MicrobesOnline Operon Predictions for Escherichia coli SECEC SMS-3-5

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 7300218 7300219 EcSMS35_0001 EcSMS35_0002 thrA thrB TRUE 0.987 2.000 0.133 1.000 Y NA
 7300219 7300220 EcSMS35_0002 EcSMS35_0003 thrB thrC TRUE 0.992 1.000 0.233 1.000 Y NA
 7300221 7300222 EcSMS35_0004 EcSMS35_0005     FALSE 0.523 12.000 0.000 NA   NA
 7300222 7300223 EcSMS35_0005 EcSMS35_0006   agcS FALSE 0.159 70.000 0.028 NA   NA
 7300224 7300225 EcSMS35_0007 EcSMS35_0008 tal2 mogA FALSE 0.223 115.000 0.042 1.000 N NA
 7300226 7300227 EcSMS35_0009 EcSMS35_0010     FALSE 0.088 149.000 0.043 NA   NA
 7300227 7300228 EcSMS35_0010 EcSMS35_0011     TRUE 0.913 25.000 0.500 NA   NA
 7300229 7300230 EcSMS35_0012 EcSMS35_0013 dnaK dnaJ TRUE 0.924 89.000 0.236 0.003 Y NA
 7300230 7300231 EcSMS35_0013 EcSMS35_0014 dnaJ   FALSE 0.001 868.000 0.000 NA   NA
 7300231 7300232 EcSMS35_0014 EcSMS35_0015     TRUE 0.941 20.000 0.571 NA   NA
 7300232 7300233 EcSMS35_0015 EcSMS35_0016     FALSE 0.085 130.000 0.000 NA   NA
 7300233 7300234 EcSMS35_0016 EcSMS35_0017   nhaA FALSE 0.009 252.000 0.000 NA   NA
 7300234 7300235 EcSMS35_0017 EcSMS35_0018 nhaA nhaR TRUE 0.687 60.000 0.292 1.000 N NA
 7300236 7300237 EcSMS35_0019 EcSMS35_0020   xlyP TRUE 0.935 40.000 0.231 1.000 Y NA
 7300240 7300241 EcSMS35_0023 EcSMS35_0024 ribF ileS TRUE 0.759 43.000 0.254 1.000 N NA
 7300241 7300242 EcSMS35_0024 EcSMS35_0025 ileS lspA TRUE 0.890 0.000 0.045 1.000 N NA
 7300242 7300243 EcSMS35_0025 EcSMS35_0026 lspA fkpB FALSE 0.472 88.000 0.154 1.000 N NA
 7300243 7300244 EcSMS35_0026 EcSMS35_0027 fkpB ispH TRUE 0.987 2.000 0.626 1.000 N NA
 7300244 7300245 EcSMS35_0027 EcSMS35_0028 ispH rihC FALSE 0.196 66.000 0.028 NA N NA
 7300245 7300246 EcSMS35_0028 EcSMS35_0029 rihC dapB FALSE 0.041 167.000 0.003 NA N NA
 7300248 7300249 EcSMS35_0031 EcSMS35_0032   carA FALSE 0.417 13.000 0.002 NA   NA
 7300249 7300250 EcSMS35_0032 EcSMS35_0033 carA carB TRUE 0.990 18.000 0.345 0.001 Y NA
 7300253 7300254 EcSMS35_0036 EcSMS35_0037 caiE caiD TRUE 0.730 6.000 0.000 1.000   NA
 7300254 7300255 EcSMS35_0037 EcSMS35_0038 caiD caiC TRUE 0.776 109.000 0.000 0.023 Y NA
 7300255 7300256 EcSMS35_0038 EcSMS35_0039 caiC caiB TRUE 0.650 74.000 0.154 0.023 N NA
 7300256 7300257 EcSMS35_0039 EcSMS35_0040 caiB caiA TRUE 0.699 129.000 0.529 1.000 N NA
 7300257 7300258 EcSMS35_0040 EcSMS35_0041 caiA caiT TRUE 0.682 31.000 0.118 1.000 N NA
 7300259 7300260 EcSMS35_0042 EcSMS35_0043   fixA FALSE 0.020 208.000 0.000 NA   NA
 7300260 7300261 EcSMS35_0043 EcSMS35_0044 fixA fixB TRUE 0.984 15.000 0.231 0.013 Y NA
 7300261 7300262 EcSMS35_0044 EcSMS35_0045 fixB fixC TRUE 0.865 51.000 0.000 0.055 Y NA
 7300262 7300263 EcSMS35_0045 EcSMS35_0046 fixC fixX TRUE 0.995 -3.000 0.167 0.055 Y NA
 7300263 7300264 EcSMS35_0046 EcSMS35_0047 fixX   FALSE 0.262 59.000 0.000 1.000 N NA
 7300264 7300265 EcSMS35_0047 EcSMS35_0048   kefF FALSE 0.166 108.000 0.000 1.000   NA
 7300265 7300266 EcSMS35_0048 EcSMS35_0049 kefF kefC TRUE 0.984 -7.000 0.560 1.000   NA
 7300266 7300267 EcSMS35_0049 EcSMS35_0050 kefC folA FALSE 0.202 81.000 0.012 1.000 N NA
 7300268 7300269 EcSMS35_0051 EcSMS35_0052     FALSE 0.268 36.000 0.000 NA   NA
 7300269 7300270 EcSMS35_0052 EcSMS35_0053   apaH FALSE 0.365 25.000 0.000 NA   NA
 7300270 7300271 EcSMS35_0053 EcSMS35_0054 apaH apaG TRUE 0.937 7.000 0.267 NA N NA
 7300271 7300272 EcSMS35_0054 EcSMS35_0055 apaG ksgA TRUE 0.864 3.000 0.078 NA N NA
 7300272 7300273 EcSMS35_0055 EcSMS35_0056 ksgA pdxA TRUE 0.965 -3.000 0.197 1.000 N NA
 7300273 7300274 EcSMS35_0056 EcSMS35_0057 pdxA surA TRUE 0.988 0.000 0.561 1.000 N NA
 7300274 7300275 EcSMS35_0057 EcSMS35_0058 surA imp TRUE 0.616 53.000 0.182 1.000 N NA
 7300277 7300278 EcSMS35_0060 EcSMS35_0061   rapA TRUE 0.929 12.000 0.294 1.000 N NA
 7300278 7300279 EcSMS35_0061 EcSMS35_0062 rapA polB TRUE 0.644 164.000 0.098 0.075 Y NA
 7300279 7300280 EcSMS35_0062 EcSMS35_0063 polB araD FALSE 0.221 75.000 0.018 1.000 N NA
 7300280 7300281 EcSMS35_0063 EcSMS35_0064 araD araA FALSE 0.272 200.000 0.017 1.000 Y NA
 7300281 7300282 EcSMS35_0064 EcSMS35_0065 araA araB TRUE 0.870 11.000 0.138 1.000 N NA
 7300283 7300284 EcSMS35_0066 EcSMS35_0067 araC   FALSE 0.002 514.000 0.000 NA   NA
 7300284 7300285 EcSMS35_0067 EcSMS35_0068     TRUE 0.620 7.000 0.000 NA   NA
 7300285 7300286 EcSMS35_0068 EcSMS35_0069     FALSE 0.053 155.000 0.000 NA   NA
 7300287 7300288 EcSMS35_0070 EcSMS35_0071 thiQ thiP TRUE 0.985 -16.000 0.522 0.017 N NA
 7300288 7300289 EcSMS35_0071 EcSMS35_0072 thiP tbpA TRUE 0.988 -24.000 0.697 0.076 N NA
 7300293 7300294 EcSMS35_0076 EcSMS35_0077 leuD leuC TRUE 0.993 11.000 0.309 0.001 Y NA
 7300294 7300295 EcSMS35_0077 EcSMS35_0078 leuC leuB TRUE 0.996 3.000 0.275 0.001 Y NA
 7300295 7300296 EcSMS35_0078 EcSMS35_0079 leuB leuA TRUE 0.995 0.000 0.126 0.001 Y NA
 7300296 7300297 EcSMS35_0079 EcSMS35_0080 leuA   FALSE 0.016 217.000 0.000 NA   NA
 7300300 7300301 EcSMS35_0083 EcSMS35_0084 ilvI ilvH TRUE 0.994 -27.000 0.371 0.002 Y NA
 7300301 7300302 EcSMS35_0084 EcSMS35_0085 ilvH fruR FALSE 0.098 180.000 0.063 1.000 N NA
 7300302 7300303 EcSMS35_0085 EcSMS35_0086 fruR mraZ FALSE 0.001 602.000 0.000 NA   NA
 7300303 7300304 EcSMS35_0086 EcSMS35_0087 mraZ mraW TRUE 0.985 2.000 0.635 NA   NA
 7300304 7300305 EcSMS35_0087 EcSMS35_0088 mraW ftsL TRUE 0.970 -3.000 0.227 1.000 N NA
 7300305 7300306 EcSMS35_0088 EcSMS35_0089 ftsL ftsI TRUE 0.809 16.000 0.124 1.000 N NA
 7300306 7300307 EcSMS35_0089 EcSMS35_0090 ftsI murE TRUE 0.974 -13.000 0.059 1.000 Y NA
 7300307 7300308 EcSMS35_0090 EcSMS35_0091 murE murF TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 7300308 7300309 EcSMS35_0091 EcSMS35_0092 murF mraY TRUE 0.996 -6.000 0.309 0.004 Y NA
 7300309 7300310 EcSMS35_0092 EcSMS35_0093 mraY murD TRUE 0.998 3.000 0.647 0.004 Y NA
 7300310 7300311 EcSMS35_0093 EcSMS35_0094 murD ftsW TRUE 0.987 0.000 0.297 0.003 N NA
 7300311 7300312 EcSMS35_0094 EcSMS35_0095 ftsW murG TRUE 0.991 -3.000 0.647 1.000 N NA
 7300312 7300313 EcSMS35_0095 EcSMS35_0096 murG murC TRUE 0.916 54.000 0.283 1.000 Y NA
 7300313 7300314 EcSMS35_0096 EcSMS35_0097 murC ddl TRUE 0.993 -7.000 0.153 0.004 Y NA
 7300314 7300315 EcSMS35_0097 EcSMS35_0098 ddl ftsQ TRUE 0.993 2.000 0.372 NA Y NA
 7300315 7300316 EcSMS35_0098 EcSMS35_0099 ftsQ ftsA TRUE 0.981 -3.000 0.389 NA N NA
 7300316 7300317 EcSMS35_0099 EcSMS35_0100 ftsA ftsZ TRUE 0.937 62.000 0.460 1.000 Y NA
 7300317 7300318 EcSMS35_0100 EcSMS35_0101 ftsZ lpxC FALSE 0.417 101.000 0.134 1.000 N NA
 7300318 7300319 EcSMS35_0101 EcSMS35_0102 lpxC secM FALSE 0.079 156.000 0.000 1.000   NA
 7300319 7300320 EcSMS35_0102 EcSMS35_0103 secM secA FALSE 0.335 62.000 0.065 1.000   NA
 7300320 7300321 EcSMS35_0103 EcSMS35_0104 secA mutT TRUE 0.551 60.000 0.168 1.000 N NA
 7300322 7300323 EcSMS35_0105 EcSMS35_0106     TRUE 0.944 10.000 0.356 NA   NA
 7300323 7300324 EcSMS35_0106 EcSMS35_0107   coaE TRUE 0.916 0.000 0.110 NA   NA
 7300326 7300327 EcSMS35_0109 EcSMS35_0110 pilC hofB TRUE 0.995 -10.000 0.571 1.000 Y NA
 7300327 7300328 EcSMS35_0110 EcSMS35_0111 hofB pilA TRUE 0.992 10.000 0.556 NA Y NA
 7300328 7300329 EcSMS35_0111 EcSMS35_0112 pilA nadC FALSE 0.025 203.000 0.015 NA N NA
 7300330 7300331 EcSMS35_0113 EcSMS35_0114 ampD ampE TRUE 0.994 -3.000 0.249 1.000 Y NA
 7300333 7300334 EcSMS35_0116 EcSMS35_0117     TRUE 0.784 3.000 0.000 1.000   NA
 7300334 7300335 EcSMS35_0117 EcSMS35_0118     TRUE 0.653 168.000 1.000 NA   NA
 7300335 7300336 EcSMS35_0118 EcSMS35_0119     TRUE 0.729 1.000 0.000 NA   NA
 7300336 7300337 EcSMS35_0119 EcSMS35_0120     FALSE 0.042 167.000 0.000 NA   NA
 7300337 7300338 EcSMS35_0120 EcSMS35_0121     FALSE 0.210 48.000 0.000 NA   NA
 7300338 7300339 EcSMS35_0121 EcSMS35_0123   pdhR FALSE 0.003 456.000 0.000 1.000   NA
 7300341 7300342 EcSMS35_0124 EcSMS35_0125 aceE aceF TRUE 0.973 15.000 0.220 1.000 Y NA
 7300342 7300343 EcSMS35_0125 EcSMS35_0126 aceF lpdA TRUE 0.856 145.000 0.463 1.000 Y NA
 7300345 7300346 EcSMS35_0128 EcSMS35_0129 acnB   FALSE 0.076 175.000 0.068 NA   NA
 7300347 7300348 EcSMS35_0130 EcSMS35_0131 speD speE TRUE 0.964 16.000 0.162 1.000 Y NA
 7300348 7300349 EcSMS35_0131 EcSMS35_0132 speE   TRUE 0.608 106.000 0.354 NA   NA
 7300354 7300355 EcSMS35_0137 EcSMS35_0138     TRUE 0.998 -3.000 0.688 1.000 Y NA
 7300355 7300356 EcSMS35_0138 EcSMS35_0139     FALSE 0.225 105.000 0.037 1.000 N NA
 7300356 7300357 EcSMS35_0139 EcSMS35_0140     TRUE 0.879 64.000 0.222 1.000 Y NA
 7300359 7300360 EcSMS35_0142 EcSMS35_0143     FALSE 0.144 69.000 0.000 NA   NA
 7300361 7300362 EcSMS35_0144 EcSMS35_0145 panC panB TRUE 0.994 12.000 0.395 0.001 Y NA
 7300362 7300363 EcSMS35_0145 EcSMS35_0146 panB   FALSE 0.186 112.000 0.000 1.000 N NA
 7300363 7300364 EcSMS35_0146 EcSMS35_0147     FALSE 0.522 54.000 0.000 0.010   NA
 7300364 7300365 EcSMS35_0147 EcSMS35_0148     TRUE 0.958 27.000 0.571 0.010   NA
 7300365 7300366 EcSMS35_0148 EcSMS35_0149     TRUE 0.975 15.000 0.571 0.010   NA
 7300366 7300367 EcSMS35_0149 EcSMS35_0150   htrE TRUE 0.948 20.000 0.571 1.000   NA
 7300367 7300368 EcSMS35_0150 EcSMS35_0151 htrE   TRUE 0.987 35.000 1.000 1.000 Y NA
 7300368 7300369 EcSMS35_0151 EcSMS35_0152     TRUE 0.925 98.000 0.500 1.000 Y NA
 7300369 7300370 EcSMS35_0152 EcSMS35_0153   folK FALSE 0.005 371.000 0.000 1.000 N NA
 7300370 7300371 EcSMS35_0153 EcSMS35_0154 folK pcnB TRUE 0.971 -3.000 0.234 1.000 N NA
 7300371 7300372 EcSMS35_0154 EcSMS35_0155 pcnB gluQ TRUE 0.807 93.000 0.131 1.000 Y NA
 7300372 7300373 EcSMS35_0155 EcSMS35_0156 gluQ dksA TRUE 0.769 37.000 0.231 1.000 N NA
 7300373 7300374 EcSMS35_0156 EcSMS35_0157 dksA sfsA FALSE 0.137 178.000 0.151 NA   NA
 7300374 7300375 EcSMS35_0157 EcSMS35_0158 sfsA ligT TRUE 0.570 15.000 0.045 NA   NA
 7300376 7300377 EcSMS35_0159 EcSMS35_0160 hrpB mrcB FALSE 0.473 94.000 0.158 1.000 N NA
 7300379 7300380 EcSMS35_0162 EcSMS35_0163 fhuA fhuC TRUE 0.886 51.000 0.156 1.000 Y NA
 7300380 7300381 EcSMS35_0163 EcSMS35_0164 fhuC fhuD TRUE 0.982 0.000 0.031 1.000 Y NA
 7300381 7300382 EcSMS35_0164 EcSMS35_0165 fhuD fhuB TRUE 0.983 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7300384 7300385 EcSMS35_0167 EcSMS35_0168 clcA yadR FALSE 0.151 82.000 0.031 NA   NA
 7300386 7300387 EcSMS35_0169 EcSMS35_0170   btuF TRUE 0.692 38.000 0.213 NA   NA
 7300387 7300388 EcSMS35_0170 EcSMS35_0171 btuF mtnN TRUE 0.894 -7.000 0.073 1.000 N NA
 7300389 7300390 EcSMS35_0172 EcSMS35_0173 dgt degP FALSE 0.293 130.000 0.101 1.000 N NA
 7300390 7300391 EcSMS35_0173 EcSMS35_0174 degP cdaR FALSE 0.136 155.000 0.080 NA N NA
 7300392 7300393 EcSMS35_0175 EcSMS35_0176   dapD FALSE 0.006 315.000 0.035 NA   NA
 7300393 7300394 EcSMS35_0176 EcSMS35_0177 dapD glnD TRUE 0.654 31.000 0.097 1.000 N NA
 7300394 7300395 EcSMS35_0177 EcSMS35_0178 glnD map TRUE 0.638 62.000 0.243 1.000 N NA
 7300398 7300399 EcSMS35_0181 EcSMS35_0182 tsf pyrH TRUE 0.551 147.000 0.416 1.000 N NA
 7300399 7300400 EcSMS35_0182 EcSMS35_0183 pyrH frr TRUE 0.659 150.000 0.626 1.000 N NA
 7300400 7300401 EcSMS35_0183 EcSMS35_0184 frr dxr FALSE 0.235 92.000 0.032 1.000 N NA
 7300401 7300402 EcSMS35_0184 EcSMS35_0185 dxr uppS FALSE 0.331 186.000 0.025 1.000 Y NA
 7300402 7300403 EcSMS35_0185 EcSMS35_0186 uppS cdsA TRUE 0.987 13.000 0.400 1.000 Y NA
 7300403 7300404 EcSMS35_0186 EcSMS35_0187 cdsA rseP TRUE 0.798 12.000 0.080 1.000 N NA
 7300404 7300405 EcSMS35_0187 EcSMS35_0188 rseP yaeT TRUE 0.946 30.000 0.204 1.000 Y NA
 7300405 7300406 EcSMS35_0188 EcSMS35_0189 yaeT skp TRUE 0.875 122.000 0.354 1.000 Y NA
 7300406 7300407 EcSMS35_0189 EcSMS35_0190 skp lpxD TRUE 0.997 4.000 0.814 1.000 Y NA
 7300407 7300408 EcSMS35_0190 EcSMS35_0191 lpxD fabZ TRUE 0.839 105.000 0.796 1.000 N NA
 7300408 7300409 EcSMS35_0191 EcSMS35_0192 fabZ lpxA TRUE 0.989 4.000 0.850 1.000 N NA
 7300409 7300410 EcSMS35_0192 EcSMS35_0193 lpxA lpxB TRUE 0.994 0.000 0.289 1.000 Y NA
 7300410 7300411 EcSMS35_0193 EcSMS35_0194 lpxB rnhB TRUE 0.963 -3.000 0.186 1.000 N NA
 7300411 7300412 EcSMS35_0194 EcSMS35_0195 rnhB dnaE TRUE 0.902 37.000 0.104 1.000 Y NA
 7300412 7300413 EcSMS35_0195 EcSMS35_0196 dnaE accA TRUE 0.836 13.000 0.122 1.000 N NA
 7300413 7300414 EcSMS35_0196 EcSMS35_0197 accA ldcC1 FALSE 0.182 99.000 0.010 1.000 N NA
 7300414 7300415 EcSMS35_0197 EcSMS35_0198 ldcC1   TRUE 0.756 57.000 0.039 NA Y NA
 7300415 7300416 EcSMS35_0198 EcSMS35_0199   tilS FALSE 0.164 65.000 0.015 NA N NA
 7300417 7300418 EcSMS35_0200 EcSMS35_0201 rof   TRUE 0.929 -7.000 0.179 NA   NA
 7300419 7300420 EcSMS35_0202 EcSMS35_0203     TRUE 0.868 -3.000 0.034 1.000   NA
 7300420 7300421 EcSMS35_0203 EcSMS35_0204   cutF FALSE 0.508 14.000 0.027 NA   NA
 7300422 7300423 EcSMS35_0205 EcSMS35_0206   proS FALSE 0.138 53.000 0.002 NA   NA
 7300423 7300424 EcSMS35_0206 EcSMS35_0207 proS   FALSE 0.164 111.000 0.048 NA   NA
 7300424 7300425 EcSMS35_0207 EcSMS35_0208   rcsF TRUE 0.964 -3.000 0.247 NA   NA
 7300425 7300426 EcSMS35_0208 EcSMS35_0209 rcsF metQ FALSE 0.434 169.000 0.500 NA   NA
 7300426 7300427 EcSMS35_0209 EcSMS35_0210 metQ metI TRUE 0.974 40.000 0.411 0.060 Y NA
 7300427 7300428 EcSMS35_0210 EcSMS35_0211 metI metN TRUE 0.996 -7.000 0.584 1.000 Y NA
 7300429 7300430 EcSMS35_0212 EcSMS35_0213   rrs FALSE 0.003 366.000 0.000 NA   NA
 7300430 7300431 EcSMS35_0213 EcSMS35_0214 rrs   FALSE 0.144 69.000 0.000 NA   NA
 7300431 7300432 EcSMS35_0214 EcSMS35_0215     FALSE 0.242 42.000 0.000 NA   NA
 7300432 7300433 EcSMS35_0215 EcSMS35_0218   rrl FALSE 0.037 174.000 0.000 NA   NA
 7300433 7300434 EcSMS35_0218 EcSMS35_0219 rrl rrf FALSE 0.124 95.000 0.000 NA   NA
 7300434 7300435 EcSMS35_0219 EcSMS35_0220 rrf   FALSE 0.179 54.000 0.000 NA   NA
 7300435 7300436 EcSMS35_0220 EcSMS35_0222   dkgB FALSE 0.047 162.000 0.000 NA   NA
 7300438 7300439 EcSMS35_0223 EcSMS35_0224     FALSE 0.252 74.000 0.066 NA   NA
 7300440 7300441 EcSMS35_0225 EcSMS35_0226 mltD gloB FALSE 0.143 210.000 0.233 1.000   NA
 7300444 7300445 EcSMS35_0229 EcSMS35_0230 dnaQ   FALSE 0.083 132.000 0.000 NA   NA
 7300449 7300450 EcSMS35_0234 EcSMS35_0236 gmhA   FALSE 0.500 116.000 0.229 1.000   NA
 7300451 7300452 EcSMS35_0235 EcSMS35_0237   yafQ FALSE 0.014 224.000 0.000 NA   NA
 7300452 7300453 EcSMS35_0237 EcSMS35_0238 yafQ dinJ TRUE 0.697 3.000 0.000 NA   NA
 7300454 7300455 EcSMS35_0239 EcSMS35_0240     FALSE 0.045 176.000 0.000 NA N NA
 7300456 7300457 EcSMS35_0241 EcSMS35_0242 lfhA flhB TRUE 0.997 -16.000 0.667 0.009 Y NA
 7300457 7300458 EcSMS35_0242 EcSMS35_0243 flhB lfiR TRUE 0.998 -10.000 1.000 1.000 Y NA
 7300458 7300459 EcSMS35_0243 EcSMS35_0244 lfiR lfiQ TRUE 0.992 2.000 0.281 1.000 Y NA
 7300459 7300460 EcSMS35_0244 EcSMS35_0245 lfiQ fliP TRUE 0.995 3.000 0.263 0.009 Y NA
 7300460 7300461 EcSMS35_0245 EcSMS35_0246 fliP lfiN TRUE 0.981 -3.000 0.368 1.000   NA
 7300461 7300462 EcSMS35_0246 EcSMS35_0247 lfiN lfiM TRUE 0.901 -7.000 0.123 NA   NA
 7300463 7300464 EcSMS35_0248 EcSMS35_0249 lafK lfiE TRUE 0.782 15.000 0.091 1.000 N NA
 7300464 7300465 EcSMS35_0249 EcSMS35_0250 lfiE fliF TRUE 0.998 5.000 1.000 0.009 Y NA
 7300465 7300466 EcSMS35_0250 EcSMS35_0251 fliF fliG TRUE 0.998 -22.000 0.970 0.009 Y NA
 7300466 7300467 EcSMS35_0251 EcSMS35_0252 fliG fliH TRUE 0.998 3.000 0.789 0.005 Y NA
 7300467 7300468 EcSMS35_0252 EcSMS35_0253 fliH lfiI TRUE 0.998 -7.000 0.816 1.000 Y NA
 7300468 7300469 EcSMS35_0253 EcSMS35_0254 lfiI lfiJ TRUE 0.812 3.000 0.035 1.000   NA
 7300469 7300470 EcSMS35_0254 EcSMS35_0255 lfiJ   TRUE 0.750 3.000 0.006 1.000   NA
 7300471 7300472 EcSMS35_0256 EcSMS35_0257     FALSE 0.014 227.000 0.000 NA   NA
 7300472 7300473 EcSMS35_0257 EcSMS35_0258     FALSE 0.004 326.000 0.000 NA   NA
 7300473 7300474 EcSMS35_0258 EcSMS35_0259   lafV FALSE 0.034 179.000 0.000 NA   NA
 7300474 7300475 EcSMS35_0259 EcSMS35_0260 lafV lfgN FALSE 0.116 128.000 0.038 NA   NA
 7300475 7300476 EcSMS35_0260 EcSMS35_0261 lfgN lfgM TRUE 0.980 13.000 0.585 0.004   NA
 7300476 7300477 EcSMS35_0261 EcSMS35_0262 lfgM lfgA FALSE 0.341 80.000 0.113 NA   NA
 7300478 7300479 EcSMS35_0263 EcSMS35_0264 lfgB flgC TRUE 0.998 3.000 0.972 1.000 Y NA
 7300479 7300480 EcSMS35_0264 EcSMS35_0265 flgC lfgD TRUE 0.998 0.000 0.914 NA Y NA
 7300480 7300481 EcSMS35_0265 EcSMS35_0266 lfgD lfgE TRUE 0.991 23.000 0.970 NA Y NA
 7300481 7300482 EcSMS35_0266 EcSMS35_0267 lfgE flgF TRUE 0.999 0.000 1.000 0.006 Y NA
 7300482 7300483 EcSMS35_0267 EcSMS35_0268 flgF flgG TRUE 0.981 79.000 0.971 0.006 Y NA
 7300483 7300484 EcSMS35_0268 EcSMS35_0269 flgG flgH TRUE 0.980 83.000 0.941 0.009 Y NA
 7300484 7300485 EcSMS35_0269 EcSMS35_0270 flgH flgI TRUE 0.999 0.000 0.912 0.011 Y NA
 7300485 7300486 EcSMS35_0270 EcSMS35_0271 flgI lfgJ TRUE 0.981 0.000 0.457 NA   NA
 7300486 7300487 EcSMS35_0271 EcSMS35_0272 lfgJ lfgK FALSE 0.034 421.000 0.457 NA   NA
 7300487 7300488 EcSMS35_0272 EcSMS35_0273 lfgK lfgL TRUE 0.978 15.000 0.576 0.002   NA
 7300488 7300489 EcSMS35_0273 EcSMS35_0274 lfgL lafW TRUE 0.957 17.000 0.667 NA   NA
 7300491 7300492 EcSMS35_0276 EcSMS35_0277 lafA lafB FALSE 0.365 206.000 0.121 1.000 Y NA
 7300492 7300493 EcSMS35_0277 EcSMS35_0278 lafB lafC TRUE 0.995 23.000 0.865 0.004 Y NA
 7300493 7300494 EcSMS35_0278 EcSMS35_0279 lafC lafD TRUE 0.763 5.000 0.054 NA   NA
 7300494 7300495 EcSMS35_0279 EcSMS35_0280 lafD lafE TRUE 0.877 -3.000 0.062 NA   NA
 7300495 7300496 EcSMS35_0280 EcSMS35_0281 lafE lafF TRUE 0.946 8.000 0.296 1.000   NA
 7300496 7300497 EcSMS35_0281 EcSMS35_0282 lafF lafS TRUE 0.903 20.000 0.333 1.000   NA
 7300497 7300498 EcSMS35_0282 EcSMS35_0283 lafS lafT TRUE 0.957 13.000 0.500 1.000 N NA
 7300498 7300499 EcSMS35_0283 EcSMS35_0284 lafT lafU TRUE 0.997 3.000 0.846 1.000 Y NA
 7300499 7300500 EcSMS35_0284 EcSMS35_0285 lafU dinB FALSE 0.237 71.000 0.000 1.000 N NA
 7300500 7300501 EcSMS35_0285 EcSMS35_0286 dinB   FALSE 0.229 52.000 0.000 NA N NA
 7300501 7300502 EcSMS35_0286 EcSMS35_0287     TRUE 0.697 3.000 0.000 NA   NA
 7300502 7300503 EcSMS35_0287 EcSMS35_0288     TRUE 0.579 10.000 0.000 NA   NA
 7300503 7300504 EcSMS35_0288 EcSMS35_0289     FALSE 0.027 191.000 0.000 NA   NA
 7300504 7300505 EcSMS35_0289 EcSMS35_0290   prfH TRUE 0.972 -3.000 0.303 NA   NA
 7300507 7300508 EcSMS35_0292 EcSMS35_0293 gpt frsA FALSE 0.169 92.000 0.040 NA   NA
 7300508 7300509 EcSMS35_0293 EcSMS35_0294 frsA crl FALSE 0.234 58.000 0.048 NA   NA
 7300511 7300512 EcSMS35_0296 EcSMS35_0297 proB proA TRUE 0.975 12.000 0.026 0.001 Y NA
 7300512 7300513 EcSMS35_0297 EcSMS35_0298 proA   FALSE 0.106 116.000 0.000 NA   NA
 7300513 7300514 EcSMS35_0298 EcSMS35_0299     FALSE 0.045 164.000 0.000 NA   NA
 7300514 7300515 EcSMS35_0299 EcSMS35_0300     FALSE 0.116 102.000 0.000 NA   NA
 7300516 7300517 EcSMS35_0301 EcSMS35_0302     TRUE 0.944 -3.000 0.000 0.013   NA
 7300517 7300518 EcSMS35_0302 EcSMS35_0303     TRUE 0.981 -3.000 0.417 NA   NA
 7300519 7300520 EcSMS35_0304 EcSMS35_0305     TRUE 0.644 120.000 0.000 1.000 Y NA
 7300520 7300521 EcSMS35_0305 EcSMS35_0306     FALSE 0.018 211.000 0.000 NA   NA
 7300521 7300522 EcSMS35_0306 EcSMS35_0307     FALSE 0.129 86.000 0.000 NA   NA
 7300522 7300523 EcSMS35_0307 EcSMS35_0308     TRUE 0.968 12.000 0.667 NA   NA
 7300523 7300524 EcSMS35_0308 EcSMS35_0309     TRUE 0.977 9.000 0.667 NA   NA
 7300524 7300525 EcSMS35_0309 EcSMS35_0310     TRUE 0.969 20.000 1.000 NA   NA
 7300525 7300526 EcSMS35_0310 EcSMS35_0311     FALSE 0.002 452.000 0.000 NA   NA
 7300526 7300527 EcSMS35_0311 EcSMS35_0312     FALSE 0.021 205.000 0.000 NA   NA
 7300527 7300528 EcSMS35_0312 EcSMS35_0313     FALSE 0.017 215.000 0.000 NA   NA
 7300528 7300529 EcSMS35_0313 EcSMS35_0314     FALSE 0.002 459.000 0.000 NA   NA
 7300530 7300531 EcSMS35_0315 EcSMS35_0316     TRUE 0.967 -31.000 0.571 NA   NA
 7300531 7300532 EcSMS35_0316 EcSMS35_0317     TRUE 0.969 -10.000 0.429 NA   NA
 7300532 7300533 EcSMS35_0317 EcSMS35_0318     TRUE 0.844 26.000 0.308 NA   NA
 7300533 7300534 EcSMS35_0318 EcSMS35_0319   matB TRUE 0.720 58.000 0.385 NA   NA
 7300534 7300535 EcSMS35_0319 EcSMS35_0320 matB matA TRUE 0.686 75.000 0.400 NA   NA
 7300535 7300536 EcSMS35_0320 EcSMS35_0321 matA   FALSE 0.002 453.000 0.000 NA   NA
 7300538 7300539 EcSMS35_0323 EcSMS35_0324 rpmJ rpmE2 TRUE 0.932 0.000 0.004 0.013   NA
 7300539 7300540 EcSMS35_0324 EcSMS35_0325 rpmE2   FALSE 0.002 940.000 0.000 1.000 N NA
 7300540 7300541 EcSMS35_0325 EcSMS35_0326     FALSE 0.017 245.000 0.000 1.000   NA
 7300542 7300543 EcSMS35_0327 EcSMS35_0328     FALSE 0.374 200.000 0.000 0.067 Y NA
 7300544 7300545 EcSMS35_0329 EcSMS35_0330     TRUE 0.902 27.000 0.438 1.000   NA
 7300549 7300550 EcSMS35_0334 EcSMS35_0335     TRUE 0.620 12.000 0.043 NA   NA
 7300550 7300551 EcSMS35_0335 EcSMS35_0336     TRUE 0.776 109.000 0.667 NA   NA
 7300552 7300553 EcSMS35_0337 EcSMS35_0338     FALSE 0.002 526.000 0.000 NA N NA
 7300553 7300554 EcSMS35_0338 EcSMS35_0339     TRUE 0.982 11.000 0.286 NA Y NA
 7300554 7300555 EcSMS35_0339 EcSMS35_0340     TRUE 0.984 -7.000 0.286 0.001   NA
 7300556 7300557 EcSMS35_0341 EcSMS35_0342   betA FALSE 0.008 261.000 0.000 NA   NA
 7300557 7300558 EcSMS35_0342 EcSMS35_0343 betA betB TRUE 0.967 14.000 0.634 1.000 N NA
 7300558 7300559 EcSMS35_0343 EcSMS35_0344 betB betI TRUE 0.950 14.000 0.459 1.000 N NA
 7300560 7300561 EcSMS35_0345 EcSMS35_0346 betT   FALSE 0.002 876.000 0.000 1.000 N NA
 7300562 7300563 EcSMS35_0347 EcSMS35_0348     FALSE 0.127 92.000 0.000 NA   NA
 7300564 7300565 EcSMS35_0349 EcSMS35_0350     TRUE 0.903 40.000 0.667 NA   NA
 7300565 7300566 EcSMS35_0350 EcSMS35_0351     TRUE 0.969 -10.000 0.429 NA   NA
 7300566 7300567 EcSMS35_0351 EcSMS35_0352     TRUE 0.990 0.000 0.714 NA   NA
 7300567 7300568 EcSMS35_0352 EcSMS35_0353     FALSE 0.348 95.000 0.125 NA   NA
 7300568 7300569 EcSMS35_0353 EcSMS35_0354     TRUE 0.938 10.000 0.278 1.000 N NA
 7300569 7300570 EcSMS35_0354 EcSMS35_0355     FALSE 0.014 224.000 0.000 NA   NA
 7300570 7300571 EcSMS35_0355 EcSMS35_0356     FALSE 0.452 16.000 0.000 NA   NA
 7300571 7300572 EcSMS35_0356 EcSMS35_0357     FALSE 0.011 243.000 0.000 NA   NA
 7300572 7300573 EcSMS35_0357 EcSMS35_0358     FALSE 0.003 344.000 0.000 NA   NA
 7300575 7300576 EcSMS35_0360 EcSMS35_0362     FALSE 0.339 27.000 0.000 NA   NA
 7300578 7300579 EcSMS35_0363 EcSMS35_0364 prpB prpC TRUE 0.873 45.000 0.502 1.000 N NA
 7300579 7300580 EcSMS35_0364 EcSMS35_0365 prpC prpD TRUE 0.753 34.000 0.216 1.000   NA
 7300580 7300581 EcSMS35_0365 EcSMS35_0366 prpD prpE TRUE 0.713 40.000 0.038 0.001   NA
 7300581 7300582 EcSMS35_0366 EcSMS35_0367 prpE codB FALSE 0.022 237.000 0.000 1.000 N NA
 7300582 7300583 EcSMS35_0367 EcSMS35_0368 codB codA TRUE 0.989 -10.000 0.250 1.000 Y NA
 7300585 7300586 EcSMS35_0370 EcSMS35_0371 cynT cynS TRUE 0.907 31.000 0.075 1.000 Y NA
 7300586 7300587 EcSMS35_0371 EcSMS35_0372 cynS cynX TRUE 0.868 33.000 0.000 1.000 Y NA
 7300588 7300589 EcSMS35_0373 EcSMS35_0374 lacA lacY TRUE 0.618 57.000 0.222 1.000   NA
 7300589 7300590 EcSMS35_0374 EcSMS35_0375 lacY lacZ TRUE 0.693 52.000 0.261 1.000   NA
 7300590 7300591 EcSMS35_0375 EcSMS35_0376 lacZ lacI FALSE 0.423 123.000 0.174 1.000 N NA
 7300591 7300592 EcSMS35_0376 EcSMS35_0377 lacI mhpR TRUE 0.804 77.000 0.000 0.053 Y NA
 7300593 7300594 EcSMS35_0378 EcSMS35_0379 mhpA mhpB TRUE 0.985 2.000 0.333 0.006   NA
 7300594 7300595 EcSMS35_0379 EcSMS35_0380 mhpB mhpC TRUE 0.896 18.000 0.300 1.000   NA
 7300595 7300596 EcSMS35_0380 EcSMS35_0381 mhpC mhpD TRUE 0.939 10.000 0.300 1.000   NA
 7300596 7300597 EcSMS35_0381 EcSMS35_0382 mhpD mhpF TRUE 0.996 -3.000 0.444 1.000 Y NA
 7300597 7300598 EcSMS35_0382 EcSMS35_0383 mhpF mhpE TRUE 0.993 -3.000 0.750 1.000 N NA
 7300598 7300599 EcSMS35_0383 EcSMS35_0384 mhpE   FALSE 0.517 176.000 0.600 1.000 N NA
 7300599 7300600 EcSMS35_0384 EcSMS35_0385     FALSE 0.116 102.000 0.000 NA   NA
 7300601 7300602 EcSMS35_0386 EcSMS35_0387 fghA2 adhC TRUE 0.645 92.000 0.327 1.000   NA
 7300602 7300603 EcSMS35_0387 EcSMS35_0388 adhC   TRUE 0.882 35.000 0.531 NA   NA
 7300603 7300604 EcSMS35_0388 EcSMS35_0389     FALSE 0.030 185.000 0.000 NA   NA
 7300604 7300605 EcSMS35_0389 EcSMS35_0390     TRUE 0.717 2.000 0.000 NA   NA
 7300605 7300606 EcSMS35_0390 EcSMS35_0391     FALSE 0.101 119.000 0.000 NA   NA
 7300606 7300607 EcSMS35_0391 EcSMS35_0392     TRUE 0.900 10.000 0.214 NA   NA
 7300607 7300608 EcSMS35_0392 EcSMS35_0393     FALSE 0.002 438.000 0.000 NA   NA
 7300609 7300610 EcSMS35_0394 EcSMS35_0395 tauA tauB TRUE 0.946 14.000 0.047 1.000 Y NA
 7300610 7300611 EcSMS35_0395 EcSMS35_0396 tauB tauC TRUE 0.998 -3.000 0.728 1.000 Y NA
 7300611 7300612 EcSMS35_0396 EcSMS35_0397 tauC tauD TRUE 0.967 -3.000 0.214 1.000 N NA
 7300615 7300616 EcSMS35_0399 EcSMS35_0401     TRUE 0.969 -42.000 0.000 0.073 Y NA
 7300617 7300618 EcSMS35_0402 EcSMS35_0403     TRUE 0.804 86.000 0.667 NA   NA
 7300620 7300621 EcSMS35_0405 EcSMS35_0406   smbA FALSE 0.417 20.000 0.000 NA   NA
 7300621 7300622 EcSMS35_0406 EcSMS35_0407 smbA   TRUE 0.613 13.000 0.000 1.000   NA
 7300626 7300627 EcSMS35_0411 EcSMS35_0412     FALSE 0.033 182.000 0.000 NA   NA
 7300627 7300628 EcSMS35_0412 EcSMS35_0413   phoA FALSE 0.138 100.000 0.032 NA   NA
 7300628 7300629 EcSMS35_0413 EcSMS35_0414 phoA psiF FALSE 0.120 119.000 0.032 NA   NA
 7300629 7300630 EcSMS35_0414 EcSMS35_0415 psiF adrA FALSE 0.507 102.000 0.250 NA   NA
 7300632 7300633 EcSMS35_0417 EcSMS35_0418   aroL FALSE 0.025 183.000 0.007 NA   NA
 7300633 7300634 EcSMS35_0418 EcSMS35_0419 aroL   FALSE 0.275 50.000 0.044 NA   NA
 7300634 7300635 EcSMS35_0419 EcSMS35_0420   aroM FALSE 0.009 258.000 0.000 NA   NA
 7300635 7300636 EcSMS35_0420 EcSMS35_0421 aroM   FALSE 0.209 72.000 0.049 NA   NA
 7300636 7300637 EcSMS35_0421 EcSMS35_0422     FALSE 0.020 208.000 0.000 NA   NA
 7300640 7300641 EcSMS35_0425 EcSMS35_0426 araJ sbcC FALSE 0.316 42.000 0.030 NA N NA
 7300641 7300642 EcSMS35_0426 EcSMS35_0427 sbcC sbcD TRUE 0.992 -3.000 0.021 0.001 Y NA
 7300643 7300644 EcSMS35_0428 EcSMS35_0429   phoB FALSE 0.139 73.000 0.000 NA   NA
 7300644 7300645 EcSMS35_0429 EcSMS35_0430 phoB phoR TRUE 0.962 58.000 0.453 0.016 Y NA
 7300647 7300648 EcSMS35_0432 EcSMS35_0433 brnQ proY TRUE 0.938 73.000 0.348 0.087 Y NA
 7300648 7300649 EcSMS35_0433 EcSMS35_0434 proY malZ FALSE 0.217 156.000 0.123 1.000 N NA
 7300649 7300650 EcSMS35_0434 EcSMS35_0435 malZ   FALSE 0.029 187.000 0.000 NA   NA
 7300652 7300653 EcSMS35_0437 EcSMS35_0438 queA tgt TRUE 0.965 55.000 0.360 0.001 Y NA
 7300653 7300654 EcSMS35_0438 EcSMS35_0439 tgt yajC TRUE 0.878 23.000 0.325 NA N NA
 7300654 7300655 EcSMS35_0439 EcSMS35_0440 yajC secD TRUE 0.888 28.000 0.045 NA Y NA
 7300655 7300656 EcSMS35_0440 EcSMS35_0441 secD secF TRUE 0.990 11.000 0.206 0.001 Y NA
 7300656 7300657 EcSMS35_0441 EcSMS35_0442 secF   FALSE 0.103 151.000 0.000 1.000 N NA
 7300657 7300658 EcSMS35_0442 EcSMS35_0443     TRUE 0.960 -7.000 0.300 NA   NA
 7300658 7300659 EcSMS35_0443 EcSMS35_0444     FALSE 0.128 88.000 0.000 NA   NA
 7300660 7300661 EcSMS35_0445 EcSMS35_0446 tsx1   FALSE 0.005 299.000 0.000 NA   NA
 7300664 7300665 EcSMS35_0449 EcSMS35_0450 nrdR ribD TRUE 0.950 4.000 0.277 NA N NA
 7300665 7300666 EcSMS35_0450 EcSMS35_0451 ribD ribH TRUE 0.847 89.000 0.034 0.001 Y NA
 7300666 7300667 EcSMS35_0451 EcSMS35_0452 ribH nusB TRUE 0.914 20.000 0.347 1.000 N NA
 7300667 7300668 EcSMS35_0452 EcSMS35_0453 nusB thiL TRUE 0.578 78.000 0.225 1.000 N NA
 7300668 7300669 EcSMS35_0453 EcSMS35_0454 thiL pgpA TRUE 0.937 -13.000 0.206 1.000 N NA
 7300670 7300671 EcSMS35_0455 EcSMS35_0456   dxs FALSE 0.257 55.000 0.009 1.000 N NA
 7300671 7300672 EcSMS35_0456 EcSMS35_0457 dxs ispA TRUE 0.921 25.000 0.060 1.000 Y NA
 7300672 7300673 EcSMS35_0457 EcSMS35_0458 ispA xseB TRUE 0.876 0.000 0.035 1.000 N NA
 7300675 7300676 EcSMS35_0460 EcSMS35_0461 thiJ panE TRUE 0.853 -37.000 0.155 NA   NA
 7300679 7300680 EcSMS35_0464 EcSMS35_0465     FALSE 0.111 109.000 0.000 NA   NA
 7300681 7300682 EcSMS35_0466 EcSMS35_0467     TRUE 0.729 -16.000 0.000 1.000   NA
 7300682 7300683 EcSMS35_0467 EcSMS35_0468   cyoE FALSE 0.046 185.000 0.000 1.000   NA
 7300683 7300684 EcSMS35_0468 EcSMS35_0469 cyoE cyoD TRUE 0.905 12.000 0.118 0.086 N NA
 7300684 7300685 EcSMS35_0469 EcSMS35_0470 cyoD cyoC TRUE 0.998 0.000 0.485 0.053 Y NA
 7300685 7300686 EcSMS35_0470 EcSMS35_0471 cyoC cyoB TRUE 0.998 -10.000 0.697 0.053 Y NA
 7300686 7300687 EcSMS35_0471 EcSMS35_0472 cyoB cyoA TRUE 0.958 22.000 0.041 0.004 Y NA
 7300689 7300690 EcSMS35_0474 EcSMS35_0475 ampG   TRUE 0.708 44.000 0.256 NA   NA
 7300690 7300691 EcSMS35_0475 EcSMS35_0476     FALSE 0.200 50.000 0.000 NA   NA
 7300692 7300693 EcSMS35_0477 EcSMS35_0478     FALSE 0.195 51.000 0.000 NA   NA
 7300693 7300694 EcSMS35_0478 EcSMS35_0479   tig FALSE 0.064 147.000 0.000 NA   NA
 7300694 7300695 EcSMS35_0479 EcSMS35_0480 tig clpP FALSE 0.400 246.000 0.351 1.000 Y NA
 7300695 7300696 EcSMS35_0480 EcSMS35_0481 clpP clpX TRUE 0.867 126.000 0.352 1.000 Y NA
 7300696 7300697 EcSMS35_0481 EcSMS35_0482 clpX lon TRUE 0.620 188.000 0.201 0.097 Y NA
 7300697 7300698 EcSMS35_0482 EcSMS35_0483 lon hupB FALSE 0.036 209.000 0.000 1.000 N NA
 7300698 7300699 EcSMS35_0483 EcSMS35_0484 hupB ppiD FALSE 0.049 192.000 0.000 1.000 N NA
 7300699 7300700 EcSMS35_0484 EcSMS35_0485 ppiD   FALSE 0.116 151.000 0.033 1.000 N NA
 7300700 7300701 EcSMS35_0485 EcSMS35_0486     FALSE 0.177 106.000 0.027 1.000   NA
 7300702 7300703 EcSMS35_0487 EcSMS35_0488 queC   FALSE 0.209 65.000 0.019 1.000   NA
 7300704 7300705 EcSMS35_0489 EcSMS35_0490 cof   FALSE 0.082 153.000 0.020 1.000   NA
 7300705 7300706 EcSMS35_0490 EcSMS35_0491   mdlA TRUE 0.762 30.000 0.179 1.000 N NA
 7300706 7300707 EcSMS35_0491 EcSMS35_0492 mdlA mdlB TRUE 0.999 -7.000 0.911 0.001 Y NA
 7300709 7300710 EcSMS35_0494 EcSMS35_0495 glnK amt TRUE 0.739 30.000 0.156 1.000 N NA
 7300715 7300716 EcSMS35_0500 EcSMS35_0501     FALSE 0.045 164.000 0.000 NA   NA
 7300716 7300717 EcSMS35_0501 EcSMS35_0502   maa FALSE 0.321 116.000 0.101 1.000   NA
 7300717 7300718 EcSMS35_0502 EcSMS35_0503 maa   FALSE 0.086 172.000 0.076 NA   NA
 7300718 7300719 EcSMS35_0503 EcSMS35_0504     TRUE 0.573 26.000 0.080 NA   NA
 7300719 7300720 EcSMS35_0504 EcSMS35_0505     FALSE 0.002 546.000 0.000 NA   NA
 7300720 7300721 EcSMS35_0505 EcSMS35_0506   acrA TRUE 0.927 23.000 0.458 1.000 N NA
 7300722 7300723 EcSMS35_0507 EcSMS35_0508 acrR kefA FALSE 0.111 128.000 0.000 NA N NA
 7300724 7300725 EcSMS35_0509 EcSMS35_0510   priC TRUE 0.941 14.000 0.474 NA   NA
 7300726 7300727 EcSMS35_0511 EcSMS35_0512   apt FALSE 0.078 153.000 0.043 NA   NA
 7300727 7300728 EcSMS35_0512 EcSMS35_0513 apt dnaX FALSE 0.276 129.000 0.088 1.000 N NA
 7300728 7300729 EcSMS35_0513 EcSMS35_0514 dnaX   TRUE 0.764 53.000 0.411 NA   NA
 7300729 7300730 EcSMS35_0514 EcSMS35_0515   recR TRUE 0.987 0.000 0.604 NA   NA
 7300730 7300731 EcSMS35_0515 EcSMS35_0516 recR htpG FALSE 0.201 110.000 0.028 1.000 N NA
 7300733 7300734 EcSMS35_0518 EcSMS35_0520 adk hemH FALSE 0.134 132.000 0.013 1.000 N NA
 7300737 7300738 EcSMS35_0522 EcSMS35_0523   fsr FALSE 0.015 238.000 0.000 NA N NA
 7300740 7300741 EcSMS35_0525 EcSMS35_0526     FALSE 0.021 204.000 0.022 NA   NA
 7300741 7300742 EcSMS35_0526 EcSMS35_0527   copA FALSE 0.005 304.000 0.000 NA   NA
 7300743 7300744 EcSMS35_0528 EcSMS35_0529 glsA1   TRUE 0.975 3.000 0.028 1.000 Y NA
 7300744 7300745 EcSMS35_0529 EcSMS35_0530   cueR FALSE 0.163 125.000 0.000 1.000 N NA
 7300746 7300747 EcSMS35_0531 EcSMS35_0532     FALSE 0.287 33.000 0.000 NA   NA
 7300747 7300748 EcSMS35_0532 EcSMS35_0533     FALSE 0.179 54.000 0.000 NA   NA
 7300748 7300749 EcSMS35_0533 EcSMS35_0534     FALSE 0.119 98.000 0.000 NA   NA
 7300750 7300751 EcSMS35_0535 EcSMS35_0536     TRUE 0.712 -7.000 0.000 NA   NA
 7300752 7300753 EcSMS35_0537 EcSMS35_0538     TRUE 0.994 -3.000 0.313 NA Y NA
 7300754 7300755 EcSMS35_0539 EcSMS35_0540     TRUE 0.607 -13.000 0.012 NA   NA
 7300756 7300757 EcSMS35_0541 EcSMS35_0542 ybbN   FALSE 0.450 61.000 0.118 1.000   NA
 7300757 7300758 EcSMS35_0542 EcSMS35_0543   tesA TRUE 0.588 29.000 0.072 1.000   NA
 7300759 7300760 EcSMS35_0544 EcSMS35_0545     TRUE 0.997 -3.000 0.535 NA Y NA
 7300761 7300762 EcSMS35_0546 EcSMS35_0547 selU   FALSE 0.190 69.000 0.012 1.000   NA
 7300763 7300764 EcSMS35_0548 EcSMS35_0549 allA allR TRUE 0.766 123.000 0.625 1.000 N NA
 7300764 7300765 EcSMS35_0549 EcSMS35_0550 allR gcl FALSE 0.261 90.000 0.054 1.000   NA
 7300765 7300766 EcSMS35_0550 EcSMS35_0551 gcl hyi TRUE 0.735 13.000 0.065 1.000   NA
 7300766 7300767 EcSMS35_0551 EcSMS35_0552 hyi   FALSE 0.448 100.000 0.154 1.000 N NA
 7300767 7300768 EcSMS35_0552 EcSMS35_0553     FALSE 0.072 170.000 0.000 1.000 N NA
 7300768 7300769 EcSMS35_0553 EcSMS35_0554   allB TRUE 0.856 61.000 0.161 1.000 Y NA
 7300769 7300770 EcSMS35_0554 EcSMS35_0555 allB   FALSE 0.169 56.000 0.000 NA   NA
 7300770 7300771 EcSMS35_0555 EcSMS35_0556     FALSE 0.398 22.000 0.000 NA   NA
 7300771 7300772 EcSMS35_0556 EcSMS35_0557     TRUE 0.548 11.000 0.000 NA   NA
 7300772 7300773 EcSMS35_0557 EcSMS35_0558     FALSE 0.242 42.000 0.000 NA   NA
 7300773 7300774 EcSMS35_0558 EcSMS35_0559     FALSE 0.398 22.000 0.000 NA   NA
 7300775 7300776 EcSMS35_0560 EcSMS35_0561   allC TRUE 0.699 11.000 0.059 NA   NA
 7300776 7300777 EcSMS35_0561 EcSMS35_0562 allC allD TRUE 0.819 22.000 0.174 1.000 N NA
 7300778 7300779 EcSMS35_0563 EcSMS35_0564     TRUE 0.952 10.000 0.412 NA   NA
 7300779 7300780 EcSMS35_0564 EcSMS35_0565     TRUE 0.910 11.000 0.265 NA   NA
 7300780 7300781 EcSMS35_0565 EcSMS35_0566   arcC TRUE 0.979 -3.000 0.375 NA   NA
 7300782 7300783 EcSMS35_0567 EcSMS35_0568 purK purE TRUE 0.995 -3.000 0.136 0.001 Y NA
 7300783 7300784 EcSMS35_0568 EcSMS35_0569 purE lpxH FALSE 0.146 117.000 0.016 1.000   NA
 7300784 7300785 EcSMS35_0569 EcSMS35_0570 lpxH ppiB TRUE 0.953 3.000 0.237 1.000   NA
 7300787 7300788 EcSMS35_0572 EcSMS35_0573     FALSE 0.093 108.000 0.011 NA   NA
 7300788 7300789 EcSMS35_0573 EcSMS35_0574   folD TRUE 0.862 2.000 0.055 1.000   NA
 7300790 7300791 EcSMS35_0575 EcSMS35_0576     FALSE 0.208 219.000 0.000 1.000 Y NA
 7300791 7300792 EcSMS35_0576 EcSMS35_0577   sfmD TRUE 0.987 31.000 0.875 1.000 Y NA
 7300792 7300793 EcSMS35_0577 EcSMS35_0578 sfmD   TRUE 0.995 13.000 0.875 1.000 Y NA
 7300793 7300794 EcSMS35_0578 EcSMS35_0579     FALSE 0.229 329.000 0.875 0.010   NA
 7300796 7300797 EcSMS35_0581 EcSMS35_0582     FALSE 0.295 32.000 0.000 NA   NA
 7300798 7300799 EcSMS35_0583 EcSMS35_0584     FALSE 0.032 183.000 0.000 NA   NA
 7300799 7300800 EcSMS35_0584 EcSMS35_0585     TRUE 0.980 1.000 0.500 NA   NA
 7300800 7300801 EcSMS35_0585 EcSMS35_0586   nfrB TRUE 0.913 -13.000 0.159 1.000   NA
 7300801 7300802 EcSMS35_0586 EcSMS35_0587 nfrB cusS FALSE 0.210 150.000 0.000 0.097 N NA
 7300802 7300803 EcSMS35_0587 EcSMS35_0588 cusS cusR TRUE 0.998 -10.000 0.600 0.001 Y NA
 7300804 7300805 EcSMS35_0589 EcSMS35_0590   cusC TRUE 0.540 -45.000 0.000 NA   NA
 7300805 7300806 EcSMS35_0590 EcSMS35_0591 cusC cusF TRUE 0.917 24.000 0.500 NA   NA
 7300806 7300807 EcSMS35_0591 EcSMS35_0592 cusF cusB FALSE 0.452 16.000 0.000 NA   NA
 7300807 7300808 EcSMS35_0592 EcSMS35_0593 cusB cusA TRUE 0.961 12.000 0.500 1.000 N NA
 7300808 7300809 EcSMS35_0593 EcSMS35_0594 cusA pheP FALSE 0.361 102.000 0.000 0.085 N NA
 7300810 7300811 EcSMS35_0595 EcSMS35_0596   nfnB FALSE 0.121 108.000 0.012 NA N NA
 7300811 7300812 EcSMS35_0596 EcSMS35_0597 nfnB   TRUE 0.733 79.000 0.500 NA   NA
 7300812 7300813 EcSMS35_0597 EcSMS35_0598     FALSE 0.148 65.000 0.000 NA   NA
 7300813 7300814 EcSMS35_0598 EcSMS35_0599     FALSE 0.147 66.000 0.000 NA   NA
 7300816 7300817 EcSMS35_0601 EcSMS35_0602 entD fepA TRUE 0.578 175.000 0.700 1.000 N NA
 7300818 7300819 EcSMS35_0603 EcSMS35_0604   fes FALSE 0.101 119.000 0.000 NA   NA
 7300819 7300820 EcSMS35_0604 EcSMS35_0605 fes   TRUE 0.960 3.000 0.320 NA   NA
 7300820 7300821 EcSMS35_0605 EcSMS35_0606   entF TRUE 0.898 -3.000 0.080 NA   NA
 7300821 7300822 EcSMS35_0606 EcSMS35_0608 entF fepE FALSE 0.031 215.000 0.000 1.000 N NA
 7300823 7300824 EcSMS35_0607 EcSMS35_0609 fepC fepG TRUE 0.985 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 7300824 7300825 EcSMS35_0609 EcSMS35_0610 fepG fepD TRUE 0.989 -3.000 0.000 0.058 Y NA
 7300828 7300829 EcSMS35_0613 EcSMS35_0614 entC entE TRUE 0.995 10.000 0.667 1.000 Y NA
 7300829 7300830 EcSMS35_0614 EcSMS35_0615 entE entB TRUE 0.992 14.000 0.667 1.000 Y NA
 7300830 7300831 EcSMS35_0615 EcSMS35_0616 entB entA TRUE 0.982 0.000 0.024 1.000 Y NA
 7300831 7300832 EcSMS35_0616 EcSMS35_0617 entA   TRUE 0.977 3.000 0.065 NA Y NA
 7300832 7300833 EcSMS35_0617 EcSMS35_0618   cstA FALSE 0.204 181.000 0.222 NA N NA
 7300833 7300834 EcSMS35_0618 EcSMS35_0619 cstA   TRUE 0.573 113.000 0.333 NA   NA
 7300837 7300838 EcSMS35_0622 EcSMS35_0623     TRUE 0.736 -15.000 0.000 1.000   NA
 7300838 7300839 EcSMS35_0623 EcSMS35_0624     FALSE 0.469 147.000 0.333 1.000   NA
 7300839 7300840 EcSMS35_0624 EcSMS35_0625   dsbG FALSE 0.050 205.000 0.067 NA N NA
 7300841 7300842 EcSMS35_0626 EcSMS35_0627 ahpC ahpF TRUE 0.965 99.000 0.551 0.001 Y NA
 7300843 7300844 EcSMS35_0628 EcSMS35_0629 uspG rnk FALSE 0.006 356.000 0.000 1.000 N NA
 7300844 7300845 EcSMS35_0629 EcSMS35_0630 rnk rna FALSE 0.023 230.000 0.018 1.000 N NA
 7300845 7300846 EcSMS35_0630 EcSMS35_0631 rna   FALSE 0.187 114.000 0.024 1.000 N NA
 7300846 7300847 EcSMS35_0631 EcSMS35_0632   citG TRUE 0.530 83.000 0.194 1.000 N NA
 7300847 7300848 EcSMS35_0632 EcSMS35_0633 citG citX TRUE 0.990 -25.000 0.400 1.000 Y NA
 7300848 7300849 EcSMS35_0633 EcSMS35_0634 citX citF TRUE 0.792 4.000 0.000 1.000 N NA
 7300849 7300850 EcSMS35_0634 EcSMS35_0635 citF citE TRUE 0.897 11.000 0.000 0.001 N NA
 7300850 7300851 EcSMS35_0635 EcSMS35_0636 citE citD TRUE 0.995 -3.000 0.537 0.001 N NA
 7300851 7300852 EcSMS35_0636 EcSMS35_0637 citD citC TRUE 0.935 15.000 0.000 1.000 Y NA
 7300853 7300854 EcSMS35_0638 EcSMS35_0639 dpiB dpiA TRUE 0.956 -31.000 0.000 1.000 Y NA
 7300858 7300859 EcSMS35_0643 EcSMS35_0644   cspE FALSE 0.037 175.000 0.000 NA   NA
 7300861 7300862 EcSMS35_0646 EcSMS35_0647   tatE FALSE 0.404 129.000 0.196 1.000   NA
 7300863 7300864 EcSMS35_0648 EcSMS35_0649 lipA   FALSE 0.030 209.000 0.005 1.000 N NA
 7300864 7300865 EcSMS35_0649 EcSMS35_0650   lipB FALSE 0.016 260.000 0.000 1.000 N NA
 7300865 7300866 EcSMS35_0650 EcSMS35_0651 lipB   FALSE 0.469 101.000 0.219 NA   NA
 7300866 7300867 EcSMS35_0651 EcSMS35_0652   dacA FALSE 0.239 110.000 0.081 NA   NA
 7300867 7300868 EcSMS35_0652 EcSMS35_0653 dacA rlpA TRUE 0.854 140.000 0.475 NA Y NA
 7300868 7300869 EcSMS35_0653 EcSMS35_0654 rlpA mrdB TRUE 0.655 11.000 0.035 NA N NA
 7300869 7300870 EcSMS35_0654 EcSMS35_0655 mrdB mrdA TRUE 0.854 3.000 0.046 1.000 N NA
 7300870 7300871 EcSMS35_0655 EcSMS35_0656 mrdA   FALSE 0.341 31.000 0.031 NA   NA
 7300871 7300872 EcSMS35_0656 EcSMS35_0657     TRUE 0.953 4.000 0.307 NA   NA
 7300872 7300873 EcSMS35_0657 EcSMS35_0658   cobC FALSE 0.008 260.000 0.000 NA   NA
 7300873 7300874 EcSMS35_0658 EcSMS35_0659 cobC nadD TRUE 0.637 24.000 0.057 1.000 N NA
 7300874 7300875 EcSMS35_0659 EcSMS35_0660 nadD holA TRUE 0.864 2.000 0.045 1.000 N NA
 7300875 7300876 EcSMS35_0660 EcSMS35_0661 holA   TRUE 0.954 0.000 0.199 NA N NA
 7300876 7300877 EcSMS35_0661 EcSMS35_0662   leuS TRUE 0.841 15.000 0.182 NA N NA
 7300878 7300879 EcSMS35_0663 EcSMS35_0665     TRUE 0.564 -34.000 0.000 NA   NA
 7300881 7300882 EcSMS35_0666 EcSMS35_0667     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7300884 7300885 EcSMS35_0669 EcSMS35_0670     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7300886 7300887 EcSMS35_0671 EcSMS35_0672 hscC rihA FALSE 0.158 84.000 0.000 NA N NA
 7300887 7300888 EcSMS35_0672 EcSMS35_0673 rihA gltL FALSE 0.424 118.000 0.195 NA N NA
 7300888 7300889 EcSMS35_0673 EcSMS35_0674 gltL gltK TRUE 0.995 0.000 0.379 1.000 Y NA
 7300889 7300890 EcSMS35_0674 EcSMS35_0675 gltK gltJ TRUE 0.999 0.000 0.933 0.016 Y NA
 7300890 7300891 EcSMS35_0675 EcSMS35_0676 gltJ gltI FALSE 0.518 170.000 0.000 0.058 Y NA
 7300891 7300892 EcSMS35_0676 EcSMS35_0677 gltI   FALSE 0.069 143.000 0.000 NA   NA
 7300894 7300895 EcSMS35_0678 EcSMS35_0680 lnt corC TRUE 0.938 25.000 0.557 1.000 N NA
 7300895 7300896 EcSMS35_0680 EcSMS35_0681 corC   FALSE 0.393 90.000 0.150 NA   NA
 7300896 7300897 EcSMS35_0681 EcSMS35_0682     TRUE 0.983 -3.000 0.457 NA   NA
 7300897 7300898 EcSMS35_0682 EcSMS35_0683     FALSE 0.159 59.000 0.000 NA   NA
 7300898 7300899 EcSMS35_0683 EcSMS35_0684   miaB TRUE 0.591 -25.000 0.000 NA   NA
 7300901 7300902 EcSMS35_0686 EcSMS35_0687     FALSE 0.268 36.000 0.000 NA   NA
 7300902 7300903 EcSMS35_0687 EcSMS35_0688     FALSE 0.216 47.000 0.000 NA   NA
 7300903 7300904 EcSMS35_0688 EcSMS35_0689     FALSE 0.483 14.000 0.000 NA   NA
 7300904 7300905 EcSMS35_0689 EcSMS35_0690     FALSE 0.279 34.000 0.000 NA   NA
 7300905 7300906 EcSMS35_0690 EcSMS35_0691     FALSE 0.387 23.000 0.000 NA   NA
 7300906 7300907 EcSMS35_0691 EcSMS35_0692     TRUE 0.620 7.000 0.000 NA   NA
 7300907 7300908 EcSMS35_0692 EcSMS35_0693   asnB FALSE 0.003 380.000 0.000 NA   NA
 7300910 7300911 EcSMS35_0695 EcSMS35_0696 nagD nagC TRUE 0.852 48.000 0.070 1.000 Y NA
 7300911 7300912 EcSMS35_0696 EcSMS35_0697 nagC nagA TRUE 0.994 9.000 0.571 1.000 Y NA
 7300912 7300913 EcSMS35_0697 EcSMS35_0698 nagA nagB TRUE 0.975 60.000 0.557 0.001 Y NA
 7300913 7300914 EcSMS35_0698 EcSMS35_0699 nagB   FALSE 0.240 49.000 0.033 NA   NA
 7300917 7300918 EcSMS35_0702 EcSMS35_0703 glnS   FALSE 0.003 442.000 0.000 1.000   NA
 7300918 7300919 EcSMS35_0703 EcSMS35_0704     FALSE 0.200 50.000 0.000 NA   NA
 7300920 7300921 EcSMS35_0705 EcSMS35_0706 fur fldA FALSE 0.037 289.000 0.156 1.000 N NA
 7300921 7300922 EcSMS35_0706 EcSMS35_0707 fldA   TRUE 0.601 140.000 0.473 1.000   NA
 7300922 7300923 EcSMS35_0707 EcSMS35_0708   ybfF FALSE 0.402 140.000 0.276 NA   NA
 7300924 7300925 EcSMS35_0709 EcSMS35_0710 seqA pgm TRUE 0.764 26.000 0.151 1.000 N NA
 7300925 7300926 EcSMS35_0710 EcSMS35_0711 pgm   FALSE 0.021 205.000 0.000 NA   NA
 7300927 7300928 EcSMS35_0712 EcSMS35_0713     FALSE 0.133 78.000 0.000 NA   NA
 7300928 7300929 EcSMS35_0713 EcSMS35_0714   potE FALSE 0.098 122.000 0.000 NA   NA
 7300929 7300930 EcSMS35_0714 EcSMS35_0715 potE speF TRUE 0.988 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 7300930 7300931 EcSMS35_0715 EcSMS35_0716 speF kdpE FALSE 0.003 596.000 0.000 1.000 N NA
 7300931 7300932 EcSMS35_0716 EcSMS35_0717 kdpE kdpD TRUE 0.996 -3.000 0.385 1.000 Y NA
 7300932 7300933 EcSMS35_0717 EcSMS35_0718 kdpD kdpC TRUE 0.916 -7.000 0.100 1.000 N NA
 7300933 7300934 EcSMS35_0718 EcSMS35_0719 kdpC kdpB TRUE 0.998 9.000 0.877 0.001 Y NA
 7300934 7300935 EcSMS35_0719 EcSMS35_0720 kdpB kdpA TRUE 0.980 23.000 0.201 0.001 Y NA
 7300936 7300937 EcSMS35_0721 EcSMS35_0722     FALSE 0.488 101.000 0.231 NA   NA
 7300937 7300938 EcSMS35_0722 EcSMS35_0723   phrB TRUE 0.771 -3.000 0.019 NA   NA
 7300940 7300941 EcSMS35_0725 EcSMS35_0726     FALSE 0.511 23.000 0.050 NA   NA
 7300941 7300942 EcSMS35_0726 EcSMS35_0727     TRUE 0.994 -6.000 0.379 NA Y NA
 7300942 7300943 EcSMS35_0727 EcSMS35_0728     TRUE 0.929 -10.000 0.211 NA   NA
 7300943 7300944 EcSMS35_0728 EcSMS35_0730   nei FALSE 0.414 36.000 0.037 1.000   NA
 7300945 7300946 EcSMS35_0729 EcSMS35_0731 abrB   FALSE 0.056 152.000 0.000 NA   NA
 7300946 7300947 EcSMS35_0731 EcSMS35_0732   gltA FALSE 0.064 147.000 0.000 NA   NA
 7300948 7300949 EcSMS35_0733 EcSMS35_0734   sdhC FALSE 0.002 521.000 0.000 NA   NA
 7300949 7300950 EcSMS35_0734 EcSMS35_0735 sdhC sdhD TRUE 0.998 -6.000 0.453 0.001 Y NA
 7300950 7300951 EcSMS35_0735 EcSMS35_0736 sdhD sdhA TRUE 0.999 0.000 0.705 0.002 Y NA
 7300951 7300952 EcSMS35_0736 EcSMS35_0737 sdhA sdhB TRUE 0.994 16.000 0.604 0.002 Y NA
 7300952 7300953 EcSMS35_0737 EcSMS35_0738 sdhB sucA FALSE 0.328 201.000 0.067 1.000 Y NA
 7300953 7300954 EcSMS35_0738 EcSMS35_0739 sucA sucB TRUE 0.991 15.000 0.667 1.000 Y NA
 7300954 7300955 EcSMS35_0739 EcSMS35_0740 sucB sucC TRUE 0.809 94.000 0.136 1.000 Y NA
 7300955 7300956 EcSMS35_0740 EcSMS35_0741 sucC sucD TRUE 0.999 0.000 0.806 0.001 Y NA
 7300956 7300957 EcSMS35_0741 EcSMS35_0742 sucD   FALSE 0.015 249.000 0.000 1.000   NA
 7300957 7300958 EcSMS35_0742 EcSMS35_0743     FALSE 0.011 271.000 0.000 1.000   NA
 7300959 7300960 EcSMS35_0744 EcSMS35_0745 cobO   TRUE 0.699 10.000 0.012 1.000 N NA
 7300960 7300961 EcSMS35_0745 EcSMS35_0746     TRUE 0.907 108.000 0.429 1.000 Y NA
 7300961 7300962 EcSMS35_0746 EcSMS35_0747     FALSE 0.152 161.000 0.121 NA   NA
 7300962 7300963 EcSMS35_0747 EcSMS35_0748     TRUE 0.990 -3.000 0.689 NA   NA
 7300963 7300964 EcSMS35_0748 EcSMS35_0749     TRUE 0.958 4.000 0.333 NA   NA
 7300964 7300965 EcSMS35_0749 EcSMS35_0750   mutE TRUE 0.998 0.000 0.651 1.000 Y NA
 7300965 7300966 EcSMS35_0750 EcSMS35_0751 mutE   TRUE 0.918 19.000 0.429 NA   NA
 7300966 7300967 EcSMS35_0751 EcSMS35_0752   mamA TRUE 0.976 0.000 0.367 NA   NA
 7300967 7300968 EcSMS35_0752 EcSMS35_0753 mamA   FALSE 0.002 547.000 0.000 NA   NA
 7300968 7300969 EcSMS35_0753 EcSMS35_0754     FALSE 0.130 81.000 0.000 NA   NA
 7300970 7300971 EcSMS35_0755 EcSMS35_0756 cydA cydB1 TRUE 0.956 16.000 0.000 0.052 Y NA
 7300971 7300972 EcSMS35_0756 EcSMS35_0757 cydB1   TRUE 0.794 15.000 0.149 NA   NA
 7300972 7300973 EcSMS35_0757 EcSMS35_0758     TRUE 0.970 0.000 0.310 NA   NA
 7300973 7300974 EcSMS35_0758 EcSMS35_0759   ybgC FALSE 0.157 150.000 0.095 NA   NA
 7300974 7300975 EcSMS35_0759 EcSMS35_0760 ybgC tolQ TRUE 0.990 -3.000 0.593 1.000   NA
 7300975 7300976 EcSMS35_0760 EcSMS35_0761 tolQ tolR TRUE 0.997 4.000 0.556 0.071 Y NA
 7300976 7300977 EcSMS35_0761 EcSMS35_0762 tolR tolA FALSE 0.402 65.000 0.114 NA N NA
 7300977 7300978 EcSMS35_0762 EcSMS35_0763 tolA tolB FALSE 0.156 130.000 0.051 NA N NA
 7300978 7300979 EcSMS35_0763 EcSMS35_0764 tolB pal TRUE 0.914 35.000 0.592 1.000 N NA
 7300979 7300980 EcSMS35_0764 EcSMS35_0765 pal ygbF TRUE 0.832 10.000 0.088 1.000   NA
 7300980 7300981 EcSMS35_0765 EcSMS35_0766 ygbF   FALSE 0.045 164.000 0.000 NA   NA
 7300981 7300982 EcSMS35_0766 EcSMS35_0767     FALSE 0.273 35.000 0.000 NA   NA
 7300982 7300983 EcSMS35_0767 EcSMS35_0768     TRUE 0.697 3.000 0.000 NA   NA
 7300983 7300984 EcSMS35_0768 EcSMS35_0769     FALSE 0.190 52.000 0.000 NA   NA
 7300984 7300985 EcSMS35_0769 EcSMS35_0770     TRUE 0.670 4.000 0.000 NA   NA
 7300985 7300986 EcSMS35_0770 EcSMS35_0771     FALSE 0.210 48.000 0.000 NA   NA
 7300986 7300987 EcSMS35_0771 EcSMS35_0772     FALSE 0.287 33.000 0.000 NA   NA
 7300987 7300988 EcSMS35_0772 EcSMS35_0773   nadA FALSE 0.010 249.000 0.000 NA   NA
 7300988 7300989 EcSMS35_0773 EcSMS35_0775 nadA pnuC TRUE 0.851 38.000 0.023 1.000 Y NA
 7300990 7300991 EcSMS35_0774 EcSMS35_0776 zitB   FALSE 0.107 114.000 0.000 NA   NA
 7300993 7300994 EcSMS35_0778 EcSMS35_0779 gpmA galM FALSE 0.257 203.000 0.009 1.000 Y NA
 7300994 7300995 EcSMS35_0779 EcSMS35_0780 galM galK TRUE 0.993 -6.000 0.083 0.001 Y NA
 7300995 7300996 EcSMS35_0780 EcSMS35_0781 galK galT TRUE 0.986 4.000 0.370 0.001 N NA
 7300996 7300997 EcSMS35_0781 EcSMS35_0782 galT galE TRUE 0.924 10.000 0.053 0.001 N NA
 7300997 7300998 EcSMS35_0782 EcSMS35_0783 galE modF FALSE 0.013 262.000 0.023 1.000   NA
 7300998 7300999 EcSMS35_0783 EcSMS35_0784 modF modE FALSE 0.372 68.000 0.009 0.095   NA
 7301000 7301001 EcSMS35_0785 EcSMS35_0786   modA FALSE 0.092 167.000 0.072 NA   NA
 7301001 7301002 EcSMS35_0786 EcSMS35_0787 modA modB TRUE 0.999 0.000 0.627 0.001 Y NA
 7301002 7301003 EcSMS35_0787 EcSMS35_0788 modB modC TRUE 0.998 3.000 0.537 0.001 Y NA
 7301007 7301008 EcSMS35_0792 EcSMS35_0793     FALSE 0.135 76.000 0.000 NA   NA
 7301008 7301009 EcSMS35_0793 EcSMS35_0794     FALSE 0.284 183.000 0.300 1.000 N NA
 7301010 7301011 EcSMS35_0795 EcSMS35_0796     FALSE 0.056 152.000 0.000 NA   NA
 7301011 7301012 EcSMS35_0796 EcSMS35_0797   bioA FALSE 0.119 59.000 0.003 NA   NA
 7301013 7301014 EcSMS35_0798 EcSMS35_0799 bioB bioF TRUE 0.996 -3.000 0.168 0.002 Y NA
 7301014 7301015 EcSMS35_0799 EcSMS35_0800 bioF bioC TRUE 0.990 -13.000 0.133 0.002 Y NA
 7301015 7301016 EcSMS35_0800 EcSMS35_0801 bioC bioD TRUE 0.990 -7.000 0.054 0.002 Y NA
 7301016 7301017 EcSMS35_0801 EcSMS35_0802 bioD uvrB FALSE 0.006 579.000 0.000 0.095 N NA
 7301019 7301020 EcSMS35_0804 EcSMS35_0805 moaA moaB TRUE 0.971 22.000 0.108 0.003 Y NA
 7301020 7301021 EcSMS35_0805 EcSMS35_0806 moaB moaC TRUE 0.991 3.000 0.109 0.003 Y NA
 7301021 7301022 EcSMS35_0806 EcSMS35_0807 moaC moaD TRUE 0.994 -7.000 0.175 0.003 Y NA
 7301022 7301023 EcSMS35_0807 EcSMS35_0808 moaD moaE TRUE 0.998 2.000 0.501 0.003 Y NA
 7301023 7301024 EcSMS35_0808 EcSMS35_0809 moaE   FALSE 0.079 137.000 0.025 NA   NA
 7301024 7301025 EcSMS35_0809 EcSMS35_0810     FALSE 0.026 207.000 0.037 NA   NA
 7301026 7301027 EcSMS35_0811 EcSMS35_0812     TRUE 0.880 0.000 0.071 NA   NA
 7301027 7301028 EcSMS35_0812 EcSMS35_0813     TRUE 0.975 -3.000 0.333 NA   NA
 7301030 7301031 EcSMS35_0814 EcSMS35_0816     TRUE 0.996 11.000 0.609 0.006 Y NA
 7301031 7301032 EcSMS35_0816 EcSMS35_0817     TRUE 0.989 -7.000 0.547 0.095   NA
 7301032 7301033 EcSMS35_0817 EcSMS35_0818     TRUE 0.983 -7.000 0.545 1.000   NA
 7301033 7301034 EcSMS35_0818 EcSMS35_0819     TRUE 0.957 3.000 0.236 1.000 N NA
 7301035 7301036 EcSMS35_0820 EcSMS35_0821     FALSE 0.050 157.000 0.000 NA   NA
 7301036 7301037 EcSMS35_0821 EcSMS35_0822     TRUE 0.931 0.000 0.143 NA   NA
 7301037 7301038 EcSMS35_0822 EcSMS35_0823   dinG FALSE 0.039 171.000 0.000 NA   NA
 7301038 7301039 EcSMS35_0823 EcSMS35_0824 dinG   TRUE 0.538 28.000 0.041 1.000 N NA
 7301039 7301040 EcSMS35_0824 EcSMS35_0825     FALSE 0.258 141.000 0.000 0.059 N NA
 7301041 7301042 EcSMS35_0826 EcSMS35_0827     FALSE 0.008 265.000 0.027 NA   NA
 7301042 7301043 EcSMS35_0827 EcSMS35_0828     FALSE 0.201 74.000 0.000 1.000   NA
 7301043 7301044 EcSMS35_0828 EcSMS35_0829   fiu TRUE 0.663 42.000 0.171 1.000   NA
 7301044 7301045 EcSMS35_0829 EcSMS35_0830 fiu   FALSE 0.008 265.000 0.000 NA   NA
 7301047 7301048 EcSMS35_0831 EcSMS35_0833   glnQ FALSE 0.129 117.000 0.000 NA N NA
 7301048 7301049 EcSMS35_0833 EcSMS35_0834 glnQ glnP TRUE 0.985 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 7301049 7301050 EcSMS35_0834 EcSMS35_0835 glnP glnH TRUE 0.700 139.000 0.051 0.071 Y NA
 7301050 7301051 EcSMS35_0835 EcSMS35_0836 glnH dps FALSE 0.004 404.000 0.000 1.000 N NA
 7301051 7301052 EcSMS35_0836 EcSMS35_0837 dps rhtA FALSE 0.008 300.000 0.044 NA   NA
 7301054 7301055 EcSMS35_0839 EcSMS35_0840     FALSE 0.007 272.000 0.000 NA   NA
 7301056 7301057 EcSMS35_0841 EcSMS35_0842 mntR   TRUE 0.859 -3.000 0.014 1.000 N NA
 7301059 7301060 EcSMS35_0844 EcSMS35_0845     FALSE 0.139 73.000 0.000 NA   NA
 7301061 7301062 EcSMS35_0846 EcSMS35_0847   supH FALSE 0.056 152.000 0.000 NA   NA
 7301062 7301063 EcSMS35_0847 EcSMS35_0848 supH   FALSE 0.099 146.000 0.000 1.000   NA
 7301063 7301064 EcSMS35_0848 EcSMS35_0849     TRUE 0.978 6.000 0.316 0.003 N NA
 7301066 7301067 EcSMS35_0851 EcSMS35_0852 moeB moeA TRUE 0.997 0.000 0.323 0.003 Y NA
 7301068 7301069 EcSMS35_0853 EcSMS35_0854   gsiA TRUE 0.882 -13.000 0.104 1.000   NA
 7301069 7301070 EcSMS35_0854 EcSMS35_0855 gsiA gsiB TRUE 0.708 20.000 0.083 1.000   NA
 7301070 7301071 EcSMS35_0855 EcSMS35_0856 gsiB gsiC TRUE 0.995 18.000 0.803 0.057 Y NA
 7301071 7301072 EcSMS35_0856 EcSMS35_0857 gsiC gsiD TRUE 0.998 3.000 0.689 0.057 Y NA
 7301072 7301073 EcSMS35_0857 EcSMS35_0858 gsiD   FALSE 0.044 177.000 0.000 NA N NA
 7301073 7301074 EcSMS35_0858 EcSMS35_0859     TRUE 0.637 110.000 0.000 NA Y NA
 7301075 7301076 EcSMS35_0860 EcSMS35_0861     TRUE 0.952 -10.000 0.300 NA   NA
 7301076 7301077 EcSMS35_0861 EcSMS35_0862     FALSE 0.014 226.000 0.000 NA   NA
 7301078 7301079 EcSMS35_0863 EcSMS35_0865 bssR   FALSE 0.162 111.000 0.047 NA   NA
 7301082 7301083 EcSMS35_0867 EcSMS35_0868 deoR   TRUE 0.629 58.000 0.235 1.000   NA
 7301085 7301086 EcSMS35_0870 EcSMS35_0871   ybjI FALSE 0.127 92.000 0.000 NA   NA
 7301086 7301087 EcSMS35_0871 EcSMS35_0872 ybjI   TRUE 0.763 0.000 0.000 NA   NA
 7301092 7301093 EcSMS35_0877 EcSMS35_0878   nfsA TRUE 0.889 -16.000 0.159 NA   NA
 7301093 7301094 EcSMS35_0878 EcSMS35_0879 nfsA rimK FALSE 0.256 61.000 0.000 1.000 N NA
 7301094 7301095 EcSMS35_0879 EcSMS35_0880 rimK   FALSE 0.232 88.000 0.065 NA   NA
 7301095 7301096 EcSMS35_0880 EcSMS35_0881     TRUE 0.542 -43.000 0.000 NA   NA
 7301096 7301097 EcSMS35_0881 EcSMS35_0882   potF FALSE 0.007 272.000 0.000 NA   NA
 7301097 7301098 EcSMS35_0882 EcSMS35_0883 potF potG TRUE 0.951 95.000 0.679 1.000 Y NA
 7301098 7301099 EcSMS35_0883 EcSMS35_0884 potG potH TRUE 0.996 10.000 0.857 1.000 Y NA
 7301099 7301100 EcSMS35_0884 EcSMS35_0885 potH potI TRUE 0.998 -3.000 0.528 0.057 Y NA
 7301100 7301101 EcSMS35_0885 EcSMS35_0886 potI   TRUE 0.606 60.000 0.264 NA   NA
 7301101 7301102 EcSMS35_0886 EcSMS35_0887   rumB TRUE 0.699 41.000 0.226 NA   NA
 7301103 7301104 EcSMS35_0888 EcSMS35_0889 artJ artM FALSE 0.394 226.000 0.143 0.071 Y NA
 7301104 7301105 EcSMS35_0889 EcSMS35_0890 artM artQ TRUE 0.999 0.000 0.714 0.016 Y NA
 7301105 7301106 EcSMS35_0890 EcSMS35_0891 artQ artI TRUE 0.992 7.000 0.260 0.057 Y NA
 7301106 7301107 EcSMS35_0891 EcSMS35_0892 artI artP TRUE 0.978 18.000 0.323 1.000 Y NA
 7301107 7301108 EcSMS35_0892 EcSMS35_0893 artP   FALSE 0.039 218.000 0.081 NA   NA
 7301109 7301110 EcSMS35_0894 EcSMS35_0895     FALSE 0.018 211.000 0.000 NA   NA
 7301110 7301111 EcSMS35_0895 EcSMS35_0897   amiD TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7301112 7301113 EcSMS35_0896 EcSMS35_0898     TRUE 0.845 63.000 0.022 0.008 Y NA
 7301113 7301114 EcSMS35_0898 EcSMS35_0899   ltaE TRUE 0.807 11.000 0.074 1.000 N NA
 7301114 7301115 EcSMS35_0899 EcSMS35_0900 ltaE poxB TRUE 0.866 37.000 0.041 1.000 Y NA
 7301115 7301116 EcSMS35_0900 EcSMS35_0901 poxB hcr FALSE 0.148 133.000 0.025 1.000 N NA
 7301116 7301117 EcSMS35_0901 EcSMS35_0902 hcr hcp TRUE 0.969 12.000 0.000 0.015 Y NA
 7301117 7301118 EcSMS35_0902 EcSMS35_0903 hcp   FALSE 0.068 144.000 0.000 NA   NA
 7301119 7301120 EcSMS35_0904 EcSMS35_0905     FALSE 0.002 809.000 0.000 1.000 N NA
 7301120 7301121 EcSMS35_0905 EcSMS35_0906     FALSE 0.507 53.000 0.105 1.000 N NA
 7301121 7301122 EcSMS35_0906 EcSMS35_0908     TRUE 0.579 10.000 0.000 NA   NA
 7301124 7301125 EcSMS35_0909 EcSMS35_0910   pbpG FALSE 0.165 165.000 0.145 NA   NA
 7301127 7301128 EcSMS35_0912 EcSMS35_0913 bglX   FALSE 0.040 252.000 0.099 1.000 N NA
 7301128 7301129 EcSMS35_0913 EcSMS35_0914     TRUE 0.984 7.000 0.521 0.056 N NA
 7301129 7301130 EcSMS35_0914 EcSMS35_0915     TRUE 0.995 -7.000 0.489 1.000 Y NA
 7301130 7301131 EcSMS35_0915 EcSMS35_0916     TRUE 0.995 5.000 0.542 1.000 Y NA
 7301133 7301134 EcSMS35_0918 EcSMS35_0919     TRUE 0.999 -3.000 0.877 0.016 Y NA
 7301134 7301135 EcSMS35_0919 EcSMS35_0920     FALSE 0.315 47.000 0.051 NA   NA
 7301136 7301137 EcSMS35_0921 EcSMS35_0922     FALSE 0.094 125.000 0.000 NA   NA
 7301137 7301138 EcSMS35_0922 EcSMS35_0923     TRUE 0.944 -3.000 0.160 NA   NA
 7301138 7301139 EcSMS35_0923 EcSMS35_0924     TRUE 0.899 -7.000 0.120 NA   NA
 7301139 7301140 EcSMS35_0924 EcSMS35_0925     TRUE 0.791 11.000 0.100 NA   NA
 7301140 7301141 EcSMS35_0925 EcSMS35_0926     FALSE 0.001 576.000 0.000 NA   NA
 7301141 7301142 EcSMS35_0926 EcSMS35_0927     FALSE 0.155 61.000 0.000 NA   NA
 7301142 7301143 EcSMS35_0927 EcSMS35_0928   molR TRUE 0.579 10.000 0.000 NA   NA
 7301143 7301144 EcSMS35_0928 EcSMS35_0929 molR metG FALSE 0.071 141.000 0.000 NA   NA
 7301145 7301146 EcSMS35_0930 EcSMS35_0931     FALSE 0.008 263.000 0.000 NA   NA
 7301146 7301147 EcSMS35_0931 EcSMS35_0932     FALSE 0.005 296.000 0.000 NA   NA
 7301147 7301148 EcSMS35_0932 EcSMS35_0933     FALSE 0.130 81.000 0.000 NA   NA
 7301148 7301149 EcSMS35_0933 EcSMS35_0934     FALSE 0.452 16.000 0.000 NA   NA
 7301149 7301150 EcSMS35_0934 EcSMS35_0935     TRUE 0.566 16.000 0.000 1.000   NA
 7301151 7301152 EcSMS35_0936 EcSMS35_0937   rcnA FALSE 0.016 219.000 0.000 NA   NA
 7301153 7301154 EcSMS35_0938 EcSMS35_0939 rcnR   FALSE 0.004 330.000 0.000 NA   NA
 7301154 7301155 EcSMS35_0939 EcSMS35_0940     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7301155 7301156 EcSMS35_0940 EcSMS35_0941     FALSE 0.115 104.000 0.000 NA   NA
 7301156 7301157 EcSMS35_0941 EcSMS35_0942     TRUE 0.957 11.000 0.500 NA   NA
 7301157 7301158 EcSMS35_0942 EcSMS35_0943     FALSE 0.417 20.000 0.000 NA   NA
 7301158 7301159 EcSMS35_0943 EcSMS35_0944     TRUE 0.712 -7.000 0.000 NA   NA
 7301159 7301160 EcSMS35_0944 EcSMS35_0945     TRUE 0.620 7.000 0.000 NA   NA
 7301160 7301161 EcSMS35_0945 EcSMS35_0946     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7301161 7301162 EcSMS35_0946 EcSMS35_0947     FALSE 0.006 288.000 0.000 NA   NA
 7301162 7301163 EcSMS35_0947 EcSMS35_0948     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7301163 7301164 EcSMS35_0948 EcSMS35_0949     FALSE 0.387 23.000 0.000 NA   NA
 7301166 7301167 EcSMS35_0951 EcSMS35_0952     FALSE 0.250 55.000 0.048 NA   NA
 7301167 7301168 EcSMS35_0952 EcSMS35_0953     TRUE 0.852 2.000 0.071 NA   NA
 7301168 7301169 EcSMS35_0953 EcSMS35_0954     TRUE 0.712 -7.000 0.000 NA   NA
 7301169 7301170 EcSMS35_0954 EcSMS35_0955     TRUE 0.924 0.000 0.125 NA   NA
 7301170 7301171 EcSMS35_0955 EcSMS35_0956     FALSE 0.010 262.000 0.000 NA N NA
 7301171 7301172 EcSMS35_0956 EcSMS35_0957     TRUE 0.964 -16.000 0.444 NA   NA
 7301172 7301173 EcSMS35_0957 EcSMS35_0958     TRUE 0.631 6.000 0.000 NA   NA
 7301175 7301176 EcSMS35_0960 EcSMS35_0961 thiM thiD TRUE 0.992 -3.000 0.037 0.005 Y NA
 7301176 7301177 EcSMS35_0961 EcSMS35_0962 thiD   FALSE 0.246 65.000 0.000 1.000 N NA
 7301177 7301178 EcSMS35_0962 EcSMS35_0964     FALSE 0.306 52.000 0.000 1.000 N NA
 7301179 7301180 EcSMS35_0963 EcSMS35_0965     TRUE 0.989 -3.000 0.600 NA N NA
 7301180 7301181 EcSMS35_0965 EcSMS35_0966   yegT TRUE 0.978 -3.000 0.364 NA   NA
 7301182 7301183 EcSMS35_0967 EcSMS35_0968 fbaB gatY FALSE 0.312 229.000 0.000 0.002 Y NA
 7301183 7301184 EcSMS35_0968 EcSMS35_0969 gatY   TRUE 0.944 29.000 0.000 0.001 Y NA
 7301184 7301185 EcSMS35_0969 EcSMS35_0970   gatA TRUE 0.957 10.000 0.000 1.000 Y NA
 7301185 7301186 EcSMS35_0970 EcSMS35_0971 gatA gatB TRUE 0.927 31.000 0.000 0.012 Y NA
 7301186 7301187 EcSMS35_0971 EcSMS35_0972 gatB gatC TRUE 0.983 4.000 0.000 0.019 Y NA
 7301187 7301188 EcSMS35_0972 EcSMS35_0973 gatC gatD FALSE 0.334 48.000 0.000 1.000 N NA
 7301188 7301189 EcSMS35_0973 EcSMS35_0974 gatD gatR FALSE 0.201 100.000 0.000 1.000 N NA
 7301192 7301193 EcSMS35_0977 EcSMS35_0978     FALSE 0.115 103.000 0.000 NA   NA
 7301193 7301194 EcSMS35_0978 EcSMS35_0979     TRUE 0.717 2.000 0.000 NA   NA
 7301194 7301195 EcSMS35_0979 EcSMS35_0980     FALSE 0.009 254.000 0.000 NA   NA
 7301195 7301196 EcSMS35_0980 EcSMS35_0981   baeR FALSE 0.066 180.000 0.062 NA   NA
 7301196 7301197 EcSMS35_0981 EcSMS35_0982 baeR baeS TRUE 0.997 -3.000 0.591 1.000 Y NA
 7301197 7301198 EcSMS35_0982 EcSMS35_0983 baeS mdtD TRUE 0.952 -3.000 0.139 1.000 N NA
 7301198 7301199 EcSMS35_0983 EcSMS35_0984 mdtD mdtC TRUE 0.978 1.000 0.438 NA N NA
 7301199 7301200 EcSMS35_0984 EcSMS35_0985 mdtC mdtB TRUE 0.980 1.000 0.062 NA Y NA
 7301200 7301201 EcSMS35_0985 EcSMS35_0986 mdtB mdtA TRUE 0.804 0.000 0.000 NA N NA
 7301202 7301203 EcSMS35_0987 EcSMS35_0988     FALSE 0.133 78.000 0.000 NA   NA
 7301209 7301210 EcSMS35_0994 EcSMS35_0995 udk dcd TRUE 0.786 92.000 0.098 1.000 Y NA
 7301210 7301211 EcSMS35_0995 EcSMS35_0996 dcd asmA TRUE 0.593 22.000 0.057 NA N NA
 7301212 7301213 EcSMS35_0997 EcSMS35_0998     TRUE 0.949 -10.000 0.286 NA   NA
 7301213 7301214 EcSMS35_0998 EcSMS35_0999     FALSE 0.004 338.000 0.000 NA   NA
 7301215 7301216 EcSMS35_1000 EcSMS35_1001   wzb TRUE 0.952 6.000 0.286 1.000 N NA
 7301216 7301217 EcSMS35_1001 EcSMS35_1002 wzb wzc TRUE 0.812 3.000 0.000 1.000 N NA
 7301217 7301218 EcSMS35_1002 EcSMS35_1003 wzc wcaA TRUE 0.673 92.000 0.000 NA Y NA
 7301218 7301219 EcSMS35_1003 EcSMS35_1004 wcaA   TRUE 0.953 3.000 0.259 NA N NA
 7301219 7301220 EcSMS35_1004 EcSMS35_1005   wcaC TRUE 0.973 -3.000 0.259 1.000 N NA
 7301220 7301221 EcSMS35_1005 EcSMS35_1006 wcaC wcaD TRUE 0.952 -25.000 0.400 NA   NA
 7301221 7301222 EcSMS35_1006 EcSMS35_1007 wcaD wcaE TRUE 0.931 11.000 0.333 NA   NA
 7301222 7301223 EcSMS35_1007 EcSMS35_1008 wcaE   TRUE 0.665 16.000 0.077 NA   NA
 7301223 7301224 EcSMS35_1008 EcSMS35_1009   gmd FALSE 0.448 27.000 0.022 1.000   NA
 7301224 7301225 EcSMS35_1009 EcSMS35_1010 gmd fcl TRUE 0.986 3.000 0.000 0.008 Y NA
 7301225 7301226 EcSMS35_1010 EcSMS35_1011 fcl nudD TRUE 0.951 3.000 0.217 1.000 N NA
 7301226 7301227 EcSMS35_1011 EcSMS35_1012 nudD wcaI TRUE 0.943 -3.000 0.108 1.000 N NA
 7301227 7301228 EcSMS35_1012 EcSMS35_1013 wcaI cpsB TRUE 0.985 3.000 0.123 1.000 Y NA
 7301228 7301229 EcSMS35_1013 EcSMS35_1014 cpsB cpsG TRUE 0.874 102.000 1.000 1.000 N NA
 7301229 7301230 EcSMS35_1014 EcSMS35_1015 cpsG   TRUE 0.820 55.000 0.538 NA N NA
 7301230 7301231 EcSMS35_1015 EcSMS35_1016   wzxC TRUE 0.961 2.000 0.304 NA   NA
 7301231 7301232 EcSMS35_1016 EcSMS35_1017 wzxC wcaK FALSE 0.328 72.000 0.095 NA   NA
 7301232 7301233 EcSMS35_1017 EcSMS35_1018 wcaK wcaL TRUE 0.914 -3.000 0.095 NA   NA
 7301233 7301234 EcSMS35_1018 EcSMS35_1019 wcaL wcaM TRUE 0.919 11.000 0.292 NA   NA
 7301234 7301235 EcSMS35_1019 EcSMS35_1020 wcaM gne FALSE 0.119 158.000 0.083 NA   NA
 7301235 7301236 EcSMS35_1020 EcSMS35_1021 gne galF FALSE 0.196 243.000 0.074 1.000 Y NA
 7301236 7301237 EcSMS35_1021 EcSMS35_1022 galF   FALSE 0.005 310.000 0.000 NA   NA
 7301237 7301238 EcSMS35_1022 EcSMS35_1023     TRUE 0.717 2.000 0.000 NA   NA
 7301238 7301239 EcSMS35_1023 EcSMS35_1024     TRUE 0.670 4.000 0.000 NA   NA
 7301239 7301240 EcSMS35_1024 EcSMS35_1025     TRUE 0.763 0.000 0.000 NA   NA
 7301240 7301241 EcSMS35_1025 EcSMS35_1026     TRUE 0.539 -49.000 0.000 NA   NA
 7301241 7301242 EcSMS35_1026 EcSMS35_1027     TRUE 0.715 -19.000 0.000 1.000   NA
 7301242 7301243 EcSMS35_1027 EcSMS35_1028     FALSE 0.387 23.000 0.000 NA   NA
 7301243 7301244 EcSMS35_1028 EcSMS35_1029     FALSE 0.398 22.000 0.000 NA   NA
 7301244 7301245 EcSMS35_1029 EcSMS35_1030     TRUE 0.548 11.000 0.000 NA   NA
 7301245 7301246 EcSMS35_1030 EcSMS35_1031   gnd FALSE 0.005 387.000 0.000 1.000 N NA
 7301246 7301247 EcSMS35_1031 EcSMS35_1032 gnd ugd FALSE 0.019 248.000 0.000 1.000 N NA
 7301247 7301248 EcSMS35_1032 EcSMS35_1033 ugd   TRUE 0.534 146.000 0.000 1.000 Y NA
 7301249 7301250 EcSMS35_1034 EcSMS35_1035 hisIE hisF TRUE 0.998 -6.000 0.430 0.002 Y NA
 7301250 7301251 EcSMS35_1035 EcSMS35_1036 hisF hisA TRUE 0.996 -18.000 0.433 0.002 Y NA
 7301251 7301252 EcSMS35_1036 EcSMS35_1037 hisA hisH TRUE 0.996 0.000 0.210 0.002 Y NA
 7301252 7301253 EcSMS35_1037 EcSMS35_1038 hisH hisB TRUE 0.994 0.000 0.128 0.002 Y NA
 7301253 7301254 EcSMS35_1038 EcSMS35_1039 hisB hisC TRUE 0.997 0.000 0.341 0.002 Y NA
 7301254 7301255 EcSMS35_1039 EcSMS35_1040 hisC hisD TRUE 0.997 -3.000 0.294 0.002 Y NA
 7301255 7301256 EcSMS35_1040 EcSMS35_1041 hisD hisG TRUE 0.991 6.000 0.171 0.002 Y NA
 7301257 7301258 EcSMS35_1042 EcSMS35_1043     FALSE 0.085 130.000 0.000 NA   NA
 7301258 7301259 EcSMS35_1043 EcSMS35_1044     FALSE 0.332 46.000 0.015 1.000 N NA
 7301259 7301260 EcSMS35_1044 EcSMS35_1045   yeeF FALSE 0.014 267.000 0.000 1.000 N NA
 7301260 7301261 EcSMS35_1045 EcSMS35_1046 yeeF   FALSE 0.304 31.000 0.000 NA   NA
 7301261 7301262 EcSMS35_1046 EcSMS35_1047     FALSE 0.273 35.000 0.000 NA   NA
 7301262 7301263 EcSMS35_1047 EcSMS35_1048     TRUE 0.932 14.000 0.419 NA   NA
 7301264 7301265 EcSMS35_1049 EcSMS35_1050 sbcB   FALSE 0.095 124.000 0.000 NA   NA
 7301266 7301267 EcSMS35_1051 EcSMS35_1052 dacD gyrI FALSE 0.298 119.000 0.110 NA N NA
 7301267 7301268 EcSMS35_1052 EcSMS35_1054 gyrI   FALSE 0.068 198.000 0.096 NA   NA
 7301271 7301272 EcSMS35_1056 EcSMS35_1057     FALSE 0.005 315.000 0.000 NA   NA
 7301272 7301273 EcSMS35_1057 EcSMS35_1058     FALSE 0.501 13.000 0.000 NA   NA
 7301273 7301274 EcSMS35_1058 EcSMS35_1059     FALSE 0.110 110.000 0.000 NA   NA
 7301274 7301275 EcSMS35_1059 EcSMS35_1060     FALSE 0.128 89.000 0.000 NA   NA
 7301275 7301276 EcSMS35_1060 EcSMS35_1061     FALSE 0.036 176.000 0.000 NA   NA
 7301276 7301277 EcSMS35_1061 EcSMS35_1062     FALSE 0.152 63.000 0.000 NA   NA
 7301277 7301278 EcSMS35_1062 EcSMS35_1063     FALSE 0.452 16.000 0.000 NA   NA
 7301278 7301279 EcSMS35_1063 EcSMS35_1064     FALSE 0.129 82.000 0.000 NA   NA
 7301281 7301282 EcSMS35_1065 EcSMS35_1067     FALSE 0.452 16.000 0.000 NA   NA
 7301282 7301283 EcSMS35_1067 EcSMS35_1068     FALSE 0.077 136.000 0.000 NA   NA
 7301283 7301284 EcSMS35_1068 EcSMS35_1069     TRUE 0.992 -3.000 0.800 NA   NA
 7301284 7301285 EcSMS35_1069 EcSMS35_1070     TRUE 0.988 -3.000 0.600 NA   NA
 7301285 7301286 EcSMS35_1070 EcSMS35_1071     FALSE 0.078 218.000 0.000 0.009   NA
 7301286 7301287 EcSMS35_1071 EcSMS35_1072     FALSE 0.129 84.000 0.000 NA   NA
 7301288 7301289 EcSMS35_1073 EcSMS35_1074     TRUE 0.997 -3.000 0.571 1.000 Y NA
 7301290 7301291 EcSMS35_1075 EcSMS35_1076     FALSE 0.126 94.000 0.000 NA   NA
 7301292 7301293 EcSMS35_1077 EcSMS35_1078     FALSE 0.001 649.000 0.000 NA   NA
 7301293 7301294 EcSMS35_1078 EcSMS35_1079     FALSE 0.001 680.000 0.000 NA   NA
 7301294 7301295 EcSMS35_1079 EcSMS35_1080     FALSE 0.006 292.000 0.000 NA   NA
 7301296 7301297 EcSMS35_1081 EcSMS35_1082     TRUE 0.829 3.000 0.067 NA   NA
 7301297 7301298 EcSMS35_1082 EcSMS35_1083     FALSE 0.166 57.000 0.000 NA   NA
 7301298 7301299 EcSMS35_1083 EcSMS35_1084     FALSE 0.483 14.000 0.000 NA   NA
 7301299 7301300 EcSMS35_1084 EcSMS35_1085     FALSE 0.002 419.000 0.000 NA   NA
 7301301 7301302 EcSMS35_1086 EcSMS35_1088     TRUE 0.969 -42.000 0.000 0.068 Y NA
 7301303 7301304 EcSMS35_1087 EcSMS35_1089     FALSE 0.023 223.000 0.000 1.000   NA
 7301304 7301305 EcSMS35_1089 EcSMS35_1090     TRUE 0.783 59.000 0.467 1.000   NA
 7301306 7301307 EcSMS35_1091 EcSMS35_1092     FALSE 0.007 270.000 0.000 NA   NA
 7301307 7301308 EcSMS35_1092 EcSMS35_1093     FALSE 0.009 256.000 0.000 NA   NA
 7301309 7301310 EcSMS35_1094 EcSMS35_1095     FALSE 0.457 120.000 0.192 1.000 N NA
 7301310 7301311 EcSMS35_1095 EcSMS35_1096     TRUE 0.989 -3.000 0.385 0.057 N NA
 7301311 7301312 EcSMS35_1096 EcSMS35_1097   dgoK_2 TRUE 0.997 -16.000 0.909 1.000 Y NA
 7301312 7301313 EcSMS35_1097 EcSMS35_1098 dgoK_2 dgoR_2 TRUE 0.993 -3.000 0.733 1.000 N NA
 7301314 7301315 EcSMS35_1099 EcSMS35_1100     FALSE 0.008 263.000 0.000 NA   NA
 7301315 7301316 EcSMS35_1100 EcSMS35_1101     TRUE 0.739 120.000 0.000 0.068 Y NA
 7301316 7301317 EcSMS35_1101 EcSMS35_1102     FALSE 0.024 220.000 0.000 1.000   NA
 7301317 7301318 EcSMS35_1102 EcSMS35_1103     FALSE 0.002 1252.000 0.000 1.000   NA
 7301318 7301319 EcSMS35_1103 EcSMS35_1104     TRUE 0.583 105.000 0.273 1.000 N NA
 7301319 7301320 EcSMS35_1104 EcSMS35_1105     TRUE 0.904 -40.000 0.226 NA N NA
 7301320 7301321 EcSMS35_1105 EcSMS35_1106     FALSE 0.257 64.000 0.061 NA   NA
 7301322 7301323 EcSMS35_1107 EcSMS35_1108     FALSE 0.174 55.000 0.000 NA   NA
 7301323 7301324 EcSMS35_1108 EcSMS35_1109     FALSE 0.015 222.000 0.000 NA   NA
 7301326 7301327 EcSMS35_1111 EcSMS35_1112     FALSE 0.004 327.000 0.000 NA   NA
 7301329 7301330 EcSMS35_1114 EcSMS35_1115     TRUE 0.927 -3.000 0.078 1.000 N NA
 7301331 7301332 EcSMS35_1116 EcSMS35_1117     FALSE 0.277 156.000 0.195 1.000   NA
 7301332 7301333 EcSMS35_1117 EcSMS35_1118   ansB FALSE 0.006 488.000 0.089 1.000   NA
 7301334 7301335 EcSMS35_1119 EcSMS35_1120     FALSE 0.025 979.000 0.000 0.084 Y NA
 7301337 7301338 EcSMS35_1122 EcSMS35_1123     FALSE 0.178 65.000 0.002 1.000   NA
 7301339 7301340 EcSMS35_1124 EcSMS35_1125     FALSE 0.002 386.000 0.000 NA   NA
 7301340 7301341 EcSMS35_1125 EcSMS35_1126     TRUE 0.638 -15.000 0.000 NA   NA
 7301342 7301343 EcSMS35_1127 EcSMS35_1128     TRUE 0.763 0.000 0.000 NA   NA
 7301344 7301345 EcSMS35_1129 EcSMS35_1130     FALSE 0.027 191.000 0.000 NA   NA
 7301345 7301346 EcSMS35_1130 EcSMS35_1131   cobU FALSE 0.056 152.000 0.000 NA   NA
 7301346 7301347 EcSMS35_1131 EcSMS35_1132 cobU cobS TRUE 0.983 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7301347 7301348 EcSMS35_1132 EcSMS35_1133 cobS cobT TRUE 0.976 12.000 0.056 0.004 Y NA
 7301348 7301349 EcSMS35_1133 EcSMS35_1134 cobT   FALSE 0.133 65.000 0.015 NA   NA
 7301351 7301352 EcSMS35_1136 EcSMS35_1137 nac cbl TRUE 0.892 102.000 0.222 0.062 Y NA
 7301354 7301355 EcSMS35_1139 EcSMS35_1140     FALSE 0.118 100.000 0.000 NA   NA
 7301355 7301356 EcSMS35_1140 EcSMS35_1141     FALSE 0.012 238.000 0.000 NA   NA
 7301357 7301358 EcSMS35_1142 EcSMS35_1143   amn FALSE 0.003 343.000 0.000 NA   NA
 7301358 7301359 EcSMS35_1143 EcSMS35_1144 amn shiA FALSE 0.195 102.000 0.021 1.000 N NA
 7301361 7301362 EcSMS35_1146 EcSMS35_1147     FALSE 0.005 313.000 0.000 NA   NA
 7301362 7301363 EcSMS35_1147 EcSMS35_1148     FALSE 0.118 100.000 0.000 NA   NA
 7301365 7301366 EcSMS35_1150 EcSMS35_1151     TRUE 0.763 0.000 0.000 NA   NA
 7301366 7301367 EcSMS35_1151 EcSMS35_1152     FALSE 0.159 59.000 0.000 NA   NA
 7301367 7301368 EcSMS35_1152 EcSMS35_1153     FALSE 0.126 94.000 0.000 NA   NA
 7301368 7301369 EcSMS35_1153 EcSMS35_1154   dicB TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7301371 7301372 EcSMS35_1156 EcSMS35_1157     FALSE 0.313 30.000 0.000 NA   NA
 7301372 7301373 EcSMS35_1157 EcSMS35_1158     TRUE 0.717 2.000 0.000 NA   NA
 7301374 7301375 EcSMS35_1159 EcSMS35_1160     TRUE 0.631 -16.000 0.000 NA   NA
 7301375 7301376 EcSMS35_1160 EcSMS35_1161     TRUE 0.579 -28.000 0.000 NA   NA
 7301376 7301377 EcSMS35_1161 EcSMS35_1162     FALSE 0.295 32.000 0.000 NA   NA
 7301377 7301378 EcSMS35_1162 EcSMS35_1163     FALSE 0.279 34.000 0.000 NA   NA
 7301378 7301379 EcSMS35_1163 EcSMS35_1164     FALSE 0.452 16.000 0.000 NA   NA
 7301379 7301380 EcSMS35_1164 EcSMS35_1165     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7301380 7301381 EcSMS35_1165 EcSMS35_1166     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7301381 7301382 EcSMS35_1166 EcSMS35_1167     TRUE 0.604 -22.000 0.000 NA   NA
 7301382 7301383 EcSMS35_1167 EcSMS35_1168     FALSE 0.126 94.000 0.000 NA   NA
 7301383 7301384 EcSMS35_1168 EcSMS35_1169     TRUE 0.712 -7.000 0.000 NA   NA
 7301384 7301385 EcSMS35_1169 EcSMS35_1170     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7301385 7301386 EcSMS35_1170 EcSMS35_1171     FALSE 0.021 204.000 0.000 NA   NA
 7301386 7301387 EcSMS35_1171 EcSMS35_1172     FALSE 0.001 588.000 0.000 NA   NA
 7301389 7301390 EcSMS35_1174 EcSMS35_1175     TRUE 0.729 1.000 0.000 NA   NA
 7301390 7301391 EcSMS35_1175 EcSMS35_1176     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7301391 7301392 EcSMS35_1176 EcSMS35_1177     FALSE 0.025 195.000 0.000 NA   NA
 7301392 7301393 EcSMS35_1177 EcSMS35_1178     TRUE 0.729 1.000 0.000 NA   NA
 7301393 7301394 EcSMS35_1178 EcSMS35_1179     TRUE 0.729 1.000 0.000 NA   NA
 7301394 7301395 EcSMS35_1179 EcSMS35_1180     TRUE 0.697 3.000 0.000 NA   NA
 7301395 7301396 EcSMS35_1180 EcSMS35_1181     FALSE 0.006 292.000 0.000 NA   NA
 7301396 7301397 EcSMS35_1181 EcSMS35_1182     TRUE 0.647 5.000 0.000 NA   NA
 7301397 7301398 EcSMS35_1182 EcSMS35_1183     FALSE 0.150 64.000 0.000 NA   NA
 7301398 7301399 EcSMS35_1183 EcSMS35_1184     TRUE 0.848 -3.000 0.000 1.000   NA
 7301399 7301400 EcSMS35_1184 EcSMS35_1185     FALSE 0.002 542.000 0.000 NA   NA
 7301400 7301401 EcSMS35_1185 EcSMS35_1186     TRUE 0.905 0.000 0.094 NA   NA
 7301401 7301402 EcSMS35_1186 EcSMS35_1187     TRUE 0.909 12.000 0.286 NA   NA
 7301402 7301403 EcSMS35_1187 EcSMS35_1188     TRUE 0.987 0.000 0.600 NA   NA
 7301403 7301404 EcSMS35_1188 EcSMS35_1189     TRUE 0.912 -22.000 0.222 NA   NA
 7301404 7301405 EcSMS35_1189 EcSMS35_1190     TRUE 0.819 15.000 0.174 NA   NA
 7301405 7301406 EcSMS35_1190 EcSMS35_1191     FALSE 0.390 52.000 0.087 NA   NA
 7301406 7301407 EcSMS35_1191 EcSMS35_1192     FALSE 0.523 12.000 0.000 NA   NA
 7301407 7301408 EcSMS35_1192 EcSMS35_1193     FALSE 0.003 347.000 0.000 NA   NA
 7301408 7301409 EcSMS35_1193 EcSMS35_1194     TRUE 0.989 -3.000 0.635 NA   NA
 7301409 7301410 EcSMS35_1194 EcSMS35_1195     TRUE 0.593 60.000 0.250 NA   NA
 7301410 7301411 EcSMS35_1195 EcSMS35_1196     TRUE 0.958 15.000 0.643 NA   NA
 7301411 7301412 EcSMS35_1196 EcSMS35_1197     TRUE 0.975 12.000 0.818 NA   NA
 7301412 7301413 EcSMS35_1197 EcSMS35_1198     FALSE 0.222 46.000 0.000 NA   NA
 7301413 7301414 EcSMS35_1198 EcSMS35_1199     TRUE 0.712 -7.000 0.000 NA   NA
 7301414 7301415 EcSMS35_1199 EcSMS35_1200     TRUE 0.763 0.000 0.000 NA   NA
 7301415 7301416 EcSMS35_1200 EcSMS35_1201     TRUE 0.647 5.000 0.000 NA   NA
 7301416 7301417 EcSMS35_1201 EcSMS35_1202     TRUE 0.530 -102.000 0.000 NA   NA
 7301417 7301418 EcSMS35_1202 EcSMS35_1203     TRUE 0.769 61.000 0.500 NA   NA
 7301418 7301419 EcSMS35_1203 EcSMS35_1204     FALSE 0.145 68.000 0.000 NA   NA
 7301419 7301420 EcSMS35_1204 EcSMS35_1206     TRUE 0.740 65.000 0.000 1.000 Y NA
 7301421 7301422 EcSMS35_1205 EcSMS35_1207     TRUE 0.969 -42.000 0.000 0.067 Y NA
 7301423 7301424 EcSMS35_1208 EcSMS35_1209     TRUE 0.579 10.000 0.000 NA   NA
 7301424 7301425 EcSMS35_1209 EcSMS35_1210     FALSE 0.263 37.000 0.000 NA   NA
 7301426 7301427 EcSMS35_1211 EcSMS35_1212     FALSE 0.005 343.000 0.000 1.000   NA
 7301427 7301428 EcSMS35_1212 EcSMS35_1213     FALSE 0.014 257.000 0.000 1.000   NA
 7301428 7301429 EcSMS35_1213 EcSMS35_1214     TRUE 0.994 1.000 0.790 0.049   NA
 7301429 7301430 EcSMS35_1214 EcSMS35_1215     FALSE 0.164 109.000 0.000 1.000   NA
 7301431 7301432 EcSMS35_1216 EcSMS35_1217     TRUE 0.999 0.000 0.857 0.001 Y NA
 7301433 7301434 EcSMS35_1218 EcSMS35_1219 hchA   FALSE 0.408 21.000 0.000 NA   NA
 7301437 7301438 EcSMS35_1222 EcSMS35_1223     FALSE 0.401 40.000 0.062 NA   NA
 7301438 7301439 EcSMS35_1223 EcSMS35_1224   dcm FALSE 0.212 67.000 0.000 1.000   NA
 7301439 7301440 EcSMS35_1224 EcSMS35_1226 dcm vsr TRUE 0.976 -19.000 0.000 0.067 Y NA
 7301442 7301443 EcSMS35_1227 EcSMS35_1228     FALSE 0.138 79.000 0.025 NA   NA
 7301443 7301444 EcSMS35_1228 EcSMS35_1230     FALSE 0.153 189.000 0.208 NA   NA
 7301445 7301446 EcSMS35_1229 EcSMS35_1231     FALSE 0.005 297.000 0.000 NA   NA
 7301448 7301449 EcSMS35_1233 EcSMS35_1234 rcsA fliR FALSE 0.011 290.000 0.000 1.000 N NA
 7301449 7301450 EcSMS35_1234 EcSMS35_1235 fliR fliQ TRUE 0.980 9.000 0.000 0.003 Y NA
 7301450 7301451 EcSMS35_1235 EcSMS35_1236 fliQ fliP TRUE 0.997 10.000 0.827 0.008 Y NA
 7301451 7301452 EcSMS35_1236 EcSMS35_1237 fliP fliO TRUE 0.992 0.000 0.203 1.000 Y NA
 7301452 7301453 EcSMS35_1237 EcSMS35_1238 fliO fliN TRUE 0.995 3.000 0.443 1.000 Y NA
 7301453 7301454 EcSMS35_1238 EcSMS35_1239 fliN fliM TRUE 0.995 -3.000 0.137 0.001 Y NA
 7301454 7301455 EcSMS35_1239 EcSMS35_1240 fliM fliL TRUE 0.999 5.000 0.957 0.001 Y NA
 7301455 7301456 EcSMS35_1240 EcSMS35_1241 fliL fliK TRUE 0.779 105.000 0.119 1.000 Y NA
 7301456 7301457 EcSMS35_1241 EcSMS35_1242 fliK fliJ TRUE 0.997 -3.000 0.317 0.008 Y NA
 7301457 7301458 EcSMS35_1242 EcSMS35_1243 fliJ fliI TRUE 0.919 19.000 0.006 1.000 Y NA
 7301458 7301459 EcSMS35_1243 EcSMS35_1244 fliI fliH TRUE 0.981 0.000 0.000 1.000 Y NA
 7301459 7301460 EcSMS35_1244 EcSMS35_1245 fliH fliG TRUE 0.987 -7.000 0.000 0.005 Y NA
 7301460 7301461 EcSMS35_1245 EcSMS35_1246 fliG fliF TRUE 0.994 -7.000 0.220 0.008 Y NA
 7301462 7301463 EcSMS35_1247 EcSMS35_1248 fliE   FALSE 0.003 351.000 0.000 NA   NA
 7301464 7301465 EcSMS35_1249 EcSMS35_1250     FALSE 0.109 111.000 0.000 NA   NA
 7301465 7301466 EcSMS35_1250 EcSMS35_1251     FALSE 0.111 109.000 0.000 NA   NA
 7301466 7301467 EcSMS35_1251 EcSMS35_1252     TRUE 0.992 -3.000 0.844 NA   NA
 7301469 7301470 EcSMS35_1254 EcSMS35_1255 amyA fliT FALSE 0.400 78.000 0.115 1.000   NA
 7301470 7301471 EcSMS35_1255 EcSMS35_1256 fliT fliS TRUE 0.975 0.000 0.324 1.000   NA
 7301471 7301472 EcSMS35_1256 EcSMS35_1257 fliS fliD TRUE 0.982 25.000 0.284 0.003 Y NA
 7301475 7301476 EcSMS35_1260 EcSMS35_1261 fliA   TRUE 0.546 46.000 0.108 1.000   NA
 7301476 7301477 EcSMS35_1261 EcSMS35_1262   fliY TRUE 0.603 88.000 0.280 1.000   NA
 7301477 7301478 EcSMS35_1262 EcSMS35_1263 fliY dcyD TRUE 0.915 105.000 0.469 1.000 Y NA
 7301478 7301479 EcSMS35_1263 EcSMS35_1264 dcyD   TRUE 0.944 15.000 0.050 1.000 Y NA
 7301479 7301480 EcSMS35_1264 EcSMS35_1265   yecC TRUE 0.991 -3.000 0.150 1.000 Y NA
 7301480 7301481 EcSMS35_1265 EcSMS35_1266 yecC sdiA FALSE 0.043 230.000 0.071 1.000 N NA
 7301483 7301484 EcSMS35_1268 EcSMS35_1269   uvrY FALSE 0.012 239.000 0.000 NA   NA
 7301484 7301485 EcSMS35_1269 EcSMS35_1270 uvrY uvrC TRUE 0.967 -3.000 0.086 0.021 N NA
 7301485 7301486 EcSMS35_1270 EcSMS35_1271 uvrC pgsA TRUE 0.644 57.000 0.227 1.000 N NA
 7301486 7301487 EcSMS35_1271 EcSMS35_1272 pgsA   FALSE 0.056 152.000 0.000 NA   NA
 7301487 7301488 EcSMS35_1272 EcSMS35_1273     FALSE 0.174 55.000 0.000 NA   NA
 7301488 7301489 EcSMS35_1273 EcSMS35_1274     FALSE 0.501 13.000 0.000 NA   NA
 7301489 7301490 EcSMS35_1274 EcSMS35_1275     FALSE 0.024 196.000 0.000 NA   NA
 7301495 7301496 EcSMS35_1280 EcSMS35_1281     FALSE 0.007 275.000 0.000 NA   NA
 7301499 7301500 EcSMS35_1284 EcSMS35_1285   araF FALSE 0.002 498.000 0.000 NA   NA
 7301500 7301501 EcSMS35_1285 EcSMS35_1286 araF araG TRUE 0.983 70.000 0.917 0.002 Y NA
 7301501 7301502 EcSMS35_1286 EcSMS35_1287 araG araH TRUE 0.993 15.000 0.451 0.002 Y NA
 7301502 7301503 EcSMS35_1287 EcSMS35_1288 araH otsB FALSE 0.440 167.000 0.037 1.000 Y NA
 7301503 7301504 EcSMS35_1288 EcSMS35_1289 otsB otsA TRUE 0.985 -25.000 0.068 0.001 Y NA
 7301506 7301507 EcSMS35_1291 EcSMS35_1292   flhD TRUE 0.763 0.000 0.000 NA   NA
 7301507 7301508 EcSMS35_1292 EcSMS35_1293 flhD flhC TRUE 0.938 3.000 0.000 0.001   NA
 7301508 7301509 EcSMS35_1293 EcSMS35_1294 flhC motA TRUE 0.623 127.000 0.408 1.000   NA
 7301509 7301510 EcSMS35_1294 EcSMS35_1295 motA motB TRUE 0.996 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 7301510 7301511 EcSMS35_1295 EcSMS35_1296 motB cheA TRUE 0.996 11.000 0.913 1.000 Y NA
 7301511 7301512 EcSMS35_1296 EcSMS35_1297 cheA cheW TRUE 0.990 21.000 0.447 0.004 Y NA
 7301512 7301513 EcSMS35_1297 EcSMS35_1298 cheW tar TRUE 0.714 145.000 0.043 0.005 Y NA
 7301513 7301514 EcSMS35_1298 EcSMS35_1299 tar tap TRUE 0.962 46.000 0.235 0.001 Y NA
 7301514 7301515 EcSMS35_1299 EcSMS35_1300 tap cheR TRUE 0.964 19.000 0.188 1.000 Y NA
 7301515 7301516 EcSMS35_1300 EcSMS35_1301 cheR cheB TRUE 0.974 3.000 0.000 1.000 Y NA
 7301516 7301517 EcSMS35_1301 EcSMS35_1302 cheB cheY TRUE 0.962 15.000 0.000 0.012 Y NA
 7301517 7301518 EcSMS35_1302 EcSMS35_1303 cheY cheZ TRUE 0.952 11.000 0.000 1.000 Y NA
 7301519 7301520 EcSMS35_1304 EcSMS35_1305     TRUE 0.853 -31.000 0.146 NA   NA
 7301520 7301521 EcSMS35_1305 EcSMS35_1306     FALSE 0.129 82.000 0.000 NA   NA
 7301522 7301523 EcSMS35_1307 EcSMS35_1308 flhB flhA TRUE 0.996 -7.000 0.287 0.008 Y NA
 7301523 7301524 EcSMS35_1308 EcSMS35_1309 flhA flhE TRUE 0.977 0.000 0.158 0.003   NA
 7301526 7301527 EcSMS35_1311 EcSMS35_1312   cutC TRUE 0.633 14.000 0.057 NA   NA
 7301527 7301528 EcSMS35_1312 EcSMS35_1313 cutC torY FALSE 0.004 388.000 0.000 1.000 N NA
 7301528 7301529 EcSMS35_1313 EcSMS35_1314 torY torZ TRUE 0.990 25.000 0.481 0.001 Y NA
 7301530 7301531 EcSMS35_1315 EcSMS35_1316     TRUE 0.973 -3.000 0.315 NA   NA
 7301531 7301532 EcSMS35_1316 EcSMS35_1317     FALSE 0.480 41.000 0.089 NA   NA
 7301532 7301533 EcSMS35_1317 EcSMS35_1318     FALSE 0.460 53.000 0.126 NA   NA
 7301533 7301534 EcSMS35_1318 EcSMS35_1319     TRUE 0.909 -3.000 0.089 NA   NA
 7301535 7301536 EcSMS35_1320 EcSMS35_1321 aspS ntpA TRUE 0.871 2.000 0.050 1.000 N NA
 7301536 7301537 EcSMS35_1321 EcSMS35_1322 ntpA   FALSE 0.374 29.000 0.035 NA   NA
 7301537 7301538 EcSMS35_1322 EcSMS35_1323   ruvC TRUE 0.766 35.000 0.277 NA   NA
 7301540 7301541 EcSMS35_1325 EcSMS35_1326 ruvA ruvB TRUE 0.997 9.000 0.549 0.001 Y NA
 7301542 7301543 EcSMS35_1327 EcSMS35_1328 znuB znuC TRUE 0.999 -3.000 0.755 0.089 Y NA
 7301544 7301545 EcSMS35_1329 EcSMS35_1330 znuA   TRUE 0.815 16.000 0.131 1.000 N NA
 7301545 7301546 EcSMS35_1330 EcSMS35_1331   msbB TRUE 0.857 119.000 0.299 1.000 Y NA
 7301547 7301548 EcSMS35_1332 EcSMS35_1333 pykA   FALSE 0.248 128.000 0.071 1.000 N NA
 7301549 7301550 EcSMS35_1334 EcSMS35_1335   zwf FALSE 0.043 166.000 0.000 NA   NA
 7301550 7301551 EcSMS35_1335 EcSMS35_1336 zwf edd FALSE 0.185 235.000 0.041 1.000 Y NA
 7301551 7301552 EcSMS35_1336 EcSMS35_1337 edd eda TRUE 0.971 37.000 0.523 1.000 Y NA
 7301554 7301555 EcSMS35_1339 EcSMS35_1340     FALSE 0.186 55.000 0.027 NA   NA
 7301555 7301556 EcSMS35_1340 EcSMS35_1341     FALSE 0.005 317.000 0.028 NA   NA
 7301556 7301557 EcSMS35_1341 EcSMS35_1343   prtB FALSE 0.056 207.000 0.092 NA   NA
 7301558 7301559 EcSMS35_1342 EcSMS35_1344 exoX   TRUE 0.927 24.000 0.500 1.000   NA
 7301559 7301560 EcSMS35_1344 EcSMS35_1345   holE FALSE 0.516 102.000 0.222 1.000   NA
 7301561 7301562 EcSMS35_1346 EcSMS35_1347     TRUE 0.983 4.000 0.613 1.000   NA
 7301562 7301563 EcSMS35_1347 EcSMS35_1348     TRUE 0.968 13.000 0.704 NA   NA
 7301563 7301564 EcSMS35_1348 EcSMS35_1349   pphA FALSE 0.002 396.000 0.000 NA   NA
 7301565 7301566 EcSMS35_1350 EcSMS35_1351     TRUE 0.609 105.000 0.353 NA   NA
 7301566 7301567 EcSMS35_1351 EcSMS35_1352   yebU FALSE 0.295 118.000 0.121 NA   NA
 7301567 7301568 EcSMS35_1352 EcSMS35_1353 yebU   TRUE 0.702 74.000 0.420 NA   NA
 7301568 7301569 EcSMS35_1353 EcSMS35_1354     TRUE 0.979 -37.000 0.840 NA   NA
 7301570 7301571 EcSMS35_1355 EcSMS35_1356   proQ TRUE 0.734 97.000 0.081 NA Y NA
 7301571 7301572 EcSMS35_1356 EcSMS35_1357 proQ prc TRUE 0.851 26.000 0.304 NA N NA
 7301572 7301573 EcSMS35_1357 EcSMS35_1358 prc   FALSE 0.139 192.000 0.042 0.019 N NA
 7301577 7301578 EcSMS35_1362 EcSMS35_1363     TRUE 0.742 75.000 0.500 NA   NA
 7301578 7301579 EcSMS35_1363 EcSMS35_1364     FALSE 0.001 670.000 0.000 NA   NA
 7301579 7301580 EcSMS35_1364 EcSMS35_1365   cspC TRUE 0.868 13.000 0.214 NA   NA
 7301580 7301581 EcSMS35_1365 EcSMS35_1367 cspC rrmA FALSE 0.082 166.000 0.038 1.000   NA
 7301582 7301583 EcSMS35_1366 EcSMS35_1368     FALSE 0.002 429.000 0.000 NA   NA
 7301583 7301584 EcSMS35_1368 EcSMS35_1369   manZ TRUE 0.869 55.000 0.755 NA   NA
 7301584 7301585 EcSMS35_1369 EcSMS35_1370 manZ manY TRUE 0.997 13.000 0.939 0.018 Y NA
 7301585 7301586 EcSMS35_1370 EcSMS35_1371 manY manX TRUE 0.833 63.000 0.000 0.018 Y NA
 7301588 7301589 EcSMS35_1373 EcSMS35_1374   sdaA TRUE 0.571 131.000 0.389 NA N NA
 7301589 7301590 EcSMS35_1374 EcSMS35_1375 sdaA   FALSE 0.343 184.000 0.409 1.000   NA
 7301590 7301591 EcSMS35_1375 EcSMS35_1376   pabB TRUE 0.899 4.000 0.116 1.000   NA
 7301593 7301594 EcSMS35_1378 EcSMS35_1379     FALSE 0.002 422.000 0.000 NA   NA
 7301595 7301596 EcSMS35_1380 EcSMS35_1381     FALSE 0.420 58.000 0.082 1.000 N NA
 7301596 7301597 EcSMS35_1381 EcSMS35_1382   slp FALSE 0.396 39.000 0.024 1.000 N NA
 7301597 7301598 EcSMS35_1382 EcSMS35_1383 slp fadD FALSE 0.125 205.000 0.169 1.000 N NA
 7301598 7301599 EcSMS35_1383 EcSMS35_1384 fadD rnd FALSE 0.445 70.000 0.115 1.000 N NA
 7301600 7301601 EcSMS35_1385 EcSMS35_1386     TRUE 0.537 56.000 0.043 0.048 N NA
 7301601 7301602 EcSMS35_1386 EcSMS35_1387     FALSE 0.440 32.000 0.000 1.000 N NA
 7301602 7301603 EcSMS35_1387 EcSMS35_1388   ttuC FALSE 0.118 251.000 0.333 1.000 N NA
 7301604 7301605 EcSMS35_1389 EcSMS35_1390     FALSE 0.159 127.000 0.000 1.000 N NA
 7301607 7301608 EcSMS35_1392 EcSMS35_1393     TRUE 0.670 4.000 0.000 NA   NA
 7301608 7301609 EcSMS35_1393 EcSMS35_1394     FALSE 0.442 17.000 0.000 NA   NA
 7301609 7301610 EcSMS35_1394 EcSMS35_1395     FALSE 0.523 12.000 0.000 NA   NA
 7301611 7301612 EcSMS35_1396 EcSMS35_1397     TRUE 0.839 18.000 0.222 NA   NA
 7301614 7301615 EcSMS35_1399 EcSMS35_1400   yeaN FALSE 0.138 55.000 0.007 NA   NA
 7301619 7301620 EcSMS35_1404 EcSMS35_1405     FALSE 0.448 43.000 0.083 NA   NA
 7301620 7301621 EcSMS35_1405 EcSMS35_1406     FALSE 0.518 181.000 0.000 0.005 Y NA
 7301621 7301622 EcSMS35_1406 EcSMS35_1407     FALSE 0.006 288.000 0.000 NA   NA
 7301622 7301623 EcSMS35_1407 EcSMS35_1408     TRUE 0.777 113.000 0.683 NA   NA
 7301624 7301625 EcSMS35_1409 EcSMS35_1410 mipA   FALSE 0.239 90.000 0.067 NA   NA
 7301626 7301627 EcSMS35_1411 EcSMS35_1412   gapA TRUE 0.824 84.000 0.154 1.000 Y NA
 7301628 7301629 EcSMS35_1413 EcSMS35_1414 msrB   TRUE 0.677 42.000 0.216 NA   NA
 7301629 7301630 EcSMS35_1414 EcSMS35_1415     FALSE 0.003 370.000 0.000 NA   NA
 7301630 7301631 EcSMS35_1415 EcSMS35_1416   ydjK TRUE 0.837 27.000 0.250 1.000 N NA
 7301631 7301632 EcSMS35_1416 EcSMS35_1417 ydjK gutB TRUE 0.838 17.000 0.167 1.000 N NA
 7301632 7301633 EcSMS35_1417 EcSMS35_1418 gutB   TRUE 0.907 21.000 0.194 0.017 N NA
 7301633 7301634 EcSMS35_1418 EcSMS35_1419     TRUE 0.992 5.000 0.368 1.000 Y NA
 7301634 7301635 EcSMS35_1419 EcSMS35_1420     TRUE 0.937 10.000 0.269 1.000 N NA
 7301635 7301636 EcSMS35_1420 EcSMS35_1421     FALSE 0.467 137.000 0.269 1.000 N NA
 7301636 7301637 EcSMS35_1421 EcSMS35_1422   ydjE TRUE 0.767 117.000 0.125 1.000 Y NA
 7301638 7301639 EcSMS35_1423 EcSMS35_1424 pncA ansA TRUE 0.739 11.000 0.040 1.000 N NA
 7301639 7301640 EcSMS35_1424 EcSMS35_1425 ansA sppA FALSE 0.174 167.000 0.113 1.000 N NA
 7301641 7301642 EcSMS35_1426 EcSMS35_1427   selD FALSE 0.201 117.000 0.033 1.000 N NA
 7301642 7301643 EcSMS35_1427 EcSMS35_1428 selD topB TRUE 0.814 5.000 0.041 1.000 N NA
 7301648 7301649 EcSMS35_1433 EcSMS35_1434     FALSE 0.422 67.000 0.111 1.000   NA
 7301649 7301650 EcSMS35_1434 EcSMS35_1435   ynjC TRUE 0.989 0.000 0.602 1.000   NA
 7301650 7301651 EcSMS35_1435 EcSMS35_1436 ynjC   TRUE 0.973 -27.000 0.627 NA   NA
 7301651 7301652 EcSMS35_1436 EcSMS35_1437     TRUE 0.623 10.000 0.032 NA   NA
 7301652 7301653 EcSMS35_1437 EcSMS35_1438     TRUE 0.898 0.000 0.087 NA   NA
 7301653 7301654 EcSMS35_1438 EcSMS35_1439     TRUE 0.819 15.000 0.174 NA   NA
 7301654 7301655 EcSMS35_1439 EcSMS35_1440     TRUE 0.827 5.000 0.083 NA   NA
 7301655 7301656 EcSMS35_1440 EcSMS35_1441   xth FALSE 0.038 167.000 0.016 NA   NA
 7301656 7301657 EcSMS35_1441 EcSMS35_1442 xth   FALSE 0.501 13.000 0.000 NA   NA
 7301658 7301659 EcSMS35_1443 EcSMS35_1444 astC astA TRUE 0.998 -3.000 0.625 1.000 Y NA
 7301659 7301660 EcSMS35_1444 EcSMS35_1445 astA astD TRUE 0.962 -3.000 0.179 1.000 N NA
 7301660 7301661 EcSMS35_1445 EcSMS35_1446 astD astB TRUE 0.978 -3.000 0.306 1.000 N NA
 7301661 7301662 EcSMS35_1446 EcSMS35_1447 astB astE TRUE 0.986 -7.000 0.126 1.000 Y NA
 7301662 7301663 EcSMS35_1447 EcSMS35_1448 astE spy FALSE 0.005 330.000 0.000 NA N NA
 7301663 7301664 EcSMS35_1448 EcSMS35_1450 spy   FALSE 0.025 203.000 0.028 NA   NA
 7301665 7301666 EcSMS35_1449 EcSMS35_1451 cho nadE FALSE 0.022 230.000 0.010 1.000 N NA
 7301667 7301668 EcSMS35_1452 EcSMS35_1453 osmE chbB FALSE 0.013 260.000 0.000 1.000   NA
 7301668 7301669 EcSMS35_1453 EcSMS35_1454 chbB chbC TRUE 0.957 85.000 0.500 0.012 Y NA
 7301669 7301670 EcSMS35_1454 EcSMS35_1455 chbC chbA TRUE 0.985 51.000 0.833 0.012 Y NA
 7301670 7301671 EcSMS35_1455 EcSMS35_1456 chbA chbR TRUE 0.978 11.000 0.727 1.000 N NA
 7301671 7301672 EcSMS35_1456 EcSMS35_1457 chbR chbF TRUE 0.798 104.000 0.625 1.000 N NA
 7301672 7301673 EcSMS35_1457 EcSMS35_1458 chbF   TRUE 0.968 13.000 0.429 0.020   NA
 7301675 7301676 EcSMS35_1460 EcSMS35_1461 cedA   FALSE 0.006 289.000 0.000 NA   NA
 7301677 7301678 EcSMS35_1462 EcSMS35_1463     FALSE 0.220 133.000 0.102 NA   NA
 7301678 7301679 EcSMS35_1463 EcSMS35_1464     FALSE 0.095 163.000 0.068 NA   NA
 7301681 7301682 EcSMS35_1466 EcSMS35_1467     FALSE 0.113 106.000 0.000 NA   NA
 7301682 7301683 EcSMS35_1467 EcSMS35_1468   pfkB FALSE 0.117 101.000 0.000 NA   NA
 7301685 7301686 EcSMS35_1470 EcSMS35_1471     FALSE 0.150 64.000 0.000 NA   NA
 7301687 7301688 EcSMS35_1472 EcSMS35_1473 thrS infC TRUE 0.814 112.000 0.186 1.000 Y NA
 7301688 7301689 EcSMS35_1473 EcSMS35_1474 infC rpmI TRUE 0.946 97.000 0.652 1.000 Y NA
 7301689 7301690 EcSMS35_1474 EcSMS35_1475 rpmI rplT TRUE 0.986 54.000 0.928 0.011 Y NA
 7301690 7301691 EcSMS35_1475 EcSMS35_1476 rplT pheS FALSE 0.160 306.000 0.202 1.000 Y NA
 7301691 7301692 EcSMS35_1476 EcSMS35_1477 pheS pheT TRUE 0.995 15.000 0.574 0.001 Y NA
 7301692 7301693 EcSMS35_1477 EcSMS35_1478 pheT ihfA TRUE 0.937 5.000 0.208 1.000 N NA
 7301693 7301694 EcSMS35_1478 EcSMS35_1479 ihfA btuC FALSE 0.202 101.000 0.023 1.000 N NA
 7301694 7301695 EcSMS35_1479 EcSMS35_1480 btuC btuE FALSE 0.408 63.000 0.084 1.000 N NA
 7301695 7301696 EcSMS35_1480 EcSMS35_1481 btuE btuD TRUE 0.858 0.000 0.000 1.000 N NA
 7301696 7301697 EcSMS35_1481 EcSMS35_1482 btuD   FALSE 0.163 78.000 0.000 NA N NA
 7301697 7301698 EcSMS35_1482 EcSMS35_1483     FALSE 0.013 247.000 0.000 NA N NA
 7301698 7301699 EcSMS35_1483 EcSMS35_1484     FALSE 0.174 63.000 0.031 NA   NA
 7301700 7301701 EcSMS35_1485 EcSMS35_1486   aroH FALSE 0.209 105.000 0.054 NA N NA
 7301701 7301702 EcSMS35_1486 EcSMS35_1487 aroH   FALSE 0.236 157.000 0.165 1.000   NA
 7301703 7301704 EcSMS35_1488 EcSMS35_1489   ppsA FALSE 0.179 54.000 0.000 NA   NA
 7301704 7301705 EcSMS35_1489 EcSMS35_1490 ppsA   FALSE 0.003 489.000 0.000 1.000 N NA
 7301705 7301706 EcSMS35_1490 EcSMS35_1491     FALSE 0.408 36.000 0.000 1.000 N NA
 7301706 7301707 EcSMS35_1491 EcSMS35_1492     TRUE 0.606 11.000 0.000 NA N NA
 7301707 7301708 EcSMS35_1492 EcSMS35_1493     FALSE 0.501 13.000 0.000 NA   NA
 7301709 7301710 EcSMS35_1494 EcSMS35_1495 fadK   FALSE 0.420 57.000 0.080 1.000 N NA
 7301710 7301711 EcSMS35_1495 EcSMS35_1496     TRUE 0.997 -3.000 0.400 0.048 Y NA
 7301711 7301712 EcSMS35_1496 EcSMS35_1497     TRUE 0.985 55.000 1.000 0.048 Y NA
 7301712 7301713 EcSMS35_1497 EcSMS35_1498     TRUE 0.996 20.000 1.000 0.012 Y NA
 7301714 7301715 EcSMS35_1499 EcSMS35_1500     FALSE 0.115 103.000 0.000 NA   NA
 7301716 7301717 EcSMS35_1501 EcSMS35_1502   pct TRUE 0.991 11.000 0.500 1.000 Y NA
 7301717 7301718 EcSMS35_1502 EcSMS35_1503 pct aroD FALSE 0.112 146.000 0.019 1.000 N NA
 7301718 7301719 EcSMS35_1503 EcSMS35_1504 aroD   TRUE 0.921 31.000 0.113 1.000 Y NA
 7301719 7301720 EcSMS35_1504 EcSMS35_1505     TRUE 0.762 12.000 0.082 NA N NA
 7301720 7301721 EcSMS35_1505 EcSMS35_1506   ydiM FALSE 0.014 227.000 0.000 NA   NA
 7301721 7301722 EcSMS35_1506 EcSMS35_1507 ydiM   FALSE 0.338 100.000 0.095 1.000   NA
 7301722 7301723 EcSMS35_1507 EcSMS35_1508   ydiK FALSE 0.002 429.000 0.000 NA   NA
 7301724 7301725 EcSMS35_1509 EcSMS35_1510   ydiL TRUE 0.938 -3.000 0.129 NA N NA
 7301725 7301726 EcSMS35_1510 EcSMS35_1511 ydiL   FALSE 0.139 100.000 0.032 NA   NA
 7301726 7301727 EcSMS35_1511 EcSMS35_1512   sufA FALSE 0.002 549.000 0.000 NA   NA
 7301727 7301728 EcSMS35_1512 EcSMS35_1513 sufA sufB TRUE 0.683 9.000 0.041 NA   NA
 7301728 7301729 EcSMS35_1513 EcSMS35_1514 sufB sufC TRUE 0.991 10.000 0.466 1.000 Y NA
 7301729 7301730 EcSMS35_1514 EcSMS35_1515 sufC sufD TRUE 0.992 -25.000 0.482 1.000 Y NA
 7301730 7301731 EcSMS35_1515 EcSMS35_1516 sufD sufS TRUE 0.964 -3.000 0.193 1.000 N NA
 7301731 7301732 EcSMS35_1516 EcSMS35_1517 sufS sufE TRUE 0.848 13.000 0.183 NA   NA
 7301732 7301733 EcSMS35_1517 EcSMS35_1518 sufE   FALSE 0.125 149.000 0.069 NA   NA
 7301734 7301735 EcSMS35_1519 EcSMS35_1520 lpp pykF FALSE 0.009 311.000 0.000 1.000 N NA
 7301738 7301739 EcSMS35_1523 EcSMS35_1524     TRUE 0.992 21.000 0.600 0.014 Y NA
 7301739 7301740 EcSMS35_1524 EcSMS35_1525     TRUE 0.943 13.000 0.458 NA   NA
 7301740 7301741 EcSMS35_1525 EcSMS35_1526     TRUE 0.882 13.000 0.235 NA   NA
 7301741 7301742 EcSMS35_1526 EcSMS35_1527     TRUE 0.996 -3.000 0.444 NA Y NA
 7301742 7301743 EcSMS35_1527 EcSMS35_1528     TRUE 0.933 4.000 0.222 NA   NA
 7301744 7301745 EcSMS35_1529 EcSMS35_1530   ydhR FALSE 0.093 126.000 0.000 NA   NA
 7301745 7301746 EcSMS35_1530 EcSMS35_1531 ydhR   FALSE 0.112 108.000 0.000 NA   NA
 7301746 7301747 EcSMS35_1531 EcSMS35_1532     TRUE 0.697 3.000 0.000 NA   NA
 7301751 7301752 EcSMS35_1536 EcSMS35_1537 cfa   FALSE 0.011 291.000 0.000 1.000 N NA
 7301755 7301756 EcSMS35_1540 EcSMS35_1541     FALSE 0.043 166.000 0.000 NA   NA
 7301757 7301758 EcSMS35_1542 EcSMS35_1543 sodB   FALSE 0.146 128.000 0.015 1.000 N NA
 7301760 7301761 EcSMS35_1545 EcSMS35_1546 lhr rnt FALSE 0.413 93.000 0.000 0.012   NA
 7301761 7301762 EcSMS35_1546 EcSMS35_1547 rnt gloA FALSE 0.415 103.000 0.136 1.000 N NA
 7301762 7301763 EcSMS35_1547 EcSMS35_1548 gloA nemA FALSE 0.301 81.000 0.057 1.000 N NA
 7301763 7301764 EcSMS35_1548 EcSMS35_1549 nemA   TRUE 0.847 37.000 0.362 1.000 N NA
 7301765 7301766 EcSMS35_1550 EcSMS35_1551   ydhF FALSE 0.282 49.000 0.045 NA   NA
 7301766 7301767 EcSMS35_1551 EcSMS35_1552 ydhF sodC_1 FALSE 0.214 81.000 0.033 1.000   NA
 7301768 7301769 EcSMS35_1553 EcSMS35_1554     TRUE 0.763 0.000 0.000 NA   NA
 7301769 7301770 EcSMS35_1554 EcSMS35_1555     TRUE 0.971 3.000 0.412 NA   NA
 7301771 7301772 EcSMS35_1556 EcSMS35_1557     FALSE 0.365 25.000 0.000 NA   NA
 7301774 7301775 EcSMS35_1559 EcSMS35_1560 anmK   FALSE 0.146 98.000 0.034 NA   NA
 7301775 7301776 EcSMS35_1560 EcSMS35_1561   pdxH FALSE 0.189 59.000 0.034 NA   NA
 7301776 7301777 EcSMS35_1561 EcSMS35_1562 pdxH tyrS FALSE 0.210 129.000 0.054 1.000 N NA
 7301777 7301778 EcSMS35_1562 EcSMS35_1563 tyrS pdxY FALSE 0.303 62.000 0.041 1.000 N NA
 7301779 7301780 EcSMS35_1564 EcSMS35_1565 gst tppB TRUE 0.653 105.000 0.344 1.000 N NA
 7301780 7301781 EcSMS35_1565 EcSMS35_1566 tppB nth FALSE 0.003 610.000 0.000 1.000 N NA
 7301781 7301782 EcSMS35_1566 EcSMS35_1567 nth rnfE TRUE 0.938 0.000 0.109 1.000 N NA
 7301782 7301783 EcSMS35_1567 EcSMS35_1568 rnfE rnfG TRUE 0.998 4.000 0.908 0.048 Y NA
 7301783 7301784 EcSMS35_1568 EcSMS35_1569 rnfG rnfD TRUE 0.998 4.000 0.924 0.048 Y NA
 7301784 7301785 EcSMS35_1569 EcSMS35_1570 rnfD rnfC TRUE 0.999 1.000 0.814 0.048 Y NA
 7301785 7301786 EcSMS35_1570 EcSMS35_1571 rnfC rnfB TRUE 0.997 -7.000 0.537 0.048 Y NA
 7301786 7301787 EcSMS35_1571 EcSMS35_1572 rnfB rnfA TRUE 0.998 0.000 0.564 0.048 Y NA
 7301787 7301788 EcSMS35_1572 EcSMS35_1573 rnfA   FALSE 0.406 77.000 0.148 NA   NA
 7301788 7301789 EcSMS35_1573 EcSMS35_1574     FALSE 0.347 86.000 0.120 NA   NA
 7301791 7301792 EcSMS35_1576 EcSMS35_1577 add malY FALSE 0.409 104.000 0.132 1.000 N NA
 7301792 7301793 EcSMS35_1577 EcSMS35_1578 malY malX TRUE 0.971 10.000 0.531 1.000 N NA
 7301794 7301795 EcSMS35_1579 EcSMS35_1580 malI   FALSE 0.186 112.000 0.000 1.000 N NA
 7301795 7301796 EcSMS35_1580 EcSMS35_1581   uidR FALSE 0.021 240.000 0.000 1.000 N NA
 7301796 7301797 EcSMS35_1581 EcSMS35_1582 uidR uidA FALSE 0.004 390.000 0.000 1.000 N NA
 7301797 7301798 EcSMS35_1582 EcSMS35_1583 uidA uidB TRUE 0.994 -3.000 0.235 1.000 Y NA
 7301798 7301799 EcSMS35_1583 EcSMS35_1584 uidB uidC TRUE 0.748 57.000 0.375 1.000   NA
 7301800 7301801 EcSMS35_1585 EcSMS35_1586   manA TRUE 0.810 101.000 0.778 NA   NA
 7301802 7301803 EcSMS35_1587 EcSMS35_1589 fumA fumC TRUE 0.725 143.000 0.000 0.001 Y NA
 7301804 7301805 EcSMS35_1588 EcSMS35_1590 tus rstB TRUE 0.559 64.000 0.200 1.000   NA
 7301805 7301806 EcSMS35_1590 EcSMS35_1591 rstB rstA TRUE 0.986 4.000 0.181 1.000 Y NA
 7301808 7301809 EcSMS35_1592 EcSMS35_1594   arcD TRUE 0.664 37.000 0.140 1.000 N NA
 7301809 7301810 EcSMS35_1594 EcSMS35_1595 arcD ydgH FALSE 0.111 186.000 0.143 NA   NA
 7301811 7301812 EcSMS35_1596 EcSMS35_1597 pntA pntB TRUE 0.997 11.000 0.745 0.001 Y NA
 7301814 7301815 EcSMS35_1599 EcSMS35_1600 mdtJ mdtI TRUE 0.998 -13.000 0.869 0.077 Y NA
 7301816 7301817 EcSMS35_1601 EcSMS35_1602     FALSE 0.007 276.000 0.000 NA   NA
 7301820 7301821 EcSMS35_1605 EcSMS35_1606   mic TRUE 0.846 135.000 0.408 NA Y NA
 7301821 7301822 EcSMS35_1606 EcSMS35_1608 mic bioD2 TRUE 0.643 125.000 0.455 NA N NA
 7301823 7301824 EcSMS35_1607 EcSMS35_1609   dmsD FALSE 0.076 195.000 0.079 1.000   NA
 7301824 7301825 EcSMS35_1609 EcSMS35_1610 dmsD dmsC2 TRUE 0.592 43.000 0.125 1.000   NA
 7301825 7301826 EcSMS35_1610 EcSMS35_1611 dmsC2 dmsB_1 TRUE 0.966 2.000 0.333 NA   NA
 7301826 7301827 EcSMS35_1611 EcSMS35_1612 dmsB_1   TRUE 0.548 11.000 0.000 NA   NA
 7301827 7301828 EcSMS35_1612 EcSMS35_1613   ynfE FALSE 0.128 88.000 0.000 NA   NA
 7301828 7301829 EcSMS35_1613 EcSMS35_1614 ynfE   FALSE 0.189 199.000 0.304 NA   NA
 7301831 7301832 EcSMS35_1616 EcSMS35_1617 speG   FALSE 0.401 35.000 0.055 NA   NA
 7301833 7301834 EcSMS35_1618 EcSMS35_1619   rspA FALSE 0.031 206.000 0.020 1.000   NA
 7301834 7301835 EcSMS35_1619 EcSMS35_1620 rspA rspB TRUE 0.741 12.000 0.049 1.000 N NA
 7301835 7301836 EcSMS35_1620 EcSMS35_1621 rspB ydfJ FALSE 0.266 58.000 0.000 1.000 N NA
 7301836 7301837 EcSMS35_1621 EcSMS35_1622 ydfJ   TRUE 0.559 -37.000 0.000 NA   NA
 7301837 7301838 EcSMS35_1622 EcSMS35_1623     TRUE 0.579 10.000 0.000 NA   NA
 7301839 7301840 EcSMS35_1624 EcSMS35_1625     FALSE 0.035 177.000 0.000 NA   NA
 7301840 7301841 EcSMS35_1625 EcSMS35_1626     FALSE 0.188 89.000 0.000 1.000   NA
 7301842 7301843 EcSMS35_1627 EcSMS35_1628 dcp   FALSE 0.003 363.000 0.000 NA   NA
 7301843 7301844 EcSMS35_1628 EcSMS35_1629     FALSE 0.009 255.000 0.000 NA   NA
 7301848 7301849 EcSMS35_1633 EcSMS35_1634     TRUE 0.968 114.000 0.789 0.012 Y NA
 7301849 7301850 EcSMS35_1634 EcSMS35_1635     TRUE 0.956 28.000 0.105 0.012 Y NA
 7301850 7301851 EcSMS35_1635 EcSMS35_1636   bglH TRUE 0.939 56.000 0.250 0.013 Y NA
 7301851 7301852 EcSMS35_1636 EcSMS35_1637 bglH celA TRUE 0.904 25.000 0.000 1.000 Y NA
 7301853 7301854 EcSMS35_1638 EcSMS35_1639 marB marA FALSE 0.295 32.000 0.000 NA   NA
 7301854 7301855 EcSMS35_1639 EcSMS35_1640 marA marR TRUE 0.993 21.000 0.667 0.046 Y NA
 7301858 7301859 EcSMS35_1643 EcSMS35_1645     FALSE 0.263 37.000 0.000 NA   NA
 7301860 7301861 EcSMS35_1644 EcSMS35_1646     FALSE 0.194 78.000 0.000 1.000   NA
 7301862 7301863 EcSMS35_1647 EcSMS35_1648   glsA2 FALSE 0.249 64.000 0.000 1.000 N NA
 7301863 7301864 EcSMS35_1648 EcSMS35_1649 glsA2   TRUE 0.811 0.000 0.037 NA   NA
 7301864 7301865 EcSMS35_1649 EcSMS35_1650     FALSE 0.195 139.000 0.098 NA   NA
 7301865 7301866 EcSMS35_1650 EcSMS35_1651   uxaB FALSE 0.025 228.000 0.000 1.000 N NA
 7301866 7301867 EcSMS35_1651 EcSMS35_1652 uxaB   FALSE 0.094 197.000 0.143 NA   NA
 7301868 7301869 EcSMS35_1653 EcSMS35_1654 tam lsrG FALSE 0.238 57.000 0.000 1.000   NA
 7301869 7301870 EcSMS35_1654 EcSMS35_1655 lsrG lsrF FALSE 0.489 24.000 0.000 1.000   NA
 7301870 7301871 EcSMS35_1655 EcSMS35_1656 lsrF lsrB TRUE 0.879 27.000 0.000 NA Y NA
 7301871 7301872 EcSMS35_1656 EcSMS35_1657 lsrB lsrD TRUE 0.994 12.000 0.844 NA Y NA
 7301872 7301873 EcSMS35_1657 EcSMS35_1658 lsrD lsrC TRUE 0.999 0.000 0.788 0.052 Y NA
 7301873 7301874 EcSMS35_1658 EcSMS35_1659 lsrC lsrA TRUE 0.998 -6.000 0.818 1.000 Y NA
 7301875 7301876 EcSMS35_1660 EcSMS35_1661 lsrR lsrK FALSE 0.221 79.000 0.000 1.000 N NA
 7301876 7301877 EcSMS35_1661 EcSMS35_1662 lsrK   FALSE 0.002 530.000 0.000 1.000   NA
 7301877 7301878 EcSMS35_1662 EcSMS35_1663     FALSE 0.005 309.000 0.000 NA   NA
 7301878 7301879 EcSMS35_1663 EcSMS35_1664     FALSE 0.001 768.000 0.000 NA   NA
 7301879 7301880 EcSMS35_1664 EcSMS35_1665     FALSE 0.046 363.000 0.000 1.000 Y NA
 7301880 7301881 EcSMS35_1665 EcSMS35_1666     TRUE 0.715 78.000 0.000 1.000 Y NA
 7301881 7301882 EcSMS35_1666 EcSMS35_1667     TRUE 0.939 14.000 0.000 1.000 Y NA
 7301882 7301883 EcSMS35_1667 EcSMS35_1669     TRUE 0.968 13.000 0.000 0.009 Y NA
 7301884 7301885 EcSMS35_1668 EcSMS35_1670     TRUE 0.969 -42.000 0.000 0.064 Y NA
 7301886 7301887 EcSMS35_1671 EcSMS35_1672     FALSE 0.006 339.000 0.000 1.000   NA
 7301887 7301888 EcSMS35_1672 EcSMS35_1673     FALSE 0.010 248.000 0.000 NA   NA
 7301888 7301889 EcSMS35_1673 EcSMS35_1674     FALSE 0.137 75.000 0.000 NA   NA
 7301889 7301890 EcSMS35_1674 EcSMS35_1675     FALSE 0.003 464.000 0.000 1.000 N NA
 7301890 7301891 EcSMS35_1675 EcSMS35_1676     TRUE 0.864 52.000 0.600 1.000   NA
 7301891 7301892 EcSMS35_1676 EcSMS35_1677     FALSE 0.009 291.000 0.000 1.000   NA
 7301892 7301893 EcSMS35_1677 EcSMS35_1678     TRUE 0.583 38.000 0.000 0.065   NA
 7301893 7301894 EcSMS35_1678 EcSMS35_1679   pqqL TRUE 0.541 57.000 0.167 1.000   NA
 7301894 7301895 EcSMS35_1679 EcSMS35_1680 pqqL gadA FALSE 0.005 362.000 0.000 1.000   NA
 7301895 7301896 EcSMS35_1680 EcSMS35_1681 gadA gadC TRUE 0.583 156.000 0.103 1.000 Y NA
 7301896 7301897 EcSMS35_1681 EcSMS35_1682 gadC   FALSE 0.019 236.000 0.000 1.000   NA
 7301897 7301898 EcSMS35_1682 EcSMS35_1683     FALSE 0.004 376.000 0.000 1.000   NA
 7301898 7301899 EcSMS35_1683 EcSMS35_1684   dos TRUE 0.993 1.000 0.130 0.005 Y NA
 7301899 7301900 EcSMS35_1684 EcSMS35_1685 dos ddpX FALSE 0.016 258.000 0.000 1.000 N NA
 7301900 7301901 EcSMS35_1685 EcSMS35_1686 ddpX   TRUE 0.793 14.000 0.091 1.000 N NA
 7301901 7301902 EcSMS35_1686 EcSMS35_1687   yddR TRUE 0.990 2.000 0.091 0.052 Y NA
 7301902 7301903 EcSMS35_1687 EcSMS35_1688 yddR yddQ TRUE 0.994 -3.000 0.143 0.052 Y NA
 7301903 7301904 EcSMS35_1688 EcSMS35_1689 yddQ   TRUE 0.995 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 7301904 7301905 EcSMS35_1689 EcSMS35_1690     TRUE 0.995 -7.000 0.219 0.002 Y NA
 7301906 7301907 EcSMS35_1691 EcSMS35_1692 osmC   FALSE 0.103 118.000 0.000 NA   NA
 7301908 7301909 EcSMS35_1693 EcSMS35_1694   rpsV TRUE 0.744 102.000 0.571 NA   NA
 7301909 7301910 EcSMS35_1694 EcSMS35_1695 rpsV sfcA TRUE 0.654 157.000 0.750 1.000   NA
 7301910 7301911 EcSMS35_1695 EcSMS35_1696 sfcA   FALSE 0.121 134.000 0.000 1.000   NA
 7301911 7301912 EcSMS35_1696 EcSMS35_1697     FALSE 0.099 146.000 0.000 1.000   NA
 7301913 7301914 EcSMS35_1698 EcSMS35_1699 fdnI fdnH TRUE 0.996 -7.000 0.333 0.002 Y NA
 7301914 7301915 EcSMS35_1699 EcSMS35_1700 fdnH fdnG TRUE 0.993 13.000 0.429 0.002 Y NA
 7301916 7301917 EcSMS35_1701 EcSMS35_1702     FALSE 0.032 258.000 0.000 0.099   NA
 7301917 7301918 EcSMS35_1702 EcSMS35_1703     FALSE 0.061 170.000 0.000 1.000   NA
 7301918 7301919 EcSMS35_1703 EcSMS35_1704     FALSE 0.470 63.000 0.000 0.011   NA
 7301919 7301920 EcSMS35_1704 EcSMS35_1705   narU FALSE 0.008 310.000 0.000 1.000   NA
 7301920 7301921 EcSMS35_1705 EcSMS35_1706 narU narZ TRUE 0.786 95.000 0.556 1.000 N NA
 7301921 7301922 EcSMS35_1706 EcSMS35_1707 narZ narY TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.001 Y NA
 7301922 7301923 EcSMS35_1707 EcSMS35_1708 narY narW TRUE 0.999 0.000 0.714 0.003 Y NA
 7301923 7301924 EcSMS35_1708 EcSMS35_1709 narW narV TRUE 0.999 -3.000 0.714 0.003 Y NA
 7301924 7301925 EcSMS35_1709 EcSMS35_1710 narV   FALSE 0.191 80.000 0.000 1.000   NA
 7301929 7301930 EcSMS35_1714 EcSMS35_1715     TRUE 0.598 -24.000 0.000 NA   NA
 7301930 7301931 EcSMS35_1715 EcSMS35_1716     TRUE 0.621 -18.000 0.000 NA   NA
 7301937 7301938 EcSMS35_1722 EcSMS35_1724     TRUE 0.572 -31.000 0.000 NA   NA
 7301940 7301941 EcSMS35_1725 EcSMS35_1726     TRUE 0.888 -3.000 0.070 NA   NA
 7301942 7301943 EcSMS35_1727 EcSMS35_1728     FALSE 0.129 86.000 0.000 NA   NA
 7301945 7301946 EcSMS35_1729 EcSMS35_1731 ydcW ydcV TRUE 0.849 22.000 0.216 1.000 N NA
 7301946 7301947 EcSMS35_1731 EcSMS35_1732 ydcV ydcU TRUE 0.998 -10.000 0.821 0.052 Y NA
 7301947 7301948 EcSMS35_1732 EcSMS35_1733 ydcU ydcT TRUE 0.998 1.000 0.643 0.052 Y NA
 7301948 7301949 EcSMS35_1733 EcSMS35_1734 ydcT ydcS TRUE 0.993 18.000 0.609 0.052 Y NA
 7301949 7301950 EcSMS35_1734 EcSMS35_1735 ydcS   FALSE 0.148 245.000 0.000 1.000 Y NA
 7301950 7301951 EcSMS35_1735 EcSMS35_1736     FALSE 0.192 79.000 0.000 1.000   NA
 7301952 7301953 EcSMS35_1737 EcSMS35_1738     FALSE 0.105 117.000 0.000 NA   NA
 7301954 7301955 EcSMS35_1739 EcSMS35_1740     FALSE 0.203 73.000 0.000 1.000   NA
 7301959 7301960 EcSMS35_1744 EcSMS35_1745   tehB FALSE 0.014 303.000 0.088 NA   NA
 7301960 7301961 EcSMS35_1745 EcSMS35_1746 tehB tehA TRUE 0.957 -3.000 0.175 1.000   NA
 7301963 7301964 EcSMS35_1747 EcSMS35_1749 rimL   FALSE 0.160 63.000 0.026 NA   NA
 7301964 7301965 EcSMS35_1749 EcSMS35_1750   mdoD FALSE 0.076 140.000 0.026 NA   NA
 7301965 7301966 EcSMS35_1750 EcSMS35_1751 mdoD   FALSE 0.008 261.000 0.000 NA   NA
 7301968 7301969 EcSMS35_1753 EcSMS35_1754 trg   FALSE 0.001 620.000 0.000 NA   NA
 7301969 7301970 EcSMS35_1754 EcSMS35_1755     FALSE 0.011 245.000 0.000 NA   NA
 7301972 7301973 EcSMS35_1757 EcSMS35_1758 aldA   FALSE 0.033 197.000 0.040 NA   NA
 7301973 7301974 EcSMS35_1758 EcSMS35_1759   hrpA FALSE 0.007 273.000 0.000 NA   NA
 7301976 7301977 EcSMS35_1761 EcSMS35_1762     TRUE 0.977 14.000 0.285 NA Y NA
 7301977 7301978 EcSMS35_1762 EcSMS35_1763   cdsA2 FALSE 0.452 16.000 0.000 NA   NA
 7301978 7301979 EcSMS35_1763 EcSMS35_1764 cdsA2   TRUE 0.980 0.000 0.179 0.002   NA
 7301979 7301980 EcSMS35_1764 EcSMS35_1765     FALSE 0.040 170.000 0.000 NA   NA
 7301980 7301981 EcSMS35_1765 EcSMS35_1766     FALSE 0.150 64.000 0.000 NA   NA
 7301981 7301982 EcSMS35_1766 EcSMS35_1767     FALSE 0.020 208.000 0.000 NA   NA
 7301982 7301983 EcSMS35_1767 EcSMS35_1768     FALSE 0.002 458.000 0.000 NA   NA
 7301983 7301984 EcSMS35_1768 EcSMS35_1769     TRUE 0.980 8.000 0.726 NA   NA
 7301984 7301985 EcSMS35_1769 EcSMS35_1770     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7301986 7301987 EcSMS35_1771 EcSMS35_1773 idhA hslJ FALSE 0.135 111.000 0.000 NA N NA
 7301989 7301990 EcSMS35_1774 EcSMS35_1775   ydbK FALSE 0.253 71.000 0.065 NA   NA
 7301990 7301991 EcSMS35_1775 EcSMS35_1776 ydbK ompN FALSE 0.005 366.000 0.000 1.000 N NA
 7301991 7301992 EcSMS35_1776 EcSMS35_1777 ompN uspF FALSE 0.125 141.000 0.000 1.000 N NA
 7301992 7301993 EcSMS35_1777 EcSMS35_1778 uspF   FALSE 0.045 176.000 0.000 NA N NA
 7301994 7301995 EcSMS35_1779 EcSMS35_1780 dbpA zntB FALSE 0.003 478.000 0.000 1.000 N NA
 7301997 7301998 EcSMS35_1782 EcSMS35_1783   abgR FALSE 0.004 331.000 0.000 NA   NA
 7301999 7302000 EcSMS35_1784 EcSMS35_1785 abgA abgB TRUE 0.975 0.000 0.128 0.002   NA
 7302000 7302001 EcSMS35_1785 EcSMS35_1786 abgB abgT FALSE 0.520 31.000 0.080 NA   NA
 7302001 7302002 EcSMS35_1786 EcSMS35_1787 abgT ogt TRUE 0.606 11.000 0.000 NA N NA
 7302002 7302003 EcSMS35_1787 EcSMS35_1788 ogt fnr FALSE 0.046 195.000 0.000 1.000 N NA
 7302003 7302004 EcSMS35_1788 EcSMS35_1789 fnr uspE TRUE 0.876 152.000 0.619 1.000 Y NA
 7302007 7302008 EcSMS35_1792 EcSMS35_1793 mppA   FALSE 0.007 337.000 0.000 1.000 N NA
 7302009 7302010 EcSMS35_1794 EcSMS35_1795     FALSE 0.207 71.000 0.000 1.000   NA
 7302010 7302011 EcSMS35_1795 EcSMS35_1797     FALSE 0.011 291.000 0.000 1.000 N NA
 7302014 7302015 EcSMS35_1799 EcSMS35_1800 tyrR   FALSE 0.213 148.000 0.137 NA   NA
 7302015 7302016 EcSMS35_1800 EcSMS35_1801     TRUE 0.992 -3.000 0.791 NA   NA
 7302018 7302019 EcSMS35_1803 EcSMS35_1804 ompG   TRUE 0.808 45.000 0.222 0.052   NA
 7302019 7302020 EcSMS35_1804 EcSMS35_1805   pgmB TRUE 0.790 14.000 0.103 1.000   NA
 7302020 7302021 EcSMS35_1805 EcSMS35_1806 pgmB   TRUE 0.848 -3.000 0.000 1.000   NA
 7302021 7302022 EcSMS35_1806 EcSMS35_1807     TRUE 0.848 -3.000 0.000 1.000   NA
 7302022 7302023 EcSMS35_1807 EcSMS35_1808     TRUE 0.887 22.000 0.347 NA   NA
 7302023 7302024 EcSMS35_1808 EcSMS35_1809     TRUE 0.872 18.000 0.261 NA N NA
 7302024 7302025 EcSMS35_1809 EcSMS35_1810     TRUE 0.778 31.000 0.205 1.000 N NA
 7302025 7302026 EcSMS35_1810 EcSMS35_1811     TRUE 0.998 -13.000 0.805 0.052 Y NA
 7302026 7302027 EcSMS35_1811 EcSMS35_1812     TRUE 0.992 21.000 0.620 0.052 Y NA
 7302027 7302028 EcSMS35_1812 EcSMS35_1813     TRUE 0.984 14.000 0.360 1.000 Y NA
 7302028 7302029 EcSMS35_1813 EcSMS35_1814   pspE FALSE 0.032 214.000 0.000 1.000 N NA
 7302029 7302030 EcSMS35_1814 EcSMS35_1815 pspE pspD FALSE 0.384 75.000 0.133 NA   NA
 7302030 7302031 EcSMS35_1815 EcSMS35_1816 pspD pspC TRUE 0.880 9.000 0.167 NA   NA
 7302031 7302032 EcSMS35_1816 EcSMS35_1817 pspC pspB TRUE 0.992 0.000 0.913 NA   NA
 7302032 7302033 EcSMS35_1817 EcSMS35_1818 pspB pspA TRUE 0.872 54.000 0.739 NA   NA
 7302035 7302036 EcSMS35_1820 EcSMS35_1821 gabT1 puuB TRUE 0.899 38.000 0.100 1.000 Y NA
 7302036 7302037 EcSMS35_1821 EcSMS35_1822 puuB puuC TRUE 0.989 2.000 0.500 0.027 N NA
 7302037 7302038 EcSMS35_1822 EcSMS35_1823 puuC puuR FALSE 0.128 150.000 0.040 1.000 N NA
 7302038 7302039 EcSMS35_1823 EcSMS35_1824 puuR puuD TRUE 0.529 27.000 0.046 1.000   NA
 7302040 7302041 EcSMS35_1825 EcSMS35_1826 puuA   FALSE 0.078 303.000 0.000 1.000 Y NA
 7302041 7302042 EcSMS35_1826 EcSMS35_1827     FALSE 0.080 134.000 0.000 NA   NA
 7302042 7302043 EcSMS35_1827 EcSMS35_1828   sapA FALSE 0.004 337.000 0.000 NA   NA
 7302043 7302044 EcSMS35_1828 EcSMS35_1829 sapA sapB TRUE 0.984 -3.000 0.264 0.052 N NA
 7302044 7302045 EcSMS35_1829 EcSMS35_1830 sapB sapC TRUE 0.993 -13.000 0.284 0.052 Y NA
 7302045 7302046 EcSMS35_1830 EcSMS35_1831 sapC sapD TRUE 0.998 0.000 0.667 1.000 Y NA
 7302046 7302047 EcSMS35_1831 EcSMS35_1832 sapD sapF TRUE 0.998 2.000 0.684 0.016 Y NA
 7302048 7302049 EcSMS35_1833 EcSMS35_1834 eefD eefC TRUE 0.940 9.000 0.143 0.052 N NA
 7302049 7302050 EcSMS35_1834 EcSMS35_1835 eefC eefB TRUE 0.981 4.000 0.367 0.052 N NA
 7302050 7302051 EcSMS35_1835 EcSMS35_1836 eefB eefA TRUE 0.954 0.000 0.167 1.000 N NA
 7302051 7302052 EcSMS35_1836 EcSMS35_1837 eefA eefR FALSE 0.428 149.000 0.286 1.000 N NA
 7302052 7302053 EcSMS35_1837 EcSMS35_1838 eefR   FALSE 0.036 176.000 0.000 NA   NA
 7302054 7302055 EcSMS35_1839 EcSMS35_1840 fabI   FALSE 0.118 145.000 0.057 NA   NA
 7302055 7302056 EcSMS35_1840 EcSMS35_1841   rnb FALSE 0.356 68.000 0.105 NA   NA
 7302056 7302057 EcSMS35_1841 EcSMS35_1842 rnb   FALSE 0.023 235.000 0.000 1.000 N NA
 7302057 7302058 EcSMS35_1842 EcSMS35_1843     FALSE 0.149 148.000 0.083 NA   NA
 7302058 7302059 EcSMS35_1843 EcSMS35_1844     FALSE 0.388 90.000 0.146 NA   NA
 7302059 7302060 EcSMS35_1844 EcSMS35_1845     FALSE 0.007 269.000 0.000 NA   NA
 7302061 7302062 EcSMS35_1846 EcSMS35_1847   pyrF TRUE 0.899 -3.000 0.045 1.000 N NA
 7302064 7302065 EcSMS35_1849 EcSMS35_1850     TRUE 0.974 7.000 0.576 NA   NA
 7302065 7302066 EcSMS35_1850 EcSMS35_1851   pgpB FALSE 0.215 149.000 0.143 NA   NA
 7302068 7302069 EcSMS35_1853 EcSMS35_1854 acnA   FALSE 0.004 320.000 0.000 NA   NA
 7302069 7302070 EcSMS35_1854 EcSMS35_1855     TRUE 0.980 3.000 0.556 NA   NA
 7302070 7302071 EcSMS35_1855 EcSMS35_1856   cysB FALSE 0.004 331.000 0.000 NA   NA
 7302071 7302072 EcSMS35_1856 EcSMS35_1857 cysB topA FALSE 0.031 209.000 0.008 1.000 N NA
 7302075 7302076 EcSMS35_1860 EcSMS35_1861   btuR TRUE 0.904 -3.000 0.050 1.000 N NA
 7302077 7302078 EcSMS35_1862 EcSMS35_1863     TRUE 0.548 11.000 0.000 NA   NA
 7302078 7302079 EcSMS35_1863 EcSMS35_1864   rluB FALSE 0.040 170.000 0.000 NA   NA
 7302079 7302080 EcSMS35_1864 EcSMS35_1865 rluB   FALSE 0.018 211.000 0.000 NA   NA
 7302080 7302081 EcSMS35_1865 EcSMS35_1866     FALSE 0.328 28.000 0.000 NA   NA
 7302081 7302082 EcSMS35_1866 EcSMS35_1867     TRUE 0.917 -39.000 0.281 NA   NA
 7302083 7302084 EcSMS35_1868 EcSMS35_1869 trpE trpD TRUE 0.991 0.000 0.010 0.001 Y NA
 7302084 7302085 EcSMS35_1869 EcSMS35_1870 trpD trpC TRUE 0.976 1.000 0.003 1.000 Y NA
 7302085 7302086 EcSMS35_1870 EcSMS35_1871 trpC trpB TRUE 0.973 12.000 0.005 0.001 Y NA
 7302086 7302087 EcSMS35_1871 EcSMS35_1872 trpB trpA TRUE 0.999 0.000 0.947 0.001 Y NA
 7302087 7302088 EcSMS35_1872 EcSMS35_1873 trpA   FALSE 0.002 381.000 0.000 NA   NA
 7302088 7302089 EcSMS35_1873 EcSMS35_1874   yciF FALSE 0.148 65.000 0.000 NA   NA
 7302089 7302090 EcSMS35_1874 EcSMS35_1875 yciF   FALSE 0.077 273.000 0.115 0.001   NA
 7302092 7302093 EcSMS35_1877 EcSMS35_1878   ispZ FALSE 0.474 30.000 0.061 NA   NA
 7302093 7302094 EcSMS35_1878 EcSMS35_1879 ispZ yciA FALSE 0.409 105.000 0.167 NA N NA
 7302096 7302097 EcSMS35_1881 EcSMS35_1882     FALSE 0.055 153.000 0.000 NA   NA
 7302097 7302098 EcSMS35_1882 EcSMS35_1884     FALSE 0.111 109.000 0.000 NA   NA
 7302099 7302100 EcSMS35_1883 EcSMS35_1885     FALSE 0.065 146.000 0.000 NA   NA
 7302101 7302102 EcSMS35_1886 EcSMS35_1887     FALSE 0.323 44.000 0.000 1.000   NA
 7302102 7302103 EcSMS35_1887 EcSMS35_1888     TRUE 0.969 -42.000 0.000 0.063 Y NA
 7302103 7302104 EcSMS35_1888 EcSMS35_1889     TRUE 0.977 -25.000 0.000 0.012 Y NA
 7302104 7302105 EcSMS35_1889 EcSMS35_1890   kch FALSE 0.002 686.000 0.000 1.000 N NA
 7302105 7302106 EcSMS35_1890 EcSMS35_1891 kch cls FALSE 0.005 371.000 0.000 1.000 N NA
 7302106 7302107 EcSMS35_1891 EcSMS35_1892 cls   TRUE 0.731 35.000 0.231 NA   NA
 7302108 7302109 EcSMS35_1893 EcSMS35_1894 oppF oppD TRUE 0.998 -3.000 0.420 0.002 Y NA
 7302109 7302110 EcSMS35_1894 EcSMS35_1895 oppD oppC TRUE 0.991 12.000 0.554 1.000 Y NA
 7302110 7302111 EcSMS35_1895 EcSMS35_1896 oppC oppB TRUE 0.995 18.000 0.870 0.051 Y NA
 7302111 7302112 EcSMS35_1896 EcSMS35_1897 oppB oppA TRUE 0.879 86.000 0.151 0.051 Y NA
 7302114 7302115 EcSMS35_1898 EcSMS35_1900     FALSE 0.339 27.000 0.000 NA   NA
 7302118 7302119 EcSMS35_1903 EcSMS35_1904     FALSE 0.127 92.000 0.000 NA   NA
 7302120 7302121 EcSMS35_1905 EcSMS35_1906 galU   FALSE 0.179 202.000 0.235 1.000 N NA
 7302121 7302122 EcSMS35_1906 EcSMS35_1907     FALSE 0.245 92.000 0.048 1.000   NA
 7302123 7302124 EcSMS35_1908 EcSMS35_1909   purU TRUE 0.600 50.000 0.200 NA   NA
 7302124 7302125 EcSMS35_1909 EcSMS35_1910 purU   FALSE 0.048 159.000 0.000 NA   NA
 7302125 7302126 EcSMS35_1910 EcSMS35_1911     FALSE 0.287 33.000 0.000 NA   NA
 7302127 7302128 EcSMS35_1912 EcSMS35_1913 narI narJ TRUE 0.998 0.000 0.500 0.003 Y NA
 7302128 7302129 EcSMS35_1913 EcSMS35_1914 narJ narH TRUE 0.999 -3.000 0.588 0.003 Y NA
 7302129 7302130 EcSMS35_1914 EcSMS35_1915 narH narG TRUE 0.998 -3.000 0.471 0.001 Y NA
 7302130 7302131 EcSMS35_1915 EcSMS35_1916 narG narK FALSE 0.004 394.000 0.000 1.000 N NA
 7302131 7302132 EcSMS35_1916 EcSMS35_1917 narK   FALSE 0.124 95.000 0.000 NA   NA
 7302133 7302134 EcSMS35_1918 EcSMS35_1919 narX narL TRUE 0.997 -7.000 0.521 0.014 Y NA
 7302137 7302138 EcSMS35_1922 EcSMS35_1923   chaB FALSE 0.174 158.000 0.140 NA   NA
 7302139 7302140 EcSMS35_1924 EcSMS35_1925     FALSE 0.003 379.000 0.000 NA   NA
 7302140 7302141 EcSMS35_1925 EcSMS35_1926     FALSE 0.002 401.000 0.000 NA   NA
 7302142 7302143 EcSMS35_1927 EcSMS35_1928 kdsA sirB1 TRUE 0.570 36.000 0.089 1.000   NA
 7302143 7302144 EcSMS35_1928 EcSMS35_1929 sirB1   TRUE 0.922 4.000 0.195 NA   NA
 7302144 7302145 EcSMS35_1929 EcSMS35_1930   hemK TRUE 0.923 -3.000 0.109 NA   NA
 7302145 7302146 EcSMS35_1930 EcSMS35_1931 hemK prfA TRUE 0.995 0.000 0.229 0.041 Y NA
 7302146 7302147 EcSMS35_1931 EcSMS35_1932 prfA hemA TRUE 0.801 42.000 0.171 0.041 N NA
 7302148 7302149 EcSMS35_1933 EcSMS35_1934 lolB ipk TRUE 0.952 0.000 0.157 1.000 N NA
 7302149 7302150 EcSMS35_1934 EcSMS35_1935 ipk prs FALSE 0.287 85.000 0.053 1.000 N NA
 7302150 7302151 EcSMS35_1935 EcSMS35_1936 prs ychM FALSE 0.172 125.000 0.027 1.000 N NA
 7302153 7302154 EcSMS35_1938 EcSMS35_1939 pth engD TRUE 0.808 117.000 0.184 1.000 Y NA
 7302156 7302157 EcSMS35_1941 EcSMS35_1942 dhaK dhaL TRUE 0.991 11.000 0.226 0.001 Y NA
 7302157 7302158 EcSMS35_1942 EcSMS35_1943 dhaL dhaM TRUE 0.843 11.000 0.118 1.000   NA
 7302158 7302159 EcSMS35_1943 EcSMS35_1944 dhaM   FALSE 0.339 27.000 0.000 NA   NA
 7302161 7302162 EcSMS35_1946 EcSMS35_1947 treA   FALSE 0.007 330.000 0.000 1.000 N NA
 7302162 7302163 EcSMS35_1947 EcSMS35_1948     TRUE 0.996 0.000 0.422 1.000 Y NA
 7302163 7302164 EcSMS35_1948 EcSMS35_1949     TRUE 0.998 -3.000 0.862 1.000 Y NA
 7302164 7302165 EcSMS35_1949 EcSMS35_1950     TRUE 0.836 10.000 0.123 NA   NA
 7302165 7302166 EcSMS35_1950 EcSMS35_1951   modD TRUE 0.816 -3.000 0.034 NA   NA
 7302166 7302167 EcSMS35_1951 EcSMS35_1952 modD   TRUE 0.541 26.000 0.034 1.000 N NA
 7302171 7302172 EcSMS35_1956 EcSMS35_1957 ldcA cvrA FALSE 0.339 95.000 0.103 NA N NA
 7302172 7302173 EcSMS35_1957 EcSMS35_1958 cvrA   FALSE 0.001 749.000 0.000 NA   NA
 7302174 7302175 EcSMS35_1959 EcSMS35_1960 dadX dadA TRUE 0.901 10.000 0.168 1.000 N NA
 7302178 7302179 EcSMS35_1963 EcSMS35_1964 nhaB dsbB TRUE 0.721 146.000 0.723 1.000 N NA
 7302180 7302181 EcSMS35_1965 EcSMS35_1966 umuC umuD TRUE 0.858 0.000 0.000 1.000 N NA
 7302183 7302184 EcSMS35_1968 EcSMS35_1969     FALSE 0.300 77.000 0.088 NA   NA
 7302184 7302185 EcSMS35_1969 EcSMS35_1970     FALSE 0.231 72.000 0.056 NA   NA
 7302188 7302189 EcSMS35_1973 EcSMS35_1974 minC minD TRUE 0.981 24.000 0.466 1.000 Y NA
 7302189 7302190 EcSMS35_1974 EcSMS35_1975 minD minE TRUE 0.995 4.000 0.618 NA Y NA
 7302192 7302193 EcSMS35_1977 EcSMS35_1978     TRUE 0.717 2.000 0.000 NA   NA
 7302193 7302194 EcSMS35_1978 EcSMS35_1979     TRUE 0.579 10.000 0.000 NA   NA
 7302195 7302196 EcSMS35_1980 EcSMS35_1981     FALSE 0.002 491.000 0.000 NA   NA
 7302196 7302197 EcSMS35_1981 EcSMS35_1982     FALSE 0.105 117.000 0.000 NA   NA
 7302197 7302198 EcSMS35_1982 EcSMS35_1983     FALSE 0.083 132.000 0.000 NA   NA
 7302198 7302199 EcSMS35_1983 EcSMS35_1984     FALSE 0.002 395.000 0.000 NA   NA
 7302199 7302200 EcSMS35_1984 EcSMS35_1985     FALSE 0.030 185.000 0.000 NA   NA
 7302201 7302202 EcSMS35_1986 EcSMS35_1987   mlrA FALSE 0.230 205.000 0.333 1.000 N NA
 7302202 7302203 EcSMS35_1987 EcSMS35_1988 mlrA   FALSE 0.015 221.000 0.000 NA   NA
 7302205 7302206 EcSMS35_1990 EcSMS35_1991 rluE   TRUE 0.909 10.000 0.182 1.000 N NA
 7302206 7302207 EcSMS35_1991 EcSMS35_1992   mnmA TRUE 0.578 54.000 0.158 1.000 N NA
 7302207 7302208 EcSMS35_1992 EcSMS35_1993 mnmA   TRUE 0.663 36.000 0.180 NA   NA
 7302208 7302209 EcSMS35_1993 EcSMS35_1994   purB TRUE 0.857 4.000 0.093 NA   NA
 7302209 7302210 EcSMS35_1994 EcSMS35_1995 purB phoP FALSE 0.066 169.000 0.011 1.000 N NA
 7302210 7302211 EcSMS35_1995 EcSMS35_1996 phoP phoQ TRUE 0.998 0.000 0.940 1.000 Y NA
 7302211 7302212 EcSMS35_1996 EcSMS35_1997 phoQ   TRUE 0.691 76.000 0.408 NA   NA
 7302214 7302215 EcSMS35_1999 EcSMS35_2000   potA TRUE 0.609 -21.000 0.000 NA   NA
 7302215 7302216 EcSMS35_2000 EcSMS35_2001 potA potB TRUE 0.996 -16.000 0.789 1.000 Y NA
 7302216 7302217 EcSMS35_2001 EcSMS35_2002 potB potC TRUE 0.996 -3.000 0.286 0.051 Y NA
 7302217 7302218 EcSMS35_2002 EcSMS35_2003 potC potD TRUE 0.990 -3.000 0.000 0.051 Y NA
 7302218 7302219 EcSMS35_2003 EcSMS35_2004 potD   FALSE 0.162 58.000 0.000 NA   NA
 7302219 7302220 EcSMS35_2004 EcSMS35_2005     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7302221 7302222 EcSMS35_2006 EcSMS35_2007 npdA nagK TRUE 0.958 16.000 0.119 1.000 Y NA
 7302222 7302223 EcSMS35_2007 EcSMS35_2008 nagK lolE TRUE 0.809 29.000 0.225 1.000 N NA
 7302223 7302224 EcSMS35_2008 EcSMS35_2009 lolE lolD TRUE 0.968 0.000 0.125 0.063 N NA
 7302224 7302225 EcSMS35_2009 EcSMS35_2010 lolD lolC TRUE 0.967 -7.000 0.175 0.063 N NA
 7302226 7302227 EcSMS35_2011 EcSMS35_2012   mfd FALSE 0.110 128.000 0.003 1.000   NA
 7302227 7302228 EcSMS35_2012 EcSMS35_2013 mfd   FALSE 0.080 148.000 0.006 1.000   NA
 7302231 7302232 EcSMS35_2016 EcSMS35_2017   ndh FALSE 0.041 227.000 0.071 1.000   NA
 7302232 7302233 EcSMS35_2017 EcSMS35_2018 ndh   FALSE 0.004 400.000 0.057 NA   NA
 7302233 7302234 EcSMS35_2018 EcSMS35_2019   nagZ TRUE 0.645 23.000 0.091 NA   NA
 7302234 7302235 EcSMS35_2019 EcSMS35_2020 nagZ thiK TRUE 0.800 11.000 0.069 1.000 N NA
 7302235 7302236 EcSMS35_2020 EcSMS35_2021 thiK   TRUE 0.941 -19.000 0.310 NA   NA
 7302236 7302237 EcSMS35_2021 EcSMS35_2022     TRUE 0.947 14.000 0.516 NA   NA
 7302237 7302238 EcSMS35_2022 EcSMS35_2023   hinT FALSE 0.464 27.000 0.051 NA   NA
 7302239 7302240 EcSMS35_2024 EcSMS35_2025   fhuE FALSE 0.287 33.000 0.000 NA   NA
 7302241 7302242 EcSMS35_2026 EcSMS35_2027 ptsG   FALSE 0.005 295.000 0.004 NA N NA
 7302242 7302243 EcSMS35_2027 EcSMS35_2028   holB TRUE 0.966 11.000 0.110 NA Y NA
 7302243 7302244 EcSMS35_2028 EcSMS35_2029 holB tmk TRUE 0.967 -3.000 0.211 1.000 N NA
 7302244 7302245 EcSMS35_2029 EcSMS35_2030 tmk   TRUE 0.928 -10.000 0.209 NA   NA
 7302245 7302246 EcSMS35_2030 EcSMS35_2031   pabC TRUE 0.934 3.000 0.204 NA   NA
 7302246 7302247 EcSMS35_2031 EcSMS35_2032 pabC fabF FALSE 0.451 120.000 0.187 1.000 N NA
 7302247 7302248 EcSMS35_2032 EcSMS35_2033 fabF acpP TRUE 0.903 88.000 0.346 1.000 Y NA
 7302248 7302249 EcSMS35_2033 EcSMS35_2034 acpP fabG TRUE 0.663 211.000 0.321 0.003 Y NA
 7302249 7302250 EcSMS35_2034 EcSMS35_2035 fabG fabD TRUE 0.993 13.000 0.432 0.003 Y NA
 7302250 7302251 EcSMS35_2035 EcSMS35_2036 fabD fabH TRUE 0.982 16.000 0.182 0.003 Y NA
 7302251 7302252 EcSMS35_2036 EcSMS35_2037 fabH plsX TRUE 0.955 68.000 0.380 0.003 Y NA
 7302252 7302253 EcSMS35_2037 EcSMS35_2038 plsX rpmF TRUE 0.730 81.000 0.418 1.000 N NA
 7302253 7302254 EcSMS35_2038 EcSMS35_2039 rpmF   TRUE 0.846 52.000 0.599 NA   NA
 7302257 7302258 EcSMS35_2042 EcSMS35_2043 rne   FALSE 0.121 134.000 0.000 1.000   NA
 7302258 7302259 EcSMS35_2043 EcSMS35_2044     TRUE 0.848 -3.000 0.000 1.000   NA
 7302260 7302261 EcSMS35_2045 EcSMS35_2046 flgL flgK TRUE 0.985 12.000 0.142 0.002 Y NA
 7302261 7302262 EcSMS35_2046 EcSMS35_2047 flgK flgJ TRUE 0.978 66.000 0.705 0.003 Y NA
 7302262 7302263 EcSMS35_2047 EcSMS35_2048 flgJ flgI TRUE 0.990 0.000 0.036 0.009 Y NA
 7302263 7302264 EcSMS35_2048 EcSMS35_2049 flgI flgH TRUE 0.977 12.000 0.073 0.009 Y NA
 7302264 7302265 EcSMS35_2049 EcSMS35_2050 flgH flgG TRUE 0.950 53.000 0.268 0.008 Y NA
 7302265 7302266 EcSMS35_2050 EcSMS35_2051 flgG flgF TRUE 0.925 137.000 0.420 0.001 Y NA
 7302266 7302267 EcSMS35_2051 EcSMS35_2052 flgF flgE TRUE 0.991 20.000 0.476 0.005 Y NA
 7302267 7302268 EcSMS35_2052 EcSMS35_2053 flgE flgD TRUE 0.932 25.000 0.116 NA Y NA
 7302268 7302269 EcSMS35_2053 EcSMS35_2054 flgD flgC TRUE 0.972 12.000 0.186 NA Y NA
 7302269 7302270 EcSMS35_2054 EcSMS35_2055 flgC flgB TRUE 0.998 4.000 0.824 0.005 Y NA
 7302270 7302271 EcSMS35_2055 EcSMS35_2056 flgB   FALSE 0.442 17.000 0.000 NA   NA
 7302272 7302273 EcSMS35_2057 EcSMS35_2058 flgA flgM TRUE 0.890 76.000 0.330 NA Y NA
 7302273 7302274 EcSMS35_2058 EcSMS35_2059 flgM flgN TRUE 0.995 5.000 0.361 0.003 Y NA
 7302275 7302276 EcSMS35_2060 EcSMS35_2061 mviN   FALSE 0.164 110.000 0.022 1.000   NA
 7302276 7302277 EcSMS35_2061 EcSMS35_2062     TRUE 0.890 2.000 0.103 NA   NA
 7302277 7302278 EcSMS35_2062 EcSMS35_2063   rimJ TRUE 0.810 11.000 0.116 NA   NA
 7302279 7302280 EcSMS35_2064 EcSMS35_2065 mdtH grxB FALSE 0.386 64.000 0.103 NA N NA
 7302280 7302281 EcSMS35_2065 EcSMS35_2066 grxB   FALSE 0.174 134.000 0.078 NA   NA
 7302281 7302282 EcSMS35_2066 EcSMS35_2067   pyrC FALSE 0.113 106.000 0.022 NA   NA
 7302282 7302283 EcSMS35_2067 EcSMS35_2068 pyrC dinI FALSE 0.159 74.000 0.031 NA   NA
 7302283 7302284 EcSMS35_2068 EcSMS35_2069 dinI bssS FALSE 0.006 290.000 0.000 NA   NA
 7302284 7302285 EcSMS35_2069 EcSMS35_2070 bssS solA TRUE 0.639 115.000 0.423 NA   NA
 7302285 7302286 EcSMS35_2070 EcSMS35_2071 solA   TRUE 0.693 48.000 0.269 NA   NA
 7302288 7302289 EcSMS35_2073 EcSMS35_2074   yceI TRUE 0.983 4.000 0.676 NA   NA
 7302291 7302292 EcSMS35_2076 EcSMS35_2077 lpxL mdtG TRUE 0.729 172.000 0.857 0.074 N NA
 7302292 7302293 EcSMS35_2077 EcSMS35_2078 mdtG msyB TRUE 0.623 83.000 0.333 NA   NA
 7302294 7302295 EcSMS35_2079 EcSMS35_2080   mdoH FALSE 0.136 173.000 0.135 NA   NA
 7302295 7302296 EcSMS35_2080 EcSMS35_2081 mdoH mdoG TRUE 0.919 23.000 0.469 NA N NA
 7302297 7302298 EcSMS35_2082 EcSMS35_2083     TRUE 0.670 4.000 0.000 NA   NA
 7302298 7302299 EcSMS35_2083 EcSMS35_2084   mdoC FALSE 0.229 45.000 0.000 NA   NA
 7302300 7302301 EcSMS35_2085 EcSMS35_2086     TRUE 0.848 2.000 0.046 1.000   NA
 7302301 7302302 EcSMS35_2086 EcSMS35_2087     FALSE 0.137 95.000 0.028 NA   NA
 7302302 7302303 EcSMS35_2087 EcSMS35_2088   csgC FALSE 0.092 277.000 0.429 NA   NA
 7302303 7302304 EcSMS35_2088 EcSMS35_2089 csgC csgA TRUE 0.843 58.000 0.667 NA   NA
 7302304 7302305 EcSMS35_2089 EcSMS35_2090 csgA csgB TRUE 0.891 41.000 0.333 0.008   NA
 7302308 7302309 EcSMS35_2093 EcSMS35_2094 csgD csgE TRUE 0.906 5.000 0.176 NA   NA
 7302309 7302310 EcSMS35_2094 EcSMS35_2095 csgE csgF TRUE 0.946 25.000 0.723 NA   NA
 7302310 7302311 EcSMS35_2095 EcSMS35_2096 csgF csgG FALSE 0.429 27.000 0.043 NA   NA
 7302312 7302313 EcSMS35_2097 EcSMS35_2098     FALSE 0.414 72.000 0.145 NA   NA
 7302313 7302314 EcSMS35_2098 EcSMS35_2099     TRUE 0.911 24.000 0.417 1.000   NA
 7302314 7302315 EcSMS35_2099 EcSMS35_2100     TRUE 0.876 55.000 0.169 1.000 Y NA
 7302317 7302318 EcSMS35_2102 EcSMS35_2103   phoH FALSE 0.001 563.000 0.000 NA   NA
 7302318 7302319 EcSMS35_2103 EcSMS35_2104 phoH   FALSE 0.004 345.000 0.000 NA N NA
 7302319 7302320 EcSMS35_2104 EcSMS35_2105     TRUE 0.990 6.000 0.378 NA Y NA
 7302320 7302321 EcSMS35_2105 EcSMS35_2106     TRUE 0.917 58.000 0.356 NA Y NA
 7302323 7302324 EcSMS35_2108 EcSMS35_2109 putP   TRUE 0.672 -10.000 0.000 NA   NA
 7302324 7302325 EcSMS35_2109 EcSMS35_2110     FALSE 0.295 32.000 0.000 NA   NA
 7302328 7302329 EcSMS35_2113 EcSMS35_2114     TRUE 0.990 -3.000 0.621 NA N NA
 7302329 7302330 EcSMS35_2114 EcSMS35_2115     TRUE 0.948 12.000 0.442 NA N NA
 7302330 7302331 EcSMS35_2115 EcSMS35_2116     TRUE 0.951 8.000 0.365 NA   NA
 7302331 7302332 EcSMS35_2116 EcSMS35_2117     TRUE 0.966 -3.000 0.256 NA   NA
 7302332 7302333 EcSMS35_2117 EcSMS35_2118     TRUE 0.983 11.000 0.625 0.026   NA
 7302333 7302334 EcSMS35_2118 EcSMS35_2119     TRUE 0.940 21.000 0.533 1.000   NA
 7302334 7302335 EcSMS35_2119 EcSMS35_2120   wrbA FALSE 0.002 629.000 0.000 1.000   NA
 7302335 7302336 EcSMS35_2120 EcSMS35_2121 wrbA   TRUE 0.864 21.000 0.290 NA   NA
 7302337 7302338 EcSMS35_2122 EcSMS35_2123 agp   FALSE 0.006 293.000 0.000 NA   NA
 7302339 7302340 EcSMS35_2124 EcSMS35_2125 cbpA cbpM TRUE 0.984 0.000 0.512 NA   NA
 7302341 7302342 EcSMS35_2126 EcSMS35_2127 torD torA TRUE 0.960 -3.000 0.077 0.045   NA
 7302342 7302343 EcSMS35_2127 EcSMS35_2128 torA torC TRUE 0.989 0.000 0.000 0.045 Y NA
 7302346 7302347 EcSMS35_2131 EcSMS35_2132 torS   FALSE 0.158 83.000 0.000 NA N NA
 7302348 7302349 EcSMS35_2133 EcSMS35_2134     FALSE 0.025 195.000 0.000 NA   NA
 7302349 7302350 EcSMS35_2134 EcSMS35_2135     FALSE 0.131 80.000 0.000 NA   NA
 7302352 7302353 EcSMS35_2136 EcSMS35_2138 appA appB FALSE 0.046 185.000 0.000 1.000   NA
 7302353 7302354 EcSMS35_2138 EcSMS35_2139 appB appC TRUE 0.983 12.000 0.158 0.045 Y NA
 7302354 7302355 EcSMS35_2139 EcSMS35_2140 appC hyaF FALSE 0.146 134.000 0.061 NA   NA
 7302355 7302356 EcSMS35_2140 EcSMS35_2141 hyaF hyaE TRUE 0.991 -3.000 0.769 NA   NA
 7302356 7302357 EcSMS35_2141 EcSMS35_2142 hyaE hyaD TRUE 0.915 -3.000 0.096 NA   NA
 7302357 7302358 EcSMS35_2142 EcSMS35_2143 hyaD hyaC TRUE 0.992 -3.000 0.177 1.000 Y NA
 7302358 7302359 EcSMS35_2143 EcSMS35_2144 hyaC hyaB TRUE 0.987 19.000 0.355 0.045 Y NA
 7302359 7302360 EcSMS35_2144 EcSMS35_2145 hyaB hyaA TRUE 0.992 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 7302361 7302362 EcSMS35_2146 EcSMS35_2147     FALSE 0.501 13.000 0.000 NA   NA
 7302362 7302363 EcSMS35_2147 EcSMS35_2148     FALSE 0.020 206.000 0.000 NA   NA
 7302363 7302364 EcSMS35_2148 EcSMS35_2150   tusE FALSE 0.374 92.000 0.140 NA   NA
 7302366 7302367 EcSMS35_2151 EcSMS35_2152     FALSE 0.364 58.000 0.094 NA   NA
 7302369 7302370 EcSMS35_2154 EcSMS35_2155     FALSE 0.252 40.000 0.000 NA   NA
 7302370 7302371 EcSMS35_2155 EcSMS35_2156   mgsA FALSE 0.197 97.000 0.055 NA   NA
 7302373 7302374 EcSMS35_2158 EcSMS35_2160     TRUE 0.797 10.000 0.090 NA   NA
 7302380 7302381 EcSMS35_2165 EcSMS35_2166   fabA TRUE 0.662 69.000 0.290 1.000 N NA
 7302382 7302383 EcSMS35_2167 EcSMS35_2168   pqiB TRUE 0.986 -3.000 0.531 NA   NA
 7302383 7302384 EcSMS35_2168 EcSMS35_2169 pqiB pqiA TRUE 0.985 5.000 0.819 NA   NA
 7302384 7302385 EcSMS35_2169 EcSMS35_2170 pqiA uup FALSE 0.142 130.000 0.054 NA   NA
 7302385 7302386 EcSMS35_2170 EcSMS35_2171 uup rlmL TRUE 0.746 12.000 0.061 1.000   NA
 7302388 7302389 EcSMS35_2172 EcSMS35_2174   pyrD FALSE 0.090 174.000 0.081 NA   NA
 7302389 7302390 EcSMS35_2174 EcSMS35_2175 pyrD   FALSE 0.187 111.000 0.000 1.000 N NA
 7302390 7302391 EcSMS35_2175 EcSMS35_2176     TRUE 0.988 14.000 0.500 1.000 Y NA
 7302391 7302392 EcSMS35_2176 EcSMS35_2177     TRUE 0.996 11.000 0.667 0.008 Y NA
 7302392 7302393 EcSMS35_2177 EcSMS35_2178     TRUE 0.800 102.000 0.000 0.008 Y NA
 7302393 7302394 EcSMS35_2178 EcSMS35_2179     TRUE 0.973 -9.000 0.000 1.000 Y NA
 7302394 7302395 EcSMS35_2179 EcSMS35_2180     TRUE 0.987 25.000 0.667 1.000 Y NA
 7302395 7302396 EcSMS35_2180 EcSMS35_2181     TRUE 0.919 108.000 0.500 1.000 Y NA
 7302397 7302398 EcSMS35_2182 EcSMS35_2183     TRUE 0.938 -7.000 0.169 1.000   NA
 7302398 7302399 EcSMS35_2183 EcSMS35_2184   ssuD TRUE 0.981 -3.000 0.341 1.000 N NA
 7302399 7302400 EcSMS35_2184 EcSMS35_2185 ssuD ssuC TRUE 0.932 9.000 0.226 1.000 N NA
 7302400 7302401 EcSMS35_2185 EcSMS35_2186 ssuC ssuB TRUE 0.997 -3.000 0.472 1.000 Y NA
 7302402 7302403 EcSMS35_2187 EcSMS35_2188 pepN   FALSE 0.216 36.000 0.006 NA   NA
 7302404 7302405 EcSMS35_2189 EcSMS35_2190 pncB asnC FALSE 0.086 168.000 0.034 1.000 N NA
 7302405 7302406 EcSMS35_2190 EcSMS35_2191 asnC ompF FALSE 0.003 602.000 0.000 1.000 N NA
 7302406 7302407 EcSMS35_2191 EcSMS35_2192 ompF aspC FALSE 0.064 185.000 0.036 1.000 N NA
 7302408 7302409 EcSMS35_2193 EcSMS35_2194     TRUE 0.591 27.000 0.089 NA   NA
 7302409 7302410 EcSMS35_2194 EcSMS35_2195     FALSE 0.305 181.000 0.372 NA   NA
 7302410 7302411 EcSMS35_2195 EcSMS35_2196   mukB FALSE 0.013 261.000 0.000 1.000   NA
 7302411 7302412 EcSMS35_2196 EcSMS35_2197 mukB mukE TRUE 0.991 0.000 0.000 0.001 Y NA
 7302412 7302413 EcSMS35_2197 EcSMS35_2198 mukE mukF TRUE 0.960 -19.000 0.036 NA Y NA
 7302413 7302414 EcSMS35_2198 EcSMS35_2199 mukF smtA TRUE 0.976 -3.000 0.325 NA N NA
 7302416 7302417 EcSMS35_2200 EcSMS35_2202   kdsB FALSE 0.055 154.000 0.023 NA   NA
 7302417 7302418 EcSMS35_2202 EcSMS35_2203 kdsB   TRUE 0.967 -3.000 0.265 NA   NA
 7302418 7302419 EcSMS35_2203 EcSMS35_2204     FALSE 0.174 52.000 0.016 NA   NA
 7302419 7302420 EcSMS35_2204 EcSMS35_2205   lpxK FALSE 0.244 37.000 0.017 NA   NA
 7302420 7302421 EcSMS35_2205 EcSMS35_2206 lpxK msbA TRUE 0.966 -3.000 0.205 1.000 N NA
 7302421 7302422 EcSMS35_2206 EcSMS35_2207 msbA   TRUE 0.687 37.000 0.075 0.073   NA
 7302422 7302423 EcSMS35_2207 EcSMS35_2208   ihfB FALSE 0.026 206.000 0.003 1.000   NA
 7302423 7302424 EcSMS35_2208 EcSMS35_2209 ihfB rpsA FALSE 0.370 160.000 0.292 1.000 N NA
 7302424 7302425 EcSMS35_2209 EcSMS35_2210 rpsA cmk TRUE 0.578 111.000 0.281 1.000 N NA
 7302425 7302426 EcSMS35_2210 EcSMS35_2211 cmk   FALSE 0.057 173.000 0.004 1.000 N NA
 7302426 7302427 EcSMS35_2211 EcSMS35_2212     FALSE 0.135 136.000 0.000 1.000 N NA
 7302427 7302428 EcSMS35_2212 EcSMS35_2213   aroA FALSE 0.121 144.000 0.000 1.000 N NA
 7302428 7302429 EcSMS35_2213 EcSMS35_2214 aroA serC TRUE 0.741 71.000 0.033 1.000 Y NA
 7302429 7302430 EcSMS35_2214 EcSMS35_2215 serC   FALSE 0.020 199.000 0.014 NA   NA
 7302431 7302432 EcSMS35_2216 EcSMS35_2217     FALSE 0.002 406.000 0.000 NA   NA
 7302432 7302433 EcSMS35_2217 EcSMS35_2218   pflB2 TRUE 0.755 55.000 0.345 1.000 N NA
 7302433 7302434 EcSMS35_2218 EcSMS35_2219 pflB2 pflA FALSE 0.102 192.000 0.092 1.000 N NA
 7302435 7302436 EcSMS35_2220 EcSMS35_2221     FALSE 0.024 210.000 0.000 NA N NA
 7302437 7302438 EcSMS35_2222 EcSMS35_2223     FALSE 0.051 156.000 0.000 NA   NA
 7302439 7302440 EcSMS35_2224 EcSMS35_2225 dmsC1 dmsB_2 TRUE 0.970 2.000 0.333 1.000   NA
 7302440 7302441 EcSMS35_2225 EcSMS35_2226 dmsB_2 dmsA TRUE 0.985 11.000 0.172 0.045 Y NA
 7302441 7302442 EcSMS35_2226 EcSMS35_2227 dmsA serS FALSE 0.022 239.000 0.000 1.000 N NA
 7302442 7302443 EcSMS35_2227 EcSMS35_2228 serS   FALSE 0.497 91.000 0.078 0.083 N NA
 7302443 7302444 EcSMS35_2228 EcSMS35_2229   lolA TRUE 0.889 11.000 0.167 1.000 N NA
 7302444 7302445 EcSMS35_2229 EcSMS35_2230 lolA ftsK FALSE 0.386 159.000 0.305 1.000 N NA
 7302445 7302446 EcSMS35_2230 EcSMS35_2231 ftsK lrp TRUE 0.556 135.000 0.345 1.000 N NA
 7302446 7302447 EcSMS35_2231 EcSMS35_2232 lrp   FALSE 0.003 363.000 0.000 NA   NA
 7302448 7302449 EcSMS35_2233 EcSMS35_2234 trxB cydD TRUE 0.670 123.000 0.049 1.000 Y NA
 7302449 7302450 EcSMS35_2234 EcSMS35_2235 cydD cudC TRUE 0.998 1.000 0.631 0.005 Y NA
 7302450 7302451 EcSMS35_2235 EcSMS35_2236 cudC aat TRUE 0.859 42.000 0.049 1.000 Y NA
 7302451 7302452 EcSMS35_2236 EcSMS35_2237 aat infA FALSE 0.012 285.000 0.020 1.000 N NA
 7302452 7302453 EcSMS35_2237 EcSMS35_2238 infA   FALSE 0.009 253.000 0.000 NA   NA
 7302454 7302455 EcSMS35_2239 EcSMS35_2240     FALSE 0.129 85.000 0.000 NA   NA
 7302455 7302456 EcSMS35_2240 EcSMS35_2241     FALSE 0.442 17.000 0.000 NA   NA
 7302456 7302457 EcSMS35_2241 EcSMS35_2242     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7302457 7302458 EcSMS35_2242 EcSMS35_2243     FALSE 0.134 77.000 0.000 NA   NA
 7302458 7302459 EcSMS35_2243 EcSMS35_2244     TRUE 0.531 -97.000 0.000 NA   NA
 7302459 7302460 EcSMS35_2244 EcSMS35_2245     FALSE 0.425 19.000 0.000 NA   NA
 7302460 7302461 EcSMS35_2245 EcSMS35_2246     FALSE 0.152 63.000 0.000 NA   NA
 7302461 7302462 EcSMS35_2246 EcSMS35_2247     FALSE 0.452 16.000 0.000 NA   NA
 7302462 7302463 EcSMS35_2247 EcSMS35_2248     FALSE 0.127 92.000 0.000 NA   NA
 7302463 7302464 EcSMS35_2248 EcSMS35_2249   flu1 FALSE 0.004 327.000 0.000 NA   NA
 7302464 7302465 EcSMS35_2249 EcSMS35_2250 flu1   TRUE 0.548 11.000 0.000 NA   NA
 7302465 7302466 EcSMS35_2250 EcSMS35_2251     FALSE 0.010 248.000 0.000 NA   NA
 7302468 7302469 EcSMS35_2252 EcSMS35_2254     TRUE 0.548 11.000 0.000 NA   NA
 7302469 7302470 EcSMS35_2254 EcSMS35_2255     FALSE 0.085 130.000 0.000 NA   NA
 7302471 7302472 EcSMS35_2256 EcSMS35_2257     FALSE 0.001 1114.000 0.000 NA N NA
 7302473 7302474 EcSMS35_2258 EcSMS35_2259     TRUE 0.935 -3.000 0.000 0.061   NA
 7302474 7302475 EcSMS35_2259 EcSMS35_2260     TRUE 0.712 -7.000 0.000 NA   NA
 7302475 7302476 EcSMS35_2260 EcSMS35_2261     FALSE 0.006 293.000 0.000 NA   NA
 7302476 7302477 EcSMS35_2261 EcSMS35_2262     FALSE 0.216 47.000 0.000 NA   NA
 7302477 7302478 EcSMS35_2262 EcSMS35_2263     TRUE 0.606 122.000 0.000 NA Y NA
 7302478 7302479 EcSMS35_2263 EcSMS35_2264     FALSE 0.504 13.000 0.022 NA   NA
 7302479 7302480 EcSMS35_2264 EcSMS35_2265   glf TRUE 0.801 -3.000 0.028 NA   NA
 7302480 7302481 EcSMS35_2265 EcSMS35_2266 glf   TRUE 0.922 19.000 0.016 1.000 Y NA
 7302481 7302482 EcSMS35_2266 EcSMS35_2267   rfbB TRUE 0.977 15.000 0.273 1.000 Y NA
 7302482 7302483 EcSMS35_2267 EcSMS35_2268 rfbB   TRUE 0.997 0.000 0.385 0.082 Y NA
 7302484 7302485 EcSMS35_2269 EcSMS35_2270     FALSE 0.003 347.000 0.000 NA   NA
 7302485 7302486 EcSMS35_2270 EcSMS35_2271     FALSE 0.131 80.000 0.000 NA   NA
 7302486 7302487 EcSMS35_2271 EcSMS35_2272     FALSE 0.351 26.000 0.000 NA   NA
 7302488 7302489 EcSMS35_2273 EcSMS35_2274     FALSE 0.053 155.000 0.000 NA   NA
 7302489 7302490 EcSMS35_2274 EcSMS35_2275     FALSE 0.001 1210.000 0.000 NA   NA
 7302492 7302493 EcSMS35_2277 EcSMS35_2278   clpA FALSE 0.004 458.000 0.000 1.000 N NA
 7302493 7302494 EcSMS35_2278 EcSMS35_2279 clpA clpS TRUE 0.911 31.000 0.596 NA   NA
 7302496 7302497 EcSMS35_2281 EcSMS35_2282 macB macA TRUE 0.995 -3.000 0.789 0.094 N NA
 7302501 7302502 EcSMS35_2286 EcSMS35_2287   dusC FALSE 0.024 231.000 0.000 1.000 N NA
 7302503 7302504 EcSMS35_2288 EcSMS35_2289     TRUE 0.980 -3.000 0.340 1.000   NA
 7302504 7302505 EcSMS35_2289 EcSMS35_2290   cdd FALSE 0.419 130.000 0.198 1.000 N NA
 7302505 7302506 EcSMS35_2290 EcSMS35_2291 cdd sanA FALSE 0.087 150.000 0.045 NA   NA
 7302506 7302507 EcSMS35_2291 EcSMS35_2292 sanA   TRUE 0.684 3.000 0.019 NA   NA
 7302507 7302508 EcSMS35_2292 EcSMS35_2293     FALSE 0.033 194.000 0.036 NA   NA
 7302508 7302509 EcSMS35_2293 EcSMS35_2294     TRUE 0.894 -6.000 0.062 1.000 N NA
 7302510 7302511 EcSMS35_2295 EcSMS35_2296 mglC mglA TRUE 0.994 16.000 0.905 1.000 Y NA
 7302511 7302512 EcSMS35_2296 EcSMS35_2297 mglA mglB TRUE 0.881 61.000 0.250 NA Y NA
 7302512 7302513 EcSMS35_2297 EcSMS35_2298 mglB galS FALSE 0.008 280.000 0.000 NA N NA
 7302513 7302514 EcSMS35_2298 EcSMS35_2299 galS   TRUE 0.578 142.000 0.500 NA   NA
 7302514 7302515 EcSMS35_2299 EcSMS35_2300   folE TRUE 0.960 17.000 0.719 NA   NA
 7302517 7302518 EcSMS35_2302 EcSMS35_2303 cirA lysP FALSE 0.006 358.000 0.000 1.000 N NA
 7302518 7302519 EcSMS35_2303 EcSMS35_2304 lysP   FALSE 0.039 205.000 0.000 1.000 N NA
 7302520 7302521 EcSMS35_2305 EcSMS35_2306   nfo FALSE 0.184 74.000 0.040 NA   NA
 7302521 7302522 EcSMS35_2306 EcSMS35_2307 nfo   TRUE 0.694 3.000 0.004 NA N NA
 7302523 7302524 EcSMS35_2308 EcSMS35_2309   rihB TRUE 0.697 100.000 0.056 NA Y NA
 7302526 7302527 EcSMS35_2311 EcSMS35_2312     FALSE 0.155 94.000 0.000 NA N NA
 7302527 7302528 EcSMS35_2312 EcSMS35_2313     TRUE 0.660 -12.000 0.008 NA N NA
 7302528 7302529 EcSMS35_2313 EcSMS35_2314   fruA FALSE 0.029 424.000 0.000 NA Y NA
 7302529 7302530 EcSMS35_2314 EcSMS35_2315 fruA fruK TRUE 0.988 17.000 0.562 1.000 Y NA
 7302530 7302531 EcSMS35_2315 EcSMS35_2316 fruK fruB TRUE 0.989 0.000 0.112 1.000 Y NA
 7302532 7302533 EcSMS35_2317 EcSMS35_2319   setB FALSE 0.142 71.000 0.000 NA   NA
 7302535 7302536 EcSMS35_2320 EcSMS35_2321     FALSE 0.027 223.000 0.000 1.000 N NA
 7302536 7302537 EcSMS35_2321 EcSMS35_2322     FALSE 0.360 118.000 0.167 NA   NA
 7302537 7302538 EcSMS35_2322 EcSMS35_2323     TRUE 0.747 39.000 0.275 NA   NA
 7302538 7302539 EcSMS35_2323 EcSMS35_2324   spr FALSE 0.002 412.000 0.000 NA   NA
 7302539 7302540 EcSMS35_2324 EcSMS35_2325 spr   FALSE 0.200 181.000 0.219 NA N NA
 7302540 7302541 EcSMS35_2325 EcSMS35_2326     TRUE 0.684 82.000 0.394 NA N NA
 7302541 7302542 EcSMS35_2326 EcSMS35_2327     TRUE 0.994 1.000 0.848 0.049   NA
 7302542 7302543 EcSMS35_2327 EcSMS35_2328     TRUE 0.995 0.000 0.833 0.049   NA
 7302543 7302544 EcSMS35_2328 EcSMS35_2329     TRUE 0.989 2.000 0.758 1.000   NA
 7302545 7302546 EcSMS35_2330 EcSMS35_2331   bcr FALSE 0.004 334.000 0.000 NA   NA
 7302546 7302547 EcSMS35_2331 EcSMS35_2332 bcr rsuA TRUE 0.523 28.000 0.036 1.000 N NA
 7302548 7302549 EcSMS35_2333 EcSMS35_2334   rplY FALSE 0.349 125.000 0.024 0.016 N NA
 7302550 7302551 EcSMS35_2335 EcSMS35_2336 ndpA   FALSE 0.229 45.000 0.000 NA   NA
 7302552 7302553 EcSMS35_2337 EcSMS35_2338     FALSE 0.499 20.000 0.040 NA   NA
 7302553 7302554 EcSMS35_2338 EcSMS35_2339     FALSE 0.138 74.000 0.000 NA   NA
 7302557 7302558 EcSMS35_2342 EcSMS35_2343   dsbE TRUE 0.997 -3.000 0.578 1.000 Y NA
 7302558 7302559 EcSMS35_2343 EcSMS35_2344 dsbE ccmF TRUE 0.999 -3.000 0.804 0.002 Y NA
 7302559 7302560 EcSMS35_2344 EcSMS35_2345 ccmF ccmE TRUE 0.996 -3.000 0.211 0.002 Y NA
 7302560 7302561 EcSMS35_2345 EcSMS35_2346 ccmE ccmD TRUE 0.981 -3.000 0.344 1.000 N NA
 7302561 7302562 EcSMS35_2346 EcSMS35_2347 ccmD ccmC TRUE 0.988 -3.000 0.501 1.000 N NA
 7302562 7302563 EcSMS35_2347 EcSMS35_2348 ccmC ccmB TRUE 0.983 42.000 0.501 0.001 Y NA
 7302563 7302564 EcSMS35_2348 EcSMS35_2349 ccmB ccmA TRUE 0.998 -3.000 0.503 0.002 Y NA
 7302564 7302565 EcSMS35_2349 EcSMS35_2350 ccmA napC TRUE 0.642 19.000 0.043 1.000 N NA
 7302565 7302566 EcSMS35_2350 EcSMS35_2351 napC napB TRUE 0.995 10.000 0.490 0.003 Y NA
 7302566 7302567 EcSMS35_2351 EcSMS35_2352 napB napH TRUE 0.997 -3.000 0.316 0.009 Y NA
 7302567 7302568 EcSMS35_2352 EcSMS35_2353 napH napG TRUE 0.991 -13.000 0.795 0.045   NA
 7302568 7302569 EcSMS35_2353 EcSMS35_2354 napG napA TRUE 0.963 7.000 0.243 0.045   NA
 7302569 7302570 EcSMS35_2354 EcSMS35_2355 napA napD TRUE 0.993 -3.000 0.875 NA N NA
 7302570 7302571 EcSMS35_2355 EcSMS35_2356 napD napF TRUE 0.928 -10.000 0.209 NA   NA
 7302572 7302573 EcSMS35_2357 EcSMS35_2358   eco FALSE 0.097 135.000 0.034 NA   NA
 7302574 7302575 EcSMS35_2359 EcSMS35_2360 mqo   FALSE 0.025 218.000 0.000 1.000   NA
 7302575 7302576 EcSMS35_2360 EcSMS35_2361   alkB FALSE 0.355 76.000 0.076 1.000 N NA
 7302576 7302577 EcSMS35_2361 EcSMS35_2362 alkB ada TRUE 0.944 0.000 0.015 0.011 N NA
 7302577 7302578 EcSMS35_2362 EcSMS35_2363 ada apbE FALSE 0.224 74.000 0.019 1.000 N NA
 7302578 7302579 EcSMS35_2363 EcSMS35_2364 apbE ompC FALSE 0.278 112.000 0.066 1.000 N NA
 7302580 7302581 EcSMS35_2365 EcSMS35_2366 yojN rcsB TRUE 0.988 17.000 0.558 1.000 Y NA
 7302583 7302584 EcSMS35_2368 EcSMS35_2369 atoS atoC TRUE 0.997 -3.000 0.364 0.014 Y NA
 7302584 7302585 EcSMS35_2369 EcSMS35_2370 atoC pcaI FALSE 0.214 196.000 0.273 1.000 N NA
 7302585 7302586 EcSMS35_2370 EcSMS35_2371 pcaI   TRUE 0.999 0.000 0.800 0.001 Y NA
 7302586 7302587 EcSMS35_2371 EcSMS35_2372     TRUE 0.992 -3.000 0.174 1.000 Y NA
 7302587 7302588 EcSMS35_2372 EcSMS35_2373   atoB TRUE 0.938 31.000 0.174 1.000 Y NA
 7302589 7302590 EcSMS35_2374 EcSMS35_2375     TRUE 0.647 5.000 0.000 NA   NA
 7302590 7302591 EcSMS35_2375 EcSMS35_2376     TRUE 0.936 1.000 0.182 NA   NA
 7302591 7302592 EcSMS35_2376 EcSMS35_2377     TRUE 0.585 24.000 0.074 NA   NA
 7302592 7302593 EcSMS35_2377 EcSMS35_2378     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7302593 7302594 EcSMS35_2378 EcSMS35_2379   gyrA FALSE 0.061 149.000 0.000 NA   NA
 7302594 7302595 EcSMS35_2379 EcSMS35_2380 gyrA   FALSE 0.003 500.000 0.000 1.000 N NA
 7302595 7302596 EcSMS35_2380 EcSMS35_2381     TRUE 0.968 13.000 0.667 NA N NA
 7302597 7302598 EcSMS35_2382 EcSMS35_2383   ubiG FALSE 0.194 78.000 0.004 1.000 N NA
 7302600 7302601 EcSMS35_2385 EcSMS35_2386 nrdA nrdB TRUE 0.834 95.000 0.000 0.001 Y NA
 7302601 7302602 EcSMS35_2386 EcSMS35_2387 nrdB   TRUE 0.876 0.000 0.034 1.000 N NA
 7302603 7302604 EcSMS35_2388 EcSMS35_2389     FALSE 0.130 81.000 0.000 NA   NA
 7302606 7302607 EcSMS35_2391 EcSMS35_2392 glpQ glpT TRUE 0.969 5.000 0.396 1.000 N NA
 7302608 7302609 EcSMS35_2393 EcSMS35_2394 glpA glpB TRUE 0.993 -10.000 0.650 0.001 N NA
 7302609 7302610 EcSMS35_2394 EcSMS35_2395 glpB glpC TRUE 0.995 -3.000 0.547 0.001 N NA
 7302610 7302611 EcSMS35_2395 EcSMS35_2396 glpC   FALSE 0.365 25.000 0.000 NA   NA
 7302611 7302612 EcSMS35_2396 EcSMS35_2397     FALSE 0.236 43.000 0.000 NA   NA
 7302612 7302613 EcSMS35_2397 EcSMS35_2398     FALSE 0.501 13.000 0.000 NA   NA
 7302614 7302615 EcSMS35_2399 EcSMS35_2400     TRUE 0.969 18.000 0.250 NA Y NA
 7302615 7302616 EcSMS35_2400 EcSMS35_2401     FALSE 0.311 57.000 0.060 NA N NA
 7302616 7302617 EcSMS35_2401 EcSMS35_2402     TRUE 0.781 15.000 0.090 1.000 N NA
 7302617 7302618 EcSMS35_2402 EcSMS35_2403     FALSE 0.024 220.000 0.000 1.000   NA
 7302618 7302619 EcSMS35_2403 EcSMS35_2404     FALSE 0.147 100.000 0.005 1.000   NA
 7302622 7302623 EcSMS35_2407 EcSMS35_2408 arnB arnC TRUE 0.992 4.000 0.378 NA Y NA
 7302623 7302624 EcSMS35_2408 EcSMS35_2409 arnC arnA TRUE 0.991 0.000 0.220 NA Y NA
 7302624 7302625 EcSMS35_2409 EcSMS35_2410 arnA   TRUE 0.997 -3.000 0.447 1.000 Y NA
 7302625 7302626 EcSMS35_2410 EcSMS35_2411   arnT TRUE 0.871 0.000 0.031 1.000 N NA
 7302626 7302627 EcSMS35_2411 EcSMS35_2412 arnT   TRUE 0.957 -3.000 0.158 1.000 N NA
 7302627 7302628 EcSMS35_2412 EcSMS35_2414     TRUE 0.958 0.000 0.226 NA   NA
 7302629 7302630 EcSMS35_2413 EcSMS35_2415 pmrD menE FALSE 0.085 110.000 0.005 NA   NA
 7302630 7302631 EcSMS35_2415 EcSMS35_2416 menE menC TRUE 0.989 -3.000 0.283 0.001 N NA
 7302631 7302632 EcSMS35_2416 EcSMS35_2417 menC menB TRUE 0.996 0.000 0.171 0.001 Y NA
 7302632 7302633 EcSMS35_2417 EcSMS35_2418 menB   TRUE 0.884 15.000 0.280 NA   NA
 7302633 7302634 EcSMS35_2418 EcSMS35_2419   menD TRUE 0.977 -3.000 0.355 NA   NA
 7302634 7302635 EcSMS35_2419 EcSMS35_2420 menD menF TRUE 0.881 89.000 0.281 1.000 Y NA
 7302635 7302636 EcSMS35_2420 EcSMS35_2421 menF   FALSE 0.183 79.000 0.043 NA   NA
 7302636 7302637 EcSMS35_2421 EcSMS35_2422     FALSE 0.335 55.000 0.077 NA   NA
 7302641 7302642 EcSMS35_2426 EcSMS35_2427     TRUE 0.672 -10.000 0.000 NA   NA
 7302643 7302644 EcSMS35_2428 EcSMS35_2429     FALSE 0.118 100.000 0.000 NA   NA
 7302645 7302646 EcSMS35_2430 EcSMS35_2431 nuoN nuoM TRUE 0.996 7.000 0.437 0.002 Y NA
 7302646 7302647 EcSMS35_2431 EcSMS35_2432 nuoM nuoL TRUE 0.926 164.000 0.713 0.002 Y NA
 7302647 7302648 EcSMS35_2432 EcSMS35_2433 nuoL nuoK TRUE 0.994 3.000 0.211 0.006 Y NA
 7302648 7302649 EcSMS35_2433 EcSMS35_2434 nuoK nuoJ TRUE 0.997 -3.000 0.269 0.003 Y NA
 7302649 7302650 EcSMS35_2434 EcSMS35_2435 nuoJ nuoI TRUE 0.993 12.000 0.428 0.006 Y NA
 7302650 7302651 EcSMS35_2435 EcSMS35_2436 nuoI nuoH TRUE 0.992 15.000 0.423 0.006 Y NA
 7302651 7302652 EcSMS35_2436 EcSMS35_2437 nuoH nuoG TRUE 0.999 -3.000 0.664 0.006 Y NA
 7302652 7302653 EcSMS35_2437 EcSMS35_2438 nuoG nuoF TRUE 0.935 53.000 0.180 0.006 Y NA
 7302653 7302654 EcSMS35_2438 EcSMS35_2439 nuoF nuoE TRUE 0.996 -3.000 0.186 0.006 Y NA
 7302654 7302655 EcSMS35_2439 EcSMS35_2440 nuoE nuoC TRUE 0.997 3.000 0.407 0.006 Y NA
 7302655 7302656 EcSMS35_2440 EcSMS35_2441 nuoC nuoB TRUE 0.973 94.000 0.691 0.003 Y NA
 7302656 7302657 EcSMS35_2441 EcSMS35_2442 nuoB nuoA TRUE 0.990 16.000 0.377 0.003 Y NA
 7302660 7302661 EcSMS35_2445 EcSMS35_2446   yfbR FALSE 0.376 84.000 0.104 1.000   NA
 7302662 7302663 EcSMS35_2447 EcSMS35_2448   yfbT TRUE 0.632 87.000 0.308 1.000   NA
 7302663 7302664 EcSMS35_2448 EcSMS35_2449 yfbT   TRUE 0.940 11.000 0.375 NA   NA
 7302664 7302665 EcSMS35_2449 EcSMS35_2450     FALSE 0.500 83.000 0.221 NA   NA
 7302665 7302666 EcSMS35_2450 EcSMS35_2451     FALSE 0.144 69.000 0.000 NA   NA
 7302667 7302668 EcSMS35_2452 EcSMS35_2453 ackA pta TRUE 0.824 75.000 0.634 1.000   NA
 7302668 7302669 EcSMS35_2453 EcSMS35_2454 pta   FALSE 0.040 169.000 0.000 NA   NA
 7302670 7302671 EcSMS35_2455 EcSMS35_2456     TRUE 0.684 58.000 0.143 0.009   NA
 7302671 7302672 EcSMS35_2456 EcSMS35_2457     FALSE 0.372 56.000 0.092 NA   NA
 7302673 7302674 EcSMS35_2458 EcSMS35_2459   folX FALSE 0.251 57.000 0.012 1.000 N NA
 7302674 7302675 EcSMS35_2459 EcSMS35_2460 folX   TRUE 0.759 21.000 0.122 1.000   NA
 7302676 7302677 EcSMS35_2461 EcSMS35_2462   hisP FALSE 0.024 197.000 0.000 NA   NA
 7302677 7302678 EcSMS35_2462 EcSMS35_2463 hisP hisM TRUE 0.995 8.000 0.643 1.000 Y NA
 7302678 7302679 EcSMS35_2463 EcSMS35_2464 hisM hisQ TRUE 0.999 -3.000 0.900 0.014 Y NA
 7302679 7302680 EcSMS35_2464 EcSMS35_2465 hisQ hisJ TRUE 0.974 90.000 0.833 0.049 Y NA
 7302680 7302681 EcSMS35_2465 EcSMS35_2466 hisJ argT FALSE 0.306 221.000 0.000 0.012 Y NA
 7302681 7302682 EcSMS35_2466 EcSMS35_2467 argT ubiX FALSE 0.014 266.000 0.000 1.000 N NA
 7302682 7302683 EcSMS35_2467 EcSMS35_2468 ubiX purF FALSE 0.289 95.000 0.056 1.000 N NA
 7302683 7302684 EcSMS35_2468 EcSMS35_2469 purF cvpA TRUE 0.775 37.000 0.262 1.000   NA
 7302684 7302685 EcSMS35_2469 EcSMS35_2470 cvpA   FALSE 0.041 236.000 0.116 NA   NA
 7302685 7302686 EcSMS35_2470 EcSMS35_2471   folC TRUE 0.931 -10.000 0.216 NA   NA
 7302686 7302687 EcSMS35_2471 EcSMS35_2472 folC accD TRUE 0.733 70.000 0.383 1.000 N NA
 7302687 7302688 EcSMS35_2472 EcSMS35_2473 accD   FALSE 0.050 156.000 0.020 NA   NA
 7302688 7302689 EcSMS35_2473 EcSMS35_2474   truA FALSE 0.167 83.000 0.038 NA   NA
 7302689 7302690 EcSMS35_2474 EcSMS35_2475 truA   TRUE 0.884 0.000 0.040 1.000 N NA
 7302694 7302695 EcSMS35_2478 EcSMS35_2480   fabB FALSE 0.016 232.000 0.000 NA N NA
 7302697 7302698 EcSMS35_2482 EcSMS35_2483     TRUE 0.853 34.000 0.425 NA   NA
 7302698 7302699 EcSMS35_2483 EcSMS35_2484     TRUE 0.935 0.000 0.153 NA   NA
 7302699 7302700 EcSMS35_2484 EcSMS35_2485   mepA TRUE 0.949 0.000 0.160 1.000   NA
 7302700 7302701 EcSMS35_2485 EcSMS35_2486 mepA aroC TRUE 0.796 4.000 0.025 1.000 N NA
 7302701 7302702 EcSMS35_2486 EcSMS35_2487 aroC prmB TRUE 0.582 35.000 0.081 1.000 N NA
 7302703 7302704 EcSMS35_2488 EcSMS35_2489     FALSE 0.129 86.000 0.000 NA   NA
 7302704 7302705 EcSMS35_2489 EcSMS35_2490     TRUE 0.973 -16.000 0.556 NA   NA
 7302706 7302707 EcSMS35_2491 EcSMS35_2492     TRUE 0.717 2.000 0.000 NA   NA
 7302707 7302708 EcSMS35_2492 EcSMS35_2493     TRUE 0.997 -3.000 0.286 0.008 Y NA
 7302708 7302709 EcSMS35_2493 EcSMS35_2494     TRUE 0.986 18.000 0.571 NA Y NA
 7302709 7302710 EcSMS35_2494 EcSMS35_2495     TRUE 0.977 17.000 0.333 NA Y NA
 7302710 7302711 EcSMS35_2495 EcSMS35_2496     TRUE 0.993 20.000 1.000 1.000 Y NA
 7302711 7302712 EcSMS35_2496 EcSMS35_2497     TRUE 0.968 81.000 1.000 1.000 Y NA
 7302712 7302713 EcSMS35_2497 EcSMS35_2498   sixA FALSE 0.003 568.000 0.000 1.000 N NA
 7302715 7302716 EcSMS35_2500 EcSMS35_2501 fadJ fadI TRUE 0.996 0.000 0.430 1.000 Y NA
 7302716 7302717 EcSMS35_2501 EcSMS35_2502 fadI   FALSE 0.064 181.000 0.061 NA   NA
 7302718 7302719 EcSMS35_2503 EcSMS35_2504     FALSE 0.003 367.000 0.000 NA   NA
 7302720 7302721 EcSMS35_2505 EcSMS35_2506     FALSE 0.351 26.000 0.000 NA   NA
 7302722 7302723 EcSMS35_2507 EcSMS35_2508     FALSE 0.137 75.000 0.000 NA   NA
 7302724 7302725 EcSMS35_2509 EcSMS35_2510     FALSE 0.296 48.000 0.000 1.000   NA
 7302725 7302726 EcSMS35_2510 EcSMS35_2511     FALSE 0.520 25.000 0.000 1.000 N NA
 7302726 7302727 EcSMS35_2511 EcSMS35_2512     FALSE 0.008 318.000 0.000 1.000 N NA
 7302730 7302731 EcSMS35_2515 EcSMS35_2516   dsdA TRUE 0.904 33.000 0.083 1.000 Y NA
 7302732 7302733 EcSMS35_2517 EcSMS35_2518 emrY emrK TRUE 0.994 0.000 1.000 1.000   NA
 7302734 7302735 EcSMS35_2519 EcSMS35_2520 evgA evgS FALSE 0.335 215.000 0.000 0.011 Y NA
 7302736 7302737 EcSMS35_2521 EcSMS35_2522     FALSE 0.201 74.000 0.000 1.000   NA
 7302737 7302738 EcSMS35_2522 EcSMS35_2523     FALSE 0.209 69.000 0.000 1.000   NA
 7302738 7302739 EcSMS35_2523 EcSMS35_2524   frc TRUE 0.542 54.000 0.134 1.000 N NA
 7302739 7302740 EcSMS35_2524 EcSMS35_2525 frc   FALSE 0.002 512.000 0.000 NA   NA
 7302740 7302741 EcSMS35_2525 EcSMS35_2526     FALSE 0.013 229.000 0.000 NA   NA
 7302744 7302745 EcSMS35_2529 EcSMS35_2530     FALSE 0.005 311.000 0.000 NA   NA
 7302747 7302748 EcSMS35_2532 EcSMS35_2533     TRUE 0.995 15.000 0.744 0.013 Y NA
 7302748 7302749 EcSMS35_2533 EcSMS35_2534     TRUE 0.967 13.000 0.051 0.074 Y NA
 7302750 7302751 EcSMS35_2535 EcSMS35_2536 fryA   TRUE 0.984 25.000 0.571 1.000 Y NA
 7302751 7302752 EcSMS35_2536 EcSMS35_2537   ypdF TRUE 0.938 0.000 0.009 0.017 N NA
 7302752 7302753 EcSMS35_2537 EcSMS35_2538 ypdF fryC TRUE 0.594 15.000 0.011 1.000 N NA
 7302753 7302754 EcSMS35_2538 EcSMS35_2539 fryC   TRUE 0.995 22.000 0.875 0.012 Y NA
 7302754 7302755 EcSMS35_2539 EcSMS35_2540   glk FALSE 0.282 219.000 0.091 1.000 Y NA
 7302756 7302757 EcSMS35_2541 EcSMS35_2542     FALSE 0.106 115.000 0.000 NA   NA
 7302760 7302761 EcSMS35_2545 EcSMS35_2546     FALSE 0.020 207.000 0.000 NA   NA
 7302761 7302762 EcSMS35_2546 EcSMS35_2547     FALSE 0.255 39.000 0.000 NA   NA
 7302763 7302764 EcSMS35_2548 EcSMS35_2549     TRUE 0.933 2.000 0.000 0.005   NA
 7302768 7302769 EcSMS35_2553 EcSMS35_2554     FALSE 0.095 124.000 0.000 NA   NA
 7302769 7302770 EcSMS35_2554 EcSMS35_2555     FALSE 0.233 44.000 0.000 NA   NA
 7302770 7302771 EcSMS35_2555 EcSMS35_2556     FALSE 0.229 45.000 0.000 NA   NA
 7302771 7302772 EcSMS35_2556 EcSMS35_2557     TRUE 0.670 4.000 0.000 NA   NA
 7302773 7302774 EcSMS35_2558 EcSMS35_2559 xapR   FALSE 0.466 42.000 0.087 NA   NA
 7302774 7302775 EcSMS35_2559 EcSMS35_2560   xapB TRUE 0.606 53.000 0.222 NA   NA
 7302775 7302776 EcSMS35_2560 EcSMS35_2561 xapB xapA FALSE 0.439 61.000 0.111 1.000   NA
 7302780 7302781 EcSMS35_2564 EcSMS35_2566   ligA TRUE 0.698 2.000 0.017 NA   NA
 7302781 7302782 EcSMS35_2566 EcSMS35_2567 ligA zipA FALSE 0.202 71.000 0.002 1.000 N NA
 7302783 7302784 EcSMS35_2568 EcSMS35_2569 cysZ cysK FALSE 0.460 185.000 0.122 1.000 Y NA
 7302784 7302785 EcSMS35_2569 EcSMS35_2570 cysK ptsH FALSE 0.004 384.000 0.019 1.000 N NA
 7302785 7302786 EcSMS35_2570 EcSMS35_2571 ptsH ptsI TRUE 0.896 45.000 0.000 0.012 Y NA
 7302786 7302787 EcSMS35_2571 EcSMS35_2572 ptsI crr TRUE 0.905 41.000 0.000 0.012 Y NA
 7302787 7302788 EcSMS35_2572 EcSMS35_2573 crr   FALSE 0.175 119.000 0.000 1.000 N NA
 7302791 7302792 EcSMS35_2576 EcSMS35_2577 cysM cysA FALSE 0.184 134.000 0.049 1.000 N NA
 7302792 7302793 EcSMS35_2577 EcSMS35_2578 cysA cysW TRUE 0.986 -10.000 0.180 1.000 Y NA
 7302793 7302794 EcSMS35_2578 EcSMS35_2579 cysW cysT TRUE 0.995 0.000 0.583 0.000 N NA
 7302794 7302795 EcSMS35_2579 EcSMS35_2580 cysT cysP TRUE 0.993 0.000 0.479 0.002 N NA
 7302795 7302796 EcSMS35_2580 EcSMS35_2581 cysP ucpA FALSE 0.113 158.000 0.043 1.000 N NA
 7302796 7302797 EcSMS35_2581 EcSMS35_2582 ucpA   FALSE 0.153 129.000 0.000 1.000 N NA
 7302798 7302799 EcSMS35_2583 EcSMS35_2584 murQ murP TRUE 0.921 4.000 0.158 1.000   NA
 7302799 7302800 EcSMS35_2584 EcSMS35_2585 murP   TRUE 0.923 5.000 0.167 1.000 N NA
 7302801 7302802 EcSMS35_2586 EcSMS35_2587     TRUE 0.609 96.000 0.333 NA   NA
 7302802 7302803 EcSMS35_2587 EcSMS35_2588     TRUE 0.529 61.000 0.204 NA   NA
 7302803 7302804 EcSMS35_2588 EcSMS35_2589     FALSE 0.221 89.000 0.059 NA   NA
 7302805 7302806 EcSMS35_2590 EcSMS35_2591 amiA hemF TRUE 0.797 4.000 0.025 1.000 N NA
 7302807 7302808 EcSMS35_2592 EcSMS35_2593     TRUE 0.709 46.000 0.250 NA N NA
 7302808 7302809 EcSMS35_2593 EcSMS35_2594     TRUE 0.788 13.000 0.106 NA N NA
 7302809 7302810 EcSMS35_2594 EcSMS35_2595   eutC TRUE 0.957 10.000 0.000 1.000 Y NA
 7302810 7302811 EcSMS35_2595 EcSMS35_2596 eutC eutB TRUE 0.962 21.000 0.000 0.000 Y NA
 7302811 7302812 EcSMS35_2596 EcSMS35_2597 eutB eutA TRUE 0.939 12.000 0.000 NA Y NA
 7302812 7302813 EcSMS35_2597 EcSMS35_2598 eutA eutH TRUE 0.996 -3.000 0.400 NA Y NA
 7302813 7302814 EcSMS35_2598 EcSMS35_2599 eutH eutG FALSE 0.267 170.000 0.222 1.000 N NA
 7302814 7302815 EcSMS35_2599 EcSMS35_2600 eutG eutJ TRUE 0.982 -10.000 0.556 1.000 N NA
 7302815 7302816 EcSMS35_2600 EcSMS35_2601 eutJ eutE TRUE 0.951 11.000 0.375 1.000 N NA
 7302816 7302817 EcSMS35_2601 EcSMS35_2602 eutE eutN TRUE 0.992 12.000 0.667 NA Y NA
 7302817 7302818 EcSMS35_2602 EcSMS35_2603 eutN eutM TRUE 0.798 107.000 0.182 NA Y NA
 7302818 7302819 EcSMS35_2603 EcSMS35_2604 eutM eutD TRUE 0.961 39.000 0.455 NA Y NA
 7302819 7302820 EcSMS35_2604 EcSMS35_2605 eutD eutT TRUE 0.938 -3.000 0.095 1.000 N NA
 7302820 7302821 EcSMS35_2605 EcSMS35_2606 eutT   TRUE 0.992 -3.000 0.214 NA Y NA
 7302821 7302822 EcSMS35_2606 EcSMS35_2607   eutP TRUE 0.977 -25.000 0.167 NA Y NA
 7302822 7302823 EcSMS35_2607 EcSMS35_2608 eutP   TRUE 0.943 13.000 0.000 1.000 Y NA
 7302823 7302824 EcSMS35_2608 EcSMS35_2609   maeB FALSE 0.018 293.000 0.070 1.000 N NA
 7302825 7302826 EcSMS35_2610 EcSMS35_2611 tal1 tktB TRUE 0.991 20.000 0.739 1.000 Y NA
 7302827 7302828 EcSMS35_2612 EcSMS35_2613     TRUE 0.532 126.000 0.333 NA   NA
 7302828 7302829 EcSMS35_2613 EcSMS35_2614   aegA1 TRUE 0.524 68.000 0.167 1.000 N NA
 7302830 7302831 EcSMS35_2615 EcSMS35_2616 narQ acrD FALSE 0.310 164.000 0.133 0.071 N NA
 7302831 7302832 EcSMS35_2616 EcSMS35_2617 acrD   FALSE 0.003 539.000 0.000 1.000 N NA
 7302832 7302833 EcSMS35_2617 EcSMS35_2618   dapE TRUE 0.960 4.000 0.292 1.000 N NA
 7302833 7302834 EcSMS35_2618 EcSMS35_2619 dapE   FALSE 0.339 28.000 0.025 NA   NA
 7302835 7302836 EcSMS35_2620 EcSMS35_2621     FALSE 0.138 74.000 0.000 NA   NA
 7302836 7302837 EcSMS35_2621 EcSMS35_2622     FALSE 0.500 15.000 0.029 NA   NA
 7302837 7302838 EcSMS35_2622 EcSMS35_2623   purC FALSE 0.031 168.000 0.006 NA   NA
 7302838 7302839 EcSMS35_2623 EcSMS35_2624 purC   FALSE 0.021 213.000 0.019 NA N NA
 7302839 7302840 EcSMS35_2624 EcSMS35_2625   dapA TRUE 0.971 17.000 0.267 NA Y NA
 7302841 7302842 EcSMS35_2626 EcSMS35_2627 gcvR bcp TRUE 0.935 0.000 0.102 1.000 N NA
 7302842 7302843 EcSMS35_2627 EcSMS35_2628 bcp hyfA FALSE 0.017 253.000 0.000 1.000 N NA
 7302843 7302844 EcSMS35_2628 EcSMS35_2629 hyfA hyfB TRUE 0.981 0.000 0.000 1.000 Y NA
 7302844 7302845 EcSMS35_2629 EcSMS35_2630 hyfB hyfC TRUE 0.952 11.000 0.000 1.000 Y NA
 7302845 7302846 EcSMS35_2630 EcSMS35_2631 hyfC hyfD TRUE 0.983 17.000 0.412 1.000 Y NA
 7302846 7302847 EcSMS35_2631 EcSMS35_2632 hyfD hyfE TRUE 0.980 12.000 0.093 0.006 Y NA
 7302847 7302848 EcSMS35_2632 EcSMS35_2633 hyfE   TRUE 0.998 5.000 0.864 0.006 Y NA
 7302848 7302849 EcSMS35_2633 EcSMS35_2634     TRUE 0.984 -10.000 0.016 0.006 Y NA
 7302849 7302850 EcSMS35_2634 EcSMS35_2635     TRUE 0.962 10.000 0.044 1.000 Y NA
 7302850 7302851 EcSMS35_2635 EcSMS35_2636     TRUE 0.993 -3.000 0.222 1.000 Y NA
 7302851 7302852 EcSMS35_2636 EcSMS35_2637     TRUE 0.951 -7.000 0.250 NA   NA
 7302852 7302853 EcSMS35_2637 EcSMS35_2638   hyfR FALSE 0.313 30.000 0.000 NA   NA
 7302853 7302854 EcSMS35_2638 EcSMS35_2639 hyfR focB TRUE 0.554 22.000 0.000 1.000 N NA
 7302856 7302857 EcSMS35_2641 EcSMS35_2642   arsC1 TRUE 0.868 21.000 0.259 1.000   NA
 7302858 7302859 EcSMS35_2643 EcSMS35_2644 hda uraA FALSE 0.321 50.000 0.048 NA N NA
 7302859 7302860 EcSMS35_2644 EcSMS35_2645 uraA upp TRUE 0.791 86.000 0.101 1.000 Y NA
 7302861 7302862 EcSMS35_2646 EcSMS35_2647   purM FALSE 0.017 214.000 0.000 NA   NA
 7302862 7302863 EcSMS35_2647 EcSMS35_2648 purM purN TRUE 0.996 0.000 0.230 0.001 Y NA
 7302863 7302864 EcSMS35_2648 EcSMS35_2649 purN ppk FALSE 0.066 172.000 0.017 1.000 N NA
 7302864 7302865 EcSMS35_2649 EcSMS35_2650 ppk ppx TRUE 0.994 5.000 0.486 1.000 Y NA
 7302866 7302867 EcSMS35_2651 EcSMS35_2652     FALSE 0.033 182.000 0.000 NA   NA
 7302868 7302869 EcSMS35_2653 EcSMS35_2654     FALSE 0.005 314.000 0.000 NA   NA
 7302869 7302870 EcSMS35_2654 EcSMS35_2655     TRUE 0.876 16.000 0.273 NA   NA
 7302871 7302872 EcSMS35_2656 EcSMS35_2657 guaA guaB TRUE 0.930 69.000 0.190 0.000 Y NA
 7302874 7302875 EcSMS35_2659 EcSMS35_2660     FALSE 0.493 110.000 0.250 NA   NA
 7302875 7302876 EcSMS35_2660 EcSMS35_2661     TRUE 0.787 56.000 0.500 NA   NA
 7302876 7302877 EcSMS35_2661 EcSMS35_2662     FALSE 0.019 210.000 0.000 NA   NA
 7302877 7302878 EcSMS35_2662 EcSMS35_2663   engA FALSE 0.152 63.000 0.000 NA   NA
 7302878 7302879 EcSMS35_2663 EcSMS35_2664 engA   FALSE 0.457 118.000 0.203 1.000   NA
 7302879 7302880 EcSMS35_2664 EcSMS35_2665     TRUE 0.961 11.000 0.492 1.000   NA
 7302880 7302881 EcSMS35_2665 EcSMS35_2666   hisS TRUE 0.879 18.000 0.259 1.000   NA
 7302881 7302882 EcSMS35_2666 EcSMS35_2667 hisS ispG FALSE 0.499 111.000 0.207 1.000 N NA
 7302882 7302883 EcSMS35_2667 EcSMS35_2668 ispG   TRUE 0.817 27.000 0.233 1.000   NA
 7302883 7302884 EcSMS35_2668 EcSMS35_2669     FALSE 0.010 285.000 0.020 1.000   NA
 7302884 7302885 EcSMS35_2669 EcSMS35_2670   ndk FALSE 0.260 150.000 0.156 1.000   NA
 7302885 7302886 EcSMS35_2670 EcSMS35_2671 ndk pbpC FALSE 0.095 149.000 0.008 1.000 N NA
 7302886 7302887 EcSMS35_2671 EcSMS35_2672 pbpC   TRUE 0.989 1.000 0.711 1.000   NA
 7302889 7302890 EcSMS35_2674 EcSMS35_2675 sseB pepB FALSE 0.375 142.000 0.253 NA   NA
 7302890 7302891 EcSMS35_2675 EcSMS35_2676 pepB iscX TRUE 0.537 59.000 0.171 1.000   NA
 7302891 7302892 EcSMS35_2676 EcSMS35_2677 iscX fdx TRUE 0.969 12.000 0.625 1.000   NA
 7302892 7302893 EcSMS35_2677 EcSMS35_2678 fdx hscA TRUE 0.990 2.000 0.794 1.000 N NA
 7302893 7302894 EcSMS35_2678 EcSMS35_2679 hscA hscB TRUE 0.990 17.000 0.634 1.000 Y NA
 7302894 7302895 EcSMS35_2679 EcSMS35_2680 hscB   TRUE 0.610 8.000 0.000 NA   NA
 7302895 7302896 EcSMS35_2680 EcSMS35_2681   iscA TRUE 0.579 -28.000 0.000 NA   NA
 7302896 7302897 EcSMS35_2681 EcSMS35_2682 iscA iscU TRUE 0.959 17.000 0.359 0.002   NA
 7302897 7302898 EcSMS35_2682 EcSMS35_2683 iscU iscS TRUE 0.906 28.000 0.448 1.000 N NA
 7302898 7302899 EcSMS35_2683 EcSMS35_2684 iscS iscR TRUE 0.690 112.000 0.424 1.000 N NA
 7302899 7302900 EcSMS35_2684 EcSMS35_2685 iscR   FALSE 0.036 271.000 0.126 1.000 N NA
 7302901 7302902 EcSMS35_2686 EcSMS35_2687 suhB   FALSE 0.083 145.000 0.003 1.000   NA
 7302902 7302903 EcSMS35_2687 EcSMS35_2689   csiE FALSE 0.042 191.000 0.000 1.000   NA
 7302904 7302905 EcSMS35_2688 EcSMS35_2690 hcaT hcaR FALSE 0.073 160.000 0.000 1.000   NA
 7302906 7302907 EcSMS35_2691 EcSMS35_2692 hcaE hcaF TRUE 0.991 -3.000 0.333 0.001 N NA
 7302907 7302908 EcSMS35_2692 EcSMS35_2693 hcaF hcaC TRUE 0.972 0.000 0.083 0.001 N NA
 7302908 7302909 EcSMS35_2693 EcSMS35_2694 hcaC hcaB TRUE 0.931 -3.000 0.083 1.000 N NA
 7302909 7302910 EcSMS35_2694 EcSMS35_2695 hcaB hcaD TRUE 0.685 10.000 0.000 1.000   NA
 7302910 7302911 EcSMS35_2695 EcSMS35_2696 hcaD   FALSE 0.121 97.000 0.000 NA   NA
 7302912 7302913 EcSMS35_2697 EcSMS35_2698     TRUE 0.673 12.000 0.000 1.000 N NA
 7302913 7302914 EcSMS35_2698 EcSMS35_2699     FALSE 0.431 33.000 0.000 1.000 N NA
 7302914 7302915 EcSMS35_2699 EcSMS35_2700     TRUE 0.947 25.000 0.148 1.000 Y NA
 7302915 7302916 EcSMS35_2700 EcSMS35_2701     TRUE 0.947 23.000 0.161 NA Y NA
 7302916 7302917 EcSMS35_2701 EcSMS35_2702     FALSE 0.121 97.000 0.000 NA   NA
 7302921 7302922 EcSMS35_2706 EcSMS35_2707 glnB   FALSE 0.517 61.000 0.146 1.000 N NA
 7302922 7302923 EcSMS35_2707 EcSMS35_2708     TRUE 0.703 -10.000 0.029 NA   NA
 7302923 7302924 EcSMS35_2708 EcSMS35_2709     FALSE 0.051 165.000 0.029 NA   NA
 7302924 7302925 EcSMS35_2709 EcSMS35_2710   purL FALSE 0.003 577.000 0.000 1.000 N NA
 7302927 7302928 EcSMS35_2711 EcSMS35_2713 tadA yhfB FALSE 0.309 58.000 0.062 NA N NA
 7302929 7302930 EcSMS35_2714 EcSMS35_2715     FALSE 0.431 32.000 0.056 NA   NA
 7302931 7302932 EcSMS35_2716 EcSMS35_2717 acpS pdxJ TRUE 0.977 0.000 0.326 1.000 N NA
 7302932 7302933 EcSMS35_2717 EcSMS35_2718 pdxJ recO TRUE 0.876 12.000 0.166 1.000 N NA
 7302933 7302934 EcSMS35_2718 EcSMS35_2719 recO era TRUE 0.822 12.000 0.109 1.000   NA
 7302934 7302935 EcSMS35_2719 EcSMS35_2720 era rnc TRUE 0.971 -3.000 0.127 0.043   NA
 7302935 7302936 EcSMS35_2720 EcSMS35_2721 rnc lepB FALSE 0.030 273.000 0.117 1.000   NA
 7302936 7302937 EcSMS35_2721 EcSMS35_2722 lepB lepA TRUE 0.849 16.000 0.187 1.000   NA
 7302937 7302938 EcSMS35_2722 EcSMS35_2723 lepA rseC FALSE 0.043 197.000 0.045 NA N NA
 7302938 7302939 EcSMS35_2723 EcSMS35_2724 rseC rseB TRUE 0.997 -3.000 0.609 NA Y NA
 7302939 7302940 EcSMS35_2724 EcSMS35_2725 rseB rseA TRUE 0.998 0.000 0.856 NA Y NA
 7302940 7302941 EcSMS35_2725 EcSMS35_2726 rseA rpoE TRUE 0.928 33.000 0.705 NA N NA
 7302950 7302951 EcSMS35_2735 EcSMS35_2736     FALSE 0.308 69.000 0.084 NA   NA
 7302951 7302952 EcSMS35_2736 EcSMS35_2737     TRUE 0.741 32.000 0.222 NA   NA
 7302952 7302953 EcSMS35_2737 EcSMS35_2738   pssA TRUE 0.532 114.000 0.121 0.050 N NA
 7302953 7302954 EcSMS35_2738 EcSMS35_2740 pssA   FALSE 0.280 97.000 0.089 NA   NA
 7302955 7302956 EcSMS35_2739 EcSMS35_2741 kgtP rrf FALSE 0.004 325.000 0.000 NA   NA
 7302956 7302957 EcSMS35_2741 EcSMS35_2742 rrf rrl FALSE 0.124 95.000 0.000 NA   NA
 7302957 7302958 EcSMS35_2742 EcSMS35_2744 rrl   FALSE 0.026 193.000 0.000 NA   NA
 7302958 7302959 EcSMS35_2744 EcSMS35_2745   rrs FALSE 0.129 85.000 0.000 NA   NA
 7302959 7302960 EcSMS35_2745 EcSMS35_2746 rrs clpB FALSE 0.002 444.000 0.000 NA   NA
 7302960 7302961 EcSMS35_2746 EcSMS35_2747 clpB   FALSE 0.237 130.000 0.108 NA   NA
 7302961 7302962 EcSMS35_2747 EcSMS35_2748   rluD TRUE 0.947 -3.000 0.168 NA   NA
 7302963 7302964 EcSMS35_2749 EcSMS35_2750     FALSE 0.005 271.000 0.004 NA   NA
 7302964 7302965 EcSMS35_2750 EcSMS35_2751   pheA FALSE 0.011 250.000 0.015 NA N NA
 7302966 7302967 EcSMS35_2752 EcSMS35_2753 tyrA aroF TRUE 0.952 11.000 0.000 1.000 Y NA
 7302968 7302969 EcSMS35_2754 EcSMS35_2755     FALSE 0.215 150.000 0.148 NA   NA
 7302969 7302970 EcSMS35_2755 EcSMS35_2756     TRUE 0.977 -7.000 0.475 NA   NA
 7302970 7302971 EcSMS35_2756 EcSMS35_2757     TRUE 0.945 16.000 0.475 1.000 N NA
 7302972 7302973 EcSMS35_2758 EcSMS35_2759 rplS trmD TRUE 0.971 42.000 0.567 1.000 Y NA
 7302973 7302974 EcSMS35_2759 EcSMS35_2760 trmD rimM TRUE 0.983 31.000 0.672 1.000 Y NA
 7302974 7302975 EcSMS35_2760 EcSMS35_2761 rimM rpsP TRUE 0.989 16.000 0.342 0.010 Y NA
 7302975 7302976 EcSMS35_2761 EcSMS35_2762 rpsP ffh TRUE 0.557 137.000 0.361 1.000 N NA
 7302977 7302978 EcSMS35_2763 EcSMS35_2764     TRUE 0.781 45.000 0.349 NA   NA
 7302978 7302979 EcSMS35_2764 EcSMS35_2765     FALSE 0.076 124.000 0.008 NA   NA
 7302981 7302982 EcSMS35_2767 EcSMS35_2768 ppnK recN FALSE 0.497 86.000 0.170 1.000 N NA
 7302982 7302983 EcSMS35_2768 EcSMS35_2769 recN   FALSE 0.146 149.000 0.049 1.000 N NA
 7302984 7302985 EcSMS35_2770 EcSMS35_2771     TRUE 0.884 -10.000 0.124 NA   NA
 7302987 7302988 EcSMS35_2773 EcSMS35_2774     TRUE 0.538 -64.000 0.000 NA   NA
 7302988 7302989 EcSMS35_2774 EcSMS35_2775     FALSE 0.001 752.000 0.000 NA   NA
 7302989 7302990 EcSMS35_2775 EcSMS35_2776     FALSE 0.004 334.000 0.000 NA   NA
 7302990 7302991 EcSMS35_2776 EcSMS35_2777     FALSE 0.001 757.000 0.000 NA   NA
 7302992 7302993 EcSMS35_2778 EcSMS35_2779     FALSE 0.004 337.000 0.000 NA   NA
 7302993 7302994 EcSMS35_2779 EcSMS35_2780     FALSE 0.417 20.000 0.000 NA   NA
 7302994 7302995 EcSMS35_2780 EcSMS35_2781   gabD FALSE 0.499 23.000 0.000 1.000   NA
 7302995 7302996 EcSMS35_2781 EcSMS35_2782 gabD gabT2 TRUE 0.920 14.000 0.303 1.000 N NA
 7302996 7302997 EcSMS35_2782 EcSMS35_2783 gabT2 gabP FALSE 0.251 237.000 0.121 1.000 Y NA
 7302997 7302998 EcSMS35_2783 EcSMS35_2784 gabP csiR TRUE 0.955 21.000 0.625 1.000 N NA
 7302999 7303000 EcSMS35_2785 EcSMS35_2786     FALSE 0.199 84.000 0.027 1.000   NA
 7303001 7303002 EcSMS35_2787 EcSMS35_2788     TRUE 0.804 10.000 0.083 NA N NA
 7303008 7303009 EcSMS35_2794 EcSMS35_2795   nrdH FALSE 0.015 209.000 0.009 NA   NA
 7303009 7303010 EcSMS35_2795 EcSMS35_2796 nrdH nrdI TRUE 0.827 -3.000 0.026 NA N NA
 7303010 7303011 EcSMS35_2796 EcSMS35_2797 nrdI nrdE TRUE 0.952 -27.000 0.000 NA Y NA
 7303011 7303012 EcSMS35_2797 EcSMS35_2798 nrdE nrdF TRUE 0.980 10.000 0.000 0.001 Y NA
 7303012 7303013 EcSMS35_2798 EcSMS35_2799 nrdF proV FALSE 0.006 356.000 0.000 1.000 N NA
 7303013 7303014 EcSMS35_2799 EcSMS35_2800 proV proW TRUE 0.998 -7.000 0.630 0.091 Y NA
 7303014 7303015 EcSMS35_2800 EcSMS35_2801 proW proX TRUE 0.976 58.000 0.695 0.048 Y NA
 7303015 7303016 EcSMS35_2801 EcSMS35_2802 proX   FALSE 0.184 53.000 0.000 NA   NA
 7303016 7303017 EcSMS35_2802 EcSMS35_2803     TRUE 0.712 -7.000 0.000 NA   NA
 7303017 7303018 EcSMS35_2803 EcSMS35_2804     FALSE 0.087 169.000 0.060 NA N NA
 7303018 7303019 EcSMS35_2804 EcSMS35_2805     TRUE 0.988 -10.000 0.915 NA   NA
 7303019 7303020 EcSMS35_2805 EcSMS35_2806   mprA FALSE 0.233 91.000 0.065 NA   NA
 7303020 7303021 EcSMS35_2806 EcSMS35_2807 mprA emrA FALSE 0.317 127.000 0.107 1.000 N NA
 7303021 7303022 EcSMS35_2807 EcSMS35_2808 emrA emrB TRUE 0.974 17.000 0.875 1.000 N NA
 7303023 7303024 EcSMS35_2809 EcSMS35_2810 luxS gshA FALSE 0.197 150.000 0.087 1.000 N NA
 7303024 7303025 EcSMS35_2810 EcSMS35_2811 gshA   FALSE 0.267 73.000 0.071 NA   NA
 7303025 7303026 EcSMS35_2811 EcSMS35_2812     TRUE 0.882 -3.000 0.067 NA   NA
 7303026 7303027 EcSMS35_2812 EcSMS35_2813     FALSE 0.007 279.000 0.000 NA   NA
 7303027 7303028 EcSMS35_2813 EcSMS35_2814     FALSE 0.153 62.000 0.000 NA   NA
 7303028 7303029 EcSMS35_2814 EcSMS35_2815     FALSE 0.155 61.000 0.000 NA   NA
 7303029 7303030 EcSMS35_2815 EcSMS35_2816     FALSE 0.152 63.000 0.000 NA   NA
 7303030 7303031 EcSMS35_2816 EcSMS35_2817     TRUE 0.717 2.000 0.000 NA   NA
 7303031 7303032 EcSMS35_2817 EcSMS35_2818   csrA FALSE 0.005 315.000 0.000 NA   NA
 7303034 7303035 EcSMS35_2820 EcSMS35_2821 alaS recX FALSE 0.250 129.000 0.085 1.000   NA
 7303035 7303036 EcSMS35_2821 EcSMS35_2822 recX recA TRUE 0.650 69.000 0.296 1.000   NA
 7303036 7303037 EcSMS35_2822 EcSMS35_2823 recA   FALSE 0.278 80.000 0.082 NA   NA
 7303037 7303038 EcSMS35_2823 EcSMS35_2824   mltB FALSE 0.072 145.000 0.026 NA   NA
 7303039 7303040 EcSMS35_2825 EcSMS35_2826 srlA srlE TRUE 0.997 -3.000 0.349 0.011 Y NA
 7303040 7303041 EcSMS35_2826 EcSMS35_2827 srlE srlB TRUE 0.973 11.000 0.000 0.011 Y NA
 7303041 7303042 EcSMS35_2827 EcSMS35_2828 srlB srlD TRUE 0.826 4.000 0.040 1.000 N NA
 7303042 7303043 EcSMS35_2828 EcSMS35_2829 srlD gutM FALSE 0.452 106.000 0.197 NA N NA
 7303043 7303044 EcSMS35_2829 EcSMS35_2830 gutM srlR TRUE 0.843 67.000 0.183 NA Y NA
 7303044 7303045 EcSMS35_2830 EcSMS35_2832 srlR gutQ TRUE 0.985 -7.000 0.562 1.000 N NA
 7303047 7303048 EcSMS35_2833 EcSMS35_2834 norV norW TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7303049 7303050 EcSMS35_2835 EcSMS35_2836 hypF   FALSE 0.186 105.000 0.018 1.000 N NA
 7303050 7303051 EcSMS35_2836 EcSMS35_2837     TRUE 0.833 -22.000 0.105 NA   NA
 7303051 7303052 EcSMS35_2837 EcSMS35_2838   ascG TRUE 0.670 4.000 0.000 NA   NA
 7303053 7303054 EcSMS35_2839 EcSMS35_2840 ascF ascB TRUE 0.992 9.000 0.485 1.000 Y NA
 7303055 7303056 EcSMS35_2841 EcSMS35_2842   hycI FALSE 0.239 43.000 0.022 NA   NA
 7303056 7303057 EcSMS35_2842 EcSMS35_2843 hycI   TRUE 0.968 -7.000 0.360 NA   NA
 7303057 7303058 EcSMS35_2843 EcSMS35_2844   hycG TRUE 0.942 -3.000 0.156 NA   NA
 7303058 7303059 EcSMS35_2844 EcSMS35_2845 hycG hycF TRUE 0.988 0.000 0.111 1.000 Y NA
 7303059 7303060 EcSMS35_2845 EcSMS35_2846 hycF hycE TRUE 0.981 10.000 0.200 1.000 Y NA
 7303060 7303061 EcSMS35_2846 EcSMS35_2847 hycE hycD TRUE 0.994 -3.000 0.235 1.000 Y NA
 7303061 7303062 EcSMS35_2847 EcSMS35_2848 hycD hycC TRUE 0.994 3.000 0.382 1.000 Y NA
 7303062 7303063 EcSMS35_2848 EcSMS35_2849 hycC hycB TRUE 0.991 -3.000 0.154 1.000 Y NA
 7303063 7303064 EcSMS35_2849 EcSMS35_2850 hycB hycA FALSE 0.094 125.000 0.000 NA   NA
 7303065 7303066 EcSMS35_2851 EcSMS35_2852 hypA hypB TRUE 0.980 4.000 0.306 0.002   NA
 7303066 7303067 EcSMS35_2852 EcSMS35_2853 hypB hypC2 TRUE 0.983 -9.000 0.139 NA Y NA
 7303067 7303068 EcSMS35_2853 EcSMS35_2854 hypC2 hypD TRUE 0.978 0.000 0.021 NA Y NA
 7303068 7303069 EcSMS35_2854 EcSMS35_2855 hypD hypE TRUE 0.996 -3.000 0.353 1.000 Y NA
 7303069 7303070 EcSMS35_2855 EcSMS35_2856 hypE fhlA FALSE 0.223 74.000 0.019 1.000 N NA
 7303070 7303071 EcSMS35_2856 EcSMS35_2857 fhlA   TRUE 0.963 6.000 0.231 0.079 N NA
 7303072 7303073 EcSMS35_2858 EcSMS35_2859     FALSE 0.134 77.000 0.000 NA   NA
 7303074 7303075 EcSMS35_2860 EcSMS35_2861 mutS pphB FALSE 0.167 106.000 0.000 1.000   NA
 7303076 7303077 EcSMS35_2862 EcSMS35_2863 kpdD kpdC TRUE 0.888 11.000 0.000 0.001   NA
 7303077 7303078 EcSMS35_2863 EcSMS35_2864 kpdC kpdB TRUE 0.991 0.000 0.000 0.001 Y NA
 7303080 7303081 EcSMS35_2866 EcSMS35_2867 rpoS nlpD FALSE 0.501 63.000 0.142 1.000 N NA
 7303081 7303082 EcSMS35_2867 EcSMS35_2868 nlpD pcm FALSE 0.139 140.000 0.030 1.000 N NA
 7303082 7303083 EcSMS35_2868 EcSMS35_2869 pcm surE TRUE 0.975 -6.000 0.353 1.000   NA
 7303083 7303084 EcSMS35_2869 EcSMS35_2870 surE truD TRUE 0.927 -25.000 0.235 1.000   NA
 7303084 7303085 EcSMS35_2870 EcSMS35_2871 truD ispF TRUE 0.957 -3.000 0.173 1.000   NA
 7303085 7303086 EcSMS35_2871 EcSMS35_2872 ispF ispD TRUE 0.996 0.000 0.419 1.000 Y NA
 7303086 7303087 EcSMS35_2872 EcSMS35_2873 ispD ftsB TRUE 0.844 19.000 0.185 1.000 N NA
 7303087 7303088 EcSMS35_2873 EcSMS35_2874 ftsB   TRUE 0.582 -12.000 0.004 NA   NA
 7303088 7303089 EcSMS35_2874 EcSMS35_2875     FALSE 0.325 87.000 0.105 NA   NA
 7303089 7303090 EcSMS35_2875 EcSMS35_2876   cysC TRUE 0.597 50.000 0.198 NA   NA
 7303090 7303091 EcSMS35_2876 EcSMS35_2877 cysC cysN TRUE 0.995 0.000 0.340 1.000 Y NA
 7303091 7303092 EcSMS35_2877 EcSMS35_2878 cysN cysD TRUE 0.993 2.000 0.574 0.000 N NA
 7303093 7303094 EcSMS35_2879 EcSMS35_2880 iap   TRUE 0.762 -3.000 0.016 NA   NA
 7303094 7303095 EcSMS35_2880 EcSMS35_2881     FALSE 0.001 794.000 0.000 NA   NA
 7303096 7303097 EcSMS35_2882 EcSMS35_2883 cas2 cas1 TRUE 0.978 3.000 0.509 NA   NA
 7303097 7303098 EcSMS35_2883 EcSMS35_2884 cas1 cse3 TRUE 0.988 -3.000 0.589 NA   NA
 7303098 7303099 EcSMS35_2884 EcSMS35_2885 cse3 cas5e TRUE 0.936 -18.000 0.282 NA   NA
 7303099 7303100 EcSMS35_2885 EcSMS35_2886 cas5e cse4 TRUE 0.975 11.000 0.780 NA   NA
 7303100 7303101 EcSMS35_2886 EcSMS35_2887 cse4 cse2 TRUE 0.883 15.000 0.276 NA   NA
 7303101 7303102 EcSMS35_2887 EcSMS35_2888 cse2 cse1 TRUE 0.976 -3.000 0.336 NA   NA
 7303102 7303103 EcSMS35_2888 EcSMS35_2889 cse1 cas3 TRUE 0.528 98.000 0.263 NA   NA
 7303103 7303104 EcSMS35_2889 EcSMS35_2890 cas3 cysH FALSE 0.002 612.000 0.003 1.000   NA
 7303104 7303105 EcSMS35_2890 EcSMS35_2891 cysH cysI FALSE 0.437 74.000 0.116 1.000 N NA
 7303105 7303106 EcSMS35_2891 EcSMS35_2892 cysI cysJ TRUE 0.999 0.000 0.791 0.000 Y NA
 7303106 7303107 EcSMS35_2892 EcSMS35_2893 cysJ   FALSE 0.018 213.000 0.000 NA   NA
 7303108 7303109 EcSMS35_2894 EcSMS35_2895 queD   FALSE 0.208 78.000 0.014 1.000 N NA
 7303109 7303110 EcSMS35_2895 EcSMS35_2896     TRUE 0.970 -9.000 0.026 NA Y NA
 7303110 7303111 EcSMS35_2896 EcSMS35_2897     FALSE 0.518 17.000 0.026 NA N NA
 7303112 7303113 EcSMS35_2898 EcSMS35_2899     TRUE 0.988 -3.000 0.102 NA Y NA
 7303113 7303114 EcSMS35_2899 EcSMS35_2900     TRUE 0.916 -22.000 0.182 1.000 N NA
 7303114 7303115 EcSMS35_2900 EcSMS35_2901     TRUE 0.590 94.000 0.250 1.000 N NA
 7303115 7303116 EcSMS35_2901 EcSMS35_2902     TRUE 0.860 70.000 0.500 0.024 N NA
 7303117 7303118 EcSMS35_2903 EcSMS35_2904     TRUE 0.532 27.000 0.058 NA N NA
 7303118 7303119 EcSMS35_2904 EcSMS35_2905   scrK FALSE 0.430 165.000 0.000 1.000 Y NA
 7303119 7303120 EcSMS35_2905 EcSMS35_2906 scrK scrY TRUE 0.587 168.000 0.167 1.000 Y NA
 7303120 7303121 EcSMS35_2906 EcSMS35_2907 scrY scrA TRUE 0.938 61.000 0.275 0.012 Y NA
 7303121 7303122 EcSMS35_2907 EcSMS35_2908 scrA scrB TRUE 0.993 6.000 0.475 1.000 Y NA
 7303122 7303123 EcSMS35_2908 EcSMS35_2909 scrB scrR TRUE 0.903 26.000 0.400 1.000 N NA
 7303125 7303126 EcSMS35_2911 EcSMS35_2912     FALSE 0.351 26.000 0.000 NA   NA
 7303126 7303127 EcSMS35_2912 EcSMS35_2913     FALSE 0.483 14.000 0.000 NA   NA
 7303127 7303128 EcSMS35_2913 EcSMS35_2914     FALSE 0.467 15.000 0.000 NA   NA
 7303128 7303129 EcSMS35_2914 EcSMS35_2915     TRUE 0.733 -6.000 0.000 NA   NA
 7303129 7303130 EcSMS35_2915 EcSMS35_2916     FALSE 0.105 117.000 0.000 NA   NA
 7303131 7303132 EcSMS35_2917 EcSMS35_2918 eno pyrG FALSE 0.324 87.000 0.068 1.000 N NA
 7303132 7303133 EcSMS35_2918 EcSMS35_2919 pyrG mazG FALSE 0.022 228.000 0.025 1.000   NA
 7303133 7303134 EcSMS35_2919 EcSMS35_2920 mazG chpA FALSE 0.205 72.000 0.000 1.000   NA
 7303134 7303135 EcSMS35_2920 EcSMS35_2921 chpA chpR TRUE 0.996 0.000 0.531 NA Y NA
 7303135 7303136 EcSMS35_2921 EcSMS35_2922 chpR relA TRUE 0.684 78.000 0.000 NA Y NA
 7303136 7303137 EcSMS35_2922 EcSMS35_2923 relA rumA FALSE 0.499 48.000 0.082 1.000 N NA
 7303139 7303140 EcSMS35_2925 EcSMS35_2926     TRUE 0.962 21.000 0.000 0.000 Y NA
 7303140 7303141 EcSMS35_2926 EcSMS35_2927   gudP TRUE 0.826 2.000 0.000 1.000 N NA
 7303141 7303142 EcSMS35_2927 EcSMS35_2928 gudP   FALSE 0.124 95.000 0.000 NA   NA
 7303144 7303145 EcSMS35_2930 EcSMS35_2931   truC TRUE 0.862 18.000 0.209 1.000 N NA
 7303145 7303146 EcSMS35_2931 EcSMS35_2932 truC   TRUE 0.984 0.000 0.518 NA   NA
 7303146 7303147 EcSMS35_2932 EcSMS35_2933     FALSE 0.001 622.000 0.000 NA   NA
 7303148 7303149 EcSMS35_2934 EcSMS35_2935 queF   FALSE 0.228 112.000 0.079 NA   NA
 7303149 7303150 EcSMS35_2935 EcSMS35_2936     FALSE 0.001 556.000 0.000 NA   NA
 7303150 7303151 EcSMS35_2936 EcSMS35_2937   sdaB TRUE 0.759 58.000 0.000 1.000 Y NA
 7303151 7303152 EcSMS35_2937 EcSMS35_2938 sdaB xni FALSE 0.187 111.000 0.000 1.000 N NA
 7303153 7303154 EcSMS35_2939 EcSMS35_2940 fucO fucA TRUE 0.646 25.000 0.066 1.000 N NA
 7303155 7303156 EcSMS35_2941 EcSMS35_2942   fucP FALSE 0.015 220.000 0.000 NA   NA
 7303156 7303157 EcSMS35_2942 EcSMS35_2943 fucP fucI TRUE 0.901 33.000 0.104 NA Y NA
 7303157 7303158 EcSMS35_2943 EcSMS35_2944 fucI fucK TRUE 0.858 109.000 0.269 1.000 Y NA
 7303158 7303159 EcSMS35_2944 EcSMS35_2945 fucK fucU TRUE 0.990 2.000 0.211 1.000 Y NA
 7303159 7303160 EcSMS35_2945 EcSMS35_2946 fucU fucR TRUE 0.914 58.000 0.308 1.000 Y NA
 7303161 7303162 EcSMS35_2947 EcSMS35_2948     TRUE 0.913 -7.000 0.144 NA   NA
 7303162 7303163 EcSMS35_2948 EcSMS35_2949   gcvA TRUE 0.654 19.000 0.081 NA   NA
 7303163 7303164 EcSMS35_2949 EcSMS35_2950 gcvA   FALSE 0.003 352.000 0.000 NA   NA
 7303165 7303166 EcSMS35_2951 EcSMS35_2952 csdA csdE TRUE 0.976 0.000 0.122 0.001   NA
 7303167 7303168 EcSMS35_2953 EcSMS35_2954   mltA FALSE 0.196 83.000 0.009 1.000 N NA
 7303169 7303170 EcSMS35_2955 EcSMS35_2956     FALSE 0.279 34.000 0.000 NA   NA
 7303170 7303171 EcSMS35_2956 EcSMS35_2957     FALSE 0.273 35.000 0.000 NA   NA
 7303172 7303173 EcSMS35_2958 EcSMS35_2959     FALSE 0.235 72.000 0.000 1.000 N NA
 7303173 7303174 EcSMS35_2959 EcSMS35_2960     TRUE 0.876 3.000 0.062 1.000 N NA
 7303174 7303175 EcSMS35_2960 EcSMS35_2961     TRUE 0.908 0.000 0.062 1.000 N NA
 7303175 7303176 EcSMS35_2961 EcSMS35_2962     FALSE 0.397 32.000 0.000 1.000   NA
 7303180 7303181 EcSMS35_2966 EcSMS35_2967 recD recB TRUE 0.999 0.000 0.688 0.001 Y NA
 7303181 7303182 EcSMS35_2967 EcSMS35_2968 recB ptrA TRUE 0.724 23.000 0.092 1.000 N NA
 7303182 7303183 EcSMS35_2968 EcSMS35_2969 ptrA recC FALSE 0.133 176.000 0.092 1.000 N NA
 7303183 7303184 EcSMS35_2969 EcSMS35_2970 recC ppdC TRUE 0.733 13.000 0.076 NA N NA
 7303184 7303185 EcSMS35_2970 EcSMS35_2971 ppdC   TRUE 0.962 -39.000 0.538 NA   NA
 7303185 7303186 EcSMS35_2971 EcSMS35_2972   ppdB TRUE 0.978 -3.000 0.373 NA   NA
 7303186 7303187 EcSMS35_2972 EcSMS35_2973 ppdB ppdA TRUE 0.992 -9.000 0.368 NA Y NA
 7303187 7303188 EcSMS35_2973 EcSMS35_2974 ppdA thyA FALSE 0.034 185.000 0.016 NA N NA
 7303188 7303189 EcSMS35_2974 EcSMS35_2975 thyA lgt TRUE 0.912 7.000 0.164 1.000 N NA
 7303189 7303190 EcSMS35_2975 EcSMS35_2976 lgt ptsP FALSE 0.103 151.000 0.000 1.000 N NA
 7303190 7303191 EcSMS35_2976 EcSMS35_2977 ptsP nudH TRUE 0.619 13.000 0.008 1.000 N NA
 7303192 7303193 EcSMS35_2978 EcSMS35_2979   mutH FALSE 0.139 79.000 0.026 NA   NA
 7303193 7303194 EcSMS35_2979 EcSMS35_2980 mutH   FALSE 0.312 69.000 0.052 1.000 N NA
 7303194 7303195 EcSMS35_2980 EcSMS35_2981     TRUE 0.548 138.000 0.429 NA   NA
 7303195 7303196 EcSMS35_2981 EcSMS35_2982   tas FALSE 0.156 108.000 0.043 NA   NA
 7303197 7303198 EcSMS35_2983 EcSMS35_2984 lplT aas TRUE 0.902 -7.000 0.124 NA   NA
 7303202 7303203 EcSMS35_2987 EcSMS35_2989   araE FALSE 0.138 129.000 0.011 1.000 N NA
 7303203 7303204 EcSMS35_2989 EcSMS35_2990 araE kduD FALSE 0.009 315.000 0.000 1.000 N NA
 7303204 7303205 EcSMS35_2990 EcSMS35_2991 kduD kduI TRUE 0.831 30.000 0.269 1.000 N NA
 7303205 7303206 EcSMS35_2991 EcSMS35_2992 kduI   FALSE 0.012 287.000 0.000 1.000 N NA
 7303207 7303208 EcSMS35_2993 EcSMS35_2994     FALSE 0.002 574.000 0.000 1.000   NA
 7303208 7303209 EcSMS35_2994 EcSMS35_2995     FALSE 0.030 185.000 0.000 NA   NA
 7303209 7303210 EcSMS35_2995 EcSMS35_2996     TRUE 0.548 11.000 0.000 NA   NA
 7303211 7303212 EcSMS35_2997 EcSMS35_2998     FALSE 0.133 78.000 0.000 NA   NA
 7303213 7303214 EcSMS35_2999 EcSMS35_3000 xdhA xdhB TRUE 0.996 11.000 0.500 0.000 Y NA
 7303214 7303215 EcSMS35_3000 EcSMS35_3001 xdhB xdhC TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.041 Y NA
 7303217 7303218 EcSMS35_3003 EcSMS35_3004     TRUE 0.902 58.000 0.265 1.000 Y NA
 7303218 7303219 EcSMS35_3004 EcSMS35_3005     TRUE 0.876 58.000 0.188 1.000 Y NA
 7303219 7303220 EcSMS35_3005 EcSMS35_3006   hyuA FALSE 0.465 41.000 0.050 1.000 N NA
 7303220 7303221 EcSMS35_3006 EcSMS35_3007 hyuA   FALSE 0.359 48.000 0.031 1.000 N NA
 7303222 7303223 EcSMS35_3008 EcSMS35_3009     FALSE 0.488 48.000 0.119 NA   NA
 7303224 7303225 EcSMS35_3010 EcSMS35_3011     FALSE 0.004 322.000 0.000 NA   NA
 7303225 7303226 EcSMS35_3011 EcSMS35_3012   ssnA TRUE 0.978 3.000 0.443 1.000 N NA
 7303226 7303227 EcSMS35_3012 EcSMS35_3013 ssnA   FALSE 0.435 51.000 0.066 1.000 N NA
 7303227 7303228 EcSMS35_3013 EcSMS35_3014     TRUE 0.999 -3.000 0.800 0.024 Y NA
 7303228 7303229 EcSMS35_3014 EcSMS35_3015     FALSE 0.080 165.000 0.000 1.000 N NA
 7303229 7303230 EcSMS35_3015 EcSMS35_3016   guaD TRUE 0.926 18.000 0.000 1.000 Y NA
 7303230 7303231 EcSMS35_3016 EcSMS35_3017 guaD   FALSE 0.366 36.000 0.000 1.000   NA
 7303232 7303233 EcSMS35_3018 EcSMS35_3019   aegA2 TRUE 0.988 0.000 0.333 0.012 N NA
 7303234 7303235 EcSMS35_3020 EcSMS35_3021     TRUE 0.717 2.000 0.000 NA   NA
 7303235 7303236 EcSMS35_3021 EcSMS35_3022   idi FALSE 0.096 123.000 0.000 NA   NA
 7303237 7303238 EcSMS35_3023 EcSMS35_3024 lysS prfB TRUE 0.986 10.000 0.162 0.036 Y NA
 7303238 7303239 EcSMS35_3024 EcSMS35_3025 prfB recJ FALSE 0.228 91.000 0.028 1.000 N NA
 7303239 7303240 EcSMS35_3025 EcSMS35_3026 recJ dsbC TRUE 0.865 6.000 0.082 1.000 N NA
 7303240 7303241 EcSMS35_3026 EcSMS35_3027 dsbC xerD TRUE 0.675 25.000 0.079 1.000 N NA
 7303243 7303244 EcSMS35_3029 EcSMS35_3030     TRUE 0.759 -19.000 0.061 NA   NA
 7303246 7303247 EcSMS35_3032 EcSMS35_3033     FALSE 0.140 164.000 0.113 NA   NA
 7303249 7303250 EcSMS35_3035 EcSMS35_3036 gcvP gcvH TRUE 0.836 119.000 0.249 1.000 Y NA
 7303250 7303251 EcSMS35_3036 EcSMS35_3037 gcvH gcvT TRUE 0.986 24.000 0.317 0.001 Y NA
 7303251 7303252 EcSMS35_3037 EcSMS35_3038 gcvT   FALSE 0.036 176.000 0.000 NA   NA
 7303254 7303255 EcSMS35_3040 EcSMS35_3041   ubiH TRUE 0.991 23.000 0.474 0.001 Y NA
 7303255 7303256 EcSMS35_3041 EcSMS35_3042 ubiH pepP TRUE 0.875 -3.000 0.026 1.000 N NA
 7303256 7303257 EcSMS35_3042 EcSMS35_3043 pepP   FALSE 0.415 26.000 0.036 NA   NA
 7303258 7303259 EcSMS35_3044 EcSMS35_3045     FALSE 0.013 246.000 0.034 NA   NA
 7303260 7303261 EcSMS35_3046 EcSMS35_3047 serA rpiA FALSE 0.018 256.000 0.029 1.000 N NA
 7303261 7303262 EcSMS35_3047 EcSMS35_3048 rpiA   FALSE 0.276 56.000 0.000 1.000 N NA
 7303263 7303264 EcSMS35_3049 EcSMS35_3050     TRUE 0.935 17.000 0.500 NA   NA
 7303264 7303265 EcSMS35_3050 EcSMS35_3051     TRUE 0.767 62.000 0.500 NA   NA
 7303265 7303266 EcSMS35_3051 EcSMS35_3052   iciA FALSE 0.237 71.000 0.000 1.000 N NA
 7303266 7303267 EcSMS35_3052 EcSMS35_3053 iciA msm FALSE 0.040 203.000 0.000 1.000 N NA
 7303267 7303268 EcSMS35_3053 EcSMS35_3054 msm   TRUE 0.975 -7.000 0.366 1.000 N NA
 7303268 7303269 EcSMS35_3054 EcSMS35_3055     TRUE 0.679 11.000 0.015 1.000 N NA
 7303269 7303270 EcSMS35_3055 EcSMS35_3057     TRUE 0.701 24.000 0.085 1.000 N NA
 7303271 7303272 EcSMS35_3056 EcSMS35_3058     FALSE 0.054 168.000 0.037 NA   NA
 7303272 7303273 EcSMS35_3058 EcSMS35_3059   argO FALSE 0.255 93.000 0.075 NA   NA
 7303275 7303276 EcSMS35_3061 EcSMS35_3062 mscS fbaA FALSE 0.007 358.000 0.038 1.000 N NA
 7303276 7303277 EcSMS35_3062 EcSMS35_3063 fbaA pgk FALSE 0.395 214.000 0.056 0.006 Y NA
 7303277 7303278 EcSMS35_3063 EcSMS35_3064 pgk epd TRUE 0.910 50.000 0.070 0.006 Y NA
 7303279 7303280 EcSMS35_3065 EcSMS35_3066     TRUE 0.669 23.000 0.103 NA   NA
 7303280 7303281 EcSMS35_3066 EcSMS35_3067     TRUE 0.985 1.000 0.605 NA   NA
 7303281 7303282 EcSMS35_3067 EcSMS35_3068     TRUE 0.972 -18.000 0.093 NA Y NA
 7303282 7303283 EcSMS35_3068 EcSMS35_3070     TRUE 0.995 -6.000 0.214 0.014 Y NA
 7303284 7303285 EcSMS35_3069 EcSMS35_3071 frcK   TRUE 0.989 -3.000 0.588 NA N NA
 7303285 7303286 EcSMS35_3071 EcSMS35_3072   glpX2 TRUE 0.936 22.000 0.545 NA N NA
 7303286 7303287 EcSMS35_3072 EcSMS35_3073 glpX2 sorE TRUE 0.988 -3.000 0.500 1.000 N NA
 7303287 7303288 EcSMS35_3073 EcSMS35_3074 sorE   FALSE 0.467 15.000 0.000 NA   NA
 7303288 7303289 EcSMS35_3074 EcSMS35_3075   cmtB FALSE 0.328 28.000 0.000 NA   NA
 7303293 7303294 EcSMS35_3079 EcSMS35_3080 speB   FALSE 0.077 136.000 0.000 NA   NA
 7303294 7303295 EcSMS35_3080 EcSMS35_3081   speA FALSE 0.065 146.000 0.000 NA   NA
 7303295 7303296 EcSMS35_3081 EcSMS35_3082 speA   FALSE 0.128 87.000 0.000 NA   NA
 7303296 7303297 EcSMS35_3082 EcSMS35_3083     FALSE 0.003 348.000 0.000 NA   NA
 7303298 7303299 EcSMS35_3084 EcSMS35_3085 metK galP FALSE 0.004 436.000 0.000 1.000 N NA
 7303299 7303300 EcSMS35_3085 EcSMS35_3086 galP sprT FALSE 0.184 77.000 0.042 NA   NA
 7303300 7303301 EcSMS35_3086 EcSMS35_3087 sprT endA FALSE 0.473 95.000 0.210 NA   NA
 7303301 7303302 EcSMS35_3087 EcSMS35_3088 endA rsmE FALSE 0.477 80.000 0.201 NA   NA
 7303302 7303303 EcSMS35_3088 EcSMS35_3089 rsmE gshB TRUE 0.838 13.000 0.173 NA   NA
 7303303 7303304 EcSMS35_3089 EcSMS35_3090 gshB   FALSE 0.334 109.000 0.120 NA N NA
 7303304 7303305 EcSMS35_3090 EcSMS35_3091     TRUE 0.967 0.000 0.263 NA N NA
 7303307 7303308 EcSMS35_3093 EcSMS35_3094     TRUE 0.814 18.000 0.189 NA   NA
 7303308 7303309 EcSMS35_3094 EcSMS35_3095     TRUE 0.900 -3.000 0.081 NA   NA
 7303309 7303310 EcSMS35_3095 EcSMS35_3096   rdgB TRUE 0.581 8.000 0.016 NA   NA
 7303310 7303311 EcSMS35_3096 EcSMS35_3097 rdgB   TRUE 0.955 -7.000 0.218 1.000 N NA
 7303312 7303313 EcSMS35_3098 EcSMS35_3099   ansB FALSE 0.097 117.000 0.018 NA   NA
 7303313 7303314 EcSMS35_3099 EcSMS35_3100 ansB   FALSE 0.039 176.000 0.027 NA   NA
 7303314 7303315 EcSMS35_3100 EcSMS35_3101     FALSE 0.408 21.000 0.000 NA   NA
 7303315 7303316 EcSMS35_3101 EcSMS35_3102     FALSE 0.387 23.000 0.000 NA   NA
 7303316 7303317 EcSMS35_3102 EcSMS35_3103   trmB TRUE 0.903 0.000 0.092 NA   NA
 7303318 7303319 EcSMS35_3104 EcSMS35_3105 mutY   TRUE 0.706 28.000 0.150 NA N NA
 7303319 7303320 EcSMS35_3105 EcSMS35_3106   mltC FALSE 0.429 64.000 0.128 NA N NA
 7303324 7303325 EcSMS35_3110 EcSMS35_3111     FALSE 0.114 105.000 0.000 NA   NA
 7303325 7303326 EcSMS35_3111 EcSMS35_3112     FALSE 0.036 176.000 0.000 NA   NA
 7303326 7303327 EcSMS35_3112 EcSMS35_3113   rafR FALSE 0.105 150.000 0.000 1.000 N NA
 7303327 7303328 EcSMS35_3113 EcSMS35_3114 rafR rafA TRUE 0.777 96.000 0.538 1.000 N NA
 7303328 7303329 EcSMS35_3114 EcSMS35_3115 rafA lacY TRUE 0.824 63.000 0.583 1.000   NA
 7303329 7303330 EcSMS35_3115 EcSMS35_3116 lacY rafD TRUE 0.835 0.000 0.000 1.000   NA
 7303330 7303331 EcSMS35_3116 EcSMS35_3117 rafD rafY1 FALSE 0.049 195.000 0.062 NA   NA
 7303332 7303333 EcSMS35_3118 EcSMS35_3119     TRUE 0.850 -81.000 0.000 0.011   NA
 7303333 7303334 EcSMS35_3119 EcSMS35_3120     FALSE 0.321 29.000 0.000 NA   NA
 7303334 7303335 EcSMS35_3120 EcSMS35_3121     FALSE 0.002 550.000 0.000 NA   NA
 7303335 7303336 EcSMS35_3121 EcSMS35_3122     TRUE 0.579 10.000 0.000 NA   NA
 7303336 7303337 EcSMS35_3122 EcSMS35_3123     FALSE 0.107 114.000 0.000 NA   NA
 7303341 7303342 EcSMS35_3127 EcSMS35_3128     FALSE 0.002 495.000 0.000 NA   NA
 7303343 7303344 EcSMS35_3129 EcSMS35_3130     FALSE 0.003 376.000 0.000 NA   NA
 7303345 7303346 EcSMS35_3131 EcSMS35_3132     FALSE 0.069 143.000 0.000 NA   NA
 7303347 7303348 EcSMS35_3133 EcSMS35_3134     FALSE 0.002 469.000 0.000 NA   NA
 7303349 7303350 EcSMS35_3135 EcSMS35_3136     FALSE 0.304 31.000 0.000 NA   NA
 7303350 7303351 EcSMS35_3136 EcSMS35_3137     TRUE 0.980 -3.000 0.000 NA Y NA
 7303351 7303352 EcSMS35_3137 EcSMS35_3138     FALSE 0.010 250.000 0.000 NA   NA
 7303354 7303355 EcSMS35_3140 EcSMS35_3141 amiC2   FALSE 0.002 867.000 0.000 1.000   NA
 7303355 7303356 EcSMS35_3141 EcSMS35_3142     FALSE 0.018 211.000 0.000 NA   NA
 7303356 7303357 EcSMS35_3142 EcSMS35_3143     TRUE 0.534 -78.000 0.000 NA   NA
 7303357 7303358 EcSMS35_3143 EcSMS35_3144     TRUE 0.981 0.000 0.000 1.000 Y NA
 7303359 7303360 EcSMS35_3145 EcSMS35_3146     TRUE 0.647 5.000 0.000 NA   NA
 7303361 7303362 EcSMS35_3147 EcSMS35_3148     TRUE 0.672 -10.000 0.000 NA   NA
 7303362 7303363 EcSMS35_3148 EcSMS35_3149     TRUE 0.579 -28.000 0.000 NA   NA
 7303364 7303365 EcSMS35_3150 EcSMS35_3151     TRUE 0.763 0.000 0.000 NA   NA
 7303366 7303367 EcSMS35_3152 EcSMS35_3153 ibrB ibrA TRUE 0.736 -15.000 0.000 1.000   NA
 7303367 7303368 EcSMS35_3153 EcSMS35_3154 ibrA   FALSE 0.006 292.000 0.000 NA   NA
 7303368 7303369 EcSMS35_3154 EcSMS35_3155     FALSE 0.195 51.000 0.000 NA   NA
 7303370 7303371 EcSMS35_3156 EcSMS35_3157     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7303371 7303372 EcSMS35_3157 EcSMS35_3158     FALSE 0.001 607.000 0.000 NA   NA
 7303372 7303373 EcSMS35_3158 EcSMS35_3159     FALSE 0.109 111.000 0.000 NA   NA
 7303375 7303376 EcSMS35_3161 EcSMS35_3162     FALSE 0.001 1246.000 0.000 NA   NA
 7303378 7303379 EcSMS35_3164 EcSMS35_3165     TRUE 0.970 -42.000 0.000 0.055 Y NA
 7303379 7303380 EcSMS35_3165 EcSMS35_3166     TRUE 0.638 -15.000 0.000 NA   NA
 7303384 7303385 EcSMS35_3170 EcSMS35_3171 sitA_2 sitB_2 TRUE 0.998 0.000 0.894 1.000 Y NA
 7303385 7303386 EcSMS35_3171 EcSMS35_3172 sitB_2 sitC_2 TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.074 Y NA
 7303386 7303387 EcSMS35_3172 EcSMS35_3173 sitC_2 sitD_2 TRUE 0.998 -3.000 0.525 0.005 Y NA
 7303387 7303388 EcSMS35_3173 EcSMS35_3174 sitD_2   FALSE 0.001 815.000 0.000 NA   NA
 7303388 7303389 EcSMS35_3174 EcSMS35_3175     FALSE 0.004 318.000 0.000 NA   NA
 7303389 7303390 EcSMS35_3175 EcSMS35_3176     FALSE 0.147 66.000 0.000 NA   NA
 7303390 7303391 EcSMS35_3176 EcSMS35_3177     FALSE 0.304 31.000 0.000 NA   NA
 7303392 7303393 EcSMS35_3178 EcSMS35_3179 iutA iucD FALSE 0.283 82.000 0.050 1.000 N NA
 7303393 7303394 EcSMS35_3179 EcSMS35_3180 iucD iucC TRUE 0.996 -3.000 0.417 1.000 Y NA
 7303394 7303395 EcSMS35_3180 EcSMS35_3181 iucC iucB TRUE 0.968 0.000 0.250 1.000   NA
 7303395 7303396 EcSMS35_3181 EcSMS35_3182 iucB iucA TRUE 0.987 1.000 0.609 1.000   NA
 7303397 7303398 EcSMS35_3183 EcSMS35_3184 shiF   FALSE 0.028 188.000 0.000 NA   NA
 7303398 7303399 EcSMS35_3184 EcSMS35_3185     FALSE 0.005 306.000 0.000 NA   NA
 7303399 7303400 EcSMS35_3185 EcSMS35_3186     FALSE 0.002 525.000 0.000 NA   NA
 7303401 7303402 EcSMS35_3187 EcSMS35_3188     FALSE 0.351 26.000 0.000 NA   NA
 7303402 7303403 EcSMS35_3188 EcSMS35_3189     FALSE 0.002 469.000 0.000 NA   NA
 7303406 7303407 EcSMS35_3192 EcSMS35_3193     FALSE 0.001 823.000 0.000 NA   NA
 7303407 7303408 EcSMS35_3193 EcSMS35_3194     FALSE 0.467 15.000 0.000 NA   NA
 7303409 7303410 EcSMS35_3195 EcSMS35_3196     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7303410 7303411 EcSMS35_3196 EcSMS35_3197     FALSE 0.144 69.000 0.000 NA   NA
 7303411 7303412 EcSMS35_3197 EcSMS35_3198     FALSE 0.003 361.000 0.000 NA   NA
 7303412 7303413 EcSMS35_3198 EcSMS35_3199     FALSE 0.004 336.000 0.000 NA   NA
 7303413 7303414 EcSMS35_3199 EcSMS35_3200     FALSE 0.116 102.000 0.000 NA   NA
 7303414 7303415 EcSMS35_3200 EcSMS35_3201     FALSE 0.001 804.000 0.000 NA   NA
 7303416 7303417 EcSMS35_3202 EcSMS35_3203     FALSE 0.425 19.000 0.000 NA   NA
 7303417 7303418 EcSMS35_3203 EcSMS35_3204     FALSE 0.321 29.000 0.000 NA   NA
 7303418 7303419 EcSMS35_3204 EcSMS35_3205     FALSE 0.236 43.000 0.000 NA   NA
 7303419 7303420 EcSMS35_3205 EcSMS35_3206     TRUE 0.631 6.000 0.000 NA   NA
 7303420 7303421 EcSMS35_3206 EcSMS35_3207     FALSE 0.128 90.000 0.000 NA   NA
 7303421 7303422 EcSMS35_3207 EcSMS35_3208     FALSE 0.129 82.000 0.000 NA   NA
 7303422 7303423 EcSMS35_3208 EcSMS35_3209     FALSE 0.452 16.000 0.000 NA   NA
 7303423 7303424 EcSMS35_3209 EcSMS35_3210     FALSE 0.152 63.000 0.000 NA   NA
 7303424 7303425 EcSMS35_3210 EcSMS35_3211     FALSE 0.023 200.000 0.000 NA   NA
 7303425 7303426 EcSMS35_3211 EcSMS35_3212     FALSE 0.216 47.000 0.000 NA   NA
 7303426 7303427 EcSMS35_3212 EcSMS35_3213     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7303427 7303428 EcSMS35_3213 EcSMS35_3214     FALSE 0.523 12.000 0.000 NA   NA
 7303428 7303429 EcSMS35_3214 EcSMS35_3215     FALSE 0.129 85.000 0.000 NA   NA
 7303429 7303430 EcSMS35_3215 EcSMS35_3216     TRUE 0.820 72.000 0.667 NA   NA
 7303430 7303431 EcSMS35_3216 EcSMS35_3217     FALSE 0.001 814.000 0.000 NA   NA
 7303433 7303434 EcSMS35_3219 EcSMS35_3220 kpsF kpsE TRUE 0.728 72.000 0.000 1.000 Y NA
 7303434 7303435 EcSMS35_3220 EcSMS35_3221 kpsE kpsD TRUE 0.908 24.000 0.000 1.000 Y NA
 7303435 7303436 EcSMS35_3221 EcSMS35_3222 kpsD kpsU TRUE 0.957 10.000 0.000 1.000 Y NA
 7303436 7303437 EcSMS35_3222 EcSMS35_3223 kpsU kpsC TRUE 0.982 -3.000 0.005 1.000 Y NA
 7303437 7303438 EcSMS35_3223 EcSMS35_3224 kpsC kpsS TRUE 0.986 23.000 0.315 0.001 Y NA
 7303439 7303440 EcSMS35_3225 EcSMS35_3226     TRUE 0.527 -198.000 0.000 NA   NA
 7303440 7303441 EcSMS35_3226 EcSMS35_3227     FALSE 0.020 206.000 0.000 NA   NA
 7303441 7303442 EcSMS35_3227 EcSMS35_3228   neuS FALSE 0.099 121.000 0.000 NA   NA
 7303442 7303443 EcSMS35_3228 EcSMS35_3229 neuS neuE TRUE 0.672 -10.000 0.000 NA   NA
 7303443 7303444 EcSMS35_3229 EcSMS35_3230 neuE neuC TRUE 0.564 -34.000 0.000 NA   NA
 7303444 7303445 EcSMS35_3230 EcSMS35_3231 neuC neuA TRUE 0.994 -3.000 0.111 0.004 Y NA
 7303445 7303446 EcSMS35_3231 EcSMS35_3232 neuA neuB TRUE 0.988 0.000 0.105 1.000 Y NA
 7303446 7303447 EcSMS35_3232 EcSMS35_3233 neuB neuD TRUE 0.872 -3.000 0.036 1.000   NA
 7303447 7303448 EcSMS35_3233 EcSMS35_3234 neuD kpsT FALSE 0.496 50.000 0.000 0.073   NA
 7303448 7303449 EcSMS35_3234 EcSMS35_3235 kpsT kpsM TRUE 0.991 -3.000 0.056 0.073 Y NA
 7303449 7303450 EcSMS35_3235 EcSMS35_3236 kpsM   FALSE 0.001 1034.000 0.000 NA N NA
 7303452 7303453 EcSMS35_3238 EcSMS35_3239 gspM gspL TRUE 0.998 2.000 0.811 1.000 Y NA
 7303453 7303454 EcSMS35_3239 EcSMS35_3240 gspL gspK TRUE 0.998 -3.000 0.537 0.065 Y NA
 7303454 7303455 EcSMS35_3240 EcSMS35_3241 gspK gspJ TRUE 0.996 0.000 0.461 1.000 Y NA
 7303455 7303456 EcSMS35_3241 EcSMS35_3242 gspJ gspI TRUE 0.994 -3.000 0.569 0.002   NA
 7303456 7303457 EcSMS35_3242 EcSMS35_3243 gspI gspH TRUE 0.995 -3.000 0.605 0.002   NA
 7303457 7303458 EcSMS35_3243 EcSMS35_3244 gspH gspG TRUE 0.986 4.000 0.425 0.002   NA
 7303458 7303459 EcSMS35_3244 EcSMS35_3245 gspG gspF TRUE 0.994 17.000 0.599 0.002 Y NA
 7303459 7303460 EcSMS35_3245 EcSMS35_3246 gspF gspE TRUE 0.999 0.000 0.653 0.002 Y NA
 7303460 7303461 EcSMS35_3246 EcSMS35_3247 gspE gspD TRUE 0.999 0.000 0.776 0.002 Y NA
 7303461 7303462 EcSMS35_3247 EcSMS35_3248 gspD gspC TRUE 0.989 30.000 0.575 0.002 Y NA
 7303462 7303463 EcSMS35_3248 EcSMS35_3249 gspC   FALSE 0.433 18.000 0.000 NA   NA
 7303463 7303464 EcSMS35_3249 EcSMS35_3250   pppA FALSE 0.147 66.000 0.000 NA   NA
 7303464 7303465 EcSMS35_3250 EcSMS35_3251 pppA   FALSE 0.024 198.000 0.000 NA   NA
 7303465 7303466 EcSMS35_3251 EcSMS35_3252   glcA FALSE 0.002 485.000 0.000 NA   NA
 7303466 7303467 EcSMS35_3252 EcSMS35_3253 glcA glcB FALSE 0.049 355.000 0.000 1.000 Y NA
 7303467 7303468 EcSMS35_3253 EcSMS35_3254 glcB   TRUE 0.529 22.000 0.052 NA   NA
 7303468 7303469 EcSMS35_3254 EcSMS35_3255   glcF TRUE 0.774 5.000 0.057 NA   NA
 7303469 7303470 EcSMS35_3255 EcSMS35_3256 glcF glcE TRUE 0.983 11.000 0.074 0.001 Y NA
 7303470 7303471 EcSMS35_3256 EcSMS35_3257 glcE glcD TRUE 0.993 0.000 0.070 0.001 Y NA
 7303474 7303475 EcSMS35_3260 EcSMS35_3261     TRUE 0.969 -3.000 0.096 0.016 N NA
 7303475 7303476 EcSMS35_3261 EcSMS35_3262     TRUE 0.535 32.000 0.064 1.000   NA
 7303476 7303477 EcSMS35_3262 EcSMS35_3263     TRUE 0.922 0.000 0.091 1.000   NA
 7303478 7303479 EcSMS35_3264 EcSMS35_3265     TRUE 0.994 -3.000 0.631 0.065   NA
 7303479 7303480 EcSMS35_3265 EcSMS35_3266     FALSE 0.304 31.000 0.000 NA   NA
 7303480 7303481 EcSMS35_3266 EcSMS35_3267     FALSE 0.523 12.000 0.000 NA   NA
 7303481 7303482 EcSMS35_3267 EcSMS35_3268     TRUE 0.989 0.000 0.667 NA   NA
 7303482 7303483 EcSMS35_3268 EcSMS35_3269     TRUE 0.888 46.000 0.667 NA   NA
 7303483 7303484 EcSMS35_3269 EcSMS35_3270     FALSE 0.295 32.000 0.000 NA   NA
 7303490 7303491 EcSMS35_3276 EcSMS35_3277 hybG hypA1 FALSE 0.501 13.000 0.000 NA   NA
 7303491 7303492 EcSMS35_3277 EcSMS35_3278 hypA1 hybE TRUE 0.814 -7.000 0.055 NA   NA
 7303492 7303493 EcSMS35_3278 EcSMS35_3279 hybE hybD TRUE 0.958 -7.000 0.291 NA   NA
 7303493 7303494 EcSMS35_3279 EcSMS35_3280 hybD hybC TRUE 0.998 0.000 0.828 1.000 Y NA
 7303494 7303495 EcSMS35_3280 EcSMS35_3281 hybC hybB TRUE 0.980 -3.000 0.000 NA Y NA
 7303495 7303496 EcSMS35_3281 EcSMS35_3282 hybB hybA TRUE 0.967 -10.000 0.000 NA Y NA
 7303496 7303497 EcSMS35_3282 EcSMS35_3283 hybA hyb0 TRUE 0.996 3.000 0.615 NA Y NA
 7303499 7303500 EcSMS35_3285 EcSMS35_3286     FALSE 0.093 119.000 0.017 NA   NA
 7303504 7303505 EcSMS35_3290 EcSMS35_3291 exbD exbB TRUE 0.997 7.000 0.810 0.055 Y NA
 7303506 7303507 EcSMS35_3292 EcSMS35_3293 metC   FALSE 0.332 140.000 0.212 NA   NA
 7303508 7303509 EcSMS35_3294 EcSMS35_3295     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7303510 7303511 EcSMS35_3296 EcSMS35_3297 yqhD dkgA FALSE 0.480 105.000 0.200 1.000   NA
 7303511 7303512 EcSMS35_3297 EcSMS35_3298 dkgA   FALSE 0.023 200.000 0.000 NA   NA
 7303512 7303513 EcSMS35_3298 EcSMS35_3299     FALSE 0.195 51.000 0.000 NA   NA
 7303515 7303516 EcSMS35_3301 EcSMS35_3302     FALSE 0.008 323.000 0.000 1.000 N NA
 7303516 7303517 EcSMS35_3302 EcSMS35_3303     TRUE 0.949 -3.000 0.027 0.023 N NA
 7303517 7303518 EcSMS35_3303 EcSMS35_3304     TRUE 0.707 11.000 0.027 1.000 N NA
 7303518 7303519 EcSMS35_3304 EcSMS35_3305     FALSE 0.234 73.000 0.000 1.000 N NA
 7303519 7303520 EcSMS35_3305 EcSMS35_3306     FALSE 0.242 42.000 0.000 NA   NA
 7303520 7303521 EcSMS35_3306 EcSMS35_3307     TRUE 0.548 11.000 0.000 NA   NA
 7303522 7303523 EcSMS35_3308 EcSMS35_3309 sufI plsC FALSE 0.490 75.000 0.154 1.000 N NA
 7303523 7303524 EcSMS35_3309 EcSMS35_3310 plsC parC FALSE 0.030 234.000 0.043 1.000 N NA
 7303524 7303525 EcSMS35_3310 EcSMS35_3311 parC   FALSE 0.130 138.000 0.000 1.000 N NA
 7303525 7303526 EcSMS35_3311 EcSMS35_3312     FALSE 0.137 109.000 0.000 NA N NA
 7303526 7303527 EcSMS35_3312 EcSMS35_3313     FALSE 0.280 53.000 0.053 NA   NA
 7303528 7303529 EcSMS35_3314 EcSMS35_3315 qseB qseC TRUE 0.997 -3.000 0.526 1.000 Y NA
 7303529 7303530 EcSMS35_3315 EcSMS35_3316 qseC mdaB FALSE 0.190 110.000 0.035 1.000   NA
 7303530 7303531 EcSMS35_3316 EcSMS35_3317 mdaB ygiN TRUE 0.669 31.000 0.025 0.023   NA
 7303532 7303533 EcSMS35_3318 EcSMS35_3319 fitR fitE TRUE 0.972 -3.000 0.242 1.000 N NA
 7303533 7303534 EcSMS35_3319 EcSMS35_3320 fitE fitD TRUE 0.975 11.000 0.156 1.000 Y NA
 7303534 7303535 EcSMS35_3320 EcSMS35_3321 fitD fitC TRUE 0.995 -3.000 0.182 0.044 Y NA
 7303535 7303536 EcSMS35_3321 EcSMS35_3322 fitC fitB TRUE 0.998 -3.000 0.857 1.000 Y NA
 7303536 7303537 EcSMS35_3322 EcSMS35_3323 fitB   FALSE 0.131 80.000 0.000 NA   NA
 7303539 7303540 EcSMS35_3325 EcSMS35_3326 parE yqiA TRUE 0.758 29.000 0.217 NA   NA
 7303540 7303541 EcSMS35_3326 EcSMS35_3327 yqiA icc TRUE 0.980 0.000 0.427 NA   NA
 7303541 7303542 EcSMS35_3327 EcSMS35_3328 icc   TRUE 0.899 25.000 0.433 NA   NA
 7303542 7303543 EcSMS35_3328 EcSMS35_3329   nudF TRUE 0.977 1.000 0.443 NA   NA
 7303544 7303545 EcSMS35_3330 EcSMS35_3331 tolC   TRUE 0.535 148.000 0.480 NA   NA
 7303545 7303546 EcSMS35_3331 EcSMS35_3332     TRUE 0.978 6.000 0.632 NA   NA
 7303546 7303547 EcSMS35_3332 EcSMS35_3333     FALSE 0.002 485.000 0.000 NA   NA
 7303547 7303548 EcSMS35_3333 EcSMS35_3334     TRUE 0.941 18.000 0.500 1.000   NA
 7303548 7303549 EcSMS35_3334 EcSMS35_3335     TRUE 0.931 30.000 0.375 0.003   NA
 7303552 7303553 EcSMS35_3338 EcSMS35_3339   ribB FALSE 0.012 238.000 0.000 NA   NA
 7303556 7303557 EcSMS35_3342 EcSMS35_3343     TRUE 0.931 27.000 0.641 NA   NA
 7303558 7303559 EcSMS35_3344 EcSMS35_3345 hldE glnE FALSE 0.500 48.000 0.083 1.000 N NA
 7303559 7303560 EcSMS35_3345 EcSMS35_3346 glnE   TRUE 0.602 23.000 0.053 1.000   NA
 7303560 7303561 EcSMS35_3346 EcSMS35_3347     FALSE 0.442 17.000 0.000 NA   NA
 7303562 7303563 EcSMS35_3348 EcSMS35_3349   cca FALSE 0.394 64.000 0.106 NA N NA
 7303564 7303565 EcSMS35_3350 EcSMS35_3351 bacA folB FALSE 0.413 100.000 0.128 1.000 N NA
 7303568 7303569 EcSMS35_3354 EcSMS35_3355 ddtA ttdB TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.000 Y NA
 7303569 7303570 EcSMS35_3355 EcSMS35_3356 ttdB   FALSE 0.376 48.000 0.037 1.000 N NA
 7303572 7303573 EcSMS35_3358 EcSMS35_3359 rpsU dnaG FALSE 0.283 111.000 0.067 1.000 N NA
 7303573 7303574 EcSMS35_3359 EcSMS35_3360 dnaG rpoD FALSE 0.236 195.000 0.299 1.000 N NA
 7303574 7303575 EcSMS35_3360 EcSMS35_3361 rpoD   FALSE 0.159 59.000 0.000 NA   NA
 7303583 7303584 EcSMS35_3369 EcSMS35_3370 ebgR ebgA FALSE 0.148 184.000 0.136 1.000 N NA
 7303584 7303585 EcSMS35_3370 EcSMS35_3371 ebgA ebgC TRUE 0.998 -3.000 0.682 NA Y NA
 7303585 7303586 EcSMS35_3371 EcSMS35_3372 ebgC   TRUE 0.735 63.000 0.412 NA N NA
 7303586 7303587 EcSMS35_3372 EcSMS35_3373     FALSE 0.080 134.000 0.000 NA   NA
 7303587 7303588 EcSMS35_3373 EcSMS35_3374     FALSE 0.442 17.000 0.000 NA   NA
 7303588 7303589 EcSMS35_3374 EcSMS35_3375   fadH FALSE 0.060 171.000 0.000 1.000   NA
 7303591 7303592 EcSMS35_3377 EcSMS35_3378     FALSE 0.128 77.000 0.019 NA   NA
 7303592 7303593 EcSMS35_3378 EcSMS35_3379     FALSE 0.125 79.000 0.019 NA   NA
 7303593 7303594 EcSMS35_3379 EcSMS35_3380   alx FALSE 0.010 284.000 0.000 1.000   NA
 7303594 7303595 EcSMS35_3380 EcSMS35_3381 alx sstT FALSE 0.008 324.000 0.000 1.000 N NA
 7303596 7303597 EcSMS35_3382 EcSMS35_3383   uxaA FALSE 0.361 83.000 0.126 NA   NA
 7303597 7303598 EcSMS35_3383 EcSMS35_3384 uxaA uxaC TRUE 0.956 15.000 0.092 1.000 Y NA
 7303600 7303601 EcSMS35_3386 EcSMS35_3387     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7303601 7303602 EcSMS35_3387 EcSMS35_3388     TRUE 0.802 91.000 0.667 NA   NA
 7303602 7303603 EcSMS35_3388 EcSMS35_3389     TRUE 0.906 30.000 0.556 NA   NA
 7303603 7303604 EcSMS35_3389 EcSMS35_3390     FALSE 0.131 80.000 0.000 NA   NA
 7303607 7303608 EcSMS35_3393 EcSMS35_3394     TRUE 0.936 19.000 0.529 NA   NA
 7303608 7303609 EcSMS35_3394 EcSMS35_3395     TRUE 0.665 147.000 0.684 NA   NA
 7303609 7303610 EcSMS35_3395 EcSMS35_3396     TRUE 0.894 38.000 0.609 NA   NA
 7303610 7303611 EcSMS35_3396 EcSMS35_3397     TRUE 0.928 3.000 0.185 NA   NA
 7303611 7303612 EcSMS35_3397 EcSMS35_3398     TRUE 0.920 -10.000 0.185 NA   NA
 7303612 7303613 EcSMS35_3398 EcSMS35_3399     FALSE 0.399 96.000 0.161 NA   NA
 7303613 7303614 EcSMS35_3399 EcSMS35_3400     FALSE 0.010 248.000 0.000 NA   NA
 7303614 7303615 EcSMS35_3400 EcSMS35_3401     FALSE 0.006 283.000 0.000 NA   NA
 7303615 7303616 EcSMS35_3401 EcSMS35_3402     FALSE 0.043 242.000 0.000 0.064   NA
 7303618 7303619 EcSMS35_3404 EcSMS35_3405     FALSE 0.346 20.000 0.005 NA   NA
 7303620 7303621 EcSMS35_3406 EcSMS35_3407     TRUE 0.695 28.000 0.157 NA   NA
 7303621 7303622 EcSMS35_3407 EcSMS35_3408   tdcG FALSE 0.100 275.000 0.000 1.000 Y NA
 7303622 7303623 EcSMS35_3408 EcSMS35_3409 tdcG   FALSE 0.457 66.000 0.150 NA N NA
 7303623 7303624 EcSMS35_3409 EcSMS35_3410   pflB1 TRUE 0.542 14.000 0.000 NA N NA
 7303624 7303625 EcSMS35_3410 EcSMS35_3411 pflB1 tdcD TRUE 0.952 34.000 0.286 1.000 Y NA
 7303625 7303626 EcSMS35_3411 EcSMS35_3412 tdcD tdcC TRUE 0.872 26.000 0.308 1.000 N NA
 7303626 7303627 EcSMS35_3412 EcSMS35_3413 tdcC tdcB TRUE 0.918 22.000 0.029 1.000 Y NA
 7303627 7303628 EcSMS35_3413 EcSMS35_3414 tdcB tdcA FALSE 0.205 99.000 0.023 1.000 N NA
 7303631 7303632 EcSMS35_3417 EcSMS35_3418     FALSE 0.398 22.000 0.000 NA   NA
 7303633 7303634 EcSMS35_3419 EcSMS35_3420 garK garR FALSE 0.453 97.000 0.152 1.000 N NA
 7303634 7303635 EcSMS35_3420 EcSMS35_3421 garR garL TRUE 0.871 36.000 0.424 1.000 N NA
 7303635 7303636 EcSMS35_3421 EcSMS35_3422 garL garP TRUE 0.961 16.000 0.143 1.000 Y NA
 7303637 7303638 EcSMS35_3423 EcSMS35_3424     FALSE 0.152 63.000 0.000 NA   NA
 7303638 7303639 EcSMS35_3424 EcSMS35_3425   garD FALSE 0.216 47.000 0.000 NA   NA
 7303639 7303640 EcSMS35_3425 EcSMS35_3426 garD sohA FALSE 0.003 344.000 0.000 NA   NA
 7303640 7303641 EcSMS35_3426 EcSMS35_3427 sohA   TRUE 0.763 0.000 0.000 NA   NA
 7303643 7303644 EcSMS35_3429 EcSMS35_3430   agaV TRUE 0.969 23.000 0.280 1.000 Y NA
 7303644 7303645 EcSMS35_3430 EcSMS35_3431 agaV agaW TRUE 0.997 11.000 0.905 0.014 Y NA
 7303645 7303646 EcSMS35_3431 EcSMS35_3432 agaW agaE TRUE 0.997 -10.000 0.619 0.014 Y NA
 7303646 7303647 EcSMS35_3432 EcSMS35_3433 agaE agaF TRUE 0.994 18.000 0.692 0.014 Y NA
 7303647 7303648 EcSMS35_3433 EcSMS35_3434 agaF nagA1 TRUE 0.975 -24.000 0.104 1.000 Y NA
 7303648 7303649 EcSMS35_3434 EcSMS35_3435 nagA1   FALSE 0.006 351.000 0.000 1.000 N NA
 7303649 7303650 EcSMS35_3435 EcSMS35_3436   kbaY TRUE 0.944 13.000 0.391 1.000 N NA
 7303650 7303651 EcSMS35_3436 EcSMS35_3437 kbaY agaB FALSE 0.513 167.000 0.087 1.000 Y NA
 7303651 7303652 EcSMS35_3437 EcSMS35_3438 agaB agaC TRUE 0.971 39.000 0.333 0.014 Y NA
 7303652 7303653 EcSMS35_3438 EcSMS35_3439 agaC agaD TRUE 0.996 -10.000 0.444 0.014 Y NA
 7303653 7303654 EcSMS35_3439 EcSMS35_3440 agaD   TRUE 0.984 1.000 0.080 1.000 Y NA
 7303656 7303657 EcSMS35_3442 EcSMS35_3443     TRUE 0.883 -42.000 0.172 1.000   NA
 7303657 7303658 EcSMS35_3443 EcSMS35_3444   diaA TRUE 0.842 20.000 0.187 1.000 N NA
 7303658 7303659 EcSMS35_3444 EcSMS35_3445 diaA   TRUE 0.971 10.000 0.613 NA   NA
 7303660 7303661 EcSMS35_3446 EcSMS35_3447     FALSE 0.200 73.000 0.045 NA   NA
 7303665 7303666 EcSMS35_3450 EcSMS35_3452     TRUE 0.968 -6.000 0.295 1.000   NA
 7303666 7303667 EcSMS35_3452 EcSMS35_3453     TRUE 0.672 -10.000 0.000 NA   NA
 7303668 7303669 EcSMS35_3454 EcSMS35_3455     TRUE 0.998 9.000 0.948 0.003 Y NA
 7303669 7303670 EcSMS35_3455 EcSMS35_3456     FALSE 0.204 81.000 0.041 NA N NA
 7303671 7303672 EcSMS35_3457 EcSMS35_3458 mtr deaD FALSE 0.085 154.000 0.009 1.000 N NA
 7303672 7303673 EcSMS35_3458 EcSMS35_3459 deaD nlpI FALSE 0.077 180.000 0.053 1.000   NA
 7303673 7303674 EcSMS35_3459 EcSMS35_3460 nlpI pnp FALSE 0.271 109.000 0.071 1.000   NA
 7303674 7303675 EcSMS35_3460 EcSMS35_3461 pnp rpsO FALSE 0.387 247.000 0.335 1.000 Y NA
 7303675 7303676 EcSMS35_3461 EcSMS35_3462 rpsO truB TRUE 0.721 149.000 0.211 1.000 Y NA
 7303676 7303677 EcSMS35_3462 EcSMS35_3463 truB rbfA TRUE 0.995 0.000 0.318 1.000 Y NA
 7303677 7303678 EcSMS35_3463 EcSMS35_3464 rbfA infB TRUE 0.821 164.000 0.530 1.000 Y NA
 7303678 7303679 EcSMS35_3464 EcSMS35_3465 infB nusA TRUE 0.893 25.000 0.342 1.000 N NA
 7303679 7303680 EcSMS35_3465 EcSMS35_3466 nusA   TRUE 0.940 28.000 0.759 NA   NA
 7303680 7303681 EcSMS35_3466 EcSMS35_3467     FALSE 0.025 195.000 0.000 NA   NA
 7303683 7303684 EcSMS35_3469 EcSMS35_3470 yhbX   FALSE 0.001 566.000 0.000 NA   NA
 7303684 7303685 EcSMS35_3470 EcSMS35_3471   secG FALSE 0.483 14.000 0.000 NA   NA
 7303685 7303686 EcSMS35_3471 EcSMS35_3472 secG glmM FALSE 0.024 228.000 0.016 1.000 N NA
 7303686 7303687 EcSMS35_3472 EcSMS35_3473 glmM folP TRUE 0.962 -7.000 0.260 1.000 N NA
 7303687 7303688 EcSMS35_3473 EcSMS35_3474 folP hflB TRUE 0.662 90.000 0.325 1.000 N NA
 7303688 7303689 EcSMS35_3474 EcSMS35_3475 hflB rrmJ FALSE 0.468 91.000 0.152 1.000 N NA
 7303693 7303694 EcSMS35_3479 EcSMS35_3480 obgE   TRUE 0.542 16.000 0.015 1.000   NA
 7303694 7303695 EcSMS35_3480 EcSMS35_3481   rpmA FALSE 0.132 127.000 0.019 1.000   NA
 7303695 7303696 EcSMS35_3481 EcSMS35_3482 rpmA rplU TRUE 0.994 21.000 0.667 0.009 Y NA
 7303697 7303698 EcSMS35_3483 EcSMS35_3484 ispB sfsB FALSE 0.025 229.000 0.000 1.000 N NA
 7303699 7303700 EcSMS35_3485 EcSMS35_3486 murA   TRUE 0.647 55.000 0.258 NA N NA
 7303700 7303701 EcSMS35_3486 EcSMS35_3487   yrbB TRUE 0.536 145.000 0.453 NA   NA
 7303701 7303702 EcSMS35_3487 EcSMS35_3488 yrbB ttg2D TRUE 0.970 0.000 0.308 NA   NA
 7303702 7303703 EcSMS35_3488 EcSMS35_3489 ttg2D   TRUE 0.808 19.000 0.188 NA   NA
 7303703 7303704 EcSMS35_3489 EcSMS35_3490     TRUE 0.975 5.000 0.562 NA   NA
 7303704 7303705 EcSMS35_3490 EcSMS35_3491     TRUE 0.993 8.000 0.530 NA Y NA
 7303706 7303707 EcSMS35_3492 EcSMS35_3493   kdsD TRUE 0.894 14.000 0.226 1.000 N NA
 7303707 7303708 EcSMS35_3493 EcSMS35_3494 kdsD kdsC TRUE 0.948 21.000 0.598 1.000   NA
 7303708 7303709 EcSMS35_3494 EcSMS35_3495 kdsC   TRUE 0.989 -3.000 0.617 NA   NA
 7303709 7303710 EcSMS35_3495 EcSMS35_3496   lptA TRUE 0.956 -31.000 0.459 NA   NA
 7303710 7303711 EcSMS35_3496 EcSMS35_3497 lptA lptB TRUE 0.971 7.000 0.543 NA   NA
 7303711 7303712 EcSMS35_3497 EcSMS35_3498 lptB rpoN TRUE 0.608 48.000 0.163 1.000   NA
 7303712 7303713 EcSMS35_3498 EcSMS35_3499 rpoN yfiA TRUE 0.960 23.000 0.820 NA N NA
 7303713 7303714 EcSMS35_3499 EcSMS35_3500 yfiA ptsN TRUE 0.790 118.000 0.728 NA N NA
 7303714 7303715 EcSMS35_3500 EcSMS35_3501 ptsN   TRUE 0.617 46.000 0.186 NA   NA
 7303715 7303716 EcSMS35_3501 EcSMS35_3502   ptsO TRUE 0.951 -3.000 0.182 NA   NA
 7303716 7303717 EcSMS35_3502 EcSMS35_3504 ptsO   FALSE 0.013 214.000 0.007 NA   NA
 7303718 7303719 EcSMS35_3503 EcSMS35_3505 mtgA elbB TRUE 0.881 -3.000 0.066 NA   NA
 7303719 7303720 EcSMS35_3505 EcSMS35_3506 elbB arcB FALSE 0.017 230.000 0.000 NA N NA
 7303720 7303721 EcSMS35_3506 EcSMS35_3507 arcB   FALSE 0.377 96.000 0.113 1.000   NA
 7303722 7303723 EcSMS35_3508 EcSMS35_3509 gltB gltD TRUE 0.982 13.000 0.096 0.000 Y NA
 7303723 7303724 EcSMS35_3509 EcSMS35_3510 gltD   FALSE 0.020 233.000 0.000 1.000   NA
 7303724 7303725 EcSMS35_3510 EcSMS35_3511     TRUE 0.988 -3.000 0.538 1.000   NA
 7303725 7303726 EcSMS35_3511 EcSMS35_3512     TRUE 0.986 -3.000 0.483 1.000   NA
 7303726 7303727 EcSMS35_3512 EcSMS35_3513     TRUE 0.952 18.000 0.633 NA   NA
 7303727 7303728 EcSMS35_3513 EcSMS35_3514     TRUE 0.978 -10.000 0.569 NA   NA
 7303729 7303730 EcSMS35_3515 EcSMS35_3516     FALSE 0.001 670.000 0.000 NA   NA
 7303730 7303731 EcSMS35_3516 EcSMS35_3517     TRUE 0.980 -3.000 0.000 NA Y NA
 7303731 7303732 EcSMS35_3517 EcSMS35_3518     TRUE 0.983 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7303732 7303733 EcSMS35_3518 EcSMS35_3519   nanT1 TRUE 0.813 48.000 0.000 1.000 Y NA
 7303733 7303734 EcSMS35_3519 EcSMS35_3520 nanT1 nanA TRUE 0.620 109.000 0.318 1.000 N NA
 7303734 7303735 EcSMS35_3520 EcSMS35_3521 nanA nanR FALSE 0.308 122.000 0.091 1.000 N NA
 7303737 7303738 EcSMS35_3523 EcSMS35_3524 sspB sspA TRUE 0.984 6.000 0.831 NA   NA
 7303740 7303741 EcSMS35_3525 EcSMS35_3527 rpsI rplM TRUE 0.994 16.000 0.601 0.009 Y NA
 7303741 7303742 EcSMS35_3527 EcSMS35_3528 rplM   FALSE 0.011 219.000 0.003 NA   NA
 7303743 7303744 EcSMS35_3529 EcSMS35_3530   degQ FALSE 0.204 154.000 0.154 NA   NA
 7303744 7303745 EcSMS35_3530 EcSMS35_3531 degQ degS TRUE 0.930 90.000 0.262 0.002 Y NA
 7303747 7303748 EcSMS35_3533 EcSMS35_3534 argR ycfR FALSE 0.003 365.000 0.000 NA   NA
 7303749 7303750 EcSMS35_3535 EcSMS35_3536   aaeB FALSE 0.140 92.000 0.027 NA   NA
 7303750 7303751 EcSMS35_3536 EcSMS35_3537 aaeB aaeA TRUE 0.979 6.000 0.667 NA   NA
 7303751 7303752 EcSMS35_3537 EcSMS35_3538 aaeA aaeX TRUE 0.830 8.000 0.100 NA   NA
 7303754 7303755 EcSMS35_3540 EcSMS35_3541 tldD   FALSE 0.083 156.000 0.050 NA   NA
 7303755 7303756 EcSMS35_3541 EcSMS35_3542   cafA TRUE 0.617 68.000 0.296 NA   NA
 7303756 7303757 EcSMS35_3542 EcSMS35_3543 cafA maf1 TRUE 0.970 -10.000 0.417 NA N NA
 7303757 7303758 EcSMS35_3543 EcSMS35_3544 maf1 lytS TRUE 0.911 9.000 0.206 NA N NA
 7303758 7303759 EcSMS35_3544 EcSMS35_3545 lytS mreC TRUE 0.998 0.000 0.550 0.001 Y NA
 7303759 7303760 EcSMS35_3545 EcSMS35_3546 mreC mreB TRUE 0.859 66.000 0.689 1.000 N NA
 7303760 7303761 EcSMS35_3546 EcSMS35_3547 mreB   FALSE 0.009 305.000 0.000 1.000 N NA
 7303762 7303763 EcSMS35_3548 EcSMS35_3549     FALSE 0.263 37.000 0.000 NA   NA
 7303763 7303764 EcSMS35_3549 EcSMS35_3550   accB FALSE 0.001 866.000 0.000 NA   NA
 7303764 7303765 EcSMS35_3550 EcSMS35_3551 accB accC TRUE 0.992 11.000 0.275 0.000 Y NA
 7303765 7303766 EcSMS35_3551 EcSMS35_3552 accC   FALSE 0.286 109.000 0.103 NA   NA
 7303766 7303767 EcSMS35_3552 EcSMS35_3553   panF TRUE 0.983 -10.000 0.682 NA   NA
 7303767 7303768 EcSMS35_3553 EcSMS35_3554 panF prmA TRUE 0.724 12.000 0.041 1.000 N NA
 7303768 7303769 EcSMS35_3554 EcSMS35_3555 prmA dusB FALSE 0.067 329.000 0.042 1.000 Y NA
 7303769 7303770 EcSMS35_3555 EcSMS35_3556 dusB fis TRUE 0.774 26.000 0.161 1.000 N NA
 7303770 7303771 EcSMS35_3556 EcSMS35_3557 fis   TRUE 0.701 86.000 0.016 1.000 Y NA
 7303771 7303772 EcSMS35_3557 EcSMS35_3558     FALSE 0.209 150.000 0.143 NA   NA
 7303774 7303775 EcSMS35_3560 EcSMS35_3561 acrE   FALSE 0.523 12.000 0.000 NA   NA
 7303775 7303776 EcSMS35_3561 EcSMS35_3562     FALSE 0.009 253.000 0.000 NA   NA
 7303776 7303777 EcSMS35_3562 EcSMS35_3563     FALSE 0.002 431.000 0.000 NA   NA
 7303777 7303778 EcSMS35_3563 EcSMS35_3564     TRUE 0.964 68.000 0.548 0.043 Y NA
 7303778 7303779 EcSMS35_3564 EcSMS35_3565     TRUE 0.997 10.000 0.815 0.012 Y NA
 7303779 7303780 EcSMS35_3565 EcSMS35_3566     TRUE 0.996 8.000 0.734 1.000 Y NA
 7303781 7303782 EcSMS35_3567 EcSMS35_3568 rrf   FALSE 0.255 39.000 0.000 NA   NA
 7303782 7303783 EcSMS35_3568 EcSMS35_3569   rrf FALSE 0.483 14.000 0.000 NA   NA
 7303783 7303784 EcSMS35_3569 EcSMS35_3570 rrf rrl FALSE 0.121 97.000 0.000 NA   NA
 7303784 7303785 EcSMS35_3570 EcSMS35_3572 rrl   FALSE 0.032 183.000 0.000 NA   NA
 7303785 7303786 EcSMS35_3572 EcSMS35_3573     FALSE 0.242 42.000 0.000 NA   NA
 7303786 7303787 EcSMS35_3573 EcSMS35_3574   rrs FALSE 0.144 69.000 0.000 NA   NA
 7303789 7303790 EcSMS35_3575 EcSMS35_3577   aroE TRUE 0.838 -3.000 0.043 NA   NA
 7303790 7303791 EcSMS35_3577 EcSMS35_3578 aroE   TRUE 0.851 5.000 0.087 NA N NA
 7303791 7303792 EcSMS35_3578 EcSMS35_3579     TRUE 0.892 5.000 0.137 NA N NA
 7303792 7303793 EcSMS35_3579 EcSMS35_3580   smg TRUE 0.835 29.000 0.331 NA   NA
 7303793 7303794 EcSMS35_3580 EcSMS35_3581 smg dprA TRUE 0.837 -28.000 0.124 NA   NA
 7303795 7303796 EcSMS35_3582 EcSMS35_3583 def fmt TRUE 0.968 15.000 0.058 0.014 Y NA
 7303796 7303797 EcSMS35_3583 EcSMS35_3584 fmt rsmB TRUE 0.939 46.000 0.305 1.000 Y NA
 7303797 7303798 EcSMS35_3584 EcSMS35_3585 rsmB trkA TRUE 0.769 22.000 0.122 1.000 N NA
 7303798 7303799 EcSMS35_3585 EcSMS35_3586 trkA mscL FALSE 0.171 130.000 0.035 1.000 N NA
 7303800 7303801 EcSMS35_3587 EcSMS35_3588 zntR   TRUE 0.785 11.000 0.095 NA   NA
 7303801 7303802 EcSMS35_3588 EcSMS35_3589   rplQ FALSE 0.096 107.000 0.012 NA   NA
 7303802 7303803 EcSMS35_3589 EcSMS35_3590 rplQ rpoA TRUE 0.939 41.000 0.873 1.000 N NA
 7303803 7303804 EcSMS35_3590 EcSMS35_3591 rpoA rpsD TRUE 0.932 26.000 0.549 1.000 N NA
 7303804 7303805 EcSMS35_3591 EcSMS35_3592 rpsD rpsK TRUE 0.984 34.000 0.509 0.012 Y NA
 7303805 7303806 EcSMS35_3592 EcSMS35_3593 rpsK rpsM TRUE 0.995 17.000 0.810 0.009 Y NA
 7303806 7303807 EcSMS35_3593 EcSMS35_3594 rpsM rpmJ TRUE 0.742 147.000 0.086 0.009 Y NA
 7303807 7303808 EcSMS35_3594 EcSMS35_3595 rpmJ secY FALSE 0.483 32.000 0.036 1.000 N NA
 7303808 7303809 EcSMS35_3595 EcSMS35_3596 secY rplO TRUE 0.983 8.000 0.730 1.000 N NA
 7303809 7303810 EcSMS35_3596 EcSMS35_3597 rplO rpmD TRUE 0.998 4.000 0.653 0.001 Y NA
 7303810 7303811 EcSMS35_3597 EcSMS35_3598 rpmD rpsE TRUE 0.998 4.000 0.789 0.012 Y NA
 7303811 7303812 EcSMS35_3598 EcSMS35_3599 rpsE rplR TRUE 0.996 15.000 0.814 0.012 Y NA
 7303812 7303813 EcSMS35_3599 EcSMS35_3600 rplR rplF TRUE 0.997 10.000 0.815 0.009 Y NA
 7303813 7303814 EcSMS35_3600 EcSMS35_3601 rplF rpsH TRUE 0.996 13.000 0.808 0.009 Y NA
 7303814 7303815 EcSMS35_3601 EcSMS35_3602 rpsH rpsN TRUE 0.983 34.000 0.473 0.009 Y NA
 7303815 7303816 EcSMS35_3602 EcSMS35_3603 rpsN rplE TRUE 0.992 15.000 0.496 0.009 Y NA
 7303816 7303817 EcSMS35_3603 EcSMS35_3604 rplE rplX TRUE 0.996 15.000 0.758 0.009 Y NA
 7303817 7303818 EcSMS35_3604 EcSMS35_3605 rplX rplN TRUE 0.997 11.000 0.810 0.012 Y NA
 7303818 7303819 EcSMS35_3605 EcSMS35_3606 rplN rpsQ TRUE 0.922 165.000 0.791 0.012 Y NA
 7303819 7303820 EcSMS35_3606 EcSMS35_3607 rpsQ rpmC TRUE 0.999 0.000 0.828 0.009 Y NA
 7303820 7303821 EcSMS35_3607 EcSMS35_3608 rpmC rplP TRUE 0.999 0.000 0.802 0.009 Y NA
 7303821 7303822 EcSMS35_3608 EcSMS35_3609 rplP rpsC TRUE 0.996 13.000 0.828 0.012 Y NA
 7303822 7303823 EcSMS35_3609 EcSMS35_3610 rpsC rplV TRUE 0.994 18.000 0.719 0.012 Y NA
 7303823 7303824 EcSMS35_3610 EcSMS35_3611 rplV rpsS TRUE 0.995 15.000 0.769 0.012 Y NA
 7303824 7303825 EcSMS35_3611 EcSMS35_3612 rpsS rplB TRUE 0.995 17.000 0.820 0.012 Y NA
 7303825 7303826 EcSMS35_3612 EcSMS35_3613 rplB rplW TRUE 0.995 18.000 0.849 0.012 Y NA
 7303826 7303827 EcSMS35_3613 EcSMS35_3614 rplW rplD TRUE 0.998 -3.000 0.513 0.009 Y NA
 7303827 7303828 EcSMS35_3614 EcSMS35_3615 rplD rplC TRUE 0.994 11.000 0.486 0.009 Y NA
 7303828 7303829 EcSMS35_3615 EcSMS35_3616 rplC rpsJ TRUE 0.973 33.000 0.307 0.012 Y NA
 7303831 7303832 EcSMS35_3617 EcSMS35_3619 bfr bfd TRUE 0.709 73.000 0.033 NA Y NA
 7303832 7303833 EcSMS35_3619 EcSMS35_3620 bfd tuf2 FALSE 0.032 183.000 0.007 NA N NA
 7303833 7303834 EcSMS35_3620 EcSMS35_3621 tuf2 fusA TRUE 0.960 71.000 0.400 0.001 Y NA
 7303834 7303835 EcSMS35_3621 EcSMS35_3622 fusA rpsG TRUE 0.938 97.000 0.579 1.000 Y NA
 7303835 7303836 EcSMS35_3622 EcSMS35_3623 rpsG rpsL TRUE 0.968 97.000 0.620 0.002 Y NA
 7303836 7303837 EcSMS35_3623 EcSMS35_3624 rpsL dsrH FALSE 0.185 126.000 0.058 NA N NA
 7303837 7303838 EcSMS35_3624 EcSMS35_3625 dsrH tusC TRUE 0.995 8.000 0.804 NA Y NA
 7303838 7303839 EcSMS35_3625 EcSMS35_3626 tusC tusD TRUE 0.998 0.000 0.790 NA Y NA
 7303839 7303840 EcSMS35_3626 EcSMS35_3627 tusD   TRUE 0.956 0.000 0.220 NA   NA
 7303840 7303841 EcSMS35_3627 EcSMS35_3628   fkpA FALSE 0.309 167.000 0.310 NA   NA
 7303843 7303844 EcSMS35_3630 EcSMS35_3631 slyD   TRUE 0.644 95.000 0.370 NA   NA
 7303844 7303845 EcSMS35_3631 EcSMS35_3632   kefB TRUE 0.950 10.000 0.400 NA   NA
 7303845 7303846 EcSMS35_3632 EcSMS35_3633 kefB kefG TRUE 0.993 0.000 0.927 1.000   NA
 7303847 7303848 EcSMS35_3634 EcSMS35_3635     TRUE 0.742 0.000 0.016 NA   NA
 7303848 7303849 EcSMS35_3635 EcSMS35_3636     TRUE 0.949 -6.000 0.222 NA   NA
 7303849 7303850 EcSMS35_3636 EcSMS35_3637     TRUE 0.679 54.000 0.303 NA   NA
 7303852 7303853 EcSMS35_3639 EcSMS35_3640 crp   FALSE 0.452 51.000 0.111 NA   NA
 7303854 7303855 EcSMS35_3641 EcSMS35_3642 argD pabA TRUE 0.861 86.000 0.088 0.010 Y NA
 7303855 7303856 EcSMS35_3642 EcSMS35_3643 pabA fic FALSE 0.404 32.000 0.008 1.000 N NA
 7303856 7303857 EcSMS35_3643 EcSMS35_3644 fic ppiA FALSE 0.015 262.000 0.000 1.000 N NA
 7303857 7303858 EcSMS35_3644 EcSMS35_3645 ppiA   FALSE 0.068 144.000 0.000 NA   NA
 7303859 7303860 EcSMS35_3646 EcSMS35_3647 tsgA nirB FALSE 0.010 262.000 0.000 NA N NA
 7303860 7303861 EcSMS35_3647 EcSMS35_3648 nirB nirD TRUE 0.997 -3.000 0.829 0.000 N NA
 7303861 7303862 EcSMS35_3648 EcSMS35_3649 nirD nirC TRUE 0.839 125.000 0.283 1.000 Y NA
 7303862 7303863 EcSMS35_3649 EcSMS35_3650 nirC cysG TRUE 0.582 19.000 0.000 1.000 N NA
 7303863 7303864 EcSMS35_3650 EcSMS35_3651 cysG   FALSE 0.010 251.000 0.000 NA   NA
 7303865 7303866 EcSMS35_3652 EcSMS35_3653     TRUE 0.859 12.000 0.185 NA   NA
 7303866 7303867 EcSMS35_3653 EcSMS35_3654     TRUE 0.975 12.000 0.828 NA   NA
 7303867 7303868 EcSMS35_3654 EcSMS35_3655     TRUE 0.935 11.000 0.312 1.000   NA
 7303868 7303869 EcSMS35_3655 EcSMS35_3656     TRUE 0.930 -3.000 0.094 1.000   NA
 7303869 7303870 EcSMS35_3656 EcSMS35_3657     TRUE 0.989 0.000 0.625 NA N NA
 7303870 7303871 EcSMS35_3657 EcSMS35_3658     FALSE 0.521 84.000 0.233 NA   NA
 7303871 7303872 EcSMS35_3658 EcSMS35_3659     TRUE 0.945 17.000 0.562 NA   NA
 7303872 7303873 EcSMS35_3659 EcSMS35_3660   trpS FALSE 0.035 160.000 0.004 NA   NA
 7303873 7303874 EcSMS35_3660 EcSMS35_3661 trpS gph TRUE 0.917 -7.000 0.118 1.000   NA
 7303874 7303875 EcSMS35_3661 EcSMS35_3662 gph rpe TRUE 0.917 -7.000 0.120 1.000   NA
 7303875 7303876 EcSMS35_3662 EcSMS35_3663 rpe dam TRUE 0.641 18.000 0.040 1.000 N NA
 7303876 7303877 EcSMS35_3663 EcSMS35_3664 dam damX FALSE 0.483 107.000 0.234 NA   NA
 7303877 7303878 EcSMS35_3664 EcSMS35_3665 damX aroB FALSE 0.127 92.000 0.022 NA   NA
 7303878 7303879 EcSMS35_3665 EcSMS35_3666 aroB aroK TRUE 0.886 57.000 0.208 1.000 Y NA
 7303879 7303880 EcSMS35_3666 EcSMS35_3667 aroK hofQ FALSE 0.122 245.000 0.319 1.000 N NA
 7303880 7303881 EcSMS35_3667 EcSMS35_3668 hofQ   TRUE 0.723 -88.000 0.072 NA   NA
 7303881 7303882 EcSMS35_3668 EcSMS35_3669     TRUE 0.970 -10.000 0.444 NA   NA
 7303884 7303885 EcSMS35_3671 EcSMS35_3672   hofM TRUE 0.992 0.000 0.870 NA   NA
 7303888 7303889 EcSMS35_3675 EcSMS35_3676     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7303889 7303890 EcSMS35_3676 EcSMS35_3677     FALSE 0.444 65.000 0.122 1.000   NA
 7303890 7303891 EcSMS35_3677 EcSMS35_3678   hslR TRUE 0.754 11.000 0.056 1.000   NA
 7303891 7303892 EcSMS35_3678 EcSMS35_3679 hslR hslO TRUE 0.762 25.000 0.140 1.000 N NA
 7303893 7303894 EcSMS35_3680 EcSMS35_3681     TRUE 0.631 6.000 0.000 NA   NA
 7303895 7303896 EcSMS35_3682 EcSMS35_3683 pckA   FALSE 0.106 115.000 0.000 NA   NA
 7303896 7303897 EcSMS35_3683 EcSMS35_3684     TRUE 0.596 59.000 0.250 NA   NA
 7303898 7303899 EcSMS35_3685 EcSMS35_3686 envZ ompR TRUE 0.997 -3.000 0.584 1.000 Y NA
 7303900 7303901 EcSMS35_3687 EcSMS35_3688 greB   TRUE 0.794 97.000 0.123 1.000 Y NA
 7303901 7303902 EcSMS35_3688 EcSMS35_3689   feoA FALSE 0.004 438.000 0.000 1.000 N NA
 7303902 7303903 EcSMS35_3689 EcSMS35_3690 feoA feoB TRUE 0.965 17.000 0.177 1.000 Y NA
 7303903 7303904 EcSMS35_3690 EcSMS35_3691 feoB   TRUE 0.981 0.000 0.455 NA   NA
 7303904 7303905 EcSMS35_3691 EcSMS35_3692     FALSE 0.022 203.000 0.000 NA   NA
 7303907 7303908 EcSMS35_3694 EcSMS35_3695 gntX gntY FALSE 0.347 59.000 0.066 1.000   NA
 7303908 7303909 EcSMS35_3695 EcSMS35_3696 gntY gntT FALSE 0.005 361.000 0.000 1.000   NA
 7303910 7303911 EcSMS35_3697 EcSMS35_3698 malQ malP TRUE 0.985 10.000 0.137 0.016 Y NA
 7303913 7303914 EcSMS35_3700 EcSMS35_3701 rtcA rtcB TRUE 0.837 4.000 0.081 NA   NA
 7303916 7303917 EcSMS35_3702 EcSMS35_3704 glpR   TRUE 0.846 17.000 0.190 1.000   NA
 7303917 7303918 EcSMS35_3704 EcSMS35_3705   glpE TRUE 0.829 45.000 0.405 1.000   NA
 7303920 7303921 EcSMS35_3707 EcSMS35_3708     TRUE 0.697 3.000 0.000 NA   NA
 7303921 7303922 EcSMS35_3708 EcSMS35_3709     TRUE 0.884 26.000 0.000 NA Y NA
 7303922 7303923 EcSMS35_3709 EcSMS35_3710   glgP FALSE 0.100 129.000 0.016 NA N NA
 7303923 7303924 EcSMS35_3710 EcSMS35_3711 glgP glgA TRUE 0.969 19.000 0.228 1.000 Y NA
 7303924 7303925 EcSMS35_3711 EcSMS35_3712 glgA glgC TRUE 0.994 0.000 0.307 1.000 Y NA
 7303925 7303926 EcSMS35_3712 EcSMS35_3713 glgC glgX TRUE 0.970 18.000 0.228 1.000 Y NA
 7303926 7303927 EcSMS35_3713 EcSMS35_3714 glgX glgB TRUE 0.992 -3.000 0.020 0.002 Y NA
 7303927 7303928 EcSMS35_3714 EcSMS35_3715 glgB asd FALSE 0.013 273.000 0.000 1.000 N NA
 7303930 7303931 EcSMS35_3717 EcSMS35_3718     TRUE 0.993 0.000 0.233 1.000 Y NA
 7303931 7303932 EcSMS35_3718 EcSMS35_3719   gntU FALSE 0.127 140.000 0.000 1.000 N NA
 7303932 7303933 EcSMS35_3719 EcSMS35_3720 gntU gntK TRUE 0.971 4.000 0.000 1.000 Y NA
 7303933 7303934 EcSMS35_3720 EcSMS35_3721 gntK gntR FALSE 0.178 118.000 0.000 1.000 N NA
 7303936 7303937 EcSMS35_3722 EcSMS35_3724     TRUE 0.597 123.000 0.400 NA   NA
 7303941 7303942 EcSMS35_3727 EcSMS35_3729 ugpQ ugpC TRUE 0.928 -3.000 0.080 1.000 N NA
 7303942 7303943 EcSMS35_3729 EcSMS35_3730 ugpC   TRUE 0.995 2.000 0.272 0.043 Y NA
 7303943 7303944 EcSMS35_3730 EcSMS35_3731   ugpA TRUE 0.997 -3.000 0.306 0.043 Y NA
 7303944 7303945 EcSMS35_3731 EcSMS35_3732 ugpA ugpB TRUE 0.971 98.000 0.793 0.043 Y NA
 7303945 7303946 EcSMS35_3732 EcSMS35_3733 ugpB   FALSE 0.018 211.000 0.000 NA   NA
 7303946 7303947 EcSMS35_3733 EcSMS35_3734     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7303949 7303950 EcSMS35_3735 EcSMS35_3737 livF livG TRUE 0.999 2.000 0.967 0.013 Y NA
 7303950 7303951 EcSMS35_3737 EcSMS35_3738 livG livM TRUE 0.997 -3.000 0.574 1.000 Y NA
 7303951 7303952 EcSMS35_3738 EcSMS35_3739 livM livH TRUE 0.998 -3.000 0.574 0.043 Y NA
 7303952 7303953 EcSMS35_3739 EcSMS35_3740 livH livK TRUE 0.813 48.000 0.000 1.000 Y NA
 7303953 7303954 EcSMS35_3740 EcSMS35_3741 livK   FALSE 0.056 152.000 0.000 NA   NA
 7303956 7303957 EcSMS35_3743 EcSMS35_3744 livJ rpoH FALSE 0.013 272.000 0.000 1.000 N NA
 7303957 7303958 EcSMS35_3744 EcSMS35_3745 rpoH ftsX FALSE 0.028 245.000 0.051 1.000 N NA
 7303958 7303959 EcSMS35_3745 EcSMS35_3746 ftsX ftsE TRUE 0.986 -7.000 0.121 1.000 Y NA
 7303959 7303960 EcSMS35_3746 EcSMS35_3747 ftsE ftsY TRUE 0.953 3.000 0.117 0.071 N NA
 7303961 7303962 EcSMS35_3748 EcSMS35_3749 rsmD   TRUE 0.806 -10.000 0.063 NA   NA
 7303964 7303965 EcSMS35_3751 EcSMS35_3752   zntA TRUE 0.762 74.000 0.325 0.063   NA
 7303966 7303967 EcSMS35_3753 EcSMS35_3754   tusA FALSE 0.017 215.000 0.000 NA   NA
 7303968 7303969 EcSMS35_3755 EcSMS35_3756     FALSE 0.254 73.000 0.066 NA   NA
 7303971 7303972 EcSMS35_3758 EcSMS35_3759   acpT TRUE 0.669 55.000 0.300 NA   NA
 7303972 7303973 EcSMS35_3759 EcSMS35_3760 acpT nikA FALSE 0.187 111.000 0.000 1.000 N NA
 7303973 7303974 EcSMS35_3760 EcSMS35_3761 nikA nikB TRUE 0.999 0.000 0.833 0.001 Y NA
 7303974 7303975 EcSMS35_3761 EcSMS35_3762 nikB nikC TRUE 0.999 -3.000 0.629 0.001 Y NA
 7303975 7303976 EcSMS35_3762 EcSMS35_3763 nikC nikD TRUE 0.998 0.000 0.409 0.001 Y NA
 7303976 7303977 EcSMS35_3763 EcSMS35_3764 nikD nikE TRUE 0.997 -3.000 0.290 0.001 Y NA
 7303977 7303978 EcSMS35_3764 EcSMS35_3765 nikE nikR TRUE 0.783 6.000 0.031 1.000 N NA
 7303978 7303979 EcSMS35_3765 EcSMS35_3766 nikR   FALSE 0.379 199.000 0.000 0.065 Y NA
 7303979 7303980 EcSMS35_3766 EcSMS35_3767     TRUE 0.774 25.000 0.150 1.000 N NA
 7303980 7303981 EcSMS35_3767 EcSMS35_3768     TRUE 0.996 -3.000 0.231 0.009 Y NA
 7303981 7303982 EcSMS35_3768 EcSMS35_3769     TRUE 0.954 74.000 0.444 0.014 Y NA
 7303982 7303983 EcSMS35_3769 EcSMS35_3770     TRUE 0.992 -7.000 0.273 1.000 Y NA
 7303983 7303984 EcSMS35_3770 EcSMS35_3771     TRUE 0.971 -10.000 0.000 1.000 Y NA
 7303984 7303985 EcSMS35_3771 EcSMS35_3772   gatY TRUE 0.970 32.000 0.429 1.000 Y NA
 7303986 7303987 EcSMS35_3773 EcSMS35_3774     FALSE 0.004 371.000 0.000 1.000   NA
 7303987 7303988 EcSMS35_3774 EcSMS35_3775     TRUE 0.992 0.000 0.500 0.005   NA
 7303988 7303989 EcSMS35_3775 EcSMS35_3776     TRUE 0.945 -3.000 0.049 0.081   NA
 7303989 7303990 EcSMS35_3776 EcSMS35_3777     FALSE 0.152 63.000 0.000 NA   NA
 7303990 7303991 EcSMS35_3777 EcSMS35_3778     FALSE 0.028 190.000 0.000 NA   NA
 7303991 7303992 EcSMS35_3778 EcSMS35_3779     FALSE 0.008 262.000 0.000 NA   NA
 7303997 7303998 EcSMS35_3784 EcSMS35_3785 uspA   FALSE 0.008 316.000 0.000 1.000 N NA
 7303999 7304000 EcSMS35_3786 EcSMS35_3787   prlC TRUE 0.828 8.000 0.098 NA   NA
 7304001 7304002 EcSMS35_3788 EcSMS35_3789 yhiR gor FALSE 0.394 72.000 0.100 1.000   NA
 7304006 7304007 EcSMS35_3793 EcSMS35_3794 arsR arsB FALSE 0.283 55.000 0.000 1.000 N NA
 7304007 7304008 EcSMS35_3794 EcSMS35_3795 arsB arsC TRUE 0.943 13.000 0.000 1.000 Y NA
 7304010 7304011 EcSMS35_3797 EcSMS35_3798     FALSE 0.001 580.000 0.000 NA   NA
 7304011 7304012 EcSMS35_3798 EcSMS35_3799     FALSE 0.128 90.000 0.000 NA   NA
 7304012 7304013 EcSMS35_3799 EcSMS35_3800   dctR FALSE 0.098 153.000 0.000 1.000 N NA
 7304014 7304015 EcSMS35_3801 EcSMS35_3802 hmuS chuA TRUE 0.836 49.000 0.056 1.000 Y NA
 7304016 7304017 EcSMS35_3803 EcSMS35_3804     FALSE 0.054 154.000 0.000 NA   NA
 7304017 7304018 EcSMS35_3804 EcSMS35_3805     TRUE 0.542 20.000 0.010 1.000 N NA
 7304018 7304019 EcSMS35_3805 EcSMS35_3806     TRUE 0.817 13.000 0.135 NA N NA
 7304019 7304020 EcSMS35_3806 EcSMS35_3807     TRUE 0.869 0.000 0.054 NA N NA
 7304020 7304021 EcSMS35_3807 EcSMS35_3808     FALSE 0.298 49.000 0.010 1.000 N NA
 7304021 7304022 EcSMS35_3808 EcSMS35_3809   hmuV TRUE 0.982 -33.000 0.220 1.000 Y NA
 7304023 7304024 EcSMS35_3810 EcSMS35_3811   hdeB FALSE 0.190 52.000 0.000 NA   NA
 7304024 7304025 EcSMS35_3811 EcSMS35_3812 hdeB   FALSE 0.115 104.000 0.000 NA   NA
 7304026 7304027 EcSMS35_3813 EcSMS35_3814   gadE FALSE 0.001 798.000 0.000 NA   NA
 7304029 7304030 EcSMS35_3816 EcSMS35_3817 mdtE mdtF FALSE 0.520 25.000 0.000 1.000 N NA
 7304031 7304032 EcSMS35_3818 EcSMS35_3819 gadW gadX FALSE 0.078 369.000 0.000 0.008 Y NA
 7304032 7304033 EcSMS35_3819 EcSMS35_3820 gadX gadB FALSE 0.006 360.000 0.000 1.000 N NA
 7304033 7304034 EcSMS35_3820 EcSMS35_3821 gadB   FALSE 0.034 211.000 0.000 1.000 N NA
 7304035 7304036 EcSMS35_3822 EcSMS35_3823   treF FALSE 0.114 105.000 0.000 NA   NA
 7304038 7304039 EcSMS35_3825 EcSMS35_3826     FALSE 0.500 49.000 0.098 1.000   NA
 7304039 7304040 EcSMS35_3826 EcSMS35_3827     FALSE 0.004 392.000 0.000 1.000   NA
 7304041 7304042 EcSMS35_3828 EcSMS35_3829     FALSE 0.174 70.000 0.000 NA N NA
 7304042 7304043 EcSMS35_3829 EcSMS35_3830     FALSE 0.014 226.000 0.000 NA   NA
 7304044 7304045 EcSMS35_3831 EcSMS35_3832 kdgK   FALSE 0.124 95.000 0.000 NA   NA
 7304045 7304046 EcSMS35_3832 EcSMS35_3834     TRUE 0.646 -13.000 0.000 NA   NA
 7304047 7304048 EcSMS35_3833 EcSMS35_3835     FALSE 0.032 183.000 0.000 NA   NA
 7304048 7304049 EcSMS35_3835 EcSMS35_3836   dctA FALSE 0.053 220.000 0.088 1.000   NA
 7304051 7304052 EcSMS35_3838 EcSMS35_3839     FALSE 0.303 121.000 0.088 1.000 N NA
 7304052 7304053 EcSMS35_3839 EcSMS35_3840   bcsZ TRUE 0.945 -18.000 0.263 1.000 N NA
 7304053 7304054 EcSMS35_3840 EcSMS35_3841 bcsZ bcsB TRUE 0.809 1.000 0.000 1.000   NA
 7304054 7304055 EcSMS35_3841 EcSMS35_3842 bcsB bcsA TRUE 0.684 41.000 0.000 0.001   NA
 7304055 7304056 EcSMS35_3842 EcSMS35_3843 bcsA   TRUE 0.987 -3.000 0.545 NA N NA
 7304056 7304057 EcSMS35_3843 EcSMS35_3844     TRUE 0.948 12.000 0.464 NA   NA
 7304058 7304059 EcSMS35_3845 EcSMS35_3846   bcsF TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7304059 7304060 EcSMS35_3846 EcSMS35_3847 bcsF   TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7304070 7304071 EcSMS35_3857 EcSMS35_3858     FALSE 0.013 231.000 0.000 NA   NA
 7304072 7304073 EcSMS35_3859 EcSMS35_3860 dppF dppD TRUE 0.998 -3.000 0.500 0.002 Y NA
 7304073 7304074 EcSMS35_3860 EcSMS35_3861 dppD dppC TRUE 0.992 11.000 0.560 1.000 Y NA
 7304074 7304075 EcSMS35_3861 EcSMS35_3862 dppC dppB TRUE 0.997 10.000 0.779 0.042 Y NA
 7304077 7304078 EcSMS35_3863 EcSMS35_3865 dppA   FALSE 0.003 352.000 0.000 NA   NA
 7304078 7304079 EcSMS35_3865 EcSMS35_3866     FALSE 0.090 128.000 0.000 NA   NA
 7304079 7304080 EcSMS35_3866 EcSMS35_3867     FALSE 0.128 91.000 0.000 NA   NA
 7304080 7304081 EcSMS35_3867 EcSMS35_3868     FALSE 0.017 324.000 0.000 0.062   NA
 7304081 7304082 EcSMS35_3868 EcSMS35_3869     FALSE 0.025 229.000 0.000 1.000 N NA
 7304083 7304084 EcSMS35_3870 EcSMS35_3872 tag   TRUE 0.860 -3.000 0.028 1.000   NA
 7304086 7304087 EcSMS35_3873 EcSMS35_3874   tkrA FALSE 0.196 104.000 0.000 1.000 N NA
 7304089 7304090 EcSMS35_3876 EcSMS35_3877     FALSE 0.097 281.000 0.000 1.000 Y NA
 7304092 7304093 EcSMS35_3879 EcSMS35_3880     TRUE 0.997 -3.000 0.571 1.000 Y NA
 7304094 7304095 EcSMS35_3881 EcSMS35_3882 glyS glyQ TRUE 0.997 10.000 0.651 0.000 Y NA
 7304095 7304096 EcSMS35_3882 EcSMS35_3883 glyQ   FALSE 0.103 95.000 0.010 NA   NA
 7304098 7304099 EcSMS35_3885 EcSMS35_3886     FALSE 0.257 46.000 0.032 NA   NA
 7304099 7304100 EcSMS35_3886 EcSMS35_3887   xylB FALSE 0.151 169.000 0.143 NA   NA
 7304100 7304101 EcSMS35_3887 EcSMS35_3888 xylB xylA TRUE 0.740 72.000 0.034 1.000 Y NA
 7304102 7304103 EcSMS35_3889 EcSMS35_3890 xylF xylG TRUE 0.928 78.000 0.518 NA Y NA
 7304103 7304104 EcSMS35_3890 EcSMS35_3891 xylG xylH TRUE 0.992 -22.000 0.469 1.000 Y NA
 7304104 7304105 EcSMS35_3891 EcSMS35_3892 xylH xylR FALSE 0.471 78.000 0.146 1.000 N NA
 7304107 7304108 EcSMS35_3894 EcSMS35_3895 malS avtA FALSE 0.121 178.000 0.085 1.000 N NA
 7304109 7304110 EcSMS35_3896 EcSMS35_3897     TRUE 0.692 102.000 0.400 1.000 N NA
 7304111 7304112 EcSMS35_3898 EcSMS35_3899 dlgD   TRUE 0.582 12.000 0.000 NA N NA
 7304112 7304113 EcSMS35_3899 EcSMS35_3900     TRUE 0.619 118.000 0.000 NA Y NA
 7304113 7304114 EcSMS35_3900 EcSMS35_3901     TRUE 0.997 3.000 0.864 NA Y NA
 7304114 7304115 EcSMS35_3901 EcSMS35_3902     TRUE 0.943 13.000 0.000 1.000 Y NA
 7304115 7304116 EcSMS35_3902 EcSMS35_3903   lyx TRUE 0.971 4.000 0.000 1.000 Y NA
 7304116 7304117 EcSMS35_3903 EcSMS35_3904 lyx sgbH TRUE 0.998 -3.000 0.900 1.000 Y NA
 7304117 7304118 EcSMS35_3904 EcSMS35_3905 sgbH   TRUE 0.994 -7.000 0.360 1.000 Y NA
 7304118 7304119 EcSMS35_3905 EcSMS35_3906   sgbE TRUE 0.990 -6.000 0.200 1.000 Y NA
 7304121 7304122 EcSMS35_3908 EcSMS35_3909     TRUE 0.980 11.000 0.833 1.000   NA
 7304125 7304126 EcSMS35_3911 EcSMS35_3913     TRUE 0.631 6.000 0.000 NA   NA
 7304128 7304129 EcSMS35_3915 EcSMS35_3916 aldB   FALSE 0.166 108.000 0.000 1.000   NA
 7304129 7304130 EcSMS35_3916 EcSMS35_3917   adhB FALSE 0.128 130.000 0.000 1.000   NA
 7304130 7304131 EcSMS35_3917 EcSMS35_3918 adhB selB FALSE 0.047 191.000 0.015 1.000 N NA
 7304131 7304132 EcSMS35_3918 EcSMS35_3919 selB selA TRUE 0.995 -3.000 0.569 0.000 N NA
 7304132 7304133 EcSMS35_3919 EcSMS35_3920 selA   FALSE 0.240 98.000 0.040 1.000 N NA
 7304133 7304134 EcSMS35_3920 EcSMS35_3921     FALSE 0.077 157.000 0.000 1.000   NA
 7304134 7304135 EcSMS35_3921 EcSMS35_3922     FALSE 0.059 172.000 0.000 1.000   NA
 7304135 7304136 EcSMS35_3922 EcSMS35_3923     TRUE 0.990 -7.000 0.500 0.007   NA
 7304136 7304137 EcSMS35_3923 EcSMS35_3924     FALSE 0.108 113.000 0.000 NA   NA
 7304137 7304138 EcSMS35_3924 EcSMS35_3925     FALSE 0.313 30.000 0.000 NA   NA
 7304138 7304139 EcSMS35_3925 EcSMS35_3926     TRUE 0.997 8.000 1.000 1.000 Y NA
 7304139 7304140 EcSMS35_3926 EcSMS35_3927     TRUE 0.890 72.000 1.000 1.000   NA
 7304141 7304142 EcSMS35_3928 EcSMS35_3929     FALSE 0.109 191.000 0.000 0.048   NA
 7304143 7304144 EcSMS35_3930 EcSMS35_3931     TRUE 0.980 3.000 0.556 NA   NA
 7304145 7304146 EcSMS35_3932 EcSMS35_3933 mtlA mtlD TRUE 0.881 95.000 0.292 1.000 Y NA
 7304146 7304147 EcSMS35_3933 EcSMS35_3934 mtlD mtlR TRUE 0.962 0.000 0.230 NA N NA
 7304151 7304152 EcSMS35_3938 EcSMS35_3939     TRUE 0.733 44.000 0.286 NA   NA
 7304152 7304153 EcSMS35_3939 EcSMS35_3940   lldP FALSE 0.010 298.000 0.000 1.000 N NA
 7304153 7304154 EcSMS35_3940 EcSMS35_3941 lldP   TRUE 0.991 0.000 0.652 1.000 N NA
 7304154 7304155 EcSMS35_3941 EcSMS35_3942   lldD TRUE 0.978 -3.000 0.309 1.000 N NA
 7304155 7304156 EcSMS35_3942 EcSMS35_3943 lldD   FALSE 0.329 48.000 0.020 1.000 N NA
 7304157 7304158 EcSMS35_3944 EcSMS35_3945 cysE gpsA TRUE 0.738 80.000 0.429 1.000 N NA
 7304158 7304159 EcSMS35_3945 EcSMS35_3946 gpsA secB TRUE 0.963 0.000 0.206 1.000 N NA
 7304159 7304160 EcSMS35_3946 EcSMS35_3947 secB grxC FALSE 0.292 63.000 0.038 1.000 N NA
 7304160 7304161 EcSMS35_3947 EcSMS35_3948 grxC   FALSE 0.125 142.000 0.048 NA N NA
 7304162 7304163 EcSMS35_3949 EcSMS35_3950 gpmI   TRUE 0.723 34.000 0.170 1.000 N NA
 7304163 7304164 EcSMS35_3950 EcSMS35_3952     TRUE 0.879 4.000 0.088 1.000   NA
 7304165 7304166 EcSMS35_3951 EcSMS35_3953   tdh FALSE 0.015 239.000 0.000 NA N NA
 7304166 7304167 EcSMS35_3953 EcSMS35_3954 tdh kbl TRUE 0.972 10.000 0.547 1.000 N NA
 7304167 7304168 EcSMS35_3954 EcSMS35_3955 kbl   FALSE 0.222 46.000 0.000 NA   NA
 7304169 7304170 EcSMS35_3956 EcSMS35_3957 rfaD rfaF TRUE 0.977 10.000 0.146 1.000 Y NA
 7304170 7304171 EcSMS35_3957 EcSMS35_3958 rfaF rfaC TRUE 0.994 4.000 0.205 0.001 Y NA
 7304172 7304173 EcSMS35_3959 EcSMS35_3960     TRUE 0.530 46.000 0.133 NA   NA
 7304173 7304174 EcSMS35_3960 EcSMS35_3961   waaW TRUE 0.678 82.000 0.000 NA Y NA
 7304174 7304175 EcSMS35_3961 EcSMS35_3962 waaW rfaY FALSE 0.460 26.000 0.000 1.000   NA
 7304175 7304176 EcSMS35_3962 EcSMS35_3963 rfaY rfaJ2 TRUE 0.954 10.000 0.375 1.000   NA
 7304176 7304177 EcSMS35_3963 EcSMS35_3964 rfaJ2 rfaI TRUE 0.996 17.000 0.833 0.001 Y NA
 7304177 7304178 EcSMS35_3964 EcSMS35_3965 rfaI rfaP TRUE 0.566 16.000 0.000 1.000   NA
 7304178 7304179 EcSMS35_3965 EcSMS35_3966 rfaP rfaG TRUE 0.796 -7.000 0.000 1.000   NA
 7304179 7304180 EcSMS35_3966 EcSMS35_3967 rfaG rfaQ TRUE 0.988 -3.000 0.079 1.000 Y NA
 7304181 7304182 EcSMS35_3968 EcSMS35_3969 waaA coaD TRUE 0.743 8.000 0.020 1.000 N NA
 7304183 7304184 EcSMS35_3970 EcSMS35_3971 mutM rpmG FALSE 0.229 98.000 0.034 1.000 N NA
 7304184 7304185 EcSMS35_3971 EcSMS35_3972 rpmG rpmB TRUE 0.986 21.000 0.332 0.009 Y NA
 7304185 7304186 EcSMS35_3972 EcSMS35_3973 rpmB radC FALSE 0.025 217.000 0.002 1.000 N NA
 7304187 7304188 EcSMS35_3974 EcSMS35_3975 coaBC dut TRUE 0.924 -22.000 0.201 1.000 N NA
 7304188 7304189 EcSMS35_3975 EcSMS35_3976 dut slmA FALSE 0.277 107.000 0.060 1.000 N NA
 7304190 7304191 EcSMS35_3977 EcSMS35_3978 pyrE rph FALSE 0.243 66.000 0.022 1.000 N NA
 7304192 7304193 EcSMS35_3979 EcSMS35_3980   dinD FALSE 0.015 222.000 0.000 NA   NA
 7304193 7304194 EcSMS35_3980 EcSMS35_3982 dinD   FALSE 0.006 291.000 0.000 NA   NA
 7304196 7304197 EcSMS35_3983 EcSMS35_3984 gmk rpoZ TRUE 0.813 55.000 0.471 1.000 N NA
 7304197 7304198 EcSMS35_3984 EcSMS35_3985 rpoZ spoT TRUE 0.975 19.000 0.291 1.000 Y NA
 7304198 7304199 EcSMS35_3985 EcSMS35_3986 spoT trmH TRUE 0.875 7.000 0.095 1.000 N NA
 7304199 7304200 EcSMS35_3986 EcSMS35_3987 trmH recG TRUE 0.858 6.000 0.076 1.000 N NA
 7304202 7304203 EcSMS35_3989 EcSMS35_3990 yicE   FALSE 0.469 121.000 0.257 NA   NA
 7304204 7304205 EcSMS35_3991 EcSMS35_3992     TRUE 0.715 -19.000 0.000 1.000   NA
 7304205 7304206 EcSMS35_3992 EcSMS35_3993     TRUE 0.893 48.000 0.000 0.005 Y NA
 7304206 7304207 EcSMS35_3993 EcSMS35_3994     TRUE 0.906 81.000 0.167 0.002 Y NA
 7304207 7304208 EcSMS35_3994 EcSMS35_3995     FALSE 0.523 12.000 0.000 NA   NA
 7304208 7304209 EcSMS35_3995 EcSMS35_3996     FALSE 0.433 18.000 0.000 NA   NA
 7304209 7304210 EcSMS35_3996 EcSMS35_3997     TRUE 0.859 27.000 0.143 0.010 N NA
 7304212 7304213 EcSMS35_3999 EcSMS35_4000 yicI   TRUE 0.957 10.000 0.000 1.000 Y NA
 7304214 7304215 EcSMS35_4001 EcSMS35_4002     FALSE 0.046 163.000 0.000 NA   NA
 7304215 7304216 EcSMS35_4002 EcSMS35_4003     FALSE 0.501 13.000 0.000 NA   NA
 7304217 7304218 EcSMS35_4004 EcSMS35_4005   sid FALSE 0.009 257.000 0.000 NA   NA
 7304219 7304220 EcSMS35_4006 EcSMS35_4007     TRUE 0.589 183.000 1.000 NA   NA
 7304220 7304221 EcSMS35_4007 EcSMS35_4008     TRUE 0.991 -7.000 1.000 NA   NA
 7304221 7304222 EcSMS35_4008 EcSMS35_4009     TRUE 0.991 -7.000 1.000 NA   NA
 7304222 7304223 EcSMS35_4009 EcSMS35_4010     FALSE 0.077 136.000 0.000 NA   NA
 7304223 7304224 EcSMS35_4010 EcSMS35_4012     FALSE 0.467 15.000 0.000 NA   NA
 7304226 7304227 EcSMS35_4013 EcSMS35_4014   setC FALSE 0.002 382.000 0.000 NA   NA
 7304227 7304228 EcSMS35_4014 EcSMS35_4015 setC   TRUE 0.760 111.000 0.000 0.062 Y NA
 7304230 7304231 EcSMS35_4017 EcSMS35_4018     FALSE 0.005 302.000 0.000 NA   NA
 7304231 7304232 EcSMS35_4018 EcSMS35_4019     TRUE 0.579 10.000 0.000 NA   NA
 7304232 7304233 EcSMS35_4019 EcSMS35_4020     FALSE 0.169 56.000 0.000 NA   NA
 7304233 7304234 EcSMS35_4020 EcSMS35_4021     FALSE 0.501 13.000 0.000 NA   NA
 7304234 7304235 EcSMS35_4021 EcSMS35_4022     FALSE 0.233 44.000 0.000 NA   NA
 7304235 7304236 EcSMS35_4022 EcSMS35_4023     FALSE 0.034 203.000 0.000 1.000   NA
 7304237 7304238 EcSMS35_4024 EcSMS35_4025   nepI FALSE 0.022 203.000 0.000 NA   NA
 7304239 7304240 EcSMS35_4026 EcSMS35_4027     TRUE 0.978 -16.000 0.636 NA   NA
 7304241 7304242 EcSMS35_4028 EcSMS35_4029     FALSE 0.184 53.000 0.000 NA   NA
 7304244 7304245 EcSMS35_4031 EcSMS35_4032 uhpT uhpC TRUE 0.686 138.000 0.000 0.042 Y NA
 7304245 7304246 EcSMS35_4032 EcSMS35_4033 uhpC uhpB TRUE 0.862 10.000 0.000 0.061 N NA
 7304246 7304247 EcSMS35_4033 EcSMS35_4034 uhpB uhpA TRUE 0.989 0.000 0.000 0.012 Y NA
 7304247 7304248 EcSMS35_4034 EcSMS35_4035 uhpA   FALSE 0.047 162.000 0.000 NA   NA
 7304248 7304249 EcSMS35_4035 EcSMS35_4036     FALSE 0.017 216.000 0.000 NA   NA
 7304249 7304250 EcSMS35_4036 EcSMS35_4037   ilvN FALSE 0.008 263.000 0.000 NA   NA
 7304250 7304251 EcSMS35_4037 EcSMS35_4038 ilvN ilvB TRUE 0.992 4.000 0.649 0.001   NA
 7304253 7304254 EcSMS35_4040 EcSMS35_4041     TRUE 0.982 -3.000 0.429 NA   NA
 7304254 7304255 EcSMS35_4041 EcSMS35_4042     TRUE 0.979 -10.000 0.571 NA   NA
 7304255 7304256 EcSMS35_4042 EcSMS35_4043     FALSE 0.354 60.000 0.094 NA   NA
 7304256 7304257 EcSMS35_4043 EcSMS35_4044     TRUE 0.969 -3.000 0.235 1.000   NA
 7304259 7304260 EcSMS35_4045 EcSMS35_4047 glvA   TRUE 0.994 0.000 0.309 1.000 Y NA
 7304264 7304265 EcSMS35_4051 EcSMS35_4052 ibpB ibpA TRUE 0.729 112.000 0.099 NA Y NA
 7304269 7304270 EcSMS35_4055 EcSMS35_4057     FALSE 0.457 120.000 0.192 1.000 N NA
 7304270 7304271 EcSMS35_4057 EcSMS35_4058     TRUE 0.990 -3.000 0.385 0.043 N NA
 7304271 7304272 EcSMS35_4058 EcSMS35_4059   dgoK_1 TRUE 0.997 -16.000 0.909 1.000 Y NA
 7304272 7304273 EcSMS35_4059 EcSMS35_4060 dgoK_1 dgoR_1 TRUE 0.993 -3.000 0.733 1.000 N NA
 7304275 7304276 EcSMS35_4062 EcSMS35_4063 yidA   FALSE 0.106 115.000 0.000 NA   NA
 7304276 7304277 EcSMS35_4063 EcSMS35_4064   gyrB FALSE 0.068 144.000 0.000 NA   NA
 7304277 7304278 EcSMS35_4064 EcSMS35_4065 gyrB recF TRUE 0.975 29.000 0.249 0.003 Y NA
 7304278 7304279 EcSMS35_4065 EcSMS35_4066 recF dnaN TRUE 0.995 0.000 0.318 1.000 Y NA
 7304279 7304280 EcSMS35_4066 EcSMS35_4067 dnaN dnaA TRUE 0.991 5.000 0.328 1.000 Y NA
 7304280 7304281 EcSMS35_4067 EcSMS35_4068 dnaA   FALSE 0.006 294.000 0.000 NA   NA
 7304281 7304282 EcSMS35_4068 EcSMS35_4069     FALSE 0.417 20.000 0.000 NA   NA
 7304283 7304284 EcSMS35_4070 EcSMS35_4071 rpmH rnpA TRUE 0.967 17.000 0.787 1.000   NA
 7304284 7304285 EcSMS35_4071 EcSMS35_4072 rnpA   FALSE 0.062 224.000 0.105 1.000 N NA
 7304285 7304286 EcSMS35_4072 EcSMS35_4073   trmE FALSE 0.506 106.000 0.221 1.000   NA
 7304286 7304287 EcSMS35_4073 EcSMS35_4074 trmE tnaC FALSE 0.011 242.000 0.000 NA   NA
 7304287 7304288 EcSMS35_4074 EcSMS35_4075 tnaC tnaA FALSE 0.035 221.000 0.077 NA   NA
 7304288 7304289 EcSMS35_4075 EcSMS35_4076 tnaA   FALSE 0.128 91.000 0.000 NA   NA
 7304289 7304290 EcSMS35_4076 EcSMS35_4077   mdtL FALSE 0.082 133.000 0.000 NA   NA
 7304290 7304291 EcSMS35_4077 EcSMS35_4078 mdtL   TRUE 0.968 -25.000 0.526 NA N NA
 7304291 7304292 EcSMS35_4078 EcSMS35_4079     FALSE 0.202 157.000 0.114 1.000 N NA
 7304292 7304293 EcSMS35_4079 EcSMS35_4080     TRUE 0.608 22.000 0.074 NA   NA
 7304296 7304297 EcSMS35_4083 EcSMS35_4084     FALSE 0.083 132.000 0.000 NA   NA
 7304299 7304300 EcSMS35_4086 EcSMS35_4087     FALSE 0.048 160.000 0.000 NA   NA
 7304300 7304301 EcSMS35_4087 EcSMS35_4088   phoU FALSE 0.054 154.000 0.000 NA   NA
 7304301 7304302 EcSMS35_4088 EcSMS35_4089 phoU pstB TRUE 0.978 15.000 0.317 NA Y NA
 7304302 7304303 EcSMS35_4089 EcSMS35_4090 pstB pstA TRUE 0.966 90.000 0.526 0.001 Y NA
 7304303 7304304 EcSMS35_4090 EcSMS35_4091 pstA pstC TRUE 0.998 0.000 0.537 0.001 Y NA
 7304304 7304305 EcSMS35_4091 EcSMS35_4092 pstC pstS TRUE 0.903 87.000 0.145 0.001 Y NA
 7304305 7304306 EcSMS35_4092 EcSMS35_4093 pstS lpfD FALSE 0.019 248.000 0.000 1.000 N NA
 7304306 7304307 EcSMS35_4093 EcSMS35_4094 lpfD lpfC TRUE 0.952 11.000 0.000 1.000 Y NA
 7304307 7304308 EcSMS35_4094 EcSMS35_4095 lpfC lpfB TRUE 0.904 25.000 0.000 1.000 Y NA
 7304308 7304309 EcSMS35_4095 EcSMS35_4096 lpfB lpfA TRUE 0.982 48.000 1.000 1.000 Y NA
 7304309 7304310 EcSMS35_4096 EcSMS35_4097 lpfA glmS FALSE 0.009 308.000 0.000 1.000 N NA
 7304310 7304311 EcSMS35_4097 EcSMS35_4098 glmS glmU FALSE 0.491 162.000 0.055 1.000 Y NA
 7304311 7304312 EcSMS35_4098 EcSMS35_4099 glmU atpC FALSE 0.011 349.000 0.067 1.000 N NA
 7304312 7304313 EcSMS35_4099 EcSMS35_4100 atpC atpD TRUE 0.995 21.000 0.837 0.002 Y NA
 7304313 7304314 EcSMS35_4100 EcSMS35_4101 atpD atpG TRUE 0.993 27.000 0.724 0.002 Y NA
 7304314 7304315 EcSMS35_4101 EcSMS35_4102 atpG atpA TRUE 0.987 51.000 0.846 0.002 Y NA
 7304315 7304316 EcSMS35_4102 EcSMS35_4103 atpA atpH TRUE 0.997 13.000 0.864 0.002 Y NA
 7304316 7304317 EcSMS35_4103 EcSMS35_4104 atpH atpF TRUE 0.987 15.000 0.242 0.002 Y NA
 7304317 7304318 EcSMS35_4104 EcSMS35_4105 atpF atpE TRUE 0.978 62.000 0.666 0.002 Y NA
 7304318 7304319 EcSMS35_4105 EcSMS35_4106 atpE atpB TRUE 0.982 47.000 0.557 0.002 Y NA
 7304319 7304320 EcSMS35_4106 EcSMS35_4107 atpB atpI TRUE 0.972 9.000 0.291 0.002   NA
 7304320 7304321 EcSMS35_4107 EcSMS35_4108 atpI gidB FALSE 0.001 779.000 0.005 1.000   NA
 7304321 7304322 EcSMS35_4108 EcSMS35_4109 gidB gidA TRUE 0.782 64.000 0.466 1.000 N NA
 7304322 7304323 EcSMS35_4109 EcSMS35_4110 gidA mioC FALSE 0.005 379.000 0.000 1.000 N NA
 7304323 7304324 EcSMS35_4110 EcSMS35_4111 mioC asnC FALSE 0.484 90.000 0.165 1.000 N NA
 7304326 7304327 EcSMS35_4113 EcSMS35_4114 yieM   TRUE 0.977 -6.000 0.443 NA   NA
 7304328 7304329 EcSMS35_4115 EcSMS35_4116 trkD rbsD FALSE 0.095 155.000 0.000 1.000 N NA
 7304329 7304330 EcSMS35_4116 EcSMS35_4117 rbsD rbsA TRUE 0.990 8.000 0.337 1.000 Y NA
 7304330 7304331 EcSMS35_4117 EcSMS35_4118 rbsA rbsC TRUE 0.994 5.000 0.504 1.000 Y NA
 7304331 7304332 EcSMS35_4118 EcSMS35_4119 rbsC rbsB TRUE 0.989 25.000 0.847 NA Y NA
 7304332 7304333 EcSMS35_4119 EcSMS35_4120 rbsB rbsK TRUE 0.872 111.000 0.347 NA Y NA
 7304333 7304334 EcSMS35_4120 EcSMS35_4122 rbsK rbsR TRUE 0.978 4.000 0.500 1.000 N NA
 7304335 7304336 EcSMS35_4121 EcSMS35_4123     TRUE 0.715 23.000 0.100 1.000   NA
 7304337 7304338 EcSMS35_4124 EcSMS35_4125 rrs   FALSE 0.129 85.000 0.000 NA   NA
 7304338 7304339 EcSMS35_4125 EcSMS35_4127   rrl FALSE 0.031 184.000 0.000 NA   NA
 7304339 7304340 EcSMS35_4127 EcSMS35_4128 rrl rrf FALSE 0.121 97.000 0.000 NA   NA
 7304340 7304341 EcSMS35_4128 EcSMS35_4129 rrf   FALSE 0.179 54.000 0.000 NA   NA
 7304341 7304342 EcSMS35_4129 EcSMS35_4130     TRUE 0.620 7.000 0.000 NA   NA
 7304346 7304347 EcSMS35_4134 EcSMS35_4135 ilvG ilvM TRUE 0.997 -3.000 0.943 0.001   NA
 7304347 7304348 EcSMS35_4135 EcSMS35_4136 ilvM ilvE TRUE 0.841 20.000 0.205 1.000   NA
 7304348 7304349 EcSMS35_4136 EcSMS35_4137 ilvE ilvD TRUE 0.794 65.000 0.075 1.000 Y NA
 7304349 7304350 EcSMS35_4137 EcSMS35_4139 ilvD ilvA TRUE 0.988 0.000 0.106 1.000 Y NA
 7304355 7304356 EcSMS35_4143 EcSMS35_4144 gppA rhlB TRUE 0.594 136.000 0.406 1.000 N NA
 7304357 7304358 EcSMS35_4145 EcSMS35_4146 trxA rho FALSE 0.015 327.000 0.087 1.000 N NA
 7304358 7304359 EcSMS35_4146 EcSMS35_4147 rho   TRUE 0.579 10.000 0.000 NA   NA
 7304359 7304360 EcSMS35_4147 EcSMS35_4148   wecA FALSE 0.523 12.000 0.000 NA   NA
 7304360 7304361 EcSMS35_4148 EcSMS35_4149 wecA   TRUE 0.997 12.000 0.735 0.004 Y NA
 7304361 7304362 EcSMS35_4149 EcSMS35_4150     TRUE 0.980 56.000 0.677 0.004 Y NA
 7304362 7304363 EcSMS35_4150 EcSMS35_4151   wecC TRUE 0.996 -3.000 0.348 1.000 Y NA
 7304363 7304364 EcSMS35_4151 EcSMS35_4152 wecC rfbB2 TRUE 0.994 0.000 0.273 1.000 Y NA
 7304364 7304365 EcSMS35_4152 EcSMS35_4153 rfbB2 rfbA TRUE 0.995 19.000 0.739 0.001 Y NA
 7304365 7304366 EcSMS35_4153 EcSMS35_4154 rfbA wecD TRUE 0.890 -22.000 0.145 1.000   NA
 7304366 7304367 EcSMS35_4154 EcSMS35_4155 wecD wecE TRUE 0.943 5.000 0.248 1.000   NA
 7304367 7304368 EcSMS35_4155 EcSMS35_4156 wecE   TRUE 0.952 2.000 0.218 1.000   NA
 7304368 7304369 EcSMS35_4156 EcSMS35_4157   wecF TRUE 0.990 -3.000 0.605 1.000   NA
 7304369 7304370 EcSMS35_4157 EcSMS35_4158 wecF wzyE TRUE 0.992 -3.000 0.684 1.000   NA
 7304370 7304371 EcSMS35_4158 EcSMS35_4159 wzyE   TRUE 0.916 3.000 0.126 1.000   NA
 7304371 7304372 EcSMS35_4159 EcSMS35_4160     FALSE 0.049 191.000 0.019 1.000 N NA
 7304372 7304373 EcSMS35_4160 EcSMS35_4161     FALSE 0.115 103.000 0.000 NA   NA
 7304373 7304374 EcSMS35_4161 EcSMS35_4162     FALSE 0.162 58.000 0.000 NA   NA
 7304374 7304375 EcSMS35_4162 EcSMS35_4163     FALSE 0.425 19.000 0.000 NA   NA
 7304375 7304376 EcSMS35_4163 EcSMS35_4164     FALSE 0.248 41.000 0.000 NA   NA
 7304376 7304377 EcSMS35_4164 EcSMS35_4165   aslB FALSE 0.065 146.000 0.000 NA   NA
 7304378 7304379 EcSMS35_4166 EcSMS35_4167 aslA hemY FALSE 0.002 664.000 0.000 1.000 N NA
 7304379 7304380 EcSMS35_4167 EcSMS35_4168 hemY   TRUE 0.986 3.000 0.144 1.000 Y NA
 7304380 7304381 EcSMS35_4168 EcSMS35_4169   hemD TRUE 0.987 22.000 0.600 1.000 Y NA
 7304381 7304382 EcSMS35_4169 EcSMS35_4170 hemD hemC TRUE 0.996 -3.000 0.205 0.001 Y NA
 7304384 7304385 EcSMS35_4172 EcSMS35_4173 cyaY   FALSE 0.210 48.000 0.000 NA   NA
 7304386 7304387 EcSMS35_4174 EcSMS35_4175   dapF FALSE 0.308 37.000 0.021 NA N NA
 7304387 7304388 EcSMS35_4175 EcSMS35_4176 dapF   TRUE 0.949 -3.000 0.175 NA   NA
 7304388 7304389 EcSMS35_4176 EcSMS35_4177   xerC TRUE 0.991 -3.000 0.714 NA   NA
 7304389 7304390 EcSMS35_4177 EcSMS35_4178 xerC   TRUE 0.979 0.000 0.367 1.000   NA
 7304390 7304391 EcSMS35_4178 EcSMS35_4179   uvrD FALSE 0.414 84.000 0.128 1.000   NA
 7304392 7304393 EcSMS35_4180 EcSMS35_4181     FALSE 0.129 83.000 0.000 NA   NA
 7304394 7304395 EcSMS35_4182 EcSMS35_4183   corA FALSE 0.011 244.000 0.000 NA   NA
 7304396 7304397 EcSMS35_4184 EcSMS35_4185     TRUE 0.988 -3.000 0.600 NA   NA
 7304397 7304398 EcSMS35_4185 EcSMS35_4186   rarD FALSE 0.005 310.000 0.000 NA   NA
 7304398 7304399 EcSMS35_4186 EcSMS35_4187 rarD   FALSE 0.421 52.000 0.099 NA   NA
 7304400 7304401 EcSMS35_4188 EcSMS35_4189 pldA recQ FALSE 0.247 119.000 0.057 1.000 N NA
 7304401 7304402 EcSMS35_4189 EcSMS35_4190 recQ rhtC FALSE 0.301 64.000 0.043 1.000 N NA
 7304404 7304405 EcSMS35_4192 EcSMS35_4193 pldB   TRUE 0.972 8.000 0.524 1.000   NA
 7304405 7304406 EcSMS35_4193 EcSMS35_4194     FALSE 0.307 76.000 0.067 1.000   NA
 7304406 7304407 EcSMS35_4194 EcSMS35_4195   metE FALSE 0.017 959.000 0.000 1.000 Y NA
 7304408 7304409 EcSMS35_4196 EcSMS35_4197     FALSE 0.223 78.000 0.000 1.000 N NA
 7304409 7304410 EcSMS35_4197 EcSMS35_4198     TRUE 0.710 26.000 0.154 NA   NA
 7304410 7304411 EcSMS35_4198 EcSMS35_4199     TRUE 0.917 17.000 0.400 NA   NA
 7304411 7304412 EcSMS35_4199 EcSMS35_4200     TRUE 0.826 -7.000 0.059 NA   NA
 7304412 7304413 EcSMS35_4200 EcSMS35_4201     TRUE 0.949 -3.000 0.176 NA   NA
 7304413 7304414 EcSMS35_4201 EcSMS35_4202     FALSE 0.299 95.000 0.095 NA   NA
 7304414 7304415 EcSMS35_4202 EcSMS35_4203     TRUE 0.731 6.000 0.048 NA   NA
 7304416 7304417 EcSMS35_4204 EcSMS35_4205     TRUE 0.609 -21.000 0.000 NA   NA
 7304418 7304419 EcSMS35_4206 EcSMS35_4207     FALSE 0.083 132.000 0.000 NA   NA
 7304421 7304422 EcSMS35_4209 EcSMS35_4210     TRUE 0.918 13.000 0.333 NA   NA
 7304422 7304423 EcSMS35_4210 EcSMS35_4211     FALSE 0.442 17.000 0.000 NA   NA
 7304423 7304424 EcSMS35_4211 EcSMS35_4212     FALSE 0.476 25.000 0.000 1.000   NA
 7304424 7304425 EcSMS35_4212 EcSMS35_4213     TRUE 0.971 -10.000 0.000 1.000 Y NA
 7304425 7304426 EcSMS35_4213 EcSMS35_4214     TRUE 0.533 24.000 0.000 1.000 N NA
 7304427 7304428 EcSMS35_4215 EcSMS35_4216 rmuC ubiE FALSE 0.183 95.000 0.047 NA   NA
 7304428 7304429 EcSMS35_4216 EcSMS35_4217 ubiE   TRUE 0.831 14.000 0.145 1.000   NA
 7304429 7304430 EcSMS35_4217 EcSMS35_4218   ubiB TRUE 0.984 -3.000 0.432 1.000   NA
 7304430 7304431 EcSMS35_4218 EcSMS35_4219 ubiB tatA FALSE 0.215 79.000 0.032 1.000   NA
 7304431 7304432 EcSMS35_4219 EcSMS35_4220 tatA tatB TRUE 0.987 4.000 0.188 1.000 Y NA
 7304432 7304433 EcSMS35_4220 EcSMS35_4221 tatB tatC TRUE 0.992 3.000 0.333 NA Y NA
 7304433 7304434 EcSMS35_4221 EcSMS35_4223 tatC tatD TRUE 0.565 42.000 0.121 NA N NA
 7304436 7304437 EcSMS35_4224 EcSMS35_4225 ubiD fre TRUE 0.858 46.000 0.090 NA Y NA
 7304438 7304439 EcSMS35_4226 EcSMS35_4227 fadA fadB TRUE 0.994 10.000 0.607 1.000 Y NA
 7304440 7304441 EcSMS35_4228 EcSMS35_4229 pepQ   TRUE 0.939 0.000 0.127 1.000   NA
 7304441 7304442 EcSMS35_4229 EcSMS35_4230   trkH TRUE 0.715 39.000 0.202 1.000   NA
 7304442 7304443 EcSMS35_4230 EcSMS35_4231 trkH hemG TRUE 0.956 12.000 0.455 1.000 N NA
 7304443 7304444 EcSMS35_4231 EcSMS35_4232 hemG rrs FALSE 0.003 377.000 0.000 NA   NA
 7304444 7304445 EcSMS35_4232 EcSMS35_4233 rrs   FALSE 0.129 85.000 0.000 NA   NA
 7304445 7304446 EcSMS35_4233 EcSMS35_4235   rrl FALSE 0.026 193.000 0.000 NA   NA
 7304446 7304447 EcSMS35_4235 EcSMS35_4236 rrl rrf FALSE 0.124 95.000 0.000 NA   NA
 7304448 7304449 EcSMS35_4237 EcSMS35_4238 mobB mobA TRUE 0.986 -18.000 0.064 0.002 Y NA
 7304450 7304451 EcSMS35_4239 EcSMS35_4240     FALSE 0.338 77.000 0.106 NA   NA
 7304451 7304452 EcSMS35_4240 EcSMS35_4241   dsbA TRUE 0.728 17.000 0.111 NA   NA
 7304452 7304453 EcSMS35_4241 EcSMS35_4242 dsbA   FALSE 0.365 25.000 0.000 NA   NA
 7304453 7304454 EcSMS35_4242 EcSMS35_4243     TRUE 0.672 -10.000 0.000 NA   NA
 7304455 7304456 EcSMS35_4244 EcSMS35_4245     FALSE 0.123 96.000 0.000 NA   NA
 7304458 7304459 EcSMS35_4247 EcSMS35_4248   engB FALSE 0.483 14.000 0.000 NA   NA
 7304463 7304464 EcSMS35_4252 EcSMS35_4253   glnG FALSE 0.020 206.000 0.000 NA   NA
 7304464 7304465 EcSMS35_4253 EcSMS35_4254 glnG glnL TRUE 0.997 3.000 0.587 0.063 Y NA
 7304465 7304466 EcSMS35_4254 EcSMS35_4255 glnL glnA FALSE 0.096 174.000 0.053 1.000 N NA
 7304467 7304468 EcSMS35_4256 EcSMS35_4257 typA   FALSE 0.077 217.000 0.000 0.037 N NA
 7304468 7304469 EcSMS35_4257 EcSMS35_4258     TRUE 0.807 110.000 0.800 NA   NA
 7304469 7304470 EcSMS35_4258 EcSMS35_4259     TRUE 0.826 102.000 0.833 NA   NA
 7304471 7304472 EcSMS35_4260 EcSMS35_4261 ompL   TRUE 0.811 67.000 0.625 NA   NA
 7304472 7304473 EcSMS35_4261 EcSMS35_4262     TRUE 0.963 43.000 0.250 0.004 Y NA
 7304473 7304474 EcSMS35_4262 EcSMS35_4263     TRUE 0.824 46.000 0.000 1.000 Y NA
 7304474 7304475 EcSMS35_4263 EcSMS35_4264     FALSE 0.437 198.000 0.000 0.003 Y NA
 7304475 7304476 EcSMS35_4264 EcSMS35_4265     TRUE 0.652 119.000 0.026 1.000 Y NA
 7304476 7304477 EcSMS35_4265 EcSMS35_4266     TRUE 0.941 16.000 0.051 1.000 Y NA
 7304477 7304478 EcSMS35_4266 EcSMS35_4267     TRUE 0.858 24.000 0.250 1.000 N NA
 7304479 7304480 EcSMS35_4268 EcSMS35_4269     TRUE 0.864 34.000 0.000 1.000 Y NA
 7304480 7304481 EcSMS35_4269 EcSMS35_4270   yihX FALSE 0.175 99.000 0.000 1.000   NA
 7304481 7304482 EcSMS35_4270 EcSMS35_4271 yihX rbn TRUE 0.812 -6.000 0.000 1.000   NA
 7304482 7304483 EcSMS35_4271 EcSMS35_4272 rbn dtd TRUE 0.911 -3.000 0.069 1.000   NA
 7304483 7304484 EcSMS35_4272 EcSMS35_4273 dtd   FALSE 0.452 45.000 0.065 1.000   NA
 7304484 7304485 EcSMS35_4273 EcSMS35_4274     FALSE 0.002 416.000 0.000 NA   NA
 7304485 7304486 EcSMS35_4274 EcSMS35_4275     FALSE 0.001 696.000 0.000 NA   NA
 7304486 7304487 EcSMS35_4275 EcSMS35_4276     FALSE 0.011 243.000 0.000 NA   NA
 7304488 7304489 EcSMS35_4277 EcSMS35_4278 fdhE fdoI TRUE 0.955 -3.000 0.182 NA N NA
 7304489 7304490 EcSMS35_4278 EcSMS35_4279 fdoI fdoH TRUE 0.999 -3.000 0.944 0.001 Y NA
 7304490 7304491 EcSMS35_4279 EcSMS35_4280 fdoH fdoG TRUE 0.997 13.000 0.833 0.001 Y NA
 7304492 7304493 EcSMS35_4281 EcSMS35_4282   fdhD TRUE 0.572 -31.000 0.000 NA   NA
 7304495 7304496 EcSMS35_4284 EcSMS35_4285     TRUE 0.989 2.000 0.727 1.000   NA
 7304496 7304497 EcSMS35_4285 EcSMS35_4286     FALSE 0.025 195.000 0.000 NA   NA
 7304498 7304499 EcSMS35_4287 EcSMS35_4288     TRUE 0.980 0.000 0.400 NA N NA
 7304499 7304500 EcSMS35_4288 EcSMS35_4289     TRUE 0.996 -10.000 0.667 NA Y NA
 7304500 7304501 EcSMS35_4289 EcSMS35_4290     TRUE 0.982 5.000 0.000 0.009 Y NA
 7304503 7304504 EcSMS35_4292 EcSMS35_4293 rhaU rhaD TRUE 0.825 10.000 0.112 NA   NA
 7304504 7304505 EcSMS35_4293 EcSMS35_4294 rhaD rhaA TRUE 0.869 83.000 0.247 1.000 Y NA
 7304505 7304506 EcSMS35_4294 EcSMS35_4295 rhaA rhaB TRUE 0.996 -3.000 0.387 1.000 Y NA
 7304507 7304508 EcSMS35_4296 EcSMS35_4297   rhaS FALSE 0.157 60.000 0.000 NA   NA
 7304508 7304509 EcSMS35_4297 EcSMS35_4299 rhaS rhaR TRUE 0.998 -16.000 0.800 0.016 Y NA
 7304513 7304514 EcSMS35_4302 EcSMS35_4303 kdgT   FALSE 0.093 149.000 0.000 1.000   NA
 7304515 7304516 EcSMS35_4304 EcSMS35_4305 cpxA cpxR TRUE 0.998 -3.000 0.791 1.000 Y NA
 7304519 7304520 EcSMS35_4308 EcSMS35_4309 cox   TRUE 0.954 3.000 0.286 NA   NA
 7304520 7304521 EcSMS35_4309 EcSMS35_4310     TRUE 0.631 6.000 0.000 NA   NA
 7304521 7304522 EcSMS35_4310 EcSMS35_4311     FALSE 0.150 64.000 0.000 NA   NA
 7304522 7304523 EcSMS35_4311 EcSMS35_4312     TRUE 0.993 0.000 1.000 NA   NA
 7304523 7304524 EcSMS35_4312 EcSMS35_4313     TRUE 0.940 0.000 0.167 NA   NA
 7304524 7304525 EcSMS35_4313 EcSMS35_4314     TRUE 0.945 -3.000 0.167 NA   NA
 7304525 7304526 EcSMS35_4314 EcSMS35_4315     TRUE 0.672 -10.000 0.000 NA   NA
 7304526 7304527 EcSMS35_4315 EcSMS35_4316     TRUE 0.763 0.000 0.000 NA   NA
 7304530 7304531 EcSMS35_4318 EcSMS35_4320     TRUE 0.647 5.000 0.000 NA   NA
 7304533 7304534 EcSMS35_4322 EcSMS35_4323     TRUE 0.763 0.000 0.000 NA   NA
 7304535 7304536 EcSMS35_4324 EcSMS35_4325     FALSE 0.229 59.000 0.000 1.000   NA
 7304536 7304537 EcSMS35_4325 EcSMS35_4326     TRUE 0.985 4.000 0.667 1.000   NA
 7304537 7304538 EcSMS35_4326 EcSMS35_4327     TRUE 0.931 100.000 1.000 0.001   NA
 7304538 7304539 EcSMS35_4327 EcSMS35_4328     TRUE 0.973 0.000 0.333 NA   NA
 7304539 7304540 EcSMS35_4328 EcSMS35_4329     TRUE 0.958 4.000 0.333 NA   NA
 7304540 7304541 EcSMS35_4329 EcSMS35_4330     TRUE 0.983 0.000 0.500 NA   NA
 7304541 7304542 EcSMS35_4330 EcSMS35_4331     TRUE 0.941 15.000 0.500 NA   NA
 7304542 7304543 EcSMS35_4331 EcSMS35_4332     TRUE 0.919 -12.000 0.200 NA   NA
 7304543 7304544 EcSMS35_4332 EcSMS35_4333     TRUE 0.871 -145.000 0.200 NA   NA
 7304544 7304545 EcSMS35_4333 EcSMS35_4334     TRUE 0.946 -37.000 0.400 NA   NA
 7304545 7304546 EcSMS35_4334 EcSMS35_4335     TRUE 0.712 -7.000 0.000 NA   NA
 7304548 7304549 EcSMS35_4337 EcSMS35_4338     TRUE 0.980 -3.000 0.400 NA   NA
 7304549 7304550 EcSMS35_4338 EcSMS35_4339     TRUE 0.988 5.000 1.000 NA   NA
 7304550 7304551 EcSMS35_4339 EcSMS35_4340     TRUE 0.986 -7.000 0.667 NA   NA
 7304551 7304552 EcSMS35_4340 EcSMS35_4341     TRUE 0.548 11.000 0.000 NA   NA
 7304552 7304553 EcSMS35_4341 EcSMS35_4342     TRUE 0.717 2.000 0.000 NA   NA
 7304553 7304554 EcSMS35_4342 EcSMS35_4343     FALSE 0.017 216.000 0.000 NA   NA
 7304556 7304557 EcSMS35_4345 EcSMS35_4346     FALSE 0.501 13.000 0.000 NA   NA
 7304557 7304558 EcSMS35_4346 EcSMS35_4347     TRUE 0.751 57.000 0.429 NA   NA
 7304558 7304559 EcSMS35_4347 EcSMS35_4348     TRUE 0.929 33.000 0.786 NA   NA
 7304559 7304560 EcSMS35_4348 EcSMS35_4349     TRUE 0.981 -7.000 0.545 NA   NA
 7304560 7304561 EcSMS35_4349 EcSMS35_4350   gpU FALSE 0.467 15.000 0.000 NA   NA
 7304561 7304562 EcSMS35_4350 EcSMS35_4351 gpU   TRUE 0.763 0.000 0.000 NA   NA
 7304562 7304563 EcSMS35_4351 EcSMS35_4352     FALSE 0.129 82.000 0.000 NA   NA
 7304565 7304566 EcSMS35_4354 EcSMS35_4355   fieF FALSE 0.467 15.000 0.000 NA   NA
 7304566 7304567 EcSMS35_4355 EcSMS35_4356 fieF pfkA FALSE 0.074 181.000 0.040 1.000 N NA
 7304567 7304568 EcSMS35_4356 EcSMS35_4357 pfkA sbp FALSE 0.011 320.000 0.049 1.000 N NA
 7304568 7304569 EcSMS35_4357 EcSMS35_4358 sbp cdh FALSE 0.193 107.000 0.000 1.000 N NA
 7304570 7304571 EcSMS35_4359 EcSMS35_4360 tpiA   FALSE 0.193 108.000 0.058 NA   NA
 7304572 7304573 EcSMS35_4361 EcSMS35_4362     FALSE 0.018 212.000 0.000 NA   NA
 7304573 7304574 EcSMS35_4362 EcSMS35_4363   uspD FALSE 0.339 27.000 0.000 NA   NA
 7304575 7304576 EcSMS35_4364 EcSMS35_4365 fpr glpX FALSE 0.401 97.000 0.117 1.000 N NA
 7304576 7304577 EcSMS35_4365 EcSMS35_4366 glpX glpK FALSE 0.141 135.000 0.025 1.000 N NA
 7304577 7304578 EcSMS35_4366 EcSMS35_4367 glpK glpF FALSE 0.496 23.000 0.004 1.000 N NA
 7304580 7304581 EcSMS35_4369 EcSMS35_4370     FALSE 0.287 33.000 0.000 NA   NA
 7304581 7304582 EcSMS35_4370 EcSMS35_4371   rraA FALSE 0.157 60.000 0.000 NA   NA
 7304582 7304583 EcSMS35_4371 EcSMS35_4372 rraA menA TRUE 0.803 93.000 0.158 NA Y NA
 7304583 7304584 EcSMS35_4372 EcSMS35_4373 menA hslU FALSE 0.360 55.000 0.051 1.000 N NA
 7304584 7304585 EcSMS35_4373 EcSMS35_4374 hslU hslV TRUE 0.995 10.000 0.752 1.000 Y NA
 7304585 7304586 EcSMS35_4374 EcSMS35_4375 hslV ftsN FALSE 0.371 93.000 0.122 NA N NA
 7304586 7304587 EcSMS35_4375 EcSMS35_4376 ftsN cytR TRUE 0.546 92.000 0.245 NA N NA
 7304587 7304588 EcSMS35_4376 EcSMS35_4377 cytR priA FALSE 0.085 156.000 0.013 1.000 N NA
 7304590 7304591 EcSMS35_4379 EcSMS35_4380   metJ FALSE 0.157 60.000 0.000 NA   NA
 7304592 7304593 EcSMS35_4381 EcSMS35_4382 metB metL TRUE 0.994 3.000 0.428 1.000 Y NA
 7304593 7304594 EcSMS35_4382 EcSMS35_4383 metL   TRUE 0.620 7.000 0.000 NA   NA
 7304595 7304596 EcSMS35_4384 EcSMS35_4385 tsx2   FALSE 0.223 78.000 0.000 1.000 N NA
 7304596 7304597 EcSMS35_4385 EcSMS35_4386     TRUE 0.921 41.000 0.000 0.001 Y NA
 7304597 7304598 EcSMS35_4386 EcSMS35_4387     FALSE 0.013 233.000 0.000 NA   NA
 7304599 7304600 EcSMS35_4388 EcSMS35_4389   metF FALSE 0.005 382.000 0.000 1.000 N NA
 7304600 7304601 EcSMS35_4389 EcSMS35_4390 metF katG FALSE 0.006 329.000 0.010 1.000 N NA
 7304601 7304602 EcSMS35_4390 EcSMS35_4391 katG   FALSE 0.167 94.000 0.012 1.000   NA
 7304603 7304604 EcSMS35_4392 EcSMS35_4393   gldA FALSE 0.007 275.000 0.000 NA   NA
 7304604 7304605 EcSMS35_4393 EcSMS35_4394 gldA fsaB TRUE 0.972 11.000 0.600 1.000 N NA
 7304605 7304606 EcSMS35_4394 EcSMS35_4395 fsaB ptsA TRUE 0.947 12.000 0.000 1.000 Y NA
 7304607 7304608 EcSMS35_4396 EcSMS35_4397     TRUE 0.991 15.000 0.400 0.010 Y NA
 7304608 7304609 EcSMS35_4397 EcSMS35_4398   pflD TRUE 0.730 51.000 0.280 1.000 N NA
 7304609 7304610 EcSMS35_4398 EcSMS35_4399 pflD   TRUE 0.972 -34.000 0.312 0.002 N NA
 7304610 7304611 EcSMS35_4399 EcSMS35_4401     TRUE 0.940 2.000 0.156 1.000 N NA
 7304612 7304613 EcSMS35_4400 EcSMS35_4402     FALSE 0.240 149.000 0.130 1.000   NA
 7304613 7304614 EcSMS35_4402 EcSMS35_4403   ppc FALSE 0.049 183.000 0.000 1.000   NA
 7304614 7304615 EcSMS35_4403 EcSMS35_4404 ppc argE FALSE 0.014 302.000 0.053 1.000 N NA
 7304616 7304617 EcSMS35_4405 EcSMS35_4406 argC argB TRUE 0.985 11.000 0.097 0.001 Y NA
 7304617 7304618 EcSMS35_4406 EcSMS35_4407 argB argH TRUE 0.745 61.000 0.017 1.000 Y NA
 7304618 7304619 EcSMS35_4407 EcSMS35_4409 argH oxyR FALSE 0.011 267.000 0.002 1.000 N NA
 7304621 7304622 EcSMS35_4410 EcSMS35_4411 fabR   TRUE 0.950 0.000 0.194 NA   NA
 7304624 7304625 EcSMS35_4413 EcSMS35_4414 btuB murI TRUE 0.643 14.000 0.025 1.000 N NA
 7304625 7304626 EcSMS35_4414 EcSMS35_4415 murI rrs FALSE 0.003 373.000 0.000 NA   NA
 7304626 7304627 EcSMS35_4415 EcSMS35_4416 rrs   FALSE 0.129 85.000 0.000 NA   NA
 7304627 7304628 EcSMS35_4416 EcSMS35_4418   rrl FALSE 0.026 193.000 0.000 NA   NA
 7304628 7304629 EcSMS35_4418 EcSMS35_4419 rrl rrf FALSE 0.124 95.000 0.000 NA   NA
 7304629 7304630 EcSMS35_4419 EcSMS35_4420 rrf murB FALSE 0.075 137.000 0.000 NA   NA
 7304630 7304631 EcSMS35_4420 EcSMS35_4421 murB birA TRUE 0.967 -3.000 0.211 1.000 N NA
 7304633 7304634 EcSMS35_4423 EcSMS35_4424     FALSE 0.031 184.000 0.000 NA   NA
 7304634 7304635 EcSMS35_4424 EcSMS35_4425     TRUE 0.610 8.000 0.000 NA   NA
 7304635 7304636 EcSMS35_4425 EcSMS35_4426     FALSE 0.105 117.000 0.000 NA   NA
 7304636 7304637 EcSMS35_4426 EcSMS35_4427     TRUE 0.631 6.000 0.000 NA   NA
 7304637 7304638 EcSMS35_4427 EcSMS35_4428   tuf1 FALSE 0.107 114.000 0.000 NA   NA
 7304638 7304639 EcSMS35_4428 EcSMS35_4429 tuf1 secE FALSE 0.021 230.000 0.009 1.000 N NA
 7304639 7304640 EcSMS35_4429 EcSMS35_4430 secE nusG TRUE 0.991 2.000 0.843 1.000 N NA
 7304640 7304641 EcSMS35_4430 EcSMS35_4431 nusG rplK TRUE 0.640 159.000 0.681 1.000 N NA
 7304641 7304642 EcSMS35_4431 EcSMS35_4432 rplK rplA TRUE 0.998 4.000 0.838 0.011 Y NA
 7304642 7304643 EcSMS35_4432 EcSMS35_4433 rplA rplJ FALSE 0.344 292.000 0.302 0.011 Y NA
 7304643 7304644 EcSMS35_4433 EcSMS35_4434 rplJ rplL TRUE 0.981 67.000 0.884 0.009 Y NA
 7304644 7304645 EcSMS35_4434 EcSMS35_4435 rplL rpoB FALSE 0.035 320.000 0.223 1.000   NA
 7304645 7304646 EcSMS35_4435 EcSMS35_4436 rpoB rpoC TRUE 0.933 77.000 0.851 0.000   NA
 7304647 7304648 EcSMS35_4437 EcSMS35_4438 thiH thiG TRUE 0.997 -3.000 0.277 0.004 Y NA
 7304648 7304649 EcSMS35_4438 EcSMS35_4439 thiG thiS TRUE 0.966 -43.000 0.087 1.000 Y NA
 7304649 7304650 EcSMS35_4439 EcSMS35_4440 thiS thiF TRUE 0.994 -16.000 0.548 1.000 Y NA
 7304650 7304651 EcSMS35_4440 EcSMS35_4441 thiF thiE TRUE 0.991 -7.000 0.242 1.000 Y NA
 7304651 7304652 EcSMS35_4441 EcSMS35_4442 thiE thiC TRUE 0.992 0.000 0.063 0.004 Y NA
 7304652 7304653 EcSMS35_4442 EcSMS35_4443 thiC rsd FALSE 0.023 233.000 0.000 1.000 N NA
 7304654 7304655 EcSMS35_4444 EcSMS35_4445 nudC hemE FALSE 0.442 40.000 0.040 1.000 N NA
 7304655 7304656 EcSMS35_4445 EcSMS35_4446 hemE nfi TRUE 0.737 10.000 0.028 1.000 N NA
 7304656 7304657 EcSMS35_4446 EcSMS35_4447 nfi   FALSE 0.455 43.000 0.086 NA   NA
 7304657 7304658 EcSMS35_4447 EcSMS35_4448   hupA FALSE 0.264 187.000 0.355 NA   NA
 7304658 7304659 EcSMS35_4448 EcSMS35_4449 hupA   TRUE 0.677 73.000 0.375 NA   NA
 7304660 7304661 EcSMS35_4450 EcSMS35_4451 zraP   TRUE 0.697 3.000 0.000 NA   NA
 7304662 7304663 EcSMS35_4452 EcSMS35_4454 zraS zraR TRUE 0.998 -3.000 0.500 0.067 Y NA
 7304664 7304665 EcSMS35_4453 EcSMS35_4455 purD purH TRUE 0.980 12.000 0.238 1.000 Y NA
 7304666 7304667 EcSMS35_4456 EcSMS35_4457   rrs FALSE 0.003 377.000 0.000 NA   NA
 7304667 7304668 EcSMS35_4457 EcSMS35_4458 rrs   FALSE 0.129 85.000 0.000 NA   NA
 7304668 7304669 EcSMS35_4458 EcSMS35_4461   rrl FALSE 0.026 193.000 0.000 NA   NA
 7304669 7304670 EcSMS35_4461 EcSMS35_4462 rrl rrf FALSE 0.124 95.000 0.000 NA   NA
 7304672 7304673 EcSMS35_4464 EcSMS35_4465     TRUE 0.644 120.000 0.000 1.000 Y NA
 7304675 7304676 EcSMS35_4467 EcSMS35_4468 metA aceB FALSE 0.014 269.000 0.000 1.000 N NA
 7304676 7304677 EcSMS35_4468 EcSMS35_4469 aceB aceA TRUE 0.947 30.000 0.043 0.001 Y NA
 7304677 7304678 EcSMS35_4469 EcSMS35_4470 aceA aceK FALSE 0.056 184.000 0.000 1.000 N NA
 7304680 7304681 EcSMS35_4472 EcSMS35_4473 metH pNaS FALSE 0.024 220.000 0.006 1.000 N NA
 7304682 7304683 EcSMS35_4474 EcSMS35_4475 pepE   TRUE 0.636 123.000 0.000 1.000 Y NA
 7304683 7304684 EcSMS35_4475 EcSMS35_4476     TRUE 0.977 -7.000 0.031 1.000 Y NA
 7304684 7304685 EcSMS35_4476 EcSMS35_4477     TRUE 0.729 52.000 0.286 1.000 N NA
 7304685 7304686 EcSMS35_4477 EcSMS35_4478     TRUE 0.992 11.000 0.333 0.013 Y NA
 7304686 7304687 EcSMS35_4478 EcSMS35_4479     TRUE 0.953 66.000 0.400 0.013 Y NA
 7304687 7304688 EcSMS35_4479 EcSMS35_4480     TRUE 0.995 0.000 0.167 0.009 Y NA
 7304688 7304689 EcSMS35_4480 EcSMS35_4481     TRUE 0.840 10.000 0.083 1.000 N NA
 7304689 7304690 EcSMS35_4481 EcSMS35_4482   sorC FALSE 0.406 70.000 0.091 1.000 N NA
 7304692 7304693 EcSMS35_4484 EcSMS35_4485   lysC FALSE 0.009 253.000 0.000 NA   NA
 7304694 7304695 EcSMS35_4486 EcSMS35_4487 pgi   FALSE 0.003 354.000 0.000 NA   NA
 7304695 7304696 EcSMS35_4487 EcSMS35_4488     TRUE 0.795 114.000 0.778 NA   NA
 7304696 7304697 EcSMS35_4488 EcSMS35_4489     TRUE 0.994 -3.000 1.000 NA   NA
 7304697 7304698 EcSMS35_4489 EcSMS35_4490     TRUE 0.930 0.000 0.140 NA   NA
 7304699 7304700 EcSMS35_4491 EcSMS35_4492     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7304702 7304703 EcSMS35_4494 EcSMS35_4495 malG malF TRUE 0.996 15.000 0.814 0.040 Y NA
 7304703 7304704 EcSMS35_4495 EcSMS35_4496 malF malE FALSE 0.481 154.000 0.000 1.000 Y NA
 7304705 7304706 EcSMS35_4497 EcSMS35_4498 malK lamB TRUE 0.874 72.000 0.111 0.050 Y NA
 7304706 7304707 EcSMS35_4498 EcSMS35_4499 lamB malM FALSE 0.054 243.000 0.143 1.000   NA
 7304707 7304708 EcSMS35_4499 EcSMS35_4500 malM   FALSE 0.007 270.000 0.000 NA   NA
 7304708 7304709 EcSMS35_4500 EcSMS35_4501   ubiC FALSE 0.015 223.000 0.000 NA   NA
 7304709 7304710 EcSMS35_4501 EcSMS35_4502 ubiC ubiA TRUE 0.976 13.000 0.248 NA Y NA
 7304712 7304713 EcSMS35_4504 EcSMS35_4505 dgkA lexA FALSE 0.409 110.000 0.141 1.000 N NA
 7304713 7304714 EcSMS35_4505 EcSMS35_4506 lexA dinF FALSE 0.259 73.000 0.033 1.000 N NA
 7304714 7304715 EcSMS35_4506 EcSMS35_4507 dinF   FALSE 0.104 116.000 0.021 NA   NA
 7304717 7304718 EcSMS35_4509 EcSMS35_4510   dusA FALSE 0.003 380.000 0.000 NA   NA
 7304718 7304719 EcSMS35_4510 EcSMS35_4511 dusA pspG FALSE 0.117 152.000 0.070 NA   NA
 7304721 7304722 EcSMS35_4513 EcSMS35_4514 dnaB alr TRUE 0.744 53.000 0.317 1.000 N NA
 7304722 7304723 EcSMS35_4514 EcSMS35_4515 alr tyrB FALSE 0.062 253.000 0.181 1.000 N NA
 7304725 7304726 EcSMS35_4517 EcSMS35_4518 aphA   FALSE 0.089 111.000 0.009 NA   NA
 7304726 7304727 EcSMS35_4518 EcSMS35_4519     TRUE 0.653 4.000 0.018 NA   NA
 7304735 7304736 EcSMS35_4527 EcSMS35_4528     FALSE 0.226 151.000 0.130 1.000   NA
 7304737 7304738 EcSMS35_4529 EcSMS35_4530 actP   TRUE 0.991 -3.000 0.733 NA   NA
 7304738 7304739 EcSMS35_4530 EcSMS35_4531   acsA FALSE 0.072 213.000 0.147 NA   NA
 7304740 7304741 EcSMS35_4532 EcSMS35_4533 nrfA nrfB TRUE 0.743 46.000 0.083 0.001   NA
 7304741 7304742 EcSMS35_4533 EcSMS35_4534 nrfB nrfC TRUE 0.966 -3.000 0.049 0.001   NA
 7304742 7304743 EcSMS35_4534 EcSMS35_4535 nrfC nrfD TRUE 0.997 -3.000 0.927 0.001 N NA
 7304743 7304744 EcSMS35_4535 EcSMS35_4536 nrfD nrfE TRUE 0.777 56.000 0.400 1.000 N NA
 7304744 7304745 EcSMS35_4536 EcSMS35_4537 nrfE nrfF TRUE 0.989 -7.000 0.214 NA Y NA
 7304745 7304746 EcSMS35_4537 EcSMS35_4538 nrfF nrfG TRUE 0.996 -3.000 0.464 NA Y NA
 7304749 7304750 EcSMS35_4541 EcSMS35_4542   fdhF FALSE 0.373 94.000 0.105 1.000   NA
 7304752 7304753 EcSMS35_4544 EcSMS35_4545   mdtO TRUE 0.989 -3.000 0.625 NA   NA
 7304753 7304754 EcSMS35_4545 EcSMS35_4546 mdtO mdtN TRUE 0.993 0.000 1.000 NA   NA
 7304754 7304755 EcSMS35_4546 EcSMS35_4547 mdtN   TRUE 0.949 19.000 0.625 NA   NA
 7304755 7304756 EcSMS35_4547 EcSMS35_4548     FALSE 0.105 117.000 0.000 NA   NA
 7304756 7304757 EcSMS35_4548 EcSMS35_4549     TRUE 0.584 -27.000 0.000 NA   NA
 7304757 7304758 EcSMS35_4549 EcSMS35_4550   alsK FALSE 0.013 273.000 0.000 1.000 N NA
 7304758 7304759 EcSMS35_4550 EcSMS35_4551 alsK alsE TRUE 0.975 -16.000 0.081 1.000 Y NA
 7304759 7304760 EcSMS35_4551 EcSMS35_4552 alsE alsC TRUE 0.949 11.000 0.385 1.000   NA
 7304760 7304761 EcSMS35_4552 EcSMS35_4553 alsC alsA TRUE 0.896 -21.000 0.154 1.000   NA
 7304761 7304762 EcSMS35_4553 EcSMS35_4554 alsA alsB TRUE 0.582 128.000 0.000 NA Y NA
 7304762 7304763 EcSMS35_4554 EcSMS35_4555 alsB rpiR TRUE 0.657 53.000 0.250 NA N NA
 7304764 7304765 EcSMS35_4556 EcSMS35_4557 rpiB   FALSE 0.387 69.000 0.125 NA   NA
 7304766 7304767 EcSMS35_4558 EcSMS35_4559 phnP   TRUE 0.800 2.000 0.000 1.000   NA
 7304767 7304768 EcSMS35_4559 EcSMS35_4560   phnN TRUE 0.699 -13.000 0.000 NA N NA
 7304768 7304769 EcSMS35_4560 EcSMS35_4561 phnN phnM TRUE 0.992 0.000 0.235 NA Y NA
 7304769 7304770 EcSMS35_4561 EcSMS35_4562 phnM phnL TRUE 0.995 -3.000 0.320 1.000 Y NA
 7304770 7304771 EcSMS35_4562 EcSMS35_4563 phnL phnK TRUE 0.972 111.000 0.859 0.012 Y NA
 7304771 7304772 EcSMS35_4563 EcSMS35_4564 phnK phnJ TRUE 0.998 -3.000 0.883 1.000 Y NA
 7304772 7304773 EcSMS35_4564 EcSMS35_4565 phnJ phnI TRUE 0.998 -7.000 0.880 1.000 Y NA
 7304773 7304774 EcSMS35_4565 EcSMS35_4566 phnI phnH TRUE 0.999 0.000 0.960 0.001 Y NA
 7304774 7304775 EcSMS35_4566 EcSMS35_4567 phnH phnG TRUE 0.999 -3.000 0.967 0.001 Y NA
 7304775 7304776 EcSMS35_4567 EcSMS35_4568 phnG phnF TRUE 0.990 1.000 0.691 1.000 N NA
 7304776 7304777 EcSMS35_4568 EcSMS35_4569 phnF phnE TRUE 0.812 21.000 0.158 1.000 N NA
 7304777 7304778 EcSMS35_4569 EcSMS35_4570 phnE phnD TRUE 0.955 65.000 0.330 0.000 Y NA
 7304778 7304779 EcSMS35_4570 EcSMS35_4571 phnD phnC TRUE 0.986 25.000 0.337 0.001 Y NA
 7304779 7304780 EcSMS35_4571 EcSMS35_4572 phnC   FALSE 0.171 133.000 0.074 NA   NA
 7304780 7304781 EcSMS35_4572 EcSMS35_4573   phnA FALSE 0.041 160.000 0.013 NA   NA
 7304782 7304783 EcSMS35_4574 EcSMS35_4575     TRUE 0.993 -3.000 0.857 NA   NA
 7304783 7304784 EcSMS35_4575 EcSMS35_4576   proP FALSE 0.008 264.000 0.000 NA   NA
 7304785 7304786 EcSMS35_4577 EcSMS35_4578 basS basR TRUE 0.988 1.000 0.143 1.000 Y NA
 7304786 7304787 EcSMS35_4578 EcSMS35_4579 basR   TRUE 0.931 -3.000 0.095 1.000   NA
 7304787 7304788 EcSMS35_4579 EcSMS35_4580   adiC FALSE 0.169 104.000 0.000 1.000   NA
 7304788 7304789 EcSMS35_4580 EcSMS35_4581 adiC adiY FALSE 0.346 137.000 0.167 1.000 N NA
 7304789 7304790 EcSMS35_4581 EcSMS35_4582 adiY   TRUE 0.542 -43.000 0.000 NA   NA
 7304790 7304791 EcSMS35_4582 EcSMS35_4583   adiA FALSE 0.011 242.000 0.000 NA   NA
 7304791 7304792 EcSMS35_4583 EcSMS35_4584 adiA melR FALSE 0.045 196.000 0.000 1.000 N NA
 7304793 7304794 EcSMS35_4585 EcSMS35_4586 melA melB TRUE 0.858 79.000 0.214 1.000 Y NA
 7304795 7304796 EcSMS35_4587 EcSMS35_4588   fumB FALSE 0.096 123.000 0.000 NA   NA
 7304796 7304797 EcSMS35_4588 EcSMS35_4589 fumB dcuB FALSE 0.194 78.000 0.000 1.000   NA
 7304799 7304800 EcSMS35_4591 EcSMS35_4592 dcuR dcuS TRUE 0.992 -3.000 0.086 0.061 Y NA
 7304801 7304802 EcSMS35_4593 EcSMS35_4594     FALSE 0.174 55.000 0.000 NA   NA
 7304802 7304803 EcSMS35_4594 EcSMS35_4595     TRUE 0.846 12.000 0.168 NA   NA
 7304803 7304804 EcSMS35_4595 EcSMS35_4596     FALSE 0.004 319.000 0.000 NA   NA
 7304804 7304805 EcSMS35_4596 EcSMS35_4597     FALSE 0.328 28.000 0.000 NA   NA
 7304806 7304807 EcSMS35_4598 EcSMS35_4599 lysU   FALSE 0.022 237.000 0.000 1.000 N NA
 7304807 7304808 EcSMS35_4599 EcSMS35_4600   ldcC2 TRUE 0.755 59.000 0.000 1.000 Y NA
 7304808 7304809 EcSMS35_4600 EcSMS35_4601 ldcC2 cadB TRUE 0.711 80.000 0.000 1.000 Y NA
 7304809 7304810 EcSMS35_4601 EcSMS35_4602 cadB cadC FALSE 0.005 366.000 0.000 1.000 N NA
 7304810 7304811 EcSMS35_4602 EcSMS35_4603 cadC   FALSE 0.001 616.000 0.000 NA   NA
 7304811 7304812 EcSMS35_4603 EcSMS35_4604     FALSE 0.113 106.000 0.000 NA   NA
 7304812 7304813 EcSMS35_4604 EcSMS35_4605   dipZ TRUE 0.737 37.000 0.217 1.000   NA
 7304813 7304814 EcSMS35_4605 EcSMS35_4606 dipZ cutA TRUE 0.860 -24.000 0.092 1.000 N NA
 7304814 7304815 EcSMS35_4606 EcSMS35_4607 cutA dcuA FALSE 0.132 116.000 0.005 1.000   NA
 7304815 7304816 EcSMS35_4607 EcSMS35_4608 dcuA aspA FALSE 0.142 118.000 0.015 1.000   NA
 7304819 7304820 EcSMS35_4611 EcSMS35_4612 groES groEL TRUE 0.982 44.000 0.631 0.067 Y NA
 7304820 7304821 EcSMS35_4612 EcSMS35_4613 groEL   FALSE 0.144 135.000 0.062 NA   NA
 7304822 7304823 EcSMS35_4614 EcSMS35_4615     FALSE 0.012 235.000 0.000 NA   NA
 7304824 7304825 EcSMS35_4616 EcSMS35_4617 efp ecnA FALSE 0.235 52.000 0.007 1.000   NA
 7304825 7304826 EcSMS35_4617 EcSMS35_4618 ecnA ecnB TRUE 0.704 111.000 0.212 0.000   NA
 7304826 7304827 EcSMS35_4618 EcSMS35_4620 ecnB sugE FALSE 0.105 175.000 0.074 1.000   NA
 7304828 7304829 EcSMS35_4619 EcSMS35_4621 blc ampC FALSE 0.218 88.000 0.022 1.000 N NA
 7304829 7304830 EcSMS35_4621 EcSMS35_4622 ampC frdD FALSE 0.253 63.000 0.022 1.000 N NA
 7304830 7304831 EcSMS35_4622 EcSMS35_4623 frdD frdC TRUE 0.997 11.000 0.787 0.002 Y NA
 7304831 7304832 EcSMS35_4623 EcSMS35_4624 frdC frdB TRUE 0.995 11.000 0.454 0.002 Y NA
 7304832 7304833 EcSMS35_4624 EcSMS35_4625 frdB frdA TRUE 0.997 -7.000 0.470 0.002 Y NA
 7304834 7304835 EcSMS35_4626 EcSMS35_4627 genX   FALSE 0.055 177.000 0.009 1.000 N NA
 7304835 7304836 EcSMS35_4627 EcSMS35_4628     TRUE 0.712 63.000 0.400 NA   NA
 7304836 7304837 EcSMS35_4628 EcSMS35_4629     TRUE 0.601 9.000 0.000 NA   NA
 7304838 7304839 EcSMS35_4630 EcSMS35_4631   psd TRUE 0.796 22.000 0.148 1.000 N NA
 7304839 7304840 EcSMS35_4631 EcSMS35_4632 psd rsgA FALSE 0.346 96.000 0.095 1.000   NA
 7304841 7304842 EcSMS35_4633 EcSMS35_4634 orn   FALSE 0.018 211.000 0.000 NA   NA
 7304842 7304843 EcSMS35_4634 EcSMS35_4635     FALSE 0.050 157.000 0.000 NA   NA
 7304843 7304844 EcSMS35_4635 EcSMS35_4636     FALSE 0.279 34.000 0.000 NA   NA
 7304846 7304847 EcSMS35_4638 EcSMS35_4639     TRUE 0.837 -25.000 0.118 NA   NA
 7304847 7304848 EcSMS35_4639 EcSMS35_4640   amiB TRUE 0.712 19.000 0.109 NA   NA
 7304848 7304849 EcSMS35_4640 EcSMS35_4641 amiB mutL TRUE 0.850 10.000 0.092 1.000 N NA
 7304849 7304850 EcSMS35_4641 EcSMS35_4642 mutL miaA TRUE 0.969 -7.000 0.188 0.067 N NA
 7304850 7304851 EcSMS35_4642 EcSMS35_4643 miaA hfq TRUE 0.770 86.000 0.531 1.000   NA
 7304851 7304852 EcSMS35_4643 EcSMS35_4644 hfq hflX FALSE 0.443 76.000 0.141 1.000   NA
 7304852 7304853 EcSMS35_4644 EcSMS35_4645 hflX hflK TRUE 0.633 86.000 0.184 0.059   NA
 7304853 7304854 EcSMS35_4645 EcSMS35_4646 hflK hflC TRUE 0.999 3.000 0.947 0.008 Y NA
 7304854 7304855 EcSMS35_4646 EcSMS35_4647 hflC   TRUE 0.639 82.000 0.348 NA   NA
 7304855 7304856 EcSMS35_4647 EcSMS35_4648   purA FALSE 0.178 104.000 0.051 NA   NA
 7304856 7304857 EcSMS35_4648 EcSMS35_4649 purA nsrR FALSE 0.022 205.000 0.010 NA N NA
 7304857 7304858 EcSMS35_4649 EcSMS35_4650 nsrR rnr TRUE 0.841 39.000 0.038 NA Y NA
 7304858 7304859 EcSMS35_4650 EcSMS35_4651 rnr   FALSE 0.292 181.000 0.147 0.011 N NA
 7304859 7304860 EcSMS35_4651 EcSMS35_4652     FALSE 0.066 127.000 0.002 NA   NA
 7304860 7304861 EcSMS35_4652 EcSMS35_4653     TRUE 0.968 19.000 0.911 NA   NA
 7304861 7304862 EcSMS35_4653 EcSMS35_4654     FALSE 0.362 50.000 0.071 NA   NA
 7304862 7304863 EcSMS35_4654 EcSMS35_4655     TRUE 0.909 18.000 0.379 NA   NA
 7304863 7304864 EcSMS35_4655 EcSMS35_4656     TRUE 0.958 10.000 0.470 NA   NA
 7304864 7304865 EcSMS35_4656 EcSMS35_4657     TRUE 0.788 3.000 0.049 NA   NA
 7304865 7304866 EcSMS35_4657 EcSMS35_4658     FALSE 0.394 84.000 0.133 NA N NA
 7304867 7304868 EcSMS35_4659 EcSMS35_4660     TRUE 0.653 137.000 0.588 NA   NA
 7304870 7304871 EcSMS35_4661 EcSMS35_4663 ulaR   FALSE 0.166 108.000 0.000 1.000   NA
 7304872 7304873 EcSMS35_4664 EcSMS35_4665 ulaA ulaB TRUE 0.841 16.000 0.059 0.013   NA
 7304873 7304874 EcSMS35_4665 EcSMS35_4666 ulaB ulaC TRUE 0.985 10.000 0.115 0.009 Y NA
 7304874 7304875 EcSMS35_4666 EcSMS35_4667 ulaC ulaD TRUE 0.982 14.000 0.328 1.000 Y NA
 7304875 7304876 EcSMS35_4667 EcSMS35_4668 ulaD ulaE TRUE 0.984 10.000 0.250 1.000 Y NA
 7304876 7304877 EcSMS35_4668 EcSMS35_4669 ulaE sgaE TRUE 0.992 0.000 0.200 1.000 Y NA
 7304879 7304880 EcSMS35_4671 EcSMS35_4672 rpsF rpsR FALSE 0.285 326.000 0.319 0.009 Y NA
 7304880 7304881 EcSMS35_4672 EcSMS35_4673 rpsR rplI TRUE 0.980 42.000 0.499 0.009 Y NA
 7304882 7304883 EcSMS35_4674 EcSMS35_4675     TRUE 0.786 53.000 0.000 1.000 Y NA
 7304883 7304884 EcSMS35_4675 EcSMS35_4676     TRUE 0.814 43.000 0.000 NA Y NA
 7304884 7304885 EcSMS35_4676 EcSMS35_4677     FALSE 0.466 21.000 0.000 NA N NA
 7304885 7304886 EcSMS35_4677 EcSMS35_4678     TRUE 0.870 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7304886 7304887 EcSMS35_4678 EcSMS35_4679     TRUE 0.988 10.000 0.200 0.042 Y NA
 7304887 7304888 EcSMS35_4679 EcSMS35_4680     TRUE 0.636 10.000 0.000 NA N NA
 7304888 7304889 EcSMS35_4680 EcSMS35_4681     TRUE 0.636 10.000 0.000 NA N NA
 7304892 7304893 EcSMS35_4684 EcSMS35_4685 fklB cycA FALSE 0.009 309.000 0.000 1.000 N NA
 7304893 7304894 EcSMS35_4685 EcSMS35_4686 cycA   FALSE 0.080 134.000 0.000 NA   NA
 7304894 7304895 EcSMS35_4686 EcSMS35_4687     TRUE 0.946 33.000 1.000 NA   NA
 7304896 7304897 EcSMS35_4688 EcSMS35_4689     FALSE 0.381 108.000 0.150 NA N NA
 7304897 7304898 EcSMS35_4689 EcSMS35_4690     TRUE 0.672 108.000 0.021 1.000 Y NA
 7304904 7304905 EcSMS35_4696 EcSMS35_4697   msrA FALSE 0.006 323.000 0.042 NA   NA
 7304906 7304907 EcSMS35_4698 EcSMS35_4699     TRUE 0.576 -30.000 0.000 NA   NA
 7304907 7304908 EcSMS35_4699 EcSMS35_4700     TRUE 0.988 -3.000 0.575 NA   NA
 7304908 7304909 EcSMS35_4700 EcSMS35_4701     TRUE 0.918 3.000 0.167 NA   NA
 7304909 7304910 EcSMS35_4701 EcSMS35_4702   chpS FALSE 0.018 212.000 0.000 NA   NA
 7304910 7304911 EcSMS35_4702 EcSMS35_4703 chpS chpB TRUE 0.994 -6.000 0.375 NA Y NA
 7304913 7304914 EcSMS35_4705 EcSMS35_4706     TRUE 0.926 133.000 0.804 NA Y NA
 7304914 7304915 EcSMS35_4706 EcSMS35_4707     TRUE 0.989 14.000 0.506 1.000 Y NA
 7304915 7304916 EcSMS35_4707 EcSMS35_4708     TRUE 0.998 -13.000 0.865 0.040 Y NA
 7304918 7304919 EcSMS35_4710 EcSMS35_4711   mpl TRUE 0.621 -18.000 0.000 NA   NA
 7304921 7304922 EcSMS35_4713 EcSMS35_4714 pmbA cybC FALSE 0.187 56.000 0.028 NA   NA
 7304922 7304923 EcSMS35_4714 EcSMS35_4715 cybC relB FALSE 0.034 192.000 0.000 NA N NA
 7304923 7304924 EcSMS35_4715 EcSMS35_4716 relB relE TRUE 0.988 -10.000 0.875 NA N NA
 7304925 7304926 EcSMS35_4717 EcSMS35_4718 nrdG nrdD FALSE 0.383 185.000 0.464 1.000 N NA
 7304928 7304929 EcSMS35_4720 EcSMS35_4721 treC treB TRUE 0.969 50.000 0.650 1.000 Y NA
 7304929 7304930 EcSMS35_4721 EcSMS35_4722 treB treR FALSE 0.428 119.000 0.168 1.000 N NA
 7304932 7304933 EcSMS35_4724 EcSMS35_4725   pyrI TRUE 0.540 34.000 0.084 NA N NA
 7304933 7304934 EcSMS35_4725 EcSMS35_4726 pyrI pyrB TRUE 0.986 13.000 0.197 0.002 Y NA
 7304934 7304935 EcSMS35_4726 EcSMS35_4727 pyrB   FALSE 0.039 171.000 0.000 NA   NA
 7304935 7304936 EcSMS35_4727 EcSMS35_4728     FALSE 0.114 105.000 0.000 NA   NA
 7304936 7304937 EcSMS35_4728 EcSMS35_4729     FALSE 0.103 132.000 0.000 NA N NA
 7304938 7304939 EcSMS35_4730 EcSMS35_4731     TRUE 0.763 0.000 0.000 NA   NA
 7304939 7304940 EcSMS35_4731 EcSMS35_4732     FALSE 0.442 17.000 0.000 NA   NA
 7304940 7304941 EcSMS35_4732 EcSMS35_4733     FALSE 0.096 123.000 0.000 NA   NA
 7304946 7304947 EcSMS35_4738 EcSMS35_4739 valS holC TRUE 0.928 0.000 0.089 1.000 N NA
 7304947 7304948 EcSMS35_4739 EcSMS35_4740 holC pepA TRUE 0.754 95.000 0.494 1.000 N NA
 7304948 7304949 EcSMS35_4740 EcSMS35_4741 pepA   FALSE 0.014 225.000 0.000 NA   NA
 7304950 7304951 EcSMS35_4742 EcSMS35_4743     TRUE 0.993 0.000 0.631 0.059   NA
 7304952 7304953 EcSMS35_4744 EcSMS35_4745   idnR FALSE 0.167 78.000 0.007 1.000   NA
 7304953 7304954 EcSMS35_4745 EcSMS35_4746 idnR idnT TRUE 0.572 67.000 0.200 1.000 N NA
 7304954 7304955 EcSMS35_4746 EcSMS35_4747 idnT idnO FALSE 0.451 65.000 0.111 1.000 N NA
 7304955 7304956 EcSMS35_4747 EcSMS35_4748 idnO idnD TRUE 0.922 24.000 0.444 1.000 N NA
 7304959 7304960 EcSMS35_4752 EcSMS35_4753     FALSE 0.029 186.000 0.000 NA   NA
 7304961 7304962 EcSMS35_4754 EcSMS35_4755     FALSE 0.058 174.000 0.000 1.000   NA
 7304964 7304965 EcSMS35_4757 EcSMS35_4758     TRUE 0.548 11.000 0.000 NA   NA
 7304966 7304967 EcSMS35_4759 EcSMS35_4760     FALSE 0.375 67.000 0.100 NA N NA
 7304967 7304968 EcSMS35_4760 EcSMS35_4761     TRUE 0.993 0.000 0.134 0.049 Y NA
 7304968 7304969 EcSMS35_4761 EcSMS35_4762     TRUE 0.993 0.000 0.060 0.000 Y NA
 7304969 7304970 EcSMS35_4762 EcSMS35_4763     TRUE 0.763 0.000 0.000 NA   NA
 7304970 7304971 EcSMS35_4763 EcSMS35_4764     TRUE 0.984 3.000 0.636 NA   NA
 7304971 7304972 EcSMS35_4764 EcSMS35_4765     TRUE 0.666 36.000 0.182 NA   NA
 7304973 7304974 EcSMS35_4766 EcSMS35_4767     FALSE 0.128 90.000 0.000 NA   NA
 7304975 7304976 EcSMS35_4768 EcSMS35_4769     FALSE 0.026 193.000 0.000 NA   NA
 7304977 7304978 EcSMS35_4770 EcSMS35_4771     FALSE 0.032 183.000 0.000 NA   NA
 7304978 7304979 EcSMS35_4771 EcSMS35_4772     TRUE 0.873 -19.000 0.000 0.049   NA
 7304979 7304980 EcSMS35_4772 EcSMS35_4773     TRUE 0.631 6.000 0.000 NA   NA
 7304980 7304981 EcSMS35_4773 EcSMS35_4774     FALSE 0.210 48.000 0.000 NA   NA
 7304981 7304982 EcSMS35_4774 EcSMS35_4775     FALSE 0.195 51.000 0.000 NA   NA
 7304984 7304985 EcSMS35_4776 EcSMS35_4778     TRUE 0.579 10.000 0.000 NA   NA
 7304985 7304986 EcSMS35_4778 EcSMS35_4779     FALSE 0.004 334.000 0.000 NA   NA
 7304986 7304987 EcSMS35_4779 EcSMS35_4780     TRUE 0.614 -19.000 0.000 NA   NA
 7304987 7304988 EcSMS35_4780 EcSMS35_4781     FALSE 0.129 82.000 0.000 NA   NA
 7304988 7304989 EcSMS35_4781 EcSMS35_4782     FALSE 0.258 38.000 0.000 NA   NA
 7304989 7304990 EcSMS35_4782 EcSMS35_4783     FALSE 0.144 69.000 0.000 NA   NA
 7304990 7304991 EcSMS35_4783 EcSMS35_4784     FALSE 0.010 247.000 0.000 NA   NA
 7304995 7304996 EcSMS35_4788 EcSMS35_4789     FALSE 0.467 15.000 0.000 NA   NA
 7304997 7304998 EcSMS35_4790 EcSMS35_4791     TRUE 0.939 -3.000 0.000 0.049   NA
 7304999 7305000 EcSMS35_4792 EcSMS35_4793     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7305002 7305003 EcSMS35_4795 EcSMS35_4796     FALSE 0.166 57.000 0.000 NA   NA
 7305004 7305005 EcSMS35_4797 EcSMS35_4798     FALSE 0.425 19.000 0.000 NA   NA
 7305005 7305006 EcSMS35_4798 EcSMS35_4799     FALSE 0.321 29.000 0.000 NA   NA
 7305006 7305007 EcSMS35_4799 EcSMS35_4800     FALSE 0.236 43.000 0.000 NA   NA
 7305007 7305008 EcSMS35_4800 EcSMS35_4801     FALSE 0.128 90.000 0.000 NA   NA
 7305008 7305009 EcSMS35_4801 EcSMS35_4802     FALSE 0.128 90.000 0.000 NA   NA
 7305009 7305010 EcSMS35_4802 EcSMS35_4803     FALSE 0.127 92.000 0.000 NA   NA
 7305010 7305011 EcSMS35_4803 EcSMS35_4804     FALSE 0.467 15.000 0.000 NA   NA
 7305011 7305012 EcSMS35_4804 EcSMS35_4805     FALSE 0.128 87.000 0.000 NA   NA
 7305012 7305013 EcSMS35_4805 EcSMS35_4806     FALSE 0.023 200.000 0.000 NA   NA
 7305013 7305014 EcSMS35_4806 EcSMS35_4807     FALSE 0.128 90.000 0.000 NA   NA
 7305014 7305015 EcSMS35_4807 EcSMS35_4808     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7305015 7305016 EcSMS35_4808 EcSMS35_4809     FALSE 0.417 20.000 0.000 NA   NA
 7305016 7305017 EcSMS35_4809 EcSMS35_4810     FALSE 0.129 85.000 0.000 NA   NA
 7305017 7305018 EcSMS35_4810 EcSMS35_4811     FALSE 0.002 422.000 0.000 NA   NA
 7305020 7305021 EcSMS35_4813 EcSMS35_4814     TRUE 0.990 3.000 1.000 NA   NA
 7305021 7305022 EcSMS35_4814 EcSMS35_4815     TRUE 0.697 3.000 0.000 NA   NA
 7305022 7305023 EcSMS35_4815 EcSMS35_4816     FALSE 0.501 13.000 0.000 NA   NA
 7305023 7305024 EcSMS35_4816 EcSMS35_4817     FALSE 0.091 127.000 0.000 NA   NA
 7305026 7305027 EcSMS35_4819 EcSMS35_4820     FALSE 0.190 52.000 0.000 NA   NA
 7305028 7305029 EcSMS35_4821 EcSMS35_4822     FALSE 0.011 240.000 0.000 NA   NA
 7305029 7305030 EcSMS35_4822 EcSMS35_4823     TRUE 0.964 4.000 0.385 NA   NA
 7305030 7305031 EcSMS35_4823 EcSMS35_4824     TRUE 0.933 7.000 0.231 1.000   NA
 7305032 7305033 EcSMS35_4825 EcSMS35_4827     TRUE 0.975 0.000 0.360 NA   NA
 7305035 7305036 EcSMS35_4828 EcSMS35_4829     TRUE 0.862 3.000 0.053 1.000 N NA
 7305036 7305037 EcSMS35_4829 EcSMS35_4830     TRUE 0.965 0.000 0.091 0.009   NA
 7305037 7305038 EcSMS35_4830 EcSMS35_4831     TRUE 0.989 -3.000 0.409 0.066   NA
 7305041 7305042 EcSMS35_4834 EcSMS35_4835     FALSE 0.148 65.000 0.000 NA   NA
 7305042 7305043 EcSMS35_4835 EcSMS35_4836   nanC FALSE 0.417 20.000 0.000 NA   NA
 7305043 7305044 EcSMS35_4836 EcSMS35_4837 nanC   FALSE 0.001 641.000 0.000 NA   NA
 7305045 7305046 EcSMS35_4838 EcSMS35_4839 fimB fimE FALSE 0.052 478.000 0.000 0.007 Y NA
 7305046 7305047 EcSMS35_4839 EcSMS35_4840 fimE   FALSE 0.003 481.000 0.000 1.000 N NA
 7305047 7305048 EcSMS35_4840 EcSMS35_4842     TRUE 0.962 107.000 0.600 0.007 Y NA
 7305050 7305051 EcSMS35_4843 EcSMS35_4844 fimC fimD1 TRUE 0.929 133.000 0.750 1.000 Y NA
 7305051 7305052 EcSMS35_4844 EcSMS35_4845 fimD1 fimF TRUE 0.957 10.000 0.000 1.000 Y NA
 7305052 7305053 EcSMS35_4845 EcSMS35_4846 fimF fimG TRUE 0.969 13.000 0.000 0.007 Y NA
 7305053 7305054 EcSMS35_4846 EcSMS35_4847 fimG fimH TRUE 0.981 20.000 0.833 0.007   NA
 7305056 7305057 EcSMS35_4849 EcSMS35_4850 uxuA uxuB TRUE 0.763 81.000 0.070 1.000 Y NA
 7305057 7305058 EcSMS35_4850 EcSMS35_4851 uxuB   FALSE 0.008 323.000 0.000 1.000 N NA
 7305060 7305061 EcSMS35_4853 EcSMS35_4854     FALSE 0.123 96.000 0.000 NA   NA
 7305061 7305062 EcSMS35_4854 EcSMS35_4855     TRUE 0.564 -34.000 0.000 NA   NA
 7305063 7305064 EcSMS35_4856 EcSMS35_4857 ptnE ptnK TRUE 0.861 4.000 0.074 1.000   NA
 7305064 7305065 EcSMS35_4857 EcSMS35_4858 ptnK ptnC TRUE 0.952 13.000 0.226 0.001   NA
 7305066 7305067 EcSMS35_4859 EcSMS35_4860 gldA cglT FALSE 0.177 68.000 0.000 NA N NA
 7305067 7305068 EcSMS35_4860 EcSMS35_4861 cglT cglE FALSE 0.492 18.000 0.000 NA N NA
 7305068 7305069 EcSMS35_4861 EcSMS35_4862 cglE   FALSE 0.010 301.000 0.000 1.000 N NA
 7305070 7305071 EcSMS35_4863 EcSMS35_4864 gcxK gcxR FALSE 0.298 75.000 0.051 1.000 N NA
 7305071 7305072 EcSMS35_4864 EcSMS35_4865 gcxR gcxI TRUE 0.823 18.000 0.154 1.000 N NA
 7305072 7305073 EcSMS35_4865 EcSMS35_4866 gcxI gcxC TRUE 0.735 13.000 0.065 1.000   NA
 7305074 7305075 EcSMS35_4867 EcSMS35_4868   ibeA FALSE 0.010 287.000 0.000 1.000   NA
 7305075 7305076 EcSMS35_4868 EcSMS35_4869 ibeA ibeT TRUE 0.977 15.000 1.000 1.000   NA
 7305077 7305078 EcSMS35_4870 EcSMS35_4871   iadA FALSE 0.283 65.000 0.037 1.000 N NA
 7305078 7305079 EcSMS35_4871 EcSMS35_4872 iadA   TRUE 0.635 13.000 0.028 1.000   NA
 7305079 7305080 EcSMS35_4872 EcSMS35_4873     TRUE 0.958 -3.000 0.019 0.001   NA
 7305081 7305082 EcSMS35_4874 EcSMS35_4875   kptA FALSE 0.148 65.000 0.000 NA   NA
 7305083 7305084 EcSMS35_4876 EcSMS35_4877     FALSE 0.018 211.000 0.000 NA   NA
 7305084 7305085 EcSMS35_4877 EcSMS35_4878     FALSE 0.375 68.000 0.118 NA   NA
 7305085 7305086 EcSMS35_4878 EcSMS35_4879     FALSE 0.112 108.000 0.000 NA   NA
 7305086 7305087 EcSMS35_4879 EcSMS35_4880     FALSE 0.004 322.000 0.000 NA   NA
 7305087 7305088 EcSMS35_4880 EcSMS35_4881   hgdC TRUE 0.896 -3.000 0.078 NA   NA
 7305088 7305089 EcSMS35_4881 EcSMS35_4882 hgdC   TRUE 0.793 10.000 0.078 NA N NA
 7305089 7305090 EcSMS35_4882 EcSMS35_4883     FALSE 0.093 115.000 0.013 NA   NA
 7305090 7305091 EcSMS35_4883 EcSMS35_4884   mdtM FALSE 0.240 41.000 0.020 NA   NA
 7305094 7305095 EcSMS35_4887 EcSMS35_4888     FALSE 0.121 97.000 0.000 NA   NA
 7305096 7305097 EcSMS35_4889 EcSMS35_4890     FALSE 0.049 158.000 0.000 NA   NA
 7305097 7305098 EcSMS35_4890 EcSMS35_4891     FALSE 0.011 241.000 0.000 NA   NA
 7305098 7305099 EcSMS35_4891 EcSMS35_4892     FALSE 0.004 331.000 0.000 NA   NA
 7305099 7305100 EcSMS35_4892 EcSMS35_4893     TRUE 0.886 11.000 0.212 NA   NA
 7305100 7305101 EcSMS35_4893 EcSMS35_4894     TRUE 0.833 50.000 0.531 NA   NA
 7305101 7305102 EcSMS35_4894 EcSMS35_4895     FALSE 0.006 304.000 0.000 NA N NA
 7305103 7305104 EcSMS35_4896 EcSMS35_4897     TRUE 0.975 10.000 0.654 NA N NA
 7305104 7305105 EcSMS35_4897 EcSMS35_4898     FALSE 0.306 103.000 0.095 NA N NA
 7305108 7305109 EcSMS35_4901 EcSMS35_4902     FALSE 0.093 215.000 0.182 NA N NA
 7305111 7305112 EcSMS35_4904 EcSMS35_4905 mdoB   FALSE 0.009 254.000 0.000 NA   NA
 7305112 7305113 EcSMS35_4905 EcSMS35_4906   dnaC TRUE 0.784 46.000 0.368 NA   NA
 7305113 7305114 EcSMS35_4906 EcSMS35_4907 dnaC dnaT TRUE 0.987 3.000 0.778 NA   NA
 7305114 7305115 EcSMS35_4907 EcSMS35_4908 dnaT   FALSE 0.165 107.000 0.046 NA   NA
 7305115 7305116 EcSMS35_4908 EcSMS35_4909     TRUE 0.991 -3.000 0.704 NA   NA
 7305117 7305118 EcSMS35_4910 EcSMS35_4911     FALSE 0.002 406.000 0.000 NA   NA
 7305118 7305119 EcSMS35_4911 EcSMS35_4912     TRUE 0.997 -42.000 0.889 0.015 Y NA
 7305122 7305123 EcSMS35_4915 EcSMS35_4916     FALSE 0.279 34.000 0.000 NA   NA
 7305123 7305124 EcSMS35_4916 EcSMS35_4917     FALSE 0.328 28.000 0.000 NA   NA
 7305124 7305125 EcSMS35_4917 EcSMS35_4918   rsmC FALSE 0.005 300.000 0.000 NA   NA
 7305126 7305127 EcSMS35_4919 EcSMS35_4920 holD rimI TRUE 0.858 -31.000 0.121 1.000   NA
 7305127 7305128 EcSMS35_4920 EcSMS35_4921 rimI yjjG TRUE 0.566 15.000 0.018 1.000   NA
 7305128 7305129 EcSMS35_4921 EcSMS35_4922 yjjG prfC FALSE 0.169 91.000 0.012 1.000   NA
 7305129 7305130 EcSMS35_4922 EcSMS35_4923 prfC osmY FALSE 0.002 393.000 0.000 NA   NA
 7305130 7305131 EcSMS35_4923 EcSMS35_4924 osmY   FALSE 0.091 127.000 0.000 NA   NA
 7305131 7305132 EcSMS35_4924 EcSMS35_4925     FALSE 0.408 122.000 0.211 NA   NA
 7305132 7305133 EcSMS35_4925 EcSMS35_4926     TRUE 0.869 -3.000 0.057 NA   NA
 7305134 7305135 EcSMS35_4927 EcSMS35_4928     TRUE 0.979 -28.000 0.810 NA   NA
 7305136 7305137 EcSMS35_4929 EcSMS35_4930   deoC FALSE 0.050 157.000 0.000 NA   NA
 7305137 7305138 EcSMS35_4930 EcSMS35_4931 deoC deoA TRUE 0.886 78.000 0.286 1.000 Y NA
 7305138 7305139 EcSMS35_4931 EcSMS35_4932 deoA deoB TRUE 0.798 52.000 0.398 1.000 N NA
 7305139 7305140 EcSMS35_4932 EcSMS35_4933 deoB deoD TRUE 0.781 57.000 0.414 1.000 N NA
 7305141 7305142 EcSMS35_4934 EcSMS35_4935   lplA FALSE 0.397 32.000 0.000 1.000   NA
 7305142 7305143 EcSMS35_4935 EcSMS35_4936 lplA   FALSE 0.506 28.000 0.066 NA   NA
 7305144 7305145 EcSMS35_4937 EcSMS35_4938 serB radA FALSE 0.330 49.000 0.024 1.000 N NA
 7305145 7305146 EcSMS35_4938 EcSMS35_4939 radA nadR TRUE 0.560 21.000 0.021 1.000 N NA
 7305146 7305147 EcSMS35_4939 EcSMS35_4940 nadR   FALSE 0.279 34.000 0.000 NA   NA
 7305149 7305150 EcSMS35_4942 EcSMS35_4943   slt FALSE 0.111 109.000 0.000 NA   NA
 7305150 7305151 EcSMS35_4943 EcSMS35_4945 slt trpR FALSE 0.492 90.000 0.167 1.000 N NA
 7305155 7305156 EcSMS35_4948 EcSMS35_4949   creB TRUE 0.576 13.000 0.038 NA   NA
 7305156 7305157 EcSMS35_4949 EcSMS35_4950 creB creC TRUE 0.998 0.000 0.776 1.000 Y NA
 7305157 7305158 EcSMS35_4950 EcSMS35_4951 creC   TRUE 0.678 58.000 0.311 NA N NA
 7305160 7300218 EcSMS35_4953 EcSMS35_0001   thrA FALSE 0.006 361.000 0.000 1.000 N NA
 7300033 7300034 EcSMS35_B0001 EcSMS35_B0002   mbeA FALSE 0.044 165.000 0.000 NA   NA
 7300034 7300035 EcSMS35_B0002 EcSMS35_B0003 mbeA mbeC TRUE 0.966 -10.000 0.400 NA   NA
 7300038 7300039 EcSMS35_B0006 EcSMS35_B0008   imm FALSE 0.002 468.000 0.000 NA   NA
 7300041 7300042 EcSMS35_B0009 EcSMS35_B0010     FALSE 0.129 84.000 0.000 NA   NA
 7300042 7300043 EcSMS35_B0010 EcSMS35_B0011     FALSE 0.002 526.000 0.000 NA   NA
 7300048 7300049 EcSMS35_D0001 EcSMS35_D0002     FALSE 0.003 367.000 0.000 NA   NA
 7300050 7300051 EcSMS35_D0003 EcSMS35_D0004     FALSE 0.002 410.000 0.000 NA   NA
 7300052 7300053 EcSMS35_A0001 EcSMS35_A0002   repA1 FALSE 0.003 364.000 0.000 NA   NA
 7300053 7300054 EcSMS35_A0002 EcSMS35_A0003 repA1 repA2 FALSE 0.007 281.000 0.000 NA   NA
 7300054 7300055 EcSMS35_A0003 EcSMS35_A0004 repA2   FALSE 0.012 239.000 0.000 NA   NA
 7300055 7300056 EcSMS35_A0004 EcSMS35_A0005     FALSE 0.258 38.000 0.000 NA   NA
 7300056 7300057 EcSMS35_A0005 EcSMS35_A0006     FALSE 0.222 46.000 0.000 NA   NA
 7300057 7300058 EcSMS35_A0006 EcSMS35_A0007     FALSE 0.011 243.000 0.000 NA   NA
 7300058 7300059 EcSMS35_A0007 EcSMS35_A0008   finO FALSE 0.470 138.000 0.333 NA   NA
 7300059 7300060 EcSMS35_A0008 EcSMS35_A0009 finO traX TRUE 0.983 4.000 0.667 NA   NA
 7300060 7300061 EcSMS35_A0009 EcSMS35_A0010 traX traI TRUE 0.888 20.000 0.333 NA   NA
 7300061 7300062 EcSMS35_A0010 EcSMS35_A0011 traI traD TRUE 0.951 0.000 0.000 0.002   NA
 7300062 7300063 EcSMS35_A0011 EcSMS35_A0012 traD traT FALSE 0.014 253.000 0.000 1.000   NA
 7300063 7300064 EcSMS35_A0012 EcSMS35_A0013 traT   FALSE 0.295 32.000 0.000 NA   NA
 7300064 7300065 EcSMS35_A0013 EcSMS35_A0014   traG FALSE 0.408 21.000 0.000 NA   NA
 7300065 7300066 EcSMS35_A0014 EcSMS35_A0015 traG traH TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7300066 7300067 EcSMS35_A0015 EcSMS35_A0016 traH trbJ TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7300067 7300068 EcSMS35_A0016 EcSMS35_A0017 trbJ trbB TRUE 0.981 -70.000 1.000 NA   NA
 7300068 7300069 EcSMS35_A0017 EcSMS35_A0018 trbB traQ TRUE 0.646 -13.000 0.000 NA   NA
 7300069 7300070 EcSMS35_A0018 EcSMS35_A0019 traQ trbA FALSE 0.101 119.000 0.000 NA   NA
 7300070 7300071 EcSMS35_A0019 EcSMS35_A0020 trbA traF FALSE 0.452 16.000 0.000 NA   NA
 7300071 7300072 EcSMS35_A0020 EcSMS35_A0021 traF trbE TRUE 0.712 -7.000 0.000 NA   NA
 7300072 7300073 EcSMS35_A0021 EcSMS35_A0022 trbE traN FALSE 0.339 27.000 0.000 NA   NA
 7300073 7300074 EcSMS35_A0022 EcSMS35_A0023 traN trbC TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7300074 7300075 EcSMS35_A0023 EcSMS35_A0024 trbC   FALSE 0.328 28.000 0.000 NA   NA
 7300075 7300076 EcSMS35_A0024 EcSMS35_A0025     FALSE 0.313 30.000 0.000 NA   NA
 7300076 7300077 EcSMS35_A0025 EcSMS35_A0026   traU FALSE 0.351 26.000 0.000 NA   NA
 7300077 7300078 EcSMS35_A0026 EcSMS35_A0027 traU traW TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7300078 7300079 EcSMS35_A0027 EcSMS35_A0028 traW trbI TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7300079 7300080 EcSMS35_A0028 EcSMS35_A0029 trbI traC TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7300080 7300081 EcSMS35_A0029 EcSMS35_A0030 traC traR FALSE 0.060 160.000 0.000 NA N NA
 7300081 7300082 EcSMS35_A0030 EcSMS35_A0031 traR traV FALSE 0.078 135.000 0.000 NA   NA
 7300082 7300083 EcSMS35_A0031 EcSMS35_A0032 traV   TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7300083 7300084 EcSMS35_A0032 EcSMS35_A0033     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7300084 7300085 EcSMS35_A0033 EcSMS35_A0034   traP TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7300085 7300086 EcSMS35_A0034 EcSMS35_A0035 traP traB TRUE 0.672 -10.000 0.000 NA   NA
 7300086 7300087 EcSMS35_A0035 EcSMS35_A0036 traB traK TRUE 0.835 0.000 0.000 1.000   NA
 7300087 7300088 EcSMS35_A0036 EcSMS35_A0037 traK traE TRUE 0.917 -13.000 0.000 0.002   NA
 7300088 7300089 EcSMS35_A0037 EcSMS35_A0038 traE traL TRUE 0.799 22.000 0.000 0.002   NA
 7300089 7300090 EcSMS35_A0038 EcSMS35_A0039 traL traA TRUE 0.840 15.000 0.000 0.002   NA
 7300090 7300091 EcSMS35_A0039 EcSMS35_A0040 traA traY TRUE 0.700 34.000 0.000 0.002   NA
 7300091 7300092 EcSMS35_A0040 EcSMS35_A0041 traY traJ FALSE 0.185 94.000 0.000 1.000   NA
 7300092 7300093 EcSMS35_A0041 EcSMS35_A0042 traJ traM FALSE 0.042 191.000 0.000 1.000   NA
 7300095 7300096 EcSMS35_A0044 EcSMS35_A0045     FALSE 0.075 137.000 0.000 NA   NA
 7300096 7300097 EcSMS35_A0045 EcSMS35_A0046     FALSE 0.096 123.000 0.000 NA   NA
 7300097 7300098 EcSMS35_A0046 EcSMS35_A0047     FALSE 0.365 25.000 0.000 NA   NA
 7300098 7300099 EcSMS35_A0047 EcSMS35_A0048     FALSE 0.130 81.000 0.000 NA   NA
 7300099 7300100 EcSMS35_A0048 EcSMS35_A0049     TRUE 0.712 -7.000 0.000 NA   NA
 7300100 7300101 EcSMS35_A0049 EcSMS35_A0050   hok FALSE 0.005 298.000 0.000 NA   NA
 7300101 7300102 EcSMS35_A0050 EcSMS35_A0051 hok   FALSE 0.069 143.000 0.000 NA   NA
 7300102 7300103 EcSMS35_A0051 EcSMS35_A0052   psiA TRUE 0.763 0.000 0.000 NA   NA
 7300103 7300104 EcSMS35_A0052 EcSMS35_A0053 psiA psiB TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7300104 7300105 EcSMS35_A0053 EcSMS35_A0054 psiB   FALSE 0.174 55.000 0.000 NA   NA
 7300105 7300106 EcSMS35_A0054 EcSMS35_A0055     FALSE 0.184 53.000 0.000 NA   NA
 7300106 7300107 EcSMS35_A0055 EcSMS35_A0056   ssb1 FALSE 0.169 56.000 0.000 NA   NA
 7300107 7300108 EcSMS35_A0056 EcSMS35_A0057 ssb1   FALSE 0.001 643.000 0.000 NA   NA
 7300108 7300109 EcSMS35_A0057 EcSMS35_A0058     TRUE 0.763 0.000 0.000 NA   NA
 7300109 7300110 EcSMS35_A0058 EcSMS35_A0059     FALSE 0.222 46.000 0.000 NA   NA
 7300110 7300111 EcSMS35_A0059 EcSMS35_A0060     FALSE 0.190 52.000 0.000 NA   NA
 7300113 7300114 EcSMS35_A0062 EcSMS35_A0063     FALSE 0.085 130.000 0.000 NA   NA
 7300114 7300115 EcSMS35_A0063 EcSMS35_A0064     TRUE 0.763 0.000 0.000 NA   NA
 7300115 7300116 EcSMS35_A0064 EcSMS35_A0065     FALSE 0.128 90.000 0.000 NA   NA
 7300117 7300118 EcSMS35_A0066 EcSMS35_A0067     FALSE 0.056 152.000 0.000 NA   NA
 7300119 7300120 EcSMS35_A0068 EcSMS35_A0069     TRUE 0.548 11.000 0.000 NA   NA
 7300120 7300121 EcSMS35_A0069 EcSMS35_A0070     FALSE 0.002 426.000 0.000 NA   NA
 7300121 7300122 EcSMS35_A0070 EcSMS35_A0071     TRUE 0.564 -34.000 0.000 NA   NA
 7300122 7300123 EcSMS35_A0071 EcSMS35_A0072   sopB FALSE 0.001 628.000 0.000 NA   NA
 7300123 7300124 EcSMS35_A0072 EcSMS35_A0073 sopB sopA TRUE 0.842 0.000 0.010 1.000 N NA
 7300124 7300125 EcSMS35_A0073 EcSMS35_A0074 sopA   FALSE 0.011 291.000 0.000 1.000 N NA
 7300125 7300126 EcSMS35_A0074 EcSMS35_A0075     TRUE 0.548 11.000 0.000 NA   NA
 7300126 7300127 EcSMS35_A0075 EcSMS35_A0076     FALSE 0.091 127.000 0.000 NA   NA
 7300127 7300128 EcSMS35_A0076 EcSMS35_A0077     FALSE 0.001 600.000 0.000 NA   NA
 7300132 7300133 EcSMS35_A0081 EcSMS35_A0082 sitD_1 sitC_1 TRUE 0.998 -3.000 0.525 0.004 Y NA
 7300133 7300134 EcSMS35_A0082 EcSMS35_A0083 sitC_1 sitB_1 TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.064 Y NA
 7300134 7300135 EcSMS35_A0083 EcSMS35_A0084 sitB_1 sitA_1 TRUE 0.998 0.000 0.894 1.000 Y NA
 7300136 7300137 EcSMS35_A0085 EcSMS35_A0086     TRUE 0.548 11.000 0.000 NA   NA
 7300138 7300139 EcSMS35_A0087 EcSMS35_A0088     FALSE 0.009 258.000 0.000 NA   NA
 7300140 7300141 EcSMS35_A0089 EcSMS35_A0090     FALSE 0.145 68.000 0.000 NA   NA
 7300141 7300142 EcSMS35_A0090 EcSMS35_A0091     FALSE 0.501 13.000 0.000 NA   NA
 7300142 7300143 EcSMS35_A0091 EcSMS35_A0092     TRUE 0.535 -75.000 0.000 NA   NA
 7300145 7300146 EcSMS35_A0094 EcSMS35_A0095   repA TRUE 0.712 -7.000 0.000 NA   NA
 7300147 7300148 EcSMS35_A0096 EcSMS35_A0097     FALSE 0.001 683.000 0.000 NA   NA
 7300148 7300149 EcSMS35_A0097 EcSMS35_A0098   hlyF TRUE 0.765 63.000 0.500 NA   NA
 7300149 7300150 EcSMS35_A0098 EcSMS35_A0099 hlyF ompT FALSE 0.032 433.000 0.000 1.000 Y NA
 7300151 7300152 EcSMS35_A0100 EcSMS35_A0101     FALSE 0.001 1122.000 0.000 NA   NA
 7300152 7300153 EcSMS35_A0101 EcSMS35_A0102     TRUE 0.934 0.000 0.000 0.047   NA
 7300153 7300154 EcSMS35_A0102 EcSMS35_A0103     FALSE 0.002 444.000 0.000 NA   NA
 7300154 7300155 EcSMS35_A0103 EcSMS35_A0104     TRUE 0.548 11.000 0.000 NA   NA
 7300159 7300160 EcSMS35_A0108 EcSMS35_A0110     TRUE 0.971 -42.000 0.000 0.047 Y NA
 7300163 7300164 EcSMS35_A0112 EcSMS35_A0113 cmi resD FALSE 0.113 106.000 0.000 NA   NA
 7300164 7300165 EcSMS35_A0113 EcSMS35_A0114 resD   FALSE 0.523 12.000 0.000 NA   NA
 7300166 7300167 EcSMS35_A0115 EcSMS35_A0116     FALSE 0.033 763.000 0.000 0.009 Y NA
 7300168 7300169 EcSMS35_A0117 EcSMS35_A0118 cmlA   FALSE 0.234 150.000 0.167 NA   NA
 7300172 7300173 EcSMS35_A0121 EcSMS35_A0122 dhfrV   FALSE 0.306 52.000 0.000 1.000 N NA
 7300173 7300174 EcSMS35_A0122 EcSMS35_A0123     FALSE 0.210 48.000 0.000 NA   NA
 7300174 7300175 EcSMS35_A0123 EcSMS35_A0124     TRUE 0.697 3.000 0.000 NA   NA
 7300175 7300176 EcSMS35_A0124 EcSMS35_A0125     TRUE 0.819 79.000 0.000 0.009 Y NA
 7300176 7300177 EcSMS35_A0125 EcSMS35_A0126     FALSE 0.002 497.000 0.000 NA   NA
 7300177 7300178 EcSMS35_A0126 EcSMS35_A0127   sul2 TRUE 0.911 9.000 0.222 NA   NA
 7300178 7300179 EcSMS35_A0127 EcSMS35_A0128 sul2 strA TRUE 0.826 61.000 0.556 1.000 N NA
 7300179 7300180 EcSMS35_A0128 EcSMS35_A0129 strA strB TRUE 0.981 6.000 0.318 0.000 N NA
 7300181 7300182 EcSMS35_A0130 EcSMS35_A0131 blaT   FALSE 0.032 183.000 0.000 NA   NA
 7300183 7300184 EcSMS35_A0132 EcSMS35_A0133   sat FALSE 0.003 369.000 0.000 NA   NA
 7300184 7300185 EcSMS35_A0133 EcSMS35_A0134 sat   FALSE 0.135 96.000 0.027 NA   NA
 7300185 7300186 EcSMS35_A0134 EcSMS35_A0135   aadA FALSE 0.328 46.000 0.027 1.000   NA
 7300189 7300190 EcSMS35_A0138 EcSMS35_A0139     TRUE 0.781 -10.000 0.054 NA   NA
 7300191 7300192 EcSMS35_A0140 EcSMS35_A0141 vagC vagD TRUE 0.937 -3.000 0.143 NA   NA
 7300194 7300195 EcSMS35_A0143 EcSMS35_A0144     TRUE 0.763 0.000 0.000 NA   NA
 7300195 7300196 EcSMS35_A0144 EcSMS35_A0145     FALSE 0.008 263.000 0.000 NA   NA
 7300196 7300197 EcSMS35_A0145 EcSMS35_A0146     FALSE 0.027 192.000 0.000 NA   NA
 7300201 7300202 EcSMS35_A0150 EcSMS35_A0151     FALSE 0.162 58.000 0.000 NA   NA
 7300205 7300206 EcSMS35_A0154 EcSMS35_A0155     FALSE 0.222 138.000 0.088 1.000   NA
 7300211 7300212 EcSMS35_A0160 EcSMS35_A0162     TRUE 0.631 6.000 0.000 NA   NA
 7300213 7300214 EcSMS35_A0161 EcSMS35_A0163     TRUE 0.548 11.000 0.000 NA   NA
 7300214 7300215 EcSMS35_A0163 EcSMS35_A0164   pemK FALSE 0.015 220.000 0.000 NA   NA
 7300215 7300216 EcSMS35_A0164 EcSMS35_A0165 pemK pemI TRUE 0.994 -31.000 0.667 NA Y NA
 7300216 7300217 EcSMS35_A0165 EcSMS35_A0166 pemI   FALSE 0.126 93.000 0.000 NA   NA
 7300217 7300052 EcSMS35_A0166 EcSMS35_A0001     TRUE 0.557 190.000 1.000 NA   NA