MicrobesOnline Operon Predictions for Coxiella burnetii Dugway 5J108-111

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
3714367	3714368	COXBU7E912_0001	COXBU7E912_0002	dnaA	dnaN	TRUE	0.909	144.000	0.328	1.000	Y	NA
3714368	3714369	COXBU7E912_0002	COXBU7E912_0003	dnaN	recF	TRUE	0.997	5.000	0.318	1.000	Y	NA
3714369	3714371	COXBU7E912_0003	CBUD_0005	recF	gyrB	TRUE	0.636	296.000	0.249	0.009	Y	NA
3714371	5608750	CBUD_0005	CBUD_0005a	gyrB		FALSE	0.063	153.000	0.000	NA		NA
5608750	5608751	CBUD_0005a	CBUD_0005b			TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
3714373	3714374	COXBU7E912_0006	COXBU7E912_0008			FALSE	0.092	108.000	0.000	NA		NA
3714374	3714375	COXBU7E912_0008	COXBU7E912_0009			FALSE	0.072	141.000	0.000	NA		NA
3714375	5608752	COXBU7E912_0009	CBUD_0010			FALSE	0.075	136.000	0.000	NA		NA
5608752	5608753	CBUD_0010	CBUD_0011			FALSE	0.080	63.000	0.000	NA		NA
5608753	5608754	CBUD_0011	CBUD_0011a			FALSE	0.017	329.000	0.000	NA		NA
5608754	5608755	CBUD_0011a	CBUD_0011b			FALSE	0.137	36.000	0.000	NA		NA
3714379	3714380	COXBU7E912_0013	CBUD_0014	glmS		TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
3714380	5608756	CBUD_0014	CBUD_0014a			FALSE	0.060	157.000	0.000	NA		NA
5608757	5608758	CBUD_0016	CBUD_0018			FALSE	0.089	50.000	0.000	NA		NA
5608758	3714386	CBUD_0018	CBUD_0020			FALSE	0.010	1319.000	0.000	NA		NA
3714388	3714389	COXBU7E912_0022	CBUD_0023			FALSE	0.360	-76.000	0.000	1.000	N	NA
3714389	3714390	CBUD_0023	COXBU7E912_0024			FALSE	0.172	129.000	0.000	1.000	N	NA
3714390	3714391	COXBU7E912_0024	COXBU7E912_0025			FALSE	0.080	73.000	0.000	NA		NA
3714391	3714392	COXBU7E912_0025	COXBU7E912_0026			FALSE	0.089	50.000	0.000	NA		NA
3714392	3714393	COXBU7E912_0026	CBUD_0027			FALSE	0.094	83.000	0.000	NA		NA
3714394	3714395	COXBU7E912_0028	COXBU7E912_0029			TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
3714395	3714396	COXBU7E912_0029	CBUD_0030			TRUE	0.651	9.000	0.000	NA		NA
3714396	3714397	CBUD_0030	COXBU7E912_0031			FALSE	0.273	24.000	0.000	NA		NA
3714398	3714399	CBUD_0032	COXBU7E912_0033			FALSE	0.365	19.000	0.000	NA		NA
3714399	3714400	COXBU7E912_0033	COXBU7E912_0034			TRUE	0.829	14.000	0.000	0.022	Y	NA
3714401	3714402	COXBU7E912_0035	COXBU7E912_0036			FALSE	0.013	441.000	0.000	NA		NA
3714402	3714403	COXBU7E912_0036	COXBU7E912_0037			FALSE	0.039	205.000	0.000	NA		NA
3714403	3714404	COXBU7E912_0037	COXBU7E912_0038			TRUE	0.979	11.000	0.044	1.000	Y	NA
3714404	3714405	COXBU7E912_0038	COXBU7E912_0039			TRUE	0.977	-7.000	0.044	1.000	N	NA
3714405	3714406	COXBU7E912_0039	COXBU7E912_0040			TRUE	0.952	3.000	0.000	1.000	Y	NA
3714407	3714408	CBUD_0041	COXBU7E912_0042	pdxB		FALSE	0.420	-19.000	0.000	NA		NA
3714408	3714409	COXBU7E912_0042	COXBU7E912_0043			FALSE	0.131	37.000	0.000	NA		NA
3714411	3714412	COXBU7E912_0045	CBUD_0046	efp		TRUE	0.918	-61.000	0.082	0.060	Y	NA
3714412	3714413	CBUD_0046	COXBU7E912_0047			FALSE	0.034	222.000	0.000	NA		NA
3714413	3714414	COXBU7E912_0047	CBUD_0048			FALSE	0.084	53.000	0.000	NA		NA
3714415	3714416	CBUD_0049	COXBU7E912_0050			TRUE	0.641	-9.000	0.000	NA		NA
3714416	5608759	COXBU7E912_0050	CBUD_0050a			FALSE	0.088	116.000	0.000	NA		NA
5608759	5608760	CBUD_0050a	CBUD_0050b			FALSE	0.238	26.000	0.000	NA		NA
3714424	3714425	COXBU7E912_0058	COXBU7E912_0059	lolB		FALSE	0.088	79.000	0.000	NA		NA
3714425	3714426	COXBU7E912_0059	COXBU7E912_0060		prs	FALSE	0.308	22.000	0.000	NA		NA
3714426	3714427	COXBU7E912_0060	COXBU7E912_0062	prs		TRUE	0.725	5.000	0.000	NA		NA
3714431	3714432	COXBU7E912_0065	COXBU7E912_0066			TRUE	0.994	2.000	0.200	NA	N	NA
3714432	3714433	COXBU7E912_0066	CBUD_0067			TRUE	0.714	14.000	0.000	NA	N	NA
3714433	3714434	CBUD_0067	COXBU7E912_0068		rfbC	TRUE	0.959	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
3714434	3714435	COXBU7E912_0068	CBUD_0069	rfbC		TRUE	0.563	10.000	0.000	1.000		NA
3714436	3714437	COXBU7E912_0070	COXBU7E912_0071		pth	TRUE	0.998	7.000	0.496	0.055	Y	NA
3714437	3714438	COXBU7E912_0071	CBUD_0072	pth	ychF	TRUE	0.932	33.000	0.184	1.000	Y	NA
3714438	3714439	CBUD_0072	CBUD_0073	ychF		TRUE	0.746	4.000	0.000	NA		NA
3714439	3714440	CBUD_0073	COXBU7E912_0074			FALSE	0.081	66.000	0.000	NA		NA
3714440	5608763	COXBU7E912_0074	CBUD_0073a			FALSE	0.066	149.000	0.000	NA		NA
5608763	3714441	CBUD_0073a	COXBU7E912_0075			FALSE	0.086	120.000	0.000	NA		NA
3714441	3714442	COXBU7E912_0075	COXBU7E912_0076			FALSE	0.095	102.000	0.000	NA		NA
3714443	3714444	CBUD_0077	COXBU7E912_0078			TRUE	0.532	-13.000	0.000	NA		NA
3714445	5608764	CBUD_0079	CBUD_0079a			FALSE	0.081	69.000	0.000	NA		NA
3714447	3714448	CBUD_0081	COXBU7E912_0082			FALSE	0.121	39.000	0.000	NA		NA
3714448	3714449	COXBU7E912_0082	CBUD_0083			FALSE	0.083	54.000	0.000	NA		NA
3714450	3714451	COXBU7E912_0084	COXBU7E912_0086			TRUE	0.687	-7.000	0.000	NA		NA
3714452	5608765	COXBU7E912_0085	CBUD_0086b			FALSE	0.065	151.000	0.000	NA		NA
5608765	3714454	CBUD_0086b	CBUD_0088		pilF	FALSE	0.014	394.000	0.000	NA		NA
3714454	3714455	CBUD_0088	CBUD_0089	pilF		FALSE	0.188	27.000	0.000	1.000		NA
3714455	3714456	CBUD_0089	COXBU7E912_0090			FALSE	0.073	49.000	0.000	1.000		NA
3714456	5608766	COXBU7E912_0090	CBUD_0090a		oppC	FALSE	0.084	122.000	0.000	NA		NA
5608766	5608767	CBUD_0090a	CBUD_0090b	oppC	oppC	FALSE	0.093	48.000	0.000	NA		NA
5608767	3714458	CBUD_0090b	COXBU7E912_0092	oppC		TRUE	0.582	11.000	0.000	NA		NA
3714458	3714459	COXBU7E912_0092	COXBU7E912_0093			TRUE	0.987	25.000	0.619	0.035	Y	NA
3714461	5608768	COXBU7E912_0094	CBUD_0095a			FALSE	0.023	262.000	0.000	NA		NA
5608768	3714462	CBUD_0095a	CBUD_0096			FALSE	0.325	21.000	0.000	NA		NA
3714462	3714463	CBUD_0096	CBUD_0097		parC	TRUE	0.767	3.000	0.000	NA		NA
3714465	3714467	COXBU7E912_0100	COXBU7E912_0102			FALSE	0.020	287.000	0.000	NA		NA
3714468	3714469	COXBU7E912_0101	CBUD_0103	pabA	rpe	TRUE	0.637	-19.000	0.000	1.000	N	NA
3714469	3714470	CBUD_0103	CBUD_0104	rpe	mucZ	TRUE	0.975	0.000	0.003	1.000	N	NA
3714471	3714472	COXBU7E912_0105	COXBU7E912_0106	gshA	gshB	TRUE	0.640	54.000	0.120	1.000		NA
3714472	3714473	COXBU7E912_0106	COXBU7E912_0108	gshB		FALSE	0.014	407.000	0.000	NA		NA
3714474	3714475	COXBU7E912_0107	CBUD_0109			FALSE	0.068	145.000	0.000	NA		NA
3714476	3714477	CBUD_0110	COXBU7E912_0112	def2		TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
3714479	3714480	COXBU7E912_0113	COXBU7E912_0114	hemL		TRUE	0.959	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
3714480	3714481	COXBU7E912_0114	COXBU7E912_0115			TRUE	0.767	3.000	0.000	NA		NA
3714483	3714484	COXBU7E912_0117	COXBU7E912_0118		ponA	TRUE	0.621	10.000	0.000	NA		NA
3714485	3714486	COXBU7E912_0119	CBUD_0120		pilN	FALSE	0.016	357.000	0.000	NA		NA
3714486	3714488	CBUD_0120	CBUD_0122	pilN		FALSE	0.280	-37.000	0.000	NA		NA
3714488	5608771	CBUD_0122	CBUD_0122a		pilQ	FALSE	0.420	-19.000	0.000	NA		NA
5608771	5608772	CBUD_0122a	CBUD_0122b	pilQ	pilQ	FALSE	0.080	65.000	0.000	NA		NA
5608772	5608773	CBUD_0122b	CBUD_0122c	pilQ	pilQ	FALSE	0.081	75.000	0.000	NA		NA
5608773	3714490	CBUD_0122c	COXBU7E912_0124	pilQ	aroK	FALSE	0.202	-67.000	0.000	NA		NA
3714490	3714491	COXBU7E912_0124	COXBU7E912_0125	aroK	aroB	TRUE	0.997	-3.000	0.208	1.000	Y	NA
5608774	5608775	CBUD_0125a	CBUD_0125b			FALSE	0.292	23.000	0.000	NA		NA
3714493	3714496	CBUD_0127	COXBU7E912_0130			FALSE	0.016	334.000	0.000	NA		NA
3714496	3714497	COXBU7E912_0130	COXBU7E912_0131			TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
5608776	3714499	CBUD_0131a	COXBU7E912_0133			FALSE	0.095	102.000	0.000	NA		NA
3714499	3714500	COXBU7E912_0133	COXBU7E912_0134		dacB	TRUE	0.800	0.000	0.000	NA		NA
3714500	3714501	COXBU7E912_0134	COXBU7E912_0135	dacB	aroE	TRUE	0.842	-7.000	0.000	1.000	N	NA
3714501	5608777	COXBU7E912_0135	CBUD_0135a	aroE		FALSE	0.099	90.000	0.000	NA		NA
3714502	3714503	CBUD_0136	COXBU7E912_0137			FALSE	0.023	265.000	0.000	NA		NA
3714504	3714505	CBUD_0138	COXBU7E912_0139		xapA	TRUE	0.906	2.000	0.000	NA	N	NA
3714505	3714506	COXBU7E912_0139	COXBU7E912_0140	xapA	deoC	TRUE	0.994	-3.000	0.083	1.000	Y	NA
3714506	3714507	COXBU7E912_0140	COXBU7E912_0141	deoC		FALSE	0.095	84.000	0.000	NA		NA
5608778	3714508	CBUD_0141a	CBUD_0142			TRUE	0.666	8.000	0.000	NA		NA
3714509	3714510	CBUD_0143	COXBU7E912_0144			FALSE	0.029	238.000	0.000	NA		NA
3714511	3714512	CBUD_0145	COXBU7E912_0146		csrA2	FALSE	0.080	128.000	0.000	NA		NA
3714512	5608779	COXBU7E912_0146	CBUD_0146a	csrA2		FALSE	0.098	96.000	0.000	NA		NA
5608779	3714513	CBUD_0146a	COXBU7E912_0147		rpiA	FALSE	0.067	147.000	0.000	NA		NA
3714513	3714514	COXBU7E912_0147	COXBU7E912_0148	rpiA		FALSE	0.156	142.000	0.000	1.000	N	NA
3714514	5608780	COXBU7E912_0148	CBUD_0148a			TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
5608780	5608781	CBUD_0148a	CBUD_0148b			FALSE	0.156	-133.000	0.000	NA		NA
5608781	5608782	CBUD_0148b	CBUD_0148c			TRUE	0.641	-9.000	0.000	NA		NA
5608782	5608783	CBUD_0148c	CBUD_0148d			FALSE	0.064	152.000	0.000	NA		NA
5608783	3714517	CBUD_0148d	COXBU7E912_0151			FALSE	0.254	-43.000	0.000	NA		NA
3714517	3714518	COXBU7E912_0151	COXBU7E912_0152			FALSE	0.078	99.000	0.000	1.000		NA
3714519	3714520	COXBU7E912_0153	COXBU7E912_0154			TRUE	0.961	4.000	0.014	1.000		NA
3714520	3714521	COXBU7E912_0154	COXBU7E912_0155			TRUE	0.963	23.000	0.405	1.000		NA
3714521	3714522	COXBU7E912_0155	COXBU7E912_0156			TRUE	0.999	-3.000	0.852	NA	Y	NA
3714522	3714523	COXBU7E912_0156	COXBU7E912_0157			TRUE	0.985	4.000	0.009	NA	Y	NA
3714523	3714524	COXBU7E912_0157	COXBU7E912_0158			TRUE	0.545	180.000	0.009	NA	Y	NA
3714524	3714525	COXBU7E912_0158	COXBU7E912_0159		prlC	FALSE	0.215	81.000	0.000	NA	N	NA
5608785	5608786	CBUD_0159a	CBUD_0159b			TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
5608787	5608788	CBUD_0160a	CBUD_0160c			FALSE	0.121	39.000	0.000	NA		NA
5608789	5608790	CBUD_0160b	CBUD_0160d			FALSE	0.081	68.000	0.000	NA		NA
5608790	5608791	CBUD_0160d	CBUD_0160e			FALSE	0.095	84.000	0.000	NA		NA
5608791	3714530	CBUD_0160e	COXBU7E912_0164		pntB	FALSE	0.227	27.000	0.000	NA		NA
3714530	3714531	COXBU7E912_0164	COXBU7E912_0165	pntB	pntAB	TRUE	0.995	-3.000	0.321	0.002		NA
3714531	3714532	COXBU7E912_0165	CBUD_0166	pntAB	pntAA	TRUE	0.603	383.000	0.829	0.002		NA
3714533	3714534	COXBU7E912_0167	COXBU7E912_0169			FALSE	0.029	238.000	0.000	NA		NA
3714535	3714536	COXBU7E912_0168	COXBU7E912_0170			FALSE	0.081	66.000	0.000	NA		NA
3714538	5608792	COXBU7E912_0172	CBUD_0172a			FALSE	0.080	128.000	0.000	NA		NA
5608792	5608793	CBUD_0172a	CBUD_0172b			FALSE	0.097	47.000	0.000	NA		NA
5608793	3714539	CBUD_0172b	COXBU7E912_0173		glmU	FALSE	0.023	267.000	0.000	NA		NA
3714539	3714540	COXBU7E912_0173	COXBU7E912_0174	glmU	atpC	TRUE	0.927	19.000	0.067	1.000	N	NA
3714540	3714542	COXBU7E912_0174	CBUD_0176	atpC	atpD	TRUE	0.959	124.000	0.837	0.007	Y	NA
3714542	3714543	CBUD_0176	COXBU7E912_0177	atpD	atpG	TRUE	0.974	36.000	0.724	0.007	Y	NA
3714543	3714544	COXBU7E912_0177	COXBU7E912_0178	atpG	atpA	TRUE	0.966	99.000	0.846	0.007	Y	NA
3714544	3714545	COXBU7E912_0178	COXBU7E912_0179	atpA	atpH	TRUE	0.998	8.000	0.864	0.007	Y	NA
3714545	3714546	COXBU7E912_0179	COXBU7E912_0180	atpH	atpF	TRUE	0.997	0.000	0.242	0.007	Y	NA
3714546	3714547	COXBU7E912_0180	COXBU7E912_0181	atpF	atpE	TRUE	0.883	129.000	0.666	0.007		NA
3714547	3714548	COXBU7E912_0181	COXBU7E912_0182	atpE	atpB	TRUE	0.979	18.000	0.557	0.007		NA
3714548	3714549	COXBU7E912_0182	CBUD_0183	atpB	atpI	TRUE	0.997	1.000	0.291	0.007	Y	NA
3714550	3714551	COXBU7E912_0184	CBUD_0185			FALSE	0.098	95.000	0.000	NA		NA
5608794	5608795	CBUD_0185a	CBUD_0187		ligD	FALSE	0.080	63.000	0.000	NA		NA
5608795	3714554	CBUD_0187	COXBU7E912_0188	ligD		FALSE	0.080	73.000	0.000	NA		NA
3714554	3714555	COXBU7E912_0188	CBUD_0189			FALSE	0.082	126.000	0.000	NA		NA
3714557	5608796	COXBU7E912_0191	CBUD_0191a			FALSE	0.344	20.000	0.000	NA		NA
5608796	3714558	CBUD_0191a	COXBU7E912_0192			FALSE	0.092	82.000	0.000	NA		NA
3714558	3714559	COXBU7E912_0192	CBUD_0193			FALSE	0.085	52.000	0.000	NA		NA
3714559	3714560	CBUD_0193	CBUD_0194			TRUE	0.758	0.000	0.000	1.000		NA
3714560	3714561	CBUD_0194	CBUD_0195		parB	TRUE	0.799	10.000	0.000	1.000	N	NA
3714561	3714562	CBUD_0195	COXBU7E912_0196	parB		TRUE	0.997	-9.000	0.827	1.000	N	NA
3714562	3714563	COXBU7E912_0196	COXBU7E912_0197		gidB	TRUE	0.995	7.000	0.339	1.000	N	NA
3714563	3714564	COXBU7E912_0197	COXBU7E912_0198	gidB	gidA	TRUE	0.955	32.000	0.466	1.000	N	NA
3714564	5608797	COXBU7E912_0198	CBUD_0198a	gidA		FALSE	0.166	-108.000	0.000	NA		NA
5608797	3714565	CBUD_0198a	CBUD_0199		trmE	FALSE	0.036	212.000	0.000	NA		NA
3714565	5608798	CBUD_0199	CBUD_0199a	trmE		FALSE	0.036	214.000	0.000	NA		NA
5608798	3714567	CBUD_0199a	COXBU7E912_0201		oxaA	FALSE	0.097	47.000	0.000	NA		NA
3714567	3714568	COXBU7E912_0201	CBUD_0202	oxaA		TRUE	0.996	4.000	0.461	NA		NA
3714568	3714569	CBUD_0202	CBUD_0203		rnpA	TRUE	0.932	36.000	0.540	NA		NA
3714569	3714570	CBUD_0203	COXBU7E912_0204	rnpA	rpmH	TRUE	0.998	-3.000	0.787	1.000		NA
3714572	3714573	COXBU7E912_0205	CBUD_0207	sun	glyS	TRUE	0.959	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
3714573	3714574	CBUD_0207	COXBU7E912_0208	glyS	glyQ	TRUE	0.998	-6.000	0.651	0.002	Y	NA
5608799	5608800	CBUD_0208a	CBUD_0208b			FALSE	0.145	35.000	0.000	NA		NA
3714575	3714576	COXBU7E912_0209	COXBU7E912_0210	com1	rpoH	FALSE	0.432	26.000	0.000	1.000	N	NA
3714577	3714578	CBUD_0211	COXBU7E912_0212			FALSE	0.365	19.000	0.000	NA		NA
5608801	3714580	CBUD_0212a	CBUD_0214		ftsX	FALSE	0.073	49.000	0.000	1.000		NA
3714580	3714581	CBUD_0214	COXBU7E912_0215	ftsX	ftsE	TRUE	0.995	-3.000	0.121	1.000	Y	NA
3714581	3714582	COXBU7E912_0215	COXBU7E912_0216	ftsE	ftsY	TRUE	0.985	7.000	0.117	1.000	N	NA
3714583	3714584	CBUD_0217	COXBU7E912_0218			TRUE	0.997	0.000	0.598	0.008		NA
3714584	3714586	COXBU7E912_0218	COXBU7E912_0220			FALSE	0.147	496.000	0.070	1.000		NA
3714590	3714591	CBUD_0224	COXBU7E912_0225	tkt	gap	TRUE	0.957	15.000	0.022	1.000	Y	NA
3714591	3714592	COXBU7E912_0225	CBUD_0226	gap	pgk	TRUE	0.666	72.000	0.017	0.009	Y	NA
3714592	3714593	CBUD_0226	COXBU7E912_0227	pgk	pyk	TRUE	0.948	-13.000	0.002	0.009	Y	NA
3714595	3714596	COXBU7E912_0229	COXBU7E912_0230	fba		FALSE	0.080	63.000	0.000	NA		NA
3714597	3714598	COXBU7E912_0231	CBUD_0232			FALSE	0.053	171.000	0.000	NA		NA
3714599	3714600	COXBU7E912_0233	COXBU7E912_0234			FALSE	0.024	235.000	0.000	1.000		NA
3714600	3714601	COXBU7E912_0234	CBUD_0235			TRUE	0.970	98.000	1.000	1.000	Y	NA
3714601	5608803	CBUD_0235	CBUD_0235a			TRUE	0.708	6.000	0.000	NA		NA
5608803	3714602	CBUD_0235a	COXBU7E912_0236			TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
3714602	3714603	COXBU7E912_0236	COXBU7E912_0237			FALSE	0.080	63.000	0.000	NA		NA
3714603	3714604	COXBU7E912_0237	CBUD_0238		feoA	FALSE	0.080	62.000	0.000	NA		NA
3714604	3714605	CBUD_0238	COXBU7E912_0239	feoA	feoB	TRUE	0.997	1.000	0.229	1.000	Y	NA
3714605	3714606	COXBU7E912_0239	COXBU7E912_0240	feoB		TRUE	0.997	0.000	0.455	NA		NA
3714609	3714610	COXBU7E912_0243	COXBU7E912_0244			FALSE	0.066	54.000	0.000	1.000		NA
5608807	5608808	CBUD_0245a	CBUD_0245b			FALSE	0.081	56.000	0.000	NA		NA
5608809	3714613	CBUD_0245c	COXBU7E912_0247			TRUE	0.621	10.000	0.000	NA		NA
3714614	3714615	COXBU7E912_0248	COXBU7E912_0249			FALSE	0.081	74.000	0.000	NA		NA
3714615	3714616	COXBU7E912_0249	COXBU7E912_0250			FALSE	0.137	36.000	0.000	NA		NA
3714616	3714617	COXBU7E912_0250	COXBU7E912_0251		bph2_2	FALSE	0.092	108.000	0.000	NA		NA
3714617	5608810	COXBU7E912_0251	CBUD_0251a	bph2_2		FALSE	0.333	-28.000	0.000	NA		NA
3714618	3714619	COXBU7E912_0252	COXBU7E912_0253	rplM	rpsI	TRUE	0.992	19.000	0.601	0.031	Y	NA
3714619	3714620	COXBU7E912_0253	CBUD_0254	rpsI	sspA	TRUE	0.753	31.000	0.014	NA	N	NA
3714620	3714621	CBUD_0254	COXBU7E912_0255	sspA	sspB	TRUE	0.995	-10.000	0.831	NA		NA
3714621	3714622	COXBU7E912_0255	COXBU7E912_0256	sspB		FALSE	0.098	88.000	0.000	NA		NA
3714623	3714624	COXBU7E912_0257	COXBU7E912_0258		gmhA	TRUE	0.997	0.000	0.613	NA		NA
3714624	3714625	COXBU7E912_0258	COXBU7E912_0259	gmhA		TRUE	0.991	6.000	0.187	1.000	N	NA
3714625	3714626	COXBU7E912_0259	CBUD_0260			TRUE	0.728	50.000	0.172	NA		NA
5608811	3714628	CBUD_0260a	COXBU7E912_0263			FALSE	0.092	82.000	0.000	NA		NA
3714629	3714630	COXBU7E912_0262	COXBU7E912_0264	ihfB	purN	FALSE	0.206	86.000	0.000	1.000	N	NA
3714630	3714631	COXBU7E912_0264	CBUD_0265	purN	purM	TRUE	0.997	-3.000	0.230	0.003	Y	NA
3714632	3714633	CBUD_0266	CBUD_0267		hda	TRUE	0.881	-66.000	0.174	NA		NA
3714634	3714636	CBUD_0268	COXBU7E912_0270			FALSE	0.070	143.000	0.000	NA		NA
3714636	3714637	COXBU7E912_0270	CBUD_0271			TRUE	0.758	0.000	0.000	1.000		NA
3714638	3714639	CBUD_0272	CBUD_0273		hemF	FALSE	0.080	90.000	0.000	1.000		NA
3714639	3714640	CBUD_0273	COXBU7E912_0274	hemF		TRUE	0.504	35.000	0.000	1.000	Y	NA
3714640	3714641	COXBU7E912_0274	COXBU7E912_0275		arcB	TRUE	0.842	-7.000	0.000	1.000	N	NA
3714642	3714643	COXBU7E912_0276	CBUD_0277	accC	accB	TRUE	0.995	7.000	0.275	0.002	Y	NA
5608812	5608813	CBUD_0279	CBUD_0280			FALSE	0.425	16.000	0.000	NA		NA
5608814	5608815	CBUD_0282	CBUD_0283			FALSE	0.080	58.000	0.000	NA		NA
3714650	3714651	COXBU7E912_0284	CBUD_0285		acnA	TRUE	0.523	11.000	0.000	1.000		NA
3714652	3714653	CBUD_0286	COXBU7E912_0287	groS	groL	TRUE	0.586	28.000	0.000	0.011	Y	NA
3714653	3714655	COXBU7E912_0287	COXBU7E912_0289	groL	gcvT	FALSE	0.174	128.000	0.000	1.000	N	NA
3714655	3714656	COXBU7E912_0289	COXBU7E912_0290	gcvT	gcvH	TRUE	0.994	11.000	0.317	0.002	Y	NA
3714656	3714657	COXBU7E912_0290	COXBU7E912_0291	gcvH	gcvPA	TRUE	0.997	3.000	0.249	1.000	Y	NA
3714657	3714658	COXBU7E912_0291	COXBU7E912_0293	gcvPA	gcvPB	TRUE	0.910	68.000	0.316	0.002	Y	NA
3714660	3714661	COXBU7E912_0294	COXBU7E912_0295			FALSE	0.402	17.000	0.000	NA		NA
3714661	3714662	COXBU7E912_0295	COXBU7E912_0296			FALSE	0.059	159.000	0.000	NA		NA
3714662	3714663	COXBU7E912_0296	COXBU7E912_0297		dapB	TRUE	0.767	3.000	0.000	NA		NA
3714663	3714664	COXBU7E912_0297	COXBU7E912_0298	dapB	sodB	TRUE	0.896	2.000	0.000	1.000	N	NA
5608816	3714665	CBUD_0298a	COXBU7E912_0299			FALSE	0.126	38.000	0.000	NA		NA
3714665	3714666	COXBU7E912_0299	CBUD_0301			FALSE	0.080	58.000	0.000	NA		NA
3714667	3714668	COXBU7E912_0300	CBUD_0302	rnt	pyrC	TRUE	0.962	-13.000	0.068	1.000	N	NA
3714670	3714671	COXBU7E912_0304	CBUD_0306			TRUE	0.746	4.000	0.000	NA		NA
3714672	3714673	COXBU7E912_0305	COXBU7E912_0307	nth		TRUE	0.957	-13.000	0.048	1.000	N	NA
3714673	3714674	COXBU7E912_0307	COXBU7E912_0308		metG	TRUE	0.967	-7.000	0.014	1.000	N	NA
3714676	3714677	COXBU7E912_0310	COXBU7E912_0311			TRUE	0.687	-7.000	0.000	NA		NA
3714678	3714679	COXBU7E912_0312	COXBU7E912_0313		dcd	TRUE	0.991	0.000	0.112	1.000	N	NA
3714679	3714680	COXBU7E912_0313	COXBU7E912_0314	dcd		FALSE	0.050	154.000	0.000	1.000		NA
5608820	5608821	CBUD_0315	CBUD_0316			FALSE	0.178	31.000	0.000	NA		NA
5608821	5608822	CBUD_0316	CBUD_0317			FALSE	0.308	22.000	0.000	NA		NA
5608822	5608823	CBUD_0317	CBUD_0318			FALSE	0.063	153.000	0.000	NA		NA
5608823	3714685	CBUD_0318	COXBU7E912_0319			FALSE	0.099	90.000	0.000	NA		NA
3714685	5608824	COXBU7E912_0319	CBUD_0319a			FALSE	0.095	84.000	0.000	NA		NA
5608825	3714686	CBUD_0319b	COXBU7E912_0320		pyrG	FALSE	0.145	35.000	0.000	NA		NA
3714686	3714687	COXBU7E912_0320	CBUD_0321	pyrG		FALSE	0.114	41.000	0.000	NA		NA
3714688	3714689	CBUD_0322	COXBU7E912_0323		speG	FALSE	0.051	178.000	0.000	NA		NA
3714690	3714691	COXBU7E912_0324	COXBU7E912_0325			FALSE	0.081	70.000	0.000	NA		NA
3714691	3714692	COXBU7E912_0325	CBUD_0326		kdsA	FALSE	0.018	313.000	0.000	NA		NA
3714692	3714693	CBUD_0326	COXBU7E912_0327	kdsA	eno	TRUE	0.672	157.000	0.125	1.000	N	NA
3714693	3714694	COXBU7E912_0327	COXBU7E912_0328	eno	ftsB	TRUE	0.992	7.000	0.241	1.000	N	NA
3714694	3714695	COXBU7E912_0328	COXBU7E912_0329	ftsB	surE	FALSE	0.064	70.000	0.000	1.000		NA
3714695	3714696	COXBU7E912_0329	COXBU7E912_0330	surE		TRUE	0.969	2.000	0.018	1.000		NA
3714696	3714697	COXBU7E912_0330	COXBU7E912_0331		rpoS	TRUE	0.499	80.000	0.027	1.000		NA
3714697	3714698	COXBU7E912_0331	COXBU7E912_0332	rpoS		FALSE	0.033	198.000	0.000	1.000		NA
3714698	3714699	COXBU7E912_0332	COXBU7E912_0334			FALSE	0.118	40.000	0.000	NA		NA
5608826	3714701	CBUD_0333a	CBUD_0335			FALSE	0.080	61.000	0.000	NA		NA
3714701	3714702	CBUD_0335	COXBU7E912_0337		rfaF	TRUE	0.986	4.000	0.138	NA		NA
3714703	3714704	COXBU7E912_0336	CBUD_0338			TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
3714705	3714706	COXBU7E912_0339	COXBU7E912_0340			FALSE	0.457	41.000	0.000	NA	Y	NA
3714706	3714707	COXBU7E912_0340	COXBU7E912_0341			FALSE	0.063	153.000	0.000	NA		NA
3714707	3714708	COXBU7E912_0341	CBUD_0342		hldE	TRUE	0.666	8.000	0.000	NA		NA
5608827	3714709	CBUD_0342a	COXBU7E912_0343			FALSE	0.040	201.000	0.000	NA		NA
3714709	3714710	COXBU7E912_0343	COXBU7E912_0344			FALSE	0.092	82.000	0.000	NA		NA
3714710	3714711	COXBU7E912_0344	COXBU7E912_0345			FALSE	0.425	16.000	0.000	NA		NA
3714711	3714712	COXBU7E912_0345	COXBU7E912_0346		icmW	TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
3714713	3714714	CBUD_0347	CBUD_0348	icmV	dotA	TRUE	0.998	-3.000	0.750	NA		NA
3714714	5608828	CBUD_0348	CBUD_0348a	dotA		FALSE	0.081	55.000	0.000	NA		NA
3714715	3714716	COXBU7E912_0349	COXBU7E912_0350		dotB	TRUE	0.553	7.000	0.000	0.038		NA
3714716	3714717	COXBU7E912_0350	COXBU7E912_0351	dotB	dotC	TRUE	0.903	38.000	0.364	NA		NA
3714717	3714718	COXBU7E912_0351	COXBU7E912_0352	dotC	dotD	TRUE	0.997	3.000	0.667	NA		NA
3714718	3714719	COXBU7E912_0352	COXBU7E912_0353	dotD	icmS	FALSE	0.060	157.000	0.000	NA		NA
3714719	3714720	COXBU7E912_0353	COXBU7E912_0354	icmS	icmT	TRUE	0.996	0.000	0.400	NA		NA
3714720	5608829	COXBU7E912_0354	CBUD_0354a	icmT		TRUE	0.582	11.000	0.000	NA		NA
3714724	3714725	COXBU7E912_0358	COXBU7E912_0359			FALSE	0.090	112.000	0.000	NA		NA
5608831	5608832	CBUD_0361	CBUD_0362			FALSE	0.080	65.000	0.000	NA		NA
3714729	3714730	COXBU7E912_0363	COXBU7E912_0364		icmQ	TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
3714730	3714731	COXBU7E912_0364	COXBU7E912_0365	icmQ	icmP	TRUE	0.997	1.000	0.500	NA		NA
3714731	3714732	COXBU7E912_0365	COXBU7E912_0366	icmP	icmO	TRUE	0.967	-24.000	0.308	NA		NA
3714732	3714733	COXBU7E912_0366	CBUD_0367	icmO	icmN	TRUE	0.563	10.000	0.000	1.000		NA
3714733	3714734	CBUD_0367	COXBU7E912_0368	icmN	icmL2	TRUE	0.687	7.000	0.000	NA		NA
3714734	3714735	COXBU7E912_0368	COXBU7E912_0369	icmL2	icmL1	TRUE	0.779	2.000	0.000	NA		NA
3714735	3714736	COXBU7E912_0369	CBUD_0370	icmL1	icmK	TRUE	0.994	11.000	1.000	NA		NA
3714736	3714737	CBUD_0370	CBUD_0371	icmK	icmE	TRUE	0.979	-13.000	0.250	NA		NA
3714737	3714738	CBUD_0371	COXBU7E912_0372	icmE	icmG	TRUE	0.963	18.000	0.250	NA		NA
3714738	3714739	COXBU7E912_0372	COXBU7E912_0373	icmG	icmC	FALSE	0.080	71.000	0.000	NA		NA
3714739	3714740	COXBU7E912_0373	COXBU7E912_0374	icmC	icmD	FALSE	0.099	94.000	0.000	NA		NA
3714740	3714741	COXBU7E912_0374	CBUD_0375	icmD	icmJ	TRUE	0.515	13.000	0.000	NA		NA
3714741	3714742	CBUD_0375	COXBU7E912_0376	icmJ	icmB	TRUE	0.794	73.000	0.267	NA		NA
3714743	3714744	COXBU7E912_0377	CBUD_0378			FALSE	0.034	218.000	0.000	NA		NA
3714744	5608834	CBUD_0378	CBUD_0378a			FALSE	0.196	-69.000	0.000	NA		NA
5608835	3714745	CBUD_0378b	COXBU7E912_0379			FALSE	0.197	29.000	0.000	NA		NA
3714745	5608836	COXBU7E912_0379	CBUD_0380			FALSE	0.024	259.000	0.000	NA		NA
5608836	5608837	CBUD_0380	CBUD_0381a			FALSE	0.158	33.000	0.000	NA		NA
3714748	3714749	COXBU7E912_0382	COXBU7E912_0383			FALSE	0.016	336.000	0.000	NA		NA
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3714751	3714752	COXBU7E912_0385	COXBU7E912_0386		rimK	TRUE	0.969	3.000	0.023	1.000		NA
3714752	3714753	COXBU7E912_0386	CBUD_0387	rimK		TRUE	0.984	-3.000	0.023	1.000	N	NA
3714755	3714756	COXBU7E912_0389	COXBU7E912_0390			FALSE	0.081	66.000	0.000	NA		NA
5608838	5608839	CBUD_0391	CBUD_0392			FALSE	0.085	52.000	0.000	NA		NA
5608839	3714759	CBUD_0392	COXBU7E912_0393		rpoD	FALSE	0.034	219.000	0.000	NA		NA
3714759	3714760	COXBU7E912_0393	CBUD_0394	rpoD	dnaG	TRUE	0.866	120.000	0.299	1.000	N	NA
3714760	3714761	CBUD_0394	COXBU7E912_0395	dnaG		TRUE	0.739	41.000	0.137	1.000		NA
3714761	3714762	COXBU7E912_0395	CBUD_0396		rpsU	TRUE	0.867	28.000	0.173	0.048		NA
3714762	3714764	CBUD_0396	COXBU7E912_0398	rpsU	nhaP	FALSE	0.081	217.000	0.000	1.000	N	NA
3714765	3714766	COXBU7E912_0399	COXBU7E912_0400		mrpA	FALSE	0.085	121.000	0.000	NA		NA
3714766	3714767	COXBU7E912_0400	COXBU7E912_0401	mrpA	mrpB	TRUE	0.997	-3.000	0.493	NA		NA
3714767	3714768	COXBU7E912_0401	COXBU7E912_0402	mrpB	mrpC	TRUE	0.997	-3.000	0.500	NA		NA
3714768	3714769	COXBU7E912_0402	COXBU7E912_0403	mrpC	mrpD	TRUE	0.999	-3.000	0.896	0.012	Y	NA
3714769	3714770	COXBU7E912_0403	COXBU7E912_0404	mrpD	mrpE	TRUE	0.999	-3.000	0.810	1.000	Y	NA
3714770	3714771	COXBU7E912_0404	COXBU7E912_0405	mrpE	mrpF	TRUE	0.999	-3.000	0.644	0.076	Y	NA
3714771	3714772	COXBU7E912_0405	COXBU7E912_0406	mrpF	mrpG	TRUE	0.998	-7.000	0.614	1.000	Y	NA
5608840	3714773	CBUD_0406a	CBUD_0407			FALSE	0.014	411.000	0.000	NA		NA
3714773	3714774	CBUD_0407	COXBU7E912_0408		wrbA	FALSE	0.179	-84.000	0.000	NA		NA
3714775	3714776	COXBU7E912_0409	COXBU7E912_0411			TRUE	0.721	3.000	0.000	1.000		NA
3714777	3714778	COXBU7E912_0410	COXBU7E912_0412		tolR	FALSE	0.070	143.000	0.000	NA		NA
3714778	3714779	COXBU7E912_0412	COXBU7E912_0413	tolR	tolQ	TRUE	0.992	-22.000	0.556	0.037	Y	NA
3714779	3714780	COXBU7E912_0413	COXBU7E912_0414	tolQ		FALSE	0.158	76.000	0.000	0.037	N	NA
5608841	5608842	CBUD_0414a	CBUD_0414b			FALSE	0.080	72.000	0.000	NA		NA
3714783	3714784	COXBU7E912_0416	COXBU7E912_0418		ruvB	FALSE	0.097	87.000	0.000	NA		NA
3714784	3714785	COXBU7E912_0418	CBUD_0419	ruvB		FALSE	0.091	110.000	0.000	NA		NA
3714785	3714786	CBUD_0419	COXBU7E912_0420		ruvA	FALSE	0.096	100.000	0.000	NA		NA
3714786	3714787	COXBU7E912_0420	COXBU7E912_0421	ruvA	ruvC	TRUE	0.998	-3.000	0.451	0.013	Y	NA
3714787	3714788	COXBU7E912_0421	COXBU7E912_0422	ruvC		TRUE	0.805	77.000	0.277	NA		NA
3714788	3714789	COXBU7E912_0422	CBUD_0423		aspS	TRUE	0.897	16.000	0.039	NA		NA
5608843	5608844	CBUD_0424	CBUD_0424a			TRUE	0.621	10.000	0.000	NA		NA
3714791	5608845	CBUD_0425	CBUD_0425a			FALSE	0.094	83.000	0.000	NA		NA
5608845	5608846	CBUD_0425a	CBUD_0425b			FALSE	0.091	49.000	0.000	NA		NA
5608846	3714793	CBUD_0425b	COXBU7E912_0427			FALSE	0.054	169.000	0.000	NA		NA
3714793	3714794	COXBU7E912_0427	COXBU7E912_0428			TRUE	0.992	-3.000	0.190	NA		NA
3714794	3714796	COXBU7E912_0428	COXBU7E912_0430			FALSE	0.033	227.000	0.000	NA		NA
3714796	5608847	COXBU7E912_0430	CBUD_0430a			FALSE	0.091	110.000	0.000	NA		NA
5608847	5608848	CBUD_0430a	CBUD_0430b			FALSE	0.236	-51.000	0.000	NA		NA
5608849	5608850	CBUD_0433a	CBUD_0433b			FALSE	0.080	72.000	0.000	NA		NA
5608850	3714801	CBUD_0433b	COXBU7E912_0435			FALSE	0.093	106.000	0.000	NA		NA
3714801	3714802	COXBU7E912_0435	COXBU7E912_0436			TRUE	0.950	50.000	0.564	0.001	Y	NA
3714802	5608851	COXBU7E912_0436	CBUD_0436a			FALSE	0.308	22.000	0.000	NA		NA
5608852	5608853	CBUD_0436b	CBUD_0438		nudH	FALSE	0.032	231.000	0.000	NA		NA
5608853	3714805	CBUD_0438	CBUD_0439	nudH	ptsP	FALSE	0.420	-19.000	0.000	NA		NA
3714805	3714806	CBUD_0439	COXBU7E912_0440	ptsP	lgt	TRUE	0.525	55.000	0.011	1.000	N	NA
3714806	3714807	COXBU7E912_0440	COXBU7E912_0441	lgt		TRUE	0.779	2.000	0.000	NA		NA
3714807	3714808	COXBU7E912_0441	CBUD_0442		thyA	FALSE	0.171	-99.000	0.000	NA		NA
5608854	5608855	CBUD_0446a	CBUD_0446b			FALSE	0.152	34.000	0.000	NA		NA
5608855	3714814	CBUD_0446b	CBUD_0448			FALSE	0.227	27.000	0.000	NA		NA
3714814	3714815	CBUD_0448	COXBU7E912_0449			FALSE	0.477	24.000	0.000	1.000	N	NA
3714815	3714816	COXBU7E912_0449	CBUD_0450			TRUE	0.997	-3.000	0.408	0.032	N	NA
3714816	3714817	CBUD_0450	COXBU7E912_0451		gpmI	TRUE	0.991	4.000	0.170	1.000	N	NA
5608856	5608857	CBUD_0455	CBUD_0456			FALSE	0.098	96.000	0.000	NA		NA
5608857	5608858	CBUD_0456	CBUD_0457			FALSE	0.273	24.000	0.000	NA		NA
5608858	3714824	CBUD_0457	COXBU7E912_0459			FALSE	0.081	67.000	0.000	NA		NA
5608859	3714827	CBUD_0460a	COXBU7E912_0461			FALSE	0.084	53.000	0.000	NA		NA
3714829	3714830	CBUD_0463	COXBU7E912_0464		grxC	TRUE	0.990	5.000	0.166	NA	N	NA
3714830	3714831	COXBU7E912_0464	COXBU7E912_0465	grxC	secB	TRUE	0.982	13.000	0.221	1.000	N	NA
3714831	3714832	COXBU7E912_0465	COXBU7E912_0466	secB	gpsA	TRUE	0.496	69.000	0.008	1.000	N	NA
3714833	3714834	COXBU7E912_0467	COXBU7E912_0468			TRUE	0.725	5.000	0.000	NA		NA
3714834	5608860	COXBU7E912_0468	CBUD_0468a			FALSE	0.056	164.000	0.000	NA		NA
5608860	3714836	CBUD_0468a	CBUD_0470			TRUE	0.746	4.000	0.000	NA		NA
3714837	3714838	COXBU7E912_0471	COXBU7E912_0473			TRUE	0.746	4.000	0.000	NA		NA
3714840	3714841	COXBU7E912_0474	COXBU7E912_0475	accA	tilS	TRUE	0.946	-24.000	0.123	1.000	N	NA
3714841	3714842	COXBU7E912_0475	COXBU7E912_0476	tilS		FALSE	0.068	78.000	0.000	1.000		NA
3714842	3714843	COXBU7E912_0476	CBUD_0477			FALSE	0.244	23.000	0.000	1.000		NA
3714843	3714844	CBUD_0477	CBUD_0478			FALSE	0.203	-49.000	0.000	1.000		NA
3714844	3714845	CBUD_0478	CBUD_0479		lepA	FALSE	0.060	136.000	0.000	1.000		NA
3714845	3714846	CBUD_0479	COXBU7E912_0480	lepA	lepB2	TRUE	0.994	-3.000	0.187	1.000	N	NA
3714846	3714847	COXBU7E912_0480	COXBU7E912_0481	lepB2	rnc	TRUE	0.935	21.000	0.117	1.000	N	NA
3714847	3714848	COXBU7E912_0481	COXBU7E912_0482	rnc	era	TRUE	0.987	-3.000	0.127	0.032		NA
3714848	3714849	COXBU7E912_0482	COXBU7E912_0483	era	recO	TRUE	0.986	-3.000	0.109	1.000		NA
3714849	5608861	COXBU7E912_0483	CBUD_0484	recO		FALSE	0.037	209.000	0.000	NA		NA
5608861	5608862	CBUD_0484	CBUD_0485			FALSE	0.319	-30.000	0.000	NA		NA
5608862	3714852	CBUD_0485	COXBU7E912_0486			TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
3714852	3714853	COXBU7E912_0486	CBUD_0487			TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
3714853	3714854	CBUD_0487	CBUD_0488		pdxJ	FALSE	0.093	48.000	0.000	NA		NA
3714855	5608863	COXBU7E912_0489	CBUD_0489a			FALSE	0.045	191.000	0.000	NA		NA
5608863	5608864	CBUD_0489a	CBUD_0489b			FALSE	0.088	79.000	0.000	NA		NA
3714857	3714858	COXBU7E912_0491	COXBU7E912_0493			FALSE	0.028	240.000	0.000	NA		NA
5608867	5608868	CBUD_0500	CBUD_0501			FALSE	0.085	78.000	0.000	NA		NA
5608868	5608869	CBUD_0501	CBUD_0502			FALSE	0.011	506.000	0.000	NA		NA
5608869	5608870	CBUD_0502	CBUD_0503			FALSE	0.350	-25.000	0.000	NA		NA
5608870	3714870	CBUD_0503	CBUD_0504			FALSE	0.100	46.000	0.000	NA		NA
3714870	3714871	CBUD_0504	COXBU7E912_0505			FALSE	0.080	71.000	0.000	NA		NA
3714871	3714872	COXBU7E912_0505	COXBU7E912_0506			FALSE	0.099	89.000	0.000	NA		NA
3714872	3714873	COXBU7E912_0506	CBUD_0507			FALSE	0.126	38.000	0.000	NA		NA
3714873	3714874	CBUD_0507	COXBU7E912_0508		hup	TRUE	0.767	3.000	0.000	NA		NA
3714875	5608871	COXBU7E912_0509	CBUD_0511			TRUE	0.725	5.000	0.000	NA		NA
5608871	5608872	CBUD_0511	CBUD_0510a			FALSE	0.360	-24.000	0.000	NA		NA
3714877	3714878	COXBU7E912_0510	COXBU7E912_0512	tldD		TRUE	0.543	71.000	0.050	NA		NA
3714878	3714879	COXBU7E912_0512	COXBU7E912_0513		mreD	TRUE	0.800	0.000	0.000	NA		NA
3714879	3714880	COXBU7E912_0513	COXBU7E912_0514	mreD	mreC	TRUE	0.998	6.000	0.550	0.005	Y	NA
3714880	3714881	COXBU7E912_0514	COXBU7E912_0515	mreC	mreB	TRUE	0.939	83.000	0.689	1.000	N	NA
3714881	3714882	COXBU7E912_0515	COXBU7E912_0516	mreB		FALSE	0.014	390.000	0.000	NA		NA
5608873	3714883	CBUD_0516a	COXBU7E912_0517		gatC	FALSE	0.066	148.000	0.000	NA		NA
3714883	3714884	COXBU7E912_0517	COXBU7E912_0518	gatC	gatA	TRUE	0.998	4.000	0.643	0.002	Y	NA
3714884	3714885	COXBU7E912_0518	COXBU7E912_0519	gatA	gatB	TRUE	0.998	5.000	0.492	0.002	Y	NA
3714887	3714888	COXBU7E912_0521	CBUD_0522	ahpC	ahpD	TRUE	0.882	19.000	0.058	1.000		NA
3714889	3714890	COXBU7E912_0523	COXBU7E912_0524			FALSE	0.288	-36.000	0.000	NA		NA
3714890	3714891	COXBU7E912_0524	COXBU7E912_0525			TRUE	0.986	-3.000	0.083	NA		NA
3714891	3714892	COXBU7E912_0525	CBUD_0526			FALSE	0.036	214.000	0.000	NA		NA
3714892	3714893	CBUD_0526	COXBU7E912_0527			TRUE	0.998	0.000	0.330	NA	Y	NA
3714895	5608874	CBUD_0528	CBUD_0528a			FALSE	0.252	25.000	0.000	NA		NA
5608874	3714896	CBUD_0528a	CBUD_0530		cysS	FALSE	0.045	191.000	0.000	NA		NA
3714896	3714897	CBUD_0530	COXBU7E912_0531	cysS	gltX1	TRUE	0.979	-9.000	0.021	1.000	Y	NA
3714899	3714900	CBUD_0533	CBUD_0534	higA		TRUE	0.708	6.000	0.000	NA		NA
5608875	5608876	CBUD_0534a	CBUD_0534b			FALSE	0.236	-51.000	0.000	NA		NA
5608876	5608877	CBUD_0534b	CBUD_0534c			FALSE	0.049	181.000	0.000	NA		NA
5608877	5608878	CBUD_0534c	CBUD_0534d			FALSE	0.088	79.000	0.000	NA		NA
5608878	5608879	CBUD_0534d	CBUD_0537			FALSE	0.080	59.000	0.000	NA		NA
5608879	5608880	CBUD_0537	CBUD_0538			FALSE	0.261	-42.000	0.000	NA		NA
5608880	5608881	CBUD_0538	CBUD_0539			FALSE	0.126	38.000	0.000	NA		NA
5608881	3714906	CBUD_0539	COXBU7E912_0540			FALSE	0.080	128.000	0.000	NA		NA
3714906	3714908	COXBU7E912_0540	CBUD_0542		tpiA	FALSE	0.008	805.000	0.000	1.000		NA
3714908	3714909	CBUD_0542	COXBU7E912_0543	tpiA	secG	TRUE	0.973	-18.000	0.184	1.000	N	NA
3714909	3714910	COXBU7E912_0543	COXBU7E912_0544	secG		TRUE	0.621	10.000	0.000	NA		NA
3714910	3714911	COXBU7E912_0544	CBUD_0545		nuoA	FALSE	0.041	200.000	0.000	NA		NA
3714911	3714912	CBUD_0545	COXBU7E912_0546	nuoA	nuoB	TRUE	0.998	5.000	0.507	0.005	Y	NA
3714912	3714913	COXBU7E912_0546	COXBU7E912_0547	nuoB	nuoC	TRUE	0.995	10.000	0.328	0.005	Y	NA
3714913	3714914	COXBU7E912_0547	CBUD_0548	nuoC	nuoD	TRUE	0.989	-28.000	0.483	0.011	Y	NA
3714914	3714915	CBUD_0548	COXBU7E912_0549	nuoD	nuoE	TRUE	0.998	0.000	0.355	0.011	Y	NA
3714915	3714916	COXBU7E912_0549	COXBU7E912_0550	nuoE	nuoF	TRUE	0.995	-10.000	0.343	0.011	Y	NA
3714916	3714918	COXBU7E912_0550	COXBU7E912_0552	nuoF	nuoG	TRUE	0.936	111.000	0.395	0.011	Y	NA
3714918	3714919	COXBU7E912_0552	COXBU7E912_0553	nuoG	nuoH	TRUE	0.999	0.000	0.515	0.011	Y	NA
3714919	3714920	COXBU7E912_0553	CBUD_0554	nuoH	nuoI	TRUE	0.993	-18.000	0.500	0.011	Y	NA
3714920	3714921	CBUD_0554	COXBU7E912_0555	nuoI	nuoJ	TRUE	0.993	14.000	0.442	0.011	Y	NA
3714921	3714922	COXBU7E912_0555	COXBU7E912_0556	nuoJ	nuoK	TRUE	0.999	-3.000	0.484	0.005	Y	NA
3714922	3714923	COXBU7E912_0556	COXBU7E912_0557	nuoK	nuoL	TRUE	0.933	57.000	0.451	0.011	Y	NA
3714923	3714924	COXBU7E912_0557	COXBU7E912_0558	nuoL	nuoM	TRUE	0.994	5.000	0.175	0.004	Y	NA
3714924	3714925	COXBU7E912_0558	COXBU7E912_0559	nuoM	nuoN	TRUE	0.995	10.000	0.340	0.004	Y	NA
3714925	3714926	COXBU7E912_0559	COXBU7E912_0560	nuoN		FALSE	0.024	256.000	0.000	NA		NA
3714926	3714927	COXBU7E912_0560	COXBU7E912_0561			FALSE	0.080	61.000	0.000	NA		NA
3714927	3714928	COXBU7E912_0561	COXBU7E912_0562		nusA	TRUE	0.997	4.000	0.759	NA		NA
3714928	3714929	COXBU7E912_0562	CBUD_0563	nusA	infB	TRUE	0.973	-33.000	0.342	1.000	N	NA
3714929	3714930	CBUD_0563	COXBU7E912_0564	infB	rbfA	TRUE	0.957	88.000	0.530	1.000	Y	NA
3714930	3714931	COXBU7E912_0564	COXBU7E912_0565	rbfA	truB	TRUE	0.987	-22.000	0.318	1.000	Y	NA
3714934	5608885	COXBU7E912_0568	CBUD_0568a			FALSE	0.084	122.000	0.000	NA		NA
3714938	3714939	COXBU7E912_0572	CBUD_0573		hemB	TRUE	0.670	-18.000	0.000	1.000	N	NA
3714943	3714944	COXBU7E912_0577	COXBU7E912_0578	glyA	nrdR	TRUE	0.985	0.000	0.024	NA	N	NA
3714944	3714945	COXBU7E912_0578	CBUD_0579	nrdR	nusB	TRUE	0.822	-133.000	0.012	NA	Y	NA
3714947	3714948	COXBU7E912_0581	COXBU7E912_0582	thiL		FALSE	0.079	92.000	0.000	1.000		NA
3714948	3714949	COXBU7E912_0582	COXBU7E912_0583			FALSE	0.056	44.000	0.000	0.011		NA
3714949	3714950	COXBU7E912_0583	COXBU7E912_0584			FALSE	0.183	22.000	0.000	0.011		NA
5608886	3714952	CBUD_0584a	COXBU7E912_0586		gltA	FALSE	0.126	38.000	0.000	NA		NA
3714952	3714953	COXBU7E912_0586	COXBU7E912_0587	gltA		FALSE	0.031	234.000	0.000	NA		NA
3714954	3714955	CBUD_0588	COXBU7E912_0589			FALSE	0.013	427.000	0.000	NA		NA
3714955	3714956	COXBU7E912_0589	CBUD_0590		sdhC	TRUE	0.515	13.000	0.000	NA		NA
3714956	3714957	CBUD_0590	CBUD_0591	sdhC	sdhD	TRUE	0.995	-12.000	0.453	0.001	Y	NA
3714957	3714958	CBUD_0591	COXBU7E912_0592	sdhD	sdhA	TRUE	0.996	13.000	0.705	0.003	Y	NA
3714958	3714959	COXBU7E912_0592	COXBU7E912_0593	sdhA	sdhB	TRUE	0.998	7.000	0.604	0.003	Y	NA
3714959	3714960	COXBU7E912_0593	COXBU7E912_0594	sdhB	sucA	TRUE	0.937	24.000	0.067	1.000	Y	NA
3714960	3714961	COXBU7E912_0594	COXBU7E912_0595	sucA	sucB	TRUE	0.998	10.000	0.667	1.000	Y	NA
3714961	3714962	COXBU7E912_0595	COXBU7E912_0596	sucB		TRUE	0.515	13.000	0.000	NA		NA
3714962	3714963	COXBU7E912_0596	COXBU7E912_0597		sucC	FALSE	0.102	45.000	0.000	NA		NA
3714963	3714964	COXBU7E912_0597	COXBU7E912_0598	sucC	sucD	TRUE	0.999	0.000	0.806	0.001	Y	NA
3714964	3714965	COXBU7E912_0598	COXBU7E912_0599	sucD		TRUE	0.755	-3.000	0.000	1.000		NA
5608887	5608888	CBUD_0600a	CBUD_0600b			FALSE	0.270	-40.000	0.000	NA		NA
5608888	5608889	CBUD_0600b	CBUD_0600c			FALSE	0.020	281.000	0.000	NA		NA
5608890	5608891	CBUD_0600d	CBUD_0600e			FALSE	0.374	-22.000	0.000	NA		NA
5608891	3714970	CBUD_0600e	COXBU7E912_0604			FALSE	0.211	28.000	0.000	NA		NA
3714972	3714973	CBUD_0605	COXBU7E912_0607	map		FALSE	0.081	55.000	0.000	NA		NA
3714974	3714975	CBUD_0608	COXBU7E912_0609	rpsB	tsf	TRUE	0.998	10.000	0.748	1.000	Y	NA
3714975	3714976	COXBU7E912_0609	COXBU7E912_0610	tsf	pyrH	TRUE	0.997	0.000	0.416	1.000	N	NA
3714976	3714977	COXBU7E912_0610	COXBU7E912_0611	pyrH	frr	TRUE	0.929	78.000	0.626	1.000	N	NA
3714977	3714978	COXBU7E912_0611	COXBU7E912_0612	frr	uppS	TRUE	0.997	-3.000	0.409	1.000	N	NA
3714978	3714979	COXBU7E912_0612	CBUD_0613	uppS	cdsA	TRUE	0.996	-10.000	0.400	1.000	Y	NA
3714979	3714980	CBUD_0613	COXBU7E912_0614	cdsA		FALSE	0.051	178.000	0.000	NA		NA
3714985	3714986	COXBU7E912_0619	COXBU7E912_0620	mvaD/idi	mvk	TRUE	0.996	-7.000	0.312	0.003	Y	NA
3714986	3714987	COXBU7E912_0620	COXBU7E912_0621	mvk		TRUE	0.755	99.000	0.040	0.001	Y	NA
3714987	3714988	COXBU7E912_0621	CBUD_0622		hmgA	TRUE	0.959	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
3714989	3714990	COXBU7E912_0623	COXBU7E912_0624	yaeT		TRUE	0.934	78.000	0.354	1.000	Y	NA
3714990	3714991	COXBU7E912_0624	COXBU7E912_0625		lpxD	TRUE	0.998	10.000	0.814	1.000	Y	NA
3714991	3714992	COXBU7E912_0625	CBUD_0626	lpxD	fabZ	TRUE	0.998	-3.000	0.796	1.000	N	NA
3714992	3714993	CBUD_0626	COXBU7E912_0627	fabZ	lpxA	TRUE	0.998	5.000	0.850	1.000	N	NA
3714993	3714994	COXBU7E912_0627	CBUD_0628	lpxA		TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
3714995	5608892	COXBU7E912_0629	CBUD_0629a			TRUE	0.605	-10.000	0.000	NA		NA
5608892	5608893	CBUD_0629a	CBUD_0629b			FALSE	0.095	102.000	0.000	NA		NA
5608893	3714997	CBUD_0629b	COXBU7E912_0631			FALSE	0.081	56.000	0.000	NA		NA
3714997	3714999	COXBU7E912_0631	CBUD_0632		lpxB	FALSE	0.059	158.000	0.000	NA		NA
3714999	3715000	CBUD_0632	COXBU7E912_0634	lpxB		TRUE	0.797	-46.000	0.044	1.000		NA
3715001	3715002	COXBU7E912_0635	COXBU7E912_0636	tadA		TRUE	0.725	5.000	0.000	NA		NA
3715002	5608894	COXBU7E912_0636	CBUD_0636a			FALSE	0.096	100.000	0.000	NA		NA
5608894	3715003	CBUD_0636a	COXBU7E912_0637			FALSE	0.040	201.000	0.000	NA		NA
3715003	3715004	COXBU7E912_0637	CBUD_0638			FALSE	0.092	109.000	0.000	NA		NA
3715006	3715007	COXBU7E912_0640	COXBU7E912_0641	ppa	putA	FALSE	0.361	119.000	0.000	1.000	Y	NA
3715007	3715008	COXBU7E912_0641	COXBU7E912_0642	putA	mip	FALSE	0.175	73.000	0.000	1.000	N	NA
3715008	3715009	COXBU7E912_0642	CBUD_0643	mip	purL	FALSE	0.209	96.000	0.000	1.000	N	NA
3715011	3715012	COXBU7E912_0645	COXBU7E912_0646			FALSE	0.365	19.000	0.000	NA		NA
3715012	3715013	COXBU7E912_0646	COXBU7E912_0647			FALSE	0.109	43.000	0.000	NA		NA
3715014	3715015	COXBU7E912_0648	COXBU7E912_0649		pdhC	FALSE	0.036	417.000	0.000	NA	N	NA
3715015	3715016	COXBU7E912_0649	COXBU7E912_0650	pdhC	pdhB	TRUE	0.999	0.000	0.556	0.056	Y	NA
3715016	3715017	COXBU7E912_0650	COXBU7E912_0651	pdhB	pdhA	TRUE	0.867	205.000	0.458	0.005	Y	NA
3715017	3715018	COXBU7E912_0651	CBUD_0652	pdhA		TRUE	0.988	-3.000	0.065	1.000	N	NA
3715019	3715020	CBUD_0653	COXBU7E912_0655		ribD	TRUE	0.905	-3.000	0.000	1.000	N	NA
3715021	3715022	COXBU7E912_0654	COXBU7E912_0656			TRUE	0.979	6.000	0.107	NA		NA
3715023	3715024	CBUD_0657	COXBU7E912_0658	ribE	ribAB	TRUE	0.952	-16.000	0.009	1.000	Y	NA
3715024	3715025	COXBU7E912_0658	COXBU7E912_0659	ribAB	ribH	TRUE	0.987	-3.000	0.008	0.003	Y	NA
3715025	3715026	COXBU7E912_0659	COXBU7E912_0660	ribH		TRUE	0.687	-7.000	0.000	NA		NA
3715026	5608895	COXBU7E912_0660	CBUD_0662			FALSE	0.053	173.000	0.000	NA		NA
5608895	5608896	CBUD_0662	CBUD_0663			TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
5608896	3715030	CBUD_0663	COXBU7E912_0664			FALSE	0.152	34.000	0.000	NA		NA
3715030	3715031	COXBU7E912_0664	COXBU7E912_0665			FALSE	0.273	24.000	0.000	NA		NA
3715032	3715033	COXBU7E912_0666	COXBU7E912_0667		recR	TRUE	0.989	14.000	0.604	NA		NA
3715033	3715034	COXBU7E912_0667	COXBU7E912_0668	recR		TRUE	0.992	12.000	0.604	NA		NA
3715034	3715035	COXBU7E912_0668	COXBU7E912_0669		dnaX	TRUE	0.874	110.000	0.411	NA		NA
3715035	5608897	COXBU7E912_0669	CBUD_0669a	dnaX		TRUE	0.746	4.000	0.000	NA		NA
5608897	3715037	CBUD_0669a	COXBU7E912_0671			FALSE	0.126	38.000	0.000	NA		NA
3715038	5608898	COXBU7E912_0673	CBUD_0673a			TRUE	0.605	-10.000	0.000	NA		NA
5608898	5608899	CBUD_0673a	CBUD_0673b			FALSE	0.164	32.000	0.000	NA		NA
5608899	5608900	CBUD_0673b	CBUD_0673c			FALSE	0.097	99.000	0.000	NA		NA
5608900	5608901	CBUD_0673c	CBUD_0673d			FALSE	0.236	-51.000	0.000	NA		NA
5608901	3715041	CBUD_0673d	COXBU7E912_0675			TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
3715042	3715043	COXBU7E912_0676	COXBU7E912_0677	dapE	dapD	TRUE	0.991	6.000	0.109	0.003	Y	NA
3715043	3715044	COXBU7E912_0677	COXBU7E912_0678	dapD		TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
3715045	3715046	CBUD_0679	COXBU7E912_0680			FALSE	0.086	51.000	0.000	NA		NA
3715046	3715047	COXBU7E912_0680	CBUD_0681		rhlE	FALSE	0.081	127.000	0.000	NA		NA
3715047	3715048	CBUD_0681	COXBU7E912_0682	rhlE		FALSE	0.073	139.000	0.000	NA		NA
3715048	3715049	COXBU7E912_0682	COXBU7E912_0683			FALSE	0.086	119.000	0.000	NA		NA
3715049	3715050	COXBU7E912_0683	COXBU7E912_0685			FALSE	0.164	32.000	0.000	NA		NA
3715051	3715052	COXBU7E912_0684	COXBU7E912_0686			TRUE	0.687	-7.000	0.000	NA		NA
3715052	3715053	COXBU7E912_0686	CBUD_0687			TRUE	0.973	-6.000	0.015	1.000	N	NA
3715053	3715054	CBUD_0687	COXBU7E912_0688			TRUE	0.940	4.000	0.000	0.013	Y	NA
5608902	5608903	CBUD_0688a	CBUD_0688b			FALSE	0.080	62.000	0.000	NA		NA
5608903	3715056	CBUD_0688b	CBUD_0690			TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
3715056	3715057	CBUD_0690	COXBU7E912_0691			TRUE	0.960	-25.000	0.206	0.018	N	NA
3715057	3715058	COXBU7E912_0691	COXBU7E912_0692			TRUE	0.977	3.000	0.059	1.000		NA
3715058	3715059	COXBU7E912_0692	COXBU7E912_0693			TRUE	0.977	-15.000	0.286	0.034		NA
3715059	3715060	COXBU7E912_0693	COXBU7E912_0694			TRUE	0.996	-7.000	0.286	1.000	Y	NA
3715060	3715061	COXBU7E912_0694	COXBU7E912_0696			TRUE	0.979	3.000	0.069	1.000		NA
3715064	3715065	COXBU7E912_0698	COXBU7E912_0699			FALSE	0.013	445.000	0.000	NA		NA
3715065	5608904	COXBU7E912_0699	CBUD_0699a			FALSE	0.099	89.000	0.000	NA		NA
5608904	3715066	CBUD_0699a	CBUD_0700		pdhAB	FALSE	0.349	-13.000	0.000	0.005		NA
3715066	3715067	CBUD_0700	CBUD_0701	pdhAB		FALSE	0.476	14.000	0.000	NA		NA
3715067	3715068	CBUD_0701	COXBU7E912_0702		wcaG	FALSE	0.015	380.000	0.000	NA		NA
3715068	3715069	COXBU7E912_0702	COXBU7E912_0703	wcaG	gmd	TRUE	0.920	-7.000	0.000	0.007	Y	NA
3715069	3715070	COXBU7E912_0703	CBUD_0704	gmd		TRUE	0.924	9.000	0.000	NA	Y	NA
3715070	3715071	CBUD_0704	COXBU7E912_0705			TRUE	0.687	-7.000	0.000	NA		NA
3715072	3715073	COXBU7E912_0706	CBUD_0707			TRUE	0.990	-3.000	0.026	0.004	Y	NA
3715073	3715074	CBUD_0707	COXBU7E912_0708			FALSE	0.081	127.000	0.000	NA		NA
3715074	3715075	COXBU7E912_0708	COXBU7E912_0709			FALSE	0.080	62.000	0.000	NA		NA
3715075	3715076	COXBU7E912_0709	CBUD_0710			TRUE	0.687	-7.000	0.000	NA		NA
3715076	3715077	CBUD_0710	COXBU7E912_0711			TRUE	0.534	31.000	0.000	0.013	Y	NA
3715077	3715078	COXBU7E912_0711	COXBU7E912_0712			FALSE	0.292	23.000	0.000	NA		NA
3715080	3715081	CBUD_0714	CBUD_0715	sat/cysC	cysQ2	TRUE	0.833	-18.000	0.000	1.000	Y	NA
3715082	3715083	COXBU7E912_0716	COXBU7E912_0717			TRUE	0.818	10.000	0.000	NA	N	NA
3715083	3715084	COXBU7E912_0717	COXBU7E912_0718			TRUE	0.914	10.000	0.000	NA	Y	NA
3715084	3715085	COXBU7E912_0718	COXBU7E912_0719			FALSE	0.012	485.000	0.000	NA		NA
3715086	3715087	COXBU7E912_0720	COXBU7E912_0721			FALSE	0.080	59.000	0.000	NA		NA
3715087	5608905	COXBU7E912_0721	CBUD_0721a			FALSE	0.089	114.000	0.000	NA		NA
3715090	3715091	COXBU7E912_0724	COXBU7E912_0725			FALSE	0.018	308.000	0.000	NA		NA
3715091	5608907	COXBU7E912_0725	CBUD_0725a			FALSE	0.010	887.000	0.000	NA		NA
5608907	3715092	CBUD_0725a	COXBU7E912_0726			TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
3715092	3715093	COXBU7E912_0726	COXBU7E912_0727			FALSE	0.174	59.000	0.000	1.000	N	NA
3715093	3715094	COXBU7E912_0727	CBUD_0728			FALSE	0.333	-28.000	0.000	NA		NA
5608908	5608909	CBUD_0728a	CBUD_0728b			FALSE	0.088	79.000	0.000	NA		NA
5608909	3715097	CBUD_0728b	CBUD_0731			FALSE	0.027	246.000	0.000	NA		NA
3715097	3715098	CBUD_0731	CBUD_0732			TRUE	0.903	24.000	0.081	1.000	N	NA
3715098	3715099	CBUD_0732	COXBU7E912_0733		speB	TRUE	0.988	0.000	0.061	1.000	N	NA
3715100	3715101	CBUD_0734	COXBU7E912_0735			TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
3715101	3715102	COXBU7E912_0735	CBUD_0736		poxB	FALSE	0.030	235.000	0.000	NA		NA
5608910	5608911	CBUD_0737a	CBUD_0737b			FALSE	0.088	79.000	0.000	NA		NA
5608911	3715105	CBUD_0737b	COXBU7E912_0739		ampC	FALSE	0.090	113.000	0.000	NA		NA
3715105	3715106	COXBU7E912_0739	COXBU7E912_0740	ampC		TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
3715107	3715108	COXBU7E912_0741	CBUD_0742			TRUE	0.999	-3.000	0.556	NA	Y	NA
3715108	3715109	CBUD_0742	COXBU7E912_0743			TRUE	0.973	-16.000	0.054	NA	Y	NA
3715109	3715110	COXBU7E912_0743	COXBU7E912_0745			TRUE	0.992	3.000	0.239	NA		NA
3715111	3715112	CBUD_0744	CBUD_0746			FALSE	0.094	103.000	0.000	NA		NA
3715112	3715113	CBUD_0746	COXBU7E912_0747			FALSE	0.080	60.000	0.000	NA		NA
3715116	3715117	COXBU7E912_0750	COXBU7E912_0751		tig	FALSE	0.292	23.000	0.000	NA		NA
3715117	3715118	COXBU7E912_0751	COXBU7E912_0752	tig	clpP	TRUE	0.996	10.000	0.351	1.000	Y	NA
3715118	3715119	COXBU7E912_0752	COXBU7E912_0753	clpP	clpX	TRUE	0.931	55.000	0.352	1.000	Y	NA
3715119	3715120	COXBU7E912_0753	COXBU7E912_0754	clpX	lon	TRUE	0.986	14.000	0.201	0.098	Y	NA
3715120	3715121	COXBU7E912_0754	COXBU7E912_0755	lon		TRUE	0.651	9.000	0.000	NA		NA
5608912	3715122	CBUD_0754a	COXBU7E912_0756		ptsH	FALSE	0.081	74.000	0.000	NA		NA
3715122	3715123	COXBU7E912_0756	COXBU7E912_0757	ptsH	hprK	FALSE	0.362	-19.000	0.000	1.000		NA
3715123	3715124	COXBU7E912_0757	COXBU7E912_0758	hprK	yfiA	TRUE	0.975	0.000	0.021	NA		NA
3715124	3715125	COXBU7E912_0758	COXBU7E912_0759	yfiA		FALSE	0.425	99.000	0.006	NA		NA
3715125	3715126	COXBU7E912_0759	COXBU7E912_0760		yhbN	TRUE	0.996	3.000	0.543	NA		NA
3715126	3715127	COXBU7E912_0760	COXBU7E912_0761	yhbN		TRUE	0.967	-37.000	0.459	NA		NA
3715127	3715128	COXBU7E912_0761	COXBU7E912_0762			TRUE	0.986	16.000	0.617	NA		NA
3715128	3715129	COXBU7E912_0762	COXBU7E912_0763		kdsD	TRUE	0.997	2.000	0.598	1.000		NA
3715130	3715131	COXBU7E912_0764	CBUD_0765	murA		TRUE	0.641	-9.000	0.000	NA		NA
3715131	3715132	CBUD_0765	COXBU7E912_0766			FALSE	0.178	31.000	0.000	NA		NA
3715133	3715134	COXBU7E912_0767	COXBU7E912_0768			FALSE	0.221	48.000	0.000	NA	N	NA
3715134	3715135	COXBU7E912_0768	COXBU7E912_0769			TRUE	0.907	0.000	0.000	1.000	N	NA
3715135	3715136	COXBU7E912_0769	COXBU7E912_0770			FALSE	0.282	161.000	0.004	NA		NA
3715136	3715137	COXBU7E912_0770	COXBU7E912_0771		rluD	TRUE	0.930	-28.000	0.168	NA		NA
5608913	5608914	CBUD_0772a	CBUD_0772b			FALSE	0.095	84.000	0.000	NA		NA
5608914	5608915	CBUD_0772b	CBUD_0772c			FALSE	0.121	39.000	0.000	NA		NA
5608915	3715140	CBUD_0772c	COXBU7E912_0774			FALSE	0.092	82.000	0.000	NA		NA
5608916	3715141	CBUD_0774a	COXBU7E912_0775			FALSE	0.202	-67.000	0.000	NA		NA
3715141	3715142	COXBU7E912_0775	COXBU7E912_0776			FALSE	0.325	21.000	0.000	NA		NA
3715142	5608917	COXBU7E912_0776	CBUD_0776a			FALSE	0.325	21.000	0.000	NA		NA
5608917	5608918	CBUD_0776a	CBUD_0776b			FALSE	0.214	-60.000	0.000	NA		NA
5608918	5608919	CBUD_0776b	CBUD_0776c			TRUE	0.800	0.000	0.000	NA		NA
5608919	5608920	CBUD_0776c	CBUD_0776d			FALSE	0.202	-67.000	0.000	NA		NA
3715146	3715147	COXBU7E912_0780	COXBU7E912_0781			FALSE	0.076	134.000	0.000	NA		NA
3715147	3715148	COXBU7E912_0781	CBUD_0782			FALSE	0.014	412.000	0.000	NA		NA
3715149	3715150	COXBU7E912_0783	COXBU7E912_0784			TRUE	0.651	9.000	0.000	NA		NA
3715150	3715151	COXBU7E912_0784	COXBU7E912_0785			FALSE	0.080	57.000	0.000	NA		NA
5608922	5608923	CBUD_0785a	CBUD_0785b			FALSE	0.083	54.000	0.000	NA		NA
5608924	3715154	CBUD_0785c	COXBU7E912_0788			TRUE	0.990	4.000	0.209	NA		NA
3715154	3715155	COXBU7E912_0788	COXBU7E912_0789			FALSE	0.094	105.000	0.000	NA		NA
3715158	5608925	COXBU7E912_0792	CBUD_0792a			FALSE	0.083	124.000	0.000	NA		NA
5608925	5608926	CBUD_0792a	CBUD_0792b			FALSE	0.236	-51.000	0.000	NA		NA
5608926	3715160	CBUD_0792b	COXBU7E912_0794			FALSE	0.088	116.000	0.000	NA		NA
3715160	3715161	COXBU7E912_0794	CBUD_0795			FALSE	0.085	-144.000	0.000	0.015		NA
3715163	3715164	COXBU7E912_0797	CBUD_0798			FALSE	0.046	187.000	0.000	NA		NA
3715164	3715165	CBUD_0798	COXBU7E912_0799			FALSE	0.030	235.000	0.000	NA		NA
3715166	3715167	COXBU7E912_0800	COXBU7E912_0801			TRUE	0.688	14.000	0.000	1.000	N	NA
3715167	3715168	COXBU7E912_0801	COXBU7E912_0802		qacE	FALSE	0.206	99.000	0.000	1.000	N	NA
3715168	5608927	COXBU7E912_0802	CBUD_0802a	qacE		FALSE	0.449	15.000	0.000	NA		NA
5608927	5608928	CBUD_0802a	CBUD_0802b			TRUE	0.767	3.000	0.000	NA		NA
5608928	5608929	CBUD_0802b	CBUD_0802c			FALSE	0.228	-55.000	0.000	NA		NA
5608929	3715170	CBUD_0802c	CBUD_0804			FALSE	0.145	35.000	0.000	NA		NA
5608930	3715173	CBUD_0806	COXBU7E912_0807			FALSE	0.077	132.000	0.000	NA		NA
3715174	3715175	COXBU7E912_0808	CBUD_0809			TRUE	0.787	1.000	0.000	NA		NA
3715175	3715176	CBUD_0809	COXBU7E912_0810			FALSE	0.091	49.000	0.000	NA		NA
3715176	3715177	COXBU7E912_0810	COXBU7E912_0811			FALSE	0.092	108.000	0.000	NA		NA
3715177	3715178	COXBU7E912_0811	COXBU7E912_0812			TRUE	0.767	3.000	0.000	NA		NA
3715180	5608931	COXBU7E912_0814	CBUD_0815			TRUE	0.621	10.000	0.000	NA		NA
5608931	5608932	CBUD_0815	CBUD_0816			FALSE	0.310	-31.000	0.000	NA		NA
5608932	3715183	CBUD_0816	COXBU7E912_0817			FALSE	0.096	100.000	0.000	NA		NA
3715183	3715184	COXBU7E912_0817	CBUD_0818			FALSE	0.044	167.000	0.000	1.000		NA
3715184	3715185	CBUD_0818	COXBU7E912_0819		prpB	FALSE	0.042	172.000	0.000	1.000		NA
3715185	3715186	COXBU7E912_0819	COXBU7E912_0820	prpB	prpC	TRUE	0.996	-7.000	0.502	1.000	N	NA
3715186	3715187	COXBU7E912_0820	COXBU7E912_0821	prpC		TRUE	0.767	3.000	0.000	NA		NA
3715187	3715188	COXBU7E912_0821	CBUD_0822		pspC	FALSE	0.098	96.000	0.000	NA		NA
3715188	3715189	CBUD_0822	COXBU7E912_0823	pspC		TRUE	0.935	7.000	0.000	NA	Y	NA
3715189	3715190	COXBU7E912_0823	COXBU7E912_0824			TRUE	0.905	-3.000	0.000	1.000	N	NA
3715190	3715191	COXBU7E912_0824	COXBU7E912_0825			TRUE	0.998	-3.000	0.667	NA		NA
3715192	3715193	COXBU7E912_0826	COXBU7E912_0827	pfpI		FALSE	0.126	38.000	0.000	NA		NA
3715194	3715195	COXBU7E912_0828	COXBU7E912_0829			FALSE	0.080	65.000	0.000	NA		NA
3715195	3715196	COXBU7E912_0829	COXBU7E912_0830			FALSE	0.041	200.000	0.000	NA		NA
5608933	5608934	CBUD_0830a	CBUD_0830b			FALSE	0.042	198.000	0.000	NA		NA
5608935	3715198	CBUD_0830c	CBUD_0832			FALSE	0.022	270.000	0.000	NA		NA
3715198	3715199	CBUD_0832	COXBU7E912_0833			FALSE	0.252	36.000	0.000	0.053	N	NA
3715199	3715200	COXBU7E912_0833	COXBU7E912_0834			TRUE	0.902	-10.000	0.000	1.000	Y	NA
3715200	3715201	COXBU7E912_0834	CBUD_0835			FALSE	0.190	116.000	0.000	1.000	N	NA
3715201	5608936	CBUD_0835	CBUD_0836			FALSE	0.026	250.000	0.000	NA		NA
5608936	5608937	CBUD_0836	CBUD_0837			FALSE	0.086	51.000	0.000	NA		NA
5608937	5608938	CBUD_0837	CBUD_0838			FALSE	0.288	-36.000	0.000	NA		NA
5608938	5608939	CBUD_0838	CBUD_0838a			FALSE	0.099	89.000	0.000	NA		NA
5608939	5608940	CBUD_0838a	CBUD_0838b			TRUE	0.746	4.000	0.000	NA		NA
3715206	3715207	COXBU7E912_0840	COXBU7E912_0841			TRUE	0.687	-7.000	0.000	NA		NA
3715207	3715208	COXBU7E912_0841	CBUD_0842			FALSE	0.131	37.000	0.000	NA		NA
3715211	3715212	CBUD_0845	COXBU7E912_0846			FALSE	0.118	40.000	0.000	NA		NA
3715213	3715214	COXBU7E912_0847	COXBU7E912_0848			FALSE	0.080	65.000	0.000	NA		NA
3715214	3715215	COXBU7E912_0848	COXBU7E912_0849			FALSE	0.047	287.000	0.000	1.000	N	NA
3715215	3715216	COXBU7E912_0849	COXBU7E912_0850			FALSE	0.344	20.000	0.000	NA		NA
3715217	3715218	COXBU7E912_0851	COXBU7E912_0852			FALSE	0.069	51.000	0.000	1.000		NA
3715218	3715219	COXBU7E912_0852	COXBU7E912_0853			FALSE	0.014	247.000	0.000	0.016		NA
3715219	3715220	COXBU7E912_0853	COXBU7E912_0854			FALSE	0.015	299.000	0.000	1.000		NA
5608941	3715222	CBUD_0855a	COXBU7E912_0856			FALSE	0.097	47.000	0.000	NA		NA
3715225	5608942	COXBU7E912_0859	CBUD_0861			FALSE	0.012	490.000	0.000	NA		NA
5608942	3715228	CBUD_0861	COXBU7E912_0862			FALSE	0.017	319.000	0.000	NA		NA
3715228	3715229	COXBU7E912_0862	CBUD_0863		folE	FALSE	0.178	31.000	0.000	NA		NA
3715229	3715230	CBUD_0863	COXBU7E912_0864	folE		TRUE	0.907	0.000	0.000	1.000	N	NA
3715230	3715231	COXBU7E912_0864	COXBU7E912_0865			TRUE	0.801	17.000	0.000	1.000	Y	NA
3715231	3715232	COXBU7E912_0865	COXBU7E912_0866		emrA	TRUE	0.998	1.000	0.600	1.000	N	NA
5608943	3715233	CBUD_0866a	CBUD_0867			TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
3715233	3715234	CBUD_0867	COXBU7E912_0868		rimI	TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
3715236	3715237	COXBU7E912_0870	COXBU7E912_0871			TRUE	0.809	8.000	0.000	0.059	N	NA
3715238	5608944	COXBU7E912_0872	CBUD_0872a			FALSE	0.094	104.000	0.000	NA		NA
3715241	3715242	CBUD_0875	COXBU7E912_0876			TRUE	0.991	-12.000	0.631	0.065		NA
3715242	3715243	COXBU7E912_0876	COXBU7E912_0877		prfC	TRUE	0.744	1.000	0.000	1.000		NA
3715243	5608945	COXBU7E912_0877	CBUD_0877a	prfC		FALSE	0.449	15.000	0.000	NA		NA
5608945	5608946	CBUD_0877a	CBUD_0877b			FALSE	0.186	-81.000	0.000	NA		NA
5608946	3715245	CBUD_0877b	COXBU7E912_0879			FALSE	0.019	288.000	0.000	NA		NA
3715245	5608947	COXBU7E912_0879	CBUD_0881			FALSE	0.014	409.000	0.000	NA		NA
5608947	5608948	CBUD_0881	CBUD_0882			TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
3715250	3715251	COXBU7E912_0884	COXBU7E912_0885			FALSE	0.193	57.000	0.000	NA	N	NA
3715251	3715252	COXBU7E912_0885	COXBU7E912_0886			FALSE	0.081	74.000	0.000	NA		NA
3715253	3715254	COXBU7E912_0887	COXBU7E912_0888		sfcA	FALSE	0.010	446.000	0.000	1.000		NA
3715254	3715255	COXBU7E912_0888	COXBU7E912_0889	sfcA	purB	FALSE	0.395	28.000	0.000	1.000	N	NA
3715256	3715257	COXBU7E912_0890	COXBU7E912_0891		rfaH	TRUE	0.734	-13.000	0.000	1.000	N	NA
3715257	3715258	COXBU7E912_0891	CBUD_0892	rfaH		TRUE	0.664	35.000	0.036	NA		NA
3715258	3715259	CBUD_0892	COXBU7E912_0893			FALSE	0.083	77.000	0.000	NA		NA
3715259	3715260	COXBU7E912_0893	CBUD_0894			TRUE	0.928	15.000	0.094	0.024		NA
3715260	3715261	CBUD_0894	CBUD_0895			TRUE	0.999	-3.000	0.511	1.000	Y	NA
3715261	3715262	CBUD_0895	COXBU7E912_0896		asnB2	TRUE	0.993	3.000	0.178	1.000	N	NA
3715262	3715263	COXBU7E912_0896	COXBU7E912_0897	asnB2		TRUE	0.744	1.000	0.000	1.000		NA
3715263	3715264	COXBU7E912_0897	COXBU7E912_0898			TRUE	0.523	11.000	0.000	1.000		NA
3715264	3715265	COXBU7E912_0898	CBUD_0899			TRUE	0.720	13.000	0.000	1.000	N	NA
3715265	3715266	CBUD_0899	COXBU7E912_0900			TRUE	0.651	9.000	0.000	NA		NA
3715266	3715267	COXBU7E912_0900	CBUD_0901			TRUE	0.746	4.000	0.000	NA		NA
3715267	3715268	CBUD_0901	COXBU7E912_0902			FALSE	0.449	15.000	0.000	NA		NA
3715268	3715269	COXBU7E912_0902	COXBU7E912_0903			FALSE	0.020	287.000	0.000	NA		NA
3715269	3715270	COXBU7E912_0903	CBUD_0904			FALSE	0.300	136.000	0.000	0.017	Y	NA
3715270	3715271	CBUD_0904	COXBU7E912_0905		asnB1	TRUE	0.907	0.000	0.000	1.000	N	NA
3715271	3715272	COXBU7E912_0905	COXBU7E912_0906	asnB1		TRUE	0.979	7.000	0.061	1.000	N	NA
3715272	3715273	COXBU7E912_0906	COXBU7E912_0907			FALSE	0.163	231.000	0.000	1.000	Y	NA
3715273	3715274	COXBU7E912_0907	COXBU7E912_0908			TRUE	0.893	11.000	0.000	1.000	Y	NA
3715275	3715276	CBUD_0909	COXBU7E912_0910			TRUE	0.978	-12.000	0.046	1.000	Y	NA
3715277	3715278	COXBU7E912_0911	COXBU7E912_0912	ugd		TRUE	0.688	14.000	0.000	1.000	N	NA
3715278	3715279	COXBU7E912_0912	COXBU7E912_0913		pgi	TRUE	0.799	10.000	0.000	1.000	N	NA
3715279	3715280	COXBU7E912_0913	COXBU7E912_0914	pgi	galU	TRUE	0.905	-3.000	0.000	1.000	N	NA
3715280	3715281	COXBU7E912_0914	CBUD_0915	galU		FALSE	0.080	64.000	0.000	NA		NA
3715281	3715282	CBUD_0915	COXBU7E912_0916		rpsO	FALSE	0.095	101.000	0.000	NA		NA
3715282	3715283	COXBU7E912_0916	COXBU7E912_0917	rpsO	pnp	TRUE	0.995	11.000	0.335	1.000	Y	NA
5608949	5608950	CBUD_0918a	CBUD_0919		comA	FALSE	0.097	47.000	0.000	NA		NA
5608950	5608951	CBUD_0919	CBUD_0919a	comA	comA	FALSE	0.100	46.000	0.000	NA		NA
5608951	5608952	CBUD_0919a	CBUD_0919b	comA	comA	FALSE	0.081	69.000	0.000	NA		NA
5608952	3715287	CBUD_0919b	CBUD_0921	comA	msbA	FALSE	0.455	-18.000	0.000	NA		NA
3715287	3715288	CBUD_0921	COXBU7E912_0923	msbA	lpxK	TRUE	0.995	0.000	0.205	1.000	N	NA
3715289	3715290	COXBU7E912_0922	COXBU7E912_0924	nadE		TRUE	0.687	7.000	0.000	NA		NA
3715291	3715292	CBUD_0925	CBUD_0926			FALSE	0.098	88.000	0.000	NA		NA
3715292	5608953	CBUD_0926	CBUD_0926a			FALSE	0.083	124.000	0.000	NA		NA
5608953	3715293	CBUD_0926a	COXBU7E912_0927		rpsF	TRUE	0.532	-13.000	0.000	NA		NA
3715293	3715294	COXBU7E912_0927	COXBU7E912_0928	rpsF	rpsR	TRUE	0.992	13.000	0.319	0.024	Y	NA
3715294	3715295	COXBU7E912_0928	COXBU7E912_0929	rpsR		TRUE	0.971	4.000	0.034	NA		NA
3715295	3715296	COXBU7E912_0929	CBUD_0930		rplI	TRUE	0.933	12.000	0.034	NA		NA
3715296	3715297	CBUD_0930	COXBU7E912_0931	rplI	dnaB	FALSE	0.389	249.000	0.074	1.000	N	NA
3715297	3715298	COXBU7E912_0931	COXBU7E912_0932	dnaB	alr	TRUE	0.985	-3.000	0.035	1.000	N	NA
3715298	3715299	COXBU7E912_0932	COXBU7E912_0934	alr		TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
3715300	3715301	COXBU7E912_0933	COXBU7E912_0935		udk	FALSE	0.091	81.000	0.000	NA		NA
3715301	3715302	COXBU7E912_0935	CBUD_0936	udk		TRUE	0.605	-10.000	0.000	NA		NA
3715304	3715305	COXBU7E912_0938	COXBU7E912_0940	aroC	asd	TRUE	0.864	13.000	0.000	1.000	Y	NA
3715309	3715310	COXBU7E912_0943	CBUD_0944			FALSE	0.089	114.000	0.000	NA		NA
3715310	3715311	CBUD_0944	COXBU7E912_0945			FALSE	0.098	95.000	0.000	NA		NA
5608954	3715313	CBUD_0945a	COXBU7E912_0947			FALSE	0.022	269.000	0.000	NA		NA
3715314	3715315	COXBU7E912_0948	CBUD_0949	typA		TRUE	0.553	12.000	0.000	NA		NA
3715315	3715316	CBUD_0949	COXBU7E912_0950		coaBC	FALSE	0.164	32.000	0.000	NA		NA
3715316	3715317	COXBU7E912_0950	COXBU7E912_0952	coaBC		FALSE	0.044	168.000	0.000	1.000		NA
3715318	3715319	CBUD_0951	COXBU7E912_0953	bdbC		TRUE	0.995	-3.000	0.308	NA		NA
3715319	3715320	COXBU7E912_0953	COXBU7E912_0954			FALSE	0.455	-18.000	0.000	NA		NA
3715321	3715322	COXBU7E912_0955	COXBU7E912_0956		truA	TRUE	0.725	5.000	0.000	NA		NA
3715322	3715323	COXBU7E912_0956	COXBU7E912_0957	truA	accD	TRUE	0.802	31.000	0.044	1.000	N	NA
3715323	3715324	COXBU7E912_0957	COXBU7E912_0958	accD	folC	TRUE	0.883	133.000	0.383	1.000	N	NA
3715324	3715325	COXBU7E912_0958	CBUD_0959	folC	dedD	TRUE	0.972	-16.000	0.216	NA		NA
3715325	3715326	CBUD_0959	COXBU7E912_0960	dedD	dedE	TRUE	0.641	68.000	0.116	NA		NA
3715326	3715327	COXBU7E912_0960	COXBU7E912_0961	dedE	purF	TRUE	0.987	9.000	0.262	1.000		NA
3715327	3715328	COXBU7E912_0961	COXBU7E912_0962	purF		TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
3715328	3715329	COXBU7E912_0962	COXBU7E912_0963			FALSE	0.402	17.000	0.000	NA		NA
3715329	3715330	COXBU7E912_0963	COXBU7E912_0964			FALSE	0.035	217.000	0.000	NA		NA
3715330	5608955	COXBU7E912_0964	CBUD_0966			FALSE	0.019	289.000	0.000	NA		NA
5608955	5608956	CBUD_0966	CBUD_0967			FALSE	0.083	54.000	0.000	NA		NA
5608956	3715334	CBUD_0967	COXBU7E912_0968			FALSE	0.097	47.000	0.000	NA		NA
3715334	5608957	COXBU7E912_0968	CBUD_0969			TRUE	0.485	-16.000	0.000	NA		NA
5608957	3715336	CBUD_0969	CBUD_0970		dusA	TRUE	0.605	-10.000	0.000	NA		NA
5608958	5608959	CBUD_0973	CBUD_0974			TRUE	0.687	7.000	0.000	NA		NA
5608959	3715341	CBUD_0974	COXBU7E912_0975		ispZ	TRUE	0.767	3.000	0.000	NA		NA
3715342	3715343	COXBU7E912_0976	CBUD_0977			FALSE	0.420	-19.000	0.000	NA		NA
3715344	5608960	CBUD_0978	CBUD_0978a			FALSE	0.084	122.000	0.000	NA		NA
3715347	3715348	CBUD_0981	COXBU7E912_0982	scpA	scpB	TRUE	0.979	5.000	0.083	NA		NA
3715348	3715349	COXBU7E912_0982	COXBU7E912_0984	scpB		TRUE	0.989	10.000	0.210	NA	N	NA
5608961	3715351	CBUD_0984a	COXBU7E912_0985			TRUE	0.515	13.000	0.000	NA		NA
3715351	3715352	COXBU7E912_0985	CBUD_0986		mutS	TRUE	0.915	-3.000	0.000	NA	N	NA
3715353	3715354	COXBU7E912_0987	COXBU7E912_0988	cinA	recA	FALSE	0.403	88.000	0.003	NA		NA
3715354	3715355	COXBU7E912_0988	COXBU7E912_0989	recA	recX	TRUE	0.994	-3.000	0.296	1.000		NA
3715355	3715356	COXBU7E912_0989	COXBU7E912_0990	recX	alaS	TRUE	0.973	-7.000	0.085	1.000		NA
3715356	3715357	COXBU7E912_0990	COXBU7E912_0991	alaS	lysC	TRUE	0.981	6.000	0.065	1.000	N	NA
3715357	3715358	COXBU7E912_0991	COXBU7E912_0992	lysC	csrA1	TRUE	0.654	140.000	0.079	1.000	N	NA
3715358	3715359	COXBU7E912_0992	COXBU7E912_0993	csrA1		FALSE	0.021	280.000	0.000	NA		NA
3715359	5608962	COXBU7E912_0993	CBUD_0994			FALSE	0.029	239.000	0.000	NA		NA
5608962	5608963	CBUD_0994	CBUD_0995			FALSE	0.137	36.000	0.000	NA		NA
3715366	3715367	COXBU7E912_1000	CBUD_1001		cyoA	FALSE	0.333	-28.000	0.000	NA		NA
3715367	3715368	CBUD_1001	COXBU7E912_1002	cyoA	cyoB	TRUE	0.974	20.000	0.200	0.003	Y	NA
3715368	3715369	COXBU7E912_1002	COXBU7E912_1003	cyoB	cyoC	TRUE	0.997	-3.000	0.267	0.031	Y	NA
3715369	5608965	COXBU7E912_1003	CBUD_1003a	cyoC	cyoD	TRUE	0.998	-3.000	0.400	0.031	Y	NA
3715371	3715372	COXBU7E912_1005	COXBU7E912_1006			FALSE	0.094	104.000	0.000	NA		NA
3715372	5608966	COXBU7E912_1006	CBUD_1006a			TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
5608966	5608967	CBUD_1006a	CBUD_1006b			TRUE	0.666	8.000	0.000	NA		NA
3715375	3715376	COXBU7E912_1009	COXBU7E912_1010			FALSE	0.087	118.000	0.000	NA		NA
3715376	3715377	COXBU7E912_1010	COXBU7E912_1011			TRUE	0.983	-3.000	0.020	1.000	N	NA
3715378	3715379	CBUD_1012	COXBU7E912_1013	pgsA		FALSE	0.381	18.000	0.000	NA		NA
3715380	3715381	CBUD_1014	CBUD_1015			FALSE	0.388	-21.000	0.000	NA		NA
3715382	3715383	COXBU7E912_1016	COXBU7E912_1017			TRUE	0.582	11.000	0.000	NA		NA
5608968	3715386	CBUD_1019a	COXBU7E912_1020			TRUE	0.656	6.000	0.000	1.000		NA
3715386	3715387	COXBU7E912_1020	COXBU7E912_1021			FALSE	0.008	794.000	0.000	1.000		NA
3715387	5608969	COXBU7E912_1021	CBUD_1021a			TRUE	0.687	-7.000	0.000	NA		NA
5608969	5608970	CBUD_1021a	CBUD_1021b			TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
3715389	3715390	COXBU7E912_1023	COXBU7E912_1024			FALSE	0.025	252.000	0.000	NA		NA
3715390	5608971	COXBU7E912_1024	CBUD_1025			FALSE	0.114	41.000	0.000	NA		NA
3715392	3715393	COXBU7E912_1026	COXBU7E912_1027			FALSE	0.089	115.000	0.000	NA		NA
3715393	3715394	COXBU7E912_1027	COXBU7E912_1028			FALSE	0.018	299.000	0.000	NA		NA
3715394	3715395	COXBU7E912_1028	COXBU7E912_1029			FALSE	0.012	466.000	0.000	NA		NA
5608972	5608973	CBUD_1029a	CBUD_1030			FALSE	0.273	24.000	0.000	NA		NA
3715397	3715398	COXBU7E912_1031	COXBU7E912_1032			FALSE	0.097	47.000	0.000	NA		NA
3715398	5608974	COXBU7E912_1032	CBUD_1033			FALSE	0.073	139.000	0.000	NA		NA
5608974	5608975	CBUD_1033	CBUD_1034			FALSE	0.080	58.000	0.000	NA		NA
5608975	5608976	CBUD_1034	CBUD_1035			FALSE	0.083	124.000	0.000	NA		NA
3715403	3715404	COXBU7E912_1037	COXBU7E912_1038		crcB	TRUE	0.976	-3.000	0.023	NA		NA
3715404	3715405	COXBU7E912_1038	COXBU7E912_1039	crcB	bioA	TRUE	0.900	1.000	0.000	1.000	N	NA
3715406	3715407	COXBU7E912_1040	COXBU7E912_1041	bioB	bioF	TRUE	0.987	-13.000	0.168	1.000	Y	NA
3715407	3715408	COXBU7E912_1041	COXBU7E912_1042	bioF		TRUE	0.980	-6.000	0.092	NA		NA
3715408	3715409	COXBU7E912_1042	CBUD_1043		bioC.1	TRUE	0.975	-10.000	0.163	NA		NA
3715409	3715410	CBUD_1043	COXBU7E912_1045	bioC.1	bioD	TRUE	0.985	-3.000	0.004	0.003	Y	NA
3715412	3715413	COXBU7E912_1046	COXBU7E912_1047		lolD	TRUE	0.997	-7.000	0.620	0.030	N	NA
3715413	3715414	COXBU7E912_1047	COXBU7E912_1048	lolD	hflX	TRUE	0.755	-3.000	0.000	1.000		NA
3715414	3715415	COXBU7E912_1048	COXBU7E912_1049	hflX	purA	TRUE	0.701	21.000	0.002	0.012		NA
3715416	3715417	CBUD_1050	COXBU7E912_1051		cyoE	TRUE	0.651	9.000	0.000	NA		NA
3715417	3715418	COXBU7E912_1051	CBUD_1052	cyoE		TRUE	0.980	-3.000	0.064	0.061		NA
3715419	3715420	COXBU7E912_1053	COXBU7E912_1054	def1		FALSE	0.190	30.000	0.000	NA		NA
3715423	3715424	COXBU7E912_1057	COXBU7E912_1059			TRUE	0.651	9.000	0.000	NA		NA
3715425	3715426	CBUD_1058	CBUD_1060	ung		TRUE	0.890	4.000	0.000	NA	N	NA
3715428	3715429	COXBU7E912_1062	COXBU7E912_1063			FALSE	0.197	29.000	0.000	NA		NA
3715429	5608979	COXBU7E912_1063	CBUD_1064			TRUE	0.485	-16.000	0.000	NA		NA
5608979	5608980	CBUD_1064	CBUD_1065		pheA	TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
5608980	3715432	CBUD_1065	COXBU7E912_1066	pheA		TRUE	0.605	-10.000	0.000	NA		NA
3715432	5608981	COXBU7E912_1066	CBUD_1066a			FALSE	0.081	69.000	0.000	NA		NA
3715433	3715434	COXBU7E912_1067	COXBU7E912_1068			FALSE	0.099	89.000	0.000	NA		NA
3715435	3715436	COXBU7E912_1069	COXBU7E912_1070			FALSE	0.086	51.000	0.000	NA		NA
3715436	3715437	COXBU7E912_1070	COXBU7E912_1071			TRUE	0.996	2.000	0.205	0.049	Y	NA
3715437	3715438	COXBU7E912_1071	CBUD_1072			TRUE	0.976	20.000	0.189	1.000	Y	NA
3715438	3715439	CBUD_1072	COXBU7E912_1073			TRUE	0.669	25.000	0.000	1.000	Y	NA
3715439	3715440	COXBU7E912_1073	COXBU7E912_1074			TRUE	0.960	0.000	0.000	1.000	Y	NA
3715441	3715442	COXBU7E912_1075	COXBU7E912_1077		pyrD	TRUE	0.961	-3.000	0.003	NA		NA
3715446	3715447	CBUD_1080	COXBU7E912_1081	ybgT	cydB1	TRUE	0.956	11.000	0.070	NA		NA
3715447	3715448	COXBU7E912_1081	COXBU7E912_1082	cydB1	cydA1	TRUE	0.999	-3.000	0.953	0.030	Y	NA
3715448	3715449	COXBU7E912_1082	CBUD_1083	cydA1		TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
3715449	3715450	CBUD_1083	CBUD_1084			FALSE	0.023	261.000	0.000	NA		NA
3715451	3715452	CBUD_1085	COXBU7E912_1086			TRUE	0.907	0.000	0.000	1.000	N	NA
3715453	3715454	COXBU7E912_1087	COXBU7E912_1088			TRUE	0.515	13.000	0.000	NA		NA
3715455	5608982	COXBU7E912_1089	CBUD_1089a			FALSE	0.145	35.000	0.000	NA		NA
5608982	5608983	CBUD_1089a	CBUD_1089b			FALSE	0.449	15.000	0.000	NA		NA
5608983	5608984	CBUD_1089b	CBUD_1090a			FALSE	0.081	74.000	0.000	NA		NA
3715458	3715459	COXBU7E912_1092	COXBU7E912_1093			FALSE	0.074	137.000	0.000	NA		NA
3715459	3715460	COXBU7E912_1093	COXBU7E912_1094		nudC	TRUE	0.582	19.000	0.000	1.000	N	NA
3715460	3715461	COXBU7E912_1094	CBUD_1095	nudC		TRUE	0.889	3.000	0.000	1.000	N	NA
3715461	3715462	CBUD_1095	COXBU7E912_1096			FALSE	0.099	89.000	0.000	NA		NA
3715462	3715463	COXBU7E912_1096	COXBU7E912_1097		cas1_1	FALSE	0.034	218.000	0.000	NA		NA
3715463	5608985	COXBU7E912_1097	CBUD_1097a	cas1_1		TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
5608985	5608986	CBUD_1097a	CBUD_1097b			FALSE	0.097	47.000	0.000	NA		NA
5608986	3715465	CBUD_1097b	COXBU7E912_1099		csy1_1	FALSE	0.080	61.000	0.000	NA		NA
3715465	3715466	COXBU7E912_1099	CBUD_1100	csy1_1	csy2_1	TRUE	0.974	-51.000	0.895	NA		NA
3715466	3715467	CBUD_1100	COXBU7E912_1101	csy2_1	csy3_1	TRUE	0.993	12.000	0.787	NA		NA
3715467	3715468	COXBU7E912_1101	COXBU7E912_1102	csy3_1	csy4_1	TRUE	0.997	-3.000	0.468	NA		NA
5608988	3715471	CBUD_1102b	COXBU7E912_1105			FALSE	0.081	69.000	0.000	NA		NA
5608989	5608990	CBUD_1106	CBUD_1107			FALSE	0.026	251.000	0.000	NA		NA
3715474	3715475	CBUD_1108	COXBU7E912_1109			FALSE	0.178	31.000	0.000	NA		NA
3715475	3715476	COXBU7E912_1109	COXBU7E912_1110			TRUE	0.800	0.000	0.000	NA		NA
3715478	3715479	CBUD_1112	COXBU7E912_1113			FALSE	0.097	99.000	0.000	NA		NA
3715480	3715481	CBUD_1114	COXBU7E912_1115			TRUE	0.687	-7.000	0.000	NA		NA
3715482	3715483	CBUD_1116	COXBU7E912_1117			FALSE	0.083	124.000	0.000	NA		NA
3715483	5608991	COXBU7E912_1117	CBUD_1117a			FALSE	0.056	164.000	0.000	NA		NA
5608991	5608992	CBUD_1117a	CBUD_1117b			FALSE	0.096	86.000	0.000	NA		NA
5608992	5608993	CBUD_1117b	CBUD_1117c			TRUE	0.687	-7.000	0.000	NA		NA
5608993	3715487	CBUD_1117c	COXBU7E912_1121			FALSE	0.022	273.000	0.000	NA		NA
3715487	3715488	COXBU7E912_1121	COXBU7E912_1122			TRUE	0.746	4.000	0.000	NA		NA
5608994	5608995	CBUD_1124a	CBUD_1124b			FALSE	0.308	22.000	0.000	NA		NA
5608995	5608996	CBUD_1124b	CBUD_1124c			FALSE	0.112	42.000	0.000	NA		NA
5608996	3715492	CBUD_1124c	CBUD_1126		rhuM	FALSE	0.015	389.000	0.000	NA		NA
3715492	3715493	CBUD_1126	COXBU7E912_1127	rhuM		FALSE	0.082	125.000	0.000	NA		NA
3715493	5608997	COXBU7E912_1127	CBUD_1127a			FALSE	0.028	241.000	0.000	NA		NA
3715495	3715496	COXBU7E912_1129	CBUD_1130			FALSE	0.102	45.000	0.000	NA		NA
3715498	3715499	COXBU7E912_1132	COXBU7E912_1133		mutY	TRUE	0.993	-3.000	0.150	NA	N	NA
3715499	3715500	COXBU7E912_1133	CBUD_1134	mutY		TRUE	0.869	6.000	0.000	NA	N	NA
3715500	3715501	CBUD_1134	COXBU7E912_1135			TRUE	0.687	7.000	0.000	NA		NA
5608998	5608999	CBUD_1134a	CBUD_1134b			TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
3715504	3715505	COXBU7E912_1138	COXBU7E912_1139			FALSE	0.035	193.000	0.000	1.000		NA
3715505	3715506	COXBU7E912_1139	COXBU7E912_1140			TRUE	0.656	6.000	0.000	1.000		NA
3715506	3715507	COXBU7E912_1140	COXBU7E912_1142			TRUE	0.998	1.000	0.688	0.086	N	NA
3715509	3715510	CBUD_1143	CBUD_1144	glpD	mpg	TRUE	0.696	-16.000	0.000	1.000	N	NA
3715510	3715511	CBUD_1144	CBUD_1145	mpg		FALSE	0.130	-130.000	0.000	1.000		NA
3715511	3715512	CBUD_1145	COXBU7E912_1146		pdxH	FALSE	0.259	22.000	0.000	1.000		NA
3715512	3715513	COXBU7E912_1146	COXBU7E912_1147	pdxH	mmsA	FALSE	0.324	32.000	0.000	1.000	N	NA
3715513	3715514	COXBU7E912_1147	COXBU7E912_1148	mmsA	mmsB	TRUE	0.964	10.000	0.043	0.001	N	NA
3715514	3715515	COXBU7E912_1148	COXBU7E912_1149	mmsB		FALSE	0.224	101.000	0.000	NA	N	NA
3715515	3715516	COXBU7E912_1149	COXBU7E912_1151		mdmC	TRUE	0.779	2.000	0.000	NA		NA
5609000	3715519	CBUD_1150a	COXBU7E912_1153			FALSE	0.178	31.000	0.000	NA		NA
5609001	5609002	CBUD_1154	CBUD_1155	kup		TRUE	0.507	-15.000	0.000	NA		NA
5609003	5609004	CBUD_1156	CBUD_1157			TRUE	0.779	2.000	0.000	NA		NA
5609004	3715524	CBUD_1157	COXBU7E912_1158			FALSE	0.365	19.000	0.000	NA		NA
3715525	3715526	CBUD_1159	COXBU7E912_1160	enhB.1		TRUE	0.779	2.000	0.000	NA		NA
3715526	3715527	COXBU7E912_1160	CBUD_1161			FALSE	0.028	241.000	0.000	NA		NA
3715527	3715528	CBUD_1161	COXBU7E912_1162		prpD	TRUE	0.779	2.000	0.000	NA		NA
3715528	5609005	COXBU7E912_1162	CBUD_1163	prpD		FALSE	0.015	362.000	0.000	NA		NA
5609005	3715530	CBUD_1163	COXBU7E912_1164			FALSE	0.087	118.000	0.000	NA		NA
3715531	3715532	COXBU7E912_1165	COXBU7E912_1166			FALSE	0.211	28.000	0.000	NA		NA
5609006	5609007	CBUD_1169	CBUD_1170		cyaA	FALSE	0.402	17.000	0.000	NA		NA
5609007	3715537	CBUD_1170	COXBU7E912_1171	cyaA		FALSE	0.420	-19.000	0.000	NA		NA
3715540	3715541	COXBU7E912_1174	COXBU7E912_1175	tgt		TRUE	0.746	4.000	0.000	NA		NA
3715542	3715543	CBUD_1176	COXBU7E912_1177			TRUE	0.844	-58.000	0.045	1.000	N	NA
3715543	3715544	COXBU7E912_1177	COXBU7E912_1178			FALSE	0.093	48.000	0.000	NA		NA
3715544	3715545	COXBU7E912_1178	COXBU7E912_1179		nagZ	FALSE	0.080	63.000	0.000	NA		NA
3715545	3715546	COXBU7E912_1179	COXBU7E912_1180	nagZ		TRUE	0.698	4.000	0.000	1.000		NA
3715546	3715547	COXBU7E912_1180	COXBU7E912_1181			TRUE	0.610	8.000	0.000	1.000		NA
3715547	3715548	COXBU7E912_1181	COXBU7E912_1182			FALSE	0.085	78.000	0.000	NA		NA
3715548	3715549	COXBU7E912_1182	CBUD_1183			FALSE	0.080	73.000	0.000	NA		NA
3715549	3715551	CBUD_1183	CBUD_1185		miaA	FALSE	0.049	182.000	0.000	NA		NA
3715551	3715552	CBUD_1185	CBUD_1186	miaA	mutL	TRUE	0.906	-75.000	0.188	0.085	N	NA
3715552	3715553	CBUD_1186	CBUD_1187	mutL		FALSE	0.156	61.000	0.000	0.085	N	NA
3715553	3715554	CBUD_1187	CBUD_1188			FALSE	0.260	38.000	0.000	1.000	N	NA
5609008	5609009	CBUD_1188a	CBUD_1188b			FALSE	0.088	79.000	0.000	NA		NA
3715556	3715557	COXBU7E912_1190	COXBU7E912_1191			TRUE	0.950	14.000	0.118	NA		NA
3715559	3715560	COXBU7E912_1193	COXBU7E912_1194			TRUE	0.998	0.000	0.600	NA	N	NA
3715561	3715562	COXBU7E912_1195	CBUD_1196			TRUE	0.767	3.000	0.000	NA		NA
3715562	3715563	CBUD_1196	COXBU7E912_1197		fumC	TRUE	0.746	4.000	0.000	NA		NA
3715563	3715564	COXBU7E912_1197	COXBU7E912_1198	fumC		FALSE	0.081	67.000	0.000	NA		NA
3715564	5609012	COXBU7E912_1198	CBUD_1198a			FALSE	0.176	-90.000	0.000	NA		NA
5609012	5609013	CBUD_1198a	CBUD_1198b			FALSE	0.099	90.000	0.000	NA		NA
3715566	3715567	COXBU7E912_1200	COXBU7E912_1201		lepB1	FALSE	0.070	143.000	0.000	NA		NA
3715567	3715568	COXBU7E912_1201	CBUD_1202	lepB1		TRUE	0.621	10.000	0.000	NA		NA
5609014	3715570	CBUD_1202a	COXBU7E912_1204			FALSE	0.094	105.000	0.000	NA		NA
5609015	5609016	CBUD_1205a	CBUD_1205b			FALSE	0.088	79.000	0.000	NA		NA
5609016	3715573	CBUD_1205b	COXBU7E912_1208			FALSE	0.076	135.000	0.000	NA		NA
3715573	3715575	COXBU7E912_1208	CBUD_1209			FALSE	0.081	70.000	0.000	NA		NA
3715576	3715577	CBUD_1210	CBUD_1211			FALSE	0.081	68.000	0.000	NA		NA
3715577	5609017	CBUD_1211	CBUD_1212			FALSE	0.319	-30.000	0.000	NA		NA
5609017	5609018	CBUD_1212	CBUD_1213			FALSE	0.041	200.000	0.000	NA		NA
5609018	5609019	CBUD_1213	CBUD_1214			FALSE	0.098	97.000	0.000	NA		NA
3715582	3715583	COXBU7E912_1216	COXBU7E912_1217	ald	etfA	FALSE	0.338	29.000	0.000	0.029	N	NA
3715583	3715584	COXBU7E912_1217	COXBU7E912_1218	etfA	etfB	TRUE	0.953	-3.000	0.000	0.006	Y	NA
3715584	3715585	COXBU7E912_1218	CBUD_1219	etfB		TRUE	0.905	-3.000	0.000	1.000	N	NA
3715588	3715589	CBUD_1222	CBUD_1223	enhA2	cbpA	FALSE	0.064	152.000	0.000	NA		NA
3715589	3715590	CBUD_1223	COXBU7E912_1224	cbpA	cbpM	TRUE	0.994	3.000	0.286	NA		NA
3715590	3715591	COXBU7E912_1224	COXBU7E912_1225	cbpM		TRUE	0.746	4.000	0.000	NA		NA
3715592	3715593	CBUD_1226	COXBU7E912_1227			FALSE	0.360	-24.000	0.000	NA		NA
3715593	3715594	COXBU7E912_1227	COXBU7E912_1228		iscS	TRUE	0.944	7.000	0.011	1.000		NA
3715594	3715595	COXBU7E912_1228	CBUD_1229	iscS		TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
3715595	3715596	CBUD_1229	COXBU7E912_1230			TRUE	0.641	-9.000	0.000	NA		NA
5609020	3715597	CBUD_1230a	CBUD_1231		suhB	TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
3715600	3715601	COXBU7E912_1234	COXBU7E912_1235	enhC	enhB	TRUE	0.998	-3.000	0.750	NA		NA
3715601	3715602	COXBU7E912_1235	CBUD_1236	enhB	enhA1	TRUE	0.515	13.000	0.000	NA		NA
3715602	3715603	CBUD_1236	COXBU7E912_1237	enhA1		FALSE	0.020	287.000	0.000	NA		NA
3715603	5609022	COXBU7E912_1237	CBUD_1237a			FALSE	0.080	72.000	0.000	NA		NA
3715605	3715606	COXBU7E912_1238	COXBU7E912_1240	secF	secD	TRUE	0.991	0.000	0.030	0.001	Y	NA
3715606	3715607	COXBU7E912_1240	COXBU7E912_1241	secD	yajC	TRUE	0.942	16.000	0.007	NA	Y	NA
3715607	5609023	COXBU7E912_1241	CBUD_1241a	yajC		FALSE	0.227	27.000	0.000	NA		NA
3715611	3715612	CBUD_1245	COXBU7E912_1246	trmU	mfd	TRUE	0.725	12.000	0.000	0.083	N	NA
3715612	3715613	COXBU7E912_1246	COXBU7E912_1247	mfd		FALSE	0.069	144.000	0.000	NA		NA
3715615	5609025	COXBU7E912_1249	CBUD_1249a	trpE		FALSE	0.021	276.000	0.000	NA		NA
5609025	5609026	CBUD_1249a	CBUD_1251		trpD	TRUE	0.651	9.000	0.000	NA		NA
5609026	3715618	CBUD_1251	COXBU7E912_1252	trpD	trpC	TRUE	0.687	-7.000	0.000	NA		NA
3715618	3715619	COXBU7E912_1252	CBUD_1253	trpC	trpBF	TRUE	0.919	-7.000	0.000	0.002	Y	NA
3715619	3715620	CBUD_1253	COXBU7E912_1255	trpBF	trpA	TRUE	0.774	17.000	0.000	0.001	Y	NA
3715622	5609027	COXBU7E912_1256	CBUD_1256a			FALSE	0.402	17.000	0.000	NA		NA
5609027	3715623	CBUD_1256a	CBUD_1257			FALSE	0.173	-94.000	0.000	NA		NA
5609028	5609029	CBUD_1257a	CBUD_1257b			TRUE	0.746	4.000	0.000	NA		NA
5609029	5609030	CBUD_1257b	CBUD_1257c			FALSE	0.093	107.000	0.000	NA		NA
5609030	5609031	CBUD_1257c	CBUD_1257d			FALSE	0.238	26.000	0.000	NA		NA
3715626	3715627	COXBU7E912_1260	COXBU7E912_1261			FALSE	0.097	99.000	0.000	NA		NA
3715627	3715628	COXBU7E912_1261	COXBU7E912_1262			FALSE	0.193	64.000	0.000	NA	N	NA
3715628	3715629	COXBU7E912_1262	COXBU7E912_1263			FALSE	0.066	149.000	0.000	NA		NA
3715630	3715631	CBUD_1264	CBUD_1265			TRUE	0.753	22.000	0.005	NA		NA
3715633	3715634	COXBU7E912_1267	COXBU7E912_1268			TRUE	0.687	7.000	0.000	NA		NA
3715636	3715637	COXBU7E912_1270	COXBU7E912_1271			FALSE	0.109	43.000	0.000	NA		NA
5609034	3715638	CBUD_1271a	COXBU7E912_1272		thiI	FALSE	0.121	39.000	0.000	NA		NA
3715638	3715639	COXBU7E912_1272	COXBU7E912_1273	thiI		TRUE	0.997	1.000	0.349	1.000	N	NA
3715641	3715642	COXBU7E912_1275	COXBU7E912_1276		uvrC	FALSE	0.202	103.000	0.000	1.000	N	NA
3715642	3715643	COXBU7E912_1276	COXBU7E912_1277	uvrC		FALSE	0.178	31.000	0.000	NA		NA
5609035	3715644	CBUD_1276a	COXBU7E912_1279			FALSE	0.034	218.000	0.000	NA		NA
3715645	3715646	COXBU7E912_1278	COXBU7E912_1280	serS		TRUE	0.668	76.000	0.078	0.082	N	NA
3715646	3715647	COXBU7E912_1280	COXBU7E912_1281		lolA	TRUE	0.972	-16.000	0.167	1.000	N	NA
3715647	3715648	COXBU7E912_1281	COXBU7E912_1282	lolA		TRUE	0.989	12.000	0.305	1.000	N	NA
5609036	3715649	CBUD_1282a	COXBU7E912_1283		trxB	FALSE	0.449	15.000	0.000	NA		NA
3715649	3715650	COXBU7E912_1283	COXBU7E912_1284	trxB		FALSE	0.238	26.000	0.000	NA		NA
3715650	3715651	COXBU7E912_1284	COXBU7E912_1285		infA	FALSE	0.080	62.000	0.000	NA		NA
5609037	3715653	CBUD_1286a	CBUD_1287			FALSE	0.099	90.000	0.000	NA		NA
3715653	5609038	CBUD_1287	CBUD_1287a			FALSE	0.152	34.000	0.000	NA		NA
3715654	3715655	CBUD_1288	COXBU7E912_1289	icd	queA	FALSE	0.223	44.000	0.000	1.000	N	NA
3715656	3715657	COXBU7E912_1290	COXBU7E912_1291			FALSE	0.080	64.000	0.000	NA		NA
3715657	3715658	COXBU7E912_1291	CBUD_1292			TRUE	0.877	4.000	0.000	1.000	N	NA
3715659	3715660	CBUD_1293	CBUD_1294			FALSE	0.381	18.000	0.000	NA		NA
3715662	3715663	COXBU7E912_1296	COXBU7E912_1297			FALSE	0.015	359.000	0.000	NA		NA
3715664	5609039	COXBU7E912_1298	CBUD_1298a			FALSE	0.164	-120.000	0.000	NA		NA
3715665	5609040	COXBU7E912_1299	CBUD_1299a			FALSE	0.075	136.000	0.000	NA		NA
5609041	5609042	CBUD_1300	CBUD_1301			FALSE	0.402	17.000	0.000	NA		NA
3715668	3715669	COXBU7E912_1302	COXBU7E912_1303			FALSE	0.025	254.000	0.000	NA		NA
3715669	3715670	COXBU7E912_1303	COXBU7E912_1304		purC	TRUE	0.787	1.000	0.000	NA		NA
3715670	3715671	COXBU7E912_1304	COXBU7E912_1305	purC		TRUE	0.969	0.000	0.009	NA		NA
3715671	3715672	COXBU7E912_1305	CBUD_1306		dapA	TRUE	0.924	17.000	0.088	NA		NA
3715672	3715674	CBUD_1306	CBUD_1308	dapA	kdgK	FALSE	0.090	202.000	0.000	1.000	N	NA
3715676	3715677	CBUD_1310	CBUD_1311			TRUE	0.755	-3.000	0.000	1.000		NA
3715678	3715679	CBUD_1312	COXBU7E912_1313	qseB	qseC	TRUE	0.995	-3.000	0.143	0.051	Y	NA
3715679	3715680	COXBU7E912_1313	CBUD_1314	qseC		FALSE	0.041	200.000	0.000	NA		NA
3715680	3715681	CBUD_1314	COXBU7E912_1315			TRUE	0.987	-3.000	0.098	NA		NA
3715683	3715684	COXBU7E912_1317	COXBU7E912_1318			TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
3715684	3715685	COXBU7E912_1318	CBUD_1319			FALSE	0.080	63.000	0.000	NA		NA
3715685	3715686	CBUD_1319	COXBU7E912_1320		orn	FALSE	0.059	159.000	0.000	NA		NA
3715686	5609043	COXBU7E912_1320	CBUD_1320a	orn		FALSE	0.051	177.000	0.000	NA		NA
3715687	3715688	CBUD_1321	COXBU7E912_1322			TRUE	0.767	3.000	0.000	NA		NA
3715690	3715691	COXBU7E912_1324	COXBU7E912_1325	gcp	mdh	TRUE	0.819	9.000	0.000	1.000	N	NA
3715691	3715692	COXBU7E912_1325	COXBU7E912_1326	mdh		FALSE	0.099	195.000	0.000	1.000	N	NA
3715693	3715694	COXBU7E912_1327	COXBU7E912_1328	xseA		TRUE	0.755	-3.000	0.000	1.000		NA
3715695	3715697	COXBU7E912_1329	COXBU7E912_1331	engA		FALSE	0.196	226.000	0.009	1.000		NA
3715697	3715698	COXBU7E912_1331	COXBU7E912_1332		hisS	TRUE	0.942	23.000	0.259	1.000		NA
3715698	3715699	COXBU7E912_1332	CBUD_1333	hisS		TRUE	0.972	-3.000	0.021	1.000		NA
3715699	3715700	CBUD_1333	CBUD_1334			FALSE	0.254	-43.000	0.000	NA		NA
5609044	5609045	CBUD_1337	CBUD_1338			FALSE	0.346	-27.000	0.000	NA		NA
3715706	3715707	COXBU7E912_1340	COXBU7E912_1341			TRUE	0.687	-7.000	0.000	NA		NA
3715709	3715710	COXBU7E912_1343	COXBU7E912_1344			FALSE	0.007	453.000	0.000	0.056		NA
3715710	3715711	COXBU7E912_1344	COXBU7E912_1345			FALSE	0.078	98.000	0.000	1.000		NA
3715711	3715712	COXBU7E912_1345	COXBU7E912_1346			TRUE	0.965	-3.000	0.007	NA		NA
3715712	3715713	COXBU7E912_1346	COXBU7E912_1347			FALSE	0.273	24.000	0.000	NA		NA
3715713	5609046	COXBU7E912_1347	CBUD_1348			FALSE	0.344	20.000	0.000	NA		NA
5609046	5609047	CBUD_1348	CBUD_1349			FALSE	0.106	44.000	0.000	NA		NA
5609047	3715716	CBUD_1349	COXBU7E912_1350		lipB	FALSE	0.079	129.000	0.000	NA		NA
3715716	3715717	COXBU7E912_1350	COXBU7E912_1351	lipB	lipA	TRUE	0.966	-70.000	0.319	0.001	Y	NA
3715717	3715718	COXBU7E912_1351	COXBU7E912_1352	lipA		TRUE	0.488	111.000	0.003	1.000	N	NA
3715718	5609048	COXBU7E912_1352	CBUD_1352a		scvA	FALSE	0.106	44.000	0.000	NA		NA
3715719	3715720	CBUD_1353	COXBU7E912_1354			TRUE	0.687	7.000	0.000	NA		NA
5609049	5609050	CBUD_1357a	CBUD_1357b			FALSE	0.080	72.000	0.000	NA		NA
5609050	5609051	CBUD_1357b	CBUD_1358			TRUE	0.515	13.000	0.000	NA		NA
5609051	5609052	CBUD_1358	CBUD_1359			TRUE	0.746	4.000	0.000	NA		NA
5609053	3715728	CBUD_1359a	COXBU7E912_1362			FALSE	0.084	123.000	0.000	NA		NA
3715729	3715730	COXBU7E912_1363	COXBU7E912_1364			TRUE	0.725	-6.000	0.000	NA		NA
3715730	3715731	COXBU7E912_1364	COXBU7E912_1365			TRUE	0.916	31.000	0.333	0.045		NA
3715732	3715733	CBUD_1366	COXBU7E912_1367	eda		TRUE	0.772	11.000	0.000	1.000	N	NA
3715733	3715734	COXBU7E912_1367	COXBU7E912_1368		exoD	TRUE	0.564	-12.000	0.000	NA		NA
3715734	5609054	COXBU7E912_1368	CBUD_1368a	exoD		FALSE	0.100	46.000	0.000	NA		NA
3715736	3715737	COXBU7E912_1370	CBUD_1371	carB	carA	TRUE	0.931	82.000	0.345	0.001	Y	NA
3715738	3715739	CBUD_1372	COXBU7E912_1373			FALSE	0.075	106.000	0.000	1.000		NA
3715739	3715740	COXBU7E912_1373	COXBU7E912_1374			TRUE	0.755	-3.000	0.000	1.000		NA
3715740	3715741	COXBU7E912_1374	COXBU7E912_1375			FALSE	0.080	71.000	0.000	NA		NA
3715742	3715743	COXBU7E912_1376	COXBU7E912_1377		dnaJ	FALSE	0.096	100.000	0.000	NA		NA
3715743	3715744	COXBU7E912_1377	COXBU7E912_1378	dnaJ	dnaK	TRUE	0.867	143.000	0.236	0.005	Y	NA
3715745	3715746	COXBU7E912_1379	COXBU7E912_1380			TRUE	0.767	3.000	0.000	NA		NA
3715747	3715748	CBUD_1381	COXBU7E912_1382	grpE		FALSE	0.081	55.000	0.000	NA		NA
3715748	3715749	COXBU7E912_1382	COXBU7E912_1383			TRUE	0.975	-10.000	0.167	NA		NA
3715750	3715751	COXBU7E912_1384	CBUD_1385		recN	TRUE	0.872	-151.000	0.170	1.000	N	NA
5609056	5609057	CBUD_1386	CBUD_1387			FALSE	0.220	-58.000	0.000	NA		NA
5609057	3715754	CBUD_1387	CBUD_1388			FALSE	0.068	146.000	0.000	NA		NA
3715754	3715755	CBUD_1388	COXBU7E912_1389		fur	FALSE	0.114	41.000	0.000	NA		NA
3715757	3715758	COXBU7E912_1390	COXBU7E912_1392			TRUE	0.978	-3.000	0.035	NA		NA
3715759	3715760	COXBU7E912_1393	COXBU7E912_1394	smpB	msrA	TRUE	0.929	-7.000	0.000	1.000	Y	NA
5609058	3715765	CBUD_1396a	CBUD_1399	hetM		FALSE	0.025	253.000	0.000	NA		NA
3715765	3715766	CBUD_1399	COXBU7E912_1400			FALSE	0.227	27.000	0.000	NA		NA
3715766	3715767	COXBU7E912_1400	COXBU7E912_1401			FALSE	0.041	200.000	0.000	NA		NA
3715767	3715768	COXBU7E912_1401	CBUD_1402			FALSE	0.037	209.000	0.000	NA		NA
3715768	3715769	CBUD_1402	COXBU7E912_1403			FALSE	0.017	317.000	0.000	NA		NA
3715769	3715770	COXBU7E912_1403	CBUD_1404			FALSE	0.031	233.000	0.000	NA		NA
3715771	3715772	COXBU7E912_1405	CBUD_1406			FALSE	0.011	565.000	0.000	NA		NA
3715772	3715773	CBUD_1406	COXBU7E912_1407			FALSE	0.121	39.000	0.000	NA		NA
3715773	3715774	COXBU7E912_1407	COXBU7E912_1408			FALSE	0.083	77.000	0.000	NA		NA
3715774	3715775	COXBU7E912_1408	COXBU7E912_1409		ihfA	TRUE	0.982	-31.000	0.535	1.000	N	NA
3715775	3715776	COXBU7E912_1409	COXBU7E912_1410	ihfA	pheT	TRUE	0.992	5.000	0.208	1.000	N	NA
3715776	3715777	COXBU7E912_1410	COXBU7E912_1411	pheT	pheS	TRUE	0.999	0.000	0.574	0.001	Y	NA
3715777	3715778	COXBU7E912_1411	COXBU7E912_1412	pheS	rplT	TRUE	0.881	77.000	0.202	1.000	Y	NA
3715779	3715780	COXBU7E912_1413	COXBU7E912_1414	rpmI	infC	TRUE	0.994	-19.000	0.652	1.000	Y	NA
3715780	3715781	COXBU7E912_1414	COXBU7E912_1415	infC	thrS	TRUE	0.885	83.000	0.186	1.000	Y	NA
5609061	5609062	CBUD_1416a	CBUD_1416b			FALSE	0.220	-58.000	0.000	NA		NA
5609062	3715784	CBUD_1416b	COXBU7E912_1418			FALSE	0.273	24.000	0.000	NA		NA
3715786	3715787	COXBU7E912_1420	COXBU7E912_1422			FALSE	0.050	154.000	0.000	1.000		NA
3715791	3715792	COXBU7E912_1424	COXBU7E912_1426		dnaE	FALSE	0.197	109.000	0.000	1.000	N	NA
3715792	3715793	COXBU7E912_1426	CBUD_1427	dnaE		TRUE	0.881	2.000	0.000	0.037	N	NA
3715793	3715794	CBUD_1427	COXBU7E912_1428		rnhB	FALSE	0.148	147.000	0.000	1.000	N	NA
3715794	3715795	COXBU7E912_1428	CBUD_1429	rnhB		TRUE	0.553	12.000	0.000	NA		NA
3715795	3715796	CBUD_1429	COXBU7E912_1430		guaA	TRUE	0.532	-13.000	0.000	NA		NA
3715796	3715797	COXBU7E912_1430	COXBU7E912_1431	guaA	guaB	TRUE	0.913	37.000	0.190	0.001	Y	NA
3715797	3715798	COXBU7E912_1431	COXBU7E912_1432	guaB		FALSE	0.099	94.000	0.000	NA		NA
3715799	3715800	CBUD_1433	CBUD_1435		treA	FALSE	0.137	251.000	0.000	1.000	Y	NA
5609063	3715803	CBUD_1435a	CBUD_1437			FALSE	0.083	77.000	0.000	NA		NA
3715804	3715805	COXBU7E912_1438	CBUD_1439	glmM	folP	TRUE	0.869	89.000	0.260	1.000	N	NA
3715805	3715806	CBUD_1439	COXBU7E912_1440	folP	hflB	TRUE	0.906	43.000	0.325	1.000	N	NA
3715806	3715807	COXBU7E912_1440	COXBU7E912_1441	hflB	rrmJ	TRUE	0.889	20.000	0.019	NA	N	NA
3715807	3715808	COXBU7E912_1441	COXBU7E912_1442	rrmJ		FALSE	0.308	22.000	0.000	NA		NA
3715808	3715809	COXBU7E912_1442	COXBU7E912_1443		sufA	TRUE	0.993	2.000	0.235	NA		NA
3715809	3715810	COXBU7E912_1443	CBUD_1444	sufA	iscU	TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
3715810	3715811	CBUD_1444	COXBU7E912_1445	iscU	sufS	TRUE	0.959	-7.000	0.006	1.000	N	NA
3715811	3715812	COXBU7E912_1445	COXBU7E912_1446	sufS	sufD	TRUE	0.961	-7.000	0.007	1.000	N	NA
3715812	3715813	COXBU7E912_1446	COXBU7E912_1447	sufD	sufC	TRUE	0.999	-3.000	0.482	1.000	Y	NA
3715813	3715814	COXBU7E912_1447	CBUD_1448	sufC	sufB	TRUE	0.986	24.000	0.466	1.000	Y	NA
3715814	3715815	CBUD_1448	COXBU7E912_1449	sufB	sufR	TRUE	0.949	-19.000	0.078	NA	N	NA
3715816	3715817	COXBU7E912_1450	COXBU7E912_1451			TRUE	0.842	-7.000	0.000	1.000	N	NA
3715817	3715818	COXBU7E912_1451	COXBU7E912_1452			FALSE	0.228	24.000	0.000	1.000		NA
3715819	5609064	COXBU7E912_1453	CBUD_1454			FALSE	0.048	183.000	0.000	NA		NA
3715823	3715824	COXBU7E912_1457	COXBU7E912_1458		yeaZ	FALSE	0.044	193.000	0.000	NA		NA
3715824	3715825	COXBU7E912_1458	COXBU7E912_1459	yeaZ		FALSE	0.069	144.000	0.000	NA		NA
3715826	3715827	COXBU7E912_1460	COXBU7E912_1461	pabB		TRUE	0.905	-3.000	0.000	1.000	N	NA
5609067	5609068	CBUD_1462c	CBUD_1462d			FALSE	0.077	131.000	0.000	NA		NA
5609069	5609070	CBUD_1462e	CBUD_1462f			FALSE	0.057	162.000	0.000	NA		NA
5609070	3715832	CBUD_1462f	COXBU7E912_1466		cysQ1	FALSE	0.030	235.000	0.000	NA		NA
3715832	3715833	COXBU7E912_1466	CBUD_1467	cysQ1	nudE	TRUE	0.989	-10.000	0.373	1.000		NA
3715836	3715837	COXBU7E912_1470	COXBU7E912_1472			TRUE	0.767	3.000	0.000	NA		NA
3715838	3715839	COXBU7E912_1471	COXBU7E912_1473			TRUE	0.666	8.000	0.000	NA		NA
3715839	3715840	COXBU7E912_1473	COXBU7E912_1474			TRUE	0.687	7.000	0.000	NA		NA
3715840	3715841	COXBU7E912_1474	COXBU7E912_1475			TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
3715841	3715842	COXBU7E912_1475	COXBU7E912_1476		nadA	TRUE	0.915	-3.000	0.000	NA	N	NA
3715842	5609072	COXBU7E912_1476	CBUD_1476a	nadA	glpE	FALSE	0.024	260.000	0.000	NA		NA
5609072	3715844	CBUD_1476a	CBUD_1478	glpE		FALSE	0.102	45.000	0.000	NA		NA
5609073	3715846	CBUD_1479a	COXBU7E912_1480			FALSE	0.042	197.000	0.000	NA		NA
3715846	3715847	COXBU7E912_1480	COXBU7E912_1481			TRUE	0.994	3.000	0.216	NA	N	NA
3715850	3715851	COXBU7E912_1484	COXBU7E912_1485			TRUE	0.881	-13.000	0.000	NA	Y	NA
3715852	3715853	CBUD_1486	CBUD_1487			TRUE	0.564	-12.000	0.000	NA		NA
3715853	3715854	CBUD_1487	COXBU7E912_1488			TRUE	0.883	51.000	0.200	1.000	Y	NA
3715854	3715856	COXBU7E912_1488	COXBU7E912_1490			FALSE	0.063	542.000	0.000	1.000	Y	NA
3715856	3715857	COXBU7E912_1490	COXBU7E912_1491			TRUE	0.799	10.000	0.000	1.000	N	NA
3715858	3715859	COXBU7E912_1492	COXBU7E912_1493			FALSE	0.035	215.000	0.000	NA		NA
3715859	3715860	COXBU7E912_1493	COXBU7E912_1494		miaB	TRUE	0.539	21.000	0.000	1.000	N	NA
3715860	3715861	COXBU7E912_1494	COXBU7E912_1495	miaB		TRUE	0.986	11.000	0.220	1.000	N	NA
3715861	3715862	COXBU7E912_1495	COXBU7E912_1496			TRUE	0.997	-3.000	0.457	NA		NA
3715862	3715863	COXBU7E912_1496	COXBU7E912_1497			TRUE	0.605	-10.000	0.000	NA		NA
3715863	3715864	COXBU7E912_1497	CBUD_1498		corC	FALSE	0.252	43.000	0.000	NA	N	NA
3715864	3715865	CBUD_1498	COXBU7E912_1499	corC	lnt	TRUE	0.997	-7.000	0.557	NA	N	NA
3715865	5609074	COXBU7E912_1499	CBUD_1500	lnt		FALSE	0.344	20.000	0.000	NA		NA
5609074	3715867	CBUD_1500	CBUD_1501			FALSE	0.080	57.000	0.000	NA		NA
3715867	3715868	CBUD_1501	CBUD_1502			FALSE	0.098	95.000	0.000	NA		NA
3715868	3715870	CBUD_1502	CBUD_1504			FALSE	0.071	142.000	0.000	NA		NA
3715872	3715873	COXBU7E912_1506	CBUD_1507	leuS		TRUE	0.985	-10.000	0.182	NA	N	NA
3715873	3715874	CBUD_1507	COXBU7E912_1508		holA	TRUE	0.994	3.000	0.199	NA	N	NA
3715874	3715875	COXBU7E912_1508	CBUD_1509	holA	nadD	TRUE	0.898	-19.000	0.010	1.000	N	NA
3715875	3715876	CBUD_1509	COXBU7E912_1510	nadD		FALSE	0.038	206.000	0.000	NA		NA
3715876	3715877	COXBU7E912_1510	COXBU7E912_1511			FALSE	0.038	206.000	0.000	NA		NA
3715877	3715878	COXBU7E912_1511	COXBU7E912_1512			TRUE	0.987	-10.000	0.307	NA		NA
3715878	3715879	COXBU7E912_1512	CBUD_1513		pbpA	TRUE	0.777	20.000	0.004	NA		NA
3715879	3715880	CBUD_1513	CBUD_1514	pbpA	rodA	TRUE	0.741	43.000	0.073	1.000	N	NA
3715880	3715881	CBUD_1514	COXBU7E912_1515	rodA	mltB	TRUE	0.740	80.000	0.096	NA	N	NA
3715881	3715882	COXBU7E912_1515	COXBU7E912_1516	mltB		FALSE	0.420	-19.000	0.000	NA		NA
3715883	3715884	COXBU7E912_1517	CBUD_1518			TRUE	0.988	10.000	0.307	NA		NA
3715884	3715885	CBUD_1518	CBUD_1519			FALSE	0.080	59.000	0.000	NA		NA
3715885	5609075	CBUD_1519	CBUD_1520			FALSE	0.027	245.000	0.000	NA		NA
5609075	5609076	CBUD_1520	CBUD_1521			TRUE	0.564	-12.000	0.000	NA		NA
5609076	3715888	CBUD_1521	CBUD_1522		ligA	FALSE	0.032	231.000	0.000	NA		NA
3715888	3715889	CBUD_1522	CBUD_1523	ligA	zipA	TRUE	0.985	1.000	0.106	1.000		NA
3715889	3715890	CBUD_1523	COXBU7E912_1524	zipA	smc	TRUE	0.602	55.000	0.115	0.010		NA
3715890	3715891	COXBU7E912_1524	CBUD_1525	smc	tppB	FALSE	0.113	179.000	0.000	1.000	N	NA
3715895	3715897	COXBU7E912_1529	CBUD_1531			FALSE	0.029	212.000	0.000	1.000		NA
3715897	3715898	CBUD_1531	COXBU7E912_1532		pyrF	FALSE	0.462	63.000	0.024	1.000		NA
3715898	3715899	COXBU7E912_1532	CBUD_1533	pyrF		TRUE	0.989	4.000	0.125	1.000	N	NA
3715899	3715900	CBUD_1533	COXBU7E912_1534			TRUE	0.997	-3.000	0.576	NA		NA
3715900	3715901	COXBU7E912_1534	CBUD_1535		rpsA	FALSE	0.306	155.000	0.005	NA		NA
3715901	3715902	CBUD_1535	COXBU7E912_1536	rpsA	cmk	TRUE	0.844	132.000	0.281	1.000	N	NA
3715902	3715903	COXBU7E912_1536	COXBU7E912_1537	cmk	aroA	TRUE	0.995	1.000	0.209	1.000	N	NA
3715903	3715904	COXBU7E912_1537	COXBU7E912_1538	aroA	serC	TRUE	0.986	6.000	0.033	1.000	Y	NA
3715904	3715905	COXBU7E912_1538	CBUD_1539	serC	gyrA	TRUE	0.656	61.000	0.067	1.000	N	NA
3715905	3715906	CBUD_1539	COXBU7E912_1540	gyrA		FALSE	0.012	453.000	0.000	NA		NA
3715907	3715908	CBUD_1541	COXBU7E912_1542		leuA	TRUE	0.734	-13.000	0.000	1.000	N	NA
3715909	3715910	COXBU7E912_1543	COXBU7E912_1544		uvrB	FALSE	0.080	60.000	0.000	NA		NA
3715911	3715912	CBUD_1545	COXBU7E912_1546	aspC		FALSE	0.081	55.000	0.000	NA		NA
5609077	3715914	CBUD_1547	COXBU7E912_1548			FALSE	0.225	-57.000	0.000	NA		NA
3715914	5609078	COXBU7E912_1548	CBUD_1547b			FALSE	0.081	75.000	0.000	NA		NA
5609078	5609079	CBUD_1547b	CBUD_1547c			FALSE	0.080	57.000	0.000	NA		NA
5609079	5609080	CBUD_1547c	CBUD_1547d			FALSE	0.296	-34.000	0.000	NA		NA
5609080	5609081	CBUD_1547d	CBUD_1547e			FALSE	0.051	177.000	0.000	NA		NA
5609081	5609082	CBUD_1547e	CBUD_1547f			FALSE	0.083	54.000	0.000	NA		NA
5609083	5609084	CBUD_1547g	CBUD_1551a			FALSE	0.058	160.000	0.000	NA		NA
3715917	5609085	COXBU7E912_1551	CBUD_1551b			FALSE	0.025	254.000	0.000	NA		NA
5609085	5609086	CBUD_1551b	CBUD_1552			FALSE	0.049	182.000	0.000	NA		NA
5609086	5609087	CBUD_1552	CBUD_1553			FALSE	0.017	318.000	0.000	NA		NA
5609087	5609088	CBUD_1553	CBUD_1553a			FALSE	0.040	201.000	0.000	NA		NA
5609088	3715920	CBUD_1553a	COXBU7E912_1554			FALSE	0.158	33.000	0.000	NA		NA
3715922	3715923	COXBU7E912_1556	COXBU7E912_1557			TRUE	0.800	0.000	0.000	NA		NA
3715923	3715924	COXBU7E912_1557	COXBU7E912_1558			TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
5609091	3715927	CBUD_1559b	COXBU7E912_1561			FALSE	0.011	671.000	0.000	NA		NA
3715927	3715928	COXBU7E912_1561	COXBU7E912_1562			TRUE	0.800	0.000	0.000	NA		NA
3715929	3715930	COXBU7E912_1563	COXBU7E912_1564			TRUE	0.748	28.000	0.039	1.000		NA
5609092	3715931	CBUD_1564a	COXBU7E912_1565			FALSE	0.054	170.000	0.000	NA		NA
3715931	3715932	COXBU7E912_1565	COXBU7E912_1566		trpR	TRUE	0.515	13.000	0.000	NA		NA
3715933	5609093	COXBU7E912_1567	CBUD_1567a			FALSE	0.015	374.000	0.000	NA		NA
3715937	3715938	COXBU7E912_1571	COXBU7E912_1572			FALSE	0.186	120.000	0.000	1.000	N	NA
3715938	3715939	COXBU7E912_1572	COXBU7E912_1573		glnA	FALSE	0.264	163.000	0.000	1.000	Y	NA
3715941	5609094	COXBU7E912_1574	CBUD_1574a			FALSE	0.344	20.000	0.000	NA		NA
5609094	3715942	CBUD_1574a	COXBU7E912_1576		holB	FALSE	0.365	19.000	0.000	NA		NA
3715942	3715943	COXBU7E912_1576	COXBU7E912_1577	holB	tmk	TRUE	0.995	-3.000	0.211	1.000	N	NA
3715943	3715944	COXBU7E912_1577	COXBU7E912_1578	tmk		TRUE	0.981	-10.000	0.209	NA		NA
3715944	3715945	COXBU7E912_1578	COXBU7E912_1579		fabF	TRUE	0.940	10.000	0.019	NA		NA
3715945	3715946	COXBU7E912_1579	COXBU7E912_1580	fabF	acpP	TRUE	0.944	45.000	0.346	1.000	Y	NA
3715946	3715947	COXBU7E912_1580	COXBU7E912_1581	acpP	fabG	TRUE	0.914	68.000	0.321	0.006	Y	NA
3715947	3715948	COXBU7E912_1581	COXBU7E912_1582	fabG	fabD	TRUE	0.933	76.000	0.432	0.006	Y	NA
3715948	3715949	COXBU7E912_1582	COXBU7E912_1583	fabD	fabH	TRUE	0.873	101.000	0.182	0.006	Y	NA
3715949	3715950	COXBU7E912_1583	COXBU7E912_1584	fabH	plsX	TRUE	0.998	-3.000	0.380	0.006	Y	NA
3715950	3715951	COXBU7E912_1584	COXBU7E912_1585	plsX	rpmF	TRUE	0.995	8.000	0.418	1.000	N	NA
3715952	3715953	CBUD_1586	COXBU7E912_1587			FALSE	0.176	56.000	0.000	1.000	N	NA
3715954	3715955	COXBU7E912_1588	COXBU7E912_1589		rluC	FALSE	0.162	29.000	0.000	1.000		NA
3715957	3715958	COXBU7E912_1591	COXBU7E912_1592		artM	TRUE	0.515	13.000	0.000	NA		NA
3715958	3715959	COXBU7E912_1592	COXBU7E912_1593	artM	artQ	TRUE	0.999	-3.000	0.714	0.009	Y	NA
3715959	3715960	COXBU7E912_1593	COXBU7E912_1594	artQ	artI	TRUE	0.955	0.000	0.000	0.021	Y	NA
3715960	3715961	COXBU7E912_1594	COXBU7E912_1595	artI	artP	TRUE	0.946	4.000	0.000	1.000	Y	NA
3715963	5609095	CBUD_1596	CBUD_1597a	kdsB		TRUE	0.985	-10.000	0.265	NA		NA
3715965	3715968	COXBU7E912_1599	COXBU7E912_1601			FALSE	0.024	260.000	0.000	NA		NA
3715968	3715969	COXBU7E912_1601	COXBU7E912_1603		bph2_1	TRUE	0.553	12.000	0.000	NA		NA
3715969	3715970	COXBU7E912_1603	COXBU7E912_1604	bph2_1	recQ	FALSE	0.343	65.000	0.000	1.000	Y	NA
3715970	5609096	COXBU7E912_1604	CBUD_1605	recQ		FALSE	0.080	73.000	0.000	NA		NA
5609096	5609097	CBUD_1605	CBUD_1606			FALSE	0.388	-21.000	0.000	NA		NA
5609097	5609098	CBUD_1606	CBUD_1607			TRUE	0.779	2.000	0.000	NA		NA
3715974	3715975	COXBU7E912_1608	COXBU7E912_1609			FALSE	0.097	47.000	0.000	NA		NA
3715975	3715976	COXBU7E912_1609	COXBU7E912_1610		xseB	TRUE	0.515	13.000	0.000	NA		NA
3715977	5609099	COXBU7E912_1611	CBUD_1611a			FALSE	0.011	575.000	0.000	NA		NA
5609099	3715978	CBUD_1611a	COXBU7E912_1612		lpdA	FALSE	0.061	155.000	0.000	NA		NA
3715978	3715979	COXBU7E912_1612	COXBU7E912_1613	lpdA	aceF	TRUE	0.995	13.000	0.463	1.000	Y	NA
3715979	3715980	COXBU7E912_1613	COXBU7E912_1614	aceF	aceE	TRUE	0.841	66.000	0.167	0.042	Y	NA
3715980	3715981	COXBU7E912_1614	COXBU7E912_1615	aceE		TRUE	0.538	45.000	0.028	1.000		NA
3715981	3715982	COXBU7E912_1615	CBUD_1616		rosB	TRUE	0.486	76.000	0.042	0.052		NA
3715982	3715983	CBUD_1616	CBUD_1617	rosB		FALSE	0.388	-21.000	0.000	NA		NA
3715985	3715986	COXBU7E912_1619	COXBU7E912_1620	trx	adk	TRUE	0.589	34.000	0.013	1.000		NA
3715986	3715987	COXBU7E912_1620	CBUD_1621	adk	fimT	FALSE	0.317	35.000	0.000	NA	N	NA
3715987	3715988	CBUD_1621	COXBU7E912_1622	fimT		TRUE	0.906	2.000	0.000	NA	N	NA
3715988	3715989	COXBU7E912_1622	CBUD_1623			TRUE	0.996	-3.000	0.349	NA		NA
3715991	5609100	COXBU7E912_1625	CBUD_1625a	cpdP		TRUE	0.787	1.000	0.000	NA		NA
3715995	3715996	CBUD_1629	COXBU7E912_1630	rpsP	rimM	TRUE	0.929	79.000	0.342	0.020	Y	NA
3715996	3715997	COXBU7E912_1630	COXBU7E912_1631	rimM	trmD	TRUE	0.999	2.000	0.672	1.000	Y	NA
3715997	3715998	COXBU7E912_1631	COXBU7E912_1632	trmD	rplS	TRUE	0.999	-3.000	0.567	1.000	Y	NA
3715998	3715999	COXBU7E912_1632	COXBU7E912_1633	rplS		TRUE	0.968	6.000	0.011	1.000	N	NA
3716000	3716001	COXBU7E912_1634	COXBU7E912_1635			FALSE	0.374	-22.000	0.000	NA		NA
3716001	3716002	COXBU7E912_1635	COXBU7E912_1636			TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
3716003	5609101	CBUD_1637	CBUD_1638			FALSE	0.016	345.000	0.000	NA		NA
5609101	3716005	CBUD_1638	CBUD_1639			FALSE	0.109	43.000	0.000	NA		NA
3716005	5609102	CBUD_1639	CBUD_1639a			FALSE	0.097	99.000	0.000	NA		NA
3716006	3716007	COXBU7E912_1640	COXBU7E912_1641			FALSE	0.065	67.000	0.000	1.000		NA
3716010	3716011	COXBU7E912_1644	COXBU7E912_1645		prfB	FALSE	0.295	-16.000	0.000	0.002		NA
5609106	3716014	CBUD_1647	COXBU7E912_1648			FALSE	0.078	130.000	0.000	NA		NA
3716014	3716015	COXBU7E912_1648	CBUD_1649		panB	FALSE	0.064	152.000	0.000	NA		NA
3716015	3716016	CBUD_1649	COXBU7E912_1650	panB	panC	TRUE	0.995	11.000	0.395	0.001	Y	NA
3716016	3716017	COXBU7E912_1650	COXBU7E912_1651	panC	panD	TRUE	0.997	-6.000	0.342	1.000	Y	NA
3716017	3716018	COXBU7E912_1651	COXBU7E912_1652	panD		TRUE	0.842	7.000	0.000	1.000	N	NA
3716018	3716019	COXBU7E912_1652	COXBU7E912_1653			FALSE	0.184	78.000	0.000	1.000	N	NA
3716019	3716020	COXBU7E912_1653	CBUD_1654			FALSE	0.205	85.000	0.000	1.000	N	NA
3716020	3716021	CBUD_1654	CBUD_1655			FALSE	0.106	186.000	0.000	1.000	N	NA
3716022	3716024	CBUD_1656	COXBU7E912_1657			FALSE	0.011	498.000	0.000	NA		NA
3716024	3716025	COXBU7E912_1657	COXBU7E912_1659			FALSE	0.016	342.000	0.000	NA		NA
3716025	3716026	COXBU7E912_1659	COXBU7E912_1660			FALSE	0.012	454.000	0.000	NA		NA
3716027	3716028	COXBU7E912_1661	COXBU7E912_1662			TRUE	0.687	7.000	0.000	NA		NA
3716028	3716029	COXBU7E912_1662	COXBU7E912_1664			FALSE	0.028	242.000	0.000	NA		NA
3716029	5609107	COXBU7E912_1664	CBUD_1664a			FALSE	0.021	276.000	0.000	NA		NA
5609107	5609108	CBUD_1664a	CBUD_1664b			FALSE	0.178	31.000	0.000	NA		NA
5609108	5609109	CBUD_1664b	CBUD_1664c			TRUE	0.687	-7.000	0.000	NA		NA
3716032	3716033	COXBU7E912_1665	COXBU7E912_1667			TRUE	0.708	6.000	0.000	NA		NA
3716033	5609110	COXBU7E912_1667	CBUD_1667a			TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
5609110	3716035	CBUD_1667a	COXBU7E912_1669			FALSE	0.047	185.000	0.000	NA		NA
3716035	3716036	COXBU7E912_1669	COXBU7E912_1670			FALSE	0.308	22.000	0.000	NA		NA
3716036	3716037	COXBU7E912_1670	CBUD_1671		lspA	TRUE	0.553	12.000	0.000	NA		NA
3716037	3716038	CBUD_1671	COXBU7E912_1672	lspA	ileS	TRUE	0.991	3.000	0.147	1.000	N	NA
3716038	3716039	COXBU7E912_1672	COXBU7E912_1673	ileS		FALSE	0.090	113.000	0.000	NA		NA
3716041	3716042	CBUD_1675	COXBU7E912_1676	ribF	mviN	TRUE	0.990	-3.000	0.169	1.000		NA
5609111	5609112	CBUD_1679	CBUD_1680			FALSE	0.179	-84.000	0.000	NA		NA
5609112	3716047	CBUD_1680	COXBU7E912_1681			FALSE	0.096	100.000	0.000	NA		NA
3716047	3716048	COXBU7E912_1681	COXBU7E912_1682		rpmA	TRUE	0.764	165.000	0.335	1.000		NA
3716048	3716049	COXBU7E912_1682	COXBU7E912_1683	rpmA	rplU	TRUE	0.997	-10.000	0.667	0.020	Y	NA
5609113	3716052	CBUD_1685a	CBUD_1686		tag	FALSE	0.067	486.000	0.000	1.000	Y	NA
3716053	3716054	COXBU7E912_1687	COXBU7E912_1688			FALSE	0.080	65.000	0.000	NA		NA
3716055	3716056	CBUD_1689	COXBU7E912_1690			FALSE	0.035	215.000	0.000	NA		NA
3716056	3716057	COXBU7E912_1690	COXBU7E912_1691			FALSE	0.015	384.000	0.000	NA		NA
3716057	5609114	COXBU7E912_1691	CBUD_1691a			FALSE	0.425	16.000	0.000	NA		NA
5609114	5609115	CBUD_1691a	CBUD_1691b			FALSE	0.261	-42.000	0.000	NA		NA
5609115	5609116	CBUD_1691b	CBUD_1691c			FALSE	0.190	30.000	0.000	NA		NA
5609116	3716059	CBUD_1691c	COXBU7E912_1693			FALSE	0.131	37.000	0.000	NA		NA
3716059	3716061	COXBU7E912_1693	COXBU7E912_1695			FALSE	0.032	229.000	0.000	NA		NA
3716061	3716062	COXBU7E912_1695	COXBU7E912_1696			FALSE	0.368	16.000	0.000	1.000		NA
5609117	5609118	CBUD_1697	CBUD_1698			FALSE	0.097	87.000	0.000	NA		NA
3716066	3716067	COXBU7E912_1700	COXBU7E912_1701			FALSE	0.402	17.000	0.000	NA		NA
3716068	3716069	COXBU7E912_1702	COXBU7E912_1703			FALSE	0.060	157.000	0.000	NA		NA
3716069	3716070	COXBU7E912_1703	CBUD_1704			FALSE	0.024	260.000	0.000	NA		NA
3716070	3716071	CBUD_1704	COXBU7E912_1705			FALSE	0.033	228.000	0.000	NA		NA
3716071	3716072	COXBU7E912_1705	CBUD_1706			TRUE	0.767	3.000	0.000	NA		NA
3716072	3716073	CBUD_1706	COXBU7E912_1707			TRUE	0.865	5.000	0.000	1.000	N	NA
3716074	3716075	CBUD_1708	COXBU7E912_1709			TRUE	0.696	-16.000	0.000	1.000	N	NA
3716075	3716076	COXBU7E912_1709	COXBU7E912_1711			FALSE	0.053	147.000	0.000	1.000		NA
3716076	3716078	COXBU7E912_1711	COXBU7E912_1712			FALSE	0.076	103.000	0.000	1.000		NA
3716078	3716079	COXBU7E912_1712	COXBU7E912_1714			FALSE	0.073	81.000	0.000	1.000		NA
3716079	5609119	COXBU7E912_1714	CBUD_1714a			FALSE	0.098	97.000	0.000	NA		NA
3716082	3716083	COXBU7E912_1716	COXBU7E912_1717	phoB		TRUE	0.991	-19.000	0.453	0.007	Y	NA
3716083	3716084	COXBU7E912_1717	CBUD_1718			FALSE	0.117	176.000	0.000	1.000	N	NA
3716084	3716085	CBUD_1718	COXBU7E912_1719			FALSE	0.073	81.000	0.000	1.000		NA
3716085	3716086	COXBU7E912_1719	COXBU7E912_1720			FALSE	0.107	-82.000	0.000	0.022		NA
3716087	5609121	COXBU7E912_1721	CBUD_1722			FALSE	0.211	28.000	0.000	NA		NA
5609121	5609122	CBUD_1722	CBUD_1723			TRUE	0.725	-6.000	0.000	NA		NA
3716090	3716091	COXBU7E912_1724	CBUD_1725			FALSE	0.082	76.000	0.000	NA		NA
3716092	3716093	COXBU7E912_1726	COXBU7E912_1727		czcD	FALSE	0.162	137.000	0.000	1.000	N	NA
3716093	3716094	COXBU7E912_1727	COXBU7E912_1728	czcD		FALSE	0.233	46.000	0.000	NA	N	NA
3716094	3716095	COXBU7E912_1728	CBUD_1729		ubiG	TRUE	0.504	-40.000	0.000	NA	N	NA
3716095	3716096	CBUD_1729	CBUD_1730	ubiG	gph	TRUE	0.936	-40.000	0.259	1.000		NA
3716096	3716097	CBUD_1730	COXBU7E912_1731	gph	xylT	FALSE	0.092	41.000	0.000	1.000		NA
3716097	3716098	COXBU7E912_1731	COXBU7E912_1732	xylT	xylB	TRUE	0.940	5.000	0.000	1.000	Y	NA
3716098	3716099	COXBU7E912_1732	COXBU7E912_1733	xylB	xylA	TRUE	0.661	70.000	0.010	1.000	Y	NA
3716100	3716101	CBUD_1734	COXBU7E912_1735			FALSE	0.145	35.000	0.000	NA		NA
3716101	3716103	COXBU7E912_1735	CBUD_1737			FALSE	0.016	337.000	0.000	NA		NA
3716108	3716109	CBUD_1742	CBUD_1743	fis	purH	TRUE	0.952	-19.000	0.101	1.000	N	NA
3716110	3716111	CBUD_1744	COXBU7E912_1745		thiDE	FALSE	0.068	78.000	0.000	1.000		NA
3716111	3716112	COXBU7E912_1745	COXBU7E912_1746	thiDE	thiG	TRUE	0.988	-3.000	0.012	0.003	Y	NA
3716112	3716113	COXBU7E912_1746	COXBU7E912_1747	thiG	thiS	TRUE	0.993	2.000	0.064	1.000	Y	NA
3716113	3716114	COXBU7E912_1747	COXBU7E912_1748	thiS	thiO	TRUE	0.905	-3.000	0.000	1.000	N	NA
3716114	3716115	COXBU7E912_1748	CBUD_1749	thiO	thiC	TRUE	0.984	0.000	0.022	1.000	N	NA
3716115	5609123	CBUD_1749	CBUD_1750	thiC		FALSE	0.098	97.000	0.000	NA		NA
5609123	5609124	CBUD_1750	CBUD_1751			FALSE	0.168	-102.000	0.000	NA		NA
5609124	5609125	CBUD_1751	CBUD_1752			FALSE	0.296	-34.000	0.000	NA		NA
3716121	3716122	CBUD_1754	COXBU7E912_1756			TRUE	0.715	-34.000	0.000	1.000	Y	NA
3716122	3716123	COXBU7E912_1756	COXBU7E912_1757			TRUE	0.755	-3.000	0.000	1.000		NA
3716124	5609126	COXBU7E912_1758	CBUD_1758a			TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
5609126	5609127	CBUD_1758a	CBUD_1758b			TRUE	0.621	10.000	0.000	NA		NA
5609127	5609128	CBUD_1758b	CBUD_1758c			TRUE	0.746	4.000	0.000	NA		NA
3716128	3716129	CBUD_1761	COXBU7E912_1763	dnaQ	rnhA	TRUE	0.573	418.000	0.248	1.000	Y	NA
3716129	3716130	COXBU7E912_1763	COXBU7E912_1764	rnhA		TRUE	0.824	15.000	0.003	1.000		NA
3716131	3716133	COXBU7E912_1765	CBUD_1767			TRUE	0.741	137.000	0.233	1.000		NA
3716140	3716141	COXBU7E912_1774	COXBU7E912_1775			TRUE	0.800	0.000	0.000	NA		NA
3716141	3716142	COXBU7E912_1775	COXBU7E912_1776		recG	FALSE	0.019	288.000	0.000	NA		NA
3716142	3716143	COXBU7E912_1776	CBUD_1777	recG		TRUE	0.982	7.000	0.076	NA	N	NA
3716143	3716144	CBUD_1777	COXBU7E912_1778		spoT	TRUE	0.936	28.000	0.215	NA	N	NA
3716144	3716145	COXBU7E912_1778	COXBU7E912_1779	spoT	rpoZ	TRUE	0.913	54.000	0.291	1.000	Y	NA
3716145	3716146	COXBU7E912_1779	COXBU7E912_1780	rpoZ	gmk	TRUE	0.910	78.000	0.471	1.000	N	NA
3716146	3716147	COXBU7E912_1780	COXBU7E912_1781	gmk	yicC	TRUE	0.989	-7.000	0.276	1.000		NA
3716148	3716149	CBUD_1782	COXBU7E912_1783	rph	murI	TRUE	0.987	0.000	0.048	1.000	N	NA
3716151	3716152	CBUD_1785	CBUD_1787	pyrE		TRUE	0.755	-3.000	0.000	1.000		NA
3716153	3716154	COXBU7E912_1786	CBUD_1788	algC	dut	TRUE	0.913	-22.000	0.039	1.000	N	NA
3716155	3716156	COXBU7E912_1789	COXBU7E912_1790		rpmB	TRUE	0.514	94.000	0.003	1.000	N	NA
3716156	3716157	COXBU7E912_1790	COXBU7E912_1791	rpmB	rpmG	TRUE	0.986	11.000	0.332	0.019		NA
3716158	3716159	COXBU7E912_1792	COXBU7E912_1793		coaD	TRUE	0.933	15.000	0.088	1.000		NA
3716159	3716160	COXBU7E912_1793	COXBU7E912_1794	coaD	folK	TRUE	0.959	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
3716160	3716161	COXBU7E912_1794	COXBU7E912_1795	folK	pcnB	TRUE	0.995	-3.000	0.234	1.000	N	NA
3716163	3716164	COXBU7E912_1797	COXBU7E912_1798			TRUE	0.746	4.000	0.000	NA		NA
3716164	3716165	COXBU7E912_1798	CBUD_1799			TRUE	0.564	-12.000	0.000	NA		NA
3716168	3716169	COXBU7E912_1802	CBUD_1803			TRUE	0.674	-6.000	0.000	1.000		NA
5609132	5609133	CBUD_1803b	CBUD_1803c			FALSE	0.081	56.000	0.000	NA		NA
5609133	3716172	CBUD_1803c	COXBU7E912_1806			FALSE	0.040	201.000	0.000	NA		NA
3716175	5609134	CBUD_1809	CBUD_1810			FALSE	0.402	17.000	0.000	NA		NA
5609134	5609135	CBUD_1810	CBUD_1811			FALSE	0.091	110.000	0.000	NA		NA
3716178	5609136	COXBU7E912_1812	CBUD_1812a			FALSE	0.080	71.000	0.000	NA		NA
5609136	5609137	CBUD_1812a	CBUD_1812b			FALSE	0.080	59.000	0.000	NA		NA
3716183	3716184	COXBU7E912_1816	CBUD_1818		hemE	FALSE	0.261	-31.000	0.000	1.000		NA
3716187	3716188	COXBU7E912_1821	COXBU7E912_1822			FALSE	0.098	88.000	0.000	NA		NA
3716188	3716189	COXBU7E912_1822	COXBU7E912_1823		ssb	TRUE	0.697	50.000	0.075	1.000	N	NA
3716190	5609139	COXBU7E912_1824	CBUD_1825			FALSE	0.082	126.000	0.000	NA		NA
5609139	5609140	CBUD_1825	CBUD_1826			FALSE	0.308	22.000	0.000	NA		NA
5609140	3716193	CBUD_1826	COXBU7E912_1827			FALSE	0.097	87.000	0.000	NA		NA
3716193	3716194	COXBU7E912_1827	COXBU7E912_1828		rplQ	TRUE	0.889	3.000	0.000	1.000	N	NA
3716194	3716195	COXBU7E912_1828	COXBU7E912_1829	rplQ	rpoA	TRUE	0.995	12.000	0.873	1.000	N	NA
3716195	3716196	COXBU7E912_1829	COXBU7E912_1830	rpoA	rpsD	TRUE	0.992	13.000	0.549	1.000	N	NA
3716196	3716197	COXBU7E912_1830	COXBU7E912_1831	rpsD	rpsK	TRUE	0.995	13.000	0.509	0.026	Y	NA
3716197	3716198	COXBU7E912_1831	COXBU7E912_1832	rpsK	rpsM	TRUE	0.986	28.000	0.810	0.019	Y	NA
3716198	5609141	COXBU7E912_1832	CBUD_1832a	rpsM		TRUE	0.725	5.000	0.000	NA		NA
5609141	3716200	CBUD_1832a	COXBU7E912_1834		secY	FALSE	0.021	275.000	0.000	NA		NA
3716200	3716201	COXBU7E912_1834	COXBU7E912_1835	secY	rplO	TRUE	0.989	18.000	0.730	1.000	N	NA
3716201	3716202	COXBU7E912_1835	COXBU7E912_1836	rplO	rpmD	TRUE	0.999	3.000	0.653	0.003	Y	NA
3716202	3716203	COXBU7E912_1836	COXBU7E912_1837	rpmD	rpsE	TRUE	0.999	4.000	0.789	0.026	Y	NA
3716203	3716204	COXBU7E912_1837	COXBU7E912_1838	rpsE	rplR	TRUE	0.997	12.000	0.814	0.026	Y	NA
3716204	3716205	COXBU7E912_1838	COXBU7E912_1839	rplR	rplF	TRUE	0.999	0.000	0.815	0.019	Y	NA
3716205	3716206	COXBU7E912_1839	CBUD_1840	rplF	rpsH	TRUE	0.973	38.000	0.808	0.019	Y	NA
3716206	3716207	CBUD_1840	COXBU7E912_1841	rpsH	rpsN	TRUE	0.998	-6.000	0.473	0.019	Y	NA
3716207	3716208	COXBU7E912_1841	COXBU7E912_1842	rpsN	rplE	TRUE	0.998	5.000	0.496	0.019	Y	NA
3716208	3716209	COXBU7E912_1842	COXBU7E912_1843	rplE	rplX	TRUE	0.959	117.000	0.758	0.019	Y	NA
3716209	3716210	COXBU7E912_1843	COXBU7E912_1844	rplX	rplN	TRUE	0.997	12.000	0.810	0.026	Y	NA
3716210	3716211	COXBU7E912_1844	CBUD_1845	rplN	rpsQ	TRUE	0.997	11.000	0.791	0.026	Y	NA
3716211	3716212	CBUD_1845	COXBU7E912_1846	rpsQ	rpmC	TRUE	0.997	11.000	0.828	0.019	Y	NA
3716212	3716213	COXBU7E912_1846	COXBU7E912_1847	rpmC	rplP	TRUE	0.999	1.000	0.802	0.019	Y	NA
3716213	3716214	COXBU7E912_1847	COXBU7E912_1848	rplP	rpsC	TRUE	0.997	12.000	0.828	0.026	Y	NA
3716214	3716215	COXBU7E912_1848	COXBU7E912_1849	rpsC	rplV	TRUE	0.999	0.000	0.719	0.026	Y	NA
3716215	3716216	COXBU7E912_1849	COXBU7E912_1850	rplV	rpsS	TRUE	0.999	0.000	0.769	0.026	Y	NA
3716216	3716217	COXBU7E912_1850	COXBU7E912_1851	rpsS	rplB	TRUE	0.996	13.000	0.820	0.026	Y	NA
3716217	3716218	COXBU7E912_1851	COXBU7E912_1852	rplB	rplW	TRUE	0.993	20.000	0.849	1.000	Y	NA
3716218	3716219	COXBU7E912_1852	CBUD_1853	rplW	rplD	TRUE	0.999	-3.000	0.513	1.000	Y	NA
3716219	3716220	CBUD_1853	COXBU7E912_1854	rplD	rplC	TRUE	0.999	-3.000	0.486	0.019	Y	NA
3716220	3716221	COXBU7E912_1854	CBUD_1855	rplC	rpsJ	TRUE	0.981	22.000	0.307	0.026	Y	NA
3716221	3716222	CBUD_1855	COXBU7E912_1856	rpsJ	tuf2	TRUE	0.878	175.000	0.318	1.000	Y	NA
3716222	3716223	COXBU7E912_1856	COXBU7E912_1857	tuf2	fusA	TRUE	0.991	16.000	0.400	0.001	Y	NA
3716223	3716224	COXBU7E912_1857	COXBU7E912_1858	fusA	rpsG	TRUE	0.997	10.000	0.579	1.000	Y	NA
3716224	3716225	COXBU7E912_1858	CBUD_1859	rpsG	rpsL	TRUE	0.996	13.000	0.620	0.004	Y	NA
3716225	3716226	CBUD_1859	COXBU7E912_1860	rpsL	rpoC	FALSE	0.371	295.000	0.122	1.000	N	NA
3716226	3716228	COXBU7E912_1860	CBUD_1862	rpoC	rpoB	TRUE	0.856	269.000	0.851	0.001	Y	NA
3716228	5609142	CBUD_1862	CBUD_1862a	rpoB		FALSE	0.449	15.000	0.000	NA		NA
5609142	3716229	CBUD_1862a	COXBU7E912_1863		rplL	TRUE	0.515	13.000	0.000	NA		NA
3716229	3716230	COXBU7E912_1863	COXBU7E912_1864	rplL	rplJ	TRUE	0.980	34.000	0.884	0.019	Y	NA
3716230	3716231	COXBU7E912_1864	COXBU7E912_1865	rplJ	rplA	TRUE	0.740	254.000	0.302	0.026	Y	NA
3716231	3716232	COXBU7E912_1865	COXBU7E912_1866	rplA	rplK	TRUE	0.999	0.000	0.838	0.026	Y	NA
3716232	3716233	COXBU7E912_1866	CBUD_1867	rplK	nusG	TRUE	0.930	125.000	0.681	1.000	N	NA
3716233	3716234	CBUD_1867	COXBU7E912_1868	nusG	secE	TRUE	0.983	25.000	0.843	1.000	N	NA
3716234	3716235	COXBU7E912_1868	COXBU7E912_1869	secE		FALSE	0.112	42.000	0.000	NA		NA
3716235	3716236	COXBU7E912_1869	COXBU7E912_1870		tuf1	FALSE	0.080	128.000	0.000	NA		NA
3716236	3716237	COXBU7E912_1870	COXBU7E912_1871	tuf1		FALSE	0.081	74.000	0.000	NA		NA
3716237	3716238	COXBU7E912_1871	COXBU7E912_1872			TRUE	0.800	0.000	0.000	NA		NA
3716238	5609143	COXBU7E912_1872	CBUD_1874			FALSE	0.077	131.000	0.000	NA		NA
5609143	3716241	CBUD_1874	COXBU7E912_1875		mtaA	FALSE	0.062	154.000	0.000	NA		NA
3716241	3716242	COXBU7E912_1875	COXBU7E912_1876	mtaA		TRUE	0.687	-7.000	0.000	NA		NA
3716242	3716243	COXBU7E912_1876	COXBU7E912_1877		cydB2	TRUE	0.687	7.000	0.000	NA		NA
3716243	3716244	COXBU7E912_1877	COXBU7E912_1878	cydB2	cydA2	TRUE	0.995	9.000	0.300	0.025	Y	NA
3716244	5609144	COXBU7E912_1878	CBUD_1878a	cydA2		FALSE	0.096	85.000	0.000	NA		NA
5609144	5609145	CBUD_1878a	CBUD_1878b			FALSE	0.020	281.000	0.000	NA		NA
5609145	3716246	CBUD_1878b	CBUD_1880			FALSE	0.252	25.000	0.000	NA		NA
3716250	3716251	CBUD_1884	CBUD_1885			FALSE	0.020	284.000	0.000	NA		NA
3716251	3716252	CBUD_1885	COXBU7E912_1886			FALSE	0.333	-28.000	0.000	NA		NA
3716252	5609146	COXBU7E912_1886	CBUD_1886a			FALSE	0.092	108.000	0.000	NA		NA
5609146	3716254	CBUD_1886a	COXBU7E912_1888			FALSE	0.034	195.000	0.000	1.000		NA
3716254	5609147	COXBU7E912_1888	CBUD_1888a			FALSE	0.109	43.000	0.000	NA		NA
5609147	5609148	CBUD_1888a	CBUD_1888b			FALSE	0.043	196.000	0.000	NA		NA
5609148	3716256	CBUD_1888b	COXBU7E912_1890			FALSE	0.081	68.000	0.000	NA		NA
3716256	3716257	COXBU7E912_1890	COXBU7E912_1891			FALSE	0.093	107.000	0.000	NA		NA
3716257	3716258	COXBU7E912_1891	CBUD_1892		gltX2	FALSE	0.080	62.000	0.000	NA		NA
3716258	5609149	CBUD_1892	CBUD_1892a	gltX2		FALSE	0.081	70.000	0.000	NA		NA
5609149	5609150	CBUD_1892a	CBUD_1892b			FALSE	0.057	161.000	0.000	NA		NA
3716261	3716262	COXBU7E912_1895	COXBU7E912_1896		coaA	TRUE	0.900	1.000	0.000	1.000	N	NA
3716262	3716263	COXBU7E912_1896	COXBU7E912_1897	coaA		TRUE	0.485	-16.000	0.000	NA		NA
3716264	3716265	COXBU7E912_1898	COXBU7E912_1899			TRUE	0.997	-3.000	0.575	NA		NA
3716266	3716267	COXBU7E912_1900	COXBU7E912_1901		ampG	FALSE	0.097	87.000	0.000	NA		NA
3716269	3716270	CBUD_1903	COXBU7E912_1904			FALSE	0.080	57.000	0.000	NA		NA
5609151	5609152	CBUD_1905	CBUD_1906			FALSE	0.420	-19.000	0.000	NA		NA
5609152	5609153	CBUD_1906	CBUD_1906a			TRUE	0.787	1.000	0.000	NA		NA
5609153	5609154	CBUD_1906a	CBUD_1906b			FALSE	0.114	41.000	0.000	NA		NA
5609154	3716274	CBUD_1906b	COXBU7E912_1908			FALSE	0.158	33.000	0.000	NA		NA
3716274	5609155	COXBU7E912_1908	CBUD_1908a			FALSE	0.118	40.000	0.000	NA		NA
5609155	5609156	CBUD_1908a	CBUD_1908b			FALSE	0.270	-40.000	0.000	NA		NA
3716276	3716277	COXBU7E912_1910	COXBU7E912_1911		rrfC	FALSE	0.087	118.000	0.000	NA		NA
3716277	5609157	COXBU7E912_1911	CBUD_1912	rrfC		FALSE	0.102	45.000	0.000	NA		NA
5609157	3716279	CBUD_1912	CBUD_1913			FALSE	0.148	-1456.000	0.000	NA		NA
3716279	3716282	CBUD_1913	COXBU7E912_1915			FALSE	0.010	3086.000	0.000	NA		NA
3716282	3716283	COXBU7E912_1915	COXBU7E912_1916			TRUE	0.725	5.000	0.000	NA		NA
3716283	5609158	COXBU7E912_1916	CBUD_1917			FALSE	0.046	189.000	0.000	NA		NA
3716287	3716288	CBUD_1920	COXBU7E912_1921		anmK	TRUE	0.992	4.000	0.184	NA	N	NA
3716288	3716289	COXBU7E912_1921	COXBU7E912_1922	anmK		FALSE	0.227	47.000	0.000	NA	N	NA
3716289	3716290	COXBU7E912_1922	COXBU7E912_1923			TRUE	0.905	-3.000	0.000	1.000	N	NA
3716291	3716292	COXBU7E912_1924	COXBU7E912_1925		pkn2	FALSE	0.064	65.000	0.000	1.000		NA
3716293	3716294	COXBU7E912_1926	COXBU7E912_1927			FALSE	0.087	118.000	0.000	NA		NA
3716295	3716296	COXBU7E912_1928	COXBU7E912_1929			TRUE	0.800	0.000	0.000	NA		NA
3716296	5609160	COXBU7E912_1929	CBUD_1929a			TRUE	0.533	146.000	0.080	1.000		NA
5609160	3716298	CBUD_1929a	COXBU7E912_1931			TRUE	0.915	-9.000	0.000	1.000	Y	NA
3716298	3716299	COXBU7E912_1931	COXBU7E912_1932			TRUE	0.929	7.000	0.000	1.000	Y	NA
5609161	5609162	CBUD_1932a	CBUD_1932b			TRUE	0.667	-3.000	0.000	0.013		NA
5609162	3716301	CBUD_1932b	COXBU7E912_1934			FALSE	0.362	91.000	0.000	0.003	Y	NA
3716302	3716303	COXBU7E912_1935	CBUD_1936			FALSE	0.026	249.000	0.000	NA		NA
3716303	3716305	CBUD_1936	COXBU7E912_1937			FALSE	0.012	480.000	0.000	NA		NA
3716305	3716306	COXBU7E912_1937	COXBU7E912_1939			FALSE	0.081	75.000	0.000	NA		NA
3716307	3716308	COXBU7E912_1940	CBUD_1941			FALSE	0.455	-18.000	0.000	NA		NA
3716308	5609163	CBUD_1941	CBUD_1941a			FALSE	0.344	20.000	0.000	NA		NA
5609163	3716309	CBUD_1941a	CBUD_1942		cas1_2	FALSE	0.022	270.000	0.000	NA		NA
3716309	5609164	CBUD_1942	CBUD_1942a	cas1_2		TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
5609164	5609165	CBUD_1942a	CBUD_1942b			FALSE	0.333	-28.000	0.000	NA		NA
5609165	3716311	CBUD_1942b	CBUD_1944		csy1_2	TRUE	0.725	5.000	0.000	NA		NA
3716311	3716312	CBUD_1944	COXBU7E912_1945	csy1_2	csy2_2	TRUE	0.998	-3.000	0.895	NA		NA
3716312	3716313	COXBU7E912_1945	CBUD_1946	csy2_2	csy3_2	TRUE	0.991	-16.000	0.787	NA		NA
3716313	3716314	CBUD_1946	COXBU7E912_1947	csy3_2	csy4_2	TRUE	0.959	9.000	0.043	NA		NA
3716314	5609166	COXBU7E912_1947	CBUD_1947a	csy4_2		TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
5609166	3716315	CBUD_1947a	COXBU7E912_1948			FALSE	0.070	143.000	0.000	NA		NA
3716317	3716318	COXBU7E912_1950	COXBU7E912_1951	pilA	pilB	TRUE	0.997	-10.000	0.556	NA	Y	NA
3716318	3716319	COXBU7E912_1951	COXBU7E912_1952	pilB	pilC	TRUE	0.998	-7.000	0.571	1.000	Y	NA
3716319	3716320	COXBU7E912_1952	COXBU7E912_1953	pilC	pilD	TRUE	0.899	26.000	0.024	1.000	Y	NA
3716320	3716321	COXBU7E912_1953	COXBU7E912_1954	pilD	coaE	TRUE	0.977	11.000	0.122	1.000	N	NA
3716321	3716322	COXBU7E912_1954	COXBU7E912_1955	coaE	queF	FALSE	0.275	21.000	0.000	1.000		NA
3716322	3716323	COXBU7E912_1955	CBUD_1956	queF		FALSE	0.252	25.000	0.000	NA		NA
5609167	3716324	CBUD_1956a	COXBU7E912_1957		mutT	TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
3716324	3716325	COXBU7E912_1957	CBUD_1958	mutT	secA	TRUE	0.960	-21.000	0.168	1.000	N	NA
5609168	5609169	CBUD_1960	CBUD_1961			FALSE	0.254	-43.000	0.000	NA		NA
3716329	3716330	COXBU7E912_1962	COXBU7E912_1963			FALSE	0.062	154.000	0.000	NA		NA
3716331	3716332	CBUD_1964	COXBU7E912_1965		lpxC	FALSE	0.018	300.000	0.000	NA		NA
3716332	3716333	COXBU7E912_1965	CBUD_1966	lpxC	ftsZ	TRUE	0.670	160.000	0.134	1.000	N	NA
3716333	3716334	CBUD_1966	CBUD_1967	ftsZ	ftsA	TRUE	0.999	1.000	0.460	1.000	Y	NA
3716336	3716337	COXBU7E912_1968	COXBU7E912_1970	ftsQ	murB	TRUE	0.994	0.000	0.070	NA	Y	NA
3716337	3716338	COXBU7E912_1970	COXBU7E912_1971	murB	murC	TRUE	0.991	-7.000	0.136	0.005	Y	NA
3716338	3716339	COXBU7E912_1971	COXBU7E912_1972	murC	murG	TRUE	0.992	-13.000	0.283	1.000	Y	NA
3716339	3716340	COXBU7E912_1972	COXBU7E912_1973	murG		FALSE	0.089	50.000	0.000	NA		NA
3716340	3716341	COXBU7E912_1973	COXBU7E912_1974		ftsW	FALSE	0.085	52.000	0.000	NA		NA
3716341	3716342	COXBU7E912_1974	COXBU7E912_1975	ftsW	murD	TRUE	0.996	0.000	0.297	0.004	N	NA
3716342	5609170	COXBU7E912_1975	CBUD_1975a	murD		TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
5609170	5609171	CBUD_1975a	CBUD_1977			FALSE	0.032	229.000	0.000	NA		NA
5609171	5609172	CBUD_1977	CBUD_1978			FALSE	0.131	37.000	0.000	NA		NA
5609172	3716346	CBUD_1978	COXBU7E912_1979			FALSE	0.081	68.000	0.000	NA		NA
3716346	3716348	COXBU7E912_1979	COXBU7E912_1980		mraY	FALSE	0.053	172.000	0.000	NA		NA
3716348	3716349	COXBU7E912_1980	COXBU7E912_1982	mraY	murF	TRUE	0.997	5.000	0.309	0.005	Y	NA
3716349	3716350	COXBU7E912_1982	COXBU7E912_1983	murF	murE	TRUE	0.999	-3.000	0.569	0.003	Y	NA
3716350	3716351	COXBU7E912_1983	COXBU7E912_1984	murE		FALSE	0.086	51.000	0.000	NA		NA
3716352	3716355	COXBU7E912_1985	CBUD_1988			FALSE	0.079	129.000	0.000	NA		NA
3716356	3716357	CBUD_1989	COXBU7E912_1990	ftsI	ftsL	TRUE	0.987	-7.000	0.153	1.000	N	NA
3716357	3716358	COXBU7E912_1990	COXBU7E912_1991	ftsL	mraW	TRUE	0.995	-3.000	0.227	1.000	N	NA
3716358	3716359	COXBU7E912_1991	CBUD_1992	mraW	mraZ	TRUE	0.996	6.000	0.635	NA		NA
3716359	3716360	CBUD_1992	COXBU7E912_1993	mraZ		FALSE	0.059	159.000	0.000	NA		NA
3716362	3716363	CBUD_1995	COXBU7E912_1996	tdh	kbl	TRUE	0.980	23.000	0.547	1.000	N	NA
5609173	3716365	CBUD_1996a	CBUD_1998			FALSE	0.090	113.000	0.000	NA		NA
3716366	3716367	COXBU7E912_1999	COXBU7E912_2000	metQ	metI	TRUE	0.874	13.000	0.000	NA	Y	NA
3716367	3716368	COXBU7E912_2000	COXBU7E912_2001	metI	metN	TRUE	0.729	-31.000	0.000	1.000	Y	NA
3716369	3716370	COXBU7E912_2002	COXBU7E912_2003			FALSE	0.085	78.000	0.000	NA		NA
3716370	3716371	COXBU7E912_2003	COXBU7E912_2004			FALSE	0.145	35.000	0.000	NA		NA
3716371	3716372	COXBU7E912_2004	COXBU7E912_2006		nadB	FALSE	0.085	121.000	0.000	NA		NA
3716373	3716374	COXBU7E912_2005	CBUD_2007		sixA	TRUE	0.779	2.000	0.000	NA		NA
3716374	5609176	CBUD_2007	CBUD_2007a	sixA		TRUE	0.641	-9.000	0.000	NA		NA
3716375	3716376	COXBU7E912_2008	COXBU7E912_2009			FALSE	0.102	45.000	0.000	NA		NA
3716376	5609177	COXBU7E912_2009	CBUD_2007b			FALSE	0.190	30.000	0.000	NA		NA
3716377	3716378	COXBU7E912_2010	COXBU7E912_2011	nadC	pssA	TRUE	0.907	0.000	0.000	1.000	N	NA
3716379	3716380	CBUD_2012	COXBU7E912_2014			TRUE	0.800	0.000	0.000	NA		NA
3716381	3716382	CBUD_2013	COXBU7E912_2015		clpB	TRUE	0.905	-3.000	0.000	1.000	N	NA
3716382	3716383	COXBU7E912_2015	COXBU7E912_2016	clpB		FALSE	0.097	313.000	0.000	1.000	Y	NA
3716383	3716384	COXBU7E912_2016	CBUD_2017		ygbF	TRUE	0.978	3.000	0.059	1.000		NA
3716384	3716385	CBUD_2017	CBUD_2018	ygbF		TRUE	0.980	-13.000	0.278	1.000		NA
3716385	3716386	CBUD_2018	CBUD_2019		tolB	TRUE	0.995	10.000	0.592	1.000	N	NA
3716386	5609178	CBUD_2019	CBUD_2019a	tolB		FALSE	0.029	239.000	0.000	NA		NA
5609178	5609179	CBUD_2019a	CBUD_2019b			FALSE	0.084	122.000	0.000	NA		NA
5609179	5609180	CBUD_2019b	CBUD_2019c		tolA	FALSE	0.476	14.000	0.000	NA		NA
5609180	3716388	CBUD_2019c	CBUD_2021	tolA		FALSE	0.043	169.000	0.000	1.000		NA
3716388	3716389	CBUD_2021	COXBU7E912_2022			FALSE	0.315	15.000	0.000	0.038		NA
3716389	3716390	COXBU7E912_2022	COXBU7E912_2023		ecnB	TRUE	0.523	11.000	0.000	1.000		NA
3716390	3716391	COXBU7E912_2023	CBUD_2024	ecnB		FALSE	0.020	254.000	0.000	1.000		NA
3716393	5609182	CBUD_2026	CBUD_2027	proS		FALSE	0.137	36.000	0.000	NA		NA
5609182	5609183	CBUD_2027	CBUD_2028			FALSE	0.065	151.000	0.000	NA		NA
5609183	3716396	CBUD_2028	COXBU7E912_2029			FALSE	0.060	157.000	0.000	NA		NA
3716396	3716397	COXBU7E912_2029	CBUD_2030			FALSE	0.089	115.000	0.000	NA		NA
3716397	3716398	CBUD_2030	COXBU7E912_2031		ubiH	TRUE	0.995	-13.000	0.474	0.001	Y	NA
3716399	3716400	COXBU7E912_2032	CBUD_2033			FALSE	0.080	58.000	0.000	NA		NA
3716401	3716402	COXBU7E912_2034	CBUD_2035			TRUE	0.564	-12.000	0.000	NA		NA
3716403	3716404	COXBU7E912_2036	CBUD_2037			FALSE	0.098	88.000	0.000	NA		NA
3716404	3716405	CBUD_2037	COXBU7E912_2038			TRUE	0.982	-3.000	0.053	NA		NA
3716405	3716406	COXBU7E912_2038	CBUD_2040			FALSE	0.305	209.000	0.034	NA		NA
3716407	3716408	COXBU7E912_2039	COXBU7E912_2041			FALSE	0.086	51.000	0.000	NA		NA
3716408	3716410	COXBU7E912_2041	CBUD_2043		parE	FALSE	0.116	189.000	0.000	NA	N	NA
3716412	3716413	COXBU7E912_2044	COXBU7E912_2046			FALSE	0.325	21.000	0.000	NA		NA
3716413	5609184	COXBU7E912_2046	CBUD_2046a			FALSE	0.031	233.000	0.000	NA		NA
5609184	5609185	CBUD_2046a	CBUD_2046b			FALSE	0.118	40.000	0.000	NA		NA
5609185	3716414	CBUD_2046b	COXBU7E912_2047			FALSE	0.093	48.000	0.000	NA		NA
3716414	3716415	COXBU7E912_2047	COXBU7E912_2048		ubiA	FALSE	0.194	112.000	0.000	1.000	N	NA
3716415	3716416	COXBU7E912_2048	COXBU7E912_2049	ubiA		TRUE	0.996	-7.000	0.248	NA	Y	NA
3716416	3716417	COXBU7E912_2049	CBUD_2050		enhA.3	FALSE	0.081	70.000	0.000	NA		NA
3716418	3716419	CBUD_2051	COXBU7E912_2052			FALSE	0.252	25.000	0.000	NA		NA
3716419	3716420	COXBU7E912_2052	COXBU7E912_2053			FALSE	0.044	193.000	0.000	NA		NA
3716420	3716421	COXBU7E912_2053	CBUD_2054			FALSE	0.137	36.000	0.000	NA		NA
3716421	3716422	CBUD_2054	CBUD_2055			TRUE	0.849	-16.000	0.000	1.000	Y	NA
3716422	3716423	CBUD_2055	COXBU7E912_2056			TRUE	0.995	-10.000	0.671	0.068	N	NA
3716423	3716424	COXBU7E912_2056	COXBU7E912_2057			FALSE	0.200	48.000	0.000	1.000	N	NA
3716425	3716426	CBUD_2058	COXBU7E912_2059			FALSE	0.091	110.000	0.000	NA		NA
3716427	3716428	CBUD_2060	COXBU7E912_2061	hemH		FALSE	0.097	99.000	0.000	NA		NA
3716428	3716429	COXBU7E912_2061	COXBU7E912_2063			FALSE	0.046	189.000	0.000	NA		NA
3716430	3716431	COXBU7E912_2062	COXBU7E912_2064	hemK	prfA	TRUE	0.996	3.000	0.229	0.032	Y	NA
3716431	3716432	COXBU7E912_2064	CBUD_2065	prfA	hemA	TRUE	0.993	-3.000	0.171	0.032	N	NA
3716434	3716435	COXBU7E912_2066	COXBU7E912_2068	folB	dksA	TRUE	0.842	-7.000	0.000	1.000	N	NA
3716435	3716436	COXBU7E912_2068	COXBU7E912_2069	dksA	dapF	FALSE	0.156	142.000	0.000	1.000	N	NA
3716436	3716437	COXBU7E912_2069	CBUD_2070	dapF		TRUE	0.605	-10.000	0.000	NA		NA
3716437	3716438	CBUD_2070	COXBU7E912_2071			FALSE	0.040	201.000	0.000	NA		NA
3716438	3716439	COXBU7E912_2071	CBUD_2072			FALSE	0.449	15.000	0.000	NA		NA
5609186	3716440	CBUD_2072a	CBUD_2074			TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
3716441	3716442	COXBU7E912_2073	CBUD_2075			TRUE	0.996	6.000	0.642	NA		NA
3716443	3716444	COXBU7E912_2076	COXBU7E912_2077	ostA		TRUE	0.970	6.000	0.014	1.000	N	NA
3716444	3716445	COXBU7E912_2077	COXBU7E912_2078		pdxA	TRUE	0.998	0.000	0.561	1.000	N	NA
3716445	3716446	COXBU7E912_2078	COXBU7E912_2079	pdxA	ksgA	TRUE	0.690	185.000	0.197	1.000	N	NA
3716446	3716447	COXBU7E912_2079	COXBU7E912_2080	ksgA		FALSE	0.193	113.000	0.000	1.000	N	NA
3716447	3716448	COXBU7E912_2080	COXBU7E912_2081			FALSE	0.054	169.000	0.000	NA		NA
3716448	3716450	COXBU7E912_2081	CBUD_2083			FALSE	0.102	45.000	0.000	NA		NA
3716450	3716451	CBUD_2083	COXBU7E912_2084		sppA	FALSE	0.064	64.000	0.000	1.000		NA
3716451	3716452	COXBU7E912_2084	COXBU7E912_2085	sppA	apaH	FALSE	0.454	13.000	0.000	1.000		NA
3716452	5609187	COXBU7E912_2085	CBUD_2085a	apaH		FALSE	0.066	149.000	0.000	NA		NA
5609187	5609188	CBUD_2085a	CBUD_2085b			FALSE	0.099	91.000	0.000	NA		NA
5609188	5609189	CBUD_2085b	CBUD_2085c			TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
3716456	3716457	COXBU7E912_2089	COXBU7E912_2091		txe	TRUE	0.980	0.000	0.042	NA		NA
3716458	3716459	COXBU7E912_2090	CBUD_2092	folA		TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
3716462	3716463	COXBU7E912_2094	COXBU7E912_2096		fmt	TRUE	0.720	13.000	0.000	1.000	N	NA
3716465	3716466	CBUD_2098	CBUD_2099	dprA		TRUE	0.988	-3.000	0.124	NA		NA
3716466	3716467	CBUD_2099	COXBU7E912_2100		topA	TRUE	0.975	3.000	0.040	NA		NA
3716469	3716470	COXBU7E912_2102	COXBU7E912_2103	purE		TRUE	0.982	3.000	0.023	NA	N	NA
3716470	3716471	COXBU7E912_2103	CBUD_2104			FALSE	0.013	443.000	0.000	NA		NA
3716472	3716473	COXBU7E912_2105	COXBU7E912_2106			TRUE	0.829	8.000	0.000	1.000	N	NA
3716473	3716474	COXBU7E912_2106	COXBU7E912_2107			TRUE	0.959	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
3716474	3716475	COXBU7E912_2107	COXBU7E912_2108			FALSE	0.091	49.000	0.000	NA		NA
3716476	3716477	CBUD_2109	CBUD_2110	argS		TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
3716477	3716478	CBUD_2110	CBUD_2111			TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
3716478	3716479	CBUD_2111	CBUD_2112		hslV	FALSE	0.045	191.000	0.000	NA		NA
3716479	3716480	CBUD_2112	CBUD_2114	hslV	hslU	TRUE	0.989	25.000	0.752	1.000	Y	NA
3716484	3716485	CBUD_2117	COXBU7E912_2118		ubiE	FALSE	0.090	80.000	0.000	NA		NA
3716485	3716486	COXBU7E912_2118	COXBU7E912_2119	ubiE		TRUE	0.989	0.000	0.145	1.000		NA
3716486	3716487	COXBU7E912_2119	COXBU7E912_2120		ubiB	TRUE	0.996	-3.000	0.432	1.000		NA
3716488	3716489	CBUD_2121	CBUD_2122			FALSE	0.080	62.000	0.000	NA		NA
3716489	5609191	CBUD_2122	CBUD_2122a		chlI	FALSE	0.091	49.000	0.000	NA		NA
5609191	5609192	CBUD_2122a	CBUD_2122b	chlI	chlI	FALSE	0.161	-123.000	0.000	NA		NA
5609192	3716491	CBUD_2122b	COXBU7E912_2124	chlI		TRUE	0.687	7.000	0.000	NA		NA
3716492	3716493	COXBU7E912_2125	COXBU7E912_2126			FALSE	0.336	79.000	0.000	0.009	Y	NA
3716494	3716495	COXBU7E912_2127	COXBU7E912_2128			FALSE	0.091	49.000	0.000	NA		NA
3716495	3716496	COXBU7E912_2128	COXBU7E912_2129			FALSE	0.037	209.000	0.000	NA		NA
3716496	3716497	COXBU7E912_2129	COXBU7E912_2130			FALSE	0.106	44.000	0.000	NA		NA
3716498	3716499	COXBU7E912_2131	CBUD_2132	metK	ahcY	TRUE	0.994	2.000	0.114	0.001	Y	NA
3716499	3716500	CBUD_2132	COXBU7E912_2133	ahcY		FALSE	0.417	27.000	0.000	1.000	N	NA
3716500	3716501	COXBU7E912_2133	CBUD_2134			FALSE	0.059	159.000	0.000	NA		NA
3716502	3716503	CBUD_2135	COXBU7E912_2136			TRUE	0.999	-3.000	0.571	0.003	Y	NA
3716503	3716504	COXBU7E912_2136	COXBU7E912_2137			TRUE	0.998	-3.000	0.429	0.047	Y	NA
3716504	3716505	COXBU7E912_2137	COXBU7E912_2138			TRUE	0.546	-10.000	0.000	1.000		NA
3716505	3716506	COXBU7E912_2138	COXBU7E912_2139			TRUE	0.755	-3.000	0.000	1.000		NA
3716508	5609195	CBUD_2141	CBUD_2141a			FALSE	0.090	112.000	0.000	NA		NA
3716510	3716511	COXBU7E912_2143	COXBU7E912_2144	metF	metE	TRUE	0.929	17.000	0.009	0.001	Y	NA
3716511	3716512	COXBU7E912_2144	COXBU7E912_2145	metE	trpS	FALSE	0.107	185.000	0.000	1.000	N	NA
3716512	3716513	COXBU7E912_2145	COXBU7E912_2146	trpS		FALSE	0.164	32.000	0.000	NA		NA
3716513	5609196	COXBU7E912_2146	CBUD_2146a			FALSE	0.081	127.000	0.000	NA		NA
5609196	3716514	CBUD_2146a	COXBU7E912_2147			FALSE	0.080	64.000	0.000	NA		NA
3716516	3716517	CBUD_2149	COXBU7E912_2150	uvrD		TRUE	0.905	-3.000	0.000	1.000	N	NA
3716518	3716519	COXBU7E912_2151	COXBU7E912_2152			FALSE	0.049	182.000	0.000	NA		NA
3716519	3716520	COXBU7E912_2152	CBUD_2153			FALSE	0.013	418.000	0.000	NA		NA
3716520	3716521	CBUD_2153	COXBU7E912_2154			FALSE	0.051	178.000	0.000	NA		NA
3716521	5609197	COXBU7E912_2154	CBUD_2154a			FALSE	0.073	138.000	0.000	NA		NA
5609198	5609199	CBUD_2155	CBUD_2156			FALSE	0.077	132.000	0.000	NA		NA
3716524	5609200	COXBU7E912_2157	CBUD_2157a			FALSE	0.420	-19.000	0.000	NA		NA
5609200	5609201	CBUD_2157a	CBUD_2157b			FALSE	0.131	37.000	0.000	NA		NA
5609201	3716526	CBUD_2157b	COXBU7E912_2159			TRUE	0.553	12.000	0.000	NA		NA
3716526	3716527	COXBU7E912_2159	COXBU7E912_2160			TRUE	0.995	-19.000	1.000	0.019	Y	NA
3716527	3716529	COXBU7E912_2160	COXBU7E912_2162		tdk	FALSE	0.438	141.000	0.004	1.000	N	NA
3716529	3716530	COXBU7E912_2162	COXBU7E912_2163	tdk		TRUE	0.620	17.000	0.000	1.000	N	NA
5609202	5609203	CBUD_2167a	CBUD_2167b			FALSE	0.080	72.000	0.000	NA		NA
3716535	3716536	COXBU7E912_2168	COXBU7E912_2169			FALSE	0.137	36.000	0.000	NA		NA
3716536	3716537	COXBU7E912_2169	COXBU7E912_2170		hemC	TRUE	0.696	-16.000	0.000	1.000	N	NA
3716537	3716538	COXBU7E912_2170	COXBU7E912_2171	hemC	aroD	TRUE	0.907	0.000	0.000	1.000	N	NA
3716538	3716539	COXBU7E912_2171	COXBU7E912_2172	aroD		TRUE	0.563	10.000	0.000	1.000		NA
3716539	3716540	COXBU7E912_2172	COXBU7E912_2173		hemD	TRUE	0.546	-10.000	0.000	1.000		NA
3716542	3716543	CBUD_2175	CBUD_2176			FALSE	0.091	81.000	0.000	NA		NA
3716543	3716544	CBUD_2176	COXBU7E912_2177		hemY	TRUE	0.999	5.000	0.765	1.000	Y	NA
3716544	3716545	COXBU7E912_2177	COXBU7E912_2178	hemY		TRUE	0.900	3.000	0.000	NA	N	NA
3716545	3716546	COXBU7E912_2178	CBUD_2179		queC	FALSE	0.381	18.000	0.000	NA		NA
3716546	3716548	CBUD_2179	COXBU7E912_2181	queC		FALSE	0.021	276.000	0.000	NA		NA
3716548	3716549	COXBU7E912_2181	COXBU7E912_2182			TRUE	0.946	12.000	0.059	NA		NA
3716551	3716552	COXBU7E912_2184	COXBU7E912_2185	rho	trxA	TRUE	0.478	176.000	0.087	1.000		NA
3716552	5609204	COXBU7E912_2185	CBUD_2185a	trxA		FALSE	0.045	191.000	0.000	NA		NA
3716555	3716556	CBUD_2188	COXBU7E912_2189		proC	TRUE	0.989	-3.000	0.152	1.000		NA
3716556	3716557	COXBU7E912_2189	COXBU7E912_2190	proC		TRUE	0.990	-3.000	0.158	NA		NA
3716557	3716558	COXBU7E912_2190	COXBU7E912_2191		pckA	TRUE	0.605	-10.000	0.000	NA		NA
3716560	3716561	CBUD_2193	COXBU7E912_2194	algH		TRUE	0.993	-7.000	0.263	NA	N	NA
3716561	3716562	COXBU7E912_2194	COXBU7E912_2195		pyrB	TRUE	0.970	-7.000	0.022	1.000	N	NA
3716562	3714367	COXBU7E912_2195	COXBU7E912_0001	pyrB	dnaA	FALSE	0.112	180.000	0.000	1.000	N	NA
3716563	3716565	COXBU7E912_A0001	CBUD_A0003		fic	FALSE	0.062	131.000	0.000	1.000		NA
3716570	3716571	COXBU7E912_A0008	COXBU7E912_A0010			FALSE	0.015	248.000	0.000	0.031		NA
3716573	3716574	COXBU7E912_A0011	CBUD_A0012			FALSE	0.032	231.000	0.000	NA		NA
3716577	5609206	COXBU7E912_A0015	CBUD_A0016			FALSE	0.211	28.000	0.000	NA		NA
5609206	3716580	CBUD_A0016	COXBU7E912_A0018			FALSE	0.011	546.000	0.000	NA		NA
3716580	3716581	COXBU7E912_A0018	COXBU7E912_A0019			TRUE	0.779	2.000	0.000	NA		NA
3716581	3716582	COXBU7E912_A0019	CBUD_A0020			TRUE	0.971	2.000	0.017	NA		NA
3716582	3716583	CBUD_A0020	CBUD_A0021			FALSE	0.280	-37.000	0.000	NA		NA
3716583	3716584	CBUD_A0021	COXBU7E912_A0022			FALSE	0.273	24.000	0.000	NA		NA
3716585	3716586	CBUD_A0023	COXBU7E912_A0024			FALSE	0.178	31.000	0.000	NA		NA
3716586	3716587	COXBU7E912_A0024	CBUD_A0026			FALSE	0.017	323.000	0.000	NA		NA
5609207	5609208	CBUD_A0026a	CBUD_A0026c			FALSE	0.018	308.000	0.000	NA		NA
3716593	3716594	COXBU7E912_A0031	COXBU7E912_A0032			FALSE	0.017	333.000	0.000	NA		NA
5609210	3716597	CBUD_A0033a	CBUD_A0035			FALSE	0.074	137.000	0.000	NA		NA
3716597	5609211	CBUD_A0035	CBUD_A0036			FALSE	0.086	51.000	0.000	NA		NA
5609211	5609212	CBUD_A0036	CBUD_A0038			FALSE	0.085	52.000	0.000	NA		NA
3716608	5609213	COXBU7E912_A0046	CBUD_A0047			FALSE	0.048	183.000	0.000	NA		NA
5609213	5609214	CBUD_A0047	CBUD_A0048			FALSE	0.202	-67.000	0.000	NA		NA
3716611	3716612	COXBU7E912_A0049	CBUD_A0050			FALSE	0.476	14.000	0.000	NA		NA
3716614	3716615	COXBU7E912_A0052	COXBU7E912_A0053			FALSE	0.080	63.000	0.000	NA		NA
3716615	5609215	COXBU7E912_A0053	CBUD_A0053a			TRUE	0.532	-13.000	0.000	NA		NA
3716618	3716619	CBUD_A0056	COXBU7E912_A0057			TRUE	0.997	-3.000	0.500	NA		NA
3716619	3716620	COXBU7E912_A0057	COXBU7E912_A0058			FALSE	0.097	87.000	0.000	NA		NA
3716620	3716621	COXBU7E912_A0058	CBUD_A0059			TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		NA
3716622	3716623	COXBU7E912_A0060	COXBU7E912_A0061			TRUE	0.928	-10.000	0.012	NA		NA
3716623	3716625	COXBU7E912_A0061	COXBU7E912_A0063			FALSE	0.033	223.000	0.000	NA		NA
5609216	3716626	CBUD_A0063a	CBUD_A0064			FALSE	0.081	69.000	0.000	NA		NA
3716626	3716627	CBUD_A0064	CBUD_A0065		parB,1	FALSE	0.022	242.000	0.000	1.000		NA
3716628	3716629	COXBU7E912_A0066	COXBU7E912_A0067			FALSE	0.118	40.000	0.000	NA		NA
3716629	3716630	COXBU7E912_A0067	COXBU7E912_A0068			TRUE	0.995	-7.000	0.444	1.000	N	NA
3716630	3716631	COXBU7E912_A0068	COXBU7E912_A0069			TRUE	0.841	29.000	0.133	1.000		NA