MicrobesOnline Operon Predictions for Clostridium botulinum A str. Hall

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
3741468	3741469	CLC_0001	CLC_0002	dnaA	dnaN	TRUE	0.675	263.000	0.328	1.000	Y	NA
3741469	3741470	CLC_0002	CLC_0003	dnaN		TRUE	0.960	19.000	0.103	1.000		NA
3741470	3741471	CLC_0003	CLC_0004		recF	TRUE	0.853	69.000	0.209	1.000		NA
3741471	3741472	CLC_0004	CLC_0005	recF		TRUE	0.928	21.000	0.024	NA		NA
3741472	3741473	CLC_0005	CLC_0006		gyrB	TRUE	0.925	18.000	0.017	NA		NA
3741473	3741474	CLC_0006	CLC_0007	gyrB	gyrA	TRUE	0.993	26.000	0.306	0.002	Y	NA
3741474	3741475	CLC_0007	CLC_0008	gyrA	rrsA	FALSE	0.004	415.000	0.000	NA		NA
3741475	3741476	CLC_0008	CLC_0011	rrsA	rrlA	FALSE	0.054	221.000	0.000	NA		NA
3741476	3741477	CLC_0011	CLC_0012	rrlA	rrfA	FALSE	0.180	92.000	0.000	NA		NA
3741477	3741478	CLC_0012	CLC_0013	rrfA		TRUE	0.705	9.000	0.000	NA		NA
3741478	3741479	CLC_0013	CLC_0015			TRUE	0.732	4.000	0.000	NA		NA
3741479	3741480	CLC_0015	CLC_0017			FALSE	0.121	165.000	0.000	NA		NA
3741480	3741481	CLC_0017	CLC_0018			TRUE	0.938	16.000	0.029	NA		NA
3741481	3741482	CLC_0018	CLC_0019			TRUE	0.957	2.000	0.014	1.000		NA
3741482	3741483	CLC_0019	CLC_0020			TRUE	0.948	5.000	0.011	1.000		NA
3741483	3741484	CLC_0020	CLC_0021			FALSE	0.558	137.000	0.016	NA		NA
3741484	3741485	CLC_0021	CLC_0022			TRUE	0.966	25.000	0.214	NA		NA
3741485	3741486	CLC_0022	CLC_0023			TRUE	0.978	17.000	0.370	NA		NA
3741486	3741487	CLC_0023	CLC_0024		serS-1	FALSE	0.007	370.000	0.000	NA		NA
3741487	3741488	CLC_0024	CLC_0025	serS-1		FALSE	0.024	276.000	0.000	NA		NA
3741488	3741489	CLC_0025	CLC_0027			TRUE	0.637	21.000	0.000	NA		NA
3741489	3741490	CLC_0027	CLC_0029			FALSE	0.015	307.000	0.000	NA		NA
3741490	3741491	CLC_0029	CLC_0031			TRUE	0.637	21.000	0.000	NA		NA
3741491	3741492	CLC_0031	CLC_0033			FALSE	0.193	85.000	0.000	NA		NA
3741493	3741494	CLC_0035	CLC_0036	psd-1		FALSE	0.002	493.000	0.000	NA		NA
3741495	3741496	CLC_0037	CLC_0038			FALSE	0.230	73.000	0.000	NA		NA
3741496	3741497	CLC_0038	CLC_0039			TRUE	0.989	9.000	0.667	NA		NA
3741497	3741498	CLC_0039	CLC_0040			TRUE	0.687	12.000	0.000	NA		NA
3741498	3741499	CLC_0040	CLC_0041			TRUE	0.654	17.000	0.000	NA		NA
3741500	3741501	CLC_0042	CLC_0043	psd-2		FALSE	0.612	103.000	0.026	NA		NA
3741501	3741502	CLC_0043	CLC_0044			FALSE	0.219	76.000	0.000	NA		NA
3741503	3741504	CLC_0045	CLC_0046			FALSE	0.162	134.000	0.000	NA		NA
3741504	3741505	CLC_0046	CLC_0047		megL	TRUE	0.645	160.000	0.034	1.000	N	NA
3741505	3741506	CLC_0047	CLC_0048	megL		FALSE	0.354	124.000	0.000	1.000	N	NA
3741506	3741507	CLC_0048	CLC_0049			FALSE	0.120	166.000	0.000	NA		NA
3741507	10195466	CLC_0049	CLC_3700		srpB	FALSE	0.167	124.000	0.000	NA		NA
10195466	3741508	CLC_3700	CLC_0051	srpB	dnaX	FALSE	0.123	164.000	0.000	NA		NA
3741508	3741509	CLC_0051	CLC_0052	dnaX		TRUE	0.801	65.000	0.100	NA		NA
3741509	3741510	CLC_0052	CLC_0053		recR	TRUE	0.973	33.000	0.604	NA		NA
3741510	3741511	CLC_0053	CLC_0054	recR		TRUE	0.817	57.000	0.071	NA		NA
3741511	3741512	CLC_0054	CLC_0055		bofA	TRUE	0.820	150.000	0.417	NA		NA
3741512	3741513	CLC_0055	CLC_0056	bofA	sfsA	FALSE	0.473	151.000	0.005	NA		NA
3741513	3741514	CLC_0056	CLC_0057	sfsA		TRUE	0.744	56.000	0.015	NA		NA
3741514	3741515	CLC_0057	CLC_0058			FALSE	0.239	118.000	0.000	1.000		NA
3741515	3741516	CLC_0058	CLC_0059			FALSE	0.224	134.000	0.000	1.000		NA
3741516	3741517	CLC_0059	CLC_0060			TRUE	0.969	19.000	0.222	NA		NA
3741517	3741518	CLC_0060	CLC_0061			FALSE	0.006	383.000	0.000	NA		NA
3741518	3741519	CLC_0061	CLC_0062			TRUE	0.682	83.000	0.007	1.000	N	NA
3741519	3741520	CLC_0062	CLC_0063			TRUE	0.942	29.000	0.035	1.000	N	NA
3741520	3741521	CLC_0063	CLC_0064		rrsB	FALSE	0.006	387.000	0.000	NA		NA
3741521	3741522	CLC_0064	CLC_0067	rrsB	rrlB	FALSE	0.053	222.000	0.000	NA		NA
3741522	3741523	CLC_0067	CLC_0068	rrlB	rrfB	FALSE	0.169	122.000	0.000	NA		NA
3741523	3741524	CLC_0068	CLC_0069	rrfB		TRUE	0.713	7.000	0.000	NA		NA
3741526	3741527	CLC_0072	CLC_0075	rrsC	rrlC	FALSE	0.053	222.000	0.000	NA		NA
3741527	3741528	CLC_0075	CLC_0076	rrlC	rrfC	FALSE	0.162	133.000	0.000	NA		NA
3741528	3741529	CLC_0076	CLC_0077	rrfC		TRUE	0.713	7.000	0.000	NA		NA
3741529	3741530	CLC_0077	CLC_0079			FALSE	0.009	343.000	0.000	NA		NA
3741530	3741531	CLC_0079	CLC_0080			TRUE	0.994	-3.000	0.800	NA		NA
3741531	3741532	CLC_0080	CLC_0081		rrsE	FALSE	0.002	645.000	0.000	NA		NA
3741532	3741533	CLC_0081	CLC_0084	rrsE	rrlE	FALSE	0.053	222.000	0.000	NA		NA
3741533	3741534	CLC_0084	CLC_0085	rrlE	rrfE	FALSE	0.336	53.000	0.000	NA		NA
3741534	3741535	CLC_0085	CLC_0086	rrfE		TRUE	0.709	8.000	0.000	NA		NA
3741535	3741536	CLC_0086	CLC_0088			FALSE	0.158	141.000	0.000	NA		NA
3741536	3741537	CLC_0088	CLC_0089		rrsF	FALSE	0.002	522.000	0.000	NA		NA
3741537	3741538	CLC_0089	CLC_0092	rrsF	rrlF	FALSE	0.053	222.000	0.000	NA		NA
3741538	3741539	CLC_0092	CLC_0093	rrlF	rrfF	FALSE	0.173	106.000	0.000	NA		NA
3741539	3741540	CLC_0093	CLC_0094	rrfF		FALSE	0.007	371.000	0.000	NA		NA
3741540	3741541	CLC_0094	CLC_0095			FALSE	0.201	82.000	0.000	NA		NA
3741542	3741543	CLC_0096	CLC_0097			TRUE	0.906	36.000	0.039	NA	N	NA
3741546	3741547	CLC_0100	CLC_0101			TRUE	0.987	-21.000	0.120	NA		NA
3741547	3741548	CLC_0101	CLC_0102			TRUE	0.955	24.000	0.034	1.000	N	NA
3741548	3741549	CLC_0102	CLC_0103			TRUE	0.681	81.000	0.034	NA		NA
3741549	3741550	CLC_0103	CLC_0104			TRUE	0.925	18.000	0.018	NA		NA
3741550	3741551	CLC_0104	CLC_0105			TRUE	0.986	2.000	0.372	NA		NA
3741551	3741552	CLC_0105	CLC_0106			TRUE	0.931	12.000	0.011	NA		NA
3741552	3741553	CLC_0106	CLC_0107			TRUE	0.860	82.000	0.333	1.000		NA
3741553	3741554	CLC_0107	CLC_0108			FALSE	0.569	121.000	0.006	1.000		NA
3741554	3741555	CLC_0108	CLC_0109			TRUE	0.968	20.000	0.078	0.010		NA
3741555	3741556	CLC_0109	CLC_0110			FALSE	0.433	156.000	0.002	NA		NA
3741558	3741559	CLC_0112	CLC_0113		arcA-1	FALSE	0.006	422.000	0.000	1.000		NA
3741560	3741561	CLC_0114	CLC_0115	ispF		FALSE	0.586	76.000	0.003	NA		NA
3741564	3741565	CLC_0118	CLC_0119	spmA		TRUE	0.992	13.000	0.655	0.003		NA
3741567	3741568	CLC_0121	CLC_0122	udgA		TRUE	0.929	29.000	0.016	1.000	N	NA
3741568	3741569	CLC_0122	CLC_0123		metG	FALSE	0.016	382.000	0.000	1.000	N	NA
3741569	3741570	CLC_0123	CLC_0124	metG		FALSE	0.414	165.000	0.003	NA		NA
3741570	3741571	CLC_0124	CLC_0125			FALSE	0.466	151.000	0.004	NA		NA
3741571	3741572	CLC_0125	CLC_0126			FALSE	0.048	228.000	0.000	NA		NA
3741572	3741573	CLC_0126	CLC_0127			TRUE	0.706	73.000	0.020	1.000		NA
3741573	3741574	CLC_0127	CLC_0128		ksgA	TRUE	0.980	2.000	0.093	1.000	N	NA
3741574	3741575	CLC_0128	CLC_0129	ksgA		FALSE	0.610	79.000	0.010	NA		NA
3741575	3741576	CLC_0129	CLC_0130			TRUE	0.759	157.000	0.278	NA		NA
3741576	3741577	CLC_0130	CLC_0131			TRUE	0.676	169.000	0.188	NA		NA
3741577	3741578	CLC_0131	CLC_0132			TRUE	0.665	168.000	0.167	NA		NA
3741578	3741579	CLC_0132	CLC_0133			TRUE	0.986	11.000	0.350	1.000	N	NA
3741579	3741580	CLC_0133	CLC_0134			TRUE	0.996	-3.000	0.349	NA	Y	NA
3741580	3741581	CLC_0134	CLC_0135			TRUE	0.698	82.000	0.019	NA	N	NA
3741581	3741582	CLC_0135	CLC_0136			FALSE	0.220	140.000	0.000	1.000		NA
3741582	3741583	CLC_0136	CLC_0137			FALSE	0.222	75.000	0.000	NA		NA
3741585	3741586	CLC_0139	CLC_0140			FALSE	0.302	57.000	0.000	NA		NA
3741586	3741587	CLC_0140	CLC_0141		nrdD	FALSE	0.020	290.000	0.000	NA		NA
3741587	3741588	CLC_0141	CLC_0142	nrdD	nrdG	TRUE	0.988	17.000	0.315	0.001	N	NA
3741589	3741590	CLC_0143	CLC_0144			FALSE	0.160	138.000	0.000	NA		NA
3741590	3741591	CLC_0144	CLC_0145			TRUE	0.974	2.000	0.111	NA		NA
3741591	3741592	CLC_0145	CLC_0146			FALSE	0.170	121.000	0.000	NA		NA
3741593	3741594	CLC_0147	CLC_0148	ileS		FALSE	0.601	151.000	0.009	1.000	N	NA
3741594	3741595	CLC_0148	CLC_0149			FALSE	0.386	216.000	0.017	1.000	N	NA
3741595	3741596	CLC_0149	CLC_0150			TRUE	0.854	75.000	0.160	1.000	N	NA
3741596	3741597	CLC_0150	CLC_0151			FALSE	0.010	336.000	0.000	NA		NA
3741597	3741598	CLC_0151	CLC_0152			TRUE	0.964	5.000	0.066	NA		NA
3741598	3741599	CLC_0152	CLC_0153			TRUE	0.970	20.000	0.210	1.000		NA
3741599	3741600	CLC_0153	CLC_0154			FALSE	0.073	225.000	0.000	1.000		NA
3741600	3741601	CLC_0154	CLC_0155			TRUE	0.709	187.000	0.333	1.000		NA
3741603	3741604	CLC_0157	CLC_0158			TRUE	0.965	15.000	0.143	NA		NA
3741604	3741605	CLC_0158	CLC_0159			TRUE	0.967	27.000	0.250	NA		NA
3741605	3741606	CLC_0159	CLC_0160			TRUE	0.989	13.000	0.800	NA		NA
3741608	3741609	CLC_0162	CLC_0163	cotS		TRUE	0.722	124.000	0.119	NA		NA
3741609	3741610	CLC_0163	CLC_0164			FALSE	0.530	196.000	0.116	NA		NA
3741610	3741611	CLC_0164	CLC_0165			TRUE	0.694	104.000	0.082	NA		NA
3741611	3741612	CLC_0165	CLC_0166			FALSE	0.018	297.000	0.000	NA		NA
3741612	3741613	CLC_0166	CLC_0167		cphB	TRUE	0.856	-30.000	0.000	NA		NA
3741613	3741614	CLC_0167	CLC_0168	cphB	cphA	TRUE	0.967	44.000	0.605	1.000	N	NA
3741614	3741615	CLC_0168	CLC_0169	cphA	ispE	TRUE	0.685	93.000	0.016	1.000	N	NA
3741615	3741616	CLC_0169	CLC_0170	ispE		FALSE	0.425	166.000	0.005	NA		NA
3741616	3741617	CLC_0170	CLC_0171			TRUE	0.840	60.000	0.133	NA		NA
3741617	3741618	CLC_0171	CLC_0172			TRUE	0.984	20.000	0.333	0.008		NA
3741618	3741619	CLC_0172	CLC_0173			TRUE	0.961	50.000	0.500	0.008		NA
3741619	3741620	CLC_0173	CLC_0174			TRUE	0.786	73.000	0.109	NA		NA
3741622	3741623	CLC_0176	CLC_0177	ypeB		FALSE	0.552	103.000	0.003	1.000		NA
3741623	3741624	CLC_0177	CLC_0178			TRUE	0.910	25.000	0.011	NA		NA
3741624	3741625	CLC_0178	CLC_0179			TRUE	0.626	132.000	0.039	NA		NA
3741625	3741626	CLC_0179	CLC_0180		pyrG	FALSE	0.192	234.000	0.004	NA		NA
3741626	3741627	CLC_0180	CLC_0181	pyrG		FALSE	0.003	448.000	0.000	NA		NA
3741627	3741628	CLC_0181	CLC_0182		rho	FALSE	0.412	172.000	0.006	NA		NA
3741630	3741631	CLC_0184	CLC_0185	tdk		TRUE	0.918	17.000	0.010	NA		NA
3741631	3741632	CLC_0185	CLC_0186		hemK	TRUE	0.966	8.000	0.098	NA		NA
3741632	3741633	CLC_0186	CLC_0187	hemK	prfA	TRUE	0.902	82.000	0.081	1.000	Y	NA
3741633	3741634	CLC_0187	CLC_0188	prfA		TRUE	0.893	28.000	0.009	NA		NA
3741634	3741635	CLC_0188	CLC_0189			TRUE	0.831	60.000	0.116	NA		NA
3741635	3741636	CLC_0189	CLC_0190			TRUE	0.956	21.000	0.052	NA	N	NA
3741636	3741637	CLC_0190	CLC_0191			TRUE	0.968	9.000	0.056	NA	N	NA
3741637	3741638	CLC_0191	CLC_0192		rpiB	TRUE	0.850	60.000	0.065	1.000	N	NA
3741638	3741639	CLC_0192	CLC_0193	rpiB	upp	TRUE	0.927	30.000	0.019	1.000	N	NA
3741639	3741640	CLC_0193	CLC_0194	upp		FALSE	0.068	507.000	0.041	1.000	Y	NA
3741640	3741641	CLC_0194	CLC_0195		tagO	TRUE	0.709	108.000	0.029	1.000	N	NA
3741641	3741642	CLC_0195	CLC_0196	tagO	mnaA	TRUE	0.993	14.000	0.346	1.000	Y	NA
3741642	3741643	CLC_0196	CLC_0197	mnaA		FALSE	0.004	492.000	0.000	1.000		NA
3741643	3741644	CLC_0197	CLC_0198		atpB	TRUE	0.980	15.000	0.330	1.000		NA
3741644	3741645	CLC_0198	CLC_0199	atpB	atpE	TRUE	0.880	40.000	0.009	0.008		NA
3741645	3741646	CLC_0199	CLC_0200	atpE	atpF	TRUE	0.839	76.000	0.095	0.008		NA
3741646	3741647	CLC_0200	CLC_0201	atpF	atpH	TRUE	0.992	3.000	0.040	0.008	Y	NA
3741647	3741648	CLC_0201	CLC_0202	atpH	atpA	TRUE	0.998	11.000	0.864	0.008	Y	NA
3741648	3741649	CLC_0202	CLC_0203	atpA	atpG	TRUE	0.997	22.000	0.846	0.008	Y	NA
3741649	3741650	CLC_0203	CLC_0204	atpG	atpD	TRUE	0.997	14.000	0.724	0.008	Y	NA
3741650	3741651	CLC_0204	CLC_0205	atpD	atpC	TRUE	0.997	25.000	0.837	0.008	Y	NA
3741651	3741652	CLC_0205	CLC_0206	atpC		FALSE	0.346	193.000	0.007	NA		NA
3741652	3741653	CLC_0206	CLC_0207		murA-1	TRUE	0.975	24.000	0.346	NA		NA
3741653	3741654	CLC_0207	CLC_0208	murA-1	spoIID	FALSE	0.415	270.000	0.243	1.000	N	NA
3741654	3741655	CLC_0208	CLC_0209	spoIID		FALSE	0.033	532.000	0.090	1.000	N	NA
3741655	3741656	CLC_0209	CLC_0210		spoIIID	TRUE	0.728	108.000	0.093	1.000		NA
3741656	3741657	CLC_0210	CLC_0211	spoIIID		TRUE	0.825	100.000	0.284	1.000		NA
3741658	3741659	CLC_0212	CLC_0213			TRUE	0.768	49.000	0.010	NA		NA
3741660	3741661	CLC_0214	CLC_0215			TRUE	0.719	6.000	0.000	NA		NA
3741661	3741662	CLC_0215	CLC_0217			TRUE	0.670	14.000	0.000	NA		NA
3741662	3741663	CLC_0217	CLC_0219			TRUE	0.646	18.000	0.000	NA		NA
3741663	3741664	CLC_0219	CLC_0220			TRUE	0.719	6.000	0.000	NA		NA
3741664	3741665	CLC_0220	CLC_0222		metK	FALSE	0.013	316.000	0.000	NA		NA
3741665	3741666	CLC_0222	CLC_0223	metK		FALSE	0.566	191.000	0.052	1.000	N	NA
3741666	3741667	CLC_0223	CLC_0224			TRUE	0.938	26.000	0.051	NA		NA
3741667	3741668	CLC_0224	CLC_0225			TRUE	0.987	-27.000	0.130	NA		NA
3741668	3741669	CLC_0225	CLC_0226		yfiA	FALSE	0.040	425.000	0.080	NA		NA
3741669	3741670	CLC_0226	CLC_0227	yfiA	secA	FALSE	0.379	228.000	0.050	NA	N	NA
3741670	3741671	CLC_0227	CLC_0228	secA	prfB	FALSE	0.089	364.000	0.048	1.000	N	NA
3741673	3741674	CLC_0230	CLC_0231			FALSE	0.021	284.000	0.000	NA		NA
3741674	3741675	CLC_0231	CLC_0232			FALSE	0.028	411.000	0.016	NA		NA
3741675	3741676	CLC_0232	CLC_0233			TRUE	0.982	21.000	0.500	NA		NA
3741676	3741677	CLC_0233	CLC_0234			TRUE	0.960	14.000	0.077	1.000		NA
3741677	3741678	CLC_0234	CLC_0235			TRUE	0.662	84.000	0.022	1.000		NA
3741678	3741679	CLC_0235	CLC_0236			TRUE	0.905	40.000	0.109	1.000		NA
3741681	3741682	CLC_0238	CLC_0239			FALSE	0.146	150.000	0.000	NA		NA
3741683	3741684	CLC_0240	CLC_0241	leuS		FALSE	0.014	377.000	0.000	NA	N	NA
3741686	3741687	CLC_0244	CLC_0245			TRUE	0.959	25.000	0.138	NA		NA
3741687	3741688	CLC_0245	CLC_0246			FALSE	0.008	360.000	0.000	NA		NA
3741688	3741689	CLC_0246	CLC_0247			TRUE	0.732	4.000	0.000	NA		NA
3741691	3741692	CLC_0249	CLC_0250	fba		FALSE	0.049	226.000	0.000	NA		NA
3741692	3741693	CLC_0250	CLC_0251			TRUE	0.696	117.000	0.082	NA		NA
3741694	3741695	CLC_0252	CLC_0253			FALSE	0.543	138.000	0.013	NA		NA
3741697	3741698	CLC_0255	CLC_0256			TRUE	0.729	106.000	0.094	1.000		NA
3741698	3741699	CLC_0256	CLC_0257			TRUE	0.856	74.000	0.281	NA		NA
3741701	3741702	CLC_0259	CLC_0260		sleB	FALSE	0.393	230.000	0.041	0.066		NA
3741702	3741703	CLC_0260	CLC_0261	sleB	cysK-1	FALSE	0.011	364.000	0.000	1.000		NA
3741703	3741704	CLC_0261	CLC_0262	cysK-1	cysE	TRUE	0.991	15.000	0.101	0.002	Y	NA
3741704	3741705	CLC_0262	CLC_0263	cysE		TRUE	0.962	22.000	0.064	1.000	N	NA
3741705	3741706	CLC_0263	CLC_0264			TRUE	0.718	148.000	0.064	1.000	N	NA
3741706	3741707	CLC_0264	CLC_0265		nth	TRUE	0.667	93.000	0.011	1.000	N	NA
3741707	3741708	CLC_0265	CLC_0266	nth		FALSE	0.028	334.000	0.000	1.000	N	NA
3741709	3741710	CLC_0267	CLC_0268			TRUE	0.907	26.000	0.004	1.000		NA
3741710	3741711	CLC_0268	CLC_0269			FALSE	0.589	110.000	0.018	NA		NA
3741712	3741713	CLC_0270	CLC_0271			FALSE	0.450	205.000	0.000	1.000	Y	NA
3741713	3741714	CLC_0271	CLC_0272		splB	TRUE	0.671	147.000	0.027	1.000	N	NA
3741714	3741715	CLC_0272	CLC_0273	splB		TRUE	0.636	128.000	0.008	1.000	N	NA
3741715	3741716	CLC_0273	CLC_0274			TRUE	0.933	13.000	0.016	NA		NA
3741716	3741717	CLC_0274	CLC_0275			FALSE	0.019	294.000	0.000	NA		NA
3741717	3741718	CLC_0275	CLC_0276			TRUE	0.639	166.000	0.097	1.000		NA
3741718	3741719	CLC_0276	CLC_0277			TRUE	0.989	2.000	0.438	1.000		NA
3741719	3741720	CLC_0277	CLC_0278			TRUE	0.996	-7.000	0.720	0.038		NA
3741720	3741721	CLC_0278	CLC_0279			FALSE	0.579	112.000	0.007	1.000		NA
3741721	3741722	CLC_0279	CLC_0280		rpoN	FALSE	0.171	329.000	0.125	1.000	N	NA
3741722	3741723	CLC_0280	CLC_0281	rpoN	cggR	FALSE	0.383	288.000	0.034	1.000	Y	NA
3741723	3741724	CLC_0281	CLC_0282	cggR	gap-1	TRUE	0.892	78.000	0.348	1.000	N	NA
3741724	3741725	CLC_0282	CLC_0283	gap-1	pgk	FALSE	0.472	297.000	0.063	0.004	Y	NA
3741725	3741726	CLC_0283	CLC_0284	pgk	tpiA	TRUE	0.943	62.000	0.141	1.000	Y	NA
3741726	3741727	CLC_0284	CLC_0285	tpiA	gpmI	TRUE	0.908	92.000	0.138	1.000	Y	NA
3741727	3741728	CLC_0285	CLC_0286	gpmI	eno	TRUE	0.921	56.000	0.016	1.000	Y	NA
3741728	3741729	CLC_0286	CLC_0287	eno	secG	FALSE	0.320	223.000	0.006	1.000	N	NA
3741729	3741730	CLC_0287	CLC_0288	secG	rnr	FALSE	0.502	209.000	0.064	1.000	N	NA
3741730	3741731	CLC_0288	CLC_0289	rnr	surE	FALSE	0.007	409.000	0.000	1.000		NA
3741731	3741732	CLC_0289	CLC_0290	surE	smpB	FALSE	0.048	257.000	0.000	1.000		NA
3741734	3741735	CLC_0292	CLC_0293			FALSE	0.001	780.000	0.000	NA		NA
3741735	3741736	CLC_0293	CLC_0295			FALSE	0.134	157.000	0.000	NA		NA
3741736	3741737	CLC_0295	CLC_0296			FALSE	0.005	391.000	0.000	NA		NA
3741738	3741739	CLC_0297	CLC_0298			FALSE	0.024	276.000	0.000	NA		NA
3741740	3741741	CLC_0299	CLC_0300			FALSE	0.212	188.000	0.000	1.000	N	NA
3741741	3741742	CLC_0300	CLC_0301			FALSE	0.012	359.000	0.000	1.000		NA
3741742	3741743	CLC_0301	CLC_0302			FALSE	0.006	384.000	0.000	NA		NA
3741743	3741744	CLC_0302	CLC_0303			FALSE	0.010	341.000	0.000	NA		NA
3741744	3741745	CLC_0303	CLC_0304			FALSE	0.002	502.000	0.000	NA		NA
3741745	3741746	CLC_0304	CLC_0305		kdgT	FALSE	0.091	212.000	0.000	1.000		NA
3741746	3741747	CLC_0305	CLC_0306	kdgT		FALSE	0.087	214.000	0.000	1.000		NA
3741747	3741748	CLC_0306	CLC_0307			TRUE	0.999	-22.000	1.000	1.000	Y	NA
3741748	3741749	CLC_0307	CLC_0308		lysP	FALSE	0.005	557.000	0.000	1.000	N	NA
3741749	3741750	CLC_0308	CLC_0309	lysP		FALSE	0.003	544.000	0.000	1.000		NA
3741750	3741751	CLC_0309	CLC_0310			FALSE	0.240	114.000	0.000	1.000		NA
3741751	3741752	CLC_0310	CLC_0311			TRUE	0.707	26.000	0.000	1.000		NA
3741752	3741753	CLC_0311	CLC_0312			FALSE	0.185	159.000	0.000	1.000		NA
3741753	3741754	CLC_0312	CLC_0313			TRUE	0.945	26.000	0.050	1.000		NA
3741754	3741755	CLC_0313	CLC_0314			TRUE	0.853	63.000	0.095	1.000	N	NA
3741755	3741756	CLC_0314	CLC_0315			FALSE	0.219	76.000	0.000	NA		NA
3741758	3741759	CLC_0317	CLC_0318			TRUE	0.998	0.000	0.800	0.042	Y	NA
3741759	3741760	CLC_0318	CLC_0319			TRUE	0.982	-3.000	0.000	0.058	Y	NA
3741760	3741761	CLC_0319	CLC_0320			FALSE	0.008	357.000	0.000	NA		NA
3741761	3741762	CLC_0320	CLC_0321			TRUE	0.695	11.000	0.000	NA		NA
3741762	3741763	CLC_0321	CLC_0322			TRUE	0.637	22.000	0.000	NA		NA
3741763	3741764	CLC_0322	CLC_0323			TRUE	0.964	25.000	0.091	1.000	N	NA
3741764	3741765	CLC_0323	CLC_0324			TRUE	0.997	-28.000	0.278	1.000	Y	NA
3741767	3741768	CLC_0326	CLC_0327	glvA-1		TRUE	0.901	163.000	0.294	1.000	Y	NA
3741769	3741770	CLC_0328	CLC_0329			TRUE	0.996	16.000	0.500	0.005	Y	NA
3741771	3741772	CLC_0330	CLC_0331			FALSE	0.365	98.000	0.000	1.000	N	NA
3741772	3741773	CLC_0331	CLC_0332			TRUE	0.992	10.000	0.235	1.000	Y	NA
3741773	3741774	CLC_0332	CLC_0333			TRUE	0.867	120.000	0.353	1.000	N	NA
3741774	3741775	CLC_0333	CLC_0334			TRUE	0.977	14.000	0.286	NA		NA
3741775	3741776	CLC_0334	CLC_0335		alr-1	FALSE	0.040	240.000	0.000	NA		NA
3741776	3741777	CLC_0335	CLC_0336	alr-1		FALSE	0.006	520.000	0.000	1.000	N	NA
3741777	3741778	CLC_0336	CLC_0337		glvA-2	FALSE	0.125	316.000	0.000	1.000	Y	NA
3741778	3741779	CLC_0337	CLC_0338	glvA-2		FALSE	0.128	314.000	0.000	1.000	Y	NA
3741779	3741780	CLC_0338	CLC_0339			FALSE	0.058	283.000	0.000	1.000	N	NA
3741782	3741783	CLC_0341	CLC_0342			FALSE	0.009	343.000	0.000	NA		NA
3741783	3741784	CLC_0342	CLC_0343			FALSE	0.004	435.000	0.000	NA		NA
3741784	3741785	CLC_0343	CLC_0344			TRUE	0.752	152.000	0.158	NA	N	NA
3741785	3741786	CLC_0344	CLC_0345			TRUE	0.936	27.000	0.035	1.000		NA
3741786	3741787	CLC_0345	CLC_0346			FALSE	0.005	438.000	0.000	1.000		NA
3741787	3741788	CLC_0346	CLC_0347			TRUE	0.873	119.000	0.385	1.000	N	NA
3741788	3741789	CLC_0347	CLC_0348		glvA-3	TRUE	0.700	262.000	0.385	1.000	Y	NA
3741789	3741790	CLC_0348	CLC_0349	glvA-3		TRUE	0.993	13.000	0.375	1.000	Y	NA
3741790	3741791	CLC_0349	CLC_0350		ilvD	TRUE	0.941	138.000	0.286	0.012	Y	NA
3741791	3741792	CLC_0350	CLC_0351	ilvD	eda	TRUE	0.961	52.000	0.091	0.065	Y	NA
3741792	3741793	CLC_0351	CLC_0352	eda		TRUE	0.991	2.000	0.091	1.000	Y	NA
3741793	3741794	CLC_0352	CLC_0353		ade	FALSE	0.170	206.000	0.000	1.000	N	NA
3741794	3741795	CLC_0353	CLC_0354	ade		FALSE	0.013	402.000	0.000	1.000	N	NA
3741795	3741796	CLC_0354	CLC_0355			TRUE	0.998	0.000	0.889	1.000	Y	NA
3741796	3741797	CLC_0355	CLC_0356			FALSE	0.011	397.000	0.000	NA	N	NA
3741797	3741798	CLC_0356	CLC_0357			TRUE	0.842	-16.000	0.000	NA		NA
3741798	3741799	CLC_0357	CLC_0358			TRUE	0.904	119.000	0.750	1.000		NA
3741799	3741800	CLC_0358	CLC_0359			FALSE	0.014	341.000	0.000	1.000		NA
3741800	3741801	CLC_0359	CLC_0360			FALSE	0.077	264.000	0.000	1.000	N	NA
3741801	3741802	CLC_0360	CLC_0361			TRUE	0.993	3.000	0.167	1.000	Y	NA
3741802	3741803	CLC_0361	CLC_0362			TRUE	0.997	2.000	0.750	1.000	Y	NA
3741803	3741804	CLC_0362	CLC_0363			TRUE	0.713	35.000	0.000	1.000	N	NA
3741806	3741807	CLC_0365	CLC_0366			FALSE	0.273	61.000	0.000	NA		NA
3741809	3741810	CLC_0368	CLC_0369			TRUE	0.942	27.000	0.000	1.000	Y	NA
3741810	3741811	CLC_0369	CLC_0370			TRUE	0.983	-3.000	0.000	0.038	Y	NA
3741811	3741812	CLC_0370	CLC_0371			TRUE	0.961	11.000	0.000	1.000	Y	NA
3741812	3741813	CLC_0371	CLC_0372			TRUE	0.915	-3.000	0.000	1.000	N	NA
3741815	3741816	CLC_0374	CLC_0375		xpt-1	TRUE	0.981	23.000	0.032	1.000	Y	NA
3741816	3741817	CLC_0375	CLC_0376	xpt-1		FALSE	0.009	451.000	0.000	1.000	N	NA
3741817	3741818	CLC_0376	CLC_0377			TRUE	0.997	13.000	1.000	1.000	Y	NA
3741818	3741819	CLC_0377	CLC_0378			TRUE	0.739	176.000	0.222	1.000	N	NA
3741819	3741820	CLC_0378	CLC_0379			TRUE	0.993	15.000	0.333	1.000	Y	NA
3741820	3741821	CLC_0379	CLC_0380			TRUE	0.993	0.000	0.750	NA		NA
3741821	3741822	CLC_0380	CLC_0381			TRUE	0.985	24.000	0.667	NA		NA
3741822	3741823	CLC_0381	CLC_0382			FALSE	0.014	314.000	0.000	NA		NA
3741823	3741824	CLC_0382	CLC_0383			TRUE	0.993	3.000	0.869	NA		NA
3741824	3741825	CLC_0383	CLC_0384			FALSE	0.018	296.000	0.000	NA		NA
3741825	3741826	CLC_0384	CLC_0385			FALSE	0.006	384.000	0.000	NA		NA
3741826	3741827	CLC_0385	CLC_0386			FALSE	0.516	135.000	0.006	NA		NA
3741827	3741828	CLC_0386	CLC_0387			FALSE	0.012	324.000	0.000	NA		NA
3741828	3741829	CLC_0387	CLC_0388			TRUE	0.855	179.000	1.000	NA		NA
3741829	3741830	CLC_0388	CLC_0389			TRUE	0.993	-7.000	0.556	NA		NA
3741830	3741831	CLC_0389	CLC_0390			TRUE	0.994	-16.000	0.556	NA		NA
3741831	3741832	CLC_0390	CLC_0391			TRUE	0.824	72.000	0.179	NA		NA
3741832	3741833	CLC_0391	CLC_0392			FALSE	0.116	231.000	0.000	1.000	N	NA
3741833	3741834	CLC_0392	CLC_0393			FALSE	0.005	397.000	0.000	NA		NA
3741834	3741835	CLC_0393	CLC_0394			TRUE	0.983	27.000	0.667	NA		NA
3741835	3741836	CLC_0394	CLC_0395			FALSE	0.032	259.000	0.000	NA		NA
3741836	3741837	CLC_0395	CLC_0396			TRUE	0.996	-13.000	1.000	NA		NA
3741837	3741838	CLC_0396	CLC_0397			TRUE	0.917	95.000	1.000	NA		NA
3741838	3741839	CLC_0397	CLC_0398			TRUE	0.930	81.000	1.000	NA		NA
3741839	3741840	CLC_0398	CLC_0399			FALSE	0.090	233.000	0.000	NA	N	NA
3741842	3741843	CLC_0401	CLC_0402			TRUE	0.957	119.000	0.667	1.000	Y	NA
3741843	3741844	CLC_0402	CLC_0403		adhE	FALSE	0.010	428.000	0.000	1.000	N	NA
3741844	3741845	CLC_0403	CLC_0404	adhE		FALSE	0.013	319.000	0.000	NA		NA
3741845	3741846	CLC_0404	CLC_0405			TRUE	0.710	63.000	0.019	NA		NA
3741847	3741848	CLC_0406	CLC_0407			FALSE	0.009	343.000	0.000	NA		NA
3741849	3741850	CLC_0408	CLC_0409			FALSE	0.007	411.000	0.000	1.000		NA
3741850	3741851	CLC_0409	CLC_0410			TRUE	0.725	108.000	0.038	1.000	N	NA
3741851	3741852	CLC_0410	CLC_0411			TRUE	0.986	10.000	0.038	1.000	Y	NA
3741852	3741853	CLC_0411	CLC_0412			TRUE	0.800	63.000	0.091	NA		NA
3741853	3741854	CLC_0412	CLC_0413			TRUE	0.873	44.000	0.087	NA		NA
3741854	3741855	CLC_0413	CLC_0414			TRUE	0.947	26.000	0.087	NA		NA
3741856	3741857	CLC_0415	CLC_0416			FALSE	0.077	200.000	0.000	NA		NA
3741858	3741859	CLC_0417	CLC_0418			FALSE	0.124	192.000	0.000	1.000		NA
3741859	3741860	CLC_0418	CLC_0419			FALSE	0.021	312.000	0.000	1.000		NA
3741862	3741863	CLC_0421	CLC_0422			FALSE	0.550	131.000	0.013	NA		NA
3741863	3741864	CLC_0422	CLC_0423			TRUE	0.988	-54.000	0.105	1.000		NA
3741864	3741865	CLC_0423	CLC_0424			TRUE	0.997	-10.000	0.429	1.000	Y	NA
3741865	3741866	CLC_0424	CLC_0425			FALSE	0.365	108.000	0.000	1.000	N	NA
3741866	3741867	CLC_0425	CLC_0426			FALSE	0.003	1230.000	0.000	1.000	N	NA
3741867	3741868	CLC_0426	CLC_0427			TRUE	0.994	23.000	0.431	0.057	Y	NA
3741868	3741869	CLC_0427	CLC_0428			TRUE	0.998	0.000	0.678	0.057	Y	NA
3741869	3741870	CLC_0428	CLC_0429			TRUE	0.991	11.000	0.091	0.057	Y	NA
3741870	3741871	CLC_0429	CLC_0430			TRUE	0.974	51.000	0.237	0.057	Y	NA
3741871	3741872	CLC_0430	CLC_0431			TRUE	0.993	14.000	0.221	0.057	Y	NA
3741872	3741873	CLC_0431	CLC_0432			FALSE	0.006	380.000	0.000	NA		NA
3741874	3741875	CLC_0433	CLC_0434			TRUE	0.947	18.000	0.059	NA		NA
3741875	3741876	CLC_0434	CLC_0435			TRUE	0.793	115.000	0.231	NA		NA
3741876	3741877	CLC_0435	CLC_0436			FALSE	0.004	848.000	0.000	1.000	N	NA
3741877	3741878	CLC_0436	CLC_0437			FALSE	0.004	677.000	0.000	1.000	N	NA
3741879	3741880	CLC_0438	CLC_0439		rnhA	TRUE	0.967	-25.000	0.003	NA		NA
3741880	3741881	CLC_0439	CLC_0440	rnhA		TRUE	0.643	63.000	0.003	NA		NA
3741881	3741882	CLC_0440	CLC_0441			FALSE	0.098	181.000	0.000	NA		NA
3741882	3741883	CLC_0441	CLC_0442			TRUE	0.977	32.000	0.429	0.030		NA
3741883	3741884	CLC_0442	CLC_0443			FALSE	0.014	314.000	0.000	NA		NA
3741884	3741885	CLC_0443	CLC_0444			FALSE	0.551	30.000	0.000	NA		NA
3741885	3741886	CLC_0444	CLC_0445			FALSE	0.130	160.000	0.000	NA		NA
3741886	3741887	CLC_0445	CLC_0446			FALSE	0.534	31.000	0.000	NA		NA
3741889	3741890	CLC_0448	CLC_0449		clpB	FALSE	0.007	364.000	0.000	NA		NA
3741892	3741893	CLC_0451	CLC_0452			FALSE	0.002	624.000	0.000	NA		NA
3741893	3741894	CLC_0452	CLC_0453			FALSE	0.053	438.000	0.000	0.005	Y	NA
3741894	3741895	CLC_0453	CLC_0454			FALSE	0.012	352.000	0.000	1.000		NA
3741895	3741896	CLC_0454	CLC_0455			TRUE	0.800	45.000	0.008	1.000		NA
3741897	3741898	CLC_0456	CLC_0457			FALSE	0.175	294.000	0.000	1.000	Y	NA
3741898	3741899	CLC_0457	CLC_0458			TRUE	0.998	0.000	0.455	0.001	Y	NA
3741900	3741901	CLC_0459	CLC_0460			FALSE	0.003	447.000	0.000	NA		NA
3741903	3741904	CLC_0462	CLC_0463			TRUE	0.994	3.000	0.313	NA	Y	NA
3741904	3741905	CLC_0463	CLC_0464			FALSE	0.007	363.000	0.000	NA		NA
3741905	3741906	CLC_0464	CLC_0465		pepP	FALSE	0.055	220.000	0.000	NA		NA
3741907	3741908	CLC_0466	CLC_0467			TRUE	0.951	58.000	0.796	1.000		NA
3741909	3741910	CLC_0468	CLC_0469	manA		FALSE	0.009	349.000	0.000	NA		NA
3741910	3741911	CLC_0469	CLC_0470			TRUE	0.864	108.000	0.500	NA		NA
3741911	3741912	CLC_0470	CLC_0471		rrsG	FALSE	0.004	410.000	0.000	NA		NA
3741912	3741913	CLC_0471	CLC_0472	rrsG		FALSE	0.155	144.000	0.000	NA		NA
3741913	3741914	CLC_0472	CLC_0474			TRUE	0.719	6.000	0.000	NA		NA
3741914	3741915	CLC_0474	CLC_0477		rrlG	FALSE	0.226	74.000	0.000	NA		NA
3741915	3741916	CLC_0477	CLC_0478	rrlG	rrfG	FALSE	0.162	133.000	0.000	NA		NA
3741916	3741917	CLC_0478	CLC_0479	rrfG		TRUE	0.705	9.000	0.000	NA		NA
3741919	3741920	CLC_0482	CLC_0483			FALSE	0.004	745.000	0.000	1.000	N	NA
3741920	3741921	CLC_0483	CLC_0484			TRUE	0.733	144.000	0.027	0.064	N	NA
3741921	3741922	CLC_0484	CLC_0485			TRUE	0.973	36.000	0.054	0.064	Y	NA
3741922	3741923	CLC_0485	CLC_0486			FALSE	0.276	252.000	0.000	1.000	Y	NA
3741923	3741924	CLC_0486	CLC_0487			FALSE	0.006	519.000	0.000	1.000	N	NA
3741925	3741926	CLC_0488	CLC_0489		panD	FALSE	0.544	88.000	0.004	NA		NA
3741926	3741927	CLC_0489	CLC_0490	panD	panC	TRUE	0.922	149.000	0.342	1.000	Y	NA
3741927	3741928	CLC_0490	CLC_0491	panC	panB	TRUE	0.980	55.000	0.395	0.001	Y	NA
3741930	3741931	CLC_0493	CLC_0494			TRUE	0.830	-10.000	0.000	NA		NA
3741931	3741932	CLC_0494	CLC_0495			FALSE	0.503	33.000	0.000	NA		NA
3741932	3741933	CLC_0495	CLC_0496			TRUE	0.982	8.000	0.333	NA		NA
3741934	3741935	CLC_0497	CLC_0498			TRUE	0.687	12.000	0.000	NA		NA
3741935	3741936	CLC_0498	CLC_0499			FALSE	0.165	126.000	0.000	NA		NA
3741936	3741937	CLC_0499	CLC_0500			FALSE	0.180	92.000	0.000	NA		NA
3741937	3741938	CLC_0500	CLC_0501			FALSE	0.062	213.000	0.000	NA		NA
3741940	3741941	CLC_0503	CLC_0504			TRUE	0.991	3.000	0.667	NA		NA
3741943	3741944	CLC_0506	CLC_0507	hypB		FALSE	0.436	236.000	0.115	1.000	N	NA
3741944	3741945	CLC_0507	CLC_0508		hypA	TRUE	0.917	56.000	0.333	1.000		NA
3741945	3741946	CLC_0508	CLC_0509	hypA		TRUE	0.925	39.000	0.214	NA		NA
3741948	3741949	CLC_0511	CLC_0512	addA		TRUE	0.633	140.000	0.010	1.000	N	NA
3741949	3741950	CLC_0512	CLC_0513		pepT	TRUE	0.793	77.000	0.056	1.000	N	NA
3741952	3741953	CLC_0515	CLC_0516			FALSE	0.069	206.000	0.000	NA		NA
3741953	3741954	CLC_0516	CLC_0517			TRUE	0.994	-40.000	0.400	NA		NA
3741954	3741955	CLC_0517	CLC_0518			FALSE	0.016	304.000	0.000	NA		NA
3741956	3741957	CLC_0519	CLC_0520			TRUE	0.995	13.000	0.461	0.049	Y	NA
3741959	3741960	CLC_0522	CLC_0523		thiE	FALSE	0.058	266.000	0.000	NA	N	NA
3741960	3741961	CLC_0523	CLC_0524	thiE	thiM-1	TRUE	0.997	-9.000	0.190	0.006	Y	NA
3741961	3741962	CLC_0524	CLC_0525	thiM-1	thiD-1	TRUE	0.669	232.000	0.039	0.006	Y	NA
3741963	3741964	CLC_0526	CLC_0527	ddlB		FALSE	0.560	156.000	0.004	1.000	N	NA
3741964	3741965	CLC_0527	CLC_0528			TRUE	0.993	4.000	0.182	1.000	Y	NA
3741965	3741966	CLC_0528	CLC_0529			TRUE	0.996	1.000	0.241	0.037	Y	NA
3741966	3741967	CLC_0529	CLC_0530			TRUE	0.991	12.000	0.167	1.000	Y	NA
3741967	3741968	CLC_0530	CLC_0531			TRUE	0.992	2.000	0.048	0.037	Y	NA
3741968	3741969	CLC_0531	CLC_0532			TRUE	0.958	29.000	0.222	NA		NA
3741969	3741970	CLC_0532	CLC_0533			FALSE	0.005	402.000	0.000	NA		NA
3741970	3741971	CLC_0533	CLC_0534			TRUE	0.796	-3.000	0.000	NA		NA
3741971	3741972	CLC_0534	CLC_0535			FALSE	0.157	142.000	0.000	NA		NA
3741972	3741973	CLC_0535	CLC_0536			TRUE	0.677	61.000	0.007	NA		NA
3741973	3741974	CLC_0536	CLC_0537			TRUE	0.700	10.000	0.000	NA		NA
3741974	3741975	CLC_0537	CLC_0538			FALSE	0.002	519.000	0.000	NA		NA
3741975	3741976	CLC_0538	CLC_0539			FALSE	0.134	274.000	0.010	NA		NA
3741976	3741977	CLC_0539	CLC_0540			FALSE	0.534	134.000	0.010	NA		NA
3741977	3741978	CLC_0540	CLC_0541			FALSE	0.524	176.000	0.050	NA		NA
3741978	3741979	CLC_0541	CLC_0542			TRUE	0.958	2.000	0.025	NA		NA
3741980	3741981	CLC_0543	CLC_0544			TRUE	0.637	21.000	0.000	NA		NA
3741982	3741983	CLC_0545	CLC_0546			FALSE	0.006	377.000	0.000	NA		NA
3741983	3741984	CLC_0546	CLC_0547		sbcC	TRUE	0.998	-25.000	0.669	0.004	N	NA
3741984	3741985	CLC_0547	CLC_0548	sbcC		TRUE	0.898	28.000	0.005	1.000		NA
3741985	3741986	CLC_0548	CLC_0549			FALSE	0.001	811.000	0.000	NA		NA
3741986	3741987	CLC_0549	CLC_0550			FALSE	0.002	641.000	0.000	NA		NA
3741987	3741988	CLC_0550	CLC_0551		cadA	TRUE	0.750	76.000	0.053	1.000		NA
3741988	3741989	CLC_0551	CLC_0552	cadA		FALSE	0.004	420.000	0.000	NA		NA
3741989	3741990	CLC_0552	CLC_0553			FALSE	0.139	154.000	0.000	NA		NA
3741990	3741991	CLC_0553	CLC_0554			FALSE	0.001	881.000	0.000	NA		NA
3741993	3741994	CLC_0556	CLC_0557			FALSE	0.001	957.000	0.000	NA		NA
3741994	3741995	CLC_0557	CLC_0558			FALSE	0.057	268.000	0.000	NA	N	NA
3741995	3741996	CLC_0558	CLC_0559			TRUE	0.989	10.000	0.667	NA		NA
3741996	3741997	CLC_0559	CLC_0560			FALSE	0.012	320.000	0.000	NA		NA
3741997	3741998	CLC_0560	CLC_0561		sagB	TRUE	0.707	165.000	0.222	NA		NA
3741998	3741999	CLC_0561	CLC_0562	sagB	sagC	TRUE	0.979	4.000	0.222	NA		NA
3741999	3742000	CLC_0562	CLC_0563	sagC	sagD	TRUE	0.977	16.000	0.318	NA		NA
3742000	3742001	CLC_0563	CLC_0564	sagD		TRUE	0.985	-25.000	0.091	NA		NA
3742001	3742002	CLC_0564	CLC_0565			TRUE	0.992	8.000	1.000	NA		NA
3742002	3742003	CLC_0565	CLC_0566		sagG	FALSE	0.014	309.000	0.000	NA		NA
3742003	3742004	CLC_0566	CLC_0567	sagG	sagH	TRUE	0.988	12.000	0.500	NA	N	NA
3742005	3742006	CLC_0568	CLC_0569	sagI		FALSE	0.227	128.000	0.000	1.000		NA
3742007	3742008	CLC_0570	CLC_0571			TRUE	0.848	118.000	0.409	NA		NA
3742008	3742009	CLC_0571	CLC_0572			TRUE	0.690	127.000	0.091	NA		NA
3742010	3742011	CLC_0573	CLC_0574	trmB		FALSE	0.062	213.000	0.000	NA		NA
3742013	3742014	CLC_0576	CLC_0577	fabG-1		TRUE	0.809	63.000	0.032	1.000	N	NA
3742016	3742017	CLC_0579	CLC_0580			FALSE	0.079	263.000	0.000	1.000	N	NA
3742017	3742018	CLC_0580	CLC_0581			FALSE	0.027	297.000	0.000	1.000		NA
3742018	3742019	CLC_0581	CLC_0582			TRUE	0.960	36.000	0.400	1.000		NA
3742019	3742020	CLC_0582	CLC_0583			FALSE	0.450	205.000	0.000	1.000	Y	NA
3742020	3742021	CLC_0583	CLC_0584		serS-2	FALSE	0.007	482.000	0.000	1.000	N	NA
3742021	3742022	CLC_0584	CLC_0585	serS-2		FALSE	0.005	578.000	0.000	1.000	N	NA
3742023	3742024	CLC_0586	CLC_0587			FALSE	0.016	330.000	0.000	1.000		NA
3742027	3742028	CLC_0590	CLC_0591			FALSE	0.108	175.000	0.000	NA		NA
3742033	3742034	CLC_0596	CLC_0597			FALSE	0.150	148.000	0.000	NA		NA
3742036	3742037	CLC_0599	CLC_0600			FALSE	0.004	418.000	0.000	NA		NA
3742037	3742038	CLC_0600	CLC_0601			TRUE	0.896	-22.000	0.000	1.000		NA
3742039	3742040	CLC_0602	CLC_0603			FALSE	0.003	472.000	0.000	NA		NA
3742040	3742041	CLC_0603	CLC_0604			FALSE	0.097	182.000	0.000	NA		NA
3742041	3742042	CLC_0604	CLC_0605			FALSE	0.251	66.000	0.000	NA		NA
3742042	3742043	CLC_0605	CLC_0606			FALSE	0.027	268.000	0.000	NA		NA
3742043	3742044	CLC_0606	CLC_0607			TRUE	0.974	10.000	0.184	NA		NA
3742044	3742045	CLC_0607	CLC_0608			FALSE	0.003	461.000	0.000	NA		NA
3742045	3742046	CLC_0608	CLC_0609			FALSE	0.001	920.000	0.000	NA		NA
3742048	3742049	CLC_0611	CLC_0612	mscL		FALSE	0.007	366.000	0.000	NA		NA
3742051	3742052	CLC_0614	CLC_0615			FALSE	0.003	488.000	0.000	NA		NA
3742052	3742053	CLC_0615	CLC_0616			TRUE	0.989	-7.000	0.165	1.000	N	NA
3742053	3742054	CLC_0616	CLC_0617			TRUE	0.968	0.000	0.035	NA		NA
3742054	3742055	CLC_0617	CLC_0618		potA	FALSE	0.001	817.000	0.000	NA		NA
3742055	3742056	CLC_0618	CLC_0619	potA	potB	TRUE	0.998	0.000	0.789	1.000	Y	NA
3742056	3742057	CLC_0619	CLC_0620	potB		TRUE	0.990	3.000	0.022	0.037	Y	NA
3742059	3742060	CLC_0622	CLC_0623			FALSE	0.002	602.000	0.000	NA		NA
3742060	3742061	CLC_0623	CLC_0624			FALSE	0.005	404.000	0.000	NA		NA
3742061	3742062	CLC_0624	CLC_0625			FALSE	0.027	268.000	0.000	NA		NA
3742062	3742063	CLC_0625	CLC_0626			FALSE	0.195	84.000	0.000	NA		NA
3742063	3742064	CLC_0626	CLC_0627			TRUE	0.732	4.000	0.000	NA		NA
3742066	3742067	CLC_0629	CLC_0630		lepB-1	FALSE	0.109	174.000	0.000	NA		NA
3742069	3742070	CLC_0632	CLC_0633			FALSE	0.002	614.000	0.000	NA		NA
3742070	3742071	CLC_0633	CLC_0634			TRUE	0.973	40.000	1.000	NA		NA
3742071	3742072	CLC_0634	CLC_0635			FALSE	0.001	694.000	0.000	NA		NA
3742072	3742073	CLC_0635	CLC_0636			FALSE	0.002	607.000	0.000	NA		NA
3742073	3742074	CLC_0636	CLC_0637			TRUE	0.981	-7.000	0.080	1.000		NA
3742074	3742075	CLC_0637	CLC_0638			TRUE	0.976	37.000	1.000	NA		NA
3742075	3742076	CLC_0638	CLC_0639			TRUE	0.941	35.000	0.222	NA		NA
3742076	3742077	CLC_0639	CLC_0640			TRUE	0.786	110.000	0.222	NA		NA
3742077	3742078	CLC_0640	CLC_0641			TRUE	0.978	23.000	0.400	NA		NA
3742078	3742079	CLC_0641	CLC_0642			TRUE	0.978	-3.000	0.095	NA		NA
3742079	3742080	CLC_0642	CLC_0643			TRUE	0.979	15.000	0.238	NA	N	NA
3742080	3742081	CLC_0643	CLC_0644			FALSE	0.002	569.000	0.000	NA		NA
3742081	3742082	CLC_0644	CLC_0645			FALSE	0.011	329.000	0.000	NA		NA
3742082	3742083	CLC_0645	CLC_0646			FALSE	0.005	397.000	0.000	NA		NA
3742086	3742087	CLC_0649	CLC_0650			FALSE	0.028	335.000	0.000	1.000	N	NA
3742088	3742089	CLC_0651	CLC_0652	asnS		FALSE	0.041	294.000	0.000	NA	N	NA
3742089	3742090	CLC_0652	CLC_0653			TRUE	0.985	16.000	0.571	NA		NA
3742090	3742091	CLC_0653	CLC_0654			FALSE	0.072	203.000	0.000	NA		NA
3742091	3742092	CLC_0654	CLC_0655			TRUE	0.992	2.000	0.714	NA		NA
3742092	3742093	CLC_0655	CLC_0656			FALSE	0.002	602.000	0.000	NA		NA
3742093	3742094	CLC_0656	CLC_0657			FALSE	0.004	429.000	0.000	NA		NA
3742094	3742095	CLC_0657	CLC_0658			TRUE	0.987	13.000	0.667	NA		NA
3742095	3742096	CLC_0658	CLC_0659			FALSE	0.004	463.000	0.000	1.000		NA
3742096	3742097	CLC_0659	CLC_0660			FALSE	0.235	197.000	0.000	0.011		NA
3742097	3742098	CLC_0660	CLC_0661			FALSE	0.153	175.000	0.000	1.000		NA
3742098	3742099	CLC_0661	CLC_0662			TRUE	0.725	5.000	0.000	NA		NA
3742099	3742100	CLC_0662	CLC_0663			TRUE	0.740	3.000	0.000	NA		NA
3742100	3742101	CLC_0663	CLC_0664			FALSE	0.170	206.000	0.000	1.000	N	NA
3742101	3742102	CLC_0664	CLC_0665			TRUE	0.965	21.000	0.085	1.000	N	NA
3742102	3742103	CLC_0665	CLC_0666			TRUE	0.999	-10.000	0.932	1.000	Y	NA
3742104	3742105	CLC_0667	CLC_0668			FALSE	0.156	143.000	0.000	NA		NA
3742105	3742106	CLC_0668	CLC_0669			TRUE	0.977	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
3742109	3742110	CLC_0672	CLC_0673			TRUE	0.787	170.000	0.286	1.000	N	NA
3742112	3742113	CLC_0675	CLC_0676			TRUE	0.720	103.000	0.083	1.000		NA
3742114	3742115	CLC_0677	CLC_0678	csaA		FALSE	0.368	208.000	0.023	1.000		NA
3742115	3742116	CLC_0678	CLC_0679			FALSE	0.056	297.000	0.000	0.029		NA
3742117	3742118	CLC_0680	CLC_0681			FALSE	0.164	128.000	0.000	NA		NA
3742118	3742119	CLC_0681	CLC_0682			FALSE	0.272	383.000	0.667	0.036	N	NA
3742119	3742120	CLC_0682	CLC_0683			TRUE	0.719	6.000	0.000	NA		NA
3742122	3742123	CLC_0685	CLC_0686			FALSE	0.239	108.000	0.000	1.000		NA
3742123	3742124	CLC_0686	CLC_0687			FALSE	0.292	58.000	0.000	NA		NA
3742125	3742126	CLC_0688	CLC_0689			TRUE	0.919	23.000	0.015	NA		NA
3742128	3742129	CLC_0691	CLC_0692			FALSE	0.548	139.000	0.006	1.000		NA
3742130	3742131	CLC_0693	CLC_0694			FALSE	0.239	118.000	0.000	1.000		NA
3742131	3742132	CLC_0694	CLC_0695		rhlE	FALSE	0.047	259.000	0.000	1.000		NA
3742132	3742133	CLC_0695	CLC_0696	rhlE		FALSE	0.003	576.000	0.000	1.000		NA
3742133	3742134	CLC_0696	CLC_0697			TRUE	0.745	172.000	0.286	1.000		NA
3742134	3742135	CLC_0697	CLC_0698			TRUE	0.974	28.000	0.250	1.000	N	NA
3742137	3742138	CLC_0700	CLC_0701			FALSE	0.228	127.000	0.000	1.000		NA
3742138	3742139	CLC_0701	CLC_0702			FALSE	0.095	184.000	0.000	NA		NA
3742139	3742140	CLC_0702	CLC_0703			TRUE	0.986	-10.000	0.154	NA		NA
3742140	3742141	CLC_0703	CLC_0704			FALSE	0.247	67.000	0.000	NA		NA
3742141	3742142	CLC_0704	CLC_0705			FALSE	0.163	131.000	0.000	NA		NA
3742144	3742145	CLC_0707	CLC_0708			TRUE	0.691	205.000	0.409	1.000		NA
3742145	3742146	CLC_0708	CLC_0709			TRUE	0.963	12.000	0.074	1.000		NA
3742146	3742147	CLC_0709	CLC_0710			FALSE	0.002	627.000	0.000	1.000		NA
3742147	3742148	CLC_0710	CLC_0711			TRUE	0.771	159.000	0.190	1.000	N	NA
3742148	3742149	CLC_0711	CLC_0712			TRUE	0.853	60.000	0.071	1.000	N	NA
3742149	3742150	CLC_0712	CLC_0713			TRUE	0.947	26.000	0.089	NA		NA
3742154	3742155	CLC_0717	CLC_0718			TRUE	0.967	7.000	0.100	NA		NA
3742156	3742157	CLC_0719	CLC_0720			TRUE	0.860	-49.000	0.000	NA		NA
3742158	3742159	CLC_0721	CLC_0722			FALSE	0.014	342.000	0.000	1.000		NA
3742159	3742160	CLC_0722	CLC_0723			TRUE	0.989	-37.000	0.118	1.000		NA
3742160	3742161	CLC_0723	CLC_0724			TRUE	0.983	31.000	1.000	NA		NA
3742161	3742162	CLC_0724	CLC_0725			TRUE	0.670	14.000	0.000	NA		NA
3742162	3742163	CLC_0725	CLC_0726			FALSE	0.001	720.000	0.000	NA		NA
3742164	3742165	CLC_0727	CLC_0728			TRUE	0.992	-3.000	0.571	NA		NA
3742166	3742167	CLC_0729	CLC_0730		greA-1	TRUE	0.632	136.000	0.008	1.000	N	NA
3742167	3742168	CLC_0730	CLC_0731	greA-1		FALSE	0.538	161.000	0.031	NA		NA
3742168	3742169	CLC_0731	CLC_0732			FALSE	0.025	275.000	0.000	NA		NA
3742169	3742170	CLC_0732	CLC_0733			TRUE	0.894	95.000	0.041	0.060	Y	NA
3742170	3742171	CLC_0733	CLC_0734			FALSE	0.188	88.000	0.000	NA		NA
3742171	3742172	CLC_0734	CLC_0735			FALSE	0.056	219.000	0.000	NA		NA
3742172	3742173	CLC_0735	CLC_0736			FALSE	0.155	144.000	0.000	NA		NA
3742173	3742174	CLC_0736	CLC_0737			TRUE	0.648	58.000	0.000	0.060	N	NA
3742176	3742177	CLC_0739	CLC_0740			FALSE	0.008	470.000	0.000	1.000	N	NA
3742177	3742178	CLC_0740	CLC_0741		fhuB	TRUE	0.949	96.000	0.500	1.000	Y	NA
3742178	3742179	CLC_0741	CLC_0742	fhuB	fhuG	TRUE	0.998	0.000	0.750	0.036	Y	NA
3742179	3742180	CLC_0742	CLC_0743	fhuG	fhuC	TRUE	0.666	228.000	0.100	1.000	Y	NA
3742180	3742181	CLC_0743	CLC_0744	fhuC	nifH	TRUE	0.983	30.000	0.150	1.000	Y	NA
3742181	3742182	CLC_0744	CLC_0745	nifH		TRUE	0.994	3.000	0.571	0.055	N	NA
3742182	3742183	CLC_0745	CLC_0746			TRUE	0.992	40.000	1.000	0.039	Y	NA
3742183	3742184	CLC_0746	CLC_0747			FALSE	0.032	323.000	0.000	1.000	N	NA
3742184	3742185	CLC_0747	CLC_0748			FALSE	0.174	97.000	0.000	NA		NA
3742187	3742188	CLC_0750	CLC_0751	gcvT	gcvH	TRUE	0.774	125.000	0.000	0.001	Y	NA
3742188	3742189	CLC_0751	CLC_0752	gcvH	gcvPA	TRUE	0.984	3.000	0.005	1.000	Y	NA
3742189	3742190	CLC_0752	CLC_0753	gcvPA	gcvPB	TRUE	0.997	0.000	0.316	0.001	Y	NA
3742190	3742191	CLC_0753	CLC_0754	gcvPB		FALSE	0.457	194.000	0.010	1.000	N	NA
3742191	3742192	CLC_0754	CLC_0755			TRUE	0.971	18.000	0.118	1.000	N	NA
3742192	3742193	CLC_0755	CLC_0756			FALSE	0.004	410.000	0.000	NA		NA
3742193	3742194	CLC_0756	CLC_0757			FALSE	0.007	362.000	0.000	NA		NA
3742194	3742195	CLC_0757	CLC_0758			TRUE	0.837	94.000	0.375	NA		NA
3742195	3742196	CLC_0758	CLC_0759			FALSE	0.074	202.000	0.000	NA		NA
3742196	3742197	CLC_0759	CLC_0760			FALSE	0.001	710.000	0.000	NA		NA
3742197	3742198	CLC_0760	CLC_0761			FALSE	0.330	54.000	0.000	NA		NA
3742198	3742199	CLC_0761	CLC_0762			FALSE	0.012	326.000	0.000	NA		NA
3742199	3742200	CLC_0762	CLC_0763			TRUE	0.935	52.000	0.273	1.000	N	NA
3742200	3742201	CLC_0763	CLC_0764			TRUE	0.985	-13.000	0.094	1.000		NA
3742201	3742202	CLC_0764	CLC_0765			FALSE	0.096	208.000	0.000	1.000		NA
3742202	3742203	CLC_0765	CLC_0766			FALSE	0.121	194.000	0.000	1.000		NA
3742204	3742205	CLC_0767	CLC_0768			TRUE	0.825	83.000	0.250	NA		NA
3742205	3742206	CLC_0768	CLC_0769			FALSE	0.003	492.000	0.000	NA		NA
3742207	3742208	CLC_0770	CLC_0771			FALSE	0.002	590.000	0.000	NA		NA
3742208	3742209	CLC_0771	CLC_0772			TRUE	0.618	26.000	0.000	NA		NA
3742211	3742212	CLC_0774	CLC_0775			FALSE	0.002	493.000	0.000	NA		NA
3742214	3742215	CLC_0777	CLC_0778			FALSE	0.174	114.000	0.000	NA		NA
3742215	3742216	CLC_0778	CLC_0779			FALSE	0.330	54.000	0.000	NA		NA
3742217	3742218	CLC_0780	CLC_0781		luxS	TRUE	0.980	-16.000	0.010	1.000	N	NA
3742218	3742219	CLC_0781	CLC_0782	luxS	metC	TRUE	0.982	2.000	0.048	0.044	N	NA
3742219	3742220	CLC_0782	CLC_0783	metC		TRUE	0.688	101.000	0.021	1.000	N	NA
3742220	3742221	CLC_0783	CLC_0784			FALSE	0.002	559.000	0.000	NA		NA
3742222	3742223	CLC_0785	CLC_0786			FALSE	0.019	366.000	0.000	1.000	N	NA
3742224	3742225	CLC_0787	CLC_0788			TRUE	0.697	88.000	0.061	NA		NA
3742225	3742226	CLC_0788	CLC_0789			FALSE	0.002	534.000	0.000	NA		NA
3742226	3742227	CLC_0789	CLC_0790			FALSE	0.245	93.000	0.000	1.000		NA
3742228	3742229	CLC_0791	CLC_0792			FALSE	0.173	102.000	0.000	NA		NA
3742229	3742230	CLC_0792	CLC_0793			TRUE	0.639	19.000	0.000	NA		NA
3742230	3742231	CLC_0793	CLC_0794			FALSE	0.191	86.000	0.000	NA		NA
3742231	3742232	CLC_0794	CLC_0795			FALSE	0.158	141.000	0.000	NA		NA
3742232	3742233	CLC_0795	CLC_0796			FALSE	0.038	244.000	0.000	NA		NA
3742233	3742234	CLC_0796	CLC_0797			FALSE	0.041	238.000	0.000	NA		NA
3742234	3742235	CLC_0797	CLC_0798			TRUE	0.637	20.000	0.000	NA		NA
3742235	3742236	CLC_0798	CLC_0799			FALSE	0.148	149.000	0.000	NA		NA
3742238	3742239	CLC_0801	CLC_0802			FALSE	0.534	31.000	0.000	NA		NA
3742239	3742240	CLC_0802	CLC_0803			FALSE	0.182	91.000	0.000	NA		NA
3742246	3742247	CLC_0810	CLC_0811	arsR	arsD	TRUE	0.724	22.000	0.000	1.000		NA
3742247	3742248	CLC_0811	CLC_0812	arsD	arsA	TRUE	0.962	19.000	0.116	1.000		NA
3742248	3742249	CLC_0812	CLC_0813	arsA	arsB	TRUE	0.889	99.000	0.093	1.000	Y	NA
3742249	3742250	CLC_0813	CLC_0814	arsB		FALSE	0.062	277.000	0.000	1.000	N	NA
3742250	3742251	CLC_0814	CLC_0815			FALSE	0.014	311.000	0.000	NA		NA
3742251	3742252	CLC_0815	CLC_0816			FALSE	0.002	508.000	0.000	NA		NA
3742252	3742253	CLC_0816	CLC_0817			TRUE	0.992	10.000	1.000	NA		NA
3742253	3742254	CLC_0817	CLC_0818			FALSE	0.568	29.000	0.000	NA		NA
3742254	3742255	CLC_0818	CLC_0819			FALSE	0.034	255.000	0.000	NA		NA
3742255	3742256	CLC_0819	CLC_0820			TRUE	0.732	4.000	0.000	NA		NA
3742256	3742257	CLC_0820	CLC_0821			FALSE	0.007	374.000	0.000	NA		NA
3742257	3742258	CLC_0821	CLC_0822			TRUE	0.991	-7.000	0.400	NA		NA
3742258	3742259	CLC_0822	CLC_0823			FALSE	0.001	691.000	0.000	NA		NA
3742259	3742260	CLC_0823	CLC_0824		thyA	TRUE	0.970	-10.000	0.017	NA		NA
3742260	3742261	CLC_0824	CLC_0825	thyA		TRUE	0.957	12.000	0.017	1.000	N	NA
3742261	3742262	CLC_0825	CLC_0826			TRUE	0.887	46.000	0.047	1.000	N	NA
3742262	3742263	CLC_0826	CLC_0827		thiD-2	TRUE	0.777	78.000	0.043	1.000	N	NA
3742263	3742264	CLC_0827	CLC_0828	thiD-2		FALSE	0.534	172.000	0.043	NA		NA
3742266	3742267	CLC_0830	CLC_0831			TRUE	0.992	3.000	0.833	NA		NA
3742267	3742268	CLC_0831	CLC_0832			FALSE	0.024	276.000	0.000	NA		NA
3742268	3742269	CLC_0832	CLC_0833			FALSE	0.078	421.000	0.167	1.000	N	NA
3742269	3742270	CLC_0833	CLC_0834			TRUE	0.992	0.000	0.667	NA		NA
3742270	3742271	CLC_0834	CLC_0835			FALSE	0.352	251.000	0.167	NA		NA
3742271	3742272	CLC_0835	CLC_0836			TRUE	0.910	45.000	0.167	1.000		NA
3742272	3742273	CLC_0836	CLC_0837			FALSE	0.001	955.000	0.000	NA		NA
3742273	3742274	CLC_0837	CLC_0838			FALSE	0.023	280.000	0.000	NA		NA
3742274	3742275	CLC_0838	CLC_0839			FALSE	0.554	184.000	0.100	NA		NA
3742275	3742276	CLC_0839	CLC_0840			TRUE	0.998	-13.000	0.750	NA	Y	NA
3742276	3742277	CLC_0840	CLC_0841			FALSE	0.063	211.000	0.000	NA		NA
3742277	3742278	CLC_0841	CLC_0842			FALSE	0.048	228.000	0.000	NA		NA
3742278	3742279	CLC_0842	CLC_0843			TRUE	0.943	154.000	0.636	1.000	Y	NA
3742279	3742280	CLC_0843	CLC_0844			FALSE	0.126	190.000	0.000	1.000		NA
3742282	3742283	CLC_0846	CLC_0847		dapB-1	FALSE	0.002	666.000	0.000	NA		NA
3742283	3742284	CLC_0847	CLC_0848	dapB-1		TRUE	0.790	22.000	0.000	NA	N	NA
3742285	3742286	CLC_0849	CLC_0850			FALSE	0.002	498.000	0.000	NA		NA
3742286	3742287	CLC_0850	CLC_0851			FALSE	0.371	46.000	0.000	NA		NA
3742288	3742289	CLC_0852	CLC_0853			TRUE	0.639	19.000	0.000	NA		NA
3742289	3742290	CLC_0853	CLC_0854			FALSE	0.019	294.000	0.000	NA		NA
3742290	3742291	CLC_0854	CLC_0855			FALSE	0.214	77.000	0.000	NA		NA
3742292	3742293	CLC_0856	CLC_0857		ha70	FALSE	0.242	95.000	0.000	1.000		NA
3742293	3742294	CLC_0857	CLC_0858	ha70	ha17	TRUE	0.982	14.000	0.429	NA		NA
3742294	3742295	CLC_0858	CLC_0859	ha17	ha33	TRUE	0.880	63.000	0.286	NA		NA
3742296	3742297	CLC_0860	CLC_0861	botR	ntnH	TRUE	0.856	162.000	0.667	1.000		NA
3742297	3742298	CLC_0861	CLC_0862	ntnH	boNT/A1	TRUE	0.721	44.000	0.000	0.001		NA
3742300	3742301	CLC_0864	CLC_0865			FALSE	0.163	132.000	0.000	NA		NA
3742301	3742302	CLC_0865	CLC_0866			FALSE	0.093	185.000	0.000	NA		NA
3742302	3742303	CLC_0866	CLC_0867			FALSE	0.010	336.000	0.000	NA		NA
3742303	3742304	CLC_0867	CLC_0868		brnQ-1	FALSE	0.005	566.000	0.000	1.000	N	NA
3742304	3742305	CLC_0868	CLC_0869	brnQ-1	brnQ-2	TRUE	0.972	151.000	1.000	0.001	Y	NA
3742307	3742308	CLC_0871	CLC_0873	feoA-1	feoB-1	FALSE	0.154	145.000	0.000	NA		NA
3742308	3742309	CLC_0873	CLC_0874	feoB-1	cobC	FALSE	0.001	715.000	0.000	NA		NA
3742309	3742310	CLC_0874	CLC_0875	cobC		FALSE	0.332	145.000	0.000	1.000	N	NA
3742310	3742311	CLC_0875	CLC_0876		cobS	FALSE	0.069	271.000	0.000	1.000	N	NA
3742311	3742312	CLC_0876	CLC_0877	cobS		FALSE	0.003	458.000	0.000	NA		NA
3742312	3742313	CLC_0877	CLC_0878			FALSE	0.014	309.000	0.000	NA		NA
3742313	3742314	CLC_0878	CLC_0879			TRUE	0.649	131.000	0.053	NA		NA
3742314	3742315	CLC_0879	CLC_0880			TRUE	0.988	18.000	0.828	NA		NA
3742315	3742316	CLC_0880	CLC_0881			FALSE	0.002	569.000	0.000	NA		NA
3742316	3742317	CLC_0881	CLC_0882			FALSE	0.026	271.000	0.000	NA		NA
3742317	3742318	CLC_0882	CLC_0883		folP	TRUE	0.821	95.000	0.003	1.000	Y	NA
3742318	3742319	CLC_0883	CLC_0884	folP		FALSE	0.497	132.000	0.003	NA		NA
3742319	3742320	CLC_0884	CLC_0885		folK	FALSE	0.511	100.000	0.003	NA		NA
3742320	3742321	CLC_0885	CLC_0886	folK		FALSE	0.309	119.000	0.000	NA	N	NA
3742321	3742322	CLC_0886	CLC_0887			FALSE	0.026	320.000	0.000	NA	N	NA
3742322	3742323	CLC_0887	CLC_0888			TRUE	0.857	55.000	0.039	1.000	N	NA
3742323	3742324	CLC_0888	CLC_0889			TRUE	0.858	142.000	0.012	0.019	Y	NA
3742324	3742325	CLC_0889	CLC_0890			FALSE	0.005	597.000	0.000	1.000	N	NA
3742325	3742326	CLC_0890	CLC_0891			FALSE	0.052	294.000	0.000	1.000	N	NA
3742326	3742327	CLC_0891	CLC_0892			TRUE	0.988	5.000	0.500	NA		NA
3742329	3742330	CLC_0894	CLC_0895		cadD	FALSE	0.017	300.000	0.000	NA		NA
3742330	3742331	CLC_0895	CLC_0896	cadD		FALSE	0.148	149.000	0.000	NA		NA
3742332	3742333	CLC_0897	CLC_0898			TRUE	0.967	19.000	0.200	NA		NA
3742333	3742334	CLC_0898	CLC_0899			TRUE	0.985	-3.000	0.100	1.000	N	NA
3742335	3742336	CLC_0900	CLC_0901			FALSE	0.002	657.000	0.000	NA		NA
3742336	3742337	CLC_0901	CLC_0902			FALSE	0.153	175.000	0.000	1.000		NA
3742337	3742338	CLC_0902	CLC_0903			FALSE	0.013	347.000	0.000	1.000		NA
3742338	3742339	CLC_0903	CLC_0904			FALSE	0.003	523.000	0.000	1.000		NA
3742339	3742340	CLC_0904	CLC_0905			FALSE	0.292	58.000	0.000	NA		NA
3742341	3742342	CLC_0906	CLC_0907			TRUE	0.871	18.000	0.000	0.005		NA
3742342	3742343	CLC_0907	CLC_0908			FALSE	0.238	105.000	0.000	1.000		NA
3742343	3742344	CLC_0908	CLC_0909			FALSE	0.115	344.000	0.000	0.061	Y	NA
3742345	3742346	CLC_0910	CLC_0911			FALSE	0.069	206.000	0.000	NA		NA
3742346	3742347	CLC_0911	CLC_0912			FALSE	0.262	63.000	0.000	NA		NA
3742348	3742349	CLC_0913	CLC_0914			FALSE	0.025	275.000	0.000	NA		NA
3742350	3742351	CLC_0915	CLC_0916			FALSE	0.011	364.000	0.000	1.000		NA
3742352	3742353	CLC_0917	CLC_0918	oxdD		FALSE	0.120	166.000	0.000	NA		NA
3742353	3742354	CLC_0918	CLC_0919			TRUE	0.712	58.000	0.010	NA		NA
3742355	3742356	CLC_0920	CLC_0921			FALSE	0.038	273.000	0.000	1.000		NA
3742357	3742358	CLC_0922	CLC_0923			FALSE	0.086	193.000	0.000	NA		NA
3742362	3742363	CLC_0927	CLC_0928			TRUE	0.989	0.000	0.400	NA		NA
3742363	3742364	CLC_0928	CLC_0929			FALSE	0.002	663.000	0.000	NA		NA
3742366	3742367	CLC_0931	CLC_0932			FALSE	0.038	243.000	0.000	NA		NA
3742368	3742369	CLC_0933	CLC_0934			FALSE	0.229	125.000	0.000	1.000		NA
3742369	3742370	CLC_0934	CLC_0935			FALSE	0.106	329.000	0.000	1.000	Y	NA
3742370	3742371	CLC_0935	CLC_0936			FALSE	0.164	128.000	0.000	NA		NA
3742373	3742374	CLC_0938	CLC_0939			FALSE	0.006	424.000	0.000	1.000		NA
3742374	3742375	CLC_0939	CLC_0940			FALSE	0.038	244.000	0.000	NA		NA
3742375	3742376	CLC_0940	CLC_0941			FALSE	0.008	353.000	0.000	NA		NA
3742382	3742383	CLC_0947	CLC_0948			FALSE	0.551	30.000	0.000	NA		NA
3742383	3742384	CLC_0948	CLC_0949			FALSE	0.008	356.000	0.000	NA		NA
3742385	3742386	CLC_0950	CLC_0951			FALSE	0.109	174.000	0.000	NA		NA
3742386	3742387	CLC_0951	CLC_0952			FALSE	0.030	264.000	0.000	NA		NA
3742387	3742388	CLC_0952	CLC_0953			FALSE	0.173	106.000	0.000	NA		NA
3742389	3742390	CLC_0954	CLC_0955			FALSE	0.002	539.000	0.000	NA		NA
3742391	3742392	CLC_0956	CLC_0957			FALSE	0.095	184.000	0.000	NA		NA
3742393	3742394	CLC_0958	CLC_0959			TRUE	0.778	0.000	0.000	NA		NA
3742394	3742395	CLC_0959	CLC_0960			FALSE	0.008	352.000	0.000	NA		NA
3742395	3742396	CLC_0960	CLC_0961			FALSE	0.005	405.000	0.000	NA		NA
3742396	3742397	CLC_0961	CLC_0962			FALSE	0.014	342.000	0.000	1.000		NA
3742397	3742398	CLC_0962	CLC_0963			TRUE	0.815	79.000	0.100	1.000	N	NA
3742398	3742399	CLC_0963	CLC_0964		cobU	FALSE	0.061	278.000	0.000	1.000	N	NA
3742400	3742401	CLC_0965	CLC_0966	tipA		FALSE	0.005	397.000	0.000	NA		NA
3742402	3742403	CLC_0967	CLC_0968		cobQ	TRUE	0.658	61.000	0.003	NA		NA
3742403	3742404	CLC_0968	CLC_0969	cobQ	cobD	TRUE	0.994	2.000	0.092	0.012	Y	NA
3742404	3742405	CLC_0969	CLC_0970	cobD		FALSE	0.400	219.000	0.026	1.000	N	NA
3742405	3742406	CLC_0970	CLC_0971		cbiM	FALSE	0.198	274.000	0.013	1.000	N	NA
3742406	3742407	CLC_0971	CLC_0972	cbiM	cbiN	TRUE	0.998	4.000	0.861	0.012	Y	NA
3742407	3742408	CLC_0972	CLC_0973	cbiN	cbiQ	TRUE	0.974	116.000	0.804	0.002	Y	NA
3742408	3742409	CLC_0973	CLC_0974	cbiQ		FALSE	0.008	424.000	0.000	NA	N	NA
3742409	3742410	CLC_0974	CLC_0975		hemC	TRUE	0.992	-31.000	0.009	NA	Y	NA
3742410	3742411	CLC_0975	CLC_0976	hemC	cobA/hemD	TRUE	0.849	136.000	0.031	1.000	Y	NA
3742411	3742412	CLC_0976	CLC_0977	cobA/hemD		FALSE	0.154	145.000	0.000	NA		NA
3742412	3742413	CLC_0977	CLC_0978		hemB	FALSE	0.031	262.000	0.000	NA		NA
3742413	3742414	CLC_0978	CLC_0979	hemB	cobB	TRUE	0.819	121.000	0.005	1.000	Y	NA
3742414	3742415	CLC_0979	CLC_0980	cobB	cobH	TRUE	0.989	25.000	0.097	0.012	Y	NA
3742415	3742416	CLC_0980	CLC_0981	cobH		FALSE	0.084	194.000	0.000	NA		NA
3742416	3742417	CLC_0981	CLC_0982			FALSE	0.106	176.000	0.000	NA		NA
3742417	3742418	CLC_0982	CLC_0983			FALSE	0.023	306.000	0.000	1.000		NA
3742418	3742419	CLC_0983	CLC_0984			FALSE	0.311	56.000	0.000	NA		NA
3742419	3742420	CLC_0984	CLC_0985			FALSE	0.169	122.000	0.000	NA		NA
3742420	3742421	CLC_0985	CLC_0986			FALSE	0.290	77.000	0.000	1.000		NA
3742421	3742422	CLC_0986	CLC_0987			FALSE	0.051	251.000	0.000	1.000		NA
3742422	3742423	CLC_0987	CLC_0988			TRUE	0.918	30.000	0.032	1.000		NA
3742423	3742424	CLC_0988	CLC_0989			TRUE	0.726	67.000	0.032	NA		NA
3742424	3742425	CLC_0989	CLC_0990			TRUE	0.801	108.000	0.250	NA		NA
3742425	3742426	CLC_0990	CLC_0991		cbiD	FALSE	0.226	74.000	0.000	NA		NA
3742426	3742427	CLC_0991	CLC_0992	cbiD	cbiE	TRUE	0.871	177.000	0.126	0.012	Y	NA
3742427	3742428	CLC_0992	CLC_0993	cbiE		FALSE	0.049	227.000	0.000	NA		NA
3742428	3742429	CLC_0993	CLC_0994		cbiT	FALSE	0.086	193.000	0.000	NA		NA
3742429	3742430	CLC_0994	CLC_0995	cbiT		TRUE	0.778	0.000	0.000	NA		NA
3742430	3742431	CLC_0995	CLC_0996			FALSE	0.459	36.000	0.000	NA		NA
3742433	3742434	CLC_0998	CLC_0999			TRUE	0.942	43.000	0.400	NA		NA
3742434	3742435	CLC_0999	CLC_1000			FALSE	0.280	60.000	0.000	NA		NA
3742435	3742436	CLC_1000	CLC_1001			FALSE	0.236	120.000	0.000	1.000		NA
3742436	3742437	CLC_1001	CLC_1002		cobI	FALSE	0.050	295.000	0.000	1.000	N	NA
3742437	3742438	CLC_1002	CLC_1003	cobI	cobM	TRUE	0.993	19.000	0.291	0.012	Y	NA
3742438	3742439	CLC_1003	CLC_1004	cobM	cbiG	TRUE	0.666	291.000	0.397	0.012	Y	NA
3742439	3742440	CLC_1004	CLC_1005	cbiG	cobJ	TRUE	0.934	158.000	0.352	0.012	Y	NA
3742440	3742441	CLC_1005	CLC_1006	cobJ	cobK	TRUE	0.953	134.000	0.423	0.012	Y	NA
3742441	3742442	CLC_1006	CLC_1007	cobK		FALSE	0.590	80.000	0.006	NA		NA
3742442	3742443	CLC_1007	CLC_1008		cbiK	FALSE	0.534	176.000	0.056	NA		NA
3742443	3742444	CLC_1008	CLC_1009	cbiK		TRUE	0.964	13.000	0.040	1.000	N	NA
3742444	3742445	CLC_1009	CLC_1010		cobO	FALSE	0.326	148.000	0.000	1.000	N	NA
3742445	3742446	CLC_1010	CLC_1011	cobO		FALSE	0.088	253.000	0.000	1.000	N	NA
3742446	3742447	CLC_1011	CLC_1012			TRUE	0.818	90.000	0.152	1.000	N	NA
3742447	3742448	CLC_1012	CLC_1013		asrA	TRUE	0.968	20.000	0.174	1.000		NA
3742448	3742449	CLC_1013	CLC_1014	asrA	asrB	TRUE	0.997	-13.000	0.750	0.038		NA
3742449	3742450	CLC_1014	CLC_1015	asrB	arsC	TRUE	0.997	13.000	0.720	0.038	Y	NA
3742450	3742451	CLC_1015	CLC_1016	arsC		FALSE	0.022	354.000	0.000	1.000	N	NA
3742451	3742452	CLC_1016	CLC_1017			FALSE	0.037	312.000	0.000	1.000	N	NA
3742452	3742453	CLC_1017	CLC_1018			TRUE	0.987	20.000	0.556	1.000	N	NA
3742453	3742454	CLC_1018	CLC_1019			TRUE	0.987	15.000	0.444	1.000	N	NA
3742454	3742455	CLC_1019	CLC_1020			TRUE	0.982	-16.000	0.067	NA		NA
3742455	3742456	CLC_1020	CLC_1021			FALSE	0.001	831.000	0.000	NA		NA
3742456	3742457	CLC_1021	CLC_1022			TRUE	0.988	21.000	0.833	NA		NA
3742457	3742458	CLC_1022	CLC_1023			TRUE	0.992	4.000	0.833	NA		NA
3742458	3742459	CLC_1023	CLC_1024			FALSE	0.022	645.000	0.154	NA		NA
3742459	3742460	CLC_1024	CLC_1025			TRUE	0.998	-10.000	0.765	1.000	Y	NA
3742461	3742462	CLC_1026	CLC_1027			TRUE	0.997	1.000	0.625	1.000	Y	NA
3742462	3742463	CLC_1027	CLC_1028			TRUE	0.993	13.000	0.375	1.000	Y	NA
3742463	3742464	CLC_1028	CLC_1029		dhaKL	FALSE	0.005	558.000	0.000	1.000	N	NA
3742464	3742465	CLC_1029	CLC_1030	dhaKL	dhaD	TRUE	0.969	11.000	0.053	1.000	N	NA
3742465	3742466	CLC_1030	CLC_1031	dhaD		FALSE	0.270	312.000	0.250	1.000	N	NA
3742467	3742468	CLC_1032	CLC_1033			FALSE	0.476	35.000	0.000	NA		NA
3742468	3742469	CLC_1033	CLC_1034			TRUE	0.842	27.000	0.000	0.011		NA
3742469	3742470	CLC_1034	CLC_1035			FALSE	0.140	153.000	0.000	NA		NA
3742470	3742471	CLC_1035	CLC_1036			FALSE	0.262	63.000	0.000	NA		NA
3742471	3742472	CLC_1036	CLC_1037			FALSE	0.173	118.000	0.000	NA		NA
3742472	3742473	CLC_1037	CLC_1038			TRUE	0.774	101.000	0.200	NA		NA
3742473	3742474	CLC_1038	CLC_1039			TRUE	0.854	46.000	0.061	NA		NA
3742474	3742475	CLC_1039	CLC_1040			FALSE	0.064	210.000	0.000	NA		NA
3742475	3742476	CLC_1040	CLC_1041			TRUE	0.982	17.000	0.486	NA		NA
3742476	3742477	CLC_1041	CLC_1042			FALSE	0.161	135.000	0.000	NA		NA
3742479	3742480	CLC_1044	CLC_1045			TRUE	0.987	26.000	0.833	NA		NA
3742482	3742483	CLC_1047	CLC_1048		recQ	FALSE	0.038	244.000	0.000	NA		NA
3742483	3742484	CLC_1048	CLC_1049	recQ		FALSE	0.259	172.000	0.000	1.000	N	NA
3742486	3742487	CLC_1051	CLC_1052			FALSE	0.240	115.000	0.000	1.000		NA
3742487	3742488	CLC_1052	CLC_1053			FALSE	0.003	447.000	0.000	NA		NA
3742488	3742489	CLC_1053	CLC_1054			TRUE	0.988	2.000	0.444	NA		NA
3742489	3742490	CLC_1054	CLC_1055			TRUE	0.981	0.000	0.167	NA		NA
3742490	3742491	CLC_1055	CLC_1056			TRUE	0.987	14.000	0.077	1.000	Y	NA
3742491	3742492	CLC_1056	CLC_1057			TRUE	0.965	15.000	0.135	NA		NA
3742492	3742493	CLC_1057	CLC_1058		lctP	FALSE	0.003	484.000	0.000	NA		NA
3742493	3742494	CLC_1058	CLC_1059	lctP		TRUE	0.939	29.000	0.098	NA		NA
3742494	3742495	CLC_1059	CLC_1060			TRUE	0.882	43.000	0.098	NA		NA
3742495	3742496	CLC_1060	CLC_1061			TRUE	0.995	32.000	0.875	0.022	Y	NA
3742496	3742497	CLC_1061	CLC_1062			TRUE	0.985	61.000	0.875	0.009	Y	NA
3742497	3742498	CLC_1062	CLC_1063			FALSE	0.027	269.000	0.000	NA		NA
3742498	3742499	CLC_1063	CLC_1064			FALSE	0.164	128.000	0.000	NA		NA
3742499	3742500	CLC_1064	CLC_1065			FALSE	0.082	196.000	0.000	NA		NA
3742500	3742501	CLC_1065	CLC_1066			TRUE	0.966	2.000	0.051	NA		NA
3742502	3742503	CLC_1067	CLC_1068			FALSE	0.001	929.000	0.000	NA		NA
3742504	3742505	CLC_1069	CLC_1070			FALSE	0.191	303.000	0.000	0.059	Y	NA
3742505	3742506	CLC_1070	CLC_1071			FALSE	0.059	215.000	0.000	NA		NA
3742508	3742509	CLC_1073	CLC_1074			FALSE	0.183	160.000	0.000	1.000		NA
3742509	3742510	CLC_1074	CLC_1075			TRUE	0.842	16.000	0.000	1.000	N	NA
3742514	3742515	CLC_1079	CLC_1080			FALSE	0.162	134.000	0.000	NA		NA
3742515	3742516	CLC_1080	CLC_1081			FALSE	0.002	554.000	0.000	NA		NA
3742516	3742517	CLC_1081	CLC_1082		feoB-2	FALSE	0.517	32.000	0.000	NA		NA
3742517	3742518	CLC_1082	CLC_1083	feoB-2		TRUE	0.940	21.000	0.029	1.000		NA
3742520	3742521	CLC_1085	CLC_1086			FALSE	0.053	222.000	0.000	NA		NA
3742521	3742522	CLC_1086	CLC_1087		tlp	FALSE	0.017	299.000	0.000	NA		NA
3742522	3742523	CLC_1087	CLC_1088	tlp		FALSE	0.057	218.000	0.000	NA		NA
3742523	3742524	CLC_1088	CLC_1089			TRUE	0.996	1.000	0.462	1.000	Y	NA
3742524	3742525	CLC_1089	CLC_1090			FALSE	0.006	535.000	0.000	1.000	N	NA
3742527	3742528	CLC_1092	CLC_1093			FALSE	0.027	270.000	0.000	NA		NA
3742528	3742529	CLC_1093	CLC_1094			TRUE	0.998	0.000	0.833	1.000	Y	NA
3742530	3742531	CLC_1095	CLC_1096			FALSE	0.085	236.000	0.000	NA	N	NA
3742532	3742533	CLC_1097	CLC_1098			TRUE	0.999	-10.000	0.870	0.034	Y	NA
3742533	3742534	CLC_1098	CLC_1099			TRUE	0.998	-3.000	0.870	1.000	Y	NA
3742534	3742535	CLC_1099	CLC_1100			TRUE	0.937	74.000	0.196	1.000	Y	NA
3742535	3742536	CLC_1100	CLC_1101			FALSE	0.179	202.000	0.000	1.000	N	NA
3742536	3742537	CLC_1101	CLC_1102			FALSE	0.006	515.000	0.000	1.000	N	NA
3742537	3742538	CLC_1102	CLC_1103			TRUE	0.997	2.000	0.389	0.007	Y	NA
3742539	3742540	CLC_1104	CLC_1105			TRUE	0.997	3.000	1.000	NA	Y	NA
3742540	3742541	CLC_1105	CLC_1106			FALSE	0.188	88.000	0.000	NA		NA
3742541	3742542	CLC_1106	CLC_1107			FALSE	0.040	239.000	0.000	NA		NA
3742543	3742544	CLC_1108	CLC_1109			FALSE	0.263	188.000	0.000	0.006		NA
3742544	3742545	CLC_1109	CLC_1110			FALSE	0.098	181.000	0.000	NA		NA
3742545	3742546	CLC_1110	CLC_1111			TRUE	0.796	-3.000	0.000	NA		NA
3742546	3742547	CLC_1111	CLC_1112			FALSE	0.080	324.000	0.023	NA		NA
3742547	3742548	CLC_1112	CLC_1113			FALSE	0.499	165.000	0.023	NA		NA
3742549	3742550	CLC_1114	CLC_1115			FALSE	0.578	116.000	0.015	NA		NA
3742550	3742551	CLC_1115	CLC_1116			FALSE	0.008	384.000	0.000	1.000		NA
3742552	3742553	CLC_1117	CLC_1118			FALSE	0.010	375.000	0.000	1.000		NA
3742553	3742554	CLC_1118	CLC_1119			FALSE	0.083	218.000	0.000	1.000		NA
3742554	3742555	CLC_1119	CLC_1120			FALSE	0.096	208.000	0.000	1.000		NA
3742555	3742556	CLC_1120	CLC_1121			TRUE	0.888	57.000	0.107	0.037		NA
3742556	3742557	CLC_1121	CLC_1122			TRUE	0.989	3.000	0.300	0.037		NA
3742557	3742558	CLC_1122	CLC_1123		glpT	TRUE	0.648	89.000	0.021	1.000		NA
3742558	3742559	CLC_1123	CLC_1124	glpT	argS	FALSE	0.005	582.000	0.000	1.000	N	NA
3742559	3742560	CLC_1124	CLC_1125	argS		FALSE	0.009	342.000	0.000	NA		NA
3742560	3742561	CLC_1125	CLC_1126			TRUE	0.830	-10.000	0.000	NA		NA
3742561	3742562	CLC_1126	CLC_1127			FALSE	0.221	139.000	0.000	1.000		NA
3742563	3742564	CLC_1128	CLC_1129		feoB-3	TRUE	0.931	26.000	0.034	NA		NA
3742564	3742565	CLC_1129	CLC_1130	feoB-3	feoA-2	TRUE	0.992	15.000	0.308	1.000	Y	NA
3742566	3742567	CLC_1131	CLC_1132			FALSE	0.062	213.000	0.000	NA		NA
3742567	3742568	CLC_1132	CLC_1133			FALSE	0.033	257.000	0.000	NA		NA
3742568	3742569	CLC_1133	CLC_1134			FALSE	0.268	62.000	0.000	NA		NA
3742569	3742570	CLC_1134	CLC_1135			FALSE	0.006	412.000	0.000	1.000		NA
3742570	3742571	CLC_1135	CLC_1136			FALSE	0.018	325.000	0.000	1.000		NA
3742571	3742572	CLC_1136	CLC_1137			TRUE	0.996	2.000	0.511	1.000	Y	NA
3742572	3742573	CLC_1137	CLC_1138			TRUE	0.952	55.000	0.154	NA	Y	NA
3742573	3742574	CLC_1138	CLC_1139			TRUE	0.840	189.000	0.250	NA	Y	NA
3742574	3742575	CLC_1139	CLC_1140			FALSE	0.048	228.000	0.000	NA		NA
3742575	3742576	CLC_1140	CLC_1141			FALSE	0.029	265.000	0.000	NA		NA
3742576	3742577	CLC_1141	CLC_1142			FALSE	0.087	191.000	0.000	NA		NA
3742577	3742578	CLC_1142	CLC_1143			FALSE	0.004	506.000	0.000	1.000		NA
3742578	3742579	CLC_1143	CLC_1144			FALSE	0.037	245.000	0.000	NA		NA
3742579	3742580	CLC_1144	CLC_1145			FALSE	0.065	209.000	0.000	NA		NA
3742584	3742585	CLC_1149	CLC_1150			FALSE	0.512	143.000	0.008	NA		NA
3742585	3742586	CLC_1150	CLC_1151			TRUE	0.748	56.000	0.008	1.000		NA
3742587	3742588	CLC_1152	CLC_1153			FALSE	0.028	596.000	0.000	0.003	Y	NA
3742589	3742590	CLC_1154	CLC_1155			TRUE	0.982	18.000	0.333	1.000	N	NA
3742590	3742591	CLC_1155	CLC_1156			FALSE	0.006	419.000	0.000	1.000		NA
3742591	3742592	CLC_1156	CLC_1157			FALSE	0.173	99.000	0.000	NA		NA
3742592	3742593	CLC_1157	CLC_1158			FALSE	0.001	807.000	0.000	NA		NA
3742593	3742594	CLC_1158	CLC_1159			TRUE	0.981	2.000	0.217	NA		NA
3742594	3742595	CLC_1159	CLC_1160			TRUE	0.988	23.000	0.084	0.034	Y	NA
3742595	3742596	CLC_1160	CLC_1161			TRUE	0.988	12.000	0.308	0.034	N	NA
3742596	3742597	CLC_1161	CLC_1162			FALSE	0.016	303.000	0.000	NA		NA
3742597	3742598	CLC_1162	CLC_1163			FALSE	0.592	104.000	0.020	NA		NA
3742598	3742599	CLC_1163	CLC_1164			TRUE	0.777	10.000	0.000	1.000		NA
3742599	3742600	CLC_1164	CLC_1165			FALSE	0.219	76.000	0.000	NA		NA
3742600	3742601	CLC_1165	CLC_1166			TRUE	0.968	1.000	0.050	NA		NA
3742601	3742602	CLC_1166	CLC_1167		maa	FALSE	0.020	288.000	0.000	NA		NA
3742604	3742605	CLC_1169	CLC_1170			FALSE	0.037	275.000	0.000	1.000		NA
3742605	3742606	CLC_1170	CLC_1171			FALSE	0.536	160.000	0.017	1.000		NA
3742608	3742609	CLC_1173	CLC_1174		mgtE	FALSE	0.002	501.000	0.000	NA		NA
3742609	3742610	CLC_1174	CLC_1175	mgtE		FALSE	0.005	1003.000	0.000	0.058	N	NA
3742610	3742611	CLC_1175	CLC_1176		serA	TRUE	0.721	228.000	0.110	0.058	Y	NA
3742611	3742612	CLC_1176	CLC_1177	serA		TRUE	0.984	-22.000	0.072	NA		NA
3742612	3742613	CLC_1177	CLC_1178			FALSE	0.002	600.000	0.000	NA		NA
3742613	3742614	CLC_1178	CLC_1179			TRUE	0.624	159.000	0.056	1.000		NA
3742616	3742617	CLC_1181	CLC_1182			TRUE	0.751	111.000	0.118	1.000		NA
3742617	3742618	CLC_1182	CLC_1183			FALSE	0.026	299.000	0.000	1.000		NA
3742618	3742619	CLC_1183	CLC_1184			FALSE	0.523	158.000	0.004	NA	N	NA
3742619	3742620	CLC_1184	CLC_1185			FALSE	0.219	76.000	0.000	NA		NA
3742620	3742621	CLC_1185	CLC_1186			FALSE	0.024	277.000	0.000	NA		NA
3742621	3742622	CLC_1186	CLC_1187			FALSE	0.567	177.000	0.091	NA		NA
3742622	3742623	CLC_1187	CLC_1188		xpt-2	FALSE	0.570	161.000	0.009	1.000	N	NA
3742623	3742624	CLC_1188	CLC_1189	xpt-2		FALSE	0.018	298.000	0.000	NA		NA
3742624	3742625	CLC_1189	CLC_1190			FALSE	0.014	309.000	0.000	NA		NA
3742625	3742626	CLC_1190	CLC_1191			TRUE	0.770	196.000	0.667	NA		NA
3742626	3742627	CLC_1191	CLC_1192			FALSE	0.008	350.000	0.000	NA		NA
3742627	3742628	CLC_1192	CLC_1193			FALSE	0.100	180.000	0.000	NA		NA
3742628	3742629	CLC_1193	CLC_1194			TRUE	0.659	137.000	0.065	NA		NA
3742629	3742630	CLC_1194	CLC_1195			FALSE	0.001	771.000	0.000	NA		NA
3742630	3742631	CLC_1195	CLC_1196			TRUE	0.848	182.000	1.000	NA		NA
3742631	3742632	CLC_1196	CLC_1197			FALSE	0.005	391.000	0.000	NA		NA
3742632	3742633	CLC_1197	CLC_1198			TRUE	0.998	2.000	0.667	0.034	Y	NA
3742633	3742634	CLC_1198	CLC_1199			TRUE	0.998	-37.000	0.900	0.034	N	NA
3742636	3742637	CLC_1201	CLC_1202		rpsA	FALSE	0.005	399.000	0.000	NA		NA
3742637	3742638	CLC_1202	CLC_1203	rpsA		FALSE	0.412	183.000	0.008	1.000		NA
3742638	3742639	CLC_1203	CLC_1204			FALSE	0.565	172.000	0.067	NA		NA
3742639	3742640	CLC_1204	CLC_1205			FALSE	0.001	869.000	0.000	NA		NA
3742640	3742641	CLC_1205	CLC_1206			TRUE	0.994	0.000	0.857	NA		NA
3742641	3742642	CLC_1206	CLC_1207			TRUE	0.992	-37.000	0.231	1.000		NA
3742642	3742643	CLC_1207	CLC_1208			FALSE	0.011	330.000	0.000	NA		NA
3742643	3742644	CLC_1208	CLC_1209		asdA	FALSE	0.004	433.000	0.000	NA		NA
3742646	3742647	CLC_1211	CLC_1212			TRUE	0.972	-6.000	0.012	NA	N	NA
3742647	3742648	CLC_1212	CLC_1213		panE	FALSE	0.005	492.000	0.000	NA	N	NA
3742648	3742649	CLC_1213	CLC_1214	panE	fchA	FALSE	0.043	303.000	0.000	1.000	N	NA
3742649	3742650	CLC_1214	CLC_1215	fchA	folD	TRUE	0.988	0.000	0.082	0.001	N	NA
3742650	3742651	CLC_1215	CLC_1216	folD		FALSE	0.019	320.000	0.000	1.000		NA
3742653	3742654	CLC_1218	CLC_1219			TRUE	0.813	118.000	0.286	NA		NA
3742654	3742655	CLC_1219	CLC_1220			FALSE	0.561	120.000	0.012	NA		NA
3742655	3742656	CLC_1220	CLC_1221			FALSE	0.003	672.000	0.000	NA	N	NA
3742656	3742657	CLC_1221	CLC_1222		cysK-2	FALSE	0.135	329.000	0.083	NA	N	NA
3742657	3742658	CLC_1222	CLC_1223	cysK-2		TRUE	0.997	-13.000	0.400	1.000	Y	NA
3742658	3742659	CLC_1223	CLC_1224			TRUE	0.989	35.000	0.400	0.034	Y	NA
3742659	3742660	CLC_1224	CLC_1225		iscS-1	TRUE	0.929	101.000	0.286	1.000	Y	NA
3742660	3742661	CLC_1225	CLC_1226	iscS-1		FALSE	0.313	72.000	0.000	1.000		NA
3742661	3742662	CLC_1226	CLC_1227			FALSE	0.479	155.000	0.008	NA		NA
3742662	3742663	CLC_1227	CLC_1228		trmU-1	FALSE	0.524	116.000	0.004	NA		NA
3742663	3742664	CLC_1228	CLC_1229	trmU-1		FALSE	0.026	340.000	0.000	1.000	N	NA
3742664	3742665	CLC_1229	CLC_1230			TRUE	0.998	-3.000	0.875	NA	Y	NA
3742665	3742666	CLC_1230	CLC_1231		bcrA	FALSE	0.014	373.000	0.000	NA	N	NA
3742666	3742667	CLC_1231	CLC_1232	bcrA		TRUE	0.814	-7.000	0.000	NA		NA
3742667	3742668	CLC_1232	CLC_1233			FALSE	0.002	603.000	0.000	NA		NA
3742668	3742669	CLC_1233	CLC_1234			FALSE	0.009	347.000	0.000	NA		NA
3742671	3742672	CLC_1236	CLC_1237			TRUE	0.991	6.000	0.556	1.000	N	NA
3742672	3742673	CLC_1237	CLC_1238			FALSE	0.017	301.000	0.000	NA		NA
3742673	3742674	CLC_1238	CLC_1239			FALSE	0.002	511.000	0.000	NA		NA
3742676	3742677	CLC_1241	CLC_1242			TRUE	0.670	14.000	0.000	NA		NA
3742677	3742678	CLC_1242	CLC_1243			FALSE	0.426	64.000	0.000	NA	N	NA
3742678	3742679	CLC_1243	CLC_1244			TRUE	0.964	3.000	0.000	NA	Y	NA
3742679	3742680	CLC_1244	CLC_1245		amyB	FALSE	0.006	671.000	0.000	0.005		NA
3742680	10195468	CLC_1245	CLC_3714	amyB		FALSE	0.162	134.000	0.000	NA		NA
10195468	3742681	CLC_3714	CLC_1246		tyrS-1	FALSE	0.002	550.000	0.000	NA		NA
3742681	3742682	CLC_1246	CLC_1247	tyrS-1		FALSE	0.055	287.000	0.000	1.000	N	NA
3742682	3742683	CLC_1247	CLC_1248			TRUE	0.996	-7.000	0.833	1.000	N	NA
3742683	3742684	CLC_1248	CLC_1249			TRUE	0.985	1.000	0.278	NA		NA
3742686	3742687	CLC_1251	CLC_1252			FALSE	0.089	189.000	0.000	NA		NA
3742687	3742688	CLC_1252	CLC_1253			FALSE	0.210	78.000	0.000	NA		NA
3742688	3742689	CLC_1253	CLC_1254			FALSE	0.613	174.000	0.095	1.000		NA
3742689	3742690	CLC_1254	CLC_1255		sdhB	FALSE	0.013	400.000	0.000	1.000	N	NA
3742690	3742691	CLC_1255	CLC_1256	sdhB	sdhA	TRUE	0.993	13.000	0.146	0.001	Y	NA
3742691	3742692	CLC_1256	CLC_1258	sdhA		FALSE	0.004	424.000	0.000	NA		NA
3742695	3742696	CLC_1261	CLC_1262			FALSE	0.006	380.000	0.000	NA		NA
3742696	3742697	CLC_1262	CLC_1263			TRUE	0.752	107.000	0.154	NA		NA
3742697	3742698	CLC_1263	CLC_1264			TRUE	0.982	2.000	0.231	NA		NA
3742698	3742699	CLC_1264	CLC_1265			TRUE	0.942	37.000	0.286	NA		NA
3742699	3742700	CLC_1265	CLC_1266			TRUE	0.651	173.000	0.071	1.000	N	NA
3742700	3742701	CLC_1266	CLC_1267			TRUE	0.997	6.000	0.786	0.033	Y	NA
3742701	3742702	CLC_1267	CLC_1268			TRUE	0.924	199.000	0.688	0.033	Y	NA
3742703	3742704	CLC_1269	CLC_1270		cotJB	TRUE	0.927	34.000	0.125	NA		NA
3742704	3742705	CLC_1270	CLC_1271	cotJB	cotJC	TRUE	0.913	31.000	0.047	NA		NA
3742705	3742706	CLC_1271	CLC_1272	cotJC		FALSE	0.094	230.000	0.000	NA	N	NA
3742706	3742707	CLC_1272	CLC_1273			TRUE	0.986	17.000	0.667	NA		NA
3742707	3742708	CLC_1273	CLC_1274			FALSE	0.002	648.000	0.000	NA		NA
3742711	3742712	CLC_1277	CLC_1278			FALSE	0.002	514.000	0.000	NA		NA
3742715	3742716	CLC_1281	CLC_1282			FALSE	0.420	39.000	0.000	NA		NA
3742716	3742717	CLC_1282	CLC_1283			FALSE	0.043	234.000	0.000	NA		NA
3742719	3742720	CLC_1285	CLC_1286			TRUE	0.991	12.000	1.000	NA		NA
3742722	3742723	CLC_1288	CLC_1289			FALSE	0.002	662.000	0.000	NA		NA
3742723	3742724	CLC_1289	CLC_1290			FALSE	0.002	880.000	0.000	1.000		NA
3742724	3742725	CLC_1290	CLC_1291			FALSE	0.021	284.000	0.000	NA		NA
3742725	3742726	CLC_1291	CLC_1292			FALSE	0.013	319.000	0.000	NA		NA
3742727	3742728	CLC_1293	CLC_1294			TRUE	0.870	40.000	0.014	1.000	N	NA
3742729	3742730	CLC_1295	CLC_1296	grdX	grdE	TRUE	0.850	91.000	0.400	NA		NA
3742730	3742731	CLC_1296	CLC_1297	grdE	grdB	TRUE	0.966	33.000	0.222	0.003		NA
3742731	3742732	CLC_1297	CLC_1298	grdB	trxB	FALSE	0.200	151.000	0.000	1.000		NA
3742732	3742733	CLC_1298	CLC_1299	trxB		TRUE	0.982	34.000	0.226	1.000	Y	NA
3742733	3742734	CLC_1299	CLC_1300		grdA	FALSE	0.261	86.000	0.000	1.000		NA
3742734	3742735	CLC_1300	CLC_1301	grdA	grdC	TRUE	0.780	95.000	0.054	0.003		NA
3742735	3742736	CLC_1301	CLC_1302	grdC	grdD	TRUE	0.991	16.000	0.622	0.003		NA
3742736	3742737	CLC_1302	CLC_1303	grdD		FALSE	0.010	427.000	0.000	1.000	N	NA
3742737	3742738	CLC_1303	CLC_1304			TRUE	0.749	66.000	0.005	0.055		NA
3742738	3742739	CLC_1304	CLC_1305		mtnK	FALSE	0.005	436.000	0.000	1.000		NA
3742739	3742740	CLC_1305	CLC_1306	mtnK	mtnA	TRUE	0.717	140.000	0.104	1.000		NA
3742740	3742741	CLC_1306	CLC_1307	mtnA		TRUE	0.632	24.000	0.000	NA		NA
3742741	3742742	CLC_1307	CLC_1308			TRUE	0.654	17.000	0.000	NA		NA
3742742	3742743	CLC_1308	CLC_1309			FALSE	0.384	44.000	0.000	NA		NA
3742743	3742744	CLC_1309	CLC_1310			TRUE	0.830	-10.000	0.000	NA		NA
3742744	3742745	CLC_1310	CLC_1311			FALSE	0.015	307.000	0.000	NA		NA
3742747	3742748	CLC_1313	CLC_1314			FALSE	0.602	162.000	0.074	NA		NA
3742748	3742749	CLC_1314	CLC_1315			FALSE	0.616	142.000	0.038	NA		NA
3742749	3742750	CLC_1315	CLC_1316			TRUE	0.982	-3.000	0.135	NA		NA
3742750	3742751	CLC_1316	CLC_1317			FALSE	0.006	383.000	0.000	NA		NA
3742751	3742752	CLC_1317	CLC_1318			TRUE	0.772	69.000	0.080	NA		NA
3742753	3742754	CLC_1319	CLC_1320			FALSE	0.006	381.000	0.000	NA		NA
3742755	3742756	CLC_1321	CLC_1322			TRUE	0.982	28.000	0.667	NA		NA
3742756	3742757	CLC_1322	CLC_1323			TRUE	0.876	57.000	0.200	NA		NA
3742757	3742758	CLC_1323	CLC_1324			TRUE	0.996	14.000	0.500	0.001	Y	NA
3742758	3742759	CLC_1324	CLC_1325			TRUE	0.993	32.000	0.667	0.050	Y	NA
3742759	3742760	CLC_1325	CLC_1326			TRUE	0.780	116.000	0.100	1.000	N	NA
3742760	3742761	CLC_1326	CLC_1327		topB	FALSE	0.015	390.000	0.000	1.000	N	NA
3742761	3742762	CLC_1327	CLC_1328	topB		FALSE	0.014	312.000	0.000	NA		NA
3742762	3742763	CLC_1328	CLC_1329			FALSE	0.251	66.000	0.000	NA		NA
3742765	3742766	CLC_1331	CLC_1332			FALSE	0.007	399.000	0.000	1.000		NA
3742766	3742767	CLC_1332	CLC_1333			FALSE	0.023	305.000	0.000	1.000		NA
3742767	3742768	CLC_1333	CLC_1334			FALSE	0.036	315.000	0.000	1.000	N	NA
3742768	3742769	CLC_1334	CLC_1335			TRUE	0.953	20.000	0.067	1.000		NA
3742769	3742770	CLC_1335	CLC_1336			TRUE	0.954	6.000	0.033	NA		NA
3742770	3742771	CLC_1336	CLC_1337			FALSE	0.292	281.000	0.230	NA		NA
3742771	3742772	CLC_1337	CLC_1338			FALSE	0.004	417.000	0.000	NA		NA
3742772	3742773	CLC_1338	CLC_1339			FALSE	0.048	228.000	0.000	NA		NA
3742773	3742774	CLC_1339	CLC_1340			FALSE	0.010	335.000	0.000	NA		NA
3742774	3742775	CLC_1340	CLC_1341			FALSE	0.024	276.000	0.000	NA		NA
3742775	3742776	CLC_1341	CLC_1342			TRUE	0.943	37.000	0.287	NA		NA
3742776	3742777	CLC_1342	CLC_1343		copZ	TRUE	0.892	123.000	0.024	0.001	Y	NA
3742777	3742778	CLC_1343	CLC_1344	copZ		FALSE	0.060	382.000	0.000	1.000	Y	NA
3742778	3742779	CLC_1344	CLC_1345			FALSE	0.007	478.000	0.000	1.000	N	NA
3742779	3742780	CLC_1345	CLC_1346			FALSE	0.010	338.000	0.000	NA		NA
3742780	3742781	CLC_1346	CLC_1347			FALSE	0.551	164.000	0.040	NA		NA
3742781	3742782	CLC_1347	CLC_1348			FALSE	0.004	419.000	0.000	NA		NA
3742784	3742785	CLC_1350	CLC_1351			TRUE	0.931	25.000	0.032	NA		NA
3742787	3742788	CLC_1353	CLC_1354			FALSE	0.002	592.000	0.000	NA		NA
3742788	3742789	CLC_1354	CLC_1355		trkA	FALSE	0.001	788.000	0.000	NA		NA
3742789	3742790	CLC_1355	CLC_1356	trkA	trkH	TRUE	0.796	-3.000	0.000	NA		NA
3742790	3742791	CLC_1356	CLC_1357	trkH		FALSE	0.003	459.000	0.000	NA		NA
3742791	3742792	CLC_1357	CLC_1358			TRUE	0.847	-19.000	0.000	NA		NA
3742793	3742794	CLC_1359	CLC_1360			TRUE	0.967	15.000	0.158	NA		NA
3742794	3742795	CLC_1360	CLC_1361			FALSE	0.014	342.000	0.000	1.000		NA
3742796	3742797	CLC_1362	CLC_1363	rbr		FALSE	0.040	295.000	0.000	NA	N	NA
3742801	3742802	CLC_1367	CLC_1368			FALSE	0.019	295.000	0.000	NA		NA
3742802	3742803	CLC_1368	CLC_1369			TRUE	0.651	209.000	0.312	NA	N	NA
3742803	3742804	CLC_1369	CLC_1370			TRUE	0.891	147.000	0.077	0.050	Y	NA
3742804	3742805	CLC_1370	CLC_1371		noxA	FALSE	0.609	199.000	0.111	0.050		NA
3742806	3742807	CLC_1372	CLC_1373			FALSE	0.016	382.000	0.000	1.000	N	NA
3742808	3742809	CLC_1374	CLC_1375			FALSE	0.043	303.000	0.000	1.000	N	NA
3742809	3742810	CLC_1375	CLC_1376			TRUE	0.989	22.000	0.214	1.000	Y	NA
3742810	3742811	CLC_1376	CLC_1377			TRUE	0.994	3.000	0.255	1.000	Y	NA
3742812	3742813	CLC_1378	CLC_1379			TRUE	0.794	75.000	0.133	NA		NA
3742814	3742815	CLC_1380	CLC_1381			FALSE	0.081	280.000	0.000	0.004		NA
3742815	3742816	CLC_1381	CLC_1382			TRUE	0.742	113.000	0.107	1.000		NA
3742816	3742817	CLC_1382	CLC_1383			FALSE	0.047	424.000	0.089	1.000		NA
3742817	3742818	CLC_1383	CLC_1384			FALSE	0.011	332.000	0.000	NA		NA
3742818	3742819	CLC_1384	CLC_1385			FALSE	0.022	283.000	0.000	NA		NA
3742819	3742820	CLC_1385	CLC_1386			FALSE	0.015	306.000	0.000	NA		NA
3742820	3742821	CLC_1386	CLC_1387			TRUE	0.939	53.000	0.500	NA		NA
3742821	3742822	CLC_1387	CLC_1388			TRUE	0.985	0.000	0.250	NA		NA
3742824	3742825	CLC_1390	CLC_1391			FALSE	0.008	458.000	0.000	1.000	N	NA
3742825	3742826	CLC_1391	CLC_1392			TRUE	0.996	-3.000	0.235	0.033	Y	NA
3742826	3742827	CLC_1392	CLC_1393			TRUE	0.995	9.000	0.353	0.033	Y	NA
3742827	3742828	CLC_1393	CLC_1394			TRUE	0.898	99.000	0.118	1.000	Y	NA
3742828	3742829	CLC_1394	CLC_1395			TRUE	0.985	-6.000	0.059	0.032		NA
3742829	3742830	CLC_1395	CLC_1396			FALSE	0.003	444.000	0.000	NA		NA
3742831	3742832	CLC_1397	CLC_1398			TRUE	0.995	0.000	0.231	1.000	Y	NA
3742835	3742836	CLC_1401	CLC_1402			TRUE	0.680	135.000	0.025	1.000	N	NA
3742836	3742837	CLC_1402	CLC_1403			FALSE	0.001	913.000	0.000	NA		NA
3742837	3742838	CLC_1403	CLC_1404			FALSE	0.366	47.000	0.000	NA		NA
3742838	3742839	CLC_1404	CLC_1405			TRUE	0.998	-28.000	0.646	NA	Y	NA
3742839	3742840	CLC_1405	CLC_1406			TRUE	0.920	141.000	0.270	1.000	Y	NA
3742840	3742841	CLC_1406	CLC_1407			FALSE	0.202	279.000	0.000	1.000	Y	NA
3742841	3742842	CLC_1407	CLC_1408			TRUE	0.987	-30.000	0.035	0.057		NA
3742842	3742843	CLC_1408	CLC_1409			TRUE	0.653	127.000	0.035	1.000		NA
3742843	3742844	CLC_1409	CLC_1410			FALSE	0.377	45.000	0.000	NA		NA
3742844	3742845	CLC_1410	CLC_1411		rnz	FALSE	0.163	129.000	0.000	NA		NA
3742845	3742846	CLC_1411	CLC_1412	rnz		FALSE	0.013	346.000	0.000	1.000		NA
3742846	3742847	CLC_1412	CLC_1413			FALSE	0.154	145.000	0.000	NA		NA
3742847	3742848	CLC_1413	CLC_1414			TRUE	0.932	13.000	0.015	NA		NA
3742848	3742849	CLC_1414	CLC_1415			TRUE	0.944	183.000	0.800	0.019	Y	NA
3742849	3742850	CLC_1415	CLC_1416			FALSE	0.281	351.000	0.600	1.000	N	NA
3742850	3742851	CLC_1416	CLC_1417			TRUE	0.965	106.000	1.000	NA	Y	NA
3742851	3742852	CLC_1417	CLC_1418			TRUE	0.991	2.000	0.600	NA		NA
3742852	3742853	CLC_1418	CLC_1419			TRUE	0.982	19.000	0.500	NA		NA
3742854	3742855	CLC_1420	CLC_1421			FALSE	0.002	558.000	0.000	NA		NA
3742855	3742856	CLC_1421	CLC_1422			TRUE	0.717	168.000	0.250	NA		NA
3742857	3742858	CLC_1423	CLC_1424	pepD-1		FALSE	0.382	58.000	0.000	1.000		NA
3742858	3742859	CLC_1424	CLC_1425			FALSE	0.161	135.000	0.000	NA		NA
3742859	3742860	CLC_1425	CLC_1426		pdxK	FALSE	0.005	398.000	0.000	NA		NA
3742862	3742863	CLC_1428	CLC_1429			TRUE	0.994	-13.000	0.500	1.000		NA
3742863	3742864	CLC_1429	CLC_1430			TRUE	0.791	173.000	0.500	NA		NA
3742864	3742865	CLC_1430	CLC_1431			FALSE	0.003	440.000	0.000	NA		NA
3742865	3742866	CLC_1431	CLC_1432			TRUE	0.998	2.000	1.000	1.000	Y	NA
3742866	3742867	CLC_1432	CLC_1433			TRUE	0.942	59.000	0.500	1.000	N	NA
3742867	3742868	CLC_1433	CLC_1434			TRUE	0.989	-10.000	0.222	1.000		NA
3742868	3742869	CLC_1434	CLC_1435			FALSE	0.240	69.000	0.000	NA		NA
3742869	3742870	CLC_1435	CLC_1436			FALSE	0.006	379.000	0.000	NA		NA
3742870	3742871	CLC_1436	CLC_1437			FALSE	0.006	384.000	0.000	NA		NA
3742871	3742872	CLC_1437	CLC_1438			TRUE	0.712	88.000	0.000	1.000	Y	NA
3742872	3742873	CLC_1438	CLC_1439			TRUE	0.993	19.000	0.400	1.000	Y	NA
3742873	3742874	CLC_1439	CLC_1440			FALSE	0.006	425.000	0.000	1.000		NA
3742878	3742879	CLC_1444	CLC_1445			FALSE	0.006	384.000	0.000	NA		NA
3742879	3742880	CLC_1445	CLC_1446			TRUE	0.791	173.000	0.500	NA		NA
3742882	3742883	CLC_1448	CLC_1449			TRUE	0.998	2.000	0.643	0.033	Y	NA
3742883	3742884	CLC_1449	CLC_1450			TRUE	0.633	131.000	0.041	NA		NA
3742884	3742885	CLC_1450	CLC_1451			FALSE	0.176	95.000	0.000	NA		NA
3742885	3742886	CLC_1451	CLC_1452			FALSE	0.005	388.000	0.000	NA		NA
3742886	3742887	CLC_1452	CLC_1453			TRUE	0.719	6.000	0.000	NA		NA
3742887	3742888	CLC_1453	CLC_1454			FALSE	0.163	132.000	0.000	NA		NA
3742888	3742889	CLC_1454	CLC_1455			FALSE	0.174	110.000	0.000	NA		NA
3742889	3742890	CLC_1455	CLC_1456			FALSE	0.126	162.000	0.000	NA		NA
3742890	3742891	CLC_1456	CLC_1457			FALSE	0.180	92.000	0.000	NA		NA
3742891	3742892	CLC_1457	CLC_1458			FALSE	0.024	276.000	0.000	NA		NA
3742892	3742893	CLC_1458	CLC_1459		uviB	FALSE	0.051	224.000	0.000	NA		NA
3742893	3742894	CLC_1459	CLC_1460	uviB		TRUE	0.994	-7.000	0.667	NA		NA
3742894	3742895	CLC_1460	CLC_1461			TRUE	0.778	0.000	0.000	NA		NA
3742895	3742896	CLC_1461	CLC_1462			FALSE	0.007	368.000	0.000	NA		NA
3742896	3742897	CLC_1462	CLC_1463			TRUE	0.992	2.000	0.750	NA		NA
3742897	3742898	CLC_1463	CLC_1464			FALSE	0.002	659.000	0.000	NA		NA
3742898	3742899	CLC_1464	CLC_1465			FALSE	0.006	384.000	0.000	NA		NA
3742899	3742900	CLC_1465	CLC_1466			FALSE	0.008	351.000	0.000	NA		NA
3742900	3742901	CLC_1466	CLC_1467			FALSE	0.072	203.000	0.000	NA		NA
3742901	3742902	CLC_1467	CLC_1468			FALSE	0.551	220.000	0.250	1.000		NA
3742902	3742903	CLC_1468	CLC_1469			FALSE	0.403	56.000	0.000	1.000		NA
3742903	3742904	CLC_1469	CLC_1470			FALSE	0.007	480.000	0.000	1.000	N	NA
3742904	3742905	CLC_1470	CLC_1471		spoVB-1	TRUE	0.943	32.000	0.137	1.000		NA
3742909	3742910	CLC_1475	CLC_1476			FALSE	0.020	361.000	0.000	1.000	N	NA
3742911	3742912	CLC_1477	CLC_1478		npr-1	FALSE	0.115	170.000	0.000	NA		NA
3742912	3742913	CLC_1478	CLC_1479	npr-1	npr-2	TRUE	0.974	137.000	1.000	0.005	Y	NA
3742913	3742914	CLC_1479	CLC_1480	npr-2	npr-3	TRUE	0.772	116.000	0.000	0.005	Y	NA
3742914	3742915	CLC_1480	CLC_1481	npr-3	npr-4	TRUE	0.976	120.000	1.000	0.005	Y	NA
3742915	3742916	CLC_1481	CLC_1482	npr-4	npr-5	TRUE	0.769	120.000	0.000	0.005	Y	NA
3742916	3742917	CLC_1482	CLC_1483	npr-5	npr-6	TRUE	0.939	34.000	0.000	0.005	Y	NA
3742917	3742918	CLC_1483	CLC_1484	npr-6	nadC	FALSE	0.005	603.000	0.000	1.000	N	NA
3742918	3742919	CLC_1484	CLC_1485	nadC	nadB	TRUE	0.994	-19.000	0.046	1.000	Y	NA
3742919	3742920	CLC_1485	CLC_1486	nadB	nadA	TRUE	0.989	3.000	0.042	1.000	Y	NA
3742922	3742923	CLC_1488	CLC_1489	hlyIII	ychF	TRUE	0.624	121.000	0.002	0.051		NA
3742924	3742925	CLC_1490	CLC_1491	mraZ	mraW	TRUE	0.902	80.000	0.635	NA		NA
3742925	3742926	CLC_1491	CLC_1492	mraW		TRUE	0.625	82.000	0.008	1.000		NA
3742926	3742927	CLC_1492	CLC_1493			TRUE	0.962	16.000	0.096	1.000		NA
3742927	3742928	CLC_1493	CLC_1494		murE	TRUE	0.747	230.000	0.265	1.000	Y	NA
3742928	3742929	CLC_1494	CLC_1495	murE	murF	TRUE	0.993	26.000	0.328	0.003	Y	NA
3742929	3742930	CLC_1495	CLC_1496	murF	mraY-2	TRUE	0.970	36.000	0.024	0.005	Y	NA
3742930	3742931	CLC_1496	CLC_1497	mraY-2		TRUE	0.793	79.000	0.014	0.005	N	NA
3742931	3742932	CLC_1497	CLC_1498			FALSE	0.101	319.000	0.015	NA	N	NA
3742932	3742933	CLC_1498	CLC_1499			TRUE	0.935	11.000	0.014	NA		NA
3742933	3742934	CLC_1499	CLC_1500		sbp	TRUE	0.901	34.000	0.053	NA		NA
3742934	3742935	CLC_1500	CLC_1501	sbp		TRUE	0.969	1.000	0.053	NA		NA
3742935	3742936	CLC_1501	CLC_1502			FALSE	0.594	93.000	0.017	NA		NA
3742936	3742937	CLC_1502	CLC_1503			TRUE	0.934	21.000	0.032	NA		NA
3742937	3742938	CLC_1503	CLC_1504			TRUE	0.973	17.000	0.246	NA		NA
3742938	3742939	CLC_1504	CLC_1505			TRUE	0.979	1.000	0.118	1.000		NA
3742939	3742940	CLC_1505	CLC_1506		divIVA	TRUE	0.986	16.000	0.579	1.000		NA
3742940	3742941	CLC_1506	CLC_1507	divIVA	aroB	FALSE	0.037	408.000	0.006	1.000	N	NA
3742941	3742942	CLC_1507	CLC_1508	aroB	mtnN	TRUE	0.964	1.000	0.003	1.000	N	NA
3742942	3742943	CLC_1508	CLC_1509	mtnN	aroF	TRUE	0.730	121.000	0.046	1.000	N	NA
3742943	3742944	CLC_1509	CLC_1510	aroF	aroA	TRUE	0.805	134.000	0.003	1.000	Y	NA
3742944	3742945	CLC_1510	CLC_1511	aroA		FALSE	0.144	217.000	0.000	1.000	N	NA
3742945	3742946	CLC_1511	CLC_1512		lspA	FALSE	0.060	404.000	0.050	1.000	N	NA
3742946	3742947	CLC_1512	CLC_1513	lspA		TRUE	0.977	4.000	0.082	1.000	N	NA
3742947	3742948	CLC_1513	CLC_1514		pyrR-1	FALSE	0.033	487.000	0.048	1.000	N	NA
3742948	3742949	CLC_1514	CLC_1515	pyrR-1		TRUE	0.965	44.000	0.140	1.000	Y	NA
3742949	3742950	CLC_1515	CLC_1516		xth	FALSE	0.005	590.000	0.000	1.000	N	NA
3742950	3742951	CLC_1516	CLC_1517	xth		FALSE	0.369	223.000	0.000	1.000	Y	NA
3742951	3742952	CLC_1517	CLC_1518			FALSE	0.067	231.000	0.000	1.000		NA
3742952	3742953	CLC_1518	CLC_1519		modA	FALSE	0.458	178.000	0.015	1.000		NA
3742953	3742954	CLC_1519	CLC_1520	modA	modB	TRUE	0.996	10.000	0.430	0.001	Y	NA
3742954	3742955	CLC_1520	CLC_1521	modB		FALSE	0.440	328.000	0.342	1.000	Y	NA
3742955	3742956	CLC_1521	CLC_1522			TRUE	0.755	54.000	0.013	NA		NA
3742956	3742957	CLC_1522	CLC_1523			FALSE	0.006	382.000	0.000	NA		NA
3742957	3742958	CLC_1523	CLC_1524			FALSE	0.017	300.000	0.000	NA		NA
3742958	3742959	CLC_1524	CLC_1525			FALSE	0.026	273.000	0.000	NA		NA
3742959	3742960	CLC_1525	CLC_1526			TRUE	0.871	88.000	0.308	1.000	N	NA
3742960	3742961	CLC_1526	CLC_1527			FALSE	0.218	142.000	0.000	1.000		NA
3742961	3742962	CLC_1527	CLC_1528			TRUE	0.761	90.000	0.147	NA		NA
3742962	3742963	CLC_1528	CLC_1529			TRUE	0.970	23.000	0.235	NA		NA
3742963	3742964	CLC_1529	CLC_1530		mtbC	TRUE	0.959	26.000	0.118	1.000		NA
3742964	3742965	CLC_1530	CLC_1531	mtbC		TRUE	0.774	85.000	0.118	1.000		NA
3742965	3742966	CLC_1531	CLC_1532			FALSE	0.020	946.000	0.000	0.002	Y	NA
3742966	3742967	CLC_1532	CLC_1533			TRUE	0.958	23.000	0.044	1.000	N	NA
3742967	3742968	CLC_1533	CLC_1534			TRUE	0.993	2.000	0.178	1.000	Y	NA
3742968	3742969	CLC_1534	CLC_1535			TRUE	0.932	144.000	0.444	NA	Y	NA
3742971	3742972	CLC_1537	CLC_1538		asnA	FALSE	0.030	329.000	0.000	1.000	N	NA
3742974	3742975	CLC_1540	CLC_1541			TRUE	0.977	27.000	0.024	1.000	Y	NA
3742975	3742976	CLC_1541	CLC_1542			FALSE	0.019	317.000	0.000	1.000		NA
3742978	3742979	CLC_1544	CLC_1545			TRUE	0.766	1.000	0.000	NA		NA
3742979	3742980	CLC_1545	CLC_1546			TRUE	0.687	12.000	0.000	NA		NA
3742980	3742981	CLC_1546	CLC_1547			FALSE	0.007	362.000	0.000	NA		NA
3742981	3742982	CLC_1547	CLC_1548			TRUE	0.949	13.000	0.041	NA		NA
3742982	3742983	CLC_1548	CLC_1549			TRUE	0.996	-7.000	0.611	0.032	N	NA
3742983	3742984	CLC_1549	CLC_1550			TRUE	0.985	36.000	0.278	0.032	Y	NA
3742984	3742985	CLC_1550	CLC_1551			TRUE	0.970	46.000	0.121	0.032	Y	NA
3742991	3742992	CLC_1557	CLC_1558			FALSE	0.174	108.000	0.000	NA		NA
3742992	3742993	CLC_1558	CLC_1559			FALSE	0.007	368.000	0.000	NA		NA
3742993	3742994	CLC_1559	CLC_1560			FALSE	0.170	206.000	0.000	1.000	N	NA
3742994	3742995	CLC_1560	CLC_1561			TRUE	0.944	27.000	0.087	NA		NA
3742997	3742998	CLC_1563	CLC_1564		ogt	TRUE	0.892	29.000	0.014	NA		NA
3742998	3742999	CLC_1564	CLC_1565	ogt		TRUE	0.917	27.000	0.014	1.000		NA
3742999	3743000	CLC_1565	CLC_1566			TRUE	0.732	165.000	0.263	NA		NA
3743000	3743001	CLC_1566	CLC_1567			TRUE	0.962	25.000	0.168	NA		NA
3743001	3743002	CLC_1567	CLC_1568			FALSE	0.008	390.000	0.000	1.000		NA
3743002	3743003	CLC_1568	CLC_1569			FALSE	0.431	53.000	0.000	1.000		NA
3743003	3743004	CLC_1569	CLC_1570			TRUE	0.625	57.000	0.000	0.003		NA
3743004	3743005	CLC_1570	CLC_1571			FALSE	0.011	486.000	0.000	0.097	N	NA
3743005	3743006	CLC_1571	CLC_1572			FALSE	0.010	436.000	0.000	1.000	N	NA
3743006	3743007	CLC_1572	CLC_1573			FALSE	0.174	98.000	0.000	NA		NA
3743007	3743008	CLC_1573	CLC_1574			FALSE	0.105	381.000	0.250	NA		NA
3743008	3743009	CLC_1574	CLC_1576			TRUE	0.618	26.000	0.000	NA		NA
3743013	3743014	CLC_1580	CLC_1581			FALSE	0.239	118.000	0.000	1.000		NA
3743015	3743016	CLC_1582	CLC_1583			TRUE	0.669	94.000	0.051	NA		NA
3743017	3743018	CLC_1584	CLC_1585		hgdC-1	TRUE	0.912	117.000	0.722	NA	N	NA
3743018	3743019	CLC_1585	CLC_1586	hgdC-1		TRUE	0.969	18.000	0.135	NA	N	NA
3743019	3743020	CLC_1586	CLC_1587			TRUE	0.991	2.000	0.405	1.000	N	NA
3743020	3743021	CLC_1587	CLC_1588		folE	TRUE	0.990	4.000	0.429	1.000	N	NA
3743021	3743022	CLC_1588	CLC_1589	folE		FALSE	0.435	184.000	0.015	1.000		NA
3743022	3743023	CLC_1589	CLC_1590			FALSE	0.567	115.000	0.005	1.000		NA
3743023	3743024	CLC_1590	CLC_1591			FALSE	0.108	175.000	0.000	NA		NA
3743024	3743025	CLC_1591	CLC_1592			FALSE	0.012	322.000	0.000	NA		NA
3743025	3743026	CLC_1592	CLC_1593			TRUE	0.939	22.000	0.040	NA		NA
3743026	3743027	CLC_1593	CLC_1594		deoC	FALSE	0.234	292.000	0.077	1.000	N	NA
3743027	3743028	CLC_1594	CLC_1595	deoC	rbsK	FALSE	0.093	344.000	0.026	1.000	N	NA
3743028	3743029	CLC_1595	CLC_1596	rbsK		FALSE	0.009	448.000	0.000	1.000	N	NA
3743029	3743030	CLC_1596	CLC_1597		hisG	TRUE	0.993	25.000	0.239	0.003	Y	NA
3743030	3743031	CLC_1597	CLC_1598	hisG	hisD	TRUE	0.957	78.000	0.254	0.003	Y	NA
3743031	3743032	CLC_1598	CLC_1599	hisD	hisB	TRUE	0.904	150.000	0.096	0.003	Y	NA
3743032	3743033	CLC_1599	CLC_1600	hisB	hisH	TRUE	0.923	128.000	0.125	0.003	Y	NA
3743033	3743034	CLC_1600	CLC_1601	hisH	hisA	TRUE	0.996	-3.000	0.124	0.003	Y	NA
3743034	3743035	CLC_1601	CLC_1602	hisA	hisC	TRUE	0.992	-3.000	0.004	0.003	Y	NA
3743035	3743036	CLC_1602	CLC_1603	hisC	hisF	TRUE	0.729	197.000	0.002	0.003	Y	NA
3743036	3743037	CLC_1603	CLC_1604	hisF	hislE	FALSE	0.140	153.000	0.000	NA		NA
3743037	3743038	CLC_1604	CLC_1605	hislE		FALSE	0.161	136.000	0.000	NA		NA
3743038	3743039	CLC_1605	CLC_1606			TRUE	0.974	14.000	0.231	NA		NA
3743039	3743040	CLC_1606	CLC_1607			TRUE	0.973	18.000	0.267	NA		NA
3743042	3743043	CLC_1609	CLC_1610			TRUE	0.748	81.000	0.070	1.000		NA
3743043	3743044	CLC_1610	CLC_1611			TRUE	0.627	153.000	0.047	1.000		NA
3743044	3743045	CLC_1611	CLC_1612			FALSE	0.022	307.000	0.000	1.000		NA
3743045	3743046	CLC_1612	CLC_1613			TRUE	0.962	3.000	0.041	NA		NA
3743046	3743047	CLC_1613	CLC_1614			TRUE	0.988	3.000	0.490	NA		NA
3743047	3743048	CLC_1614	CLC_1615			TRUE	0.829	117.000	0.352	NA		NA
3743048	3743049	CLC_1615	CLC_1616			TRUE	0.999	-9.000	0.741	0.018	Y	NA
3743049	3743050	CLC_1616	CLC_1617		arcA-2	FALSE	0.005	564.000	0.000	1.000	N	NA
3743050	3743051	CLC_1617	CLC_1618	arcA-2	arcD	TRUE	0.843	125.000	0.022	1.000	Y	NA
3743053	3743054	CLC_1620	CLC_1621			FALSE	0.007	371.000	0.000	NA		NA
3743054	3743055	CLC_1621	CLC_1622			FALSE	0.410	40.000	0.000	NA		NA
3743057	3743058	CLC_1624	CLC_1625			FALSE	0.524	190.000	0.067	1.000		NA
3743058	3743059	CLC_1625	CLC_1626			FALSE	0.006	419.000	0.000	1.000		NA
3743059	3743060	CLC_1626	CLC_1627			FALSE	0.054	247.000	0.000	1.000		NA
3743060	3743061	CLC_1627	CLC_1628			TRUE	0.807	149.000	0.222	1.000	N	NA
3743061	3743062	CLC_1628	CLC_1629			TRUE	0.998	2.000	0.900	0.006	Y	NA
3743062	3743063	CLC_1629	CLC_1630			FALSE	0.014	392.000	0.000	1.000	N	NA
3743063	3743064	CLC_1630	CLC_1631			FALSE	0.147	304.000	0.000	1.000	Y	NA
3743064	3743065	CLC_1631	CLC_1632			FALSE	0.291	247.000	0.000	1.000	Y	NA
3743065	3743066	CLC_1632	CLC_1633			TRUE	0.969	42.000	0.167	1.000	Y	NA
3743066	3743067	CLC_1633	CLC_1634			TRUE	0.732	4.000	0.000	NA		NA
3743067	3743068	CLC_1634	CLC_1635			FALSE	0.050	225.000	0.000	NA		NA
3743070	3743071	CLC_1637	CLC_1638			TRUE	0.842	158.000	0.600	NA		NA
3743072	3743073	CLC_1639	CLC_1640			TRUE	0.997	-22.000	0.261	1.000	Y	NA
3743074	3743075	CLC_1641	CLC_1642			FALSE	0.343	52.000	0.000	NA		NA
3743076	3743077	CLC_1643	CLC_1644			TRUE	0.976	9.000	0.171	1.000		NA
3743078	3743079	CLC_1645	CLC_1646			TRUE	0.833	190.000	1.000	NA		NA
3743081	3743082	CLC_1648	CLC_1649	metF		TRUE	0.669	173.000	0.045	0.002		NA
3743082	3743083	CLC_1649	CLC_1650			TRUE	0.989	-10.000	0.075	0.001		NA
3743085	3743086	CLC_1652	CLC_1653			TRUE	0.994	-7.000	0.667	NA		NA
3743086	3743087	CLC_1653	CLC_1654			FALSE	0.008	350.000	0.000	NA		NA
3743087	3743088	CLC_1654	CLC_1655			FALSE	0.116	169.000	0.000	NA		NA
3743088	3743089	CLC_1655	CLC_1656		acoA	TRUE	0.947	21.000	0.065	NA		NA
3743089	3743090	CLC_1656	CLC_1657	acoA	acoB	TRUE	0.993	3.000	0.076	0.001	Y	NA
3743090	3743091	CLC_1657	CLC_1658	acoB	acoX	TRUE	0.915	53.000	0.162	0.055		NA
3743091	3743092	CLC_1658	CLC_1659	acoX	acoC	TRUE	0.932	36.000	0.081	0.055		NA
3743092	3743093	CLC_1659	CLC_1660	acoC	acoL	TRUE	0.990	13.000	0.148	1.000	Y	NA
3743093	3743094	CLC_1660	CLC_1661	acoL		TRUE	0.962	25.000	0.074	1.000	N	NA
3743094	3743095	CLC_1661	CLC_1662			FALSE	0.027	339.000	0.000	1.000	N	NA
3743095	3743096	CLC_1662	CLC_1663			TRUE	0.997	-7.000	0.793	0.097	N	NA
3743096	3743097	CLC_1663	CLC_1664		thrC	FALSE	0.004	815.000	0.000	1.000	N	NA
3743097	3743098	CLC_1664	CLC_1665	thrC	thrB	TRUE	0.992	10.000	0.233	1.000	Y	NA
3743098	3743099	CLC_1665	CLC_1666	thrB		TRUE	0.821	127.000	0.008	1.000	Y	NA
3743099	3743100	CLC_1666	CLC_1667		hom-1	TRUE	0.655	223.000	0.010	0.002	Y	NA
3743100	3743101	CLC_1667	CLC_1668	hom-1		FALSE	0.005	587.000	0.000	1.000	N	NA
3743101	3743102	CLC_1668	CLC_1669			FALSE	0.006	509.000	0.000	1.000	N	NA
3743102	3743103	CLC_1669	CLC_1670			FALSE	0.106	329.000	0.000	1.000	Y	NA
3743103	3743104	CLC_1670	CLC_1671		gltA-1	TRUE	0.996	0.000	0.667	0.048	N	NA
3743104	3743105	CLC_1671	CLC_1672	gltA-1		FALSE	0.119	229.000	0.000	1.000	N	NA
3743105	3743106	CLC_1672	CLC_1673			TRUE	0.713	7.000	0.000	NA		NA
3743106	3743107	CLC_1673	CLC_1674			FALSE	0.004	423.000	0.000	NA		NA
3743107	3743108	CLC_1674	CLC_1675			FALSE	0.174	109.000	0.000	NA		NA
3743108	3743109	CLC_1675	CLC_1676			FALSE	0.100	180.000	0.000	NA		NA
3743109	3743110	CLC_1676	CLC_1677			FALSE	0.008	359.000	0.000	NA		NA
3743110	3743111	CLC_1677	CLC_1678			FALSE	0.020	288.000	0.000	NA		NA
3743111	3743112	CLC_1678	CLC_1679			FALSE	0.091	186.000	0.000	NA		NA
3743112	3743113	CLC_1679	CLC_1680			FALSE	0.003	468.000	0.000	NA		NA
3743113	3743114	CLC_1680	CLC_1681			FALSE	0.136	156.000	0.000	NA		NA
3743114	3743115	CLC_1681	CLC_1682			FALSE	0.429	38.000	0.000	NA		NA
3743115	3743116	CLC_1682	CLC_1683			FALSE	0.003	459.000	0.000	NA		NA
3743116	3743117	CLC_1683	CLC_1684			TRUE	0.961	33.000	0.379	NA		NA
3743117	3743118	CLC_1684	CLC_1685		alr-2	FALSE	0.003	438.000	0.000	NA		NA
3743118	3743119	CLC_1685	CLC_1686	alr-2		FALSE	0.011	421.000	0.000	1.000	N	NA
3743119	3743120	CLC_1686	CLC_1687			TRUE	0.704	88.000	0.016	0.096		NA
3743120	3743121	CLC_1687	CLC_1688			FALSE	0.040	240.000	0.000	NA		NA
3743123	3743124	CLC_1690	CLC_1691			FALSE	0.001	913.000	0.000	NA		NA
3743128	3743129	CLC_1695	CLC_1696			TRUE	0.684	137.000	0.027	1.000	N	NA
3743129	3743130	CLC_1696	CLC_1697			TRUE	0.996	14.000	0.667	0.032	Y	NA
3743130	3743131	CLC_1697	CLC_1698			TRUE	0.998	4.000	1.000	0.032	Y	NA
3743131	3743132	CLC_1698	CLC_1699			TRUE	0.962	31.000	0.265	1.000		NA
3743134	3743135	CLC_1701	CLC_1702			FALSE	0.026	272.000	0.000	NA		NA
3743137	3743138	CLC_1704	CLC_1705			FALSE	0.609	151.000	0.011	1.000	N	NA
3743138	3743139	CLC_1705	CLC_1706		fruK	FALSE	0.185	200.000	0.000	1.000	N	NA
3743141	3743142	CLC_1708	CLC_1709			TRUE	0.861	152.000	0.667	NA		NA
3743144	3743145	CLC_1711	CLC_1712			FALSE	0.442	37.000	0.000	NA		NA
3743146	3743147	CLC_1713	CLC_1714	safA		FALSE	0.005	402.000	0.000	NA		NA
3743148	3743149	CLC_1715	CLC_1716			FALSE	0.017	376.000	0.000	1.000	N	NA
3743151	3743152	CLC_1718	CLC_1719			FALSE	0.002	571.000	0.000	NA		NA
3743154	3743155	CLC_1721	CLC_1722			FALSE	0.018	323.000	0.000	1.000		NA
3743155	3743156	CLC_1722	CLC_1723		deaD	FALSE	0.421	179.000	0.006	1.000		NA
3743156	3743157	CLC_1723	CLC_1724	deaD		FALSE	0.544	154.000	0.025	NA		NA
3743157	3743158	CLC_1724	CLC_1725			FALSE	0.005	399.000	0.000	NA		NA
3743158	3743159	CLC_1725	CLC_1726			FALSE	0.007	406.000	0.000	1.000		NA
3743161	3743162	CLC_1728	CLC_1729			FALSE	0.273	61.000	0.000	NA		NA
3743162	3743163	CLC_1729	CLC_1730		cheX	TRUE	0.992	0.000	0.100	NA	Y	NA
3743165	3743166	CLC_1732	CLC_1733			FALSE	0.599	61.000	0.000	0.002		NA
3743171	3743172	CLC_1738	CLC_1739		hfq	TRUE	0.703	101.000	0.064	1.000		NA
3743172	3743173	CLC_1739	CLC_1740	hfq	miaA	TRUE	0.808	86.000	0.192	1.000		NA
3743173	3743174	CLC_1740	CLC_1741	miaA		TRUE	0.970	16.000	0.097	1.000	N	NA
3743174	3743175	CLC_1741	CLC_1742		mutS	FALSE	0.152	146.000	0.000	NA		NA
3743175	3743176	CLC_1742	CLC_1743	mutS	miaB	FALSE	0.205	80.000	0.000	NA		NA
3743177	3743178	CLC_1744	CLC_1745			TRUE	0.725	85.000	0.087	NA		NA
3743178	3743179	CLC_1745	CLC_1746		aspB-1	TRUE	0.730	55.000	0.008	NA		NA
3743180	3743181	CLC_1747	CLC_1748			TRUE	0.894	82.000	0.571	NA		NA
3743181	3743182	CLC_1748	CLC_1749			FALSE	0.036	248.000	0.000	NA		NA
3743182	3743183	CLC_1749	CLC_1750		cmk	TRUE	0.821	64.000	0.047	1.000	N	NA
3743183	3743184	CLC_1750	CLC_1751	cmk	aroH	TRUE	0.746	76.000	0.020	1.000	N	NA
3743184	3743185	CLC_1751	CLC_1752	aroH		TRUE	0.967	0.000	0.024	1.000		NA
3743185	3743186	CLC_1752	CLC_1753		gluD	FALSE	0.028	295.000	0.000	1.000		NA
3743186	3743187	CLC_1753	CLC_1754	gluD		FALSE	0.393	235.000	0.068	1.000	N	NA
3743187	3743188	CLC_1754	CLC_1755		rluB	FALSE	0.062	368.000	0.013	1.000	N	NA
3743188	3743189	CLC_1755	CLC_1756	rluB		FALSE	0.003	463.000	0.000	NA		NA
3743189	3743190	CLC_1756	CLC_1757			FALSE	0.174	98.000	0.000	NA		NA
3743190	3743191	CLC_1757	CLC_1758			FALSE	0.019	295.000	0.000	NA		NA
3743192	3743193	CLC_1759	CLC_1760			FALSE	0.010	373.000	0.000	1.000		NA
3743194	3743195	CLC_1761	CLC_1762			TRUE	0.966	2.000	0.034	1.000		NA
3743195	3743196	CLC_1762	CLC_1763			TRUE	0.746	115.000	0.111	1.000		NA
3743196	3743197	CLC_1763	CLC_1764			TRUE	0.707	131.000	0.111	NA		NA
3743199	3743200	CLC_1766	CLC_1767	pcaC-1		FALSE	0.222	138.000	0.000	1.000		NA
3743200	3743201	CLC_1767	CLC_1768			FALSE	0.093	185.000	0.000	NA		NA
3743201	3743202	CLC_1768	CLC_1769			FALSE	0.045	232.000	0.000	NA		NA
3743202	3743203	CLC_1769	CLC_1770			TRUE	0.974	-19.000	0.019	NA		NA
3743204	3743205	CLC_1771	CLC_1772			TRUE	0.985	3.000	0.200	0.048		NA
3743205	3743206	CLC_1772	CLC_1773			TRUE	0.982	-3.000	0.111	1.000		NA
3743206	3743207	CLC_1773	CLC_1774			TRUE	0.678	135.000	0.056	1.000		NA
3743208	3743209	CLC_1775	CLC_1776	hypE	hypD	TRUE	0.902	168.000	0.353	1.000	Y	NA
3743209	3743210	CLC_1776	CLC_1777	hypD		TRUE	0.996	-7.000	0.363	NA	Y	NA
3743210	3743211	CLC_1777	CLC_1778		hypF	TRUE	0.996	-37.000	0.181	NA	Y	NA
3743211	3743212	CLC_1778	CLC_1779	hypF		TRUE	0.972	-16.000	0.008	1.000		NA
3743212	3743213	CLC_1779	CLC_1780			FALSE	0.049	255.000	0.000	1.000		NA
3743213	3743214	CLC_1780	CLC_1781			FALSE	0.550	160.000	0.022	1.000		NA
3743214	3743215	CLC_1781	CLC_1782		hupL	TRUE	0.974	33.000	0.079	1.000	Y	NA
3743215	3743216	CLC_1782	CLC_1783	hupL	hupS	TRUE	0.973	102.000	0.778	0.001	Y	NA
3743219	3743220	CLC_1786	CLC_1787			FALSE	0.069	206.000	0.000	NA		NA
3743220	3743221	CLC_1787	CLC_1788			FALSE	0.001	891.000	0.000	NA		NA
3743222	3743223	CLC_1789	CLC_1790			FALSE	0.011	362.000	0.000	1.000		NA
3743223	3743224	CLC_1790	CLC_1791			TRUE	0.967	20.000	0.048	0.001		NA
3743224	3743225	CLC_1791	CLC_1792			TRUE	0.993	12.000	0.154	0.001	Y	NA
3743225	3743226	CLC_1792	CLC_1793			FALSE	0.008	476.000	0.000	1.000	N	NA
3743226	3743227	CLC_1793	CLC_1794			FALSE	0.067	259.000	0.000	NA	N	NA
3743230	3743231	CLC_1797	CLC_1798		ytfJ	FALSE	0.243	68.000	0.000	NA		NA
3743232	3743233	CLC_1799	CLC_1800	scpB	scpA	TRUE	0.993	-7.000	0.570	NA		NA
3743233	3743234	CLC_1800	CLC_1801	scpA		TRUE	0.970	-25.000	0.006	NA		NA
3743234	3743235	CLC_1801	CLC_1802		dacF	FALSE	0.316	213.000	0.021	NA		NA
3743235	3743236	CLC_1802	CLC_1803	dacF		FALSE	0.579	123.000	0.018	NA		NA
3743236	3743237	CLC_1803	CLC_1804			FALSE	0.132	159.000	0.000	NA		NA
3743237	3743238	CLC_1804	CLC_1805			FALSE	0.575	142.000	0.024	NA		NA
3743238	3743239	CLC_1805	CLC_1806		pdp	TRUE	0.675	107.000	0.061	NA		NA
3743239	3743240	CLC_1806	CLC_1807	pdp	punA	FALSE	0.186	286.000	0.000	1.000	Y	NA
3743240	3743241	CLC_1807	CLC_1808	punA	xerD	TRUE	0.861	38.000	0.004	1.000	N	NA
3743241	3743242	CLC_1808	CLC_1809	xerD		TRUE	0.732	52.000	0.004	NA		NA
3743242	3743243	CLC_1809	CLC_1810			TRUE	0.975	-9.000	0.034	NA		NA
3743243	3743244	CLC_1810	CLC_1811			FALSE	0.385	205.000	0.033	NA		NA
3743244	3743245	CLC_1811	CLC_1812			FALSE	0.007	484.000	0.000	1.000	N	NA
3743245	3743246	CLC_1812	CLC_1813			FALSE	0.003	551.000	0.000	1.000		NA
3743246	3743247	CLC_1813	CLC_1814			FALSE	0.001	1485.000	0.000	NA		NA
3743247	3743248	CLC_1814	CLC_1815			FALSE	0.161	136.000	0.000	NA		NA
3743248	3743249	CLC_1815	CLC_1816		spo0A	FALSE	0.155	287.000	0.027	1.000		NA
3743249	3743250	CLC_1816	CLC_1817	spo0A	spoIVB	FALSE	0.091	430.000	0.393	1.000		NA
3743250	3743251	CLC_1817	CLC_1818	spoIVB	metA	FALSE	0.006	422.000	0.000	1.000		NA
3743251	3743252	CLC_1818	CLC_1819	metA	hom-2	TRUE	0.972	27.000	0.005	1.000	Y	NA
3743252	3743253	CLC_1819	CLC_1820	hom-2		TRUE	0.947	40.000	0.017	1.000	Y	NA
3743253	3743254	CLC_1820	CLC_1821		recN	FALSE	0.046	299.000	0.000	1.000	N	NA
3743254	3743255	CLC_1821	CLC_1822	recN	argR	TRUE	0.971	13.000	0.086	1.000	N	NA
3743255	3743256	CLC_1822	CLC_1823	argR	ppnK	TRUE	0.982	2.000	0.117	1.000	N	NA
3743256	3743257	CLC_1823	CLC_1824	ppnK		TRUE	0.985	0.000	0.120	1.000	N	NA
3743257	3743258	CLC_1824	CLC_1825		dxs	TRUE	0.975	22.000	0.189	1.000	N	NA
3743258	3743259	CLC_1825	CLC_1826	dxs		TRUE	0.965	1.000	0.037	NA		NA
3743259	3743260	CLC_1826	CLC_1827		ispA	FALSE	0.001	801.000	0.000	NA		NA
3743260	3743261	CLC_1827	CLC_1828	ispA	xseB	TRUE	0.733	125.000	0.053	1.000	N	NA
3743261	3743262	CLC_1828	CLC_1829	xseB	xseA	TRUE	0.958	123.000	0.412	0.001	Y	NA
3743262	3743263	CLC_1829	CLC_1830	xseA	nusB	TRUE	0.800	71.000	0.043	1.000	N	NA
3743263	3743264	CLC_1830	CLC_1831	nusB	asp	TRUE	0.772	139.000	0.223	NA		NA
3743264	3743265	CLC_1831	CLC_1832	asp		TRUE	0.754	82.000	0.108	NA		NA
3743265	3743266	CLC_1832	CLC_1833			TRUE	0.906	62.000	0.407	NA		NA
3743266	3743267	CLC_1833	CLC_1834		spoIIIAF	TRUE	0.903	138.000	0.907	NA		NA
3743267	3743268	CLC_1834	CLC_1835	spoIIIAF		TRUE	0.977	36.000	0.918	NA		NA
3743268	3743269	CLC_1835	CLC_1836			TRUE	0.991	9.000	0.864	NA		NA
3743269	3743270	CLC_1836	CLC_1837			TRUE	0.987	27.000	0.895	NA		NA
3743270	3743271	CLC_1837	CLC_1838			TRUE	0.969	43.000	0.926	NA		NA
3743271	3743272	CLC_1838	CLC_1839			TRUE	0.965	37.000	0.604	NA		NA
3743272	3743273	CLC_1839	CLC_1840			FALSE	0.532	195.000	0.112	NA		NA
3743273	3743274	CLC_1840	CLC_1841		efp	TRUE	0.851	41.000	0.037	NA		NA
3743274	3743275	CLC_1841	CLC_1842	efp	aroQ	TRUE	0.678	89.000	0.010	1.000	N	NA
3743275	3743276	CLC_1842	CLC_1843	aroQ	aroK	TRUE	0.801	155.000	0.015	1.000	Y	NA
3743276	3743277	CLC_1843	CLC_1844	aroK		FALSE	0.572	134.000	0.020	NA		NA
3743277	3743278	CLC_1844	CLC_1845			TRUE	0.993	6.000	1.000	NA		NA
3743278	3743279	CLC_1845	CLC_1846			TRUE	0.977	16.000	0.333	NA		NA
3743279	3743280	CLC_1846	CLC_1847			TRUE	0.977	28.000	0.500	NA		NA
3743280	3743281	CLC_1847	CLC_1848			TRUE	0.994	-21.000	0.500	NA		NA
3743281	3743282	CLC_1848	CLC_1849			TRUE	0.992	-3.000	0.500	NA		NA
3743282	3743283	CLC_1849	CLC_1850			TRUE	0.995	-19.000	0.667	NA		NA
3743283	3743284	CLC_1850	CLC_1851			FALSE	0.084	402.000	0.250	NA		NA
3743284	3743285	CLC_1851	CLC_1852			TRUE	0.788	186.000	0.109	NA	Y	NA
3743285	3743286	CLC_1852	CLC_1853			TRUE	0.890	145.000	0.135	1.000	Y	NA
3743286	3743287	CLC_1853	CLC_1854			FALSE	0.148	149.000	0.000	NA		NA
3743287	3743288	CLC_1854	CLC_1855			FALSE	0.175	96.000	0.000	NA		NA
3743288	3743289	CLC_1855	CLC_1856		dapF	TRUE	0.766	1.000	0.000	NA		NA
3743290	3743291	CLC_1857	CLC_1858		truA-1	TRUE	0.699	69.000	0.005	NA	N	NA
3743292	3743293	CLC_1859	CLC_1860			FALSE	0.459	36.000	0.000	NA		NA
3743295	3743296	CLC_1862	CLC_1863			FALSE	0.002	505.000	0.000	NA		NA
3743296	3743297	CLC_1863	CLC_1864		cloSI	FALSE	0.004	470.000	0.000	1.000		NA
3743298	3743299	CLC_1865	CLC_1866			TRUE	0.986	2.000	0.333	NA		NA
3743299	3743300	CLC_1866	CLC_1867			TRUE	0.998	-10.000	0.857	1.000	Y	NA
3743303	3743304	CLC_1870	CLC_1871			TRUE	0.997	-3.000	0.500	1.000	Y	NA
3743304	3743305	CLC_1871	CLC_1872			FALSE	0.282	283.000	0.222	NA		NA
3743305	3743306	CLC_1872	CLC_1873			TRUE	0.795	189.000	0.714	NA		NA
3743306	3743307	CLC_1873	CLC_1874			TRUE	0.992	0.000	0.625	NA		NA
3743309	3743310	CLC_1876	CLC_1877			TRUE	0.999	-3.000	0.933	0.006	Y	NA
3743312	3743313	CLC_1879	CLC_1880	moeB	moaD	TRUE	0.991	2.000	0.571	1.000		NA
3743313	3743314	CLC_1880	CLC_1881	moaD	aor	FALSE	0.602	153.000	0.033	1.000		NA
3743314	3743315	CLC_1881	CLC_1882	aor	aorR	FALSE	0.012	409.000	0.000	1.000	N	NA
3743315	3743316	CLC_1882	CLC_1883	aorR		TRUE	0.948	50.000	0.500	1.000		NA
3743316	3743317	CLC_1883	CLC_1884		moaC	TRUE	0.951	2.000	0.006	1.000		NA
3743317	3743318	CLC_1884	CLC_1885	moaC	moaA	TRUE	0.993	4.000	0.071	0.002	Y	NA
3743318	3743319	CLC_1885	CLC_1886	moaA		TRUE	0.951	59.000	0.053	0.002	Y	NA
3743319	3743320	CLC_1886	CLC_1887		moeA	TRUE	0.996	12.000	0.481	0.002	Y	NA
3743320	3743321	CLC_1887	CLC_1888	moeA	mog	TRUE	0.985	24.000	0.017	0.002	Y	NA
3743321	3743322	CLC_1888	CLC_1889	mog	tupC	TRUE	0.644	95.000	0.006	1.000	N	NA
3743322	3743323	CLC_1889	CLC_1890	tupC	tupB	TRUE	0.992	-3.000	0.389	1.000	N	NA
3743323	3743324	CLC_1890	CLC_1891	tupB		TRUE	0.996	9.000	0.524	0.031	Y	NA
3743324	3743325	CLC_1891	CLC_1892			FALSE	0.140	219.000	0.000	1.000	N	NA
3743325	3743326	CLC_1892	CLC_1893			TRUE	0.973	0.000	0.071	NA		NA
3743326	3743327	CLC_1893	CLC_1894			FALSE	0.039	241.000	0.000	NA		NA
3743327	3743328	CLC_1894	CLC_1895			FALSE	0.012	322.000	0.000	NA		NA
3743328	3743329	CLC_1895	CLC_1896			TRUE	0.988	15.000	0.667	1.000		NA
3743331	3743332	CLC_1898	CLC_1899			TRUE	0.999	-3.000	0.846	0.006	Y	NA
3743333	3743334	CLC_1900	CLC_1901			FALSE	0.004	419.000	0.000	NA		NA
3743334	3743335	CLC_1901	CLC_1902			FALSE	0.001	1294.000	0.000	NA		NA
3743335	3743336	CLC_1902	CLC_1903			TRUE	0.724	22.000	0.000	1.000		NA
3743337	3743338	CLC_1904	CLC_1905			FALSE	0.016	363.000	0.000	NA	N	NA
3743338	3743339	CLC_1905	CLC_1906			TRUE	0.955	13.000	0.028	NA	N	NA
3743339	3743340	CLC_1906	CLC_1907			FALSE	0.585	42.000	0.000	NA	N	NA
3743340	3743341	CLC_1907	CLC_1908			TRUE	0.990	22.000	0.800	1.000	N	NA
3743342	3743343	CLC_1909	CLC_1910			FALSE	0.459	36.000	0.000	NA		NA
3743343	3743344	CLC_1910	CLC_1911			FALSE	0.003	459.000	0.000	NA		NA
3743344	3743345	CLC_1911	CLC_1912			FALSE	0.177	94.000	0.000	NA		NA
3743346	3743347	CLC_1913	CLC_1914			TRUE	0.999	-10.000	0.750	0.018	Y	NA
3743347	3743348	CLC_1914	CLC_1915			FALSE	0.128	161.000	0.000	NA		NA
3743348	3743349	CLC_1915	CLC_1916			FALSE	0.060	214.000	0.000	NA		NA
3743349	3743350	CLC_1916	CLC_1917			TRUE	0.941	26.000	0.061	NA		NA
3743350	3743351	CLC_1917	CLC_1918			TRUE	0.950	45.000	0.469	1.000		NA
3743351	3743352	CLC_1918	CLC_1919			TRUE	0.972	3.000	0.103	NA		NA
3743352	3743353	CLC_1919	CLC_1920			TRUE	0.737	161.000	0.250	NA		NA
3743354	3743355	CLC_1921	CLC_1922			FALSE	0.471	83.000	0.000	0.006		NA
3743355	3743356	CLC_1922	CLC_1923			TRUE	0.996	-10.000	0.500	0.006		NA
3743356	3743357	CLC_1923	CLC_1924			TRUE	0.995	-10.000	0.400	0.006		NA
3743357	3743358	CLC_1924	CLC_1925			TRUE	0.963	42.000	0.400	0.006		NA
3743360	3743361	CLC_1927	CLC_1928	pcaC-2		TRUE	0.971	13.000	0.144	1.000		NA
3743361	3743362	CLC_1928	CLC_1929			FALSE	0.140	181.000	0.000	1.000		NA
3743363	3743364	CLC_1930	CLC_1931		hsp90	FALSE	0.005	598.000	0.000	1.000	N	NA
3743365	3743366	CLC_1932	CLC_1933		treP	FALSE	0.007	482.000	0.000	1.000	N	NA
3743366	3743367	CLC_1933	CLC_1934	treP	treC	TRUE	0.963	82.000	0.650	1.000	Y	NA
3743367	3743368	CLC_1934	CLC_1935	treC	treR	TRUE	0.969	33.000	0.336	1.000	N	NA
3743369	3743370	CLC_1936	CLC_1937			FALSE	0.479	273.000	0.015	0.008	Y	NA
3743370	3743371	CLC_1937	CLC_1938			TRUE	0.994	1.000	0.217	1.000	Y	NA
3743371	3743372	CLC_1938	CLC_1939			TRUE	0.993	20.000	0.400	1.000	Y	NA
3743372	3743373	CLC_1939	CLC_1940			TRUE	0.666	200.000	0.222	1.000	N	NA
3743373	3743374	CLC_1940	CLC_1941			FALSE	0.195	84.000	0.000	NA		NA
3743376	3743377	CLC_1943	CLC_1944			FALSE	0.030	264.000	0.000	NA		NA
3743379	3743380	CLC_1946	CLC_1947			FALSE	0.163	131.000	0.000	NA		NA
3743380	3743381	CLC_1947	CLC_1948			TRUE	0.806	-6.000	0.000	NA		NA
3743381	3743382	CLC_1948	CLC_1949			FALSE	0.254	65.000	0.000	NA		NA
3743382	3743383	CLC_1949	CLC_1950			FALSE	0.008	357.000	0.000	NA		NA
3743385	3743386	CLC_1952	CLC_1953			TRUE	0.977	16.000	0.273	1.000		NA
3743386	3743387	CLC_1953	CLC_1954			FALSE	0.005	443.000	0.000	1.000		NA
3743387	3743388	CLC_1954	CLC_1955			FALSE	0.043	234.000	0.000	NA		NA
3743388	3743389	CLC_1955	CLC_1956			FALSE	0.032	260.000	0.000	NA		NA
3743390	3743391	CLC_1957	CLC_1958			FALSE	0.012	320.000	0.000	NA		NA
3743394	3743395	CLC_1961	CLC_1962	aspB-2		TRUE	0.985	20.000	0.088	1.000	Y	NA
3743395	3743396	CLC_1962	CLC_1963			TRUE	0.837	-13.000	0.000	NA		NA
3743396	3743397	CLC_1963	CLC_1964			FALSE	0.191	86.000	0.000	NA		NA
3743397	3743398	CLC_1964	CLC_1965			FALSE	0.007	365.000	0.000	NA		NA
3743398	3743399	CLC_1965	CLC_1966		cat-2	FALSE	0.366	113.000	0.000	1.000	N	NA
3743399	3743400	CLC_1966	CLC_1967	cat-2		FALSE	0.002	495.000	0.000	NA		NA
3743400	3743401	CLC_1967	CLC_1968			FALSE	0.173	100.000	0.000	NA		NA
3743401	3743402	CLC_1968	CLC_1969			TRUE	0.632	24.000	0.000	NA		NA
3743402	3743403	CLC_1969	CLC_1970			FALSE	0.160	138.000	0.000	NA		NA
3743403	3743404	CLC_1970	CLC_1971			FALSE	0.226	74.000	0.000	NA		NA
3743404	3743405	CLC_1971	CLC_1972			FALSE	0.050	225.000	0.000	NA		NA
3743405	3743406	CLC_1972	CLC_1973			FALSE	0.096	183.000	0.000	NA		NA
3743406	3743407	CLC_1973	CLC_1974			FALSE	0.184	90.000	0.000	NA		NA
3743407	3743408	CLC_1974	CLC_1975			FALSE	0.194	311.000	0.000	0.002	Y	NA
3743409	3743410	CLC_1976	CLC_1977	pepQ	pepIP	TRUE	0.790	82.000	0.054	0.032		NA
3743411	3743412	CLC_1978	CLC_1979			TRUE	0.929	17.000	0.019	NA		NA
3743412	3743413	CLC_1979	CLC_1980			FALSE	0.007	409.000	0.000	1.000		NA
3743414	3743415	CLC_1981	CLC_1982			TRUE	0.637	20.000	0.000	NA		NA
3743416	3743417	CLC_1983	CLC_1984			FALSE	0.044	233.000	0.000	NA		NA
3743417	3743418	CLC_1984	CLC_1985			FALSE	0.003	473.000	0.000	NA		NA
3743418	3743419	CLC_1985	CLC_1986			FALSE	0.173	105.000	0.000	NA		NA
3743419	3743420	CLC_1986	CLC_1987			TRUE	0.986	15.000	0.600	NA		NA
3743420	3743421	CLC_1987	CLC_1988			TRUE	0.993	-3.000	0.600	NA		NA
3743421	3743422	CLC_1988	CLC_1989			TRUE	0.860	122.000	0.500	NA		NA
3743422	3743423	CLC_1989	CLC_1990			FALSE	0.244	304.000	0.231	1.000		NA
3743423	3743424	CLC_1990	CLC_1991			FALSE	0.106	176.000	0.000	NA		NA
3743424	3743425	CLC_1991	CLC_1992			FALSE	0.069	206.000	0.000	NA		NA
3743425	3743426	CLC_1992	CLC_1993			FALSE	0.157	142.000	0.000	NA		NA
3743428	3743429	CLC_1995	CLC_1996			TRUE	0.826	44.000	0.027	NA		NA
3743429	3743430	CLC_1996	CLC_1997			TRUE	0.657	92.000	0.027	1.000		NA
3743430	3743431	CLC_1997	CLC_1998			FALSE	0.371	46.000	0.000	NA		NA
3743432	3743433	CLC_1999	CLC_2000		rfbB	TRUE	0.961	42.000	0.087	1.000	Y	NA
3743433	3743434	CLC_2000	CLC_2001	rfbB		FALSE	0.024	277.000	0.000	NA		NA
3743434	3743435	CLC_2001	CLC_2002			FALSE	0.035	251.000	0.000	NA		NA
3743436	3743437	CLC_2003	CLC_2004			FALSE	0.011	331.000	0.000	NA		NA
3743437	3743438	CLC_2004	CLC_2005			TRUE	0.814	-7.000	0.000	NA		NA
3743438	3743439	CLC_2005	CLC_2006			FALSE	0.001	851.000	0.000	NA		NA
3743439	3743440	CLC_2006	CLC_2007			FALSE	0.035	250.000	0.000	NA		NA
3743440	3743441	CLC_2007	CLC_2008			FALSE	0.027	268.000	0.000	NA		NA
3743441	3743442	CLC_2008	CLC_2009			TRUE	0.993	-6.000	0.600	NA		NA
3743442	3743443	CLC_2009	CLC_2010			TRUE	0.989	0.000	0.250	1.000	N	NA
3743443	3743444	CLC_2010	CLC_2011			FALSE	0.004	628.000	0.000	1.000	N	NA
3743444	3743445	CLC_2011	CLC_2012			TRUE	0.990	-7.000	0.312	NA		NA
3743445	3743446	CLC_2012	CLC_2013			FALSE	0.036	249.000	0.000	NA		NA
3743446	3743447	CLC_2013	CLC_2014			FALSE	0.173	119.000	0.000	NA		NA
3743447	3743448	CLC_2014	CLC_2015		codA	TRUE	0.636	23.000	0.000	NA		NA
3743448	3743449	CLC_2015	CLC_2016	codA		TRUE	0.973	44.000	0.250	1.000	Y	NA
3743449	3743450	CLC_2016	CLC_2017			FALSE	0.009	345.000	0.000	NA		NA
3743450	3743451	CLC_2017	CLC_2018			FALSE	0.479	167.000	0.018	NA		NA
3743451	3743452	CLC_2018	CLC_2019			TRUE	0.670	14.000	0.000	NA		NA
3743452	3743453	CLC_2019	CLC_2020			FALSE	0.001	765.000	0.000	NA		NA
3743453	3743454	CLC_2020	CLC_2021			TRUE	0.989	14.000	0.750	1.000		NA
3743454	3743455	CLC_2021	CLC_2022			TRUE	0.995	-3.000	0.917	NA		NA
3743457	3743458	CLC_2024	CLC_2025			FALSE	0.003	490.000	0.000	NA		NA
3743458	3743459	CLC_2025	CLC_2026			FALSE	0.025	274.000	0.000	NA		NA
3743461	3743462	CLC_2028	CLC_2029			FALSE	0.292	58.000	0.000	NA		NA
3743462	3743463	CLC_2029	CLC_2030			FALSE	0.005	399.000	0.000	NA		NA
3743463	3743464	CLC_2030	CLC_2031			FALSE	0.019	295.000	0.000	NA		NA
3743464	3743465	CLC_2031	CLC_2032			TRUE	0.995	-7.000	0.140	1.000	Y	NA
3743465	3743466	CLC_2032	CLC_2033			FALSE	0.005	406.000	0.000	NA		NA
3743466	3743467	CLC_2033	CLC_2034			FALSE	0.257	64.000	0.000	NA		NA
3743467	3743468	CLC_2034	CLC_2035			FALSE	0.033	256.000	0.000	NA		NA
3743468	3743469	CLC_2035	CLC_2036			FALSE	0.036	248.000	0.000	NA		NA
3743469	3743470	CLC_2036	CLC_2037			TRUE	0.646	18.000	0.000	NA		NA
3743470	3743471	CLC_2037	CLC_2038			FALSE	0.013	316.000	0.000	NA		NA
3743471	3743472	CLC_2038	CLC_2039			FALSE	0.237	70.000	0.000	NA		NA
3743472	3743473	CLC_2039	CLC_2040			FALSE	0.011	329.000	0.000	NA		NA
3743473	3743474	CLC_2040	CLC_2041			FALSE	0.455	49.000	0.000	1.000		NA
3743474	3743475	CLC_2041	CLC_2042			FALSE	0.170	121.000	0.000	NA		NA
3743475	3743476	CLC_2042	CLC_2043			FALSE	0.093	185.000	0.000	NA		NA
3743477	3743478	CLC_2044	CLC_2045			TRUE	0.942	24.000	0.000	NA	Y	NA
3743479	3743480	CLC_2046	CLC_2047			FALSE	0.003	530.000	0.000	1.000		NA
3743480	3743481	CLC_2047	CLC_2048			FALSE	0.002	548.000	0.000	NA		NA
3743481	3743482	CLC_2048	CLC_2049			TRUE	0.959	74.000	0.500	NA	Y	NA
3743482	3743483	CLC_2049	CLC_2050		eutE	TRUE	0.995	0.000	0.769	1.000	N	NA
3743483	3743484	CLC_2050	CLC_2051	eutE		TRUE	0.989	35.000	0.692	NA	Y	NA
3743484	3743485	CLC_2051	CLC_2052			TRUE	0.989	21.000	0.750	NA	N	NA
3743485	3743486	CLC_2052	CLC_2053			TRUE	0.680	199.000	0.273	NA	N	NA
3743486	3743487	CLC_2053	CLC_2054			TRUE	0.990	-3.000	0.389	NA		NA
3743487	3743488	CLC_2054	CLC_2055			TRUE	0.881	78.000	0.444	NA		NA
3743488	3743489	CLC_2055	CLC_2056			TRUE	0.998	-18.000	0.615	NA	Y	NA
3743489	3743490	CLC_2056	CLC_2057			TRUE	0.992	7.000	0.222	NA	Y	NA
3743490	3743491	CLC_2057	CLC_2058			TRUE	0.994	-3.000	0.118	1.000	Y	NA
3743491	3743492	CLC_2058	CLC_2059			TRUE	0.958	40.000	0.375	1.000	N	NA
3743492	3743493	CLC_2059	CLC_2060			TRUE	0.922	164.000	0.815	0.002	N	NA
3743493	3743494	CLC_2060	CLC_2061			TRUE	0.975	50.000	0.370	1.000	Y	NA
3743494	3743495	CLC_2061	CLC_2062			TRUE	0.958	38.000	0.500	NA		NA
3743495	3743496	CLC_2062	CLC_2063			TRUE	0.983	24.000	0.571	NA		NA
3743496	3743497	CLC_2063	CLC_2064			FALSE	0.230	73.000	0.000	NA		NA
3743497	3743498	CLC_2064	CLC_2065			FALSE	0.207	79.000	0.000	NA		NA
3743498	3743499	CLC_2065	CLC_2066			TRUE	0.996	-13.000	0.810	NA		NA
3743499	3743500	CLC_2066	CLC_2067			FALSE	0.004	486.000	0.000	1.000		NA
3743500	3743501	CLC_2067	CLC_2068			TRUE	0.774	117.000	0.094	1.000	N	NA
3743502	3743503	CLC_2069	CLC_2070			FALSE	0.330	146.000	0.000	1.000	N	NA
3743504	3743505	CLC_2071	CLC_2072			FALSE	0.587	28.000	0.000	NA		NA
3743505	3743506	CLC_2072	CLC_2073			TRUE	0.840	-15.000	0.000	NA		NA
3743506	3743507	CLC_2073	CLC_2074			FALSE	0.001	805.000	0.000	NA		NA
3743507	3743508	CLC_2074	CLC_2075			TRUE	0.952	13.000	0.053	NA		NA
3743508	3743509	CLC_2075	CLC_2076			FALSE	0.022	282.000	0.000	NA		NA
3743509	3743510	CLC_2076	CLC_2077			TRUE	0.857	-31.000	0.000	NA		NA
3743510	3743511	CLC_2077	CLC_2078			FALSE	0.019	317.000	0.000	1.000		NA
3743511	3743512	CLC_2078	CLC_2079			TRUE	0.998	-3.000	0.700	1.000	Y	NA
3743512	3743513	CLC_2079	CLC_2080			TRUE	0.647	198.000	0.300	NA		NA
3743513	3743514	CLC_2080	CLC_2081			TRUE	0.993	-7.000	0.500	NA		NA
3743514	3743515	CLC_2081	CLC_2082			TRUE	0.910	72.000	0.500	1.000		NA
3743515	3743516	CLC_2082	CLC_2083			FALSE	0.367	60.000	0.000	1.000		NA
3743516	3743517	CLC_2083	CLC_2084			FALSE	0.022	308.000	0.000	1.000		NA
3743517	3743518	CLC_2084	CLC_2085			TRUE	0.993	-7.000	0.400	1.000	N	NA
3743518	3743519	CLC_2085	CLC_2086			TRUE	0.978	17.000	0.375	NA		NA
3743519	3743520	CLC_2086	CLC_2087			FALSE	0.003	452.000	0.000	NA		NA
3743520	3743521	CLC_2087	CLC_2088			TRUE	0.825	67.000	0.091	NA	N	NA
3743521	3743522	CLC_2088	CLC_2089			TRUE	0.840	84.000	0.222	NA	N	NA
3743522	3743523	CLC_2089	CLC_2090			FALSE	0.003	566.000	0.000	1.000		NA
3743523	3743524	CLC_2090	CLC_2091			TRUE	0.993	-10.000	0.429	1.000		NA
3743524	3743525	CLC_2091	CLC_2092			FALSE	0.001	786.000	0.000	NA		NA
3743525	3743526	CLC_2092	CLC_2093			FALSE	0.012	326.000	0.000	NA		NA
3743526	3743527	CLC_2093	CLC_2094			FALSE	0.189	212.000	0.000	0.011		NA
3743527	3743528	CLC_2094	CLC_2095			TRUE	0.984	13.000	0.241	0.011		NA
3743528	3743529	CLC_2095	CLC_2096			TRUE	0.987	29.000	0.119	0.008	Y	NA
3743529	3743530	CLC_2096	CLC_2097			TRUE	0.984	24.000	0.081	1.000	Y	NA
3743530	3743531	CLC_2097	CLC_2098			FALSE	0.042	235.000	0.000	NA		NA
3743531	3743532	CLC_2098	CLC_2099			FALSE	0.010	338.000	0.000	NA		NA
3743532	3743533	CLC_2099	CLC_2100			FALSE	0.010	340.000	0.000	NA		NA
3743535	3743536	CLC_2102	CLC_2103			TRUE	0.661	133.000	0.065	NA		NA
3743537	3743538	CLC_2104	CLC_2105			FALSE	0.226	74.000	0.000	NA		NA
3743539	3743540	CLC_2106	CLC_2107			TRUE	0.980	7.000	0.222	1.000		NA
3743542	3743543	CLC_2109	CLC_2110	enr		TRUE	0.701	97.000	0.059	1.000		NA
3743543	3743544	CLC_2110	CLC_2111			TRUE	0.967	48.000	1.000	NA		NA
3743544	3743545	CLC_2111	CLC_2112			FALSE	0.086	192.000	0.000	NA		NA
3743545	3743546	CLC_2112	CLC_2113			TRUE	0.687	12.000	0.000	NA		NA
3743546	3743547	CLC_2113	CLC_2114			TRUE	0.963	12.000	0.103	NA		NA
3743547	3743548	CLC_2114	CLC_2115		cmr4	TRUE	0.935	28.000	0.064	NA		NA
3743548	3743549	CLC_2115	CLC_2116	cmr4	cmr3	TRUE	0.986	12.000	0.556	NA		NA
3743549	3743550	CLC_2116	CLC_2117	cmr3	crm2	TRUE	0.971	17.000	0.222	NA		NA
3743550	3743551	CLC_2117	CLC_2118	crm2		TRUE	0.987	1.000	0.375	NA		NA
3743551	3743552	CLC_2118	CLC_2119			TRUE	0.976	13.000	0.250	NA		NA
3743552	3743553	CLC_2119	CLC_2120			FALSE	0.343	52.000	0.000	NA		NA
3743553	3743554	CLC_2120	CLC_2121		cas6	TRUE	0.637	20.000	0.000	NA		NA
3743554	3743555	CLC_2121	CLC_2122	cas6		FALSE	0.001	1739.000	0.000	NA		NA
3743555	3743556	CLC_2122	CLC_2123			FALSE	0.204	81.000	0.000	NA		NA
3743556	3743557	CLC_2123	CLC_2124			FALSE	0.001	773.000	0.000	NA		NA
3743557	3743558	CLC_2124	CLC_2125			FALSE	0.005	398.000	0.000	NA		NA
3743559	3743560	CLC_2126	CLC_2127			FALSE	0.001	925.000	0.000	NA		NA
3743561	3743562	CLC_2128	CLC_2129			FALSE	0.615	168.000	0.033	1.000	N	NA
3743564	3743565	CLC_2131	CLC_2132			TRUE	0.707	209.000	0.064	1.000	Y	NA
3743566	3743567	CLC_2133	CLC_2134			FALSE	0.010	341.000	0.000	NA		NA
3743568	3743569	CLC_2135	CLC_2136	hgdC-2		TRUE	0.859	77.000	0.333	NA		NA
3743569	3743570	CLC_2136	CLC_2137			FALSE	0.017	301.000	0.000	NA		NA
3743570	3743571	CLC_2137	CLC_2138			TRUE	0.996	19.000	0.750	0.019	Y	NA
3743571	3743572	CLC_2138	CLC_2139			TRUE	0.981	39.000	0.750	0.043	N	NA
3743572	3743573	CLC_2139	CLC_2140			FALSE	0.060	265.000	0.000	NA	N	NA
3743573	3743574	CLC_2140	CLC_2141			TRUE	0.997	0.000	0.750	NA	Y	NA
3743574	3743575	CLC_2141	CLC_2142			TRUE	0.942	63.000	0.667	NA	N	NA
3743575	3743576	CLC_2142	CLC_2143			FALSE	0.006	382.000	0.000	NA		NA
3743576	3743577	CLC_2143	CLC_2144			TRUE	0.684	96.000	0.068	NA		NA
3743577	3743578	CLC_2144	CLC_2145			TRUE	0.999	-9.000	0.838	0.004	Y	NA
3743578	3743579	CLC_2145	CLC_2146			TRUE	0.964	25.000	0.193	NA		NA
3743579	3743580	CLC_2146	CLC_2147			FALSE	0.002	589.000	0.000	NA		NA
3743580	3743581	CLC_2147	CLC_2148		motB-1	FALSE	0.018	296.000	0.000	NA		NA
3743581	3743582	CLC_2148	CLC_2149	motB-1	motA-1	TRUE	0.993	18.000	0.257	0.005	Y	NA
3743584	3743585	CLC_2151	CLC_2152			FALSE	0.014	311.000	0.000	NA		NA
3743585	3743586	CLC_2152	CLC_2153			FALSE	0.023	280.000	0.000	NA		NA
3743586	3743587	CLC_2153	CLC_2154			TRUE	0.973	6.000	0.153	NA		NA
3743587	3743588	CLC_2154	CLC_2155		pepD-2	FALSE	0.173	118.000	0.000	NA		NA
3743588	3743589	CLC_2155	CLC_2156	pepD-2		FALSE	0.021	558.000	0.000	1.000	Y	NA
3743593	3743594	CLC_2160	CLC_2161			TRUE	0.994	14.000	0.448	NA	Y	NA
3743594	3743595	CLC_2161	CLC_2162			FALSE	0.005	456.000	0.000	1.000		NA
3743595	3743596	CLC_2162	CLC_2163			TRUE	0.752	14.000	0.000	1.000		NA
3743598	3743599	CLC_2165	CLC_2166			FALSE	0.175	96.000	0.000	NA		NA
3743599	3743600	CLC_2166	CLC_2167			FALSE	0.013	348.000	0.000	1.000		NA
3743602	3743603	CLC_2169	CLC_2170			FALSE	0.003	438.000	0.000	NA		NA
3743603	3743604	CLC_2170	CLC_2171			FALSE	0.006	382.000	0.000	NA		NA
3743605	3743606	CLC_2172	CLC_2173			TRUE	0.639	19.000	0.000	NA		NA
3743606	3743607	CLC_2173	CLC_2174			TRUE	0.976	3.000	0.148	NA		NA
3743608	3743609	CLC_2175	CLC_2176		thiM-2	FALSE	0.080	220.000	0.000	1.000		NA
3743609	3743610	CLC_2176	CLC_2177	thiM-2	thiW	TRUE	0.983	-22.000	0.059	NA		NA
3743610	3743611	CLC_2177	CLC_2178	thiW		FALSE	0.186	89.000	0.000	NA		NA
3743611	3743612	CLC_2178	CLC_2179			FALSE	0.124	163.000	0.000	NA		NA
3743612	3743613	CLC_2179	CLC_2180			TRUE	0.717	128.000	0.095	1.000		NA
3743613	3743614	CLC_2180	CLC_2181			FALSE	0.541	185.000	0.095	NA		NA
3743614	3743615	CLC_2181	CLC_2182		bioD	FALSE	0.021	285.000	0.000	NA		NA
3743615	3743616	CLC_2182	CLC_2183	bioD	bioB	TRUE	0.992	3.000	0.025	0.001	Y	NA
3743616	3743617	CLC_2183	CLC_2184	bioB		TRUE	0.968	-7.000	0.018	NA		NA
3743617	3743618	CLC_2184	CLC_2185			FALSE	0.159	139.000	0.000	NA		NA
3743618	3743619	CLC_2185	CLC_2186			TRUE	0.990	-12.000	0.247	NA		NA
3743619	3743620	CLC_2186	CLC_2187			FALSE	0.157	142.000	0.000	NA		NA
3743621	3743622	CLC_2188	CLC_2189			TRUE	0.966	31.000	0.015	1.000	Y	NA
3743623	3743624	CLC_2190	CLC_2191			FALSE	0.030	264.000	0.000	NA		NA
3743626	3743627	CLC_2193	CLC_2194			FALSE	0.115	198.000	0.000	1.000		NA
3743627	3743628	CLC_2194	CLC_2195			FALSE	0.003	455.000	0.000	NA		NA
3743628	3743629	CLC_2195	CLC_2197			FALSE	0.152	146.000	0.000	NA		NA
3743629	3743630	CLC_2197	CLC_2198			FALSE	0.292	58.000	0.000	NA		NA
3743631	3743632	CLC_2199	CLC_2200			FALSE	0.003	442.000	0.000	NA		NA
3743633	3743634	CLC_2201	CLC_2202			FALSE	0.001	852.000	0.000	NA		NA
3743634	3743635	CLC_2202	CLC_2203		msrB	TRUE	0.667	174.000	0.200	NA		NA
3743635	3743636	CLC_2203	CLC_2204	msrB	sodF	FALSE	0.114	232.000	0.000	1.000	N	NA
3743636	3743637	CLC_2204	CLC_2205	sodF		FALSE	0.366	113.000	0.000	1.000	N	NA
3743637	3743638	CLC_2205	CLC_2206			TRUE	0.999	-7.000	0.867	0.006	Y	NA
3743638	3743639	CLC_2206	CLC_2207			FALSE	0.469	280.000	0.462	1.000	N	NA
3743639	3743640	CLC_2207	CLC_2208			FALSE	0.002	507.000	0.000	NA		NA
3743640	3743641	CLC_2208	CLC_2209			TRUE	0.963	36.000	0.500	NA		NA
3743641	3743642	CLC_2209	CLC_2210			TRUE	0.985	-7.000	0.167	NA		NA
3743642	3743643	CLC_2210	CLC_2211			TRUE	0.777	202.000	0.556	1.000	N	NA
3743643	3743644	CLC_2211	CLC_2212			TRUE	0.994	-3.000	0.125	1.000	Y	NA
3743645	3743646	CLC_2213	CLC_2214			FALSE	0.012	321.000	0.000	NA		NA
3743647	3743648	CLC_2215	CLC_2216			FALSE	0.600	83.000	0.011	NA		NA
3743648	3743649	CLC_2216	CLC_2217		def-1	FALSE	0.024	303.000	0.000	1.000		NA
3743649	3743650	CLC_2217	CLC_2218	def-1		TRUE	0.993	1.000	0.529	1.000	N	NA
3743650	3743651	CLC_2218	CLC_2219			FALSE	0.057	242.000	0.000	1.000		NA
3743651	3743652	CLC_2219	CLC_2220			TRUE	0.976	-3.000	0.077	NA		NA
3743656	3743657	CLC_2224	CLC_2225			TRUE	0.985	-7.000	0.179	NA		NA
3743657	3743658	CLC_2225	CLC_2226			TRUE	0.987	-19.000	0.143	NA		NA
3743658	3743659	CLC_2226	CLC_2227			TRUE	0.984	-3.000	0.182	NA		NA
3743659	3743660	CLC_2227	CLC_2228			FALSE	0.005	454.000	0.000	1.000		NA
3743660	3743661	CLC_2228	CLC_2229			FALSE	0.007	405.000	0.000	1.000		NA
3743661	3743662	CLC_2229	CLC_2230			FALSE	0.459	70.000	0.000	1.000	N	NA
3743662	3743663	CLC_2230	CLC_2231			TRUE	0.830	-10.000	0.000	NA		NA
3743663	3743664	CLC_2231	CLC_2232			FALSE	0.104	177.000	0.000	NA		NA
3743665	3743666	CLC_2233	CLC_2234			FALSE	0.226	74.000	0.000	NA		NA
3743667	3743668	CLC_2235	CLC_2236			TRUE	0.996	-7.000	0.138	0.086	Y	NA
3743668	3743669	CLC_2236	CLC_2237			TRUE	0.969	-7.000	0.023	NA		NA
3743669	3743670	CLC_2237	CLC_2238			FALSE	0.146	150.000	0.000	NA		NA
3743670	3743671	CLC_2238	CLC_2239			FALSE	0.008	358.000	0.000	NA		NA
3743671	3743672	CLC_2239	CLC_2240			TRUE	0.995	-124.000	0.500	NA		NA
3743676	3743677	CLC_2244	CLC_2245	ptsH	aspB-3	TRUE	0.736	111.000	0.047	1.000	N	NA
3743677	3743678	CLC_2245	CLC_2246	aspB-3		FALSE	0.213	145.000	0.000	1.000		NA
3743678	3743679	CLC_2246	CLC_2247			TRUE	0.796	-3.000	0.000	NA		NA
3743679	3743680	CLC_2247	CLC_2248			TRUE	0.926	19.000	0.020	NA		NA
3743680	3743681	CLC_2248	CLC_2249		spoVS	FALSE	0.499	163.000	0.020	NA		NA
3743681	3743682	CLC_2249	CLC_2250	spoVS		FALSE	0.556	139.000	0.016	NA		NA
3743682	3743683	CLC_2250	CLC_2251		recA	FALSE	0.257	235.000	0.018	1.000		NA
3743683	3743684	CLC_2251	CLC_2252	recA	pgsA	TRUE	0.653	148.000	0.022	1.000	N	NA
3743684	3743685	CLC_2252	CLC_2253	pgsA		TRUE	0.990	-16.000	0.132	1.000	N	NA
3743685	3743686	CLC_2253	CLC_2254		ftsK	TRUE	0.716	95.000	0.031	1.000	N	NA
3743686	3743687	CLC_2254	CLC_2255	ftsK	clpP-1	FALSE	0.035	481.000	0.047	1.000	N	NA
3743687	3743688	CLC_2255	CLC_2256	clpP-1	dapG	FALSE	0.331	248.000	0.045	1.000	N	NA
3743688	3743689	CLC_2256	CLC_2257	dapG		TRUE	0.965	16.000	0.148	NA		NA
3743689	3743690	CLC_2257	CLC_2258			TRUE	0.766	77.000	0.104	NA		NA
3743690	3743691	CLC_2258	CLC_2259		pnpA	FALSE	0.569	175.000	0.057	1.000		NA
3743691	3743692	CLC_2259	CLC_2260	pnpA	rpsO	TRUE	0.675	264.000	0.335	1.000	Y	NA
3743692	3743693	CLC_2260	CLC_2261	rpsO	ribF	TRUE	0.820	82.000	0.119	1.000	N	NA
3743693	3743694	CLC_2261	CLC_2262	ribF	truB	TRUE	0.984	13.000	0.308	1.000	N	NA
3743694	3743695	CLC_2262	CLC_2263	truB		TRUE	0.984	1.000	0.221	1.000		NA
3743695	3743696	CLC_2263	CLC_2264		rbfA	TRUE	0.988	-10.000	0.173	1.000		NA
3743696	3743697	CLC_2264	CLC_2265	rbfA	infB	TRUE	0.991	31.000	0.530	1.000	Y	NA
3743697	3743698	CLC_2265	CLC_2266	infB		TRUE	0.989	18.000	0.223	NA	Y	NA
3743698	3743699	CLC_2266	CLC_2267			TRUE	0.994	-13.000	0.408	NA	N	NA
3743699	3743700	CLC_2267	CLC_2268		nusA	TRUE	0.959	60.000	0.323	NA	Y	NA
3743700	3743701	CLC_2268	CLC_2269	nusA		TRUE	0.988	17.000	0.759	NA		NA
3743701	3743702	CLC_2269	CLC_2270		polC	FALSE	0.135	305.000	0.059	NA		NA
3743702	3743703	CLC_2270	CLC_2271	polC	gcpE	FALSE	0.232	279.000	0.040	1.000	N	NA
3743703	3743704	CLC_2271	CLC_2272	gcpE		TRUE	0.752	141.000	0.092	1.000	N	NA
3743704	3743705	CLC_2272	CLC_2273		dxr	TRUE	0.964	45.000	0.568	1.000	N	NA
3743705	3743706	CLC_2273	CLC_2274	dxr		TRUE	0.821	37.000	0.008	NA		NA
3743706	3743707	CLC_2274	CLC_2275			TRUE	0.800	100.000	0.250	NA		NA
3743707	3743708	CLC_2275	CLC_2276			FALSE	0.286	59.000	0.000	NA		NA
3743708	3743709	CLC_2276	CLC_2277		cdsA	FALSE	0.091	186.000	0.000	NA		NA
3743709	3743710	CLC_2277	CLC_2278	cdsA	uppS	TRUE	0.983	25.000	0.055	1.000	Y	NA
3743710	3743711	CLC_2278	CLC_2279	uppS	frr	TRUE	0.923	66.000	0.409	1.000	N	NA
3743711	3743712	CLC_2279	CLC_2280	frr	pyrH	TRUE	0.989	16.000	0.626	1.000	N	NA
3743714	3743715	CLC_2282	CLC_2283	tsf	rpsB	TRUE	0.964	88.000	0.748	1.000	Y	NA
3743715	3743716	CLC_2283	CLC_2284	rpsB	codY	FALSE	0.268	237.000	0.006	1.000	N	NA
3743716	3743717	CLC_2284	CLC_2285	codY	topA	FALSE	0.448	207.000	0.025	1.000	N	NA
3743717	3743718	CLC_2285	CLC_2286	topA	dprA	FALSE	0.276	372.000	0.238	1.000	Y	NA
3743719	3743720	CLC_2287	CLC_2288			TRUE	0.939	16.000	0.003	1.000	N	NA
3743721	3743722	CLC_2289	CLC_2290	rnhB		FALSE	0.225	297.000	0.148	1.000		NA
3743722	3743723	CLC_2290	CLC_2291		lepB-2	FALSE	0.130	304.000	0.007	0.044		NA
3743723	3743724	CLC_2291	CLC_2292	lepB-2	rplS	TRUE	0.774	59.000	0.006	1.000	N	NA
3743724	3743725	CLC_2292	CLC_2293	rplS	trmD	TRUE	0.941	151.000	0.567	1.000	Y	NA
3743725	3743726	CLC_2293	CLC_2294	trmD	rimM	TRUE	0.998	-9.000	0.672	1.000	Y	NA
3743726	3743727	CLC_2294	CLC_2295	rimM		TRUE	0.836	113.000	0.324	1.000		NA
3743727	3743728	CLC_2295	CLC_2296		rpsP	TRUE	0.979	21.000	0.385	1.000		NA
3743728	3743729	CLC_2296	CLC_2297	rpsP	ffh	TRUE	0.973	31.000	0.361	1.000	N	NA
3743729	3743730	CLC_2297	CLC_2298	ffh		TRUE	0.971	13.000	0.151	1.000		NA
3743730	3743731	CLC_2298	CLC_2299		ftsY	FALSE	0.393	224.000	0.081	1.000		NA
3743731	3743732	CLC_2299	CLC_2300	ftsY	smc	TRUE	0.799	163.000	0.165	0.017	N	NA
3743732	3743733	CLC_2300	CLC_2301	smc		TRUE	0.914	13.000	0.003	NA		NA
3743733	3743734	CLC_2301	CLC_2302			FALSE	0.569	123.000	0.016	NA		NA
3743734	3743735	CLC_2302	CLC_2303		rnc	TRUE	0.993	-7.000	0.064	1.000	Y	NA
3743735	3743736	CLC_2303	CLC_2304	rnc	acpP-1	TRUE	0.756	112.000	0.068	1.000	N	NA
3743736	3743737	CLC_2304	CLC_2305	acpP-1	plsX	TRUE	0.919	78.000	0.034	0.004	Y	NA
3743737	3743738	CLC_2305	CLC_2306	plsX	rpmF	TRUE	0.890	90.000	0.418	1.000	N	NA
3743738	3743739	CLC_2306	CLC_2307	rpmF		TRUE	0.986	14.000	0.599	NA		NA
3743739	3743740	CLC_2307	CLC_2308		ackA	TRUE	0.676	118.000	0.061	NA		NA
3743740	3743741	CLC_2308	CLC_2309	ackA	pta	TRUE	0.894	140.000	0.137	1.000	Y	NA
3743741	3743742	CLC_2309	CLC_2310	pta		FALSE	0.015	334.000	0.000	1.000		NA
3743742	3743743	CLC_2310	CLC_2311			FALSE	0.010	367.000	0.000	1.000		NA
3743743	3743744	CLC_2311	CLC_2312			FALSE	0.551	30.000	0.000	NA		NA
3743744	3743745	CLC_2312	CLC_2313			TRUE	0.992	9.000	1.000	NA		NA
3743745	3743746	CLC_2313	CLC_2314			TRUE	0.981	33.000	1.000	NA		NA
3743746	3743747	CLC_2314	CLC_2315			TRUE	0.985	22.000	0.667	NA		NA
3743747	3743748	CLC_2315	CLC_2316			FALSE	0.002	996.000	0.000	1.000		NA
3743748	3743749	CLC_2316	CLC_2317			FALSE	0.021	312.000	0.000	1.000		NA
3743749	3743750	CLC_2317	CLC_2318			FALSE	0.007	368.000	0.000	NA		NA
3743750	3743751	CLC_2318	CLC_2319			FALSE	0.003	452.000	0.000	NA		NA
3743751	3743752	CLC_2319	CLC_2320			FALSE	0.240	69.000	0.000	NA		NA
3743752	3743753	CLC_2320	CLC_2321			FALSE	0.058	217.000	0.000	NA		NA
3743755	3743756	CLC_2323	CLC_2324			FALSE	0.391	43.000	0.000	NA		NA
3743756	3743757	CLC_2324	CLC_2325			FALSE	0.184	90.000	0.000	NA		NA
3743757	3743758	CLC_2325	CLC_2326			FALSE	0.143	151.000	0.000	NA		NA
3743758	3743759	CLC_2326	CLC_2327		prdE	TRUE	0.970	14.000	0.154	1.000		NA
3743759	3743760	CLC_2327	CLC_2328	prdE	prdD	TRUE	0.994	14.000	1.000	0.002		NA
3743760	3743761	CLC_2328	CLC_2329	prdD	prdB	FALSE	0.037	341.000	0.000	0.002		NA
3743761	3743762	CLC_2329	CLC_2330	prdB		FALSE	0.219	76.000	0.000	NA		NA
3743762	3743763	CLC_2330	CLC_2331		prdA	TRUE	0.705	9.000	0.000	NA		NA
3743763	3743764	CLC_2331	CLC_2332	prdA		TRUE	0.989	25.000	1.000	NA		NA
3743764	3743765	CLC_2332	CLC_2333			TRUE	0.989	22.000	1.000	NA		NA
3743765	3743766	CLC_2333	CLC_2334			FALSE	0.002	641.000	0.000	NA		NA
3743766	3743767	CLC_2334	CLC_2335			TRUE	0.973	40.000	1.000	NA		NA
3743769	3743770	CLC_2337	CLC_2338			FALSE	0.036	248.000	0.000	NA		NA
3743772	3743773	CLC_2339	CLC_2341			FALSE	0.173	104.000	0.000	NA		NA
3743773	3743774	CLC_2341	CLC_2342			FALSE	0.230	73.000	0.000	NA		NA
3743774	3743775	CLC_2342	CLC_2343			TRUE	0.959	31.000	0.286	NA		NA
3743775	3743776	CLC_2343	CLC_2344			FALSE	0.244	176.000	0.000	1.000	N	NA
3743777	3743778	CLC_2345	CLC_2346			TRUE	0.789	60.000	0.036	1.000		NA
3743779	3743780	CLC_2347	CLC_2348		coaD	TRUE	0.953	13.000	0.055	NA		NA
3743780	3743781	CLC_2348	CLC_2349	coaD		TRUE	0.990	2.000	0.367	1.000	N	NA
3743781	3743782	CLC_2349	CLC_2350		recG	FALSE	0.529	262.000	0.016	0.010	Y	NA
3743782	3743783	CLC_2350	CLC_2351	recG		FALSE	0.082	350.000	0.048	1.000		NA
3743783	3743784	CLC_2351	CLC_2352			TRUE	0.985	15.000	0.567	NA		NA
3743786	3743787	CLC_2354	CLC_2355			TRUE	0.872	78.000	0.400	NA		NA
3743787	3743788	CLC_2355	CLC_2356			FALSE	0.033	378.000	0.005	NA		NA
3743788	3743789	CLC_2356	CLC_2357		rpe	TRUE	0.984	2.000	0.166	1.000	N	NA
3743789	3743790	CLC_2357	CLC_2358	rpe	rsgA	TRUE	0.987	-6.000	0.213	1.000		NA
3743790	3743791	CLC_2358	CLC_2359	rsgA		FALSE	0.566	207.000	0.196	1.000		NA
3743791	3743792	CLC_2359	CLC_2360			TRUE	0.998	-22.000	0.704	1.000	Y	NA
3743792	3743793	CLC_2360	CLC_2361			TRUE	0.960	19.000	0.105	1.000		NA
3743793	3743794	CLC_2361	CLC_2362		sun	TRUE	0.971	12.000	0.135	1.000		NA
3743794	3743795	CLC_2362	CLC_2363	sun		TRUE	0.954	21.000	0.076	1.000		NA
3743795	3743796	CLC_2363	CLC_2364		fmt	FALSE	0.112	318.000	0.035	1.000		NA
3743796	3743797	CLC_2364	CLC_2365	fmt	def-2	TRUE	0.983	17.000	0.009	0.023	Y	NA
3743797	3743798	CLC_2365	CLC_2366	def-2	priA	TRUE	0.929	28.000	0.010	1.000	N	NA
3743798	3743799	CLC_2366	CLC_2367	priA	coaBC	FALSE	0.144	338.000	0.099	1.000	N	NA
3743799	3743800	CLC_2367	CLC_2368	coaBC	rpoZ	TRUE	0.967	2.000	0.013	1.000	N	NA
3743800	3743801	CLC_2368	CLC_2369	rpoZ	gmk	TRUE	0.986	-19.000	0.035	1.000	N	NA
3743801	3743802	CLC_2369	CLC_2370	gmk		TRUE	0.980	0.000	0.143	NA		NA
3743802	3743803	CLC_2370	CLC_2371			TRUE	0.969	16.000	0.189	NA		NA
3743803	3743804	CLC_2371	CLC_2372		ansA	FALSE	0.353	194.000	0.003	1.000		NA
3743806	3743807	CLC_2374	CLC_2375	spoIVA		FALSE	0.006	385.000	0.000	NA		NA
3743809	3743810	CLC_2377	CLC_2378			FALSE	0.598	171.000	0.068	1.000		NA
3743810	3743811	CLC_2378	CLC_2379			TRUE	0.970	3.000	0.061	1.000		NA
3743811	3743812	CLC_2379	CLC_2380		phoU	FALSE	0.032	452.000	0.028	NA	N	NA
3743812	3743813	CLC_2380	CLC_2381	phoU	pstB	TRUE	0.982	30.000	0.182	NA	Y	NA
3743813	3743814	CLC_2381	CLC_2382	pstB	pstA	TRUE	0.992	13.000	0.112	0.002	Y	NA
3743814	3743815	CLC_2382	CLC_2383	pstA	pstC	TRUE	0.999	0.000	0.907	0.002	Y	NA
3743815	3743816	CLC_2383	CLC_2384	pstC	pstS	TRUE	0.787	208.000	0.206	1.000	Y	NA
3743816	3743817	CLC_2384	CLC_2385	pstS		FALSE	0.305	247.000	0.028	1.000	N	NA
3743817	3743818	CLC_2385	CLC_2386			TRUE	0.991	12.000	0.110	0.068	Y	NA
3743818	3743819	CLC_2386	CLC_2387			TRUE	0.939	11.000	0.018	NA		NA
3743819	3743820	CLC_2387	CLC_2388		nrdR	FALSE	0.020	449.000	0.013	NA		NA
3743820	3743821	CLC_2388	CLC_2389	nrdR		FALSE	0.513	131.000	0.005	NA		NA
3743821	3743822	CLC_2389	CLC_2390		sigG	FALSE	0.574	147.000	0.026	NA		NA
3743822	3743823	CLC_2390	CLC_2391	sigG	sigE	TRUE	0.975	75.000	0.602	0.006	Y	NA
3743823	3743824	CLC_2391	CLC_2392	sigE	spoIIGA	TRUE	0.991	12.000	0.856	1.000		NA
3743824	3743825	CLC_2392	CLC_2393	spoIIGA	ftsZ	FALSE	0.104	313.000	0.024	1.000		NA
3743825	3743826	CLC_2393	CLC_2394	ftsZ	ftsA	TRUE	0.993	23.000	0.460	1.000	Y	NA
3743826	3743827	CLC_2394	CLC_2395	ftsA		FALSE	0.549	157.000	0.008	NA	N	NA
3743829	3743830	CLC_2397	CLC_2398	pilT	aroE	TRUE	0.972	2.000	0.028	1.000	N	NA
3743830	3743831	CLC_2398	CLC_2399	aroE		FALSE	0.221	139.000	0.000	1.000		NA
3743831	3743832	CLC_2399	CLC_2400			FALSE	0.343	52.000	0.000	NA		NA
3743833	3743834	CLC_2401	CLC_2402			FALSE	0.213	200.000	0.000	0.022		NA
3743834	3743835	CLC_2402	CLC_2403			TRUE	0.830	-10.000	0.000	NA		NA
3743836	3743837	CLC_2404	CLC_2405			FALSE	0.243	68.000	0.000	NA		NA
3743837	3743838	CLC_2405	CLC_2406			TRUE	0.852	-22.000	0.000	NA		NA
3743838	3743839	CLC_2406	CLC_2407			TRUE	0.874	-9.000	0.000	1.000		NA
3743839	3743840	CLC_2407	CLC_2408			FALSE	0.010	437.000	0.000	1.000	N	NA
3743840	3743841	CLC_2408	CLC_2409			FALSE	0.059	239.000	0.000	1.000		NA
3743841	3743842	CLC_2409	CLC_2410			FALSE	0.410	40.000	0.000	NA		NA
3743842	3743843	CLC_2410	CLC_2411			TRUE	0.670	14.000	0.000	NA		NA
3743843	3743844	CLC_2411	CLC_2412			FALSE	0.207	79.000	0.000	NA		NA
3743844	3743845	CLC_2412	CLC_2413			FALSE	0.141	152.000	0.000	NA		NA
3743845	3743846	CLC_2413	CLC_2414			FALSE	0.051	224.000	0.000	NA		NA
3743846	3743847	CLC_2414	CLC_2415			FALSE	0.003	485.000	0.000	NA		NA
3743847	3743848	CLC_2415	CLC_2416			FALSE	0.207	79.000	0.000	NA		NA
3743848	3743849	CLC_2416	CLC_2417			FALSE	0.165	127.000	0.000	NA		NA
3743849	3743850	CLC_2417	CLC_2418			FALSE	0.173	119.000	0.000	NA		NA
3743850	3743851	CLC_2418	CLC_2419			TRUE	0.636	23.000	0.000	NA		NA
3743851	3743852	CLC_2419	CLC_2420			TRUE	0.695	11.000	0.000	NA		NA
3743852	3743853	CLC_2420	CLC_2421			TRUE	0.994	-19.000	0.500	NA		NA
3743854	3743855	CLC_2422	CLC_2423			FALSE	0.098	207.000	0.000	1.000		NA
3743856	3743857	CLC_2424	CLC_2425		udk	TRUE	0.691	86.000	0.012	1.000	N	NA
3743857	3743858	CLC_2425	CLC_2426	udk		TRUE	0.748	148.000	0.100	1.000	N	NA
3743858	3743859	CLC_2426	CLC_2427			TRUE	0.986	-7.000	0.146	1.000		NA
3743859	3743860	CLC_2427	CLC_2428			TRUE	0.715	83.000	0.067	NA		NA
3743860	3743861	CLC_2428	CLC_2429		typA	TRUE	0.623	78.000	0.012	NA		NA
3743861	3743862	CLC_2429	CLC_2430	typA		FALSE	0.010	644.000	0.004	1.000		NA
3743862	3743863	CLC_2430	CLC_2431			TRUE	0.929	48.000	0.289	1.000		NA
3743863	3743864	CLC_2431	CLC_2432			TRUE	0.773	122.000	0.211	NA		NA
3743864	3743865	CLC_2432	CLC_2433			TRUE	0.949	14.000	0.047	NA		NA
3743865	3743866	CLC_2433	CLC_2434			TRUE	0.699	207.000	0.537	NA		NA
3743866	3743867	CLC_2434	CLC_2435		alaS	TRUE	0.722	115.000	0.110	NA		NA
3743867	3743868	CLC_2435	CLC_2436	alaS		FALSE	0.015	499.000	0.015	NA		NA
3743868	3743869	CLC_2436	CLC_2437			TRUE	0.972	13.000	0.209	NA		NA
3743869	3743870	CLC_2437	CLC_2438			FALSE	0.352	50.000	0.000	NA		NA
3743870	3743871	CLC_2438	CLC_2439			TRUE	0.677	13.000	0.000	NA		NA
3743871	3743872	CLC_2439	CLC_2440		iscS-2	TRUE	0.974	2.000	0.035	1.000	N	NA
3743872	3743873	CLC_2440	CLC_2441	iscS-2		TRUE	0.987	-7.000	0.125	NA	N	NA
3743873	3743874	CLC_2441	CLC_2442			FALSE	0.364	220.000	0.025	NA	N	NA
3743874	3743875	CLC_2442	CLC_2443		hisK	FALSE	0.062	398.000	0.041	1.000	N	NA
3743875	3743876	CLC_2443	CLC_2444	hisK		FALSE	0.066	367.000	0.041	1.000		NA
3743876	3743877	CLC_2444	CLC_2445			TRUE	0.746	108.000	0.143	NA		NA
3743879	3743880	CLC_2447	CLC_2448			FALSE	0.169	122.000	0.000	NA		NA
3743880	3743881	CLC_2448	CLC_2449			FALSE	0.001	745.000	0.000	NA		NA
3743883	3743884	CLC_2451	CLC_2452			FALSE	0.007	364.000	0.000	NA		NA
3743884	3743885	CLC_2452	CLC_2453			FALSE	0.189	199.000	0.000	1.000	N	NA
3743885	3743886	CLC_2453	CLC_2454			TRUE	0.988	-3.000	0.182	1.000	N	NA
3743886	3743887	CLC_2454	CLC_2455			TRUE	0.987	5.000	0.400	1.000		NA
3743887	3743888	CLC_2455	CLC_2456			TRUE	0.947	6.000	0.011	1.000		NA
3743888	3743889	CLC_2456	CLC_2457			TRUE	0.976	17.000	0.011	NA	Y	NA
3743889	3743890	CLC_2457	CLC_2458			TRUE	0.960	9.000	0.026	NA	N	NA
3743890	3743891	CLC_2458	CLC_2459			TRUE	0.975	41.000	0.250	1.000	Y	NA
3743891	3743892	CLC_2459	CLC_2460			TRUE	0.932	41.000	0.143	0.047		NA
3743892	3743893	CLC_2460	CLC_2461			TRUE	0.977	4.000	0.143	1.000		NA
3743893	3743894	CLC_2461	CLC_2462			TRUE	0.961	9.000	0.044	1.000		NA
3743894	3743895	CLC_2462	CLC_2463			TRUE	0.965	-3.000	0.011	1.000		NA
3743895	3743896	CLC_2463	CLC_2464			TRUE	0.925	19.000	0.011	1.000		NA
3743896	3743897	CLC_2464	CLC_2465		argF	FALSE	0.008	466.000	0.000	1.000	N	NA
3743897	3743898	CLC_2465	CLC_2466	argF	arcC	TRUE	0.949	95.000	0.500	1.000	Y	NA
3743898	3743899	CLC_2466	CLC_2467	arcC	glyA	FALSE	0.020	564.000	0.000	1.000	Y	NA
3743900	3743901	CLC_2468	CLC_2469			TRUE	0.983	-3.000	0.154	NA		NA
3743902	3743903	CLC_2470	CLC_2471			FALSE	0.484	201.000	0.095	NA		NA
3743903	10195469	CLC_2471	CLC_3726			TRUE	0.862	-158.000	0.000	NA		NA
3743904	3743905	CLC_2472	CLC_2473			FALSE	0.004	411.000	0.000	NA		NA
3743905	3743906	CLC_2473	CLC_2474			TRUE	0.857	77.000	0.185	1.000	N	NA
3743906	3743907	CLC_2474	CLC_2475			TRUE	0.666	154.000	0.111	NA		NA
3743907	3743908	CLC_2475	CLC_2476			FALSE	0.010	339.000	0.000	NA		NA
3743909	3743910	CLC_2477	CLC_2478			TRUE	0.713	122.000	0.034	1.000	N	NA
3743910	3743911	CLC_2478	CLC_2479			FALSE	0.010	426.000	0.000	1.000	N	NA
3743911	3743912	CLC_2479	CLC_2480		hprK	TRUE	0.974	-7.000	0.006	1.000	N	NA
3743912	3743913	CLC_2480	CLC_2481	hprK		TRUE	0.879	32.000	0.018	NA		NA
3743913	3743914	CLC_2481	CLC_2482			FALSE	0.115	171.000	0.000	NA		NA
3743914	3743915	CLC_2482	CLC_2483			TRUE	0.988	-34.000	0.130	NA		NA
3743915	3743916	CLC_2483	CLC_2484			TRUE	0.786	109.000	0.222	NA		NA
3743916	3743917	CLC_2484	CLC_2485			TRUE	0.970	0.000	0.049	NA		NA
3743917	3743918	CLC_2485	CLC_2486			TRUE	0.981	-10.000	0.073	NA		NA
3743918	3743919	CLC_2486	CLC_2487			TRUE	0.778	0.000	0.000	NA		NA
3743923	3743924	CLC_2491	CLC_2492			FALSE	0.003	455.000	0.000	NA		NA
3743924	3743925	CLC_2492	CLC_2493			FALSE	0.002	547.000	0.000	NA		NA
3743925	3743926	CLC_2493	CLC_2494			FALSE	0.001	1052.000	0.000	NA		NA
3743926	3743927	CLC_2494	CLC_2495		def-3	TRUE	0.964	18.000	0.065	1.000	N	NA
3743927	3743928	CLC_2495	CLC_2496	def-3		FALSE	0.144	217.000	0.000	1.000	N	NA
3743928	3743929	CLC_2496	CLC_2497			TRUE	0.990	29.000	0.238	0.005	Y	NA
3743929	3743930	CLC_2497	CLC_2498			TRUE	0.999	-7.000	0.776	0.005	Y	NA
3743930	3743931	CLC_2498	CLC_2499			TRUE	0.996	14.000	0.462	0.005	Y	NA
3743931	3743932	CLC_2499	CLC_2500			TRUE	0.998	-7.000	0.487	0.005	Y	NA
3743932	3743933	CLC_2500	CLC_2501			TRUE	0.994	15.000	0.258	0.005	Y	NA
3743933	3743934	CLC_2501	CLC_2502			TRUE	0.970	39.000	0.489	0.005		NA
3743934	3743935	CLC_2502	CLC_2503			TRUE	0.993	13.000	0.848	0.005		NA
3743935	3743936	CLC_2503	CLC_2504			TRUE	0.985	-13.000	0.025	0.005		NA
3743936	3743937	CLC_2504	CLC_2505			FALSE	0.023	306.000	0.000	1.000		NA
3743937	3743938	CLC_2505	CLC_2506			TRUE	0.966	-25.000	0.002	NA		NA
3743938	3743939	CLC_2506	CLC_2507			FALSE	0.341	184.000	0.002	NA		NA
3743939	3743940	CLC_2507	CLC_2508			TRUE	0.637	22.000	0.000	NA		NA
3743940	3743941	CLC_2508	CLC_2509			FALSE	0.429	38.000	0.000	NA		NA
3743943	3743944	CLC_2511	CLC_2512			FALSE	0.011	328.000	0.000	NA		NA
3743944	3743945	CLC_2512	CLC_2513			TRUE	0.961	55.000	0.088	0.004	Y	NA
3743945	3743946	CLC_2513	CLC_2514			TRUE	0.718	66.000	0.027	NA		NA
3743946	3743947	CLC_2514	CLC_2515			TRUE	0.823	78.000	0.222	NA		NA
3743947	3743948	CLC_2515	CLC_2516		fliA	TRUE	0.921	29.000	0.029	1.000		NA
3743948	3743949	CLC_2516	CLC_2517	fliA		TRUE	0.963	14.000	0.062	NA	N	NA
3743949	3743950	CLC_2517	CLC_2518		flhG	TRUE	0.967	15.000	0.094	NA	N	NA
3743950	3743951	CLC_2518	CLC_2519	flhG	flhF	TRUE	0.993	-6.000	0.382	1.000	N	NA
3743951	3743952	CLC_2519	CLC_2520	flhF	flhA	TRUE	0.997	-3.000	0.440	1.000	Y	NA
3743952	3743953	CLC_2520	CLC_2521	flhA		TRUE	0.991	28.000	0.207	0.002	Y	NA
3743953	3743954	CLC_2521	CLC_2522		fliQ	TRUE	0.983	34.000	0.114	0.002	Y	NA
3743954	3743955	CLC_2522	CLC_2523	fliQ	fliP	TRUE	0.993	12.000	0.162	0.003	Y	NA
3743955	3743956	CLC_2523	CLC_2524	fliP		TRUE	0.997	-16.000	0.386	1.000	Y	NA
3743956	3743957	CLC_2524	CLC_2525		fliL	FALSE	0.230	73.000	0.000	NA		NA
3743957	3743958	CLC_2525	CLC_2526	fliL	motB-2	TRUE	0.796	-3.000	0.000	NA		NA
3743958	3743959	CLC_2526	CLC_2527	motB-2	motA-2	TRUE	0.997	-7.000	0.350	1.000	Y	NA
3743959	3743960	CLC_2527	CLC_2528	motA-2		TRUE	0.996	-3.000	0.301	NA	Y	NA
3743960	3743961	CLC_2528	CLC_2529		flgE	FALSE	0.597	234.000	0.077	NA	Y	NA
3743961	3743962	CLC_2529	CLC_2530	flgE		TRUE	0.749	82.000	0.100	NA		NA
3743962	3743963	CLC_2530	CLC_2531		flgD	TRUE	0.952	15.000	0.064	NA		NA
3743963	3743964	CLC_2531	CLC_2532	flgD	fliK	TRUE	0.883	30.000	0.012	NA		NA
3743964	3743965	CLC_2532	CLC_2533	fliK		TRUE	0.964	6.000	0.006	0.005		NA
3743965	3743966	CLC_2533	CLC_2534		fliI	TRUE	0.942	104.000	0.241	0.007	Y	NA
3743966	3743967	CLC_2534	CLC_2535	fliI	fliH	TRUE	0.979	40.000	0.379	NA	Y	NA
3743967	3743968	CLC_2535	CLC_2536	fliH	fliG	TRUE	0.997	-16.000	0.308	NA	Y	NA
3743968	3743969	CLC_2536	CLC_2537	fliG	fliF	TRUE	0.997	7.000	0.477	0.005	Y	NA
3743969	3743970	CLC_2537	CLC_2538	fliF	fliE	TRUE	0.991	16.000	0.112	0.005	Y	NA
3743970	3743971	CLC_2538	CLC_2539	fliE	flgC	TRUE	0.992	12.000	0.095	0.004	Y	NA
3743971	3743972	CLC_2539	CLC_2540	flgC	flgB	TRUE	0.973	98.000	0.804	0.004	Y	NA
3743972	3743973	CLC_2540	CLC_2541	flgB		FALSE	0.007	572.000	0.000	0.004		NA
3743973	3743974	CLC_2541	CLC_2542			TRUE	0.742	144.000	0.182	NA		NA
3743974	3743975	CLC_2542	CLC_2543		argH	FALSE	0.002	540.000	0.000	NA		NA
3743975	3743976	CLC_2543	CLC_2544	argH	argG	TRUE	0.991	22.000	0.278	1.000	Y	NA
3743976	3743977	CLC_2544	CLC_2545	argG		FALSE	0.019	295.000	0.000	NA		NA
3743977	3743978	CLC_2545	CLC_2546			TRUE	0.985	23.000	0.667	NA		NA
3743978	3743979	CLC_2546	CLC_2547		cls	FALSE	0.100	180.000	0.000	NA		NA
3743981	3743982	CLC_2549	CLC_2550			FALSE	0.022	283.000	0.000	NA		NA
3743982	3743983	CLC_2550	CLC_2551			FALSE	0.035	251.000	0.000	NA		NA
3743983	3743984	CLC_2551	CLC_2552			FALSE	0.510	40.000	0.000	1.000		NA
3743984	3743985	CLC_2552	CLC_2553			TRUE	0.934	29.000	0.000	1.000	Y	NA
3743985	3743986	CLC_2553	CLC_2554			TRUE	0.972	32.000	0.051	1.000	Y	NA
3743986	3743987	CLC_2554	CLC_2555			TRUE	0.957	15.000	0.091	NA		NA
3743987	3743988	CLC_2555	CLC_2556			FALSE	0.491	34.000	0.000	NA		NA
3743988	3743989	CLC_2556	CLC_2557			FALSE	0.604	27.000	0.000	NA		NA
3743989	3743990	CLC_2557	CLC_2558		glf	TRUE	0.956	0.000	0.012	NA		NA
3743990	3743991	CLC_2558	CLC_2559	glf		TRUE	0.822	105.000	0.012	NA	Y	NA
3743991	3743992	CLC_2559	CLC_2560			FALSE	0.126	211.000	0.000	NA	N	NA
3743992	3743993	CLC_2560	CLC_2561			TRUE	0.829	19.000	0.000	1.000	N	NA
3743993	3743994	CLC_2561	CLC_2562			TRUE	0.982	16.000	0.027	1.000	Y	NA
3743994	3743995	CLC_2562	CLC_2563			TRUE	0.966	35.000	0.400	NA	N	NA
3743995	3743996	CLC_2563	CLC_2564			FALSE	0.003	438.000	0.000	NA		NA
3743996	3743997	CLC_2564	CLC_2565			FALSE	0.146	150.000	0.000	NA		NA
3743997	3743998	CLC_2565	CLC_2566			TRUE	0.914	121.000	1.000	NA		NA
3743998	3743999	CLC_2566	CLC_2567			FALSE	0.003	484.000	0.000	NA		NA
3743999	3744000	CLC_2567	CLC_2568		fliC	TRUE	0.852	77.000	0.250	1.000		NA
3744000	3744001	CLC_2568	CLC_2569	fliC		TRUE	0.662	185.000	0.250	NA		NA
3744001	3744002	CLC_2569	CLC_2570			FALSE	0.191	86.000	0.000	NA		NA
3744002	3744003	CLC_2570	CLC_2571			TRUE	0.660	16.000	0.000	NA		NA
3744003	3744004	CLC_2571	CLC_2572			FALSE	0.174	108.000	0.000	NA		NA
3744004	3744005	CLC_2572	CLC_2573			FALSE	0.007	497.000	0.000	1.000	N	NA
3744005	3744006	CLC_2573	CLC_2574			FALSE	0.252	90.000	0.000	1.000		NA
3744006	3744007	CLC_2574	CLC_2575			TRUE	0.738	17.000	0.000	1.000		NA
3744007	3744008	CLC_2575	CLC_2576			TRUE	0.680	28.000	0.000	1.000		NA
3744008	3744009	CLC_2576	CLC_2577			FALSE	0.173	105.000	0.000	NA		NA
3744009	3744010	CLC_2577	CLC_2578			TRUE	0.709	8.000	0.000	NA		NA
3744010	3744011	CLC_2578	CLC_2579			TRUE	0.707	26.000	0.000	1.000		NA
3744011	3744012	CLC_2579	CLC_2580			FALSE	0.442	37.000	0.000	NA		NA
3744012	3744013	CLC_2580	CLC_2581			FALSE	0.371	46.000	0.000	NA		NA
3744013	3744014	CLC_2581	CLC_2582			FALSE	0.224	134.000	0.000	1.000		NA
3744014	3744015	CLC_2582	CLC_2583			FALSE	0.251	66.000	0.000	NA		NA
3744015	3744016	CLC_2583	CLC_2584			TRUE	0.814	-7.000	0.000	NA		NA
3744016	3744017	CLC_2584	CLC_2585			FALSE	0.259	87.000	0.000	1.000		NA
3744017	3744018	CLC_2585	CLC_2586			TRUE	0.724	22.000	0.000	1.000		NA
3744018	3744019	CLC_2586	CLC_2587			TRUE	0.979	-3.000	0.071	1.000		NA
3744019	3744020	CLC_2587	CLC_2588			TRUE	0.981	-10.000	0.053	1.000		NA
3744020	3744021	CLC_2588	CLC_2589		rfbC	TRUE	0.995	-3.000	0.196	1.000	Y	NA
3744021	3744022	CLC_2589	CLC_2590	rfbC		TRUE	0.990	1.000	0.457	1.000		NA
3744022	3744023	CLC_2590	CLC_2591			FALSE	0.464	47.000	0.000	1.000		NA
3744023	3744024	CLC_2591	CLC_2592			TRUE	0.956	2.000	0.013	1.000		NA
3744024	3744025	CLC_2592	CLC_2593			TRUE	0.639	19.000	0.000	NA		NA
3744025	3744026	CLC_2593	CLC_2594			FALSE	0.182	91.000	0.000	NA		NA
3744026	3744027	CLC_2594	CLC_2595			TRUE	0.851	142.000	0.037	1.000	Y	NA
3744027	3744028	CLC_2595	CLC_2596			TRUE	0.699	123.000	0.069	1.000		NA
3744028	3744029	CLC_2596	CLC_2597			TRUE	0.956	40.000	0.468	1.000		NA
3744029	3744030	CLC_2597	CLC_2598			FALSE	0.135	221.000	0.000	1.000	N	NA
3744030	3744031	CLC_2598	CLC_2599			TRUE	0.870	120.000	0.267	0.002		NA
3744031	3744032	CLC_2599	CLC_2600			FALSE	0.500	41.000	0.000	1.000		NA
3744032	3744033	CLC_2600	CLC_2601			TRUE	0.705	9.000	0.000	NA		NA
3744033	3744034	CLC_2601	CLC_2602			TRUE	0.969	4.000	0.095	NA		NA
3744034	3744035	CLC_2602	CLC_2603			TRUE	0.627	25.000	0.000	NA		NA
3744035	3744036	CLC_2603	CLC_2604			FALSE	0.483	223.000	0.105	1.000	N	NA
3744036	3744037	CLC_2604	CLC_2605			TRUE	0.801	214.000	0.133	0.002	Y	NA
3744037	3744038	CLC_2605	CLC_2606			TRUE	0.736	150.000	0.200	NA		NA
3744038	3744039	CLC_2606	CLC_2607		fliD	TRUE	0.932	27.000	0.043	NA		NA
3744039	3744040	CLC_2607	CLC_2608	fliD	fliS	TRUE	0.980	54.000	0.370	0.002	Y	NA
3744040	3744041	CLC_2608	CLC_2609	fliS		TRUE	0.900	37.000	0.093	NA		NA
3744041	3744042	CLC_2609	CLC_2610			TRUE	0.786	55.000	0.028	NA		NA
3744042	3744043	CLC_2610	CLC_2611		csrA	TRUE	0.952	16.000	0.028	NA	N	NA
3744043	3744044	CLC_2611	CLC_2612	csrA		TRUE	0.976	0.000	0.096	NA		NA
3744044	3744045	CLC_2612	CLC_2613		flgL	TRUE	0.847	89.000	0.385	NA		NA
3744045	3744046	CLC_2613	CLC_2614	flgL	flgK	TRUE	0.990	18.000	0.071	0.001	Y	NA
3744046	3744047	CLC_2614	CLC_2615	flgK		FALSE	0.278	289.000	0.082	0.002		NA
3744047	3744048	CLC_2615	CLC_2616			TRUE	0.993	0.000	0.421	0.002		NA
3744048	3744049	CLC_2616	CLC_2617		fliN	FALSE	0.004	497.000	0.000	1.000		NA
3744049	3744050	CLC_2617	CLC_2618	fliN	fliM	TRUE	0.998	-7.000	0.508	0.001	Y	NA
3744050	3744051	CLC_2618	CLC_2619	fliM		TRUE	0.984	28.000	0.039	0.010	Y	NA
3744051	3744052	CLC_2619	CLC_2620		cheY	TRUE	0.943	100.000	0.417	1.000	Y	NA
3744052	3744053	CLC_2620	CLC_2621	cheY	cheC	TRUE	0.979	28.000	0.082	NA	Y	NA
3744053	3744054	CLC_2621	CLC_2622	cheC	cheA	TRUE	0.986	26.000	0.176	NA	Y	NA
3744054	3744055	CLC_2622	CLC_2623	cheA	cheR	TRUE	0.987	13.000	0.081	1.000	Y	NA
3744055	3744056	CLC_2623	CLC_2624	cheR	cheB	TRUE	0.988	15.000	0.107	1.000	Y	NA
3744056	3744057	CLC_2624	CLC_2625	cheB	cheD	TRUE	0.984	23.000	0.070	1.000	Y	NA
3744057	3744058	CLC_2625	CLC_2626	cheD	cheW	TRUE	0.985	17.000	0.063	1.000	Y	NA
3744058	3744059	CLC_2626	CLC_2627	cheW		TRUE	0.978	16.000	0.231	NA	N	NA
3744059	3744060	CLC_2627	CLC_2628			FALSE	0.070	253.000	0.000	NA	N	NA
3744060	3744061	CLC_2628	CLC_2629			TRUE	0.845	83.000	0.273	1.000		NA
3744061	3744062	CLC_2629	CLC_2630			FALSE	0.052	249.000	0.000	1.000		NA
3744062	3744063	CLC_2630	CLC_2631			TRUE	0.902	127.000	0.082	0.047	Y	NA
3744063	3744064	CLC_2631	CLC_2632			FALSE	0.033	257.000	0.000	NA		NA
3744064	3744065	CLC_2632	CLC_2633			FALSE	0.031	261.000	0.000	NA		NA
3744065	3744066	CLC_2633	CLC_2634			FALSE	0.028	266.000	0.000	NA		NA
3744066	3744067	CLC_2634	CLC_2635		murG	FALSE	0.004	630.000	0.000	1.000	N	NA
3744069	3744070	CLC_2637	CLC_2638		recJ	FALSE	0.355	123.000	0.000	1.000	N	NA
3744072	3744073	CLC_2640	CLC_2641			FALSE	0.002	995.000	0.000	1.000		NA
3744074	3744075	CLC_2642	CLC_2643			TRUE	0.681	68.000	0.008	1.000		NA
3744076	3744077	CLC_2644	CLC_2645	glpP		TRUE	0.851	49.000	0.018	1.000	N	NA
3744077	3744078	CLC_2645	CLC_2646			TRUE	0.975	74.000	0.552	0.001	Y	NA
3744078	3744079	CLC_2646	CLC_2647			FALSE	0.007	367.000	0.000	NA		NA
3744080	3744081	CLC_2648	CLC_2649			TRUE	0.979	13.000	0.333	NA		NA
3744081	3744082	CLC_2649	CLC_2650			FALSE	0.003	461.000	0.000	NA		NA
3744082	3744083	CLC_2650	CLC_2651			TRUE	0.975	20.000	0.333	NA		NA
3744084	3744085	CLC_2652	CLC_2653		galE	FALSE	0.429	38.000	0.000	NA		NA
3744085	3744086	CLC_2653	CLC_2654	galE		FALSE	0.024	347.000	0.000	1.000	N	NA
3744086	3744087	CLC_2654	CLC_2655			FALSE	0.021	284.000	0.000	NA		NA
3744087	3744088	CLC_2655	CLC_2656			TRUE	0.850	-21.000	0.000	NA		NA
3744088	3744089	CLC_2656	CLC_2657			FALSE	0.026	272.000	0.000	NA		NA
3744089	3744090	CLC_2657	CLC_2658			FALSE	0.004	624.000	0.000	1.000	N	NA
3744092	3744093	CLC_2660	CLC_2661	glpK		FALSE	0.364	264.000	0.131	1.000	N	NA
3744095	3744096	CLC_2663	CLC_2664			TRUE	0.832	132.000	0.400	NA		NA
3744096	3744097	CLC_2664	CLC_2665			TRUE	0.979	-16.000	0.038	NA		NA
3744097	3744098	CLC_2665	CLC_2666			TRUE	0.989	6.000	0.419	1.000	N	NA
3744098	3744099	CLC_2666	CLC_2667			FALSE	0.553	174.000	0.027	NA	N	NA
3744100	3744101	CLC_2668	CLC_2669			FALSE	0.001	748.000	0.000	NA		NA
3744101	3744102	CLC_2669	CLC_2670			FALSE	0.016	304.000	0.000	NA		NA
3744103	3744104	CLC_2671	CLC_2672	gerAC		TRUE	0.958	-46.000	0.000	0.005		NA
3744104	3744105	CLC_2672	CLC_2673		gerAA	TRUE	0.947	-10.000	0.000	0.005		NA
3744105	3744106	CLC_2673	CLC_2674	gerAA		FALSE	0.032	260.000	0.000	NA		NA
3744106	3744107	CLC_2674	CLC_2675			FALSE	0.050	225.000	0.000	NA		NA
3744107	3744108	CLC_2675	CLC_2676			TRUE	0.754	2.000	0.000	NA		NA
3744108	3744109	CLC_2676	CLC_2677			FALSE	0.021	359.000	0.000	1.000	N	NA
3744109	3744110	CLC_2677	CLC_2678			FALSE	0.137	220.000	0.000	1.000	N	NA
3744110	3744111	CLC_2678	CLC_2679			FALSE	0.587	77.000	0.004	NA		NA
3744113	3744114	CLC_2681	CLC_2682			FALSE	0.484	197.000	0.000	1.000	Y	NA
3744116	3744117	CLC_2684	CLC_2685			FALSE	0.008	391.000	0.000	1.000		NA
3744117	3744118	CLC_2685	CLC_2686			FALSE	0.028	267.000	0.000	NA		NA
3744118	3744119	CLC_2686	CLC_2687			TRUE	0.854	133.000	0.500	NA		NA
3744119	3744120	CLC_2687	CLC_2688			FALSE	0.002	517.000	0.000	NA		NA
3744120	3744121	CLC_2688	CLC_2689		nrdB	FALSE	0.009	344.000	0.000	NA		NA
3744121	3744122	CLC_2689	CLC_2690	nrdB	nrdA	FALSE	0.082	196.000	0.000	NA		NA
3744122	3744123	CLC_2690	CLC_2691	nrdA		FALSE	0.046	230.000	0.000	NA		NA
3744124	3744125	CLC_2692	CLC_2693			FALSE	0.391	237.000	0.167	NA		NA
3744126	3744127	CLC_2694	CLC_2695	dinB		FALSE	0.008	465.000	0.000	1.000	N	NA
3744127	3744128	CLC_2695	CLC_2696			TRUE	0.986	0.000	0.062	0.021	N	NA
3744128	3744129	CLC_2696	CLC_2697		pyrR-2	FALSE	0.009	447.000	0.000	1.000	N	NA
3744129	3744130	CLC_2697	CLC_2698	pyrR-2		FALSE	0.011	329.000	0.000	NA		NA
3744130	3744131	CLC_2698	CLC_2699			FALSE	0.004	430.000	0.000	NA		NA
3744131	3744132	CLC_2699	CLC_2700			TRUE	0.988	18.000	0.571	1.000	N	NA
3744134	3744135	CLC_2702	CLC_2703	ligT		FALSE	0.461	185.000	0.034	NA		NA
3744135	3744136	CLC_2703	CLC_2704			FALSE	0.040	240.000	0.000	NA		NA
3744139	3744140	CLC_2707	CLC_2708			TRUE	0.888	133.000	0.667	1.000		NA
3744141	3744142	CLC_2709	CLC_2710		nagB	FALSE	0.351	228.000	0.000	1.000	Y	NA
3744142	3744143	CLC_2710	CLC_2711	nagB	nagA	TRUE	0.966	68.000	0.273	0.001	Y	NA
3744143	3744144	CLC_2711	CLC_2712	nagA		TRUE	0.864	161.000	0.545	1.000	N	NA
3744147	3744148	CLC_2715	CLC_2716	nagE		FALSE	0.007	480.000	0.000	1.000	N	NA
3744149	3744150	CLC_2717	CLC_2718			FALSE	0.110	234.000	0.000	1.000	N	NA
3744150	3744151	CLC_2718	CLC_2719			TRUE	0.958	59.000	0.571	0.041	N	NA
3744151	3744152	CLC_2719	CLC_2720			FALSE	0.022	356.000	0.000	1.000	N	NA
3744153	3744154	CLC_2721	CLC_2722			TRUE	0.815	171.000	0.583	NA		NA
3744154	3744155	CLC_2722	CLC_2723			FALSE	0.002	538.000	0.000	NA		NA
3744155	3744156	CLC_2723	CLC_2724			TRUE	0.998	9.000	0.909	0.001	Y	NA
3744157	3744158	CLC_2725	CLC_2726			FALSE	0.082	219.000	0.000	1.000		NA
3744158	3744159	CLC_2726	CLC_2727			TRUE	0.998	5.000	0.800	0.041	Y	NA
3744159	3744160	CLC_2727	CLC_2728			TRUE	0.998	-3.000	0.800	0.029	Y	NA
3744162	3744163	CLC_2730	CLC_2731			FALSE	0.174	115.000	0.000	NA		NA
3744163	3744164	CLC_2731	CLC_2732			FALSE	0.002	640.000	0.000	NA		NA
3744164	3744165	CLC_2732	CLC_2733			FALSE	0.004	420.000	0.000	NA		NA
3744165	3744166	CLC_2733	CLC_2734			FALSE	0.011	329.000	0.000	NA		NA
3744166	3744167	CLC_2734	CLC_2735			FALSE	0.458	163.000	0.003	1.000		NA
3744167	3744168	CLC_2735	CLC_2736			FALSE	0.002	1027.000	0.000	1.000		NA
3744168	3744169	CLC_2736	CLC_2737			TRUE	0.725	5.000	0.000	NA		NA
3744169	3744170	CLC_2737	CLC_2738			TRUE	0.847	-19.000	0.000	NA		NA
3744170	3744171	CLC_2738	CLC_2739			FALSE	0.001	886.000	0.000	NA		NA
3744171	3744172	CLC_2739	CLC_2740			FALSE	0.233	72.000	0.000	NA		NA
3744174	3744175	CLC_2742	CLC_2743			FALSE	0.001	1809.000	0.000	NA		NA
3744175	3744176	CLC_2743	CLC_2744			TRUE	0.969	17.000	0.083	0.045		NA
3744176	3744177	CLC_2744	CLC_2745			TRUE	0.960	20.000	0.042	0.045		NA
3744177	3744178	CLC_2745	CLC_2746			FALSE	0.006	430.000	0.000	1.000		NA
3744178	3744179	CLC_2746	CLC_2747			FALSE	0.156	143.000	0.000	NA		NA
3744179	3744180	CLC_2747	CLC_2748			TRUE	0.637	21.000	0.000	NA		NA
3744180	3744181	CLC_2748	CLC_2749			FALSE	0.163	130.000	0.000	NA		NA
3744181	3744182	CLC_2749	CLC_2750			TRUE	0.915	102.000	1.000	NA		NA
3744184	3744185	CLC_2752	CLC_2753			FALSE	0.214	77.000	0.000	NA		NA
3744185	3744186	CLC_2753	CLC_2754			TRUE	0.713	7.000	0.000	NA		NA
3744186	3744187	CLC_2754	CLC_2755			FALSE	0.338	65.000	0.000	1.000		NA
3744188	3744189	CLC_2756	CLC_2757			FALSE	0.309	73.000	0.000	1.000		NA
3744190	3744191	CLC_2758	CLC_2759	rumA-1		FALSE	0.021	287.000	0.000	NA		NA
3744192	3744193	CLC_2760	CLC_2761			TRUE	0.968	26.000	0.214	1.000		NA
3744194	3744195	CLC_2762	CLC_2763	ribH	ribAB	TRUE	0.981	32.000	0.054	0.002	Y	NA
3744195	3744196	CLC_2763	CLC_2764	ribAB	ribE	FALSE	0.330	308.000	0.051	1.000	Y	NA
3744196	3744197	CLC_2764	CLC_2765	ribE	ribD	TRUE	0.998	-19.000	0.456	1.000	Y	NA
3744197	3744198	CLC_2765	CLC_2766	ribD	pepD-3	FALSE	0.013	404.000	0.000	1.000	N	NA
3744200	3744201	CLC_2768	CLC_2769	mgtA		FALSE	0.001	743.000	0.000	NA		NA
3744201	3744202	CLC_2769	CLC_2770		purD	FALSE	0.011	328.000	0.000	NA		NA
3744202	3744203	CLC_2770	CLC_2771	purD	purH	TRUE	0.909	149.000	0.238	1.000	Y	NA
3744203	3744204	CLC_2771	CLC_2772	purH	purN	TRUE	0.781	214.000	0.225	1.000	Y	NA
3744204	3744205	CLC_2772	CLC_2773	purN	purM	TRUE	0.942	128.000	0.238	0.001	Y	NA
3744205	3744206	CLC_2773	CLC_2774	purM	purF-1	TRUE	0.956	61.000	0.248	1.000	Y	NA
3744206	3744207	CLC_2774	CLC_2775	purF-1	purC	TRUE	0.890	92.000	0.082	1.000	Y	NA
3744207	3744208	CLC_2775	CLC_2776	purC	purE	TRUE	0.991	0.000	0.035	1.000	Y	NA
3744210	3744211	CLC_2778	CLC_2779			FALSE	0.018	375.000	0.000	1.000	N	NA
3744211	3744212	CLC_2779	CLC_2780			TRUE	0.951	26.000	0.033	1.000	N	NA
3744212	3744213	CLC_2780	CLC_2781			TRUE	0.977	31.000	0.443	1.000	N	NA
3744213	3744214	CLC_2781	CLC_2782			TRUE	0.965	36.000	0.049	1.000	Y	NA
3744214	3744215	CLC_2782	CLC_2783		hydA	FALSE	0.025	342.000	0.000	1.000	N	NA
3744215	3744216	CLC_2783	CLC_2784	hydA		TRUE	0.930	50.000	0.012	1.000	Y	NA
3744216	3744217	CLC_2784	CLC_2785		dpaL	TRUE	0.971	22.000	0.133	1.000	N	NA
3744217	3744218	CLC_2785	CLC_2786	dpaL		FALSE	0.056	285.000	0.000	1.000	N	NA
3744219	3744220	CLC_2787	CLC_2788			TRUE	0.960	15.000	0.104	NA		NA
3744220	3744221	CLC_2788	CLC_2789			TRUE	0.985	-19.000	0.109	NA		NA
3744221	3744222	CLC_2789	CLC_2790			TRUE	0.985	-18.000	0.109	NA		NA
3744222	3744223	CLC_2790	CLC_2791			TRUE	0.945	26.000	0.032	NA	N	NA
3744223	3744224	CLC_2791	CLC_2792			TRUE	0.981	-3.000	0.047	1.000	N	NA
3744224	3744225	CLC_2792	CLC_2793			TRUE	0.998	-3.000	0.862	1.000	Y	NA
3744225	3744226	CLC_2793	CLC_2794			TRUE	0.938	52.000	0.031	1.000	Y	NA
3744226	3744227	CLC_2794	CLC_2795			TRUE	0.852	138.000	0.500	NA		NA
3744227	3744228	CLC_2795	CLC_2796			TRUE	0.651	128.000	0.053	NA		NA
3744229	3744230	CLC_2797	CLC_2798			FALSE	0.011	331.000	0.000	NA		NA
3744230	3744231	CLC_2798	CLC_2799			FALSE	0.006	528.000	0.000	0.081		NA
3744231	3744232	CLC_2799	CLC_2800			FALSE	0.002	950.000	0.000	1.000		NA
3744232	3744233	CLC_2800	CLC_2801		trmU-2	FALSE	0.003	507.000	0.000	1.000		NA
3744235	3744236	CLC_2803	CLC_2804			TRUE	0.962	0.000	0.005	NA	N	NA
3744238	3744239	CLC_2806	CLC_2807		thiC	TRUE	0.899	19.000	0.003	NA		NA
3744239	3744240	CLC_2807	CLC_2808	thiC	purF-2	FALSE	0.349	211.000	0.003	1.000	N	NA
3744240	3744241	CLC_2808	CLC_2809	purF-2		FALSE	0.030	263.000	0.000	NA		NA
3744241	3744242	CLC_2809	CLC_2810			TRUE	0.723	56.000	0.008	NA		NA
3744242	3744243	CLC_2810	CLC_2811			TRUE	0.754	2.000	0.000	NA		NA
3744243	3744244	CLC_2811	CLC_2812			TRUE	0.965	7.000	0.083	NA		NA
3744244	3744245	CLC_2812	CLC_2813			TRUE	0.702	207.000	0.375	1.000	N	NA
3744246	3744247	CLC_2814	CLC_2815		ribB	FALSE	0.002	590.000	0.000	NA		NA
3744249	3744250	CLC_2817	CLC_2818			FALSE	0.254	89.000	0.000	1.000		NA
3744250	3744251	CLC_2818	CLC_2819			TRUE	0.988	23.000	0.917	NA		NA
3744252	3744253	CLC_2820	CLC_2821			TRUE	0.759	117.000	0.167	NA		NA
3744253	3744254	CLC_2821	CLC_2822			FALSE	0.015	308.000	0.000	NA		NA
3744254	3744255	CLC_2822	CLC_2823			FALSE	0.009	379.000	0.000	1.000		NA
3744257	3744258	CLC_2825	CLC_2826			FALSE	0.064	210.000	0.000	NA		NA
3744258	3744259	CLC_2826	CLC_2827			FALSE	0.174	98.000	0.000	NA		NA
10195470	3744261	CLC_3733	CLC_2829			FALSE	0.174	110.000	0.000	NA		NA
3744261	3744262	CLC_2829	CLC_2830			TRUE	0.812	139.000	0.342	NA		NA
3744262	3744263	CLC_2830	CLC_2831			TRUE	0.990	-9.000	0.283	NA		NA
3744263	3744264	CLC_2831	CLC_2832			TRUE	0.685	76.000	0.028	NA		NA
3744264	3744265	CLC_2832	CLC_2833		rpoD	TRUE	0.689	74.000	0.026	NA		NA
3744265	3744266	CLC_2833	CLC_2834	rpoD	dnaG	TRUE	0.975	25.000	0.209	1.000	N	NA
3744266	3744267	CLC_2834	CLC_2835	dnaG		FALSE	0.236	284.000	0.056	1.000	N	NA
3744269	3744270	CLC_2837	CLC_2838	ppdK		TRUE	0.670	80.000	0.019	1.000		NA
3744270	3744271	CLC_2838	CLC_2839			FALSE	0.002	510.000	0.000	NA		NA
3744271	3744272	CLC_2839	CLC_2840			TRUE	0.740	3.000	0.000	NA		NA
3744272	3744273	CLC_2840	CLC_2841		era	FALSE	0.005	399.000	0.000	NA		NA
3744273	3744274	CLC_2841	CLC_2842	era	cdd	TRUE	0.959	16.000	0.077	1.000		NA
3744274	3744275	CLC_2842	CLC_2843	cdd		TRUE	0.756	84.000	0.040	1.000	N	NA
3744275	3744276	CLC_2843	CLC_2844			TRUE	0.840	39.000	0.023	NA		NA
3744276	3744277	CLC_2844	CLC_2845			TRUE	0.984	-3.000	0.182	NA		NA
3744277	3744278	CLC_2845	CLC_2846			TRUE	0.933	23.000	0.032	NA		NA
3744278	3744279	CLC_2846	CLC_2847		yqfC	TRUE	0.996	-10.000	0.851	NA		NA
3744279	3744280	CLC_2847	CLC_2848	yqfC		TRUE	0.625	114.000	0.029	NA		NA
3744280	3744281	CLC_2848	CLC_2849		rpsU	TRUE	0.933	43.000	0.150	0.022		NA
3744281	3744282	CLC_2849	CLC_2850	rpsU		TRUE	0.689	137.000	0.071	1.000		NA
3744282	3744283	CLC_2850	CLC_2851			TRUE	0.889	57.000	0.051	0.033	N	NA
3744283	3744284	CLC_2851	CLC_2852			TRUE	0.981	0.000	0.163	NA		NA
3744284	3744285	CLC_2852	CLC_2853		prmA	TRUE	0.791	98.000	0.227	NA		NA
3744285	3744286	CLC_2853	CLC_2854	prmA	dnaJ	TRUE	0.684	178.000	0.133	1.000	N	NA
3744286	3744287	CLC_2854	CLC_2855	dnaJ	dnaK	TRUE	0.930	143.000	0.196	0.002	Y	NA
3744287	3744288	CLC_2855	CLC_2856	dnaK	grpE	TRUE	0.973	55.000	0.224	0.004	Y	NA
3744288	3744289	CLC_2856	CLC_2857	grpE	hrcA	TRUE	0.977	27.000	0.286	1.000	N	NA
3744289	3744290	CLC_2857	CLC_2858	hrcA		FALSE	0.539	201.000	0.062	1.000	N	NA
3744290	3744291	CLC_2858	CLC_2859		lepA	TRUE	0.960	27.000	0.083	1.000	N	NA
3744291	3744292	CLC_2859	CLC_2860	lepA		FALSE	0.494	141.000	0.004	NA		NA
3744292	3744293	CLC_2860	CLC_2861			TRUE	0.765	71.000	0.077	NA		NA
3744293	3744294	CLC_2861	CLC_2862		gpr	TRUE	0.765	185.000	0.521	NA		NA
3744296	3744297	CLC_2864	CLC_2865	holA		TRUE	0.951	29.000	0.163	NA		NA
3744297	3744298	CLC_2865	CLC_2866			TRUE	0.915	12.000	0.002	NA		NA
3744298	3744299	CLC_2866	CLC_2867			TRUE	0.689	105.000	0.077	NA		NA
3744299	3744300	CLC_2867	CLC_2868			FALSE	0.002	509.000	0.000	NA		NA
3744301	3744302	CLC_2869	CLC_2871			FALSE	0.001	996.000	0.000	NA		NA
3744303	3744304	CLC_2872	CLC_2873	selB	selA	TRUE	0.991	19.000	0.569	0.001	N	NA
3744304	3744305	CLC_2873	CLC_2874	selA	selD	TRUE	0.917	67.000	0.055	1.000	Y	NA
3744305	3744306	CLC_2874	CLC_2875	selD		FALSE	0.365	106.000	0.000	1.000	N	NA
3744308	3744309	CLC_2877	CLC_2878			FALSE	0.257	326.000	0.047	NA	Y	NA
3744309	3744310	CLC_2878	CLC_2879			TRUE	0.978	16.000	0.231	NA	N	NA
3744310	3744311	CLC_2879	CLC_2880			TRUE	0.961	11.000	0.033	NA	N	NA
3744311	3744312	CLC_2880	CLC_2881		nadD	TRUE	0.926	83.000	0.199	1.000	Y	NA
3744312	3744313	CLC_2881	CLC_2882	nadD		FALSE	0.418	243.000	0.150	NA	N	NA
3744313	3744314	CLC_2882	CLC_2883		obg	TRUE	0.933	27.000	0.046	NA		NA
3744314	3744315	CLC_2883	CLC_2884	obg	rpmA	FALSE	0.135	379.000	0.335	1.000		NA
3744315	3744316	CLC_2884	CLC_2885	rpmA		TRUE	0.993	3.000	0.203	NA	Y	NA
3744316	3744317	CLC_2885	CLC_2886		rplU	TRUE	0.993	3.000	0.208	NA	Y	NA
3744317	3744318	CLC_2886	CLC_2887	rplU		TRUE	0.876	124.000	0.018	0.017	Y	NA
3744318	3744319	CLC_2887	CLC_2888			TRUE	0.704	158.000	0.180	NA		NA
3744319	3744320	CLC_2888	CLC_2889			TRUE	0.994	-22.000	0.420	NA		NA
3744320	3744321	CLC_2889	CLC_2890			TRUE	0.735	113.000	0.098	1.000		NA
3744321	3744322	CLC_2890	CLC_2891			TRUE	0.912	55.000	0.135	0.006		NA
3744322	3744323	CLC_2891	CLC_2892		rodA-2	FALSE	0.033	320.000	0.000	1.000	N	NA
3744323	3744324	CLC_2892	CLC_2893	rodA-2	minE	TRUE	0.814	99.000	0.008	NA	Y	NA
3744324	3744325	CLC_2893	CLC_2894	minE	minD	TRUE	0.992	14.000	0.347	NA	Y	NA
3744325	3744326	CLC_2894	CLC_2895	minD	minC	TRUE	0.992	18.000	0.368	1.000	Y	NA
3744326	3744327	CLC_2895	CLC_2896	minC		FALSE	0.573	175.000	0.060	1.000		NA
3744327	3744328	CLC_2896	CLC_2897		mreD	TRUE	0.956	20.000	0.089	1.000		NA
3744328	3744329	CLC_2897	CLC_2898	mreD	mreC	TRUE	0.992	11.000	0.550	0.002		NA
3744329	3744330	CLC_2898	CLC_2899	mreC		TRUE	0.992	7.000	0.689	1.000	N	NA
3744330	3744331	CLC_2899	CLC_2900			TRUE	0.944	29.000	0.040	1.000	N	NA
3744331	3744332	CLC_2900	CLC_2901		maf	TRUE	0.964	15.000	0.074	NA	N	NA
3744332	3744333	CLC_2901	CLC_2902	maf		TRUE	0.936	16.000	0.026	NA		NA
3744333	3744334	CLC_2902	CLC_2903			TRUE	0.831	110.000	0.357	NA		NA
3744334	3744335	CLC_2903	CLC_2904			FALSE	0.550	226.000	0.364	NA		NA
3744337	3744338	CLC_2906	CLC_2907	pheB		TRUE	0.751	57.000	0.020	NA		NA
3744338	10195471	CLC_2907	CLC_3735			TRUE	0.830	-10.000	0.000	NA		NA
3744340	3744341	CLC_2909	CLC_2910		coaE	TRUE	0.877	39.000	0.058	NA		NA
3744341	3744342	CLC_2910	CLC_2911	coaE	polA	TRUE	0.970	12.000	0.068	1.000	N	NA
3744342	3744343	CLC_2911	CLC_2912	polA	aroC	TRUE	0.935	18.000	0.003	1.000	N	NA
3744343	3744344	CLC_2912	CLC_2913	aroC		FALSE	0.588	142.000	0.002	1.000	N	NA
3744344	3744345	CLC_2913	CLC_2914			TRUE	0.902	147.000	1.000	NA		NA
3744345	3744346	CLC_2914	CLC_2915			TRUE	0.989	19.000	1.000	NA		NA
3744346	3744347	CLC_2915	CLC_2916			TRUE	0.801	156.000	0.400	NA		NA
3744347	3744348	CLC_2916	CLC_2917			FALSE	0.226	74.000	0.000	NA		NA
3744348	3744349	CLC_2917	CLC_2918			FALSE	0.174	97.000	0.000	NA		NA
3744349	3744350	CLC_2918	CLC_2919			TRUE	0.670	14.000	0.000	NA		NA
3744350	3744351	CLC_2919	CLC_2920			FALSE	0.174	98.000	0.000	NA		NA
3744351	3744352	CLC_2920	CLC_2921			TRUE	0.985	12.000	0.500	NA		NA
3744352	3744353	CLC_2921	CLC_2922			TRUE	0.687	12.000	0.000	NA		NA
3744353	3744354	CLC_2922	CLC_2923			TRUE	0.719	6.000	0.000	NA		NA
3744354	3744355	CLC_2923	CLC_2924			TRUE	0.986	15.000	0.600	NA		NA
3744355	3744356	CLC_2924	CLC_2925			TRUE	0.984	23.000	0.600	NA		NA
3744356	3744357	CLC_2925	CLC_2926			TRUE	0.989	2.000	0.500	NA		NA
3744357	3744358	CLC_2926	CLC_2927			TRUE	0.984	15.000	0.500	NA		NA
3744358	3744359	CLC_2927	CLC_2928			TRUE	0.986	13.000	0.600	NA		NA
3744359	3744360	CLC_2928	CLC_2929			TRUE	0.992	-13.000	0.400	NA		NA
3744360	3744361	CLC_2929	CLC_2930			TRUE	0.677	13.000	0.000	NA		NA
3744361	3744362	CLC_2930	CLC_2931			FALSE	0.219	76.000	0.000	NA		NA
3744362	3744363	CLC_2931	CLC_2932			TRUE	0.965	35.000	0.500	NA		NA
3744363	3744364	CLC_2932	CLC_2933			TRUE	0.988	16.000	0.750	NA		NA
3744364	3744365	CLC_2933	CLC_2934			TRUE	0.991	5.000	0.750	NA		NA
3744365	3744366	CLC_2934	CLC_2935			TRUE	0.991	6.000	0.750	NA		NA
3744366	3744367	CLC_2935	CLC_2936			TRUE	0.991	5.000	0.750	NA		NA
3744367	3744368	CLC_2936	CLC_2937			TRUE	0.991	0.000	0.500	NA		NA
3744368	3744369	CLC_2937	CLC_2938			FALSE	0.001	687.000	0.000	NA		NA
3744369	3744370	CLC_2938	CLC_2939			TRUE	0.762	173.000	0.400	NA		NA
3744370	3744371	CLC_2939	CLC_2940			TRUE	0.957	57.000	1.000	NA		NA
3744371	3744372	CLC_2940	CLC_2941			TRUE	0.830	-10.000	0.000	NA		NA
3744372	3744373	CLC_2941	CLC_2942			FALSE	0.173	118.000	0.000	NA		NA
3744373	3744374	CLC_2942	CLC_2943			TRUE	0.952	62.000	0.667	0.021		NA
3744375	3744376	CLC_2944	CLC_2945			FALSE	0.017	302.000	0.000	NA		NA
3744376	3744377	CLC_2945	CLC_2947			FALSE	0.002	564.000	0.000	NA		NA
3744377	3744378	CLC_2947	CLC_2948			FALSE	0.004	431.000	0.000	NA		NA
3744378	3744379	CLC_2948	CLC_2949			TRUE	0.972	13.000	0.200	NA		NA
3744380	3744381	CLC_2950	CLC_2951			TRUE	0.841	185.000	1.000	NA		NA
3744381	3744382	CLC_2951	CLC_2952			FALSE	0.040	239.000	0.000	NA		NA
3744382	3744383	CLC_2952	CLC_2953			TRUE	0.917	57.000	0.400	NA		NA
3744383	3744384	CLC_2953	CLC_2954			TRUE	0.807	141.000	0.333	NA		NA
3744386	3744387	CLC_2956	CLC_2957	aspS-2	hisS	TRUE	0.961	41.000	0.028	0.032	Y	NA
3744387	3744388	CLC_2957	CLC_2958	hisS		TRUE	0.969	19.000	0.111	1.000	N	NA
3744388	3744389	CLC_2958	CLC_2959			TRUE	0.878	38.000	0.035	1.000		NA
3744389	3744390	CLC_2959	CLC_2960		dtd	TRUE	0.796	61.000	0.048	1.000		NA
3744390	3744391	CLC_2960	CLC_2961	dtd	relA	TRUE	0.932	43.000	0.177	1.000	N	NA
3744391	3744392	CLC_2961	CLC_2962	relA	apt	TRUE	0.746	124.000	0.068	1.000	N	NA
3744392	3744393	CLC_2962	CLC_2963	apt		FALSE	0.589	109.000	0.010	1.000		NA
3744393	3744394	CLC_2963	CLC_2964		secF	FALSE	0.302	229.000	0.028	1.000		NA
3744394	3744395	CLC_2964	CLC_2965	secF	secD	TRUE	0.998	2.000	0.516	0.001	Y	NA
3744395	3744396	CLC_2965	CLC_2966	secD		TRUE	0.690	94.000	0.048	1.000		NA
3744396	3744397	CLC_2966	CLC_2967			TRUE	0.833	157.000	0.540	NA		NA
3744397	3744398	CLC_2967	CLC_2968			TRUE	0.791	90.000	0.212	NA		NA
3744398	3744399	CLC_2968	CLC_2969		yajC	TRUE	0.820	55.000	0.055	NA		NA
3744399	3744400	CLC_2969	CLC_2970	yajC	tgt	FALSE	0.550	180.000	0.035	NA	N	NA
3744400	3744401	CLC_2970	CLC_2971	tgt	queA	TRUE	0.944	56.000	0.014	0.001	Y	NA
3744401	3744402	CLC_2971	CLC_2972	queA	ruvB	TRUE	0.934	34.000	0.069	1.000	N	NA
3744402	3744403	CLC_2972	CLC_2973	ruvB	ruvA	TRUE	0.996	20.000	0.549	0.002	Y	NA
3744403	3744404	CLC_2973	CLC_2974	ruvA		FALSE	0.375	182.000	0.007	NA		NA
3744404	3744405	CLC_2974	CLC_2975			FALSE	0.032	377.000	0.003	NA		NA
3744405	3744406	CLC_2975	CLC_2976			FALSE	0.518	151.000	0.015	NA		NA
3744406	3744407	CLC_2976	CLC_2977			TRUE	0.744	16.000	0.000	1.000		NA
3744407	3744408	CLC_2977	CLC_2978			FALSE	0.257	88.000	0.000	1.000		NA
3744408	3744409	CLC_2978	CLC_2979			FALSE	0.267	286.000	0.176	1.000		NA
3744409	3744410	CLC_2979	CLC_2980			TRUE	0.639	150.000	0.071	NA		NA
3744410	3744411	CLC_2980	CLC_2981			FALSE	0.541	173.000	0.051	NA		NA
3744411	3744412	CLC_2981	CLC_2982			FALSE	0.530	129.000	0.002	1.000		NA
3744416	3744417	CLC_2986	CLC_2987			TRUE	0.979	16.000	0.386	NA		NA
3744417	3744418	CLC_2987	CLC_2988			TRUE	0.977	23.000	0.386	NA		NA
3744418	3744419	CLC_2988	CLC_2989		sigF	FALSE	0.459	202.000	0.078	NA		NA
3744419	3744420	CLC_2989	CLC_2990	sigF	spoIIAB	TRUE	0.991	19.000	0.842	1.000	N	NA
3744420	3744421	CLC_2990	CLC_2991	spoIIAB	spoIIAA	TRUE	0.997	17.000	0.669	0.001	Y	NA
3744421	3744422	CLC_2991	CLC_2992	spoIIAA		FALSE	0.025	301.000	0.000	1.000		NA
3744424	3744425	CLC_2994	CLC_2995			FALSE	0.224	328.000	0.024	NA	Y	NA
3744425	3744426	CLC_2995	CLC_2996			TRUE	0.950	21.000	0.079	NA		NA
3744426	3744427	CLC_2996	CLC_2997		mviN	FALSE	0.078	398.000	0.053	0.003		NA
3744427	3744428	CLC_2997	CLC_2998	mviN		TRUE	0.954	19.000	0.075	1.000		NA
3744428	3744429	CLC_2998	CLC_2999			TRUE	0.763	110.000	0.000	0.015	Y	NA
3744429	3744430	CLC_2999	CLC_3000			TRUE	0.667	115.000	0.000	NA	Y	NA
3744430	3744431	CLC_3000	CLC_3001			TRUE	0.861	78.000	0.016	NA	Y	NA
3744431	3744432	CLC_3001	CLC_3002			TRUE	0.988	19.000	0.146	1.000	Y	NA
3744432	3744433	CLC_3002	CLC_3003			TRUE	0.992	0.000	0.077	1.000	Y	NA
3744433	3744434	CLC_3003	CLC_3004			TRUE	0.976	23.000	0.176	0.015		NA
3744434	3744435	CLC_3004	CLC_3005			TRUE	0.991	-10.000	0.375	NA		NA
3744435	3744436	CLC_3005	CLC_3006			TRUE	0.665	15.000	0.000	NA		NA
3744436	3744437	CLC_3006	CLC_3007			FALSE	0.542	37.000	0.000	1.000		NA
3744437	3744438	CLC_3007	CLC_3008			TRUE	0.631	31.000	0.000	1.000		NA
3744438	3744439	CLC_3008	CLC_3009			FALSE	0.238	100.000	0.000	1.000		NA
3744439	3744440	CLC_3009	CLC_3010			TRUE	0.884	63.000	0.154	0.039		NA
3744440	3744441	CLC_3010	CLC_3011			TRUE	0.855	130.000	0.035	1.000	Y	NA
3744441	3744442	CLC_3011	CLC_3012			TRUE	0.770	181.000	0.037	1.000	Y	NA
3744442	3744443	CLC_3012	CLC_3013			TRUE	0.948	195.000	1.000	0.003	Y	NA
3744443	3744444	CLC_3013	CLC_3014			FALSE	0.240	69.000	0.000	NA		NA
3744444	3744445	CLC_3014	CLC_3015			TRUE	0.847	-19.000	0.000	NA		NA
3744445	3744446	CLC_3015	CLC_3016		galU	FALSE	0.365	99.000	0.000	1.000	N	NA
3744446	3744447	CLC_3016	CLC_3017	galU		FALSE	0.448	50.000	0.000	1.000		NA
3744447	3744448	CLC_3017	CLC_3018			FALSE	0.213	145.000	0.000	1.000		NA
3744448	3744449	CLC_3018	CLC_3019			FALSE	0.009	986.000	0.002	1.000	N	NA
3744451	3744452	CLC_3021	CLC_3022			FALSE	0.080	198.000	0.000	NA		NA
3744452	3744453	CLC_3022	CLC_3023			FALSE	0.035	444.000	0.000	1.000	Y	NA
3744453	3744454	CLC_3023	CLC_3024			FALSE	0.042	236.000	0.000	NA		NA
3744454	3744455	CLC_3024	CLC_3025			FALSE	0.440	188.000	0.031	NA		NA
3744455	3744456	CLC_3025	CLC_3026			TRUE	0.747	133.000	0.078	1.000	N	NA
3744456	3744457	CLC_3026	CLC_3027			FALSE	0.002	574.000	0.000	NA		NA
3744459	3744460	CLC_3029	CLC_3030			FALSE	0.100	180.000	0.000	NA		NA
3744462	3744463	CLC_3032	CLC_3033		pheT	FALSE	0.396	205.000	0.038	NA		NA
3744463	3744464	CLC_3033	CLC_3034	pheT	pheS	TRUE	0.954	161.000	0.574	0.001	Y	NA
3744464	3744465	CLC_3034	CLC_3035	pheS		FALSE	0.165	348.000	0.006	1.000	Y	NA
3744465	3744466	CLC_3035	CLC_3036			TRUE	0.704	91.000	0.022	1.000	N	NA
3744466	3744467	CLC_3036	CLC_3037			TRUE	0.993	11.000	0.137	0.003	Y	NA
3744467	3744468	CLC_3037	CLC_3038		rplT	TRUE	0.622	124.000	0.004	1.000	N	NA
3744468	3744469	CLC_3038	CLC_3039	rplT	rpmI	TRUE	0.996	30.000	0.928	0.013	Y	NA
3744469	3744470	CLC_3039	CLC_3040	rpmI	infC	TRUE	0.995	22.000	0.652	1.000	Y	NA
3744470	3744471	CLC_3040	CLC_3041	infC	thrS	FALSE	0.443	255.000	0.007	1.000	Y	NA
3744471	3744472	CLC_3041	CLC_3042	thrS		FALSE	0.009	348.000	0.000	NA		NA
3744474	3744475	CLC_3044	CLC_3045			TRUE	0.993	2.000	0.952	NA		NA
3744476	3744477	CLC_3046	CLC_3047			TRUE	0.700	10.000	0.000	NA		NA
3744477	3744478	CLC_3047	CLC_3049			TRUE	0.725	5.000	0.000	NA		NA
3744478	3744479	CLC_3049	CLC_3051			TRUE	0.732	4.000	0.000	NA		NA
3744479	3744480	CLC_3051	CLC_3052			TRUE	0.719	6.000	0.000	NA		NA
3744481	3744482	CLC_3053	CLC_3054	hsp33		TRUE	0.915	38.000	0.063	1.000	N	NA
3744482	3744483	CLC_3054	CLC_3055			TRUE	0.721	86.000	0.056	1.000		NA
3744483	3744484	CLC_3055	CLC_3056			FALSE	0.026	299.000	0.000	1.000		NA
3744484	3744485	CLC_3056	CLC_3057			TRUE	0.998	0.000	0.444	0.001	Y	NA
3744485	3744486	CLC_3057	CLC_3058			TRUE	0.995	14.000	0.571	1.000	Y	NA
3744486	3744487	CLC_3058	CLC_3059			TRUE	0.991	16.000	0.124	0.026	Y	NA
3744487	3744488	CLC_3059	CLC_3060			TRUE	0.927	81.000	0.093	0.026	Y	NA
3744489	3744490	CLC_3061	CLC_3062	asd	dapA	TRUE	0.981	23.000	0.029	1.000	Y	NA
3744490	3744491	CLC_3062	CLC_3063	dapA	dapB-2	FALSE	0.595	223.000	0.022	1.000	Y	NA
3744494	3744495	CLC_3066	CLC_3067			TRUE	0.735	78.000	0.071	NA		NA
3744495	3744496	CLC_3067	CLC_3068			FALSE	0.413	199.000	0.034	NA		NA
3744500	3744501	CLC_3072	CLC_3073	folC	valS	FALSE	0.037	446.000	0.006	0.098	N	NA
3744501	3744502	CLC_3073	CLC_3074	valS		TRUE	0.974	21.000	0.002	1.000	Y	NA
3744502	3744503	CLC_3074	CLC_3075			FALSE	0.009	454.000	0.000	1.000	N	NA
3744503	3744504	CLC_3075	CLC_3076			TRUE	0.993	3.000	1.000	NA		NA
3744504	3744505	CLC_3076	CLC_3077			FALSE	0.003	458.000	0.000	NA		NA
3744506	3744507	CLC_3078	CLC_3079			FALSE	0.075	201.000	0.000	NA		NA
3744509	3744510	CLC_3081	CLC_3082			TRUE	0.998	-3.000	0.876	1.000	Y	NA
3744510	3744511	CLC_3082	CLC_3083			TRUE	0.633	144.000	0.034	1.000		NA
3744512	3744513	CLC_3084	CLC_3085		recX	TRUE	0.912	25.000	0.012	NA		NA
3744513	3744514	CLC_3085	CLC_3086	recX		TRUE	0.928	22.000	0.015	1.000		NA
3744515	3744516	CLC_3087	CLC_3088			TRUE	0.855	38.000	0.029	NA		NA
3744516	3744517	CLC_3088	CLC_3089			TRUE	0.794	57.000	0.029	1.000		NA
3744518	3744519	CLC_3090	CLC_3091			TRUE	0.799	42.000	0.011	NA		NA
3744519	3744520	CLC_3091	CLC_3092		proC	FALSE	0.542	128.000	0.011	NA		NA
3744520	3744521	CLC_3092	CLC_3093	proC		TRUE	0.856	112.000	0.286	1.000	N	NA
3744521	3744522	CLC_3093	CLC_3094			TRUE	0.994	7.000	0.583	0.002	N	NA
3744522	3744523	CLC_3094	CLC_3095			TRUE	0.852	64.000	0.167	1.000		NA
3744523	3744524	CLC_3095	CLC_3096			FALSE	0.002	635.000	0.000	1.000		NA
3744524	3744525	CLC_3096	CLC_3097			TRUE	0.795	37.000	0.002	NA		NA
3744525	3744526	CLC_3097	CLC_3098			TRUE	0.972	12.000	0.182	NA		NA
3744526	3744527	CLC_3098	CLC_3099			TRUE	0.965	23.000	0.182	NA		NA
3744528	3744529	CLC_3100	CLC_3101			FALSE	0.240	69.000	0.000	NA		NA
3744531	3744532	CLC_3103	CLC_3104			TRUE	0.990	3.000	0.583	NA		NA
3744532	3744533	CLC_3104	CLC_3105			TRUE	0.995	-19.000	0.600	NA		NA
3744534	3744535	CLC_3106	CLC_3107			FALSE	0.021	358.000	0.000	1.000	N	NA
3744535	3744536	CLC_3107	CLC_3108			TRUE	0.997	13.000	0.714	0.017	Y	NA
3744536	3744537	CLC_3108	CLC_3109		bcd	TRUE	0.989	12.000	0.364	0.039	N	NA
3744537	3744538	CLC_3109	CLC_3110	bcd		TRUE	0.890	194.000	0.500	1.000	Y	NA
3744538	3744539	CLC_3110	CLC_3111		hbd	TRUE	0.983	25.000	0.054	1.000	Y	NA
3744539	3744540	CLC_3111	CLC_3112	hbd	crt	TRUE	0.990	31.000	0.486	1.000	Y	NA
3744540	3744541	CLC_3112	CLC_3113	crt		FALSE	0.004	416.000	0.000	NA		NA
3744541	3744542	CLC_3113	CLC_3114			TRUE	0.900	44.000	0.154	NA		NA
3744542	3744543	CLC_3114	CLC_3115			FALSE	0.036	276.000	0.000	1.000		NA
3744543	3744544	CLC_3115	CLC_3116			FALSE	0.007	402.000	0.000	1.000		NA
3744544	3744545	CLC_3116	CLC_3117			TRUE	0.811	68.000	0.100	1.000		NA
3744545	3744546	CLC_3117	CLC_3118			FALSE	0.121	165.000	0.000	NA		NA
3744546	3744547	CLC_3118	CLC_3119		lgt	FALSE	0.173	102.000	0.000	NA		NA
3744547	3744548	CLC_3119	CLC_3120	lgt		FALSE	0.094	209.000	0.000	1.000		NA
3744548	3744549	CLC_3120	CLC_3121			TRUE	0.799	43.000	0.012	NA		NA
3744551	3744552	CLC_3123	CLC_3124			FALSE	0.582	195.000	0.080	1.000	N	NA
3744552	3744553	CLC_3124	CLC_3125		pflA	FALSE	0.004	642.000	0.000	1.000	N	NA
3744553	3744554	CLC_3125	CLC_3126	pflA	pfl	TRUE	0.696	180.000	0.163	1.000	N	NA
3744554	3744555	CLC_3126	CLC_3127	pfl		FALSE	0.002	512.000	0.000	NA		NA
3744555	3744556	CLC_3127	CLC_3128			FALSE	0.004	428.000	0.000	NA		NA
3744556	3744557	CLC_3128	CLC_3129			FALSE	0.400	167.000	0.002	NA		NA
3744561	3744562	CLC_3133	CLC_3134			FALSE	0.059	215.000	0.000	NA		NA
3744562	3744563	CLC_3134	CLC_3135			FALSE	0.320	55.000	0.000	NA		NA
3744563	3744564	CLC_3135	CLC_3136			FALSE	0.343	52.000	0.000	NA		NA
3744564	3744565	CLC_3136	CLC_3137			FALSE	0.056	219.000	0.000	NA		NA
3744565	3744566	CLC_3137	CLC_3138			TRUE	0.902	24.000	0.005	NA		NA
3744566	3744567	CLC_3138	CLC_3139		lon	TRUE	0.954	15.000	0.048	1.000		NA
3744567	3744568	CLC_3139	CLC_3140	lon	lonB	TRUE	0.909	138.000	0.072	0.001	Y	NA
3744568	3744569	CLC_3140	CLC_3141	lonB	clpX	TRUE	0.900	128.000	0.042	0.002	Y	NA
3744569	3744570	CLC_3141	CLC_3142	clpX	clpP-2	TRUE	0.979	20.000	0.022	1.000	Y	NA
3744570	3744571	CLC_3142	CLC_3143	clpP-2	tig	TRUE	0.844	126.000	0.024	1.000	Y	NA
3744571	3744572	CLC_3143	CLC_3144	tig		FALSE	0.460	178.000	0.005	NA	N	NA
3744572	3744573	CLC_3144	CLC_3145			TRUE	0.779	107.000	0.211	NA		NA
3744573	3744574	CLC_3145	CLC_3146		pyrE	FALSE	0.060	214.000	0.000	NA		NA
3744574	3744575	CLC_3146	CLC_3147	pyrE	pyrD	TRUE	0.971	34.000	0.060	1.000	Y	NA
3744575	3744576	CLC_3147	CLC_3148	pyrD	pyrK	TRUE	0.994	0.000	0.592	1.000	N	NA
3744576	3744577	CLC_3148	CLC_3149	pyrK	pyrF	TRUE	0.828	145.000	0.112	0.002	N	NA
3744577	3744578	CLC_3149	CLC_3150	pyrF	pyrC	TRUE	0.984	24.000	0.064	1.000	Y	NA
3744578	3744579	CLC_3150	CLC_3151	pyrC	pyrI	TRUE	0.981	22.000	0.032	1.000	Y	NA
3744579	3744580	CLC_3151	CLC_3152	pyrI	pyrB	TRUE	0.996	2.000	0.197	0.001	Y	NA
3744580	3744581	CLC_3152	CLC_3153	pyrB		FALSE	0.069	255.000	0.000	NA	N	NA
3744581	3744582	CLC_3153	CLC_3154			TRUE	0.938	23.000	0.039	NA		NA
3744582	3744583	CLC_3154	CLC_3155			FALSE	0.008	360.000	0.000	NA		NA
3744583	3744584	CLC_3155	CLC_3156			TRUE	0.849	129.000	0.041	NA	Y	NA
3744584	3744585	CLC_3156	CLC_3157			TRUE	0.667	112.000	0.053	NA		NA
3744585	3744586	CLC_3157	CLC_3158			TRUE	0.906	37.000	0.105	NA		NA
3744586	3744587	CLC_3158	CLC_3159			TRUE	0.778	0.000	0.000	NA		NA
3744587	3744588	CLC_3159	CLC_3160			TRUE	0.861	-51.000	0.000	NA		NA
3744588	3744589	CLC_3160	CLC_3161			TRUE	0.940	52.000	0.500	NA		NA
3744589	3744590	CLC_3161	CLC_3162			TRUE	0.705	9.000	0.000	NA		NA
3744590	3744591	CLC_3162	CLC_3163			TRUE	0.713	7.000	0.000	NA		NA
3744591	3744592	CLC_3163	CLC_3164			TRUE	0.951	28.000	0.105	1.000		NA
3744592	3744593	CLC_3164	CLC_3165			TRUE	0.973	18.000	0.263	NA		NA
3744593	3744594	CLC_3165	CLC_3166			TRUE	0.950	16.000	0.056	NA		NA
3744594	3744595	CLC_3166	CLC_3167			TRUE	0.974	0.000	0.078	NA		NA
3744596	3744597	CLC_3168	CLC_3169			TRUE	0.618	26.000	0.000	NA		NA
3744597	3744598	CLC_3169	CLC_3171			FALSE	0.551	30.000	0.000	NA		NA
3744598	3744599	CLC_3171	CLC_3172			FALSE	0.604	27.000	0.000	NA		NA
3744599	3744600	CLC_3172	CLC_3174			TRUE	0.719	6.000	0.000	NA		NA
3744600	3744601	CLC_3174	CLC_3175			TRUE	0.713	7.000	0.000	NA		NA
3744601	3744602	CLC_3175	CLC_3176			TRUE	0.705	9.000	0.000	NA		NA
3744602	3744603	CLC_3176	CLC_3178			FALSE	0.247	67.000	0.000	NA		NA
3744603	3744604	CLC_3178	CLC_3180			TRUE	0.660	16.000	0.000	NA		NA
3744604	3744605	CLC_3180	CLC_3182			TRUE	0.732	4.000	0.000	NA		NA
3744605	3744606	CLC_3182	CLC_3184			TRUE	0.725	5.000	0.000	NA		NA
3744606	3744607	CLC_3184	CLC_3185			TRUE	0.660	16.000	0.000	NA		NA
3744607	3744608	CLC_3185	CLC_3187			TRUE	0.719	6.000	0.000	NA		NA
3744608	3744609	CLC_3187	CLC_3188			TRUE	0.713	7.000	0.000	NA		NA
3744609	3744610	CLC_3188	CLC_3189			TRUE	0.705	9.000	0.000	NA		NA
3744610	3744611	CLC_3189	CLC_3191			FALSE	0.247	67.000	0.000	NA		NA
3744611	3744612	CLC_3191	CLC_3193			TRUE	0.660	16.000	0.000	NA		NA
3744612	3744613	CLC_3193	CLC_3195			TRUE	0.732	4.000	0.000	NA		NA
3744613	3744614	CLC_3195	CLC_3197			TRUE	0.725	5.000	0.000	NA		NA
3744614	3744615	CLC_3197	CLC_3199			TRUE	0.709	8.000	0.000	NA		NA
3744615	3744616	CLC_3199	CLC_3200			TRUE	0.713	7.000	0.000	NA		NA
3744616	3744617	CLC_3200	CLC_3202			TRUE	0.709	8.000	0.000	NA		NA
3744618	3744619	CLC_3203	CLC_3204			TRUE	0.970	17.000	0.085	0.018		NA
3744620	3744621	CLC_3205	CLC_3206			TRUE	0.817	113.000	0.300	NA		NA
3744622	3744623	CLC_3207	CLC_3208		gatB	FALSE	0.555	154.000	0.002	1.000	N	NA
3744623	3744624	CLC_3208	CLC_3209	gatB	gatA	TRUE	0.990	36.000	0.492	0.001	Y	NA
3744624	3744625	CLC_3209	CLC_3210	gatA	gatC	TRUE	0.992	37.000	0.643	0.001	Y	NA
3744625	3744626	CLC_3210	CLC_3211	gatC		FALSE	0.602	135.000	0.002	1.000	N	NA
3744626	3744627	CLC_3211	CLC_3212			FALSE	0.018	297.000	0.000	NA		NA
3744627	3744628	CLC_3212	CLC_3213		ligA	TRUE	0.766	101.000	0.182	NA		NA
3744628	3744629	CLC_3213	CLC_3214	ligA	pcrA	TRUE	0.989	12.000	0.039	0.012	Y	NA
3744629	3744630	CLC_3214	CLC_3215	pcrA		TRUE	0.624	127.000	0.025	1.000		NA
3744630	3744631	CLC_3215	CLC_3216			FALSE	0.026	298.000	0.000	1.000		NA
3744631	3744632	CLC_3216	CLC_3217			TRUE	0.682	84.000	0.041	NA		NA
3744632	3744633	CLC_3217	CLC_3218			TRUE	0.957	14.000	0.083	NA		NA
3744635	3744636	CLC_3220	CLC_3221		pgi	TRUE	0.940	11.000	0.018	NA		NA
3744636	3744637	CLC_3221	CLC_3222	pgi		FALSE	0.561	84.000	0.005	NA		NA
3744637	3744638	CLC_3222	CLC_3223			FALSE	0.014	309.000	0.000	NA		NA
3744639	3744640	CLC_3224	CLC_3225		ldhA-1	FALSE	0.002	544.000	0.000	NA		NA
3744641	3744642	CLC_3226	CLC_3227	ldhA-2		FALSE	0.002	814.000	0.000	1.000		NA
3744642	3744643	CLC_3227	CLC_3228			FALSE	0.083	218.000	0.000	1.000		NA
3744643	3744644	CLC_3228	CLC_3229			TRUE	0.995	18.000	0.400	0.016	Y	NA
3744644	3744645	CLC_3229	CLC_3230			TRUE	0.994	13.000	0.800	0.039	N	NA
3744645	3744646	CLC_3230	CLC_3231		fldC	TRUE	0.808	167.000	0.400	NA	N	NA
3744646	3744647	CLC_3231	CLC_3232	fldC	fldB	TRUE	0.996	2.000	0.500	NA	Y	NA
3744647	3744648	CLC_3232	CLC_3233	fldB	fldI	TRUE	0.994	5.000	0.875	NA	N	NA
3744648	3744649	CLC_3233	CLC_3234	fldI	fldA	TRUE	0.992	0.000	0.429	NA	N	NA
3744649	3744650	CLC_3234	CLC_3235	fldA		TRUE	0.963	54.000	0.500	0.032	N	NA
3744650	3744651	CLC_3235	CLC_3236			FALSE	0.008	466.000	0.000	1.000	N	NA
3744651	3744652	CLC_3236	CLC_3237		guaA	FALSE	0.008	459.000	0.000	1.000	N	NA
3744652	3744653	CLC_3237	CLC_3238	guaA	guaB	TRUE	0.994	13.000	0.190	0.001	Y	NA
3744655	3744656	CLC_3240	CLC_3241	groL	groES	TRUE	0.995	30.000	0.674	0.004	Y	NA
3744658	3744659	CLC_3242	CLC_3244			FALSE	0.003	453.000	0.000	NA		NA
3744659	3744660	CLC_3244	CLC_3245			FALSE	0.510	173.000	0.024	1.000		NA
3744660	3744661	CLC_3245	CLC_3246		gltA-2	TRUE	0.637	150.000	0.018	1.000	N	NA
3744661	3744662	CLC_3246	CLC_3247	gltA-2		TRUE	0.996	0.000	0.667	0.038	N	NA
3744662	3744663	CLC_3247	CLC_3248			FALSE	0.067	231.000	0.000	1.000		NA
3744665	3744666	CLC_3250	CLC_3251			TRUE	0.997	1.000	0.444	0.014	Y	NA
3744668	3744669	CLC_3253	CLC_3254		pyc	FALSE	0.009	381.000	0.000	1.000		NA
3744669	3744670	CLC_3254	CLC_3255	pyc		FALSE	0.008	460.000	0.000	1.000	N	NA
3744671	3744672	CLC_3256	CLC_3257			FALSE	0.042	236.000	0.000	NA		NA
3744675	3744676	CLC_3261	CLC_3262			FALSE	0.262	63.000	0.000	NA		NA
3744676	3744677	CLC_3262	CLC_3263			TRUE	0.660	16.000	0.000	NA		NA
3744678	3744679	CLC_3264	CLC_3265			FALSE	0.517	138.000	0.007	NA		NA
3744679	3744680	CLC_3265	CLC_3266			TRUE	0.985	-3.000	0.217	NA		NA
3744680	3744681	CLC_3266	CLC_3267		rimI	TRUE	0.985	-7.000	0.127	1.000		NA
3744682	3744683	CLC_3268	CLC_3269	tyrS-2		FALSE	0.044	233.000	0.000	NA		NA
3744683	3744684	CLC_3269	CLC_3270			TRUE	0.657	136.000	0.062	NA		NA
3744684	3744685	CLC_3270	CLC_3271			FALSE	0.568	148.000	0.025	NA		NA
3744685	3744686	CLC_3271	CLC_3272			FALSE	0.197	83.000	0.000	NA		NA
3744690	3744691	CLC_3276	CLC_3277	trpS		FALSE	0.102	179.000	0.000	NA		NA
3744691	3744692	CLC_3277	CLC_3278			FALSE	0.018	297.000	0.000	NA		NA
3744694	3744695	CLC_3280	CLC_3281	cgs	lysA	FALSE	0.193	265.000	0.003	1.000	N	NA
3744695	3744696	CLC_3281	CLC_3282	lysA	lysC	TRUE	0.980	16.000	0.016	1.000	Y	NA
3744696	3744697	CLC_3282	CLC_3283	lysC		FALSE	0.054	396.000	0.000	1.000	Y	NA
3744698	3744699	CLC_3284	CLC_3285			TRUE	0.688	137.000	0.069	1.000		NA
3744700	3744701	CLC_3286	CLC_3287		ftsH-1	TRUE	0.988	21.000	0.583	0.096		NA
3744701	3744702	CLC_3287	CLC_3288	ftsH-1		FALSE	0.019	427.000	0.000	0.015	N	NA
3744702	3744703	CLC_3288	CLC_3289		proS	FALSE	0.182	201.000	0.000	1.000	N	NA
3744703	3744704	CLC_3289	CLC_3290	proS		FALSE	0.010	427.000	0.000	1.000	N	NA
3744704	3744705	CLC_3290	CLC_3291			TRUE	0.646	18.000	0.000	NA		NA
3744705	3744706	CLC_3291	CLC_3292			FALSE	0.006	379.000	0.000	NA		NA
3744706	3744707	CLC_3292	CLC_3293			FALSE	0.149	214.000	0.000	1.000	N	NA
3744707	3744708	CLC_3293	CLC_3294			TRUE	0.996	23.000	1.000	1.000	Y	NA
3744708	3744709	CLC_3294	CLC_3295			FALSE	0.526	265.000	0.667	NA		NA
3744709	3744710	CLC_3295	CLC_3296			TRUE	0.990	5.000	0.667	NA		NA
3744712	3744713	CLC_3298	CLC_3299			FALSE	0.007	367.000	0.000	NA		NA
3744713	3744714	CLC_3299	CLC_3300			FALSE	0.279	307.000	0.400	NA		NA
3744714	3744715	CLC_3300	CLC_3301			TRUE	0.964	60.000	0.400	NA	Y	NA
3744715	3744716	CLC_3301	CLC_3302			FALSE	0.390	242.000	0.000	0.007	Y	NA
3744716	3744717	CLC_3302	CLC_3303			TRUE	0.912	120.000	0.429	0.009	N	NA
3744717	3744718	CLC_3303	CLC_3304			TRUE	0.808	125.000	0.071	0.009	N	NA
3744718	3744719	CLC_3304	CLC_3305			TRUE	0.899	82.000	0.071	1.000	Y	NA
3744719	3744720	CLC_3305	CLC_3306			FALSE	0.022	356.000	0.000	1.000	N	NA
3744722	3744723	CLC_3308	CLC_3309	speD		FALSE	0.139	154.000	0.000	NA		NA
3744723	3744724	CLC_3309	CLC_3310			FALSE	0.002	522.000	0.000	NA		NA
3744724	3744725	CLC_3310	CLC_3311			FALSE	0.002	496.000	0.000	NA		NA
3744725	3744726	CLC_3311	CLC_3312		rumA-2	FALSE	0.003	990.000	0.000	1.000	N	NA
3744726	3744727	CLC_3312	CLC_3313	rumA-2		FALSE	0.044	233.000	0.000	NA		NA
3744727	3744728	CLC_3313	CLC_3314			FALSE	0.012	327.000	0.000	NA		NA
3744728	3744729	CLC_3314	CLC_3315		pykA	TRUE	0.669	144.000	0.057	1.000		NA
3744729	3744730	CLC_3315	CLC_3316	pykA	pfkA	TRUE	0.973	34.000	0.015	0.002	Y	NA
3744730	3744731	CLC_3316	CLC_3317	pfkA	dnaE	FALSE	0.319	242.000	0.029	1.000	N	NA
3744731	3744732	CLC_3317	CLC_3318	dnaE		FALSE	0.495	163.000	0.010	1.000		NA
3744732	3744733	CLC_3318	CLC_3319			TRUE	0.986	7.000	0.470	NA		NA
3744733	3744734	CLC_3319	CLC_3320			TRUE	0.987	-3.000	0.259	NA		NA
3744734	3744735	CLC_3320	CLC_3321		murB	TRUE	0.690	120.000	0.080	NA		NA
3744735	3744736	CLC_3321	CLC_3322	murB		TRUE	0.740	69.000	0.009	1.000	N	NA
3744736	3744737	CLC_3322	CLC_3323		uvrC	TRUE	0.865	49.000	0.004	0.042	N	NA
3744737	3744738	CLC_3323	CLC_3324	uvrC		TRUE	0.916	14.000	0.005	NA		NA
3744738	3744739	CLC_3324	CLC_3325			FALSE	0.401	187.000	0.017	NA		NA
3744739	3744740	CLC_3325	CLC_3326			TRUE	0.938	28.000	0.053	1.000		NA
3744740	3744741	CLC_3326	CLC_3327			TRUE	0.987	5.000	0.285	1.000	N	NA
3744741	3744742	CLC_3327	CLC_3328			TRUE	0.954	11.000	0.047	NA		NA
3744742	3744743	CLC_3328	CLC_3329		uvrA	FALSE	0.529	99.000	0.005	NA		NA
3744743	3744744	CLC_3329	CLC_3330	uvrA	uvrB	TRUE	0.992	19.000	0.154	0.001	Y	NA
3744744	3744745	CLC_3330	CLC_3331	uvrB		TRUE	0.957	2.000	0.013	1.000		NA
3744745	3744746	CLC_3331	CLC_3332			TRUE	0.789	89.000	0.060	0.007		NA
3744746	3744747	CLC_3332	CLC_3333			FALSE	0.401	210.000	0.015	1.000	N	NA
3744747	3744748	CLC_3333	CLC_3334			TRUE	0.997	-10.000	0.431	1.000	Y	NA
3744748	3744749	CLC_3334	CLC_3335			FALSE	0.482	156.000	0.010	NA		NA
3744749	3744750	CLC_3335	CLC_3336			TRUE	0.791	93.000	0.222	NA		NA
3744750	3744751	CLC_3336	CLC_3337			FALSE	0.490	214.000	0.167	NA		NA
3744751	3744752	CLC_3337	CLC_3338			TRUE	0.996	0.000	0.180	0.001	Y	NA
3744752	3744753	CLC_3338	CLC_3339			FALSE	0.247	263.000	0.019	1.000	N	NA
3744753	3744754	CLC_3339	CLC_3340			TRUE	0.987	-43.000	0.039	1.000	N	NA
3744754	3744755	CLC_3340	CLC_3341		alr-3	TRUE	0.895	139.000	0.571	1.000	N	NA
3744755	3744756	CLC_3341	CLC_3342	alr-3		TRUE	0.979	28.000	0.068	NA	Y	NA
3744756	3744757	CLC_3342	CLC_3343			FALSE	0.517	200.000	0.064	NA	N	NA
3744757	3744758	CLC_3343	CLC_3344		acpS	TRUE	0.973	-3.000	0.020	NA	N	NA
3744758	3744759	CLC_3344	CLC_3345	acpS		FALSE	0.596	115.000	0.020	NA		NA
3744759	3744760	CLC_3345	CLC_3346			TRUE	0.705	9.000	0.000	NA		NA
3744760	3744761	CLC_3346	CLC_3347			FALSE	0.010	334.000	0.000	NA		NA
3744761	3744762	CLC_3347	CLC_3348			FALSE	0.023	305.000	0.000	1.000		NA
3744762	3744763	CLC_3348	CLC_3349			FALSE	0.130	160.000	0.000	NA		NA
3744763	3744764	CLC_3349	CLC_3350		rpsD-1	FALSE	0.145	253.000	0.002	NA		NA
3744766	3744767	CLC_3352	CLC_3353			FALSE	0.044	233.000	0.000	NA		NA
3744769	3744770	CLC_3355	CLC_3356	glmS		FALSE	0.005	603.000	0.000	1.000	N	NA
3744770	3744771	CLC_3356	CLC_3357			TRUE	0.916	19.000	0.005	1.000		NA
3744771	3744772	CLC_3357	CLC_3358		srlD	TRUE	0.959	24.000	0.040	0.043		NA
3744772	3744773	CLC_3358	CLC_3359	srlD		TRUE	0.964	20.000	0.080	1.000	N	NA
3744773	3744774	CLC_3359	CLC_3360			TRUE	0.788	216.000	0.133	0.007	Y	NA
3744774	3744775	CLC_3360	CLC_3361			TRUE	0.995	13.000	0.349	0.007	Y	NA
3744775	3744776	CLC_3361	CLC_3362		gutM	TRUE	0.912	43.000	0.116	NA	N	NA
3744776	3744777	CLC_3362	CLC_3363	gutM		TRUE	0.982	14.000	0.333	NA	N	NA
3744777	3744778	CLC_3363	CLC_3364			TRUE	0.936	35.000	0.091	1.000	N	NA
3744778	3744779	CLC_3364	CLC_3365		glmM	FALSE	0.022	355.000	0.000	1.000	N	NA
3744779	3744780	CLC_3365	CLC_3366	glmM		FALSE	0.161	135.000	0.000	NA		NA
3744780	3744781	CLC_3366	CLC_3367			TRUE	0.778	0.000	0.000	NA		NA
3744781	3744782	CLC_3367	CLC_3368			TRUE	0.973	16.000	0.075	0.001		NA
3744782	3744783	CLC_3368	CLC_3369			TRUE	0.791	102.000	0.200	1.000		NA
3744783	3744784	CLC_3369	CLC_3370		buk-1	FALSE	0.341	263.000	0.163	1.000		NA
3744784	3744785	CLC_3370	CLC_3371	buk-1	ptb	TRUE	0.988	29.000	0.275	1.000	Y	NA
3744785	3744786	CLC_3371	CLC_3372	ptb	buk-2	TRUE	0.995	-7.000	0.118	1.000	Y	NA
3744786	3744787	CLC_3372	CLC_3373	buk-2		FALSE	0.575	101.000	0.007	1.000		NA
3744787	3744788	CLC_3373	CLC_3374			TRUE	0.971	2.000	0.083	NA		NA
3744788	3744789	CLC_3374	CLC_3375			TRUE	0.995	-30.000	0.502	NA		NA
3744791	3744792	CLC_3377	CLC_3378		trx	TRUE	0.909	66.000	0.429	1.000		NA
3744792	3744793	CLC_3378	CLC_3379	trx	iadA	TRUE	0.642	109.000	0.025	1.000		NA
3744793	3744794	CLC_3379	CLC_3380	iadA		TRUE	0.708	75.000	0.025	1.000		NA
3744794	3744795	CLC_3380	CLC_3381			TRUE	0.969	28.000	0.333	NA		NA
3744795	3744796	CLC_3381	CLC_3382		ptsI	TRUE	0.682	103.000	0.069	NA		NA
3744798	3744799	CLC_3384	CLC_3385			TRUE	0.664	70.000	0.006	1.000		NA
3744799	3744800	CLC_3385	CLC_3386			TRUE	0.948	101.000	0.262	0.001	Y	NA
3744800	3744801	CLC_3386	CLC_3387			TRUE	0.679	141.000	0.026	1.000	N	NA
3744801	3744802	CLC_3387	CLC_3388			FALSE	0.073	266.000	0.000	1.000	N	NA
3744802	3744803	CLC_3388	CLC_3389		rpsI	FALSE	0.041	306.000	0.000	1.000	N	NA
3744803	3744804	CLC_3389	CLC_3390	rpsI	rplM	TRUE	0.995	26.000	0.601	0.013	Y	NA
3744804	3744805	CLC_3390	CLC_3391	rplM	truA-2	TRUE	0.854	124.000	0.031	1.000	Y	NA
3744805	3744806	CLC_3391	CLC_3392	truA-2		TRUE	0.992	0.000	0.404	1.000	N	NA
3744806	3744807	CLC_3392	CLC_3393			TRUE	0.996	-3.000	0.304	1.000	Y	NA
3744807	3744808	CLC_3393	CLC_3394			TRUE	0.999	-15.000	0.713	0.025	Y	NA
3744808	3744809	CLC_3394	CLC_3395		rplQ	TRUE	0.770	91.000	0.074	1.000	N	NA
3744809	3744810	CLC_3395	CLC_3396	rplQ	rpoA	TRUE	0.975	44.000	0.873	1.000	N	NA
3744810	3744811	CLC_3396	CLC_3397	rpoA	rpsD-2	TRUE	0.933	68.000	0.549	1.000	N	NA
3744811	3744812	CLC_3397	CLC_3398	rpsD-2	rpsK	TRUE	0.991	35.000	0.509	0.017	Y	NA
3744812	3744813	CLC_3398	CLC_3399	rpsK	rpsM	TRUE	0.997	18.000	0.810	0.013	Y	NA
3744813	3744814	CLC_3399	CLC_3400	rpsM	rpmJ	TRUE	0.839	113.000	0.194	0.013		NA
3744814	3744815	CLC_3400	CLC_3401	rpmJ	infA	TRUE	0.976	17.000	0.257	1.000		NA
3744815	3744816	CLC_3401	CLC_3402	infA		TRUE	0.965	8.000	0.090	NA		NA
3744816	3744817	CLC_3402	CLC_3403		map-1	TRUE	0.969	15.000	0.185	NA		NA
3744817	3744818	CLC_3403	CLC_3404	map-1	adk	TRUE	0.990	0.000	0.290	1.000	N	NA
3744818	3744819	CLC_3404	CLC_3405	adk	secY	TRUE	0.978	24.000	0.241	1.000	N	NA
3744819	3744820	CLC_3405	CLC_3406	secY	rplO	TRUE	0.994	1.000	0.730	1.000	N	NA
3744820	3744821	CLC_3406	CLC_3407	rplO	rpmD	TRUE	0.996	20.000	0.653	0.002	Y	NA
3744821	3744822	CLC_3407	CLC_3408	rpmD	rpsE	TRUE	0.997	14.000	0.789	0.017	Y	NA
3744822	3744823	CLC_3408	CLC_3409	rpsE	rplR	TRUE	0.997	18.000	0.814	0.017	Y	NA
3744823	3744824	CLC_3409	CLC_3410	rplR	rplF	TRUE	0.997	19.000	0.815	0.013	Y	NA
3744824	3744825	CLC_3410	CLC_3411	rplF	rpsH	TRUE	0.996	24.000	0.808	0.013	Y	NA
3744825	3744826	CLC_3411	CLC_3412	rpsH	rpsN	TRUE	0.993	30.000	0.473	0.013	Y	NA
3744826	3744827	CLC_3412	CLC_3413	rpsN	rplE	TRUE	0.995	17.000	0.496	0.013	Y	NA
3744827	3744828	CLC_3413	CLC_3414	rplE	rplX	TRUE	0.988	23.000	0.057	0.013	Y	NA
3744828	3744829	CLC_3414	CLC_3415	rplX	rplN	TRUE	0.988	24.000	0.071	0.017	Y	NA
3744829	3744830	CLC_3415	CLC_3416	rplN	rpsQ	TRUE	0.993	35.000	0.791	0.017	Y	NA
3744830	3744831	CLC_3416	CLC_3417	rpsQ	rpmC	TRUE	0.997	22.000	0.828	0.013	Y	NA
3744831	3744832	CLC_3417	CLC_3418	rpmC	rplP	TRUE	0.999	-10.000	0.802	0.013	Y	NA
3744832	3744833	CLC_3418	CLC_3419	rplP	rpsC	TRUE	0.997	18.000	0.828	0.017	Y	NA
3744833	3744834	CLC_3419	CLC_3420	rpsC	rplV	TRUE	0.996	18.000	0.719	0.017	Y	NA
3744834	3744835	CLC_3420	CLC_3421	rplV	rpsS	TRUE	0.996	22.000	0.769	0.017	Y	NA
3744835	3744836	CLC_3421	CLC_3422	rpsS	rplB	TRUE	0.981	70.000	0.820	0.017	Y	NA
3744836	3744837	CLC_3422	CLC_3423	rplB	rplW	TRUE	0.988	55.000	0.849	0.017	Y	NA
3744837	3744838	CLC_3423	CLC_3424	rplW	rplD	TRUE	0.997	0.000	0.307	0.013	Y	NA
3744838	3744839	CLC_3424	CLC_3425	rplD	rplC	TRUE	0.995	25.000	0.544	0.013	Y	NA
3744839	3744840	CLC_3425	CLC_3426	rplC	rpsJ	TRUE	0.961	90.000	0.467	0.017	Y	NA
3744840	3744841	CLC_3426	CLC_3427	rpsJ	tuf-1	FALSE	0.255	397.000	0.318	1.000	Y	NA
3744841	3744842	CLC_3427	CLC_3428	tuf-1	fusA-1	TRUE	0.987	40.000	0.400	0.001	Y	NA
3744842	3744843	CLC_3428	CLC_3429	fusA-1	rpsG	TRUE	0.970	66.000	0.579	1.000	Y	NA
3744843	3744844	CLC_3429	CLC_3430	rpsG	rpsL	TRUE	0.921	161.000	0.224	0.002	Y	NA
3744844	3744845	CLC_3430	CLC_3431	rpsL		TRUE	0.955	76.000	0.239	0.017	Y	NA
3744845	3744846	CLC_3431	CLC_3432		rpoC	TRUE	0.743	125.000	0.065	1.000	N	NA
3744846	3744847	CLC_3432	CLC_3433	rpoC	rpoB	TRUE	0.997	21.000	0.851	0.001	Y	NA
3744847	3744848	CLC_3433	CLC_3434	rpoB	rplL	FALSE	0.420	265.000	0.223	1.000	N	NA
3744848	3744849	CLC_3434	CLC_3435	rplL	rplJ	TRUE	0.987	47.000	0.884	1.000	Y	NA
3744849	3744850	CLC_3435	CLC_3436	rplJ	rplA	TRUE	0.836	202.000	0.302	1.000	Y	NA
3744850	3744851	CLC_3436	CLC_3437	rplA	rplK	TRUE	0.986	57.000	0.838	0.017	Y	NA
3744851	3744852	CLC_3437	CLC_3438	rplK	nusG	TRUE	0.941	71.000	0.681	1.000	N	NA
3744852	3744853	CLC_3438	CLC_3439	nusG	secE	TRUE	0.972	47.000	0.843	1.000	N	NA
3744853	3744854	CLC_3439	CLC_3440	secE	rpmG	TRUE	0.901	50.000	0.100	1.000	N	NA
3744854	3744855	CLC_3440	CLC_3441	rpmG	tuf-2	TRUE	0.757	202.000	0.099	1.000	Y	NA
3744856	3744857	CLC_3442	CLC_3444			TRUE	0.639	19.000	0.000	NA		NA
3744858	3744859	CLC_3445	CLC_3446	sigH		TRUE	0.872	74.000	0.361	NA		NA
3744859	3744860	CLC_3446	CLC_3447			TRUE	0.972	3.000	0.109	NA		NA
3744860	3744861	CLC_3447	CLC_3448		thyX	TRUE	0.971	3.000	0.032	1.000	N	NA
3744861	3744862	CLC_3448	CLC_3449	thyX		TRUE	0.981	-10.000	0.055	1.000		NA
3744862	3744863	CLC_3449	CLC_3450		cysS	TRUE	0.893	49.000	0.129	1.000		NA
3744863	3744864	CLC_3450	CLC_3451	cysS	ilvA	TRUE	0.913	29.000	0.003	1.000	N	NA
3744864	3744865	CLC_3451	CLC_3452	ilvA		TRUE	0.713	72.000	0.004	1.000	N	NA
3744865	3744866	CLC_3452	CLC_3453		ispD	TRUE	0.625	111.000	0.002	1.000	N	NA
3744866	3744867	CLC_3453	CLC_3454	ispD		TRUE	0.977	2.000	0.134	NA		NA
3744869	3744870	CLC_3456	CLC_3457		radA	TRUE	0.959	19.000	0.126	NA		NA
3744870	3744871	CLC_3457	CLC_3458	radA	clpC	TRUE	0.868	120.000	0.009	0.015	Y	NA
3744871	3744872	CLC_3458	CLC_3459	clpC		TRUE	0.983	2.000	0.129	1.000	N	NA
3744872	3744873	CLC_3459	CLC_3460			TRUE	0.993	5.000	0.848	1.000		NA
3744873	3744874	CLC_3460	CLC_3461		ctsR	TRUE	0.986	23.000	0.681	NA		NA
3744874	3744875	CLC_3461	CLC_3462	ctsR		FALSE	0.005	396.000	0.000	NA		NA
3744875	3744876	CLC_3462	CLC_3463		fusA-2	FALSE	0.059	347.000	0.021	NA		NA
3744877	3744878	CLC_3465	CLC_3467			FALSE	0.587	28.000	0.000	NA		NA
3744879	3744880	CLC_3468	CLC_3469	rrfH	rrlH	FALSE	0.178	93.000	0.000	NA		NA
3744883	3744884	CLC_3473	CLC_3648			TRUE	0.719	6.000	0.000	NA		NA
3744885	3744886	CLC_3477	CLC_3478	rrfI	rrlI	FALSE	0.177	94.000	0.000	NA		NA
3744886	3744887	CLC_3478	CLC_3479	rrlI	rrsI	FALSE	0.053	222.000	0.000	NA		NA
3744887	3744888	CLC_3479	CLC_3480	rrsI	murD	FALSE	0.002	571.000	0.000	NA		NA
3744888	3744889	CLC_3480	CLC_3481	murD	glyS	FALSE	0.014	826.000	0.002	0.094	N	NA
3744889	3744890	CLC_3481	CLC_3482	glyS	lysS	FALSE	0.151	320.000	0.000	0.094	Y	NA
3744890	3744891	CLC_3482	CLC_3483	lysS	greA-2	TRUE	0.967	19.000	0.098	1.000	N	NA
3744891	3744892	CLC_3483	CLC_3484	greA-2		FALSE	0.585	131.000	0.023	NA		NA
3744892	3744893	CLC_3484	CLC_3485			TRUE	0.746	50.000	0.005	NA		NA
3744893	3744894	CLC_3485	CLC_3486			TRUE	0.970	10.000	0.054	1.000	N	NA
3744894	3744895	CLC_3486	CLC_3487		fhs	FALSE	0.597	155.000	0.011	1.000	N	NA
3744895	3744896	CLC_3487	CLC_3488	fhs	ftsH-2	FALSE	0.256	203.000	0.000	0.094	N	NA
3744896	3744897	CLC_3488	CLC_3489	ftsH-2	hpt-2	TRUE	0.844	82.000	0.180	1.000	N	NA
3744897	3744898	CLC_3489	CLC_3490	hpt-2	tilS	TRUE	0.993	-16.000	0.137	0.030	N	NA
3744898	3744899	CLC_3490	CLC_3491	tilS	spoIIE	TRUE	0.691	149.000	0.041	1.000	N	NA
3744900	3744901	CLC_3493	CLC_3495			TRUE	0.695	11.000	0.000	NA		NA
3744901	3744902	CLC_3495	CLC_3649			FALSE	0.330	54.000	0.000	NA		NA
3744902	3744903	CLC_3649	CLC_3498			FALSE	0.330	54.000	0.000	NA		NA
3744903	3744904	CLC_3498	CLC_3500			TRUE	0.725	5.000	0.000	NA		NA
3744904	3744905	CLC_3500	CLC_3502			FALSE	0.517	32.000	0.000	NA		NA
3744905	3744906	CLC_3502	CLC_3504			TRUE	0.725	5.000	0.000	NA		NA
3744906	3744907	CLC_3504	CLC_3506			TRUE	0.725	5.000	0.000	NA		NA
3744908	3744909	CLC_3507	CLC_3508			TRUE	0.863	62.000	0.179	1.000		NA
3744909	3744910	CLC_3508	CLC_3509			TRUE	0.819	95.000	0.303	NA		NA
3744910	3744911	CLC_3509	CLC_3510		yabP	TRUE	0.988	15.000	0.774	NA		NA
3744911	3744912	CLC_3510	CLC_3511	yabP		TRUE	0.716	120.000	0.108	NA		NA
3744912	3744913	CLC_3511	CLC_3512		hup	TRUE	0.762	74.000	0.024	1.000	N	NA
3744913	3744914	CLC_3512	CLC_3513	hup		FALSE	0.588	128.000	0.014	1.000		NA
3744914	3744915	CLC_3513	CLC_3514		spoVB-2	TRUE	0.937	15.000	0.015	1.000		NA
3744915	3744916	CLC_3514	CLC_3515	spoVB-2		TRUE	0.703	133.000	0.108	NA		NA
3744916	3744917	CLC_3515	CLC_3516		prsA-1	FALSE	0.548	199.000	0.088	NA	N	NA
3744917	3744918	CLC_3516	CLC_3517	prsA-1	mfd	TRUE	0.707	84.000	0.016	1.000	N	NA
3744918	3744919	CLC_3517	CLC_3518	mfd	pth	TRUE	0.965	28.000	0.137	1.000	N	NA
3744919	3744920	CLC_3518	CLC_3519	pth		TRUE	0.654	110.000	0.009	1.000	N	NA
3744920	3744921	CLC_3519	CLC_3520			TRUE	0.937	35.000	0.095	1.000	N	NA
3744921	3744922	CLC_3520	CLC_3521			TRUE	0.997	1.000	0.653	1.000	Y	NA
3744922	3744923	CLC_3521	CLC_3522		prs	TRUE	0.672	180.000	0.123	1.000	N	NA
3744923	3744924	CLC_3522	CLC_3523	prs	glmU	TRUE	0.963	21.000	0.069	1.000	N	NA
3744924	3744925	CLC_3523	CLC_3524	glmU	spoVG	TRUE	0.778	162.000	0.011	1.000	Y	NA
3744925	3744926	CLC_3524	CLC_3525	spoVG	purR	TRUE	0.777	103.000	0.099	1.000	N	NA
3744927	3744928	CLC_3526	CLC_3527	murC		TRUE	0.642	65.000	0.004	NA		NA
3744928	3744929	CLC_3527	CLC_3528			FALSE	0.210	78.000	0.000	NA		NA
3744929	3744930	CLC_3528	CLC_3530			FALSE	0.178	93.000	0.000	NA		NA
3744930	3744931	CLC_3530	CLC_3531			TRUE	0.793	86.000	0.156	1.000		NA
3744931	3744932	CLC_3531	CLC_3532			FALSE	0.187	275.000	0.044	NA		NA
3744933	3744934	CLC_3533	CLC_3534			TRUE	0.874	45.000	0.067	1.000		NA
3744934	3744935	CLC_3534	CLC_3535			TRUE	0.760	68.000	0.058	NA		NA
3744936	3744937	CLC_3536	CLC_3537			TRUE	0.932	33.000	0.133	NA		NA
3744938	3744939	CLC_3538	CLC_3539			FALSE	0.043	303.000	0.000	1.000	N	NA
3744939	3744940	CLC_3539	CLC_3540			TRUE	0.939	15.000	0.028	NA		NA
3744940	3744941	CLC_3540	CLC_3541			TRUE	0.935	18.000	0.030	NA		NA
3744941	3744942	CLC_3541	CLC_3542		murI	FALSE	0.610	147.000	0.007	1.000	N	NA
3744945	3744946	CLC_3545	CLC_3546	murA-2		TRUE	0.947	26.000	0.058	1.000		NA
3744946	3744947	CLC_3546	CLC_3547			TRUE	0.926	17.000	0.016	NA		NA
3744947	3744948	CLC_3547	CLC_3548			TRUE	0.979	15.000	0.357	NA		NA
3744948	3744949	CLC_3548	CLC_3549			FALSE	0.381	179.000	0.005	NA		NA
3744950	3744951	CLC_3550	CLC_3551			FALSE	0.018	298.000	0.000	NA		NA
3744951	3744952	CLC_3551	CLC_3552			TRUE	0.963	36.000	0.500	NA		NA
3744953	3744954	CLC_3553	CLC_3554			FALSE	0.358	247.000	0.000	0.043	Y	NA
3744954	3744955	CLC_3554	CLC_3555		map-2	TRUE	0.938	32.000	0.059	1.000	N	NA
3744957	3744958	CLC_3557	CLC_3558			TRUE	0.995	-7.000	0.810	NA		NA
3744958	3744959	CLC_3558	CLC_3559			FALSE	0.004	416.000	0.000	NA		NA
3744959	3744960	CLC_3559	CLC_3560			TRUE	0.964	3.000	0.053	NA		NA
3744960	3744961	CLC_3560	CLC_3561			TRUE	0.996	1.000	0.237	0.001	Y	NA
3744961	3744962	CLC_3561	CLC_3562			TRUE	0.981	9.000	0.260	1.000		NA
3744962	3744963	CLC_3562	CLC_3563			FALSE	0.020	315.000	0.000	1.000		NA
3744963	3744964	CLC_3563	CLC_3564			FALSE	0.045	300.000	0.000	1.000	N	NA
3744966	3744967	CLC_3566	CLC_3567			TRUE	0.782	107.000	0.220	NA		NA
3744967	3744968	CLC_3567	CLC_3568			FALSE	0.464	181.000	0.031	NA		NA
3744968	3744969	CLC_3568	CLC_3569			TRUE	0.676	88.000	0.031	1.000		NA
3744970	3744971	CLC_3570	CLC_3571			TRUE	0.936	29.000	0.025	1.000	N	NA
3744971	3744972	CLC_3571	CLC_3572		accA	FALSE	0.397	200.000	0.003	1.000	N	NA
3744972	3744973	CLC_3572	CLC_3573	accA	accD	TRUE	0.979	47.000	0.234	0.001	Y	NA
3744973	3744974	CLC_3573	CLC_3574	accD	accC	TRUE	0.990	20.000	0.090	0.001	Y	NA
3744974	3744975	CLC_3574	CLC_3575	accC	fabZ	TRUE	0.975	32.000	0.077	1.000	Y	NA
3744975	3744976	CLC_3575	CLC_3576	fabZ	accB	TRUE	0.988	20.000	0.058	0.004	Y	NA
3744976	3744977	CLC_3576	CLC_3577	accB	fabF	TRUE	0.990	4.000	0.074	1.000	Y	NA
3744977	3744978	CLC_3577	CLC_3578	fabF	fabG-2	TRUE	0.949	20.000	0.000	1.000	Y	NA
3744978	3744979	CLC_3578	CLC_3579	fabG-2	fabD	TRUE	0.968	18.000	0.000	0.004	Y	NA
3744979	3744980	CLC_3579	CLC_3580	fabD		TRUE	0.959	21.000	0.099	1.000		NA
3744980	3744981	CLC_3580	CLC_3581		acpP-2	TRUE	0.788	126.000	0.216	1.000		NA
3744981	3744982	CLC_3581	CLC_3582	acpP-2	fabH	TRUE	0.935	41.000	0.121	0.004		NA
3744982	3744983	CLC_3582	CLC_3583	fabH		TRUE	0.986	-7.000	0.098	1.000	N	NA
3744983	3744984	CLC_3583	CLC_3584			TRUE	0.947	16.000	0.032	1.000		NA
3744984	3744985	CLC_3584	CLC_3585			FALSE	0.580	97.000	0.007	1.000		NA
3744986	3744987	CLC_3586	CLC_3587			TRUE	0.993	-7.000	0.083	NA	Y	NA
3744987	3744988	CLC_3587	CLC_3650			FALSE	0.182	91.000	0.000	NA		NA
3744988	3744989	CLC_3650	CLC_3651			TRUE	0.725	5.000	0.000	NA		NA
3744989	3744990	CLC_3651	CLC_3652			TRUE	0.700	10.000	0.000	NA		NA
3744990	3744991	CLC_3652	CLC_3653			TRUE	0.646	18.000	0.000	NA		NA
3744991	3744992	CLC_3653	CLC_3654			FALSE	0.292	58.000	0.000	NA		NA
3744992	3744993	CLC_3654	CLC_3600			TRUE	0.709	8.000	0.000	NA		NA
3744993	3744994	CLC_3600	CLC_3655			TRUE	0.639	19.000	0.000	NA		NA
3744994	3744995	CLC_3655	CLC_3656			TRUE	0.719	6.000	0.000	NA		NA
3744995	3744996	CLC_3656	CLC_3657			TRUE	0.725	5.000	0.000	NA		NA
3744996	3744997	CLC_3657	CLC_3608			TRUE	0.700	10.000	0.000	NA		NA
3744997	3744998	CLC_3608	CLC_3609			TRUE	0.646	18.000	0.000	NA		NA
3744999	3745000	CLC_3610	CLC_3611			TRUE	0.920	13.000	0.006	NA		NA
3745002	3745003	CLC_3613	CLC_3614			TRUE	0.785	103.000	0.222	NA		NA
3745003	3745004	CLC_3614	CLC_3615		purA	FALSE	0.494	126.000	0.002	NA		NA
3745004	3745005	CLC_3615	CLC_3616	purA		FALSE	0.305	232.000	0.033	1.000		NA
3745005	3745006	CLC_3616	CLC_3617			FALSE	0.446	166.000	0.010	NA		NA
3745006	3745007	CLC_3617	CLC_3618			FALSE	0.537	193.000	0.111	NA		NA
3745007	3745008	CLC_3618	CLC_3619		dnaB	FALSE	0.100	242.000	0.000	1.000	N	NA
3745008	3745009	CLC_3619	CLC_3620	dnaB		TRUE	0.957	31.000	0.053	0.015	N	NA
3745009	3745010	CLC_3620	CLC_3621		rplI	TRUE	0.962	11.000	0.024	1.000	N	NA
3745010	3745011	CLC_3621	CLC_3622	rplI		TRUE	0.985	0.000	0.119	1.000	N	NA
3745011	3745012	CLC_3622	CLC_3623			TRUE	0.984	1.000	0.210	1.000		NA
3745012	3745013	CLC_3623	CLC_3624			TRUE	0.965	12.000	0.116	NA		NA
3745013	3745014	CLC_3624	CLC_3625		rpsR	FALSE	0.531	148.000	0.015	NA		NA
3745014	3745015	CLC_3625	CLC_3626	rpsR	ssb	TRUE	0.932	19.000	0.002	1.000	N	NA
3745015	3745016	CLC_3626	CLC_3627	ssb	rpsF	TRUE	0.937	16.000	0.002	1.000	N	NA
3745016	3745017	CLC_3627	CLC_3628	rpsF		FALSE	0.585	106.000	0.002	NA	N	NA
3745017	3745018	CLC_3628	CLC_3629			FALSE	0.025	274.000	0.000	NA		NA
3745018	3745019	CLC_3629	CLC_3630			TRUE	0.962	16.000	0.121	NA		NA
3745019	3745020	CLC_3630	CLC_3631			TRUE	0.968	7.000	0.105	NA		NA
3745021	3745022	CLC_3632	CLC_3633		ytvI	TRUE	0.962	14.000	0.111	NA		NA
3745022	3745023	CLC_3633	CLC_3634	ytvI		TRUE	0.802	58.000	0.058	NA		NA
3745024	3745025	CLC_3635	CLC_3636			TRUE	0.786	53.000	0.024	NA		NA
3745025	3745026	CLC_3636	CLC_3637			TRUE	0.873	38.000	0.047	NA		NA
3745026	3745027	CLC_3637	CLC_3638		soj	TRUE	0.991	16.000	0.827	1.000	N	NA
3745027	3745028	CLC_3638	CLC_3639	soj		TRUE	0.744	127.000	0.069	1.000	N	NA
3745028	3745029	CLC_3639	CLC_3640		gidB	TRUE	0.768	100.000	0.089	1.000	N	NA
3745029	3745030	CLC_3640	CLC_3641	gidB	gidA-2	TRUE	0.985	24.000	0.466	1.000	N	NA
3745030	3745031	CLC_3641	CLC_3642	gidA-2	trmE	TRUE	0.981	9.000	0.266	1.000		NA
3745031	3745032	CLC_3642	CLC_3643	trmE	jag	TRUE	0.889	48.000	0.116	1.000		NA
3745032	3745033	CLC_3643	CLC_3644	jag	oxaA	TRUE	0.975	18.000	0.254	1.000		NA
3745033	3745034	CLC_3644	CLC_3645	oxaA		TRUE	0.979	26.000	0.461	NA		NA
3745034	3745035	CLC_3645	CLC_3646		rnpA	TRUE	0.992	-3.000	0.540	NA		NA
3745035	3745036	CLC_3646	CLC_3647	rnpA	rpmH	TRUE	0.956	55.000	0.787	1.000		NA