MicrobesOnline Operon Predictions for Coxiella burnetii CbuK_Q154

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5611357 5611358 CbuK_0001 CbuK_0002     TRUE 0.939 144.000 0.328 1.000 Y NA
 5611358 5611359 CbuK_0002 CbuK_0003   recF TRUE 0.998 5.000 0.318 1.000 Y NA
 5611359 5611360 CbuK_0003 CbuK_0004 recF gyrB TRUE 0.762 296.000 0.249 0.008 Y NA
 5611360 5611361 CbuK_0004 CbuK_0005 gyrB   FALSE 0.048 145.000 0.000 NA   NA
 5611362 5611363 CbuK_0006 CbuK_0007     FALSE 0.117 51.000 0.000 NA   NA
 5611365 5611366 CbuK_0009 CbuK_0010     TRUE 0.997 0.000 0.598 0.007   NA
 5611367 5611368 CbuK_0011 CbuK_0012   ftsE TRUE 0.986 7.000 0.117 1.000 N NA
 5611368 5611369 CbuK_0012 CbuK_0013 ftsE ftsX TRUE 0.993 -3.000 0.121 1.000 Y NA
 5611369 5611370 CbuK_0013 CbuK_0014 ftsX   FALSE 0.120 49.000 0.000 NA   NA
 5611371 5611372 CbuK_0015 CbuK_0016     FALSE 0.296 19.000 0.000 NA   NA
 5611373 5611374 CbuK_0017 CbuK_0018 rpoH com1 FALSE 0.514 26.000 0.000 1.000 N NA
 5611376 5611377 CbuK_0020 CbuK_0021 glyQ glyS TRUE 0.999 -6.000 0.651 0.002 Y NA
 5611377 5611378 CbuK_0021 CbuK_0022 glyS sun TRUE 0.933 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5611380 5611381 CbuK_0024 CbuK_0025 rpmH rnpA TRUE 0.998 -3.000 0.787 1.000   NA
 5611381 5611382 CbuK_0025 CbuK_0026 rnpA   TRUE 0.970 36.000 0.540 NA   NA
 5611382 5611383 CbuK_0026 CbuK_0027     TRUE 0.996 4.000 0.461 NA   NA
 5611383 5611384 CbuK_0027 CbuK_0028     FALSE 0.048 145.000 0.000 NA   NA
 5611384 5611385 CbuK_0028 CbuK_0029   trmE FALSE 0.033 185.000 0.000 NA   NA
 5611387 5611388 CbuK_0031 CbuK_0032 gidA gidB TRUE 0.982 32.000 0.466 1.000 N NA
 5611388 5611389 CbuK_0032 CbuK_0033 gidB parA TRUE 0.996 7.000 0.339 1.000 N NA
 5611389 5611390 CbuK_0033 CbuK_0034 parA parB TRUE 0.999 -9.000 0.827 1.000 N NA
 5611390 5611391 CbuK_0034 CbuK_0035 parB   TRUE 0.823 10.000 0.000 1.000 N NA
 5611391 5611392 CbuK_0035 CbuK_0036     TRUE 0.611 0.000 0.000 NA   NA
 5611392 5611393 CbuK_0036 CbuK_0037     FALSE 0.117 51.000 0.000 NA   NA
 5611393 5611394 CbuK_0037 CbuK_0038     FALSE 0.083 82.000 0.000 NA   NA
 5611394 5611395 CbuK_0038 CbuK_0039     FALSE 0.277 20.000 0.000 NA   NA
 5611397 5611398 CbuK_0041 CbuK_0042     TRUE 0.648 -3.000 0.000 1.000   NA
 5611398 5611399 CbuK_0042 CbuK_0043     FALSE 0.104 63.000 0.000 NA   NA
 5611400 5611401 CbuK_0044 CbuK_0045     FALSE 0.076 95.000 0.000 NA   NA
 5611402 5611403 CbuK_0046 CbuK_0047 atpI atpB TRUE 0.997 1.000 0.291 1.000 Y NA
 5611403 5611404 CbuK_0047 CbuK_0048 atpB atpE TRUE 0.990 18.000 0.557 0.007   NA
 5611404 5611405 CbuK_0048 CbuK_0049 atpE atpF TRUE 0.943 129.000 0.666 0.007   NA
 5611405 5611406 CbuK_0049 CbuK_0050 atpF atpH TRUE 0.997 0.000 0.242 0.007 Y NA
 5611406 5611407 CbuK_0050 CbuK_0051 atpH atpA TRUE 0.999 8.000 0.864 0.007 Y NA
 5611407 5611408 CbuK_0051 CbuK_0052 atpA atpG TRUE 0.986 99.000 0.846 0.007 Y NA
 5611408 5611409 CbuK_0052 CbuK_0053 atpG atpD TRUE 0.993 36.000 0.724 0.007 Y NA
 5611409 5611410 CbuK_0053 CbuK_0054 atpD atpC TRUE 0.983 124.000 0.837 0.007 Y NA
 5611410 5611411 CbuK_0054 CbuK_0055 atpC glmU TRUE 0.941 19.000 0.067 1.000 N NA
 5611411 5611412 CbuK_0055 CbuK_0056 glmU   FALSE 0.018 267.000 0.000 NA   NA
 5611412 5611413 CbuK_0056 CbuK_0057     FALSE 0.114 55.000 0.000 NA   NA
 5611413 5611414 CbuK_0057 CbuK_0058     FALSE 0.059 128.000 0.000 NA   NA
 5611416 5611417 CbuK_0060 CbuK_0061     FALSE 0.100 66.000 0.000 NA   NA
 5611418 5611419 CbuK_0062 CbuK_0064   pntAA FALSE 0.022 238.000 0.000 NA   NA
 5611420 5611421 CbuK_0063 CbuK_0065   pntAB TRUE 0.795 383.000 0.829 0.003   NA
 5611421 5611422 CbuK_0065 CbuK_0066 pntAB pntB TRUE 0.994 -3.000 0.321 0.003   NA
 5611422 5611423 CbuK_0066 CbuK_0067 pntB   FALSE 0.191 27.000 0.000 NA   NA
 5611423 5611424 CbuK_0067 CbuK_0068     FALSE 0.082 84.000 0.000 NA   NA
 5611428 5611429 CbuK_0072 CbuK_0073 tkt gap TRUE 0.957 15.000 0.022 1.000 Y NA
 5611429 5611430 CbuK_0073 CbuK_0074 gap pgk TRUE 0.794 72.000 0.017 0.010 Y NA
 5611430 5611431 CbuK_0074 CbuK_0075 pgk pyk TRUE 0.968 -13.000 0.002 0.010 Y NA
 5611434 5611435 CbuK_0078 CbuK_0079     FALSE 0.063 121.000 0.000 NA   NA
 5611436 5611437 CbuK_0080 CbuK_0081 glmS   FALSE 0.024 227.000 0.000 NA   NA
 5611437 5611438 CbuK_0081 CbuK_0082     FALSE 0.042 159.000 0.000 NA   NA
 5611442 5611443 CbuK_0086 CbuK_0087     TRUE 0.607 2.000 0.000 NA   NA
 5611445 5611446 CbuK_0089 CbuK_0090     TRUE 0.862 5.000 0.000 1.000 N NA
 5611446 5611447 CbuK_0090 CbuK_0091     FALSE 0.211 129.000 0.000 1.000 N NA
 5611447 5611448 CbuK_0091 CbuK_0092     FALSE 0.090 73.000 0.000 NA   NA
 5611448 5611449 CbuK_0092 CbuK_0093     FALSE 0.060 127.000 0.000 NA   NA
 5611449 5611450 CbuK_0093 CbuK_0094     FALSE 0.127 43.000 0.000 NA   NA
 5611451 5611452 CbuK_0095 CbuK_0096     TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5611452 5611453 CbuK_0096 CbuK_0097     FALSE 0.539 9.000 0.000 NA   NA
 5611453 5611454 CbuK_0097 CbuK_0098     FALSE 0.214 24.000 0.000 NA   NA
 5611455 5611456 CbuK_0099 CbuK_0100     FALSE 0.296 19.000 0.000 NA   NA
 5611456 5611457 CbuK_0100 CbuK_0101     FALSE 0.106 95.000 0.000 0.019   NA
 5611458 5611459 CbuK_0102 CbuK_0103     FALSE 0.010 441.000 0.000 NA   NA
 5611459 5611460 CbuK_0103 CbuK_0104     FALSE 0.028 205.000 0.000 NA   NA
 5611460 5611461 CbuK_0104 CbuK_0105   lolD.1 TRUE 0.980 11.000 0.044 1.000 Y NA
 5611461 5611462 CbuK_0105 CbuK_0106 lolD.1   TRUE 0.976 -7.000 0.044 NA N NA
 5611462 5611463 CbuK_0106 CbuK_0107     TRUE 0.931 3.000 0.000 NA Y NA
 5611464 5611465 CbuK_0108 CbuK_0109 pdxB   FALSE 0.523 -19.000 0.000 NA   NA
 5611465 5611466 CbuK_0109 CbuK_0110     FALSE 0.022 239.000 0.000 NA   NA
 5611468 5611469 CbuK_0112 CbuK_0113 efp   TRUE 0.991 5.000 0.082 0.059 Y NA
 5611469 5611470 CbuK_0113 CbuK_0114     FALSE 0.027 210.000 0.000 NA   NA
 5611470 5611471 CbuK_0114 CbuK_0115     FALSE 0.116 53.000 0.000 NA   NA
 5611472 5611473 CbuK_0116 CbuK_0117     FALSE 0.075 97.000 0.000 NA   NA
 5611473 5611474 CbuK_0117 CbuK_0118   sodC FALSE 0.099 80.000 0.000 1.000   NA
 5611481 5611482 CbuK_0125 CbuK_0126 lolB   FALSE 0.085 79.000 0.000 NA   NA
 5611482 5611483 CbuK_0126 CbuK_0127   prs FALSE 0.243 22.000 0.000 NA   NA
 5611484 5611485 CbuK_0128 CbuK_0129     TRUE 0.576 -7.000 0.000 NA   NA
 5611487 5611488 CbuK_0131 CbuK_0132     TRUE 0.993 2.000 0.200 NA N NA
 5611488 5611489 CbuK_0132 CbuK_0133     TRUE 0.706 14.000 0.000 NA N NA
 5611489 5611490 CbuK_0133 CbuK_0134   rfbC TRUE 0.933 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5611490 5611491 CbuK_0134 CbuK_0135 rfbC   TRUE 0.564 10.000 0.000 1.000   NA
 5611492 5611493 CbuK_0136 CbuK_0137 rplY pth TRUE 0.998 7.000 0.496 0.053 Y NA
 5611493 5611494 CbuK_0137 CbuK_0138 pth ychF TRUE 0.963 33.000 0.184 1.000 Y NA
 5611494 5611495 CbuK_0138 CbuK_0139 ychF   TRUE 0.604 4.000 0.000 NA   NA
 5611495 5611496 CbuK_0139 CbuK_0140     FALSE 0.100 66.000 0.000 NA   NA
 5611496 5611497 CbuK_0140 CbuK_0141     FALSE 0.046 149.000 0.000 NA   NA
 5611497 5611498 CbuK_0141 CbuK_0142     FALSE 0.069 106.000 0.000 NA   NA
 5611498 5611499 CbuK_0142 CbuK_0143     FALSE 0.071 102.000 0.000 NA   NA
 5611500 5611501 CbuK_0144 CbuK_0145     FALSE 0.545 -13.000 0.000 NA   NA
 5611502 5611503 CbuK_0146 CbuK_0147     FALSE 0.096 69.000 0.000 NA   NA
 5611504 5611505 CbuK_0148 CbuK_0149     FALSE 0.025 221.000 0.000 NA   NA
 5611506 5611507 CbuK_0150 CbuK_0151     TRUE 0.576 -7.000 0.000 NA   NA
 5611508 5611509 CbuK_0152 CbuK_0153     FALSE 0.082 83.000 0.000 NA   NA
 5611509 5611510 CbuK_0153 CbuK_0154     FALSE 0.137 39.000 0.000 NA   NA
 5611510 5611511 CbuK_0154 CbuK_0155   pilF FALSE 0.011 397.000 0.000 NA   NA
 5611511 5611512 CbuK_0155 CbuK_0156 pilF   FALSE 0.221 27.000 0.000 1.000   NA
 5611512 5611513 CbuK_0156 CbuK_0157   oppD TRUE 0.648 -3.000 0.000 1.000   NA
 5611513 5611514 CbuK_0157 CbuK_0158 oppD oppC FALSE 0.075 122.000 0.000 1.000   NA
 5611514 5611515 CbuK_0158 CbuK_0159 oppC oppB TRUE 0.999 11.000 0.738 0.022 Y NA
 5611515 5611516 CbuK_0159 CbuK_0160 oppB oppA TRUE 0.994 25.000 0.619 0.022 Y NA
 5611518 5611519 CbuK_0162 CbuK_0163     FALSE 0.018 261.000 0.000 NA   NA
 5611519 5611520 CbuK_0163 CbuK_0164     FALSE 0.259 21.000 0.000 NA   NA
 5611520 5611521 CbuK_0164 CbuK_0165   parC TRUE 0.611 3.000 0.000 NA   NA
 5611527 5611528 CbuK_0171 CbuK_0172   rpe TRUE 0.826 -19.000 0.000 1.000 N NA
 5611528 5611529 CbuK_0172 CbuK_0173 rpe djlA TRUE 0.958 0.000 0.003 1.000 N NA
 5611530 5611531 CbuK_0174 CbuK_0175 gshA gshB TRUE 0.811 54.000 0.120 1.000   NA
 5611531 5611532 CbuK_0175 CbuK_0176 gshB   FALSE 0.011 407.000 0.000 NA   NA
 5611533 5611534 CbuK_0177 CbuK_0178     FALSE 0.048 145.000 0.000 NA   NA
 5611535 5611536 CbuK_0179 CbuK_0180 def2   TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5611538 5611539 CbuK_0182 CbuK_0183 hemL   TRUE 0.933 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5611539 5611540 CbuK_0183 CbuK_0184     TRUE 0.611 3.000 0.000 NA   NA
 5611541 5611542 CbuK_0185 CbuK_0186   ponA FALSE 0.518 10.000 0.000 NA   NA
 5611543 5611544 CbuK_0187 CbuK_0188   pilN TRUE 0.942 -3.000 0.015 NA   NA
 5611544 5611545 CbuK_0188 CbuK_0189 pilN   FALSE 0.079 89.000 0.000 NA   NA
 5611545 5611546 CbuK_0189 CbuK_0190   pilQ FALSE 0.523 -19.000 0.000 NA   NA
 5611546 5611547 CbuK_0190 CbuK_0191 pilQ aroK TRUE 0.991 -67.000 0.319 1.000   NA
 5611547 5611548 CbuK_0191 CbuK_0192 aroK aroB TRUE 0.994 -19.000 0.208 1.000 Y NA
 5611549 5611550 CbuK_0193 CbuK_0194     FALSE 0.228 23.000 0.000 NA   NA
 5611553 5611554 CbuK_0197 CbuK_0198   dacB TRUE 0.611 0.000 0.000 NA   NA
 5611554 5611555 CbuK_0198 CbuK_0199 dacB aroE TRUE 0.855 -7.000 0.000 1.000 N NA
 5611555 5611556 CbuK_0199 CbuK_0200 aroE   FALSE 0.078 90.000 0.000 NA   NA
 5611557 5611558 CbuK_0201 CbuK_0202     FALSE 0.018 265.000 0.000 NA   NA
 5611559 5611560 CbuK_0203 CbuK_0204   xapA TRUE 0.861 2.000 0.000 NA N NA
 5611560 5611561 CbuK_0204 CbuK_0205 xapA deoC TRUE 0.991 -3.000 0.083 1.000 Y NA
 5611561 5611562 CbuK_0205 CbuK_0206 deoC   FALSE 0.082 84.000 0.000 NA   NA
 5611563 5611564 CbuK_0207 CbuK_0208     FALSE 0.549 8.000 0.000 NA   NA
 5611565 5611566 CbuK_0209 CbuK_0210     FALSE 0.022 238.000 0.000 NA   NA
 5611567 5611568 CbuK_0211 CbuK_0212   csrA2.1 FALSE 0.059 128.000 0.000 NA   NA
 5611568 5611569 CbuK_0212 CbuK_0213 csrA2.1   FALSE 0.076 96.000 0.000 NA   NA
 5611569 5611570 CbuK_0213 CbuK_0214   rpiA FALSE 0.047 147.000 0.000 NA   NA
 5611570 5611571 CbuK_0214 CbuK_0215 rpiA   FALSE 0.187 142.000 0.000 1.000 N NA
 5611571 5611572 CbuK_0215 CbuK_0216     TRUE 0.869 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5611572 5611573 CbuK_0216 CbuK_0217     FALSE 0.373 48.000 0.000 1.000 N NA
 5611573 5611574 CbuK_0217 CbuK_0218     TRUE 0.916 -13.000 0.000 1.000 Y NA
 5611574 5611575 CbuK_0218 CbuK_0219     FALSE 0.087 99.000 0.000 1.000   NA
 5611577 5611578 CbuK_0221 CbuK_0222     TRUE 0.944 4.000 0.014 1.000   NA
 5611578 5611579 CbuK_0222 CbuK_0223     TRUE 0.977 23.000 0.405 1.000   NA
 5611579 5611580 CbuK_0223 CbuK_0224     TRUE 0.999 -3.000 0.852 NA Y NA
 5611580 5611581 CbuK_0224 CbuK_0225   fabA TRUE 0.978 4.000 0.009 NA Y NA
 5611581 5611582 CbuK_0225 CbuK_0226 fabA   FALSE 0.030 198.000 0.000 NA   NA
 5611582 5611583 CbuK_0226 CbuK_0227   prlC FALSE 0.083 81.000 0.000 NA   NA
 5611587 5611588 CbuK_0231 CbuK_0232     FALSE 0.038 171.000 0.000 NA   NA
 5611589 5611590 CbuK_0233 CbuK_0234     FALSE 0.027 235.000 0.000 1.000   NA
 5611590 5611591 CbuK_0234 CbuK_0235     TRUE 0.987 98.000 1.000 1.000 Y NA
 5611591 5611592 CbuK_0235 CbuK_0236     FALSE 0.083 104.000 0.000 1.000   NA
 5611592 5611593 CbuK_0236 CbuK_0237     FALSE 0.104 63.000 0.000 NA   NA
 5611593 5611594 CbuK_0237 CbuK_0238   feoA FALSE 0.105 62.000 0.000 NA   NA
 5611594 5611595 CbuK_0238 CbuK_0239 feoA feoB TRUE 0.996 1.000 0.229 1.000 Y NA
 5611595 5611596 CbuK_0239 CbuK_0240 feoB   TRUE 0.996 0.000 0.455 NA   NA
 5611596 5611597 CbuK_0240 CbuK_0241     FALSE 0.117 51.000 0.000 NA   NA
 5611598 5611599 CbuK_0242 CbuK_0244     FALSE 0.375 14.000 0.000 NA   NA
 5611602 5611603 CbuK_0246 CbuK_0247     FALSE 0.136 54.000 0.000 1.000   NA
 5611607 5611608 CbuK_0251 CbuK_0252     FALSE 0.518 10.000 0.000 NA   NA
 5611609 5611610 CbuK_0253 CbuK_0254     FALSE 0.089 74.000 0.000 NA   NA
 5611610 5611611 CbuK_0254 CbuK_0255     FALSE 0.147 36.000 0.000 NA   NA
 5611611 5611612 CbuK_0255 CbuK_0256     FALSE 0.068 108.000 0.000 NA   NA
 5611612 5611613 CbuK_0256 CbuK_0257     FALSE 0.128 42.000 0.000 NA   NA
 5611614 5611615 CbuK_0258 CbuK_0259 rplM rpsI TRUE 0.996 19.000 0.601 0.030 Y NA
 5611615 5611616 CbuK_0259 CbuK_0260 rpsI sspA TRUE 0.797 31.000 0.014 NA N NA
 5611616 5611617 CbuK_0260 CbuK_0261 sspA sspB TRUE 0.998 2.000 0.831 NA   NA
 5611617 5611618 CbuK_0261 CbuK_0262 sspB   FALSE 0.079 88.000 0.000 NA   NA
 5611619 5611620 CbuK_0263 CbuK_0264   gmhA TRUE 0.997 0.000 0.613 NA   NA
 5611620 5611621 CbuK_0264 CbuK_0265 gmhA   TRUE 0.992 6.000 0.187 1.000 N NA
 5611621 5611622 CbuK_0265 CbuK_0266     TRUE 0.855 50.000 0.172 NA   NA
 5611623 5611624 CbuK_0267 CbuK_0268     FALSE 0.083 82.000 0.000 NA   NA
 5611625 5611626 CbuK_0269 CbuK_0270 ihfB purN FALSE 0.275 86.000 0.000 1.000 N NA
 5611626 5611627 CbuK_0270 CbuK_0271 purN purM TRUE 0.997 -3.000 0.230 0.003 Y NA
 5611628 5611629 CbuK_0272 CbuK_0273     TRUE 0.986 3.000 0.174 NA   NA
 5611630 5611631 CbuK_0274 CbuK_0275     FALSE 0.050 143.000 0.000 NA   NA
 5611631 5611632 CbuK_0275 CbuK_0276     TRUE 0.611 0.000 0.000 NA   NA
 5611633 5611634 CbuK_0277 CbuK_0278   hemF FALSE 0.098 81.000 0.000 1.000   NA
 5611634 5611635 CbuK_0278 CbuK_0279 hemF   TRUE 0.622 35.000 0.000 1.000 Y NA
 5611635 5611636 CbuK_0279 CbuK_0280   arcB TRUE 0.855 -7.000 0.000 1.000 N NA
 5611637 5611638 CbuK_0281 CbuK_0282 accC accB TRUE 0.997 7.000 0.275 0.002 Y NA
 5611639 5611640 CbuK_0283 CbuK_0284     FALSE 0.117 51.000 0.000 NA   NA
 5611640 5611641 CbuK_0284 CbuK_0285     FALSE 0.012 345.000 0.000 NA   NA
 5611644 5611645 CbuK_0288 CbuK_0289   acnA FALSE 0.525 11.000 0.000 1.000   NA
 5611646 5611647 CbuK_0290 CbuK_0291 groES groEL TRUE 0.673 28.000 0.000 1.000 Y NA
 5611647 5611648 CbuK_0291 CbuK_0292 groEL gvcT FALSE 0.218 127.000 0.000 1.000 N NA
 5611648 5611649 CbuK_0292 CbuK_0293 gvcT gvcH TRUE 0.996 11.000 0.317 0.002 Y NA
 5611649 5611650 CbuK_0293 CbuK_0294 gvcH gvcPA TRUE 0.997 3.000 0.249 1.000 Y NA
 5611650 5611651 CbuK_0294 CbuK_0295 gvcPA gvcPB TRUE 0.969 68.000 0.316 0.002 Y NA
 5611652 5611653 CbuK_0296 CbuK_0297   ahpD.1 FALSE 0.025 222.000 0.000 NA   NA
 5611655 5611656 CbuK_0299 CbuK_0300     FALSE 0.186 226.000 0.000 1.000 Y NA
 5611656 5611657 CbuK_0300 CbuK_0301     FALSE 0.329 17.000 0.000 NA   NA
 5611657 5611658 CbuK_0301 CbuK_0302     FALSE 0.010 476.000 0.000 NA   NA
 5611658 5611659 CbuK_0302 CbuK_0303   dapB TRUE 0.611 3.000 0.000 NA   NA
 5611659 5611660 CbuK_0303 CbuK_0304 dapB sodB TRUE 0.870 2.000 0.000 1.000 N NA
 5611661 5611662 CbuK_0305 CbuK_0306   ahpC.1 FALSE 0.142 38.000 0.000 NA   NA
 5611662 5611663 CbuK_0306 CbuK_0307 ahpC.1   FALSE 0.110 58.000 0.000 NA   NA
 5611664 5611665 CbuK_0308 CbuK_0309 rnt pyrC TRUE 0.979 -13.000 0.068 1.000 N NA
 5611668 5611669 CbuK_0312 CbuK_0313     TRUE 0.604 4.000 0.000 NA   NA
 5611670 5611671 CbuK_0314 CbuK_0315 nth rnfB TRUE 0.975 -13.000 0.048 1.000 N NA
 5611671 5611672 CbuK_0315 CbuK_0316 rnfB metG TRUE 0.965 -7.000 0.014 1.000 N NA
 5611675 5611676 CbuK_0319 CbuK_0320     TRUE 0.576 -7.000 0.000 NA   NA
 5611678 5611679 CbuK_0322 CbuK_0323   dcd TRUE 0.988 0.000 0.112 1.000 N NA
 5611679 5611680 CbuK_0323 CbuK_0324 dcd   FALSE 0.045 154.000 0.000 NA   NA
 5611681 5611682 CbuK_0325 CbuK_0326     FALSE 0.243 22.000 0.000 NA   NA
 5611682 5611683 CbuK_0326 CbuK_0327     FALSE 0.088 75.000 0.000 NA   NA
 5611684 5611685 CbuK_0328 CbuK_0329   pyrG FALSE 0.152 35.000 0.000 NA   NA
 5611685 5611686 CbuK_0329 CbuK_0330 pyrG   FALSE 0.131 41.000 0.000 NA   NA
 5611687 5611688 CbuK_0331 CbuK_0332   speG FALSE 0.035 178.000 0.000 NA   NA
 5611689 5611690 CbuK_0333 CbuK_0334     FALSE 0.094 70.000 0.000 NA   NA
 5611690 5611691 CbuK_0334 CbuK_0335   kdsA FALSE 0.014 313.000 0.000 NA   NA
 5611693 5611694 CbuK_0336 CbuK_0338 eno ftsB TRUE 0.994 7.000 0.241 1.000 N NA
 5611694 5611695 CbuK_0338 CbuK_0339 ftsB surE FALSE 0.111 70.000 0.000 1.000   NA
 5611695 5611696 CbuK_0339 CbuK_0340 surE   TRUE 0.949 2.000 0.018 1.000   NA
 5611696 5611697 CbuK_0340 CbuK_0341   rpoS.1 TRUE 0.566 80.000 0.027 1.000   NA
 5611697 5611698 CbuK_0341 CbuK_0342 rpoS.1   FALSE 0.020 248.000 0.000 NA   NA
 5611698 5611699 CbuK_0342 CbuK_0343     FALSE 0.135 40.000 0.000 NA   NA
 5611701 5611702 CbuK_0345 CbuK_0346     FALSE 0.107 61.000 0.000 NA   NA
 5611702 5611703 CbuK_0346 CbuK_0347   rfaF TRUE 0.982 4.000 0.138 NA   NA
 5611704 5611705 CbuK_0348 CbuK_0349     TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5611706 5611707 CbuK_0350 CbuK_0351     TRUE 0.566 41.000 0.000 NA Y NA
 5611707 5611708 CbuK_0351 CbuK_0352     FALSE 0.105 62.000 0.000 NA   NA
 5611708 5611709 CbuK_0352 CbuK_0353     FALSE 0.523 -19.000 0.000 NA   NA
 5611709 5611710 CbuK_0353 CbuK_0354   rfaE FALSE 0.549 8.000 0.000 NA   NA
 5611715 5611716 CbuK_0359 CbuK_0360     FALSE 0.152 35.000 0.000 NA   NA
 5611716 5611717 CbuK_0360 CbuK_0361     FALSE 0.065 118.000 0.000 NA   NA
 5611718 5611719 CbuK_0362 CbuK_0363     FALSE 0.119 65.000 0.000 1.000   NA
 5611720 5611721 CbuK_0364 CbuK_0365     TRUE 0.869 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5611721 5611722 CbuK_0365 CbuK_0366     FALSE 0.357 47.000 0.000 NA N NA
 5611722 5611723 CbuK_0366 CbuK_0367     TRUE 0.992 4.000 0.184 NA N NA
 5611726 5611727 CbuK_0370 CbuK_0371     FALSE 0.040 166.000 0.000 NA   NA
 5611727 5611728 CbuK_0371 CbuK_0372     TRUE 0.590 5.000 0.000 NA   NA
 5611728 5611729 CbuK_0372 CbuK_0374     FALSE 0.009 651.000 0.000 NA   NA
 5611729 5611730 CbuK_0374 CbuK_0375     FALSE 0.504 -1456.000 0.000 NA   NA
 5611730 5611731 CbuK_0375 CbuK_0376     FALSE 0.008 1028.000 0.000 NA   NA
 5611731 5611732 CbuK_0376 CbuK_0377     FALSE 0.040 165.000 0.000 NA   NA
 5611733 5611734 CbuK_0378 CbuK_0379     FALSE 0.135 40.000 0.000 NA   NA
 5611734 5611735 CbuK_0379 CbuK_0380     FALSE 0.539 9.000 0.000 NA   NA
 5611735 5611736 CbuK_0380 CbuK_0381     TRUE 0.608 1.000 0.000 NA   NA
 5611737 5611738 CbuK_0382 CbuK_0383     FALSE 0.062 123.000 0.000 NA   NA
 5611740 5611741 CbuK_0385 CbuK_0386 ampG   FALSE 0.080 87.000 0.000 NA   NA
 5611742 5611743 CbuK_0387 CbuK_0388     TRUE 0.997 -3.000 0.575 NA   NA
 5611744 5611745 CbuK_0389 CbuK_0390   coaA FALSE 0.535 -16.000 0.000 NA   NA
 5611745 5611746 CbuK_0390 CbuK_0391 coaA   TRUE 0.870 1.000 0.000 1.000 N NA
 5611748 5611749 CbuK_0393 CbuK_0394   gltX2 FALSE 0.094 70.000 0.000 NA   NA
 5611749 5611750 CbuK_0394 CbuK_0395 gltX2   FALSE 0.105 62.000 0.000 NA   NA
 5611750 5611751 CbuK_0395 CbuK_0396     FALSE 0.069 107.000 0.000 NA   NA
 5611751 5611752 CbuK_0396 CbuK_0397     FALSE 0.097 68.000 0.000 NA   NA
 5611752 5611753 CbuK_0397 CbuK_0398     FALSE 0.013 334.000 0.000 NA   NA
 5611753 5611754 CbuK_0398 CbuK_0399     FALSE 0.037 195.000 0.000 1.000   NA
 5611754 5611755 CbuK_0399 CbuK_0400     FALSE 0.025 220.000 0.000 NA   NA
 5611755 5611756 CbuK_0400 CbuK_0401     FALSE 0.015 284.000 0.000 NA   NA
 5611760 5611761 CbuK_0405 CbuK_0406     FALSE 0.203 25.000 0.000 NA   NA
 5611761 5611762 CbuK_0406 CbuK_0407     FALSE 0.016 281.000 0.000 NA   NA
 5611762 5611763 CbuK_0407 CbuK_0408   cydA1.1 FALSE 0.081 85.000 0.000 NA   NA
 5611763 5611764 CbuK_0408 CbuK_0409 cydA1.1 cybB1.1 FALSE 0.539 9.000 0.000 NA   NA
 5611764 5611765 CbuK_0409 CbuK_0410 cybB1.1   TRUE 0.563 7.000 0.000 NA   NA
 5611765 5611766 CbuK_0410 CbuK_0411   mtaA TRUE 0.576 -7.000 0.000 NA   NA
 5611766 5611767 CbuK_0411 CbuK_0412 mtaA   FALSE 0.045 154.000 0.000 NA   NA
 5611767 5611768 CbuK_0412 CbuK_0413     FALSE 0.057 131.000 0.000 NA   NA
 5611768 5611769 CbuK_0413 CbuK_0414     TRUE 0.611 0.000 0.000 NA   NA
 5611769 5611770 CbuK_0414 CbuK_0415   tuf1.1 FALSE 0.089 74.000 0.000 NA   NA
 5611770 5611771 CbuK_0415 CbuK_0416 tuf1.1   FALSE 0.059 128.000 0.000 NA   NA
 5611771 5611772 CbuK_0416 CbuK_0417   secE FALSE 0.128 42.000 0.000 NA   NA
 5611772 5611773 CbuK_0417 CbuK_0418 secE nusG TRUE 0.993 25.000 0.843 1.000 N NA
 5611773 5611774 CbuK_0418 CbuK_0419 nusG rplK TRUE 0.966 125.000 0.681 1.000 N NA
 5611774 5611775 CbuK_0419 CbuK_0420 rplK rplA TRUE 0.999 0.000 0.838 0.039 Y NA
 5611775 5611776 CbuK_0420 CbuK_0421 rplA rplJ TRUE 0.837 254.000 0.302 0.039 Y NA
 5611776 5611777 CbuK_0421 CbuK_0422 rplJ rplL TRUE 0.994 34.000 0.884 0.028 Y NA
 5611777 5611778 CbuK_0422 CbuK_0423 rplL   FALSE 0.407 13.000 0.000 NA   NA
 5611778 5611779 CbuK_0423 CbuK_0424   rpoB FALSE 0.356 15.000 0.000 NA   NA
 5611779 5611780 CbuK_0424 CbuK_0425 rpoB rpoC TRUE 0.942 269.000 0.851 0.002 Y NA
 5611780 5611781 CbuK_0425 CbuK_0426 rpoC   FALSE 0.051 141.000 0.000 NA   NA
 5611783 5611784 CbuK_0428 CbuK_0429 rpsL rpsG TRUE 0.998 13.000 0.620 0.006 Y NA
 5611784 5611785 CbuK_0429 CbuK_0430 rpsG fusA TRUE 0.998 10.000 0.579 1.000 Y NA
 5611785 5611786 CbuK_0430 CbuK_0431 fusA tuf1.2 TRUE 0.995 16.000 0.400 0.002 Y NA
 5611786 5611787 CbuK_0431 CbuK_0432 tuf1.2 rpsJ TRUE 0.909 181.000 0.318 1.000 Y NA
 5611787 5611788 CbuK_0432 CbuK_0433 rpsJ rplC TRUE 0.989 22.000 0.307 0.039 Y NA
 5611788 5611789 CbuK_0433 CbuK_0434 rplC rplD TRUE 0.999 -3.000 0.486 0.028 Y NA
 5611789 5611790 CbuK_0434 CbuK_0435 rplD rplW TRUE 0.999 -3.000 0.513 1.000 Y NA
 5611790 5611791 CbuK_0435 CbuK_0436 rplW rplB TRUE 0.997 20.000 0.849 1.000 Y NA
 5611791 5611792 CbuK_0436 CbuK_0437 rplB rpsS TRUE 0.998 13.000 0.820 0.039 Y NA
 5611792 5611793 CbuK_0437 CbuK_0438 rpsS rplV TRUE 0.999 0.000 0.769 0.039 Y NA
 5611793 5611794 CbuK_0438 CbuK_0439 rplV rpsC TRUE 0.999 0.000 0.719 0.039 Y NA
 5611794 5611795 CbuK_0439 CbuK_0440 rpsC rplP TRUE 0.999 12.000 0.828 0.039 Y NA
 5611795 5611796 CbuK_0440 CbuK_0441 rplP rpmC TRUE 0.999 1.000 0.802 0.028 Y NA
 5611796 5611797 CbuK_0441 CbuK_0442 rpmC rpsQ TRUE 0.999 11.000 0.828 0.028 Y NA
 5611797 5611798 CbuK_0442 CbuK_0443 rpsQ rplN TRUE 0.999 11.000 0.791 0.039 Y NA
 5611798 5611799 CbuK_0443 CbuK_0444 rplN rplX TRUE 0.998 12.000 0.810 0.039 Y NA
 5611799 5611800 CbuK_0444 CbuK_0445 rplX rplE TRUE 0.982 117.000 0.758 0.028 Y NA
 5611800 5611801 CbuK_0445 CbuK_0446 rplE rpsN TRUE 0.999 5.000 0.496 0.028 Y NA
 5611801 5611802 CbuK_0446 CbuK_0447 rpsN rpsH TRUE 0.999 -6.000 0.473 0.028 Y NA
 5611802 5611803 CbuK_0447 CbuK_0448 rpsH rplF TRUE 0.993 38.000 0.808 0.028 Y NA
 5611803 5611804 CbuK_0448 CbuK_0449 rplF rplR TRUE 0.999 0.000 0.815 0.028 Y NA
 5611804 5611805 CbuK_0449 CbuK_0450 rplR rpsE TRUE 0.999 12.000 0.814 0.039 Y NA
 5611805 5611806 CbuK_0450 CbuK_0451 rpsE rpmD TRUE 0.999 4.000 0.789 0.039 Y NA
 5611806 5611807 CbuK_0451 CbuK_0452 rpmD rplO TRUE 0.999 3.000 0.653 0.005 Y NA
 5611807 5611808 CbuK_0452 CbuK_0453 rplO secY TRUE 0.995 18.000 0.730 1.000 N NA
 5611808 5611809 CbuK_0453 CbuK_0454 secY   FALSE 0.017 275.000 0.000 NA   NA
 5611809 5611810 CbuK_0454 CbuK_0455   rpsM TRUE 0.590 5.000 0.000 NA   NA
 5611810 5611811 CbuK_0455 CbuK_0456 rpsM rpsK TRUE 0.995 28.000 0.810 0.028 Y NA
 5611811 5611812 CbuK_0456 CbuK_0457 rpsK rpsD TRUE 0.997 13.000 0.509 0.039 Y NA
 5611812 5611813 CbuK_0457 CbuK_0458 rpsD rpoA TRUE 0.996 13.000 0.549 1.000 N NA
 5611813 5611814 CbuK_0458 CbuK_0459 rpoA rplQ TRUE 0.998 12.000 0.873 1.000 N NA
 5611814 5611815 CbuK_0459 CbuK_0460 rplQ   TRUE 0.872 3.000 0.000 1.000 N NA
 5611815 5611816 CbuK_0460 CbuK_0461     FALSE 0.080 87.000 0.000 NA   NA
 5611816 5611817 CbuK_0461 CbuK_0462     FALSE 0.061 126.000 0.000 NA   NA
 5611818 5611819 CbuK_0463 CbuK_0464 ssb   TRUE 0.841 50.000 0.075 NA N NA
 5611819 5611820 CbuK_0464 CbuK_0465     FALSE 0.079 88.000 0.000 NA   NA
 5611825 5611826 CbuK_0470 CbuK_0471 hemE   FALSE 0.154 41.000 0.000 1.000   NA
 5611830 5611831 CbuK_0475 CbuK_0476 dinP katE FALSE 0.305 71.000 0.000 1.000 N NA
 5611832 5611833 CbuK_0477 CbuK_0479     FALSE 0.329 17.000 0.000 NA   NA
 5611834 5611835 CbuK_0478 CbuK_0480     TRUE 0.604 4.000 0.000 NA   NA
 5611837 5611838 CbuK_0482 CbuK_0483 cca.2 folK TRUE 0.994 -3.000 0.234 1.000 N NA
 5611838 5611839 CbuK_0483 CbuK_0484 folK coaD TRUE 0.933 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5611839 5611840 CbuK_0484 CbuK_0485 coaD   TRUE 0.934 15.000 0.088 NA   NA
 5611841 5611842 CbuK_0486 CbuK_0487 rpmG rpmB TRUE 0.991 11.000 0.332 0.028   NA
 5611842 5611843 CbuK_0487 CbuK_0488 rpmB radC FALSE 0.541 94.000 0.003 1.000 N NA
 5611843 5611844 CbuK_0488 CbuK_0489 radC   FALSE 0.203 25.000 0.000 NA   NA
 5611845 5611846 CbuK_0490 CbuK_0491 dut algC TRUE 0.968 -22.000 0.039 1.000 N NA
 5611847 5611848 CbuK_0492 CbuK_0493   pyrE TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5611850 5611851 CbuK_0495 CbuK_0496 murI rph TRUE 0.981 0.000 0.048 1.000 N NA
 5611852 5611853 CbuK_0497 CbuK_0498 yicC gmk TRUE 0.991 -7.000 0.276 NA   NA
 5611853 5611854 CbuK_0498 CbuK_0499 gmk rpoZ TRUE 0.963 78.000 0.471 1.000 N NA
 5611854 5611855 CbuK_0499 CbuK_0500 rpoZ spoT TRUE 0.970 54.000 0.291 1.000 Y NA
 5611855 5611856 CbuK_0500 CbuK_0501 spoT   TRUE 0.958 28.000 0.215 NA N NA
 5611856 5611857 CbuK_0501 CbuK_0502   recG TRUE 0.981 7.000 0.076 NA N NA
 5611857 5611858 CbuK_0502 CbuK_0503 recG   FALSE 0.016 281.000 0.000 NA   NA
 5611858 5611859 CbuK_0503 CbuK_0504     TRUE 0.611 0.000 0.000 NA   NA
 5611861 5611862 CbuK_0505 CbuK_0507 htpG p1 FALSE 0.021 262.000 0.000 1.000   NA
 5611865 5611866 CbuK_0510 CbuK_0511     TRUE 0.796 137.000 0.233 1.000   NA
 5611867 5611868 CbuK_0512 CbuK_0513   rnhA FALSE 0.154 41.000 0.000 1.000   NA
 5611873 5611874 CbuK_0518 CbuK_0519     FALSE 0.518 10.000 0.000 NA   NA
 5611874 5611875 CbuK_0519 CbuK_0520   icmH TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5611876 5611877 CbuK_0521 CbuK_0522     TRUE 0.648 -3.000 0.000 1.000   NA
 5611877 5611878 CbuK_0522 CbuK_0523     TRUE 0.846 14.000 0.000 1.000 Y NA
 5611880 5611881 CbuK_0525 CbuK_0526   thiC FALSE 0.075 97.000 0.000 NA   NA
 5611881 5611882 CbuK_0526 CbuK_0527 thiC thiO TRUE 0.974 0.000 0.022 1.000 N NA
 5611882 5611883 CbuK_0527 CbuK_0528 thiO thiS TRUE 0.869 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5611883 5611884 CbuK_0528 CbuK_0529 thiS thiG TRUE 0.989 2.000 0.064 1.000 Y NA
 5611884 5611885 CbuK_0529 CbuK_0530 thiG thiDE TRUE 0.982 -3.000 0.012 0.004 Y NA
 5611885 5611886 CbuK_0530 CbuK_0531 thiDE   FALSE 0.101 78.000 0.000 1.000   NA
 5611887 5611888 CbuK_0532 CbuK_0533 purH fis TRUE 0.982 -19.000 0.101 1.000 N NA
 5611893 5611894 CbuK_0537 CbuK_0539     FALSE 0.013 336.000 0.000 NA   NA
 5611894 5611895 CbuK_0539 CbuK_0540     FALSE 0.101 65.000 0.000 NA   NA
 5611896 5611897 CbuK_0541 CbuK_0542 xylA xylB TRUE 0.763 70.000 0.010 1.000 Y NA
 5611897 5611898 CbuK_0542 CbuK_0543 xylB xylT TRUE 0.929 5.000 0.000 1.000 Y NA
 5611898 5611899 CbuK_0543 CbuK_0544 xylT   FALSE 0.196 26.000 0.000 NA   NA
 5611899 5611900 CbuK_0544 CbuK_0545   gph FALSE 0.243 22.000 0.000 NA   NA
 5611900 5611901 CbuK_0545 CbuK_0546 gph ubiG TRUE 0.991 -7.000 0.259 1.000   NA
 5611901 5611902 CbuK_0546 CbuK_0547 ubiG   TRUE 0.827 -13.000 0.000 NA N NA
 5611902 5611903 CbuK_0547 CbuK_0548   czcD FALSE 0.371 42.000 0.000 NA N NA
 5611903 5611904 CbuK_0548 CbuK_0549 czcD   FALSE 0.198 137.000 0.000 1.000 N NA
 5611905 5611906 CbuK_0550 CbuK_0551     FALSE 0.087 76.000 0.000 NA   NA
 5611907 5611908 CbuK_0552 CbuK_0553     FALSE 0.228 23.000 0.000 NA   NA
 5611908 5611909 CbuK_0553 CbuK_0554     FALSE 0.051 142.000 0.000 NA   NA
 5611909 5611910 CbuK_0554 CbuK_0555     TRUE 0.593 -82.000 0.000 0.028   NA
 5611910 5611911 CbuK_0555 CbuK_0556     FALSE 0.098 81.000 0.000 1.000   NA
 5611911 5611912 CbuK_0556 CbuK_0557   phoR FALSE 0.141 176.000 0.000 1.000 N NA
 5611912 5611913 CbuK_0557 CbuK_0558 phoR phoB TRUE 0.998 -19.000 0.453 0.010 Y NA
 5611915 5611916 CbuK_0560 CbuK_0561     FALSE 0.103 64.000 0.000 NA   NA
 5611916 5611917 CbuK_0561 CbuK_0562     FALSE 0.091 72.000 0.000 NA   NA
 5611917 5611918 CbuK_0562 CbuK_0563     FALSE 0.071 103.000 0.000 NA   NA
 5611918 5611919 CbuK_0563 CbuK_0564     FALSE 0.047 147.000 0.000 NA   NA
 5611919 5611920 CbuK_0564 CbuK_0565     TRUE 0.998 -16.000 0.600 1.000 N NA
 5611921 5611922 CbuK_0566 CbuK_0567     TRUE 0.590 5.000 0.000 NA   NA
 5611922 5611923 CbuK_0567 CbuK_0568     TRUE 0.611 3.000 0.000 NA   NA
 5611923 5611924 CbuK_0568 CbuK_0569     FALSE 0.024 228.000 0.000 NA   NA
 5611924 5611925 CbuK_0569 CbuK_0570     FALSE 0.018 260.000 0.000 NA   NA
 5611925 5611926 CbuK_0570 CbuK_0571     FALSE 0.043 157.000 0.000 NA   NA
 5611927 5611928 CbuK_0572 CbuK_0573 ampD   FALSE 0.329 17.000 0.000 NA   NA
 5611930 5611931 CbuK_0575 CbuK_0576     FALSE 0.019 255.000 0.000 NA   NA
 5611931 5611932 CbuK_0576 CbuK_0577   ispB FALSE 0.101 65.000 0.000 NA   NA
 5611937 5611938 CbuK_0582 CbuK_0583 tpiA secG TRUE 0.990 -18.000 0.184 1.000 N NA
 5611938 5611939 CbuK_0583 CbuK_0584 secG   FALSE 0.518 10.000 0.000 NA   NA
 5611939 5611940 CbuK_0584 CbuK_0585   nuoA FALSE 0.029 200.000 0.000 NA   NA
 5611940 5611941 CbuK_0585 CbuK_0586 nuoA nuoB TRUE 0.999 5.000 0.507 0.006 Y NA
 5611941 5611942 CbuK_0586 CbuK_0587 nuoB nuoC TRUE 0.997 10.000 0.328 0.006 Y NA
 5611942 5611943 CbuK_0587 CbuK_0588 nuoC nuoD TRUE 0.998 -7.000 0.483 0.012 Y NA
 5611943 5611944 CbuK_0588 CbuK_0589 nuoD nuoE TRUE 0.998 0.000 0.355 0.011 Y NA
 5611944 5611945 CbuK_0589 CbuK_0590 nuoE nuoF TRUE 0.998 -10.000 0.343 0.011 Y NA
 5611945 5611946 CbuK_0590 CbuK_0591 nuoF   FALSE 0.523 -19.000 0.000 NA   NA
 5611946 5611947 CbuK_0591 CbuK_0592   nuoG FALSE 0.479 11.000 0.000 NA   NA
 5611947 5611948 CbuK_0592 CbuK_0593 nuoG nuoH TRUE 0.999 0.000 0.515 0.012 Y NA
 5611948 5611949 CbuK_0593 CbuK_0594 nuoH nuoI TRUE 0.998 -18.000 0.500 0.012 Y NA
 5611949 5611950 CbuK_0594 CbuK_0595 nuoI nuoJ TRUE 0.996 14.000 0.442 0.012 Y NA
 5611950 5611951 CbuK_0595 CbuK_0596 nuoJ nuoK TRUE 0.999 -3.000 0.484 0.006 Y NA
 5611951 5611952 CbuK_0596 CbuK_0597 nuoK nuoL TRUE 0.982 57.000 0.451 0.012 Y NA
 5611952 5611953 CbuK_0597 CbuK_0598 nuoL nuoM TRUE 0.995 5.000 0.175 0.012 Y NA
 5611953 5611954 CbuK_0598 CbuK_0599 nuoM nuoN TRUE 0.997 10.000 0.340 0.012 Y NA
 5611954 5611955 CbuK_0599 CbuK_0600 nuoN   FALSE 0.019 257.000 0.000 NA   NA
 5611955 5611956 CbuK_0600 CbuK_0601     FALSE 0.107 61.000 0.000 NA   NA
 5611956 5611957 CbuK_0601 CbuK_0602   nusA TRUE 0.998 4.000 0.759 NA   NA
 5611957 5611958 CbuK_0602 CbuK_0603 nusA infB TRUE 0.996 6.000 0.342 1.000 N NA
 5611958 5611959 CbuK_0603 CbuK_0604 infB rbfA TRUE 0.978 88.000 0.530 1.000 Y NA
 5611959 5611960 CbuK_0604 CbuK_0605 rbfA truB TRUE 0.997 -22.000 0.318 1.000 Y NA
 5611963 5611964 CbuK_0608 CbuK_0609     FALSE 0.016 277.000 0.000 NA   NA
 5611966 5611967 CbuK_0611 CbuK_0612     FALSE 0.180 140.000 0.000 NA N NA
 5611967 5611968 CbuK_0612 CbuK_0613     FALSE 0.355 48.000 0.000 NA N NA
 5611968 5611969 CbuK_0613 CbuK_0614   htrA TRUE 0.872 0.000 0.000 1.000 N NA
 5611969 5611970 CbuK_0614 CbuK_0615 htrA   FALSE 0.232 161.000 0.004 NA   NA
 5611970 5611971 CbuK_0615 CbuK_0616   rluD TRUE 0.863 41.000 0.168 NA   NA
 5611973 5611974 CbuK_0618 CbuK_0619     FALSE 0.137 39.000 0.000 NA   NA
 5611974 5611975 CbuK_0619 CbuK_0620     FALSE 0.083 82.000 0.000 NA   NA
 5611976 5611977 CbuK_0621 CbuK_0622     TRUE 0.576 -7.000 0.000 NA   NA
 5611977 5611978 CbuK_0622 CbuK_0623     FALSE 0.259 21.000 0.000 NA   NA
 5611978 5611979 CbuK_0623 CbuK_0624     FALSE 0.259 21.000 0.000 NA   NA
 5611979 5611980 CbuK_0624 CbuK_0625     TRUE 0.611 0.000 0.000 NA   NA
 5611983 5611984 CbuK_0628 CbuK_0629     FALSE 0.056 132.000 0.000 NA   NA
 5611984 5611985 CbuK_0629 CbuK_0631     FALSE 0.012 339.000 0.000 NA   NA
 5611986 5611987 CbuK_0630 CbuK_0632     TRUE 0.608 1.000 0.000 NA   NA
 5611987 5611988 CbuK_0632 CbuK_0633     FALSE 0.032 187.000 0.000 NA   NA
 5611988 5611989 CbuK_0633 CbuK_0634     FALSE 0.068 108.000 0.000 NA   NA
 5611989 5611990 CbuK_0634 CbuK_0635     TRUE 0.611 3.000 0.000 NA   NA
 5611992 5611993 CbuK_0637 CbuK_0638     TRUE 0.915 10.000 0.000 0.001 Y NA
 5611993 5611994 CbuK_0638 CbuK_0639     FALSE 0.251 100.000 0.000 1.000 N NA
 5611994 5611995 CbuK_0639 CbuK_0640     FALSE 0.047 167.000 0.000 1.000   NA
 5611995 5611996 CbuK_0640 CbuK_0641   prpB FALSE 0.045 172.000 0.000 1.000   NA
 5611996 5611997 CbuK_0641 CbuK_0642 prpB prpC TRUE 0.998 -7.000 0.502 1.000 N NA
 5611997 5611998 CbuK_0642 CbuK_0643 prpC   TRUE 0.611 3.000 0.000 NA   NA
 5611998 5611999 CbuK_0643 CbuK_0644     FALSE 0.076 96.000 0.000 NA   NA
 5611999 5612000 CbuK_0644 CbuK_0645     TRUE 0.917 7.000 0.000 NA Y NA
 5612000 5612001 CbuK_0645 CbuK_0646     TRUE 0.869 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5612001 5612002 CbuK_0646 CbuK_0647     TRUE 0.997 -3.000 0.667 NA   NA
 5612003 5612004 CbuK_0648 CbuK_0649 pfpI   FALSE 0.142 38.000 0.000 NA   NA
 5612005 5612006 CbuK_0650 CbuK_0651     FALSE 0.011 402.000 0.000 NA   NA
 5612006 5612007 CbuK_0651 CbuK_0652     FALSE 0.027 210.000 0.000 NA   NA
 5612009 5612010 CbuK_0654 CbuK_0655     FALSE 0.017 268.000 0.000 NA   NA
 5612010 5612011 CbuK_0655 CbuK_0656     FALSE 0.152 35.000 0.000 NA   NA
 5612011 5612012 CbuK_0656 CbuK_0657     TRUE 0.559 -10.000 0.000 NA   NA
 5612012 5612013 CbuK_0657 CbuK_0658     FALSE 0.232 116.000 0.000 1.000 N NA
 5612013 5612014 CbuK_0658 CbuK_0659     FALSE 0.020 250.000 0.000 NA   NA
 5612015 5612016 CbuK_0660 CbuK_0661     FALSE 0.108 60.000 0.000 NA   NA
 5612016 5612017 CbuK_0661 CbuK_0662     FALSE 0.010 435.000 0.000 NA   NA
 5612017 5612018 CbuK_0662 CbuK_0663     FALSE 0.009 490.000 0.000 NA   NA
 5612018 5612019 CbuK_0663 CbuK_0664   folE FALSE 0.172 31.000 0.000 NA   NA
 5612019 5612020 CbuK_0664 CbuK_0665 folE   TRUE 0.872 0.000 0.000 1.000 N NA
 5612020 5612021 CbuK_0665 CbuK_0666     FALSE 0.329 17.000 0.000 NA   NA
 5612021 5612022 CbuK_0666 CbuK_0667     FALSE 0.259 21.000 0.000 NA   NA
 5612023 5612024 CbuK_0668 CbuK_0669     TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5612024 5612025 CbuK_0669 CbuK_0670   rimI TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5612027 5612028 CbuK_0672 CbuK_0673     TRUE 0.850 8.000 0.000 0.062 N NA
 5612029 5612030 CbuK_0674 CbuK_0675     FALSE 0.068 109.000 0.000 NA   NA
 5612033 5612034 CbuK_0678 CbuK_0679     TRUE 0.997 -12.000 0.631 0.053   NA
 5612034 5612035 CbuK_0679 CbuK_0680   prfC TRUE 0.651 1.000 0.000 1.000   NA
 5612035 5612036 CbuK_0680 CbuK_0681 prfC   FALSE 0.356 15.000 0.000 NA   NA
 5612036 5612037 CbuK_0681 CbuK_0682     FALSE 0.015 288.000 0.000 NA   NA
 5612041 5612042 CbuK_0686 CbuK_0687     FALSE 0.352 57.000 0.000 1.000 N NA
 5612042 5612043 CbuK_0687 CbuK_0688     FALSE 0.105 74.000 0.000 1.000   NA
 5612046 5612047 CbuK_0691 CbuK_0692 sfcA purB FALSE 0.494 28.000 0.000 1.000 N NA
 5612048 5612049 CbuK_0693 CbuK_0694   rfaH TRUE 0.838 -13.000 0.000 1.000 N NA
 5612049 5612050 CbuK_0694 CbuK_0695 rfaH   TRUE 0.727 35.000 0.036 NA   NA
 5612050 5612051 CbuK_0695 CbuK_0696     FALSE 0.087 77.000 0.000 NA   NA
 5612051 5612052 CbuK_0696 CbuK_0697     TRUE 0.938 15.000 0.094 1.000   NA
 5612052 5612053 CbuK_0697 CbuK_0698     TRUE 0.999 -3.000 0.511 1.000 Y NA
 5612053 5612054 CbuK_0698 CbuK_0699   asnB1.1 TRUE 0.992 3.000 0.178 1.000 N NA
 5612054 5612055 CbuK_0699 CbuK_0700 asnB1.1   TRUE 0.651 1.000 0.000 1.000   NA
 5612055 5612056 CbuK_0700 CbuK_0701     FALSE 0.525 11.000 0.000 1.000   NA
 5612056 5612057 CbuK_0701 CbuK_0702     TRUE 0.748 13.000 0.000 1.000 N NA
 5612057 5612058 CbuK_0702 CbuK_0703     FALSE 0.539 9.000 0.000 NA   NA
 5612058 5612059 CbuK_0703 CbuK_0704     TRUE 0.604 4.000 0.000 NA   NA
 5612059 5612060 CbuK_0704 CbuK_0705     FALSE 0.356 15.000 0.000 NA   NA
 5612060 5612061 CbuK_0705 CbuK_0706     FALSE 0.015 287.000 0.000 NA   NA
 5612061 5612062 CbuK_0706 CbuK_0707     FALSE 0.363 136.000 0.000 0.017 Y NA
 5612062 5612063 CbuK_0707 CbuK_0708   asnB1.2 TRUE 0.872 0.000 0.000 1.000 N NA
 5612063 5612064 CbuK_0708 CbuK_0709 asnB1.2   TRUE 0.979 7.000 0.061 1.000 N NA
 5612064 5612065 CbuK_0709 CbuK_0710   wecB FALSE 0.181 231.000 0.000 1.000 Y NA
 5612065 5612066 CbuK_0710 CbuK_0711 wecB   TRUE 0.894 11.000 0.000 1.000 Y NA
 5612067 5612068 CbuK_0712 CbuK_0713     TRUE 0.985 -12.000 0.046 1.000 Y NA
 5612069 5612070 CbuK_0714 CbuK_0715 ugd   TRUE 0.722 14.000 0.000 1.000 N NA
 5612070 5612071 CbuK_0715 CbuK_0716   pgi TRUE 0.823 10.000 0.000 1.000 N NA
 5612071 5612072 CbuK_0716 CbuK_0717 pgi galU TRUE 0.869 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5612072 5612073 CbuK_0717 CbuK_0718 galU   FALSE 0.103 64.000 0.000 NA   NA
 5612073 5612074 CbuK_0718 CbuK_0719   rpsO FALSE 0.071 101.000 0.000 NA   NA
 5612074 5612075 CbuK_0719 CbuK_0720 rpsO pnp TRUE 0.997 11.000 0.335 1.000 Y NA
 5612077 5612078 CbuK_0722 CbuK_0723     FALSE 0.122 47.000 0.000 NA   NA
 5612078 5612079 CbuK_0723 CbuK_0724     FALSE 0.530 -18.000 0.000 NA   NA
 5612079 5612080 CbuK_0724 CbuK_0725   lpxK TRUE 0.994 0.000 0.205 1.000 N NA
 5612081 5612082 CbuK_0726 CbuK_0727 nadE   TRUE 0.563 7.000 0.000 NA   NA
 5612083 5612084 CbuK_0728 CbuK_0729     FALSE 0.031 192.000 0.000 NA   NA
 5612084 5612085 CbuK_0729 CbuK_0730     FALSE 0.062 123.000 0.000 NA   NA
 5612085 5612086 CbuK_0730 CbuK_0731   rpsF FALSE 0.545 -13.000 0.000 NA   NA
 5612086 5612087 CbuK_0731 CbuK_0732 rpsF rpsR TRUE 0.995 13.000 0.319 0.026 Y NA
 5612087 5612088 CbuK_0732 CbuK_0733 rpsR   TRUE 0.957 4.000 0.034 NA   NA
 5612088 5612089 CbuK_0733 CbuK_0734   rplI TRUE 0.919 12.000 0.034 NA   NA
 5612089 5612090 CbuK_0734 CbuK_0735 rplI dnaB FALSE 0.454 249.000 0.074 1.000 N NA
 5612090 5612091 CbuK_0735 CbuK_0736 dnaB alr TRUE 0.977 -3.000 0.035 1.000 N NA
 5612091 5612092 CbuK_0736 CbuK_0737 alr   TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5612093 5612094 CbuK_0738 CbuK_0739   udk FALSE 0.083 81.000 0.000 NA   NA
 5612094 5612095 CbuK_0739 CbuK_0740 udk   TRUE 0.559 -10.000 0.000 NA   NA
 5612096 5612097 CbuK_0741 CbuK_0742 aroC asd TRUE 0.862 13.000 0.000 1.000 Y NA
 5612099 5612100 CbuK_0744 CbuK_0745     FALSE 0.061 125.000 0.000 NA   NA
 5612100 5612101 CbuK_0745 CbuK_0746     FALSE 0.076 95.000 0.000 NA   NA
 5612102 5612103 CbuK_0747 CbuK_0748     FALSE 0.011 392.000 0.000 NA   NA
 5612104 5612105 CbuK_0749 CbuK_0750 bipA   FALSE 0.444 12.000 0.000 NA   NA
 5612105 5612106 CbuK_0750 CbuK_0751   coaBC FALSE 0.166 32.000 0.000 NA   NA
 5612106 5612107 CbuK_0751 CbuK_0752 coaBC   TRUE 0.648 -3.000 0.000 1.000   NA
 5612108 5612109 CbuK_0753 CbuK_0754 bdbC   TRUE 0.993 -3.000 0.308 NA   NA
 5612109 5612110 CbuK_0754 CbuK_0755     FALSE 0.137 39.000 0.000 NA   NA
 5612111 5612112 CbuK_0756 CbuK_0757   truA TRUE 0.590 5.000 0.000 NA   NA
 5612112 5612113 CbuK_0757 CbuK_0758 truA accD TRUE 0.864 31.000 0.044 1.000 N NA
 5612113 5612114 CbuK_0758 CbuK_0759 accD folC TRUE 0.930 133.000 0.383 1.000 N NA
 5612114 5612115 CbuK_0759 CbuK_0760 folC dedD TRUE 0.986 -16.000 0.216 NA   NA
 5612115 5612116 CbuK_0760 CbuK_0761 dedD dedE TRUE 0.763 68.000 0.116 NA   NA
 5612116 5612117 CbuK_0761 CbuK_0762 dedE purF TRUE 0.989 9.000 0.262 1.000   NA
 5612117 5612118 CbuK_0762 CbuK_0763 purF   TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5612118 5612119 CbuK_0763 CbuK_0764     FALSE 0.329 17.000 0.000 NA   NA
 5612119 5612120 CbuK_0764 CbuK_0765     FALSE 0.026 217.000 0.000 NA   NA
 5612120 5612121 CbuK_0765 CbuK_0766     FALSE 0.020 249.000 0.000 NA   NA
 5612121 5612122 CbuK_0766 CbuK_0767     TRUE 0.559 -10.000 0.000 NA   NA
 5612122 5612123 CbuK_0767 CbuK_0768     FALSE 0.067 112.000 0.000 NA   NA
 5612123 5612124 CbuK_0768 CbuK_0769     FALSE 0.009 550.000 0.000 NA   NA
 5612125 5612126 CbuK_0770 CbuK_0771   ispZ TRUE 0.611 3.000 0.000 NA   NA
 5612127 5612128 CbuK_0772 CbuK_0773     FALSE 0.075 98.000 0.000 NA   NA
 5612132 5612133 CbuK_0777 CbuK_0778 scpA scpB TRUE 0.972 5.000 0.083 NA   NA
 5612133 5612134 CbuK_0778 CbuK_0779 scpB   TRUE 0.991 10.000 0.210 NA N NA
 5612135 5612136 CbuK_0780 CbuK_0781     FALSE 0.407 13.000 0.000 NA   NA
 5612136 5612137 CbuK_0781 CbuK_0782   mutS TRUE 0.860 -3.000 0.000 NA N NA
 5612138 5612139 CbuK_0783 CbuK_0784   recA FALSE 0.368 88.000 0.003 NA   NA
 5612139 5612140 CbuK_0784 CbuK_0785 recA recX TRUE 0.993 -3.000 0.296 1.000   NA
 5612140 5612141 CbuK_0785 CbuK_0786 recX alaS TRUE 0.972 -7.000 0.085 1.000   NA
 5612141 5612142 CbuK_0786 CbuK_0787 alaS lysC TRUE 0.981 6.000 0.065 1.000 N NA
 5612142 5612143 CbuK_0787 CbuK_0788 lysC csrA2.2 TRUE 0.698 140.000 0.079 1.000 N NA
 5612143 5612144 CbuK_0788 CbuK_0789 csrA2.2   FALSE 0.016 280.000 0.000 NA   NA
 5612144 5612145 CbuK_0789 CbuK_0790     FALSE 0.022 239.000 0.000 NA   NA
 5612151 5612152 CbuK_0795 CbuK_0797   cyoA FALSE 0.549 8.000 0.000 NA   NA
 5612152 5612153 CbuK_0797 CbuK_0798 cyoA cyoB TRUE 0.984 20.000 0.200 0.003 Y NA
 5612153 5612154 CbuK_0798 CbuK_0799 cyoB cyoC TRUE 0.997 -3.000 0.267 0.031 Y NA
 5612154 5612155 CbuK_0799 CbuK_0800 cyoC cyoD TRUE 0.998 -3.000 0.400 0.031 Y NA
 5612156 5612157 CbuK_0801 CbuK_0802     FALSE 0.070 104.000 0.000 NA   NA
 5612157 5612158 CbuK_0802 CbuK_0803     FALSE 0.121 48.000 0.000 NA   NA
 5612160 5612161 CbuK_0805 CbuK_0806     FALSE 0.065 118.000 0.000 NA   NA
 5612161 5612162 CbuK_0806 CbuK_0807     TRUE 0.972 -3.000 0.020 1.000 N NA
 5612163 5612164 CbuK_0808 CbuK_0809 pgsA   FALSE 0.312 18.000 0.000 NA   NA
 5612165 5612166 CbuK_0810 CbuK_0811     FALSE 0.515 -21.000 0.000 NA   NA
 5612167 5612168 CbuK_0812 CbuK_0813     FALSE 0.479 11.000 0.000 NA   NA
 5612171 5612172 CbuK_0816 CbuK_0817     TRUE 0.621 6.000 0.000 1.000   NA
 5612172 5612173 CbuK_0817 CbuK_0818     FALSE 0.010 794.000 0.000 1.000   NA
 5612173 5612174 CbuK_0818 CbuK_0819     TRUE 0.997 -7.000 0.600 NA   NA
 5612175 5612176 CbuK_0820 CbuK_0821     FALSE 0.019 252.000 0.000 NA   NA
 5612176 5612177 CbuK_0821 CbuK_0822     FALSE 0.131 41.000 0.000 NA   NA
 5612178 5612179 CbuK_0823 CbuK_0824     FALSE 0.065 115.000 0.000 NA   NA
 5612179 5612180 CbuK_0824 CbuK_0825     FALSE 0.015 299.000 0.000 NA   NA
 5612180 5612181 CbuK_0825 CbuK_0826     FALSE 0.010 466.000 0.000 NA   NA
 5612183 5612184 CbuK_0828 CbuK_0829     FALSE 0.122 47.000 0.000 NA   NA
 5612184 5612185 CbuK_0829 CbuK_0830     FALSE 0.053 139.000 0.000 NA   NA
 5612187 5612188 CbuK_0832 CbuK_0833     TRUE 0.950 -3.000 0.023 NA   NA
 5612188 5612189 CbuK_0833 CbuK_0834   bioA TRUE 0.870 1.000 0.000 1.000 N NA
 5612190 5612191 CbuK_0835 CbuK_0836 bioB bioF TRUE 0.993 -13.000 0.168 1.000 Y NA
 5612191 5612192 CbuK_0836 CbuK_0837 bioF bioH TRUE 0.973 -6.000 0.092 NA   NA
 5612192 5612193 CbuK_0837 CbuK_0838 bioH bioC.1 TRUE 0.980 -10.000 0.163 NA   NA
 5612193 5612194 CbuK_0838 CbuK_0839 bioC.1 bioD TRUE 0.977 -3.000 0.004 0.003 Y NA
 5612196 5612197 CbuK_0841 CbuK_0842 lolC lolD.2 TRUE 0.998 -7.000 0.620 0.023 N NA
 5612197 5612198 CbuK_0842 CbuK_0843 lolD.2 hflX TRUE 0.648 -3.000 0.000 1.000   NA
 5612198 5612199 CbuK_0843 CbuK_0844 hflX purA TRUE 0.723 21.000 0.002 0.013   NA
 5612200 5612201 CbuK_0845 CbuK_0846   cyoE FALSE 0.539 9.000 0.000 NA   NA
 5612201 5612202 CbuK_0846 CbuK_0847 cyoE   TRUE 0.971 -3.000 0.064 0.050   NA
 5612202 5612203 CbuK_0847 CbuK_0848   def1 FALSE 0.013 334.000 0.000 NA   NA
 5612203 5612204 CbuK_0848 CbuK_0849 def1   FALSE 0.176 30.000 0.000 NA   NA
 5612206 5612207 CbuK_0851 CbuK_0852 ung   TRUE 0.859 4.000 0.000 NA N NA
 5612209 5612210 CbuK_0854 CbuK_0855     FALSE 0.178 29.000 0.000 NA   NA
 5612210 5612211 CbuK_0855 CbuK_0856     FALSE 0.535 -16.000 0.000 NA   NA
 5612211 5612212 CbuK_0856 CbuK_0857     TRUE 0.559 -10.000 0.000 NA   NA
 5612212 5612213 CbuK_0857 CbuK_0858     FALSE 0.096 69.000 0.000 NA   NA
 5612214 5612215 CbuK_0859 CbuK_0860     FALSE 0.079 88.000 0.000 NA   NA
 5612216 5612217 CbuK_0861 CbuK_0862     FALSE 0.117 51.000 0.000 NA   NA
 5612217 5612218 CbuK_0862 CbuK_0863     TRUE 0.996 2.000 0.205 0.049 Y NA
 5612218 5612219 CbuK_0863 CbuK_0864     TRUE 0.982 20.000 0.189 1.000 Y NA
 5612219 5612220 CbuK_0864 CbuK_0865     TRUE 0.700 25.000 0.000 1.000 Y NA
 5612220 5612221 CbuK_0865 CbuK_0866     TRUE 0.935 0.000 0.000 1.000 Y NA
 5612222 5612223 CbuK_0867 CbuK_0868   pyrD TRUE 0.913 -3.000 0.003 NA   NA
 5612226 5612227 CbuK_0871 CbuK_0872   cybB1.2 TRUE 0.952 11.000 0.070 NA   NA
 5612227 5612228 CbuK_0872 CbuK_0873 cybB1.2 cydA1.2 TRUE 0.999 -3.000 0.953 0.031 Y NA
 5612228 5612229 CbuK_0873 CbuK_0874 cydA1.2   TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5612229 5612230 CbuK_0874 CbuK_0875     FALSE 0.015 285.000 0.000 NA   NA
 5612231 5612232 CbuK_0876 CbuK_0877 bcp   TRUE 0.654 0.000 0.000 1.000   NA
 5612233 5612234 CbuK_0878 CbuK_0879     FALSE 0.407 13.000 0.000 NA   NA
 5612235 5612236 CbuK_0880 CbuK_0881     FALSE 0.152 35.000 0.000 NA   NA
 5612238 5612239 CbuK_0883 CbuK_0884     FALSE 0.054 137.000 0.000 NA   NA
 5612239 5612240 CbuK_0884 CbuK_0885   nudC FALSE 0.296 19.000 0.000 NA   NA
 5612240 5612241 CbuK_0885 CbuK_0886 nudC   FALSE 0.067 111.000 0.000 NA   NA
 5612243 5612244 CbuK_0888 CbuK_0889     FALSE 0.011 389.000 0.000 NA   NA
 5612244 5612245 CbuK_0889 CbuK_0890     FALSE 0.061 125.000 0.000 NA   NA
 5612245 5612246 CbuK_0890 CbuK_0891     FALSE 0.022 240.000 0.000 NA   NA
 5612247 5612248 CbuK_0892 CbuK_0893     FALSE 0.124 45.000 0.000 NA   NA
 5612250 5612251 CbuK_0895 CbuK_0896   mutY TRUE 0.990 -3.000 0.150 NA N NA
 5612251 5612252 CbuK_0896 CbuK_0897 mutY   TRUE 0.845 6.000 0.000 NA N NA
 5612252 5612253 CbuK_0897 CbuK_0898     TRUE 0.563 7.000 0.000 NA   NA
 5612256 5612257 CbuK_0901 CbuK_0902     FALSE 0.037 193.000 0.000 1.000   NA
 5612257 5612258 CbuK_0902 CbuK_0903     TRUE 0.621 6.000 0.000 1.000   NA
 5612258 5612259 CbuK_0903 CbuK_0904     TRUE 0.999 1.000 0.688 0.097 N NA
 5612261 5612262 CbuK_0906 CbuK_0907 glpD mpg TRUE 0.833 -16.000 0.000 1.000 N NA
 5612262 5612263 CbuK_0907 CbuK_0908 mpg   TRUE 0.604 -10.000 0.000 1.000   NA
 5612263 5612264 CbuK_0908 CbuK_0909   pdxH FALSE 0.278 22.000 0.000 1.000   NA
 5612264 5612265 CbuK_0909 CbuK_0910 pdxH mmsA FALSE 0.462 32.000 0.000 1.000 N NA
 5612265 5612266 CbuK_0910 CbuK_0911 mmsA mmsB FALSE 0.518 10.000 0.000 NA   NA
 5612266 5612267 CbuK_0911 CbuK_0912 mmsB mltB.1 FALSE 0.033 185.000 0.000 NA   NA
 5612267 5612268 CbuK_0912 CbuK_0913 mltB.1 mdmC TRUE 0.607 2.000 0.000 NA   NA
 5612271 5612272 CbuK_0916 CbuK_0917     FALSE 0.172 31.000 0.000 NA   NA
 5612272 5612273 CbuK_0917 CbuK_0918     FALSE 0.054 306.000 0.000 NA N NA
 5612273 5612274 CbuK_0918 CbuK_0919     FALSE 0.191 27.000 0.000 NA   NA
 5612274 5612275 CbuK_0919 CbuK_0920     FALSE 0.296 19.000 0.000 NA   NA
 5612276 5612277 CbuK_0921 CbuK_0922 enhB.1   TRUE 0.607 2.000 0.000 NA   NA
 5612277 5612278 CbuK_0922 CbuK_0923     FALSE 0.034 180.000 0.000 NA   NA
 5612278 5612279 CbuK_0923 CbuK_0924   prpD TRUE 0.607 2.000 0.000 NA   NA
 5612279 5612280 CbuK_0924 CbuK_0925 prpD   FALSE 0.094 70.000 0.000 NA   NA
 5612282 5612283 CbuK_0927 CbuK_0928     FALSE 0.096 69.000 0.000 NA   NA
 5612284 5612285 CbuK_0929 CbuK_0930     FALSE 0.184 28.000 0.000 NA   NA
 5612288 5612289 CbuK_0933 CbuK_0934     FALSE 0.523 -19.000 0.000 NA   NA
 5612291 5612292 CbuK_0936 CbuK_0937 tgt   TRUE 0.604 4.000 0.000 NA   NA
 5612293 5612294 CbuK_0938 CbuK_0939     TRUE 0.974 -13.000 0.045 1.000 N NA
 5612294 5612295 CbuK_0939 CbuK_0940     FALSE 0.080 87.000 0.000 NA   NA
 5612297 5612298 CbuK_0942 CbuK_0943   nagZ FALSE 0.322 67.000 0.000 1.000 N NA
 5612298 5612299 CbuK_0943 CbuK_0944 nagZ   TRUE 0.647 4.000 0.000 1.000   NA
 5612299 5612300 CbuK_0944 CbuK_0945     TRUE 0.594 8.000 0.000 1.000   NA
 5612300 5612301 CbuK_0945 CbuK_0946     FALSE 0.086 78.000 0.000 NA   NA
 5612301 5612302 CbuK_0946 CbuK_0947     FALSE 0.090 73.000 0.000 NA   NA
 5612302 5612303 CbuK_0947 CbuK_0949     FALSE 0.137 39.000 0.000 NA   NA
 5612305 5612306 CbuK_0950 CbuK_0951   miaA FALSE 0.128 42.000 0.000 NA   NA
 5612306 5612307 CbuK_0951 CbuK_0952 miaA mutL TRUE 0.946 33.000 0.188 0.096 N NA
 5612307 5612308 CbuK_0952 CbuK_0953 mutL   FALSE 0.356 61.000 0.000 0.096 N NA
 5612308 5612309 CbuK_0953 CbuK_0954     FALSE 0.417 38.000 0.000 1.000 N NA
 5612311 5612312 CbuK_0956 CbuK_0957     TRUE 0.949 14.000 0.118 NA   NA
 5612316 5612317 CbuK_0961 CbuK_0962     TRUE 0.998 0.000 0.600 NA N NA
 5612318 5612319 CbuK_0963 CbuK_0964     TRUE 0.611 3.000 0.000 NA   NA
 5612319 5612320 CbuK_0964 CbuK_0965   fumC TRUE 0.604 4.000 0.000 NA   NA
 5612320 5612321 CbuK_0965 CbuK_0966 fumC   FALSE 0.099 67.000 0.000 NA   NA
 5612321 5612322 CbuK_0966 CbuK_0967   aldC TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5612323 5612324 CbuK_0968 CbuK_0969   lepB1.1 FALSE 0.055 136.000 0.000 NA   NA
 5612324 5612325 CbuK_0969 CbuK_0970 lepB1.1   FALSE 0.518 10.000 0.000 NA   NA
 5612325 5612326 CbuK_0970 CbuK_0971     TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5612329 5612330 CbuK_0974 CbuK_0975     FALSE 0.056 135.000 0.000 NA   NA
 5612330 5612331 CbuK_0975 CbuK_0976     FALSE 0.094 70.000 0.000 NA   NA
 5612332 5612333 CbuK_0977 CbuK_0978     FALSE 0.097 68.000 0.000 NA   NA
 5612333 5612334 CbuK_0978 CbuK_0979     TRUE 0.817 -30.000 0.000 1.000 N NA
 5612334 5612335 CbuK_0979 CbuK_0980     FALSE 0.021 246.000 0.000 NA   NA
 5612337 5612338 CbuK_0982 CbuK_0983 ald etfA FALSE 0.504 29.000 0.000 0.029 N NA
 5612338 5612339 CbuK_0983 CbuK_0984 etfA etfB TRUE 0.938 -3.000 0.000 0.007 Y NA
 5612339 5612340 CbuK_0984 CbuK_0985 etfB   TRUE 0.869 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5612343 5612344 CbuK_0988 CbuK_0989 enhA.2   FALSE 0.092 71.000 0.000 NA   NA
 5612346 5612347 CbuK_0991 CbuK_0992 ahpD.3   TRUE 0.993 3.000 0.286 NA   NA
 5612347 5612348 CbuK_0992 CbuK_0993     TRUE 0.604 4.000 0.000 NA   NA
 5612349 5612350 CbuK_0994 CbuK_0995     TRUE 0.611 0.000 0.000 NA   NA
 5612350 5612351 CbuK_0995 CbuK_0996   iscS.1 TRUE 0.928 7.000 0.011 1.000   NA
 5612351 5612352 CbuK_0996 CbuK_0997 iscS.1   TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5612352 5612353 CbuK_0997 CbuK_0998     TRUE 0.566 -9.000 0.000 NA   NA
 5612354 5612355 CbuK_0999 CbuK_1000   suhB TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5612358 5612359 CbuK_1003 CbuK_1004 enhC enhB.2 TRUE 0.998 -3.000 0.750 NA   NA
 5612359 5612360 CbuK_1004 CbuK_1005 enhB.2 enhA.3 FALSE 0.407 13.000 0.000 NA   NA
 5612360 5612361 CbuK_1005 CbuK_1006 enhA.3   FALSE 0.016 283.000 0.000 NA   NA
 5612361 5612362 CbuK_1006 CbuK_1007     FALSE 0.091 72.000 0.000 NA   NA
 5612364 5612365 CbuK_1009 CbuK_1010 secF secD TRUE 0.987 0.000 0.030 0.001 Y NA
 5612365 5612366 CbuK_1010 CbuK_1011 secD yajC TRUE 0.937 15.000 0.007 NA Y NA
 5612366 5612367 CbuK_1011 CbuK_1012 yajC   FALSE 0.131 41.000 0.000 NA   NA
 5612367 5612368 CbuK_1012 CbuK_1013     FALSE 0.012 349.000 0.000 NA   NA
 5612369 5612370 CbuK_1014 CbuK_1015 trmU mfd TRUE 0.787 12.000 0.000 0.094 N NA
 5612374 5612375 CbuK_1019 CbuK_1020 trpE trpD FALSE 0.017 276.000 0.000 NA   NA
 5612375 5612376 CbuK_1020 CbuK_1021 trpD trpC TRUE 0.576 -7.000 0.000 NA   NA
 5612376 5612377 CbuK_1021 CbuK_1022 trpC trpBF TRUE 0.931 -7.000 0.000 0.002 Y NA
 5612377 5612378 CbuK_1022 CbuK_1023 trpBF trpA TRUE 0.831 17.000 0.000 0.001 Y NA
 5612380 5612381 CbuK_1025 CbuK_1026     FALSE 0.127 60.000 0.000 1.000   NA
 5612381 5612382 CbuK_1026 CbuK_1027     FALSE 0.097 68.000 0.000 NA   NA
 5612383 5612384 CbuK_1028 CbuK_1029     FALSE 0.069 107.000 0.000 NA   NA
 5612385 5612386 CbuK_1030 CbuK_1031     FALSE 0.073 99.000 0.000 NA   NA
 5612386 5612387 CbuK_1031 CbuK_1032     FALSE 0.052 140.000 0.000 NA   NA
 5612387 5612388 CbuK_1032 CbuK_1033     FALSE 0.046 149.000 0.000 NA   NA
 5612389 5612390 CbuK_1034 CbuK_1035     TRUE 0.707 22.000 0.005 NA   NA
 5612392 5612393 CbuK_1037 CbuK_1038     TRUE 0.563 7.000 0.000 NA   NA
 5612396 5612397 CbuK_1041 CbuK_1042     FALSE 0.127 43.000 0.000 NA   NA
 5612398 5612399 CbuK_1043 CbuK_1044   thiI FALSE 0.137 39.000 0.000 NA   NA
 5612399 5612400 CbuK_1044 CbuK_1045 thiI iscS.2 TRUE 0.997 1.000 0.349 1.000 N NA
 5612402 5612403 CbuK_1047 CbuK_1048   uvrC FALSE 0.248 103.000 0.000 1.000 N NA
 5612403 5612404 CbuK_1048 CbuK_1049 uvrC   FALSE 0.172 31.000 0.000 NA   NA
 5612408 5612409 CbuK_1053 CbuK_1054 serS   TRUE 0.807 76.000 0.078 0.092 N NA
 5612409 5612410 CbuK_1054 CbuK_1055     TRUE 0.955 23.000 0.167 1.000 N NA
 5612410 5612411 CbuK_1055 CbuK_1056   ftsK TRUE 0.992 12.000 0.305 1.000 N NA
 5612412 5612413 CbuK_1057 CbuK_1058 trxB   FALSE 0.196 26.000 0.000 NA   NA
 5612413 5612414 CbuK_1058 CbuK_1059   infA FALSE 0.105 62.000 0.000 NA   NA
 5612416 5612417 CbuK_1061 CbuK_1062     FALSE 0.078 90.000 0.000 NA   NA
 5612417 5612418 CbuK_1062 CbuK_1063     FALSE 0.157 34.000 0.000 NA   NA
 5612419 5612420 CbuK_1064 CbuK_1065 icd queA FALSE 0.382 44.000 0.000 1.000 N NA
 5612421 5612422 CbuK_1066 CbuK_1067     FALSE 0.103 64.000 0.000 NA   NA
 5612422 5612423 CbuK_1067 CbuK_1068     TRUE 0.604 4.000 0.000 NA   NA
 5612423 5612424 CbuK_1068 CbuK_1069     TRUE 0.576 -7.000 0.000 NA   NA
 5612425 5612426 CbuK_1070 CbuK_1071     FALSE 0.312 18.000 0.000 NA   NA
 5612430 5612431 CbuK_1075 CbuK_1076     FALSE 0.055 136.000 0.000 NA   NA
 5612433 5612434 CbuK_1078 CbuK_1079     FALSE 0.019 254.000 0.000 NA   NA
 5612434 5612435 CbuK_1079 CbuK_1080   purC TRUE 0.608 1.000 0.000 NA   NA
 5612435 5612436 CbuK_1080 CbuK_1081 purC   TRUE 0.933 0.000 0.009 NA   NA
 5612436 5612437 CbuK_1081 CbuK_1082   dapA TRUE 0.925 17.000 0.088 NA   NA
 5612437 5612438 CbuK_1082 CbuK_1084 dapA kdgK FALSE 0.104 213.000 0.000 1.000 N NA
 5612440 5612441 CbuK_1085 CbuK_1086     TRUE 0.648 -3.000 0.000 1.000   NA
 5612442 5612443 CbuK_1087 CbuK_1088 qseB qseC TRUE 0.994 -3.000 0.143 1.000 Y NA
 5612443 5612444 CbuK_1088 CbuK_1089 qseC addB FALSE 0.029 200.000 0.000 NA   NA
 5612444 5612445 CbuK_1089 CbuK_1090 addB addA TRUE 0.976 -3.000 0.098 NA   NA
 5612449 5612450 CbuK_1094 CbuK_1095     FALSE 0.103 64.000 0.000 NA   NA
 5612450 5612451 CbuK_1095 CbuK_1096   orn FALSE 0.042 159.000 0.000 NA   NA
 5612451 5612452 CbuK_1096 CbuK_1097 orn   FALSE 0.036 177.000 0.000 NA   NA
 5612453 5612454 CbuK_1098 CbuK_1099     TRUE 0.611 3.000 0.000 NA   NA
 5612456 5612457 CbuK_1101 CbuK_1102 gcp mdh TRUE 0.835 9.000 0.000 1.000 N NA
 5612457 5612458 CbuK_1102 CbuK_1103 mdh   FALSE 0.013 317.000 0.000 NA   NA
 5612459 5612460 CbuK_1104 CbuK_1105 xseA   TRUE 0.648 -3.000 0.000 1.000   NA
 5612461 5612462 CbuK_1106 CbuK_1107     FALSE 0.188 226.000 0.009 1.000   NA
 5612462 5612463 CbuK_1107 CbuK_1108   hisS TRUE 0.958 23.000 0.259 1.000   NA
 5612463 5612464 CbuK_1108 CbuK_1109 hisS   TRUE 0.950 -3.000 0.021 1.000   NA
 5612464 5612465 CbuK_1109 CbuK_1111     FALSE 0.054 137.000 0.000 NA   NA
 5612470 5612471 CbuK_1115 CbuK_1116     TRUE 0.576 -7.000 0.000 NA   NA
 5612473 5612474 CbuK_1118 CbuK_1119     FALSE 0.352 57.000 0.000 1.000 N NA
 5612476 5612477 CbuK_1121 CbuK_1122     FALSE 0.088 98.000 0.000 1.000   NA
 5612477 5612478 CbuK_1122 CbuK_1123     TRUE 0.923 -3.000 0.007 NA   NA
 5612478 5612479 CbuK_1123 CbuK_1124     FALSE 0.214 24.000 0.000 NA   NA
 5612479 5612480 CbuK_1124 CbuK_1125     FALSE 0.277 20.000 0.000 NA   NA
 5612480 5612481 CbuK_1125 CbuK_1126   lipB TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5612481 5612482 CbuK_1126 CbuK_1127 lipB lipA TRUE 0.997 -70.000 0.319 0.001 Y NA
 5612482 5612483 CbuK_1127 CbuK_1128 lipA   FALSE 0.502 111.000 0.003 1.000 N NA
 5612483 5612484 CbuK_1128 CbuK_1129   scvA FALSE 0.125 44.000 0.000 NA   NA
 5612485 5612486 CbuK_1130 CbuK_1131     TRUE 0.563 7.000 0.000 NA   NA
 5612489 5612490 CbuK_1134 CbuK_1135     FALSE 0.062 123.000 0.000 NA   NA
 5612491 5612492 CbuK_1136 CbuK_1137   rspA FALSE 0.122 47.000 0.000 NA   NA
 5612492 5612493 CbuK_1137 CbuK_1138 rspA   TRUE 0.962 31.000 0.333 0.045   NA
 5612494 5612495 CbuK_1139 CbuK_1140 eda   TRUE 0.799 11.000 0.000 1.000 N NA
 5612495 5612496 CbuK_1140 CbuK_1141   exoD TRUE 0.552 -12.000 0.000 NA   NA
 5612496 5612497 CbuK_1141 CbuK_1142 exoD   FALSE 0.123 46.000 0.000 NA   NA
 5612500 5612501 CbuK_1145 CbuK_1146 carB carA TRUE 0.970 82.000 0.345 0.001 Y NA
 5612502 5612503 CbuK_1147 CbuK_1148     FALSE 0.082 106.000 0.000 1.000   NA
 5612503 5612504 CbuK_1148 CbuK_1149     TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5612504 5612505 CbuK_1149 CbuK_1150     FALSE 0.092 71.000 0.000 NA   NA
 5612506 5612507 CbuK_1151 CbuK_1152   dnaJ FALSE 0.073 99.000 0.000 NA   NA
 5612507 5612508 CbuK_1152 CbuK_1153 dnaJ dnaK TRUE 0.914 143.000 0.236 0.004 Y NA
 5612509 5612510 CbuK_1154 CbuK_1155     TRUE 0.611 3.000 0.000 NA   NA
 5612511 5612512 CbuK_1156 CbuK_1157 grpE   FALSE 0.114 55.000 0.000 NA   NA
 5612512 5612513 CbuK_1157 CbuK_1158     TRUE 0.980 -10.000 0.167 NA   NA
 5612514 5612515 CbuK_1159 CbuK_1160   recN TRUE 0.991 5.000 0.170 1.000 N NA
 5612515 5612516 CbuK_1160 CbuK_1161 recN   FALSE 0.079 88.000 0.000 NA   NA
 5612517 5612518 CbuK_1162 CbuK_1163     FALSE 0.011 400.000 0.000 NA   NA
 5612518 5612519 CbuK_1163 CbuK_1164     FALSE 0.048 146.000 0.000 NA   NA
 5612519 5612520 CbuK_1164 CbuK_1165   fur FALSE 0.131 41.000 0.000 NA   NA
 5612522 5612523 CbuK_1167 CbuK_1168     TRUE 0.957 -3.000 0.035 NA   NA
 5612524 5612525 CbuK_1169 CbuK_1170 smpB msrA TRUE 0.926 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 5612528 5612529 CbuK_1173 CbuK_1174     FALSE 0.019 254.000 0.000 NA   NA
 5612529 5612530 CbuK_1174 CbuK_1175     FALSE 0.191 27.000 0.000 NA   NA
 5612530 5612531 CbuK_1175 CbuK_1176     FALSE 0.029 200.000 0.000 NA   NA
 5612531 5612532 CbuK_1176 CbuK_1177     FALSE 0.027 209.000 0.000 NA   NA
 5612532 5612533 CbuK_1177 CbuK_1178     FALSE 0.013 317.000 0.000 NA   NA
 5612533 5612534 CbuK_1178 CbuK_1179     FALSE 0.023 233.000 0.000 NA   NA
 5612534 5612535 CbuK_1179 CbuK_1180     FALSE 0.044 155.000 0.000 NA   NA
 5612535 5612536 CbuK_1180 CbuK_1181     FALSE 0.017 271.000 0.000 NA   NA
 5612536 5612537 CbuK_1181 CbuK_1182     FALSE 0.137 39.000 0.000 NA   NA
 5612537 5612538 CbuK_1182 CbuK_1183     FALSE 0.087 77.000 0.000 NA   NA
 5612538 5612539 CbuK_1183 CbuK_1184   ihfA TRUE 0.995 14.000 0.535 1.000 N NA
 5612539 5612540 CbuK_1184 CbuK_1185 ihfA pheT TRUE 0.993 5.000 0.208 1.000 N NA
 5612540 5612541 CbuK_1185 CbuK_1186 pheT pheS TRUE 0.999 -3.000 0.574 0.001 Y NA
 5612541 5612542 CbuK_1186 CbuK_1187 pheS rplT TRUE 0.937 77.000 0.202 1.000 Y NA
 5612544 5612545 CbuK_1189 CbuK_1190 rpmI infC TRUE 0.999 -19.000 0.652 1.000 Y NA
 5612545 5612546 CbuK_1190 CbuK_1191 infC thrS TRUE 0.926 83.000 0.186 1.000 Y NA
 5612548 5612549 CbuK_1193 CbuK_1194     FALSE 0.214 24.000 0.000 NA   NA
 5612550 5612551 CbuK_1195 CbuK_1196     TRUE 0.552 -12.000 0.000 NA   NA
 5612551 5612552 CbuK_1196 CbuK_1197     FALSE 0.059 128.000 0.000 NA   NA
 5612555 5612556 CbuK_1200 CbuK_1201   dnaE FALSE 0.240 109.000 0.000 1.000 N NA
 5612556 5612557 CbuK_1201 CbuK_1202 dnaE   TRUE 0.878 2.000 0.000 0.041 N NA
 5612557 5612558 CbuK_1202 CbuK_1203   rnhB FALSE 0.175 148.000 0.000 1.000 N NA
 5612558 5612559 CbuK_1203 CbuK_1204 rnhB   FALSE 0.444 12.000 0.000 NA   NA
 5612559 5612560 CbuK_1204 CbuK_1205   guaA FALSE 0.545 -13.000 0.000 NA   NA
 5612560 5612561 CbuK_1205 CbuK_1206 guaA guaB TRUE 0.964 37.000 0.190 0.001 Y NA
 5612561 5612562 CbuK_1206 CbuK_1207 guaB   FALSE 0.077 94.000 0.000 NA   NA
 5612563 5612564 CbuK_1208 CbuK_1209   treA TRUE 0.607 2.000 0.000 NA   NA
 5612564 5612565 CbuK_1209 CbuK_1210 treA   FALSE 0.008 1548.000 0.000 NA   NA
 5612565 5612566 CbuK_1210 CbuK_1211     FALSE 0.087 77.000 0.000 NA   NA
 5612567 5612568 CbuK_1212 CbuK_1213 glmM folP TRUE 0.918 89.000 0.260 1.000 N NA
 5612568 5612569 CbuK_1213 CbuK_1214 folP ftsH TRUE 0.964 43.000 0.325 1.000 N NA
 5612569 5612570 CbuK_1214 CbuK_1215 ftsH rrmJ TRUE 0.890 20.000 0.019 NA N NA
 5612570 5612571 CbuK_1215 CbuK_1216 rrmJ   FALSE 0.243 22.000 0.000 NA   NA
 5612571 5612572 CbuK_1216 CbuK_1217     TRUE 0.990 2.000 0.235 NA   NA
 5612572 5612573 CbuK_1217 CbuK_1218   iscU TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5612573 5612574 CbuK_1218 CbuK_1219 iscU csdB TRUE 0.956 -7.000 0.006 1.000 N NA
 5612574 5612575 CbuK_1219 CbuK_1220 csdB sufD TRUE 0.957 -7.000 0.007 1.000 N NA
 5612575 5612576 CbuK_1220 CbuK_1221 sufD sufC TRUE 0.999 -3.000 0.482 1.000 Y NA
 5612576 5612577 CbuK_1221 CbuK_1222 sufC   TRUE 0.992 24.000 0.466 1.000 Y NA
 5612578 5612579 CbuK_1223 CbuK_1224     TRUE 0.855 -7.000 0.000 1.000 N NA
 5612579 5612580 CbuK_1224 CbuK_1225     FALSE 0.214 24.000 0.000 NA   NA
 5612581 5612582 CbuK_1226 CbuK_1227     FALSE 0.033 183.000 0.000 NA   NA
 5612584 5612585 CbuK_1229 CbuK_1230     FALSE 0.031 193.000 0.000 NA   NA
 5612585 5612586 CbuK_1230 CbuK_1231     FALSE 0.049 144.000 0.000 NA   NA
 5612587 5612588 CbuK_1232 CbuK_1233 pabB   TRUE 0.869 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5612590 5612591 CbuK_1235 CbuK_1236     FALSE 0.057 131.000 0.000 NA   NA
 5612594 5612595 CbuK_1239 CbuK_1240   cysQ1.1 TRUE 0.646 19.000 0.000 1.000 N NA
 5612595 5612596 CbuK_1240 CbuK_1241 cysQ1.1 nudE TRUE 0.994 -10.000 0.373 1.000   NA
 5612599 5612600 CbuK_1244 CbuK_1245     TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5612601 5612602 CbuK_1246 CbuK_1247     TRUE 0.607 2.000 0.000 NA   NA
 5612602 5612603 CbuK_1247 CbuK_1248     TRUE 0.563 7.000 0.000 NA   NA
 5612603 5612604 CbuK_1248 CbuK_1249     TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5612604 5612605 CbuK_1249 CbuK_1250   nadA TRUE 0.814 -19.000 0.000 NA N NA
 5612605 5612606 CbuK_1250 CbuK_1251 nadA   FALSE 0.279 83.000 0.000 1.000 N NA
 5612606 5612607 CbuK_1251 CbuK_1252     FALSE 0.380 45.000 0.000 1.000 N NA
 5612609 5612610 CbuK_1254 CbuK_1255     FALSE 0.030 197.000 0.000 NA   NA
 5612610 5612611 CbuK_1255 CbuK_1256     TRUE 0.994 3.000 0.216 NA N NA
 5612614 5612615 CbuK_1259 CbuK_1260     TRUE 0.911 -13.000 0.000 NA Y NA
 5612616 5612617 CbuK_1261 CbuK_1262   yfcX TRUE 0.552 -12.000 0.000 NA   NA
 5612617 5612618 CbuK_1262 CbuK_1263 yfcX   TRUE 0.953 52.000 0.200 1.000 Y NA
 5612618 5612619 CbuK_1263 CbuK_1264     FALSE 0.076 544.000 0.000 1.000 Y NA
 5612619 5612620 CbuK_1264 CbuK_1265     TRUE 0.823 10.000 0.000 1.000 N NA
 5612621 5612622 CbuK_1266 CbuK_1267     FALSE 0.026 215.000 0.000 NA   NA
 5612622 5612623 CbuK_1267 CbuK_1268   miaB TRUE 0.602 21.000 0.000 1.000 N NA
 5612623 5612624 CbuK_1268 CbuK_1269 miaB   TRUE 0.990 11.000 0.220 1.000 N NA
 5612624 5612625 CbuK_1269 CbuK_1270     TRUE 0.996 -3.000 0.457 NA   NA
 5612625 5612626 CbuK_1270 CbuK_1271     FALSE 0.113 56.000 0.000 NA   NA
 5612626 5612627 CbuK_1271 CbuK_1272     FALSE 0.367 43.000 0.000 NA N NA
 5612627 5612628 CbuK_1272 CbuK_1273   cutE TRUE 0.886 233.000 0.557 NA N NA
 5612628 5612629 CbuK_1273 CbuK_1274 cutE   FALSE 0.277 20.000 0.000 NA   NA
 5612629 5612630 CbuK_1274 CbuK_1275     FALSE 0.111 57.000 0.000 NA   NA
 5612630 5612631 CbuK_1275 CbuK_1276     FALSE 0.024 229.000 0.000 NA   NA
 5612631 5612632 CbuK_1276 CbuK_1277     FALSE 0.051 142.000 0.000 NA   NA
 5612634 5612635 CbuK_1279 CbuK_1280 leuS   TRUE 0.990 8.000 0.182 NA N NA
 5612635 5612636 CbuK_1280 CbuK_1281   holA TRUE 0.993 3.000 0.199 NA N NA
 5612636 5612637 CbuK_1281 CbuK_1282 holA nadD TRUE 0.952 -19.000 0.010 1.000 N NA
 5612637 5612638 CbuK_1282 CbuK_1283 nadD   FALSE 0.028 206.000 0.000 NA   NA
 5612638 5612639 CbuK_1283 CbuK_1284     FALSE 0.077 92.000 0.000 NA   NA
 5612641 5612642 CbuK_1286 CbuK_1287     TRUE 0.993 2.000 0.307 NA   NA
 5612642 5612643 CbuK_1287 CbuK_1288   pbpA TRUE 0.735 20.000 0.004 NA   NA
 5612643 5612644 CbuK_1288 CbuK_1289 pbpA rodA TRUE 0.851 44.000 0.073 1.000 N NA
 5612644 5612645 CbuK_1289 CbuK_1290 rodA mltB.2 TRUE 0.807 80.000 0.096 NA N NA
 5612645 5612646 CbuK_1290 CbuK_1291 mltB.2   FALSE 0.523 -19.000 0.000 NA   NA
 5612647 5612648 CbuK_1292 CbuK_1293 htpX   TRUE 0.990 10.000 0.307 NA   NA
 5612648 5612649 CbuK_1293 CbuK_1294     FALSE 0.110 59.000 0.000 NA   NA
 5612649 5612650 CbuK_1294 CbuK_1295     FALSE 0.013 321.000 0.000 NA   NA
 5612650 5612651 CbuK_1295 CbuK_1296   ligA FALSE 0.024 231.000 0.000 NA   NA
 5612651 5612652 CbuK_1296 CbuK_1297 ligA zipA TRUE 0.978 1.000 0.106 1.000   NA
 5612652 5612653 CbuK_1297 CbuK_1298 zipA smc TRUE 0.809 55.000 0.115 0.011   NA
 5612653 5612654 CbuK_1298 CbuK_1299 smc   FALSE 0.135 179.000 0.000 1.000 N NA
 5612658 5612659 CbuK_1303 CbuK_1304 rfe   FALSE 0.032 212.000 0.000 1.000   NA
 5612659 5612660 CbuK_1304 CbuK_1305   pyrF TRUE 0.616 63.000 0.024 1.000   NA
 5612660 5612661 CbuK_1305 CbuK_1306 pyrF   TRUE 0.989 4.000 0.125 1.000 N NA
 5612661 5612662 CbuK_1306 CbuK_1307     TRUE 0.997 -3.000 0.576 NA   NA
 5612662 5612663 CbuK_1307 CbuK_1308   rpsA FALSE 0.254 155.000 0.005 NA   NA
 5612663 5612664 CbuK_1308 CbuK_1309 rpsA cmk TRUE 0.896 132.000 0.281 1.000 N NA
 5612664 5612665 CbuK_1309 CbuK_1310 cmk aroA TRUE 0.994 1.000 0.209 1.000 N NA
 5612665 5612666 CbuK_1310 CbuK_1311 aroA serC TRUE 0.984 6.000 0.033 1.000 Y NA
 5612666 5612667 CbuK_1311 CbuK_1312 serC gyrA TRUE 0.818 61.000 0.067 1.000 N NA
 5612669 5612670 CbuK_1314 CbuK_1315     FALSE 0.020 248.000 0.000 NA   NA
 5612671 5612672 CbuK_1316 CbuK_1317   leuA TRUE 0.838 -13.000 0.000 1.000 N NA
 5612673 5612674 CbuK_1318 CbuK_1320   uvrB FALSE 0.108 60.000 0.000 NA   NA
 5612675 5612676 CbuK_1319 CbuK_1321 aspC   FALSE 0.114 55.000 0.000 NA   NA
 5612677 5612678 CbuK_1322 CbuK_1323     FALSE 0.009 648.000 0.000 NA   NA
 5612678 5612679 CbuK_1323 CbuK_1324     FALSE 0.070 105.000 0.000 NA   NA
 5612679 5612680 CbuK_1324 CbuK_1325     FALSE 0.036 177.000 0.000 NA   NA
 5612681 5612682 CbuK_1326 CbuK_1327     FALSE 0.042 160.000 0.000 NA   NA
 5612683 5612684 CbuK_1328 CbuK_1329     FALSE 0.019 254.000 0.000 NA   NA
 5612684 5612685 CbuK_1329 CbuK_1330     FALSE 0.034 182.000 0.000 NA   NA
 5612685 5612686 CbuK_1330 CbuK_1331     FALSE 0.029 200.000 0.000 NA   NA
 5612686 5612687 CbuK_1331 CbuK_1332     FALSE 0.161 33.000 0.000 NA   NA
 5612689 5612690 CbuK_1334 CbuK_1335     TRUE 0.611 0.000 0.000 NA   NA
 5612690 5612691 CbuK_1335 CbuK_1336     TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5612693 5612694 CbuK_1338 CbuK_1339     FALSE 0.075 98.000 0.000 NA   NA
 5612694 5612695 CbuK_1339 CbuK_1340     FALSE 0.008 671.000 0.000 NA   NA
 5612695 5612696 CbuK_1340 CbuK_1341     FALSE 0.136 53.000 0.000 1.000   NA
 5612697 5612698 CbuK_1342 CbuK_1343     TRUE 0.775 28.000 0.039 NA   NA
 5612699 5612700 CbuK_1344 CbuK_1345     FALSE 0.038 171.000 0.000 NA   NA
 5612700 5612701 CbuK_1345 CbuK_1346   trpR FALSE 0.444 12.000 0.000 NA   NA
 5612702 5612703 CbuK_1347 CbuK_1348     FALSE 0.025 220.000 0.000 NA   NA
 5612704 5612705 CbuK_1349 CbuK_1350 recJ   FALSE 0.066 113.000 0.000 NA   NA
 5612706 5612707 CbuK_1351 CbuK_1352     FALSE 0.228 120.000 0.000 1.000 N NA
 5612707 5612708 CbuK_1352 CbuK_1353   glnA FALSE 0.281 163.000 0.000 1.000 Y NA
 5612708 5612709 CbuK_1353 CbuK_1354 glnA   FALSE 0.045 154.000 0.000 NA   NA
 5612710 5612711 CbuK_1355 CbuK_1356     FALSE 0.542 48.000 0.000 NA Y NA
 5612711 5612712 CbuK_1356 CbuK_1357     FALSE 0.277 20.000 0.000 NA   NA
 5612712 5612713 CbuK_1357 CbuK_1358   holB FALSE 0.296 19.000 0.000 NA   NA
 5612713 5612714 CbuK_1358 CbuK_1359 holB tmk TRUE 0.994 -3.000 0.211 1.000 N NA
 5612714 5612715 CbuK_1359 CbuK_1360 tmk   TRUE 0.686 176.000 0.209 NA   NA
 5612715 5612716 CbuK_1360 CbuK_1361   fabF TRUE 0.925 10.000 0.019 NA   NA
 5612716 5612717 CbuK_1361 CbuK_1362 fabF   TRUE 0.979 45.000 0.346 1.000 Y NA
 5612717 5612718 CbuK_1362 CbuK_1363   fabG TRUE 0.971 68.000 0.321 0.007 Y NA
 5612718 5612719 CbuK_1363 CbuK_1364 fabG fabD TRUE 0.978 68.000 0.432 0.007 Y NA
 5612721 5612722 CbuK_1366 CbuK_1367   fabH TRUE 0.823 10.000 0.000 1.000 N NA
 5612722 5612723 CbuK_1367 CbuK_1368 fabH plsX TRUE 0.998 -3.000 0.380 0.007 Y NA
 5612723 5612724 CbuK_1368 CbuK_1369 plsX rpmF TRUE 0.997 8.000 0.418 1.000 N NA
 5612725 5612726 CbuK_1370 CbuK_1371     FALSE 0.355 56.000 0.000 1.000 N NA
 5612727 5612728 CbuK_1372 CbuK_1373   rluC FALSE 0.207 29.000 0.000 1.000   NA
 5612730 5612731 CbuK_1375 CbuK_1376   artM FALSE 0.407 13.000 0.000 NA   NA
 5612731 5612732 CbuK_1376 CbuK_1377 artM artQ TRUE 0.974 148.000 0.714 0.015 Y NA
 5612732 5612733 CbuK_1377 CbuK_1378 artQ artI TRUE 0.939 0.000 0.000 0.015 Y NA
 5612733 5612734 CbuK_1378 CbuK_1379 artI artP TRUE 0.933 4.000 0.000 1.000 Y NA
 5612736 5612737 CbuK_1381 CbuK_1382 kdsB   TRUE 0.990 -10.000 0.265 NA   NA
 5612737 5612738 CbuK_1382 CbuK_1383     FALSE 0.064 120.000 0.000 NA   NA
 5612740 5612741 CbuK_1385 CbuK_1386     FALSE 0.009 482.000 0.000 NA   NA
 5612741 5612742 CbuK_1386 CbuK_1387     FALSE 0.444 12.000 0.000 NA   NA
 5612742 5612743 CbuK_1387 CbuK_1388   recQ FALSE 0.507 65.000 0.000 1.000 Y NA
 5612743 5612744 CbuK_1388 CbuK_1389 recQ   FALSE 0.090 73.000 0.000 NA   NA
 5612745 5612746 CbuK_1390 CbuK_1391     FALSE 0.122 47.000 0.000 NA   NA
 5612746 5612747 CbuK_1391 CbuK_1392   xseB FALSE 0.407 13.000 0.000 NA   NA
 5612748 5612749 CbuK_1393 CbuK_1395 bioC.2   FALSE 0.009 575.000 0.000 NA   NA
 5612751 5612752 CbuK_1396 CbuK_1397 lpdA pdhC.1 TRUE 0.997 13.000 0.463 1.000 Y NA
 5612752 5612753 CbuK_1397 CbuK_1398 pdhC.1 aceE TRUE 0.931 66.000 0.167 0.042 Y NA
 5612753 5612754 CbuK_1398 CbuK_1399 aceE   TRUE 0.670 45.000 0.028 1.000   NA
 5612754 5612755 CbuK_1399 CbuK_1400     TRUE 0.627 76.000 0.042 0.042   NA
 5612755 5612756 CbuK_1400 CbuK_1401     FALSE 0.515 -21.000 0.000 NA   NA
 5612758 5612759 CbuK_1403 CbuK_1404 trx.1 adk TRUE 0.664 34.000 0.013 1.000   NA
 5612759 5612760 CbuK_1404 CbuK_1405 adk   FALSE 0.418 35.000 0.000 NA N NA
 5612760 5612761 CbuK_1405 CbuK_1406     TRUE 0.861 2.000 0.000 NA N NA
 5612761 5612762 CbuK_1406 CbuK_1407     TRUE 0.995 -3.000 0.349 NA   NA
 5612764 5612765 CbuK_1409 CbuK_1410 cpdP   TRUE 0.608 1.000 0.000 NA   NA
 5612768 5612769 CbuK_1413 CbuK_1414 rpsP rimM TRUE 0.970 79.000 0.342 0.021 Y NA
 5612769 5612770 CbuK_1414 CbuK_1415 rimM trmD TRUE 0.999 2.000 0.672 1.000 Y NA
 5612770 5612771 CbuK_1415 CbuK_1416 trmD rplS TRUE 0.999 -3.000 0.567 1.000 Y NA
 5612771 5612772 CbuK_1416 CbuK_1417 rplS ogt TRUE 0.962 6.000 0.011 1.000 N NA
 5612773 5612774 CbuK_1418 CbuK_1419     FALSE 0.513 -22.000 0.000 NA   NA
 5612774 5612775 CbuK_1419 CbuK_1420     TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5612776 5612777 CbuK_1421 CbuK_1422     FALSE 0.113 56.000 0.000 NA   NA
 5612777 5612778 CbuK_1422 CbuK_1423     FALSE 0.127 43.000 0.000 NA   NA
 5612778 5612779 CbuK_1423 CbuK_1424     FALSE 0.073 99.000 0.000 NA   NA
 5612780 5612781 CbuK_1425 CbuK_1426     FALSE 0.099 67.000 0.000 NA   NA
 5612786 5612787 CbuK_1431 CbuK_1432     TRUE 0.604 4.000 0.000 NA   NA
 5612787 5612788 CbuK_1432 CbuK_1433     TRUE 0.590 5.000 0.000 NA   NA
 5612789 5612790 CbuK_1434 CbuK_1435   lpxA TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5612790 5612791 CbuK_1435 CbuK_1436 lpxA fabZ TRUE 0.999 5.000 0.850 1.000 N NA
 5612791 5612792 CbuK_1436 CbuK_1437 fabZ lpxD TRUE 0.999 -3.000 0.796 1.000 N NA
 5612792 5612793 CbuK_1437 CbuK_1438 lpxD   TRUE 0.999 10.000 0.814 1.000 Y NA
 5612793 5612794 CbuK_1438 CbuK_1439   yaeT TRUE 0.970 78.000 0.354 1.000 Y NA
 5612795 5612796 CbuK_1440 CbuK_1441 hmgA   TRUE 0.933 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5612796 5612797 CbuK_1441 CbuK_1442   mvk TRUE 0.808 99.000 0.040 0.001 Y NA
 5612797 5612798 CbuK_1442 CbuK_1443 mvk mvaD TRUE 0.997 -7.000 0.312 0.002 Y NA
 5612801 5612802 CbuK_1446 CbuK_1447     FALSE 0.214 24.000 0.000 NA   NA
 5612806 5612807 CbuK_1451 CbuK_1452   cdsA FALSE 0.035 178.000 0.000 NA   NA
 5612807 5612808 CbuK_1452 CbuK_1453 cdsA uppS TRUE 0.998 -10.000 0.400 1.000 Y NA
 5612808 5612809 CbuK_1453 CbuK_1454 uppS frr TRUE 0.997 -3.000 0.409 1.000 N NA
 5612809 5612810 CbuK_1454 CbuK_1455 frr pyrH TRUE 0.974 78.000 0.626 1.000 N NA
 5612810 5612811 CbuK_1455 CbuK_1456 pyrH tsf TRUE 0.997 0.000 0.416 1.000 N NA
 5612811 5612812 CbuK_1456 CbuK_1457 tsf rpsB TRUE 0.999 10.000 0.748 1.000 Y NA
 5612813 5612814 CbuK_1458 CbuK_1459   map FALSE 0.114 55.000 0.000 NA   NA
 5612816 5612817 CbuK_1461 CbuK_1462     FALSE 0.184 28.000 0.000 NA   NA
 5612818 5612819 CbuK_1463 CbuK_1464     FALSE 0.016 281.000 0.000 NA   NA
 5612819 5612820 CbuK_1464 CbuK_1465     FALSE 0.137 39.000 0.000 NA   NA
 5612822 5612823 CbuK_1467 CbuK_1468   sucD TRUE 0.648 -3.000 0.000 1.000   NA
 5612823 5612824 CbuK_1468 CbuK_1469 sucD sucC TRUE 0.999 0.000 0.806 0.001 Y NA
 5612824 5612825 CbuK_1469 CbuK_1470 sucC sucB TRUE 0.749 202.000 0.136 1.000 Y NA
 5612825 5612826 CbuK_1470 CbuK_1471 sucB sucA TRUE 0.999 10.000 0.667 1.000 Y NA
 5612826 5612827 CbuK_1471 CbuK_1472 sucA sdhB TRUE 0.945 24.000 0.067 1.000 Y NA
 5612827 5612828 CbuK_1472 CbuK_1473 sdhB sdhA TRUE 0.999 7.000 0.604 0.002 Y NA
 5612828 5612829 CbuK_1473 CbuK_1474 sdhA sdhD TRUE 0.998 13.000 0.705 0.002 Y NA
 5612829 5612830 CbuK_1474 CbuK_1475 sdhD sdhC TRUE 0.998 -12.000 0.453 0.001 Y NA
 5612830 5612831 CbuK_1475 CbuK_1476 sdhC   FALSE 0.407 13.000 0.000 NA   NA
 5612831 5612832 CbuK_1476 CbuK_1478     FALSE 0.044 156.000 0.000 NA   NA
 5612834 5612835 CbuK_1479 CbuK_1480     FALSE 0.057 130.000 0.000 NA   NA
 5612836 5612837 CbuK_1481 CbuK_1482     FALSE 0.012 346.000 0.000 NA   NA
 5612837 5612838 CbuK_1482 CbuK_1483   gltA FALSE 0.011 391.000 0.000 NA   NA
 5612838 5612839 CbuK_1483 CbuK_1484 gltA   FALSE 0.142 38.000 0.000 NA   NA
 5612840 5612841 CbuK_1485 CbuK_1486     FALSE 0.321 22.000 0.000 0.008   NA
 5612841 5612842 CbuK_1486 CbuK_1487     FALSE 0.174 44.000 0.000 0.008   NA
 5612842 5612843 CbuK_1487 CbuK_1488   thiL FALSE 0.092 92.000 0.000 1.000   NA
 5612845 5612846 CbuK_1490 CbuK_1491 nusB   TRUE 0.975 -10.000 0.012 NA Y NA
 5612846 5612847 CbuK_1491 CbuK_1492   glyA TRUE 0.974 0.000 0.024 NA N NA
 5612851 5612852 CbuK_1496 CbuK_1498 hemB   TRUE 0.645 18.000 0.000 NA N NA
 5612855 5612856 CbuK_1500 CbuK_1501     FALSE 0.343 16.000 0.000 NA   NA
 5612857 5612858 CbuK_1502 CbuK_1503     FALSE 0.172 31.000 0.000 NA   NA
 5612858 5612859 CbuK_1503 CbuK_1504   murA TRUE 0.566 -9.000 0.000 NA   NA
 5612860 5612861 CbuK_1505 CbuK_1506 kdsD   TRUE 0.997 2.000 0.598 1.000   NA
 5612861 5612862 CbuK_1506 CbuK_1507     TRUE 0.992 16.000 0.617 NA   NA
 5612862 5612863 CbuK_1507 CbuK_1508     TRUE 0.954 50.000 0.459 NA   NA
 5612863 5612864 CbuK_1508 CbuK_1509     TRUE 0.997 3.000 0.543 NA   NA
 5612864 5612865 CbuK_1509 CbuK_1510   yfiA FALSE 0.376 99.000 0.006 NA   NA
 5612865 5612866 CbuK_1510 CbuK_1511 yfiA hprK TRUE 0.950 0.000 0.021 NA   NA
 5612866 5612867 CbuK_1511 CbuK_1512 hprK ptsH TRUE 0.568 -19.000 0.000 1.000   NA
 5612868 5612869 CbuK_1513 CbuK_1514   pmbA FALSE 0.082 84.000 0.000 NA   NA
 5612869 5612870 CbuK_1514 CbuK_1515 pmbA lon FALSE 0.539 9.000 0.000 NA   NA
 5612870 5612871 CbuK_1515 CbuK_1516 lon clpX TRUE 0.990 14.000 0.201 0.081 Y NA
 5612871 5612872 CbuK_1516 CbuK_1517 clpX clpP TRUE 0.978 55.000 0.352 1.000 Y NA
 5612872 5612873 CbuK_1517 CbuK_1518 clpP tig TRUE 0.997 10.000 0.351 1.000 Y NA
 5612873 5612874 CbuK_1518 CbuK_1519 tig   FALSE 0.549 8.000 0.000 NA   NA
 5612877 5612878 CbuK_1521 CbuK_1523     FALSE 0.108 60.000 0.000 NA   NA
 5612878 5612879 CbuK_1523 CbuK_1524     FALSE 0.071 103.000 0.000 NA   NA
 5612880 5612881 CbuK_1525 CbuK_1526     TRUE 0.991 3.000 0.239 NA   NA
 5612881 5612882 CbuK_1526 CbuK_1527     TRUE 0.984 -16.000 0.054 NA Y NA
 5612882 5612883 CbuK_1527 CbuK_1528     TRUE 0.999 -3.000 0.556 NA Y NA
 5612884 5612885 CbuK_1529 CbuK_1530     TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5612885 5612886 CbuK_1530 CbuK_1531     FALSE 0.066 113.000 0.000 NA   NA
 5612888 5612889 CbuK_1533 CbuK_1534 poxB   FALSE 0.023 235.000 0.000 NA   NA
 5612889 5612890 CbuK_1534 CbuK_1535     TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5612891 5612892 CbuK_1536 CbuK_1537 sepB   TRUE 0.982 0.000 0.061 1.000 N NA
 5612892 5612893 CbuK_1537 CbuK_1538     TRUE 0.921 24.000 0.081 1.000 N NA
 5612893 5612894 CbuK_1538 CbuK_1539     FALSE 0.084 246.000 0.000 1.000 N NA
 5612895 5612896 CbuK_1540 CbuK_1541     FALSE 0.119 50.000 0.000 NA   NA
 5612896 5612897 CbuK_1541 CbuK_1542     FALSE 0.348 59.000 0.000 1.000 N NA
 5612897 5612898 CbuK_1542 CbuK_1543     FALSE 0.008 991.000 0.000 NA   NA
 5612898 5612899 CbuK_1543 CbuK_1544     FALSE 0.014 306.000 0.000 NA   NA
 5612901 5612902 CbuK_1545 CbuK_1547     FALSE 0.081 86.000 0.000 NA   NA
 5612902 5612903 CbuK_1547 CbuK_1548     FALSE 0.329 17.000 0.000 NA   NA
 5612904 5612905 CbuK_1549 CbuK_1550   rfbI FALSE 0.009 485.000 0.000 NA   NA
 5612905 5612906 CbuK_1550 CbuK_1551 rfbI   TRUE 0.903 10.000 0.000 NA Y NA
 5612906 5612907 CbuK_1551 CbuK_1552     TRUE 0.811 10.000 0.000 NA N NA
 5612908 5612909 CbuK_1553 CbuK_1554 cysQ1.2   TRUE 0.912 -18.000 0.000 1.000 Y NA
 5612911 5612912 CbuK_1556 CbuK_1557     FALSE 0.228 23.000 0.000 NA   NA
 5612912 5612913 CbuK_1557 CbuK_1558     TRUE 0.671 31.000 0.000 0.011 Y NA
 5612913 5612914 CbuK_1558 CbuK_1559     TRUE 0.576 -7.000 0.000 NA   NA
 5612914 5612915 CbuK_1559 CbuK_1560     FALSE 0.078 90.000 0.000 NA   NA
 5612915 5612916 CbuK_1560 CbuK_1561     FALSE 0.060 127.000 0.000 NA   NA
 5612916 5612917 CbuK_1561 CbuK_1562     TRUE 0.986 -3.000 0.026 0.003 Y NA
 5612918 5612919 CbuK_1563 CbuK_1564     TRUE 0.576 -7.000 0.000 NA   NA
 5612919 5612920 CbuK_1564 CbuK_1565   gmd TRUE 0.910 9.000 0.000 NA Y NA
 5612920 5612921 CbuK_1565 CbuK_1566 gmd wcaG TRUE 0.931 -7.000 0.000 0.006 Y NA
 5612921 5612922 CbuK_1566 CbuK_1567 wcaG   FALSE 0.011 380.000 0.000 NA   NA
 5612922 5612923 CbuK_1567 CbuK_1568     FALSE 0.329 17.000 0.000 NA   NA
 5612923 5612924 CbuK_1568 CbuK_1569     FALSE 0.545 -13.000 0.000 NA   NA
 5612924 5612925 CbuK_1569 CbuK_1570     FALSE 0.079 89.000 0.000 NA   NA
 5612925 5612926 CbuK_1570 CbuK_1571     FALSE 0.010 445.000 0.000 NA   NA
 5612928 5612929 CbuK_1573 CbuK_1574     TRUE 0.972 3.000 0.069 1.000   NA
 5612929 5612930 CbuK_1574 CbuK_1575     TRUE 0.997 -7.000 0.286 1.000 Y NA
 5612930 5612931 CbuK_1575 CbuK_1576     TRUE 0.991 -15.000 0.286 0.025   NA
 5612931 5612932 CbuK_1576 CbuK_1577     TRUE 0.969 3.000 0.059 1.000   NA
 5612932 5612933 CbuK_1577 CbuK_1578     TRUE 0.991 -25.000 0.206 0.013 N NA
 5612933 5612934 CbuK_1578 CbuK_1579     TRUE 0.993 -3.000 0.111 0.002 Y NA
 5612935 5612936 CbuK_1580 CbuK_1581     TRUE 0.938 4.000 0.000 0.009 Y NA
 5612936 5612937 CbuK_1581 CbuK_1582     TRUE 0.967 -6.000 0.015 1.000 N NA
 5612937 5612938 CbuK_1582 CbuK_1583     TRUE 0.576 -7.000 0.000 NA   NA
 5612939 5612940 CbuK_1584 CbuK_1585 rfbA.2   FALSE 0.166 32.000 0.000 NA   NA
 5612940 5612941 CbuK_1585 CbuK_1586     FALSE 0.064 119.000 0.000 NA   NA
 5612941 5612942 CbuK_1586 CbuK_1587   rhlE FALSE 0.053 139.000 0.000 NA   NA
 5612942 5612943 CbuK_1587 CbuK_1588 rhlE   FALSE 0.060 127.000 0.000 NA   NA
 5612943 5612944 CbuK_1588 CbuK_1589     FALSE 0.117 51.000 0.000 NA   NA
 5612945 5612946 CbuK_1590 CbuK_1591   dapD TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5612946 5612947 CbuK_1591 CbuK_1592 dapD dapE TRUE 0.992 6.000 0.109 0.002 Y NA
 5612948 5612949 CbuK_1593 CbuK_1594     TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5612949 5612950 CbuK_1594 CbuK_1595     FALSE 0.073 99.000 0.000 NA   NA
 5612950 5612951 CbuK_1595 CbuK_1596     FALSE 0.166 32.000 0.000 NA   NA
 5612951 5612952 CbuK_1596 CbuK_1597     TRUE 0.559 -10.000 0.000 NA   NA
 5612953 5612954 CbuK_1598 CbuK_1599     FALSE 0.142 38.000 0.000 NA   NA
 5612954 5612955 CbuK_1599 CbuK_1600   dnaX TRUE 0.604 4.000 0.000 NA   NA
 5612955 5612956 CbuK_1600 CbuK_1601 dnaX   TRUE 0.910 110.000 0.411 NA   NA
 5612956 5612957 CbuK_1601 CbuK_1602   recR TRUE 0.994 12.000 0.604 NA   NA
 5612957 5612958 CbuK_1602 CbuK_1603 recR   TRUE 0.993 14.000 0.604 NA   NA
 5612959 5612960 CbuK_1604 CbuK_1605     FALSE 0.214 24.000 0.000 NA   NA
 5612960 5612961 CbuK_1605 CbuK_1606     FALSE 0.157 34.000 0.000 NA   NA
 5612961 5612962 CbuK_1606 CbuK_1607     FALSE 0.038 172.000 0.000 NA   NA
 5612962 5612963 CbuK_1607 CbuK_1608   ribH TRUE 0.576 -7.000 0.000 NA   NA
 5612963 5612964 CbuK_1608 CbuK_1609 ribH ribA TRUE 0.980 -3.000 0.008 0.002 Y NA
 5612964 5612965 CbuK_1609 CbuK_1610 ribA ribE TRUE 0.818 41.000 0.009 1.000 Y NA
 5612966 5612967 CbuK_1611 CbuK_1612     TRUE 0.974 6.000 0.107 NA   NA
 5612968 5612969 CbuK_1613 CbuK_1614 ribD   TRUE 0.869 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5612970 5612971 CbuK_1615 CbuK_1616     TRUE 0.983 -3.000 0.065 1.000 N NA
 5612971 5612972 CbuK_1616 CbuK_1617     TRUE 0.929 205.000 0.458 0.003 Y NA
 5612972 5612973 CbuK_1617 CbuK_1618   pdhC.2 TRUE 0.999 0.000 0.556 0.040 Y NA
 5612973 5612974 CbuK_1618 CbuK_1619 pdhC.2   FALSE 0.040 417.000 0.000 NA N NA
 5612975 5612976 CbuK_1620 CbuK_1621     FALSE 0.127 43.000 0.000 NA   NA
 5612976 5612977 CbuK_1621 CbuK_1622     FALSE 0.062 123.000 0.000 NA   NA
 5612979 5612980 CbuK_1624 CbuK_1625 purL mip FALSE 0.390 42.000 0.000 1.000 N NA
 5612980 5612981 CbuK_1625 CbuK_1626 mip putA FALSE 0.299 73.000 0.000 1.000 N NA
 5612981 5612982 CbuK_1626 CbuK_1627 putA ppa FALSE 0.386 119.000 0.000 1.000 Y NA
 5612984 5612985 CbuK_1629 CbuK_1630     FALSE 0.068 109.000 0.000 NA   NA
 5612985 5612986 CbuK_1630 CbuK_1631     FALSE 0.029 201.000 0.000 NA   NA
 5612986 5612987 CbuK_1631 CbuK_1632     FALSE 0.072 100.000 0.000 NA   NA
 5612987 5612988 CbuK_1632 CbuK_1633     TRUE 0.590 5.000 0.000 NA   NA
 5612989 5612990 CbuK_1634 CbuK_1635   lpxB TRUE 0.957 -10.000 0.044 1.000   NA
 5612990 5612991 CbuK_1635 CbuK_1636 lpxB   FALSE 0.345 60.000 0.000 1.000 N NA
 5612992 5612993 CbuK_1637 CbuK_1638     TRUE 0.611 0.000 0.000 NA   NA
 5612993 5612994 CbuK_1638 CbuK_1639   prfB TRUE 0.636 -16.000 0.000 0.002   NA
 5612995 5612996 CbuK_1640 CbuK_1641     FALSE 0.096 69.000 0.000 NA   NA
 5612998 5612999 CbuK_1643 CbuK_1644   panB FALSE 0.077 92.000 0.000 NA   NA
 5612999 5613000 CbuK_1644 CbuK_1645 panB panC TRUE 0.997 11.000 0.395 0.001 Y NA
 5613000 5613001 CbuK_1645 CbuK_1646 panC panD TRUE 0.998 -6.000 0.342 1.000 Y NA
 5613001 5613002 CbuK_1646 CbuK_1647 panD frgA TRUE 0.848 7.000 0.000 1.000 N NA
 5613002 5613003 CbuK_1647 CbuK_1648 frgA   FALSE 0.288 78.000 0.000 1.000 N NA
 5613003 5613004 CbuK_1648 CbuK_1649     FALSE 0.277 85.000 0.000 1.000 N NA
 5613004 5613005 CbuK_1649 CbuK_1650     FALSE 0.030 199.000 0.000 NA   NA
 5613006 5613007 CbuK_1651 CbuK_1652     FALSE 0.009 497.000 0.000 NA   NA
 5613007 5613008 CbuK_1652 CbuK_1653     FALSE 0.012 339.000 0.000 NA   NA
 5613008 5613009 CbuK_1653 CbuK_1654     FALSE 0.010 454.000 0.000 NA   NA
 5613010 5613011 CbuK_1655 CbuK_1656     FALSE 0.090 73.000 0.000 NA   NA
 5613011 5613012 CbuK_1656 CbuK_1657     FALSE 0.021 242.000 0.000 NA   NA
 5613012 5613013 CbuK_1657 CbuK_1658     FALSE 0.017 276.000 0.000 NA   NA
 5613013 5613014 CbuK_1658 CbuK_1659     FALSE 0.084 80.000 0.000 NA   NA
 5613014 5613015 CbuK_1659 CbuK_1660     TRUE 0.576 -7.000 0.000 NA   NA
 5613016 5613017 CbuK_1661 CbuK_1662     FALSE 0.166 32.000 0.000 NA   NA
 5613017 5613018 CbuK_1662 CbuK_1663   aacA4.2 TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5613018 5613019 CbuK_1663 CbuK_1664 aacA4.2 lspA FALSE 0.012 373.000 0.000 NA   NA
 5613019 5613020 CbuK_1664 CbuK_1665 lspA ileS TRUE 0.990 3.000 0.147 1.000 N NA
 5613020 5613021 CbuK_1665 CbuK_1666 ileS   FALSE 0.066 113.000 0.000 NA   NA
 5613022 5613023 CbuK_1667 CbuK_1668     FALSE 0.037 175.000 0.000 NA   NA
 5613024 5613025 CbuK_1669 CbuK_1670 ribF mviN TRUE 0.985 -3.000 0.169 1.000   NA
 5613029 5613030 CbuK_1674 CbuK_1675     FALSE 0.072 100.000 0.000 NA   NA
 5613030 5613031 CbuK_1675 CbuK_1676   rpmA TRUE 0.832 165.000 0.335 1.000   NA
 5613031 5613032 CbuK_1676 CbuK_1677 rpmA rplU TRUE 0.999 -10.000 0.667 0.019 Y NA
 5613032 5613033 CbuK_1677 CbuK_1678 rplU ahpD.4 FALSE 0.080 87.000 0.000 NA   NA
 5613035 5613036 CbuK_1680 CbuK_1681     FALSE 0.479 11.000 0.000 NA   NA
 5613036 5613037 CbuK_1681 CbuK_1682     FALSE 0.008 655.000 0.000 NA   NA
 5613037 5613038 CbuK_1682 CbuK_1683     FALSE 0.059 128.000 0.000 NA   NA
 5613044 5613045 CbuK_1689 CbuK_1690     FALSE 0.009 503.000 0.000 NA   NA
 5613045 5613046 CbuK_1690 CbuK_1691     FALSE 0.123 46.000 0.000 NA   NA
 5613046 5613047 CbuK_1691 CbuK_1692     FALSE 0.092 71.000 0.000 NA   NA
 5613047 5613048 CbuK_1692 CbuK_1693     FALSE 0.079 89.000 0.000 NA   NA
 5613048 5613049 CbuK_1693 CbuK_1694     FALSE 0.142 38.000 0.000 NA   NA
 5613049 5613050 CbuK_1694 CbuK_1695   hupB TRUE 0.611 3.000 0.000 NA   NA
 5613051 5613052 CbuK_1696 CbuK_1697     TRUE 0.577 6.000 0.000 NA   NA
 5613053 5613054 CbuK_1698 CbuK_1699 tldD   TRUE 0.644 71.000 0.050 NA   NA
 5613054 5613055 CbuK_1699 CbuK_1700   mreD TRUE 0.611 0.000 0.000 NA   NA
 5613055 5613056 CbuK_1700 CbuK_1701 mreD mreC TRUE 0.999 6.000 0.550 0.004 Y NA
 5613056 5613057 CbuK_1701 CbuK_1702 mreC mreB TRUE 0.975 83.000 0.689 1.000 N NA
 5613058 5613059 CbuK_1703 CbuK_1704   gatC FALSE 0.047 148.000 0.000 NA   NA
 5613059 5613060 CbuK_1704 CbuK_1705 gatC gatA TRUE 0.999 4.000 0.643 0.002 Y NA
 5613060 5613061 CbuK_1705 CbuK_1706 gatA gatB TRUE 0.999 5.000 0.492 0.002 Y NA
 5613063 5613064 CbuK_1708 CbuK_1709 ahpC.2 ahpD.5 TRUE 0.892 19.000 0.058 1.000   NA
 5613065 5613066 CbuK_1710 CbuK_1711     FALSE 0.214 24.000 0.000 NA   NA
 5613066 5613067 CbuK_1711 CbuK_1712     TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5613067 5613068 CbuK_1712 CbuK_1713     FALSE 0.027 207.000 0.000 NA   NA
 5613068 5613069 CbuK_1713 CbuK_1714     TRUE 0.998 0.000 0.330 NA Y NA
 5613071 5613072 CbuK_1716 CbuK_1717     FALSE 0.203 25.000 0.000 NA   NA
 5613072 5613073 CbuK_1717 CbuK_1718   cysS FALSE 0.037 174.000 0.000 NA   NA
 5613073 5613074 CbuK_1718 CbuK_1719 cysS gltX1 TRUE 0.981 -9.000 0.021 0.077 Y NA
 5613076 5613077 CbuK_1721 CbuK_1722     TRUE 0.577 6.000 0.000 NA   NA
 5613078 5613079 CbuK_1723 CbuK_1724     FALSE 0.013 328.000 0.000 NA   NA
 5613080 5613081 CbuK_1725 CbuK_1726 pdxJ   FALSE 0.121 48.000 0.000 NA   NA
 5613081 5613082 CbuK_1726 CbuK_1727     TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5613082 5613083 CbuK_1727 CbuK_1728     TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5613083 5613084 CbuK_1728 CbuK_1729   recO FALSE 0.020 250.000 0.000 NA   NA
 5613084 5613085 CbuK_1729 CbuK_1730 recO era TRUE 0.979 -3.000 0.109 1.000   NA
 5613085 5613086 CbuK_1730 CbuK_1731 era rnc TRUE 0.983 -3.000 0.127 0.022   NA
 5613086 5613087 CbuK_1731 CbuK_1732 rnc lepB1.2 TRUE 0.951 21.000 0.117 1.000 N NA
 5613087 5613088 CbuK_1732 CbuK_1733 lepB1.2 lepA TRUE 0.992 -3.000 0.187 1.000 N NA
 5613088 5613089 CbuK_1733 CbuK_1734 lepA   FALSE 0.065 136.000 0.000 1.000   NA
 5613089 5613090 CbuK_1734 CbuK_1735     FALSE 0.329 17.000 0.000 NA   NA
 5613090 5613091 CbuK_1735 CbuK_1736     FALSE 0.228 23.000 0.000 NA   NA
 5613091 5613092 CbuK_1736 CbuK_1737   tilS FALSE 0.101 78.000 0.000 1.000   NA
 5613092 5613093 CbuK_1737 CbuK_1738 tilS accA TRUE 0.984 -24.000 0.123 1.000 N NA
 5613095 5613096 CbuK_1740 CbuK_1741     TRUE 0.604 4.000 0.000 NA   NA
 5613097 5613098 CbuK_1742 CbuK_1743     TRUE 0.604 4.000 0.000 NA   NA
 5613098 5613099 CbuK_1743 CbuK_1744     FALSE 0.041 164.000 0.000 NA   NA
 5613099 5613100 CbuK_1744 CbuK_1745     TRUE 0.590 5.000 0.000 NA   NA
 5613101 5613102 CbuK_1746 CbuK_1747 gpsA secB TRUE 0.638 69.000 0.008 1.000 N NA
 5613102 5613103 CbuK_1747 CbuK_1748 secB grxC TRUE 0.987 13.000 0.221 1.000 N NA
 5613103 5613104 CbuK_1748 CbuK_1749 grxC   TRUE 0.990 5.000 0.166 NA N NA
 5613104 5613105 CbuK_1749 CbuK_1750     FALSE 0.012 360.000 0.000 NA   NA
 5613107 5613108 CbuK_1752 CbuK_1753     FALSE 0.116 53.000 0.000 NA   NA
 5613110 5613111 CbuK_1755 CbuK_1756     FALSE 0.123 46.000 0.000 NA   NA
 5613111 5613112 CbuK_1756 CbuK_1757     FALSE 0.099 67.000 0.000 NA   NA
 5613117 5613118 CbuK_1762 CbuK_1763 gpmI   TRUE 0.991 4.000 0.170 1.000 N NA
 5613118 5613119 CbuK_1763 CbuK_1764   cptA TRUE 0.997 -3.000 0.408 0.019 N NA
 5613119 5613120 CbuK_1764 CbuK_1765 cptA   FALSE 0.542 24.000 0.000 1.000 N NA
 5613120 5613121 CbuK_1765 CbuK_1766     FALSE 0.191 27.000 0.000 NA   NA
 5613121 5613122 CbuK_1766 CbuK_1767     FALSE 0.157 34.000 0.000 NA   NA
 5613123 5613124 CbuK_1768 CbuK_1769     FALSE 0.015 293.000 0.000 NA   NA
 5613128 5613129 CbuK_1773 CbuK_1774 thyA   TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5613129 5613130 CbuK_1774 CbuK_1775   lgt TRUE 0.607 2.000 0.000 NA   NA
 5613130 5613131 CbuK_1775 CbuK_1776 lgt ptsP TRUE 0.707 55.000 0.011 1.000 N NA
 5613131 5613132 CbuK_1776 CbuK_1777 ptsP   TRUE 0.981 -19.000 0.097 1.000 N NA
 5613132 5613133 CbuK_1777 CbuK_1778     FALSE 0.507 -49.000 0.000 NA   NA
 5613134 5613135 CbuK_1779 CbuK_1780   nrdA FALSE 0.243 22.000 0.000 NA   NA
 5613135 5613136 CbuK_1780 CbuK_1781 nrdA nrdB TRUE 0.988 50.000 0.564 0.001 Y NA
 5613136 5613137 CbuK_1781 CbuK_1782 nrdB   FALSE 0.069 106.000 0.000 NA   NA
 5613139 5613140 CbuK_1784 CbuK_1785     FALSE 0.068 110.000 0.000 NA   NA
 5613140 5613141 CbuK_1785 CbuK_1786     FALSE 0.011 387.000 0.000 NA   NA
 5613141 5613142 CbuK_1786 CbuK_1787     TRUE 0.987 -3.000 0.190 NA   NA
 5613142 5613143 CbuK_1787 CbuK_1788     FALSE 0.039 169.000 0.000 NA   NA
 5613143 5613144 CbuK_1788 CbuK_1789     FALSE 0.120 49.000 0.000 NA   NA
 5613144 5613145 CbuK_1789 CbuK_1790     FALSE 0.082 83.000 0.000 NA   NA
 5613147 5613148 CbuK_1792 CbuK_1793 aspS   TRUE 0.886 16.000 0.039 NA   NA
 5613148 5613149 CbuK_1793 CbuK_1794   ruvC TRUE 0.850 116.000 0.277 NA   NA
 5613149 5613150 CbuK_1794 CbuK_1795 ruvC ruvA TRUE 0.998 -3.000 0.451 0.010 Y NA
 5613150 5613151 CbuK_1795 CbuK_1796 ruvA   FALSE 0.072 100.000 0.000 NA   NA
 5613151 5613152 CbuK_1796 CbuK_1797     FALSE 0.343 16.000 0.000 NA   NA
 5613152 5613153 CbuK_1797 CbuK_1798   ruvB TRUE 0.607 2.000 0.000 NA   NA
 5613153 5613154 CbuK_1798 CbuK_1799 ruvB   FALSE 0.081 86.000 0.000 NA   NA
 5613156 5613157 CbuK_1801 CbuK_1802   tolQ FALSE 0.277 76.000 0.000 NA N NA
 5613157 5613158 CbuK_1802 CbuK_1803 tolQ tolR TRUE 0.998 -22.000 0.556 0.017 Y NA
 5613158 5613159 CbuK_1803 CbuK_1804 tolR   FALSE 0.145 37.000 0.000 NA   NA
 5613160 5613161 CbuK_1805 CbuK_1806     FALSE 0.008 2270.000 0.000 NA   NA
 5613161 5613162 CbuK_1806 CbuK_1807     FALSE 0.076 96.000 0.000 NA   NA
 5613162 5613163 CbuK_1807 CbuK_1808     TRUE 0.653 3.000 0.000 1.000   NA
 5613164 5613165 CbuK_1809 CbuK_1810 wrbA   TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5613165 5613166 CbuK_1810 CbuK_1811     FALSE 0.010 411.000 0.000 NA   NA
 5613167 5613168 CbuK_1812 CbuK_1813 mrpG mrpF TRUE 0.999 -7.000 0.614 1.000 Y NA
 5613168 5613169 CbuK_1813 CbuK_1814 mrpF mrpE TRUE 0.999 -3.000 0.644 0.038 Y NA
 5613169 5613170 CbuK_1814 CbuK_1815 mrpE mrpD TRUE 0.999 -3.000 0.810 1.000 Y NA
 5613170 5613171 CbuK_1815 CbuK_1816 mrpD mrpC TRUE 0.999 -3.000 0.896 0.008 Y NA
 5613171 5613172 CbuK_1816 CbuK_1817 mrpC   TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5613172 5613173 CbuK_1817 CbuK_1818     FALSE 0.063 121.000 0.000 NA   NA
 5613174 5613175 CbuK_1819 CbuK_1820     FALSE 0.058 129.000 0.000 NA   NA
 5613177 5613178 CbuK_1822 CbuK_1823 rpsU   TRUE 0.916 28.000 0.173 0.031   NA
 5613178 5613179 CbuK_1823 CbuK_1824   dnaG TRUE 0.849 41.000 0.137 1.000   NA
 5613179 5613180 CbuK_1824 CbuK_1825 dnaG rpoS.2 TRUE 0.914 120.000 0.299 1.000 N NA
 5613183 5613184 CbuK_1828 CbuK_1829     FALSE 0.100 66.000 0.000 NA   NA
 5613185 5613186 CbuK_1830 CbuK_1831   rimK TRUE 0.974 -3.000 0.023 1.000 N NA
 5613186 5613187 CbuK_1831 CbuK_1832 rimK   TRUE 0.955 3.000 0.023 1.000   NA
 5613187 5613188 CbuK_1832 CbuK_1833     FALSE 0.053 155.000 0.000 1.000   NA
 5613189 5613190 CbuK_1834 CbuK_1835     FALSE 0.015 296.000 0.000 NA   NA
 5613190 5613191 CbuK_1835 CbuK_1836     FALSE 0.034 182.000 0.000 NA   NA
 5613191 5613192 CbuK_1836 CbuK_1837     FALSE 0.070 104.000 0.000 NA   NA
 5613192 5613193 CbuK_1837 CbuK_1838     FALSE 0.161 33.000 0.000 NA   NA
 5613193 5613194 CbuK_1838 CbuK_1839     FALSE 0.018 259.000 0.000 NA   NA
 5613194 5613195 CbuK_1839 CbuK_1840     FALSE 0.178 29.000 0.000 NA   NA
 5613196 5613197 CbuK_1841 CbuK_1842     FALSE 0.111 57.000 0.000 NA   NA
 5613197 5613198 CbuK_1842 CbuK_1843     FALSE 0.026 218.000 0.000 NA   NA
 5613199 5613200 CbuK_1844 CbuK_1845 icmB icmJ TRUE 0.885 73.000 0.267 NA   NA
 5613200 5613201 CbuK_1845 CbuK_1846 icmJ icmD FALSE 0.407 13.000 0.000 NA   NA
 5613201 5613202 CbuK_1846 CbuK_1847 icmD icmC FALSE 0.081 85.000 0.000 NA   NA
 5613202 5613203 CbuK_1847 CbuK_1848 icmC icmG FALSE 0.092 71.000 0.000 NA   NA
 5613203 5613204 CbuK_1848 CbuK_1849 icmG icmE TRUE 0.970 18.000 0.250 NA   NA
 5613204 5613205 CbuK_1849 CbuK_1850 icmE icmK TRUE 0.989 -13.000 0.250 NA   NA
 5613205 5613206 CbuK_1850 CbuK_1851 icmK icmL.1 TRUE 0.997 11.000 1.000 NA   NA
 5613206 5613207 CbuK_1851 CbuK_1852 icmL.1 icmL.2 TRUE 0.607 2.000 0.000 NA   NA
 5613207 5613208 CbuK_1852 CbuK_1853 icmL.2 icmN TRUE 0.563 7.000 0.000 NA   NA
 5613208 5613209 CbuK_1853 CbuK_1854 icmN icmO TRUE 0.564 10.000 0.000 1.000   NA
 5613209 5613210 CbuK_1854 CbuK_1855 icmO icmP TRUE 0.990 -24.000 0.308 NA   NA
 5613210 5613211 CbuK_1855 CbuK_1856 icmP icmQ TRUE 0.996 1.000 0.500 NA   NA
 5613211 5613212 CbuK_1856 CbuK_1857 icmQ   TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5613216 5613217 CbuK_1861 CbuK_1862     FALSE 0.067 112.000 0.000 NA   NA
 5613217 5613218 CbuK_1862 CbuK_1863     FALSE 0.077 92.000 0.000 NA   NA
 5613218 5613219 CbuK_1863 CbuK_1864     FALSE 0.017 275.000 0.000 NA   NA
 5613220 5613221 CbuK_1865 CbuK_1866 icmT icmS TRUE 0.995 0.000 0.400 NA   NA
 5613221 5613222 CbuK_1866 CbuK_1867 icmS dotD FALSE 0.043 157.000 0.000 NA   NA
 5613222 5613223 CbuK_1867 CbuK_1868 dotD dotC TRUE 0.997 3.000 0.667 NA   NA
 5613223 5613224 CbuK_1868 CbuK_1869 dotC dotB TRUE 0.954 38.000 0.364 NA   NA
 5613224 5613225 CbuK_1869 CbuK_1870 dotB   TRUE 0.650 7.000 0.000 0.017   NA
 5613225 5613226 CbuK_1870 CbuK_1871     FALSE 0.040 166.000 0.000 NA   NA
 5613227 5613228 CbuK_1872 CbuK_1873     FALSE 0.039 167.000 0.000 NA   NA
 5613228 5613229 CbuK_1873 CbuK_1874   dotA FALSE 0.114 55.000 0.000 NA   NA
 5613229 5613230 CbuK_1874 CbuK_1875 dotA icmV TRUE 0.998 -3.000 0.750 NA   NA
 5613231 5613232 CbuK_1876 CbuK_1877 icmW   TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5613232 5613233 CbuK_1877 CbuK_1878   icmX FALSE 0.343 16.000 0.000 NA   NA
 5613233 5613234 CbuK_1878 CbuK_1879 icmX   FALSE 0.083 82.000 0.000 NA   NA
 5613234 5613235 CbuK_1879 CbuK_1880     FALSE 0.356 15.000 0.000 NA   NA
 5613236 5613237 CbuK_1881 CbuK_1882     FALSE 0.070 104.000 0.000 NA   NA
 5613237 5613238 CbuK_1882 CbuK_1883     FALSE 0.009 480.000 0.000 NA   NA
 5613239 5613240 CbuK_1884 CbuK_1885     FALSE 0.530 -18.000 0.000 NA   NA
 5613240 5613241 CbuK_1885 CbuK_1886     FALSE 0.277 20.000 0.000 NA   NA
 5613241 5613242 CbuK_1886 CbuK_1887     FALSE 0.017 270.000 0.000 NA   NA
 5613242 5613243 CbuK_1887 CbuK_1888     TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5613243 5613244 CbuK_1888 CbuK_1889     TRUE 0.590 5.000 0.000 NA   NA
 5613244 5613245 CbuK_1889 CbuK_1890     TRUE 0.998 -3.000 0.895 NA   NA
 5613245 5613246 CbuK_1890 CbuK_1891     TRUE 0.997 -16.000 0.787 NA   NA
 5613246 5613247 CbuK_1891 CbuK_1892     TRUE 0.581 89.000 0.043 NA   NA
 5613247 5613248 CbuK_1892 CbuK_1893     TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5613248 5613249 CbuK_1893 CbuK_1894     FALSE 0.050 143.000 0.000 NA   NA
 5613251 5613252 CbuK_1896 CbuK_1897 pilA pilB TRUE 0.998 -10.000 0.556 NA Y NA
 5613252 5613253 CbuK_1897 CbuK_1898 pilB pilC FALSE 0.157 34.000 0.000 NA   NA
 5613253 5613254 CbuK_1898 CbuK_1899 pilC pilD FALSE 0.196 26.000 0.000 NA   NA
 5613254 5613255 CbuK_1899 CbuK_1900 pilD coaE TRUE 0.981 11.000 0.122 1.000 N NA
 5613255 5613256 CbuK_1900 CbuK_1901 coaE queF FALSE 0.295 21.000 0.000 1.000   NA
 5613256 5613257 CbuK_1901 CbuK_1902 queF   FALSE 0.203 25.000 0.000 NA   NA
 5613258 5613259 CbuK_1903 CbuK_1904   mutT TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5613259 5613260 CbuK_1904 CbuK_1905 mutT secA TRUE 0.987 -21.000 0.168 1.000 N NA
 5613263 5613264 CbuK_1908 CbuK_1909     TRUE 0.577 6.000 0.000 NA   NA
 5613264 5613265 CbuK_1909 CbuK_1910     FALSE 0.045 154.000 0.000 NA   NA
 5613266 5613267 CbuK_1911 CbuK_1912   lpxC FALSE 0.014 300.000 0.000 NA   NA
 5613267 5613268 CbuK_1912 CbuK_1913 lpxC ftsZ TRUE 0.728 160.000 0.134 1.000 N NA
 5613268 5613269 CbuK_1913 CbuK_1914 ftsZ ftsA TRUE 0.999 1.000 0.460 1.000 Y NA
 5613271 5613272 CbuK_1916 CbuK_1917 ftsQ murB TRUE 0.990 0.000 0.070 NA Y NA
 5613272 5613273 CbuK_1917 CbuK_1918 murB murC TRUE 0.993 -7.000 0.136 0.005 Y NA
 5613273 5613274 CbuK_1918 CbuK_1919 murC murG TRUE 0.996 -13.000 0.283 1.000 Y NA
 5613274 5613275 CbuK_1919 CbuK_1920 murG   FALSE 0.119 50.000 0.000 NA   NA
 5613275 5613276 CbuK_1920 CbuK_1921   ftsW FALSE 0.012 375.000 0.000 NA   NA
 5613276 5613277 CbuK_1921 CbuK_1922 ftsW murD TRUE 0.996 0.000 0.297 0.004 N NA
 5613277 5613278 CbuK_1922 CbuK_1923 murD   TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5613278 5613279 CbuK_1923 CbuK_1924     FALSE 0.023 233.000 0.000 NA   NA
 5613279 5613280 CbuK_1924 CbuK_1925     FALSE 0.097 68.000 0.000 NA   NA
 5613280 5613281 CbuK_1925 CbuK_1926   mray FALSE 0.038 172.000 0.000 NA   NA
 5613281 5613282 CbuK_1926 CbuK_1927 mray murF TRUE 0.998 5.000 0.309 0.005 Y NA
 5613282 5613283 CbuK_1927 CbuK_1928 murF murE TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.003 Y NA
 5613283 5613284 CbuK_1928 CbuK_1929 murE   FALSE 0.117 51.000 0.000 NA   NA
 5613285 5613286 CbuK_1930 CbuK_1931     FALSE 0.058 129.000 0.000 NA   NA
 5613287 5613288 CbuK_1932 CbuK_1933 ftsI ftsL TRUE 0.989 -7.000 0.153 1.000 N NA
 5613288 5613289 CbuK_1933 CbuK_1934 ftsL mraW TRUE 0.994 -3.000 0.227 1.000 N NA
 5613289 5613290 CbuK_1934 CbuK_1935 mraW mraZ TRUE 0.997 6.000 0.635 NA   NA
 5613290 5613291 CbuK_1935 CbuK_1936 mraZ   FALSE 0.042 159.000 0.000 NA   NA
 5613291 5613292 CbuK_1936 CbuK_1937     FALSE 0.088 75.000 0.000 NA   NA
 5613294 5613295 CbuK_1939 CbuK_1940 tdh kbl TRUE 0.990 23.000 0.547 1.000 N NA
 5613296 5613297 CbuK_1941 CbuK_1942     FALSE 0.122 47.000 0.000 NA   NA
 5613298 5613299 CbuK_1943 CbuK_1944 metQ metI TRUE 0.855 13.000 0.000 NA Y NA
 5613299 5613300 CbuK_1944 CbuK_1945 metI metN TRUE 0.730 23.000 0.000 1.000 Y NA
 5613300 5613301 CbuK_1945 CbuK_1946 metN   FALSE 0.014 306.000 0.000 NA   NA
 5613302 5613303 CbuK_1947 CbuK_1948     FALSE 0.092 71.000 0.000 NA   NA
 5613303 5613304 CbuK_1948 CbuK_1949     FALSE 0.152 35.000 0.000 NA   NA
 5613304 5613305 CbuK_1949 CbuK_1950   nadB FALSE 0.063 121.000 0.000 NA   NA
 5613306 5613307 CbuK_1951 CbuK_1952   sixA TRUE 0.607 2.000 0.000 NA   NA
 5613307 5613308 CbuK_1952 CbuK_1953 sixA   TRUE 0.566 -9.000 0.000 NA   NA
 5613309 5613310 CbuK_1954 CbuK_1955     FALSE 0.124 45.000 0.000 NA   NA
 5613311 5613312 CbuK_1956 CbuK_1957   madC FALSE 0.356 15.000 0.000 NA   NA
 5613312 5613313 CbuK_1957 CbuK_1958 madC ppsC TRUE 0.872 0.000 0.000 1.000 N NA
 5613314 5613315 CbuK_1959 CbuK_1960   cls TRUE 0.611 0.000 0.000 NA   NA
 5613316 5613317 CbuK_1961 CbuK_1962   clpB TRUE 0.869 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5613317 5613318 CbuK_1962 CbuK_1963 clpB queE FALSE 0.112 313.000 0.000 1.000 Y NA
 5613318 5613319 CbuK_1963 CbuK_1964 queE ybgF TRUE 0.969 3.000 0.059 1.000   NA
 5613319 5613320 CbuK_1964 CbuK_1965 ybgF   TRUE 0.990 -13.000 0.278 1.000   NA
 5613320 5613321 CbuK_1965 CbuK_1966   tolB TRUE 0.997 10.000 0.592 1.000 N NA
 5613321 5613322 CbuK_1966 CbuK_1967 tolB   FALSE 0.022 239.000 0.000 NA   NA
 5613322 5613323 CbuK_1967 CbuK_1968     FALSE 0.071 103.000 0.000 NA   NA
 5613323 5613324 CbuK_1968 CbuK_1969   tolA FALSE 0.375 14.000 0.000 NA   NA
 5613324 5613325 CbuK_1969 CbuK_1970 tolA   FALSE 0.046 169.000 0.000 1.000   NA
 5613325 5613326 CbuK_1970 CbuK_1971     FALSE 0.439 15.000 0.000 0.036   NA
 5613326 5613327 CbuK_1971 CbuK_1972   ecnB FALSE 0.525 11.000 0.000 1.000   NA
 5613327 5613328 CbuK_1972 CbuK_1973 ecnB   FALSE 0.025 242.000 0.000 1.000   NA
 5613330 5613331 CbuK_1975 CbuK_1976 proS   FALSE 0.172 36.000 0.000 1.000   NA
 5613331 5613332 CbuK_1976 CbuK_1977     FALSE 0.036 176.000 0.000 NA   NA
 5613332 5613333 CbuK_1977 CbuK_1978   visC.1 FALSE 0.078 91.000 0.000 NA   NA
 5613333 5613334 CbuK_1978 CbuK_1979 visC.1 visC.2 TRUE 0.998 -13.000 0.474 0.001 Y NA
 5613335 5613336 CbuK_1980 CbuK_1981     FALSE 0.110 58.000 0.000 NA   NA
 5613338 5613339 CbuK_1983 CbuK_1984     FALSE 0.042 159.000 0.000 NA   NA
 5613340 5613341 CbuK_1985 CbuK_1986     FALSE 0.070 105.000 0.000 NA   NA
 5613341 5613342 CbuK_1986 CbuK_1987   hemH FALSE 0.073 99.000 0.000 NA   NA
 5613343 5613344 CbuK_1988 CbuK_1989     FALSE 0.068 110.000 0.000 NA   NA
 5613345 5613346 CbuK_1990 CbuK_1991     FALSE 0.373 48.000 0.000 1.000 N NA
 5613346 5613347 CbuK_1991 CbuK_1992     TRUE 0.998 -10.000 0.671 0.071 N NA
 5613347 5613348 CbuK_1992 CbuK_1993     TRUE 0.913 -16.000 0.000 1.000 Y NA
 5613348 5613349 CbuK_1993 CbuK_1994     FALSE 0.147 36.000 0.000 NA   NA
 5613349 5613350 CbuK_1994 CbuK_1995     FALSE 0.031 193.000 0.000 NA   NA
 5613350 5613351 CbuK_1995 CbuK_1996     FALSE 0.203 25.000 0.000 NA   NA
 5613352 5613353 CbuK_1997 CbuK_1998 enhA.5   FALSE 0.094 70.000 0.000 NA   NA
 5613353 5613354 CbuK_1998 CbuK_1999   ubiA TRUE 0.996 -7.000 0.248 NA Y NA
 5613354 5613355 CbuK_1999 CbuK_2000 ubiA   FALSE 0.236 112.000 0.000 1.000 N NA
 5613355 5613356 CbuK_2000 CbuK_2001     FALSE 0.121 48.000 0.000 NA   NA
 5613356 5613357 CbuK_2001 CbuK_2002     FALSE 0.081 86.000 0.000 NA   NA
 5613357 5613358 CbuK_2002 CbuK_2003     FALSE 0.051 142.000 0.000 NA   NA
 5613358 5613359 CbuK_2003 CbuK_2004     FALSE 0.259 21.000 0.000 NA   NA
 5613361 5613362 CbuK_2006 CbuK_2007 parE   FALSE 0.116 189.000 0.000 NA N NA
 5613362 5613363 CbuK_2007 CbuK_2008     FALSE 0.117 51.000 0.000 NA   NA
 5613364 5613365 CbuK_2009 CbuK_2010     FALSE 0.285 209.000 0.034 NA   NA
 5613365 5613366 CbuK_2010 CbuK_2011     TRUE 0.965 -3.000 0.053 NA   NA
 5613370 5613371 CbuK_2015 CbuK_2016 hemK prfA TRUE 0.997 3.000 0.229 0.032 Y NA
 5613371 5613372 CbuK_2016 CbuK_2017 prfA hemA TRUE 0.992 -3.000 0.171 0.032 N NA
 5613374 5613375 CbuK_2019 CbuK_2020 folB dksA FALSE 0.382 44.000 0.000 1.000 N NA
 5613375 5613376 CbuK_2020 CbuK_2021 dksA dapF FALSE 0.187 142.000 0.000 1.000 N NA
 5613376 5613377 CbuK_2021 CbuK_2022 dapF   TRUE 0.559 -10.000 0.000 NA   NA
 5613377 5613378 CbuK_2022 CbuK_2023     FALSE 0.029 201.000 0.000 NA   NA
 5613378 5613379 CbuK_2023 CbuK_2024     FALSE 0.356 15.000 0.000 NA   NA
 5613380 5613381 CbuK_2025 CbuK_2026     TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5613382 5613383 CbuK_2027 CbuK_2029     TRUE 0.997 6.000 0.642 NA   NA
 5613384 5613385 CbuK_2028 CbuK_2030 ostA   TRUE 0.965 6.000 0.014 1.000 N NA
 5613385 5613386 CbuK_2030 CbuK_2031   pdxA TRUE 0.998 0.000 0.561 1.000 N NA
 5613386 5613387 CbuK_2031 CbuK_2032 pdxA ksgA TRUE 0.755 185.000 0.197 1.000 N NA
 5613387 5613388 CbuK_2032 CbuK_2033 ksgA uspA.2 FALSE 0.234 113.000 0.000 1.000 N NA
 5613388 5613389 CbuK_2033 CbuK_2034 uspA.2   FALSE 0.039 169.000 0.000 NA   NA
 5613389 5613390 CbuK_2034 CbuK_2035     FALSE 0.124 45.000 0.000 NA   NA
 5613390 5613391 CbuK_2035 CbuK_2036   sppA FALSE 0.121 64.000 0.000 1.000   NA
 5613391 5613392 CbuK_2036 CbuK_2037 sppA apaH FALSE 0.452 13.000 0.000 1.000   NA
 5613392 5613393 CbuK_2037 CbuK_2038 apaH   FALSE 0.046 149.000 0.000 NA   NA
 5613393 5613394 CbuK_2038 CbuK_2039     FALSE 0.081 85.000 0.000 NA   NA
 5613396 5613397 CbuK_2041 CbuK_2042 relB   TRUE 0.962 0.000 0.042 NA   NA
 5613398 5613399 CbuK_2043 CbuK_2044 folA   TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5613401 5613402 CbuK_2046 CbuK_2047   fmt TRUE 0.748 13.000 0.000 1.000 N NA
 5613403 5613404 CbuK_2048 CbuK_2049     TRUE 0.980 -3.000 0.124 NA   NA
 5613404 5613405 CbuK_2049 CbuK_2050   topA TRUE 0.960 3.000 0.040 NA   NA
 5613407 5613408 CbuK_2052 CbuK_2053 purE   TRUE 0.973 3.000 0.023 NA N NA
 5613408 5613409 CbuK_2053 CbuK_2054     FALSE 0.010 443.000 0.000 NA   NA
 5613410 5613411 CbuK_2055 CbuK_2056     TRUE 0.841 8.000 0.000 1.000 N NA
 5613411 5613412 CbuK_2056 CbuK_2057     TRUE 0.933 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5613412 5613413 CbuK_2057 CbuK_2058     FALSE 0.120 49.000 0.000 NA   NA
 5613414 5613415 CbuK_2059 CbuK_2060 argS   TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5613415 5613416 CbuK_2060 CbuK_2061     TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5613416 5613417 CbuK_2061 CbuK_2062   hslV FALSE 0.032 191.000 0.000 NA   NA
 5613417 5613418 CbuK_2062 CbuK_2063 hslV hslU TRUE 0.995 25.000 0.752 1.000 Y NA
 5613422 5613423 CbuK_2067 CbuK_2068   ubiE FALSE 0.084 80.000 0.000 NA   NA
 5613423 5613424 CbuK_2068 CbuK_2069 ubiE   TRUE 0.984 0.000 0.145 1.000   NA
 5613424 5613425 CbuK_2069 CbuK_2070   ubiB TRUE 0.996 -3.000 0.432 1.000   NA
 5613426 5613427 CbuK_2071 CbuK_2072     FALSE 0.105 62.000 0.000 NA   NA
 5613427 5613428 CbuK_2072 CbuK_2073     FALSE 0.120 49.000 0.000 NA   NA
 5613428 5613429 CbuK_2073 CbuK_2074     TRUE 0.966 7.000 0.074 NA   NA
 5613430 5613431 CbuK_2075 CbuK_2076   metC FALSE 0.476 79.000 0.000 0.009 Y NA
 5613432 5613433 CbuK_2077 CbuK_2078     FALSE 0.021 242.000 0.000 NA   NA
 5613433 5613434 CbuK_2078 CbuK_2079     FALSE 0.120 49.000 0.000 NA   NA
 5613434 5613435 CbuK_2079 CbuK_2080     FALSE 0.027 209.000 0.000 NA   NA
 5613435 5613436 CbuK_2080 CbuK_2081     FALSE 0.077 94.000 0.000 NA   NA
 5613437 5613438 CbuK_2082 CbuK_2083 metK ahcY TRUE 0.993 2.000 0.114 0.001 Y NA
 5613438 5613439 CbuK_2083 CbuK_2084 ahcY   FALSE 0.191 27.000 0.000 NA   NA
 5613439 5613440 CbuK_2084 CbuK_2085     FALSE 0.042 159.000 0.000 NA   NA
 5613442 5613443 CbuK_2086 CbuK_2088     TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5613443 5613444 CbuK_2088 CbuK_2089     TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5613444 5613445 CbuK_2089 CbuK_2090     FALSE 0.196 26.000 0.000 NA   NA
 5613445 5613446 CbuK_2090 CbuK_2091     FALSE 0.509 -28.000 0.000 NA   NA
 5613446 5613447 CbuK_2091 CbuK_2092     FALSE 0.104 63.000 0.000 NA   NA
 5613447 5613448 CbuK_2092 CbuK_2093     FALSE 0.067 112.000 0.000 NA   NA
 5613449 5613450 CbuK_2094 CbuK_2095 metF metE TRUE 0.937 18.000 0.009 0.001 Y NA
 5613450 5613451 CbuK_2095 CbuK_2096 metE trpS FALSE 0.127 185.000 0.000 1.000 N NA
 5613451 5613452 CbuK_2096 CbuK_2097 trpS   FALSE 0.166 32.000 0.000 NA   NA
 5613452 5613453 CbuK_2097 CbuK_2098     FALSE 0.060 127.000 0.000 NA   NA
 5613453 5613454 CbuK_2098 CbuK_2099     FALSE 0.103 64.000 0.000 NA   NA
 5613455 5613456 CbuK_2100 CbuK_2101 uvrD   TRUE 0.869 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5613457 5613458 CbuK_2102 CbuK_2103     FALSE 0.034 182.000 0.000 NA   NA
 5613458 5613459 CbuK_2103 CbuK_2104     FALSE 0.010 418.000 0.000 NA   NA
 5613459 5613460 CbuK_2104 CbuK_2105     FALSE 0.035 178.000 0.000 NA   NA
 5613460 5613461 CbuK_2105 CbuK_2106     FALSE 0.053 138.000 0.000 NA   NA
 5613463 5613464 CbuK_2108 CbuK_2109     FALSE 0.523 -19.000 0.000 NA   NA
 5613464 5613465 CbuK_2109 CbuK_2110     FALSE 0.444 12.000 0.000 NA   NA
 5613465 5613466 CbuK_2110 CbuK_2111     TRUE 0.999 -19.000 1.000 NA Y NA
 5613466 5613467 CbuK_2111 CbuK_2112   tdk FALSE 0.431 141.000 0.004 NA N NA
 5613467 5613468 CbuK_2112 CbuK_2113 tdk   TRUE 0.680 17.000 0.000 1.000 N NA
 5613469 5613470 CbuK_2114 CbuK_2115     FALSE 0.076 95.000 0.000 NA   NA
 5613472 5613473 CbuK_2117 CbuK_2118     FALSE 0.147 36.000 0.000 NA   NA
 5613473 5613474 CbuK_2118 CbuK_2119   hemC TRUE 0.833 -16.000 0.000 1.000 N NA
 5613474 5613475 CbuK_2119 CbuK_2120 hemC aroD TRUE 0.872 0.000 0.000 1.000 N NA
 5613475 5613476 CbuK_2120 CbuK_2121 aroD   TRUE 0.564 10.000 0.000 1.000   NA
 5613476 5613477 CbuK_2121 CbuK_2122   hemD TRUE 0.604 -10.000 0.000 1.000   NA
 5613477 5613478 CbuK_2122 CbuK_2123 hemD   FALSE 0.085 79.000 0.000 NA   NA
 5613479 5613480 CbuK_2124 CbuK_2125     FALSE 0.094 70.000 0.000 NA   NA
 5613481 5613482 CbuK_2126 CbuK_2127     FALSE 0.083 81.000 0.000 NA   NA
 5613482 5613483 CbuK_2127 CbuK_2128   hemY TRUE 0.999 5.000 0.765 1.000 Y NA
 5613483 5613484 CbuK_2128 CbuK_2129 hemY   TRUE 0.862 3.000 0.000 NA N NA
 5613484 5613485 CbuK_2129 CbuK_2130   queC FALSE 0.312 18.000 0.000 NA   NA
 5613485 5613486 CbuK_2130 CbuK_2131 queC   FALSE 0.385 16.000 0.000 1.000   NA
 5613488 5613489 CbuK_2133 CbuK_2134     FALSE 0.029 200.000 0.000 NA   NA
 5613490 5613491 CbuK_2135 CbuK_2136 rho trx.2 FALSE 0.494 176.000 0.087 1.000   NA
 5613492 5613493 CbuK_2137 CbuK_2138     FALSE 0.277 20.000 0.000 NA   NA
 5613494 5613495 CbuK_2139 CbuK_2140   proC TRUE 0.984 -3.000 0.152 1.000   NA
 5613495 5613496 CbuK_2140 CbuK_2141 proC   TRUE 0.983 -3.000 0.158 NA   NA
 5613496 5613497 CbuK_2141 CbuK_2142   pckA TRUE 0.559 -10.000 0.000 NA   NA
 5613498 5613499 CbuK_2143 CbuK_2144 algH   TRUE 0.994 -7.000 0.263 NA N NA
 5613499 5613500 CbuK_2144 CbuK_2145   pyrB TRUE 0.969 -7.000 0.022 1.000 N NA
 5613500 5611357 CbuK_2145 CbuK_0001 pyrB   FALSE 0.099 222.000 0.000 1.000 N NA
 5611313 5611314 CbuK_A0001 CbuK_A0002     FALSE 0.057 131.000 0.000 NA   NA
 5611314 5611315 CbuK_A0002 CbuK_A0003     FALSE 0.040 166.000 0.000 NA   NA
 5611315 5611316 CbuK_A0003 CbuK_A0004     FALSE 0.014 307.000 0.000 NA   NA
 5611317 5611318 CbuK_A0005 CbuK_A0006     FALSE 0.048 145.000 0.000 NA   NA
 5611318 5611319 CbuK_A0006 CbuK_A0007     FALSE 0.014 308.000 0.000 NA   NA
 5611320 5611321 CbuK_A0008 CbuK_A0009     FALSE 0.046 183.000 0.000 0.043   NA
 5611321 5611322 CbuK_A0009 CbuK_A0010     FALSE 0.013 317.000 0.000 NA   NA
 5611324 5611325 CbuK_A0012 CbuK_A0013     FALSE 0.054 137.000 0.000 NA   NA
 5611325 5611326 CbuK_A0013 CbuK_A0014     FALSE 0.117 51.000 0.000 NA   NA
 5611326 5611327 CbuK_A0014 CbuK_A0015     FALSE 0.090 73.000 0.000 NA   NA
 5611331 5611332 CbuK_A0019 CbuK_A0020     FALSE 0.108 60.000 0.000 NA   NA
 5611339 5611340 CbuK_A0027 CbuK_A0028     TRUE 0.576 -7.000 0.000 NA   NA
 5611342 5611343 CbuK_A0030 CbuK_A0031     TRUE 0.996 0.000 0.500 NA   NA
 5611343 5611344 CbuK_A0031 CbuK_A0032     FALSE 0.080 87.000 0.000 NA   NA
 5611344 5611345 CbuK_A0032 CbuK_A0033     TRUE 0.605 -3.000 0.000 NA   NA
 5611346 5611347 CbuK_A0034 CbuK_A0035     TRUE 0.925 -10.000 0.012 NA   NA
 5611347 5611348 CbuK_A0035 CbuK_A0036     FALSE 0.031 195.000 0.000 NA   NA
 5611349 5611350 CbuK_A0037 CbuK_A0038     FALSE 0.096 69.000 0.000 NA   NA
 5611350 5611351 CbuK_A0038 CbuK_A0039   parB FALSE 0.025 242.000 0.000 1.000   NA
 5611352 5611353 CbuK_A0040 CbuK_A0041     FALSE 0.135 40.000 0.000 NA   NA
 5611353 5611354 CbuK_A0041 CbuK_A0042     TRUE 0.997 -7.000 0.444 1.000 N NA
 5611354 5611355 CbuK_A0042 CbuK_A0043     TRUE 0.889 28.000 0.133 1.000   NA