MicrobesOnline Operon Predictions for Azorhizobium caulinodans ORS 571

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 3726627 3726628 AZC_0001 AZC_0002     TRUE 0.989 -3.000 0.135 NA   NA
 3726628 3726629 AZC_0002 AZC_0003     TRUE 0.989 -3.000 0.169 NA N NA
 3726629 3726630 AZC_0003 AZC_0004     TRUE 0.958 5.000 0.078 1.000 N NA
 3726630 3726631 AZC_0004 AZC_0005     TRUE 0.967 4.000 0.092 1.000 N NA
 3726631 3726632 AZC_0005 AZC_0006     FALSE 0.072 90.000 0.000 1.000 N NA
 3726632 3726633 AZC_0006 AZC_0007     TRUE 0.874 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3726633 3726634 AZC_0007 AZC_0008     FALSE 0.130 122.000 0.000 0.092 N NA
 3726634 3726635 AZC_0008 AZC_0009     TRUE 0.992 -3.000 0.220 1.000 N NA
 3726635 3726636 AZC_0009 AZC_0010     TRUE 0.852 59.000 0.457 NA   NA
 3726636 3726637 AZC_0010 AZC_0011     TRUE 0.918 22.000 0.222 NA   NA
 3726637 3726638 AZC_0011 AZC_0012     TRUE 0.947 14.000 0.213 NA   NA
 3726638 3726639 AZC_0012 AZC_0013     TRUE 0.542 99.000 0.231 1.000 N NA
 3726639 3726640 AZC_0013 AZC_0014     TRUE 0.464 89.000 0.113 1.000 N NA
 3726640 3726641 AZC_0014 AZC_0015     FALSE 0.327 193.000 0.112 1.000   NA
 3726641 3726642 AZC_0015 AZC_0016   lysR FALSE 0.094 98.000 0.000 1.000   NA
 3726642 3726643 AZC_0016 AZC_0017 lysR   FALSE 0.042 342.000 0.000 NA   NA
 3726643 3726644 AZC_0017 AZC_0018   nusA TRUE 0.997 0.000 0.759 NA   NA
 3726644 3726645 AZC_0018 AZC_0019 nusA   TRUE 0.951 22.000 0.075 NA Y NA
 3726645 3726646 AZC_0019 AZC_0020     TRUE 0.992 -3.000 0.223 NA N NA
 3726646 3726647 AZC_0020 AZC_0021     TRUE 0.827 232.000 0.530 1.000 Y NA
 3726647 3726648 AZC_0021 AZC_0022     TRUE 0.997 0.000 0.318 1.000 Y NA
 3726648 3726649 AZC_0022 AZC_0023     FALSE 0.192 33.000 0.000 NA N NA
 3726650 3726651 AZC_0024 AZC_0025     TRUE 0.999 -3.000 0.875 NA Y NA
 3726651 3726652 AZC_0025 AZC_0026     TRUE 0.722 219.000 0.281 NA Y NA
 3726652 3726653 AZC_0026 AZC_0027     FALSE 0.052 96.000 0.000 NA N NA
 3726654 3726655 AZC_0028 AZC_0029 marR   FALSE 0.050 114.000 0.000 1.000 N NA
 3726655 3726656 AZC_0029 AZC_0030     FALSE 0.128 46.000 0.000 NA N NA
 3726658 3726659 AZC_0032 AZC_0033     FALSE 0.058 102.000 0.000 1.000 N NA
 3726659 3726660 AZC_0033 AZC_0034     FALSE 0.152 39.000 0.000 NA N NA
 3726662 3726663 AZC_0036 AZC_0037     TRUE 0.995 -3.000 0.182 0.018 N NA
 3726663 3726664 AZC_0037 AZC_0038     TRUE 0.537 18.000 0.000 1.000   NA
 3726664 3726665 AZC_0038 AZC_0039   wcbD FALSE 0.064 160.000 0.000 1.000   NA
 3726665 3726666 AZC_0039 AZC_0040 wcbD   TRUE 0.997 -3.000 0.194 NA Y NA
 3726666 3726667 AZC_0040 AZC_0041   wcbD TRUE 0.995 -3.000 0.056 NA Y NA
 3726667 3726668 AZC_0041 AZC_0042 wcbD wzt TRUE 0.979 9.000 0.036 1.000 Y NA
 3726671 3726672 AZC_0045 AZC_0046     FALSE 0.054 173.000 0.000 NA   NA
 3726673 3726674 AZC_0047 AZC_0048     FALSE 0.161 66.000 0.000 NA   NA
 3726674 3726675 AZC_0048 AZC_0049     FALSE 0.058 137.000 0.000 NA   NA
 3726676 3726677 AZC_0050 AZC_0051 wbpY   TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.018 Y NA
 3726677 3726678 AZC_0051 AZC_0052     FALSE 0.402 24.000 0.000 NA   NA
 3726678 3726679 AZC_0052 AZC_0053     FALSE 0.055 166.000 0.000 NA   NA
 3726679 3726680 AZC_0053 AZC_0054     TRUE 0.998 4.000 0.444 0.004 Y NA
 3726680 3726681 AZC_0054 AZC_0055     FALSE 0.052 267.000 0.000 1.000   NA
 3726681 3726682 AZC_0055 AZC_0056     FALSE 0.070 123.000 0.000 1.000   NA
 3726682 3726683 AZC_0056 AZC_0057     FALSE 0.068 93.000 0.000 1.000 N NA
 3726683 3726684 AZC_0057 AZC_0058     FALSE 0.061 175.000 0.000 1.000   NA
 3726684 3726685 AZC_0058 AZC_0059     TRUE 0.908 19.000 0.156 NA   NA
 3726686 3726687 AZC_0060 AZC_0061     FALSE 0.034 261.000 0.000 1.000 N NA
 3726687 3726688 AZC_0061 AZC_0062     TRUE 0.458 199.000 0.000 0.015 Y NA
 3726689 3726690 AZC_0063 AZC_0064     TRUE 0.740 333.000 0.335 1.000 Y NA
 3726690 3726691 AZC_0064 AZC_0065     FALSE 0.048 231.000 0.000 NA   NA
 3726691 3726692 AZC_0065 AZC_0066     TRUE 0.984 4.000 0.240 NA   NA
 3726692 3726693 AZC_0066 AZC_0067     TRUE 0.971 17.000 0.520 NA   NA
 3726693 3726694 AZC_0067 AZC_0068     TRUE 0.979 2.000 0.128 NA   NA
 3726694 3726695 AZC_0068 AZC_0069     TRUE 0.990 -3.000 0.139 1.000   NA
 3726695 3726696 AZC_0069 AZC_0070     TRUE 0.997 0.000 0.944 1.000   NA
 3726696 3726697 AZC_0070 AZC_0071     TRUE 0.997 0.000 0.623 0.091   NA
 3726697 3726698 AZC_0071 AZC_0072     TRUE 0.896 62.000 0.660 1.000   NA
 3726698 3726699 AZC_0072 AZC_0073     TRUE 0.733 178.000 0.791 NA   NA
 3726703 3726704 AZC_0077 AZC_0078     FALSE 0.056 160.000 0.000 NA   NA
 3726704 3726705 AZC_0078 AZC_0079     FALSE 0.135 59.000 0.000 1.000 N NA
 3726705 3726706 AZC_0079 AZC_0080     TRUE 0.446 41.000 0.009 1.000 N NA
 3726706 3726707 AZC_0080 AZC_0081     TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3726707 3726708 AZC_0081 AZC_0082   glcE TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3726708 3726709 AZC_0082 AZC_0083 glcE glcD TRUE 0.990 16.000 0.266 0.014 Y NA
 3726710 3726711 AZC_0084 AZC_0085 lysR azlC FALSE 0.101 66.000 0.000 NA N NA
 3726711 3726712 AZC_0085 AZC_0086 azlC   TRUE 0.948 29.000 0.595 NA   NA
 3726713 3726714 AZC_0087 AZC_0088     TRUE 0.499 18.000 0.000 NA   NA
 3726714 3726715 AZC_0088 AZC_0089     FALSE 0.047 234.000 0.000 NA   NA
 3726716 3726717 AZC_0090 AZC_0091     TRUE 0.873 79.000 0.261 NA Y NA
 3726717 3726718 AZC_0091 AZC_0092     TRUE 0.545 15.000 0.000 NA   NA
 3726719 3726720 AZC_0093 AZC_0094     FALSE 0.240 43.000 0.000 1.000   NA
 3726720 3726721 AZC_0094 AZC_0095     FALSE 0.249 41.000 0.000 1.000   NA
 3726721 3726722 AZC_0095 AZC_0096   ftsK FALSE 0.202 160.000 0.035 1.000 N NA
 3726722 3726723 AZC_0096 AZC_0097 ftsK   TRUE 0.896 14.000 0.081 1.000 N NA
 3726723 3726724 AZC_0097 AZC_0098     FALSE 0.115 198.000 0.003 1.000 N NA
 3726724 3726725 AZC_0098 AZC_0099     TRUE 0.502 63.000 0.049 1.000 N NA
 3726728 3726729 AZC_0102 AZC_0103     FALSE 0.146 50.000 0.000 1.000 N NA
 3726730 3726731 AZC_0104 AZC_0105     TRUE 0.872 0.000 0.000 1.000   NA
 3726731 3726732 AZC_0105 AZC_0106     FALSE 0.158 72.000 0.000 1.000   NA
 3726732 3726733 AZC_0106 AZC_0107     FALSE 0.072 120.000 0.000 1.000   NA
 3726734 3726735 AZC_0108 AZC_0109 fef-1   FALSE 0.227 46.000 0.000 1.000   NA
 3726735 3726736 AZC_0109 AZC_0110     FALSE 0.289 33.000 0.000 NA   NA
 3726736 3726737 AZC_0110 AZC_0111     TRUE 0.988 11.000 0.733 NA   NA
 3726737 3726738 AZC_0111 AZC_0112     TRUE 0.841 1.000 0.000 NA   NA
 3726740 3726741 AZC_0114 AZC_0115     FALSE 0.049 326.000 0.000 1.000   NA
 3726742 3726743 AZC_0116 AZC_0117 marR   FALSE 0.065 157.000 0.000 1.000   NA
 3726744 3726745 AZC_0118 AZC_0119     FALSE 0.028 680.000 0.000 1.000 N NA
 3726745 3726746 AZC_0119 AZC_0120     FALSE 0.381 101.000 0.071 1.000   NA
 3726747 3726748 AZC_0121 AZC_0122     TRUE 0.998 -3.000 0.179 0.074 Y NA
 3726748 3726749 AZC_0122 AZC_0123     TRUE 0.986 5.000 0.179 0.074   NA
 3726750 3726751 AZC_0124 AZC_0125     TRUE 0.459 23.000 0.000 1.000   NA
 3726751 3726752 AZC_0125 AZC_0126     TRUE 0.999 -7.000 0.613 1.000 Y NA
 3726752 3726753 AZC_0126 AZC_0127   lysR TRUE 0.459 37.000 0.000 0.079 N NA
 3726754 3726755 AZC_0128 AZC_0129     TRUE 0.982 -3.000 0.046 1.000   NA
 3726755 3726756 AZC_0129 AZC_0130     TRUE 0.979 -3.000 0.038 NA   NA
 3726756 3726757 AZC_0130 AZC_0131     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3726757 3726758 AZC_0131 AZC_0132     TRUE 0.851 14.000 0.027 NA   NA
 3726758 3726759 AZC_0132 AZC_0133     TRUE 0.998 -3.000 0.882 NA   NA
 3726759 3726760 AZC_0133 AZC_0134     TRUE 0.915 48.000 0.711 NA   NA
 3726760 3726761 AZC_0134 AZC_0135     TRUE 0.998 -3.000 0.391 NA Y NA
 3726761 3726762 AZC_0135 AZC_0136     FALSE 0.366 98.000 0.087 NA N NA
 3726763 3726764 AZC_0137 AZC_0138     TRUE 0.924 11.000 0.083 1.000 N NA
 3726765 3726766 AZC_0139 AZC_0140     FALSE 0.421 41.000 0.008 NA N NA
 3726766 3726767 AZC_0140 AZC_0141     TRUE 0.559 71.000 0.108 1.000 N NA
 3726768 3726769 AZC_0142 AZC_0143     FALSE 0.209 53.000 0.000 1.000   NA
 3726769 3726770 AZC_0143 AZC_0144     FALSE 0.083 97.000 0.000 NA   NA
 3726771 3726772 AZC_0145 AZC_0146     TRUE 0.872 0.000 0.000 1.000   NA
 3726774 3726775 AZC_0148 AZC_0149     FALSE 0.048 361.000 0.000 1.000   NA
 3726778 3726779 AZC_0152 AZC_0153     TRUE 0.807 4.000 0.000 NA   NA
 3726779 3726780 AZC_0153 AZC_0154     TRUE 0.997 -3.000 0.538 NA   NA
 3726780 3726781 AZC_0154 AZC_0155     TRUE 0.992 5.000 0.583 1.000   NA
 3726782 3726783 AZC_0156 AZC_0157     FALSE 0.218 131.000 0.038 1.000 N NA
 3726783 3726784 AZC_0157 AZC_0158     TRUE 0.933 4.000 0.010 NA   NA
 3726784 3726785 AZC_0158 AZC_0159     TRUE 0.704 31.000 0.044 NA   NA
 3726785 3726786 AZC_0159 AZC_0160     TRUE 0.940 2.000 0.018 NA N NA
 3726786 3726787 AZC_0160 AZC_0161     TRUE 0.689 73.000 0.256 NA N NA
 3726787 3726788 AZC_0161 AZC_0162     FALSE 0.049 116.000 0.000 1.000 N NA
 3726789 3726790 AZC_0163 AZC_0164     FALSE 0.320 174.000 0.000 1.000 Y NA
 3726791 3726792 AZC_0165 AZC_0166     TRUE 0.999 -3.000 0.857 1.000 Y NA
 3726795 3726796 AZC_0169 AZC_0170   dctM TRUE 0.987 -3.000 0.000 NA Y NA
 3726796 3726797 AZC_0170 AZC_0171 dctM dctP TRUE 0.764 34.000 0.000 1.000 Y NA
 3726797 3726798 AZC_0171 AZC_0172 dctP   TRUE 0.710 4.000 0.000 NA N NA
 3726798 3726799 AZC_0172 AZC_0173     FALSE 0.078 101.000 0.000 NA   NA
 3726799 3726800 AZC_0173 AZC_0174     FALSE 0.043 328.000 0.000 NA   NA
 3726800 3726801 AZC_0174 AZC_0175     TRUE 0.989 -3.000 0.137 NA   NA
 3726801 3726802 AZC_0175 AZC_0176     TRUE 0.465 82.000 0.083 1.000 N NA
 3726802 3726803 AZC_0176 AZC_0177     TRUE 0.867 36.000 0.208 0.091 N NA
 3726803 3726804 AZC_0177 AZC_0178     TRUE 0.771 29.000 0.080 1.000 N NA
 3726804 3726805 AZC_0178 AZC_0179     TRUE 0.808 24.000 0.074 1.000 N NA
 3726809 3726810 AZC_0183 AZC_0184 fepC   TRUE 0.999 -3.000 0.857 NA Y NA
 3726810 3726811 AZC_0184 AZC_0185     TRUE 0.997 -3.000 0.182 NA Y NA
 3726811 3726812 AZC_0185 AZC_0186     TRUE 0.976 15.000 0.156 NA Y NA
 3726812 3726813 AZC_0186 AZC_0187     TRUE 0.558 97.000 0.242 1.000 N NA
 3726813 3726814 AZC_0187 AZC_0188     FALSE 0.042 918.000 0.000 1.000   NA
 3726814 3726815 AZC_0188 AZC_0189     FALSE 0.067 138.000 0.000 1.000   NA
 3726815 3726816 AZC_0189 AZC_0190     TRUE 0.711 40.000 0.000 1.000 Y NA
 3726816 3726817 AZC_0190 AZC_0191     FALSE 0.151 48.000 0.000 1.000 N NA
 3726817 3726818 AZC_0191 AZC_0192     FALSE 0.410 1255.000 0.000 0.002 Y NA
 3726818 3726819 AZC_0192 AZC_0193     FALSE 0.037 201.000 0.000 1.000 N NA
 3726819 3726820 AZC_0193 AZC_0194     TRUE 0.999 -3.000 0.800 1.000 Y NA
 3726821 3726822 AZC_0195 AZC_0196     FALSE 0.039 178.000 0.000 1.000 N NA
 3726823 3726824 AZC_0197 AZC_0198     TRUE 0.999 -3.000 0.800 NA Y NA
 3726824 3726825 AZC_0198 AZC_0199     TRUE 0.997 4.000 0.400 NA Y NA
 3726825 3726826 AZC_0199 AZC_0200     TRUE 0.989 32.000 0.704 0.046 Y NA
 3726826 3726827 AZC_0200 AZC_0201     TRUE 0.987 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3726827 3726828 AZC_0201 AZC_0202     FALSE 0.069 83.000 0.000 NA N NA
 3726828 3726829 AZC_0202 AZC_0203     TRUE 0.978 11.000 0.419 NA   NA
 3726829 3726830 AZC_0203 AZC_0204   lysR TRUE 0.483 90.000 0.116 NA   NA
 3726834 3726835 AZC_0208 AZC_0209     FALSE 0.042 159.000 0.000 1.000 N NA
 3726835 3726836 AZC_0209 AZC_0210     FALSE 0.064 118.000 0.000 NA   NA
 3726838 3726839 AZC_0212 AZC_0213     FALSE 0.045 284.000 0.000 NA   NA
 3726839 3726840 AZC_0213 AZC_0214     FALSE 0.206 90.000 0.003 1.000 N NA
 3726840 3726841 AZC_0214 AZC_trnS01   trnS FALSE 0.044 303.000 0.000 NA   NA
 3726841 3726842 AZC_trnS01 AZC_0215 trnS   FALSE 0.057 151.000 0.000 NA   NA
 3726842 3726843 AZC_0215 AZC_0216     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3726843 3726844 AZC_0216 AZC_0217     FALSE 0.259 36.000 0.000 NA   NA
 3726846 3726847 AZC_0218 AZC_0219     FALSE 0.072 108.000 0.000 NA   NA
 3726847 3726848 AZC_0219 AZC_0220     FALSE 0.040 456.000 0.000 NA   NA
 3726849 3726850 AZC_0221 AZC_0222 hslU   TRUE 0.938 90.000 0.752 1.000 Y NA
 3726850 3726851 AZC_0222 AZC_0223     TRUE 0.486 19.000 0.000 NA   NA
 3726851 3726852 AZC_0223 AZC_0224     TRUE 0.973 1.000 0.071 NA   NA
 3726856 3726857 AZC_0228 AZC_0229 metW   TRUE 0.992 4.000 0.509 NA   NA
 3726858 3726859 AZC_0230 AZC_0231     TRUE 0.943 28.000 0.116 1.000 Y NA
 3726859 3726860 AZC_0231 AZC_0232     FALSE 0.095 78.000 0.000 1.000 N NA
 3726862 3726863 AZC_0234 AZC_0235     TRUE 0.592 69.000 0.000 1.000 Y NA
 3726866 3726867 AZC_0238 AZC_0239     FALSE 0.042 154.000 0.000 1.000 N NA
 3726867 3726868 AZC_0239 AZC_0240     TRUE 0.855 91.000 0.303 1.000 Y NA
 3726869 3726870 AZC_0241 AZC_0242 asnC   FALSE 0.247 31.000 0.000 1.000 N NA
 3726871 3726872 AZC_0243 AZC_0244     TRUE 0.816 57.000 0.333 NA   NA
 3726873 3726874 AZC_0245 AZC_0246   lysR TRUE 0.559 49.000 0.044 NA   NA
 3726876 3726877 AZC_0248 AZC_0249     FALSE 0.183 55.000 0.000 NA   NA
 3726877 3726878 AZC_0249 AZC_0250     TRUE 0.855 0.000 0.000 NA   NA
 3726878 3726879 AZC_0250 AZC_0251     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3726881 3726882 AZC_0253 AZC_0254     FALSE 0.031 351.000 0.000 1.000 N NA
 3726882 3726883 AZC_0254 AZC_0255     FALSE 0.040 170.000 0.000 1.000 N NA
 3726884 3726885 AZC_0256 AZC_0257   lepA FALSE 0.058 144.000 0.000 NA   NA
 3726885 3726886 AZC_0257 AZC_0258 lepA hemY FALSE 0.216 95.000 0.002 1.000   NA
 3726886 3726887 AZC_0258 AZC_0259 hemY   TRUE 0.996 -3.000 0.408 NA   NA
 3726887 3726888 AZC_0259 AZC_0260     TRUE 0.951 15.000 0.263 NA   NA
 3726888 3726889 AZC_0260 AZC_0261     TRUE 0.995 4.000 0.056 0.001 Y NA
 3726890 3726891 AZC_0262 AZC_0263     TRUE 0.816 23.000 0.070 1.000 N NA
 3726896 3726897 AZC_0268 AZC_0269     FALSE 0.183 55.000 0.000 NA   NA
 3726897 3726898 AZC_0269 AZC_0270     FALSE 0.059 129.000 0.000 NA   NA
 3726899 3726900 AZC_0271 AZC_0272 lysR   FALSE 0.286 28.000 0.000 1.000 N NA
 3726900 3726901 AZC_0272 AZC_0273     FALSE 0.102 94.000 0.000 1.000   NA
 3726902 3726903 AZC_0274 AZC_0275     FALSE 0.042 340.000 0.000 NA   NA
 3726903 3726904 AZC_0275 AZC_0276     FALSE 0.038 662.000 0.000 NA   NA
 3726904 3726905 AZC_0276 AZC_trnE03   trnE FALSE 0.038 643.000 0.000 NA   NA
 3726905 3726906 AZC_trnE03 AZC_0277 trnE   FALSE 0.065 117.000 0.000 NA   NA
 3726908 3726909 AZC_0279 AZC_0280     TRUE 0.995 -7.000 0.408 NA N NA
 3726909 3726910 AZC_0280 AZC_0281   cpaA FALSE 0.162 146.000 0.014 1.000 N NA
 3726910 3726911 AZC_0281 AZC_0282 cpaA   TRUE 0.936 12.000 0.125 NA   NA
 3726911 3726912 AZC_0282 AZC_0283     FALSE 0.050 201.000 0.000 NA   NA
 3726914 3726915 AZC_0285 AZC_0286   hrpB FALSE 0.036 226.000 0.000 1.000 N NA
 3726916 3726917 AZC_0287 AZC_0288     FALSE 0.064 162.000 0.000 1.000   NA
 3726917 3726918 AZC_0288 AZC_0289     TRUE 0.456 184.000 0.231 1.000   NA
 3726924 3726925 AZC_0295 AZC_0296     FALSE 0.032 177.000 0.000 NA N NA
 3726925 3726926 AZC_0296 AZC_0297     FALSE 0.037 761.000 0.000 NA   NA
 3726926 3726927 AZC_0297 AZC_0298     FALSE 0.071 109.000 0.000 NA   NA
 3726927 3726928 AZC_0298 AZC_0299     FALSE 0.157 67.000 0.000 NA   NA
 3726930 3726931 AZC_0301 AZC_0302     FALSE 0.037 203.000 0.000 1.000 N NA
 3726931 3726932 AZC_0302 AZC_0303     FALSE 0.030 416.000 0.000 1.000 N NA
 3726933 3726934 AZC_0304 AZC_0305     FALSE 0.140 200.000 0.000 0.032 N NA
 3726934 3726935 AZC_0305 AZC_0306     TRUE 0.598 154.000 0.071 1.000 Y NA
 3726937 3726938 AZC_0308 AZC_0309     FALSE 0.225 137.000 0.033 NA   NA
 3726938 3726939 AZC_0309 AZC_0310     FALSE 0.266 94.000 0.016 NA   NA
 3726942 3726943 AZC_0313 AZC_0314   argJ FALSE 0.149 69.000 0.000 NA   NA
 3726943 3726944 AZC_0314 AZC_0315 argJ   TRUE 0.972 -3.000 0.024 1.000 N NA
 3726944 3726945 AZC_0315 AZC_0316     FALSE 0.042 336.000 0.000 NA   NA
 3726946 3726947 AZC_0317 AZC_0318     FALSE 0.360 68.000 0.004 1.000   NA
 3726947 3726948 AZC_0318 AZC_0319     TRUE 0.757 6.000 0.000 NA   NA
 3726948 3726949 AZC_0319 AZC_0320     FALSE 0.059 132.000 0.000 NA   NA
 3726951 3726952 AZC_0322 AZC_0323     TRUE 0.902 44.000 0.588 NA   NA
 3726953 3726954 AZC_0324 AZC_0325     FALSE 0.091 100.000 0.000 1.000   NA
 3726955 3726956 AZC_0326 AZC_0327     FALSE 0.030 424.000 0.000 1.000 N NA
 3726959 3726960 AZC_0330 AZC_0331     FALSE 0.052 180.000 0.000 NA   NA
 3726961 3726962 AZC_0332 AZC_0333     TRUE 0.711 76.000 0.257 1.000   NA
 3726963 3726964 AZC_0334 AZC_0335     FALSE 0.048 227.000 0.000 NA   NA
 3726964 3726965 AZC_0335 AZC_0336     FALSE 0.063 119.000 0.000 NA   NA
 3726969 3726970 AZC_0340 AZC_0341     FALSE 0.038 599.000 0.000 NA   NA
 3726972 3726973 AZC_0343 AZC_0344   ptsN TRUE 0.503 194.000 0.353 NA N NA
 3726973 3726974 AZC_0344 AZC_0345 ptsN   FALSE 0.176 59.000 0.000 NA   NA
 3726975 3726976 AZC_0346 AZC_0347     FALSE 0.247 37.000 0.000 NA   NA
 3726976 3726977 AZC_0347 AZC_0348     TRUE 0.944 44.000 0.955 NA   NA
 3726977 3726978 AZC_0348 AZC_0349     FALSE 0.133 187.000 0.013 NA N NA
 3726978 3726979 AZC_0349 AZC_0350     FALSE 0.178 109.000 0.013 NA N NA
 3726979 3726980 AZC_0350 AZC_0351     FALSE 0.072 81.000 0.000 NA N NA
 3726980 3726981 AZC_0351 AZC_0352     TRUE 0.875 31.000 0.000 0.024 Y NA
 3726981 3726982 AZC_0352 AZC_0353     FALSE 0.056 104.000 0.000 1.000 N NA
 3726982 3726983 AZC_0353 AZC_0354     TRUE 0.996 -16.000 0.452 NA   NA
 3726983 3726984 AZC_0354 AZC_0355     FALSE 0.057 151.000 0.000 NA   NA
 3726986 3726987 AZC_0357 AZC_0358     TRUE 0.704 9.000 0.000 NA   NA
 3726987 3726988 AZC_0358 AZC_0359     TRUE 0.774 64.000 0.286 NA   NA
 3726990 3726991 AZC_0361 AZC_0362     TRUE 0.969 -3.000 0.009 NA   NA
 3726991 3726992 AZC_0362 AZC_0363   gntR TRUE 0.885 25.000 0.192 NA   NA
 3726992 3726993 AZC_0363 AZC_0364 gntR   FALSE 0.042 1074.000 0.000 1.000   NA
 3726994 3726995 AZC_0365 AZC_0366     FALSE 0.036 2269.000 0.000 NA   NA
 3726998 3726999 AZC_0369 AZC_0370     FALSE 0.048 229.000 0.000 NA   NA
 3726999 3727000 AZC_0370 AZC_0371     TRUE 0.774 16.000 0.006 NA   NA
 3727002 3727003 AZC_0373 AZC_0374     TRUE 0.897 10.000 0.023 NA   NA
 3727004 3727005 AZC_0375 AZC_0376     FALSE 0.201 46.000 0.000 NA   NA
 3727007 3727008 AZC_0378 AZC_0379     FALSE 0.106 86.000 0.000 NA   NA
 3727008 3727009 AZC_0379 AZC_0380     FALSE 0.047 233.000 0.000 NA   NA
 3727009 3727010 AZC_0380 AZC_0381     FALSE 0.056 160.000 0.000 NA   NA
 3727012 3727013 AZC_0383 AZC_0384     FALSE 0.065 116.000 0.000 NA   NA
 3727013 3727014 AZC_0384 AZC_0385     FALSE 0.085 96.000 0.000 NA   NA
 3727014 3727015 AZC_0385 AZC_0386   matE TRUE 0.732 20.000 0.006 NA   NA
 3727018 3727019 AZC_0389 AZC_0390     TRUE 0.988 -13.000 0.095 NA   NA
 3727019 3727020 AZC_0390 AZC_0391     FALSE 0.222 41.000 0.000 NA   NA
 3727022 3727023 AZC_0393 AZC_0394     TRUE 0.998 -3.000 0.751 NA N NA
 3727025 3727026 AZC_0396 AZC_0397     TRUE 0.994 -3.000 0.258 1.000   NA
 3727027 3727028 AZC_0398 AZC_0399     TRUE 0.878 31.000 0.259 NA   NA
 3727028 3727029 AZC_0399 AZC_0400     FALSE 0.326 144.000 0.096 NA   NA
 3727029 3727030 AZC_0400 AZC_0401     FALSE 0.145 159.000 0.004 NA   NA
 3727030 3727031 AZC_0401 AZC_0402     TRUE 0.982 -3.000 0.047 1.000   NA
 3727032 3727033 AZC_0403 AZC_0404     FALSE 0.188 64.000 0.000 1.000   NA
 3727035 3727036 AZC_0406 AZC_0407     TRUE 0.686 25.000 0.012 NA   NA
 3727036 3727037 AZC_0407 AZC_0408     FALSE 0.099 89.000 0.000 NA   NA
 3727038 3727039 AZC_0409 AZC_0410     FALSE 0.221 124.000 0.028 NA   NA
 3727039 3727040 AZC_0410 AZC_0411     FALSE 0.359 30.000 0.000 1.000   NA
 3727040 3727041 AZC_0411 AZC_0412     FALSE 0.389 25.000 0.000 NA   NA
 3727045 3727046 AZC_0416 AZC_0417     TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3727046 3727047 AZC_0417 AZC_0418     FALSE 0.067 114.000 0.000 NA   NA
 3727048 3727049 AZC_0419 AZC_0420     TRUE 0.997 4.000 0.154 0.002 Y NA
 3727049 3727050 AZC_0420 AZC_0421     FALSE 0.034 156.000 0.000 NA N NA
 3727051 3727052 AZC_0422 AZC_0423     TRUE 0.943 8.000 0.056 1.000   NA
 3727053 3727054 AZC_0424 AZC_0425     TRUE 0.799 50.000 0.000 0.007 Y NA
 3727056 3727057 AZC_0427 AZC_0428     TRUE 0.893 8.000 0.019 NA N NA
 3727058 3727059 AZC_0429 AZC_0430     TRUE 0.599 30.000 0.007 NA   NA
 3727059 3727060 AZC_0430 AZC_0431     TRUE 0.999 -3.000 0.829 0.001   NA
 3727060 3727061 AZC_0431 AZC_0432     TRUE 0.971 11.000 0.087 0.001   NA
 3727062 3727063 AZC_0433 AZC_0434   marR TRUE 0.598 46.000 0.067 1.000 N NA
 3727065 3727066 AZC_0436 AZC_0437     FALSE 0.041 396.000 0.000 NA   NA
 3727067 3727068 AZC_0438 AZC_0439     FALSE 0.284 190.000 0.075 1.000   NA
 3727068 3727069 AZC_0439 AZC_0440     FALSE 0.041 371.000 0.000 NA   NA
 3727070 3727071 AZC_0441 AZC_0442     FALSE 0.050 206.000 0.000 NA   NA
 3727072 3727073 AZC_0443 AZC_0444     FALSE 0.058 138.000 0.000 NA   NA
 3727074 3727075 AZC_0445 AZC_0446     TRUE 0.573 36.000 0.014 1.000   NA
 3727075 3727076 AZC_0446 AZC_0447     FALSE 0.058 142.000 0.000 NA   NA
 3727076 3727077 AZC_0447 AZC_0448     FALSE 0.271 35.000 0.000 NA   NA
 3727078 3727079 AZC_0449 AZC_0450     FALSE 0.198 47.000 0.000 NA   NA
 3727081 3727082 AZC_0452 AZC_0453     FALSE 0.105 92.000 0.000 1.000   NA
 3727083 3727084 AZC_0454 AZC_0455     FALSE 0.131 75.000 0.000 NA   NA
 3727084 3727085 AZC_0455 AZC_0456   mutY FALSE 0.187 52.000 0.000 NA   NA
 3727086 3727087 AZC_0457 AZC_0458     TRUE 0.728 81.000 0.333 NA   NA
 3727089 3727090 AZC_0460 AZC_0461     TRUE 0.850 163.000 0.236 0.001 Y NA
 3727094 3727095 AZC_0465 AZC_0466 iclR   FALSE 0.118 87.000 0.000 1.000   NA
 3727095 3727096 AZC_0466 AZC_0467   gntR FALSE 0.060 181.000 0.000 1.000   NA
 3727096 3727097 AZC_0467 AZC_0468 gntR   FALSE 0.223 99.000 0.017 1.000 N NA
 3727097 3727098 AZC_0468 AZC_0469     FALSE 0.282 135.000 0.076 1.000 N NA
 3727098 3727099 AZC_0469 AZC_0470     TRUE 0.449 400.000 0.000 0.001 Y NA
 3727099 3727100 AZC_0470 AZC_0471     FALSE 0.050 306.000 0.000 1.000   NA
 3727100 3727101 AZC_0471 AZC_0472     FALSE 0.263 39.000 0.000 1.000   NA
 3727104 3727105 AZC_0475 AZC_0476 gntR   TRUE 0.980 2.000 0.133 1.000   NA
 3727105 3727106 AZC_0476 AZC_0477     TRUE 0.651 37.000 0.044 1.000   NA
 3727106 3727107 AZC_0477 AZC_0478     TRUE 0.959 39.000 0.429 1.000 Y NA
 3727107 3727108 AZC_0478 AZC_0479     TRUE 0.996 6.000 0.231 0.045 Y NA
 3727108 3727109 AZC_0479 AZC_0480     TRUE 0.996 -3.000 0.064 1.000 Y NA
 3727109 3727110 AZC_0480 AZC_0481     TRUE 0.999 0.000 0.617 0.098 Y NA
 3727110 3727111 AZC_0481 AZC_0482     FALSE 0.029 446.000 0.000 1.000 N NA
 3727111 3727112 AZC_0482 AZC_0483     TRUE 0.994 4.000 0.037 0.001 Y NA
 3727113 3727114 AZC_0484 AZC_0485     FALSE 0.044 298.000 0.000 NA   NA
 3727115 3727116 AZC_0486 AZC_0487     TRUE 0.594 142.000 0.071 NA Y NA
 3727118 3727119 AZC_0489 AZC_0490     FALSE 0.316 213.000 0.143 1.000 N NA
 3727120 3727121 AZC_0491 AZC_0492     TRUE 0.861 25.000 0.141 NA   NA
 3727124 3727125 AZC_0495 AZC_0496     TRUE 0.993 -3.000 0.236 1.000   NA
 3727125 3727126 AZC_0496 AZC_0497     TRUE 0.992 2.000 0.432 NA   NA
 3727126 3727127 AZC_0497 AZC_0498     FALSE 0.173 167.000 0.014 NA   NA
 3727127 3727128 AZC_0498 AZC_0499     FALSE 0.297 96.000 0.026 1.000   NA
 3727128 3727129 AZC_0499 AZC_0500     TRUE 0.951 12.000 0.181 1.000   NA
 3727129 3727130 AZC_0500 AZC_0501     FALSE 0.369 97.000 0.078 1.000 N NA
 3727130 3727131 AZC_0501 AZC_0502     TRUE 0.847 75.000 0.032 0.003 Y NA
 3727131 3727132 AZC_0502 AZC_0503     TRUE 0.943 28.000 0.011 0.003 Y NA
 3727132 3727133 AZC_0503 AZC_0504     TRUE 0.822 161.000 0.439 1.000 Y NA
 3727133 3727134 AZC_0504 AZC_0505     FALSE 0.057 149.000 0.000 NA   NA
 3727135 3727136 AZC_0506 AZC_0507     TRUE 0.874 17.000 0.068 NA   NA
 3727136 3727137 AZC_0507 AZC_0508     FALSE 0.178 300.000 0.034 NA   NA
 3727137 3727138 AZC_0508 AZC_0509     TRUE 0.972 2.000 0.077 NA   NA
 3727138 3727139 AZC_0509 AZC_0510     FALSE 0.186 232.000 0.031 NA   NA
 3727141 3727142 AZC_0512 AZC_0513   ruvC FALSE 0.231 45.000 0.000 1.000   NA
 3727142 3727143 AZC_0513 AZC_0514 ruvC   TRUE 0.518 34.000 0.002 NA   NA
 3727143 3727144 AZC_0514 AZC_0515   ruvA TRUE 0.685 22.000 0.002 NA   NA
 3727145 3727146 AZC_0516 AZC_0517     TRUE 0.990 -3.000 0.162 NA   NA
 3727147 3727148 AZC_0518 AZC_0519   ruvB TRUE 0.524 45.000 0.000 0.009   NA
 3727148 3727149 AZC_0519 AZC_0520 ruvB   FALSE 0.389 103.000 0.082 1.000   NA
 3727149 3727150 AZC_0520 AZC_0521   tolQ TRUE 0.696 136.000 0.593 1.000   NA
 3727150 3727151 AZC_0521 AZC_0522 tolQ tolR TRUE 0.995 4.000 0.220 1.000 Y NA
 3727151 3727152 AZC_0522 AZC_0523 tolR tolA TRUE 0.952 12.000 0.195 NA   NA
 3727152 3727153 AZC_0523 AZC_0524 tolA   TRUE 0.863 15.000 0.043 NA   NA
 3727153 3727154 AZC_0524 AZC_0525     TRUE 0.572 469.000 0.592 1.000 N NA
 3727154 3727155 AZC_0525 AZC_0526     FALSE 0.409 197.000 0.199 1.000   NA
 3727155 3727156 AZC_0526 AZC_0527   mesJ TRUE 0.485 86.000 0.085 1.000   NA
 3727156 3727157 AZC_0527 AZC_0528 mesJ ftsH TRUE 0.459 96.000 0.145 1.000 N NA
 3727157 3727158 AZC_0528 AZC_0529 ftsH   FALSE 0.028 695.000 0.000 1.000 N NA
 3727158 3727159 AZC_0529 AZC_0530     FALSE 0.139 188.000 0.011 1.000 N NA
 3727159 3727160 AZC_0530 AZC_0531     FALSE 0.259 36.000 0.000 NA   NA
 3727162 3727163 AZC_0533 AZC_0534 radA   FALSE 0.384 110.000 0.094 1.000   NA
 3727163 3727164 AZC_0534 AZC_0535     TRUE 0.881 21.000 0.101 1.000   NA
 3727164 3727165 AZC_0535 AZC_0536     FALSE 0.374 104.000 0.100 1.000 N NA
 3727165 3727166 AZC_0536 AZC_0537     FALSE 0.069 92.000 0.000 1.000 N NA
 3727166 3727167 AZC_0537 AZC_0538     FALSE 0.083 74.000 0.000 NA N NA
 3727167 3727168 AZC_0538 AZC_0539     TRUE 0.989 -3.000 0.141 NA   NA
 3727168 3727169 AZC_0539 AZC_0540     FALSE 0.298 32.000 0.000 NA   NA
 3727170 3727171 AZC_0541 AZC_0542     FALSE 0.187 52.000 0.000 NA   NA
 3727172 3727173 AZC_0543 AZC_0544     TRUE 0.850 37.000 0.267 1.000   NA
 3727174 3727175 AZC_0545 AZC_0546     FALSE 0.207 55.000 0.000 1.000   NA
 3727176 3727177 AZC_0547 AZC_0548     TRUE 0.909 9.000 0.025 NA   NA
 3727178 3727179 AZC_0549 AZC_0550     FALSE 0.331 130.000 0.095 NA   NA
 3727179 3727180 AZC_0550 AZC_0551     TRUE 0.583 55.000 0.062 NA   NA
 3727181 3727182 AZC_0552 AZC_0553     TRUE 0.689 19.000 0.005 NA N NA
 3727183 3727184 AZC_0554 AZC_0555     TRUE 0.874 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3727184 3727185 AZC_0555 AZC_0556     FALSE 0.263 39.000 0.000 1.000   NA
 3727185 3727186 AZC_0556 AZC_0557     FALSE 0.068 130.000 0.000 1.000   NA
 3727187 3727188 AZC_0558 AZC_0559     TRUE 0.962 1.000 0.036 NA   NA
 3727188 3727189 AZC_0559 AZC_0560     FALSE 0.382 105.000 0.091 NA   NA
 3727191 3727192 AZC_0562 AZC_0563     TRUE 0.999 -3.000 0.465 1.000 Y NA
 3727192 3727193 AZC_0563 AZC_0564     TRUE 0.991 13.000 0.400 1.000 Y NA
 3727193 3727194 AZC_0564 AZC_0565   cobW TRUE 0.505 45.000 0.020 NA   NA
 3727196 3727197 AZC_0567 AZC_0568     TRUE 0.475 86.000 0.090 NA   NA
 3727197 3727198 AZC_0568 AZC_0569     TRUE 0.966 5.000 0.097 NA   NA
 3727198 3727199 AZC_0569 AZC_0570     FALSE 0.259 36.000 0.000 NA   NA
 3727200 3727201 AZC_0571 AZC_0572   luxR FALSE 0.296 125.000 0.067 NA   NA
 3727204 3727205 AZC_0575 AZC_0576     TRUE 0.534 92.000 0.197 1.000 N NA
 3727205 3727206 AZC_0576 AZC_0577     TRUE 0.781 51.000 0.013 1.000 Y NA
 3727207 3727208 AZC_0578 AZC_0579     FALSE 0.035 233.000 0.000 1.000 N NA
 3727208 3727209 AZC_0579 AZC_0580   lysR FALSE 0.027 793.000 0.000 1.000 N NA
 3727210 3727211 AZC_0581 AZC_0582   cydD TRUE 0.972 -3.000 0.025 1.000 N NA
 3727211 3727212 AZC_0582 AZC_0583 cydD   TRUE 0.999 -3.000 0.631 0.006 Y NA
 3727212 3727213 AZC_0583 AZC_0584   cydA TRUE 0.774 75.000 0.059 1.000 Y NA
 3727213 3727214 AZC_0584 AZC_0585 cydA   TRUE 0.999 5.000 0.953 0.071 Y NA
 3727214 3727215 AZC_0585 AZC_0586     TRUE 0.932 19.000 0.230 NA   NA
 3727216 3727217 AZC_0587 AZC_0588     FALSE 0.113 89.000 0.000 1.000   NA
 3727217 3727218 AZC_0588 AZC_0589     FALSE 0.058 135.000 0.000 NA   NA
 3727218 3727219 AZC_0589 AZC_0590     TRUE 0.673 5.000 0.000 NA N NA
 3727219 3727220 AZC_0590 AZC_0591     FALSE 0.044 292.000 0.000 NA   NA
 3727220 3727221 AZC_0591 AZC_0592     FALSE 0.153 68.000 0.000 NA   NA
 3727222 3727223 AZC_0593 AZC_0594 tetR hupT FALSE 0.062 97.000 0.000 1.000 N NA
 3727223 3727224 AZC_0594 AZC_0595 hupT hupU TRUE 0.994 -3.000 0.319 1.000 N NA
 3727224 3727225 AZC_0595 AZC_0596 hupU hupV TRUE 0.999 -3.000 0.389 0.001 Y NA
 3727225 3727226 AZC_0596 AZC_0597 hupV hypF TRUE 0.879 8.000 0.008 1.000 N NA
 3727226 3727227 AZC_0597 AZC_0598 hypF hupS FALSE 0.036 216.000 0.000 1.000 N NA
 3727227 3727228 AZC_0598 AZC_0599 hupS hupL TRUE 1.000 -3.000 0.611 0.001 Y NA
 3727228 3727229 AZC_0599 AZC_0600 hupL hupC TRUE 0.993 13.000 0.355 0.071 Y NA
 3727229 3727230 AZC_0600 AZC_0601 hupC hupD TRUE 0.642 265.000 0.177 1.000 Y NA
 3727230 3727231 AZC_0601 AZC_0602 hupD hupF TRUE 0.983 5.000 0.308 NA N NA
 3727231 3727232 AZC_0602 AZC_0603 hupF hupG TRUE 0.991 0.000 0.308 NA   NA
 3727232 3727233 AZC_0603 AZC_0604 hupG hupH TRUE 0.924 10.000 0.051 NA   NA
 3727233 3727234 AZC_0604 AZC_0605 hupH hupJ TRUE 0.647 11.000 0.000 NA   NA
 3727234 3727235 AZC_0605 AZC_0606 hupJ hupK TRUE 0.996 -3.000 0.255 0.071   NA
 3727235 3727236 AZC_0606 AZC_0607 hupK hypA TRUE 0.994 3.000 0.262 0.004   NA
 3727236 3727237 AZC_0607 AZC_0608 hypA hypB TRUE 0.990 0.000 0.086 0.004   NA
 3727237 3727238 AZC_0608 AZC_0609 hypB hoxA TRUE 0.933 5.000 0.029 1.000 N NA
 3727238 3727239 AZC_0609 AZC_0610 hoxA hypC TRUE 0.959 10.000 0.200 NA N NA
 3727239 3727240 AZC_0610 AZC_0611 hypC hypD TRUE 0.973 13.000 0.080 NA Y NA
 3727240 3727241 AZC_0611 AZC_0612 hypD hypE TRUE 0.998 -3.000 0.353 1.000 Y NA
 3727241 3727242 AZC_0612 AZC_0613 hypE hupE TRUE 0.718 66.000 0.005 NA Y NA
 3727242 3727243 AZC_0613 AZC_16r01 hupE   FALSE 0.036 1100.000 0.000 NA   NA
 3727243 3727244 AZC_16r01 AZC_trnI04   trnI FALSE 0.048 227.000 0.000 NA   NA
 3727244 3727245 AZC_trnI04 AZC_trnA05 trnI trnA FALSE 0.178 58.000 0.000 NA   NA
 3727245 3727246 AZC_trnA05 AZC_23r01 trnA   FALSE 0.040 407.000 0.000 NA   NA
 3727246 3727247 AZC_23r01 AZC_5r01     FALSE 0.131 75.000 0.000 NA   NA
 3727247 3727248 AZC_5r01 AZC_0614     FALSE 0.041 376.000 0.000 NA   NA
 3727248 3727249 AZC_0614 AZC_0615     FALSE 0.414 26.000 0.000 1.000   NA
 3727249 3727250 AZC_0615 AZC_0616     TRUE 0.980 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3727250 3727251 AZC_0616 AZC_0617     TRUE 0.876 31.000 0.000 0.019 Y NA
 3727251 3727252 AZC_0617 AZC_0618   marR TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.019 Y NA
 3727253 3727254 AZC_0619 AZC_0620   cheY FALSE 0.375 913.000 0.000 0.019 Y NA
 3727256 3727257 AZC_0622 AZC_0623   motD TRUE 0.860 29.000 0.188 NA   NA
 3727257 3727258 AZC_0623 AZC_0624 motD motC TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3727258 3727259 AZC_0624 AZC_0625 motC motB TRUE 0.855 0.000 0.000 NA   NA
 3727259 3727260 AZC_0625 AZC_0626 motB   TRUE 0.983 9.000 0.421 NA   NA
 3727260 3727261 AZC_0626 AZC_0627   fliF TRUE 0.987 -3.000 0.105 NA   NA
 3727261 3727262 AZC_0627 AZC_0628 fliF fliP FALSE 0.254 470.000 0.000 1.000 Y NA
 3727262 3727263 AZC_0628 AZC_0629 fliP fliL TRUE 0.997 -3.000 0.605 1.000   NA
 3727263 3727264 AZC_0629 AZC_0630 fliL   TRUE 0.984 19.000 0.576 0.005   NA
 3727264 3727265 AZC_0630 AZC_0631     TRUE 0.995 0.000 0.592 NA   NA
 3727265 3727266 AZC_0631 AZC_0632     TRUE 0.595 300.000 0.531 NA   NA
 3727266 3727267 AZC_0632 AZC_0633   flgA TRUE 0.998 -3.000 0.261 NA Y NA
 3727267 3727268 AZC_0633 AZC_0634 flgA flgG TRUE 0.930 42.000 0.252 NA Y NA
 3727268 3727269 AZC_0634 AZC_0635 flgG fliE_2 TRUE 0.997 13.000 0.771 0.004 Y NA
 3727269 3727270 AZC_0635 AZC_0636 fliE_2 flgC TRUE 0.998 -3.000 0.115 0.002 Y NA
 3727270 3727271 AZC_0636 AZC_0637 flgC flgB TRUE 0.999 0.000 0.804 0.002 Y NA
 3727271 3727272 AZC_0637 AZC_0638 flgB   FALSE 0.296 80.000 0.007 NA   NA
 3727272 3727273 AZC_0638 AZC_0639     TRUE 0.992 5.000 0.595 NA   NA
 3727273 3727274 AZC_0639 AZC_0640   fliG TRUE 0.991 16.000 0.571 1.000 Y NA
 3727274 3727275 AZC_0640 AZC_0641 fliG fliN TRUE 0.998 11.000 0.875 0.004 Y NA
 3727275 3727276 AZC_0641 AZC_0642 fliN   TRUE 0.490 113.000 0.207 NA   NA
 3727276 3727277 AZC_0642 AZC_0643   fliM TRUE 0.987 2.000 0.242 NA   NA
 3727277 3727278 AZC_0643 AZC_0644 fliM motA TRUE 0.998 5.000 0.879 1.000 Y NA
 3727279 3727280 AZC_0645 AZC_0646   fliI TRUE 0.952 62.000 0.529 1.000 Y NA
 3727280 3727281 AZC_0646 AZC_0647 fliI flaE FALSE 0.389 109.000 0.000 1.000 Y NA
 3727281 3727282 AZC_0647 AZC_0648 flaE flgK TRUE 0.968 37.000 0.250 0.004 Y NA
 3727282 3727283 AZC_0648 AZC_0649 flgK   TRUE 0.996 10.000 0.333 0.004 Y NA
 3727283 3727284 AZC_0649 AZC_0650   flaF TRUE 0.961 21.000 0.114 NA Y NA
 3727284 3727285 AZC_0650 AZC_0651 flaF flbT TRUE 0.999 -3.000 0.829 NA Y NA
 3727285 3727286 AZC_0651 AZC_0652 flbT flgD TRUE 0.941 69.000 0.528 NA Y NA
 3727286 3727287 AZC_0652 AZC_0653 flgD fliQ TRUE 0.999 -3.000 0.509 NA Y NA
 3727287 3727288 AZC_0653 AZC_0654 fliQ flhA TRUE 0.860 285.000 0.349 0.001 Y NA
 3727288 3727289 AZC_0654 AZC_0655 flhA   TRUE 0.999 -3.000 0.442 1.000 Y NA
 3727289 3727290 AZC_0655 AZC_0656     TRUE 0.977 4.000 0.148 NA   NA
 3727290 3727291 AZC_0656 AZC_0657     TRUE 0.708 54.000 0.160 NA   NA
 3727291 3727292 AZC_0657 AZC_0658     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3727292 3727293 AZC_0658 AZC_0659     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3727293 3727294 AZC_0659 AZC_0660     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3727294 3727295 AZC_0660 AZC_0661   cheA TRUE 0.456 207.000 0.000 0.014 Y NA
 3727295 3727296 AZC_0661 AZC_0662 cheA cheW TRUE 0.996 -3.000 0.009 0.014 Y NA
 3727296 3727297 AZC_0662 AZC_0663 cheW cheY2 TRUE 0.812 29.000 0.000 1.000 Y NA
 3727297 3727298 AZC_0663 AZC_0664 cheY2   TRUE 0.999 -3.000 0.268 0.019 Y NA
 3727298 3727299 AZC_0664 AZC_0665     TRUE 0.996 -3.000 0.113 1.000 Y NA
 3727299 3727300 AZC_0665 AZC_0666     TRUE 0.574 72.000 0.000 1.000 Y NA
 3727302 3727303 AZC_0668 AZC_trnQ06   trnQ FALSE 0.058 143.000 0.000 NA   NA
 3727304 3727305 AZC_0669 AZC_0670     TRUE 0.545 15.000 0.000 NA   NA
 3727306 3727307 AZC_0671 AZC_0672   lysR TRUE 0.873 20.000 0.092 NA   NA
 3727308 3727309 AZC_0673 AZC_0674     FALSE 0.043 143.000 0.000 1.000 N NA
 3727309 3727310 AZC_0674 AZC_0675     TRUE 0.452 65.000 0.026 NA   NA
 3727311 3727312 AZC_0676 AZC_0677     FALSE 0.258 157.000 0.048 1.000   NA
 3727313 3727314 AZC_0678 AZC_0679     FALSE 0.213 43.000 0.000 NA   NA
 3727314 3727315 AZC_0679 AZC_0680     TRUE 0.802 28.000 0.026 0.069 N NA
 3727315 3727316 AZC_0680 AZC_0681     TRUE 0.999 -3.000 0.640 0.015 Y NA
 3727316 3727317 AZC_0681 AZC_0682     TRUE 0.980 14.000 0.360 0.070   NA
 3727317 3727318 AZC_0682 AZC_0683     TRUE 0.904 37.000 0.462 1.000   NA
 3727318 3727319 AZC_0683 AZC_0684     TRUE 0.467 70.000 0.052 1.000 N NA
 3727319 3727320 AZC_0684 AZC_0685   nrtB TRUE 0.995 12.000 0.323 0.001 Y NA
 3727320 3727321 AZC_0685 AZC_0686 nrtB nrtA TRUE 0.914 141.000 0.915 NA Y NA
 3727321 3727322 AZC_0686 AZC_0687 nrtA   FALSE 0.026 315.000 0.000 NA N NA
 3727322 3727323 AZC_0687 AZC_0688     FALSE 0.153 47.000 0.000 1.000 N NA
 3727323 3727324 AZC_0688 AZC_0689   dnaJ FALSE 0.048 118.000 0.000 1.000 N NA
 3727324 3727325 AZC_0689 AZC_0690 dnaJ dnaK TRUE 0.792 417.000 0.236 0.003 Y NA
 3727325 3727326 AZC_0690 AZC_0691 dnaK   FALSE 0.028 243.000 0.000 NA N NA
 3727326 3727327 AZC_0691 AZC_0692     TRUE 0.996 -3.000 0.466 NA N NA
 3727327 3727328 AZC_0692 AZC_0693     FALSE 0.157 67.000 0.000 NA   NA
 3727329 3727330 AZC_0694 AZC_0695     TRUE 0.993 0.000 0.420 NA   NA
 3727330 3727331 AZC_0695 AZC_0696     FALSE 0.207 55.000 0.000 1.000   NA
 3727334 3727335 AZC_0699 AZC_0700     FALSE 0.053 250.000 0.000 1.000   NA
 3727335 3727336 AZC_0700 AZC_0701     TRUE 0.620 51.000 0.069 1.000   NA
 3727337 3727338 AZC_0702 AZC_0703     FALSE 0.051 194.000 0.000 NA   NA
 3727338 3727339 AZC_0703 AZC_0704     TRUE 0.592 72.000 0.123 NA   NA
 3727339 3727340 AZC_0704 AZC_0705     FALSE 0.305 111.000 0.054 NA   NA
 3727340 3727341 AZC_0705 AZC_0706     FALSE 0.311 34.000 0.000 1.000   NA
 3727341 3727342 AZC_0706 AZC_0707     FALSE 0.033 283.000 0.000 1.000 N NA
 3727342 3727343 AZC_0707 AZC_0708     TRUE 0.714 20.000 0.012 NA N NA
 3727343 3727344 AZC_0708 AZC_0709     TRUE 0.623 62.000 0.132 NA N NA
 3727344 3727345 AZC_0709 AZC_0710     FALSE 0.033 295.000 0.000 1.000 N NA
 3727345 3727346 AZC_0710 AZC_0711     TRUE 0.986 -3.000 0.085 NA   NA
 3727346 3727347 AZC_0711 AZC_0712     TRUE 0.975 18.000 0.642 NA   NA
 3727347 3727348 AZC_0712 AZC_0713     FALSE 0.358 234.000 0.196 1.000 N NA
 3727348 3727349 AZC_0713 AZC_0714     TRUE 1.000 -3.000 0.863 0.044 Y NA
 3727349 3727350 AZC_0714 AZC_0715     TRUE 0.593 78.000 0.173 1.000 N NA
 3727352 3727353 AZC_0717 AZC_0718     FALSE 0.042 360.000 0.000 NA   NA
 3727353 3727354 AZC_0718 AZC_0719     FALSE 0.052 182.000 0.000 NA   NA
 3727354 3727355 AZC_0719 AZC_0720     FALSE 0.101 88.000 0.000 NA   NA
 3727355 3727356 AZC_0720 AZC_0721     TRUE 0.995 -3.000 0.333 NA   NA
 3727359 3727360 AZC_0724 AZC_0725     TRUE 0.502 133.000 0.000 0.014 Y NA
 3727360 3727361 AZC_0725 AZC_0726     TRUE 0.519 120.000 0.000 0.014 Y NA
 3727362 3727363 AZC_0727 AZC_0728     TRUE 0.978 25.000 0.375 1.000 Y NA
 3727365 3727366 AZC_0730 AZC_0731 gntR   TRUE 0.525 81.000 0.000 1.000 Y NA
 3727366 3727367 AZC_0731 AZC_0732     FALSE 0.116 190.000 0.000 0.086 N NA
 3727367 3727368 AZC_0732 AZC_0733     FALSE 0.299 23.000 0.000 NA N NA
 3727369 3727370 AZC_0734 AZC_0735     FALSE 0.038 535.000 0.000 NA   NA
 3727370 3727371 AZC_0735 AZC_0736     FALSE 0.261 30.000 0.000 1.000 N NA
 3727372 3727373 AZC_0737 AZC_0738     FALSE 0.051 190.000 0.000 NA   NA
 3727373 3727374 AZC_0738 AZC_0739     FALSE 0.110 90.000 0.000 1.000   NA
 3727374 3727375 AZC_0739 AZC_0740     FALSE 0.118 87.000 0.000 1.000   NA
 3727377 3727378 AZC_0742 AZC_0743 marR   TRUE 0.980 -3.000 0.054 1.000 N NA
 3727379 3727380 AZC_0744 AZC_0745     FALSE 0.169 63.000 0.000 NA   NA
 3727380 3727381 AZC_0745 AZC_0746     FALSE 0.207 104.000 0.005 1.000   NA
 3727383 3727384 AZC_0748 AZC_0749     FALSE 0.053 177.000 0.000 NA   NA
 3727384 3727385 AZC_0749 AZC_0750     FALSE 0.096 90.000 0.000 NA   NA
 3727385 3727386 AZC_0750 AZC_0751     TRUE 0.779 5.000 0.000 NA   NA
 3727386 3727387 AZC_0751 AZC_0752     FALSE 0.444 22.000 0.000 NA   NA
 3727387 3727388 AZC_0752 AZC_0753     FALSE 0.276 89.000 0.012 NA   NA
 3727390 3727391 AZC_0755 AZC_0756     FALSE 0.173 61.000 0.000 NA   NA
 3727391 3727392 AZC_0756 AZC_0757     TRUE 0.988 0.000 0.212 NA   NA
 3727395 3727396 AZC_0760 AZC_0761     TRUE 0.998 5.000 0.703 NA Y NA
 3727396 3727397 AZC_0761 AZC_0762     TRUE 0.999 4.000 0.730 0.001 Y NA
 3727397 3727398 AZC_0762 AZC_0763     TRUE 0.657 149.000 0.128 1.000 Y NA
 3727400 3727401 AZC_0765 AZC_0766     TRUE 0.748 169.000 0.151 0.086 Y NA
 3727401 3727402 AZC_0766 AZC_0767     FALSE 0.362 109.000 0.075 1.000   NA
 3727403 3727404 AZC_0768 AZC_0769     FALSE 0.040 171.000 0.000 1.000 N NA
 3727406 3727407 AZC_0771 AZC_0772     FALSE 0.343 31.000 0.000 1.000   NA
 3727407 3727408 AZC_0772 AZC_0773     TRUE 0.976 -3.000 0.000 0.007   NA
 3727408 3727409 AZC_0773 AZC_0774     TRUE 0.777 79.000 0.071 1.000 Y NA
 3727409 3727410 AZC_0774 AZC_0775     TRUE 0.999 -3.000 0.762 0.095 Y NA
 3727410 3727411 AZC_0775 AZC_0776     TRUE 0.979 19.000 0.147 0.095 Y NA
 3727411 3727412 AZC_0776 AZC_0777     TRUE 0.638 80.000 0.000 0.095 Y NA
 3727413 3727414 AZC_0778 AZC_0779     FALSE 0.125 78.000 0.000 NA   NA
 3727414 3727415 AZC_0779 AZC_0780     TRUE 0.945 30.000 0.571 1.000   NA
 3727415 3727416 AZC_0780 AZC_0781   lacI FALSE 0.042 159.000 0.000 1.000 N NA
 3727416 3727417 AZC_0781 AZC_0782 lacI   TRUE 0.998 -3.000 0.761 1.000 N NA
 3727417 3727418 AZC_0782 AZC_0783     TRUE 0.778 313.000 0.870 0.095 N NA
 3727418 3727419 AZC_0783 AZC_0784     TRUE 0.998 -3.000 0.660 0.095 N NA
 3727419 3727420 AZC_0784 AZC_0785     TRUE 0.997 9.000 0.632 0.095 Y NA
 3727420 3727421 AZC_0785 AZC_0786     TRUE 0.972 5.000 0.132 1.000   NA
 3727422 3727423 AZC_0787 AZC_0788     TRUE 0.967 -3.000 0.013 1.000 N NA
 3727423 3727424 AZC_0788 AZC_0789     TRUE 0.924 8.000 0.026 1.000   NA
 3727427 3727428 AZC_0792 AZC_0793     TRUE 0.558 95.000 0.200 1.000   NA
 3727429 3727430 AZC_0794 AZC_0795     FALSE 0.054 173.000 0.000 NA   NA
 3727430 3727431 AZC_0795 AZC_0796     TRUE 0.679 10.000 0.000 NA   NA
 3727431 3727432 AZC_0796 AZC_0797     TRUE 0.947 23.000 0.069 1.000 Y NA
 3727432 3727433 AZC_0797 AZC_0798     TRUE 0.933 35.000 0.050 0.019 Y NA
 3727434 3727435 AZC_0799 AZC_0800     FALSE 0.148 138.000 0.003 NA   NA
 3727435 3727436 AZC_0800 AZC_0801     FALSE 0.082 85.000 0.000 1.000 N NA
 3727436 3727437 AZC_0801 AZC_0802     FALSE 0.036 209.000 0.000 1.000 N NA
 3727437 3727438 AZC_0802 AZC_trnL07   trnL FALSE 0.054 171.000 0.000 NA   NA
 3727441 3727442 AZC_0805 AZC_0806     FALSE 0.139 72.000 0.000 NA   NA
 3727442 3727443 AZC_0806 AZC_0807     TRUE 0.842 81.000 0.048 0.006 Y NA
 3727443 3727444 AZC_0807 AZC_0808     TRUE 0.702 207.000 0.222 1.000 Y NA
 3727444 3727445 AZC_0808 AZC_0809     TRUE 0.999 -3.000 0.450 0.007 Y NA
 3727445 3727446 AZC_0809 AZC_0810     TRUE 0.998 4.000 0.528 1.000 Y NA
 3727446 3727447 AZC_0810 AZC_0811     TRUE 0.999 -3.000 0.694 0.095 Y NA
 3727447 3727448 AZC_0811 AZC_0812     TRUE 0.911 176.000 0.697 0.095 Y NA
 3727451 3727452 AZC_0815 AZC_0816     TRUE 0.497 86.000 0.000 1.000 Y NA
 3727452 3727453 AZC_0816 AZC_0817     TRUE 0.930 72.000 0.308 0.095 Y NA
 3727453 3727454 AZC_0817 AZC_0818     TRUE 0.999 -3.000 0.615 1.000 Y NA
 3727454 3727455 AZC_0818 AZC_0819     FALSE 0.153 47.000 0.000 1.000 N NA
 3727455 3727456 AZC_0819 AZC_0820     TRUE 0.837 23.000 0.094 1.000 N NA
 3727456 3727457 AZC_0820 AZC_0821     FALSE 0.034 257.000 0.000 1.000 N NA
 3727458 3727459 AZC_0822 AZC_0823     TRUE 0.994 -3.000 0.309 1.000 N NA
 3727459 3727460 AZC_0823 AZC_0824     FALSE 0.027 942.000 0.000 1.000 N NA
 3727460 3727461 AZC_0824 AZC_0825     FALSE 0.134 74.000 0.000 NA   NA
 3727462 3727463 AZC_0826 AZC_0827     FALSE 0.341 29.000 0.000 NA   NA
 3727464 3727465 AZC_trnT08 AZC_0828 trnT   FALSE 0.089 94.000 0.000 NA   NA
 3727465 3727466 AZC_0828 AZC_0829     FALSE 0.059 131.000 0.000 NA   NA
 3727466 3727467 AZC_0829 AZC_0830     FALSE 0.341 29.000 0.000 NA   NA
 3727467 3727468 AZC_0830 AZC_0831     FALSE 0.137 73.000 0.000 NA   NA
 3727469 3727470 AZC_0832 AZC_0833     FALSE 0.038 667.000 0.000 NA   NA
 3727470 3727471 AZC_0833 AZC_0834   dnaB TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3727471 3727472 AZC_0834 AZC_0835 dnaB   TRUE 0.855 0.000 0.000 NA   NA
 3727472 3727473 AZC_0835 AZC_0836     FALSE 0.217 42.000 0.000 NA   NA
 3727473 3727474 AZC_0836 AZC_0837     FALSE 0.039 459.000 0.000 NA   NA
 3727474 3727475 AZC_0837 AZC_0838     TRUE 0.647 11.000 0.000 NA   NA
 3727475 3727476 AZC_0838 AZC_0839     TRUE 0.912 -7.000 0.000 NA   NA
 3727476 3727477 AZC_0839 AZC_0840     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3727477 3727478 AZC_0840 AZC_0841     TRUE 0.799 26.000 0.067 NA   NA
 3727478 3727479 AZC_0841 AZC_0842     TRUE 0.823 3.000 0.000 NA   NA
 3727479 3727480 AZC_0842 AZC_0843     FALSE 0.056 158.000 0.000 NA   NA
 3727480 3727481 AZC_0843 AZC_0844     TRUE 0.979 16.000 0.667 NA   NA
 3727481 3727482 AZC_0844 AZC_0845     TRUE 0.853 79.000 0.667 NA   NA
 3727482 3727483 AZC_0845 AZC_0846     TRUE 0.994 0.000 0.500 NA   NA
 3727483 3727484 AZC_0846 AZC_0847     TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA   NA
 3727484 3727485 AZC_0847 AZC_0848     TRUE 0.917 35.000 0.500 NA   NA
 3727485 3727486 AZC_0848 AZC_0849     TRUE 0.855 0.000 0.000 NA   NA
 3727486 3727487 AZC_0849 AZC_0850     FALSE 0.051 191.000 0.000 NA   NA
 3727487 3727488 AZC_0850 AZC_0851     TRUE 0.833 2.000 0.000 NA   NA
 3727488 3727489 AZC_0851 AZC_0852     FALSE 0.037 715.000 0.000 NA   NA
 3727489 3727490 AZC_0852 AZC_0853     TRUE 0.725 8.000 0.000 NA   NA
 3727490 3727491 AZC_0853 AZC_0854     TRUE 0.679 10.000 0.000 NA   NA
 3727491 3727492 AZC_0854 AZC_0855     FALSE 0.134 74.000 0.000 NA   NA
 3727492 3727493 AZC_0855 AZC_0856     FALSE 0.166 64.000 0.000 NA   NA
 3727493 3727494 AZC_0856 AZC_0857     FALSE 0.205 45.000 0.000 NA   NA
 3727494 3727495 AZC_0857 AZC_0858     FALSE 0.171 62.000 0.000 NA   NA
 3727495 3727496 AZC_0858 AZC_0859     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3727496 3727497 AZC_0859 AZC_0860     FALSE 0.056 158.000 0.000 NA   NA
 3727498 3727499 AZC_0861 AZC_0862     FALSE 0.039 532.000 0.000 NA   NA
 3727499 3727500 AZC_0862 AZC_0863     FALSE 0.051 194.000 0.000 NA   NA
 3727500 3727501 AZC_0863 AZC_0864     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3727501 3727502 AZC_0864 AZC_0865     FALSE 0.041 384.000 0.000 NA   NA
 3727505 3727506 AZC_0868 AZC_0869     TRUE 0.596 13.000 0.000 NA   NA
 3727507 3727508 AZC_0870 AZC_0871     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3727508 3727509 AZC_0871 AZC_0872     TRUE 0.968 15.000 0.421 NA   NA
 3727509 3727510 AZC_0872 AZC_0873     FALSE 0.036 1467.000 0.000 NA   NA
 3727510 3727511 AZC_0873 AZC_0874     FALSE 0.078 101.000 0.000 NA   NA
 3727511 3727512 AZC_0874 AZC_0875     TRUE 0.647 11.000 0.000 NA   NA
 3727514 3727515 AZC_0877 AZC_0878   trmH FALSE 0.030 394.000 0.000 1.000 N NA
 3727515 3727516 AZC_0878 AZC_0879 trmH   FALSE 0.104 64.000 0.000 NA N NA
 3727517 3727518 AZC_trnY09 AZC_trnG10 trnY trnG FALSE 0.240 38.000 0.000 NA   NA
 3727518 3727519 AZC_trnG10 AZC_0880 trnG   FALSE 0.055 162.000 0.000 NA   NA
 3727519 3727520 AZC_0880 AZC_trnW11   trnW FALSE 0.048 216.000 0.000 NA   NA
 3727520 3727521 AZC_trnW11 AZC_0881 trnW secE FALSE 0.068 113.000 0.000 NA   NA
 3727521 3727522 AZC_0881 AZC_0882 secE nusG TRUE 0.998 -3.000 0.843 1.000 N NA
 3727522 3727523 AZC_0882 AZC_0883 nusG   TRUE 0.653 276.000 0.681 1.000 N NA
 3727523 3727524 AZC_0883 AZC_0884     TRUE 0.999 6.000 0.838 0.016 Y NA
 3727524 3727525 AZC_0884 AZC_0885     TRUE 0.793 587.000 0.302 0.016 Y NA
 3727525 3727526 AZC_0885 AZC_0886     TRUE 0.986 52.000 0.884 0.012 Y NA
 3727526 3727527 AZC_0886 AZC_0887     FALSE 0.422 241.000 0.223 1.000   NA
 3727527 3727528 AZC_0887 AZC_0888     TRUE 0.892 116.000 0.851 0.001   NA
 3727528 3727529 AZC_0888 AZC_0889     TRUE 0.636 81.000 0.002 1.000 Y NA
 3727530 3727531 AZC_0890 AZC_0891     TRUE 0.494 154.000 0.250 1.000   NA
 3727532 3727533 AZC_0892 AZC_0893     FALSE 0.178 171.000 0.018 NA   NA
 3727533 3727534 AZC_0893 AZC_0894     FALSE 0.051 192.000 0.000 NA   NA
 3727534 3727535 AZC_0894 AZC_0895     FALSE 0.058 140.000 0.000 NA   NA
 3727535 3727536 AZC_0895 AZC_0896   rgpF TRUE 0.486 19.000 0.000 NA   NA
 3727536 3727537 AZC_0896 AZC_0897 rgpF   FALSE 0.180 57.000 0.000 NA   NA
 3727539 3727540 AZC_0899 AZC_0900     FALSE 0.051 192.000 0.000 NA   NA
 3727541 3727542 AZC_0901 AZC_0902     FALSE 0.054 170.000 0.000 NA   NA
 3727542 3727543 AZC_0902 AZC_0903     FALSE 0.407 68.000 0.000 0.027   NA
 3727543 3727544 AZC_0903 AZC_0904     TRUE 0.779 5.000 0.000 NA   NA
 3727544 3727545 AZC_0904 AZC_0905     FALSE 0.066 115.000 0.000 NA   NA
 3727545 3727546 AZC_0905 AZC_0906     TRUE 0.883 53.000 0.525 1.000   NA
 3727547 3727548 AZC_0907 AZC_0908     FALSE 0.028 610.000 0.000 1.000 N NA
 3727549 3727550 AZC_0909 AZC_0910     TRUE 0.869 9.000 0.003 NA   NA
 3727551 3727552 AZC_0911 AZC_0912   lysR FALSE 0.074 117.000 0.000 1.000   NA
 3727554 3727555 AZC_0914 AZC_0915     FALSE 0.054 239.000 0.000 1.000   NA
 3727555 3727556 AZC_0915 AZC_0916     FALSE 0.036 212.000 0.000 1.000 N NA
 3727559 3727560 AZC_0919 AZC_0920   cysW TRUE 0.992 2.000 0.070 1.000 Y NA
 3727560 3727561 AZC_0920 AZC_0921 cysW cysT TRUE 0.999 -3.000 0.935 0.001 N NA
 3727561 3727562 AZC_0921 AZC_0922 cysT   TRUE 0.499 146.000 0.097 0.002 N NA
 3727562 3727563 AZC_0922 AZC_0923     FALSE 0.324 79.000 0.019 1.000 N NA
 3727563 3727564 AZC_0923 AZC_0924     TRUE 0.958 9.000 0.139 NA   NA
 3727564 3727565 AZC_0924 AZC_0925     TRUE 0.907 29.000 0.309 NA   NA
 3727565 3727566 AZC_0925 AZC_0926     TRUE 0.978 23.000 0.919 NA   NA
 3727567 3727568 AZC_0927 AZC_0928     TRUE 0.995 10.000 0.830 0.001 N NA
 3727568 3727569 AZC_0928 AZC_0929     FALSE 0.030 419.000 0.000 1.000 N NA
 3727570 3727571 AZC_0930 AZC_0931     FALSE 0.118 87.000 0.000 1.000   NA
 3727572 3727573 AZC_0932 AZC_0933     TRUE 0.774 46.000 0.000 0.084 Y NA
 3727573 3727574 AZC_0933 AZC_0934     FALSE 0.073 107.000 0.000 NA   NA
 3727576 3727577 AZC_0936 AZC_0937     FALSE 0.359 30.000 0.000 1.000   NA
 3727577 3727578 AZC_0937 AZC_0938     TRUE 0.483 75.000 0.061 NA   NA
 3727578 3727579 AZC_0938 AZC_0939     TRUE 0.990 3.000 0.362 NA   NA
 3727580 3727581 AZC_0940 AZC_0941 yaeC   FALSE 0.041 112.000 0.000 NA N NA
 3727581 3727582 AZC_0941 AZC_0942     TRUE 0.749 24.000 0.038 1.000 N NA
 3727585 3727586 AZC_0945 AZC_0946     TRUE 0.596 13.000 0.000 NA   NA
 3727586 3727587 AZC_0946 AZC_0947     FALSE 0.029 212.000 0.000 NA N NA
 3727587 3727588 AZC_0947 AZC_0948     FALSE 0.066 146.000 0.000 1.000   NA
 3727591 3727592 AZC_0951 AZC_0952   algI TRUE 0.986 3.000 0.250 NA   NA
 3727592 3727593 AZC_0952 AZC_0953 algI   TRUE 0.701 22.000 0.015 NA N NA
 3727595 3727596 AZC_0955 AZC_0956     FALSE 0.188 191.000 0.022 1.000   NA
 3727596 3727597 AZC_0956 AZC_0957     TRUE 0.687 54.000 0.140 NA   NA
 3727597 3727598 AZC_0957 AZC_0958     FALSE 0.046 247.000 0.000 NA   NA
 3727598 3727599 AZC_0958 AZC_0959     FALSE 0.292 138.000 0.069 NA   NA
 3727600 3727601 AZC_0960 AZC_0961     TRUE 0.965 0.000 0.043 1.000 N NA
 3727601 3727602 AZC_0961 AZC_0962     TRUE 0.632 68.000 0.137 NA   NA
 3727602 3727603 AZC_0962 AZC_0963     TRUE 0.893 82.000 0.972 NA   NA
 3727604 3727605 AZC_0964 AZC_0965   lysR FALSE 0.134 74.000 0.000 NA   NA
 3727608 3727609 AZC_0968 AZC_0969     TRUE 0.843 53.000 0.400 NA   NA
 3727609 3727610 AZC_0969 AZC_0970     TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.001 Y NA
 3727610 3727611 AZC_0970 AZC_0971     FALSE 0.056 104.000 0.000 1.000 N NA
 3727611 3727612 AZC_0971 AZC_0972     TRUE 0.982 5.000 0.000 0.019 Y NA
 3727613 3727614 AZC_0973 AZC_0974     FALSE 0.039 178.000 0.000 1.000 N NA
 3727614 3727615 AZC_0974 AZC_0975     TRUE 0.490 14.000 0.000 1.000 N NA
 3727616 3727617 AZC_0976 AZC_0977     TRUE 0.972 -3.000 0.016 NA   NA
 3727618 3727619 AZC_0978 AZC_0979     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3727621 3727622 AZC_0981 AZC_0982     FALSE 0.050 203.000 0.000 NA   NA
 3727622 3727623 AZC_0982 AZC_0983     TRUE 0.988 13.000 0.286 1.000 Y NA
 3727624 3727625 AZC_0984 AZC_0985     TRUE 0.579 442.000 0.140 1.000 Y NA
 3727625 3727626 AZC_0985 AZC_0986     FALSE 0.214 50.000 0.000 1.000   NA
 3727627 3727628 AZC_0987 AZC_0988     FALSE 0.048 221.000 0.000 NA   NA
 3727628 3727629 AZC_0988 AZC_0989     FALSE 0.039 178.000 0.000 1.000 N NA
 3727629 3727630 AZC_0989 AZC_0990     TRUE 0.679 10.000 0.000 NA   NA
 3727630 3727631 AZC_0990 AZC_0991     FALSE 0.075 104.000 0.000 NA   NA
 3727631 3727632 AZC_0991 AZC_0992     FALSE 0.058 102.000 0.000 1.000 N NA
 3727632 3727633 AZC_0992 AZC_0993   iclR FALSE 0.172 41.000 0.000 1.000 N NA
 3727634 3727635 AZC_0994 AZC_0995     TRUE 1.000 -7.000 0.857 0.001 Y NA
 3727635 3727636 AZC_0995 AZC_0996     TRUE 0.994 12.000 0.517 1.000 Y NA
 3727636 3727637 AZC_0996 AZC_0997     FALSE 0.032 313.000 0.000 1.000 N NA
 3727639 3727640 AZC_0999 AZC_1000     FALSE 0.085 106.000 0.000 1.000   NA
 3727641 3727642 AZC_1001 AZC_1002 cobW   TRUE 0.956 22.000 0.458 NA   NA
 3727642 3727643 AZC_1002 AZC_1003   ndvA FALSE 0.348 237.000 0.188 1.000 N NA
 3727644 3727645 AZC_1004 AZC_1005     FALSE 0.185 53.000 0.000 NA   NA
 3727645 3727646 AZC_1005 AZC_1006     TRUE 0.952 19.000 0.333 1.000   NA
 3727646 3727647 AZC_1006 AZC_1007     TRUE 0.985 0.000 0.167 1.000   NA
 3727647 3727648 AZC_1007 AZC_1008     FALSE 0.046 450.000 0.000 1.000   NA
 3727649 3727650 AZC_1009 AZC_1010   lysE FALSE 0.138 57.000 0.000 1.000 N NA
 3727650 3727651 AZC_1010 AZC_1011 lysE   FALSE 0.195 48.000 0.000 NA   NA
 3727651 3727652 AZC_1011 AZC_1012   recF FALSE 0.065 117.000 0.000 NA   NA
 3727652 3727653 AZC_1012 AZC_1013 recF   TRUE 0.986 15.000 0.318 1.000 Y NA
 3727653 3727654 AZC_1013 AZC_1014   dnaA TRUE 0.741 284.000 0.328 1.000 Y NA
 3727654 3727655 AZC_1014 AZC_1015 dnaA   FALSE 0.027 1148.000 0.000 1.000 N NA
 3727656 3727657 AZC_1016 AZC_1017     FALSE 0.389 44.000 0.003 1.000 N NA
 3727657 3727658 AZC_1017 AZC_1018     TRUE 0.999 -3.000 0.375 0.001 Y NA
 3727658 3727659 AZC_1018 AZC_1019     TRUE 0.966 -3.000 0.005 NA   NA
 3727659 3727660 AZC_1019 AZC_1020     FALSE 0.181 116.000 0.008 NA   NA
 3727660 3727661 AZC_1020 AZC_1021     FALSE 0.129 63.000 0.000 1.000 N NA
 3727662 3727663 AZC_1022 AZC_1023     TRUE 0.998 -3.000 0.947 NA   NA
 3727664 3727665 AZC_1024 AZC_1025     TRUE 0.995 -3.000 0.383 1.000 N NA
 3727665 3727666 AZC_1025 AZC_1026     FALSE 0.041 161.000 0.000 1.000 N NA
 3727666 3727667 AZC_1026 AZC_1027     FALSE 0.365 27.000 0.000 NA   NA
 3727667 3727668 AZC_1027 AZC_1028     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3727668 3727669 AZC_1028 AZC_1029     FALSE 0.037 717.000 0.000 NA   NA
 3727669 3727670 AZC_1029 AZC_1030     FALSE 0.072 90.000 0.000 1.000 N NA
 3727670 3727671 AZC_1030 AZC_1031     FALSE 0.381 54.000 0.000 0.069 N NA
 3727671 3727672 AZC_1031 AZC_1032     FALSE 0.045 123.000 0.000 1.000 N NA
 3727672 3727673 AZC_1032 AZC_1033     FALSE 0.050 318.000 0.000 1.000   NA
 3727674 3727675 AZC_1034 AZC_1035 fdxB   FALSE 0.042 334.000 0.000 NA   NA
 3727675 3727676 AZC_1035 AZC_1036   nifX TRUE 0.975 10.000 0.309 NA   NA
 3727676 3727677 AZC_1036 AZC_1037 nifX nifN TRUE 0.979 26.000 0.663 0.004   NA
 3727677 3727678 AZC_1037 AZC_1038 nifN nifE TRUE 0.998 6.000 0.475 0.002 Y NA
 3727678 3727679 AZC_1038 AZC_1039 nifE nifK TRUE 0.892 138.000 0.380 0.002 Y NA
 3727679 3727680 AZC_1039 AZC_1040 nifK nifD TRUE 0.980 80.000 0.902 0.001 Y NA
 3727680 3727681 AZC_1040 AZC_1041 nifD nifH2 TRUE 0.756 68.000 0.098 0.001 N NA
 3727682 3727683 AZC_1042 AZC_1043 sufE fdxN FALSE 0.051 187.000 0.000 NA   NA
 3727683 3727684 AZC_1043 AZC_1044 fdxN sufB FALSE 0.164 131.000 0.004 1.000   NA
 3727684 3727685 AZC_1044 AZC_1045 sufB sufC TRUE 0.989 17.000 0.466 1.000 Y NA
 3727685 3727686 AZC_1045 AZC_1046 sufC sufD TRUE 0.999 -3.000 0.482 1.000 Y NA
 3727686 3727687 AZC_1046 AZC_1047 sufD sufS TRUE 0.991 -3.000 0.193 1.000 N NA
 3727688 3727689 AZC_1048 AZC_1049   nifA TRUE 0.566 16.000 0.000 1.000   NA
 3727689 3727690 AZC_1049 AZC_1050 nifA ahpD FALSE 0.058 199.000 0.000 1.000   NA
 3727690 3727691 AZC_1050 AZC_1051 ahpD   TRUE 0.967 5.000 0.095 1.000   NA
 3727692 3727693 AZC_1052 AZC_1053   modD FALSE 0.180 125.000 0.011 NA   NA
 3727694 3727695 AZC_1054 AZC_1055     FALSE 0.072 90.000 0.000 1.000 N NA
 3727695 3727696 AZC_1055 AZC_1056     TRUE 0.999 -3.000 0.491 0.001 Y NA
 3727696 3727697 AZC_1056 AZC_1057     TRUE 0.966 79.000 0.568 0.001 Y NA
 3727697 3727698 AZC_1057 AZC_1058   phnC TRUE 0.928 124.000 0.589 0.002 Y NA
 3727698 3727699 AZC_1058 AZC_1059 phnC   FALSE 0.029 519.000 0.000 1.000 N NA
 3727699 3727700 AZC_1059 AZC_1060     FALSE 0.269 99.000 0.034 1.000 N NA
 3727701 3727702 AZC_1061 AZC_1062 tetR   TRUE 0.469 155.000 0.233 NA   NA
 3727702 3727703 AZC_1062 AZC_1063     FALSE 0.054 170.000 0.000 NA   NA
 3727703 3727704 AZC_1063 AZC_1064     FALSE 0.084 107.000 0.000 1.000   NA
 3727704 3727705 AZC_1064 AZC_1065     TRUE 0.709 48.000 0.135 1.000   NA
 3727705 3727706 AZC_1065 AZC_1066     FALSE 0.056 213.000 0.000 1.000   NA
 3727706 3727707 AZC_1066 AZC_1067     TRUE 0.983 -3.000 0.054 1.000   NA
 3727710 3727711 AZC_1070 AZC_1071     FALSE 0.074 106.000 0.000 NA   NA
 3727711 3727712 AZC_1071 AZC_1072     TRUE 0.927 12.000 0.111 1.000 N NA
 3727713 3727714 AZC_1073 AZC_1074     TRUE 0.852 23.000 0.000 NA Y NA
 3727714 3727715 AZC_1074 AZC_1075   marR FALSE 0.138 57.000 0.000 1.000 N NA
 3727715 3727716 AZC_1075 AZC_1076 marR   TRUE 0.998 -3.000 0.800 NA   NA
 3727716 3727717 AZC_1076 AZC_1077   hlyD FALSE 0.050 206.000 0.000 NA   NA
 3727717 3727718 AZC_1077 AZC_1078 hlyD   FALSE 0.035 235.000 0.000 1.000 N NA
 3727719 3727720 AZC_1079 AZC_1080 lysR   FALSE 0.037 754.000 0.000 NA   NA
 3727720 3727721 AZC_1080 AZC_1081     FALSE 0.068 113.000 0.000 NA   NA
 3727721 3727722 AZC_1081 AZC_1082     FALSE 0.283 119.000 0.048 1.000   NA
 3727724 3727725 AZC_1084 AZC_1085     FALSE 0.216 101.000 0.016 1.000 N NA
 3727728 3727729 AZC_1088 AZC_1089     TRUE 0.964 9.000 0.177 NA   NA
 3727729 3727730 AZC_1089 AZC_1090     FALSE 0.153 68.000 0.000 NA   NA
 3727731 3727732 AZC_1091 AZC_1092     TRUE 0.586 59.000 0.069 NA   NA
 3727733 3727734 AZC_1093 AZC_1094     TRUE 0.874 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3727734 3727735 AZC_1094 AZC_1095     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3727735 3727736 AZC_1095 AZC_1096     FALSE 0.145 70.000 0.000 NA   NA
 3727737 3727738 AZC_1097 AZC_1098     TRUE 0.998 -3.000 0.941 NA   NA
 3727738 3727739 AZC_1098 AZC_1099     TRUE 0.984 11.000 0.582 NA   NA
 3727744 3727745 AZC_1104 AZC_1105     FALSE 0.052 180.000 0.000 NA   NA
 3727746 3727747 AZC_1106 AZC_1107     TRUE 0.872 68.000 0.600 1.000   NA
 3727747 3727748 AZC_1107 AZC_1108   gntR FALSE 0.076 88.000 0.000 1.000 N NA
 3727749 3727750 AZC_1109 AZC_1110     TRUE 0.596 13.000 0.000 NA   NA
 3727750 3727751 AZC_1110 AZC_1111     FALSE 0.047 234.000 0.000 NA   NA
 3727751 3727752 AZC_1111 AZC_1112     FALSE 0.051 192.000 0.000 NA   NA
 3727752 3727753 AZC_1112 AZC_1113     TRUE 0.923 27.000 0.345 NA   NA
 3727755 3727756 AZC_1115 AZC_1116     TRUE 0.987 -3.000 0.093 NA   NA
 3727756 3727757 AZC_1116 AZC_1117     FALSE 0.208 185.000 0.035 NA   NA
 3727757 3727758 AZC_1117 AZC_1118     TRUE 0.808 27.000 0.082 NA   NA
 3727758 3727759 AZC_1118 AZC_1119     TRUE 0.997 -3.000 0.577 NA   NA
 3727759 3727760 AZC_1119 AZC_1120     TRUE 0.880 36.000 0.344 NA   NA
 3727760 3727761 AZC_1120 AZC_1121     TRUE 0.957 9.000 0.133 NA   NA
 3727762 3727763 AZC_1122 AZC_1123     FALSE 0.298 32.000 0.000 NA   NA
 3727764 3727765 AZC_1124 AZC_1125     TRUE 0.984 8.000 0.390 NA   NA
 3727765 3727766 AZC_1125 AZC_1126     TRUE 0.996 -3.000 0.500 NA   NA
 3727766 3727767 AZC_1126 AZC_1127     TRUE 0.898 40.000 0.500 NA   NA
 3727767 3727768 AZC_1127 AZC_1128     FALSE 0.298 32.000 0.000 NA   NA
 3727768 3727769 AZC_1128 AZC_1129     FALSE 0.037 755.000 0.000 NA   NA
 3727769 3727770 AZC_1129 AZC_1130     TRUE 0.986 29.000 0.713 1.000 Y NA
 3727770 3727771 AZC_1130 AZC_1131   lipA FALSE 0.202 110.000 0.023 NA N NA
 3727771 3727772 AZC_1131 AZC_1132 lipA cycH FALSE 0.035 132.000 0.000 NA N NA
 3727772 3727773 AZC_1132 AZC_1133 cycH cycJ TRUE 0.792 80.000 0.096 1.000 Y NA
 3727773 3727774 AZC_1133 AZC_1134 cycJ ccmF TRUE 0.998 -3.000 0.125 0.002 Y NA
 3727774 3727775 AZC_1134 AZC_1135 ccmF cycL TRUE 0.997 5.000 0.644 NA Y NA
 3727775 3727776 AZC_1135 AZC_1136 cycL   FALSE 0.380 108.000 0.000 NA Y NA
 3727776 3727777 AZC_1136 AZC_1137     FALSE 0.029 481.000 0.000 1.000 N NA
 3727779 3727780 AZC_1139 AZC_1140     FALSE 0.051 112.000 0.000 1.000 N NA
 3727782 3727783 AZC_1142 AZC_1143     FALSE 0.039 490.000 0.000 NA   NA
 3727785 3727786 AZC_1145 AZC_1146   greA FALSE 0.377 344.000 0.241 1.000 N NA
 3727788 3727789 AZC_1148 AZC_1149   lysR FALSE 0.265 135.000 0.065 1.000 N NA
 3727789 3727790 AZC_1149 AZC_1150 lysR   FALSE 0.028 734.000 0.000 1.000 N NA
 3727791 3727792 AZC_1151 AZC_1152     TRUE 0.775 95.000 0.600 NA   NA
 3727792 3727793 AZC_1152 AZC_1153     TRUE 0.968 -3.000 0.008 NA   NA
 3727793 3727794 AZC_1153 AZC_trnSec12   trnSec TRUE 0.911 -131.000 0.000 NA   NA
 3727794 3727795 AZC_trnSec12 AZC_1154 trnSec   FALSE 0.036 1980.000 0.000 NA   NA
 3727795 3727796 AZC_1154 AZC_1155     TRUE 0.959 0.000 0.016 1.000   NA
 3727796 3727797 AZC_1155 AZC_1156     TRUE 0.943 8.000 0.083 NA N NA
 3727797 3727798 AZC_1156 AZC_1157     FALSE 0.350 194.000 0.182 NA N NA
 3727798 3727799 AZC_1157 AZC_1158     TRUE 0.999 -3.000 0.333 0.001 Y NA
 3727799 3727800 AZC_1158 AZC_1159     TRUE 0.996 -3.000 0.205 0.001   NA
 3727800 3727801 AZC_1159 AZC_1160     TRUE 0.877 13.000 0.000 0.002   NA
 3727802 3727803 AZC_1161 AZC_1162     TRUE 0.979 -3.000 0.054 NA N NA
 3727803 3727804 AZC_1162 AZC_1163     TRUE 0.619 85.000 0.005 NA Y NA
 3727804 3727805 AZC_1163 AZC_1164     FALSE 0.249 91.000 0.008 NA   NA
 3727806 3727807 AZC_1165 AZC_1166     FALSE 0.081 110.000 0.000 1.000   NA
 3727807 3727808 AZC_1166 AZC_1167     TRUE 0.975 3.000 0.000 1.000 Y NA
 3727808 3727809 AZC_1167 AZC_1168     FALSE 0.103 87.000 0.000 NA   NA
 3727809 3727810 AZC_1168 AZC_1169     FALSE 0.195 48.000 0.000 NA   NA
 3727810 3727811 AZC_1169 AZC_1170     TRUE 0.997 -7.000 0.250 0.002   NA
 3727811 3727812 AZC_1170 AZC_1171     TRUE 0.991 0.000 0.100 0.002   NA
 3727812 3727813 AZC_1171 AZC_1172     TRUE 0.998 9.000 0.533 0.002 Y NA
 3727814 3727815 AZC_1173 AZC_1174     TRUE 0.995 5.000 0.636 0.067 N NA
 3727815 3727816 AZC_1174 AZC_1175   araC TRUE 0.974 5.000 0.182 1.000 N NA
 3727816 3727817 AZC_1175 AZC_1176 araC   TRUE 0.954 16.000 0.333 1.000 N NA
 3727817 3727818 AZC_1176 AZC_1177     TRUE 0.996 4.000 0.148 0.066 Y NA
 3727818 3727819 AZC_1177 AZC_1178     TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.019 Y NA
 3727819 3727820 AZC_1178 AZC_1179     TRUE 1.000 -3.000 0.776 0.019 Y NA
 3727822 3727823 AZC_1181 AZC_1182     FALSE 0.173 61.000 0.000 NA   NA
 3727824 3727825 AZC_1183 AZC_1184     TRUE 0.997 -3.000 0.634 1.000 N NA
 3727826 3727827 AZC_1185 AZC_1186     TRUE 0.959 65.000 0.469 0.092 Y NA
 3727827 3727828 AZC_1186 AZC_1187     TRUE 0.999 4.000 0.844 1.000 Y NA
 3727831 3727832 AZC_1190 AZC_1191 fkbM asnC FALSE 0.057 146.000 0.000 NA   NA
 3727833 3727834 AZC_1192 AZC_1193     FALSE 0.356 116.000 0.000 NA Y NA
 3727837 3727838 AZC_1196 AZC_1197     TRUE 0.733 24.000 0.032 1.000 N NA
 3727839 3727840 AZC_1198 AZC_1199   dnaJ TRUE 0.582 335.000 0.519 NA   NA
 3727842 3727843 AZC_1201 AZC_1202     FALSE 0.212 163.000 0.032 NA   NA
 3727843 3727844 AZC_1202 AZC_1203     TRUE 0.978 -3.000 0.032 NA   NA
 3727846 3727847 AZC_1205 AZC_1206 cysA   FALSE 0.162 44.000 0.000 1.000 N NA
 3727847 3727848 AZC_1206 AZC_1207   chaA FALSE 0.163 148.000 0.015 1.000 N NA
 3727848 3727849 AZC_1207 AZC_1208 chaA   TRUE 0.683 23.000 0.011 1.000 N NA
 3727850 3727851 AZC_1209 AZC_1210     FALSE 0.144 52.000 0.000 1.000 N NA
 3727851 3727852 AZC_1210 AZC_1211     FALSE 0.042 150.000 0.000 1.000 N NA
 3727852 3727853 AZC_1211 AZC_1212   sbcD TRUE 0.997 0.000 0.312 1.000 Y NA
 3727854 3727855 AZC_1213 AZC_1214     FALSE 0.063 119.000 0.000 NA   NA
 3727855 3727856 AZC_1214 AZC_1215     TRUE 0.679 10.000 0.000 NA   NA
 3727856 3727857 AZC_1215 AZC_1216     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3727858 3727859 AZC_1217 AZC_1218     TRUE 0.996 -3.000 0.008 0.002 Y NA
 3727860 3727861 AZC_1219 AZC_1220 surE   FALSE 0.047 233.000 0.000 NA   NA
 3727861 3727862 AZC_1220 AZC_1221     TRUE 0.620 52.000 0.078 NA   NA
 3727862 3727863 AZC_1221 AZC_1222     FALSE 0.028 229.000 0.000 NA N NA
 3727866 3727867 AZC_1225 AZC_1226     FALSE 0.058 145.000 0.000 NA   NA
 3727867 3727868 AZC_1226 AZC_1227     FALSE 0.276 115.000 0.045 NA   NA
 3727869 3727870 AZC_1228 AZC_1229     FALSE 0.090 93.000 0.000 NA   NA
 3727872 3727873 AZC_1231 AZC_1232     TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.092 Y NA
 3727873 3727874 AZC_1232 AZC_1233     TRUE 1.000 -3.000 0.833 0.092 Y NA
 3727874 3727875 AZC_1233 AZC_1234     TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.092 Y NA
 3727875 3727876 AZC_1234 AZC_1235     TRUE 0.999 -3.000 0.400 1.000 Y NA
 3727876 3727877 AZC_1235 AZC_1236     TRUE 0.952 17.000 0.300 1.000   NA
 3727877 3727878 AZC_1236 AZC_1237     TRUE 0.997 -3.000 0.300 0.067   NA
 3727878 3727879 AZC_1237 AZC_1238     TRUE 0.994 2.000 0.333 0.066   NA
 3727879 3727880 AZC_1238 AZC_1239     TRUE 0.546 77.000 0.000 1.000 Y NA
 3727881 3727882 AZC_1240 AZC_1241     TRUE 0.827 21.000 0.043 1.000   NA
 3727882 3727883 AZC_1241 AZC_1242     FALSE 0.045 124.000 0.000 1.000 N NA
 3727884 3727885 AZC_1243 AZC_1244     FALSE 0.380 88.000 0.058 1.000 N NA
 3727885 3727886 AZC_1244 AZC_1245     TRUE 0.754 8.000 0.000 1.000   NA
 3727887 3727888 AZC_1246 AZC_1247     FALSE 0.180 57.000 0.000 NA   NA
 3727889 3727890 AZC_1248 AZC_1249 bcpB   FALSE 0.058 142.000 0.000 NA   NA
 3727891 3727892 AZC_1250 AZC_1251     FALSE 0.356 19.000 0.000 NA N NA
 3727892 3727893 AZC_1251 AZC_1252     TRUE 0.969 9.000 0.204 NA   NA
 3727897 3727898 AZC_1256 AZC_1257     FALSE 0.425 201.000 0.222 NA   NA
 3727899 3727900 AZC_1258 AZC_1259 exbB exbD TRUE 0.998 4.000 0.810 1.000 Y NA
 3727900 3727901 AZC_1259 AZC_1260 exbD   TRUE 0.985 -3.000 0.089 1.000 N NA
 3727901 3727902 AZC_1260 AZC_1261     FALSE 0.039 177.000 0.000 1.000 N NA
 3727902 3727903 AZC_1261 AZC_1262     FALSE 0.278 106.000 0.052 NA N NA
 3727903 3727904 AZC_1262 AZC_1263   ribD TRUE 0.979 6.000 0.277 NA N NA
 3727904 3727905 AZC_1263 AZC_1264 ribD   TRUE 0.837 130.000 0.456 1.000 Y NA
 3727905 3727906 AZC_1264 AZC_1265     TRUE 0.704 145.000 0.030 0.001 Y NA
 3727906 3727907 AZC_1265 AZC_1266   nusB TRUE 0.820 50.000 0.347 1.000 N NA
 3727907 3727908 AZC_1266 AZC_1267 nusB   TRUE 0.913 22.000 0.225 1.000 N NA
 3727908 3727909 AZC_1267 AZC_1268     FALSE 0.029 453.000 0.000 1.000 N NA
 3727909 3727910 AZC_1268 AZC_1269   arsR FALSE 0.027 859.000 0.000 1.000 N NA
 3727910 3727911 AZC_1269 AZC_1270 arsR   TRUE 0.883 -7.000 0.000 1.000 N NA
 3727911 3727912 AZC_1270 AZC_1271     TRUE 0.874 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3727912 3727913 AZC_1271 AZC_1272     TRUE 0.849 24.000 0.000 1.000 Y NA
 3727914 3727915 AZC_1273 AZC_1274   arsH TRUE 0.704 9.000 0.000 NA   NA
 3727915 3727916 AZC_1274 AZC_1275 arsH   TRUE 0.512 17.000 0.000 NA   NA
 3727916 3727917 AZC_1275 AZC_1276     FALSE 0.178 35.000 0.000 NA N NA
 3727917 3727918 AZC_1276 AZC_1277     FALSE 0.044 303.000 0.000 NA   NA
 3727918 3727919 AZC_1277 AZC_1278     TRUE 0.769 48.000 0.218 NA   NA
 3727919 3727920 AZC_1278 AZC_1279     TRUE 0.998 -3.000 0.857 NA N NA
 3727921 3727922 AZC_1280 AZC_1281     FALSE 0.033 276.000 0.000 1.000 N NA
 3727922 3727923 AZC_1281 AZC_1282     TRUE 0.465 186.000 0.000 0.015 Y NA
 3727923 3727924 AZC_1282 AZC_1283     FALSE 0.034 268.000 0.000 1.000 N NA
 3727924 3727925 AZC_1283 AZC_1284     TRUE 0.999 -3.000 0.538 NA Y NA
 3727925 3727926 AZC_1284 AZC_1285     TRUE 0.968 43.000 0.636 NA Y NA
 3727928 3727929 AZC_1287 AZC_1288     FALSE 0.080 111.000 0.000 1.000   NA
 3727929 3727930 AZC_1288 AZC_1289     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3727930 3727931 AZC_1289 AZC_1290     FALSE 0.259 36.000 0.000 NA   NA
 3727933 3727934 AZC_1292 AZC_1293     TRUE 0.961 30.000 0.800 NA   NA
 3727934 3727935 AZC_1293 AZC_1294     FALSE 0.377 26.000 0.000 NA   NA
 3727937 3727938 AZC_1296 AZC_1297     TRUE 0.990 -3.000 0.152 NA   NA
 3727939 3727940 AZC_1298 AZC_1299 lysR   FALSE 0.183 55.000 0.000 NA   NA
 3727940 3727941 AZC_1299 AZC_1300     TRUE 0.984 33.000 0.500 0.022 Y NA
 3727944 3727945 AZC_1303 AZC_1304     FALSE 0.060 185.000 0.000 1.000   NA
 3727945 3727946 AZC_1304 AZC_1305     TRUE 0.990 4.000 0.364 1.000   NA
 3727947 3727948 AZC_1306 AZC_1307     FALSE 0.050 198.000 0.000 NA   NA
 3727948 3727949 AZC_1307 AZC_1308   lysR FALSE 0.037 201.000 0.000 1.000 N NA
 3727950 3727951 AZC_1309 AZC_1310     TRUE 0.966 26.000 0.750 NA   NA
 3727953 3727954 AZC_1312 AZC_1313     TRUE 0.988 -3.000 0.111 NA   NA
 3727955 3727956 AZC_1314 AZC_1315 araC   FALSE 0.031 337.000 0.000 1.000 N NA
 3727958 3727959 AZC_1317 AZC_1318     FALSE 0.083 108.000 0.000 1.000   NA
 3727959 3727960 AZC_1318 AZC_1319     TRUE 0.985 2.000 0.088 0.082   NA
 3727960 3727961 AZC_1319 AZC_1320     TRUE 0.679 10.000 0.000 NA   NA
 3727961 3727962 AZC_1320 AZC_1321     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3727962 3727963 AZC_1321 AZC_1322     TRUE 0.779 5.000 0.000 NA   NA
 3727963 3727964 AZC_1322 AZC_1323     TRUE 0.647 11.000 0.000 NA   NA
 3727966 3727967 AZC_1325 AZC_1326     FALSE 0.027 874.000 0.000 1.000 N NA
 3727967 3727968 AZC_1326 AZC_1327   araC FALSE 0.029 446.000 0.000 1.000 N NA
 3727969 3727970 AZC_1328 AZC_1329     FALSE 0.041 388.000 0.000 NA   NA
 3727970 3727971 AZC_1329 AZC_1330     FALSE 0.044 295.000 0.000 NA   NA
 3727971 3727972 AZC_1330 AZC_1331   fecI FALSE 0.042 348.000 0.000 NA   NA
 3727972 3727973 AZC_1331 AZC_1332 fecI fecR TRUE 0.826 105.000 1.000 NA N NA
 3727973 3727974 AZC_1332 AZC_1333 fecR   FALSE 0.356 116.000 0.000 NA Y NA
 3727975 3727976 AZC_1334 AZC_1335     FALSE 0.414 26.000 0.000 1.000   NA
 3727977 3727978 AZC_1336 AZC_1337 lysR   FALSE 0.045 283.000 0.000 NA   NA
 3727978 3727979 AZC_1337 AZC_1338     FALSE 0.117 81.000 0.000 NA   NA
 3727979 3727980 AZC_1338 AZC_1339     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3727980 3727981 AZC_1339 AZC_1340     FALSE 0.294 85.000 0.000 0.066   NA
 3727981 3727982 AZC_1340 AZC_1341     FALSE 0.348 126.000 0.000 1.000 Y NA
 3727982 3727983 AZC_1341 AZC_1342   crcB FALSE 0.027 261.000 0.000 NA N NA
 3727983 3727984 AZC_1342 AZC_1343 crcB   FALSE 0.185 34.000 0.000 NA N NA
 3727987 3727988 AZC_1346 AZC_1347     FALSE 0.044 553.000 0.000 1.000   NA
 3727988 3727989 AZC_1347 AZC_1348     FALSE 0.035 240.000 0.000 1.000 N NA
 3727990 3727991 AZC_1349 AZC_1350     FALSE 0.183 55.000 0.000 NA   NA
 3727991 3727992 AZC_1350 AZC_1351     TRUE 0.995 -3.000 0.050 1.000 Y NA
 3727992 3727993 AZC_1351 AZC_1352     FALSE 0.029 446.000 0.000 1.000 N NA
 3727994 3727995 AZC_1353 AZC_1354     TRUE 0.999 -3.000 0.556 0.066 Y NA
 3727995 3727996 AZC_1354 AZC_1355     FALSE 0.129 63.000 0.000 1.000 N NA
 3727996 3727997 AZC_1355 AZC_1356     FALSE 0.033 270.000 0.000 1.000 N NA
 3727997 3727998 AZC_1356 AZC_1357     FALSE 0.038 189.000 0.000 1.000 N NA
 3727998 3727999 AZC_1357 AZC_1358     TRUE 0.579 64.000 0.074 NA   NA
 3727999 3728000 AZC_1358 AZC_1359     TRUE 0.936 10.000 0.074 NA   NA
 3728001 3728002 AZC_1360 AZC_1361   nodW TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.022 Y NA
 3728002 3728003 AZC_1361 AZC_1362 nodW   TRUE 0.901 27.000 0.000 0.018 Y NA
 3728004 3728005 AZC_1363 AZC_1364   hlyD TRUE 0.993 -3.000 0.292 NA N NA
 3728006 3728007 AZC_1365 AZC_1366     TRUE 0.596 63.000 0.072 1.000   NA
 3728011 3728012 AZC_1370 AZC_1371     FALSE 0.161 66.000 0.000 NA   NA
 3728012 3728013 AZC_1371 AZC_1372     TRUE 0.951 27.000 0.565 NA   NA
 3728013 3728014 AZC_1372 AZC_1373     TRUE 0.878 57.000 0.543 NA   NA
 3728014 3728015 AZC_1373 AZC_1374     FALSE 0.398 112.000 0.122 NA   NA
 3728015 3728016 AZC_1374 AZC_1375     TRUE 0.992 -3.000 0.224 1.000 N NA
 3728016 3728017 AZC_1375 AZC_1376     FALSE 0.286 28.000 0.000 1.000 N NA
 3728017 3728018 AZC_1376 AZC_1377     FALSE 0.058 102.000 0.000 1.000 N NA
 3728018 3728019 AZC_1377 AZC_1378   tetR FALSE 0.034 264.000 0.000 1.000 N NA
 3728019 3728020 AZC_1378 AZC_1379 tetR   FALSE 0.068 133.000 0.000 1.000   NA
 3728020 3728021 AZC_1379 AZC_1380   matE TRUE 0.481 22.000 0.000 1.000   NA
 3728022 3728023 AZC_1381 AZC_1382   marR TRUE 0.762 43.000 0.185 NA   NA
 3728024 3728025 AZC_1383 AZC_1384     FALSE 0.318 88.000 0.000 0.011   NA
 3728025 3728026 AZC_1384 AZC_1385     FALSE 0.325 30.000 0.000 NA   NA
 3728027 3728028 AZC_1386 AZC_1387     FALSE 0.055 233.000 0.000 1.000   NA
 3728028 3728029 AZC_1387 AZC_1388     TRUE 0.481 116.000 0.200 1.000   NA
 3728030 3728031 AZC_1389 AZC_1390     FALSE 0.166 64.000 0.000 NA   NA
 3728032 3728033 AZC_1391 AZC_1392     FALSE 0.182 66.000 0.000 1.000   NA
 3728033 3728034 AZC_1392 AZC_1393     TRUE 0.935 4.000 0.000 0.066   NA
 3728034 3728035 AZC_1393 AZC_1394     TRUE 0.997 2.000 0.143 0.002 Y NA
 3728037 3728038 AZC_1396 AZC_1397     FALSE 0.058 196.000 0.000 1.000   NA
 3728038 3728039 AZC_1397 AZC_1398     FALSE 0.138 194.000 0.000 0.042 N NA
 3728039 3728040 AZC_1398 AZC_1399     FALSE 0.053 174.000 0.000 NA   NA
 3728040 3728041 AZC_1399 AZC_1400     FALSE 0.074 106.000 0.000 NA   NA
 3728041 3728042 AZC_1400 AZC_1401     TRUE 0.999 5.000 0.917 0.001 Y NA
 3728042 3728043 AZC_1401 AZC_1402     TRUE 0.999 -3.000 0.705 0.066 Y NA
 3728044 3728045 AZC_1403 AZC_1404     TRUE 0.999 -3.000 0.263 0.003 Y NA
 3728045 3728046 AZC_1404 AZC_1405     FALSE 0.266 355.000 0.000 1.000 Y NA
 3728046 3728047 AZC_1405 AZC_1406     FALSE 0.064 118.000 0.000 NA   NA
 3728051 3728052 AZC_1410 AZC_1411     TRUE 0.486 46.000 0.017 NA   NA
 3728052 3728053 AZC_1411 AZC_1412     TRUE 0.977 4.000 0.167 1.000 N NA
 3728053 3728054 AZC_1412 AZC_1413     TRUE 0.940 11.000 0.133 1.000 N NA
 3728054 3728055 AZC_1413 AZC_1414     TRUE 0.988 -3.000 0.133 1.000 N NA
 3728055 3728056 AZC_1414 AZC_1415     FALSE 0.299 85.000 0.021 1.000 N NA
 3728056 3728057 AZC_1415 AZC_1416     TRUE 0.971 -3.000 0.021 1.000 N NA
 3728057 3728058 AZC_1416 AZC_1417     TRUE 0.966 32.000 0.357 1.000 Y NA
 3728058 3728059 AZC_1417 AZC_1418     TRUE 0.999 -3.000 0.357 0.091 Y NA
 3728059 3728060 AZC_1418 AZC_1419     TRUE 0.961 41.000 0.500 NA Y NA
 3728060 3728061 AZC_1419 AZC_1420     TRUE 0.647 97.000 0.333 NA   NA
 3728065 3728066 AZC_1424 AZC_1425     TRUE 0.945 16.000 0.271 1.000 N NA
 3728066 3728067 AZC_1425 AZC_1426     TRUE 0.999 -3.000 0.405 0.001 Y NA
 3728067 3728068 AZC_1426 AZC_1427     TRUE 1.000 -3.000 0.625 0.001 Y NA
 3728068 3728069 AZC_1427 AZC_1428     TRUE 0.997 13.000 0.583 0.001 Y NA
 3728069 3728070 AZC_1428 AZC_1429     TRUE 0.992 -3.000 0.242 1.000 N NA
 3728070 3728071 AZC_1429 AZC_1430     FALSE 0.033 288.000 0.000 1.000 N NA
 3728071 3728072 AZC_1430 AZC_1431     TRUE 0.987 4.000 0.000 0.003 Y NA
 3728072 3728073 AZC_1431 AZC_1432     TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3728073 3728074 AZC_1432 AZC_1433   nnrS TRUE 0.788 23.000 0.041 NA   NA
 3728074 3728075 AZC_1433 AZC_1434 nnrS   FALSE 0.171 62.000 0.000 NA   NA
 3728076 3728077 AZC_1435 AZC_1436     FALSE 0.050 114.000 0.000 1.000 N NA
 3728077 3728078 AZC_1436 AZC_1437     TRUE 1.000 -19.000 0.824 0.042 Y NA
 3728078 3728079 AZC_1437 AZC_1438     TRUE 0.999 -3.000 0.824 1.000 Y NA
 3728079 3728080 AZC_1438 AZC_1439     TRUE 0.999 2.000 1.000 0.090 Y NA
 3728080 3728081 AZC_1439 AZC_1440     TRUE 0.989 29.000 0.867 1.000 Y NA
 3728081 3728082 AZC_1440 AZC_1441     FALSE 0.348 80.000 0.028 1.000 N NA
 3728082 3728083 AZC_1441 AZC_1442     TRUE 0.720 76.000 0.314 1.000 N NA
 3728083 3728084 AZC_1442 AZC_1443     TRUE 0.999 0.000 0.782 0.001 Y NA
 3728084 3728085 AZC_1443 AZC_1444     FALSE 0.066 150.000 0.000 1.000   NA
 3728090 3728091 AZC_1449 AZC_1450     TRUE 0.998 11.000 1.000 0.012 Y NA
 3728091 3728092 AZC_1450 AZC_1451     TRUE 0.966 57.000 0.500 0.090 Y NA
 3728092 3728093 AZC_1451 AZC_1452     TRUE 0.979 29.000 0.500 1.000 Y NA
 3728093 3728094 AZC_1452 AZC_1453     TRUE 0.463 91.000 0.000 1.000 Y NA
 3728094 3728095 AZC_1453 AZC_1454     TRUE 0.916 14.000 0.000 1.000 Y NA
 3728095 3728096 AZC_1454 AZC_1455     FALSE 0.121 86.000 0.000 1.000   NA
 3728101 3728102 AZC_trnM13 AZC_1460 trnM   FALSE 0.045 267.000 0.000 NA   NA
 3728105 3728106 AZC_1463 AZC_1464     FALSE 0.187 52.000 0.000 NA   NA
 3728106 3728107 AZC_1464 AZC_1465     FALSE 0.128 76.000 0.000 NA   NA
 3728108 3728109 AZC_1466 AZC_1467   thrB TRUE 0.988 -3.000 0.104 1.000   NA
 3728109 3728110 AZC_1467 AZC_1468 thrB   TRUE 0.986 4.000 0.251 1.000   NA
 3728110 3728111 AZC_1468 AZC_1469     FALSE 0.092 92.000 0.000 NA   NA
 3728114 3728115 AZC_1472 AZC_1473     TRUE 0.996 -3.000 0.412 NA   NA
 3728116 3728117 AZC_1474 AZC_1475     FALSE 0.081 110.000 0.000 1.000   NA
 3728117 3728118 AZC_1475 AZC_1476     FALSE 0.067 134.000 0.000 1.000   NA
 3728120 3728121 AZC_1478 AZC_1479     FALSE 0.247 37.000 0.000 NA   NA
 3728121 3728122 AZC_1479 AZC_1480     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3728122 3728123 AZC_1480 AZC_1481     FALSE 0.123 79.000 0.000 NA   NA
 3728124 3728125 AZC_1482 AZC_1483     TRUE 0.817 14.000 0.011 NA   NA
 3728126 3728127 AZC_1484 AZC_1485     FALSE 0.377 26.000 0.000 NA   NA
 3728127 3728128 AZC_1485 AZC_1486     FALSE 0.306 82.000 0.011 NA   NA
 3728131 3728132 AZC_1489 AZC_1490     FALSE 0.143 53.000 0.000 1.000 N NA
 3728132 3728133 AZC_1490 AZC_1491     TRUE 0.864 39.000 0.375 1.000 N NA
 3728134 3728135 AZC_1492 AZC_1493     FALSE 0.336 123.000 0.111 1.000 N NA
 3728135 3728136 AZC_1493 AZC_1494     TRUE 0.996 2.000 0.444 0.002   NA
 3728136 3728137 AZC_1494 AZC_1495     TRUE 0.998 -3.000 0.433 0.002   NA
 3728137 3728138 AZC_1495 AZC_1496     TRUE 0.998 14.000 0.875 0.002 Y NA
 3728139 3728140 AZC_1497 AZC_1498 araC   FALSE 0.102 573.000 0.000 0.095   NA
 3728141 3728142 AZC_1499 AZC_1500     TRUE 0.906 89.000 0.493 1.000 Y NA
 3728142 3728143 AZC_1500 AZC_1501     TRUE 0.996 14.000 0.901 1.000 Y NA
 3728143 3728144 AZC_1501 AZC_1502     TRUE 0.999 -3.000 0.786 1.000 Y NA
 3728144 3728145 AZC_1502 AZC_1503     FALSE 0.272 96.000 0.029 1.000 N NA
 3728145 3728146 AZC_1503 AZC_1504     FALSE 0.063 168.000 0.000 1.000   NA
 3728149 3728150 AZC_1506 AZC_1507 arsR   TRUE 0.478 44.000 0.020 1.000 N NA
 3728150 3728151 AZC_1507 AZC_1508     FALSE 0.074 118.000 0.000 1.000   NA
 3728151 3728152 AZC_1508 AZC_1509     FALSE 0.070 125.000 0.000 1.000   NA
 3728152 3728153 AZC_1509 AZC_1510     TRUE 0.996 8.000 0.466 1.000 Y NA
 3728153 3728154 AZC_1510 AZC_1511     FALSE 0.027 1101.000 0.000 1.000 N NA
 3728154 3728155 AZC_1511 AZC_1512     TRUE 0.863 340.000 0.556 0.090 Y NA
 3728155 3728156 AZC_1512 AZC_1513     TRUE 1.000 -3.000 0.818 0.090 Y NA
 3728156 3728157 AZC_1513 AZC_1514     TRUE 0.998 -3.000 0.818 1.000   NA
 3728157 3728158 AZC_1514 AZC_1515     FALSE 0.056 215.000 0.000 1.000   NA
 3728158 3728159 AZC_1515 AZC_1516     TRUE 0.935 15.000 0.189 NA   NA
 3728159 3728160 AZC_1516 AZC_1517   gntR TRUE 0.879 33.000 0.300 NA   NA
 3728161 3728162 AZC_1518 AZC_1519     FALSE 0.134 74.000 0.000 NA   NA
 3728163 3728164 AZC_1520 AZC_1521     TRUE 0.998 2.000 0.600 NA Y NA
 3728164 3728165 AZC_1521 AZC_1522     TRUE 0.649 50.000 0.000 NA Y NA
 3728167 3728168 AZC_1524 AZC_1525     TRUE 0.712 23.000 0.011 NA   NA
 3728170 3728171 AZC_1527 AZC_1528     FALSE 0.392 2086.000 0.000 0.006 Y NA
 3728171 3728172 AZC_1528 AZC_1529     FALSE 0.259 421.000 0.000 1.000 Y NA
 3728172 3728173 AZC_1529 AZC_1530     TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3728174 3728175 AZC_trnQ15 AZC_1531 trnQ   FALSE 0.078 101.000 0.000 NA   NA
 3728175 3728176 AZC_1531 AZC_1532     FALSE 0.040 455.000 0.000 NA   NA
 3728176 3728177 AZC_1532 AZC_1533     TRUE 0.997 -3.000 0.632 NA   NA
 3728177 3728178 AZC_1533 AZC_1534     TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3728178 3728179 AZC_1534 AZC_1535   argK TRUE 0.949 5.000 0.054 1.000 N NA
 3728179 3728180 AZC_1535 AZC_1536 argK   FALSE 0.083 97.000 0.000 NA   NA
 3728180 3728181 AZC_1536 AZC_1537     TRUE 0.902 79.000 1.000 NA   NA
 3728183 3728184 AZC_1539 AZC_1540     FALSE 0.382 45.000 0.005 NA N NA
 3728184 3728185 AZC_1540 AZC_1541     TRUE 0.548 81.000 0.128 NA   NA
 3728185 3728186 AZC_1541 AZC_1542     FALSE 0.289 33.000 0.000 NA   NA
 3728186 3728187 AZC_1542 AZC_1543     TRUE 0.874 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3728188 3728189 AZC_1544 AZC_1545     TRUE 0.995 -3.000 0.347 NA   NA
 3728189 3728190 AZC_1545 AZC_1546     FALSE 0.053 175.000 0.000 NA   NA
 3728190 3728191 AZC_1546 AZC_1547     FALSE 0.145 70.000 0.000 NA   NA
 3728192 3728193 AZC_1548 AZC_1549     TRUE 0.991 0.000 0.029 1.000 Y NA
 3728193 3728194 AZC_1549 AZC_1550     TRUE 0.989 -3.000 0.161 1.000 N NA
 3728194 3728195 AZC_1550 AZC_1551     FALSE 0.247 197.000 0.071 1.000 N NA
 3728195 3728196 AZC_1551 AZC_1552     TRUE 0.999 2.000 0.742 1.000 Y NA
 3728196 3728197 AZC_1552 AZC_1553     TRUE 0.999 2.000 0.871 0.090 Y NA
 3728197 3728198 AZC_1553 AZC_1554     TRUE 0.864 438.000 0.593 0.090 Y NA
 3728200 3728201 AZC_1556 AZC_1557     FALSE 0.054 173.000 0.000 NA   NA
 3728201 3728202 AZC_1557 AZC_1558     FALSE 0.030 198.000 0.000 NA N NA
 3728202 3728203 AZC_1558 AZC_1559     FALSE 0.120 80.000 0.000 NA   NA
 3728204 3728205 AZC_1560 AZC_1561     TRUE 0.478 70.000 0.045 NA   NA
 3728205 3728206 AZC_1561 AZC_trnR16   trnR FALSE 0.058 135.000 0.000 NA   NA
 3728207 3728208 AZC_1562 AZC_1563     FALSE 0.045 283.000 0.000 NA   NA
 3728209 3728210 AZC_1564 AZC_1565     FALSE 0.029 498.000 0.000 1.000 N NA
 3728210 3728211 AZC_1565 AZC_1566     TRUE 0.986 21.000 0.201 0.001 Y NA
 3728211 3728212 AZC_1566 AZC_1567     TRUE 0.997 16.000 0.877 0.001 Y NA
 3728212 3728213 AZC_1567 AZC_1568     FALSE 0.241 428.000 0.106 1.000 N NA
 3728213 3728214 AZC_1568 AZC_1569     TRUE 0.999 -3.000 0.695 1.000 Y NA
 3728214 3728215 AZC_1569 AZC_1570     FALSE 0.045 270.000 0.000 NA   NA
 3728215 3728216 AZC_1570 AZC_1571     FALSE 0.057 148.000 0.000 NA   NA
 3728216 3728217 AZC_1571 AZC_1572     FALSE 0.029 515.000 0.000 1.000 N NA
 3728217 3728218 AZC_1572 AZC_1573     FALSE 0.398 85.000 0.047 NA   NA
 3728220 3728221 AZC_1575 AZC_1576   hlyD FALSE 0.038 185.000 0.000 1.000 N NA
 3728221 3728222 AZC_1576 AZC_1577 hlyD   TRUE 0.985 4.000 0.300 NA N NA
 3728222 3728223 AZC_1577 AZC_1578     FALSE 0.048 229.000 0.000 NA   NA
 3728223 3728224 AZC_1578 AZC_1579     FALSE 0.058 141.000 0.000 NA   NA
 3728224 3728225 AZC_1579 AZC_1580     FALSE 0.045 282.000 0.000 NA   NA
 3728225 3728226 AZC_1580 AZC_1581     TRUE 0.988 -3.000 0.103 1.000   NA
 3728226 3728227 AZC_1581 AZC_1582     TRUE 0.830 4.000 0.000 1.000   NA
 3728227 3728228 AZC_1582 AZC_1583     TRUE 0.961 8.000 0.120 1.000   NA
 3728230 3728231 AZC_1585 AZC_1586     TRUE 0.675 327.000 0.129 0.089 Y NA
 3728231 3728232 AZC_1586 AZC_1587     TRUE 0.997 13.000 0.815 0.012 Y NA
 3728232 3728233 AZC_1587 AZC_1588     TRUE 0.999 -3.000 0.734 1.000 Y NA
 3728235 3728236 AZC_1590 AZC_1591   dnaJ TRUE 0.893 30.000 0.286 NA   NA
 3728238 3728239 AZC_1593 AZC_1594   clpS FALSE 0.130 325.000 0.011 NA   NA
 3728239 3728240 AZC_1594 AZC_1595 clpS   TRUE 0.674 166.000 0.596 NA   NA
 3728241 3728242 AZC_1596 AZC_1597     TRUE 0.983 -3.000 0.014 0.080 N NA
 3728242 3728243 AZC_1597 AZC_1598     TRUE 0.997 -3.000 0.180 1.000 Y NA
 3728244 3728245 AZC_1599 AZC_1600     TRUE 0.994 -3.000 0.275 NA   NA
 3728246 3728247 AZC_1601 AZC_1602 glnA glnB TRUE 0.884 54.000 0.145 1.000 Y NA
 3728249 3728250 AZC_1604 AZC_1605     FALSE 0.122 231.000 0.000 0.064 N NA
 3728251 3728252 AZC_1606 AZC_trnL17 lysR trnL FALSE 0.054 173.000 0.000 NA   NA
 3728252 3728253 AZC_trnL17 AZC_1607 trnL   FALSE 0.076 103.000 0.000 NA   NA
 3728253 3728254 AZC_1607 AZC_1608     TRUE 0.928 65.000 0.351 1.000 Y NA
 3728254 3728255 AZC_1608 AZC_1609   clpX TRUE 0.724 562.000 0.352 1.000 Y NA
 3728255 3728256 AZC_1609 AZC_1610 clpX   TRUE 0.721 139.000 0.201 1.000 Y NA
 3728256 3728257 AZC_1610 AZC_1611     FALSE 0.031 352.000 0.000 1.000 N NA
 3728261 3728262 AZC_trnV18 AZC_1615 trnV   FALSE 0.059 131.000 0.000 NA   NA
 3728262 3728263 AZC_1615 AZC_1616     FALSE 0.046 246.000 0.000 NA   NA
 3728264 3728265 AZC_trnD19 AZC_1617 trnD   FALSE 0.043 316.000 0.000 NA   NA
 3728265 3728266 AZC_1617 AZC_1618     FALSE 0.079 100.000 0.000 NA   NA
 3728266 3728267 AZC_1618 AZC_1619     FALSE 0.137 73.000 0.000 NA   NA
 3728267 3728268 AZC_1619 AZC_1620     TRUE 0.553 10.000 0.000 NA N NA
 3728268 3728269 AZC_1620 AZC_1621     FALSE 0.043 109.000 0.000 NA N NA
 3728269 3728270 AZC_1621 AZC_1622     TRUE 0.847 -3.000 0.000 NA N NA
 3728270 3728271 AZC_1622 AZC_1623     TRUE 0.994 4.000 0.182 NA Y NA
 3728271 3728272 AZC_1623 AZC_1624     TRUE 0.988 23.000 0.643 1.000 Y NA
 3728272 3728273 AZC_1624 AZC_1625     TRUE 0.996 -3.000 0.094 1.000 Y NA
 3728273 3728274 AZC_1625 AZC_1626     TRUE 0.987 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3728280 3728281 AZC_1632 AZC_1633   yjbN FALSE 0.032 314.000 0.000 1.000 N NA
 3728281 3728282 AZC_1633 AZC_1634 yjbN   FALSE 0.046 262.000 0.000 NA   NA
 3728282 3728283 AZC_1634 AZC_1635     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3728284 3728285 AZC_1636 AZC_1637 gntR   FALSE 0.037 197.000 0.000 1.000 N NA
 3728285 3728286 AZC_1637 AZC_1638     FALSE 0.052 276.000 0.000 1.000   NA
 3728286 3728287 AZC_1638 AZC_1639     FALSE 0.131 82.000 0.000 1.000   NA
 3728287 3728288 AZC_1639 AZC_1640     TRUE 0.995 -3.000 0.043 NA Y NA
 3728288 3728289 AZC_1640 AZC_1641     TRUE 0.995 -3.000 0.043 NA Y NA
 3728289 3728290 AZC_1641 AZC_1642     TRUE 0.847 -3.000 0.000 NA N NA
 3728290 3728291 AZC_1642 AZC_1643     FALSE 0.028 238.000 0.000 NA N NA
 3728291 3728292 AZC_1643 AZC_1644     FALSE 0.146 120.000 0.000 0.080 N NA
 3728292 3728293 AZC_1644 AZC_1645     TRUE 0.994 -7.000 0.025 1.000 Y NA
 3728293 3728294 AZC_1645 AZC_1646     TRUE 0.980 -3.000 0.034 1.000   NA
 3728294 3728295 AZC_1646 AZC_1647     TRUE 0.986 -3.000 0.086 NA   NA
 3728295 3728296 AZC_1647 AZC_1648     TRUE 0.982 5.000 0.241 NA   NA
 3728296 3728297 AZC_1648 AZC_1649     TRUE 0.972 5.000 0.147 NA   NA
 3728297 3728298 AZC_1649 AZC_1650     TRUE 0.988 -3.000 0.118 NA   NA
 3728298 3728299 AZC_1650 AZC_1651     TRUE 0.995 -12.000 0.333 NA   NA
 3728299 3728300 AZC_1651 AZC_1652     TRUE 0.978 7.000 0.250 NA   NA
 3728300 3728301 AZC_1652 AZC_1653     TRUE 0.966 32.000 0.357 1.000 Y NA
 3728301 3728302 AZC_1653 AZC_1654   mipA TRUE 0.989 -7.000 0.143 1.000 N NA
 3728303 3728304 AZC_1655 AZC_1656   mazG TRUE 0.853 2.000 0.000 1.000   NA
 3728305 3728306 AZC_1657 AZC_1658     TRUE 0.855 0.000 0.000 NA   NA
 3728307 3728308 AZC_1659 AZC_1660     TRUE 0.979 19.000 0.791 NA   NA
 3728308 3728309 AZC_1660 AZC_1661   sixA TRUE 0.942 4.000 0.020 NA   NA
 3728310 3728311 AZC_1662 AZC_1663   mipA FALSE 0.041 113.000 0.000 NA N NA
 3728311 3728312 AZC_1663 AZC_1664 mipA   FALSE 0.030 193.000 0.000 NA N NA
 3728312 3728313 AZC_1664 AZC_1665     TRUE 0.486 19.000 0.000 NA   NA
 3728313 3728314 AZC_1665 AZC_1666     FALSE 0.062 122.000 0.000 NA   NA
 3728314 3728315 AZC_1666 AZC_1667     FALSE 0.028 576.000 0.000 1.000 N NA
 3728315 3728316 AZC_1667 AZC_1668     TRUE 0.999 -3.000 0.396 0.003 Y NA
 3728316 3728317 AZC_1668 AZC_1669     TRUE 0.978 31.000 0.262 0.003 Y NA
 3728317 3728318 AZC_1669 AZC_1670     TRUE 0.996 12.000 0.483 0.006 Y NA
 3728318 3728319 AZC_1670 AZC_1671     TRUE 0.840 353.000 0.355 0.006 Y NA
 3728319 3728320 AZC_1671 AZC_1672     TRUE 0.998 4.000 0.343 0.006 Y NA
 3728320 3728321 AZC_1672 AZC_1673     TRUE 0.757 6.000 0.000 NA   NA
 3728321 3728322 AZC_1673 AZC_1674     TRUE 0.855 0.000 0.000 NA   NA
 3728322 3728323 AZC_1674 AZC_1675     TRUE 0.957 82.000 0.515 0.006 Y NA
 3728323 3728324 AZC_1675 AZC_1676     TRUE 0.971 62.000 0.500 0.006 Y NA
 3728324 3728325 AZC_1676 AZC_1677     TRUE 0.875 240.000 0.442 0.006 Y NA
 3728325 3728326 AZC_1677 AZC_1678     TRUE 0.995 14.000 0.484 0.003 Y NA
 3728326 3728327 AZC_1678 AZC_1679     TRUE 0.998 5.000 0.451 0.006 Y NA
 3728327 3728328 AZC_1679 AZC_1680     TRUE 0.998 3.000 0.251 0.002 Y NA
 3728328 3728329 AZC_1680 AZC_1681     TRUE 0.994 16.000 0.453 0.002 Y NA
 3728329 3728330 AZC_1681 AZC_1682     TRUE 0.520 201.000 0.372 1.000 N NA
 3728330 3728331 AZC_1682 AZC_1683     TRUE 0.978 9.000 0.307 1.000   NA
 3728331 3728332 AZC_1683 AZC_1684     TRUE 0.656 58.000 0.105 1.000   NA
 3728332 3728333 AZC_1684 AZC_1685     TRUE 0.942 13.000 0.172 NA   NA
 3728333 3728334 AZC_1685 AZC_1686     FALSE 0.107 636.000 0.006 NA   NA
 3728334 3728335 AZC_1686 AZC_1687   lolC TRUE 0.984 -3.000 0.076 1.000 N NA
 3728335 3728336 AZC_1687 AZC_1688 lolC lolD TRUE 0.997 -3.000 0.620 1.000 N NA
 3728338 3728339 AZC_1690 AZC_1691     FALSE 0.094 91.000 0.000 NA   NA
 3728341 3728342 AZC_1693 AZC_1694     TRUE 0.918 104.000 0.748 1.000 Y NA
 3728342 3728343 AZC_1694 AZC_1695     TRUE 0.938 24.000 0.416 1.000 N NA
 3728343 3728344 AZC_1695 AZC_1696     TRUE 0.629 259.000 0.626 1.000 N NA
 3728344 3728345 AZC_1696 AZC_1697     TRUE 0.967 14.000 0.409 1.000 N NA
 3728345 3728346 AZC_1697 AZC_1698     TRUE 0.999 -3.000 0.400 1.000 Y NA
 3728346 3728347 AZC_1698 AZC_1699     TRUE 0.993 10.000 0.372 1.000 Y NA
 3728347 3728348 AZC_1699 AZC_1700     TRUE 0.905 39.000 0.568 1.000 N NA
 3728348 3728349 AZC_1700 AZC_1701     TRUE 0.907 23.000 0.002 1.000 Y NA
 3728349 3728350 AZC_1701 AZC_1702   lpxD TRUE 0.698 71.000 0.005 1.000 Y NA
 3728350 3728351 AZC_1702 AZC_1703 lpxD fabZ TRUE 0.992 -3.000 0.212 1.000 N NA
 3728351 3728352 AZC_1703 AZC_1704 fabZ   TRUE 0.993 -3.000 0.264 1.000 N NA
 3728352 3728353 AZC_1704 AZC_1705     TRUE 0.990 7.000 0.552 NA   NA
 3728353 3728354 AZC_1705 AZC_1706     TRUE 0.991 -3.000 0.173 NA   NA
 3728356 3728357 AZC_1708 AZC_1709     TRUE 0.908 13.000 0.069 NA   NA
 3728358 3728359 AZC_1710 AZC_1711 gltA   FALSE 0.152 115.000 0.005 1.000 N NA
 3728359 3728360 AZC_1711 AZC_1712     TRUE 0.468 75.000 0.005 0.044 N NA
 3728360 3728361 AZC_1712 AZC_1713     FALSE 0.307 134.000 0.078 NA   NA
 3728364 3728365 AZC_1716 AZC_1717     FALSE 0.271 114.000 0.000 0.001   NA
 3728365 3728366 AZC_1717 AZC_1718     FALSE 0.068 133.000 0.000 1.000   NA
 3728366 3728367 AZC_1718 AZC_1719     TRUE 0.573 214.000 0.083 1.000 Y NA
 3728369 3728370 AZC_1721 AZC_1722     FALSE 0.058 139.000 0.000 NA   NA
 3728370 3728371 AZC_1722 AZC_1723     FALSE 0.163 65.000 0.000 NA   NA
 3728372 3728373 AZC_1724 AZC_1725     FALSE 0.409 49.000 0.004 NA   NA
 3728374 3728375 AZC_1726 AZC_1727     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3728375 3728376 AZC_1727 AZC_1728     FALSE 0.365 27.000 0.000 NA   NA
 3728376 3728377 AZC_1728 AZC_1729     FALSE 0.033 283.000 0.000 1.000 N NA
 3728377 3728378 AZC_1729 AZC_1730     FALSE 0.149 69.000 0.000 NA   NA
 3728378 3728379 AZC_1730 AZC_1731     FALSE 0.296 96.000 0.029 NA   NA
 3728379 3728380 AZC_1731 AZC_1732     FALSE 0.159 115.000 0.006 1.000 N NA
 3728380 3728381 AZC_1732 AZC_1733   scpA TRUE 0.980 0.000 0.103 NA   NA
 3728381 3728382 AZC_1733 AZC_1734 scpA scpB TRUE 0.997 -3.000 0.570 NA   NA
 3728382 3728383 AZC_1734 AZC_1735 scpB   TRUE 0.962 -3.000 0.011 NA N NA
 3728383 3728384 AZC_1735 AZC_1736   tatA TRUE 0.636 70.000 0.176 1.000 N NA
 3728384 3728385 AZC_1736 AZC_1737 tatA tatB TRUE 0.879 152.000 0.353 0.006 Y NA
 3728385 3728386 AZC_1737 AZC_1738 tatB   TRUE 0.973 34.000 0.535 NA Y NA
 3728386 3728387 AZC_1738 AZC_1739     FALSE 0.226 196.000 0.065 NA N NA
 3728387 3728388 AZC_1739 AZC_1740     FALSE 0.030 402.000 0.000 1.000 N NA
 3728388 3728389 AZC_1740 AZC_1741   pdhA FALSE 0.309 159.000 0.104 1.000 N NA
 3728389 3728390 AZC_1741 AZC_1742 pdhA   TRUE 0.845 11.000 0.005 NA   NA
 3728390 3728391 AZC_1742 AZC_1743   pdhB TRUE 0.903 6.000 0.005 NA   NA
 3728391 3728392 AZC_1743 AZC_1744 pdhB pdhC TRUE 0.983 16.000 0.254 1.000 Y NA
 3728392 3728393 AZC_1744 AZC_1745 pdhC   FALSE 0.158 148.000 0.007 NA   NA
 3728393 3728394 AZC_1745 AZC_1746   lpdA FALSE 0.172 120.000 0.007 NA   NA
 3728394 3728395 AZC_1746 AZC_1747 lpdA   FALSE 0.178 146.000 0.022 1.000 N NA
 3728395 3728396 AZC_1747 AZC_1748     TRUE 0.956 5.000 0.081 NA N NA
 3728399 3728400 AZC_1751 AZC_1752     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3728400 3728401 AZC_1752 AZC_1753     FALSE 0.259 36.000 0.000 NA   NA
 3728401 3728402 AZC_1753 AZC_1754     TRUE 0.482 68.000 0.043 NA   NA
 3728403 3728404 AZC_trnP20 AZC_trnP21 trnP trnP FALSE 0.052 180.000 0.000 NA   NA
 3728404 3728405 AZC_trnP21 AZC_1755 trnP   FALSE 0.058 135.000 0.000 NA   NA
 3728406 3728407 AZC_1756 AZC_1757     FALSE 0.040 443.000 0.000 NA   NA
 3728408 3728409 AZC_1758 AZC_1759     TRUE 0.981 31.000 0.654 NA Y NA
 3728409 3728410 AZC_1759 AZC_1760     TRUE 0.998 6.000 0.758 0.088 Y NA
 3728410 3728411 AZC_1760 AZC_1761     TRUE 0.994 7.000 0.823 1.000   NA
 3728411 3728412 AZC_1761 AZC_1762     TRUE 0.763 470.000 0.731 0.041   NA
 3728412 3728413 AZC_1762 AZC_1763     TRUE 0.944 14.000 0.221 1.000 N NA
 3728413 3728414 AZC_1763 AZC_1764     TRUE 0.992 11.000 0.664 0.003 N NA
 3728414 3728415 AZC_1764 AZC_1765     TRUE 0.872 0.000 0.000 1.000   NA
 3728415 3728416 AZC_1765 AZC_1766     TRUE 0.681 11.000 0.000 1.000   NA
 3728416 3728417 AZC_1766 AZC_1767   ureE TRUE 0.906 45.000 0.315 0.001 N NA
 3728417 3728418 AZC_1767 AZC_1768 ureE ureF TRUE 0.989 22.000 0.330 0.003 Y NA
 3728418 3728419 AZC_1768 AZC_1769 ureF ureG TRUE 0.999 -3.000 0.283 0.003 Y NA
 3728419 3728420 AZC_1769 AZC_1770 ureG   FALSE 0.444 22.000 0.000 NA   NA
 3728421 3728422 AZC_1771 AZC_1772     FALSE 0.042 947.000 0.000 1.000   NA
 3728422 3728423 AZC_1772 AZC_1773     TRUE 0.787 461.000 0.220 0.001 Y NA
 3728423 3728424 AZC_1773 AZC_1774     TRUE 0.938 26.000 0.014 0.079 Y NA
 3728424 3728425 AZC_1774 AZC_1775     TRUE 0.777 229.000 0.157 0.002 Y NA
 3728429 3728430 AZC_1779 AZC_1780     FALSE 0.198 47.000 0.000 NA   NA
 3728430 3728431 AZC_1780 AZC_1781     FALSE 0.043 329.000 0.000 NA   NA
 3728434 3728435 AZC_1784 AZC_1785     TRUE 0.968 -3.000 0.005 1.000   NA
 3728435 3728436 AZC_1785 AZC_1786     TRUE 0.982 -3.000 0.048 1.000   NA
 3728437 3728438 AZC_1787 AZC_1788     FALSE 0.171 62.000 0.000 NA   NA
 3728438 3728439 AZC_1788 AZC_1789     FALSE 0.046 245.000 0.000 NA   NA
 3728440 3728441 AZC_1790 AZC_1791     TRUE 0.481 22.000 0.000 1.000   NA
 3728441 3728442 AZC_1791 AZC_1792     FALSE 0.061 123.000 0.000 NA   NA
 3728442 3728443 AZC_1792 AZC_1793     FALSE 0.187 52.000 0.000 NA   NA
 3728443 3728444 AZC_1793 AZC_1794     TRUE 0.825 13.000 0.015 1.000 N NA
 3728445 3728446 AZC_1795 AZC_1796     TRUE 0.874 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3728446 3728447 AZC_1796 AZC_1797     TRUE 0.936 22.000 0.000 0.002 Y NA
 3728447 3728448 AZC_1797 AZC_1798     FALSE 0.396 20.000 0.000 1.000 N NA
 3728448 3728449 AZC_1798 AZC_1799     TRUE 0.799 59.000 0.333 1.000 N NA
 3728449 3728450 AZC_1799 AZC_1800     TRUE 0.998 13.000 1.000 0.088 Y NA
 3728450 3728451 AZC_1800 AZC_1801     TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.088 Y NA
 3728451 3728452 AZC_1801 AZC_1802     TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.088 Y NA
 3728452 3728453 AZC_1802 AZC_1803     TRUE 0.535 101.000 0.250 NA N NA
 3728453 3728454 AZC_1803 AZC_1804     TRUE 0.823 15.000 0.019 NA   NA
 3728454 3728455 AZC_1804 AZC_1805   lysR FALSE 0.320 77.000 0.005 1.000   NA
 3728457 3728458 AZC_1807 AZC_1808 osmC   FALSE 0.034 266.000 0.000 1.000 N NA
 3728458 3728459 AZC_1808 AZC_1809     TRUE 0.970 10.000 0.000 0.043 Y NA
 3728459 3728460 AZC_1809 AZC_1810     FALSE 0.038 189.000 0.000 1.000 N NA
 3728460 3728461 AZC_1810 AZC_1811     TRUE 0.753 67.000 0.000 0.012 Y NA
 3728461 3728462 AZC_1811 AZC_1812     FALSE 0.308 107.000 0.062 1.000 N NA
 3728462 3728463 AZC_1812 AZC_1813     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3728463 3728464 AZC_1813 AZC_1814     FALSE 0.108 85.000 0.000 NA   NA
 3728464 3728465 AZC_1814 AZC_1815     FALSE 0.127 584.000 0.000 0.043   NA
 3728465 3728466 AZC_1815 AZC_1816     FALSE 0.033 165.000 0.000 NA N NA
 3728466 3728467 AZC_1816 AZC_1817     TRUE 0.650 102.000 0.365 NA   NA
 3728467 3728468 AZC_1817 AZC_1818     TRUE 0.808 104.000 0.805 NA   NA
 3728469 3728470 AZC_1819 AZC_1820     FALSE 0.074 117.000 0.000 1.000   NA
 3728470 3728471 AZC_1820 AZC_1821     TRUE 0.750 182.000 0.150 0.064 Y NA
 3728474 3728475 AZC_1824 AZC_1825     FALSE 0.301 35.000 0.000 1.000   NA
 3728476 3728477 AZC_1826 AZC_1827     TRUE 0.945 10.000 0.119 1.000 N NA
 3728478 3728479 AZC_1828 AZC_1829     FALSE 0.194 100.000 0.000 0.064 N NA
 3728479 3728480 AZC_1829 AZC_1830     FALSE 0.156 46.000 0.000 1.000 N NA
 3728480 3728481 AZC_1830 AZC_1831   oac3 FALSE 0.042 149.000 0.000 1.000 N NA
 3728481 3728482 AZC_1831 AZC_1832 oac3 oac2 TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.004 Y NA
 3728482 3728483 AZC_1832 AZC_1833 oac2 oac1 TRUE 0.996 0.000 0.068 0.004 Y NA
 3728483 3728484 AZC_1833 AZC_1834 oac1   TRUE 0.997 2.000 0.337 1.000 Y NA
 3728484 3728485 AZC_1834 AZC_1835     FALSE 0.051 195.000 0.000 NA   NA
 3728486 3728487 AZC_1836 AZC_1837     TRUE 0.898 176.000 0.600 0.088 Y NA
 3728487 3728488 AZC_1837 AZC_1838     TRUE 0.999 -3.000 0.600 0.012 Y NA
 3728488 3728489 AZC_1838 AZC_1839     TRUE 0.999 1.000 0.750 1.000 Y NA
 3728490 3728491 AZC_1840 AZC_1841     FALSE 0.328 78.000 0.000 0.011 N NA
 3728492 3728493 AZC_1842 AZC_1843     TRUE 0.968 -3.000 0.000 0.079   NA
 3728493 3728494 AZC_1843 AZC_1844   nac FALSE 0.191 63.000 0.000 1.000   NA
 3728496 3728497 AZC_1846 AZC_1847     FALSE 0.052 185.000 0.000 NA   NA
 3728497 3728498 AZC_1847 AZC_1848     TRUE 0.735 121.000 0.202 1.000 Y NA
 3728498 3728499 AZC_1848 AZC_1849     TRUE 0.954 8.000 0.112 1.000 N NA
 3728499 3728500 AZC_1849 AZC_1850     FALSE 0.035 237.000 0.000 1.000 N NA
 3728500 3728501 AZC_1850 AZC_1851   recJ FALSE 0.053 109.000 0.000 1.000 N NA
 3728502 3728503 AZC_1852 AZC_1853     TRUE 0.981 5.000 0.228 NA   NA
 3728505 3728506 AZC_1855 AZC_1856     FALSE 0.232 108.000 0.028 1.000 N NA
 3728506 3728507 AZC_1856 AZC_1857     TRUE 0.900 22.000 0.159 1.000   NA
 3728507 3728508 AZC_1857 AZC_1858     TRUE 0.996 -3.000 0.406 NA   NA
 3728508 3728509 AZC_1858 AZC_1859     TRUE 0.943 7.000 0.050 NA   NA
 3728511 3728512 AZC_1861 AZC_1862     FALSE 0.047 404.000 0.000 1.000   NA
 3728513 3728514 AZC_1863 AZC_1864 tetR   TRUE 0.550 17.000 0.000 1.000   NA
 3728516 3728517 AZC_1866 AZC_1867   trmH FALSE 0.058 140.000 0.000 NA   NA
 3728517 3728518 AZC_1867 AZC_trnM22 trmH trnM FALSE 0.049 208.000 0.000 NA   NA
 3728519 3728520 AZC_1868 AZC_1869     TRUE 0.997 -3.000 0.500 1.000   NA
 3728520 3728521 AZC_1869 AZC_1870     TRUE 0.996 11.000 0.500 0.088 Y NA
 3728521 3728522 AZC_1870 AZC_1871     TRUE 0.999 0.000 0.500 0.088 Y NA
 3728522 3728523 AZC_1871 AZC_1872     TRUE 0.745 36.000 0.000 1.000 Y NA
 3728523 3728524 AZC_1872 AZC_1873   lysR FALSE 0.045 127.000 0.000 1.000 N NA
 3728525 3728526 AZC_1874 AZC_1875     TRUE 0.987 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3728526 3728527 AZC_1875 AZC_1876   maoC TRUE 0.911 15.000 0.043 0.079 N NA
 3728527 3728528 AZC_1876 AZC_1877 maoC   TRUE 0.978 -3.000 0.043 1.000 N NA
 3728528 3728529 AZC_1877 AZC_1878     FALSE 0.043 141.000 0.000 1.000 N NA
 3728531 3728532 AZC_1880 AZC_1881     TRUE 0.995 -3.000 0.375 NA   NA
 3728532 3728533 AZC_1881 AZC_1882     TRUE 0.994 -3.000 0.308 1.000 N NA
 3728533 3728534 AZC_1882 AZC_1883     FALSE 0.361 57.000 0.000 0.079 N NA
 3728534 3728535 AZC_1883 AZC_1884     FALSE 0.152 39.000 0.000 NA N NA
 3728535 3728536 AZC_1884 AZC_1885     TRUE 0.550 74.000 0.000 NA Y NA
 3728536 3728537 AZC_1885 AZC_1886     TRUE 0.982 4.000 0.000 0.088 Y NA
 3728537 3728538 AZC_1886 AZC_1887     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.040 Y NA
 3728538 3728539 AZC_1887 AZC_1888     FALSE 0.247 31.000 0.000 1.000 N NA
 3728539 3728540 AZC_1888 AZC_1889     FALSE 0.044 538.000 0.000 1.000   NA
 3728540 3728541 AZC_1889 AZC_1890     FALSE 0.094 91.000 0.000 NA   NA
 3728541 3728542 AZC_1890 AZC_1891     TRUE 0.568 14.000 0.000 NA   NA
 3728543 3728544 AZC_1892 AZC_1893     TRUE 0.978 6.000 0.211 1.000   NA
 3728544 3728545 AZC_1893 AZC_1894     TRUE 0.634 97.000 0.158 0.063   NA
 3728545 3728546 AZC_1894 AZC_1895   lysR FALSE 0.393 176.000 0.200 1.000 N NA
 3728547 3728548 AZC_1896 AZC_1897 dctP dctM TRUE 0.999 -3.000 0.500 NA Y NA
 3728549 3728550 AZC_1898 AZC_1899     TRUE 0.833 2.000 0.000 NA   NA
 3728550 3728551 AZC_1899 AZC_1900     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3728551 3728552 AZC_1900 AZC_1901     TRUE 0.545 15.000 0.000 NA   NA
 3728552 3728553 AZC_1901 AZC_1902     FALSE 0.041 377.000 0.000 NA   NA
 3728553 3728554 AZC_1902 AZC_1903     FALSE 0.075 105.000 0.000 NA   NA
 3728554 3728555 AZC_1903 AZC_1904     TRUE 0.990 1.000 0.333 NA N NA
 3728557 3728558 AZC_1906 AZC_1907     TRUE 0.545 64.000 0.050 1.000   NA
 3728558 3728559 AZC_1907 AZC_1908     TRUE 0.619 117.000 0.375 1.000   NA
 3728559 3728560 AZC_1908 AZC_1909     TRUE 0.994 27.000 0.804 0.001 Y NA
 3728560 3728561 AZC_1909 AZC_1910     TRUE 0.947 17.000 0.141 0.079   NA
 3728563 3728564 AZC_1912 AZC_1913     TRUE 0.877 71.000 0.667 1.000   NA
 3728564 3728565 AZC_1913 AZC_1914     FALSE 0.059 130.000 0.000 NA   NA
 3728565 3728566 AZC_1914 AZC_1915     FALSE 0.042 345.000 0.000 NA   NA
 3728566 3728567 AZC_1915 AZC_1916     FALSE 0.041 396.000 0.000 NA   NA
 3728567 3728568 AZC_1916 AZC_1917     FALSE 0.330 84.000 0.021 NA   NA
 3728568 3728569 AZC_1917 AZC_1918     FALSE 0.440 134.000 0.190 1.000   NA
 3728570 3728571 AZC_1919 AZC_1920     FALSE 0.052 181.000 0.000 NA   NA
 3728571 3728572 AZC_1920 AZC_1921     FALSE 0.070 123.000 0.000 1.000   NA
 3728572 3728573 AZC_1921 AZC_1922   fhaC TRUE 0.807 4.000 0.000 NA   NA
 3728574 3728575 AZC_1923 AZC_1924     TRUE 0.946 10.000 0.000 1.000 Y NA
 3728575 3728576 AZC_1924 AZC_1925     TRUE 0.997 -3.000 0.167 1.000 Y NA
 3728576 3728577 AZC_1925 AZC_1926     TRUE 0.998 -3.000 0.167 0.012 Y NA
 3728577 3728578 AZC_1926 AZC_1927     TRUE 0.761 49.000 0.000 0.087 Y NA
 3728579 3728580 AZC_1928 AZC_1929 lysR   FALSE 0.045 272.000 0.000 NA   NA
 3728580 3728581 AZC_1929 AZC_1930     FALSE 0.115 82.000 0.000 NA   NA
 3728582 3728583 AZC_1931 AZC_1932     TRUE 0.927 36.000 0.333 0.040   NA
 3728583 3728584 AZC_1932 AZC_1933     FALSE 0.188 51.000 0.000 NA   NA
 3728584 3728585 AZC_1933 AZC_trnE23   trnE FALSE 0.081 99.000 0.000 NA   NA
 3728585 3728586 AZC_trnE23 AZC_1934 trnE   FALSE 0.040 442.000 0.000 NA   NA
 3728587 3728588 AZC_1935 AZC_1936     TRUE 0.720 165.000 0.082 0.040 Y NA
 3728588 3728589 AZC_1936 AZC_1937     TRUE 0.938 17.000 0.226 NA   NA
 3728590 3728591 AZC_1938 AZC_1939     FALSE 0.065 117.000 0.000 NA   NA
 3728592 3728593 AZC_1940 AZC_1941     TRUE 0.904 53.000 0.200 1.000 Y NA
 3728594 3728595 AZC_1942 AZC_1943     TRUE 0.992 24.000 0.914 1.000 Y NA
 3728595 3728596 AZC_1943 AZC_1944     TRUE 0.808 116.000 0.333 NA Y NA
 3728598 3728599 AZC_1946 AZC_1947     TRUE 0.581 9.000 0.000 NA N NA
 3728601 3728602 AZC_1949 AZC_1950 lysR   FALSE 0.049 115.000 0.000 1.000 N NA
 3728602 3728603 AZC_1950 AZC_1951     TRUE 0.814 107.000 0.294 1.000 Y NA
 3728603 3728604 AZC_1951 AZC_1952     TRUE 0.997 11.000 0.833 1.000 Y NA
 3728605 3728606 AZC_1953 AZC_1954     TRUE 0.947 50.000 0.424 1.000 Y NA
 3728607 3728608 AZC_1955 AZC_1956     FALSE 0.425 25.000 0.000 1.000   NA
 3728608 3728609 AZC_1956 AZC_1957     TRUE 0.998 -3.000 1.000 1.000   NA
 3728609 3728610 AZC_1957 AZC_1958     TRUE 1.000 -3.000 0.833 0.087 Y NA
 3728610 3728611 AZC_1958 AZC_1959     TRUE 1.000 -3.000 0.833 0.087 Y NA
 3728611 3728612 AZC_1959 AZC_1960     TRUE 0.591 88.000 0.222 1.000 N NA
 3728612 3728613 AZC_1960 AZC_1961     TRUE 0.992 -3.000 0.111 0.063 N NA
 3728613 3728614 AZC_1961 AZC_1962     TRUE 0.996 -3.000 0.500 1.000 N NA
 3728614 3728615 AZC_1962 AZC_1963     FALSE 0.120 308.000 0.000 0.043 N NA
 3728615 3728616 AZC_1963 AZC_1964   lysR FALSE 0.065 95.000 0.000 1.000 N NA
 3728616 3728617 AZC_1964 AZC_1965 lysR   TRUE 0.997 0.000 1.000 1.000 N NA
 3728617 3728618 AZC_1965 AZC_1966     TRUE 0.961 11.000 0.231 1.000 N NA
 3728618 3728619 AZC_1966 AZC_1967   gntR FALSE 0.034 264.000 0.000 1.000 N NA
 3728621 3728622 AZC_1969 AZC_1970     TRUE 0.998 10.000 1.000 0.087 Y NA
 3728622 3728623 AZC_1970 AZC_1971     TRUE 0.938 187.000 1.000 0.087 Y NA
 3728623 3728624 AZC_1971 AZC_1972     TRUE 0.987 23.000 0.400 0.087 Y NA
 3728627 3728628 AZC_1975 AZC_1976     TRUE 0.958 2.000 0.046 NA N NA
 3728628 3728629 AZC_1976 AZC_1977     FALSE 0.170 36.000 0.000 NA N NA
 3728629 3728630 AZC_1977 AZC_1978     TRUE 0.999 -3.000 0.400 1.000 Y NA
 3728630 3728631 AZC_1978 AZC_1979     TRUE 0.974 38.000 0.667 NA Y NA
 3728631 3728632 AZC_1979 AZC_1980     TRUE 0.983 -3.000 0.077 NA N NA
 3728632 3728633 AZC_1980 AZC_1981     FALSE 0.028 600.000 0.000 1.000 N NA
 3728634 3728635 AZC_1982 AZC_1983     TRUE 0.999 -3.000 0.388 0.006 Y NA
 3728635 3728636 AZC_1983 AZC_1984     TRUE 0.998 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 3728636 3728637 AZC_1984 AZC_1985     TRUE 0.998 2.000 0.452 0.087 Y NA
 3728637 3728638 AZC_1985 AZC_1986     TRUE 0.835 132.000 0.290 0.087 Y NA
 3728640 3728641 AZC_1988 AZC_1989     TRUE 0.996 -3.000 0.462 1.000 N NA
 3728641 3728642 AZC_1989 AZC_1990     TRUE 0.999 -3.000 0.423 0.087 Y NA
 3728642 3728643 AZC_1990 AZC_1991     TRUE 0.999 -3.000 0.308 0.087 Y NA
 3728643 3728644 AZC_1991 AZC_1992     TRUE 0.998 4.000 0.348 0.087 Y NA
 3728646 3728647 AZC_1994 AZC_1995     FALSE 0.189 119.000 0.000 0.064   NA
 3728648 3728649 AZC_1996 AZC_1997   lysR FALSE 0.044 128.000 0.000 1.000 N NA
 3728651 3728652 AZC_1999 AZC_2000     FALSE 0.050 114.000 0.000 1.000 N NA
 3728652 3728653 AZC_2000 AZC_2001   pdxJ TRUE 0.572 70.000 0.026 0.043 N NA
 3728653 3728654 AZC_2001 AZC_2002 pdxJ   TRUE 0.994 -3.000 0.326 1.000 N NA
 3728654 3728655 AZC_2002 AZC_2003     FALSE 0.237 213.000 0.070 1.000 N NA
 3728655 3728656 AZC_2003 AZC_2004     TRUE 0.981 -3.000 0.062 1.000 N NA
 3728656 3728657 AZC_2004 AZC_2005     TRUE 0.993 -3.000 0.098 0.042   NA
 3728657 3728658 AZC_2005 AZC_2006   recO TRUE 0.919 8.000 0.021 1.000   NA
 3728658 3728659 AZC_2006 AZC_2007 recO   FALSE 0.395 610.000 0.020 1.000 Y NA
 3728659 3728660 AZC_2007 AZC_2008     TRUE 0.896 5.000 0.003 1.000 N NA
 3728663 3728664 AZC_2011 AZC_2012     TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.006 Y NA
 3728664 3728665 AZC_2012 AZC_2013     TRUE 0.999 -3.000 0.625 1.000 Y NA
 3728665 3728666 AZC_2013 AZC_2014     TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.087 Y NA
 3728666 3728667 AZC_2014 AZC_2015     TRUE 0.991 16.000 0.375 0.087 Y NA
 3728667 3728668 AZC_2015 AZC_2016     FALSE 0.404 178.000 0.182 1.000   NA
 3728668 3728669 AZC_2016 AZC_2017     TRUE 0.542 42.000 0.000 0.009   NA
 3728672 3728673 AZC_2020 AZC_2021     TRUE 0.489 81.000 0.097 1.000 N NA
 3728673 3728674 AZC_2021 AZC_2022   yjgF FALSE 0.220 30.000 0.000 NA N NA
 3728674 3728675 AZC_2022 AZC_2023 yjgF   TRUE 0.970 10.000 0.286 NA N NA
 3728676 3728677 AZC_2024 AZC_2025 dadA asnC FALSE 0.312 139.000 0.100 1.000 N NA
 3728677 3728678 AZC_2025 AZC_2026 asnC   TRUE 0.816 56.000 0.316 1.000   NA
 3728678 3728679 AZC_2026 AZC_2027     TRUE 0.998 -3.000 0.900 1.000   NA
 3728679 3728680 AZC_2027 AZC_2028     TRUE 1.000 -3.000 0.900 0.087 Y NA
 3728680 3728681 AZC_2028 AZC_2029     TRUE 0.947 75.000 0.450 0.087 Y NA
 3728681 3728682 AZC_2029 AZC_2030     TRUE 0.745 84.000 0.375 1.000   NA
 3728682 3728683 AZC_2030 AZC_2031     TRUE 0.516 173.000 0.300 1.000   NA
 3728683 3728684 AZC_2031 AZC_2032     TRUE 0.940 13.000 0.150 1.000   NA
 3728685 3728686 AZC_2033 AZC_2034     TRUE 0.945 17.000 0.250 1.000   NA
 3728687 3728688 AZC_2035 AZC_2036     TRUE 0.795 42.000 0.000 0.078 Y NA
 3728688 3728689 AZC_2036 AZC_2037     TRUE 0.981 5.000 0.235 NA   NA
 3728689 3728690 AZC_2037 AZC_2038     TRUE 0.939 28.000 0.476 NA   NA
 3728692 3728693 AZC_2040 AZC_2041   lysR FALSE 0.030 200.000 0.000 NA N NA
 3728696 3728697 AZC_2044 AZC_2045     TRUE 0.874 39.000 0.412 1.000 N NA
 3728697 3728698 AZC_2045 AZC_2046     TRUE 0.955 94.000 0.800 0.087 Y NA
 3728698 3728699 AZC_2046 AZC_2047     TRUE 1.000 -3.000 0.850 0.087 Y NA
 3728699 3728700 AZC_2047 AZC_2048     TRUE 0.982 11.000 0.471 1.000   NA
 3728700 3728701 AZC_2048 AZC_2049     FALSE 0.096 90.000 0.000 NA   NA
 3728703 3728704 AZC_2051 AZC_2052 lysR   TRUE 0.498 107.000 0.200 NA   NA
 3728704 3728705 AZC_2052 AZC_2053     TRUE 0.778 22.000 0.028 NA   NA
 3728705 3728706 AZC_2053 AZC_2054     TRUE 0.586 35.000 0.018 NA   NA
 3728707 3728708 AZC_2055 AZC_2056     FALSE 0.120 80.000 0.000 NA   NA
 3728708 3728709 AZC_2056 AZC_2057     TRUE 0.990 12.000 0.196 0.087 Y NA
 3728709 3728710 AZC_2057 AZC_2058     TRUE 0.999 -3.000 0.741 1.000 Y NA
 3728711 3728712 AZC_2059 AZC_2060     TRUE 0.528 16.000 0.000 NA   NA
 3728712 3728713 AZC_2060 AZC_2061     TRUE 0.971 7.000 0.182 NA   NA
 3728713 3728714 AZC_2061 AZC_2062     TRUE 0.992 16.000 0.400 0.078 Y NA
 3728714 3728715 AZC_2062 AZC_2063   luxE TRUE 0.923 -7.000 0.000 1.000   NA
 3728715 3728716 AZC_2063 AZC_2064 luxE luxC TRUE 0.980 4.000 0.024 0.001   NA
 3728716 3728717 AZC_2064 AZC_2065 luxC   FALSE 0.072 120.000 0.000 1.000   NA
 3728717 3728718 AZC_2065 AZC_2066     TRUE 0.774 37.000 0.179 1.000 N NA
 3728718 3728719 AZC_2066 AZC_2067   lrp FALSE 0.054 107.000 0.000 1.000 N NA
 3728720 3728721 AZC_2068 AZC_2069 lysE   FALSE 0.383 111.000 0.000 1.000 Y NA
 3728721 3728722 AZC_2069 AZC_2070     TRUE 0.978 19.000 0.233 1.000 Y NA
 3728722 3728723 AZC_2070 AZC_2071     TRUE 0.999 -3.000 0.867 1.000 Y NA
 3728723 3728724 AZC_2071 AZC_2072     TRUE 0.789 91.000 0.067 0.087 Y NA
 3728726 3728727 AZC_2074 AZC_2075     TRUE 0.979 9.000 0.129 0.005   NA
 3728727 3728728 AZC_2075 AZC_2076     TRUE 0.756 34.000 0.097 NA   NA
 3728728 3728729 AZC_2076 AZC_2077     TRUE 0.933 20.000 0.250 NA   NA
 3728729 3728730 AZC_2077 AZC_2078     TRUE 0.998 -3.000 0.917 1.000   NA
 3728730 3728731 AZC_2078 AZC_2079     TRUE 0.999 0.000 1.000 0.087 Y NA
 3728731 3728732 AZC_2079 AZC_2080     TRUE 0.958 61.000 0.417 0.087 Y NA
 3728732 3728733 AZC_2080 AZC_2081     FALSE 0.047 400.000 0.000 1.000   NA
 3728733 3728734 AZC_2081 AZC_2082     FALSE 0.158 72.000 0.000 1.000   NA
 3728734 3728735 AZC_2082 AZC_2083     TRUE 0.473 20.000 0.000 NA   NA
 3728735 3728736 AZC_2083 AZC_2084     TRUE 0.981 2.000 0.154 NA   NA
 3728736 3728737 AZC_2084 AZC_2085     TRUE 0.919 16.000 0.150 NA   NA
 3728738 3728739 AZC_2086 AZC_2087 arsR   FALSE 0.043 138.000 0.000 1.000 N NA
 3728740 3728741 AZC_2088 AZC_2089     FALSE 0.261 92.000 0.000 0.063   NA
 3728741 3728742 AZC_2089 AZC_2090   deoR FALSE 0.079 112.000 0.000 1.000   NA
 3728743 3728744 AZC_2091 AZC_2092     FALSE 0.129 83.000 0.000 1.000   NA
 3728744 3728745 AZC_2092 AZC_2093     TRUE 0.995 4.000 0.124 0.087 Y NA
 3728745 3728746 AZC_2093 AZC_2094     TRUE 0.997 -3.000 0.423 0.087 N NA
 3728746 3728747 AZC_2094 AZC_2095     TRUE 0.757 51.000 0.097 0.087   NA
 3728748 3728749 AZC_2096 AZC_2097     FALSE 0.050 320.000 0.000 1.000   NA
 3728750 3728751 AZC_2098 AZC_2099     TRUE 0.998 12.000 0.915 0.010 Y NA
 3728751 3728752 AZC_2099 AZC_2100     TRUE 1.000 -3.000 0.847 0.063 Y NA
 3728752 3728753 AZC_2100 AZC_2101     TRUE 1.000 -3.000 0.906 0.063 Y NA
 3728753 3728754 AZC_2101 AZC_2102   surF1 TRUE 0.998 -3.000 0.849 NA   NA
 3728754 3728755 AZC_2102 AZC_2103 surF1   TRUE 0.946 13.000 0.188 NA   NA
 3728755 3728756 AZC_2103 AZC_2104   fis TRUE 0.999 -49.000 0.682 1.000 Y NA
 3728758 3728759 AZC_2106 AZC_2107     TRUE 0.999 0.000 0.449 0.001 Y NA
 3728759 3728760 AZC_2107 AZC_2108   gntR FALSE 0.070 91.000 0.000 1.000 N NA
 3728760 3728761 AZC_2108 AZC_2109 gntR   TRUE 0.995 -3.000 0.364 1.000 N NA
 3728761 3728762 AZC_2109 AZC_2110     TRUE 0.919 79.000 0.455 1.000 Y NA
 3728762 3728763 AZC_2110 AZC_2111     TRUE 0.999 0.000 0.571 0.087 Y NA
 3728763 3728764 AZC_2111 AZC_2112     TRUE 0.999 -3.000 0.643 1.000 Y NA
 3728764 3728765 AZC_2112 AZC_2113     TRUE 0.999 -7.000 0.533 0.040 Y NA
 3728765 3728766 AZC_2113 AZC_2114     TRUE 0.980 2.000 0.133 1.000   NA
 3728766 3728767 AZC_2114 AZC_2115     TRUE 0.518 86.000 0.111 1.000   NA
 3728767 3728768 AZC_2115 AZC_2116     TRUE 0.996 -3.000 0.278 0.043 N NA
 3728768 3728769 AZC_2116 AZC_2117     TRUE 1.000 -3.000 0.933 0.002 Y NA
 3728769 3728770 AZC_2117 AZC_2118     TRUE 0.999 -3.000 0.737 1.000 Y NA
 3728772 3728773 AZC_2120 AZC_2121     TRUE 0.725 8.000 0.000 NA   NA
 3728773 3728774 AZC_2121 AZC_2122     FALSE 0.038 601.000 0.000 NA   NA
 3728774 3728775 AZC_2122 AZC_2123     TRUE 0.476 87.000 0.000 NA Y NA
 3728777 3728778 AZC_2125 AZC_2126 nlp   TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3728778 3728779 AZC_2126 AZC_2127     FALSE 0.280 34.000 0.000 NA   NA
 3728779 3728780 AZC_2127 AZC_2128     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3728780 3728781 AZC_2128 AZC_2129     FALSE 0.439 24.000 0.000 1.000   NA
 3728781 3728782 AZC_2129 AZC_2130     TRUE 0.986 2.000 0.222 NA   NA
 3728782 3728783 AZC_2130 AZC_2131     TRUE 0.994 -3.000 0.308 NA   NA
 3728783 3728784 AZC_2131 AZC_2132   dnaA FALSE 0.043 326.000 0.000 NA   NA
 3728784 3728785 AZC_2132 AZC_2133 dnaA   TRUE 0.647 11.000 0.000 NA   NA
 3728785 3728786 AZC_2133 AZC_2134     FALSE 0.051 190.000 0.000 NA   NA
 3728786 3728787 AZC_2134 AZC_2135     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3728789 3728790 AZC_2137 AZC_2138     TRUE 0.855 0.000 0.000 NA   NA
 3728790 3728791 AZC_2138 AZC_2139     TRUE 0.807 4.000 0.000 NA   NA
 3728791 3728792 AZC_2139 AZC_2140     TRUE 0.991 -3.000 0.194 NA   NA
 3728792 3728793 AZC_2140 AZC_2141     TRUE 0.993 -3.000 0.250 NA   NA
 3728793 3728794 AZC_2141 AZC_2142     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3728794 3728795 AZC_2142 AZC_2143     TRUE 0.991 -3.000 0.190 NA   NA
 3728795 3728796 AZC_2143 AZC_2144     TRUE 0.965 5.000 0.095 NA   NA
 3728796 3728797 AZC_2144 AZC_2145     FALSE 0.052 181.000 0.000 NA   NA
 3728797 3728798 AZC_2145 AZC_2146     FALSE 0.053 175.000 0.000 NA   NA
 3728798 3728799 AZC_2146 AZC_2147     FALSE 0.044 298.000 0.000 NA   NA
 3728799 3728800 AZC_2147 AZC_2148     TRUE 0.810 25.000 0.069 NA   NA
 3728800 3728801 AZC_2148 AZC_2149     TRUE 0.770 33.000 0.103 NA   NA
 3728801 3728802 AZC_2149 AZC_2150     TRUE 0.704 9.000 0.000 NA   NA
 3728802 3728803 AZC_2150 AZC_2151     FALSE 0.074 106.000 0.000 NA   NA
 3728803 3728804 AZC_2151 AZC_2152     TRUE 0.995 -3.000 0.317 NA   NA
 3728804 3728805 AZC_2152 AZC_2153     TRUE 0.987 -3.000 0.100 NA   NA
 3728805 3728806 AZC_2153 AZC_2154     TRUE 0.996 -3.000 0.429 NA   NA
 3728806 3728807 AZC_2154 AZC_2155     TRUE 0.976 9.000 0.286 NA   NA
 3728807 3728808 AZC_2155 AZC_2156     TRUE 0.930 26.000 0.364 NA   NA
 3728808 3728809 AZC_2156 AZC_2157     TRUE 0.991 -3.000 0.182 NA   NA
 3728809 3728810 AZC_2157 AZC_2158   gpI TRUE 0.988 -3.000 0.125 NA   NA
 3728810 3728811 AZC_2158 AZC_2159 gpI   TRUE 0.946 12.000 0.167 NA   NA
 3728811 3728812 AZC_2159 AZC_2160     FALSE 0.053 175.000 0.000 NA   NA
 3728812 3728813 AZC_2160 AZC_2161     TRUE 0.647 11.000 0.000 NA   NA
 3728813 3728814 AZC_2161 AZC_2162     FALSE 0.036 1751.000 0.000 NA   NA
 3728814 3728815 AZC_2162 AZC_2163     TRUE 0.894 23.000 0.182 NA   NA
 3728815 3728816 AZC_2163 AZC_2164     TRUE 0.987 11.000 0.667 NA   NA
 3728816 3728817 AZC_2164 AZC_2165     FALSE 0.055 163.000 0.000 NA   NA
 3728817 3728818 AZC_2165 AZC_2166     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3728818 3728819 AZC_2166 AZC_2167     FALSE 0.049 213.000 0.000 NA   NA
 3728819 3728820 AZC_2167 AZC_2168     FALSE 0.444 22.000 0.000 NA   NA
 3728820 3728821 AZC_2168 AZC_2169     FALSE 0.153 68.000 0.000 NA   NA
 3728822 3728823 AZC_2170 AZC_trnS24   trnS FALSE 0.051 190.000 0.000 NA   NA
 3728824 3728825 AZC_2171 AZC_2172   dacC TRUE 0.949 30.000 0.198 NA Y NA
 3728825 3728826 AZC_2172 AZC_2173 dacC   TRUE 0.874 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3728826 3728827 AZC_2173 AZC_2174     TRUE 0.450 16.000 0.000 1.000 N NA
 3728827 3728828 AZC_2174 AZC_2175     TRUE 0.740 31.000 0.075 1.000 N NA
 3728829 3728830 AZC_2176 AZC_2177   bioY FALSE 0.068 113.000 0.000 NA   NA
 3728831 3728832 AZC_2178 AZC_2179 tatD   FALSE 0.400 51.000 0.004 NA   NA
 3728832 3728833 AZC_2179 AZC_2180     FALSE 0.224 170.000 0.040 NA   NA
 3728835 3728836 AZC_2182 AZC_2183 lrgA lrgB TRUE 0.995 5.000 0.840 NA   NA
 3728839 3728840 AZC_2186 AZC_2187 mrp   FALSE 0.063 87.000 0.000 NA N NA
 3728841 3728842 AZC_2188 AZC_2189     FALSE 0.422 68.000 0.022 NA   NA
 3728842 3728843 AZC_2189 AZC_2190     FALSE 0.135 193.000 0.002 1.000   NA
 3728843 3728844 AZC_2190 AZC_2191     TRUE 0.997 3.000 0.231 0.011 Y NA
 3728844 3728845 AZC_2191 AZC_2192     FALSE 0.421 23.000 0.000 NA   NA
 3728846 3728847 AZC_2193 AZC_2194     FALSE 0.050 204.000 0.000 NA   NA
 3728850 3728851 AZC_trnK25 AZC_2197 trnK   FALSE 0.041 388.000 0.000 NA   NA
 3728852 3728853 AZC_2198 AZC_2199     TRUE 0.959 -3.000 0.004 1.000 N NA
 3728855 3728856 AZC_2201 AZC_2202 lexA   TRUE 0.455 138.000 0.232 1.000 N NA
 3728856 3728857 AZC_2202 AZC_2203   moaC TRUE 0.998 -3.000 0.093 0.003 Y NA
 3728857 3728858 AZC_2203 AZC_2204 moaC   TRUE 0.943 0.000 0.003 NA   NA
 3728858 3728859 AZC_2204 AZC_2205     FALSE 0.357 67.000 0.005 NA   NA
 3728859 3728860 AZC_2205 AZC_2206     TRUE 0.998 -3.000 0.293 1.000 Y NA
 3728860 3728861 AZC_2206 AZC_2207     TRUE 0.983 5.000 0.019 1.000 Y NA
 3728861 3728862 AZC_2207 AZC_2208     TRUE 0.704 144.000 0.026 0.000 Y NA
 3728862 3728863 AZC_2208 AZC_2209     TRUE 0.842 12.000 0.006 1.000   NA
 3728864 3728865 AZC_2210 AZC_2211   lacY FALSE 0.212 51.000 0.000 1.000   NA
 3728867 3728868 AZC_2213 AZC_2214     TRUE 0.997 8.000 0.667 NA Y NA
 3728868 3728869 AZC_2214 AZC_2215     TRUE 0.996 14.000 1.000 NA Y NA
 3728869 3728870 AZC_2215 AZC_2216     TRUE 0.907 7.000 0.011 NA   NA
 3728871 3728872 AZC_2217 AZC_2218     FALSE 0.053 177.000 0.000 NA   NA
 3728873 3728874 AZC_2219 AZC_2220     TRUE 0.847 -3.000 0.000 NA N NA
 3728876 3728877 AZC_2222 AZC_2223     TRUE 0.586 90.000 0.002 1.000 Y NA
 3728877 3728878 AZC_2223 AZC_2224     FALSE 0.034 249.000 0.000 1.000 N NA
 3728879 3728880 AZC_2225 AZC_2226 mgtC   FALSE 0.051 188.000 0.000 NA   NA
 3728880 3728881 AZC_2226 AZC_2227     FALSE 0.069 111.000 0.000 NA   NA
 3728882 3728883 AZC_2228 AZC_2229   purS TRUE 0.821 180.000 0.460 1.000 Y NA
 3728883 3728884 AZC_2229 AZC_2230 purS   TRUE 0.916 295.000 0.656 0.001 Y NA
 3728884 3728885 AZC_2230 AZC_2231     TRUE 0.959 68.000 0.346 0.001 Y NA
 3728885 3728886 AZC_2231 AZC_2232   bolA TRUE 0.593 57.000 0.093 NA N NA
 3728886 3728887 AZC_2232 AZC_2233 bolA   FALSE 0.213 43.000 0.000 NA   NA
 3728887 3728888 AZC_2233 AZC_2234     FALSE 0.389 28.000 0.000 1.000   NA
 3728889 3728890 AZC_2235 AZC_2236   relB TRUE 0.865 36.000 0.306 NA   NA
 3728890 3728891 AZC_2236 AZC_2237 relB   FALSE 0.066 115.000 0.000 NA   NA
 3728891 3728892 AZC_2237 AZC_2238     FALSE 0.083 97.000 0.000 NA   NA
 3728893 3728894 AZC_2239 AZC_2240     TRUE 0.989 -3.000 0.129 1.000   NA
 3728894 3728895 AZC_2240 AZC_2241     TRUE 0.815 93.000 0.674 1.000   NA
 3728898 3728899 AZC_2244 AZC_2245     TRUE 0.971 14.000 0.017 0.085 Y NA
 3728899 3728900 AZC_2245 AZC_2246     FALSE 0.291 236.000 0.000 1.000 Y NA
 3728900 3728901 AZC_2246 AZC_2247     FALSE 0.222 121.000 0.026 NA   NA
 3728901 3728902 AZC_2247 AZC_2248     FALSE 0.045 275.000 0.000 NA   NA
 3728903 3728904 AZC_2249 AZC_2250     FALSE 0.050 203.000 0.000 NA   NA
 3728904 3728905 AZC_2250 AZC_2251     FALSE 0.419 55.000 0.008 NA   NA
 3728905 3728906 AZC_2251 AZC_2252     TRUE 0.991 14.000 0.205 0.001 Y NA
 3728906 3728907 AZC_2252 AZC_2253     TRUE 0.789 46.000 0.009 1.000 Y NA
 3728907 3728908 AZC_2253 AZC_2254   rfaE TRUE 0.990 13.000 0.191 0.012 Y NA
 3728910 3728911 AZC_2256 AZC_2257     TRUE 0.994 -3.000 0.033 1.000 Y NA
 3728911 3728912 AZC_2257 AZC_2258   cobQ TRUE 0.965 27.000 0.078 0.006 Y NA
 3728914 3728915 AZC_2260 AZC_2261     FALSE 0.337 146.000 0.000 1.000 Y NA
 3728915 3728916 AZC_2261 AZC_2262     FALSE 0.039 502.000 0.000 NA   NA
 3728916 3728917 AZC_2262 AZC_2263     FALSE 0.067 114.000 0.000 NA   NA
 3728919 3728920 AZC_2265 AZC_2266     TRUE 0.528 16.000 0.000 NA   NA
 3728921 3728922 AZC_2267 AZC_2268     FALSE 0.047 120.000 0.000 1.000 N NA
 3728922 3728923 AZC_2268 AZC_2269     TRUE 0.565 77.000 0.143 1.000 N NA
 3728923 3728924 AZC_2269 AZC_2270     TRUE 0.997 0.000 0.143 0.077 Y NA
 3728924 3728925 AZC_2270 AZC_2271     TRUE 0.903 16.000 0.030 0.042 N NA
 3728925 3728926 AZC_2271 AZC_2272     TRUE 0.811 0.000 0.000 1.000 N NA
 3728927 3728928 AZC_2273 AZC_2274 iclR   FALSE 0.061 123.000 0.000 NA   NA
 3728928 3728929 AZC_2274 AZC_2275     TRUE 0.915 21.000 0.200 NA   NA
 3728929 3728930 AZC_2275 AZC_2276     TRUE 0.987 -3.000 0.113 1.000 N NA
 3728930 3728931 AZC_2276 AZC_2277     TRUE 0.997 -3.000 0.189 1.000 Y NA
 3728931 3728932 AZC_2277 AZC_2278     TRUE 1.000 -3.000 0.973 0.085 Y NA
 3728934 3728935 AZC_2280 AZC_2281 ntrB nodW TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.021 Y NA
 3728935 3728936 AZC_2281 AZC_2282 nodW   TRUE 0.561 105.000 0.000 0.017 Y NA
 3728936 3728937 AZC_2282 AZC_2283     FALSE 0.041 375.000 0.000 NA   NA
 3728937 3728938 AZC_2283 AZC_2284     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3728938 3728939 AZC_2284 AZC_2285     FALSE 0.078 113.000 0.000 1.000   NA
 3728939 3728940 AZC_2285 AZC_2286     FALSE 0.052 284.000 0.000 1.000   NA
 3728941 3728942 AZC_2287 AZC_2288     TRUE 0.911 10.000 0.036 NA   NA
 3728945 3728946 AZC_2290 AZC_2291 nptA   FALSE 0.044 292.000 0.000 NA   NA
 3728947 3728948 AZC_2292 AZC_2293 merR   TRUE 0.743 16.000 0.005 1.000 N NA
 3728948 3728949 AZC_2293 AZC_2294     TRUE 0.501 103.000 0.207 1.000 N NA
 3728949 3728950 AZC_2294 AZC_2295   plsX TRUE 0.999 -3.000 0.380 0.004 Y NA
 3728950 3728951 AZC_2295 AZC_2296 plsX   FALSE 0.321 98.000 0.044 NA   NA
 3728951 3728952 AZC_2296 AZC_2297     TRUE 0.985 -3.000 0.071 NA   NA
 3728954 3728955 AZC_2299 AZC_2300     TRUE 0.973 -3.000 0.027 1.000 N NA
 3728955 3728956 AZC_2300 AZC_2301     TRUE 0.990 0.000 0.250 1.000   NA
 3728958 3728959 AZC_2303 AZC_2304     FALSE 0.050 196.000 0.000 NA   NA
 3728959 3728960 AZC_2304 AZC_2305     FALSE 0.043 329.000 0.000 NA   NA
 3728960 3728961 AZC_2305 AZC_2306     FALSE 0.043 145.000 0.000 1.000 N NA
 3728961 3728962 AZC_2306 AZC_2307     FALSE 0.043 145.000 0.000 1.000 N NA
 3728962 3728963 AZC_2307 AZC_2308     TRUE 0.967 61.000 0.360 0.000 Y NA
 3728963 3728964 AZC_2308 AZC_2309   exoD FALSE 0.260 83.000 0.002 NA   NA
 3728964 3728965 AZC_2309 AZC_2310 exoD   FALSE 0.405 98.000 0.091 NA   NA
 3728966 3728967 AZC_2311 AZC_2312 groES   TRUE 0.949 54.000 0.222 0.006 Y NA
 3728967 3728968 AZC_2312 AZC_2313     FALSE 0.043 309.000 0.000 NA   NA
 3728969 3728970 AZC_2314 AZC_2315     FALSE 0.310 31.000 0.000 NA   NA
 3728970 3728971 AZC_2315 AZC_2316     FALSE 0.161 141.000 0.007 NA   NA
 3728971 3728972 AZC_2316 AZC_2317     TRUE 0.822 13.000 0.007 NA   NA
 3728973 3728974 AZC_2318 AZC_2319     TRUE 0.992 6.000 0.696 NA N NA
 3728974 3728975 AZC_2319 AZC_2320     FALSE 0.402 24.000 0.000 NA   NA
 3728975 3728976 AZC_2320 AZC_2321     FALSE 0.153 68.000 0.000 NA   NA
 3728976 3728977 AZC_2321 AZC_2322     FALSE 0.231 96.000 0.008 NA   NA
 3728977 3728978 AZC_2322 AZC_2323     FALSE 0.115 56.000 0.000 NA N NA
 3728979 3728980 AZC_2324 AZC_2325     TRUE 0.969 31.000 0.160 0.002 Y NA
 3728980 3728981 AZC_2325 AZC_2326     FALSE 0.426 66.000 0.027 1.000 N NA
 3728981 3728982 AZC_2326 AZC_2327     FALSE 0.380 45.000 0.002 1.000 N NA
 3728982 3728983 AZC_2327 AZC_2328     TRUE 0.906 4.000 0.002 1.000 N NA
 3728983 3728984 AZC_2328 AZC_2329     FALSE 0.127 190.000 0.002 NA   NA
 3728984 3728985 AZC_2329 AZC_2330     TRUE 0.473 20.000 0.000 NA   NA
 3728991 3728992 AZC_2336 AZC_2337 iclR   TRUE 0.874 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3728993 3728994 AZC_2338 AZC_2339     FALSE 0.035 130.000 0.000 NA N NA
 3728994 3728995 AZC_2339 AZC_2340     TRUE 0.859 30.000 0.200 NA   NA
 3728995 3728996 AZC_2340 AZC_2341     TRUE 0.990 -3.000 0.150 NA   NA
 3728996 3728997 AZC_2341 AZC_2342     TRUE 0.757 6.000 0.000 NA   NA
 3728997 3728998 AZC_2342 AZC_2343     TRUE 0.461 21.000 0.000 NA   NA
 3728998 3728999 AZC_2343 AZC_2344     FALSE 0.079 100.000 0.000 NA   NA
 3729000 3729001 AZC_2345 AZC_2346 tetR   FALSE 0.086 72.000 0.000 NA N NA
 3729001 3729002 AZC_2346 AZC_2347     TRUE 0.993 2.000 0.476 NA   NA
 3729002 3729003 AZC_2347 AZC_2348     FALSE 0.238 208.000 0.050 1.000   NA
 3729003 3729004 AZC_2348 AZC_2349     TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3729004 3729005 AZC_2349 AZC_2350     TRUE 0.754 8.000 0.000 1.000   NA
 3729005 3729006 AZC_2350 AZC_2351     TRUE 0.945 49.000 0.417 NA Y NA
 3729006 3729007 AZC_2351 AZC_2352     TRUE 0.976 25.000 0.357 NA Y NA
 3729007 3729008 AZC_2352 AZC_2353   lysR FALSE 0.032 308.000 0.000 1.000 N NA
 3729008 3729009 AZC_2353 AZC_2354 lysR   FALSE 0.060 99.000 0.000 1.000 N NA
 3729009 3729010 AZC_2354 AZC_2355     TRUE 0.999 0.000 0.818 0.002 Y NA
 3729012 3729013 AZC_2357 AZC_2358     TRUE 0.449 83.000 0.065 NA   NA
 3729014 3729015 AZC_2359 AZC_trnV27   trnV FALSE 0.075 104.000 0.000 NA   NA
 3729015 3729016 AZC_trnV27 AZC_2360 trnV   FALSE 0.096 90.000 0.000 NA   NA
 3729017 3729018 AZC_2361 AZC_2362     TRUE 0.990 21.000 0.412 0.085 Y NA
 3729018 3729019 AZC_2362 AZC_2363     TRUE 0.999 -3.000 0.706 1.000 Y NA
 3729021 3729022 AZC_2365 AZC_2366     TRUE 0.928 27.000 0.055 1.000 Y NA
 3729023 3729024 AZC_2367 AZC_2368 dedA   FALSE 0.040 440.000 0.000 NA   NA
 3729024 3729025 AZC_2368 AZC_2369     TRUE 0.972 75.000 0.627 0.001 Y NA
 3729025 3729026 AZC_2369 AZC_2370   modC TRUE 0.999 -3.000 0.537 0.001 Y NA
 3729027 3729028 AZC_2371 AZC_2372 lysR   FALSE 0.128 76.000 0.000 NA   NA
 3729028 3729029 AZC_2372 AZC_2373     TRUE 0.978 6.000 0.231 NA   NA
 3729029 3729030 AZC_2373 AZC_2374     FALSE 0.033 293.000 0.000 1.000 N NA
 3729030 3729031 AZC_2374 AZC_2375     TRUE 0.901 48.000 0.026 0.001 Y NA
 3729031 3729032 AZC_2375 AZC_2376     TRUE 0.908 78.000 0.146 0.001 Y NA
 3729033 3729034 AZC_2377 AZC_2378     TRUE 0.884 8.000 0.004 NA   NA
 3729034 3729035 AZC_2378 AZC_2379     FALSE 0.357 56.000 0.004 1.000 N NA
 3729035 3729036 AZC_2379 AZC_2380     TRUE 0.924 34.000 0.515 NA   NA
 3729036 3729037 AZC_2380 AZC_2381     TRUE 0.914 20.000 0.185 NA   NA
 3729037 3729038 AZC_2381 AZC_2382     TRUE 0.991 -3.000 0.197 NA   NA
 3729038 3729039 AZC_2382 AZC_2383     TRUE 0.995 -3.000 0.037 1.000 Y NA
 3729040 3729041 AZC_2384 AZC_2385     FALSE 0.395 68.000 0.015 NA   NA
 3729042 3729043 AZC_2386 AZC_2387     FALSE 0.177 122.000 0.006 1.000   NA
 3729044 3729045 AZC_2388 AZC_2389     FALSE 0.059 134.000 0.000 NA   NA
 3729046 3729047 AZC_2390 AZC_2391     TRUE 0.964 4.000 0.079 1.000 N NA
 3729048 3729049 AZC_2392 AZC_2393 mscS   FALSE 0.046 103.000 0.000 NA N NA
 3729049 3729050 AZC_2393 AZC_2394     FALSE 0.047 120.000 0.000 1.000 N NA
 3729050 3729051 AZC_2394 AZC_2395     FALSE 0.300 67.000 0.002 1.000 N NA
 3729052 3729053 AZC_2396 AZC_2397     FALSE 0.389 25.000 0.000 NA   NA
 3729055 3729056 AZC_2399 AZC_2400     TRUE 0.969 0.000 0.038 1.000   NA
 3729058 3729059 AZC_2402 AZC_2403     FALSE 0.316 179.000 0.000 1.000 Y NA
 3729059 3729060 AZC_2403 AZC_2404     TRUE 0.824 118.000 0.394 NA Y NA
 3729060 3729061 AZC_2404 AZC_2405     TRUE 0.999 -7.000 0.490 NA Y NA
 3729061 3729062 AZC_2405 AZC_2406     TRUE 0.936 159.000 0.784 0.015 Y NA
 3729062 3729063 AZC_2406 AZC_2407     TRUE 0.997 -3.000 0.143 1.000 Y NA
 3729063 3729064 AZC_2407 AZC_2408     TRUE 0.895 18.000 0.038 0.061 N NA
 3729064 3729065 AZC_2408 AZC_2409     TRUE 0.911 23.000 0.248 1.000 N NA
 3729065 3729066 AZC_2409 AZC_2410     FALSE 0.099 75.000 0.000 1.000 N NA
 3729066 3729067 AZC_2410 AZC_2411     TRUE 0.711 40.000 0.000 1.000 Y NA
 3729067 3729068 AZC_2411 AZC_2412     TRUE 0.462 214.000 0.000 0.009 Y NA
 3729068 3729069 AZC_2412 AZC_2413     FALSE 0.083 84.000 0.000 1.000 N NA
 3729069 3729070 AZC_2413 AZC_2414     TRUE 0.998 3.000 0.201 0.000 Y NA
 3729072 3729073 AZC_2416 AZC_2417     TRUE 0.756 100.000 0.176 NA Y NA
 3729073 3729074 AZC_2417 AZC_2418     TRUE 0.998 4.000 0.824 NA Y NA
 3729074 3729075 AZC_2418 AZC_2419     FALSE 0.037 881.000 0.000 NA   NA
 3729075 3729076 AZC_2419 AZC_2420     FALSE 0.055 163.000 0.000 NA   NA
 3729076 3729077 AZC_2420 AZC_2421     TRUE 0.987 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3729078 3729079 AZC_2422 AZC_2423     FALSE 0.063 119.000 0.000 NA   NA
 3729079 3729080 AZC_2423 AZC_2424     FALSE 0.389 25.000 0.000 NA   NA
 3729080 3729081 AZC_2424 AZC_2425     FALSE 0.027 283.000 0.000 NA N NA
 3729081 3729082 AZC_2425 AZC_2426   hlyD TRUE 0.991 -3.000 0.222 NA N NA
 3729083 3729084 AZC_2427 AZC_2428     FALSE 0.039 504.000 0.000 NA   NA
 3729084 3729085 AZC_2428 AZC_2429     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3729085 3729086 AZC_2429 AZC_2430     TRUE 0.987 -3.000 0.125 NA N NA
 3729086 3729087 AZC_2430 AZC_2431     TRUE 0.987 -3.000 0.000 NA Y NA
 3729090 3729091 AZC_2434 AZC_2435   chrR TRUE 0.619 32.000 0.019 NA   NA
 3729092 3729093 AZC_2436 AZC_2437     TRUE 0.998 -3.000 0.722 NA   NA
 3729093 3729094 AZC_2437 AZC_2438     TRUE 0.938 16.000 0.213 NA   NA
 3729095 3729096 AZC_2439 AZC_2440     TRUE 0.596 13.000 0.000 NA   NA
 3729096 3729097 AZC_2440 AZC_2441     TRUE 0.994 4.000 0.667 NA   NA
 3729097 3729098 AZC_2441 AZC_2442     TRUE 0.921 18.000 0.182 NA   NA
 3729098 3729099 AZC_2442 AZC_2443     TRUE 0.643 70.000 0.182 1.000 N NA
 3729099 3729100 AZC_2443 AZC_2444   gntR TRUE 0.915 69.000 1.000 1.000 N NA
 3729101 3729102 AZC_2445 AZC_2446     TRUE 0.954 0.000 0.022 1.000 N NA
 3729102 3729103 AZC_2446 AZC_2447     TRUE 0.632 29.000 0.022 NA N NA
 3729103 3729104 AZC_2447 AZC_2448     FALSE 0.275 257.000 0.000 NA Y NA
 3729104 3729105 AZC_2448 AZC_2449     TRUE 1.000 -3.000 0.855 0.084 Y NA
 3729105 3729106 AZC_2449 AZC_2450     TRUE 0.933 5.000 0.034 NA N NA
 3729108 3729109 AZC_2452 AZC_2453     FALSE 0.149 69.000 0.000 NA   NA
 3729110 3729111 AZC_2454 AZC_2455 gntR   FALSE 0.139 56.000 0.000 1.000 N NA
 3729111 3729112 AZC_2455 AZC_2456     TRUE 0.999 0.000 0.667 0.084 Y NA
 3729112 3729113 AZC_2456 AZC_2457     TRUE 0.996 14.000 0.667 0.084 Y NA
 3729113 3729114 AZC_2457 AZC_2458     FALSE 0.427 87.000 0.059 1.000   NA
 3729114 3729115 AZC_2458 AZC_2459     TRUE 0.950 38.000 0.868 1.000   NA
 3729115 3729116 AZC_2459 AZC_2460     TRUE 0.837 50.000 0.053 1.000 Y NA
 3729116 3729117 AZC_2460 AZC_2461     TRUE 0.990 29.000 0.714 0.084 Y NA
 3729117 3729118 AZC_2461 AZC_2462     TRUE 0.998 0.000 0.286 0.084 Y NA
 3729118 3729119 AZC_2462 AZC_2463     TRUE 0.996 9.000 0.333 0.084 Y NA
 3729119 3729120 AZC_2463 AZC_2464     TRUE 0.693 30.000 0.043 1.000 N NA
 3729122 3729123 AZC_2466 AZC_2467     FALSE 0.052 110.000 0.000 1.000 N NA
 3729123 3729124 AZC_2467 AZC_2468     TRUE 0.960 -3.000 0.005 1.000 N NA
 3729124 3729125 AZC_2468 AZC_2469     FALSE 0.042 149.000 0.000 1.000 N NA
 3729125 3729126 AZC_2469 AZC_2470     TRUE 0.999 -3.000 0.750 0.084 Y NA
 3729126 3729127 AZC_2470 AZC_2471     TRUE 0.984 11.000 0.143 1.000 Y NA
 3729127 3729128 AZC_2471 AZC_2472     TRUE 0.997 -3.000 0.143 1.000 Y NA
 3729129 3729130 AZC_2473 AZC_2474 marR   FALSE 0.043 138.000 0.000 1.000 N NA
 3729130 3729131 AZC_2474 AZC_2475     TRUE 0.929 32.000 0.556 1.000 N NA
 3729131 3729132 AZC_2475 AZC_2476     TRUE 0.921 95.000 0.667 1.000 Y NA
 3729132 3729133 AZC_2476 AZC_2477     TRUE 0.994 2.000 0.600 1.000 N NA
 3729133 3729134 AZC_2477 AZC_2478     TRUE 0.918 33.000 0.500 1.000 N NA
 3729134 3729135 AZC_2478 AZC_2479   iclR TRUE 0.945 23.000 0.429 1.000 N NA
 3729136 3729137 AZC_2480 AZC_2481     FALSE 0.169 63.000 0.000 NA   NA
 3729137 3729138 AZC_2481 AZC_2482     FALSE 0.140 79.000 0.000 1.000   NA
 3729138 3729139 AZC_2482 AZC_2483   gntR FALSE 0.196 61.000 0.000 1.000   NA
 3729140 3729141 AZC_2484 AZC_2485     TRUE 0.860 69.000 0.156 1.000 Y NA
 3729141 3729142 AZC_2485 AZC_2486     TRUE 0.989 8.000 0.156 1.000 Y NA
 3729142 3729143 AZC_2486 AZC_2487     TRUE 0.999 0.000 0.455 0.011 Y NA
 3729143 3729144 AZC_2487 AZC_2488     TRUE 0.881 61.000 0.571 1.000   NA
 3729144 3729145 AZC_2488 AZC_2489     TRUE 0.989 5.000 0.429 1.000   NA
 3729146 3729147 AZC_2490 AZC_2491     FALSE 0.148 49.000 0.000 1.000 N NA
 3729148 3729149 AZC_2492 AZC_2493 tauA   FALSE 0.183 39.000 0.000 1.000 N NA
 3729149 3729150 AZC_2493 AZC_2494     TRUE 0.985 7.000 0.442 NA N NA
 3729150 3729151 AZC_2494 AZC_2495     TRUE 0.710 4.000 0.000 NA N NA
 3729151 3729152 AZC_2495 AZC_2496     FALSE 0.290 36.000 0.000 1.000   NA
 3729152 3729153 AZC_2496 AZC_2497     TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3729153 3729154 AZC_2497 AZC_2498   lysR FALSE 0.148 49.000 0.000 1.000 N NA
 3729154 3729155 AZC_2498 AZC_2499 lysR   FALSE 0.068 93.000 0.000 1.000 N NA
 3729155 3729156 AZC_2499 AZC_2500   caiB TRUE 0.874 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3729156 3729157 AZC_2500 AZC_2501 caiB   TRUE 0.998 -3.000 0.667 0.041 N NA
 3729157 3729158 AZC_2501 AZC_2502     TRUE 0.964 31.000 0.667 0.075 N NA
 3729158 3729159 AZC_2502 AZC_2503     TRUE 0.946 137.000 1.000 0.084 Y NA
 3729159 3729160 AZC_2503 AZC_2504     TRUE 0.996 8.000 0.500 1.000 Y NA
 3729160 3729161 AZC_2504 AZC_2505     TRUE 0.798 35.000 0.182 1.000 N NA
 3729161 3729162 AZC_2505 AZC_2506     TRUE 0.978 4.000 0.182 1.000 N NA
 3729162 3729163 AZC_2506 AZC_2507     FALSE 0.147 40.000 0.000 NA N NA
 3729164 3729165 AZC_2508 AZC_2509     TRUE 0.930 17.000 0.200 NA   NA
 3729165 3729166 AZC_2509 AZC_2510   gntT FALSE 0.044 128.000 0.000 1.000 N NA
 3729166 3729167 AZC_2510 AZC_2511 gntT   FALSE 0.264 383.000 0.000 1.000 Y NA
 3729168 3729169 AZC_2512 AZC_2513     FALSE 0.038 189.000 0.000 1.000 N NA
 3729172 3729173 AZC_2516 AZC_2517     TRUE 0.534 118.000 0.000 0.009 Y NA
 3729173 3729174 AZC_2517 AZC_2518   tfoX FALSE 0.032 177.000 0.000 NA N NA
 3729174 3729175 AZC_2518 AZC_2519 tfoX   TRUE 0.690 22.000 0.012 NA N NA
 3729175 3729176 AZC_2519 AZC_2520     TRUE 0.934 21.000 0.269 NA   NA
 3729176 3729177 AZC_2520 AZC_2521     TRUE 0.969 -3.000 0.010 NA   NA
 3729177 3729178 AZC_2521 AZC_2522   dctM FALSE 0.229 159.000 0.039 NA   NA
 3729178 3729179 AZC_2522 AZC_2523 dctM dctQ TRUE 0.992 13.000 0.465 NA Y NA
 3729179 3729180 AZC_2523 AZC_2524 dctQ rluD FALSE 0.074 80.000 0.000 NA N NA
 3729180 3729181 AZC_2524 AZC_2525 rluD crcB TRUE 0.584 55.000 0.083 NA N NA
 3729181 3729182 AZC_2525 AZC_2526 crcB   TRUE 0.596 13.000 0.000 NA   NA
 3729182 3729183 AZC_2526 AZC_2527     FALSE 0.217 42.000 0.000 NA   NA
 3729183 3729184 AZC_2527 AZC_2528     TRUE 0.941 6.000 0.051 1.000 N NA
 3729184 3729185 AZC_2528 AZC_2529     FALSE 0.144 145.000 0.008 1.000 N NA
 3729185 3729186 AZC_2529 AZC_2530     TRUE 0.891 75.000 0.873 1.000 N NA
 3729186 3729187 AZC_2530 AZC_2531     TRUE 0.514 140.000 0.308 1.000 N NA
 3729187 3729188 AZC_2531 AZC_2532     TRUE 0.944 127.000 0.810 0.011 Y NA
 3729188 3729189 AZC_2532 AZC_2533     FALSE 0.050 114.000 0.000 1.000 N NA
 3729189 3729190 AZC_2533 AZC_2534   secY TRUE 0.965 -3.000 0.010 1.000 N NA
 3729190 3729191 AZC_2534 AZC_2535 secY   TRUE 0.646 375.000 0.730 1.000 N NA
 3729191 3729192 AZC_2535 AZC_2536     TRUE 1.000 -3.000 0.653 0.002 Y NA
 3729192 3729193 AZC_2536 AZC_2537     TRUE 0.992 29.000 0.789 0.014 Y NA
 3729193 3729194 AZC_2537 AZC_2538     TRUE 0.996 18.000 0.814 0.014 Y NA
 3729194 3729195 AZC_2538 AZC_2539     TRUE 0.997 13.000 0.815 0.011 Y NA
 3729195 3729196 AZC_2539 AZC_2540     TRUE 0.996 20.000 0.808 0.011 Y NA
 3729196 3729197 AZC_2540 AZC_2541     TRUE 0.994 11.000 0.295 0.011 Y NA
 3729197 3729198 AZC_2541 AZC_2542     TRUE 0.917 90.000 0.309 0.011 Y NA
 3729198 3729199 AZC_2542 AZC_2543     TRUE 1.000 -7.000 0.758 0.011 Y NA
 3729199 3729200 AZC_2543 AZC_2544     TRUE 1.000 -3.000 0.810 0.014 Y NA
 3729200 3729201 AZC_2544 AZC_2545     TRUE 0.924 252.000 0.791 0.014 Y NA
 3729201 3729202 AZC_2545 AZC_2546     TRUE 0.998 10.000 0.828 0.011 Y NA
 3729202 3729203 AZC_2546 AZC_2547     TRUE 1.000 -3.000 0.802 0.011 Y NA
 3729203 3729204 AZC_2547 AZC_2548     TRUE 0.993 29.000 0.828 0.014 Y NA
 3729204 3729205 AZC_2548 AZC_2549     TRUE 0.997 0.000 0.109 0.014 Y NA
 3729205 3729206 AZC_2549 AZC_2550     TRUE 0.994 7.000 0.119 0.014 Y NA
 3729206 3729207 AZC_2550 AZC_2551     TRUE 0.998 12.000 0.820 0.014 Y NA
 3729207 3729208 AZC_2551 AZC_2552     TRUE 0.995 23.000 0.849 0.010 Y NA
 3729208 3729209 AZC_2552 AZC_2553     TRUE 0.999 -3.000 0.513 0.011 Y NA
 3729209 3729210 AZC_2553 AZC_2554     TRUE 0.999 -3.000 0.486 0.011 Y NA
 3729210 3729211 AZC_2554 AZC_2555     TRUE 0.998 2.000 0.307 0.014 Y NA
 3729211 3729212 AZC_2555 AZC_2556     TRUE 0.919 67.000 0.318 1.000 Y NA
 3729212 3729213 AZC_2556 AZC_2557     TRUE 0.922 64.000 0.102 0.001 Y NA
 3729213 3729214 AZC_2557 AZC_2558     TRUE 0.966 19.000 0.114 1.000 Y NA
 3729214 3729215 AZC_2558 AZC_2559     TRUE 0.995 18.000 0.620 0.002 Y NA
 3729215 3729216 AZC_2559 AZC_2560     FALSE 0.039 465.000 0.000 NA   NA
 3729216 3729217 AZC_2560 AZC_2561     TRUE 0.992 0.000 0.338 NA   NA
 3729217 3729218 AZC_2561 AZC_2562   lemA TRUE 0.977 8.000 0.257 NA   NA
 3729220 3729221 AZC_2564 AZC_2565     FALSE 0.051 297.000 0.000 1.000   NA
 3729221 3729222 AZC_2565 AZC_2566     FALSE 0.376 65.000 0.003 1.000   NA
 3729223 3729224 AZC_2567 AZC_2568     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3729224 3729225 AZC_2568 AZC_2569   hflK FALSE 0.050 196.000 0.000 NA   NA
 3729225 3729226 AZC_2569 AZC_2570 hflK hflC TRUE 1.000 -3.000 0.947 0.008 Y NA
 3729226 3729227 AZC_2570 AZC_2571 hflC   TRUE 0.965 14.000 0.348 NA   NA
 3729227 3729228 AZC_2571 AZC_2572     FALSE 0.369 170.000 0.150 NA   NA
 3729228 3729229 AZC_2572 AZC_2573     FALSE 0.139 308.000 0.000 0.008 N NA
 3729234 3729235 AZC_2578 AZC_2579     TRUE 0.874 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3729235 3729236 AZC_2579 AZC_2580     TRUE 0.997 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 3729236 3729237 AZC_2580 AZC_2581     TRUE 0.997 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 3729238 3729239 AZC_2582 AZC_2583     TRUE 0.967 5.000 0.000 1.000 Y NA
 3729239 3729240 AZC_2583 AZC_2584     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3729240 3729241 AZC_2584 AZC_2585   parA TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3729243 3729244 AZC_2587 AZC_2588     TRUE 0.987 -3.000 0.095 1.000   NA
 3729244 3729245 AZC_2588 AZC_2589     FALSE 0.142 71.000 0.000 NA   NA
 3729245 3729246 AZC_2589 AZC_2590     FALSE 0.325 30.000 0.000 NA   NA
 3729246 3729247 AZC_2590 AZC_2591     FALSE 0.059 129.000 0.000 NA   NA
 3729247 3729248 AZC_2591 AZC_2592     FALSE 0.049 212.000 0.000 NA   NA
 3729248 3729249 AZC_2592 AZC_2593     TRUE 0.929 11.000 0.080 NA   NA
 3729249 3729250 AZC_2593 AZC_2594     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3729250 3729251 AZC_2594 AZC_2595     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3729251 3729252 AZC_2595 AZC_2596   ompA TRUE 0.476 239.000 0.308 NA   NA
 3729252 3729253 AZC_2596 AZC_2597 ompA imcF FALSE 0.444 22.000 0.000 NA   NA
 3729253 3729254 AZC_2597 AZC_2598 imcF impA FALSE 0.062 121.000 0.000 NA   NA
 3729254 3729255 AZC_2598 AZC_2599 impA   TRUE 0.729 65.000 0.221 NA   NA
 3729255 3729256 AZC_2599 AZC_2600     TRUE 0.975 5.000 0.176 NA   NA
 3729256 3729257 AZC_2600 AZC_2601     FALSE 0.386 168.000 0.167 NA   NA
 3729257 3729258 AZC_2601 AZC_2602     TRUE 0.976 21.000 0.750 NA   NA
 3729258 3729259 AZC_2602 AZC_2603     TRUE 0.993 -3.000 0.250 NA   NA
 3729259 3729260 AZC_2603 AZC_2604     TRUE 0.994 -3.000 0.300 NA   NA
 3729260 3729261 AZC_2604 AZC_2605     TRUE 0.994 -3.000 0.300 NA   NA
 3729261 3729262 AZC_2605 AZC_2606   ubiE FALSE 0.222 41.000 0.000 NA   NA
 3729262 3729263 AZC_2606 AZC_2607 ubiE thiC FALSE 0.048 382.000 0.000 1.000   NA
 3729263 3729264 AZC_2607 AZC_trnH28 thiC trnH FALSE 0.054 171.000 0.000 NA   NA
 3729265 3729266 AZC_2608 AZC_2609     FALSE 0.106 86.000 0.000 NA   NA
 3729266 3729267 AZC_2609 AZC_2610     FALSE 0.111 59.000 0.000 NA N NA
 3729267 3729268 AZC_2610 AZC_2611   lacI FALSE 0.229 33.000 0.000 1.000 N NA
 3729268 3729269 AZC_2611 AZC_2612 lacI ethD TRUE 0.993 8.000 0.800 NA   NA
 3729269 3729270 AZC_2612 AZC_2613 ethD   TRUE 0.886 31.000 0.286 NA   NA
 3729271 3729272 AZC_2614 AZC_2615     TRUE 0.619 161.000 0.500 1.000 N NA
 3729272 3729273 AZC_2615 AZC_2616     FALSE 0.410 222.000 0.000 0.083 Y NA
 3729273 3729274 AZC_2616 AZC_2617     TRUE 0.999 4.000 0.833 0.011 Y NA
 3729274 3729275 AZC_2617 AZC_2618     TRUE 0.998 5.000 0.833 1.000 Y NA
 3729275 3729276 AZC_2618 AZC_2619     TRUE 0.996 -3.000 0.500 1.000 N NA
 3729280 3729281 AZC_2623 AZC_2624     TRUE 0.453 293.000 0.000 0.003 Y NA
 3729281 3729282 AZC_2624 AZC_2625     TRUE 0.874 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3729282 3729283 AZC_2625 AZC_2626     TRUE 0.497 114.000 0.000 0.083 Y NA
 3729283 3729284 AZC_2626 AZC_2627     TRUE 0.988 10.000 0.074 0.083 Y NA
 3729284 3729285 AZC_2627 AZC_2628     TRUE 0.997 14.000 0.871 0.083 Y NA
 3729285 3729286 AZC_2628 AZC_2629     TRUE 0.996 11.000 0.742 1.000 Y NA
 3729286 3729287 AZC_2629 AZC_2630     TRUE 1.000 -3.000 0.677 0.006 Y NA
 3729287 3729288 AZC_2630 AZC_2631     TRUE 0.619 12.000 0.000 NA   NA
 3729288 3729289 AZC_2631 AZC_2632     TRUE 0.647 11.000 0.000 NA   NA
 3729289 3729290 AZC_2632 AZC_2633     TRUE 0.468 222.000 0.000 0.005 Y NA
 3729290 3729291 AZC_2633 AZC_2634     TRUE 0.887 31.000 0.000 0.005 Y NA
 3729291 3729292 AZC_2634 AZC_2635     FALSE 0.042 945.000 0.000 1.000   NA
 3729293 3729294 AZC_2636 AZC_2637     TRUE 0.616 32.000 0.026 1.000 N NA
 3729294 3729295 AZC_2637 AZC_2638     TRUE 0.455 38.000 0.000 0.075 N NA
 3729295 3729296 AZC_2638 AZC_2639   lysR TRUE 0.588 70.000 0.130 1.000 N NA
 3729296 3729297 AZC_2639 AZC_2640 lysR   FALSE 0.257 154.000 0.065 1.000 N NA
 3729299 3729300 AZC_2642 AZC_2643     TRUE 0.949 27.000 0.600 NA N NA
 3729300 3729301 AZC_2643 AZC_2644     TRUE 0.862 30.000 0.222 1.000 N NA
 3729301 3729302 AZC_2644 AZC_2645     TRUE 0.993 13.000 0.500 1.000 Y NA
 3729302 3729303 AZC_2645 AZC_2646     TRUE 0.990 23.000 0.800 NA Y NA
 3729306 3729307 AZC_2649 AZC_2650     TRUE 0.960 6.000 0.033 0.075 N NA
 3729307 3729308 AZC_2650 AZC_2651     FALSE 0.032 300.000 0.000 1.000 N NA
 3729308 3729309 AZC_2651 AZC_2652     TRUE 0.992 -3.000 0.000 0.083 Y NA
 3729309 3729310 AZC_2652 AZC_2653     TRUE 0.980 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3729310 3729311 AZC_2653 AZC_2654     TRUE 0.994 -331.000 0.000 0.008 Y NA
 3729311 3729312 AZC_2654 AZC_2655     TRUE 0.925 13.000 0.000 1.000 Y NA
 3729312 3729313 AZC_2655 AZC_2656     FALSE 0.048 117.000 0.000 1.000 N NA
 3729315 3729316 AZC_2658 AZC_2659     FALSE 0.135 59.000 0.000 1.000 N NA
 3729316 3729317 AZC_2659 AZC_2660     TRUE 0.992 -3.000 0.000 0.083 Y NA
 3729317 3729318 AZC_2660 AZC_2661     TRUE 0.998 0.000 0.400 0.083 Y NA
 3729318 3729319 AZC_2661 AZC_2662     TRUE 0.997 0.000 0.333 1.000 Y NA
 3729319 3729320 AZC_2662 AZC_2663     TRUE 1.000 -19.000 1.000 0.006 Y NA
 3729320 3729321 AZC_2663 AZC_2664     TRUE 0.875 18.000 0.094 1.000 N NA
 3729321 3729322 AZC_2664 AZC_2665     TRUE 0.501 83.000 0.000 NA Y NA
 3729323 3729324 AZC_2666 AZC_2667     FALSE 0.056 212.000 0.000 1.000   NA
 3729324 3729325 AZC_2667 AZC_2668   hlyD TRUE 0.491 267.000 0.361 1.000 N NA
 3729325 3729326 AZC_2668 AZC_2669 hlyD   TRUE 0.900 28.000 0.298 1.000 N NA
 3729329 3729330 AZC_2672 AZC_2673     FALSE 0.185 53.000 0.000 NA   NA
 3729330 3729331 AZC_2673 AZC_2674     FALSE 0.188 38.000 0.000 1.000 N NA
 3729331 3729332 AZC_2674 AZC_2675   gntR FALSE 0.434 17.000 0.000 1.000 N NA
 3729332 3729333 AZC_2675 AZC_2676 gntR   FALSE 0.445 150.000 0.000 0.088 Y NA
 3729333 3729334 AZC_2676 AZC_2677     FALSE 0.059 187.000 0.000 1.000   NA
 3729335 3729336 AZC_2678 AZC_2679     TRUE 0.823 3.000 0.000 NA   NA
 3729336 3729337 AZC_2679 AZC_2680     TRUE 0.975 41.000 0.750 1.000 Y NA
 3729337 3729338 AZC_2680 AZC_2681     TRUE 0.999 0.000 1.000 0.011 Y NA
 3729338 3729339 AZC_2681 AZC_2682     TRUE 0.979 66.000 0.857 0.083 Y NA
 3729340 3729341 AZC_2683 AZC_2684     TRUE 0.998 -3.000 0.600 0.060   NA
 3729341 3729342 AZC_2684 AZC_2685     TRUE 0.999 -7.000 0.600 1.000 Y NA
 3729343 3729344 AZC_2686 AZC_2687     TRUE 0.995 6.000 1.000 NA   NA
 3729344 3729345 AZC_2687 AZC_2688     TRUE 0.990 5.000 0.462 NA   NA
 3729345 3729346 AZC_2688 AZC_2689     TRUE 0.922 25.000 0.308 NA   NA
 3729346 3729347 AZC_2689 AZC_2690   dctP TRUE 0.992 20.000 0.750 1.000 Y NA
 3729348 3729349 AZC_2691 AZC_2692 lacI   FALSE 0.384 21.000 0.000 1.000 N NA
 3729350 3729351 AZC_2693 AZC_2694     FALSE 0.213 35.000 0.000 1.000 N NA
 3729351 3729352 AZC_2694 AZC_2695     TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.006 Y NA
 3729352 3729353 AZC_2695 AZC_2696     TRUE 0.997 0.000 0.317 1.000 Y NA
 3729353 3729354 AZC_2696 AZC_2697     TRUE 1.000 -3.000 0.829 0.083 Y NA
 3729354 3729355 AZC_2697 AZC_2698     TRUE 0.828 36.000 0.000 0.083 Y NA
 3729355 3729356 AZC_2698 AZC_2699     FALSE 0.031 364.000 0.000 1.000 N NA
 3729357 3729358 AZC_2700 AZC_2701   araC TRUE 0.997 -3.000 0.596 1.000 N NA
 3729358 3729359 AZC_2701 AZC_2702 araC   FALSE 0.027 880.000 0.000 1.000 N NA
 3729359 3729360 AZC_2702 AZC_2703     TRUE 0.988 0.000 0.224 NA   NA
 3729360 3729361 AZC_2703 AZC_2704     FALSE 0.174 60.000 0.000 NA   NA
 3729362 3729363 AZC_2705 AZC_2706   araC FALSE 0.071 122.000 0.000 1.000   NA
 3729363 3729364 AZC_2706 AZC_2707 araC   FALSE 0.090 80.000 0.000 1.000 N NA
 3729364 3729365 AZC_2707 AZC_2708     TRUE 0.711 10.000 0.000 1.000   NA
 3729366 3729367 AZC_2709 AZC_2710     TRUE 0.811 58.000 0.000 0.000 Y NA
 3729367 3729368 AZC_2710 AZC_2711     FALSE 0.429 199.000 0.250 1.000 N NA
 3729368 3729369 AZC_2711 AZC_2712     FALSE 0.033 289.000 0.000 1.000 N NA
 3729369 3729370 AZC_2712 AZC_2713     FALSE 0.039 182.000 0.000 1.000 N NA
 3729370 3729371 AZC_2713 AZC_2714     TRUE 0.729 27.000 0.049 NA N NA
 3729371 3729372 AZC_2714 AZC_2715     TRUE 0.998 4.000 0.750 NA Y NA
 3729372 3729373 AZC_2715 AZC_2716     TRUE 0.996 -7.000 0.068 1.000 Y NA
 3729373 3729374 AZC_2716 AZC_2717     FALSE 0.039 176.000 0.000 1.000 N NA
 3729374 3729375 AZC_2717 AZC_2718     FALSE 0.063 170.000 0.000 1.000   NA
 3729375 3729376 AZC_2718 AZC_2719     TRUE 0.934 59.000 0.500 0.000   NA
 3729376 3729377 AZC_2719 AZC_2720     TRUE 0.980 9.000 0.208 0.061 N NA
 3729377 3729378 AZC_2720 AZC_2721   iclR FALSE 0.035 236.000 0.000 1.000 N NA
 3729378 3729379 AZC_2721 AZC_2722 iclR   TRUE 0.928 21.000 0.267 1.000 N NA
 3729379 3729380 AZC_2722 AZC_2723     TRUE 0.996 10.000 0.462 0.083 Y NA
 3729380 3729381 AZC_2723 AZC_2724     TRUE 0.972 33.000 0.308 0.083 Y NA
 3729381 3729382 AZC_2724 AZC_2725     TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 3729382 3729383 AZC_2725 AZC_2726   aroM TRUE 0.948 7.000 0.065 NA   NA
 3729383 3729384 AZC_2726 AZC_2727 aroM   TRUE 0.811 24.000 0.065 NA   NA
 3729384 3729385 AZC_2727 AZC_2728     TRUE 0.996 4.000 0.857 NA   NA
 3729386 3729387 AZC_2729 AZC_2730 ybaK   FALSE 0.069 111.000 0.000 NA   NA
 3729387 3729388 AZC_2730 AZC_2731   lysR FALSE 0.144 52.000 0.000 1.000 N NA
 3729389 3729390 AZC_2732 AZC_2733     FALSE 0.311 34.000 0.000 1.000   NA
 3729390 3729391 AZC_2733 AZC_2734     TRUE 0.999 -3.000 0.409 1.000 Y NA
 3729391 3729392 AZC_2734 AZC_2735     TRUE 0.998 9.000 0.900 1.000 Y NA
 3729392 3729393 AZC_2735 AZC_2736     TRUE 0.882 -13.000 0.000 1.000 N NA
 3729393 3729394 AZC_2736 AZC_2737     FALSE 0.110 70.000 0.000 1.000 N NA
 3729398 3729399 AZC_2741 AZC_2742     FALSE 0.178 58.000 0.000 NA   NA
 3729401 3729402 AZC_2744 AZC_2745     FALSE 0.043 148.000 0.000 1.000 N NA
 3729402 3729403 AZC_2745 AZC_2746     TRUE 0.957 0.000 0.025 1.000 N NA
 3729403 3729404 AZC_2746 AZC_2747     TRUE 0.936 37.000 0.713 NA   NA
 3729404 3729405 AZC_2747 AZC_2748     TRUE 0.975 17.000 0.620 NA   NA
 3729406 3729407 AZC_2749 AZC_2750     FALSE 0.090 80.000 0.000 1.000 N NA
 3729407 3729408 AZC_2750 AZC_2751     FALSE 0.307 26.000 0.000 1.000 N NA
 3729408 3729409 AZC_2751 AZC_2752     FALSE 0.038 596.000 0.000 NA   NA
 3729410 3729411 AZC_2753 AZC_2754     TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 3729412 3729413 AZC_2755 AZC_trnP29   trnP FALSE 0.038 656.000 0.000 NA   NA
 3729413 3729414 AZC_trnP29 AZC_2756 trnP   FALSE 0.059 131.000 0.000 NA   NA
 3729414 3729415 AZC_2756 AZC_2757     FALSE 0.085 96.000 0.000 NA   NA
 3729417 3729418 AZC_2759 AZC_2760     TRUE 0.851 89.000 0.812 NA   NA
 3729418 3729419 AZC_2760 AZC_2761     TRUE 0.773 45.000 0.207 NA   NA
 3729421 3729422 AZC_2763 AZC_2764     TRUE 0.970 27.000 0.846 NA   NA
 3729423 3729424 AZC_2765 AZC_2766     FALSE 0.074 89.000 0.000 1.000 N NA
 3729425 3729426 AZC_2767 AZC_2768 gntR   TRUE 0.490 14.000 0.000 1.000 N NA
 3729428 3729429 AZC_2770 AZC_2771     FALSE 0.354 28.000 0.000 NA   NA
 3729433 3729434 AZC_2775 AZC_2776     TRUE 0.991 -3.000 0.194 NA   NA
 3729434 3729435 AZC_2776 AZC_2777     TRUE 0.991 -3.000 0.194 1.000 N NA
 3729436 3729437 AZC_2778 AZC_2779 lacI   TRUE 0.795 29.000 0.103 1.000 N NA
 3729438 3729439 AZC_2780 AZC_2781     FALSE 0.223 104.000 0.000 0.060   NA
 3729439 3729440 AZC_2781 AZC_2782     FALSE 0.222 41.000 0.000 NA   NA
 3729442 3729443 AZC_2784 AZC_2785     FALSE 0.050 197.000 0.000 NA   NA
 3729443 3729444 AZC_2785 AZC_2786     FALSE 0.063 168.000 0.000 1.000   NA
 3729444 3729445 AZC_2786 AZC_2787     TRUE 0.964 2.000 0.039 1.000   NA
 3729445 3729446 AZC_2787 AZC_2788     TRUE 0.509 58.000 0.029 1.000   NA
 3729448 3729449 AZC_2790 AZC_2791 marR   TRUE 0.638 79.000 0.219 1.000 N NA
 3729449 3729450 AZC_2791 AZC_2792     TRUE 1.000 -3.000 0.750 0.038 Y NA
 3729450 3729451 AZC_2792 AZC_2793     TRUE 0.999 -3.000 0.833 1.000 Y NA
 3729451 3729452 AZC_2793 AZC_2794     TRUE 0.925 83.000 0.536 1.000 Y NA
 3729452 3729453 AZC_2794 AZC_2795     TRUE 0.934 28.000 0.440 NA   NA
 3729453 3729454 AZC_2795 AZC_2796     TRUE 0.998 -3.000 0.680 NA   NA
 3729454 3729455 AZC_2796 AZC_2797     TRUE 0.982 2.000 0.171 NA   NA
 3729455 3729456 AZC_2797 AZC_2798     TRUE 0.977 6.000 0.214 NA   NA
 3729456 3729457 AZC_2798 AZC_2799     FALSE 0.052 186.000 0.000 NA   NA
 3729458 3729459 AZC_2800 AZC_2801     TRUE 0.999 -3.000 0.519 0.017 Y NA
 3729459 3729460 AZC_2801 AZC_2802     FALSE 0.376 926.000 0.000 0.017 Y NA
 3729460 3729461 AZC_2802 AZC_2803     TRUE 0.890 28.000 0.000 0.060 Y NA
 3729461 3729462 AZC_2803 AZC_2804     FALSE 0.370 116.000 0.129 1.000 N NA
 3729463 3729464 AZC_2805 AZC_2806     TRUE 0.469 46.000 0.013 NA   NA
 3729464 3729465 AZC_2806 AZC_2807     TRUE 0.686 34.000 0.062 1.000 N NA
 3729466 3729467 AZC_2808 AZC_2809     FALSE 0.058 140.000 0.000 NA   NA
 3729468 3729469 AZC_2810 AZC_2811     TRUE 0.833 2.000 0.000 NA   NA
 3729471 3729472 AZC_2813 AZC_2814     FALSE 0.069 127.000 0.000 1.000   NA
 3729472 3729473 AZC_2814 AZC_2815     FALSE 0.058 196.000 0.000 1.000   NA
 3729473 3729474 AZC_2815 AZC_2816     FALSE 0.185 254.000 0.033 NA   NA
 3729474 3729475 AZC_2816 AZC_2817   tolC FALSE 0.183 192.000 0.024 NA   NA
 3729475 3729476 AZC_2817 AZC_2818 tolC   TRUE 0.484 37.000 0.009 1.000 N NA
 3729476 3729477 AZC_2818 AZC_2819     FALSE 0.074 106.000 0.000 NA   NA
 3729478 3729479 AZC_trnC30 AZC_2820 trnC   FALSE 0.049 214.000 0.000 NA   NA
 3729479 3729480 AZC_2820 AZC_trnN31   trnN FALSE 0.052 184.000 0.000 NA   NA
 3729480 3729481 AZC_trnN31 AZC_2821 trnN   FALSE 0.063 119.000 0.000 NA   NA
 3729481 3729482 AZC_2821 AZC_2822     FALSE 0.079 100.000 0.000 NA   NA
 3729482 3729483 AZC_2822 AZC_2823     TRUE 0.807 4.000 0.000 NA   NA
 3729483 3729484 AZC_2823 AZC_2824     FALSE 0.064 118.000 0.000 NA   NA
 3729484 3729485 AZC_2824 AZC_2825     FALSE 0.162 116.000 0.008 1.000 N NA
 3729485 3729486 AZC_2825 AZC_2826     TRUE 0.618 30.000 0.018 1.000 N NA
 3729486 3729487 AZC_2826 AZC_2827     FALSE 0.039 176.000 0.000 1.000 N NA
 3729487 3729488 AZC_2827 AZC_2828     TRUE 0.502 136.000 0.000 0.012 Y NA
 3729489 3729490 AZC_2829 AZC_2830     TRUE 0.486 19.000 0.000 NA   NA
 3729492 3729493 AZC_2832 AZC_2833     FALSE 0.076 103.000 0.000 NA   NA
 3729493 3729494 AZC_2833 AZC_2834     FALSE 0.044 129.000 0.000 1.000 N NA
 3729494 3729495 AZC_2834 AZC_2835     FALSE 0.038 187.000 0.000 1.000 N NA
 3729496 3729497 AZC_2836 AZC_2837     TRUE 0.999 2.000 0.692 0.008 Y NA
 3729498 3729499 AZC_2838 AZC_trnL32   trnL FALSE 0.048 219.000 0.000 NA   NA
 3729502 3729503 AZC_2841 AZC_2842   recQ FALSE 0.178 67.000 0.000 1.000   NA
 3729503 3729504 AZC_2842 AZC_2843 recQ   FALSE 0.057 103.000 0.000 1.000 N NA
 3729504 3729505 AZC_2843 AZC_2844     TRUE 1.000 -3.000 0.643 0.003 Y NA
 3729505 3729506 AZC_2844 AZC_2845     TRUE 0.874 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3729509 3729510 AZC_2848 AZC_2849     TRUE 0.985 -3.000 0.070 1.000   NA
 3729510 3729511 AZC_2849 AZC_2850     TRUE 0.655 59.000 0.108 1.000   NA
 3729511 3729512 AZC_2850 AZC_2851     TRUE 0.999 -7.000 0.452 1.000 Y NA
 3729514 3729515 AZC_2853 AZC_2854     FALSE 0.055 234.000 0.000 1.000   NA
 3729515 3729516 AZC_2854 AZC_2855   recA FALSE 0.290 264.000 0.054 0.097 N NA
 3729516 3729517 AZC_2855 AZC_2856 recA lacI FALSE 0.035 237.000 0.000 1.000 N NA
 3729518 3729519 AZC_2857 AZC_2858     TRUE 0.666 43.000 0.100 1.000 N NA
 3729519 3729520 AZC_2858 AZC_2859   araC FALSE 0.037 198.000 0.000 1.000 N NA
 3729520 3729521 AZC_2859 AZC_2860 araC   FALSE 0.043 321.000 0.000 NA   NA
 3729521 3729522 AZC_2860 AZC_2861     TRUE 0.996 -3.000 0.429 NA   NA
 3729522 3729523 AZC_2861 AZC_2862     TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3729524 3729525 AZC_2863 AZC_2864     FALSE 0.230 88.000 0.000 0.074 N NA
 3729525 3729526 AZC_2864 AZC_2865   iclR TRUE 0.943 17.000 0.286 1.000 N NA
 3729526 3729527 AZC_2865 AZC_2866 iclR   TRUE 0.598 33.000 0.024 1.000 N NA
 3729527 3729528 AZC_2866 AZC_2867   npd TRUE 0.975 0.000 0.060 1.000   NA
 3729528 3729529 AZC_2867 AZC_2868 npd   TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3729529 3729530 AZC_2868 AZC_2869     TRUE 0.999 -7.000 0.444 0.038 Y NA
 3729530 3729531 AZC_2869 AZC_2870     TRUE 0.998 -13.000 0.214 1.000 Y NA
 3729531 3729532 AZC_2870 AZC_2871     TRUE 0.992 11.000 0.214 0.082 Y NA
 3729532 3729533 AZC_2871 AZC_2872     TRUE 0.922 80.000 0.500 NA Y NA
 3729534 3729535 AZC_2873 AZC_2874     TRUE 0.998 0.000 0.400 1.000 Y NA
 3729535 3729536 AZC_2874 AZC_2875     TRUE 0.859 23.000 0.000 1.000 Y NA
 3729536 3729537 AZC_2875 AZC_2876     TRUE 0.992 4.000 0.111 1.000 Y NA
 3729537 3729538 AZC_2876 AZC_2877     TRUE 0.986 23.000 0.278 0.004 Y NA
 3729538 3729539 AZC_2877 AZC_2878     FALSE 0.034 260.000 0.000 1.000 N NA
 3729539 3729540 AZC_2878 AZC_2879     FALSE 0.391 352.000 0.000 0.061 Y NA
 3729540 3729541 AZC_2879 AZC_2880     TRUE 0.565 142.000 0.333 1.000   NA
 3729543 3729544 AZC_2882 AZC_2883     TRUE 0.772 49.000 0.250 1.000 N NA
 3729544 3729545 AZC_2883 AZC_2884   iclR TRUE 0.565 62.000 0.075 1.000 N NA
 3729545 3729546 AZC_2884 AZC_2885 iclR   FALSE 0.045 533.000 0.000 1.000   NA
 3729548 3729549 AZC_2887 AZC_2888     FALSE 0.037 804.000 0.000 NA   NA
 3729549 3729550 AZC_2888 AZC_2889     FALSE 0.045 277.000 0.000 NA   NA
 3729550 3729551 AZC_2889 AZC_2890     TRUE 0.876 9.000 0.005 NA   NA
 3729552 3729553 AZC_2891 AZC_2892     TRUE 0.924 16.000 0.165 NA   NA
 3729553 3729554 AZC_2892 AZC_2893   secF TRUE 0.919 14.000 0.113 NA   NA
 3729554 3729555 AZC_2893 AZC_2894 secF secD TRUE 0.995 14.000 0.356 0.000 Y NA
 3729555 3729556 AZC_2894 AZC_2895 secD yajC TRUE 0.910 35.000 0.099 NA Y NA
 3729557 3729558 AZC_2896 AZC_2897 cobS   TRUE 0.903 10.000 0.028 NA   NA
 3729558 3729559 AZC_2897 AZC_2898     TRUE 0.987 4.000 0.305 NA   NA
 3729559 3729560 AZC_2898 AZC_2899     TRUE 0.976 -3.000 0.022 1.000   NA
 3729561 3729562 AZC_2900 AZC_2901     FALSE 0.069 128.000 0.000 1.000   NA
 3729564 3729565 AZC_2903 AZC_2904     TRUE 0.826 44.000 0.300 NA   NA
 3729565 3729566 AZC_2904 AZC_2905     TRUE 0.996 0.000 0.750 1.000 N NA
 3729568 3729569 AZC_2907 AZC_2908     TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.006 Y NA
 3729569 3729570 AZC_2908 AZC_2909     TRUE 0.998 -3.000 0.375 1.000 Y NA
 3729570 3729571 AZC_2909 AZC_2910     TRUE 0.999 0.000 0.556 0.082 Y NA
 3729571 3729572 AZC_2910 AZC_2911     TRUE 0.927 7.000 0.028 NA   NA
 3729573 3729574 AZC_2912 AZC_2913 marR   TRUE 0.874 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3729575 3729576 AZC_2914 AZC_2915     FALSE 0.041 377.000 0.000 NA   NA
 3729576 3729577 AZC_2915 AZC_2916     FALSE 0.041 383.000 0.000 NA   NA
 3729577 3729578 AZC_2916 AZC_2917     TRUE 0.989 0.000 0.000 0.015 Y NA
 3729578 3729579 AZC_2917 AZC_2918     TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3729581 3729582 AZC_2920 AZC_2921     FALSE 0.064 118.000 0.000 NA   NA
 3729582 3729583 AZC_2921 AZC_2922     TRUE 0.977 86.000 0.882 0.000 Y NA
 3729583 3729584 AZC_2922 AZC_2923     TRUE 0.934 40.000 0.233 1.000 Y NA
 3729584 3729585 AZC_2923 AZC_2924     TRUE 0.659 210.000 0.176 1.000 Y NA
 3729585 3729586 AZC_2924 AZC_2925     FALSE 0.049 211.000 0.000 NA   NA
 3729586 3729587 AZC_2925 AZC_trnS33   trnS FALSE 0.037 991.000 0.000 NA   NA
 3729587 3729588 AZC_trnS33 AZC_2926 trnS   FALSE 0.072 108.000 0.000 NA   NA
 3729588 3729589 AZC_2926 AZC_2927     FALSE 0.137 73.000 0.000 NA   NA
 3729589 3729590 AZC_2927 AZC_2928     FALSE 0.031 190.000 0.000 NA N NA
 3729591 3729592 AZC_2929 AZC_2930     TRUE 0.986 10.000 0.533 NA   NA
 3729592 3729593 AZC_2930 AZC_2931     TRUE 0.995 -3.000 0.447 NA N NA
 3729593 3729594 AZC_2931 AZC_2932     FALSE 0.029 512.000 0.000 1.000 N NA
 3729595 3729596 AZC_2933 AZC_2934   coxE TRUE 0.833 2.000 0.000 NA   NA
 3729596 3729597 AZC_2934 AZC_2935 coxE   TRUE 0.993 5.000 0.645 NA   NA
 3729597 3729598 AZC_2935 AZC_2936     FALSE 0.098 96.000 0.000 1.000   NA
 3729598 3729599 AZC_2936 AZC_2937     FALSE 0.076 115.000 0.000 1.000   NA
 3729599 3729600 AZC_2937 AZC_2938     TRUE 0.739 99.000 0.037 0.059 Y NA
 3729600 3729601 AZC_2938 AZC_2939     TRUE 0.674 125.000 0.037 0.060 Y NA
 3729601 3729602 AZC_2939 AZC_2940     FALSE 0.065 156.000 0.000 1.000   NA
 3729602 3729603 AZC_2940 AZC_2941     FALSE 0.271 35.000 0.000 NA   NA
 3729604 3729605 AZC_2942 AZC_2943     TRUE 0.998 0.000 0.406 0.082 Y NA
 3729605 3729606 AZC_2943 AZC_2944     TRUE 0.999 -3.000 0.386 1.000 Y NA
 3729606 3729607 AZC_2944 AZC_2945     TRUE 1.000 -3.000 0.881 0.038 Y NA
 3729607 3729608 AZC_2945 AZC_2946     TRUE 0.992 4.000 0.475 NA   NA
 3729608 3729609 AZC_2946 AZC_2947     TRUE 0.740 58.000 0.207 NA   NA
 3729609 3729610 AZC_2947 AZC_2948     FALSE 0.054 173.000 0.000 NA   NA
 3729612 3729613 AZC_2950 AZC_2951     FALSE 0.340 73.000 0.009 NA   NA
 3729614 3729615 AZC_2952 AZC_2953     FALSE 0.192 49.000 0.000 NA   NA
 3729615 3729616 AZC_2953 AZC_2954     TRUE 0.980 -3.000 0.040 NA   NA
 3729616 3729617 AZC_2954 AZC_2955     TRUE 0.618 68.000 0.122 NA   NA
 3729617 3729618 AZC_2955 AZC_2956     TRUE 0.644 152.000 0.536 1.000 N NA
 3729618 3729619 AZC_2956 AZC_2957   coxF TRUE 0.937 8.000 0.050 NA   NA
 3729619 3729620 AZC_2957 AZC_2958 coxF   TRUE 0.946 5.000 0.038 NA   NA
 3729620 3729621 AZC_2958 AZC_2959     TRUE 0.452 231.000 0.153 0.060 N NA
 3729621 3729622 AZC_2959 AZC_2960     TRUE 0.984 48.000 0.741 0.002 Y NA
 3729623 3729624 AZC_2961 AZC_2962     FALSE 0.053 175.000 0.000 NA   NA
 3729624 3729625 AZC_2962 AZC_2963   matE FALSE 0.040 174.000 0.000 1.000 N NA
 3729625 3729626 AZC_2963 AZC_2964 matE   TRUE 0.585 47.000 0.051 NA   NA
 3729629 3729630 AZC_2967 AZC_2968     FALSE 0.048 224.000 0.000 NA   NA
 3729630 3729631 AZC_2968 AZC_2969     FALSE 0.325 30.000 0.000 NA   NA
 3729631 3729632 AZC_2969 AZC_2970     TRUE 0.590 175.000 0.077 1.000 Y NA
 3729633 3729634 AZC_2971 AZC_2972 merR   TRUE 0.706 83.000 0.353 NA N NA
 3729634 3729635 AZC_2972 AZC_2973     TRUE 0.958 15.000 0.042 NA Y NA
 3729635 3729636 AZC_2973 AZC_2974     TRUE 0.491 202.000 0.031 1.000 Y NA
 3729636 3729637 AZC_2974 AZC_2975     TRUE 0.698 60.000 0.154 1.000   NA
 3729637 3729638 AZC_2975 AZC_2976     FALSE 0.045 280.000 0.000 NA   NA
 3729640 3729641 AZC_2978 AZC_2979     FALSE 0.039 508.000 0.000 NA   NA
 3729642 3729643 AZC_2980 AZC_2981     FALSE 0.131 75.000 0.000 NA   NA
 3729646 3729647 AZC_2984 AZC_2985     FALSE 0.086 105.000 0.000 1.000   NA
 3729647 3729648 AZC_2985 AZC_2986     TRUE 0.730 31.000 0.057 NA   NA
 3729648 3729649 AZC_2986 AZC_2987     TRUE 0.969 4.000 0.086 NA   NA
 3729649 3729650 AZC_2987 AZC_2988     TRUE 0.925 8.000 0.033 NA   NA
 3729650 3729651 AZC_2988 AZC_2989     FALSE 0.066 115.000 0.000 NA   NA
 3729652 3729653 AZC_2990 AZC_2991     TRUE 0.965 5.000 0.000 NA Y NA
 3729653 3729654 AZC_2991 AZC_2992     TRUE 0.905 27.000 0.025 NA Y NA
 3729654 3729655 AZC_2992 AZC_2993     TRUE 0.988 2.000 0.025 NA Y NA
 3729655 3729656 AZC_2993 AZC_2994     TRUE 0.997 -3.000 0.066 0.082 Y NA
 3729656 3729657 AZC_2994 AZC_2995     TRUE 0.926 177.000 0.803 0.082 Y NA
 3729657 3729658 AZC_2995 AZC_2996     TRUE 0.632 41.000 0.050 1.000   NA
 3729658 3729659 AZC_2996 AZC_2997   rpiR TRUE 0.995 -3.000 0.333 1.000   NA
 3729660 3729661 AZC_2998 AZC_2999 tetR   FALSE 0.384 21.000 0.000 1.000 N NA
 3729661 3729662 AZC_2999 AZC_3000     TRUE 0.908 39.000 0.600 NA N NA
 3729662 3729663 AZC_3000 AZC_3001     TRUE 0.964 77.000 1.000 NA Y NA
 3729663 3729664 AZC_3001 AZC_3002     TRUE 0.999 0.000 1.000 0.082 Y NA
 3729664 3729665 AZC_3002 AZC_3003     TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 3729668 3729669 AZC_3006 AZC_3007     TRUE 0.992 8.000 0.748 1.000   NA
 3729669 3729670 AZC_3007 AZC_3008     FALSE 0.115 88.000 0.000 1.000   NA
 3729670 3729671 AZC_3008 AZC_3009     FALSE 0.055 106.000 0.000 1.000 N NA
 3729672 3729673 AZC_3010 AZC_3011 lysR arsC FALSE 0.274 29.000 0.000 1.000 N NA
 3729674 3729675 AZC_3012 AZC_3013     TRUE 0.998 4.000 0.615 0.096 Y NA
 3729677 3729678 AZC_3015 AZC_3016   terC FALSE 0.053 177.000 0.000 NA   NA
 3729678 3729679 AZC_3016 AZC_3017 terC   FALSE 0.048 219.000 0.000 NA   NA
 3729680 3729681 AZC_3018 AZC_3019 lysR   FALSE 0.043 139.000 0.000 1.000 N NA
 3729681 3729682 AZC_3019 AZC_3020     TRUE 0.973 18.000 0.650 1.000 N NA
 3729682 3729683 AZC_3020 AZC_3021     FALSE 0.048 227.000 0.000 NA   NA
 3729684 3729685 AZC_3022 AZC_3023     TRUE 0.993 10.000 0.545 0.001   NA
 3729686 3729687 AZC_3024 AZC_3025     FALSE 0.050 206.000 0.000 NA   NA
 3729687 3729688 AZC_3025 AZC_3026     FALSE 0.050 202.000 0.000 NA   NA
 3729688 3729689 AZC_3026 AZC_3027     TRUE 0.725 8.000 0.000 NA   NA
 3729689 3729690 AZC_3027 AZC_3028     FALSE 0.042 158.000 0.000 1.000 N NA
 3729691 3729692 AZC_3029 AZC_3030     FALSE 0.092 92.000 0.000 NA   NA
 3729692 3729693 AZC_3030 AZC_3031   lysR FALSE 0.153 68.000 0.000 NA   NA
 3729694 3729695 AZC_3032 AZC_3033 chrA chrA TRUE 0.999 -3.000 0.571 0.001 Y NA
 3729695 3729696 AZC_3033 AZC_3034 chrA   FALSE 0.051 188.000 0.000 NA   NA
 3729696 3729697 AZC_3034 AZC_3035     FALSE 0.161 66.000 0.000 NA   NA
 3729698 3729699 AZC_3036 AZC_3037     FALSE 0.159 45.000 0.000 1.000 N NA
 3729699 3729700 AZC_3037 AZC_3038   iclR FALSE 0.061 98.000 0.000 1.000 N NA
 3729701 3729702 AZC_3039 AZC_3040 agaF agaG TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.002 Y NA
 3729702 3729703 AZC_3040 AZC_3041 agaG   TRUE 0.898 114.000 0.667 1.000 Y NA
 3729703 3729704 AZC_3041 AZC_3042     TRUE 0.880 576.000 0.667 0.081 Y NA
 3729704 3729705 AZC_3042 AZC_3043     TRUE 0.986 -3.000 0.097 1.000 N NA
 3729705 3729706 AZC_3043 AZC_3044     TRUE 0.993 -3.000 0.097 0.006 N NA
 3729706 3729707 AZC_3044 AZC_3045     TRUE 0.985 -7.000 0.059 1.000   NA
 3729707 3729708 AZC_3045 AZC_3046     TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3729708 3729709 AZC_3046 AZC_3047     TRUE 0.971 -3.000 0.000 0.059   NA
 3729709 3729710 AZC_3047 AZC_3048     TRUE 0.807 572.000 0.944 0.059   NA
 3729712 3729713 AZC_3050 AZC_3051     TRUE 0.861 72.000 0.182 1.000 Y NA
 3729715 3729716 AZC_3053 AZC_3054     FALSE 0.025 330.000 0.000 NA N NA
 3729717 3729718 AZC_3055 AZC_3056     FALSE 0.058 143.000 0.000 NA   NA
 3729718 3729719 AZC_3056 AZC_3057     FALSE 0.173 139.000 0.019 1.000 N NA
 3729719 3729720 AZC_3057 AZC_3058     FALSE 0.053 176.000 0.000 NA   NA
 3729720 3729721 AZC_3058 AZC_3059     FALSE 0.325 30.000 0.000 NA   NA
 3729724 3729725 AZC_3062 AZC_3063     TRUE 0.932 3.000 0.005 NA   NA
 3729726 3729727 AZC_3064 AZC_3065     FALSE 0.216 88.000 0.004 1.000 N NA
 3729727 3729728 AZC_3065 AZC_3066     TRUE 0.725 8.000 0.000 NA   NA
 3729728 3729729 AZC_3066 AZC_3067     FALSE 0.370 60.000 0.003 NA   NA
 3729729 3729730 AZC_3067 AZC_3068   secG FALSE 0.337 110.000 0.083 1.000 N NA
 3729730 3729731 AZC_3068 AZC_3069 secG   FALSE 0.037 208.000 0.000 1.000 N NA
 3729731 3729732 AZC_3069 AZC_3070     FALSE 0.054 108.000 0.000 1.000 N NA
 3729733 3729734 AZC_3071 AZC_3072     TRUE 0.904 17.000 0.109 1.000   NA
 3729734 3729735 AZC_3072 AZC_3073     FALSE 0.255 172.000 0.069 1.000 N NA
 3729735 3729736 AZC_3073 AZC_3074     FALSE 0.419 61.000 0.020 1.000 N NA
 3729736 3729737 AZC_3074 AZC_3075     TRUE 0.802 171.000 0.153 0.001 Y NA
 3729738 3729739 AZC_3076 AZC_3077     TRUE 0.995 12.000 0.667 1.000 Y NA
 3729739 3729740 AZC_3077 AZC_3078     FALSE 0.049 326.000 0.000 1.000   NA
 3729740 3729741 AZC_3078 AZC_3079     FALSE 0.439 24.000 0.000 1.000   NA
 3729741 3729742 AZC_3079 AZC_3080     TRUE 0.770 7.000 0.000 1.000   NA
 3729742 3729743 AZC_3080 AZC_3081     FALSE 0.431 304.000 0.252 1.000   NA
 3729743 3729744 AZC_3081 AZC_3082     TRUE 0.974 10.000 0.000 0.003 Y NA
 3729744 3729745 AZC_3082 AZC_3083   ntrX FALSE 0.046 121.000 0.000 1.000 N NA
 3729745 3729746 AZC_3083 AZC_3084 ntrX ntrY TRUE 0.998 4.000 0.533 0.086 Y NA
 3729746 3729747 AZC_3084 AZC_3085 ntrY   TRUE 0.471 185.000 0.000 0.012 Y NA
 3729747 3729748 AZC_3085 AZC_3086   ntrC TRUE 0.488 146.000 0.000 0.020 Y NA
 3729748 3729749 AZC_3086 AZC_3087 ntrC ntrB TRUE 0.995 8.000 0.297 0.086 Y NA
 3729749 3729750 AZC_3087 AZC_3088 ntrB nifR3 TRUE 0.985 -3.000 0.094 1.000 N NA
 3729751 3729752 AZC_3089 AZC_3090   cinA TRUE 0.983 -3.000 0.061 NA   NA
 3729752 3729753 AZC_3090 AZC_3091 cinA   FALSE 0.047 234.000 0.000 NA   NA
 3729753 3729754 AZC_3091 AZC_3092     TRUE 0.991 2.000 0.344 NA   NA
 3729754 3729755 AZC_3092 AZC_3093     TRUE 0.996 -3.000 0.483 NA   NA
 3729755 3729756 AZC_3093 AZC_3094     FALSE 0.088 103.000 0.000 1.000   NA
 3729756 3729757 AZC_3094 AZC_3095   luxR TRUE 0.794 48.000 0.000 0.016 Y NA
 3729758 3729759 AZC_3096 AZC_3097     FALSE 0.042 154.000 0.000 1.000 N NA
 3729759 3729760 AZC_3097 AZC_3098     TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3729762 3729763 AZC_3100 AZC_3101     TRUE 0.798 27.000 0.071 NA   NA
 3729764 3729765 AZC_3102 AZC_3103     FALSE 0.032 308.000 0.000 1.000 N NA
 3729765 3729766 AZC_3103 AZC_3104     FALSE 0.039 519.000 0.000 NA   NA
 3729766 3729767 AZC_3104 AZC_3105     FALSE 0.063 119.000 0.000 NA   NA
 3729767 3729768 AZC_3105 AZC_3106     FALSE 0.081 99.000 0.000 NA   NA
 3729769 3729770 AZC_3107 AZC_3108     TRUE 0.995 -3.000 0.062 NA Y NA
 3729771 3729772 AZC_3109 AZC_3110     FALSE 0.067 114.000 0.000 NA   NA
 3729773 3729774 AZC_3111 AZC_3112     FALSE 0.073 107.000 0.000 NA   NA
 3729774 3729775 AZC_3112 AZC_3113     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3729776 3729777 AZC_3114 AZC_3115     TRUE 0.986 -3.000 0.084 NA   NA
 3729779 3729780 AZC_3117 AZC_3118     TRUE 0.998 -3.000 0.239 1.000 Y NA
 3729782 3729783 AZC_3120 AZC_3121     FALSE 0.028 591.000 0.000 1.000 N NA
 3729783 3729784 AZC_3121 AZC_3122     FALSE 0.102 284.000 0.000 0.086 N NA
 3729784 3729785 AZC_3122 AZC_3123     TRUE 0.919 2.000 0.000 0.095 N NA
 3729785 3729786 AZC_3123 AZC_3124     FALSE 0.065 116.000 0.000 NA   NA
 3729787 3729788 AZC_3125 AZC_3126     FALSE 0.184 54.000 0.000 NA   NA
 3729788 3729789 AZC_3126 AZC_3127     FALSE 0.032 331.000 0.000 1.000 N NA
 3729789 3729790 AZC_3127 AZC_3128     FALSE 0.083 97.000 0.000 NA   NA
 3729792 3729793 AZC_3130 AZC_3131     FALSE 0.422 90.000 0.071 NA   NA
 3729794 3729795 AZC_3132 AZC_3133     FALSE 0.063 120.000 0.000 NA   NA
 3729795 3729796 AZC_3133 AZC_3134     FALSE 0.113 83.000 0.000 NA   NA
 3729796 3729797 AZC_3134 AZC_3135     FALSE 0.058 141.000 0.000 NA   NA
 3729797 3729798 AZC_3135 AZC_3136     FALSE 0.311 79.000 0.008 NA   NA
 3729798 3729799 AZC_3136 AZC_3137     FALSE 0.247 37.000 0.000 NA   NA
 3729799 3729800 AZC_3137 AZC_3138     TRUE 0.989 -3.000 0.137 NA   NA
 3729800 3729801 AZC_3138 AZC_3139     TRUE 0.768 26.000 0.042 1.000   NA
 3729801 3729802 AZC_3139 AZC_3140     FALSE 0.288 82.000 0.007 NA   NA
 3729803 3729804 AZC_3141 AZC_3142     FALSE 0.045 270.000 0.000 NA   NA
 3729806 3729807 AZC_3144 AZC_3145     TRUE 0.987 -3.000 0.102 NA   NA
 3729809 3729810 AZC_3147 AZC_3148     TRUE 0.993 6.000 0.768 NA   NA
 3729810 3729811 AZC_3148 AZC_3149     TRUE 0.566 84.000 0.157 NA   NA
 3729811 3729812 AZC_3149 AZC_3150     FALSE 0.279 241.000 0.096 NA   NA
 3729812 3729813 AZC_3150 AZC_3151     TRUE 0.859 25.000 0.138 NA   NA
 3729813 3729814 AZC_3151 AZC_3152     FALSE 0.045 278.000 0.000 NA   NA
 3729815 3729816 AZC_trnT34 AZC_3153 trnT   FALSE 0.060 128.000 0.000 NA   NA
 3729818 3729819 AZC_3155 AZC_3156     FALSE 0.106 86.000 0.000 NA   NA
 3729820 3729821 AZC_3157 AZC_3158     TRUE 0.943 23.000 0.065 NA Y NA
 3729822 3729823 AZC_3159 AZC_3160     TRUE 0.613 40.000 0.039 1.000   NA
 3729823 3729824 AZC_3160 AZC_3161     TRUE 0.997 -3.000 0.038 0.081 Y NA
 3729824 3729825 AZC_3161 AZC_3162     TRUE 0.999 -3.000 0.472 1.000 Y NA
 3729825 3729826 AZC_3162 AZC_3163     TRUE 0.609 67.000 0.000 1.000 Y NA
 3729826 3729827 AZC_3163 AZC_3164     TRUE 0.999 5.000 0.795 0.081 Y NA
 3729827 3729828 AZC_3164 AZC_3165     FALSE 0.156 46.000 0.000 1.000 N NA
 3729829 3729830 AZC_3166 AZC_3167     TRUE 0.996 -10.000 0.222 0.059   NA
 3729830 3729831 AZC_3167 AZC_3168     TRUE 0.654 12.000 0.000 1.000   NA
 3729831 3729832 AZC_3168 AZC_3169     TRUE 0.995 9.000 0.294 0.081 Y NA
 3729832 3729833 AZC_3169 AZC_3170     TRUE 0.962 11.000 0.000 0.081 Y NA
 3729833 3729834 AZC_3170 AZC_3171     TRUE 0.976 8.000 0.000 0.019 Y NA
 3729834 3729835 AZC_3171 AZC_3172   dszA TRUE 0.847 -3.000 0.000 NA N NA
 3729835 3729836 AZC_3172 AZC_3173 dszA   FALSE 0.282 24.000 0.000 NA N NA
 3729837 3729838 AZC_3174 AZC_3175     TRUE 0.651 36.000 0.062 NA N NA
 3729840 3729841 AZC_3177 AZC_3178     FALSE 0.034 149.000 0.000 NA N NA
 3729841 3729842 AZC_3178 AZC_3179     FALSE 0.029 215.000 0.000 NA N NA
 3729845 3729846 AZC_3182 AZC_3183   marR FALSE 0.112 58.000 0.000 NA N NA
 3729848 3729849 AZC_3185 AZC_3186     TRUE 0.978 -25.000 0.027 NA   NA
 3729849 3729850 AZC_3186 AZC_3187     TRUE 0.679 10.000 0.000 NA   NA
 3729850 3729851 AZC_3187 AZC_3188     TRUE 0.998 6.000 0.742 1.000 Y NA
 3729851 3729852 AZC_3188 AZC_3189     TRUE 0.996 -3.000 0.032 0.072 Y NA
 3729852 3729853 AZC_3189 AZC_3190     TRUE 0.974 -3.000 0.029 1.000 N NA
 3729854 3729855 AZC_3191 AZC_3192     TRUE 0.925 87.000 0.615 NA Y NA
 3729855 3729856 AZC_3192 AZC_3193     TRUE 0.999 -3.000 0.643 0.080 Y NA
 3729856 3729857 AZC_3193 AZC_3194     TRUE 0.997 -3.000 0.174 1.000 Y NA
 3729857 3729858 AZC_3194 AZC_3195     TRUE 0.997 0.000 0.174 0.037 Y NA
 3729858 3729859 AZC_3195 AZC_3196     FALSE 0.060 128.000 0.000 NA   NA
 3729859 3729860 AZC_3196 AZC_3197     FALSE 0.041 388.000 0.000 NA   NA
 3729860 3729861 AZC_3197 AZC_3198   iclR FALSE 0.259 36.000 0.000 NA   NA
 3729861 3729862 AZC_3198 AZC_3199 iclR   FALSE 0.144 77.000 0.000 1.000   NA
 3729862 3729863 AZC_3199 AZC_3200     FALSE 0.129 83.000 0.000 1.000   NA
 3729863 3729864 AZC_3200 AZC_3201     TRUE 0.853 2.000 0.000 1.000   NA
 3729864 3729865 AZC_3201 AZC_3202     TRUE 0.990 5.000 0.263 0.080   NA
 3729865 3729866 AZC_3202 AZC_3203     FALSE 0.341 29.000 0.000 NA   NA
 3729866 3729867 AZC_3203 AZC_3204     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3729867 3729868 AZC_3204 AZC_3205     FALSE 0.148 49.000 0.000 1.000 N NA
 3729868 3729869 AZC_3205 AZC_3206     TRUE 0.999 -3.000 0.474 1.000 Y NA
 3729869 3729870 AZC_3206 AZC_3207     TRUE 0.999 -3.000 0.308 0.005 Y NA
 3729871 3729872 AZC_3208 AZC_3209     TRUE 0.779 5.000 0.000 NA   NA
 3729872 3729873 AZC_3209 AZC_3210     FALSE 0.053 175.000 0.000 NA   NA
 3729873 3729874 AZC_3210 AZC_3211     TRUE 0.463 13.000 0.000 NA N NA
 3729874 3729875 AZC_3211 AZC_3212     TRUE 0.849 24.000 0.000 1.000 Y NA
 3729878 3729879 AZC_3215 AZC_3216     TRUE 0.984 9.000 0.429 NA   NA
 3729879 3729880 AZC_3216 AZC_3217     TRUE 0.872 25.000 0.159 NA   NA
 3729880 3729881 AZC_3217 AZC_3218     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3729881 3729882 AZC_3218 AZC_3219     TRUE 0.966 25.000 0.714 NA   NA
 3729882 3729883 AZC_3219 AZC_3220     TRUE 0.988 11.000 0.714 NA   NA
 3729883 3729884 AZC_3220 AZC_3221     TRUE 0.989 5.000 0.429 NA   NA
 3729884 3729885 AZC_3221 AZC_3222     FALSE 0.380 134.000 0.143 NA   NA
 3729885 3729886 AZC_3222 AZC_3223   araC FALSE 0.053 257.000 0.000 1.000   NA
 3729886 3729887 AZC_3223 AZC_3224 araC   FALSE 0.356 115.000 0.111 1.000 N NA
 3729887 3729888 AZC_3224 AZC_3225     TRUE 0.989 2.000 0.278 1.000   NA
 3729888 3729889 AZC_3225 AZC_3226     FALSE 0.043 721.000 0.000 1.000   NA
 3729890 3729891 AZC_3227 AZC_3228     FALSE 0.072 108.000 0.000 NA   NA
 3729891 3729892 AZC_3228 AZC_3229     FALSE 0.228 40.000 0.000 NA   NA
 3729894 3729895 AZC_3231 AZC_3232   tadD TRUE 0.993 14.000 0.333 0.011 Y NA
 3729895 3729896 AZC_3232 AZC_3233 tadD   FALSE 0.244 108.000 0.000 0.011   NA
 3729896 3729897 AZC_3233 AZC_3234     FALSE 0.148 585.000 0.000 0.006   NA
 3729899 3729900 AZC_3236 AZC_3237     FALSE 0.055 166.000 0.000 NA   NA
 3729901 3729902 AZC_3238 AZC_3239   fecR TRUE 0.788 92.000 0.667 NA N NA
 3729902 3729903 AZC_3239 AZC_3240 fecR   FALSE 0.368 112.000 0.000 NA Y NA
 3729903 3729904 AZC_3240 AZC_3241     FALSE 0.421 23.000 0.000 NA   NA
 3729904 3729905 AZC_3241 AZC_3242   pvdS FALSE 0.228 40.000 0.000 NA   NA
 3729906 3729907 AZC_3243 AZC_3244     TRUE 0.997 -3.000 0.583 1.000 N NA
 3729907 3729908 AZC_3244 AZC_3245     TRUE 0.995 -3.000 0.364 NA N NA
 3729909 3729910 AZC_3246 AZC_3247     TRUE 0.882 68.000 0.200 1.000 Y NA
 3729910 3729911 AZC_3247 AZC_3248     FALSE 0.055 106.000 0.000 1.000 N NA
 3729911 3729912 AZC_3248 AZC_3249     TRUE 0.688 44.000 0.000 1.000 Y NA
 3729912 3729913 AZC_3249 AZC_3250     TRUE 0.823 3.000 0.000 NA   NA
 3729913 3729914 AZC_3250 AZC_3251     FALSE 0.235 39.000 0.000 NA   NA
 3729915 3729916 AZC_3252 AZC_3253     FALSE 0.050 305.000 0.000 1.000   NA
 3729916 3729917 AZC_3253 AZC_3254     FALSE 0.260 409.000 0.000 1.000 Y NA
 3729917 3729918 AZC_3254 AZC_3255     TRUE 0.970 48.000 0.750 NA Y NA
 3729918 3729919 AZC_3255 AZC_3256     FALSE 0.131 75.000 0.000 NA   NA
 3729920 3729921 AZC_3257 AZC_3258     TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3729921 3729922 AZC_3258 AZC_3259     TRUE 0.982 5.000 0.000 0.037 Y NA
 3729922 3729923 AZC_3259 AZC_3260     FALSE 0.421 23.000 0.000 NA   NA
 3729923 3729924 AZC_3260 AZC_3261     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3729925 3729926 AZC_3262 AZC_3263     TRUE 0.927 36.000 0.333 0.037   NA
 3729926 3729927 AZC_3263 AZC_trnR35   trnR FALSE 0.037 770.000 0.000 NA   NA
 3729927 3729928 AZC_trnR35 AZC_3264 trnR   FALSE 0.057 152.000 0.000 NA   NA
 3729929 3729930 AZC_3265 AZC_3266     FALSE 0.280 34.000 0.000 NA   NA
 3729931 3729932 AZC_3267 AZC_3268     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3729932 3729933 AZC_3268 AZC_3269     FALSE 0.064 118.000 0.000 NA   NA
 3729933 3729934 AZC_3269 AZC_3270     FALSE 0.142 71.000 0.000 NA   NA
 3729938 3729939 AZC_3274 AZC_3275     TRUE 0.997 11.000 0.550 0.001 Y NA
 3729939 3729940 AZC_3275 AZC_3276     TRUE 0.947 35.000 0.095 0.016 Y NA
 3729940 3729941 AZC_3276 AZC_3277     FALSE 0.035 241.000 0.000 1.000 N NA
 3729941 3729942 AZC_3277 AZC_3278     FALSE 0.274 311.000 0.000 1.000 Y NA
 3729942 3729943 AZC_3278 AZC_3279     TRUE 0.905 10.000 0.040 1.000 N NA
 3729943 3729944 AZC_3279 AZC_3280     TRUE 0.791 66.000 0.040 1.000 Y NA
 3729944 3729945 AZC_3280 AZC_3281     TRUE 0.931 84.000 0.600 1.000 Y NA
 3729945 3729946 AZC_3281 AZC_3282     TRUE 0.999 -16.000 0.600 1.000 Y NA
 3729946 3729947 AZC_3282 AZC_3283     TRUE 0.998 11.000 1.000 0.011 Y NA
 3729947 3729948 AZC_3283 AZC_3284     TRUE 0.989 -3.000 0.167 1.000 N NA
 3729950 3729951 AZC_3286 AZC_3287   hlyD TRUE 0.971 13.000 0.436 NA N NA
 3729951 3729952 AZC_3287 AZC_3288 hlyD nodT TRUE 0.887 75.000 0.265 1.000 Y NA
 3729953 3729954 AZC_3289 AZC_3290 tetR   FALSE 0.041 167.000 0.000 1.000 N NA
 3729956 3729957 AZC_3292 AZC_3293   luxR TRUE 0.998 -3.000 0.206 1.000 Y NA
 3729957 3729958 AZC_3293 AZC_3294 luxR   TRUE 0.496 121.000 0.235 NA   NA
 3729958 3729959 AZC_3294 AZC_3295     FALSE 0.044 301.000 0.000 NA   NA
 3729961 3729962 AZC_3297 AZC_3298     TRUE 0.995 -3.000 0.333 1.000   NA
 3729962 3729963 AZC_3298 AZC_3299     FALSE 0.040 171.000 0.000 1.000 N NA
 3729963 3729964 AZC_3299 AZC_3300   dctQ TRUE 0.998 -3.000 0.359 NA Y NA
 3729964 3729965 AZC_3300 AZC_3301 dctQ dctM TRUE 0.999 -3.000 0.900 NA Y NA
 3729966 3729967 AZC_3302 AZC_3303     TRUE 0.854 83.000 0.734 NA   NA
 3729967 3729968 AZC_3303 AZC_3304     TRUE 0.652 313.000 0.667 NA   NA
 3729968 3729969 AZC_3304 AZC_3305   hae1 FALSE 0.166 175.000 0.014 NA   NA
 3729969 3729970 AZC_3305 AZC_3306 hae1 hlyD TRUE 0.959 31.000 0.854 1.000 N NA
 3729971 3729972 AZC_3307 AZC_3308 secA   FALSE 0.048 226.000 0.000 NA   NA
 3729975 3729976 AZC_3311 AZC_3312     FALSE 0.067 114.000 0.000 NA   NA
 3729976 3729977 AZC_3312 AZC_3313     FALSE 0.031 347.000 0.000 1.000 N NA
 3729977 3729978 AZC_3313 AZC_3314     FALSE 0.039 475.000 0.000 NA   NA
 3729978 3729979 AZC_3314 AZC_3315     FALSE 0.123 231.000 0.003 NA   NA
 3729980 3729981 AZC_3316 AZC_3317     FALSE 0.054 172.000 0.000 NA   NA
 3729981 3729982 AZC_3317 AZC_3318     TRUE 0.967 10.000 0.220 NA   NA
 3729983 3729984 AZC_3319 AZC_3320   expE7 TRUE 0.850 34.000 0.231 NA   NA
 3729984 3729985 AZC_3320 AZC_3321 expE7 expE6 TRUE 0.991 4.000 0.462 NA   NA
 3729985 3729986 AZC_3321 AZC_3322 expE6 expE5 TRUE 0.986 9.000 0.500 NA   NA
 3729986 3729987 AZC_3322 AZC_3323 expE5 expE4 TRUE 0.991 10.000 0.800 1.000   NA
 3729987 3729988 AZC_3323 AZC_3324 expE4 expE3 TRUE 0.990 -3.000 0.152 1.000   NA
 3729988 3729989 AZC_3324 AZC_3325 expE3 expE2 TRUE 0.990 -3.000 0.152 NA   NA
 3729989 3729990 AZC_3325 AZC_3326 expE2 expE1 TRUE 0.772 135.000 0.833 NA   NA
 3729990 3729991 AZC_3326 AZC_3327 expE1 expD2 FALSE 0.047 403.000 0.000 1.000   NA
 3729991 3729992 AZC_3327 AZC_3328 expD2 expD1 TRUE 0.965 15.000 0.167 0.005   NA
 3729993 3729994 AZC_3329 AZC_3330 expG expC TRUE 0.894 57.000 0.667 1.000 N NA
 3729994 3729995 AZC_3330 AZC_3331 expC   FALSE 0.059 133.000 0.000 NA   NA
 3729995 3729996 AZC_3331 AZC_3332     FALSE 0.298 32.000 0.000 NA   NA
 3729997 3729998 AZC_3333 AZC_3334     FALSE 0.187 52.000 0.000 NA   NA
 3729998 3729999 AZC_3334 AZC_3335     TRUE 0.992 6.000 0.667 1.000 N NA
 3729999 3730000 AZC_3335 AZC_3336     TRUE 0.893 18.000 0.000 1.000 Y NA
 3730000 3730001 AZC_3336 AZC_3337     TRUE 0.986 18.000 0.390 NA Y NA
 3730001 3730002 AZC_3337 AZC_3338     TRUE 0.956 73.000 0.756 NA Y NA
 3730005 3730006 AZC_3341 AZC_3342 gntR   TRUE 0.720 5.000 0.000 1.000 N NA
 3730006 3730007 AZC_3342 AZC_3343     FALSE 0.055 164.000 0.000 NA   NA
 3730007 3730008 AZC_3343 AZC_3344     TRUE 0.713 111.000 0.562 NA   NA
 3730008 3730009 AZC_3344 AZC_3345     TRUE 0.998 -3.000 0.594 0.080 N NA
 3730009 3730010 AZC_3345 AZC_3346     TRUE 0.997 4.000 0.864 0.080 N NA
 3730010 3730011 AZC_3346 AZC_3347     FALSE 0.110 70.000 0.000 1.000 N NA
 3730011 3730012 AZC_3347 AZC_3348     TRUE 0.965 -3.000 0.000 0.057 N NA
 3730012 3730013 AZC_3348 AZC_3349     FALSE 0.034 265.000 0.000 1.000 N NA
 3730014 3730015 AZC_3350 AZC_3351     FALSE 0.197 60.000 0.000 1.000   NA
 3730015 3730016 AZC_3351 AZC_3352     TRUE 0.995 -3.000 0.353 NA   NA
 3730016 3730017 AZC_3352 AZC_3353     FALSE 0.262 114.000 0.038 NA   NA
 3730017 3730018 AZC_3353 AZC_3354     TRUE 0.879 31.000 0.250 1.000   NA
 3730018 3730019 AZC_3354 AZC_3355     TRUE 0.593 34.000 0.000 0.039   NA
 3730019 3730020 AZC_3355 AZC_3356     TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3730020 3730021 AZC_3356 AZC_3357   lysR FALSE 0.049 116.000 0.000 1.000 N NA
 3730022 3730023 AZC_3358 AZC_3359     FALSE 0.031 190.000 0.000 NA N NA
 3730023 3730024 AZC_3359 AZC_3360     FALSE 0.041 381.000 0.000 NA   NA
 3730024 3730025 AZC_3360 AZC_3361     FALSE 0.247 37.000 0.000 NA   NA
 3730026 3730027 AZC_3362 AZC_3363     FALSE 0.353 134.000 0.138 1.000 N NA
 3730027 3730028 AZC_3363 AZC_3364     TRUE 0.960 -3.000 0.008 NA N NA
 3730028 3730029 AZC_3364 AZC_3365     FALSE 0.370 59.000 0.012 NA N NA
 3730029 3730030 AZC_3365 AZC_3366     FALSE 0.444 22.000 0.000 NA   NA
 3730031 3730032 AZC_3367 AZC_3368     FALSE 0.439 24.000 0.000 1.000   NA
 3730032 3730033 AZC_3368 AZC_3369     FALSE 0.047 233.000 0.000 NA   NA
 3730036 3730037 AZC_3372 AZC_3373 ftsJ   TRUE 0.994 -3.000 0.316 NA N NA
 3730037 3730038 AZC_3373 AZC_3374     FALSE 0.142 152.000 0.007 1.000 N NA
 3730038 3730039 AZC_3374 AZC_3375     FALSE 0.172 41.000 0.000 1.000 N NA
 3730044 3730045 AZC_3380 AZC_3381     FALSE 0.046 457.000 0.000 1.000   NA
 3730045 3730046 AZC_3381 AZC_3382     TRUE 0.873 26.000 0.179 NA   NA
 3730046 3730047 AZC_3382 AZC_3383     TRUE 0.988 -3.000 0.118 NA   NA
 3730047 3730048 AZC_3383 AZC_3384     TRUE 0.980 -3.000 0.041 NA   NA
 3730048 3730049 AZC_3384 AZC_3385     TRUE 0.993 -3.000 0.233 NA   NA
 3730049 3730050 AZC_3385 AZC_3386     TRUE 0.984 -3.000 0.065 NA   NA
 3730051 3730052 AZC_3387 AZC_3388     FALSE 0.066 151.000 0.000 1.000   NA
 3730052 3730053 AZC_3388 AZC_3389     TRUE 0.787 97.000 0.198 1.000 Y NA
 3730053 3730054 AZC_3389 AZC_3390     FALSE 0.065 155.000 0.000 1.000   NA
 3730054 3730055 AZC_3390 AZC_3391   gntR TRUE 0.572 37.000 0.018 1.000   NA
 3730056 3730057 AZC_3392 AZC_3393 phnG phnH TRUE 1.000 0.000 0.967 0.002 Y NA
 3730057 3730058 AZC_3393 AZC_3394 phnH   TRUE 0.999 4.000 0.960 0.002 Y NA
 3730058 3730059 AZC_3394 AZC_3395     TRUE 0.999 -3.000 0.880 1.000 Y NA
 3730059 3730060 AZC_3395 AZC_3396     TRUE 0.977 -3.000 0.024 1.000   NA
 3730060 3730061 AZC_3396 AZC_3397   phnK FALSE 0.163 236.000 0.016 1.000   NA
 3730061 3730062 AZC_3397 AZC_3398 phnK phnL TRUE 1.000 -3.000 0.859 0.037 Y NA
 3730062 3730063 AZC_3398 AZC_3399 phnL   TRUE 0.970 16.000 0.104 1.000 Y NA
 3730063 3730064 AZC_3399 AZC_3400   phnN TRUE 0.994 -3.000 0.017 1.000 Y NA
 3730065 3730066 AZC_3401 AZC_3402     TRUE 0.984 1.000 0.182 NA   NA
 3730066 3730067 AZC_3402 AZC_3403     TRUE 0.891 12.000 0.040 NA   NA
 3730067 3730068 AZC_3403 AZC_3404     TRUE 0.477 83.000 0.080 NA   NA
 3730069 3730070 AZC_3405 AZC_3406     TRUE 0.886 23.000 0.062 0.057 N NA
 3730072 3730073 AZC_3408 AZC_3409     FALSE 0.053 176.000 0.000 NA   NA
 3730073 3730074 AZC_3409 AZC_3410   nifU TRUE 0.829 30.000 0.148 NA   NA
 3730074 3730075 AZC_3410 AZC_3411 nifU nifS TRUE 0.887 14.000 0.068 1.000 N NA
 3730075 3730076 AZC_3411 AZC_3412 nifS fixU FALSE 0.247 148.000 0.057 1.000 N NA
 3730076 3730077 AZC_3412 AZC_3413 fixU   TRUE 0.978 6.000 0.215 1.000   NA
 3730077 3730078 AZC_3413 AZC_3414   nifB FALSE 0.053 261.000 0.000 1.000   NA
 3730078 3730079 AZC_3414 AZC_3415 nifB fdxN TRUE 0.779 22.000 0.024 1.000   NA
 3730079 3730080 AZC_3415 AZC_3416 fdxN   TRUE 0.879 20.000 0.100 NA   NA
 3730080 3730081 AZC_3416 AZC_3417     TRUE 0.914 12.000 0.067 NA   NA
 3730081 3730082 AZC_3417 AZC_3418     TRUE 0.995 -10.000 0.154 0.011   NA
 3730082 3730083 AZC_3418 AZC_3419     TRUE 0.991 -3.000 0.171 1.000   NA
 3730083 3730084 AZC_3419 AZC_3420   nifZ TRUE 0.997 -3.000 0.286 0.004   NA
 3730084 3730085 AZC_3420 AZC_3421 nifZ   TRUE 0.775 73.000 0.360 NA   NA
 3730085 3730086 AZC_3421 AZC_3422     TRUE 0.741 47.000 0.182 NA   NA
 3730086 3730087 AZC_3422 AZC_3423     TRUE 0.989 -3.000 0.137 NA   NA
 3730087 3730088 AZC_3423 AZC_3424     FALSE 0.189 145.000 0.026 1.000 N NA
 3730088 3730089 AZC_3424 AZC_3425     FALSE 0.118 292.000 0.000 0.058 N NA
 3730091 3730092 AZC_3427 AZC_3428     TRUE 0.751 42.000 0.167 NA   NA
 3730092 3730093 AZC_3428 AZC_3429     TRUE 0.950 19.000 0.333 NA   NA
 3730093 3730094 AZC_3429 AZC_3430     FALSE 0.363 74.000 0.016 NA   NA
 3730095 3730096 AZC_3431 AZC_3432     TRUE 0.578 94.000 0.222 NA   NA
 3730096 3730097 AZC_3432 AZC_3433     TRUE 0.964 14.000 0.333 NA   NA
 3730097 3730098 AZC_3433 AZC_3434     TRUE 0.461 21.000 0.000 NA   NA
 3730098 3730099 AZC_3434 AZC_3435     TRUE 0.709 25.000 0.014 1.000   NA
 3730099 3730100 AZC_3435 AZC_3436     FALSE 0.176 150.000 0.009 1.000   NA
 3730101 3730102 AZC_3437 AZC_3438     TRUE 0.823 34.000 0.216 NA N NA
 3730103 3730104 AZC_3439 AZC_3440     TRUE 0.990 -3.000 0.158 NA   NA
 3730104 3730105 AZC_3440 AZC_3441     TRUE 0.989 -3.000 0.034 0.057   NA
 3730105 3730106 AZC_3441 AZC_3442     TRUE 0.910 9.000 0.034 1.000 N NA
 3730107 3730108 AZC_3443 AZC_3444 nifH1 nifQ FALSE 0.404 205.000 0.047 0.004   NA
 3730108 3730109 AZC_3444 AZC_3445 nifQ   TRUE 0.566 16.000 0.000 1.000   NA
 3730109 3730110 AZC_3445 AZC_3446   nifW FALSE 0.057 206.000 0.000 1.000   NA
 3730110 3730111 AZC_3446 AZC_3447 nifW fixA FALSE 0.369 285.000 0.189 1.000   NA
 3730111 3730112 AZC_3447 AZC_3448 fixA fixB TRUE 0.987 23.000 0.330 0.016 Y NA
 3730112 3730113 AZC_3448 AZC_3449 fixB fixC TRUE 0.996 12.000 0.491 0.058 Y NA
 3730113 3730114 AZC_3449 AZC_3450 fixC fixX TRUE 0.913 107.000 0.461 0.058 Y NA
 3730114 3730115 AZC_3450 AZC_3451 fixX   FALSE 0.365 27.000 0.000 NA   NA
 3730115 3730116 AZC_3451 AZC_3452     FALSE 0.038 579.000 0.000 NA   NA
 3730116 3730117 AZC_3452 AZC_3453     TRUE 1.000 -3.000 0.870 0.007 Y NA
 3730117 3730118 AZC_3453 AZC_3454     TRUE 0.982 11.000 0.466 1.000   NA
 3730118 3730119 AZC_3454 AZC_3455   fdhD TRUE 0.600 159.000 0.180 0.002   NA
 3730119 3730120 AZC_3455 AZC_3456 fdhD   TRUE 0.884 80.000 0.458 0.002   NA
 3730121 3730122 AZC_3457 AZC_3458     FALSE 0.290 157.000 0.087 1.000 N NA
 3730122 3730123 AZC_3458 AZC_3459     FALSE 0.195 48.000 0.000 NA   NA
 3730123 3730124 AZC_3459 AZC_3460     TRUE 0.681 96.000 0.386 NA   NA
 3730124 3730125 AZC_3460 AZC_3461     TRUE 0.782 43.000 0.200 1.000   NA
 3730125 3730126 AZC_3461 AZC_3462     TRUE 0.815 39.000 0.226 NA   NA
 3730126 3730127 AZC_3462 AZC_3463   terC FALSE 0.149 69.000 0.000 NA   NA
 3730127 3730128 AZC_3463 AZC_3464 terC   FALSE 0.057 207.000 0.000 1.000   NA
 3730128 3730129 AZC_3464 AZC_3465     FALSE 0.066 148.000 0.000 1.000   NA
 3730131 3730132 AZC_3467 AZC_3468   fkbM TRUE 0.971 3.000 0.080 NA   NA
 3730133 3730134 AZC_3469 AZC_3470     FALSE 0.078 101.000 0.000 NA   NA
 3730134 3730135 AZC_3470 AZC_3471     TRUE 0.986 -3.000 0.107 1.000 N NA
 3730135 3730136 AZC_3471 AZC_3472     FALSE 0.145 51.000 0.000 1.000 N NA
 3730136 3730137 AZC_3472 AZC_3473     TRUE 0.977 -3.000 0.029 NA   NA
 3730137 3730138 AZC_3473 AZC_3474     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3730138 3730139 AZC_3474 AZC_3475     TRUE 0.994 -3.000 0.286 NA   NA
 3730140 3730141 AZC_3476 AZC_3477     TRUE 0.994 -3.000 0.033 NA Y NA
 3730141 3730142 AZC_3477 AZC_3478     TRUE 0.996 -3.000 0.457 1.000   NA
 3730142 3730143 AZC_3478 AZC_3479     TRUE 0.989 -3.000 0.119 1.000   NA
 3730143 3730144 AZC_3479 AZC_3480     TRUE 0.999 -3.000 0.624 1.000 Y NA
 3730144 3730145 AZC_3480 AZC_3481     FALSE 0.034 266.000 0.000 1.000 N NA
 3730145 3730146 AZC_3481 AZC_3482     FALSE 0.046 249.000 0.000 NA   NA
 3730146 3730147 AZC_3482 AZC_3483     TRUE 0.986 14.000 0.812 NA   NA
 3730148 3730149 AZC_3484 AZC_3485     TRUE 0.655 59.000 0.120 NA   NA
 3730149 3730150 AZC_3485 AZC_3486     TRUE 0.986 8.000 0.450 NA   NA
 3730150 3730151 AZC_3486 AZC_3487   doxX TRUE 0.831 56.000 0.367 NA   NA
 3730151 3730152 AZC_3487 AZC_3488 doxX   FALSE 0.054 170.000 0.000 NA   NA
 3730152 3730153 AZC_3488 AZC_3489     TRUE 0.594 255.000 0.495 1.000   NA
 3730153 3730154 AZC_3489 AZC_3490     TRUE 0.640 85.000 0.254 1.000 N NA
 3730154 3730155 AZC_3490 AZC_3491     FALSE 0.045 127.000 0.000 1.000 N NA
 3730155 3730156 AZC_3491 AZC_3492     FALSE 0.166 181.000 0.011 1.000   NA
 3730156 3730157 AZC_3492 AZC_3493     FALSE 0.039 462.000 0.000 NA   NA
 3730161 3730162 AZC_3497 AZC_3498     TRUE 0.494 84.000 0.085 1.000   NA
 3730163 3730164 AZC_3499 AZC_3500     TRUE 0.993 22.000 0.630 0.058 Y NA
 3730164 3730165 AZC_3500 AZC_3501     TRUE 0.914 37.000 0.011 0.001 Y NA
 3730166 3730167 AZC_3502 AZC_3503     FALSE 0.307 90.000 0.033 1.000 N NA
 3730167 3730168 AZC_3503 AZC_3504     FALSE 0.274 84.000 0.006 NA   NA
 3730169 3730170 AZC_3505 AZC_3506     TRUE 0.976 -3.000 0.026 NA   NA
 3730170 3730171 AZC_3506 AZC_3507     TRUE 0.984 -3.000 0.063 NA   NA
 3730171 3730172 AZC_3507 AZC_3508     TRUE 0.995 -3.000 0.346 NA   NA
 3730173 3730174 AZC_3509 AZC_3510     TRUE 0.986 12.000 0.697 NA   NA
 3730174 3730175 AZC_3510 AZC_3511     TRUE 0.998 -3.000 0.816 NA   NA
 3730175 3730176 AZC_3511 AZC_3512     TRUE 0.940 44.000 0.876 NA   NA
 3730177 3730178 AZC_3513 AZC_3514     FALSE 0.043 878.000 0.000 1.000   NA
 3730178 3730179 AZC_3514 AZC_3515     FALSE 0.039 181.000 0.000 1.000 N NA
 3730179 3730180 AZC_3515 AZC_3516     FALSE 0.051 112.000 0.000 1.000 N NA
 3730180 3730181 AZC_3516 AZC_3517     FALSE 0.042 151.000 0.000 1.000 N NA
 3730181 3730182 AZC_3517 AZC_3518     TRUE 1.000 -3.000 0.758 0.079 Y NA
 3730182 3730183 AZC_3518 AZC_3519     TRUE 0.994 11.000 0.545 1.000 Y NA
 3730185 3730186 AZC_3520 AZC_3521     FALSE 0.120 67.000 0.000 1.000 N NA
 3730186 3730187 AZC_3521 AZC_3522     TRUE 0.872 0.000 0.000 1.000   NA
 3730187 3730188 AZC_3522 AZC_3523     FALSE 0.128 76.000 0.000 NA   NA
 3730188 3730189 AZC_3523 AZC_3524     FALSE 0.046 253.000 0.000 NA   NA
 3730190 3730191 AZC_3525 AZC_3526     FALSE 0.149 69.000 0.000 NA   NA
 3730192 3730193 AZC_3527 AZC_3528     FALSE 0.083 97.000 0.000 NA   NA
 3730196 3730197 AZC_3531 AZC_3532     FALSE 0.043 319.000 0.000 NA   NA
 3730197 3730198 AZC_3532 AZC_3533   hpa2 TRUE 0.992 -3.000 0.205 1.000   NA
 3730199 3730200 AZC_3534 AZC_3535     FALSE 0.049 332.000 0.000 1.000   NA
 3730201 3730202 AZC_3536 AZC_3537     FALSE 0.044 295.000 0.000 NA   NA
 3730202 3730203 AZC_3537 AZC_3538     FALSE 0.100 95.000 0.000 1.000   NA
 3730203 3730204 AZC_3538 AZC_3539     FALSE 0.040 169.000 0.000 1.000 N NA
 3730204 3730205 AZC_3539 AZC_3540     TRUE 0.907 27.000 0.000 0.008 Y NA
 3730205 3730206 AZC_3540 AZC_3541     FALSE 0.051 113.000 0.000 1.000 N NA
 3730206 3730207 AZC_3541 AZC_3542     FALSE 0.126 77.000 0.000 NA   NA
 3730208 3730209 AZC_3543 AZC_3544     TRUE 0.995 3.000 0.745 NA   NA
 3730210 3730211 AZC_3545 AZC_3546     TRUE 0.572 70.000 0.000 NA Y NA
 3730213 3730214 AZC_3548 AZC_3549     FALSE 0.059 129.000 0.000 NA   NA
 3730214 3730215 AZC_3549 AZC_3550     TRUE 0.938 12.000 0.133 NA   NA
 3730215 3730216 AZC_3550 AZC_trnK37   trnK FALSE 0.044 291.000 0.000 NA   NA
 3730216 3730217 AZC_trnK37 AZC_trnK38 trnK trnK FALSE 0.117 81.000 0.000 NA   NA
 3730217 3730218 AZC_trnK38 AZC_3551 trnK   FALSE 0.046 247.000 0.000 NA   NA
 3730219 3730220 AZC_3552 AZC_3553 thiG thiS TRUE 0.861 59.000 0.104 1.000 Y NA
 3730220 3730221 AZC_3553 AZC_3554 thiS   TRUE 0.827 80.000 0.625 1.000 N NA
 3730221 3730222 AZC_3554 AZC_3555   marR FALSE 0.144 52.000 0.000 1.000 N NA
 3730223 3730224 AZC_3556 AZC_3557     TRUE 0.907 8.000 0.029 NA N NA
 3730224 3730225 AZC_3557 AZC_3558     FALSE 0.044 134.000 0.000 1.000 N NA
 3730225 3730226 AZC_3558 AZC_3559     FALSE 0.131 208.000 0.000 0.057 N NA
 3730227 3730228 AZC_3560 AZC_3561     FALSE 0.176 447.000 0.000 0.001   NA
 3730228 3730229 AZC_3561 AZC_3562     TRUE 0.937 7.000 0.000 0.001   NA
 3730229 3730230 AZC_3562 AZC_3563     TRUE 0.995 -3.000 0.333 NA   NA
 3730231 3730232 AZC_3564 AZC_3565     TRUE 1.000 -3.000 0.859 0.000 Y NA
 3730237 3730238 AZC_trnL39 AZC_3570 trnL   FALSE 0.074 106.000 0.000 NA   NA
 3730238 3730239 AZC_3570 AZC_3571     FALSE 0.038 657.000 0.000 NA   NA
 3730239 3730240 AZC_3571 AZC_3572     FALSE 0.042 342.000 0.000 NA   NA
 3730240 3730241 AZC_3572 AZC_3573     FALSE 0.081 99.000 0.000 NA   NA
 3730243 3730244 AZC_3575 AZC_3576     FALSE 0.446 104.000 0.143 NA   NA
 3730244 3730245 AZC_3576 AZC_3577     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3730245 3730246 AZC_3577 AZC_3578     TRUE 0.528 16.000 0.000 NA   NA
 3730246 3730247 AZC_3578 AZC_3579     TRUE 0.742 7.000 0.000 NA   NA
 3730247 3730248 AZC_3579 AZC_3580     FALSE 0.178 58.000 0.000 NA   NA
 3730248 3730249 AZC_3580 AZC_3581     TRUE 0.704 9.000 0.000 NA   NA
 3730249 3730250 AZC_3581 AZC_3582     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3730250 3730251 AZC_3582 AZC_3583     FALSE 0.047 236.000 0.000 NA   NA
 3730251 3730252 AZC_3583 AZC_3584     TRUE 0.995 4.000 0.800 NA   NA
 3730252 3730253 AZC_3584 AZC_3585     TRUE 0.715 102.000 0.500 NA   NA
 3730253 3730254 AZC_3585 AZC_3586     FALSE 0.039 518.000 0.000 NA   NA
 3730254 3730255 AZC_3586 AZC_3587     TRUE 0.679 10.000 0.000 NA   NA
 3730255 3730256 AZC_3587 AZC_3588     TRUE 0.572 173.000 0.400 NA   NA
 3730256 3730257 AZC_3588 AZC_3589     FALSE 0.037 701.000 0.000 NA   NA
 3730257 3730258 AZC_3589 AZC_3590     TRUE 0.911 -25.000 0.000 NA   NA
 3730258 3730259 AZC_3590 AZC_3591     TRUE 0.823 3.000 0.000 NA   NA
 3730259 3730260 AZC_3591 AZC_3592     FALSE 0.235 39.000 0.000 NA   NA
 3730260 3730261 AZC_3592 AZC_3593     TRUE 0.882 -15.000 0.000 1.000 N NA
 3730261 3730262 AZC_3593 AZC_3594     TRUE 0.912 -7.000 0.000 NA   NA
 3730262 3730263 AZC_3594 AZC_3595     TRUE 0.779 5.000 0.000 NA   NA
 3730263 3730264 AZC_3595 AZC_3596     TRUE 0.568 14.000 0.000 NA   NA
 3730264 3730265 AZC_3596 AZC_3597     TRUE 0.905 5.000 0.002 NA   NA
 3730265 3730266 AZC_3597 AZC_3598     FALSE 0.429 71.000 0.000 0.004   NA
 3730266 3730267 AZC_3598 AZC_3599     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3730267 3730268 AZC_3599 AZC_3600     TRUE 0.855 0.000 0.000 NA   NA
 3730268 3730269 AZC_3600 AZC_3601     FALSE 0.087 95.000 0.000 NA   NA
 3730269 3730270 AZC_3601 AZC_3602     FALSE 0.041 401.000 0.000 NA   NA
 3730270 3730271 AZC_3602 AZC_3603     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3730271 3730272 AZC_3603 AZC_3604     TRUE 0.841 1.000 0.000 NA   NA
 3730272 3730273 AZC_3604 AZC_3605     FALSE 0.054 169.000 0.000 NA   NA
 3730273 3730274 AZC_3605 AZC_3606     FALSE 0.060 128.000 0.000 NA   NA
 3730274 3730275 AZC_3606 AZC_3607     FALSE 0.395 103.000 0.000 NA Y NA
 3730275 3730276 AZC_3607 AZC_3608     FALSE 0.040 427.000 0.000 NA   NA
 3730276 3730277 AZC_3608 AZC_3609     FALSE 0.161 189.000 0.013 NA   NA
 3730277 3730278 AZC_3609 AZC_3610     FALSE 0.290 87.000 0.013 NA   NA
 3730278 3730279 AZC_3610 AZC_3611     TRUE 0.926 5.000 0.014 NA   NA
 3730279 3730280 AZC_3611 AZC_3612   sufS TRUE 0.994 -3.000 0.309 NA   NA
 3730280 3730281 AZC_3612 AZC_3613 sufS sufD FALSE 0.380 180.000 0.193 1.000 N NA
 3730281 3730282 AZC_3613 AZC_3614 sufD sufC TRUE 0.999 -3.000 0.482 1.000 Y NA
 3730282 3730283 AZC_3614 AZC_3615 sufC sufB TRUE 0.815 205.000 0.466 1.000 Y NA
 3730283 3730284 AZC_3615 AZC_3616 sufB   TRUE 0.648 49.000 0.109 1.000 N NA
 3730288 3730289 AZC_3620 AZC_3621     FALSE 0.077 102.000 0.000 NA   NA
 3730290 3730291 AZC_3622 AZC_3623     FALSE 0.046 265.000 0.000 NA   NA
 3730292 3730293 AZC_3624 AZC_3625     FALSE 0.218 143.000 0.041 1.000 N NA
 3730293 3730294 AZC_3625 AZC_3626     TRUE 0.777 246.000 0.396 1.000 Y NA
 3730295 3730296 AZC_3627 AZC_3628     FALSE 0.050 315.000 0.000 1.000   NA
 3730296 3730297 AZC_3628 AZC_3629     FALSE 0.053 249.000 0.000 1.000   NA
 3730297 3730298 AZC_3629 AZC_3630     TRUE 0.709 70.000 0.007 1.000 Y NA
 3730298 3730299 AZC_3630 AZC_3631     TRUE 0.973 14.000 0.089 1.000 Y NA
 3730299 3730300 AZC_3631 AZC_3632     FALSE 0.083 97.000 0.000 NA   NA
 3730301 3730302 AZC_3633 AZC_3634     FALSE 0.107 452.000 0.000 0.057 N NA
 3730302 3730303 AZC_3634 AZC_3635     FALSE 0.344 180.000 0.154 1.000 N NA
 3730303 3730304 AZC_3635 AZC_3636     FALSE 0.165 201.000 0.000 0.038   NA
 3730308 3730309 AZC_3640 AZC_3641     TRUE 0.776 47.000 0.222 NA   NA
 3730310 3730311 AZC_3642 AZC_3643     TRUE 0.573 104.000 0.299 1.000 N NA
 3730311 3730312 AZC_3643 AZC_3644     FALSE 0.037 831.000 0.000 NA   NA
 3730312 3730313 AZC_3644 AZC_3645     FALSE 0.077 102.000 0.000 NA   NA
 3730313 3730314 AZC_3645 AZC_3646     FALSE 0.153 68.000 0.000 NA   NA
 3730315 3730316 AZC_3647 AZC_3648     FALSE 0.070 123.000 0.000 1.000   NA
 3730317 3730318 AZC_3649 AZC_3650     TRUE 0.998 -7.000 0.273 1.000 Y NA
 3730318 3730319 AZC_3650 AZC_3651     TRUE 0.848 36.000 0.000 0.016 Y NA
 3730321 3730322 AZC_3653 AZC_3654   argK FALSE 0.057 209.000 0.000 1.000   NA
 3730322 3730323 AZC_3654 AZC_3655 argK   FALSE 0.047 120.000 0.000 1.000 N NA
 3730326 3730327 AZC_3658 AZC_3659     FALSE 0.049 211.000 0.000 NA   NA
 3730328 3730329 AZC_3660 AZC_3661     FALSE 0.353 57.000 0.004 1.000 N NA
 3730330 3730331 AZC_3662 AZC_3663     FALSE 0.157 67.000 0.000 NA   NA
 3730331 3730332 AZC_3663 AZC_3664     FALSE 0.099 89.000 0.000 NA   NA
 3730332 3730333 AZC_3664 AZC_3665     TRUE 0.481 22.000 0.000 1.000   NA
 3730333 3730334 AZC_3665 AZC_3666     TRUE 0.961 23.000 0.149 1.000 Y NA
 3730336 3730337 AZC_3668 AZC_3669     FALSE 0.162 139.000 0.005 1.000   NA
 3730339 3730340 AZC_3671 AZC_3672     FALSE 0.057 150.000 0.000 NA   NA
 3730340 3730341 AZC_3672 AZC_3673     TRUE 0.855 0.000 0.000 NA   NA
 3730341 3730342 AZC_3673 AZC_3674     FALSE 0.142 71.000 0.000 NA   NA
 3730342 3730343 AZC_3674 AZC_3675   exsB TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3730343 3730344 AZC_3675 AZC_3676 exsB   TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3730344 3730345 AZC_3676 AZC_3677     FALSE 0.069 83.000 0.000 NA N NA
 3730346 3730347 AZC_3678 AZC_3679 dnaJ cobS FALSE 0.258 120.000 0.037 1.000   NA
 3730347 3730348 AZC_3679 AZC_3680 cobS cobT TRUE 0.893 75.000 0.433 0.001   NA
 3730348 3730349 AZC_3680 AZC_3681 cobT   TRUE 0.990 0.000 0.260 NA   NA
 3730350 3730351 AZC_3682 AZC_3683     TRUE 0.694 51.000 0.142 NA   NA
 3730353 3730354 AZC_3685 AZC_3686     FALSE 0.061 123.000 0.000 NA   NA
 3730354 3730355 AZC_3686 AZC_3687     FALSE 0.055 165.000 0.000 NA   NA
 3730356 3730357 AZC_3688 AZC_3689   hlyD TRUE 0.731 75.000 0.286 1.000   NA
 3730357 3730358 AZC_3689 AZC_3690 hlyD acr TRUE 0.997 0.000 0.667 0.099 N NA
 3730358 3730359 AZC_3690 AZC_3691 acr   FALSE 0.032 307.000 0.000 1.000 N NA
 3730359 3730360 AZC_3691 AZC_3692     TRUE 0.999 -7.000 0.914 1.000 Y NA
 3730360 3730361 AZC_3692 AZC_3693   yaeC TRUE 0.946 24.000 0.091 NA Y NA
 3730362 3730363 AZC_3694 AZC_3695     FALSE 0.060 126.000 0.000 NA   NA
 3730366 3730367 AZC_3698 AZC_3699     TRUE 0.990 0.000 0.273 1.000   NA
 3730367 3730368 AZC_3699 AZC_3700     TRUE 0.989 -3.000 0.133 NA   NA
 3730368 3730369 AZC_3700 AZC_3701     FALSE 0.198 47.000 0.000 NA   NA
 3730369 3730370 AZC_3701 AZC_3702     TRUE 0.959 -3.000 0.006 NA N NA
 3730370 3730371 AZC_3702 AZC_3703   arsR FALSE 0.106 86.000 0.000 NA   NA
 3730374 3730375 AZC_3706 AZC_3707     FALSE 0.076 103.000 0.000 NA   NA
 3730375 3730376 AZC_3707 AZC_trnA40   trnA FALSE 0.052 180.000 0.000 NA   NA
 3730376 3730377 AZC_trnA40 AZC_3708 trnA ftsY FALSE 0.059 130.000 0.000 NA   NA
 3730377 3730378 AZC_3708 AZC_3709 ftsY   TRUE 0.977 -3.000 0.042 1.000 N NA
 3730378 3730379 AZC_3709 AZC_3710     TRUE 0.973 3.000 0.109 1.000 N NA
 3730380 3730381 AZC_3711 AZC_3712     FALSE 0.095 68.000 0.000 NA N NA
 3730381 3730382 AZC_3712 AZC_3713     TRUE 0.450 16.000 0.000 1.000 N NA
 3730382 3730383 AZC_3713 AZC_3714     FALSE 0.038 189.000 0.000 1.000 N NA
 3730384 3730385 AZC_3715 AZC_3716     TRUE 0.984 -3.000 0.069 NA   NA
 3730385 3730386 AZC_3716 AZC_3717   sppA FALSE 0.405 109.000 0.142 1.000 N NA
 3730386 3730387 AZC_3717 AZC_3718 sppA   FALSE 0.044 129.000 0.000 1.000 N NA
 3730387 3730388 AZC_3718 AZC_3719     FALSE 0.042 158.000 0.000 1.000 N NA
 3730388 3730389 AZC_3719 AZC_3720     FALSE 0.047 386.000 0.000 1.000   NA
 3730394 3730395 AZC_3724 AZC_3725     TRUE 0.997 -3.000 0.511 NA   NA
 3730396 3730397 AZC_3726 AZC_3727     FALSE 0.428 679.000 0.000 0.001 Y NA
 3730399 3730400 AZC_3729 AZC_3730     TRUE 0.989 -3.000 0.135 NA   NA
 3730400 3730401 AZC_3730 AZC_3731     FALSE 0.059 129.000 0.000 NA   NA
 3730402 3730403 AZC_3732 AZC_3733   cysT FALSE 0.043 332.000 0.000 NA   NA
 3730403 3730404 AZC_3733 AZC_3734 cysT cysW TRUE 0.996 5.000 0.583 0.001 N NA
 3730406 3730407 AZC_3736 AZC_3737     TRUE 0.659 70.000 0.179 NA   NA
 3730409 3730410 AZC_3739 AZC_3740 maoC   FALSE 0.028 628.000 0.000 1.000 N NA
 3730412 3730413 AZC_3742 AZC_3743     FALSE 0.033 299.000 0.000 1.000 N NA
 3730413 3730414 AZC_3743 AZC_3744     TRUE 0.995 11.000 0.291 0.000 Y NA
 3730414 3730415 AZC_3744 AZC_3745     TRUE 0.999 2.000 0.705 0.001 Y NA
 3730415 3730416 AZC_3745 AZC_3746     TRUE 0.967 81.000 0.604 0.001 Y NA
 3730419 3730420 AZC_3749 AZC_3750     FALSE 0.293 386.000 0.158 1.000 N NA
 3730420 3730421 AZC_3750 AZC_3751     TRUE 0.989 -3.000 0.058 0.069 N NA
 3730421 3730422 AZC_3751 AZC_3752     TRUE 0.942 10.000 0.029 0.069 N NA
 3730422 3730423 AZC_3752 AZC_3753     FALSE 0.067 137.000 0.000 1.000   NA
 3730423 3730424 AZC_3753 AZC_3754     TRUE 0.822 85.000 0.600 1.000   NA
 3730425 3730426 AZC_3755 AZC_3756     TRUE 0.987 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3730426 3730427 AZC_3756 AZC_3757   bioY TRUE 0.992 -3.000 0.211 NA   NA
 3730427 3730428 AZC_3757 AZC_3758 bioY   FALSE 0.259 36.000 0.000 NA   NA
 3730428 3730429 AZC_3758 AZC_3759     FALSE 0.040 428.000 0.000 NA   NA
 3730429 3730430 AZC_3759 AZC_3760     TRUE 0.998 10.000 0.700 0.056 Y NA
 3730430 3730431 AZC_3760 AZC_3761     TRUE 0.988 -3.000 0.125 NA   NA
 3730432 3730433 AZC_3762 AZC_3763     TRUE 0.490 14.000 0.000 1.000 N NA
 3730433 3730434 AZC_3763 AZC_3764     TRUE 0.999 -3.000 0.626 0.098 Y NA
 3730435 3730436 AZC_3765 AZC_3766     FALSE 0.036 214.000 0.000 1.000 N NA
 3730439 3730440 AZC_3769 AZC_3770     TRUE 0.997 -3.000 0.588 NA   NA
 3730441 3730442 AZC_3771 AZC_3772 lysR   TRUE 0.996 -3.000 0.471 1.000 N NA
 3730442 3730443 AZC_3772 AZC_3773     TRUE 0.781 44.000 0.059 0.010   NA
 3730443 3730444 AZC_3773 AZC_3774     TRUE 0.994 -3.000 0.250 1.000   NA
 3730444 3730445 AZC_3774 AZC_3775     TRUE 0.997 4.000 0.250 0.077 Y NA
 3730445 3730446 AZC_3775 AZC_3776     TRUE 0.996 4.000 0.286 1.000 Y NA
 3730446 3730447 AZC_3776 AZC_3777     TRUE 0.986 6.000 0.056 1.000 Y NA
 3730447 3730448 AZC_3777 AZC_3778     TRUE 0.976 -3.000 0.000 0.008   NA
 3730448 3730449 AZC_3778 AZC_3779     TRUE 0.498 21.000 0.000 1.000   NA
 3730449 3730450 AZC_3779 AZC_3780     TRUE 0.678 7.000 0.000 1.000 N NA
 3730450 3730451 AZC_3780 AZC_3781   rebB FALSE 0.044 308.000 0.000 NA   NA
 3730451 3730452 AZC_3781 AZC_3782 rebB rebB FALSE 0.056 156.000 0.000 NA   NA
 3730452 3730453 AZC_3782 AZC_3783 rebB rebB FALSE 0.052 185.000 0.000 NA   NA
 3730453 3730454 AZC_3783 AZC_3784 rebB   TRUE 0.663 79.000 0.222 NA   NA
 3730454 3730455 AZC_3784 AZC_3785     TRUE 0.647 11.000 0.000 NA   NA
 3730455 3730456 AZC_3785 AZC_3786     FALSE 0.190 50.000 0.000 NA   NA
 3730456 3730457 AZC_3786 AZC_3787     FALSE 0.142 71.000 0.000 NA   NA
 3730457 3730458 AZC_3787 AZC_3788     FALSE 0.377 26.000 0.000 NA   NA
 3730459 3730460 AZC_3789 AZC_3790     FALSE 0.204 110.000 0.007 1.000   NA
 3730461 3730462 AZC_3791 AZC_trnG42   trnG FALSE 0.048 222.000 0.000 NA   NA
 3730462 3730463 AZC_trnG42 AZC_3792 trnG nodD FALSE 0.036 1282.000 0.000 NA   NA
 3730464 3730465 AZC_3793 AZC_3794     FALSE 0.103 87.000 0.000 NA   NA
 3730465 3730466 AZC_3794 AZC_3795     FALSE 0.094 91.000 0.000 NA   NA
 3730466 3730467 AZC_3795 AZC_3796     FALSE 0.192 49.000 0.000 NA   NA
 3730467 3730468 AZC_3796 AZC_3797     TRUE 0.992 12.000 0.583 0.001   NA
 3730468 3730469 AZC_3797 AZC_3798     TRUE 0.999 1.000 0.917 0.001   NA
 3730469 3730470 AZC_3798 AZC_3799     TRUE 0.914 28.000 0.318 NA   NA
 3730470 3730471 AZC_3799 AZC_3800     TRUE 0.678 73.000 0.208 NA   NA
 3730475 3730476 AZC_3804 AZC_3805     FALSE 0.046 252.000 0.000 NA   NA
 3730476 3730477 AZC_3805 AZC_3806     TRUE 0.869 83.000 0.087 0.003 Y NA
 3730477 3730478 AZC_3806 AZC_3807     FALSE 0.310 31.000 0.000 NA   NA
 3730478 3730479 AZC_3807 AZC_3808     FALSE 0.036 1422.000 0.000 NA   NA
 3730479 3730480 AZC_3808 AZC_3809     TRUE 0.994 0.000 0.250 0.055   NA
 3730480 3730481 AZC_3809 AZC_3810   noeC TRUE 0.595 81.000 0.192 1.000 N NA
 3730481 3730482 AZC_3810 AZC_3811 noeC nodZ FALSE 0.060 181.000 0.000 1.000   NA
 3730482 3730483 AZC_3811 AZC_3812 nodZ nodJ TRUE 0.713 30.000 0.000 0.001   NA
 3730483 3730484 AZC_3812 AZC_3813 nodJ nodI TRUE 0.956 -3.000 0.000 0.090 N NA
 3730484 3730485 AZC_3813 AZC_3814 nodI nodU TRUE 0.882 -25.000 0.000 1.000 N NA
 3730485 3730486 AZC_3814 AZC_3815 nodU nodS TRUE 0.930 37.000 0.700 1.000 N NA
 3730486 3730487 AZC_3815 AZC_3816 nodS nodC TRUE 0.740 27.000 0.048 1.000 N NA
 3730487 3730488 AZC_3816 AZC_3817 nodC nodB TRUE 0.808 29.000 0.120 1.000 N NA
 3730488 3730489 AZC_3817 AZC_3818 nodB nodA TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3730489 3730490 AZC_3818 AZC_3819 nodA   TRUE 0.704 9.000 0.000 NA   NA
 3730492 3730493 AZC_3821 AZC_3822     FALSE 0.310 31.000 0.000 NA   NA
 3730494 3730495 AZC_3823 AZC_3824 mauG   FALSE 0.028 252.000 0.000 NA N NA
 3730495 3730496 AZC_3824 AZC_3825     TRUE 0.855 0.000 0.000 NA   NA
 3730497 3730498 AZC_3826 AZC_3827     TRUE 0.993 6.000 0.750 NA   NA
 3730498 3730499 AZC_3827 AZC_3828     TRUE 0.863 22.000 0.000 NA Y NA
 3730499 3730500 AZC_3828 AZC_3829     FALSE 0.071 109.000 0.000 NA   NA
 3730500 3730501 AZC_3829 AZC_3830     TRUE 0.833 2.000 0.000 NA   NA
 3730501 3730502 AZC_3830 AZC_3831     TRUE 0.995 -3.000 0.364 NA   NA
 3730502 3730503 AZC_3831 AZC_3832     TRUE 0.994 -3.000 0.273 NA   NA
 3730503 3730504 AZC_3832 AZC_3833     TRUE 0.993 -3.000 0.222 1.000   NA
 3730504 3730505 AZC_3833 AZC_3834     TRUE 0.847 -3.000 0.000 NA N NA
 3730505 3730506 AZC_3834 AZC_3835     TRUE 0.704 9.000 0.000 NA   NA
 3730506 3730507 AZC_3835 AZC_3836     FALSE 0.044 296.000 0.000 NA   NA
 3730507 3730508 AZC_3836 AZC_3837     FALSE 0.038 631.000 0.000 NA   NA
 3730508 3730509 AZC_3837 AZC_3838     TRUE 0.599 129.000 0.400 NA   NA
 3730509 3730510 AZC_3838 AZC_3839     FALSE 0.064 118.000 0.000 NA   NA
 3730510 3730511 AZC_3839 AZC_3840     TRUE 0.995 -3.000 0.364 NA   NA
 3730511 3730512 AZC_3840 AZC_3841     TRUE 0.625 86.000 0.222 NA   NA
 3730512 3730513 AZC_3841 AZC_3842     FALSE 0.043 314.000 0.000 NA   NA
 3730513 3730514 AZC_3842 AZC_3843     FALSE 0.171 62.000 0.000 NA   NA
 3730514 3730515 AZC_3843 AZC_3844     TRUE 0.621 183.000 0.500 NA   NA
 3730517 3730518 AZC_3846 AZC_3847     FALSE 0.444 22.000 0.000 NA   NA
 3730521 3730522 AZC_3850 AZC_3851     FALSE 0.062 172.000 0.000 1.000   NA
 3730522 3730523 AZC_3851 AZC_3852     FALSE 0.171 335.000 0.000 0.003   NA
 3730523 3730524 AZC_3852 AZC_3853     FALSE 0.181 56.000 0.000 NA   NA
 3730524 3730525 AZC_3853 AZC_3854   lysR FALSE 0.161 66.000 0.000 NA   NA
 3730525 3730526 AZC_3854 AZC_3855 lysR   FALSE 0.402 24.000 0.000 NA   NA
 3730528 3730529 AZC_3857 AZC_3858   trbB FALSE 0.053 176.000 0.000 NA   NA
 3730529 3730530 AZC_3858 AZC_3859 trbB trbC TRUE 0.998 -3.000 0.286 NA Y NA
 3730530 3730531 AZC_3859 AZC_3860 trbC trbD TRUE 0.999 0.000 1.000 NA Y NA
 3730531 3730532 AZC_3860 AZC_3861 trbD trbE TRUE 0.989 14.000 0.400 NA Y NA
 3730532 3730533 AZC_3861 AZC_3862 trbE trbJ TRUE 0.987 -3.000 0.000 NA Y NA
 3730533 3730534 AZC_3862 AZC_3863 trbJ   TRUE 0.619 12.000 0.000 NA   NA
 3730534 3730535 AZC_3863 AZC_3864   trbL TRUE 0.807 4.000 0.000 NA   NA
 3730535 3730536 AZC_3864 AZC_3865 trbL trbF TRUE 0.999 -3.000 0.571 1.000 Y NA
 3730536 3730537 AZC_3865 AZC_3866 trbF trbG TRUE 0.996 3.000 0.286 NA Y NA
 3730537 3730538 AZC_3866 AZC_3867 trbG trbI TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA Y NA
 3730538 3730539 AZC_3867 AZC_3868 trbI   TRUE 0.823 3.000 0.000 NA   NA
 3730541 3730542 AZC_3870 AZC_3871     TRUE 0.997 -3.000 0.083 0.076 Y NA
 3730542 3730543 AZC_3871 AZC_3872     TRUE 0.999 2.000 0.841 0.010 Y NA
 3730543 3730544 AZC_3872 AZC_3873     TRUE 0.994 -3.000 0.023 1.000 Y NA
 3730544 3730545 AZC_3873 AZC_3874     TRUE 0.987 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3730545 3730546 AZC_3874 AZC_3875     TRUE 0.974 9.000 0.000 0.035 Y NA
 3730546 3730547 AZC_3875 AZC_3876     TRUE 0.812 29.000 0.000 1.000 Y NA
 3730547 3730548 AZC_3876 AZC_3877     FALSE 0.035 229.000 0.000 1.000 N NA
 3730549 3730550 AZC_3878 AZC_3879     FALSE 0.056 157.000 0.000 NA   NA
 3730550 3730551 AZC_3879 AZC_3880     FALSE 0.041 384.000 0.000 NA   NA
 3730553 3730554 AZC_3882 AZC_3883     FALSE 0.046 424.000 0.000 1.000   NA
 3730554 3730555 AZC_3883 AZC_3884     TRUE 0.562 86.000 0.152 1.000   NA
 3730555 3730556 AZC_3884 AZC_3885     TRUE 0.654 143.000 0.562 1.000 N NA
 3730556 3730557 AZC_3885 AZC_3886     TRUE 0.999 -7.000 0.625 0.035 Y NA
 3730557 3730558 AZC_3886 AZC_3887     TRUE 0.999 0.000 0.833 1.000 Y NA
 3730558 3730559 AZC_3887 AZC_3888     TRUE 0.998 11.000 0.833 0.076 Y NA
 3730559 3730560 AZC_3888 AZC_3889     TRUE 0.937 100.000 0.909 NA Y NA
 3730560 3730561 AZC_3889 AZC_3890   amiR TRUE 0.963 14.000 0.375 NA N NA
 3730561 3730562 AZC_3890 AZC_3891 amiR amiC TRUE 0.997 0.000 0.938 NA N NA
 3730562 3730563 AZC_3891 AZC_3892 amiC   FALSE 0.069 112.000 0.000 NA   NA
 3730563 3730564 AZC_3892 AZC_3893     TRUE 0.853 2.000 0.000 1.000   NA
 3730564 3730565 AZC_3893 AZC_3894     TRUE 0.995 -3.000 0.400 1.000 N NA
 3730565 3730566 AZC_3894 AZC_3895     TRUE 0.944 40.000 0.172 0.076 Y NA
 3730566 3730567 AZC_3895 AZC_3896     TRUE 0.999 -3.000 0.875 1.000 Y NA
 3730567 3730568 AZC_3896 AZC_3897     TRUE 0.874 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3730568 3730569 AZC_3897 AZC_3898     TRUE 0.573 11.000 0.000 1.000 N NA
 3730569 3730570 AZC_3898 AZC_3899     FALSE 0.127 64.000 0.000 1.000 N NA
 3730570 3730571 AZC_3899 AZC_3900     TRUE 0.874 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3730572 3730573 AZC_3901 AZC_3902     FALSE 0.025 342.000 0.000 NA N NA
 3730574 3730575 AZC_3903 AZC_3904     FALSE 0.036 222.000 0.000 1.000 N NA
 3730575 3730576 AZC_3904 AZC_3905     TRUE 0.586 299.000 0.120 1.000 Y NA
 3730576 3730577 AZC_3905 AZC_3906     TRUE 0.910 17.000 0.139 NA   NA
 3730577 3730578 AZC_3906 AZC_3907     FALSE 0.089 94.000 0.000 NA   NA
 3730580 3730581 AZC_3909 AZC_3910     FALSE 0.110 70.000 0.000 1.000 N NA
 3730581 3730582 AZC_3910 AZC_3911   hlyD TRUE 0.982 14.000 0.720 1.000 N NA
 3730582 3730583 AZC_3911 AZC_3912 hlyD   FALSE 0.240 43.000 0.000 1.000   NA
 3730583 3730584 AZC_3912 AZC_3913     FALSE 0.089 102.000 0.000 1.000   NA
 3730584 3730585 AZC_3913 AZC_3914     FALSE 0.052 111.000 0.000 1.000 N NA
 3730586 3730587 AZC_3915 AZC_3916   abrB FALSE 0.115 82.000 0.000 NA   NA
 3730588 3730589 AZC_3917 AZC_3918     TRUE 0.473 20.000 0.000 NA   NA
 3730589 3730590 AZC_3918 AZC_3919   ubiE TRUE 0.774 35.000 0.115 1.000   NA
 3730590 3730591 AZC_3919 AZC_3920 ubiE   FALSE 0.134 74.000 0.000 NA   NA
 3730591 3730592 AZC_3920 AZC_3921     FALSE 0.166 64.000 0.000 NA   NA
 3730592 3730593 AZC_3921 AZC_3922     FALSE 0.048 227.000 0.000 NA   NA
 3730593 3730594 AZC_3922 AZC_3923     FALSE 0.045 287.000 0.000 NA   NA
 3730594 3730595 AZC_3923 AZC_3924     FALSE 0.078 101.000 0.000 NA   NA
 3730595 3730596 AZC_3924 AZC_3925     TRUE 0.679 10.000 0.000 NA   NA
 3730596 3730597 AZC_3925 AZC_3926     FALSE 0.419 64.000 0.011 1.000   NA
 3730597 3730598 AZC_3926 AZC_3927     TRUE 0.653 168.000 0.543 NA   NA
 3730598 3730599 AZC_3927 AZC_3928     TRUE 0.989 -3.000 0.144 NA   NA
 3730599 3730600 AZC_3928 AZC_3929     FALSE 0.346 208.000 0.151 NA   NA
 3730600 3730601 AZC_3929 AZC_trnA43   trnA FALSE 0.056 159.000 0.000 NA   NA
 3730601 3730602 AZC_trnA43 AZC_trnA44 trnA trnA FALSE 0.048 216.000 0.000 NA   NA
 3730602 3730603 AZC_trnA44 AZC_3930 trnA   FALSE 0.058 142.000 0.000 NA   NA
 3730604 3730605 AZC_3931 AZC_3932     TRUE 0.957 11.000 0.209 1.000 N NA
 3730605 3730606 AZC_3932 AZC_3933     FALSE 0.039 477.000 0.000 NA   NA
 3730606 3730607 AZC_3933 AZC_3934   cobW TRUE 0.915 22.000 0.211 NA   NA
 3730607 3730608 AZC_3934 AZC_3935 cobW cobN TRUE 0.983 4.000 0.204 1.000   NA
 3730608 3730609 AZC_3935 AZC_3936 cobN cobG TRUE 0.453 631.000 0.333 1.000   NA
 3730609 3730610 AZC_3936 AZC_3937 cobG   TRUE 0.993 -3.000 0.255 1.000 N NA
 3730610 3730611 AZC_3937 AZC_3938     TRUE 0.999 -3.000 0.191 0.006 Y NA
 3730611 3730612 AZC_3938 AZC_3939     TRUE 0.998 -3.000 0.138 0.006 Y NA
 3730612 3730613 AZC_3939 AZC_3940     FALSE 0.286 28.000 0.000 1.000 N NA
 3730615 3730616 AZC_3942 AZC_3943   cbiG TRUE 0.995 -3.000 0.139 0.006   NA
 3730616 3730617 AZC_3943 AZC_3944 cbiG   TRUE 0.984 14.000 0.397 0.006   NA
 3730619 3730620 AZC_3946 AZC_3947 cbiA   FALSE 0.054 170.000 0.000 NA   NA
 3730620 3730621 AZC_3947 AZC_3948     FALSE 0.347 154.000 0.118 NA   NA
 3730622 3730623 AZC_3949 AZC_3950     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3730624 3730625 AZC_3951 AZC_3952     TRUE 0.700 87.000 0.361 1.000 N NA
 3730625 3730626 AZC_3952 AZC_3953   rimM TRUE 0.870 162.000 0.342 0.010 Y NA
 3730626 3730627 AZC_3953 AZC_3954 rimM   TRUE 0.966 53.000 0.672 1.000 Y NA
 3730627 3730628 AZC_3954 AZC_3955     TRUE 0.851 173.000 0.567 1.000 Y NA
 3730629 3730630 AZC_3956 AZC_3957     FALSE 0.310 31.000 0.000 NA   NA
 3730630 3730631 AZC_3957 AZC_3958     FALSE 0.341 29.000 0.000 NA   NA
 3730631 3730632 AZC_3958 AZC_3959     FALSE 0.058 141.000 0.000 NA   NA
 3730632 3730633 AZC_3959 AZC_3960     TRUE 0.479 93.000 0.117 1.000   NA
 3730633 3730634 AZC_3960 AZC_3961     FALSE 0.054 243.000 0.000 1.000   NA
 3730634 3730635 AZC_3961 AZC_3962     TRUE 0.460 333.000 0.000 0.001 Y NA
 3730635 3730636 AZC_3962 AZC_3963     TRUE 0.474 212.000 0.000 0.004 Y NA
 3730636 3730637 AZC_3963 AZC_3964     FALSE 0.363 118.000 0.000 1.000 Y NA
 3730637 3730638 AZC_3964 AZC_3965     TRUE 0.854 8.000 0.000 0.097 N NA
 3730639 3730640 AZC_3966 AZC_3967     TRUE 0.474 118.000 0.227 1.000 N NA
 3730640 3730641 AZC_3967 AZC_3968     TRUE 0.984 -3.000 0.082 1.000 N NA
 3730641 3730642 AZC_3968 AZC_3969     TRUE 0.999 4.000 0.501 0.002 Y NA
 3730642 3730643 AZC_3969 AZC_3970     FALSE 0.042 149.000 0.000 1.000 N NA
 3730643 3730644 AZC_3970 AZC_3971     TRUE 0.941 19.000 0.000 0.008 Y NA
 3730646 3730647 AZC_3973 AZC_3974 marR   TRUE 0.995 11.000 0.392 0.080 Y NA
 3730647 3730648 AZC_3974 AZC_3975     TRUE 0.999 -3.000 0.592 1.000 Y NA
 3730648 3730649 AZC_3975 AZC_3976     TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3730650 3730651 AZC_3977 AZC_3978 csaA   FALSE 0.440 55.000 0.009 1.000   NA
 3730651 3730652 AZC_3978 AZC_3979     FALSE 0.338 109.000 0.062 1.000   NA
 3730652 3730653 AZC_3979 AZC_3980     TRUE 0.765 69.000 0.308 NA   NA
 3730653 3730654 AZC_3980 AZC_3981     FALSE 0.250 289.000 0.080 NA   NA
 3730655 3730656 AZC_3982 AZC_3983     TRUE 0.990 -3.000 0.170 NA   NA
 3730656 3730657 AZC_3983 AZC_3984     TRUE 0.988 -3.000 0.107 NA   NA
 3730657 3730658 AZC_3984 AZC_3985     FALSE 0.060 126.000 0.000 NA   NA
 3730658 3730659 AZC_3985 AZC_3986     TRUE 0.999 -3.000 0.800 1.000 Y NA
 3730659 3730660 AZC_3986 AZC_3987     FALSE 0.113 83.000 0.000 NA   NA
 3730660 3730661 AZC_3987 AZC_3988     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3730661 3730662 AZC_3988 AZC_3989     FALSE 0.050 114.000 0.000 1.000 N NA
 3730662 3730663 AZC_3989 AZC_3990     TRUE 0.997 -3.000 0.152 1.000 Y NA
 3730663 3730664 AZC_3990 AZC_3991     TRUE 0.962 4.000 0.052 1.000   NA
 3730664 3730665 AZC_3991 AZC_3992     TRUE 0.821 20.000 0.034 1.000   NA
 3730665 3730666 AZC_3992 AZC_3993     TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3730666 3730667 AZC_3993 AZC_3994     TRUE 0.992 4.000 0.333 0.097   NA
 3730667 3730668 AZC_3994 AZC_3995     TRUE 0.990 4.000 0.375 1.000   NA
 3730668 3730669 AZC_3995 AZC_3996     TRUE 0.987 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3730669 3730670 AZC_3996 AZC_3997     FALSE 0.057 151.000 0.000 NA   NA
 3730670 3730671 AZC_3997 AZC_3998     TRUE 0.519 105.000 0.209 NA   NA
 3730673 3730674 AZC_4000 AZC_4001     FALSE 0.341 29.000 0.000 NA   NA
 3730677 3730678 AZC_4004 AZC_4005     FALSE 0.058 135.000 0.000 NA   NA
 3730678 3730679 AZC_4005 AZC_4006     TRUE 0.742 7.000 0.000 NA   NA
 3730680 3730681 AZC_4007 AZC_4008     FALSE 0.068 113.000 0.000 NA   NA
 3730682 3730683 AZC_4009 AZC_4010   lysE FALSE 0.419 58.000 0.018 1.000 N NA
 3730683 3730684 AZC_4010 AZC_4011 lysE   FALSE 0.141 129.000 0.005 1.000 N NA
 3730684 3730685 AZC_4011 AZC_4012     TRUE 0.490 45.000 0.016 NA   NA
 3730685 3730686 AZC_4012 AZC_4013     TRUE 0.492 43.000 0.014 NA   NA
 3730686 3730687 AZC_4013 AZC_4014     TRUE 0.544 351.000 0.092 1.000 Y NA
 3730687 3730688 AZC_4014 AZC_4015     TRUE 0.999 -3.000 0.256 0.000 Y NA
 3730688 3730689 AZC_4015 AZC_4016     TRUE 0.651 134.000 0.113 1.000 Y NA
 3730689 3730690 AZC_4016 AZC_4017     FALSE 0.223 134.000 0.032 NA   NA
 3730691 3730692 AZC_4018 AZC_4019     FALSE 0.120 80.000 0.000 NA   NA
 3730694 3730695 AZC_4021 AZC_4022     FALSE 0.063 120.000 0.000 NA   NA
 3730695 3730696 AZC_4022 AZC_4023     TRUE 0.986 -3.000 0.083 NA   NA
 3730696 3730697 AZC_4023 AZC_4024   apaG FALSE 0.086 72.000 0.000 NA N NA
 3730697 3730698 AZC_4024 AZC_4025 apaG trkH TRUE 0.947 14.000 0.006 NA Y NA
 3730699 3730700 AZC_4026 AZC_4027     FALSE 0.253 122.000 0.052 1.000 N NA
 3730700 3730701 AZC_4027 AZC_4028     TRUE 0.995 -3.000 0.058 1.000 Y NA
 3730703 3730704 AZC_4030 AZC_4031     FALSE 0.069 111.000 0.000 NA   NA
 3730704 3730705 AZC_4031 AZC_4032   phoB TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3730705 3730706 AZC_4032 AZC_4033 phoB phoU TRUE 0.958 7.000 0.128 NA N NA
 3730706 3730707 AZC_4033 AZC_4034 phoU   TRUE 0.968 18.000 0.126 NA Y NA
 3730707 3730708 AZC_4034 AZC_4035     TRUE 0.972 68.000 0.526 0.001 Y NA
 3730708 3730709 AZC_4035 AZC_4036   pstC TRUE 0.996 15.000 0.537 0.001 Y NA
 3730709 3730710 AZC_4036 AZC_4037 pstC   TRUE 0.500 206.000 0.000 0.001 Y NA
 3730710 3730711 AZC_4037 AZC_4038     FALSE 0.138 57.000 0.000 1.000 N NA
 3730717 3730718 AZC_4044 AZC_4045     TRUE 0.709 55.000 0.167 NA   NA
 3730720 3730721 AZC_4047 AZC_4048     FALSE 0.089 94.000 0.000 NA   NA
 3730723 3730724 AZC_4050 AZC_4051     FALSE 0.402 67.000 0.000 0.056   NA
 3730724 3730725 AZC_4051 AZC_4052   yceI TRUE 0.974 -3.000 0.022 NA   NA
 3730725 3730726 AZC_4052 AZC_4053 yceI   FALSE 0.045 269.000 0.000 NA   NA
 3730726 3730727 AZC_4053 AZC_4054     TRUE 0.986 -3.000 0.105 1.000 N NA
 3730727 3730728 AZC_4054 AZC_4055     TRUE 0.995 4.000 0.787 1.000   NA
 3730728 3730729 AZC_4055 AZC_4056     FALSE 0.051 297.000 0.000 1.000   NA
 3730729 3730730 AZC_4056 AZC_4057     FALSE 0.042 159.000 0.000 1.000 N NA
 3730730 3730731 AZC_4057 AZC_4058     FALSE 0.222 109.000 0.025 1.000 N NA
 3730731 3730732 AZC_4058 AZC_4059     FALSE 0.220 118.000 0.019 1.000   NA
 3730734 3730735 AZC_4061 AZC_4062     FALSE 0.043 776.000 0.000 1.000   NA
 3730735 3730736 AZC_4062 AZC_4063     FALSE 0.227 46.000 0.000 1.000   NA
 3730736 3730737 AZC_4063 AZC_4064     FALSE 0.175 129.000 0.018 1.000 N NA
 3730738 3730739 AZC_4065 AZC_4066     TRUE 0.990 26.000 0.829 1.000 Y NA
 3730739 3730740 AZC_4066 AZC_4067     TRUE 0.992 5.000 0.304 0.011   NA
 3730740 3730741 AZC_4067 AZC_4068     FALSE 0.439 111.000 0.145 1.000   NA
 3730741 3730742 AZC_4068 AZC_4069     TRUE 0.977 41.000 0.420 0.001 Y NA
 3730742 3730743 AZC_4069 AZC_4070     FALSE 0.220 104.000 0.020 1.000 N NA
 3730743 3730744 AZC_4070 AZC_trnR45   trnR FALSE 0.043 320.000 0.000 NA   NA
 3730745 3730746 AZC_4071 AZC_4072     FALSE 0.046 245.000 0.000 NA   NA
 3730746 3730747 AZC_4072 AZC_4073   ahs1 TRUE 0.999 -3.000 0.518 0.002 Y NA
 3730747 3730748 AZC_4073 AZC_4074 ahs1 lamB TRUE 0.989 -3.000 0.125 1.000   NA
 3730748 3730749 AZC_4074 AZC_4075 lamB   FALSE 0.400 94.000 0.065 1.000   NA
 3730749 3730750 AZC_4075 AZC_4076     TRUE 0.999 -7.000 0.636 0.035 Y NA
 3730750 3730751 AZC_4076 AZC_4077     TRUE 0.999 -3.000 0.913 1.000 Y NA
 3730751 3730752 AZC_4077 AZC_4078     TRUE 0.999 0.000 0.957 0.075 Y NA
 3730752 3730753 AZC_4078 AZC_4079     TRUE 0.981 32.000 0.679 NA Y NA
 3730753 3730754 AZC_4079 AZC_4080     TRUE 0.608 59.000 0.082 NA   NA
 3730755 3730756 AZC_4081 AZC_4082 lysR   FALSE 0.097 76.000 0.000 1.000 N NA
 3730756 3730757 AZC_4082 AZC_4083     FALSE 0.031 364.000 0.000 1.000 N NA
 3730757 3730758 AZC_4083 AZC_4084     TRUE 0.770 7.000 0.000 1.000   NA
 3730763 3730764 AZC_4089 AZC_4090 wrbA   FALSE 0.061 175.000 0.000 1.000   NA
 3730764 3730765 AZC_4090 AZC_4091     FALSE 0.073 107.000 0.000 NA   NA
 3730765 3730766 AZC_4091 AZC_4092     FALSE 0.123 79.000 0.000 NA   NA
 3730766 3730767 AZC_4092 AZC_4093     TRUE 0.536 152.000 0.035 1.000 Y NA
 3730767 3730768 AZC_4093 AZC_4094     TRUE 0.995 19.000 0.667 0.010 Y NA
 3730769 3730770 AZC_4095 AZC_trnS46   trnS FALSE 0.047 241.000 0.000 NA   NA
 3730771 3730772 AZC_4096 AZC_4097     FALSE 0.424 314.000 0.000 0.012 Y NA
 3730772 3730773 AZC_4097 AZC_4098     FALSE 0.063 165.000 0.000 1.000   NA
 3730775 3730776 AZC_4100 AZC_4101 fmdB   TRUE 0.854 62.000 0.478 NA   NA
 3730776 3730777 AZC_4101 AZC_4102     TRUE 0.709 79.000 0.312 1.000 N NA
 3730777 3730778 AZC_4102 AZC_4103     TRUE 0.990 12.000 0.600 0.035   NA
 3730778 3730779 AZC_4103 AZC_4104     TRUE 0.984 13.000 0.639 1.000   NA
 3730779 3730780 AZC_4104 AZC_4105     TRUE 0.997 13.000 0.888 0.075 Y NA
 3730780 3730781 AZC_4105 AZC_4106     TRUE 0.757 269.000 0.367 NA Y NA
 3730782 3730783 AZC_4107 AZC_4108   luxR TRUE 0.971 -10.000 0.000 0.015 N NA
 3730783 3730784 AZC_4108 AZC_4109 luxR   TRUE 0.791 14.000 0.000 0.058 N NA
 3730784 3730785 AZC_4109 AZC_4110     TRUE 0.998 -3.000 0.898 NA N NA
 3730785 3730786 AZC_4110 AZC_4111     FALSE 0.033 163.000 0.000 NA N NA
 3730786 3730787 AZC_4111 AZC_4112     FALSE 0.193 62.000 0.000 1.000   NA
 3730787 3730788 AZC_4112 AZC_4113     FALSE 0.061 177.000 0.000 1.000   NA
 3730790 3730791 AZC_4115 AZC_4116     TRUE 0.909 41.000 0.027 0.003 Y NA
 3730791 3730792 AZC_4116 AZC_4117     TRUE 0.977 9.000 0.000 0.003 Y NA
 3730792 3730793 AZC_4117 AZC_4118     FALSE 0.057 147.000 0.000 NA   NA
 3730795 3730796 AZC_4120 AZC_4121     FALSE 0.261 30.000 0.000 1.000 N NA
 3730797 3730798 AZC_4122 AZC_4123   lysR FALSE 0.286 28.000 0.000 1.000 N NA
 3730798 3730799 AZC_4123 AZC_4124 lysR   FALSE 0.045 126.000 0.000 1.000 N NA
 3730799 3730800 AZC_4124 AZC_4125     TRUE 0.948 158.000 0.837 0.002 Y NA
 3730800 3730801 AZC_4125 AZC_4126     TRUE 0.988 38.000 0.724 0.002 Y NA
 3730801 3730802 AZC_4126 AZC_4127     TRUE 0.990 39.000 0.846 0.002 Y NA
 3730802 3730803 AZC_4127 AZC_4128     TRUE 0.999 0.000 0.864 0.002 Y NA
 3730803 3730804 AZC_4128 AZC_4129     FALSE 0.030 429.000 0.000 1.000 N NA
 3730804 3730805 AZC_4129 AZC_4130     TRUE 0.998 2.000 0.532 1.000 Y NA
 3730805 3730806 AZC_4130 AZC_4131     TRUE 0.999 -3.000 0.308 0.010 Y NA
 3730806 3730807 AZC_4131 AZC_4132     TRUE 0.836 108.000 0.205 0.075 Y NA
 3730807 3730808 AZC_4132 AZC_4133     FALSE 0.038 192.000 0.000 1.000 N NA
 3730808 3730809 AZC_4133 AZC_4134     TRUE 0.996 0.000 0.408 0.021 N NA
 3730809 3730810 AZC_4134 AZC_4135     TRUE 0.567 64.000 0.067 NA   NA
 3730810 3730811 AZC_4135 AZC_4136     TRUE 0.832 43.000 0.307 NA   NA
 3730811 3730812 AZC_4136 AZC_4137     TRUE 0.489 117.000 0.221 NA   NA
 3730812 3730813 AZC_4137 AZC_4138     TRUE 0.990 -3.000 0.170 1.000 N NA
 3730813 3730814 AZC_4138 AZC_4139     TRUE 0.778 115.000 0.065 0.001 Y NA
 3730814 3730815 AZC_4139 AZC_4140     FALSE 0.113 83.000 0.000 NA   NA
 3730815 3730816 AZC_4140 AZC_4141     FALSE 0.125 78.000 0.000 NA   NA
 3730817 3730818 AZC_4142 AZC_4143     TRUE 0.964 20.000 0.500 NA   NA
 3730818 3730819 AZC_4143 AZC_4144     FALSE 0.157 67.000 0.000 NA   NA
 3730819 3730820 AZC_4144 AZC_4145     FALSE 0.123 79.000 0.000 NA   NA
 3730822 3730823 AZC_4147 AZC_4148     TRUE 0.989 27.000 0.496 0.015 Y NA
 3730823 3730824 AZC_4148 AZC_4149     FALSE 0.043 329.000 0.000 NA   NA
 3730824 3730825 AZC_4149 AZC_4150     FALSE 0.162 114.000 0.002 NA   NA
 3730825 3730826 AZC_4150 AZC_4151   maoC TRUE 0.620 40.000 0.005 0.067 N NA
 3730826 3730827 AZC_4151 AZC_4152 maoC maoC TRUE 0.999 -3.000 0.433 0.054 Y NA
 3730829 3730830 AZC_4154 AZC_4155     FALSE 0.129 127.000 0.002 1.000 N NA
 3730830 3730831 AZC_4155 AZC_4156   terC FALSE 0.151 133.000 0.009 1.000 N NA
 3730831 3730832 AZC_4156 AZC_4157 terC terC TRUE 0.769 130.000 0.133 0.055 Y NA
 3730832 3730833 AZC_4157 AZC_4158 terC   TRUE 0.667 74.000 0.222 1.000 N NA
 3730834 3730835 AZC_4159 AZC_4160     TRUE 0.537 18.000 0.000 1.000   NA
 3730835 3730836 AZC_4160 AZC_4161     TRUE 0.999 -3.000 0.230 0.002 Y NA
 3730836 3730837 AZC_4161 AZC_4162   lysR FALSE 0.113 181.000 0.002 1.000 N NA
 3730838 3730839 AZC_4163 AZC_4164     FALSE 0.045 267.000 0.000 NA   NA
 3730841 3730842 AZC_4166 AZC_4167     TRUE 0.960 19.000 0.489 NA N NA
 3730842 3730843 AZC_4167 AZC_4168     TRUE 0.997 -3.000 0.591 NA N NA
 3730843 3730844 AZC_4168 AZC_4169     TRUE 0.993 -3.000 0.254 NA   NA
 3730845 3730846 AZC_4170 AZC_4171     TRUE 0.792 29.000 0.100 1.000 N NA
 3730847 3730848 AZC_4172 AZC_4173     FALSE 0.065 154.000 0.000 1.000   NA
 3730848 3730849 AZC_4173 AZC_4174     FALSE 0.217 49.000 0.000 1.000   NA
 3730850 3730851 AZC_4175 AZC_4176     FALSE 0.314 181.000 0.000 1.000 Y NA
 3730851 3730852 AZC_4176 AZC_4177     TRUE 0.678 7.000 0.000 1.000 N NA
 3730853 3730854 AZC_4178 AZC_4179 lysR   FALSE 0.103 87.000 0.000 NA   NA
 3730854 3730855 AZC_4179 AZC_4180     FALSE 0.058 136.000 0.000 NA   NA
 3730856 3730857 AZC_4181 AZC_4182     FALSE 0.180 57.000 0.000 NA   NA
 3730857 3730858 AZC_4182 AZC_4183     FALSE 0.062 121.000 0.000 NA   NA
 3730859 3730860 AZC_4184 AZC_4185     FALSE 0.059 132.000 0.000 NA   NA
 3730861 3730862 AZC_4186 AZC_4187     FALSE 0.078 87.000 0.000 1.000 N NA
 3730862 3730863 AZC_4187 AZC_4188     FALSE 0.282 148.000 0.065 NA   NA
 3730863 3730864 AZC_4188 AZC_4189     TRUE 0.830 48.000 0.333 NA   NA
 3730864 3730865 AZC_4189 AZC_4190     TRUE 0.966 21.000 0.312 0.055   NA
 3730868 3730869 AZC_4193 AZC_trnL47   trnL FALSE 0.047 238.000 0.000 NA   NA
 3730870 3730871 AZC_4194 AZC_4195     FALSE 0.128 76.000 0.000 NA   NA
 3730871 3730872 AZC_4195 AZC_5r02     FALSE 0.044 294.000 0.000 NA   NA
 3730872 3730873 AZC_5r02 AZC_23r02     FALSE 0.131 75.000 0.000 NA   NA
 3730873 3730874 AZC_23r02 AZC_trnA48   trnA FALSE 0.040 407.000 0.000 NA   NA
 3730874 3730875 AZC_trnA48 AZC_trnI49 trnA trnI FALSE 0.178 58.000 0.000 NA   NA
 3730875 3730876 AZC_trnI49 AZC_16r02 trnI   FALSE 0.048 227.000 0.000 NA   NA
 3730877 3730878 AZC_4196 AZC_4197     FALSE 0.123 79.000 0.000 NA   NA
 3730878 3730879 AZC_4197 AZC_4198     FALSE 0.134 74.000 0.000 NA   NA
 3730879 3730880 AZC_4198 AZC_4199     TRUE 0.807 4.000 0.000 NA   NA
 3730882 3730883 AZC_4201 AZC_4202   tetR TRUE 0.667 50.000 0.111 NA   NA
 3730883 3730884 AZC_4202 AZC_4203 tetR   FALSE 0.053 109.000 0.000 1.000 N NA
 3730884 3730885 AZC_4203 AZC_4204   radC TRUE 0.947 6.000 0.065 1.000 N NA
 3730886 3730887 AZC_4205 AZC_4206     FALSE 0.039 492.000 0.000 NA   NA
 3730887 3730888 AZC_4206 AZC_4207     TRUE 0.983 9.000 0.405 1.000   NA
 3730889 3730890 AZC_4208 AZC_4209     TRUE 0.864 210.000 0.450 0.075 Y NA
 3730890 3730891 AZC_4209 AZC_4210     TRUE 0.911 104.000 0.458 0.075 Y NA
 3730891 3730892 AZC_4210 AZC_4211     TRUE 0.999 0.000 0.917 0.075 Y NA
 3730892 3730893 AZC_4211 AZC_4212     FALSE 0.047 244.000 0.000 NA   NA
 3730894 3730895 AZC_4213 AZC_4214     TRUE 0.694 59.000 0.182 1.000 N NA
 3730895 3730896 AZC_4214 AZC_4215     FALSE 0.274 29.000 0.000 1.000 N NA
 3730896 3730897 AZC_4215 AZC_4216     FALSE 0.033 298.000 0.000 1.000 N NA
 3730897 3730898 AZC_4216 AZC_4217     TRUE 0.923 -7.000 0.000 1.000   NA
 3730898 3730899 AZC_4217 AZC_4218     TRUE 0.983 -3.000 0.057 NA   NA
 3730899 3730900 AZC_4218 AZC_4219     TRUE 0.996 -3.000 0.500 NA   NA
 3730900 3730901 AZC_4219 AZC_4220     TRUE 0.993 -3.000 0.250 NA   NA
 3730902 3730903 AZC_4221 AZC_4222     TRUE 0.977 17.000 0.667 NA   NA
 3730903 3730904 AZC_4222 AZC_4223     TRUE 0.996 0.000 0.667 NA   NA
 3730904 3730905 AZC_4223 AZC_4224     FALSE 0.043 138.000 0.000 1.000 N NA
 3730906 3730907 AZC_4225 AZC_4226   amtB FALSE 0.033 299.000 0.000 1.000 N NA
 3730907 3730908 AZC_4226 AZC_4227 amtB glnK TRUE 0.836 31.000 0.197 1.000 N NA
 3730908 3730909 AZC_4227 AZC_4228 glnK   FALSE 0.034 263.000 0.000 1.000 N NA
 3730910 3730911 AZC_4229 AZC_4230     FALSE 0.192 49.000 0.000 NA   NA
 3730911 3730912 AZC_4230 AZC_4231     TRUE 0.977 0.000 0.077 NA   NA
 3730915 3730916 AZC_4234 AZC_4235     FALSE 0.203 57.000 0.000 1.000   NA
 3730917 3730918 AZC_4236 AZC_4237     FALSE 0.061 124.000 0.000 NA   NA
 3730918 3730919 AZC_4237 AZC_4238     FALSE 0.157 67.000 0.000 NA   NA
 3730919 3730920 AZC_4238 AZC_4239     FALSE 0.053 176.000 0.000 NA   NA
 3730920 3730921 AZC_4239 AZC_4240     TRUE 0.979 -3.000 0.045 1.000 N NA
 3730921 3730922 AZC_4240 AZC_4241     TRUE 0.796 56.000 0.294 NA   NA
 3730922 3730923 AZC_4241 AZC_4242     FALSE 0.263 254.000 0.083 NA   NA
 3730923 3730924 AZC_4242 AZC_4243     TRUE 0.999 -3.000 0.598 0.003   NA
 3730924 3730925 AZC_4243 AZC_4244     FALSE 0.150 184.000 0.008 NA   NA
 3730925 3730926 AZC_4244 AZC_4245     FALSE 0.041 394.000 0.000 NA   NA
 3730926 3730927 AZC_4245 AZC_4246     TRUE 0.997 4.000 0.202 0.002 Y NA
 3730927 3730928 AZC_4246 AZC_4247     TRUE 0.770 17.000 0.015 1.000 N NA
 3730928 3730929 AZC_4247 AZC_4248     TRUE 0.635 23.000 0.002 1.000 N NA
 3730929 3730930 AZC_4248 AZC_4249     TRUE 0.869 194.000 0.316 0.000 Y NA
 3730933 3730934 AZC_4252 AZC_4253     FALSE 0.201 46.000 0.000 NA   NA
 3730934 3730935 AZC_4253 AZC_4254   rluD FALSE 0.253 116.000 0.046 1.000 N NA
 3730937 3730938 AZC_4256 AZC_4257     TRUE 0.964 11.000 0.222 1.000   NA
 3730939 3730940 AZC_4258 AZC_4259 smc   FALSE 0.162 177.000 0.012 NA   NA
 3730940 3730941 AZC_4259 AZC_4260     TRUE 0.447 121.000 0.195 NA   NA
 3730941 3730942 AZC_4260 AZC_4261     TRUE 0.948 50.000 0.628 0.002   NA
 3730942 3730943 AZC_4261 AZC_4262     TRUE 0.788 91.000 0.278 0.002   NA
 3730943 3730944 AZC_4262 AZC_4263     TRUE 0.703 114.000 0.016 0.002 Y NA
 3730944 3730945 AZC_4263 AZC_4264     FALSE 0.330 32.000 0.000 1.000   NA
 3730947 3730948 AZC_4266 AZC_4267     FALSE 0.058 142.000 0.000 NA   NA
 3730949 3730950 AZC_4268 AZC_4269     FALSE 0.027 946.000 0.000 1.000 N NA
 3730951 3730952 AZC_4270 AZC_trnV50   trnV FALSE 0.090 93.000 0.000 NA   NA
 3730952 3730953 AZC_trnV50 AZC_4271 trnV   FALSE 0.070 110.000 0.000 NA   NA
 3730953 3730954 AZC_4271 AZC_4272     TRUE 0.807 4.000 0.000 NA   NA
 3730954 3730955 AZC_4272 AZC_4273     FALSE 0.321 119.000 0.092 1.000 N NA
 3730955 3730956 AZC_4273 AZC_4274     TRUE 0.998 -3.000 0.313 NA Y NA
 3730956 3730957 AZC_4274 AZC_4275     FALSE 0.094 91.000 0.000 NA   NA
 3730957 3730958 AZC_4275 AZC_4276     TRUE 0.666 73.000 0.200 NA   NA
 3730958 3730959 AZC_4276 AZC_4277     FALSE 0.110 84.000 0.000 NA   NA
 3730961 3730962 AZC_4279 AZC_4280 lysR   FALSE 0.048 230.000 0.000 NA   NA
 3730962 3730963 AZC_4280 AZC_4281     FALSE 0.042 336.000 0.000 NA   NA
 3730963 3730964 AZC_4281 AZC_4282     FALSE 0.207 55.000 0.000 1.000   NA
 3730966 3730967 AZC_4284 AZC_4285     FALSE 0.242 99.000 0.015 NA   NA
 3730968 3730969 AZC_4286 AZC_4287     TRUE 0.502 84.000 0.120 1.000 N NA
 3730969 3730970 AZC_4287 AZC_4288     FALSE 0.166 64.000 0.000 NA   NA
 3730971 3730972 AZC_4289 AZC_4290     TRUE 0.993 -3.000 0.262 1.000 N NA
 3730972 3730973 AZC_4290 AZC_4291     FALSE 0.337 509.000 0.218 1.000 N NA
 3730974 3730975 AZC_4292 AZC_4293     FALSE 0.134 74.000 0.000 NA   NA
 3730976 3730977 AZC_4294 AZC_4295     TRUE 0.514 36.000 0.003 1.000   NA
 3730977 3730978 AZC_4295 AZC_4296   grxC FALSE 0.419 58.000 0.007 1.000   NA
 3730978 3730979 AZC_4296 AZC_4297 grxC   TRUE 0.604 37.000 0.027 1.000   NA
 3730979 3730980 AZC_4297 AZC_4298     TRUE 0.973 -3.000 0.019 NA   NA
 3730981 3730982 AZC_4299 AZC_4300     FALSE 0.084 107.000 0.000 1.000   NA
 3730982 3730983 AZC_4300 AZC_4301     FALSE 0.034 253.000 0.000 1.000 N NA
 3730983 3730984 AZC_4301 AZC_4302     FALSE 0.081 99.000 0.000 NA   NA
 3730984 3730985 AZC_4302 AZC_4303     TRUE 0.757 6.000 0.000 NA   NA
 3730985 3730986 AZC_4303 AZC_4304     FALSE 0.146 76.000 0.000 1.000   NA
 3730986 3730987 AZC_4304 AZC_4305     TRUE 0.987 -3.000 0.007 0.010   NA
 3730987 3730988 AZC_4305 AZC_4306     TRUE 0.534 56.000 0.043 NA   NA
 3730988 3730989 AZC_4306 AZC_4307     FALSE 0.222 145.000 0.033 NA   NA
 3730989 3730990 AZC_4307 AZC_4308     TRUE 0.998 0.000 0.319 0.010 Y NA
 3730992 3730993 AZC_4310 AZC_4311     TRUE 0.948 35.000 0.763 NA   NA
 3730994 3730995 AZC_4312 AZC_4313     TRUE 0.971 54.000 0.432 0.003 Y NA
 3730995 3730996 AZC_4313 AZC_4314     TRUE 0.833 346.000 0.321 0.003 Y NA
 3730996 3730997 AZC_4314 AZC_4315     TRUE 0.809 77.000 0.106 1.000 Y NA
 3730997 3730998 AZC_4315 AZC_4316     FALSE 0.361 158.000 0.134 NA   NA
 3730998 3730999 AZC_4316 AZC_4317     TRUE 0.579 55.000 0.060 NA   NA
 3730999 3731000 AZC_4317 AZC_4318     TRUE 0.619 12.000 0.000 NA   NA
 3731001 3731002 AZC_4319 AZC_4320     FALSE 0.203 57.000 0.000 1.000   NA
 3731002 3731003 AZC_4320 AZC_4321     TRUE 0.578 85.000 0.197 1.000 N NA
 3731003 3731004 AZC_4321 AZC_4322     TRUE 0.974 0.000 0.056 1.000   NA
 3731004 3731005 AZC_4322 AZC_4323     FALSE 0.352 161.000 0.116 1.000   NA
 3731005 3731006 AZC_4323 AZC_4324     TRUE 0.990 -3.000 0.153 1.000   NA
 3731006 3731007 AZC_4324 AZC_4325     TRUE 0.995 7.000 0.631 0.055   NA
 3731007 3731008 AZC_4325 AZC_4326     FALSE 0.061 178.000 0.000 1.000   NA
 3731008 3731009 AZC_4326 AZC_4327     TRUE 0.855 0.000 0.000 NA   NA
 3731009 3731010 AZC_4327 AZC_4328     FALSE 0.149 69.000 0.000 NA   NA
 3731010 3731011 AZC_4328 AZC_4329     FALSE 0.193 120.000 0.014 NA   NA
 3731011 3731012 AZC_4329 AZC_4330     TRUE 0.989 -3.000 0.132 NA   NA
 3731012 3731013 AZC_4330 AZC_4331     FALSE 0.212 129.000 0.026 NA   NA
 3731013 3731014 AZC_4331 AZC_4332     FALSE 0.184 154.000 0.017 NA   NA
 3731015 3731016 AZC_4333 AZC_4334     FALSE 0.178 67.000 0.000 1.000   NA
 3731016 3731017 AZC_4334 AZC_4335     TRUE 0.828 95.000 0.800 NA   NA
 3731017 3731018 AZC_4335 AZC_4336     TRUE 0.991 10.000 0.800 NA   NA
 3731019 3731020 AZC_4337 AZC_4338     FALSE 0.089 94.000 0.000 NA   NA
 3731021 3731022 AZC_4339 AZC_4340 arsR   TRUE 0.991 -3.000 0.160 1.000   NA
 3731022 3731023 AZC_4340 AZC_4341     TRUE 0.804 81.000 0.007 0.001 Y NA
 3731026 3731027 AZC_4344 AZC_4345 acpP   FALSE 0.205 56.000 0.000 1.000   NA
 3731029 3731030 AZC_4347 AZC_4348     FALSE 0.079 100.000 0.000 NA   NA
 3731030 3731031 AZC_4348 AZC_4349     FALSE 0.386 110.000 0.000 1.000 Y NA
 3731031 3731032 AZC_4349 AZC_4350     FALSE 0.212 98.000 0.012 1.000 N NA
 3731032 3731033 AZC_4350 AZC_4351     FALSE 0.037 122.000 0.000 NA N NA
 3731033 3731034 AZC_4351 AZC_4352   htpG FALSE 0.106 63.000 0.000 NA N NA
 3731035 3731036 AZC_4353 AZC_4354     TRUE 0.807 4.000 0.000 NA   NA
 3731037 3731038 AZC_4355 AZC_4356     TRUE 0.997 11.000 0.631 0.003 Y NA
 3731038 3731039 AZC_4356 AZC_4357     TRUE 0.998 10.000 0.659 0.005 Y NA
 3731039 3731040 AZC_4357 AZC_4358     TRUE 0.999 -3.000 0.864 NA Y NA
 3731040 3731041 AZC_4358 AZC_4359     TRUE 0.998 3.000 0.679 NA Y NA
 3731041 3731042 AZC_4359 AZC_4360     TRUE 0.995 -9.000 0.049 1.000 Y NA
 3731042 3731043 AZC_4360 AZC_4361     TRUE 0.830 4.000 0.000 1.000   NA
 3731047 3731048 AZC_4365 AZC_4366     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.015 Y NA
 3731052 3731053 AZC_4370 AZC_4371     TRUE 0.957 14.000 0.120 0.005 N NA
 3731053 3731054 AZC_4371 AZC_4372     TRUE 0.628 7.000 0.000 NA N NA
 3731054 3731055 AZC_4372 AZC_4373     TRUE 0.774 30.000 0.103 NA N NA
 3731055 3731056 AZC_4373 AZC_4374     TRUE 0.999 5.000 1.000 1.000 Y NA
 3731056 3731057 AZC_4374 AZC_4375     TRUE 0.993 18.000 0.750 NA Y NA
 3731058 3731059 AZC_4376 AZC_4377 gntR   TRUE 0.874 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3731064 3731065 AZC_4382 AZC_4383     FALSE 0.053 257.000 0.000 1.000   NA
 3731065 3731066 AZC_4383 AZC_4384     FALSE 0.435 166.000 0.200 1.000   NA
 3731067 3731068 AZC_4385 AZC_4386 hmuT   TRUE 0.999 -3.000 0.852 1.000 Y NA
 3731068 3731069 AZC_4386 AZC_4387     TRUE 0.995 5.000 0.292 1.000 Y NA
 3731071 3731072 AZC_4389 AZC_4390 tetR hlyD TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3731072 3731073 AZC_4390 AZC_4391 hlyD   TRUE 0.994 -3.000 0.179 0.094   NA
 3731073 3731074 AZC_4391 AZC_4392     TRUE 0.991 2.000 0.161 0.004   NA
 3731076 3731077 AZC_4394 AZC_4395     TRUE 0.967 82.000 0.793 0.074 Y NA
 3731077 3731078 AZC_4395 AZC_4396     TRUE 0.999 0.000 0.559 0.074 Y NA
 3731078 3731079 AZC_4396 AZC_4397     FALSE 0.112 273.000 0.000 0.074 N NA
 3731079 3731080 AZC_4397 AZC_4398   tauC TRUE 0.897 387.000 0.719 0.074 Y NA
 3731080 3731081 AZC_4398 AZC_4399 tauC   TRUE 0.999 -3.000 0.797 1.000 Y NA
 3731081 3731082 AZC_4399 AZC_4400     TRUE 0.972 11.000 0.314 NA   NA
 3731082 3731083 AZC_4400 AZC_4401     TRUE 0.987 15.000 0.931 NA   NA
 3731083 3731084 AZC_4401 AZC_4402     TRUE 0.996 4.000 0.835 NA   NA
 3731084 3731085 AZC_4402 AZC_4403     TRUE 0.974 -3.000 0.019 NA   NA
 3731085 3731086 AZC_4403 AZC_4404   lacI FALSE 0.040 407.000 0.000 NA   NA
 3731086 3731087 AZC_4404 AZC_4405 lacI   TRUE 0.951 22.000 0.444 1.000 N NA
 3731087 3731088 AZC_4405 AZC_4406     TRUE 0.997 13.000 0.667 0.010 Y NA
 3731088 3731089 AZC_4406 AZC_4407     TRUE 0.958 71.000 0.500 0.074 Y NA
 3731089 3731090 AZC_4407 AZC_4408     FALSE 0.340 137.000 0.000 1.000 Y NA
 3731090 3731091 AZC_4408 AZC_4409     TRUE 0.874 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3731091 3731092 AZC_4409 AZC_4410     TRUE 0.934 24.000 0.048 1.000 Y NA
 3731092 3731093 AZC_4410 AZC_4411     FALSE 0.052 185.000 0.000 NA   NA
 3731093 3731094 AZC_4411 AZC_4412     TRUE 0.992 0.000 0.333 NA   NA
 3731096 3731097 AZC_4414 AZC_4415     FALSE 0.173 61.000 0.000 NA   NA
 3731097 3731098 AZC_4415 AZC_4416     FALSE 0.048 219.000 0.000 NA   NA
 3731098 3731099 AZC_4416 AZC_4417     TRUE 0.741 150.000 0.750 NA   NA
 3731099 3731100 AZC_4417 AZC_4418     FALSE 0.066 145.000 0.000 1.000   NA
 3731101 3731102 AZC_4419 AZC_4420 fkbM   TRUE 0.497 95.000 0.154 NA   NA
 3731102 3731103 AZC_4420 AZC_4421     TRUE 0.919 9.000 0.034 NA   NA
 3731103 3731104 AZC_4421 AZC_4422     TRUE 0.806 57.000 0.034 1.000 Y NA
 3731104 3731105 AZC_4422 AZC_4423     TRUE 0.836 134.000 0.303 0.094 Y NA
 3731105 3731106 AZC_4423 AZC_4424     FALSE 0.394 138.000 0.061 0.094   NA
 3731107 3731108 AZC_4425 AZC_4426     FALSE 0.113 83.000 0.000 NA   NA
 3731108 3731109 AZC_4426 AZC_4427     TRUE 0.996 -3.000 0.520 NA N NA
 3731109 3731110 AZC_4427 AZC_4428     TRUE 0.499 18.000 0.000 NA   NA
 3731110 3731111 AZC_4428 AZC_4429     FALSE 0.044 297.000 0.000 NA   NA
 3731113 3731114 AZC_4431 AZC_4432 fecI fecR TRUE 0.982 11.000 0.571 NA N NA
 3731114 3731115 AZC_4432 AZC_4433 fecR   FALSE 0.331 131.000 0.000 NA Y NA
 3731115 3731116 AZC_4433 AZC_4434     FALSE 0.068 93.000 0.000 1.000 N NA
 3731117 3731118 AZC_4435 AZC_5r03     FALSE 0.042 334.000 0.000 NA   NA
 3731118 3731119 AZC_5r03 AZC_23r03     FALSE 0.131 75.000 0.000 NA   NA
 3731119 3731120 AZC_23r03 AZC_trnA51   trnA FALSE 0.040 407.000 0.000 NA   NA
 3731120 3731121 AZC_trnA51 AZC_trnI52 trnA trnI FALSE 0.178 58.000 0.000 NA   NA
 3731121 3731122 AZC_trnI52 AZC_16r03 trnI   FALSE 0.048 227.000 0.000 NA   NA
 3731123 3731124 AZC_4436 AZC_4437     TRUE 0.995 0.000 0.586 1.000   NA
 3731126 3731127 AZC_4439 AZC_4440     FALSE 0.078 101.000 0.000 NA   NA
 3731128 3731129 AZC_4441 AZC_4442     TRUE 0.996 11.000 0.706 1.000 Y NA
 3731129 3731130 AZC_4442 AZC_4443     FALSE 0.041 379.000 0.000 NA   NA
 3731132 3731133 AZC_4445 AZC_4446     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3731134 3731135 AZC_4447 AZC_4448     TRUE 0.994 29.000 0.928 0.010 Y NA
 3731135 3731136 AZC_4448 AZC_4449     TRUE 0.716 156.000 0.202 1.000 Y NA
 3731136 3731137 AZC_4449 AZC_4450     TRUE 0.960 87.000 0.574 0.000 Y NA
 3731138 3731139 AZC_4451 AZC_4452     FALSE 0.172 41.000 0.000 1.000 N NA
 3731140 3731141 AZC_4453 AZC_4454     TRUE 0.826 24.000 0.006 0.054   NA
 3731142 3731143 AZC_4455 AZC_4456 dsbE ccmD TRUE 0.980 4.000 0.172 1.000   NA
 3731143 3731144 AZC_4456 AZC_4457 ccmD ccmC TRUE 0.994 2.000 0.501 1.000   NA
 3731146 3731147 AZC_4459 AZC_4460 ccmB ccmA TRUE 0.901 215.000 0.503 0.002 Y NA
 3731148 3731149 AZC_4461 AZC_4462     TRUE 0.797 22.000 0.038 NA   NA
 3731149 3731150 AZC_4462 AZC_4463     FALSE 0.042 342.000 0.000 NA   NA
 3731150 3731151 AZC_4463 AZC_4464     FALSE 0.289 33.000 0.000 NA   NA
 3731151 3731152 AZC_4464 AZC_4465     FALSE 0.031 342.000 0.000 1.000 N NA
 3731154 3731155 AZC_4467 AZC_4468 gntR lacI TRUE 0.908 25.000 0.000 0.035 Y NA
 3731155 3731156 AZC_4468 AZC_4469 lacI   TRUE 0.538 34.000 0.012 1.000 N NA
 3731156 3731157 AZC_4469 AZC_4470     FALSE 0.054 173.000 0.000 NA   NA
 3731158 3731159 AZC_trnM53 AZC_4471 trnM   FALSE 0.069 111.000 0.000 NA   NA
 3731159 3731160 AZC_4471 AZC_4472     TRUE 0.983 2.000 0.165 1.000   NA
 3731161 3731162 AZC_4473 AZC_4474     FALSE 0.181 56.000 0.000 NA   NA
 3731162 3731163 AZC_4474 AZC_4475     FALSE 0.117 81.000 0.000 NA   NA
 3731163 3731164 AZC_4475 AZC_4476     TRUE 0.742 7.000 0.000 NA   NA
 3731164 3731165 AZC_4476 AZC_4477     FALSE 0.061 123.000 0.000 NA   NA
 3731165 3731166 AZC_4477 AZC_4478     FALSE 0.130 139.000 0.003 1.000 N NA
 3731167 3731168 AZC_4479 AZC_4480     FALSE 0.064 118.000 0.000 NA   NA
 3731169 3731170 AZC_4481 AZC_4482     FALSE 0.295 545.000 0.156 NA   NA
 3731171 3731172 AZC_4483 AZC_4484     FALSE 0.410 53.000 0.012 1.000 N NA
 3731172 3731173 AZC_4484 AZC_4485     TRUE 0.460 51.000 0.016 NA   NA
 3731173 10737307 AZC_4485 AZC_4485a     FALSE 0.171 62.000 0.000 NA   NA
 3731174 3731175 AZC_tmRNA01 AZC_4486   xerD FALSE 0.128 76.000 0.000 NA   NA
 10737307 3731174 AZC_4485a AZC_tmRNA01     TRUE 0.911 -207.000 0.000 NA   NA
 3731175 3731176 AZC_4486 AZC_4487 xerD   TRUE 0.872 14.000 0.043 NA   NA
 3731177 3731178 AZC_4488 AZC_4489     TRUE 0.967 21.000 0.147 1.000 Y NA
 3731178 3731179 AZC_4489 AZC_4490     FALSE 0.273 317.000 0.000 1.000 Y NA
 3731179 3731180 AZC_4490 AZC_4491     FALSE 0.229 241.000 0.069 1.000 N NA
 3731180 3731181 AZC_4491 AZC_4492     TRUE 0.632 65.000 0.034 0.024 N NA
 3731181 3731182 AZC_4492 AZC_4493   hemK TRUE 0.995 4.000 0.229 1.000 Y NA
 3731182 3731183 AZC_4493 AZC_4494 hemK   FALSE 0.138 518.000 0.021 NA   NA
 3731184 3731185 AZC_4495 AZC_4496     FALSE 0.029 518.000 0.000 1.000 N NA
 3731185 3731186 AZC_4496 AZC_4497     TRUE 0.743 32.000 0.086 1.000 N NA
 3731186 3731187 AZC_4497 AZC_4498   hisF TRUE 0.928 55.000 0.105 0.002 Y NA
 3731187 3731188 AZC_4498 AZC_4499 hisF   TRUE 0.998 4.000 0.433 0.002 Y NA
 3731188 3731189 AZC_4499 AZC_4500     TRUE 0.998 -3.000 0.070 0.002 Y NA
 3731189 3731190 AZC_4500 AZC_4501     TRUE 0.996 -3.000 0.417 NA   NA
 3731190 3731191 AZC_4501 AZC_4502     TRUE 0.915 10.000 0.041 NA   NA
 3731191 3731192 AZC_4502 AZC_4503   secY FALSE 0.035 234.000 0.000 1.000 N NA
 3731193 3731194 AZC_4504 AZC_4505     FALSE 0.377 26.000 0.000 NA   NA
 3731195 3731196 AZC_4506 AZC_4507     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3731196 3731197 AZC_4507 AZC_4508     FALSE 0.227 46.000 0.000 1.000   NA
 3731198 3731199 AZC_4509 AZC_4510     FALSE 0.394 70.000 0.019 NA   NA
 3731199 3731200 AZC_4510 AZC_4511     FALSE 0.092 92.000 0.000 NA   NA
 3731200 3731201 AZC_4511 AZC_4512     TRUE 0.998 -7.000 0.120 0.034 Y NA
 3731201 3731202 AZC_4512 AZC_4513     TRUE 0.847 55.000 0.080 NA Y NA
 3731202 3731203 AZC_4513 AZC_4514     TRUE 0.547 168.000 0.053 NA Y NA
 3731203 3731204 AZC_4514 AZC_4515     TRUE 0.999 8.000 0.902 0.073 Y NA
 3731206 3731207 AZC_4517 AZC_4518     FALSE 0.037 757.000 0.000 NA   NA
 3731207 3731208 AZC_4518 AZC_4519     FALSE 0.101 88.000 0.000 NA   NA
 3731208 3731209 AZC_4519 AZC_4520     TRUE 0.979 0.000 0.117 1.000 N NA
 3731209 3731210 AZC_4520 AZC_4521     TRUE 0.999 -3.000 0.752 1.000 Y NA
 3731210 3731211 AZC_4521 AZC_4522     TRUE 0.998 -3.000 0.671 0.086 N NA
 3731211 3731212 AZC_4522 AZC_4523   fixN FALSE 0.032 311.000 0.000 1.000 N NA
 3731212 3731213 AZC_4523 AZC_4524 fixN fixO TRUE 0.875 12.000 0.000 0.001 N NA
 3731213 3731214 AZC_4524 AZC_4525 fixO fixQ TRUE 0.991 4.000 0.214 0.001 N NA
 3731214 3731215 AZC_4525 AZC_4526 fixQ fixP TRUE 0.992 3.000 0.217 0.001 N NA
 3731215 3731216 AZC_4526 AZC_4527 fixP fixG TRUE 0.561 106.000 0.000 0.015 Y NA
 3731216 3731217 AZC_4527 AZC_4528 fixG fixH TRUE 0.449 48.000 0.023 NA N NA
 3731217 3731218 AZC_4528 AZC_4529 fixH   TRUE 0.704 165.000 0.206 NA Y NA
 3731218 3731219 AZC_4529 AZC_4530     TRUE 0.999 -3.000 0.713 NA Y NA
 3731219 3731220 AZC_4530 AZC_4531     TRUE 0.969 -3.000 0.010 NA   NA
 3731221 3731222 AZC_4532 AZC_4533     TRUE 0.996 6.000 0.409 1.000 Y NA
 3731223 3731224 AZC_4534 AZC_4535 iclR   TRUE 0.993 -3.000 0.278 1.000 N NA
 3731224 3731225 AZC_4535 AZC_4536     TRUE 0.996 -3.000 0.083 1.000 Y NA
 3731225 3731226 AZC_4536 AZC_4537     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3731226 3731227 AZC_4537 AZC_4538     TRUE 0.982 -10.000 0.044 NA   NA
 3731227 3731228 AZC_4538 AZC_4539     FALSE 0.441 69.000 0.029 NA   NA
 3731229 3731230 AZC_4540 AZC_4541     FALSE 0.048 117.000 0.000 1.000 N NA
 3731230 3731231 AZC_4541 AZC_4542     TRUE 0.997 5.000 0.309 0.003 Y NA
 3731231 3731232 AZC_4542 AZC_4543     TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.001 Y NA
 3731232 3731233 AZC_4543 AZC_4544     TRUE 0.932 24.000 0.043 1.000 Y NA
 3731233 3731234 AZC_4544 AZC_4545     TRUE 0.950 14.000 0.228 NA   NA
 3731234 3731235 AZC_4545 AZC_4546     TRUE 0.978 0.000 0.089 NA   NA
 3731235 3731236 AZC_4546 AZC_4547   mraZ TRUE 0.997 -3.000 0.635 NA   NA
 3731237 3731238 AZC_4548 AZC_4549 dnaJ   TRUE 0.986 -3.000 0.098 1.000 N NA
 3731240 3731241 AZC_4551 AZC_4552     FALSE 0.039 473.000 0.000 NA   NA
 3731243 3731244 AZC_4554 AZC_4555   murG TRUE 0.997 -3.000 0.647 1.000 N NA
 3731244 3731245 AZC_4555 AZC_4556 murG   TRUE 0.920 59.000 0.283 1.000 Y NA
 3731245 3731246 AZC_4556 AZC_4557     FALSE 0.249 41.000 0.000 1.000   NA
 3731246 3731247 AZC_4557 AZC_4558     TRUE 0.911 -16.000 0.000 NA   NA
 3731247 3731248 AZC_4558 AZC_4559     FALSE 0.057 150.000 0.000 NA   NA
 3731248 3731249 AZC_4559 AZC_4560     FALSE 0.116 68.000 0.000 1.000 N NA
 3731249 3731250 AZC_4560 AZC_4561     TRUE 0.513 160.000 0.000 0.003 Y NA
 3731250 3731251 AZC_4561 AZC_4562   ftsQ TRUE 0.904 15.000 0.000 NA Y NA
 3731251 3731252 AZC_4562 AZC_4563 ftsQ ftsA TRUE 0.987 -3.000 0.137 NA N NA
 3731252 3731253 AZC_4563 AZC_4564 ftsA ftsZ TRUE 0.768 89.000 0.114 1.000 Y NA
 3731253 3731254 AZC_4564 AZC_4565 ftsZ   FALSE 0.260 480.000 0.134 1.000 N NA
 3731256 3731257 AZC_4567 AZC_4568   recN TRUE 0.964 7.000 0.117 1.000   NA
 3731261 3731262 AZC_4572 AZC_4573     TRUE 0.545 15.000 0.000 NA   NA
 3731262 3731263 AZC_4573 AZC_4574     FALSE 0.325 30.000 0.000 NA   NA
 3731264 3731265 AZC_4575 AZC_4576     FALSE 0.203 57.000 0.000 1.000   NA
 3731265 3731266 AZC_4576 AZC_4577     TRUE 0.975 11.000 0.333 1.000   NA
 3731266 3731267 AZC_4577 AZC_4578     FALSE 0.045 273.000 0.000 NA   NA
 3731268 3731269 AZC_4579 AZC_4580     FALSE 0.066 148.000 0.000 1.000   NA
 3731269 3731270 AZC_4580 AZC_4581   ispG FALSE 0.100 95.000 0.000 1.000   NA
 3731270 3731271 AZC_4581 AZC_4582 ispG yceI TRUE 0.679 10.000 0.000 NA   NA
 3731272 3731273 AZC_4583 AZC_4584     TRUE 0.740 72.000 0.315 1.000 N NA
 3731273 3731274 AZC_4584 AZC_4585     TRUE 0.888 146.000 0.732 NA Y NA
 3731274 3731275 AZC_4585 AZC_4586     TRUE 0.923 88.000 0.615 NA Y NA
 3731275 3731276 AZC_4586 AZC_4587     TRUE 0.999 0.000 0.589 0.073 Y NA
 3731276 3731277 AZC_4587 AZC_4588     TRUE 0.583 527.000 0.621 1.000 N NA
 3731277 3731278 AZC_4588 AZC_4589     TRUE 0.995 -3.000 0.421 1.000 N NA
 3731279 3731280 AZC_4590 AZC_4591 tetR   FALSE 0.139 174.000 0.009 1.000 N NA
 3731280 3731281 AZC_4591 AZC_4592     TRUE 0.618 453.000 0.189 1.000 Y NA
 3731281 3731282 AZC_4592 AZC_4593     TRUE 0.998 -3.000 0.205 0.065 Y NA
 3731283 3731284 AZC_4594 AZC_4595     FALSE 0.081 110.000 0.000 1.000   NA
 3731289 3731290 AZC_4600 AZC_4601     TRUE 0.983 7.000 0.324 1.000   NA
 3731290 3731291 AZC_4601 AZC_4602     TRUE 0.995 -3.000 0.332 NA   NA
 3731291 3731292 AZC_4602 AZC_4603     TRUE 0.980 4.000 0.183 NA   NA
 3731292 3731293 AZC_4603 AZC_4604     FALSE 0.082 98.000 0.000 NA   NA
 3731293 3731294 AZC_4604 AZC_4605     FALSE 0.259 36.000 0.000 NA   NA
 3731294 3731295 AZC_4605 AZC_4606     FALSE 0.054 173.000 0.000 NA   NA
 3731296 3731297 AZC_4607 AZC_4608     FALSE 0.061 123.000 0.000 NA   NA
 3731297 3731298 AZC_4608 AZC_4609     FALSE 0.056 160.000 0.000 NA   NA
 3731298 3731299 AZC_4609 AZC_4610     FALSE 0.049 211.000 0.000 NA   NA
 3731300 3731301 AZC_4611 AZC_4612 ftsE ftsX TRUE 0.960 23.000 0.139 1.000 Y NA
 3731301 3731302 AZC_4612 AZC_4613 ftsX   TRUE 0.802 71.000 0.417 NA   NA
 3731302 3731303 AZC_4613 AZC_4614     TRUE 0.993 -3.000 0.250 NA   NA
 3731303 3731304 AZC_4614 AZC_4615     TRUE 0.471 58.000 0.024 NA   NA
 3731307 3731308 AZC_4618 AZC_4619     TRUE 0.994 -3.000 0.019 1.000 Y NA
 3731308 3731309 AZC_4619 AZC_4620     TRUE 0.972 14.000 0.084 1.000 Y NA
 3731310 3731311 AZC_4621 AZC_4622     FALSE 0.083 108.000 0.000 1.000   NA
 3731311 3731312 AZC_4622 AZC_4623     TRUE 1.000 -3.000 0.750 0.053 Y NA
 3731312 3731313 AZC_4623 AZC_4624     FALSE 0.223 127.000 0.025 1.000   NA
 3731313 3731314 AZC_4624 AZC_4625     TRUE 0.977 -3.000 0.025 1.000   NA
 3731315 3731316 AZC_4626 AZC_4627     TRUE 0.997 -3.000 0.128 NA Y NA
 3731317 3731318 AZC_4628 AZC_4629     FALSE 0.092 92.000 0.000 NA   NA
 3731318 3731319 AZC_4629 AZC_4630     TRUE 0.971 10.000 0.286 1.000 N NA
 3731320 3731321 AZC_4631 AZC_4632     TRUE 0.725 8.000 0.000 NA   NA
 3731322 3731323 AZC_4633 AZC_4634     FALSE 0.365 27.000 0.000 NA   NA
 3731323 3731324 AZC_4634 AZC_4635     FALSE 0.131 75.000 0.000 NA   NA
 3731325 3731326 AZC_4636 AZC_4637     TRUE 0.996 -3.000 0.082 NA Y NA
 3731326 3731327 AZC_4637 AZC_4638     TRUE 0.817 71.000 0.098 NA Y NA
 3731328 3731329 AZC_4639 AZC_4640     TRUE 0.961 11.000 0.003 1.000 Y NA
 3731331 3731332 AZC_4642 AZC_4643 fabA   TRUE 0.802 228.000 0.451 1.000 Y NA
 3731332 3731333 AZC_4643 AZC_4644     TRUE 0.787 115.000 0.265 1.000 Y NA
 3731335 3731336 AZC_4646 AZC_4647     TRUE 0.945 12.000 0.158 NA   NA
 3731337 3731338 AZC_4648 AZC_4649     FALSE 0.069 112.000 0.000 NA   NA
 3731339 3731340 AZC_4650 AZC_4651     TRUE 0.974 -3.000 0.021 NA   NA
 3731340 3731341 AZC_4651 AZC_4652   hemN FALSE 0.166 64.000 0.000 NA   NA
 3731343 3731344 AZC_4654 AZC_4655 fixL fixJ TRUE 0.999 -7.000 0.208 0.018 Y NA
 3731344 3731345 AZC_4655 AZC_4656 fixJ   TRUE 0.966 37.000 0.250 0.014 Y NA
 3731345 3731346 AZC_4656 AZC_4657     FALSE 0.055 106.000 0.000 1.000 N NA
 3731346 3731347 AZC_4657 AZC_4658     FALSE 0.036 223.000 0.000 1.000 N NA
 3731348 3731349 AZC_4659 AZC_4660     FALSE 0.142 150.000 0.002 NA   NA
 3731349 3731350 AZC_4660 AZC_4661     FALSE 0.161 66.000 0.000 NA   NA
 3731350 3731351 AZC_4661 AZC_4662     TRUE 0.874 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3731353 3731354 AZC_4664 AZC_4665     TRUE 0.535 71.000 0.092 1.000 N NA
 3731354 3731355 AZC_4665 AZC_4666     TRUE 0.998 0.000 0.242 0.015 Y NA
 3731355 3731356 AZC_4666 AZC_4667   hlyD FALSE 0.032 316.000 0.000 1.000 N NA
 3731356 3731357 AZC_4667 AZC_4668 hlyD prtD TRUE 0.994 11.000 0.688 0.005   NA
 3731358 3731359 AZC_4669 AZC_4670     FALSE 0.052 111.000 0.000 1.000 N NA
 3731359 3731360 AZC_4670 AZC_4671     TRUE 0.472 37.000 0.002 NA   NA
 3731364 3731365 AZC_4675 AZC_4676     TRUE 0.859 29.000 0.213 NA N NA
 3731365 3731366 AZC_4676 AZC_4677     TRUE 0.558 49.000 0.055 1.000 N NA
 3731367 3731368 AZC_4678 AZC_4679     FALSE 0.298 32.000 0.000 NA   NA
 3731368 3731369 AZC_4679 AZC_4680   uspA TRUE 0.459 23.000 0.000 1.000   NA
 3731369 3731370 AZC_4680 AZC_4681 uspA   FALSE 0.149 69.000 0.000 NA   NA
 3731370 3731371 AZC_4681 AZC_4682     TRUE 0.673 53.000 0.125 NA   NA
 3731376 3731377 AZC_4687 AZC_4688     TRUE 0.956 5.000 0.060 NA   NA
 3731377 3731378 AZC_4688 AZC_4689     FALSE 0.241 125.000 0.038 NA   NA
 3731379 3731380 AZC_4690 AZC_4691     FALSE 0.054 240.000 0.000 1.000   NA
 3731381 3731382 AZC_4692 AZC_4693     TRUE 0.957 55.000 0.560 1.000 Y NA
 3731382 3731383 AZC_4693 AZC_4694     TRUE 0.833 2.000 0.000 NA   NA
 3731384 3731385 AZC_4695 AZC_4696     FALSE 0.046 121.000 0.000 1.000 N NA
 3731385 3731386 AZC_4696 AZC_4697     FALSE 0.300 123.000 0.068 NA   NA
 3731386 3731387 AZC_4697 AZC_4698   fmu FALSE 0.297 134.000 0.071 NA   NA
 3731388 3731389 AZC_4699 AZC_4700 tetR   TRUE 0.524 19.000 0.000 1.000   NA
 3731390 3731391 AZC_4701 AZC_4702     FALSE 0.039 179.000 0.000 1.000 N NA
 3731392 3731393 AZC_4703 AZC_4704 nifU   TRUE 0.583 149.000 0.061 1.000 Y NA
 3731393 3731394 AZC_4704 AZC_4705     TRUE 0.993 -3.000 0.209 1.000   NA
 3731394 3731395 AZC_4705 AZC_4706     FALSE 0.102 94.000 0.000 1.000   NA
 3731397 3731398 AZC_4708 AZC_4709     TRUE 0.477 198.000 0.266 1.000   NA
 3731398 3731399 AZC_4709 AZC_4710     TRUE 0.614 137.000 0.466 1.000 N NA
 3731399 3731400 AZC_4710 AZC_4711   parA TRUE 0.995 -3.000 0.339 1.000 N NA
 3731400 3731401 AZC_4711 AZC_4712 parA parB TRUE 0.912 60.000 0.827 1.000 N NA
 3731401 3731402 AZC_4712 AZC_4713 parB   FALSE 0.038 183.000 0.000 1.000 N NA
 3731402 3731403 AZC_4713 AZC_4714   mutS FALSE 0.104 73.000 0.000 1.000 N NA
 3731404 3731405 AZC_4715 AZC_4716 rho   FALSE 0.167 256.000 0.024 NA   NA
 3731405 3731406 AZC_4716 AZC_4717   hemE TRUE 0.542 55.000 0.044 NA   NA