   TRUE 0.926 0.000 0.003 NA   NA
 5694447 5694448 THA_1644 THA_1645     TRUE 0.328 37.000 0.000 NA   NA
 5694448 5694449 THA_1645 THA_1646   coaB FALSE 0.126 -37.000 0.000 NA   NA
 5694449 5694450 THA_1646 THA_1647 coaB panB TRUE 0.980 2.000 0.006 1.000 Y NA
 5694450 5694451 THA_1647 THA_1648 panB   FALSE 0.208 57.000 0.000 1.000   NA
 5694453 5694454 THA_1650 THA_1651     TRUE 0.866 -16.000 0.048 NA   NA
 5694454 5694455 THA_1651 THA_1652     TRUE 0.965 11.000 0.017 NA   NA
 5694455 5694456 THA_1652 THA_1653     TRUE 0.977 13.000 0.017 1.000   NA
 5694456 5694457 THA_1653 THA_1654     TRUE 0.947 0.000 0.007 NA   NA
 5694457 5694458 THA_1654 THA_1655     TRUE 0.693 52.000 0.010 NA   NA
 5694458 5694459 THA_1655 THA_1656     TRUE 0.980 -3.000 0.014 1.000 N NA
 5694460 5694461 THA_1657 THA_1658     TRUE 0.967 20.000 0.182 NA   NA
 5694461 5694462 THA_1658 THA_1659     FALSE 0.012 318.000 0.000 NA   NA
 5694463 5694464 THA_1660 THA_1661     TRUE 0.998 -3.000 0.057 0.020 Y NA
 5694464 5694465 THA_1661 THA_1662     TRUE 0.998 -3.000 0.056 0.020 Y NA
 5694465 5694466 THA_1662 THA_1663     TRUE 0.998 -3.000 0.083 0.012 Y NA
 5694466 5694467 THA_1663 THA_1664     TRUE 0.968 -7.000 0.000 0.020 Y NA
 5694467 5694468 THA_1664 THA_1665   thrC TRUE 0.956 -3.000 0.000 0.006 N NA
 5694469 5694470 THA_1666 THA_1667     TRUE 0.973 -3.000 0.013 NA   NA
 5694470 5694471 THA_1667 THA_1668   thrS TRUE 0.969 14.000 0.014 NA   NA
 5694471 5694472 THA_1668 THA_1669 thrS   TRUE 0.953 5.000 0.056 1.000   NA
 5694472 5694473 THA_1669 THA_1670     TRUE 0.281 99.000 0.004 NA   NA
 5694473 5694474 THA_1670 THA_1671     TRUE 0.982 5.000 0.036 NA Y NA
 5694474 5694475 THA_1671 THA_1672     TRUE 0.973 -7.000 0.167 NA   NA
 5694475 5694476 THA_1672 THA_1673     TRUE 0.974 16.000 0.095 NA   NA
 5694476 5694477 THA_1673 THA_1674     FALSE 0.271 125.000 0.014 NA   NA
 5694477 5694478 THA_1674 THA_1675     TRUE 0.288 42.000 0.000 NA   NA
 5694478 5694479 THA_1675 THA_1676     FALSE 0.178 56.000 0.000 NA   NA
 5694479 5694480 THA_1676 THA_1677   gidB TRUE 0.989 -3.000 0.003 1.000 Y NA
 5694480 5694481 THA_1677 THA_1678 gidB trmE TRUE 0.945 15.000 0.002 1.000   NA
 5694484 5694485 THA_1681 THA_1682     FALSE 0.044 132.000 0.000 1.000   NA
 5694485 5694486 THA_1682 THA_1683     TRUE 0.971 0.000 0.050 1.000   NA
 5694486 5694487 THA_1683 THA_1684     TRUE 0.994 13.000 0.167 0.020 N NA
 5694487 5694488 THA_1684 THA_1685     TRUE 0.998 -7.000 0.447 0.005 Y NA
 5694488 5694489 THA_1685 THA_1686     TRUE 0.993 -19.000 0.468 0.002 Y NA
 5694489 5694490 THA_1686 THA_1687     TRUE 0.999 14.000 0.667 0.005 Y NA
 5694490 5694491 THA_1687 THA_1688     TRUE 0.998 4.000 0.531 0.005 Y NA
 5694491 5694492 THA_1688 THA_1689     TRUE 0.998 1.000 0.162 0.001 Y NA
 5694494 5694495 THA_1691 THA_1692     TRUE 0.990 3.000 0.212 NA Y NA
 5694495 5694496 THA_1692 THA_1693     TRUE 0.996 -3.000 0.182 NA Y NA
 5694496 5694497 THA_1693 THA_1694     TRUE 0.997 -3.000 0.310 NA Y NA
 5694497 5694498 THA_1694 THA_1695     TRUE 0.997 -3.000 0.310 1.000 Y NA
 5694498 5694499 THA_1695 THA_1696     TRUE 0.999 -3.000 0.364 0.019 Y NA
 5694500 5694501 THA_1697 THA_1698     TRUE 0.863 51.000 0.200 1.000   NA
 5694504 5694505 THA_1701 THA_1702     TRUE 0.990 13.000 0.006 1.000 Y NA
 5694507 5694508 THA_1704 THA_1705     TRUE 0.519 24.000 0.000 NA   NA
 5694508 5694509 THA_1705 THA_1706     TRUE 0.490 25.000 0.000 NA   NA
 5694509 5694510 THA_1706 THA_1707     TRUE 0.985 7.000 0.400 NA   NA
 5694510 5694511 THA_1707 THA_1708     FALSE 0.166 57.000 0.000 NA   NA
 5694511 5694512 THA_1708 THA_1709     TRUE 0.801 15.000 0.000 1.000   NA
 5694512 5694513 THA_1709 THA_1710     TRUE 0.961 12.000 0.003 1.000 N NA
 5694513 5694514 THA_1710 THA_1711   prfA TRUE 0.900 -10.000 0.003 1.000 N NA
 5694514 5694515 THA_1711 THA_1712 prfA   TRUE 0.913 -12.000 0.009 1.000 N NA
 5694515 5694516 THA_1712 THA_1713     TRUE 0.991 1.000 0.143 0.006 N NA
 5694516 5694517 THA_1713 THA_1714   miaA TRUE 0.973 3.000 0.017 0.051 N NA
 5694517 5694518 THA_1714 THA_1715 miaA   TRUE 0.926 4.000 0.012 NA   NA
 5694518 5694519 THA_1715 THA_1716     TRUE 0.982 -10.000 0.667 NA   NA
 5694519 5694520 THA_1716 THA_1717     TRUE 0.898 -22.000 0.400 NA   NA
 5694520 5694521 THA_1717 THA_1718     TRUE 0.948 0.000 0.004 1.000   NA
 5694521 5694522 THA_1718 THA_1719     TRUE 0.962 -3.000 0.004 NA   NA
 5694522 5694523 THA_1719 THA_1720   nadE2 TRUE 0.893 3.000 0.003 NA   NA
 5694524 5694525 THA_1721 THA_1722     TRUE 0.922 -12.000 0.044 NA   NA
 5694525 5694526 THA_1722 THA_1723     TRUE 0.925 24.000 0.044 NA   NA
 5694526 5694527 THA_1723 THA_1724     TRUE 0.920 -15.000 0.167 NA   NA
 5694527 5694528 THA_1724 THA_1725     TRUE 0.983 -3.000 0.044 1.000 N NA
 5694528 5694529 THA_1725 THA_1726     TRUE 0.923 4.000 0.010 NA   NA
 5694530 5694531 THA_1727 THA_1728 nusA   TRUE 0.993 12.000 0.759 NA   NA
 5694531 5694532 THA_1728 THA_1729     FALSE 0.186 55.000 0.000 NA   NA
 5694533 5694534 THA_1730 THA_1731     TRUE 0.591 21.000 0.000 NA   NA
 5694534 5694535 THA_1731 THA_1732     TRUE 0.970 17.000 0.100 NA   NA
 5694535 5694536 THA_1732 THA_1733     TRUE 0.943 -16.000 0.278 1.000 N NA
 5694536 5694537 THA_1733 THA_1734     TRUE 0.961 -7.000 0.056 NA   NA
 5694537 5694538 THA_1734 THA_1735     TRUE 0.919 2.000 0.004 NA   NA
 5694538 5694539 THA_1735 THA_1736   glmM TRUE 0.964 -3.000 0.003 1.000 N NA
 5694539 5694540 THA_1736 THA_1737 glmM   TRUE 0.920 6.000 0.004 NA   NA
 5694540 5694541 THA_1737 THA_1738     TRUE 0.977 -3.000 0.022 NA   NA
 5694541 5694542 THA_1738 THA_1739   rplI TRUE 0.976 6.000 0.003 1.000 Y NA
 5694542 5694543 THA_1739 THA_1740 rplI   TRUE 0.973 -3.000 0.007 1.000   NA
 5694543 5694544 THA_1740 THA_1741     TRUE 0.784 13.000 0.000 NA   NA
 5694544 5694545 THA_1741 THA_1742     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5694545 5694546 THA_1742 THA_1743     TRUE 0.971 -3.000 0.010 NA   NA
 5694547 5694548 THA_1744 THA_1745     TRUE 0.984 -3.000 0.133 NA   NA
 5694548 5694549 THA_1745 THA_1746     TRUE 0.943 -12.000 0.143 NA   NA
 5694549 5694550 THA_1746 THA_1747     TRUE 0.983 -3.000 0.095 NA   NA
 5694550 5694551 THA_1747 THA_1748     TRUE 0.933 2.000 0.008 NA   NA
 5694551 5694552 THA_1748 THA_1749     TRUE 0.987 -3.000 0.120 1.000 N NA
 5694552 5694553 THA_1749 THA_1750     TRUE 0.997 0.000 0.606 NA Y NA
 5694553 5694554 THA_1750 THA_1751     TRUE 0.978 12.000 0.074 NA N NA
 5694554 5694555 THA_1751 THA_1752     TRUE 0.988 15.000 0.333 NA   NA
 5694555 5694556 THA_1752 THA_1753     TRUE 0.989 -3.000 0.273 NA   NA
 5694556 5694557 THA_1753 THA_1754     TRUE 0.702 -28.000 0.023 1.000 N NA
 5694557 5694558 THA_1754 THA_1755   flhA TRUE 0.998 -3.000 0.440 1.000 Y NA
 5694559 5694560 THA_1756 THA_1757     TRUE 0.715 9.000 0.000 NA   NA
 5694560 5694561 THA_1757 THA_1758     TRUE 0.726 16.000 0.000 NA   NA
 5694562 5694563 THA_1759 THA_1760     FALSE 0.012 332.000 0.000 NA   NA
 5694566 5694567 THA_1763 THA_1764     TRUE 0.971 2.000 0.200 NA   NA
 5694567 5694568 THA_1764 THA_1765     TRUE 0.545 -25.000 0.003 NA   NA
 5694568 5694569 THA_1765 THA_1766     TRUE 0.963 -3.000 0.003 1.000   NA
 5694569 5694570 THA_1766 THA_1767     TRUE 0.707 -19.000 0.002 1.000 N NA
 5694570 5694571 THA_1767 THA_1768     TRUE 0.904 22.000 0.007 NA   NA
 5694571 5694572 THA_1768 THA_1769     TRUE 0.981 -3.000 0.076 NA   NA
 5694572 5694573 THA_1769 THA_1770     TRUE 0.962 5.000 0.003 0.012 N NA
 5694576 5694577 THA_1773 THA_1774     TRUE 0.957 18.000 0.031 NA   NA
 5694577 5694578 THA_1774 THA_1775     TRUE 0.980 -3.000 0.047 NA N NA
 5694578 5694579 THA_1775 THA_1776     TRUE 0.967 -7.000 0.055 1.000   NA
 5694579 5694580 THA_1776 THA_1777     TRUE 0.931 29.000 0.006 0.020   NA
 5694580 5694581 THA_1777 THA_1778   rsgA TRUE 0.904 4.000 0.003 1.000   NA
 5694581 5694582 THA_1778 THA_1779 rsgA   TRUE 0.978 -3.000 0.015 1.000   NA
 5694582 5694583 THA_1779 THA_1780     TRUE 0.936 21.000 0.011 1.000   NA
 5694583 5694584 THA_1780 THA_1781     FALSE 0.071 101.000 0.000 1.000   NA
 5694584 5694585 THA_1781 THA_1782     TRUE 0.996 15.000 0.298 NA Y NA
 5694585 5694586 THA_1782 THA_1783   rbfA TRUE 0.721 41.000 0.003 NA N NA
 5694586 5694587 THA_1783 THA_1784 rbfA   TRUE 0.929 -10.000 0.008 1.000 N NA
 5694587 5694588 THA_1784 THA_1785     TRUE 0.987 5.000 0.095 1.000 Y NA
 5694588 5694589 THA_1785 THA_1786   argS TRUE 0.978 12.000 0.003 0.051 N NA
 5694589 5694590 THA_1786 THA_1787 argS   TRUE 0.920 2.000 0.003 1.000   NA
 5694590 5694591 THA_1787 THA_1788     TRUE 0.814 -19.000 0.013 1.000   NA
 5694591 5694592 THA_1788 THA_1789     TRUE 0.939 -7.000 0.007 NA   NA
 5694592 5694593 THA_1789 THA_1790     TRUE 0.929 9.000 0.003 NA   NA
 5694593 5694594 THA_1790 THA_1791     TRUE 0.965 11.000 0.018 NA   NA
 5694595 5694596 THA_1792 THA_1793 fabF   TRUE 0.981 3.000 0.017 NA Y NA
 5694596 5694597 THA_1793 THA_1794     TRUE 0.948 6.000 0.017 NA   NA
 5694597 5694598 THA_1794 THA_1795     TRUE 0.979 -3.000 0.043 NA   NA
 5694598 5694599 THA_1795 THA_1796   fabD TRUE 0.968 -3.000 0.008 NA   NA
 5694599 5694600 THA_1796 THA_1797 fabD   FALSE 0.025 157.000 0.000 NA   NA
 5694600 5694601 THA_1797 THA_1798     FALSE 0.016 227.000 0.000 NA   NA
 5694601 5694602 THA_1798 THA_1799   thiC TRUE 0.996 0.000 0.012 0.002 Y NA
 5694602 5694603 THA_1799 THA_1800 thiC   TRUE 0.641 2.000 0.000 NA   NA
 5694603 5694604 THA_1800 THA_1801     TRUE 0.709 0.000 0.000 NA   NA
 5694604 5694605 THA_1801 THA_1802   pfkA TRUE 0.490 95.000 0.034 1.000 N NA
 5694605 5694606 THA_1802 THA_1803 pfkA   TRUE 0.990 -3.000 0.231 1.000   NA
 5694607 5694608 THA_1804 THA_1805     TRUE 0.959 -16.000 0.667 NA   NA
 5694608 5694609 THA_1805 THA_1806     TRUE 0.917 -13.000 0.086 NA   NA
 5694609 5694610 THA_1806 THA_1807     TRUE 0.948 5.000 0.072 NA   NA
 5694610 5694611 THA_1807 THA_1808     TRUE 0.287 159.000 0.143 NA   NA
 5694611 5694612 THA_1808 THA_1809     FALSE 0.025 201.000 0.000 1.000   NA
 5694612 5694613 THA_1809 THA_1810     TRUE 0.989 -3.000 0.250 NA   NA
 5694613 5694614 THA_1810 THA_1811     TRUE 0.910 -7.000 0.002 NA   NA
 5694614 5694615 THA_1811 THA_1812     FALSE 0.192 132.000 0.003 1.000   NA
 5694615 5694616 THA_1812 THA_1813     TRUE 0.669 3.000 0.000 1.000   NA
 5694616 5694617 THA_1813 THA_1814   mviN TRUE 0.811 -16.000 0.004 1.000   NA
 5694618 5694619 THA_1815 THA_1816   dprA TRUE 0.945 6.000 0.009 1.000   NA
 5694619 5694620 THA_1816 THA_1817 dprA panC TRUE 0.693 -22.000 0.003 1.000 N NA
 5694620 5694621 THA_1817 THA_1818 panC   TRUE 0.901 23.000 0.003 1.000 N NA
 5694621 5694622 THA_1818 THA_1819     TRUE 0.953 12.000 0.002 1.000 N NA
 5694622 5694623 THA_1819 THA_1820     TRUE 0.956 7.000 0.010 1.000   NA
 5694623 5694624 THA_1820 THA_1821     TRUE 0.923 -22.000 0.500 1.000   NA
 5694624 5694625 THA_1821 THA_1822   hslU TRUE 0.960 12.000 0.003 1.000 N NA
 5694625 5694626 THA_1822 THA_1823 hslU   TRUE 0.971 14.000 0.008 1.000 N NA
 5694626 5694627 THA_1823 THA_1824     TRUE 0.998 11.000 0.278 0.019 Y NA
 5694627 5694628 THA_1824 THA_1825     TRUE 0.991 17.000 0.061 1.000 Y NA
 5694628 5694629 THA_1825 THA_1826   aspS TRUE 0.925 6.000 0.003 1.000 N NA
 5694629 5694630 THA_1826 THA_1827 aspS   TRUE 0.952 -7.000 0.008 1.000 N NA
 5694630 5694631 THA_1827 THA_1828     TRUE 0.966 11.000 0.009 1.000 N NA
 5694631 5694632 THA_1828 THA_1829     TRUE 0.851 -27.000 0.281 1.000 N NA
 5694632 5694633 THA_1829 THA_1830     TRUE 0.615 -31.000 0.011 1.000   NA
 5694633 10253771 THA_1830 THA_2041     FALSE 0.069 102.000 0.000 1.000   NA
 10253771 5694634 THA_2041 THA_1831     FALSE 0.015 356.000 0.000 1.000   NA
 5694634 5694635 THA_1831 THA_1832     TRUE 0.932 31.000 0.250 NA   NA
 5694635 5694636 THA_1832 THA_1833     TRUE 0.948 -13.000 0.250 NA   NA
 5694636 5694637 THA_1833 THA_1834   rpmH TRUE 0.453 66.000 0.002 1.000   NA
 5694637 5694638 THA_1834 THA_1835 rpmH rnpA TRUE 0.963 -18.000 0.787 1.000   NA
 5694638 5694639 THA_1835 THA_1836 rnpA   FALSE 0.238 214.000 0.105 1.000 N NA
 5694639 5694640 THA_1836 THA_1837     TRUE 0.980 6.000 0.254 1.000   NA
 5694640 5694641 THA_1837 THA_1838     TRUE 0.599 -46.000 0.019 1.000   NA
 5694641 5694642 THA_1838 THA_1839     TRUE 0.964 -7.000 0.023 1.000   NA
 5694644 5694645 THA_1841 THA_1842 glnA2   FALSE 0.056 125.000 0.000 1.000 N NA
 5694645 5694646 THA_1842 THA_1843     TRUE 0.668 18.000 0.000 NA   NA
 5694646 5694647 THA_1843 THA_1844     TRUE 0.641 2.000 0.000 NA   NA
 5694647 5694648 THA_1844 THA_1845     TRUE 0.604 3.000 0.000 NA   NA
 5694649 5694650 THA_1846 THA_1847     TRUE 0.930 -3.000 0.000 0.051   NA
 5694650 5694651 THA_1847 THA_1848     TRUE 0.980 3.000 0.111 0.051   NA
 5694652 5694653 THA_1849 THA_1850     FALSE 0.016 221.000 0.000 NA   NA
 5694653 5694654 THA_1850 THA_1851     FALSE 0.016 225.000 0.000 NA   NA
 5694654 5694655 THA_1851 THA_1852     TRUE 0.773 14.000 0.000 NA   NA
 5694655 5694656 THA_1852 THA_1853     FALSE 0.124 66.000 0.000 NA   NA
 5694656 5694657 THA_1853 THA_1854     FALSE 0.020 188.000 0.000 NA   NA
 5694658 5694659 THA_1855 THA_1856     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5694659 5694660 THA_1856 THA_1857     TRUE 0.573 -10.000 0.000 NA   NA
 5694660 5694661 THA_1857 THA_1858     TRUE 0.970 -3.000 0.005 1.000   NA
 5694662 5694663 THA_1859 THA_1860     TRUE 0.942 2.000 0.008 1.000   NA
 5694663 5694664 THA_1860 THA_1861     TRUE 0.907 27.000 0.019 1.000   NA
 5694664 5694665 THA_1861 THA_1862   murB TRUE 0.925 -10.000 0.007 1.000 N NA
 5694665 5694666 THA_1862 THA_1863 murB   TRUE 0.975 13.000 0.011 1.000 N NA
 5694666 5694667 THA_1863 THA_1864     TRUE 0.950 5.000 0.021 1.000 N NA
 5694667 5694668 THA_1864 THA_1865     TRUE 0.955 6.000 0.052 NA   NA
 5694668 5694669 THA_1865 THA_1866     TRUE 0.986 1.000 0.500 NA   NA
 5694669 5694670 THA_1866 THA_1867     TRUE 0.933 29.000 0.222 NA   NA
 5694670 5694671 THA_1867 THA_1868     TRUE 0.996 -3.000 0.889 1.000 N NA
 5694672 5694673 THA_1869 THA_1870   acpP2 TRUE 0.966 9.000 0.040 NA   NA
 5694674 5694675 THA_1871 THA_1872 ruvB   TRUE 0.942 -7.000 0.008 NA   NA
 5694675 5694676 THA_1872 THA_1873     TRUE 0.928 21.000 0.013 NA   NA
 5694676 5694677 THA_1873 THA_1874     TRUE 0.986 -3.000 0.115 1.000   NA
 5694677 5694678 THA_1874 THA_1875     TRUE 0.993 14.000 0.643 NA N NA
 5694678 5694679 THA_1875 THA_1876     TRUE 0.987 -3.000 0.214 NA   NA
 5694679 5694680 THA_1876 THA_1877   rumA TRUE 0.979 16.000 0.111 1.000   NA
 5694680 5694681 THA_1877 THA_1878 rumA   TRUE 0.804 29.000 0.002 1.000   NA
 5694681 5694682 THA_1878 THA_1879     TRUE 0.876 5.000 0.002 NA   NA
 5694682 5694683 THA_1879 THA_1880     TRUE 0.995 14.000 1.000 NA   NA
 5694683 5694684 THA_1880 THA_1881     TRUE 0.984 6.000 0.400 1.000   NA
 5694684 5694685 THA_1881 THA_1882   prfB TRUE 0.946 15.000 0.002 1.000   NA
 5694685 5694686 THA_1882 THA_1883 prfB minD TRUE 0.959 12.000 0.003 1.000 N NA
 5694686 5694687 THA_1883 THA_1884 minD   TRUE 0.954 6.000 0.037 NA   NA
 5694687 5694688 THA_1884 THA_1885     TRUE 0.946 27.000 0.250 NA   NA
 5694688 5694689 THA_1885 THA_1886     TRUE 0.981 26.000 1.000 NA   NA
 5694689 5694690 THA_1886 THA_1887     TRUE 0.970 -3.000 0.009 NA   NA
 5694690 5694691 THA_1887 THA_1888   ftsY TRUE 0.883 5.000 0.003 NA   NA
 5694691 5694692 THA_1888 THA_1889 ftsY   TRUE 0.939 6.000 0.006 1.000   NA
 5694692 5694693 THA_1889 THA_1890     TRUE 0.815 -21.000 0.022 1.000   NA
 5694693 5694694 THA_1890 THA_1891     TRUE 0.951 4.000 0.087 NA   NA
 5694694 5694695 THA_1891 THA_1892     TRUE 0.357 90.000 0.005 NA N NA
 5694695 5694696 THA_1892 THA_1893     TRUE 0.987 -3.000 0.005 0.021 N NA
 5694696 5694697 THA_1893 THA_1894     TRUE 0.917 5.000 0.006 NA N NA
 5694698 5694699 THA_1895 THA_1896     TRUE 0.943 7.000 0.007 NA   NA
 5694699 5694700 THA_1896 THA_1897     TRUE 0.593 5.000 0.000 NA   NA
 5694700 5694701 THA_1897 THA_1898     TRUE 0.433 99.000 0.022 1.000   NA
 5694701 5694702 THA_1898 THA_1899     TRUE 0.899 3.000 0.003 NA   NA
 5694702 5694703 THA_1899 THA_1900     TRUE 0.673 45.000 0.003 NA   NA
 5694703 5694704 THA_1900 THA_1901   valS TRUE 0.984 12.000 0.008 0.050 N NA
 5694704 5694705 THA_1901 THA_1902 valS   TRUE 0.938 -7.000 0.003 1.000 N NA
 5694706 5694707 THA_1903 THA_1904     TRUE 0.999 0.000 0.538 0.020 Y NA
 5694707 5694708 THA_1904 THA_1905     TRUE 0.998 -3.000 0.141 0.020 Y NA
 5694708 5694709 THA_1905 THA_1906     TRUE 0.994 4.000 0.083 0.020 Y NA
 5694709 5694710 THA_1906 THA_1907     TRUE 0.999 -3.000 0.714 0.020 Y NA
 5694710 5694711 THA_1907 THA_1908     FALSE 0.250 47.000 0.000 NA   NA
 5694711 5694712 THA_1908 THA_1909     FALSE 0.197 54.000 0.000 NA   NA
 5694712 5694713 THA_1909 THA_1910     TRUE 0.996 21.000 0.200 0.019 Y NA
 5694713 5694714 THA_1910 THA_1911     TRUE 0.394 30.000 0.000 NA   NA
 5694714 5694715 THA_1911 THA_1912   guaB TRUE 0.413 29.000 0.000 NA   NA
 5694715 5694716 THA_1912 THA_1913 guaB   FALSE 0.014 286.000 0.000 NA   NA
 5694718 5694719 THA_1915 THA_1916     TRUE 0.572 104.000 0.222 1.000 N NA
 5694720 5694721 THA_1917 THA_1918     FALSE 0.265 54.000 0.000 1.000 N NA
 5694722 5694723 THA_1919 THA_1920     FALSE 0.062 109.000 0.000 1.000   NA
 5694723 5694724 THA_1920 THA_1921   nadA TRUE 0.949 4.000 0.024 1.000   NA
 5694724 5694725 THA_1921 THA_1922 nadA nadC TRUE 0.997 4.000 0.198 0.002 Y NA
 5694726 5694727 THA_1923 THA_1924     TRUE 0.438 -33.000 0.000 0.005   NA
 5694727 5694728 THA_1924 THA_1925     FALSE 0.238 49.000 0.000 NA   NA
 5694728 5694729 THA_1925 THA_1926     FALSE 0.134 64.000 0.000 NA   NA
 5694730 5694731 THA_1927 THA_1928     FALSE 0.128 65.000 0.000 NA   NA
 5694731 5694732 THA_1928 THA_1929     TRUE 0.339 36.000 0.000 NA   NA
 5694732 5694733 THA_1929 THA_1930     FALSE 0.018 317.000 0.000 1.000 N NA
 5694733 5694734 THA_1930 THA_1931     TRUE 0.983 54.000 0.375 0.019 Y NA
 5694734 5694735 THA_1931 THA_1932     TRUE 0.997 -13.000 1.000 0.019 Y NA
 5694735 5694736 THA_1932 THA_1933     TRUE 0.999 19.000 1.000 0.019 Y NA
 5694736 5694737 THA_1933 THA_1934     TRUE 0.779 16.000 0.000 1.000   NA
 5694737 5694738 THA_1934 THA_1935     TRUE 0.573 -10.000 0.000 NA   NA
 5694738 5694739 THA_1935 THA_1936     TRUE 0.979 -7.000 0.250 NA   NA
 5694739 5694740 THA_1936 THA_1937     TRUE 0.998 14.000 0.222 0.019 Y NA
 5694740 5694741 THA_1937 THA_1938     TRUE 0.784 13.000 0.000 NA   NA
 5694741 5694742 THA_1938 THA_1939     TRUE 0.735 11.000 0.000 NA   NA
 5694742 5694743 THA_1939 THA_1940     TRUE 0.828 13.000 0.000 1.000   NA
 5694743 5694744 THA_1940 THA_1941     TRUE 0.616 23.000 0.000 1.000   NA
 5694744 5694745 THA_1941 THA_1942     TRUE 0.728 18.000 0.000 1.000   NA
 5694746 5694747 THA_1943 THA_1944     FALSE 0.016 320.000 0.000 1.000   NA
 5694747 5694748 THA_1944 THA_1945     TRUE 0.977 15.000 0.092 NA   NA
 5694748 5694749 THA_1945 THA_1946     TRUE 0.697 17.000 0.000 NA   NA
 5694749 5694750 THA_1946 THA_1947     TRUE 0.957 18.000 0.013 1.000 N NA
 5694751 5694752 THA_1948 THA_1949     FALSE 0.018 211.000 0.000 NA   NA
 5694752 5694753 THA_1949 THA_1950     FALSE 0.009 1066.000 0.000 NA   NA
 5694753 5694754 THA_1950 THA_1951     FALSE 0.009 1096.000 0.000 NA   NA
 5694755 5694756 THA_1952 THA_1953     FALSE 0.010 373.000 0.000 NA   NA
 5694756 5694757 THA_1953 THA_1954     TRUE 0.773 14.000 0.000 NA   NA
 5694757 5694758 THA_1954 THA_1955     TRUE 0.984 3.000 0.065 NA Y NA
 5694758 5694759 THA_1955 THA_1956     TRUE 0.986 6.000 0.053 NA Y NA
 5694759 5694760 THA_1956 THA_1957     TRUE 0.989 -3.000 0.258 NA   NA
 5694760 5694761 THA_1957 THA_1958     TRUE 0.810 -22.000 0.097 NA   NA
 5694761 5694762 THA_1958 THA_1959     TRUE 0.988 13.000 0.259 NA   NA
 5694762 5694763 THA_1959 THA_1960     TRUE 0.994 14.000 0.778 NA   NA
 5694763 5694764 THA_1960 THA_1961     TRUE 0.980 13.000 0.091 NA   NA
 5694764 5694765 THA_1961 THA_1962     FALSE 0.011 406.000 0.000 NA N NA
 5694765 5694766 THA_1962 THA_1963     TRUE 0.567 22.000 0.000 NA   NA
 5694767 5694768 THA_1964 THA_1965     TRUE 0.968 16.000 0.044 NA   NA
 5694768 10253772 THA_1965 THA_2042     FALSE 0.034 131.000 0.000 NA   NA
 10253772 5694769 THA_2042 THA_1966     FALSE 0.015 358.000 0.000 1.000   NA
 5694769 5694770 THA_1966 THA_1967     TRUE 0.826 12.000 0.000 1.000 N NA
 5694770 5694771 THA_1967 THA_1968     TRUE 0.999 -3.000 0.711 0.017 Y NA
 5694771 5694772 THA_1968 THA_1969     TRUE 0.987 23.000 0.200 NA Y NA
 5694772 5694773 THA_1969 THA_1970     TRUE 0.988 5.000 0.182 NA Y NA
 5694773 5694774 THA_1970 THA_1971     TRUE 0.659 5.000 0.000 1.000   NA
 5694776 5694777 THA_1973 THA_1974   arsB TRUE 0.682 5.000 0.000 1.000 N NA
 5694777 5694778 THA_1974 THA_1975 arsB   TRUE 0.367 41.000 0.000 1.000   NA
 5694778 5694779 THA_1975 THA_1976     TRUE 0.706 19.000 0.000 1.000   NA
 5694779 5694780 THA_1976 THA_1977     FALSE 0.032 163.000 0.000 1.000   NA
 5694780 5694781 THA_1977 THA_1978     TRUE 0.999 0.000 0.724 0.002 Y NA
 5694781 5694782 THA_1978 THA_1979     TRUE 0.726 16.000 0.000 NA   NA
 5694783 5694784 THA_1980 THA_1981     FALSE 0.021 180.000 0.000 NA   NA
 5694786 10253773 THA_1983 THA_2043     TRUE 0.996 9.000 0.048 0.029 Y NA
 10253773 5694787 THA_2043 THA_1984     FALSE 0.039 142.000 0.000 1.000   NA
 5694788 5694789 THA_1985 THA_1986     TRUE 0.988 55.000 0.674 0.017 Y NA
 5694789 5694790 THA_1986 THA_1987     TRUE 0.964 2.000 0.000 0.017 Y NA
 5694790 5694791 THA_1987 THA_1988     TRUE 0.914 29.000 0.000 0.017 Y NA
 5694791 5694792 THA_1988 THA_1989     TRUE 0.994 0.000 1.000 1.000 N NA
 5694792 5694793 THA_1989 THA_1990     TRUE 0.857 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5694793 5694794 THA_1990 THA_1991     FALSE 0.012 778.000 0.000 1.000   NA
 5694794 5694795 THA_1991 THA_1992     FALSE 0.010 478.000 0.000 NA   NA
 5694795 5694796 THA_1992 THA_1993     FALSE 0.042 116.000 0.000 NA   NA
 5694796 5694797 THA_1993 THA_1994     FALSE 0.037 127.000 0.000 NA   NA
 5694800 5694801 THA_1997 THA_1998     FALSE 0.012 339.000 0.000 NA   NA
 5694801 5694802 THA_1998 THA_1999     FALSE 0.040 121.000 0.000 NA   NA
 5694802 5694803 THA_1999 THA_2000     TRUE 0.985 6.000 0.111 0.029   NA
 5694803 10253731 THA_2000 THA_2001     FALSE 0.032 667.000 0.000 0.029   NA