MicrobesOnline Operon Predictions for Salmonella enterica subsp. enterica serovar Kentucky str. CVM29188

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 4385800 4385801 Sente_010100000015 Sente_010100000020     FALSE 0.350 108.000 0.081 NA   NA
 4385801 4385802 Sente_010100000020 Sente_010100000025     TRUE 0.610 100.000 0.219 NA   NA
 4385802 4385803 Sente_010100000025 Sente_010100000030     FALSE 0.023 57.000 0.000 NA   NA
 4385803 4385804 Sente_010100000030 Sente_010100000035     FALSE 0.026 102.000 0.000 NA   NA
 4385804 4385805 Sente_010100000035 Sente_010100000040     FALSE 0.032 31.000 0.000 NA   NA
 4385805 4385806 Sente_010100000040 Sente_010100000045     FALSE 0.027 41.000 0.000 NA   NA
 4385807 4385808 Sente_010100000050 Sente_010100000055     TRUE 0.611 129.000 0.196 1.000   NA
 4385809 4385810 Sente_010100000060 Sente_010100000065     FALSE 0.028 39.000 0.000 NA   NA
 4385811 4385812 Sente_010100000070 Sente_010100000075     FALSE 0.006 208.000 0.000 NA   NA
 4385814 4385815 Sente_010100000085 Sente_010100000090     TRUE 0.912 -3.000 0.000 0.093 Y NA
 4385818 4385819 Sente_010100000105 Sente_010100000110     TRUE 0.886 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 4385819 4385820 Sente_010100000110 Sente_010100000115     TRUE 0.959 -3.000 0.537 0.002 N NA
 4385820 4385821 Sente_010100000115 Sente_010100000120     TRUE 0.964 10.000 0.373 0.001 N NA
 4385821 4385822 Sente_010100000120 Sente_010100000125     TRUE 0.922 4.000 0.231 1.000 N NA
 4385822 4385823 Sente_010100000125 Sente_010100000130     TRUE 0.903 -28.000 0.400 1.000 Y NA
 4385823 4385824 Sente_010100000130 Sente_010100000135     FALSE 0.425 38.000 0.000 1.000 N NA
 4385826 4385827 Sente_010100000145 Sente_010100000150     FALSE 0.076 235.000 0.018 1.000 N NA
 4385828 4385829 Sente_010100000155 Sente_010100000160     FALSE 0.346 85.000 0.083 NA   NA
 4385831 4385832 Sente_010100000170 Sente_010100000175     TRUE 0.951 0.000 1.000 1.000   NA
 4385832 4385833 Sente_010100000175 Sente_010100000180     TRUE 0.980 -3.000 0.444 0.057 Y NA
 4385833 4385834 Sente_010100000180 Sente_010100000185     TRUE 0.891 -7.000 0.556 0.057   NA
 4385834 4385835 Sente_010100000185 Sente_010100000190     FALSE 0.022 333.000 0.000 0.057   NA
 4385835 4385836 Sente_010100000190 Sente_010100000195     TRUE 0.678 242.000 0.551 1.000 Y NA
 4385837 4385838 Sente_010100000200 Sente_010100000205     FALSE 0.032 317.000 0.000 1.000 N NA
 4385838 4385839 Sente_010100000205 Sente_010100000210     FALSE 0.089 166.000 0.000 1.000   NA
 4385839 4385840 Sente_010100000210 Sente_010100000215     TRUE 0.626 -39.000 0.333 1.000   NA
 4385843 4385844 Sente_010100000230 Sente_010100000235     TRUE 0.660 64.000 0.333 NA   NA
 4385844 4385845 Sente_010100000235 Sente_010100000240     FALSE 0.060 -3.000 0.000 NA   NA
 4385845 4385846 Sente_010100000240 Sente_010100000245     FALSE 0.023 75.000 0.000 NA   NA
 4385846 4385847 Sente_010100000245 Sente_010100000250     TRUE 0.928 3.000 0.065 NA Y NA
 4385847 4385848 Sente_010100000250 Sente_010100000255     TRUE 0.909 0.000 0.000 1.000 Y NA
 4385848 4385849 Sente_010100000255 Sente_010100000260     TRUE 0.897 14.000 0.000 1.000 Y NA
 4385849 4385850 Sente_010100000260 Sente_010100000265     TRUE 0.916 10.000 0.000 1.000 Y NA
 4385853 4385854 Sente_010100000280 Sente_010100000285     TRUE 0.980 0.000 0.300 0.068 Y NA
 4385854 4385855 Sente_010100000285 Sente_010100000290     TRUE 0.927 -3.000 0.077 1.000 Y NA
 4385856 4385857 Sente_010100000295 Sente_010100000300     FALSE 0.069 250.000 0.000 1.000 N NA
 4385857 4385858 Sente_010100000300 Sente_010100000305     FALSE 0.060 -3.000 0.000 NA   NA
 4385858 4385859 Sente_010100000305 Sente_010100000310     TRUE 0.726 31.000 0.320 NA   NA
 4385860 4385861 Sente_010100000315 Sente_010100000320     TRUE 0.808 -3.000 0.250 NA   NA
 4385861 4385862 Sente_010100000320 Sente_010100000325     TRUE 0.877 47.000 0.700 1.000 N NA
 4385862 4385863 Sente_010100000325 Sente_010100000330     FALSE 0.403 12.000 0.000 1.000   NA
 4385863 4385864 Sente_010100000330 Sente_010100000335     TRUE 0.830 91.000 1.000 NA   NA
 4385866 4385867 Sente_010100000345 Sente_010100000350     TRUE 0.819 0.000 0.208 NA   NA
 4385867 4385868 Sente_010100000350 Sente_010100000355     TRUE 0.797 97.000 0.667 NA   NA
 4385868 4385869 Sente_010100000355 Sente_010100000360     FALSE 0.152 199.000 0.000 1.000 N NA
 4385869 4385870 Sente_010100000360 Sente_010100000365     TRUE 0.908 -22.000 0.222 0.014 Y NA
 4385870 4385871 Sente_010100000365 Sente_010100000370     TRUE 0.985 15.000 0.625 0.014 Y NA
 4385871 4385872 Sente_010100000370 Sente_010100000375     TRUE 0.991 3.000 0.857 0.014 Y NA
 4385872 4385873 Sente_010100000375 Sente_010100000380     TRUE 0.848 15.000 0.250 1.000   NA
 4385873 4385874 Sente_010100000380 Sente_010100000385     TRUE 0.756 67.000 0.250 0.005   NA
 4385875 4385876 Sente_010100000390 Sente_010100000395     FALSE 0.231 167.000 0.000 1.000 N NA
 4385876 4385877 Sente_010100000395 Sente_010100000400     FALSE 0.026 99.000 0.000 NA   NA
 4385881 4385882 Sente_010100000420 Sente_010100000425     FALSE 0.335 13.000 0.043 NA   NA
 4385887 4385888 Sente_010100000450 Sente_010100000455     FALSE 0.007 200.000 0.000 NA   NA
 4385888 4385889 Sente_010100000455 Sente_010100000460     FALSE 0.001 425.000 0.000 NA   NA
 4385889 4385890 Sente_010100000460 Sente_010100000465     FALSE 0.060 -3.000 0.000 NA   NA
 4385890 4385891 Sente_010100000465 Sente_010100000470     FALSE 0.056 16.000 0.000 NA   NA
 4385891 4385892 Sente_010100000470 Sente_010100000475     FALSE 0.002 265.000 0.000 NA   NA
 4385892 4385893 Sente_010100000475 Sente_010100000480   ampC FALSE 0.009 324.000 0.000 1.000   NA
 4385893 4385894 Sente_010100000480 Sente_010100000485 ampC   FALSE 0.390 94.000 0.022 1.000 N NA
 4385896 4385897 Sente_010100000495 Sente_010100000500     FALSE 0.061 15.000 0.000 NA   NA
 4385897 4385898 Sente_010100000500 Sente_010100000505     FALSE 0.002 279.000 0.000 NA   NA
 4385898 4385899 Sente_010100000505 Sente_010100000510     FALSE 0.076 0.000 0.000 NA   NA
 4385899 4385900 Sente_010100000510 Sente_010100000515     TRUE 0.669 28.000 0.217 NA   NA
 4385900 4385901 Sente_010100000515 Sente_010100000520     FALSE 0.084 7.000 0.000 NA   NA
 4385902 4385903 Sente_010100000525 Sente_010100000530     TRUE 0.612 32.000 0.074 0.028   NA
 4385903 4385904 Sente_010100000530 Sente_010100000535     FALSE 0.326 107.000 0.052 1.000   NA
 4385904 4385905 Sente_010100000535 Sente_010100000540     TRUE 0.977 -3.000 0.526 1.000 Y NA
 4385906 4385907 Sente_010100000545 Sente_010100000550     FALSE 0.186 72.000 0.053 NA   NA
 4385907 4385908 Sente_010100000550 Sente_010100000555     TRUE 0.727 111.000 0.005 1.000 Y NA
 4385908 4385909 Sente_010100000555 Sente_010100000560     FALSE 0.083 257.000 0.043 1.000 N NA
 4385909 4385910 Sente_010100000560 Sente_010100000565     TRUE 0.689 74.000 0.154 1.000 N NA
 4385911 4385912 Sente_010100000570 Sente_010100000575     TRUE 0.986 11.000 1.000 NA Y NA
 4385912 4385913 Sente_010100000575 Sente_010100000580     TRUE 0.955 42.000 1.000 NA Y NA
 4385914 4385915 Sente_010100000585 Sente_010100000590     FALSE 0.024 80.000 0.000 NA   NA
 4385915 4385916 Sente_010100000590 Sente_010100000595     FALSE 0.006 203.000 0.000 NA   NA
 4385917 4385918 Sente_010100000600 Sente_010100000605     FALSE 0.030 -10.000 0.000 NA   NA
 4385918 4385919 Sente_010100000605 Sente_010100000610     FALSE 0.399 44.000 0.000 1.000 N NA
 4385919 4385920 Sente_010100000610 Sente_010100000615     FALSE 0.056 197.000 0.000 1.000   NA
 4385920 4385921 Sente_010100000615 Sente_010100000620     TRUE 0.655 106.000 0.200 1.000   NA
 4385922 4385923 Sente_010100000625 Sente_010100000630     FALSE 0.017 -28.000 0.000 NA   NA
 4385924 4385925 Sente_010100000635 Sente_010100000640     FALSE 0.531 140.000 0.212 NA   NA
 4385926 4385927 Sente_010100000645 Sente_010100000650     FALSE 0.227 -7.000 0.048 NA   NA
 4385927 4385928 Sente_010100000650 Sente_010100000655     TRUE 0.990 7.000 0.810 0.083 Y NA
 4385929 4385930 Sente_010100000660 Sente_010100000665     FALSE 0.307 124.000 0.078 NA   NA
 4385930 4385931 Sente_010100000665 Sente_010100000670     TRUE 0.833 -13.000 1.000 NA   NA
 4385934 4385935 Sente_010100000685 Sente_010100000700     FALSE 0.000 2035.000 0.000 NA   NA
 4385935 4385936 Sente_010100000700 Sente_010100000705     TRUE 0.738 -3.000 0.167 NA   NA
 4385936 4385937 Sente_010100000705 Sente_010100000710     FALSE 0.454 8.000 0.051 NA   NA
 4385937 4385938 Sente_010100000710 Sente_010100000715     TRUE 0.989 3.000 0.615 0.019 Y NA
 4385938 4385939 Sente_010100000715 Sente_010100000720     TRUE 0.746 -10.000 0.000 NA Y NA
 4385939 4385940 Sente_010100000720 Sente_010100000725     TRUE 0.859 -3.000 0.000 NA Y NA
 4385940 4385941 Sente_010100000725 Sente_010100000730     TRUE 0.986 0.000 0.828 1.000 Y NA
 4385941 4385942 Sente_010100000730 Sente_010100000735     TRUE 0.738 -7.000 0.291 NA   NA
 4385942 4385943 Sente_010100000735 Sente_010100000740     FALSE 0.282 -7.000 0.055 NA   NA
 4385943 4385944 Sente_010100000740 Sente_010100000745     TRUE 0.839 28.000 0.667 NA   NA
 4385944 4385945 Sente_010100000745 Sente_010100000750     FALSE 0.533 76.000 0.091 NA N NA
 4385945 4385946 Sente_010100000750 Sente_010100000755     TRUE 0.957 0.000 0.182 NA Y NA
 4385948 4385949 Sente_010100000765 Sente_010100000770     FALSE 0.003 670.000 0.000 1.000   NA
 4385950 4385951 Sente_010100000775 Sente_010100000780     FALSE 0.041 -6.000 0.000 NA   NA
 4385951 4385952 Sente_010100000780 Sente_010100000785     FALSE 0.067 14.000 0.000 NA   NA
 4385952 4385953 Sente_010100000785 Sente_010100000790     TRUE 0.984 12.000 0.647 1.000 Y NA
 4385953 4385954 Sente_010100000790 Sente_010100000795     TRUE 0.831 111.000 0.070 1.000 Y NA
 4385954 4385955 Sente_010100000795 Sente_010100000800     FALSE 0.016 -31.000 0.000 NA   NA
 4385955 4385956 Sente_010100000800 Sente_010100000805     FALSE 0.029 35.000 0.000 NA   NA
 4385957 4385958 Sente_010100000810 Sente_010100000815     FALSE 0.023 64.000 0.000 NA   NA
 4385960 4385961 Sente_010100000825 Sente_010100000830     FALSE 0.427 39.000 0.000 0.004   NA
 4385962 4385963 Sente_010100000835 Sente_010100000840     FALSE 0.015 154.000 0.000 NA   NA
 4385964 4385965 Sente_010100000845 Sente_010100000850     FALSE 0.076 0.000 0.000 NA   NA
 4385967 4385968 Sente_010100000860 Sente_010100000865     TRUE 0.688 15.000 0.125 NA   NA
 4385968 4385969 Sente_010100000865 Sente_010100000870     FALSE 0.023 73.000 0.000 NA   NA
 4385969 4385970 Sente_010100000870 Sente_010100000875     FALSE 0.037 -7.000 0.000 NA   NA
 4385970 4385971 Sente_010100000875 Sente_010100000880     TRUE 0.939 11.000 0.864 NA   NA
 4385972 4385973 Sente_010100000885 Sente_010100000890     FALSE 0.000 777.000 0.000 NA   NA
 4385975 4385976 Sente_010100000900 Sente_010100000905     FALSE 0.023 53.000 0.000 NA   NA
 4385976 4385977 Sente_010100000905 Sente_010100000910     FALSE 0.000 646.000 0.000 NA   NA
 4385977 4385978 Sente_010100000910 Sente_010100000915     FALSE 0.001 403.000 0.000 NA   NA
 4385978 4385979 Sente_010100000915 Sente_010100000920     FALSE 0.082 243.000 0.000 0.002   NA
 4385979 4385980 Sente_010100000920 Sente_010100000925     FALSE 0.013 161.000 0.000 NA   NA
 4385980 4385981 Sente_010100000925 Sente_010100000930     FALSE 0.023 70.000 0.000 NA   NA
 4385981 4385982 Sente_010100000930 Sente_010100000935     FALSE 0.028 38.000 0.000 NA   NA
 4385982 4385983 Sente_010100000935 Sente_010100000940     FALSE 0.006 205.000 0.000 NA   NA
 4385985 4385986 Sente_010100000950 Sente_010100t03282     FALSE 0.013 161.000 0.000 NA   NA
 4385986 4385987 Sente_010100t03282 Sente_010100000955     FALSE 0.026 106.000 0.000 NA   NA
 4385987 4385988 Sente_010100000955 Sente_010100000960     FALSE 0.028 39.000 0.000 NA   NA
 4385994 4385995 Sente_010100000990 Sente_010100000995     TRUE 0.761 28.000 0.150 1.000 N NA
 4385996 4385997 Sente_010100001000 Sente_010100001005     TRUE 0.664 0.000 0.092 NA   NA
 4385997 4385998 Sente_010100001005 Sente_010100001010     FALSE 0.492 53.000 0.155 NA   NA
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 4385999 4386000 Sente_010100001015 Sente_010100001020     FALSE 0.013 133.000 0.018 NA   NA
 4386001 4386002 Sente_010100001025 Sente_010100001030     TRUE 0.823 -7.000 0.218 1.000 N NA
 4386002 4386003 Sente_010100001030 Sente_010100001035     FALSE 0.053 8.000 0.016 NA   NA
 4386003 4386004 Sente_010100001035 Sente_010100001040     FALSE 0.564 -3.000 0.081 NA   NA
 4386004 4386005 Sente_010100001040 Sente_010100001045     TRUE 0.721 19.000 0.189 NA   NA
 4386006 4386007 Sente_010100001050 Sente_010100001055     FALSE 0.363 132.000 0.000 1.000 N NA
 4386008 4386009 Sente_010100001060 Sente_010100001065     TRUE 0.902 0.000 0.263 NA N NA
 4386009 4386010 Sente_010100001065 Sente_010100001070     FALSE 0.231 216.000 0.120 NA N NA
 4386010 4386011 Sente_010100001070 Sente_010100001075     TRUE 0.692 20.000 0.173 NA   NA
 4386011 4386012 Sente_010100001075 Sente_010100001080     FALSE 0.566 77.000 0.201 NA   NA
 4386012 4386013 Sente_010100001080 Sente_010100001085     TRUE 0.657 95.000 0.210 1.000   NA
 4386013 4386014 Sente_010100001085 Sente_010100001090     FALSE 0.261 79.000 0.042 1.000   NA
 4386019 4386020 Sente_010100001115 Sente_010100001120     FALSE 0.015 87.000 0.009 NA   NA
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 4386021 4386022 Sente_010100001125 Sente_010100001130     FALSE 0.007 199.000 0.000 NA   NA
 4386023 4386024 Sente_010100001135 Sente_010100001140     FALSE 0.024 49.000 0.000 NA   NA
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 4386027 4386028 Sente_010100001155 Sente_010100001160     TRUE 0.813 3.000 0.027 0.028 N NA
 4386028 4386029 Sente_010100001160 Sente_010100001165     TRUE 0.658 14.000 0.027 1.000 N NA
 4386029 4386030 Sente_010100001165 Sente_010100001170     FALSE 0.306 39.000 0.000 NA N NA
 4386030 4386031 Sente_010100001170 Sente_010100001175     FALSE 0.002 260.000 0.000 NA   NA
 4386031 4386032 Sente_010100001175 Sente_010100001180     FALSE 0.006 205.000 0.000 NA   NA
 4386033 4386034 Sente_010100001185 Sente_010100001190     FALSE 0.490 101.000 0.133 NA   NA
 4386035 4386036 Sente_010100001195 Sente_010100001200     FALSE 0.137 315.000 0.000 1.000 Y NA
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 4386037 4386038 Sente_010100001205 Sente_010100001210     TRUE 0.895 24.000 0.458 1.000 N NA
 4386038 4386039 Sente_010100001210 Sente_010100001215     TRUE 0.934 -3.000 0.500 1.000 N NA
 4386039 4386040 Sente_010100001215 Sente_010100001220     FALSE 0.497 214.000 0.545 NA N NA
 4386040 4386041 Sente_010100001220 Sente_010100001225     TRUE 0.928 -3.000 0.588 NA N NA
 4386042 4386043 Sente_010100001230 Sente_010100001235     TRUE 0.956 -6.000 0.214 0.018 Y NA
 4386043 4386044 Sente_010100001235 Sente_010100001240     TRUE 0.862 -12.000 0.093 1.000 Y NA
 4386044 4386045 Sente_010100001240 Sente_010100001245     TRUE 0.923 1.000 0.605 NA   NA
 4386045 4386046 Sente_010100001245 Sente_010100001250     FALSE 0.504 26.000 0.103 NA   NA
 4386046 4386047 Sente_010100001250 Sente_010100001255     FALSE 0.084 3.000 0.000 NA   NA
 4386048 4386049 Sente_010100001260 Sente_010100001265     TRUE 0.925 22.000 0.070 0.006 Y NA
 4386049 4386050 Sente_010100001265 Sente_010100001270     TRUE 0.868 102.000 0.056 0.006 Y NA
 4386050 4386051 Sente_010100001270 Sente_010100001275     FALSE 0.075 233.000 0.038 NA N NA
 4386053 4386054 Sente_010100001285 Sente_010100001290     FALSE 0.319 94.000 0.075 NA   NA
 4386055 4386056 Sente_010100001295 Sente_010100001300     FALSE 0.060 -3.000 0.000 NA   NA
 4386063 4386064 Sente_010100001335 Sente_010100001340     FALSE 0.036 26.000 0.000 NA   NA
 4386064 4386065 Sente_010100001340 Sente_010100001345     TRUE 0.622 -3.000 0.000 1.000 N NA
 4386071 4386072 Sente_010100001375 Sente_010100001380 gcvT   TRUE 0.965 26.000 0.317 0.001 Y NA
 4386072 4386073 Sente_010100001380 Sente_010100001385     TRUE 0.889 163.000 0.249 0.001 Y NA
 4386073 4386074 Sente_010100001385 Sente_010100001390     FALSE 0.004 226.000 0.000 NA   NA
 4386074 4386075 Sente_010100001390 Sente_010100001395     FALSE 0.000 621.000 0.000 NA   NA
 4386077 4386078 Sente_010100001405 Sente_010100001410     FALSE 0.271 164.000 0.113 NA   NA
 4386079 4386080 Sente_010100001415 Sente_010100001420     FALSE 0.038 15.000 0.004 NA   NA
 4386081 4386082 Sente_010100001425 Sente_010100001430     FALSE 0.212 -19.000 0.061 NA   NA
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 4386087 4386088 Sente_010100001455 Sente_010100001460 prfB   TRUE 0.974 10.000 0.162 0.047 Y NA
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 4386107 4386108 Sente_010100001545 Sente_010100001550     TRUE 0.954 44.000 0.714 1.000 Y NA
 4386108 4386109 Sente_010100001550 Sente_010100001555     TRUE 0.965 75.000 0.750 0.012 Y NA
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 4386112 4386113 Sente_010100001570 Sente_010100001575     FALSE 0.014 128.000 0.011 NA   NA
 4386113 4386114 Sente_010100001575 Sente_010100001580     FALSE 0.455 -7.000 0.087 NA   NA
 4386114 4386115 Sente_010100001580 Sente_010100001585     FALSE 0.436 -3.000 0.059 NA   NA
 4386116 4386117 Sente_010100001590 Sente_010100001595     FALSE 0.014 -16.000 0.005 NA   NA
 4386118 4386119 Sente_010100001600 Sente_010100001605     FALSE 0.120 118.000 0.016 1.000   NA
 4386119 4386120 Sente_010100001605 Sente_010100001610     TRUE 0.966 -3.000 0.136 0.001 Y NA
 4386121 4386122 Sente_010100001615 Sente_010100001620     TRUE 0.896 4.000 0.375 NA   NA
 4386122 4386123 Sente_010100001620 Sente_010100001625     TRUE 0.851 12.000 0.265 NA   NA
 4386123 4386124 Sente_010100001625 Sente_010100001630     TRUE 0.901 10.000 0.412 NA   NA
 4386125 4386126 Sente_010100001635 Sente_010100001640     TRUE 0.821 22.000 0.174 1.000 N NA
 4386126 4386127 Sente_010100001640 Sente_010100001645     FALSE 0.512 11.000 0.059 NA   NA
 4386128 4386129 Sente_010100001650 Sente_010100001655     TRUE 0.782 23.000 0.133 1.000 N NA
 4386129 4386130 Sente_010100001655 Sente_010100001660     TRUE 0.875 59.000 0.161 1.000 Y NA
 4386130 4386131 Sente_010100001660 Sente_010100001665     TRUE 0.882 79.000 0.161 1.000 Y NA
 4386131 4386132 Sente_010100001665 Sente_010100001670     TRUE 0.779 96.000 0.250 1.000 N NA
 4386132 4386133 Sente_010100001670 Sente_010100001675     FALSE 0.474 66.000 0.051 1.000 N NA
 4386133 4386134 Sente_010100001675 Sente_010100001680     TRUE 0.715 101.000 0.154 1.000 N NA
 4386134 4386135 Sente_010100001680 Sente_010100001685     TRUE 0.646 13.000 0.065 1.000   NA
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 4386136 4386137 Sente_010100001690 Sente_010100001695     TRUE 0.866 79.000 0.625 1.000 N NA
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 4386141 4386142 Sente_010100001715 Sente_010100001720     TRUE 0.908 37.000 0.261 NA Y NA
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 4386146 4386147 Sente_010100001740 Sente_010100001745     TRUE 0.972 -3.000 0.535 NA Y NA
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 4386978 4386979 Sente_010100005914 Sente_010100005919     TRUE 0.953 -3.000 0.091 0.011 Y NA
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 4386980 4386981 Sente_010100005924 Sente_010100005929     TRUE 0.978 -3.000 0.406 0.096 Y NA
 4386982 4386983 Sente_010100t07711 Sente_010100t07713     FALSE 0.080 11.000 0.000 NA   NA
 4386983 4386984 Sente_010100t07713 Sente_010100005939     FALSE 0.016 152.000 0.000 NA   NA
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 4386987 4386988 Sente_010100005954 Sente_010100005959     FALSE 0.023 71.000 0.000 NA   NA
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 4386998 4386999 Sente_010100006009 Sente_010100006014     FALSE 0.022 67.000 0.000 NA   NA
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 4387020 4387021 Sente_010100006119 Sente_010100006124     TRUE 0.971 -7.000 0.537 0.018 Y NA
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 4387353 4387354 Sente_010100007828 Sente_010100007833     TRUE 0.974 0.000 0.168 0.009 Y NA
 4387354 4387355 Sente_010100007833 Sente_010100007838     TRUE 0.968 11.000 0.107 0.009 Y NA
 4387355 4387356 Sente_010100007838 Sente_010100007843     TRUE 0.960 -3.000 0.124 0.009 Y NA
 4387356 4387357 Sente_010100007843 Sente_010100007848     FALSE 0.001 316.000 0.000 NA   NA
 4387357 4387358 Sente_010100007848 Sente_010100007853     FALSE 0.016 151.000 0.000 NA   NA
 4387358 4387359 Sente_010100007853 Sente_010100007858     FALSE 0.391 217.000 0.231 1.000 N NA
 4387360 4387361 Sente_010100007863 Sente_010100007868     FALSE 0.572 -3.000 0.083 NA   NA
 4387361 4387362 Sente_010100007868 Sente_010100007873     FALSE 0.565 19.000 0.000 1.000 N NA
 4387362 4387363 Sente_010100007873 Sente_010100007878     TRUE 0.728 11.000 0.000 0.001   NA
 4387363 4387364 Sente_010100007878 Sente_010100007883     TRUE 0.956 15.000 0.759 0.001   NA
 4387364 4387365 Sente_010100007883 Sente_010100007888     TRUE 0.872 16.000 0.500 NA   NA
 4387365 4387366 Sente_010100007888 Sente_010100007893     FALSE 0.030 -10.000 0.000 NA   NA
 4387366 4387367 Sente_010100007893 Sente_010100007898     FALSE 0.046 20.000 0.000 NA   NA
 4387367 4387368 Sente_010100007898 Sente_010100007903     TRUE 0.983 4.000 0.645 NA Y NA
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 4387369 4387370 Sente_010100007908 Sente_010100007913     TRUE 0.803 -3.000 0.242 NA   NA
 4387370 4387371 Sente_010100007913 Sente_010100007918     TRUE 0.875 4.000 0.296 NA   NA
 4387371 4387372 Sente_010100007918 Sente_010100007923     TRUE 0.862 10.000 0.268 NA   NA
 4387372 4387373 Sente_010100007923 Sente_010100007928     FALSE 0.343 -3.000 0.000 1.000   NA
 4387373 4387374 Sente_010100007928 Sente_010100007933     TRUE 0.935 12.000 0.000 0.024 Y NA
 4387374 4387375 Sente_010100007933 Sente_010100007938     TRUE 0.964 -3.000 0.259 1.000 Y NA
 4387375 4387376 Sente_010100007938 Sente_010100007943     TRUE 0.984 3.000 0.714 NA Y NA
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 4387379 4387380 Sente_010100007958 Sente_010100007963     TRUE 0.701 58.000 0.080 0.002 N NA
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 4387382 4387383 Sente_010100007973 Sente_010100007978     FALSE 0.380 119.000 0.096 NA   NA
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 4387387 4387388 Sente_010100007998 Sente_010100008003     FALSE 0.001 447.000 0.000 NA   NA
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 4387428 4387429 Sente_010100008203 Sente_010100008208     FALSE 0.083 377.000 0.000 1.000 Y NA
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 4387632 4387633 Sente_010100009230 Sente_010100009235     TRUE 0.920 12.000 0.260 1.000 N NA
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 4387794 4387795 Sente_010100010040 Sente_010100010045     TRUE 0.622 -3.000 0.000 1.000 N NA
 4387797 4387798 Sente_010100010055 Sente_010100010060     TRUE 0.856 19.000 0.209 1.000 N NA
 4387798 4387799 Sente_010100010060 Sente_010100010065     TRUE 0.908 0.000 0.518 NA   NA
 4387799 4387800 Sente_010100010065 Sente_010100010070     FALSE 0.000 611.000 0.000 NA   NA
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 4387802 4387803 Sente_010100010080 Sente_010100010085     FALSE 0.003 565.000 0.000 1.000   NA
 4387803 4387804 Sente_010100010085 Sente_010100010090     TRUE 0.901 59.000 0.238 1.000 Y NA
 4387806 4387807 Sente_010100010100 Sente_010100010105 xni   FALSE 0.085 6.000 0.000 NA   NA
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 4387809 4387810 Sente_010100010115 Sente_010100010120     FALSE 0.001 409.000 0.000 NA   NA
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 4387812 4387813 Sente_010100010130 Sente_010100010135 fucI   FALSE 0.076 0.000 0.000 NA   NA
 4387813 4387814 Sente_010100010135 Sente_010100010140     FALSE 0.060 -3.000 0.000 NA   NA
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 4387851 4387852 Sente_010100010315 Sente_010100010320     FALSE 0.052 17.000 0.000 NA   NA
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 4387938 4387939 Sente_010100010751 Sente_010100010756     TRUE 0.623 -22.000 0.017 NA Y NA
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 4387940 4387941 Sente_010100010761 Sente_010100010766     FALSE 0.029 417.000 0.070 1.000 N NA
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 4388112 4388113 Sente_010100011651 Sente_010100011656     TRUE 0.984 -3.000 0.471 0.001 Y NA
 4388115 4388116 Sente_010100011666 Sente_010100011671     FALSE 0.025 88.000 0.000 NA   NA
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 4388426 4388427 Sente_010100013231 Sente_010100013236     FALSE 0.191 182.000 0.000 1.000 N NA
 4388429 4388430 Sente_010100013246 Sente_010100013251     FALSE 0.526 30.000 0.041 1.000 N NA
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 4388432 4388433 Sente_010100013261 Sente_010100013266     FALSE 0.083 10.000 0.000 NA   NA
 4388433 4388434 Sente_010100013266 Sente_010100013271     FALSE 0.005 218.000 0.000 NA   NA
 4388434 4388435 Sente_010100013271 Sente_010100013276     FALSE 0.025 -13.000 0.000 NA   NA
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 4388444 4388445 Sente_010100013321 Sente_010100013326     FALSE 0.060 -3.000 0.000 NA   NA
 4388445 4388446 Sente_010100013326 Sente_010100013331     FALSE 0.001 370.000 0.000 NA   NA
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 4388601 4388602 Sente_010100014103 Sente_010100014108     FALSE 0.023 -15.000 0.000 NA   NA
 4388602 4388603 Sente_010100014108 Sente_010100014113     FALSE 0.026 42.000 0.000 NA   NA
 4388603 4388604 Sente_010100014113 Sente_010100014118     FALSE 0.024 80.000 0.000 NA   NA
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 4388606 4388607 Sente_010100014128 Sente_010100014133     TRUE 0.987 11.000 0.454 0.004 Y NA
 4388607 4388608 Sente_010100014133 Sente_010100014138     TRUE 0.991 11.000 0.787 0.004 Y NA
 4388608 4388609 Sente_010100014138 Sente_010100014143     FALSE 0.432 111.000 0.031 1.000 N NA
 4388612 4388613 Sente_010100014158 Sente_010100014163     TRUE 0.786 108.000 0.212 0.000   NA
 4388613 4388614 Sente_010100014163 Sente_010100014168     FALSE 0.141 19.000 0.007 1.000   NA
 4388620 4388621 Sente_010100014198 Sente_010100014203     TRUE 0.964 44.000 0.631 0.005 Y NA
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 4388626 4388627 Sente_010100014228 Sente_010100014233     FALSE 0.162 121.000 0.024 1.000   NA
 4388627 4388628 Sente_010100014233 Sente_010100014238     FALSE 0.539 -24.000 0.092 1.000 N NA
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 4388629 4388630 Sente_010100014243 Sente_010100t15190     FALSE 0.025 116.000 0.000 NA   NA
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 4389108 4389109 Sente_010100016659 Sente_010100016664     FALSE 0.011 148.000 0.021 NA   NA
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 4389121 4389122 Sente_010100016724 Sente_010100016729     FALSE 0.068 115.000 0.005 1.000   NA
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 4389951 4389952 Sente_010100020910 Sente_010100020915     FALSE 0.022 65.000 0.000 NA   NA
 4389953 4389954 Sente_010100020920 Sente_010100020925     FALSE 0.002 294.000 0.000 NA   NA
 4389954 4389955 Sente_010100020925 Sente_010100020930     FALSE 0.025 89.000 0.000 NA   NA
 4389955 4389956 Sente_010100020930 Sente_010100020935     FALSE 0.314 147.000 0.000 1.000 N NA
 4389956 4389957 Sente_010100020935 Sente_010100020940     TRUE 0.965 -3.000 0.167 0.037 Y NA
 4389957 4389958 Sente_010100020940 Sente_010100020945     TRUE 0.806 50.000 0.000 0.037 Y NA
 4389958 4389959 Sente_010100020945 Sente_010100020950     TRUE 0.913 16.000 0.000 0.013 Y NA
 4389959 4389960 Sente_010100020950 Sente_010100020955     FALSE 0.483 68.000 0.154 NA   NA
 4389961 4389962 Sente_010100020960 Sente_010100020965     FALSE 0.023 59.000 0.000 NA   NA
 4389962 4389963 Sente_010100020965 Sente_010100020970     FALSE 0.438 35.000 0.000 1.000 N NA
 4389963 4389964 Sente_010100020970 Sente_010100020975     FALSE 0.017 -25.000 0.000 NA   NA
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 4389966 4389967 Sente_010100020985 Sente_010100020990     TRUE 0.805 54.000 0.000 0.015 Y NA
 4389967 4389968 Sente_010100020990 Sente_010100020995     FALSE 0.178 110.000 0.000 1.000   NA
 4389969 4389970 Sente_010100021000 Sente_010100021005     FALSE 0.002 274.000 0.000 NA   NA
 4389970 4389971 Sente_010100021005 Sente_010100021010     TRUE 0.976 19.000 0.345 0.000 Y NA
 4389971 4389972 Sente_010100021010 Sente_010100021015     FALSE 0.014 49.000 0.002 NA   NA
 4389973 4389974 Sente_010100021020 Sente_010100021025     FALSE 0.001 423.000 0.000 NA   NA
 4389977 4389978 Sente_010100021040 Sente_010100021045     TRUE 0.912 -22.000 0.400 1.000 Y NA
 4389978 4389979 Sente_010100021045 Sente_010100021050     TRUE 0.914 0.000 0.231 1.000 N NA
 4389979 4389980 Sente_010100021050 Sente_010100021055     TRUE 0.962 11.000 0.373 0.001 N NA
 4389980 4389981 Sente_010100021055 Sente_010100021060     TRUE 0.960 -3.000 0.537 0.001 N NA
 4389981 4389982 Sente_010100021060 Sente_010100021065     TRUE 0.949 30.000 0.426 1.000 Y NA
 4389983 4389984 Sente_010100021070 Sente_010100021075     FALSE 0.023 121.000 0.000 NA   NA
 4389984 4389985 Sente_010100021075 Sente_010100021080     TRUE 0.701 159.000 0.060 1.000 Y NA
 4389985 4389986 Sente_010100021080 Sente_010100021085     TRUE 0.986 16.000 0.720 0.002 Y NA
 4389986 4389987 Sente_010100021085 Sente_010100021090     TRUE 0.991 13.000 0.886 0.002 Y NA
 4389987 4389988 Sente_010100021090 Sente_010100021095     FALSE 0.519 135.000 0.068 1.000 N NA
 4389988 4389989 Sente_010100021095 Sente_010100021100     TRUE 0.988 2.000 1.000 1.000 Y NA
 4389990 4389991 Sente_010100021105 Sente_010100021110     FALSE 0.056 16.000 0.000 NA   NA
 4389993 4389994 Sente_010100021120 Sente_010100021125 ispH   TRUE 0.960 3.000 0.626 1.000 N NA
 4389994 4389995 Sente_010100021125 Sente_010100021130   lspA TRUE 0.585 155.000 0.154 1.000 N NA
 4389995 4389996 Sente_010100021130 Sente_010100021135 lspA   TRUE 0.748 0.000 0.045 1.000 N NA
 4389996 4389997 Sente_010100021135 Sente_010100021140     TRUE 0.926 9.000 0.254 1.000 N NA
 4389997 4389998 Sente_010100021140 Sente_010100021145     FALSE 0.053 8.000 0.019 NA   NA
 4390000 4390001 Sente_010100021155 Sente_010100021160     FALSE 0.072 13.000 0.000 NA   NA
 4390001 4390002 Sente_010100021160 Sente_010100021175     FALSE 0.000 2372.000 0.000 NA   NA
 4390002 4390003 Sente_010100021175 Sente_010100021180     FALSE 0.007 199.000 0.000 NA   NA
 4390003 4390004 Sente_010100021180 Sente_010100021185     FALSE 0.158 197.000 0.000 1.000 N NA
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 4390053 4390054 Sente_010100021430 Sente_010100021435     FALSE 0.507 -7.000 0.071 1.000   NA
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 4390771 4390772 Sente_010100025020 Sente_010100025025   fliL TRUE 0.873 105.000 0.119 1.000 Y NA
 4390772 4390773 Sente_010100025025 Sente_010100025030 fliL   TRUE 0.993 5.000 0.957 0.001 Y NA
 4390773 4390774 Sente_010100025030 Sente_010100025035     TRUE 0.966 -3.000 0.137 0.001 Y NA
 4390774 4390775 Sente_010100025035 Sente_010100025040     TRUE 0.980 0.000 0.443 1.000 Y NA
 4390775 4390776 Sente_010100025040 Sente_010100025045     TRUE 0.967 0.000 0.203 1.000 Y NA
 4390776 4390777 Sente_010100025045 Sente_010100025050     TRUE 0.977 28.000 0.827 0.007 Y NA
 4390777 4390778 Sente_010100025050 Sente_010100025055     TRUE 0.951 9.000 0.028 0.001 Y NA
 4390778 4390779 Sente_010100025055 Sente_010100025060     FALSE 0.047 282.000 0.000 1.000 N NA
 4390781 4390782 Sente_010100025070 Sente_010100025075     FALSE 0.001 309.000 0.000 NA   NA
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 4391073 4391074 Sente_010100026547 Sente_010100026552     FALSE 0.173 93.000 0.000 1.000   NA
 4391076 4391077 Sente_010100026562 Sente_010100026567     FALSE 0.060 -3.000 0.000 NA   NA
 4391077 4391078 Sente_010100026567 Sente_010100026572     FALSE 0.076 12.000 0.000 NA   NA
 4391078 4391079 Sente_010100026572 Sente_010100026577     FALSE 0.060 -3.000 0.000 NA   NA
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 4391081 4391082 Sente_010100026587 Sente_010100026592     FALSE 0.031 32.000 0.000 NA   NA
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 4391083 4391084 Sente_010100026597 Sente_010100026602     TRUE 0.978 0.000 0.379 1.000 Y NA
 4391084 4391085 Sente_010100026602 Sente_010100026607     TRUE 0.991 0.000 0.933 0.009 Y NA
 4391085 4391086 Sente_010100026607 Sente_010100026612     TRUE 0.699 160.000 0.000 0.040 Y NA
 4391086 4391087 Sente_010100026612 Sente_010100026617     FALSE 0.022 355.000 0.000 1.000 N NA
 4391087 4391088 Sente_010100026617 Sente_010100026622     TRUE 0.920 20.000 0.557 1.000 N NA
 4391088 4391089 Sente_010100026622 Sente_010100026627     FALSE 0.060 -3.000 0.000 NA   NA
 4391089 4391090 Sente_010100026627 Sente_010100026632     FALSE 0.076 12.000 0.000 NA   NA
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 4391091 4391092 Sente_010100026637 Sente_010100026642     FALSE 0.023 59.000 0.000 NA   NA
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 4391102 4391103 Sente_010100026692 Sente_010100026697     TRUE 0.972 14.000 0.328 1.000 Y NA
 4391106 4391107 Sente_010100026712 Sente_010100026717     FALSE 0.423 105.000 0.071 1.000   NA
 4391109 4391110 Sente_010100026727 Sente_010100026732     TRUE 0.748 131.000 0.588 NA   NA
 4391111 4391112 Sente_010100026737 Sente_010100026742     TRUE 0.682 85.000 0.133 1.000 N NA
 4391112 4391113 Sente_010100026742 Sente_010100026747     FALSE 0.428 3.000 0.049 NA   NA
 4391113 4391114 Sente_010100026747 Sente_010100026752     TRUE 0.908 10.000 0.470 NA   NA
 4391114 4391115 Sente_010100026752 Sente_010100026757     TRUE 0.833 18.000 0.379 NA   NA
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 4391119 4391120 Sente_010100026777 Sente_010100026782     TRUE 0.778 91.000 0.147 0.009 N NA
 4391120 4391121 Sente_010100026782 Sente_010100026787     TRUE 0.759 38.000 0.038 NA Y NA
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 4391126 4391127 Sente_010100026812 Sente_010100026817     FALSE 0.327 215.000 0.184 0.064   NA
 4391127 4391128 Sente_010100026817 Sente_010100026822     FALSE 0.546 72.000 0.141 1.000   NA
 4391128 4391129 Sente_010100026822 Sente_010100026827   miaA TRUE 0.795 83.000 0.531 1.000   NA
 4391129 4391130 Sente_010100026827 Sente_010100026832 miaA mutL TRUE 0.853 -7.000 0.188 0.058 N NA
 4391130 4391131 Sente_010100026832 Sente_010100026837 mutL   TRUE 0.853 10.000 0.092 1.000 N NA
 4391131 4391132 Sente_010100026837 Sente_010100026842     TRUE 0.614 17.000 0.109 NA   NA
 4391132 4391133 Sente_010100026842 Sente_010100026847     FALSE 0.350 -28.000 0.118 NA   NA
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 4391201 4391202 Sente_010100027207 Sente_010100027212     TRUE 0.933 -19.000 0.548 1.000 Y NA
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 4391204 4391205 Sente_010100027222 Sente_010100027227     FALSE 0.021 364.000 0.000 1.000 N NA
 4391206 4391207 Sente_010100027232 Sente_010100027237   hemE FALSE 0.477 41.000 0.040 1.000 N NA
 4391207 4391208 Sente_010100027237 Sente_010100027242 hemE   TRUE 0.713 10.000 0.028 1.000 N NA
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 4391209 4391210 Sente_010100027247 Sente_010100027252     FALSE 0.492 187.000 0.355 1.000   NA
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 4391224 4391225 Sente_010100027322 Sente_010100027327     FALSE 0.273 51.000 0.069 NA   NA
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 4391238 4391239 Sente_010100027392 Sente_010100027397     FALSE 0.005 213.000 0.000 NA   NA
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 7289863 7289864 SeKA_C0045 SeKA_C0046     FALSE 0.060 -3.000 0.000 NA   NA
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