MicrobesOnline Operon Predictions for Clostridium butyricum 5521

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 11523917 11666280         TRUE NA -16.000 0.000 NA   NA
 11666280 11808672         TRUE NA -16.000 0.000 NA   NA
 11808672 11523918         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 11523918 11666281         TRUE NA -45.000 0.000 NA   NA
 11666281 11808673         TRUE NA -45.000 0.000 NA   NA
 11808673 11523919         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 11523919 11666282         TRUE NA -16.000 0.000 NA   NA
 11666282 11808674         TRUE NA -16.000 0.000 NA   NA
 11808674 11523920         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 11523920 11666283         TRUE NA -42.000 0.000 NA   NA
 11666283 11808675         TRUE NA -42.000 0.000 NA   NA
 11808675 11523921         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 11523921 11666284         TRUE NA -16.000 0.000 NA   NA
 11666284 11808676         TRUE NA -16.000 0.000 NA   NA
 11808676 11523922         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 11523922 11666285         TRUE NA -42.000 0.000 NA   NA
 11666285 11808677         TRUE NA -42.000 0.000 NA   NA
 11808677 11523923         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 11523923 11666286         TRUE NA -16.000 0.000 NA   NA
 11666286 11808678         TRUE NA -16.000 0.000 NA   NA
 5972160 4726349 CBY_4090 CBY_4091     FALSE 0.329 110.000 0.000 1.000 N NA
 4726349 4726350 CBY_4091 CBY_4092     FALSE 0.081 230.000 0.000 0.068   NA
 4726350 5972161 CBY_4092 CBY_4093     FALSE 0.017 377.000 0.000 1.000   NA
 5972161 5972162 CBY_4093 CBY_4094     FALSE 0.418 82.000 0.000 NA   NA
 5972163 5972164 CBY_4095 CBY_4096     FALSE 0.073 243.000 0.000 NA N NA
 5972165 5972166 CBY_4097 CBY_4098     TRUE 0.879 117.000 0.000 1.000 Y NA
 5972166 5972167 CBY_4098 CBY_4099     TRUE 0.844 79.000 0.143 1.000   NA
 5972167 5972168 CBY_4099 CBY_4100     FALSE 0.150 199.000 0.000 NA   NA
 5972168 5972169 CBY_4100 CBY_4101     FALSE 0.306 117.000 0.000 NA   NA
 5972169 5972170 CBY_4101 CBY_4102     FALSE 0.217 172.000 0.000 NA   NA
 5972170 5972171 CBY_4102 CBY_4103     FALSE 0.195 182.000 0.000 NA   NA
 5972172 5972173 CBY_1747 CBY_1748     FALSE 0.401 87.000 0.000 NA   NA
 5972173 5972174 CBY_1748 CBY_1749     TRUE 0.845 96.000 0.250 NA   NA
 5972174 5972175 CBY_1749 CBY_1750     FALSE 0.014 407.000 0.000 NA   NA
 4726748 4726749 CBY_4080 CBY_4081 glgD glgC TRUE 0.996 25.000 0.309 0.001 Y NA
 4726749 5972176 CBY_4081 CBY_4082 glgC   TRUE 0.927 153.000 0.049 1.000 Y NA
 5972176 5972177 CBY_4082 CBY_4083     FALSE 0.175 190.000 0.000 NA   NA
 5972177 5972178 CBY_4083 CBY_4084     FALSE 0.302 118.000 0.000 NA   NA
 5972178 5972179 CBY_4084 CBY_4085   glgB TRUE 0.954 100.000 0.050 1.000 Y NA
 5972179 5972180 CBY_4085 CBY_4385 glgB rrf FALSE 0.010 509.000 0.000 NA   NA
 5972180 5972181 CBY_4385 CBY_4386 rrf rrl FALSE 0.108 217.000 0.000 NA   NA
 5972182 5972183 CBY_4087 CBY_4088     FALSE 0.044 274.000 0.000 NA   NA
 5972185 5972186 CBY_1186 CBY_1187     FALSE 0.396 88.000 0.000 NA   NA
 5972188 5972189 CBY_1190 CBY_1191     TRUE 0.831 -3.000 0.000 1.000   NA
 5972190 5972191 CBY_1192 CBY_1193     FALSE 0.461 72.000 0.000 NA   NA
 5972192 5972193 CBY_1194 CBY_1195 ilvB   TRUE 0.974 -7.000 0.189 0.003   NA
 5972193 5972194 CBY_1195 CBY_1196     FALSE 0.265 143.000 0.000 NA   NA
 5972195 5972196 CBY_1197 CBY_1198     TRUE 0.998 13.000 0.492 0.024 Y NA
 5972196 5972197 CBY_1198 CBY_1199   gatC TRUE 0.998 16.000 0.643 1.000 Y NA
 5972197 5972198 CBY_1199 CBY_1200 gatC aspS FALSE 0.275 415.000 0.009 1.000 Y NA
 5972198 5972199 CBY_1200 CBY_1201 aspS   FALSE 0.007 747.000 0.000 NA   NA
 5972199 5972200 CBY_1201 CBY_1202     FALSE 0.015 401.000 0.000 NA   NA
 5972200 5972201 CBY_1202 CBY_1203   asd FALSE 0.115 214.000 0.000 NA   NA
 5972203 5972204 CBY_1205 CBY_1206     FALSE 0.025 326.000 0.000 NA   NA
 5972204 5972205 CBY_1206 CBY_1207     FALSE 0.038 285.000 0.000 NA   NA
 5972205 5972206 CBY_1207 CBY_1208     FALSE 0.079 236.000 0.000 NA   NA
 5972208 5972209 CBY_1210 CBY_1211     FALSE 0.152 198.000 0.000 NA   NA
 5972209 5972210 CBY_1211 CBY_1212     FALSE 0.062 252.000 0.000 1.000 N NA
 5972210 5972211 CBY_1212 CBY_1213     FALSE 0.081 236.000 0.000 NA N NA
 5972211 5972212 CBY_1213 CBY_1214     TRUE 0.854 116.000 0.500 NA   NA
 5972212 5972213 CBY_1214 CBY_1215     FALSE 0.123 210.000 0.000 NA   NA
 5972213 5972214 CBY_1215 CBY_1216     TRUE 0.996 -13.000 0.200 1.000 Y NA
 5972215 5972216 CBY_1217 CBY_1218     TRUE 0.979 15.000 0.269 NA N NA
 5972218 5972219 CBY_1220 CBY_1221     TRUE 0.970 15.000 0.125 NA   NA
 5972219 5972220 CBY_1221 CBY_1222     TRUE 0.964 4.000 0.062 NA   NA
 5972220 4726954 CBY_1222 CBY_1223     FALSE 0.268 135.000 0.000 1.000   NA
 5972221 5972222 CBY_1224 CBY_1225 lgt   TRUE 0.653 42.000 0.000 1.000 N NA
 5972222 5972223 CBY_1225 CBY_1226     TRUE 0.890 98.000 0.600 NA N NA
 5972223 5972224 CBY_1226 CBY_1227     FALSE 0.408 85.000 0.000 NA   NA
 5972224 5972225 CBY_1227 CBY_1228     TRUE 0.825 16.000 0.000 NA   NA
 5972225 5972226 CBY_1228 CBY_1229   trx FALSE 0.462 68.000 0.000 0.005   NA
 5972226 5972227 CBY_1229 CBY_1230 trx gidA TRUE 0.783 129.000 0.250 1.000   NA
 5972227 4726960 CBY_1230 CBY_1231 gidA   FALSE 0.057 254.000 0.000 1.000   NA
 5972229 5972230 CBY_0802 CBY_0803     TRUE 0.984 26.000 0.933 NA   NA
 4727118 5972232 CBY_0805 CBY_0806     TRUE 0.783 25.000 0.000 1.000   NA
 5972232 5972233 CBY_0806 CBY_0807     FALSE 0.040 282.000 0.000 1.000 N NA
 5972233 5972234 CBY_0807 CBY_0808     FALSE 0.041 277.000 0.000 NA   NA
 5972236 5972237 CBY_0810 CBY_0811     FALSE 0.017 377.000 0.000 NA   NA
 5972237 5972238 CBY_0811 CBY_0812     TRUE 0.992 23.000 0.025 1.000 Y NA
 5972238 5972239 CBY_0812 CBY_0813     FALSE 0.152 198.000 0.000 NA   NA
 5972239 4727125 CBY_0813 CBY_0814     FALSE 0.077 237.000 0.000 NA   NA
 4727125 5972240 CBY_0814 CBY_0815     FALSE 0.031 301.000 0.000 NA   NA
 5972240 5972241 CBY_0815 CBY_0816   pyc FALSE 0.270 135.000 0.000 NA   NA
 5972241 5972242 CBY_0816 CBY_0817 pyc   FALSE 0.012 449.000 0.000 NA   NA
 5972242 5972243 CBY_0817 CBY_0818     FALSE 0.019 359.000 0.000 NA   NA
 5972243 5972244 CBY_0818 CBY_0819     TRUE 0.728 203.000 0.000 1.000 Y NA
 5972244 5972245 CBY_0819 CBY_0820     TRUE 0.965 45.000 0.000 1.000 Y NA
 5972245 5972246 CBY_0820 CBY_0821     TRUE 0.998 -7.000 0.818 0.041 Y NA
 5972246 5972247 CBY_0821 CBY_0822     TRUE 0.995 32.000 0.273 1.000 Y NA
 5972248 4727142 CBY_0824 CBY_0825     TRUE 0.821 -9.000 0.000 NA   NA
 4727142 5972249 CBY_0825 CBY_0826     TRUE 0.998 5.000 1.000 1.000 Y NA
 5972249 5972250 CBY_0826 CBY_0827     TRUE 0.841 2.000 0.000 NA   NA
 5972250 5972251 CBY_0827 CBY_0828     FALSE 0.229 166.000 0.000 NA   NA
 5972251 5972252 CBY_0828 CBY_0829     TRUE 0.997 29.000 1.000 0.025 Y NA
 5972254 5972255 CBY_1052 CBY_1053     FALSE 0.111 216.000 0.000 NA   NA
 5972255 5972256 CBY_1053 CBY_1054     FALSE 0.017 379.000 0.000 NA   NA
 5972257 5972258 CBY_1055 CBY_1056     FALSE 0.010 546.000 0.000 1.000 N NA
 5972259 5972260 CBY_1057 CBY_1058     FALSE 0.468 198.000 0.061 NA   NA
 5972260 5972261 CBY_1058 CBY_1059     TRUE 0.983 16.000 0.429 NA   NA
 5972261 4727289 CBY_1059 CBY_1060     TRUE 0.922 19.000 0.008 NA   NA
 4727289 5972262 CBY_1060 CBY_1061     FALSE 0.034 291.000 0.000 NA   NA
 5972262 5972263 CBY_1061 CBY_1062     FALSE 0.318 112.000 0.000 NA   NA
 5972264 4727400 CBY_0590 CBY_0591     TRUE 0.842 3.000 0.000 NA   NA
 4727400 5972265 CBY_0591 CBY_0592     TRUE 0.808 20.000 0.000 NA   NA
 5972265 5972266 CBY_0592 CBY_0593     TRUE 0.812 19.000 0.000 NA   NA
 5972266 5972267 CBY_0593 CBY_0594     TRUE 0.793 23.000 0.000 NA   NA
 5972267 5972268 CBY_0594 CBY_0595     TRUE 0.634 44.000 0.000 NA   NA
 5972268 5972269 CBY_0595 CBY_0596     TRUE 0.825 -7.000 0.000 NA   NA
 5972269 5972270 CBY_0596 CBY_0597     FALSE 0.393 89.000 0.000 NA   NA
 5972270 5972271 CBY_0597 CBY_0598     TRUE 0.804 -30.000 0.000 NA   NA
 5972271 5972272 CBY_0598 CBY_0599     TRUE 0.837 0.000 0.000 NA   NA
 5972272 5972273 CBY_0599 CBY_0600     TRUE 0.839 1.000 0.000 NA   NA
 5972273 5972274 CBY_0600 CBY_0601     TRUE 0.987 14.000 0.667 NA   NA
 5972274 5972275 CBY_0601 CBY_0602     TRUE 0.667 40.000 0.000 NA   NA
 5972275 5972276 CBY_0602 CBY_0603     TRUE 0.807 -22.000 0.000 NA   NA
 5972276 5972277 CBY_0603 CBY_0604     TRUE 0.832 -3.000 0.000 NA   NA
 5972277 5972278 CBY_0604 CBY_0605     TRUE 0.835 13.000 0.000 NA   NA
 5972279 5972280 CBY_1063 CBY_1064     FALSE 0.241 159.000 0.000 NA   NA
 5972280 5972281 CBY_1064 CBY_1065     TRUE 0.994 -3.000 0.044 0.001 Y NA
 5972281 5972282 CBY_1065 CBY_1066     FALSE 0.008 743.000 0.000 NA N NA
 5972282 5972283 CBY_1066 CBY_1067     TRUE 0.894 106.000 0.000 NA Y NA
 5972283 5972284 CBY_1067 CBY_1068     FALSE 0.096 223.000 0.000 NA   NA
 5972284 5972285 CBY_1068 CBY_1069     FALSE 0.335 107.000 0.000 NA   NA
 5972285 5972286 CBY_1069 CBY_1070     TRUE 0.866 118.000 0.667 NA   NA
 5972286 5972287 CBY_1070 CBY_1071     FALSE 0.148 200.000 0.000 NA   NA
 5972290 5972291 CBY_1074 CBY_1075     FALSE 0.030 303.000 0.000 NA   NA
 5972292 5972293 CBY_1076 CBY_1077     FALSE 0.185 186.000 0.000 NA   NA
 5972293 4727570 CBY_1077 CBY_1078     FALSE 0.023 334.000 0.000 NA   NA
 5972294 5972295 CBY_1079 CBY_1080     FALSE 0.440 77.000 0.000 NA   NA
 5972296 5972297 CBY_1081 CBY_1082     FALSE 0.312 115.000 0.000 NA   NA
 5972297 5972298 CBY_1082 CBY_1083     TRUE 0.829 15.000 0.000 NA   NA
 5972298 5972299 CBY_1083 CBY_1084     FALSE 0.036 288.000 0.000 NA   NA
 5972299 5972300 CBY_1084 CBY_1085     FALSE 0.461 72.000 0.000 NA   NA
 5972300 5972301 CBY_1085 CBY_1086     FALSE 0.020 354.000 0.000 NA   NA
 5972301 5972302 CBY_1086 CBY_1087     FALSE 0.302 118.000 0.000 NA   NA
 5972306 4727686 CBY_0774 CBY_0775     FALSE 0.009 550.000 0.000 1.000   NA
 4727686 5972307 CBY_0775 CBY_0776     FALSE 0.007 854.000 0.000 NA   NA
 5972307 5972308 CBY_0776 CBY_0777     FALSE 0.277 130.000 0.000 NA   NA
 5972308 5972309 CBY_0777 CBY_0778     FALSE 0.344 104.000 0.000 NA   NA
 5972310 5972311 CBY_0548 CBY_0549     FALSE 0.103 220.000 0.000 NA   NA
 5972313 5972314 CBY_0551 CBY_0552     FALSE 0.019 369.000 0.000 1.000 N NA
 5972314 5972315 CBY_0552 CBY_0553   argD TRUE 0.634 45.000 0.000 1.000 N NA
 5972315 5972316 CBY_0553 CBY_0554 argD   FALSE 0.024 329.000 0.000 1.000 N NA
 5972316 5972317 CBY_0554 CBY_0555     FALSE 0.012 461.000 0.000 NA   NA
 5972318 5972319 CBY_4228 CBY_0557     FALSE 0.256 152.000 0.000 NA   NA
 5972320 5972321 CBY_0558 CBY_0560 ytxC infC FALSE 0.235 162.000 0.000 NA   NA
 5972322 5972323 CBY_0290 CBY_0291     FALSE 0.072 242.000 0.000 NA   NA
 5972323 5972324 CBY_0291 CBY_0292   recA FALSE 0.119 281.000 0.018 1.000   NA
 5972324 5972325 CBY_0292 CBY_0293 recA   FALSE 0.219 171.000 0.000 NA   NA
 5972326 5972327 CBY_1867 CBY_1868 trpB   TRUE 0.914 211.000 0.375 0.002 Y NA
 5972327 5972328 CBY_1868 CBY_1869   trpC FALSE 0.063 250.000 0.000 NA   NA
 5972328 5972329 CBY_1869 CBY_1870 trpC   FALSE 0.376 93.000 0.000 NA   NA
 5972330 5972331 CBY_0308 CBY_0309     TRUE 0.842 4.000 0.000 NA   NA
 5972331 5972332 CBY_0309 CBY_0310     FALSE 0.015 395.000 0.000 NA   NA
 5972333 5972334 CBY_3238 CBY_3239   cysT FALSE 0.350 102.000 0.000 NA   NA
 5972334 5972335 CBY_3239 CBY_3240 cysT cysW TRUE 0.966 47.000 0.935 0.001 N NA
 5972335 5972336 CBY_3240 CBY_3241 cysW   TRUE 0.962 0.000 0.060 1.000 N NA
 5972336 5972337 CBY_3241 CBY_3242     TRUE 0.838 91.000 0.194 1.000 N NA
 5972337 5972338 CBY_3242 CBY_3243     TRUE 0.997 -16.000 0.484 0.037 Y NA
 5972338 5972339 CBY_3243 CBY_3244   cysD TRUE 0.965 39.000 0.500 1.000 N NA
 5972339 5972340 CBY_3244 CBY_3245 cysD   TRUE 0.989 2.000 0.933 0.001 N NA
 5972341 5972342 CBY_3246 CBY_3247     FALSE 0.014 414.000 0.000 NA   NA
 5972343 5972344 CBY_3248 CBY_3249     FALSE 0.134 206.000 0.000 NA   NA
 5972344 5972345 CBY_3249 CBY_3250     FALSE 0.020 354.000 0.000 1.000   NA
 5972345 5972346 CBY_3250 CBY_3251     FALSE 0.023 336.000 0.000 NA   NA
 5972346 5972347 CBY_3251 CBY_3252     FALSE 0.221 170.000 0.000 NA   NA
 5972349 5972350 CBY_3254 CBY_3255     TRUE 0.997 21.000 0.429 0.011 Y NA
 5972350 5972351 CBY_3255 CBY_3256     FALSE 0.394 284.000 0.000 1.000 Y NA
 5972351 5972352 CBY_3256 CBY_3257     TRUE 0.947 141.000 0.111 1.000 Y NA
 5972352 4728213 CBY_3257 CBY_3258     FALSE 0.353 248.000 0.182 0.010 N NA
 4728213 4728214 CBY_3258 CBY_3259     FALSE 0.020 355.000 0.000 1.000 N NA
 5972353 5972354 CBY_0540 CBY_0541 trmD rplS FALSE 0.271 134.000 0.000 NA   NA
 5972354 5972355 CBY_0541 CBY_0542 rplS   FALSE 0.094 311.000 0.027 1.000   NA
 5972355 5972356 CBY_0542 CBY_0543     TRUE 0.970 -13.000 0.148 1.000   NA
 5972356 5972357 CBY_0543 CBY_0544     FALSE 0.008 745.000 0.000 1.000 N NA
 5972357 5972358 CBY_0544 CBY_0545     TRUE 0.959 13.000 0.053 1.000 N NA
 5972358 5972359 CBY_0545 CBY_0546   topA TRUE 0.991 45.000 0.238 1.000 Y NA
 5972359 5972360 CBY_0546 CBY_0547 topA   FALSE 0.144 202.000 0.000 NA   NA
 5972363 5972364 CBY_0222 CBY_0223   mgtA FALSE 0.444 76.000 0.000 NA   NA
 5972364 5972365 CBY_0223 CBY_0224 mgtA   FALSE 0.182 187.000 0.000 1.000   NA
 5972365 5972366 CBY_0224 CBY_0225   mgtA TRUE 0.983 17.000 0.444 1.000   NA
 5972368 5972369 CBY_0227 CBY_0228     FALSE 0.069 244.000 0.000 NA   NA
 5972369 5972370 CBY_0228 CBY_0229   hisS FALSE 0.256 152.000 0.000 NA   NA
 5972370 5972371 CBY_0229 CBY_0230 hisS   FALSE 0.022 340.000 0.000 NA   NA
 5972371 5972372 CBY_0230 CBY_0231   aat FALSE 0.024 329.000 0.000 NA   NA
 5972372 5972373 CBY_0231 CBY_0232 aat   TRUE 0.804 21.000 0.000 NA   NA
 5972373 5972374 CBY_0232 CBY_0233   nifJ FALSE 0.008 714.000 0.000 NA   NA
 5972374 5972375 CBY_0233 CBY_0234 nifJ   FALSE 0.036 289.000 0.000 NA   NA
 5972375 5972376 CBY_0234 CBY_0235     FALSE 0.038 285.000 0.000 NA   NA
 5972376 5972377 CBY_0235 CBY_0236   pfkB TRUE 0.975 146.000 0.816 1.000 Y NA
 5972377 5972378 CBY_0236 CBY_0237 pfkB   TRUE 0.998 2.000 0.721 1.000 Y NA
 5972378 5972379 CBY_0237 CBY_0238     TRUE 0.531 146.000 0.016 NA N NA
 5972379 5972380 CBY_0238 CBY_0239     FALSE 0.054 264.000 0.000 NA N NA
 5972380 5972381 CBY_0239 CBY_0240     FALSE 0.319 115.000 0.000 NA N NA
 5972381 5972382 CBY_0240 CBY_0241     TRUE 0.521 185.000 0.057 NA   NA
 5972382 5972383 CBY_0241 CBY_0242     TRUE 0.737 32.000 0.000 1.000   NA
 5972383 5972384 CBY_0242 CBY_0243     FALSE 0.300 118.000 0.000 1.000   NA
 5972386 5972387 CBY_0245 CBY_0246 kduD   TRUE 0.520 62.000 0.000 1.000 N NA
 5972387 5972388 CBY_0246 CBY_0247     TRUE 0.930 141.000 0.046 1.000 Y NA
 5972388 5972389 CBY_0247 CBY_0248     TRUE 0.764 194.000 0.000 1.000 Y NA
 5972389 5972390 CBY_0248 CBY_0249     TRUE 0.997 3.000 0.286 1.000 Y NA
 5972390 5972391 CBY_0249 CBY_0250   uxaC FALSE 0.048 270.000 0.000 NA   NA
 5972393 5972394 CBY_2705 CBY_2706     FALSE 0.044 274.000 0.000 NA   NA
 5972395 5972396 CBY_4330 CBY_2708 rrs gyrA FALSE 0.010 540.000 0.000 NA   NA
 5972396 5972397 CBY_2708 CBY_2709 gyrA gyrB TRUE 0.997 22.000 0.306 0.002 Y NA
 5972397 4728407 CBY_2709 CBY_2710 gyrB   TRUE 0.798 56.000 0.017 NA   NA
 4728407 4728408 CBY_2710 CBY_2711     TRUE 0.944 15.000 0.024 NA   NA
 4728408 5972398 CBY_2711 CBY_2712   yaaA TRUE 0.719 164.000 0.209 1.000   NA
 5972398 5972399 CBY_2712 CBY_2713 yaaA dnaN TRUE 0.929 39.000 0.103 1.000   NA
 5972399 5972400 CBY_2713 CBY_2714 dnaN dnaA TRUE 0.806 263.000 0.328 1.000 Y NA
 5972401 5972402 CBY_2715 CBY_2716 rpmH rnpA TRUE 0.949 59.000 0.787 1.000   NA
 5972402 5972403 CBY_2716 CBY_2717 rnpA   TRUE 0.982 -28.000 0.540 NA   NA
 5972403 5972404 CBY_2717 CBY_2718     TRUE 0.979 24.000 0.461 NA   NA
 5972404 5972405 CBY_2718 CBY_2719     TRUE 0.921 56.000 0.254 1.000   NA
 5972405 5972406 CBY_2719 CBY_2720   trmE TRUE 0.665 163.000 0.116 1.000   NA
 5972406 5972407 CBY_2720 CBY_2721 trmE gidA TRUE 0.980 12.000 0.266 1.000   NA
 5972407 5972408 CBY_2721 CBY_2722 gidA gidB TRUE 0.981 21.000 0.466 1.000 N NA
 5972408 5972409 CBY_2722 CBY_2723 gidB spo0J TRUE 0.731 114.000 0.089 1.000 N NA
 5972409 5972410 CBY_2723 CBY_2724 spo0J   FALSE 0.435 208.000 0.069 1.000 N NA
 5972410 5972411 CBY_2724 CBY_2725     TRUE 0.988 14.000 0.827 1.000 N NA
 5972411 5972412 CBY_2725 CBY_2726     TRUE 0.897 40.000 0.047 NA   NA
 5972413 5972414 CBY_2727 CBY_2728 yyaC   TRUE 0.826 57.000 0.035 NA   NA
 5972414 5972415 CBY_2728 CBY_2729     TRUE 0.986 54.000 0.148 1.000 Y NA
 5972416 5972417 CBY_2730 CBY_2731     TRUE 0.959 24.000 0.105 NA   NA
 5972417 5972418 CBY_2731 CBY_2732     TRUE 0.972 0.000 0.121 NA   NA
 5972418 5972419 CBY_2732 CBY_2733   rpsF TRUE 0.664 102.000 0.028 NA   NA
 5972419 5972420 CBY_2733 CBY_2734 rpsF   TRUE 0.926 14.000 0.003 1.000 N NA
 5972420 5972421 CBY_2734 CBY_2735   rpsR TRUE 0.890 29.000 0.003 1.000 N NA
 5972421 5972422 CBY_2735 CBY_2736 rpsR   FALSE 0.123 274.000 0.015 NA   NA
 5972422 5972423 CBY_2736 CBY_2737     TRUE 0.945 21.000 0.043 NA   NA
 5972423 5972424 CBY_2737 CBY_2738   rplI TRUE 0.973 3.000 0.119 1.000 N NA
 5972424 5972425 CBY_2738 CBY_2739 rplI lonC TRUE 0.948 13.000 0.024 1.000 N NA
 5972425 5972426 CBY_2739 CBY_2740 lonC dnaB TRUE 0.633 134.000 0.053 1.000 N NA
 5972426 5972427 CBY_2740 CBY_2741 dnaB proC FALSE 0.008 623.000 0.000 1.000 N NA
 5972428 5972429 CBY_2742 CBY_2743     TRUE 0.973 -7.000 0.167 NA   NA
 5972429 5972430 CBY_2743 CBY_2744     FALSE 0.090 228.000 0.000 1.000 N NA
 5972432 5972433 CBY_1233 CBY_1234     FALSE 0.039 282.000 0.000 NA   NA
 5972433 5972434 CBY_1234 CBY_1235   dapA FALSE 0.014 417.000 0.000 1.000 N NA
 5972434 5972435 CBY_1235 CBY_1236 dapA   TRUE 0.753 151.000 0.222 NA   NA
 5972435 5972436 CBY_1236 CBY_1237     FALSE 0.208 176.000 0.000 NA   NA
 5972436 5972437 CBY_1237 CBY_4235   rrf FALSE 0.073 241.000 0.000 NA   NA
 5972437 5972438 CBY_4235 CBY_4236 rrf rrl FALSE 0.262 147.000 0.000 NA   NA
 5972439 5972440 CBY_1239 CBY_1240     FALSE 0.044 274.000 0.000 NA   NA
 5972441 5972442 CBY_0326 CBY_0327     TRUE 0.812 19.000 0.000 NA   NA
 5972443 5972444 CBY_0328 CBY_0329     TRUE 0.935 16.000 0.015 1.000   NA
 5972444 5972445 CBY_0329 CBY_0330     TRUE 0.712 73.000 0.012 NA   NA
 5972446 5972447 CBY_0332 CBY_0333     FALSE 0.029 307.000 0.000 NA   NA
 5972447 5972448 CBY_0333 CBY_0334     TRUE 0.907 88.000 0.667 NA   NA
 5972448 5972449 CBY_0334 CBY_0335     TRUE 0.506 63.000 0.000 NA   NA
 5972449 5972450 CBY_0335 CBY_0336     FALSE 0.178 189.000 0.000 NA   NA
 5972450 5972451 CBY_0336 CBY_0337     FALSE 0.302 118.000 0.000 NA   NA
 5972451 5972452 CBY_0337 CBY_0338     TRUE 0.792 178.000 0.667 NA   NA
 5972452 5972453 CBY_0338 CBY_0339   uvdE FALSE 0.098 222.000 0.000 NA   NA
 5972453 5972454 CBY_0339 CBY_0340 uvdE   FALSE 0.267 136.000 0.000 1.000   NA
 5972454 5972455 CBY_0340 CBY_0341     FALSE 0.193 182.000 0.000 1.000   NA
 5972455 5972456 CBY_0341 CBY_0342     FALSE 0.019 360.000 0.000 NA   NA
 5972456 5972457 CBY_0342 CBY_0343     TRUE 0.648 221.000 0.000 NA Y NA
 5972457 5972458 CBY_0343 CBY_0344     FALSE 0.110 217.000 0.000 1.000 N NA
 5972458 5972459 CBY_0344 CBY_0345     TRUE 0.530 61.000 0.000 NA N NA
 5972461 5972462 CBY_0347 CBY_0348 valS   FALSE 0.270 142.000 0.000 1.000 N NA
 5972462 5972463 CBY_0348 CBY_0349   folC FALSE 0.028 315.000 0.000 1.000 N NA
 5972463 5972464 CBY_0349 CBY_0350 folC   TRUE 0.873 51.000 0.059 NA   NA
 4728608 5972469 CBY_0180 CBY_0181     TRUE 0.837 12.000 0.000 NA   NA
 5972469 5972470 CBY_0181 CBY_0182     TRUE 0.825 -7.000 0.000 NA   NA
 5972471 5972472 CBY_3147 CBY_3148     FALSE 0.316 113.000 0.000 NA   NA
 5972472 5972473 CBY_3148 CBY_3149     TRUE 0.937 20.000 0.022 1.000 N NA
 5972473 5972474 CBY_3149 CBY_3150     FALSE 0.059 253.000 0.000 1.000   NA
 5972474 4728665 CBY_3150 CBY_3151   pheS FALSE 0.009 561.000 0.000 1.000   NA
 4728665 5972475 CBY_3151 CBY_3152 pheS pheT TRUE 0.851 254.000 0.574 0.001 Y NA
 5972475 5972476 CBY_3152 CBY_3153 pheT   FALSE 0.025 326.000 0.000 NA   NA
 5972476 5972477 CBY_3153 CBY_3154     FALSE 0.372 95.000 0.000 NA   NA
 5972479 5972480 CBY_3156 CBY_3157     TRUE 0.998 -7.000 0.933 0.009 Y NA
 5972480 5972481 CBY_3157 CBY_3158     FALSE 0.205 177.000 0.000 NA   NA
 5972481 5972482 CBY_3158 CBY_3159     FALSE 0.026 322.000 0.000 NA   NA
 5972482 5972483 CBY_3159 CBY_3160     TRUE 0.985 15.000 0.569 NA   NA
 5972485 5972486 CBY_3162 CBY_3163     FALSE 0.321 111.000 0.000 NA   NA
 4728679 5972488 CBY_3165 CBY_3166     FALSE 0.045 272.000 0.000 0.019 N NA
 5972488 5972489 CBY_3166 CBY_3167   xth TRUE 0.752 31.000 0.000 1.000 N NA
 5972489 5972490 CBY_3167 CBY_3168 xth   FALSE 0.019 362.000 0.000 1.000 N NA
 5972490 5972491 CBY_3168 CBY_3169     TRUE 0.675 133.000 0.080 NA   NA
 5972492 5972493 CBY_3170 CBY_3171     FALSE 0.162 195.000 0.000 NA   NA
 5972494 5972495 CBY_3172 CBY_3173   rnz TRUE 0.828 41.000 0.004 NA   NA
 5972495 5972496 CBY_3173 CBY_3174 rnz   FALSE 0.367 96.000 0.000 NA   NA
 5972496 5972497 CBY_3174 CBY_3175     FALSE 0.021 350.000 0.000 NA   NA
 5972497 5972498 CBY_3175 CBY_3176     TRUE 0.699 196.000 0.435 NA   NA
 5972498 5972499 CBY_3176 CBY_3177     TRUE 0.986 0.000 0.530 1.000   NA
 5972499 5972500 CBY_3177 CBY_3178     FALSE 0.057 257.000 0.000 1.000 N NA
 5972500 5972501 CBY_3178 CBY_3179     FALSE 0.373 96.000 0.000 1.000 N NA
 4728695 5972502 CBY_3181 CBY_3182     TRUE 0.547 57.000 0.000 NA   NA
 5972502 4728696 CBY_3182 CBY_3183     TRUE 0.574 53.000 0.000 NA   NA
 4728696 5972503 CBY_3183 CBY_3184     FALSE 0.298 251.000 0.111 1.000 N NA
 5972503 5972504 CBY_3184 CBY_3185     TRUE 0.984 55.000 0.111 0.039 Y NA
 5972504 5972505 CBY_3185 CBY_3186     TRUE 0.997 0.000 0.222 0.039 Y NA
 5972505 5972506 CBY_3186 CBY_3187     TRUE 0.986 74.000 0.444 0.039 Y NA
 5972506 5972507 CBY_3187 CBY_3188     TRUE 0.734 202.000 0.000 1.000 Y NA
 5972507 5972508 CBY_3188 CBY_3189   pulA TRUE 0.997 2.000 0.250 1.000 Y NA
 5972508 5972509 CBY_3189 CBY_3190 pulA   FALSE 0.277 130.000 0.000 NA   NA
 5972511 5972512 CBY_3192 CBY_3193     TRUE 0.831 122.000 0.405 1.000 N NA
 5972512 5972513 CBY_3193 CBY_3194   folE FALSE 0.251 317.000 0.429 1.000 N NA
 5972513 5972514 CBY_3194 CBY_3195 folE   FALSE 0.039 416.000 0.012 1.000   NA
 5972514 5972515 CBY_3195 CBY_3196     TRUE 0.624 140.000 0.053 1.000   NA
 5972517 5972518 CBY_3198 CBY_3199     FALSE 0.294 124.000 0.000 1.000 N NA
 5972518 5972519 CBY_3199 CBY_3200     TRUE 0.998 -7.000 0.812 0.009 Y NA
 5972520 5972521 CBY_3201 CBY_3202     FALSE 0.031 300.000 0.000 NA   NA
 5972521 5972522 CBY_3202 CBY_3203     FALSE 0.104 219.000 0.000 NA   NA
 5972522 5972523 CBY_3203 CBY_3204     TRUE 0.943 51.000 0.386 NA   NA
 5972526 5972527 CBY_3207 CBY_3208     FALSE 0.268 138.000 0.000 NA   NA
 5972527 5972528 CBY_3208 CBY_3209   scpA TRUE 0.754 30.000 0.000 NA   NA
 5972528 5972529 CBY_3209 CBY_3210 scpA scpB TRUE 0.984 -13.000 0.570 NA   NA
 5972530 5972531 CBY_3211 CBY_3212 ytfJ   TRUE 0.977 9.000 0.182 NA   NA
 5972532 5972533 CBY_3213 CBY_3214     FALSE 0.260 149.000 0.000 NA   NA
 5972533 5972534 CBY_3214 CBY_3215     FALSE 0.022 343.000 0.000 NA   NA
 5972536 5972537 CBY_3217 CBY_3218 argF   TRUE 0.864 129.000 0.000 1.000 Y NA
 5972537 5972538 CBY_3218 CBY_3219     TRUE 0.835 55.000 0.037 NA   NA
 5972538 5972539 CBY_3219 CBY_3220     FALSE 0.272 133.000 0.000 NA   NA
 5972539 5972540 CBY_3220 CBY_3222     FALSE 0.098 222.000 0.000 NA   NA
 5972541 5972542 CBY_3223 CBY_3224     TRUE 0.775 27.000 0.000 NA   NA
 5972542 5972543 CBY_3224 CBY_3225     TRUE 0.785 25.000 0.000 NA   NA
 5972543 5972544 CBY_3225 CBY_3226     TRUE 0.998 -3.000 0.933 0.009 Y NA
 5972545 5972546 CBY_3227 CBY_3228     FALSE 0.354 101.000 0.000 NA   NA
 5972546 5972547 CBY_3228 CBY_3229     FALSE 0.058 254.000 0.000 NA   NA
 5972547 5972548 CBY_3229 CBY_3230     TRUE 0.814 132.000 0.400 NA   NA
 5972548 5972549 CBY_3230 CBY_3231     FALSE 0.010 502.000 0.000 NA   NA
 5972549 5972550 CBY_3231 CBY_3232     FALSE 0.401 87.000 0.000 NA   NA
 5972550 5972551 CBY_3232 CBY_3233     FALSE 0.069 244.000 0.000 NA   NA
 5972551 5972552 CBY_3233 CBY_3234   gidA TRUE 0.982 -3.000 0.381 0.036   NA
 5972554 5972555 CBY_3236 CBY_3237     FALSE 0.019 362.000 0.000 NA   NA
 5972557 5972558 CBY_2445 CBY_2446     FALSE 0.044 274.000 0.000 NA   NA
 5972559 5972560 CBY_4317 CBY_4318 rrf   TRUE 0.842 7.000 0.000 NA   NA
 5972560 5972561 CBY_4318 CBY_4319     FALSE 0.014 409.000 0.000 NA   NA
 5972562 5972563 CBY_2450 CBY_2451     FALSE 0.018 371.000 0.000 1.000   NA
 5972564 5972565 CBY_2452 CBY_4320   rrs FALSE 0.009 577.000 0.000 NA   NA
 5972565 5972566 CBY_4320 CBY_4321 rrs rrl FALSE 0.069 244.000 0.000 NA   NA
 5972567 5972568 CBY_2454 CBY_2455     FALSE 0.044 274.000 0.000 NA   NA
 5972569 5972570 CBY_3378 CBY_3379   cdd TRUE 0.514 62.000 0.000 NA   NA
 5972570 5972571 CBY_3379 CBY_3380 cdd deoB TRUE 0.609 123.000 0.031 1.000 N NA
 5972571 5972572 CBY_3380 CBY_3381 deoB   TRUE 0.970 40.000 0.000 1.000 Y NA
 5972572 5972573 CBY_3381 CBY_3382     TRUE 0.993 -7.000 0.018 0.003 Y NA
 5972573 5972574 CBY_3382 CBY_3383   deoD FALSE 0.355 102.000 0.000 1.000 N NA
 5972574 5972575 CBY_3383 CBY_3384 deoD   TRUE 0.494 66.000 0.000 1.000 N NA
 5972577 5972578 CBY_3386 CBY_3387   deoB TRUE 0.568 189.000 0.093 1.000 N NA
 5972578 5972579 CBY_3387 CBY_3388 deoB   FALSE 0.237 163.000 0.000 1.000 N NA
 5972579 5972580 CBY_3388 CBY_3389     FALSE 0.037 287.000 0.000 NA   NA
 5972580 5972581 CBY_3389 CBY_3391     FALSE 0.309 116.000 0.000 NA   NA
 5972581 5972582 CBY_3391 CBY_3392     FALSE 0.026 322.000 0.000 1.000 N NA
 5972582 5972583 CBY_3392 CBY_3393     FALSE 0.012 463.000 0.000 1.000 N NA
 5972583 5972584 CBY_3393 CBY_3394   cobB TRUE 0.973 63.000 0.039 1.000 Y NA
 5972584 5972585 CBY_3394 CBY_3395 cobB   TRUE 0.992 34.000 0.097 0.013 Y NA
 5972585 5972586 CBY_3395 CBY_3396     FALSE 0.331 108.000 0.000 NA   NA
 5972586 5972587 CBY_3396 CBY_3397   cbiD FALSE 0.059 253.000 0.000 NA   NA
 5972587 5972588 CBY_3397 CBY_3398 cbiD cbiE TRUE 0.996 3.000 0.126 0.013 Y NA
 5972588 5972589 CBY_3398 CBY_3399 cbiE   TRUE 0.911 90.000 0.000 0.001 Y NA
 5972589 5972590 CBY_3399 CBY_3400   cobI TRUE 0.981 41.000 0.010 0.013 Y NA
 5972590 5972591 CBY_3400 CBY_3401 cobI cobM TRUE 0.957 161.000 0.291 0.013 Y NA
 5972591 5972592 CBY_3401 CBY_3402 cobM   TRUE 0.998 0.000 0.397 0.013 Y NA
 5972592 5972593 CBY_3402 CBY_3403   cobJ TRUE 0.995 32.000 0.352 0.013 Y NA
 5972593 5972594 CBY_3403 CBY_3404 cobJ cobK TRUE 0.993 42.000 0.423 0.013 Y NA
 5972594 5972595 CBY_3404 CBY_3405 cobK cobD TRUE 0.844 154.000 0.000 0.013 Y NA
 5972595 5972596 CBY_3405 CBY_3406 cobD   TRUE 0.707 79.000 0.017 0.013 N NA
 5972596 5972597 CBY_3406 CBY_3407   cobQ FALSE 0.396 87.000 0.000 0.013 N NA
 5972597 5972598 CBY_3407 CBY_3408 cobQ   TRUE 0.761 55.000 0.003 NA   NA
 5972598 5972599 CBY_3408 CBY_3409     TRUE 0.829 15.000 0.000 NA   NA
 5972602 5972603 CBY_3413 CBY_3414     FALSE 0.211 175.000 0.000 NA   NA
 5972603 5972604 CBY_3414 CBY_3415     FALSE 0.009 567.000 0.000 1.000   NA
 5972605 5972606 CBY_3416 CBY_3417 ade   FALSE 0.052 266.000 0.000 NA N NA
 5972608 5972609 CBY_3419 CBY_3420     TRUE 0.766 57.000 0.007 NA   NA
 5972610 5972611 CBY_3421 CBY_3422     TRUE 0.988 2.000 0.750 0.004 N NA
 5972611 5972612 CBY_3422 CBY_3423     TRUE 0.829 -7.000 0.000 1.000 N NA
 5972612 5972613 CBY_3423 CBY_3424     TRUE 0.955 12.000 0.041 1.000 N NA
 5972613 5972614 CBY_3424 CBY_3425     TRUE 0.845 5.000 0.000 1.000 N NA
 5972614 5972615 CBY_3425 CBY_3426     TRUE 0.981 75.000 0.223 0.039 Y NA
 5972615 5972616 CBY_3426 CBY_3427     TRUE 0.998 15.000 0.536 1.000 Y NA
 5972616 5972617 CBY_3427 CBY_3428     TRUE 0.968 42.000 0.000 1.000 Y NA
 5972617 5972618 CBY_3428 CBY_3429     TRUE 0.989 63.000 0.429 0.039 Y NA
 5972618 5972619 CBY_3429 CBY_3430     TRUE 0.998 19.000 0.600 1.000 Y NA
 5972619 5972620 CBY_3430 CBY_3431     FALSE 0.369 95.000 0.000 1.000   NA
 5972620 5972621 CBY_3431 CBY_3432     FALSE 0.040 280.000 0.000 NA   NA
 5972621 5972622 CBY_3432 CBY_3433     TRUE 0.842 6.000 0.000 NA   NA
 5972622 5972623 CBY_3433 CBY_3434     TRUE 0.802 21.000 0.000 1.000   NA
 5972623 5972624 CBY_3434 CBY_3435     FALSE 0.022 339.000 0.000 NA   NA
 5972624 5972625 CBY_3435 CBY_3436     TRUE 0.832 14.000 0.000 NA   NA
 5972625 5972626 CBY_3436 CBY_3437     FALSE 0.179 190.000 0.000 1.000 N NA
 5972626 5972627 CBY_3437 CBY_3438   hemA FALSE 0.032 299.000 0.000 1.000 N NA
 5972627 5972628 CBY_3438 CBY_3439 hemA   TRUE 0.992 -39.000 0.018 NA Y NA
 5972628 5972629 CBY_3439 CBY_3440   hemC TRUE 0.990 24.000 0.009 NA Y NA
 5972629 5972630 CBY_3440 CBY_3441 hemC   TRUE 0.985 40.000 0.031 1.000 Y NA
 5972630 5972631 CBY_3441 CBY_3442   hemB TRUE 0.970 69.000 0.044 1.000 Y NA
 5972631 5972632 CBY_3442 CBY_3443 hemB hemL TRUE 0.770 223.000 0.026 0.001 Y NA
 5972632 5972633 CBY_3443 CBY_3444 hemL   FALSE 0.021 347.000 0.000 1.000   NA
 5972633 5972634 CBY_3444 CBY_3445     FALSE 0.009 547.000 0.000 1.000   NA
 5972634 5972635 CBY_3445 CBY_3446     FALSE 0.235 162.000 0.000 NA   NA
 5972637 5972638 CBY_3448 CBY_3449     TRUE 0.803 -39.000 0.000 NA   NA
 5972638 5972639 CBY_3449 CBY_3450   thrC FALSE 0.318 112.000 0.000 NA   NA
 5972639 5972640 CBY_3450 CBY_3451 thrC thrB TRUE 0.829 15.000 0.000 NA   NA
 5972641 5972642 CBY_4160 CBY_4161     FALSE 0.156 197.000 0.000 NA   NA
 5972642 5972643 CBY_4161 CBY_4162     FALSE 0.094 222.000 0.000 0.073   NA
 5972644 5972645 CBY_4163 CBY_4164     FALSE 0.008 632.000 0.000 NA   NA
 5972645 5972646 CBY_4164 CBY_4165     TRUE 0.842 7.000 0.000 NA   NA
 5972646 5972647 CBY_4165 CBY_4166     TRUE 0.986 24.000 1.000 NA   NA
 5972649 5972650 CBY_4168 CBY_4169     TRUE 0.832 -3.000 0.000 NA   NA
 5972652 5972653 CBY_4171 CBY_4172 galE   FALSE 0.030 304.000 0.000 1.000   NA
 5972653 5972654 CBY_4172 CBY_4173     TRUE 0.842 4.000 0.000 NA   NA
 5972654 5972655 CBY_4173 CBY_4174     FALSE 0.008 610.000 0.000 NA   NA
 5972655 5972656 CBY_4174 CBY_4175     FALSE 0.289 124.000 0.000 NA   NA
 5972656 5972657 CBY_4175 CBY_4176     TRUE 0.739 32.000 0.000 NA   NA
 5972657 5972658 CBY_4176 CBY_4177     TRUE 0.639 43.000 0.000 NA   NA
 5972658 5972659 CBY_4177 CBY_4178     TRUE 0.989 3.000 0.000 NA Y NA
 5972659 5972660 CBY_4178 CBY_4179     TRUE 0.993 40.000 0.286 NA Y NA
 5972660 5972661 CBY_4179 CBY_4180     TRUE 0.995 -6.000 0.067 NA Y NA
 5972661 5972662 CBY_4180 CBY_4181     TRUE 0.564 241.000 0.000 NA Y NA
 5972662 5972663 CBY_4181 CBY_4182     TRUE 0.726 82.000 0.027 1.000 N NA
 5972663 5972664 CBY_4182 CBY_4183     TRUE 0.982 21.000 0.500 1.000 N NA
 5972664 4728863 CBY_4183 CBY_4184   galU TRUE 0.497 255.000 0.000 1.000 Y NA
 5972665 5972666 CBY_4185 CBY_4186     TRUE 0.747 136.000 0.188 NA   NA
 5972667 5972668 CBY_4187 CBY_4188     TRUE 0.817 18.000 0.000 NA   NA
 5972668 5972669 CBY_4188 CBY_4189     FALSE 0.385 91.000 0.000 NA   NA
 4728866 5972670 CBY_4190 CBY_4191     TRUE 0.613 48.000 0.000 NA   NA
 5972670 5972671 CBY_4191 CBY_4192     FALSE 0.181 188.000 0.000 NA   NA
 5972671 5972672 CBY_4192 CBY_4193     TRUE 0.819 -10.000 0.000 NA   NA
 5972673 5972674 CBY_4194 CBY_4195     TRUE 0.519 61.000 0.000 0.037 N NA
 5972674 5972675 CBY_4195 CBY_4196     TRUE 0.844 2.000 0.000 1.000 N NA
 5972675 5972676 CBY_4196 CBY_4197     TRUE 0.804 -25.000 0.000 1.000   NA
 5972676 5972677 CBY_4197 CBY_4198     TRUE 0.835 13.000 0.000 NA   NA
 5972677 5972678 CBY_4198 CBY_4199     TRUE 0.775 27.000 0.000 NA   NA
 5972678 5972679 CBY_4199 CBY_4200     FALSE 0.471 265.000 0.000 NA Y NA
 5972679 5972680 CBY_4200 CBY_4201     TRUE 0.982 28.000 0.000 NA Y NA
 5972680 5972681 CBY_4201 CBY_4202     TRUE 0.824 -7.000 0.000 1.000   NA
 5972681 5972682 CBY_4202 CBY_4203     TRUE 0.739 32.000 0.000 NA   NA
 5972682 5972683 CBY_4203 CBY_4204   rfbB TRUE 0.986 -25.000 0.000 NA Y NA
 5972683 5972684 CBY_4204 CBY_4205 rfbB rfbC TRUE 0.994 27.000 0.106 1.000 Y NA
 5972684 5972685 CBY_4205 CBY_4206 rfbC rfbA TRUE 0.993 32.000 0.115 1.000 Y NA
 5972686 5972687 CBY_4207 CBY_4208     TRUE 0.928 132.000 0.034 NA Y NA
 5972687 5972688 CBY_4208 CBY_4209     FALSE 0.032 298.000 0.000 NA   NA
 5972689 5972690 CBY_4210 CBY_4211     FALSE 0.050 266.000 0.000 NA   NA
 11531823 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2277.000 0.000 NA   NA
 11674186 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2277.000 0.000 NA   NA
 11816578 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2277.000 0.000 NA   NA
 11531824 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2294.000 0.000 NA   NA
 11674187 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2294.000 0.000 NA   NA
 11816579 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2294.000 0.000 NA   NA
 11531825 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2340.000 0.000 NA   NA
 11674188 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2340.000 0.000 NA   NA
 11816580 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2340.000 0.000 NA   NA
 11531826 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2357.000 0.000 NA   NA
 11674189 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2357.000 0.000 NA   NA
 11816581 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2357.000 0.000 NA   NA
 11531827 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2400.000 0.000 NA   NA
 11674190 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2400.000 0.000 NA   NA
 11816582 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2400.000 0.000 NA   NA
 11531828 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2417.000 0.000 NA   NA
 11674191 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2417.000 0.000 NA   NA
 11816583 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2417.000 0.000 NA   NA
 11531829 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2460.000 0.000 NA   NA
 11674192 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2460.000 0.000 NA   NA
 11816584 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2460.000 0.000 NA   NA
 5972691 5972692 CBY_4267 CBY_4268 rrs rrf FALSE 0.007 890.000 0.000 NA   NA
 5972692 5972693 CBY_4268 CBY_4269 rrf rrl FALSE 0.341 105.000 0.000 NA   NA
 5972694 5972695 CBY_2062 CBY_2063     FALSE 0.044 274.000 0.000 NA   NA
 5972696 5972697 CBY_4270 CBY_4271   rrs FALSE 0.266 140.000 0.000 NA   NA
 5972697 5972698 CBY_4271 CBY_2066 rrs   FALSE 0.008 615.000 0.000 NA   NA
 5972698 5972699 CBY_2066 CBY_2068     TRUE 0.841 2.000 0.000 NA   NA
 5972699 5972700 CBY_2068 CBY_2069     FALSE 0.056 257.000 0.000 NA   NA
 5972700 5972701 CBY_2069 CBY_2070     TRUE 0.832 -3.000 0.000 NA   NA
 5972701 5972702 CBY_2070 CBY_2071     TRUE 0.793 23.000 0.000 NA   NA
 5972702 5972703 CBY_2071 CBY_2072     FALSE 0.207 178.000 0.000 1.000 N NA
 5972703 5972704 CBY_2072 CBY_2073     TRUE 0.815 173.000 0.000 0.012 Y NA
 5972704 5972705 CBY_2073 CBY_2074     TRUE 0.938 67.000 0.000 0.012 Y NA
 5972705 5972706 CBY_2074 CBY_2075     FALSE 0.060 254.000 0.000 NA N NA
 5972706 5972707 CBY_2075 CBY_2076     FALSE 0.172 191.000 0.000 NA   NA
 5972707 5972708 CBY_2076 CBY_2077     FALSE 0.128 208.000 0.000 NA   NA
 5972708 5972709 CBY_2077 CBY_2078     FALSE 0.049 268.000 0.000 NA   NA
 5972709 5972710 CBY_2078 CBY_2079   phnA FALSE 0.466 71.000 0.000 NA   NA
 5972710 5972711 CBY_2079 CBY_2080 phnA   TRUE 0.672 216.000 0.000 1.000 Y NA
 5972711 5972712 CBY_2080 CBY_2081     TRUE 0.994 -7.000 0.041 NA Y NA
 5972714 5972715 CBY_2083 CBY_2084     FALSE 0.011 481.000 0.000 NA   NA
 5972715 5972716 CBY_2084 CBY_2085     FALSE 0.277 208.000 0.005 NA   NA
 5972716 5972717 CBY_2085 CBY_2086     TRUE 0.764 58.000 0.008 NA   NA
 5972717 5972718 CBY_2086 CBY_2087   murA TRUE 0.942 27.000 0.058 1.000   NA
 5972719 5972720 CBY_2088 CBY_2089     FALSE 0.335 220.000 0.049 NA   NA
 5972720 5972721 CBY_2089 CBY_2090     TRUE 0.749 152.000 0.220 NA   NA
 5972721 5972722 CBY_2090 CBY_2091     TRUE 0.966 17.000 0.097 NA   NA
 5972722 5972723 CBY_2091 CBY_2092     TRUE 0.839 78.000 0.125 NA   NA
 5972723 5972724 CBY_2092 CBY_2093     FALSE 0.131 207.000 0.000 NA   NA
 5972724 5972725 CBY_2093 CBY_2094     TRUE 0.998 -7.000 0.600 NA Y NA
 5972726 5972727 CBY_4272 CBY_4273     TRUE 0.842 5.000 0.000 NA   NA
 5972727 5972728 CBY_4273 CBY_4274     TRUE 0.590 51.000 0.000 NA   NA
 5972728 5972729 CBY_4274 CBY_4275     TRUE 0.780 26.000 0.000 NA   NA
 5972729 5972730 CBY_4275 CBY_4276     TRUE 0.841 8.000 0.000 NA   NA
 5972730 5972731 CBY_4276 CBY_4277     TRUE 0.842 5.000 0.000 NA   NA
 5972731 5972732 CBY_4277 CBY_4278     TRUE 0.599 50.000 0.000 NA   NA
 5972732 5972733 CBY_4278 CBY_4279     TRUE 0.780 26.000 0.000 NA   NA
 5972733 5972734 CBY_4279 CBY_4280     TRUE 0.841 8.000 0.000 NA   NA
 5972734 5972735 CBY_4280 CBY_4281     TRUE 0.842 5.000 0.000 NA   NA
 5972736 5972737 CBY_0951 CBY_0952   glpK FALSE 0.449 75.000 0.000 NA   NA
 5972737 5972738 CBY_0952 CBY_0953 glpK   FALSE 0.384 183.000 0.006 1.000   NA
 5972738 5972739 CBY_0953 CBY_0954     TRUE 0.507 238.000 0.476 0.036   NA
 5972739 5972740 CBY_0954 CBY_0955     TRUE 0.871 98.000 0.417 NA   NA
 5972740 5972741 CBY_0955 CBY_0956     FALSE 0.010 505.000 0.000 NA   NA
 5972741 5972742 CBY_0956 CBY_0957     FALSE 0.046 272.000 0.000 NA   NA
 5972744 5972745 CBY_0959 CBY_0960     FALSE 0.019 357.000 0.000 NA   NA
 5972745 5972746 CBY_0960 CBY_0961   udk FALSE 0.029 305.000 0.000 NA   NA
 5972746 5972747 CBY_0961 CBY_0962 udk   FALSE 0.030 303.000 0.000 NA   NA
 5972747 5972748 CBY_0962 CBY_0963     FALSE 0.214 173.000 0.000 NA   NA
 5972748 5972749 CBY_0963 CBY_0964     FALSE 0.461 72.000 0.000 NA   NA
 5972750 5972751 CBY_0965 CBY_0966 ilvA   FALSE 0.092 225.000 0.000 NA   NA
 5972754 5972755 CBY_0969 CBY_0970     TRUE 0.695 37.000 0.000 NA   NA
 5972757 5972758 CBY_0972 CBY_0973     FALSE 0.316 112.000 0.000 1.000   NA
 5972758 5972759 CBY_0973 CBY_0974     FALSE 0.196 181.000 0.000 NA   NA
 5972759 5972760 CBY_0974 CBY_0975     FALSE 0.025 324.000 0.000 NA   NA
 5972760 5972761 CBY_0975 CBY_0976     TRUE 0.754 30.000 0.000 NA   NA
 5972761 5972762 CBY_0976 CBY_0977   rluB FALSE 0.081 234.000 0.000 NA   NA
 5972762 5972763 CBY_0977 CBY_0978 rluB   TRUE 0.767 28.000 0.000 1.000   NA
 5972764 5972765 CBY_0979 CBY_0980     FALSE 0.344 104.000 0.000 NA   NA
 5972765 5972766 CBY_0980 CBY_0981     FALSE 0.264 144.000 0.000 NA   NA
 5972767 5972768 CBY_0982 CBY_0983     FALSE 0.316 113.000 0.000 NA   NA
 5972768 5972769 CBY_0983 CBY_0984     FALSE 0.354 101.000 0.000 NA   NA
 5972770 5972771 CBY_0985 CBY_0986     TRUE 0.968 28.000 0.231 NA   NA
 5972772 5972773 CBY_0987 CBY_0988 glyA   FALSE 0.247 159.000 0.000 NA N NA
 5972773 5972774 CBY_0988 CBY_0989     FALSE 0.008 603.000 0.000 NA   NA
 5972776 5972777 CBY_0991 CBY_0992     FALSE 0.225 168.000 0.000 NA   NA
 5972779 5972780 CBY_0994 CBY_0995     FALSE 0.185 185.000 0.000 1.000   NA
 5972780 5972781 CBY_0995 CBY_0996     FALSE 0.268 138.000 0.000 NA   NA
 5972781 5972782 CBY_0996 CBY_0997     TRUE 0.814 -13.000 0.000 NA   NA
 5972782 5972783 CBY_0997 CBY_0998     TRUE 0.809 -19.000 0.000 NA   NA
 5972783 5972784 CBY_0998 CBY_1000     FALSE 0.027 318.000 0.000 NA   NA
 5972786 5972787 CBY_1001 CBY_1002     FALSE 0.205 177.000 0.000 NA   NA
 5972787 5972788 CBY_1002 CBY_1003     FALSE 0.261 148.000 0.000 NA   NA
 5972788 5972789 CBY_1003 CBY_1004     FALSE 0.035 290.000 0.000 1.000   NA
 5972789 5972790 CBY_1004 CBY_1005     FALSE 0.277 133.000 0.000 1.000 N NA
 5972790 5972791 CBY_1005 CBY_1006     FALSE 0.273 136.000 0.000 1.000 N NA
 5972796 5972797 CBY_0780 CBY_0781 hisI   TRUE 0.713 34.000 0.000 NA   NA
 5972797 4729038 CBY_0781 CBY_0782   hisF TRUE 0.762 29.000 0.000 NA   NA
 4729038 5972798 CBY_0782 CBY_0783 hisF hisA TRUE 0.992 50.000 0.433 0.005 Y NA
 5972798 5972799 CBY_0783 CBY_0784 hisA hisH TRUE 0.996 -3.000 0.124 0.005 Y NA
 5972799 5972800 CBY_0784 CBY_0785 hisH hisB TRUE 0.994 28.000 0.125 0.005 Y NA
 5972800 5972801 CBY_0785 CBY_0786 hisB   TRUE 0.997 23.000 0.341 1.000 Y NA
 5972801 5972802 CBY_0786 CBY_0787   hisD TRUE 0.996 -13.000 0.165 1.000 Y NA
 5972802 5972803 CBY_0787 CBY_0788 hisD hisG TRUE 0.943 181.000 0.254 0.005 Y NA
 5972803 5972804 CBY_0788 CBY_0789 hisG hisZ TRUE 0.991 45.000 0.239 0.005 Y NA
 5972806 5972807 CBY_0791 CBY_0792 thiI   TRUE 0.983 0.000 0.349 1.000 N NA
 5972807 5972808 CBY_0792 CBY_0793     FALSE 0.075 240.000 0.000 1.000 N NA
 5972808 5972809 CBY_0793 CBY_0794     TRUE 0.829 16.000 0.000 1.000 N NA
 5972809 5972810 CBY_0794 CBY_0795     FALSE 0.048 269.000 0.000 1.000   NA
 5972810 5972811 CBY_0795 CBY_0796     FALSE 0.396 88.000 0.000 NA   NA
 5972812 4729090 CBY_2746 CBY_2747     TRUE 0.829 15.000 0.000 NA   NA
 4729090 5972813 CBY_2747 CBY_2748     FALSE 0.256 152.000 0.000 NA   NA
 5972813 5972814 CBY_2748 CBY_2749   argS FALSE 0.156 197.000 0.000 NA   NA
 5972814 4729094 CBY_2749 CBY_2750 argS   FALSE 0.009 573.000 0.000 1.000   NA
 4729094 5972815 CBY_2750 CBY_2751     FALSE 0.281 128.000 0.000 NA   NA
 5972815 5972816 CBY_2751 CBY_2752     TRUE 0.984 21.000 0.667 NA   NA
 5972818 5972819 CBY_2754 CBY_2755     FALSE 0.026 320.000 0.000 NA   NA
 5972819 4729101 CBY_2755 CBY_2756   asnA FALSE 0.331 108.000 0.000 NA   NA
 4729101 5972820 CBY_2756 CBY_2757 asnA   FALSE 0.026 319.000 0.000 0.046 N NA
 5972821 5972822 CBY_2758 CBY_2759     TRUE 0.672 134.000 0.077 1.000 N NA
 5972823 5972824 CBY_2760 CBY_2761 pflA pflB FALSE 0.334 214.000 0.032 1.000 N NA
 5972824 5972825 CBY_2761 CBY_2762 pflB pyrE FALSE 0.008 672.000 0.000 1.000 N NA
 5972825 5972826 CBY_2762 CBY_2763 pyrE   TRUE 0.989 34.000 0.041 1.000 Y NA
 5972826 5972827 CBY_2763 CBY_2764     TRUE 0.983 21.000 0.592 1.000 N NA
 5972827 5972828 CBY_2764 CBY_2765   pyrF TRUE 0.564 193.000 0.112 0.004 N NA
 5972828 5972829 CBY_2765 CBY_2766 pyrF   TRUE 0.987 42.000 0.064 1.000 Y NA
 5972829 5972830 CBY_2766 CBY_2767     TRUE 0.923 146.000 0.032 NA Y NA
 5972830 5972831 CBY_2767 CBY_2768   pyrB TRUE 0.997 1.000 0.197 NA Y NA
 5972831 5972832 CBY_2768 CBY_2769 pyrB   FALSE 0.018 375.000 0.000 1.000 N NA
 5972832 5972833 CBY_2769 CBY_2770     TRUE 0.700 96.000 0.036 1.000 N NA
 5972833 4729117 CBY_2770 CBY_2771     FALSE 0.014 413.000 0.000 1.000 N NA
 4729117 4729118 CBY_2771 CBY_2772     TRUE 0.869 91.000 0.333 NA   NA
 4729118 5972834 CBY_2772 CBY_2773     TRUE 0.597 132.000 0.035 NA   NA
 5972834 5972835 CBY_2773 CBY_2774   ychF FALSE 0.068 244.000 0.000 1.000   NA
 5972839 5972840 CBY_2778 CBY_2779     TRUE 0.931 34.000 0.071 NA N NA
 5972840 5972841 CBY_2779 CBY_2780     TRUE 0.994 -10.000 0.056 NA Y NA
 5972841 5972842 CBY_2780 CBY_2781     TRUE 0.962 5.000 0.056 NA   NA
 5972842 5972843 CBY_2781 CBY_2782   mviN TRUE 0.908 64.000 0.286 NA   NA
 5972843 5972844 CBY_2782 CBY_2783 mviN   TRUE 0.939 13.000 0.015 1.000   NA
 5972844 5972845 CBY_2783 CBY_2784     TRUE 0.651 92.000 0.015 1.000   NA
 5972845 5972846 CBY_2784 CBY_2785     FALSE 0.467 244.000 0.417 1.000   NA
 5972846 4729134 CBY_2785 CBY_2786     FALSE 0.032 424.000 0.002 1.000 N NA
 4729134 4729135 CBY_2786 CBY_2787     TRUE 0.881 166.000 0.002 0.001 Y NA
 4729135 5972847 CBY_2787 CBY_2788     FALSE 0.032 301.000 0.000 NA N NA
 5972847 5972848 CBY_2788 CBY_2789     TRUE 0.985 -13.000 0.669 NA N NA
 5972848 5972849 CBY_2789 CBY_2790     FALSE 0.051 265.000 0.000 NA   NA
 5972849 5972850 CBY_2790 CBY_2791     FALSE 0.270 135.000 0.000 NA   NA
 5972850 5972851 CBY_2791 CBY_2792     FALSE 0.182 187.000 0.000 1.000   NA
 5972851 5972852 CBY_2792 CBY_2793     FALSE 0.034 292.000 0.000 NA   NA
 5972852 5972853 CBY_2793 CBY_2794     TRUE 0.594 129.000 0.031 NA   NA
 5972853 5972854 CBY_2794 CBY_2795     TRUE 0.863 60.000 0.078 1.000 N NA
 5972854 5972855 CBY_2795 CBY_2796     FALSE 0.268 137.000 0.000 NA   NA
 5972856 5972857 CBY_2797 CBY_2798     TRUE 0.986 19.000 0.796 1.000   NA
 5972859 5972860 CBY_2800 CBY_2801     FALSE 0.376 203.000 0.029 1.000   NA
 5972860 5972861 CBY_2801 CBY_2802     TRUE 0.725 33.000 0.000 1.000   NA
 5972862 5972863 CBY_2803 CBY_2804     FALSE 0.015 394.000 0.000 NA   NA
 5972863 5972864 CBY_2804 CBY_2805     TRUE 0.998 -16.000 0.876 1.000 Y NA
 5972864 5972865 CBY_2805 CBY_2806     TRUE 0.958 44.000 0.528 NA   NA
 5972866 5972867 CBY_2807 CBY_2808     FALSE 0.430 79.000 0.000 NA   NA
 5972868 5972869 CBY_2809 CBY_2810     TRUE 0.599 50.000 0.000 NA   NA
 5972869 5972870 CBY_2810 CBY_2811     TRUE 0.841 2.000 0.000 NA   NA
 5972870 5972871 CBY_2811 CBY_2812     TRUE 0.916 52.000 0.182 NA   NA
 5972871 5972872 CBY_2812 CBY_2813     FALSE 0.012 477.000 0.000 1.000 N NA
 5972872 5972873 CBY_2813 CBY_2814     FALSE 0.079 236.000 0.000 NA   NA
 5972873 5972874 CBY_2814 CBY_2815     TRUE 0.837 0.000 0.000 NA   NA
 5972874 5972875 CBY_2815 CBY_2816     TRUE 0.841 2.000 0.000 NA   NA
 5972875 5972876 CBY_2816 CBY_2817     TRUE 0.837 12.000 0.000 NA   NA
 5972876 5972877 CBY_2817 CBY_2818     TRUE 0.825 -7.000 0.000 NA   NA
 5972877 5972878 CBY_2818 CBY_2819     TRUE 0.988 0.000 0.833 NA   NA
 5972878 5972879 CBY_2819 CBY_2820     TRUE 0.976 0.000 0.188 NA   NA
 5972879 5972880 CBY_2820 CBY_2821     TRUE 0.977 2.000 0.188 NA   NA
 5972881 4729147 CBY_0694 CBY_0696   apt FALSE 0.187 185.000 0.000 NA   NA
 4729147 5972882 CBY_0696 CBY_0697 apt   FALSE 0.284 127.000 0.000 NA   NA
 4729264 5972885 CBY_3111 CBY_3112     FALSE 0.012 450.000 0.000 1.000   NA
 5972885 5972886 CBY_3112 CBY_3113     FALSE 0.061 251.000 0.000 NA   NA
 5972886 4729269 CBY_3113 CBY_3114     FALSE 0.041 278.000 0.000 NA   NA
 4729269 5972887 CBY_3114 CBY_3115     FALSE 0.258 151.000 0.000 NA   NA
 5972887 5972888 CBY_3115 CBY_3116     TRUE 0.754 30.000 0.000 NA   NA
 5972888 5972889 CBY_3116 CBY_3117     FALSE 0.266 141.000 0.000 NA   NA
 5972891 5972892 CBY_3119 CBY_3120     TRUE 0.997 -13.000 0.325 0.009 Y NA
 5972892 5972893 CBY_3120 CBY_3121     FALSE 0.319 111.000 0.000 1.000   NA
 5972893 5972894 CBY_3121 CBY_3122   add FALSE 0.019 359.000 0.000 1.000   NA
 5972896 4729281 CBY_3124 CBY_3125     FALSE 0.022 342.000 0.000 NA   NA
 4729281 5972897 CBY_3125 CBY_3126     FALSE 0.312 115.000 0.000 NA   NA
 5972897 5972898 CBY_3126 CBY_3127     FALSE 0.251 154.000 0.000 NA   NA
 5972898 5972899 CBY_3127 CBY_3128     FALSE 0.249 157.000 0.000 1.000 N NA
 5972899 5972900 CBY_3128 CBY_3129     FALSE 0.030 730.000 0.039 1.000 N NA
 5972900 4729287 CBY_3129 CBY_3130     FALSE 0.071 242.000 0.000 1.000   NA
 5972901 5972902 CBY_3132 CBY_3133     TRUE 0.694 173.000 0.197 1.000 N NA
 5972903 5972904 CBY_3134 CBY_3135     FALSE 0.030 306.000 0.000 1.000 N NA
 5972904 5972905 CBY_3135 CBY_3136     FALSE 0.265 142.000 0.000 NA   NA
 5972906 5972907 CBY_3137 CBY_3138     FALSE 0.132 204.000 0.000 0.059   NA
 5972908 5972909 CBY_3139 CBY_3140     FALSE 0.261 148.000 0.000 NA   NA
 5972910 5972911 CBY_3141 CBY_3142     FALSE 0.393 89.000 0.000 NA   NA
 5972913 5972914 CBY_3144 CBY_3145 treR treC TRUE 0.756 169.000 0.336 1.000 N NA
 5972914 5972915 CBY_3145 CBY_3146 treC treP FALSE 0.268 138.000 0.000 NA   NA
 4729311 5972916 CBY_0646 CBY_0647     FALSE 0.274 132.000 0.000 NA   NA
 5972917 5972918 CBY_0317 CBY_0318   eno FALSE 0.134 206.000 0.000 NA   NA
 4729347 5972919 CBY_0319 CBY_0320     FALSE 0.425 80.000 0.000 NA   NA
 5972919 5972920 CBY_0320 CBY_0322   modA TRUE 0.739 32.000 0.000 NA   NA
 5972921 5972922 CBY_0323 CBY_0324     TRUE 0.970 5.000 0.094 NA   NA
 5972922 5972923 CBY_0324 CBY_0325     TRUE 0.954 -3.000 0.043 NA   NA
 5972924 5972925 CBY_0178 CBY_0179     FALSE 0.030 303.000 0.000 NA   NA
 5972926 5972927 CBY_0196 CBY_0197     FALSE 0.111 216.000 0.000 NA   NA
 5972927 5972928 CBY_0197 CBY_0198     FALSE 0.131 207.000 0.000 NA   NA
 5972928 5972929 CBY_0198 CBY_0199   recG FALSE 0.059 253.000 0.000 NA   NA
 5972929 5972930 CBY_0199 CBY_0200 recG   TRUE 0.968 63.000 0.016 1.000 Y NA
 5972930 5972931 CBY_0200 CBY_0201   coaD TRUE 0.983 2.000 0.367 1.000 N NA
 5972931 5972932 CBY_0201 CBY_0202 coaD   TRUE 0.934 12.000 0.008 NA   NA
 5972933 5972934 CBY_0203 CBY_0204 ylbJ   TRUE 0.643 115.000 0.036 NA   NA
 5972935 5972936 CBY_0205 CBY_0206 pta ackA TRUE 0.991 39.000 0.137 1.000 Y NA
 5972936 5972937 CBY_0206 CBY_0207 ackA   TRUE 0.637 144.000 0.061 NA   NA
 5972937 5972938 CBY_0207 CBY_0208   rpmF TRUE 0.987 4.000 0.599 NA   NA
 5972938 5972939 CBY_0208 CBY_0209 rpmF plsX FALSE 0.196 356.000 0.418 1.000 N NA
 5972939 5972940 CBY_0209 CBY_0210 plsX acpP TRUE 0.970 66.000 0.034 0.004 Y NA
 5972940 5972941 CBY_0210 CBY_0211 acpP rnc TRUE 0.742 100.000 0.068 1.000 N NA
 5972941 5972942 CBY_0211 CBY_0212 rnc   TRUE 0.995 -7.000 0.064 1.000 Y NA
 5972942 5972943 CBY_0212 CBY_0213   smc FALSE 0.411 196.000 0.027 1.000 N NA
 5972943 5972944 CBY_0213 CBY_0214 smc ftsY FALSE 0.476 217.000 0.165 0.018 N NA
 5972944 5972945 CBY_0214 CBY_0215 ftsY   FALSE 0.444 209.000 0.081 1.000   NA
 5972945 5972946 CBY_0215 CBY_0216   ffh TRUE 0.973 14.000 0.151 1.000   NA
 5972946 5972947 CBY_0216 CBY_0217 ffh rpsP TRUE 0.952 43.000 0.361 1.000 N NA
 5972947 5972948 CBY_0217 CBY_0218 rpsP   TRUE 0.946 49.000 0.385 1.000   NA
 5972948 5972949 CBY_0218 CBY_0219   rimM FALSE 0.113 215.000 0.000 NA   NA
 5972950 5972951 CBY_0028 CBY_0029     TRUE 0.835 13.000 0.000 NA   NA
 5972951 5972952 CBY_0029 CBY_0030     TRUE 0.959 42.000 0.489 0.006   NA
 5972952 5972953 CBY_0030 CBY_0031     TRUE 0.997 13.000 0.258 0.006 Y NA
 5972953 5972954 CBY_0031 CBY_0032     TRUE 0.998 -7.000 0.487 0.006 Y NA
 5972954 5972955 CBY_0032 CBY_0033     TRUE 0.997 18.000 0.462 0.006 Y NA
 5972955 5972956 CBY_0033 CBY_0034     TRUE 0.998 -7.000 0.776 0.006 Y NA
 5972956 5972957 CBY_0034 CBY_0035     TRUE 0.997 4.000 0.238 0.006 Y NA
 4729511 5972959 CBY_0037 CBY_0038     FALSE 0.019 359.000 0.000 1.000   NA
 5972959 5972960 CBY_0038 CBY_0039     TRUE 0.960 -10.000 0.075 0.001   NA
 5972962 5972963 CBY_0041 CBY_0042     FALSE 0.023 332.000 0.000 NA   NA
 5972963 5972964 CBY_0042 CBY_0043     TRUE 0.961 19.000 0.083 NA   NA
 5972964 5972965 CBY_0043 CBY_0044     FALSE 0.007 989.000 0.000 NA   NA
 5972965 5972966 CBY_0044 CBY_0045     TRUE 0.934 19.000 0.018 NA   NA
 5972966 4729521 CBY_0045 CBY_0046     TRUE 0.907 28.000 0.011 1.000 N NA
 5972967 4729524 CBY_0047 CBY_0048     FALSE 0.023 335.000 0.000 NA   NA
 5972969 5972970 CBY_0050 CBY_0051     TRUE 0.798 22.000 0.000 NA   NA
 5972970 5972971 CBY_0051 CBY_0052     TRUE 0.841 2.000 0.000 NA   NA
 5972972 5972973 CBY_0698 CBY_0700     TRUE 0.819 -10.000 0.000 NA   NA
 4729572 5972974 CBY_1139 CBY_1140     FALSE 0.376 93.000 0.000 NA   NA
 5972974 5972975 CBY_1140 CBY_1141     FALSE 0.063 250.000 0.000 NA   NA
 5972975 5972976 CBY_1141 CBY_1142     FALSE 0.466 71.000 0.000 NA   NA
 5972976 5972977 CBY_1142 CBY_1143     TRUE 0.839 11.000 0.000 NA   NA
 5972977 5972978 CBY_1143 CBY_1144     TRUE 0.701 36.000 0.000 NA   NA
 5972978 5972979 CBY_1144 CBY_1145     FALSE 0.344 104.000 0.000 NA   NA
 5972979 5972980 CBY_1145 CBY_1146     FALSE 0.103 220.000 0.000 NA   NA
 5972980 4729577 CBY_1146 CBY_1147     TRUE 0.842 4.000 0.000 NA   NA
 4729577 4729578 CBY_1147 CBY_1148     TRUE 0.936 0.000 0.011 1.000   NA
 4729578 5972981 CBY_1148 CBY_1149     FALSE 0.251 154.000 0.000 NA   NA
 5972984 4729600 CBY_0767 CBY_0768     FALSE 0.061 251.000 0.000 1.000   NA
 4729600 5972985 CBY_0768 CBY_0769     FALSE 0.265 142.000 0.000 NA   NA
 4729633 5972986 CBY_0606 CBY_0607     TRUE 0.817 18.000 0.000 NA   NA
 5972986 5972987 CBY_0607 CBY_0608   argR TRUE 0.832 -3.000 0.000 NA   NA
 5972987 5972988 CBY_0608 CBY_0609 argR recN TRUE 0.962 19.000 0.086 1.000 N NA
 5972988 5972989 CBY_0609 CBY_0610 recN spoIVB FALSE 0.135 314.000 0.079 1.000   NA
 5972989 5972990 CBY_0610 CBY_0611 spoIVB   FALSE 0.081 234.000 0.000 NA   NA
 5972990 5972991 CBY_0611 CBY_0612   spo0A FALSE 0.418 82.000 0.000 NA   NA
 5972991 5972992 CBY_0612 CBY_0613 spo0A   FALSE 0.009 573.000 0.000 NA   NA
 5972992 5972993 CBY_0613 CBY_0614     FALSE 0.007 937.000 0.000 NA   NA
 5972993 5972994 CBY_0614 CBY_0615     FALSE 0.108 217.000 0.000 NA   NA
 5972994 5972995 CBY_0615 CBY_0616     FALSE 0.457 73.000 0.000 NA   NA
 5972995 4729639 CBY_0616 CBY_0617     TRUE 0.829 -6.000 0.000 NA   NA
 4729639 5972996 CBY_0617 CBY_0618     FALSE 0.008 680.000 0.000 NA   NA
 5972996 5972997 CBY_0618 CBY_0619     FALSE 0.013 418.000 0.000 NA   NA
 5972997 5972998 CBY_0619 CBY_0620     FALSE 0.241 159.000 0.000 NA   NA
 5972998 5972999 CBY_0620 CBY_0621     FALSE 0.198 180.000 0.000 NA   NA
 5972999 5973000 CBY_0621 CBY_0622     FALSE 0.123 210.000 0.000 NA   NA
 5973000 5973001 CBY_0622 CBY_0623     FALSE 0.248 155.000 0.000 NA   NA
 5973001 5973002 CBY_0623 CBY_0624     FALSE 0.064 249.000 0.000 NA   NA
 5973002 5973003 CBY_0624 CBY_0625     FALSE 0.016 391.000 0.000 NA   NA
 5973003 5973004 CBY_0625 CBY_0626     FALSE 0.022 340.000 0.000 1.000   NA
 5973004 5973005 CBY_0626 CBY_0627     TRUE 0.950 91.000 0.018 1.000 Y NA
 5973005 5973006 CBY_0627 CBY_0628     TRUE 0.997 13.000 0.345 0.036 Y NA
 5973006 5973007 CBY_0628 CBY_0629     TRUE 0.998 3.000 0.349 1.000 Y NA
 5973007 5973008 CBY_0629 CBY_0630     TRUE 0.994 2.000 0.018 0.024 Y NA
 5973008 5973009 CBY_0630 CBY_0631     TRUE 0.974 24.000 0.286 NA   NA
 5973009 5973010 CBY_0631 CBY_0632   spoIIM FALSE 0.064 249.000 0.000 NA   NA
 5973010 5973011 CBY_0632 CBY_0633 spoIIM   TRUE 0.676 92.000 0.021 NA   NA
 5973011 5973012 CBY_0633 CBY_0634     FALSE 0.159 196.000 0.000 NA   NA
 5973012 5973013 CBY_0634 CBY_0635     TRUE 0.842 3.000 0.000 NA   NA
 5973013 5973014 CBY_0635 CBY_0636     FALSE 0.230 165.000 0.000 NA   NA
 5973014 5973015 CBY_0636 CBY_0637     FALSE 0.046 272.000 0.000 NA   NA
 5973017 5973018 CBY_0639 CBY_0640     TRUE 0.798 22.000 0.000 NA   NA
 5973018 5973019 CBY_0640 CBY_0641     FALSE 0.356 100.000 0.000 NA   NA
 5973020 5973021 CBY_0648 CBY_0649     FALSE 0.226 167.000 0.000 NA   NA
 5973021 5973022 CBY_0649 CBY_0650     FALSE 0.117 213.000 0.000 NA   NA
 5973022 5973023 CBY_0650 CBY_0651     FALSE 0.120 211.000 0.000 NA   NA
 5973023 5973024 CBY_0651 CBY_0652     FALSE 0.047 271.000 0.000 NA   NA
 5973024 5973025 CBY_0652 CBY_0653     FALSE 0.100 221.000 0.000 NA   NA
 5973027 5973028 CBY_0655 CBY_0656   aguB FALSE 0.205 177.000 0.000 NA   NA
 5973028 5973029 CBY_0656 CBY_0657 aguB   TRUE 0.791 23.000 0.000 1.000   NA
 5973029 5973030 CBY_0657 CBY_0658     FALSE 0.435 191.000 0.027 1.000 N NA
 5973032 5973033 CBY_0660 CBY_0661     FALSE 0.022 347.000 0.000 1.000 N NA
 5973033 5973034 CBY_0661 CBY_0662     FALSE 0.337 108.000 0.000 1.000 N NA
 5973034 5973035 CBY_0662 CBY_0663     TRUE 0.926 17.000 0.007 1.000 N NA
 5973035 5973036 CBY_0663 CBY_0664     TRUE 0.997 1.000 0.286 0.036 Y NA
 5973036 4729746 CBY_0664 CBY_0665     TRUE 0.998 14.000 0.789 1.000 Y NA
 4729746 5973037 CBY_0665 CBY_0666     TRUE 0.911 154.000 0.018 1.000 Y NA
 5973037 5973038 CBY_0666 CBY_0667     TRUE 0.951 138.000 0.133 1.000 Y NA
 5973038 5973039 CBY_0667 CBY_0668     FALSE 0.020 352.000 0.000 NA   NA
 5973041 5973042 CBY_0670 CBY_0671     TRUE 0.998 2.000 0.889 1.000 Y NA
 5973042 5973043 CBY_0671 CBY_0672     TRUE 0.718 34.000 0.000 1.000 N NA
 5973043 5973044 CBY_0672 CBY_0673     TRUE 0.725 33.000 0.000 1.000   NA
 5973044 5973045 CBY_0673 CBY_0674     TRUE 0.687 38.000 0.000 NA   NA
 5973046 5973047 CBY_0675 CBY_0676     TRUE 0.840 10.000 0.000 NA   NA
 5973047 5973048 CBY_0676 CBY_0677     TRUE 0.985 19.000 0.714 NA   NA
 5973049 5973050 CBY_0678 CBY_0679     TRUE 0.779 27.000 0.000 1.000 N NA
 5973051 5973052 CBY_0680 CBY_0681     TRUE 0.961 28.000 0.160 NA   NA
 5973053 5973054 CBY_0682 CBY_0683 ribH   TRUE 0.940 122.000 0.054 0.001 Y NA
 5973054 5973055 CBY_0683 CBY_0684   ribE TRUE 0.983 49.000 0.051 1.000 Y NA
 5973055 5973056 CBY_0684 CBY_0685 ribE ribD TRUE 0.998 16.000 0.456 1.000 Y NA
 5973056 5973057 CBY_0685 CBY_0686 ribD   FALSE 0.011 480.000 0.000 1.000   NA
 5973060 5973061 CBY_0761 CBY_0762     TRUE 0.815 -7.000 0.000 0.002   NA
 5973061 5973062 CBY_0762 CBY_0763     FALSE 0.266 140.000 0.000 NA   NA
 5973063 5973064 CBY_0797 CBY_0798   tuf FALSE 0.008 652.000 0.000 NA   NA
 5973064 5973065 CBY_0798 CBY_0799 tuf fusA TRUE 0.913 214.000 0.400 0.001 Y NA
 5973065 5973066 CBY_0799 CBY_0800 fusA rpsG TRUE 0.983 92.000 0.579 1.000 Y NA
 5973066 5973067 CBY_0800 CBY_0801 rpsG rpsL FALSE 0.237 161.000 0.000 NA   NA
 5973068 5973069 CBY_4139 CBY_4140     TRUE 0.842 6.000 0.000 NA   NA
 5973070 5973071 CBY_4141 CBY_4142     TRUE 0.937 190.000 0.267 1.000 Y NA
 5973071 5973072 CBY_4142 CBY_4143     FALSE 0.009 577.000 0.000 NA N NA
 5973072 5973073 CBY_4143 CBY_4144     FALSE 0.011 491.000 0.000 NA   NA
 5973073 5973074 CBY_4144 CBY_4145     FALSE 0.187 185.000 0.000 NA   NA
 5973074 5973075 CBY_4145 CBY_4146     FALSE 0.374 94.000 0.000 NA   NA
 5973075 5973076 CBY_4146 CBY_4147     FALSE 0.013 419.000 0.000 NA   NA
 5973078 5973079 CBY_4149 CBY_4150     TRUE 0.568 54.000 0.000 NA   NA
 5973079 5973080 CBY_4150 CBY_4151   prfC FALSE 0.309 116.000 0.000 NA   NA
 5973080 5973081 CBY_4151 CBY_4152 prfC   FALSE 0.007 1032.000 0.000 NA   NA
 5973081 5973082 CBY_4152 CBY_4153     FALSE 0.258 151.000 0.000 NA   NA
 5973082 5973083 CBY_4153 CBY_4154     FALSE 0.008 654.000 0.000 NA   NA
 5973083 5973084 CBY_4154 CBY_4155     FALSE 0.008 590.000 0.000 NA   NA
 5973084 5973085 CBY_4155 CBY_4156     FALSE 0.011 493.000 0.000 NA   NA
 5973085 5973086 CBY_4156 CBY_4157     FALSE 0.010 521.000 0.000 NA   NA
 5973086 4729868 CBY_4157 CBY_4158     TRUE 0.834 15.000 0.000 NA N NA
 4729868 5973087 CBY_4158 CBY_4159     FALSE 0.011 482.000 0.000 NA   NA
 5973089 5973090 CBY_0740 CBY_0741     TRUE 0.488 66.000 0.000 NA   NA
 5973090 5973091 CBY_0741 CBY_0742     TRUE 0.605 50.000 0.000 1.000 N NA
 5973091 5973092 CBY_0742 CBY_0743     FALSE 0.060 252.000 0.000 NA   NA
 5973094 5973095 CBY_0745 CBY_0746     FALSE 0.021 349.000 0.000 NA   NA
 5973095 5973096 CBY_0746 CBY_0747     FALSE 0.227 169.000 0.000 1.000 N NA
 5973096 5973097 CBY_0747 CBY_0748     FALSE 0.091 225.000 0.000 1.000   NA
 5973097 5973098 CBY_0748 CBY_0749     FALSE 0.075 238.000 0.000 1.000   NA
 5973098 5973099 CBY_0749 CBY_0750     TRUE 0.998 3.000 0.465 1.000 Y NA
 5973101 5973102 CBY_0752 CBY_0753 pepT   TRUE 0.608 106.000 0.013 NA N NA
 5973102 5973103 CBY_0753 CBY_0754     FALSE 0.178 189.000 0.000 NA   NA
 5973105 5973106 CBY_0756 CBY_0757     FALSE 0.281 128.000 0.000 NA   NA
 5973106 4729884 CBY_0757 CBY_0758     FALSE 0.050 266.000 0.000 NA   NA
 4729884 5973107 CBY_0758 CBY_0759   feoB TRUE 0.695 37.000 0.000 NA   NA
 5973108 5973109 CBY_0391 CBY_0392     FALSE 0.233 163.000 0.000 NA   NA
 5973109 5973110 CBY_0392 CBY_0393     TRUE 0.747 31.000 0.000 NA   NA
 5973112 5973113 CBY_0395 CBY_0396     FALSE 0.208 176.000 0.000 NA   NA
 5973113 5973114 CBY_0396 CBY_0397   nagB FALSE 0.211 175.000 0.000 NA   NA
 5973117 5973118 CBY_0400 CBY_0401     FALSE 0.414 80.000 0.000 0.052   NA
 5973119 5973120 CBY_0402 CBY_0403     FALSE 0.108 217.000 0.000 NA   NA
 5973120 5973121 CBY_0403 CBY_0404     FALSE 0.233 166.000 0.000 1.000 N NA
 5973123 5973124 CBY_0406 CBY_0407 trpA trpB TRUE 0.992 -7.000 0.008 0.001 Y NA
 5973126 5973127 CBY_0409 CBY_0410     TRUE 0.868 99.000 0.400 1.000 N NA
 5973127 5973128 CBY_0410 CBY_0411     TRUE 0.987 1.000 0.667 NA   NA
 5973128 5973129 CBY_0411 CBY_0412     TRUE 0.939 21.000 0.029 NA   NA
 5973129 5973130 CBY_0412 CBY_0413     TRUE 0.988 -3.000 0.869 1.000   NA
 5973130 5973131 CBY_0413 CBY_0414     FALSE 0.013 425.000 0.000 1.000   NA
 5973131 5973132 CBY_0414 CBY_0415     TRUE 0.949 60.000 0.000 1.000 Y NA
 5973132 5973133 CBY_0415 CBY_0416     TRUE 0.845 7.000 0.000 1.000 N NA
 5973133 5973134 CBY_0416 CBY_0417     FALSE 0.032 296.000 0.000 1.000   NA
 5973134 5973135 CBY_0417 CBY_0418     FALSE 0.024 329.000 0.000 1.000   NA
 5973135 5973136 CBY_0418 CBY_0419     TRUE 0.971 -10.000 0.153 NA   NA
 5973136 5973137 CBY_0419 CBY_0420     FALSE 0.026 321.000 0.000 NA   NA
 5973137 5973138 CBY_0420 CBY_0421     FALSE 0.321 111.000 0.000 NA   NA
 5973138 5973139 CBY_0421 CBY_0422     FALSE 0.187 185.000 0.000 NA   NA
 5973139 5973140 CBY_0422 CBY_0423     TRUE 0.935 33.000 0.073 NA   NA
 5973140 5973141 CBY_0423 CBY_0424     FALSE 0.113 215.000 0.000 NA   NA
 5973141 5973142 CBY_0424 CBY_0425     FALSE 0.233 163.000 0.000 NA   NA
 5973144 5973145 CBY_0427 CBY_0428     TRUE 0.998 13.000 0.455 0.023 Y NA
 5973145 5973146 CBY_0428 CBY_0429   nikC TRUE 0.998 0.000 0.364 1.000 Y NA
 5973146 5973147 CBY_0429 CBY_0430 nikC nikB TRUE 0.998 2.000 0.500 0.001 Y NA
 5973147 5973148 CBY_0430 CBY_0431 nikB nikA TRUE 0.978 102.000 0.429 0.049 Y NA
 5973148 5973149 CBY_0431 CBY_0432 nikA   TRUE 0.789 134.000 0.286 1.000 N NA
 5973149 5973150 CBY_0432 CBY_0433     FALSE 0.149 201.000 0.000 1.000 N NA
 5973152 5973153 CBY_0435 CBY_0436     TRUE 0.835 14.000 0.000 1.000 N NA
 5973153 5973154 CBY_0436 CBY_0437     TRUE 0.988 7.000 0.000 0.008 Y NA
 5973154 5973155 CBY_0437 CBY_0438   gufA FALSE 0.066 249.000 0.000 1.000 N NA
 5973156 5973157 CBY_0439 CBY_0440     FALSE 0.014 407.000 0.000 NA   NA
 5973157 5973158 CBY_0440 CBY_0441     TRUE 0.990 4.000 0.957 NA   NA
 5973158 5973159 CBY_0441 CBY_0442     FALSE 0.038 285.000 0.000 NA   NA
 5973160 5973161 CBY_0443 CBY_0445     FALSE 0.018 364.000 0.000 NA   NA
 5973161 5973162 CBY_0445 CBY_0446     TRUE 0.803 -43.000 0.000 NA   NA
 5973162 5973163 CBY_0446 CBY_0447     FALSE 0.009 548.000 0.000 NA   NA
 5973163 5973164 CBY_0447 CBY_0448     TRUE 0.665 40.000 0.000 1.000   NA
 5973164 5973165 CBY_0448 CBY_0449     FALSE 0.246 155.000 0.000 1.000   NA
 5973166 5973167 CBY_0450 CBY_0451     FALSE 0.019 358.000 0.000 NA   NA
 5973168 5973169 CBY_0452 CBY_0453     FALSE 0.165 194.000 0.000 NA   NA
 5973169 5973170 CBY_0453 CBY_0454     FALSE 0.030 304.000 0.000 NA   NA
 5973170 5973171 CBY_0454 CBY_0455     TRUE 0.992 60.000 0.708 0.035 Y NA
 5973171 5973172 CBY_0455 CBY_0456     TRUE 0.998 0.000 0.848 0.035 Y NA
 5973172 5973173 CBY_0456 CBY_0457     TRUE 0.996 -7.000 0.109 0.035 Y NA
 5973173 5973174 CBY_0457 CBY_0458     FALSE 0.016 389.000 0.000 1.000 N NA
 5973174 5973175 CBY_0458 CBY_0459     FALSE 0.362 100.000 0.000 1.000 N NA
 5973177 5973178 CBY_0461 CBY_0462     FALSE 0.209 171.000 0.000 0.008   NA
 5973180 5973181 CBY_0464 CBY_0465 pflA pflB TRUE 0.959 -34.000 0.082 1.000 N NA
 5973181 5973182 CBY_0465 CBY_0466 pflB   FALSE 0.010 546.000 0.000 1.000 N NA
 5973182 5973183 CBY_0466 CBY_0467     FALSE 0.013 418.000 0.000 0.035 N NA
 5973183 5973184 CBY_0467 CBY_0468     TRUE 0.949 180.000 0.333 1.000 Y NA
 5973184 5973185 CBY_0468 CBY_0469     TRUE 0.988 -7.000 1.000 0.008   NA
 5973187 5973188 CBY_0471 CBY_0472     TRUE 0.985 22.000 0.000 1.000 Y NA
 5973188 5973189 CBY_0472 CBY_0473     TRUE 0.802 21.000 0.000 1.000   NA
 5973191 5973192 CBY_0475 CBY_0476     TRUE 0.842 7.000 0.000 NA   NA
 5973192 5973193 CBY_0476 CBY_0477     FALSE 0.226 167.000 0.000 NA   NA
 5973193 5973194 CBY_0477 CBY_0478     FALSE 0.009 607.000 0.000 1.000 N NA
 5973194 5973195 CBY_0478 CBY_0479     TRUE 0.950 21.000 0.053 1.000 N NA
 5973197 5973198 CBY_0481 CBY_0482     TRUE 0.498 64.000 0.000 NA   NA
 5973198 5973199 CBY_0482 CBY_0483     TRUE 0.493 65.000 0.000 NA   NA
 5973199 5973200 CBY_0483 CBY_0484     TRUE 0.804 -34.000 0.000 NA   NA
 5973200 5973201 CBY_0484 CBY_0485     TRUE 0.825 -7.000 0.000 NA   NA
 5973203 5973204 CBY_0487 CBY_0488     FALSE 0.350 102.000 0.000 NA   NA
 5973204 5973205 CBY_0488 CBY_0489     FALSE 0.016 382.000 0.000 NA   NA
 5973205 5973206 CBY_0489 CBY_0490     FALSE 0.022 345.000 0.000 NA   NA
 5973206 5973207 CBY_0490 CBY_0491     FALSE 0.011 487.000 0.000 NA   NA
 5973207 5973208 CBY_0491 CBY_0492     TRUE 0.825 -7.000 0.000 NA   NA
 5973208 5973209 CBY_0492 CBY_0493     FALSE 0.015 403.000 0.000 NA   NA
 5973209 5973210 CBY_0493 CBY_0494     FALSE 0.335 107.000 0.000 NA   NA
 5973210 5973211 CBY_0494 CBY_0495     TRUE 0.812 -15.000 0.000 NA   NA
 5973211 5973212 CBY_0495 CBY_0496     TRUE 0.996 25.000 0.318 NA Y NA
 5973214 5973215 CBY_0498 CBY_0499   ahpC TRUE 0.931 166.000 0.084 1.000 Y NA
 5973215 5973216 CBY_0499 CBY_0500 ahpC   FALSE 0.063 251.000 0.000 1.000 N NA
 5973216 5973217 CBY_0500 CBY_0501     FALSE 0.218 173.000 0.000 1.000 N NA
 5973217 5973218 CBY_0501 CBY_0502     TRUE 0.960 28.000 0.143 0.004 N NA
 5973218 5973219 CBY_0502 CBY_0503     FALSE 0.029 307.000 0.000 1.000 N NA
 5973219 5973220 CBY_0503 CBY_0504     TRUE 0.988 10.000 0.000 0.021 Y NA
 5973220 5973221 CBY_0504 CBY_0505     FALSE 0.071 240.000 0.000 0.050   NA
 5973221 5973222 CBY_0505 CBY_0506     TRUE 0.971 12.000 0.118 1.000   NA
 5973222 5973223 CBY_0506 CBY_0507   dhaK TRUE 0.996 25.000 0.226 0.001 Y NA
 5973223 5973224 CBY_0507 CBY_0508 dhaK   TRUE 0.960 0.000 0.053 1.000 N NA
 5973224 5973225 CBY_0508 CBY_0509     FALSE 0.253 291.000 0.250 1.000 N NA
 5973225 5973226 CBY_0509 CBY_0510     FALSE 0.223 171.000 0.000 1.000 N NA
 5973226 5973227 CBY_0510 CBY_0511     TRUE 0.984 0.000 0.429 1.000 N NA
 5973227 5973228 CBY_0511 CBY_0512     FALSE 0.171 191.000 0.000 1.000   NA
 5973228 5973229 CBY_0512 CBY_0513     TRUE 0.958 -25.000 0.081 0.001   NA
 5973229 5973230 CBY_0513 CBY_0514     TRUE 0.836 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5973230 5973231 CBY_0514 CBY_0515     TRUE 0.835 14.000 0.000 1.000 N NA
 5973231 5973232 CBY_0515 CBY_0516   nifE TRUE 0.997 15.000 0.342 0.001 Y NA
 5973232 5973233 CBY_0516 CBY_0517 nifE   TRUE 0.943 190.000 0.380 0.001 Y NA
 5973233 5973234 CBY_0517 CBY_0518   nifD TRUE 0.998 3.000 0.902 0.001 Y NA
 5973234 5973235 CBY_0518 CBY_0519 nifD   TRUE 0.978 19.000 0.294 1.000 N NA
 5973235 5973236 CBY_0519 CBY_0520     TRUE 0.998 22.000 0.860 0.003 Y NA
 5973236 5973237 CBY_0520 CBY_0521   nifH TRUE 0.785 25.000 0.000 NA   NA
 5973238 4729927 CBY_1088 CBY_1089     TRUE 0.811 -16.000 0.000 NA   NA
 4729927 5973239 CBY_1089 CBY_1090     TRUE 0.494 178.000 0.031 1.000 N NA
 5973239 5973240 CBY_1090 CBY_1091   clpP FALSE 0.407 203.000 0.042 1.000 N NA
 5973240 5973241 CBY_1091 CBY_1092 clpP   FALSE 0.165 191.000 0.000 0.026   NA
 5973241 5973242 CBY_1092 CBY_1093     FALSE 0.294 121.000 0.000 1.000   NA
 5973242 5973243 CBY_1093 CBY_1094     TRUE 0.752 145.000 0.208 1.000   NA
 5973243 4729933 CBY_1094 CBY_1095     FALSE 0.023 334.000 0.000 1.000   NA
 4729933 4729934 CBY_1095 CBY_1096     TRUE 0.557 55.000 0.000 1.000   NA
 4729934 5973244 CBY_1096 CBY_1097     TRUE 0.844 155.000 0.000 1.000 Y NA
 5973244 5973245 CBY_1097 CBY_1098     TRUE 0.662 174.000 0.148 NA   NA
 5973245 5973246 CBY_1098 CBY_1099     FALSE 0.455 212.000 0.104 NA   NA
 5973246 5973247 CBY_1099 CBY_1100   pnp TRUE 0.626 146.000 0.057 1.000   NA
 5973247 5973248 CBY_1100 CBY_1101 pnp rpsO TRUE 0.976 102.000 0.335 1.000 Y NA
 5973248 5973249 CBY_1101 CBY_1102 rpsO ribF TRUE 0.744 118.000 0.119 1.000 N NA
 5973249 5973250 CBY_1102 CBY_1103 ribF truB TRUE 0.980 16.000 0.308 1.000 N NA
 5973250 5973251 CBY_1103 CBY_1104 truB   TRUE 0.975 17.000 0.221 1.000   NA
 5973251 5973252 CBY_1104 CBY_1105   rbfA TRUE 0.975 0.000 0.173 1.000   NA
 5973252 5973253 CBY_1105 CBY_1106 rbfA infB TRUE 0.998 14.000 0.530 1.000 Y NA
 5973253 5973254 CBY_1106 CBY_1107 infB   TRUE 0.997 16.000 0.223 NA Y NA
 5973254 5973255 CBY_1107 CBY_1108     TRUE 0.983 -7.000 0.408 NA N NA
 5973255 5973256 CBY_1108 CBY_1109   nusA TRUE 0.997 16.000 0.323 NA Y NA
 5973256 5973257 CBY_1109 CBY_1110 nusA   TRUE 0.986 18.000 0.759 NA   NA
 5973257 5973258 CBY_1110 CBY_1111   polC FALSE 0.153 288.000 0.059 NA   NA
 5973258 5973259 CBY_1111 CBY_1112 polC ispG FALSE 0.178 267.000 0.040 1.000 N NA
 5973259 5973260 CBY_1112 CBY_1113 ispG rseP TRUE 0.489 204.000 0.092 1.000 N NA
 5973260 5973261 CBY_1113 CBY_1114 rseP dxr TRUE 0.984 18.000 0.568 1.000 N NA
 5973261 5973262 CBY_1114 CBY_1115 dxr   TRUE 0.902 28.000 0.008 NA   NA
 5973262 5973263 CBY_1115 CBY_1116   cdsA TRUE 0.671 127.000 0.068 NA   NA
 5973263 5973264 CBY_1116 CBY_1117 cdsA uppS TRUE 0.958 14.000 0.055 1.000   NA
 5973264 5973265 CBY_1117 CBY_1118 uppS frr TRUE 0.874 96.000 0.409 1.000 N NA
 5973265 5973266 CBY_1118 CBY_1119 frr pyrH TRUE 0.839 11.000 0.000 NA   NA
 5973266 5973267 CBY_1119 CBY_1120 pyrH tsf FALSE 0.019 357.000 0.000 NA   NA
 5973267 5973268 CBY_1120 CBY_1121 tsf   FALSE 0.354 101.000 0.000 NA   NA
 5973269 5973270 CBY_0001 CBY_0002     TRUE 0.939 -13.000 0.025 1.000   NA
 5973270 5973271 CBY_0002 CBY_0003     FALSE 0.095 223.000 0.000 1.000   NA
 5973271 5973272 CBY_0003 CBY_0004     TRUE 0.953 -52.000 0.063 NA   NA
 5973272 5973273 CBY_0004 CBY_0005     FALSE 0.405 250.000 0.300 NA   NA
 5973275 5973276 CBY_0007 CBY_0008     TRUE 0.934 10.000 0.007 1.000   NA
 5973276 5973277 CBY_0008 CBY_0009     TRUE 0.495 130.000 0.005 1.000   NA
 5973277 5973278 CBY_0009 CBY_0010     TRUE 0.952 39.000 0.250 1.000   NA
 5973278 5973279 CBY_0010 CBY_0011     FALSE 0.098 222.000 0.000 NA   NA
 5973279 5973280 CBY_0011 CBY_0012     FALSE 0.035 290.000 0.000 NA   NA
 5973280 5973281 CBY_0012 CBY_0013     FALSE 0.263 145.000 0.000 NA   NA
 5973283 5973284 CBY_0015 CBY_0016     FALSE 0.212 174.000 0.000 NA   NA
 5973285 5973286 CBY_0017 CBY_0018     TRUE 0.668 109.000 0.041 NA   NA
 5973287 5973288 CBY_0019 CBY_0020     FALSE 0.041 278.000 0.000 NA   NA
 5973288 5973289 CBY_0020 CBY_0021     TRUE 0.568 54.000 0.000 NA   NA
 5973289 5973290 CBY_0021 CBY_0022     FALSE 0.082 233.000 0.000 NA   NA
 5973290 5973291 CBY_0022 CBY_0023   lon TRUE 0.952 -10.000 0.048 1.000   NA
 5973291 5973292 CBY_0023 CBY_0024 lon lonB TRUE 0.833 218.000 0.072 0.002 Y NA
 5973292 5973293 CBY_0024 CBY_0025 lonB clpX TRUE 0.765 230.000 0.042 0.003 Y NA
 5973293 5973294 CBY_0025 CBY_0026 clpX clpP TRUE 0.978 43.000 0.002 1.000 Y NA
 5973294 5973295 CBY_0026 CBY_0027 clpP tig FALSE 0.237 161.000 0.000 NA   NA
 5973296 5973297 CBY_4250 CBY_4251 rrs rrl FALSE 0.070 243.000 0.000 NA   NA
 5973297 5973298 CBY_4251 CBY_4252 rrl rrf FALSE 0.312 115.000 0.000 NA   NA
 5973298 5973299 CBY_4252 CBY_4253 rrf   TRUE 0.841 9.000 0.000 NA   NA
 5973299 5973300 CBY_4253 CBY_4254     TRUE 0.842 5.000 0.000 NA   NA
 5973300 4729985 CBY_4254 CBY_1477     FALSE 0.268 137.000 0.000 NA   NA
 4729985 5973301 CBY_1477 CBY_1478     TRUE 0.945 13.000 0.021 1.000   NA
 5973301 5973302 CBY_1478 CBY_1479     TRUE 0.978 21.000 0.370 NA   NA
 5973302 5973303 CBY_1479 CBY_1480   serS FALSE 0.013 422.000 0.000 NA   NA
 5973303 5973304 CBY_1480 CBY_4256 serS   FALSE 0.054 260.000 0.000 NA   NA
 5973304 5973305 CBY_4256 CBY_4257     TRUE 0.634 44.000 0.000 NA   NA
 5973305 5973306 CBY_4257 CBY_4258     FALSE 0.023 335.000 0.000 NA   NA
 5973306 5973307 CBY_4258 CBY_4259     TRUE 0.762 29.000 0.000 NA   NA
 5973307 5973308 CBY_4259 CBY_1485     FALSE 0.217 172.000 0.000 NA   NA
 5973308 5973309 CBY_1485 CBY_1486   addB TRUE 0.942 19.000 0.029 1.000 N NA
 5973309 5973310 CBY_1486 CBY_1487 addB addA TRUE 0.991 52.000 0.408 0.004 Y NA
 4730003 5973314 CBY_1871 CBY_1872     TRUE 0.840 3.000 0.000 1.000   NA
 5973316 5973317 CBY_1874 CBY_1875     TRUE 0.545 172.000 0.047 NA   NA
 5973317 5973318 CBY_1875 CBY_1876     FALSE 0.025 328.000 0.000 NA N NA
 5973320 4730012 CBY_1878 CBY_1879     FALSE 0.122 211.000 0.000 1.000 N NA
 4730012 5973321 CBY_1879 CBY_1880     FALSE 0.466 71.000 0.000 NA   NA
 5973321 4730013 CBY_1880 CBY_1881     FALSE 0.044 274.000 0.000 NA   NA
 4730013 5973322 CBY_1881 CBY_1882     TRUE 0.657 41.000 0.000 NA   NA
 5973322 5973323 CBY_1882 CBY_1883     TRUE 0.807 -22.000 0.000 NA   NA
 5973323 5973324 CBY_1883 CBY_1884     FALSE 0.418 81.000 0.000 1.000   NA
 5973325 5973326 CBY_1885 CBY_1886     FALSE 0.254 152.000 0.000 1.000   NA
 5973327 5973328 CBY_1887 CBY_1888     TRUE 0.997 -18.000 0.312 NA Y NA
 5973328 5973329 CBY_1888 CBY_1889   nifJ FALSE 0.008 688.000 0.000 1.000 N NA
 5973334 5973335 CBY_1895 CBY_1896     FALSE 0.012 442.000 0.000 NA   NA
 5973336 5973337 CBY_1897 CBY_1898     TRUE 0.799 -18.000 0.000 0.003   NA
 5973338 5973339 CBY_1899 CBY_1900     FALSE 0.312 115.000 0.000 NA   NA
 5973341 5973342 CBY_1902 CBY_1903     FALSE 0.027 314.000 0.000 NA   NA
 5973342 5973343 CBY_1903 CBY_1904   xpt FALSE 0.008 720.000 0.000 NA   NA
 5973343 5973344 CBY_1904 CBY_1905 xpt   TRUE 0.952 96.000 0.032 1.000 Y NA
 5973344 5973345 CBY_1905 CBY_1906     FALSE 0.008 630.000 0.000 NA   NA
 5973345 5973346 CBY_1906 CBY_1907     FALSE 0.021 351.000 0.000 NA   NA
 5973346 5973347 CBY_1907 CBY_1908     FALSE 0.020 352.000 0.000 NA   NA
 5973347 5973348 CBY_1908 CBY_1909     FALSE 0.092 227.000 0.000 NA N NA
 5973348 5973349 CBY_1909 CBY_1910     FALSE 0.284 127.000 0.000 NA   NA
 5973349 5973350 CBY_1910 CBY_1911     FALSE 0.272 133.000 0.000 NA   NA
 5973350 5973351 CBY_1911 CBY_1912     FALSE 0.264 144.000 0.000 NA   NA
 5973351 5973352 CBY_1912 CBY_1913     FALSE 0.453 74.000 0.000 NA   NA
 5973352 5973353 CBY_1913 CBY_1914     TRUE 0.762 29.000 0.000 NA   NA
 5973353 5973354 CBY_1914 CBY_1915     FALSE 0.008 607.000 0.000 NA   NA
 5973354 5973355 CBY_1915 CBY_1916     FALSE 0.092 225.000 0.000 NA   NA
 5973357 5973358 CBY_1918 CBY_1919     TRUE 0.621 46.000 0.000 NA   NA
 5973358 5973359 CBY_1919 CBY_1920     FALSE 0.017 376.000 0.000 NA   NA
 5973359 5973360 CBY_1920 CBY_1921     FALSE 0.350 102.000 0.000 NA   NA
 5973360 5973361 CBY_1921 CBY_1922     FALSE 0.175 190.000 0.000 NA   NA
 5973361 5973362 CBY_1922 CBY_1923     FALSE 0.013 435.000 0.000 NA   NA
 5973362 5973363 CBY_1923 CBY_1924     FALSE 0.221 170.000 0.000 NA   NA
 5973363 5973364 CBY_1924 CBY_1925     FALSE 0.067 245.000 0.000 NA   NA
 5973364 5973365 CBY_1925 CBY_1926     FALSE 0.023 331.000 0.000 NA   NA
 5973365 5973366 CBY_1926 CBY_1927     FALSE 0.190 184.000 0.000 NA   NA
 5973366 5973367 CBY_1927 CBY_1928     FALSE 0.033 297.000 0.000 1.000 N NA
 5973367 5973368 CBY_1928 CBY_1929     FALSE 0.039 283.000 0.000 NA   NA
 5973370 5973371 CBY_1931 CBY_1932     TRUE 0.989 10.000 0.833 NA   NA
 5973371 5973372 CBY_1932 CBY_1933     TRUE 0.979 4.000 0.211 NA   NA
 5973372 5973373 CBY_1933 CBY_1934     FALSE 0.185 186.000 0.000 NA   NA
 5973373 5973374 CBY_1934 CBY_1935     TRUE 0.762 29.000 0.000 NA   NA
 5973374 5973375 CBY_1935 CBY_1936     FALSE 0.052 264.000 0.000 NA   NA
 5973375 5973376 CBY_1936 CBY_1937     FALSE 0.341 105.000 0.000 NA   NA
 5973376 5973377 CBY_1937 CBY_1938     TRUE 0.727 33.000 0.000 NA   NA
 5973377 5973378 CBY_1938 CBY_1939     FALSE 0.159 196.000 0.000 NA   NA
 5973378 5973379 CBY_1939 CBY_1940     TRUE 0.672 40.000 0.000 1.000 N NA
 5973379 5973380 CBY_1940 CBY_1941     FALSE 0.233 163.000 0.000 NA   NA
 5973380 5973381 CBY_1941 CBY_1942     TRUE 0.970 38.000 0.667 NA   NA
 5973381 5973382 CBY_1942 CBY_1943     TRUE 0.948 57.000 0.667 NA   NA
 5973383 5973384 CBY_1944 CBY_1945     FALSE 0.060 252.000 0.000 NA   NA
 5973384 5973385 CBY_1945 CBY_1946     FALSE 0.466 71.000 0.000 NA   NA
 5973385 5973386 CBY_1946 CBY_1947     FALSE 0.289 124.000 0.000 NA   NA
 5973386 5973387 CBY_1947 CBY_1948     TRUE 0.739 148.000 0.188 NA   NA
 5973388 5973389 CBY_1949 CBY_1950     TRUE 0.814 -13.000 0.000 NA   NA
 5973389 5973390 CBY_1950 CBY_1951     TRUE 0.574 53.000 0.000 NA   NA
 5973391 5973392 CBY_1952 CBY_1953     FALSE 0.010 532.000 0.000 NA   NA
 5973393 5973394 CBY_1954 CBY_1955     FALSE 0.358 99.000 0.000 NA   NA
 5973394 5973395 CBY_1955 CBY_1956     FALSE 0.066 246.000 0.000 NA   NA
 5973395 5973396 CBY_1956 CBY_1957     FALSE 0.140 203.000 0.000 NA   NA
 5973396 5973397 CBY_1957 CBY_1958     TRUE 0.840 10.000 0.000 NA   NA
 5973397 5973398 CBY_1958 CBY_1959     FALSE 0.140 203.000 0.000 NA   NA
 5973398 5973399 CBY_1959 CBY_1960     FALSE 0.022 336.000 0.000 1.000   NA
 5973399 5973400 CBY_1960 CBY_1961     FALSE 0.026 320.000 0.000 NA   NA
 5973400 5973401 CBY_1961 CBY_1962     TRUE 0.837 12.000 0.000 NA   NA
 5973401 5973402 CBY_1962 CBY_1963     TRUE 0.841 8.000 0.000 NA   NA
 5973402 5973403 CBY_1963 CBY_1964     FALSE 0.385 91.000 0.000 NA   NA
 5973403 5973404 CBY_1964 CBY_1965     FALSE 0.156 197.000 0.000 NA   NA
 5973404 5973405 CBY_1965 CBY_1966     FALSE 0.335 107.000 0.000 NA   NA
 5973405 5973406 CBY_1966 CBY_1968     FALSE 0.214 173.000 0.000 NA   NA
 5973406 5973407 CBY_1968 CBY_1969     FALSE 0.369 98.000 0.000 NA N NA
 5973407 5973408 CBY_1969 CBY_1970     FALSE 0.265 143.000 0.000 NA   NA
 5973408 5973409 CBY_1970 CBY_1971     FALSE 0.477 68.000 0.000 NA   NA
 5973409 5973410 CBY_1971 CBY_1972     TRUE 0.988 78.000 0.700 1.000 Y NA
 5973410 5973411 CBY_1972 CBY_1973     TRUE 0.928 49.000 0.200 1.000   NA
 5973411 5973412 CBY_1973 CBY_1974     TRUE 0.978 -10.000 0.286 1.000   NA
 5973412 5973413 CBY_1974 CBY_1975     FALSE 0.014 405.000 0.000 NA   NA
 5973415 5973416 CBY_1977 CBY_1978     TRUE 0.933 78.000 1.000 0.004 N NA
 5973416 5973417 CBY_1978 CBY_1979     FALSE 0.018 371.000 0.000 1.000 N NA
 5973417 5973418 CBY_1979 CBY_1980     FALSE 0.124 211.000 0.000 NA N NA
 5973418 5973419 CBY_1980 CBY_1981     FALSE 0.267 139.000 0.000 NA   NA
 5973419 5973420 CBY_1981 CBY_1982     FALSE 0.246 156.000 0.000 NA   NA
 5973420 5973421 CBY_1982 CBY_1983     FALSE 0.258 154.000 0.000 NA N NA
 5973421 5973422 CBY_1983 CBY_1984     FALSE 0.042 277.000 0.000 1.000 N NA
 5973422 5973423 CBY_1984 CBY_1985     FALSE 0.217 171.000 0.000 1.000   NA
 5973423 5973424 CBY_1985 CBY_1986     FALSE 0.217 171.000 0.000 1.000   NA
 5973424 5973425 CBY_1986 CBY_1987     FALSE 0.229 165.000 0.000 1.000   NA
 5973425 5973426 CBY_1987 CBY_1988     TRUE 0.836 12.000 0.000 1.000   NA
 5973428 5973429 CBY_1990 CBY_1991     FALSE 0.483 67.000 0.000 NA   NA
 5973429 5973430 CBY_1991 CBY_1992     TRUE 0.514 62.000 0.000 NA   NA
 5973430 5973431 CBY_1992 CBY_1993     FALSE 0.296 121.000 0.000 NA   NA
 5973431 5973432 CBY_1993 CBY_1994     TRUE 0.519 61.000 0.000 1.000   NA
 5973432 5973433 CBY_1994 CBY_1995     TRUE 0.754 30.000 0.000 NA   NA
 5973433 5973434 CBY_1995 CBY_1996     FALSE 0.007 773.000 0.000 NA   NA
 5973434 5973435 CBY_1996 CBY_1997     FALSE 0.203 178.000 0.000 NA   NA
 5973435 5973436 CBY_1997 CBY_1998     FALSE 0.108 217.000 0.000 NA   NA
 5973436 5973437 CBY_1998 CBY_1999     FALSE 0.402 86.000 0.000 1.000   NA
 5973437 5973438 CBY_1999 CBY_2000     FALSE 0.273 136.000 0.000 1.000 N NA
 5973438 5973439 CBY_2000 CBY_2001     TRUE 0.832 -3.000 0.000 NA   NA
 5973439 5973440 CBY_2001 CBY_2002     FALSE 0.084 231.000 0.000 NA   NA
 5973440 5973441 CBY_2002 CBY_2003     FALSE 0.012 450.000 0.000 NA   NA
 5973441 5973442 CBY_2003 CBY_2004     FALSE 0.128 208.000 0.000 NA   NA
 5973442 5973443 CBY_2004 CBY_2005     FALSE 0.021 349.000 0.000 NA   NA
 5973445 5973446 CBY_2007 CBY_2008     FALSE 0.080 235.000 0.000 NA   NA
 5973446 5973447 CBY_2008 CBY_2009     FALSE 0.208 176.000 0.000 NA   NA
 5973447 5973448 CBY_2009 CBY_2010     TRUE 0.812 19.000 0.000 NA   NA
 5973450 5973451 CBY_2012 CBY_2013     TRUE 0.973 -16.000 0.208 NA   NA
 5973451 5973452 CBY_2013 CBY_2014     FALSE 0.277 133.000 0.000 1.000 N NA
 5973452 5973453 CBY_2014 CBY_2015     TRUE 0.998 -12.000 0.741 0.021 Y NA
 5973453 5973454 CBY_2015 CBY_2016     TRUE 0.961 37.000 0.352 NA   NA
 5973454 5973455 CBY_2016 CBY_2017     TRUE 0.986 4.000 0.490 NA   NA
 5973455 5973456 CBY_2017 CBY_2018     TRUE 0.976 4.000 0.163 NA   NA
 5973458 5973459 CBY_2020 CBY_2021     FALSE 0.064 249.000 0.000 NA   NA
 5973459 5973460 CBY_2021 CBY_2022     FALSE 0.108 217.000 0.000 NA   NA
 5973460 5973461 CBY_2022 CBY_2023     FALSE 0.314 114.000 0.000 NA   NA
 5973461 5973462 CBY_2023 CBY_2024     TRUE 0.972 0.000 0.127 NA   NA
 5973462 5973463 CBY_2024 CBY_2025     FALSE 0.264 140.000 0.000 1.000   NA
 5973463 5973464 CBY_2025 CBY_2026     TRUE 0.832 -3.000 0.000 NA   NA
 5973464 5973465 CBY_2026 CBY_2027     TRUE 0.606 49.000 0.000 NA   NA
 5973467 5973468 CBY_2029 CBY_2030     TRUE 0.874 86.000 0.300 NA   NA
 5973468 5973469 CBY_2030 CBY_2031     TRUE 0.982 8.000 0.300 1.000 N NA
 5973469 5973470 CBY_2031 CBY_2032     FALSE 0.020 352.000 0.000 NA   NA
 5973470 5973471 CBY_2032 CBY_2033     TRUE 0.978 -10.000 0.286 NA   NA
 5973471 5973472 CBY_2033 CBY_2034     TRUE 0.998 3.000 0.571 0.031 Y NA
 5973472 5973473 CBY_2034 CBY_2035     TRUE 0.980 106.000 0.611 0.031 Y NA
 5973473 5973474 CBY_2035 CBY_2036     TRUE 0.777 93.000 0.083 1.000 N NA
 5973476 5973477 CBY_2038 CBY_2039     FALSE 0.201 179.000 0.000 NA   NA
 5973477 5973478 CBY_2039 CBY_2040     TRUE 0.953 19.000 0.055 NA   NA
 5973478 5973479 CBY_2040 CBY_2041     TRUE 0.898 63.000 0.209 NA   NA
 5973479 5973480 CBY_2041 CBY_2042     FALSE 0.327 109.000 0.000 NA   NA
 5973480 5973481 CBY_2042 CBY_2043     FALSE 0.401 87.000 0.000 NA   NA
 5973482 5973483 CBY_2044 CBY_2045     FALSE 0.144 202.000 0.000 NA   NA
 5973484 5973485 CBY_2046 CBY_2047     FALSE 0.012 446.000 0.000 1.000   NA
 5973485 5973486 CBY_2047 CBY_2048     TRUE 0.986 18.000 0.733 0.001   NA
 5973486 5973487 CBY_2048 CBY_2049     TRUE 0.819 -10.000 0.000 NA   NA
 5973487 5973488 CBY_2049 CBY_2051     FALSE 0.075 239.000 0.000 NA   NA
 5973489 5973490 CBY_2052 CBY_2053     TRUE 0.986 -7.000 0.614 NA   NA
 5973491 5973492 CBY_2054 CBY_2055     FALSE 0.063 251.000 0.000 1.000 N NA
 5973492 5973493 CBY_2055 CBY_2056     TRUE 0.903 48.000 0.087 1.000 N NA
 5973493 5973494 CBY_2056 CBY_2057     TRUE 0.998 1.000 0.957 1.000 Y NA
 5973494 5973495 CBY_2057 CBY_2058     TRUE 0.994 28.000 0.087 NA Y NA
 5973495 5973496 CBY_2058 CBY_2059     FALSE 0.010 516.000 0.000 NA   NA
 5973497 5973498 CBY_2822 CBY_2823     TRUE 0.839 1.000 0.000 NA   NA
 5973498 5973499 CBY_2823 CBY_2824     TRUE 0.837 12.000 0.000 NA   NA
 5973499 5973500 CBY_2824 CBY_2825     TRUE 0.819 -10.000 0.000 NA   NA
 5973500 5973501 CBY_2825 CBY_2826     FALSE 0.401 87.000 0.000 NA   NA
 5973501 5973502 CBY_2826 CBY_2827     TRUE 0.958 49.000 0.667 NA   NA
 5973502 5973503 CBY_2827 CBY_2828     TRUE 0.832 14.000 0.000 NA   NA
 5973503 5973504 CBY_2828 CBY_2829     TRUE 0.984 5.000 0.375 NA   NA
 5973504 5973505 CBY_2829 CBY_2830     TRUE 0.979 -3.000 0.250 NA   NA
 5973505 5973506 CBY_2830 CBY_2831     TRUE 0.837 0.000 0.000 NA   NA
 5973506 5973507 CBY_2831 CBY_2832     TRUE 0.839 11.000 0.000 NA   NA
 5973507 5973508 CBY_2832 CBY_2833     TRUE 0.920 46.000 0.133 NA   NA
 5973508 5973509 CBY_2833 CBY_2834     TRUE 0.974 3.000 0.133 NA   NA
 5973509 5973510 CBY_2834 CBY_2835     TRUE 0.970 -22.000 0.167 NA   NA
 5973510 5973511 CBY_2835 CBY_2836     TRUE 0.972 18.000 0.167 NA   NA
 5973511 5973512 CBY_2836 CBY_2837     TRUE 0.987 0.000 0.667 NA   NA
 5973512 5973513 CBY_2837 CBY_2838     FALSE 0.385 91.000 0.000 NA   NA
 5973513 5973514 CBY_2838 CBY_2839     TRUE 0.837 0.000 0.000 NA   NA
 5973514 5973515 CBY_2839 CBY_2840     FALSE 0.064 249.000 0.000 NA   NA
 5973515 5973516 CBY_2840 CBY_2841     TRUE 0.842 4.000 0.000 NA   NA
 5973516 5973517 CBY_2841 CBY_2842     FALSE 0.170 192.000 0.000 NA   NA
 5973517 5973518 CBY_2842 CBY_2843     FALSE 0.306 117.000 0.000 NA   NA
 5973518 5973519 CBY_2843 CBY_2844     TRUE 0.808 20.000 0.000 NA   NA
 5973519 5973520 CBY_2844 CBY_2845     FALSE 0.272 133.000 0.000 NA   NA
 5973520 5973521 CBY_2845 CBY_2846     FALSE 0.265 142.000 0.000 NA   NA
 5973521 5973522 CBY_2846 CBY_2847     TRUE 0.837 0.000 0.000 NA   NA
 5973522 5973523 CBY_2847 CBY_2848     TRUE 0.841 2.000 0.000 NA   NA
 5973523 5973524 CBY_2848 CBY_2849     TRUE 0.754 30.000 0.000 NA   NA
 5973524 4730057 CBY_2849 CBY_2850     TRUE 0.819 -10.000 0.000 NA   NA
 4730057 5973525 CBY_2850 CBY_2851     TRUE 0.842 3.000 0.000 NA   NA
 5973525 5973526 CBY_2851 CBY_2852     TRUE 0.808 20.000 0.000 NA   NA
 5973526 5973527 CBY_2852 CBY_2853     TRUE 0.812 19.000 0.000 NA   NA
 5973527 5973528 CBY_2853 CBY_2854     TRUE 0.522 61.000 0.000 NA   NA
 5973528 5973529 CBY_2854 CBY_2855     TRUE 0.817 18.000 0.000 NA   NA
 5973529 5973530 CBY_2855 CBY_2856     FALSE 0.327 109.000 0.000 NA   NA
 5973530 5973531 CBY_2856 CBY_2857     TRUE 0.829 15.000 0.000 NA   NA
 5973531 5973532 CBY_2857 CBY_2858   dnaB TRUE 0.825 16.000 0.000 NA   NA
 5973532 5973533 CBY_2858 CBY_2859 dnaB   TRUE 0.839 1.000 0.000 NA   NA
 5973533 5973534 CBY_2859 CBY_2860     TRUE 0.841 2.000 0.000 NA   NA
 5973534 5973535 CBY_2860 CBY_2861     TRUE 0.970 -15.000 0.154 1.000 N NA
 5973535 5973536 CBY_2861 CBY_2862     FALSE 0.430 79.000 0.000 NA   NA
 5973536 5973537 CBY_2862 CBY_2863     TRUE 0.829 15.000 0.000 NA   NA
 5973537 5973538 CBY_2863 CBY_2864     TRUE 0.530 60.000 0.000 NA   NA
 5973538 5973539 CBY_2864 CBY_2865     TRUE 0.964 37.000 0.400 NA   NA
 5973539 5973540 CBY_2865 CBY_2866     FALSE 0.216 168.000 0.000 0.027   NA
 5973541 5973542 CBY_2867 CBY_2868     FALSE 0.361 98.000 0.000 NA   NA
 5973542 5973543 CBY_2868 CBY_2869     FALSE 0.339 106.000 0.000 NA   NA
 5973543 5973544 CBY_2869 CBY_2871     FALSE 0.372 95.000 0.000 NA   NA
 5973545 5973546 CBY_2870 CBY_2872     FALSE 0.165 194.000 0.000 NA   NA
 5973546 5973547 CBY_2872 CBY_2873     TRUE 0.626 107.000 0.018 1.000 N NA
 5973547 5973548 CBY_2873 CBY_2874     TRUE 0.944 105.000 0.027 1.000 Y NA
 5973548 5973549 CBY_2874 CBY_2875     TRUE 0.987 -7.000 0.000 0.013 Y NA
 5973549 5973550 CBY_2875 CBY_2876     FALSE 0.008 625.000 0.000 NA   NA
 5973550 5973551 CBY_2876 CBY_2877     TRUE 0.812 19.000 0.000 NA   NA
 5973551 5973552 CBY_2877 CBY_2878     FALSE 0.023 336.000 0.000 NA   NA
 5973552 5973553 CBY_2878 CBY_2879     FALSE 0.274 132.000 0.000 NA   NA
 5973553 5973554 CBY_2879 CBY_2880   pabB TRUE 0.995 12.000 0.050 1.000 Y NA
 5973554 5973555 CBY_2880 CBY_2881 pabB pabA TRUE 0.997 -7.000 0.375 1.000 Y NA
 5973555 5973556 CBY_2881 CBY_2882 pabA   FALSE 0.029 307.000 0.000 1.000 N NA
 5973556 5973557 CBY_2882 CBY_2883     TRUE 0.921 50.000 0.179 NA   NA
 5973557 5973558 CBY_2883 CBY_2884     TRUE 0.971 34.000 0.556 NA   NA
 5973558 5973559 CBY_2884 CBY_2885     TRUE 0.983 -13.000 0.556 NA   NA
 5973559 5973560 CBY_2885 CBY_2886     TRUE 0.989 -6.000 1.000 NA   NA
 5973560 5973561 CBY_2886 CBY_4332     FALSE 0.056 257.000 0.000 NA   NA
 5973561 5973562 CBY_4332 CBY_2888     FALSE 0.302 118.000 0.000 NA   NA
 5973562 5973563 CBY_2888 CBY_2889   coaE TRUE 0.959 15.000 0.058 NA   NA
 5973563 5973564 CBY_2889 CBY_2890 coaE   TRUE 0.655 138.000 0.068 1.000 N NA
 5973566 5973567 CBY_2892 CBY_4333     FALSE 0.048 269.000 0.000 NA   NA
 5973567 5973568 CBY_4333 CBY_2894     FALSE 0.088 228.000 0.000 NA   NA
 5973568 5973569 CBY_2894 CBY_2895     FALSE 0.480 153.000 0.008 NA   NA
 5973569 5973570 CBY_2895 CBY_2896     FALSE 0.092 299.000 0.016 NA   NA
 5973570 5973571 CBY_2896 CBY_2897     TRUE 0.832 -3.000 0.000 NA   NA
 5973571 5973572 CBY_2897 CBY_2898     TRUE 0.841 9.000 0.000 NA   NA
 5973575 5973576 CBY_2105 CBY_2106     FALSE 0.044 274.000 0.000 NA   NA
 5973577 5973578 CBY_4283 CBY_4284 rrf rrs FALSE 0.296 121.000 0.000 NA   NA
 5973579 5973580 CBY_0832 CBY_0833     FALSE 0.146 201.000 0.000 NA   NA
 5973582 5973583 CBY_0835 CBY_0836     FALSE 0.075 239.000 0.000 NA   NA
 5973584 5973585 CBY_0837 CBY_0838     TRUE 0.989 61.000 0.380 NA Y NA
 5973585 5973586 CBY_0838 CBY_0839     TRUE 0.931 187.000 0.189 NA Y NA
 5973586 5973587 CBY_0839 CBY_0840     TRUE 0.937 40.000 0.148 NA N NA
 5973587 5973588 CBY_0840 CBY_0841   nanA TRUE 0.899 192.000 0.074 1.000 Y NA
 5973588 5973589 CBY_0841 CBY_0842 nanA   TRUE 0.845 60.000 0.058 1.000 N NA
 5973590 5973591 CBY_0843 CBY_0844     FALSE 0.013 426.000 0.000 1.000 N NA
 5973591 5973592 CBY_0844 CBY_0845     FALSE 0.008 635.000 0.000 1.000 N NA
 5973592 5973593 CBY_0845 CBY_0846     FALSE 0.157 468.000 0.000 0.002 Y NA
 5973593 4730108 CBY_0846 CBY_0847     FALSE 0.122 210.000 0.000 1.000   NA
 4730108 5973594 CBY_0847 CBY_0848     FALSE 0.007 683.000 0.000 0.092   NA
 5973596 5973597 CBY_0850 CBY_0851     FALSE 0.016 385.000 0.000 NA   NA
 5973597 5973598 CBY_0851 CBY_0852   amt TRUE 0.842 61.000 0.061 NA   NA
 5973598 5973599 CBY_0852 CBY_0853 amt   TRUE 0.634 45.000 0.000 1.000 N NA
 5973601 5973602 CBY_0855 CBY_0856     TRUE 0.988 0.000 0.793 0.092 N NA
 5973604 5973605 CBY_0858 CBY_0859     TRUE 0.989 2.000 0.889 NA   NA
 5973605 5973606 CBY_0859 CBY_0860     FALSE 0.421 81.000 0.000 NA   NA
 5973606 5973607 CBY_0860 CBY_0861     FALSE 0.032 298.000 0.000 0.032 N NA
 5973607 5973608 CBY_0861 CBY_0862     FALSE 0.016 387.000 0.000 1.000 N NA
 5973608 5973609 CBY_0862 CBY_0863     TRUE 0.817 172.000 0.000 0.011 Y NA
 5973609 5973610 CBY_0863 CBY_0864     TRUE 0.951 57.000 0.000 0.011 Y NA
 5973610 5973611 CBY_0864 CBY_0865     TRUE 0.919 85.000 0.000 NA Y NA
 5973611 5973612 CBY_0865 CBY_0866     TRUE 0.978 33.000 0.000 NA Y NA
 5973612 5973613 CBY_0866 CBY_0867     FALSE 0.012 451.000 0.000 1.000 N NA
 5973615 5973616 CBY_0870 CBY_0871     TRUE 0.870 122.000 0.000 0.012 Y NA
 5973617 5973618 CBY_0872 CBY_0873     TRUE 0.971 131.000 0.500 0.075 Y NA
 5973619 5973620 CBY_0874 CBY_0875     TRUE 0.910 91.000 0.000 0.011 Y NA
 5973620 5973621 CBY_0875 CBY_0876     FALSE 0.446 270.000 0.000 0.011 Y NA
 5973621 5973622 CBY_0876 CBY_0877     FALSE 0.195 404.000 0.000 NA Y NA
 5973622 5973623 CBY_0877 CBY_0878     TRUE 0.856 143.000 0.000 NA Y NA
 5973623 5973624 CBY_0878 CBY_0879     TRUE 0.998 24.000 0.800 0.033 Y NA
 5973624 5973625 CBY_0879 CBY_0880     FALSE 0.237 161.000 0.000 NA   NA
 5973625 5973626 CBY_0880 CBY_0881     FALSE 0.237 161.000 0.000 NA   NA
 5973626 5973627 CBY_0881 CBY_0882     TRUE 0.979 -7.000 0.273 NA   NA
 5973629 5973630 CBY_0884 CBY_0885     TRUE 0.804 -34.000 0.000 NA   NA
 5973630 5973631 CBY_0885 CBY_0886     TRUE 0.989 -3.000 0.875 1.000 N NA
 5973631 5973632 CBY_0886 CBY_0887   phnW TRUE 0.876 48.000 0.049 1.000 N NA
 5973632 5973633 CBY_0887 CBY_0888 phnW phnX TRUE 0.982 3.000 0.315 1.000   NA
 5973633 5973634 CBY_0888 CBY_0889 phnX   TRUE 0.924 -25.000 0.012 1.000   NA
 5973636 5973637 CBY_0891 CBY_0892     FALSE 0.017 378.000 0.000 1.000 N NA
 5973638 5973639 CBY_0893 CBY_0894     TRUE 0.974 -10.000 0.200 NA   NA
 5973640 5973641 CBY_0895 CBY_0896     FALSE 0.165 195.000 0.000 1.000 N NA
 5973641 5973642 CBY_0896 CBY_0897     FALSE 0.220 377.000 0.000 NA Y NA
 5973642 5973643 CBY_0897 CBY_0898     TRUE 0.743 199.000 0.000 NA Y NA
 5973643 5973644 CBY_0898 CBY_0899     FALSE 0.048 269.000 0.000 NA   NA
 5973644 5973645 CBY_0899 CBY_0900     TRUE 0.823 64.000 0.056 NA   NA
 5973645 5973646 CBY_0900 CBY_0901     TRUE 0.842 3.000 0.000 NA   NA
 5973647 5973648 CBY_0902 CBY_0903     FALSE 0.318 112.000 0.000 NA   NA
 5973648 5973649 CBY_0903 CBY_0904     TRUE 0.987 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 5973649 5973650 CBY_0904 CBY_0905     FALSE 0.012 466.000 0.000 1.000 N NA
 5973651 5973652 CBY_0906 CBY_0907     FALSE 0.045 274.000 0.000 1.000 N NA
 5973652 5973653 CBY_0907 CBY_0908   pglB TRUE 0.994 15.000 0.033 NA Y NA
 5973653 5973654 CBY_0908 CBY_0909 pglB   FALSE 0.034 292.000 0.000 NA   NA
 5973656 5973657 CBY_0053 CBY_0054   dxs TRUE 0.835 13.000 0.000 NA   NA
 5973657 5973658 CBY_0054 CBY_0055 dxs   TRUE 0.994 17.000 0.048 1.000 Y NA
 5973658 5973659 CBY_0055 CBY_0056   xseB TRUE 0.954 -10.000 0.053 1.000   NA
 5973659 5973660 CBY_0056 CBY_0057 xseB xseA TRUE 0.983 12.000 0.412 0.001   NA
 5973660 5973661 CBY_0057 CBY_0058 xseA   TRUE 0.951 -10.000 0.045 1.000 N NA
 5973661 5973662 CBY_0058 CBY_0059     TRUE 0.842 5.000 0.000 NA   NA
 5973662 5973663 CBY_0059 CBY_0060   nusB FALSE 0.026 319.000 0.000 NA   NA
 5973663 5973664 CBY_0060 CBY_0061 nusB   TRUE 0.784 123.000 0.223 NA   NA
 5973664 5973665 CBY_0061 CBY_0062     TRUE 0.773 102.000 0.108 NA   NA
 5973665 5973666 CBY_0062 CBY_0063   spoIIIAG TRUE 0.958 41.000 0.407 NA   NA
 5973666 5973667 CBY_0063 CBY_0064 spoIIIAG   TRUE 0.989 14.000 0.907 NA   NA
 5973667 5973668 CBY_0064 CBY_0065   spoIIIAE TRUE 0.989 6.000 0.918 NA   NA
 5973668 5973669 CBY_0065 CBY_0066 spoIIIAE spoIIIAD TRUE 0.911 94.000 0.864 NA   NA
 5973669 5973670 CBY_0066 CBY_0067 spoIIIAD spoIIIAC TRUE 0.989 12.000 0.895 NA   NA
 5973670 5973671 CBY_0067 CBY_0068 spoIIIAC spoIIIAB TRUE 0.822 176.000 0.926 NA   NA
 5973671 5973672 CBY_0068 CBY_0069 spoIIIAB spoIIIAA TRUE 0.984 -12.000 0.604 NA   NA
 5973672 5973673 CBY_0069 CBY_0070 spoIIIAA   TRUE 0.616 180.000 0.112 NA   NA
 5973673 4730127 CBY_0070 CBY_0071   efp TRUE 0.518 174.000 0.037 NA   NA
 4730127 4730128 CBY_0071 CBY_0072 efp   FALSE 0.396 173.000 0.002 NA   NA
 4730128 5973674 CBY_0072 CBY_0073     TRUE 0.819 -10.000 0.000 NA   NA
 5973674 5973675 CBY_0073 CBY_0074     TRUE 0.814 -13.000 0.000 NA   NA
 5973675 4730130 CBY_0074 CBY_0075     TRUE 0.522 61.000 0.000 NA   NA
 4730130 5973676 CBY_0075 CBY_0076     TRUE 0.988 -12.000 1.000 NA   NA
 5973676 5973677 CBY_0076 CBY_0077     TRUE 0.988 -10.000 1.000 NA   NA
 5973677 5973678 CBY_0077 CBY_0078     TRUE 0.727 33.000 0.000 NA   NA
 5973678 5973679 CBY_0078 CBY_0079     TRUE 0.841 2.000 0.000 NA   NA
 5973679 5973680 CBY_0079 CBY_0080     TRUE 0.996 -7.000 0.135 1.000 Y NA
 5973680 5973681 CBY_0080 CBY_0081     FALSE 0.118 212.000 0.000 NA   NA
 5973681 5973682 CBY_0081 CBY_0082   dapF TRUE 0.731 61.000 0.003 NA   NA
 5973684 5973685 CBY_0084 CBY_0085     FALSE 0.147 202.000 0.000 1.000 N NA
 5973685 5973686 CBY_0085 CBY_0086     TRUE 0.930 15.000 0.008 1.000 N NA
 5973686 5973687 CBY_0086 CBY_0087   rluD TRUE 0.938 27.000 0.048 1.000 N NA
 5973687 5973688 CBY_0087 CBY_0088 rluD   FALSE 0.285 203.000 0.002 1.000 N NA
 5973688 5973689 CBY_0088 CBY_0089     TRUE 0.984 17.000 0.579 1.000   NA
 5973689 5973690 CBY_0089 CBY_0090     FALSE 0.123 271.000 0.010 NA   NA
 5973690 5973691 CBY_0090 CBY_0091     TRUE 0.952 12.000 0.032 NA   NA
 5973691 5973692 CBY_0091 CBY_0092     TRUE 0.664 92.000 0.017 NA   NA
 5973692 5973693 CBY_0092 CBY_0093     TRUE 0.964 13.000 0.070 NA   NA
 5973693 5973694 CBY_0093 CBY_0094     TRUE 0.964 12.000 0.070 NA   NA
 5973694 5973695 CBY_0094 CBY_0095     TRUE 0.930 -13.000 0.014 NA   NA
 5973695 5973696 CBY_0095 CBY_0096   ftsW FALSE 0.340 203.000 0.015 NA N NA
 5973696 5973697 CBY_0096 CBY_0097 ftsW mraY TRUE 0.916 25.000 0.014 0.003 N NA
 5973697 5973698 CBY_0097 CBY_0098 mraY   TRUE 0.984 40.000 0.024 0.003 Y NA
 5973698 5973699 CBY_0098 CBY_0099     TRUE 0.988 59.000 0.328 0.002 Y NA
 5973699 5973700 CBY_0099 CBY_0100     TRUE 0.739 282.000 0.265 1.000 Y NA
 5973700 5973701 CBY_0100 CBY_0101     FALSE 0.423 274.000 0.000 0.002 Y NA
 5973701 5973702 CBY_0101 CBY_0102     FALSE 0.425 80.000 0.000 NA   NA
 5973702 5973703 CBY_0102 CBY_0103   mraW TRUE 0.866 40.000 0.017 NA   NA
 5973703 5973704 CBY_0103 CBY_0104 mraW mraZ TRUE 0.987 13.000 0.635 NA   NA
 5973704 5973705 CBY_0104 CBY_0105 mraZ   FALSE 0.140 203.000 0.000 NA   NA
 5973705 5973706 CBY_0105 CBY_0106     FALSE 0.088 228.000 0.000 NA   NA
 5973706 5973707 CBY_0106 CBY_0107     TRUE 0.687 38.000 0.000 NA   NA
 5973707 5973708 CBY_0107 CBY_0108     TRUE 0.981 29.000 0.750 NA   NA
 5973708 5973709 CBY_0108 CBY_0109     TRUE 0.819 -10.000 0.000 NA   NA
 5973709 5973710 CBY_0109 CBY_0110   gidA FALSE 0.131 207.000 0.000 NA   NA
 5973710 5973711 CBY_0110 CBY_0111 gidA   FALSE 0.042 276.000 0.000 NA   NA
 5973711 5973712 CBY_0111 CBY_0112     FALSE 0.264 144.000 0.000 NA   NA
 5973712 5973713 CBY_0112 CBY_0113     TRUE 0.542 58.000 0.000 NA   NA
 5973713 5973714 CBY_0113 CBY_0114     FALSE 0.230 165.000 0.000 NA   NA
 5973714 5973715 CBY_0114 CBY_0115     FALSE 0.380 92.000 0.000 NA   NA
 5973715 5973716 CBY_0115 CBY_0116     FALSE 0.411 84.000 0.000 NA   NA
 5973716 5973717 CBY_0116 CBY_0117     TRUE 0.807 21.000 0.000 1.000 N NA
 5973720 5973721 CBY_1491 CBY_1492     FALSE 0.134 206.000 0.000 NA   NA
 5973721 5973722 CBY_1492 CBY_1493     TRUE 0.752 30.000 0.000 1.000   NA
 5973722 5973723 CBY_1493 CBY_1494     TRUE 0.825 16.000 0.000 NA   NA
 5973723 4730146 CBY_1494 CBY_1495     TRUE 0.786 26.000 0.000 NA N NA
 4730146 5973724 CBY_1495 CBY_1496     FALSE 0.033 293.000 0.000 NA   NA
 5973724 5973725 CBY_1496 CBY_1497     TRUE 0.893 70.000 0.250 NA   NA
 5973725 5973726 CBY_1497 CBY_1498     TRUE 0.997 21.000 0.375 1.000 Y NA
 5973726 5973727 CBY_1498 CBY_1499     TRUE 0.973 81.000 0.111 1.000 Y NA
 5973727 5973728 CBY_1499 CBY_1500     TRUE 0.982 28.000 0.000 0.010 Y NA
 5973728 5973729 CBY_1500 CBY_1501     TRUE 0.596 50.000 0.000 1.000   NA
 5973729 5973730 CBY_1501 CBY_1502     FALSE 0.015 401.000 0.000 NA   NA
 5973732 5973733 CBY_1504 CBY_1505     FALSE 0.359 98.000 0.000 1.000   NA
 5973733 5973734 CBY_1505 CBY_1506     FALSE 0.131 208.000 0.000 1.000 N NA
 5973734 5973735 CBY_1506 CBY_1507     FALSE 0.084 233.000 0.000 1.000 N NA
 5973735 5973736 CBY_1507 CBY_1508     FALSE 0.171 191.000 0.000 1.000   NA
 5973736 5973737 CBY_1508 CBY_1509     FALSE 0.252 153.000 0.000 1.000   NA
 5973737 5973738 CBY_1509 CBY_1510     FALSE 0.275 131.000 0.000 NA   NA
 5973738 5973739 CBY_1510 CBY_1511     FALSE 0.115 214.000 0.000 NA   NA
 5973739 5973740 CBY_1511 CBY_1512     FALSE 0.029 308.000 0.000 NA   NA
 5973740 5973741 CBY_1512 CBY_1513     FALSE 0.444 76.000 0.000 NA   NA
 5973741 5973742 CBY_1513 CBY_1514   prmA FALSE 0.035 290.000 0.000 NA   NA
 5973742 5973743 CBY_1514 CBY_1515 prmA   FALSE 0.370 97.000 0.000 1.000 N NA
 5973743 5973744 CBY_1515 CBY_1516     TRUE 0.566 55.000 0.000 1.000 N NA
 5973744 5973745 CBY_1516 CBY_1517     FALSE 0.265 143.000 0.000 NA   NA
 5973745 5973746 CBY_1517 CBY_1518     TRUE 0.514 62.000 0.000 NA   NA
 5973746 5973747 CBY_1518 CBY_1519     FALSE 0.407 280.000 0.000 1.000 Y NA
 5973748 5973749 CBY_1520 CBY_1521     FALSE 0.023 333.000 0.000 NA   NA
 5973750 5973751 CBY_1522 CBY_1523     FALSE 0.016 386.000 0.000 NA   NA
 5973751 5973752 CBY_1523 CBY_1524     FALSE 0.288 123.000 0.000 0.031 N NA
 5973752 5973753 CBY_1524 CBY_1525     FALSE 0.102 220.000 0.000 1.000   NA
 5973755 5973756 CBY_1527 CBY_1528     TRUE 0.838 13.000 0.000 1.000 N NA
 5973756 5973757 CBY_1528 CBY_1529     FALSE 0.136 205.000 0.000 NA   NA
 5973757 5973758 CBY_1529 CBY_1530     FALSE 0.259 150.000 0.000 NA   NA
 5973758 5973759 CBY_1530 CBY_1531     FALSE 0.188 184.000 0.000 1.000   NA
 5973759 5973760 CBY_1531 CBY_1532     FALSE 0.254 152.000 0.000 1.000   NA
 5973762 5973763 CBY_1534 CBY_1535     TRUE 0.488 66.000 0.000 NA   NA
 5973763 5973764 CBY_1535 CBY_1536     FALSE 0.020 352.000 0.000 NA   NA
 5973764 5973765 CBY_1536 CBY_1537     FALSE 0.070 243.000 0.000 NA   NA
 5973765 5973766 CBY_1537 CBY_1538     FALSE 0.219 171.000 0.000 NA   NA
 5973766 5973767 CBY_1538 CBY_1539     FALSE 0.042 275.000 0.000 NA   NA
 5973769 5973770 CBY_1541 CBY_1542     FALSE 0.263 145.000 0.000 NA   NA
 5973772 5973773 CBY_1544 CBY_1545     FALSE 0.098 222.000 0.000 NA   NA
 5973774 5973775 CBY_4104 CBY_4105     FALSE 0.098 222.000 0.000 NA   NA
 5973776 5973777 CBY_4106 CBY_4107     TRUE 0.991 70.000 1.000 0.032 Y NA
 5973777 5973778 CBY_4107 CBY_4108     TRUE 0.998 19.000 0.800 0.032 Y NA
 5973778 5973779 CBY_4108 CBY_4109     FALSE 0.028 308.000 0.000 0.090 N NA
 5973780 5973781 CBY_4110 CBY_4111     TRUE 0.988 3.000 0.748 NA   NA
 5973781 5973782 CBY_4111 CBY_4112     FALSE 0.233 163.000 0.000 NA   NA
 5973783 5973784 CBY_4113 CBY_4114     FALSE 0.036 288.000 0.000 NA   NA
 5973784 5973785 CBY_4114 CBY_4115     FALSE 0.103 220.000 0.000 NA   NA
 5973785 5973786 CBY_4115 CBY_4116     TRUE 0.974 17.000 0.188 NA   NA
 5973786 5973787 CBY_4116 CBY_4117   speD FALSE 0.009 552.000 0.000 NA   NA
 5973787 5973788 CBY_4117 CBY_4118 speD   TRUE 0.996 13.000 0.091 1.000 Y NA
 5973788 5973789 CBY_4118 CBY_4119   speE TRUE 0.979 83.000 0.237 1.000 Y NA
 5973789 5973790 CBY_4119 CBY_4120 speE lys1 TRUE 0.976 59.000 0.036 1.000 Y NA
 5973790 5973791 CBY_4120 CBY_4121 lys1 nspC TRUE 0.973 120.000 0.444 1.000 Y NA
 5973791 5973792 CBY_4121 CBY_4122 nspC speB TRUE 0.982 48.000 0.035 1.000 Y NA
 5973792 5973793 CBY_4122 CBY_4123 speB   FALSE 0.262 143.000 0.000 1.000   NA
 5973793 5973794 CBY_4123 CBY_4124     TRUE 0.781 24.000 0.000 0.030   NA
 5973794 5973795 CBY_4124 CBY_4125     FALSE 0.268 145.000 0.000 1.000 N NA
 5973795 5973796 CBY_4125 CBY_4126     FALSE 0.068 246.000 0.000 1.000 N NA
 5973796 5973797 CBY_4126 CBY_4127     TRUE 0.963 166.000 0.463 0.032 Y NA
 5973797 5973798 CBY_4127 CBY_4128     TRUE 0.998 -7.000 0.926 0.032 Y NA
 5973798 5973799 CBY_4128 CBY_4129     TRUE 0.926 169.000 0.074 1.000 Y NA
 5973799 5973800 CBY_4129 CBY_4130     FALSE 0.265 148.000 0.000 1.000 N NA
 5973801 5973802 CBY_4131 CBY_4132     TRUE 0.994 32.000 0.222 0.020 Y NA
 5973803 5973804 CBY_4133 CBY_4134     TRUE 0.962 48.000 0.000 0.005 Y NA
 5973805 5973806 CBY_4135 CBY_4136     FALSE 0.367 96.000 0.000 NA   NA
 5973807 5973808 CBY_4137 CBY_4138     FALSE 0.235 162.000 0.000 NA   NA
 5973810 5973811 CBY_0176 CBY_0177     FALSE 0.260 149.000 0.000 NA   NA
 5973812 5973813 CBY_1751 CBY_1752     FALSE 0.243 158.000 0.000 NA   NA
 5973813 5973814 CBY_1752 CBY_1753     FALSE 0.172 191.000 0.000 NA   NA
 5973814 5973815 CBY_1753 CBY_1754     FALSE 0.009 572.000 0.000 NA   NA
 5973817 5973818 CBY_1756 CBY_1757     FALSE 0.013 430.000 0.000 NA   NA
 5973818 5973819 CBY_1757 CBY_1758     FALSE 0.408 85.000 0.000 NA   NA
 5973819 5973820 CBY_1758 CBY_1759     FALSE 0.015 396.000 0.000 NA   NA
 5973822 5973823 CBY_1761 CBY_1762     FALSE 0.014 411.000 0.000 1.000   NA
 5973823 5973824 CBY_1762 CBY_1763     FALSE 0.359 294.000 0.000 NA Y NA
 5973824 5973825 CBY_1763 CBY_1764     FALSE 0.027 320.000 0.000 NA N NA
 5973827 5973828 CBY_1765 CBY_1767     TRUE 0.825 -7.000 0.000 NA   NA
 5973828 5973829 CBY_1767 CBY_1768     FALSE 0.341 105.000 0.000 NA   NA
 5973829 5973830 CBY_1768 CBY_1769     TRUE 0.657 41.000 0.000 NA   NA
 5973830 5973831 CBY_1769 CBY_1770     FALSE 0.008 667.000 0.000 NA   NA
 5973831 5973832 CBY_1770 CBY_1771     FALSE 0.014 412.000 0.000 1.000 N NA
 5973832 5973833 CBY_1771 CBY_1772     FALSE 0.012 453.000 0.000 NA N NA
 5973833 5973834 CBY_1772 CBY_1773     FALSE 0.018 373.000 0.000 NA N NA
 5973834 5973835 CBY_1773 CBY_1774   folP TRUE 0.973 58.000 0.019 0.003 Y NA
 5973835 5973836 CBY_1774 CBY_1775 folP   TRUE 0.870 107.000 0.533 1.000   NA
 5973836 5973837 CBY_1775 CBY_1776   dapA FALSE 0.021 350.000 0.000 1.000   NA
 5973839 5973840 CBY_1778 CBY_1779     FALSE 0.016 390.000 0.000 1.000 N NA
 5973840 5973841 CBY_1779 CBY_1780     TRUE 0.998 -13.000 0.640 1.000 Y NA
 5973841 5973842 CBY_1780 CBY_1781     TRUE 0.625 282.000 0.066 0.032 Y NA
 5973842 5973843 CBY_1781 CBY_1782     FALSE 0.009 548.000 0.000 1.000   NA
 5973843 5973844 CBY_1782 CBY_1783     TRUE 0.847 124.000 0.583 0.012   NA
 5973844 5973845 CBY_1783 CBY_1784     TRUE 0.963 28.000 0.182 NA   NA
 5973845 5973846 CBY_1784 CBY_1785   lepB TRUE 0.674 176.000 0.182 NA   NA
 5973846 5973847 CBY_1785 CBY_1786 lepB lepB TRUE 0.886 109.000 0.000 0.001 Y NA
 5973847 5973848 CBY_1786 CBY_1787 lepB lepB TRUE 0.816 172.000 0.000 0.001 Y NA
 5973848 5973849 CBY_1787 CBY_1788 lepB lysA FALSE 0.011 478.000 0.000 1.000 N NA
 5973849 5973850 CBY_1788 CBY_1789 lysA   FALSE 0.008 668.000 0.000 1.000   NA
 5973850 5973851 CBY_1789 CBY_1790     FALSE 0.015 401.000 0.000 NA   NA
 5973852 5973853 CBY_1791 CBY_1792     TRUE 0.825 -7.000 0.000 NA   NA
 5973854 5973855 CBY_1793 CBY_1794     FALSE 0.232 164.000 0.000 NA   NA
 5973857 5973858 CBY_1796 CBY_1797     TRUE 0.984 53.000 0.088 0.001 Y NA
 5973858 5973859 CBY_1797 CBY_1798     TRUE 0.928 55.000 0.287 NA   NA
 5973859 5973860 CBY_1798 CBY_1799     FALSE 0.042 276.000 0.000 NA   NA
 5973860 5973861 CBY_1799 CBY_1800     FALSE 0.156 478.000 0.000 1.000 Y NA
 5973861 5973862 CBY_1800 CBY_1801     TRUE 0.547 57.000 0.000 NA   NA
 5973862 5973863 CBY_1801 CBY_1802     TRUE 0.832 -3.000 0.000 NA   NA
 5973863 5973864 CBY_1802 CBY_1803     FALSE 0.408 85.000 0.000 NA   NA
 5973864 5973865 CBY_1803 CBY_1804     FALSE 0.389 90.000 0.000 NA   NA
 5973865 5973866 CBY_1804 CBY_1805     FALSE 0.047 271.000 0.000 NA   NA
 5973866 5973867 CBY_1805 CBY_1806     TRUE 0.530 60.000 0.000 NA   NA
 5973867 5973868 CBY_1806 CBY_1807     FALSE 0.028 316.000 0.000 NA N NA
 5973868 5973869 CBY_1807 CBY_1808     TRUE 0.956 29.000 0.125 NA   NA
 5973869 5973870 CBY_1808 CBY_1809     TRUE 0.817 51.000 0.015 NA   NA
 5973870 5973871 CBY_1809 CBY_1810     TRUE 0.824 72.000 0.077 NA   NA
 5973871 5973872 CBY_1810 CBY_1811     TRUE 0.733 110.000 0.083 NA   NA
 5973872 5973873 CBY_1811 CBY_1812     TRUE 0.986 3.000 0.576 0.008 N NA
 5973873 5973874 CBY_1812 CBY_1813     FALSE 0.191 183.000 0.000 1.000   NA
 5973874 5973875 CBY_1813 CBY_1814     TRUE 0.702 75.000 0.011 NA   NA
 5973875 5973876 CBY_1814 CBY_1815     FALSE 0.372 95.000 0.000 NA   NA
 5973876 5973877 CBY_1815 CBY_1816     TRUE 0.981 32.000 1.000 1.000   NA
 5973877 5973878 CBY_1816 CBY_1817     FALSE 0.282 301.000 0.444 1.000   NA
 5973878 5973879 CBY_1817 CBY_1818     TRUE 0.901 210.000 0.233 0.003 Y NA
 5973879 5973880 CBY_1818 CBY_1819     TRUE 0.967 -7.000 0.100 NA   NA
 5973880 5973881 CBY_1819 CBY_1820     FALSE 0.178 189.000 0.000 NA   NA
 5973881 5973882 CBY_1820 CBY_1821     TRUE 0.998 -7.000 0.816 1.000 Y NA
 5973882 5973883 CBY_1821 CBY_1822     FALSE 0.241 159.000 0.000 NA   NA
 5973883 5973884 CBY_1822 CBY_1823     FALSE 0.051 265.000 0.000 NA   NA
 5973884 5973885 CBY_1823 CBY_1824   rumA FALSE 0.031 304.000 0.000 NA N NA
 5973885 5973886 CBY_1824 CBY_1825 rumA pyk FALSE 0.009 551.000 0.000 1.000 N NA
 5973886 5973887 CBY_1825 CBY_1826 pyk pfkA TRUE 0.788 212.000 0.011 0.004 Y NA
 5973887 5973888 CBY_1826 CBY_1827 pfkA   FALSE 0.035 532.000 0.029 1.000   NA
 5973888 5973889 CBY_1827 CBY_1828     FALSE 0.321 110.000 0.000 1.000   NA
 5973889 5973890 CBY_1828 CBY_1829     FALSE 0.009 541.000 0.000 1.000   NA
 5973890 5973891 CBY_1829 CBY_1830     FALSE 0.064 249.000 0.000 NA   NA
 5973891 5973892 CBY_1830 CBY_1831     TRUE 0.811 -16.000 0.000 NA   NA
 5973894 5973895 CBY_1833 CBY_1834     FALSE 0.441 170.000 0.009 NA   NA
 5973895 5973896 CBY_1834 CBY_1835     TRUE 0.980 23.000 0.470 NA   NA
 5973896 5973897 CBY_1835 CBY_1836     TRUE 0.979 -3.000 0.259 NA   NA
 5973897 5973898 CBY_1836 CBY_1837   murB FALSE 0.134 315.000 0.080 NA   NA
 5973898 5973899 CBY_1837 CBY_1838 murB uvrC FALSE 0.239 216.000 0.003 1.000 N NA
 5973899 5973900 CBY_1838 CBY_1839 uvrC   FALSE 0.315 199.000 0.005 1.000 N NA
 5973900 5973901 CBY_1839 CBY_1840     TRUE 0.981 2.000 0.285 1.000 N NA
 5973901 5973902 CBY_1840 CBY_1841     FALSE 0.468 202.000 0.070 NA   NA
 5973902 5973903 CBY_1841 CBY_1842   uvrA TRUE 0.562 103.000 0.002 NA   NA
 5973903 5973904 CBY_1842 CBY_1843 uvrA uvrB TRUE 0.942 166.000 0.154 0.001 Y NA
 5973904 5973905 CBY_1843 CBY_1844 uvrB   FALSE 0.276 215.000 0.013 NA   NA
 5973905 5973906 CBY_1844 CBY_1845     TRUE 0.952 21.000 0.060 NA   NA
 5973906 5973907 CBY_1845 CBY_1846     TRUE 0.528 144.000 0.015 1.000 N NA
 5973907 5973908 CBY_1846 CBY_1847   ftsE TRUE 0.997 -10.000 0.431 1.000 Y NA
 5973908 5973909 CBY_1847 CBY_1848 ftsE   FALSE 0.284 210.000 0.010 NA   NA
 5973909 5973910 CBY_1848 CBY_1849     FALSE 0.125 365.000 0.167 NA   NA
 5973910 5973911 CBY_1849 CBY_1850     TRUE 0.997 0.000 0.180 0.002 Y NA
 5973911 5973912 CBY_1850 CBY_1851     FALSE 0.432 187.000 0.019 1.000 N NA
 5973912 5973913 CBY_1851 CBY_1852     TRUE 0.946 10.000 0.019 NA   NA
 5973913 5973914 CBY_1852 CBY_1853     FALSE 0.035 290.000 0.000 NA   NA
 5973914 5973915 CBY_1853 CBY_1854     TRUE 0.836 63.000 0.064 NA   NA
 5973915 5973916 CBY_1854 CBY_1855   acpS TRUE 0.945 -3.000 0.020 NA N NA
 5973916 5973917 CBY_1855 CBY_1856 acpS   TRUE 0.750 70.000 0.020 NA   NA
 5973917 5973918 CBY_1856 CBY_1857     FALSE 0.010 536.000 0.000 NA   NA
 5973918 5973919 CBY_1857 CBY_1858     TRUE 0.581 196.000 0.150 1.000   NA
 5973919 5973920 CBY_1858 CBY_1859     FALSE 0.136 205.000 0.000 NA   NA
 5973920 5973921 CBY_1859 CBY_1860     TRUE 0.648 42.000 0.000 NA   NA
 5973921 5973922 CBY_1860 CBY_1861     TRUE 0.819 -10.000 0.000 NA   NA
 5973922 5973923 CBY_1861 CBY_1862     TRUE 0.713 207.000 0.000 NA Y NA
 5973923 5973924 CBY_1862 CBY_1863     FALSE 0.446 75.000 0.000 1.000   NA
 5973924 5973925 CBY_1863 CBY_1864     TRUE 0.745 66.000 0.015 1.000   NA
 5973925 5973926 CBY_1864 CBY_1865     FALSE 0.265 149.000 0.000 1.000 N NA
 5973926 5973927 CBY_1865 CBY_1866     TRUE 0.564 124.000 0.016 NA   NA
 5973929 5973930 CBY_0283 CBY_0284     TRUE 0.832 14.000 0.000 NA   NA
 5973930 5973931 CBY_0284 CBY_0285     TRUE 0.945 17.000 0.031 1.000   NA
 5973933 5973934 CBY_0287 CBY_0288   gshAB FALSE 0.070 244.000 0.000 1.000 N NA
 5973934 5973935 CBY_0288 CBY_0289 gshAB   FALSE 0.281 128.000 0.000 NA   NA
 5973936 5973937 CBY_2456 CBY_2457 cutC   FALSE 0.051 265.000 0.000 NA   NA
 5973937 5973938 CBY_2457 CBY_2458     TRUE 0.925 29.000 0.033 1.000   NA
 5973940 5973941 CBY_2460 CBY_2461     TRUE 0.931 -10.000 0.011 NA N NA
 5973941 5973942 CBY_2461 CBY_2462     FALSE 0.011 495.000 0.000 NA   NA
 5973942 5973943 CBY_2462 CBY_2463     TRUE 0.805 -27.000 0.000 NA   NA
 5973943 5973944 CBY_2463 CBY_2464     TRUE 0.639 43.000 0.000 NA   NA
 5973944 5973945 CBY_2464 CBY_2465     TRUE 0.988 0.000 0.000 0.031 Y NA
 5973945 5973946 CBY_2465 CBY_2466     TRUE 0.991 69.000 1.000 0.031 Y NA
 5973947 5973948 CBY_2467 CBY_2468     TRUE 0.817 -7.000 0.000 0.019   NA
 5973948 5973949 CBY_2468 CBY_2469     FALSE 0.277 129.000 0.000 1.000   NA
 5973950 5973951 CBY_2470 CBY_2471 gltA   TRUE 0.988 3.000 0.667 0.029 N NA
 5973951 5973952 CBY_2471 CBY_2472     TRUE 0.582 153.000 0.039 1.000 N NA
 5973952 5973953 CBY_2472 CBY_2473     FALSE 0.073 242.000 0.000 1.000 N NA
 5973953 5973954 CBY_2473 CBY_2474     FALSE 0.009 542.000 0.000 0.012 N NA
 5973954 5973955 CBY_2474 CBY_2475     FALSE 0.007 826.000 0.000 0.022   NA
 5973955 5973956 CBY_2475 CBY_2476     TRUE 0.631 42.000 0.000 0.001   NA
 5973956 5973957 CBY_2476 CBY_2477     TRUE 0.793 23.000 0.000 NA   NA
 5973957 5973958 CBY_2477 CBY_2478     FALSE 0.008 664.000 0.000 NA   NA
 5973958 5973959 CBY_2478 CBY_2479     TRUE 0.727 33.000 0.000 NA   NA
 5973959 5973960 CBY_2479 CBY_2480     FALSE 0.258 151.000 0.000 NA   NA
 5973960 5973961 CBY_2480 CBY_2481     FALSE 0.095 223.000 0.000 1.000   NA
 5973961 5973962 CBY_2481 CBY_2482     FALSE 0.108 217.000 0.000 NA   NA
 5973962 5973963 CBY_2482 CBY_2483     FALSE 0.016 383.000 0.000 NA   NA
 5973963 5973964 CBY_2483 CBY_2484     FALSE 0.010 530.000 0.000 NA   NA
 5973964 5973965 CBY_2484 CBY_2485     FALSE 0.007 1761.000 0.000 NA   NA
 5973965 5973966 CBY_2485 CBY_2486     FALSE 0.007 1261.000 0.000 NA   NA
 5973968 5973969 CBY_2488 CBY_2489     TRUE 0.621 46.000 0.000 NA   NA
 5973971 5973972 CBY_4322 CBY_2491     FALSE 0.258 151.000 0.000 NA   NA
 5973972 5973973 CBY_2491 CBY_2492     TRUE 0.963 90.000 0.067 0.071 Y NA
 5973973 5973974 CBY_2492 CBY_2493     TRUE 0.995 12.000 0.067 1.000 Y NA
 5973974 5973975 CBY_2493 CBY_2494     TRUE 0.725 78.000 0.022 1.000   NA
 5973975 5973976 CBY_2494 CBY_2495   gltA FALSE 0.099 221.000 0.000 1.000   NA
 5973976 5973977 CBY_2495 CBY_2496 gltA   TRUE 0.987 0.000 0.667 0.029 N NA
 5973977 5973978 CBY_2496 CBY_2497     FALSE 0.201 179.000 0.000 NA   NA
 5973978 5973979 CBY_2497 CBY_2498     FALSE 0.066 246.000 0.000 NA   NA
 5973981 5973982 CBY_2500 CBY_2501     FALSE 0.055 258.000 0.000 NA   NA
 5973982 5973983 CBY_2501 CBY_2502   aepY TRUE 0.939 42.000 0.200 1.000   NA
 5973983 5973984 CBY_2502 CBY_2503 aepY   TRUE 0.918 71.000 0.486 1.000   NA
 5973984 5973985 CBY_2503 CBY_2504     TRUE 0.905 43.000 0.077 0.003 N NA
 5973985 5973986 CBY_2504 CBY_2505     FALSE 0.053 262.000 0.000 NA   NA
 5973986 5973987 CBY_2505 CBY_2506     FALSE 0.025 326.000 0.000 NA   NA
 5973987 5973988 CBY_2506 CBY_2507     FALSE 0.265 142.000 0.000 NA   NA
 5973989 5973990 CBY_4367 CBY_3493 rrs   FALSE 0.008 719.000 0.000 NA   NA
 5973990 5973991 CBY_3493 CBY_3494     TRUE 0.841 9.000 0.000 NA   NA
 5973991 5973992 CBY_3494 CBY_3495     FALSE 0.233 163.000 0.000 NA   NA
 5973992 5973993 CBY_3495 CBY_3496     FALSE 0.088 229.000 0.000 1.000 N NA
 5973993 5973994 CBY_3496 CBY_3497     FALSE 0.040 283.000 0.000 1.000 N NA
 5973994 5973995 CBY_3497 CBY_3498   malQ TRUE 0.995 0.000 0.058 0.030 Y NA
 5973995 5973996 CBY_3498 CBY_3499 malQ   TRUE 0.948 32.000 0.111 1.000 N NA
 5973996 5973997 CBY_3499 CBY_3500     FALSE 0.016 387.000 0.000 NA   NA
 5973997 5973998 CBY_3500 CBY_3501     TRUE 0.909 50.000 0.122 NA   NA
 5973998 4730305 CBY_3501 CBY_3502     FALSE 0.023 331.000 0.000 NA   NA
 4730305 5973999 CBY_3502 CBY_4368     FALSE 0.036 288.000 0.000 NA   NA
 5973999 5974000 CBY_4368 CBY_3503     FALSE 0.389 90.000 0.000 NA   NA
 5974000 5974001 CBY_3503 CBY_3504     TRUE 0.728 63.000 0.005 NA   NA
 5974001 5974002 CBY_3504 CBY_3505     TRUE 0.980 13.000 0.283 NA   NA
 5974002 5974003 CBY_3505 CBY_3506     TRUE 0.817 109.000 0.239 1.000   NA
 5974003 5974004 CBY_3506 CBY_3507     TRUE 0.951 37.000 0.209 1.000 N NA
 5974004 5974005 CBY_3507 CBY_3508     FALSE 0.400 210.000 0.056 1.000 N NA
 5974007 5974008 CBY_3510 CBY_3511 ppdK   TRUE 0.621 108.000 0.019 1.000   NA
 5974008 5974009 CBY_3511 CBY_3512     TRUE 0.690 185.000 0.273 NA   NA
 5974009 5974010 CBY_3512 CBY_3513   recO TRUE 0.934 7.000 0.007 NA   NA
 5974010 5974011 CBY_3513 CBY_3514 recO era TRUE 0.971 4.000 0.108 1.000   NA
 5974011 5974012 CBY_3514 CBY_3515 era   FALSE 0.048 366.000 0.007 1.000   NA
 5974012 5974013 CBY_3515 CBY_3516     TRUE 0.678 80.000 0.010 NA   NA
 5974013 5974014 CBY_3516 CBY_3517     TRUE 0.975 -3.000 0.182 NA   NA
 5974014 5974015 CBY_3517 CBY_3518   yqfD TRUE 0.918 31.000 0.032 NA   NA
 5974015 5974016 CBY_3518 CBY_3519 yqfD yqfC TRUE 0.988 -3.000 0.851 NA   NA
 5974016 5974017 CBY_3519 CBY_3520 yqfC   FALSE 0.414 196.000 0.029 NA   NA
 5974017 5974018 CBY_3520 CBY_3521   rpsU TRUE 0.950 33.000 0.150 0.018   NA
 5974018 5974019 CBY_3521 CBY_3522 rpsU   TRUE 0.659 136.000 0.071 1.000   NA
 5974019 5974020 CBY_3522 CBY_3523     TRUE 0.579 162.000 0.051 0.030 N NA
 5974020 5974021 CBY_3523 CBY_3524     TRUE 0.976 5.000 0.163 NA   NA
 5974021 5974022 CBY_3524 CBY_3525   prmA TRUE 0.979 9.000 0.227 NA   NA
 5974022 5974023 CBY_3525 CBY_3526 prmA trmB FALSE 0.401 173.000 0.003 1.000   NA
 5974023 5974024 CBY_3526 CBY_3527 trmB   FALSE 0.017 373.000 0.000 1.000   NA
 5974024 5974025 CBY_3527 CBY_3528     TRUE 0.514 62.000 0.000 NA   NA
 5974027 5974028 CBY_3530 CBY_3531 dnaJ dnaK TRUE 0.953 153.000 0.196 0.002 Y NA
 5974028 5974029 CBY_3531 CBY_3532 dnaK grpE TRUE 0.974 96.000 0.224 0.005 Y NA
 5974029 5974030 CBY_3532 CBY_3533 grpE hrcA TRUE 0.956 38.000 0.286 1.000 N NA
 5974030 5974031 CBY_3533 CBY_3534 hrcA   FALSE 0.235 254.000 0.062 1.000 N NA
 5974031 5974032 CBY_3534 CBY_3535   lepA TRUE 0.837 70.000 0.083 1.000 N NA
 5974032 5974033 CBY_3535 CBY_3536 lepA   FALSE 0.110 268.000 0.002 NA   NA
 5974033 5974034 CBY_3536 CBY_3537     FALSE 0.425 197.000 0.038 NA   NA
 5974034 5974035 CBY_3537 CBY_3538   gpr TRUE 0.556 229.000 0.521 1.000   NA
 5974037 5974038 CBY_3540 CBY_3541 holA   TRUE 0.603 193.000 0.163 NA   NA
 5974038 5974039 CBY_3541 CBY_3542     TRUE 0.934 5.000 0.006 NA   NA
 5974039 5974040 CBY_3542 CBY_3543   spoVAE FALSE 0.023 332.000 0.000 NA   NA
 5974040 5974041 CBY_3543 CBY_3544 spoVAE spoVAD TRUE 0.973 29.000 0.386 NA   NA
 5974041 5974042 CBY_3544 CBY_3545 spoVAD spoVAC TRUE 0.759 172.000 0.386 NA   NA
 5974042 5974043 CBY_3545 CBY_3546 spoVAC sigF FALSE 0.111 339.000 0.078 NA   NA
 5974043 5974044 CBY_3546 CBY_3547 sigF spoIIAB TRUE 0.989 10.000 0.842 1.000 N NA
 5974044 5974045 CBY_3547 CBY_3548 spoIIAB spoIIAA TRUE 0.998 16.000 0.669 0.001 Y NA
 5974045 5974046 CBY_3548 CBY_3549 spoIIAA   FALSE 0.367 196.000 0.014 1.000 N NA
 5974046 5974047 CBY_3549 CBY_3550     FALSE 0.273 137.000 0.000 1.000 N NA
 5974047 5974048 CBY_3550 CBY_3551     FALSE 0.285 126.000 0.000 NA   NA
 5974050 5974051 CBY_3553 CBY_3554     FALSE 0.017 379.000 0.000 1.000 N NA
 5974051 5974052 CBY_3554 CBY_3555     FALSE 0.018 371.000 0.000 1.000 N NA
 5974052 5974053 CBY_3555 CBY_3556     FALSE 0.210 228.000 0.008 1.000 N NA
 5974053 5974054 CBY_3556 CBY_3557     TRUE 0.970 83.000 0.088 1.000 Y NA
 5974054 5974055 CBY_3557 CBY_3558     TRUE 0.841 9.000 0.000 NA   NA
 5974055 5974056 CBY_3558 CBY_3559     FALSE 0.436 78.000 0.000 NA   NA
 5974056 5974057 CBY_3559 CBY_3560     TRUE 0.941 19.000 0.029 1.000   NA
 5974057 5974058 CBY_3560 CBY_3561     TRUE 0.909 40.000 0.062 NA N NA
 5974058 5974059 CBY_3561 CBY_3562     TRUE 0.967 15.000 0.094 NA N NA
 5974059 5974060 CBY_3562 CBY_3563     TRUE 0.982 -6.000 0.382 1.000 N NA
 5974060 5974061 CBY_3563 CBY_3564   flhA TRUE 0.998 1.000 0.440 1.000 Y NA
 5974061 5974062 CBY_3564 CBY_3565 flhA   TRUE 0.956 146.000 0.207 0.004 Y NA
 5974062 5974063 CBY_3565 CBY_3566     TRUE 0.996 14.000 0.114 0.004 Y NA
 5974063 5974064 CBY_3566 CBY_3567   fliP TRUE 0.996 14.000 0.162 0.004 Y NA
 5974064 5974065 CBY_3567 CBY_3568 fliP   TRUE 0.817 -10.000 0.000 1.000   NA
 5974065 5974066 CBY_3568 CBY_3569   fliL TRUE 0.839 10.000 0.000 1.000   NA
 5974066 5974067 CBY_3569 CBY_3570 fliL   TRUE 0.997 6.000 0.314 1.000 Y NA
 5974067 5974068 CBY_3570 CBY_3571     TRUE 0.998 4.000 0.350 1.000 Y NA
 5974068 5974069 CBY_3571 CBY_3572     TRUE 0.997 12.000 0.301 NA Y NA
 5974069 5974070 CBY_3572 CBY_3573     FALSE 0.479 532.000 0.545 NA Y NA
 5974070 5974071 CBY_3573 CBY_3574     TRUE 0.634 150.000 0.063 NA   NA
 5974071 5974072 CBY_3574 CBY_3575     TRUE 0.963 1.000 0.064 NA   NA
 5974072 5974073 CBY_3575 CBY_3576     TRUE 0.937 13.000 0.012 NA   NA
 5974073 5974074 CBY_3576 CBY_3577   fliJ TRUE 0.920 117.000 0.006 0.003 Y NA
 5974074 5974075 CBY_3577 CBY_3578 fliJ fliI TRUE 0.967 118.000 0.241 1.000 Y NA
 5974075 5974076 CBY_3578 CBY_3579 fliI   TRUE 0.967 135.000 0.379 NA Y NA
 5974076 5974077 CBY_3579 CBY_3580   fliG TRUE 0.997 -16.000 0.308 NA Y NA
 5974077 5974078 CBY_3580 CBY_3581 fliG   TRUE 0.842 6.000 0.000 NA   NA
 5974078 5974079 CBY_3581 CBY_3582     FALSE 0.430 79.000 0.000 NA   NA
 5974079 5974080 CBY_3582 CBY_3583   fliE TRUE 0.789 24.000 0.000 NA   NA
 5974080 5974081 CBY_3583 CBY_3584 fliE flgC TRUE 0.996 15.000 0.095 0.002 Y NA
 5974081 5974082 CBY_3584 CBY_3585 flgC flgB TRUE 0.998 14.000 0.804 1.000 Y NA
 5974082 5974083 CBY_3585 CBY_3586 flgB   FALSE 0.102 1093.000 0.000 1.000 Y NA
 5974083 5974084 CBY_3586 CBY_3587     TRUE 0.775 27.000 0.000 NA   NA
 5974084 5974085 CBY_3587 CBY_3588     TRUE 0.798 22.000 0.000 NA   NA
 5974085 5974086 CBY_3588 CBY_3589     FALSE 0.007 954.000 0.000 NA   NA
 5974086 5974087 CBY_3589 CBY_3590     FALSE 0.270 135.000 0.000 NA   NA
 5974087 5974088 CBY_3590 CBY_3591     TRUE 0.884 67.000 0.190 NA   NA
 5974088 5974089 CBY_3591 CBY_3592     FALSE 0.162 195.000 0.000 NA   NA
 5974089 5974090 CBY_3592 CBY_3593     FALSE 0.266 140.000 0.000 NA   NA
 5974090 5974091 CBY_3593 CBY_3594     FALSE 0.010 508.000 0.000 NA   NA
 5974091 5974092 CBY_3594 CBY_3595     TRUE 0.821 18.000 0.000 1.000 N NA
 5974092 5974093 CBY_3595 CBY_3596     TRUE 0.836 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5974093 5974094 CBY_3596 CBY_3597     TRUE 0.839 11.000 0.000 NA   NA
 5974094 5974095 CBY_3597 CBY_3598     TRUE 0.754 30.000 0.000 NA   NA
 5974095 5974096 CBY_3598 CBY_3599     FALSE 0.160 195.000 0.000 1.000   NA
 5974096 5974097 CBY_3599 CBY_3600     TRUE 0.993 17.000 0.016 1.000 Y NA
 5974097 5974098 CBY_3600 CBY_3601     TRUE 0.775 27.000 0.000 NA   NA
 5974098 5974099 CBY_3601 CBY_3602     TRUE 0.560 55.000 0.000 NA   NA
 5974099 5974100 CBY_3602 CBY_3603     TRUE 0.579 52.000 0.000 1.000   NA
 5974100 5974101 CBY_3603 CBY_3604     TRUE 0.820 17.000 0.000 1.000   NA
 5974101 5974102 CBY_3604 CBY_3605     TRUE 0.819 -10.000 0.000 NA   NA
 5974102 5974103 CBY_3605 CBY_3606     TRUE 0.599 50.000 0.000 NA   NA
 5974103 5974104 CBY_3606 CBY_3607     FALSE 0.483 67.000 0.000 NA   NA
 5974104 5974105 CBY_3607 CBY_3608     TRUE 0.995 24.000 0.111 0.003 Y NA
 5974105 5974106 CBY_3608 CBY_3609     TRUE 0.998 -3.000 0.549 1.000 Y NA
 5974106 5974107 CBY_3609 CBY_3610     TRUE 0.948 3.000 0.022 1.000   NA
 5974107 5974108 CBY_3610 CBY_3611     TRUE 0.932 17.000 0.014 1.000   NA
 5974108 5974109 CBY_3611 CBY_3612     TRUE 0.983 42.000 0.020 1.000 Y NA
 5974109 5974110 CBY_3612 CBY_3613     TRUE 0.804 21.000 0.000 NA   NA
 5974110 5974111 CBY_3613 CBY_3614     TRUE 0.793 23.000 0.000 NA   NA
 5974111 5974112 CBY_3614 CBY_3615     FALSE 0.187 187.000 0.000 1.000 N NA
 5974112 5974113 CBY_3615 CBY_3616     FALSE 0.259 150.000 0.000 NA   NA
 5974113 5974114 CBY_3616 CBY_3617     TRUE 0.943 22.000 0.043 NA   NA
 5974114 5974115 CBY_3617 CBY_3618   fliS TRUE 0.997 17.000 0.370 0.001 Y NA
 5974115 5974116 CBY_3618 CBY_3619 fliS   TRUE 0.969 12.000 0.093 NA   NA
 5974116 5974117 CBY_3619 CBY_3620   flaG TRUE 0.931 25.000 0.028 NA   NA
 5974117 5974118 CBY_3620 CBY_3621 flaG csrA TRUE 0.909 33.000 0.028 NA N NA
 5974118 5974119 CBY_3621 CBY_3622 csrA   TRUE 0.970 5.000 0.096 NA   NA
 5974119 5974120 CBY_3622 CBY_3623   flgL TRUE 0.925 61.000 0.385 NA   NA
 5974120 5974121 CBY_3623 CBY_3624 flgL flgK TRUE 0.984 51.000 0.071 0.001 Y NA
 5974121 5974122 CBY_3624 CBY_3625 flgK   TRUE 0.841 65.000 0.082 0.001   NA
 5974122 5974123 CBY_3625 CBY_3626     TRUE 0.943 11.000 0.019 0.002   NA
 5974123 5974124 CBY_3626 CBY_3627     FALSE 0.034 292.000 0.000 1.000   NA
 5974124 5974125 CBY_3627 CBY_3628   fliM TRUE 0.998 -10.000 0.508 0.001 Y NA
 5974125 5974126 CBY_3628 CBY_3629 fliM   TRUE 0.993 19.000 0.039 0.012 Y NA
 5974126 5974127 CBY_3629 CBY_3630     TRUE 0.970 128.000 0.417 1.000 Y NA
 5974127 5974128 CBY_3630 CBY_3631     TRUE 0.995 16.000 0.082 NA Y NA
 5974128 5974129 CBY_3631 CBY_3632     TRUE 0.995 29.000 0.176 NA Y NA
 5974129 5974130 CBY_3632 CBY_3633   cheR TRUE 0.991 35.000 0.081 1.000 Y NA
 5974130 5974131 CBY_3633 CBY_3634 cheR   TRUE 0.996 10.000 0.107 1.000 Y NA
 5974131 5974132 CBY_3634 CBY_3635     TRUE 0.995 13.000 0.070 1.000 Y NA
 5974132 5974133 CBY_3635 CBY_3636     TRUE 0.995 10.000 0.063 1.000 Y NA
 5974133 5974134 CBY_3636 CBY_3637     TRUE 0.971 14.000 0.115 NA N NA
 5974134 5974135 CBY_3637 CBY_3638     TRUE 0.723 101.000 0.056 NA N NA
 5974135 5974136 CBY_3638 CBY_3639     TRUE 0.909 187.000 0.082 0.050 Y NA
 5974136 5974137 CBY_3639 CBY_3640     TRUE 0.814 175.000 0.000 1.000 Y NA
 5974137 5974138 CBY_3640 CBY_3641     FALSE 0.012 447.000 0.000 NA   NA
 5974138 5974139 CBY_3641 CBY_3642   nifJ FALSE 0.113 297.000 0.032 NA   NA
 5974139 5974140 CBY_3642 CBY_3643 nifJ   TRUE 0.788 216.000 0.016 1.000 Y NA
 5974140 5974141 CBY_3643 CBY_3644   murG FALSE 0.477 153.000 0.006 1.000 N NA
 5974141 5974142 CBY_3644 CBY_3645 murG recJ FALSE 0.033 421.000 0.002 1.000 N NA
 5974142 5974143 CBY_3645 CBY_3646 recJ   TRUE 0.720 63.000 0.004 NA   NA
 5974143 5974144 CBY_3646 CBY_3647     FALSE 0.378 198.000 0.020 NA   NA
 5974144 5974145 CBY_3647 CBY_3648     TRUE 0.984 87.000 0.552 0.001 Y NA
 5974145 5974146 CBY_3648 CBY_3649     FALSE 0.009 576.000 0.000 NA N NA
 5974146 5974147 CBY_3649 CBY_3650     FALSE 0.014 409.000 0.000 NA N NA
 5974147 5974148 CBY_3650 CBY_3651     TRUE 0.504 179.000 0.039 NA   NA
 5974148 5974149 CBY_3651 CBY_3652     TRUE 0.844 58.000 0.053 NA   NA
 5974149 5974150 CBY_3652 CBY_3653   pepF TRUE 0.547 155.000 0.028 1.000   NA
 5974150 5974151 CBY_3653 CBY_3654 pepF   TRUE 0.632 156.000 0.070 NA   NA
 5974153 5974154 CBY_3656 CBY_3657 dltC   TRUE 0.842 112.000 0.387 NA   NA
 5974154 5974155 CBY_3657 CBY_3658     TRUE 0.984 -3.000 0.435 NA N NA
 5974155 5974156 CBY_3658 CBY_3659     TRUE 0.615 124.000 0.033 NA N NA
 5974157 5974158 CBY_3660 CBY_3661     TRUE 0.996 22.000 0.231 1.000 Y NA
 5974159 5974160 CBY_3662 CBY_3663     TRUE 0.810 61.000 0.034 NA   NA
 5974163 5974164 CBY_3666 CBY_3667     TRUE 0.959 9.000 0.050 NA   NA
 5974167 5974168 CBY_3670 CBY_3671     FALSE 0.127 208.000 0.000 1.000   NA
 5974168 5974169 CBY_3671 CBY_3672     FALSE 0.336 102.000 0.000 0.007   NA
 5974169 5974170 CBY_3672 CBY_3673     FALSE 0.188 184.000 0.000 1.000   NA
 5974172 5974173 CBY_3675 CBY_3676     FALSE 0.011 501.000 0.000 NA   NA
 5974173 5974174 CBY_3676 CBY_3677     TRUE 0.769 28.000 0.000 NA   NA
 5974174 5974175 CBY_3677 CBY_3678     TRUE 0.841 8.000 0.000 NA   NA
 5974175 5974176 CBY_3678 CBY_3679     FALSE 0.152 198.000 0.000 NA   NA
 5974177 5974178 CBY_3680 CBY_3681     FALSE 0.396 88.000 0.000 NA   NA
 5974178 5974179 CBY_3681 CBY_3682     FALSE 0.079 236.000 0.000 NA   NA
 5974180 5974181 CBY_3683 CBY_3684     TRUE 0.997 -7.000 0.243 1.000 Y NA
 5974181 5974182 CBY_3684 CBY_3685     FALSE 0.341 105.000 0.000 NA   NA
 5974182 5974183 CBY_3685 CBY_3686   kdpC TRUE 0.798 22.000 0.000 NA   NA
 5974183 5974184 CBY_3686 CBY_3687 kdpC kdpB TRUE 0.998 18.000 0.877 0.001 Y NA
 5974184 5974185 CBY_3687 CBY_3688 kdpB kdpA TRUE 0.996 17.000 0.112 0.001 Y NA
 5974185 5974186 CBY_3688 CBY_3689 kdpA   FALSE 0.023 328.000 0.000 0.044   NA
 5974186 5974187 CBY_3689 CBY_3690     TRUE 0.963 22.000 0.118 1.000   NA
 5974187 5974188 CBY_3690 CBY_3691   dhaK TRUE 0.996 23.000 0.226 0.001 Y NA
 5974188 5974189 CBY_3691 CBY_3692 dhaK clpB FALSE 0.147 202.000 0.000 1.000 N NA
 5974191 5974192 CBY_3694 CBY_3695     TRUE 0.813 17.000 0.000 0.025   NA
 5974192 5974193 CBY_3695 CBY_3696     FALSE 0.063 250.000 0.000 NA   NA
 5974193 5974194 CBY_3696 CBY_3697     FALSE 0.385 91.000 0.000 NA   NA
 5974194 5974195 CBY_3697 CBY_3698     TRUE 0.896 40.000 0.046 NA   NA
 5974195 5974196 CBY_3698 CBY_3699     FALSE 0.128 208.000 0.000 NA   NA
 5974196 5974197 CBY_3699 CBY_3700     TRUE 0.919 187.000 0.115 NA Y NA
 5974197 5974198 CBY_3700 CBY_3701     TRUE 0.837 0.000 0.000 NA   NA
 5974199 5974200 CBY_1037 CBY_1038     FALSE 0.021 349.000 0.000 NA   NA
 5974200 4730308 CBY_1038 CBY_1039     FALSE 0.007 724.000 0.000 1.000   NA
 4730308 5974201 CBY_1039 CBY_1040     FALSE 0.040 278.000 0.000 1.000   NA
 5974201 5974202 CBY_1040 CBY_1041     TRUE 0.953 -7.000 0.044 1.000 N NA
 5974202 5974203 CBY_1041 CBY_1042     TRUE 0.821 -9.000 0.000 NA   NA
 5974203 5974204 CBY_1042 CBY_1043     FALSE 0.079 236.000 0.000 NA   NA
 5974204 5974205 CBY_1043 CBY_1044     TRUE 0.574 53.000 0.000 NA   NA
 5974205 5974206 CBY_1044 CBY_1045   panB TRUE 0.837 0.000 0.000 NA   NA
 5974206 5974207 CBY_1045 CBY_1046 panB panC TRUE 0.985 75.000 0.395 0.001 Y NA
 5974207 5974208 CBY_1046 CBY_1047 panC panD TRUE 0.990 55.000 0.342 1.000 Y NA
 5974210 5974211 CBY_1049 CBY_1050 mutS   FALSE 0.298 120.000 0.000 NA   NA
 5974211 5974212 CBY_1050 CBY_1051     FALSE 0.444 76.000 0.000 NA   NA
 5974215 4730333 CBY_0559 CBY_0561     FALSE 0.261 148.000 0.000 NA   NA
 4730333 5974216 CBY_0561 CBY_0562     FALSE 0.021 344.000 0.000 1.000   NA
 5974216 5974217 CBY_0562 CBY_0563     TRUE 0.943 16.000 0.023 1.000   NA
 5974217 5974218 CBY_0563 CBY_0564   hslO FALSE 0.018 370.000 0.000 1.000   NA
 5974218 5974219 CBY_0564 CBY_0565 hslO   TRUE 0.925 34.000 0.063 1.000   NA
 5974219 5974220 CBY_0565 CBY_0566     TRUE 0.669 118.000 0.056 1.000   NA
 5974221 5974222 CBY_0567 CBY_0568 dapA dapB TRUE 0.994 12.000 0.022 1.000 Y NA
 5974223 5974224 CBY_0569 CBY_0570     FALSE 0.233 163.000 0.000 NA   NA
 5974224 5974225 CBY_0570 CBY_0571     TRUE 0.590 51.000 0.000 NA   NA
 5974225 5974226 CBY_0571 CBY_0572     TRUE 0.996 22.000 0.273 1.000 Y NA
 5974226 5974227 CBY_0572 CBY_0573     TRUE 0.998 6.000 0.636 0.031 Y NA
 5974227 5974228 CBY_0573 CBY_0574     TRUE 0.998 2.000 0.667 0.031 Y NA
 5974228 5974229 CBY_0574 CBY_0575     FALSE 0.025 322.000 0.000 1.000   NA
 5974229 5974230 CBY_0575 CBY_0576     FALSE 0.029 306.000 0.000 1.000   NA
 5974230 5974231 CBY_0576 CBY_0577   oppA FALSE 0.056 258.000 0.000 1.000 N NA
 5974231 5974232 CBY_0577 CBY_0578 oppA   TRUE 0.962 118.000 0.179 1.000 Y NA
 5974232 5974233 CBY_0578 CBY_0579     TRUE 0.998 0.000 0.436 0.001 Y NA
 5974233 5974234 CBY_0579 CBY_0580     TRUE 0.997 13.000 0.300 1.000 Y NA
 5974234 5974235 CBY_0580 CBY_0581     TRUE 0.998 13.000 0.806 0.031 Y NA
 5974235 5974236 CBY_0581 CBY_0582     FALSE 0.138 535.000 0.000 1.000 Y NA
 5974238 5974239 CBY_1122 CBY_1123 miaB   FALSE 0.012 456.000 0.000 NA   NA
 5974239 5974240 CBY_1123 CBY_1124     TRUE 0.961 44.000 0.605 NA   NA
 5974240 5974241 CBY_1124 CBY_1125     FALSE 0.017 375.000 0.000 NA   NA
 5974241 5974242 CBY_1125 CBY_1126     TRUE 0.785 25.000 0.000 NA   NA
 5974242 5974243 CBY_1126 CBY_1127     FALSE 0.072 241.000 0.000 1.000   NA
 5974243 5974244 CBY_1127 CBY_1128   cmk TRUE 0.590 51.000 0.000 NA   NA
 5974244 5974245 CBY_1128 CBY_1130 cmk   FALSE 0.324 110.000 0.000 NA   NA
 5974245 5974246 CBY_1130 CBY_1131     FALSE 0.272 133.000 0.000 NA   NA
 5974246 5974247 CBY_1131 CBY_1132     TRUE 0.785 74.000 0.049 NA   NA
 5974247 5974248 CBY_1132 CBY_1133     FALSE 0.042 275.000 0.000 NA   NA
 5974248 5974249 CBY_1133 CBY_1134     TRUE 0.967 88.000 0.078 1.000 Y NA
 5974249 5974250 CBY_1134 CBY_1135     TRUE 0.812 121.000 0.290 NA N NA
 5974250 5974251 CBY_1135 CBY_1136     FALSE 0.298 120.000 0.000 NA   NA
 5974251 5974252 CBY_1136 CBY_1137     FALSE 0.248 155.000 0.000 NA   NA
 5974252 5974253 CBY_1137 CBY_1138     FALSE 0.466 71.000 0.000 NA   NA
 5974254 5974255 CBY_1320 CBY_1321     TRUE 0.568 54.000 0.000 NA   NA
 5974255 5974256 CBY_1321 CBY_1322     FALSE 0.477 68.000 0.000 NA   NA
 5974256 5974257 CBY_1322 CBY_1323     TRUE 0.837 12.000 0.000 NA   NA
 5974257 5974258 CBY_1323 CBY_1324     TRUE 0.805 119.000 0.273 NA   NA
 5974258 5974259 CBY_1324 CBY_1325     TRUE 0.975 14.000 0.182 NA   NA
 5974259 5974260 CBY_1325 CBY_1326     TRUE 0.762 29.000 0.000 NA   NA
 5974260 5974261 CBY_1326 CBY_1327     TRUE 0.812 19.000 0.000 NA   NA
 5974261 5974262 CBY_1327 CBY_1328     TRUE 0.841 2.000 0.000 NA   NA
 4730360 4730361 CBY_0736 CBY_0737     FALSE 0.013 425.000 0.000 NA   NA
 4730361 5974263 CBY_0737 CBY_0738     TRUE 0.785 25.000 0.000 NA   NA
 5974266 5974267 CBY_3262 CBY_3263     FALSE 0.237 161.000 0.000 NA   NA
 5974267 5974268 CBY_3263 CBY_3264     TRUE 0.841 2.000 0.000 NA   NA
 5974268 5974269 CBY_3264 CBY_3265     FALSE 0.126 209.000 0.000 NA   NA
 5974269 5974270 CBY_3265 CBY_3266     FALSE 0.346 103.000 0.000 NA   NA
 5974270 4730381 CBY_3266 CBY_3267     FALSE 0.009 551.000 0.000 1.000   NA
 4730381 5974271 CBY_3267 CBY_3268     FALSE 0.008 602.000 0.000 NA   NA
 5974271 5974272 CBY_3268 CBY_3269     TRUE 0.986 24.000 1.000 NA   NA
 5974272 4730383 CBY_3269 CBY_3270     TRUE 0.812 19.000 0.000 NA   NA
 4730383 4730384 CBY_3270 CBY_3271     TRUE 0.568 54.000 0.000 NA   NA
 4730384 5974273 CBY_3271 CBY_3272     FALSE 0.140 203.000 0.000 NA   NA
 5974273 5974274 CBY_3272 CBY_3273     TRUE 0.804 21.000 0.000 NA   NA
 5974274 5974275 CBY_3273 CBY_3274     TRUE 0.837 12.000 0.000 NA   NA
 5974275 5974276 CBY_3274 CBY_3275     TRUE 0.798 22.000 0.000 NA   NA
 5974276 5974277 CBY_3275 CBY_3276     TRUE 0.839 1.000 0.000 NA   NA
 5974277 5974278 CBY_3276 CBY_3277     TRUE 0.982 16.000 0.400 NA   NA
 5974278 5974279 CBY_3277 CBY_3278     TRUE 0.798 22.000 0.000 NA   NA
 5974279 5974280 CBY_3278 CBY_3279     TRUE 0.821 17.000 0.000 NA   NA
 5974280 5974281 CBY_3279 CBY_3280     TRUE 0.804 21.000 0.000 NA   NA
 5974281 5974282 CBY_3280 CBY_3281     TRUE 0.812 19.000 0.000 NA   NA
 5974282 5974283 CBY_3281 CBY_3282     TRUE 0.837 0.000 0.000 NA   NA
 5974283 5974284 CBY_3282 CBY_3283     FALSE 0.405 86.000 0.000 NA   NA
 5974284 5974285 CBY_3283 CBY_3284     TRUE 0.839 1.000 0.000 NA   NA
 5974285 5974286 CBY_3284 CBY_3285     TRUE 0.808 20.000 0.000 NA   NA
 5974286 5974287 CBY_3285 CBY_3286     FALSE 0.457 73.000 0.000 NA   NA
 5974287 5974288 CBY_3286 CBY_3287     FALSE 0.284 127.000 0.000 NA   NA
 5974288 5974289 CBY_3287 CBY_3288     FALSE 0.010 511.000 0.000 NA   NA
 5974289 5974290 CBY_3288 CBY_3289     FALSE 0.007 786.000 0.000 NA   NA
 5974292 5974293 CBY_3291 CBY_3292     FALSE 0.299 119.000 0.000 NA   NA
 5974293 5974294 CBY_3292 CBY_3293     FALSE 0.206 176.000 0.000 1.000   NA
 5974294 5974295 CBY_3293 CBY_3294     FALSE 0.041 277.000 0.000 1.000   NA
 5974295 5974296 CBY_3294 CBY_3295     FALSE 0.123 210.000 0.000 NA   NA
 5974296 5974297 CBY_3295 CBY_3296     FALSE 0.239 160.000 0.000 NA   NA
 5974297 5974298 CBY_3296 CBY_3297     FALSE 0.029 306.000 0.000 NA   NA
 5974298 5974299 CBY_3297 CBY_3298     FALSE 0.385 91.000 0.000 NA   NA
 5974299 5974300 CBY_3298 CBY_3299     FALSE 0.205 177.000 0.000 NA   NA
 5974302 5974303 CBY_3301 CBY_3302     FALSE 0.148 200.000 0.000 NA   NA
 5974303 5974304 CBY_3302 CBY_3303     FALSE 0.390 89.000 0.000 1.000   NA
 5974304 5974305 CBY_3303 CBY_3304     FALSE 0.335 107.000 0.000 NA   NA
 5974305 5974306 CBY_3304 CBY_3305   ruvA FALSE 0.345 194.000 0.007 NA   NA
 5974306 5974307 CBY_3305 CBY_3306 ruvA ruvB TRUE 0.970 149.000 0.549 0.003 Y NA
 5974307 5974308 CBY_3306 CBY_3307 ruvB queA TRUE 0.629 158.000 0.069 1.000 N NA
 5974308 5974309 CBY_3307 CBY_3308 queA tgt TRUE 0.849 194.000 0.014 0.001 Y NA
 5974309 5974310 CBY_3308 CBY_3309 tgt yajC FALSE 0.168 269.000 0.035 NA N NA
 5974310 5974311 CBY_3309 CBY_3310 yajC   TRUE 0.601 158.000 0.055 NA   NA
 5974311 5974312 CBY_3310 CBY_3311   secD FALSE 0.017 375.000 0.000 NA   NA
 5974312 5974313 CBY_3311 CBY_3312 secD   TRUE 0.825 -7.000 0.000 NA   NA
 5974314 5974315 CBY_4343 CBY_4344     TRUE 0.842 5.000 0.000 NA   NA
 5974315 5974316 CBY_4344 CBY_4345     TRUE 0.841 2.000 0.000 NA   NA
 5974316 5974317 CBY_4345 CBY_4346     TRUE 0.839 11.000 0.000 NA   NA
 5974317 5974318 CBY_4346 CBY_4347     TRUE 0.842 4.000 0.000 NA   NA
 5974318 5974319 CBY_4347 CBY_4348     TRUE 0.842 6.000 0.000 NA   NA
 5974319 5974320 CBY_4348 CBY_4349     TRUE 0.747 31.000 0.000 NA   NA
 5974320 5974321 CBY_4349 CBY_4350     TRUE 0.825 16.000 0.000 NA   NA
 5974321 5974322 CBY_4350 CBY_4351     TRUE 0.639 43.000 0.000 NA   NA
 5974322 5974323 CBY_4351 CBY_4352     TRUE 0.839 11.000 0.000 NA   NA
 5974323 5974324 CBY_4352 CBY_4353     TRUE 0.841 2.000 0.000 NA   NA
 5974324 5974325 CBY_4353 CBY_4354     TRUE 0.842 6.000 0.000 NA   NA
 5974325 5974326 CBY_4354 CBY_4355     TRUE 0.798 22.000 0.000 NA   NA
 5974326 5974327 CBY_4355 CBY_4356     TRUE 0.613 48.000 0.000 NA   NA
 5974329 5974330 CBY_3467 CBY_3468     TRUE 0.998 13.000 0.512 0.030 Y NA
 5974330 5974331 CBY_3468 CBY_3469     TRUE 0.974 11.000 0.148 1.000   NA
 5974331 5974332 CBY_3469 CBY_3470     FALSE 0.054 259.000 0.000 1.000   NA
 5974332 5974333 CBY_3470 CBY_3471     TRUE 0.942 64.000 0.000 NA Y NA
 5974335 5974336 CBY_3473 CBY_3474     TRUE 0.997 32.000 0.905 0.016 Y NA
 5974336 5974337 CBY_3474 CBY_3475     TRUE 0.996 -10.000 0.143 0.016 Y NA
 5974337 5974338 CBY_3475 CBY_3476     FALSE 0.273 136.000 0.000 1.000 N NA
 5974338 5974339 CBY_3476 CBY_3477     TRUE 0.808 102.000 0.178 1.000 N NA
 5974339 5974340 CBY_3477 CBY_3478     TRUE 0.944 19.000 0.033 1.000 N NA
 5974340 5974341 CBY_3478 CBY_3479     TRUE 0.986 46.000 0.080 1.000 Y NA
 5974341 5974342 CBY_3479 CBY_4357     FALSE 0.011 465.000 0.000 NA   NA
 5974342 5974343 CBY_4357 CBY_4358     TRUE 0.808 20.000 0.000 NA   NA
 5974343 5974344 CBY_4358 CBY_4359     FALSE 0.048 270.000 0.000 NA   NA
 5974344 5974345 CBY_4359 CBY_4360     FALSE 0.018 372.000 0.000 NA   NA
 5974345 5974346 CBY_4360 CBY_4361     TRUE 0.842 4.000 0.000 NA   NA
 5974346 5974347 CBY_4361 CBY_4362     TRUE 0.841 2.000 0.000 NA   NA
 5974347 5974348 CBY_4362 CBY_4363     TRUE 0.840 10.000 0.000 NA   NA
 5974348 5974349 CBY_4363 CBY_3487     FALSE 0.053 261.000 0.000 NA   NA
 5974349 5974350 CBY_3487 CBY_4364   rrs FALSE 0.017 374.000 0.000 NA   NA
 5974350 5974351 CBY_4364 CBY_4365 rrs   FALSE 0.267 139.000 0.000 NA   NA
 5974351 5974352 CBY_4365 CBY_4366   rrl FALSE 0.316 113.000 0.000 NA   NA
 5974353 5974354 CBY_3490 CBY_3491     FALSE 0.044 274.000 0.000 NA   NA
 5974357 5974358 CBY_0121 CBY_0122     FALSE 0.396 88.000 0.000 NA   NA
 5974358 5974359 CBY_0122 CBY_0123     TRUE 0.780 26.000 0.000 NA   NA
 5974359 5974360 CBY_0123 CBY_0124     TRUE 0.980 20.000 0.400 NA   NA
 5974360 5974361 CBY_0124 CBY_0125     TRUE 0.977 20.000 0.300 NA   NA
 5974361 5974362 CBY_0125 CBY_0126     TRUE 0.982 9.000 0.333 NA   NA
 5974362 5974363 CBY_0126 CBY_0127     TRUE 0.988 3.000 0.667 NA   NA
 5974363 5974364 CBY_0127 CBY_0128     TRUE 0.933 17.000 0.014 NA   NA
 5974364 5974365 CBY_0128 CBY_0129     TRUE 0.611 98.000 0.009 NA   NA
 5974365 5974366 CBY_0129 CBY_0130     TRUE 0.796 69.000 0.047 NA   NA
 5974366 5974367 CBY_0130 CBY_0131     TRUE 0.956 127.000 0.141 1.000 Y NA
 5974367 5974368 CBY_0131 CBY_0132     TRUE 0.964 74.000 0.025 1.000 Y NA
 5974368 5974369 CBY_0132 CBY_0133     FALSE 0.007 767.000 0.000 NA   NA
 5974369 5974370 CBY_0133 CBY_0134     TRUE 0.495 159.000 0.015 NA   NA
 5974370 5974371 CBY_0134 CBY_0135     TRUE 0.532 135.000 0.015 1.000   NA
 5974371 5974372 CBY_0135 CBY_0136     TRUE 0.920 50.000 0.176 1.000   NA
 5974372 5974373 CBY_0136 CBY_0137     FALSE 0.046 272.000 0.000 1.000   NA
 5974376 5974377 CBY_0140 CBY_0141     FALSE 0.026 323.000 0.000 1.000 N NA
 5974379 5974380 CBY_0143 CBY_0144     TRUE 0.976 22.000 0.326 1.000   NA
 5974380 5974381 CBY_0144 CBY_0145     TRUE 0.998 -7.000 0.928 1.000 Y NA
 5974381 5974382 CBY_0145 CBY_0146     TRUE 0.998 -6.000 0.492 0.030 Y NA
 5974382 5974383 CBY_0146 CBY_0147     TRUE 0.981 65.000 0.131 0.030 Y NA
 5974386 5974387 CBY_0150 CBY_0151     FALSE 0.008 699.000 0.000 NA   NA
 5974387 5974388 CBY_0151 CBY_0152     FALSE 0.023 331.000 0.000 NA   NA
 5974388 5974389 CBY_0152 CBY_0153     FALSE 0.104 218.000 0.000 1.000   NA
 5974391 5974392 CBY_0155 CBY_0156     TRUE 0.988 -10.000 1.000 NA   NA
 5974392 5974393 CBY_0156 CBY_0157     TRUE 0.673 214.000 0.750 NA   NA
 5974393 5974394 CBY_0157 CBY_0158     FALSE 0.256 152.000 0.000 NA   NA
 5974394 5974395 CBY_0158 CBY_0159     TRUE 0.590 51.000 0.000 NA   NA
 5974395 5974396 CBY_0159 CBY_0160   cadA FALSE 0.007 1182.000 0.000 NA N NA
 5974396 5974397 CBY_0160 CBY_0161 cadA   TRUE 0.821 130.000 0.417 NA   NA
 5974398 5974399 CBY_0162 CBY_0163     TRUE 0.621 46.000 0.000 NA   NA
 5974399 5974400 CBY_0163 CBY_0164     TRUE 0.983 13.000 0.375 NA   NA
 5974401 5974402 CBY_0165 CBY_0166 pssA   FALSE 0.262 143.000 0.000 1.000   NA
 5974402 5974403 CBY_0166 CBY_0167     FALSE 0.393 89.000 0.000 NA   NA
 5974404 5974405 CBY_0168 CBY_0169     TRUE 0.987 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 5974406 5974407 CBY_0170 CBY_0171     FALSE 0.235 161.000 0.000 1.000   NA
 5974407 5974408 CBY_0171 CBY_0172     TRUE 0.989 6.000 0.000 0.030 Y NA
 5974408 5974409 CBY_0172 CBY_0173     TRUE 0.998 8.000 0.667 0.030 Y NA
 5974409 5974410 CBY_0173 CBY_0174     TRUE 0.506 63.000 0.000 NA   NA
 5974410 5974411 CBY_0174 CBY_0175     TRUE 0.835 13.000 0.000 NA   NA
 5974412 5974413 CBY_0360 CBY_0361 amt   TRUE 0.713 34.000 0.000 NA   NA
 5974413 5974414 CBY_0361 CBY_0362     FALSE 0.149 498.000 0.000 1.000 Y NA
 5974414 5974415 CBY_0362 CBY_0363     FALSE 0.060 252.000 0.000 NA   NA
 5974415 4730417 CBY_0363 CBY_0364     FALSE 0.015 401.000 0.000 NA   NA
 4730417 5974416 CBY_0364 CBY_0365     TRUE 0.997 19.000 0.257 1.000 Y NA
 5974416 5974417 CBY_0365 CBY_0366     FALSE 0.047 273.000 0.000 NA N NA
 5974418 5974419 CBY_0367 CBY_0368     FALSE 0.013 445.000 0.000 1.000 N NA
 5974420 5974421 CBY_0369 CBY_0370     FALSE 0.115 214.000 0.000 0.083 N NA
 5974421 5974422 CBY_0370 CBY_0371     FALSE 0.170 192.000 0.000 NA   NA
 5974422 5974423 CBY_0371 CBY_4225     FALSE 0.172 191.000 0.000 NA   NA
 5974423 5974424 CBY_4225 CBY_0373     FALSE 0.082 233.000 0.000 NA   NA
 5974424 5974425 CBY_0373 CBY_0374     FALSE 0.347 105.000 0.000 1.000 N NA
 5974425 5974426 CBY_0374 CBY_0375     TRUE 0.917 33.000 0.043 1.000   NA
 5974426 5974427 CBY_0375 CBY_0376     TRUE 0.939 38.000 0.133 1.000   NA
 5974427 5974428 CBY_0376 CBY_0377     TRUE 0.998 16.000 0.933 0.016 Y NA
 5974428 5974429 CBY_0377 CBY_0378     TRUE 0.998 -10.000 0.933 0.016 Y NA
 5974429 5974430 CBY_0378 CBY_0379     TRUE 0.997 12.000 0.267 0.016 Y NA
 5974430 5974431 CBY_0379 CBY_0380     TRUE 0.933 6.000 0.006 NA   NA
 5974431 5974432 CBY_0380 CBY_0381     TRUE 0.933 10.000 0.006 NA   NA
 5974432 5974433 CBY_0381 CBY_0382     TRUE 0.687 38.000 0.000 NA   NA
 5974433 5974434 CBY_0382 CBY_0383   cobT FALSE 0.108 217.000 0.000 NA   NA
 5974434 5974435 CBY_0383 CBY_0384 cobT   TRUE 0.996 17.000 0.104 1.000 Y NA
 5974435 5974436 CBY_0384 CBY_0385   cobS TRUE 0.996 3.000 0.092 1.000 Y NA
 5974436 5974437 CBY_0385 CBY_0386 cobS   FALSE 0.439 189.000 0.026 NA   NA
 5974437 5974438 CBY_0386 CBY_0387     TRUE 0.983 -7.000 0.434 NA   NA
 5974438 5974439 CBY_0387 CBY_0388   cobQ TRUE 0.770 55.000 0.005 1.000 N NA
 5974442 4730422 CBY_3742 CBY_3743     FALSE 0.015 399.000 0.000 NA   NA
 4730422 5974443 CBY_3743 CBY_3744     TRUE 0.953 23.000 0.070 1.000 N NA
 5974443 5974444 CBY_3744 CBY_3745     TRUE 0.996 -7.000 0.174 1.000 Y NA
 5974444 5974445 CBY_3745 CBY_3746     FALSE 0.086 231.000 0.000 1.000 N NA
 5974445 5974446 CBY_3746 CBY_3747     FALSE 0.139 205.000 0.000 1.000 N NA
 5974446 5974447 CBY_3747 CBY_3748     FALSE 0.293 122.000 0.000 NA   NA
 5974447 5974448 CBY_3748 CBY_3749     TRUE 0.552 56.000 0.000 NA   NA
 5974448 5974449 CBY_3749 CBY_3750   gltA TRUE 0.987 0.000 0.667 0.027 N NA
 5974449 5974450 CBY_3750 CBY_3751 gltA   FALSE 0.061 253.000 0.000 1.000 N NA
 5974450 5974451 CBY_3751 CBY_3752     FALSE 0.277 133.000 0.000 1.000 N NA
 5974451 5974452 CBY_3752 CBY_3753     FALSE 0.010 539.000 0.000 1.000 N NA
 5974452 5974453 CBY_3753 CBY_3754     FALSE 0.075 238.000 0.000 1.000   NA
 5974453 5974454 CBY_3754 CBY_3755     TRUE 0.644 84.000 0.005 1.000   NA
 5974454 5974455 CBY_3755 CBY_4370     FALSE 0.358 99.000 0.000 NA   NA
 5974455 5974456 CBY_4370 CBY_3757     FALSE 0.027 316.000 0.000 NA   NA
 5974456 5974457 CBY_3757 CBY_3758     FALSE 0.217 172.000 0.000 NA   NA
 5974457 5974458 CBY_3758 CBY_3759     TRUE 0.814 -12.000 0.000 1.000   NA
 5974458 5974459 CBY_3759 CBY_3760     TRUE 0.785 25.000 0.000 NA   NA
 5974459 5974460 CBY_3760 CBY_3761     FALSE 0.014 406.000 0.000 NA   NA
 5974460 5974461 CBY_3761 CBY_3762   celB FALSE 0.063 250.000 0.000 NA   NA
 5974461 5974462 CBY_3762 CBY_3763 celB   TRUE 0.699 36.000 0.000 1.000   NA
 5974462 5974463 CBY_3763 CBY_3764     TRUE 0.626 45.000 0.000 1.000   NA
 5974463 5974464 CBY_3764 CBY_3765     TRUE 0.935 70.000 0.000 0.010 Y NA
 5974465 5974466 CBY_3766 CBY_3767 bioA bioD TRUE 0.996 3.000 0.124 0.001 Y NA
 5974466 5974467 CBY_3767 CBY_3768 bioD   TRUE 0.953 17.000 0.048 NA   NA
 5974468 5974469 CBY_3769 CBY_3770     FALSE 0.036 288.000 0.000 NA   NA
 5974469 5974470 CBY_3770 CBY_3771     FALSE 0.027 315.000 0.000 1.000   NA
 5974470 5974471 CBY_3771 CBY_3772     TRUE 0.942 22.000 0.041 1.000 N NA
 5974471 5974472 CBY_3772 CBY_3773     FALSE 0.073 242.000 0.000 1.000 N NA
 5974472 5974473 CBY_3773 CBY_3774     TRUE 0.843 10.000 0.000 1.000 N NA
 5974473 5974474 CBY_3774 CBY_3775     FALSE 0.418 82.000 0.000 NA   NA
 5974474 5974475 CBY_3775 CBY_3777     TRUE 0.809 -19.000 0.000 NA   NA
 5974475 5974476 CBY_3777 CBY_3778     FALSE 0.362 293.000 0.000 1.000 Y NA
 5974476 5974477 CBY_3778 CBY_4371   srpB FALSE 0.010 505.000 0.000 NA   NA
 5974478 5974479 CBY_3779 CBY_3780   folA TRUE 0.639 108.000 0.024 1.000 N NA
 5974479 5974480 CBY_3780 CBY_3781 folA thyA TRUE 0.675 110.000 0.046 1.000 N NA
 5974480 5974481 CBY_3781 CBY_3782 thyA   FALSE 0.316 113.000 0.000 NA   NA
 5974482 5974483 CBY_3783 CBY_3784     TRUE 0.713 125.000 0.100 NA   NA
 5974483 5974484 CBY_3784 CBY_3785   recR TRUE 0.779 180.000 0.604 NA   NA
 5974484 5974485 CBY_3785 CBY_3786 recR   FALSE 0.349 225.000 0.071 NA   NA
 5974485 5974486 CBY_3786 CBY_3787   bofA TRUE 0.978 24.000 0.417 NA   NA
 5974486 5974487 CBY_3787 CBY_3788 bofA   FALSE 0.032 298.000 0.000 NA   NA
 5974487 5974488 CBY_3788 CBY_3789     FALSE 0.449 75.000 0.000 NA   NA
 5974488 5974489 CBY_3789 CBY_3790   serC FALSE 0.123 210.000 0.000 NA   NA
 5974489 5974490 CBY_3790 CBY_3791 serC   FALSE 0.303 494.000 0.060 1.000 Y NA
 5974490 5974491 CBY_3791 CBY_3792     FALSE 0.326 232.000 0.072 1.000   NA
 5974493 5974494 CBY_3794 CBY_3795     FALSE 0.096 224.000 0.000 1.000 N NA
 5974494 5974495 CBY_3795 CBY_3796     TRUE 0.684 38.000 0.000 1.000   NA
 5974495 5974496 CBY_3796 CBY_3797     FALSE 0.053 260.000 0.000 1.000   NA
 5974498 5974499 CBY_4372 CBY_4373 rrs rrl FALSE 0.018 368.000 0.000 NA   NA
 5974500 5974501 CBY_3800 CBY_3801     FALSE 0.044 274.000 0.000 NA   NA
 5974502 5974503 CBY_1150 CBY_1151     TRUE 0.837 0.000 0.000 NA   NA
 5974503 5974504 CBY_1151 CBY_1152     FALSE 0.096 223.000 0.000 NA   NA
 5974504 5974505 CBY_1152 CBY_1153     TRUE 0.780 26.000 0.000 NA   NA
 5974505 5974506 CBY_1153 CBY_1155     TRUE 0.821 17.000 0.000 NA   NA
 5974506 5974507 CBY_1155 CBY_1156     TRUE 0.829 15.000 0.000 NA   NA
 5974507 5974508 CBY_1156 CBY_1157     TRUE 0.819 -10.000 0.000 NA   NA
 5974508 5974509 CBY_1157 CBY_1158     TRUE 0.988 3.000 0.667 NA   NA
 5974509 5974510 CBY_1158 CBY_1159     TRUE 0.975 -3.000 0.182 NA   NA
 5974510 5974511 CBY_1159 CBY_1160     TRUE 0.808 20.000 0.000 NA   NA
 5974511 4730436 CBY_1160 CBY_1161     TRUE 0.769 28.000 0.000 NA   NA
 5974513 5974514 CBY_2508 CBY_2509     FALSE 0.044 274.000 0.000 NA   NA
 5974515 5974516 CBY_4324 CBY_4325 rrs rrf FALSE 0.007 889.000 0.000 NA   NA
 5974516 5974517 CBY_4325 CBY_4326 rrf rrl FALSE 0.344 104.000 0.000 NA   NA
 5974518 5974519 CBY_2512 CBY_2513     FALSE 0.044 274.000 0.000 NA   NA
 5974520 5974521 CBY_1162 CBY_1163     TRUE 0.916 167.000 0.051 0.016 Y NA
 5974521 5974522 CBY_1163 CBY_1164   cax FALSE 0.046 273.000 0.000 1.000 N NA
 5974523 5974524 CBY_1165 CBY_1166     TRUE 0.496 64.000 0.000 0.096 N NA
 5974524 4730449 CBY_1166 CBY_1167     FALSE 0.258 151.000 0.000 NA   NA
 4730449 5974525 CBY_1167 CBY_1168     FALSE 0.411 84.000 0.000 NA   NA
 5974525 5974526 CBY_1168 CBY_1169     FALSE 0.377 92.000 0.000 1.000   NA
 5974526 5974527 CBY_1169 CBY_1170     TRUE 0.976 30.000 0.500 NA   NA
 5974527 5974528 CBY_1170 CBY_1171     TRUE 0.808 20.000 0.000 NA   NA
 5974528 5974529 CBY_1171 CBY_1172     TRUE 0.832 -3.000 0.000 NA   NA
 5974529 5974530 CBY_1172 CBY_1173     FALSE 0.217 172.000 0.000 NA   NA
 5974530 5974531 CBY_1173 CBY_1174     FALSE 0.291 123.000 0.000 NA   NA
 5974531 5974532 CBY_1174 CBY_1175     TRUE 0.812 -15.000 0.000 NA   NA
 5974534 5974535 CBY_1177 CBY_1178     FALSE 0.010 518.000 0.000 NA   NA
 5974535 5974536 CBY_1178 CBY_1179     FALSE 0.014 407.000 0.000 NA   NA
 5974536 5974537 CBY_1179 CBY_1180     FALSE 0.090 227.000 0.000 NA   NA
 5974537 5974538 CBY_1180 CBY_1181     TRUE 0.837 0.000 0.000 NA   NA
 5974538 5974539 CBY_1181 CBY_1182     TRUE 0.837 12.000 0.000 NA   NA
 5974541 5974542 CBY_1184 CBY_1185     FALSE 0.321 111.000 0.000 NA   NA
 5974543 5974544 CBY_1011 CBY_1012     TRUE 0.542 58.000 0.000 NA   NA
 5974544 5974545 CBY_1012 CBY_1013     FALSE 0.049 268.000 0.000 NA   NA
 5974545 5974546 CBY_1013 CBY_1014     FALSE 0.256 152.000 0.000 NA   NA
 5974546 5974547 CBY_1014 CBY_1015     FALSE 0.103 220.000 0.000 NA   NA
 5974547 5974548 CBY_1015 CBY_1016     FALSE 0.245 159.000 0.000 1.000 N NA
 5974548 5974549 CBY_1016 CBY_1017     TRUE 0.982 -3.000 0.364 NA   NA
 5974549 4730456 CBY_1017 CBY_1018     FALSE 0.013 421.000 0.000 NA   NA
 4730456 5974550 CBY_1018 CBY_1019     FALSE 0.011 478.000 0.000 NA   NA
 5974550 5974551 CBY_1019 CBY_1021   purE FALSE 0.025 323.000 0.000 NA   NA
 5974551 5974552 CBY_1021 CBY_1022 purE purC TRUE 0.994 0.000 0.035 1.000 Y NA
 5974552 5974553 CBY_1022 CBY_1023 purC purF TRUE 0.957 108.000 0.082 1.000 Y NA
 5974553 5974554 CBY_1023 CBY_1024 purF purM TRUE 0.976 92.000 0.248 1.000 Y NA
 5974554 5974555 CBY_1024 CBY_1025 purM purN TRUE 0.997 -12.000 0.238 0.001 Y NA
 5974555 5974556 CBY_1025 CBY_1026 purN purH TRUE 0.941 181.000 0.225 1.000 Y NA
 5974556 5974557 CBY_1026 CBY_1027 purH purD TRUE 0.951 168.000 0.238 1.000 Y NA
 5974557 5974558 CBY_1027 CBY_1028 purD   FALSE 0.018 370.000 0.000 NA   NA
 5974558 5974559 CBY_1028 CBY_1029     FALSE 0.241 159.000 0.000 NA   NA
 5974559 5974560 CBY_1029 CBY_1030     FALSE 0.265 143.000 0.000 NA   NA
 5974560 5974561 CBY_1030 CBY_1031     TRUE 0.841 9.000 0.000 NA   NA
 5974561 5974562 CBY_1031 CBY_1032     FALSE 0.267 139.000 0.000 NA   NA
 5974562 5974563 CBY_1032 CBY_1033     TRUE 0.488 66.000 0.000 NA   NA
 5974565 5974566 CBY_1035 CBY_1036     TRUE 0.812 19.000 0.000 NA   NA
 5974567 5974568 CBY_0699 CBY_0701   truA FALSE 0.237 161.000 0.000 NA   NA
 5974568 5974569 CBY_0701 CBY_0702 truA   TRUE 0.498 237.000 0.404 1.000 N NA
 5974569 5974570 CBY_0702 CBY_0703     TRUE 0.997 3.000 0.304 1.000 Y NA
 5974570 5974571 CBY_0703 CBY_0704     TRUE 0.998 -24.000 0.713 0.019 Y NA
 5974571 5974572 CBY_0704 CBY_0705   rplQ FALSE 0.166 290.000 0.074 1.000 N NA
 5974572 5974573 CBY_0705 CBY_0706 rplQ rpoA TRUE 0.989 13.000 0.873 1.000 N NA
 5974573 5974574 CBY_0706 CBY_0707 rpoA rpsD TRUE 0.869 109.000 0.549 1.000 N NA
 5974574 5974575 CBY_0707 CBY_0708 rpsD rpsK TRUE 0.997 28.000 0.509 0.013 Y NA
 5974575 5974576 CBY_0708 CBY_0709 rpsK rpsM TRUE 0.998 16.000 0.810 0.010 Y NA
 5974576 5974577 CBY_0709 CBY_0710 rpsM rpmJ TRUE 0.584 199.000 0.194 0.010   NA
 5974577 5974578 CBY_0710 CBY_0711 rpmJ infA TRUE 0.923 55.000 0.257 1.000   NA
 5974578 5974579 CBY_0711 CBY_0712 infA   TRUE 0.969 8.000 0.090 NA   NA
 5974579 5974580 CBY_0712 CBY_0713   map TRUE 0.840 88.000 0.185 NA   NA
 5974580 5974581 CBY_0713 CBY_0714 map   TRUE 0.981 0.000 0.290 1.000 N NA
 5974581 5974582 CBY_0714 CBY_0715     TRUE 0.971 26.000 0.241 1.000 N NA
 5974582 5974583 CBY_0715 CBY_0716   rplO TRUE 0.988 2.000 0.730 1.000 N NA
 5974583 5974584 CBY_0716 CBY_0717 rplO rpmD TRUE 0.997 22.000 0.653 0.002 Y NA
 5974584 5974585 CBY_0717 CBY_0718 rpmD rpsE TRUE 0.998 14.000 0.789 0.013 Y NA
 5974585 5974586 CBY_0718 CBY_0719 rpsE rplR TRUE 0.998 20.000 0.814 0.013 Y NA
 5974586 5974587 CBY_0719 CBY_0720 rplR   TRUE 0.998 20.000 0.815 0.010 Y NA
 5974587 5974588 CBY_0720 CBY_0721   rpsH TRUE 0.990 71.000 0.808 0.010 Y NA
 5974588 5974589 CBY_0721 CBY_0722 rpsH rpsN TRUE 0.996 33.000 0.473 0.010 Y NA
 5974589 5974590 CBY_0722 CBY_0723 rpsN   TRUE 0.998 17.000 0.496 0.010 Y NA
 5974590 5974591 CBY_0723 CBY_0724   rplX TRUE 0.998 23.000 0.758 0.010 Y NA
 5974591 5974592 CBY_0724 CBY_0725 rplX rplN TRUE 0.998 16.000 0.810 0.013 Y NA
 5974592 5974593 CBY_0725 CBY_0726 rplN rpsQ TRUE 0.997 28.000 0.791 0.013 Y NA
 5974593 5974594 CBY_0726 CBY_0727 rpsQ rpmC TRUE 0.998 24.000 0.828 0.010 Y NA
 5974594 5974595 CBY_0727 CBY_0728 rpmC rplP TRUE 0.998 0.000 0.802 0.010 Y NA
 5974595 5974596 CBY_0728 CBY_0729 rplP rpsC TRUE 0.998 18.000 0.828 0.013 Y NA
 5974596 5974597 CBY_0729 CBY_0730 rpsC rplV TRUE 0.997 24.000 0.719 0.013 Y NA
 5974597 5974598 CBY_0730 CBY_0731 rplV rpsS TRUE 0.998 22.000 0.769 0.013 Y NA
 5974598 5974599 CBY_0731 CBY_0732 rpsS rplB TRUE 0.991 63.000 0.820 0.013 Y NA
 5974599 5974600 CBY_0732 CBY_0733 rplB rplW TRUE 0.991 65.000 0.849 0.013 Y NA
 5974600 5974601 CBY_0733 CBY_0734 rplW rplD TRUE 0.997 0.000 0.307 0.010 Y NA
 5974601 5974602 CBY_0734 CBY_0735 rplD   TRUE 0.979 26.000 0.544 0.010   NA
 5974603 5974604 CBY_0294 CBY_0295     FALSE 0.008 607.000 0.000 NA   NA
 5974604 5974605 CBY_0295 CBY_0296     FALSE 0.038 286.000 0.000 1.000 N NA
 5974607 5974608 CBY_0298 CBY_0299     FALSE 0.111 216.000 0.000 NA   NA
 5974608 5974609 CBY_0299 CBY_0300     FALSE 0.152 198.000 0.000 NA   NA
 5974610 4730487 CBY_0311 CBY_0312   luxS FALSE 0.298 122.000 0.000 1.000 N NA
 4730487 5974611 CBY_0312 CBY_0313 luxS   TRUE 0.811 -16.000 0.000 NA   NA
 5974611 5974612 CBY_0313 CBY_0315     TRUE 0.832 14.000 0.000 NA   NA
 5974614 5974615 CBY_0279 CBY_0280   rpmG FALSE 0.203 178.000 0.000 NA   NA
 5974615 5974616 CBY_0280 CBY_0281 rpmG secE TRUE 0.820 51.000 0.016 1.000 N NA
 5974616 5974617 CBY_0281 CBY_0282 secE nusG TRUE 0.835 13.000 0.000 NA   NA
 5974618 5974619 CBY_0642 CBY_0643 rpoC rpoB TRUE 0.998 22.000 0.851 0.001 Y NA
 5974619 5974620 CBY_0643 CBY_0644 rpoB rplL FALSE 0.179 329.000 0.223 1.000 N NA
 5974620 5974621 CBY_0644 CBY_0645 rplL   TRUE 0.606 49.000 0.000 NA   NA
 4730512 5974622 CBY_2514 CBY_2515 spoIVA   FALSE 0.218 258.000 0.060 1.000   NA
 5974622 5974623 CBY_2515 CBY_2516     TRUE 0.965 5.000 0.068 1.000   NA
 5974623 5974624 CBY_2516 CBY_2517     TRUE 0.962 0.000 0.061 1.000   NA
 5974624 5974625 CBY_2517 CBY_2518     FALSE 0.140 203.000 0.000 NA   NA
 5974625 5974626 CBY_2518 CBY_2519     FALSE 0.088 228.000 0.000 NA   NA
 5974626 5974627 CBY_2519 CBY_2520     FALSE 0.012 445.000 0.000 NA   NA
 5974627 5974628 CBY_2520 CBY_2521     FALSE 0.430 79.000 0.000 NA   NA
 5974628 5974629 CBY_2521 CBY_2522     TRUE 0.839 11.000 0.000 NA   NA
 5974629 5974630 CBY_2522 CBY_2523     FALSE 0.401 87.000 0.000 NA   NA
 5974630 5974631 CBY_2523 CBY_2524     TRUE 0.837 0.000 0.000 NA   NA
 5974631 5974632 CBY_2524 CBY_2525     TRUE 0.832 14.000 0.000 NA   NA
 5974635 5974636 CBY_2528 CBY_2529     FALSE 0.094 222.000 0.000 0.055   NA
 5974637 5974638 CBY_2530 CBY_2531     TRUE 0.837 0.000 0.000 NA   NA
 5974638 5974639 CBY_2531 CBY_2532     TRUE 0.829 15.000 0.000 NA   NA
 5974639 5974640 CBY_2532 CBY_2533     TRUE 0.522 61.000 0.000 NA   NA
 5974640 5974641 CBY_2533 CBY_2534     FALSE 0.105 218.000 0.000 NA   NA
 5974641 5974642 CBY_2534 CBY_2535     TRUE 0.841 2.000 0.000 NA   NA
 5974642 5974643 CBY_2535 CBY_2536     TRUE 0.840 10.000 0.000 NA   NA
 5974643 5974644 CBY_2536 CBY_2537     TRUE 0.837 12.000 0.000 NA   NA
 5974644 5974645 CBY_2537 CBY_2538     TRUE 0.825 -7.000 0.000 NA   NA
 5974645 5974646 CBY_2538 CBY_2539     TRUE 0.988 0.000 0.833 NA   NA
 5974646 5974647 CBY_2539 CBY_2540     TRUE 0.976 0.000 0.188 NA   NA
 5974647 5974648 CBY_2540 CBY_2541     TRUE 0.977 2.000 0.188 NA   NA
 5974648 5974649 CBY_2541 CBY_2542     TRUE 0.839 1.000 0.000 NA   NA
 5974649 5974650 CBY_2542 CBY_2543     TRUE 0.837 12.000 0.000 NA   NA
 5974650 5974651 CBY_2543 CBY_2544     TRUE 0.837 0.000 0.000 NA   NA
 5974651 5974652 CBY_2544 CBY_2545     TRUE 0.775 27.000 0.000 NA   NA
 5974652 5974653 CBY_2545 CBY_2546     FALSE 0.453 74.000 0.000 NA   NA
 5974653 5974654 CBY_2546 CBY_2547     TRUE 0.832 14.000 0.000 NA   NA
 5974654 5974655 CBY_2547 CBY_2548     TRUE 0.983 12.000 0.375 NA   NA
 5974655 5974656 CBY_2548 CBY_2549     TRUE 0.980 12.000 0.250 NA   NA
 5974656 5974657 CBY_2549 CBY_2550     TRUE 0.989 0.000 1.000 NA   NA
 5974657 5974658 CBY_2550 CBY_2551     TRUE 0.825 -7.000 0.000 NA   NA
 5974658 5974659 CBY_2551 CBY_2552     TRUE 0.837 12.000 0.000 NA   NA
 5974659 5974660 CBY_2552 CBY_2553     TRUE 0.935 44.000 0.200 NA   NA
 5974660 5974661 CBY_2553 CBY_2554     TRUE 0.975 -7.000 0.200 NA   NA
 5974661 5974662 CBY_2554 CBY_2555     TRUE 0.832 -3.000 0.000 NA   NA
 5974662 5974663 CBY_2555 CBY_2556     TRUE 0.840 10.000 0.000 NA   NA
 5974663 5974664 CBY_2556 CBY_2557     TRUE 0.832 -3.000 0.000 NA   NA
 5974664 5974665 CBY_2557 CBY_2558     FALSE 0.256 152.000 0.000 NA   NA
 5974665 5974666 CBY_2558 CBY_2559     FALSE 0.268 138.000 0.000 NA   NA
 5974666 5974667 CBY_2559 CBY_2560     TRUE 0.754 30.000 0.000 NA   NA
 5974667 5974668 CBY_2560 CBY_2561     FALSE 0.081 234.000 0.000 NA   NA
 5974668 5974669 CBY_2561 CBY_2562     TRUE 0.819 -10.000 0.000 NA   NA
 5974669 5974670 CBY_2562 CBY_2563     TRUE 0.617 47.000 0.000 NA   NA
 5974670 5974671 CBY_2563 CBY_2564     TRUE 0.817 18.000 0.000 NA   NA
 5974671 5974672 CBY_2564 CBY_2565     TRUE 0.803 -40.000 0.000 NA   NA
 5974672 5974673 CBY_2565 CBY_2566     TRUE 0.837 0.000 0.000 NA   NA
 5974673 5974674 CBY_2566 CBY_2567     TRUE 0.832 -3.000 0.000 NA   NA
 5974674 5974675 CBY_2567 CBY_2568     TRUE 0.812 19.000 0.000 NA   NA
 5974675 5974676 CBY_2568 CBY_2569     TRUE 0.842 3.000 0.000 NA   NA
 5974676 5974677 CBY_2569 CBY_2570     TRUE 0.805 -27.000 0.000 NA   NA
 5974677 5974678 CBY_2570 CBY_2571     TRUE 0.754 30.000 0.000 NA   NA
 5974678 5974679 CBY_2571 CBY_2572     TRUE 0.775 27.000 0.000 NA   NA
 5974679 5974680 CBY_2572 CBY_2573     TRUE 0.842 5.000 0.000 NA   NA
 5974680 5974681 CBY_2573 CBY_2574     TRUE 0.536 59.000 0.000 NA   NA
 5974681 5974682 CBY_2574 CBY_2575     TRUE 0.987 11.000 0.667 NA   NA
 5974682 5974683 CBY_2575 CBY_2576     TRUE 0.840 10.000 0.000 NA   NA
 5974683 5974684 CBY_2576 CBY_2577     TRUE 0.837 0.000 0.000 NA   NA
 5974684 5974685 CBY_2577 CBY_2578     TRUE 0.839 11.000 0.000 NA   NA
 5974685 5974686 CBY_2578 CBY_2579     TRUE 0.962 26.000 0.143 NA   NA
 5974686 5974687 CBY_2579 CBY_2580     TRUE 0.975 6.000 0.143 NA   NA
 5974687 5974688 CBY_2580 CBY_2581     FALSE 0.056 256.000 0.000 NA   NA
 5974688 5974689 CBY_2581 CBY_2582     TRUE 0.807 -22.000 0.000 NA   NA
 5974689 5974690 CBY_2582 CBY_2583     TRUE 0.825 16.000 0.000 NA   NA
 5974691 5974692 CBY_2584 CBY_2585     TRUE 0.986 16.000 0.667 NA   NA
 5974692 5974693 CBY_2585 CBY_2586     TRUE 0.819 -10.000 0.000 NA   NA
 5974694 5974695 CBY_2587 CBY_2588 ppk   TRUE 0.989 39.000 0.070 1.000 Y NA
 5974695 5974696 CBY_2588 CBY_2589   phoU TRUE 0.858 136.000 0.000 NA Y NA
 5974696 5974697 CBY_2589 CBY_2590 phoU pstB TRUE 0.996 22.000 0.182 NA Y NA
 5974697 5974698 CBY_2590 CBY_2591 pstB pstA TRUE 0.996 10.000 0.112 0.001 Y NA
 5974698 5974699 CBY_2591 CBY_2592 pstA pstC TRUE 0.998 0.000 0.907 0.001 Y NA
 5974699 5974700 CBY_2592 CBY_2593 pstC   TRUE 0.965 117.000 0.206 1.000 Y NA
 5974700 5974701 CBY_2593 CBY_2594     FALSE 0.037 506.000 0.028 1.000 N NA
 5974701 5974702 CBY_2594 CBY_2595     TRUE 0.995 -25.000 0.110 1.000 Y NA
 5974702 5974703 CBY_2595 CBY_2596     TRUE 0.943 13.000 0.018 NA   NA
 5974703 5974704 CBY_2596 CBY_2597   nrdR FALSE 0.294 210.000 0.013 NA   NA
 5974704 5974705 CBY_2597 CBY_2598 nrdR   TRUE 0.717 73.000 0.013 NA   NA
 5974705 5974706 CBY_2598 CBY_2599   sigG TRUE 0.646 133.000 0.060 NA   NA
 5974706 5974707 CBY_2599 CBY_2600 sigG sigE TRUE 0.986 83.000 0.602 0.006 Y NA
 5974707 5974708 CBY_2600 CBY_2601 sigE spoIIGA TRUE 0.988 14.000 0.856 1.000   NA
 5974708 5974709 CBY_2601 CBY_2602 spoIIGA ftsZ FALSE 0.056 378.000 0.024 1.000   NA
 5974709 5974710 CBY_2602 CBY_2603 ftsZ ftsA TRUE 0.998 15.000 0.460 1.000 Y NA
 5974710 5974711 CBY_2603 CBY_2604 ftsA   FALSE 0.169 238.000 0.004 0.005 N NA
 5974711 5974712 CBY_2604 CBY_2605   sigK TRUE 0.504 171.000 0.025 1.000 N NA
 5974712 5974713 CBY_2605 CBY_2606 sigK   TRUE 0.832 73.000 0.087 1.000 N NA
 5974713 5974714 CBY_2606 CBY_2607     FALSE 0.085 294.000 0.008 1.000 N NA
 5974714 5974715 CBY_2607 CBY_2608     TRUE 0.975 9.000 0.146 1.000   NA
 5974715 5974716 CBY_2608 CBY_2609     TRUE 0.958 18.000 0.067 1.000   NA
 5974716 5974717 CBY_2609 CBY_2610   typA TRUE 0.639 93.000 0.012 1.000   NA
 5974717 5974718 CBY_2610 CBY_2611 typA   FALSE 0.063 321.000 0.004 1.000   NA
 5974718 5974719 CBY_2611 CBY_2612     TRUE 0.909 64.000 0.289 1.000   NA
 5974719 5974720 CBY_2612 CBY_2613     TRUE 0.904 61.000 0.211 NA   NA
 5974720 5974721 CBY_2613 CBY_2614     TRUE 0.602 150.000 0.047 NA   NA
 5974721 5974722 CBY_2614 CBY_2615     TRUE 0.955 48.000 0.537 NA   NA
 5974722 5974723 CBY_2615 CBY_2616   alaS TRUE 0.698 140.000 0.110 NA   NA
 5974723 5974724 CBY_2616 CBY_2617 alaS   FALSE 0.036 457.000 0.015 NA   NA
 5974724 5974725 CBY_2617 CBY_2618     TRUE 0.973 -19.000 0.209 NA   NA
 5974725 5974726 CBY_2618 CBY_2619   trmU TRUE 0.489 141.000 0.006 NA   NA
 5974726 5974727 CBY_2619 CBY_2620 trmU nifU TRUE 0.967 6.000 0.073 1.000 N NA
 5974727 5974728 CBY_2620 CBY_2621 nifU nifS TRUE 0.955 2.000 0.035 1.000 N NA
 5974728 5974729 CBY_2621 CBY_2622 nifS   TRUE 0.973 5.000 0.125 NA N NA
 5974729 5974730 CBY_2622 CBY_2623     FALSE 0.188 239.000 0.010 NA   NA
 5974730 5974731 CBY_2623 CBY_2624     FALSE 0.007 1202.000 0.000 NA   NA
 5974731 5974732 CBY_2624 CBY_2625     TRUE 0.990 1.000 1.000 NA   NA
 5974732 5974733 CBY_2625 CBY_2626     FALSE 0.012 464.000 0.000 NA   NA
 5974733 5974734 CBY_2626 CBY_2627     TRUE 0.974 32.000 0.500 NA   NA
 5974734 5974735 CBY_2627 CBY_2628     TRUE 0.985 14.000 0.500 NA   NA
 5974736 5974737 CBY_2629 CBY_2630     TRUE 0.987 16.000 0.750 NA   NA
 5974737 5974738 CBY_2630 CBY_2631     TRUE 0.985 25.000 1.000 0.001   NA
 5974738 5974739 CBY_2631 CBY_2632     FALSE 0.007 1060.000 0.000 1.000   NA
 5974740 5974741 CBY_2633 CBY_2634     TRUE 0.969 33.000 0.400 NA   NA
 5974741 5974742 CBY_2634 CBY_2635     TRUE 0.984 1.000 0.400 NA   NA
 5974742 5974743 CBY_2635 CBY_2636     TRUE 0.840 10.000 0.000 NA   NA
 5974743 5974744 CBY_2636 CBY_2637     TRUE 0.839 11.000 0.000 NA   NA
 5974744 5974745 CBY_2637 CBY_2638     TRUE 0.847 109.000 0.400 0.012   NA
 5974745 5974746 CBY_2638 CBY_2639     FALSE 0.011 469.000 0.000 1.000   NA
 5974746 5974747 CBY_2639 CBY_2640     TRUE 0.974 -34.000 0.231 1.000   NA
 5974747 5974748 CBY_2640 CBY_2641     TRUE 0.989 0.000 0.857 NA   NA
 5974748 5974749 CBY_2641 CBY_2642     FALSE 0.013 426.000 0.000 NA   NA
 5974749 5974750 CBY_2642 CBY_2643   accA FALSE 0.296 121.000 0.000 NA   NA
 5974750 5974751 CBY_2643 CBY_2644 accA accD TRUE 0.997 -7.000 0.234 0.001 Y NA
 5974751 5974752 CBY_2644 CBY_2645 accD accC TRUE 0.995 -7.000 0.090 0.002 Y NA
 5974752 5974753 CBY_2645 CBY_2646 accC fabZ TRUE 0.995 9.000 0.045 1.000 Y NA
 5974753 5974754 CBY_2646 CBY_2647 fabZ accB TRUE 0.995 4.000 0.047 0.003 Y NA
 5974754 5974755 CBY_2647 CBY_2648 accB fabF TRUE 0.994 22.000 0.074 1.000 Y NA
 5974755 5974756 CBY_2648 CBY_2649 fabF fabG TRUE 0.997 16.000 0.236 1.000 Y NA
 5974756 5974757 CBY_2649 CBY_2650 fabG fabD TRUE 0.954 130.000 0.149 0.003 Y NA
 5974757 5974758 CBY_2650 CBY_2651 fabD   TRUE 0.967 -7.000 0.099 1.000   NA
 5974758 5974759 CBY_2651 CBY_2652     FALSE 0.385 91.000 0.000 NA   NA
 5974760 5974761 CBY_0301 CBY_0302 amt   TRUE 0.526 166.000 0.028 1.000 N NA
 5974761 5974762 CBY_0302 CBY_0303   glnA FALSE 0.182 419.000 0.000 1.000 Y NA
 5974762 5974763 CBY_0303 CBY_0304 glnA   TRUE 0.930 39.000 0.103 1.000 N NA
 5974763 5974764 CBY_0304 CBY_0305     FALSE 0.157 259.000 0.017 1.000 N NA
 5974764 5974765 CBY_0305 CBY_0306     TRUE 0.997 15.000 0.222 0.001 Y NA
 5974767 5974768 CBY_1546 CBY_1547     FALSE 0.033 294.000 0.000 NA   NA
 5974768 5974769 CBY_1547 CBY_1548     TRUE 0.754 30.000 0.000 NA   NA
 5974769 5974770 CBY_1548 CBY_1549     TRUE 0.989 14.000 1.000 NA   NA
 5974770 5974771 CBY_1549 CBY_1550     TRUE 0.628 188.000 0.167 NA   NA
 5974771 5974772 CBY_1550 CBY_1551     TRUE 0.988 4.000 0.750 1.000 N NA
 5974772 5974773 CBY_1551 CBY_1552     TRUE 0.982 14.000 0.364 1.000 N NA
 5974773 5974774 CBY_1552 CBY_1553     TRUE 0.998 2.000 0.636 0.017 Y NA
 5974774 5974775 CBY_1553 CBY_1554   galU FALSE 0.018 375.000 0.000 1.000 N NA
 5974775 5974776 CBY_1554 CBY_1555 galU   FALSE 0.306 318.000 0.000 0.014 Y NA
 5974776 5974777 CBY_1555 CBY_1556     FALSE 0.029 309.000 0.000 1.000 N NA
 5974777 5974778 CBY_1556 CBY_1557     FALSE 0.314 117.000 0.000 NA N NA
 5974778 5974779 CBY_1557 CBY_1558   tyrS FALSE 0.111 217.000 0.000 NA N NA
 5974779 5974780 CBY_1558 CBY_1559 tyrS   FALSE 0.034 292.000 0.000 NA   NA
 5974780 5974781 CBY_1559 CBY_1560     FALSE 0.222 346.000 0.500 NA   NA
 5974781 5974782 CBY_1560 CBY_1561     TRUE 0.951 26.000 0.077 1.000   NA
 5974782 5974783 CBY_1561 CBY_1562   fucO FALSE 0.021 350.000 0.000 1.000   NA
 5974785 5974786 CBY_1564 CBY_1565 fucI   TRUE 0.995 24.000 0.119 1.000 Y NA
 5974786 5974787 CBY_1565 CBY_1566     TRUE 0.998 -6.000 0.455 1.000 Y NA
 5974787 5974788 CBY_1566 CBY_1567     TRUE 0.997 21.000 0.333 1.000 Y NA
 5974788 5974789 CBY_1567 CBY_1568   fucP TRUE 0.951 140.000 0.133 NA Y NA
 5974790 5974791 CBY_1569 CBY_1570     TRUE 0.905 34.000 0.033 NA   NA
 5974792 5974793 CBY_1571 CBY_1572     TRUE 0.539 136.000 0.017 NA   NA
 5974793 5974794 CBY_1572 CBY_1573     TRUE 0.945 21.000 0.043 NA   NA
 5974794 5974795 CBY_1573 CBY_1574     TRUE 0.668 117.000 0.052 NA   NA
 5974795 5974796 CBY_1574 CBY_1575     TRUE 0.520 184.000 0.054 NA   NA
 5974798 5974799 CBY_1577 CBY_1578   dcd TRUE 0.929 13.000 0.005 NA   NA
 5974799 5974800 CBY_1578 CBY_1579 dcd   FALSE 0.166 193.000 0.000 1.000   NA
 5974800 5974801 CBY_1579 CBY_1580     TRUE 0.959 4.000 0.049 NA   NA
 5974801 5974802 CBY_1580 CBY_1581     TRUE 0.957 5.000 0.042 NA   NA
 5974804 5974805 CBY_1583 CBY_1584     FALSE 0.198 182.000 0.000 1.000 N NA
 5974805 5974806 CBY_1584 CBY_1585   aroF FALSE 0.007 970.000 0.000 1.000 N NA
 5974806 5974807 CBY_1585 CBY_1586 aroF aroB TRUE 0.948 85.000 0.008 0.002 Y NA
 5974807 5974808 CBY_1586 CBY_1587 aroB aroA TRUE 0.995 15.000 0.051 1.000 Y NA
 5974808 5974809 CBY_1587 CBY_1588 aroA aroC TRUE 0.994 -22.000 0.057 1.000 Y NA
 5974809 5974810 CBY_1588 CBY_1589 aroC   TRUE 0.988 34.000 0.026 1.000 Y NA
 5974810 5974811 CBY_1589 CBY_1590   aroE TRUE 0.955 78.000 0.009 1.000 Y NA
 5974811 5974812 CBY_1590 CBY_1591 aroE aroK TRUE 0.971 77.000 0.069 1.000 Y NA
 5974816 5974817 CBY_1595 CBY_1596   aroE TRUE 0.899 64.000 0.224 1.000 N NA
 5974817 5974818 CBY_1596 CBY_1597 aroE   FALSE 0.140 205.000 0.000 NA N NA
 5974818 5974819 CBY_1597 CBY_1598     TRUE 0.842 5.000 0.000 NA   NA
 5974819 5974820 CBY_1598 CBY_1599     TRUE 0.839 11.000 0.000 NA   NA
 5974820 5974821 CBY_1599 CBY_1600   aroD FALSE 0.301 121.000 0.000 1.000 N NA
 5974821 5974822 CBY_1600 CBY_1601 aroD aroF TRUE 0.770 191.000 0.000 0.002 Y NA
 5974822 5974823 CBY_1601 CBY_1602 aroF   TRUE 0.952 82.000 0.009 1.000 Y NA
 5974823 5974824 CBY_1602 CBY_1603     FALSE 0.117 213.000 0.000 NA   NA
 5974824 5974825 CBY_1603 CBY_1604     TRUE 0.835 13.000 0.000 NA   NA
 5974825 5974826 CBY_1604 CBY_1605     FALSE 0.018 372.000 0.000 1.000 N NA
 5974826 5974827 CBY_1605 CBY_1606     FALSE 0.010 520.000 0.000 1.000 N NA
 5974827 5974828 CBY_1606 CBY_1607     TRUE 0.974 75.000 0.091 0.028 Y NA
 5974828 5974829 CBY_1607 CBY_1608     TRUE 0.996 12.000 0.091 0.028 Y NA
 5974829 5974830 CBY_1608 CBY_1609     TRUE 0.995 12.000 0.055 1.000 Y NA
 5974830 5974831 CBY_1609 CBY_1610     TRUE 0.994 -13.000 0.055 0.001 Y NA
 5974831 5974832 CBY_1610 CBY_1611     TRUE 0.996 -7.000 0.176 1.000 Y NA
 5974832 5974833 CBY_1611 CBY_1612     TRUE 0.822 -10.000 0.000 1.000 N NA
 5974833 5974834 CBY_1612 CBY_1613     TRUE 0.842 12.000 0.000 NA N NA
 5974834 5974835 CBY_1613 CBY_1614     TRUE 0.995 2.000 0.053 NA Y NA
 5974835 5974836 CBY_1614 CBY_1615     FALSE 0.294 125.000 0.000 NA N NA
 5974836 5974837 CBY_1615 CBY_1616     TRUE 0.989 4.000 0.000 1.000 Y NA
 5974837 5974838 CBY_1616 CBY_1617     FALSE 0.302 118.000 0.000 NA   NA
 5974838 5974839 CBY_1617 CBY_1618     FALSE 0.040 281.000 0.000 NA   NA
 5974839 5974840 CBY_1618 CBY_1619     FALSE 0.110 217.000 0.000 1.000 N NA
 5974840 5974841 CBY_1619 CBY_1620     FALSE 0.076 237.000 0.000 1.000   NA
 5974841 5974842 CBY_1620 CBY_1621     FALSE 0.361 98.000 0.000 NA   NA
 5974842 5974843 CBY_1621 CBY_1622     TRUE 0.812 -15.000 0.000 NA   NA
 5974843 5974844 CBY_1622 CBY_1623     FALSE 0.074 240.000 0.000 NA   NA
 5974844 5974845 CBY_1623 CBY_1624     FALSE 0.009 563.000 0.000 NA   NA
 5974846 5974847 CBY_1625 CBY_1626     TRUE 0.988 -3.000 0.875 1.000   NA
 5974847 5974848 CBY_1626 CBY_1627     TRUE 0.829 171.000 0.875 0.093 N NA
 5974848 5974849 CBY_1627 CBY_1628     TRUE 0.998 -3.000 0.875 1.000 Y NA
 5974849 5974850 CBY_1628 CBY_1629     TRUE 0.971 39.000 0.000 0.012 Y NA
 5974850 5974851 CBY_1629 CBY_1630     TRUE 0.998 17.000 0.875 1.000 Y NA
 5974851 5974852 CBY_1630 CBY_1631     FALSE 0.309 116.000 0.000 NA   NA
 5974852 5974853 CBY_1631 CBY_1632     TRUE 0.805 -28.000 0.000 NA   NA
 5974853 5974854 CBY_1632 CBY_1633     FALSE 0.483 67.000 0.000 NA   NA
 5974855 5974856 CBY_1634 CBY_1635     FALSE 0.466 71.000 0.000 NA   NA
 5974856 5974857 CBY_1635 CBY_1636     TRUE 0.590 51.000 0.000 NA   NA
 5974857 5974858 CBY_1636 CBY_1637     TRUE 0.590 51.000 0.000 NA   NA
 5974858 5974859 CBY_1637 CBY_1638     TRUE 0.581 52.000 0.000 NA   NA
 5974859 5974860 CBY_1638 CBY_1639     FALSE 0.436 78.000 0.000 NA   NA
 5974860 5974861 CBY_1639 CBY_1640     TRUE 0.549 56.000 0.000 1.000   NA
 5974861 5974862 CBY_1640 CBY_1641     FALSE 0.181 188.000 0.000 NA   NA
 5974862 5974863 CBY_1641 CBY_1642     FALSE 0.094 224.000 0.000 NA   NA
 5974863 5974864 CBY_1642 CBY_1643     TRUE 0.590 51.000 0.000 NA   NA
 5974864 5974865 CBY_1643 CBY_1644     TRUE 0.832 14.000 0.000 NA   NA
 5974865 5974866 CBY_1644 CBY_1645     TRUE 0.811 -16.000 0.000 NA   NA
 5974868 5974869 CBY_1647 CBY_1648     TRUE 0.825 17.000 0.000 1.000 N NA
 5974869 5974870 CBY_1648 CBY_1649     TRUE 0.595 232.000 0.000 0.028 Y NA
 5974870 5974871 CBY_1649 CBY_1650     TRUE 0.780 26.000 0.000 NA   NA
 5974871 5974872 CBY_1650 CBY_1651     FALSE 0.287 125.000 0.000 NA   NA
 5974872 5974873 CBY_1651 CBY_1652     TRUE 0.984 92.000 0.607 0.028 Y NA
 5974873 5974874 CBY_1652 CBY_1653     TRUE 0.998 4.000 0.786 0.028 Y NA
 5974874 5974875 CBY_1653 CBY_1654     TRUE 0.925 141.000 0.033 NA Y NA
 5974875 5974876 CBY_1654 CBY_1655     FALSE 0.439 79.000 0.000 NA N NA
 5974876 5974877 CBY_1655 CBY_1656     TRUE 0.700 37.000 0.000 1.000 N NA
 5974877 5974878 CBY_1656 CBY_1657     FALSE 0.097 224.000 0.000 NA N NA
 5974878 5974879 CBY_1657 CBY_1658     TRUE 0.929 76.000 0.000 NA Y NA
 5974879 5974880 CBY_1658 CBY_1659     FALSE 0.212 173.000 0.000 1.000   NA
 5974880 5974881 CBY_1659 CBY_1660     FALSE 0.051 265.000 0.000 1.000   NA
 5974881 5974882 CBY_1660 CBY_1661   manA TRUE 0.795 183.000 0.000 0.027 Y NA
 5974882 5974883 CBY_1661 CBY_1662 manA   FALSE 0.269 143.000 0.000 1.000 N NA
 5974884 5974885 CBY_1663 CBY_1664 fbp   FALSE 0.047 272.000 0.000 1.000 N NA
 5974885 5974886 CBY_1664 CBY_1665     TRUE 0.580 53.000 0.000 1.000 N NA
 5974887 5974888 CBY_1666 CBY_1667     FALSE 0.134 206.000 0.000 NA   NA
 5974888 5974889 CBY_1667 CBY_1668     TRUE 0.815 56.000 0.024 1.000 N NA
 5974889 5974890 CBY_1668 CBY_1669     TRUE 0.963 -3.000 0.072 1.000   NA
 5974890 5974891 CBY_1669 CBY_1670     TRUE 0.913 75.000 0.500 0.027   NA
 5974891 5974892 CBY_1670 CBY_1671     FALSE 0.232 164.000 0.000 NA   NA
 5974893 5974894 CBY_1672 CBY_1673 argF argD TRUE 0.983 41.000 0.017 1.000 Y NA
 5974894 5974895 CBY_1673 CBY_1674 argD argB TRUE 0.923 131.000 0.022 1.000 Y NA
 5974895 5974896 CBY_1674 CBY_1675 argB argJ TRUE 0.971 105.000 0.239 0.002 Y NA
 5974896 5974897 CBY_1675 CBY_1676 argJ   FALSE 0.067 245.000 0.000 NA   NA
 5974897 5974898 CBY_1676 CBY_1677   argC FALSE 0.312 115.000 0.000 NA   NA
 5974898 5974899 CBY_1677 CBY_1678 argC argH TRUE 0.928 122.000 0.020 1.000 Y NA
 5974899 5974900 CBY_1678 CBY_1679 argH argG TRUE 0.997 2.000 0.278 1.000 Y NA
 5974900 5974901 CBY_1679 CBY_1680 argG   FALSE 0.023 332.000 0.000 NA   NA
 5974901 5974902 CBY_1680 CBY_1681     TRUE 0.966 -3.000 0.082 NA   NA
 5974903 5974904 CBY_1682 CBY_1683     FALSE 0.038 284.000 0.000 1.000   NA
 5974904 5974905 CBY_1683 CBY_1684   nagE FALSE 0.164 194.000 0.000 1.000   NA
 5974905 5974906 CBY_1684 CBY_1685 nagE sdaAB FALSE 0.064 250.000 0.000 1.000 N NA
 5974906 5974907 CBY_1685 CBY_1686 sdaAB sdaAA TRUE 0.995 17.000 0.098 0.001 Y NA
 5974907 5974908 CBY_1686 CBY_1687 sdaAA   FALSE 0.013 429.000 0.000 NA   NA
 5974908 5974909 CBY_1687 CBY_1688     FALSE 0.444 76.000 0.000 NA   NA
 5974909 5974910 CBY_1688 CBY_1689     TRUE 0.995 19.000 0.118 0.003 Y NA
 5974910 5974911 CBY_1689 CBY_1690     FALSE 0.115 214.000 0.000 NA   NA
 5974913 5974914 CBY_1692 CBY_1693     FALSE 0.010 507.000 0.000 NA   NA
 5974914 5974915 CBY_1693 CBY_1694     FALSE 0.265 142.000 0.000 NA   NA
 5974915 5974916 CBY_1694 CBY_1695     TRUE 0.876 38.000 0.017 NA   NA
 5974916 5974917 CBY_1695 CBY_1696     FALSE 0.248 155.000 0.000 NA   NA
 5974917 5974918 CBY_1696 CBY_1697     FALSE 0.178 189.000 0.000 NA   NA
 5974918 5974919 CBY_1697 CBY_1698     TRUE 0.774 141.000 0.250 1.000 N NA
 5974919 5974920 CBY_1698 CBY_1699   thiW FALSE 0.015 399.000 0.000 NA   NA
 5974920 5974921 CBY_1699 CBY_1700 thiW thiD TRUE 0.801 76.000 0.065 NA   NA
 5974921 5974922 CBY_1700 CBY_1701 thiD thiC TRUE 0.805 203.000 0.004 0.003 Y NA
 5974922 5974923 CBY_1701 CBY_1702 thiC thiM TRUE 0.993 15.000 0.022 0.003 Y NA
 5974923 5974924 CBY_1702 CBY_1703 thiM thiE TRUE 0.986 58.000 0.190 0.003 Y NA
 5974924 5974925 CBY_1703 CBY_1704 thiE   FALSE 0.058 255.000 0.000 1.000 N NA
 5974925 5974926 CBY_1704 CBY_1705   recQ FALSE 0.033 298.000 0.000 1.000 N NA
 5974930 5974931 CBY_1709 CBY_1710     FALSE 0.015 395.000 0.000 NA   NA
 5974931 5974932 CBY_1710 CBY_1711     TRUE 0.980 101.000 0.500 NA Y NA
 5974932 5974933 CBY_1711 CBY_1712     TRUE 0.997 25.000 0.667 1.000 Y NA
 5974933 5974934 CBY_1712 CBY_1713     FALSE 0.020 355.000 0.000 NA   NA
 5974934 5974935 CBY_1713 CBY_1714     FALSE 0.254 153.000 0.000 NA   NA
 5974935 5974936 CBY_1714 CBY_1715     TRUE 0.997 5.000 0.200 0.017 Y NA
 5974936 5974937 CBY_1715 CBY_1716     TRUE 0.982 22.000 0.577 NA N NA
 5974937 5974938 CBY_1716 CBY_1717     TRUE 0.998 21.000 0.654 NA Y NA
 5974938 5974939 CBY_1717 CBY_1718     FALSE 0.008 710.000 0.000 NA   NA
 5974939 5974940 CBY_1718 CBY_1719     FALSE 0.059 253.000 0.000 NA   NA
 5974940 5974941 CBY_1719 CBY_1720     FALSE 0.016 386.000 0.000 NA   NA
 5974941 5974942 CBY_1720 CBY_1721     TRUE 0.702 108.000 0.058 NA   NA
 5974942 5974943 CBY_1721 CBY_1722     FALSE 0.025 328.000 0.000 1.000 N NA
 5974944 5974945 CBY_1723 CBY_1724   galT TRUE 0.518 188.000 0.060 1.000 N NA
 5974945 5974946 CBY_1724 CBY_1725 galT galE TRUE 0.817 102.000 0.204 0.001 N NA
 5974946 5974947 CBY_1725 CBY_1726 galE galK TRUE 0.836 59.000 0.051 0.001 N NA
 5974950 5974951 CBY_1729 CBY_1730     FALSE 0.362 100.000 0.000 1.000 N NA
 5974954 5974955 CBY_3804 CBY_3805 rpe   TRUE 0.993 2.000 0.003 0.027 Y NA
 5974955 5974956 CBY_3805 CBY_3806     TRUE 0.977 48.000 0.008 1.000 Y NA
 5974956 5974957 CBY_3806 CBY_3807     TRUE 0.992 20.000 0.018 0.002 Y NA
 5974957 5974958 CBY_3807 CBY_3808     TRUE 0.947 61.000 0.000 1.000 Y NA
 5974958 5974959 CBY_3808 CBY_3809     TRUE 0.921 83.000 0.000 1.000 Y NA
 5974959 5974960 CBY_3809 CBY_3810     FALSE 0.306 117.000 0.000 NA   NA
 5974960 5974961 CBY_3810 CBY_3811     TRUE 0.942 34.000 0.115 NA   NA
 5974961 5974962 CBY_3811 CBY_3812     TRUE 0.977 26.000 0.431 0.015   NA
 5974962 5974963 CBY_3812 CBY_3813     TRUE 0.966 29.000 0.235 0.015   NA
 5974963 5974964 CBY_3813 CBY_3814     TRUE 0.765 131.000 0.214 1.000   NA
 5974970 5974971 CBY_3820 CBY_3821     TRUE 0.978 0.000 0.222 NA   NA
 5974971 5974972 CBY_3821 CBY_3822   lepB FALSE 0.131 207.000 0.000 NA   NA
 5974972 5974973 CBY_3822 CBY_3823 lepB   TRUE 0.812 19.000 0.000 NA   NA
 5974973 5974974 CBY_3823 CBY_3824     TRUE 0.972 -3.000 0.130 NA   NA
 5974975 5974976 CBY_3825 CBY_3826     FALSE 0.208 176.000 0.000 NA   NA
 5974979 5974980 CBY_3829 CBY_3830     TRUE 0.987 73.000 0.536 1.000 Y NA
 5974980 5974981 CBY_3830 CBY_3831     TRUE 0.994 34.000 0.223 0.028 Y NA
 5974981 5974982 CBY_3831 CBY_3832     FALSE 0.020 356.000 0.000 1.000   NA
 5974982 5974983 CBY_3832 CBY_3833     FALSE 0.279 128.000 0.000 1.000   NA
 5974983 5974984 CBY_3833 CBY_3834     TRUE 0.998 14.000 0.860 0.002 Y NA
 5974984 5974985 CBY_3834 CBY_3835     FALSE 0.273 137.000 0.000 1.000 N NA
 5974985 5974986 CBY_3835 CBY_3836     FALSE 0.151 198.000 0.000 1.000   NA
 5974986 5974987 CBY_3836 CBY_3837     FALSE 0.221 169.000 0.000 1.000   NA
 5974987 5974988 CBY_3837 CBY_3838     FALSE 0.267 139.000 0.000 NA   NA
 5974988 5974989 CBY_3838 CBY_3839     TRUE 0.839 11.000 0.000 NA   NA
 5974989 5974990 CBY_3839 CBY_3840     FALSE 0.046 273.000 0.000 1.000 N NA
 5974990 5974991 CBY_3840 CBY_3841   chrA TRUE 0.710 35.000 0.000 1.000 N NA
 5974991 5974992 CBY_3841 CBY_3842 chrA chrA TRUE 0.988 2.000 0.000 0.001 Y NA
 5974992 5974993 CBY_3842 CBY_3843 chrA   FALSE 0.226 167.000 0.000 NA   NA
 5974993 5974994 CBY_3843 CBY_3844   accC FALSE 0.275 131.000 0.000 NA   NA
 5974994 5974995 CBY_3844 CBY_3845 accC   TRUE 0.966 43.000 0.000 0.001 Y NA
 5974995 5974996 CBY_3845 CBY_3846     TRUE 0.834 15.000 0.000 NA N NA
 5974996 5974997 CBY_3846 CBY_3847     TRUE 0.998 -3.000 0.596 NA Y NA
 5974997 5974998 CBY_3847 CBY_3848     FALSE 0.265 138.000 0.000 1.000   NA
 5974998 5974999 CBY_3848 CBY_3849     TRUE 0.862 39.000 0.013 NA   NA
 5974999 5975000 CBY_3849 CBY_3850     TRUE 0.938 13.000 0.013 NA   NA
 5975000 5975001 CBY_3850 CBY_3851     TRUE 0.946 15.000 0.026 NA   NA
 5975001 5975002 CBY_3851 CBY_3852     FALSE 0.130 282.000 0.026 1.000 N NA
 5975002 5975003 CBY_3852 CBY_3853     FALSE 0.191 183.000 0.000 1.000   NA
 5975003 5975004 CBY_3853 CBY_3854     TRUE 0.975 2.000 0.148 1.000   NA
 5975004 5975005 CBY_3854 CBY_3855     FALSE 0.100 222.000 0.000 1.000 N NA
 5975005 5975006 CBY_3855 CBY_3856     FALSE 0.369 95.000 0.000 1.000   NA
 5975006 5975007 CBY_3856 CBY_3857     FALSE 0.103 220.000 0.000 NA   NA
 5975008 5975009 CBY_3858 CBY_3859     TRUE 0.970 20.000 0.167 NA   NA
 5975010 5975011 CBY_3860 CBY_3861     FALSE 0.076 238.000 0.000 NA   NA
 5975011 5975012 CBY_3861 CBY_3862     TRUE 0.814 -13.000 0.000 NA   NA
 5975012 5975013 CBY_3862 CBY_3863     FALSE 0.281 128.000 0.000 NA   NA
 5975013 5975014 CBY_3863 CBY_3864     TRUE 0.819 -10.000 0.000 NA   NA
 5975014 5975015 CBY_3864 CBY_3865     TRUE 0.649 220.000 0.000 0.047 Y NA
 5975016 5975017 CBY_3866 CBY_3867     TRUE 0.992 27.000 0.050 1.000 Y NA
 5975018 5975019 CBY_3868 CBY_3869     FALSE 0.168 193.000 0.000 NA   NA
 5975020 5975021 CBY_3870 CBY_3871   alr TRUE 0.835 130.000 0.500 1.000 N NA
 5975022 5975023 CBY_3872 CBY_3873     FALSE 0.059 253.000 0.000 NA   NA
 5975023 5975024 CBY_3873 CBY_3874   pulA TRUE 0.775 27.000 0.000 NA   NA
 5975024 5975025 CBY_3874 CBY_3875 pulA   FALSE 0.165 194.000 0.000 NA   NA
 5975026 5975027 CBY_3876 CBY_3877     FALSE 0.036 289.000 0.000 NA   NA
 5975028 5975029 CBY_3878 CBY_3879   chrA TRUE 0.998 -3.000 0.758 0.001 Y NA
 5975029 5975030 CBY_3879 CBY_3880 chrA   FALSE 0.133 206.000 0.000 1.000   NA
 5975030 5975031 CBY_3880 CBY_3881     TRUE 0.921 20.000 0.010 0.026   NA
 5975031 5975032 CBY_3881 CBY_3882     FALSE 0.067 247.000 0.000 1.000 N NA
 5975032 5975033 CBY_3882 CBY_3883     FALSE 0.277 133.000 0.000 1.000 N NA
 5975033 5975034 CBY_3883 CBY_3884     TRUE 0.951 57.000 0.000 0.027 Y NA
 5975034 5975035 CBY_3884 CBY_3885     FALSE 0.393 89.000 0.000 NA   NA
 5975035 5975036 CBY_3885 CBY_3886     FALSE 0.251 154.000 0.000 NA   NA
 5975036 5975037 CBY_3886 CBY_3887     TRUE 0.744 80.000 0.035 NA   NA
 5975037 5975038 CBY_3887 CBY_3888   deoD FALSE 0.278 132.000 0.000 1.000 N NA
 5975038 5975039 CBY_3888 CBY_3889 deoD cdd TRUE 0.986 20.000 0.000 1.000 Y NA
 5975039 5975040 CBY_3889 CBY_3890 cdd   TRUE 0.522 158.000 0.021 1.000   NA
 5975040 5975041 CBY_3890 CBY_3891     TRUE 0.988 2.000 0.720 0.028   NA
 5975041 5975042 CBY_3891 CBY_3892     TRUE 0.983 -7.000 0.438 1.000   NA
 5975042 5975043 CBY_3892 CBY_3893     FALSE 0.318 216.000 0.030 1.000   NA
 5975043 5975044 CBY_3893 CBY_3894     TRUE 0.721 155.000 0.182 1.000   NA
 5975044 5975045 CBY_3894 CBY_3895     FALSE 0.008 737.000 0.000 1.000 N NA
 5975045 5975046 CBY_3895 CBY_3896     TRUE 0.989 -3.000 0.894 NA N NA
 5975046 5975047 CBY_3896 CBY_3897     FALSE 0.008 627.000 0.000 NA   NA
 5975047 5975048 CBY_3897 CBY_3898     FALSE 0.243 158.000 0.000 NA   NA
 5975048 5975049 CBY_3898 CBY_3899   clpS TRUE 0.987 6.000 0.596 NA   NA
 5975049 5975050 CBY_3899 CBY_3900 clpS   FALSE 0.019 363.000 0.000 NA   NA
 5975050 5975051 CBY_3900 CBY_3901     FALSE 0.024 329.000 0.000 1.000   NA
 5975051 5975052 CBY_3901 CBY_3902     TRUE 0.827 15.000 0.000 1.000   NA
 5975052 5975053 CBY_3902 CBY_3903     FALSE 0.154 197.000 0.000 1.000   NA
 5975053 5975054 CBY_3903 CBY_3904     FALSE 0.010 528.000 0.000 1.000   NA
 5975054 5975055 CBY_3904 CBY_3905     FALSE 0.436 79.000 0.000 1.000 N NA
 5975055 5975056 CBY_3905 CBY_3906     TRUE 0.784 152.000 0.333 1.000   NA
 5975056 5975057 CBY_3906 CBY_3907     TRUE 0.986 -10.000 0.800 1.000   NA
 5975057 5975058 CBY_3907 CBY_3908     TRUE 0.716 189.000 0.400 0.091 N NA
 5975058 5975059 CBY_3908 CBY_3909     TRUE 0.984 78.000 0.400 1.000 Y NA
 5975059 5975060 CBY_3909 CBY_3910     FALSE 0.126 209.000 0.000 NA   NA
 5975062 5975063 CBY_3912 CBY_3913     TRUE 0.817 18.000 0.000 NA   NA
 5975063 5975064 CBY_3913 CBY_3914     FALSE 0.425 80.000 0.000 NA   NA
 5975064 5975065 CBY_3914 CBY_3915   trpS FALSE 0.070 244.000 0.000 1.000 N NA
 5975065 5975066 CBY_3915 CBY_3916 trpS   FALSE 0.012 449.000 0.000 NA   NA
 5975066 5975067 CBY_3916 CBY_3917     FALSE 0.239 160.000 0.000 NA   NA
 5975067 5975068 CBY_3917 CBY_3918     FALSE 0.028 311.000 0.000 NA   NA
 5975068 5975069 CBY_3918 CBY_3919     FALSE 0.175 190.000 0.000 NA   NA
 5975069 5975070 CBY_3919 CBY_3920   nadC FALSE 0.034 291.000 0.000 1.000   NA
 5975070 5975071 CBY_3920 CBY_3921 nadC   TRUE 0.994 -22.000 0.046 1.000 Y NA
 5975071 5975072 CBY_3921 CBY_3922   nadA TRUE 0.994 -7.000 0.042 1.000 Y NA
 5975073 5975074 CBY_3923 CBY_3924     TRUE 0.984 0.000 0.412 1.000 N NA
 5975074 5975075 CBY_3924 CBY_3925     TRUE 0.984 -6.000 0.471 NA   NA
 5975076 5975077 CBY_3926 CBY_3927 hcp   FALSE 0.329 229.000 0.069 NA   NA
 5975078 5975079 CBY_3928 CBY_3929     TRUE 0.747 31.000 0.000 NA   NA
 5975080 5975081 CBY_3930 CBY_3931   deoC TRUE 0.874 178.000 0.009 1.000 Y NA
 5975083 5975084 CBY_3933 CBY_3934     FALSE 0.275 131.000 0.000 NA   NA
 5975084 5975085 CBY_3934 CBY_3935   brnQ FALSE 0.298 122.000 0.000 1.000 N NA
 5975085 5975086 CBY_3935 CBY_3936 brnQ   FALSE 0.008 689.000 0.000 1.000 N NA
 5975086 5975087 CBY_3936 CBY_3937   trx FALSE 0.085 229.000 0.000 1.000   NA
 5975087 5975088 CBY_3937 CBY_3938 trx   FALSE 0.040 280.000 0.000 NA   NA
 5975088 5975089 CBY_3938 CBY_3939     FALSE 0.226 167.000 0.000 NA   NA
 5975091 5975092 CBY_3941 CBY_3942     FALSE 0.264 140.000 0.000 1.000   NA
 5975094 5975095 CBY_4378 CBY_4379 rrf rrl FALSE 0.162 195.000 0.000 NA   NA
 5975096 5975097 CBY_3945 CBY_3946     FALSE 0.044 274.000 0.000 NA   NA
 5975098 5975099 CBY_2900 CBY_2901 rpsI   FALSE 0.015 394.000 0.000 NA   NA
 5975099 5975100 CBY_2901 CBY_2902   cwlD FALSE 0.412 190.000 0.018 1.000 N NA
 5975100 5975101 CBY_2902 CBY_2903 cwlD   FALSE 0.038 494.000 0.026 1.000 N NA
 5975101 5975102 CBY_2903 CBY_2904   fumB TRUE 0.987 60.000 0.262 0.001 Y NA
 5975104 5975105 CBY_2906 CBY_2907     TRUE 0.503 63.000 0.000 1.000   NA
 5975105 5975106 CBY_2907 CBY_2908     TRUE 0.998 -28.000 0.857 1.000 Y NA
 5975106 5975107 CBY_2908 CBY_2909     FALSE 0.394 197.000 0.022 1.000 N NA
 5975107 5975108 CBY_2909 CBY_2910     TRUE 0.574 53.000 0.000 NA   NA
 5975108 5975109 CBY_2910 CBY_2911     TRUE 0.825 16.000 0.000 NA   NA
 5975109 5975110 CBY_2911 CBY_2912   ptsP FALSE 0.092 226.000 0.000 1.000 N NA
 5975110 5975111 CBY_2912 CBY_2913 ptsP   FALSE 0.037 285.000 0.000 1.000   NA
 5975111 5975112 CBY_2913 CBY_2914   iadA FALSE 0.268 135.000 0.000 1.000   NA
 5975114 5975115 CBY_2916 CBY_2917     TRUE 0.982 -33.000 0.502 NA   NA
 5975115 5975116 CBY_2917 CBY_2918     TRUE 0.675 138.000 0.083 NA   NA
 5975116 5975117 CBY_2918 CBY_2919   ptb FALSE 0.100 289.000 0.013 NA   NA
 5975117 5975118 CBY_2919 CBY_2920 ptb buk TRUE 0.976 96.000 0.275 1.000 Y NA
 5975118 5975119 CBY_2920 CBY_2921 buk ilvC FALSE 0.010 542.000 0.000 1.000 N NA
 5975119 5975120 CBY_2921 CBY_2922 ilvC   FALSE 0.042 278.000 0.000 1.000 N NA
 5975120 5975121 CBY_2922 CBY_2923     FALSE 0.151 198.000 0.000 0.077 N NA
 5975121 5975122 CBY_2923 CBY_2924     TRUE 0.568 54.000 0.000 NA   NA
 5975122 5975123 CBY_2924 CBY_2925     FALSE 0.126 209.000 0.000 NA   NA
 5975123 5975124 CBY_2925 CBY_2926     TRUE 0.981 30.000 0.000 NA Y NA
 5975124 5975125 CBY_2926 CBY_2927     TRUE 0.976 34.000 0.000 NA Y NA
 5975125 5975126 CBY_2927 CBY_2928     FALSE 0.208 176.000 0.000 NA   NA
 5975126 5975127 CBY_2928 CBY_2929     TRUE 0.683 93.000 0.025 NA   NA
 5975127 5975128 CBY_2929 CBY_2930   glmM FALSE 0.060 252.000 0.000 1.000   NA
 5975128 5975129 CBY_2930 CBY_2931 glmM   FALSE 0.198 180.000 0.000 NA   NA
 5975129 5975130 CBY_2931 CBY_2932   ilvN FALSE 0.010 514.000 0.000 NA   NA
 5975130 5975131 CBY_2932 CBY_2933 ilvN   TRUE 0.925 113.000 0.006 1.000 Y NA
 5975131 5975132 CBY_2933 CBY_2934   leuC TRUE 0.993 15.000 0.016 1.000 Y NA
 5975132 5975133 CBY_2934 CBY_2935 leuC leuD TRUE 0.998 14.000 0.615 0.001 Y NA
 5975133 5975134 CBY_2935 CBY_2936 leuD leuB TRUE 0.923 193.000 0.191 0.001 Y NA
 5975134 5975135 CBY_2936 CBY_2937 leuB ilvD TRUE 0.995 7.000 0.044 1.000 Y NA
 5975135 5975136 CBY_2937 CBY_2938 ilvD ilvB TRUE 0.920 168.000 0.062 0.002 Y NA
 5975136 5975137 CBY_2938 CBY_2939 ilvB   FALSE 0.137 206.000 0.000 1.000 N NA
 5975137 5975138 CBY_2939 CBY_2940     FALSE 0.024 329.000 0.000 1.000 N NA
 5975138 5975139 CBY_2940 CBY_2941     TRUE 0.986 96.000 1.000 0.028 Y NA
 5975139 5975140 CBY_2941 CBY_2942     TRUE 0.998 0.000 1.000 0.028 Y NA
 5975140 5975141 CBY_2942 CBY_2943   malQ TRUE 0.957 189.000 0.667 1.000 Y NA
 5975141 5975142 CBY_2943 CBY_2944 malQ   FALSE 0.066 249.000 0.000 1.000 N NA
 5975142 5975143 CBY_2944 CBY_2945     FALSE 0.051 266.000 0.000 1.000 N NA
 5975143 5975144 CBY_2945 CBY_2946     TRUE 0.958 127.000 0.167 1.000 Y NA
 5975144 5975145 CBY_2946 CBY_2947     TRUE 0.987 6.000 0.610 NA   NA
 5975147 5975148 CBY_2949 CBY_2950     TRUE 0.983 5.000 0.333 NA N NA
 5975148 5975149 CBY_2950 CBY_2951     TRUE 0.747 135.000 0.182 NA N NA
 5975149 5975150 CBY_2951 CBY_2952     FALSE 0.275 131.000 0.000 NA   NA
 5975150 5975151 CBY_2952 CBY_2953     FALSE 0.321 111.000 0.000 NA   NA
 5975151 5975152 CBY_2953 CBY_4335     FALSE 0.408 85.000 0.000 NA   NA
 5975152 5975153 CBY_4335 CBY_2954   glmS FALSE 0.223 169.000 0.000 NA   NA
 5975153 5975154 CBY_2954 CBY_2955 glmS   FALSE 0.011 504.000 0.000 1.000 N NA
 5975154 5975155 CBY_2955 CBY_2956     TRUE 0.957 -10.000 0.065 0.052   NA
 5975155 5975156 CBY_2956 CBY_2957     TRUE 0.840 10.000 0.000 NA   NA
 5975156 5975157 CBY_2957 CBY_2958   tnsA FALSE 0.058 254.000 0.000 NA   NA
 5975157 5975158 CBY_2958 CBY_2959 tnsA   TRUE 0.842 3.000 0.000 NA   NA
 5975158 5975159 CBY_2959 CBY_2960     TRUE 0.811 -16.000 0.000 NA   NA
 5975159 5975160 CBY_2960 CBY_2961     FALSE 0.007 874.000 0.000 NA   NA
 5975160 5975161 CBY_2961 CBY_2962     TRUE 0.739 32.000 0.000 NA   NA
 5975161 5975162 CBY_2962 CBY_2963   tnsA FALSE 0.022 339.000 0.000 NA   NA
 5975162 5975163 CBY_2963 CBY_2964 tnsA   TRUE 0.826 -3.000 0.000 0.052   NA
 5975163 5975164 CBY_2964 CBY_2965     TRUE 0.825 -7.000 0.000 NA   NA
 5975164 5975165 CBY_2965 CBY_2966     TRUE 0.817 18.000 0.000 NA   NA
 5975165 5975166 CBY_2966 CBY_2967     TRUE 0.606 49.000 0.000 NA   NA
 5975166 5975167 CBY_2967 CBY_2968     FALSE 0.389 90.000 0.000 NA   NA
 5975167 5975168 CBY_2968 CBY_2969     TRUE 0.998 2.000 0.390 NA Y NA
 5975168 5975169 CBY_2969 CBY_2970   tnsA FALSE 0.013 430.000 0.000 NA   NA
 5975169 5975170 CBY_2970 CBY_2971 tnsA   TRUE 0.506 63.000 0.000 NA   NA
 5975170 5975171 CBY_2971 CBY_2972   tnsB TRUE 0.832 -3.000 0.000 NA   NA
 5975171 5975172 CBY_2972 CBY_2973 tnsB   TRUE 0.986 -3.000 0.600 1.000   NA
 5975172 5975173 CBY_2973 CBY_2974     TRUE 0.958 51.000 0.750 NA   NA
 5975173 5975174 CBY_2974 CBY_2975     TRUE 0.842 6.000 0.000 NA   NA
 5975174 5975175 CBY_2975 CBY_2976     FALSE 0.104 219.000 0.000 NA   NA
 5975175 5975176 CBY_2976 CBY_2977     TRUE 0.775 27.000 0.000 NA   NA
 5975176 5975177 CBY_2977 CBY_2978     TRUE 0.798 22.000 0.000 NA   NA
 5975177 5975178 CBY_2978 CBY_2979     FALSE 0.085 230.000 0.000 NA   NA
 5975178 5975179 CBY_2979 CBY_2980     FALSE 0.032 299.000 0.000 NA   NA
 5975179 5975180 CBY_2980 CBY_2981     FALSE 0.269 136.000 0.000 NA   NA
 5975180 5975181 CBY_2981 CBY_2982     FALSE 0.251 154.000 0.000 NA   NA
 5975181 5975182 CBY_2982 CBY_2983     FALSE 0.009 575.000 0.000 NA   NA
 5975182 5975183 CBY_2983 CBY_2984     FALSE 0.271 134.000 0.000 NA   NA
 5975183 5975184 CBY_2984 CBY_2985     TRUE 0.865 128.000 0.000 1.000 Y NA
 5975184 5975185 CBY_2985 CBY_2986     TRUE 0.991 40.000 0.143 0.009 Y NA
 5975185 5975186 CBY_2986 CBY_2987     TRUE 0.985 21.000 0.000 0.015 Y NA
 5975186 5975187 CBY_2987 CBY_2988     TRUE 0.983 27.000 0.000 1.000 Y NA
 5975187 5975188 CBY_2988 CBY_2989     TRUE 0.998 22.000 1.000 0.001 Y NA
 5975188 5975189 CBY_2989 CBY_2990     TRUE 0.993 45.000 0.400 1.000 Y NA
 5975189 5975190 CBY_2990 CBY_2991   pfkB FALSE 0.232 370.000 0.000 1.000 Y NA
 5975190 5975191 CBY_2991 CBY_2992 pfkB   TRUE 0.973 58.000 0.019 1.000 Y NA
 5975193 5975194 CBY_2994 CBY_2995     TRUE 0.962 -13.000 0.087 NA   NA
 5975198 5975199 CBY_2999 CBY_3000     FALSE 0.013 431.000 0.000 1.000 N NA
 5975199 5975200 CBY_3000 CBY_3001     FALSE 0.057 255.000 0.000 NA   NA
 5975200 5975201 CBY_3001 CBY_3002     TRUE 0.785 25.000 0.000 NA   NA
 5975201 5975202 CBY_3002 CBY_3003     TRUE 0.890 28.000 0.002 NA   NA
 5975202 5975203 CBY_3003 CBY_3004     FALSE 0.265 143.000 0.000 NA   NA
 5975213 5975214 CBY_3014 CBY_3015     TRUE 0.945 37.000 0.167 1.000   NA
 5975214 5975215 CBY_3015 CBY_3016   fixA FALSE 0.013 426.000 0.000 1.000 N NA
 5975215 5975216 CBY_3016 CBY_3017 fixA etfA TRUE 0.994 49.000 0.875 0.008 Y NA
 5975216 5975217 CBY_3017 CBY_3018 etfA   TRUE 0.998 5.000 0.875 0.007 Y NA
 5975217 5975218 CBY_3018 CBY_3019     FALSE 0.134 206.000 0.000 NA   NA
 5975218 5975219 CBY_3019 CBY_3020     FALSE 0.223 169.000 0.000 NA   NA
 5975219 5975220 CBY_3020 CBY_3021     TRUE 0.985 -7.000 0.600 0.003   NA
 5975220 5975221 CBY_3021 CBY_3022     FALSE 0.082 232.000 0.000 1.000   NA
 5975221 5975222 CBY_3022 CBY_3023     TRUE 0.993 33.000 0.133 1.000 Y NA
 5975222 5975223 CBY_3023 CBY_3024     TRUE 0.832 83.000 0.133 NA   NA
 5975223 5975224 CBY_3024 CBY_3025     TRUE 0.983 30.000 1.000 NA   NA
 5975224 5975225 CBY_3025 CBY_3026     FALSE 0.444 78.000 0.000 NA N NA
 5975225 5975226 CBY_3026 CBY_3027     FALSE 0.187 187.000 0.000 1.000 N NA
 5975228 5975229 CBY_3029 CBY_3030 nagA   TRUE 0.483 68.000 0.000 1.000 N NA
 5975229 5975230 CBY_3030 CBY_3031     TRUE 0.646 197.000 0.286 0.015 N NA
 5975230 5975231 CBY_3031 CBY_3032     TRUE 0.992 53.000 0.600 0.009 Y NA
 5975231 5975232 CBY_3032 CBY_3033     TRUE 0.996 33.000 0.600 NA Y NA
 5975232 5975233 CBY_3033 CBY_3034     TRUE 0.984 2.000 0.400 NA   NA
 5975233 5975234 CBY_3034 CBY_3035     TRUE 0.926 36.000 0.071 1.000   NA
 5975234 5975235 CBY_3035 CBY_3036     FALSE 0.020 354.000 0.000 1.000   NA
 5975235 5975236 CBY_3036 CBY_3037     TRUE 0.733 160.000 0.222 1.000   NA
 5975236 5975237 CBY_3037 CBY_3038     TRUE 0.884 85.000 0.364 1.000 N NA
 5975237 5975238 CBY_3038 CBY_3039     FALSE 0.208 176.000 0.000 NA   NA
 5975238 5975239 CBY_3039 CBY_3040     FALSE 0.064 249.000 0.000 NA   NA
 5975239 5975240 CBY_3040 CBY_3041     FALSE 0.020 356.000 0.000 1.000   NA
 5975240 5975241 CBY_3041 CBY_3042     TRUE 0.978 78.000 0.162 1.000 Y NA
 5975241 5975242 CBY_3042 CBY_3043     TRUE 0.985 14.000 0.545 0.025 N NA
 5975242 5975243 CBY_3043 CBY_3044     TRUE 0.997 23.000 0.714 0.008 Y NA
 5975243 5975244 CBY_3044 CBY_3045     TRUE 0.696 176.000 0.216 1.000 N NA
 5975245 5975246 CBY_3046 CBY_3047     TRUE 0.798 22.000 0.000 NA   NA
 5975247 5975248 CBY_3048 CBY_3049     FALSE 0.029 582.000 0.024 1.000   NA
 5975248 5975249 CBY_3049 CBY_3050   groS FALSE 0.019 359.000 0.000 1.000   NA
 5975249 5975250 CBY_3050 CBY_3051 groS groL TRUE 0.989 71.000 0.674 0.089 Y NA
 5975250 5975251 CBY_3051 CBY_3052 groL   FALSE 0.257 150.000 0.000 1.000   NA
 5975251 5975252 CBY_3052 CBY_3053   guaB FALSE 0.014 410.000 0.000 1.000   NA
 5975252 5975253 CBY_3053 CBY_3054 guaB guaA TRUE 0.959 126.000 0.190 0.001 Y NA
 5975253 5975254 CBY_3054 CBY_3055 guaA   FALSE 0.193 183.000 0.000 NA   NA
 5975256 5975257 CBY_3057 CBY_3058   pgi FALSE 0.052 264.000 0.000 NA   NA
 5975257 5975258 CBY_3058 CBY_3059 pgi   TRUE 0.946 6.000 0.018 NA   NA
 5975258 5975259 CBY_3059 CBY_3060     FALSE 0.103 220.000 0.000 NA   NA
 5975259 5975260 CBY_3060 CBY_3061     TRUE 0.879 55.000 0.083 NA   NA
 5975260 5975261 CBY_3061 CBY_3062     FALSE 0.203 254.000 0.041 NA   NA
 5975261 5975262 CBY_3062 CBY_3063   pcrA FALSE 0.009 593.000 0.000 1.000 N NA
 5975262 5975263 CBY_3063 CBY_3064 pcrA ligA TRUE 0.901 176.000 0.039 0.010 Y NA
 5975263 5975264 CBY_3064 CBY_3065 ligA gatC FALSE 0.022 619.000 0.006 1.000 N NA
 5975264 5975265 CBY_3065 CBY_3066 gatC   TRUE 0.997 22.000 0.643 0.001 Y NA
 5975265 5975266 CBY_3066 CBY_3067     TRUE 0.997 20.000 0.492 0.001 Y NA
 5975270 5975271 CBY_3071 CBY_3072   rdgB TRUE 0.676 72.000 0.002 1.000 N NA
 5975271 5975272 CBY_3072 CBY_3073 rdgB   TRUE 0.956 23.000 0.085 1.000   NA
 5975273 5975274 CBY_4285 CBY_4286 rrf   TRUE 0.789 24.000 0.000 NA   NA
 5975274 5975275 CBY_4286 CBY_4287     TRUE 0.842 4.000 0.000 NA   NA
 5975275 5975276 CBY_4287 CBY_2112     FALSE 0.025 323.000 0.000 NA   NA
 5975276 5975277 CBY_2112 CBY_2113     FALSE 0.212 174.000 0.000 NA   NA
 5975277 5975278 CBY_2113 CBY_2114     TRUE 0.973 27.000 0.333 NA   NA
 5975278 5975279 CBY_2114 CBY_2115     FALSE 0.028 309.000 0.000 NA   NA
 5975279 5975280 CBY_2115 CBY_2116     FALSE 0.016 380.000 0.000 NA   NA
 5975280 5975281 CBY_2116 CBY_2117     FALSE 0.410 179.000 0.010 0.039   NA
 5975283 5975284 CBY_2119 CBY_2120 fusA   FALSE 0.293 217.000 0.021 NA   NA
 5975284 5975285 CBY_2120 CBY_2121     FALSE 0.007 889.000 0.000 NA   NA
 5975285 5975286 CBY_2121 CBY_2122     FALSE 0.304 119.000 0.000 1.000 N NA
 5975286 5975287 CBY_2122 CBY_2123     TRUE 0.989 3.000 0.000 1.000 Y NA
 5975287 5975288 CBY_2123 CBY_2124     TRUE 0.986 18.000 0.000 0.015 Y NA
 5975288 5975289 CBY_2124 CBY_2125     TRUE 0.998 -13.000 1.000 0.015 Y NA
 5975289 5975290 CBY_2125 CBY_2126     TRUE 0.998 14.000 1.000 0.015 Y NA
 5975290 5975291 CBY_2126 CBY_2127     TRUE 0.839 157.000 0.000 0.009 Y NA
 5975293 5975294 CBY_2129 CBY_2130     FALSE 0.031 301.000 0.000 NA   NA
 5975294 5975295 CBY_2130 CBY_2131     TRUE 0.969 -19.000 0.154 NA   NA
 5975295 5975296 CBY_2131 CBY_2132     FALSE 0.361 98.000 0.000 NA   NA
 5975297 5975298 CBY_2133 CBY_2134     FALSE 0.164 194.000 0.000 1.000   NA
 5975299 5975300 CBY_2135 CBY_2136     TRUE 0.587 51.000 0.000 1.000   NA
 5975300 5975301 CBY_2136 CBY_2137     FALSE 0.008 747.000 0.000 1.000 N NA
 5975301 5975302 CBY_2137 CBY_4288   rrf FALSE 0.148 200.000 0.000 NA   NA
 5975302 5975303 CBY_4288 CBY_4289 rrf   TRUE 0.842 6.000 0.000 NA   NA
 5975308 5975309 CBY_2144 CBY_4290     FALSE 0.418 82.000 0.000 NA   NA
 5975309 5975310 CBY_4290 CBY_4290     TRUE 0.802 -52.000 0.000 NA   NA
 5975313 5975314 CBY_0185 CBY_0186     FALSE 0.190 184.000 0.000 NA   NA
 5975314 5975315 CBY_0186 CBY_0187     FALSE 0.131 207.000 0.000 NA   NA
 5975315 5975316 CBY_0187 CBY_0188   miaA TRUE 0.891 53.000 0.097 0.089 N NA
 5975316 5975317 CBY_0188 CBY_0189 miaA hfq TRUE 0.932 45.000 0.192 1.000   NA
 5975317 5975318 CBY_0189 CBY_0190 hfq   FALSE 0.093 224.000 0.000 1.000   NA
 5975318 5975319 CBY_0190 CBY_0191     FALSE 0.266 147.000 0.000 1.000 N NA
 5975321 5975322 CBY_0193 CBY_0194     TRUE 0.700 148.000 0.118 NA   NA
 5975324 5975325 CBY_3702 CBY_3703     FALSE 0.033 294.000 0.000 NA   NA
 5975325 5975326 CBY_3703 CBY_3704     TRUE 0.701 36.000 0.000 NA   NA
 5975326 4730534 CBY_3704 CBY_3705     FALSE 0.226 167.000 0.000 NA   NA
 4730534 5975327 CBY_3705 CBY_3706     FALSE 0.302 118.000 0.000 NA   NA
 5975327 5975328 CBY_3706 CBY_3707     TRUE 0.821 -9.000 0.000 NA   NA
 5975328 5975329 CBY_3707 CBY_3708     FALSE 0.372 95.000 0.000 NA   NA
 5975329 5975330 CBY_3708 CBY_3709     TRUE 0.832 -3.000 0.000 NA   NA
 5975332 5975333 CBY_3711 CBY_3712   asrA FALSE 0.296 120.000 0.000 1.000   NA
 5975333 5975334 CBY_3712 CBY_3713 asrA asrB TRUE 0.985 3.000 0.455 0.026   NA
 5975334 5975335 CBY_3713 CBY_3714 asrB asrC TRUE 0.988 13.000 0.000 0.025 Y NA
 5975335 5975336 CBY_3714 CBY_3715 asrC   FALSE 0.114 214.000 0.000 1.000   NA
 5975336 5975337 CBY_3715 CBY_3716     FALSE 0.054 259.000 0.000 NA   NA
 5975339 5975340 CBY_3718 CBY_3719     TRUE 0.745 31.000 0.000 1.000   NA
 5975343 5975344 CBY_3722 CBY_3723   thiH TRUE 0.996 -7.000 0.128 0.003 Y NA
 5975344 5975345 CBY_3723 CBY_3724 thiH thiG TRUE 0.997 19.000 0.277 0.003 Y NA
 5975347 5975348 CBY_3726 CBY_3727 thiF thiS TRUE 0.998 2.000 0.346 1.000 Y NA
 5975349 5975350 CBY_3728 CBY_3729     FALSE 0.221 170.000 0.000 NA   NA
 5975350 5975351 CBY_3729 CBY_3730   map TRUE 0.797 183.000 0.000 1.000 Y NA
 5975351 5975352 CBY_3730 CBY_3731 map   FALSE 0.020 357.000 0.000 1.000 N NA
 5975352 5975353 CBY_3731 CBY_3732     TRUE 0.994 42.000 0.594 1.000 Y NA
 5975353 5975354 CBY_3732 CBY_3733     TRUE 0.998 0.000 0.400 0.027 Y NA
 5975354 5975355 CBY_3733 CBY_3734     TRUE 0.998 2.000 0.947 0.005 Y NA
 5975355 5975356 CBY_3734 CBY_3735   recQ FALSE 0.073 242.000 0.000 1.000 N NA
 5975356 5975357 CBY_3735 CBY_3736 recQ   FALSE 0.265 139.000 0.000 1.000   NA
 5975357 5975358 CBY_3736 CBY_3737     FALSE 0.177 189.000 0.000 1.000   NA
 5975358 5975359 CBY_3737 CBY_3738     FALSE 0.239 361.000 0.000 1.000 Y NA
 5975359 5975360 CBY_3738 CBY_3739     TRUE 0.987 10.000 0.605 NA   NA
 5975360 5975361 CBY_3739 CBY_3740     FALSE 0.430 184.000 0.017 NA   NA
 5975361 5975362 CBY_3740 CBY_3741     FALSE 0.131 208.000 0.000 1.000 N NA
 5975363 5975364 CBY_0251 CBY_0252 gltX   FALSE 0.050 266.000 0.000 NA   NA
 5975365 5975366 CBY_0253 CBY_0254     FALSE 0.120 211.000 0.000 NA   NA
 5975366 4730539 CBY_0254 CBY_0255     TRUE 0.832 -3.000 0.000 NA   NA
 5975367 5975368 CBY_0256 CBY_0257     FALSE 0.010 508.000 0.000 NA   NA
 5975371 5975372 CBY_0260 CBY_0261     TRUE 0.843 41.000 0.009 NA   NA
 5975372 5975373 CBY_0261 CBY_0262     FALSE 0.324 110.000 0.000 NA   NA
 5975377 5975378 CBY_0266 CBY_0267     FALSE 0.401 87.000 0.000 NA   NA
 5975378 5975379 CBY_0267 CBY_0268     FALSE 0.065 248.000 0.000 NA   NA
 5975379 5975380 CBY_0268 CBY_0269     TRUE 0.984 -25.000 0.646 NA   NA
 5975380 5975381 CBY_0269 CBY_0270     TRUE 0.997 -16.000 0.270 1.000 Y NA
 5975381 5975382 CBY_0270 CBY_0271     FALSE 0.014 402.000 0.000 0.088 N NA
 5975382 5975383 CBY_0271 CBY_0272   trx FALSE 0.142 202.000 0.000 1.000   NA
 5975384 5975385 CBY_0273 CBY_0274 ilvE nadE FALSE 0.243 358.000 0.000 1.000 Y NA
 5975386 5975387 CBY_0275 CBY_0276     TRUE 0.997 3.000 0.313 NA Y NA
 5975387 5975388 CBY_0276 CBY_0277     FALSE 0.033 295.000 0.000 NA   NA
 5975389 5975390 CBY_1413 CBY_1414     FALSE 0.359 101.000 0.000 1.000 N NA
 5975390 5975391 CBY_1414 CBY_1415   cbiM TRUE 0.998 2.000 0.861 0.009 Y NA
 5975391 5975392 CBY_1415 CBY_1416 cbiM   FALSE 0.128 570.000 0.000 1.000 Y NA
 5975392 5975393 CBY_1416 CBY_1417   cbiQ TRUE 0.997 10.000 0.335 0.002 Y NA
 5975393 5975394 CBY_1417 CBY_1418 cbiQ   FALSE 0.054 261.000 0.000 1.000 N NA
 5975397 5975398 CBY_1421 CBY_1422     FALSE 0.007 946.000 0.000 NA   NA
 5975399 5975400 CBY_1423 CBY_1424     FALSE 0.325 109.000 0.000 1.000   NA
 5975401 5975402 CBY_1425 CBY_1426     TRUE 0.842 4.000 0.000 NA   NA
 5975402 5975403 CBY_1426 CBY_1427     FALSE 0.466 71.000 0.000 NA   NA
 5975409 5975410 CBY_1434 CBY_1435     TRUE 0.901 95.000 0.714 NA   NA
 5975410 5975411 CBY_1435 CBY_1436     TRUE 0.984 -13.000 0.625 1.000   NA
 5975411 5975412 CBY_1436 CBY_1437     TRUE 0.980 10.000 0.250 NA N NA
 5975412 5975413 CBY_1437 CBY_1438     FALSE 0.081 234.000 0.000 NA   NA
 5975413 5975414 CBY_1438 CBY_1439     FALSE 0.298 120.000 0.000 NA   NA
 5975414 5975415 CBY_1439 CBY_1440     FALSE 0.029 306.000 0.000 NA   NA
 5975415 5975416 CBY_1440 CBY_1441     FALSE 0.009 554.000 0.000 0.075 N NA
 5975416 5975417 CBY_1441 CBY_1442     FALSE 0.049 269.000 0.000 1.000 N NA
 5975419 5975420 CBY_1444 CBY_1446     TRUE 0.842 5.000 0.000 NA   NA
 5975422 5975423 CBY_1448 CBY_1449     FALSE 0.023 338.000 0.000 NA N NA
 5975423 5975424 CBY_1449 CBY_1450     FALSE 0.046 273.000 0.000 1.000 N NA
 5975424 5975425 CBY_1450 CBY_1451     FALSE 0.014 406.000 0.000 0.026 N NA
 5975426 5975427 CBY_1452 CBY_1453     TRUE 0.983 90.000 0.571 0.016 Y NA
 5975428 5975429 CBY_1454 CBY_1455     TRUE 0.989 13.000 1.000 NA N NA
 5975429 5975430 CBY_1455 CBY_1456     FALSE 0.083 235.000 0.000 NA N NA
 5975432 5975433 CBY_1458 CBY_1459     FALSE 0.009 554.000 0.000 NA   NA
 5975433 5975434 CBY_1459 CBY_1460     TRUE 0.997 34.000 0.943 0.015 Y NA
 5975434 5975435 CBY_1460 CBY_1461     TRUE 0.998 19.000 0.812 0.015 Y NA
 5975435 5975436 CBY_1461 CBY_1462     TRUE 0.686 205.000 0.583 NA   NA
 5975436 5975437 CBY_1462 CBY_1463     FALSE 0.041 277.000 0.000 NA   NA
 5975437 5975438 CBY_1463 CBY_1464     TRUE 0.950 50.000 0.455 1.000 N NA
 5975438 5975439 CBY_1464 CBY_1465     TRUE 0.998 -7.000 0.455 1.000 Y NA
 5975440 5975441 CBY_1466 CBY_1467     FALSE 0.030 300.000 0.000 0.075   NA
 5975442 5975443 CBY_1468 CBY_1469     TRUE 0.705 35.000 0.000 NA   NA
 5975443 5975444 CBY_1469 CBY_1470   feoB FALSE 0.306 117.000 0.000 NA   NA
 5975445 5975446 CBY_0357 CBY_0358     FALSE 0.268 138.000 0.000 NA   NA
 5975448 5975449 CBY_1731 CBY_1732     FALSE 0.483 67.000 0.000 NA   NA
 5975450 5975451 CBY_1733 CBY_1734     TRUE 0.984 59.000 0.129 0.025 Y NA
 5975451 5975452 CBY_1734 CBY_1735     FALSE 0.113 216.000 0.000 1.000 N NA
 5975452 5975453 CBY_1735 CBY_1736     TRUE 0.627 96.000 0.010 1.000 N NA
 5975453 5975454 CBY_1736 CBY_1737     FALSE 0.015 392.000 0.000 1.000   NA
 5975454 5975455 CBY_1737 CBY_1738     FALSE 0.188 184.000 0.000 1.000   NA
 5975457 5975458 CBY_1740 CBY_1741     FALSE 0.012 442.000 0.000 NA   NA
 5975458 5975459 CBY_1741 CBY_1742   gidA FALSE 0.294 124.000 0.000 1.000 N NA
 5975459 5975460 CBY_1742 CBY_1743 gidA   TRUE 0.947 61.000 0.000 1.000 Y NA
 5975460 5975461 CBY_1743 CBY_1744     TRUE 0.953 55.000 0.000 0.001 Y NA
 5975461 5975462 CBY_1744 CBY_1745     TRUE 0.522 61.000 0.000 NA   NA
 5975462 5975463 CBY_1745 CBY_1746     FALSE 0.012 445.000 0.000 NA   NA
 5975464 5975465 CBY_2314 CBY_2315     FALSE 0.477 68.000 0.000 NA   NA
 5975465 5975466 CBY_2315 CBY_2316     FALSE 0.031 302.000 0.000 NA   NA
 5975466 5975467 CBY_2316 CBY_2317     FALSE 0.444 76.000 0.000 NA   NA
 5975467 5975468 CBY_2317 CBY_2318     FALSE 0.335 107.000 0.000 NA   NA
 5975468 5975469 CBY_2318 CBY_2319   asrA FALSE 0.058 254.000 0.000 NA   NA
 5975469 5975470 CBY_2319 CBY_2320 asrA asrB TRUE 0.985 3.000 0.455 0.025   NA
 5975470 5975471 CBY_2320 CBY_2321 asrB asrC TRUE 0.997 13.000 0.200 0.025 Y NA
 5975471 5975472 CBY_2321 CBY_2322 asrC   FALSE 0.014 421.000 0.000 1.000 N NA
 5975472 5975473 CBY_2322 CBY_2323     FALSE 0.094 225.000 0.000 1.000 N NA
 5975473 5975474 CBY_2323 CBY_2324   rpiA TRUE 0.483 68.000 0.000 1.000 N NA
 5975474 5975475 CBY_2324 CBY_2325 rpiA   TRUE 0.837 11.000 0.000 1.000   NA
 5975476 5975477 CBY_2326 CBY_2327     FALSE 0.354 100.000 0.000 1.000   NA
 5975477 5975478 CBY_2327 CBY_2328     TRUE 0.995 3.000 0.051 1.000 Y NA
 5975479 5975480 CBY_2329 CBY_2330     FALSE 0.282 130.000 0.000 1.000 N NA
 5975480 5975481 CBY_2330 CBY_2331     TRUE 0.995 -3.000 0.069 1.000 Y NA
 5975481 5975482 CBY_2331 CBY_2332     FALSE 0.072 242.000 0.000 NA   NA
 5975482 5975483 CBY_2332 CBY_2333     FALSE 0.108 217.000 0.000 NA   NA
 5975483 5975484 CBY_2333 CBY_2334     FALSE 0.027 314.000 0.000 1.000   NA
 5975486 5975487 CBY_2336 CBY_2337   polC FALSE 0.051 265.000 0.000 1.000   NA
 5975487 5975488 CBY_2337 CBY_2338 polC   FALSE 0.054 260.000 0.000 NA   NA
 5975488 5975489 CBY_2338 CBY_2339     TRUE 0.784 129.000 0.250 NA   NA
 5975491 5975492 CBY_2341 CBY_2342   xylB FALSE 0.070 244.000 0.000 1.000 N NA
 5975492 5975493 CBY_2342 CBY_2343 xylB   TRUE 0.956 93.000 0.043 1.000 Y NA
 5975493 5975494 CBY_2343 CBY_2344     TRUE 0.873 121.000 0.000 1.000 Y NA
 5975494 5975495 CBY_2344 CBY_2345   tkt TRUE 0.950 90.000 0.016 1.000 Y NA
 5975495 5975496 CBY_2345 CBY_2346 tkt   FALSE 0.026 321.000 0.000 NA   NA
 5975496 5975497 CBY_2346 CBY_2347     FALSE 0.428 236.000 0.222 NA   NA
 5975497 5975498 CBY_2347 CBY_2348     TRUE 0.862 83.000 0.222 1.000 N NA
 5975498 5975499 CBY_2348 CBY_2349     FALSE 0.199 179.000 0.000 1.000   NA
 5975499 5975500 CBY_2349 CBY_2350     FALSE 0.036 288.000 0.000 1.000   NA
 5975502 5975503 CBY_2352 CBY_2353     FALSE 0.015 401.000 0.000 NA   NA
 5975503 5975504 CBY_2353 CBY_2354     FALSE 0.171 193.000 0.000 1.000 N NA
 5975504 5975505 CBY_2354 CBY_2355     TRUE 0.998 4.000 0.600 0.006 Y NA
 5975507 5975508 CBY_2357 CBY_2358 maeB   FALSE 0.402 86.000 0.000 1.000   NA
 5975508 5975509 CBY_2358 CBY_2359     FALSE 0.055 257.000 0.000 1.000   NA
 5975509 5975510 CBY_2359 CBY_2360     TRUE 0.998 -22.000 1.000 0.061 Y NA
 5975510 5975511 CBY_2360 CBY_2361     FALSE 0.015 400.000 0.000 1.000   NA
 5975513 5975514 CBY_2363 CBY_2364     FALSE 0.010 516.000 0.000 NA   NA
 5975514 5975515 CBY_2364 CBY_2365     TRUE 0.979 -7.000 0.269 NA   NA
 5975515 5975516 CBY_2365 CBY_2366     TRUE 0.957 -13.000 0.066 NA   NA
 5975516 5975517 CBY_2366 CBY_2367     TRUE 0.693 74.000 0.008 1.000   NA
 5975517 5975518 CBY_2367 CBY_2368   cbiQ TRUE 0.997 -7.000 0.236 0.009 Y NA
 5975518 5975519 CBY_2368 CBY_2369 cbiQ   TRUE 0.998 16.000 0.489 1.000 Y NA
 5975519 5975520 CBY_2369 CBY_2370     TRUE 0.796 22.000 0.000 1.000   NA
 5975520 5975521 CBY_2370 CBY_2371     FALSE 0.012 427.000 0.000 0.025   NA
 5975521 5975522 CBY_2371 CBY_2372     TRUE 0.811 -10.000 0.000 0.025   NA
 5975522 5975523 CBY_2372 CBY_2373     FALSE 0.269 134.000 0.000 1.000   NA
 5975523 5975524 CBY_2373 CBY_2374     FALSE 0.014 409.000 0.000 NA   NA
 5975524 5975525 CBY_2374 CBY_2376     TRUE 0.837 0.000 0.000 NA   NA
 5975526 5975527 CBY_3947 CBY_3948   secA FALSE 0.022 345.000 0.000 NA   NA
 5975527 5975528 CBY_3948 CBY_3949 secA prfB FALSE 0.111 314.000 0.048 1.000 N NA
 5975530 5975531 CBY_3951 CBY_3952     FALSE 0.025 323.000 0.000 NA   NA
 5975531 5975532 CBY_3952 CBY_3953     TRUE 0.970 155.000 0.600 1.000 Y NA
 5975532 5975533 CBY_3953 CBY_3954     FALSE 0.251 154.000 0.000 NA   NA
 5975533 5975534 CBY_3954 CBY_3955     FALSE 0.162 195.000 0.000 NA   NA
 5975534 5975535 CBY_3955 CBY_3956     FALSE 0.406 87.000 0.000 1.000 N NA
 5975535 5975536 CBY_3956 CBY_3957     FALSE 0.012 449.000 0.000 NA   NA
 5975537 5975538 CBY_3958 CBY_3959 rimI   TRUE 0.967 -16.000 0.127 1.000   NA
 5975538 5975539 CBY_3959 CBY_3960     TRUE 0.977 -3.000 0.217 NA   NA
 5975540 5975541 CBY_3961 CBY_4381     FALSE 0.318 112.000 0.000 NA   NA
 5975541 5975542 CBY_4381 CBY_3963     FALSE 0.251 154.000 0.000 NA   NA
 5975542 5975543 CBY_3963 CBY_3964     FALSE 0.296 123.000 0.000 1.000 N NA
 5975543 5975544 CBY_3964 CBY_3965     FALSE 0.275 137.000 0.000 NA N NA
 5975544 5975545 CBY_3965 CBY_3966     FALSE 0.286 129.000 0.000 NA N NA
 5975546 5975547 CBY_3967 CBY_3968     FALSE 0.094 222.000 0.000 0.050   NA
 5975547 5975548 CBY_3968 CBY_3969     FALSE 0.263 142.000 0.000 1.000   NA
 5975549 5975550 CBY_4382 CBY_3971     FALSE 0.025 326.000 0.000 NA   NA
 5975550 5975551 CBY_3971 CBY_3972     FALSE 0.321 111.000 0.000 NA   NA
 5975553 5975554 CBY_3974 CBY_3975     TRUE 0.644 103.000 0.021 NA   NA
 5975556 5975557 CBY_3977 CBY_3978     FALSE 0.245 157.000 0.000 NA   NA
 5975557 5975558 CBY_3978 CBY_3979     TRUE 0.994 13.000 0.037 1.000 Y NA
 5975558 5975559 CBY_3979 CBY_3980     TRUE 0.532 146.000 0.017 1.000   NA
 5975559 5975560 CBY_3980 CBY_3981     FALSE 0.124 209.000 0.000 1.000   NA
 5975562 5975563 CBY_3983 CBY_3984     FALSE 0.017 385.000 0.000 NA N NA
 5975563 5975564 CBY_3984 CBY_3985     FALSE 0.094 224.000 0.000 NA   NA
 5975564 5975565 CBY_3985 CBY_3986   maf FALSE 0.069 244.000 0.000 NA   NA
 5975565 5975566 CBY_3986 CBY_3987 maf   TRUE 0.901 46.000 0.074 NA N NA
 5975566 5975567 CBY_3987 CBY_3988     TRUE 0.939 24.000 0.040 1.000 N NA
 5975567 5975568 CBY_3988 CBY_3989   mreC TRUE 0.988 8.000 0.689 1.000 N NA
 5975568 5975569 CBY_3989 CBY_3990 mreC mreD TRUE 0.985 13.000 0.550 0.002   NA
 5975569 5975570 CBY_3990 CBY_3991 mreD   TRUE 0.967 -3.000 0.089 1.000   NA
 5975570 5975571 CBY_3991 CBY_3992   sfsA FALSE 0.016 381.000 0.000 NA   NA
 5975571 5975572 CBY_3992 CBY_3993 sfsA minC FALSE 0.123 210.000 0.000 NA   NA
 5975572 5975573 CBY_3993 CBY_3994 minC minD TRUE 0.997 22.000 0.368 1.000 Y NA
 5975573 5975574 CBY_3994 CBY_3995 minD minE TRUE 0.997 15.000 0.347 NA Y NA
 5975574 5975575 CBY_3995 CBY_3996 minE mrdB FALSE 0.327 398.000 0.022 NA Y NA
 5975575 5975576 CBY_3996 CBY_3997 mrdB   FALSE 0.275 131.000 0.000 NA   NA
 5975576 5975577 CBY_3997 CBY_3998     TRUE 0.667 145.000 0.081 NA   NA
 5975577 5975578 CBY_3998 CBY_3999     FALSE 0.150 199.000 0.000 NA   NA
 5975578 5975579 CBY_3999 CBY_4000     FALSE 0.094 224.000 0.000 NA   NA
 5975579 5975580 CBY_4000 CBY_4001     TRUE 0.981 -22.000 0.420 NA   NA
 5975580 5975581 CBY_4001 CBY_4002     TRUE 0.740 140.000 0.180 NA   NA
 5975581 5975582 CBY_4002 CBY_4003   rplU TRUE 0.915 146.000 0.018 0.013 Y NA
 5975582 5975583 CBY_4003 CBY_4004 rplU   TRUE 0.997 5.000 0.208 NA Y NA
 5975583 5975584 CBY_4004 CBY_4005   rpmA TRUE 0.997 5.000 0.203 NA Y NA
 5975584 5975585 CBY_4005 CBY_4006 rpmA   FALSE 0.237 309.000 0.335 1.000   NA
 5975585 5975586 CBY_4006 CBY_4007     TRUE 0.587 155.000 0.046 NA   NA
 5975586 5975587 CBY_4007 CBY_4008   nadD TRUE 0.687 167.000 0.150 NA N NA
 5975587 5975588 CBY_4008 CBY_4009 nadD   TRUE 0.995 26.000 0.199 1.000 Y NA
 5975588 5975589 CBY_4009 CBY_4010     FALSE 0.136 283.000 0.033 NA N NA
 5975589 5975590 CBY_4010 CBY_4011     TRUE 0.955 27.000 0.093 NA N NA
 5975592 5975593 CBY_4013 CBY_4014     FALSE 0.011 477.000 0.000 NA   NA
 5975593 5975594 CBY_4014 CBY_4015     TRUE 0.972 21.000 0.214 NA   NA
 5975594 5975595 CBY_4015 CBY_4016   rumA TRUE 0.619 140.000 0.051 NA   NA
 5975596 5975597 CBY_4017 CBY_4018     FALSE 0.208 176.000 0.000 NA   NA
 5975598 5975599 CBY_4019 CBY_4020     TRUE 0.836 4.000 0.000 0.050   NA
 5975599 5975600 CBY_4020 CBY_4021     FALSE 0.316 113.000 0.000 NA   NA
 5975600 5975601 CBY_4021 CBY_4022     FALSE 0.014 405.000 0.000 NA   NA
 5975601 5975602 CBY_4022 CBY_4023     TRUE 0.842 3.000 0.000 NA   NA
 5975602 5975603 CBY_4023 CBY_4024     TRUE 0.984 1.000 0.429 NA   NA
 5975605 5975606 CBY_4026 CBY_4027     FALSE 0.411 84.000 0.000 NA   NA
 5975606 5975607 CBY_4027 CBY_4028     TRUE 0.581 52.000 0.000 NA   NA
 5975607 5975608 CBY_4028 CBY_4029     FALSE 0.007 1040.000 0.000 NA   NA
 5975608 5975609 CBY_4029 CBY_4030     FALSE 0.020 354.000 0.000 NA   NA
 5975609 5975610 CBY_4030 CBY_4031     FALSE 0.226 167.000 0.000 NA   NA
 5975610 5975611 CBY_4031 CBY_4032     FALSE 0.134 206.000 0.000 NA   NA
 5975611 5975612 CBY_4032 CBY_4033   rfbF TRUE 0.713 34.000 0.000 NA   NA
 5975612 5975613 CBY_4033 CBY_4034 rfbF   TRUE 0.998 -6.000 0.624 1.000 Y NA
 5975613 5975614 CBY_4034 CBY_4035     TRUE 0.939 -10.000 0.021 NA   NA
 5975614 5975615 CBY_4035 CBY_4036     TRUE 0.947 22.000 0.052 NA   NA
 5975615 5975616 CBY_4036 CBY_4037     TRUE 0.936 29.000 0.052 NA   NA
 5975616 5975617 CBY_4037 CBY_4038     FALSE 0.012 464.000 0.000 NA   NA
 5975617 5975618 CBY_4038 CBY_4039     FALSE 0.335 107.000 0.000 NA   NA
 5975618 5975619 CBY_4039 CBY_4040     TRUE 0.560 55.000 0.000 NA   NA
 5975619 5975620 CBY_4040 CBY_4041     FALSE 0.048 272.000 0.000 NA N NA
 5975620 5975621 CBY_4041 CBY_4042   yhbH TRUE 0.988 7.000 0.683 NA   NA
 5975621 5975622 CBY_4042 CBY_4043 yhbH   TRUE 0.988 4.000 0.761 NA   NA
 5975622 5975623 CBY_4043 CBY_4044     TRUE 0.612 105.000 0.014 NA   NA
 5975623 5975624 CBY_4044 CBY_4045     TRUE 0.832 14.000 0.000 NA   NA
 5975624 5975625 CBY_4045 CBY_4046     TRUE 0.498 64.000 0.000 NA   NA
 5975627 5975628 CBY_4048 CBY_4049     TRUE 0.947 42.000 0.281 NA   NA
 5975629 5975630 CBY_4050 CBY_4051     FALSE 0.165 194.000 0.000 NA   NA
 5975631 5975632 CBY_4052 CBY_4053     FALSE 0.436 78.000 0.000 NA   NA
 5975632 5975633 CBY_4053 CBY_4054   cysK FALSE 0.009 576.000 0.000 1.000   NA
 5975633 5975634 CBY_4054 CBY_4055 cysK cysE TRUE 0.950 125.000 0.101 0.001 Y NA
 5975634 5975635 CBY_4055 CBY_4056 cysE   TRUE 0.963 11.000 0.064 1.000 N NA
 5975635 5975636 CBY_4056 CBY_4057     TRUE 0.589 170.000 0.064 1.000 N NA
 5975636 5975637 CBY_4057 CBY_4058   nth TRUE 0.937 13.000 0.011 1.000 N NA
 5975637 5975638 CBY_4058 CBY_4059 nth   TRUE 0.555 107.000 0.002 1.000 N NA
 5975638 5975639 CBY_4059 CBY_4060     FALSE 0.252 155.000 0.000 1.000 N NA
 5975639 5975640 CBY_4060 CBY_4061     TRUE 0.997 -10.000 0.286 1.000 Y NA
 5975640 5975641 CBY_4061 CBY_4062     TRUE 0.878 82.000 0.286 1.000 N NA
 5975641 5975642 CBY_4062 CBY_4063     FALSE 0.407 252.000 0.333 1.000 N NA
 5975642 5975643 CBY_4063 CBY_4064     FALSE 0.191 185.000 0.000 1.000 N NA
 5975643 5975644 CBY_4064 CBY_4065     TRUE 0.930 20.000 0.016 NA   NA
 5975644 5975645 CBY_4065 CBY_4066   rpoN FALSE 0.037 287.000 0.000 NA   NA
 5975645 5975646 CBY_4066 CBY_4067 rpoN   FALSE 0.356 386.000 0.034 1.000 Y NA
 5975646 5975647 CBY_4067 CBY_4068   gap TRUE 0.811 74.000 0.067 1.000 N NA
 5975647 5975648 CBY_4068 CBY_4069 gap pgk TRUE 0.907 132.000 0.005 0.004 Y NA
 5975648 5975649 CBY_4069 CBY_4070 pgk tpiA FALSE 0.461 391.000 0.141 1.000 Y NA
 5975649 5975650 CBY_4070 CBY_4071 tpiA gpmI TRUE 0.556 336.000 0.138 1.000 Y NA
 5975650 5975651 CBY_4071 CBY_4072 gpmI   FALSE 0.285 126.000 0.000 NA   NA
 5975651 5975652 CBY_4072 CBY_4073   eno FALSE 0.088 228.000 0.000 NA   NA
 5975652 5975653 CBY_4073 CBY_4074 eno   FALSE 0.016 379.000 0.000 1.000   NA
 5975653 5975654 CBY_4074 CBY_4075   secG FALSE 0.140 201.000 0.000 0.038   NA
 5975654 5975655 CBY_4075 CBY_4076 secG   FALSE 0.026 321.000 0.000 NA   NA
 5975655 5975656 CBY_4076 CBY_4078     FALSE 0.010 537.000 0.000 NA   NA
 5975657 4730559 CBY_2653 CBY_2654     TRUE 0.560 55.000 0.000 NA   NA
 4730559 5975658 CBY_2654 CBY_2655     TRUE 0.924 67.000 0.500 NA   NA
 5975658 5975659 CBY_2655 CBY_2656     TRUE 0.953 18.000 0.052 NA   NA
 5975659 5975660 CBY_2656 CBY_2657     TRUE 0.987 16.000 0.740 NA   NA
 5975660 5975661 CBY_2657 CBY_2658     FALSE 0.190 184.000 0.000 NA   NA
 5975661 5975662 CBY_2658 CBY_2659     TRUE 0.727 33.000 0.000 NA   NA
 5975664 5975665 CBY_2661 CBY_2662     TRUE 0.842 3.000 0.000 NA   NA
 5975665 5975666 CBY_2662 CBY_2663     TRUE 0.982 10.000 0.333 NA   NA
 5975666 5975667 CBY_2663 CBY_2664     TRUE 0.701 36.000 0.000 NA   NA
 5975667 5975668 CBY_2664 CBY_2665     FALSE 0.205 177.000 0.000 NA   NA
 5975668 5975669 CBY_2665 CBY_2666     FALSE 0.172 191.000 0.000 NA   NA
 5975669 5975670 CBY_2666 CBY_2667   hisC FALSE 0.261 145.000 0.000 1.000   NA
 5975670 5975671 CBY_2667 CBY_2668 hisC leuA TRUE 0.897 103.000 0.000 1.000 Y NA
 5975672 5975673 CBY_2669 CBY_2670     FALSE 0.237 161.000 0.000 NA   NA
 5975674 5975675 CBY_2671 CBY_2672     FALSE 0.274 138.000 0.000 NA N NA
 5975677 5975678 CBY_2674 CBY_2675     FALSE 0.012 442.000 0.000 NA   NA
 5975680 5975681 CBY_2677 CBY_2678     FALSE 0.011 479.000 0.000 1.000 N NA
 5975681 5975682 CBY_2678 CBY_2679     FALSE 0.237 161.000 0.000 NA   NA
 5975682 5975683 CBY_2679 CBY_2680     FALSE 0.461 156.000 0.006 NA   NA
 5975683 5975684 CBY_2680 CBY_2681     TRUE 0.641 90.000 0.009 1.000 N NA
 5975684 5975685 CBY_2681 CBY_2682     FALSE 0.463 169.000 0.013 1.000 N NA
 5975685 5975686 CBY_2682 CBY_2683     FALSE 0.212 176.000 0.000 1.000 N NA
 5975686 5975687 CBY_2683 CBY_2684     TRUE 0.986 -10.000 0.000 0.003 Y NA
 5975689 5975690 CBY_2686 CBY_2687     FALSE 0.361 98.000 0.000 NA   NA
 5975690 5975691 CBY_2687 CBY_2688     FALSE 0.091 226.000 0.000 NA   NA
 5975691 5975692 CBY_2688 CBY_2689     FALSE 0.035 291.000 0.000 1.000 N NA
 5975692 5975693 CBY_2689 CBY_2690     FALSE 0.010 527.000 0.000 NA   NA
 5975693 5975694 CBY_2690 CBY_2691     FALSE 0.018 370.000 0.000 NA   NA
 5975694 5975695 CBY_2691 CBY_2692     FALSE 0.099 221.000 0.000 1.000   NA
 5975695 5975696 CBY_2692 CBY_2693     TRUE 0.793 227.000 0.054 1.000 Y NA
 5975696 5975697 CBY_2693 CBY_2694     TRUE 0.483 68.000 0.000 1.000 N NA
 5975697 5975698 CBY_2694 CBY_2695     TRUE 0.973 32.000 0.462 1.000 N NA
 5975698 5975699 CBY_2695 CBY_2696     FALSE 0.011 497.000 0.000 NA   NA
 5975699 5975700 CBY_2696 CBY_2697     FALSE 0.120 211.000 0.000 NA   NA
 5975700 5975701 CBY_2697 CBY_2698     FALSE 0.430 79.000 0.000 NA   NA
 5975701 5975702 CBY_2698 CBY_2699   tyrS TRUE 0.713 34.000 0.000 NA   NA
 5975702 5975703 CBY_2699 CBY_2700 tyrS   FALSE 0.007 775.000 0.000 1.000   NA
 5975703 5975704 CBY_2700 CBY_2701     FALSE 0.325 109.000 0.000 1.000   NA
 5975704 5975705 CBY_2701 CBY_2702     TRUE 0.980 77.000 0.196 1.000 Y NA
 5975705 5975706 CBY_2702 CBY_2703     TRUE 0.988 80.000 0.870 1.000 Y NA
 5975706 5975707 CBY_2703 CBY_2704     TRUE 0.819 -10.000 0.000 NA   NA
 5975708 5975709 CBY_2375 CBY_2377     TRUE 0.678 39.000 0.000 NA   NA
 5975711 5975712 CBY_2379 CBY_2380     TRUE 0.905 52.000 0.127 NA   NA
 5975712 5975713 CBY_2380 CBY_2381     FALSE 0.335 107.000 0.000 NA   NA
 5975713 5975714 CBY_2381 CBY_2382     FALSE 0.075 239.000 0.000 NA   NA
 5975714 5975715 CBY_2382 CBY_2383     TRUE 0.747 31.000 0.000 NA   NA
 5975715 5975716 CBY_2383 CBY_2384     FALSE 0.085 230.000 0.000 NA   NA
 5975716 5975717 CBY_2384 CBY_2385     TRUE 0.997 1.000 0.286 0.016 Y NA
 5975717 5975718 CBY_2385 CBY_2386   xfp FALSE 0.037 288.000 0.000 1.000 N NA
 5975718 5975719 CBY_2386 CBY_2387 xfp   TRUE 0.645 42.000 0.000 1.000   NA
 5975719 5975720 CBY_2387 CBY_2388     FALSE 0.018 370.000 0.000 1.000   NA
 5975720 5975721 CBY_2388 CBY_2389     FALSE 0.037 286.000 0.000 1.000   NA
 5975721 5975722 CBY_2389 CBY_2390     FALSE 0.273 136.000 0.000 1.000 N NA
 5975722 5975723 CBY_2390 CBY_2391     TRUE 0.998 1.000 0.941 0.006 Y NA
 5975726 5975727 CBY_2394 CBY_2395     FALSE 0.079 236.000 0.000 NA   NA
 5975727 5975728 CBY_2395 CBY_2396     FALSE 0.034 293.000 0.000 1.000 N NA
 5975729 5975730 CBY_2397 CBY_2398     TRUE 0.530 60.000 0.000 NA   NA
 5975732 5975733 CBY_2400 CBY_2401     FALSE 0.028 310.000 0.000 NA   NA
 5975733 5975734 CBY_2401 CBY_2402     TRUE 0.989 9.000 0.833 NA   NA
 5975734 5975735 CBY_2402 CBY_2403   def FALSE 0.016 385.000 0.000 1.000 N NA
 5975735 5975736 CBY_2403 CBY_2404 def   FALSE 0.159 196.000 0.000 NA   NA
 5975736 5975737 CBY_2404 CBY_2405     FALSE 0.281 128.000 0.000 NA   NA
 5975737 5975738 CBY_2405 CBY_2406     TRUE 0.838 13.000 0.000 1.000 N NA
 5975738 5975739 CBY_2406 CBY_2407     FALSE 0.025 323.000 0.000 1.000   NA
 5975739 5975740 CBY_2407 CBY_2408     FALSE 0.307 116.000 0.000 1.000   NA
 5975740 5975741 CBY_2408 CBY_2409     TRUE 0.884 111.000 0.000 0.006 Y NA
 5975741 5975742 CBY_2409 CBY_2410     FALSE 0.049 270.000 0.000 1.000 N NA
 5975742 5975743 CBY_2410 CBY_2411     FALSE 0.417 84.000 0.000 1.000 N NA
 5975743 5975744 CBY_2411 CBY_2412     TRUE 0.887 109.000 0.000 0.026 Y NA
 5975744 5975745 CBY_2412 CBY_2413     TRUE 0.983 25.000 0.000 0.026 Y NA
 5975745 5975746 CBY_2413 CBY_2414     FALSE 0.195 182.000 0.000 NA   NA
 5975746 5975747 CBY_2414 CBY_2415     FALSE 0.009 547.000 0.000 NA   NA
 5975747 5975748 CBY_2415 CBY_2416     TRUE 0.952 134.000 0.133 1.000 Y NA
 5975748 5975749 CBY_2416 CBY_2417     TRUE 0.998 -6.000 0.867 0.006 Y NA
 5975751 5975752 CBY_2419 CBY_2420     TRUE 0.985 -3.000 0.571 1.000   NA
 5975752 5975753 CBY_2420 CBY_2421     TRUE 0.985 3.000 0.429 NA   NA
 5975753 5975754 CBY_2421 CBY_2422     FALSE 0.201 179.000 0.000 NA   NA
 5975754 5975755 CBY_2422 CBY_2423     TRUE 0.903 96.000 0.000 0.012 Y NA
 5975755 5975756 CBY_2423 CBY_2424     TRUE 0.987 -7.000 0.000 0.001 Y NA
 5975756 5975757 CBY_2424 CBY_2425     TRUE 0.953 55.000 0.000 0.001 Y NA
 5975757 5975758 CBY_2425 CBY_2426     TRUE 0.988 0.000 0.000 0.012 Y NA
 5975758 5975759 CBY_2426 CBY_2427   lys1 TRUE 0.836 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5975759 5975760 CBY_2427 CBY_2428 lys1   TRUE 0.836 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5975760 5975761 CBY_2428 CBY_2429     FALSE 0.301 121.000 0.000 1.000 N NA
 5975763 5975764 CBY_2431 CBY_2432     FALSE 0.065 248.000 0.000 NA   NA
 5975764 5975765 CBY_2432 CBY_2433     FALSE 0.019 357.000 0.000 NA   NA
 5975765 5975766 CBY_2433 CBY_2434     FALSE 0.258 151.000 0.000 NA   NA
 5975767 5975768 CBY_2435 CBY_2436 nrdD nrdG TRUE 0.826 134.000 0.464 1.000 N NA
 5975769 5975770 CBY_2437 CBY_2438   tkt FALSE 0.214 175.000 0.000 1.000 N NA
 5975770 5975771 CBY_2438 CBY_2439 tkt   TRUE 0.895 169.000 0.016 1.000 Y NA
 5975771 5975772 CBY_2439 CBY_2440     TRUE 0.979 52.000 0.032 NA Y NA
 5975772 5975773 CBY_2440 CBY_2441     TRUE 0.978 127.000 0.847 NA Y NA
 5975773 5975774 CBY_2441 CBY_2442     TRUE 0.997 21.000 0.504 1.000 Y NA
 5975774 5975775 CBY_2442 CBY_2443     TRUE 0.997 14.000 0.337 1.000 Y NA
 5975775 5975776 CBY_2443 CBY_2444   rbsK TRUE 0.821 17.000 0.000 NA   NA
 5975777 5975778 CBY_2146 CBY_2147     FALSE 0.396 88.000 0.000 NA   NA
 5975778 5975779 CBY_2147 CBY_2148     TRUE 0.971 11.000 0.109 NA   NA
 5975779 5975780 CBY_2148 CBY_2149     TRUE 0.955 31.000 0.150 0.002   NA
 5975780 5975781 CBY_2149 CBY_2150   cysS TRUE 0.903 53.000 0.129 1.000   NA
 5975781 5975782 CBY_2150 CBY_2151 cysS proS TRUE 0.991 19.000 0.005 0.032 Y NA
 5975782 5975783 CBY_2151 CBY_2152 proS ispD FALSE 0.030 447.000 0.002 1.000 N NA
 5975783 5975784 CBY_2152 CBY_2153 ispD   TRUE 0.961 27.000 0.134 NA   NA
 5975786 5975787 CBY_2155 CBY_2156   radA FALSE 0.367 236.000 0.126 1.000   NA
 5975788 5975789 CBY_2157 CBY_2158     FALSE 0.028 310.000 0.000 NA   NA
 5975790 5975791 CBY_2159 CBY_2160   gidA TRUE 0.994 4.000 0.027 1.000 Y NA
 5975791 5975792 CBY_2160 CBY_2161 gidA   FALSE 0.207 389.000 0.000 1.000 Y NA
 5975792 5975793 CBY_2161 CBY_2162     TRUE 0.962 25.000 0.129 1.000 N NA
 5975793 5975794 CBY_2162 CBY_2163     TRUE 0.986 -19.000 0.848 1.000   NA
 5975794 5975795 CBY_2163 CBY_2164     TRUE 0.987 15.000 0.681 1.000   NA
 5975797 5975798 CBY_2166 CBY_2167     TRUE 0.784 122.000 0.222 1.000   NA
 5975798 5975799 CBY_2167 CBY_2168     TRUE 0.938 11.000 0.011 NA   NA
 5975799 5975800 CBY_2168 CBY_2169     TRUE 0.983 4.000 0.372 NA   NA
 5975800 5975801 CBY_2169 CBY_2170     TRUE 0.934 19.000 0.018 NA   NA
 5975801 5975802 CBY_2170 CBY_2171   tmk TRUE 0.488 140.000 0.006 NA   NA
 5975802 5975803 CBY_2171 CBY_2172 tmk   TRUE 0.556 106.000 0.002 NA   NA
 5975804 5975805 CBY_2173 CBY_2174     TRUE 0.576 115.000 0.013 NA   NA
 5975806 5975807 CBY_4292 CBY_4293     TRUE 0.842 5.000 0.000 NA   NA
 5975807 5975808 CBY_4293 CBY_4294   rrf TRUE 0.842 5.000 0.000 NA   NA
 5975808 5975809 CBY_4294 CBY_4295 rrf rrl FALSE 0.483 67.000 0.000 NA   NA
 5975810 5975811 CBY_2178 CBY_2179     FALSE 0.044 274.000 0.000 NA   NA
 5975812 5975813 CBY_4296 CBY_4297     TRUE 0.842 3.000 0.000 NA   NA
 5975813 5975814 CBY_4297 CBY_4298   rrs FALSE 0.266 140.000 0.000 NA   NA
 5975816 5975817 CBY_2184 CBY_2185 murD glyS FALSE 0.077 293.000 0.002 0.085 N NA
 5975817 5975818 CBY_2185 CBY_4300 glyS   FALSE 0.015 398.000 0.000 NA   NA
 5975820 5975821 CBY_4301 CBY_4302     FALSE 0.033 293.000 0.000 NA   NA
 5975821 5975822 CBY_4302 CBY_2190   lysS FALSE 0.198 180.000 0.000 NA   NA
 5975822 5975823 CBY_2190 CBY_2191 lysS   TRUE 0.968 15.000 0.098 1.000 N NA
 5975823 5975824 CBY_2191 CBY_2192     FALSE 0.071 347.000 0.022 1.000 N NA
 5975824 5975825 CBY_2192 CBY_2193     TRUE 0.961 8.000 0.054 1.000 N NA
 5975825 5975826 CBY_2193 CBY_2194   fhs TRUE 0.532 129.000 0.011 1.000 N NA
 5975828 5975829 CBY_2196 CBY_2197   hpt TRUE 0.893 62.000 0.180 1.000 N NA
 5975829 5975830 CBY_2197 CBY_2198 hpt   TRUE 0.974 2.000 0.137 0.032 N NA
 5975830 5975831 CBY_2198 CBY_2199   spoIIE TRUE 0.603 134.000 0.041 1.000   NA
 5975831 5975832 CBY_2199 CBY_2200 spoIIE   FALSE 0.014 414.000 0.000 1.000   NA
 5975832 5975833 CBY_2200 CBY_4303     FALSE 0.414 83.000 0.000 NA   NA
 5975833 5975834 CBY_4303 CBY_4304     TRUE 0.829 15.000 0.000 NA   NA
 5975834 5975835 CBY_4304 CBY_4305     TRUE 0.817 18.000 0.000 NA   NA
 5975835 5975836 CBY_4305 CBY_4306     TRUE 0.842 5.000 0.000 NA   NA
 5975836 5975837 CBY_4306 CBY_4307     TRUE 0.842 6.000 0.000 NA   NA
 5975837 5975838 CBY_4307 CBY_4308     TRUE 0.817 18.000 0.000 NA   NA
 5975838 5975839 CBY_4308 CBY_4309     TRUE 0.842 5.000 0.000 NA   NA
 5975839 5975840 CBY_4309 CBY_4310     TRUE 0.842 4.000 0.000 NA   NA
 5975840 5975841 CBY_4310 CBY_4311     TRUE 0.808 20.000 0.000 NA   NA
 5975841 5975842 CBY_4311 CBY_2210     FALSE 0.086 229.000 0.000 NA   NA
 5975842 5975843 CBY_2210 CBY_2211     TRUE 0.721 141.000 0.134 1.000 N NA
 5975843 5975844 CBY_2211 CBY_2212   yabQ TRUE 0.810 77.000 0.074 NA   NA
 5975844 5975845 CBY_2212 CBY_2213 yabQ yabP TRUE 0.988 10.000 0.774 NA   NA
 5975845 5975846 CBY_2213 CBY_2214 yabP   TRUE 0.613 179.000 0.108 NA   NA
 5975846 5975847 CBY_2214 CBY_2215     TRUE 0.777 65.000 0.024 1.000 N NA
 5975847 5975848 CBY_2215 CBY_2216     FALSE 0.262 218.000 0.014 1.000   NA
 5975848 5975849 CBY_2216 CBY_2217     TRUE 0.936 16.000 0.015 1.000   NA
 5975849 5975850 CBY_2217 CBY_2218   spoVT TRUE 0.718 125.000 0.108 NA   NA
 5975850 5975851 CBY_2218 CBY_2219 spoVT   FALSE 0.449 210.000 0.088 NA   NA
 5975851 5975852 CBY_2219 CBY_2220   mfd TRUE 0.555 126.000 0.016 1.000   NA
 5975852 5975853 CBY_2220 CBY_2221 mfd pth TRUE 0.972 15.000 0.137 1.000 N NA
 5975853 5975854 CBY_2221 CBY_2222 pth   TRUE 0.852 36.000 0.002 1.000 N NA
 5975854 5975855 CBY_2222 CBY_2223     TRUE 0.998 1.000 0.653 1.000 Y NA
 5975855 5975856 CBY_2223 CBY_2224   prsA TRUE 0.773 107.000 0.123 1.000 N NA
 5975856 5975857 CBY_2224 CBY_2225 prsA glmU TRUE 0.893 48.000 0.069 1.000 N NA
 5975857 5975858 CBY_2225 CBY_2226 glmU   TRUE 0.741 225.000 0.011 1.000 Y NA
 5975858 5975859 CBY_2226 CBY_2227   purR FALSE 0.472 209.000 0.099 1.000 N NA
 5975862 5975863 CBY_2230 CBY_2231   asnS FALSE 0.045 273.000 0.000 1.000   NA
 5975864 5975865 CBY_2232 CBY_2233     FALSE 0.252 155.000 0.000 1.000 N NA
 5975865 5975866 CBY_2233 CBY_2234   nrdG TRUE 0.634 45.000 0.000 1.000 N NA
 5975866 5975867 CBY_2234 CBY_2235 nrdG   FALSE 0.056 258.000 0.000 1.000 N NA
 5975867 5975868 CBY_2235 CBY_2236   nifV TRUE 0.670 134.000 0.074 1.000 N NA
 5975868 5975869 CBY_2236 CBY_2237 nifV nrdD FALSE 0.025 327.000 0.000 1.000 N NA
 5975870 5975871 CBY_2238 CBY_2239     TRUE 0.842 3.000 0.000 NA   NA
 5975871 5975872 CBY_2239 CBY_2240     FALSE 0.327 109.000 0.000 NA   NA
 5975874 5975875 CBY_2242 CBY_2244     TRUE 0.798 22.000 0.000 NA   NA
 5975876 5975877 CBY_2245 CBY_2246     TRUE 0.958 18.000 0.067 NA   NA
 5975877 5975878 CBY_2246 CBY_2247   lgt TRUE 0.819 -10.000 0.000 NA   NA
 5975878 5975879 CBY_2247 CBY_2248 lgt   FALSE 0.327 109.000 0.000 NA   NA
 5975879 5975880 CBY_2248 CBY_2249     TRUE 0.980 16.000 0.312 NA   NA
 5975880 5975881 CBY_2249 CBY_2250   ksgA TRUE 0.493 136.000 0.006 NA   NA
 5975881 5975882 CBY_2250 CBY_2251 ksgA   TRUE 0.969 1.000 0.093 1.000 N NA
 5975882 5975883 CBY_2251 CBY_2252     FALSE 0.224 228.000 0.013 1.000   NA
 5975883 5975884 CBY_2252 CBY_2253     FALSE 0.013 433.000 0.000 NA   NA
 5975884 5975885 CBY_2253 CBY_2254   metG TRUE 0.504 166.000 0.020 NA N NA
 5975885 5975886 CBY_2254 CBY_2255 metG metG TRUE 0.765 215.000 0.005 0.000 Y NA
 5975888 5975889 CBY_2257 CBY_2258     FALSE 0.010 528.000 0.000 NA N NA
 5975889 5975890 CBY_2258 CBY_2259     FALSE 0.321 111.000 0.000 NA   NA
 5975890 5975891 CBY_2259 CBY_2260     TRUE 0.832 14.000 0.000 NA   NA
 5975893 5975894 CBY_2262 CBY_2263     TRUE 0.987 0.000 0.667 1.000 N NA
 5975894 5975895 CBY_2263 CBY_2264     TRUE 0.836 160.000 0.000 0.038 Y NA
 5975895 5975896 CBY_2264 CBY_2265   ileS FALSE 0.222 225.000 0.009 1.000 N NA
 5975898 5975899 CBY_2267 CBY_2268     FALSE 0.356 267.000 0.333 NA   NA
 5975899 5975900 CBY_2268 CBY_2269     TRUE 0.894 102.000 0.750 NA   NA
 5975900 5975901 CBY_2269 CBY_2270     FALSE 0.259 150.000 0.000 NA   NA
 5975901 5975902 CBY_2270 CBY_2271     TRUE 0.998 5.000 0.606 1.000 Y NA
 5975903 5975904 CBY_2272 CBY_2273     FALSE 0.198 180.000 0.000 NA   NA
 5975905 5975906 CBY_2274 CBY_2275     TRUE 0.892 46.000 0.067 1.000   NA
 5975907 5975908 CBY_2276 CBY_2277     TRUE 0.758 116.000 0.133 NA   NA
 5975909 5975910 CBY_2278 CBY_2279     TRUE 0.902 67.000 0.286 1.000   NA
 5975910 5975911 CBY_2279 CBY_2280     FALSE 0.356 99.000 0.000 1.000   NA
 5975911 5975912 CBY_2280 CBY_2281     FALSE 0.269 134.000 0.000 1.000   NA
 5975912 5975913 CBY_2281 CBY_2282     TRUE 0.979 2.000 0.231 NA   NA
 5975913 5975914 CBY_2282 CBY_2283     TRUE 0.654 117.000 0.045 NA   NA
 5975914 5975915 CBY_2283 CBY_2284   murI FALSE 0.464 159.000 0.007 1.000 N NA
 5975916 5975917 CBY_2285 CBY_2286     FALSE 0.159 197.000 0.000 1.000 N NA
 5975918 5975919 CBY_2287 CBY_2288   carB TRUE 0.596 136.000 0.038 NA   NA
 5975919 5975920 CBY_2288 CBY_2289 carB carA TRUE 0.995 15.000 0.054 0.000 Y NA
 5975920 5975921 CBY_2289 CBY_2290 carA   FALSE 0.013 428.000 0.000 1.000 N NA
 5975921 5975922 CBY_2290 CBY_2291   mgsA FALSE 0.041 279.000 0.000 1.000 N NA
 5975922 5975923 CBY_2291 CBY_2292 mgsA proA FALSE 0.116 215.000 0.000 1.000 N NA
 5975923 5975924 CBY_2292 CBY_2293 proA proB TRUE 0.973 106.000 0.281 0.001 Y NA
 5975927 5975928 CBY_2296 CBY_2297     TRUE 0.944 3.000 0.017 NA   NA
 5975928 5975929 CBY_2297 CBY_2298     FALSE 0.152 198.000 0.000 NA   NA
 5975930 5975931 CBY_2299 CBY_2300     FALSE 0.085 229.000 0.000 1.000   NA
 5975931 5975932 CBY_2300 CBY_2301     FALSE 0.237 160.000 0.000 1.000   NA
 5975935 5975936 CBY_2304 CBY_2305     FALSE 0.010 502.000 0.000 NA   NA
 5975936 5975937 CBY_2305 CBY_2306     FALSE 0.266 141.000 0.000 NA   NA
 5975937 5975938 CBY_2306 CBY_2307     FALSE 0.030 303.000 0.000 NA   NA
 5975938 5975939 CBY_2307 CBY_2308     TRUE 0.762 29.000 0.000 NA   NA
 5975939 5975940 CBY_2308 CBY_2309     FALSE 0.117 213.000 0.000 NA   NA
 5975940 5975941 CBY_2309 CBY_2310     FALSE 0.425 80.000 0.000 NA   NA
 5975941 5975942 CBY_2310 CBY_2311     TRUE 0.737 32.000 0.000 1.000   NA
 5975943 5975944 CBY_4315 CBY_2313     FALSE 0.223 169.000 0.000 NA   NA
 5975945 5975946 CBY_1402 CBY_1403     FALSE 0.302 118.000 0.000 NA   NA
 5975948 5975949 CBY_1405 CBY_1406     TRUE 0.695 37.000 0.000 NA   NA
 5975949 5975950 CBY_1406 CBY_1407     FALSE 0.316 113.000 0.000 NA   NA
 5975950 5975951 CBY_1407 CBY_1408     TRUE 0.747 31.000 0.000 NA   NA
 5975951 5975952 CBY_1408 CBY_1409     FALSE 0.425 80.000 0.000 NA   NA
 5975952 5975953 CBY_1409 CBY_1410     TRUE 0.835 13.000 0.000 NA   NA
 5975953 5975954 CBY_1410 CBY_1411     TRUE 0.819 -10.000 0.000 NA   NA
 5975954 5975955 CBY_1411 CBY_1412     TRUE 0.713 34.000 0.000 NA   NA
 5975956 5975957 CBY_1329 CBY_1330     TRUE 0.798 22.000 0.000 NA   NA
 5975958 5975959 CBY_1331 CBY_1332     FALSE 0.314 114.000 0.000 NA   NA
 5975960 5975961 CBY_1333 CBY_1334     TRUE 0.793 23.000 0.000 NA   NA
 5975963 5975964 CBY_1336 CBY_1337     FALSE 0.053 263.000 0.000 NA   NA
 5975964 5975965 CBY_1337 CBY_1338     TRUE 0.687 38.000 0.000 NA   NA
 5975965 5975966 CBY_1338 CBY_1339     FALSE 0.018 372.000 0.000 NA   NA
 5975966 5975967 CBY_1339 CBY_1340     TRUE 0.977 91.000 0.250 1.000 Y NA
 5975967 5975968 CBY_1340 CBY_1341     FALSE 0.048 270.000 0.000 NA   NA
 5975968 5975969 CBY_1341 CBY_1342     FALSE 0.030 304.000 0.000 NA   NA
 5975969 5975970 CBY_1342 CBY_1343     FALSE 0.405 86.000 0.000 NA   NA
 5975972 5975973 CBY_1345 CBY_1346     TRUE 0.845 3.000 0.000 1.000 N NA
 5975973 5975974 CBY_1346 CBY_1347     FALSE 0.230 165.000 0.000 NA   NA
 5975974 5975975 CBY_1347 CBY_1348     FALSE 0.038 284.000 0.000 NA   NA
 5975975 5975976 CBY_1348 CBY_1349     TRUE 0.836 12.000 0.000 1.000   NA
 5975976 5975977 CBY_1349 CBY_1350     FALSE 0.008 636.000 0.000 NA   NA
 5975977 5975978 CBY_1350 CBY_1351     FALSE 0.009 581.000 0.000 NA   NA
 5975978 5975979 CBY_1351 CBY_1352     TRUE 0.809 -19.000 0.000 NA   NA
 5975979 5975980 CBY_1352 CBY_1353     TRUE 0.606 49.000 0.000 NA   NA
 5975980 5975981 CBY_1353 CBY_1354     FALSE 0.113 215.000 0.000 NA   NA
 5975981 5975982 CBY_1354 CBY_1355   dnaB TRUE 0.841 2.000 0.000 NA   NA
 5975982 5975983 CBY_1355 CBY_1356 dnaB   FALSE 0.037 287.000 0.000 1.000   NA
 5975983 5975984 CBY_1356 CBY_1357     FALSE 0.028 310.000 0.000 1.000   NA
 5975984 5975985 CBY_1357 CBY_1358     TRUE 0.559 241.000 0.000 0.025 Y NA
 5975985 5975986 CBY_1358 CBY_1359     TRUE 0.990 4.000 1.000 0.025 N NA
 5975986 5975987 CBY_1359 CBY_1360     TRUE 0.825 125.000 0.400 1.000 N NA
 5975987 5975988 CBY_1360 CBY_1361     TRUE 0.817 -7.000 0.000 0.016   NA
 5975988 5975989 CBY_1361 CBY_1362     FALSE 0.021 346.000 0.000 1.000   NA
 5975989 5975990 CBY_1362 CBY_1363     FALSE 0.011 471.000 0.000 NA   NA
 5975990 5975991 CBY_1363 CBY_1364     FALSE 0.027 315.000 0.000 NA   NA
 5975991 5975992 CBY_1364 CBY_1365     TRUE 0.841 2.000 0.000 NA   NA
 5975992 5975993 CBY_1365 CBY_1366     FALSE 0.401 87.000 0.000 NA   NA
 5975993 5975994 CBY_1366 CBY_1367     FALSE 0.011 494.000 0.000 1.000   NA
 5975994 5975995 CBY_1367 CBY_1368     FALSE 0.056 256.000 0.000 1.000   NA
 5975995 5975996 CBY_1368 CBY_1369     FALSE 0.069 244.000 0.000 NA   NA
 5975996 5975997 CBY_1369 CBY_1370     TRUE 0.968 -10.000 0.125 NA   NA
 5975997 5975998 CBY_1370 CBY_1371     FALSE 0.268 145.000 0.000 1.000 N NA
 5975999 5976000 CBY_1372 CBY_1373   pcp TRUE 0.882 40.000 0.029 NA   NA
 5976000 5976001 CBY_1373 CBY_1374 pcp   TRUE 0.934 52.000 0.300 NA   NA
 5976001 5976002 CBY_1374 CBY_1375     TRUE 0.985 25.000 0.939 NA   NA
 5976002 5976003 CBY_1375 CBY_1376     FALSE 0.050 267.000 0.000 NA   NA
 5976004 5976005 CBY_1377 CBY_1378     FALSE 0.029 305.000 0.000 NA   NA
 5976005 5976006 CBY_1378 CBY_1379     FALSE 0.146 200.000 0.000 0.041 N NA
 5976006 5976007 CBY_1379 CBY_1380     FALSE 0.009 561.000 0.000 1.000   NA
 5976007 4730573 CBY_1380 CBY_1381     TRUE 0.725 33.000 0.000 1.000   NA
 4730573 5976008 CBY_1381 CBY_1382     FALSE 0.094 222.000 0.000 0.048   NA
 5976008 5976009 CBY_1382 CBY_1383     FALSE 0.266 147.000 0.000 1.000 N NA
 5976011 5976012 CBY_1385 CBY_1386     FALSE 0.053 260.000 0.000 1.000   NA
 5976012 5976013 CBY_1386 CBY_1387     FALSE 0.230 165.000 0.000 NA   NA
 5976013 5976014 CBY_1387 CBY_1388     FALSE 0.049 268.000 0.000 NA   NA
 5976016 5976017 CBY_1390 CBY_1391     FALSE 0.075 239.000 0.000 NA   NA
 5976017 5976018 CBY_1391 CBY_1392     TRUE 0.951 -7.000 0.041 NA   NA
 5976018 5976019 CBY_1392 CBY_1393     TRUE 0.981 -13.000 0.419 1.000 N NA
 5976019 5976020 CBY_1393 CBY_1394     TRUE 0.962 5.000 0.058 NA   NA
 5976020 5976021 CBY_1394 CBY_1395     FALSE 0.243 158.000 0.000 NA   NA
 5976021 5976022 CBY_1395 CBY_1396     FALSE 0.063 250.000 0.000 NA   NA
 5976023 5976024 CBY_1397 CBY_1398     FALSE 0.336 106.000 0.000 1.000   NA
 5976025 5976026 CBY_1399 CBY_1400     FALSE 0.022 337.000 0.000 NA   NA
 5976026 5976027 CBY_1400 CBY_1401     FALSE 0.008 642.000 0.000 NA   NA
 5976028 5976029 CBY_3074 CBY_3075     FALSE 0.091 226.000 0.000 NA   NA
 5976029 5976030 CBY_3075 CBY_3076     TRUE 0.978 -7.000 0.250 1.000 N NA
 5976030 5976031 CBY_3076 CBY_3077     TRUE 0.998 -3.000 0.800 0.015 Y NA
 5976031 5976032 CBY_3077 CBY_3078     FALSE 0.031 300.000 0.000 NA   NA
 5976032 5976033 CBY_3078 CBY_3079     FALSE 0.190 184.000 0.000 NA   NA
 5976033 5976034 CBY_3079 CBY_3080     FALSE 0.318 112.000 0.000 NA   NA
 5976037 5976038 CBY_3082 CBY_3084     TRUE 0.504 64.000 0.000 1.000 N NA
 5976038 5976039 CBY_3084 CBY_3085     FALSE 0.094 222.000 0.000 0.048   NA
 5976039 5976040 CBY_3085 CBY_3086     TRUE 0.621 46.000 0.000 NA   NA
 5976041 5976042 CBY_3087 CBY_3088     FALSE 0.082 232.000 0.000 1.000   NA
 5976044 5976045 CBY_3090 CBY_3091     TRUE 0.623 44.000 0.000 0.041   NA
 5976045 5976046 CBY_3091 CBY_3092     FALSE 0.331 108.000 0.000 NA   NA
 5976048 5976049 CBY_3094 CBY_3095     FALSE 0.067 245.000 0.000 NA   NA
 5976049 5976050 CBY_3095 CBY_3096     FALSE 0.457 73.000 0.000 NA   NA
 5976050 5976051 CBY_3096 CBY_3097     FALSE 0.282 131.000 0.000 NA N NA
 5976053 5976054 CBY_3099 CBY_3100     TRUE 0.769 28.000 0.000 NA   NA
 5976057 5976058 CBY_3103 CBY_3104     FALSE 0.324 110.000 0.000 NA   NA
 5976058 5976059 CBY_3104 CBY_3106     TRUE 0.747 31.000 0.000 NA   NA
 5976064 5976065 CBY_4237 CBY_4238   rrl FALSE 0.314 114.000 0.000 NA   NA
 5976066 5976067 CBY_1242 CBY_1243     FALSE 0.044 274.000 0.000 NA   NA
 5976068 5976069 CBY_4239 CBY_1245     FALSE 0.019 357.000 0.000 NA   NA
 5976069 5976070 CBY_1245 CBY_1246     FALSE 0.030 305.000 0.000 1.000 N NA
 5976070 5976071 CBY_1246 CBY_1247     TRUE 0.842 5.000 0.000 NA   NA
 5976071 5976072 CBY_1247 CBY_1248     FALSE 0.016 384.000 0.000 NA   NA
 5976072 5976073 CBY_1248 CBY_1249     TRUE 0.972 3.000 0.114 NA   NA
 5976076 5976077 CBY_1252 CBY_1253     TRUE 0.961 18.000 0.079 1.000   NA
 5976078 5976079 CBY_1254 CBY_1255     TRUE 0.930 9.000 0.004 NA   NA
 5976079 5976080 CBY_1255 CBY_1256     TRUE 0.787 117.000 0.200 NA   NA
 5976080 5976081 CBY_1256 CBY_1257     FALSE 0.069 244.000 0.000 NA   NA
 5976081 5976082 CBY_1257 CBY_1258     FALSE 0.031 302.000 0.000 NA   NA
 5976082 5976083 CBY_1258 CBY_1259     FALSE 0.425 80.000 0.000 NA   NA
 5976083 5976084 CBY_1259 CBY_1260     FALSE 0.293 122.000 0.000 NA   NA
 5976086 5976087 CBY_1262 CBY_1263     TRUE 0.978 -28.000 0.357 NA   NA
 5976087 5976088 CBY_1263 CBY_1264     TRUE 0.800 180.000 0.800 NA   NA
 5976090 5976091 CBY_1266 CBY_1267   yabG TRUE 0.703 146.000 0.119 NA   NA
 5976091 5976092 CBY_1267 CBY_1268 yabG   FALSE 0.195 289.000 0.116 NA   NA
 5976092 5976093 CBY_1268 CBY_1269     FALSE 0.089 376.000 0.082 NA   NA
 5976093 5976094 CBY_1269 CBY_1270     TRUE 0.708 130.000 0.109 1.000   NA
 5976094 5976095 CBY_1270 CBY_1271   cphA TRUE 0.987 3.000 0.605 1.000 N NA
 5976095 5976096 CBY_1271 CBY_1272 cphA ispE TRUE 0.671 89.000 0.016 0.083 N NA
 5976096 5976097 CBY_1272 CBY_1273 ispE spoIIR TRUE 0.692 76.000 0.009 NA   NA
 5976097 5976098 CBY_1273 CBY_1274 spoIIR   TRUE 0.925 15.000 0.005 NA   NA
 5976098 5976099 CBY_1274 CBY_1275     TRUE 0.820 48.000 0.011 NA   NA
 5976099 5976100 CBY_1275 CBY_1276     FALSE 0.396 203.000 0.039 NA   NA
 5976100 5976101 CBY_1276 CBY_1277   pyrG FALSE 0.373 184.000 0.004 NA   NA
 5976101 5976102 CBY_1277 CBY_1278 pyrG rho FALSE 0.040 283.000 0.000 1.000 N NA
 5976103 5976104 CBY_1279 CBY_1280   rpmE FALSE 0.252 213.000 0.004 1.000 N NA
 5976105 5976106 CBY_1281 CBY_1282 tdk   TRUE 0.934 22.000 0.026 1.000   NA
 5976106 5976107 CBY_1282 CBY_1283   prfA FALSE 0.295 235.000 0.060 1.000   NA
 5976107 5976108 CBY_1283 CBY_1284 prfA   TRUE 0.561 115.000 0.009 NA   NA
 5976108 5976109 CBY_1284 CBY_1285     TRUE 0.936 19.000 0.020 NA   NA
 5976109 5976110 CBY_1285 CBY_1286   rpiB TRUE 0.934 21.000 0.020 NA N NA
 5976110 5976111 CBY_1286 CBY_1287 rpiB upp TRUE 0.552 139.000 0.019 1.000 N NA
 5976111 5976112 CBY_1287 CBY_1288 upp   TRUE 0.994 19.000 0.041 1.000 Y NA
 5976112 5976113 CBY_1288 CBY_1289     TRUE 0.627 97.000 0.011 1.000 N NA
 5976113 5976114 CBY_1289 CBY_1290     FALSE 0.331 236.000 0.083 1.000 N NA
 5976114 5976115 CBY_1290 CBY_1291     FALSE 0.007 861.000 0.000 NA   NA
 5976115 5976116 CBY_1291 CBY_1292   atpB TRUE 0.917 19.000 0.005 NA   NA
 5976116 5976117 CBY_1292 CBY_1293 atpB atpE TRUE 0.935 32.000 0.069 0.004   NA
 5976117 5976118 CBY_1293 CBY_1294 atpE atpF TRUE 0.952 52.000 0.643 0.004   NA
 5976118 5976119 CBY_1294 CBY_1295 atpF atpH TRUE 0.995 3.000 0.040 0.004 Y NA
 5976119 5976120 CBY_1295 CBY_1296 atpH atpA TRUE 0.998 11.000 0.864 0.004 Y NA
 5976120 5976121 CBY_1296 CBY_1297 atpA atpG TRUE 0.967 176.000 0.846 0.004 Y NA
 5976121 5976122 CBY_1297 CBY_1298 atpG atpD TRUE 0.998 17.000 0.724 0.004 Y NA
 5976122 5976123 CBY_1298 CBY_1299 atpD atpC TRUE 0.998 15.000 0.837 0.004 Y NA
 5976123 5976124 CBY_1299 CBY_1300 atpC   FALSE 0.137 257.000 0.007 NA   NA
 5976124 5976125 CBY_1300 CBY_1301   murA TRUE 0.976 23.000 0.346 NA   NA
 5976125 5976126 CBY_1301 CBY_1302 murA spoIID FALSE 0.360 255.000 0.243 1.000 N NA
 5976126 5976127 CBY_1302 CBY_1303 spoIID   FALSE 0.061 491.000 0.090 NA   NA
 5976127 5976128 CBY_1303 CBY_1304   spoIIID TRUE 0.660 156.000 0.093 NA   NA
 5976128 5976129 CBY_1304 CBY_1305 spoIIID   TRUE 0.878 80.000 0.284 1.000   NA
 5976131 5976132 CBY_1307 CBY_1308     FALSE 0.380 92.000 0.000 NA   NA
 5976132 5976133 CBY_1308 CBY_4240     FALSE 0.226 167.000 0.000 NA   NA
 5976133 5976134 CBY_4240 CBY_4241     TRUE 0.842 7.000 0.000 NA   NA
 5976134 5976135 CBY_4241 CBY_4242     TRUE 0.821 17.000 0.000 NA   NA
 5976135 5976136 CBY_4242 CBY_4243     TRUE 0.840 10.000 0.000 NA   NA
 5976136 5976137 CBY_4243 CBY_4244     TRUE 0.841 8.000 0.000 NA   NA
 5976137 5976138 CBY_4244 CBY_4245     TRUE 0.812 19.000 0.000 NA   NA
 5976138 5976139 CBY_4245 CBY_4246     TRUE 0.841 8.000 0.000 NA   NA
 5976139 5976140 CBY_4246 CBY_1316   metK FALSE 0.009 581.000 0.000 NA   NA
 5976140 5976141 CBY_1316 CBY_1317 metK   FALSE 0.201 264.000 0.052 1.000 N NA
 5976141 5976142 CBY_1317 CBY_1318     TRUE 0.961 16.000 0.069 NA   NA
 5976142 5976143 CBY_1318 CBY_1319     TRUE 0.915 -27.000 0.005 NA   NA
 5976144 5976145 CBY_0911 CBY_0912     FALSE 0.077 237.000 0.000 NA   NA
 5976145 5976146 CBY_0912 CBY_0913     FALSE 0.393 89.000 0.000 NA   NA
 5976148 5976149 CBY_0915 CBY_0916     TRUE 0.997 29.000 0.826 1.000 Y NA
 5976149 5976150 CBY_0916 CBY_0917     TRUE 0.931 42.000 0.145 NA N NA
 5976150 5976151 CBY_0917 CBY_0918     FALSE 0.012 455.000 0.000 NA   NA
 5976151 5976152 CBY_0918 CBY_0919     TRUE 0.793 23.000 0.000 NA   NA
 5976152 5976153 CBY_0919 CBY_0920     TRUE 0.599 50.000 0.000 NA   NA
 5976153 5976154 CBY_0920 CBY_0922     TRUE 0.613 48.000 0.000 NA   NA
 5976154 5976155 CBY_0922 CBY_0923     FALSE 0.243 158.000 0.000 NA   NA
 5976155 5976156 CBY_0923 CBY_0924     FALSE 0.012 477.000 0.000 1.000 N NA
 5976156 5976157 CBY_0924 CBY_0925     FALSE 0.406 87.000 0.000 1.000 N NA
 5976157 5976158 CBY_0925 CBY_0926     FALSE 0.408 84.000 0.000 1.000   NA
 5976158 5976159 CBY_0926 CBY_0927     TRUE 0.584 50.000 0.000 0.008   NA
 5976159 5976160 CBY_0927 CBY_0928     FALSE 0.070 243.000 0.000 NA   NA
 5976160 5976161 CBY_0928 CBY_0929     TRUE 0.506 63.000 0.000 NA   NA
 5976161 5976162 CBY_0929 CBY_0930     FALSE 0.201 175.000 0.000 0.008   NA
 5976162 5976163 CBY_0930 CBY_0931     FALSE 0.267 139.000 0.000 NA   NA
 5976163 5976164 CBY_0931 CBY_0932     TRUE 0.506 63.000 0.000 NA   NA
 5976164 5976165 CBY_0932 CBY_0933     FALSE 0.271 134.000 0.000 NA   NA
 5976165 5976166 CBY_0933 CBY_0934     FALSE 0.194 181.000 0.000 1.000   NA
 5976166 5976167 CBY_0934 CBY_0935     TRUE 0.841 2.000 0.000 NA   NA
 5976167 5976168 CBY_0935 CBY_0936     TRUE 0.727 33.000 0.000 NA   NA
 5976168 5976169 CBY_0936 CBY_0937     TRUE 0.536 59.000 0.000 NA   NA
 5976169 5976170 CBY_0937 CBY_0938     FALSE 0.418 82.000 0.000 NA   NA
 5976170 5976171 CBY_0938 CBY_0939     FALSE 0.128 208.000 0.000 NA   NA
 5976171 5976172 CBY_0939 CBY_0940     FALSE 0.268 138.000 0.000 NA   NA
 5976172 5976173 CBY_0940 CBY_0941     FALSE 0.277 130.000 0.000 NA   NA
 5976175 5976176 CBY_0943 CBY_0944     TRUE 0.821 78.000 0.091 NA   NA
 5976176 5976177 CBY_0944 CBY_0945     TRUE 0.970 26.000 0.227 NA   NA
 5976177 5976178 CBY_0945 CBY_0946     TRUE 0.856 72.000 0.132 NA   NA
 5976183 5976184 CBY_0689 CBY_0690     TRUE 0.841 2.000 0.000 NA   NA
 5976184 5976185 CBY_0690 CBY_0691     TRUE 0.837 0.000 0.000 NA   NA
 5976185 5976186 CBY_0691 CBY_0692     FALSE 0.302 118.000 0.000 NA   NA
 5976186 5976187 CBY_0692 CBY_0693     FALSE 0.212 174.000 0.000 NA   NA
 5976187 5976188 CBY_0693 CBY_0695     TRUE 0.829 15.000 0.000 NA   NA
 5976189 4730586 CBY_0584 CBY_0585     TRUE 0.842 5.000 0.000 NA   NA
 4730586 5976190 CBY_0585 CBY_0586     FALSE 0.302 118.000 0.000 NA   NA
 5976190 5976191 CBY_0586 CBY_0587     TRUE 0.842 3.000 0.000 NA   NA
 5976192 5976193 CBY_3313 CBY_3314   dtd TRUE 0.488 66.000 0.000 NA   NA
 5976193 5976194 CBY_3314 CBY_3315 dtd   TRUE 0.697 103.000 0.048 1.000   NA
 5976194 5976195 CBY_3315 CBY_3316     TRUE 0.547 162.000 0.035 1.000   NA
 5976195 5976196 CBY_3316 CBY_3317   hisS TRUE 0.708 133.000 0.111 1.000 N NA
 5976196 5976197 CBY_3317 CBY_3318 hisS aspS TRUE 0.784 221.000 0.028 0.031 Y NA
 5976197 5976198 CBY_3318 CBY_3319 aspS   FALSE 0.349 104.000 0.000 1.000 N NA
 5976200 5976201 CBY_3321 CBY_3322   asrA TRUE 0.750 154.000 0.227 1.000   NA
 5976201 5976202 CBY_3322 CBY_3323 asrA asrB TRUE 0.988 1.000 0.750 0.024   NA
 5976202 5976203 CBY_3323 CBY_3324 asrB asrC TRUE 0.998 17.000 0.720 0.023 Y NA
 5976203 5976204 CBY_3324 CBY_3325 asrC   FALSE 0.358 293.000 0.000 0.024 Y NA
 5976204 5976205 CBY_3325 CBY_3326     TRUE 0.994 14.000 0.039 NA Y NA
 5976205 5976206 CBY_3326 CBY_3327     TRUE 0.842 4.000 0.000 NA   NA
 5976206 5976207 CBY_3327 CBY_3328     FALSE 0.421 81.000 0.000 NA   NA
 5976207 5976208 CBY_3328 CBY_3329     FALSE 0.262 146.000 0.000 NA   NA
 5976208 5976209 CBY_3329 CBY_3330     FALSE 0.367 98.000 0.000 1.000 N NA
 5976209 5976210 CBY_3330 CBY_3331     FALSE 0.019 357.000 0.000 NA   NA
 5976210 5976211 CBY_3331 CBY_3332     TRUE 0.832 -3.000 0.000 NA   NA
 5976211 5976212 CBY_3332 CBY_3333     TRUE 0.962 21.000 0.111 0.002   NA
 5976212 5976213 CBY_3333 CBY_3334   moaC TRUE 0.981 29.000 0.000 0.002 Y NA
 5976213 5976214 CBY_3334 CBY_3335 moaC mobB TRUE 0.986 -10.000 0.000 0.002 Y NA
 5976214 5976215 CBY_3335 CBY_3336 mobB moaA TRUE 0.988 -3.000 0.000 0.002 Y NA
 5976215 5976216 CBY_3336 CBY_3337 moaA   TRUE 0.706 95.000 0.042 0.024   NA
 5976216 5976217 CBY_3337 CBY_3338     TRUE 0.927 -12.000 0.011 1.000   NA
 5976223 5976224 CBY_3344 CBY_3345     TRUE 0.760 195.000 0.000 1.000 Y NA
 5976224 5976225 CBY_3345 CBY_3346     TRUE 0.994 26.000 0.083 1.000 Y NA
 5976225 5976226 CBY_3346 CBY_3347     TRUE 0.985 21.000 0.000 0.012 Y NA
 5976226 5976227 CBY_3347 CBY_3348   gmd TRUE 0.987 16.000 0.000 1.000 Y NA
 5976227 5976228 CBY_3348 CBY_3349 gmd   TRUE 0.987 46.000 0.099 0.003 Y NA
 5976228 5976229 CBY_3349 CBY_3350     TRUE 0.989 2.000 0.000 NA Y NA
 5976229 5976230 CBY_3350 CBY_3351     TRUE 0.988 12.000 0.000 NA Y NA
 5976230 5976231 CBY_3351 CBY_3352     TRUE 0.574 53.000 0.000 NA   NA
 5976231 5976232 CBY_3352 CBY_3353     TRUE 0.657 41.000 0.000 NA   NA
 5976232 5976233 CBY_3353 CBY_3354     TRUE 0.856 69.000 0.118 NA   NA
 5976233 5976234 CBY_3354 CBY_3356     TRUE 0.889 109.000 0.000 NA Y NA
 5976236 5976237 CBY_3357 CBY_3358     FALSE 0.444 76.000 0.000 NA   NA
 5976237 5976238 CBY_3358 CBY_3359     TRUE 0.687 38.000 0.000 NA   NA
 5976238 5976239 CBY_3359 CBY_3360     FALSE 0.212 173.000 0.000 1.000   NA
 5976239 5976240 CBY_3360 CBY_3361     TRUE 0.839 2.000 0.000 1.000   NA
 5976240 5976241 CBY_3361 CBY_3362     TRUE 0.807 -22.000 0.000 NA   NA
 5976241 5976242 CBY_3362 CBY_3363     TRUE 0.560 55.000 0.000 NA   NA
 5976242 5976243 CBY_3363 CBY_3364     TRUE 0.932 24.000 0.027 1.000 N NA
 5976244 5976245 CBY_3365 CBY_3366     FALSE 0.144 201.000 0.000 1.000   NA
 5976246 5976247 CBY_3367 CBY_3368     TRUE 0.687 38.000 0.000 NA   NA
 5976247 5976248 CBY_3368 CBY_3369     TRUE 0.809 -19.000 0.000 NA   NA
 5976250 5976251 CBY_3371 CBY_3372     FALSE 0.067 245.000 0.000 NA   NA
 5976251 5976252 CBY_3372 CBY_3373     FALSE 0.377 92.000 0.000 1.000   NA
 5976252 5976253 CBY_3373 CBY_3374     FALSE 0.037 287.000 0.000 1.000   NA
 5976253 5976254 CBY_3374 CBY_3375     FALSE 0.311 117.000 0.000 1.000 N NA
 5976254 5976255 CBY_3375 CBY_3376     FALSE 0.025 327.000 0.000 1.000 N NA
 5976255 5976256 CBY_3376 CBY_3377     TRUE 0.667 40.000 0.000 NA   NA
 4730591 5976259 CBY_0523 CBY_0524   rpe TRUE 0.976 5.000 0.166 1.000 N NA
 5976259 5976260 CBY_0524 CBY_0525 rpe rsgA TRUE 0.977 -6.000 0.213 1.000   NA
 5976260 5976261 CBY_0525 CBY_0526 rsgA   TRUE 0.800 109.000 0.196 1.000   NA
 5976261 5976262 CBY_0526 CBY_0527     TRUE 0.998 3.000 0.704 1.000 Y NA
 5976262 5976263 CBY_0527 CBY_0528     TRUE 0.970 2.000 0.105 1.000   NA
 5976263 5976264 CBY_0528 CBY_0529   sun TRUE 0.972 15.000 0.135 1.000   NA
 5976264 5976265 CBY_0529 CBY_0530 sun fmt TRUE 0.917 207.000 0.305 1.000 Y NA
 5976265 5976266 CBY_0530 CBY_0531 fmt def TRUE 0.823 200.000 0.009 0.014 Y NA
 5976266 5976267 CBY_0531 CBY_0532 def   TRUE 0.936 13.000 0.010 1.000 N NA
 5976267 5976268 CBY_0532 CBY_0533   coaBC TRUE 0.789 93.000 0.099 1.000 N NA
 5976268 5976269 CBY_0533 CBY_0534 coaBC rpoZ TRUE 0.977 2.000 0.192 1.000 N NA
 5976269 5976270 CBY_0534 CBY_0535 rpoZ gmk TRUE 0.982 -19.000 0.471 1.000 N NA
 5976270 5976271 CBY_0535 CBY_0536 gmk   TRUE 0.974 0.000 0.143 NA   NA
 5976271 5976272 CBY_0536 CBY_0537     TRUE 0.974 16.000 0.189 NA   NA
 5976272 5976273 CBY_0537 CBY_0538     FALSE 0.041 277.000 0.000 NA   NA