MicrobesOnline Operon Predictions for Clostridium kluyveri DSM 555

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
3708217	3708218	CKL_0001	CKL_0002	dnaA	dnaN	TRUE	0.637	259.000	0.328	1.000	Y	NA
3708218	3708219	CKL_0002	CKL_0003	dnaN		TRUE	0.965	28.000	0.103	1.000		NA
3708219	3708220	CKL_0003	CKL_0004		recF	TRUE	0.891	81.000	0.209	1.000		NA
3708220	3708221	CKL_0004	CKL_0005	recF		TRUE	0.961	20.000	0.024	NA		NA
3708221	3708222	CKL_0005	CKL_0006		gyrB1	TRUE	0.948	22.000	0.017	NA		NA
3708222	3708223	CKL_0006	CKL_0007	gyrB1	gyrA1	TRUE	0.998	17.000	0.306	0.002	Y	NA
3708223	3708224	CKL_0007	CKL_0008	gyrA1		FALSE	0.006	567.000	0.000	NA		NA
3708224	3708225	CKL_0008	CKL_0009			FALSE	0.007	556.000	0.000	NA		NA
3708225	3708226	CKL_0009	CKL_0010			TRUE	0.529	57.000	0.000	NA		NA
3708226	3708227	CKL_0010	CKL_0011			TRUE	0.933	10.000	0.000	NA		NA
3708227	3708228	CKL_0011	CKL_0012			TRUE	0.942	4.000	0.000	NA		NA
3708228	3708229	CKL_0012	CKL_0013			FALSE	0.129	176.000	0.000	NA		NA
3708229	3708230	CKL_0013	CKL_0014			TRUE	0.378	156.000	0.029	1.000		NA
3708230	3708231	CKL_0014	CKL_0015			TRUE	0.881	37.000	0.021	1.000		NA
3708231	3708232	CKL_0015	CKL_0016			TRUE	0.599	49.000	0.000	1.000		NA
3708232	3708233	CKL_0016	CKL_0017			TRUE	0.994	18.000	0.370	NA		NA
3708233	3708234	CKL_0017	CKL_0018		serS	FALSE	0.016	372.000	0.000	NA		NA
3708234	3708235	CKL_0018	CKL_0019	serS		FALSE	0.027	305.000	0.000	NA		NA
3708235	3708236	CKL_0019	CKL_0020			TRUE	0.829	26.000	0.000	NA		NA
3708238	3708239	CKL_0022	CKL_0023	vanR	vanS	TRUE	0.999	-10.000	0.385	0.024	Y	NA
3708241	3708242	CKL_0025	CKL_0026			FALSE	0.023	322.000	0.000	NA		NA
3708242	3708243	CKL_0026	CKL_0027			FALSE	0.085	208.000	0.000	NA		NA
3708246	3708247	CKL_0030	CKL_0031			FALSE	0.156	160.000	0.000	NA		NA
3708249	3708250	CKL_0033	CKL_0034			FALSE	0.006	618.000	0.000	NA		NA
3708251	3708252	CKL_0035	CKL_0036			TRUE	0.772	192.000	0.600	NA		NA
3708252	3708253	CKL_0036	CKL_0037			TRUE	0.956	-13.000	0.000	NA		NA
3708253	3708254	CKL_0037	CKL_0038			TRUE	0.922	14.000	0.000	NA		NA
3708254	3708255	CKL_0038	CKL_0039			TRUE	0.939	87.000	0.175	1.000	Y	NA
3708255	3708256	CKL_0039	CKL_0040			FALSE	0.196	136.000	0.000	1.000		NA
3708257	3708258	CKL_0041	CKL_0042			TRUE	0.721	37.000	0.000	NA		NA
3708260	3708261	CKL_0044	CKL_0045			FALSE	0.015	381.000	0.000	NA		NA
3708261	3708262	CKL_0045	CKL_0046			TRUE	0.478	66.000	0.000	NA		NA
3708264	3708265	CKL_0048	CKL_0049		psd	TRUE	0.683	40.000	0.000	1.000		NA
3708267	3708268	CKL_0051	CKL_0052			TRUE	0.974	31.000	0.205	NA		NA
3708269	3708270	CKL_0053	CKL_0054		tadA	FALSE	0.164	152.000	0.000	NA		NA
3708270	3708271	CKL_0054	CKL_0055	tadA		FALSE	0.162	153.000	0.000	NA		NA
3708272	3708273	CKL_0056	CKL_0057			TRUE	0.942	4.000	0.000	NA		NA
3708274	3708275	CKL_0058	CKL_0059			FALSE	0.345	100.000	0.000	NA		NA
3708275	3708276	CKL_0059	CKL_0060		flr	FALSE	0.030	294.000	0.000	NA		NA
3708276	3708277	CKL_0060	CKL_0061	flr		FALSE	0.017	363.000	0.000	NA		NA
3708277	3708278	CKL_0061	CKL_0062			FALSE	0.272	118.000	0.000	NA		NA
3708279	3708280	CKL_0063	CKL_0064			FALSE	0.101	196.000	0.000	NA		NA
3708280	3708281	CKL_0064	CKL_0065			TRUE	0.557	54.000	0.000	NA		NA
3708281	3708282	CKL_0065	CKL_0066		ppsA	TRUE	0.907	18.000	0.000	NA		NA
3708282	3708283	CKL_0066	CKL_0067	ppsA		TRUE	0.381	74.000	0.000	1.000	N	NA
3708283	3708284	CKL_0067	CKL_0068			FALSE	0.083	211.000	0.000	1.000		NA
3708284	3708285	CKL_0068	CKL_0069			TRUE	0.915	16.000	0.000	NA		NA
3708285	3708286	CKL_0069	CKL_0070			TRUE	0.997	-3.000	0.375	NA		NA
3708286	3708287	CKL_0070	CKL_0071			TRUE	0.616	46.000	0.000	NA		NA
3708287	3708288	CKL_0071	CKL_0072			FALSE	0.024	318.000	0.000	NA		NA
3708288	3708289	CKL_0072	CKL_0073			TRUE	0.999	-7.000	0.286	0.009	Y	NA
3708290	3708291	CKL_0074	CKL_0075			TRUE	0.422	82.000	0.000	NA		NA
3708291	3708292	CKL_0075	CKL_0076			TRUE	0.380	92.000	0.000	NA		NA
3708292	3708293	CKL_0076	CKL_0077			TRUE	0.983	15.000	0.071	NA		NA
3708293	3708294	CKL_0077	CKL_0078			FALSE	0.009	416.000	0.000	NA	N	NA
3708294	3708295	CKL_0078	CKL_0079			TRUE	0.858	45.000	0.000	NA	Y	NA
3708296	3708297	CKL_0080	CKL_0081			TRUE	0.845	25.000	0.000	1.000		NA
3708297	3708298	CKL_0081	CKL_0082			FALSE	0.101	230.000	0.000	0.064		NA
3708298	3708299	CKL_0082	CKL_0083			TRUE	0.364	96.000	0.000	NA		NA
3708299	3708300	CKL_0083	CKL_0084			TRUE	0.992	10.000	0.154	NA		NA
3708300	3708301	CKL_0084	CKL_0085		apeB	FALSE	0.221	129.000	0.000	NA		NA
3708302	3708303	CKL_0086	CKL_0087		purA	TRUE	0.729	76.000	0.033	NA		NA
3708303	3708304	CKL_0087	CKL_0088	purA		FALSE	0.179	128.000	0.000	1.000	N	NA
3708306	3708307	CKL_0090	CKL_0091			FALSE	0.086	207.000	0.000	NA		NA
3708307	3708308	CKL_0091	CKL_0092			TRUE	0.933	10.000	0.000	NA		NA
3708308	3708309	CKL_0092	CKL_0093			TRUE	0.936	7.000	0.000	NA		NA
3708309	3708310	CKL_0093	CKL_0094			FALSE	0.312	108.000	0.000	NA		NA
3708310	3708311	CKL_0094	CKL_0095			TRUE	0.933	10.000	0.000	NA		NA
3708311	3708312	CKL_0095	CKL_0096			TRUE	0.872	22.000	0.000	NA		NA
3708312	3708313	CKL_0096	CKL_0097			TRUE	0.940	5.000	0.000	NA		NA
3708314	3708315	CKL_0098	CKL_0099			TRUE	0.997	-7.000	0.083	NA	Y	NA
3708316	3708317	CKL_0100	CKL_0101			TRUE	0.862	42.000	0.032	1.000		NA
3708317	3708318	CKL_0101	CKL_0102		fabH1	TRUE	0.991	-7.000	0.098	1.000	N	NA
3708318	3708319	CKL_0102	CKL_0103	fabH1	acp1	TRUE	0.985	25.000	0.121	0.006		NA
3708319	3708320	CKL_0103	CKL_0104	acp1	fabI	TRUE	0.993	13.000	0.216	1.000		NA
3708320	3708321	CKL_0104	CKL_0105	fabI	fabD	TRUE	0.986	16.000	0.099	1.000		NA
3708321	3708322	CKL_0105	CKL_0106	fabD	fabG1	TRUE	0.998	11.000	0.149	0.006	Y	NA
3708322	3708323	CKL_0106	CKL_0107	fabG1	fabF	TRUE	0.994	25.000	0.236	1.000	Y	NA
3708323	3708324	CKL_0107	CKL_0108	fabF	accB	TRUE	0.989	2.000	0.074	1.000		NA
3708324	3708325	CKL_0108	CKL_0109	accB	fabZ	TRUE	0.985	20.000	0.058	0.006		NA
3708325	3708326	CKL_0109	CKL_0110	fabZ	accC	TRUE	0.986	25.000	0.077	1.000	Y	NA
3708326	3708327	CKL_0110	CKL_0111	accC	accD	TRUE	0.837	121.000	0.090	1.000	Y	NA
3708327	3708328	CKL_0111	CKL_0112	accD	accA	TRUE	0.979	69.000	0.234	0.001	Y	NA
3708329	3708330	CKL_0113	CKL_0114	ftn		FALSE	0.276	169.000	0.008	1.000		NA
3708330	3708331	CKL_0114	CKL_0115			TRUE	0.799	101.000	0.129	NA		NA
3708331	3708332	CKL_0115	CKL_0116			TRUE	0.729	136.000	0.220	NA		NA
3708332	3708333	CKL_0116	CKL_0117			FALSE	0.026	309.000	0.000	NA		NA
3708333	3708334	CKL_0117	CKL_0118		asnS	TRUE	0.799	29.000	0.000	NA		NA
3708334	3708335	CKL_0118	CKL_0119	asnS	ogt	FALSE	0.011	391.000	0.000	1.000	N	NA
3708335	3708336	CKL_0119	CKL_0120	ogt		TRUE	0.700	39.000	0.000	1.000		NA
3708336	3708337	CKL_0120	CKL_0121			TRUE	0.683	40.000	0.000	1.000		NA
3708337	3708338	CKL_0121	CKL_0122			TRUE	0.999	-37.000	0.669	0.003	N	NA
3708338	3708339	CKL_0122	CKL_0123			FALSE	0.297	112.000	0.000	NA		NA
3708339	3708340	CKL_0123	CKL_0124			TRUE	0.529	57.000	0.000	NA		NA
3708340	3708341	CKL_0124	CKL_0125			TRUE	0.956	-16.000	0.000	NA		NA
3708341	3708342	CKL_0125	CKL_0126			TRUE	0.966	16.000	0.016	NA		NA
3708342	3708343	CKL_0126	CKL_0127		murA1	TRUE	0.965	23.000	0.058	1.000		NA
3708343	3708344	CKL_0127	CKL_0128	murA1		FALSE	0.011	433.000	0.000	NA		NA
3708347	3708348	CKL_0131	CKL_0132	murI		TRUE	0.499	62.000	0.000	1.000		NA
3708348	3708349	CKL_0132	CKL_0133			TRUE	0.639	121.000	0.071	1.000		NA
3708350	3708351	CKL_0134	CKL_0135			TRUE	0.721	123.000	0.133	NA		NA
3708352	3708353	CKL_0136	CKL_0137			TRUE	0.862	50.000	0.058	NA		NA
3708353	3708354	CKL_0137	CKL_0138		comB	TRUE	0.916	39.000	0.067	1.000		NA
3708355	3708356	CKL_0139	CKL_0140			TRUE	0.767	32.000	0.000	NA		NA
3708356	3708357	CKL_0140	CKL_0141			TRUE	0.669	139.000	0.156	1.000		NA
3708357	3708358	CKL_0141	CKL_0142			FALSE	0.098	198.000	0.000	NA		NA
3708358	3708359	CKL_0142	CKL_0143		murC	TRUE	0.602	83.000	0.004	NA		NA
3708360	3708361	CKL_0144	CKL_0145			TRUE	0.721	104.000	0.099	1.000	N	NA
3708361	3708362	CKL_0145	CKL_0146		gcaD	TRUE	0.570	156.000	0.011	1.000	Y	NA
3708362	3708363	CKL_0146	CKL_0147	gcaD	prs	TRUE	0.957	25.000	0.069	1.000	N	NA
3708363	3708364	CKL_0147	CKL_0148	prs		FALSE	0.054	484.000	0.123	1.000	N	NA
3708364	3708365	CKL_0148	CKL_0149			TRUE	0.985	1.000	0.000	1.000	Y	NA
3708365	3708366	CKL_0149	CKL_0150			TRUE	0.358	81.000	0.000	1.000	N	NA
3708366	3708367	CKL_0150	CKL_0151		pth	TRUE	0.530	95.000	0.009	1.000	N	NA
3708367	3708368	CKL_0151	CKL_0152	pth	mfd	TRUE	0.759	108.000	0.137	1.000	N	NA
3708368	3708369	CKL_0152	CKL_0153	mfd	prsA	TRUE	0.636	76.000	0.016	1.000	N	NA
3708369	3708370	CKL_0153	CKL_0154	prsA		FALSE	0.220	236.000	0.088	NA	N	NA
3708370	3708371	CKL_0154	CKL_0155			TRUE	0.511	170.000	0.108	NA		NA
3708371	3708372	CKL_0155	CKL_0156			TRUE	0.969	14.000	0.015	1.000		NA
3708372	3708373	CKL_0156	CKL_0157		hup	FALSE	0.031	415.000	0.014	1.000		NA
3708373	3708374	CKL_0157	CKL_0158	hup		TRUE	0.575	98.000	0.024	1.000	N	NA
3708374	3708375	CKL_0158	CKL_0159			TRUE	0.861	64.000	0.108	NA		NA
3708375	3708376	CKL_0159	CKL_0160			TRUE	0.992	32.000	0.774	NA		NA
3708376	3708377	CKL_0160	CKL_0161			TRUE	0.819	128.000	0.303	NA		NA
3708377	3708378	CKL_0161	CKL_0162			TRUE	0.572	180.000	0.179	1.000		NA
3708378	3708379	CKL_0162	CKL_0163			FALSE	0.234	126.000	0.000	NA		NA
3708379	3708380	CKL_0163	CKL_0164			TRUE	0.936	7.000	0.000	NA		NA
3708380	3708381	CKL_0164	CKL_0165			TRUE	0.929	12.000	0.000	NA		NA
3708381	3708382	CKL_0165	CKL_0166			TRUE	0.931	11.000	0.000	NA		NA
3708382	3708383	CKL_0166	CKL_0167			TRUE	0.936	7.000	0.000	NA		NA
3708383	3708384	CKL_0167	CKL_0168			TRUE	0.926	13.000	0.000	NA		NA
3708384	3708385	CKL_0168	CKL_0169			FALSE	0.043	261.000	0.000	NA		NA
3708385	3708386	CKL_0169	CKL_0170		tilS	FALSE	0.300	180.000	0.041	1.000	N	NA
3708386	3708387	CKL_0170	CKL_0171	tilS	hpt	TRUE	0.994	5.000	0.137	0.045	N	NA
3708387	3708388	CKL_0171	CKL_0172	hpt	ftsH1	TRUE	0.856	83.000	0.180	1.000	N	NA
3708388	3708389	CKL_0172	CKL_0173	ftsH1		TRUE	0.491	139.000	0.055	NA		NA
3708389	3708390	CKL_0173	CKL_0174			FALSE	0.288	152.000	0.003	NA		NA
3708390	3708391	CKL_0174	CKL_0175		dus	TRUE	0.980	9.000	0.054	1.000	N	NA
3708391	3708392	CKL_0175	CKL_0176	dus		TRUE	0.688	61.000	0.005	NA		NA
3708392	3708393	CKL_0176	CKL_0177		greA1	FALSE	0.296	177.000	0.023	NA		NA
3708393	3708394	CKL_0177	CKL_0178	greA1	lysS	TRUE	0.981	18.000	0.098	1.000	N	NA
3708394	3708395	CKL_0178	CKL_0179	lysS		FALSE	0.165	151.000	0.000	NA		NA
3708395	3708396	CKL_0179	CKL_0180		glyS	FALSE	0.024	319.000	0.000	NA		NA
3708396	3708397	CKL_0180	CKL_0181	glyS	murD	FALSE	0.015	626.000	0.002	0.045	N	NA
3708397	3708398	CKL_0181	CKL_0182	murD		FALSE	0.006	622.000	0.000	NA		NA
3708398	3708399	CKL_0182	CKL_0183			TRUE	0.894	20.000	0.000	NA		NA
3708399	3708400	CKL_0183	CKL_0184			TRUE	0.942	4.000	0.000	NA		NA
3708400	3708401	CKL_0184	CKL_0185			FALSE	0.008	495.000	0.000	NA		NA
3708401	3708402	CKL_0185	CKL_0186			FALSE	0.292	113.000	0.000	NA		NA
3708402	3708403	CKL_0186	CKL_0187			TRUE	0.933	10.000	0.000	NA		NA
3708403	3708404	CKL_0187	CKL_0188			TRUE	0.942	4.000	0.000	NA		NA
3708404	3708405	CKL_0188	CKL_0189		fusA1	FALSE	0.015	387.000	0.000	NA		NA
3708405	3708406	CKL_0189	CKL_0190	fusA1		TRUE	0.368	147.000	0.021	NA		NA
3708406	3708407	CKL_0190	CKL_0191		cobC1	FALSE	0.345	100.000	0.000	NA		NA
3708407	3708408	CKL_0191	CKL_0192	cobC1		FALSE	0.120	159.000	0.000	NA	N	NA
3708408	3708409	CKL_0192	CKL_0193			TRUE	0.976	55.000	0.681	NA		NA
3708409	3708410	CKL_0193	CKL_0194			TRUE	0.999	3.000	0.848	1.000		NA
3708410	3708411	CKL_0194	CKL_0195		clpC	TRUE	0.980	21.000	0.129	1.000	N	NA
3708411	3708412	CKL_0195	CKL_0196	clpC	radA	TRUE	0.677	150.000	0.009	0.019	Y	NA
3708412	3708413	CKL_0196	CKL_0197	radA		TRUE	0.989	15.000	0.126	1.000		NA
3708415	3708416	CKL_0199	CKL_0200		ispD	TRUE	0.994	-10.000	0.134	NA		NA
3708416	3708417	CKL_0200	CKL_0201	ispD	cysS	FALSE	0.060	213.000	0.000	1.000	N	NA
3708417	3708418	CKL_0201	CKL_0202	cysS		TRUE	0.959	34.000	0.129	1.000		NA
3708418	3708419	CKL_0202	CKL_0203			TRUE	0.995	9.000	0.150	0.004		NA
3708419	3708420	CKL_0203	CKL_0204			TRUE	0.992	-3.000	0.109	NA		NA
3708420	3708421	CKL_0204	CKL_0205		rpoD1	TRUE	0.934	78.000	0.361	NA		NA
3708421	3708422	CKL_0205	CKL_0206	rpoD1		FALSE	0.066	222.000	0.000	NA		NA
3708422	3708423	CKL_0206	CKL_0207			TRUE	0.933	10.000	0.000	NA		NA
3708423	3708424	CKL_0207	CKL_0208		tuf1	TRUE	0.394	89.000	0.000	NA		NA
3708424	3708425	CKL_0208	CKL_0209	tuf1	rpmG	TRUE	0.483	234.000	0.099	1.000	Y	NA
3708425	3708426	CKL_0209	CKL_0210	rpmG	secE	TRUE	0.902	44.000	0.100	1.000	N	NA
3708426	3708427	CKL_0210	CKL_0211	secE	nusG	TRUE	0.981	49.000	0.843	1.000	N	NA
3708427	3708428	CKL_0211	CKL_0212	nusG	rplK	TRUE	0.955	82.000	0.681	1.000	N	NA
3708428	3708429	CKL_0212	CKL_0213	rplK	rplA	TRUE	0.993	59.000	0.838	0.024	Y	NA
3708429	3708430	CKL_0213	CKL_0214	rplA	rplJ	TRUE	0.857	168.000	0.302	1.000	Y	NA
3708430	3708431	CKL_0214	CKL_0215	rplJ	rplL	TRUE	0.997	31.000	0.884	1.000	Y	NA
3708431	3708432	CKL_0215	CKL_0216	rplL	rpoB	FALSE	0.239	294.000	0.223	1.000	N	NA
3708432	3708433	CKL_0216	CKL_0217	rpoB	rpoC	TRUE	0.999	18.000	0.851	0.001	Y	NA
3708433	3708434	CKL_0217	CKL_0218	rpoC		TRUE	0.623	113.000	0.065	1.000	N	NA
3708434	3708435	CKL_0218	CKL_0219		rpsL	TRUE	0.718	235.000	0.239	0.024	Y	NA
3708435	3708436	CKL_0219	CKL_0220	rpsL	rpsG	TRUE	0.908	145.000	0.224	0.004	Y	NA
3708436	3708437	CKL_0220	CKL_0221	rpsG	fusA2	TRUE	0.980	79.000	0.579	1.000	Y	NA
3708437	3708438	CKL_0221	CKL_0222	fusA2	tuf2	TRUE	0.993	45.000	0.400	0.002	Y	NA
3708438	3708439	CKL_0222	CKL_0223	tuf2	rpsJ	TRUE	0.395	366.000	0.318	1.000	Y	NA
3708439	3708440	CKL_0223	CKL_0224	rpsJ	rplC	TRUE	0.980	88.000	0.467	0.024	Y	NA
3708440	3708441	CKL_0224	CKL_0225	rplC	rplD	TRUE	0.998	25.000	0.544	0.018	Y	NA
3708441	3708442	CKL_0225	CKL_0226	rplD	rplW	TRUE	0.999	0.000	0.307	0.018	Y	NA
3708442	3708443	CKL_0226	CKL_0227	rplW	rplB	TRUE	0.993	59.000	0.849	0.022	Y	NA
3708443	3708444	CKL_0227	CKL_0228	rplB	rpsS	TRUE	0.969	136.000	0.820	0.024	Y	NA
3708444	3708445	CKL_0228	CKL_0229	rpsS	rplV	TRUE	0.999	24.000	0.769	0.024	Y	NA
3708445	3708446	CKL_0229	CKL_0230	rplV	rpsC	TRUE	0.999	16.000	0.719	0.024	Y	NA
3708446	3708447	CKL_0230	CKL_0231	rpsC	rplP	TRUE	0.999	18.000	0.828	0.024	Y	NA
3708447	3708448	CKL_0231	CKL_0232	rplP	rpmC	TRUE	1.000	-10.000	0.802	0.018	Y	NA
3708448	3708449	CKL_0232	CKL_0233	rpmC	rpsQ	TRUE	0.999	20.000	0.828	0.018	Y	NA
3708449	3708450	CKL_0233	CKL_0234	rpsQ	rplN	TRUE	0.998	26.000	0.791	0.024	Y	NA
3708450	3708451	CKL_0234	CKL_0235	rplN	rplX	TRUE	0.999	19.000	0.810	0.024	Y	NA
3708451	3708452	CKL_0235	CKL_0236	rplX	rplE	TRUE	0.999	24.000	0.758	0.018	Y	NA
3708452	3708453	CKL_0236	CKL_0237	rplE	rpsN	TRUE	0.999	13.000	0.496	0.018	Y	NA
3708453	3708454	CKL_0237	CKL_0238	rpsN	rpsH	TRUE	0.996	33.000	0.473	0.018	Y	NA
3708454	3708455	CKL_0238	CKL_0239	rpsH	rplF	TRUE	0.991	77.000	0.808	0.018	Y	NA
3708455	3708456	CKL_0239	CKL_0240	rplF	rplR	TRUE	0.999	19.000	0.815	0.018	Y	NA
3708456	3708457	CKL_0240	CKL_0241	rplR	rpsE	TRUE	0.999	18.000	0.814	0.024	Y	NA
3708457	3708458	CKL_0241	CKL_0242	rpsE	rpmD	TRUE	0.999	13.000	0.789	0.024	Y	NA
3708458	3708459	CKL_0242	CKL_0243	rpmD	rplO	TRUE	0.999	24.000	0.653	0.003	Y	NA
3708459	3708460	CKL_0243	CKL_0244	rplO	secY	TRUE	0.998	2.000	0.730	1.000	N	NA
3708460	3708461	CKL_0244	CKL_0245	secY	adk	TRUE	0.987	22.000	0.241	1.000	N	NA
3708461	3708462	CKL_0245	CKL_0246	adk	map1	TRUE	0.996	-3.000	0.290	1.000	N	NA
3708462	3708463	CKL_0246	CKL_0247	map1	infA	TRUE	0.917	102.000	0.160	1.000	Y	NA
3708463	3708464	CKL_0247	CKL_0248	infA	rpmJ	TRUE	0.992	18.000	0.257	1.000		NA
3708464	3708465	CKL_0248	CKL_0249	rpmJ	rpsM	TRUE	0.669	186.000	0.194	0.018		NA
3708465	3708466	CKL_0249	CKL_0250	rpsM	rpsK	TRUE	0.999	18.000	0.810	0.018	Y	NA
3708466	3708467	CKL_0250	CKL_0251	rpsK	rpsD1	TRUE	0.998	23.000	0.509	0.024	Y	NA
3708467	3708468	CKL_0251	CKL_0252	rpsD1	rpoA	TRUE	0.954	66.000	0.549	1.000	N	NA
3708468	3708469	CKL_0252	CKL_0253	rpoA	rplQ	TRUE	0.982	49.000	0.873	1.000	N	NA
3708469	3708470	CKL_0253	CKL_0254	rplQ		TRUE	0.542	131.000	0.074	1.000	N	NA
3708470	3708471	CKL_0254	CKL_0255			TRUE	1.000	-15.000	0.713	0.029	Y	NA
3708471	3708472	CKL_0255	CKL_0256			TRUE	0.998	13.000	0.304	1.000	Y	NA
3708472	3708473	CKL_0256	CKL_0257		truA	TRUE	0.997	-3.000	0.404	1.000	N	NA
3708473	3708474	CKL_0257	CKL_0258	truA	rplM	TRUE	0.555	179.000	0.031	1.000	Y	NA
3708474	3708475	CKL_0258	CKL_0259	rplM	rpsI	TRUE	0.998	26.000	0.601	0.018	Y	NA
3708475	3708476	CKL_0259	CKL_0260	rpsI		FALSE	0.086	187.000	0.000	1.000	N	NA
3708477	3708478	CKL_0261	CKL_0262			TRUE	0.813	141.000	0.400	NA		NA
3708478	3708479	CKL_0262	CKL_0263			TRUE	0.937	76.000	0.375	NA		NA
3708479	3708480	CKL_0263	CKL_0264			FALSE	0.010	456.000	0.000	NA		NA
3708480	3708481	CKL_0264	CKL_0265			FALSE	0.009	488.000	0.000	NA		NA
3708481	3708482	CKL_0265	CKL_0266			TRUE	0.790	30.000	0.000	NA		NA
3708482	3708483	CKL_0266	CKL_0267			TRUE	0.957	-46.000	0.000	NA		NA
3708483	3708484	CKL_0267	CKL_0268			TRUE	0.829	54.000	0.045	NA		NA
3708484	3708485	CKL_0268	CKL_0269			TRUE	0.987	14.000	0.125	1.000	N	NA
3708487	3708488	CKL_0271	CKL_0272			TRUE	0.906	31.000	0.018	NA		NA
3708491	3708492	CKL_0275	CKL_0276			FALSE	0.282	116.000	0.000	NA		NA
3708493	3708494	CKL_0277	CKL_0278			TRUE	0.998	-3.000	0.455	NA		NA
3708494	3708495	CKL_0278	CKL_0279			TRUE	0.963	52.000	0.400	NA		NA
3708495	3708496	CKL_0279	CKL_0280			TRUE	0.768	142.000	0.300	NA		NA
3708496	3708497	CKL_0280	CKL_0281			TRUE	0.835	110.000	0.222	NA		NA
3708497	3708498	CKL_0281	CKL_0282			TRUE	0.951	-3.000	0.000	NA		NA
3708498	3708499	CKL_0282	CKL_0283			TRUE	0.842	25.000	0.000	NA		NA
3708499	3708500	CKL_0283	CKL_0284			TRUE	0.996	-7.000	0.222	NA		NA
3708500	3708501	CKL_0284	CKL_0285			TRUE	0.998	-52.000	0.625	NA		NA
3708501	3708502	CKL_0285	CKL_0286			TRUE	0.965	48.000	0.375	NA		NA
3708502	3708503	CKL_0286	CKL_0287			TRUE	0.696	39.000	0.000	NA		NA
3708503	3708504	CKL_0287	CKL_0288			TRUE	0.544	56.000	0.000	1.000		NA
3708504	3708505	CKL_0288	CKL_0289			TRUE	0.997	12.000	0.500	NA		NA
3708505	3708506	CKL_0289	CKL_0290			TRUE	0.376	93.000	0.000	NA		NA
3708506	3708507	CKL_0290	CKL_0291			TRUE	0.955	-10.000	0.000	NA		NA
3708507	3708508	CKL_0291	CKL_0292			TRUE	0.446	76.000	0.000	NA		NA
3708508	3708509	CKL_0292	CKL_0293			TRUE	0.594	49.000	0.000	NA		NA
3708509	3708510	CKL_0293	CKL_0294			TRUE	0.954	-7.000	0.000	NA		NA
3708510	3708511	CKL_0294	CKL_0295			FALSE	0.028	301.000	0.000	NA		NA
3708512	3708513	CKL_0296	CKL_0297			TRUE	0.870	34.000	0.000	0.007		NA
3708513	3708514	CKL_0297	CKL_0298			FALSE	0.010	461.000	0.000	NA		NA
3708514	3708515	CKL_0298	CKL_0299			TRUE	0.394	89.000	0.000	NA		NA
3708515	3708516	CKL_0299	CKL_0300			FALSE	0.008	516.000	0.000	NA		NA
3708516	3708517	CKL_0300	CKL_0301			FALSE	0.026	286.000	0.000	1.000	N	NA
3708517	3708518	CKL_0301	CKL_0302		mutE	FALSE	0.240	112.000	0.000	1.000	N	NA
3708518	3708519	CKL_0302	CKL_0303	mutE	fumA	TRUE	0.569	43.000	0.000	1.000	N	NA
3708519	3708520	CKL_0303	CKL_0304	fumA	fumB	TRUE	0.987	52.000	0.262	0.001	Y	NA
3708520	3708521	CKL_0304	CKL_0305	fumB		FALSE	0.061	212.000	0.000	1.000	N	NA
3708521	3708522	CKL_0305	CKL_0306			TRUE	0.369	96.000	0.000	1.000		NA
3708522	3708523	CKL_0306	CKL_0307		pts1	TRUE	0.669	41.000	0.000	1.000		NA
3708523	3708524	CKL_0307	CKL_0308	pts1		TRUE	0.696	105.000	0.069	NA		NA
3708524	3708525	CKL_0308	CKL_0309			TRUE	0.997	-7.000	0.333	NA		NA
3708525	3708526	CKL_0309	CKL_0310		trx	TRUE	0.909	86.000	0.286	1.000		NA
3708526	3708527	CKL_0310	CKL_0311	trx	trxR	TRUE	0.949	50.000	0.250	1.000		NA
3708529	3708530	CKL_0313	CKL_0314			TRUE	0.998	-33.000	0.502	NA		NA
3708530	3708531	CKL_0314	CKL_0315			TRUE	0.992	-19.000	0.083	NA		NA
3708531	3708532	CKL_0315	CKL_0316		glmM	FALSE	0.015	636.000	0.017	1.000		NA
3708532	3708533	CKL_0316	CKL_0317	glmM	glmS	FALSE	0.017	569.000	0.030	1.000	N	NA
3708533	3708534	CKL_0317	CKL_0318	glmS		FALSE	0.039	274.000	0.000	1.000		NA
3708534	3708535	CKL_0318	CKL_0319			TRUE	0.475	67.000	0.000	NA		NA
3708535	3708536	CKL_0319	CKL_0320			FALSE	0.005	738.000	0.000	NA		NA
3708536	3708537	CKL_0320	CKL_0321			FALSE	0.005	842.000	0.000	1.000		NA
3708537	3708538	CKL_0321	CKL_0322			FALSE	0.041	669.000	0.167	1.000	N	NA
3708538	3708539	CKL_0322	CKL_0323			TRUE	0.961	61.000	0.583	1.000	N	NA
3708539	3708540	CKL_0323	CKL_0324			FALSE	0.095	201.000	0.000	1.000		NA
3708540	3708541	CKL_0324	CKL_0325			TRUE	0.455	73.000	0.000	NA		NA
3708541	3708542	CKL_0325	CKL_0326		proC1	TRUE	0.489	63.000	0.000	NA		NA
3708542	3708543	CKL_0326	CKL_0327	proC1		FALSE	0.169	148.000	0.000	NA		NA
3708543	3708544	CKL_0327	CKL_0328			FALSE	0.015	384.000	0.000	NA		NA
3708545	3708546	CKL_0329	CKL_0330			TRUE	0.427	82.000	0.000	1.000		NA
3708547	3708548	CKL_0331	CKL_0332			TRUE	0.441	78.000	0.000	NA		NA
3708548	3708549	CKL_0332	CKL_0333			FALSE	0.005	748.000	0.000	NA		NA
3708549	3708550	CKL_0333	CKL_0334			TRUE	0.998	3.000	0.229	NA	Y	NA
3708550	3708551	CKL_0334	CKL_0335			TRUE	0.964	25.000	0.071	NA		NA
3708552	3708553	CKL_0336	CKL_0337	gerKB1		TRUE	0.872	22.000	0.000	NA		NA
3708553	3708554	CKL_0337	CKL_0338		gerKC1	TRUE	0.585	50.000	0.000	NA		NA
3708554	3708555	CKL_0338	CKL_0339	gerKC1	gerKA1	TRUE	0.973	4.000	0.000	0.009		NA
3708556	3708557	CKL_0340	CKL_0341		fur1	TRUE	0.636	54.000	0.000	0.063	N	NA
3708559	3708560	CKL_0343	CKL_0344	msrA		FALSE	0.202	122.000	0.000	1.000	N	NA
3708561	3708562	CKL_0345	CKL_0346			FALSE	0.111	190.000	0.000	1.000		NA
3708563	3708564	CKL_0347	CKL_0348			TRUE	0.602	48.000	0.000	NA		NA
3708564	3708565	CKL_0348	CKL_0349			FALSE	0.230	127.000	0.000	NA		NA
3708566	3708567	CKL_0350	CKL_0351			TRUE	0.982	-12.000	0.000	0.001		NA
3708568	3708569	CKL_0352	CKL_0353			FALSE	0.055	236.000	0.000	NA		NA
3708569	3708570	CKL_0353	CKL_0354			TRUE	0.998	-3.000	0.571	NA		NA
3708570	3708571	CKL_0354	CKL_0355			FALSE	0.173	145.000	0.000	NA		NA
3708571	3708572	CKL_0355	CKL_0356			TRUE	0.449	75.000	0.000	NA		NA
3708572	3708573	CKL_0356	CKL_0357			FALSE	0.089	204.000	0.000	NA		NA
3708574	3708575	CKL_0358	CKL_0359		def1	TRUE	0.702	33.000	0.000	1.000	N	NA
3708576	3708577	CKL_0360	CKL_0361			TRUE	0.999	-3.000	0.455	1.000	Y	NA
3708578	3708579	CKL_0362	CKL_0363	ahpF	ahpC	TRUE	0.999	13.000	0.551	1.000	Y	NA
3708580	3708581	CKL_0364	CKL_0365			TRUE	0.949	0.000	0.000	NA		NA
3708581	3708582	CKL_0365	CKL_0366			TRUE	0.394	89.000	0.000	NA		NA
3708582	3708583	CKL_0366	CKL_0367			TRUE	0.872	120.000	0.462	1.000	N	NA
3708583	3708584	CKL_0367	CKL_0368			TRUE	1.000	-7.000	0.867	0.009	Y	NA
3708584	3708585	CKL_0368	CKL_0369			FALSE	0.047	252.000	0.000	NA		NA
3708585	3708586	CKL_0369	CKL_0370		anfD	FALSE	0.008	517.000	0.000	NA		NA
3708586	3708587	CKL_0370	CKL_0371	anfD	anfG	TRUE	0.996	31.000	1.000	0.007		NA
3708587	3708588	CKL_0371	CKL_0372	anfG	anfK	TRUE	0.999	15.000	0.941	0.007		NA
3708588	3708589	CKL_0372	CKL_0373	anfK		FALSE	0.168	131.000	0.000	1.000	N	NA
3708589	3708590	CKL_0373	CKL_0374			TRUE	0.972	16.000	0.029	1.000		NA
3708590	3708591	CKL_0374	CKL_0375			TRUE	0.507	61.000	0.000	1.000		NA
3708591	3708592	CKL_0375	CKL_0376			TRUE	0.992	16.000	0.138	0.030		NA
3708592	3708593	CKL_0376	CKL_0377			TRUE	0.960	22.000	0.036	NA		NA
3708593	3708594	CKL_0377	CKL_0378			TRUE	0.992	6.000	0.028	NA	Y	NA
3708594	3708595	CKL_0378	CKL_0379			FALSE	0.173	145.000	0.000	NA		NA
3708597	3708598	CKL_0381	CKL_0382			TRUE	0.901	19.000	0.000	NA		NA
3708599	3708600	CKL_0383	CKL_0384			TRUE	0.995	0.000	0.200	NA		NA
3708600	3708601	CKL_0384	CKL_0385			TRUE	0.993	3.000	0.167	1.000	N	NA
3708601	3708602	CKL_0385	CKL_0386			FALSE	0.121	160.000	0.000	1.000	N	NA
3708602	3708603	CKL_0386	CKL_0387			TRUE	0.604	163.000	0.182	1.000	N	NA
3708604	3708605	CKL_0388	CKL_0389			TRUE	0.986	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
3708605	3708606	CKL_0389	CKL_0390			FALSE	0.040	269.000	0.000	NA		NA
3708606	3708607	CKL_0390	CKL_0391			TRUE	0.944	83.000	0.500	NA		NA
3708607	3708608	CKL_0391	CKL_0392			TRUE	0.994	4.000	0.188	NA		NA
3708608	3708609	CKL_0392	CKL_0393			TRUE	0.996	3.000	0.312	NA		NA
3708609	3708610	CKL_0393	CKL_0394		algI	FALSE	0.004	685.000	0.000	NA	N	NA
3708610	3708611	CKL_0394	CKL_0395	algI		TRUE	0.929	12.000	0.000	NA		NA
3708612	3708613	CKL_0396	CKL_0397			FALSE	0.011	434.000	0.000	NA		NA
3708613	3708614	CKL_0397	CKL_0398			FALSE	0.034	469.000	0.000	NA	Y	NA
3708614	3708615	CKL_0398	CKL_0399			TRUE	0.999	5.000	0.500	NA	Y	NA
3708615	3708616	CKL_0399	CKL_0400			FALSE	0.042	262.000	0.000	NA		NA
3708616	3708617	CKL_0400	CKL_0401			TRUE	0.996	-7.000	0.273	NA		NA
3708617	3708618	CKL_0401	CKL_0402			FALSE	0.033	289.000	0.000	NA		NA
3708619	3708620	CKL_0403	CKL_0404			TRUE	0.433	81.000	0.000	1.000		NA
3708620	3708621	CKL_0404	CKL_0405			TRUE	0.894	20.000	0.000	NA		NA
3708621	3708622	CKL_0405	CKL_0406			FALSE	0.016	374.000	0.000	NA		NA
3708622	3708623	CKL_0406	CKL_0407			TRUE	0.516	59.000	0.000	NA		NA
3708623	3708624	CKL_0407	CKL_0408			FALSE	0.044	258.000	0.000	NA		NA
3708624	3708625	CKL_0408	CKL_0409			TRUE	0.779	126.000	0.222	NA		NA
3708627	3708628	CKL_0411	CKL_0412			FALSE	0.003	849.000	0.000	1.000	N	NA
3708628	3708629	CKL_0412	CKL_0413			FALSE	0.032	290.000	0.000	NA		NA
3708630	3708631	CKL_0414	CKL_0415			TRUE	0.615	81.000	0.000	0.011		NA
3708632	3708633	CKL_0416	CKL_0417			TRUE	0.997	4.000	0.500	NA		NA
3708633	3708634	CKL_0417	CKL_0418			FALSE	0.245	124.000	0.000	NA		NA
3708636	3708637	CKL_0420	CKL_0421			FALSE	0.013	413.000	0.000	NA		NA
3708637	3708638	CKL_0421	CKL_0422			FALSE	0.016	377.000	0.000	NA		NA
3708638	3708639	CKL_0422	CKL_0423			TRUE	0.998	6.000	0.722	NA	N	NA
3708639	3708640	CKL_0423	CKL_0424			TRUE	0.951	-3.000	0.000	NA		NA
3708640	3708641	CKL_0424	CKL_0425			TRUE	0.947	1.000	0.000	NA		NA
3708641	3708642	CKL_0425	CKL_0426		ilvE1	FALSE	0.011	436.000	0.000	NA		NA
3708642	3708643	CKL_0426	CKL_0427	ilvE1		FALSE	0.091	182.000	0.000	1.000	N	NA
3708643	3708644	CKL_0427	CKL_0428			FALSE	0.018	318.000	0.000	1.000	N	NA
3708646	3708647	CKL_0430	CKL_0431			TRUE	0.830	112.000	0.259	1.000	N	NA
3708648	3708649	CKL_0432	CKL_0433			TRUE	0.931	41.000	0.109	1.000		NA
3708654	3708655	CKL_0438	CKL_0439			FALSE	0.008	440.000	0.000	1.000	N	NA
3708655	3708656	CKL_0439	CKL_0440		fhs	FALSE	0.074	199.000	0.000	1.000	N	NA
3708656	3708657	CKL_0440	CKL_0441	fhs	fchA	TRUE	0.975	21.000	0.095	1.000	N	NA
3708657	3708658	CKL_0441	CKL_0442	fchA	folD	TRUE	0.908	58.000	0.082	0.001	N	NA
3708658	3708659	CKL_0442	CKL_0443	folD		FALSE	0.027	280.000	0.000	1.000	N	NA
3708659	3708660	CKL_0443	CKL_0444			TRUE	0.810	28.000	0.000	NA		NA
3708662	3708663	CKL_0446	CKL_0447	gcp	pyc	FALSE	0.006	488.000	0.000	1.000	N	NA
3708663	3708664	CKL_0447	CKL_0448	pyc		FALSE	0.052	243.000	0.000	1.000		NA
3708664	3708665	CKL_0448	CKL_0449			TRUE	0.422	83.000	0.000	1.000		NA
3708665	3708666	CKL_0449	CKL_0450			FALSE	0.041	264.000	0.000	NA		NA
3708666	3708667	CKL_0450	CKL_0451			FALSE	0.144	167.000	0.000	NA		NA
3708669	3708670	CKL_0453	CKL_0454		crt1	FALSE	0.077	215.000	0.000	1.000		NA
3708670	3708671	CKL_0454	CKL_0455	crt1	bcd	TRUE	0.620	176.000	0.054	1.000	Y	NA
3708671	3708672	CKL_0455	CKL_0456	bcd	etfB1	TRUE	0.995	17.000	0.364	0.066	N	NA
3708672	3708673	CKL_0456	CKL_0457	etfB1	etfA1	TRUE	0.999	20.000	0.714	0.023	Y	NA
3708673	3708674	CKL_0457	CKL_0458	etfA1	hbd1	TRUE	0.557	185.000	0.216	1.000	N	NA
3708674	3708675	CKL_0458	CKL_0459	hbd1		FALSE	0.069	248.000	0.000	0.051	N	NA
3708675	3708676	CKL_0459	CKL_0460			TRUE	0.964	0.000	0.000	0.051	N	NA
3708676	3708677	CKL_0460	CKL_0461			FALSE	0.076	197.000	0.000	1.000	N	NA
3708677	3708678	CKL_0461	CKL_0462			TRUE	0.398	131.000	0.012	NA		NA
3708678	3708679	CKL_0462	CKL_0463		groS	FALSE	0.018	355.000	0.000	NA		NA
3708679	3708680	CKL_0463	CKL_0464	groS	groL	TRUE	0.991	68.000	0.674	0.006	Y	NA
3708680	3708681	CKL_0464	CKL_0465	groL	guaB	FALSE	0.012	369.000	0.000	1.000	N	NA
3708681	3708682	CKL_0465	CKL_0466	guaB	guaA	TRUE	0.895	153.000	0.190	0.001	Y	NA
3708682	3708683	CKL_0466	CKL_0467	guaA		FALSE	0.288	134.000	0.002	1.000	N	NA
3708683	3708684	CKL_0467	CKL_0468			TRUE	0.949	0.000	0.000	NA		NA
3708684	3708685	CKL_0468	CKL_0469			TRUE	0.936	7.000	0.000	NA		NA
3708685	3708686	CKL_0469	CKL_0470			FALSE	0.007	554.000	0.000	NA		NA
3708686	3708687	CKL_0470	CKL_0471			TRUE	0.883	21.000	0.000	NA		NA
3708687	3708688	CKL_0471	CKL_0472			TRUE	0.936	7.000	0.000	NA		NA
3708688	3708689	CKL_0472	CKL_0473			FALSE	0.053	240.000	0.000	NA		NA
3708689	3708690	CKL_0473	CKL_0474			TRUE	0.894	20.000	0.000	NA		NA
3708690	3708691	CKL_0474	CKL_0475			FALSE	0.006	582.000	0.000	NA		NA
3708691	3708692	CKL_0475	CKL_0476			FALSE	0.179	142.000	0.000	NA		NA
3708692	3708693	CKL_0476	CKL_0477			FALSE	0.305	110.000	0.000	NA		NA
3708693	3708694	CKL_0477	CKL_0478			TRUE	0.997	16.000	0.667	NA		NA
3708694	3708695	CKL_0478	CKL_0479			FALSE	0.277	117.000	0.000	NA		NA
3708695	3708696	CKL_0479	CKL_0480			TRUE	0.992	0.000	0.104	NA		NA
3708696	3708697	CKL_0480	CKL_0481			TRUE	0.980	16.000	0.062	NA		NA
3708697	3708698	CKL_0481	CKL_0482			FALSE	0.005	680.000	0.000	NA		NA
3708698	3708699	CKL_0482	CKL_0483			FALSE	0.288	114.000	0.000	NA		NA
3708699	3708700	CKL_0483	CKL_0484			TRUE	0.493	62.000	0.000	NA		NA
3708700	3708701	CKL_0484	CKL_0485			TRUE	0.940	5.000	0.000	NA		NA
3708701	3708702	CKL_0485	CKL_0486			FALSE	0.042	262.000	0.000	NA		NA
3708702	3708703	CKL_0486	CKL_0487			FALSE	0.008	515.000	0.000	1.000		NA
3708703	3708704	CKL_0487	CKL_0488			FALSE	0.098	198.000	0.000	NA		NA
3708705	3708706	CKL_0489	CKL_0490			TRUE	0.501	61.000	0.000	NA		NA
3708707	3708708	CKL_0491	CKL_0492			TRUE	0.938	6.000	0.000	NA		NA
3708708	3708709	CKL_0492	CKL_0493			FALSE	0.037	278.000	0.000	NA		NA
3708710	3708711	CKL_0494	CKL_0495			TRUE	0.527	201.000	0.135	0.091		NA
3708712	3708713	CKL_0496	CKL_0497			FALSE	0.004	1135.000	0.000	NA		NA
3708716	3708717	CKL_0500	CKL_0501			FALSE	0.051	243.000	0.000	NA		NA
3708718	3708719	CKL_0502	CKL_0503			TRUE	0.401	126.000	0.000	0.008		NA
3708719	3708720	CKL_0503	CKL_0504			TRUE	0.907	18.000	0.000	NA		NA
3708722	3708723	CKL_0506	CKL_0507			FALSE	0.018	319.000	0.000	1.000	N	NA
3708723	3708724	CKL_0507	CKL_0508		napA	FALSE	0.025	287.000	0.000	1.000	N	NA
3708724	3708725	CKL_0508	CKL_0509	napA		FALSE	0.043	234.000	0.000	1.000	N	NA
3708725	3708726	CKL_0509	CKL_0510			FALSE	0.155	161.000	0.000	NA		NA
3708726	3708727	CKL_0510	CKL_0511			TRUE	0.564	53.000	0.000	NA		NA
3708727	3708728	CKL_0511	CKL_0512		dnaK1	FALSE	0.308	109.000	0.000	NA		NA
3708728	3708729	CKL_0512	CKL_0513	dnaK1	dnaK2	TRUE	0.995	16.000	0.050	0.003	Y	NA
3708729	3708730	CKL_0513	CKL_0514	dnaK2	dnaK3	TRUE	0.694	91.000	0.000	NA	Y	NA
3708730	3708731	CKL_0514	CKL_0515	dnaK3	dnaK4	TRUE	0.912	35.000	0.000	NA	Y	NA
3708731	3708732	CKL_0515	CKL_0516	dnaK4		TRUE	0.854	24.000	0.000	NA		NA
3708732	3708733	CKL_0516	CKL_0517			TRUE	0.881	38.000	0.027	NA		NA
3708733	3708734	CKL_0517	CKL_0518			TRUE	0.721	37.000	0.000	NA		NA
3708734	3708735	CKL_0518	CKL_0519			FALSE	0.226	128.000	0.000	NA		NA
3708735	3708736	CKL_0519	CKL_0520			FALSE	0.092	203.000	0.000	1.000		NA
3708736	3708737	CKL_0520	CKL_0521			FALSE	0.232	113.000	0.000	NA	N	NA
3708737	3708738	CKL_0521	CKL_0522			TRUE	0.935	-3.000	0.000	NA	N	NA
3708738	3708739	CKL_0522	CKL_0523			TRUE	0.952	67.000	0.526	1.000	N	NA
3708739	3708740	CKL_0523	CKL_0524			FALSE	0.027	305.000	0.000	NA		NA
3708740	3708741	CKL_0524	CKL_0525			FALSE	0.005	750.000	0.000	NA		NA
3708741	3708742	CKL_0525	CKL_0526			FALSE	0.131	174.000	0.000	NA		NA
3708742	3708743	CKL_0526	CKL_0527			FALSE	0.010	471.000	0.000	1.000		NA
3708744	3708745	CKL_0528	CKL_0529			TRUE	0.986	13.000	0.087	NA		NA
3708745	3708746	CKL_0529	CKL_0530			TRUE	0.901	19.000	0.000	NA		NA
3708746	3708747	CKL_0530	CKL_0531			TRUE	0.942	4.000	0.000	NA		NA
3708748	3708749	CKL_0532	CKL_0533			FALSE	0.208	132.000	0.000	NA		NA
3708749	3708750	CKL_0533	CKL_0534			TRUE	0.709	38.000	0.000	NA		NA
3708750	3708751	CKL_0534	CKL_0535			FALSE	0.131	174.000	0.000	NA		NA
3708754	3708755	CKL_0538	CKL_0539	tgl		TRUE	0.990	-3.000	0.077	NA		NA
3708755	3708756	CKL_0539	CKL_0540			TRUE	0.380	92.000	0.000	NA		NA
3708756	3708757	CKL_0540	CKL_0541			TRUE	0.442	79.000	0.000	1.000		NA
3708758	3708759	CKL_0542	CKL_0543	stc	adh1	FALSE	0.042	235.000	0.000	1.000	N	NA
3708763	3708764	CKL_0547	CKL_0548			FALSE	0.007	551.000	0.000	NA		NA
3708764	3708765	CKL_0548	CKL_0549			FALSE	0.229	143.000	0.000	0.066	N	NA
3708766	3708767	CKL_0550	CKL_0551			FALSE	0.081	212.000	0.000	1.000		NA
3708767	3708768	CKL_0551	CKL_0552			FALSE	0.325	104.000	0.000	NA		NA
3708769	3708770	CKL_0553	CKL_0554			FALSE	0.021	334.000	0.000	NA		NA
3708770	3708771	CKL_0554	CKL_0555			FALSE	0.018	357.000	0.000	NA		NA
3708771	3708772	CKL_0555	CKL_0556			FALSE	0.249	123.000	0.000	NA		NA
3708772	3708773	CKL_0556	CKL_0557			TRUE	0.455	73.000	0.000	NA		NA
3708773	3708774	CKL_0557	CKL_0558			TRUE	0.546	97.000	0.000	0.011		NA
3708776	3708777	CKL_0560	CKL_0561			TRUE	0.986	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
3708777	3708778	CKL_0561	CKL_0562			FALSE	0.020	306.000	0.000	1.000	N	NA
3708778	3708779	CKL_0562	CKL_0563			TRUE	0.863	20.000	0.000	1.000	N	NA
3708780	3708781	CKL_0564	CKL_0565			FALSE	0.011	431.000	0.000	NA		NA
3708782	3708783	CKL_0566	CKL_0567			FALSE	0.016	373.000	0.000	NA		NA
3708783	3708784	CKL_0567	CKL_0568			FALSE	0.006	580.000	0.000	NA		NA
3708784	3708785	CKL_0568	CKL_0569			TRUE	0.607	48.000	0.000	1.000		NA
3708788	3708789	CKL_0572	CKL_0573		cheB1	FALSE	0.066	204.000	0.000	NA	N	NA
3708789	3708790	CKL_0573	CKL_0574	cheB1		TRUE	0.995	14.000	0.302	1.000		NA
3708790	3708791	CKL_0574	CKL_0575			FALSE	0.066	223.000	0.000	1.000		NA
3708791	3708792	CKL_0575	CKL_0576			TRUE	0.454	114.000	0.000	0.017		NA
3708792	3708793	CKL_0576	CKL_0577			FALSE	0.004	929.000	0.000	NA		NA
3708793	3708794	CKL_0577	CKL_0578			TRUE	0.570	52.000	0.000	NA		NA
3708794	3708795	CKL_0578	CKL_0579			TRUE	0.966	24.000	0.070	NA		NA
3708795	3708796	CKL_0579	CKL_0580			FALSE	0.004	1592.000	0.000	NA		NA
3708797	3708798	CKL_0581	CKL_0582			TRUE	0.467	69.000	0.000	NA		NA
3708798	3708799	CKL_0582	CKL_0583			FALSE	0.005	812.000	0.000	NA		NA
3708799	3708800	CKL_0583	CKL_0584			FALSE	0.048	225.000	0.000	1.000	N	NA
3708800	3708801	CKL_0584	CKL_0585			FALSE	0.005	825.000	0.000	1.000		NA
3708801	3708802	CKL_0585	CKL_0586			FALSE	0.184	139.000	0.000	NA		NA
3708802	3708803	CKL_0586	CKL_0587			FALSE	0.005	690.000	0.000	NA		NA
3708804	3708805	CKL_0588	CKL_0589			TRUE	0.957	-31.000	0.000	NA		NA
3708805	3708806	CKL_0589	CKL_0590			FALSE	0.032	290.000	0.000	1.000		NA
3708807	3708808	CKL_0591	CKL_0592			TRUE	0.484	54.000	0.000	1.000	N	NA
3708809	3708810	CKL_0593	CKL_0594			FALSE	0.083	210.000	0.000	NA		NA
3708810	3708811	CKL_0594	CKL_0595			TRUE	0.549	55.000	0.000	NA		NA
3708811	3708812	CKL_0595	CKL_0596			TRUE	0.957	-114.000	0.000	NA		NA
3708812	3708813	CKL_0596	CKL_0597			FALSE	0.004	1003.000	0.000	NA		NA
3708813	3708814	CKL_0597	CKL_0598			FALSE	0.057	233.000	0.000	NA		NA
3708815	3708816	CKL_0599	CKL_0600			TRUE	0.957	-21.000	0.000	1.000		NA
3708818	3708819	CKL_0602	CKL_0603	proS	ftsH2	FALSE	0.066	207.000	0.000	1.000	N	NA
3708819	3708820	CKL_0603	CKL_0604	ftsH2		TRUE	0.981	55.000	0.583	0.013		NA
3708820	3708821	CKL_0604	CKL_0605		hydE	TRUE	0.468	70.000	0.000	1.000		NA
3708821	3708822	CKL_0605	CKL_0606	hydE		FALSE	0.155	161.000	0.000	NA		NA
3708822	3708823	CKL_0606	CKL_0607		lysC1	FALSE	0.144	167.000	0.000	NA		NA
3708823	3708824	CKL_0607	CKL_0608	lysC1	lysA	TRUE	0.923	46.000	0.016	1.000	Y	NA
3708824	3708825	CKL_0608	CKL_0609	lysA	ndvB	TRUE	0.682	54.000	0.003	1.000	N	NA
3708825	3708826	CKL_0609	CKL_0610	ndvB	trpS	FALSE	0.033	259.000	0.000	1.000	N	NA
3708826	3708827	CKL_0610	CKL_0611	trpS		FALSE	0.072	219.000	0.000	NA		NA
3708827	3708828	CKL_0611	CKL_0612			TRUE	0.955	-9.000	0.000	NA		NA
3708830	3708831	CKL_0614	CKL_0615			FALSE	0.053	239.000	0.000	NA		NA
3708831	3708832	CKL_0615	CKL_0616			TRUE	0.475	67.000	0.000	NA		NA
3708833	3708834	CKL_0617	CKL_0618			TRUE	0.951	-3.000	0.000	NA		NA
3708834	3708835	CKL_0618	CKL_0619			FALSE	0.038	275.000	0.000	NA		NA
3708835	3708836	CKL_0619	CKL_0620			TRUE	0.996	-25.000	0.231	1.000		NA
3708836	3708837	CKL_0620	CKL_0621			TRUE	0.999	0.000	0.857	NA		NA
3708837	3708838	CKL_0621	CKL_0622			FALSE	0.018	357.000	0.000	NA		NA
3708838	3708839	CKL_0622	CKL_0623			TRUE	0.751	34.000	0.000	NA		NA
3708840	3708841	CKL_0624	CKL_0625			TRUE	0.982	-3.000	0.019	NA		NA
3708841	3708842	CKL_0625	CKL_0626			TRUE	0.980	26.000	0.193	NA		NA
3708842	3708843	CKL_0626	CKL_0627			TRUE	1.000	-9.000	0.838	0.005	Y	NA
3708843	3708844	CKL_0627	CKL_0628			TRUE	0.957	-25.000	0.000	NA		NA
3708844	3708845	CKL_0628	CKL_0629			TRUE	0.696	39.000	0.000	NA		NA
3708845	3708846	CKL_0629	CKL_0630		fur2	TRUE	0.977	27.000	0.167	NA		NA
3708846	3708847	CKL_0630	CKL_0631	fur2		TRUE	0.967	4.000	0.000	0.061		NA
3708847	3708848	CKL_0631	CKL_0632			TRUE	0.845	25.000	0.000	1.000		NA
3708848	3708849	CKL_0632	CKL_0633			FALSE	0.127	153.000	0.000	1.000	N	NA
3708849	3708850	CKL_0633	CKL_0634			FALSE	0.312	109.000	0.000	1.000		NA
3708850	3708851	CKL_0634	CKL_0635			FALSE	0.253	122.000	0.000	NA		NA
3708851	3708852	CKL_0635	CKL_0636			FALSE	0.013	414.000	0.000	NA		NA
3708852	3708853	CKL_0636	CKL_0637		panB	TRUE	0.989	-7.000	0.055	1.000		NA
3708853	3708854	CKL_0637	CKL_0638	panB	panC	TRUE	0.999	2.000	0.395	0.001	Y	NA
3708854	3708855	CKL_0638	CKL_0639	panC		FALSE	0.085	210.000	0.000	1.000		NA
3708856	3708857	CKL_0640	CKL_0641	spoVR		TRUE	0.998	6.000	0.761	NA		NA
3708857	3708858	CKL_0641	CKL_0642			TRUE	0.998	5.000	0.683	NA		NA
3708858	3708859	CKL_0642	CKL_0643			FALSE	0.007	476.000	0.000	NA	N	NA
3708859	3708860	CKL_0643	CKL_0644			TRUE	0.998	-28.000	0.500	1.000		NA
3708860	3708861	CKL_0644	CKL_0645			TRUE	0.997	15.000	0.667	1.000		NA
3708861	3708862	CKL_0645	CKL_0646			TRUE	0.995	25.000	0.500	0.004		NA
3708862	3708863	CKL_0646	CKL_0647			FALSE	0.019	315.000	0.000	1.000	N	NA
3708863	3708864	CKL_0647	CKL_0648			TRUE	0.829	40.000	0.000	0.005		NA
3708865	3708866	CKL_0649	CKL_0650	carA1	carB1	TRUE	0.953	61.000	0.054	0.001	Y	NA
3708866	3708867	CKL_0650	CKL_0651	carB1	amaA	TRUE	0.656	42.000	0.000	1.000		NA
3708868	3708869	CKL_0652	CKL_0653			TRUE	0.999	4.000	0.600	1.000	Y	NA
3708870	3708871	CKL_0654	CKL_0655			TRUE	0.956	-16.000	0.000	NA		NA
3708871	3708872	CKL_0655	CKL_0656			TRUE	0.908	18.000	0.000	1.000		NA
3708872	3708873	CKL_0656	CKL_0657		hemA	FALSE	0.137	171.000	0.000	1.000		NA
3708873	3708874	CKL_0657	CKL_0658	hemA	hemL	TRUE	0.977	24.000	0.000	0.001	Y	NA
3708874	3708875	CKL_0658	CKL_0659	hemL		FALSE	0.097	178.000	0.000	1.000	N	NA
3708875	3708876	CKL_0659	CKL_0660		ald	TRUE	0.889	16.000	0.000	1.000	N	NA
3708876	3708877	CKL_0660	CKL_0661	ald		FALSE	0.161	132.000	0.000	NA	N	NA
3708877	3708878	CKL_0661	CKL_0662			TRUE	0.915	16.000	0.000	NA		NA
3708880	3708881	CKL_0664	CKL_0665			FALSE	0.049	246.000	0.000	NA		NA
3708881	3708882	CKL_0665	CKL_0666			TRUE	0.999	2.000	0.511	1.000	Y	NA
3708884	3708885	CKL_0668	CKL_0669		polA	TRUE	0.407	86.000	0.000	NA		NA
3708885	3708886	CKL_0669	CKL_0670	polA	coaE	TRUE	0.960	24.000	0.068	1.000	N	NA
3708886	3708887	CKL_0670	CKL_0671	coaE		TRUE	0.880	45.000	0.058	NA		NA
3708887	3708888	CKL_0671	CKL_0672			FALSE	0.245	124.000	0.000	NA		NA
3708888	3708889	CKL_0672	CKL_0673			FALSE	0.010	466.000	0.000	NA		NA
3708889	3708890	CKL_0673	CKL_0674			FALSE	0.139	169.000	0.000	NA		NA
3708890	3708891	CKL_0674	CKL_0675			FALSE	0.176	144.000	0.000	NA		NA
3708892	3708893	CKL_0676	CKL_0677	cotJC	cotJB	TRUE	0.980	13.000	0.047	NA		NA
3708893	3708894	CKL_0677	CKL_0678	cotJB		TRUE	0.992	3.000	0.125	NA		NA
3708896	3708897	CKL_0680	CKL_0681			TRUE	0.790	30.000	0.000	NA		NA
3708897	3708898	CKL_0681	CKL_0682			FALSE	0.049	248.000	0.000	NA		NA
3708899	3708900	CKL_0683	CKL_0684			TRUE	0.376	93.000	0.000	NA		NA
3708900	3708901	CKL_0684	CKL_0685			FALSE	0.050	245.000	0.000	NA		NA
3708902	3708903	CKL_0686	CKL_0687			TRUE	0.606	133.000	0.000	0.016	Y	NA
3708903	3708904	CKL_0687	CKL_0688			TRUE	0.984	93.000	0.889	1.000	Y	NA
3708904	3708905	CKL_0688	CKL_0689			FALSE	0.039	270.000	0.000	NA		NA
3708905	3708906	CKL_0689	CKL_0690			FALSE	0.028	300.000	0.000	NA		NA
3708906	3708907	CKL_0690	CKL_0691			FALSE	0.144	167.000	0.000	NA		NA
3708909	3708910	CKL_0693	CKL_0694			TRUE	0.999	0.000	0.903	NA		NA
3708913	3708914	CKL_0697	CKL_0698			TRUE	0.952	36.000	0.118	1.000		NA
3708916	3708917	CKL_0700	CKL_0701	sdhB	sdhA	TRUE	0.998	4.000	0.146	0.001	Y	NA
3708919	3708920	CKL_0703	CKL_0704		thrC	FALSE	0.125	156.000	0.000	1.000	N	NA
3708920	3708921	CKL_0704	CKL_0705	thrC		FALSE	0.004	796.000	0.000	1.000	N	NA
3708921	3708922	CKL_0705	CKL_0706			TRUE	0.612	40.000	0.000	1.000	N	NA
3708923	3708924	CKL_0707	CKL_0708			TRUE	0.998	21.000	0.461	0.028	Y	NA
3708924	3708925	CKL_0708	CKL_0709			FALSE	0.111	190.000	0.000	1.000		NA
3708926	3708927	CKL_0710	CKL_0711			TRUE	0.554	55.000	0.000	1.000		NA
3708929	3708930	CKL_0713	CKL_0714	hemB	cobD1	TRUE	0.492	53.000	0.000	1.000	N	NA
3708930	3708931	CKL_0714	CKL_0715	cobD1	cobO	TRUE	0.484	54.000	0.000	1.000	N	NA
3708931	3708932	CKL_0715	CKL_0716	cobO	cbiG	TRUE	0.951	33.000	0.000	0.013	Y	NA
3708932	3708933	CKL_0716	CKL_0717	cbiG		TRUE	0.692	55.000	0.006	1.000	N	NA
3708933	3708934	CKL_0717	CKL_0718		hemC	TRUE	0.942	-16.000	0.000	1.000	N	NA
3708934	3708935	CKL_0718	CKL_0719	hemC	hemD	TRUE	0.972	29.000	0.031	1.000	Y	NA
3708935	3708936	CKL_0719	CKL_0720	hemD	cbiK	TRUE	0.980	12.000	0.000	1.000	Y	NA
3708936	3708937	CKL_0720	CKL_0721	cbiK	cbiP	TRUE	0.993	-15.000	0.003	1.000	Y	NA
3708937	3708938	CKL_0721	CKL_0722	cbiP	cbiB	TRUE	0.995	5.000	0.021	0.005	Y	NA
3708938	3708939	CKL_0722	CKL_0723	cbiB	cbiC	TRUE	0.997	8.000	0.097	0.013	Y	NA
3708939	3708940	CKL_0723	CKL_0724	cbiC	cbiD	TRUE	0.998	11.000	0.168	0.013	Y	NA
3708940	3708941	CKL_0724	CKL_0725	cbiD	cbiE	TRUE	0.997	16.000	0.126	0.013	Y	NA
3708941	3708942	CKL_0725	CKL_0726	cbiE	cbiT	TRUE	0.993	-3.000	0.000	0.001	Y	NA
3708942	3708943	CKL_0726	CKL_0727	cbiT	cbiL	TRUE	0.992	14.000	0.007	0.013	Y	NA
3708943	3708944	CKL_0727	CKL_0728	cbiL	cbiF	TRUE	0.998	16.000	0.291	0.013	Y	NA
3708944	3708945	CKL_0728	CKL_0729	cbiF	cbiJ	TRUE	0.998	-3.000	0.076	0.013	Y	NA
3708945	3708946	CKL_0729	CKL_0730	cbiJ	cbiH	TRUE	0.999	15.000	0.423	0.013	Y	NA
3708946	3708947	CKL_0730	CKL_0731	cbiH	cobU	TRUE	0.887	56.000	0.008	1.000	Y	NA
3708947	3708948	CKL_0731	CKL_0732	cobU	cobC2	TRUE	0.523	49.000	0.000	1.000	N	NA
3708952	3708953	CKL_0736	CKL_0737	bdh1		TRUE	0.799	29.000	0.000	NA		NA
3708953	3708954	CKL_0737	CKL_0738			TRUE	0.428	81.000	0.000	NA		NA
3708956	3708957	CKL_0740	CKL_0741			TRUE	0.819	27.000	0.000	NA		NA
3708957	3708958	CKL_0741	CKL_0742			FALSE	0.078	213.000	0.000	NA		NA
3708958	3708959	CKL_0742	CKL_0743			FALSE	0.006	583.000	0.000	NA		NA
3708960	3708961	CKL_0744	CKL_0745			FALSE	0.107	191.000	0.000	NA		NA
3708962	3708963	CKL_0746	CKL_0747			TRUE	0.437	79.000	0.000	NA		NA
3708963	3708964	CKL_0747	CKL_0748		nadA	FALSE	0.010	466.000	0.000	NA		NA
3708964	3708965	CKL_0748	CKL_0749	nadA	nadB	TRUE	0.994	29.000	0.210	0.004	Y	NA
3708965	3708966	CKL_0749	CKL_0750	nadB	nadC	TRUE	0.998	12.000	0.223	0.004	Y	NA
3708967	3708968	CKL_0751	CKL_0752		prfC	FALSE	0.046	230.000	0.000	1.000	N	NA
3708968	3708969	CKL_0752	CKL_0753	prfC		FALSE	0.093	202.000	0.000	1.000		NA
3708969	3708970	CKL_0753	CKL_0754			FALSE	0.297	113.000	0.000	1.000		NA
3708971	3708972	CKL_0755	CKL_0756			FALSE	0.016	665.000	0.025	NA		NA
3708972	3708973	CKL_0756	CKL_0757			TRUE	0.463	157.000	0.062	NA		NA
3708973	3708974	CKL_0757	CKL_0758		tyrS1	FALSE	0.089	204.000	0.000	NA		NA
3708975	3708976	CKL_0759	CKL_0760			TRUE	0.994	-7.000	0.127	1.000		NA
3708976	3708977	CKL_0760	CKL_0761			TRUE	0.994	5.000	0.217	NA		NA
3708977	3708978	CKL_0761	CKL_0762			TRUE	0.847	38.000	0.007	NA		NA
3708979	3708980	CKL_0763	CKL_0764			FALSE	0.318	91.000	0.000	1.000	N	NA
3708980	3708981	CKL_0764	CKL_0765			FALSE	0.009	418.000	0.000	1.000	N	NA
3708983	3708984	CKL_0767	CKL_0768			FALSE	0.187	138.000	0.000	NA		NA
3708984	3708985	CKL_0768	CKL_0769			TRUE	0.991	-3.000	0.090	NA		NA
3708985	3708986	CKL_0769	CKL_0770			TRUE	0.975	-13.000	0.000	0.049		NA
3708986	3708987	CKL_0770	CKL_0771			TRUE	0.949	0.000	0.000	NA		NA
3708987	3708988	CKL_0771	CKL_0772			TRUE	0.829	26.000	0.000	NA		NA
3708988	3708989	CKL_0772	CKL_0773			TRUE	0.962	10.000	0.000	0.049		NA
3708989	3708990	CKL_0773	CKL_0774			TRUE	0.997	0.000	0.231	0.063		NA
3708991	3708992	CKL_0775	CKL_0776			TRUE	0.996	19.000	0.569	NA		NA
3708993	3708994	CKL_0777	CKL_0778	proV	proW	TRUE	0.999	2.000	0.333	1.000	Y	NA
3708994	3708995	CKL_0778	CKL_0779	proW	proX	TRUE	0.999	21.000	0.714	0.028	Y	NA
3708995	3708996	CKL_0779	CKL_0780	proX		FALSE	0.016	329.000	0.000	1.000	N	NA
3708996	3708997	CKL_0780	CKL_0781			FALSE	0.179	128.000	0.000	1.000	N	NA
3708999	3709000	CKL_0783	CKL_0784		aroF	FALSE	0.147	166.000	0.000	NA		NA
3709000	3709001	CKL_0784	CKL_0785	aroF	tyrA	TRUE	0.966	28.000	0.008	1.000	Y	NA
3709001	3709002	CKL_0785	CKL_0786	tyrA	aroB	TRUE	0.991	6.000	0.011	1.000	Y	NA
3709002	3709003	CKL_0786	CKL_0787	aroB	aroA	TRUE	0.955	41.000	0.051	1.000	Y	NA
3709003	3709004	CKL_0787	CKL_0788	aroA	aroC	TRUE	0.996	-22.000	0.057	1.000	Y	NA
3709004	3709005	CKL_0788	CKL_0789	aroC	pheA	TRUE	0.971	29.000	0.026	1.000	Y	NA
3709005	3709006	CKL_0789	CKL_0790	pheA	aroE1	TRUE	0.970	32.000	0.009	0.041	Y	NA
3709006	3709007	CKL_0790	CKL_0791	aroE1	aroK	TRUE	0.907	78.000	0.069	1.000	Y	NA
3709007	3709008	CKL_0791	CKL_0792	aroK		FALSE	0.170	147.000	0.000	NA		NA
3709008	3709009	CKL_0792	CKL_0793			TRUE	0.778	31.000	0.000	NA		NA
3709009	3709010	CKL_0793	CKL_0794			FALSE	0.321	105.000	0.000	NA		NA
3709010	3709011	CKL_0794	CKL_0795			FALSE	0.164	152.000	0.000	NA		NA
3709011	3709012	CKL_0795	CKL_0796		actP	TRUE	0.995	12.000	0.287	NA		NA
3709012	3709013	CKL_0796	CKL_0797	actP		TRUE	0.959	68.000	0.088	0.001	Y	NA
3709013	3709014	CKL_0797	CKL_0798		pgm1	FALSE	0.156	134.000	0.000	1.000	N	NA
3709014	3709015	CKL_0798	CKL_0799	pgm1	fbp	TRUE	0.382	167.000	0.000	1.000	Y	NA
3709017	3709018	CKL_0801	CKL_0802			FALSE	0.052	241.000	0.000	NA		NA
3709018	3709019	CKL_0802	CKL_0803			FALSE	0.101	196.000	0.000	NA		NA
3709019	3709020	CKL_0803	CKL_0804			FALSE	0.014	390.000	0.000	NA		NA
3709020	3709021	CKL_0804	CKL_0805			FALSE	0.193	136.000	0.000	NA		NA
3709021	3709022	CKL_0805	CKL_0806			FALSE	0.172	146.000	0.000	NA		NA
3709022	3709023	CKL_0806	CKL_0807			FALSE	0.027	305.000	0.000	NA		NA
3709023	3709024	CKL_0807	CKL_0808			TRUE	0.713	89.000	0.044	NA		NA
3709024	3709025	CKL_0808	CKL_0809			FALSE	0.154	162.000	0.000	NA		NA
3709025	3709026	CKL_0809	CKL_0810			FALSE	0.122	181.000	0.000	1.000		NA
3709028	3709029	CKL_0812	CKL_0813			TRUE	0.945	73.000	0.500	1.000	N	NA
3709029	3709030	CKL_0813	CKL_0814			TRUE	0.975	96.000	0.375	0.008	Y	NA
3709032	3709033	CKL_0816	CKL_0817	iscS	thiI	TRUE	0.997	-3.000	0.349	1.000	N	NA
3709034	3709035	CKL_0818	CKL_0819			TRUE	0.995	10.000	0.286	1.000		NA
3709038	3709039	CKL_0822	CKL_0823			TRUE	0.997	-3.000	0.114	1.000	Y	NA
3709039	3709040	CKL_0823	CKL_0824			TRUE	0.986	26.000	0.091	NA	Y	NA
3709040	3709041	CKL_0824	CKL_0825		nifD1	FALSE	0.011	385.000	0.000	NA	N	NA
3709041	3709042	CKL_0825	CKL_0826	nifD1	nifK1	TRUE	0.991	0.000	0.000	0.011	Y	NA
3709042	3709043	CKL_0826	CKL_0827	nifK1		FALSE	0.024	318.000	0.000	NA		NA
3709043	3709044	CKL_0827	CKL_0828			FALSE	0.144	167.000	0.000	NA		NA
3709044	3709045	CKL_0828	CKL_0829			TRUE	0.995	30.000	0.466	1.000	Y	NA
3709045	3709046	CKL_0829	CKL_0830			TRUE	0.998	17.000	0.266	0.003	Y	NA
3709046	3709047	CKL_0830	CKL_0831		sufS	TRUE	0.988	0.000	0.077	1.000	N	NA
3709047	3709048	CKL_0831	CKL_0832	sufS	nifU1	TRUE	0.996	-13.000	0.292	1.000	N	NA
3709050	3709051	CKL_0834	CKL_0835			FALSE	0.073	218.000	0.000	NA		NA
3709051	3709052	CKL_0835	CKL_0836			FALSE	0.006	588.000	0.000	NA		NA
3709052	3709053	CKL_0836	CKL_0837			FALSE	0.009	491.000	0.000	NA		NA
3709053	3709054	CKL_0837	CKL_0838			FALSE	0.007	542.000	0.000	NA		NA
3709054	3709055	CKL_0838	CKL_0839			TRUE	0.955	16.000	0.000	0.021		NA
3709055	3709056	CKL_0839	CKL_0840			TRUE	0.941	36.000	0.000	0.021	Y	NA
3709056	3709057	CKL_0840	CKL_0841			TRUE	0.966	63.000	0.400	0.021		NA
3709057	3709058	CKL_0841	CKL_0842			FALSE	0.007	560.000	0.000	NA		NA
3709058	3709059	CKL_0842	CKL_0843		dhaA	FALSE	0.010	468.000	0.000	NA		NA
3709059	3709060	CKL_0843	CKL_0844	dhaA	dhaC	TRUE	0.783	103.000	0.000	0.001	Y	NA
3709060	3709061	CKL_0844	CKL_0845	dhaC		FALSE	0.010	448.000	0.000	NA		NA
3709061	3709062	CKL_0845	CKL_0846			TRUE	0.936	7.000	0.000	NA		NA
3709062	3709063	CKL_0846	CKL_0847			TRUE	0.987	14.000	0.125	1.000	N	NA
3709063	3709064	CKL_0847	CKL_0848			TRUE	0.904	61.000	0.167	1.000		NA
3709064	3709065	CKL_0848	CKL_0849			TRUE	0.981	34.000	0.333	NA		NA
3709065	3709066	CKL_0849	CKL_0850			FALSE	0.102	293.000	0.000	NA	Y	NA
3709066	3709067	CKL_0850	CKL_0851			TRUE	0.994	18.000	0.105	NA	Y	NA
3709067	3709068	CKL_0851	CKL_0852			TRUE	0.854	119.000	0.105	NA	Y	NA
3709068	3709069	CKL_0852	CKL_0853			TRUE	0.994	18.000	0.105	NA	Y	NA
3709069	3709070	CKL_0853	CKL_0854			TRUE	0.932	71.000	0.105	NA	Y	NA
3709070	3709071	CKL_0854	CKL_0855			TRUE	0.994	18.000	0.105	NA	Y	NA
3709071	3709072	CKL_0855	CKL_0856			TRUE	0.546	220.000	0.105	NA	Y	NA
3709072	3709073	CKL_0856	CKL_0857			TRUE	0.994	18.000	0.105	NA	Y	NA
3709073	3709074	CKL_0857	CKL_0858		pheB	FALSE	0.072	219.000	0.000	NA		NA
3709074	3709075	CKL_0858	CKL_0859	pheB	hom1	FALSE	0.010	453.000	0.000	1.000		NA
3709075	3709076	CKL_0859	CKL_0860	hom1	thrB	TRUE	0.454	139.000	0.000	1.000	Y	NA
3709076	3709077	CKL_0860	CKL_0861	thrB		FALSE	0.156	160.000	0.000	NA		NA
3709077	3709078	CKL_0861	CKL_0862			TRUE	0.950	59.000	0.364	NA		NA
3709078	3709079	CKL_0862	CKL_0863			TRUE	0.715	179.000	0.357	NA		NA
3709079	3709080	CKL_0863	CKL_0864			TRUE	0.975	12.000	0.026	NA		NA
3709080	3709081	CKL_0864	CKL_0865			TRUE	0.980	15.000	0.074	NA	N	NA
3709081	3709082	CKL_0865	CKL_0866			TRUE	0.951	23.000	0.040	1.000	N	NA
3709082	3709083	CKL_0866	CKL_0867			TRUE	0.997	17.000	0.689	1.000	N	NA
3709083	3709084	CKL_0867	CKL_0868			TRUE	0.998	12.000	0.550	0.003		NA
3709084	3709085	CKL_0868	CKL_0869			TRUE	0.683	40.000	0.000	1.000		NA
3709085	3709086	CKL_0869	CKL_0870		minC	FALSE	0.048	224.000	0.000	1.000	N	NA
3709086	3709087	CKL_0870	CKL_0871	minC	minD	TRUE	0.998	15.000	0.368	1.000	Y	NA
3709087	3709088	CKL_0871	CKL_0872	minD	minE	TRUE	0.998	14.000	0.347	NA	Y	NA
3709088	3709089	CKL_0872	CKL_0873	minE	rodA	TRUE	0.758	70.000	0.000	NA	Y	NA
3709089	3709090	CKL_0873	CKL_0874	rodA		FALSE	0.103	195.000	0.000	NA		NA
3709090	3709091	CKL_0874	CKL_0875			TRUE	0.980	19.000	0.081	NA		NA
3709091	3709092	CKL_0875	CKL_0876			TRUE	0.573	143.000	0.098	1.000		NA
3709092	3709093	CKL_0876	CKL_0877			TRUE	0.998	-31.000	0.420	NA		NA
3709093	3709094	CKL_0877	CKL_0878		rne	TRUE	0.937	47.000	0.180	NA		NA
3709094	3709095	CKL_0878	CKL_0879	rne	rplU	TRUE	0.759	131.000	0.018	0.021	Y	NA
3709095	3709096	CKL_0879	CKL_0880	rplU		TRUE	0.998	4.000	0.208	NA	Y	NA
3709096	3709097	CKL_0880	CKL_0881		rpmA	TRUE	0.998	4.000	0.203	NA	Y	NA
3709097	3709098	CKL_0881	CKL_0882	rpmA		TRUE	0.535	226.000	0.335	1.000		NA
3709098	3709099	CKL_0882	CKL_0883		nadD	TRUE	0.978	15.000	0.045	1.000		NA
3709099	3709100	CKL_0883	CKL_0884	nadD		TRUE	0.987	34.000	0.199	1.000	Y	NA
3709100	3709101	CKL_0884	CKL_0885			TRUE	0.555	44.000	0.000	NA	N	NA
3709101	3709102	CKL_0885	CKL_0886		rluD1	TRUE	0.895	72.000	0.047	NA	Y	NA
3709104	3709105	CKL_0888	CKL_0889		aspC1	FALSE	0.114	166.000	0.000	1.000	N	NA
3709105	3709106	CKL_0889	CKL_0890	aspC1		TRUE	0.575	52.000	0.000	1.000		NA
3709106	3709107	CKL_0890	CKL_0891			FALSE	0.107	193.000	0.000	1.000		NA
3709107	3709108	CKL_0891	CKL_0892		comE	TRUE	0.808	42.000	0.006	NA		NA
3709108	3709109	CKL_0892	CKL_0893	comE		TRUE	0.954	39.000	0.163	NA		NA
3709111	3709112	CKL_0895	CKL_0896	gpr		TRUE	0.896	122.000	0.521	1.000		NA
3709112	3709113	CKL_0896	CKL_0897			TRUE	0.818	71.000	0.077	NA		NA
3709113	3709114	CKL_0897	CKL_0898		lepA	TRUE	0.615	80.000	0.004	NA		NA
3709114	3709115	CKL_0898	CKL_0899	lepA		TRUE	0.984	12.000	0.083	1.000	N	NA
3709115	3709116	CKL_0899	CKL_0900		hrcA	FALSE	0.317	191.000	0.062	1.000	N	NA
3709116	3709117	CKL_0900	CKL_0901	hrcA	grpE	TRUE	0.858	103.000	0.286	1.000	N	NA
3709117	3709118	CKL_0901	CKL_0902	grpE	dnaK5	TRUE	0.970	84.000	0.224	0.006	Y	NA
3709118	3709119	CKL_0902	CKL_0903	dnaK5	dnaJ	TRUE	0.917	132.000	0.196	0.003	Y	NA
3709119	3709120	CKL_0903	CKL_0904	dnaJ	prmA	TRUE	0.824	85.000	0.133	1.000	N	NA
3709120	3709121	CKL_0904	CKL_0905	prmA		TRUE	0.981	28.000	0.227	NA		NA
3709121	3709122	CKL_0905	CKL_0906			TRUE	0.857	88.000	0.163	NA		NA
3709122	3709123	CKL_0906	CKL_0907			TRUE	0.845	60.000	0.051	0.050	N	NA
3709123	3709124	CKL_0907	CKL_0908		rpsU	TRUE	0.503	149.000	0.071	1.000		NA
3709124	3709125	CKL_0908	CKL_0909	rpsU		TRUE	0.981	29.000	0.150	0.026		NA
3709125	3709126	CKL_0909	CKL_0910			FALSE	0.144	244.000	0.029	NA		NA
3709126	3709127	CKL_0910	CKL_0911			TRUE	0.999	-13.000	0.851	NA		NA
3709127	3709128	CKL_0911	CKL_0912			TRUE	0.882	39.000	0.032	NA		NA
3709128	3709129	CKL_0912	CKL_0913			TRUE	0.995	-3.000	0.182	NA		NA
3709129	3709130	CKL_0913	CKL_0914			TRUE	0.818	47.000	0.023	NA		NA
3709130	3709131	CKL_0914	CKL_0915		cdd	TRUE	0.832	46.000	0.040	1.000	N	NA
3709131	3709132	CKL_0915	CKL_0916	cdd		TRUE	0.991	-7.000	0.077	1.000		NA
3709132	3709133	CKL_0916	CKL_0917		recO	TRUE	0.915	46.000	0.108	1.000		NA
3709133	3709134	CKL_0917	CKL_0918	recO		TRUE	0.958	17.000	0.007	NA		NA
3709134	3709135	CKL_0918	CKL_0919			TRUE	0.441	236.000	0.273	NA		NA
3709135	3709136	CKL_0919	CKL_0920		ppdK	TRUE	0.676	80.000	0.019	NA		NA
3709136	3709137	CKL_0920	CKL_0921	ppdK		FALSE	0.015	379.000	0.000	NA		NA
3709137	3709138	CKL_0921	CKL_0922		gyaR	TRUE	0.529	57.000	0.000	NA		NA
3709140	3709141	CKL_0924	CKL_0925	proB2		FALSE	0.105	171.000	0.000	1.000	N	NA
3709142	3709143	CKL_0926	CKL_0927			FALSE	0.066	222.000	0.000	NA		NA
3709143	3709144	CKL_0927	CKL_0928			FALSE	0.351	99.000	0.000	NA		NA
3709145	3709146	CKL_0929	CKL_0930			FALSE	0.330	104.000	0.000	1.000		NA
3709146	3709147	CKL_0930	CKL_0931			TRUE	0.402	117.000	0.000	0.063		NA
3709147	3709148	CKL_0931	CKL_0932			TRUE	0.629	45.000	0.000	1.000		NA
3709148	3709149	CKL_0932	CKL_0933			FALSE	0.190	138.000	0.000	1.000		NA
3709151	3709152	CKL_0935	CKL_0936			FALSE	0.009	487.000	0.000	NA		NA
3709152	3709153	CKL_0936	CKL_0937		bioB1	TRUE	0.833	54.000	0.048	NA		NA
3709153	3709154	CKL_0937	CKL_0938	bioB1	bioA	TRUE	0.996	20.000	0.124	0.002	Y	NA
3709156	3709157	CKL_0940	CKL_0941		dnaG	FALSE	0.137	262.000	0.056	1.000	N	NA
3709157	3709158	CKL_0941	CKL_0942	dnaG	rpoD2	TRUE	0.986	21.000	0.209	1.000	N	NA
3709158	3709159	CKL_0942	CKL_0943	rpoD2		TRUE	0.638	95.000	0.026	NA		NA
3709159	3709160	CKL_0943	CKL_0944			TRUE	0.821	49.000	0.028	NA		NA
3709160	3709161	CKL_0944	CKL_0945			TRUE	0.997	-9.000	0.283	NA		NA
3709161	3709162	CKL_0945	CKL_0946			TRUE	0.917	90.000	0.342	NA		NA
3709162	3709163	CKL_0946	CKL_0947			FALSE	0.005	789.000	0.000	NA		NA
3709164	3709165	CKL_0948	CKL_0949	feoB1	feoA	TRUE	0.998	12.000	0.267	1.000	Y	NA
3709168	3709169	CKL_0952	CKL_0953			FALSE	0.321	105.000	0.000	NA		NA
3709169	3709170	CKL_0953	CKL_0954			FALSE	0.012	422.000	0.000	NA		NA
3709170	3709171	CKL_0954	CKL_0955			TRUE	0.529	57.000	0.000	NA		NA
3709171	3709172	CKL_0955	CKL_0956			TRUE	0.931	11.000	0.000	NA		NA
3709172	3709173	CKL_0956	CKL_0957		folP	FALSE	0.167	150.000	0.000	NA		NA
3709173	3709174	CKL_0957	CKL_0958	folP	folE	TRUE	0.813	95.000	0.016	1.000	Y	NA
3709174	3709175	CKL_0958	CKL_0959	folE		TRUE	0.983	16.000	0.081	1.000		NA
3709175	3709176	CKL_0959	CKL_0960			TRUE	0.899	28.000	0.003	1.000		NA
3709177	3709178	CKL_0961	CKL_0962			TRUE	0.778	31.000	0.000	NA		NA
3709178	3709179	CKL_0962	CKL_0963			FALSE	0.253	122.000	0.000	NA		NA
3709179	3709180	CKL_0963	CKL_0964			TRUE	0.947	1.000	0.000	NA		NA
3709180	3709181	CKL_0964	CKL_0965			TRUE	0.919	103.000	0.556	1.000	N	NA
3709181	3709182	CKL_0965	CKL_0966			TRUE	0.997	2.000	0.125	1.000	Y	NA
3709183	3709184	CKL_0967	CKL_0968			FALSE	0.007	556.000	0.000	NA		NA
3709184	3709185	CKL_0968	CKL_0969			TRUE	0.529	57.000	0.000	NA		NA
3709185	3709186	CKL_0969	CKL_0970			TRUE	0.935	8.000	0.000	NA		NA
3709187	3709188	CKL_0971	CKL_0972			TRUE	0.938	37.000	0.088	1.000		NA
3709189	3709190	CKL_0973	CKL_0974			TRUE	0.908	37.000	0.027	0.063	N	NA
3709192	3709193	CKL_0976	CKL_0977	metH1		FALSE	0.243	125.000	0.000	1.000		NA
3709193	3709194	CKL_0977	CKL_0978			FALSE	0.132	176.000	0.000	1.000		NA
3709194	3709195	CKL_0978	CKL_0979			TRUE	0.954	30.000	0.000	0.043	Y	NA
3709195	3709196	CKL_0979	CKL_0980			TRUE	0.988	30.000	0.158	1.000	Y	NA
3709196	3709197	CKL_0980	CKL_0981		argG	TRUE	0.567	142.000	0.002	1.000	Y	NA
3709197	3709198	CKL_0981	CKL_0982	argG	argH	TRUE	0.998	4.000	0.278	1.000	Y	NA
3709199	3709200	CKL_0983	CKL_0984			TRUE	0.665	100.000	0.043	NA		NA
3709201	3709202	CKL_0985	CKL_0986			FALSE	0.221	129.000	0.000	NA		NA
3709202	3709203	CKL_0986	CKL_0987			FALSE	0.345	100.000	0.000	NA		NA
3709203	3709204	CKL_0987	CKL_0988			TRUE	0.377	94.000	0.000	1.000		NA
3709208	3709209	CKL_0992	CKL_0993	nadE		TRUE	0.864	30.000	0.004	NA	N	NA
3709209	3709210	CKL_0993	CKL_0994			TRUE	0.978	56.000	0.313	NA	Y	NA
3709210	3709211	CKL_0994	CKL_0995			FALSE	0.043	232.000	0.000	NA	N	NA
3709211	3709212	CKL_0995	CKL_0996		addB	FALSE	0.219	118.000	0.000	1.000	N	NA
3709212	3709213	CKL_0996	CKL_0997	addB	surE	TRUE	0.534	57.000	0.000	1.000		NA
3709213	3709214	CKL_0997	CKL_0998	surE	tal	TRUE	0.446	78.000	0.000	1.000		NA
3709215	3709216	CKL_0999	CKL_1000		rpoE	TRUE	0.996	-10.000	0.250	NA		NA
3709217	3709218	CKL_1001	CKL_1002		metB1	TRUE	0.975	4.000	0.021	1.000	N	NA
3709218	3709219	CKL_1002	CKL_1003	metB1	cysK	TRUE	0.968	42.000	0.051	0.019	Y	NA
3709219	3709220	CKL_1003	CKL_1004	cysK		TRUE	0.476	68.000	0.000	1.000		NA
3709221	3709222	CKL_1005	CKL_1006			FALSE	0.095	179.000	0.000	1.000	N	NA
3709223	3709224	CKL_1007	CKL_1008	aroD	aroE2	TRUE	0.662	167.000	0.061	1.000	Y	NA
3709224	3709225	CKL_1008	CKL_1009	aroE2		FALSE	0.236	113.000	0.000	1.000	N	NA
3709225	3709226	CKL_1009	CKL_1010			FALSE	0.052	242.000	0.000	1.000		NA
3709226	3709227	CKL_1010	CKL_1011			FALSE	0.085	210.000	0.000	1.000		NA
3709228	3709229	CKL_1012	CKL_1013			FALSE	0.309	137.000	0.000	0.028		NA
3709229	3709230	CKL_1013	CKL_1014		aroE3	TRUE	0.934	101.000	0.571	1.000		NA
3709230	3709231	CKL_1014	CKL_1015	aroE3		TRUE	0.582	42.000	0.000	1.000	N	NA
3709231	3709232	CKL_1015	CKL_1016			TRUE	0.517	49.000	0.000	NA	N	NA
3709234	3709235	CKL_1018	CKL_1019		spsC	TRUE	0.994	4.000	0.012	0.019	Y	NA
3709235	3709236	CKL_1019	CKL_1020	spsC		TRUE	0.714	74.000	0.039	1.000	N	NA
3709237	3709238	CKL_1021	CKL_1022		glnS	FALSE	0.008	523.000	0.000	NA		NA
3709238	3709239	CKL_1022	CKL_1023	glnS		FALSE	0.092	181.000	0.000	1.000	N	NA
3709239	3709240	CKL_1023	CKL_1024		asnB	FALSE	0.122	159.000	0.000	1.000	N	NA
3709240	3709241	CKL_1024	CKL_1025	asnB		FALSE	0.134	173.000	0.000	1.000		NA
3709241	3709242	CKL_1025	CKL_1026			FALSE	0.164	155.000	0.000	1.000		NA
3709243	3709244	CKL_1027	CKL_1028			TRUE	0.686	78.000	0.020	NA		NA
3709245	3709246	CKL_1029	CKL_1030			TRUE	0.509	60.000	0.000	NA		NA
3709246	3709247	CKL_1030	CKL_1031			TRUE	0.815	55.000	0.000	NA	Y	NA
3709247	3709248	CKL_1031	CKL_1032			FALSE	0.012	371.000	0.000	NA	N	NA
3709248	3709249	CKL_1032	CKL_1033		nifH1	FALSE	0.008	440.000	0.000	1.000	N	NA
3709249	3709250	CKL_1033	CKL_1034	nifH1	nifD2	TRUE	0.902	25.000	0.000	0.011	N	NA
3709250	3709251	CKL_1034	CKL_1035	nifD2	nifK2	TRUE	0.953	169.000	0.750	0.011	Y	NA
3709251	3709252	CKL_1035	CKL_1036	nifK2	nifB1	FALSE	0.015	384.000	0.000	1.000		NA
3709252	3709253	CKL_1036	CKL_1037	nifB1		TRUE	0.793	30.000	0.000	1.000		NA
3709253	3709254	CKL_1037	CKL_1038			TRUE	0.871	42.000	0.000	NA	Y	NA
3709254	3709255	CKL_1038	CKL_1039			TRUE	0.978	13.000	0.000	NA	Y	NA
3709255	3709256	CKL_1039	CKL_1040			TRUE	0.660	100.000	0.000	1.000	Y	NA
3709256	3709257	CKL_1040	CKL_1041			TRUE	0.937	37.000	0.000	0.027	Y	NA
3709257	3709258	CKL_1041	CKL_1042		nifD3	FALSE	0.307	94.000	0.000	1.000	N	NA
3709258	3709259	CKL_1042	CKL_1043	nifD3	nifD4	TRUE	0.981	20.000	0.000	0.011	Y	NA
3709259	3709260	CKL_1043	CKL_1044	nifD4	nifK3	TRUE	0.996	39.000	0.667	0.011	Y	NA
3709260	3709261	CKL_1044	CKL_1045	nifK3	nifH2	FALSE	0.157	198.000	0.000	0.011	N	NA
3709261	3709262	CKL_1045	CKL_1046	nifH2	nifD5	FALSE	0.132	222.000	0.000	0.011		NA
3709262	3709263	CKL_1046	CKL_1047	nifD5	nifD6	TRUE	0.599	85.000	0.000	0.011		NA
3709263	3709264	CKL_1047	CKL_1048	nifD6	nifK4	TRUE	0.992	-7.000	0.000	0.011	Y	NA
3709264	3709265	CKL_1048	CKL_1049	nifK4	oppA1	FALSE	0.129	151.000	0.000	1.000	N	NA
3709265	3709266	CKL_1049	CKL_1050	oppA1	oppB	TRUE	0.922	44.000	0.000	0.002	Y	NA
3709266	3709267	CKL_1050	CKL_1051	oppB	oppC	TRUE	0.978	23.000	0.000	0.002	Y	NA
3709267	3709268	CKL_1051	CKL_1052	oppC	oppD	TRUE	0.993	-7.000	0.000	0.002	Y	NA
3709268	3709269	CKL_1052	CKL_1053	oppD	oppF	TRUE	0.986	18.000	0.000	0.001	Y	NA
3709269	3709270	CKL_1053	CKL_1054	oppF		TRUE	0.460	71.000	0.000	NA		NA
3709270	3709271	CKL_1054	CKL_1055			TRUE	0.441	78.000	0.000	NA		NA
3709271	3709272	CKL_1055	CKL_1056			TRUE	0.927	13.000	0.000	1.000		NA
3709272	3709273	CKL_1056	CKL_1057			FALSE	0.017	362.000	0.000	NA		NA
3709273	3709274	CKL_1057	CKL_1058			FALSE	0.277	117.000	0.000	NA		NA
3709274	3709275	CKL_1058	CKL_1059			TRUE	0.394	89.000	0.000	NA		NA
3709276	3709277	CKL_1060	CKL_1061			FALSE	0.042	262.000	0.000	NA		NA
3709277	3709278	CKL_1061	CKL_1062			TRUE	0.946	2.000	0.000	NA		NA
3709279	3709280	CKL_1063	CKL_1064		gerXA	FALSE	0.124	179.000	0.000	NA		NA
3709280	3709281	CKL_1064	CKL_1065	gerXA		TRUE	0.999	-7.000	0.500	0.008		NA
3709282	3709283	CKL_1066	CKL_1067			TRUE	0.509	60.000	0.000	NA		NA
3709284	3709285	CKL_1068	CKL_1069	topA2	bdh2	TRUE	0.597	41.000	0.000	1.000	N	NA
3709286	3709287	CKL_1070	CKL_1071			TRUE	0.977	71.000	0.714	0.021		NA
3709288	3709289	CKL_1072	CKL_1073			TRUE	0.934	28.000	0.033	NA		NA
3709289	3709290	CKL_1073	CKL_1074			FALSE	0.006	495.000	0.000	NA	N	NA
3709290	3709291	CKL_1074	CKL_1075			TRUE	0.698	111.000	0.000	0.063	Y	NA
3709291	3709292	CKL_1075	CKL_1076			FALSE	0.047	478.000	0.000	0.063	Y	NA
3709292	3709293	CKL_1076	CKL_1077			TRUE	0.694	112.000	0.000	0.063	Y	NA
3709293	3709294	CKL_1077	CKL_1078			TRUE	0.759	105.000	0.000	0.004	Y	NA
3709294	3709295	CKL_1078	CKL_1079			FALSE	0.006	533.000	0.000	1.000	N	NA
3709295	3709296	CKL_1079	CKL_1080		ilvC1	FALSE	0.029	505.000	0.000	1.000	Y	NA
3709296	3709297	CKL_1080	CKL_1081	ilvC1	ilvB1	TRUE	0.932	56.000	0.006	0.002	Y	NA
3709297	3709298	CKL_1081	CKL_1082	ilvB1		FALSE	0.039	241.000	0.000	1.000	N	NA
3709298	3709299	CKL_1082	CKL_1083			FALSE	0.007	451.000	0.000	NA	N	NA
3709300	3709301	CKL_1084	CKL_1085			TRUE	0.679	40.000	0.000	NA		NA
3709301	3709302	CKL_1085	CKL_1086			FALSE	0.157	159.000	0.000	NA		NA
3709303	3709304	CKL_1087	CKL_1088	nifS1	trmU	TRUE	0.872	19.000	0.000	1.000	N	NA
3709304	3709305	CKL_1088	CKL_1089	trmU	ilvC2	FALSE	0.015	350.000	0.000	1.000	N	NA
3709305	3709306	CKL_1089	CKL_1090	ilvC2		FALSE	0.057	234.000	0.000	NA		NA
3709307	3709308	CKL_1091	CKL_1092			FALSE	0.065	223.000	0.000	NA		NA
3709308	3709309	CKL_1092	CKL_1093			TRUE	0.998	3.000	0.667	1.000	N	NA
3709309	3709310	CKL_1093	CKL_1094			TRUE	0.936	-3.000	0.000	1.000	N	NA
3709310	3709311	CKL_1094	CKL_1095			FALSE	0.086	209.000	0.000	1.000		NA
3709311	3709312	CKL_1095	CKL_1096			FALSE	0.077	215.000	0.000	1.000		NA
3709312	3709313	CKL_1096	CKL_1097			FALSE	0.202	134.000	0.000	1.000		NA
3709314	3709315	CKL_1098	CKL_1099			TRUE	0.679	40.000	0.000	NA		NA
3709315	3709316	CKL_1099	CKL_1100			FALSE	0.095	201.000	0.000	1.000		NA
3709316	3709317	CKL_1100	CKL_1101			TRUE	0.854	24.000	0.000	NA		NA
3709317	3709318	CKL_1101	CKL_1102			TRUE	0.863	23.000	0.000	NA		NA
3709318	3709319	CKL_1102	CKL_1103			FALSE	0.239	125.000	0.000	NA		NA
3709319	3709320	CKL_1103	CKL_1104			TRUE	0.799	29.000	0.000	NA		NA
3709320	3709321	CKL_1104	CKL_1105		hom2	FALSE	0.044	258.000	0.000	NA		NA
3709322	3709323	CKL_1106	CKL_1107	act	pfl	TRUE	0.991	11.000	0.163	1.000	N	NA
3709323	3709324	CKL_1107	CKL_1108	pfl		FALSE	0.033	259.000	0.000	1.000	N	NA
3709324	3709325	CKL_1108	CKL_1109			TRUE	0.997	-7.000	0.133	NA	Y	NA
3709325	3709326	CKL_1109	CKL_1110			FALSE	0.078	325.000	0.000	NA	Y	NA
3709327	3709328	CKL_1111	CKL_1112			TRUE	0.446	141.000	0.000	NA	Y	NA
3709328	3709329	CKL_1112	CKL_1113		exeE1	TRUE	0.903	82.000	0.071	NA	Y	NA
3709329	3709330	CKL_1113	CKL_1114	exeE1	exeF3	TRUE	0.878	120.000	0.141	1.000	Y	NA
3709330	3709331	CKL_1114	CKL_1115	exeF3		TRUE	0.872	22.000	0.000	NA		NA
3709331	3709332	CKL_1115	CKL_1116			TRUE	0.956	-13.000	0.000	NA		NA
3709332	3709333	CKL_1116	CKL_1117			TRUE	0.616	46.000	0.000	NA		NA
3709333	3709334	CKL_1117	CKL_1118			TRUE	0.522	58.000	0.000	NA		NA
3709334	3709335	CKL_1118	CKL_1119			TRUE	0.933	10.000	0.000	NA		NA
3709335	3709336	CKL_1119	CKL_1120			TRUE	0.608	47.000	0.000	NA		NA
3709336	3709337	CKL_1120	CKL_1121			FALSE	0.225	129.000	0.000	1.000		NA
3709337	3709338	CKL_1121	CKL_1122		cheY	FALSE	0.020	306.000	0.000	1.000	N	NA
3709338	3709339	CKL_1122	CKL_1123	cheY	cheA1	TRUE	0.999	24.000	0.750	0.021	Y	NA
3709339	3709340	CKL_1123	CKL_1124	cheA1	cheW1	TRUE	0.995	47.000	0.750	0.018	Y	NA
3709340	3709341	CKL_1124	CKL_1125	cheW1		TRUE	0.999	19.000	0.500	0.016	Y	NA
3709342	3709343	CKL_1126	CKL_1127			TRUE	0.963	103.000	0.250	0.002	Y	NA
3709343	3709344	CKL_1127	CKL_1128			FALSE	0.135	171.000	0.000	NA		NA
3709347	3709348	CKL_1131	CKL_1132			FALSE	0.005	797.000	0.000	NA		NA
3709348	3709349	CKL_1132	CKL_1133			FALSE	0.064	224.000	0.000	NA		NA
3709349	3709350	CKL_1133	CKL_1134			FALSE	0.081	211.000	0.000	NA		NA
3709350	3709351	CKL_1134	CKL_1135			TRUE	0.951	-3.000	0.000	NA		NA
3709351	3709352	CKL_1135	CKL_1136			FALSE	0.025	315.000	0.000	NA		NA
3709352	3709353	CKL_1136	CKL_1137			FALSE	0.033	289.000	0.000	NA		NA
3709353	3709354	CKL_1137	CKL_1138			FALSE	0.023	323.000	0.000	NA		NA
3709354	3709355	CKL_1138	CKL_1139			TRUE	0.926	13.000	0.000	NA		NA
3709355	3709356	CKL_1139	CKL_1140			TRUE	0.810	28.000	0.000	NA		NA
3709356	3709357	CKL_1140	CKL_1141			TRUE	0.947	1.000	0.000	NA		NA
3709357	3709358	CKL_1141	CKL_1142			TRUE	0.992	33.000	0.800	NA		NA
3709358	3709359	CKL_1142	CKL_1143			FALSE	0.047	252.000	0.000	NA		NA
3709359	3709360	CKL_1143	CKL_1144		dut	TRUE	0.770	32.000	0.000	1.000		NA
3709362	3709363	CKL_1146	CKL_1147	gloA	ssb1	FALSE	0.339	86.000	0.000	1.000	N	NA
3709363	3709364	CKL_1147	CKL_1148	ssb1		FALSE	0.033	288.000	0.000	NA		NA
3709364	3709365	CKL_1148	CKL_1149		flaB	TRUE	0.577	51.000	0.000	NA		NA
3709365	3709366	CKL_1149	CKL_1150	flaB	flgB	FALSE	0.140	320.000	0.000	0.004	Y	NA
3709366	3709367	CKL_1150	CKL_1151	flgB	flgC	TRUE	0.999	13.000	0.804	0.004	Y	NA
3709367	3709368	CKL_1151	CKL_1152	flgC	fliE	TRUE	0.997	12.000	0.095	0.004	Y	NA
3709368	3709369	CKL_1152	CKL_1153	fliE	fliF	TRUE	0.997	16.000	0.112	0.005	Y	NA
3709369	3709370	CKL_1153	CKL_1154	fliF	fliG	TRUE	0.999	6.000	0.477	0.005	Y	NA
3709370	3709371	CKL_1154	CKL_1155	fliG	fliH	TRUE	0.999	-16.000	0.308	NA	Y	NA
3709371	3709372	CKL_1155	CKL_1156	fliH	fliI	TRUE	0.994	31.000	0.379	NA	Y	NA
3709372	3709373	CKL_1156	CKL_1157	fliI	fliJ	TRUE	0.991	39.000	0.241	0.006	Y	NA
3709373	3709374	CKL_1157	CKL_1158	fliJ		TRUE	0.899	51.000	0.000	0.005	Y	NA
3709374	3709375	CKL_1158	CKL_1159		flgD	TRUE	0.799	29.000	0.000	NA		NA
3709375	3709376	CKL_1159	CKL_1160	flgD	flgE	TRUE	0.478	233.000	0.298	NA		NA
3709376	3709377	CKL_1160	CKL_1161	flgE		TRUE	0.743	253.000	0.545	NA	Y	NA
3709377	3709378	CKL_1161	CKL_1162		fliL	TRUE	0.937	57.000	0.077	NA	Y	NA
3709378	3709379	CKL_1162	CKL_1163	fliL	fliO	TRUE	0.921	49.000	0.023	1.000	Y	NA
3709379	3709380	CKL_1163	CKL_1164	fliO	fliP	TRUE	0.999	-10.000	0.386	1.000	Y	NA
3709380	3709381	CKL_1164	CKL_1165	fliP	fliQ	TRUE	0.998	11.000	0.162	0.006	Y	NA
3709381	3709382	CKL_1165	CKL_1166	fliQ		TRUE	0.957	81.000	0.114	0.002	Y	NA
3709382	3709383	CKL_1166	CKL_1167		flhA	TRUE	0.999	6.000	0.207	0.002	Y	NA
3709383	3709384	CKL_1167	CKL_1168	flhA	flhF	TRUE	0.999	0.000	0.440	1.000	Y	NA
3709384	3709385	CKL_1168	CKL_1169	flhF	fleN	TRUE	0.997	-6.000	0.382	1.000	N	NA
3709385	3709386	CKL_1169	CKL_1170	fleN		TRUE	0.792	56.000	0.045	1.000	N	NA
3709386	3709387	CKL_1170	CKL_1171			TRUE	0.862	41.000	0.029	NA		NA
3709387	3709388	CKL_1171	CKL_1172		flgG1	FALSE	0.230	197.000	0.018	NA		NA
3709388	3709389	CKL_1172	CKL_1173	flgG1	flgG2	TRUE	0.987	33.000	0.088	0.004	Y	NA
3709389	3709390	CKL_1173	CKL_1174	flgG2		TRUE	0.460	71.000	0.000	NA		NA
3709390	3709391	CKL_1174	CKL_1175			FALSE	0.089	204.000	0.000	NA		NA
3709397	3709398	CKL_1181	CKL_1182	mraW		TRUE	0.912	28.000	0.010	1.000		NA
3709398	3709399	CKL_1182	CKL_1183		ftsI	TRUE	0.987	7.000	0.072	1.000		NA
3709399	3709400	CKL_1183	CKL_1184	ftsI	murE	TRUE	0.797	189.000	0.265	1.000	Y	NA
3709400	3709401	CKL_1184	CKL_1185	murE	murF	TRUE	0.980	81.000	0.328	0.002	Y	NA
3709401	3709402	CKL_1185	CKL_1186	murF	mraY	TRUE	0.977	34.000	0.024	0.004	Y	NA
3709402	3709403	CKL_1186	CKL_1187	mraY	ftsW	TRUE	0.774	72.000	0.014	0.004	N	NA
3709403	3709404	CKL_1187	CKL_1188	ftsW	ftsQ	FALSE	0.236	177.000	0.015	NA	N	NA
3709404	3709405	CKL_1188	CKL_1189	ftsQ		TRUE	0.965	16.000	0.014	NA		NA
3709405	3709406	CKL_1189	CKL_1190			TRUE	0.981	16.000	0.070	NA		NA
3709406	3709407	CKL_1190	CKL_1191			TRUE	0.985	11.000	0.070	NA		NA
3709407	3709408	CKL_1191	CKL_1192			FALSE	0.337	157.000	0.017	NA		NA
3709408	3709409	CKL_1192	CKL_1193			TRUE	0.976	13.000	0.032	NA		NA
3709409	3709410	CKL_1193	CKL_1194			TRUE	0.979	30.000	0.246	NA		NA
3709410	3709411	CKL_1194	CKL_1195			TRUE	0.967	29.000	0.118	1.000		NA
3709411	3709412	CKL_1195	CKL_1196			TRUE	0.997	16.000	0.579	NA		NA
3709412	3709413	CKL_1196	CKL_1197			TRUE	0.433	126.000	0.027	NA	N	NA
3709413	3709414	CKL_1197	CKL_1198			FALSE	0.047	228.000	0.000	1.000	N	NA
3709414	3709415	CKL_1198	CKL_1199			TRUE	0.990	-10.000	0.082	1.000	N	NA
3709416	3709417	CKL_1200	CKL_1201	pyrP	pyrR	TRUE	0.986	31.000	0.140	1.000	Y	NA
3709417	3709418	CKL_1201	CKL_1202	pyrR		FALSE	0.206	183.000	0.010	NA	N	NA
3709419	3709420	CKL_1203	CKL_1204	dapF		TRUE	0.949	0.000	0.000	NA		NA
3709420	3709421	CKL_1204	CKL_1205		exeE2	FALSE	0.226	128.000	0.000	NA		NA
3709421	3709422	CKL_1205	CKL_1206	exeE2	exeF4	TRUE	0.573	224.000	0.135	1.000	Y	NA
3709422	3709423	CKL_1206	CKL_1207	exeF4		TRUE	0.768	103.000	0.109	NA		NA
3709423	3709424	CKL_1207	CKL_1208			TRUE	0.978	31.000	0.250	NA		NA
3709424	3709425	CKL_1208	CKL_1209			TRUE	0.999	-19.000	0.667	NA		NA
3709425	3709426	CKL_1209	CKL_1210			TRUE	0.985	35.000	0.500	NA		NA
3709426	3709427	CKL_1210	CKL_1211			TRUE	0.964	57.000	0.500	NA		NA
3709427	3709428	CKL_1211	CKL_1212			TRUE	0.997	4.000	0.500	NA		NA
3709428	3709429	CKL_1212	CKL_1213			TRUE	0.471	68.000	0.000	NA		NA
3709429	3709430	CKL_1213	CKL_1214			TRUE	0.778	31.000	0.000	NA		NA
3709430	3709431	CKL_1214	CKL_1215		pepQ	FALSE	0.022	330.000	0.000	NA		NA
3709431	3709432	CKL_1215	CKL_1216	pepQ	efp	FALSE	0.249	263.000	0.160	1.000	N	NA
3709432	3709433	CKL_1216	CKL_1217	efp		TRUE	0.881	40.000	0.037	NA		NA
3709433	3709434	CKL_1217	CKL_1218			TRUE	0.560	161.000	0.112	NA		NA
3709434	3709435	CKL_1218	CKL_1219			TRUE	0.998	3.000	0.604	NA		NA
3709435	3709436	CKL_1219	CKL_1220			TRUE	0.976	66.000	0.926	NA		NA
3709436	3709437	CKL_1220	CKL_1221			TRUE	0.998	10.000	0.895	NA		NA
3709437	3709438	CKL_1221	CKL_1222			TRUE	0.998	10.000	0.864	NA		NA
3709438	3709439	CKL_1222	CKL_1223			TRUE	0.998	16.000	0.918	NA		NA
3709439	3709440	CKL_1223	CKL_1224			TRUE	0.998	16.000	0.907	NA		NA
3709440	3709441	CKL_1224	CKL_1225			TRUE	0.920	96.000	0.407	NA		NA
3709441	3709442	CKL_1225	CKL_1226			TRUE	0.538	165.000	0.108	NA		NA
3709442	3709443	CKL_1226	CKL_1227		nusB	TRUE	0.599	186.000	0.223	NA		NA
3709443	3709444	CKL_1227	CKL_1228	nusB	xseA	TRUE	0.960	21.000	0.043	1.000	N	NA
3709444	3709445	CKL_1228	CKL_1229	xseA	xseB	TRUE	0.999	16.000	0.412	0.001	Y	NA
3709445	3709446	CKL_1229	CKL_1230	xseB	fps	TRUE	0.949	25.000	0.053	1.000	N	NA
3709446	3709447	CKL_1230	CKL_1231	fps	dxs	TRUE	0.909	63.000	0.048	1.000	Y	NA
3709447	3709448	CKL_1231	CKL_1232	dxs		TRUE	0.985	21.000	0.189	1.000	N	NA
3709448	3709449	CKL_1232	CKL_1233		ppnK	TRUE	0.992	-3.000	0.120	1.000	N	NA
3709449	3709450	CKL_1233	CKL_1234	ppnK		TRUE	0.992	-3.000	0.117	1.000	N	NA
3709450	3709451	CKL_1234	CKL_1235		recN	TRUE	0.985	12.000	0.086	1.000	N	NA
3709451	3709452	CKL_1235	CKL_1236	recN		FALSE	0.341	206.000	0.079	1.000		NA
3709452	3709453	CKL_1236	CKL_1237		spo0A	TRUE	0.588	221.000	0.393	1.000		NA
3709453	3709454	CKL_1237	CKL_1238	spo0A		FALSE	0.063	210.000	0.000	1.000	N	NA
3709454	3709455	CKL_1238	CKL_1239		spoIIM	TRUE	0.536	121.000	0.033	NA		NA
3709455	3709456	CKL_1239	CKL_1240	spoIIM		TRUE	0.985	-3.000	0.034	NA		NA
3709456	3709457	CKL_1240	CKL_1241		xerD	TRUE	0.925	24.000	0.004	NA		NA
3709457	3709458	CKL_1241	CKL_1242	xerD	deoB	TRUE	0.769	51.000	0.024	1.000	N	NA
3709458	3709459	CKL_1242	CKL_1243	deoB	pdp	TRUE	0.486	133.000	0.058	1.000	N	NA
3709459	3709460	CKL_1243	CKL_1244	pdp		FALSE	0.161	155.000	0.000	NA		NA
3709460	3709461	CKL_1244	CKL_1245			TRUE	0.911	62.000	0.200	NA		NA
3709463	3709464	CKL_1247	CKL_1248			TRUE	0.395	69.000	0.000	1.000	N	NA
3709466	3709467	CKL_1250	CKL_1251			TRUE	0.879	18.000	0.000	1.000	N	NA
3709467	3709468	CKL_1251	CKL_1252			TRUE	0.700	39.000	0.000	1.000		NA
3709468	3709469	CKL_1252	CKL_1253		dacA2	FALSE	0.267	120.000	0.000	1.000		NA
3709469	3709470	CKL_1253	CKL_1254	dacA2	cca	FALSE	0.287	166.000	0.021	1.000	N	NA
3709470	3709471	CKL_1254	CKL_1255	cca	scpA	TRUE	0.979	-9.000	0.006	NA		NA
3709471	3709472	CKL_1255	CKL_1256	scpA	scpB	TRUE	0.998	5.000	0.570	NA		NA
3709473	3709474	CKL_1257	CKL_1258			FALSE	0.051	242.000	0.000	NA		NA
3709476	3709477	CKL_1260	CKL_1261			FALSE	0.312	108.000	0.000	NA		NA
3709477	3709478	CKL_1261	CKL_1262			TRUE	0.467	69.000	0.000	NA		NA
3709479	3709480	CKL_1263	CKL_1264		rnfC	FALSE	0.119	236.000	0.022	NA	N	NA
3709480	3709481	CKL_1264	CKL_1265	rnfC	rnfD	TRUE	0.997	20.000	0.284	0.060	Y	NA
3709481	3709482	CKL_1265	CKL_1266	rnfD	rnfG	TRUE	0.985	89.000	0.678	0.060	Y	NA
3709482	3709483	CKL_1266	CKL_1267	rnfG	rnfE	TRUE	0.996	3.000	0.050	0.060	Y	NA
3709483	3709484	CKL_1267	CKL_1268	rnfE	rnfA	TRUE	1.000	0.000	0.875	0.060	Y	NA
3709484	3709485	CKL_1268	CKL_1269	rnfA	rnfB	TRUE	0.993	16.000	0.037	0.060	Y	NA
3709486	3709487	CKL_1270	CKL_1271			FALSE	0.239	125.000	0.000	NA		NA
3709487	3709488	CKL_1271	CKL_1272			TRUE	0.364	96.000	0.000	NA		NA
3709489	3709490	CKL_1273	CKL_1274		trpE	FALSE	0.012	424.000	0.000	1.000		NA
3709490	3709491	CKL_1274	CKL_1275	trpE	trpG	TRUE	0.999	1.000	0.293	0.001	Y	NA
3709491	3709492	CKL_1275	CKL_1276	trpG	trpD	TRUE	0.996	-10.000	0.053	1.000	Y	NA
3709492	3709493	CKL_1276	CKL_1277	trpD	trpC	TRUE	0.997	16.000	0.216	1.000	Y	NA
3709493	3709494	CKL_1277	CKL_1278	trpC	trpF	TRUE	0.995	32.000	0.264	0.001	Y	NA
3709494	3709495	CKL_1278	CKL_1279	trpF	trpB1	TRUE	0.999	-3.000	0.375	0.001	Y	NA
3709495	3709496	CKL_1279	CKL_1280	trpB1	trpA	TRUE	0.998	19.000	0.248	0.001	Y	NA
3709496	3709497	CKL_1280	CKL_1281	trpA		TRUE	0.422	82.000	0.000	NA		NA
3709498	3709499	CKL_1282	CKL_1283			TRUE	0.994	-3.000	0.154	NA		NA
3709500	3709501	CKL_1284	CKL_1285	glyA		FALSE	0.160	156.000	0.000	NA		NA
3709501	3709502	CKL_1285	CKL_1286		purL	FALSE	0.286	115.000	0.000	NA		NA
3709502	3709503	CKL_1286	CKL_1287	purL		FALSE	0.175	129.000	0.000	1.000	N	NA
3709503	3709504	CKL_1287	CKL_1288			TRUE	0.875	79.000	0.163	NA		NA
3709504	3709505	CKL_1288	CKL_1289			TRUE	0.997	2.000	0.490	NA		NA
3709505	3709506	CKL_1289	CKL_1290			TRUE	0.574	117.000	0.038	NA		NA
3709506	3709507	CKL_1290	CKL_1291			FALSE	0.249	123.000	0.000	NA		NA
3709507	3709508	CKL_1291	CKL_1292			FALSE	0.078	213.000	0.000	NA		NA
3709508	3709509	CKL_1292	CKL_1293		hisZ	FALSE	0.151	136.000	0.000	1.000	N	NA
3709509	3709510	CKL_1293	CKL_1294	hisZ	hisG	TRUE	0.975	75.000	0.239	0.005	Y	NA
3709510	3709511	CKL_1294	CKL_1295	hisG	hisD	TRUE	0.999	11.000	0.254	0.005	Y	NA
3709511	3709512	CKL_1295	CKL_1296	hisD	hisC	TRUE	0.998	15.000	0.165	0.005	Y	NA
3709512	3709513	CKL_1296	CKL_1297	hisC	hisB	TRUE	0.998	23.000	0.341	0.005	Y	NA
3709513	3709514	CKL_1297	CKL_1298	hisB	hisH	TRUE	0.997	16.000	0.125	0.005	Y	NA
3709514	3709515	CKL_1298	CKL_1299	hisH	hisA	TRUE	0.991	31.000	0.124	0.005	Y	NA
3709515	3709516	CKL_1299	CKL_1300	hisA	hisF	TRUE	0.999	3.000	0.433	0.005	Y	NA
3709516	3709517	CKL_1300	CKL_1301	hisF	hisI	TRUE	0.990	55.000	0.430	0.005	Y	NA
3709517	3709518	CKL_1301	CKL_1302	hisI	hisE	TRUE	0.979	51.000	0.152	0.005	Y	NA
3709518	3709519	CKL_1302	CKL_1303	hisE		FALSE	0.243	125.000	0.000	1.000		NA
3709519	3709520	CKL_1303	CKL_1304			TRUE	0.422	82.000	0.000	NA		NA
3709520	3709521	CKL_1304	CKL_1305		hisK	FALSE	0.187	138.000	0.000	NA		NA
3709522	3709523	CKL_1306	CKL_1307			TRUE	0.403	87.000	0.000	NA		NA
3709523	3709524	CKL_1307	CKL_1308			FALSE	0.019	351.000	0.000	NA		NA
3709524	3709525	CKL_1308	CKL_1309			TRUE	0.582	51.000	0.000	1.000		NA
3709526	3709527	CKL_1310	CKL_1311			FALSE	0.020	307.000	0.000	1.000	N	NA
3709527	3709528	CKL_1311	CKL_1312			TRUE	0.802	158.000	0.091	0.027	Y	NA
3709528	3709529	CKL_1312	CKL_1313			TRUE	0.997	12.000	0.143	0.027	Y	NA
3709529	3709530	CKL_1313	CKL_1314			TRUE	0.998	13.000	0.333	1.000	Y	NA
3709530	3709531	CKL_1314	CKL_1315			TRUE	0.998	0.000	0.067	0.001	Y	NA
3709531	3709532	CKL_1315	CKL_1316			TRUE	0.848	48.000	0.000	1.000	Y	NA
3709532	3709533	CKL_1316	CKL_1317			FALSE	0.088	185.000	0.000	1.000	N	NA
3709533	3709534	CKL_1317	CKL_1318		nifS2	TRUE	0.991	1.000	0.125	1.000	N	NA
3709534	3709535	CKL_1318	CKL_1319	nifS2	nifU2	TRUE	0.983	-3.000	0.035	1.000	N	NA
3709535	3709536	CKL_1319	CKL_1320	nifU2		TRUE	0.586	92.000	0.008	NA		NA
3709536	3709537	CKL_1320	CKL_1321			TRUE	0.980	27.000	0.209	NA		NA
3709537	3709538	CKL_1321	CKL_1322			FALSE	0.080	212.000	0.000	NA		NA
3709538	3709539	CKL_1322	CKL_1323			TRUE	0.709	38.000	0.000	NA		NA
3709539	3709540	CKL_1323	CKL_1324		alaS	FALSE	0.013	406.000	0.000	NA		NA
3709540	3709541	CKL_1324	CKL_1325	alaS		TRUE	0.862	65.000	0.110	NA		NA
3709541	3709542	CKL_1325	CKL_1326			TRUE	0.960	64.000	0.537	NA		NA
3709542	3709543	CKL_1326	CKL_1327			TRUE	0.873	43.000	0.047	NA		NA
3709543	3709544	CKL_1327	CKL_1328		fur3	TRUE	0.654	166.000	0.211	NA		NA
3709544	3709545	CKL_1328	CKL_1329	fur3		TRUE	0.973	38.000	0.289	1.000		NA
3709545	3709546	CKL_1329	CKL_1330			FALSE	0.278	164.000	0.004	1.000		NA
3709546	3709547	CKL_1330	CKL_1331			TRUE	0.964	16.000	0.012	NA		NA
3709547	3709548	CKL_1331	CKL_1332			TRUE	0.981	16.000	0.067	NA		NA
3709548	3709549	CKL_1332	CKL_1333			TRUE	0.993	2.000	0.146	1.000		NA
3709549	3709550	CKL_1333	CKL_1334			TRUE	0.598	78.000	0.008	1.000	N	NA
3709550	3709551	CKL_1334	CKL_1335		sigE1	TRUE	0.748	93.000	0.087	1.000	N	NA
3709551	3709552	CKL_1335	CKL_1336	sigE1	pilT	FALSE	0.079	332.000	0.025	0.044	N	NA
3709552	3709553	CKL_1336	CKL_1337	pilT		TRUE	0.366	160.000	0.042	NA	N	NA
3709553	3709554	CKL_1337	CKL_1338		ftsA	FALSE	0.009	745.000	0.008	NA	N	NA
3709554	3709555	CKL_1338	CKL_1339	ftsA	ftsZ	TRUE	0.998	20.000	0.460	1.000	Y	NA
3709555	3709556	CKL_1339	CKL_1340	ftsZ		FALSE	0.100	281.000	0.024	1.000		NA
3709556	3709557	CKL_1340	CKL_1341		sigE2	TRUE	0.994	30.000	0.856	1.000		NA
3709557	3709558	CKL_1341	CKL_1342	sigE2	sigG	TRUE	0.989	74.000	0.602	0.011	Y	NA
3709558	3709559	CKL_1342	CKL_1343	sigG		TRUE	0.840	56.000	0.060	NA		NA
3709559	3709560	CKL_1343	CKL_1344			TRUE	0.677	72.000	0.013	NA		NA
3709560	3709561	CKL_1344	CKL_1345			FALSE	0.326	152.000	0.013	NA		NA
3709561	3709562	CKL_1345	CKL_1346		phoB	TRUE	0.743	59.000	0.018	NA		NA
3709562	3709563	CKL_1346	CKL_1347	phoB	phoR	TRUE	0.997	10.000	0.110	0.078	Y	NA
3709563	3709564	CKL_1347	CKL_1348	phoR	pstS	FALSE	0.295	169.000	0.028	1.000	N	NA
3709564	3709565	CKL_1348	CKL_1349	pstS	pstC	TRUE	0.935	98.000	0.206	1.000	Y	NA
3709565	3709566	CKL_1349	CKL_1350	pstC	pstA	TRUE	1.000	-3.000	0.907	0.002	Y	NA
3709566	3709567	CKL_1350	CKL_1351	pstA	pstB	TRUE	0.997	13.000	0.112	0.002	Y	NA
3709567	3709568	CKL_1351	CKL_1352	pstB	phoU	TRUE	0.950	75.000	0.182	NA	Y	NA
3709568	3709569	CKL_1352	CKL_1353	phoU		TRUE	0.526	126.000	0.000	NA	Y	NA
3709569	3709570	CKL_1353	CKL_1354		pitA	TRUE	0.995	-7.000	0.041	NA	Y	NA
3709570	3709571	CKL_1354	CKL_1355	pitA		FALSE	0.025	289.000	0.000	1.000	N	NA
3709571	3709572	CKL_1355	CKL_1356			TRUE	0.987	4.000	0.061	1.000		NA
3709572	3709573	CKL_1356	CKL_1357		gpsA	TRUE	0.988	4.000	0.068	1.000		NA
3709573	3709574	CKL_1357	CKL_1358	gpsA		FALSE	0.192	137.000	0.000	1.000		NA
3709574	3709575	CKL_1358	CKL_1359			FALSE	0.103	196.000	0.000	1.000		NA
3709575	3709576	CKL_1359	CKL_1360			TRUE	0.999	-3.000	0.889	1.000	Y	NA
3709576	3709577	CKL_1360	CKL_1361			TRUE	0.585	112.000	0.049	NA	N	NA
3709577	3709578	CKL_1361	CKL_1362			FALSE	0.245	124.000	0.000	NA		NA
3709578	3709579	CKL_1362	CKL_1363			FALSE	0.020	349.000	0.000	NA		NA
3709579	3709580	CKL_1363	CKL_1364			TRUE	0.991	16.000	0.189	NA		NA
3709580	3709581	CKL_1364	CKL_1365			TRUE	0.994	-3.000	0.143	NA		NA
3709581	3709582	CKL_1365	CKL_1366			TRUE	0.985	-58.000	0.035	1.000	N	NA
3709582	3709583	CKL_1366	CKL_1367		coaBC	TRUE	0.976	-3.000	0.013	1.000	N	NA
3709583	3709584	CKL_1367	CKL_1368	coaBC		TRUE	0.738	100.000	0.099	1.000	N	NA
3709584	3709585	CKL_1368	CKL_1369			TRUE	0.461	111.000	0.010	1.000	N	NA
3709585	3709586	CKL_1369	CKL_1370			TRUE	0.991	16.000	0.009	0.025	Y	NA
3709586	3709587	CKL_1370	CKL_1371			TRUE	0.969	19.000	0.035	NA		NA
3709587	3709588	CKL_1371	CKL_1372			TRUE	0.815	72.000	0.076	NA		NA
3709588	3709589	CKL_1372	CKL_1373			TRUE	0.991	10.000	0.135	1.000		NA
3709589	3709590	CKL_1373	CKL_1374			TRUE	0.993	-28.000	0.105	1.000		NA
3709590	3709591	CKL_1374	CKL_1375			TRUE	0.999	-25.000	0.704	1.000	Y	NA
3709591	3709592	CKL_1375	CKL_1376			TRUE	0.977	29.000	0.196	1.000		NA
3709592	3709593	CKL_1376	CKL_1377			TRUE	0.962	39.000	0.213	1.000		NA
3709593	3709594	CKL_1377	CKL_1378			TRUE	0.993	2.000	0.166	1.000	N	NA
3709594	3709595	CKL_1378	CKL_1379			TRUE	0.543	98.000	0.005	NA		NA
3709597	3709598	CKL_1381	CKL_1382			FALSE	0.173	145.000	0.000	NA		NA
3709598	3709599	CKL_1382	CKL_1383			TRUE	0.996	18.000	0.567	NA		NA
3709599	3709600	CKL_1383	CKL_1384			TRUE	0.654	105.000	0.048	1.000		NA
3709600	3709601	CKL_1384	CKL_1385			TRUE	0.781	126.000	0.016	0.012	Y	NA
3709601	3709602	CKL_1385	CKL_1386		coaD	TRUE	0.996	6.000	0.367	1.000	N	NA
3709602	3709603	CKL_1386	CKL_1387	coaD		TRUE	0.967	22.000	0.055	NA		NA
3709604	3709605	CKL_1388	CKL_1389			TRUE	0.693	89.000	0.036	NA		NA
3709606	3709607	CKL_1390	CKL_1391	pta	ackA	FALSE	0.078	898.000	0.137	1.000	Y	NA
3709607	3709608	CKL_1391	CKL_1392	ackA		TRUE	0.476	149.000	0.061	NA		NA
3709608	3709609	CKL_1392	CKL_1393		rpmF	TRUE	0.997	14.000	0.599	NA		NA
3709609	3709610	CKL_1393	CKL_1394	rpmF		TRUE	0.588	217.000	0.418	1.000	N	NA
3709610	3709611	CKL_1394	CKL_1395			TRUE	0.804	131.000	0.034	0.005	Y	NA
3709611	3709612	CKL_1395	CKL_1396			TRUE	0.398	169.000	0.068	1.000	N	NA
3709612	3709613	CKL_1396	CKL_1397			TRUE	0.996	-10.000	0.064	1.000	Y	NA
3709613	3709614	CKL_1397	CKL_1398			TRUE	0.413	130.000	0.027	1.000	N	NA
3709614	3709615	CKL_1398	CKL_1399		ftsY	TRUE	0.986	24.000	0.165	0.017	N	NA
3709615	3709616	CKL_1399	CKL_1400	ftsY		TRUE	0.765	94.000	0.081	1.000		NA
3709616	3709617	CKL_1400	CKL_1401			TRUE	0.989	17.000	0.151	1.000		NA
3709617	3709618	CKL_1401	CKL_1402		rpsP	TRUE	0.902	94.000	0.361	1.000	N	NA
3709618	3709619	CKL_1402	CKL_1403	rpsP		TRUE	0.994	20.000	0.385	1.000		NA
3709619	3709620	CKL_1403	CKL_1404			TRUE	0.693	180.000	0.324	1.000		NA
3709620	3709621	CKL_1404	CKL_1405			TRUE	0.999	-9.000	0.672	1.000	Y	NA
3709621	3709622	CKL_1405	CKL_1406		rplS	TRUE	0.918	162.000	0.567	1.000	Y	NA
3709622	3709623	CKL_1406	CKL_1407	rplS		TRUE	0.706	52.000	0.006	1.000	N	NA
3709623	3709624	CKL_1407	CKL_1408			TRUE	0.977	14.000	0.007	0.055		NA
3709624	3709625	CKL_1408	CKL_1409			TRUE	0.986	20.000	0.148	1.000		NA
3709626	3709627	CKL_1410	CKL_1411			FALSE	0.029	430.000	0.003	0.082	N	NA
3709627	3709628	CKL_1411	CKL_1412			TRUE	0.560	70.000	0.000	0.043	N	NA
3709629	3709630	CKL_1413	CKL_1414			TRUE	0.942	4.000	0.000	NA		NA
3709630	3709631	CKL_1414	CKL_1415			TRUE	0.553	267.000	0.238	1.000	Y	NA
3709631	3709632	CKL_1415	CKL_1416		codY	FALSE	0.054	328.000	0.025	1.000	N	NA
3709632	3709633	CKL_1416	CKL_1417	codY	rpsB	FALSE	0.032	356.000	0.006	1.000	N	NA
3709633	3709634	CKL_1417	CKL_1418	rpsB	tsf	TRUE	0.851	222.000	0.748	1.000	Y	NA
3709634	3709635	CKL_1418	CKL_1419	tsf	pyrH	TRUE	0.905	99.000	0.416	1.000	N	NA
3709635	3709636	CKL_1419	CKL_1420	pyrH	frr	TRUE	0.995	21.000	0.626	1.000	N	NA
3709636	3709637	CKL_1420	CKL_1421	frr	uppS1	TRUE	0.938	70.000	0.409	1.000	N	NA
3709637	3709638	CKL_1421	CKL_1422	uppS1		TRUE	0.472	216.000	0.055	1.000	Y	NA
3709638	3709639	CKL_1422	CKL_1423		dxr	TRUE	0.418	222.000	0.044	1.000	Y	NA
3709639	3709640	CKL_1423	CKL_1424	dxr		TRUE	0.990	28.000	0.568	1.000	N	NA
3709640	3709641	CKL_1424	CKL_1425		ispG	TRUE	0.915	40.000	0.092	1.000	N	NA
3709641	3709642	CKL_1425	CKL_1426	ispG	polC	FALSE	0.178	222.000	0.040	1.000	N	NA
3709642	3709643	CKL_1426	CKL_1427	polC		FALSE	0.150	274.000	0.059	NA		NA
3709643	3709644	CKL_1427	CKL_1428		nusA	TRUE	0.997	19.000	0.759	NA		NA
3709644	3709645	CKL_1428	CKL_1429	nusA		TRUE	0.998	13.000	0.323	NA	Y	NA
3709645	3709646	CKL_1429	CKL_1430			TRUE	0.997	-10.000	0.408	NA	N	NA
3709646	3709647	CKL_1430	CKL_1431		infB	TRUE	0.996	18.000	0.223	NA	Y	NA
3709647	3709648	CKL_1431	CKL_1432	infB		TRUE	0.998	19.000	0.530	1.000	Y	NA
3709648	3709649	CKL_1432	CKL_1433			TRUE	0.995	-13.000	0.173	1.000		NA
3709649	3709650	CKL_1433	CKL_1434		truB	TRUE	0.995	0.000	0.221	1.000		NA
3709650	3709651	CKL_1434	CKL_1435	truB	ribF	TRUE	0.994	12.000	0.308	1.000	N	NA
3709651	3709652	CKL_1435	CKL_1436	ribF	rpsO	TRUE	0.710	116.000	0.119	1.000	N	NA
3709652	3709653	CKL_1436	CKL_1437	rpsO	pnp	TRUE	0.972	71.000	0.335	1.000	Y	NA
3709653	3709654	CKL_1437	CKL_1438	pnp		TRUE	0.715	96.000	0.057	1.000		NA
3709654	3709655	CKL_1438	CKL_1439			TRUE	0.739	109.000	0.104	NA		NA
3709655	3709656	CKL_1439	CKL_1440		lysC2	FALSE	0.248	276.000	0.148	NA		NA
3709656	3709657	CKL_1440	CKL_1441	lysC2		TRUE	0.838	57.000	0.080	1.000	N	NA
3709657	3709658	CKL_1441	CKL_1442		ftsK	FALSE	0.342	168.000	0.042	1.000	N	NA
3709658	3709659	CKL_1442	CKL_1443	ftsK		TRUE	0.420	132.000	0.031	1.000	N	NA
3709659	3709660	CKL_1443	CKL_1444		pgsA	TRUE	0.993	-16.000	0.132	1.000	N	NA
3709660	3709661	CKL_1444	CKL_1445	pgsA	recA	TRUE	0.372	134.000	0.022	1.000	N	NA
3709661	3709662	CKL_1445	CKL_1446	recA		FALSE	0.058	329.000	0.018	1.000		NA
3709662	3709663	CKL_1446	CKL_1447			FALSE	0.346	149.000	0.016	NA		NA
3709663	3709664	CKL_1447	CKL_1448			FALSE	0.330	165.000	0.020	NA		NA
3709664	3709665	CKL_1448	CKL_1449			TRUE	0.963	19.000	0.020	NA		NA
3709665	3709666	CKL_1449	CKL_1450			TRUE	0.990	5.000	0.107	NA		NA
3709666	3709667	CKL_1450	CKL_1451		aspC2	TRUE	0.816	51.000	0.031	1.000		NA
3709667	3709668	CKL_1451	CKL_1452	aspC2	ptsH	TRUE	0.965	20.000	0.047	1.000	N	NA
3709670	3709671	CKL_1454	CKL_1455	purB		FALSE	0.292	113.000	0.000	NA		NA
3709675	3709676	CKL_1459	CKL_1460			TRUE	0.656	42.000	0.000	1.000		NA
3709676	3709677	CKL_1460	CKL_1461			FALSE	0.026	308.000	0.000	NA		NA
3709677	3709678	CKL_1461	CKL_1462			FALSE	0.029	298.000	0.000	NA		NA
3709678	3709679	CKL_1462	CKL_1463			FALSE	0.075	216.000	0.000	NA		NA
3709679	3709680	CKL_1463	CKL_1464			TRUE	0.996	3.000	0.370	1.000	N	NA
3709684	3709685	CKL_1468	CKL_1469		kdpD	FALSE	0.105	171.000	0.000	1.000	N	NA
3709685	3709686	CKL_1469	CKL_1470	kdpD	kdpE	TRUE	0.998	-3.000	0.243	1.000	Y	NA
3709686	3709687	CKL_1470	CKL_1471	kdpE	kdpA	FALSE	0.009	428.000	0.000	1.000	N	NA
3709687	3709688	CKL_1471	CKL_1472	kdpA	kdpB	TRUE	0.998	14.000	0.201	0.001	Y	NA
3709688	3709689	CKL_1472	CKL_1473	kdpB	kdpC	TRUE	0.916	232.000	0.877	0.001	Y	NA
3709690	3709691	CKL_1474	CKL_1475			TRUE	0.864	38.000	0.000	0.001		NA
3709691	3709692	CKL_1475	CKL_1476			FALSE	0.293	114.000	0.000	1.000		NA
3709693	3709694	CKL_1477	CKL_1478			FALSE	0.011	436.000	0.000	NA		NA
3709694	3709695	CKL_1478	CKL_1479			FALSE	0.110	168.000	0.000	1.000	N	NA
3709695	3709696	CKL_1479	CKL_1480			TRUE	0.956	29.000	0.079	1.000		NA
3709696	3709697	CKL_1480	CKL_1481		rluD2	FALSE	0.103	245.000	0.005	1.000		NA
3709697	3709698	CKL_1481	CKL_1482	rluD2		TRUE	0.799	44.000	0.007	1.000		NA
3709700	3709701	CKL_1484	CKL_1485			TRUE	0.993	20.000	0.312	1.000		NA
3709701	3709702	CKL_1485	CKL_1486			TRUE	0.904	82.000	0.250	NA		NA
3709702	3709703	CKL_1486	CKL_1487			TRUE	0.954	27.000	0.063	NA		NA
3709703	3709704	CKL_1487	CKL_1488			TRUE	0.457	72.000	0.000	NA		NA
3709704	3709705	CKL_1488	CKL_1489		hprK	FALSE	0.008	498.000	0.000	NA		NA
3709705	3709706	CKL_1489	CKL_1490	hprK		TRUE	0.974	-7.000	0.006	1.000	N	NA
3709706	3709707	CKL_1490	CKL_1491			FALSE	0.036	250.000	0.000	1.000	N	NA
3709707	3709708	CKL_1491	CKL_1492			FALSE	0.008	529.000	0.000	NA		NA
3709708	3709709	CKL_1492	CKL_1493			TRUE	0.493	62.000	0.000	NA		NA
3709709	3709710	CKL_1493	CKL_1494			TRUE	0.997	2.000	0.111	1.000	Y	NA
3709711	3709712	CKL_1495	CKL_1496			TRUE	0.956	16.000	0.002	NA		NA
3709712	3709713	CKL_1496	CKL_1497			TRUE	0.758	150.000	0.308	NA		NA
3709714	3709715	CKL_1498	CKL_1499			TRUE	0.988	0.000	0.062	NA		NA
3709715	3709716	CKL_1499	CKL_1500			FALSE	0.049	246.000	0.000	NA		NA
3709716	3709717	CKL_1500	CKL_1501			FALSE	0.110	188.000	0.000	NA		NA
3709719	3709720	CKL_1503	CKL_1504			FALSE	0.246	211.000	0.000	1.000	Y	NA
3709720	3709721	CKL_1504	CKL_1505			TRUE	0.978	20.000	0.000	0.060	Y	NA
3709721	3709722	CKL_1505	CKL_1506			TRUE	0.997	9.000	0.222	1.000	Y	NA
3709722	3709723	CKL_1506	CKL_1507			TRUE	0.935	8.000	0.000	NA		NA
3709723	3709724	CKL_1507	CKL_1508			TRUE	0.665	41.000	0.000	NA		NA
3709724	3709725	CKL_1508	CKL_1509			TRUE	0.951	-3.000	0.000	NA		NA
3709725	3709726	CKL_1509	CKL_1510			TRUE	0.929	1.000	0.000	NA	N	NA
3709726	3709727	CKL_1510	CKL_1511			TRUE	0.987	-7.000	0.000	1.000	Y	NA
3709727	3709728	CKL_1511	CKL_1512			FALSE	0.206	121.000	0.000	1.000	N	NA
3709728	3709729	CKL_1512	CKL_1513			TRUE	1.000	-3.000	0.714	0.008	Y	NA
3709729	3709730	CKL_1513	CKL_1514			TRUE	0.539	56.000	0.000	NA		NA
3709730	3709731	CKL_1514	CKL_1515			TRUE	0.957	-60.000	0.000	NA		NA
3709731	3709732	CKL_1515	CKL_1516			TRUE	0.949	0.000	0.000	NA		NA
3709732	3709733	CKL_1516	CKL_1517			TRUE	0.993	16.000	0.278	1.000		NA
3709733	3709734	CKL_1517	CKL_1518			FALSE	0.106	194.000	0.000	1.000		NA
3709734	3709735	CKL_1518	CKL_1519			TRUE	0.507	61.000	0.000	1.000		NA
3709735	3709736	CKL_1519	CKL_1520			TRUE	0.982	-121.000	0.000	0.002		NA
3709736	3709737	CKL_1520	CKL_1521			FALSE	0.064	225.000	0.000	1.000		NA
3709737	3709738	CKL_1521	CKL_1522			TRUE	0.998	6.000	0.833	NA		NA
3709738	3709739	CKL_1522	CKL_1523			FALSE	0.023	322.000	0.000	NA		NA
3709739	3709740	CKL_1523	CKL_1524			TRUE	0.921	5.000	0.000	1.000	N	NA
3709740	3709741	CKL_1524	CKL_1525			FALSE	0.116	285.000	0.000	1.000	Y	NA
3709741	3709742	CKL_1525	CKL_1526			TRUE	0.978	7.000	0.038	1.000	N	NA
3709742	3709743	CKL_1526	CKL_1527			TRUE	0.691	81.000	0.038	1.000	N	NA
3709743	3709744	CKL_1527	CKL_1528			TRUE	0.562	54.000	0.000	1.000		NA
3709744	3709745	CKL_1528	CKL_1529			TRUE	0.954	-7.000	0.000	NA		NA
3709746	3709747	CKL_1530	CKL_1531			FALSE	0.024	319.000	0.000	NA		NA
3709748	3709749	CKL_1532	CKL_1533			FALSE	0.268	119.000	0.000	NA		NA
3709749	3709750	CKL_1533	CKL_1534			FALSE	0.025	316.000	0.000	1.000		NA
3709752	3709753	CKL_1536	CKL_1537			FALSE	0.014	392.000	0.000	1.000		NA
3709753	3709754	CKL_1537	CKL_1538			FALSE	0.143	140.000	0.000	1.000	N	NA
3709754	3709755	CKL_1538	CKL_1539			TRUE	0.479	124.000	0.034	1.000	N	NA
3709756	3709757	CKL_1540	CKL_1541			TRUE	0.501	61.000	0.000	NA		NA
3709757	3709758	CKL_1541	CKL_1542			FALSE	0.098	198.000	0.000	NA		NA
3709759	3709760	CKL_1543	CKL_1544			FALSE	0.021	332.000	0.000	NA		NA
3709760	3709761	CKL_1544	CKL_1545			FALSE	0.010	398.000	0.000	1.000	N	NA
3709761	3709762	CKL_1545	CKL_1546		aspA1	FALSE	0.138	262.000	0.000	1.000	Y	NA
3709762	3709763	CKL_1546	CKL_1547	aspA1	galE	FALSE	0.210	120.000	0.000	1.000	N	NA
3709763	3709764	CKL_1547	CKL_1548	galE	argS	FALSE	0.008	443.000	0.000	1.000	N	NA
3709764	3709765	CKL_1548	CKL_1549	argS		FALSE	0.140	142.000	0.000	1.000	N	NA
3709765	3709766	CKL_1549	CKL_1550			TRUE	0.598	99.000	0.018	1.000		NA
3709766	3709767	CKL_1550	CKL_1551			FALSE	0.330	130.000	0.000	0.060		NA
3709767	3709768	CKL_1551	CKL_1552			TRUE	0.806	64.000	0.058	1.000		NA
3709768	3709769	CKL_1552	CKL_1553		argC	FALSE	0.030	295.000	0.000	1.000		NA
3709769	3709770	CKL_1553	CKL_1554	argC	argJ	TRUE	0.997	26.000	0.303	0.002	Y	NA
3709770	3709771	CKL_1554	CKL_1555	argJ	argB	TRUE	0.998	18.000	0.239	0.002	Y	NA
3709771	3709772	CKL_1555	CKL_1556	argB	argD	TRUE	0.990	13.000	0.022	1.000	Y	NA
3709772	3709773	CKL_1556	CKL_1557	argD		FALSE	0.176	144.000	0.000	NA		NA
3709773	3709774	CKL_1557	CKL_1558			FALSE	0.120	181.000	0.000	NA		NA
3709776	3709777	CKL_1560	CKL_1561			FALSE	0.170	147.000	0.000	NA		NA
3709777	3709778	CKL_1561	CKL_1562			FALSE	0.322	89.000	0.000	NA	N	NA
3709778	3709779	CKL_1562	CKL_1563			TRUE	0.951	-3.000	0.000	NA		NA
3709779	3709780	CKL_1563	CKL_1564			TRUE	0.713	112.000	0.091	NA		NA
3709780	3709781	CKL_1564	CKL_1565			TRUE	0.978	24.000	0.124	1.000		NA
3709781	3709782	CKL_1565	CKL_1566		cmk	TRUE	0.480	133.000	0.039	1.000		NA
3709782	3709783	CKL_1566	CKL_1567	cmk		TRUE	0.977	12.000	0.047	1.000	N	NA
3709783	3709784	CKL_1567	CKL_1568		speH	FALSE	0.078	261.000	0.008	1.000	N	NA
3709784	3709785	CKL_1568	CKL_1569	speH		TRUE	0.442	79.000	0.000	1.000		NA
3709789	3709790	CKL_1573	CKL_1574		mutS	TRUE	0.966	19.000	0.041	1.000	N	NA
3709790	3709791	CKL_1574	CKL_1575	mutS	mutL	TRUE	0.989	41.000	0.220	0.002	Y	NA
3709791	3709792	CKL_1575	CKL_1576	mutL	miaA	TRUE	0.984	14.000	0.097	1.000	N	NA
3709792	3709793	CKL_1576	CKL_1577	miaA		TRUE	0.755	127.000	0.192	1.000		NA
3709793	3709794	CKL_1577	CKL_1578			TRUE	0.754	89.000	0.064	1.000		NA
3709796	3709797	CKL_1580	CKL_1581			TRUE	0.437	79.000	0.000	NA		NA
3709799	3709800	CKL_1583	CKL_1584			TRUE	0.998	-3.000	0.583	NA		NA
3709800	3709801	CKL_1584	CKL_1585			TRUE	0.998	-19.000	0.600	NA		NA
3709801	3709802	CKL_1585	CKL_1586			FALSE	0.080	212.000	0.000	NA		NA
3709803	3709804	CKL_1587	CKL_1588			TRUE	0.432	80.000	0.000	NA		NA
3709804	3709805	CKL_1588	CKL_1589			FALSE	0.127	177.000	0.000	NA		NA
3709805	3709806	CKL_1589	CKL_1590			TRUE	0.829	26.000	0.000	NA		NA
3709806	3709807	CKL_1590	CKL_1591			TRUE	0.995	22.000	0.600	NA		NA
3709807	3709808	CKL_1591	CKL_1592			TRUE	0.998	1.000	0.750	NA		NA
3709808	3709809	CKL_1592	CKL_1593			TRUE	0.998	12.000	0.750	NA		NA
3709809	3709810	CKL_1593	CKL_1594			TRUE	0.997	19.000	0.857	NA		NA
3709810	3709811	CKL_1594	CKL_1595			FALSE	0.087	205.000	0.000	NA		NA
3709813	3709814	CKL_1597	CKL_1598		malL	TRUE	0.988	-18.000	0.000	1.000	Y	NA
3709814	3709815	CKL_1598	CKL_1599	malL		FALSE	0.021	301.000	0.000	1.000	N	NA
3709815	3709816	CKL_1599	CKL_1600			TRUE	0.432	80.000	0.000	NA		NA
3709816	3709817	CKL_1600	CKL_1601		feoB2	FALSE	0.039	271.000	0.000	NA		NA
3709817	3709818	CKL_1601	CKL_1602	feoB2		TRUE	0.990	62.000	0.871	1.000	Y	NA
3709818	3709819	CKL_1602	CKL_1603			TRUE	0.998	30.000	0.791	0.011	Y	NA
3709819	3709820	CKL_1603	CKL_1604		infC	FALSE	0.018	321.000	0.000	1.000	N	NA
3709820	3709821	CKL_1604	CKL_1605	infC	nhaC	FALSE	0.227	116.000	0.000	1.000	N	NA
3709821	3709822	CKL_1605	CKL_1606	nhaC		FALSE	0.133	147.000	0.000	1.000	N	NA
3709824	3709825	CKL_1608	CKL_1609	punA	metA1	TRUE	0.612	40.000	0.000	1.000	N	NA
3709826	3709827	CKL_1610	CKL_1611			FALSE	0.007	549.000	0.000	NA		NA
3709827	3709828	CKL_1611	CKL_1612			TRUE	0.894	20.000	0.000	NA		NA
3709828	3709829	CKL_1612	CKL_1613			TRUE	0.938	6.000	0.000	NA		NA
3709829	3709830	CKL_1613	CKL_1614		aad	FALSE	0.292	113.000	0.000	NA		NA
3709830	3709831	CKL_1614	CKL_1615	aad		FALSE	0.118	164.000	0.000	1.000	N	NA
3709831	3709832	CKL_1615	CKL_1616			TRUE	0.977	14.000	0.000	NA	Y	NA
3709833	3709834	CKL_1617	CKL_1618	ilvH	ilvI	TRUE	0.998	7.000	0.136	0.001	Y	NA
3709834	3709835	CKL_1618	CKL_1619	ilvI	gltD	FALSE	0.027	829.000	0.000	0.011	Y	NA
3709835	3709836	CKL_1619	CKL_1620	gltD	gltB	TRUE	0.997	11.000	0.099	0.001	Y	NA
3709837	3709838	CKL_1621	CKL_1622			TRUE	0.360	97.000	0.000	NA		NA
3709841	3709842	CKL_1625	CKL_1626	ndk		FALSE	0.203	133.000	0.000	NA		NA
3709842	3709843	CKL_1626	CKL_1627			FALSE	0.165	151.000	0.000	NA		NA
3709843	3709844	CKL_1627	CKL_1628			FALSE	0.165	151.000	0.000	NA		NA
3709845	3709846	CKL_1629	CKL_1630			TRUE	0.997	21.000	0.833	NA		NA
3709846	3709847	CKL_1630	CKL_1631		metA2	FALSE	0.022	329.000	0.000	NA		NA
3709848	3709849	CKL_1632	CKL_1633	metB2	metK1	FALSE	0.283	100.000	0.000	1.000	N	NA
3709851	3709852	CKL_1635	CKL_1636	thiE1	thiH	TRUE	0.998	-3.000	0.128	0.005	Y	NA
3709852	3709853	CKL_1636	CKL_1637	thiH	thiG	TRUE	0.999	12.000	0.277	0.005	Y	NA
3709853	3709854	CKL_1637	CKL_1638	thiG	thiF	TRUE	0.948	56.000	0.054	0.047	Y	NA
3709854	3709855	CKL_1638	CKL_1639	thiF	thiS	TRUE	0.997	2.000	0.115	1.000	Y	NA
3709855	3709856	CKL_1639	CKL_1640	thiS		FALSE	0.004	1019.000	0.000	NA		NA
3709856	3709857	CKL_1640	CKL_1641			TRUE	0.997	5.000	0.380	NA		NA
3709857	3709858	CKL_1641	CKL_1642			FALSE	0.023	291.000	0.000	NA	N	NA
3709858	3709859	CKL_1642	CKL_1643			TRUE	0.999	7.000	0.833	1.000	Y	NA
3709859	3709860	CKL_1643	CKL_1644			TRUE	0.948	68.000	0.500	1.000	N	NA
3709860	3709861	CKL_1644	CKL_1645			TRUE	0.992	25.000	0.571	1.000	N	NA
3709863	3709864	CKL_1647	CKL_1648			TRUE	0.951	-3.000	0.000	NA		NA
3709864	3709865	CKL_1648	CKL_1649			FALSE	0.033	289.000	0.000	NA		NA
3709865	3709866	CKL_1649	CKL_1650			TRUE	0.485	64.000	0.000	NA		NA
3709866	3709867	CKL_1650	CKL_1651			TRUE	0.996	-3.000	0.286	1.000	N	NA
3709869	3709870	CKL_1653	CKL_1654			FALSE	0.004	943.000	0.000	NA		NA
3709870	3709871	CKL_1654	CKL_1655			TRUE	0.629	45.000	0.000	1.000		NA
3709871	3709872	CKL_1655	CKL_1656			FALSE	0.062	230.000	0.000	1.000		NA
3709872	3709873	CKL_1656	CKL_1657			TRUE	0.895	15.000	0.000	1.000	N	NA
3709873	3709874	CKL_1657	CKL_1658			TRUE	0.998	13.000	1.000	0.095	N	NA
3709874	3709875	CKL_1658	CKL_1659			FALSE	0.120	159.000	0.000	NA	N	NA
3709877	3709878	CKL_1661	CKL_1662			FALSE	0.012	415.000	0.000	NA		NA
3709878	3709879	CKL_1662	CKL_1663			TRUE	0.997	2.000	0.333	NA		NA
3709879	3709880	CKL_1663	CKL_1664			TRUE	0.940	51.000	0.222	NA		NA
3709880	3709881	CKL_1664	CKL_1665			TRUE	0.790	30.000	0.000	NA		NA
3709881	3709882	CKL_1665	CKL_1666			TRUE	0.974	52.000	0.600	NA		NA
3709882	3709883	CKL_1666	CKL_1667			TRUE	0.721	37.000	0.000	NA		NA
3709883	3709884	CKL_1667	CKL_1668			TRUE	0.944	3.000	0.000	NA		NA
3709884	3709885	CKL_1668	CKL_1669			TRUE	0.616	46.000	0.000	NA		NA
3709885	3709886	CKL_1669	CKL_1670			TRUE	0.933	10.000	0.000	NA		NA
3709886	3709887	CKL_1670	CKL_1671			TRUE	0.721	37.000	0.000	NA		NA
3709887	3709888	CKL_1671	CKL_1672			TRUE	0.696	39.000	0.000	NA		NA
3709888	3709889	CKL_1672	CKL_1673			FALSE	0.139	169.000	0.000	NA		NA
3709889	3709890	CKL_1673	CKL_1674			TRUE	0.883	21.000	0.000	NA		NA
3709890	3709891	CKL_1674	CKL_1675			FALSE	0.203	133.000	0.000	NA		NA
3709891	3709892	CKL_1675	CKL_1676			TRUE	0.954	-7.000	0.000	NA		NA
3709893	3709894	CKL_1677	CKL_1678			FALSE	0.221	129.000	0.000	NA		NA
3709894	3709895	CKL_1678	CKL_1679			FALSE	0.011	388.000	0.000	NA	N	NA
3709895	3709896	CKL_1679	CKL_1680			TRUE	0.947	1.000	0.000	NA		NA
3709897	3709898	CKL_1681	CKL_1682			TRUE	1.000	-16.000	0.750	0.020	Y	NA
3709898	3709899	CKL_1682	CKL_1683			TRUE	0.549	55.000	0.000	NA		NA
3709899	3709900	CKL_1683	CKL_1684			TRUE	0.998	-7.000	0.400	NA		NA
3709900	3709901	CKL_1684	CKL_1685			FALSE	0.164	152.000	0.000	NA		NA
3709901	3709902	CKL_1685	CKL_1686			FALSE	0.193	136.000	0.000	NA		NA
3709903	3709904	CKL_1687	CKL_1688			FALSE	0.159	157.000	0.000	NA		NA
3709905	3709906	CKL_1689	CKL_1690			TRUE	0.919	25.000	0.000	0.011		NA
3709906	3709907	CKL_1690	CKL_1691			FALSE	0.099	233.000	0.000	0.058		NA
3709907	3709908	CKL_1691	CKL_1692			TRUE	0.433	81.000	0.000	1.000		NA
3709908	3709909	CKL_1692	CKL_1693		ilvD	FALSE	0.028	304.000	0.000	1.000		NA
3709909	3709910	CKL_1693	CKL_1694	ilvD		FALSE	0.288	138.000	0.005	1.000	N	NA
3709910	3709911	CKL_1694	CKL_1695			FALSE	0.071	220.000	0.000	1.000		NA
3709911	3709912	CKL_1695	CKL_1696		bioB2	TRUE	0.433	81.000	0.000	1.000		NA
3709912	3709913	CKL_1696	CKL_1697	bioB2		TRUE	0.422	82.000	0.000	NA		NA
3709914	3709915	CKL_1698	CKL_1699			FALSE	0.249	124.000	0.000	1.000		NA
3709916	3709917	CKL_1700	CKL_1701		gerKC2	FALSE	0.203	133.000	0.000	NA		NA
3709917	3709918	CKL_1701	CKL_1702	gerKC2	gerKB2	TRUE	0.999	9.000	0.750	0.007		NA
3709918	3709919	CKL_1702	CKL_1703	gerKB2	gerKA2	TRUE	0.998	21.000	0.750	0.007		NA
3709920	3709921	CKL_1704	CKL_1705			TRUE	0.872	22.000	0.000	NA		NA
3709921	3709922	CKL_1705	CKL_1706			TRUE	0.544	56.000	0.000	1.000		NA
3709922	3709923	CKL_1706	CKL_1707			TRUE	0.999	-3.000	0.862	1.000	Y	NA
3709923	3709924	CKL_1707	CKL_1708			TRUE	0.942	42.000	0.031	1.000	Y	NA
3709924	3709925	CKL_1708	CKL_1709			TRUE	0.651	42.000	0.000	NA		NA
3709927	3709928	CKL_1711	CKL_1712			TRUE	0.874	35.000	0.011	NA		NA
3709928	3709929	CKL_1712	CKL_1713			TRUE	0.564	53.000	0.000	NA		NA
3709929	3709930	CKL_1713	CKL_1714			FALSE	0.135	171.000	0.000	NA		NA
3709930	3709931	CKL_1714	CKL_1715			TRUE	0.829	26.000	0.000	NA		NA
3709931	3709932	CKL_1715	CKL_1716			TRUE	0.531	201.000	0.135	0.080		NA
3709932	3709933	CKL_1716	CKL_1717			TRUE	0.929	12.000	0.000	NA		NA
3709933	3709934	CKL_1717	CKL_1718			FALSE	0.011	442.000	0.000	NA		NA
3709936	3709937	CKL_1720	CKL_1721			FALSE	0.003	992.000	0.000	1.000	N	NA
3709937	3709938	CKL_1721	CKL_1722			TRUE	0.703	85.000	0.049	1.000	N	NA
3709938	3709939	CKL_1722	CKL_1723			FALSE	0.010	461.000	0.000	NA		NA
3709939	3709940	CKL_1723	CKL_1724			TRUE	0.931	11.000	0.000	NA		NA
3709940	3709941	CKL_1724	CKL_1725			FALSE	0.074	217.000	0.000	NA		NA
3709941	3709942	CKL_1725	CKL_1726			TRUE	0.956	-21.000	0.000	NA		NA
3709943	3709944	CKL_1727	CKL_1728			TRUE	0.531	201.000	0.135	0.080		NA
3709944	3709945	CKL_1728	CKL_1729			FALSE	0.009	474.000	0.000	1.000		NA
3709945	3709946	CKL_1729	CKL_1730			FALSE	0.011	434.000	0.000	1.000		NA
3709946	3709947	CKL_1730	CKL_1731			TRUE	0.976	-3.000	0.000	0.016		NA
3709947	3709948	CKL_1731	CKL_1732			TRUE	0.782	31.000	0.000	1.000		NA
3709948	3709949	CKL_1732	CKL_1733			TRUE	0.535	86.000	0.003	1.000	N	NA
3709949	3709950	CKL_1733	CKL_1734			TRUE	0.987	14.000	0.000	0.005	Y	NA
3709950	3709951	CKL_1734	CKL_1735			TRUE	0.981	20.000	0.000	0.016	Y	NA
3709954	3709955	CKL_1738	CKL_1739			TRUE	0.999	-7.000	0.333	0.009	Y	NA
3709955	3709956	CKL_1739	CKL_1740			TRUE	0.999	-19.000	0.714	NA		NA
3709956	3709957	CKL_1740	CKL_1741			TRUE	0.910	17.000	0.000	NA		NA
3709957	3709958	CKL_1741	CKL_1742			FALSE	0.353	176.000	0.000	1.000	Y	NA
3709959	3709960	CKL_1743	CKL_1744	vnfN	vnfE	TRUE	1.000	-15.000	1.000	0.044	Y	NA
3709960	3709961	CKL_1744	CKL_1745	vnfE	vnfK	TRUE	0.693	113.000	0.000	0.057	Y	NA
3709961	3709962	CKL_1745	CKL_1746	vnfK	vnfG	TRUE	0.929	24.000	0.000	0.006		NA
3709962	3709963	CKL_1746	CKL_1747	vnfG	vnfD	TRUE	0.999	9.000	0.833	0.006		NA
3709963	3709964	CKL_1747	CKL_1748	vnfD	vnfH	FALSE	0.187	186.000	0.000	0.006	N	NA
3709964	3709965	CKL_1748	CKL_1749	vnfH	nifB2	TRUE	0.371	132.000	0.000	0.006		NA
3709966	3709967	CKL_1750	CKL_1751			TRUE	0.958	-40.000	0.000	1.000		NA
3709967	3709968	CKL_1751	CKL_1752			TRUE	0.955	-10.000	0.000	NA		NA
3709968	3709969	CKL_1752	CKL_1753			FALSE	0.345	100.000	0.000	NA		NA
3709969	3709970	CKL_1753	CKL_1754			TRUE	0.994	18.000	0.040	0.002	Y	NA
3709971	3709972	CKL_1755	CKL_1756			TRUE	0.446	76.000	0.000	NA		NA
3709972	3709973	CKL_1756	CKL_1757		nifV1	TRUE	0.631	44.000	0.000	NA		NA
3709973	3709974	CKL_1757	CKL_1758	nifV1	nifV2	TRUE	0.666	157.000	0.081	0.001		NA
3709974	3709975	CKL_1758	CKL_1759	nifV2		FALSE	0.108	225.000	0.000	0.058		NA
3709976	3709977	CKL_1760	CKL_1761			FALSE	0.013	399.000	0.000	NA		NA
3709978	3709979	CKL_1762	CKL_1763	metH2	metE	TRUE	0.994	-3.000	0.030	1.000	Y	NA
3709979	3709980	CKL_1763	CKL_1764	metE		FALSE	0.183	140.000	0.000	NA		NA
3709980	3709981	CKL_1764	CKL_1765			TRUE	0.452	74.000	0.000	NA		NA
3709982	3709983	CKL_1766	CKL_1767			TRUE	0.946	2.000	0.000	NA		NA
3709983	3709984	CKL_1767	CKL_1768			FALSE	0.018	355.000	0.000	NA		NA
3709985	3709986	CKL_1769	CKL_1770	bfmBC	lplA	TRUE	0.991	12.000	0.188	1.000	N	NA
3709986	3709987	CKL_1770	CKL_1771	lplA	gcvPB	TRUE	0.972	1.000	0.009	1.000	N	NA
3709987	3709988	CKL_1771	CKL_1772	gcvPB	gcvPA	TRUE	0.999	-3.000	0.316	0.001	Y	NA
3709988	3709989	CKL_1772	CKL_1773	gcvPA	gcvH	TRUE	0.996	19.000	0.249	1.000	Y	NA
3709989	3709990	CKL_1773	CKL_1774	gcvH	gcvT	TRUE	0.997	13.000	0.092	0.002	Y	NA
3709990	3709991	CKL_1774	CKL_1775	gcvT		FALSE	0.012	366.000	0.000	NA	N	NA
3709991	3709992	CKL_1775	CKL_1776		thiC	FALSE	0.093	179.000	0.000	NA	N	NA
3709992	3709993	CKL_1776	CKL_1777	thiC		FALSE	0.013	405.000	0.000	1.000		NA
3709993	3709994	CKL_1777	CKL_1778			FALSE	0.312	109.000	0.000	1.000		NA
3709994	3709995	CKL_1778	CKL_1779			TRUE	0.964	32.000	0.093	0.015	N	NA
3709995	3709996	CKL_1779	CKL_1780			FALSE	0.132	148.000	0.000	1.000	N	NA
3709996	3709997	CKL_1780	CKL_1781			FALSE	0.025	315.000	0.000	NA		NA
3709999	3710000	CKL_1783	CKL_1784			TRUE	1.000	-3.000	0.933	0.008	Y	NA
3710000	3710001	CKL_1784	CKL_1785			TRUE	0.919	42.000	0.117	1.000	N	NA
3710003	3710004	CKL_1787	CKL_1788			FALSE	0.091	202.000	0.000	NA		NA
3710004	3710005	CKL_1788	CKL_1789			FALSE	0.009	474.000	0.000	NA		NA
3710005	3710006	CKL_1789	CKL_1790			FALSE	0.026	312.000	0.000	1.000		NA
3710006	3710007	CKL_1790	CKL_1791			FALSE	0.004	874.000	0.000	1.000		NA
3710008	3710009	CKL_1792	CKL_1793			TRUE	0.478	66.000	0.000	NA		NA
3710010	3710011	CKL_1794	CKL_1795		cysN	FALSE	0.022	295.000	0.000	1.000	N	NA
3710011	3710012	CKL_1795	CKL_1796	cysN	cysD	TRUE	0.979	80.000	0.830	0.001	N	NA
3710012	3710013	CKL_1796	CKL_1797	cysD		TRUE	0.977	16.000	0.064	1.000	N	NA
3710013	3710014	CKL_1797	CKL_1798		aprA	TRUE	0.999	-16.000	0.484	0.057	Y	NA
3710014	3710015	CKL_1798	CKL_1799	aprA	cysC	TRUE	0.977	5.000	0.031	1.000	N	NA
3710015	3710016	CKL_1799	CKL_1800	cysC	cysA	TRUE	0.674	97.000	0.000	1.000	Y	NA
3710016	3710017	CKL_1800	CKL_1801	cysA	cysW	TRUE	0.995	2.000	0.060	1.000	Y	NA
3710017	3710018	CKL_1801	CKL_1802	cysW	cysT	TRUE	0.999	12.000	0.935	0.001	N	NA
3710018	3710019	CKL_1802	CKL_1803	cysT	sbpA	TRUE	0.975	31.000	0.112	0.001	N	NA
3710019	3710020	CKL_1803	CKL_1804	sbpA		FALSE	0.007	486.000	0.000	1.000	N	NA
3710021	3710022	CKL_1805	CKL_1806			TRUE	0.991	5.000	0.109	NA		NA
3710022	3710023	CKL_1806	CKL_1807			TRUE	0.862	43.000	0.038	NA		NA
3710023	3710024	CKL_1807	CKL_1808			TRUE	0.381	74.000	0.000	1.000	N	NA
3710025	3710026	CKL_1809	CKL_1810			FALSE	0.016	371.000	0.000	NA		NA
3710026	3710027	CKL_1810	CKL_1811			TRUE	0.478	66.000	0.000	NA		NA
3710028	3710029	CKL_1812	CKL_1813			FALSE	0.005	730.000	0.000	1.000		NA
3710029	3710030	CKL_1813	CKL_1814			FALSE	0.305	110.000	0.000	NA		NA
3710030	3710031	CKL_1814	CKL_1815			FALSE	0.037	276.000	0.000	NA		NA
3710031	3710032	CKL_1815	CKL_1816			TRUE	0.997	-3.000	0.381	1.000		NA
3710032	3710033	CKL_1816	CKL_1817			TRUE	0.992	-3.000	0.100	1.000		NA
3710035	3710036	CKL_1819	CKL_1820			FALSE	0.019	351.000	0.000	NA		NA
3710036	3710037	CKL_1820	CKL_1821			TRUE	0.938	6.000	0.000	NA		NA
3710038	3710039	CKL_1822	CKL_1823			FALSE	0.277	117.000	0.000	NA		NA
3710039	3710040	CKL_1823	CKL_1824			TRUE	0.529	57.000	0.000	NA		NA
3710040	3710041	CKL_1824	CKL_1825			TRUE	0.407	86.000	0.000	NA		NA
3710041	3710042	CKL_1825	CKL_1826			TRUE	0.910	17.000	0.000	NA		NA
3710042	3710043	CKL_1826	CKL_1827			TRUE	0.910	17.000	0.000	NA		NA
3710043	3710044	CKL_1827	CKL_1828			FALSE	0.076	215.000	0.000	NA		NA
3710044	3710045	CKL_1828	CKL_1829			FALSE	0.164	152.000	0.000	NA		NA
3710045	3710046	CKL_1829	CKL_1830			TRUE	0.901	19.000	0.000	NA		NA
3710046	3710047	CKL_1830	CKL_1831			TRUE	0.955	-10.000	0.000	NA		NA
3710047	3710048	CKL_1831	CKL_1832			TRUE	0.954	-7.000	0.000	NA		NA
3710048	3710049	CKL_1832	CKL_1833			TRUE	0.894	20.000	0.000	NA		NA
3710049	3710050	CKL_1833	CKL_1834			TRUE	0.942	4.000	0.000	NA		NA
3710050	3710051	CKL_1834	CKL_1835			TRUE	0.999	-13.000	1.000	NA		NA
3710051	3710052	CKL_1835	CKL_1836			TRUE	0.998	5.000	0.571	NA		NA
3710052	3710053	CKL_1836	CKL_1837			TRUE	0.998	-7.000	0.643	NA		NA
3710053	3710054	CKL_1837	CKL_1838			TRUE	0.999	-25.000	0.900	NA		NA
3710054	3710055	CKL_1838	CKL_1839			TRUE	0.997	9.000	0.500	NA		NA
3710055	3710056	CKL_1839	CKL_1840			FALSE	0.038	275.000	0.000	NA		NA
3710056	3710057	CKL_1840	CKL_1841			TRUE	0.936	7.000	0.000	NA		NA
3710057	3710058	CKL_1841	CKL_1842			FALSE	0.096	200.000	0.000	NA		NA
3710058	3710059	CKL_1842	CKL_1843			TRUE	0.509	60.000	0.000	NA		NA
3710059	3710060	CKL_1843	CKL_1844			FALSE	0.331	103.000	0.000	NA		NA
3710060	3710061	CKL_1844	CKL_1845			FALSE	0.006	639.000	0.000	NA		NA
3710061	3710062	CKL_1845	CKL_1846			FALSE	0.351	99.000	0.000	NA		NA
3710062	3710063	CKL_1846	CKL_1847			TRUE	0.944	3.000	0.000	NA		NA
3710063	3710064	CKL_1847	CKL_1848			TRUE	0.595	114.000	0.000	NA	Y	NA
3710066	3710067	CKL_1850	CKL_1851			FALSE	0.117	184.000	0.000	NA		NA
3710067	3710068	CKL_1851	CKL_1852			FALSE	0.031	291.000	0.000	NA		NA
3710068	3710069	CKL_1852	CKL_1853			TRUE	0.422	82.000	0.000	NA		NA
3710069	3710070	CKL_1853	CKL_1854			TRUE	0.951	46.000	0.231	NA		NA
3710070	3710071	CKL_1854	CKL_1855			TRUE	0.388	90.000	0.000	NA		NA
3710071	3710072	CKL_1855	CKL_1856			TRUE	0.997	19.000	0.750	NA		NA
3710072	3710073	CKL_1856	CKL_1857			TRUE	0.998	2.000	0.500	NA		NA
3710073	3710074	CKL_1857	CKL_1858			TRUE	0.998	4.000	0.667	NA		NA
3710074	3710075	CKL_1858	CKL_1859			TRUE	0.997	4.000	0.400	NA		NA
3710075	3710076	CKL_1859	CKL_1860			TRUE	0.998	0.000	0.500	NA		NA
3710076	3710077	CKL_1860	CKL_1861			TRUE	0.998	-3.000	0.500	NA		NA
3710077	3710078	CKL_1861	CKL_1862			TRUE	0.616	46.000	0.000	NA		NA
3710078	3710079	CKL_1862	CKL_1863			TRUE	0.997	16.000	0.600	NA		NA
3710079	3710080	CKL_1863	CKL_1864			TRUE	0.995	21.000	0.600	NA		NA
3710080	3710081	CKL_1864	CKL_1865			FALSE	0.129	176.000	0.000	NA		NA
3710081	3710082	CKL_1865	CKL_1866			TRUE	0.493	62.000	0.000	NA		NA
3710082	3710083	CKL_1866	CKL_1868			TRUE	0.938	6.000	0.000	NA		NA
3710083	3710084	CKL_1868	CKL_1869			TRUE	0.999	-7.000	0.800	NA		NA
3710084	3710085	CKL_1869	CKL_1870			TRUE	0.955	-9.000	0.000	NA		NA
3710085	3710086	CKL_1870	CKL_1871			TRUE	0.956	-10.000	0.000	1.000		NA
3710086	3710087	CKL_1871	CKL_1872			TRUE	0.437	79.000	0.000	NA		NA
3710088	3710089	CKL_1873	CKL_1874			FALSE	0.006	567.000	0.000	NA		NA
3710090	3710091	CKL_1875	CKL_1876			FALSE	0.268	119.000	0.000	NA		NA
3710091	3710092	CKL_1876	CKL_1877			FALSE	0.068	221.000	0.000	NA		NA
3710092	3710093	CKL_1877	CKL_1878			TRUE	0.594	49.000	0.000	NA		NA
3710093	3710094	CKL_1878	CKL_1879			TRUE	0.842	25.000	0.000	NA		NA
3710094	3710095	CKL_1879	CKL_1880			FALSE	0.085	208.000	0.000	NA		NA
3710095	3710096	CKL_1880	CKL_1881			TRUE	0.947	1.000	0.000	NA		NA
3710096	3710097	CKL_1881	CKL_1882			FALSE	0.151	164.000	0.000	NA		NA
3710097	3710098	CKL_1882	CKL_1883			TRUE	0.934	9.000	0.000	NA		NA
3710098	3710099	CKL_1883	CKL_1884			FALSE	0.026	308.000	0.000	NA		NA
3710099	3710100	CKL_1884	CKL_1885			TRUE	0.997	-7.000	0.294	NA		NA
3710100	3710101	CKL_1885	CKL_1886			FALSE	0.117	184.000	0.000	NA		NA
3710101	3710102	CKL_1886	CKL_1887			FALSE	0.040	269.000	0.000	NA		NA
3710102	3710103	CKL_1887	CKL_1888			TRUE	0.951	-3.000	0.000	NA		NA
3710103	3710104	CKL_1888	CKL_1889			TRUE	0.919	15.000	0.000	NA		NA
3710104	3710105	CKL_1889	CKL_1891			TRUE	0.478	66.000	0.000	NA		NA
3710105	3710106	CKL_1891	CKL_1892			TRUE	0.942	4.000	0.000	NA		NA
3710106	3710107	CKL_1892	CKL_1893			TRUE	0.942	4.000	0.000	NA		NA
3710107	3710108	CKL_1893	CKL_1894			TRUE	0.665	41.000	0.000	NA		NA
3710108	3710109	CKL_1894	CKL_1895			TRUE	0.949	0.000	0.000	NA		NA
3710109	3710110	CKL_1895	CKL_1901			TRUE	0.944	3.000	0.000	NA		NA
3710110	3710111	CKL_1901	CKL_1902			TRUE	0.944	3.000	0.000	NA		NA
3710111	3710112	CKL_1902	CKL_1903			FALSE	0.107	191.000	0.000	NA		NA
3710112	3710113	CKL_1903	CKL_1904			FALSE	0.172	146.000	0.000	NA		NA
3710113	3710114	CKL_1904	CKL_1905			FALSE	0.129	176.000	0.000	NA		NA
3710114	3710115	CKL_1905	CKL_1906			FALSE	0.173	145.000	0.000	NA		NA
3710115	3710116	CKL_1906	CKL_1907			TRUE	0.810	28.000	0.000	NA		NA
3710116	3710117	CKL_1907	CKL_1908			FALSE	0.156	160.000	0.000	NA		NA
3710117	3710118	CKL_1908	CKL_1909			FALSE	0.203	133.000	0.000	NA		NA
3710118	3710119	CKL_1909	CKL_1910			TRUE	0.951	-3.000	0.000	NA		NA
3710119	3710120	CKL_1910	CKL_1911			TRUE	0.883	21.000	0.000	NA		NA
3710121	3710122	CKL_1912	CKL_1913			TRUE	0.901	19.000	0.000	NA		NA
3710122	3710123	CKL_1913	CKL_1914			FALSE	0.012	429.000	0.000	NA		NA
3710123	3710124	CKL_1914	CKL_1915			FALSE	0.014	403.000	0.000	1.000		NA
3710124	3710125	CKL_1915	CKL_1916			TRUE	0.437	79.000	0.000	NA		NA
3710125	3710126	CKL_1916	CKL_1917			TRUE	0.883	21.000	0.000	NA		NA
3710126	3710127	CKL_1917	CKL_1918			FALSE	0.157	159.000	0.000	NA		NA
3710127	3710128	CKL_1918	CKL_1919			FALSE	0.322	106.000	0.000	1.000		NA
3710128	3710129	CKL_1919	CKL_1920			TRUE	0.952	-3.000	0.000	1.000		NA
3710129	3710130	CKL_1920	CKL_1921			FALSE	0.305	110.000	0.000	NA		NA
3710130	3710131	CKL_1921	CKL_1922			FALSE	0.035	284.000	0.000	NA		NA
3710131	3710132	CKL_1922	CKL_1923			TRUE	0.938	6.000	0.000	NA		NA
3710133	3710134	CKL_1924	CKL_1925			FALSE	0.041	264.000	0.000	NA		NA
3710134	3710135	CKL_1925	CKL_1926			TRUE	0.577	51.000	0.000	NA		NA
3710135	3710136	CKL_1926	CKL_1927			TRUE	0.910	17.000	0.000	NA		NA
3710136	3710137	CKL_1927	CKL_1928			TRUE	0.931	11.000	0.000	NA		NA
3710137	3710138	CKL_1928	CKL_1929			FALSE	0.036	279.000	0.000	NA		NA
3710138	3710139	CKL_1929	CKL_1930			TRUE	0.998	-13.000	0.500	NA		NA
3710139	3710140	CKL_1930	CKL_1931			FALSE	0.208	132.000	0.000	NA		NA
3710140	3710141	CKL_1931	CKL_1932			TRUE	0.996	0.000	0.250	NA		NA
3710141	3710142	CKL_1932	CKL_1933			TRUE	0.919	15.000	0.000	NA		NA
3710142	3710143	CKL_1933	CKL_1934			TRUE	0.942	4.000	0.000	NA		NA
3710143	3710144	CKL_1934	CKL_1935			TRUE	0.999	-13.000	1.000	NA		NA
3710144	3710145	CKL_1935	CKL_1936			TRUE	0.998	5.000	0.571	NA		NA
3710145	3710146	CKL_1936	CKL_1937			TRUE	0.998	-7.000	0.643	NA		NA
3710146	3710147	CKL_1937	CKL_1938			TRUE	0.999	-25.000	0.900	NA		NA
3710147	3710148	CKL_1938	CKL_1939			TRUE	0.997	9.000	0.500	NA		NA
3710148	3710149	CKL_1939	CKL_1940			FALSE	0.038	275.000	0.000	NA		NA
3710149	3710150	CKL_1940	CKL_1941			TRUE	0.936	7.000	0.000	NA		NA
3710150	3710151	CKL_1941	CKL_1942			FALSE	0.096	200.000	0.000	NA		NA
3710151	3710152	CKL_1942	CKL_1943			TRUE	0.509	60.000	0.000	NA		NA
3710152	3710153	CKL_1943	CKL_1944			FALSE	0.331	103.000	0.000	NA		NA
3710153	3710154	CKL_1944	CKL_1945			FALSE	0.006	639.000	0.000	NA		NA
3710154	3710155	CKL_1945	CKL_1946			FALSE	0.351	99.000	0.000	NA		NA
3710157	3710158	CKL_1948	CKL_1949			FALSE	0.098	198.000	0.000	NA		NA
3710158	3710159	CKL_1949	CKL_1950			FALSE	0.031	291.000	0.000	NA		NA
3710159	3710160	CKL_1950	CKL_1951			TRUE	0.422	82.000	0.000	NA		NA
3710160	3710161	CKL_1951	CKL_1952			TRUE	0.951	46.000	0.231	NA		NA
3710161	3710162	CKL_1952	CKL_1953			TRUE	0.443	77.000	0.000	NA		NA
3710162	3710163	CKL_1953	CKL_1954			TRUE	0.997	19.000	0.750	NA		NA
3710163	3710164	CKL_1954	CKL_1955			TRUE	0.998	2.000	0.500	NA		NA
3710164	3710165	CKL_1955	CKL_1956			TRUE	0.998	4.000	0.667	NA		NA
3710165	3710166	CKL_1956	CKL_1957			TRUE	0.997	4.000	0.400	NA		NA
3710166	3710167	CKL_1957	CKL_1958			TRUE	0.998	-24.000	0.500	NA		NA
3710167	3710168	CKL_1958	CKL_1959			TRUE	0.998	-3.000	0.500	NA		NA
3710168	3710169	CKL_1959	CKL_1960			TRUE	0.616	46.000	0.000	NA		NA
3710169	3710170	CKL_1960	CKL_1961			TRUE	0.997	16.000	0.600	NA		NA
3710170	3710171	CKL_1961	CKL_1962			TRUE	0.883	21.000	0.000	NA		NA
3710171	3710172	CKL_1962	CKL_1963			TRUE	0.883	21.000	0.000	NA		NA
3710172	3710173	CKL_1963	CKL_1964			TRUE	0.929	12.000	0.000	NA		NA
3710173	3710174	CKL_1964	CKL_1965			TRUE	0.493	62.000	0.000	NA		NA
3710174	3710175	CKL_1965	CKL_1966			TRUE	0.938	6.000	0.000	NA		NA
3710175	3710176	CKL_1966	CKL_1967			TRUE	0.999	-7.000	0.800	NA		NA
3710176	3710177	CKL_1967	CKL_1968			TRUE	0.955	-9.000	0.000	NA		NA
3710177	3710178	CKL_1968	CKL_1969			TRUE	0.956	-10.000	0.000	1.000		NA
3710178	3710179	CKL_1969	CKL_1970			TRUE	0.437	79.000	0.000	NA		NA
3710180	3710181	CKL_1971	CKL_1972			FALSE	0.006	567.000	0.000	NA		NA
3710182	3710183	CKL_1973	CKL_1974			FALSE	0.268	119.000	0.000	NA		NA
3710183	3710184	CKL_1974	CKL_1975			FALSE	0.068	221.000	0.000	NA		NA
3710184	3710185	CKL_1975	CKL_1976			TRUE	0.594	49.000	0.000	NA		NA
3710185	3710186	CKL_1976	CKL_1977			TRUE	0.842	25.000	0.000	NA		NA
3710186	3710187	CKL_1977	CKL_1978			FALSE	0.085	208.000	0.000	NA		NA
3710187	3710188	CKL_1978	CKL_1979			TRUE	0.947	1.000	0.000	NA		NA
3710188	3710189	CKL_1979	CKL_1980			FALSE	0.151	164.000	0.000	NA		NA
3710189	3710190	CKL_1980	CKL_1981			TRUE	0.934	9.000	0.000	NA		NA
3710190	3710191	CKL_1981	CKL_1982			FALSE	0.026	308.000	0.000	NA		NA
3710191	3710192	CKL_1982	CKL_1983			TRUE	0.997	-7.000	0.294	NA		NA
3710192	3710193	CKL_1983	CKL_1984			FALSE	0.117	184.000	0.000	NA		NA
3710193	3710194	CKL_1984	CKL_1985			FALSE	0.040	269.000	0.000	NA		NA
3710194	3710195	CKL_1985	CKL_1986			TRUE	0.951	-3.000	0.000	NA		NA
3710195	3710196	CKL_1986	CKL_1987			TRUE	0.919	15.000	0.000	NA		NA
3710196	3710197	CKL_1987	CKL_1988			TRUE	0.478	66.000	0.000	NA		NA
3710197	3710198	CKL_1988	CKL_1989			TRUE	0.942	4.000	0.000	NA		NA
3710198	3710199	CKL_1989	CKL_1990			TRUE	0.942	4.000	0.000	NA		NA
3710199	3710200	CKL_1990	CKL_1991			TRUE	0.665	41.000	0.000	NA		NA
3710200	3710201	CKL_1991	CKL_1992			TRUE	0.949	0.000	0.000	NA		NA
3710201	3710202	CKL_1992	CKL_1993			TRUE	0.944	3.000	0.000	NA		NA
3710202	3710203	CKL_1993	CKL_1994			TRUE	0.944	3.000	0.000	NA		NA
3710203	3710204	CKL_1994	CKL_1995			FALSE	0.107	191.000	0.000	NA		NA
3710204	3710205	CKL_1995	CKL_1996			TRUE	0.942	4.000	0.000	NA		NA
3710205	3710206	CKL_1996	CKL_1997			TRUE	0.946	2.000	0.000	NA		NA
3710206	3710207	CKL_1997	CKL_1998			FALSE	0.129	176.000	0.000	NA		NA
3710207	3710208	CKL_1998	CKL_1999			TRUE	0.957	-37.000	0.000	NA		NA
3710208	3710209	CKL_1999	CKL_2000			TRUE	0.951	-3.000	0.000	NA		NA
3710209	3710210	CKL_2000	CKL_2001			TRUE	0.810	28.000	0.000	NA		NA
3710210	3710211	CKL_2001	CKL_2002			TRUE	0.936	7.000	0.000	NA		NA
3710211	3710212	CKL_2002	CKL_2003			TRUE	0.947	1.000	0.000	NA		NA
3710212	3710213	CKL_2003	CKL_2004			TRUE	0.951	-3.000	0.000	NA		NA
3710213	3710214	CKL_2004	CKL_2005			TRUE	0.929	12.000	0.000	NA		NA
3710214	3710215	CKL_2005	CKL_2006			TRUE	0.491	102.000	0.000	0.029		NA
3710216	3710217	CKL_2007	CKL_2008			TRUE	0.936	7.000	0.000	NA		NA
3710218	3710219	CKL_2009	CKL_2010			TRUE	0.949	0.000	0.000	NA		NA
3710222	3710223	CKL_2013	CKL_2014			TRUE	0.894	20.000	0.000	NA		NA
3710225	3710226	CKL_2016	CKL_2017			TRUE	0.376	93.000	0.000	NA		NA
3710226	3710227	CKL_2017	CKL_2018			TRUE	0.799	29.000	0.000	NA		NA
3710227	3710228	CKL_2018	CKL_2019			FALSE	0.047	252.000	0.000	NA		NA
3710230	3710231	CKL_2021	CKL_2022			FALSE	0.158	158.000	0.000	NA		NA
3710231	3710232	CKL_2022	CKL_2023			TRUE	0.516	59.000	0.000	NA		NA
3710232	3710233	CKL_2023	CKL_2024			TRUE	0.993	-25.000	0.100	1.000		NA
3710234	3710235	CKL_2025	CKL_2026			FALSE	0.221	129.000	0.000	NA		NA
3710236	3710237	CKL_2027	CKL_2028			FALSE	0.315	107.000	0.000	NA		NA
3710237	3710238	CKL_2028	CKL_2029			FALSE	0.208	132.000	0.000	NA		NA
3710239	3710240	CKL_2030	CKL_2031			TRUE	0.999	-7.000	0.869	1.000		NA
3710240	3710241	CKL_2031	CKL_2032		rbr1	FALSE	0.030	298.000	0.000	1.000		NA
3710242	3710243	CKL_2033	CKL_2034			FALSE	0.165	151.000	0.000	NA		NA
3710243	3710244	CKL_2034	CKL_2035			FALSE	0.007	556.000	0.000	NA		NA
3710245	3710246	CKL_2036	CKL_2037	gerKC3		FALSE	0.108	192.000	0.000	1.000		NA
3710248	3710249	CKL_2039	CKL_2040			FALSE	0.343	116.000	0.000	0.088	N	NA
3710249	3710250	CKL_2040	CKL_2041			FALSE	0.124	179.000	0.000	NA		NA
3710250	3710251	CKL_2041	CKL_2042			TRUE	0.416	83.000	0.000	NA		NA
3710253	3710254	CKL_2044	CKL_2045			TRUE	0.998	15.000	1.000	NA		NA
3710256	3710257	CKL_2047	CKL_2048			TRUE	0.602	48.000	0.000	NA		NA
3710257	3710258	CKL_2048	CKL_2049			TRUE	0.938	6.000	0.000	NA		NA
3710258	3710259	CKL_2049	CKL_2050			FALSE	0.189	137.000	0.000	NA		NA
3710259	3710260	CKL_2050	CKL_2051			TRUE	0.501	61.000	0.000	NA		NA
3710260	3710261	CKL_2051	CKL_2052			TRUE	0.995	6.000	0.250	NA		NA
3710261	3710262	CKL_2052	CKL_2053			FALSE	0.080	213.000	0.000	1.000		NA
3710262	3710263	CKL_2053	CKL_2054			TRUE	0.994	-7.000	0.141	NA		NA
3710263	3710264	CKL_2054	CKL_2055			FALSE	0.066	222.000	0.000	NA		NA
3710264	3710265	CKL_2055	CKL_2056			TRUE	0.741	35.000	0.000	NA		NA
3710265	3710266	CKL_2056	CKL_2057			TRUE	0.949	0.000	0.000	NA		NA
3710266	3710267	CKL_2057	CKL_2058			TRUE	0.951	-3.000	0.000	NA		NA
3710267	3710268	CKL_2058	CKL_2059			TRUE	0.997	0.000	0.429	NA		NA
3710268	3710269	CKL_2059	CKL_2060			TRUE	0.994	22.000	0.316	0.054		NA
3710269	3710270	CKL_2060	CKL_2061			TRUE	0.995	-117.000	0.105	0.054		NA
3710270	3710271	CKL_2061	CKL_2062			TRUE	0.854	24.000	0.000	NA		NA
3710271	3710272	CKL_2062	CKL_2063			TRUE	0.897	14.000	0.000	NA	N	NA
3710272	3710273	CKL_2063	CKL_2064			TRUE	0.907	12.000	0.000	1.000	N	NA
3710273	3710274	CKL_2064	CKL_2065			TRUE	0.761	28.000	0.000	1.000	N	NA
3710274	3710275	CKL_2065	CKL_2066			TRUE	0.836	22.000	0.000	1.000	N	NA
3710275	3710276	CKL_2066	CKL_2067			TRUE	0.978	35.000	0.048	0.024	Y	NA
3710276	3710277	CKL_2067	CKL_2068			TRUE	0.997	26.000	0.455	0.024	Y	NA
3710277	3710278	CKL_2068	CKL_2069			TRUE	0.834	51.000	0.000	1.000	Y	NA
3710280	3710281	CKL_2071	CKL_2072			FALSE	0.053	240.000	0.000	NA		NA
3710281	3710282	CKL_2072	CKL_2073			TRUE	0.999	-15.000	0.681	NA		NA
3710282	3710283	CKL_2073	CKL_2074			FALSE	0.011	431.000	0.000	NA		NA
3710283	3710284	CKL_2074	CKL_2075			TRUE	0.996	-28.000	0.200	NA		NA
3710284	3710285	CKL_2075	CKL_2076			FALSE	0.066	222.000	0.000	NA		NA
3710285	3710286	CKL_2076	CKL_2077			TRUE	0.998	-7.000	0.667	NA		NA
3710286	3710287	CKL_2077	CKL_2078			TRUE	0.956	-18.000	0.000	NA		NA
3710288	3710289	CKL_2079	CKL_2080			FALSE	0.336	102.000	0.000	NA		NA
3710289	3710290	CKL_2080	CKL_2081			FALSE	0.146	167.000	0.000	1.000		NA
3710290	3710291	CKL_2081	CKL_2082			TRUE	0.821	40.000	0.000	0.009		NA
3710292	3710293	CKL_2083	CKL_2084			FALSE	0.039	270.000	0.000	NA		NA
3710293	3710294	CKL_2084	CKL_2085			TRUE	0.732	36.000	0.000	NA		NA
3710294	3710295	CKL_2085	CKL_2086			TRUE	0.919	15.000	0.000	NA		NA
3710298	3710299	CKL_2089	CKL_2090			FALSE	0.007	546.000	0.000	NA		NA
3710299	3710300	CKL_2090	CKL_2091			TRUE	0.979	-19.000	0.000	0.009		NA
3710300	3710301	CKL_2091	CKL_2092			FALSE	0.208	132.000	0.000	NA		NA
3710302	3710303	CKL_2093	CKL_2094			TRUE	0.829	26.000	0.000	NA		NA
3710303	3710304	CKL_2094	CKL_2095			TRUE	0.915	59.000	0.190	NA		NA
3710304	3710305	CKL_2095	CKL_2096			TRUE	0.933	10.000	0.000	NA		NA
3710305	3710306	CKL_2096	CKL_2097			TRUE	0.475	67.000	0.000	NA		NA
3710306	3710307	CKL_2097	CKL_2098		capI	FALSE	0.029	424.000	0.000	0.002		NA
3710307	3710308	CKL_2098	CKL_2099	capI	rkpK	TRUE	0.986	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
3710308	3710309	CKL_2099	CKL_2100	rkpK		TRUE	0.896	20.000	0.000	1.000		NA
3710309	3710310	CKL_2100	CKL_2101			TRUE	0.937	40.000	0.065	0.043		NA
3710310	3710311	CKL_2101	CKL_2102		fabG2	TRUE	0.925	68.000	0.081	1.000	Y	NA
3710311	3710312	CKL_2102	CKL_2103	fabG2	ilvB2	TRUE	0.884	17.000	0.000	1.000	N	NA
3710312	3710313	CKL_2103	CKL_2104	ilvB2		TRUE	0.770	32.000	0.000	1.000		NA
3710313	3710314	CKL_2104	CKL_2105			TRUE	0.943	4.000	0.000	1.000		NA
3710314	3710315	CKL_2105	CKL_2106			TRUE	0.686	61.000	0.000	0.009		NA
3710315	3710316	CKL_2106	CKL_2107			TRUE	0.849	37.000	0.000	0.009		NA
3710316	3710317	CKL_2107	CKL_2108			TRUE	0.985	1.000	0.000	1.000	Y	NA
3710317	3710318	CKL_2108	CKL_2109			TRUE	0.940	28.000	0.000	1.000	Y	NA
3710318	3710319	CKL_2109	CKL_2110			TRUE	0.910	17.000	0.000	NA		NA
3710319	3710320	CKL_2110	CKL_2111			FALSE	0.297	112.000	0.000	NA		NA
3710320	3710321	CKL_2111	CKL_2112			FALSE	0.312	108.000	0.000	NA		NA
3710321	3710322	CKL_2112	CKL_2113		fliD	TRUE	0.938	29.000	0.043	NA		NA
3710322	3710323	CKL_2113	CKL_2114	fliD	fliS	TRUE	0.993	42.000	0.370	0.002	Y	NA
3710323	3710324	CKL_2114	CKL_2115	fliS		TRUE	0.636	128.000	0.093	NA		NA
3710324	3710325	CKL_2115	CKL_2116		flaG	FALSE	0.323	173.000	0.028	NA		NA
3710325	3710326	CKL_2116	CKL_2117	flaG		TRUE	0.951	21.000	0.028	NA	N	NA
3710326	3710327	CKL_2117	CKL_2118			TRUE	0.992	-6.000	0.096	NA		NA
3710327	3710328	CKL_2118	CKL_2119		flgL	TRUE	0.986	30.000	0.385	NA		NA
3710328	3710329	CKL_2119	CKL_2120	flgL		TRUE	0.539	56.000	0.000	NA		NA
3710329	3710330	CKL_2120	CKL_2121		flgK	FALSE	0.155	161.000	0.000	NA		NA
3710330	3710331	CKL_2121	CKL_2122	flgK		TRUE	0.712	135.000	0.082	0.002		NA
3710331	3710332	CKL_2122	CKL_2123		flgM	TRUE	0.994	28.000	0.421	0.002		NA
3710332	3710333	CKL_2123	CKL_2124	flgM	fliN	FALSE	0.064	225.000	0.000	1.000		NA
3710333	3710334	CKL_2124	CKL_2125	fliN	fliM	TRUE	1.000	-7.000	0.508	0.001	Y	NA
3710334	3710335	CKL_2125	CKL_2126	fliM	cheW2	TRUE	0.934	63.000	0.039	0.016	Y	NA
3710335	3710336	CKL_2126	CKL_2127	cheW2		TRUE	0.782	220.000	0.417	1.000	Y	NA
3710336	3710337	CKL_2127	CKL_2128		cheC	TRUE	0.976	35.000	0.082	NA	Y	NA
3710337	3710338	CKL_2128	CKL_2129	cheC	cheA2	TRUE	0.997	12.000	0.176	NA	Y	NA
3710338	3710339	CKL_2129	CKL_2130	cheA2	cheR	TRUE	0.994	13.000	0.081	1.000	Y	NA
3710339	3710340	CKL_2130	CKL_2131	cheR	cheB2	TRUE	0.996	6.000	0.107	1.000	Y	NA
3710340	3710341	CKL_2131	CKL_2132	cheB2	cheD	TRUE	0.988	23.000	0.070	1.000	Y	NA
3710341	3710342	CKL_2132	CKL_2133	cheD	cheW3	TRUE	0.983	26.000	0.063	1.000	Y	NA
3710342	3710343	CKL_2133	CKL_2134	cheW3		TRUE	0.864	93.000	0.231	1.000	N	NA
3710343	3710344	CKL_2134	CKL_2135		ilvE2	TRUE	0.975	12.000	0.037	1.000	N	NA
3710346	3710347	CKL_2137	CKL_2138			FALSE	0.259	200.000	0.032	NA		NA
3710347	3710348	CKL_2138	CKL_2139		murG1	FALSE	0.028	276.000	0.000	1.000	N	NA
3710348	3710349	CKL_2139	CKL_2140	murG1	recJ	FALSE	0.032	351.000	0.002	1.000	N	NA
3710349	3710350	CKL_2140	CKL_2141	recJ		TRUE	0.781	44.000	0.002	1.000		NA
3710350	3710351	CKL_2141	CKL_2142			TRUE	0.718	60.000	0.012	NA		NA
3710351	3710352	CKL_2142	CKL_2143		gyrA2	TRUE	0.966	17.000	0.020	NA		NA
3710352	3710353	CKL_2143	CKL_2144	gyrA2	gyrB2	TRUE	0.937	180.000	0.552	0.001	Y	NA
3710353	3710354	CKL_2144	CKL_2145	gyrB2		FALSE	0.240	112.000	0.000	1.000	N	NA
3710354	3710355	CKL_2145	CKL_2146			TRUE	0.998	-70.000	0.138	0.087	Y	NA
3710355	3710356	CKL_2146	CKL_2147			TRUE	0.487	124.000	0.023	1.000		NA
3710357	3710358	CKL_2148	CKL_2149			TRUE	0.894	20.000	0.000	NA		NA
3710358	3710359	CKL_2149	CKL_2150			TRUE	0.957	-76.000	0.000	NA		NA
3710359	3710360	CKL_2150	CKL_2151			TRUE	0.951	-3.000	0.000	NA		NA
3710360	3710361	CKL_2151	CKL_2152			TRUE	0.956	-19.000	0.000	NA		NA
3710362	3710363	CKL_2153	CKL_2154			TRUE	0.915	16.000	0.000	NA		NA
3710363	3710364	CKL_2154	CKL_2155			TRUE	0.997	-3.000	0.100	1.000	Y	NA
3710364	3710365	CKL_2155	CKL_2156			FALSE	0.132	148.000	0.000	1.000	N	NA
3710365	3710366	CKL_2156	CKL_2157		leuB	TRUE	0.582	42.000	0.000	1.000	N	NA
3710366	3710367	CKL_2157	CKL_2158	leuB	leuD	TRUE	0.999	-3.000	0.191	0.002	Y	NA
3710367	3710368	CKL_2158	CKL_2159	leuD	leuC	TRUE	1.000	2.000	0.615	0.001	Y	NA
3710368	3710369	CKL_2159	CKL_2160	leuC	leuA2	TRUE	0.975	47.000	0.086	0.002	Y	NA
3710369	3710370	CKL_2160	CKL_2161	leuA2		FALSE	0.005	588.000	0.000	1.000	N	NA
3710370	3710371	CKL_2161	CKL_2162			FALSE	0.112	188.000	0.000	1.000		NA
3710371	3710372	CKL_2162	CKL_2163			TRUE	0.901	19.000	0.000	NA		NA
3710372	3710373	CKL_2163	CKL_2164			TRUE	0.372	94.000	0.000	NA		NA
3710373	3710374	CKL_2164	CKL_2165			TRUE	0.598	173.000	0.182	NA		NA
3710374	3710375	CKL_2165	CKL_2166		ribH	FALSE	0.103	172.000	0.000	1.000	N	NA
3710375	3710376	CKL_2166	CKL_2167	ribH	ribAB	TRUE	0.992	23.000	0.054	0.001	Y	NA
3710376	3710377	CKL_2167	CKL_2168	ribAB	ribE	TRUE	0.896	77.000	0.051	1.000	Y	NA
3710377	3710378	CKL_2168	CKL_2169	ribE	ribD	TRUE	0.997	22.000	0.456	1.000	Y	NA
3710378	3710379	CKL_2169	CKL_2170	ribD		FALSE	0.007	539.000	0.000	NA		NA
3710379	3710380	CKL_2170	CKL_2171			FALSE	0.078	213.000	0.000	NA		NA
3710380	3710381	CKL_2171	CKL_2172			TRUE	0.996	38.000	0.600	0.007	Y	NA
3710383	3710384	CKL_2174	CKL_2175			TRUE	1.000	-24.000	0.857	1.000	Y	NA
3710384	3710385	CKL_2175	CKL_2176			TRUE	0.764	45.000	0.000	0.024		NA
3710385	3710386	CKL_2176	CKL_2177			TRUE	0.981	-28.000	0.000	0.005		NA
3710386	3710387	CKL_2177	CKL_2178			TRUE	0.526	228.000	0.333	1.000		NA
3710387	3710388	CKL_2178	CKL_2179			FALSE	0.168	130.000	0.000	NA	N	NA
3710388	3710389	CKL_2179	CKL_2180			TRUE	0.676	35.000	0.000	NA	N	NA
3710389	3710390	CKL_2180	CKL_2181			FALSE	0.006	576.000	0.000	NA		NA
3710392	3710393	CKL_2183	CKL_2184			TRUE	0.393	90.000	0.000	1.000		NA
3710393	3710394	CKL_2184	CKL_2185			TRUE	0.868	163.000	0.143	0.001	Y	NA
3710394	3710395	CKL_2185	CKL_2186			TRUE	0.974	17.000	0.056	1.000	N	NA
3710397	3710398	CKL_2188	CKL_2189			FALSE	0.238	126.000	0.000	1.000		NA
3710400	3710401	CKL_2191	CKL_2192			TRUE	0.963	25.000	0.070	NA		NA
3710401	3710402	CKL_2192	CKL_2193			TRUE	0.980	18.000	0.070	NA		NA
3710402	3710403	CKL_2193	CKL_2194			TRUE	0.585	50.000	0.000	NA		NA
3710404	3710405	CKL_2195	CKL_2196			FALSE	0.168	131.000	0.000	1.000	N	NA
3710406	3710407	CKL_2197	CKL_2198			TRUE	0.608	47.000	0.000	NA		NA
3710407	3710408	CKL_2198	CKL_2199			TRUE	0.896	119.000	0.500	NA		NA
3710410	3710411	CKL_2201	CKL_2202			TRUE	0.984	2.000	0.000	NA	Y	NA
3710411	3710412	CKL_2202	CKL_2203			FALSE	0.074	217.000	0.000	NA		NA
3710412	3710413	CKL_2203	CKL_2204		thyX	TRUE	0.938	6.000	0.000	NA		NA
3710415	3710416	CKL_2206	CKL_2207			TRUE	0.997	-18.000	0.312	NA	N	NA
3710416	3710417	CKL_2207	CKL_2208			TRUE	0.476	55.000	0.000	1.000	N	NA
3710417	3710418	CKL_2208	CKL_2209			FALSE	0.186	126.000	0.000	1.000	N	NA
3710420	3710421	CKL_2211	CKL_2212		htpG	FALSE	0.027	282.000	0.000	1.000	N	NA
3710421	3710422	CKL_2212	CKL_2213	htpG		FALSE	0.051	242.000	0.000	NA		NA
3710422	3710423	CKL_2213	CKL_2214			TRUE	0.994	-3.000	0.150	NA		NA
3710423	3710424	CKL_2214	CKL_2215			FALSE	0.103	195.000	0.000	NA		NA
3710424	3710425	CKL_2215	CKL_2216			FALSE	0.353	82.000	0.000	1.000	N	NA
3710426	3710427	CKL_2217	CKL_2218			TRUE	0.778	31.000	0.000	NA		NA
3710427	3710428	CKL_2218	CKL_2219			TRUE	0.951	-3.000	0.000	NA		NA
3710429	3710430	CKL_2220	CKL_2221			TRUE	0.991	17.000	0.217	1.000		NA
3710432	3710433	CKL_2223	CKL_2224			TRUE	0.639	157.000	0.167	1.000		NA
3710433	3710434	CKL_2224	CKL_2225			FALSE	0.278	101.000	0.000	1.000	N	NA
3710434	3710435	CKL_2225	CKL_2226			TRUE	0.810	28.000	0.000	NA		NA
3710435	3710436	CKL_2226	CKL_2227			FALSE	0.312	108.000	0.000	NA		NA
3710436	3710437	CKL_2227	CKL_2228			TRUE	0.829	26.000	0.000	NA		NA
3710437	3710438	CKL_2228	CKL_2229			TRUE	0.951	-3.000	0.000	NA		NA
3710444	3710445	CKL_2235	CKL_2236			TRUE	0.998	6.000	0.286	NA	Y	NA
3710445	3710446	CKL_2236	CKL_2237			FALSE	0.095	179.000	0.000	1.000	N	NA
3710446	3710447	CKL_2237	CKL_2238			FALSE	0.193	136.000	0.000	NA		NA
3710447	3710448	CKL_2238	CKL_2239			TRUE	0.955	-10.000	0.000	NA		NA
3710450	3710451	CKL_2241	CKL_2242			TRUE	0.975	3.000	0.000	0.004		NA
3710451	3710452	CKL_2242	CKL_2243			FALSE	0.035	284.000	0.000	NA		NA
3710452	3710453	CKL_2243	CKL_2244			TRUE	0.954	-7.000	0.000	NA		NA
3710453	3710454	CKL_2244	CKL_2245			FALSE	0.184	139.000	0.000	NA		NA
3710454	3710455	CKL_2245	CKL_2246			TRUE	0.669	56.000	0.000	0.069		NA
3710455	3710456	CKL_2246	CKL_2247			TRUE	0.446	76.000	0.000	NA		NA
3710457	3710458	CKL_2248	CKL_2249			TRUE	0.770	89.000	0.074	NA		NA
3710458	3710459	CKL_2249	CKL_2250			FALSE	0.013	409.000	0.000	NA		NA
3710460	3710461	CKL_2251	CKL_2252		ppk	FALSE	0.023	292.000	0.000	1.000	N	NA
3710461	3710462	CKL_2252	CKL_2253	ppk	ppx1	TRUE	0.991	21.000	0.093	1.000	Y	NA
3710463	3710464	CKL_2254	CKL_2255	ppx2		TRUE	0.472	69.000	0.000	1.000		NA
3710466	3710467	CKL_2257	CKL_2258			FALSE	0.021	344.000	0.000	NA		NA
3710467	3710468	CKL_2258	CKL_2259			TRUE	0.696	39.000	0.000	NA		NA
3710471	3710472	CKL_2262	CKL_2263			TRUE	0.999	-10.000	0.571	1.000	Y	NA
3710472	3710473	CKL_2263	CKL_2264			TRUE	0.610	56.000	0.000	0.086	N	NA
3710474	3710475	CKL_2265	CKL_2266			TRUE	0.755	34.000	0.000	1.000		NA
3710476	3710477	CKL_2267	CKL_2268		lpdA	FALSE	0.332	88.000	0.000	1.000	N	NA
3710477	3710478	CKL_2268	CKL_2269	lpdA	pdhC	TRUE	0.968	49.000	0.148	1.000	Y	NA
3710478	3710479	CKL_2269	CKL_2270	pdhC	pdhB	TRUE	0.921	40.000	0.000	0.054	Y	NA
3710479	3710480	CKL_2270	CKL_2271	pdhB	pdhA	TRUE	0.998	2.000	0.076	0.001	Y	NA
3710480	3710481	CKL_2271	CKL_2272	pdhA		FALSE	0.068	204.000	0.000	1.000	N	NA
3710481	3710482	CKL_2272	CKL_2273		lipA2	FALSE	0.125	156.000	0.000	1.000	N	NA
3710482	3710483	CKL_2273	CKL_2274	lipA2	lipB	TRUE	0.990	21.000	0.012	0.001	Y	NA
3710483	3710484	CKL_2274	CKL_2275	lipB		FALSE	0.084	209.000	0.000	NA		NA
3710484	3710485	CKL_2275	CKL_2276			TRUE	0.944	3.000	0.000	NA		NA
3710486	3710487	CKL_2277	CKL_2278			TRUE	0.422	82.000	0.000	NA		NA
3710487	3710488	CKL_2278	CKL_2279			TRUE	0.412	85.000	0.000	NA		NA
3710488	3710489	CKL_2279	CKL_2280			TRUE	0.942	4.000	0.000	NA		NA
3710489	3710490	CKL_2280	CKL_2281			FALSE	0.144	167.000	0.000	NA		NA
3710495	3710496	CKL_2286	CKL_2287			TRUE	0.732	36.000	0.000	NA		NA
3710496	3710497	CKL_2287	CKL_2288			FALSE	0.018	355.000	0.000	NA		NA
3710497	3710498	CKL_2288	CKL_2289			TRUE	0.991	4.000	0.111	NA		NA
3710499	3710500	CKL_2290	CKL_2291			TRUE	0.991	2.000	0.118	1.000	N	NA
3710500	3710501	CKL_2291	CKL_2292			TRUE	0.998	0.000	0.636	1.000	N	NA
3710503	3710504	CKL_2294	CKL_2295			TRUE	0.462	119.000	0.000	0.004		NA
3710504	3710505	CKL_2295	CKL_2296			TRUE	0.757	52.000	0.000	0.004		NA
3710506	3710507	CKL_2297	CKL_2298			FALSE	0.249	124.000	0.000	1.000		NA
3710507	3710508	CKL_2298	CKL_2299			FALSE	0.059	231.000	0.000	NA		NA
3710508	3710509	CKL_2299	CKL_2300			TRUE	0.946	2.000	0.000	NA		NA
3710509	3710510	CKL_2300	CKL_2301			TRUE	0.767	32.000	0.000	NA		NA
3710510	3710511	CKL_2301	CKL_2302			TRUE	0.999	-7.000	0.833	NA		NA
3710511	3710512	CKL_2302	CKL_2303			FALSE	0.057	216.000	0.000	1.000	N	NA
3710512	3710513	CKL_2303	CKL_2304			FALSE	0.023	324.000	0.000	1.000		NA
3710513	3710514	CKL_2304	CKL_2305			FALSE	0.302	112.000	0.000	1.000		NA
3710514	3710515	CKL_2305	CKL_2306			TRUE	0.952	-3.000	0.000	1.000		NA
3710515	3710516	CKL_2306	CKL_2307			TRUE	0.921	22.000	0.003	1.000	N	NA
3710516	3710517	CKL_2307	CKL_2308		rotA	FALSE	0.059	214.000	0.000	1.000	N	NA
3710518	3710519	CKL_2309	CKL_2310		asn	FALSE	0.020	651.000	0.000	1.000	Y	NA
3710520	3710521	CKL_2311	CKL_2312		uppP	FALSE	0.064	272.000	0.000	0.086		NA
3710521	3710522	CKL_2312	CKL_2313	uppP		FALSE	0.015	386.000	0.000	NA		NA
3710522	3710523	CKL_2313	CKL_2314			FALSE	0.004	988.000	0.000	NA		NA
3710523	3710524	CKL_2314	CKL_2315			FALSE	0.004	865.000	0.000	NA		NA
3710526	3710527	CKL_2317	CKL_2318			TRUE	0.467	69.000	0.000	NA		NA
3710527	3710528	CKL_2318	CKL_2319			TRUE	0.737	30.000	0.000	1.000	N	NA
3710528	3710529	CKL_2319	CKL_2320			TRUE	0.991	17.000	0.200	NA		NA
3710529	3710530	CKL_2320	CKL_2321			TRUE	0.998	-16.000	0.500	NA		NA
3710530	3710531	CKL_2321	CKL_2322			TRUE	0.925	87.000	0.429	1.000	N	NA
3710532	3710533	CKL_2323	CKL_2324			FALSE	0.021	337.000	0.000	NA		NA
3710533	3710534	CKL_2324	CKL_2325			TRUE	0.957	-115.000	0.000	NA		NA
3710537	3710538	CKL_2328	CKL_2329			TRUE	0.608	47.000	0.000	NA		NA
3710538	3710539	CKL_2329	CKL_2330		hydF	FALSE	0.038	276.000	0.000	1.000		NA
3710539	3710540	CKL_2330	CKL_2331	hydF	aspA2	TRUE	0.899	64.000	0.171	1.000		NA
3710540	3710541	CKL_2331	CKL_2332	aspA2		TRUE	0.683	40.000	0.000	1.000		NA
3710541	3710542	CKL_2332	CKL_2333			TRUE	0.437	79.000	0.000	NA		NA
3710542	3710543	CKL_2333	CKL_2334			TRUE	0.412	85.000	0.000	NA		NA
3710543	3710544	CKL_2334	CKL_2335		clpA	FALSE	0.011	434.000	0.000	NA		NA
3710544	3710545	CKL_2335	CKL_2336	clpA	clpS	TRUE	0.998	6.000	0.596	NA		NA
3710545	3710546	CKL_2336	CKL_2337	clpS	dnaK6	FALSE	0.168	149.000	0.000	NA		NA
3710546	3710547	CKL_2337	CKL_2338	dnaK6	dnaK7	TRUE	0.972	18.000	0.000	NA	Y	NA
3710547	3710548	CKL_2338	CKL_2339	dnaK7		TRUE	0.639	43.000	0.000	NA		NA
3710548	3710549	CKL_2339	CKL_2340		dnaK8	TRUE	0.921	15.000	0.000	1.000		NA
3710549	3710550	CKL_2340	CKL_2341	dnaK8	dnaK9	TRUE	0.996	11.000	0.050	0.003	Y	NA
3710550	3710551	CKL_2341	CKL_2342	dnaK9		FALSE	0.015	345.000	0.000	1.000	N	NA
3710551	3710552	CKL_2342	CKL_2343			FALSE	0.165	151.000	0.000	NA		NA
3710554	3710555	CKL_2345	CKL_2346			TRUE	0.938	6.000	0.000	NA		NA
3710555	3710556	CKL_2346	CKL_2347			FALSE	0.032	290.000	0.000	NA		NA
3710556	3710557	CKL_2347	CKL_2348			FALSE	0.014	395.000	0.000	NA		NA
3710557	3710558	CKL_2348	CKL_2349			FALSE	0.154	135.000	0.000	1.000	N	NA
3710558	3710559	CKL_2349	CKL_2350			TRUE	0.999	-3.000	0.750	1.000	Y	NA
3710559	3710560	CKL_2350	CKL_2351			FALSE	0.181	234.000	0.000	1.000	Y	NA
3710560	3710561	CKL_2351	CKL_2352			FALSE	0.151	164.000	0.000	NA		NA
3710561	3710562	CKL_2352	CKL_2353			FALSE	0.161	155.000	0.000	NA		NA
3710562	3710563	CKL_2353	CKL_2354			TRUE	0.696	39.000	0.000	NA		NA
3710563	3710564	CKL_2354	CKL_2355			TRUE	0.861	37.000	0.000	0.003		NA
3710564	3710565	CKL_2355	CKL_2356			TRUE	0.755	34.000	0.000	1.000		NA
3710565	3710566	CKL_2356	CKL_2357			TRUE	0.980	11.000	0.000	1.000	Y	NA
3710566	3710567	CKL_2357	CKL_2358			TRUE	0.472	69.000	0.000	1.000		NA
3710567	3710568	CKL_2358	CKL_2359			TRUE	0.987	33.000	0.500	1.000		NA
3710568	3710569	CKL_2359	CKL_2360			TRUE	0.963	25.000	0.083	1.000	N	NA
3710569	3710570	CKL_2360	CKL_2361			FALSE	0.039	272.000	0.000	NA		NA
3710570	3710571	CKL_2361	CKL_2362			TRUE	0.998	-7.000	0.471	NA		NA
3710571	3710572	CKL_2362	CKL_2363			TRUE	0.993	3.000	0.165	1.000	N	NA
3710572	3710573	CKL_2363	CKL_2364			FALSE	0.162	153.000	0.000	NA		NA
3710573	3710574	CKL_2364	CKL_2365			FALSE	0.151	164.000	0.000	NA		NA
3710575	3710576	CKL_2366	CKL_2367			TRUE	0.939	6.000	0.000	1.000		NA
3710577	3710578	CKL_2368	CKL_2369			FALSE	0.047	254.000	0.000	1.000		NA
3710578	3710579	CKL_2369	CKL_2370			FALSE	0.167	150.000	0.000	NA		NA
3710579	3710580	CKL_2370	CKL_2371			TRUE	0.767	120.000	0.167	NA		NA
3710580	3710581	CKL_2371	CKL_2372			FALSE	0.124	179.000	0.000	NA		NA
3710583	3710584	CKL_2374	CKL_2375	carB2	carA2	TRUE	0.990	22.000	0.017	0.001	Y	NA
3710584	3710585	CKL_2375	CKL_2376	carA2	argF	TRUE	0.977	15.000	0.000	1.000	Y	NA
3710585	3710586	CKL_2376	CKL_2377	argF		TRUE	0.974	17.000	0.000	1.000	Y	NA
3710586	3710587	CKL_2377	CKL_2378			FALSE	0.018	322.000	0.000	1.000	N	NA
3710587	3710588	CKL_2378	CKL_2379		recQ	TRUE	0.936	-3.000	0.000	1.000	N	NA
3710588	3710589	CKL_2379	CKL_2380	recQ		FALSE	0.277	117.000	0.000	NA		NA
3710589	3710590	CKL_2380	CKL_2381			FALSE	0.302	111.000	0.000	NA		NA
3710592	3710593	CKL_2383	CKL_2384			FALSE	0.262	121.000	0.000	1.000		NA
3710593	3710594	CKL_2384	CKL_2385			FALSE	0.030	298.000	0.000	1.000		NA
3710594	3710595	CKL_2385	CKL_2386			TRUE	0.961	94.000	0.750	0.084	N	NA
3710596	3710597	CKL_2387	CKL_2388			FALSE	0.073	218.000	0.000	NA		NA
3710597	3710598	CKL_2388	CKL_2389			FALSE	0.007	555.000	0.000	NA		NA
3710598	3710599	CKL_2389	CKL_2390			TRUE	0.979	6.000	0.027	NA		NA
3710600	3710601	CKL_2391	CKL_2392			FALSE	0.110	188.000	0.000	NA		NA
3710601	3710602	CKL_2392	CKL_2393			TRUE	0.998	8.000	0.270	1.000	Y	NA
3710602	3710603	CKL_2393	CKL_2394			TRUE	1.000	-70.000	0.646	0.023	Y	NA
3710603	3710604	CKL_2394	CKL_2395			TRUE	0.376	76.000	0.000	1.000	N	NA
3710604	3710605	CKL_2395	CKL_2396			TRUE	0.984	13.000	0.085	NA	N	NA
3710605	3710606	CKL_2396	CKL_2397			TRUE	0.990	-34.000	0.063	NA		NA
3710606	3710607	CKL_2397	CKL_2398			FALSE	0.239	125.000	0.000	NA		NA
3710607	3710608	CKL_2398	CKL_2399		pyrD1	FALSE	0.208	132.000	0.000	NA		NA
3710608	3710609	CKL_2399	CKL_2400	pyrD1		TRUE	0.998	1.000	0.301	0.023		NA
3710609	3710610	CKL_2400	CKL_2401			TRUE	0.813	28.000	0.000	1.000		NA
3710610	3710611	CKL_2401	CKL_2402			TRUE	0.972	30.000	0.034	1.000	Y	NA
3710611	3710612	CKL_2402	CKL_2403		amaB	TRUE	0.858	40.000	0.034	1.000	N	NA
3710612	3710613	CKL_2403	CKL_2404	amaB		FALSE	0.171	130.000	0.000	1.000	N	NA
3710613	3710614	CKL_2404	CKL_2405		dhaT1	TRUE	0.992	12.000	0.222	1.000	N	NA
3710614	3710615	CKL_2405	CKL_2406	dhaT1		FALSE	0.046	229.000	0.000	1.000	N	NA
3710615	3710616	CKL_2406	CKL_2407		speB	FALSE	0.052	221.000	0.000	1.000	N	NA
3710616	3710617	CKL_2407	CKL_2408	speB	maeB	FALSE	0.092	181.000	0.000	1.000	N	NA
3710617	3710618	CKL_2408	CKL_2409	maeB		FALSE	0.319	107.000	0.000	1.000		NA
3710618	3710619	CKL_2409	CKL_2410			FALSE	0.325	104.000	0.000	NA		NA
3710619	3710620	CKL_2410	CKL_2411		rnz	FALSE	0.147	166.000	0.000	NA		NA
3710620	3710621	CKL_2411	CKL_2412	rnz		FALSE	0.146	167.000	0.000	1.000		NA
3710621	3710622	CKL_2412	CKL_2413			FALSE	0.287	116.000	0.000	1.000		NA
3710622	3710623	CKL_2413	CKL_2414		pdxT	FALSE	0.112	166.000	0.000	NA	N	NA
3710623	3710624	CKL_2414	CKL_2415	pdxT	pdxS	TRUE	0.999	4.000	0.488	NA	Y	NA
3710624	3710625	CKL_2415	CKL_2416	pdxS		FALSE	0.149	166.000	0.000	1.000		NA
3710626	3710627	CKL_2417	CKL_2418			FALSE	0.353	82.000	0.000	1.000	N	NA
3710630	3710631	CKL_2421	CKL_2422			FALSE	0.056	235.000	0.000	NA		NA
3710631	3710632	CKL_2422	CKL_2423			TRUE	0.956	-13.000	0.000	NA		NA
3710632	3710633	CKL_2423	CKL_2424			FALSE	0.286	115.000	0.000	NA		NA
3710635	3710636	CKL_2426	CKL_2427			FALSE	0.061	231.000	0.000	1.000		NA
3710637	3710638	CKL_2428	CKL_2429			FALSE	0.049	246.000	0.000	NA		NA
3710638	3710639	CKL_2429	CKL_2430			FALSE	0.008	494.000	0.000	NA		NA
3710639	3710640	CKL_2430	CKL_2431			FALSE	0.162	154.000	0.000	NA		NA
3710641	3710642	CKL_2432	CKL_2433			TRUE	0.790	30.000	0.000	NA		NA
3710643	3710644	CKL_2434	CKL_2435	msrB		FALSE	0.158	158.000	0.000	NA		NA
3710645	3710646	CKL_2436	CKL_2437			TRUE	0.788	85.000	0.000	0.066	Y	NA
3710646	3710647	CKL_2437	CKL_2438			TRUE	0.990	25.000	0.125	1.000	Y	NA
3710648	3710649	CKL_2439	CKL_2440			TRUE	0.451	130.000	0.038	1.000	N	NA
3710651	3710652	CKL_2442	CKL_2443	hcp		FALSE	0.033	288.000	0.000	NA		NA
3710652	3710653	CKL_2443	CKL_2444			TRUE	0.942	4.000	0.000	NA		NA
3710654	3710655	CKL_2445	CKL_2446			TRUE	1.000	-7.000	0.667	0.007	Y	NA
3710655	3710656	CKL_2446	CKL_2447			FALSE	0.137	144.000	0.000	1.000	N	NA
3710656	3710657	CKL_2447	CKL_2448			FALSE	0.118	183.000	0.000	NA		NA
3710658	3710659	CKL_2449	CKL_2450			FALSE	0.008	522.000	0.000	NA		NA
3710660	3710661	CKL_2451	CKL_2452			TRUE	0.994	0.000	0.182	NA		NA
3710661	3710662	CKL_2452	CKL_2453			TRUE	0.991	16.000	0.184	NA		NA
3710662	3710663	CKL_2453	CKL_2454			FALSE	0.181	141.000	0.000	NA		NA
3710663	3710664	CKL_2454	CKL_2455			TRUE	0.995	25.000	0.137	0.002	Y	NA
3710664	3710665	CKL_2455	CKL_2456			TRUE	0.367	79.000	0.000	1.000	N	NA
3710665	3710666	CKL_2456	CKL_2457			TRUE	0.639	43.000	0.000	NA		NA
3710666	3710667	CKL_2457	CKL_2458			FALSE	0.149	165.000	0.000	NA		NA
3710667	3710668	CKL_2458	CKL_2459		nifE1	FALSE	0.147	166.000	0.000	NA		NA
3710668	3710669	CKL_2459	CKL_2460	nifE1	nifE2	TRUE	1.000	-19.000	1.000	0.039	Y	NA
3710669	3710670	CKL_2460	CKL_2461	nifE2	nifH3	TRUE	0.998	-3.000	0.571	0.051	N	NA
3710670	3710671	CKL_2461	CKL_2462	nifH3		FALSE	0.339	86.000	0.000	1.000	N	NA
3710671	3710672	CKL_2462	CKL_2463		sugE	FALSE	0.206	121.000	0.000	1.000	N	NA
3710674	3710675	CKL_2465	CKL_2466		neuA	TRUE	0.910	17.000	0.000	NA		NA
3710675	3710676	CKL_2466	CKL_2467	neuA		TRUE	0.937	40.000	0.013	1.000	Y	NA
3710676	3710677	CKL_2467	CKL_2468			TRUE	0.974	17.000	0.000	1.000	Y	NA
3710677	3710678	CKL_2468	CKL_2469			TRUE	0.721	37.000	0.000	NA		NA
3710678	3710679	CKL_2469	CKL_2470			TRUE	0.988	-7.000	0.046	NA		NA
3710679	3710680	CKL_2470	CKL_2471			TRUE	0.955	-10.000	0.000	NA		NA
3710680	3710681	CKL_2471	CKL_2472			TRUE	0.894	20.000	0.000	NA		NA
3710681	3710682	CKL_2472	CKL_2473			TRUE	0.980	-7.000	0.008	1.000		NA
3710682	3710683	CKL_2473	CKL_2474		rfbB	TRUE	0.527	58.000	0.000	1.000		NA
3710683	3710684	CKL_2474	CKL_2475	rfbB		TRUE	0.778	31.000	0.000	NA		NA
3710684	3710685	CKL_2475	CKL_2476			TRUE	0.907	18.000	0.000	NA		NA
3710685	3710686	CKL_2476	CKL_2477			TRUE	0.957	-63.000	0.000	NA		NA
3710686	3710687	CKL_2477	CKL_2478			TRUE	0.954	-7.000	0.000	NA		NA
3710687	3710688	CKL_2478	CKL_2479			TRUE	0.585	50.000	0.000	NA		NA
3710688	3710689	CKL_2479	CKL_2480			TRUE	0.855	186.000	1.000	NA		NA
3710689	3710690	CKL_2480	CKL_2481			TRUE	0.412	85.000	0.000	NA		NA
3710690	3710691	CKL_2481	CKL_2482			TRUE	0.380	92.000	0.000	NA		NA
3710691	3710692	CKL_2482	CKL_2483			FALSE	0.348	83.000	0.000	1.000	N	NA
3710692	3710693	CKL_2483	CKL_2484			FALSE	0.006	497.000	0.000	1.000	N	NA
3710693	3710694	CKL_2484	CKL_2485			TRUE	0.643	70.000	0.000	0.013		NA
3710694	3710695	CKL_2485	CKL_2486			FALSE	0.005	735.000	0.000	NA		NA
3710695	3710696	CKL_2486	CKL_2487			TRUE	0.998	-3.000	0.569	NA		NA
3710696	3710697	CKL_2487	CKL_2488			TRUE	0.992	0.000	0.118	NA		NA
3710697	3710698	CKL_2488	CKL_2489			TRUE	0.994	0.000	0.167	NA		NA
3710698	3710699	CKL_2489	CKL_2490			FALSE	0.015	387.000	0.000	1.000		NA
3710699	3710700	CKL_2490	CKL_2491			TRUE	0.981	0.000	0.033	1.000	N	NA
3710700	3710701	CKL_2491	CKL_2492			TRUE	0.991	1.000	0.095	1.000		NA
3710701	3710702	CKL_2492	CKL_2493			TRUE	0.455	73.000	0.000	NA		NA
3710702	3710703	CKL_2493	CKL_2494			FALSE	0.012	422.000	0.000	NA		NA
3710704	3710705	CKL_2495	CKL_2496		phzA	FALSE	0.219	118.000	0.000	1.000	N	NA
3710706	3710707	CKL_2497	CKL_2498			TRUE	0.999	6.000	0.682	1.000	Y	NA
3710707	3710708	CKL_2498	CKL_2499			TRUE	0.998	6.000	0.115	0.010	Y	NA
3710708	3710709	CKL_2499	CKL_2500			FALSE	0.175	146.000	0.000	1.000		NA
3710709	3710710	CKL_2500	CKL_2501			FALSE	0.330	104.000	0.000	1.000		NA
3710710	3710711	CKL_2501	CKL_2502			FALSE	0.035	285.000	0.000	1.000		NA
3710713	3710714	CKL_2504	CKL_2505			FALSE	0.072	219.000	0.000	NA		NA
3710714	3710715	CKL_2505	CKL_2506			TRUE	0.967	29.000	0.000	0.001	Y	NA
3710715	3710716	CKL_2506	CKL_2507			TRUE	0.940	28.000	0.000	1.000	Y	NA
3710716	3710717	CKL_2507	CKL_2508			TRUE	0.981	8.000	0.000	1.000	Y	NA
3710717	3710718	CKL_2508	CKL_2509			TRUE	0.724	31.000	0.000	1.000	N	NA
3710718	3710719	CKL_2509	CKL_2510			TRUE	1.000	-3.000	0.750	0.039	Y	NA
3710719	3710720	CKL_2510	CKL_2511			FALSE	0.020	351.000	0.000	1.000		NA
3710720	3710721	CKL_2511	CKL_2512			FALSE	0.007	544.000	0.000	1.000		NA
3710721	3710722	CKL_2512	CKL_2513			TRUE	0.799	29.000	0.000	NA		NA
3710722	3710723	CKL_2513	CKL_2514			FALSE	0.006	585.000	0.000	NA		NA
3710723	3710724	CKL_2514	CKL_2515			TRUE	0.863	23.000	0.000	NA		NA
3710724	3710725	CKL_2515	CKL_2516			TRUE	0.476	68.000	0.000	1.000		NA
3710725	3710726	CKL_2516	CKL_2517			FALSE	0.016	339.000	0.000	1.000	N	NA
3710726	3710727	CKL_2517	CKL_2518			FALSE	0.006	630.000	0.000	NA		NA
3710727	3710728	CKL_2518	CKL_2519			FALSE	0.005	795.000	0.000	NA		NA
3710728	3710729	CKL_2519	CKL_2520			FALSE	0.086	207.000	0.000	NA		NA
3710729	3710730	CKL_2520	CKL_2521			FALSE	0.340	101.000	0.000	NA		NA
3710730	3710731	CKL_2521	CKL_2522			FALSE	0.031	266.000	0.000	1.000	N	NA
3710731	3710732	CKL_2522	CKL_2523			TRUE	0.532	201.000	0.135	0.070		NA
3710732	3710733	CKL_2523	CKL_2524			TRUE	0.472	69.000	0.000	1.000		NA
3710733	3710734	CKL_2524	CKL_2525			TRUE	0.836	22.000	0.000	1.000	N	NA
3710734	3710735	CKL_2525	CKL_2526			TRUE	0.999	-7.000	0.869	1.000		NA
3710736	3710737	CKL_2527	CKL_2528	crt2		FALSE	0.168	151.000	0.000	1.000		NA
3710738	3710739	CKL_2529	CKL_2530			FALSE	0.013	415.000	0.000	1.000		NA
3710739	3710740	CKL_2530	CKL_2531			TRUE	0.921	15.000	0.000	1.000		NA
3710742	3710743	CKL_2533	CKL_2534	arsC		TRUE	0.872	19.000	0.000	1.000	N	NA
3710743	3710744	CKL_2534	CKL_2535			TRUE	0.907	12.000	0.000	1.000	N	NA
3710744	3710745	CKL_2535	CKL_2536			FALSE	0.015	391.000	0.000	1.000		NA
3710745	3710746	CKL_2536	CKL_2537			TRUE	0.607	48.000	0.000	1.000		NA
3710746	3710747	CKL_2537	CKL_2538			FALSE	0.004	1014.000	0.000	1.000		NA
3710747	3710748	CKL_2538	CKL_2539			TRUE	0.532	201.000	0.135	0.070		NA
3710748	3710749	CKL_2539	CKL_2540			FALSE	0.023	325.000	0.000	NA		NA
3710749	3710750	CKL_2540	CKL_2541			TRUE	0.829	26.000	0.000	NA		NA
3710750	3710751	CKL_2541	CKL_2542			TRUE	0.998	-7.000	0.643	NA		NA
3710751	3710752	CKL_2542	CKL_2543			FALSE	0.007	554.000	0.000	NA		NA
3710754	3710755	CKL_2545	CKL_2546			TRUE	0.924	14.000	0.000	1.000		NA
3710755	3710756	CKL_2546	CKL_2547			FALSE	0.108	169.000	0.000	1.000	N	NA
3710756	3710757	CKL_2547	CKL_2548			TRUE	0.999	-3.000	0.308	1.000	Y	NA
3710757	3710758	CKL_2548	CKL_2549			FALSE	0.307	214.000	0.000	0.066	Y	NA
3710758	3710759	CKL_2549	CKL_2550			TRUE	0.457	72.000	0.000	NA		NA
3710759	3710760	CKL_2550	CKL_2551			FALSE	0.351	99.000	0.000	NA		NA
3710760	3710761	CKL_2551	CKL_2552			FALSE	0.111	187.000	0.000	NA		NA
3710761	3710762	CKL_2552	CKL_2553			FALSE	0.258	121.000	0.000	NA		NA
3710762	3710763	CKL_2553	CKL_2554			FALSE	0.012	417.000	0.000	NA		NA
3710763	3710764	CKL_2554	CKL_2555			TRUE	0.974	-3.000	0.000	0.039		NA
3710764	3710765	CKL_2555	CKL_2556			FALSE	0.090	203.000	0.000	NA		NA
3710765	3710766	CKL_2556	CKL_2557			FALSE	0.044	259.000	0.000	NA		NA
3710766	3710767	CKL_2557	CKL_2558			FALSE	0.160	156.000	0.000	NA		NA
3710767	3710768	CKL_2558	CKL_2559			FALSE	0.005	836.000	0.000	NA		NA
3710768	3710769	CKL_2559	CKL_2560			FALSE	0.239	125.000	0.000	NA		NA
3710769	3710770	CKL_2560	CKL_2561			FALSE	0.338	137.000	0.005	NA		NA
3710770	3710771	CKL_2561	CKL_2562			TRUE	0.951	-3.000	0.000	NA		NA
3710771	3710772	CKL_2562	CKL_2563			FALSE	0.026	311.000	0.000	NA		NA
3710772	3710773	CKL_2563	CKL_2564			FALSE	0.331	103.000	0.000	NA		NA
3710773	3710774	CKL_2564	CKL_2565			TRUE	0.624	45.000	0.000	NA		NA
3710774	3710775	CKL_2565	CKL_2566			TRUE	0.936	7.000	0.000	NA		NA
3710775	3710776	CKL_2566	CKL_2567			FALSE	0.319	107.000	0.000	1.000		NA
3710776	3710777	CKL_2567	CKL_2568			TRUE	0.931	11.000	0.000	NA		NA
3710777	3710778	CKL_2568	CKL_2569			FALSE	0.018	355.000	0.000	NA		NA
3710778	3710779	CKL_2569	CKL_2570			FALSE	0.168	151.000	0.000	1.000		NA
3710779	3710780	CKL_2570	CKL_2571			TRUE	0.982	-72.000	0.000	0.003		NA
3710780	3710781	CKL_2571	CKL_2572			FALSE	0.101	197.000	0.000	1.000		NA
3710782	3710783	CKL_2573	CKL_2574			TRUE	0.939	20.000	0.000	0.050		NA
3710783	3710784	CKL_2574	CKL_2575			TRUE	0.759	33.000	0.000	NA		NA
3710784	3710785	CKL_2575	CKL_2576			TRUE	0.616	46.000	0.000	NA		NA
3710786	3710787	CKL_2577	CKL_2578			FALSE	0.114	331.000	0.000	0.023	Y	NA
3710787	3710788	CKL_2578	CKL_2579			FALSE	0.149	166.000	0.000	1.000		NA
3710788	3710789	CKL_2579	CKL_2580			FALSE	0.160	156.000	0.000	NA		NA
3710789	3710790	CKL_2580	CKL_2581			TRUE	0.955	-10.000	0.000	NA		NA
3710790	3710791	CKL_2581	CKL_2582			FALSE	0.010	470.000	0.000	1.000		NA
3710791	3710792	CKL_2582	CKL_2583			FALSE	0.006	571.000	0.000	1.000		NA
3710792	3710793	CKL_2583	CKL_2584			TRUE	0.782	31.000	0.000	1.000		NA
3710793	3710794	CKL_2584	CKL_2585			FALSE	0.042	262.000	0.000	NA		NA
3710794	3710795	CKL_2585	CKL_2586			FALSE	0.019	354.000	0.000	NA		NA
3710796	3710797	CKL_2587	CKL_2588			TRUE	0.956	-15.000	0.000	NA		NA
3710798	3710799	CKL_2589	CKL_2590			TRUE	0.957	-25.000	0.000	NA		NA
3710799	3710800	CKL_2590	CKL_2591			FALSE	0.053	239.000	0.000	NA		NA
3710800	3710801	CKL_2591	CKL_2592			FALSE	0.245	124.000	0.000	NA		NA
3710801	3710802	CKL_2592	CKL_2593			TRUE	0.955	36.000	0.074	0.037		NA
3710804	3710805	CKL_2595	CKL_2596			TRUE	0.957	75.000	0.095	0.001	Y	NA
3710805	3710806	CKL_2596	CKL_2597			TRUE	0.996	-3.000	0.104	0.001		NA
3710806	3710807	CKL_2597	CKL_2598			FALSE	0.155	161.000	0.000	NA		NA
3710807	3710808	CKL_2598	CKL_2599			TRUE	0.922	14.000	0.000	NA		NA
3710809	3710810	CKL_2600	CKL_2601			TRUE	0.380	92.000	0.000	NA		NA
3710811	3710812	CKL_2602	CKL_2603			FALSE	0.315	107.000	0.000	NA		NA
3710812	3710813	CKL_2603	CKL_2604			TRUE	0.585	50.000	0.000	NA		NA
3710815	3710816	CKL_2606	CKL_2607			FALSE	0.097	199.000	0.000	NA		NA
3710816	3710817	CKL_2607	CKL_2608			TRUE	0.926	13.000	0.000	NA		NA
3710817	3710818	CKL_2608	CKL_2609			TRUE	0.956	-16.000	0.000	NA		NA
3710818	3710819	CKL_2609	CKL_2610			FALSE	0.153	163.000	0.000	NA		NA
3710819	3710820	CKL_2610	CKL_2611			TRUE	0.998	-3.000	0.700	NA		NA
3710820	3710821	CKL_2611	CKL_2612			TRUE	0.754	145.000	0.333	1.000	N	NA
3710821	3710822	CKL_2612	CKL_2613			TRUE	0.999	-13.000	0.583	1.000	Y	NA
3710822	3710823	CKL_2613	CKL_2614			FALSE	0.044	259.000	0.000	1.000		NA
3710823	3710824	CKL_2614	CKL_2615			TRUE	0.881	73.000	0.154	1.000		NA
3710824	3710825	CKL_2615	CKL_2616			TRUE	0.878	44.000	0.017	0.051		NA
3710825	3710826	CKL_2616	CKL_2617			TRUE	0.987	-19.000	0.035	1.000		NA
3710826	3710827	CKL_2617	CKL_2618			FALSE	0.060	232.000	0.000	1.000		NA
3710827	3710828	CKL_2618	CKL_2619			FALSE	0.293	114.000	0.000	1.000		NA
3710828	3710829	CKL_2619	CKL_2620			FALSE	0.012	431.000	0.000	1.000		NA
3710829	3710830	CKL_2620	CKL_2621			TRUE	0.997	4.000	0.500	NA		NA
3710830	3710831	CKL_2621	CKL_2622			TRUE	0.998	1.000	0.600	NA		NA
3710831	3710832	CKL_2622	CKL_2623			TRUE	0.990	35.000	0.750	NA		NA
3710832	3710833	CKL_2623	CKL_2624			TRUE	0.670	197.000	0.375	NA		NA
3710833	3710834	CKL_2624	CKL_2625			TRUE	0.907	18.000	0.000	NA		NA
3710834	3710835	CKL_2625	CKL_2626			TRUE	0.951	-3.000	0.000	NA		NA
3710835	3710836	CKL_2626	CKL_2627			TRUE	0.412	85.000	0.000	NA		NA
3710836	3710837	CKL_2627	CKL_2628			TRUE	0.929	12.000	0.000	NA		NA
3710837	3710838	CKL_2628	CKL_2629			TRUE	0.996	18.000	0.500	NA		NA
3710838	3710839	CKL_2629	CKL_2630			TRUE	0.998	3.000	0.667	NA		NA
3710839	3710840	CKL_2630	CKL_2631			TRUE	0.922	14.000	0.000	NA		NA
3710840	3710841	CKL_2631	CKL_2632			FALSE	0.115	185.000	0.000	NA		NA
3710841	3710842	CKL_2632	CKL_2633			FALSE	0.026	308.000	0.000	NA		NA
3710842	3710843	CKL_2633	CKL_2634			TRUE	0.996	12.000	0.400	NA		NA
3710843	3710844	CKL_2634	CKL_2635			TRUE	0.996	4.000	0.286	NA		NA
3710844	3710845	CKL_2635	CKL_2636			TRUE	0.951	-3.000	0.000	NA		NA
3710845	3710846	CKL_2636	CKL_2637			TRUE	0.938	6.000	0.000	NA		NA
3710846	3710847	CKL_2637	CKL_2638			TRUE	0.999	4.000	1.000	NA		NA
3710847	3710848	CKL_2638	CKL_2639			TRUE	0.991	20.000	0.250	NA		NA
3710848	3710849	CKL_2639	CKL_2640			TRUE	0.996	13.000	0.444	NA		NA
3710849	3710850	CKL_2640	CKL_2641			TRUE	0.994	20.000	0.409	NA		NA
3710850	3710851	CKL_2641	CKL_2642			TRUE	0.994	1.000	0.182	NA		NA
3710851	3710852	CKL_2642	CKL_2643			TRUE	0.984	51.000	1.000	NA		NA
3710852	3710853	CKL_2643	CKL_2644			TRUE	0.971	59.000	0.667	NA		NA
3710853	3710854	CKL_2644	CKL_2645			TRUE	0.997	-7.000	0.333	NA		NA
3710854	3710855	CKL_2645	CKL_2646			TRUE	0.696	39.000	0.000	NA		NA
3710855	3710856	CKL_2646	CKL_2647			TRUE	0.784	136.000	0.300	NA		NA
3710856	3710857	CKL_2647	CKL_2648			TRUE	0.996	0.000	0.300	NA		NA
3710857	3710858	CKL_2648	CKL_2649			FALSE	0.341	102.000	0.000	1.000		NA
3710858	3710859	CKL_2649	CKL_2650		metK2	TRUE	0.997	-19.000	0.375	1.000	N	NA
3710859	3710860	CKL_2650	CKL_2651	metK2		TRUE	0.997	3.000	0.385	NA		NA
3710860	3710861	CKL_2651	CKL_2652			TRUE	0.791	111.000	0.154	NA		NA
3710863	3710864	CKL_2654	CKL_2655			TRUE	0.998	-3.000	0.500	NA		NA
3710864	3710865	CKL_2655	CKL_2656			TRUE	0.995	0.000	0.227	NA		NA
3710865	3710866	CKL_2656	CKL_2657			TRUE	0.998	-19.000	0.636	NA		NA
3710866	3710867	CKL_2657	CKL_2658			TRUE	0.535	219.000	0.294	NA		NA
3710867	3710868	CKL_2658	CKL_2659			TRUE	0.996	-3.000	0.267	NA		NA
3710868	3710869	CKL_2659	CKL_2660			TRUE	0.997	0.000	0.375	NA		NA
3710869	3710870	CKL_2660	CKL_2661			TRUE	0.507	94.000	0.000	0.069		NA
3710870	3710871	CKL_2661	CKL_2662			TRUE	0.610	79.000	0.002	NA		NA
3710871	3710872	CKL_2662	CKL_2663			TRUE	0.997	5.000	0.524	NA		NA
3710872	3710873	CKL_2663	CKL_2664			TRUE	0.997	-7.000	0.333	NA		NA
3710873	3710874	CKL_2664	CKL_2665			TRUE	0.998	-25.000	0.444	NA		NA
3710874	3710875	CKL_2665	CKL_2666			TRUE	0.963	47.000	0.333	NA		NA
3710875	3710876	CKL_2666	CKL_2667			FALSE	0.351	99.000	0.000	NA		NA
3710876	3710877	CKL_2667	CKL_2668			TRUE	0.891	96.000	0.286	NA		NA
3710878	3710879	CKL_2669	CKL_2670			TRUE	0.923	57.000	0.200	1.000		NA
3710880	3710881	CKL_2671	CKL_2672			FALSE	0.010	408.000	0.000	1.000	N	NA
3710881	3710882	CKL_2672	CKL_2673			TRUE	0.778	31.000	0.000	NA		NA
3710884	3710885	CKL_2675	CKL_2676			TRUE	0.533	201.000	0.135	0.069		NA
3710886	3710887	CKL_2677	CKL_2678			TRUE	0.901	19.000	0.000	NA		NA
3710890	3710891	CKL_2681	CKL_2682			TRUE	0.915	16.000	0.000	NA		NA
3710891	3710892	CKL_2682	CKL_2683		purD	FALSE	0.086	185.000	0.000	NA	N	NA
3710892	3710893	CKL_2683	CKL_2684	purD	purH	TRUE	0.977	49.000	0.238	1.000	Y	NA
3710893	3710894	CKL_2684	CKL_2685	purH	purN	TRUE	0.996	20.000	0.225	1.000	Y	NA
3710894	3710895	CKL_2685	CKL_2686	purN	purM	TRUE	0.999	-12.000	0.238	0.001	Y	NA
3710895	3710896	CKL_2686	CKL_2687	purM	purF	TRUE	0.997	14.000	0.248	1.000	Y	NA
3710896	3710897	CKL_2687	CKL_2688	purF	purC	TRUE	0.965	41.000	0.082	1.000	Y	NA
3710897	3710898	CKL_2688	CKL_2689	purC	purE	TRUE	0.994	3.000	0.035	1.000	Y	NA
3710899	3710900	CKL_2690	CKL_2691			FALSE	0.055	236.000	0.000	NA		NA
3710901	3710902	CKL_2692	CKL_2693			FALSE	0.070	220.000	0.000	NA		NA
3710902	3710903	CKL_2693	CKL_2694			FALSE	0.008	499.000	0.000	1.000		NA
3710903	3710904	CKL_2694	CKL_2695			TRUE	0.683	40.000	0.000	1.000		NA
3710906	3710907	CKL_2697	CKL_2698			TRUE	0.427	98.000	0.000	0.081	N	NA
3710907	3710908	CKL_2698	CKL_2699		pck	FALSE	0.097	178.000	0.000	1.000	N	NA
3710909	3710910	CKL_2700	CKL_2701			TRUE	0.994	28.000	0.796	1.000		NA
3710911	3710912	CKL_2702	CKL_2703	clpB		TRUE	0.393	90.000	0.000	1.000		NA
3710912	3710913	CKL_2703	CKL_2704			TRUE	0.996	20.000	0.429	0.027		NA
3710913	3710914	CKL_2704	CKL_2705			FALSE	0.007	541.000	0.000	NA		NA
3710914	3710915	CKL_2705	CKL_2706			TRUE	0.639	43.000	0.000	NA		NA
3710915	3710916	CKL_2706	CKL_2707			TRUE	0.767	32.000	0.000	NA		NA
3710916	3710917	CKL_2707	CKL_2708			FALSE	0.031	291.000	0.000	NA		NA
3710917	3710918	CKL_2708	CKL_2709			TRUE	0.940	5.000	0.000	NA		NA
3710918	3710919	CKL_2709	CKL_2710			TRUE	0.997	2.000	0.380	NA		NA
3710919	3710920	CKL_2710	CKL_2711			FALSE	0.030	294.000	0.000	NA		NA
3710920	3710921	CKL_2711	CKL_2712			TRUE	0.996	13.000	0.429	NA		NA
3710921	3710922	CKL_2712	CKL_2713			TRUE	0.983	23.000	0.173	NA		NA
3710922	3710923	CKL_2713	CKL_2714			FALSE	0.065	223.000	0.000	NA		NA
3710923	3710924	CKL_2714	CKL_2715			TRUE	0.995	-7.000	0.179	NA		NA
3710924	3710925	CKL_2715	CKL_2716			TRUE	0.995	-19.000	0.143	NA		NA
3710925	3710926	CKL_2716	CKL_2717			TRUE	0.995	-3.000	0.182	NA		NA
3710926	3710927	CKL_2717	CKL_2718			FALSE	0.016	369.000	0.000	NA		NA
3710927	3710928	CKL_2718	CKL_2719			TRUE	0.951	-3.000	0.000	NA		NA
3710928	3710929	CKL_2719	CKL_2720			TRUE	0.997	9.000	0.417	NA		NA
3710931	3710932	CKL_2722	CKL_2723			TRUE	0.460	73.000	0.000	1.000		NA
3710934	3710935	CKL_2725	CKL_2726	fur4		TRUE	0.962	21.000	0.034	NA		NA
3710935	3710936	CKL_2726	CKL_2727			FALSE	0.080	212.000	0.000	NA		NA
3710936	3710937	CKL_2727	CKL_2728			TRUE	0.961	13.000	0.000	0.022		NA
3710937	3710938	CKL_2728	CKL_2729			FALSE	0.324	184.000	0.000	NA	Y	NA
3710938	3710939	CKL_2729	CKL_2730			TRUE	0.563	43.000	0.000	NA	N	NA
3710939	3710940	CKL_2730	CKL_2731			FALSE	0.042	235.000	0.000	1.000	N	NA
3710940	3710941	CKL_2731	CKL_2732		pbp	TRUE	0.879	18.000	0.000	1.000	N	NA
3710941	3710942	CKL_2732	CKL_2733	pbp		FALSE	0.010	396.000	0.000	1.000	N	NA
3710942	3710943	CKL_2733	CKL_2734		ltaA	FALSE	0.041	238.000	0.000	1.000	N	NA
3710943	3710944	CKL_2734	CKL_2735	ltaA	proA	TRUE	0.384	201.000	0.002	1.000	Y	NA
3710944	3710945	CKL_2735	CKL_2736	proA	proB1	TRUE	0.985	57.000	0.281	0.002	Y	NA
3710945	3710946	CKL_2736	CKL_2737	proB1	proC2	TRUE	0.942	49.000	0.003	0.002	Y	NA
3710946	3710947	CKL_2737	CKL_2738	proC2	clcA	FALSE	0.210	120.000	0.000	1.000	N	NA
3710947	3710948	CKL_2738	CKL_2739	clcA	livK	FALSE	0.116	165.000	0.000	1.000	N	NA
3710948	3710949	CKL_2739	CKL_2740	livK	livF	TRUE	0.748	76.000	0.000	1.000	Y	NA
3710949	3710950	CKL_2740	CKL_2741	livF	livG	TRUE	0.996	1.000	0.028	0.021	Y	NA
3710950	3710951	CKL_2741	CKL_2742	livG	livM	TRUE	0.999	-13.000	0.349	1.000	Y	NA
3710951	3710952	CKL_2742	CKL_2743	livM	livH	TRUE	0.999	14.000	0.345	0.022	Y	NA
3710954	3710955	CKL_2745	CKL_2746	def3		TRUE	0.997	1.000	0.529	1.000	N	NA
3710955	3710956	CKL_2746	CKL_2747			FALSE	0.019	353.000	0.000	1.000		NA
3710956	3710957	CKL_2747	CKL_2748			FALSE	0.030	293.000	0.000	NA		NA
11447771	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2332.000	0.000	NA		NA
11590134	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2332.000	0.000	NA		NA
11732526	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2332.000	0.000	NA		NA
11447772	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2362.000	0.000	NA		NA
11590135	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2362.000	0.000	NA		NA
11732527	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2362.000	0.000	NA		NA
11447773	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2398.000	0.000	NA		NA
11590136	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2398.000	0.000	NA		NA
11732528	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2398.000	0.000	NA		NA
11447774	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2428.000	0.000	NA		NA
11590137	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2428.000	0.000	NA		NA
11732529	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2428.000	0.000	NA		NA
11447775	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2463.000	0.000	NA		NA
11590138	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2463.000	0.000	NA		NA
11732530	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2463.000	0.000	NA		NA
11447776	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2493.000	0.000	NA		NA
11590139	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2493.000	0.000	NA		NA
11732531	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2493.000	0.000	NA		NA
11447777	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2529.000	0.000	NA		NA
11590140	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2529.000	0.000	NA		NA
11732532	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2529.000	0.000	NA		NA
11447778	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2559.000	0.000	NA		NA
11590141	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2559.000	0.000	NA		NA
11732533	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2559.000	0.000	NA		NA
11447779	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2595.000	0.000	NA		NA
11590142	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2595.000	0.000	NA		NA
11732534	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2595.000	0.000	NA		NA
11447780	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2625.000	0.000	NA		NA
11590143	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2625.000	0.000	NA		NA
11732535	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2625.000	0.000	NA		NA
11447781	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2660.000	0.000	NA		NA
11590144	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2660.000	0.000	NA		NA
11732536	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2660.000	0.000	NA		NA
11447782	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2690.000	0.000	NA		NA
11590145	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2690.000	0.000	NA		NA
11732537	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2690.000	0.000	NA		NA
11447783	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2726.000	0.000	NA		NA
11590146	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2726.000	0.000	NA		NA
11732538	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2726.000	0.000	NA		NA
11447784	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2756.000	0.000	NA		NA
11590147	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2756.000	0.000	NA		NA
11732539	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2756.000	0.000	NA		NA
11447785	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2792.000	0.000	NA		NA
11590148	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2792.000	0.000	NA		NA
11732540	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2792.000	0.000	NA		NA
11447786	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2822.000	0.000	NA		NA
11590149	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2822.000	0.000	NA		NA
11732541	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2822.000	0.000	NA		NA
11447787	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2858.000	0.000	NA		NA
11590150	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2858.000	0.000	NA		NA
11732542	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2858.000	0.000	NA		NA
11447788	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2888.000	0.000	NA		NA
11590151	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2888.000	0.000	NA		NA
11732543	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2888.000	0.000	NA		NA
11447789	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2924.000	0.000	NA		NA
11590152	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2924.000	0.000	NA		NA
11732544	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2924.000	0.000	NA		NA
11447790	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2954.000	0.000	NA		NA
11590153	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2954.000	0.000	NA		NA
11732545	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2954.000	0.000	NA		NA
11447791	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2989.000	0.000	NA		NA
11590154	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2989.000	0.000	NA		NA
11732546	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	2989.000	0.000	NA		NA
11447792	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	3019.000	0.000	NA		NA
11590155	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	3019.000	0.000	NA		NA
11732547	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	3019.000	0.000	NA		NA
11447793	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	3055.000	0.000	NA		NA
11590156	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	3055.000	0.000	NA		NA
11732548	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	3055.000	0.000	NA		NA
11447794	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	3085.000	0.000	NA		NA
11590157	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	3085.000	0.000	NA		NA
11732549	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	3085.000	0.000	NA		NA
11447795	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	3121.000	0.000	NA		NA
11590158	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	3121.000	0.000	NA		NA
11732550	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	3121.000	0.000	NA		NA
3710958	3710959	CKL_2749	CKL_2750			TRUE	0.533	201.000	0.135	0.067		NA
11447796	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4579.000	0.000	NA		NA
11590159	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4579.000	0.000	NA		NA
11732551	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4579.000	0.000	NA		NA
11447797	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4609.000	0.000	NA		NA
11590160	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4609.000	0.000	NA		NA
11732552	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4609.000	0.000	NA		NA
11447798	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4643.000	0.000	NA		NA
11590161	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4643.000	0.000	NA		NA
11732553	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4643.000	0.000	NA		NA
11447799	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4673.000	0.000	NA		NA
11590162	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4673.000	0.000	NA		NA
11732554	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4673.000	0.000	NA		NA
11447800	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4709.000	0.000	NA		NA
11590163	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4709.000	0.000	NA		NA
11732555	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4709.000	0.000	NA		NA
11447801	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4739.000	0.000	NA		NA
11590164	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4739.000	0.000	NA		NA
11732556	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4739.000	0.000	NA		NA
11447802	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4774.000	0.000	NA		NA
11590165	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4774.000	0.000	NA		NA
11732557	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4774.000	0.000	NA		NA
11447803	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4804.000	0.000	NA		NA
11590166	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4804.000	0.000	NA		NA
11732558	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4804.000	0.000	NA		NA
11447804	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4840.000	0.000	NA		NA
11590167	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4840.000	0.000	NA		NA
11732559	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4840.000	0.000	NA		NA
11447805	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4870.000	0.000	NA		NA
11590168	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4870.000	0.000	NA		NA
11732560	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4870.000	0.000	NA		NA
11447806	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4904.000	0.000	NA		NA
11590169	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4904.000	0.000	NA		NA
11732561	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4904.000	0.000	NA		NA
11447807	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4934.000	0.000	NA		NA
11590170	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4934.000	0.000	NA		NA
11732562	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4934.000	0.000	NA		NA
11447808	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4971.000	0.000	NA		NA
11590171	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4971.000	0.000	NA		NA
11732563	3710955		CKL_2746			FALSE	NA	4971.000	0.000	NA		NA
3710960	3710961	CKL_2751	CKL_2752			TRUE	0.999	15.000	0.667	NA	Y	NA
3710961	3710962	CKL_2752	CKL_2753			TRUE	0.994	27.000	0.324	NA	Y	NA
3710962	3710963	CKL_2753	CKL_2754			FALSE	0.317	260.000	0.194	1.000		NA
3710963	3710964	CKL_2754	CKL_2755			TRUE	0.996	19.000	0.629	NA		NA
3710964	3710965	CKL_2755	CKL_2756			TRUE	0.996	3.000	0.295	NA		NA
3710965	3710966	CKL_2756	CKL_2757			TRUE	0.998	1.000	0.778	NA		NA
3710966	3710967	CKL_2757	CKL_2758			TRUE	0.994	17.000	0.318	NA		NA
3710969	3710970	CKL_2760	CKL_2761			TRUE	0.938	6.000	0.000	NA		NA
3710970	3710971	CKL_2761	CKL_2762			FALSE	0.120	181.000	0.000	NA		NA
3710971	3710972	CKL_2762	CKL_2763			FALSE	0.073	219.000	0.000	1.000		NA
3710973	3710974	CKL_2764	CKL_2765	gerKA3	gerKB3	TRUE	0.979	-7.000	0.000	0.006		NA
3710974	3710975	CKL_2765	CKL_2766	gerKB3	gerKC4	TRUE	0.980	-13.000	0.000	0.006		NA
3710977	3710978	CKL_2768	CKL_2769		mdh	FALSE	0.104	194.000	0.000	NA		NA
3710978	3710979	CKL_2769	CKL_2770	mdh		TRUE	0.679	40.000	0.000	NA		NA
3710979	3710980	CKL_2770	CKL_2771		sod	FALSE	0.172	146.000	0.000	NA		NA
3710981	3710982	CKL_2772	CKL_2773			TRUE	0.991	0.000	0.000	0.020	Y	NA
3710982	3710983	CKL_2773	CKL_2774			TRUE	0.815	81.000	0.000	0.020	Y	NA
3710983	3710984	CKL_2774	CKL_2775			TRUE	0.936	29.000	0.000	1.000	Y	NA
3710986	3710987	CKL_2777	CKL_2778	deoC		FALSE	0.015	348.000	0.000	NA	N	NA
3710987	3710988	CKL_2778	CKL_2779			TRUE	0.989	21.000	0.059	NA	Y	NA
3710988	3710989	CKL_2779	CKL_2780		nifD7	FALSE	0.078	214.000	0.000	1.000		NA
3710989	3710990	CKL_2780	CKL_2781	nifD7	nifD8	TRUE	0.869	34.000	0.000	0.008		NA
3710990	3710991	CKL_2781	CKL_2782	nifD8		TRUE	0.946	2.000	0.000	NA		NA
3710991	3710992	CKL_2782	CKL_2783			FALSE	0.017	367.000	0.000	NA		NA
3710992	3710993	CKL_2783	CKL_2784		nifK5	TRUE	0.907	18.000	0.000	NA		NA
3710993	3710994	CKL_2784	CKL_2785	nifK5	nifk6	FALSE	0.128	225.000	0.000	0.008		NA
3710994	3710995	CKL_2785	CKL_2786	nifk6	nifD9	TRUE	0.785	45.000	0.000	0.008		NA
3710995	3710996	CKL_2786	CKL_2787	nifD9		FALSE	0.006	605.000	0.000	1.000		NA
3710996	3710997	CKL_2787	CKL_2788		kipA	FALSE	0.004	594.000	0.000	NA	N	NA
3710997	3710998	CKL_2788	CKL_2789	kipA	kipI	TRUE	0.999	-9.000	0.596	NA	Y	NA
3710998	3710999	CKL_2789	CKL_2790	kipI		TRUE	0.832	26.000	0.000	1.000		NA
3711000	3711001	CKL_2791	CKL_2792	map2	hrb	FALSE	0.054	240.000	0.000	1.000		NA
3711001	3711002	CKL_2792	CKL_2793	hrb		FALSE	0.023	325.000	0.000	1.000		NA
3711003	3711004	CKL_2794	CKL_2795		hbd2	TRUE	0.924	4.000	0.000	1.000	N	NA
3711004	3711005	CKL_2795	CKL_2796	hbd2		FALSE	0.103	172.000	0.000	1.000	N	NA
3711005	3711006	CKL_2796	CKL_2797			TRUE	0.999	0.000	0.793	0.075	N	NA
3711006	3711007	CKL_2797	CKL_2798			FALSE	0.014	402.000	0.000	1.000		NA
3711009	3711010	CKL_2800	CKL_2801			TRUE	0.696	39.000	0.000	NA		NA
3711010	3711011	CKL_2801	CKL_2802			TRUE	0.732	36.000	0.000	NA		NA
3711011	3711012	CKL_2802	CKL_2803			TRUE	0.501	61.000	0.000	NA		NA
3711012	3711013	CKL_2803	CKL_2804			FALSE	0.139	170.000	0.000	1.000		NA
3711013	3711014	CKL_2804	CKL_2805			TRUE	0.368	95.000	0.000	NA		NA
3711014	3711015	CKL_2805	CKL_2806			TRUE	0.947	1.000	0.000	NA		NA
3711015	3711016	CKL_2806	CKL_2807			FALSE	0.067	203.000	0.000	NA	N	NA
3711018	3711019	CKL_2809	CKL_2810			TRUE	0.883	21.000	0.000	NA		NA
3711019	3711020	CKL_2810	CKL_2811		trmB	TRUE	0.360	98.000	0.000	1.000		NA
3711022	3711023	CKL_2813	CKL_2814			TRUE	0.925	24.000	0.004	NA		NA
3711023	3711024	CKL_2814	CKL_2815			TRUE	0.988	37.000	0.667	NA		NA
3711024	3711025	CKL_2815	CKL_2816			FALSE	0.057	214.000	0.000	NA	N	NA
3711025	3711026	CKL_2816	CKL_2817			FALSE	0.187	138.000	0.000	NA		NA
3711027	3711028	CKL_2818	CKL_2819			TRUE	0.998	-7.000	0.426	NA		NA
3711029	3711030	CKL_2820	CKL_2821			FALSE	0.045	255.000	0.000	NA		NA
3711030	3711031	CKL_2821	CKL_2822			FALSE	0.198	134.000	0.000	NA		NA
3711031	3711032	CKL_2822	CKL_2823			TRUE	0.863	160.000	0.286	1.000	Y	NA
3711032	3711033	CKL_2823	CKL_2824			TRUE	0.539	56.000	0.000	NA		NA
3711033	3711034	CKL_2824	CKL_2825			FALSE	0.005	716.000	0.000	NA		NA
3711034	3711035	CKL_2825	CKL_2826			TRUE	1.000	-10.000	0.915	NA	Y	NA
3711036	3711037	CKL_2827	CKL_2828			FALSE	0.162	153.000	0.000	NA		NA
3711043	3711044	CKL_2834	CKL_2835			FALSE	0.308	109.000	0.000	NA		NA
3711045	3711046	CKL_2836	CKL_2837			FALSE	0.315	107.000	0.000	NA		NA
3711048	3711049	CKL_2839	CKL_2840			FALSE	0.141	168.000	0.000	NA		NA
3711049	3711050	CKL_2840	CKL_2841			FALSE	0.016	378.000	0.000	NA		NA
3711050	3711051	CKL_2841	CKL_2842		gmk	TRUE	0.544	56.000	0.000	1.000		NA
3711051	3711052	CKL_2842	CKL_2843	gmk		FALSE	0.243	125.000	0.000	1.000		NA
3711052	3711053	CKL_2843	CKL_2844			FALSE	0.103	195.000	0.000	NA		NA
3711053	3711054	CKL_2844	CKL_2845			FALSE	0.020	348.000	0.000	NA		NA
3711056	3711057	CKL_2847	CKL_2848		gerKA4	TRUE	0.999	-3.000	0.500	0.006		NA
3711058	3711059	CKL_2849	CKL_2850			TRUE	0.405	88.000	0.000	1.000		NA
3711059	3711060	CKL_2850	CKL_2851			FALSE	0.321	105.000	0.000	NA		NA
3711061	3711062	CKL_2852	CKL_2853			FALSE	0.176	144.000	0.000	NA		NA
3711062	3711063	CKL_2853	CKL_2854			FALSE	0.006	580.000	0.000	NA		NA
3711064	3711065	CKL_2855	CKL_2856			FALSE	0.153	163.000	0.000	NA		NA
3711065	3711066	CKL_2856	CKL_2857			TRUE	0.938	6.000	0.000	NA		NA
3711066	3711067	CKL_2857	CKL_2858			TRUE	0.934	9.000	0.000	NA		NA
3711068	3711069	CKL_2859	CKL_2860			TRUE	0.842	25.000	0.000	NA		NA
3711069	3711070	CKL_2860	CKL_2861			TRUE	0.394	89.000	0.000	NA		NA
3711070	3711071	CKL_2861	CKL_2862			FALSE	0.141	168.000	0.000	NA		NA
3711071	3711072	CKL_2862	CKL_2863			FALSE	0.258	121.000	0.000	NA		NA
3711073	3711074	CKL_2864	CKL_2865			TRUE	0.940	5.000	0.000	NA		NA
3711074	3711075	CKL_2865	CKL_2866			FALSE	0.028	300.000	0.000	NA		NA
3711078	3711079	CKL_2869	CKL_2870			TRUE	0.953	30.000	0.000	0.063	Y	NA
3711079	3711080	CKL_2870	CKL_2871			FALSE	0.047	253.000	0.000	1.000		NA
3711084	3711085	CKL_2875	CKL_2876			FALSE	0.004	1360.000	0.000	NA		NA
3711087	3711088	CKL_2878	CKL_2879			FALSE	0.117	184.000	0.000	NA		NA
3711088	3711089	CKL_2879	CKL_2880			FALSE	0.070	220.000	0.000	NA		NA
3711090	3711091	CKL_2881	CKL_2882			TRUE	0.379	75.000	0.000	1.000	N	NA
3711091	3711092	CKL_2882	CKL_2883			FALSE	0.010	459.000	0.000	1.000		NA
3711092	3711093	CKL_2883	CKL_2884			FALSE	0.005	746.000	0.000	NA		NA
3711094	3711095	CKL_2885	CKL_2886			TRUE	0.957	-25.000	0.000	NA		NA
3711095	3711096	CKL_2886	CKL_2887			FALSE	0.198	134.000	0.000	NA		NA
3711096	3711097	CKL_2887	CKL_2888			FALSE	0.004	1499.000	0.000	NA		NA
3711097	3711098	CKL_2888	CKL_2889			FALSE	0.124	179.000	0.000	NA		NA
3711099	3711100	CKL_2890	CKL_2891			FALSE	0.021	335.000	0.000	NA		NA
3711101	3711102	CKL_2892	CKL_2893			FALSE	0.004	870.000	0.000	NA		NA
3711102	3711103	CKL_2893	CKL_2894			FALSE	0.144	167.000	0.000	NA		NA
3711103	3711104	CKL_2894	CKL_2895			TRUE	0.907	18.000	0.000	NA		NA
3711104	3711105	CKL_2895	CKL_2896			FALSE	0.005	727.000	0.000	NA		NA
3711105	3711106	CKL_2896	CKL_2897			FALSE	0.016	374.000	0.000	1.000		NA
3711106	3711107	CKL_2897	CKL_2898			FALSE	0.169	148.000	0.000	NA		NA
3711107	3711108	CKL_2898	CKL_2899			TRUE	0.940	5.000	0.000	NA		NA
3711108	3711109	CKL_2899	CKL_2900			FALSE	0.004	856.000	0.000	NA		NA
3711114	3711115	CKL_2905	CKL_2906			TRUE	0.994	27.000	0.231	0.092	Y	NA
3711116	3711117	CKL_2907	CKL_2908		cobT	FALSE	0.066	222.000	0.000	NA		NA
3711117	3711118	CKL_2908	CKL_2909	cobT	sirC	FALSE	0.246	211.000	0.000	1.000	Y	NA
3711118	3711119	CKL_2909	CKL_2910	sirC	cobD2	TRUE	0.912	49.000	0.013	1.000	Y	NA
3711119	3711120	CKL_2910	CKL_2911	cobD2		TRUE	0.700	39.000	0.000	1.000		NA
3711120	3711121	CKL_2911	CKL_2912			TRUE	0.950	0.000	0.000	1.000		NA
3711121	3711122	CKL_2912	CKL_2913			FALSE	0.113	165.000	0.000	NA	N	NA
3711124	3711125	CKL_2915	CKL_2916		aroH	FALSE	0.173	147.000	0.000	1.000		NA
3711125	3711126	CKL_2916	CKL_2917	aroH	thiE2	FALSE	0.085	188.000	0.000	1.000	N	NA
3711126	3711127	CKL_2917	CKL_2918	thiE2	thiM	TRUE	0.993	-9.000	0.000	0.004	Y	NA
3711127	3711128	CKL_2918	CKL_2919	thiM	thiD	TRUE	0.936	67.000	0.039	0.004	Y	NA
3711129	3711130	CKL_2920	CKL_2921			TRUE	0.931	11.000	0.000	NA		NA
3711131	3711132	CKL_2922	CKL_2923			TRUE	0.577	79.000	0.000	0.063		NA
3711132	3711133	CKL_2923	CKL_2924			FALSE	0.084	209.000	0.000	NA		NA
3711133	3711134	CKL_2924	CKL_2925			FALSE	0.103	195.000	0.000	NA		NA
3711134	3711135	CKL_2925	CKL_2926			FALSE	0.004	1000.000	0.000	NA		NA
3711135	3711136	CKL_2926	CKL_2927			FALSE	0.018	360.000	0.000	NA		NA
3711138	3711139	CKL_2929	CKL_2930			TRUE	0.602	48.000	0.000	NA		NA
3711139	3711140	CKL_2930	CKL_2931			TRUE	0.739	95.000	0.069	NA		NA
3711140	3711141	CKL_2931	CKL_2932			TRUE	0.467	69.000	0.000	NA		NA
3711142	3711143	CKL_2933	CKL_2934			TRUE	0.416	83.000	0.000	NA		NA
3711143	3711144	CKL_2934	CKL_2935			FALSE	0.126	178.000	0.000	NA		NA
3711144	3711145	CKL_2935	CKL_2936			TRUE	0.467	69.000	0.000	NA		NA
3711145	3711146	CKL_2936	CKL_2937			TRUE	0.536	201.000	0.135	0.062		NA
3711146	3711147	CKL_2937	CKL_2938			FALSE	0.182	170.000	0.000	0.062	N	NA
3711147	3711148	CKL_2938	CKL_2939			TRUE	0.972	-3.000	0.000	0.062		NA
3711148	3711149	CKL_2939	CKL_2940			FALSE	0.072	219.000	0.000	NA		NA
3711149	3711150	CKL_2940	CKL_2941			TRUE	0.997	-3.000	0.333	NA		NA
3711150	3711151	CKL_2941	CKL_2942			TRUE	0.997	4.000	0.444	NA		NA
3711152	3711153	CKL_2943	CKL_2944			TRUE	0.674	56.000	0.000	0.062		NA
3711153	3711154	CKL_2944	CKL_2945			TRUE	0.982	32.000	0.333	1.000		NA
3711155	3711156	CKL_2946	CKL_2947			TRUE	0.955	-7.000	0.000	1.000		NA
3711156	3711157	CKL_2947	CKL_2948			TRUE	0.832	26.000	0.000	1.000		NA
3711157	3711158	CKL_2948	CKL_2949			FALSE	0.010	450.000	0.000	NA		NA
3711158	3711159	CKL_2949	CKL_2950			FALSE	0.308	109.000	0.000	NA		NA
3711159	3711160	CKL_2950	CKL_2951			TRUE	0.957	-76.000	0.000	NA		NA
3711160	3711161	CKL_2951	CKL_2952			TRUE	0.901	19.000	0.000	NA		NA
3711161	3711162	CKL_2952	CKL_2953			TRUE	0.954	-7.000	0.000	NA		NA
3711162	3711163	CKL_2953	CKL_2954			TRUE	0.437	79.000	0.000	NA		NA
3711163	3711164	CKL_2954	CKL_2955			FALSE	0.154	162.000	0.000	NA		NA
3711164	3711165	CKL_2955	CKL_2956			FALSE	0.322	106.000	0.000	1.000		NA
3711165	3711166	CKL_2956	CKL_2957			FALSE	0.105	193.000	0.000	NA		NA
3711166	3711167	CKL_2957	CKL_2958			TRUE	0.938	6.000	0.000	NA		NA
3711167	3711168	CKL_2958	CKL_2959			FALSE	0.268	119.000	0.000	NA		NA
3711168	3711169	CKL_2959	CKL_2960			TRUE	0.929	12.000	0.000	NA		NA
3711169	3711170	CKL_2960	CKL_2961			TRUE	0.516	59.000	0.000	NA		NA
3711170	3711171	CKL_2961	CKL_2962			TRUE	0.478	66.000	0.000	NA		NA
3711172	3711173	CKL_2963	CKL_2964			FALSE	0.005	741.000	0.000	NA		NA
3711176	3711177	CKL_2967	CKL_2968			FALSE	0.005	724.000	0.000	NA		NA
3711177	3711178	CKL_2968	CKL_2969			FALSE	0.033	289.000	0.000	NA		NA
3711178	3711179	CKL_2969	CKL_2970			FALSE	0.015	380.000	0.000	NA		NA
3711180	3711181	CKL_2971	CKL_2972			FALSE	0.030	293.000	0.000	NA		NA
3711181	3711182	CKL_2972	CKL_2973			FALSE	0.022	329.000	0.000	NA		NA
3711183	3711184	CKL_2974	CKL_2975			TRUE	0.759	33.000	0.000	NA		NA
3711185	3711186	CKL_2976	CKL_2977			TRUE	0.915	16.000	0.000	NA		NA
3711188	3711189	CKL_2979	CKL_2980			FALSE	0.024	320.000	0.000	NA		NA
3711189	3711190	CKL_2980	CKL_2981			FALSE	0.037	277.000	0.000	NA		NA
3711190	3711191	CKL_2981	CKL_2982			TRUE	0.407	86.000	0.000	NA		NA
3711191	3711192	CKL_2982	CKL_2983			FALSE	0.010	448.000	0.000	NA		NA
3711192	3711193	CKL_2983	CKL_2984			FALSE	0.181	141.000	0.000	NA		NA
3711195	3711196	CKL_2986	CKL_2987			FALSE	0.149	165.000	0.000	NA		NA
3711196	3711197	CKL_2987	CKL_2988			FALSE	0.149	165.000	0.000	NA		NA
3711197	3711198	CKL_2988	CKL_2989			FALSE	0.085	210.000	0.000	1.000		NA
3711199	3711200	CKL_2990	CKL_2991			FALSE	0.336	102.000	0.000	NA		NA
3711200	3711201	CKL_2991	CKL_2992			FALSE	0.010	443.000	0.000	NA		NA
3711201	3711202	CKL_2992	CKL_2993			TRUE	0.957	-46.000	0.000	NA		NA
3711205	3711206	CKL_2996	CKL_2997	porB	porA	TRUE	0.999	14.000	0.500	0.002	Y	NA
3711206	3711207	CKL_2997	CKL_2998	porA	porD	TRUE	0.998	12.000	0.182	0.002	Y	NA
3711207	3711208	CKL_2998	CKL_2999	porD	porC	TRUE	0.999	0.000	0.205	0.001	Y	NA
3711208	3711209	CKL_2999	CKL_3000	porC		FALSE	0.029	510.000	0.000	1.000	Y	NA
3711209	3711210	CKL_3000	CKL_3001			FALSE	0.049	223.000	0.000	1.000	N	NA
3711210	3711211	CKL_3001	CKL_3002			TRUE	0.982	76.000	1.000	0.002	N	NA
3711211	3711212	CKL_3002	CKL_3003			TRUE	0.821	116.000	0.222	1.000		NA
3711212	3711213	CKL_3003	CKL_3004			TRUE	0.360	98.000	0.000	1.000		NA
3711213	3711214	CKL_3004	CKL_3005			TRUE	0.999	2.000	0.333	0.073	Y	NA
3711214	3711215	CKL_3005	CKL_3006			FALSE	0.162	154.000	0.000	NA		NA
3711216	3711217	CKL_3007	CKL_3008			TRUE	0.360	97.000	0.000	NA		NA
3711217	3711218	CKL_3008	CKL_3009			FALSE	0.198	134.000	0.000	NA		NA
3711218	3711219	CKL_3009	CKL_3010			FALSE	0.159	157.000	0.000	NA		NA
3711219	3711220	CKL_3010	CKL_3011			FALSE	0.165	151.000	0.000	NA		NA
3711220	3711221	CKL_3011	CKL_3012			TRUE	0.999	-7.000	0.448	NA	Y	NA
3711222	3711223	CKL_3013	CKL_3014	sigL	4hbD	FALSE	0.029	272.000	0.000	1.000	N	NA
3711223	3711224	CKL_3014	CKL_3015	4hbD	sucD	TRUE	0.976	37.000	0.054	0.034	Y	NA
3711224	3711225	CKL_3015	CKL_3016	sucD	cat1	TRUE	0.959	62.000	0.182	1.000	Y	NA
3711225	3711226	CKL_3016	CKL_3017	cat1	orfY	TRUE	0.562	54.000	0.000	1.000		NA
3711226	3711227	CKL_3017	CKL_3018	orfY	cat2	FALSE	0.199	135.000	0.000	1.000		NA
3711227	3711228	CKL_3018	CKL_3019	cat2		FALSE	0.021	301.000	0.000	1.000	N	NA
3711228	3711229	CKL_3019	CKL_3020		abfD	TRUE	0.966	8.000	0.011	1.000	N	NA
3711229	3711230	CKL_3020	CKL_3021	abfD		FALSE	0.024	290.000	0.000	1.000	N	NA
3711230	3711231	CKL_3021	CKL_3022			FALSE	0.026	284.000	0.000	1.000	N	NA
3711231	3711232	CKL_3022	CKL_3023			TRUE	0.779	42.000	0.000	0.034		NA
3711232	3711233	CKL_3023	CKL_3024			TRUE	0.499	62.000	0.000	1.000		NA
3711233	3711234	CKL_3024	CKL_3025			TRUE	0.992	-3.000	0.024	0.001		NA
3711234	3711235	CKL_3025	CKL_3026		fadD	TRUE	0.966	18.000	0.024	1.000		NA
3711235	3711236	CKL_3026	CKL_3027	fadD	acp2	TRUE	0.998	-3.000	0.667	1.000		NA
3711236	3711237	CKL_3027	CKL_3028	acp2		TRUE	0.956	-16.000	0.000	NA		NA
3711239	3711240	CKL_3030	CKL_3031			FALSE	0.097	199.000	0.000	NA		NA
3711241	3711242	CKL_3032	CKL_3033			TRUE	0.991	-7.000	0.078	NA		NA
3711244	3711245	CKL_3035	CKL_3036			FALSE	0.005	799.000	0.000	NA		NA
3711245	3711246	CKL_3036	CKL_3037			TRUE	0.651	42.000	0.000	NA		NA
3711246	3711247	CKL_3037	CKL_3038			TRUE	0.394	89.000	0.000	NA		NA
3711247	3711248	CKL_3038	CKL_3039			FALSE	0.009	473.000	0.000	NA		NA
3711248	3711249	CKL_3039	CKL_3040			TRUE	0.457	74.000	0.000	1.000		NA
3711250	3711251	CKL_3041	CKL_3042			TRUE	0.984	4.000	0.000	1.000	Y	NA
3711251	3711252	CKL_3042	CKL_3043			TRUE	0.430	96.000	0.000	0.091	N	NA
3711252	3711253	CKL_3043	CKL_3044			TRUE	0.987	-10.000	0.000	1.000	Y	NA
3711253	3711254	CKL_3044	CKL_3045			TRUE	0.959	23.000	0.000	1.000	Y	NA
3711254	3711255	CKL_3045	CKL_3046			TRUE	0.988	27.000	0.118	1.000	Y	NA
3711256	3711257	CKL_3047	CKL_3048			TRUE	0.993	-3.000	0.111	NA		NA
3711257	3711258	CKL_3048	CKL_3049			TRUE	0.998	1.000	0.667	NA		NA
3711258	3711259	CKL_3049	CKL_3050		gdh	TRUE	0.385	91.000	0.000	NA		NA
3711259	3711260	CKL_3050	CKL_3051	gdh		FALSE	0.071	201.000	0.000	1.000	N	NA
3711260	3711261	CKL_3051	CKL_3052			FALSE	0.239	125.000	0.000	NA		NA
3711261	3711262	CKL_3052	CKL_3053			FALSE	0.098	198.000	0.000	NA		NA
3711264	3711265	CKL_3055	CKL_3056			FALSE	0.037	243.000	0.000	NA	N	NA
3711265	3711266	CKL_3056	CKL_3057			TRUE	0.985	16.000	0.000	0.020	Y	NA
3711266	3711267	CKL_3057	CKL_3058			TRUE	0.975	16.000	0.000	1.000	Y	NA
3711267	3711268	CKL_3058	CKL_3059			TRUE	0.836	22.000	0.000	1.000	N	NA
3711268	3711269	CKL_3059	CKL_3060			TRUE	0.994	-7.000	0.071	0.044		NA
3711269	3711270	CKL_3060	CKL_3061			FALSE	0.325	104.000	0.000	NA		NA
3711271	3711272	CKL_3062	CKL_3063	trpB2		FALSE	0.014	395.000	0.000	NA		NA
3711272	3711273	CKL_3063	CKL_3064			FALSE	0.062	227.000	0.000	NA		NA
3711273	3711274	CKL_3064	CKL_3065			FALSE	0.018	357.000	0.000	NA		NA
3711274	3711275	CKL_3065	CKL_3066			TRUE	0.846	117.000	0.286	NA		NA
3711275	3711276	CKL_3066	CKL_3067			FALSE	0.317	106.000	0.000	NA		NA
3711276	3711277	CKL_3067	CKL_3068			TRUE	0.471	68.000	0.000	NA		NA
3711279	3711280	CKL_3070	CKL_3071			FALSE	0.010	463.000	0.000	NA		NA
3711280	3711281	CKL_3071	CKL_3072			TRUE	0.994	13.000	0.273	NA		NA
3711283	3711284	CKL_3074	CKL_3075		nifK/nifB	FALSE	0.156	162.000	0.000	1.000		NA
3711284	3711285	CKL_3075	CKL_3076	nifK/nifB	nifE3	TRUE	0.997	24.000	0.342	0.004	Y	NA
3711285	3711286	CKL_3076	CKL_3077	nifE3	nifK7	TRUE	0.983	78.000	0.380	0.004	Y	NA
3711286	3711287	CKL_3077	CKL_3078	nifK7	nifD10	TRUE	1.000	0.000	0.902	0.004	Y	NA
3711287	3711288	CKL_3078	CKL_3079	nifD10		TRUE	0.989	22.000	0.294	1.000	N	NA
3711288	3711289	CKL_3079	CKL_3080			TRUE	0.999	15.000	0.860	0.002	Y	NA
3711289	3711290	CKL_3080	CKL_3081		nifH4	FALSE	0.345	166.000	0.040	1.000	N	NA
3711292	3711293	CKL_3083	CKL_3084		mop	FALSE	0.302	111.000	0.000	NA		NA
3711293	3711294	CKL_3084	CKL_3085	mop		FALSE	0.246	134.000	0.000	0.090	N	NA
3711294	3711295	CKL_3085	CKL_3086		modB	TRUE	0.999	2.000	0.342	1.000	Y	NA
3711295	3711296	CKL_3086	CKL_3087	modB	modA	TRUE	0.926	78.000	0.028	0.001	Y	NA
3711298	3711299	CKL_3089	CKL_3090			FALSE	0.018	360.000	0.000	NA		NA
3711299	3711300	CKL_3090	CKL_3091			TRUE	0.951	-3.000	0.000	NA		NA
3711302	3711303	CKL_3093	CKL_3094			FALSE	0.058	232.000	0.000	NA		NA
3711304	3711305	CKL_3095	CKL_3096			TRUE	0.832	26.000	0.000	1.000		NA
3711305	3711306	CKL_3096	CKL_3097			TRUE	0.990	24.000	0.333	NA		NA
3711306	3711307	CKL_3097	CKL_3098			FALSE	0.068	221.000	0.000	NA		NA
3711308	3711309	CKL_3099	CKL_3100			FALSE	0.336	102.000	0.000	NA		NA
3711309	3711310	CKL_3100	CKL_3101			TRUE	0.957	-36.000	0.000	NA		NA
3711310	3711311	CKL_3101	CKL_3102			FALSE	0.104	194.000	0.000	NA		NA
3711311	3711312	CKL_3102	CKL_3103			FALSE	0.014	396.000	0.000	NA		NA
3711312	3711313	CKL_3103	CKL_3104			TRUE	0.467	69.000	0.000	NA		NA
3711313	3711314	CKL_3104	CKL_3105			TRUE	0.446	76.000	0.000	NA		NA
3711314	3711315	CKL_3105	CKL_3106			TRUE	0.709	38.000	0.000	NA		NA
3711315	3711316	CKL_3106	CKL_3107			TRUE	0.501	61.000	0.000	NA		NA
3711316	3711317	CKL_3107	CKL_3108			FALSE	0.006	569.000	0.000	NA		NA
3711318	3711319	CKL_3109	CKL_3110			TRUE	0.974	74.000	0.917	NA		NA
3711320	3711321	CKL_3111	CKL_3112			TRUE	0.357	80.000	0.000	NA	N	NA
3711322	3711323	CKL_3113	CKL_3114			TRUE	0.509	60.000	0.000	NA		NA
3711323	3711324	CKL_3114	CKL_3115			FALSE	0.288	114.000	0.000	NA		NA
3711324	3711325	CKL_3115	CKL_3116			TRUE	0.996	-13.000	0.222	NA		NA
3711325	3711326	CKL_3116	CKL_3117			FALSE	0.212	248.000	0.000	0.072	Y	NA
3711327	3711328	CKL_3118	CKL_3119		gabT	FALSE	0.036	251.000	0.000	1.000	N	NA
3711328	3711329	CKL_3119	CKL_3120	gabT		FALSE	0.133	147.000	0.000	1.000	N	NA
3711329	3711330	CKL_3120	CKL_3121			FALSE	0.107	290.000	0.000	1.000	Y	NA
3711330	3711331	CKL_3121	CKL_3122			FALSE	0.045	257.000	0.000	NA		NA
3711331	3711332	CKL_3122	CKL_3123			FALSE	0.081	211.000	0.000	NA		NA
3711334	3711335	CKL_3125	CKL_3126		aspS	FALSE	0.013	362.000	0.000	1.000	N	NA
3711335	3711336	CKL_3126	CKL_3127	aspS	hisS	TRUE	0.893	87.000	0.028	0.029	Y	NA
3711336	3711337	CKL_3127	CKL_3128	hisS		TRUE	0.938	37.000	0.111	1.000	N	NA
3711337	3711338	CKL_3128	CKL_3129			TRUE	0.860	43.000	0.035	1.000		NA
3711338	3711339	CKL_3129	CKL_3130		dtd	TRUE	0.745	82.000	0.048	1.000		NA
3711339	3711340	CKL_3130	CKL_3131	dtd	relA	TRUE	0.871	75.000	0.177	1.000	N	NA
3711340	3711341	CKL_3131	CKL_3132	relA	apt	TRUE	0.684	100.000	0.068	1.000	N	NA
3711341	3711342	CKL_3132	CKL_3133	apt		FALSE	0.084	187.000	0.000	NA	N	NA
3711342	3711343	CKL_3133	CKL_3134			TRUE	0.996	-7.000	0.250	NA		NA
3711343	3711344	CKL_3134	CKL_3135			TRUE	0.822	27.000	0.000	1.000		NA
3711344	3711345	CKL_3135	CKL_3136		secF	FALSE	0.346	167.000	0.028	1.000		NA
3711345	3711346	CKL_3136	CKL_3137	secF		TRUE	0.999	2.000	0.516	0.001	Y	NA
3711346	3711347	CKL_3137	CKL_3138			TRUE	0.443	150.000	0.048	1.000		NA
3711347	3711348	CKL_3138	CKL_3139			TRUE	0.953	78.000	0.540	NA		NA
3711348	3711349	CKL_3139	CKL_3140			TRUE	0.706	142.000	0.212	NA		NA
3711349	3711350	CKL_3140	CKL_3141			TRUE	0.779	74.000	0.055	NA		NA
3711350	3711351	CKL_3141	CKL_3142		tgt	TRUE	0.786	53.000	0.035	NA	N	NA
3711351	3711352	CKL_3142	CKL_3143	tgt	queA	TRUE	0.994	15.000	0.014	0.001	Y	NA
3711352	3711353	CKL_3143	CKL_3144	queA	ruvB	TRUE	0.854	50.000	0.069	1.000	N	NA
3711353	3711354	CKL_3144	CKL_3145	ruvB	ruvA	TRUE	0.999	15.000	0.549	0.002	Y	NA
3711354	3711355	CKL_3145	CKL_3146	ruvA		FALSE	0.256	173.000	0.007	NA		NA
3711355	3711356	CKL_3146	CKL_3147			TRUE	0.557	54.000	0.000	NA		NA
3711356	3711357	CKL_3147	CKL_3148			FALSE	0.180	143.000	0.000	1.000		NA
3711357	3711358	CKL_3148	CKL_3149			TRUE	0.624	90.000	0.015	1.000		NA
3711358	3711359	CKL_3149	CKL_3150			TRUE	0.666	80.000	0.015	1.000		NA
3711359	3711360	CKL_3150	CKL_3151			TRUE	0.868	86.000	0.176	1.000		NA
3711360	3711361	CKL_3151	CKL_3152			FALSE	0.141	169.000	0.000	1.000		NA
3711363	3711364	CKL_3154	CKL_3155		spoIIAB	TRUE	0.998	10.000	0.842	1.000	N	NA
3711364	3711365	CKL_3155	CKL_3156	spoIIAB	spoIIAA	TRUE	0.999	15.000	0.669	0.002	Y	NA
3711365	3711366	CKL_3156	CKL_3157	spoIIAA	speE	FALSE	0.004	594.000	0.000	1.000	N	NA
3711366	3711367	CKL_3157	CKL_3158	speE		FALSE	0.167	152.000	0.000	1.000		NA
3711369	3711370	CKL_3160	CKL_3161			TRUE	0.993	2.000	0.024	1.000	Y	NA
3711370	3711371	CKL_3161	CKL_3162			TRUE	0.386	72.000	0.000	1.000	N	NA
3711371	3711372	CKL_3162	CKL_3163			TRUE	0.896	20.000	0.000	1.000		NA
3711372	3711373	CKL_3163	CKL_3164			TRUE	0.984	15.000	0.075	1.000		NA
3711373	3711374	CKL_3164	CKL_3165			TRUE	0.995	9.000	0.098	NA	Y	NA
3711374	3711375	CKL_3165	CKL_3166			TRUE	0.904	37.000	0.000	NA	Y	NA
3711375	3711376	CKL_3166	CKL_3167			TRUE	0.965	21.000	0.000	1.000	Y	NA
3711376	3711377	CKL_3167	CKL_3168			TRUE	0.800	53.000	0.027	1.000		NA
3711377	3711378	CKL_3168	CKL_3169			TRUE	0.943	53.000	0.154	0.044		NA
3711378	3711379	CKL_3169	CKL_3170			TRUE	0.582	42.000	0.000	1.000	N	NA
3711379	3711380	CKL_3170	CKL_3171			TRUE	0.713	38.000	0.000	1.000		NA
3711380	3711381	CKL_3171	CKL_3172			FALSE	0.164	155.000	0.000	1.000		NA
3711381	3711382	CKL_3172	CKL_3173			TRUE	0.522	58.000	0.000	NA		NA
3711382	3711383	CKL_3173	CKL_3174			TRUE	0.721	37.000	0.000	NA		NA
3711383	3711384	CKL_3174	CKL_3175			TRUE	0.764	68.000	0.000	NA	Y	NA
3711384	3711385	CKL_3175	CKL_3176			TRUE	0.989	6.000	0.000	0.012	Y	NA
3711385	3711386	CKL_3176	CKL_3177		capD	TRUE	0.992	20.000	0.037	0.012	Y	NA
3711386	3711387	CKL_3177	CKL_3178	capD	galU	TRUE	0.712	179.000	0.056	0.012	Y	NA
3711387	3711388	CKL_3178	CKL_3179	galU		TRUE	0.992	25.000	0.500	1.000		NA
3711388	3711389	CKL_3179	CKL_3180		pgm2	TRUE	0.989	28.000	0.417	1.000		NA
3711391	3711392	CKL_3182	CKL_3183			TRUE	0.965	20.000	0.031	NA		NA
3711392	3711393	CKL_3183	CKL_3184			TRUE	0.922	37.000	0.078	1.000	N	NA
3711394	3711395	CKL_3185	CKL_3186			FALSE	0.025	317.000	0.000	NA		NA
3711397	3711398	CKL_3188	CKL_3189			FALSE	0.181	141.000	0.000	NA		NA
3711399	3711400	CKL_3190	CKL_3191		pheT	FALSE	0.283	196.000	0.038	NA		NA
3711400	3711401	CKL_3191	CKL_3192	pheT	pheS	TRUE	0.993	53.000	0.574	0.001	Y	NA
3711401	3711402	CKL_3192	CKL_3193	pheS		FALSE	0.101	363.000	0.006	1.000	Y	NA
3711402	3711403	CKL_3193	CKL_3194		rplT	TRUE	0.755	137.000	0.027	0.014	Y	NA
3711403	3711404	CKL_3194	CKL_3195	rplT	rpmI	TRUE	0.998	30.000	0.928	0.012	Y	NA
3711404	3711405	CKL_3195	CKL_3196	rpmI	thrS	FALSE	0.148	256.000	0.000	1.000	Y	NA
3711405	3711406	CKL_3196	CKL_3197	thrS		FALSE	0.006	599.000	0.000	NA		NA
3711407	3711408	CKL_3198	CKL_3199			TRUE	0.940	5.000	0.000	NA		NA
3711408	3711409	CKL_3199	CKL_3200			TRUE	0.942	4.000	0.000	NA		NA
3711409	3711410	CKL_3200	CKL_3201			TRUE	0.938	6.000	0.000	NA		NA
3711410	3711411	CKL_3201	CKL_3202			TRUE	0.935	8.000	0.000	NA		NA
3711414	3711415	CKL_3205	CKL_3206	dapB2	dapA4	TRUE	0.625	145.000	0.022	1.000	Y	NA
3711415	3711416	CKL_3206	CKL_3207	dapA4	asd	TRUE	0.910	56.000	0.029	1.000	Y	NA
3711417	3711418	CKL_3208	CKL_3209			TRUE	0.503	137.000	0.056	1.000		NA
3711418	3711419	CKL_3209	CKL_3210			TRUE	0.779	80.000	0.063	1.000		NA
3711419	3711420	CKL_3210	CKL_3211		dapD	FALSE	0.219	118.000	0.000	1.000	N	NA
3711421	3711422	CKL_3212	CKL_3213	ssb2		TRUE	0.735	98.000	0.071	NA		NA
3711422	3711423	CKL_3213	CKL_3214			FALSE	0.239	207.000	0.034	NA		NA
3711427	3711428	CKL_3218	CKL_3219	folC	valS	TRUE	0.962	19.000	0.006	0.089	N	NA
3711428	3711429	CKL_3219	CKL_3220	valS		FALSE	0.016	327.000	0.000	NA	N	NA
3711430	3711431	CKL_3221	CKL_3222			FALSE	0.149	211.000	0.000	0.023		NA
3711431	3711432	CKL_3222	CKL_3223			TRUE	0.549	55.000	0.000	NA		NA
3711435	3711436	CKL_3226	CKL_3227			FALSE	0.007	545.000	0.000	NA		NA
3711436	3711437	CKL_3227	CKL_3228			TRUE	0.957	-45.000	0.000	NA		NA
3711437	3711438	CKL_3228	CKL_3229			FALSE	0.331	103.000	0.000	NA		NA
3711438	3711439	CKL_3229	CKL_3230			TRUE	0.883	21.000	0.000	NA		NA
3711439	3711440	CKL_3230	CKL_3231			FALSE	0.277	117.000	0.000	NA		NA
3711440	3711441	CKL_3231	CKL_3232			FALSE	0.249	123.000	0.000	NA		NA
3711441	3711442	CKL_3232	CKL_3233			TRUE	0.948	58.000	0.333	NA		NA
3711442	3711443	CKL_3233	CKL_3234			TRUE	0.912	76.000	0.250	NA		NA
3711443	3711444	CKL_3234	CKL_3235			TRUE	0.901	19.000	0.000	NA		NA
3711444	3711445	CKL_3235	CKL_3236			FALSE	0.203	133.000	0.000	NA		NA
3711446	3711447	CKL_3237	CKL_3238			FALSE	0.014	394.000	0.000	NA		NA
3711447	3711448	CKL_3238	CKL_3239			TRUE	0.982	-7.000	0.030	1.000	N	NA
3711448	3711449	CKL_3239	CKL_3240			TRUE	0.988	15.000	0.061	0.001	N	NA
3711449	3711450	CKL_3240	CKL_3241			TRUE	0.989	23.000	0.333	1.000	N	NA
3711451	3711452	CKL_3242	CKL_3243			TRUE	0.407	86.000	0.000	NA		NA
3711452	3711453	CKL_3243	CKL_3244			TRUE	0.926	13.000	0.000	NA		NA
3711453	3711454	CKL_3244	CKL_3245			FALSE	0.013	413.000	0.000	NA		NA
3711454	3711455	CKL_3245	CKL_3246			TRUE	0.915	16.000	0.000	NA		NA
3711455	3711456	CKL_3246	CKL_3247			TRUE	0.929	12.000	0.000	NA		NA
3711456	3711457	CKL_3247	CKL_3248			TRUE	0.995	4.000	0.250	NA		NA
3711457	3711458	CKL_3248	CKL_3249			TRUE	0.995	4.000	0.250	NA		NA
3711458	3711459	CKL_3249	CKL_3250			TRUE	0.994	5.000	0.214	NA		NA
3711459	3711460	CKL_3250	CKL_3251			TRUE	0.998	1.000	0.643	NA		NA
3711460	3711461	CKL_3251	CKL_3252			TRUE	0.999	-25.000	0.900	NA		NA
3711461	3711462	CKL_3252	CKL_3253			TRUE	0.997	11.000	0.500	NA		NA
3711462	3711463	CKL_3253	CKL_3254			FALSE	0.037	276.000	0.000	NA		NA
3711463	3711464	CKL_3254	CKL_3255			TRUE	0.936	7.000	0.000	NA		NA
3711464	3711465	CKL_3255	CKL_3256			FALSE	0.127	177.000	0.000	NA		NA
3711465	3711466	CKL_3256	CKL_3257			FALSE	0.157	159.000	0.000	NA		NA
3711466	3711467	CKL_3257	CKL_3258			TRUE	0.949	0.000	0.000	NA		NA
3711467	3711468	CKL_3258	CKL_3259			FALSE	0.234	126.000	0.000	NA		NA
3711468	3711469	CKL_3259	CKL_3260			FALSE	0.029	299.000	0.000	NA		NA
3711469	3711470	CKL_3260	CKL_3261			TRUE	0.449	75.000	0.000	NA		NA
3711470	3711471	CKL_3261	CKL_3262			TRUE	0.931	11.000	0.000	NA		NA
3711471	3711472	CKL_3262	CKL_3263			TRUE	0.946	2.000	0.000	NA		NA
3711472	3711473	CKL_3263	CKL_3264			TRUE	0.994	27.000	0.750	NA		NA
3711473	3711474	CKL_3264	CKL_3265			TRUE	0.998	-15.000	0.500	NA		NA
3711474	3711475	CKL_3265	CKL_3266			TRUE	0.883	21.000	0.000	NA		NA
3711475	3711476	CKL_3266	CKL_3267			TRUE	0.922	14.000	0.000	NA		NA
3711476	3711477	CKL_3267	CKL_3268			TRUE	0.949	0.000	0.000	NA		NA
3711477	3711478	CKL_3268	CKL_3269			TRUE	0.998	3.000	0.667	NA		NA
3711478	3711479	CKL_3269	CKL_3270			TRUE	0.916	60.000	0.200	NA		NA
3711479	3711480	CKL_3270	CKL_3271			TRUE	0.995	18.000	0.400	NA		NA
3711480	3711481	CKL_3271	CKL_3272			TRUE	0.995	23.000	0.667	NA		NA
3711481	3711482	CKL_3272	CKL_3273			TRUE	0.585	50.000	0.000	NA		NA
3711482	3711483	CKL_3273	CKL_3274			TRUE	0.516	59.000	0.000	NA		NA
3711483	3711484	CKL_3274	CKL_3275			TRUE	0.933	10.000	0.000	NA		NA
3711484	3711485	CKL_3275	CKL_3276			TRUE	0.443	77.000	0.000	NA		NA
3711485	3711486	CKL_3276	CKL_3277			TRUE	0.481	65.000	0.000	NA		NA
3711486	3711487	CKL_3277	CKL_3278			TRUE	0.955	-10.000	0.000	NA		NA
3711487	3711488	CKL_3278	CKL_3279			TRUE	0.996	3.000	0.300	NA		NA
3711488	3711489	CKL_3279	CKL_3280			TRUE	0.997	0.000	0.375	NA		NA
3711489	3711490	CKL_3280	CKL_3281			TRUE	0.991	0.000	0.026	0.001		NA
3711490	3711491	CKL_3281	CKL_3282			TRUE	0.639	43.000	0.000	NA		NA
3711491	3711492	CKL_3282	CKL_3283			FALSE	0.176	144.000	0.000	NA		NA
3711493	3711494	CKL_3284	CKL_3285			TRUE	0.820	55.000	0.042	NA		NA
3711495	3711496	CKL_3286	CKL_3287			FALSE	0.268	119.000	0.000	NA		NA
3711496	3711497	CKL_3287	CKL_3288			FALSE	0.068	221.000	0.000	NA		NA
3711497	3711498	CKL_3288	CKL_3289			FALSE	0.340	101.000	0.000	NA		NA
3711498	3711499	CKL_3289	CKL_3290			TRUE	0.951	-3.000	0.000	NA		NA
3711499	3711500	CKL_3290	CKL_3291			FALSE	0.040	269.000	0.000	NA		NA
3711500	3711501	CKL_3291	CKL_3292			TRUE	0.951	-3.000	0.000	NA		NA
3711501	3711502	CKL_3292	CKL_3293			TRUE	0.616	46.000	0.000	NA		NA
3711502	3711503	CKL_3293	CKL_3294			TRUE	0.938	6.000	0.000	NA		NA
3711503	3711504	CKL_3294	CKL_3295			FALSE	0.235	237.000	0.000	0.060	Y	NA
3711504	3711505	CKL_3295	CKL_3296			TRUE	0.942	4.000	0.000	NA		NA
3711505	3711506	CKL_3296	CKL_3297			FALSE	0.282	116.000	0.000	NA		NA
3711506	3711507	CKL_3297	CKL_3298			TRUE	0.994	16.000	0.286	NA		NA
3711507	3711508	CKL_3298	CKL_3299			TRUE	0.942	4.000	0.000	NA		NA
3711508	3711509	CKL_3299	CKL_3300			FALSE	0.107	191.000	0.000	NA		NA
3711509	3711510	CKL_3300	CKL_3301			TRUE	0.942	4.000	0.000	NA		NA
3711510	3711511	CKL_3301	CKL_3302			TRUE	0.946	2.000	0.000	NA		NA
3711511	3711512	CKL_3302	CKL_3303			TRUE	0.926	13.000	0.000	NA		NA
3711512	3711513	CKL_3303	CKL_3304			TRUE	0.915	16.000	0.000	NA		NA
3711513	3711514	CKL_3304	CKL_3305			TRUE	0.926	13.000	0.000	NA		NA
3711514	3711515	CKL_3305	CKL_3306			TRUE	0.957	-37.000	0.000	NA		NA
3711515	3711516	CKL_3306	CKL_3307			TRUE	0.951	-3.000	0.000	NA		NA
3711516	3711517	CKL_3307	CKL_3308			TRUE	0.778	31.000	0.000	NA		NA
3711517	3711518	CKL_3308	CKL_3309			TRUE	0.954	-7.000	0.000	NA		NA
3711518	3711519	CKL_3309	CKL_3310			TRUE	0.947	1.000	0.000	NA		NA
3711519	3711520	CKL_3310	CKL_3311			TRUE	0.872	22.000	0.000	NA		NA
3711520	3711521	CKL_3311	CKL_3312			FALSE	0.113	186.000	0.000	NA		NA
3711521	3711522	CKL_3312	CKL_3313			TRUE	0.539	56.000	0.000	NA		NA
3711523	3711524	CKL_3314	CKL_3315			TRUE	0.883	21.000	0.000	NA		NA
3711526	3711527	CKL_3317	CKL_3318			FALSE	0.006	492.000	0.000	1.000	N	NA
3711527	3711528	CKL_3318	CKL_3319			TRUE	0.385	91.000	0.000	NA		NA
3711528	3711529	CKL_3319	CKL_3320			FALSE	0.139	169.000	0.000	NA		NA
3711529	3711530	CKL_3320	CKL_3321		fprA	FALSE	0.008	440.000	0.000	1.000	N	NA
3711531	3711532	CKL_3322	CKL_3323			FALSE	0.225	129.000	0.000	1.000		NA
3711533	3711534	CKL_3324	CKL_3325			TRUE	0.999	0.000	0.876	1.000	Y	NA
3711534	3711535	CKL_3325	CKL_3326			FALSE	0.276	196.000	0.034	1.000		NA
3711538	3711539	CKL_3329	CKL_3330			TRUE	0.932	25.000	0.015	1.000		NA
3711541	3711542	CKL_3332	CKL_3333			TRUE	0.763	112.000	0.127	NA		NA
3711542	3711543	CKL_3333	CKL_3334			FALSE	0.172	146.000	0.000	NA		NA
3711543	3711544	CKL_3334	CKL_3335		greA2	FALSE	0.020	350.000	0.000	NA		NA
3711548	3711549	CKL_3339	CKL_3340			FALSE	0.217	130.000	0.000	NA		NA
3711549	3711550	CKL_3340	CKL_3341			TRUE	0.863	44.000	0.000	1.000	Y	NA
3711556	3711557	CKL_3347	CKL_3348		engB	TRUE	0.782	45.000	0.005	NA		NA
3711557	3711558	CKL_3348	CKL_3349	engB	lon	TRUE	0.980	13.000	0.048	1.000		NA
3711558	3711559	CKL_3349	CKL_3350	lon	clpX	TRUE	0.823	116.000	0.030	0.087	Y	NA
3711559	3711560	CKL_3350	CKL_3351	clpX	clpP	TRUE	0.985	20.000	0.022	1.000	Y	NA
3711560	3711561	CKL_3351	CKL_3352	clpP	tig	TRUE	0.620	148.000	0.024	1.000	Y	NA
3711561	3711562	CKL_3352	CKL_3353	tig		FALSE	0.008	430.000	0.000	NA	N	NA
3711562	3711563	CKL_3353	CKL_3354			TRUE	0.460	71.000	0.000	NA		NA
3711563	3711564	CKL_3354	CKL_3355		pyrE	FALSE	0.007	564.000	0.000	NA		NA
3711564	3711565	CKL_3355	CKL_3356	pyrE	pyrD2	TRUE	0.994	11.000	0.060	1.000	Y	NA
3711565	3711566	CKL_3356	CKL_3357	pyrD2	pyrK	TRUE	0.985	36.000	0.592	1.000	N	NA
3711566	3711567	CKL_3357	CKL_3358	pyrK	pyrF	TRUE	0.970	35.000	0.112	0.001	N	NA
3711567	3711568	CKL_3358	CKL_3359	pyrF	pyrC	TRUE	0.983	26.000	0.064	1.000	Y	NA
3711568	3711569	CKL_3359	CKL_3360	pyrC	pyrI	TRUE	0.967	32.000	0.032	1.000	Y	NA
3711569	3711570	CKL_3360	CKL_3361	pyrI	pyrB	TRUE	0.998	14.000	0.197	0.001	Y	NA
3711571	3711572	CKL_3362	CKL_3363			FALSE	0.124	157.000	0.000	1.000	N	NA
3711573	3711574	CKL_3364	CKL_3365			FALSE	0.115	185.000	0.000	NA		NA
3711576	3711577	CKL_3367	CKL_3368			TRUE	0.983	5.000	0.000	1.000	Y	NA
3711577	3711578	CKL_3368	CKL_3369			TRUE	0.467	69.000	0.000	NA		NA
3711578	3711579	CKL_3369	CKL_3370			FALSE	0.076	215.000	0.000	NA		NA
3711579	3711580	CKL_3370	CKL_3371			FALSE	0.331	103.000	0.000	NA		NA
3711580	3711581	CKL_3371	CKL_3372			TRUE	0.363	252.000	0.259	1.000	N	NA
3711581	3711582	CKL_3372	CKL_3373			FALSE	0.038	300.000	0.000	0.070	N	NA
3711584	3711585	CKL_3375	CKL_3376		rnr	TRUE	0.947	47.000	0.143	0.014	N	NA
3711585	3711586	CKL_3376	CKL_3377	rnr		FALSE	0.165	251.000	0.064	1.000	N	NA
3711586	3711587	CKL_3377	CKL_3378			FALSE	0.163	200.000	0.006	1.000	N	NA
3711587	3711588	CKL_3378	CKL_3379			TRUE	0.797	100.000	0.016	1.000	Y	NA
3711588	3711589	CKL_3379	CKL_3380			TRUE	0.995	19.000	0.138	1.000	Y	NA
3711589	3711590	CKL_3380	CKL_3381			TRUE	0.993	22.000	0.141	1.000	Y	NA
3711590	3711591	CKL_3381	CKL_3382			TRUE	0.878	121.000	0.063	0.002	Y	NA
3711591	3711592	CKL_3382	CKL_3383			FALSE	0.120	181.000	0.000	NA		NA
3711592	3711593	CKL_3383	CKL_3384			TRUE	0.761	55.000	0.016	NA		NA
3711593	3711594	CKL_3384	CKL_3385			TRUE	0.417	117.000	0.007	1.000	N	NA
3711594	3711595	CKL_3385	CKL_3386			FALSE	0.041	237.000	0.000	1.000	N	NA
3711595	3711596	CKL_3386	CKL_3387			FALSE	0.168	149.000	0.000	NA		NA
3711598	3711599	CKL_3389	CKL_3390			FALSE	0.019	353.000	0.000	NA		NA
3711599	3711600	CKL_3390	CKL_3391			FALSE	0.046	253.000	0.000	NA		NA
3711600	3711601	CKL_3391	CKL_3392			TRUE	0.979	13.000	0.000	1.000	Y	NA
3711601	3711602	CKL_3392	CKL_3393			FALSE	0.216	146.000	0.000	0.087	N	NA
3711602	3711603	CKL_3393	CKL_3394			TRUE	0.987	-6.000	0.000	1.000	Y	NA
3711606	3711607	CKL_3397	CKL_3398			TRUE	0.991	20.000	0.250	NA		NA
3711607	3711608	CKL_3398	CKL_3399			TRUE	0.919	15.000	0.000	NA		NA
3711608	3711609	CKL_3399	CKL_3400			FALSE	0.115	185.000	0.000	NA		NA
3711611	3711612	CKL_3402	CKL_3403			FALSE	0.152	165.000	0.000	1.000		NA
3711613	3711614	CKL_3404	CKL_3405			FALSE	0.008	513.000	0.000	1.000		NA
3711614	3711615	CKL_3405	CKL_3406			FALSE	0.239	125.000	0.000	NA		NA
3711615	3711616	CKL_3406	CKL_3407			FALSE	0.009	486.000	0.000	NA		NA
3711616	3711617	CKL_3407	CKL_3408			FALSE	0.312	108.000	0.000	NA		NA
3711619	3711620	CKL_3410	CKL_3411			TRUE	0.975	-3.000	0.011	1.000	N	NA
3711620	3711621	CKL_3411	CKL_3412			FALSE	0.103	172.000	0.000	1.000	N	NA
3711621	3711622	CKL_3412	CKL_3413			TRUE	0.998	-7.000	0.101	0.001	Y	NA
3711622	3711623	CKL_3413	CKL_3414			FALSE	0.007	564.000	0.000	1.000		NA
3711625	3711626	CKL_3416	CKL_3417			TRUE	0.991	11.000	0.022	1.000	Y	NA
3711626	3711627	CKL_3417	CKL_3418			FALSE	0.015	351.000	0.000	1.000	N	NA
3711627	3711628	CKL_3418	CKL_3419			FALSE	0.265	104.000	0.000	1.000	N	NA
3711628	3711629	CKL_3419	CKL_3420			FALSE	0.083	191.000	0.000	1.000	N	NA
3711631	3711632	CKL_3422	CKL_3423			FALSE	0.070	220.000	0.000	NA		NA
3711632	3711633	CKL_3423	CKL_3424			FALSE	0.042	316.000	0.000	0.069		NA
3711635	3711636	CKL_3426	CKL_3427	cbiO	cbiQ	TRUE	0.999	-3.000	0.335	0.001	Y	NA
3711636	3711637	CKL_3427	CKL_3428	cbiQ	cbiN	TRUE	1.000	-3.000	0.804	0.001	Y	NA
3711637	3711638	CKL_3428	CKL_3429	cbiN	cbiM	TRUE	1.000	5.000	0.861	0.009	Y	NA
3711639	3711640	CKL_3430	CKL_3431			FALSE	0.290	196.000	0.000	NA	Y	NA
3711641	3711642	CKL_3432	CKL_3433	sodA		FALSE	0.047	253.000	0.000	1.000		NA
3711642	3711643	CKL_3433	CKL_3434			FALSE	0.161	158.000	0.000	1.000		NA
3711643	3711644	CKL_3434	CKL_3435			FALSE	0.179	128.000	0.000	1.000	N	NA
3711644	3711645	CKL_3435	CKL_3436		dhaT2	FALSE	0.027	281.000	0.000	1.000	N	NA
3711645	3711646	CKL_3436	CKL_3437	dhaT2		TRUE	0.997	21.000	0.286	0.033	Y	NA
3711646	3711647	CKL_3437	CKL_3438			FALSE	0.013	367.000	0.000	1.000	N	NA
3711647	3711648	CKL_3438	CKL_3439		dinB	FALSE	0.101	174.000	0.000	1.000	N	NA
3711649	3711650	CKL_3440	CKL_3441			FALSE	0.034	286.000	0.000	NA		NA
3711650	3711651	CKL_3441	CKL_3442			FALSE	0.197	195.000	0.000	0.011		NA
3711651	3711652	CKL_3442	CKL_3443			FALSE	0.004	2031.000	0.000	1.000		NA
3711652	3711653	CKL_3443	CKL_3444			FALSE	0.164	152.000	0.000	NA		NA
3711653	3711654	CKL_3444	CKL_3445			TRUE	0.651	42.000	0.000	NA		NA
3711654	3711655	CKL_3445	CKL_3446			FALSE	0.106	192.000	0.000	NA		NA
3711656	3711657	CKL_3447	CKL_3448			FALSE	0.033	289.000	0.000	NA		NA
3711657	3711658	CKL_3448	CKL_3449			FALSE	0.013	409.000	0.000	NA		NA
3711658	3711659	CKL_3449	CKL_3450			FALSE	0.023	322.000	0.000	NA		NA
3711659	3711660	CKL_3450	CKL_3451			FALSE	0.010	468.000	0.000	NA		NA
3711660	3711661	CKL_3451	CKL_3452			TRUE	0.810	28.000	0.000	NA		NA
3711661	3711662	CKL_3452	CKL_3453			TRUE	0.901	19.000	0.000	NA		NA
3711662	3711663	CKL_3453	CKL_3454			TRUE	0.463	70.000	0.000	NA		NA
3711663	3711664	CKL_3454	CKL_3455			TRUE	0.665	41.000	0.000	NA		NA
3711664	3711665	CKL_3455	CKL_3456			TRUE	0.944	3.000	0.000	NA		NA
3711665	3711666	CKL_3456	CKL_3457			TRUE	0.936	7.000	0.000	NA		NA
3711666	3711667	CKL_3457	CKL_3458			TRUE	0.931	11.000	0.000	NA		NA
3711667	3711668	CKL_3458	CKL_3459			TRUE	0.935	8.000	0.000	NA		NA
3711668	3711669	CKL_3459	CKL_3460			TRUE	0.938	6.000	0.000	NA		NA
3711669	3711670	CKL_3460	CKL_3461			TRUE	0.570	52.000	0.000	NA		NA
3711670	3711671	CKL_3461	CKL_3462			FALSE	0.226	128.000	0.000	NA		NA
3711671	3711672	CKL_3462	CKL_3463			TRUE	0.994	3.000	0.085	0.014		NA
3711672	3711673	CKL_3463	CKL_3464		rpH	TRUE	0.971	0.000	0.006	1.000	N	NA
3711673	3711674	CKL_3464	CKL_3465	rpH	hypE	TRUE	0.546	46.000	0.000	1.000	N	NA
3711675	3711676	CKL_3466	CKL_3467			TRUE	0.730	164.000	0.300	NA		NA
3711679	3711680	CKL_3470	CKL_3471	gatB	gatA	TRUE	0.999	-10.000	0.492	0.001	Y	NA
3711680	3711681	CKL_3471	CKL_3472	gatA	gatC	TRUE	0.991	64.000	0.643	0.001	Y	NA
3711681	3711682	CKL_3472	CKL_3473	gatC		FALSE	0.048	250.000	0.000	NA		NA
3711682	3711683	CKL_3473	CKL_3474			FALSE	0.022	328.000	0.000	NA		NA
3711683	3711684	CKL_3474	CKL_3475			FALSE	0.302	112.000	0.000	1.000		NA
3711684	3711685	CKL_3475	CKL_3476			TRUE	0.490	64.000	0.000	1.000		NA
3711685	3711686	CKL_3476	CKL_3477			TRUE	0.656	42.000	0.000	1.000		NA
3711686	3711687	CKL_3477	CKL_3478			TRUE	0.990	-49.000	0.055	NA		NA
3711687	3711688	CKL_3478	CKL_3479			TRUE	0.767	32.000	0.000	NA		NA
3711688	3711689	CKL_3479	CKL_3480			TRUE	0.628	114.000	0.054	NA		NA
3711689	3711690	CKL_3480	CKL_3481			FALSE	0.060	230.000	0.000	NA		NA
3711690	3711691	CKL_3481	CKL_3482		ligA1	FALSE	0.054	219.000	0.000	1.000	N	NA
3711691	3711692	CKL_3482	CKL_3483	ligA1		TRUE	0.975	0.000	0.003	NA		NA
3711692	3711693	CKL_3483	CKL_3484		pcrA	TRUE	0.646	72.000	0.005	NA		NA
3711693	3711694	CKL_3484	CKL_3485	pcrA		FALSE	0.274	187.000	0.025	1.000		NA
3711694	3711695	CKL_3485	CKL_3486		rsuA	FALSE	0.015	385.000	0.000	1.000		NA
3711695	3711696	CKL_3486	CKL_3487	rsuA		FALSE	0.264	204.000	0.041	NA		NA
3711696	3711697	CKL_3487	CKL_3488			TRUE	0.828	71.000	0.083	NA		NA
3711699	3711700	CKL_3490	CKL_3491		pgi	FALSE	0.055	338.000	0.018	NA		NA
3711702	3711703	CKL_3493	CKL_3494	glgD	glgC	TRUE	0.990	50.000	0.309	0.000	Y	NA
3711703	3711704	CKL_3494	CKL_3495	glgC	apu	TRUE	0.954	41.000	0.049	1.000	Y	NA
3711704	3711705	CKL_3495	CKL_3496	apu	glgP	TRUE	0.976	58.000	0.186	0.010	Y	NA
3711705	3711706	CKL_3496	CKL_3497	glgP	glgA	TRUE	0.983	35.000	0.143	1.000	Y	NA
3711706	3711707	CKL_3497	CKL_3498	glgA	glgB	TRUE	0.822	54.000	0.000	1.000	Y	NA
3711707	3711708	CKL_3498	CKL_3499	glgB		FALSE	0.014	352.000	0.000	1.000	N	NA
3711708	3711709	CKL_3499	CKL_3500			TRUE	0.639	43.000	0.000	NA		NA
3711710	3711711	CKL_3501	CKL_3502			TRUE	0.984	3.000	0.000	NA	Y	NA
3711712	3711713	CKL_3503	CKL_3504			TRUE	0.921	108.000	0.625	1.000	N	NA
3711714	3711715	CKL_3505	CKL_3506			FALSE	0.268	119.000	0.000	NA		NA
3711715	3711716	CKL_3506	CKL_3507			FALSE	0.075	216.000	0.000	NA		NA
3711718	3711719	CKL_3509	CKL_3510			TRUE	0.967	19.000	0.042	1.000	N	NA
3711719	3711720	CKL_3510	CKL_3511			TRUE	0.993	13.000	0.050	1.000	Y	NA
3711720	3711721	CKL_3511	CKL_3512			TRUE	0.999	-3.000	0.671	0.086	N	NA
3711722	3711723	CKL_3513	CKL_3514	fabH2		TRUE	0.953	70.000	0.500	NA		NA
3711723	3711724	CKL_3514	CKL_3515			FALSE	0.019	352.000	0.000	NA		NA
3711724	3711725	CKL_3515	CKL_3516		etfA2	TRUE	0.974	24.000	0.000	0.008	Y	NA
3711725	3711726	CKL_3516	CKL_3517	etfA2	etfB2	TRUE	0.999	3.000	0.667	0.014	Y	NA
3711726	3711727	CKL_3517	CKL_3518	etfB2		FALSE	0.027	306.000	0.000	NA		NA
3711727	3711728	CKL_3518	CKL_3519			FALSE	0.120	181.000	0.000	NA		NA
3711728	3711729	CKL_3519	CKL_3520			TRUE	0.933	10.000	0.000	NA		NA
3711729	3711730	CKL_3520	CKL_3521			TRUE	0.956	-19.000	0.000	NA		NA
3711734	3711735	CKL_3525	CKL_3526		aroP	FALSE	0.135	171.000	0.000	NA		NA
3711736	3711737	CKL_3527	CKL_3528	tyrS2		FALSE	0.005	666.000	0.000	1.000		NA
3711738	3711739	CKL_3529	CKL_3530			FALSE	0.249	123.000	0.000	NA		NA
3711739	3711740	CKL_3530	CKL_3531			FALSE	0.004	2716.000	0.000	NA		NA
3711742	3711743	CKL_3533	CKL_3534			TRUE	0.999	1.000	0.860	0.084	N	NA
3711743	3711744	CKL_3534	CKL_3535			TRUE	0.981	16.000	0.070	NA		NA
3711744	3711745	CKL_3535	CKL_3536			TRUE	0.998	10.000	0.833	NA		NA
3711745	3711746	CKL_3536	CKL_3537			TRUE	0.709	141.000	0.211	NA		NA
3711746	3711747	CKL_3537	CKL_3538			FALSE	0.018	359.000	0.000	NA		NA
3711747	3711748	CKL_3538	CKL_3539			TRUE	0.437	79.000	0.000	NA		NA
3711748	3711749	CKL_3539	CKL_3540			TRUE	0.996	3.000	0.289	NA		NA
3711749	3711750	CKL_3540	CKL_3541			FALSE	0.036	281.000	0.000	NA		NA
3711750	3711751	CKL_3541	CKL_3542			TRUE	0.994	-3.000	0.154	1.000		NA
3711751	3711752	CKL_3542	CKL_3543			TRUE	0.996	3.000	0.231	0.084	N	NA
3711752	3711753	CKL_3543	CKL_3544			TRUE	0.999	-34.000	0.500	1.000	Y	NA
3711753	3711754	CKL_3544	CKL_3545			FALSE	0.015	384.000	0.000	NA		NA
3711754	3711755	CKL_3545	CKL_3546			FALSE	0.057	233.000	0.000	NA		NA
3711755	3711756	CKL_3546	CKL_3547			TRUE	0.432	80.000	0.000	NA		NA
3711756	3711757	CKL_3547	CKL_3548			FALSE	0.133	172.000	0.000	NA		NA
3711757	3711758	CKL_3548	CKL_3549			FALSE	0.009	482.000	0.000	NA		NA
3711760	3711761	CKL_3551	CKL_3552			TRUE	0.999	-3.000	0.875	1.000		NA
3711761	3711762	CKL_3552	CKL_3553			TRUE	0.977	73.000	0.875	0.084	N	NA
3711762	3711763	CKL_3553	CKL_3554			TRUE	0.999	-3.000	0.875	1.000	Y	NA
3711763	3711764	CKL_3554	CKL_3555			TRUE	0.951	-3.000	0.000	NA		NA
3711764	3711765	CKL_3555	CKL_3556			TRUE	0.403	87.000	0.000	NA		NA
3711765	3711766	CKL_3556	CKL_3557			FALSE	0.018	360.000	0.000	NA		NA
3711766	3711767	CKL_3557	CKL_3558		pyk	FALSE	0.139	143.000	0.000	1.000	N	NA
3711767	3711768	CKL_3558	CKL_3559	pyk	pfk1	TRUE	0.941	55.000	0.015	0.002	Y	NA
3711768	3711769	CKL_3559	CKL_3560	pfk1	dnaE	FALSE	0.207	203.000	0.029	1.000	N	NA
3711769	3711770	CKL_3560	CKL_3561	dnaE		TRUE	0.369	127.000	0.009	1.000	N	NA
3711770	3711771	CKL_3561	CKL_3562			TRUE	0.970	12.000	0.012	1.000		NA
3711771	3711772	CKL_3562	CKL_3563			TRUE	0.996	14.000	0.470	NA		NA
3711772	3711773	CKL_3563	CKL_3564			TRUE	0.996	-3.000	0.259	NA		NA
3711773	3711774	CKL_3564	CKL_3565		murB	TRUE	0.462	170.000	0.080	NA		NA
3711774	3711775	CKL_3565	CKL_3566	murB	uvrC	FALSE	0.130	211.000	0.003	1.000	N	NA
3711775	3711776	CKL_3566	CKL_3567	uvrC		TRUE	0.955	18.000	0.005	NA		NA
3711776	3711777	CKL_3567	CKL_3568			TRUE	0.426	134.000	0.026	NA		NA
3711777	3711778	CKL_3568	CKL_3569			TRUE	0.995	5.000	0.285	1.000	N	NA
3711778	3711779	CKL_3569	CKL_3570			TRUE	0.801	60.000	0.047	NA		NA
3711779	3711780	CKL_3570	CKL_3571		uvrA	TRUE	0.652	70.000	0.005	NA		NA
3711780	3711781	CKL_3571	CKL_3572	uvrA	uvrB	TRUE	0.995	26.000	0.154	0.001	Y	NA
3711781	3711782	CKL_3572	CKL_3573	uvrB		TRUE	0.976	4.000	0.013	1.000		NA
3711782	3711783	CKL_3573	CKL_3574			TRUE	0.533	176.000	0.060	0.007		NA
3711783	3711784	CKL_3574	CKL_3575			FALSE	0.180	201.000	0.015	1.000	N	NA
3711784	3711785	CKL_3575	CKL_3576			TRUE	0.999	-10.000	0.431	1.000	Y	NA
3711785	3711786	CKL_3576	CKL_3577		tktB	FALSE	0.071	201.000	0.000	1.000	N	NA
3711786	3711787	CKL_3577	CKL_3578	tktB	tktA	TRUE	0.999	0.000	0.180	0.000	Y	NA
3711787	3711788	CKL_3578	CKL_3579	tktA		FALSE	0.251	177.000	0.019	1.000	N	NA
3711788	3711789	CKL_3579	CKL_3580			TRUE	0.985	-40.000	0.039	1.000	N	NA
3711789	3711790	CKL_3580	CKL_3581		alr	FALSE	0.005	549.000	0.000	1.000	N	NA
3711790	3711791	CKL_3581	CKL_3582	alr		TRUE	0.416	152.000	0.000	NA	Y	NA
3711791	3711792	CKL_3582	CKL_3583			TRUE	0.704	92.000	0.064	NA	N	NA
3711792	3711793	CKL_3583	CKL_3584		acpS	TRUE	0.981	-28.000	0.020	NA	N	NA
3711793	3711794	CKL_3584	CKL_3585	acpS		FALSE	0.314	168.000	0.020	NA		NA
3711794	3711795	CKL_3585	CKL_3586			FALSE	0.036	279.000	0.000	NA		NA
3711795	3711796	CKL_3586	CKL_3587			FALSE	0.325	105.000	0.000	1.000		NA
3711796	3711797	CKL_3587	CKL_3588			TRUE	0.544	145.000	0.041	0.041		NA
3711797	3711798	CKL_3588	CKL_3589			FALSE	0.007	554.000	0.000	NA		NA
3711798	3711799	CKL_3589	CKL_3590			TRUE	0.898	90.000	0.281	NA		NA
3711799	3711800	CKL_3590	CKL_3591			FALSE	0.300	214.000	0.094	1.000	N	NA
3711800	3711801	CKL_3591	CKL_3592			TRUE	0.918	62.000	0.222	NA		NA
3711803	3711804	CKL_3594	CKL_3595		cat3	FALSE	0.058	232.000	0.000	NA		NA
3711804	3711805	CKL_3595	CKL_3596	cat3		FALSE	0.014	352.000	0.000	1.000	N	NA
3711806	3711807	CKL_3597	CKL_3598			TRUE	0.980	12.000	0.041	NA		NA
3711807	3711808	CKL_3598	CKL_3599		fba	FALSE	0.015	388.000	0.000	NA		NA
3711808	3711809	CKL_3599	CKL_3600	fba		FALSE	0.056	217.000	0.000	1.000	N	NA
3711809	3711810	CKL_3600	CKL_3601			TRUE	0.988	10.000	0.098	NA		NA
3711810	3711811	CKL_3601	CKL_3602			TRUE	0.956	-16.000	0.000	NA		NA
3711811	3711812	CKL_3602	CKL_3603			TRUE	0.819	27.000	0.000	NA		NA
3711812	3711813	CKL_3603	CKL_3604			TRUE	0.432	80.000	0.000	NA		NA
3711813	3711814	CKL_3604	CKL_3605		leuS	FALSE	0.008	492.000	0.000	NA		NA
3711817	3711818	CKL_3608	CKL_3609			TRUE	0.988	5.000	0.077	1.000		NA
3711818	3711819	CKL_3609	CKL_3610			TRUE	0.976	44.000	0.500	NA		NA
3711819	3711820	CKL_3610	CKL_3611			TRUE	0.404	133.000	0.016	NA		NA
3711820	3711821	CKL_3611	CKL_3612		tex	FALSE	0.009	482.000	0.000	NA		NA
3711821	3711822	CKL_3612	CKL_3613	tex		FALSE	0.010	412.000	0.000	1.000	N	NA
3711822	3711823	CKL_3613	CKL_3614			TRUE	0.995	-3.000	0.044	1.000	Y	NA
3711823	3711824	CKL_3614	CKL_3615			TRUE	0.986	-25.000	0.044	1.000	N	NA
3711824	3711825	CKL_3615	CKL_3616			TRUE	0.522	58.000	0.000	NA		NA
3711825	3711826	CKL_3616	CKL_3617		prfB	FALSE	0.181	141.000	0.000	NA		NA
3711826	3711827	CKL_3617	CKL_3618	prfB	secA	TRUE	0.420	142.000	0.048	1.000	N	NA
3711827	3711828	CKL_3618	CKL_3619	secA		TRUE	0.376	164.000	0.050	NA	N	NA
3711828	3711829	CKL_3619	CKL_3620		ilvE3	FALSE	0.009	415.000	0.000	NA	N	NA
3711830	3711831	CKL_3621	CKL_3622			FALSE	0.013	365.000	0.000	1.000	N	NA
3711832	3711833	CKL_3623	CKL_3624			FALSE	0.153	163.000	0.000	NA		NA
3711835	3711836	CKL_3626	CKL_3627			TRUE	0.984	1.000	0.038	NA		NA
3711836	3711837	CKL_3627	CKL_3628			FALSE	0.009	494.000	0.000	1.000		NA
3711837	3711838	CKL_3628	CKL_3629			TRUE	0.507	61.000	0.000	1.000		NA
3711839	3711840	CKL_3630	CKL_3631			TRUE	0.782	31.000	0.000	1.000		NA
3711841	3711842	CKL_3632	CKL_3633			FALSE	0.061	229.000	0.000	NA		NA
3711842	3711843	CKL_3633	CKL_3634			FALSE	0.282	116.000	0.000	NA		NA
3711843	3711844	CKL_3634	CKL_3635			TRUE	0.696	39.000	0.000	NA		NA
3711844	3711845	CKL_3635	CKL_3636			FALSE	0.127	177.000	0.000	NA		NA
3711846	3711847	CKL_3637	CKL_3638			TRUE	0.955	-7.000	0.000	1.000		NA
3711847	3711848	CKL_3638	CKL_3639			TRUE	0.704	51.000	0.000	0.066		NA
3711848	3711849	CKL_3639	CKL_3640			TRUE	0.938	6.000	0.000	NA		NA
3711850	3711851	CKL_3641	CKL_3642			FALSE	0.267	120.000	0.000	1.000		NA
3711851	3711852	CKL_3642	CKL_3643			FALSE	0.133	147.000	0.000	1.000	N	NA
3711852	3711853	CKL_3643	CKL_3644			TRUE	0.896	20.000	0.000	1.000		NA
3711853	3711854	CKL_3644	CKL_3645			TRUE	0.977	-30.000	0.000	0.038		NA
3711854	3711855	CKL_3645	CKL_3646			TRUE	0.989	17.000	0.167	NA		NA
3711855	3711856	CKL_3646	CKL_3647			TRUE	0.608	47.000	0.000	NA		NA
3711856	3711857	CKL_3647	CKL_3648			TRUE	0.608	47.000	0.000	NA		NA
3711857	3711858	CKL_3648	CKL_3649			TRUE	1.000	-9.000	0.838	0.003	Y	NA
3711858	3711859	CKL_3649	CKL_3650			TRUE	0.980	26.000	0.193	NA		NA
3711859	3711860	CKL_3650	CKL_3651			TRUE	0.982	-3.000	0.019	NA		NA
3711864	3711865	CKL_3655	CKL_3656			TRUE	0.957	-40.000	0.000	NA		NA
3711865	3711866	CKL_3656	CKL_3657			TRUE	0.449	75.000	0.000	NA		NA
3711866	3711867	CKL_3657	CKL_3658			FALSE	0.004	1476.000	0.000	NA		NA
3711867	3711868	CKL_3658	CKL_3659			TRUE	0.925	42.000	0.108	NA		NA
3711868	3711869	CKL_3659	CKL_3660			FALSE	0.012	426.000	0.000	NA		NA
3711870	3711871	CKL_3661	CKL_3662			FALSE	0.203	133.000	0.000	NA		NA
3711872	3711873	CKL_3663	CKL_3664			FALSE	0.305	110.000	0.000	NA		NA
3711873	3711874	CKL_3664	CKL_3665			FALSE	0.087	205.000	0.000	NA		NA
3711874	3711875	CKL_3665	CKL_3666			TRUE	0.910	17.000	0.000	NA		NA
3711877	3711878	CKL_3668	CKL_3669			TRUE	0.980	-27.000	0.005	NA		NA
3711878	3711879	CKL_3669	CKL_3670			TRUE	0.991	-31.000	0.069	NA		NA
3711880	3711881	CKL_3671	CKL_3672			TRUE	0.989	7.000	0.000	0.007	Y	NA
3711881	3711882	CKL_3672	CKL_3673			TRUE	0.582	42.000	0.000	1.000	N	NA
3711883	3711884	CKL_3674	CKL_3675	metK3		FALSE	0.048	250.000	0.000	NA		NA
3711884	3711885	CKL_3675	CKL_3676			TRUE	0.938	6.000	0.000	NA		NA
3711885	3711886	CKL_3676	CKL_3677			TRUE	0.883	21.000	0.000	NA		NA
3711886	3711887	CKL_3677	CKL_3678			TRUE	0.933	10.000	0.000	NA		NA
3711887	3711888	CKL_3678	CKL_3679			TRUE	0.938	6.000	0.000	NA		NA
3711890	3711891	CKL_3681	CKL_3682			TRUE	0.886	98.000	0.284	1.000		NA
3711891	3711892	CKL_3682	CKL_3683			FALSE	0.111	345.000	0.093	1.000		NA
3711892	3711893	CKL_3683	CKL_3684			TRUE	0.547	147.000	0.090	1.000		NA
3711893	3711894	CKL_3684	CKL_3685		murA2	TRUE	0.718	137.000	0.243	1.000	N	NA
3711894	3711895	CKL_3685	CKL_3686	murA2		FALSE	0.200	393.000	0.346	NA		NA
3711895	3711896	CKL_3686	CKL_3687		atpC	FALSE	0.057	310.000	0.007	NA		NA
3711896	3711897	CKL_3687	CKL_3688	atpC	atpD	TRUE	0.995	51.000	0.837	0.002	Y	NA
3711897	3711898	CKL_3688	CKL_3689	atpD	atpG	TRUE	0.999	13.000	0.724	0.002	Y	NA
3711898	3711899	CKL_3689	CKL_3690	atpG	atpA	TRUE	0.999	27.000	0.846	0.002	Y	NA
3711899	3711900	CKL_3690	CKL_3691	atpA	atpH	TRUE	1.000	5.000	0.864	0.002	Y	NA
3711900	3711901	CKL_3691	CKL_3692	atpH	atpF	TRUE	0.996	5.000	0.040	0.002	Y	NA
3711901	3711902	CKL_3692	CKL_3693	atpF	atpE	TRUE	0.915	62.000	0.095	0.002		NA
3711902	3711903	CKL_3693	CKL_3694	atpE	atpB	TRUE	0.872	50.000	0.009	0.002		NA
3711903	3711904	CKL_3694	CKL_3695	atpB	atpI	TRUE	0.930	34.000	0.005	0.002		NA
3711904	3711905	CKL_3695	CKL_3696	atpI	thlA1	FALSE	0.013	413.000	0.000	1.000		NA
3711905	3711906	CKL_3696	CKL_3697	thlA1	thlA2	FALSE	0.030	881.000	0.000	0.001	Y	NA
3711906	3711907	CKL_3697	CKL_3698	thlA2	thlA3	FALSE	0.033	797.000	0.000	0.001	Y	NA
3711907	3711908	CKL_3698	CKL_3699	thlA3	epsC	FALSE	0.091	183.000	0.000	1.000	N	NA
3711908	3711909	CKL_3699	CKL_3700	epsC		TRUE	0.982	53.000	0.346	1.000	Y	NA
3711909	3711910	CKL_3700	CKL_3701			FALSE	0.065	313.000	0.029	1.000	N	NA
3711910	3711911	CKL_3701	CKL_3702		upp	TRUE	0.541	191.000	0.041	1.000	Y	NA
3711911	3711912	CKL_3702	CKL_3703	upp		TRUE	0.648	76.000	0.019	1.000	N	NA
3711912	3711913	CKL_3703	CKL_3704			TRUE	0.689	98.000	0.065	1.000	N	NA
3711913	3711914	CKL_3704	CKL_3705			TRUE	0.961	22.000	0.056	NA	N	NA
3711914	3711915	CKL_3705	CKL_3706		zupT	TRUE	0.757	67.000	0.052	NA	N	NA
3711915	3711916	CKL_3706	CKL_3707	zupT		TRUE	0.855	73.000	0.116	NA		NA
3711916	3711917	CKL_3707	CKL_3708		prfA	TRUE	0.706	61.000	0.009	NA		NA
3711917	3711918	CKL_3708	CKL_3709	prfA		TRUE	0.884	118.000	0.081	0.026	Y	NA
3711918	3711919	CKL_3709	CKL_3710			TRUE	0.991	0.000	0.098	NA		NA
3711920	3711921	CKL_3711	CKL_3712		rpmE	FALSE	0.230	127.000	0.000	NA		NA
3711922	3711923	CKL_3713	CKL_3714			FALSE	0.199	196.000	0.006	NA		NA
3711923	3711924	CKL_3714	CKL_3715		pyrG	FALSE	0.034	285.000	0.000	NA		NA
3711924	3711925	CKL_3715	CKL_3716	pyrG		FALSE	0.091	256.000	0.004	NA		NA
3711925	3711926	CKL_3716	CKL_3717			FALSE	0.211	220.000	0.039	NA		NA
3711926	3711927	CKL_3717	CKL_3718			FALSE	0.035	283.000	0.000	NA		NA
3711929	3711930	CKL_3720	CKL_3721			TRUE	0.841	77.000	0.109	NA		NA
3711930	3711931	CKL_3721	CKL_3722			TRUE	0.915	53.000	0.067	0.005		NA
3711931	3711932	CKL_3722	CKL_3723			TRUE	0.988	16.000	0.133	NA		NA
3711932	3711933	CKL_3723	CKL_3724		ispE	FALSE	0.316	145.000	0.005	NA		NA
3711933	3711934	CKL_3724	CKL_3725	ispE	cphA	TRUE	0.520	123.000	0.016	0.083	N	NA
3711934	3711935	CKL_3725	CKL_3726	cphA	cphB	TRUE	0.469	288.000	0.605	1.000	N	NA
3711935	3711936	CKL_3726	CKL_3727	cphB		FALSE	0.272	240.000	0.109	1.000		NA
3711936	3711937	CKL_3727	CKL_3728			FALSE	0.046	490.000	0.082	NA		NA
3711937	3711938	CKL_3728	CKL_3729			TRUE	0.402	205.000	0.116	NA		NA
3711938	3711939	CKL_3729	CKL_3730		cotS2	TRUE	0.695	125.000	0.119	NA		NA
3711940	3711941	CKL_3731	CKL_3732			FALSE	0.025	289.000	0.000	1.000	N	NA
3711941	3711942	CKL_3732	CKL_3733			TRUE	0.955	30.000	0.000	0.030	Y	NA
3711942	3711943	CKL_3733	CKL_3734			FALSE	0.020	306.000	0.000	1.000	N	NA
3711943	3711944	CKL_3734	CKL_3735			TRUE	0.999	-3.000	0.389	0.005	Y	NA
3711944	3711945	CKL_3735	CKL_3736			FALSE	0.148	136.000	0.000	NA	N	NA
3711946	3711947	CKL_3737	CKL_3738			TRUE	0.994	27.000	0.800	NA		NA
3711947	3711948	CKL_3738	CKL_3739			TRUE	0.741	35.000	0.000	NA		NA
3711948	3711949	CKL_3739	CKL_3740			TRUE	0.863	23.000	0.000	NA		NA
3711951	3711952	CKL_3742	CKL_3743			TRUE	0.891	104.000	0.333	1.000		NA
3711953	3711954	CKL_3744	CKL_3745			TRUE	0.962	22.000	0.000	1.000	Y	NA
3711955	3711956	CKL_3746	CKL_3747	manC		TRUE	0.429	204.000	0.160	1.000	N	NA
3711957	3711958	CKL_3748	CKL_3749			TRUE	0.936	-3.000	0.000	1.000	N	NA
3711959	3711960	CKL_3750	CKL_3751			FALSE	0.184	139.000	0.000	NA		NA
3711960	3711961	CKL_3751	CKL_3752		ileS	TRUE	0.638	67.000	0.009	1.000	N	NA
3711961	3711962	CKL_3752	CKL_3753	ileS		FALSE	0.008	455.000	0.000	1.000	N	NA
3711964	3711965	CKL_3755	CKL_3756		nrdG	TRUE	0.682	35.000	0.000	1.000	N	NA
3711965	3711966	CKL_3756	CKL_3757	nrdG	nrdD	TRUE	0.729	153.000	0.315	1.000	N	NA
3711966	3711967	CKL_3757	CKL_3758	nrdD		FALSE	0.005	562.000	0.000	1.000	N	NA
3711967	3711968	CKL_3758	CKL_3759			FALSE	0.155	161.000	0.000	NA		NA
3711968	3711969	CKL_3759	CKL_3760			FALSE	0.236	294.000	0.188	NA		NA
3711969	3711970	CKL_3760	CKL_3761			TRUE	0.995	5.000	0.278	NA		NA
3711970	3711971	CKL_3761	CKL_3762		ksgA	TRUE	0.596	92.000	0.010	NA		NA
3711971	3711972	CKL_3762	CKL_3763	ksgA		TRUE	0.991	-7.000	0.093	1.000	N	NA
3711972	3711973	CKL_3763	CKL_3764			TRUE	0.751	59.000	0.020	1.000		NA
3711973	3711974	CKL_3764	CKL_3765			FALSE	0.020	346.000	0.000	NA		NA
3711974	3711975	CKL_3765	CKL_3766		metS	TRUE	0.679	142.000	0.221	NA	N	NA
3711975	3711976	CKL_3766	CKL_3767	metS		FALSE	0.016	338.000	0.000	1.000	N	NA
3711976	3711977	CKL_3767	CKL_3768			TRUE	0.399	89.000	0.000	1.000		NA
3711977	3711978	CKL_3768	CKL_3769			TRUE	0.997	21.000	0.655	0.002		NA
3711980	3711981	CKL_3771	CKL_3772			TRUE	0.736	36.000	0.000	1.000		NA
3711982	3711983	CKL_3773	CKL_3774		ispF	TRUE	0.485	64.000	0.000	NA		NA
3711985	3711986	CKL_3776	CKL_3777			TRUE	0.907	18.000	0.000	NA		NA
3711986	3711987	CKL_3777	CKL_3778			TRUE	0.992	9.000	0.160	NA		NA
3711989	3711990	CKL_3780	CKL_3781		rbo	TRUE	0.607	74.000	0.000	0.040		NA
3711990	3711991	CKL_3781	CKL_3782	rbo	rbr2	TRUE	0.995	22.000	0.129	0.040	Y	NA
3711994	3711995	CKL_3785	CKL_3786			FALSE	0.020	349.000	0.000	NA		NA
3711995	3711996	CKL_3786	CKL_3787			TRUE	0.990	16.000	0.078	0.007		NA
3711996	3711997	CKL_3787	CKL_3788		motB	TRUE	0.393	129.000	0.006	1.000		NA
3711997	3711998	CKL_3788	CKL_3789	motB	motA	TRUE	0.998	-3.000	0.144	1.000	Y	NA
3711998	3711999	CKL_3789	CKL_3790	motA		FALSE	0.044	259.000	0.000	1.000		NA
3711999	3712000	CKL_3790	CKL_3791			TRUE	0.849	90.000	0.154	1.000		NA
3712000	3712001	CKL_3791	CKL_3792			TRUE	0.966	12.000	0.005	NA		NA
3712001	3712002	CKL_3792	CKL_3793			TRUE	0.996	8.000	0.372	NA		NA
3712002	3712003	CKL_3793	CKL_3794			TRUE	0.967	16.000	0.018	NA		NA
3712003	3712004	CKL_3794	CKL_3795		tmk	TRUE	0.503	127.000	0.034	NA		NA
3712004	3712005	CKL_3795	CKL_3796	tmk	speA2	TRUE	0.960	20.000	0.034	1.000	N	NA
3712005	3712006	CKL_3796	CKL_3797	speA2		TRUE	0.994	-21.000	0.120	NA		NA
3712007	3712008	CKL_3798	CKL_3799			TRUE	0.965	19.000	0.039	NA	N	NA
3712008	3712009	CKL_3799	CKL_3800			FALSE	0.116	163.000	0.000	NA	N	NA
3712009	3712010	CKL_3800	CKL_3801		npdA	FALSE	0.045	231.000	0.000	1.000	N	NA
3712011	3712012	CKL_3802	CKL_3803			TRUE	0.529	57.000	0.000	NA		NA
3712012	3712013	CKL_3803	CKL_3804			FALSE	0.007	556.000	0.000	NA		NA
3712013	3712014	CKL_3804	CKL_3805			FALSE	0.005	788.000	0.000	NA		NA
3712016	3712017	CKL_3807	CKL_3808			TRUE	0.929	12.000	0.000	NA		NA
3712017	3712018	CKL_3808	CKL_3809			TRUE	0.958	23.000	0.000	NA	Y	NA
3712018	3712019	CKL_3809	CKL_3810			TRUE	0.998	-9.000	0.228	NA	Y	NA
3712019	3712020	CKL_3810	CKL_3811			FALSE	0.104	194.000	0.000	NA		NA
3712020	3712021	CKL_3811	CKL_3812			TRUE	0.935	8.000	0.000	NA		NA
3712021	3712022	CKL_3812	CKL_3813			TRUE	0.529	57.000	0.000	NA		NA
3712022	3712023	CKL_3813	CKL_3814			FALSE	0.007	556.000	0.000	NA		NA
3712023	3712024	CKL_3814	CKL_3815			FALSE	0.005	728.000	0.000	NA		NA
3712024	3712025	CKL_3815	CKL_3816			TRUE	0.970	23.000	0.072	NA		NA
3712025	3712026	CKL_3816	CKL_3817			TRUE	0.995	20.000	0.110	0.041	Y	NA
3712026	3712027	CKL_3817	CKL_3818			FALSE	0.006	638.000	0.000	NA		NA
3712027	3712028	CKL_3818	CKL_3819			TRUE	0.564	53.000	0.000	NA		NA
3712028	3712029	CKL_3819	CKL_3820			TRUE	0.709	101.000	0.065	1.000		NA
3712029	3712030	CKL_3820	CKL_3821			TRUE	0.786	57.000	0.031	1.000		NA
3712030	3712031	CKL_3821	CKL_3822		sfsA	FALSE	0.355	144.000	0.015	NA		NA
3712031	3712032	CKL_3822	CKL_3823	sfsA		FALSE	0.071	286.000	0.005	NA		NA
3712032	3712033	CKL_3823	CKL_3824			TRUE	0.850	130.000	0.417	NA		NA
3712033	3712034	CKL_3824	CKL_3825		recR	TRUE	0.800	76.000	0.071	NA		NA
3712034	3712035	CKL_3825	CKL_3826	recR		TRUE	0.976	50.000	0.604	NA		NA
3712035	3712036	CKL_3826	CKL_3827		dnaX	TRUE	0.824	81.000	0.100	NA		NA
3712036	3712037	CKL_3827	CKL_3828	dnaX		FALSE	0.016	377.000	0.000	NA		NA
3712037	3712038	CKL_3828	CKL_3829		hydG	FALSE	0.072	219.000	0.000	NA		NA
3712038	3712039	CKL_3829	CKL_3830	hydG		FALSE	0.029	497.000	0.000	1.000	Y	NA
3712040	3712041	CKL_3831	CKL_3832			TRUE	0.957	-40.000	0.000	NA		NA
3712041	3712042	CKL_3832	CKL_3833			TRUE	0.954	-7.000	0.000	NA		NA
3712042	3712043	CKL_3833	CKL_3834			TRUE	0.778	31.000	0.000	NA		NA
3712044	3712045	CKL_3835	CKL_3836			TRUE	0.996	-3.000	0.250	1.000		NA
3712047	3712048	CKL_3838	CKL_3839			TRUE	0.901	19.000	0.000	NA		NA
3712048	3712049	CKL_3839	CKL_3840			FALSE	0.117	184.000	0.000	NA		NA
3712049	3712050	CKL_3840	CKL_3841			TRUE	0.998	5.000	0.600	NA		NA
3712050	3712051	CKL_3841	CKL_3842			TRUE	0.998	-3.000	0.500	NA		NA
3712051	3712052	CKL_3842	CKL_3843			FALSE	0.032	393.000	0.000	0.004		NA
3712052	3712053	CKL_3843	CKL_3844			TRUE	0.985	17.000	0.057	0.055		NA
3712053	3712054	CKL_3844	CKL_3845			FALSE	0.006	640.000	0.000	1.000		NA
3712054	3712055	CKL_3845	CKL_3846			FALSE	0.014	539.000	0.000	0.038		NA
3712055	3712056	CKL_3846	CKL_3847			TRUE	0.941	-16.000	0.000	NA	N	NA
3712056	3712057	CKL_3847	CKL_3848			TRUE	0.467	69.000	0.000	NA		NA
3712057	3712058	CKL_3848	CKL_3849			TRUE	0.910	17.000	0.000	NA		NA
3712058	3712059	CKL_3849	CKL_3850			TRUE	0.995	-3.000	0.200	NA		NA
3712059	3712060	CKL_3850	CKL_3851			TRUE	0.915	16.000	0.000	NA		NA
3712060	3712061	CKL_3851	CKL_3852			TRUE	0.956	-16.000	0.000	NA		NA
3712061	3712062	CKL_3852	CKL_3853			FALSE	0.282	128.000	0.000	0.082	N	NA
3712062	3712063	CKL_3853	CKL_3854			TRUE	0.999	4.000	0.667	0.014	Y	NA
3712063	3712064	CKL_3854	CKL_3855			TRUE	0.919	23.000	0.000	0.055		NA
3712065	3712066	CKL_3856	CKL_3857			TRUE	0.741	35.000	0.000	NA		NA
3712066	3712067	CKL_3857	CKL_3858			FALSE	0.315	92.000	0.000	1.000	N	NA
3712067	3712068	CKL_3858	CKL_3859			FALSE	0.116	165.000	0.000	1.000	N	NA
3712069	3712070	CKL_3860	CKL_3861			TRUE	0.919	15.000	0.000	NA		NA
3712072	3712073	CKL_3863	CKL_3864			TRUE	0.916	16.000	0.000	1.000		NA
3712073	3712074	CKL_3864	CKL_3865			TRUE	0.369	96.000	0.000	1.000		NA
3712074	3712075	CKL_3865	CKL_3866			FALSE	0.042	262.000	0.000	NA		NA
3712075	3712076	CKL_3866	CKL_3867			TRUE	0.437	79.000	0.000	NA		NA
3712076	3712077	CKL_3867	CKL_3868			TRUE	0.438	123.000	0.000	0.004		NA
3712077	3712078	CKL_3868	CKL_3869			FALSE	0.282	116.000	0.000	NA		NA
3712078	3712079	CKL_3869	CKL_3870			TRUE	0.871	105.000	0.286	NA		NA
3712079	3712080	CKL_3870	CKL_3871			FALSE	0.159	157.000	0.000	NA		NA
3712080	3712081	CKL_3871	CKL_3872			FALSE	0.187	138.000	0.000	NA		NA
3712081	3712082	CKL_3872	CKL_3873			TRUE	0.956	16.000	0.000	0.018		NA
3712082	3712083	CKL_3873	CKL_3874			TRUE	0.997	7.000	0.500	NA		NA
3712083	3712084	CKL_3874	CKL_3875			TRUE	0.994	11.000	0.250	NA		NA
3712084	3712085	CKL_3875	CKL_3876			TRUE	0.994	19.000	0.375	NA		NA
3712087	3712088	CKL_3878	CKL_3879			TRUE	0.956	-13.000	0.000	NA		NA
3712088	3712089	CKL_3879	CKL_3880			TRUE	0.926	13.000	0.000	NA		NA
3712089	3712090	CKL_3880	CKL_3881			TRUE	0.997	-3.000	0.333	NA		NA
3712090	3712091	CKL_3881	CKL_3882			FALSE	0.029	297.000	0.000	NA		NA
3712091	3712092	CKL_3882	CKL_3883			TRUE	0.416	83.000	0.000	NA		NA
3712092	3712093	CKL_3883	CKL_3884			TRUE	0.998	-49.000	0.571	NA		NA
3712093	3712094	CKL_3884	CKL_3885			TRUE	0.879	102.000	0.286	NA		NA
3712094	3712095	CKL_3885	CKL_3886			FALSE	0.044	258.000	0.000	NA		NA
3712095	3712096	CKL_3886	CKL_3887			TRUE	0.847	147.000	0.571	NA		NA
3712096	3712097	CKL_3887	CKL_3888			TRUE	0.998	-3.000	0.571	NA		NA
3712097	3712098	CKL_3888	CKL_3889			TRUE	0.996	-3.000	0.286	1.000	N	NA
3712098	3712099	CKL_3889	CKL_3890			TRUE	0.997	1.000	0.400	NA		NA
3712099	3712100	CKL_3890	CKL_3891			TRUE	0.997	16.000	0.600	NA		NA
3712100	3712101	CKL_3891	CKL_3892			FALSE	0.052	243.000	0.000	1.000		NA
3712101	3712102	CKL_3892	CKL_3893			TRUE	0.946	60.000	0.333	NA		NA
3712102	3712103	CKL_3893	CKL_3894			TRUE	0.996	14.000	0.500	NA		NA
3712103	3712104	CKL_3894	CKL_3895			TRUE	0.998	4.000	0.714	NA		NA
3712104	3712105	CKL_3895	CKL_3896			TRUE	0.955	-10.000	0.000	NA		NA
3712105	3712106	CKL_3896	CKL_3897			TRUE	0.863	23.000	0.000	NA		NA
3712106	3712107	CKL_3897	CKL_3898			TRUE	0.485	64.000	0.000	NA		NA
3712107	3712108	CKL_3898	CKL_3899			TRUE	0.949	0.000	0.000	NA		NA
3712108	3712109	CKL_3899	CKL_3900			FALSE	0.036	281.000	0.000	NA		NA
3712111	3712112	CKL_3902	CKL_3903			TRUE	0.894	50.000	0.053	0.011	N	NA
3712112	3712113	CKL_3903	CKL_3904		rplI	TRUE	0.969	13.000	0.024	1.000	N	NA
3712113	3712114	CKL_3904	CKL_3905	rplI		TRUE	0.991	0.000	0.119	1.000	N	NA
3712114	3712115	CKL_3905	CKL_3906			TRUE	0.990	19.000	0.210	NA		NA
3712115	3712116	CKL_3906	CKL_3907			TRUE	0.989	12.000	0.116	NA		NA
3712116	3712117	CKL_3907	CKL_3908		rpsR	FALSE	0.353	144.000	0.015	NA		NA
3712117	3712118	CKL_3908	CKL_3909	rpsR	ssb3	TRUE	0.836	22.000	0.000	1.000	N	NA
3712118	3712119	CKL_3909	CKL_3910	ssb3	rpsF	TRUE	0.903	13.000	0.000	1.000	N	NA
3712119	3712120	CKL_3910	CKL_3911	rpsF		TRUE	0.457	131.000	0.028	NA		NA
3712120	3712121	CKL_3911	CKL_3912			TRUE	0.991	5.000	0.121	NA		NA
3712122	3712123	CKL_3913	CKL_3914			TRUE	0.778	77.000	0.058	NA		NA
3712124	3712125	CKL_3915	CKL_3916		parB	TRUE	0.570	122.000	0.047	NA		NA
3712125	3712126	CKL_3916	CKL_3917	parB	parA	TRUE	0.998	8.000	0.827	1.000	N	NA
3712126	3712127	CKL_3917	CKL_3918	parA		FALSE	0.106	194.000	0.000	1.000		NA
3712127	3712128	CKL_3918	CKL_3919		gidB	FALSE	0.004	878.000	0.000	1.000		NA
3712128	3712129	CKL_3919	CKL_3920	gidB	gidA	TRUE	0.990	25.000	0.466	1.000	N	NA
3712129	3712130	CKL_3920	CKL_3921	gidA	trmE	TRUE	0.995	11.000	0.266	1.000		NA
3712130	3712131	CKL_3921	CKL_3922	trmE		TRUE	0.859	71.000	0.116	1.000		NA
3712131	3712132	CKL_3922	CKL_3923		oxaA	TRUE	0.993	17.000	0.254	1.000		NA
3712132	3712133	CKL_3923	CKL_3924	oxaA		TRUE	0.994	21.000	0.461	NA		NA
3712133	3712134	CKL_3924	CKL_3925		rnpA	TRUE	0.998	-3.000	0.540	NA		NA
3712134	3712135	CKL_3925	CKL_3926	rnpA	rpmH	TRUE	0.981	51.000	0.787	1.000		NA
3712136	3712137	CKL_4000	CKL_4001			TRUE	0.994	16.000	0.222	0.055		NA
3712137	3712138	CKL_4001	CKL_4002			TRUE	0.948	1.000	0.000	1.000		NA
3712138	3712139	CKL_4002	CKL_4003			TRUE	0.926	13.000	0.000	NA		NA
3712139	3712140	CKL_4003	CKL_4004			TRUE	0.956	-19.000	0.000	NA		NA
3712140	3712141	CKL_4004	CKL_4005			FALSE	0.115	185.000	0.000	NA		NA
3712141	3712142	CKL_4005	CKL_4006			FALSE	0.111	187.000	0.000	NA		NA
3712142	3712143	CKL_4006	CKL_4007			FALSE	0.016	372.000	0.000	NA		NA
3712143	3712144	CKL_4007	CKL_4008			TRUE	0.709	38.000	0.000	NA		NA
3712144	3712145	CKL_4008	CKL_4009			FALSE	0.353	141.000	0.000	0.002		NA
3712145	3712146	CKL_4009	CKL_4010			TRUE	0.934	9.000	0.000	NA		NA
3712146	3712147	CKL_4010	CKL_4011			TRUE	0.549	55.000	0.000	NA		NA
3712147	3712148	CKL_4011	CKL_4012			TRUE	0.929	12.000	0.000	NA		NA
3712148	3712149	CKL_4012	CKL_4013			FALSE	0.281	117.000	0.000	1.000		NA
3712149	3712150	CKL_4013	CKL_4014			TRUE	0.951	-3.000	0.000	NA		NA
3712150	3712151	CKL_4014	CKL_4015			TRUE	0.915	16.000	0.000	NA		NA
3712151	3712152	CKL_4015	CKL_4016			TRUE	0.951	-3.000	0.000	NA		NA
3712152	3712153	CKL_4016	CKL_4017			TRUE	0.938	6.000	0.000	NA		NA
3712153	3712154	CKL_4017	CKL_4018			TRUE	0.949	0.000	0.000	NA		NA
3712154	3712155	CKL_4018	CKL_4019			TRUE	0.894	20.000	0.000	NA		NA
3712155	3712156	CKL_4019	CKL_4020			TRUE	0.400	88.000	0.000	NA		NA
3712156	3712157	CKL_4020	CKL_4021			TRUE	0.957	-28.000	0.000	NA		NA
3712157	3712158	CKL_4021	CKL_4022			TRUE	0.951	-3.000	0.000	NA		NA
3712158	3712159	CKL_4022	CKL_4023			TRUE	0.955	-10.000	0.000	NA		NA
3712159	3712160	CKL_4023	CKL_4024			TRUE	0.944	3.000	0.000	NA		NA
3712160	3712161	CKL_4024	CKL_4025			TRUE	0.947	1.000	0.000	NA		NA
3712161	3712162	CKL_4025	CKL_4026			TRUE	0.947	1.000	0.000	NA		NA
3712162	3712163	CKL_4026	CKL_4027			TRUE	0.946	2.000	0.000	NA		NA
3712163	3712164	CKL_4027	CKL_4028			TRUE	0.951	-3.000	0.000	NA		NA
3712164	3712165	CKL_4028	CKL_4029			TRUE	0.922	14.000	0.000	NA		NA
3712165	3712166	CKL_4029	CKL_4030			FALSE	0.049	247.000	0.000	NA		NA
3712167	3712168	CKL_4031	CKL_4032			FALSE	0.027	399.000	0.000	0.021		NA
3712168	3712169	CKL_4032	CKL_4033			TRUE	0.404	122.000	0.000	0.021		NA
3712169	3712170	CKL_4033	CKL_4034			FALSE	0.202	134.000	0.000	1.000		NA
3712171	3712172	CKL_4035	CKL_4036			FALSE	0.011	434.000	0.000	NA		NA
3712172	3712173	CKL_4036	CKL_4037			TRUE	0.938	54.000	0.231	NA		NA
3712175	3712176	CKL_4039	CKL_4040			FALSE	0.203	133.000	0.000	NA		NA
3712176	3712177	CKL_4040	CKL_4041			TRUE	0.585	50.000	0.000	NA		NA
3712177	3712178	CKL_4041	CKL_4042			FALSE	0.012	425.000	0.000	NA		NA
3712178	3712179	CKL_4042	CKL_4043			TRUE	0.778	31.000	0.000	NA		NA
3712179	3712180	CKL_4043	CKL_4044			TRUE	0.929	12.000	0.000	NA		NA
3712182	3712183	CKL_4046	CKL_4047			TRUE	0.946	2.000	0.000	NA		NA
3712183	3712184	CKL_4047	CKL_4048			FALSE	0.023	326.000	0.000	NA		NA
3712184	3712185	CKL_4048	CKL_4049			TRUE	0.385	91.000	0.000	NA		NA
3712185	3712186	CKL_4049	CKL_4050			FALSE	0.268	119.000	0.000	NA		NA
3712186	3712187	CKL_4050	CKL_4051			TRUE	0.926	13.000	0.000	NA		NA
3712187	3712188	CKL_4051	CKL_4052			FALSE	0.045	255.000	0.000	NA		NA
3712188	3712189	CKL_4052	CKL_4053			TRUE	0.956	-24.000	0.000	NA		NA
3712189	3712190	CKL_4053	CKL_4054			TRUE	0.947	1.000	0.000	NA		NA
3712190	3712191	CKL_4054	CKL_4055			TRUE	0.946	2.000	0.000	NA		NA
3712191	3712192	CKL_4055	CKL_4056			TRUE	0.942	4.000	0.000	NA		NA
3712192	3712193	CKL_4056	CKL_4057			TRUE	0.922	14.000	0.000	NA		NA
3712193	3712194	CKL_4057	CKL_4058			FALSE	0.059	231.000	0.000	NA		NA
3712194	3712195	CKL_4058	CKL_4059			FALSE	0.056	235.000	0.000	NA		NA
3712195	3712196	CKL_4059	CKL_4060			TRUE	0.949	64.000	0.400	NA		NA
3712196	3712197	CKL_4060	CKL_4061			TRUE	0.696	39.000	0.000	NA		NA
3712197	3712198	CKL_4061	CKL_4062			TRUE	0.951	-3.000	0.000	NA		NA
3712198	3712199	CKL_4062	CKL_4063			TRUE	0.962	34.000	0.143	NA		NA
3712199	3712200	CKL_4063	CKL_4064			TRUE	0.991	-37.000	0.071	NA		NA
3712200	3712201	CKL_4064	CKL_4065			TRUE	0.894	20.000	0.000	NA		NA
3712201	3712202	CKL_4065	CKL_4066			TRUE	0.481	65.000	0.000	NA		NA
3712202	3712203	CKL_4066	CKL_4067			TRUE	0.999	-19.000	0.846	NA		NA
3712203	3712204	CKL_4067	CKL_4068			TRUE	0.999	-43.000	0.846	NA		NA
3712204	3712205	CKL_4068	CKL_4069			TRUE	0.998	-3.000	0.692	NA		NA
3712205	3712206	CKL_4069	CKL_4070			TRUE	0.997	-10.000	0.267	NA		NA
3712206	3712207	CKL_4070	CKL_4071			TRUE	0.822	130.000	0.333	NA		NA
3712207	3712208	CKL_4071	CKL_4072			TRUE	0.887	76.000	0.182	NA		NA
3712208	3712209	CKL_4072	CKL_4073			TRUE	0.751	34.000	0.000	NA		NA
3712209	3712210	CKL_4073	CKL_4074			FALSE	0.028	302.000	0.000	NA		NA
3712210	3712136	CKL_4074	CKL_4000			FALSE	0.006	600.000	0.000	NA		NA