MicrobesOnline Operon Predictions for Cyanothece sp. ATCC 51142

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5426093 5426094 cce_4767 cce_4768     FALSE 0.116 172.000 0.000 NA   NA
 5426094 5426095 cce_4768 cce_4769     FALSE 0.386 64.000 0.000 NA   NA
 5426095 5426096 cce_4769 cce_4770     FALSE 0.324 41.000 0.000 NA   NA
 5426096 5426097 cce_4770 cce_4771     FALSE 0.307 97.000 0.000 NA   NA
 5426097 5426098 cce_4771 cce_4772     FALSE 0.338 48.000 0.000 NA   NA
 5426098 5426099 cce_4772 cce_4773     TRUE 0.904 -7.000 0.571 NA   NA
 5426100 5426101 cce_4774 cce_4775     FALSE 0.327 26.000 0.000 NA   NA
 5426101 5426102 cce_4775 cce_4776     FALSE 0.312 96.000 0.000 NA   NA
 5426102 5426103 cce_4776 cce_4777     FALSE 0.228 121.000 0.000 NA   NA
 5426103 5426104 cce_4777 cce_4778     FALSE 0.213 -39.000 0.000 NA   NA
 5426107 5426108 cce_4781 cce_4782     FALSE 0.290 102.000 0.000 NA   NA
 5426108 5426109 cce_4782 cce_4783     FALSE 0.169 148.000 0.000 NA   NA
 5426109 5426110 cce_4783 cce_4784     FALSE 0.325 27.000 0.000 NA   NA
 5426110 5426111 cce_4784 cce_4785     FALSE 0.217 125.000 0.000 NA   NA
 5426111 5426112 cce_4785 cce_4786     FALSE 0.342 16.000 0.000 NA   NA
 5426113 5426114 cce_4787 cce_4788     FALSE 0.030 249.000 0.000 NA   NA
 5426115 5426116 cce_4789 cce_4790     FALSE 0.385 65.000 0.000 NA   NA
 5426116 5426117 cce_4790 cce_4791     FALSE 0.384 69.000 0.000 NA   NA
 5426117 5426118 cce_4791 cce_4792     FALSE 0.340 17.000 0.000 NA   NA
 5426121 5426122 cce_4795 cce_4796     FALSE 0.011 339.000 0.000 NA   NA
 5426122 5426123 cce_4796 cce_4797     FALSE 0.318 38.000 0.000 NA   NA
 5426123 5426124 cce_4797 cce_4798     FALSE 0.331 44.000 0.000 NA   NA
 5426126 5426127 cce_4800 cce_4801     FALSE 0.222 -28.000 0.000 NA   NA
 5426130 5426131 cce_4804 cce_4805     FALSE 0.022 273.000 0.000 NA   NA
 5426131 5426132 cce_4805 cce_4806     FALSE 0.014 317.000 0.000 NA   NA
 5426132 5426133 cce_4806 cce_4807     TRUE 0.835 116.000 0.333 NA   NA
 5426133 5426134 cce_4807 cce_4808   topA2 TRUE 0.513 20.000 0.002 NA   NA
 5426135 5426136 cce_4809 cce_4810     FALSE 0.066 198.000 0.000 NA   NA
 5426138 5426139 cce_4812 cce_4813   coxC2 TRUE 0.961 54.000 0.714 0.059 N NA
 5426139 5426140 cce_4813 cce_4814 coxC2 coxA2 TRUE 0.851 20.000 0.000 0.003 Y NA
 5426140 5426141 cce_4814 cce_4815 coxA2 coxB2 TRUE 0.966 8.000 0.333 0.003 Y NA
 5426141 5426142 cce_4815 cce_4816 coxB2   FALSE 0.326 42.000 0.000 NA   NA
 5426142 5426143 cce_4816 cce_4817     FALSE 0.289 -3.000 0.000 NA   NA
 5426143 5426144 cce_4817 cce_4818     FALSE 0.018 294.000 0.000 NA   NA
 5426145 5426146 cce_4819 cce_4820     FALSE 0.005 495.000 0.000 NA   NA
 5426146 5426147 cce_4820 cce_4821   metE FALSE 0.243 114.000 0.000 NA   NA
 5426147 5426148 cce_4821 cce_4822 metE   FALSE 0.284 103.000 0.000 NA   NA
 5426148 5426149 cce_4822 cce_4823     FALSE 0.354 52.000 0.000 NA   NA
 5426150 5426151 cce_4824 cce_4825     FALSE 0.276 -6.000 0.000 NA   NA
 5426152 5426153 cce_4826 cce_4827     FALSE 0.091 182.000 0.000 NA   NA
 5426154 5426155 cce_4828 cce_4829     FALSE 0.077 190.000 0.000 NA   NA
 5426156 5426157 cce_4830 cce_4831     FALSE 0.006 471.000 0.000 NA   NA
 5426158 5426159 cce_4832 cce_4833     FALSE 0.343 15.000 0.000 NA   NA
 5426159 5426160 cce_4833 cce_4834     TRUE 0.851 119.000 0.400 NA   NA
 5426161 5426162 cce_4835 cce_4836 thrS3   TRUE 0.516 63.000 0.000 1.000   NA
 5426162 5426163 cce_4836 cce_4837   moaB1 TRUE 0.631 25.000 0.006 1.000   NA
 5426166 5426167 cce_4840 cce_4841     FALSE 0.322 4.000 0.000 NA   NA
 5426167 5426168 cce_4841 cce_4842   cysS2 FALSE 0.373 122.000 0.002 NA   NA
 5426168 5426169 cce_4842 cce_4843 cysS2   FALSE 0.318 38.000 0.000 NA   NA
 5426169 5426170 cce_4843 cce_4844     TRUE 0.962 74.000 1.000 NA   NA
 5426170 5426171 cce_4844 cce_4845     FALSE 0.343 132.000 0.002 NA   NA
 5426171 5426172 cce_4845 cce_4846     TRUE 0.613 55.000 0.002 1.000 N NA
 5426172 5426173 cce_4846 cce_4847     TRUE 0.778 -12.000 0.133 1.000 N NA
 5426175 5426176 cce_4849 cce_4850     TRUE 0.686 35.000 0.045 NA   NA
 5426176 5426177 cce_4850 cce_4851     TRUE 0.914 -3.000 0.600 NA   NA
 5426177 5426178 cce_4851 cce_4852   hemB1 TRUE 0.600 75.000 0.005 NA   NA
 5426178 5426179 cce_4852 cce_4853 hemB1   FALSE 0.383 70.000 0.000 NA   NA
 5426180 5426181 cce_4854 cce_4855     TRUE 0.864 151.000 0.667 1.000 N NA
 5426181 5426182 cce_4855 cce_4856     FALSE 0.314 32.000 0.000 NA   NA
 5426182 5426183 cce_4856 cce_4857     FALSE 0.180 141.000 0.000 NA   NA
 5426183 5426184 cce_4857 cce_4858     TRUE 0.642 -12.000 0.051 NA   NA
 5426184 5426185 cce_4858 cce_4859   fur4 FALSE 0.043 228.000 0.000 NA   NA
 5426186 5426187 cce_4860 cce_4861     TRUE 0.844 -31.000 0.080 1.000 Y NA
 5426187 5426188 cce_4861 cce_4862     TRUE 0.961 56.000 0.339 1.000 Y NA
 5426191 5426192 cce_4865 cce_4866   dnaN2 TRUE 0.583 91.000 0.002 1.000   NA
 5426192 5426193 cce_4866 cce_4867 dnaN2   TRUE 0.513 9.000 0.002 NA   NA
 5426194 5426195 cce_4868 cce_4869     FALSE 0.316 3.000 0.000 NA   NA
 5426196 5426197 cce_4870 cce_4871     FALSE 0.007 420.000 0.000 NA   NA
 5426197 5426198 cce_4871 cce_4872     TRUE 0.948 64.000 0.667 NA   NA
 5426198 5426199 cce_4872 cce_4873     TRUE 0.933 91.000 0.667 NA   NA
 5426199 5426200 cce_4873 cce_4874     FALSE 0.010 354.000 0.000 NA   NA
 5426200 5426201 cce_4874 cce_4875     FALSE 0.249 112.000 0.000 NA   NA
 5426201 5426202 cce_4875 cce_4876     FALSE 0.063 204.000 0.000 NA   NA
 5426202 5426203 cce_4876 cce_4877   nrdB2 FALSE 0.341 49.000 0.000 NA   NA
 5426203 5426204 cce_4877 cce_4878 nrdB2   FALSE 0.004 919.000 0.000 NA   NA
 5426204 5426205 cce_4878 cce_4879     FALSE 0.003 1030.000 0.000 NA   NA
 5426205 5426206 cce_4879 cce_4880     FALSE 0.034 240.000 0.000 NA   NA
 5426206 5426207 cce_4880 cce_4881     FALSE 0.331 89.000 0.000 NA   NA
 5426209 5426210 cce_4883 cce_4884     TRUE 0.906 -7.000 0.500 1.000 N NA
 5426210 5426211 cce_4884 cce_4885     TRUE 0.513 -3.000 0.006 NA   NA
 5426211 5426212 cce_4885 cce_4886     FALSE 0.184 139.000 0.000 NA   NA
 5426213 5426214 cce_4887 cce_4888     FALSE 0.289 -3.000 0.000 NA   NA
 5426215 5426216 cce_4889 cce_4890     FALSE 0.005 551.000 0.000 NA   NA
 5426224 5426225 cce_4898 cce_4899     FALSE 0.276 -6.000 0.000 NA   NA
 5426226 5426227 cce_4900 cce_4901     FALSE 0.272 106.000 0.000 NA   NA
 5426227 5426228 cce_4901 cce_4902     FALSE 0.317 126.000 0.000 1.000   NA
 5426228 5426229 cce_4902 cce_4903     FALSE 0.282 31.000 0.000 NA N NA
 5426229 5426230 cce_4903 cce_4904     FALSE 0.007 416.000 0.000 NA   NA
 5426230 5426231 cce_4904 cce_4905     FALSE 0.385 67.000 0.000 NA   NA
 5426233 5426234 cce_4907 cce_4908     FALSE 0.082 187.000 0.000 NA   NA
 5426239 5426240 cce_4913 cce_4914     FALSE 0.256 110.000 0.000 NA   NA
 5426240 5426241 cce_4914 cce_4915     TRUE 0.761 57.000 0.054 NA   NA
 5426241 5426242 cce_4915 cce_4916     FALSE 0.351 84.000 0.000 NA   NA
 5426242 5426243 cce_4916 cce_4917     TRUE 0.922 -28.000 1.000 NA   NA
 5426243 5426244 cce_4917 cce_4918     TRUE 0.918 5.000 0.500 NA   NA
 5426244 5426245 cce_4918 cce_4919     FALSE 0.108 175.000 0.000 NA   NA
 5426245 5426246 cce_4919 cce_4920     FALSE 0.336 19.000 0.000 NA   NA
 5426246 5426247 cce_4920 cce_4921     FALSE 0.325 27.000 0.000 NA   NA
 5426248 5426249 cce_4922 cce_4923 xerC   FALSE 0.069 264.000 0.000 0.084 N NA
 5426249 5426250 cce_4923 cce_4924     FALSE 0.393 -6.000 0.000 1.000   NA
 5426250 5426251 cce_4924 cce_4925     TRUE 0.508 75.000 0.000 1.000   NA
 5426253 5426254 cce_4927 cce_4928     FALSE 0.127 160.000 0.000 NA N NA
 5426254 5426255 cce_4928 cce_4929     FALSE 0.233 -22.000 0.000 NA   NA
 5426256 5426257 cce_4930 cce_4931     FALSE 0.138 224.000 0.000 0.027   NA
 5426259 5426260 cce_4933 cce_4934     FALSE 0.438 32.000 0.000 1.000   NA
 5426260 5426261 cce_4934 cce_4935     FALSE 0.008 388.000 0.000 NA   NA
 5426261 5426262 cce_4935 cce_4936     FALSE 0.003 936.000 0.000 NA   NA
 5426262 5426263 cce_4936 cce_4937     FALSE 0.042 229.000 0.000 NA   NA
 5426263 5426264 cce_4937 cce_4938     FALSE 0.042 229.000 0.000 NA   NA
 5426264 5426265 cce_4938 cce_4939     TRUE 0.930 32.000 0.667 NA   NA
 5426265 5426266 cce_4939 cce_4940     TRUE 0.893 97.000 0.400 NA   NA
 5426266 5426267 cce_4940 cce_4941     TRUE 0.883 103.000 0.400 NA   NA
 5426267 5426268 cce_4941 cce_4942     FALSE 0.007 419.000 0.000 NA   NA
 5426268 5426269 cce_4942 cce_4943     FALSE 0.027 256.000 0.000 NA   NA
 5426269 5426270 cce_4943 cce_4944     TRUE 0.693 170.000 0.333 NA   NA
 5426270 5426271 cce_4944 cce_4945     FALSE 0.007 414.000 0.000 NA   NA
 5426271 5426272 cce_4945 cce_4946     TRUE 0.834 -13.000 0.002 0.001 Y NA
 5426272 5426273 cce_4946 cce_4947     FALSE 0.007 722.000 0.000 1.000   NA
 5426273 5426274 cce_4947 cce_4948     FALSE 0.004 784.000 0.000 NA   NA
 5426274 5426275 cce_4948 cce_4949     FALSE 0.020 282.000 0.000 NA   NA
 5426275 5426276 cce_4949 cce_4950     FALSE 0.016 302.000 0.000 NA   NA
 5426278 5426279 cce_4952 cce_4953     FALSE 0.331 24.000 0.000 NA   NA
 5426279 5426280 cce_4953 cce_4954     FALSE 0.037 235.000 0.000 NA   NA
 5426280 5426281 cce_4954 cce_4955     TRUE 0.944 -3.000 1.000 NA   NA
 5426281 5426282 cce_4955 cce_4956     FALSE 0.385 61.000 0.000 NA   NA
 5426282 5426283 cce_4956 cce_4957     FALSE 0.004 776.000 0.000 NA   NA
 5426283 5426284 cce_4957 cce_4958     TRUE 0.901 63.000 0.286 NA   NA
 5426284 5426285 cce_4958 cce_4959     TRUE 0.868 164.000 1.000 NA   NA
 5426285 5426286 cce_4959 cce_4960     FALSE 0.312 96.000 0.000 NA   NA
 5426289 5426290 cce_4963 cce_4964     FALSE 0.180 141.000 0.000 NA   NA
 5426290 5426291 cce_4964 cce_4965     FALSE 0.194 134.000 0.000 NA   NA
 5426291 5426292 cce_4965 cce_4966     FALSE 0.128 168.000 0.000 NA   NA
 5426292 5426293 cce_4966 cce_4967     TRUE 0.874 -31.000 0.533 NA   NA
 5426293 5426294 cce_4967 cce_4968     FALSE 0.009 367.000 0.000 NA   NA
 5426295 5426296 cce_4969 cce_4970     FALSE 0.004 635.000 0.000 NA   NA
 5426296 5426297 cce_4970 cce_4971     TRUE 0.957 51.000 1.000 NA   NA
 5426297 5426298 cce_4971 cce_4972     TRUE 0.955 16.000 1.000 NA   NA
 5426298 5426299 cce_4972 cce_4973     TRUE 0.961 78.000 1.000 NA   NA
 5426299 5426300 cce_4973 cce_4974     FALSE 0.005 554.000 0.000 NA   NA
 5426303 5426304 cce_4977 cce_4978     TRUE 0.568 22.000 0.006 NA   NA
 5426304 5426305 cce_4978 cce_4979     TRUE 0.887 -13.000 0.500 NA   NA
 5426306 5426307 cce_4980 cce_4981     FALSE 0.225 -27.000 0.000 NA   NA
 5426307 5426308 cce_4981 cce_4982     FALSE 0.289 -3.000 0.000 NA   NA
 5426308 5426309 cce_4982 cce_4983     TRUE 0.855 169.000 1.000 NA   NA
 5426309 5426310 cce_4983 cce_4984     TRUE 0.944 -3.000 1.000 NA   NA
 5426310 5426311 cce_4984 cce_4985     TRUE 0.953 44.000 1.000 NA   NA
 5426311 5426312 cce_4985 cce_4986     TRUE 0.931 -16.000 1.000 NA   NA
 5426312 5426313 cce_4986 cce_4987     TRUE 0.944 -3.000 1.000 NA   NA
 5426313 5426314 cce_4987 cce_4988     TRUE 0.955 10.000 1.000 NA   NA
 5426314 5426315 cce_4988 cce_4989     TRUE 0.936 20.000 0.667 NA   NA
 5426315 5426316 cce_4989 cce_4990     TRUE 0.927 0.000 0.667 NA   NA
 5426316 5426317 cce_4990 cce_4991     TRUE 0.954 9.000 1.000 NA   NA
 5426317 5426318 cce_4991 cce_4992     TRUE 0.924 -25.000 1.000 NA   NA
 5426318 5426319 cce_4992 cce_4993     TRUE 0.915 3.000 0.500 NA   NA
 5426319 5426320 cce_4993 cce_4994     TRUE 0.935 67.000 0.500 NA   NA
 5426320 5426321 cce_4994 cce_4995     FALSE 0.316 31.000 0.000 NA   NA
 5426324 5426325 cce_4998 cce_4999     TRUE 0.829 -7.000 0.250 NA   NA
 5426325 5426326 cce_4999 cce_5000     FALSE 0.300 99.000 0.000 NA   NA
 5426326 5426327 cce_5000 cce_5001     TRUE 0.775 0.000 0.111 NA   NA
 5426327 5426328 cce_5001 cce_5002     FALSE 0.320 39.000 0.000 NA   NA
 5426328 5426329 cce_5002 cce_5003     FALSE 0.200 168.000 0.000 1.000   NA
 5426329 5426330 cce_5003 cce_5004     FALSE 0.026 262.000 0.000 NA   NA
 5426330 5426331 cce_5004 cce_5005     FALSE 0.169 148.000 0.000 NA   NA
 5426331 5426332 cce_5005 cce_5006     FALSE 0.080 188.000 0.000 NA   NA
 5426332 5426333 cce_5006 cce_5007     TRUE 0.960 56.000 1.000 NA   NA
 5426333 5426334 cce_5007 cce_5008     TRUE 0.948 67.000 0.667 NA   NA
 5426334 5426335 cce_5008 cce_5009     FALSE 0.333 7.000 0.000 NA   NA
 5426337 5426338 cce_5011 cce_5012     FALSE 0.342 16.000 0.000 NA   NA
 5426338 5426339 cce_5012 cce_5013     FALSE 0.016 362.000 0.000 1.000   NA
 5426339 5426340 cce_5013 cce_5014     TRUE 0.805 8.000 0.118 NA   NA
 5426340 5426341 cce_5014 cce_5015     FALSE 0.318 94.000 0.000 NA   NA
 5426341 5426342 cce_5015 cce_5016     FALSE 0.314 32.000 0.000 NA   NA
 5426342 5426343 cce_5016 cce_5017     FALSE 0.087 184.000 0.000 NA   NA
 5426343 5426344 cce_5017 cce_5018     FALSE 0.327 5.000 0.000 NA   NA
 5426344 5426345 cce_5018 cce_5019     FALSE 0.341 49.000 0.000 NA   NA
 5426345 5426346 cce_5019 cce_5020     FALSE 0.326 42.000 0.000 NA   NA
 5426346 5426347 cce_5020 cce_5021     FALSE 0.304 0.000 0.000 NA   NA
 5426347 5426348 cce_5021 cce_5022     TRUE 0.951 28.000 1.000 NA   NA
 5426348 5426349 cce_5022 cce_5023     TRUE 0.916 -46.000 1.000 NA   NA
 5426349 5426350 cce_5023 cce_5024     FALSE 0.313 34.000 0.000 NA   NA
 5426350 5426351 cce_5024 cce_5025     FALSE 0.369 79.000 0.000 NA   NA
 5426351 5426352 cce_5025 cce_5026     TRUE 0.932 29.000 0.667 NA   NA
 5426352 5426353 cce_5026 cce_5027     TRUE 0.930 -18.000 1.000 NA   NA
 5426353 5426354 cce_5027 cce_5028     FALSE 0.316 31.000 0.000 NA   NA
 5426354 5426355 cce_5028 cce_5029     FALSE 0.335 8.000 0.000 NA   NA
 5426355 5426356 cce_5029 cce_5030     FALSE 0.307 97.000 0.000 NA   NA
 5426357 5426358 cce_5031 cce_5032     FALSE 0.440 31.000 0.000 1.000   NA
 5426358 5426359 cce_5032 cce_5033     FALSE 0.433 23.000 0.000 1.000 N NA
 5426360 5426361 cce_5034 cce_5035 xseB xseA TRUE 0.939 3.000 0.412 0.001   NA
 5426361 5426362 cce_5035 cce_5036 xseA   FALSE 0.430 -39.000 0.002 1.000 N NA
 5426362 5426363 cce_5036 cce_5037   hicB TRUE 0.819 -25.000 0.250 1.000   NA
 5426363 5426364 cce_5037 cce_5038 hicB hicA TRUE 0.792 -10.000 0.192 NA   NA
 5426364 5426365 cce_5038 cce_5039 hicA   TRUE 0.775 51.000 0.077 NA   NA
 5426365 5426366 cce_5039 cce_5040     FALSE 0.171 147.000 0.000 NA   NA
 5426368 5426369 cce_5042 cce_5043     FALSE 0.270 -7.000 0.000 NA   NA
 5426370 5426371 cce_5044 cce_5045     TRUE 0.605 3.000 0.000 0.026   NA
 5426371 5426372 cce_5045 cce_5046     TRUE 0.612 4.000 0.000 0.026   NA
 5426374 5426375 cce_5048 cce_5049     FALSE 0.334 21.000 0.000 NA   NA
 5426375 5426376 cce_5049 cce_5050     FALSE 0.331 44.000 0.000 NA   NA
 5426376 5426377 cce_5050 cce_5051     FALSE 0.010 360.000 0.000 NA   NA
 5426377 5426378 cce_5051 cce_5052     FALSE 0.003 993.000 0.000 NA   NA
 5426378 5426379 cce_5052 cce_5053     TRUE 0.931 -16.000 1.000 NA   NA
 5426379 5426380 cce_5053 cce_5054     FALSE 0.006 462.000 0.000 NA   NA
 5426384 5426385 cce_5058 cce_5059     FALSE 0.082 187.000 0.000 NA   NA
 5426385 5426386 cce_5059 cce_5060     FALSE 0.339 10.000 0.000 NA   NA
 5426391 5426392 cce_5065 cce_5066     FALSE 0.289 -3.000 0.000 NA   NA
 5426392 5426393 cce_5066 cce_5067     FALSE 0.270 -7.000 0.000 NA   NA
 5426394 5426395 cce_5068 cce_5069     FALSE 0.194 134.000 0.000 NA   NA
 5426397 5426398 cce_5071 cce_5072     FALSE 0.344 14.000 0.000 NA   NA
 5426398 5426399 cce_5072 cce_5073     FALSE 0.313 34.000 0.000 NA   NA
 5426399 5426400 cce_5073 cce_5074     FALSE 0.343 50.000 0.000 NA   NA
 5426400 5426401 cce_5074 cce_5075     FALSE 0.328 43.000 0.000 NA   NA
 5426402 5426403 cce_5076 cce_5077     FALSE 0.327 5.000 0.000 NA   NA
 5426404 5426405 cce_5078 cce_5079     FALSE 0.351 84.000 0.000 NA   NA
 5426405 5426406 cce_5079 cce_5080     FALSE 0.328 43.000 0.000 NA   NA
 5426407 5426408 cce_5081 cce_5082     FALSE 0.297 100.000 0.000 NA   NA
 5426408 5426409 cce_5082 cce_5083     FALSE 0.336 19.000 0.000 NA   NA
 5426409 5426410 cce_5083 cce_5084     FALSE 0.122 170.000 0.000 NA   NA
 5426410 5426411 cce_5084 cce_5085     TRUE 0.936 51.000 0.625 NA   NA
 5426411 5426412 cce_5085 cce_5086     FALSE 0.010 355.000 0.000 NA   NA
 5426412 5426413 cce_5086 cce_5087     TRUE 0.598 34.000 0.000 0.035   NA
 5426417 5426418 cce_5091 cce_5092     FALSE 0.326 42.000 0.000 NA   NA
 5426419 5426420 cce_5093 cce_5094     TRUE 0.933 77.000 0.500 NA   NA
 5426422 5426423 cce_5096 cce_5097     FALSE 0.239 -19.000 0.000 NA   NA
 5426424 5426425 cce_5098 cce_5099     FALSE 0.089 183.000 0.000 NA   NA
 5426425 5426426 cce_5099 cce_5100     FALSE 0.032 243.000 0.000 NA   NA
 5426426 5426427 cce_5100 cce_5101     FALSE 0.265 -9.000 0.000 NA   NA
 5426427 5426428 cce_5101 cce_5102     FALSE 0.289 -3.000 0.000 NA   NA
 5426428 5426429 cce_5102 cce_5103     FALSE 0.386 63.000 0.000 NA   NA
 5426429 5426430 cce_5103 cce_5104     FALSE 0.331 44.000 0.000 NA   NA
 5426430 5426431 cce_5104 cce_5105     FALSE 0.270 -7.000 0.000 NA   NA
 5426433 5426434 cce_5107 cce_5108     FALSE 0.007 433.000 0.000 NA   NA
 5426434 5426435 cce_5108 cce_5109     FALSE 0.313 34.000 0.000 NA   NA
 5426435 5426436 cce_5109 cce_5110     FALSE 0.312 2.000 0.000 NA   NA
 5426436 5426437 cce_5110 cce_5111     FALSE 0.330 6.000 0.000 NA   NA
 5426437 5426438 cce_5111 cce_5112     FALSE 0.322 4.000 0.000 NA   NA
 5426438 5426439 cce_5112 cce_5113     FALSE 0.218 -31.000 0.000 NA   NA
 5426439 5426440 cce_5113 cce_5114     FALSE 0.341 11.000 0.000 NA   NA
 5426440 5426441 cce_5114 cce_5115     FALSE 0.322 28.000 0.000 NA   NA
 5426441 5426442 cce_5115 cce_5116     FALSE 0.089 213.000 0.000 1.000   NA
 5426442 5426443 cce_5116 cce_5117     FALSE 0.318 38.000 0.000 NA   NA
 5426447 5426448 cce_5121 cce_5122     FALSE 0.289 -3.000 0.000 NA   NA
 5426450 5426451 cce_5124 cce_5125     FALSE 0.344 14.000 0.000 NA   NA
 5426451 5426452 cce_5125 cce_5126     FALSE 0.242 154.000 0.000 1.000   NA
 5426452 5426453 cce_5126 cce_5127     TRUE 0.495 -25.000 0.017 NA   NA
 5426454 5426455 cce_5128 cce_5129     FALSE 0.343 15.000 0.000 NA   NA
 5426455 5426456 cce_5129 cce_5130     FALSE 0.135 165.000 0.000 NA   NA
 5426456 5426457 cce_5130 cce_5131     FALSE 0.304 0.000 0.000 NA   NA
 5426457 5426458 cce_5131 cce_5132     FALSE 0.318 30.000 0.000 NA   NA
 5426459 5426460 cce_5133 cce_5134     FALSE 0.318 38.000 0.000 NA   NA
 5426460 5426461 cce_5134 cce_5135     FALSE 0.290 102.000 0.000 NA   NA
 5426466 5426467 cce_5140 cce_5141     FALSE 0.313 34.000 0.000 NA   NA
 5426470 5426471 cce_5144 cce_5145     FALSE 0.334 88.000 0.000 NA   NA
 5426471 5426472 cce_5145 cce_5146     FALSE 0.233 -22.000 0.000 NA   NA
 5426472 5426473 cce_5146 cce_5147     FALSE 0.200 -124.000 0.000 NA   NA
 5426473 5426474 cce_5147 cce_5148     FALSE 0.314 35.000 0.000 NA   NA
 5426474 5426475 cce_5148 cce_5149     FALSE 0.318 38.000 0.000 NA   NA
 5426475 5426476 cce_5149 cce_5150     FALSE 0.242 -18.000 0.000 NA   NA
 5426476 5426477 cce_5150 cce_5151     FALSE 0.243 114.000 0.000 NA   NA
 5426477 5426478 cce_5151 cce_5152     FALSE 0.055 241.000 0.000 1.000   NA
 5426479 5426480 cce_5153 cce_5154     FALSE 0.147 159.000 0.000 NA   NA
 5426480 5426481 cce_5154 cce_5155     FALSE 0.337 9.000 0.000 NA   NA
 5426485 5426486 cce_5159 cce_5160     TRUE 0.562 -7.000 0.000 0.013   NA
 5426486 5426487 cce_5160 cce_5161     FALSE 0.289 -3.000 0.000 NA   NA
 5426488 5426489 cce_5162 cce_5163     FALSE 0.044 227.000 0.000 NA   NA
 5426489 5426490 cce_5163 cce_5164     FALSE 0.358 53.000 0.000 NA   NA
 5426490 5426491 cce_5164 cce_5165     FALSE 0.078 189.000 0.000 NA   NA
 5426491 5426492 cce_5165 cce_5166     FALSE 0.270 107.000 0.000 NA   NA
 5426493 5426494 cce_5167 cce_5168     FALSE 0.207 129.000 0.000 NA   NA
 5426497 5426498 cce_5171 cce_5172     FALSE 0.027 257.000 0.000 NA   NA
 5426498 5426499 cce_5172 cce_5173     FALSE 0.361 54.000 0.000 NA   NA
 5426500 5426501 cce_5174 cce_5175 ppk2   FALSE 0.341 11.000 0.000 NA   NA
 5426502 5426503 cce_5176 cce_5177   pykF2 TRUE 0.846 7.000 0.000 0.006 Y NA
 5426503 5426504 cce_5177 cce_5178 pykF2 pgi2 TRUE 0.834 32.000 0.000 0.006 Y NA
 5426504 5426505 cce_5178 cce_5179 pgi2 eno2 TRUE 0.837 94.000 0.000 0.006 Y NA
 5426505 5426506 cce_5179 cce_5180 eno2   FALSE 0.008 397.000 0.000 NA   NA
 5426506 5426507 cce_5180 cce_5181     FALSE 0.314 35.000 0.000 NA   NA
 5426507 5426508 cce_5181 cce_5182     FALSE 0.228 -12.000 0.000 NA N NA
 5426509 5426510 cce_5183 cce_5184 ackA2   FALSE 0.200 163.000 0.000 1.000 N NA
 5426512 5426513 cce_5186 cce_5187 glgP2 ldh FALSE 0.469 80.000 0.000 1.000 N NA
 5426513 5426514 cce_5187 cce_5188 ldh   TRUE 0.807 80.000 0.000 1.000 Y NA
 5426514 5426515 cce_5188 cce_5189   pstB3 FALSE 0.361 107.000 0.000 1.000 N NA
 5426515 5426516 cce_5189 cce_5190 pstB3 pstB4 TRUE 0.967 48.000 0.333 0.002 Y NA
 5426516 5426517 cce_5190 cce_5191 pstB4   FALSE 0.437 33.000 0.000 1.000   NA
 5426517 5426518 cce_5191 cce_5192     FALSE 0.439 37.000 0.000 1.000   NA
 5426518 5426519 cce_5192 cce_5193     FALSE 0.455 128.000 0.000 0.079   NA
 5426519 5426520 cce_5193 cce_5194     FALSE 0.195 169.000 0.000 1.000   NA
 5426520 5426521 cce_5194 cce_5195     FALSE 0.289 -3.000 0.000 NA   NA
 5426522 5426523 cce_5196 cce_5197   ptsS4 FALSE 0.372 191.000 0.000 1.000 Y NA
 5426523 5426524 cce_5197 cce_5198 ptsS4   FALSE 0.032 287.000 0.000 1.000   NA
 5426525 5426526 cce_5199 cce_5200     FALSE 0.020 281.000 0.000 NA   NA
 5426526 5426527 cce_5200 cce_5201     TRUE 0.809 109.000 0.222 NA   NA
 5426527 5426528 cce_5201 cce_5202     FALSE 0.047 223.000 0.000 NA   NA
 5426528 5426529 cce_5202 cce_5203     FALSE 0.171 147.000 0.000 NA   NA
 5426529 5426530 cce_5203 cce_5204     FALSE 0.020 285.000 0.000 NA   NA
 5426531 5426532 cce_5205 cce_5206     FALSE 0.344 13.000 0.000 NA   NA
 5426534 5426535 cce_5208 cce_5209     TRUE 0.929 26.000 0.083 0.013 Y NA
 5426535 5426536 cce_5209 cce_5210     FALSE 0.078 189.000 0.000 NA   NA
 5426536 5426537 cce_5210 cce_5211     TRUE 0.948 60.000 0.667 NA   NA
 5426537 5426538 cce_5211 cce_5212     FALSE 0.384 68.000 0.000 NA   NA
 5426541 5426542 cce_5215 cce_5216     FALSE 0.266 108.000 0.000 NA   NA
 5426542 5426543 cce_5216 cce_5217     FALSE 0.316 37.000 0.000 NA   NA
 5426637 5426638 cce_0001 cce_0002     FALSE 0.289 -3.000 0.000 NA   NA
 5426638 5426639 cce_0002 cce_0003     FALSE 0.322 92.000 0.000 NA   NA
 5426639 5426640 cce_0003 cce_0004   czcA FALSE 0.042 229.000 0.000 NA   NA
 5426640 5426641 cce_0004 cce_0005 czcA   TRUE 0.675 192.000 0.583 NA   NA
 5426641 5426642 cce_0005 cce_0006     TRUE 0.820 86.000 0.133 NA   NA
 5426642 5426643 cce_0006 cce_0007     FALSE 0.158 154.000 0.000 NA   NA
 5426643 5426644 cce_0007 cce_0008     FALSE 0.035 239.000 0.000 NA   NA
 5426644 5426645 cce_0008 cce_0009     FALSE 0.289 -3.000 0.000 NA   NA
 5426645 5426646 cce_0009 cce_0010   xisI1 FALSE 0.266 108.000 0.000 NA   NA
 5426646 5426647 cce_0010 cce_0011 xisI1 xisH1 FALSE 0.333 45.000 0.000 NA   NA
 5426654 5426655 cce_0018 cce_0019     TRUE 0.735 120.000 0.148 NA   NA
 5426657 5426658 cce_0021 cce_0022     TRUE 0.910 82.000 0.375 NA   NA
 5426658 10702203 cce_0022 cce_6000     TRUE 0.796 3.000 0.089 1.000   NA
 10702203 5426659 cce_6000 cce_RNA001     FALSE 0.236 -21.000 0.000 NA   NA
 5426659 5426660 cce_RNA001 cce_0023     FALSE 0.008 396.000 0.000 NA   NA
 5426660 5426661 cce_0023 cce_0024     TRUE 0.775 0.000 0.111 NA   NA
 5426661 5426662 cce_0024 cce_0025     FALSE 0.331 44.000 0.000 NA   NA
 5426662 5426663 cce_0025 cce_0026     FALSE 0.314 32.000 0.000 NA   NA
 5426664 5426665 cce_0027 cce_0028     FALSE 0.460 88.000 0.000 1.000   NA
 5426665 5426666 cce_0028 cce_0029     FALSE 0.006 475.000 0.000 NA   NA
 5426667 5426668 cce_0030 cce_0031 hisIE   FALSE 0.343 12.000 0.000 NA   NA
 5426669 5426670 cce_0032 cce_0033 feoB1 feoA1 TRUE 0.931 77.000 0.117 1.000 Y NA
 5426670 5426671 cce_0033 cce_0034 feoA1   FALSE 0.008 538.000 0.000 1.000   NA
 5426673 5426674 cce_0036 cce_0037 ald   TRUE 0.575 86.000 0.006 NA   NA
 5426676 5426677 cce_0039 cce_0040 rfbW mtfB TRUE 0.906 -51.000 0.188 0.023 Y NA
 5426677 5426678 cce_0040 cce_0041 mtfB   TRUE 0.864 5.000 0.250 NA   NA
 5426678 5426679 cce_0041 cce_0042     TRUE 0.853 14.000 0.200 NA   NA
 5426679 5426680 cce_0042 cce_0043   gmhA TRUE 0.761 12.000 0.051 1.000 N NA
 5426680 5426681 cce_0043 cce_0044 gmhA   TRUE 0.881 22.000 0.040 1.000 Y NA
 5426681 5426682 cce_0044 cce_0045     FALSE 0.044 252.000 0.000 1.000 N NA
 5426682 5426683 cce_0045 cce_0046     TRUE 0.789 17.000 0.000 1.000 Y NA
 5426684 5426685 cce_0047 cce_0048     FALSE 0.322 28.000 0.000 NA   NA
 5426685 5426686 cce_0048 cce_0049     FALSE 0.304 98.000 0.000 NA   NA
 5426686 5426687 cce_0049 cce_0050     TRUE 0.785 -19.000 0.217 NA   NA
 5426687 5426688 cce_0050 cce_0051     FALSE 0.329 25.000 0.000 NA   NA
 5426688 5426689 cce_0051 cce_0052     FALSE 0.003 921.000 0.000 NA   NA
 5426689 5426690 cce_0052 cce_0053     TRUE 0.886 51.000 0.286 NA   NA
 5426690 5426691 cce_0053 cce_RNA002     FALSE 0.380 73.000 0.000 NA   NA
 5426691 5426692 cce_RNA002 cce_0054   lgt FALSE 0.386 63.000 0.000 NA   NA
 5426692 5426693 cce_0054 cce_0055 lgt   TRUE 0.663 15.000 0.009 1.000   NA
 5426693 5426694 cce_0055 cce_0056     TRUE 0.588 20.000 0.009 NA   NA
 5426694 5426695 cce_0056 cce_0057     TRUE 0.788 22.000 0.100 NA   NA
 5426695 5426696 cce_0057 cce_0058     FALSE 0.266 108.000 0.000 NA   NA
 5426697 5426698 cce_0059 cce_0060     FALSE 0.307 97.000 0.000 NA   NA
 5426698 5426699 cce_0060 cce_0061   glcD TRUE 0.626 57.000 0.009 NA   NA
 5426700 5426701 cce_0062 cce_0063   ruvC TRUE 0.579 99.000 0.004 1.000   NA
 5426702 5426703 cce_0064 cce_0065 argC   FALSE 0.081 213.000 0.000 1.000 N NA
 5426703 5426704 cce_0065 cce_0066     TRUE 0.944 25.000 0.125 0.001 Y NA
 5426704 5426705 cce_0066 cce_0067     TRUE 0.948 24.000 0.286 1.000 Y NA
 5426705 5426706 cce_0067 cce_0068   exoD2 TRUE 0.788 22.000 0.100 NA   NA
 5426706 5426707 cce_0068 cce_0069 exoD2   FALSE 0.011 339.000 0.000 NA   NA
 5426708 5426709 cce_0070 cce_0071     FALSE 0.329 25.000 0.000 NA   NA
 5426709 5426710 cce_0071 cce_0072     TRUE 0.505 165.000 0.054 1.000   NA
 5426714 5426715 cce_0076 cce_0077   metH FALSE 0.293 101.000 0.000 NA   NA
 5426715 5426716 cce_0077 cce_0078 metH   FALSE 0.015 362.000 0.000 1.000 N NA
 5426716 5426717 cce_0078 cce_0079     TRUE 0.826 94.000 0.176 NA   NA
 5426717 5426718 cce_0079 cce_0080   ctpB FALSE 0.026 258.000 0.000 NA   NA
 5426718 5426719 cce_0080 cce_0081 ctpB rps14 FALSE 0.079 215.000 0.000 1.000 N NA
 5426724 5426725 cce_0086 cce_0087     TRUE 0.748 6.000 0.070 NA   NA
 5426725 5426726 cce_0087 cce_0088     TRUE 0.789 59.000 0.070 NA   NA
 5426731 5426732 cce_0093 cce_0094     FALSE 0.333 23.000 0.000 NA   NA
 5426732 5426733 cce_0094 cce_0095     FALSE 0.338 18.000 0.000 NA   NA
 5426733 5426734 cce_0095 cce_0096     FALSE 0.318 30.000 0.000 NA   NA
 5426737 5426738 cce_0099 cce_0100 nblA1 nblA2 TRUE 0.944 45.000 0.800 NA   NA
 5426739 5426740 cce_0101 cce_0102     FALSE 0.310 1.000 0.000 NA   NA
 5426740 5426741 cce_0102 cce_0103   rpiA FALSE 0.312 128.000 0.000 1.000   NA
 5426742 5426743 cce_0104 cce_0105     TRUE 0.804 -3.000 0.174 NA   NA
 5426744 5426745 cce_0106 cce_0107     FALSE 0.172 146.000 0.000 NA   NA
 5426747 5426748 cce_0109 cce_0110     FALSE 0.004 579.000 0.000 NA N NA
 5426748 5426749 cce_0110 cce_0111     FALSE 0.314 32.000 0.000 NA   NA
 5426750 5426751 cce_0112 cce_0113     TRUE 0.812 99.000 0.171 NA   NA
 5426752 5426753 cce_0114 cce_0115 hypF   TRUE 0.663 55.000 0.008 1.000 N NA
 5426753 5426754 cce_0115 cce_0116     TRUE 0.776 101.000 0.120 NA   NA
 5426754 5426755 cce_0116 cce_0117     TRUE 0.759 113.000 0.158 NA   NA
 5426756 5426757 cce_0118 cce_0119     FALSE 0.347 85.000 0.000 NA   NA
 5426757 5426758 cce_0119 cce_0120     FALSE 0.356 192.000 0.087 NA   NA
 5426758 5426759 cce_0120 cce_0121     TRUE 0.552 126.000 0.041 NA   NA
 5426759 5426760 cce_0121 cce_0122     FALSE 0.087 267.000 0.027 NA   NA
 5426760 5426761 cce_0122 cce_0123   thiL TRUE 0.580 42.000 0.003 1.000 N NA
 5426761 5426762 cce_0123 cce_0124 thiL   TRUE 0.557 -3.000 0.004 1.000 N NA
 5426763 5426764 cce_0125 cce_0126 cutA   TRUE 0.622 12.000 0.005 1.000 N NA
 5426766 5426767 cce_0128 cce_0129     TRUE 0.854 1.000 0.250 NA   NA
 5426767 5426768 cce_0129 cce_0130     TRUE 0.798 -49.000 0.292 NA   NA
 5426768 5426769 cce_0130 cce_0131     TRUE 0.815 5.000 0.143 NA   NA
 5426770 5426771 cce_0132 cce_0133     FALSE 0.385 65.000 0.000 NA   NA
 5426772 5426773 cce_0134 cce_0135     FALSE 0.437 161.000 0.021 1.000   NA
 5426773 5426774 cce_0135 cce_0136   rpl28 FALSE 0.392 139.000 0.003 1.000 N NA
 5426774 5426775 cce_0136 cce_0137 rpl28   FALSE 0.469 118.000 0.002 1.000   NA
 5426775 5426776 cce_0137 cce_0138     TRUE 0.806 87.000 0.083 1.000   NA
 5426776 5426777 cce_0138 cce_0139     FALSE 0.279 138.000 0.000 1.000   NA
 5426778 5426779 cce_0140 cce_0141     TRUE 0.498 79.000 0.000 1.000   NA
 5426779 5426780 cce_0141 cce_0142     FALSE 0.409 102.000 0.000 1.000   NA
 5426780 5426781 cce_0142 cce_0143     FALSE 0.459 22.000 0.000 1.000   NA
 5426782 5426783 cce_0144 cce_0145 pepN kaiB4 FALSE 0.006 813.000 0.000 1.000   NA
 5426783 5426784 cce_0145 cce_0146 kaiB4   FALSE 0.019 340.000 0.000 1.000   NA
 5426784 5426785 cce_0146 cce_0147     FALSE 0.015 311.000 0.000 NA   NA
 5426787 5426788 cce_0149 cce_0150     TRUE 0.715 41.000 0.053 NA   NA
 5426788 5426789 cce_0150 cce_0151     FALSE 0.011 344.000 0.000 NA   NA
 5426790 5426791 cce_0152 cce_0153     TRUE 0.721 59.000 0.015 1.000   NA
 5426791 5426792 cce_0153 cce_0154   ndbB TRUE 0.893 33.000 0.324 1.000   NA
 5426792 5426793 cce_0154 cce_0155 ndbB lrtA FALSE 0.140 153.000 0.000 NA N NA
 5426794 5426795 cce_0156 cce_0157   lipB FALSE 0.234 118.000 0.000 NA   NA
 5426795 5426796 cce_0157 cce_0158 lipB   FALSE 0.331 44.000 0.000 NA   NA
 5426797 5426798 cce_0159 cce_0160 tgt   TRUE 0.613 26.000 0.004 1.000   NA
 5426801 5426802 cce_0163 cce_0164     FALSE 0.385 60.000 0.000 NA   NA
 5426802 5426803 cce_0164 cce_0165     FALSE 0.139 275.000 0.000 1.000 Y NA
 5426803 5426804 cce_0165 cce_0166     FALSE 0.335 121.000 0.000 1.000   NA
 5426804 5426805 cce_0166 cce_0167     TRUE 0.646 33.000 0.012 1.000   NA
 5426807 5426808 cce_0169 cce_0170     FALSE 0.327 26.000 0.000 NA   NA
 5426808 5426809 cce_0170 cce_0171     FALSE 0.339 10.000 0.000 NA   NA
 5426809 5426810 cce_0171 cce_0172   hemL FALSE 0.020 333.000 0.000 1.000   NA
 5426811 5426812 cce_0173 cce_0174   gst1 TRUE 0.875 45.000 0.032 1.000 Y NA
 5426814 5426815 cce_0176 cce_0177     TRUE 0.923 122.000 1.000 NA   NA
 5426816 5426817 cce_0178 cce_0179     FALSE 0.320 29.000 0.000 NA   NA
 5426817 5426818 cce_0179 cce_0180     FALSE 0.382 72.000 0.000 NA   NA
 5426818 5426819 cce_0180 cce_0181     FALSE 0.214 -37.000 0.000 NA   NA
 5426819 5426820 cce_0181 cce_0182     FALSE 0.270 -7.000 0.000 NA   NA
 5426820 5426821 cce_0182 cce_0183   spoIID TRUE 0.944 79.000 0.667 NA   NA
 5426822 5426823 cce_0184 cce_0185     FALSE 0.008 387.000 0.000 NA   NA
 5426823 5426824 cce_0185 cce_0186     FALSE 0.011 342.000 0.000 NA   NA
 5426824 5426825 cce_0186 cce_0187     FALSE 0.093 181.000 0.000 NA   NA
 5426825 5426826 cce_0187 cce_0188     FALSE 0.348 51.000 0.000 NA   NA
 5426826 5426827 cce_0188 cce_0189     FALSE 0.221 124.000 0.000 NA   NA
 5426828 5426829 cce_0190 cce_0191     TRUE 0.768 -76.000 0.250 NA   NA
 5426833 5426834 cce_0195 cce_0196     FALSE 0.290 102.000 0.000 NA   NA
 5426836 5426837 cce_0198 cce_0199 ntcB chlI FALSE 0.384 102.000 0.000 1.000 N NA
 5426838 5426839 cce_0200 cce_0201     TRUE 0.555 -10.000 0.020 NA   NA
 5426839 5426840 cce_0201 cce_0202     FALSE 0.185 247.000 0.000 1.000 Y NA
 5426840 5426841 cce_0202 cce_0203     TRUE 0.748 90.000 0.070 NA   NA
 5426842 5426843 cce_0204 cce_0205     FALSE 0.007 419.000 0.000 NA   NA
 5426846 5426847 cce_0208 cce_0209     TRUE 0.593 8.000 0.002 1.000   NA
 5426848 5426849 cce_0210 cce_0211     FALSE 0.004 515.000 0.000 NA N NA
 5426849 5426850 cce_0211 cce_0212     TRUE 0.730 63.000 0.042 NA N NA
 5426850 5426851 cce_0212 cce_0213     FALSE 0.213 157.000 0.000 1.000 N NA
 5426851 5426852 cce_0213 cce_0214     FALSE 0.012 331.000 0.000 NA   NA
 5426852 5426853 cce_0214 cce_0215     TRUE 0.697 14.000 0.038 NA   NA
 5426853 5426854 cce_0215 cce_0216     FALSE 0.343 12.000 0.000 NA   NA
 5426854 5426855 cce_0216 cce_0217   rps4 FALSE 0.355 83.000 0.000 NA   NA
 5426855 5426856 cce_0217 cce_0218 rps4   FALSE 0.227 -25.000 0.000 NA   NA
 5426856 5426857 cce_0218 cce_0219   rps1-1 FALSE 0.006 441.000 0.000 NA   NA
 5426857 5426858 cce_0219 cce_0220 rps1-1   FALSE 0.010 455.000 0.000 1.000   NA
 5426858 5426859 cce_0220 cce_0221     FALSE 0.020 271.000 0.000 NA N NA
 5426859 5426860 cce_0221 cce_0222     TRUE 0.638 148.000 0.143 NA N NA
 5426861 5426862 cce_0223 cce_0224 rpl7 rpl10 TRUE 0.986 75.000 0.884 0.014 Y NA
 5426862 5426863 cce_0224 cce_0225 rpl10 rpl1 TRUE 0.766 205.000 0.302 0.018 Y NA
 5426863 5426864 cce_0225 cce_0226 rpl1 rpl11 TRUE 0.985 63.000 0.838 0.018 Y NA
 5426864 5426865 cce_0226 cce_0227 rpl11 nusG TRUE 0.940 3.000 0.681 1.000 N NA
 5426865 5426866 cce_0227 cce_0228 nusG secE TRUE 0.923 -24.000 0.843 1.000 N NA
 5426866 5426867 cce_0228 cce_RNA003 secE   FALSE 0.091 182.000 0.000 NA   NA
 5426867 5426868 cce_RNA003 cce_0229     FALSE 0.338 48.000 0.000 NA   NA
 5426868 5426869 cce_0229 cce_0230     TRUE 0.901 13.000 0.357 NA   NA
 5426869 5426870 cce_0230 cce_0231     TRUE 0.557 -10.000 0.021 NA   NA
 5426870 5426871 cce_0231 cce_0232   argH FALSE 0.265 135.000 0.000 1.000 N NA
 5426871 5426872 cce_0232 cce_0233 argH   TRUE 0.595 42.000 0.013 NA   NA
 5426872 5426873 cce_0233 cce_0234     TRUE 0.808 33.000 0.146 NA   NA
 5426873 5426874 cce_0234 cce_0235     FALSE 0.017 284.000 0.000 NA N NA
 5426875 5426876 cce_0236 cce_0237     TRUE 0.609 47.000 0.013 NA   NA
 5426876 5426877 cce_0237 cce_0238     TRUE 0.767 26.000 0.084 NA   NA
 5426878 5426879 cce_0239 cce_0240   murD FALSE 0.015 372.000 0.000 1.000   NA
 5426879 5426880 cce_0240 cce_0241 murD   FALSE 0.423 131.000 0.003 1.000 N NA
 5426880 5426881 cce_0241 cce_0242     FALSE 0.466 81.000 0.000 1.000 N NA
 5426881 5426882 cce_0242 cce_0243     TRUE 0.839 20.000 0.000 0.023 Y NA
 5426882 5426883 cce_0243 cce_0244     FALSE 0.186 171.000 0.000 1.000   NA
 5426883 5426884 cce_0244 cce_0245     TRUE 0.664 143.000 0.105 1.000   NA
 5426886 5426887 cce_0247 cce_0248     FALSE 0.068 225.000 0.000 1.000 N NA
 5426887 5426888 cce_0248 cce_0249     FALSE 0.178 142.000 0.000 NA   NA
 5426891 5426892 cce_0252 cce_0253     FALSE 0.338 18.000 0.000 NA   NA
 5426892 5426893 cce_0253 cce_0254     TRUE 0.907 33.000 0.471 NA   NA
 5426893 5426894 cce_0254 cce_0255     TRUE 0.631 110.000 0.048 NA   NA
 5426894 5426895 cce_0255 cce_0256     TRUE 0.903 76.000 0.310 NA   NA
 5426895 5426896 cce_0256 cce_0257     TRUE 0.674 118.000 0.086 NA   NA
 5426896 5426897 cce_0257 cce_0258   cysH FALSE 0.042 255.000 0.000 1.000 N NA
 5426901 5426902 cce_0262 cce_0263   aroQ TRUE 0.895 12.000 0.333 NA   NA
 5426902 5426903 cce_0263 cce_0264 aroQ   TRUE 0.776 68.000 0.059 NA   NA
 5426904 5426905 cce_0265 cce_0266     FALSE 0.304 0.000 0.000 NA   NA
 5426905 5426906 cce_0266 cce_0267   psbA3 FALSE 0.320 93.000 0.000 NA   NA
 5426908 5426909 cce_0269 cce_0270     TRUE 0.912 27.000 0.474 NA   NA
 5426909 5426910 cce_0270 cce_0271     FALSE 0.155 155.000 0.000 NA   NA
 5426910 5426911 cce_0271 cce_0272     FALSE 0.341 49.000 0.000 NA   NA
 5426911 5426912 cce_0272 cce_0273     FALSE 0.326 42.000 0.000 NA   NA
 5426912 5426913 cce_0273 cce_0274     FALSE 0.203 -64.000 0.000 NA   NA
 5426913 5426914 cce_0274 cce_0275     FALSE 0.074 192.000 0.000 NA   NA
 5426914 5426915 cce_0275 cce_0276     FALSE 0.316 31.000 0.000 NA   NA
 5426915 5426916 cce_0276 cce_0277   rne TRUE 0.766 57.000 0.043 1.000 N NA
 5426918 5426919 cce_0279 cce_0280     FALSE 0.249 112.000 0.000 NA   NA
 5426920 5426921 cce_0281 cce_0282   hisF TRUE 0.543 98.000 0.002 1.000 N NA
 5426921 5426922 cce_0282 cce_0283 hisF   TRUE 0.689 73.000 0.021 NA   NA
 5426923 5426924 cce_RNA004 cce_0284 ffs gatC FALSE 0.316 37.000 0.000 NA   NA
 5426924 5426925 cce_0284 cce_0285 gatC ycf3 FALSE 0.359 174.000 0.020 1.000   NA
 5426925 5426926 cce_0285 cce_0286 ycf3   FALSE 0.217 163.000 0.000 1.000   NA
 5426926 5426927 cce_0286 cce_0287     TRUE 0.825 67.000 0.071 1.000   NA
 5426929 5426930 cce_0289 cce_0290   rps21-2 FALSE 0.063 234.000 0.000 1.000   NA
 5426930 5426931 cce_0290 cce_0291 rps21-2   TRUE 0.657 141.000 0.095 1.000   NA
 5426932 5426933 cce_0292 cce_0293 pdhA asd FALSE 0.070 223.000 0.000 1.000 N NA
 5426933 5426934 cce_0293 cce_0294 asd dapA TRUE 0.909 58.000 0.052 1.000 Y NA
 5426934 5426935 cce_0294 cce_0295 dapA   TRUE 0.911 112.000 0.605 1.000   NA
 5426935 5426936 cce_0295 cce_0296     FALSE 0.488 151.000 0.047 NA   NA
 5426937 5426938 cce_RNA005 cce_0297     FALSE 0.360 82.000 0.000 NA   NA
 5426939 5426940 cce_0298 cce_0299 rpaA mutL TRUE 0.603 157.000 0.091 1.000   NA
 5426940 5426941 cce_0299 cce_0300 mutL   FALSE 0.312 96.000 0.000 NA   NA
 5426941 5426942 cce_0300 cce_0301     TRUE 0.623 116.000 0.054 NA   NA
 5426943 5426944 cce_0302 cce_0303 cmpD cmpC TRUE 0.960 -34.000 0.600 0.001 Y NA
 5426944 5426945 cce_0303 cce_0304 cmpC cmpB TRUE 0.985 83.000 0.867 0.001 Y NA
 5426945 5426946 cce_0304 cce_0305 cmpB cmpA TRUE 0.972 40.000 0.867 NA Y NA
 5426946 5426947 cce_0305 cce_0306 cmpA   FALSE 0.004 628.000 0.000 NA   NA
 5426949 5426950 cce_0308 cce_0309   hisH FALSE 0.211 128.000 0.000 NA   NA
 5426950 5426951 cce_0309 cce_0310 hisH aslB TRUE 0.839 58.000 0.091 1.000   NA
 5426951 5426952 cce_0310 cce_0311 aslB   TRUE 0.809 109.000 0.222 NA   NA
 5426952 5426953 cce_0311 cce_0312     TRUE 0.963 68.000 1.000 NA   NA
 5426955 5426956 cce_0314 cce_0315 panB chlM TRUE 0.874 61.000 0.008 1.000 Y NA
 5426956 5426957 cce_0315 cce_0316 chlM   TRUE 0.651 34.000 0.017 1.000 N NA
 5426957 5426958 cce_0316 cce_0317     FALSE 0.425 253.000 0.483 1.000   NA
 5426958 5426959 cce_0317 cce_0318     TRUE 0.867 64.000 0.182 NA   NA
 5426960 5426961 cce_RNA006 cce_0319     FALSE 0.005 505.000 0.000 NA   NA
 5426963 5426964 cce_0321 cce_0322     FALSE 0.150 157.000 0.000 NA   NA
 5426964 5426965 cce_0322 cce_0323     FALSE 0.321 -31.000 0.000 1.000   NA
 5426967 5426968 cce_0325 cce_0326     TRUE 0.954 22.000 1.000 NA   NA
 5426968 5426969 cce_0326 cce_0327   recG FALSE 0.331 148.000 0.004 NA   NA
 5426969 5426970 cce_0327 cce_0328 recG   FALSE 0.213 157.000 0.000 1.000 N NA
 5426971 5426972 cce_0329 cce_0330     FALSE 0.017 296.000 0.000 NA   NA
 5426972 5426973 cce_0330 cce_0331     TRUE 0.769 45.000 0.081 NA   NA
 5426973 5426974 cce_0331 cce_0332     TRUE 0.944 -3.000 1.000 NA   NA
 5426977 5426978 cce_0335 cce_0336     TRUE 0.555 120.000 0.034 NA   NA
 5426979 5426980 cce_0337 cce_0338     TRUE 0.763 14.000 0.071 NA   NA
 5426981 5426982 cce_0339 cce_0340     TRUE 0.571 81.000 0.004 NA   NA
 5426982 5426983 cce_0340 cce_0341     FALSE 0.007 595.000 0.000 1.000   NA
 5426983 5426984 cce_0341 cce_0342     TRUE 0.679 66.000 0.007 1.000 N NA
 5426985 5426986 cce_0343 cce_0344     FALSE 0.347 85.000 0.000 NA   NA
 5426987 5426988 cce_0345 cce_0346     FALSE 0.019 287.000 0.000 NA   NA
 5426989 5426990 cce_0347 cce_0348     TRUE 0.940 20.000 0.280 NA Y NA
 5426990 5426991 cce_0348 cce_0349     FALSE 0.289 -3.000 0.000 NA   NA
 5426992 5426993 cce_0350 cce_0351     FALSE 0.171 147.000 0.000 NA   NA
 5426993 5426994 cce_0351 cce_0352     FALSE 0.333 7.000 0.000 NA   NA
 5426994 5426995 cce_0352 cce_0353     FALSE 0.316 3.000 0.000 NA   NA
 5426995 5426996 cce_0353 cce_0354     TRUE 0.695 -15.000 0.087 NA   NA
 5426996 5426997 cce_0354 cce_0355     FALSE 0.327 5.000 0.000 NA   NA
 5426997 5426998 cce_0355 cce_0356     FALSE 0.339 10.000 0.000 NA   NA
 5426998 5426999 cce_0356 cce_0357     TRUE 0.909 110.000 0.667 NA   NA
 5427000 5427001 cce_0358 cce_0359     FALSE 0.003 790.000 0.000 NA N NA
 11431768 5426994   cce_0352     FALSE NA 7447.000 0.000 NA   NA
 11574131 5426994   cce_0352     FALSE NA 7447.000 0.000 NA   NA
 11716523 5426994   cce_0352     FALSE NA 7447.000 0.000 NA   NA
 11431769 5426994   cce_0352     FALSE NA 7484.000 0.000 NA   NA
 11574132 5426994   cce_0352     FALSE NA 7484.000 0.000 NA   NA
 11716524 5426994   cce_0352     FALSE NA 7484.000 0.000 NA   NA
 11431770 5426994   cce_0352     FALSE NA 7518.000 0.000 NA   NA
 11574133 5426994   cce_0352     FALSE NA 7518.000 0.000 NA   NA
 11716525 5426994   cce_0352     FALSE NA 7518.000 0.000 NA   NA
 11431771 5426994   cce_0352     FALSE NA 7555.000 0.000 NA   NA
 11574134 5426994   cce_0352     FALSE NA 7555.000 0.000 NA   NA
 11716526 5426994   cce_0352     FALSE NA 7555.000 0.000 NA   NA
 11431772 5426994   cce_0352     FALSE NA 7588.000 0.000 NA   NA
 11574135 5426994   cce_0352     FALSE NA 7588.000 0.000 NA   NA
 11716527 5426994   cce_0352     FALSE NA 7588.000 0.000 NA   NA
 11431773 5426994   cce_0352     FALSE NA 7625.000 0.000 NA   NA
 11574136 5426994   cce_0352     FALSE NA 7625.000 0.000 NA   NA
 11716528 5426994   cce_0352     FALSE NA 7625.000 0.000 NA   NA
 11431774 5426994   cce_0352     FALSE NA 7660.000 0.000 NA   NA
 11574137 5426994   cce_0352     FALSE NA 7660.000 0.000 NA   NA
 11716529 5426994   cce_0352     FALSE NA 7660.000 0.000 NA   NA
 5427001 5427002 cce_0359 cce_0360     TRUE 0.883 30.000 0.333 NA   NA
 5427004 5427005 cce_0362 cce_0363     TRUE 0.675 114.000 0.077 NA   NA
 5427006 5427007 cce_0364 cce_0365     TRUE 0.611 46.000 0.003 1.000   NA
 5427008 5427009 cce_0366 cce_0367     TRUE 0.922 28.000 0.512 NA   NA
 5427009 5427010 cce_0367 cce_0368     TRUE 0.673 127.000 0.073 1.000   NA
 5427011 5427012 cce_0369 cce_0370     FALSE 0.142 183.000 0.000 1.000   NA
 5427012 5427013 cce_0370 cce_0371   matE2 FALSE 0.263 136.000 0.000 1.000 N NA
 5427016 5427017 cce_0374 cce_0375 rffM   FALSE 0.449 -55.000 0.015 NA   NA
 5427017 5427018 cce_0375 cce_0376     TRUE 0.932 15.000 0.600 NA   NA
 5427019 5427020 cce_0377 cce_0378     TRUE 0.566 85.000 0.005 NA   NA
 5427020 5427021 cce_0378 cce_0379     TRUE 0.929 43.000 0.500 1.000   NA
 5427021 5427022 cce_0379 cce_0380     FALSE 0.223 123.000 0.000 NA   NA
 5427022 5427023 cce_0380 cce_0381     FALSE 0.320 93.000 0.000 NA   NA
 5427023 5427024 cce_0381 cce_0382     FALSE 0.044 226.000 0.000 NA   NA
 5427024 5427025 cce_0382 cce_0383     TRUE 0.574 46.000 0.007 NA   NA
 5427025 5427026 cce_0383 cce_0384     FALSE 0.075 240.000 0.004 NA   NA
 5427026 5427027 cce_0384 cce_0385     FALSE 0.059 208.000 0.000 NA   NA
 5427027 5427028 cce_0385 cce_0386     FALSE 0.012 334.000 0.000 NA   NA
 5427028 5427029 cce_0386 cce_0387     FALSE 0.023 272.000 0.000 NA   NA
 5427029 5427030 cce_0387 cce_0388     FALSE 0.421 28.000 0.000 1.000 N NA
 5427031 5427032 cce_0389 cce_0390   trk TRUE 0.978 64.000 0.469 0.006 Y NA
 5427032 5427033 cce_0390 cce_0391 trk   FALSE 0.094 220.000 0.003 NA N NA
 5427033 5427034 cce_0391 cce_0392   psbT FALSE 0.295 180.000 0.028 NA   NA
 5427034 5427035 cce_0392 cce_0393 psbT   FALSE 0.383 164.000 0.027 NA   NA
 5427035 5427036 cce_0393 cce_0394   npl TRUE 0.641 91.000 0.024 NA   NA
 5427036 5427037 cce_0394 cce_0395 npl   FALSE 0.478 128.000 0.005 1.000   NA
 5427037 5427038 cce_0395 cce_0396   fumC TRUE 0.663 70.000 0.003 1.000   NA
 5427038 5427039 cce_0396 cce_0397 fumC   TRUE 0.619 18.000 0.003 1.000   NA
 5427039 5427040 cce_0397 cce_0398     TRUE 0.834 -12.000 0.286 NA   NA
 5427040 5427041 cce_0398 cce_0399   natB FALSE 0.016 303.000 0.000 NA   NA
 5427041 5427042 cce_0399 cce_RNA007 natB   FALSE 0.186 138.000 0.000 NA   NA
 5427045 5427046 cce_RNA008 cce_0402   spoU FALSE 0.322 28.000 0.000 NA   NA
 5427048 5427049 cce_0404 cce_0405 purU mmsB TRUE 0.500 128.000 0.012 1.000 N NA
 5427049 5427050 cce_0405 cce_0406 mmsB   TRUE 0.572 -7.000 0.022 NA   NA
 5427050 5427051 cce_0406 cce_0407     TRUE 0.543 101.000 0.010 NA   NA
 5427051 5427052 cce_0407 cce_0408     FALSE 0.098 198.000 0.000 1.000 N NA
 5427055 5427056 cce_0411 cce_0412     TRUE 0.803 5.000 0.121 NA   NA
 5427057 5427058 cce_0413 cce_0414     TRUE 0.917 30.000 0.467 1.000 N NA
 5427059 5427060 cce_0415 cce_0416     TRUE 0.622 75.000 0.008 NA   NA
 5427060 5427061 cce_0416 cce_0417     FALSE 0.103 177.000 0.000 NA   NA
 5427061 5427062 cce_0417 cce_0418   pilC TRUE 0.700 89.000 0.044 NA   NA
 5427062 5427063 cce_0418 cce_0419 pilC pilT1 TRUE 0.935 40.000 0.218 1.000 Y NA
 5427063 5427064 cce_0419 cce_0420 pilT1 gspE TRUE 0.944 37.000 0.178 0.018 Y NA
 5427064 5427065 cce_0420 cce_0421 gspE   TRUE 0.787 81.000 0.077 NA   NA
 5427065 5427066 cce_0421 cce_0422   kaiC1 FALSE 0.034 240.000 0.000 NA   NA
 5427066 5427067 cce_0422 cce_0423 kaiC1 kaiB1 TRUE 0.954 93.000 0.927 1.000   NA
 5427067 5427068 cce_0423 cce_0424 kaiB1 kaiA TRUE 0.948 87.000 0.732 1.000   NA
 5427068 5427069 cce_0424 cce_0425 kaiA   TRUE 0.647 116.000 0.067 NA   NA
 5427069 5427070 cce_0425 cce_0426   purN TRUE 0.571 17.000 0.006 NA   NA
 5427070 5427071 cce_0426 cce_0427 purN   FALSE 0.228 174.000 0.006 NA N NA
 5427072 5427073 cce_0428 cce_0429     TRUE 0.573 18.000 0.006 NA   NA
 5427073 5427074 cce_0429 cce_0430     TRUE 0.632 83.000 0.014 NA   NA
 5427074 5427075 cce_0430 cce_0431     FALSE 0.304 0.000 0.000 NA   NA
 5427076 5427077 cce_0432 cce_0433     FALSE 0.060 206.000 0.000 NA   NA
 5427078 5427079 cce_0434 cce_0435 pilT2 kaiB3 TRUE 0.912 100.000 0.462 1.000   NA
 5427079 5427080 cce_0435 cce_0436 kaiB3   TRUE 0.840 63.000 0.087 1.000   NA
 5427087 5427088 cce_0443 cce_0444     TRUE 0.754 96.000 0.086 NA   NA
 5427088 5427089 cce_0444 cce_0445   cheW TRUE 0.975 105.000 0.762 0.005 Y NA
 5427089 5427090 cce_0445 cce_0446 cheW   TRUE 0.975 31.000 0.857 1.000 Y NA
 5427090 5427091 cce_0446 cce_0447     FALSE 0.073 193.000 0.000 NA   NA
 5427091 5427092 cce_0447 cce_0448     FALSE 0.212 -40.000 0.000 NA   NA
 5427094 5427095 cce_0450 cce_0451 cbiB   TRUE 0.724 49.000 0.030 1.000   NA
 5427095 5427096 cce_0451 cce_0452     TRUE 0.765 -10.000 0.146 NA   NA
 5427098 5427099 cce_0454 cce_0455     TRUE 0.927 -3.000 0.744 NA   NA
 5427100 5427101 cce_0456 cce_0457     FALSE 0.379 58.000 0.000 NA   NA
 5427105 5427106 cce_0461 cce_0462 ntcA   TRUE 0.929 25.000 0.612 NA   NA
 5427106 5427107 cce_0462 cce_0463     FALSE 0.289 -3.000 0.000 NA   NA
 5427107 5427108 cce_0463 cce_0464     FALSE 0.470 12.000 0.000 1.000   NA
 5427108 5427109 cce_0464 cce_0465     FALSE 0.021 280.000 0.000 NA   NA
 5427111 5427112 cce_0467 cce_0468     FALSE 0.476 186.000 0.167 NA   NA
 5427114 5427115 cce_0470 cce_0471     TRUE 0.703 97.000 0.040 1.000 N NA
 5427117 5427118 cce_0473 cce_0474     FALSE 0.342 86.000 0.000 NA   NA
 5427121 5427122 cce_0477 cce_0478     TRUE 0.889 34.000 0.364 NA   NA
 5427125 5427126 cce_0481 cce_0482     TRUE 0.911 98.000 0.429 1.000   NA
 5427126 5427127 cce_0482 cce_0483     FALSE 0.480 120.000 0.013 NA   NA
 5427129 5427130 cce_0485 cce_0486     FALSE 0.122 170.000 0.000 NA   NA
 5427130 5427131 cce_0486 cce_0487     FALSE 0.113 173.000 0.000 NA   NA
 5427131 5427132 cce_0487 cce_0488     FALSE 0.187 183.000 0.004 NA   NA
 5427133 5427134 cce_0489 cce_0490   gshB FALSE 0.469 80.000 0.000 1.000 N NA
 5427134 5427135 cce_0490 cce_0491 gshB grxC1 TRUE 0.612 0.000 0.010 1.000 N NA
 5427136 5427137 cce_0492 cce_0493   ptpS FALSE 0.308 129.000 0.000 1.000   NA
 5427137 5427138 cce_0493 cce_0494 ptpS   FALSE 0.059 208.000 0.000 NA   NA
 5427138 5427139 cce_0494 cce_0495     FALSE 0.099 179.000 0.000 NA   NA
 5427140 5427141 cce_0496 cce_0497     FALSE 0.016 303.000 0.000 NA   NA
 5427141 5427142 cce_0497 cce_0498     FALSE 0.076 191.000 0.000 NA   NA
 5427142 5427143 cce_0498 cce_0499     FALSE 0.339 10.000 0.000 NA   NA
 5427143 5427144 cce_0499 cce_0500     TRUE 0.628 37.000 0.023 NA   NA
 5427145 5427146 cce_0501 cce_0502   pyrFE FALSE 0.313 33.000 0.000 NA   NA
 5427146 5427147 cce_0502 cce_0503 pyrFE ruvB TRUE 0.625 59.000 0.002 1.000 N NA
 5427147 5427148 cce_0503 cce_0504 ruvB   FALSE 0.417 114.000 0.003 NA   NA
 5427150 5427151 cce_0506 cce_0507     TRUE 0.790 23.000 0.103 NA   NA
 5427151 5427152 cce_0507 cce_0508     FALSE 0.022 275.000 0.000 NA   NA
 5427154 5427155 cce_0510 cce_0511 thrB   FALSE 0.379 74.000 0.000 NA   NA
 5427155 5427156 cce_0511 cce_0512     FALSE 0.340 17.000 0.000 NA   NA
 5427156 5427157 cce_0512 cce_0513     FALSE 0.232 119.000 0.000 NA   NA
 5427157 5427158 cce_0513 cce_0514     FALSE 0.385 61.000 0.000 NA   NA
 5427158 5427159 cce_0514 cce_0515     TRUE 0.619 34.000 0.000 0.009   NA
 5427160 5427161 cce_0516 cce_0517     FALSE 0.324 41.000 0.000 NA   NA
 5427162 5427163 cce_0518 cce_0519     FALSE 0.380 73.000 0.000 NA   NA
 5427163 5427164 cce_0519 cce_0520     TRUE 0.777 80.000 0.006 0.009   NA
 5427164 5427165 cce_0520 cce_0521     FALSE 0.322 4.000 0.000 NA   NA
 5427165 5427166 cce_0521 cce_0522     FALSE 0.344 13.000 0.000 NA   NA
 5427166 5427167 cce_0522 cce_0523     FALSE 0.344 13.000 0.000 NA   NA
 5427167 5427168 cce_0523 cce_0524     FALSE 0.336 19.000 0.000 NA   NA
 5427168 5427169 cce_0524 cce_0525     FALSE 0.295 233.000 0.000 0.022 Y NA
 5427169 5427170 cce_0525 cce_0526     TRUE 0.813 -3.000 0.138 1.000   NA
 5427170 5427171 cce_0526 cce_0527     TRUE 0.903 39.000 0.417 NA   NA
 5427171 5427172 cce_0527 cce_0528     TRUE 0.943 63.000 0.600 NA   NA
 5427174 5427175 cce_0530 cce_0531     FALSE 0.204 130.000 0.000 NA   NA
 5427177 5427178 cce_0533 cce_0534     FALSE 0.376 76.000 0.000 NA   NA
 5427178 5427179 cce_0534 cce_0535     TRUE 0.841 51.000 0.167 NA   NA
 5427180 5427181 cce_0536 cce_0537     FALSE 0.017 301.000 0.000 NA   NA
 5427181 5427182 cce_0537 cce_0538   cbiL FALSE 0.149 158.000 0.000 NA   NA
 5427183 5427184 cce_0539 cce_0540     TRUE 0.741 70.000 0.003 0.049 N NA
 5427184 5427185 cce_0540 cce_0541     TRUE 0.648 66.000 0.011 NA   NA
 5427185 5427186 cce_0541 cce_0542     FALSE 0.432 143.000 0.021 NA   NA
 5427186 5427187 cce_0542 cce_0543     TRUE 0.647 11.000 0.021 NA   NA
 5427187 5427188 cce_0543 cce_0544   corA TRUE 0.671 14.000 0.014 1.000 N NA
 5427188 5427189 cce_0544 cce_RNA009 corA rnpB FALSE 0.379 58.000 0.000 NA   NA
 5427190 5427191 cce_0545 cce_0546     TRUE 0.722 0.000 0.069 NA   NA
 5427191 5427192 cce_0546 cce_0547     FALSE 0.045 327.000 0.025 NA   NA
 5427192 5427193 cce_0547 cce_0548   nifZ TRUE 0.932 92.000 0.354 0.003   NA
 5427193 5427194 cce_0548 cce_0549 nifZ nifV TRUE 0.802 -13.000 0.171 1.000   NA
 5427194 5427195 cce_0549 cce_0550 nifV   TRUE 0.830 29.000 0.182 NA   NA
 5427195 5427196 cce_0550 cce_0551     FALSE 0.073 193.000 0.000 NA   NA
 5427196 5427197 cce_0551 cce_0552     FALSE 0.328 43.000 0.000 NA   NA
 5427197 5427198 cce_0552 cce_0553   cysE2 TRUE 0.945 17.000 0.769 NA   NA
 5427199 5427200 cce_0554 cce_0555 nifB   TRUE 0.659 4.000 0.032 NA   NA
 5427200 5427201 cce_0555 cce_0556     TRUE 0.930 19.000 0.600 NA   NA
 5427201 5427202 cce_0556 cce_0557   nifS TRUE 0.703 98.000 0.057 NA   NA
 5427202 5427203 cce_0557 cce_0558 nifS nifU TRUE 0.810 174.000 0.716 1.000 N NA
 5427203 5427204 cce_0558 cce_0559 nifU nifH FALSE 0.039 261.000 0.000 1.000 N NA
 5427204 5427205 cce_0559 cce_0560 nifH nifD TRUE 0.671 155.000 0.065 0.001 N NA
 5427205 5427206 cce_0560 cce_0561 nifD nifK TRUE 0.924 182.000 0.902 0.001 Y NA
 5427206 5427207 cce_0561 cce_0562 nifK   FALSE 0.155 211.000 0.013 NA   NA
 5427207 5427208 cce_0562 cce_0563   nifE TRUE 0.704 62.000 0.025 NA   NA
 5427208 5427209 cce_0563 cce_0564 nifE nifN TRUE 0.965 105.000 0.475 0.002 Y NA
 5427209 5427210 cce_0564 cce_0565 nifN nifX TRUE 0.963 55.000 0.663 0.003   NA
 5427210 5427211 cce_0565 cce_0566 nifX   TRUE 0.726 136.000 0.210 NA   NA
 5427211 5427212 cce_0566 cce_0567     TRUE 0.864 83.000 0.214 NA   NA
 5427212 5427213 cce_0567 cce_0568   nifW TRUE 0.705 -3.000 0.067 NA   NA
 5427213 5427214 cce_0568 cce_0569 nifW hesA TRUE 0.675 129.000 0.078 1.000   NA
 5427214 5427215 cce_0569 cce_0570 hesA hesB TRUE 0.962 72.000 1.000 NA   NA
 5427215 5427216 cce_0570 cce_0571 hesB   TRUE 0.931 100.000 0.750 NA   NA
 5427216 5427217 cce_0571 cce_0572     TRUE 0.929 91.000 0.625 NA   NA
 5427217 5427218 cce_0572 cce_0573     TRUE 0.870 -10.000 0.400 NA   NA
 5427218 5427219 cce_0573 cce_0574     FALSE 0.054 213.000 0.000 NA   NA
 5427219 5427220 cce_0574 cce_0575   feoB2 TRUE 0.846 -34.000 0.214 0.003   NA
 5427220 5427221 cce_0575 cce_0576 feoB2 feoA2 TRUE 0.915 0.000 0.143 1.000 Y NA
 5427221 5427222 cce_0576 cce_0577 feoA2   FALSE 0.325 124.000 0.000 1.000   NA
 5427222 5427223 cce_0577 cce_0578     TRUE 0.600 30.000 0.000 0.047   NA
 5427223 5427224 cce_0578 cce_0579   fdxB TRUE 0.535 -28.000 0.013 1.000   NA
 5427224 5427225 cce_0579 cce_0580 fdxB vapB FALSE 0.300 99.000 0.000 NA   NA
 5427225 5427226 cce_0580 cce_0581 vapB vapC2 TRUE 0.887 1.000 0.359 NA   NA
 5427226 5427227 cce_0581 cce_0582 vapC2   TRUE 0.641 124.000 0.074 NA   NA
 5427227 5427228 cce_0582 cce_0583     FALSE 0.312 2.000 0.000 NA   NA
 5427228 5427229 cce_0583 cce_0584     FALSE 0.167 149.000 0.000 NA   NA
 5427229 5427230 cce_0584 cce_0585     FALSE 0.347 85.000 0.000 NA   NA
 5427230 5427231 cce_0585 cce_0586     FALSE 0.140 163.000 0.000 NA   NA
 5427231 5427232 cce_0586 cce_0587     TRUE 0.599 64.000 0.004 NA   NA
 5427232 5427233 cce_0587 cce_0588     TRUE 0.671 68.000 0.004 1.000   NA
 5427236 5427237 cce_0591 cce_0592     FALSE 0.339 10.000 0.000 NA   NA
 5427237 5427238 cce_0592 cce_0593     FALSE 0.224 220.000 0.059 NA   NA
 5427238 5427239 cce_0593 cce_0594   proB FALSE 0.009 447.000 0.000 1.000 N NA
 5427239 5427240 cce_0594 cce_0595 proB glk TRUE 0.592 31.000 0.005 1.000 N NA
 5427240 5427241 cce_0595 cce_0596 glk   TRUE 0.683 50.000 0.017 1.000 N NA
 5427243 5427244 cce_0598 cce_0599     FALSE 0.058 209.000 0.000 NA   NA
 5427244 5427245 cce_0599 cce_0600   ppx FALSE 0.223 123.000 0.000 NA   NA
 5427248 5427249 cce_0603 cce_0604 ndhF3 ndhD3 TRUE 0.979 40.000 0.714 0.003 Y NA
 5427249 5427250 cce_0604 cce_0605 ndhD3 cupA TRUE 0.944 95.000 0.857 NA   NA
 5427250 5427251 cce_0605 cce_0606 cupA pgm FALSE 0.012 332.000 0.000 NA   NA
 5427251 5427252 cce_0606 cce_0607 pgm   FALSE 0.014 314.000 0.000 NA   NA
 5427252 5427253 cce_0607 cce_0608     FALSE 0.040 232.000 0.000 NA   NA
 5427255 5427256 cce_0610 cce_0611   chlH2 FALSE 0.004 811.000 0.000 NA   NA
 5427257 5427258 cce_0612 cce_0613     TRUE 0.933 0.000 0.750 NA   NA
 5427258 5427259 cce_0613 cce_0614     FALSE 0.354 52.000 0.000 NA   NA
 5427260 5427261 cce_0615 cce_0616     FALSE 0.331 89.000 0.000 NA   NA
 5427261 5427262 cce_0616 cce_0617     FALSE 0.438 32.000 0.000 1.000   NA
 5427262 5427263 cce_0617 cce_0618     FALSE 0.457 44.000 0.000 1.000   NA
 5427263 5427264 cce_0618 cce_0619   rfbB1 TRUE 0.696 16.000 0.018 1.000   NA
 5427264 5427265 cce_0619 cce_0620 rfbB1   FALSE 0.354 52.000 0.000 NA   NA
 5427265 5427266 cce_0620 cce_0621     FALSE 0.334 88.000 0.000 NA   NA
 5427267 5427268 cce_0622 cce_0623   pnp FALSE 0.343 143.000 0.005 NA   NA
 5427269 5427270 cce_0624 cce_0625     FALSE 0.079 221.000 0.000 1.000   NA
 5427270 5427271 cce_0625 cce_0626     TRUE 0.516 62.000 0.000 1.000   NA
 5427273 5427274 cce_0628 cce_0629 ilvN   FALSE 0.026 258.000 0.000 NA   NA
 5427274 5427275 cce_0629 cce_0630     FALSE 0.007 401.000 0.000 NA   NA
 5427275 5427276 cce_0630 cce_0631     TRUE 0.543 103.000 0.002 1.000   NA
 5427279 5427280 cce_0634 cce_0635     FALSE 0.451 129.000 0.000 0.072   NA
 5427280 5427281 cce_0635 cce_0636   psbA5 FALSE 0.279 138.000 0.000 1.000   NA
 5427281 5427282 cce_0636 cce_0637 psbA5   FALSE 0.057 210.000 0.000 NA   NA
 5427282 5427283 cce_0637 cce_0638     FALSE 0.240 115.000 0.000 NA   NA
 5427283 5427284 cce_0638 cce_0639     FALSE 0.007 594.000 0.000 1.000   NA
 5427284 5427285 cce_0639 cce_0640     FALSE 0.318 38.000 0.000 NA   NA
 5427287 5427288 cce_0642 cce_0643     TRUE 0.845 35.000 0.222 NA   NA
 5427290 5427291 cce_0645 cce_0646 devA devB TRUE 0.705 -3.000 0.000 NA Y NA
 5427292 5427293 cce_0647 cce_0648   devC FALSE 0.335 8.000 0.000 NA   NA
 5427293 5427294 cce_0648 cce_0649 devC   FALSE 0.122 170.000 0.000 NA   NA
 5427295 5427296 cce_0650 cce_0651     FALSE 0.408 164.000 0.017 1.000   NA
 5427297 5427298 cce_0652 cce_0653   pmbA FALSE 0.016 302.000 0.000 NA   NA
 5427298 5427299 cce_0653 cce_0654 pmbA petF2 FALSE 0.284 103.000 0.000 NA   NA
 5427301 5427302 cce_0656 cce_0657     TRUE 0.980 3.000 0.833 0.023 Y NA
 5427302 5427303 cce_0657 cce_0658     FALSE 0.006 765.000 0.000 1.000 N NA
 5427304 5427305 cce_0659 cce_0660 psbC psbD1 TRUE 0.941 -43.000 0.878 0.003   NA
 5427305 5427306 cce_0660 cce_0661 psbD1   FALSE 0.008 562.000 0.000 1.000   NA
 5427306 5427307 cce_0661 cce_0662     FALSE 0.373 126.000 0.003 NA   NA
 5427307 5427308 cce_0662 cce_0663   sdhA FALSE 0.006 475.000 0.000 NA   NA
 5427311 5427312 cce_0666 cce_0667 pgi1   FALSE 0.316 95.000 0.000 NA   NA
 5427314 5427315 cce_0669 cce_0670 pfkA1   FALSE 0.010 356.000 0.000 NA   NA
 5427315 5427316 cce_0670 cce_0671     FALSE 0.297 100.000 0.000 NA   NA
 5427317 5427318 cce_0672 cce_0673     TRUE 0.922 -3.000 0.667 NA   NA
 5427318 5427319 cce_0673 cce_RNA010     FALSE 0.249 112.000 0.000 NA   NA
 5427320 5427321 cce_0674 cce_0675     FALSE 0.386 64.000 0.000 NA   NA
 5427322 5427323 cce_0676 cce_0677     TRUE 0.836 68.000 0.118 NA   NA
 5427323 5427324 cce_0677 cce_0678     FALSE 0.008 397.000 0.000 NA   NA
 5427324 5427325 cce_0678 cce_0679     TRUE 0.707 112.000 0.104 NA N NA
 5427325 5427326 cce_0679 cce_0680     FALSE 0.038 234.000 0.000 NA   NA
 5427326 5427327 cce_0680 cce_0681     FALSE 0.338 18.000 0.000 NA   NA
 5427327 5427328 cce_0681 cce_0682     FALSE 0.005 559.000 0.000 NA   NA
 5427328 5427329 cce_0682 cce_0683     FALSE 0.312 2.000 0.000 NA   NA
 5427330 5427331 cce_0684 cce_0685   sufB FALSE 0.236 -21.000 0.000 NA   NA
 5427331 5427332 cce_0685 cce_0686 sufB sufC TRUE 0.968 57.000 0.466 1.000 Y NA
 5427332 5427333 cce_0686 cce_0687 sufC   FALSE 0.153 156.000 0.000 NA   NA
 5427333 5427334 cce_0687 cce_0688   ndk FALSE 0.085 185.000 0.000 NA   NA
 5427336 5427337 cce_0690 cce_0691     FALSE 0.435 96.000 0.000 1.000   NA
 5427339 5427340 cce_0693 cce_0694     FALSE 0.203 -67.000 0.000 NA   NA
 5427340 5427341 cce_0694 cce_0695     FALSE 0.376 109.000 0.000 1.000   NA
 5427341 5427342 cce_0695 cce_0696     FALSE 0.360 82.000 0.000 NA   NA
 5427342 5427343 cce_0696 cce_0697     FALSE 0.333 7.000 0.000 NA   NA
 5427343 5427344 cce_0697 cce_0698     TRUE 0.501 78.000 0.000 1.000   NA
 5427344 5427345 cce_0698 cce_0699     FALSE 0.034 240.000 0.000 NA   NA
 5427346 5427347 cce_0700 cce_0701   pykF4 FALSE 0.318 38.000 0.000 NA   NA
 5427347 5427348 cce_0701 cce_0702 pykF4   FALSE 0.444 39.000 0.000 1.000   NA
 5427348 5427349 cce_0702 cce_0703     TRUE 0.766 110.000 0.154 NA   NA
 5427349 5427350 cce_0703 cce_0704   tsf FALSE 0.250 173.000 0.006 NA   NA
 5427350 5427351 cce_0704 cce_0705 tsf rps2 TRUE 0.948 21.000 0.748 1.000   NA
 5427352 5427353 cce_0706 cce_0707 moaE glmM FALSE 0.230 180.000 0.003 1.000 N NA
 5427355 5427356 cce_0709 cce_0710     FALSE 0.226 122.000 0.000 NA   NA
 5427356 5427357 cce_0710 cce_0711     FALSE 0.374 77.000 0.000 NA   NA
 5427357 5427358 cce_0711 cce_0712     FALSE 0.192 165.000 0.000 1.000 N NA
 5427358 5427359 cce_0712 cce_0713     TRUE 0.964 125.000 0.750 0.023 Y NA
 5427359 5427360 cce_0713 cce_0714     TRUE 0.975 7.000 0.800 1.000 Y NA
 5427360 5427361 cce_0714 cce_0715     TRUE 0.862 196.000 0.600 0.005 Y NA
 5427361 5427362 cce_0715 cce_0716     TRUE 0.980 79.000 0.600 0.005 Y NA
 5427364 5427365 cce_0718 cce_0719     TRUE 0.574 121.000 0.021 1.000   NA
 5427365 5427366 cce_0719 cce_0720     FALSE 0.011 403.000 0.000 1.000 N NA
 5427366 5427367 cce_0720 cce_RNA011     FALSE 0.196 133.000 0.000 NA   NA
 5427367 5427368 cce_RNA011 cce_0721     FALSE 0.093 181.000 0.000 NA   NA
 5427368 5427369 cce_0721 cce_0722     FALSE 0.007 407.000 0.000 NA   NA
 5427369 5427370 cce_0722 cce_0723     FALSE 0.021 278.000 0.000 NA   NA
 5427370 5427371 cce_0723 cce_0724     FALSE 0.018 295.000 0.000 NA   NA
 5427371 5427372 cce_0724 cce_0725     FALSE 0.004 607.000 0.000 NA   NA
 5427372 5427373 cce_0725 cce_0726     FALSE 0.008 393.000 0.000 NA   NA
 5427373 5427374 cce_0726 cce_0727     FALSE 0.316 3.000 0.000 NA   NA
 5427374 5427375 cce_0727 cce_0728     FALSE 0.023 272.000 0.000 NA   NA
 5427375 5427376 cce_0728 cce_RNA012     FALSE 0.341 49.000 0.000 NA   NA
 5427376 5427377 cce_RNA012 cce_0729     FALSE 0.025 264.000 0.000 NA   NA
 5427377 5427378 cce_0729 cce_0730     TRUE 0.946 6.000 0.833 NA   NA
 5427378 5427379 cce_0730 cce_0731     TRUE 0.878 148.000 0.833 NA   NA
 5427379 5427380 cce_0731 cce_0732     TRUE 0.835 -61.000 0.417 NA   NA
 5427380 5427381 cce_0732 cce_0733     FALSE 0.007 408.000 0.000 NA   NA
 5427383 5427384 cce_0735 cce_0736 lpdA psbX FALSE 0.338 180.000 0.024 1.000   NA
 5427384 5427385 cce_0736 cce_0737 psbX   TRUE 0.587 156.000 0.111 NA   NA
 5427385 5427386 cce_0737 cce_0738     TRUE 0.609 6.000 0.014 NA   NA
 5427386 5427387 cce_0738 cce_0739     FALSE 0.402 127.000 0.005 NA   NA
 5427391 5427392 cce_0743 cce_0744     FALSE 0.166 150.000 0.000 NA   NA
 5427395 5427396 cce_0747 cce_0748     FALSE 0.412 32.000 0.000 1.000 N NA
 5427397 5427398 cce_0749 cce_0750     FALSE 0.328 90.000 0.000 NA   NA
 5427398 5427399 cce_0750 cce_0751     FALSE 0.331 89.000 0.000 NA   NA
 5427399 5427400 cce_0751 cce_0752     TRUE 0.652 -3.000 0.025 1.000 N NA
 5427400 5427401 cce_0752 cce_0753     FALSE 0.266 220.000 0.061 1.000   NA
 5427402 5427403 cce_0754 cce_0755     FALSE 0.334 21.000 0.000 NA   NA
 5427403 5427404 cce_0755 cce_0756     FALSE 0.383 59.000 0.000 NA   NA
 5427404 5427405 cce_0756 cce_0757     TRUE 0.778 110.000 0.176 NA   NA
 5427408 5427409 cce_0760 cce_0761     FALSE 0.234 118.000 0.000 NA   NA
 5427409 5427410 cce_0761 cce_0762     FALSE 0.442 38.000 0.000 1.000   NA
 5427410 5427411 cce_0762 cce_0763     FALSE 0.176 143.000 0.000 NA   NA
 5427411 5427412 cce_0763 cce_0764     TRUE 0.761 74.000 0.053 NA   NA
 5427412 5427413 cce_0764 cce_0765     FALSE 0.078 189.000 0.000 NA   NA
 5427414 5427415 cce_0766 cce_0767   lipA1 TRUE 0.799 52.000 0.000 1.000 Y NA
 5427416 5427417 cce_0768 cce_0769     FALSE 0.195 -28.000 0.000 NA N NA
 5427417 5427418 cce_0769 cce_0770     FALSE 0.308 50.000 0.000 NA N NA
 5427419 5427420 cce_0771 cce_0772     TRUE 0.790 -7.000 0.000 0.048 Y NA
 5427422 5427423 cce_0774 cce_0775     TRUE 0.663 8.000 0.028 NA   NA
 5427423 5427424 cce_0775 cce_0776   psbQ TRUE 0.923 75.000 0.339 1.000   NA
 5427424 5427425 cce_0776 cce_0777 psbQ   TRUE 0.753 136.000 0.200 1.000   NA
 5427427 5427428 cce_0779 cce_0780     TRUE 0.835 133.000 0.044 0.020 Y NA
 5427429 5427430 cce_0781 cce_0782     FALSE 0.487 -52.000 0.023 NA   NA
 5427432 5427433 cce_0784 cce_0785     TRUE 0.695 68.000 0.008 1.000   NA
 5427433 5427434 cce_0785 cce_0786     FALSE 0.386 64.000 0.000 NA   NA
 5427434 5427435 cce_0786 cce_0787     FALSE 0.328 43.000 0.000 NA   NA
 5427435 5427436 cce_0787 cce_0788     FALSE 0.176 143.000 0.000 NA   NA
 11431775 5427430   cce_0782     FALSE NA 8871.000 0.000 NA   NA
 11574138 5427430   cce_0782     FALSE NA 8871.000 0.000 NA   NA
 11716530 5427430   cce_0782     FALSE NA 8871.000 0.000 NA   NA
 11431776 5427430   cce_0782     FALSE NA 8907.000 0.000 NA   NA
 11574139 5427430   cce_0782     FALSE NA 8907.000 0.000 NA   NA
 11716531 5427430   cce_0782     FALSE NA 8907.000 0.000 NA   NA
 11431777 5427430   cce_0782     FALSE NA 8947.000 0.000 NA   NA
 11574140 5427430   cce_0782     FALSE NA 8947.000 0.000 NA   NA
 11716532 5427430   cce_0782     FALSE NA 8947.000 0.000 NA   NA
 11431778 5427430   cce_0782     FALSE NA 8983.000 0.000 NA   NA
 11574141 5427430   cce_0782     FALSE NA 8983.000 0.000 NA   NA
 11716533 5427430   cce_0782     FALSE NA 8983.000 0.000 NA   NA
 11431779 5427440   cce_0792     FALSE NA 1558.000 0.000 NA   NA
 11574142 5427440   cce_0792     FALSE NA 1558.000 0.000 NA   NA
 11716534 5427440   cce_0792     FALSE NA 1558.000 0.000 NA   NA
 11431780 5427440   cce_0792     FALSE NA 1516.000 0.000 NA   NA
 11574143 5427440   cce_0792     FALSE NA 1516.000 0.000 NA   NA
 11716535 5427440   cce_0792     FALSE NA 1516.000 0.000 NA   NA
 11431781 5427440   cce_0792     FALSE NA 1480.000 0.000 NA   NA
 11574144 5427440   cce_0792     FALSE NA 1480.000 0.000 NA   NA
 11716536 5427440   cce_0792     FALSE NA 1480.000 0.000 NA   NA
 11431782 5427440   cce_0792     FALSE NA 1437.000 0.000 NA   NA
 11574145 5427440   cce_0792     FALSE NA 1437.000 0.000 NA   NA
 11716537 5427440   cce_0792     FALSE NA 1437.000 0.000 NA   NA
 11431783 5427440   cce_0792     FALSE NA 1401.000 0.000 NA   NA
 11574146 5427440   cce_0792     FALSE NA 1401.000 0.000 NA   NA
 11716538 5427440   cce_0792     FALSE NA 1401.000 0.000 NA   NA
 11431784 5427440   cce_0792     FALSE NA 1359.000 0.000 NA   NA
 11574147 5427440   cce_0792     FALSE NA 1359.000 0.000 NA   NA
 11716539 5427440   cce_0792     FALSE NA 1359.000 0.000 NA   NA
 11431785 5427440   cce_0792     FALSE NA 1323.000 0.000 NA   NA
 11574148 5427440   cce_0792     FALSE NA 1323.000 0.000 NA   NA
 11716540 5427440   cce_0792     FALSE NA 1323.000 0.000 NA   NA
 11431786 5427440   cce_0792     FALSE NA 1285.000 0.000 NA   NA
 11574149 5427440   cce_0792     FALSE NA 1285.000 0.000 NA   NA
 11716541 5427440   cce_0792     FALSE NA 1285.000 0.000 NA   NA
 11431787 5427440   cce_0792     FALSE NA 1249.000 0.000 NA   NA
 11574150 5427440   cce_0792     FALSE NA 1249.000 0.000 NA   NA
 11716542 5427440   cce_0792     FALSE NA 1249.000 0.000 NA   NA
 11431788 5427440   cce_0792     FALSE NA 1206.000 0.000 NA   NA
 11574151 5427440   cce_0792     FALSE NA 1206.000 0.000 NA   NA
 11716543 5427440   cce_0792     FALSE NA 1206.000 0.000 NA   NA
 11431789 5427440   cce_0792     FALSE NA 1170.000 0.000 NA   NA
 11574152 5427440   cce_0792     FALSE NA 1170.000 0.000 NA   NA
 11716544 5427440   cce_0792     FALSE NA 1170.000 0.000 NA   NA
 11431790 5427440   cce_0792     FALSE NA 1134.000 0.000 NA   NA
 11574153 5427440   cce_0792     FALSE NA 1134.000 0.000 NA   NA
 11716545 5427440   cce_0792     FALSE NA 1134.000 0.000 NA   NA
 11431791 5427440   cce_0792     FALSE NA 1098.000 0.000 NA   NA
 11574154 5427440   cce_0792     FALSE NA 1098.000 0.000 NA   NA
 11716546 5427440   cce_0792     FALSE NA 1098.000 0.000 NA   NA
 11431792 5427440   cce_0792     FALSE NA 1058.000 0.000 NA   NA
 11574155 5427440   cce_0792     FALSE NA 1058.000 0.000 NA   NA
 11716547 5427440   cce_0792     FALSE NA 1058.000 0.000 NA   NA
 11431793 5427440   cce_0792     FALSE NA 1022.000 0.000 NA   NA
 11574156 5427440   cce_0792     FALSE NA 1022.000 0.000 NA   NA
 11716548 5427440   cce_0792     FALSE NA 1022.000 0.000 NA   NA
 11431794 5427440   cce_0792     FALSE NA 983.000 0.000 NA   NA
 11574157 5427440   cce_0792     FALSE NA 983.000 0.000 NA   NA
 11716549 5427440   cce_0792     FALSE NA 983.000 0.000 NA   NA
 11431795 5427440   cce_0792     FALSE NA 947.000 0.000 NA   NA
 11574158 5427440   cce_0792     FALSE NA 947.000 0.000 NA   NA
 11716550 5427440   cce_0792     FALSE NA 947.000 0.000 NA   NA
 5427440 5427441 cce_0792 cce_0793     TRUE 0.861 67.000 0.167 NA   NA
 5427441 5427442 cce_0793 cce_0794     FALSE 0.132 166.000 0.000 NA   NA
 5427443 5427444 cce_0795 cce_0796     FALSE 0.059 207.000 0.000 NA   NA
 5427445 5427446 cce_0797 cce_0798 pdxH rpe FALSE 0.059 232.000 0.000 1.000 N NA
 5427447 5427448 cce_0799 cce_0800   ackA1 TRUE 0.539 114.000 0.007 1.000   NA
 5427448 5427449 cce_0800 cce_RNA013 ackA1   FALSE 0.379 58.000 0.000 NA   NA
 5427449 5427450 cce_RNA013 cce_0801   rpl19 FALSE 0.293 101.000 0.000 NA   NA
 5427450 5427451 cce_0801 cce_0802 rpl19 cobO TRUE 0.642 61.000 0.003 1.000 N NA
 5427451 5427452 cce_0802 cce_0803 cobO   TRUE 0.561 12.000 0.006 NA N NA
 5427452 5427453 cce_0803 cce_0804   psbP FALSE 0.216 192.000 0.019 NA   NA
 5427454 5427455 cce_0805 cce_0806     TRUE 0.700 91.000 0.050 NA N NA
 5427455 5427456 cce_0806 cce_0807     TRUE 0.823 83.000 0.133 NA N NA
 5427458 5427459 cce_0809 cce_0810     FALSE 0.314 32.000 0.000 NA   NA
 5427461 5427462 cce_0812 cce_0813     TRUE 0.702 -37.000 0.129 NA   NA
 5427464 5427465 cce_0815 cce_0816     TRUE 0.629 130.000 0.080 NA   NA
 5427465 5427466 cce_0816 cce_0817     TRUE 0.840 62.000 0.120 NA   NA
 5427466 5427467 cce_0817 cce_0818   murE FALSE 0.437 19.000 0.000 1.000 N NA
 5427468 5427469 cce_0819 cce_0820     TRUE 0.786 20.000 0.098 NA   NA
 5427471 5427472 cce_0822 cce_0823     TRUE 0.870 28.000 0.274 NA   NA
 5427473 5427474 cce_0824 cce_0825     FALSE 0.042 263.000 0.000 1.000   NA
 5427477 5427478 cce_0828 cce_0829   trpD FALSE 0.175 144.000 0.000 NA   NA
 5427482 5427483 cce_0833 cce_0834   exoD1 TRUE 0.804 88.000 0.118 NA   NA
 5427483 5427484 cce_0834 cce_0835 exoD1 ahcY FALSE 0.465 118.000 0.010 NA   NA
 5427485 5427486 cce_0836 cce_0837     FALSE 0.320 29.000 0.000 NA   NA
 5427487 5427488 cce_0838 cce_0839     FALSE 0.374 77.000 0.000 NA   NA
 5427488 5427489 cce_0839 cce_0840     TRUE 0.831 68.000 0.111 NA   NA
 5427489 5427490 cce_0840 cce_0841   pntB FALSE 0.300 99.000 0.000 NA   NA
 5427490 5427491 cce_0841 cce_0842 pntB pntA-2 TRUE 0.871 8.000 0.090 0.001   NA
 5427491 5427492 cce_0842 cce_0843 pntA-2 pntA-1 TRUE 0.968 15.000 0.829 0.001   NA
 5427494 5427495 cce_0845 cce_0846     FALSE 0.276 105.000 0.000 NA   NA
 5427498 5427499 cce_0849 cce_0850     FALSE 0.385 60.000 0.000 NA   NA
 5427499 5427500 cce_0850 cce_0851     FALSE 0.316 31.000 0.000 NA   NA
 5427503 5427504 cce_0854 cce_0855     FALSE 0.181 200.000 0.015 NA   NA
 5427504 5427505 cce_0855 cce_0856   merA FALSE 0.481 122.000 0.015 NA   NA
 5427505 5427506 cce_0856 cce_0857 merA   TRUE 0.852 101.000 0.273 NA   NA
 5427506 5427507 cce_0857 cce_0858     TRUE 0.840 47.000 0.182 NA   NA
 5427508 5427509 cce_0859 cce_0860   psbH TRUE 0.490 152.000 0.048 NA   NA
 5427509 5427510 cce_0860 cce_0861 psbH   FALSE 0.396 215.000 0.167 1.000   NA
 5427510 5427511 cce_0861 cce_0862     FALSE 0.096 208.000 0.000 1.000   NA
 5427511 5427512 cce_0862 cce_0863     TRUE 0.790 5.000 0.075 1.000   NA
 5427512 5427513 cce_0863 cce_0864     FALSE 0.462 47.000 0.000 1.000   NA
 5427513 5427514 cce_0864 cce_0865     FALSE 0.315 36.000 0.000 NA   NA
 5427514 5427515 cce_0865 cce_0866     FALSE 0.304 0.000 0.000 NA   NA
 5427515 5427516 cce_0866 cce_0867     FALSE 0.191 135.000 0.000 NA   NA
 5427516 5427517 cce_0867 cce_0868     FALSE 0.272 106.000 0.000 NA   NA
 5427517 5427518 cce_0868 cce_0869     FALSE 0.041 230.000 0.000 NA   NA
 5427518 5427519 cce_0869 cce_0870     FALSE 0.171 147.000 0.000 NA   NA
 5427520 5427521 cce_0871 cce_0872 icfA2   FALSE 0.331 24.000 0.000 NA   NA
 5427522 5427523 cce_0873 cce_0874     FALSE 0.007 403.000 0.000 NA   NA
 5427524 5427525 cce_0875 cce_0876 sigA   FALSE 0.007 635.000 0.000 1.000   NA
 5427525 5427526 cce_0876 cce_0877   crtE TRUE 0.873 19.000 0.214 1.000   NA
 5427527 5427528 cce_0878 cce_0879     FALSE 0.008 391.000 0.000 NA   NA
 5427528 5427529 cce_0879 cce_0880     FALSE 0.119 171.000 0.000 NA   NA
 5427530 5427531 cce_0881 cce_0882   pstB1-2 TRUE 0.784 -22.000 0.222 NA   NA
 5427531 5427532 cce_0882 cce_0883 pstB1-2 pstB1 TRUE 0.844 29.000 0.000 0.002 Y NA
 5427532 5427533 cce_0883 cce_0884 pstB1 pstA1 TRUE 0.737 132.000 0.000 0.003 Y NA
 5427533 5427534 cce_0884 cce_0885 pstA1 pstC1 TRUE 0.516 236.000 0.081 0.003 Y NA
 5427534 5427535 cce_0885 cce_0886 pstC1 pstS TRUE 0.894 133.000 0.135 0.003 Y NA
 5427537 5427538 cce_RNA014 cce_RNA015     FALSE 0.342 16.000 0.000 NA   NA
 5427541 5427542 cce_0890 cce_0891 glgA2   FALSE 0.076 217.000 0.000 1.000 N NA
 5427542 5427543 cce_0891 cce_0892     TRUE 0.896 93.000 0.333 1.000 N NA
 5427543 5427544 cce_0892 cce_0893   psbM TRUE 0.843 88.000 0.139 1.000   NA
 5427545 5427546 cce_0894 cce_0895     TRUE 0.532 44.000 0.003 NA   NA
 5427546 5427547 cce_0895 cce_0896     TRUE 0.758 80.000 0.057 NA   NA
 5427547 5427548 cce_0896 cce_0897   proA1 TRUE 0.567 68.000 0.002 NA   NA
 5427548 5427549 cce_0897 cce_0898 proA1   FALSE 0.318 30.000 0.000 NA   NA
 5427549 5427550 cce_0898 cce_0899     FALSE 0.253 -13.000 0.000 NA   NA
 5427550 5427551 cce_0899 cce_0900     FALSE 0.201 131.000 0.000 NA   NA
 5427551 5427552 cce_0900 cce_0901     FALSE 0.004 893.000 0.000 NA   NA
 5427552 5427553 cce_0901 cce_0902   carA TRUE 0.567 73.000 0.002 NA   NA
 5427553 5427554 cce_0902 cce_0903 carA   FALSE 0.338 87.000 0.000 NA   NA
 5427555 5427556 cce_0904 cce_0905     FALSE 0.010 358.000 0.000 NA   NA
 5427557 5427558 cce_0906 cce_0907     TRUE 0.933 35.000 0.706 NA   NA
 5427559 5427560 cce_0908 cce_0909     TRUE 0.754 4.000 0.077 NA   NA
 5427562 5427563 cce_0911 cce_0912   mraY TRUE 0.668 86.000 0.027 NA   NA
 5427564 5427565 cce_0913 cce_0914   tly FALSE 0.010 454.000 0.000 1.000   NA
 5427565 5427566 cce_0914 cce_0915 tly   TRUE 0.586 66.000 0.003 NA   NA
 5427567 5427568 cce_0916 cce_0917     FALSE 0.467 17.000 0.000 1.000   NA
 5427568 5427569 cce_0917 cce_0918     FALSE 0.054 213.000 0.000 NA   NA
 5427574 5427575 cce_0922 cce_0923 rodA   FALSE 0.251 177.000 0.003 1.000 N NA
 5427575 5427576 cce_0923 cce_0924     FALSE 0.076 217.000 0.000 1.000 N NA
 5427576 5427577 cce_0924 cce_0925     TRUE 0.643 129.000 0.087 NA   NA
 5427581 5427582 cce_0929 cce_0930     FALSE 0.289 -3.000 0.000 NA   NA
 5427582 5427583 cce_0930 cce_0931     FALSE 0.337 9.000 0.000 NA   NA
 5427584 5427585 cce_0932 cce_0933     FALSE 0.221 124.000 0.000 NA   NA
 5427585 5427586 cce_0933 cce_0934     FALSE 0.348 51.000 0.000 NA   NA
 5427586 5427587 cce_0934 cce_0935     FALSE 0.048 222.000 0.000 NA   NA
 5427587 5427588 cce_0935 cce_0936     TRUE 0.565 158.000 0.100 NA   NA
 5427589 5427590 cce_0937 cce_0938     FALSE 0.385 67.000 0.000 NA   NA
 5427590 5427591 cce_0938 cce_0939   gph FALSE 0.452 5.000 0.000 1.000   NA
 5427591 5427592 cce_0939 cce_0940 gph panD TRUE 0.610 6.000 0.004 1.000   NA
 5427593 5427594 cce_0941 cce_0942     FALSE 0.333 45.000 0.000 NA   NA
 5427594 5427595 cce_0942 cce_0943     TRUE 0.905 30.000 0.043 0.019 Y NA
 5427595 5427596 cce_0943 cce_0944     FALSE 0.302 178.000 0.014 1.000 N NA
 5427596 5427597 cce_0944 cce_0945     FALSE 0.053 214.000 0.000 NA   NA
 5427597 5427598 cce_0945 cce_0946     TRUE 0.505 92.000 0.003 NA   NA
 5427599 5427600 cce_0947 cce_0948     TRUE 0.747 18.000 0.043 1.000   NA
 5427606 5427607 cce_0954 cce_0955     TRUE 0.691 18.000 0.037 NA   NA
 5427608 5427609 cce_0956 cce_0957   ribF FALSE 0.006 880.000 0.000 1.000   NA
 5427609 5427610 cce_0957 cce_0958 ribF   FALSE 0.018 335.000 0.000 1.000 N NA
 5427610 5427611 cce_0958 cce_0959     FALSE 0.094 275.000 0.043 NA   NA
 5427611 5427612 cce_0959 cce_0960     FALSE 0.385 65.000 0.000 NA   NA
 5427613 5427614 cce_0961 cce_0962     FALSE 0.341 11.000 0.000 NA   NA
 5427614 5427615 cce_0962 cce_0963   ispD TRUE 0.598 59.000 0.004 NA   NA
 5427615 5427616 cce_0963 cce_0964 ispD   TRUE 0.569 52.000 0.004 NA   NA
 5427617 5427618 cce_0965 cce_0966   lmbP TRUE 0.664 -6.000 0.032 1.000   NA
 5427618 5427619 cce_0966 cce_0967 lmbP   TRUE 0.804 12.000 0.111 NA   NA
 5427620 5427621 cce_0968 cce_0969     FALSE 0.009 374.000 0.000 NA   NA
 5427621 5427622 cce_0969 cce_0970     TRUE 0.970 34.000 0.700 1.000 Y NA
 5427622 5427623 cce_0970 cce_0971     FALSE 0.006 751.000 0.000 1.000 N NA
 5427625 5427626 cce_0973 cce_0974 glpK   FALSE 0.434 88.000 0.000 1.000 N NA
 5427627 5427628 cce_0975 cce_0976     TRUE 0.815 26.000 0.143 NA   NA
 5427628 5427629 cce_0976 cce_0977     FALSE 0.015 310.000 0.000 NA   NA
 5427629 5427630 cce_0977 cce_0978     FALSE 0.330 6.000 0.000 NA   NA
 5427630 5427631 cce_0978 cce_0979     FALSE 0.289 -3.000 0.000 NA   NA
 5427632 5427633 cce_0980 cce_0981     TRUE 0.718 -7.000 0.087 NA   NA
 5427633 5427634 cce_0981 cce_0982     FALSE 0.354 52.000 0.000 NA   NA
 5427635 5427636 cce_0983 cce_0984     FALSE 0.008 385.000 0.000 NA   NA
 5427636 5427637 cce_0984 cce_0985     FALSE 0.327 26.000 0.000 NA   NA
 5427637 5427638 cce_0985 cce_0986     FALSE 0.011 423.000 0.000 1.000   NA
 5427638 5427639 cce_0986 cce_0987   glgC1 FALSE 0.237 148.000 0.000 1.000 N NA
 5427639 5427640 cce_0987 cce_0988 glgC1   TRUE 0.722 55.000 0.020 1.000   NA
 5427640 5427641 cce_0988 cce_0989   psaA FALSE 0.008 546.000 0.000 1.000   NA
 5427641 5427642 cce_0989 cce_0990 psaA psaB TRUE 0.646 180.000 0.154 0.002   NA
 5427642 5427643 cce_0990 cce_0991 psaB   FALSE 0.107 199.000 0.000 1.000   NA
 5427643 5427644 cce_0991 cce_0992     TRUE 0.610 136.000 0.083 NA   NA
 5427644 5427645 cce_0992 cce_0993     FALSE 0.025 266.000 0.000 NA   NA
 5427647 5427648 cce_0995 cce_0996 prk   FALSE 0.005 494.000 0.000 NA   NA
 5427649 5427650 cce_0997 cce_0998 gdhA trpF FALSE 0.071 353.000 0.000 1.000 Y NA
 5427651 5427652 cce_0999 cce_1000 psaK2   FALSE 0.034 240.000 0.000 NA   NA
 5427652 5427653 cce_1000 cce_1001   clpC2 FALSE 0.040 232.000 0.000 NA   NA
 5427654 5427655 cce_1002 cce_1003     FALSE 0.341 11.000 0.000 NA   NA
 5427655 5427656 cce_1003 cce_1004   sufS FALSE 0.085 210.000 0.000 1.000 N NA
 5427656 5427657 cce_1004 cce_1005 sufS sufD TRUE 0.796 46.000 0.081 1.000 N NA
 5427657 5427658 cce_1005 cce_1006 sufD   FALSE 0.061 231.000 0.000 1.000 N NA
 5427658 5427659 cce_1006 cce_1007     FALSE 0.384 68.000 0.000 NA   NA
 5427660 5427661 cce_1008 cce_1009     FALSE 0.019 290.000 0.000 NA   NA
 5427661 5427662 cce_1009 cce_1010     TRUE 0.924 41.000 0.571 NA   NA
 5427662 5427663 cce_1010 cce_1011     TRUE 0.903 34.000 0.429 NA   NA
 5427664 5427665 cce_1012 cce_1013     FALSE 0.174 145.000 0.000 NA   NA
 5427668 5427669 cce_1016 cce_1017 rnd   FALSE 0.096 263.000 0.014 1.000   NA
 5427669 5427670 cce_1017 cce_1018     TRUE 0.579 104.000 0.009 1.000 N NA
 5427670 5427671 cce_1018 cce_1019     TRUE 0.794 50.000 0.074 1.000 N NA
 5427671 5427672 cce_1019 cce_1020     TRUE 0.784 60.000 0.065 NA   NA
 5427673 5427674 cce_1021 cce_1022     FALSE 0.339 10.000 0.000 NA   NA
 5427674 5427675 cce_1022 cce_1023     FALSE 0.375 -10.000 0.000 1.000   NA
 5427675 5427676 cce_1023 cce_1024     FALSE 0.437 35.000 0.000 1.000   NA
 5427676 5427677 cce_1024 cce_1025     TRUE 0.925 3.000 0.500 1.000   NA
 5427677 5427678 cce_1025 cce_1026     TRUE 0.501 78.000 0.000 1.000   NA
 5427678 5427679 cce_1026 cce_1027     TRUE 0.936 51.000 0.625 NA   NA
 5427679 5427680 cce_1027 cce_1028     FALSE 0.385 66.000 0.000 NA   NA
 5427680 5427681 cce_1028 cce_1029     FALSE 0.012 410.000 0.000 1.000   NA
 5427681 5427682 cce_1029 cce_1030   trxA3 TRUE 0.938 75.000 0.477 1.000   NA
 5427682 5427683 cce_1030 cce_1031 trxA3   TRUE 0.869 118.000 0.486 NA   NA
 5427683 5427684 cce_1031 cce_1032   tyrS FALSE 0.289 158.000 0.005 NA N NA
 5427685 5427686 cce_1033 cce_1034     FALSE 0.022 273.000 0.000 NA   NA
 5427686 5427687 cce_1034 cce_1035     TRUE 0.833 109.000 0.032 1.000 Y NA
 5427687 5427688 cce_1035 cce_1036     TRUE 0.838 124.000 0.400 NA N NA
 5427688 5427689 cce_1036 cce_1037     TRUE 0.897 26.000 0.375 NA   NA
 5427689 5427690 cce_1037 cce_1038     FALSE 0.340 17.000 0.000 NA   NA
 5427690 5427691 cce_1038 cce_1039     FALSE 0.021 278.000 0.000 NA   NA
 5427692 5427693 cce_1040 cce_1041     FALSE 0.153 230.000 0.034 NA   NA
 5427693 5427694 cce_1041 cce_1042     TRUE 0.724 68.000 0.034 NA   NA
 5427695 5427696 cce_1043 cce_1044     FALSE 0.029 251.000 0.000 NA   NA
 5427696 5427697 cce_1044 cce_1045     FALSE 0.180 141.000 0.000 NA   NA
 5427697 5427698 cce_1045 cce_1046     TRUE 0.938 15.000 0.667 NA   NA
 5427704 5427705 cce_1052 cce_1053     TRUE 0.516 32.000 0.004 NA   NA
 5427705 5427706 cce_1053 cce_1054     FALSE 0.005 488.000 0.000 NA   NA
 5427706 5427707 cce_1054 cce_1055     FALSE 0.316 3.000 0.000 NA   NA
 5427707 5427708 cce_1055 cce_1056     FALSE 0.322 4.000 0.000 NA   NA
 5427709 5427710 cce_RNA017 cce_1057     FALSE 0.249 112.000 0.000 NA   NA
 5427710 5427711 cce_1057 cce_1058     TRUE 0.947 17.000 0.810 NA   NA
 5427711 5427712 cce_1058 cce_1059     TRUE 0.627 -3.000 0.033 NA   NA
 5427712 5427713 cce_1059 cce_1060     TRUE 0.562 73.000 0.002 NA   NA
 5427713 5427714 cce_1060 cce_1061     FALSE 0.035 239.000 0.000 NA   NA
 5427715 5427716 cce_1062 cce_1063   hupS FALSE 0.013 308.000 0.000 NA N NA
 5427716 5427717 cce_1063 cce_1064 hupS hupL TRUE 0.977 103.000 0.750 0.001 Y NA
 5427717 5427718 cce_1064 cce_1065 hupL   FALSE 0.334 88.000 0.000 NA   NA
 5427718 5427719 cce_1065 cce_1066     TRUE 0.917 4.000 0.500 NA   NA
 5427720 5427721 cce_1067 cce_1068     FALSE 0.333 45.000 0.000 NA   NA
 5427723 5427724 cce_1070 cce_1071     FALSE 0.125 169.000 0.000 NA   NA
 5427724 5427725 cce_1071 cce_1072   avaIR FALSE 0.169 148.000 0.000 NA   NA
 5427725 5427726 cce_1072 cce_1073 avaIR avaIM FALSE 0.205 -54.000 0.000 NA   NA
 5427726 5427727 cce_1073 cce_1074 avaIM chlD FALSE 0.328 90.000 0.000 NA   NA
 5427727 5427728 cce_1074 cce_1075 chlD   TRUE 0.513 59.000 0.000 1.000   NA
 5427728 5427729 cce_1075 cce_1076     TRUE 0.922 66.000 0.333 1.000   NA
 5427729 5427730 cce_1076 cce_1077     TRUE 0.960 55.000 1.000 NA   NA
 5427731 5427732 cce_1078 cce_1079 ribA   FALSE 0.223 123.000 0.000 NA   NA
 5427732 5427733 cce_1079 cce_1080     FALSE 0.344 14.000 0.000 NA   NA
 5427733 5427734 cce_1080 cce_1081     FALSE 0.049 252.000 0.000 1.000   NA
 5427740 5427741 cce_1087 cce_1088     TRUE 0.846 -13.000 0.333 NA   NA
 5427741 5427742 cce_1088 cce_1089     FALSE 0.328 43.000 0.000 NA   NA
 5427743 5427744 cce_1090 cce_1091     TRUE 0.858 73.000 0.167 NA   NA
 5427745 5427746 cce_1092 cce_RNA018     FALSE 0.006 434.000 0.000 NA   NA
 5427746 5427747 cce_RNA018 cce_RNA019     FALSE 0.333 7.000 0.000 NA   NA
 5427747 5427748 cce_RNA019 cce_1093     FALSE 0.316 37.000 0.000 NA   NA
 5427749 5427750 cce_1094 cce_1095     TRUE 0.891 66.000 0.250 NA   NA
 5427750 5427751 cce_1095 cce_1096     TRUE 0.749 138.000 0.250 NA   NA
 5427752 5427753 cce_1097 cce_1098     FALSE 0.380 73.000 0.000 NA   NA
 5427753 5427754 cce_1098 cce_1099     FALSE 0.348 51.000 0.000 NA   NA
 5427754 5427755 cce_1099 cce_1100     FALSE 0.063 204.000 0.000 NA   NA
 5427755 5427756 cce_1100 cce_1101     FALSE 0.318 38.000 0.000 NA   NA
 5427756 5427757 cce_1101 cce_1102     FALSE 0.385 66.000 0.000 NA   NA
 5427757 5427758 cce_1102 cce_1103     FALSE 0.228 121.000 0.000 NA   NA
 5427758 5427759 cce_1103 cce_1104     FALSE 0.222 -28.000 0.000 NA   NA
 5427759 5427760 cce_1104 cce_1105     FALSE 0.211 128.000 0.000 NA   NA
 5427760 5427761 cce_1105 cce_1106     TRUE 0.624 29.000 0.021 NA   NA
 5427763 5427764 cce_1108 cce_1109     TRUE 0.713 41.000 0.032 1.000   NA
 5427765 5427766 cce_1110 cce_1111     FALSE 0.004 656.000 0.000 NA   NA
 5427766 5427767 cce_1111 cce_1112     FALSE 0.272 106.000 0.000 NA   NA
 5427767 5427768 cce_1112 cce_1113     FALSE 0.020 322.000 0.000 1.000 N NA
 5427770 5427771 cce_1115 cce_1116 exbD exbB1 TRUE 0.979 35.000 0.810 0.029 Y NA
 5427773 5427774 cce_1118 cce_1119     FALSE 0.021 277.000 0.000 NA   NA
 5427777 5427778 cce_1122 cce_1123     FALSE 0.322 28.000 0.000 NA   NA
 5427778 5427779 cce_1123 cce_1124     FALSE 0.385 67.000 0.000 NA   NA
 5427780 5427781 cce_1125 cce_1126 pyrD   FALSE 0.104 202.000 0.000 1.000   NA
 5427781 5427782 cce_1126 cce_1127     TRUE 0.833 -25.000 0.338 NA   NA
 5427784 5427785 cce_1129 cce_1130     FALSE 0.270 107.000 0.000 NA   NA
 5427788 5427789 cce_1133 cce_1134 fadD   TRUE 0.894 35.000 0.388 NA   NA
 5427789 5427790 cce_1134 cce_1135     FALSE 0.228 121.000 0.000 NA   NA
 5427791 5427792 cce_1136 cce_1137 ychF   TRUE 0.573 88.000 0.002 1.000 N NA
 5427792 5427793 cce_1137 cce_1138     TRUE 0.974 64.000 0.400 0.021 Y NA
 5427795 5427796 cce_1140 cce_1141     FALSE 0.360 82.000 0.000 NA   NA
 5427796 5427797 cce_1141 cce_1142     TRUE 0.877 117.000 0.500 NA   NA
 5427800 5427801 cce_1145 cce_1146     FALSE 0.344 13.000 0.000 NA   NA
 5427801 5427802 cce_1146 cce_1147     FALSE 0.343 12.000 0.000 NA   NA
 5427802 5427803 cce_1147 cce_1148     FALSE 0.300 99.000 0.000 NA   NA
 5427805 5427806 cce_1150 cce_1151     FALSE 0.374 57.000 0.000 NA   NA
 5427806 5427807 cce_1151 cce_1152     FALSE 0.331 89.000 0.000 NA   NA
 5427811 5427812 cce_1156 cce_1157     FALSE 0.310 1.000 0.000 NA   NA
 5427812 5427813 cce_1157 cce_1158     FALSE 0.422 99.000 0.000 1.000   NA
 5427813 5427814 cce_1158 cce_1159   exbB3 FALSE 0.053 244.000 0.000 1.000   NA
 5427814 5427815 cce_1159 cce_1160 exbB3   TRUE 0.915 154.000 0.375 0.029 Y NA
 5427815 5427816 cce_1160 cce_1161     TRUE 0.984 10.000 1.000 0.018 Y NA
 5427818 5427819 cce_1163 cce_1164 ptsS3 pstC2 TRUE 0.875 4.000 0.040 1.000 Y NA
 5427819 5427820 cce_1164 cce_1165 pstC2 pstA2 TRUE 0.974 12.000 0.485 0.003 Y NA
 5427820 5427821 cce_1165 cce_1166 pstA2 pstB2 TRUE 0.915 -6.000 0.086 0.003 Y NA
 5427822 5427823 cce_1167 cce_1168     TRUE 0.521 0.000 0.005 NA   NA
 5427825 5427826 cce_1170 cce_1171     TRUE 0.612 39.000 0.017 NA   NA
 5427826 5427827 cce_1171 cce_1172     TRUE 0.717 61.000 0.013 1.000   NA
 5427827 5427828 cce_1172 cce_1173     TRUE 0.830 12.000 0.150 NA   NA
 5427828 5427829 cce_1173 cce_1174   tmk TRUE 0.764 41.000 0.091 NA N NA
 5427829 5427830 cce_1174 cce_1175 tmk   FALSE 0.256 110.000 0.000 NA   NA
 5427830 5427831 cce_1175 cce_1176   ndhB FALSE 0.039 233.000 0.000 NA   NA
 5427833 5427834 cce_1178 cce_1179     FALSE 0.335 8.000 0.000 NA   NA
 5427834 5427835 cce_1179 cce_1180     FALSE 0.384 68.000 0.000 NA   NA
 5427835 5427836 cce_1180 cce_1181     TRUE 0.654 15.000 0.010 1.000 N NA
 5427836 5427837 cce_1181 cce_1182     FALSE 0.412 130.000 0.008 NA   NA
 5427837 5427838 cce_1182 cce_1183     FALSE 0.017 301.000 0.000 NA   NA
 5427840 5427841 cce_1185 cce_1186     TRUE 0.878 -115.000 0.100 0.014 Y NA
 5427841 5427842 cce_1186 cce_1187   cobW TRUE 0.506 76.000 0.000 1.000   NA
 5427842 5427843 cce_1187 cce_1188 cobW   TRUE 0.659 65.000 0.013 NA   NA
 5427843 5427844 cce_1188 cce_1189     FALSE 0.312 96.000 0.000 NA   NA
 5427844 5427845 cce_1189 cce_1190     TRUE 0.648 7.000 0.008 1.000   NA
 5427846 5427847 cce_1191 cce_1192     FALSE 0.016 302.000 0.000 NA   NA
 5427847 5427848 cce_1192 cce_1193     TRUE 0.884 14.000 0.286 NA   NA
 5427848 5427849 cce_1193 cce_1194     TRUE 0.655 -49.000 0.095 NA   NA
 5427849 5427850 cce_1194 cce_1195     TRUE 0.807 3.000 0.143 NA   NA
 5427850 5427851 cce_1195 cce_1196     TRUE 0.871 38.000 0.286 NA   NA
 5427851 5427852 cce_1196 cce_1197     FALSE 0.304 0.000 0.000 NA   NA
 5427852 5427853 cce_1197 cce_1198     TRUE 0.706 155.000 0.250 NA   NA
 5427853 5427854 cce_1198 cce_1199     TRUE 0.939 9.000 0.267 NA Y NA
 11431796 5427852   cce_1197     FALSE NA 2386.000 0.000 NA   NA
 11574159 5427852   cce_1197     FALSE NA 2386.000 0.000 NA   NA
 11716551 5427852   cce_1197     FALSE NA 2386.000 0.000 NA   NA
 11431797 5427852   cce_1197     FALSE NA 2422.000 0.000 NA   NA
 11574160 5427852   cce_1197     FALSE NA 2422.000 0.000 NA   NA
 11716552 5427852   cce_1197     FALSE NA 2422.000 0.000 NA   NA
 11431798 5427852   cce_1197     FALSE NA 2456.000 0.000 NA   NA
 11574161 5427852   cce_1197     FALSE NA 2456.000 0.000 NA   NA
 11716553 5427852   cce_1197     FALSE NA 2456.000 0.000 NA   NA
 11431799 5427852   cce_1197     FALSE NA 2492.000 0.000 NA   NA
 11574162 5427852   cce_1197     FALSE NA 2492.000 0.000 NA   NA
 11716554 5427852   cce_1197     FALSE NA 2492.000 0.000 NA   NA
 11431800 5427852   cce_1197     FALSE NA 2528.000 0.000 NA   NA
 11574163 5427852   cce_1197     FALSE NA 2528.000 0.000 NA   NA
 11716555 5427852   cce_1197     FALSE NA 2528.000 0.000 NA   NA
 11431801 5427852   cce_1197     FALSE NA 2564.000 0.000 NA   NA
 11574164 5427852   cce_1197     FALSE NA 2564.000 0.000 NA   NA
 11716556 5427852   cce_1197     FALSE NA 2564.000 0.000 NA   NA
 11431802 5427852   cce_1197     FALSE NA 2600.000 0.000 NA   NA
 11574165 5427852   cce_1197     FALSE NA 2600.000 0.000 NA   NA
 11716557 5427852   cce_1197     FALSE NA 2600.000 0.000 NA   NA
 11431803 5427852   cce_1197     FALSE NA 2636.000 0.000 NA   NA
 11574166 5427852   cce_1197     FALSE NA 2636.000 0.000 NA   NA
 11716558 5427852   cce_1197     FALSE NA 2636.000 0.000 NA   NA
 11431804 5427852   cce_1197     FALSE NA 2670.000 0.000 NA   NA
 11574167 5427852   cce_1197     FALSE NA 2670.000 0.000 NA   NA
 11716559 5427852   cce_1197     FALSE NA 2670.000 0.000 NA   NA
 11431805 5427852   cce_1197     FALSE NA 2706.000 0.000 NA   NA
 11574168 5427852   cce_1197     FALSE NA 2706.000 0.000 NA   NA
 11716560 5427852   cce_1197     FALSE NA 2706.000 0.000 NA   NA
 11431806 5427852   cce_1197     FALSE NA 2741.000 0.000 NA   NA
 11574169 5427852   cce_1197     FALSE NA 2741.000 0.000 NA   NA
 11716561 5427852   cce_1197     FALSE NA 2741.000 0.000 NA   NA
 5427858 5427859 cce_1203 cce_1204     FALSE 0.466 81.000 0.000 1.000 N NA
 5427860 5427861 cce_1205 cce_1206 tatC   FALSE 0.348 65.000 0.000 NA N NA
 5427862 5427863 cce_1207 cce_1208 sps ruvA TRUE 0.642 12.000 0.005 1.000   NA
 5427863 5427864 cce_1208 cce_1209 ruvA   TRUE 0.519 4.000 0.003 NA   NA
 5427864 5427865 cce_1209 cce_1210   purL TRUE 0.537 44.000 0.004 NA   NA
 5427865 5427866 cce_1210 cce_1211 purL   FALSE 0.230 364.000 0.223 1.000 Y NA
 5427866 5427867 cce_1211 cce_1212     FALSE 0.022 274.000 0.000 NA   NA
 5427868 5427869 cce_1213 cce_1214   narB FALSE 0.414 31.000 0.000 1.000 N NA
 5427869 5427870 cce_1214 cce_1215 narB   FALSE 0.442 124.000 0.009 NA   NA
 5427870 5427871 cce_1215 cce_1216     TRUE 0.901 -19.000 0.667 NA   NA
 5427871 5427872 cce_1216 cce_1217     FALSE 0.369 79.000 0.000 NA   NA
 5427873 5427874 cce_1218 cce_1219     TRUE 0.868 -3.000 0.333 NA   NA
 5427877 5427878 cce_1222 cce_1223 nrtP nirA TRUE 0.685 113.000 0.056 1.000   NA
 5427879 5427880 cce_1224 cce_1225     FALSE 0.289 -3.000 0.000 NA   NA
 5427880 5427881 cce_1225 cce_1226     FALSE 0.170 175.000 0.000 1.000   NA
 5427881 5427882 cce_1226 cce_1227     FALSE 0.103 177.000 0.000 NA   NA
 5427882 5427883 cce_1227 cce_1228     FALSE 0.330 6.000 0.000 NA   NA
 5427883 5427884 cce_1228 cce_1229     FALSE 0.218 -31.000 0.000 NA   NA
 5427885 5427886 cce_1230 cce_1231     TRUE 0.725 174.000 0.467 NA   NA
 5427887 5427888 cce_1232 cce_1233     TRUE 0.982 8.000 0.909 0.092 Y NA
 5427888 5427889 cce_1233 cce_1234     TRUE 0.919 -3.000 0.185 1.000 Y NA
 5427889 5427890 cce_1234 cce_1235   topA1 FALSE 0.018 329.000 0.000 1.000 N NA
 5427892 5427893 cce_1237 cce_1238     FALSE 0.376 76.000 0.000 NA   NA
 5427893 5427894 cce_1238 cce_1239     FALSE 0.358 53.000 0.000 NA   NA
 5427895 5427896 cce_1240 cce_1241 mntB mntA TRUE 0.977 -3.000 0.857 0.092 Y NA
 5427896 5427897 cce_1241 cce_1242 mntA mntC TRUE 0.799 227.000 0.894 1.000 Y NA
 5427897 5427898 cce_1242 cce_1243 mntC   FALSE 0.162 152.000 0.000 NA   NA
 5427898 5427899 cce_1243 cce_1244     FALSE 0.069 196.000 0.000 NA   NA
 5427899 5427900 cce_1244 cce_1245     FALSE 0.020 332.000 0.000 1.000   NA
 5427901 5427902 cce_1246 cce_1247     FALSE 0.006 772.000 0.000 1.000   NA
 5427903 5427904 cce_1248 cce_1249     FALSE 0.230 120.000 0.000 NA   NA
 5427904 5427905 cce_1249 cce_1250     FALSE 0.276 105.000 0.000 NA   NA
 5427905 5427906 cce_1250 cce_1251     TRUE 0.857 12.000 0.214 NA   NA
 5427906 5427907 cce_1251 cce_1252     FALSE 0.374 57.000 0.000 NA   NA
 5427907 5427908 cce_1252 cce_1253     FALSE 0.149 158.000 0.000 NA   NA
 5427908 5427909 cce_1253 cce_1254     FALSE 0.343 15.000 0.000 NA   NA
 5427910 5427911 cce_1255 cce_1256     FALSE 0.008 390.000 0.000 NA   NA
 5427911 5427912 cce_1256 cce_1257     FALSE 0.051 217.000 0.000 NA   NA
 5427914 5427915 cce_1259 cce_1260     FALSE 0.073 193.000 0.000 NA   NA
 5427916 5427917 cce_1261 cce_1262     FALSE 0.358 53.000 0.000 NA   NA
 5427917 5427918 cce_1262 cce_1263     FALSE 0.227 -25.000 0.000 NA   NA
 5427920 5427921 cce_1265 cce_1266   glmS FALSE 0.272 106.000 0.000 NA   NA
 5427921 5427922 cce_1266 cce_1267 glmS   FALSE 0.007 663.000 0.000 1.000   NA
 5427922 5427923 cce_1267 cce_1268   nth TRUE 0.610 22.000 0.003 1.000   NA
 5427925 5427926 cce_1270 cce_1271 ftsH1   FALSE 0.385 62.000 0.000 NA   NA
 5427927 5427928 cce_1272 cce_1273   purK TRUE 0.628 61.000 0.007 NA   NA
 5427928 5427929 cce_1273 cce_1274 purK   TRUE 0.789 -10.000 0.005 1.000 Y NA
 5427931 5427932 cce_1276 cce_1277     FALSE 0.019 341.000 0.000 1.000   NA
 5427932 5427933 cce_1277 cce_1278     TRUE 0.491 147.000 0.043 NA   NA
 5427935 5427936 cce_1280 cce_1281   dpm1 TRUE 0.914 82.000 0.400 NA   NA
 5427937 5427938 cce_1282 cce_1283     FALSE 0.374 77.000 0.000 NA   NA
 5427942 5427943 cce_1287 cce_1288     FALSE 0.290 134.000 0.000 1.000   NA
 5427943 5427944 cce_1288 cce_1289   psaJ FALSE 0.011 432.000 0.000 1.000   NA
 5427944 5427945 cce_1289 cce_1290 psaJ psaF TRUE 0.935 56.000 0.318 0.013   NA
 5427945 5427946 cce_1290 cce_1291 psaF   FALSE 0.045 225.000 0.000 NA   NA
 5427948 5427949 cce_1292 cce_1293     TRUE 0.881 26.000 0.308 NA   NA
 5427949 5427950 cce_1293 cce_1294     FALSE 0.004 638.000 0.000 NA   NA
 5427951 5427952 cce_1295 cce_1296   bcp FALSE 0.061 205.000 0.000 NA   NA
 5427953 5427954 cce_1297 cce_1298     TRUE 0.764 27.000 0.058 1.000   NA
 5427954 5427955 cce_1298 cce_1299   dnaJ1 TRUE 0.878 -3.000 0.067 1.000 Y NA
 5427957 5427958 cce_1301 cce_1302     FALSE 0.004 631.000 0.000 NA   NA
 5427958 5427959 cce_1302 cce_1303   psbJ TRUE 0.510 147.000 0.049 NA   NA
 5427959 5427960 cce_1303 cce_1304 psbJ psbL TRUE 0.965 36.000 0.878 0.002   NA
 5427960 5427961 cce_1304 cce_1305 psbL psbF TRUE 0.968 11.000 0.872 0.002   NA
 5427961 5427962 cce_1305 cce_1306 psbF   FALSE 0.333 22.000 0.000 NA   NA
 5427962 5427963 cce_1306 cce_1307   psbE FALSE 0.201 -112.000 0.000 NA   NA
 5427963 5427964 cce_1307 cce_1308 psbE   TRUE 0.935 85.000 0.625 NA   NA
 5427964 5427965 cce_1308 cce_1309   rub1 TRUE 0.932 83.000 0.521 NA   NA
 5427965 5427966 cce_1309 cce_1310 rub1 gldA FALSE 0.084 385.000 0.000 0.009 Y NA
 5427966 5427967 cce_1310 cce_1311 gldA   TRUE 0.743 70.000 0.026 1.000 N NA
 5427967 5427968 cce_1311 cce_1312     FALSE 0.031 245.000 0.000 NA   NA
 5427968 5427969 cce_1312 cce_1313   isiB2 TRUE 0.803 116.000 0.250 NA   NA
 5427969 5427970 cce_1313 cce_1314 isiB2 ftsZ FALSE 0.018 336.000 0.000 1.000 N NA
 5427970 5427971 cce_1314 cce_1315 ftsZ   FALSE 0.013 319.000 0.000 NA   NA
 5427972 5427973 cce_1316 cce_1317   ispE TRUE 0.805 60.000 0.080 NA   NA
 5427974 5427975 cce_1318 cce_1319 pheS   FALSE 0.321 125.000 0.000 1.000   NA
 5427975 5427976 cce_1319 cce_1320     FALSE 0.128 168.000 0.000 NA   NA
 5427977 5427978 cce_1321 cce_1322 pheT   FALSE 0.244 171.000 0.004 NA   NA
 5427980 5427981 cce_1324 cce_1325     FALSE 0.080 188.000 0.000 NA   NA
 5427981 5427982 cce_1325 cce_1326     FALSE 0.026 259.000 0.000 NA   NA
 5427982 5427983 cce_1326 cce_1327     FALSE 0.327 5.000 0.000 NA   NA
 5427984 5427985 cce_1328 cce_1329 hflX   FALSE 0.178 142.000 0.000 NA   NA
 5427987 5427988 cce_1331 cce_1332 nagB   TRUE 0.865 32.000 0.273 NA   NA
 5427988 5427989 cce_1332 cce_1333     TRUE 0.537 159.000 0.083 NA   NA
 5427990 5427991 cce_1334 cce_1335     FALSE 0.238 116.000 0.000 NA   NA
 5427991 5427992 cce_1335 cce_1336     FALSE 0.330 6.000 0.000 NA   NA
 5427993 5427994 cce_1337 cce_1338 pmgA   FALSE 0.058 233.000 0.000 1.000 N NA
 5427994 5427995 cce_1338 cce_1339     TRUE 0.691 31.000 0.047 NA   NA
 5427995 5427996 cce_1339 cce_1340   trpE1 TRUE 0.598 55.000 0.006 NA   NA
 5427996 5427997 cce_1340 cce_1341 trpE1 psaD FALSE 0.381 198.000 0.091 1.000   NA
 5427997 5427998 cce_1341 cce_1342 psaD   FALSE 0.217 125.000 0.000 NA   NA
 5427999 5428000 cce_1343 cce_1344 groES groEL1 TRUE 0.985 76.000 0.905 0.091 Y NA
 5428000 5428001 cce_1344 cce_1345 groEL1   FALSE 0.318 118.000 0.000 1.000 N NA
 5428002 5428003 cce_1346 cce_1347     FALSE 0.155 155.000 0.000 NA   NA
 5428005 5428006 cce_1349 cce_1350 uppS2   TRUE 0.654 -3.000 0.043 NA   NA
 5428006 5428007 cce_1350 cce_1351   lysA TRUE 0.690 44.000 0.040 NA   NA
 5428007 5428008 cce_1351 cce_1352 lysA   FALSE 0.018 293.000 0.000 NA   NA
 5428008 5428009 cce_1352 cce_1353     TRUE 0.783 61.000 0.062 NA   NA
 5428011 5428012 cce_1355 cce_1356 dnaJ3 dnaK3 TRUE 0.975 64.000 0.390 0.004 Y NA
 5428017 5428018 cce_1361 cce_1362     TRUE 0.825 4.000 0.167 NA   NA
 5428019 5428020 cce_1363 cce_1364     TRUE 0.814 125.000 0.254 1.000   NA
 5428020 5428021 cce_1364 cce_1365     TRUE 0.614 110.000 0.043 NA   NA
 5428021 5428022 cce_1365 cce_1366   rnpA TRUE 0.562 -28.000 0.041 NA   NA
 5428022 5428023 cce_1366 cce_1367 rnpA rpl34 TRUE 0.947 38.000 0.787 1.000   NA
 5428023 5428024 cce_1367 cce_1368 rpl34   FALSE 0.464 101.000 0.002 NA   NA
 5428026 5428027 cce_1370 cce_1371     TRUE 0.947 15.000 0.800 NA   NA
 5428027 5428028 cce_1371 cce_1372     TRUE 0.645 121.000 0.071 NA   NA
 5428029 5428030 cce_1373 cce_1374     FALSE 0.340 134.000 0.003 NA   NA
 5428030 5428031 cce_1374 cce_1375     FALSE 0.015 308.000 0.000 NA   NA
 5428031 5428032 cce_1375 cce_1376   tal FALSE 0.065 201.000 0.000 NA   NA
 5428033 5428034 cce_1377 cce_1378 dcoH1   FALSE 0.386 64.000 0.000 NA   NA
 5428035 5428036 cce_1379 cce_1380 exsB   FALSE 0.016 302.000 0.000 NA   NA
 5428037 5428038 cce_1381 cce_1382     TRUE 0.578 97.000 0.013 NA   NA
 5428039 5428040 cce_1383 cce_1384 petB petD TRUE 0.884 134.000 0.471 0.079   NA
 5428041 5428042 cce_1385 cce_1386     FALSE 0.057 210.000 0.000 NA   NA
 5428042 5428043 cce_1386 cce_1387     TRUE 0.893 -16.000 0.202 NA Y NA
 5428043 5428044 cce_1387 cce_1388   hrcA FALSE 0.418 114.000 0.004 NA N NA
 5428044 5428045 cce_1388 cce_1389 hrcA   TRUE 0.661 49.000 0.031 NA N NA
 5428046 5428047 cce_1390 cce_1391   rpl21 FALSE 0.306 143.000 0.002 NA   NA
 5428047 5428048 cce_1391 cce_1392 rpl21 rpl27 TRUE 0.978 40.000 0.667 0.012 Y NA
 5428049 5428050 cce_1393 cce_1394     TRUE 0.912 12.000 0.417 NA   NA
 5428050 5428051 cce_1394 cce_1395     TRUE 0.788 22.000 0.100 NA   NA
 5428051 5428052 cce_1395 cce_1396     FALSE 0.048 221.000 0.000 NA   NA
 5428053 5428054 cce_1397 cce_1398     TRUE 0.777 0.000 0.087 1.000 N NA
 5428055 5428056 cce_1399 cce_1400     FALSE 0.289 -3.000 0.000 NA   NA
 5428059 5428060 cce_1403 cce_1404     FALSE 0.484 83.000 0.000 1.000   NA
 5428061 5428062 cce_1405 cce_1406     FALSE 0.290 134.000 0.000 1.000   NA
 5428062 5428063 cce_1406 cce_1407     TRUE 0.878 48.000 0.280 NA   NA
 5428063 5428064 cce_1407 cce_1408     TRUE 0.841 91.000 0.200 NA   NA
 5428065 5428066 cce_1409 cce_1410     TRUE 0.885 78.000 0.250 NA   NA
 5428067 5428068 cce_1411 cce_1412     TRUE 0.874 -13.000 0.091 1.000 Y NA
 5428068 5428069 cce_1412 cce_1413     FALSE 0.332 307.000 0.227 1.000 Y NA
 5428069 5428070 cce_1413 cce_1414     FALSE 0.005 505.000 0.000 NA   NA
 5428070 5428071 cce_1414 cce_1415     TRUE 0.802 122.000 0.273 NA   NA
 5428071 5428072 cce_1415 cce_1416     FALSE 0.284 103.000 0.000 NA   NA
 5428074 5428075 cce_RNA021 cce_1418     FALSE 0.354 52.000 0.000 NA   NA
 5428075 5428076 cce_1418 cce_1419     FALSE 0.030 247.000 0.000 NA   NA
 5428077 5428078 cce_1420 cce_1421     FALSE 0.313 33.000 0.000 NA   NA
 5428079 5428080 cce_1422 cce_1423     TRUE 0.761 4.000 0.083 NA   NA
 5428083 5428084 cce_1426 cce_1427     TRUE 0.583 39.000 0.012 NA   NA
 5428084 5428085 cce_1427 cce_RNA022     FALSE 0.326 42.000 0.000 NA   NA
 5428085 5428086 cce_RNA022 cce_1428     FALSE 0.004 716.000 0.000 NA   NA
 5428087 5428088 cce_1429 cce_1430     FALSE 0.431 176.000 0.051 1.000   NA
 5428089 5428090 cce_1431 cce_1432     FALSE 0.005 571.000 0.000 NA   NA
 5428093 5428094 cce_1435 cce_1436     FALSE 0.329 25.000 0.000 NA   NA
 5428096 5428097 cce_1438 cce_1439     FALSE 0.344 13.000 0.000 NA   NA
 5428098 5428099 cce_1440 cce_1441     FALSE 0.228 121.000 0.000 NA   NA
 5428100 5428101 cce_1442 cce_1443     FALSE 0.068 197.000 0.000 NA   NA
 5428102 5428103 cce_1444 cce_1445     FALSE 0.106 176.000 0.000 NA   NA
 5428104 5428105 cce_1446 cce_1447     FALSE 0.343 15.000 0.000 NA   NA
 5428105 5428106 cce_1447 cce_1448     FALSE 0.314 35.000 0.000 NA   NA
 5428108 5428109 cce_1450 cce_1451     FALSE 0.331 24.000 0.000 NA   NA
 5428110 5428111 cce_1452 cce_1453     FALSE 0.218 -31.000 0.000 NA   NA
 5428112 5428113 cce_RNA023 cce_1454     FALSE 0.328 90.000 0.000 NA   NA
 5428114 5428115 cce_1455 cce_1456 thrC1   FALSE 0.010 419.000 0.000 1.000 N NA
 5428115 5428116 cce_1456 cce_1457     TRUE 0.983 95.000 1.000 0.007 Y NA
 5428116 5428117 cce_1457 cce_1458     FALSE 0.301 234.000 0.000 0.007 Y NA
 5428117 5428118 cce_1458 cce_1459     FALSE 0.249 112.000 0.000 NA   NA
 5428119 5428120 cce_1460 cce_1461     FALSE 0.344 13.000 0.000 NA   NA
 5428120 5428121 cce_1461 cce_1462     TRUE 0.945 9.000 0.790 NA   NA
 5428121 5428122 cce_1462 cce_1463     TRUE 0.944 22.000 0.790 NA   NA
 5428125 5428126 cce_1466 cce_1467     FALSE 0.082 212.000 0.000 1.000 N NA
 5428126 5428127 cce_1467 cce_1468     TRUE 0.877 82.000 0.118 0.077 N NA
 5428129 5428130 cce_1470 cce_1471     TRUE 0.974 64.000 0.414 0.089 Y NA
 5428131 5428132 cce_1472 cce_1473   cysK TRUE 0.928 41.000 0.500 1.000   NA
 5428132 5428133 cce_1473 cce_1474 cysK malQ FALSE 0.102 196.000 0.000 1.000 N NA
 5428133 5428134 cce_1474 cce_1475 malQ   FALSE 0.031 245.000 0.000 NA   NA
 5428134 5428135 cce_1475 cce_1476     FALSE 0.182 140.000 0.000 NA   NA
 5428135 5428136 cce_1476 cce_1477     TRUE 0.862 99.000 0.286 NA   NA
 5428136 5428137 cce_1477 cce_1478     TRUE 0.836 67.000 0.118 NA   NA
 5428139 5428140 cce_RNA024 cce_1480     FALSE 0.354 52.000 0.000 NA   NA
 5428142 5428143 cce_1482 cce_1483     TRUE 0.565 149.000 0.077 NA   NA
 5428143 5428144 cce_1483 cce_1484     FALSE 0.038 263.000 0.000 1.000 N NA
 5428145 5428146 cce_1485 cce_1486     TRUE 0.973 33.000 0.600 0.089 Y NA
 5428147 5428148 cce_1487 cce_1488     FALSE 0.257 -12.000 0.000 NA   NA
 5428148 5428149 cce_1488 cce_1489   hemB3 FALSE 0.479 84.000 0.000 1.000   NA
 5428149 5428150 cce_1489 cce_1490 hemB3   FALSE 0.221 124.000 0.000 NA   NA
 5428150 5428151 cce_1490 cce_1491     FALSE 0.338 18.000 0.000 NA   NA
 5428151 5428152 cce_1491 cce_1492     FALSE 0.382 72.000 0.000 NA   NA
 5428152 5428153 cce_1492 cce_1493     TRUE 0.906 19.000 0.400 NA   NA
 5428153 5428154 cce_1493 cce_1494     TRUE 0.928 -3.000 0.750 NA   NA
 5428154 5428155 cce_1494 cce_1495   thrS2 FALSE 0.372 78.000 0.000 NA   NA
 5428156 5428157 cce_1496 cce_1497     TRUE 0.865 111.000 0.400 NA   NA
 5428158 5428159 cce_1498 cce_1499     FALSE 0.232 119.000 0.000 NA   NA
 5428159 5428160 cce_1499 cce_1500     FALSE 0.172 146.000 0.000 NA   NA
 5428160 5428161 cce_1500 cce_1501   folE2 TRUE 0.942 69.000 0.600 NA   NA
 5428161 5428162 cce_1501 cce_1502 folE2   FALSE 0.233 -22.000 0.000 NA   NA
 5428162 5428163 cce_1502 cce_1503   atpA2 FALSE 0.341 11.000 0.000 NA   NA
 5428163 5428164 cce_1503 cce_1504 atpA2   FALSE 0.308 15.000 0.000 NA N NA
 5428164 5428165 cce_1504 cce_1505     FALSE 0.270 -7.000 0.000 NA   NA
 5428165 5428166 cce_1505 cce_1506     FALSE 0.333 23.000 0.000 NA   NA
 5428166 5428167 cce_1506 cce_1507     TRUE 0.980 4.000 0.767 0.004 Y NA
 5428167 5428168 cce_1507 cce_1508     TRUE 0.982 39.000 0.900 0.004 Y NA
 5428168 5428169 cce_1508 cce_1509     TRUE 0.951 78.000 0.767 NA   NA
 5428169 5428170 cce_1509 cce_1510     TRUE 0.715 177.000 0.491 NA   NA
 5428170 5428171 cce_1510 cce_1511     TRUE 0.911 -13.000 0.671 NA   NA
 5428171 5428172 cce_1511 cce_1512   atpB2 TRUE 0.961 -10.000 0.443 0.004 Y NA
 5428172 5428173 cce_1512 cce_1513 atpB2   FALSE 0.009 372.000 0.000 NA   NA
 5428176 5428177 cce_1516 cce_1517     TRUE 0.944 -3.000 1.000 NA   NA
 5428177 5428178 cce_1517 cce_1518     TRUE 0.896 -7.000 0.500 NA   NA
 5428180 5428181 cce_1520 cce_1521     TRUE 0.702 244.000 0.500 0.020 Y NA
 5428181 5428182 cce_1521 cce_1522   ggt2 FALSE 0.035 270.000 0.000 1.000 N NA
 5428183 5428184 cce_1523 cce_1524     TRUE 0.905 3.000 0.433 NA   NA
 5428185 5428186 cce_1525 cce_1526 yrdA psbY TRUE 0.851 66.000 0.103 1.000   NA
 5428186 5428187 cce_1526 cce_1527 psbY pyrF FALSE 0.249 182.000 0.005 1.000   NA
 5428187 5428188 cce_1527 cce_1528 pyrF   FALSE 0.465 -49.000 0.017 NA   NA
 5428188 5428189 cce_1528 cce_1529     FALSE 0.344 13.000 0.000 NA   NA
 5428189 5428190 cce_1529 cce_1530     TRUE 0.852 57.000 0.161 NA   NA
 5428190 5428191 cce_1530 cce_1531   cbiQ3 TRUE 0.819 -13.000 0.204 1.000   NA
 5428193 5428194 cce_1533 cce_1534 pgsA   TRUE 0.590 26.000 0.003 1.000 N NA
 5428194 5428195 cce_1534 cce_1535     FALSE 0.034 272.000 0.000 1.000 N NA
 5428195 5428196 cce_1535 cce_1536     TRUE 0.857 13.000 0.212 NA   NA
 5428196 5428197 cce_1536 cce_1537     FALSE 0.034 240.000 0.000 NA   NA
 5428198 5428199 cce_1538 cce_1539     TRUE 0.896 8.000 0.353 NA   NA
 5428199 5428200 cce_1539 cce_1540     FALSE 0.215 126.000 0.000 NA   NA
 5428201 5428202 cce_1541 cce_1542   gpmA FALSE 0.338 18.000 0.000 NA   NA
 5428204 5428205 cce_1544 cce_1545     FALSE 0.383 59.000 0.000 NA   NA
 5428205 5428206 cce_1545 cce_1546     TRUE 0.634 93.000 0.023 NA   NA
 5428206 5428207 cce_1546 cce_RNA025     FALSE 0.379 74.000 0.000 NA   NA
 5428207 10702204 cce_RNA025 cce_6001     FALSE 0.342 16.000 0.000 NA   NA
 5428208 5428209 cce_1547 cce_1548     TRUE 0.675 123.000 0.095 NA   NA
 5428209 5428210 cce_1548 cce_1549     FALSE 0.386 63.000 0.000 NA   NA
 5428210 5428211 cce_1549 cce_1550     FALSE 0.316 3.000 0.000 NA   NA
 5428212 5428213 cce_1551 cce_1552     FALSE 0.006 448.000 0.000 NA   NA
 5428213 5428214 cce_1552 cce_1553     FALSE 0.289 -3.000 0.000 NA   NA
 5428214 5428215 cce_1553 cce_1554     FALSE 0.327 5.000 0.000 NA   NA
 5428217 5428218 cce_1556 cce_1557     FALSE 0.184 139.000 0.000 NA   NA
 5428219 5428220 cce_1558 cce_1559     TRUE 0.507 127.000 0.010 1.000   NA
 5428220 5428221 cce_1559 cce_1560     FALSE 0.031 281.000 0.000 1.000 N NA
 5428222 5428223 cce_1561 cce_1562 dnaG   FALSE 0.487 96.000 0.002 NA   NA
 5428224 5428225 cce_1563 cce_1564     FALSE 0.015 311.000 0.000 NA   NA
 5428227 5428228 cce_1566 cce_1567     FALSE 0.339 10.000 0.000 NA   NA
 5428228 5428229 cce_1567 cce_1568     TRUE 0.748 11.000 0.062 NA   NA
 5428229 5428230 cce_1568 cce_1569   sqdX FALSE 0.324 176.000 0.031 NA   NA
 5428231 5428232 cce_1570 cce_1571 surE1   TRUE 0.722 59.000 0.034 NA   NA
 5428232 5428233 cce_1571 cce_1572     FALSE 0.013 320.000 0.000 NA   NA
 5428233 5428234 cce_1572 cce_1573     TRUE 0.863 151.000 0.750 NA   NA
 5428234 5428235 cce_1573 cce_1574     TRUE 0.950 95.000 1.000 NA   NA
 5428235 5428236 cce_1574 cce_1575     TRUE 0.941 23.000 0.750 NA   NA
 5428236 5428237 cce_1575 cce_1576     TRUE 0.940 6.000 0.750 NA   NA
 5428237 5428238 cce_1576 cce_1577     FALSE 0.006 477.000 0.000 NA   NA
 5428238 5428239 cce_1577 cce_1578   pilM FALSE 0.051 217.000 0.000 NA   NA
 5428239 5428240 cce_1578 cce_1579 pilM   TRUE 0.890 4.000 0.087 NA Y NA
 5428240 5428241 cce_1579 cce_1580     TRUE 0.930 -3.000 0.760 NA   NA
 5428241 5428242 cce_1580 cce_1581   gspD TRUE 0.866 87.000 0.240 NA   NA
 5428242 5428243 cce_1581 cce_1582 gspD   TRUE 0.773 75.000 0.040 1.000   NA
 5428244 5428245 cce_RNA026 cce_1583   fabD FALSE 0.316 37.000 0.000 NA   NA
 5428245 5428246 cce_1583 cce_1584 fabD fabH TRUE 0.901 44.000 0.019 0.003 Y NA
 5428246 5428247 cce_1584 cce_1585 fabH plsX TRUE 0.975 69.000 0.380 0.003 Y NA
 5428248 5428249 cce_1586 cce_1587 map1 dnaJ2 FALSE 0.283 196.000 0.039 1.000 N NA
 5428250 5428251 cce_1588 cce_1589     FALSE 0.345 59.000 0.000 NA N NA
 5428251 5428252 cce_1589 cce_1590     FALSE 0.215 126.000 0.000 NA   NA
 5428253 5428254 cce_1591 cce_1592     TRUE 0.893 43.000 0.286 1.000   NA
 5428254 5428255 cce_1592 cce_1593     TRUE 0.892 -3.000 0.429 NA   NA
 5428257 5428258 cce_1595 cce_1596 putA   FALSE 0.342 16.000 0.000 NA   NA
 5428259 5428260 cce_1597 cce_1598   moaB2 FALSE 0.461 20.000 0.000 1.000   NA
 5428260 5428261 cce_1598 cce_1599 moaB2 psb28 TRUE 0.584 125.000 0.029 1.000   NA
 5428263 5428264 cce_1601 cce_1602     FALSE 0.458 138.000 0.008 1.000   NA
 5428264 5428265 cce_1602 cce_1603   glgP3 TRUE 0.515 67.000 0.000 1.000   NA
 5428266 5428267 cce_1604 cce_1605 pykF3 menE FALSE 0.022 312.000 0.000 1.000 N NA
 5428268 5428269 cce_1606 cce_1607 petF4 petF3 TRUE 0.911 102.000 0.059 0.002 Y NA
 5428271 5428272 cce_1609 cce_1610     TRUE 0.721 15.000 0.048 NA   NA
 5428272 5428273 cce_1610 cce_1611     TRUE 0.525 132.000 0.040 NA   NA
 5428274 5428275 cce_1612 cce_1613     TRUE 0.722 3.000 0.060 NA   NA
 5428275 5428276 cce_1613 cce_1614   ilvE TRUE 0.772 86.000 0.054 1.000   NA
 5428276 5428277 cce_1614 cce_1615 ilvE   FALSE 0.020 270.000 0.000 NA N NA
 5428279 5428280 cce_1617 cce_1618   cobM FALSE 0.403 -76.000 0.007 NA   NA
 5428281 5428282 cce_1619 cce_1620 cysQ sodB TRUE 0.738 126.000 0.004 1.000 Y NA
 5428284 5428285 cce_1622 cce_1623   nusB FALSE 0.186 138.000 0.000 NA   NA
 5428285 5428286 cce_1623 cce_1624 nusB   TRUE 0.556 115.000 0.029 NA   NA
 5428286 5428287 cce_1624 cce_1625     FALSE 0.022 275.000 0.000 NA   NA
 5428288 5428289 cce_1626 cce_1627     FALSE 0.040 268.000 0.000 1.000   NA
 5428289 5428290 cce_1627 cce_1628     FALSE 0.162 152.000 0.000 NA   NA
 5428294 5428295 cce_1632 cce_1633     TRUE 0.810 12.000 0.118 NA   NA
 5428295 5428296 cce_1633 cce_1634     TRUE 0.804 96.000 0.143 NA   NA
 5428296 5428297 cce_1634 cce_1635   cbiJ TRUE 0.635 8.000 0.019 NA   NA
 5428297 5428298 cce_1635 cce_1636 cbiJ   TRUE 0.621 4.000 0.019 NA   NA
 5428298 5428299 cce_1636 cce_1637     FALSE 0.006 478.000 0.000 NA   NA
 5428299 5428300 cce_1637 cce_1638     FALSE 0.289 -3.000 0.000 NA   NA
 5428302 5428303 cce_1640 cce_1641 nrdB1   FALSE 0.324 41.000 0.000 NA   NA
 5428303 5428304 cce_1641 cce_1642     FALSE 0.307 97.000 0.000 NA   NA
 5428304 5428305 cce_1642 cce_1643     TRUE 0.490 54.000 0.000 1.000   NA
 5428310 5428311 cce_1648 cce_1649     TRUE 0.867 105.000 0.353 NA   NA
 5428312 5428313 cce_1650 cce_1651     FALSE 0.006 447.000 0.000 NA   NA
 5428313 5428314 cce_1651 cce_1652     FALSE 0.226 122.000 0.000 NA   NA
 5428317 5428318 cce_1655 cce_1656     FALSE 0.239 -19.000 0.000 NA   NA
 5428318 5428319 cce_1656 cce_1657     FALSE 0.087 184.000 0.000 NA   NA
 5428319 5428320 cce_1657 cce_1658     FALSE 0.354 52.000 0.000 NA   NA
 5428320 5428321 cce_1658 cce_1659   hemB2 FALSE 0.280 104.000 0.000 NA   NA
 5428324 5428325 cce_1661 cce_1662     TRUE 0.598 96.000 0.016 NA   NA
 5428326 5428327 cce_1663 cce_1664     TRUE 0.907 57.000 0.333 NA   NA
 5428328 5428329 cce_1665 cce_1666 petF1   FALSE 0.010 461.000 0.000 1.000   NA
 5428329 5428330 cce_1666 cce_1667     FALSE 0.004 636.000 0.000 NA   NA
 5428331 5428332 cce_1668 cce_1669 tldD   TRUE 0.615 57.000 0.007 NA   NA
 5428335 5428336 cce_1672 cce_1673     FALSE 0.038 271.000 0.000 1.000   NA
 5428337 5428338 cce_1674 cce_1675 gatB   FALSE 0.004 681.000 0.000 NA   NA
 5428338 5428339 cce_1675 cce_1676     FALSE 0.034 240.000 0.000 NA   NA
 5428339 5428340 cce_1676 cce_1677     TRUE 0.813 11.000 0.122 NA   NA
 5428341 5428342 cce_1678 cce_1679     FALSE 0.022 275.000 0.000 NA   NA
 5428343 5428344 cce_1680 cce_1681     TRUE 0.949 -3.000 0.489 NA Y NA
 5428344 5428345 cce_1681 cce_1682     TRUE 0.926 30.000 0.605 NA   NA
 5428345 5428346 cce_1682 cce_1683     TRUE 0.924 33.000 0.605 NA   NA
 5428346 5428347 cce_1683 cce_1684     TRUE 0.939 -3.000 0.913 NA   NA
 5428347 5428348 cce_1684 cce_1685     TRUE 0.902 28.000 0.404 NA   NA
 5428348 5428349 cce_1685 cce_1686     TRUE 0.969 57.000 0.306 0.007 Y NA
 5428349 5428350 cce_1686 cce_1687     TRUE 0.702 85.000 0.019 1.000   NA
 5428350 5428351 cce_1687 cce_1688     TRUE 0.821 85.000 0.046 0.040   NA
 5428351 5428352 cce_1688 cce_1689     TRUE 0.972 74.000 0.375 0.040 Y NA
 5428352 5428353 cce_1689 cce_1690   ndhD5 FALSE 0.007 570.000 0.000 1.000 N NA
 5428353 5428354 cce_1690 cce_1691 ndhD5   FALSE 0.253 -13.000 0.000 NA   NA
 5428355 5428356 cce_1692 cce_1693 ndhF4 ndhD4 TRUE 0.967 132.000 0.875 0.003 Y NA
 5428357 5428358 cce_1694 cce_1695     TRUE 0.966 11.000 0.500 1.000 Y NA
 5428359 5428360 cce_1696 cce_1697     TRUE 0.936 51.000 0.625 NA   NA
 5428360 5428361 cce_1697 cce_1698     FALSE 0.228 121.000 0.000 NA   NA
 5428361 5428362 cce_1698 cce_1699     TRUE 0.818 83.000 0.118 NA   NA
 5428362 5428363 cce_1699 cce_1700     TRUE 0.751 37.000 0.059 1.000 N NA
 5428363 5428364 cce_1700 cce_1701     TRUE 0.840 26.000 0.196 NA   NA
 5428364 5428365 cce_1701 cce_1702     FALSE 0.004 593.000 0.000 NA   NA
 5428365 5428366 cce_1702 cce_1703     FALSE 0.270 -7.000 0.000 NA   NA
 5428368 5428369 cce_1705 cce_1706     TRUE 0.865 -19.000 0.429 NA   NA
 5428370 5428371 cce_1707 cce_1708     TRUE 0.847 51.000 0.182 NA   NA
 5428371 5428372 cce_1708 cce_1709     FALSE 0.480 76.000 0.000 1.000 N NA
 5428372 5428373 cce_1709 cce_1710   gatA TRUE 0.541 109.000 0.006 1.000 N NA
 5428374 5428375 cce_1711 cce_1712     FALSE 0.342 86.000 0.000 NA   NA
 5428376 5428377 cce_1713 cce_1714     FALSE 0.166 150.000 0.000 NA   NA
 5428377 5428378 cce_1714 cce_1715     FALSE 0.343 50.000 0.000 NA   NA
 5428382 5428383 cce_1719 cce_1720     FALSE 0.018 345.000 0.000 1.000   NA
 5428387 5428388 cce_1724 cce_1725     FALSE 0.442 94.000 0.000 1.000   NA
 5428390 5428391 cce_1727 cce_1728     FALSE 0.077 190.000 0.000 NA   NA
 5428391 5428392 cce_1728 cce_1729     FALSE 0.409 102.000 0.000 1.000   NA
 5428392 5428393 cce_1729 cce_1730   rfbC TRUE 0.833 9.000 0.118 1.000   NA
 5428393 5428394 cce_1730 cce_1731 rfbC   TRUE 0.630 29.000 0.027 NA N NA
 5428395 5428396 cce_1732 cce_1733     FALSE 0.483 -48.000 0.021 NA   NA
 5428396 5428397 cce_1733 cce_1734     FALSE 0.384 68.000 0.000 NA   NA
 5428397 5428398 cce_1734 cce_1735     FALSE 0.103 177.000 0.000 NA   NA
 5428400 5428401 cce_1737 cce_1738     TRUE 0.918 91.000 0.312 0.075   NA
 5428401 5428402 cce_1738 cce_1739     TRUE 0.756 108.000 0.125 NA   NA
 5428402 5428403 cce_1739 cce_1740     FALSE 0.261 -10.000 0.000 NA   NA
 5428403 5428404 cce_1740 cce_1741     TRUE 0.921 21.000 0.500 NA   NA
 5428404 5428405 cce_1741 cce_1742     FALSE 0.329 25.000 0.000 NA   NA
 5428406 5428407 cce_1743 cce_1744   cobD TRUE 0.494 155.000 0.039 1.000 N NA
 5428407 5428408 cce_1744 cce_1745 cobD   TRUE 0.667 -16.000 0.052 1.000 N NA
 5428409 5428410 cce_1746 cce_1747   psaC FALSE 0.057 210.000 0.000 NA   NA
 5428410 5428411 cce_1747 cce_1748 psaC   FALSE 0.385 180.000 0.043 1.000   NA
 5428412 5428413 cce_1749 cce_1750     TRUE 0.644 131.000 0.093 NA   NA
 5428413 5428414 cce_1750 cce_1751   sasA TRUE 0.783 89.000 0.098 NA   NA
 5428416 5428417 cce_1753 cce_1754   pth TRUE 0.716 35.000 0.005 0.018   NA
 5428421 5428422 cce_1758 cce_1759 gltX kpsM FALSE 0.024 254.000 0.000 NA N NA
 5428423 5428424 cce_1760 cce_1761     TRUE 0.562 -16.000 0.012 1.000   NA
 5428425 5428426 cce_1762 cce_1763 ndhJ ndhK TRUE 0.968 2.000 0.406 0.003 Y NA
 5428426 5428427 cce_1763 cce_1764 ndhK ndhC TRUE 0.974 52.000 0.428 0.003 Y NA
 5428429 5428430 cce_1766 cce_1767     TRUE 0.642 48.000 0.020 NA   NA
 5428430 5428431 cce_1767 cce_1768     TRUE 0.702 114.000 0.028 0.060   NA
 5428435 5428436 cce_1772 cce_1773 aspA   TRUE 0.519 37.000 0.004 NA   NA
 5428436 5428437 cce_1773 cce_1774   birA TRUE 0.518 36.000 0.004 NA   NA
 5428440 5428441 cce_1777 cce_1778     FALSE 0.023 270.000 0.000 NA   NA
 5428442 5428443 cce_1779 cce_1780 dacB   TRUE 0.708 115.000 0.105 NA   NA
 5428443 5428444 cce_1780 cce_1781   aroA FALSE 0.082 187.000 0.000 NA   NA
 5428444 5428445 cce_1781 cce_1782 aroA   FALSE 0.227 110.000 0.000 NA N NA
 5428445 5428446 cce_1782 cce_1783     FALSE 0.379 58.000 0.000 NA   NA
 5428447 5428448 cce_1784 cce_1785   isiA FALSE 0.083 219.000 0.000 1.000   NA
 5428448 5428449 cce_1785 cce_1786 isiA   TRUE 0.790 120.000 0.235 NA   NA
 5428449 5428450 cce_1786 cce_1787     TRUE 0.861 58.000 0.176 NA   NA
 5428452 5428453 cce_1789 cce_1790 gpmI secG TRUE 0.718 39.000 0.041 1.000 N NA
 5428454 5428455 cce_1791 cce_1792     FALSE 0.012 329.000 0.000 NA   NA
 5428456 5428457 cce_1793 cce_1794 rub2   FALSE 0.012 404.000 0.000 1.000   NA
 5428457 5428458 cce_1794 cce_1795     FALSE 0.009 379.000 0.000 NA   NA
 5428458 5428459 cce_1795 cce_1796     FALSE 0.008 395.000 0.000 NA   NA
 5428459 5428460 cce_1796 cce_1797     FALSE 0.318 30.000 0.000 NA   NA
 5428460 5428461 cce_1797 cce_1798     FALSE 0.006 472.000 0.000 NA   NA
 5428462 5428463 cce_1799 cce_1800 trmH   TRUE 0.887 28.000 0.150 0.003   NA
 5428463 5428464 cce_1800 cce_1801     TRUE 0.842 53.000 0.113 1.000   NA
 5428464 5428465 cce_1801 cce_1802   rimM FALSE 0.239 180.000 0.003 1.000 N NA
 5428468 5428469 cce_1805 cce_1806     FALSE 0.009 501.000 0.000 1.000   NA
 5428469 5428470 cce_1806 cce_1807     FALSE 0.115 195.000 0.000 1.000   NA
 5428473 5428474 cce_1810 cce_1811     TRUE 0.711 141.000 0.220 NA N NA
 5428475 5428476 cce_1812 cce_1813     TRUE 0.906 3.000 0.446 NA   NA
 5428477 5428478 cce_1814 cce_1815     FALSE 0.289 -3.000 0.000 NA   NA
 5428480 5428481 cce_1817 cce_1818   ligA TRUE 0.648 64.000 0.002 1.000   NA
 5428482 5428483 cce_1819 cce_1820     TRUE 0.961 7.000 0.800 0.074   NA
 5428483 5428484 cce_1820 cce_1821     TRUE 0.655 26.000 0.011 1.000   NA
 5428484 5428485 cce_1821 cce_1822   metK TRUE 0.644 109.000 0.030 1.000   NA
 5428486 5428487 cce_1823 cce_1824     FALSE 0.324 41.000 0.000 NA   NA
 5428487 5428488 cce_1824 cce_1825     FALSE 0.333 22.000 0.000 NA   NA
 5428488 5428489 cce_1825 cce_1826     FALSE 0.253 -13.000 0.000 NA   NA
 5428489 5428490 cce_1826 cce_1827     FALSE 0.320 29.000 0.000 NA   NA
 5428491 5428492 cce_1828 cce_1829 lpxA lpxB2 TRUE 0.829 125.000 0.062 1.000 Y NA
 5428492 5428493 cce_1829 cce_1830 lpxB2 lpxB1 FALSE 0.385 238.000 0.008 0.001 Y NA
 5428493 5428494 cce_1830 cce_1831 lpxB1   FALSE 0.333 22.000 0.000 NA   NA
 5428495 5428496 cce_1832 cce_1833     TRUE 0.698 4.000 0.047 NA   NA
 5428496 5428497 cce_1833 cce_1834     TRUE 0.770 -7.000 0.143 NA   NA
 5428497 5428498 cce_1834 cce_1835     FALSE 0.344 14.000 0.000 NA   NA
 5428498 5428499 cce_1835 cce_1836     FALSE 0.322 4.000 0.000 NA   NA
 5428500 5428501 cce_1837 cce_1838 psbB   FALSE 0.072 194.000 0.000 NA   NA
 5428502 5428503 cce_1839 cce_1840 infB   FALSE 0.397 203.000 0.171 NA N NA
 5428503 5428504 cce_1840 cce_1841   nusA TRUE 0.950 53.000 0.323 NA Y NA
 5428504 5428505 cce_1841 cce_1842 nusA   TRUE 0.940 41.000 0.759 NA   NA
 5428505 5428506 cce_1842 cce_1843     FALSE 0.014 316.000 0.000 NA   NA
 5428506 5428507 cce_1843 cce_1844     FALSE 0.015 362.000 0.000 1.000 N NA
 5428507 5428508 cce_1844 cce_1845     FALSE 0.021 276.000 0.000 NA   NA
 5428508 5428509 cce_1845 cce_1846     FALSE 0.236 -21.000 0.000 NA   NA
 5428509 5428510 cce_1846 cce_1847   comE FALSE 0.352 134.000 0.003 NA   NA
 5428511 5428512 cce_1848 cce_1849   ndhM TRUE 0.721 86.000 0.048 NA   NA
 5428512 5428513 cce_1849 cce_1850 ndhM mdh TRUE 0.667 20.000 0.029 NA   NA
 5428513 5428514 cce_1850 cce_1851 mdh   FALSE 0.230 120.000 0.000 NA   NA
 5428515 5428516 cce_1852 cce_1853   pknA TRUE 0.490 61.000 0.000 1.000 N NA
 5428517 5428518 cce_1854 cce_1855     TRUE 0.516 62.000 0.000 1.000   NA
 5428518 5428519 cce_1855 cce_1856     TRUE 0.947 7.000 0.846 NA   NA
 5428519 5428520 cce_1856 cce_1857     FALSE 0.224 197.000 0.030 NA   NA
 5428520 5428521 cce_1857 cce_1858     TRUE 0.490 64.000 0.000 1.000 N NA
 5428521 5428522 cce_1858 cce_1859   ptsS1 FALSE 0.056 235.000 0.000 1.000 N NA
 5428522 5428523 cce_1859 cce_1860 ptsS1   FALSE 0.417 100.000 0.000 1.000   NA
 5428523 5428524 cce_1860 cce_1861     FALSE 0.403 103.000 0.000 1.000   NA
 5428526 5428527 cce_1863 cce_1864   dnaN1 FALSE 0.385 62.000 0.000 NA   NA
 5428529 5428530 cce_1866 cce_1867     TRUE 0.653 137.000 0.118 NA   NA
 5428530 5428531 cce_1867 cce_1868     FALSE 0.385 60.000 0.000 NA   NA
 5428531 5428532 cce_1868 cce_1869     FALSE 0.297 100.000 0.000 NA   NA
 5428532 5428533 cce_1869 cce_1870     TRUE 0.950 35.000 1.000 NA   NA
 5428535 5428536 cce_1872 cce_1873   sigC FALSE 0.015 372.000 0.000 1.000   NA
 5428536 5428537 cce_1873 cce_1874 sigC melB TRUE 0.799 57.000 0.061 1.000 N NA
 5428540 5428541 cce_1877 cce_1878     TRUE 0.970 75.000 0.333 0.014 Y NA
 5428541 5428542 cce_1878 cce_1879   slt FALSE 0.042 255.000 0.000 1.000 N NA
 5428542 5428543 cce_1879 cce_1880 slt   TRUE 0.763 33.000 0.091 NA   NA
 5428543 5428544 cce_1880 cce_1881     FALSE 0.238 116.000 0.000 NA   NA
 5428546 5428547 cce_1882 cce_1883     FALSE 0.031 246.000 0.000 NA   NA
 5428551 5428552 cce_1887 cce_1888   mutS2 FALSE 0.219 235.000 0.000 1.000 Y NA
 5428552 5428553 cce_1888 cce_1889 mutS2   FALSE 0.310 172.000 0.005 1.000   NA
 5428553 5428554 cce_1889 cce_1890     TRUE 0.594 108.000 0.000 0.000   NA
 5428554 5428555 cce_1890 cce_1891     TRUE 0.878 61.000 0.214 NA   NA
 5428557 5428558 cce_1893 cce_1894     TRUE 0.820 73.000 0.100 NA   NA
 5428560 5428561 cce_1896 cce_1897   ama2 TRUE 0.765 6.000 0.080 NA   NA
 5428562 5428563 cce_1898 cce_1899 patB lexA TRUE 0.661 96.000 0.017 1.000   NA
 5428563 5428564 cce_1899 cce_1900 lexA gltA FALSE 0.445 141.000 0.011 1.000 N NA
 5428564 5428565 cce_1900 cce_1901 gltA   FALSE 0.303 201.000 0.074 NA   NA
 5428566 5428567 cce_1902 cce_1903 moaA amiA1 FALSE 0.055 236.000 0.000 1.000 N NA
 5428567 5428568 cce_1903 cce_1904 amiA1   FALSE 0.087 178.000 0.000 NA N NA
 5428570 5428571 cce_1906 cce_1907     FALSE 0.289 -3.000 0.000 NA   NA
 5428572 5428573 cce_1908 cce_1909     FALSE 0.386 63.000 0.000 NA   NA
 5428573 5428574 cce_1909 cce_1910   clpP4 FALSE 0.006 435.000 0.000 NA   NA
 5428574 5428575 cce_1910 cce_1911 clpP4 clpP3 TRUE 0.979 32.000 0.745 0.001 Y NA
 5428575 5428576 cce_1911 cce_1912 clpP3   FALSE 0.361 54.000 0.000 NA   NA
 5428576 5428577 cce_1912 cce_1913     TRUE 0.935 24.000 0.667 NA   NA
 5428579 5428580 cce_1915 cce_1916     FALSE 0.322 28.000 0.000 NA   NA
 5428582 5428583 cce_1918 cce_1919     TRUE 0.855 116.000 0.400 NA   NA
 5428584 5428585 cce_1920 cce_1921     TRUE 0.929 26.000 0.222 NA Y NA
 5428588 5428589 cce_1924 cce_1925     TRUE 0.590 102.000 0.000 0.010   NA
 5428590 5428591 cce_1926 cce_RNA029     FALSE 0.006 475.000 0.000 NA   NA
 5428593 5428594 cce_1928 cce_1929     FALSE 0.223 123.000 0.000 NA   NA
 5428595 5428596 cce_1930 cce_1931     FALSE 0.009 369.000 0.000 NA   NA
 5428599 5428600 cce_1934 cce_1935     TRUE 0.764 -24.000 0.195 NA   NA
 5428601 5428602 cce_1936 cce_1937     FALSE 0.013 322.000 0.000 NA   NA
 5428604 5428605 cce_1939 cce_1940     FALSE 0.316 37.000 0.000 NA   NA
 5428609 5428610 cce_1944 cce_1945 apcF secA FALSE 0.304 130.000 0.000 1.000   NA
 5428612 5428613 cce_1946 cce_1947 metS   TRUE 0.703 58.000 0.027 NA   NA
 5428613 5428614 cce_1947 cce_1948     FALSE 0.201 -121.000 0.000 NA   NA
 5428615 5428616 cce_1949 cce_1950     FALSE 0.291 27.000 0.000 NA N NA
 5428617 5428618 cce_1951 cce_1952 fur2   TRUE 0.933 34.000 0.444 0.040 N NA
 5428618 5428619 cce_1952 cce_1953   ftsH4 TRUE 0.831 84.000 0.111 1.000 N NA
 5428619 5428620 cce_1953 cce_1954 ftsH4 chlB FALSE 0.009 467.000 0.000 1.000 N NA
 5428620 5428621 cce_1954 cce_1955 chlB   FALSE 0.336 19.000 0.000 NA   NA
 5428621 5428622 cce_1955 cce_1956     FALSE 0.257 -12.000 0.000 NA   NA
 5428623 5428624 cce_1957 cce_1958     TRUE 0.868 -3.000 0.333 NA   NA
 5428624 5428625 cce_1958 cce_1959     FALSE 0.194 134.000 0.000 NA   NA
 5428625 5428626 cce_1959 cce_1960     FALSE 0.304 0.000 0.000 NA   NA
 5428628 5428629 cce_1962 cce_1963 lepB3   TRUE 0.805 63.000 0.087 NA N NA
 5428630 5428631 cce_1964 cce_1965     FALSE 0.382 72.000 0.000 NA   NA
 5428631 5428632 cce_1965 cce_1966     FALSE 0.020 284.000 0.000 NA   NA
 5428632 5428633 cce_1966 cce_1967     TRUE 0.855 9.000 0.215 NA   NA
 5428635 5428636 cce_1969 cce_1970   cbiC2 TRUE 0.849 13.000 0.190 NA   NA
 5428637 5428638 cce_1971 cce_1972     TRUE 0.859 83.000 0.200 NA   NA
 5428638 5428639 cce_1972 cce_1973   btpA TRUE 0.744 50.000 0.059 NA   NA
 5428639 5428640 cce_1973 cce_1974 btpA   FALSE 0.019 287.000 0.000 NA   NA
 5428640 5428641 cce_1974 cce_1975   coxC1 FALSE 0.004 696.000 0.000 NA   NA
 5428641 5428642 cce_1975 cce_1976 coxC1 coxA1 TRUE 0.965 86.000 0.289 0.002 Y NA
 5428642 5428643 cce_1976 cce_1977 coxA1 coxB1 TRUE 0.931 125.000 0.263 0.002 Y NA
 5428645 5428646 cce_1979 cce_RNA031     FALSE 0.005 516.000 0.000 NA   NA
 5428647 5428648 cce_1980 cce_1981   cbiD TRUE 0.543 -3.000 0.011 NA   NA
 5428649 5428650 cce_1982 cce_1983   aphA TRUE 0.972 -28.000 1.000 0.040 Y NA
 5428650 5428651 cce_1983 cce_1984 aphA   FALSE 0.040 267.000 0.000 1.000   NA
 5428651 5428652 cce_1984 cce_1985     TRUE 0.895 1.000 0.333 1.000   NA
 5428652 5428653 cce_1985 cce_1986     FALSE 0.245 -16.000 0.000 NA   NA
 5428653 5428654 cce_1986 cce_1987     FALSE 0.347 85.000 0.000 NA   NA
 5428654 5428655 cce_1987 cce_1988     FALSE 0.258 102.000 0.000 NA N NA
 5428655 5428656 cce_1988 cce_1989     TRUE 0.671 -3.000 0.054 NA N NA
 5428658 5428659 cce_1991 cce_1992     FALSE 0.234 156.000 0.000 1.000   NA
 5428660 5428661 cce_1993 cce_1994     FALSE 0.008 393.000 0.000 NA   NA
 5428661 5428662 cce_1994 cce_1995     TRUE 0.793 59.000 0.048 1.000   NA
 5428662 5428663 cce_1995 cce_1996     TRUE 0.636 151.000 0.048 0.038   NA
 5428664 5428665 cce_1997 cce_1998     FALSE 0.378 75.000 0.000 NA   NA
 5428665 5428666 cce_1998 cce_1999   mreC TRUE 0.977 10.000 0.550 0.002 Y NA
 5428666 5428667 cce_1999 cce_2000 mreC mreB FALSE 0.182 233.000 0.043 1.000 N NA
 5428670 5428671 cce_2002 cce_2003   dnaK1 FALSE 0.348 51.000 0.000 NA   NA
 5428674 5428675 cce_2006 cce_2007     FALSE 0.322 40.000 0.000 NA   NA
 5428676 5428677 cce_2008 cce_2009     FALSE 0.236 117.000 0.000 NA   NA
 5428678 5428679 cce_2010 cce_2011 mgtE1   FALSE 0.386 63.000 0.000 NA   NA
 5428679 5428680 cce_2011 cce_2012     FALSE 0.135 165.000 0.000 NA   NA
 5428680 5428681 cce_2012 cce_2013     FALSE 0.014 316.000 0.000 NA   NA
 5428682 5428683 cce_2014 cce_2015     FALSE 0.333 7.000 0.000 NA   NA
 5428683 5428684 cce_2015 cce_2016   acs FALSE 0.042 229.000 0.000 NA   NA
 5428684 5428685 cce_2016 cce_2017 acs   FALSE 0.344 14.000 0.000 NA   NA
 5428685 5428686 cce_2017 cce_2018     FALSE 0.304 0.000 0.000 NA   NA
 5428686 5428687 cce_2018 cce_2019     FALSE 0.333 23.000 0.000 NA   NA
 5428687 5428688 cce_2019 cce_2020     FALSE 0.386 63.000 0.000 NA   NA
 5428688 5428689 cce_2020 cce_2021     TRUE 0.885 -15.000 0.500 NA   NA
 5428689 5428690 cce_2021 cce_2022     FALSE 0.333 23.000 0.000 NA   NA
 5428692 5428693 cce_2024 cce_2025     TRUE 0.716 45.000 0.049 NA   NA
 5428694 5428695 cce_2026 cce_2027     TRUE 0.667 4.000 0.015 1.000   NA
 5428695 5428696 cce_2027 cce_2028     TRUE 0.618 36.000 0.006 1.000   NA
 5428696 5428697 cce_2028 cce_2029     TRUE 0.929 12.000 0.543 NA   NA
 5428697 5428698 cce_2029 cce_2030     FALSE 0.045 225.000 0.000 NA   NA
 5428698 5428699 cce_2030 cce_2031     FALSE 0.312 96.000 0.000 NA   NA
 5428699 5428700 cce_2031 cce_2032     TRUE 0.857 35.000 0.250 NA   NA
 5428702 5428703 cce_2034 cce_2035     FALSE 0.253 111.000 0.000 NA   NA
 5428703 5428704 cce_2035 cce_2036     FALSE 0.304 0.000 0.000 NA   NA
 5428704 5428705 cce_2036 cce_2037     FALSE 0.030 250.000 0.000 NA   NA
 5428708 5428709 cce_2040 cce_2041     TRUE 0.903 33.000 0.429 NA   NA
 5428710 5428711 cce_2042 cce_2043   ftsH3 FALSE 0.239 -19.000 0.000 NA   NA
 5428711 5428712 cce_2043 cce_2044 ftsH3   FALSE 0.479 84.000 0.000 1.000   NA
 5428714 5428715 cce_2046 cce_2047 uvrB   FALSE 0.322 40.000 0.000 NA   NA
 5428719 5428720 cce_2051 cce_2052 fus2   FALSE 0.015 310.000 0.000 NA   NA
 5428720 5428721 cce_2052 cce_2053     TRUE 0.641 136.000 0.105 NA   NA
 5428721 5428722 cce_2053 cce_2054   futB TRUE 0.690 19.000 0.021 1.000 N NA
 5428723 5428724 cce_2055 cce_2056     FALSE 0.005 546.000 0.000 NA   NA
 5428724 5428725 cce_2056 cce_2057     FALSE 0.014 316.000 0.000 NA   NA
 5428725 5428726 cce_2057 cce_2058     TRUE 0.912 1.000 0.500 NA   NA
 5428727 5428728 cce_2059 cce_2060     TRUE 0.648 3.000 0.030 NA   NA
 5428730 5428731 cce_RNA033 cce_2062     FALSE 0.385 65.000 0.000 NA   NA
 5428731 5428732 cce_2062 cce_2063     TRUE 0.796 16.000 0.077 1.000 N NA
 5428732 5428733 cce_2063 cce_2064     FALSE 0.249 112.000 0.000 NA   NA
 5428733 5428734 cce_2064 cce_2065     FALSE 0.343 50.000 0.000 NA   NA
 5428735 5428736 cce_2066 cce_2067     TRUE 0.723 3.000 0.045 1.000 N NA
 5428736 5428737 cce_2067 cce_2068     TRUE 0.677 25.000 0.036 NA   NA
 5428737 5428738 cce_2068 cce_2069     TRUE 0.672 21.000 0.032 NA   NA
 5428738 5428739 cce_2069 cce_2070     FALSE 0.005 550.000 0.000 NA   NA
 5428739 5428740 cce_2070 cce_2071     FALSE 0.007 400.000 0.000 NA   NA
 5428740 5428741 cce_2071 cce_2072     FALSE 0.336 19.000 0.000 NA   NA
 5428741 5428742 cce_2072 cce_2073     FALSE 0.383 59.000 0.000 NA   NA
 5428742 5428743 cce_2073 cce_2074     TRUE 0.941 21.000 0.750 NA   NA
 5428743 5428744 cce_2074 cce_2075     FALSE 0.329 25.000 0.000 NA   NA
 5428747 5428748 cce_2078 cce_2079     FALSE 0.180 232.000 0.054 NA   NA
 5428749 5428750 cce_2080 cce_2081     FALSE 0.050 219.000 0.000 NA   NA
 5428750 5428751 cce_2081 cce_2082   accD TRUE 0.568 33.000 0.010 NA   NA
 5428752 5428753 cce_2083 cce_2084     FALSE 0.013 318.000 0.000 NA   NA
 5428753 5428754 cce_2084 cce_2085     TRUE 0.860 70.000 0.167 NA   NA
 5428754 5428755 cce_2085 cce_2086     FALSE 0.344 14.000 0.000 NA   NA
 5428755 5428756 cce_2086 cce_2087     FALSE 0.327 26.000 0.000 NA   NA
 5428759 5428760 cce_2090 cce_2091     TRUE 0.920 0.000 0.625 NA N NA
 5428760 5428761 cce_2091 cce_2092     FALSE 0.384 68.000 0.000 NA   NA
 5428761 5428762 cce_2092 cce_2093     FALSE 0.318 38.000 0.000 NA   NA
 5428764 5428765 cce_2095 cce_2096     FALSE 0.338 18.000 0.000 NA   NA
 5428765 5428766 cce_2096 cce_2097     TRUE 0.606 -51.000 0.000 NA Y NA
 5428766 5428767 cce_2097 cce_2098     FALSE 0.289 -3.000 0.000 NA   NA
 5428767 5428768 cce_2098 cce_2099     FALSE 0.031 246.000 0.000 NA   NA
 5428768 5428769 cce_2099 cce_2100     FALSE 0.227 -25.000 0.000 NA   NA
 5428769 5428770 cce_2100 cce_2101     TRUE 0.916 78.000 0.071 1.000 Y NA
 5428770 5428771 cce_2101 cce_2102     TRUE 0.760 34.000 0.088 NA   NA
 5428774 5428775 cce_2105 cce_2106     FALSE 0.482 52.000 0.000 1.000   NA
 5428775 5428776 cce_2106 cce_2107     TRUE 0.956 45.000 0.667 0.039   NA
 5428776 5428777 cce_2107 cce_2108     TRUE 0.956 20.000 0.667 0.039   NA
 5428777 5428778 cce_2108 cce_2109     TRUE 0.943 23.000 0.667 1.000   NA
 5428778 5428779 cce_2109 cce_2110     TRUE 0.951 6.000 0.800 1.000   NA
 5428779 5428780 cce_2110 cce_2111     TRUE 0.945 10.000 0.786 NA   NA
 5428780 5428781 cce_2111 cce_2112     TRUE 0.850 -3.000 0.273 NA   NA
 5428782 5428783 cce_2113 cce_2114     FALSE 0.253 -13.000 0.000 NA   NA
 5428783 5428784 cce_2114 cce_2115     TRUE 0.590 37.000 0.014 NA   NA
 5428784 5428785 cce_2115 cce_2116     TRUE 0.732 66.000 0.021 1.000 N NA
 5428785 5428786 cce_2116 cce_2117   hemD TRUE 0.657 25.000 0.014 1.000 N NA
 5428786 5428787 cce_2117 cce_2118 hemD   FALSE 0.421 137.000 0.014 NA   NA
 5428787 5428788 cce_2118 cce_2119     FALSE 0.021 279.000 0.000 NA   NA
 5428789 5428790 cce_2120 cce_2121 ilvC accB FALSE 0.444 125.000 0.003 1.000 N NA
 5428790 5428791 cce_2121 cce_2122 accB efp TRUE 0.858 66.000 0.120 1.000 N NA
 5428791 5428792 cce_2122 cce_2123 efp   TRUE 0.581 86.000 0.002 1.000 N NA
 5428793 5428794 cce_2124 cce_2125 dxr   FALSE 0.486 102.000 0.004 NA   NA
 5428795 5428796 cce_2126 cce_2127     FALSE 0.027 256.000 0.000 NA   NA
 5428797 5428798 cce_2128 cce_2129 ndhL   TRUE 0.948 41.000 0.925 NA   NA
 5428798 5428799 cce_2129 cce_2130   trpA TRUE 0.832 90.000 0.175 NA   NA
 5428799 5428800 cce_2130 cce_2131 trpA   FALSE 0.009 365.000 0.000 NA   NA
 5428800 5428801 cce_2131 cce_2132     FALSE 0.338 87.000 0.000 NA   NA
 5428802 5428803 cce_2133 cce_2134 prmA serA TRUE 0.509 161.000 0.053 1.000 N NA
 5428803 5428804 cce_2134 cce_2135 serA   FALSE 0.223 123.000 0.000 NA   NA
 5428804 5428805 cce_2135 cce_2136     FALSE 0.049 356.000 0.048 NA   NA
 5428805 5428806 cce_2136 cce_2137   recQ FALSE 0.315 84.000 0.000 NA N NA
 5428808 5428809 cce_2139 cce_2140 malZ   FALSE 0.312 96.000 0.000 NA   NA
 5428809 5428810 cce_2140 cce_2141     FALSE 0.333 23.000 0.000 NA   NA
 5428811 5428812 cce_2142 cce_2143     FALSE 0.289 -3.000 0.000 NA   NA
 5428813 5428814 cce_2144 cce_2145     FALSE 0.322 4.000 0.000 NA   NA
 5428815 5428816 cce_2146 cce_2147     FALSE 0.016 303.000 0.000 NA   NA
 5428816 5428817 cce_2147 cce_2148     FALSE 0.270 -7.000 0.000 NA   NA
 5428820 5428821 cce_2151 cce_2152   mutS1 TRUE 0.584 7.000 0.003 1.000 N NA
 5428822 5428823 cce_2153 cce_2154     FALSE 0.227 -25.000 0.000 NA   NA
 5428823 5428824 cce_2154 cce_2155     FALSE 0.245 -16.000 0.000 NA   NA
 5428825 5428826 cce_2156 cce_2157 eno1   TRUE 0.593 33.000 0.015 NA   NA
 5428827 5428828 cce_2158 cce_2159     TRUE 0.958 83.000 1.000 NA   NA
 5428828 5428829 cce_2159 cce_2160     TRUE 0.931 113.000 1.000 NA   NA
 5428829 5428830 cce_2160 cce_2161     TRUE 0.848 134.000 0.500 NA   NA
 5428830 5428831 cce_2161 cce_2162     TRUE 0.914 32.000 0.500 NA   NA
 5428831 5428832 cce_2162 cce_2163     TRUE 0.859 -49.000 0.500 NA   NA
 5428832 5428833 cce_2163 cce_2164     FALSE 0.213 127.000 0.000 NA   NA
 5428836 5428837 cce_2167 cce_2168     FALSE 0.201 131.000 0.000 NA   NA
 5428837 5428838 cce_2168 cce_2169     FALSE 0.346 183.000 0.057 NA   NA
 5428838 5428839 cce_2169 cce_2170   ppk1 TRUE 0.591 150.000 0.000 1.000 Y NA
 5428839 5428840 cce_2170 cce_2171 ppk1 ppiB FALSE 0.089 206.000 0.000 1.000 N NA
 5428840 5428841 cce_2171 cce_2172 ppiB ycf4 TRUE 0.756 139.000 0.220 1.000   NA
 5428841 5428842 cce_2172 cce_2173 ycf4   FALSE 0.376 76.000 0.000 NA   NA
 5428842 5428843 cce_2173 cce_2174     FALSE 0.333 22.000 0.000 NA   NA
 5428843 5428844 cce_2174 cce_2175     FALSE 0.228 152.000 0.000 1.000 N NA
 5428846 5428847 cce_2177 cce_2178     FALSE 0.243 114.000 0.000 NA   NA
 5428847 5428848 cce_2178 cce_2179     TRUE 0.879 -19.000 0.500 NA   NA
 5428849 5428850 cce_2180 cce_2181     TRUE 0.933 -3.000 0.800 NA   NA
 5428850 5428851 cce_2181 cce_2182     FALSE 0.320 29.000 0.000 NA   NA
 5428852 5428853 cce_2183 cce_2184     FALSE 0.055 212.000 0.000 NA   NA
 5428854 5428855 cce_2185 cce_2186     FALSE 0.383 59.000 0.000 NA   NA
 5428855 5428856 cce_2186 cce_2187     FALSE 0.223 123.000 0.000 NA   NA
 5428856 5428857 cce_2187 cce_2188     FALSE 0.331 44.000 0.000 NA   NA
 5428857 5428858 cce_2188 cce_2189     FALSE 0.385 61.000 0.000 NA   NA
 5428858 5428859 cce_2189 cce_2190     FALSE 0.048 222.000 0.000 NA   NA
 5428859 5428860 cce_2190 cce_2191     FALSE 0.223 123.000 0.000 NA   NA
 5428861 5428862 cce_2192 cce_2193   hlyB1 FALSE 0.456 138.000 0.000 0.005   NA
 5428862 5428863 cce_2193 cce_2194 hlyB1   TRUE 0.490 63.000 0.000 1.000 N NA
 5428864 5428865 cce_2195 cce_2196     FALSE 0.207 129.000 0.000 NA   NA
 5428866 5428867 cce_2197 cce_2198     FALSE 0.270 107.000 0.000 NA   NA
 5428867 5428868 cce_2198 cce_2199     FALSE 0.338 87.000 0.000 NA   NA
 5428869 5428870 cce_2200 cce_2201 ycf41   FALSE 0.122 191.000 0.000 1.000   NA
 5428871 5428872 cce_2202 cce_2203     FALSE 0.338 48.000 0.000 NA   NA
 5428872 5428873 cce_2203 cce_2204     FALSE 0.233 -22.000 0.000 NA   NA
 5428873 5428874 cce_2204 cce_2205     FALSE 0.313 33.000 0.000 NA   NA
 5428877 5428878 cce_2208 cce_2209     TRUE 0.774 115.000 0.143 1.000   NA
 5428878 5428879 cce_2209 cce_2210     FALSE 0.253 -13.000 0.000 NA   NA
 5428880 5428881 cce_2211 cce_2212     FALSE 0.020 282.000 0.000 NA   NA
 5428881 5428882 cce_2212 cce_2213     TRUE 0.871 136.000 0.667 NA   NA
 5428882 5428883 cce_2213 cce_2214     TRUE 0.885 128.000 0.667 NA   NA
 5428883 5428884 cce_2214 cce_2215     FALSE 0.011 348.000 0.000 NA   NA
 5428884 5428885 cce_2215 cce_2216     FALSE 0.369 56.000 0.000 NA   NA
 5428886 5428887 cce_2217 cce_2218     FALSE 0.297 100.000 0.000 NA   NA
 5428887 5428888 cce_2218 cce_2219     FALSE 0.239 -19.000 0.000 NA   NA
 5428888 5428889 cce_2219 cce_2220     TRUE 0.706 48.000 0.023 1.000   NA
 5428890 5428891 cce_2221 cce_2222 ndhE ndhG TRUE 0.976 46.000 0.506 0.002 Y NA
 5428891 5428892 cce_2222 cce_2223 ndhG ndhI TRUE 0.952 87.000 0.192 0.006 Y NA
 5428892 5428893 cce_2223 cce_2224 ndhI ndhA TRUE 0.953 34.000 0.242 0.006 Y NA
 5428894 5428895 cce_2225 cce_2226   dcoH2 FALSE 0.345 110.000 0.000 1.000 N NA
 5428896 5428897 cce_2227 cce_2228     TRUE 0.856 76.000 0.167 NA   NA
 5428897 5428898 cce_2228 cce_2229   pepP2 FALSE 0.400 162.000 0.031 NA   NA
 5428898 5428899 cce_2229 cce_2230 pepP2   TRUE 0.535 141.000 0.033 1.000   NA
 5428899 5428900 cce_2230 cce_2231   dfrA TRUE 0.506 141.000 0.022 1.000   NA
 5428900 5428901 cce_2231 cce_2232 dfrA   FALSE 0.074 220.000 0.000 1.000 N NA
 5428901 5428902 cce_2232 cce_2233     FALSE 0.011 873.000 0.000 0.070   NA
 5428905 5428906 cce_2236 cce_2237 cphB cphA TRUE 0.903 114.000 0.588 1.000 N NA
 5428906 5428907 cce_2237 cce_2238 cphA clpS1 FALSE 0.006 447.000 0.000 NA   NA
 5428907 5428908 cce_2238 cce_2239 clpS1   TRUE 0.895 94.000 0.378 NA   NA
 5428908 5428909 cce_2239 cce_2240   hofG FALSE 0.382 72.000 0.000 NA   NA
 5428910 5428911 cce_2241 cce_2242     TRUE 0.898 49.000 0.286 1.000   NA
 5428911 5428912 cce_2242 cce_2243     FALSE 0.026 296.000 0.000 1.000 N NA
 5428913 5428914 cce_2244 cce_2245     FALSE 0.036 237.000 0.000 NA   NA
 5428914 5428915 cce_2245 cce_2246   cyaA FALSE 0.126 444.000 0.500 NA   NA
 5428915 5428916 cce_2246 cce_2247 cyaA   TRUE 0.843 47.000 0.135 1.000   NA
 5428917 5428918 cce_2248 cce_2249 glgB1   FALSE 0.051 246.000 0.000 1.000   NA
 5428920 5428921 cce_2251 cce_2252     TRUE 0.686 35.000 0.045 NA   NA
 5428921 5428922 cce_2252 cce_2253   manC TRUE 0.574 139.000 0.046 1.000   NA
 5428922 5428923 cce_2253 cce_2254 manC   TRUE 0.625 43.000 0.018 NA   NA
 5428924 5428925 cce_2255 cce_2256 polA cupB FALSE 0.312 147.000 0.003 NA   NA
 5428925 5428926 cce_2256 cce_2257 cupB icfA1 FALSE 0.425 174.000 0.069 NA   NA
 5428926 5428927 cce_2257 cce_2258 icfA1   FALSE 0.343 50.000 0.000 NA   NA
 5428927 5428928 cce_2258 cce_2259     TRUE 0.829 -3.000 0.222 NA   NA
 5428929 5428930 cce_2260 cce_2261     FALSE 0.348 51.000 0.000 NA   NA
 5428930 5428931 cce_2261 cce_2262     FALSE 0.221 124.000 0.000 NA   NA
 5428931 5428932 cce_2262 cce_2263     FALSE 0.093 181.000 0.000 NA   NA
 5428932 5428933 cce_2263 cce_2264     FALSE 0.198 132.000 0.000 NA   NA
 5428934 5428935 cce_2265 cce_2266     TRUE 0.932 6.000 0.634 NA   NA
 5428935 5428936 cce_2266 cce_2267     TRUE 0.871 35.000 0.237 1.000   NA
 5428936 5428937 cce_2267 cce_2268     FALSE 0.443 86.000 0.000 1.000 N NA
 5428937 5428938 cce_2268 cce_2269     FALSE 0.174 145.000 0.000 NA   NA
 5428938 5428939 cce_2269 cce_2270     FALSE 0.338 18.000 0.000 NA   NA
 5428939 5428940 cce_2270 cce_2271     FALSE 0.330 6.000 0.000 NA   NA
 5428940 5428941 cce_2271 cce_2272     FALSE 0.314 35.000 0.000 NA   NA
 5428941 5428942 cce_2272 cce_2273     TRUE 0.716 21.000 0.049 NA   NA
 5428946 5428947 cce_2277 cce_2278     FALSE 0.259 181.000 0.000 0.018   NA
 5428947 5428948 cce_2278 cce_2279     FALSE 0.178 173.000 0.000 1.000   NA
 5428949 5428950 cce_2280 cce_2281     TRUE 0.858 3.000 0.250 NA   NA
 5428951 5428952 cce_2282 cce_2283 asnS   TRUE 0.650 53.000 0.005 1.000   NA
 5428952 5428953 cce_2283 cce_2284     FALSE 0.344 14.000 0.000 NA   NA
 5428955 5428956 cce_2286 cce_2287     FALSE 0.116 172.000 0.000 NA   NA
 5428958 5428959 cce_2289 cce_2290     FALSE 0.328 43.000 0.000 NA   NA
 5428959 5428960 cce_2290 cce_2291   ymxG FALSE 0.063 204.000 0.000 NA   NA
 5428960 5428961 cce_2291 cce_2292 ymxG   FALSE 0.215 126.000 0.000 NA   NA
 5428961 5428962 cce_2292 cce_2293     FALSE 0.032 243.000 0.000 NA   NA
 5428963 5428964 cce_2294 cce_2295   ndhF1 FALSE 0.328 90.000 0.000 NA   NA
 5428964 5428965 cce_2295 cce_2296 ndhF1   FALSE 0.374 139.000 0.006 NA   NA
 5428965 5428966 cce_2296 cce_2297     TRUE 0.863 7.000 0.239 NA   NA
 5428966 5428967 cce_2297 cce_2298   apt TRUE 0.661 42.000 0.016 1.000 N NA
 5428967 5428968 cce_2298 cce_2299 apt   FALSE 0.020 282.000 0.000 NA   NA
 5428969 5428970 cce_2300 cce_2301     TRUE 0.606 92.000 0.000 0.043   NA
 5428971 5428972 cce_2302 cce_2303 uppS1   FALSE 0.339 119.000 0.000 1.000   NA
 5428975 5428976 cce_2306 cce_2307     TRUE 0.917 -15.000 0.789 NA   NA
 5428976 5428977 cce_2307 cce_2308   cpcF FALSE 0.304 0.000 0.000 NA   NA
 5428977 5428978 cce_2308 cce_2309 cpcF   FALSE 0.289 -3.000 0.000 NA   NA
 5428979 5428980 cce_2310 cce_2311     TRUE 0.732 36.000 0.069 NA   NA
 5428981 5428982 cce_2312 cce_2313 ispG   FALSE 0.005 497.000 0.000 NA   NA
 5428983 5428984 cce_2314 cce_2315 hisD1 hoxH FALSE 0.480 76.000 0.000 1.000 N NA
 5428984 5428985 cce_2315 cce_2316 hoxH hoxY TRUE 0.896 140.000 0.322 1.000 Y NA
 5428985 5428986 cce_2316 cce_2317 hoxY hoxU TRUE 0.948 56.000 0.404 0.006   NA
 5428986 5428987 cce_2317 cce_2318 hoxU hoxF TRUE 0.937 12.000 0.368 0.006   NA
 5428987 5428988 cce_2318 cce_2319 hoxF hoxE TRUE 0.965 -24.000 0.667 0.005 Y NA
 5428988 5428989 cce_2319 cce_2320 hoxE   FALSE 0.092 211.000 0.000 1.000   NA
 5428989 5428990 cce_2320 cce_2321     TRUE 0.948 14.000 0.500 0.056   NA
 5428993 5428994 cce_2324 cce_2325 ho2 hemN TRUE 0.708 141.000 0.161 1.000 N NA
 5428995 5428996 cce_2326 cce_2327     FALSE 0.212 -40.000 0.000 NA   NA
 5428998 5428999 cce_2329 cce_2330   fur1 FALSE 0.361 54.000 0.000 NA   NA
 5428999 5429000 cce_2330 cce_2331 fur1   TRUE 0.829 112.000 0.231 1.000   NA
 5429000 5429001 cce_2331 cce_2332     FALSE 0.066 199.000 0.000 NA   NA
 5429003 5429004 cce_2334 cce_2335     FALSE 0.364 81.000 0.000 NA   NA
 5429005 5429006 cce_2336 cce_2337     FALSE 0.150 157.000 0.000 NA   NA
 5429006 5429007 cce_2337 cce_2338   todF TRUE 0.564 89.000 0.006 NA   NA
 5429011 5429012 cce_2342 cce_2343 ribC   FALSE 0.014 313.000 0.000 NA   NA
 5429012 5429013 cce_2343 cce_2344     FALSE 0.035 238.000 0.000 NA   NA
 5429016 5429017 cce_RNA034 cce_2347     FALSE 0.078 189.000 0.000 NA   NA
 5429017 5429018 cce_2347 cce_2348     FALSE 0.015 312.000 0.000 NA   NA
 5429018 5429019 cce_2348 cce_2349     FALSE 0.052 216.000 0.000 NA   NA
 5429019 5429020 cce_2349 cce_2350     TRUE 0.866 75.000 0.189 NA   NA
 5429020 5429021 cce_2350 cce_2351     FALSE 0.172 146.000 0.000 NA   NA
 5429022 5429023 cce_2352 cce_2353     FALSE 0.333 7.000 0.000 NA   NA
 5429023 5429024 cce_2353 cce_2354     FALSE 0.203 -73.000 0.000 NA   NA
 5429024 5429025 cce_2354 cce_2355     FALSE 0.148 404.000 0.286 0.003 N NA
 5429025 5429026 cce_2355 cce_2356     TRUE 0.849 87.000 0.000 0.005 Y NA
 5429026 5429027 cce_2356 cce_2357   sucC FALSE 0.401 0.000 0.000 1.000 N NA
 5429027 5429028 cce_2357 cce_2358 sucC sucD TRUE 0.658 235.000 0.265 0.000 Y NA
 5429028 5429029 cce_2358 cce_2359 sucD thrA TRUE 0.563 141.000 0.048 1.000 N NA
 5429029 5429030 cce_2359 cce_2360 thrA   TRUE 0.855 12.000 0.167 1.000 N NA
 5429031 5429032 cce_2361 cce_2362 galE1   TRUE 0.959 22.000 0.400 1.000 Y NA
 5429032 5429033 cce_2362 cce_2363     TRUE 0.786 69.000 0.000 NA Y NA
 5429033 5429034 cce_2363 cce_2364     FALSE 0.386 63.000 0.000 NA   NA
 5429034 5429035 cce_2364 cce_2365     FALSE 0.338 48.000 0.000 NA   NA
 5429036 5429037 cce_2366 cce_2367     FALSE 0.297 190.000 0.049 NA   NA
 5429039 5429040 cce_2369 cce_2370     FALSE 0.158 154.000 0.000 NA   NA
 5429040 5429041 cce_2370 cce_2371     FALSE 0.233 -22.000 0.000 NA   NA
 5429042 5429043 cce_2372 cce_2373 murB murC TRUE 0.891 135.000 0.136 0.003 Y NA
 5429044 5429045 cce_2374 cce_2375     FALSE 0.257 -3.000 0.000 NA N NA
 5429045 5429046 cce_2375 cce_2376     TRUE 0.844 17.000 0.000 0.018 Y NA
 5429046 10702205 cce_2376 cce_2377     FALSE 0.056 211.000 0.000 NA   NA
 5429047 5429048 cce_2378 cce_2379 lpxC   TRUE 0.911 67.000 0.052 1.000 Y NA
 5429048 5429049 cce_2379 cce_2380   purC TRUE 0.634 128.000 0.058 1.000 N NA
 5429050 5429051 cce_2381 cce_2382     FALSE 0.217 125.000 0.000 NA   NA
 5429051 5429052 cce_2382 cce_2383   proA2 TRUE 0.640 11.000 0.019 NA   NA
 5429052 5429053 cce_2383 cce_2384 proA2   FALSE 0.224 160.000 0.000 1.000   NA
 5429053 5429054 cce_2384 cce_2385     TRUE 0.494 55.000 0.000 1.000   NA
 5429057 5429058 cce_2388 cce_2389     FALSE 0.008 396.000 0.000 NA   NA
 5429058 5429059 cce_2389 cce_2390   trxM2 FALSE 0.386 63.000 0.000 NA   NA
 5429060 5429061 cce_2391 cce_2392     TRUE 0.676 108.000 0.062 NA   NA
 5429062 5429063 cce_2393 cce_2394     FALSE 0.343 15.000 0.000 NA   NA
 5429065 5429066 cce_2396 cce_2397     TRUE 0.914 74.000 0.364 NA   NA
 5429071 5429072 cce_2402 cce_2403     FALSE 0.026 304.000 0.000 1.000   NA
 5429072 5429073 cce_2403 cce_2404     TRUE 0.698 66.000 0.024 NA   NA
 5429073 5429074 cce_2404 cce_2405     FALSE 0.132 166.000 0.000 NA   NA
 5429075 5429076 cce_2406 cce_2407     TRUE 0.729 40.000 0.061 NA   NA
 5429080 5429081 cce_2411 cce_2412   fabG FALSE 0.486 72.000 0.000 1.000 N NA
 5429081 5429082 cce_2412 cce_2413 fabG   FALSE 0.330 6.000 0.000 NA   NA
 5429083 5429084 cce_2414 cce_2415 xisH4   TRUE 0.760 161.000 0.400 NA   NA
 5429084 5429085 cce_2415 cce_2416     FALSE 0.343 15.000 0.000 NA   NA
 5429088 5429089 cce_2419 cce_2420     TRUE 0.789 49.000 0.000 1.000 Y NA
 5429089 5429090 cce_2420 cce_2421     FALSE 0.060 206.000 0.000 NA   NA
 5429090 5429091 cce_2421 cce_2422     TRUE 0.925 75.000 0.429 NA   NA
 5429091 5429092 cce_2422 cce_2423     TRUE 0.927 46.000 0.556 NA   NA
 5429092 5429093 cce_2423 cce_2424   sigH TRUE 0.896 0.000 0.409 NA   NA
 5429094 5429095 cce_2425 cce_2426 recJ2   FALSE 0.009 364.000 0.000 NA   NA
 5429095 5429096 cce_2426 cce_2427     TRUE 0.497 176.000 0.120 NA   NA
 5429096 5429097 cce_2427 cce_2428   phrA1 TRUE 0.513 97.000 0.006 NA N NA
 5429097 5429098 cce_2428 cce_2429 phrA1   FALSE 0.024 254.000 0.000 NA N NA
 5429098 5429099 cce_2429 cce_2430   msrA2 FALSE 0.256 212.000 0.000 NA Y NA
 5429102 5429103 cce_2433 cce_2434 ccmK4 ccmK3 TRUE 0.893 180.000 0.938 NA Y NA
 5429103 5429104 cce_2434 cce_2435 ccmK3   TRUE 0.782 100.000 0.125 NA   NA
 5429106 5429107 cce_2437 cce_2438   recN FALSE 0.159 178.000 0.000 1.000   NA
 5429109 5429110 cce_2440 cce_2441     FALSE 0.032 244.000 0.000 NA   NA
 5429110 5429111 cce_2441 cce_2442     FALSE 0.344 14.000 0.000 NA   NA
 5429111 5429112 cce_2442 cce_2443     TRUE 0.959 82.000 1.000 NA   NA
 5429112 5429113 cce_2443 cce_2444     FALSE 0.341 49.000 0.000 NA   NA
 5429113 5429114 cce_2444 cce_2445     FALSE 0.310 1.000 0.000 NA   NA
 5429114 5429115 cce_2445 cce_2446   thrC FALSE 0.236 -21.000 0.000 NA   NA
 5429116 5429117 cce_2447 cce_2448     FALSE 0.018 343.000 0.000 1.000   NA
 5429117 5429118 cce_2448 cce_2449     FALSE 0.041 256.000 0.000 1.000 N NA
 5429119 5429120 cce_2450 cce_2451     FALSE 0.019 288.000 0.000 NA   NA
 5429120 5429121 cce_2451 cce_2452     TRUE 0.787 37.000 0.114 NA   NA
 5429121 5429122 cce_2452 cce_2453     TRUE 0.662 10.000 0.026 NA   NA
 5429122 5429123 cce_2453 cce_2454   gpmB FALSE 0.034 273.000 0.000 1.000 N NA
 5429124 5429125 cce_2455 cce_2456     TRUE 0.861 6.000 0.235 NA   NA
 5429125 5429126 cce_2456 cce_2457     TRUE 0.844 15.000 0.182 NA   NA
 5429126 5429127 cce_2457 cce_2458     TRUE 0.760 109.000 0.136 NA   NA
 5429128 5429129 cce_2459 cce_2460     FALSE 0.318 38.000 0.000 NA   NA
 5429129 5429130 cce_2460 cce_2461   gidA FALSE 0.128 168.000 0.000 NA   NA
 5429130 5429131 cce_2461 cce_2462 gidA   FALSE 0.204 130.000 0.000 NA   NA
 5429131 5429132 cce_2462 cce_2463     TRUE 0.910 0.000 0.500 NA   NA
 5429132 5429133 cce_2463 cce_2464     FALSE 0.053 214.000 0.000 NA   NA
 5429133 5429134 cce_2464 cce_2465   sds TRUE 0.778 85.000 0.060 1.000 N NA
 5429134 5429135 cce_2465 cce_2466 sds murI FALSE 0.017 771.000 0.024 1.000 N NA
 5429135 5429136 cce_2466 cce_2467 murI amiA2 TRUE 0.853 87.000 0.011 1.000 Y NA
 5429136 5429137 cce_2467 cce_2468 amiA2   TRUE 0.760 169.000 0.417 1.000 N NA
 5429137 5429138 cce_2468 cce_2469     FALSE 0.074 225.000 0.000 1.000   NA
 5429138 5429139 cce_2469 cce_2470     FALSE 0.005 553.000 0.000 NA   NA
 5429139 5429140 cce_2470 cce_2471     FALSE 0.333 23.000 0.000 NA   NA
 5429140 5429141 cce_2471 cce_2472     FALSE 0.180 141.000 0.000 NA   NA
 5429141 5429142 cce_2472 cce_2473   minE FALSE 0.264 165.000 0.005 NA N NA
 5429144 5429145 cce_2475 cce_2476 minD minC TRUE 0.954 40.000 0.368 1.000 Y NA
 5429145 5429146 cce_2476 cce_2477 minC   FALSE 0.237 148.000 0.000 1.000 N NA
 5429147 5429148 cce_2478 cce_2479     TRUE 0.783 32.000 0.111 NA   NA
 5429149 5429150 cce_2480 cce_2481     TRUE 0.828 9.000 0.154 NA   NA
 5429150 5429151 cce_2481 cce_2482     TRUE 0.751 41.000 0.074 NA   NA
 5429151 5429152 cce_2482 cce_2483     FALSE 0.010 352.000 0.000 NA   NA
 5429152 5429153 cce_2483 cce_2484     TRUE 0.618 4.000 0.018 NA   NA
 5429153 5429154 cce_2484 cce_2485   psbD2 TRUE 0.759 47.000 0.073 NA   NA
 5429154 5429155 cce_2485 cce_2486 psbD2   FALSE 0.007 430.000 0.000 NA   NA
 5429155 5429156 cce_2486 cce_2487     TRUE 0.609 24.000 0.014 NA   NA
 5429156 5429157 cce_2487 cce_2488     TRUE 0.956 15.000 1.000 NA   NA
 5429161 5429162 cce_2492 cce_2493     FALSE 0.456 89.000 0.000 1.000   NA
 5429162 5429163 cce_2493 cce_2494     FALSE 0.453 90.000 0.000 1.000   NA
 5429163 5429164 cce_2494 cce_2495     FALSE 0.064 228.000 0.000 1.000 N NA
 5429164 5429165 cce_2495 cce_2496   smtA TRUE 0.764 83.000 0.043 1.000   NA
 5429165 5429166 cce_2496 cce_2497 smtA   TRUE 0.566 140.000 0.043 1.000   NA
 5429166 5429167 cce_2497 cce_2498   ksgA TRUE 0.571 30.000 0.002 1.000   NA
 5429170 5429171 cce_2501 cce_2502     TRUE 0.659 105.000 0.049 NA   NA
 5429172 5429173 cce_2503 cce_2504     FALSE 0.318 38.000 0.000 NA   NA
 5429175 5429176 cce_2506 cce_2507     TRUE 0.911 66.000 0.333 NA   NA
 5429177 5429178 cce_2508 cce_2509     TRUE 0.949 0.000 0.231 0.011 Y NA
 5429178 5429179 cce_2509 cce_2510     FALSE 0.027 257.000 0.000 NA   NA
 5429179 5429180 cce_2510 cce_2511     FALSE 0.026 260.000 0.000 NA   NA
 5429185 5429186 cce_2516 cce_2517     FALSE 0.056 211.000 0.000 NA   NA
 5429186 5429187 cce_2517 cce_2518     TRUE 0.856 14.000 0.211 NA   NA
 5429188 5429189 cce_2519 cce_2520     TRUE 0.902 107.000 0.538 NA   NA
 5429189 5429190 cce_2520 cce_2521     TRUE 0.866 74.000 0.189 NA   NA
 5429190 5429191 cce_2521 cce_2522     TRUE 0.714 31.000 0.036 1.000   NA
 5429192 5429193 cce_2523 cce_2524     FALSE 0.008 399.000 0.000 NA   NA
 5429193 5429194 cce_2524 cce_2525     TRUE 0.763 9.000 0.055 1.000 N NA
 5429194 5429195 cce_2525 cce_2526     TRUE 0.924 10.000 0.055 0.005 Y NA
 5429195 5429196 cce_2526 cce_2527     TRUE 0.984 42.000 1.000 0.005 Y NA
 5429196 5429197 cce_2527 cce_2528     TRUE 0.860 39.000 0.250 NA   NA
 5429200 5429201 cce_2531 cce_2532 dnaX   TRUE 0.616 27.000 0.005 1.000   NA
 5429201 5429202 cce_2532 cce_2533     TRUE 0.644 51.000 0.018 NA   NA
 5429202 5429203 cce_2533 cce_2534     TRUE 0.630 46.000 0.018 NA   NA
 5429204 5429205 cce_2535 cce_2536 opcA zwf TRUE 0.845 124.000 0.080 1.000 Y NA
 5429210 5429211 cce_2541 cce_2542     FALSE 0.382 72.000 0.000 NA   NA
 5429212 5429213 cce_2543 cce_2544     TRUE 0.860 70.000 0.167 NA   NA
 5429214 5429215 cce_2545 cce_2546     TRUE 0.835 18.000 0.167 NA   NA
 5429215 5429216 cce_2546 cce_2547     TRUE 0.716 24.000 0.035 1.000 N NA
 5429216 5429217 cce_2547 cce_2548   rfbD TRUE 0.721 64.000 0.017 1.000 N NA
 5429217 5429218 cce_2548 cce_2549 rfbD rfbA TRUE 0.931 10.000 0.164 1.000 Y NA
 5429218 5429219 cce_2549 cce_2550 rfbA   FALSE 0.172 146.000 0.000 NA   NA
 5429221 5429222 cce_2552 cce_2553     FALSE 0.113 173.000 0.000 NA   NA
 5429223 5429224 cce_2554 cce_2555     FALSE 0.469 86.000 0.000 1.000   NA
 5429224 5429225 cce_2555 cce_2556     TRUE 0.641 134.000 0.100 NA   NA
 5429226 5429227 cce_2557 cce_2558 phnC phnD TRUE 0.979 97.000 0.750 0.001 Y NA
 5429227 5429228 cce_2558 cce_2559 phnD phnE TRUE 0.951 160.000 0.828 0.000 Y NA
 5429228 5429229 cce_2559 cce_2560 phnE   TRUE 0.950 12.000 0.759 1.000 N NA
 5429229 5429230 cce_2560 cce_2561     FALSE 0.366 80.000 0.000 NA   NA
 5429232 5429233 cce_2563 cce_2564   ubiA TRUE 0.511 99.000 0.004 NA   NA
 5429233 5429234 cce_2564 cce_2565 ubiA   TRUE 0.561 13.000 0.004 NA   NA
 5429234 5429235 cce_2565 cce_2566   sigF FALSE 0.038 234.000 0.000 NA   NA
 5429235 5429236 cce_2566 cce_2567 sigF   FALSE 0.038 264.000 0.000 1.000 N NA
 5429237 5429238 cce_2568 cce_2569 hemH   FALSE 0.006 434.000 0.000 NA   NA
 5429238 5429239 cce_2569 cce_2570   ubiE TRUE 0.552 103.000 0.013 NA   NA
 5429239 5429240 cce_2570 cce_2571 ubiE   FALSE 0.007 409.000 0.000 NA   NA
 5429241 5429242 cce_2572 cce_2573 psbO ho1 FALSE 0.017 360.000 0.000 1.000   NA
 5429244 5429245 cce_2575 cce_2576     FALSE 0.262 109.000 0.000 NA   NA
 5429247 5429248 cce_2578 cce_2579 infC1   FALSE 0.091 182.000 0.000 NA   NA
 5429248 5429249 cce_2579 cce_2580     FALSE 0.335 20.000 0.000 NA   NA
 5429249 5429250 cce_2580 cce_2581     FALSE 0.155 155.000 0.000 NA   NA
 5429250 5429251 cce_2581 cce_2582     TRUE 0.904 -3.000 0.500 NA   NA
 5429252 5429253 cce_2583 cce_2584     FALSE 0.333 45.000 0.000 NA   NA
 5429253 5429254 cce_2584 cce_2585     FALSE 0.344 13.000 0.000 NA   NA
 5429254 5429255 cce_2585 cce_2586     FALSE 0.243 114.000 0.000 NA   NA
 5429255 5429256 cce_2586 cce_2587     FALSE 0.369 56.000 0.000 NA   NA
 5429256 5429257 cce_2587 cce_RNA035     FALSE 0.182 140.000 0.000 NA   NA
 5429258 5429259 cce_2588 cce_2589     TRUE 0.773 140.000 0.308 NA   NA
 5429259 5429260 cce_2589 cce_2590     TRUE 0.825 44.000 0.154 NA   NA
 5429260 5429261 cce_2590 cce_2591   folK TRUE 0.600 7.000 0.003 1.000   NA
 5429261 5429262 cce_2591 cce_2592 folK   TRUE 0.708 5.000 0.033 1.000 N NA
 5429262 5429263 cce_2592 cce_2593     FALSE 0.425 42.000 0.000 1.000 N NA
 5429265 5429266 cce_2595 cce_2596     TRUE 0.832 42.000 0.125 1.000   NA
 5429266 5429267 cce_2596 cce_2597     FALSE 0.307 97.000 0.000 NA   NA
 5429268 5429269 cce_2598 cce_2599 surE2   TRUE 0.652 10.000 0.022 NA   NA
 5429270 5429271 cce_2600 cce_2601 nadC   TRUE 0.607 18.000 0.004 1.000 N NA
 5429272 5429273 cce_2602 cce_2603     TRUE 0.955 18.000 1.000 NA   NA
 5429273 5429274 cce_2603 cce_2604     TRUE 0.942 103.000 1.000 NA   NA
 5429281 5429282 cce_2611 cce_2612   sppA2 FALSE 0.017 338.000 0.000 1.000 N NA
 5429282 5429283 cce_2612 cce_2613 sppA2 recF TRUE 0.602 46.000 0.004 1.000 N NA
 5429283 5429284 cce_2613 cce_2614 recF   FALSE 0.012 327.000 0.000 NA   NA
 5429284 5429285 cce_2614 cce_2615   proC FALSE 0.439 206.000 0.224 NA   NA
 5429285 5429286 cce_2615 cce_2616 proC sfsA TRUE 0.575 7.000 0.008 NA   NA
 5429286 5429287 cce_2616 cce_2617 sfsA   FALSE 0.021 276.000 0.000 NA   NA
 5429287 5429288 cce_2617 cce_2618     FALSE 0.322 28.000 0.000 NA   NA
 5429289 5429290 cce_2619 cce_2620     FALSE 0.341 11.000 0.000 NA   NA
 5429291 5429292 cce_2621 cce_2622     FALSE 0.316 3.000 0.000 NA   NA
 5429292 5429293 cce_2622 cce_2623   era TRUE 0.504 77.000 0.000 1.000   NA
 5429293 5429294 cce_2623 cce_2624 era   TRUE 0.619 96.000 0.007 1.000   NA
 5429294 5429295 cce_2624 cce_2625   psbU TRUE 0.583 164.000 0.095 1.000   NA
 5429296 5429297 cce_2626 cce_2627   pyrC1 FALSE 0.462 103.000 0.003 NA   NA
 5429298 5429299 cce_2628 cce_2629     FALSE 0.041 266.000 0.000 1.000   NA
 5429299 5429300 cce_2629 cce_2630   upp TRUE 0.651 65.000 0.004 1.000 N NA
 5429300 5429301 cce_2630 cce_2631 upp   TRUE 0.659 62.000 0.013 NA   NA
 5429301 5429302 cce_2631 cce_2632     FALSE 0.057 210.000 0.000 NA   NA
 5429302 5429303 cce_2632 cce_2633     TRUE 0.681 116.000 0.017 0.015   NA
 5429303 5429304 cce_2633 cce_2634     TRUE 0.516 131.000 0.015 1.000   NA
 5429304 5429305 cce_2634 cce_2635     TRUE 0.649 3.000 0.013 1.000   NA
 5429305 5429306 cce_2635 cce_2636     TRUE 0.776 56.000 0.069 NA   NA
 5429307 5429308 cce_2637 cce_2638     FALSE 0.182 140.000 0.000 NA   NA
 5429315 5429316 cce_2645 cce_2646   rimK FALSE 0.229 158.000 0.000 1.000   NA
 5429316 5429317 cce_2646 cce_2647 rimK   TRUE 0.732 85.000 0.031 1.000   NA
 5429318 5429319 cce_2648 cce_2649     FALSE 0.457 24.000 0.000 1.000   NA
 5429319 5429320 cce_2649 cce_2650     FALSE 0.023 270.000 0.000 NA   NA
 5429321 5429322 cce_2651 cce_2652 cpcB cpcA TRUE 0.955 98.000 0.727 0.004   NA
 5429322 5429323 cce_2652 cce_2653 cpcA cpcC2 TRUE 0.866 125.000 0.273 0.004   NA
 5429323 5429324 cce_2653 cce_2654 cpcC2 cpcC1 TRUE 0.941 30.000 0.455 0.004   NA
 5429324 5429325 cce_2654 cce_2655 cpcC1 cpcD TRUE 0.944 81.000 0.375 0.004   NA
 5429325 5429326 cce_2655 cce_2656 cpcD cpcE FALSE 0.462 8.000 0.000 1.000   NA
 5429327 5429328 cce_2657 cce_2658   glgC2 FALSE 0.263 223.000 0.000 1.000 Y NA
 5429330 5429331 cce_2660 cce_2661   msrA1 FALSE 0.233 -22.000 0.000 NA   NA
 5429331 5429332 cce_2661 cce_2662 msrA1   TRUE 0.758 5.000 0.077 NA   NA
 5429333 5429334 cce_2663 cce_2664     FALSE 0.211 128.000 0.000 NA   NA
 5429335 5429336 cce_2665 cce_2666     TRUE 0.893 25.000 0.286 1.000   NA
 5429337 5429338 cce_2667 cce_2668 moeB   FALSE 0.041 256.000 0.000 1.000 N NA
 5429338 5429339 cce_2668 cce_2669     TRUE 0.971 96.000 0.750 1.000 Y NA
 5429339 5429340 cce_2669 cce_2670   hetC FALSE 0.007 553.000 0.000 1.000 N NA
 5429340 5429341 cce_2670 cce_2671 hetC   FALSE 0.011 343.000 0.000 NA   NA
 5429342 5429343 cce_2672 cce_2673     FALSE 0.085 185.000 0.000 NA   NA
 5429343 5429344 cce_2673 cce_2674     FALSE 0.008 392.000 0.000 NA   NA
 5429344 5429345 cce_2674 cce_2675     FALSE 0.085 185.000 0.000 NA   NA
 5429345 5429346 cce_2675 cce_2676     FALSE 0.029 253.000 0.000 NA   NA
 5429346 5429347 cce_2676 cce_2677   hetP FALSE 0.091 182.000 0.000 NA   NA
 5429347 5429348 cce_2677 cce_2678 hetP   FALSE 0.017 297.000 0.000 NA   NA
 5429350 5429351 cce_2680 cce_2681     TRUE 0.634 57.000 0.003 1.000 N NA
 5429351 5429352 cce_2681 cce_2682     TRUE 0.601 5.000 0.003 1.000   NA
 5429352 5429353 cce_2682 cce_2683     TRUE 0.608 21.000 0.003 1.000   NA
 5429354 5429355 cce_2684 cce_2685     TRUE 0.624 119.000 0.065 NA N NA
 5429358 5429359 cce_2688 cce_2689     TRUE 0.592 1.000 0.015 NA   NA
 5429359 5429360 cce_2689 cce_2690     FALSE 0.457 24.000 0.000 1.000   NA
 5429360 5429361 cce_2690 cce_2691     FALSE 0.240 115.000 0.000 NA   NA
 5429361 5429362 cce_2691 cce_2692     TRUE 0.831 45.000 0.167 NA   NA
 5429362 5429363 cce_2692 cce_2693   aspC TRUE 0.788 14.000 0.070 1.000 N NA
 5429363 5429364 cce_2693 cce_2694 aspC   TRUE 0.658 96.000 0.035 NA   NA
 5429364 5429365 cce_2694 cce_2695     TRUE 0.915 -7.000 0.667 NA   NA
 5429367 5429368 cce_2697 cce_2698 mgtE2   FALSE 0.389 101.000 0.000 1.000 N NA
 5429371 5429372 cce_2701 cce_2702     FALSE 0.160 153.000 0.000 NA   NA
 5429373 5429374 cce_2703 cce_2704 hypE   FALSE 0.426 98.000 0.000 1.000   NA
 5429375 5429376 cce_2705 cce_2706 xisH2 xisI2 TRUE 0.922 -12.000 0.800 NA   NA
 5429377 5429378 cce_2707 cce_2708     FALSE 0.191 135.000 0.000 NA   NA
 5429379 5429380 cce_2709 cce_2710     FALSE 0.084 186.000 0.000 NA   NA
 5429380 5429381 cce_2710 cce_2711     FALSE 0.270 -7.000 0.000 NA   NA
 5429381 5429382 cce_2711 cce_2712     FALSE 0.202 -102.000 0.000 NA   NA
 5429382 5429383 cce_2712 cce_2713   desC2 FALSE 0.383 70.000 0.000 NA   NA
 5429383 5429384 cce_2713 cce_2714 desC2   TRUE 0.860 2.000 0.222 1.000 N NA
 5429385 5429386 cce_2715 cce_2716     TRUE 0.741 6.000 0.065 NA   NA
 5429387 5429388 cce_2717 cce_2718     TRUE 0.681 57.000 0.021 NA   NA
 5429388 5429389 cce_2718 cce_2719     TRUE 0.600 125.000 0.057 NA   NA
 5429389 5429390 cce_2719 cce_2720     FALSE 0.234 118.000 0.000 NA   NA
 5429390 5429391 cce_2720 cce_2721     FALSE 0.217 125.000 0.000 NA   NA
 5429391 5429392 cce_2721 cce_2722     TRUE 0.914 37.000 0.500 NA   NA
 5429392 5429393 cce_2722 cce_2723     TRUE 0.708 117.000 0.111 NA   NA
 5429396 5429397 cce_2726 cce_2727     FALSE 0.213 -39.000 0.000 NA   NA
 5429397 5429398 cce_2727 cce_2728     FALSE 0.314 35.000 0.000 NA   NA
 5429398 5429399 cce_2728 cce_2729     TRUE 0.623 172.000 0.238 NA   NA
 5429399 5429400 cce_2729 cce_2730     FALSE 0.014 315.000 0.000 NA   NA
 5429401 5429402 cce_2731 cce_2732     TRUE 0.585 129.000 0.056 NA   NA
 5429402 5429403 cce_2732 cce_2733     TRUE 0.903 44.000 0.400 NA   NA
 5429405 5429406 cce_2735 cce_2736     FALSE 0.032 244.000 0.000 NA   NA
 5429406 5429407 cce_2736 cce_2737     FALSE 0.007 422.000 0.000 NA   NA
 5429412 5429413 cce_2742 cce_2743     TRUE 0.945 84.000 0.231 1.000 Y NA
 5429414 5429415 cce_2744 cce_2745     FALSE 0.073 193.000 0.000 NA   NA
 5429415 5429416 cce_2745 cce_2746     FALSE 0.004 598.000 0.000 NA   NA
 5429418 5429419 cce_2748 cce_2749     FALSE 0.324 41.000 0.000 NA   NA
 5429421 5429422 cce_2751 cce_2752     FALSE 0.253 111.000 0.000 NA   NA
 5429422 5429423 cce_2752 cce_2753     TRUE 0.516 65.000 0.000 1.000   NA
 5429426 5429427 cce_2756 cce_2757     TRUE 0.776 22.000 0.067 1.000 N NA
 5429427 5429428 cce_2757 cce_2758   nadD TRUE 0.596 -3.000 0.010 1.000 N NA
 5429428 5429429 cce_2758 cce_2759 nadD   TRUE 0.901 18.000 0.014 0.002 Y NA
 5429430 5429431 cce_2760 cce_2761     TRUE 0.669 79.000 0.019 NA   NA
 5429432 5429433 cce_2762 cce_2763     TRUE 0.804 -40.000 0.308 NA   NA
 5429435 5429436 cce_2765 cce_2766     TRUE 0.636 42.000 0.007 1.000   NA
 5429436 5429437 cce_2766 cce_2767     TRUE 0.654 15.000 0.022 NA   NA
 5429437 5429438 cce_2767 cce_2768     FALSE 0.005 452.000 0.000 NA N NA
 5429438 5429439 cce_2768 cce_2769     TRUE 0.707 51.000 0.041 NA   NA
 5429439 5429440 cce_2769 cce_2770     FALSE 0.164 151.000 0.000 NA   NA
 5429440 5429441 cce_2770 cce_2771   manA1 FALSE 0.232 119.000 0.000 NA   NA
 5429441 5429442 cce_2771 cce_2772 manA1   TRUE 0.704 129.000 0.111 1.000 N NA
 5429442 5429443 cce_2772 cce_2773     TRUE 0.598 34.000 0.016 NA   NA
 5429443 5429444 cce_2773 cce_2774     FALSE 0.480 115.000 0.011 NA   NA
 5429448 5429449 cce_2778 cce_2779   crtQ TRUE 0.954 58.000 0.800 NA   NA
 5429449 5429450 cce_2779 cce_2780 crtQ   FALSE 0.009 365.000 0.000 NA   NA
 5429450 5429451 cce_2780 cce_2781     FALSE 0.180 141.000 0.000 NA   NA
 5429453 5429454 cce_2783 cce_2784 hisS2   TRUE 0.651 54.000 0.006 1.000 N NA
 5429456 5429457 cce_2786 cce_2787     FALSE 0.059 232.000 0.000 1.000 N NA
 5429457 5429458 cce_2787 cce_2788     TRUE 0.983 31.000 1.000 0.007 Y NA
 5429458 5429459 cce_2788 cce_2789   pdxA FALSE 0.332 167.000 0.006 1.000 N NA
 5429459 5429460 cce_2789 cce_2790 pdxA   FALSE 0.320 93.000 0.000 NA   NA
 5429461 5429462 cce_2791 cce_2792 petM psb28-2 TRUE 0.793 105.000 0.120 1.000   NA
 5429462 5429463 cce_2792 cce_2793 psb28-2   FALSE 0.442 38.000 0.000 1.000   NA
 5429463 5429464 cce_2793 cce_2794     FALSE 0.471 13.000 0.000 1.000   NA
 5429465 5429466 cce_2795 cce_2796     FALSE 0.375 175.000 0.048 NA   NA
 5429467 5429468 cce_2797 cce_2798     FALSE 0.035 277.000 0.000 1.000   NA
 5429468 5429469 cce_2798 cce_2799     TRUE 0.874 49.000 0.211 1.000   NA
 5429469 5429470 cce_2799 cce_2800     TRUE 0.975 43.000 0.571 0.016 Y NA
 5429470 5429471 cce_2800 cce_2801     TRUE 0.892 20.000 0.286 1.000 N NA
 5429471 5429472 cce_2801 cce_2802     TRUE 0.945 64.000 0.625 NA   NA
 5429472 5429473 cce_2802 cce_2803     FALSE 0.024 269.000 0.000 NA   NA
 5429475 5429476 cce_2805 cce_2806     FALSE 0.041 231.000 0.000 NA   NA
 5429481 5429482 cce_2811 cce_2812   atpE FALSE 0.383 70.000 0.000 NA   NA
 5429482 5429483 cce_2812 cce_2813 atpE atpB1 TRUE 0.984 84.000 0.837 0.003 Y NA
 5429483 5429484 cce_2813 cce_2814 atpB1   FALSE 0.015 310.000 0.000 NA   NA
 5429484 5429485 cce_2814 cce_2815     TRUE 0.905 91.000 0.421 NA   NA
 5429489 5429490 cce_2819 cce_2820     FALSE 0.466 132.000 0.021 NA   NA
 5429492 5429493 cce_2822 cce_2823     TRUE 0.907 76.000 0.333 NA   NA
 5429493 5429494 cce_2823 cce_2824     FALSE 0.035 340.000 0.015 NA   NA
 5429495 5429496 cce_2825 cce_2826   recR TRUE 0.567 79.000 0.003 NA   NA
 5429497 5429498 cce_2827 cce_2828     TRUE 0.489 82.000 0.000 1.000   NA
 5429500 5429501 cce_2830 cce_2831     FALSE 0.233 -22.000 0.000 NA   NA
 5429503 5429504 cce_2833 cce_2834     FALSE 0.205 -55.000 0.000 NA   NA
 5429506 5429507 cce_2836 cce_2837     FALSE 0.327 5.000 0.000 NA   NA
 5429507 5429508 cce_2837 cce_2838     FALSE 0.009 363.000 0.000 NA   NA
 5429509 5429510 cce_2839 cce_2840     FALSE 0.327 5.000 0.000 NA   NA
 5429511 5429512 cce_2841 cce_2842     FALSE 0.257 -12.000 0.000 NA   NA
 5429512 5429513 cce_2842 cce_2843     FALSE 0.312 96.000 0.000 NA   NA
 5429516 5429517 cce_2846 cce_2847     FALSE 0.312 96.000 0.000 NA   NA
 5429517 5429518 cce_2847 cce_2848     TRUE 0.914 -3.000 0.600 NA   NA
 5429519 5429520 cce_2849 cce_2850     FALSE 0.328 90.000 0.000 NA   NA
 5429520 5429521 cce_2850 cce_2851     FALSE 0.289 -3.000 0.000 NA   NA
 5429522 5429523 cce_2852 cce_2853     FALSE 0.313 -40.000 0.000 1.000   NA
 5429523 5429524 cce_2853 cce_2854     FALSE 0.351 84.000 0.000 NA   NA
 5429524 5429525 cce_2854 cce_2855     FALSE 0.091 182.000 0.000 NA   NA
 5429525 5429526 cce_2855 cce_2856     FALSE 0.361 54.000 0.000 NA   NA
 5429526 5429527 cce_2856 cce_2857     TRUE 0.907 -13.000 0.667 NA   NA
 5429527 5429528 cce_2857 cce_2858     FALSE 0.253 111.000 0.000 NA   NA
 5429528 5429529 cce_2858 cce_2859     FALSE 0.320 39.000 0.000 NA   NA
 5429529 5429530 cce_2859 cce_2860     TRUE 0.778 -24.000 0.167 1.000   NA
 5429530 5429531 cce_2860 cce_2861     FALSE 0.010 362.000 0.000 NA   NA
 5429531 5429532 cce_2861 cce_2862     FALSE 0.261 -10.000 0.000 NA   NA
 5429532 5429533 cce_2862 cce_2863     FALSE 0.232 119.000 0.000 NA   NA
 5429534 5429535 cce_2864 cce_2865     TRUE 0.699 -37.000 0.125 NA   NA
 5429536 5429537 cce_2866 cce_2867     FALSE 0.004 588.000 0.000 NA   NA
 5429538 5429539 cce_2868 cce_2869     FALSE 0.386 63.000 0.000 NA   NA
 5429539 5429540 cce_2869 cce_2870     FALSE 0.304 0.000 0.000 NA   NA
 5429540 5429541 cce_2870 cce_2871     FALSE 0.331 24.000 0.000 NA   NA
 5429541 5429542 cce_2871 cce_2872     TRUE 0.503 111.000 0.012 NA   NA
 5429542 5429543 cce_2872 cce_2873     TRUE 0.922 -3.000 0.667 NA   NA
 5429543 5429544 cce_2873 cce_2874     FALSE 0.018 295.000 0.000 NA   NA
 5429545 5429546 cce_2875 cce_2876     FALSE 0.262 109.000 0.000 NA   NA
 5429548 5429549 cce_2878 cce_2879     FALSE 0.182 140.000 0.000 NA   NA
 5429550 5429551 cce_2880 cce_2881   fur3 FALSE 0.014 313.000 0.000 NA   NA
 5429552 5429553 cce_2882 cce_2883   purQ TRUE 0.974 -3.000 0.656 0.001 Y NA
 5429554 5429555 cce_2884 cce_2885 gloA   TRUE 0.668 16.000 0.014 1.000 N NA
 5429555 5429556 cce_2885 cce_2886     FALSE 0.052 216.000 0.000 NA   NA
 5429556 5429557 cce_2886 cce_2887   trpG TRUE 0.865 16.000 0.231 NA   NA
 5429557 5429558 cce_2887 cce_2888 trpG dgkA TRUE 0.877 47.000 0.231 1.000 N NA
 5429558 5429559 cce_2888 cce_2889 dgkA   TRUE 0.802 91.000 0.123 NA   NA
 5429559 5429560 cce_2889 cce_2890     TRUE 0.694 10.000 0.039 NA   NA
 5429561 5429562 cce_2891 cce_2892     FALSE 0.035 238.000 0.000 NA   NA
 5429562 5429563 cce_2892 cce_2893     FALSE 0.219 -30.000 0.000 NA   NA
 5429564 5429565 cce_2894 cce_2895   pepP1 TRUE 0.658 5.000 0.012 1.000   NA
 5429565 5429566 cce_2895 cce_2896 pepP1 ggt1 FALSE 0.129 282.000 0.000 1.000 Y NA
 5429569 5429570 cce_2899 cce_2900     FALSE 0.238 116.000 0.000 NA   NA
 5429572 5429573 cce_2902 cce_2903 hypA hypB TRUE 0.909 -9.000 0.333 0.001   NA
 5429573 5429574 cce_2903 cce_RNA036 hypB ssaA FALSE 0.338 48.000 0.000 NA   NA
 5429574 5429575 cce_RNA036 cce_2904 ssaA   FALSE 0.276 105.000 0.000 NA   NA
 5429575 5429576 cce_2904 cce_2905     TRUE 0.918 22.000 0.259 0.006   NA
 5429578 5429579 cce_2907 cce_2908 hypD apcA FALSE 0.389 188.000 0.069 1.000   NA
 5429579 5429580 cce_2908 cce_2909 apcA apcB TRUE 0.968 88.000 0.906 0.004   NA
 5429582 5429583 cce_2911 cce_2912 apcC   FALSE 0.032 287.000 0.000 1.000   NA
 5429584 5429585 cce_2913 cce_2914 tig   FALSE 0.069 196.000 0.000 NA   NA
 5429587 5429588 cce_2916 cce_2917     FALSE 0.336 19.000 0.000 NA   NA
 5429589 5429590 cce_2918 cce_2919     TRUE 0.849 13.000 0.150 1.000 N NA
 5429591 5429592 cce_2920 cce_2921     FALSE 0.155 155.000 0.000 NA   NA
 5429592 5429593 cce_2921 cce_2922     FALSE 0.222 -28.000 0.000 NA   NA
 5429593 5429594 cce_2922 cce_2923   pyrG FALSE 0.356 -37.000 0.002 NA   NA
 5429595 5429596 cce_2924 cce_2925   htpG FALSE 0.318 143.000 0.003 NA   NA
 5429597 5429598 cce_2926 cce_2927   nadB TRUE 0.710 70.000 0.012 1.000   NA
 5429598 5429599 cce_2927 cce_2928 nadB   FALSE 0.049 220.000 0.000 NA   NA
 5429601 5429602 cce_2930 cce_2931     FALSE 0.215 126.000 0.000 NA   NA
 5429603 5429604 cce_2932 cce_2933     FALSE 0.264 188.000 0.032 NA   NA
 5429604 5429605 cce_2933 cce_2934     TRUE 0.757 83.000 0.061 NA   NA
 5429605 5429606 cce_2934 cce_2935     TRUE 0.781 8.000 0.091 NA   NA
 5429606 5429607 cce_2935 cce_2936   dapB FALSE 0.374 77.000 0.000 NA   NA
 5429609 5429610 cce_2938 cce_2939   sbtA FALSE 0.005 538.000 0.000 NA   NA
 5429611 5429612 cce_2940 cce_2941     TRUE 0.632 58.000 0.009 NA   NA
 5429613 5429614 cce_2942 cce_2943     FALSE 0.437 193.000 0.167 NA   NA
 5429615 5429616 cce_2944 cce_2945     TRUE 0.738 0.000 0.085 NA N NA
 5429616 5429617 cce_2945 cce_2946     FALSE 0.012 679.000 0.000 0.065 N NA
 5429617 5429618 cce_2946 cce_RNA037     FALSE 0.158 154.000 0.000 NA   NA
 5429618 5429619 cce_RNA037 cce_2947     FALSE 0.314 35.000 0.000 NA   NA
 5429620 5429621 cce_2948 cce_2949     TRUE 0.562 61.000 0.002 NA   NA
 5429621 5429622 cce_2949 cce_2950     FALSE 0.319 151.000 0.004 NA   NA
 5429623 5429624 cce_2951 cce_2952     FALSE 0.021 325.000 0.000 1.000   NA
 5429626 5429627 cce_2954 cce_2955   psbV FALSE 0.464 174.000 0.061 1.000   NA
 5429627 5429628 cce_2955 cce_2956 psbV   FALSE 0.385 61.000 0.000 NA   NA
 5429629 5429630 cce_2957 cce_2958 gst2 petC1 FALSE 0.028 290.000 0.000 1.000 N NA
 5429630 5429631 cce_2958 cce_2959 petC1 petA TRUE 0.860 178.000 0.881 0.035   NA
 5429631 5429632 cce_2959 cce_2960 petA   FALSE 0.360 82.000 0.000 NA   NA
 5429632 5429633 cce_2960 cce_2961   znuC FALSE 0.227 -25.000 0.000 NA   NA
 5429633 5429634 cce_2961 cce_2962 znuC znuA TRUE 0.893 10.000 0.050 1.000 Y NA
 5429634 5429635 cce_2962 cce_2963 znuA znuB TRUE 0.976 48.000 0.616 0.075 Y NA
 5429635 5429636 cce_2963 cce_2964 znuB   FALSE 0.343 12.000 0.000 NA   NA
 5429636 5429637 cce_2964 cce_2965     FALSE 0.122 170.000 0.000 NA   NA
 5429637 5429638 cce_2965 cce_2966   hemE FALSE 0.146 160.000 0.000 NA   NA
 5429638 5429639 cce_2966 cce_2967 hemE   FALSE 0.039 270.000 0.000 1.000   NA
 5429640 5429641 cce_2968 cce_2969     TRUE 0.892 48.000 0.333 NA   NA
 5429641 5429642 cce_2969 cce_2970   galE2 TRUE 0.877 52.000 0.250 NA   NA
 5429644 5429645 cce_2972 cce_2973     FALSE 0.046 224.000 0.000 NA   NA
 5429646 5429647 cce_2974 cce_2975   hisS TRUE 0.530 16.000 0.003 NA   NA
 5429647 5429648 cce_2975 cce_2976 hisS   TRUE 0.625 6.000 0.018 NA   NA
 5429648 5429649 cce_2976 cce_2977     FALSE 0.125 169.000 0.000 NA   NA
 5429650 5429651 cce_2978 cce_2979     TRUE 0.936 51.000 0.625 NA   NA
 5429652 5429653 cce_2980 cce_2981     TRUE 0.552 160.000 0.000 1.000 Y NA
 5429654 5429655 cce_2982 cce_2983     FALSE 0.245 153.000 0.000 1.000   NA
 5429656 5429657 cce_2984 cce_2985     FALSE 0.048 221.000 0.000 NA   NA
 5429657 5429658 cce_2985 cce_2986     TRUE 0.950 37.000 1.000 NA   NA
 5429658 5429659 cce_2986 cce_2987     TRUE 0.890 55.000 0.222 1.000   NA
 5429659 5429660 cce_2987 cce_2988     FALSE 0.159 178.000 0.000 1.000   NA
 5429661 5429662 cce_2989 cce_2990     TRUE 0.911 13.000 0.250 0.065 N NA
 5429664 5429665 cce_2992 cce_2993 glyS   FALSE 0.474 116.000 0.003 1.000 N NA
 5429666 5429667 cce_2994 cce_2995     TRUE 0.554 1.000 0.008 NA   NA
 5429667 5429668 cce_2995 cce_2996     TRUE 0.566 48.000 0.006 NA   NA
 5429668 5429669 cce_2996 cce_2997     TRUE 0.891 56.000 0.273 NA   NA
 5429670 5429671 cce_2998 cce_2999 arsC   TRUE 0.894 -3.000 0.438 NA   NA
 5429671 5429672 cce_2999 cce_3000     TRUE 0.854 19.000 0.214 NA   NA
 5429676 5429677 cce_3004 cce_3005     TRUE 0.844 11.000 0.133 1.000   NA
 5429677 5429678 cce_3005 cce_3006     FALSE 0.458 83.000 0.000 1.000 N NA
 5429680 5429681 cce_3008 cce_3009     TRUE 0.816 -13.000 0.250 NA   NA
 5429681 5429682 cce_3009 cce_3010     FALSE 0.326 42.000 0.000 NA   NA
 5429682 5429683 cce_3010 cce_3011     FALSE 0.442 94.000 0.000 1.000   NA
 5429684 5429685 cce_3012 cce_3013     FALSE 0.164 151.000 0.000 NA   NA
 5429685 5429686 cce_3013 cce_3014     FALSE 0.366 80.000 0.000 NA   NA
 5429686 5429687 cce_3014 cce_3015     FALSE 0.064 202.000 0.000 NA   NA
 5429687 5429688 cce_3015 cce_3016     FALSE 0.122 170.000 0.000 NA   NA
 5429691 5429692 cce_3019 cce_3020     TRUE 0.799 82.000 0.091 NA   NA
 5429692 5429693 cce_3020 cce_3021   ribG TRUE 0.749 127.000 0.200 NA   NA
 5429693 5429694 cce_3021 cce_3022 ribG   FALSE 0.004 707.000 0.000 NA   NA
 5429695 5429696 cce_3023 cce_3024   smf TRUE 0.827 57.000 0.002 NA Y NA
 5429698 5429699 cce_3025 cce_3026 thiC deoC FALSE 0.027 294.000 0.000 1.000 N NA
 5429699 5429700 cce_3026 cce_3027 deoC   FALSE 0.386 -7.000 0.000 1.000   NA
 5429701 5429702 cce_3028 cce_3029     TRUE 0.567 -9.000 0.022 NA   NA
 5429702 5429703 cce_3029 cce_3030     FALSE 0.005 516.000 0.000 NA   NA
 5429705 5429706 cce_3032 cce_3033     FALSE 0.230 120.000 0.000 NA   NA
 5429706 5429707 cce_3033 cce_3034     FALSE 0.006 464.000 0.000 NA   NA
 5429707 5429708 cce_3034 cce_3035     FALSE 0.331 89.000 0.000 NA   NA
 5429708 5429709 cce_3035 cce_3036     FALSE 0.068 197.000 0.000 NA   NA
 5429709 5429710 cce_3036 cce_3037     FALSE 0.340 17.000 0.000 NA   NA
 5429711 5429712 cce_3038 cce_3039     FALSE 0.322 4.000 0.000 NA   NA
 5429712 5429713 cce_3039 cce_3040     FALSE 0.437 19.000 0.000 1.000 N NA
 5429713 5429714 cce_3040 cce_3041     FALSE 0.342 74.000 0.000 NA N NA
 5429714 5429715 cce_3041 cce_3042     FALSE 0.346 70.000 0.000 NA N NA
 5429715 5429716 cce_3042 cce_3043     TRUE 0.880 176.000 0.600 1.000 Y NA
 5429716 5429717 cce_3043 cce_3044     TRUE 0.936 69.000 0.125 1.000 Y NA
 5429717 5429718 cce_3044 cce_3045     TRUE 0.881 23.000 0.250 1.000 N NA
 5429718 5429719 cce_3045 cce_3046     TRUE 0.908 58.000 0.333 NA   NA
 5429719 5429720 cce_3046 cce_3047     TRUE 0.844 136.000 0.500 NA   NA
 5429720 5429721 cce_3047 cce_3048     TRUE 0.877 43.000 0.286 NA   NA
 5429721 5429722 cce_3048 cce_3049     TRUE 0.929 109.000 0.875 NA   NA
 5429723 5429724 cce_3050 cce_3051     FALSE 0.069 229.000 0.000 1.000   NA
 5429724 5429725 cce_3051 cce_3052     FALSE 0.470 12.000 0.000 1.000   NA
 5429725 5429726 cce_3052 cce_3053     TRUE 0.597 21.000 0.000 0.065 N NA
 5429726 5429727 cce_3053 cce_3054   exbB2 TRUE 0.956 -16.000 0.471 0.023 Y NA
 5429727 5429728 cce_3054 cce_3055 exbB2   FALSE 0.352 109.000 0.000 1.000 N NA
 5429728 5429729 cce_3055 cce_3056     FALSE 0.373 104.000 0.000 1.000 N NA
 5429729 5429730 cce_3056 cce_3057     TRUE 0.959 20.000 0.400 1.000 Y NA
 5429730 5429731 cce_3057 cce_3058     TRUE 0.944 -3.000 1.000 NA   NA
 5429731 5429732 cce_3058 cce_3059     FALSE 0.072 194.000 0.000 NA   NA
 5429732 5429733 cce_3059 cce_3060   hlyB2 TRUE 0.844 43.000 0.000 0.005 Y NA
 5429733 5429734 cce_3060 cce_3061 hlyB2   FALSE 0.100 178.000 0.000 NA   NA
 5429734 5429735 cce_3061 cce_3062     TRUE 0.676 187.000 0.500 NA   NA
 5429736 5429737 cce_3063 cce_3064     TRUE 0.834 -3.000 0.231 NA   NA
 5429740 5429741 cce_3067 cce_3068     FALSE 0.304 0.000 0.000 NA   NA
 5429745 5429746 cce_3072 cce_3073     FALSE 0.106 200.000 0.000 1.000   NA
 5429746 5429747 cce_3073 cce_3074     TRUE 0.704 145.000 0.000 0.003 Y NA
 5429747 5429748 cce_3074 cce_3075     TRUE 0.984 5.000 1.000 0.004 Y NA
 5429749 5429750 cce_3076 cce_3077     FALSE 0.207 129.000 0.000 NA   NA
 5429750 5429751 cce_3077 cce_3078     TRUE 0.957 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 5429751 5429752 cce_3078 cce_3079     TRUE 0.982 0.000 1.000 0.004 Y NA
 5429752 5429753 cce_3079 cce_3080     TRUE 0.805 -7.000 0.000 0.004 Y NA
 5429753 5429754 cce_3080 cce_3081     FALSE 0.278 96.000 0.000 NA N NA
 5429754 5429755 cce_3081 cce_3082     FALSE 0.330 80.000 0.000 NA N NA
 5429755 5429756 cce_3082 cce_3083     FALSE 0.008 395.000 0.000 NA   NA
 5429756 5429757 cce_3083 cce_3084     FALSE 0.329 25.000 0.000 NA   NA
 5429757 5429758 cce_3084 cce_3085     FALSE 0.084 186.000 0.000 NA   NA
 5429760 5429761 cce_3087 cce_3088     TRUE 0.922 60.000 0.400 NA   NA
 5429763 5429764 cce_3090 cce_3091     FALSE 0.436 47.000 0.000 1.000 N NA
 5429765 5429766 cce_3092 cce_3093     FALSE 0.039 224.000 0.000 NA N NA
 5429767 5429768 cce_3094 cce_3095 argD   TRUE 0.783 77.000 0.070 NA   NA
 5429769 5429770 cce_3096 cce_3097 pta   FALSE 0.374 57.000 0.000 NA   NA
 5429770 5429771 cce_3097 cce_3098     FALSE 0.318 94.000 0.000 NA   NA
 5429771 5429772 cce_3098 cce_3099     FALSE 0.461 -22.000 0.009 NA   NA
 5429773 5429774 cce_3100 cce_3101 desC1   FALSE 0.137 185.000 0.000 1.000   NA
 5429774 5429775 cce_3101 cce_3102     FALSE 0.379 58.000 0.000 NA   NA
 5429775 5429776 cce_3102 cce_3103   rps21-1 TRUE 0.886 28.000 0.333 NA   NA
 5429776 5429777 cce_3103 cce_3104 rps21-1   FALSE 0.009 483.000 0.000 1.000   NA
 5429779 5429780 cce_3106 cce_3107     FALSE 0.016 364.000 0.000 1.000   NA
 5429780 5429781 cce_3107 cce_3108     FALSE 0.204 130.000 0.000 NA   NA
 5429781 5429782 cce_3108 cce_3109     FALSE 0.245 -16.000 0.000 NA   NA
 5429782 5429783 cce_3109 cce_3110     FALSE 0.330 6.000 0.000 NA   NA
 5429783 5429784 cce_3110 cce_3111     FALSE 0.238 116.000 0.000 NA   NA
 5429784 5429785 cce_3111 cce_3112     TRUE 0.894 -3.000 0.444 NA   NA
 5429785 5429786 cce_3112 cce_3113     FALSE 0.142 162.000 0.000 NA   NA
 5429786 5429787 cce_3113 cce_3114     TRUE 0.926 -22.000 1.000 NA   NA
 5429787 5429788 cce_3114 cce_3115     FALSE 0.331 24.000 0.000 NA   NA
 5429788 5429789 cce_3115 cce_3116     FALSE 0.304 0.000 0.000 NA   NA
 5429789 5429790 cce_3116 cce_3117     FALSE 0.014 317.000 0.000 NA   NA
 5429791 5429792 cce_3118 cce_3119     TRUE 0.935 62.000 0.429 1.000 N NA
 5429792 5429793 cce_3119 cce_3120     TRUE 0.824 50.000 0.100 1.000   NA
 5429793 5429794 cce_3120 cce_3121     FALSE 0.249 217.000 0.047 1.000   NA
 5429794 5429795 cce_3121 cce_3122   aroB3 TRUE 0.796 14.000 0.070 1.000   NA
 5429796 5429797 cce_3123 cce_3124     FALSE 0.308 129.000 0.000 1.000   NA
 5429797 5429798 cce_3124 cce_3125     FALSE 0.080 436.000 0.267 NA   NA
 5429799 5429800 cce_RNA039 cce_3126     FALSE 0.290 102.000 0.000 NA   NA
 5429804 5429805 cce_3130 cce_3131     FALSE 0.233 -22.000 0.000 NA   NA
 5429806 5429807 cce_3132 cce_3133     TRUE 0.815 -7.000 0.222 NA   NA
 5429807 5429808 cce_3133 cce_3134   trpB FALSE 0.022 275.000 0.000 NA   NA
 5429808 5429809 cce_3134 cce_3135 trpB rnc FALSE 0.442 122.000 0.002 1.000 N NA
 5429809 5429810 cce_3135 cce_3136 rnc clcD FALSE 0.414 3.000 0.000 1.000 N NA
 5429810 5429811 cce_3136 cce_3137 clcD   FALSE 0.049 220.000 0.000 NA   NA
 5429811 5429812 cce_3137 cce_3138     FALSE 0.329 25.000 0.000 NA   NA
 5429813 5429814 cce_3139 cce_3140     TRUE 0.866 6.000 0.250 NA   NA
 5429815 5429816 cce_3141 cce_3142     FALSE 0.010 356.000 0.000 NA   NA
 5429817 5429818 cce_3143 cce_3144 lipA2   FALSE 0.032 243.000 0.000 NA   NA
 5429820 5429821 cce_3146 cce_3147 chlP   FALSE 0.186 171.000 0.000 1.000   NA
 5429823 5429824 cce_3149 cce_3150   rpl20 TRUE 0.563 60.000 0.002 NA   NA
 5429824 5429825 cce_3150 cce_3151 rpl20 rpl35 TRUE 0.983 47.000 0.928 0.010 Y NA
 5429825 5429826 cce_3151 cce_3152 rpl35   TRUE 0.498 42.000 0.002 NA   NA
 5429826 5429827 cce_3152 cce_3153     FALSE 0.005 516.000 0.000 NA   NA
 5429827 5429828 cce_3153 cce_3154   ftrV TRUE 0.784 87.000 0.065 1.000   NA
 5429830 5429831 cce_3156 cce_3157     TRUE 0.513 59.000 0.000 1.000   NA
 5429832 5429833 cce_3158 cce_3159     FALSE 0.155 155.000 0.000 NA   NA
 5429833 5429834 cce_3159 cce_3160     TRUE 0.892 -3.000 0.429 NA   NA
 5429836 5429837 cce_3162 cce_3163   hofD TRUE 0.611 90.000 0.005 1.000 N NA
 5429838 5429839 cce_3164 cce_3165 rbcS rbcX TRUE 0.950 24.000 0.913 NA   NA
 5429839 5429840 cce_3165 cce_3166 rbcX rbcL TRUE 0.950 82.000 0.792 NA   NA
 5429843 5429844 cce_3169 cce_3170     FALSE 0.270 107.000 0.000 NA   NA
 5429848 5429849 cce_3174 cce_3175     FALSE 0.027 256.000 0.000 NA   NA
 5429850 5429851 cce_3176 cce_3177 petF5   TRUE 0.589 122.000 0.032 1.000 N NA
 5429851 5429852 cce_3177 cce_3178   desA TRUE 0.558 130.000 0.032 1.000 N NA
 5429853 5429854 cce_3179 cce_3180   sir FALSE 0.009 364.000 0.000 NA   NA
 5429854 5429855 cce_3180 cce_3181 sir   TRUE 0.771 85.000 0.055 1.000 N NA
 5429855 5429856 cce_3181 cce_3182     TRUE 0.936 65.000 0.500 NA   NA
 5429856 5429857 cce_3182 cce_3183     TRUE 0.893 18.000 0.333 NA   NA
 5429857 5429858 cce_3183 cce_3184     TRUE 0.932 7.000 0.625 NA   NA
 5429858 5429859 cce_3184 cce_3185     TRUE 0.739 12.000 0.061 NA N NA
 5429860 5429861 cce_3186 cce_3187     FALSE 0.198 132.000 0.000 NA   NA
 5429861 5429862 cce_3187 cce_3188     FALSE 0.174 145.000 0.000 NA   NA
 5429862 5429863 cce_3188 cce_3189     FALSE 0.189 136.000 0.000 NA   NA
 5429863 5429864 cce_3189 cce_3190     TRUE 0.785 68.000 0.066 NA   NA
 5429864 5429865 cce_3190 cce_3191     TRUE 0.555 2.000 0.008 NA   NA
 5429865 5429866 cce_3191 cce_3192     FALSE 0.445 122.000 0.008 NA   NA
 5429866 5429867 cce_3192 cce_3193   chrA TRUE 0.752 47.000 0.049 1.000 N NA
 5429867 5429868 cce_3193 cce_3194 chrA   FALSE 0.433 7.000 0.000 1.000 N NA
 5429869 5429870 cce_3195 cce_3196     TRUE 0.516 64.000 0.000 1.000   NA
 5429871 5429872 cce_3197 cce_3198     FALSE 0.348 51.000 0.000 NA   NA
 5429872 5429873 cce_3198 cce_3199     FALSE 0.221 124.000 0.000 NA   NA
 5429874 5429875 cce_3200 cce_3201   hemF FALSE 0.184 139.000 0.000 NA   NA
 5429875 5429876 cce_3201 cce_3202 hemF icd FALSE 0.140 180.000 0.000 1.000 N NA
 5429880 5429881 cce_3206 cce_3207     TRUE 0.833 11.000 0.115 1.000   NA
 5429881 5429882 cce_3207 cce_3208   cpcG FALSE 0.393 204.000 0.115 1.000   NA
 5429882 5429883 cce_3208 cce_3209 cpcG guaB FALSE 0.026 306.000 0.000 1.000   NA
 5429883 5429884 cce_3209 cce_3210 guaB   FALSE 0.005 577.000 0.000 NA   NA
 5429886 5429887 cce_3212 cce_3213     FALSE 0.242 -18.000 0.000 NA   NA
 5429891 5429892 cce_3217 cce_3218     FALSE 0.339 10.000 0.000 NA   NA
 5429892 5429893 cce_3218 cce_3219     FALSE 0.029 253.000 0.000 NA   NA
 5429893 5429894 cce_3219 cce_3220     FALSE 0.289 -3.000 0.000 NA   NA
 5429895 5429896 cce_3221 cce_3222 clpB2   FALSE 0.005 550.000 0.000 NA   NA
 5429896 5429897 cce_3222 cce_3223     FALSE 0.153 156.000 0.000 NA   NA
 5429898 5429899 cce_3224 cce_3225 argB   FALSE 0.282 165.000 0.005 NA   NA
 5429899 5429900 cce_3225 cce_3226     FALSE 0.044 226.000 0.000 NA   NA
 5429900 5429901 cce_3226 cce_3227     FALSE 0.063 204.000 0.000 NA   NA
 5429901 5429902 cce_3227 cce_3228     FALSE 0.282 187.000 0.037 NA   NA
 5429907 5429908 cce_3232 cce_3233   gmd TRUE 0.945 104.000 0.235 0.005 Y NA
 5429908 5429909 cce_3233 cce_3234 gmd   FALSE 0.059 350.000 0.000 NA Y NA
 5429909 5429910 cce_3234 cce_3235     TRUE 0.944 98.000 0.375 NA Y NA
 5429912 5429913 cce_3237 cce_3238     TRUE 0.558 111.000 0.025 NA   NA
 5429913 5429914 cce_3238 cce_3239     TRUE 0.879 91.000 0.300 NA   NA
 5429914 5429915 cce_3239 cce_3240     FALSE 0.158 154.000 0.000 NA   NA
 5429915 5429916 cce_3240 cce_3241     FALSE 0.261 -10.000 0.000 NA   NA
 5429916 5429917 cce_3241 cce_3242     FALSE 0.100 178.000 0.000 NA   NA
 5429917 5429918 cce_3242 cce_3243     FALSE 0.020 285.000 0.000 NA   NA
 5429920 5429921 cce_3245 cce_3246     FALSE 0.269 142.000 0.000 1.000   NA
 5429921 5429922 cce_3246 cce_3247     FALSE 0.042 229.000 0.000 NA   NA
 5429924 5429925 cce_3249 cce_3250     FALSE 0.007 416.000 0.000 NA   NA
 5429926 5429927 cce_3251 cce_3252 argF   FALSE 0.019 325.000 0.000 1.000 N NA
 5429927 5429928 cce_3252 cce_3253   pfkA2 FALSE 0.445 13.000 0.000 1.000 N NA
 5429929 5429930 cce_3254 cce_3255     TRUE 0.762 73.000 0.053 NA   NA
 5429932 5429933 cce_3256 cce_3257 rpl32   TRUE 0.648 77.000 0.003 1.000   NA
 5429933 5429934 cce_3257 cce_3258     TRUE 0.953 6.000 1.000 NA   NA
 5429934 5429935 cce_3258 cce_3259     TRUE 0.827 10.000 0.150 NA   NA
 5429935 5429936 cce_3259 cce_3260   ribD TRUE 0.632 59.000 0.002 1.000 N NA
 5429937 5429938 cce_3261 cce_3262 amt1   TRUE 0.619 30.000 0.020 NA   NA
 5429939 5429940 cce_3263 cce_3264   cytM FALSE 0.253 111.000 0.000 NA   NA
 5429941 5429942 cce_3265 cce_3266 petG guaA FALSE 0.020 332.000 0.000 1.000   NA
 5429943 5429944 cce_3267 cce_3268 smpB   FALSE 0.389 123.000 0.003 NA   NA
 5429947 5429948 cce_3271 cce_3272     FALSE 0.027 256.000 0.000 NA   NA
 5429948 5429949 cce_3272 cce_3273     FALSE 0.343 12.000 0.000 NA   NA
 5429949 5429950 cce_3273 cce_3274     FALSE 0.322 28.000 0.000 NA   NA
 5429951 5429952 cce_3275 cce_3276 accC   TRUE 0.697 84.000 0.016 1.000   NA
 5429952 5429953 cce_3276 cce_3277     FALSE 0.097 180.000 0.000 NA   NA
 5429954 5429955 cce_3278 cce_3279     FALSE 0.318 38.000 0.000 NA   NA
 5429955 5429956 cce_3279 cce_3280   acnB FALSE 0.014 381.000 0.000 1.000   NA
 5429956 5429957 cce_3280 cce_3281 acnB   FALSE 0.365 55.000 0.000 NA   NA
 5429959 5429960 cce_3283 cce_3284     FALSE 0.333 45.000 0.000 NA   NA
 5429960 5429961 cce_3284 cce_3285   xisH3 FALSE 0.325 27.000 0.000 NA   NA
 5429961 5429962 cce_3285 cce_3286 xisH3   TRUE 0.849 -12.000 0.333 NA   NA
 5429962 5429963 cce_3286 cce_3287     TRUE 0.910 69.000 0.333 NA   NA
 5429965 5429966 cce_3289 cce_3290   hisB TRUE 0.492 30.000 0.002 NA   NA
 5429968 5429969 cce_3292 cce_3293 hisC suhB TRUE 0.584 -10.000 0.015 1.000 N NA
 5429969 5429970 cce_3293 cce_3294 suhB   FALSE 0.379 58.000 0.000 NA   NA
 5429971 5429972 cce_3295 cce_3296     FALSE 0.238 116.000 0.000 NA   NA
 5429973 5429974 cce_3297 cce_3298     FALSE 0.072 194.000 0.000 NA   NA
 5429975 5429976 cce_3299 cce_3300   pdxJ TRUE 0.494 148.000 0.046 NA   NA
 5429978 5429979 cce_3302 cce_3303     FALSE 0.328 43.000 0.000 NA   NA
 5429979 5429980 cce_3303 cce_3304     FALSE 0.012 336.000 0.000 NA   NA
 5429980 5429981 cce_3304 cce_3305     TRUE 0.652 -19.000 0.069 NA   NA
 5429983 5429984 cce_3307 cce_3308     FALSE 0.318 38.000 0.000 NA   NA
 5429984 5429985 cce_3308 cce_3309     FALSE 0.322 28.000 0.000 NA   NA
 5429985 5429986 cce_3309 cce_3310     FALSE 0.289 -3.000 0.000 NA   NA
 5429987 5429988 cce_3311 cce_3312     TRUE 0.790 81.000 0.080 NA   NA
 5429988 5429989 cce_3312 cce_3313     FALSE 0.060 206.000 0.000 NA   NA
 5429989 5429990 cce_3313 cce_3314     TRUE 0.665 73.000 0.015 NA   NA
 5429990 5429991 cce_3314 cce_3315     FALSE 0.024 267.000 0.000 NA   NA
 5429992 5429993 cce_3316 cce_3317     TRUE 0.628 14.000 0.015 NA   NA
 5429993 5429994 cce_3317 cce_3318     FALSE 0.390 144.000 0.012 NA   NA
 5429994 5429995 cce_3318 cce_3319     TRUE 0.692 24.000 0.025 1.000 N NA
 5429997 5429998 cce_3321 cce_3322     FALSE 0.204 130.000 0.000 NA   NA
 5430002 5430003 cce_3326 cce_3327     TRUE 0.666 79.000 0.005 1.000   NA
 5430007 5430008 cce_3331 cce_3332     FALSE 0.017 300.000 0.000 NA   NA
 5430009 5430010 cce_3333 cce_3334     TRUE 0.757 24.000 0.074 NA   NA
 5430010 5430011 cce_3334 cce_3335     TRUE 0.827 11.000 0.148 NA   NA
 5430013 5430014 cce_3337 cce_3338   xdhC FALSE 0.311 85.000 0.000 NA N NA
 5430014 5430015 cce_3338 cce_3339 xdhC   TRUE 0.821 7.000 0.146 NA   NA
 5430016 5430017 cce_3340 cce_3341     FALSE 0.318 30.000 0.000 NA   NA
 5430018 5430019 cce_3342 cce_3343     FALSE 0.093 181.000 0.000 NA   NA
 5430019 5430020 cce_3343 cce_3344     FALSE 0.331 122.000 0.000 1.000   NA
 5430021 5430022 cce_3345 cce_3346   rnb TRUE 0.704 -3.000 0.066 NA   NA
 5430022 5430023 cce_3346 cce_3347 rnb rps18 FALSE 0.475 152.000 0.027 1.000 N NA
 5430023 5430024 cce_3347 cce_3348 rps18 rpl33 TRUE 0.903 33.000 0.037 0.009 Y NA
 5430024 5430025 cce_3348 cce_3349 rpl33   FALSE 0.243 114.000 0.000 NA   NA
 5430025 5430026 cce_3349 cce_3350     FALSE 0.289 -3.000 0.000 NA   NA
 5430027 5430028 cce_3351 cce_3352     FALSE 0.309 13.000 0.000 NA N NA
 5430028 5430029 cce_3352 cce_3353     FALSE 0.330 6.000 0.000 NA   NA
 5430029 5430030 cce_3353 cce_3354     FALSE 0.289 -3.000 0.000 NA   NA
 5430030 5430031 cce_3354 cce_3355     TRUE 0.920 7.000 0.500 NA   NA
 5430031 5430032 cce_3355 cce_3356     FALSE 0.333 23.000 0.000 NA   NA
 5430033 5430034 cce_3357 cce_3358     FALSE 0.094 252.000 0.019 NA   NA
 5430035 5430036 cce_3359 cce_3360 cobQ   TRUE 0.703 16.000 0.021 1.000   NA
 5430037 5430038 cce_3361 cce_3362     FALSE 0.061 205.000 0.000 NA   NA
 5430039 5430040 cce_3363 cce_3364     TRUE 0.689 71.000 0.021 NA   NA
 5430040 5430041 cce_3364 cce_3365     TRUE 0.583 29.000 0.012 NA   NA
 5430041 5430042 cce_3365 cce_3366   ccmA FALSE 0.063 204.000 0.000 NA   NA
 5430042 5430043 cce_3366 cce_3367 ccmA   FALSE 0.015 307.000 0.000 NA   NA
 5430043 5430044 cce_3367 cce_3368     TRUE 0.950 3.000 1.000 NA   NA
 5430046 5430047 cce_3370 cce_3371   sppA1 FALSE 0.004 669.000 0.000 NA   NA
 5430047 5430048 cce_3371 cce_3372 sppA1 aroH TRUE 0.864 44.000 0.207 1.000 N NA
 5430051 5430052 cce_3375 cce_3376   rimI FALSE 0.464 87.000 0.000 1.000   NA
 5430053 5430054 cce_3377 cce_3378     TRUE 0.927 67.000 0.429 NA   NA
 5430054 5430055 cce_3378 cce_3379     TRUE 0.947 42.000 0.286 1.000 Y NA
 5430055 5430056 cce_3379 cce_3380     FALSE 0.132 166.000 0.000 NA   NA
 5430056 5430057 cce_3380 cce_3381     FALSE 0.369 56.000 0.000 NA   NA
 5430059 5430060 cce_3383 cce_3384     FALSE 0.140 163.000 0.000 NA   NA
 5430060 5430061 cce_3384 cce_3385     TRUE 0.663 16.000 0.025 NA   NA
 5430061 5430062 cce_3385 cce_3386   nblB FALSE 0.325 -19.000 0.000 1.000 N NA
 5430063 5430064 cce_3387 cce_3388     FALSE 0.339 10.000 0.000 NA   NA
 5430064 5430065 cce_3388 cce_3389     TRUE 0.653 28.000 0.029 NA   NA
 5430065 5430066 cce_3389 cce_3390     FALSE 0.016 304.000 0.000 NA   NA
 5430066 5430067 cce_3390 cce_3391     TRUE 0.530 -15.000 0.005 1.000   NA
 5430067 5430068 cce_3391 cce_3392   rps16 TRUE 0.870 -19.000 0.385 1.000   NA
 5430068 5430069 cce_3392 cce_3393 rps16   TRUE 0.552 82.000 0.003 NA   NA
 5430069 5430070 cce_3393 cce_3394   psbI TRUE 0.655 133.000 0.107 NA   NA
 5430071 5430072 cce_3395 cce_3396 ndhN glgA1 FALSE 0.031 291.000 0.000 1.000   NA
 5430073 5430074 cce_3397 cce_3398   ftrC TRUE 0.739 -3.000 0.090 NA   NA
 5430074 5430075 cce_3398 cce_3399 ftrC   FALSE 0.025 266.000 0.000 NA   NA
 5430075 5430076 cce_3399 cce_3400     FALSE 0.108 175.000 0.000 NA   NA
 5430077 5430078 cce_3401 cce_3402 trpE2   FALSE 0.464 142.000 0.013 1.000   NA
 5430079 5430080 cce_3403 cce_3404     FALSE 0.270 -7.000 0.000 NA   NA
 5430080 5430081 cce_3404 cce_3405   dnaB1 FALSE 0.270 -7.000 0.000 NA   NA
 5430082 5430083 cce_3406 cce_3407     TRUE 0.693 23.000 0.041 NA   NA
 5430084 5430085 cce_3408 cce_3409     TRUE 0.659 21.000 0.027 NA   NA
 5430085 5430086 cce_3409 cce_3410   petC2 TRUE 0.809 127.000 0.333 NA N NA
 5430086 5430087 cce_3410 cce_3411 petC2 psbA2 TRUE 0.920 75.000 0.222 0.034   NA
 5430089 5430090 cce_3413 cce_3414   cydB FALSE 0.442 30.000 0.000 1.000   NA
 5430090 5430091 cce_3414 cce_3415 cydB cydA TRUE 0.979 5.000 0.750 0.034 Y NA
 5430091 5430092 cce_3415 cce_3416 cydA   TRUE 0.758 47.000 0.048 1.000   NA
 5430093 5430094 cce_3417 cce_3418 natA   TRUE 0.729 44.000 0.042 1.000 N NA
 5430095 5430096 cce_3419 cce_3420   pykF1 TRUE 0.642 33.000 0.028 NA   NA
 5430097 5430098 cce_3421 cce_3422   rfbB2 FALSE 0.314 32.000 0.000 NA   NA
 5430098 5430099 cce_3422 cce_3423 rfbB2 ugd TRUE 0.918 121.000 0.291 1.000 Y NA
 5430099 5430100 cce_3423 cce_3424 ugd   FALSE 0.006 481.000 0.000 NA   NA
 5430101 5430102 cce_3425 cce_3426     FALSE 0.007 389.000 0.000 NA N NA
 5430104 5430105 cce_3428 cce_3429     TRUE 0.834 -13.000 0.250 1.000 N NA
 5430105 5430106 cce_3429 cce_3430     TRUE 0.761 6.000 0.077 NA   NA
 5430106 5430107 cce_3430 cce_3431     FALSE 0.384 69.000 0.000 NA   NA
 5430108 5430109 cce_3432 cce_3433     FALSE 0.044 227.000 0.000 NA   NA
 5430109 5430110 cce_3433 cce_3434     TRUE 0.713 28.000 0.053 NA   NA
 5430111 5430112 cce_3435 cce_3436     FALSE 0.172 146.000 0.000 NA   NA
 5430112 5430113 cce_3436 cce_3437     TRUE 0.944 89.000 0.800 NA   NA
 5430114 5430115 cce_3438 cce_3439     TRUE 0.856 7.000 0.222 NA   NA
 5430116 5430117 cce_3440 cce_3441     FALSE 0.200 168.000 0.000 1.000   NA
 5430117 5430118 cce_3441 cce_3442     FALSE 0.014 316.000 0.000 NA   NA
 5430120 5430121 cce_3444 cce_3445     TRUE 0.705 113.000 0.098 NA   NA
 5430123 5430124 cce_3447 cce_3448     FALSE 0.385 61.000 0.000 NA   NA
 5430126 5430127 cce_3450 cce_3451     TRUE 0.876 47.000 0.273 NA   NA
 5430128 5430129 cce_3452 cce_3453     FALSE 0.335 8.000 0.000 NA   NA
 5430129 5430130 cce_3453 cce_3454     FALSE 0.344 14.000 0.000 NA   NA
 5430130 5430131 cce_3454 cce_3455     FALSE 0.078 189.000 0.000 NA   NA
 5430131 5430132 cce_3455 cce_3456     FALSE 0.344 14.000 0.000 NA   NA
 5430132 5430133 cce_3456 cce_3457     FALSE 0.078 189.000 0.000 NA   NA
 5430133 5430134 cce_3457 cce_3458     FALSE 0.004 738.000 0.000 NA   NA
 5430135 5430136 cce_3459 cce_3460     TRUE 0.863 57.000 0.147 1.000 N NA
 5430136 5430137 cce_3460 cce_3461     FALSE 0.005 887.000 0.000 1.000 N NA
 5430138 5430139 cce_3462 cce_3463 lysS   FALSE 0.009 374.000 0.000 NA   NA
 5430140 5430141 cce_3464 cce_3465   glgX TRUE 0.619 107.000 0.038 NA   NA
 5430141 5430142 cce_3465 cce_3466 glgX   FALSE 0.146 160.000 0.000 NA   NA
 5430145 5430146 cce_3469 cce_3470     TRUE 0.789 40.000 0.111 NA   NA
 5430146 5430147 cce_3470 cce_3471     TRUE 0.772 8.000 0.083 NA   NA
 5430150 5430151 cce_3474 cce_3475     FALSE 0.324 91.000 0.000 NA   NA
 5430151 5430152 cce_3475 cce_3476     FALSE 0.108 198.000 0.000 1.000   NA
 5430152 5430153 cce_3476 cce_3477   psbA4 FALSE 0.044 258.000 0.000 1.000   NA
 5430153 5430154 cce_3477 cce_3478 psbA4   FALSE 0.011 337.000 0.000 NA   NA
 5430155 5430156 cce_3479 cce_3480     FALSE 0.226 122.000 0.000 NA   NA
 5430157 5430158 cce_3481 cce_3482     FALSE 0.337 9.000 0.000 NA   NA
 5430159 5430160 cce_3483 cce_3484 bicA   FALSE 0.015 361.000 0.000 1.000 N NA
 5430161 5430162 cce_3485 cce_3486     FALSE 0.227 -25.000 0.000 NA   NA
 5430162 5430163 cce_3486 cce_3487   rpoC2 FALSE 0.486 72.000 0.000 1.000 N NA
 5430163 5430164 cce_3487 cce_3488 rpoC2 rpoB TRUE 0.849 110.000 0.006 0.001 Y NA
 5430164 5430165 cce_3488 cce_3489 rpoB   TRUE 0.563 38.000 0.012 NA N NA
 5430165 5430166 cce_3489 cce_3490   rps20 FALSE 0.226 196.000 0.034 NA N NA
 5430168 5430169 cce_3492 cce_3493     FALSE 0.095 209.000 0.000 1.000   NA
 5430169 5430170 cce_3493 cce_3494     FALSE 0.026 867.000 0.000 1.000 Y NA
 5430172 5430173 cce_3496 cce_3497   gltS FALSE 0.298 125.000 0.000 1.000 N NA
 5430173 5430174 cce_3497 cce_3498 gltS   FALSE 0.459 45.000 0.000 1.000   NA
 5430174 5430175 cce_3498 cce_3499     FALSE 0.006 464.000 0.000 NA   NA
 5430175 5430176 cce_3499 cce_3500     FALSE 0.207 129.000 0.000 NA   NA
 5430176 5430177 cce_3500 cce_3501   psbA1 FALSE 0.191 170.000 0.000 1.000   NA
 5430177 5430178 cce_3501 cce_3502 psbA1   FALSE 0.195 169.000 0.000 1.000   NA
 5430178 5430179 cce_3502 cce_3503     TRUE 0.800 66.000 0.050 1.000   NA
 5430181 5430182 cce_3505 cce_3506     TRUE 0.823 16.000 0.138 NA   NA
 5430182 5430183 cce_3506 cce_3507     TRUE 0.857 29.000 0.241 NA   NA
 5430184 5430185 cce_3508 cce_3509     TRUE 0.948 -7.000 0.300 0.034 Y NA
 5430185 5430186 cce_3509 cce_3510     TRUE 0.934 -13.000 0.200 0.000 Y NA
 5430186 5430187 cce_3510 cce_3511     FALSE 0.011 345.000 0.000 NA   NA
 5430187 5430188 cce_3511 cce_3512     FALSE 0.043 228.000 0.000 NA   NA
 5430188 5430189 cce_3512 cce_3513     FALSE 0.270 107.000 0.000 NA   NA
 5430191 5430192 cce_3515 cce_3516   bioD TRUE 0.679 2.000 0.027 1.000 N NA
 5430193 5430194 cce_3517 cce_3518     FALSE 0.029 382.000 0.000 0.014   NA
 5430194 5430195 cce_3518 cce_3519   phoU FALSE 0.408 187.000 0.105 NA   NA
 5430195 5430196 cce_3519 cce_3520 phoU   TRUE 0.503 184.000 0.200 NA N NA
 5430201 5430202 cce_3525 cce_3526     TRUE 0.755 116.000 0.167 NA   NA
 5430202 5430203 cce_3526 cce_3527     FALSE 0.004 688.000 0.000 NA   NA
 5430203 5430204 cce_3527 cce_3528     TRUE 0.749 60.000 0.045 NA   NA
 5430204 5430205 cce_3528 cce_3529     FALSE 0.191 135.000 0.000 NA   NA
 5430205 5430206 cce_3529 cce_3530     FALSE 0.322 28.000 0.000 NA   NA
 5430206 5430207 cce_3530 cce_3531     FALSE 0.019 286.000 0.000 NA   NA
 5430208 5430209 cce_3532 cce_3533     TRUE 0.646 71.000 0.011 NA   NA
 5430209 5430210 cce_3533 cce_3534   trpS TRUE 0.705 85.000 0.024 1.000 N NA
 5430212 5430213 cce_3536 cce_3537     TRUE 0.938 13.000 0.667 NA   NA
 5430213 5430214 cce_3537 cce_3538     FALSE 0.385 65.000 0.000 NA   NA
 5430214 5430215 cce_3538 cce_3539     TRUE 0.948 54.000 0.750 NA   NA
 5430220 5430221 cce_3544 cce_3545     TRUE 0.843 -7.000 0.286 NA   NA
 5430221 5430222 cce_3545 cce_3546     TRUE 0.683 -3.000 0.054 NA   NA
 5430222 5430223 cce_3546 cce_3547     TRUE 0.495 80.000 0.000 1.000   NA
 5430224 5430225 cce_3548 cce_3549     FALSE 0.204 130.000 0.000 NA   NA
 5430226 5430227 cce_3550 cce_3551     FALSE 0.221 124.000 0.000 NA   NA
 5430227 5430228 cce_3551 cce_3552     FALSE 0.348 51.000 0.000 NA   NA
 5430229 5430230 cce_3553 cce_3554     TRUE 0.709 -3.000 0.069 NA   NA
 5430230 5430231 cce_3554 cce_3555     FALSE 0.314 35.000 0.000 NA   NA
 5430233 5430234 cce_3557 cce_3558     FALSE 0.275 239.000 0.000 0.018 Y NA
 5430234 5430235 cce_3558 cce_3559     TRUE 0.981 63.000 0.600 0.018 Y NA
 5430236 5430237 cce_3560 cce_3561     FALSE 0.334 88.000 0.000 NA   NA
 5430237 5430238 cce_3561 cce_3562     FALSE 0.253 111.000 0.000 NA   NA
 5430238 5430239 cce_3562 cce_3563   clpS2 FALSE 0.008 384.000 0.000 NA   NA
 5430239 5430240 cce_3563 cce_3564 clpS2   TRUE 0.865 4.000 0.255 NA   NA
 5430240 5430241 cce_3564 cce_3565     TRUE 0.779 84.000 0.078 NA   NA
 5430241 5430242 cce_3565 cce_3566     FALSE 0.316 37.000 0.000 NA   NA
 5430243 5430244 cce_3567 cce_3568     FALSE 0.300 99.000 0.000 NA   NA
 5430245 5430246 cce_3569 cce_3570     TRUE 0.811 88.000 0.091 1.000   NA
 5430246 5430247 cce_3570 cce_3571   apcD FALSE 0.178 173.000 0.000 1.000   NA
 5430247 5430248 cce_3571 cce_3572 apcD   TRUE 0.582 192.000 0.357 NA   NA
 5430250 5430251 cce_3574 cce_3575     TRUE 0.618 79.000 0.008 NA   NA
 5430253 5430254 cce_3577 cce_3578     TRUE 0.746 7.000 0.067 NA   NA
 5430254 5430255 cce_3578 cce_3579   ftsH2 FALSE 0.004 724.000 0.000 NA   NA
 5430256 5430257 cce_3580 cce_3581     TRUE 0.801 5.000 0.119 NA   NA
 5430257 5430258 cce_3581 cce_3582     TRUE 0.871 -19.000 0.471 NA   NA
 5430258 5430259 cce_3582 cce_3583     FALSE 0.230 256.000 0.190 NA   NA
 5430259 5430260 cce_3583 cce_3584     TRUE 0.718 118.000 0.120 NA   NA
 5430261 5430262 cce_3585 cce_3586   sigJ FALSE 0.024 267.000 0.000 NA   NA
 5430264 5430265 cce_3588 cce_3589     FALSE 0.325 27.000 0.000 NA   NA
 5430267 5430268 cce_3591 cce_3592 pyrH rrf TRUE 0.912 -13.000 0.626 1.000 N NA
 5430268 5430269 cce_3592 cce_3593 rrf codA FALSE 0.024 305.000 0.000 1.000 N NA
 5430269 5430270 cce_3593 cce_3594 codA sigD FALSE 0.013 377.000 0.000 1.000 N NA
 5430270 5430271 cce_3594 cce_3595 sigD   TRUE 0.638 162.000 0.190 NA   NA
 5430271 5430272 cce_3595 cce_3596   mutT TRUE 0.563 13.000 0.005 NA   NA
 5430274 5430275 cce_3598 cce_3599     TRUE 0.909 43.000 0.429 NA   NA
 5430275 5430276 cce_3599 cce_3600     TRUE 0.812 121.000 0.286 NA   NA
 5430276 5430277 cce_3600 cce_3601     TRUE 0.736 13.000 0.054 NA   NA
 5430277 5430278 cce_3601 cce_3602     TRUE 0.555 132.000 0.054 NA N NA
 5430279 5430280 cce_3603 cce_3604     FALSE 0.380 73.000 0.000 NA   NA
 5430281 5430282 cce_3605 cce_3606     TRUE 0.877 52.000 0.044 NA Y NA
 5430283 5430284 cce_3607 cce_3608     FALSE 0.304 0.000 0.000 NA   NA
 5430284 5430285 cce_3608 cce_3609     FALSE 0.234 118.000 0.000 NA   NA
 5430285 5430286 cce_3609 cce_3610     FALSE 0.276 105.000 0.000 NA   NA
 5430286 5430287 cce_3610 cce_3611     FALSE 0.158 154.000 0.000 NA   NA
 5430289 5430290 cce_3613 cce_3614     TRUE 0.972 8.000 0.429 0.003 Y NA
 5430292 5430293 cce_3616 cce_RNA042     FALSE 0.005 547.000 0.000 NA   NA
 5430294 5430295 cce_3617 cce_3618 leuB   TRUE 0.732 66.000 0.037 NA   NA
 5430295 5430296 cce_3618 cce_3619     FALSE 0.012 326.000 0.000 NA   NA
 5430299 5430300 cce_RNA043 cce_3622     FALSE 0.013 323.000 0.000 NA   NA
 5430301 5430302 cce_3623 cce_3624     TRUE 0.838 115.000 0.077 NA Y NA
 5430302 5430303 cce_3624 cce_3625     FALSE 0.044 226.000 0.000 NA   NA
 5430303 5430304 cce_3625 cce_3626     TRUE 0.914 39.000 0.404 1.000   NA
 5430304 5430305 cce_3626 cce_3627     TRUE 0.821 137.000 0.423 NA   NA
 5430306 5430307 cce_3628 cce_3629     TRUE 0.680 54.000 0.025 NA   NA
 5430307 5430308 cce_3629 cce_3630     FALSE 0.471 115.000 0.009 NA   NA
 5430308 5430309 cce_3630 cce_3631     TRUE 0.597 25.000 0.012 NA   NA
 5430309 5430310 cce_3631 cce_3632     FALSE 0.475 78.000 0.000 1.000 N NA
 5430310 5430311 cce_3632 cce_3633   psb27 FALSE 0.337 9.000 0.000 NA   NA
 5430311 5430312 cce_3633 cce_3634 psb27   TRUE 0.492 139.000 0.036 NA   NA
 5430314 5430315 cce_3636 cce_3637     FALSE 0.019 286.000 0.000 NA   NA
 5430315 5430316 cce_3637 cce_3638   trmU FALSE 0.486 71.000 0.000 1.000 N NA
 5430317 5430318 cce_3639 cce_3640     FALSE 0.014 316.000 0.000 NA   NA
 5430318 5430319 cce_3640 cce_3641     FALSE 0.018 292.000 0.000 NA   NA
 5430319 5430320 cce_3641 cce_3642     TRUE 0.941 12.000 0.710 NA   NA
 5430320 5430321 cce_3642 cce_3643     TRUE 0.894 36.000 0.379 NA   NA
 5430321 5430322 cce_3643 cce_3644     TRUE 0.583 -15.000 0.034 NA   NA
 5430322 5430323 cce_3644 cce_3645     TRUE 0.902 103.000 0.500 NA   NA
 5430323 5430324 cce_3645 cce_3646     FALSE 0.004 719.000 0.000 NA   NA
 5430324 5430325 cce_3646 cce_3647     FALSE 0.380 73.000 0.000 NA   NA
 5430325 5430326 cce_3647 cce_3648     TRUE 0.917 40.000 0.500 NA   NA
 5430326 5430327 cce_3648 cce_3649     TRUE 0.700 -19.000 0.100 NA   NA
 5430327 5430328 cce_3649 cce_3650     TRUE 0.792 10.000 0.100 NA   NA
 5430328 5430329 cce_3650 cce_3651   oppC FALSE 0.166 150.000 0.000 NA   NA
 5430329 5430330 cce_3651 cce_3652 oppC   FALSE 0.028 254.000 0.000 NA   NA
 5430330 5430331 cce_3652 cce_3653     TRUE 0.956 14.000 1.000 NA   NA
 5430331 5430332 cce_3653 cce_3654     TRUE 0.917 0.000 0.550 NA   NA
 5430332 5430333 cce_3654 cce_3655   rluD2 TRUE 0.567 95.000 0.003 1.000 N NA
 5430334 5430335 cce_3656 cce_3657     TRUE 0.895 42.000 0.369 NA   NA
 5430335 5430336 cce_3657 cce_3658     TRUE 0.529 241.000 0.762 NA   NA
 5430337 5430338 cce_3659 cce_3660     FALSE 0.025 300.000 0.000 1.000 N NA
 5430338 5430339 cce_3660 cce_3661     FALSE 0.048 222.000 0.000 NA   NA
 5430340 5430341 cce_3662 cce_3663   wecB FALSE 0.187 167.000 0.000 1.000 N NA
 5430343 5430344 cce_3665 cce_3666     TRUE 0.510 110.000 0.012 NA   NA
 5430348 5430349 cce_3670 cce_3671     FALSE 0.247 196.000 0.038 NA   NA
 5430350 5430351 cce_3672 cce_3673     TRUE 0.915 38.000 0.500 NA   NA
 5430351 5430352 cce_3673 cce_3674   hemK TRUE 0.740 2.000 0.074 NA   NA
 5430352 5430353 cce_3674 cce_3675 hemK   FALSE 0.386 64.000 0.000 NA   NA
 5430355 5430356 cce_3677 cce_3678 cbiM   TRUE 0.690 63.000 0.021 NA   NA
 5430356 5430357 cce_3678 cce_3679   cbiQ2 TRUE 0.675 69.000 0.017 NA   NA
 5430357 5430358 cce_3679 cce_3680 cbiQ2   TRUE 0.666 5.000 0.017 1.000 N NA
 5430358 5430359 cce_3680 cce_3681   moaC1 TRUE 0.838 21.000 0.004 1.000 Y NA
 5430361 5430362 cce_3683 cce_3684     TRUE 0.875 -7.000 0.400 NA   NA
 5430362 5430363 cce_3684 cce_3685     TRUE 0.867 78.000 0.200 NA   NA
 5430364 5430365 cce_3686 cce_3687 panC   TRUE 0.583 93.000 0.011 NA   NA
 5430366 5430367 cce_3688 cce_3689     TRUE 0.739 4.000 0.069 NA   NA
 5430367 5430368 cce_3689 cce_3690     TRUE 0.788 69.000 0.069 NA   NA
 5430370 5430371 cce_3692 cce_3693     TRUE 0.833 95.000 0.143 1.000   NA
 5430373 5430374 cce_3695 cce_3696     TRUE 0.815 57.000 0.070 1.000   NA
 5430374 5430375 cce_3696 cce_3697     TRUE 0.613 113.000 0.047 NA   NA
 5430375 5430376 cce_3697 cce_3698     TRUE 0.855 -3.000 0.286 NA   NA
 5430377 5430378 cce_3699 cce_3700     TRUE 0.896 44.000 0.357 NA   NA
 5430379 5430380 cce_3701 cce_3702   cobA TRUE 0.924 34.000 0.500 1.000   NA
 5430381 5430382 cce_3703 cce_3704     FALSE 0.376 76.000 0.000 NA   NA
 5430382 5430383 cce_3704 cce_3705     FALSE 0.007 402.000 0.000 NA   NA
 5430384 5430385 cce_3706 cce_3707   glcE FALSE 0.373 104.000 0.000 1.000 N NA
 5430385 5430386 cce_3707 cce_3708 glcE glcF TRUE 0.941 28.000 0.153 0.021 Y NA
 5430388 5430389 cce_3710 cce_3711     FALSE 0.029 253.000 0.000 NA   NA
 5430389 5430390 cce_3711 cce_3712     FALSE 0.266 108.000 0.000 NA   NA
 5430390 5430391 cce_3712 cce_3713   phy FALSE 0.061 195.000 0.000 NA N NA
 5430391 5430392 cce_3713 cce_3714 phy   TRUE 0.970 13.000 0.409 0.033 Y NA
 5430392 5430393 cce_3714 cce_3715     TRUE 0.953 13.000 0.200 0.016 Y NA
 5430395 5430396 cce_3717 cce_3718     FALSE 0.355 83.000 0.000 NA   NA
 5430396 5430397 cce_3718 cce_3719   alr FALSE 0.249 112.000 0.000 NA   NA
 5430397 5430398 cce_3719 cce_3720 alr   TRUE 0.588 36.000 0.014 NA   NA
 5430399 5430400 cce_3721 cce_3722     FALSE 0.025 311.000 0.000 1.000   NA
 5430400 5430401 cce_3722 cce_3723     TRUE 0.975 56.000 0.429 0.010 Y NA
 5430401 5430402 cce_3723 cce_3724     FALSE 0.083 211.000 0.000 1.000 N NA
 5430406 5430407 cce_3728 cce_3729 cyp   FALSE 0.010 357.000 0.000 NA   NA
 5430407 5430408 cce_3729 cce_3730     FALSE 0.042 229.000 0.000 NA   NA
 5430408 5430409 cce_3730 cce_3731   rbcR TRUE 0.664 144.000 0.150 NA   NA
 5430411 5430412 cce_3733 cce_3734     TRUE 0.820 78.000 0.105 NA   NA
 5430420 5430421 cce_3742 cce_3743     FALSE 0.088 301.000 0.061 NA   NA
 5430423 5430424 cce_3745 cce_3746   gnd FALSE 0.013 382.000 0.000 1.000 N NA
 5430425 5430426 cce_3747 cce_3748     FALSE 0.360 82.000 0.000 NA   NA
 5430426 5430427 cce_3748 cce_3749     TRUE 0.937 -3.000 0.867 NA   NA
 5430431 5430432 cce_3753 cce_3754     TRUE 0.531 146.000 0.036 1.000   NA
 5430432 5430433 cce_3754 cce_3755   crtB TRUE 0.886 140.000 0.691 1.000   NA
 5430434 5430435 cce_3756 cce_3757   ama1 FALSE 0.243 114.000 0.000 NA   NA
 5430436 5430437 cce_3758 cce_3759     TRUE 0.734 105.000 0.000 1.000 Y NA
 5430437 5430438 cce_3759 cce_3760     TRUE 0.504 77.000 0.000 1.000   NA
 5430438 5430439 cce_3760 cce_3761     TRUE 0.803 188.000 0.667 0.003   NA
 5430439 5430440 cce_3761 cce_3762     FALSE 0.330 114.000 0.000 1.000 N NA
 5430440 5430441 cce_3762 cce_3763     FALSE 0.323 116.000 0.000 1.000 N NA
 5430442 5430443 cce_3764 cce_3765     TRUE 0.770 63.000 0.054 NA   NA
 5430443 5430444 cce_3765 cce_3766     FALSE 0.221 124.000 0.000 NA   NA
 5430444 5430445 cce_3766 cce_3767     FALSE 0.030 249.000 0.000 NA   NA
 5430446 5430447 cce_3768 cce_3769     FALSE 0.335 20.000 0.000 NA   NA
 5430447 5430448 cce_3769 cce_3770     FALSE 0.270 107.000 0.000 NA   NA
 5430448 5430449 cce_3770 cce_3771     FALSE 0.386 63.000 0.000 NA   NA
 5430449 5430450 cce_3771 cce_3772     FALSE 0.290 102.000 0.000 NA   NA
 5430450 5430451 cce_3772 cce_3773     TRUE 0.646 19.000 0.000 0.008   NA
 5430451 5430452 cce_3773 cce_3774     FALSE 0.054 243.000 0.000 1.000   NA
 5430452 5430453 cce_3774 cce_3775     TRUE 0.771 145.000 0.160 0.016   NA
 5430455 5430456 cce_3777 cce_3778     FALSE 0.310 1.000 0.000 NA   NA
 5430456 5430457 cce_3778 cce_3779     FALSE 0.297 100.000 0.000 NA   NA
 5430457 5430458 cce_3779 cce_RNA044     FALSE 0.012 326.000 0.000 NA   NA
 11431807 5430458   cce_RNA044     FALSE NA 132.000 0.000 NA   NA
 11574170 5430458   cce_RNA044     FALSE NA 132.000 0.000 NA   NA
 11716562 5430458   cce_RNA044     FALSE NA 132.000 0.000 NA   NA
 11431808 5430458   cce_RNA044     FALSE NA 169.000 0.000 NA   NA
 11574171 5430458   cce_RNA044     FALSE NA 169.000 0.000 NA   NA
 11716563 5430458   cce_RNA044     FALSE NA 169.000 0.000 NA   NA
 11431809 5430458   cce_RNA044     FALSE NA 203.000 0.000 NA   NA
 11574172 5430458   cce_RNA044     FALSE NA 203.000 0.000 NA   NA
 11716564 5430458   cce_RNA044     FALSE NA 203.000 0.000 NA   NA
 11431810 5430458   cce_RNA044     FALSE NA 240.000 0.000 NA   NA
 11574173 5430458   cce_RNA044     FALSE NA 240.000 0.000 NA   NA
 11716565 5430458   cce_RNA044     FALSE NA 240.000 0.000 NA   NA
 11431811 5430458   cce_RNA044     FALSE NA 272.000 0.000 NA   NA
 11574174 5430458   cce_RNA044     FALSE NA 272.000 0.000 NA   NA
 11716566 5430458   cce_RNA044     FALSE NA 272.000 0.000 NA   NA
 5430459 5430460 cce_3780 cce_3781     FALSE 0.006 442.000 0.000 NA   NA
 5430461 5430462 cce_3782 cce_3783     FALSE 0.456 89.000 0.000 1.000   NA
 5430462 5430463 cce_3783 cce_3784     FALSE 0.340 17.000 0.000 NA   NA
 5430464 5430465 cce_3785 cce_3786     FALSE 0.318 38.000 0.000 NA   NA
 5430466 5430467 cce_3787 cce_3788     FALSE 0.331 44.000 0.000 NA   NA
 5430468 5430469 cce_3789 cce_3790     TRUE 0.751 5.000 0.073 NA   NA
 5430469 5430470 cce_3790 cce_3791     FALSE 0.333 22.000 0.000 NA   NA
 5430470 5430471 cce_3791 cce_3792     TRUE 0.931 0.000 0.714 NA   NA
 5430471 5430472 cce_3792 cce_3793     TRUE 0.951 4.000 1.000 NA   NA
 5430472 5430473 cce_3793 cce_3794     FALSE 0.038 272.000 0.000 1.000   NA
 5430473 5430474 cce_3794 cce_3795     TRUE 0.494 55.000 0.000 1.000   NA
 5430474 5430475 cce_3795 cce_3796     FALSE 0.139 184.000 0.000 1.000   NA
 5430476 5430477 cce_3797 cce_3798     TRUE 0.891 67.000 0.250 NA   NA
 5430478 5430479 cce_3799 cce_3800     TRUE 0.715 -28.000 0.133 NA   NA
 5430481 5430482 cce_3802 cce_3803     FALSE 0.313 34.000 0.000 NA   NA
 5430482 5430483 cce_3803 cce_3804     FALSE 0.222 -28.000 0.000 NA   NA
 5430483 5430484 cce_3804 cce_3805     TRUE 0.771 38.000 0.000 1.000 Y NA
 5430485 5430486 cce_3806 cce_3807     FALSE 0.221 124.000 0.000 NA   NA
 5430486 5430487 cce_3807 cce_3808     FALSE 0.348 51.000 0.000 NA   NA
 5430488 5430489 cce_3809 cce_3810     FALSE 0.169 148.000 0.000 NA   NA
 5430489 5430490 cce_3810 cce_3811     FALSE 0.280 104.000 0.000 NA   NA
 5430491 5430492 cce_3812 cce_3813     TRUE 0.747 -43.000 0.200 NA   NA
 5430494 5430495 cce_3815 cce_3816   purB FALSE 0.103 177.000 0.000 NA   NA
 5430497 5430498 cce_3818 cce_RNA045   rrn16Sa FALSE 0.004 683.000 0.000 NA   NA
 5430498 5430499 cce_RNA045 cce_RNA046 rrn16Sa   FALSE 0.240 115.000 0.000 NA   NA
 5430499 5430500 cce_RNA046 cce_RNA047   rrn23Sa FALSE 0.176 143.000 0.000 NA   NA
 5430500 5430501 cce_RNA047 cce_RNA048 rrn23Sa   FALSE 0.200 -155.000 0.000 NA   NA
 5430501 5430502 cce_RNA048 cce_RNA049   rrn5Sa FALSE 0.003 2773.000 0.000 NA   NA
 5430502 5430503 cce_RNA049 cce_3819 rrn5Sa mocD FALSE 0.201 131.000 0.000 NA   NA
 5430503 5430504 cce_3819 cce_3820 mocD   FALSE 0.289 -3.000 0.000 NA   NA
 5430506 5430507 cce_3822 cce_3823 ppc   TRUE 0.750 43.000 0.071 NA   NA
 5430508 5430509 cce_3824 cce_3825     TRUE 0.677 25.000 0.016 1.000   NA
 5430509 5430510 cce_3825 cce_3826   cysA FALSE 0.409 96.000 0.000 1.000 N NA
 5430510 5430511 cce_3826 cce_3827 cysA cysW TRUE 0.877 26.000 0.039 1.000 Y NA
 5430511 5430512 cce_3827 cce_3828 cysW cysT TRUE 0.890 4.000 0.156 0.000 N NA
 5430512 5430513 cce_3828 cce_3829 cysT   TRUE 0.607 -6.000 0.031 NA   NA
 5430513 5430514 cce_3829 cce_3830   sbpA TRUE 0.893 18.000 0.333 NA   NA
 5430515 5430516 cce_3831 cce_3832     FALSE 0.132 166.000 0.000 NA   NA
 5430516 5430517 cce_3832 cce_3833     FALSE 0.016 288.000 0.000 NA N NA
 5430517 5430518 cce_3833 cce_3834     TRUE 0.895 79.000 0.229 1.000   NA
 5430518 5430519 cce_3834 cce_3835     TRUE 0.944 85.000 0.643 1.000   NA
 5430519 5430520 cce_3835 cce_3836     FALSE 0.058 291.000 0.000 0.032   NA
 5430521 5430522 cce_3837 cce_3838   rpoC1 FALSE 0.344 14.000 0.000 NA   NA
 5430522 5430523 cce_3838 cce_3839 rpoC1   FALSE 0.005 502.000 0.000 NA   NA
 5430524 5430525 cce_3840 cce_3841     FALSE 0.333 23.000 0.000 NA   NA
 5430525 5430526 cce_3841 cce_3842   glcP FALSE 0.450 27.000 0.000 1.000   NA
 5430526 5430527 cce_3842 cce_3843 glcP   FALSE 0.356 -16.000 0.000 1.000   NA
 5430527 5430528 cce_3843 cce_3844     TRUE 0.937 18.000 0.667 NA   NA
 5430528 5430529 cce_3844 cce_3845     TRUE 0.938 15.000 0.667 NA   NA
 5430529 5430530 cce_3845 cce_3846     TRUE 0.885 40.000 0.333 NA   NA
 5430531 5430532 cce_3847 cce_3848     FALSE 0.338 18.000 0.000 NA   NA
 5430534 5430535 cce_3850 cce_3851     FALSE 0.222 -28.000 0.000 NA   NA
 5430536 5430537 cce_3852 cce_3853     FALSE 0.383 59.000 0.000 NA   NA
 5430537 5430538 cce_3853 cce_3854     FALSE 0.221 124.000 0.000 NA   NA
 5430538 5430539 cce_3854 cce_3855     FALSE 0.348 51.000 0.000 NA   NA
 5430539 5430540 cce_3855 cce_3856     FALSE 0.339 10.000 0.000 NA   NA
 5430540 5430541 cce_3856 cce_3857     FALSE 0.289 -3.000 0.000 NA   NA
 5430543 5430544 cce_3859 cce_3860     FALSE 0.232 119.000 0.000 NA   NA
 5430545 5430546 cce_3861 cce_3862     FALSE 0.348 51.000 0.000 NA   NA
 5430546 5430547 cce_3862 cce_3863     FALSE 0.221 124.000 0.000 NA   NA
 5430549 5430550 cce_3865 cce_3866     TRUE 0.789 17.000 0.000 1.000 Y NA
 5430552 5430553 cce_3868 cce_3869     FALSE 0.372 78.000 0.000 NA   NA
 5430553 5430554 cce_3869 cce_3870     FALSE 0.337 9.000 0.000 NA   NA
 5430556 5430557 cce_3872 cce_3873     FALSE 0.341 49.000 0.000 NA   NA
 5430557 5430558 cce_3873 cce_3874     TRUE 0.913 16.000 0.429 NA   NA
 5430560 5430561 cce_3876 cce_3877     TRUE 0.791 36.000 0.042 0.059   NA
 5430561 5430562 cce_3877 cce_3878     TRUE 0.859 -10.000 0.354 NA   NA
 5430564 5430565 cce_3880 cce_3881     TRUE 0.911 105.000 0.500 1.000   NA
 5430565 5430566 cce_3881 cce_3882   lepB1 TRUE 0.798 3.000 0.091 1.000   NA
 5430566 5430567 cce_3882 cce_3883 lepB1   TRUE 0.704 60.000 0.010 1.000   NA
 5430567 5430568 cce_3883 cce_3884     TRUE 0.600 60.000 0.004 NA   NA
 5430568 5430569 cce_3884 cce_3885   kdpD FALSE 0.312 96.000 0.000 NA   NA
 5430571 5430572 cce_3887 cce_3888 kdpC   FALSE 0.335 20.000 0.000 NA   NA
 5430572 5430573 cce_3888 cce_3889     FALSE 0.322 4.000 0.000 NA   NA
 5430573 5430574 cce_3889 cce_3890     FALSE 0.440 3.000 0.000 1.000   NA
 5430574 5430575 cce_3890 cce_3891   kdpB FALSE 0.411 34.000 0.000 1.000 N NA
 5430575 5430576 cce_3891 cce_3892 kdpB kdpA TRUE 0.977 47.000 0.556 0.001 Y NA
 5430577 5430578 cce_3893 cce_3894     FALSE 0.470 12.000 0.000 1.000   NA
 5430578 5430579 cce_3894 cce_3895     TRUE 0.970 -7.000 0.889 1.000 Y NA
 5430580 5430581 cce_3896 cce_3897 lnt   TRUE 0.743 86.000 0.059 NA   NA
 5430581 5430582 cce_3897 cce_3898     TRUE 0.772 76.000 0.060 NA   NA
 5430582 5430583 cce_3898 cce_3899     TRUE 0.761 105.000 0.120 NA   NA
 5430583 5430584 cce_3899 cce_3900     TRUE 0.760 45.000 0.075 NA   NA
 5430587 5430588 cce_3903 cce_3904     FALSE 0.318 30.000 0.000 NA   NA
 5430588 5430589 cce_3904 cce_3905     FALSE 0.261 -10.000 0.000 NA   NA
 5430589 5430590 cce_3905 cce_3906     FALSE 0.119 171.000 0.000 NA   NA
 5430590 5430591 cce_3906 cce_3907     FALSE 0.035 239.000 0.000 NA   NA
 5430593 5430594 cce_3909 cce_3910     TRUE 0.781 81.000 0.073 NA   NA
 5430594 5430595 cce_3910 cce_3911     FALSE 0.313 34.000 0.000 NA   NA
 5430595 5430596 cce_3911 cce_3912     FALSE 0.344 13.000 0.000 NA   NA
 5430596 5430597 cce_3912 cce_3913     TRUE 0.869 -28.000 0.500 NA   NA
 5430597 5430598 cce_3913 cce_3914     TRUE 0.928 42.000 0.500 1.000   NA
 5430600 5430601 cce_3916 cce_3917     FALSE 0.246 113.000 0.000 NA   NA
 5430601 5430602 cce_3917 cce_3918   gidB FALSE 0.333 22.000 0.000 NA   NA
 5430602 5430603 cce_3918 cce_3919 gidB   FALSE 0.220 112.000 0.000 NA N NA
 5430605 5430606 cce_3921 cce_3922     FALSE 0.360 82.000 0.000 NA   NA
 5430606 5430607 cce_3922 cce_3923     FALSE 0.385 66.000 0.000 NA   NA
 5430607 5430608 cce_3923 cce_3924     FALSE 0.116 172.000 0.000 NA   NA
 5430608 5430609 cce_3924 cce_3925     FALSE 0.340 17.000 0.000 NA   NA
 5430609 5430610 cce_3925 cce_3926     FALSE 0.290 102.000 0.000 NA   NA
 5430610 5430611 cce_3926 cce_3927     FALSE 0.383 59.000 0.000 NA   NA
 5430611 5430612 cce_3927 cce_3928   ftsY FALSE 0.036 237.000 0.000 NA   NA
 5430613 5430614 cce_3929 cce_3930     TRUE 0.638 108.000 0.047 NA   NA
 5430615 5430616 cce_3931 cce_3932     FALSE 0.385 65.000 0.000 NA   NA
 5430616 5430617 cce_3932 cce_3933   accA FALSE 0.116 194.000 0.000 1.000   NA
 5430617 5430618 cce_3933 cce_3934 accA   FALSE 0.085 296.000 0.033 1.000   NA
 5430618 5430619 cce_3934 cce_3935   folE1 TRUE 0.912 27.000 0.391 1.000   NA
 5430621 5430622 cce_3937 cce_3938     TRUE 0.941 3.000 0.154 0.011 Y NA
 5430622 5430623 cce_3938 cce_3939     TRUE 0.884 56.000 0.250 NA   NA
 5430623 5430624 cce_3939 cce_3940     FALSE 0.021 278.000 0.000 NA   NA
 5430624 5430625 cce_3940 cce_3941     FALSE 0.270 -7.000 0.000 NA   NA
 5430626 5430627 cce_3942 cce_3943     TRUE 0.855 0.000 0.263 NA   NA
 5430627 5430628 cce_3943 cce_3944     FALSE 0.380 73.000 0.000 NA   NA
 5430628 5430629 cce_3944 cce_3945     FALSE 0.198 132.000 0.000 NA   NA
 5430631 5430632 cce_3947 cce_3948 thrS1   FALSE 0.320 93.000 0.000 NA   NA
 5430633 5430634 cce_3949 cce_3950     FALSE 0.034 240.000 0.000 NA   NA
 5430634 5430635 cce_3950 cce_3951   glyA FALSE 0.017 299.000 0.000 NA   NA
 5430636 5430637 cce_3952 cce_3953     FALSE 0.270 -7.000 0.000 NA   NA
 5430637 5430638 cce_3953 cce_3954     TRUE 0.834 12.000 0.158 NA   NA
 5430638 5430639 cce_3954 cce_3955     FALSE 0.338 48.000 0.000 NA   NA
 5430639 5430640 cce_3955 cce_3956     FALSE 0.009 375.000 0.000 NA   NA
 5430640 5430641 cce_3956 cce_3957   purM FALSE 0.042 229.000 0.000 NA   NA
 5430645 5430646 cce_3961 cce_3962 hypC psaI FALSE 0.040 232.000 0.000 NA   NA
 5430646 5430647 cce_3962 cce_3963 psaI psaL2 TRUE 0.925 98.000 0.371 0.009   NA
 5430650 5430651 cce_3966 cce_3967     TRUE 0.696 96.000 0.049 NA   NA
 5430653 5430654 cce_3969 cce_3970 cbiC1 cbiE TRUE 0.833 142.000 0.054 0.008 Y NA
 5430656 5430657 cce_3972 cce_RNA050 cysC rrn16Sb FALSE 0.005 551.000 0.000 NA   NA
 5430657 5430658 cce_RNA050 cce_RNA051 rrn16Sb   FALSE 0.240 115.000 0.000 NA   NA
 5430658 5430659 cce_RNA051 cce_RNA052   rrn23Sb FALSE 0.176 143.000 0.000 NA   NA
 5430659 5430660 cce_RNA052 cce_RNA053 rrn23Sb   FALSE 0.200 -155.000 0.000 NA   NA
 5430660 5430661 cce_RNA053 cce_RNA054   rrn5Sb FALSE 0.003 2773.000 0.000 NA   NA
 5430666 5430667 cce_3977 cce_3978     TRUE 0.906 12.000 0.385 NA   NA
 5430667 5430668 cce_3978 cce_3979     FALSE 0.017 296.000 0.000 NA   NA
 5430668 5430669 cce_3979 cce_3980     TRUE 0.897 8.000 0.357 NA   NA
 5430670 5430671 cce_3981 cce_3982     TRUE 0.779 -7.000 0.154 NA   NA
 5430671 5430672 cce_3982 cce_3983     TRUE 0.848 -3.000 0.269 NA   NA
 5430672 5430673 cce_3983 cce_3984     FALSE 0.316 37.000 0.000 NA   NA
 5430674 5430675 cce_3985 cce_3986     TRUE 0.740 29.000 0.047 1.000   NA
 5430675 5430676 cce_3986 cce_3987   pcrA TRUE 0.564 105.000 0.005 1.000   NA
 5430678 5430679 cce_3989 cce_3990   glyQ FALSE 0.012 395.000 0.000 1.000 N NA
 5430680 5430681 cce_3991 cce_3992 ctpA xthA TRUE 0.550 116.000 0.015 1.000 N NA
 5430681 5430682 cce_3992 cce_3993 xthA   TRUE 0.898 21.000 0.024 0.047 Y NA
 5430682 5430683 cce_3993 cce_3994     FALSE 0.276 105.000 0.000 NA   NA
 5430683 5430684 cce_3994 cce_3995     TRUE 0.609 53.000 0.008 NA   NA
 5430685 5430686 cce_3996 cce_3997     FALSE 0.160 153.000 0.000 NA   NA
 5430688 5430689 cce_3999 cce_4000     TRUE 0.823 -45.000 0.364 NA   NA
 5430689 5430690 cce_4000 cce_4001     FALSE 0.333 23.000 0.000 NA   NA
 5430691 5430692 cce_4002 cce_4003 rpaB asnB FALSE 0.187 167.000 0.000 1.000 N NA
 5430693 5430694 cce_4004 cce_4005 dnaK2 grpE TRUE 0.909 137.000 0.224 0.005 Y NA
 5430694 5430695 cce_4005 cce_4006 grpE   FALSE 0.012 333.000 0.000 NA   NA
 5430699 5430700 cce_4010 cce_4011     TRUE 0.771 70.000 0.057 NA   NA
 5430701 5430702 cce_4012 cce_4013   rpl3 FALSE 0.010 361.000 0.000 NA   NA
 5430702 5430703 cce_4013 cce_4014 rpl3   FALSE 0.261 -10.000 0.000 NA   NA
 5430703 5430704 cce_4014 cce_4015   rplD FALSE 0.204 -57.000 0.000 NA   NA
 5430704 5430705 cce_4015 cce_4016 rplD rpl23 TRUE 0.967 -7.000 0.513 0.009 Y NA
 5430705 5430706 cce_4016 cce_4017 rpl23 rpl2 TRUE 0.980 98.000 0.849 0.011 Y NA
 5430706 5430707 cce_4017 cce_4018 rpl2 rps19 TRUE 0.981 26.000 0.820 0.011 Y NA
 5430707 5430708 cce_4018 cce_4019 rps19 rpl22 TRUE 0.982 83.000 0.769 0.011 Y NA
 5430708 5430709 cce_4019 cce_4020 rpl22 rps3 TRUE 0.979 24.000 0.719 0.011 Y NA
 5430709 5430710 cce_4020 cce_4021 rps3 rpl16 TRUE 0.981 39.000 0.828 0.011 Y NA
 5430710 5430711 cce_4021 cce_4022 rpl16 rpl29 TRUE 0.981 4.000 0.802 0.009 Y NA
 5430711 5430712 cce_4022 cce_4023 rpl29 rps17 TRUE 0.982 8.000 0.828 0.009 Y NA
 5430712 5430713 cce_4023 cce_4024 rps17 rpl14 TRUE 0.981 18.000 0.791 0.011 Y NA
 5430713 5430714 cce_4024 cce_4025 rpl14 rpl24 TRUE 0.921 3.000 0.071 0.011 Y NA
 5430714 5430715 cce_4025 cce_4026 rpl24   FALSE 0.341 11.000 0.000 NA   NA
 5430715 5430716 cce_4026 cce_4027   rpl5 FALSE 0.316 3.000 0.000 NA   NA
 5430716 5430717 cce_4027 cce_4028 rpl5 rps8 TRUE 0.919 39.000 0.059 0.009 Y NA
 5430717 5430718 cce_4028 cce_4029 rps8 rpl6 TRUE 0.985 70.000 0.808 0.009 Y NA
 5430718 5430719 cce_4029 cce_4030 rpl6 rpl18 TRUE 0.980 3.000 0.815 0.009 Y NA
 5430719 5430720 cce_4030 cce_4031 rpl18 rps5 TRUE 0.981 43.000 0.814 0.011 Y NA
 5430720 5430721 cce_4031 cce_4032 rps5 rpl15 TRUE 0.941 29.000 0.148 0.011 Y NA
 5430721 5430722 cce_4032 cce_4033 rpl15 secY TRUE 0.736 192.000 0.730 1.000 N NA
 5430722 5430723 cce_4033 cce_4034 secY adk TRUE 0.719 77.000 0.020 1.000 N NA
 5430723 5430724 cce_4034 cce_4035 adk infA FALSE 0.461 143.000 0.015 1.000 N NA
 5430724 5430725 cce_4035 cce_4036 infA rpl36 TRUE 0.769 145.000 0.257 1.000   NA
 5430725 5430726 cce_4036 cce_4037 rpl36 rps13 TRUE 0.919 68.000 0.194 0.009   NA
 5430726 5430727 cce_4037 cce_4038 rps13 rps11 TRUE 0.975 108.000 0.810 0.009 Y NA
 5430727 5430728 cce_4038 cce_4039 rps11 rpoA TRUE 0.869 105.000 0.308 1.000 N NA
 5430728 5430729 cce_4039 cce_4040 rpoA rpl17 TRUE 0.955 86.000 0.873 1.000 N NA
 5430729 5430730 cce_4040 cce_4041 rpl17 truA TRUE 0.794 156.000 0.102 1.000 Y NA
 5430730 5430731 cce_4041 cce_4042 truA rpl13 TRUE 0.914 66.000 0.058 1.000 Y NA
 5430731 5430732 cce_4042 cce_4043 rpl13 rps9 TRUE 0.973 0.000 0.601 0.009 Y NA
 5430732 5430733 cce_4043 cce_4044 rps9 rpl31 TRUE 0.919 38.000 0.062 0.009 Y NA
 5430733 5430734 cce_4044 cce_4045 rpl31 prfA TRUE 0.922 84.000 0.110 1.000 Y NA
 5430734 5430735 cce_4045 cce_4046 prfA   TRUE 0.523 47.000 0.004 NA N NA
 5430736 5430737 cce_4047 cce_4048     FALSE 0.218 -31.000 0.000 NA   NA
 5430738 5430739 cce_4049 cce_4050     TRUE 0.898 -31.000 0.227 1.000 Y NA
 5430739 5430740 cce_4050 cce_4051     FALSE 0.024 253.000 0.000 NA N NA
 5430740 5430741 cce_4051 cce_4052     TRUE 0.571 0.000 0.016 NA N NA
 5430741 5430742 cce_4052 cce_4053     FALSE 0.436 47.000 0.000 1.000 N NA
 5430742 5430743 cce_4053 cce_4054     FALSE 0.437 35.000 0.000 1.000   NA
 5430743 5430744 cce_4054 cce_4055     FALSE 0.328 90.000 0.000 NA   NA
 5430746 5430747 cce_4057 cce_4058     FALSE 0.313 34.000 0.000 NA   NA
 5430747 5430748 cce_4058 cce_4059     FALSE 0.222 -28.000 0.000 NA   NA
 5430750 5430751 cce_4061 cce_4062     FALSE 0.369 56.000 0.000 NA   NA
 5430752 5430753 cce_4063 cce_4064     TRUE 0.662 122.000 0.083 NA   NA
 5430755 5430756 cce_4066 cce_4067     TRUE 0.920 -6.000 0.681 NA   NA
 5430757 5430758 cce_4068 cce_4069     TRUE 0.535 27.000 0.004 NA   NA
 5430758 5430759 cce_4069 cce_4070     TRUE 0.815 9.000 0.130 NA   NA
 5430759 5430760 cce_4070 cce_4071     TRUE 0.680 43.000 0.037 NA   NA
 5430760 5430761 cce_4071 cce_4072     TRUE 0.708 59.000 0.028 NA   NA
 5430761 5430762 cce_4072 cce_4073     TRUE 0.493 -22.000 0.015 NA   NA
 5430762 5430763 cce_4073 cce_4074     FALSE 0.059 238.000 0.000 1.000   NA
 5430763 5430764 cce_4074 cce_4075   ppnK TRUE 0.948 28.000 0.314 1.000 Y NA
 5430764 5430765 cce_4075 cce_4076 ppnK   FALSE 0.123 186.000 0.000 1.000 N NA
 5430766 5430767 cce_4077 cce_4078 dnaE-n   FALSE 0.080 188.000 0.000 NA   NA
 5430767 5430768 cce_4078 cce_4079     FALSE 0.380 73.000 0.000 NA   NA
 5430771 5430772 cce_4082 cce_4083     FALSE 0.335 204.000 0.071 1.000   NA
 5430772 5430773 cce_4083 cce_4084   trxM1 FALSE 0.081 220.000 0.000 1.000   NA
 5430776 5430777 cce_4087 cce_4088 rps10 tufA TRUE 0.932 109.000 0.318 1.000 Y NA
 5430777 5430778 cce_4088 cce_4089 tufA fus1 TRUE 0.953 119.000 0.400 0.001 Y NA
 5430778 5430779 cce_4089 cce_4090 fus1 rps7 TRUE 0.907 164.000 0.579 1.000 Y NA
 5430779 5430780 cce_4090 cce_4091 rps7 rps12 TRUE 0.955 135.000 0.620 0.002 Y NA
 5430780 5430781 cce_4091 cce_4092 rps12   TRUE 0.494 110.000 0.009 NA   NA
 5430781 5430782 cce_4092 cce_4093     FALSE 0.380 73.000 0.000 NA   NA
 5430782 5430783 cce_4093 cce_4094     TRUE 0.788 21.000 0.100 NA   NA
 5430785 5430786 cce_4096 cce_4097     FALSE 0.004 735.000 0.000 NA   NA
 5430786 5430787 cce_4097 cce_4098     TRUE 0.494 55.000 0.000 1.000   NA
 5430787 5430788 cce_4098 cce_4099     TRUE 0.728 101.000 0.077 NA   NA
 5430788 5430789 cce_4099 cce_4100     FALSE 0.322 4.000 0.000 NA   NA
 5430789 5430790 cce_4100 cce_4101     FALSE 0.327 26.000 0.000 NA   NA
 5430790 5430791 cce_4101 cce_4102     FALSE 0.289 -3.000 0.000 NA   NA
 5430791 5430792 cce_4102 cce_4103     FALSE 0.004 612.000 0.000 NA   NA
 5430792 5430793 cce_4103 cce_4104     TRUE 0.841 138.000 0.500 NA   NA
 5430793 5430794 cce_4104 cce_4105     FALSE 0.018 291.000 0.000 NA   NA
 5430795 5430796 cce_4106 cce_4107     FALSE 0.013 320.000 0.000 NA   NA
 5430796 5430797 cce_4107 cce_4108     FALSE 0.289 -3.000 0.000 NA   NA
 5430797 5430798 cce_4108 cce_4109   coxB3 TRUE 0.936 19.000 0.667 NA   NA
 5430798 5430799 cce_4109 cce_4110 coxB3 coxA3 TRUE 0.772 -25.000 0.000 0.002 Y NA
 5430799 5430800 cce_4110 cce_4111 coxA3 coxC3 TRUE 0.986 15.000 1.000 0.002 Y NA
 5430800 5430801 cce_4111 cce_4112 coxC3   FALSE 0.482 119.000 0.000 0.032 N NA
 5430802 5430803 cce_4113 cce_4114     TRUE 0.943 54.000 0.200 1.000 Y NA
 5430803 5430804 cce_4114 cce_4115     TRUE 0.964 3.000 0.400 0.058 Y NA
 5430804 5430805 cce_4115 cce_4116     TRUE 0.612 130.000 0.071 NA   NA
 5430806 5430807 cce_4117 cce_4118 acp fabF TRUE 0.957 85.000 0.346 1.000 Y NA
 5430807 5430808 cce_4118 cce_4119 fabF   FALSE 0.014 385.000 0.000 1.000   NA
 5430808 5430809 cce_4119 cce_4120     TRUE 0.791 90.000 0.075 1.000   NA
 5430809 5430810 cce_4120 cce_4121     FALSE 0.249 -15.000 0.000 NA   NA
 5430810 5430811 cce_4121 cce_4122   chlG FALSE 0.180 141.000 0.000 NA   NA
 5430819 5430820 cce_4130 cce_4131 folC ccdA TRUE 0.700 46.000 0.026 1.000 N NA
 5430820 5430821 cce_4131 cce_4132 ccdA ccs1 TRUE 0.877 154.000 0.371 NA Y NA
 5430822 5430823 cce_4133 cce_4134     TRUE 0.715 3.000 0.036 1.000   NA
 5430823 5430824 cce_4134 cce_4135     FALSE 0.471 13.000 0.000 1.000   NA
 5430826 5430827 cce_4137 cce_4138     FALSE 0.383 59.000 0.000 NA   NA
 5430828 5430829 cce_4139 cce_4140   hisA FALSE 0.112 196.000 0.000 1.000   NA
 5430830 5430831 cce_4141 cce_4142   sigG TRUE 0.619 112.000 0.047 NA   NA
 5430831 5430832 cce_4142 cce_4143 sigG   TRUE 0.599 118.000 0.047 NA   NA
 5430832 5430833 cce_4143 cce_4144     TRUE 0.687 113.000 0.083 NA   NA
 5430834 5430835 cce_4145 cce_4146   dapF FALSE 0.222 -28.000 0.000 NA   NA
 5430836 5430837 cce_4147 cce_4148     FALSE 0.010 354.000 0.000 NA   NA
 5430837 5430838 cce_4148 cce_4149     FALSE 0.338 48.000 0.000 NA   NA
 5430838 5430839 cce_4149 cce_4150     TRUE 0.747 -22.000 0.163 NA   NA
 5430839 5430840 cce_4150 cce_4151   bioF TRUE 0.753 -10.000 0.128 NA   NA
 5430840 5430841 cce_4151 cce_4152 bioF aspS FALSE 0.401 135.000 0.003 1.000 N NA
 5430842 5430843 cce_4153 cce_4154     TRUE 0.859 0.000 0.273 NA   NA
 5430843 5430844 cce_4154 cce_4155     FALSE 0.256 110.000 0.000 NA   NA
 5430844 5430845 cce_4155 cce_4156     FALSE 0.050 219.000 0.000 NA   NA
 5430845 5430846 cce_4156 cce_4157     TRUE 0.729 0.000 0.071 NA   NA
 5430846 5430847 cce_4157 cce_4158     TRUE 0.887 0.000 0.375 NA   NA
 5430847 5430848 cce_4158 cce_4159     FALSE 0.191 135.000 0.000 NA   NA
 5430849 5430850 cce_4160 cce_4161     TRUE 0.636 5.000 0.007 1.000   NA
 5430850 5430851 cce_4161 cce_4162     FALSE 0.473 139.000 0.000 0.001   NA
 5430851 5430852 cce_4162 cce_4163     TRUE 0.878 67.000 0.222 NA N NA
 5430852 5430853 cce_4163 cce_4164     TRUE 0.974 67.000 0.667 NA Y NA
 5430853 5430854 cce_4164 cce_4165     FALSE 0.344 117.000 0.000 1.000   NA
 5430854 5430855 cce_4165 cce_4166     TRUE 0.809 83.000 0.074 1.000   NA
 5430857 5430858 cce_4168 cce_4169 cscK   FALSE 0.327 5.000 0.000 NA   NA
 5430858 5430859 cce_4169 cce_4170     TRUE 0.650 38.000 0.030 NA   NA
 5430859 5430860 cce_4170 cce_4171     FALSE 0.243 114.000 0.000 NA   NA
 5430860 5430861 cce_4171 cce_4172     FALSE 0.194 134.000 0.000 NA   NA
 5430861 5430862 cce_4172 cce_4173     TRUE 0.901 91.000 0.400 NA   NA
 5430864 5430865 cce_4175 cce_4176     TRUE 0.978 57.000 0.500 0.006 Y NA
 5430865 5430866 cce_4176 cce_4177     TRUE 0.977 68.000 0.429 0.006 Y NA
 5430867 5430868 cce_4178 cce_4179     TRUE 0.842 30.000 0.212 NA   NA
 5430868 5430869 cce_4179 cce_4180     FALSE 0.249 112.000 0.000 NA   NA
 5430869 5430870 cce_4180 cce_4181     FALSE 0.336 19.000 0.000 NA   NA
 5430871 5430872 cce_4182 cce_4183     FALSE 0.379 58.000 0.000 NA   NA
 5430872 5430873 cce_4183 cce_4184     TRUE 0.787 19.000 0.098 NA   NA
 5430873 5430874 cce_4184 cce_4185     TRUE 0.837 73.000 0.120 NA   NA
 5430876 5430877 cce_4187 cce_4188     TRUE 0.598 52.000 0.002 1.000 N NA
 5430877 5430878 cce_4188 cce_4189     TRUE 0.862 71.000 0.133 1.000 N NA
 5430878 5430879 cce_4189 cce_4190     TRUE 0.981 71.000 0.571 0.003 Y NA
 5430879 5430880 cce_4190 cce_4191     TRUE 0.976 79.000 0.429 0.003 Y NA
 5430882 5430883 cce_4193 cce_4194     TRUE 0.893 163.000 0.286 0.003 Y NA
 5430883 5430884 cce_4194 cce_4195     TRUE 0.975 38.000 0.857 1.000 Y NA
 5430884 5430885 cce_4195 cce_4196     TRUE 0.959 134.000 0.750 0.015 Y NA
 5430885 5430886 cce_4196 cce_4197     FALSE 0.297 100.000 0.000 NA   NA
 5430887 5430888 cce_4198 cce_4199     TRUE 0.659 103.000 0.031 1.000 N NA
 5430888 5430889 cce_4199 cce_4200   aroC TRUE 0.600 82.000 0.002 1.000 N NA
 5430889 5430890 cce_4200 cce_4201 aroC   FALSE 0.209 -48.000 0.000 NA   NA
 5430890 5430891 cce_4201 cce_4202     FALSE 0.004 652.000 0.000 NA   NA
 5430891 5430892 cce_4202 cce_4203     FALSE 0.069 188.000 0.000 NA N NA
 5430892 5430893 cce_4203 cce_4204     FALSE 0.271 0.000 0.000 NA N NA
 5430895 5430896 cce_4206 cce_4207     TRUE 0.584 50.000 0.010 NA N NA
 5430896 5430897 cce_4207 cce_4208   talC FALSE 0.072 221.000 0.000 1.000 N NA
 5430897 5430898 cce_4208 cce_4209 talC   TRUE 0.788 42.000 0.105 NA   NA
 5430899 5430900 cce_4210 cce_4211     FALSE 0.080 188.000 0.000 NA   NA
 5430900 5430901 cce_4211 cce_4212     TRUE 0.544 99.000 0.008 NA   NA
 5430901 5430902 cce_4212 cce_4213     FALSE 0.465 18.000 0.000 1.000   NA
 5430902 5430903 cce_4213 cce_4214     FALSE 0.341 11.000 0.000 NA   NA
 5430904 5430905 cce_4215 cce_4216     FALSE 0.322 4.000 0.000 NA   NA
 5430905 5430906 cce_4216 cce_4217     FALSE 0.333 23.000 0.000 NA   NA
 5430906 5430907 cce_4217 cce_4218     FALSE 0.310 1.000 0.000 NA   NA
 5430909 5430910 cce_4220 cce_4221   purA FALSE 0.078 216.000 0.000 1.000 N NA
 5430910 5430911 cce_4221 cce_4222 purA rpl25 TRUE 0.655 30.000 0.017 1.000 N NA
 5430913 5430914 cce_4224 cce_4225     FALSE 0.106 176.000 0.000 NA   NA
 5430914 5430915 cce_4225 cce_4226     TRUE 0.766 -18.000 0.179 NA   NA
 5430916 5430917 cce_4227 cce_4228 ilvB gabD TRUE 0.649 151.000 0.118 1.000 N NA
 5430917 5430918 cce_4228 cce_4229 gabD   FALSE 0.024 305.000 0.000 1.000 N NA
 5430918 5430919 cce_4229 cce_4230     TRUE 0.789 17.000 0.000 1.000 Y NA
 5430919 5430920 cce_4230 cce_4231     FALSE 0.031 289.000 0.000 1.000   NA
 5430920 5430921 cce_4231 cce_4232     TRUE 0.643 11.000 0.000 0.012   NA
 5430921 5430922 cce_4232 cce_4233     FALSE 0.054 243.000 0.000 1.000   NA
 5430922 5430923 cce_4233 cce_4234     FALSE 0.460 21.000 0.000 1.000   NA
 5430924 5430925 cce_4235 cce_4236     FALSE 0.322 4.000 0.000 NA   NA
 5430929 5430930 cce_4240 cce_4241     FALSE 0.221 124.000 0.000 NA   NA
 5430930 5430931 cce_4241 cce_4242     FALSE 0.348 51.000 0.000 NA   NA
 5430933 5430934 cce_4244 cce_4245     FALSE 0.182 140.000 0.000 NA   NA
 5430934 5430935 cce_4245 cce_4246     FALSE 0.289 -3.000 0.000 NA   NA
 5430936 5430937 cce_4247 cce_4248 clpC1   TRUE 0.706 8.000 0.045 NA   NA
 5430937 5430938 cce_4248 cce_4249   hisG TRUE 0.499 27.000 0.002 NA   NA
 5430938 5430939 cce_4249 cce_4250 hisG   FALSE 0.036 237.000 0.000 NA   NA
 5430939 5430940 cce_4250 cce_4251   cinA FALSE 0.331 44.000 0.000 NA   NA
 5430944 5430945 cce_4255 cce_4256     FALSE 0.051 240.000 0.000 1.000 N NA
 5430945 5430946 cce_4256 cce_4257     TRUE 0.519 22.000 0.003 NA   NA
 5430946 5430947 cce_4257 cce_4258   valS TRUE 0.565 36.000 0.009 NA   NA
 5430948 5430949 cce_4259 cce_4260     FALSE 0.272 106.000 0.000 NA   NA
 5430950 5430951 cce_4261 cce_4262     TRUE 0.850 -3.000 0.273 NA   NA
 5430951 5430952 cce_4262 cce_4263     FALSE 0.320 39.000 0.000 NA   NA
 5430952 5430953 cce_4263 cce_4264     FALSE 0.239 -19.000 0.000 NA   NA
 5430954 5430955 cce_4265 cce_4266     TRUE 0.582 38.000 0.012 NA   NA
 5430956 5430957 cce_4267 cce_4268 cdsA cbiT FALSE 0.442 144.000 0.012 1.000 N NA
 5430957 5430958 cce_4268 cce_4269 cbiT   TRUE 0.835 43.000 0.130 1.000   NA
 5430958 5430959 cce_4269 cce_4270     TRUE 0.930 7.000 0.500 1.000   NA
 5430960 5430961 cce_4271 cce_4272     TRUE 0.825 86.000 0.143 NA   NA
 5430961 5430962 cce_4272 cce_4273   psaM TRUE 0.725 102.000 0.053 1.000   NA
 5430962 5430963 cce_4273 cce_4274 psaM   TRUE 0.792 108.000 0.184 NA   NA
 5430963 5430964 cce_4274 cce_4275     FALSE 0.030 247.000 0.000 NA   NA
 5430965 5430966 cce_4276 cce_4277     FALSE 0.385 62.000 0.000 NA   NA
 5430966 5430967 cce_4277 cce_4278   crtO TRUE 0.827 40.000 0.133 1.000 N NA
 5430967 5430968 cce_4278 cce_4279 crtO ccmN FALSE 0.300 131.000 0.000 1.000   NA
 5430968 5430969 cce_4279 cce_4280 ccmN ccmM TRUE 0.760 110.000 0.040 0.003   NA
 5430969 5430970 cce_4280 cce_4281 ccmM ccmL TRUE 0.911 63.000 0.333 NA   NA
 5430970 5430971 cce_4281 cce_4282 ccmL ccmK1 TRUE 0.973 20.000 0.818 NA Y NA
 5430971 5430972 cce_4282 cce_4283 ccmK1 ccmK2 TRUE 0.955 63.000 0.316 NA Y NA
 5430972 5430973 cce_4283 cce_4284 ccmK2   FALSE 0.015 311.000 0.000 NA   NA
 5430975 5430976 cce_4286 cce_4287     FALSE 0.226 122.000 0.000 NA   NA
 5430976 5430977 cce_4287 cce_4288     FALSE 0.226 122.000 0.000 NA   NA
 5430977 5430978 cce_4288 cce_4289     TRUE 0.959 153.000 1.000 0.015 Y NA
 5430982 5430983 cce_4293 cce_4294     TRUE 0.807 -18.000 0.250 NA   NA
 5430984 5430985 cce_4295 cce_4296     TRUE 0.772 79.000 0.043 1.000   NA
 5430985 5430986 cce_4296 cce_4297     TRUE 0.654 32.000 0.032 NA   NA
 5430986 5430987 cce_4297 cce_4298     FALSE 0.313 34.000 0.000 NA   NA
 5430989 5430990 cce_4300 cce_4301     FALSE 0.005 506.000 0.000 NA   NA
 5430991 5430992 cce_4302 cce_4303     TRUE 0.896 8.000 0.348 NA   NA
 5430993 5430994 cce_4304 cce_4305 tpi folP TRUE 0.769 61.000 0.039 1.000 N NA
 5430994 5430995 cce_4305 cce_4306 folP   FALSE 0.010 433.000 0.000 1.000 N NA
 5430995 5430996 cce_4306 cce_4307     FALSE 0.470 50.000 0.000 1.000   NA
 5430996 5430997 cce_4307 cce_4308     FALSE 0.055 242.000 0.000 1.000   NA
 5430999 5431000 cce_4310 cce_4311     FALSE 0.289 -3.000 0.000 NA   NA
 5431000 5431001 cce_4311 cce_4312     FALSE 0.336 19.000 0.000 NA   NA
 5431001 5431002 cce_4312 cce_4313     FALSE 0.011 337.000 0.000 NA   NA
 5431003 5431004 cce_4314 cce_4315 argJ   FALSE 0.333 23.000 0.000 NA   NA
 5431005 5431006 cce_4316 cce_4317     TRUE 0.877 151.000 0.154 0.003 Y NA
 5431006 5431007 cce_4317 cce_4318     TRUE 0.853 18.000 0.000 0.003 Y NA
 5431008 5431009 cce_RNA055 cce_4319     FALSE 0.385 61.000 0.000 NA   NA
 5431009 5431010 cce_4319 cce_4320     FALSE 0.256 110.000 0.000 NA   NA
 5431010 5431011 cce_4320 cce_4321     TRUE 0.867 4.000 0.267 NA   NA
 5431013 5431014 cce_4323 cce_4324   fpg FALSE 0.071 195.000 0.000 NA   NA
 5431014 5431015 cce_4324 cce_4325 fpg psaE TRUE 0.743 17.000 0.040 1.000   NA
 5431015 5431016 cce_4325 cce_4326 psaE   TRUE 0.879 81.000 0.242 NA   NA
 5431017 5431018 cce_4327 cce_4328   ecaA FALSE 0.010 438.000 0.000 1.000 N NA
 5431018 5431019 cce_4328 cce_4329 ecaA ppa FALSE 0.011 406.000 0.000 1.000 N NA
 5431019 5431020 cce_4329 cce_4330 ppa ndhO TRUE 0.650 40.000 0.028 NA   NA
 5431020 5431021 cce_4330 cce_4331 ndhO   FALSE 0.005 542.000 0.000 NA   NA
 5431021 5431022 cce_4331 cce_4332     FALSE 0.166 150.000 0.000 NA   NA
 5431024 5431025 cce_4334 cce_4335     TRUE 0.801 -27.000 0.273 NA   NA
 5431025 5431026 cce_4335 cce_4336     FALSE 0.327 26.000 0.000 NA   NA
 5431027 5431028 cce_4337 cce_4338     TRUE 0.895 -3.000 0.462 NA   NA
 5431028 5431029 cce_4338 cce_4339     FALSE 0.110 174.000 0.000 NA   NA
 5431029 5431030 cce_4339 cce_4340     TRUE 0.749 12.000 0.061 NA   NA
 5431031 5431032 cce_4341 cce_4342     FALSE 0.435 46.000 0.000 1.000 N NA
 5431032 5431033 cce_4342 cce_4343     FALSE 0.116 172.000 0.000 NA   NA
 5431033 5431034 cce_4343 cce_4344     TRUE 0.927 61.000 0.429 NA   NA
 5431035 5431036 cce_4345 cce_4346   gcvT FALSE 0.263 170.000 0.006 NA   NA
 5431038 5431039 cce_4348 cce_4349     TRUE 0.922 -3.000 0.667 NA   NA
 5431040 5431041 cce_4350 cce_4351 bioB   FALSE 0.457 -55.000 0.016 NA   NA
 5431041 5431042 cce_4351 cce_4352   lspA TRUE 0.868 -51.000 0.554 NA   NA
 5431043 5431044 cce_4353 cce_4354 glsF purH FALSE 0.013 386.000 0.000 1.000 N NA
 5431044 5431045 cce_4354 cce_4355 purH   FALSE 0.445 109.000 0.003 NA   NA
 5431046 5431047 cce_4356 cce_4357     TRUE 0.671 109.000 0.011 0.035 N NA
 5431047 5431048 cce_4357 cce_4358   chlH1 FALSE 0.044 436.000 0.000 1.000 Y NA
 5431048 5431049 cce_4358 cce_4359 chlH1   TRUE 0.490 65.000 0.000 1.000 N NA
 5431050 5431051 cce_4360 cce_4361     TRUE 0.812 3.000 0.150 NA   NA
 5431052 5431053 cce_4362 cce_4363     TRUE 0.897 -15.000 0.600 NA   NA
 5431053 5431054 cce_4363 cce_4364     FALSE 0.316 3.000 0.000 NA   NA
 5431054 5431055 cce_4364 cce_4365     FALSE 0.270 -7.000 0.000 NA   NA
 5431055 5431056 cce_4365 cce_4366     FALSE 0.076 265.000 0.000 0.045   NA
 5431057 5431058 cce_4367 cce_4368     FALSE 0.037 236.000 0.000 NA   NA
 5431059 5431060 cce_4369 cce_4370   argG FALSE 0.245 168.000 0.003 NA   NA
 5431060 5431061 cce_4370 cce_4371 argG   FALSE 0.132 166.000 0.000 NA   NA
 5431061 5431062 cce_4371 cce_4372     FALSE 0.316 95.000 0.000 NA   NA
 5431062 5431063 cce_4372 cce_4373     FALSE 0.245 -16.000 0.000 NA   NA
 5431063 5431064 cce_4373 cce_4374   phoD FALSE 0.322 4.000 0.000 NA   NA
 5431065 5431066 cce_4375 cce_4376     FALSE 0.030 248.000 0.000 NA   NA
 5431066 5431067 cce_4376 cce_4377     TRUE 0.769 11.000 0.077 NA   NA
 5431068 5431069 cce_4378 cce_4379 hemC   FALSE 0.158 154.000 0.000 NA   NA
 5431069 5431070 cce_4379 cce_4380     FALSE 0.006 482.000 0.000 NA   NA
 5431071 5431072 cce_4381 cce_4382   holB FALSE 0.100 197.000 0.000 1.000 N NA
 5431074 5431075 cce_4384 cce_4385     TRUE 0.801 87.000 0.111 NA   NA
 5431075 5431076 cce_4385 cce_4386     FALSE 0.429 151.000 0.026 NA   NA
 5431076 5431077 cce_4386 cce_4387     FALSE 0.379 58.000 0.000 NA   NA
 5431077 5431078 cce_4387 cce_4388     FALSE 0.018 291.000 0.000 NA   NA
 5431078 5431079 cce_4388 cce_4389     FALSE 0.005 493.000 0.000 NA   NA
 5431079 5431080 cce_4389 cce_4390   rnhA TRUE 0.583 66.000 0.003 NA   NA
 5431080 5431081 cce_4390 cce_4391 rnhA   FALSE 0.306 123.000 0.000 1.000 N NA
 5431081 5431082 cce_4391 cce_4392     FALSE 0.318 94.000 0.000 NA   NA
 5431087 5431088 cce_4397 cce_4398   rpl9 FALSE 0.093 181.000 0.000 NA   NA
 5431089 5431090 cce_4399 cce_4400   ilvD FALSE 0.050 249.000 0.000 1.000   NA
 5431090 5431091 cce_4400 cce_4401 ilvD gyrA1 FALSE 0.058 233.000 0.000 1.000 N NA
 5431091 5431092 cce_4401 cce_4402 gyrA1   FALSE 0.054 237.000 0.000 1.000 N NA
 5431092 5431093 cce_4402 cce_4403     TRUE 0.805 110.000 0.222 NA   NA
 5431093 5431094 cce_4403 cce_4404   manA2 FALSE 0.060 206.000 0.000 NA   NA
 5431094 5431095 cce_4404 cce_4405 manA2   TRUE 0.724 8.000 0.037 1.000 N NA
 5431095 5431096 cce_4405 cce_4406     FALSE 0.256 139.000 0.000 1.000 N NA
 5431097 5431098 cce_4407 cce_4408     TRUE 0.664 36.000 0.036 NA   NA
 5431098 5431099 cce_4408 cce_4409   menC TRUE 0.720 7.000 0.036 1.000 N NA
 5431099 5431100 cce_4409 cce_4410 menC   FALSE 0.461 46.000 0.000 1.000   NA
 5431100 5431101 cce_4410 cce_4411     FALSE 0.312 -43.000 0.000 1.000   NA
 5431101 5431102 cce_4411 cce_4412     TRUE 0.515 176.000 0.100 1.000   NA
 5431102 5431103 cce_4412 cce_4413     TRUE 0.635 170.000 0.100 0.031   NA
 5431108 5431109 cce_4418 cce_4419     TRUE 0.867 28.000 0.267 NA   NA
 5431109 5431110 cce_4419 cce_4420   folB FALSE 0.008 395.000 0.000 NA   NA
 5431112 5431113 cce_4422 cce_4423     FALSE 0.017 296.000 0.000 NA   NA
 5431113 5431114 cce_4423 cce_4424   murF TRUE 0.680 121.000 0.071 1.000 N NA
 5431115 5431116 cce_4425 cce_4426     TRUE 0.813 51.000 0.118 NA   NA
 5431116 5431117 cce_4426 cce_4427     FALSE 0.018 294.000 0.000 NA   NA
 5431117 5431118 cce_4427 cce_4428     TRUE 0.887 55.000 0.267 NA   NA
 5431119 5431120 cce_4429 cce_4430     FALSE 0.382 72.000 0.000 NA   NA
 5431120 5431121 cce_4430 cce_4431     TRUE 0.856 68.000 0.154 NA   NA
 5431125 5431126 cce_4435 cce_4436   deaD FALSE 0.053 214.000 0.000 NA   NA
 5431126 5431127 cce_4436 cce_4437 deaD   TRUE 0.673 161.000 0.017 1.000 Y NA
 5431127 5431128 cce_4437 cce_4438   clpX FALSE 0.039 261.000 0.000 1.000 N NA
 5431128 5431129 cce_4438 cce_4439 clpX clpP2 TRUE 0.883 12.000 0.037 1.000 Y NA
 5431129 5431130 cce_4439 cce_4440 clpP2 aroB1 FALSE 0.059 232.000 0.000 1.000 N NA
 5431131 5431132 cce_4441 cce_4442 psbN   FALSE 0.012 412.000 0.000 1.000   NA
 5431132 5431133 cce_4442 cce_4443     FALSE 0.467 17.000 0.000 1.000   NA
 5431134 5431135 cce_4444 cce_4445     FALSE 0.032 243.000 0.000 NA   NA
 5431135 5431136 cce_4445 cce_4446   petN TRUE 0.661 -34.000 0.091 NA   NA
 5431137 5431138 cce_4447 cce_4448     TRUE 0.650 44.000 0.025 NA   NA
 5431138 5431139 cce_4448 cce_4449     TRUE 0.696 58.000 0.025 NA   NA
 5431139 5431140 cce_4449 cce_4450     FALSE 0.006 436.000 0.000 NA   NA
 5431140 5431141 cce_4450 cce_4451     TRUE 0.728 155.000 0.286 NA   NA
 5431141 5431142 cce_4451 cce_4452     TRUE 0.834 58.000 0.119 NA   NA
 5431142 5431143 cce_4452 cce_4453     TRUE 0.780 55.000 0.071 NA   NA
 5431143 5431144 cce_4453 cce_4454     TRUE 0.775 58.000 0.061 NA   NA
 5431144 5431145 cce_4454 cce_4455   aroB2 TRUE 0.855 114.000 0.333 1.000 N NA
 5431145 5431146 cce_4455 cce_4456 aroB2   TRUE 0.927 7.000 0.562 NA   NA
 5431146 5431147 cce_4456 cce_4457     TRUE 0.896 25.000 0.364 NA   NA
 5431148 5431149 cce_4458 cce_4459     FALSE 0.110 174.000 0.000 NA   NA
 5431149 5431150 cce_4459 cce_4460   proS TRUE 0.573 65.000 0.002 NA   NA
 5431151 5431152 cce_4461 cce_4462     FALSE 0.077 190.000 0.000 NA   NA
 5431152 5431153 cce_4462 cce_4463   tyrA TRUE 0.664 3.000 0.036 NA   NA
 5431153 5431154 cce_4463 cce_4464 tyrA   TRUE 0.664 67.000 0.014 NA   NA
 5431154 5431155 cce_4464 cce_4465     FALSE 0.410 164.000 0.037 NA   NA
 5431156 5431157 cce_4466 cce_4467     TRUE 0.878 10.000 0.278 NA   NA
 5431157 5431158 cce_4467 cce_4468     FALSE 0.348 51.000 0.000 NA   NA
 5431160 5431161 cce_4470 cce_4471     TRUE 0.894 49.000 0.333 NA   NA
 5431162 5431163 cce_4472 cce_4473   aroE TRUE 0.651 12.000 0.021 NA   NA
 5431163 5431164 cce_4473 cce_4474 aroE   FALSE 0.386 64.000 0.000 NA   NA
 5431165 5431166 cce_4475 cce_4476     TRUE 0.769 36.000 0.095 NA   NA
 5431168 5431169 cce_4478 cce_4479 ilvG menA FALSE 0.035 520.000 0.000 1.000 Y NA
 5431170 5431171 cce_4480 cce_4481 menF   TRUE 0.594 168.000 0.130 1.000 N NA
 5431171 5431172 cce_4481 cce_4482   atp1 FALSE 0.050 248.000 0.000 1.000   NA
 5431172 5431173 cce_4482 cce_4483 atp1 atpI TRUE 0.807 39.000 0.099 1.000   NA
 5431173 5431174 cce_4483 cce_4484 atpI atpH TRUE 0.732 256.000 0.679 0.003 Y NA
 5431174 5431175 cce_4484 cce_4485 atpH atpG TRUE 0.969 87.000 0.368 0.003 Y NA
 5431175 5431176 cce_4485 cce_4486 atpG atpF TRUE 0.978 13.000 0.569 0.003 Y NA
 5431176 5431177 cce_4486 cce_4487 atpF atpD TRUE 0.940 3.000 0.132 0.003 Y NA
 5431177 5431178 cce_4487 cce_4488 atpD atpA1 TRUE 0.983 45.000 0.864 0.003 Y NA
 5431178 5431179 cce_4488 cce_4489 atpA1 atpC1 TRUE 0.983 89.000 0.846 0.003 Y NA
 5431181 5431182 cce_4491 cce_4492     FALSE 0.134 212.000 0.007 NA   NA
 5431182 5431183 cce_4492 cce_4493     FALSE 0.235 196.000 0.018 1.000 N NA
 5431183 5431184 cce_4493 cce_4494     TRUE 0.577 35.000 0.012 NA   NA
 5431184 5431185 cce_4494 cce_4495     FALSE 0.064 203.000 0.000 NA   NA
 5431187 5431188 cce_4497 cce_4498     TRUE 0.669 -7.000 0.058 NA   NA
 5431188 5431189 cce_4498 cce_4499     FALSE 0.316 95.000 0.000 NA   NA
 5431189 5431190 cce_4499 cce_4500     FALSE 0.014 317.000 0.000 NA   NA
 5431191 5431192 cce_4501 cce_4502     FALSE 0.335 20.000 0.000 NA   NA
 5431193 5431194 cce_4503 cce_4504     FALSE 0.043 228.000 0.000 NA   NA
 5431194 5431195 cce_4504 cce_4505     TRUE 0.709 80.000 0.034 NA   NA
 5431195 5431196 cce_4505 cce_4506     TRUE 0.714 66.000 0.034 NA N NA
 5431196 5431197 cce_4506 cce_4507   rsu1 FALSE 0.407 121.000 0.005 NA N NA
 5431197 5431198 cce_4507 cce_4508 rsu1   TRUE 0.713 3.000 0.036 1.000   NA
 5431199 5431200 cce_4509 cce_4510   shc FALSE 0.277 197.000 0.034 1.000   NA
 5431201 5431202 cce_4511 cce_4512   lysC FALSE 0.091 205.000 0.000 1.000 N NA
 5431202 5431203 cce_4512 cce_4513 lysC   FALSE 0.009 365.000 0.000 NA   NA
 5431204 5431205 cce_4514 cce_4515     TRUE 0.815 115.000 0.273 NA   NA
 5431207 5431208 cce_4517 cce_4518   psbK FALSE 0.355 83.000 0.000 NA   NA
 5431208 5431209 cce_4518 cce_4519 psbK   TRUE 0.829 60.000 0.075 1.000   NA
 5431209 5431210 cce_4519 cce_4520   hisD2 TRUE 0.554 159.000 0.071 1.000 N NA
 5431210 5431211 cce_4520 cce_4521 hisD2   TRUE 0.661 168.000 0.025 1.000 Y NA
 5431211 5431212 cce_4521 cce_4522     TRUE 0.839 54.000 0.114 1.000 N NA
 5431213 5431214 cce_4523 cce_4524   rph FALSE 0.178 184.000 0.003 NA   NA
 5431214 5431215 cce_4524 cce_4525 rph   FALSE 0.462 47.000 0.000 1.000   NA
 5431221 5431222 cce_4531 cce_4532   chlL FALSE 0.006 464.000 0.000 NA   NA
 5431222 5431223 cce_4532 cce_4533 chlL   FALSE 0.442 153.000 0.033 NA   NA
 5431223 5431224 cce_4533 cce_4534   chlN TRUE 0.622 4.000 0.019 NA   NA
 5431224 5431225 cce_4534 cce_4535 chlN   FALSE 0.196 133.000 0.000 NA   NA
 5431225 5431226 cce_4535 cce_4536     FALSE 0.341 11.000 0.000 NA   NA
 5431226 5431227 cce_4536 cce_4537     FALSE 0.223 123.000 0.000 NA   NA
 5431229 5431230 cce_4539 cce_4540   ftsW FALSE 0.486 133.000 0.014 1.000 N NA
 5431232 5431233 cce_4542 cce_4543     TRUE 0.937 121.000 0.300 0.015 Y NA
 5431233 5431234 cce_4543 cce_4544     TRUE 0.940 39.000 0.250 1.000 Y NA
 5431235 5431236 cce_4545 cce_4546 ileS recO FALSE 0.261 137.000 0.000 1.000 N NA
 5431239 5431240 cce_4549 cce_4550     FALSE 0.257 -12.000 0.000 NA   NA
 5431240 5431241 cce_4550 cce_4551     FALSE 0.385 66.000 0.000 NA   NA
 5431241 5431242 cce_4551 cce_4552     FALSE 0.228 121.000 0.000 NA   NA
 5431242 5431243 cce_4552 cce_4553     FALSE 0.374 77.000 0.000 NA   NA
 5431243 5431244 cce_4553 cce_4554     FALSE 0.328 43.000 0.000 NA   NA
 5431244 5431245 cce_4554 cce_4555     TRUE 0.789 44.000 0.103 NA   NA
 5431245 5431246 cce_4555 cce_4556     FALSE 0.318 38.000 0.000 NA   NA
 5431246 5431247 cce_4556 cce_4557     TRUE 0.683 69.000 0.000 0.013   NA
 5431247 5431248 cce_4557 cce_4558     TRUE 0.943 45.000 0.143 0.013 Y NA
 5431248 5431249 cce_4558 cce_4559     FALSE 0.379 58.000 0.000 NA   NA
 5431249 5431250 cce_4559 cce_4560     FALSE 0.013 325.000 0.000 NA   NA
 5431250 5431251 cce_4560 cce_4561     FALSE 0.265 -9.000 0.000 NA   NA
 5431251 5431252 cce_4561 cce_4562     TRUE 0.974 -25.000 1.000 0.003 Y NA
 5431252 5431253 cce_4562 cce_4563     TRUE 0.510 -37.000 0.000 0.003   NA
 5431253 5431254 cce_4563 cce_4564     TRUE 0.567 -3.000 0.000 0.045   NA
 5431254 5431255 cce_4564 cce_4565   dnaB2 TRUE 0.735 3.000 0.011 0.045   NA
 5431256 5431257 cce_4566 cce_4567     FALSE 0.385 66.000 0.000 NA   NA
 5431258 5431259 cce_4568 cce_4569     FALSE 0.007 409.000 0.000 NA   NA
 5431259 5431260 cce_4569 cce_4570     TRUE 0.560 20.000 0.005 NA   NA
 5431260 5431261 cce_4570 cce_4571   sqdB FALSE 0.380 150.000 0.013 NA   NA
 5431262 5431263 cce_4572 cce_4573     FALSE 0.318 94.000 0.000 NA   NA
 5431264 5431265 cce_4574 cce_4575     FALSE 0.263 136.000 0.000 1.000 N NA
 5431266 5431267 cce_4576 cce_4577 ycf37 glnH FALSE 0.312 128.000 0.000 1.000   NA
 5431267 5431268 cce_4577 cce_4578 glnH   TRUE 0.954 24.000 0.353 1.000 Y NA
 5431268 5431269 cce_4578 cce_4579     TRUE 0.925 39.000 0.079 0.015 Y NA
 5431269 5431270 cce_4579 cce_4580     TRUE 0.793 79.000 0.079 NA   NA
 5431270 5431271 cce_4580 cce_4581     TRUE 0.782 108.000 0.167 NA   NA
 5431271 5431272 cce_4581 cce_4582   leuD TRUE 0.689 99.000 0.051 NA   NA
 5431272 5431273 cce_4582 cce_4583 leuD   TRUE 0.509 74.000 0.000 1.000   NA
 5431273 5431274 cce_4583 cce_4584     FALSE 0.238 155.000 0.000 1.000   NA
 5431276 5431277 cce_4586 cce_4587     FALSE 0.008 393.000 0.000 NA   NA
 5431278 5431279 cce_4588 cce_4589     FALSE 0.172 146.000 0.000 NA   NA
 5431279 5431280 cce_4589 cce_4590     FALSE 0.334 171.000 0.024 NA   NA
 5431280 5431281 cce_4590 cce_4591   gmk TRUE 0.822 20.000 0.143 NA   NA
 5431281 5431282 cce_4591 cce_4592 gmk   FALSE 0.056 211.000 0.000 NA   NA
 5431282 5431283 cce_4592 cce_4593     TRUE 0.912 55.000 0.375 NA   NA
 5431283 5431284 cce_4593 cce_4594     FALSE 0.334 21.000 0.000 NA   NA
 5431284 5431285 cce_4594 cce_4595   glgB2 FALSE 0.383 59.000 0.000 NA   NA
 5431287 5431288 cce_4597 cce_4598     FALSE 0.341 49.000 0.000 NA   NA
 5431288 5431289 cce_4598 cce_4599     FALSE 0.025 266.000 0.000 NA   NA
 5431289 5431290 cce_4599 cce_4600   ctaB TRUE 0.921 80.000 0.090 1.000 Y NA
 5431291 5431292 cce_4601 cce_4602     TRUE 0.737 -34.000 0.176 NA   NA
 5431292 5431293 cce_4602 cce_4603     TRUE 0.714 118.000 0.118 NA   NA
 5431293 5431294 cce_4603 cce_4604     FALSE 0.012 328.000 0.000 NA   NA
 5431295 5431296 cce_4605 cce_4606     TRUE 0.722 59.000 0.034 NA   NA
 5431296 5431297 cce_4606 cce_4607     TRUE 0.861 143.000 0.667 NA   NA
 5431297 5431298 cce_4607 cce_4608     FALSE 0.044 227.000 0.000 NA   NA
 5431298 5431299 cce_4608 cce_4609     TRUE 0.897 109.000 0.511 NA   NA
 5431299 5431300 cce_4609 cce_4610     FALSE 0.004 803.000 0.000 NA   NA
 5431300 5431301 cce_4610 cce_4611     TRUE 0.940 63.000 0.545 NA   NA
 5431301 5431302 cce_4611 cce_4612     TRUE 0.860 46.000 0.226 NA   NA
 5431305 5431306 cce_4615 cce_4616   map2 FALSE 0.031 281.000 0.000 1.000 N NA
 5431306 5431307 cce_4616 cce_4617 map2   TRUE 0.748 96.000 0.079 NA   NA
 5431307 5431308 cce_4617 cce_4618     FALSE 0.276 105.000 0.000 NA   NA
 5431313 5431314 cce_4623 cce_4624     TRUE 0.638 71.000 0.013 NA N NA
 5431315 5431316 cce_4625 cce_4626   gor FALSE 0.019 289.000 0.000 NA   NA
 5431317 5431318 cce_4627 cce_4628 tktA   FALSE 0.070 223.000 0.000 1.000 N NA
 5431318 5431319 cce_4628 cce_4629     TRUE 0.879 7.000 0.286 NA   NA
 5431320 5431321 cce_4630 cce_4631     FALSE 0.044 226.000 0.000 NA   NA
 5431321 5431322 cce_4631 cce_4632     FALSE 0.257 -12.000 0.000 NA   NA
 5431322 5431323 cce_4632 cce_4633     FALSE 0.284 103.000 0.000 NA   NA
 5431324 5431325 cce_4634 cce_4635     TRUE 0.754 36.000 0.082 NA   NA
 5431326 5431327 cce_4636 cce_4637     TRUE 0.731 91.000 0.061 NA   NA
 5431330 5431331 cce_4640 cce_4641   cbiA FALSE 0.243 114.000 0.000 NA   NA
 5431331 5431332 cce_4641 cce_4642 cbiA   FALSE 0.013 374.000 0.000 1.000 N NA
 5431335 5431336 cce_4645 cce_4646 secF secD TRUE 0.974 32.000 0.516 0.001 Y NA
 5431336 5431337 cce_4646 cce_4647 secD pdhB TRUE 0.686 128.000 0.091 1.000 N NA
 5431338 5431339 cce_4648 cce_4649     TRUE 0.883 103.000 0.400 NA   NA
 5431339 5431340 cce_4649 cce_4650     FALSE 0.013 322.000 0.000 NA   NA
 5431340 5431341 cce_4650 cce_4651     TRUE 0.977 47.000 1.000 NA Y NA
 5431341 5431342 cce_4651 cce_4652     FALSE 0.013 321.000 0.000 NA   NA
 5431342 5431343 cce_4652 cce_4653     FALSE 0.330 6.000 0.000 NA   NA
 5431344 5431345 cce_4654 cce_4655     FALSE 0.046 224.000 0.000 NA   NA
 5431345 5431346 cce_4655 cce_4656     TRUE 0.816 16.000 0.125 NA   NA
 5431346 5431347 cce_4656 cce_4657     TRUE 0.608 181.000 0.292 NA   NA
 5431347 5431348 cce_4657 cce_4658   met3 FALSE 0.056 319.000 0.018 1.000   NA
 5431349 5431350 cce_4659 cce_4660     TRUE 0.845 17.000 0.000 0.014 Y NA
 5431353 5431354 cce_4663 cce_4664     FALSE 0.005 556.000 0.000 NA   NA
 5431356 5431357 cce_4666 cce_4667 pheA   FALSE 0.476 110.000 0.006 NA   NA
 5431358 5431359 cce_4668 cce_4669   hspA2 FALSE 0.014 313.000 0.000 NA   NA
 5431360 5431361 cce_4670 cce_4671     FALSE 0.091 182.000 0.000 NA   NA
 5431361 5431362 cce_4671 cce_4672     FALSE 0.338 48.000 0.000 NA   NA
 5431362 5431363 cce_4672 cce_4673     FALSE 0.014 315.000 0.000 NA   NA
 5431363 5431364 cce_4673 cce_4674   rbfA TRUE 0.702 18.000 0.025 1.000 N NA
 5431365 5431366 cce_4675 cce_4676     FALSE 0.227 -25.000 0.000 NA   NA
 5431367 5431368 cce_4677 cce_4678     FALSE 0.392 172.000 0.047 NA   NA
 5431368 5431369 cce_4678 cce_4679   ribH TRUE 0.631 53.000 0.003 1.000   NA
 5431369 5431370 cce_4679 cce_4680 ribH psbZ TRUE 0.750 83.000 0.037 1.000   NA
 5431371 5431372 cce_4681 cce_4682     FALSE 0.005 558.000 0.000 NA   NA
 5431372 5431373 cce_4682 cce_4683     TRUE 0.720 70.000 0.018 1.000 N NA
 5431374 5431375 cce_4684 cce_4685   thiS TRUE 0.806 28.000 0.095 1.000   NA
 5431375 5431376 cce_4685 cce_4686 thiS thiE TRUE 0.935 4.000 0.219 1.000 Y NA
 5431376 5431377 cce_4686 cce_4687 thiE talA TRUE 0.715 31.000 0.041 1.000 N NA
 5431377 5431378 cce_4687 cce_4688 talA   FALSE 0.009 376.000 0.000 NA   NA
 5431378 5431379 cce_4688 cce_4689     FALSE 0.385 62.000 0.000 NA   NA
 5431380 5431381 cce_4690 cce_4691     FALSE 0.198 132.000 0.000 NA   NA
 5431381 5431382 cce_4691 cce_4692   ppsA FALSE 0.011 342.000 0.000 NA   NA
 5431384 5431385 cce_4694 cce_4695     TRUE 0.885 112.000 0.500 NA   NA
 5431389 5431390 cce_4699 cce_4700     FALSE 0.314 32.000 0.000 NA   NA
 5431391 5431392 cce_4701 cce_4702 gst3 feoA3 FALSE 0.411 34.000 0.000 1.000 N NA
 5431393 5431394 cce_4703 cce_4704     TRUE 0.716 138.000 0.200 NA   NA
 5431394 5431395 cce_4704 cce_4705     TRUE 0.852 86.000 0.200 NA   NA
 5431395 5431396 cce_4705 cce_4706     TRUE 0.846 18.000 0.192 NA   NA
 5431396 5431397 cce_4706 cce_4707     FALSE 0.304 0.000 0.000 NA   NA
 5431397 5431398 cce_4707 cce_4708     TRUE 0.837 23.000 0.129 1.000   NA
 5431398 5431399 cce_4708 cce_4709     TRUE 0.694 41.000 0.024 1.000   NA
 5431399 5431400 cce_4709 cce_4710   rsu2 FALSE 0.361 107.000 0.000 1.000 N NA
 5431401 5431402 cce_4711 cce_4712     FALSE 0.327 26.000 0.000 NA   NA
 5431402 5431403 cce_4712 cce_4713     TRUE 0.801 -27.000 0.273 NA   NA
 5431404 5431405 cce_4714 cce_4715   kaiB2 FALSE 0.408 -3.000 0.000 1.000   NA
 5431405 5431406 cce_4715 cce_4716 kaiB2 kaiC2 TRUE 0.922 82.000 0.375 1.000   NA
 5431406 5431407 cce_4716 cce_4717 kaiC2 ndhH TRUE 0.522 126.000 0.015 1.000 N NA
 5431408 5431409 cce_4718 cce_4719 lepA   FALSE 0.378 75.000 0.000 NA   NA
 5431410 5431411 cce_4720 cce_4721     FALSE 0.473 -19.000 0.010 NA   NA
 5431412 5431413 cce_4722 cce_4723   dnaE-c TRUE 0.493 32.000 0.002 NA   NA
 5431414 5431415 cce_4724 cce_4725     FALSE 0.245 -16.000 0.000 NA   NA
 5431416 5431417 cce_4726 cce_4727     FALSE 0.278 131.000 0.000 1.000 N NA
 5431418 5431419 cce_4728 cce_4729     FALSE 0.014 315.000 0.000 NA   NA
 5431419 5431420 cce_4729 cce_4730     TRUE 0.767 156.000 0.379 NA   NA
 5431422 5431423 cce_4732 cce_4733     FALSE 0.007 403.000 0.000 NA   NA
 5431424 5431425 cce_4734 cce_4735   ddlA FALSE 0.138 164.000 0.000 NA   NA
 5431427 5431428 cce_4737 cce_4738     TRUE 0.692 11.000 0.037 NA   NA
 5431428 5431429 cce_4738 cce_4739     FALSE 0.463 19.000 0.000 1.000   NA
 5431429 5431430 cce_4739 cce_4740     FALSE 0.003 937.000 0.000 NA   NA
 5431430 5431431 cce_4740 cce_4741     FALSE 0.052 216.000 0.000 NA   NA
 5431431 5431432 cce_4741 cce_4742     TRUE 0.737 38.000 0.070 NA   NA
 5431432 5431433 cce_4742 cce_4743   pgl FALSE 0.276 208.000 0.076 NA N NA
 5431435 5431436 cce_4745 cce_4746     TRUE 0.849 39.000 0.222 NA   NA
 5431436 5431437 cce_4746 cce_4747     TRUE 0.655 -7.000 0.050 NA   NA
 5431437 5431438 cce_4747 cce_4748     TRUE 0.815 21.000 0.133 NA   NA
 5431438 5431439 cce_4748 cce_4749     FALSE 0.415 156.000 0.029 NA   NA
 5431439 5431440 cce_4749 cce_4750     FALSE 0.343 12.000 0.000 NA   NA
 5431440 5431441 cce_4750 cce_4751     FALSE 0.421 40.000 0.000 1.000 N NA
 5431443 5431444 cce_4753 cce_4754     TRUE 0.666 161.000 0.222 NA   NA
 5431445 5431446 cce_4755 cce_4756     TRUE 0.538 0.000 0.007 NA   NA
 5431447 5431448 cce_4757 cce_4758 cobU   TRUE 0.628 4.000 0.009 1.000 N NA
 5431449 5431450 cce_4759 cce_4760   gpsA FALSE 0.022 321.000 0.000 1.000   NA
 5431450 5431451 cce_4760 cce_4761 gpsA   FALSE 0.255 180.000 0.019 NA N NA
 5431455 5431456 cce_4765 cce_4766     FALSE 0.113 173.000 0.000 NA   NA
 5426544 5426545 cce_5256 cce_5257     FALSE 0.005 510.000 0.000 NA   NA
 5426545 5426546 cce_5257 cce_5258     TRUE 0.916 -3.000 0.500 1.000   NA
 5426546 5426547 cce_5258 cce_5259     TRUE 0.645 178.000 0.333 NA   NA
 5426548 5426549 cce_5260 cce_5261     FALSE 0.331 24.000 0.000 NA   NA
 5426551 5426552 cce_5263 cce_5264     TRUE 0.555 -3.000 0.013 NA   NA
 5426552 5426553 cce_5264 cce_5265     FALSE 0.046 224.000 0.000 NA   NA
 5426553 5426554 cce_5265 cce_5266     TRUE 0.887 -13.000 0.500 NA   NA
 5426555 5426556 cce_5267 cce_5268     TRUE 0.949 34.000 1.000 NA   NA
 5426559 5426560 cce_5271 cce_5272     FALSE 0.162 152.000 0.000 NA   NA
 5426561 5426562 cce_5273 cce_5274     TRUE 0.510 73.000 0.000 1.000   NA
 5426562 5426563 cce_5274 cce_5275     FALSE 0.067 231.000 0.000 1.000   NA
 5426563 5426564 cce_5275 cce_5276     TRUE 0.804 -7.000 0.200 NA   NA
 5426565 5426566 cce_5277 cce_5278     TRUE 0.844 136.000 0.500 NA   NA
 5426567 5426568 cce_5279 cce_5280     FALSE 0.018 344.000 0.000 1.000   NA
 5426568 5426544 cce_5280 cce_5256     FALSE 0.312 96.000 0.000 NA   NA
 5426569 5426570 cce_5300 cce_5301     FALSE 0.463 19.000 0.000 1.000   NA
 5426572 5426573 cce_5303 cce_5304     FALSE 0.284 103.000 0.000 NA   NA
 5426573 5426574 cce_5304 cce_5305     TRUE 0.936 -10.000 1.000 NA   NA
 5426576 5426577 cce_5307 cce_5308     FALSE 0.313 34.000 0.000 NA   NA
 5426579 5426569 cce_5310 cce_5300     FALSE 0.028 301.000 0.000 1.000   NA
 5426584 5426585 cce_5285 cce_5286     FALSE 0.166 150.000 0.000 NA   NA
 5426587 5426588 cce_5288 cce_5289     FALSE 0.333 7.000 0.000 NA   NA
 5426588 5426589 cce_5289 cce_5290     FALSE 0.338 18.000 0.000 NA   NA
 5426589 5426590 cce_5290 cce_5291     FALSE 0.236 117.000 0.000 NA   NA
 5426591 5426592 cce_5292 cce_5293     FALSE 0.318 94.000 0.000 NA   NA
 5426592 5426593 cce_5293 cce_5294     FALSE 0.003 1155.000 0.000 NA   NA
 5426594 5426595 cce_5295 cce_5296   vapC1 TRUE 0.885 -15.000 0.500 NA   NA
 5426597 5426598 cce_5298 cce_5299     FALSE 0.010 355.000 0.000 NA   NA
 5426598 5426580 cce_5299 cce_5281     FALSE 0.327 5.000 0.000 NA   NA
 5426599 5426600 cce_5218 cce_5219     FALSE 0.003 1005.000 0.000 NA   NA
 5426601 5426602 cce_5220 cce_5221     TRUE 0.872 -9.000 0.333 1.000   NA
 5426604 5426605 cce_5223 cce_5224     FALSE 0.341 11.000 0.000 NA   NA
 5426605 5426606 cce_5224 cce_5225     FALSE 0.354 52.000 0.000 NA   NA
 5426610 5426611 cce_5229 cce_5230     FALSE 0.138 164.000 0.000 NA   NA
 5426611 5426612 cce_5230 cce_5231     FALSE 0.242 -18.000 0.000 NA   NA
 5426612 5426613 cce_5231 cce_5232     FALSE 0.245 -16.000 0.000 NA   NA
 5426613 5426614 cce_5232 cce_5233     FALSE 0.313 34.000 0.000 NA   NA
 5426615 5426616 cce_5234 cce_5235     TRUE 0.630 -3.000 0.019 1.000 N NA
 5426616 5426617 cce_5235 cce_5236     TRUE 0.924 1.000 0.625 NA   NA
 5426617 5426618 cce_5236 cce_5237     TRUE 0.938 -3.000 0.875 NA   NA
 5426618 5426619 cce_5237 cce_5238     FALSE 0.333 23.000 0.000 NA   NA
 5426619 5426620 cce_5238 cce_5239     FALSE 0.440 31.000 0.000 1.000   NA
 5426620 5426621 cce_5239 cce_5240     FALSE 0.206 -52.000 0.000 NA   NA
 5426621 5426622 cce_5240 cce_5241     FALSE 0.383 59.000 0.000 NA   NA
 5426622 5426623 cce_5241 cce_5242     TRUE 0.936 63.000 0.500 NA   NA
 5426623 5426624 cce_5242 cce_5243     TRUE 0.928 53.000 0.500 NA   NA
 5426624 5426625 cce_5243 cce_5244     TRUE 0.954 23.000 1.000 NA   NA
 5426625 5426626 cce_5244 cce_5245     TRUE 0.956 12.000 1.000 NA   NA
 5426626 5426627 cce_5245 cce_5246     FALSE 0.280 104.000 0.000 NA   NA
 5426627 5426628 cce_5246 cce_5247     FALSE 0.322 28.000 0.000 NA   NA
 5426628 5426629 cce_5247 cce_5248     FALSE 0.316 37.000 0.000 NA   NA
 5426633 5426634 cce_5252 cce_5253     FALSE 0.318 94.000 0.000 NA   NA
 5426634 5426635 cce_5253 cce_5254     FALSE 0.135 165.000 0.000 NA   NA
 5426635 5426636 cce_5254 cce_5255     FALSE 0.003 1105.000 0.000 NA   NA
 5426636 5426599 cce_5255 cce_5218     FALSE 0.343 15.000 0.000 NA   NA