MicrobesOnline Operon Predictions for Polynucleobacter necessarius STIR1

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 7349338 7349339 Pnec_0001 Pnec_0002     TRUE 0.730 265.000 0.328 1.000 Y NA
 7349339 7349340 Pnec_0002 Pnec_0003     TRUE 0.970 12.000 0.114 1.000 Y NA
 7349340 7349341 Pnec_0003 Pnec_0004     TRUE 0.717 2.000 0.002 1.000   NA
 7349341 7349342 Pnec_0004 Pnec_0005     TRUE 0.860 15.000 0.081 NA   NA
 7349342 7349343 Pnec_0005 Pnec_0006     FALSE 0.197 110.000 0.030 NA   NA
 7349343 7349344 Pnec_0006 Pnec_0007     TRUE 0.997 -3.000 0.716 0.016 Y NA
 7349344 7349345 Pnec_0007 Pnec_0008     TRUE 0.972 23.000 0.157 NA Y NA
 7349345 7349346 Pnec_0008 Pnec_0009     TRUE 0.972 17.000 0.159 NA Y NA
 7349346 7349347 Pnec_0009 Pnec_0010     TRUE 0.975 3.000 0.000 0.020 Y NA
 7349347 7349348 Pnec_0010 Pnec_0011     FALSE 0.174 110.000 0.000 NA   NA
 7349348 7349349 Pnec_0011 Pnec_0012     FALSE 0.180 107.000 0.000 NA   NA
 7349349 7349350 Pnec_0012 Pnec_0013     TRUE 0.769 -7.000 0.002 1.000 N NA
 7349350 7349351 Pnec_0013 Pnec_0014     FALSE 0.595 19.000 0.003 1.000 N NA
 7349351 7349352 Pnec_0014 Pnec_0015     TRUE 0.974 24.000 0.827 1.000 N NA
 7349352 7349353 Pnec_0015 Pnec_0016     FALSE 0.092 603.000 0.000 1.000 N NA
 7349353 7349354 Pnec_0016 Pnec_0017     TRUE 0.988 45.000 0.557 0.008 Y NA
 7349354 7349355 Pnec_0017 Pnec_0018     TRUE 0.972 64.000 0.666 0.008 Y NA
 7349355 7349356 Pnec_0018 Pnec_0019     TRUE 0.995 2.000 0.242 0.008 Y NA
 7349356 7349357 Pnec_0019 Pnec_0020     TRUE 0.990 46.000 0.864 0.008 Y NA
 7349357 7349358 Pnec_0020 Pnec_0021     TRUE 0.995 18.000 0.846 0.008 Y NA
 7349358 7349359 Pnec_0021 Pnec_0022     TRUE 0.980 56.000 0.724 0.008 Y NA
 7349359 7349360 Pnec_0022 Pnec_0023     TRUE 0.995 22.000 0.837 0.008 Y NA
 7349360 7349361 Pnec_0023 Pnec_0024     FALSE 0.165 85.000 0.003 1.000 N NA
 7349361 7349362 Pnec_0024 Pnec_0025     FALSE 0.113 267.000 0.000 1.000 N NA
 7349365 7349366 Pnec_0028 Pnec_R0001     FALSE 0.107 185.000 0.000 NA   NA
 7349369 7349370 Pnec_0031 Pnec_0032     TRUE 0.958 35.000 0.613 NA   NA
 7349370 7349371 Pnec_0032 Pnec_0033     FALSE 0.239 78.000 0.000 NA   NA
 7349373 7349374 Pnec_R0002 Pnec_R0003     FALSE 0.342 60.000 0.000 NA   NA
 7349374 7349375 Pnec_R0003 Pnec_R0004     TRUE 0.673 29.000 0.000 NA   NA
 7349375 7349376 Pnec_R0004 Pnec_R0005     FALSE 0.081 268.000 0.000 NA   NA
 7349376 7349377 Pnec_R0005 Pnec_R0006     FALSE 0.116 168.000 0.000 NA   NA
 7349377 7349378 Pnec_R0006 Pnec_R0007     FALSE 0.184 105.000 0.000 NA   NA
 7349378 7349379 Pnec_R0007 Pnec_R0008     TRUE 0.740 6.000 0.000 NA   NA
 7349379 7349380 Pnec_R0008 Pnec_R0009     TRUE 0.684 22.000 0.000 NA   NA
 7349380 7349381 Pnec_R0009 Pnec_0035     FALSE 0.319 63.000 0.000 NA   NA
 7349381 7349382 Pnec_0035 Pnec_R0010     TRUE 0.682 14.000 0.000 NA   NA
 7349382 7349383 Pnec_R0010 Pnec_0036     TRUE 0.685 21.000 0.000 NA   NA
 7349383 7349384 Pnec_0036 Pnec_0037     TRUE 0.978 8.000 0.843 1.000 N NA
 7349384 7349385 Pnec_0037 Pnec_0038     TRUE 0.666 170.000 0.681 1.000 N NA
 7349385 7349386 Pnec_0038 Pnec_0039   rplA TRUE 0.997 3.000 0.838 0.050 Y NA
 7349386 7349387 Pnec_0039 Pnec_0040 rplA   TRUE 0.735 237.000 0.302 1.000 Y NA
 7349387 7349388 Pnec_0040 Pnec_0041   rplL TRUE 0.990 37.000 0.884 1.000 Y NA
 7349388 7349389 Pnec_0041 Pnec_0042 rplL rpoB FALSE 0.422 228.000 0.223 1.000   NA
 7349389 7349390 Pnec_0042 Pnec_0043 rpoB   TRUE 0.993 2.000 0.851 0.002   NA
 7349390 7349391 Pnec_0043 Pnec_0044     TRUE 0.685 21.000 0.000 NA   NA
 7349391 7349392 Pnec_0044 Pnec_0045   rpsL FALSE 0.435 53.000 0.000 NA   NA
 7349392 7349393 Pnec_0045 Pnec_0046 rpsL   TRUE 0.908 162.000 0.620 0.008 Y NA
 7349393 7349394 Pnec_0046 Pnec_0047     TRUE 0.890 28.000 0.002 1.000 Y NA
 7349394 7349395 Pnec_0047 Pnec_0048     TRUE 0.991 46.000 1.000 0.003 Y NA
 7349395 7349396 Pnec_0048 Pnec_0049     FALSE 0.423 117.000 0.002 1.000 Y NA
 7349396 7349397 Pnec_0049 Pnec_0050     TRUE 0.819 199.000 0.307 0.050 Y NA
 7349397 7349398 Pnec_0050 Pnec_0051     TRUE 0.992 12.000 0.486 0.037 Y NA
 7349398 7349399 Pnec_0051 Pnec_0052   rplW TRUE 0.995 -3.000 0.513 1.000 Y NA
 7349399 7349400 Pnec_0052 Pnec_0053 rplW rplB TRUE 0.995 3.000 0.849 1.000 Y NA
 7349400 7349401 Pnec_0053 Pnec_0054 rplB   TRUE 0.994 20.000 0.820 0.050 Y NA
 7349401 7349402 Pnec_0054 Pnec_0055   rplV TRUE 0.995 5.000 0.769 0.050 Y NA
 7349402 7349403 Pnec_0055 Pnec_0056 rplV   TRUE 0.994 9.000 0.719 0.050 Y NA
 7349403 7349404 Pnec_0056 Pnec_0057   rplP TRUE 0.997 3.000 0.828 0.050 Y NA
 7349404 7349405 Pnec_0057 Pnec_0058 rplP   TRUE 0.980 15.000 0.802 0.037   NA
 7349405 7349406 Pnec_0058 Pnec_0059     TRUE 0.981 13.000 0.828 0.037   NA
 7349406 7349407 Pnec_0059 Pnec_0060     TRUE 0.894 184.000 0.791 0.050 Y NA
 7349407 7349408 Pnec_0060 Pnec_0061   rplX TRUE 0.994 10.000 0.810 0.050 Y NA
 7349408 7349409 Pnec_0061 Pnec_0062 rplX   TRUE 0.993 17.000 0.758 0.037 Y NA
 7349409 7349410 Pnec_0062 Pnec_0063   rpsN TRUE 0.990 10.000 0.309 0.037 Y NA
 7349410 7349411 Pnec_0063 Pnec_0064 rpsN   TRUE 0.989 25.000 0.295 0.037 Y NA
 7349411 7349412 Pnec_0064 Pnec_0065     TRUE 0.994 11.000 0.808 0.037 Y NA
 7349412 7349413 Pnec_0065 Pnec_0066     TRUE 0.994 14.000 0.815 0.037 Y NA
 7349413 7349414 Pnec_0066 Pnec_0067   rpsE TRUE 0.994 26.000 0.814 0.050 Y NA
 7349414 7349415 Pnec_0067 Pnec_0068 rpsE   TRUE 0.993 25.000 0.789 0.050 Y NA
 7349415 7349416 Pnec_0068 Pnec_0069     TRUE 0.994 28.000 0.653 0.007 Y NA
 7349416 7349417 Pnec_0069 Pnec_0070     TRUE 0.972 18.000 0.730 1.000 N NA
 7349417 7349418 Pnec_0070 Pnec_0071   infA TRUE 0.920 5.000 0.083 1.000 N NA
 7349418 7349419 Pnec_0071 Pnec_0072 infA   TRUE 0.886 35.000 0.104 1.000   NA
 7349419 7349420 Pnec_0072 Pnec_0073   rpsM TRUE 0.954 25.000 0.194 0.037   NA
 7349420 7349421 Pnec_0073 Pnec_0074 rpsM   TRUE 0.994 19.000 0.810 0.037 Y NA
 7349421 7349422 Pnec_0074 Pnec_0075     TRUE 0.912 119.000 0.509 0.050 Y NA
 7349422 7349423 Pnec_0075 Pnec_0076     TRUE 0.967 25.000 0.549 1.000 N NA
 7349423 7349424 Pnec_0076 Pnec_0077   rplQ TRUE 0.974 17.000 0.873 1.000 N NA
 7349424 7349425 Pnec_0077 Pnec_0078 rplQ   FALSE 0.349 70.000 0.020 1.000 N NA
 7349425 7349426 Pnec_0078 Pnec_0079     TRUE 0.810 -3.000 0.005 1.000 N NA
 7349427 7349428 Pnec_0080 Pnec_0081   engB TRUE 0.862 -16.000 0.024 1.000   NA
 7349432 7349433 Pnec_0085 Pnec_0086     TRUE 0.985 6.000 0.208 1.000 Y NA
 7349433 7349434 Pnec_0086 Pnec_0087     TRUE 0.876 53.000 0.319 1.000   NA
 7349435 7349436 Pnec_0088 Pnec_0089     TRUE 0.681 13.000 0.000 NA   NA
 7349436 7349437 Pnec_0089 Pnec_0090     FALSE 0.074 326.000 0.000 NA   NA
 7349437 7349438 Pnec_0090 Pnec_0091     TRUE 0.729 7.000 0.000 NA   NA
 7349438 7349439 Pnec_0091 Pnec_0092     TRUE 0.682 14.000 0.000 NA   NA
 7349439 7349440 Pnec_0092 Pnec_0093     FALSE 0.095 208.000 0.000 NA   NA
 7349440 7349441 Pnec_0093 Pnec_0094     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA   NA
 7349441 7349442 Pnec_0094 Pnec_0095     TRUE 0.687 11.000 0.000 NA   NA
 7349442 7349443 Pnec_0095 Pnec_0096     TRUE 0.994 0.000 0.530 NA Y NA
 7349443 7349444 Pnec_0096 Pnec_0097     TRUE 0.960 22.000 0.562 NA   NA
 7349444 7349445 Pnec_0097 Pnec_0098     TRUE 0.738 0.000 0.007 NA   NA
 7349445 7349446 Pnec_0098 Pnec_0099     TRUE 0.711 71.000 0.222 NA N NA
 7349446 7349447 Pnec_0099 Pnec_0100     TRUE 0.789 19.000 0.047 NA   NA
 7349447 7349448 Pnec_0100 Pnec_0101     TRUE 0.830 0.000 0.000 NA   NA
 7349448 7349449 Pnec_0101 Pnec_0102     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA   NA
 7349449 7349450 Pnec_0102 Pnec_0103     TRUE 0.670 32.000 0.000 NA   NA
 7349450 7349451 Pnec_0103 Pnec_0104     TRUE 0.660 65.000 0.129 NA N NA
 7349451 7349452 Pnec_0104 Pnec_0105   hisG TRUE 0.914 21.000 0.123 1.000 N NA
 7349452 7349453 Pnec_0105 Pnec_0106 hisG   TRUE 0.989 28.000 0.254 0.010 Y NA
 7349455 7349456 Pnec_0108 Pnec_0109 hisB   TRUE 0.959 50.000 0.111 0.010 Y NA
 7349456 7349457 Pnec_0109 Pnec_0110     TRUE 0.945 16.000 0.007 0.010 Y NA
 7349457 7349458 Pnec_0110 Pnec_0111     TRUE 0.971 0.000 0.002 0.010 Y NA
 7349458 7349459 Pnec_0111 Pnec_0112     TRUE 0.989 40.000 0.430 0.010 Y NA
 7349459 7349460 Pnec_0112 Pnec_0113     TRUE 0.980 39.000 0.152 0.010 Y NA
 7349460 7349461 Pnec_0113 Pnec_0114     TRUE 0.872 36.000 0.079 1.000 N NA
 7349461 7349462 Pnec_0114 Pnec_0115     TRUE 0.886 17.000 0.080 1.000 N NA
 7349462 7349463 Pnec_0115 Pnec_0116   tatB TRUE 0.972 46.000 0.157 0.014 Y NA
 7349463 7349464 Pnec_0116 Pnec_0117 tatB   TRUE 0.980 36.000 0.314 NA Y NA
 7349466 7349467 Pnec_0119 Pnec_0120     FALSE 0.178 132.000 0.000 1.000   NA
 7349467 7349468 Pnec_0120 Pnec_0121     FALSE 0.074 310.000 0.000 NA   NA
 7349472 7349473 Pnec_0126 Pnec_0127     TRUE 0.682 24.000 0.000 NA   NA
 7349473 7349474 Pnec_0127 Pnec_0128     TRUE 0.682 24.000 0.000 NA   NA
 7349474 7349475 Pnec_0128 Pnec_0129     TRUE 0.682 12.000 0.000 NA   NA
 7349475 7349476 Pnec_0129 Pnec_0130     FALSE 0.605 40.000 0.000 NA   NA
 7349476 7349477 Pnec_0130 Pnec_0131     TRUE 0.641 37.000 0.000 NA   NA
 7349478 7349479 Pnec_0133 Pnec_0134     TRUE 0.757 21.000 0.000 1.000 N NA
 7349480 7349481 Pnec_0135 Pnec_0136     TRUE 0.983 11.000 0.108 0.003 Y NA
 7349481 7349482 Pnec_0136 Pnec_0137     TRUE 0.994 32.000 0.630 0.003 Y NA
 7349482 7349483 Pnec_0137 Pnec_0138     TRUE 0.687 100.000 0.370 NA N NA
 7349483 7349484 Pnec_0138 Pnec_0139     TRUE 0.967 30.000 0.831 NA   NA
 7349484 7349485 Pnec_0139 Pnec_R0011     TRUE 0.682 19.000 0.000 NA   NA
 7349485 7349486 Pnec_R0011 Pnec_0140     FALSE 0.274 71.000 0.000 NA   NA
 7349486 7349487 Pnec_0140 Pnec_0141     TRUE 0.841 28.000 0.000 0.015   NA
 7349487 7349488 Pnec_0141 Pnec_0142     FALSE 0.314 64.000 0.000 NA   NA
 7349491 7349492 Pnec_0145 Pnec_0146     TRUE 0.644 15.000 0.015 NA   NA
 7349492 7349493 Pnec_0146 Pnec_0147     FALSE 0.554 96.000 0.124 1.000 N NA
 7349493 7349494 Pnec_0147 Pnec_0148   prfA TRUE 0.991 5.000 0.229 0.072 Y NA
 7349494 7349495 Pnec_0148 Pnec_0149 prfA hemA TRUE 0.976 1.000 0.171 0.072 N NA
 7349497 7349498 Pnec_0151 Pnec_0152     TRUE 0.744 7.000 0.013 1.000   NA
 7349498 7349499 Pnec_0152 Pnec_0153     TRUE 0.944 6.000 0.174 1.000   NA
 7349499 7349500 Pnec_0153 Pnec_0154     TRUE 0.988 -7.000 0.814 1.000 N NA
 7349502 7349503 Pnec_0156 Pnec_0157     TRUE 0.821 -16.000 0.000 NA   NA
 7349505 7349506 Pnec_0159 Pnec_0160 trpC trpD TRUE 0.984 11.000 0.293 1.000 Y NA
 7349506 7349507 Pnec_0160 Pnec_0161 trpD   TRUE 0.969 21.000 0.105 1.000 Y NA
 7349507 7349508 Pnec_0161 Pnec_0162     TRUE 0.995 -16.000 0.230 0.002 Y NA
 7349508 7349509 Pnec_0162 Pnec_0163     TRUE 0.857 0.000 0.014 1.000 N NA
 7349510 7349511 Pnec_0164 Pnec_0165 apaG   FALSE 0.294 131.000 0.063 NA N NA
 7349511 7349512 Pnec_0165 Pnec_0166     FALSE 0.542 52.000 0.000 1.000 N NA
 7349513 7349514 Pnec_0167 Pnec_0168     FALSE 0.082 265.000 0.000 NA   NA
 7349514 7349515 Pnec_0168 Pnec_0169     TRUE 0.628 38.000 0.000 NA   NA
 7349516 7349517 Pnec_0170 Pnec_0171     TRUE 0.682 12.000 0.000 NA   NA
 7349517 7349518 Pnec_0171 Pnec_0172     FALSE 0.075 299.000 0.000 NA   NA
 7349518 7349519 Pnec_0172 Pnec_0173     TRUE 0.681 13.000 0.000 NA   NA
 7349519 7349520 Pnec_0173 Pnec_0174     TRUE 0.977 -3.000 0.227 1.000 N NA
 7349520 7349521 Pnec_0174 Pnec_0175     TRUE 0.964 -3.000 0.124 1.000 N NA
 7349521 7349522 Pnec_0175 Pnec_0176     TRUE 0.986 -3.000 0.089 1.000 Y NA
 7349522 7349523 Pnec_0176 Pnec_0177     TRUE 0.997 0.000 0.569 0.006 Y NA
 7349523 7349524 Pnec_0177 Pnec_0178   mraY TRUE 0.996 -9.000 0.309 0.010 Y NA
 7349524 7349525 Pnec_0178 Pnec_0179 mraY   TRUE 0.994 14.000 0.647 0.010 Y NA
 7349525 7349526 Pnec_0179 Pnec_0180     TRUE 0.988 -3.000 0.297 0.007 N NA
 7349526 7349527 Pnec_0180 Pnec_0181   murG TRUE 0.970 21.000 0.647 1.000 N NA
 7349527 7349528 Pnec_0181 Pnec_0182 murG murC TRUE 0.993 -3.000 0.283 1.000 Y NA
 7349528 7349529 Pnec_0182 Pnec_0183 murC ddl TRUE 0.993 -7.000 0.153 0.010 Y NA
 7349529 7349530 Pnec_0183 Pnec_0184 ddl   TRUE 0.994 -3.000 0.372 NA Y NA
 7349530 7349531 Pnec_0184 Pnec_0185     TRUE 0.979 -7.000 0.389 NA N NA
 7349531 7349532 Pnec_0185 Pnec_0186     TRUE 0.972 50.000 0.460 1.000 Y NA
 7349532 7349533 Pnec_0186 Pnec_0187     FALSE 0.208 113.000 0.018 1.000 N NA
 7349533 7349534 Pnec_0187 Pnec_0188   lpxC FALSE 0.589 44.000 0.012 1.000 N NA
 7349536 7349537 Pnec_0190 Pnec_0191     FALSE 0.107 186.000 0.000 NA   NA
 7349537 7349538 Pnec_0191 Pnec_0192     TRUE 0.687 11.000 0.000 NA   NA
 7349538 7349539 Pnec_0192 Pnec_0193     TRUE 0.699 10.000 0.000 NA   NA
 7349539 7349540 Pnec_0193 Pnec_0194     FALSE 0.469 51.000 0.000 NA   NA
 7349540 7349541 Pnec_0194 Pnec_0195     TRUE 0.628 38.000 0.000 NA   NA
 7349541 7349542 Pnec_0195 Pnec_0196     TRUE 0.682 14.000 0.000 NA   NA
 7349542 7349543 Pnec_0196 Pnec_0197     TRUE 0.681 13.000 0.000 NA   NA
 7349544 7349545 Pnec_0198 Pnec_0199     TRUE 0.884 12.000 0.110 NA   NA
 7349545 7349546 Pnec_0199 Pnec_0200     FALSE 0.545 27.000 0.002 1.000   NA
 7349546 7349547 Pnec_0200 Pnec_0201     TRUE 0.920 0.000 0.050 1.000   NA
 7349547 7349548 Pnec_0201 Pnec_0202     FALSE 0.493 414.000 0.571 1.000   NA
 7349548 7349549 Pnec_0202 Pnec_0203     FALSE 0.252 168.000 0.056 1.000   NA
 7349552 7349553 Pnec_0206 Pnec_0207     FALSE 0.106 188.000 0.000 NA   NA
 7349555 7349556 Pnec_0209 Pnec_0210     TRUE 0.683 15.000 0.000 NA   NA
 7349558 7349559 Pnec_0212 Pnec_0213   rpmA TRUE 0.993 20.000 0.667 0.035 Y NA
 7349559 7349560 Pnec_0213 Pnec_0214 rpmA obgE TRUE 0.718 88.000 0.335 1.000   NA
 7349560 7349561 Pnec_0214 Pnec_0215 obgE   TRUE 0.973 -3.000 0.206 1.000   NA
 7349562 7349563 Pnec_0216 Pnec_0217     TRUE 0.803 3.000 0.000 NA   NA
 7349566 7349567 Pnec_0220 Pnec_0221     FALSE 0.106 145.000 0.007 1.000   NA
 7349567 7349568 Pnec_0221 Pnec_0222     FALSE 0.110 276.000 0.000 1.000 N NA
 7349568 7349569 Pnec_0222 Pnec_0223     TRUE 0.989 46.000 0.564 0.002 Y NA
 7349569 7349570 Pnec_0223 Pnec_0224     FALSE 0.073 333.000 0.000 NA   NA
 11524902 7349567   Pnec_0221     FALSE NA 4850.000 0.000 NA   NA
 11667265 7349567   Pnec_0221     FALSE NA 4850.000 0.000 NA   NA
 11809657 7349567   Pnec_0221     FALSE NA 4850.000 0.000 NA   NA
 11524903 7349567   Pnec_0221     FALSE NA 4876.000 0.000 NA   NA
 11667266 7349567   Pnec_0221     FALSE NA 4876.000 0.000 NA   NA
 11809658 7349567   Pnec_0221     FALSE NA 4876.000 0.000 NA   NA
 11524904 7349567   Pnec_0221     FALSE NA 4895.000 0.000 NA   NA
 11667267 7349567   Pnec_0221     FALSE NA 4895.000 0.000 NA   NA
 11809659 7349567   Pnec_0221     FALSE NA 4895.000 0.000 NA   NA
 11524905 7349567   Pnec_0221     FALSE NA 4921.000 0.000 NA   NA
 11667268 7349567   Pnec_0221     FALSE NA 4921.000 0.000 NA   NA
 11809660 7349567   Pnec_0221     FALSE NA 4921.000 0.000 NA   NA
 11524906 7349567   Pnec_0221     FALSE NA 4940.000 0.000 NA   NA
 11667269 7349567   Pnec_0221     FALSE NA 4940.000 0.000 NA   NA
 11809661 7349567   Pnec_0221     FALSE NA 4940.000 0.000 NA   NA
 11524907 7349567   Pnec_0221     FALSE NA 4966.000 0.000 NA   NA
 11667270 7349567   Pnec_0221     FALSE NA 4966.000 0.000 NA   NA
 11809662 7349567   Pnec_0221     FALSE NA 4966.000 0.000 NA   NA
 11524908 7349567   Pnec_0221     FALSE NA 4997.000 0.000 NA   NA
 11667271 7349567   Pnec_0221     FALSE NA 4997.000 0.000 NA   NA
 11809663 7349567   Pnec_0221     FALSE NA 4997.000 0.000 NA   NA
 7349571 7349572 Pnec_0225 Pnec_0226     FALSE 0.419 56.000 0.029 NA   NA
 7349572 7349573 Pnec_0226 Pnec_0227     TRUE 0.811 -27.000 0.000 NA   NA
 7349573 7349574 Pnec_0227 Pnec_0228     FALSE 0.245 77.000 0.000 NA   NA
 7349574 7349575 Pnec_0228 Pnec_0229     TRUE 0.923 17.000 0.152 1.000 N NA
 7349575 7349576 Pnec_0229 Pnec_0230     TRUE 0.972 54.000 0.275 0.003 Y NA
 7349576 7349577 Pnec_0230 Pnec_0231     TRUE 0.936 37.000 0.254 1.000 N NA
 7349580 7349581 Pnec_0234 Pnec_0235     FALSE 0.496 47.000 0.007 1.000 N NA
 7349581 7349582 Pnec_0235 Pnec_0236     TRUE 0.863 3.000 0.027 1.000 N NA
 7349582 7349583 Pnec_0236 Pnec_0237     TRUE 0.942 -16.000 0.110 NA   NA
 7349583 7349584 Pnec_0237 Pnec_0238     FALSE 0.099 169.000 0.016 NA   NA
 7349584 7349585 Pnec_0238 Pnec_0239     TRUE 0.905 10.000 0.107 1.000   NA
 7349588 7349589 Pnec_0242 Pnec_0243     FALSE 0.568 43.000 0.000 NA   NA
 7349589 7349590 Pnec_0243 Pnec_0244     TRUE 0.959 -3.000 0.141 NA   NA
 7349590 7349591 Pnec_0244 Pnec_0245     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA   NA
 7349592 7349593 Pnec_0246 Pnec_0247     FALSE 0.094 211.000 0.000 NA   NA
 7349595 7349596 Pnec_0249 Pnec_0250     TRUE 0.971 40.000 0.198 1.000 Y NA
 7349598 7349599 Pnec_0252 Pnec_0253     FALSE 0.475 73.000 0.049 1.000 N NA
 7349599 7349600 Pnec_0253 Pnec_0254   leuS TRUE 0.703 43.000 0.009 0.069 N NA
 7349600 7349601 Pnec_0254 Pnec_0255 leuS   TRUE 0.922 15.000 0.182 NA N NA
 7349601 7349602 Pnec_0255 Pnec_0256     TRUE 0.925 18.000 0.199 NA N NA
 7349602 7349603 Pnec_0256 Pnec_0257   proA FALSE 0.505 66.000 0.047 1.000 N NA
 7349603 7349604 Pnec_0257 Pnec_0258 proA   TRUE 0.708 22.000 0.028 NA   NA
 7349604 7349605 Pnec_0258 Pnec_0259     FALSE 0.286 74.000 0.029 NA   NA
 7349605 7349606 Pnec_0259 Pnec_0260     FALSE 0.140 78.000 0.004 NA N NA
 7349606 7349607 Pnec_0260 Pnec_0261     TRUE 0.705 13.000 0.011 1.000 N NA
 7349608 7349609 Pnec_0262 Pnec_0263 apaH   FALSE 0.533 40.000 0.004 1.000 N NA
 7349610 7349611 Pnec_0264 Pnec_0265     TRUE 0.973 -7.000 0.263 NA N NA
 7349611 7349612 Pnec_0265 Pnec_0266     TRUE 0.900 33.000 0.109 1.000 N NA
 7349612 7349613 Pnec_0266 Pnec_0267   pyrB TRUE 0.992 0.000 0.247 1.000 Y NA
 7349613 7349614 Pnec_0267 Pnec_0268 pyrB   FALSE 0.368 39.000 0.002 NA   NA
 7349614 7349615 Pnec_0268 Pnec_0269     TRUE 0.682 24.000 0.000 NA   NA
 7349615 7349616 Pnec_0269 Pnec_0270     FALSE 0.568 43.000 0.000 NA   NA
 7349616 7349617 Pnec_0270 Pnec_0271     TRUE 0.830 0.000 0.000 NA   NA
 7349617 7349618 Pnec_0271 Pnec_0272     TRUE 0.682 14.000 0.000 NA   NA
 7349618 7349619 Pnec_0272 Pnec_0273     TRUE 0.681 26.000 0.000 NA   NA
 7349620 7349621 Pnec_0274 Pnec_0275     TRUE 0.681 13.000 0.000 NA   NA
 7349621 7349622 Pnec_0275 Pnec_0276     TRUE 0.684 22.000 0.000 NA   NA
 7349623 7349624 Pnec_0277 Pnec_0278     TRUE 0.921 33.000 0.018 1.000 Y NA
 7349624 7349625 Pnec_0278 Pnec_0279     TRUE 0.993 12.000 0.500 0.005 Y NA
 7349625 7349626 Pnec_0279 Pnec_0280     TRUE 0.985 3.000 0.118 1.000 Y NA
 7349626 7349627 Pnec_0280 Pnec_0281     TRUE 0.971 39.000 0.074 0.006 Y NA
 7349628 7349629 Pnec_0282 Pnec_0283     TRUE 0.820 1.000 0.000 NA   NA
 7349630 7349631 Pnec_0284 Pnec_0285     FALSE 0.112 176.000 0.000 NA   NA
 7349631 7349632 Pnec_0285 Pnec_0286     TRUE 0.609 35.000 0.013 NA   NA
 7349632 7349633 Pnec_0286 Pnec_0287     TRUE 0.654 36.000 0.000 NA   NA
 7349633 7349634 Pnec_0287 Pnec_0288     TRUE 0.803 3.000 0.000 NA   NA
 7349635 7349636 Pnec_0289 Pnec_0290     FALSE 0.127 110.000 0.003 1.000 N NA
 7349636 7349637 Pnec_0290 Pnec_0291   ribH TRUE 0.967 6.000 0.347 1.000 N NA
 7349637 7349638 Pnec_0291 Pnec_0292 ribH   TRUE 0.974 16.000 0.051 0.003 Y NA
 7349639 7349640 Pnec_0293 Pnec_0294     TRUE 0.827 -10.000 0.000 NA   NA
 7349640 7349641 Pnec_0294 Pnec_0295     TRUE 0.682 24.000 0.000 NA   NA
 7349641 7349642 Pnec_0295 Pnec_0296     TRUE 0.975 8.000 1.000 NA   NA
 7349642 7349643 Pnec_0296 Pnec_0297     TRUE 0.824 26.000 0.059 NA   NA
 7349643 7349644 Pnec_0297 Pnec_0298     FALSE 0.285 60.000 0.009 NA N NA
 7349644 7349645 Pnec_0298 Pnec_0299     TRUE 0.987 17.000 0.456 1.000 Y NA
 7349646 7349647 Pnec_0300 Pnec_0301     TRUE 0.747 -31.000 0.011 NA   NA
 7349647 7349648 Pnec_0301 Pnec_0302     TRUE 0.966 0.000 0.167 1.000   NA
 7349648 7349649 Pnec_0302 Pnec_0303   tolB TRUE 0.705 122.000 0.592 1.000   NA
 7349649 7349650 Pnec_0303 Pnec_0304 tolB   TRUE 0.674 127.000 0.215 0.013 N NA
 7349650 7349651 Pnec_0304 Pnec_0305     TRUE 0.972 29.000 0.460 0.067 N NA
 7349651 7349652 Pnec_0305 Pnec_0306     TRUE 0.995 4.000 0.556 0.028 Y NA
 7349653 7349654 Pnec_0307 Pnec_0308 glyA nrdR TRUE 0.840 35.000 0.069 NA N NA
 7349655 7349656 Pnec_0309 Pnec_0310 adk   FALSE 0.352 115.000 0.056 1.000 N NA
 7349656 7349657 Pnec_0310 Pnec_0311     TRUE 0.933 30.000 0.265 NA   NA
 7349657 7349658 Pnec_0311 Pnec_0312   lpxK TRUE 0.731 69.000 0.263 NA   NA
 7349658 7349659 Pnec_0312 Pnec_0313 lpxK   TRUE 0.897 23.000 0.096 1.000 N NA
 7349659 7349660 Pnec_0313 Pnec_0314     TRUE 0.916 141.000 0.746 0.028 Y NA
 7349661 7349662 Pnec_0315 Pnec_0316     FALSE 0.105 190.000 0.000 NA   NA
 7349664 7349665 Pnec_0318 Pnec_0319     TRUE 0.712 -7.000 0.006 NA   NA
 7349665 7349666 Pnec_0319 Pnec_0320     FALSE 0.576 32.000 0.004 1.000   NA
 7349666 7349667 Pnec_0320 Pnec_0321     FALSE 0.233 58.000 0.006 NA   NA
 7349667 7349668 Pnec_0321 Pnec_0322     FALSE 0.100 198.000 0.000 NA   NA
 7349668 7349669 Pnec_0322 Pnec_0323     FALSE 0.281 70.000 0.000 NA   NA
 7349669 7349670 Pnec_0323 Pnec_0324     FALSE 0.103 194.000 0.000 NA   NA
 7349670 7349671 Pnec_0324 Pnec_0325     FALSE 0.203 93.000 0.000 NA   NA
 7349671 7349672 Pnec_0325 Pnec_0326     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA   NA
 7349672 7349673 Pnec_0326 Pnec_0327     FALSE 0.101 197.000 0.000 NA   NA
 7349673 7349674 Pnec_0327 Pnec_0328     FALSE 0.095 208.000 0.000 NA   NA
 7349676 7349677 Pnec_0330 Pnec_0331     FALSE 0.499 133.000 0.000 1.000 Y NA
 7349677 7349678 Pnec_0331 Pnec_0332     TRUE 0.990 14.000 0.624 1.000 Y NA
 7349678 7349679 Pnec_0332 Pnec_0333     TRUE 0.834 52.000 0.000 1.000 Y NA
 7349679 7349680 Pnec_0333 Pnec_0334     TRUE 0.859 -28.000 0.000 1.000 N NA
 7349680 7349681 Pnec_0334 Pnec_0335     TRUE 0.874 -16.000 0.024 1.000 N NA
 7349681 7349682 Pnec_0335 Pnec_0336     TRUE 0.843 7.000 0.041 1.000 N NA
 7349682 7349683 Pnec_0336 Pnec_0337     TRUE 0.935 -3.000 0.054 1.000 N NA
 7349683 7349684 Pnec_0337 Pnec_0338     TRUE 0.738 15.000 0.000 1.000   NA
 7349684 7349685 Pnec_0338 Pnec_0339     TRUE 0.830 0.000 0.000 NA   NA
 7349685 7349686 Pnec_0339 Pnec_0340     TRUE 0.868 3.000 0.044 NA   NA
 7349686 7349687 Pnec_0340 Pnec_0341     TRUE 0.833 -7.000 0.000 NA   NA
 7349687 7349688 Pnec_0341 Pnec_0342     TRUE 0.681 16.000 0.000 NA   NA
 7349689 7349690 Pnec_0343 Pnec_0344     TRUE 0.680 17.000 0.000 NA   NA
 7349690 7349691 Pnec_0344 Pnec_0345     TRUE 0.985 -3.000 0.667 NA   NA
 7349691 7349692 Pnec_0345 Pnec_0346     FALSE 0.069 409.000 0.000 NA   NA
 7349692 7349693 Pnec_0346 Pnec_0347     TRUE 0.685 21.000 0.000 NA   NA
 7349694 7349695 Pnec_0348 Pnec_0349     FALSE 0.225 82.000 0.000 NA   NA
 7349697 7349698 Pnec_0351 Pnec_0352     TRUE 0.803 3.000 0.000 NA   NA
 7349699 7349700 Pnec_0354 Pnec_0355     TRUE 0.621 60.000 0.095 NA   NA
 7349701 7349702 Pnec_0356 Pnec_0357     TRUE 0.682 23.000 0.000 NA   NA
 7349703 7349704 Pnec_0358 Pnec_0359     TRUE 0.668 33.000 0.000 NA   NA
 7349704 7349705 Pnec_0359 Pnec_0360     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA   NA
 7349705 7349706 Pnec_0360 Pnec_0361     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA   NA
 7349706 7349707 Pnec_0361 Pnec_0362     TRUE 0.621 99.000 0.263 NA   NA
 7349714 7349715 Pnec_0369 Pnec_0370     FALSE 0.156 107.000 0.007 1.000   NA
 7349715 7349716 Pnec_0370 Pnec_0371     FALSE 0.354 57.000 0.008 1.000   NA
 7349716 7349717 Pnec_0371 Pnec_0372     FALSE 0.090 354.000 0.000 1.000   NA
 7349717 7349718 Pnec_0372 Pnec_0373     FALSE 0.605 40.000 0.000 NA   NA
 7349718 7349719 Pnec_0373 Pnec_0374     TRUE 0.684 22.000 0.000 NA   NA
 7349720 7349721 Pnec_0375 Pnec_0376     TRUE 0.699 10.000 0.000 NA   NA
 7349724 7349725 Pnec_0379 Pnec_0380     TRUE 0.684 11.000 0.008 1.000 N NA
 7349727 7349728 Pnec_0382 Pnec_0383     FALSE 0.067 600.000 0.000 NA   NA
 7349731 7349732 Pnec_0386 Pnec_0387   thyA TRUE 0.918 12.000 0.134 1.000 N NA
 7349732 7349733 Pnec_0387 Pnec_0388 thyA   FALSE 0.187 71.000 0.003 1.000   NA
 7349733 7349734 Pnec_0388 Pnec_0389     TRUE 0.815 2.000 0.000 NA   NA
 7349734 7349735 Pnec_0389 Pnec_0390     TRUE 0.684 20.000 0.000 NA   NA
 7349737 7349738 Pnec_0392 Pnec_0393     TRUE 0.908 13.000 0.156 NA   NA
 7349738 7349739 Pnec_0393 Pnec_0394     TRUE 0.863 51.000 0.089 0.004   NA
 7349739 7349740 Pnec_0394 Pnec_0395     FALSE 0.366 58.000 0.000 NA   NA
 7349740 7349741 Pnec_0395 Pnec_0396     FALSE 0.201 94.000 0.000 NA   NA
 7349742 7349743 Pnec_0397 Pnec_0398     TRUE 0.963 9.000 0.389 1.000   NA
 7349743 7349744 Pnec_0398 Pnec_0399     TRUE 0.629 12.000 0.006 1.000   NA
 7349745 7349746 Pnec_0400 Pnec_0401     TRUE 0.894 9.000 0.107 NA   NA
 7349747 7349748 Pnec_0402 Pnec_0403     TRUE 0.721 106.000 0.599 NA   NA
 7349748 7349749 Pnec_0403 Pnec_0404     TRUE 0.761 86.000 0.418 1.000 N NA
 7349749 7349750 Pnec_0404 Pnec_0405     TRUE 0.997 -3.000 0.380 0.010 Y NA
 7349750 7349751 Pnec_0405 Pnec_0406     TRUE 0.976 45.000 0.182 0.010 Y NA
 7349751 7349752 Pnec_0406 Pnec_0407     TRUE 0.991 35.000 0.432 0.010 Y NA
 7349752 7349753 Pnec_0407 Pnec_0408     TRUE 0.919 102.000 0.321 0.010 Y NA
 7349753 7349754 Pnec_0408 Pnec_0409     TRUE 0.986 22.000 0.346 1.000 Y NA
 7349754 7349755 Pnec_0409 Pnec_0410     FALSE 0.214 75.000 0.005 1.000 N NA
 7349755 7349756 Pnec_0410 Pnec_0411     FALSE 0.131 137.000 0.008 1.000 N NA
 7349756 7349757 Pnec_0411 Pnec_0412     TRUE 0.968 0.000 0.187 1.000   NA
 7349757 7349758 Pnec_0412 Pnec_0413   rnc TRUE 0.926 6.000 0.117 1.000   NA
 7349758 7349759 Pnec_0413 Pnec_0414 rnc   TRUE 0.844 45.000 0.058 0.027   NA
 7349759 7349760 Pnec_0414 Pnec_0415   recO TRUE 0.868 6.000 0.049 1.000   NA
 7349760 7349761 Pnec_0415 Pnec_0416 recO   TRUE 0.681 13.000 0.000 NA   NA
 7349761 7349762 Pnec_0416 Pnec_0417     TRUE 0.680 27.000 0.000 NA   NA
 7349762 7349763 Pnec_0417 Pnec_0418     TRUE 0.949 -7.000 0.081 1.000 N NA
 7349764 7349765 Pnec_0419 Pnec_0420     FALSE 0.263 74.000 0.000 NA   NA
 7349765 7349766 Pnec_0420 Pnec_0421     FALSE 0.251 76.000 0.000 NA   NA
 7349766 7349767 Pnec_0421 Pnec_0422     FALSE 0.421 88.000 0.074 NA   NA
 7349768 7349769 Pnec_0423 Pnec_0424     TRUE 0.940 31.000 0.227 1.000 N NA
 7349769 7349770 Pnec_0424 Pnec_R0012     FALSE 0.160 117.000 0.000 NA   NA
 7349770 7349771 Pnec_R0012 Pnec_R0013     FALSE 0.484 50.000 0.000 NA   NA
 7349771 7349772 Pnec_R0013 Pnec_0425     FALSE 0.133 138.000 0.000 NA   NA
 7349774 7349775 Pnec_0427 Pnec_0428   rpsF FALSE 0.137 135.000 0.000 NA   NA
 7349775 7349776 Pnec_0428 Pnec_0429 rpsF   FALSE 0.379 135.000 0.122 NA   NA
 7349776 7349777 Pnec_0429 Pnec_0430   rpsR TRUE 0.896 14.000 0.128 NA   NA
 7349777 7349778 Pnec_0430 Pnec_0431 rpsR   TRUE 0.992 14.000 0.499 0.032 Y NA
 7349778 7349779 Pnec_0431 Pnec_0432     TRUE 0.882 26.000 0.074 1.000 N NA
 7349779 7349780 Pnec_0432 Pnec_0433     FALSE 0.067 588.000 0.000 NA   NA
 7349781 7349782 Pnec_0434 Pnec_0435     FALSE 0.090 233.000 0.000 NA   NA
 7349782 7349783 Pnec_0435 Pnec_0436     TRUE 0.742 34.000 0.023 1.000 N NA
 7349783 7349784 Pnec_0436 Pnec_0437     TRUE 0.987 23.000 0.447 1.000 Y NA
 7349784 7349785 Pnec_0437 Pnec_0438     TRUE 0.890 48.000 0.227 1.000 N NA
 7349785 7349786 Pnec_0438 Pnec_0439     TRUE 0.980 1.000 0.473 NA N NA
 7349786 7349787 Pnec_0439 Pnec_0440     TRUE 0.975 42.000 0.351 NA Y NA
 7349787 7349788 Pnec_0440 Pnec_0441     TRUE 0.957 12.000 0.061 1.000 Y NA
 7349788 7349789 Pnec_0441 Pnec_0442     TRUE 0.915 0.000 0.060 NA   NA
 7349790 7349791 Pnec_0443 Pnec_0444     TRUE 0.670 32.000 0.000 NA   NA
 7349791 7349792 Pnec_0444 Pnec_0445     TRUE 0.987 -3.000 0.102 1.000 Y NA
 7349792 7349793 Pnec_0445 Pnec_0446     TRUE 0.975 10.000 0.125 1.000 Y NA
 7349793 7349794 Pnec_0446 Pnec_0447     TRUE 0.676 27.000 0.011 1.000   NA
 7349794 7349795 Pnec_0447 Pnec_0448     FALSE 0.153 121.000 0.000 NA   NA
 7349795 7349796 Pnec_0448 Pnec_0449     TRUE 0.682 19.000 0.000 NA   NA
 7349796 7349797 Pnec_0449 Pnec_0450     TRUE 0.981 -7.000 0.501 NA   NA
 7349797 7349798 Pnec_0450 Pnec_0451     TRUE 0.668 33.000 0.000 NA   NA
 7349800 7349801 Pnec_0453 Pnec_0454     FALSE 0.418 54.000 0.000 NA   NA
 7349801 7349802 Pnec_0454 Pnec_0456     FALSE 0.079 283.000 0.000 NA   NA
 7349802 7349803 Pnec_0456 Pnec_0457     FALSE 0.163 115.000 0.000 NA   NA
 7349803 7349804 Pnec_0457 Pnec_0458     FALSE 0.168 112.000 0.000 NA   NA
 7349804 7349805 Pnec_0458 Pnec_0459     FALSE 0.568 43.000 0.000 NA   NA
 7349805 7349806 Pnec_0459 Pnec_0460     FALSE 0.178 108.000 0.000 NA   NA
 7349806 7349807 Pnec_0460 Pnec_0461     FALSE 0.110 178.000 0.000 NA   NA
 7349808 7349809 Pnec_0462 Pnec_0463     TRUE 0.803 -33.000 0.021 NA   NA
 7349809 7349810 Pnec_0463 Pnec_0464     TRUE 0.928 -3.000 0.048 1.000 N NA
 7349810 7349811 Pnec_0464 Pnec_0465     TRUE 0.662 54.000 0.055 1.000 N NA
 7349811 7349812 Pnec_0465 Pnec_0466     TRUE 0.823 32.000 0.046 1.000 N NA
 7349813 7349814 Pnec_0467 Pnec_0468     FALSE 0.098 137.000 0.003 1.000 N NA
 7349814 7349815 Pnec_0468 Pnec_0469     TRUE 0.924 29.000 0.160 1.000 N NA
 7349815 7349816 Pnec_0469 Pnec_0470     TRUE 0.960 30.000 0.448 1.000 N NA
 7349816 7349817 Pnec_0470 Pnec_0471     TRUE 0.976 22.000 0.359 0.002   NA
 7349817 7349818 Pnec_0471 Pnec_0472     TRUE 0.980 -34.000 0.500 1.000   NA
 7349818 7349819 Pnec_0472 Pnec_0473     TRUE 0.989 29.000 0.634 1.000 Y NA
 7349819 7349820 Pnec_0473 Pnec_0474     TRUE 0.965 38.000 0.794 1.000 N NA
 7349821 7349822 Pnec_0475 Pnec_0476     TRUE 0.830 0.000 0.000 NA   NA
 7349822 7349823 Pnec_0476 Pnec_0477     TRUE 0.943 36.000 0.048 1.000 Y NA
 7349823 7349824 Pnec_0477 Pnec_0478     FALSE 0.568 43.000 0.000 NA   NA
 7349824 7349825 Pnec_0478 Pnec_0479     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA   NA
 7349825 7349826 Pnec_0479 Pnec_0480     TRUE 0.790 38.000 0.000 0.053   NA
 7349826 7349827 Pnec_0480 Pnec_0481     TRUE 0.681 16.000 0.000 NA   NA
 7349827 7349828 Pnec_0481 Pnec_0482     FALSE 0.120 157.000 0.000 NA   NA
 7349829 7349830 Pnec_0483 Pnec_0484     FALSE 0.252 101.000 0.000 1.000 N NA
 7349831 7349832 Pnec_0485 Pnec_0486 lysS   TRUE 0.983 13.000 0.162 0.063 Y NA
 7349832 7349833 Pnec_0486 Pnec_0487     TRUE 0.735 37.000 0.028 1.000 N NA
 7349833 7349834 Pnec_0487 Pnec_0488     FALSE 0.551 8.000 0.005 NA   NA
 7349835 7349836 Pnec_0489 Pnec_0490     TRUE 0.986 -7.000 0.620 1.000 N NA
 7349836 7349837 Pnec_0490 Pnec_0491     TRUE 0.913 -27.000 0.061 NA N NA
 7349837 7349838 Pnec_0491 Pnec_0492     FALSE 0.207 91.000 0.000 NA   NA
 7349838 7349839 Pnec_0492 Pnec_0493     TRUE 0.776 4.000 0.000 NA   NA
 7349839 7349840 Pnec_0493 Pnec_0494     TRUE 0.676 28.000 0.000 NA   NA
 7349842 7349843 Pnec_0495 Pnec_0496     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA   NA
 7349843 7349844 Pnec_0496 Pnec_0497     FALSE 0.057 134.000 0.002 NA   NA
 7349845 7349846 Pnec_0498 Pnec_0499     TRUE 0.893 37.000 0.115 1.000 N NA
 7349846 7349847 Pnec_0499 Pnec_0500   dapD TRUE 0.983 10.000 0.109 0.006 Y NA
 7349848 7349849 Pnec_0501 Pnec_0502     TRUE 0.759 19.000 0.003 0.018   NA
 7349849 7349850 Pnec_0502 Pnec_0503     FALSE 0.576 10.000 0.002 1.000   NA
 7349850 7349851 Pnec_0503 Pnec_0504     TRUE 0.736 64.000 0.000 1.000 Y NA
 7349852 7349853 Pnec_0505 Pnec_0506     TRUE 0.754 5.000 0.000 NA   NA
 7349854 7349855 Pnec_0507 Pnec_0508   tsf TRUE 0.996 0.000 0.748 1.000 Y NA
 7349855 7349856 Pnec_0508 Pnec_0509 tsf pyrH FALSE 0.220 187.000 0.047 1.000 N NA
 7349856 7349857 Pnec_0509 Pnec_0510 pyrH frr TRUE 0.858 12.000 0.058 1.000 N NA
 7349857 7349858 Pnec_0510 Pnec_0511 frr   TRUE 0.961 26.000 0.409 1.000 N NA
 7349858 7349859 Pnec_0511 Pnec_0512     TRUE 0.987 27.000 0.400 1.000 Y NA
 7349859 7349860 Pnec_0512 Pnec_0513     TRUE 0.994 0.000 0.372 1.000 Y NA
 7349860 7349861 Pnec_0513 Pnec_0514     TRUE 0.985 -12.000 0.568 1.000 N NA
 7349861 7349862 Pnec_0514 Pnec_0515     TRUE 0.992 -3.000 0.204 1.000 Y NA
 7349862 7349863 Pnec_0515 Pnec_0516     TRUE 0.986 19.000 0.354 1.000 Y NA
 7349863 7349864 Pnec_0516 Pnec_0517   lpxD TRUE 0.993 6.000 0.814 1.000 Y NA
 7349864 7349865 Pnec_0517 Pnec_0518 lpxD fabZ TRUE 0.948 47.000 0.796 1.000 N NA
 7349865 7349866 Pnec_0518 Pnec_0519 fabZ   TRUE 0.989 0.000 0.850 1.000 N NA
 7349866 7349867 Pnec_0519 Pnec_0520     TRUE 0.984 11.000 0.289 1.000 Y NA
 7349867 7349868 Pnec_0520 Pnec_0521   rnhB TRUE 0.972 -3.000 0.186 1.000 N NA
 7349868 7349869 Pnec_0521 Pnec_0522 rnhB   TRUE 0.892 15.000 0.046 0.031 N NA
 7349870 7349871 Pnec_0523 Pnec_0524     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA   NA
 7349871 7349872 Pnec_0524 Pnec_0525     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA   NA
 7349872 7349873 Pnec_0525 Pnec_0526   smpB FALSE 0.333 61.000 0.000 NA   NA
 7349874 7349875 Pnec_0527 Pnec_0528     TRUE 0.921 -7.000 0.063 NA   NA
 7349875 7349876 Pnec_0528 Pnec_0529     FALSE 0.467 27.000 0.003 NA   NA
 7349876 7349877 Pnec_0529 Pnec_0530   guaA TRUE 0.965 25.000 0.190 0.002 N NA
 7349877 7349878 Pnec_0530 Pnec_0531 guaA   FALSE 0.534 31.000 0.002 1.000   NA
 7349878 7349879 Pnec_0531 Pnec_0532     TRUE 0.776 4.000 0.000 NA   NA
 7349879 7349880 Pnec_0532 Pnec_0533     FALSE 0.165 114.000 0.000 NA   NA
 7349880 7349881 Pnec_0533 Pnec_0534     FALSE 0.245 77.000 0.000 NA   NA
 7349881 7349882 Pnec_0534 Pnec_0535     FALSE 0.187 104.000 0.000 NA   NA
 7349882 7349883 Pnec_0535 Pnec_0536     TRUE 0.814 -24.000 0.000 NA   NA
 7349883 7349884 Pnec_0536 Pnec_0537     FALSE 0.314 64.000 0.000 NA   NA
 7349884 7349885 Pnec_0537 Pnec_0538     FALSE 0.551 45.000 0.000 NA   NA
 7349885 7349886 Pnec_0538 Pnec_0539     FALSE 0.465 29.000 0.004 NA   NA
 7349886 7349887 Pnec_0539 Pnec_0540     FALSE 0.387 56.000 0.000 NA   NA
 7349887 7349888 Pnec_0540 Pnec_0541     TRUE 0.815 2.000 0.000 NA   NA
 7349888 7349889 Pnec_0541 Pnec_0542     FALSE 0.460 62.000 0.038 1.000   NA
 7349889 7349890 Pnec_0542 Pnec_0543     TRUE 0.955 -3.000 0.115 NA N NA
 7349890 7349891 Pnec_0543 Pnec_0544     FALSE 0.244 78.000 0.023 NA   NA
 7349891 7349892 Pnec_0544 Pnec_0545     FALSE 0.214 87.000 0.000 NA   NA
 7349893 7349894 Pnec_0546 Pnec_0547     TRUE 0.681 13.000 0.000 NA   NA
 7349894 7349895 Pnec_0547 Pnec_0548     TRUE 0.906 6.000 0.077 1.000   NA
 7349895 7349896 Pnec_0548 Pnec_0549     TRUE 0.731 18.000 0.034 NA   NA
 7349896 7349897 Pnec_0549 Pnec_0550     TRUE 0.695 27.000 0.025 NA   NA
 7349899 7349900 Pnec_0552 Pnec_0553     TRUE 0.833 -7.000 0.000 NA   NA
 7349900 7349901 Pnec_0553 Pnec_0554     TRUE 0.803 -39.000 0.000 NA   NA
 7349902 7349903 Pnec_0557 Pnec_0558     TRUE 0.623 67.000 0.007 NA Y NA
 7349903 7349904 Pnec_0558 Pnec_0559     TRUE 0.898 81.000 0.396 NA Y NA
 7349904 7349905 Pnec_0559 Pnec_0560     FALSE 0.137 130.000 0.007 1.000 N NA
 7349905 7349906 Pnec_0560 Pnec_0561     TRUE 0.682 25.000 0.000 NA   NA
 7349906 7349907 Pnec_0561 Pnec_0562     FALSE 0.239 78.000 0.000 NA   NA
 7349907 7349908 Pnec_0562 Pnec_0563     FALSE 0.582 240.000 0.901 NA   NA
 7349908 7349909 Pnec_0563 Pnec_0564     TRUE 0.823 -15.000 0.000 NA   NA
 7349909 7349910 Pnec_0564 Pnec_0565     TRUE 0.975 0.000 0.333 NA   NA
 7349910 7349911 Pnec_0565 Pnec_0566     TRUE 0.870 48.000 0.241 NA   NA
 7349912 7349913 Pnec_0567 Pnec_0568     TRUE 0.833 -7.000 0.000 NA   NA
 7349913 7349914 Pnec_0568 Pnec_0569     FALSE 0.225 82.000 0.000 NA   NA
 7349915 7349916 Pnec_0570 Pnec_0571   cls TRUE 0.843 -3.000 0.022 NA   NA
 7349917 7349918 Pnec_0572 Pnec_0573     TRUE 0.610 112.000 0.250 1.000   NA
 7349919 7349920 Pnec_0574 Pnec_0575     FALSE 0.095 131.000 0.008 NA   NA
 7349920 7349921 Pnec_0575 Pnec_0576     FALSE 0.103 194.000 0.000 NA   NA
 7349924 7349925 Pnec_0579 Pnec_0580     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA   NA
 7349925 7349926 Pnec_0580 Pnec_0581     TRUE 0.754 5.000 0.000 NA   NA
 7349926 7349927 Pnec_0581 Pnec_0582     FALSE 0.195 98.000 0.000 NA   NA
 7349927 7349928 Pnec_0582 Pnec_0583     TRUE 0.682 12.000 0.000 NA   NA
 7349928 7349929 Pnec_0583 Pnec_0584     FALSE 0.092 222.000 0.000 NA   NA
 7349929 7349930 Pnec_0584 Pnec_0585     TRUE 0.933 7.000 0.000 NA Y NA
 7349932 7349933 Pnec_0588 Pnec_0589     FALSE 0.084 253.000 0.000 NA   NA
 7349934 7349935 Pnec_0590 Pnec_0591     FALSE 0.351 55.000 0.014 NA   NA
 7349935 7349936 Pnec_0591 Pnec_0592     FALSE 0.609 4.000 0.004 NA   NA
 7349943 7349944 Pnec_0599 Pnec_0600     FALSE 0.133 138.000 0.000 NA   NA
 7349944 7349945 Pnec_0600 Pnec_0601     FALSE 0.148 127.000 0.000 NA   NA
 7349948 7349949 Pnec_0604 Pnec_0605     TRUE 0.682 14.000 0.000 NA   NA
 7349950 7349951 Pnec_0606 Pnec_0607     TRUE 0.619 34.000 0.005 1.000 N NA
 7349951 7349952 Pnec_0607 Pnec_0608     FALSE 0.176 133.000 0.000 1.000   NA
 7349952 7349953 Pnec_0608 Pnec_0609     FALSE 0.201 168.000 0.043 1.000   NA
 7349953 7349954 Pnec_0609 Pnec_0610     TRUE 0.803 13.000 0.043 1.000   NA
 7349956 7349957 Pnec_0612 Pnec_0613     TRUE 0.681 18.000 0.000 NA   NA
 7349957 7349958 Pnec_0613 Pnec_0614     FALSE 0.303 66.000 0.000 NA   NA
 7349959 7349960 Pnec_0615 Pnec_0616     FALSE 0.263 74.000 0.000 NA   NA
 7349960 7349961 Pnec_0616 Pnec_0617     FALSE 0.193 100.000 0.000 NA   NA
 7349961 7349962 Pnec_0617 Pnec_0618     FALSE 0.291 68.000 0.000 NA   NA
 7349962 7349963 Pnec_0618 Pnec_0619     TRUE 0.683 15.000 0.000 NA   NA
 7349963 7349964 Pnec_0619 Pnec_0620     FALSE 0.210 89.000 0.000 NA   NA
 7349966 7349967 Pnec_0622 Pnec_0623     TRUE 0.995 -7.000 0.500 1.000 Y NA
 7349967 7349968 Pnec_0623 Pnec_0624     FALSE 0.124 204.000 0.000 1.000   NA
 7349970 7349971 Pnec_0626 Pnec_0627     TRUE 0.654 36.000 0.000 NA   NA
 7349973 7349974 Pnec_0629 Pnec_0630     FALSE 0.071 346.000 0.000 NA   NA
 7349974 7349975 Pnec_0630 Pnec_0631     FALSE 0.314 64.000 0.000 NA   NA
 7349975 7349976 Pnec_0631 Pnec_0632     FALSE 0.427 285.000 0.372 NA   NA
 7349976 7349977 Pnec_0632 Pnec_0633     TRUE 0.953 36.000 0.516 NA   NA
 7349977 7349978 Pnec_0633 Pnec_0634     TRUE 0.811 29.000 0.056 NA   NA
 7349979 7349980 Pnec_0635 Pnec_0636     TRUE 0.944 4.000 0.154 NA N NA
 7349980 7349981 Pnec_0636 Pnec_0637   rpmE2 FALSE 0.408 90.000 0.067 NA N NA
 7349981 7349982 Pnec_0637 Pnec_0638 rpmE2 rho FALSE 0.252 153.000 0.049 1.000 N NA
 7349982 7349983 Pnec_0638 Pnec_0639 rho   FALSE 0.242 264.000 0.087 1.000   NA
 7349984 7349985 Pnec_0640 Pnec_0641     TRUE 0.977 9.000 0.173 NA Y NA
 7349989 7349990 Pnec_0644 Pnec_0645     TRUE 0.795 67.000 0.411 NA   NA
 7349990 7349991 Pnec_0645 Pnec_0646   recR TRUE 0.961 28.000 0.604 NA   NA
 7349991 7349992 Pnec_0646 Pnec_0647 recR   FALSE 0.110 241.000 0.000 1.000   NA
 7349992 7349993 Pnec_0647 Pnec_0648     FALSE 0.209 211.000 0.000 0.015   NA
 7349993 7349994 Pnec_0648 Pnec_0649     FALSE 0.069 413.000 0.000 NA   NA
 7349994 7349995 Pnec_0649 Pnec_0651     TRUE 0.729 7.000 0.000 NA   NA
 7349995 7349996 Pnec_0651 Pnec_0652     TRUE 0.820 1.000 0.000 NA   NA
 7349996 7349997 Pnec_0652 Pnec_0655     FALSE 0.582 42.000 0.000 NA   NA
 7349997 7349998 Pnec_0655 Pnec_0656     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA   NA
 7349998 7349999 Pnec_0656 Pnec_0657     TRUE 0.743 38.000 0.032 1.000 N NA
 7349999 7350000 Pnec_0657 Pnec_0658     TRUE 0.685 21.000 0.000 NA   NA
 7350000 7350001 Pnec_0658 Pnec_0660     TRUE 0.833 -7.000 0.000 NA   NA
 7350003 7350004 Pnec_0662 Pnec_0663 ndk   TRUE 0.632 78.000 0.156 1.000   NA
 7350004 7350005 Pnec_0663 Pnec_0664   ispG FALSE 0.592 27.000 0.004 1.000   NA
 7350005 7350006 Pnec_0664 Pnec_0665 ispG   TRUE 0.935 33.000 0.207 1.000 N NA
 7350006 7350007 Pnec_0665 Pnec_0666     TRUE 0.891 48.000 0.259 1.000   NA
 7350007 7350008 Pnec_0666 Pnec_0667     TRUE 0.980 0.000 0.492 NA   NA
 7350008 7350009 Pnec_0667 Pnec_0668   engA TRUE 0.968 -3.000 0.203 NA   NA
 7350009 7350010 Pnec_0668 Pnec_0669 engA   FALSE 0.187 163.000 0.036 1.000   NA
 7350012 7350013 Pnec_0671 Pnec_0672     TRUE 0.820 1.000 0.000 NA   NA
 7350013 7350014 Pnec_0672 Pnec_0673     TRUE 0.827 -10.000 0.000 NA   NA
 7350014 7350015 Pnec_0673 Pnec_0674     TRUE 0.998 0.000 0.947 0.017 Y NA
 7350015 7350016 Pnec_0674 Pnec_0675     TRUE 0.826 21.000 0.045 1.000 N NA
 7350016 7350017 Pnec_0675 Pnec_0676     TRUE 0.742 62.000 0.161 1.000 N NA
 7350017 7350018 Pnec_0676 Pnec_0677     FALSE 0.281 55.000 0.002 1.000   NA
 7350018 7350019 Pnec_0677 Pnec_0678     TRUE 0.928 3.000 0.095 NA   NA
 7350022 7350023 Pnec_0681 Pnec_R0016     FALSE 0.098 201.000 0.000 NA   NA
 7350024 7350025 Pnec_0682 Pnec_0683     TRUE 0.891 50.000 0.147 0.029 N NA
 7350025 7350026 Pnec_0683 Pnec_0684     FALSE 0.435 15.000 0.002 NA   NA
 7350029 7350030 Pnec_0687 Pnec_0688     TRUE 0.859 41.000 0.123 NA N NA
 7350031 7350032 Pnec_0689 Pnec_0690     FALSE 0.095 209.000 0.000 NA   NA
 7350032 7350033 Pnec_0690 Pnec_0691     TRUE 0.699 10.000 0.000 NA   NA
 7350033 7350034 Pnec_0691 Pnec_0693     TRUE 0.776 4.000 0.000 NA   NA
 7350034 7350035 Pnec_0693 Pnec_0694     TRUE 0.671 30.000 0.000 NA   NA
 7350035 7350036 Pnec_0694 Pnec_0695     FALSE 0.512 105.000 0.123 1.000   NA
 7350038 7350039 Pnec_0697 Pnec_0698     FALSE 0.205 92.000 0.000 NA   NA
 7350039 7350040 Pnec_0698 Pnec_0699     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA   NA
 7350040 7350041 Pnec_0699 Pnec_0700     TRUE 0.699 10.000 0.000 NA   NA
 7350041 7350042 Pnec_0700 Pnec_0701     TRUE 0.833 -7.000 0.000 NA   NA
 7350043 7350044 Pnec_0702 Pnec_0703     TRUE 0.874 54.000 0.318 1.000 N NA
 7350044 7350045 Pnec_0703 Pnec_0704     TRUE 0.961 19.000 0.404 1.000 N NA
 7350045 7350046 Pnec_0704 Pnec_0705     TRUE 0.871 36.000 0.088 1.000   NA
 7350047 7350048 Pnec_0706 Pnec_0707     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA   NA
 7350048 7350049 Pnec_0707 Pnec_0708     FALSE 0.219 85.000 0.000 NA   NA
 7350049 7350050 Pnec_0708 Pnec_0709     FALSE 0.205 92.000 0.000 NA   NA
 7350052 7350053 Pnec_0711 Pnec_0712     TRUE 0.827 -10.000 0.000 NA   NA
 7350053 7350054 Pnec_0712 Pnec_0713     FALSE 0.539 46.000 0.000 NA   NA
 7350054 7350055 Pnec_0713 Pnec_0714     FALSE 0.100 199.000 0.000 NA   NA
 7350056 7350057 Pnec_0715 Pnec_0716     TRUE 0.867 -7.000 0.000 1.000   NA
 7350057 7350058 Pnec_0716 Pnec_0717     FALSE 0.163 115.000 0.000 NA   NA
 7350058 7350059 Pnec_0717 Pnec_0718     FALSE 0.087 238.000 0.000 NA   NA
 7350060 7350061 Pnec_0719 Pnec_0720     FALSE 0.582 42.000 0.000 NA   NA
 7350061 7350062 Pnec_0720 Pnec_0721     FALSE 0.199 96.000 0.000 NA   NA
 7350062 7350063 Pnec_0721 Pnec_0722     FALSE 0.093 220.000 0.000 NA   NA
 7350063 7350064 Pnec_0722 Pnec_0723     TRUE 0.665 34.000 0.000 NA   NA
 7350064 7350065 Pnec_0723 Pnec_0724     FALSE 0.086 241.000 0.000 NA   NA
 7350065 7350066 Pnec_0724 Pnec_0725     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA   NA
 7350066 7350067 Pnec_0725 Pnec_0726     TRUE 0.830 0.000 0.000 NA   NA
 7350067 7350068 Pnec_0726 Pnec_0727     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA   NA
 7350068 7350069 Pnec_0727 Pnec_0728     FALSE 0.076 295.000 0.000 NA   NA
 7350069 7350070 Pnec_0728 Pnec_0729     TRUE 0.682 24.000 0.000 NA   NA
 7350070 7350071 Pnec_0729 Pnec_0730     FALSE 0.109 180.000 0.000 NA   NA
 7350071 7350072 Pnec_0730 Pnec_0731     FALSE 0.083 255.000 0.000 NA   NA
 7350072 7350073 Pnec_0731 Pnec_0732     TRUE 0.680 17.000 0.000 NA   NA
 7350073 7350074 Pnec_0732 Pnec_0733     FALSE 0.085 246.000 0.000 NA   NA
 7350074 7350075 Pnec_0733 Pnec_0734     TRUE 0.699 10.000 0.000 NA   NA
 7350075 7350076 Pnec_0734 Pnec_0735     TRUE 0.803 3.000 0.000 NA   NA
 7350076 7350077 Pnec_0735 Pnec_0736     TRUE 0.815 2.000 0.000 NA   NA
 7350077 7350078 Pnec_0736 Pnec_0737     FALSE 0.068 489.000 0.000 NA   NA
 7350078 7350079 Pnec_0737 Pnec_0738     FALSE 0.582 42.000 0.000 NA   NA
 7350079 7350080 Pnec_0738 Pnec_0739     FALSE 0.109 180.000 0.000 NA   NA
 7350080 7350081 Pnec_0739 Pnec_0741     FALSE 0.498 49.000 0.000 NA   NA
 7350081 7350082 Pnec_0741 Pnec_0742     FALSE 0.582 42.000 0.000 NA   NA
 7350082 7350083 Pnec_0742 Pnec_0743     FALSE 0.263 74.000 0.000 NA   NA
 7350083 7350084 Pnec_0743 Pnec_R0017     FALSE 0.281 70.000 0.000 NA   NA
 7350084 7350085 Pnec_R0017 Pnec_0744     FALSE 0.085 244.000 0.000 NA   NA
 7350088 7350089 Pnec_0747 Pnec_0748     TRUE 0.815 -22.000 0.000 NA   NA
 7350089 7350090 Pnec_0748 Pnec_0749     FALSE 0.214 87.000 0.000 NA   NA
 7350091 7350092 Pnec_R0018 Pnec_0750     FALSE 0.203 93.000 0.000 NA   NA
 7350093 7350094 Pnec_0751 Pnec_0752     TRUE 0.758 77.000 0.000 0.024 Y NA
 7350094 7350095 Pnec_0752 Pnec_0753     TRUE 0.978 6.000 0.286 0.005 N NA
 7350095 7350096 Pnec_0753 Pnec_0754     TRUE 0.970 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7350096 7350097 Pnec_0754 Pnec_0755     TRUE 0.638 42.000 0.017 1.000 N NA
 7350098 7350099 Pnec_0756 Pnec_R0019     FALSE 0.333 61.000 0.000 NA   NA
 7350099 7350100 Pnec_R0019 Pnec_0757     FALSE 0.071 338.000 0.000 NA   NA
 7350100 7350101 Pnec_0757 Pnec_0758     TRUE 0.934 -31.000 0.000 0.001   NA
 7350101 7350102 Pnec_0758 Pnec_0759     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA   NA
 7350102 7350103 Pnec_0759 Pnec_0760     FALSE 0.104 192.000 0.000 NA   NA
 7350103 7350104 Pnec_0760 Pnec_0761     FALSE 0.086 241.000 0.000 NA   NA
 7350104 7350105 Pnec_0761 Pnec_0762     FALSE 0.251 76.000 0.000 NA   NA
 7350105 7350106 Pnec_0762 Pnec_0763     FALSE 0.605 40.000 0.000 NA   NA
 7350106 7350107 Pnec_0763 Pnec_0764     TRUE 0.641 37.000 0.000 NA   NA
 7350107 7350108 Pnec_0764 Pnec_0765     FALSE 0.291 68.000 0.000 NA   NA
 7350109 7350110 Pnec_0767 Pnec_0768     TRUE 0.927 75.000 0.198 0.005 Y NA
 7350111 7350112 Pnec_0769 Pnec_0770     FALSE 0.187 104.000 0.000 NA   NA
 7350112 7350113 Pnec_0770 Pnec_0771     TRUE 0.729 7.000 0.000 NA   NA
 7350113 7350114 Pnec_0771 Pnec_0772     FALSE 0.126 146.000 0.000 NA   NA
 7350114 7350115 Pnec_0772 Pnec_0773     TRUE 0.821 -16.000 0.000 NA   NA
 7350115 7350116 Pnec_0773 Pnec_0774     FALSE 0.077 288.000 0.000 NA   NA
 7350116 7350117 Pnec_0774 Pnec_0775     FALSE 0.469 51.000 0.000 NA   NA
 7350117 7350118 Pnec_0775 Pnec_0776     FALSE 0.178 108.000 0.000 NA   NA
 7350118 7350119 Pnec_0776 Pnec_0777     FALSE 0.073 328.000 0.000 NA   NA
 7350119 7350120 Pnec_0777 Pnec_0778     FALSE 0.110 178.000 0.000 NA   NA
 7350120 7350121 Pnec_0778 Pnec_0779     TRUE 0.682 12.000 0.000 NA   NA
 7350121 7350122 Pnec_0779 Pnec_0780     TRUE 0.803 3.000 0.000 NA   NA
 7350123 7350124 Pnec_0781 Pnec_0782     TRUE 0.881 43.000 0.017 1.000 Y NA
 7350125 7350126 Pnec_0783 Pnec_R0020     FALSE 0.184 105.000 0.000 NA   NA
 7350126 7350127 Pnec_R0020 Pnec_0784     FALSE 0.078 286.000 0.000 NA   NA
 7350129 7350130 Pnec_0786 Pnec_0787     FALSE 0.161 116.000 0.000 NA   NA
 7350131 7350132 Pnec_0789 Pnec_0790     TRUE 0.679 80.000 0.218 1.000   NA
 7350132 7350133 Pnec_0790 Pnec_0791     FALSE 0.303 66.000 0.000 NA   NA
 7350134 7350135 Pnec_0792 Pnec_0793     TRUE 0.682 23.000 0.000 NA   NA
 7350135 7350136 Pnec_0793 Pnec_0794     FALSE 0.459 45.000 0.003 1.000 N NA
 7350136 7350137 Pnec_0794 Pnec_0795     TRUE 0.983 16.000 0.291 1.000 Y NA
 7350139 7350140 Pnec_R0021 Pnec_0797     FALSE 0.112 176.000 0.000 NA   NA
 7350140 7350141 Pnec_0797 Pnec_0798     TRUE 0.684 20.000 0.000 NA   NA
 7350141 7350142 Pnec_0798 Pnec_0799     TRUE 0.680 27.000 0.000 NA   NA
 7350142 7350143 Pnec_0799 Pnec_0800     TRUE 0.830 0.000 0.000 NA   NA
 7350143 7350144 Pnec_0800 Pnec_0801     FALSE 0.098 201.000 0.000 NA   NA
 7350144 7350145 Pnec_0801 Pnec_0802     FALSE 0.353 59.000 0.000 NA   NA
 7350145 7350146 Pnec_0802 Pnec_0803     TRUE 0.776 4.000 0.000 NA   NA
 7350146 7350147 Pnec_0803 Pnec_0804     FALSE 0.187 104.000 0.000 NA   NA
 7350148 7350149 Pnec_0805 Pnec_0806     FALSE 0.517 151.000 0.310 NA   NA
 7350149 7350150 Pnec_0806 Pnec_0807     TRUE 0.724 71.000 0.277 NA   NA
 7350150 7350151 Pnec_0807 Pnec_0808     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA   NA
 7350151 7350152 Pnec_0808 Pnec_0809     TRUE 0.830 0.000 0.000 NA   NA
 7350153 7350154 Pnec_0810 Pnec_0811   ilvH TRUE 0.997 0.000 0.371 0.002 Y NA
 7350154 7350155 Pnec_0811 Pnec_0812 ilvH   TRUE 0.946 54.000 0.092 0.003 Y NA
 7350155 7350156 Pnec_0812 Pnec_0813     TRUE 0.718 47.000 0.046 1.000 N NA
 7350156 7350157 Pnec_0813 Pnec_0814     TRUE 0.987 28.000 0.466 1.000 Y NA
 7350157 7350158 Pnec_0814 Pnec_0815     FALSE 0.252 233.000 0.073 1.000 N NA
 7350158 7350159 Pnec_0815 Pnec_0816     FALSE 0.135 201.000 0.000 1.000 N NA
 7350159 7350160 Pnec_0816 Pnec_0817     TRUE 0.731 269.000 0.335 1.000 Y NA
 7350160 7350161 Pnec_0817 Pnec_0818     TRUE 0.682 25.000 0.000 NA   NA
 7350161 7350162 Pnec_0818 Pnec_0819   tpiA TRUE 0.681 18.000 0.000 NA   NA
 7350162 7350163 Pnec_0819 Pnec_0820 tpiA   TRUE 0.934 21.000 0.184 1.000 N NA
 7350163 7350164 Pnec_0820 Pnec_R0022     FALSE 0.214 87.000 0.000 NA   NA
 7350164 7350165 Pnec_R0022 Pnec_0821     FALSE 0.174 110.000 0.000 NA   NA
 7350165 7350166 Pnec_0821 Pnec_0822     TRUE 0.995 6.000 0.507 0.006 Y NA
 7350166 7350167 Pnec_0822 Pnec_0823     TRUE 0.994 4.000 0.328 0.006 Y NA
 7350167 7350168 Pnec_0823 Pnec_0824     TRUE 0.995 4.000 0.483 0.011 Y NA
 7350168 7350169 Pnec_0824 Pnec_0825     TRUE 0.991 24.000 0.355 0.009 Y NA
 7350169 7350170 Pnec_0825 Pnec_0826     TRUE 0.996 -3.000 0.343 0.009 Y NA
 7350170 7350171 Pnec_0826 Pnec_0827     TRUE 0.991 33.000 0.395 0.011 Y NA
 7350171 7350172 Pnec_0827 Pnec_0828     TRUE 0.994 9.000 0.515 0.011 Y NA
 7350172 7350173 Pnec_0828 Pnec_0829     TRUE 0.992 12.000 0.500 0.011 Y NA
 7350173 7350174 Pnec_0829 Pnec_0830     TRUE 0.992 21.000 0.442 0.011 Y NA
 7350174 7350175 Pnec_0830 Pnec_0831     TRUE 0.997 -3.000 0.484 0.006 Y NA
 7350175 7350176 Pnec_0831 Pnec_0832     TRUE 0.996 3.000 0.451 0.011 Y NA
 7350176 7350177 Pnec_0832 Pnec_0833     TRUE 0.986 25.000 0.175 0.011 Y NA
 7350177 7350178 Pnec_0833 Pnec_0834     TRUE 0.991 11.000 0.340 0.011 Y NA
 7350178 7350179 Pnec_0834 Pnec_0835     FALSE 0.188 115.000 0.017 1.000   NA
 7350179 7350180 Pnec_0835 Pnec_0836     FALSE 0.426 66.000 0.046 NA   NA
 7350180 7350181 Pnec_0836 Pnec_0837     FALSE 0.524 47.000 0.000 NA   NA
 7350181 7350182 Pnec_0837 Pnec_0838     FALSE 0.526 62.000 0.000 0.046   NA
 7350183 7350184 Pnec_0839 Pnec_0840     TRUE 0.672 -25.000 0.005 NA   NA
 7350184 7350185 Pnec_0840 Pnec_0841   rnhA FALSE 0.256 75.000 0.000 NA   NA
 7350185 7350186 Pnec_0841 Pnec_0842 rnhA   TRUE 0.622 10.000 0.003 1.000 N NA
 7350187 7350188 Pnec_0843 Pnec_0844     TRUE 0.685 21.000 0.000 NA   NA
 7350188 7350189 Pnec_0844 Pnec_0845     TRUE 0.830 0.000 0.000 NA   NA
 7350189 7350190 Pnec_0845 Pnec_0847     TRUE 0.654 36.000 0.000 NA   NA
 7350190 7350191 Pnec_0847 Pnec_0848     FALSE 0.087 415.000 0.000 1.000   NA
 7350191 7350192 Pnec_0848 Pnec_0849   carB TRUE 0.997 0.000 0.345 0.001 Y NA
 7350192 7350193 Pnec_0849 Pnec_0850 carB   TRUE 0.814 59.000 0.241 1.000 N NA
 7350193 7350194 Pnec_0850 Pnec_0851     FALSE 0.257 195.000 0.089 NA   NA
 7350196 7350197 Pnec_0853 Pnec_0854     FALSE 0.312 158.000 0.095 NA N NA
 7350197 7350198 Pnec_0854 Pnec_0855     TRUE 0.682 25.000 0.000 NA   NA
 7350198 7350199 Pnec_0855 Pnec_0856     FALSE 0.353 59.000 0.000 NA   NA
 7350200 7350201 Pnec_0857 Pnec_0858     FALSE 0.303 66.000 0.000 NA   NA
 7350201 7350202 Pnec_0858 Pnec_0859     FALSE 0.153 121.000 0.000 NA   NA
 7350202 7350203 Pnec_0859 Pnec_0860     FALSE 0.479 117.000 0.167 NA   NA
 7350204 7350205 Pnec_R0023 Pnec_R0024     TRUE 0.628 38.000 0.000 NA   NA
 7350205 7350206 Pnec_R0024 Pnec_0861     FALSE 0.245 77.000 0.000 NA   NA
 7350206 7350207 Pnec_0861 Pnec_0862     FALSE 0.121 155.000 0.000 NA   NA
 7350207 7350208 Pnec_0862 Pnec_0863     TRUE 0.699 10.000 0.000 NA   NA
 7350209 7350210 Pnec_0864 Pnec_0865     TRUE 0.829 -9.000 0.000 NA   NA
 7350210 7350211 Pnec_0865 Pnec_0866     TRUE 0.616 59.000 0.084 NA   NA
 7350211 7350212 Pnec_0866 Pnec_0867     TRUE 0.963 18.000 0.657 NA   NA
 7350213 7350214 Pnec_0868 Pnec_0869     TRUE 0.682 12.000 0.000 NA   NA
 7350214 7350215 Pnec_0869 Pnec_0870     FALSE 0.183 79.000 0.006 1.000   NA
 7350215 7350216 Pnec_0870 Pnec_0871     FALSE 0.451 44.000 0.002 1.000 N NA
 7350216 7350217 Pnec_0871 Pnec_0872     TRUE 0.814 14.000 0.055 NA   NA
 7350218 7350219 Pnec_0873 Pnec_0874     FALSE 0.455 126.000 0.162 NA   NA
 7350219 7350220 Pnec_0874 Pnec_0875     TRUE 0.959 -3.000 0.133 NA N NA
 7350220 7350221 Pnec_0875 Pnec_0876     FALSE 0.508 111.000 0.136 1.000   NA
 7350221 7350222 Pnec_0876 Pnec_0877     FALSE 0.184 532.000 0.095 NA   NA
 7350222 7350223 Pnec_0877 Pnec_0878     FALSE 0.128 112.000 0.011 NA   NA
 7350225 7350226 Pnec_0880 Pnec_0881     FALSE 0.096 275.000 0.032 NA   NA
 7350227 7350228 Pnec_0882 Pnec_0883     TRUE 0.925 13.000 0.209 NA   NA
 7350228 7350229 Pnec_0883 Pnec_0884     TRUE 0.971 1.000 0.211 1.000 N NA
 7350229 7350230 Pnec_0884 Pnec_0885     TRUE 0.963 31.000 0.110 NA Y NA
 7350230 7350231 Pnec_0885 Pnec_0886     FALSE 0.176 109.000 0.000 NA   NA
 7350232 7350233 Pnec_0887 Pnec_0888     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA   NA
 7350233 7350234 Pnec_0888 Pnec_0889     TRUE 0.682 14.000 0.000 NA   NA
 7350234 7350235 Pnec_0889 Pnec_0890     FALSE 0.188 84.000 0.014 NA   NA
 7350235 7350236 Pnec_0890 Pnec_0891     TRUE 0.827 -10.000 0.000 NA   NA
 7350236 7350237 Pnec_0891 Pnec_0892     TRUE 0.776 4.000 0.000 NA   NA
 7350237 7350238 Pnec_0892 Pnec_0893     FALSE 0.251 76.000 0.000 NA   NA
 7350238 7350239 Pnec_0893 Pnec_R0025     FALSE 0.068 511.000 0.000 NA   NA
 7350239 7350240 Pnec_R0025 Pnec_R0026     FALSE 0.453 52.000 0.000 NA   NA
 7350240 7350241 Pnec_R0026 Pnec_R0027     TRUE 0.670 32.000 0.000 NA   NA
 7350241 7350242 Pnec_R0027 Pnec_0894   gltX FALSE 0.233 79.000 0.000 NA   NA
 7350244 7350245 Pnec_0896 Pnec_0897   eno TRUE 0.945 21.000 0.241 1.000 N NA
 7350245 7350246 Pnec_0897 Pnec_0898 eno   TRUE 0.880 41.000 0.125 1.000 N NA
 7350246 7350247 Pnec_0898 Pnec_0899   pyrG TRUE 0.966 -3.000 0.138 1.000 N NA
 7350249 7350250 Pnec_0901 Pnec_0902     TRUE 0.814 -12.000 0.007 1.000 N NA
 7350250 7350251 Pnec_0902 Pnec_0903     TRUE 0.642 22.000 0.007 1.000   NA
 7350253 7350254 Pnec_0905 Pnec_R0028     FALSE 0.193 100.000 0.000 NA   NA
 7350254 7350255 Pnec_R0028 Pnec_0906     FALSE 0.182 106.000 0.000 NA   NA
 7350255 7350256 Pnec_0906 Pnec_0907   clpX TRUE 0.777 193.000 0.201 0.086 Y NA
 7350256 7350257 Pnec_0907 Pnec_0908 clpX   TRUE 0.985 31.000 0.352 1.000 Y NA
 7350257 7350258 Pnec_0908 Pnec_0909   tig TRUE 0.985 31.000 0.351 1.000 Y NA
 7350258 7350259 Pnec_0909 Pnec_R0029 tig   FALSE 0.366 58.000 0.000 NA   NA
 7350259 7350260 Pnec_R0029 Pnec_0910     FALSE 0.233 79.000 0.000 NA   NA
 7350260 7350261 Pnec_0910 Pnec_0911     TRUE 0.987 14.000 0.419 1.000 Y NA
 7350262 7350263 Pnec_0912 Pnec_0913     TRUE 0.721 18.000 0.014 1.000 N NA
 7350264 7350265 Pnec_0914 Pnec_0915     FALSE 0.179 81.000 0.004 1.000 N NA
 7350265 7350266 Pnec_0915 Pnec_0916     TRUE 0.826 3.000 0.030 NA   NA
 7350266 7350267 Pnec_0916 Pnec_0917     FALSE 0.435 118.000 0.130 NA   NA
 7350267 7350268 Pnec_0917 Pnec_0918     TRUE 0.776 4.000 0.000 NA   NA
 7350268 7350269 Pnec_0918 Pnec_0919     FALSE 0.303 66.000 0.000 NA   NA
 7350269 7350270 Pnec_0919 Pnec_0920     FALSE 0.098 114.000 0.006 NA   NA
 7350270 7350271 Pnec_0920 Pnec_0921     TRUE 0.953 3.000 0.168 NA   NA
 7350275 7350276 Pnec_0925 Pnec_0926     TRUE 0.693 -3.000 0.004 NA   NA
 7350276 7350277 Pnec_0926 Pnec_0927     TRUE 0.971 0.000 0.209 1.000   NA
 7350277 7350278 Pnec_0927 Pnec_0928     FALSE 0.552 34.000 0.003 1.000   NA
 7350278 7350279 Pnec_0928 Pnec_0929     TRUE 0.735 15.000 0.022 1.000   NA
 7350279 7350280 Pnec_0929 Pnec_0930     TRUE 0.976 16.000 0.157 1.000 Y NA
 7350280 7350281 Pnec_0930 Pnec_0931     TRUE 0.938 -13.000 0.069 1.000 N NA
 7350281 7350282 Pnec_0931 Pnec_0932     TRUE 0.958 15.000 0.366 1.000 N NA
 7350284 7350285 Pnec_0934 Pnec_0935     TRUE 0.993 31.000 0.688 0.014 Y NA
 7350286 7350287 Pnec_0936 Pnec_0937     TRUE 0.815 -22.000 0.000 NA   NA
 7350287 7350288 Pnec_0937 Pnec_0938     TRUE 0.809 -28.000 0.000 NA   NA
 7350288 7350289 Pnec_0938 Pnec_0939     FALSE 0.070 362.000 0.000 NA   NA
 7350290 7350291 Pnec_0940 Pnec_0941     TRUE 0.900 75.000 0.106 0.003 Y NA
 7350292 7350293 Pnec_0942 Pnec_0944     TRUE 0.618 39.000 0.000 NA   NA
 7350293 7350294 Pnec_0944 Pnec_R0030     FALSE 0.111 177.000 0.000 NA   NA
 7350294 7350295 Pnec_R0030 Pnec_0945     FALSE 0.091 229.000 0.000 NA   NA
 7350295 7350296 Pnec_0945 Pnec_0946     FALSE 0.113 175.000 0.000 NA   NA
 7350296 7350297 Pnec_0946 Pnec_0947     TRUE 0.681 16.000 0.000 NA   NA
 7350297 7350298 Pnec_0947 Pnec_0948     FALSE 0.189 89.000 0.008 1.000   NA
 7350298 7350299 Pnec_0948 Pnec_0949     TRUE 0.952 23.000 0.118 0.001   NA
 7350299 7350300 Pnec_0949 Pnec_R0031     FALSE 0.071 348.000 0.000 NA   NA
 7350301 7350302 Pnec_0950 Pnec_0951     TRUE 0.776 4.000 0.000 NA   NA
 7350303 7350304 Pnec_0952 Pnec_0953     FALSE 0.079 280.000 0.000 NA   NA
 7350304 7350305 Pnec_0953 Pnec_0956     FALSE 0.568 43.000 0.000 NA   NA
 7350306 7350307 Pnec_0957 Pnec_0958     FALSE 0.344 69.000 0.000 1.000   NA
 7350307 7350308 Pnec_0958 Pnec_0959     TRUE 0.875 -3.000 0.000 1.000   NA
 7350308 7350309 Pnec_0959 Pnec_0960     FALSE 0.160 145.000 0.000 1.000   NA
 7350310 7350311 Pnec_0961 Pnec_0962     FALSE 0.524 47.000 0.000 NA   NA
 7350311 7350312 Pnec_0962 Pnec_0963     TRUE 0.970 11.000 0.108 1.000 Y NA
 7350312 7350313 Pnec_0963 Pnec_0964     TRUE 0.989 19.000 0.588 1.000 Y NA
 7350313 7350314 Pnec_0964 Pnec_0965     FALSE 0.594 41.000 0.000 NA   NA
 7350314 7350315 Pnec_0965 Pnec_0966     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA   NA
 7350318 7350319 Pnec_0969 Pnec_0970     TRUE 0.851 -3.000 0.024 NA   NA
 7350319 7350320 Pnec_0970 Pnec_0971     TRUE 0.696 7.000 0.016 NA   NA
 7350320 7350321 Pnec_0971 Pnec_0972     TRUE 0.675 58.000 0.111 NA   NA
 7350322 7350323 Pnec_0973 Pnec_0974     FALSE 0.453 52.000 0.000 NA   NA
 7350324 7350325 Pnec_0975 Pnec_R0032     FALSE 0.168 112.000 0.000 NA   NA
 7350325 7350326 Pnec_R0032 Pnec_0976     FALSE 0.263 74.000 0.000 NA   NA
 7350326 7350327 Pnec_0976 Pnec_0977     FALSE 0.416 62.000 0.023 1.000 N NA
 7350327 7350328 Pnec_0977 Pnec_0978     TRUE 0.953 -34.000 0.123 1.000 N NA
 7350328 7350329 Pnec_0978 Pnec_0979     TRUE 0.869 10.000 0.059 1.000 N NA
 7350329 7350330 Pnec_0979 Pnec_0980   cysS TRUE 0.882 3.000 0.036 1.000 N NA
 7350331 7350332 Pnec_0981 Pnec_0982     TRUE 0.847 -28.000 0.000 1.000   NA
 7350332 7350333 Pnec_0982 Pnec_0983     TRUE 0.964 -3.000 0.136 1.000   NA
 7350335 7350336 Pnec_0985 Pnec_0986     TRUE 0.682 24.000 0.000 NA   NA
 7350336 7350337 Pnec_0986 Pnec_0987     FALSE 0.152 122.000 0.000 NA   NA
 7350340 7350341 Pnec_0990 Pnec_0991     TRUE 0.971 -3.000 0.037 NA Y NA
 7350341 7350342 Pnec_0991 Pnec_0992     FALSE 0.239 78.000 0.000 NA   NA
 7350342 7350343 Pnec_0992 Pnec_0993     TRUE 0.699 10.000 0.000 NA   NA
 7350343 7350344 Pnec_0993 Pnec_0994     FALSE 0.590 47.000 0.000 1.000   NA
 7350344 7350345 Pnec_0994 Pnec_0995     TRUE 0.699 10.000 0.000 NA   NA
 7350345 7350346 Pnec_0995 Pnec_0996     TRUE 0.938 1.000 0.103 NA   NA
 7350346 7350347 Pnec_0996 Pnec_0997     TRUE 0.982 13.000 0.253 1.000 Y NA
 7350347 7350348 Pnec_0997 Pnec_0998   sucA TRUE 0.973 53.000 0.667 1.000 Y NA
 7350350 7350351 Pnec_1000 Pnec_1001     FALSE 0.111 177.000 0.000 NA   NA
 7350351 7350352 Pnec_1001 Pnec_R0033     TRUE 0.628 38.000 0.000 NA   NA
 7350352 7350353 Pnec_R0033 Pnec_1002     TRUE 0.681 26.000 0.000 NA   NA
 7350353 7350354 Pnec_1002 Pnec_1003     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA   NA
 7350354 7350355 Pnec_1003 Pnec_1004     TRUE 0.982 -22.000 0.535 1.000   NA
 7350355 7350356 Pnec_1004 Pnec_1005     TRUE 0.758 66.000 0.208 1.000 N NA
 7350356 7350357 Pnec_1005 Pnec_1006     TRUE 0.994 34.000 0.574 0.001 Y NA
 7350357 7350358 Pnec_1006 Pnec_1007     TRUE 0.979 26.000 0.202 1.000 Y NA
 7350358 7350359 Pnec_1007 Pnec_1008     TRUE 0.994 26.000 0.928 0.026 Y NA
 7350359 7350360 Pnec_1008 Pnec_1009     TRUE 0.886 128.000 0.652 1.000 Y NA
 7350360 7350361 Pnec_1009 Pnec_1010     TRUE 0.923 58.000 0.186 1.000 Y NA
 7350361 7350362 Pnec_1010 Pnec_R0034     FALSE 0.150 124.000 0.000 NA   NA
 7350362 7350363 Pnec_R0034 Pnec_1011     TRUE 0.682 19.000 0.000 NA   NA
 7350363 7350364 Pnec_1011 Pnec_1012     TRUE 0.767 15.000 0.026 1.000 N NA
 7350364 7350365 Pnec_1012 Pnec_1013     FALSE 0.346 81.000 0.034 1.000 N NA
 7350365 7350366 Pnec_1013 Pnec_1014     TRUE 0.990 48.000 0.789 0.001 Y NA
 7350367 7350368 Pnec_1015 Pnec_1016     FALSE 0.076 292.000 0.000 NA   NA
 7350368 7350369 Pnec_1016 Pnec_1017     TRUE 0.673 29.000 0.000 NA   NA
 7350369 7350370 Pnec_1017 Pnec_1018     TRUE 0.726 3.000 0.008 NA   NA
 7350371 7350372 Pnec_1019 Pnec_1020     FALSE 0.325 62.000 0.000 NA   NA
 7350374 7350375 Pnec_1022 Pnec_1023     TRUE 0.729 7.000 0.000 NA   NA
 7350375 7350376 Pnec_1023 Pnec_1025     TRUE 0.682 23.000 0.000 NA   NA
 7350376 7350377 Pnec_1025 Pnec_1026     FALSE 0.125 148.000 0.000 NA   NA
 7350377 7350378 Pnec_1026 Pnec_1027     TRUE 0.815 2.000 0.000 NA   NA
 7350378 7350379 Pnec_1027 Pnec_1028     TRUE 0.682 24.000 0.000 NA   NA
 7350379 7350380 Pnec_1028 Pnec_1029     TRUE 0.684 22.000 0.000 NA   NA
 7350380 7350381 Pnec_1029 Pnec_1030     FALSE 0.148 167.000 0.000 1.000   NA
 7350381 7350382 Pnec_1030 Pnec_1031     TRUE 0.941 11.000 0.294 NA   NA
 7350382 7350383 Pnec_1031 Pnec_1032     TRUE 0.886 22.000 0.111 NA   NA
 7350383 7350384 Pnec_1032 Pnec_1033     TRUE 0.948 37.000 0.370 1.000   NA
 7350384 7350385 Pnec_1033 Pnec_1034     TRUE 0.983 20.000 0.926 0.013   NA
 7350385 7350386 Pnec_1034 Pnec_1035     TRUE 0.878 52.000 0.370 NA   NA
 7350386 7350387 Pnec_1035 Pnec_1036     TRUE 0.871 51.000 0.312 NA   NA
 7350387 7350388 Pnec_1036 Pnec_1037     FALSE 0.605 66.000 0.109 NA   NA
 7350389 7350390 Pnec_1038 Pnec_1039     FALSE 0.400 55.000 0.000 NA   NA
 7350391 7350392 Pnec_1040 Pnec_1041     FALSE 0.207 91.000 0.000 NA   NA
 7350392 7350393 Pnec_1041 Pnec_1042     TRUE 0.646 23.000 0.007 1.000   NA
 7350393 7350394 Pnec_1042 Pnec_1043     TRUE 0.741 61.000 0.153 1.000 N NA
 7350394 7350395 Pnec_1043 Pnec_1044     TRUE 0.960 5.000 0.262 1.000   NA
 7350395 7350396 Pnec_1044 Pnec_1045     TRUE 0.764 0.000 0.009 NA   NA
 7350396 7350397 Pnec_1045 Pnec_1046     TRUE 0.731 4.000 0.013 NA   NA
 7350397 7350398 Pnec_1046 Pnec_1047     TRUE 0.705 108.000 0.383 1.000 N NA
 7350398 7350399 Pnec_1047 Pnec_1048   trpA TRUE 0.955 7.000 0.232 1.000 N NA
 7350399 7350400 Pnec_1048 Pnec_1049 trpA   TRUE 0.992 21.000 0.344 0.001 Y NA
 7350400 7350401 Pnec_1049 Pnec_1050     TRUE 0.992 21.000 0.375 0.003 Y NA
 7350401 7350402 Pnec_1050 Pnec_1051   truA TRUE 0.849 48.000 0.139 1.000 N NA
 7350402 7350403 Pnec_1051 Pnec_1052 truA   TRUE 0.652 4.000 0.006 NA   NA
 7350403 7350404 Pnec_1052 Pnec_1053     FALSE 0.601 11.000 0.010 NA   NA
 7350404 7350405 Pnec_1053 Pnec_1054     TRUE 0.966 50.000 0.196 0.051 Y NA
 7350405 7350406 Pnec_1054 Pnec_1055   leuD TRUE 0.986 24.000 0.141 0.003 Y NA
 7350406 7350407 Pnec_1055 Pnec_1056 leuD   TRUE 0.825 33.000 0.050 1.000   NA
 7350407 7350408 Pnec_1056 Pnec_1057     TRUE 0.711 13.000 0.017 1.000   NA
 7350408 7350409 Pnec_1057 Pnec_1058   gltA TRUE 0.699 18.000 0.011 1.000 N NA
 7350409 7350410 Pnec_1058 Pnec_1059 gltA   FALSE 0.548 83.000 0.136 NA   NA
 7350410 7350411 Pnec_1059 Pnec_1060     TRUE 0.960 -3.000 0.151 NA   NA
 7350411 7350412 Pnec_1060 Pnec_1061     TRUE 0.994 17.000 0.604 0.003 Y NA
 7350412 7350413 Pnec_1061 Pnec_1062     TRUE 0.996 5.000 0.705 0.003 Y NA
 7350413 7350414 Pnec_1062 Pnec_1063     TRUE 0.993 25.000 0.453 0.001 Y NA
 7350414 7350415 Pnec_1063 Pnec_1064     FALSE 0.483 146.000 0.185 1.000 N NA
 7350416 7350417 Pnec_1065 Pnec_1066     TRUE 0.632 13.000 0.014 NA   NA
 7350418 7350419 Pnec_1067 Pnec_1068     TRUE 0.732 0.000 0.007 NA   NA
 7350420 7350421 Pnec_1069 Pnec_1070     TRUE 0.875 -3.000 0.000 1.000   NA
 7350421 7350422 Pnec_1070 Pnec_1071     TRUE 0.661 35.000 0.000 NA   NA
 7350422 7350423 Pnec_1071 Pnec_1072     FALSE 0.054 141.000 0.002 NA   NA
 7350423 7350424 Pnec_1072 Pnec_1073     FALSE 0.120 211.000 0.000 1.000   NA
 7350424 7350425 Pnec_1073 Pnec_1074     TRUE 0.616 23.000 0.006 1.000   NA
 7350425 7350426 Pnec_1074 Pnec_1075     TRUE 0.683 15.000 0.000 NA   NA
 7350426 7350427 Pnec_1075 Pnec_1076     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA   NA
 7350427 7350428 Pnec_1076 Pnec_1077     TRUE 0.753 10.000 0.000 1.000   NA
 7350428 7350429 Pnec_1077 Pnec_1078   aat FALSE 0.448 84.000 0.058 1.000 N NA
 7350429 7350430 Pnec_1078 Pnec_1079 aat   TRUE 0.993 -3.000 0.285 1.000 Y NA
 7350430 7350431 Pnec_1079 Pnec_1080     TRUE 0.920 -3.000 0.044 1.000 N NA
 7350431 7350432 Pnec_1080 Pnec_1081     FALSE 0.151 95.000 0.003 1.000 N NA
 7350433 7350434 Pnec_1082 Pnec_1083     FALSE 0.509 119.000 0.160 1.000   NA
 7350435 7350436 Pnec_1084 Pnec_1085     FALSE 0.083 261.000 0.000 NA   NA
 7350437 7350438 Pnec_1086 Pnec_1087     TRUE 0.989 10.000 0.463 1.000 Y NA
 7350438 7350439 Pnec_1087 Pnec_1088   aceE TRUE 0.978 16.000 0.101 0.043 Y NA
 7350441 7350442 Pnec_1090 Pnec_1091     FALSE 0.469 51.000 0.000 NA   NA
 7350442 7350443 Pnec_1091 Pnec_1092   rbfA TRUE 0.990 4.000 0.318 1.000 Y NA
 7350443 7350444 Pnec_1092 Pnec_1093 rbfA infB TRUE 0.991 6.000 0.530 1.000 Y NA
 7350444 7350445 Pnec_1093 Pnec_1094 infB nusA TRUE 0.956 14.000 0.342 1.000 N NA
 7350445 7350446 Pnec_1094 Pnec_1095 nusA   TRUE 0.986 -3.000 0.759 NA   NA
 7350446 7350447 Pnec_1095 Pnec_1096     FALSE 0.055 173.000 0.004 NA   NA
 7350447 7350448 Pnec_1096 Pnec_1097     FALSE 0.207 91.000 0.000 NA   NA
 7350448 7350449 Pnec_1097 Pnec_1098     TRUE 0.729 7.000 0.000 NA   NA
 7350451 7350452 Pnec_1100 Pnec_1101     FALSE 0.176 138.000 0.038 NA   NA
 7350452 7350453 Pnec_1101 Pnec_1102     TRUE 0.988 -3.000 0.800 1.000   NA
 7350453 7350454 Pnec_1102 Pnec_1103     TRUE 0.987 -3.000 0.296 0.013   NA
 7350454 7350455 Pnec_1103 Pnec_1104     TRUE 0.992 0.000 0.815 0.013   NA
 7350456 7350457 Pnec_1105 Pnec_1106     FALSE 0.233 103.000 0.000 1.000   NA
 7350457 7350458 Pnec_1106 Pnec_1107     TRUE 0.917 27.000 0.147 1.000   NA
 7350458 7350459 Pnec_1107 Pnec_1108     TRUE 0.977 37.000 0.727 0.014   NA
 7350460 7350461 Pnec_1109 Pnec_1110     TRUE 0.975 -3.000 0.297 NA   NA
 7350461 7350462 Pnec_1110 Pnec_1111     TRUE 0.943 -3.000 0.081 NA N NA
 7350463 7350464 Pnec_1112 Pnec_1113     TRUE 0.683 15.000 0.000 NA   NA
 7350465 7350466 Pnec_1115 Pnec_1116     TRUE 0.681 16.000 0.000 NA   NA
 7350466 7350467 Pnec_1116 Pnec_1117     FALSE 0.168 112.000 0.000 NA   NA
 7350467 7350468 Pnec_1117 Pnec_1118     FALSE 0.303 66.000 0.000 NA   NA
 7350469 7350470 Pnec_1120 Pnec_1121     TRUE 0.824 -13.000 0.000 NA   NA
 7350470 7350471 Pnec_1121 Pnec_1122     FALSE 0.378 57.000 0.000 NA   NA
 7350471 7350472 Pnec_1122 Pnec_1123     FALSE 0.124 149.000 0.000 NA   NA
 7350472 7350473 Pnec_1123 Pnec_1124     FALSE 0.325 62.000 0.000 NA   NA
 7350473 7350474 Pnec_1124 Pnec_1125     TRUE 0.962 6.000 0.388 NA   NA
 7350477 7350478 Pnec_1128 Pnec_1129     FALSE 0.147 169.000 0.018 1.000 N NA
 7350478 7350479 Pnec_1129 Pnec_1130     TRUE 0.632 17.000 0.007 1.000   NA
 7350480 7350481 Pnec_1131 Pnec_1132     TRUE 0.627 10.000 0.011 NA   NA
 7350481 7350482 Pnec_1132 Pnec_1133     TRUE 0.687 11.000 0.000 NA   NA
 7350482 7350483 Pnec_1133 Pnec_1134     TRUE 0.681 16.000 0.000 NA   NA
 7350483 7350484 Pnec_1134 Pnec_1135     FALSE 0.130 142.000 0.000 NA   NA
 7350485 7350486 Pnec_1136 Pnec_1137     FALSE 0.269 72.000 0.000 NA   NA
 7350490 7350491 Pnec_1141 Pnec_1142     FALSE 0.069 391.000 0.000 NA   NA
 7350491 7350492 Pnec_1142 Pnec_1143     TRUE 0.684 22.000 0.000 NA   NA
 7350492 7350493 Pnec_1143 Pnec_1144     TRUE 0.671 31.000 0.000 NA   NA
 7350493 7350494 Pnec_1144 Pnec_1145     FALSE 0.092 226.000 0.000 NA   NA
 7350494 7350495 Pnec_1145 Pnec_1146     FALSE 0.184 105.000 0.011 1.000   NA
 7350495 7350496 Pnec_1146 Pnec_1147     TRUE 0.989 -25.000 0.453 0.004   NA
 7350496 7350497 Pnec_1147 Pnec_1148     TRUE 0.884 14.000 0.104 NA N NA
 7350497 7350498 Pnec_1148 Pnec_1149     TRUE 0.682 12.000 0.000 NA   NA
 7350498 7350499 Pnec_1149 Pnec_1150     TRUE 0.776 4.000 0.000 NA   NA
 7350499 7350500 Pnec_1150 Pnec_1152     FALSE 0.524 47.000 0.000 NA   NA
 7350500 7350501 Pnec_1152 Pnec_1154     FALSE 0.212 88.000 0.000 NA   NA
 7350502 7350503 Pnec_1155 Pnec_1156     FALSE 0.135 137.000 0.000 NA   NA
 7350503 7350504 Pnec_1156 Pnec_1157     TRUE 0.820 1.000 0.000 NA   NA
 7350505 7350506 Pnec_R0035 Pnec_1158     FALSE 0.453 52.000 0.000 NA   NA
 7350506 7350507 Pnec_1158 Pnec_1159     FALSE 0.150 124.000 0.000 NA   NA
 7350507 7350508 Pnec_1159 Pnec_1160     TRUE 0.627 28.000 0.005 1.000 N NA
 7350508 7350509 Pnec_1160 Pnec_1161     TRUE 0.933 7.000 0.130 1.000 N NA
 7350512 7350513 Pnec_1164 Pnec_1165     TRUE 0.683 27.000 0.009 1.000 N NA
 7350513 7350514 Pnec_1165 Pnec_1166     FALSE 0.269 72.000 0.000 NA   NA
 7350515 7350516 Pnec_1167 Pnec_1168     TRUE 0.819 -18.000 0.000 NA   NA
 7350516 7350517 Pnec_1168 Pnec_1169     TRUE 0.682 19.000 0.000 NA   NA
 7350519 7350520 Pnec_1171 Pnec_1172     FALSE 0.130 142.000 0.000 NA   NA
 7350520 7350521 Pnec_1172 Pnec_1173     TRUE 0.833 -7.000 0.000 NA   NA
 7350521 7350522 Pnec_1173 Pnec_1174     FALSE 0.171 111.000 0.000 NA   NA
 7350522 7350523 Pnec_1174 Pnec_1175     TRUE 0.815 2.000 0.000 NA   NA
 7350523 7350524 Pnec_1175 Pnec_1176     FALSE 0.072 337.000 0.000 NA   NA
 7350524 7350525 Pnec_1176 Pnec_1177     TRUE 0.680 17.000 0.000 NA   NA
 7350525 7350526 Pnec_1177 Pnec_1180     FALSE 0.110 179.000 0.000 NA   NA
 7350526 7350527 Pnec_1180 Pnec_1181     FALSE 0.139 134.000 0.000 NA   NA
 7350528 7350529 Pnec_1182 Pnec_1184     TRUE 0.684 22.000 0.000 NA   NA
 7350530 7350531 Pnec_1187 Pnec_1188   pepN TRUE 0.786 47.000 0.071 1.000 N NA
 7350531 7350532 Pnec_1188 Pnec_1189 pepN   FALSE 0.475 46.000 0.006 1.000   NA
 7350532 7350533 Pnec_1189 Pnec_1190     TRUE 0.833 -7.000 0.000 NA   NA
 7350533 7350534 Pnec_1190 Pnec_1191     TRUE 0.830 0.000 0.000 NA   NA
 7350534 7350535 Pnec_1191 Pnec_1192     FALSE 0.075 303.000 0.000 NA   NA
 7350537 7350538 Pnec_1194 Pnec_1195     FALSE 0.152 122.000 0.000 NA   NA
 7350538 7350539 Pnec_1195 Pnec_1196     FALSE 0.353 59.000 0.000 NA   NA
 7350540 7350541 Pnec_1197 Pnec_1198     FALSE 0.151 77.000 0.006 NA   NA
 7350542 7350543 Pnec_1199 Pnec_1200     TRUE 0.989 25.000 0.205 0.003 Y NA
 7350544 7350545 Pnec_1201 Pnec_1202     TRUE 0.618 6.000 0.005 NA N NA
 7350545 7350546 Pnec_1202 Pnec_1203     TRUE 0.992 -3.000 0.283 NA Y NA
 7350547 7350548 Pnec_1204 Pnec_1205     FALSE 0.091 229.000 0.000 NA   NA
 7350548 7350549 Pnec_1205 Pnec_1206   dcd FALSE 0.207 91.000 0.000 NA   NA
 7350549 7350550 Pnec_1206 Pnec_1207 dcd   FALSE 0.594 41.000 0.000 NA   NA
 7350550 7350551 Pnec_1207 Pnec_1208     FALSE 0.176 109.000 0.000 NA   NA
 7350552 7350553 Pnec_1209 Pnec_1210     FALSE 0.236 104.000 0.036 NA   NA
 7350553 7350554 Pnec_1210 Pnec_1211     TRUE 0.899 -7.000 0.048 NA   NA
 7350554 7350555 Pnec_1211 Pnec_1212   panC TRUE 0.830 -3.000 0.018 NA   NA
 7350556 7350557 Pnec_1213 Pnec_1214     TRUE 0.815 2.000 0.000 NA   NA
 7350557 7350558 Pnec_1214 Pnec_1215     FALSE 0.096 207.000 0.000 NA   NA
 7350558 7350559 Pnec_1215 Pnec_1216     TRUE 0.833 -7.000 0.000 NA   NA
 7350559 7350560 Pnec_1216 Pnec_1217     TRUE 0.712 36.000 0.000 1.000   NA
 7350560 7350561 Pnec_1217 Pnec_1218     TRUE 0.917 2.000 0.000 0.019   NA
 7350561 7350562 Pnec_1218 Pnec_1219     FALSE 0.498 49.000 0.000 NA   NA
 7350562 7350563 Pnec_1219 Pnec_1220     FALSE 0.096 207.000 0.000 NA   NA
 7350564 7350565 Pnec_1221 Pnec_1224     FALSE 0.075 296.000 0.000 NA   NA
 7350565 7350566 Pnec_1224 Pnec_R0036     TRUE 0.641 37.000 0.000 NA   NA
 7350566 7350567 Pnec_R0036 Pnec_1225     TRUE 0.820 1.000 0.000 NA   NA
 7350568 7350569 Pnec_1226 Pnec_1227     FALSE 0.142 132.000 0.000 NA   NA
 7350569 7350570 Pnec_1227 Pnec_1228     FALSE 0.084 247.000 0.000 NA   NA
 7350570 7350571 Pnec_1228 Pnec_1229     FALSE 0.179 136.000 0.037 NA   NA
 7350571 7350572 Pnec_1229 Pnec_1230     TRUE 0.811 29.000 0.056 NA   NA
 7350572 7350573 Pnec_1230 Pnec_1231     TRUE 0.684 4.000 0.003 1.000   NA
 7350573 7350574 Pnec_1231 Pnec_1232     TRUE 0.670 6.000 0.003 1.000 N NA
 7350574 7350575 Pnec_1232 Pnec_1233     TRUE 0.962 31.000 0.494 1.000 N NA
 7350576 7350577 Pnec_1234 Pnec_1235     TRUE 0.991 -3.000 0.631 0.041   NA
 7350577 7350578 Pnec_1235 Pnec_1236     FALSE 0.288 56.000 0.004 1.000   NA
 7350580 7350581 Pnec_1237 Pnec_1238     FALSE 0.418 54.000 0.000 NA   NA
 7350581 7350582 Pnec_1238 Pnec_1239     TRUE 0.817 23.000 0.043 1.000 N NA
 7350582 7350583 Pnec_1239 Pnec_1240     TRUE 0.705 107.000 0.066 1.000 Y NA
 7350583 7350584 Pnec_1240 Pnec_1241     TRUE 0.651 46.000 0.044 NA   NA
 7350584 7350585 Pnec_1241 Pnec_1242     TRUE 0.942 21.000 0.307 NA   NA
 7350585 7350586 Pnec_1242 Pnec_1243     TRUE 0.890 5.000 0.074 NA   NA
 7350586 7350587 Pnec_1243 Pnec_1244     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA   NA
 7350589 7350590 Pnec_1246 Pnec_1247     TRUE 0.912 -3.000 0.050 NA   NA
 7350590 7350591 Pnec_1247 Pnec_1248     TRUE 0.700 15.000 0.026 NA   NA
 7350593 7350594 Pnec_1250 Pnec_1251     TRUE 0.684 20.000 0.000 NA   NA
 7350595 7350596 Pnec_1252 Pnec_1253     TRUE 0.777 7.000 0.034 NA   NA
 7350596 7350597 Pnec_1253 Pnec_1254     FALSE 0.127 145.000 0.000 NA   NA
 7350598 7350599 Pnec_1256 Pnec_1257     FALSE 0.222 84.000 0.000 NA   NA
 7350600 7350601 Pnec_1258 Pnec_1259     TRUE 0.712 9.000 0.000 NA   NA
 7350601 7350602 Pnec_1259 Pnec_1260     TRUE 0.820 1.000 0.000 NA   NA
 7350603 7350604 Pnec_1261 Pnec_1262     TRUE 0.776 4.000 0.000 NA   NA
 7350604 7350605 Pnec_1262 Pnec_R0038     FALSE 0.217 86.000 0.000 NA   NA
 7350606 7350607 Pnec_1263 Pnec_1264     TRUE 0.641 37.000 0.000 NA   NA
 7350607 7350608 Pnec_1264 Pnec_1265     FALSE 0.366 58.000 0.000 NA   NA
 7350608 7350609 Pnec_1265 Pnec_1266     FALSE 0.148 115.000 0.017 NA   NA
 7350610 7350611 Pnec_1267 Pnec_1268     FALSE 0.156 119.000 0.000 NA   NA
 7350612 7350613 Pnec_1269 Pnec_1270     FALSE 0.073 334.000 0.000 NA   NA
 7350614 7350615 Pnec_1271 Pnec_1272     TRUE 0.676 28.000 0.000 NA   NA
 7350616 7350617 Pnec_1273 Pnec_1274     FALSE 0.516 40.000 0.010 NA   NA
 7350620 7350621 Pnec_1277 Pnec_1278     TRUE 0.895 3.000 0.046 1.000   NA
 7350622 7350623 Pnec_1279 Pnec_1280     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA   NA
 7350623 7350624 Pnec_1280 Pnec_1282   rplS FALSE 0.119 162.000 0.000 NA   NA
 7350624 7350625 Pnec_1282 Pnec_1283 rplS   TRUE 0.871 134.000 0.567 1.000 Y NA
 7350625 7350626 Pnec_1283 Pnec_1284     TRUE 0.979 49.000 0.672 1.000 Y NA
 7350626 7350627 Pnec_1284 Pnec_1285   rpsP TRUE 0.923 93.000 0.342 0.024 Y NA
 7350628 7350629 Pnec_1286 Pnec_1287     TRUE 0.781 26.000 0.045 NA   NA
 7350630 7350631 Pnec_1288 Pnec_1289     TRUE 0.792 62.000 0.118 0.012 N NA
 7350631 7350632 Pnec_1289 Pnec_1290     TRUE 0.997 1.000 0.667 0.023 Y NA
 7350632 7350633 Pnec_1290 Pnec_1291     TRUE 0.611 57.000 0.051 1.000 N NA
 7350633 7350634 Pnec_1291 Pnec_1292     FALSE 0.228 81.000 0.000 NA   NA
 7350636 7350637 Pnec_1295 Pnec_1298     FALSE 0.582 42.000 0.000 NA   NA
 7350637 7350638 Pnec_1298 Pnec_1299     FALSE 0.129 143.000 0.000 NA   NA
 7350638 7350639 Pnec_1299 Pnec_1300     TRUE 0.806 -33.000 0.000 NA   NA
 7350639 7350640 Pnec_1300 Pnec_1301     FALSE 0.453 52.000 0.000 NA   NA
 7350640 7350641 Pnec_1301 Pnec_1302     FALSE 0.203 93.000 0.000 NA   NA
 7350641 7350642 Pnec_1302 Pnec_1303     FALSE 0.072 335.000 0.000 NA   NA
 7350642 7350643 Pnec_1303 Pnec_1304     TRUE 0.991 -3.000 0.191 1.000 Y NA
 7350643 7350644 Pnec_1304 Pnec_1305     TRUE 0.836 46.000 0.006 1.000 Y NA
 7350644 7350645 Pnec_1305 Pnec_1306     TRUE 0.792 18.000 0.034 1.000 N NA
 7350645 7350646 Pnec_1306 Pnec_1307     FALSE 0.369 61.000 0.013 1.000 N NA
 7350646 7350647 Pnec_1307 Pnec_1308   rpsA TRUE 0.874 53.000 0.292 1.000 N NA
 7350647 7350648 Pnec_1308 Pnec_1309 rpsA cmk FALSE 0.545 155.000 0.281 1.000 N NA
 7350648 7350649 Pnec_1309 Pnec_1310 cmk   TRUE 0.940 19.000 0.209 1.000 N NA
 7350649 7350650 Pnec_1310 Pnec_1311     TRUE 0.985 0.000 0.100 1.000 Y NA
 7350650 7350651 Pnec_1311 Pnec_1312     TRUE 0.980 10.000 0.198 1.000 Y NA
 7350651 7350652 Pnec_1312 Pnec_1313     TRUE 0.902 55.000 0.098 1.000 Y NA
 7350652 7350653 Pnec_1313 Pnec_1314     TRUE 0.987 0.000 0.121 1.000 Y NA
 7350653 7350654 Pnec_1314 Pnec_1315     TRUE 0.870 26.000 0.067 1.000 N NA
 7350655 7350656 Pnec_1316 Pnec_1317     FALSE 0.451 97.000 0.071 1.000 N NA
 7350656 7350657 Pnec_1317 Pnec_1318     FALSE 0.123 151.000 0.000 NA   NA
 7350657 7350658 Pnec_1318 Pnec_R0039     FALSE 0.156 119.000 0.000 NA   NA
 7350659 7350660 Pnec_1319 Pnec_1320     FALSE 0.123 151.000 0.000 NA   NA
 7350660 7350661 Pnec_1320 Pnec_1321     TRUE 0.807 40.000 0.000 0.010   NA
 7350661 7350662 Pnec_1321 Pnec_1322     TRUE 0.671 31.000 0.000 NA   NA
 7350662 7350663 Pnec_1322 Pnec_1323     TRUE 0.682 14.000 0.000 NA   NA
 7350663 7350664 Pnec_1323 Pnec_1324     FALSE 0.286 69.000 0.000 NA   NA
 7350665 7350666 Pnec_1325 Pnec_1326     FALSE 0.084 142.000 0.008 NA   NA
 7350666 7350667 Pnec_1326 Pnec_1327     TRUE 0.851 57.000 0.333 1.000   NA
 7350667 7350668 Pnec_1327 Pnec_1328     FALSE 0.101 197.000 0.000 NA   NA
 7350668 7350669 Pnec_1328 Pnec_1329     TRUE 0.682 24.000 0.000 NA   NA
 7350669 7350670 Pnec_1329 Pnec_1330     FALSE 0.123 151.000 0.000 NA   NA
 7350670 7350671 Pnec_1330 Pnec_1331     TRUE 0.685 21.000 0.000 NA   NA
 7350671 7350672 Pnec_1331 Pnec_1332     TRUE 0.754 5.000 0.000 NA   NA
 7350672 7350673 Pnec_1332 Pnec_1333     TRUE 0.879 22.000 0.000 0.001   NA
 7350673 7350674 Pnec_1333 Pnec_1334     FALSE 0.300 139.000 0.062 1.000   NA
 7350675 7350676 Pnec_1335 Pnec_1336     TRUE 0.657 11.000 0.008 1.000   NA
 7350676 7350677 Pnec_1336 Pnec_1337     TRUE 0.699 10.000 0.000 NA   NA
 7350677 7350678 Pnec_1337 Pnec_1338     FALSE 0.274 71.000 0.000 NA   NA
 7350679 7350680 Pnec_1339 Pnec_1340     FALSE 0.210 70.000 0.004 1.000   NA
 7350684 7350685 Pnec_1344 Pnec_1345     TRUE 0.830 0.000 0.000 NA   NA
 7350685 7350686 Pnec_1345 Pnec_1346     TRUE 0.900 33.000 0.118 1.000   NA
 7350686 7350687 Pnec_1346 Pnec_1347     FALSE 0.219 85.000 0.000 NA   NA
 7350687 7350688 Pnec_1347 Pnec_1348     TRUE 0.820 1.000 0.000 NA   NA
 7350690 7350691 Pnec_1350 Pnec_1351     FALSE 0.160 117.000 0.000 NA   NA
 7350693 7350694 Pnec_1353 Pnec_1354     TRUE 0.681 18.000 0.000 NA   NA
 7350697 7350698 Pnec_1357 Pnec_1358     TRUE 0.951 -3.000 0.111 NA   NA
 7350698 7350699 Pnec_1358 Pnec_1359     TRUE 0.716 26.000 0.030 NA   NA
 7350699 7350700 Pnec_1359 Pnec_1360     TRUE 0.981 13.000 0.231 1.000 Y NA
 7350700 7350701 Pnec_1360 Pnec_1361     TRUE 0.980 -3.000 0.128 0.004   NA
 7350701 7350702 Pnec_1361 Pnec_1362     TRUE 0.968 20.000 0.250 0.004   NA
 7350702 7350703 Pnec_1362 Pnec_1363     TRUE 0.981 11.000 0.525 0.004 N NA
 7350703 7350704 Pnec_1363 Pnec_1364     FALSE 0.304 134.000 0.070 NA N NA
 7350704 7350705 Pnec_1364 Pnec_1365     TRUE 0.990 10.000 0.713 NA Y NA
 7350707 7350708 Pnec_1367 Pnec_1368     FALSE 0.274 71.000 0.000 NA   NA
 7350708 7350709 Pnec_1368 Pnec_1370     TRUE 0.683 15.000 0.000 NA   NA
 7350709 7350710 Pnec_1370 Pnec_1371     FALSE 0.158 118.000 0.000 NA   NA
 7350712 7350713 Pnec_1375 Pnec_1376     TRUE 0.994 -3.000 0.429 NA Y NA
 7350713 7350714 Pnec_1376 Pnec_1377     TRUE 0.992 -3.000 0.286 NA Y NA
 7350714 7350715 Pnec_1377 Pnec_1378     TRUE 0.996 -3.000 0.222 0.004 Y NA
 7350715 7350716 Pnec_1378 Pnec_1379     TRUE 0.983 -3.000 0.018 0.004 Y NA
 7350716 7350717 Pnec_1379 Pnec_1380     TRUE 0.982 -3.000 0.344 1.000 N NA
 7350717 7350718 Pnec_1380 Pnec_1381     TRUE 0.984 0.000 0.501 1.000 N NA
 7350718 7350719 Pnec_1381 Pnec_1382     TRUE 0.997 -3.000 0.501 0.002 Y NA
 7350719 7350720 Pnec_1382 Pnec_1383     TRUE 0.997 -3.000 0.503 0.004 Y NA
 7350720 7350721 Pnec_1383 Pnec_1384     FALSE 0.119 160.000 0.000 NA   NA
 7350721 7350722 Pnec_1384 Pnec_1386     TRUE 0.618 39.000 0.000 NA   NA
 7350722 7350723 Pnec_1386 Pnec_1387     TRUE 0.682 24.000 0.000 NA   NA
 7350723 7350724 Pnec_1387 Pnec_1388     FALSE 0.154 98.000 0.006 1.000   NA
 7350724 7350725 Pnec_1388 Pnec_1389     FALSE 0.517 28.000 0.006 NA   NA
 7350725 7350726 Pnec_1389 Pnec_1390     FALSE 0.120 90.000 0.006 NA   NA
 7350726 7350727 Pnec_1390 Pnec_1391     FALSE 0.245 77.000 0.000 NA   NA
 7350728 7350729 Pnec_1392 Pnec_1393     TRUE 0.792 -3.000 0.011 NA   NA
 7350730 7350731 Pnec_1394 Pnec_1395     FALSE 0.080 271.000 0.000 NA   NA
 7350731 7350732 Pnec_1395 Pnec_1396     TRUE 0.817 -19.000 0.000 NA   NA
 7350734 7350735 Pnec_1398 Pnec_1400     FALSE 0.269 72.000 0.000 NA   NA
 7350735 7350736 Pnec_1400 Pnec_1401     FALSE 0.102 195.000 0.000 NA   NA
 7350737 7350738 Pnec_1402 Pnec_1403     TRUE 0.907 101.000 0.551 1.000 Y NA
 7350739 7350740 Pnec_1404 Pnec_1405     TRUE 0.712 9.000 0.000 NA   NA
 7350741 7350742 Pnec_1406 Pnec_1407     FALSE 0.108 184.000 0.000 NA   NA
 7350745 7350746 Pnec_1410 Pnec_1411     TRUE 0.682 25.000 0.000 NA   NA
 7350746 7350747 Pnec_1411 Pnec_1412     FALSE 0.453 52.000 0.000 NA   NA
 7350747 7350748 Pnec_1412 Pnec_1413     FALSE 0.092 225.000 0.000 NA   NA
 7350748 7350749 Pnec_1413 Pnec_1414     FALSE 0.106 188.000 0.000 NA   NA
 7350751 7350752 Pnec_R0040 Pnec_1416     TRUE 0.681 13.000 0.000 NA   NA
 7350752 7350753 Pnec_1416 Pnec_1417     FALSE 0.472 237.000 0.299 1.000 N NA
 7350753 7350754 Pnec_1417 Pnec_1418     TRUE 0.915 25.000 0.137 1.000   NA
 7350754 7350755 Pnec_1418 Pnec_1419   rpsU FALSE 0.608 128.000 0.173 0.037   NA
 7350757 7350758 Pnec_1421 Pnec_1422     TRUE 0.865 26.000 0.069 1.000   NA
 7350758 7350759 Pnec_1422 Pnec_1423     TRUE 0.980 34.000 0.246 1.000 Y NA
 7350759 7350760 Pnec_1423 Pnec_1424     TRUE 0.969 0.000 0.177 1.000 N NA
 7350761 7350762 Pnec_1425 Pnec_1426     TRUE 0.863 58.000 0.066 1.000 Y NA
 7350763 7350764 Pnec_1427 Pnec_1428     TRUE 0.740 6.000 0.000 NA   NA
 7350764 7350765 Pnec_1428 Pnec_1429     TRUE 0.654 36.000 0.000 NA   NA
 7350766 7350767 Pnec_1430 Pnec_1431     TRUE 0.878 22.000 0.104 NA   NA
 7350767 7350768 Pnec_1431 Pnec_1432     TRUE 0.969 -3.000 0.209 NA   NA
 7350770 7350771 Pnec_1434 Pnec_1435     FALSE 0.574 32.000 0.002 1.000 N NA
 7350772 7350773 Pnec_1436 Pnec_1437     TRUE 0.900 -3.000 0.006 0.046 N NA
 7350774 7350775 Pnec_1438 Pnec_1439     TRUE 0.970 20.000 1.000 NA   NA
 7350775 7350776 Pnec_1439 Pnec_1440     FALSE 0.107 86.000 0.004 NA   NA
 7350778 7350779 Pnec_1442 Pnec_1443   argD FALSE 0.414 74.000 0.040 1.000 N NA
 7350780 7350781 Pnec_1444 Pnec_1445     TRUE 0.973 28.000 0.061 0.010 Y NA
 7350781 7350782 Pnec_1445 Pnec_1446     FALSE 0.214 87.000 0.000 NA   NA
 7350782 7350783 Pnec_1446 Pnec_1447     FALSE 0.100 199.000 0.000 NA   NA
 7350783 7350784 Pnec_1447 Pnec_1448     FALSE 0.256 75.000 0.000 NA   NA
 7350784 7350785 Pnec_1448 Pnec_1449     TRUE 0.671 30.000 0.000 NA   NA
 7350785 7350786 Pnec_1449 Pnec_1450     TRUE 0.981 4.000 0.626 1.000 N NA
 7350787 7350788 Pnec_1451 Pnec_1452   rpmB FALSE 0.160 145.000 0.000 1.000   NA
 7350788 7350789 Pnec_1452 Pnec_1453 rpmB rpmG TRUE 0.990 12.000 0.332 0.023 Y NA
 7350790 7350791 Pnec_1454 Pnec_1455     TRUE 0.785 29.000 0.045 NA N NA
 7350791 7350792 Pnec_1455 Pnec_1456     TRUE 0.948 -3.000 0.099 NA N NA
 7350793 7350794 Pnec_1457 Pnec_1458   ileS TRUE 0.681 13.000 0.000 NA   NA
 7350794 7350795 Pnec_1458 Pnec_1459 ileS   TRUE 0.876 12.000 0.071 1.000 N NA
 7350795 7350796 Pnec_1459 Pnec_1460     TRUE 0.777 10.000 0.024 1.000 N NA
 7350796 7350797 Pnec_1460 Pnec_1461   dut TRUE 0.907 42.000 0.201 1.000 N NA
 7350798 7350799 Pnec_1462 Pnec_1463     FALSE 0.362 43.000 0.004 NA   NA
 7350799 7350800 Pnec_1463 Pnec_1464     TRUE 0.984 -3.000 0.596 NA   NA
 7350801 7350802 Pnec_1465 Pnec_1466     FALSE 0.136 85.000 0.007 NA   NA
 7350803 7350804 Pnec_1467 Pnec_1468     TRUE 0.661 35.000 0.000 NA   NA
 7350804 7350805 Pnec_1468 Pnec_1469     TRUE 0.804 78.000 0.088 1.000 Y NA
 7350808 7350809 Pnec_1472 Pnec_1473     TRUE 0.875 6.000 0.069 NA   NA
 7350813 7350814 Pnec_1477 Pnec_1478     TRUE 0.927 12.000 0.217 NA   NA
 7350814 7350815 Pnec_1478 Pnec_1479     FALSE 0.598 19.000 0.010 NA   NA
 7350815 7350816 Pnec_1479 Pnec_1480     TRUE 0.837 -3.000 0.008 1.000 N NA
 7350816 7350817 Pnec_1480 Pnec_1481     FALSE 0.435 53.000 0.000 NA   NA
 7350817 7350818 Pnec_1481 Pnec_1482     FALSE 0.145 129.000 0.000 NA   NA
 7350819 7350820 Pnec_1483 Pnec_1484   dnaK TRUE 0.911 101.000 0.236 0.004 Y NA
 7350820 7350821 Pnec_1484 Pnec_1485 dnaK   TRUE 0.624 146.000 0.030 0.009 Y NA
 7350821 7350822 Pnec_1485 Pnec_1486   hemH FALSE 0.470 67.000 0.043 1.000 N NA
 7350822 7350823 Pnec_1486 Pnec_1487 hemH hrcA TRUE 0.779 41.000 0.048 1.000 N NA
 7350824 7350825 Pnec_1488 Pnec_1489     TRUE 0.913 27.000 0.170 NA   NA
 7350825 7350826 Pnec_1489 Pnec_1490     FALSE 0.054 204.000 0.006 NA   NA
 7350827 7350828 Pnec_1491 Pnec_1492     TRUE 0.806 -33.000 0.000 NA   NA
 7350829 7350830 Pnec_1493 Pnec_1494     TRUE 0.729 7.000 0.000 NA   NA
 7350830 7350831 Pnec_1494 Pnec_1496     FALSE 0.233 79.000 0.000 NA   NA
 7350831 7350832 Pnec_1496 Pnec_1497     FALSE 0.486 31.000 0.005 NA   NA
 7350834 7350835 Pnec_1499 Pnec_1500   glcF TRUE 0.720 8.000 0.000 NA   NA
 7350835 7350836 Pnec_1500 Pnec_1501 glcF   TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA   NA
 7350836 7350837 Pnec_1501 Pnec_1502     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA   NA
 7350838 7350839 Pnec_1503 Pnec_1504     TRUE 0.709 11.000 0.011 1.000 N NA
 7350840 7350841 Pnec_1505 Pnec_1506 queA   TRUE 0.997 -3.000 0.360 0.001 Y NA
 7350841 7350842 Pnec_1506 Pnec_1507     FALSE 0.572 135.000 0.325 NA N NA
 7350842 7350843 Pnec_1507 Pnec_1508     TRUE 0.946 39.000 0.083 NA Y NA
 7350843 7350844 Pnec_1508 Pnec_1509   secF TRUE 0.995 4.000 0.332 0.002 Y NA
 7350845 7350846 Pnec_1510 Pnec_1511     TRUE 0.777 -3.000 0.002 1.000 N NA
 7350849 7350850 Pnec_1514 Pnec_1515     TRUE 0.985 25.000 0.829 0.002   NA
 7350850 7350851 Pnec_1515 Pnec_1516     TRUE 0.892 34.000 0.040 0.002   NA
 7350852 7350853 Pnec_1517 Pnec_1518     FALSE 0.603 86.000 0.200 NA   NA
 7350853 7350854 Pnec_1518 Pnec_1519     TRUE 0.973 29.000 0.080 0.072 Y NA
 7350855 7350856 Pnec_1520 Pnec_1521     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA   NA
 7350856 7350857 Pnec_1521 Pnec_1522     TRUE 0.830 0.000 0.000 NA   NA
 7350857 7350858 Pnec_1522 Pnec_1523     FALSE 0.080 273.000 0.000 NA   NA
 7350858 7350859 Pnec_1523 Pnec_1524     FALSE 0.484 50.000 0.000 NA   NA
 7350859 7350860 Pnec_1524 Pnec_1525     FALSE 0.251 76.000 0.000 NA   NA
 7350861 7350862 Pnec_1526 Pnec_1527     TRUE 0.803 3.000 0.000 NA   NA
 7350862 7350863 Pnec_1527 Pnec_1528     TRUE 0.992 5.000 0.201 0.001 Y NA
 7350863 7350864 Pnec_1528 Pnec_1529     TRUE 0.913 42.000 0.038 1.000 Y NA
 7350864 7350865 Pnec_1529 Pnec_1530     TRUE 0.874 8.000 0.055 1.000 N NA
 7350865 7350866 Pnec_1530 Pnec_1531     TRUE 0.952 61.000 0.218 0.006 Y NA
 7350866 7350867 Pnec_1531 Pnec_1532     TRUE 0.980 3.000 0.032 0.006 Y NA
 7350868 7350869 Pnec_1533 Pnec_1534     TRUE 0.931 22.000 0.223 NA   NA
 7350869 7350870 Pnec_1534 Pnec_1535     TRUE 0.824 47.000 0.138 NA   NA
 7350870 7350871 Pnec_1535 Pnec_1536     TRUE 0.864 18.000 0.088 NA   NA
 7350871 7350872 Pnec_1536 Pnec_1537     TRUE 0.740 6.000 0.000 NA   NA
 7350875 7350876 Pnec_1540 Pnec_1541     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA   NA
 7350876 7350877 Pnec_1541 Pnec_1542     FALSE 0.076 291.000 0.000 NA   NA
 7350877 7350878 Pnec_1542 Pnec_1543     FALSE 0.524 47.000 0.000 NA   NA
 7350878 7350879 Pnec_1543 Pnec_1544     TRUE 0.754 5.000 0.000 NA   NA
 7350879 7350880 Pnec_1544 Pnec_1545     TRUE 0.682 12.000 0.000 NA   NA
 7350880 7350881 Pnec_1545 Pnec_1546     TRUE 0.655 94.000 0.220 1.000 N NA
 7350881 7350882 Pnec_1546 Pnec_1547   sucC TRUE 0.987 16.000 0.151 0.001 Y NA
 7350882 7350883 Pnec_1547 Pnec_1548 sucC   FALSE 0.073 190.000 0.004 1.000   NA
 7350883 7350884 Pnec_1548 Pnec_1549     TRUE 0.963 5.000 0.296 1.000   NA
 7350884 7350885 Pnec_1549 Pnec_1550     FALSE 0.154 120.000 0.000 NA   NA
 7350885 7350886 Pnec_1550 Pnec_R0041     FALSE 0.096 207.000 0.000 NA   NA
 7350886 7350887 Pnec_R0041 Pnec_1551     FALSE 0.088 237.000 0.000 NA   NA
 7350891 7350892 Pnec_1555 Pnec_1556     FALSE 0.085 245.000 0.000 NA   NA
 7350892 7350893 Pnec_1556 Pnec_1557     FALSE 0.485 54.000 0.000 1.000   NA
 7350893 7350894 Pnec_1557 Pnec_1558     FALSE 0.143 131.000 0.000 NA   NA
 7350896 7350897 Pnec_1560 Pnec_1561     FALSE 0.435 49.000 0.012 NA   NA
 7350898 7350899 Pnec_1562 Pnec_1563     FALSE 0.136 66.000 0.002 NA   NA
 7350899 7350900 Pnec_1563 Pnec_1564     TRUE 0.738 -10.000 0.007 NA   NA
 7350900 7350901 Pnec_1564 Pnec_1565     TRUE 0.900 31.000 0.150 NA   NA
 7350901 7350902 Pnec_1565 Pnec_1566     TRUE 0.623 23.000 0.010 NA N NA
 7350902 7350903 Pnec_1566 Pnec_1567   glyQ FALSE 0.271 60.000 0.003 1.000 N NA
 7350903 7350904 Pnec_1567 Pnec_1568 glyQ glyS TRUE 0.994 28.000 0.651 0.001 Y NA
 7350904 7350905 Pnec_1568 Pnec_1569 glyS   TRUE 0.963 -3.000 0.123 1.000 N NA
 7350905 7350906 Pnec_1569 Pnec_1570     TRUE 0.957 8.000 0.279 1.000 N NA
 7350907 7350908 Pnec_1571 Pnec_1572     TRUE 0.776 4.000 0.000 NA   NA
 7350908 7350909 Pnec_1572 Pnec_1573     TRUE 0.813 -25.000 0.000 NA   NA
 7350909 7350910 Pnec_1573 Pnec_1574     TRUE 0.968 0.000 0.168 1.000 N NA
 7350911 7350912 Pnec_1575 Pnec_1576     TRUE 0.963 14.000 0.642 NA   NA
 7350912 7350913 Pnec_1576 Pnec_1577     TRUE 0.946 -7.000 0.074 1.000 N NA
 7350913 7350914 Pnec_1577 Pnec_1578     TRUE 0.960 15.000 0.396 1.000 N NA
 7350914 7350915 Pnec_1578 Pnec_1579     FALSE 0.314 130.000 0.019 0.011 N NA
 7350915 7350916 Pnec_1579 Pnec_1580     TRUE 0.849 50.000 0.161 1.000 N NA
 7350916 7350917 Pnec_1580 Pnec_1581   purH TRUE 0.812 48.000 0.101 1.000 N NA
 7350917 7350918 Pnec_1581 Pnec_1582 purH   TRUE 0.747 32.000 0.023 1.000 N NA
 7350918 7350919 Pnec_1582 Pnec_1583   ruvA TRUE 0.992 30.000 0.451 0.007 Y NA
 7350919 7350920 Pnec_1583 Pnec_1584 ruvA ruvB TRUE 0.990 43.000 0.549 0.002 Y NA
 7350923 7350924 Pnec_1587 Pnec_1588   argC FALSE 0.271 78.000 0.031 NA   NA
 7350924 7350925 Pnec_1588 Pnec_1589 argC   FALSE 0.298 97.000 0.032 1.000 N NA
 7350925 7350926 Pnec_1589 Pnec_1590   rplM TRUE 0.993 10.000 0.601 0.022 Y NA
 7350928 7350929 Pnec_R0042 Pnec_1592     FALSE 0.197 97.000 0.000 NA   NA
 7350929 7350930 Pnec_1592 Pnec_1593     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA   NA
 7350930 7350931 Pnec_1593 Pnec_1595     TRUE 0.699 10.000 0.000 NA   NA
 7350931 7350932 Pnec_1595 Pnec_1596     TRUE 0.662 38.000 0.012 1.000 N NA
 7350932 7350933 Pnec_1596 Pnec_1597     TRUE 0.845 24.000 0.050 1.000 N NA
 7350933 7350934 Pnec_1597 Pnec_1598     TRUE 0.819 17.000 0.057 NA   NA
 7350934 7350935 Pnec_1598 Pnec_1599     FALSE 0.255 54.000 0.005 NA   NA
 7350935 7350936 Pnec_1599 Pnec_1600     TRUE 0.975 4.000 0.432 1.000   NA
 7350936 7350937 Pnec_1600 Pnec_1601     TRUE 0.767 55.000 0.135 1.000   NA
 7350937 7350938 Pnec_1601 Pnec_1602     FALSE 0.445 69.000 0.044 1.000   NA
 7350938 7350939 Pnec_1602 Pnec_1603     TRUE 0.929 0.000 0.074 NA   NA
 7350939 7350940 Pnec_1603 Pnec_1604     TRUE 0.821 0.000 0.019 NA   NA
 7350941 7350942 Pnec_1605 Pnec_1606     TRUE 0.723 14.000 0.019 1.000   NA
 7350942 7350943 Pnec_1606 Pnec_1607     TRUE 0.668 33.000 0.000 NA   NA
 7350944 7350945 Pnec_1608 Pnec_1609     FALSE 0.217 82.000 0.007 1.000 N NA
 7350948 7350949 Pnec_1612 Pnec_1613     TRUE 0.966 25.000 0.598 1.000   NA
 7350949 7350950 Pnec_1613 Pnec_1614     TRUE 0.976 4.000 0.617 NA   NA
 7350950 7350951 Pnec_1614 Pnec_1615     TRUE 0.979 0.000 0.459 NA   NA
 7350951 7350952 Pnec_1615 Pnec_1616     TRUE 0.983 -3.000 0.543 NA   NA
 7350952 7350953 Pnec_1616 Pnec_1617     FALSE 0.058 190.000 0.006 NA   NA
 7350953 7350954 Pnec_1617 Pnec_1618     TRUE 0.941 34.000 0.309 NA N NA
 7350954 7350955 Pnec_1618 Pnec_1619     TRUE 0.991 -3.000 0.177 1.000 Y NA
 7350955 7350956 Pnec_1619 Pnec_1620     TRUE 0.949 4.000 0.194 NA   NA
 7350957 7350958 Pnec_1621 Pnec_1622     TRUE 0.981 -15.000 0.021 0.003 Y NA
 7350959 7350960 Pnec_1623 Pnec_1624   ipk TRUE 0.617 12.000 0.004 1.000 N NA
 7350960 7350961 Pnec_1624 Pnec_R0043 ipk   TRUE 0.836 -1.000 0.000 NA   NA
 7350961 7350962 Pnec_R0043 Pnec_1625     FALSE 0.400 55.000 0.000 NA   NA
 7350962 7350963 Pnec_1625 Pnec_1626     FALSE 0.432 137.000 0.122 1.000 N NA
 7350963 7350964 Pnec_1626 Pnec_1627     TRUE 0.938 88.000 0.496 0.036 Y NA
 7350965 7350966 Pnec_1628 Pnec_1629   coaD TRUE 0.864 17.000 0.088 NA   NA
 7350966 7350967 Pnec_1629 Pnec_1630 coaD   TRUE 0.942 37.000 0.367 NA N NA
 7350967 7350968 Pnec_1630 Pnec_1631     TRUE 0.844 23.000 0.070 NA   NA
 7350968 7350969 Pnec_1631 Pnec_1632     TRUE 0.991 0.000 0.598 0.006   NA
 7350970 7350971 Pnec_1633 Pnec_1634     FALSE 0.201 94.000 0.008 1.000 N NA
 7350972 7350973 Pnec_1635 Pnec_1636     TRUE 0.759 8.000 0.019 1.000   NA
 7350973 7350974 Pnec_1636 Pnec_1637     TRUE 0.992 3.000 0.321 1.000 Y NA
 7350974 7350975 Pnec_1637 Pnec_1638     TRUE 0.970 0.000 0.255 NA   NA
 7350975 7350976 Pnec_1638 Pnec_1639     TRUE 0.986 -3.000 0.722 NA   NA
 7350978 7350979 Pnec_1641 Pnec_1642     TRUE 0.901 31.000 0.152 NA   NA
 7350979 7350980 Pnec_1642 Pnec_1643     TRUE 0.956 -3.000 0.129 NA   NA
 7350980 7350981 Pnec_1643 Pnec_1644     FALSE 0.592 129.000 0.268 1.000 N NA
 7350981 7350982 Pnec_1644 Pnec_1645     TRUE 0.991 44.000 0.741 0.004 Y NA
 7350982 7350983 Pnec_1645 Pnec_1646     FALSE 0.083 180.000 0.006 1.000   NA
 7350984 7350985 Pnec_1647 Pnec_1648     TRUE 0.911 -7.000 0.045 1.000   NA
 7350986 7350987 Pnec_1649 Pnec_1650 gpsA   TRUE 0.897 24.000 0.097 1.000 N NA
 7350987 7350988 Pnec_1650 Pnec_1651     TRUE 0.940 29.000 0.221 1.000 N NA
 7350988 7350989 Pnec_1651 Pnec_1652     TRUE 0.944 10.000 0.269 NA N NA
 7350990 7350991 Pnec_1653 Pnec_1654     TRUE 0.800 13.000 0.036 1.000 N NA
 7350991 7350992 Pnec_1654 Pnec_1655     TRUE 0.682 23.000 0.000 NA   NA
 7350993 7350994 Pnec_1656 Pnec_1657     TRUE 0.992 6.000 0.205 0.002 Y NA
 7350994 7350995 Pnec_1657 Pnec_1658     TRUE 0.990 18.000 0.261 0.002 Y NA
 7350995 7350996 Pnec_1658 Pnec_1659     TRUE 0.803 3.000 0.000 NA   NA
 7350996 7350997 Pnec_1659 Pnec_1660     TRUE 0.673 29.000 0.000 NA   NA
 7350997 7350998 Pnec_1660 Pnec_1661     FALSE 0.199 96.000 0.000 NA   NA
 7350998 7350999 Pnec_1661 Pnec_1662     TRUE 0.670 32.000 0.000 NA   NA
 7350999 7351000 Pnec_1662 Pnec_1663     TRUE 0.682 14.000 0.000 NA   NA
 7351000 7351001 Pnec_1663 Pnec_1664     TRUE 0.835 26.000 0.065 NA   NA
 7351003 7351004 Pnec_1666 Pnec_1667     TRUE 0.827 -10.000 0.000 NA   NA
 7351004 7351005 Pnec_1667 Pnec_1668     TRUE 0.633 -19.000 0.003 NA   NA
 7351005 7351006 Pnec_1668 Pnec_1669   lipB TRUE 0.997 -3.000 0.319 0.001 Y NA
 7351006 7351007 Pnec_1669 Pnec_1670 lipB   TRUE 0.939 8.000 0.219 NA   NA
 7351007 7351008 Pnec_1670 Pnec_1671     FALSE 0.550 17.000 0.007 NA   NA
 7351008 7351009 Pnec_1671 Pnec_1672     TRUE 0.916 27.000 0.179 NA   NA
 7351009 7351010 Pnec_1672 Pnec_1673     FALSE 0.357 814.000 0.320 NA   NA
 7351011 7351012 Pnec_1674 Pnec_1675     TRUE 0.967 -3.000 0.147 1.000 N NA
 7351014 7351015 Pnec_1677 Pnec_1678     FALSE 0.176 109.000 0.000 NA   NA
 7351015 7351016 Pnec_1678 Pnec_1680     TRUE 0.808 -30.000 0.000 NA   NA
 7351016 7351017 Pnec_1680 Pnec_1681     FALSE 0.129 143.000 0.000 NA   NA
 7351017 7351018 Pnec_1681 Pnec_1682     FALSE 0.077 289.000 0.000 NA   NA
 7351018 7351019 Pnec_1682 Pnec_1683     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA   NA
 7351020 7351021 Pnec_1684 Pnec_1685     TRUE 0.984 -3.000 0.573 NA   NA
 7351021 7351022 Pnec_1685 Pnec_1686     TRUE 0.813 36.000 0.062 NA   NA
 7351024 7351025 Pnec_1688 Pnec_1689     TRUE 0.988 -3.000 0.041 0.001 Y NA
 7351027 7351028 Pnec_1691 Pnec_1692     TRUE 0.820 1.000 0.000 NA   NA
 7351028 7351029 Pnec_1692 Pnec_1693     FALSE 0.090 233.000 0.000 NA   NA
 7351030 7351031 Pnec_1694 Pnec_1695     FALSE 0.548 63.000 0.071 NA   NA
 7351031 7351032 Pnec_1695 Pnec_1696     TRUE 0.676 28.000 0.000 NA   NA
 7351033 7351034 Pnec_1697 Pnec_1700     TRUE 0.720 8.000 0.000 NA   NA
 7351034 7351035 Pnec_1700 Pnec_1701     FALSE 0.114 170.000 0.000 NA   NA
 7351035 7351036 Pnec_1701 Pnec_1702     FALSE 0.197 97.000 0.000 NA   NA
 7351036 7351037 Pnec_1702 Pnec_1703     FALSE 0.070 390.000 0.000 NA   NA
 7351037 7351038 Pnec_1703 Pnec_1704     TRUE 0.654 36.000 0.000 NA   NA
 7351038 7351039 Pnec_1704 Pnec_1705     TRUE 0.676 28.000 0.000 NA   NA
 7351039 7351040 Pnec_1705 Pnec_1706     FALSE 0.256 75.000 0.000 NA   NA
 7351040 7351041 Pnec_1706 Pnec_1707     TRUE 0.960 0.000 0.009 1.000 Y NA
 7351041 7351042 Pnec_1707 Pnec_1708     TRUE 0.634 36.000 0.014 NA N NA
 7351042 7351043 Pnec_1708 Pnec_1709     TRUE 0.836 23.000 0.059 NA N NA
 7351043 7351044 Pnec_1709 Pnec_1710     TRUE 0.981 -3.000 0.316 1.000 N NA
 7351046 7351047 Pnec_1712 Pnec_1713     TRUE 0.923 0.000 0.054 1.000   NA
 7351047 7351048 Pnec_1713 Pnec_1714     TRUE 0.665 34.000 0.000 NA   NA
 7351048 7351049 Pnec_1714 Pnec_1715     FALSE 0.605 40.000 0.000 NA   NA
 7351051 7351052 Pnec_1717 Pnec_1718     TRUE 0.841 37.000 0.061 1.000 N NA
 7351052 7351053 Pnec_1718 Pnec_1719     TRUE 0.743 235.000 0.114 0.001 Y NA
 7351054 7351055 Pnec_1720 Pnec_1721     TRUE 0.776 4.000 0.000 NA   NA
 7351055 7351056 Pnec_1721 Pnec_1722     TRUE 0.682 25.000 0.000 NA   NA
 7351056 7351057 Pnec_1722 Pnec_1723     FALSE 0.260 60.000 0.002 1.000 N NA
 7351060 7351061 Pnec_1726 Pnec_1727     FALSE 0.231 82.000 0.023 NA   NA
 7351061 7351062 Pnec_1727 Pnec_1728   metX TRUE 0.984 -3.000 0.509 NA N NA
 7351062 7351063 Pnec_1728 Pnec_1729 metX slmA TRUE 0.802 -3.000 0.006 1.000   NA
 7351063 7351064 Pnec_1729 Pnec_1730 slmA   TRUE 0.721 11.000 0.017 1.000   NA
 7351064 7351065 Pnec_1730 Pnec_1731     FALSE 0.597 14.000 0.003 1.000 N NA
 7351065 7351066 Pnec_1731 Pnec_1732     FALSE 0.285 100.000 0.045 NA   NA
 7351066 7351067 Pnec_1732 Pnec_1733     FALSE 0.290 70.000 0.024 NA   NA
 7351067 7351068 Pnec_1733 Pnec_1734     TRUE 0.983 -19.000 0.714 NA   NA
 7351068 7351069 Pnec_1734 Pnec_1735   gatB FALSE 0.510 27.000 0.005 NA   NA
 7351069 7351070 Pnec_1735 Pnec_1736 gatB   TRUE 0.997 -3.000 0.492 0.002 Y NA
 7351070 7351071 Pnec_1736 Pnec_1737     TRUE 0.998 -3.000 0.643 0.002 Y NA
 7351072 7351073 Pnec_1738 Pnec_1739     TRUE 0.760 112.000 0.689 1.000 N NA
 7351073 7351074 Pnec_1739 Pnec_1740     TRUE 0.997 -3.000 0.550 0.004 Y NA
 7351074 7351075 Pnec_1740 Pnec_1741     TRUE 0.973 9.000 0.108 1.000 Y NA
 7351075 7351076 Pnec_1741 Pnec_1742     TRUE 0.939 -18.000 0.073 1.000 N NA
 7351077 7351078 Pnec_1743 Pnec_1744     FALSE 0.118 165.000 0.000 NA   NA
 7351079 7351080 Pnec_1745 Pnec_1746     TRUE 0.753 10.000 0.000 1.000   NA
 7351080 7351081 Pnec_1746 Pnec_1747     TRUE 0.720 8.000 0.000 NA   NA
 7351081 7351082 Pnec_1747 Pnec_1749     FALSE 0.093 219.000 0.000 NA   NA
 7351082 7351083 Pnec_1749 Pnec_1750     FALSE 0.077 288.000 0.000 NA   NA
 7351083 7351084 Pnec_1750 Pnec_1751     TRUE 0.977 4.000 0.633 NA   NA
 7351084 7351085 Pnec_1751 Pnec_1752     TRUE 0.764 9.000 0.000 1.000   NA
 7351085 7351086 Pnec_1752 Pnec_1753     FALSE 0.192 121.000 0.000 1.000   NA
 7351086 7351087 Pnec_1753 Pnec_1754     FALSE 0.346 167.000 0.003 1.000 Y NA
 7351088 7351089 Pnec_1755 Pnec_1756     TRUE 0.670 32.000 0.000 NA   NA
 7351090 7351091 Pnec_1758 Pnec_1759     FALSE 0.186 125.000 0.000 1.000   NA
 7351091 7351092 Pnec_1759 Pnec_1760     TRUE 0.618 39.000 0.000 NA   NA
 7351093 7351094 Pnec_1761 Pnec_1762     TRUE 0.670 32.000 0.000 NA   NA
 7351094 7351095 Pnec_1762 Pnec_1763     FALSE 0.342 60.000 0.000 NA   NA
 7351095 7351096 Pnec_1763 Pnec_1764     FALSE 0.189 103.000 0.000 NA   NA
 7351096 7351097 Pnec_1764 Pnec_1765     TRUE 0.985 -3.000 0.286 0.041   NA
 7351097 7351098 Pnec_1765 Pnec_1766     TRUE 0.991 -19.000 0.686 0.011   NA
 7351098 7351099 Pnec_1766 Pnec_1767     FALSE 0.150 124.000 0.000 NA   NA
 7351099 7351100 Pnec_1767 Pnec_1768     FALSE 0.474 46.000 0.012 NA   NA
 7351100 7351101 Pnec_1768 Pnec_1769     TRUE 0.641 37.000 0.000 NA   NA
 7351101 7351102 Pnec_1769 Pnec_1770     FALSE 0.291 68.000 0.000 NA   NA
 7351102 7351103 Pnec_1770 Pnec_1771     FALSE 0.160 117.000 0.000 NA   NA
 7351103 7351104 Pnec_1771 Pnec_R0044     FALSE 0.074 322.000 0.000 NA   NA
 7351104 7351105 Pnec_R0044 Pnec_1772     FALSE 0.171 111.000 0.000 NA   NA
 7351105 7351106 Pnec_1772 Pnec_1773     TRUE 0.982 3.000 0.605 1.000   NA
 7351106 7351107 Pnec_1773 Pnec_1774     TRUE 0.987 -3.000 0.810 NA   NA
 7351107 7351108 Pnec_1774 Pnec_1775     FALSE 0.429 98.000 0.094 NA   NA
 7351108 7351109 Pnec_1775 Pnec_1776     TRUE 0.940 2.000 0.075 1.000 N NA
 7351109 7351110 Pnec_1776 Pnec_1777     TRUE 0.850 3.000 0.021 1.000 N NA
 7351110 7351111 Pnec_1777 Pnec_1778     TRUE 0.982 9.000 0.105 0.034 Y NA
 7351112 7351113 Pnec_1779 Pnec_1780     FALSE 0.071 197.000 0.004 1.000   NA
 7351114 7351115 Pnec_1781 Pnec_1782     FALSE 0.498 49.000 0.000 NA   NA
 7351115 7351116 Pnec_1782 Pnec_1783   trmE FALSE 0.285 91.000 0.003 0.011   NA
 7351116 7351117 Pnec_1783 Pnec_1784 trmE   TRUE 0.944 40.000 0.221 0.036   NA
 7351117 7351118 Pnec_1784 Pnec_1785     TRUE 0.964 7.000 0.461 NA   NA
 7351118 7351119 Pnec_1785 Pnec_1786     TRUE 0.980 2.000 0.540 NA   NA
 7351119 7351120 Pnec_1786 Pnec_1787   rpmH TRUE 0.890 60.000 0.787 1.000   NA