MicrobesOnline Operon Predictions for Clostridium sporogenes ATCC 15579

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 6024544 6024545 CLOSPO_00001 CLOSPO_00002     FALSE 0.069 230.000 0.000 NA   NA
 6024546 6024547 CLOSPO_00003 CLOSPO_00004     TRUE 0.926 10.000 0.000 NA   NA
 6024547 6024548 CLOSPO_00004 CLOSPO_00005     TRUE 0.328 143.000 0.000 NA   NA
 6024548 6024549 CLOSPO_00005 CLOSPO_00006     FALSE 0.006 538.000 0.000 NA   NA
 6024549 6024550 CLOSPO_00006 CLOSPO_00007     TRUE 0.380 90.000 0.000 NA   NA
 6024550 6024551 CLOSPO_00007 CLOSPO_00008     TRUE 0.341 139.000 0.000 NA   NA
 6024551 6024552 CLOSPO_00008 CLOSPO_00009     TRUE 0.379 96.000 0.000 NA   NA
 6024552 6024553 CLOSPO_00009 CLOSPO_00010     TRUE 0.928 9.000 0.000 NA   NA
 6024553 6024554 CLOSPO_00010 CLOSPO_00011     TRUE 0.930 7.000 0.000 NA   NA
 6024554 6024555 CLOSPO_00011 CLOSPO_00012     FALSE 0.130 199.000 0.000 NA   NA
 6024555 6024556 CLOSPO_00012 CLOSPO_00013     TRUE 0.969 16.000 0.029 NA   NA
 6024556 6024557 CLOSPO_00013 CLOSPO_00014     TRUE 0.970 -13.000 0.014 NA   NA
 6024557 6024558 CLOSPO_00014 CLOSPO_00015     TRUE 0.970 -10.000 0.011 NA   NA
 6024558 6024559 CLOSPO_00015 CLOSPO_00016     TRUE 0.599 137.000 0.016 NA   NA
 6024559 6024560 CLOSPO_00016 CLOSPO_00017     TRUE 0.977 25.000 0.214 NA   NA
 6024560 6024561 CLOSPO_00017 CLOSPO_00018     TRUE 0.991 -13.000 0.370 NA   NA
 6024561 6024562 CLOSPO_00018 CLOSPO_00019     FALSE 0.012 372.000 0.000 NA   NA
 6024562 6024563 CLOSPO_00019 CLOSPO_00020     FALSE 0.032 277.000 0.000 NA   NA
 6024563 6024564 CLOSPO_00020 CLOSPO_00021     TRUE 0.866 24.000 0.000 NA   NA
 6024564 6024565 CLOSPO_00021 CLOSPO_00022     FALSE 0.021 307.000 0.000 NA   NA
 6024565 6024566 CLOSPO_00022 CLOSPO_00023     TRUE 0.866 24.000 0.000 NA   NA
 6024566 6024567 CLOSPO_00023 CLOSPO_00024     TRUE 0.387 87.000 0.000 NA   NA
 6024568 6024569 CLOSPO_00025 CLOSPO_00026     TRUE 0.668 103.000 0.026 NA   NA
 6024569 6024570 CLOSPO_00026 CLOSPO_00027     TRUE 0.832 77.000 0.205 NA   NA
 6024571 6024572 CLOSPO_00028 CLOSPO_00029     TRUE 0.348 137.000 0.000 NA   NA
 6024572 6024573 CLOSPO_00029 CLOSPO_00030     TRUE 0.601 170.000 0.034 1.000 N NA
 6024573 6024574 CLOSPO_00030 CLOSPO_00031     FALSE 0.091 250.000 0.000 1.000 N NA
 6024574 6024575 CLOSPO_00031 CLOSPO_00032     FALSE 0.274 157.000 0.000 NA   NA
 6024575 6024576 CLOSPO_00032 CLOSPO_00033     TRUE 0.366 127.000 0.000 NA   NA
 6024576 6024577 CLOSPO_00033 CLOSPO_00034     FALSE 0.286 155.000 0.000 NA   NA
 6024577 6024578 CLOSPO_00034 CLOSPO_00035     TRUE 0.812 66.000 0.100 NA   NA
 6024578 6024579 CLOSPO_00035 CLOSPO_00036     TRUE 0.988 24.000 0.604 NA   NA
 6024579 6024580 CLOSPO_00036 CLOSPO_00037     TRUE 0.829 57.000 0.071 NA   NA
 6024580 6024581 CLOSPO_00037 CLOSPO_00038     TRUE 0.829 147.000 0.417 NA   NA
 6024581 6024582 CLOSPO_00038 CLOSPO_00039     TRUE 0.514 149.000 0.005 NA   NA
 6024582 6024583 CLOSPO_00039 CLOSPO_00040     TRUE 0.765 55.000 0.015 NA   NA
 6024583 6024584 CLOSPO_00040 CLOSPO_00041     TRUE 0.707 111.000 0.031 1.000   NA
 6024584 6024585 CLOSPO_00041 CLOSPO_00042     TRUE 0.703 142.000 0.065 1.000   NA
 6024585 6024586 CLOSPO_00042 CLOSPO_00043     TRUE 0.984 19.000 0.222 NA   NA
 6024586 6024587 CLOSPO_00043 CLOSPO_00044     FALSE 0.010 386.000 0.000 NA   NA
 6024587 6024588 CLOSPO_00044 CLOSPO_00045     TRUE 0.700 85.000 0.007 NA N NA
 6024588 6024589 CLOSPO_00045 CLOSPO_00046     TRUE 0.958 29.000 0.035 NA N NA
 6024589 6024590 CLOSPO_00046 CLOSPO_00047     FALSE 0.010 387.000 0.000 NA   NA
 6024590 6024591 CLOSPO_00047 CLOSPO_00048     TRUE 0.317 147.000 0.000 NA   NA
 6024591 6024592 CLOSPO_00048 CLOSPO_00049     TRUE 0.928 9.000 0.000 NA   NA
 6024592 6024593 CLOSPO_00049 CLOSPO_00050     TRUE 0.341 139.000 0.000 NA   NA
 6024593 6024594 CLOSPO_00050 CLOSPO_00051     TRUE 0.379 94.000 0.000 NA   NA
 6024594 6024595 CLOSPO_00051 CLOSPO_00052     TRUE 0.929 8.000 0.000 NA   NA
 6024595 6024596 CLOSPO_00052 CLOSPO_00053     TRUE 0.803 31.000 0.000 NA   NA
 6024596 6024597 CLOSPO_00053 CLOSPO_00054     FALSE 0.161 189.000 0.000 NA   NA
 6024597 6024598 CLOSPO_00054 CLOSPO_00055     FALSE 0.034 368.000 0.021 NA   NA
 6024598 6024599 CLOSPO_00055 CLOSPO_00056     FALSE 0.014 349.000 0.000 NA   NA
 6024599 6024600 CLOSPO_00056 CLOSPO_00057     TRUE 0.990 23.000 0.681 NA   NA
 6024600 6024601 CLOSPO_00057 CLOSPO_00058     TRUE 0.996 5.000 0.848 1.000   NA
 6024601 6024602 CLOSPO_00058 CLOSPO_00059     TRUE 0.991 -7.000 0.129 1.000 N NA
 6024602 6024603 CLOSPO_00059 CLOSPO_00060     TRUE 0.889 120.000 0.009 0.023 Y NA
 6024603 6024604 CLOSPO_00060 CLOSPO_00061     TRUE 0.986 10.000 0.126 NA   NA
 6024606 6024607 CLOSPO_00063 CLOSPO_00064     TRUE 0.987 2.000 0.134 NA   NA
 6024607 6024608 CLOSPO_00064 CLOSPO_00065     TRUE 0.703 106.000 0.002 1.000 N NA
 6024608 6024609 CLOSPO_00065 CLOSPO_00066     TRUE 0.745 72.000 0.004 1.000 N NA
 6024609 6024610 CLOSPO_00066 CLOSPO_00067     TRUE 0.944 29.000 0.003 1.000 N NA
 6024610 6024611 CLOSPO_00067 CLOSPO_00068     TRUE 0.907 49.000 0.129 1.000   NA
 6024611 6024612 CLOSPO_00068 CLOSPO_00069     TRUE 0.982 -10.000 0.055 1.000   NA
 6024612 6024613 CLOSPO_00069 CLOSPO_00070     TRUE 0.986 3.000 0.032 1.000 N NA
 6024613 6024614 CLOSPO_00070 CLOSPO_00071     TRUE 0.986 3.000 0.109 NA   NA
 6024614 6024615 CLOSPO_00071 CLOSPO_00072     TRUE 0.947 44.000 0.361 NA   NA
 6024615 6024616 CLOSPO_00072 CLOSPO_00073     TRUE 0.466 65.000 0.000 NA   NA
 6024616 6024617 CLOSPO_00073 CLOSPO_00074     TRUE 0.878 22.000 0.000 NA   NA
 6024617 6024618 CLOSPO_00074 CLOSPO_00075     FALSE 0.004 1479.000 0.000 NA   NA
 6024618 6024619 CLOSPO_00075 CLOSPO_00076     TRUE 0.871 50.000 0.016 1.000 N NA
 6024619 6024620 CLOSPO_00076 CLOSPO_00077     TRUE 0.977 47.000 0.843 1.000 N NA
 6024620 6024621 CLOSPO_00077 CLOSPO_00078     TRUE 0.944 71.000 0.681 1.000 N NA
 6024621 6024622 CLOSPO_00078 CLOSPO_00079     TRUE 0.987 57.000 0.838 0.024 Y NA
 6024622 6024623 CLOSPO_00079 CLOSPO_00080     TRUE 0.789 203.000 0.302 1.000 Y NA
 6024623 6024624 CLOSPO_00080 CLOSPO_00081     TRUE 0.989 48.000 0.884 1.000 Y NA
 6024624 6024625 CLOSPO_00081 CLOSPO_00082     TRUE 0.310 264.000 0.223 1.000 N NA
 6024625 6024626 CLOSPO_00082 CLOSPO_00083     TRUE 0.998 21.000 0.851 0.001 Y NA
 6024626 6024627 CLOSPO_00083 CLOSPO_00084     TRUE 0.795 125.000 0.065 1.000 N NA
 6024627 6024628 CLOSPO_00084 CLOSPO_00085     TRUE 0.959 76.000 0.239 0.024 Y NA
 6024628 6024629 CLOSPO_00085 CLOSPO_00086     TRUE 0.955 113.000 0.224 0.004 Y NA
 6024629 6024630 CLOSPO_00086 CLOSPO_00087     TRUE 0.961 121.000 0.579 1.000 Y NA
 6024630 6024631 CLOSPO_00087 CLOSPO_00088     TRUE 0.991 40.000 0.400 0.002 Y NA
 6024631 6024632 CLOSPO_00088 CLOSPO_00089     FALSE 0.213 402.000 0.318 1.000 Y NA
 6024632 6024633 CLOSPO_00089 CLOSPO_00090     TRUE 0.973 69.000 0.467 0.024 Y NA
 6024633 6024634 CLOSPO_00090 CLOSPO_00091     TRUE 0.997 25.000 0.544 0.018 Y NA
 6024634 6024635 CLOSPO_00091 CLOSPO_00092     TRUE 0.998 0.000 0.307 0.018 Y NA
 6024635 6024636 CLOSPO_00092 CLOSPO_00093     TRUE 0.988 55.000 0.849 0.024 Y NA
 6024636 6024637 CLOSPO_00093 CLOSPO_00094     TRUE 0.993 42.000 0.820 0.024 Y NA
 6024637 6024638 CLOSPO_00094 CLOSPO_00095     TRUE 0.998 22.000 0.769 0.024 Y NA
 6024638 6024639 CLOSPO_00095 CLOSPO_00096     TRUE 0.998 18.000 0.719 0.024 Y NA
 6024639 6024640 CLOSPO_00096 CLOSPO_00097     TRUE 0.998 24.000 0.828 0.024 Y NA
 6024640 6024641 CLOSPO_00097 CLOSPO_00098     TRUE 0.999 -10.000 0.802 0.018 Y NA
 6024641 6024642 CLOSPO_00098 CLOSPO_00099     TRUE 0.991 49.000 0.828 0.018 Y NA
 6024642 6024643 CLOSPO_00099 CLOSPO_00100     TRUE 0.995 35.000 0.791 0.024 Y NA
 6024643 6024644 CLOSPO_00100 CLOSPO_00101     TRUE 0.992 24.000 0.071 0.024 Y NA
 6024644 6024645 CLOSPO_00101 CLOSPO_00102     TRUE 0.992 23.000 0.057 0.018 Y NA
 6024645 6024646 CLOSPO_00102 CLOSPO_00103     TRUE 0.998 17.000 0.496 0.018 Y NA
 6024646 6024647 CLOSPO_00103 CLOSPO_00104     TRUE 0.995 30.000 0.473 0.018 Y NA
 6024647 6024648 CLOSPO_00104 CLOSPO_00105     TRUE 0.998 24.000 0.808 0.018 Y NA
 6024648 6024649 CLOSPO_00105 CLOSPO_00106     TRUE 0.999 10.000 0.815 0.018 Y NA
 6024649 6024650 CLOSPO_00106 CLOSPO_00107     TRUE 0.998 18.000 0.814 0.024 Y NA
 6024650 6024651 CLOSPO_00107 CLOSPO_00108     TRUE 0.999 14.000 0.789 0.024 Y NA
 6024651 6024652 CLOSPO_00108 CLOSPO_00109     TRUE 0.998 20.000 0.653 0.003 Y NA
 6024652 6024653 CLOSPO_00109 CLOSPO_00110     TRUE 0.997 1.000 0.730 1.000 N NA
 6024653 6024654 CLOSPO_00110 CLOSPO_00111     TRUE 0.986 24.000 0.241 1.000 N NA
 6024654 6024655 CLOSPO_00111 CLOSPO_00112     TRUE 0.994 0.000 0.290 1.000 N NA
 6024655 6024656 CLOSPO_00112 CLOSPO_00113     TRUE 0.989 6.000 0.185 NA   NA
 6024656 6024657 CLOSPO_00113 CLOSPO_00114     TRUE 0.984 8.000 0.090 NA   NA
 6024657 6024658 CLOSPO_00114 CLOSPO_00115     TRUE 0.553 238.000 0.075 0.026 Y NA
 6024658 6024659 CLOSPO_00115 CLOSPO_00116     TRUE 0.998 18.000 0.810 0.018 Y NA
 6024659 6024660 CLOSPO_00116 CLOSPO_00117     TRUE 0.994 35.000 0.509 0.024 Y NA
 6024660 6024661 CLOSPO_00117 CLOSPO_00118     TRUE 0.937 68.000 0.549 1.000 N NA
 6024661 6024662 CLOSPO_00118 CLOSPO_00119     TRUE 0.980 44.000 0.873 1.000 N NA
 6024662 6024663 CLOSPO_00119 CLOSPO_00120     TRUE 0.824 82.000 0.074 1.000 N NA
 6024663 6024664 CLOSPO_00120 CLOSPO_00121     TRUE 0.999 -15.000 0.713 0.041 Y NA
 6024664 6024665 CLOSPO_00121 CLOSPO_00122     TRUE 0.997 -3.000 0.304 1.000 Y NA
 6024665 6024666 CLOSPO_00122 CLOSPO_00123     TRUE 0.995 0.000 0.404 1.000 N NA
 6024666 6024667 CLOSPO_00123 CLOSPO_00124     TRUE 0.884 121.000 0.031 1.000 Y NA
 6024667 6024668 CLOSPO_00124 CLOSPO_00125     TRUE 0.997 26.000 0.601 0.018 Y NA
 6024668 6024669 CLOSPO_00125 CLOSPO_00126     FALSE 0.042 304.000 0.000 1.000 N NA
 6024669 6024670 CLOSPO_00126 CLOSPO_00127     FALSE 0.085 256.000 0.000 1.000 N NA
 6024670 6024671 CLOSPO_00127 CLOSPO_00128     TRUE 0.716 141.000 0.026 1.000 N NA
 6024671 6024672 CLOSPO_00128 CLOSPO_00129     TRUE 0.959 106.000 0.262 0.001 Y NA
 6024672 6024673 CLOSPO_00129 CLOSPO_00130     TRUE 0.683 70.000 0.006 1.000   NA
 6024675 6024676 CLOSPO_00132 CLOSPO_00133     TRUE 0.940 33.000 0.069 NA   NA
 6024676 6024677 CLOSPO_00133 CLOSPO_00134     TRUE 0.978 28.000 0.333 NA   NA
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