MicrobesOnline Operon Predictions for Acholeplasma laidlawii PG-8A

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 3736339 3736340 ACL_0001 ACL_0002 dnaA   FALSE 0.039 174.000 0.000 NA   NA
 3736342 3736343 ACL_0004 ACL_0005   recF TRUE 0.996 -3.000 0.209 1.000   NA
 3736343 3736344 ACL_0005 ACL_0006 recF gyrB TRUE 0.998 -10.000 0.249 0.009 Y NA
 3736344 3736345 ACL_0006 ACL_0007 gyrB gyrA TRUE 0.989 19.000 0.306 0.004 Y NA
 3736345 3736346 ACL_0007 ACL_0008 gyrA   FALSE 0.017 348.000 0.000 1.000 N NA
 3736346 3736347 ACL_0008 ACL_0009   serS FALSE 0.023 263.000 0.000 1.000 N NA
 3736347 3736348 ACL_0009 ACL_0010 serS   FALSE 0.034 201.000 0.000 1.000 N NA
 3736348 3736349 ACL_0010 ACL_0011     TRUE 0.998 -3.000 0.889 1.000 Y NA
 3736351 3736352 ACL_0013 ACL_0014 pduL   TRUE 0.557 50.000 0.007 NA   NA
 3736352 3736353 ACL_0014 ACL_0015     TRUE 0.928 -3.000 0.000 1.000   NA
 3736353 3736354 ACL_0015 ACL_0016   ksgA TRUE 0.993 -13.000 0.093 1.000 N NA
 3736354 3736355 ACL_0016 ACL_0017 ksgA   FALSE 0.065 211.000 0.002 1.000 N NA
 3736355 3736356 ACL_0017 ACL_0018   prsA FALSE 0.035 197.000 0.000 1.000 N NA
 3736356 3736357 ACL_0018 ACL_0019 prsA pth TRUE 0.968 0.000 0.002 1.000 N NA
 3736357 3736358 ACL_0019 ACL_0020 pth mfd TRUE 0.904 36.000 0.137 1.000 N NA
 3736358 3736359 ACL_0020 ACL_0021 mfd   TRUE 0.916 -7.000 0.000 NA   NA
 3736359 3736360 ACL_0021 ACL_0022   tyrB FALSE 0.145 73.000 0.000 NA   NA
 3736360 3736361 ACL_0022 ACL_0023 tyrB lacA TRUE 0.917 6.000 0.000 1.000   NA
 3736361 3736362 ACL_0023 ACL_0024 lacA   TRUE 0.921 -16.000 0.000 NA   NA
 3736362 3736363 ACL_0024 ACL_0025   cls TRUE 0.602 20.000 0.000 NA   NA
 3736363 3736364 ACL_0025 ACL_0026 cls   TRUE 0.232 55.000 0.000 NA   NA
 3736366 3736367 ACL_0028 ACL_0029 pfl pflA TRUE 0.995 -13.000 0.163 1.000 N NA
 3736367 3736368 ACL_0029 ACL_0030 pflA   FALSE 0.059 153.000 0.000 1.000 N NA
 3736368 3736369 ACL_0030 ACL_0031     TRUE 0.195 62.000 0.000 NA   NA
 3736369 3736370 ACL_0031 ACL_0032   fhs FALSE 0.108 96.000 0.000 NA   NA
 3736370 3736371 ACL_0032 ACL_0033 fhs folD TRUE 0.964 0.000 0.000 0.004 N NA
 3736371 3736372 ACL_0033 ACL_0034 folD   TRUE 0.936 3.000 0.000 NA   NA
 3736372 3736373 ACL_0034 ACL_0035     FALSE 0.016 311.000 0.000 NA   NA
 3736373 3736374 ACL_0035 ACL_0036     TRUE 0.939 30.000 0.222 NA   NA
 3736374 3736375 ACL_0036 ACL_0037     TRUE 0.816 120.000 0.889 NA   NA
 3736375 3736376 ACL_0037 ACL_0038     TRUE 0.994 -3.000 0.077 0.061 Y NA
 3736376 3736377 ACL_0038 ACL_0039     TRUE 0.792 16.000 0.000 1.000 Y NA
 3736379 3736380 ACL_0041 ACL_0042     TRUE 0.190 105.000 0.000 0.004   NA
 3736380 3736381 ACL_0042 ACL_0043   ppa FALSE 0.044 174.000 0.000 1.000 N NA
 3736381 3736382 ACL_0043 ACL_0044 ppa   TRUE 0.905 6.000 0.000 NA   NA
 3736382 3736383 ACL_0044 ACL_0045     FALSE 0.044 160.000 0.000 NA   NA
 3736383 3736384 ACL_0045 ACL_0046     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 3736384 3736385 ACL_0046 ACL_0047   glyA FALSE 0.013 478.000 0.000 NA   NA
 3736385 3736386 ACL_0047 ACL_0048 glyA rnfC TRUE 0.731 17.000 0.000 1.000 N NA
 3736386 3736387 ACL_0048 ACL_0049 rnfC rnfD TRUE 0.964 3.000 0.000 0.099 Y NA
 3736387 3736388 ACL_0049 ACL_0050 rnfD   TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 3736388 3736389 ACL_0050 ACL_0051     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 3736389 3736390 ACL_0051 ACL_0052   rnfE TRUE 0.934 2.000 0.000 NA   NA
 3736390 3736391 ACL_0052 ACL_0053 rnfE   TRUE 0.918 -10.000 0.000 NA   NA
 3736391 3736392 ACL_0053 ACL_0054   apbE TRUE 0.488 25.000 0.000 NA   NA
 3736392 3736393 ACL_0054 ACL_0055 apbE   TRUE 0.837 13.000 0.000 NA   NA
 3736393 3736394 ACL_0055 ACL_0056     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 3736394 3736395 ACL_0056 ACL_0057   rpmE FALSE 0.044 160.000 0.000 NA   NA
 3736395 3736396 ACL_0057 ACL_0058 rpmE tdk TRUE 0.627 61.000 0.028 1.000 N NA
 3736396 3736397 ACL_0058 ACL_0059 tdk   TRUE 0.981 -13.000 0.009 1.000 Y NA
 3736397 3736398 ACL_0059 ACL_0060   ffs TRUE 0.398 32.000 0.000 NA   NA
 3736398 3736399 ACL_0060 ACL_0061 ffs   FALSE 0.132 77.000 0.000 NA   NA
 3736399 3736400 ACL_0061 ACL_0062   tktA TRUE 0.892 8.000 0.000 NA   NA
 3736400 3736401 ACL_0062 ACL_0063 tktA gidA TRUE 0.593 22.000 0.000 1.000 N NA
 3736401 3736402 ACL_0063 ACL_0064 gidA gidB TRUE 0.997 -7.000 0.466 1.000 N NA
 3736402 3736403 ACL_0064 ACL_0065 gidB   TRUE 0.945 12.000 0.004 NA   NA
 3736403 3736404 ACL_0065 ACL_0066     FALSE 0.018 283.000 0.000 NA   NA
 3736404 3736405 ACL_0066 ACL_0067     FALSE 0.034 186.000 0.000 NA   NA
 3736405 3736406 ACL_0067 ACL_0068     FALSE 0.037 176.000 0.000 NA   NA
 3736406 3736407 ACL_0068 ACL_0069     FALSE 0.121 82.000 0.000 NA   NA
 3736407 3736408 ACL_0069 ACL_0070     TRUE 0.414 30.000 0.000 NA   NA
 3736408 3736409 ACL_0070 ACL_0071     TRUE 0.885 9.000 0.000 NA   NA
 3736409 3736410 ACL_0071 ACL_0072     TRUE 0.892 8.000 0.000 NA   NA
 3736410 3736411 ACL_0072 ACL_0073     TRUE 0.740 16.000 0.000 NA   NA
 3736411 3736412 ACL_0073 ACL_0074     TRUE 0.535 23.000 0.000 NA   NA
 3736412 3736413 ACL_0074 ACL_0075     TRUE 0.302 46.000 0.000 NA   NA
 3736413 3736414 ACL_0075 ACL_0076     TRUE 0.919 5.000 0.000 NA   NA
 3736414 3736415 ACL_0076 ACL_0077     TRUE 0.535 23.000 0.000 NA   NA
 3736415 3736416 ACL_0077 ACL_0078     TRUE 0.332 41.000 0.000 NA   NA
 3736416 3736417 ACL_0078 ACL_0079     TRUE 0.740 16.000 0.000 NA   NA
 3736417 3736418 ACL_0079 ACL_0080     TRUE 0.892 8.000 0.000 NA   NA
 3736418 3736419 ACL_0080 ACL_0081     FALSE 0.109 95.000 0.000 NA   NA
 3736419 3736420 ACL_0081 ACL_0082   mmsB FALSE 0.060 143.000 0.000 NA   NA
 3736420 3736421 ACL_0082 ACL_0083 mmsB   FALSE 0.090 109.000 0.000 NA   NA
 3736421 3736422 ACL_0083 ACL_0084     TRUE 0.856 12.000 0.000 NA   NA
 3736422 3736423 ACL_0084 ACL_0085     FALSE 0.015 356.000 0.000 NA   NA
 3736423 3736424 ACL_0085 ACL_0086   rpsJ FALSE 0.028 210.000 0.000 NA   NA
 3736424 3736425 ACL_0086 ACL_0087 rpsJ rplC TRUE 0.956 46.000 0.467 0.057 Y NA
 3736425 3736426 ACL_0087 ACL_0088 rplC rplD TRUE 0.997 12.000 0.544 0.042 Y NA
 3736426 3736427 ACL_0088 ACL_0089 rplD rplW TRUE 0.998 0.000 0.307 1.000 Y NA
 3736427 3736428 ACL_0089 ACL_0090 rplW rplB TRUE 0.974 32.000 0.849 1.000 Y NA
 3736428 3736429 ACL_0090 ACL_0091 rplB rpsS TRUE 0.997 13.000 0.820 0.057 Y NA
 3736429 3736430 ACL_0091 ACL_0092 rpsS rplV TRUE 0.997 13.000 0.769 0.057 Y NA
 3736430 3736431 ACL_0092 ACL_0093 rplV rpsC TRUE 0.998 8.000 0.719 0.057 Y NA
 3736431 3736432 ACL_0093 ACL_0094 rpsC rplP TRUE 0.999 6.000 0.828 0.057 Y NA
 3736432 3736433 ACL_0094 ACL_0095 rplP rpmC TRUE 0.999 -3.000 0.802 0.042 Y NA
 3736433 3736434 ACL_0095 ACL_0096 rpmC rpsQ TRUE 0.996 15.000 0.828 0.042 Y NA
 3736434 3736435 ACL_0096 ACL_0097 rpsQ rplN TRUE 0.992 19.000 0.791 0.057 Y NA
 3736435 3736436 ACL_0097 ACL_0098 rplN rplX TRUE 0.997 14.000 0.810 0.057 Y NA
 3736436 3736437 ACL_0098 ACL_0099 rplX rplE TRUE 0.999 0.000 0.758 0.042 Y NA
 3736437 3736438 ACL_0099 ACL_0100 rplE rpsN TRUE 0.997 11.000 0.309 0.042 Y NA
 3736438 3736439 ACL_0100 ACL_0101 rpsN rpsH TRUE 0.995 13.000 0.295 0.042 Y NA
 3736439 3736440 ACL_0101 ACL_0102 rpsH rplF TRUE 0.992 19.000 0.808 0.042 Y NA
 3736440 3736441 ACL_0102 ACL_0103 rplF rplR TRUE 0.997 13.000 0.815 0.042 Y NA
 3736441 3736442 ACL_0103 ACL_0104 rplR rpsE TRUE 0.996 15.000 0.814 0.057 Y NA
 3736442 3736443 ACL_0104 ACL_0105 rpsE rpmD TRUE 0.999 5.000 0.789 0.057 Y NA
 3736443 3736444 ACL_0105 ACL_0106 rpmD rplO TRUE 0.998 12.000 0.653 0.007 Y NA
 3736444 3736445 ACL_0106 ACL_0107 rplO secY TRUE 0.998 2.000 0.730 1.000 N NA
 3736445 3736446 ACL_0107 ACL_0108 secY adk TRUE 0.997 0.000 0.241 1.000 N NA
 3736446 3736447 ACL_0108 ACL_0109 adk   TRUE 0.997 -3.000 0.290 1.000 N NA
 3736447 3736448 ACL_0109 ACL_0110   infA TRUE 0.997 3.000 0.160 1.000 Y NA
 3736448 3736449 ACL_0110 ACL_0111 infA rpmJ TRUE 0.983 13.000 0.078 1.000   NA
 3736449 3736450 ACL_0111 ACL_0112 rpmJ rpsM TRUE 0.985 13.000 0.067 0.042   NA
 3736450 3736451 ACL_0112 ACL_0113 rpsM rpsK TRUE 0.999 3.000 0.810 0.042 Y NA
 3736451 3736452 ACL_0113 ACL_0114 rpsK rpoA TRUE 0.969 24.000 0.308 1.000 N NA
 3736452 3736453 ACL_0114 ACL_0115 rpoA rplQ TRUE 0.998 6.000 0.873 1.000 N NA
 3736453 3736454 ACL_0115 ACL_0116 rplQ   FALSE 0.026 218.000 0.000 NA   NA
 3736454 3736455 ACL_0116 ACL_0117     FALSE 0.114 87.000 0.000 NA   NA
 3736455 3736456 ACL_0117 ACL_0118   tag TRUE 0.940 -16.000 0.000 1.000 Y NA
 3736456 3736457 ACL_0118 ACL_0119 tag   TRUE 0.766 16.000 0.000 1.000 N NA
 3736458 3736459 ACL_0120 ACL_0121   trxB1 TRUE 0.925 -25.000 0.000 NA   NA
 3736459 3736460 ACL_0121 ACL_0122 trxB1   TRUE 0.928 -3.000 0.000 1.000   NA
 3736461 3736462 ACL_0123 ACL_0124     TRUE 0.999 -24.000 0.713 0.037 Y NA
 3736462 3736463 ACL_0124 ACL_0125     TRUE 0.994 -3.000 0.095 1.000 Y NA
 3736463 3736464 ACL_0125 ACL_0126     TRUE 0.992 -10.000 0.076 1.000 N NA
 3736464 3736465 ACL_0126 ACL_0127   tmk TRUE 0.790 24.000 0.006 1.000 N NA
 3736465 3736466 ACL_0127 ACL_0128 tmk holB TRUE 0.997 -3.000 0.254 1.000   NA
 3736466 3736467 ACL_0128 ACL_0129 holB   TRUE 0.976 -7.000 0.006 1.000   NA
 3736467 3736468 ACL_0129 ACL_0130     TRUE 0.995 -3.000 0.078 0.008   NA
 3736470 3736471 ACL_0132 ACL_0133 metG   TRUE 0.919 5.000 0.000 NA   NA
 3736471 3736472 ACL_0133 ACL_0134     TRUE 0.560 22.000 0.000 NA   NA
 3736474 3736475 ACL_0136 ACL_0137   rplM FALSE 0.048 163.000 0.000 1.000 N NA
 3736475 3736476 ACL_0137 ACL_0138 rplM rpsI TRUE 0.999 5.000 0.601 0.042 Y NA
 3736476 3736477 ACL_0138 ACL_0139 rpsI gltX FALSE 0.098 224.000 0.006 1.000 Y NA
 3736477 3736478 ACL_0139 ACL_0140 gltX   TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 3736478 3736479 ACL_0140 ACL_0141     FALSE 0.107 97.000 0.000 NA   NA
 3736479 3736480 ACL_0141 ACL_0142     FALSE 0.108 96.000 0.000 NA   NA
 3736480 3736481 ACL_0142 ACL_0143   cysS TRUE 0.203 60.000 0.000 NA   NA
 3736481 3736482 ACL_0143 ACL_0144 cysS   TRUE 0.995 0.000 0.129 1.000   NA
 3736482 3736483 ACL_0144 ACL_0145     FALSE 0.100 110.000 0.000 1.000   NA
 3736483 3736484 ACL_0145 ACL_0146     TRUE 0.550 46.000 0.003 1.000 N NA
 3736484 3736485 ACL_0146 ACL_0147     TRUE 0.947 10.000 0.002 1.000   NA
 3736485 3736486 ACL_0147 ACL_0148     TRUE 0.282 48.000 0.000 NA   NA
 3736486 3736487 ACL_0148 ACL_0149   rpmG1 FALSE 0.043 161.000 0.000 NA   NA
 3736487 3736488 ACL_0149 ACL_0150 rpmG1   TRUE 0.983 13.000 0.080 1.000   NA
 3736488 3736489 ACL_0150 ACL_0151   nusG TRUE 0.998 0.000 0.843 1.000   NA
 3736489 3736490 ACL_0151 ACL_0152 nusG   TRUE 0.930 4.000 0.000 NA   NA
 3736490 3736491 ACL_0152 ACL_0153     TRUE 0.509 24.000 0.000 NA   NA
 3736491 3736492 ACL_0153 ACL_0154     TRUE 0.916 -7.000 0.000 NA   NA
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 3736494 3736495 ACL_0156 ACL_0157     TRUE 0.877 10.000 0.000 NA   NA
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 3736496 3736497 ACL_0158 ACL_0159     TRUE 0.925 0.000 0.000 NA   NA
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 3736498 3736499 ACL_0160 ACL_0161     FALSE 0.021 259.000 0.000 NA   NA
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 3736500 3736501 ACL_0162 ACL_0163     FALSE 0.109 95.000 0.000 NA   NA
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 3736520 3736521 ACL_0182 ACL_0183     TRUE 0.925 0.000 0.000 NA   NA
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 3736522 3736523 ACL_0184 ACL_0185   rpsL FALSE 0.021 261.000 0.000 NA   NA
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 3736530 3736531 ACL_0192 ACL_0193   rpsF FALSE 0.091 108.000 0.000 NA   NA
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 3736552 3736553 ACL_0214 ACL_0215     FALSE 0.020 266.000 0.000 NA   NA
 3736553 3736554 ACL_0215 ACL_0216   tyrA TRUE 0.937 -3.000 0.000 1.000 Y NA
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 3736575 3736576 ACL_0237 ACL_0238 ampS   FALSE 0.120 99.000 0.000 1.000   NA
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 3736585 3736586 ACL_0247 ACL_0248 polC   FALSE 0.109 95.000 0.000 NA   NA
 3736586 3736587 ACL_0248 ACL_0249   pheS FALSE 0.021 261.000 0.000 NA   NA
 3736587 3736588 ACL_0249 ACL_0250 pheS pheT TRUE 0.999 0.000 0.574 0.002 Y NA
 3736588 3736589 ACL_0250 ACL_0251 pheT   FALSE 0.181 69.000 0.000 1.000   NA
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 3736600 3736601 ACL_0262 ACL_0263     FALSE 0.056 147.000 0.000 NA N NA
 3736601 3736602 ACL_0263 ACL_0264     TRUE 0.738 16.000 0.000 NA N NA
 3736602 3736603 ACL_0264 ACL_0265     TRUE 0.954 -3.000 0.000 0.035   NA
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 3736606 3736607 ACL_0268 ACL_0269     FALSE 0.054 151.000 0.000 NA   NA
 3736607 3736608 ACL_0269 ACL_0270     FALSE 0.031 197.000 0.000 NA   NA
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 3736618 3736619 ACL_0280 ACL_0281   nagK TRUE 0.936 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 3736619 3736620 ACL_0281 ACL_0282 nagK glmS TRUE 0.943 2.000 0.000 1.000   NA
 3736620 3736621 ACL_0282 ACL_0283 glmS   TRUE 0.929 5.000 0.000 1.000   NA
 3736621 3736622 ACL_0283 ACL_0284     TRUE 0.929 5.000 0.000 1.000   NA
 3736622 3736623 ACL_0284 ACL_0285     TRUE 0.708 18.000 0.000 NA Y NA
 3736623 3736624 ACL_0285 ACL_0286   pigL TRUE 0.810 14.000 0.000 NA   NA
 3736624 3736625 ACL_0286 ACL_0287 pigL   FALSE 0.049 155.000 0.000 NA   NA
 3736625 3736626 ACL_0287 ACL_0288   pgpA1 TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA N NA
 3736626 3736627 ACL_0288 ACL_0289 pgpA1   FALSE 0.116 101.000 0.000 1.000 N NA
 3736629 3736630 ACL_0291 ACL_0292     TRUE 0.928 -3.000 0.000 1.000   NA
 3736630 3736631 ACL_0292 ACL_0293     FALSE 0.016 359.000 0.000 1.000 N NA
 3736631 3736632 ACL_0293 ACL_0294     FALSE 0.112 91.000 0.000 NA   NA
 3736632 3736633 ACL_0294 ACL_0295     TRUE 0.212 57.000 0.000 NA   NA
 3736633 3736634 ACL_0295 ACL_0296   proS TRUE 0.916 -7.000 0.000 NA   NA
 3736636 3736637 ACL_0298 ACL_0299 fusA   TRUE 0.324 43.000 0.000 NA   NA
 3736637 3736638 ACL_0299 ACL_0300     TRUE 0.918 -10.000 0.000 NA   NA
 3736638 3736639 ACL_0300 ACL_0301     FALSE 0.098 105.000 0.000 NA   NA
 3736640 3736641 ACL_0302 ACL_0303 sodA fbpA FALSE 0.165 68.000 0.000 NA N NA
 3736642 3736643 ACL_0304 ACL_0305 gmk rpoZ TRUE 0.998 2.000 0.471 1.000   NA
 3736643 3736644 ACL_0305 ACL_0306 rpoZ uvrC FALSE 0.146 106.000 0.000 0.073   NA
 3736644 3736645 ACL_0306 ACL_0307 uvrC   TRUE 0.928 -3.000 0.000 1.000   NA
 3736645 3736646 ACL_0307 ACL_0308     FALSE 0.104 108.000 0.000 1.000   NA
 3736648 3736649 ACL_0310 ACL_0311   galM TRUE 0.856 13.000 0.000 1.000   NA
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 3736778 3736779 ACL_0440 ACL_0441 trmA   FALSE 0.032 193.000 0.000 NA   NA
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 3736780 3736781 ACL_0442 ACL_0443     FALSE 0.027 215.000 0.000 NA   NA
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 3736783 3736784 ACL_0445 ACL_0446     FALSE 0.069 143.000 0.000 1.000   NA
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 3736788 3736789 ACL_0450 ACL_0451     FALSE 0.106 98.000 0.000 NA   NA
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 3736792 3736793 ACL_0454 ACL_0455     FALSE 0.152 71.000 0.000 NA   NA
 3736793 3736794 ACL_0455 ACL_0456     FALSE 0.085 111.000 0.000 NA   NA
 3736794 3736795 ACL_0456 ACL_0457   accB FALSE 0.013 429.000 0.000 NA   NA
 3736795 3736796 ACL_0457 ACL_0458 accB accC TRUE 0.995 0.000 0.071 0.004 Y NA
 3736796 3736797 ACL_0458 ACL_0459 accC accD TRUE 0.996 -19.000 0.090 0.004 Y NA
 3736797 3736798 ACL_0459 ACL_0460 accD accA TRUE 0.998 -3.000 0.234 0.003 Y NA
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 3736799 3736800 ACL_0461 ACL_0462 fabH1 fabD TRUE 0.994 10.000 0.182 1.000 Y NA
 3736800 3736801 ACL_0462 ACL_0463 fabD fabG1 TRUE 0.996 0.000 0.149 1.000 Y NA
 3736801 3736802 ACL_0463 ACL_0464 fabG1 fabB TRUE 0.990 15.000 0.236 1.000 Y NA
 3736802 3736803 ACL_0464 ACL_0465 fabB fabZ TRUE 0.990 3.000 0.026 NA Y NA
 3736803 3736804 ACL_0465 ACL_0466 fabZ birA TRUE 0.977 3.000 0.004 NA   NA
 3736804 3736805 ACL_0466 ACL_0467 birA trxB2 FALSE 0.123 96.000 0.000 1.000   NA
 3736805 3736806 ACL_0467 ACL_0468 trxB2   FALSE 0.030 201.000 0.000 NA   NA
 3736806 3736807 ACL_0468 ACL_0469     TRUE 0.916 -7.000 0.000 NA   NA
 3736807 3736808 ACL_0469 ACL_0470     FALSE 0.186 64.000 0.000 NA   NA
 3736808 3736809 ACL_0470 ACL_0471     FALSE 0.017 301.000 0.000 NA   NA
 3736809 3736810 ACL_0471 ACL_0472     TRUE 0.999 0.000 0.928 0.053 Y NA
 3736810 3736811 ACL_0472 ACL_0473     TRUE 0.998 -10.000 0.492 0.053 Y NA
 3736811 3736812 ACL_0473 ACL_0474     TRUE 0.989 5.000 0.017 0.053 Y NA
 3736812 3736813 ACL_0474 ACL_0475   nusB FALSE 0.070 142.000 0.000 1.000   NA
 3736813 3736814 ACL_0475 ACL_0476 nusB xseA TRUE 0.980 6.000 0.012 1.000   NA
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 3736815 3736816 ACL_0477 ACL_0478 xseB   TRUE 0.981 -3.000 0.012 1.000   NA
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 3736826 3736827 ACL_0488 ACL_0489     FALSE 0.109 94.000 0.000 NA   NA
 3736827 3736828 ACL_0489 ACL_0490     FALSE 0.104 100.000 0.000 NA   NA
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 3736830 3736831 ACL_0492 ACL_0493 pncB   TRUE 0.634 20.000 0.000 1.000 N NA
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 3736842 3736843 ACL_0504 ACL_0505 fabG2 fabH2 TRUE 0.802 21.000 0.003 NA Y NA
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 3736865 3736866 ACL_0527 ACL_0528   glgP FALSE 0.078 121.000 0.000 NA N NA
 3736866 3736867 ACL_0528 ACL_0529 glgP glgB FALSE 0.146 88.000 0.000 1.000 Y NA
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 3736876 3736877 ACL_0538 ACL_0539     TRUE 0.885 9.000 0.000 NA   NA
 3736877 3736878 ACL_0539 ACL_0540     FALSE 0.022 276.000 0.000 1.000   NA
 3736878 3736879 ACL_0540 ACL_0541   valS TRUE 0.973 -28.000 0.002 1.000 Y NA
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 3736883 3736884 ACL_0545 ACL_0546     TRUE 0.998 1.000 0.643 NA   NA
 3736884 3736885 ACL_0546 ACL_0547     FALSE 0.083 116.000 0.000 NA   NA
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 3736890 3736891 ACL_0552 ACL_0553 lplA1   FALSE 0.081 119.000 0.000 NA   NA
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 3736892 3736893 ACL_0554 ACL_0555 rpmF mraW1 FALSE 0.170 71.000 0.000 1.000 N NA
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 3736902 3736903 ACL_0564 ACL_0565     TRUE 0.875 10.000 0.000 NA N NA
 3736903 3736904 ACL_0565 ACL_0566     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 3736904 3736905 ACL_0566 ACL_0567     FALSE 0.160 69.000 0.000 NA   NA
 3736905 3736906 ACL_0567 ACL_0568     TRUE 0.916 -7.000 0.000 NA   NA
 3736906 3736907 ACL_0568 ACL_0569     TRUE 0.927 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3736907 3736908 ACL_0569 ACL_0570     FALSE 0.033 208.000 0.000 1.000   NA
 3736908 3736909 ACL_0570 ACL_0571     FALSE 0.123 81.000 0.000 NA   NA
 3736909 3736910 ACL_0571 ACL_0572     FALSE 0.053 152.000 0.000 NA   NA
 3736910 3736911 ACL_0572 ACL_0573     TRUE 0.641 19.000 0.000 NA   NA
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 3736912 3736913 ACL_0574 ACL_0575     FALSE 0.060 152.000 0.000 1.000   NA
 3736913 3736914 ACL_0575 ACL_0576     TRUE 0.997 -15.000 0.333 NA   NA
 3736914 3736915 ACL_0576 ACL_0577     FALSE 0.118 85.000 0.000 NA   NA
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 3736921 3736922 ACL_0583 ACL_0584     FALSE 0.175 70.000 0.000 1.000   NA
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 3736924 3736925 ACL_0586 ACL_0587     FALSE 0.061 142.000 0.000 NA   NA
 3736925 3736926 ACL_0587 ACL_0588     TRUE 0.926 -40.000 0.000 NA   NA
 3736926 3736927 ACL_0588 ACL_0589   hsdM1 FALSE 0.108 96.000 0.000 NA   NA
 3736927 3736928 ACL_0589 ACL_0590 hsdM1 hsdS1 TRUE 0.996 -10.000 0.138 0.067 Y NA
 3736928 3736929 ACL_0590 ACL_0591 hsdS1 hsdR1 TRUE 0.995 5.000 0.069 0.004 Y NA
 3736929 3736930 ACL_0591 ACL_0592 hsdR1   FALSE 0.155 70.000 0.000 NA   NA
 3736930 3736931 ACL_0592 ACL_0593     FALSE 0.015 329.000 0.000 NA   NA
 3736931 3736932 ACL_0593 ACL_0594     TRUE 0.954 -52.000 0.000 0.067   NA
 3736932 3736933 ACL_0594 ACL_0595     TRUE 0.774 18.000 0.000 0.067   NA
 3736933 3736934 ACL_0595 ACL_0596     FALSE 0.111 92.000 0.000 NA   NA
 3736934 3736935 ACL_0596 ACL_0597     TRUE 0.924 -22.000 0.000 NA   NA
 3736935 3736936 ACL_0597 ACL_0598     TRUE 0.916 -7.000 0.000 NA   NA
 3736936 3736937 ACL_0598 ACL_0599     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 3736937 3736938 ACL_0599 ACL_0600   metK2 TRUE 0.282 48.000 0.000 NA   NA
 3736938 3736939 ACL_0600 ACL_0601 metK2   TRUE 0.935 -34.000 0.000 1.000   NA
 3736939 3736940 ACL_0601 ACL_0602     FALSE 0.058 144.000 0.000 NA   NA
 3736940 3736941 ACL_0602 ACL_0603     TRUE 0.992 10.000 0.167 NA   NA
 3736941 3736942 ACL_0603 ACL_0604     FALSE 0.082 117.000 0.000 NA   NA
 3736942 3736943 ACL_0604 ACL_0605     TRUE 0.459 27.000 0.000 NA   NA
 3736943 3736944 ACL_0605 ACL_0606     TRUE 0.473 26.000 0.000 NA   NA
 3736944 3736945 ACL_0606 ACL_0607     TRUE 0.445 28.000 0.000 NA   NA
 3736945 3736946 ACL_0607 ACL_0608     TRUE 0.997 -3.000 0.333 NA   NA
 3736946 3736947 ACL_0608 ACL_0609     TRUE 0.676 18.000 0.000 NA   NA
 3736947 3736948 ACL_0609 ACL_0610     TRUE 0.740 16.000 0.000 NA   NA
 3736948 3736949 ACL_0610 ACL_0611     TRUE 0.609 175.000 0.615 NA   NA
 3736949 3736950 ACL_0611 ACL_0612     TRUE 0.995 5.000 0.154 NA   NA
 3736950 3736951 ACL_0612 ACL_0613     TRUE 0.473 26.000 0.000 NA   NA
 3736951 3736952 ACL_0613 ACL_0614     TRUE 0.919 -13.000 0.000 NA   NA
 3736952 3736953 ACL_0614 ACL_0615     TRUE 0.921 -16.000 0.000 NA   NA
 3736953 3736954 ACL_0615 ACL_0616     TRUE 0.918 -10.000 0.000 NA   NA
 3736954 3736955 ACL_0616 ACL_0617     TRUE 0.918 -10.000 0.000 NA   NA
 3736955 3736956 ACL_0617 ACL_0618     TRUE 0.934 2.000 0.000 NA   NA
 3736956 3736957 ACL_0618 ACL_0619     FALSE 0.028 210.000 0.000 NA   NA
 3736957 3736958 ACL_0619 ACL_0620     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 3736958 3736959 ACL_0620 ACL_0621     TRUE 0.905 6.000 0.000 NA   NA
 3736959 3736960 ACL_0621 ACL_0622     TRUE 0.925 0.000 0.000 NA   NA
 3736960 3736961 ACL_0622 ACL_0623     TRUE 0.810 14.000 0.000 NA   NA
 3736961 3736962 ACL_0623 ACL_0624     TRUE 0.925 0.000 0.000 NA   NA
 3736962 3736963 ACL_0624 ACL_0625     TRUE 0.934 2.000 0.000 NA   NA
 3736963 3736964 ACL_0625 ACL_0626     TRUE 0.641 19.000 0.000 NA   NA
 3736964 3736965 ACL_0626 ACL_0627     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 3736965 3736966 ACL_0627 ACL_0628     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 3736966 3736967 ACL_0628 ACL_0629     TRUE 0.916 -7.000 0.000 NA   NA
 3736967 3736968 ACL_0629 ACL_0630     FALSE 0.023 243.000 0.000 NA   NA
 3736968 3736969 ACL_0630 ACL_0631     TRUE 0.329 42.000 0.000 NA   NA
 3736969 3736970 ACL_0631 ACL_0632     FALSE 0.065 137.000 0.000 NA   NA
 3736970 3736971 ACL_0632 ACL_0633   mcrB FALSE 0.087 123.000 0.000 1.000   NA
 3736971 3736972 ACL_0633 ACL_0634 mcrB mcrC TRUE 0.852 86.000 0.759 NA   NA
 3736972 3736973 ACL_0634 ACL_0635 mcrC   FALSE 0.114 87.000 0.000 NA   NA
 3736973 3736974 ACL_0635 ACL_0636     FALSE 0.109 94.000 0.000 NA   NA
 3736974 3736975 ACL_0636 ACL_0637     FALSE 0.109 94.000 0.000 NA   NA
 3736975 3736976 ACL_0637 ACL_0638     FALSE 0.011 887.000 0.000 NA   NA
 3736976 3736977 ACL_0638 ACL_0639     FALSE 0.012 593.000 0.000 NA   NA
 3736977 3736978 ACL_0639 ACL_0640     FALSE 0.118 130.000 0.000 0.047   NA
 3736978 3736979 ACL_0640 ACL_0641   gltS TRUE 0.925 -28.000 0.000 NA N NA
 3736979 3736980 ACL_0641 ACL_0642 gltS   FALSE 0.053 151.000 0.000 NA N NA
 3736980 3736981 ACL_0642 ACL_0643     TRUE 0.942 2.000 0.000 1.000 N NA
 3736981 3736982 ACL_0643 ACL_0644     TRUE 0.934 0.000 0.000 1.000 N NA
 3736982 3736983 ACL_0644 ACL_0645   aes FALSE 0.179 69.000 0.000 1.000 N NA
 3736983 3736984 ACL_0645 ACL_0646 aes rluA1 TRUE 0.927 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3736986 3736987 ACL_0648 ACL_0649     FALSE 0.015 481.000 0.000 1.000   NA
 3736987 3736988 ACL_0649 ACL_0650     TRUE 0.992 2.000 0.022 0.049 Y NA
 3736988 3736989 ACL_0650 ACL_0651     TRUE 0.994 -10.000 0.096 1.000 Y NA
 3736989 3736990 ACL_0651 ACL_0652     FALSE 0.123 95.000 0.000 1.000 N NA
 3736990 3736991 ACL_0652 ACL_0653     TRUE 0.351 44.000 0.000 1.000   NA
 3736991 3736992 ACL_0653 ACL_0654   selR TRUE 0.884 11.000 0.000 1.000   NA
 3736993 3736994 ACL_0655 ACL_0656 malQ amyA4 TRUE 0.971 3.000 0.000 0.013 Y NA
 3736996 3736997 ACL_0658 ACL_0659 amyA2   TRUE 0.938 5.000 0.000 1.000 Y NA
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 3736999 3737000 ACL_0661 ACL_0662     TRUE 0.873 12.000 0.000 1.000   NA
 3737000 3737001 ACL_0662 ACL_0663     FALSE 0.025 236.000 0.000 NA   NA
 3737001 3737002 ACL_0663 ACL_0664     TRUE 0.925 0.000 0.000 NA   NA
 3737003 3737004 ACL_0665 ACL_0666     TRUE 0.925 0.000 0.000 NA   NA
 3737006 3737007 ACL_0668 ACL_0669     TRUE 0.897 7.000 0.000 NA   NA
 3737007 3737008 ACL_0669 ACL_0670     TRUE 0.207 59.000 0.000 NA   NA
 3737008 3737009 ACL_0670 ACL_0671     FALSE 0.041 168.000 0.000 NA   NA
 3737012 3737013 ACL_0674 ACL_0675     TRUE 0.856 12.000 0.000 NA   NA
 3737014 3737015 ACL_0676 ACL_0677 lepA   FALSE 0.016 311.000 0.000 NA   NA
 3737015 3737016 ACL_0677 ACL_0678   hemN FALSE 0.088 110.000 0.000 NA   NA
 3737016 3737017 ACL_0678 ACL_0679 hemN xerD TRUE 0.927 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3737017 3737018 ACL_0679 ACL_0680 xerD deoB TRUE 0.978 -3.000 0.008 1.000 N NA
 3737019 3737020 ACL_0681 ACL_0682     TRUE 0.449 63.000 0.006 NA   NA
 3737020 3737021 ACL_0682 ACL_0683   deoA TRUE 0.934 0.000 0.000 1.000 N NA
 3737021 3737022 ACL_0683 ACL_0684 deoA   TRUE 0.302 46.000 0.000 NA   NA
 3737023 3737024 ACL_0685 ACL_0686 gpmB kefB FALSE 0.066 144.000 0.000 1.000 N NA
 3737024 3737025 ACL_0686 ACL_0687 kefB   TRUE 0.779 15.000 0.000 NA   NA
 3737026 3737027 ACL_0688 ACL_0689   plsC TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 3737027 3737028 ACL_0689 ACL_0690 plsC folA TRUE 0.986 5.000 0.022 1.000 N NA
 3737028 3737029 ACL_0690 ACL_0691 folA thyA TRUE 0.997 -3.000 0.295 1.000 N NA
 3737029 3737030 ACL_0691 ACL_0692 thyA argE TRUE 0.731 17.000 0.000 1.000 N NA
 3737030 3737031 ACL_0692 ACL_0693 argE   TRUE 0.245 53.000 0.000 NA   NA
 3737031 3737032 ACL_0693 ACL_0694     FALSE 0.111 92.000 0.000 NA   NA
 3737032 3737033 ACL_0694 ACL_0695     FALSE 0.056 155.000 0.000 1.000   NA
 3737033 3737034 ACL_0695 ACL_0696     TRUE 0.967 2.000 0.000 0.011   NA
 3737034 3737035 ACL_0696 ACL_0697     TRUE 0.999 -10.000 0.872 0.008   NA
 3737035 3737036 ACL_0697 ACL_0698   deoD TRUE 0.928 -3.000 0.000 1.000   NA
 3737036 3737037 ACL_0698 ACL_0699 deoD deoC TRUE 0.941 -19.000 0.000 1.000 Y NA
 3737037 3737038 ACL_0699 ACL_0700 deoC   TRUE 0.509 24.000 0.000 NA   NA
 3737038 3737039 ACL_0700 ACL_0701   surE FALSE 0.167 68.000 0.000 NA   NA
 3737039 3737040 ACL_0701 ACL_0702 surE   TRUE 0.928 -3.000 0.000 1.000   NA
 3737040 3737041 ACL_0702 ACL_0703     FALSE 0.025 227.000 0.000 NA   NA
 3737041 3737042 ACL_0703 ACL_0704     TRUE 0.925 0.000 0.000 NA   NA
 3737042 3737043 ACL_0704 ACL_0705     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 3737043 3737044 ACL_0705 ACL_0706   ftsZ TRUE 0.492 40.000 0.000 0.019 N NA
 3737044 3737045 ACL_0706 ACL_0707 ftsZ tgt TRUE 0.221 61.000 0.000 1.000 N NA
 3737049 3737050 ACL_0711 ACL_0712     TRUE 0.954 -3.000 0.000 0.031 N NA
 3737050 3737051 ACL_0712 ACL_0713     TRUE 0.939 4.000 0.000 1.000   NA
 3737051 3737052 ACL_0713 ACL_0714     FALSE 0.109 106.000 0.000 1.000   NA
 3737052 3737053 ACL_0714 ACL_0715     TRUE 0.801 15.000 0.000 1.000 N NA
 3737053 3737054 ACL_0715 ACL_0716     TRUE 0.929 5.000 0.000 1.000   NA
 3737054 3737055 ACL_0716 ACL_0717     TRUE 0.943 2.000 0.000 1.000   NA
 3737055 3737056 ACL_0717 ACL_0718     TRUE 0.950 2.000 0.000 1.000 Y NA
 3737056 3737057 ACL_0718 ACL_0719     TRUE 0.997 -3.000 0.222 0.048 Y NA
 3737057 3737058 ACL_0719 ACL_0720     TRUE 0.992 13.000 0.250 NA   NA
 3737058 3737059 ACL_0720 ACL_0721     TRUE 0.998 -13.000 0.500 NA   NA
 3737059 3737060 ACL_0721 ACL_0722     TRUE 0.998 6.000 0.625 1.000   NA
 3737060 3737061 ACL_0722 ACL_0723     TRUE 0.996 16.000 1.000 0.048 Y NA
 3737061 3737062 ACL_0723 ACL_0724     TRUE 0.999 -16.000 1.000 0.048 Y NA
 3737062 3737063 ACL_0724 ACL_0725     TRUE 0.875 80.000 0.375 0.048 Y NA
 3737063 3737064 ACL_0725 ACL_0726     FALSE 0.044 174.000 0.000 1.000 N NA
 3737064 3737065 ACL_0726 ACL_0727     TRUE 0.957 -19.000 0.000 0.030 N NA
 3737065 3737066 ACL_0727 ACL_0728     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 3737066 3737067 ACL_0728 ACL_0729     TRUE 0.918 -10.000 0.000 NA   NA
 3737067 3737068 ACL_0729 ACL_0730     TRUE 0.947 6.000 0.000 0.030   NA
 3737068 3737069 ACL_0730 ACL_0731     FALSE 0.059 153.000 0.000 1.000   NA
 3737069 3737070 ACL_0731 ACL_0732     FALSE 0.111 92.000 0.000 NA   NA
 3737070 3737071 ACL_0732 ACL_0733     FALSE 0.178 66.000 0.000 NA   NA
 3737071 3737072 ACL_0733 ACL_0734     TRUE 0.740 16.000 0.000 NA   NA
 3737072 3737073 ACL_0734 ACL_0735     TRUE 0.905 6.000 0.000 NA   NA
 3737074 3737075 ACL_0736 ACL_0737     FALSE 0.050 154.000 0.000 NA   NA
 3737075 3737076 ACL_0737 ACL_0738     TRUE 0.994 -13.000 0.121 NA   NA
 3737077 3737078 ACL_0739 ACL_0740     FALSE 0.123 96.000 0.000 1.000   NA
 3737078 3737079 ACL_0740 ACL_0741     TRUE 0.958 -19.000 0.000 0.024   NA
 3737079 3737080 ACL_0741 ACL_0742     FALSE 0.036 195.000 0.000 1.000 N NA
 3737080 3737081 ACL_0742 ACL_0743     TRUE 0.274 127.000 0.012 1.000 N NA
 3737081 3737082 ACL_0743 ACL_0744     FALSE 0.145 73.000 0.000 NA   NA
 3737082 3737083 ACL_0744 ACL_0745     TRUE 0.382 35.000 0.000 NA   NA
 3737083 3737084 ACL_0745 ACL_0746     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 3737084 3737085 ACL_0746 ACL_0747     FALSE 0.112 91.000 0.000 NA   NA
 3737085 3737086 ACL_0747 ACL_0748     FALSE 0.034 184.000 0.000 NA   NA
 3737087 3737088 ACL_0749 ACL_0750     TRUE 0.199 61.000 0.000 NA   NA
 3737089 3737090 ACL_0751 ACL_0752     FALSE 0.066 136.000 0.000 NA   NA
 3737090 3737091 ACL_0752 ACL_0753     TRUE 0.918 -10.000 0.000 NA   NA
 3737091 3737092 ACL_0753 ACL_0754     TRUE 0.934 2.000 0.000 NA   NA
 3737092 3737093 ACL_0754 ACL_0755     TRUE 0.995 5.000 0.163 NA   NA
 3737093 3737094 ACL_0755 ACL_0756     FALSE 0.026 224.000 0.000 NA   NA
 3737094 3737095 ACL_0756 ACL_0757     TRUE 0.930 1.000 0.000 NA   NA
 3737095 3737096 ACL_0757 ACL_0758     TRUE 0.979 -3.000 0.011 NA   NA
 3737096 3737097 ACL_0758 ACL_0759     FALSE 0.058 144.000 0.000 NA   NA
 3737097 3737098 ACL_0759 ACL_0760     TRUE 0.856 12.000 0.000 NA   NA
 3737100 3737101 ACL_0762 ACL_0763     FALSE 0.076 123.000 0.000 NA   NA
 3737101 3737102 ACL_0763 ACL_0764     FALSE 0.069 133.000 0.000 NA   NA
 3737104 3737105 ACL_0766 ACL_0767     FALSE 0.068 134.000 0.000 NA   NA
 3737107 3737108 ACL_0769 ACL_0770     FALSE 0.041 166.000 0.000 NA   NA
 3737108 3737109 ACL_0770 ACL_0771     FALSE 0.015 330.000 0.000 NA   NA
 3737109 3737110 ACL_0771 ACL_0772     FALSE 0.013 435.000 0.000 NA   NA
 3737110 3737111 ACL_0772 ACL_0773     TRUE 0.203 60.000 0.000 NA   NA
 3737111 3737112 ACL_0773 ACL_0774     TRUE 0.994 0.000 0.111 NA   NA
 3737112 3737113 ACL_0774 ACL_0775     TRUE 0.998 -7.000 0.593 NA   NA
 3737113 3737114 ACL_0775 ACL_0776     TRUE 0.926 -7.000 0.000 1.000 N NA
 3737114 3737115 ACL_0776 ACL_0777   trpB FALSE 0.013 934.000 0.000 1.000 N NA
 3737117 3737118 ACL_0779 ACL_0780   merA FALSE 0.027 215.000 0.000 NA   NA
 3737118 3737119 ACL_0780 ACL_0781 merA   TRUE 0.209 90.000 0.000 0.007 N NA
 3737119 3737120 ACL_0781 ACL_0782     FALSE 0.040 182.000 0.000 1.000 N NA
 3737120 3737121 ACL_0782 ACL_0783     FALSE 0.011 675.000 0.000 NA   NA
 3737121 3737122 ACL_0783 ACL_0784     FALSE 0.077 122.000 0.000 NA   NA
 3737122 3737123 ACL_0784 ACL_0785     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 3737123 3737124 ACL_0785 ACL_0786   dapB TRUE 0.282 48.000 0.000 NA   NA
 3737124 3737125 ACL_0786 ACL_0787 dapB dapA TRUE 0.970 -7.000 0.002 1.000 Y NA
 3737125 3737126 ACL_0787 ACL_0788 dapA asd TRUE 0.937 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3737126 3737127 ACL_0788 ACL_0789 asd lysC TRUE 0.984 17.000 0.119 0.002 Y NA
 3737127 3737128 ACL_0789 ACL_0790 lysC lysA TRUE 0.988 2.000 0.016 1.000 Y NA
 3737128 3737129 ACL_0790 ACL_0791 lysA   FALSE 0.021 284.000 0.000 1.000 N NA
 3737129 3737130 ACL_0791 ACL_0792     FALSE 0.091 120.000 0.000 1.000 N NA
 3737130 3737131 ACL_0792 ACL_0793   guaC FALSE 0.111 105.000 0.000 1.000 N NA
 3737131 3737132 ACL_0793 ACL_0794 guaC   TRUE 0.186 68.000 0.000 1.000 N NA
 3737133 3737134 ACL_0795 ACL_0796     FALSE 0.098 105.000 0.000 NA   NA
 3737135 3737136 ACL_0797 ACL_0798 idi mvaK2 TRUE 0.995 -7.000 0.097 0.050 N NA
 3737136 3737137 ACL_0798 ACL_0799 mvaK2 mvaD TRUE 0.998 -3.000 0.312 0.004 Y NA
 3737137 3737138 ACL_0799 ACL_0800 mvaD mvaK1 TRUE 0.998 -3.000 0.281 0.004 Y NA
 3737139 3737140 ACL_0801 ACL_0802   indA TRUE 0.808 14.000 0.000 NA N NA
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 3737289 3737290 ACL_0951 ACL_0952 phoP rpsU FALSE 0.037 192.000 0.000 1.000   NA
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 3737299 3737300 ACL_0961 ACL_0962   zwf FALSE 0.057 154.000 0.000 1.000 N NA
 3737300 3737301 ACL_0962 ACL_0963 zwf gnd TRUE 0.937 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3737301 3737302 ACL_0963 ACL_0964 gnd   FALSE 0.157 75.000 0.000 1.000 N NA
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 3737434 3737435 ACL_1096 ACL_1097     FALSE 0.019 309.000 0.000 1.000 N NA
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 3737436 3737437 ACL_1098 ACL_1099     TRUE 0.998 -7.000 0.816 1.000 Y NA
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 3737439 3737440 ACL_1101 ACL_1102 ada   TRUE 0.928 -3.000 0.000 1.000   NA
 3737441 3737442 ACL_1103 ACL_1104   lrgB FALSE 0.144 80.000 0.000 1.000   NA
 3737442 3737443 ACL_1104 ACL_1105 lrgB lrgA TRUE 0.994 -7.000 0.121 1.000   NA
 3737443 3737444 ACL_1105 ACL_1106 lrgA ribD FALSE 0.037 190.000 0.000 1.000   NA
 3737444 3737445 ACL_1106 ACL_1107 ribD fixB FALSE 0.099 110.000 0.000 1.000 N NA
 3737445 3737446 ACL_1107 ACL_1108 fixB fixA TRUE 0.996 15.000 0.700 0.007 Y NA
 3737446 3737447 ACL_1108 ACL_1109 fixA caiA TRUE 0.998 5.000 0.273 0.024 N NA
 3737449 3737450 ACL_1111 ACL_1112     FALSE 0.044 160.000 0.000 NA   NA
 3737450 3737451 ACL_1112 ACL_1113     FALSE 0.118 85.000 0.000 NA   NA
 3737451 3737452 ACL_1113 ACL_1114     FALSE 0.067 135.000 0.000 NA   NA
 3737452 3737453 ACL_1114 ACL_1115     FALSE 0.088 110.000 0.000 NA   NA
 3737453 3737454 ACL_1115 ACL_1116     TRUE 0.877 10.000 0.000 NA   NA
 3737454 3737455 ACL_1116 ACL_1117     TRUE 0.925 0.000 0.000 NA   NA
 3737455 3737456 ACL_1117 ACL_1118     TRUE 0.831 14.000 0.000 1.000   NA
 3737456 3737457 ACL_1118 ACL_1119     TRUE 0.943 2.000 0.000 1.000   NA
 3737457 3737458 ACL_1119 ACL_1120     FALSE 0.013 663.000 0.000 1.000   NA
 3737460 3737461 ACL_1122 ACL_1123     FALSE 0.095 106.000 0.000 NA   NA
 3737465 3737466 ACL_1127 ACL_1128     TRUE 0.273 49.000 0.000 NA   NA
 3737466 3737467 ACL_1128 ACL_1129     TRUE 0.779 15.000 0.000 NA   NA
 3737467 3737468 ACL_1129 ACL_1130     FALSE 0.129 78.000 0.000 NA   NA
 3737468 3737469 ACL_1130 ACL_1131     FALSE 0.109 93.000 0.000 NA N NA
 3737469 3737470 ACL_1131 ACL_1132     TRUE 0.971 4.000 0.000 0.003 Y NA
 3737470 3737471 ACL_1132 ACL_1133     FALSE 0.065 137.000 0.000 NA   NA
 3737471 3737472 ACL_1133 ACL_1134     TRUE 0.885 9.000 0.000 NA   NA
 3737472 3737473 ACL_1134 ACL_1135     TRUE 0.207 59.000 0.000 NA   NA
 3737473 3737474 ACL_1135 ACL_1136     TRUE 0.885 9.000 0.000 NA   NA
 3737474 3737475 ACL_1136 ACL_1137     FALSE 0.127 80.000 0.000 NA   NA
 3737475 3737476 ACL_1137 ACL_1138   pfs TRUE 0.934 2.000 0.000 NA   NA
 3737476 3737477 ACL_1138 ACL_1139 pfs udk TRUE 0.937 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3737477 3737478 ACL_1139 ACL_1140 udk   TRUE 0.837 13.000 0.000 NA   NA
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 3737481 3737482 ACL_1143 ACL_1144     FALSE 0.121 82.000 0.000 NA   NA
 3737482 3737483 ACL_1144 ACL_1145     FALSE 0.140 75.000 0.000 NA   NA
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 3737484 3737485 ACL_1146 ACL_1147     FALSE 0.065 137.000 0.000 NA   NA
 3737485 3737486 ACL_1147 ACL_1148     FALSE 0.014 368.000 0.000 NA   NA
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 3737503 3737504 ACL_1165 ACL_1166 ung   TRUE 0.926 -40.000 0.000 NA   NA
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 3737535 3737536 ACL_1197 ACL_1198 spoU thiI TRUE 0.961 9.000 0.005 1.000 N NA
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 3737547 3737548 ACL_1209 ACL_1210 pgk   FALSE 0.112 91.000 0.000 NA   NA
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 3737574 3737575 ACL_1236 ACL_1237     FALSE 0.065 147.000 0.000 1.000   NA
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 3737606 3737607 ACL_1268 ACL_1269   hsdR2 FALSE 0.039 174.000 0.000 NA   NA
 3737607 3737608 ACL_1269 ACL_1270 hsdR2   TRUE 0.919 5.000 0.000 NA   NA
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 3737609 3737610 ACL_1271 ACL_1272 hsdS2 hsdM2 TRUE 0.955 -7.000 0.000 0.054 Y NA
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 3737612 3737613 ACL_1274 ACL_1275     FALSE 0.054 150.000 0.000 NA   NA
 3737613 3737614 ACL_1275 ACL_1276     TRUE 0.445 28.000 0.000 NA   NA
 3737614 3737615 ACL_1276 ACL_1277     TRUE 0.509 24.000 0.000 NA   NA
 3737616 3737617 ACL_1278 ACL_1279     FALSE 0.060 143.000 0.000 NA   NA
 3737617 3737618 ACL_1279 ACL_1280     FALSE 0.088 110.000 0.000 NA   NA
 3737618 3737619 ACL_1280 ACL_1281   mgtA2 FALSE 0.017 302.000 0.000 NA   NA
 3737619 3737620 ACL_1281 ACL_1282 mgtA2   FALSE 0.045 174.000 0.000 1.000   NA
 3737620 3737621 ACL_1282 ACL_1283     FALSE 0.039 183.000 0.000 1.000   NA
 3737621 3737622 ACL_1283 ACL_1284     TRUE 0.999 -16.000 0.928 0.041 Y NA
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 3737623 3737624 ACL_1285 ACL_1286     TRUE 0.998 -3.000 0.253 0.041 Y NA
 3737625 3737626 ACL_1287 ACL_1288     FALSE 0.082 117.000 0.000 NA   NA
 3737626 3737627 ACL_1288 ACL_1289   nrdB TRUE 0.925 0.000 0.000 NA   NA
 3737627 3737628 ACL_1289 ACL_1290 nrdB nrdA TRUE 0.997 11.000 0.250 0.001 Y NA
 3737628 3737629 ACL_1290 ACL_1291 nrdA nrdI TRUE 0.997 1.000 0.267 1.000 Y NA
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 3737770 3737771 ACL_1432 ACL_1433 rnpA rpmH TRUE 0.844 103.000 0.787 1.000   NA