MicrobesOnline Operon Predictions for Rickettsia massiliae MTU5

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 7231480 7231481 RMA_0001 RMA_0002   trxA FALSE 0.231 312.000 0.053 NA   NA
 7231481 7231482 RMA_0002 RMA_0003 trxA rfbE TRUE 0.985 -22.000 0.778 1.000   NA
 7231482 7231483 RMA_0003 RMA_0004 rfbE rfbA TRUE 0.993 1.000 0.304 1.000 Y NA
 7231483 7231484 RMA_0004 RMA_0005 rfbA gltD TRUE 0.972 -3.000 0.088 1.000 N NA
 7231485 7231486 RMA_0006 RMA_0007 lpxA fabZ TRUE 0.980 7.000 0.264 1.000 N NA
 7231486 7231487 RMA_0007 RMA_0008 fabZ lpxD TRUE 0.842 184.000 0.212 1.000 N NA
 7231489 7231490 RMA_0010 RMA_RNA01     FALSE 0.028 531.000 0.000 NA   NA
 7231491 7231492 RMA_0011 RMA_0012     TRUE 0.719 127.000 0.000 NA   NA
 7231492 7231493 RMA_0012 RMA_0013     TRUE 0.882 -13.000 0.000 NA   NA
 7231493 7231494 RMA_0013 RMA_0014     TRUE 0.660 97.000 0.000 NA   NA
 7231494 7231495 RMA_0014 RMA_0015     TRUE 0.929 0.000 0.000 NA   NA
 7231495 7231496 RMA_0015 RMA_0016     TRUE 0.733 30.000 0.000 NA   NA
 7231497 7231498 RMA_0017 RMA_0018   znuA TRUE 0.873 -12.000 0.008 NA   NA
 7231498 7231499 RMA_0018 RMA_0019 znuA pcnB TRUE 0.857 -24.000 0.023 1.000 N NA
 7231500 7231501 RMA_0020 RMA_RNA02 sca1   TRUE 0.685 109.000 0.000 NA   NA
 7231501 7231502 RMA_RNA02 RMA_0021     FALSE 0.019 687.000 0.000 NA   NA
 7231502 7231503 RMA_0021 RMA_0022     FALSE 0.065 373.000 0.000 NA   NA
 7231503 7231504 RMA_0022 RMA_0023     TRUE 0.855 -18.000 0.000 NA   NA
 7231504 7231505 RMA_0023 RMA_0024     FALSE 0.012 1424.000 0.000 NA   NA
 7231506 7231507 RMA_0025 RMA_0026 atpF atpX TRUE 0.997 -3.000 0.863 0.013 Y NA
 7231507 7231508 RMA_0026 RMA_0027 atpX atpE TRUE 0.959 19.000 0.278 0.013   NA
 7231508 7231509 RMA_0027 RMA_0028 atpE atpB TRUE 0.951 59.000 0.628 0.013   NA
 7231509 7231510 RMA_0028 RMA_0029 atpB   TRUE 0.970 -13.000 0.195 NA   NA
 7231510 7231511 RMA_0029 RMA_0030   dsbG TRUE 0.947 6.000 0.043 NA   NA
 7231513 7231514 RMA_0032 RMA_0033   recF FALSE 0.049 417.000 0.000 1.000   NA
 7231514 7231515 RMA_0033 RMA_0034 recF   TRUE 0.701 114.000 0.000 NA   NA
 7231515 7231516 RMA_0034 RMA_0035     TRUE 0.684 38.000 0.000 NA   NA
 7231516 7231517 RMA_0035 RMA_0036     TRUE 0.717 132.000 0.000 NA   NA
 7231517 7231518 RMA_0036 RMA_0037     TRUE 0.924 3.000 0.000 NA   NA
 7231518 7231519 RMA_0037 RMA_0038     TRUE 0.649 87.000 0.000 NA   NA
 7231519 7231520 RMA_0038 RMA_0039     TRUE 0.895 -10.000 0.000 NA   NA
 7231520 7231521 RMA_0039 RMA_0040     TRUE 0.659 50.000 0.000 NA   NA
 7231521 7231522 RMA_0040 RMA_0041     TRUE 0.725 31.000 0.000 NA   NA
 7231522 7231523 RMA_0041 RMA_0042     FALSE 0.236 243.000 0.000 NA   NA
 7231523 7231524 RMA_0042 RMA_0043     TRUE 0.678 40.000 0.000 NA   NA
 7231524 7231525 RMA_0043 RMA_0044     TRUE 0.643 82.000 0.000 NA   NA
 7231525 7231526 RMA_0044 RMA_0045     TRUE 0.801 -24.000 0.000 NA   NA
 7231526 7231527 RMA_0045 RMA_0046     FALSE 0.053 407.000 0.000 NA   NA
 7231527 7231528 RMA_0046 RMA_0047     FALSE 0.036 476.000 0.000 NA   NA
 7231531 7231532 RMA_0050 RMA_0051 cvpA   FALSE 0.277 229.000 0.000 NA   NA
 7231532 7231533 RMA_0051 RMA_0052     TRUE 0.892 9.000 0.000 NA   NA
 7231533 7231534 RMA_0052 RMA_0053     FALSE 0.014 983.000 0.000 NA   NA
 7231534 7231535 RMA_0053 RMA_0054     FALSE 0.340 -91.000 0.000 NA   NA
 7231535 7231536 RMA_0054 RMA_0055     TRUE 0.882 -13.000 0.000 NA   NA
 7231537 7231538 RMA_0056 RMA_0057     TRUE 0.906 98.000 0.250 NA   NA
 7231538 7231539 RMA_0057 RMA_0058     TRUE 0.676 -37.000 0.000 NA   NA
 7231539 7231540 RMA_0058 RMA_0059     FALSE 0.016 804.000 0.000 NA   NA
 7231540 7231541 RMA_0059 RMA_0060     TRUE 0.847 -19.000 0.000 NA   NA
 7231541 7231542 RMA_0060 RMA_0061     FALSE 0.020 665.000 0.000 NA   NA
 7231542 7231543 RMA_0061 RMA_0062     FALSE 0.464 196.000 0.000 NA   NA
 7231545 7231546 RMA_0064 RMA_0065   gcp FALSE 0.586 80.000 0.004 NA   NA
 7231546 7231547 RMA_0065 RMA_0066 gcp aco1 FALSE 0.492 183.000 0.005 1.000 N NA
 7231547 7231548 RMA_0066 RMA_0067 aco1   TRUE 0.719 143.000 0.000 NA   NA
 7231549 7231550 RMA_0068 RMA_0069 rpsF rpsR TRUE 0.972 25.000 0.319 0.053 Y NA
 7231550 7231551 RMA_0069 RMA_0070 rpsR rplI TRUE 0.990 12.000 0.499 0.053 Y NA
 7231551 7231552 RMA_0070 RMA_0071 rplI tilS FALSE 0.105 294.000 0.002 0.086 N NA
 7231552 7231553 RMA_0071 RMA_0072 tilS ftsH TRUE 0.880 98.000 0.145 1.000 N NA
 7231553 7231554 RMA_0072 RMA_0073 ftsH   TRUE 0.822 18.000 0.000 NA   NA
 7231554 7231555 RMA_0073 RMA_0074     FALSE 0.409 207.000 0.000 NA   NA
 7231555 7231556 RMA_0074 RMA_0075   sdhB FALSE 0.022 624.000 0.000 NA   NA
 7231556 7231557 RMA_0075 RMA_0076 sdhB   TRUE 0.876 11.000 0.000 NA   NA
 7231558 7231559 RMA_0077 RMA_0078   lgt TRUE 0.779 -57.000 0.170 NA   NA
 7231560 7231561 RMA_0079 RMA_0080   yidC FALSE 0.486 185.000 0.008 1.000 N NA
 7231561 7231562 RMA_0080 RMA_0081 yidC pgsA TRUE 0.916 0.000 0.008 0.093 N NA
 7231562 7231563 RMA_0081 RMA_0082 pgsA   TRUE 0.813 14.000 0.005 1.000   NA
 7231565 7231566 RMA_0084 RMA_0085     FALSE 0.355 215.000 0.000 NA   NA
 7231566 7231567 RMA_0085 RMA_0086     TRUE 0.915 -4.000 0.000 NA   NA
 7231569 7231570 RMA_0088 RMA_0089 tlc1 uhpC TRUE 0.995 4.000 0.875 NA N NA
 7231570 7231571 RMA_0089 RMA_0090 uhpC ndk TRUE 0.788 19.000 0.007 NA N NA
 7231571 7231572 RMA_0090 RMA_0091 ndk gidA TRUE 0.903 4.000 0.007 1.000 N NA
 7231572 7231573 RMA_0091 RMA_0092 gidA gidB TRUE 0.975 -22.000 0.466 1.000 N NA
 7231573 7231574 RMA_0092 RMA_0093 gidB soj TRUE 0.988 -3.000 0.339 1.000 N NA
 7231574 7231575 RMA_0093 RMA_0094 soj   TRUE 0.992 -13.000 0.827 1.000 N NA
 7231575 7231576 RMA_0094 RMA_0095   abcT1 FALSE 0.148 262.000 0.006 1.000   NA
 7231576 7231577 RMA_0095 RMA_0096 abcT1   TRUE 0.901 -9.000 0.013 NA   NA
 7231577 7231578 RMA_0096 RMA_0097   kdsA TRUE 0.699 33.000 0.011 NA   NA
 7231578 7231579 RMA_0097 RMA_0098 kdsA   FALSE 0.157 270.000 0.000 NA   NA
 7231579 7231580 RMA_0098 RMA_0099     FALSE 0.032 493.000 0.000 NA   NA
 7231580 7231581 RMA_0099 RMA_0100     TRUE 0.847 -19.000 0.000 NA   NA
 7231583 7231584 RMA_0102 RMA_0103 dgt argS TRUE 0.857 144.000 0.062 1.000 N NA
 7231584 7231585 RMA_0103 RMA_0104 argS   TRUE 0.670 155.000 0.008 NA   NA
 7231585 7231586 RMA_0104 RMA_0105   parC FALSE 0.447 191.000 0.007 NA   NA
 7231588 7231589 RMA_0107 RMA_0108 dcd secB TRUE 0.738 34.000 0.015 1.000 N NA
 7231589 7231590 RMA_0108 RMA_0109 secB czcR FALSE 0.360 207.000 0.005 1.000 N NA
 7231590 7231591 RMA_0109 RMA_0110 czcR queF TRUE 0.951 4.000 0.038 1.000   NA
 7231592 7231593 RMA_0111 RMA_0112   pntB TRUE 0.791 49.000 0.047 NA   NA
 7231593 7231594 RMA_0112 RMA_0113 pntB ompW TRUE 0.801 108.000 0.046 0.092 N NA
 7231595 7231596 RMA_0114 RMA_0115 sam proP1 TRUE 0.979 -22.000 0.556 1.000   NA
 7231596 7231597 RMA_0115 RMA_0116 proP1   TRUE 0.923 -3.000 0.000 NA   NA
 7231597 7231598 RMA_0116 RMA_RNA03     TRUE 0.651 88.000 0.000 NA   NA
 7231598 7231599 RMA_RNA03 RMA_0117   secG FALSE 0.563 180.000 0.000 NA   NA
 7231599 7231600 RMA_0117 RMA_0118 secG   FALSE 0.024 613.000 0.000 NA   NA
 7231602 7231603 RMA_0120 RMA_0121 cysS rpsB TRUE 0.659 193.000 0.000 1.000 Y NA
 7231603 7231604 RMA_0121 RMA_0122 rpsB tsf TRUE 0.959 188.000 0.748 1.000 Y NA
 7231604 7231605 RMA_0122 RMA_0123 tsf   FALSE 0.025 569.000 0.000 NA   NA
 7231605 7231606 RMA_0123 RMA_0124     TRUE 0.855 -18.000 0.000 NA   NA
 7231607 7231608 RMA_0125 RMA_0126 kdtA   TRUE 0.814 -54.000 0.179 NA   NA
 7231608 7231609 RMA_0126 RMA_0127   aatA TRUE 0.857 148.000 0.062 NA   NA
 7231609 7231610 RMA_0127 RMA_0128 aatA   TRUE 0.668 45.000 0.000 NA   NA
 7231610 7231611 RMA_0128 RMA_0129     TRUE 0.906 -7.000 0.000 NA   NA
 7231612 7231613 RMA_0130 RMA_0131   vacJ TRUE 0.808 -37.000 0.049 1.000   NA
 7231613 7231614 RMA_0131 RMA_0132 vacJ   FALSE 0.561 -103.000 0.070 NA N NA
 7231614 7231615 RMA_0132 RMA_0133   prs TRUE 0.834 178.000 0.133 NA N NA
 7231615 7231616 RMA_0133 RMA_0134 prs alr TRUE 0.723 -69.000 0.200 1.000 N NA
 7231616 7231617 RMA_0134 RMA_0135 alr   TRUE 0.710 138.000 0.012 NA N NA
 7231617 7231618 RMA_0135 RMA_0136   mkl TRUE 0.922 70.000 0.178 NA Y NA
 7231618 7231619 RMA_0136 RMA_0137 mkl   TRUE 0.963 2.000 0.050 NA   NA
 7231620 7231621 RMA_0138 RMA_0139     TRUE 0.833 16.000 0.000 NA   NA
 7231622 7231623 RMA_0140 RMA_0141 rpmB rpmE TRUE 0.942 -9.000 0.009 0.051 Y NA
 7231623 7231624 RMA_0141 RMA_RNA04 rpmE   FALSE 0.307 225.000 0.000 NA   NA
 7231624 7231625 RMA_RNA04 RMA_0142   engB TRUE 0.658 93.000 0.000 NA   NA
 7231625 7231626 RMA_0142 RMA_0143 engB argB TRUE 0.686 -52.000 0.046 1.000   NA
 7231626 7231627 RMA_0143 RMA_0144 argB virB3 TRUE 0.829 13.000 0.004 NA N NA
 7231627 7231628 RMA_0144 RMA_0145 virB3 virB4-1 TRUE 0.977 62.000 0.789 NA Y NA
 7231628 7231629 RMA_0145 RMA_0146 virB4-1 virB6-1 TRUE 0.969 118.000 0.421 1.000 Y NA
 7231629 7231630 RMA_0146 RMA_0147 virB6-1 virB6-2 TRUE 0.992 -25.000 1.000 0.005 Y NA
 7231630 7231631 RMA_0147 RMA_0148 virB6-2 virB6-3 TRUE 0.997 7.000 1.000 0.005 Y NA
 7231631 7231632 RMA_0148 RMA_0149 virB6-3 virB6-4 TRUE 0.971 175.000 0.750 0.005 Y NA
 7231632 7231633 RMA_0149 RMA_0150 virB6-4   TRUE 0.701 156.000 0.000 NA   NA
 7231633 7231634 RMA_0150 RMA_0151     FALSE 0.400 -64.000 0.000 NA   NA
 7231634 7231635 RMA_0151 RMA_0152     FALSE 0.023 615.000 0.000 NA   NA
 7231635 7231636 RMA_0152 RMA_0153     FALSE 0.379 -67.000 0.000 NA   NA
 7231636 7231637 RMA_0153 RMA_0154     TRUE 0.625 68.000 0.000 NA   NA
 7231637 7231638 RMA_0154 RMA_0155     TRUE 0.929 0.000 0.000 NA   NA
 7231638 7231639 RMA_0155 RMA_0156     TRUE 0.918 4.000 0.000 NA   NA
 7231639 7231640 RMA_0156 RMA_0157     FALSE 0.390 -66.000 0.000 NA   NA
 7231640 7231641 RMA_0157 RMA_0158   trmD FALSE 0.035 485.000 0.000 NA   NA
 7231641 7231642 RMA_0158 RMA_0159 trmD rplS TRUE 0.980 27.000 0.567 1.000 Y NA
 7231644 7231645 RMA_0161 RMA_0162 secF nuoF TRUE 0.740 125.000 0.015 1.000 N NA
 7231645 7231646 RMA_0162 RMA_0163 nuoF lepB TRUE 0.625 181.000 0.021 1.000 N NA
 7231646 7231647 RMA_0163 RMA_0164 lepB rnc TRUE 0.921 0.000 0.010 1.000 N NA
 7231647 7231648 RMA_0164 RMA_0165 rnc era TRUE 0.944 -19.000 0.098 0.031   NA
 7231648 7231649 RMA_0165 RMA_0166 era ruvC TRUE 0.657 112.000 0.007 1.000   NA
 7231649 7231650 RMA_0166 RMA_0167 ruvC   TRUE 0.888 -7.000 0.006 1.000 N NA
 7231651 7231652 RMA_0168 RMA_0169     TRUE 0.975 -19.000 0.400 NA   NA
 7231652 7231653 RMA_0169 RMA_0170     TRUE 0.972 5.000 0.118 NA   NA
 7231653 7231654 RMA_0170 RMA_0171   mrp TRUE 0.619 -54.000 0.025 NA N NA
 7231655 7231656 RMA_0172 RMA_0173 hflK hflC2 TRUE 0.984 93.000 0.947 0.021 Y NA
 7231656 7231657 RMA_0173 RMA_0174 hflC2 htrA TRUE 0.945 23.000 0.084 0.021 Y NA
 7231657 7231658 RMA_0174 RMA_0175 htrA   TRUE 0.773 35.000 0.023 NA   NA
 7231658 7231659 RMA_0175 RMA_0176   sdhC TRUE 0.796 153.000 0.026 NA   NA
 7231659 7231660 RMA_0176 RMA_0177 sdhC sdhD TRUE 0.960 150.000 0.291 0.003 Y NA
 7231660 7231661 RMA_0177 RMA_0178 sdhD sdhA TRUE 0.982 137.000 0.705 0.005 Y NA
 7231661 7231662 RMA_0178 RMA_0179 sdhA yqiY TRUE 0.622 103.000 0.006 1.000 N NA
 7231662 7231663 RMA_0179 RMA_0180 yqiY rpsL TRUE 0.758 70.000 0.044 1.000 N NA
 7231663 7231664 RMA_0180 RMA_0181 rpsL rpsG TRUE 0.900 27.000 0.029 0.010 Y NA
 7231664 7231665 RMA_0181 RMA_0182 rpsG fusA TRUE 0.978 10.000 0.114 1.000 Y NA
 7231665 7231666 RMA_0182 RMA_RNA05 fusA   TRUE 0.716 150.000 0.000 NA   NA
 7231666 7231667 RMA_RNA05 RMA_0183   secE TRUE 0.654 91.000 0.000 NA   NA
 7231667 7231668 RMA_0183 RMA_0184 secE nusG TRUE 0.990 13.000 0.843 1.000 N NA
 7231668 7231669 RMA_0184 RMA_0185 nusG rplK TRUE 0.698 273.000 0.681 1.000 N NA
 7231669 7231670 RMA_0185 RMA_0186 rplK rplA TRUE 0.997 0.000 0.838 0.068 Y NA
 7231670 7231671 RMA_0186 RMA_0187 rplA rplJ TRUE 0.958 111.000 0.302 0.068 Y NA
 7231671 7231672 RMA_0187 RMA_0188 rplJ rplL TRUE 0.988 144.000 0.884 0.050 Y NA
 7231672 7231673 RMA_0188 RMA_0189 rplL rpoB FALSE 0.070 849.000 0.223 1.000   NA
 7231673 7231674 RMA_0189 RMA_0190 rpoB rpoC TRUE 0.799 254.000 0.851 0.003   NA
 7231676 7231677 RMA_0192 RMA_0193 pepA   TRUE 0.712 187.000 0.061 1.000 N NA
 7231677 7231678 RMA_0193 RMA_0194     TRUE 0.829 77.000 0.082 NA   NA
 7231678 7231679 RMA_0194 RMA_0195   aspS FALSE 0.584 77.000 0.005 NA   NA
 7231680 7231681 RMA_0196 RMA_0197     FALSE 0.067 370.000 0.000 NA   NA
 7231681 7231682 RMA_0197 RMA_0198   dapB TRUE 0.660 35.000 0.006 NA   NA
 7231682 7231683 RMA_0198 RMA_0199 dapB   TRUE 0.701 125.000 0.011 1.000   NA
 7231683 7231684 RMA_0199 RMA_0200   yqiX TRUE 0.972 -15.000 0.250 1.000   NA
 7231684 7231685 RMA_0200 RMA_0201 yqiX gatB FALSE 0.590 170.000 0.005 1.000 N NA
 7231685 7231686 RMA_0201 RMA_0202 gatB gatA TRUE 0.995 0.000 0.492 0.004 Y NA
 7231686 7231687 RMA_0202 RMA_0203 gatA gatC TRUE 0.996 -3.000 0.643 0.004 Y NA
 7231687 7231688 RMA_0203 RMA_0204 gatC frr FALSE 0.030 767.000 0.002 1.000 Y NA
 7231688 7231689 RMA_0204 RMA_0205 frr pyrH TRUE 0.648 287.000 0.626 1.000 N NA
 7231689 7231690 RMA_0205 RMA_0206 pyrH mnhE TRUE 0.854 -15.000 0.008 1.000 N NA
 7231690 7231691 RMA_0206 RMA_0207 mnhE emrB TRUE 0.950 -22.000 0.171 0.088 N NA
 7231693 7231694 RMA_0209 RMA_RNA06     FALSE 0.035 485.000 0.000 NA   NA
 7231694 7231695 RMA_RNA06 RMA_0210   omp1 TRUE 0.638 170.000 0.000 NA   NA
 7231695 7231696 RMA_0210 RMA_0211 omp1   FALSE 0.442 239.000 0.016 1.000 Y NA
 7231697 7231698 RMA_0212 RMA_0213 nusB rrmJ TRUE 0.910 4.000 0.010 NA N NA
 7231701 7231702 RMA_0216 RMA_0217     TRUE 0.917 0.000 0.008 NA   NA
 7231704 7231705 RMA_0219 RMA_0220   acrF FALSE 0.496 253.000 0.179 NA   NA
 7231706 7231707 RMA_0221 RMA_0222 hupA holB TRUE 0.870 137.000 0.020 1.000 Y NA
 7231707 7231708 RMA_0222 RMA_0223 holB ffh FALSE 0.423 205.000 0.000 1.000 N NA
 7231709 7231710 RMA_0224 RMA_0225     TRUE 0.782 -25.000 0.000 NA   NA
 7231710 7231711 RMA_0225 RMA_0226     TRUE 0.924 3.000 0.000 NA   NA
 7231711 7231712 RMA_0226 RMA_0227     TRUE 0.740 28.000 0.000 NA   NA
 7231712 7231713 RMA_0227 RMA_0228     TRUE 0.855 -18.000 0.000 NA   NA
 7231713 7231714 RMA_0228 RMA_0229     TRUE 0.761 -28.000 0.000 NA   NA
 7231714 7231715 RMA_0229 RMA_0230     TRUE 0.857 13.000 0.000 NA   NA
 7231717 7231718 RMA_0232 RMA_0233     TRUE 0.708 34.000 0.000 NA   NA
 7231718 7231719 RMA_0233 RMA_0234     TRUE 0.815 19.000 0.000 NA   NA
 7231719 7231720 RMA_0234 RMA_0235   gltP TRUE 0.692 111.000 0.000 NA   NA
 7231720 7231721 RMA_0235 RMA_0236 gltP cutA TRUE 0.727 38.000 0.017 1.000 N NA
 7231721 7231722 RMA_0236 RMA_0237 cutA   TRUE 0.937 3.000 0.017 1.000 N NA
 7231722 7231723 RMA_0237 RMA_0238   sucB TRUE 0.669 163.000 0.013 1.000 N NA
 7231723 7231724 RMA_0238 RMA_0239 sucB sucA TRUE 0.977 162.000 0.667 1.000 Y NA
 7231724 7231725 RMA_0239 RMA_0240 sucA   FALSE 0.187 255.000 0.000 NA   NA
 7231725 7231726 RMA_0240 RMA_0241     TRUE 0.638 60.000 0.000 NA   NA
 7231726 7231727 RMA_0241 RMA_0242   recN TRUE 0.627 66.000 0.000 NA   NA
 7231727 7231728 RMA_0242 RMA_0243 recN comL TRUE 0.973 -4.000 0.117 1.000   NA
 7231728 7231729 RMA_0243 RMA_0244 comL   FALSE 0.074 360.000 0.000 NA   NA
 7231729 7231730 RMA_0244 RMA_0245   dnaJ TRUE 0.645 57.000 0.000 NA   NA
 7231730 7231731 RMA_0245 RMA_0246 dnaJ dnaK TRUE 0.954 127.000 0.236 0.006 Y NA
 7231733 7231734 RMA_0248 RMA_0249     TRUE 0.642 -40.000 0.000 NA   NA
 7231734 7231735 RMA_0249 RMA_0250     FALSE 0.013 1083.000 0.000 NA   NA
 7231736 7231737 RMA_0251 RMA_0252   holA TRUE 0.964 8.000 0.097 NA   NA
 7231737 7231738 RMA_0252 RMA_0253 holA coq7 TRUE 0.633 106.000 0.007 1.000 N NA
 7231738 7231739 RMA_0253 RMA_0254 coq7 coxC FALSE 0.022 627.000 0.000 1.000 N NA
 7231739 7231740 RMA_0254 RMA_0255 coxC virB2 TRUE 0.753 108.000 0.022 NA N NA
 7231743 7231744 RMA_0258 RMA_0259     FALSE 0.353 -81.000 0.000 NA   NA
 7231744 7231745 RMA_0259 RMA_0260   pbpC TRUE 0.839 15.000 0.000 NA   NA
 7231746 7231747 RMA_0261 RMA_0262     TRUE 0.923 -3.000 0.000 NA   NA
 7231747 7231748 RMA_0262 RMA_0263     FALSE 0.046 431.000 0.000 NA   NA
 7231748 7231749 RMA_0263 RMA_0264     FALSE 0.011 2022.000 0.000 NA   NA
 7231749 7231750 RMA_0264 RMA_0265     TRUE 0.902 7.000 0.000 NA   NA
 7231751 7231752 RMA_0266 RMA_0267 uspA imp TRUE 0.972 10.000 0.200 NA   NA
 7231752 7231753 RMA_0267 RMA_0268 imp   TRUE 0.952 -46.000 0.778 NA   NA
 7231753 7231754 RMA_0268 RMA_0269   fdxB TRUE 0.966 4.000 0.068 NA   NA
 7231754 7231755 RMA_0269 RMA_0270 fdxB hscA TRUE 0.835 62.000 0.091 1.000 N NA
 7231755 7231756 RMA_0270 RMA_0271 hscA hscB TRUE 0.994 -12.000 0.634 1.000 Y NA
 7231759 7231760 RMA_0274 RMA_0275 grxC1 atm1 TRUE 0.922 145.000 0.068 1.000 Y NA
 7231760 7231761 RMA_0275 RMA_0276 atm1 gyrA FALSE 0.083 353.000 0.000 1.000 N NA
 7231761 7231762 RMA_0276 RMA_0277 gyrA   FALSE 0.015 874.000 0.000 NA   NA
 7231762 7231763 RMA_0277 RMA_0278     FALSE 0.016 864.000 0.000 NA   NA
 7231763 7231764 RMA_0278 RMA_0279   def FALSE 0.042 447.000 0.000 NA   NA
 7231764 7231765 RMA_0279 RMA_0280 def fmt TRUE 0.955 -3.000 0.008 0.077 Y NA
 7231765 7231766 RMA_0280 RMA_RNA07 fmt rrl FALSE 0.016 848.000 0.000 NA   NA
 7231766 7231767 RMA_RNA07 RMA_RNA08 rrl rrf FALSE 0.206 250.000 0.000 NA   NA
 7231767 7231768 RMA_RNA08 RMA_0286 rrf   TRUE 0.717 121.000 0.000 NA   NA
 7231768 7231769 RMA_0286 RMA_0287     TRUE 0.876 11.000 0.000 NA   NA
 7231769 7231770 RMA_0287 RMA_0288     FALSE 0.379 -67.000 0.000 NA   NA
 7231771 7231772 RMA_0289 RMA_0290 n2B   FALSE 0.381 211.000 0.000 NA   NA
 7231772 7231773 RMA_0290 RMA_0291     TRUE 0.896 8.000 0.000 NA   NA
 7231774 7231775 RMA_0292 RMA_0293     TRUE 0.667 163.000 0.000 NA   NA
 7231777 7231778 RMA_0295 RMA_0296   cydA TRUE 0.956 152.000 0.500 NA   NA
 7231778 7231779 RMA_0296 RMA_0297 cydA cydB TRUE 0.979 8.000 0.095 0.046 Y NA
 7231779 7231780 RMA_0297 RMA_0298 cydB   TRUE 0.720 130.000 0.000 NA N NA
 7231780 7231781 RMA_0298 RMA_0299     TRUE 0.989 11.000 0.681 NA   NA
 7231781 7231782 RMA_0299 RMA_0300   lgtF TRUE 0.842 -16.000 0.007 NA   NA
 7231782 7231783 RMA_0300 RMA_0301 lgtF mpp TRUE 0.950 2.000 0.025 NA   NA
 7231783 7231784 RMA_0301 RMA_0302 mpp purC TRUE 0.697 154.000 0.011 1.000   NA
 7231784 7231785 RMA_0302 RMA_0303 purC   FALSE 0.325 222.000 0.000 NA   NA
 7231785 7231786 RMA_0303 RMA_0304   thrS TRUE 0.609 51.000 0.006 NA   NA
 7231786 7231787 RMA_0304 RMA_0305 thrS   FALSE 0.024 613.000 0.000 NA   NA
 7231787 7231788 RMA_0305 RMA_0306     FALSE 0.015 883.000 0.000 NA   NA
 7231788 7231789 RMA_0306 RMA_0307     FALSE 0.125 309.000 0.000 NA   NA
 7231790 7231791 RMA_0308 RMA_0309     TRUE 0.924 3.000 0.000 NA   NA
 7231791 7231792 RMA_0309 RMA_0310     TRUE 0.902 7.000 0.000 NA   NA
 7231792 7231793 RMA_0310 RMA_0311     TRUE 0.718 137.000 0.000 NA   NA
 7231794 7231795 RMA_0312 RMA_0313 tolC   TRUE 0.980 2.000 0.146 NA   NA
 7231795 7231796 RMA_0313 RMA_0314     TRUE 0.705 195.000 0.073 NA   NA
 7231796 7231797 RMA_0314 RMA_0315   parE FALSE 0.426 210.000 0.016 NA   NA
 7231797 7231798 RMA_0315 RMA_0316 parE ctp TRUE 0.937 0.000 0.015 1.000 N NA
 7231798 7231799 RMA_0316 RMA_0317 ctp barA FALSE 0.368 212.000 0.000 1.000 N NA
 7231799 7231800 RMA_0317 RMA_0318 barA   TRUE 0.875 51.000 0.143 1.000   NA
 7231800 7231801 RMA_0318 RMA_0319     TRUE 0.984 13.000 0.583 NA   NA
 7231801 7231802 RMA_0319 RMA_0320     TRUE 0.923 -10.000 0.022 NA   NA
 7231802 7231803 RMA_0320 RMA_0321   rplM FALSE 0.604 90.000 0.006 1.000   NA
 7231803 7231804 RMA_0321 RMA_0322 rplM rpsI TRUE 0.987 7.000 0.231 0.046 Y NA
 7231804 7231805 RMA_0322 RMA_RNA09 rpsI   FALSE 0.217 248.000 0.000 NA   NA
 7231805 7231806 RMA_RNA09 RMA_0323     FALSE 0.029 513.000 0.000 NA   NA
 7231806 7231807 RMA_0323 RMA_0324     TRUE 0.624 69.000 0.000 NA   NA
 7231807 7231808 RMA_0324 RMA_0325     FALSE 0.088 345.000 0.000 NA   NA
 7231808 7231809 RMA_0325 RMA_0326     FALSE 0.038 469.000 0.000 NA   NA
 7231810 7231811 RMA_0327 RMA_0328 nudH pleD TRUE 0.826 22.000 0.017 1.000 N NA
 7231812 7231813 RMA_0329 RMA_0330 efp suhB FALSE 0.277 266.000 0.047 1.000 N NA
 7231813 7231814 RMA_0330 RMA_0331 suhB   FALSE 0.586 60.000 0.005 NA   NA
 7231814 7231815 RMA_0331 RMA_0332   psd TRUE 0.921 7.000 0.018 NA   NA
 7231815 7231816 RMA_0332 RMA_0333 psd pssA TRUE 0.972 149.000 0.466 0.006 Y NA
 7231816 7231817 RMA_0333 RMA_0334 pssA emrA TRUE 0.911 -6.000 0.013 0.061 N NA
 7231817 7231818 RMA_0334 RMA_0335 emrA   FALSE 0.105 325.000 0.000 NA   NA
 7231819 7231820 RMA_0336 RMA_0337   bolA1 TRUE 0.893 -18.000 0.022 NA   NA
 7231821 7231822 RMA_0338 RMA_0339   murC FALSE 0.297 221.000 0.006 NA N NA
 7231822 7231823 RMA_0339 RMA_0340 murC murB TRUE 0.977 10.000 0.108 0.012 Y NA
 7231823 7231824 RMA_0340 RMA_0341 murB ddl TRUE 0.658 243.000 0.135 0.012 Y NA
 7231824 7231825 RMA_0341 RMA_0342 ddl ftsQ TRUE 0.992 -6.000 0.372 NA Y NA
 7231825 7231826 RMA_0342 RMA_0343 ftsQ ftsA TRUE 0.904 129.000 0.137 NA N NA
 7231827 7231828 RMA_0344 RMA_0345   cycM TRUE 0.874 -16.000 0.014 NA N NA
 7231830 7231831 RMA_0347 RMA_0348 lpxC   FALSE 0.070 348.000 0.005 NA   NA
 7231832 7231833 RMA_0349 RMA_0350 rne coxW FALSE 0.237 243.000 0.000 1.000 N NA
 7231833 7231834 RMA_0350 RMA_0351 coxW rluA1 TRUE 0.940 4.000 0.022 1.000 N NA
 7231834 7231835 RMA_0351 RMA_0352 rluA1 pbpE TRUE 0.939 107.000 0.412 1.000 N NA
 7231835 7231836 RMA_0352 RMA_0353 pbpE xth1 TRUE 0.812 82.000 0.063 1.000 N NA
 7231836 7231837 RMA_0353 RMA_0354 xth1 pdhA TRUE 0.817 23.000 0.018 1.000 N NA
 7231837 7231838 RMA_0354 RMA_0355 pdhA pdhB TRUE 0.966 161.000 0.456 0.002 Y NA
 7231840 7231841 RMA_0357 RMA_0358 hlpA icd TRUE 0.802 75.000 0.062 1.000 N NA
 7231841 7231842 RMA_0358 RMA_0359 icd   TRUE 0.840 106.000 0.069 1.000 N NA
 7231842 7231843 RMA_0359 RMA_0360   mnhB TRUE 0.937 46.000 0.184 NA Y NA
 7231843 7231844 RMA_0360 RMA_0361 mnhB ccmB TRUE 0.883 -13.000 0.000 NA N NA
 7231844 7231845 RMA_0361 RMA_0362 ccmB   TRUE 0.636 77.000 0.000 NA   NA
 7231845 7231846 RMA_0362 RMA_0363   petA TRUE 0.986 22.000 0.875 NA   NA
 7231846 7231847 RMA_0363 RMA_0364 petA petB TRUE 0.772 -49.000 0.021 0.003 Y NA
 7231847 7231848 RMA_0364 RMA_0365 petB   TRUE 0.667 118.000 0.005 1.000 N NA
 7231848 7231849 RMA_0365 RMA_0366   fbcH FALSE 0.579 72.000 0.006 1.000 N NA
 7231849 7231850 RMA_0366 RMA_0367 fbcH   FALSE 0.137 291.000 0.000 NA   NA
 7231850 7231851 RMA_0367 RMA_0368   hspC1 TRUE 0.958 21.000 0.286 NA   NA
 7231852 7231853 RMA_0369 RMA_0370     TRUE 0.826 17.000 0.000 NA   NA
 7231853 7231854 RMA_0370 RMA_0371     TRUE 0.801 -24.000 0.000 NA   NA
 7231854 7231855 RMA_0371 RMA_0372   prfB TRUE 0.886 10.000 0.000 NA   NA
 7231856 7231857 RMA_0373 RMA_RNA10 lepA   TRUE 0.656 92.000 0.000 NA   NA
 7231858 7231859 RMA_0374 RMA_0375     FALSE 0.038 471.000 0.000 NA   NA
 7231859 7231860 RMA_0375 RMA_0376     FALSE 0.079 356.000 0.000 NA   NA
 7231861 7231862 RMA_0377 RMA_0378     TRUE 0.674 42.000 0.000 NA   NA
 7231862 7231863 RMA_0378 RMA_0379     TRUE 0.708 34.000 0.000 NA   NA
 7231863 7231864 RMA_0379 RMA_0380     FALSE 0.021 662.000 0.000 NA   NA
 7231864 7231865 RMA_0380 RMA_0381     TRUE 0.929 0.000 0.000 NA   NA
 7231865 7231866 RMA_0381 RMA_0382     TRUE 0.715 151.000 0.000 NA   NA
 7231866 7231867 RMA_0382 RMA_0383     FALSE 0.026 560.000 0.000 NA   NA
 7231867 7231868 RMA_0383 RMA_0384     TRUE 0.826 -22.000 0.000 NA   NA
 7231869 7231870 RMA_0385 RMA_0386     TRUE 0.876 11.000 0.000 NA   NA
 7231870 7231871 RMA_0386 RMA_0387   rodA FALSE 0.563 180.000 0.000 NA   NA
 7231871 7231872 RMA_0387 RMA_0388 rodA ptrB FALSE 0.428 201.000 0.010 1.000 N NA
 7231872 7231873 RMA_0388 RMA_0389 ptrB nuoL3 TRUE 0.932 176.000 0.538 1.000 N NA
 7231873 7231874 RMA_0389 RMA_0390 nuoL3 vapC1 TRUE 0.991 -4.000 0.556 NA   NA
 7231874 7231875 RMA_0390 RMA_0391 vapC1 vapB1 TRUE 0.935 52.000 0.444 NA   NA
 7231875 7231876 RMA_0391 RMA_0392 vapB1 nuoL2 TRUE 0.862 155.000 0.070 NA   NA
 7231876 7231877 RMA_0392 RMA_0393 nuoL2 nuoN2 TRUE 0.890 84.000 0.067 0.008 Y NA
 7231877 7231878 RMA_0393 RMA_0394 nuoN2 mnhC TRUE 0.993 -3.000 0.426 0.022 Y NA
 7231878 7231879 RMA_0394 RMA_0395 mnhC virB9-1 TRUE 0.823 92.000 0.065 NA N NA
 7231879 7231880 RMA_0395 RMA_0396 virB9-1 virB8-1 TRUE 0.989 -16.000 0.455 NA Y NA
 7231881 7231882 RMA_0397 RMA_0398   virB8-2 TRUE 0.921 53.000 0.316 NA   NA
 7231882 7231883 RMA_0398 RMA_0399 virB8-2 virB9-2 TRUE 0.982 -13.000 0.421 NA   NA
 7231883 7231884 RMA_0399 RMA_0400 virB9-2 virB10 TRUE 0.897 184.000 0.421 NA   NA
 7231884 7231885 RMA_0400 RMA_0401 virB10 virB11 TRUE 0.956 -42.000 0.452 1.000 Y NA
 7231885 7231886 RMA_0401 RMA_0402 virB11 virD4 TRUE 0.958 167.000 0.405 1.000 Y NA
 7231886 7231887 RMA_0402 RMA_0403 virD4 gppA TRUE 0.945 10.000 0.054 1.000 N NA
 7231891 7231892 RMA_0407 RMA_0408     TRUE 0.966 -43.000 0.875 NA   NA
 7231892 7231893 RMA_0408 RMA_0409   cysQ TRUE 0.959 -3.000 0.048 NA   NA
 7231894 7231895 RMA_0410 RMA_0411 mutS lacA TRUE 0.632 171.000 0.000 1.000 N NA
 7231896 7231897 RMA_0412 RMA_0413 nlpD1   TRUE 0.928 1.000 0.000 NA   NA
 7231897 7231898 RMA_0413 RMA_0414     TRUE 0.661 99.000 0.000 NA   NA
 7231898 7231899 RMA_0414 RMA_0415   thyX FALSE 0.298 226.000 0.000 NA   NA
 7231899 7231900 RMA_0415 RMA_0416 thyX tolB TRUE 0.646 75.000 0.014 1.000 N NA
 7231904 7231905 RMA_0420 RMA_0421 mnmA atrC1 TRUE 0.731 126.000 0.014 1.000 N NA
 7231905 7231906 RMA_0421 RMA_0422 atrC1 hisS FALSE 0.587 69.000 0.008 1.000 N NA
 7231906 7231907 RMA_0422 RMA_0423 hisS   FALSE 0.074 360.000 0.000 NA   NA
 7231907 7231908 RMA_0423 RMA_0424     TRUE 0.635 61.000 0.000 NA   NA
 7231908 7231909 RMA_0424 RMA_0425     FALSE 0.312 -123.000 0.000 NA   NA
 7231910 7231911 RMA_0426 RMA_0427     FALSE 0.024 593.000 0.000 NA   NA
 7231911 7231912 RMA_0427 RMA_0428     TRUE 0.642 -40.000 0.000 NA   NA
 7231912 7231913 RMA_0428 RMA_0429     TRUE 0.857 13.000 0.000 NA   NA
 7231913 7231914 RMA_0429 RMA_0430     FALSE 0.047 424.000 0.000 NA   NA
 7231914 7231915 RMA_0430 RMA_0431     FALSE 0.032 490.000 0.000 NA   NA
 7231916 7231917 RMA_0432 RMA_0433 tolQ tolR TRUE 0.982 0.000 0.059 0.030 Y NA
 7231917 7231918 RMA_0433 RMA_0434 tolR   TRUE 0.958 -22.000 0.240 NA   NA
 7231918 7231919 RMA_0434 RMA_0435   spoT2 FALSE 0.014 1006.000 0.000 NA   NA
 7231920 7231921 RMA_0436 RMA_0437 proP2   TRUE 0.931 134.000 0.273 0.076   NA
 7231921 7231922 RMA_0437 RMA_0438   aprD TRUE 0.862 182.000 0.267 0.011   NA
 7231922 7231923 RMA_0438 RMA_0439 aprD asd TRUE 0.874 -13.000 0.011 1.000   NA
 7231923 7231924 RMA_0439 RMA_0440 asd pkcI TRUE 0.895 -10.000 0.012 1.000 N NA
 7231924 7231925 RMA_0440 RMA_0441 pkcI   TRUE 0.695 133.000 0.010 NA   NA
 7231926 7231927 RMA_0442 RMA_0443 hslV hslU TRUE 0.996 -3.000 0.752 1.000 Y NA
 7231927 7231928 RMA_0443 RMA_0444 hslU   FALSE 0.437 204.000 0.000 NA   NA
 7231928 7231929 RMA_0444 RMA_0445     TRUE 0.847 -19.000 0.000 NA   NA
 7231929 7231930 RMA_0445 RMA_0446     FALSE 0.547 -51.000 0.000 NA   NA
 7231930 7231931 RMA_0446 RMA_0447     TRUE 0.719 143.000 0.000 NA   NA
 7231931 7231932 RMA_0447 RMA_0448     TRUE 0.918 4.000 0.000 NA   NA
 7231932 7231933 RMA_0448 RMA_0449     FALSE 0.024 611.000 0.000 NA   NA
 7231933 7231934 RMA_0449 RMA_0450     TRUE 0.629 65.000 0.000 NA   NA
 7231934 7231935 RMA_0450 RMA_0451     TRUE 0.902 7.000 0.000 NA   NA
 7231935 7231936 RMA_0451 RMA_0452   lpxB TRUE 0.857 13.000 0.000 NA   NA
 7231938 7231939 RMA_0454 RMA_0455   cyaY TRUE 0.699 116.000 0.012 NA   NA
 7231939 7231940 RMA_0455 RMA_0456 cyaY   TRUE 0.686 138.000 0.008 NA   NA
 7231940 7231941 RMA_0456 RMA_0457     FALSE 0.141 288.000 0.000 NA   NA
 7231941 7231942 RMA_0457 RMA_0458     FALSE 0.578 -48.000 0.000 NA   NA
 7231942 7231943 RMA_0458 RMA_0459     TRUE 0.635 61.000 0.000 NA   NA
 7231943 7231944 RMA_0459 RMA_0460     TRUE 0.629 65.000 0.000 NA   NA
 7231944 7231945 RMA_0460 RMA_0461     FALSE 0.030 509.000 0.000 NA   NA
 7231946 7231947 RMA_0462 RMA_0463 gltX topA TRUE 0.644 109.000 0.007 1.000 N NA
 7231947 7231948 RMA_0463 RMA_0464 topA   TRUE 0.918 4.000 0.000 NA   NA
 7231948 7231949 RMA_0464 RMA_0465     TRUE 0.761 -28.000 0.000 NA   NA
 7231949 7231950 RMA_0465 RMA_0466     TRUE 0.915 -4.000 0.000 NA   NA
 7231950 7231951 RMA_0466 RMA_0467     FALSE 0.547 -51.000 0.000 NA   NA
 7231951 7231952 RMA_0467 RMA_0468   tdpX1 TRUE 0.719 129.000 0.000 NA   NA
 7231952 7231953 RMA_0468 RMA_0469 tdpX1 hflC1 TRUE 0.792 76.000 0.014 1.000 Y NA
 7231953 7231954 RMA_0469 RMA_0470 hflC1   FALSE 0.067 370.000 0.000 1.000   NA
 7231955 7231956 RMA_0471 RMA_0472     TRUE 0.700 156.000 0.000 1.000   NA
 7231956 7231957 RMA_0472 RMA_0473     TRUE 0.646 86.000 0.000 1.000   NA
 7231957 7231958 RMA_0473 RMA_0474   capD TRUE 0.822 195.000 0.271 0.002   NA
 7231958 7231959 RMA_0474 RMA_0475 capD rffE TRUE 0.974 -7.000 0.148 1.000   NA
 7231959 7231960 RMA_0475 RMA_0476 rffE   TRUE 0.642 -40.000 0.000 NA   NA
 7231960 7231961 RMA_0476 RMA_0477     TRUE 0.833 16.000 0.000 NA   NA
 7231961 7231962 RMA_0477 RMA_0478     FALSE 0.050 416.000 0.000 NA   NA
 7231963 7231964 RMA_0479 RMA_0480     TRUE 0.921 89.000 0.312 NA   NA
 7231964 7231965 RMA_0480 RMA_0481     TRUE 0.975 4.000 0.129 NA   NA
 7231967 7231968 RMA_0483 RMA_0484   rpsD FALSE 0.011 1434.000 0.000 NA   NA
 7231972 7231973 RMA_0488 RMA_0489 asmA rimM FALSE 0.109 322.000 0.000 NA N NA
 7231974 7231975 RMA_0490 RMA_0491   xseB TRUE 0.820 14.000 0.007 NA   NA
 7231975 7231976 RMA_0491 RMA_0492 xseB   TRUE 0.684 38.000 0.000 NA   NA
 7231976 7231977 RMA_0492 RMA_0493     TRUE 0.815 19.000 0.000 NA   NA
 7231977 7231978 RMA_0493 RMA_0494     FALSE 0.504 189.000 0.000 NA   NA
 7231978 7231979 RMA_0494 RMA_0495     TRUE 0.902 7.000 0.000 NA   NA
 7231980 7231981 RMA_0496 RMA_0497 mpg   TRUE 0.918 4.000 0.000 NA   NA
 7231981 7231982 RMA_0497 RMA_0498     TRUE 0.629 65.000 0.000 NA   NA
 7231982 7231983 RMA_0498 RMA_0499   nuoE TRUE 0.889 -7.000 0.007 NA   NA
 7231983 7231984 RMA_0499 RMA_0500 nuoE   TRUE 0.635 61.000 0.000 NA   NA
 7231984 7231985 RMA_0500 RMA_0501   nuoD TRUE 0.718 138.000 0.000 NA   NA
 7231985 7231986 RMA_0501 RMA_0502 nuoD nuoC TRUE 0.993 6.000 0.483 0.020 Y NA
 7231986 7231987 RMA_0502 RMA_0503 nuoC nuoB TRUE 0.981 -22.000 0.328 0.007 Y NA
 7231987 7231988 RMA_0503 RMA_0504 nuoB nuoA TRUE 0.993 5.000 0.507 0.007 Y NA
 7231988 7231989 RMA_0504 RMA_0505 nuoA rfaL TRUE 0.953 -3.000 0.031 NA N NA
 7231989 7231990 RMA_0505 RMA_0506 rfaL   TRUE 0.969 1.000 0.066 NA   NA
 7231991 7231992 RMA_0507 RMA_0508     FALSE 0.317 -115.000 0.000 NA   NA
 7231992 7231993 RMA_0508 RMA_RNA11     FALSE 0.260 238.000 0.000 NA   NA
 7231993 7231994 RMA_RNA11 RMA_0509   xerD TRUE 0.792 22.000 0.000 NA   NA
 7231994 7231995 RMA_0509 RMA_0510 xerD   FALSE 0.596 76.000 0.008 NA   NA
 7231995 7231996 RMA_0510 RMA_0511     TRUE 0.958 111.000 0.571 NA   NA
 7231998 7231999 RMA_0513 RMA_0514 lnt   FALSE 0.563 180.000 0.000 NA   NA
 7231999 7232000 RMA_0514 RMA_0515   ampD1 TRUE 0.656 92.000 0.000 NA   NA
 7232000 7232001 RMA_0515 RMA_0516 ampD1   FALSE 0.021 654.000 0.000 NA   NA
 7232001 7232002 RMA_0516 RMA_0517     TRUE 0.929 0.000 0.000 NA   NA
 7232002 7232003 RMA_0517 RMA_0518     FALSE 0.453 -58.000 0.000 NA   NA
 7232003 7232004 RMA_0518 RMA_0519     FALSE 0.302 -174.000 0.000 NA   NA
 7232004 7232005 RMA_0519 RMA_0520     TRUE 0.662 -39.000 0.000 NA   NA
 7232005 7232006 RMA_0520 RMA_0521     TRUE 0.882 -13.000 0.000 NA   NA
 7232007 7232008 RMA_0522 RMA_0523     TRUE 0.929 0.000 0.000 NA   NA
 7232008 7232009 RMA_0523 RMA_0524   dsbB TRUE 0.845 14.000 0.000 NA   NA
 7232010 7232011 RMA_0525 RMA_0526 lysK   TRUE 0.776 130.000 0.021 1.000   NA
 7232011 7232012 RMA_0526 RMA_0527   tme TRUE 0.832 52.000 0.071 1.000   NA
 7232012 7232013 RMA_0527 RMA_0528 tme   TRUE 0.736 29.000 0.000 NA   NA
 7232013 7232014 RMA_0528 RMA_0529     TRUE 0.691 -36.000 0.000 NA   NA
 7232015 7232016 RMA_0530 RMA_0531     TRUE 0.930 -34.000 0.286 NA   NA
 7232018 7232019 RMA_0533 RMA_0534     TRUE 0.656 51.000 0.000 NA   NA
 7232019 7232020 RMA_0534 RMA_0535     FALSE 0.359 -79.000 0.000 NA   NA
 7232020 7232021 RMA_0535 RMA_0536   mdh FALSE 0.090 344.000 0.000 NA   NA
 7232025 7232026 RMA_0540 RMA_0541 tlc2 pyrG FALSE 0.396 209.000 0.000 1.000 N NA
 7232026 7232027 RMA_0541 RMA_0542 pyrG kdsB TRUE 0.940 -3.000 0.019 1.000 N NA
 7232028 7232029 RMA_RNA12 RMA_RNA13     TRUE 0.833 16.000 0.000 NA   NA
 7232031 7232032 RMA_0544 RMA_0545   folE TRUE 0.966 -7.000 0.092 1.000   NA
 7232032 7232033 RMA_0545 RMA_0546 folE proS TRUE 0.681 133.000 0.008 0.051 N NA
 7232033 7232034 RMA_0546 RMA_0547 proS   FALSE 0.421 205.000 0.000 1.000   NA
 7232034 7232035 RMA_0547 RMA_0548     TRUE 0.753 59.000 0.034 NA   NA
 7232035 7232036 RMA_0548 RMA_0549   ruvA TRUE 0.820 -19.000 0.007 NA   NA
 7232036 7232037 RMA_0549 RMA_0550 ruvA ruvB FALSE 0.167 1171.000 0.549 0.004 Y NA
 7232037 7232038 RMA_0550 RMA_0551 ruvB msbA1 FALSE 0.491 -52.000 0.007 1.000 N NA
 7232038 7232039 RMA_0551 RMA_0552 msbA1 ampG4 FALSE 0.593 173.000 0.010 NA   NA
 7232039 7232040 RMA_0552 RMA_0553 ampG4 dacF TRUE 0.960 159.000 0.625 NA   NA
 7232041 7232042 RMA_0554 RMA_0555 rlpA osmY TRUE 0.745 -40.000 0.029 NA   NA
 7232042 7232043 RMA_0555 RMA_0556 osmY ispZ FALSE 0.464 202.000 0.014 NA   NA
 7232043 7232044 RMA_0556 RMA_0557 ispZ   TRUE 0.836 25.000 0.027 1.000 N NA
 7232044 7232045 RMA_0557 RMA_0558     TRUE 0.993 1.000 0.629 NA   NA
 7232045 7232046 RMA_0558 RMA_0559     TRUE 0.719 146.000 0.000 NA   NA
 7232047 7232048 RMA_0560 RMA_0561   tlpA TRUE 0.606 190.000 0.026 1.000 N NA
 7232048 7232049 RMA_0561 RMA_0562 tlpA sppA1 TRUE 0.896 150.000 0.042 1.000 Y NA
 7232049 7232050 RMA_0562 RMA_0563 sppA1 dut TRUE 0.914 2.000 0.008 1.000 N NA
 7232050 7232051 RMA_0563 RMA_0564 dut mltE1 FALSE 0.336 211.000 0.006 1.000 N NA
 7232051 7232052 RMA_0564 RMA_0565 mltE1   TRUE 0.750 71.000 0.041 NA   NA
 7232052 7232053 RMA_0565 RMA_0566   mccF TRUE 0.887 204.000 0.571 NA   NA
 7232056 7232057 RMA_0569 RMA_0570   coxA FALSE 0.400 207.000 0.012 1.000   NA
 7232057 7232058 RMA_0570 RMA_0571 coxA   TRUE 0.874 -15.000 0.000 NA   NA
 7232058 7232059 RMA_0571 RMA_0572   coxB FALSE 0.072 365.000 0.000 NA   NA
 7232059 7232060 RMA_0572 RMA_0573 coxB   TRUE 0.815 19.000 0.000 NA   NA
 7232061 7232062 RMA_0574 RMA_0575 nlpD2 lspA TRUE 0.749 -55.000 0.031 0.028 Y NA
 7232062 7232063 RMA_0575 RMA_0576 lspA   TRUE 0.814 103.000 0.054 NA   NA
 7232063 7232064 RMA_0576 RMA_0577   murD FALSE 0.576 172.000 0.006 NA   NA
 7232064 7232065 RMA_0577 RMA_0578 murD ftsW TRUE 0.933 118.000 0.297 0.009 N NA
 7232065 7232066 RMA_0578 RMA_0579 ftsW murG TRUE 0.993 -3.000 0.647 1.000 N NA
 7232066 7232067 RMA_0579 RMA_0580 murG   FALSE 0.055 399.000 0.000 NA   NA
 7232067 7232068 RMA_0580 RMA_0581     FALSE 0.054 405.000 0.000 NA   NA
 7232069 7232070 RMA_0582 RMA_0583     FALSE 0.367 212.000 0.000 NA   NA
 7232070 7232071 RMA_0583 RMA_0584     TRUE 0.886 10.000 0.000 NA   NA
 7232071 7232072 RMA_0584 RMA_0585     TRUE 0.867 12.000 0.000 NA   NA
 7232072 7232073 RMA_0585 RMA_0586     FALSE 0.057 396.000 0.000 NA   NA
 7232073 7232074 RMA_0586 RMA_0587     FALSE 0.535 -52.000 0.000 NA   NA
 7232074 7232075 RMA_0587 RMA_0588     FALSE 0.432 -61.000 0.000 NA   NA
 7232075 7232076 RMA_0588 RMA_0589     TRUE 0.924 3.000 0.000 NA   NA
 7232076 7232077 RMA_0589 RMA_0590     FALSE 0.035 485.000 0.000 NA   NA
 7232077 7232078 RMA_0590 RMA_0591     TRUE 0.857 13.000 0.000 NA   NA
 7232078 7232079 RMA_0591 RMA_0592     FALSE 0.316 223.000 0.000 NA   NA
 7232079 7232080 RMA_0592 RMA_0593     TRUE 0.974 -9.000 0.182 NA   NA
 7232080 7232081 RMA_0593 RMA_0594     TRUE 0.769 -27.000 0.000 NA   NA
 7232081 7232082 RMA_0594 RMA_0595     TRUE 0.857 13.000 0.000 NA   NA
 7232083 7232084 RMA_0596 RMA_0597 dapF   TRUE 0.921 -25.000 0.109 1.000 N NA
 7232084 7232085 RMA_0597 RMA_0598   pheS TRUE 0.764 82.000 0.007 1.000 Y NA
 7232085 7232086 RMA_0598 RMA_0599 pheS pheT TRUE 0.995 -3.000 0.574 0.002 Y NA
 7232086 7232087 RMA_0599 RMA_0600 pheT dnaN TRUE 0.918 5.000 0.015 1.000 N NA
 7232087 7232088 RMA_0600 RMA_0601 dnaN   FALSE 0.056 367.000 0.002 NA   NA
 7232088 7232089 RMA_0601 RMA_0602   leuS TRUE 0.842 129.000 0.051 NA   NA
 7232090 7232091 RMA_0603 RMA_0604 rnd2   TRUE 0.736 151.000 0.015 1.000   NA
 7232091 7232092 RMA_0604 RMA_0605   cdsA TRUE 0.772 -25.000 0.011 1.000 N NA
 7232092 7232093 RMA_0605 RMA_0606 cdsA uppS TRUE 0.956 -40.000 0.400 1.000 Y NA
 7232093 7232094 RMA_0606 RMA_0607 uppS envZ TRUE 0.679 146.000 0.006 1.000 N NA
 7232094 7232095 RMA_0607 RMA_0608 envZ ompR TRUE 0.985 -25.000 0.592 1.000 Y NA
 7232096 7232097 RMA_0609 RMA_0610 ilvE dapA TRUE 0.904 168.000 0.087 1.000 Y NA
 7232097 7232098 RMA_0610 RMA_0611 dapA smpB TRUE 0.818 -21.000 0.008 1.000 N NA
 7232098 7232099 RMA_0611 RMA_0612 smpB dsbA TRUE 0.796 109.000 0.007 1.000 Y NA
 7232100 7232101 RMA_0613 RMA_0614 sucD sucC TRUE 0.924 178.000 0.256 0.002 Y NA
 7232101 7232102 RMA_0614 RMA_0615 sucC   TRUE 0.648 54.000 0.000 NA   NA
 7232102 7232103 RMA_0615 RMA_0616     TRUE 0.676 -37.000 0.000 NA   NA
 7232103 7232104 RMA_0616 RMA_0617     TRUE 0.605 -43.000 0.000 NA   NA
 7232104 7232105 RMA_0617 RMA_0618     FALSE 0.017 775.000 0.000 NA   NA
 7232105 7232106 RMA_0618 RMA_0619     TRUE 0.701 88.000 0.018 1.000   NA
 7232106 7232107 RMA_0619 RMA_0620   rbfA FALSE 0.012 1327.000 0.000 1.000   NA
 7232107 7232108 RMA_0620 RMA_0621 rbfA   TRUE 0.903 4.000 0.007 NA   NA
 7232109 7232110 RMA_0622 RMA_0623   recR TRUE 0.677 139.000 0.006 NA   NA
 7232111 7232112 RMA_0624 RMA_0625     FALSE 0.013 1039.000 0.000 NA   NA
 7232112 7232113 RMA_0625 RMA_0626   ppnK TRUE 0.635 61.000 0.000 NA   NA
 7232114 7232115 RMA_0627 RMA_0628   gpsA FALSE 0.304 249.000 0.029 1.000   NA
 7232115 7232116 RMA_0628 RMA_0629 gpsA   FALSE 0.017 772.000 0.000 1.000   NA
 7232116 7232117 RMA_0629 RMA_0630     TRUE 0.847 58.000 0.096 NA   NA
 7232117 7232118 RMA_0630 RMA_0631   trxB1 FALSE 0.438 193.000 0.007 NA   NA
 7232118 7232119 RMA_0631 RMA_0632 trxB1   FALSE 0.269 231.000 0.000 NA   NA
 7232119 7232120 RMA_0632 RMA_0633   gabD TRUE 0.675 162.000 0.000 NA   NA
 7232120 7232121 RMA_0633 RMA_0634 gabD   TRUE 0.800 158.000 0.040 NA   NA
 7232121 7232122 RMA_0634 RMA_0635   lgtD TRUE 0.976 -7.000 0.182 NA   NA
 7232122 7232123 RMA_0635 RMA_0636 lgtD uvrD FALSE 0.525 185.000 0.012 NA N NA
 7232123 7232124 RMA_0636 RMA_0637 uvrD   FALSE 0.011 1463.000 0.000 NA   NA
 7232126 7232127 RMA_0639 RMA_0640 lon1   FALSE 0.045 437.000 0.000 NA   NA
 7232127 7232128 RMA_0640 RMA_0641     TRUE 0.627 73.000 0.000 NA   NA
 7232129 7232130 RMA_0642 RMA_RNA14     FALSE 0.537 184.000 0.000 NA   NA
 7232131 7232132 RMA_0643 RMA_0644 yhbH   TRUE 0.929 0.000 0.000 NA   NA
 7232132 7232133 RMA_0644 RMA_0645     TRUE 0.801 -24.000 0.000 NA   NA
 7232134 7232135 RMA_0646 RMA_0647 folD trxB2 TRUE 0.800 147.000 0.026 1.000 N NA
 7232136 7232137 RMA_0648 RMA_0649 famC   FALSE 0.080 355.000 0.000 NA   NA
 7232137 7232138 RMA_0649 RMA_0650     TRUE 0.626 67.000 0.000 NA   NA
 7232138 7232139 RMA_0650 RMA_0651     FALSE 0.017 788.000 0.000 NA   NA
 7232139 7232140 RMA_0651 RMA_0652     FALSE 0.014 961.000 0.000 NA   NA
 7232140 7232141 RMA_0652 RMA_0653   nrdA FALSE 0.084 349.000 0.000 NA   NA
 7232141 7232142 RMA_0653 RMA_0654 nrdA   TRUE 0.896 8.000 0.000 NA   NA
 7232142 7232143 RMA_0654 RMA_0655     TRUE 0.826 -22.000 0.000 NA   NA
 7232143 7232144 RMA_0655 RMA_0656     FALSE 0.492 -55.000 0.000 NA   NA
 7232144 7232145 RMA_0656 RMA_0657   nrdF FALSE 0.206 250.000 0.000 NA   NA
 7232145 7232146 RMA_0657 RMA_0658 nrdF   TRUE 0.852 117.000 0.065 NA   NA
 7232146 7232147 RMA_0658 RMA_0659     FALSE 0.059 392.000 0.000 NA   NA
 7232147 7232148 RMA_0659 RMA_0660     TRUE 0.803 21.000 0.000 NA   NA
 7232148 7232149 RMA_0660 RMA_0661     FALSE 0.056 398.000 0.000 NA   NA
 7232149 7232150 RMA_0661 RMA_0662     TRUE 0.624 69.000 0.000 NA   NA
 7232151 7232152 RMA_0663 RMA_0664 miaA exoC FALSE 0.023 551.000 0.007 1.000 N NA
 7232152 7232153 RMA_0664 RMA_0665 exoC abcT2 FALSE 0.599 171.000 0.009 1.000   NA
 7232153 7232154 RMA_0665 RMA_0666 abcT2   TRUE 0.934 175.000 0.543 NA   NA
 7232154 7232155 RMA_0666 RMA_0667     TRUE 0.914 -31.000 0.144 NA   NA
 7232155 7232156 RMA_0667 RMA_0668   kpsF TRUE 0.970 6.000 0.115 NA   NA
 7232156 7232157 RMA_0668 RMA_0669 kpsF pnp FALSE 0.440 192.000 0.006 1.000 N NA
 7232157 7232158 RMA_0669 RMA_0670 pnp rpsO TRUE 0.967 139.000 0.335 1.000 Y NA
 7232158 7232159 RMA_0670 RMA_0671 rpsO truB TRUE 0.990 3.000 0.211 1.000 Y NA
 7232160 7232161 RMA_0672 RMA_0673 tlc4 sca4 FALSE 0.135 292.000 0.000 NA   NA
 7232165 7232166 RMA_0677 RMA_0678   def2 FALSE 0.152 256.000 0.004 NA   NA
 7232166 7232167 RMA_0678 RMA_0679 def2   FALSE 0.422 205.000 0.000 NA   NA
 7232167 7232168 RMA_0679 RMA_0680     TRUE 0.680 108.000 0.000 NA   NA
 7232169 7232170 RMA_0681 RMA_0682 addA   FALSE 0.311 224.000 0.000 NA   NA
 7232170 7232171 RMA_0682 RMA_0683   ppdK FALSE 0.227 247.000 0.000 NA   NA
 7232172 7232173 RMA_RNA15 RMA_0684 rnpB   TRUE 0.714 119.000 0.000 NA   NA
 7232175 7232176 RMA_0686 RMA_0687 bioY2 folC FALSE 0.536 177.000 0.004 NA   NA
 7232176 7232177 RMA_0687 RMA_0688 folC sodB TRUE 0.726 144.000 0.013 1.000 N NA
 7232177 7232178 RMA_0688 RMA_0689 sodB rssA TRUE 0.890 5.000 0.004 1.000   NA
 7232178 7232179 RMA_0689 RMA_0690 rssA birA TRUE 0.765 109.000 0.024 1.000   NA
 7232179 7232180 RMA_0690 RMA_0691 birA   FALSE 0.015 877.000 0.000 NA   NA
 7232180 7232181 RMA_0691 RMA_0692     TRUE 0.707 155.000 0.000 NA   NA
 7232181 7232182 RMA_0692 RMA_0693     FALSE 0.028 542.000 0.000 NA   NA
 7232182 7232183 RMA_0693 RMA_0694     FALSE 0.094 343.000 0.000 NA   NA
 7232183 7232184 RMA_0694 RMA_0695     TRUE 0.640 80.000 0.000 NA   NA
 7232184 7232185 RMA_0695 RMA_0696     FALSE 0.020 674.000 0.000 NA   NA
 7232185 7232186 RMA_0696 RMA_0697     TRUE 0.645 57.000 0.000 NA   NA
 7232186 7232187 RMA_0697 RMA_0698     TRUE 0.718 122.000 0.000 NA   NA
 7232187 7232188 RMA_0698 RMA_0699     TRUE 0.902 7.000 0.000 NA   NA
 7232188 7232189 RMA_0699 RMA_0700     TRUE 0.970 -13.000 0.194 NA   NA
 7232189 7232190 RMA_0700 RMA_0701   infC TRUE 0.629 43.000 0.007 NA   NA
 7232190 7232191 RMA_0701 RMA_0702 infC pdhC TRUE 0.674 146.000 0.005 1.000 N NA
 7232191 7232192 RMA_0702 RMA_0703 pdhC prfA TRUE 0.672 133.000 0.005 1.000 N NA
 7232192 7232193 RMA_0703 RMA_0704 prfA recJ FALSE 0.439 -55.000 0.005 1.000 N NA
 7232193 7232194 RMA_0704 RMA_0705 recJ   TRUE 0.616 46.000 0.005 1.000 N NA
 7232194 7232195 RMA_0705 RMA_0706   rho FALSE 0.101 341.000 0.000 1.000 N NA
 7232195 7232196 RMA_0706 RMA_0707 rho sppA2 TRUE 0.674 126.000 0.005 1.000 N NA
 7232196 7232197 RMA_0707 RMA_0708 sppA2 himD TRUE 0.980 0.000 0.142 1.000 N NA
 7232197 7232198 RMA_0708 RMA_0709 himD   FALSE 0.014 936.000 0.000 NA   NA
 7232198 7232199 RMA_0709 RMA_0710     TRUE 0.822 18.000 0.000 NA   NA
 7232199 7232200 RMA_0710 RMA_0711     FALSE 0.076 358.000 0.000 NA   NA
 7232200 7232201 RMA_0711 RMA_0712     TRUE 0.826 17.000 0.000 NA   NA
 7232201 7232202 RMA_0712 RMA_0713     FALSE 0.011 1585.000 0.000 NA   NA
 7232202 7232203 RMA_0713 RMA_0714     FALSE 0.348 216.000 0.000 NA   NA
 7232203 7232204 RMA_0714 RMA_0715     TRUE 0.923 -3.000 0.000 NA   NA
 7232204 7232205 RMA_0715 RMA_0716     FALSE 0.040 457.000 0.000 NA   NA
 7232205 7232206 RMA_0716 RMA_0717   traE TRUE 0.994 0.000 0.667 NA   NA
 7232206 7232207 RMA_0717 RMA_0718 traE   TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 7232207 7232208 RMA_0718 RMA_0719     TRUE 0.939 -61.000 1.000 NA   NA
 7232208 7232209 RMA_0719 RMA_0720   traB TRUE 0.985 25.000 1.000 NA   NA
 7232209 7232210 RMA_0720 RMA_0721 traB traV TRUE 0.978 0.000 0.125 NA   NA
 7232210 7232211 RMA_0721 RMA_0722 traV   TRUE 0.978 0.000 0.125 NA   NA
 7232211 7232212 RMA_0722 RMA_0723     TRUE 0.651 88.000 0.000 NA   NA
 7232212 7232213 RMA_0723 RMA_0724     TRUE 0.689 110.000 0.000 NA   NA
 7232213 7232214 RMA_0724 RMA_0725     TRUE 0.703 -34.000 0.000 NA   NA
 7232214 7232215 RMA_0725 RMA_0726   traU FALSE 0.164 266.000 0.000 NA   NA
 7232215 7232216 RMA_0726 RMA_0727 traU trbC TRUE 0.990 -15.000 0.800 NA   NA
 7232216 7232217 RMA_0727 RMA_0728 trbC traN TRUE 0.970 -30.000 0.600 NA   NA
 7232217 7232218 RMA_0728 RMA_0729 traN traF TRUE 0.703 -34.000 0.000 NA   NA
 7232218 7232219 RMA_0729 RMA_0730 traF traH TRUE 0.839 15.000 0.000 NA   NA
 7232219 7232220 RMA_0730 RMA_0731 traH traG TRUE 0.639 79.000 0.000 NA   NA
 7232220 7232221 RMA_0731 RMA_0732 traG   TRUE 0.826 -22.000 0.000 NA   NA
 7232221 7232222 RMA_0732 RMA_0733   traD_F TRUE 0.990 -10.000 0.333 NA Y NA
 7232223 7232224 RMA_0734 RMA_0735   traA_Ti TRUE 0.919 44.000 0.286 NA   NA
 7232225 7232226 RMA_0736 RMA_0737     FALSE 0.520 186.000 0.000 NA   NA
 7232226 7232227 RMA_0737 RMA_0738     FALSE 0.587 -46.000 0.000 NA   NA
 7232228 7232229 RMA_0739 RMA_0740     TRUE 0.895 -10.000 0.000 NA   NA
 7232229 7232230 RMA_0740 RMA_0741     TRUE 0.915 -4.000 0.000 NA   NA
 7232230 7232231 RMA_0741 RMA_0742     TRUE 0.629 65.000 0.000 NA   NA
 7232231 7232232 RMA_0742 RMA_0743     TRUE 0.635 61.000 0.000 NA   NA
 7232233 7232234 RMA_0744 RMA_0745     TRUE 0.678 40.000 0.000 NA   NA
 7232234 7232235 RMA_0745 RMA_0746     TRUE 0.697 -34.000 0.000 0.059   NA
 7232242 7232243 RMA_0753 RMA_0754 spoT6   TRUE 0.673 159.000 0.011 NA   NA
 7232245 7232246 RMA_0756 RMA_RNA16     TRUE 0.718 140.000 0.000 NA   NA
 7232247 7232248 RMA_0757 RMA_0758   cmk TRUE 0.657 94.000 0.000 1.000   NA
 7232248 7232249 RMA_0758 RMA_0759 cmk rpsA TRUE 0.933 148.000 0.281 1.000 N NA
 7232249 7232250 RMA_0759 RMA_0760 rpsA clpP TRUE 0.665 112.000 0.009 1.000 N NA
 7232250 7232251 RMA_0760 RMA_RNA17 clpP   TRUE 0.667 163.000 0.000 NA   NA
 7232251 7232252 RMA_RNA17 RMA_0761     FALSE 0.182 259.000 0.000 NA   NA
 7232252 7232253 RMA_0761 RMA_0762     FALSE 0.515 -54.000 0.000 NA   NA
 7232255 7232256 RMA_0764 RMA_0765     FALSE 0.340 -91.000 0.000 NA   NA
 7232256 7232257 RMA_0765 RMA_0766   fni FALSE 0.030 510.000 0.000 NA   NA
 7232258 7232259 RMA_0767 RMA_0768     TRUE 0.715 33.000 0.000 NA   NA
 7232259 7232260 RMA_0768 RMA_0769     TRUE 0.720 -33.000 0.000 NA   NA
 7232260 7232261 RMA_0769 RMA_0770     TRUE 0.640 59.000 0.000 NA   NA
 7232261 7232262 RMA_0770 RMA_0771     TRUE 0.674 42.000 0.000 NA   NA
 7232262 7232263 RMA_0771 RMA_0772     TRUE 0.717 121.000 0.000 NA   NA
 7232265 7232266 RMA_RNA18 RMA_0774   glmU FALSE 0.217 248.000 0.000 NA   NA
 7232266 7232267 RMA_0774 RMA_0775 glmU   TRUE 0.910 -3.000 0.008 NA   NA
 7232267 7232268 RMA_0775 RMA_0776   rpmJ TRUE 0.747 46.000 0.024 NA   NA
 7232269 7232270 RMA_0777 RMA_0778     TRUE 0.678 40.000 0.000 NA   NA
 7232270 7232271 RMA_0778 RMA_0779   mltE2 TRUE 0.664 102.000 0.000 NA   NA
 7232271 7232272 RMA_0779 RMA_0780 mltE2   TRUE 0.960 -16.000 0.146 NA   NA
 7232272 7232273 RMA_0780 RMA_0781     FALSE 0.115 317.000 0.000 NA   NA
 7232273 7232274 RMA_0781 RMA_0782     FALSE 0.049 419.000 0.000 NA   NA
 7232274 7232275 RMA_0782 RMA_0783     TRUE 0.713 152.000 0.000 NA   NA
 7232275 7232276 RMA_0783 RMA_0784     TRUE 0.647 55.000 0.000 NA   NA
 7232276 7232277 RMA_0784 RMA_0785     FALSE 0.031 499.000 0.000 NA   NA
 7232277 7232278 RMA_0785 RMA_0786   lpdA2 TRUE 0.690 156.000 0.012 1.000   NA
 7232278 7232279 RMA_0786 RMA_0787 lpdA2   FALSE 0.182 248.000 0.004 1.000 N NA
 7232280 7232281 RMA_0788 RMA_0789 rnd   TRUE 0.935 1.000 0.015 NA   NA
 7232282 7232283 RMA_0790 RMA_0791     FALSE 0.022 630.000 0.000 NA   NA
 7232283 7232284 RMA_0791 RMA_0792     FALSE 0.051 415.000 0.000 NA   NA
 7232284 7232285 RMA_0792 RMA_0793     FALSE 0.469 -57.000 0.000 NA   NA
 7232285 7232286 RMA_0793 RMA_0794     TRUE 0.720 -33.000 0.000 NA   NA
 7232286 7232287 RMA_0794 RMA_0795     TRUE 0.792 22.000 0.000 NA   NA
 7232287 7232288 RMA_0795 RMA_0796     TRUE 0.777 23.000 0.000 NA   NA
 7232288 7232289 RMA_0796 RMA_0797     TRUE 0.876 11.000 0.000 NA   NA
 7232289 7232290 RMA_0797 RMA_0798   mccF2 TRUE 0.865 -16.000 0.000 NA   NA
 7232290 7232291 RMA_0798 RMA_0799 mccF2 hemC TRUE 0.905 -3.000 0.003 NA N NA
 7232291 7232292 RMA_0799 RMA_0800 hemC   FALSE 0.243 240.000 0.000 NA   NA
 7232292 7232293 RMA_0800 RMA_0801     TRUE 0.910 5.000 0.000 NA   NA
 7232293 7232294 RMA_0801 RMA_0802     FALSE 0.100 341.000 0.000 NA   NA
 7232295 7232296 RMA_RNA19 RMA_0803   trpS TRUE 0.638 60.000 0.000 NA   NA
 7232297 7232298 RMA_0804 RMA_0805 plsC   TRUE 0.849 53.000 0.092 NA N NA
 7232298 7232299 RMA_0805 RMA_0806     FALSE 0.027 559.000 0.000 NA   NA
 7232300 7232301 RMA_0807 RMA_0808     TRUE 0.725 31.000 0.000 NA   NA
 7232301 7232302 RMA_0808 RMA_0809     TRUE 0.882 -13.000 0.000 NA   NA
 7232302 7232303 RMA_0809 RMA_0810     TRUE 0.900 -22.000 0.045 NA   NA
 7232303 7232304 RMA_0810 RMA_0811   lysE FALSE 0.467 -73.000 0.026 1.000   NA
 7232304 7232305 RMA_0811 RMA_0812 lysE ampG1 FALSE 0.052 408.000 0.000 NA   NA
 7232306 7232307 RMA_0813 RMA_0814     TRUE 0.697 112.000 0.000 NA   NA
 7232307 7232308 RMA_0814 RMA_0815     FALSE 0.492 -55.000 0.000 NA   NA
 7232308 7232309 RMA_0815 RMA_0816   tlc3 TRUE 0.656 51.000 0.000 NA   NA
 7232309 7232310 RMA_0816 RMA_0817 tlc3   TRUE 0.983 20.000 0.778 NA   NA
 7232310 7232311 RMA_0817 RMA_0818   ispB TRUE 0.908 7.000 0.014 NA   NA
 7232311 7232312 RMA_0818 RMA_RNA20 ispB   TRUE 0.777 23.000 0.000 NA   NA
 7232313 7232314 RMA_RNA21 RMA_0819   pepP TRUE 0.671 43.000 0.000 NA   NA
 7232314 7232315 RMA_0819 RMA_0820 pepP potE TRUE 0.927 103.000 0.136 1.000 Y NA
 7232315 7232316 RMA_0820 RMA_0821 potE iscA2 FALSE 0.013 1117.000 0.013 NA   NA
 7232316 7232317 RMA_0821 RMA_0822 iscA2 iscU TRUE 0.962 4.000 0.056 NA   NA
 7232317 7232318 RMA_0822 RMA_0823 iscU iscS TRUE 0.952 146.000 0.448 1.000 N NA
 7232318 7232319 RMA_0823 RMA_0824 iscS spl1 TRUE 0.885 103.000 0.052 0.002 Y NA
 7232319 7232320 RMA_0824 RMA_0825 spl1 iscR TRUE 0.979 -3.000 0.168 1.000 N NA
 7232320 7232321 RMA_0825 RMA_0826 iscR   FALSE 0.041 453.000 0.000 NA   NA
 7232321 7232322 RMA_0826 RMA_0827     TRUE 0.626 67.000 0.000 NA   NA
 7232322 7232323 RMA_0827 RMA_0828     TRUE 0.725 31.000 0.000 NA   NA
 7232323 7232324 RMA_0828 RMA_0829     TRUE 0.718 137.000 0.000 NA   NA
 7232324 7232325 RMA_0829 RMA_0830     FALSE 0.012 1323.000 0.000 NA   NA
 7232325 7232326 RMA_0830 RMA_0831     TRUE 0.715 151.000 0.000 NA   NA
 7232326 7232327 RMA_0831 RMA_0832     FALSE 0.019 705.000 0.000 NA   NA
 7232327 7232328 RMA_0832 RMA_0833     FALSE 0.012 1222.000 0.000 NA   NA
 7232330 7232331 RMA_0835 RMA_0836   hemB TRUE 0.701 95.000 0.017 NA   NA
 7232334 7232335 RMA_0839 RMA_0840 ubiX dnaB FALSE 0.063 379.000 0.000 1.000 N NA
 7232336 7232337 RMA_0841 RMA_0842     TRUE 0.910 5.000 0.000 NA   NA
 7232337 7232338 RMA_0842 RMA_0843     TRUE 0.701 114.000 0.000 NA   NA
 7232338 7232339 RMA_0843 RMA_0844     FALSE 0.596 -45.000 0.000 NA   NA
 7232340 7232341 RMA_0845 RMA_0846 rluA2   TRUE 0.866 22.000 0.034 NA   NA
 7232341 7232342 RMA_0846 RMA_0847     TRUE 0.927 5.000 0.017 NA   NA
 7232342 7232343 RMA_0847 RMA_0848   radA TRUE 0.723 -28.000 0.005 1.000 N NA
 7232343 7232344 RMA_0848 RMA_0849 radA   TRUE 0.908 -3.000 0.007 NA   NA
 7232344 7232345 RMA_0849 RMA_0850   recO FALSE 0.603 58.000 0.008 NA   NA
 7232345 7232346 RMA_0850 RMA_0851 recO   FALSE 0.048 420.000 0.000 1.000 N NA
 7232347 7232348 RMA_0852 RMA_0853   infB FALSE 0.064 374.000 0.000 NA   NA
 7232348 7232349 RMA_0853 RMA_0854 infB nusA TRUE 0.693 239.000 0.342 1.000 N NA
 7232349 7232350 RMA_0854 RMA_0855 nusA   TRUE 0.990 11.000 0.759 NA   NA
 7232350 7232351 RMA_0855 RMA_0856     FALSE 0.090 344.000 0.000 NA   NA
 7232352 7232353 RMA_0857 RMA_0858     TRUE 0.691 -36.000 0.000 NA   NA
 7232354 7232355 RMA_0859 RMA_0860 tlyA tyrS TRUE 0.818 141.000 0.008 0.026 Y NA
 7232355 7232356 RMA_0860 RMA_0861 tyrS   TRUE 0.899 4.000 0.004 NA   NA
 7232356 7232357 RMA_0861 RMA_0862     TRUE 0.989 3.000 0.400 NA   NA
 7232357 7232358 RMA_0862 RMA_0863     FALSE 0.471 195.000 0.000 NA   NA
 7232360 7232361 RMA_0865 RMA_0866     TRUE 0.642 -40.000 0.000 NA   NA
 7232361 7232362 RMA_0866 RMA_0867     TRUE 0.625 68.000 0.000 NA   NA
 7232364 7232365 RMA_0868 RMA_0869     FALSE 0.460 198.000 0.000 NA   NA
 7232365 7232366 RMA_0869 RMA_0870     TRUE 0.629 65.000 0.000 NA   NA
 7232366 7232367 RMA_0870 RMA_0871     FALSE 0.399 208.000 0.000 NA   NA
 7232367 7232368 RMA_0871 RMA_0872     TRUE 0.717 121.000 0.000 NA   NA
 7232368 7232369 RMA_0872 RMA_0873     FALSE 0.033 487.000 0.000 NA   NA
 7232369 7232370 RMA_0873 RMA_0874     TRUE 0.741 -31.000 0.000 NA   NA
 7232370 7232371 RMA_0874 RMA_0875     FALSE 0.012 1234.000 0.000 NA   NA
 7232373 7232374 RMA_0877 RMA_0878     TRUE 0.719 142.000 0.000 NA   NA
 7232374 7232375 RMA_0878 RMA_0879     FALSE 0.348 -85.000 0.000 NA   NA
 7232375 7232376 RMA_0879 RMA_0880     TRUE 0.697 36.000 0.000 NA   NA
 7232376 7232377 RMA_0880 RMA_0881     FALSE 0.416 -63.000 0.000 NA   NA
 7232377 7232378 RMA_0881 RMA_0882   comF2 TRUE 0.701 156.000 0.000 NA   NA
 7232378 7232379 RMA_0882 RMA_0883 comF2   TRUE 0.636 77.000 0.000 NA   NA
 7232379 7232380 RMA_0883 RMA_0884     TRUE 0.662 47.000 0.000 NA   NA
 7232380 7232381 RMA_0884 RMA_0885     TRUE 0.826 -22.000 0.000 NA   NA
 7232381 7232382 RMA_0885 RMA_0886   ubiH FALSE 0.033 487.000 0.000 NA   NA
 7232382 7232383 RMA_0886 RMA_0887 ubiH   TRUE 0.878 -28.000 0.057 1.000 N NA
 7232384 7232385 RMA_0888 RMA_0889 ntrX   TRUE 0.741 -31.000 0.000 NA   NA
 7232386 7232387 RMA_0890 RMA_0891   pbpA1 FALSE 0.022 632.000 0.000 NA   NA
 7232387 7232388 RMA_0891 RMA_0892 pbpA1   TRUE 0.914 -25.000 0.091 NA   NA
 7232388 7232389 RMA_0892 RMA_0893   pbpA2 FALSE 0.023 619.000 0.000 NA   NA
 7232389 7232390 RMA_0893 RMA_0894 pbpA2 ftsL FALSE 0.195 344.000 0.065 NA   NA
 7232390 7232391 RMA_0894 RMA_0895 ftsL mraW TRUE 0.970 4.000 0.089 NA   NA
 7232391 7232392 RMA_0895 RMA_0896 mraW mraZ TRUE 0.993 0.000 0.635 NA   NA
 7232393 7232394 RMA_0897 RMA_0898     FALSE 0.416 -63.000 0.000 NA   NA
 7232394 7232395 RMA_0898 RMA_0899   panF FALSE 0.044 438.000 0.000 NA   NA
 7232395 7232396 RMA_0899 RMA_0900 panF   TRUE 0.632 62.000 0.000 NA   NA
 7232397 7232398 RMA_0901 RMA_0902 uvrC   FALSE 0.600 168.000 0.006 NA   NA
 7232398 7232399 RMA_0902 RMA_0903     TRUE 0.682 186.000 0.048 NA   NA
 7232399 7232400 RMA_0903 RMA_0904     FALSE 0.322 -109.000 0.000 NA   NA
 7232400 7232401 RMA_0904 RMA_0905     FALSE 0.013 1031.000 0.000 NA   NA
 7232401 7232402 RMA_0905 RMA_0906     FALSE 0.047 428.000 0.000 NA   NA
 7232402 7232403 RMA_0906 RMA_0907     TRUE 0.826 -22.000 0.000 NA   NA
 7232403 7232404 RMA_0907 RMA_RNA23     FALSE 0.014 961.000 0.000 NA   NA
 7232404 7232405 RMA_RNA23 RMA_0908     TRUE 0.692 37.000 0.000 NA   NA
 7232405 7232406 RMA_0908 RMA_0909     FALSE 0.110 321.000 0.000 NA   NA
 7232406 7232407 RMA_0909 RMA_0910     FALSE 0.037 475.000 0.000 NA   NA
 7232407 7232408 RMA_0910 RMA_0911     TRUE 0.740 28.000 0.000 NA   NA
 7232408 7232409 RMA_0911 RMA_0912   secA TRUE 0.928 1.000 0.000 NA   NA
 7232411 7232412 RMA_0914 RMA_0915 acpS rpoZ TRUE 0.919 1.000 0.009 1.000 N NA
 7232412 7232413 RMA_0915 RMA_0916 rpoZ murA FALSE 0.588 66.000 0.008 1.000 N NA
 7232413 7232414 RMA_0916 RMA_0917 murA gyrB TRUE 0.634 160.000 0.004 1.000 N NA
 7232415 7232416 RMA_0918 RMA_RNA24     TRUE 0.707 155.000 0.000 NA   NA
 7232416 7232417 RMA_RNA24 RMA_0919   mgtE FALSE 0.164 266.000 0.000 NA   NA
 7232417 7232418 RMA_0919 RMA_0920 mgtE   FALSE 0.016 846.000 0.000 NA   NA
 7232419 7232420 RMA_0921 RMA_0922 proP9   FALSE 0.286 227.000 0.000 NA   NA
 7232420 7232421 RMA_0922 RMA_0923     TRUE 0.619 -42.000 0.000 NA   NA
 7232424 7232425 RMA_0925 RMA_0926 yajC secD TRUE 0.923 -16.000 0.009 NA Y NA
 7232425 7232426 RMA_0926 RMA_0927 secD   TRUE 0.688 226.000 0.263 1.000   NA
 7232426 7232427 RMA_0927 RMA_0928     TRUE 0.979 -7.000 0.250 NA   NA
 7232427 7232428 RMA_0928 RMA_0929   ccmE TRUE 0.629 -37.000 0.005 NA   NA
 7232428 7232429 RMA_0929 RMA_0930 ccmE ppa TRUE 0.718 118.000 0.013 1.000 N NA
 7232429 7232430 RMA_0930 RMA_0931 ppa mviN FALSE 0.388 204.000 0.006 1.000   NA
 7232430 7232431 RMA_0931 RMA_0932 mviN traX TRUE 0.821 -22.000 0.012 NA   NA
 7232431 7232432 RMA_0932 RMA_0933 traX   TRUE 0.950 38.000 0.500 NA   NA
 7232433 7232434 RMA_0934 RMA_0935 recG   FALSE 0.017 772.000 0.000 NA   NA
 7232434 7232435 RMA_0935 RMA_0936     TRUE 0.710 118.000 0.000 NA   NA
 7232436 7232437 RMA_0937 RMA_0938 scoA scoB TRUE 0.915 57.000 0.125 0.002 Y NA
 7232437 7232438 RMA_0938 RMA_0939 scoB   TRUE 0.665 46.000 0.000 NA   NA
 7232438 7232439 RMA_0939 RMA_0940     TRUE 0.691 -36.000 0.000 NA   NA
 7232440 7232441 RMA_0941 RMA_0942 rickA mraY TRUE 0.644 112.000 0.003 NA   NA
 7232441 7232442 RMA_0942 RMA_0943 mraY murF TRUE 0.811 179.000 0.037 0.008 Y NA
 7232442 7232443 RMA_0943 RMA_0944 murF murE TRUE 0.746 204.000 0.051 0.005 Y NA
 7232443 7232444 RMA_0944 RMA_0945 murE mfd TRUE 0.677 132.000 0.007 0.096 N NA
 7232444 7232445 RMA_0945 RMA_0946 mfd   TRUE 0.917 -24.000 0.078 NA   NA
 7232446 7232447 RMA_0947 RMA_0948 pspE dnaA TRUE 0.917 1.000 0.008 NA N NA
 7232447 7232448 RMA_0948 RMA_0949 dnaA   FALSE 0.325 222.000 0.000 NA   NA
 7232449 7232450 RMA_0950 RMA_0951     TRUE 0.833 16.000 0.000 NA   NA
 7232452 7232453 RMA_0953 RMA_0954     TRUE 0.708 34.000 0.000 NA   NA
 7232453 7232454 RMA_0954 RMA_0955     TRUE 0.640 80.000 0.000 NA   NA
 7232454 7232455 RMA_0955 RMA_0956     FALSE 0.478 194.000 0.000 NA   NA
 7232455 7232456 RMA_0956 RMA_0957     TRUE 0.662 -39.000 0.000 NA   NA
 7232456 7232457 RMA_0957 RMA_0958   ychF FALSE 0.103 328.000 0.000 NA   NA
 7232457 7232458 RMA_0958 RMA_0959 ychF   FALSE 0.469 -57.000 0.000 NA   NA
 7232458 7232459 RMA_0959 RMA_0960   pth FALSE 0.043 446.000 0.000 NA   NA
 7232459 7232460 RMA_0960 RMA_0961 pth rplY TRUE 0.653 316.000 0.496 0.052 Y NA
 7232460 7232461 RMA_0961 RMA_0962 rplY nrdG FALSE 0.014 755.000 0.002 1.000 N NA
 7232462 7232463 RMA_0963 RMA_0964 rpmI rplT TRUE 0.992 20.000 0.928 0.032 Y NA
 7232463 7232464 RMA_0964 RMA_0965 rplT rpmH FALSE 0.577 74.000 0.007 0.032   NA
 7232464 7232465 RMA_0965 RMA_0966 rpmH rnpA TRUE 0.987 14.000 0.787 1.000   NA
 7232466 7232467 RMA_0967 RMA_0968     FALSE 0.265 237.000 0.000 NA   NA
 7232467 7232468 RMA_0968 RMA_0969     FALSE 0.017 770.000 0.000 NA   NA
 7232468 7232469 RMA_0969 RMA_0970     FALSE 0.100 341.000 0.000 NA   NA
 7232469 7232470 RMA_0970 RMA_0971   corA FALSE 0.603 175.000 0.000 1.000 N NA
 7232472 7232473 RMA_0973 RMA_0974     FALSE 0.019 697.000 0.000 NA   NA
 7232473 7232474 RMA_0974 RMA_RNA26   rrs FALSE 0.026 567.000 0.000 NA   NA
 7232474 7232475 RMA_RNA26 RMA_0975 rrs   FALSE 0.045 436.000 0.000 NA   NA
 7232475 7232476 RMA_0975 RMA_0976     FALSE 0.097 342.000 0.000 NA   NA
 7232476 7232477 RMA_0976 RMA_0977   ntrY TRUE 0.658 93.000 0.000 NA   NA
 7232477 7232478 RMA_0977 RMA_0978 ntrY rpsU FALSE 0.072 362.000 0.000 1.000   NA
 7232479 7232480 RMA_0979 RMA_0980     FALSE 0.060 389.000 0.000 NA   NA
 7232480 7232481 RMA_0980 RMA_0981     TRUE 0.899 -9.000 0.000 NA   NA
 7232481 7232482 RMA_0981 RMA_0982   ileS FALSE 0.582 178.000 0.000 NA   NA
 7232482 7232483 RMA_0982 RMA_0983 ileS   TRUE 0.610 174.000 0.000 NA   NA
 7232483 7232484 RMA_0983 RMA_0984     FALSE 0.564 -49.000 0.000 NA   NA
 7232485 7232486 RMA_0985 RMA_0986 accC pccB TRUE 0.942 35.000 0.157 1.000 Y NA
 7232486 7232487 RMA_0986 RMA_0987 pccB   FALSE 0.070 367.000 0.000 1.000 N NA
 7232489 7232490 RMA_0989 RMA_0990 tfoX znuB FALSE 0.485 -60.000 0.016 NA   NA
 7232491 7232492 RMA_0991 RMA_0992 ubiG gltX FALSE 0.307 217.000 0.008 1.000 N NA
 7232492 7232493 RMA_0992 RMA_0993 gltX   TRUE 0.915 -3.000 0.010 NA   NA
 7232496 7232497 RMA_0996 RMA_0997 spoT12 groEL FALSE 0.014 960.000 0.000 1.000   NA
 7232497 7232498 RMA_0997 RMA_0998 groEL groES TRUE 0.980 0.000 0.050 0.094 Y NA
 7232498 7232499 RMA_0998 RMA_0999 groES   FALSE 0.040 461.000 0.000 NA   NA
 7232499 7232500 RMA_0999 RMA_1000     FALSE 0.082 354.000 0.000 NA   NA
 7232500 7232501 RMA_1000 RMA_1001     TRUE 0.642 -40.000 0.000 NA   NA
 7232501 7232502 RMA_1001 RMA_1002     FALSE 0.273 230.000 0.000 NA   NA
 7232502 7232503 RMA_1002 RMA_1003     TRUE 0.627 73.000 0.000 NA   NA
 7232503 7232504 RMA_1003 RMA_1004     TRUE 0.656 92.000 0.000 NA   NA
 7232504 7232505 RMA_1004 RMA_1005     TRUE 0.915 -4.000 0.000 NA   NA
 7232505 7232506 RMA_1005 RMA_1006   rph FALSE 0.020 668.000 0.000 NA   NA
 7232507 7232508 RMA_1007 RMA_1008 grpE perM TRUE 0.877 20.000 0.034 NA   NA
 7232508 7232509 RMA_1008 RMA_1009 perM   TRUE 0.987 4.000 0.362 NA   NA
 7232509 7232510 RMA_1009 RMA_1010     TRUE 0.631 64.000 0.000 NA   NA
 7232510 7232511 RMA_1010 RMA_1011     TRUE 0.801 -24.000 0.000 NA   NA
 7232511 7232512 RMA_1011 RMA_1012     FALSE 0.087 347.000 0.000 NA   NA
 7232513 7232514 RMA_1013 RMA_RNA27     FALSE 0.012 1190.000 0.000 NA   NA
 7232514 7232515 RMA_RNA27 RMA_1014   rpsT TRUE 0.636 77.000 0.000 NA   NA
 7232515 7232516 RMA_1014 RMA_1015 rpsT rplQ TRUE 0.952 4.000 0.008 0.032 Y NA
 7232516 7232517 RMA_1015 RMA_1016 rplQ rpoA TRUE 0.992 11.000 0.873 1.000 N NA
 7232517 7232518 RMA_1016 RMA_1017 rpoA rpsK TRUE 0.965 19.000 0.308 1.000 N NA
 7232518 7232519 RMA_1017 RMA_1018 rpsK rpsM TRUE 0.990 22.000 0.810 0.032 Y NA
 7232519 7232520 RMA_1018 RMA_1019 rpsM adk TRUE 0.685 61.000 0.017 1.000 N NA
 7232520 7232521 RMA_1019 RMA_1020 adk secY TRUE 0.967 13.000 0.241 1.000 N NA
 7232521 7232522 RMA_1020 RMA_1021 secY rplO TRUE 0.993 4.000 0.730 1.000 N NA
 7232522 7232523 RMA_1021 RMA_1022 rplO rpmD TRUE 0.991 14.000 0.653 0.006 Y NA
 7232523 7232524 RMA_1022 RMA_1023 rpmD rpsE TRUE 0.988 24.000 0.789 0.043 Y NA
 7232524 7232525 RMA_1023 RMA_1024 rpsE rplR TRUE 0.996 -6.000 0.814 0.043 Y NA
 7232525 7232526 RMA_1024 RMA_1025 rplR rplF TRUE 0.992 16.000 0.815 0.032 Y NA
 7232526 7232527 RMA_1025 RMA_1026 rplF rpsH TRUE 0.995 10.000 0.808 0.032 Y NA
 7232527 7232528 RMA_1026 RMA_1027 rpsH rpsN TRUE 0.976 20.000 0.295 0.032 Y NA
 7232528 7232529 RMA_1027 RMA_1028 rpsN rplE TRUE 0.993 0.000 0.309 0.032 Y NA
 7232529 7232530 RMA_1028 RMA_1029 rplE rplX TRUE 0.980 -3.000 0.057 0.032 Y NA
 7232530 7232531 RMA_1029 RMA_1030 rplX rplN TRUE 0.984 1.000 0.071 0.043 Y NA
 7232531 7232532 RMA_1030 RMA_1031 rplN rpsQ TRUE 0.977 75.000 0.791 0.043 Y NA
 7232532 7232533 RMA_1031 RMA_1032 rpsQ rpmC TRUE 0.994 -16.000 0.828 0.032 Y NA
 7232533 7232534 RMA_1032 RMA_1033 rpmC rplP TRUE 0.996 -7.000 0.802 0.032 Y NA
 7232534 7232535 RMA_1033 RMA_1034 rplP rpsC TRUE 0.997 0.000 0.828 0.043 Y NA
 7232535 7232536 RMA_1034 RMA_1035 rpsC rplV TRUE 0.953 -25.000 0.109 0.043 Y NA
 7232536 7232537 RMA_1035 RMA_1036 rplV rpsS TRUE 0.986 3.000 0.119 0.043 Y NA
 7232537 7232538 RMA_1036 RMA_1037 rpsS rplB TRUE 0.991 19.000 0.820 0.043 Y NA
 7232538 7232539 RMA_1037 RMA_1038 rplB rplW TRUE 0.997 1.000 0.849 1.000 Y NA
 7232539 7232540 RMA_1038 RMA_1039 rplW rplD TRUE 0.943 -54.000 0.513 1.000 Y NA
 7232540 7232541 RMA_1039 RMA_1040 rplD rplC TRUE 0.967 107.000 0.486 0.032 Y NA
 7232541 7232542 RMA_1040 RMA_1041 rplC rpsJ TRUE 0.992 1.000 0.307 0.043 Y NA
 7232542 7232543 RMA_1041 RMA_1042 rpsJ tuf TRUE 0.762 247.000 0.318 1.000 Y NA
 7232543 7232544 RMA_1042 RMA_RNA28 tuf   TRUE 0.627 73.000 0.000 NA   NA
 7232544 7232545 RMA_RNA28 RMA_RNA29     TRUE 0.631 171.000 0.000 NA   NA
 7232546 7232547 RMA_1043 RMA_1044     TRUE 0.608 102.000 0.002 NA   NA
 7232547 7232548 RMA_1044 RMA_1045   fumC TRUE 0.909 -3.000 0.007 NA   NA
 7232548 7232549 RMA_1045 RMA_1046 fumC   FALSE 0.583 69.000 0.007 NA N NA
 7232549 7232550 RMA_1046 RMA_1047     TRUE 0.989 -6.000 0.500 NA   NA
 7232550 7232551 RMA_1047 RMA_1048   ftsZ FALSE 0.250 239.000 0.000 NA   NA
 7232551 7232552 RMA_1048 RMA_1049 ftsZ   FALSE 0.139 289.000 0.000 NA   NA
 7232552 7232553 RMA_1049 RMA_1050     FALSE 0.062 385.000 0.000 NA   NA
 7232554 7232555 RMA_1051 RMA_1052   ampG2 FALSE 0.041 438.000 0.011 NA   NA
 7232555 7232556 RMA_1052 RMA_1053 ampG2 rhlE TRUE 0.616 173.000 0.000 NA   NA
 7232556 7232557 RMA_1053 RMA_1054 rhlE cspA FALSE 0.061 503.000 0.000 1.000 Y NA
 7232558 7232559 RMA_1055 RMA_RNA30     TRUE 0.718 147.000 0.000 NA   NA
 7232560 7232561 RMA_1056 RMA_1057 ksgA   FALSE 0.576 70.000 0.006 1.000   NA
 7232561 7232562 RMA_1057 RMA_1058   ostA TRUE 0.840 132.000 0.051 1.000   NA
 7232563 7232564 RMA_1059 RMA_1060 xseA   TRUE 0.629 160.000 0.002 1.000   NA
 7232564 7232565 RMA_1060 RMA_1061     FALSE 0.106 323.000 0.000 NA   NA
 7232565 7232566 RMA_1061 RMA_1062     TRUE 0.647 86.000 0.000 NA   NA
 7232566 7232567 RMA_1062 RMA_1063   xth2 TRUE 0.801 -24.000 0.000 NA   NA
 7232567 7232568 RMA_1063 RMA_1064 xth2 engA FALSE 0.074 357.000 0.000 0.019   NA
 7232569 7232570 RMA_1065 RMA_1066     TRUE 0.692 37.000 0.000 NA   NA
 7232570 7232571 RMA_1066 RMA_1067     FALSE 0.118 313.000 0.000 NA   NA
 7232571 7232572 RMA_1067 RMA_1068   ubiB FALSE 0.015 926.000 0.000 NA   NA
 7232572 7232573 RMA_1068 RMA_1069 ubiB ubiE TRUE 0.893 148.000 0.115 1.000   NA
 7232574 7232575 RMA_1070 RMA_1071 mutM   FALSE 0.400 -64.000 0.000 NA   NA
 7232575 7232576 RMA_1071 RMA_1072     FALSE 0.123 311.000 0.000 NA   NA
 7232576 7232577 RMA_1072 RMA_1073     TRUE 0.867 12.000 0.000 NA   NA
 7232580 7232581 RMA_1076 RMA_1077     TRUE 0.717 134.000 0.000 NA   NA
 7232581 7232582 RMA_1077 RMA_1078     TRUE 0.792 22.000 0.000 NA   NA
 7232582 7232583 RMA_1078 RMA_1079     FALSE 0.469 -57.000 0.000 NA   NA
 7232583 7232584 RMA_1079 RMA_1080   tatD TRUE 0.725 31.000 0.000 NA   NA
 7232584 7232585 RMA_1080 RMA_1081 tatD metG TRUE 0.896 53.000 0.221 NA N NA
 7232585 7232586 RMA_1081 RMA_1082 metG tmk TRUE 0.908 -3.000 0.008 0.091 N NA
 7232589 7232590 RMA_1085 RMA_1086     FALSE 0.564 -49.000 0.000 NA   NA
 7232590 7232591 RMA_1086 RMA_1087   valS FALSE 0.070 367.000 0.000 NA   NA
 7232591 7232592 RMA_1087 RMA_1088 valS   TRUE 0.695 -31.000 0.002 NA N NA
 7232592 7232593 RMA_1088 RMA_1089     TRUE 0.977 53.000 0.750 NA Y NA
 7232594 7232595 RMA_1090 RMA_1091     TRUE 0.915 -4.000 0.000 NA   NA
 7232595 7232596 RMA_1091 RMA_1092     TRUE 0.865 -16.000 0.000 NA   NA
 7232597 7232598 RMA_1093 RMA_1094     FALSE 0.286 227.000 0.000 NA   NA
 7232598 7232599 RMA_1094 RMA_1095     FALSE 0.564 -49.000 0.000 NA   NA
 7232599 7232600 RMA_1095 RMA_1096     TRUE 0.792 22.000 0.000 NA   NA
 7232600 7232601 RMA_1096 RMA_1097     TRUE 0.718 122.000 0.000 NA   NA
 7232602 7232603 RMA_1098 RMA_1099     TRUE 0.927 -1.000 0.000 NA   NA
 7232603 7232604 RMA_1099 RMA_1100     FALSE 0.445 -60.000 0.000 NA   NA
 7232604 7232605 RMA_1100 RMA_1101     TRUE 0.890 -12.000 0.000 NA   NA
 7232606 7232607 RMA_1102 RMA_1103     TRUE 0.667 163.000 0.000 NA   NA
 7232608 7232609 RMA_1104 RMA_1105 clpX rimJ TRUE 0.649 37.000 0.006 1.000 N NA
 7232609 7232610 RMA_1105 RMA_1106 rimJ exsB TRUE 0.606 166.000 0.005 NA   NA
 7232610 7232611 RMA_1106 RMA_1107 exsB   TRUE 0.671 -33.000 0.004 NA   NA
 7232612 7232613 RMA_RNA31 RMA_1108   msbA2 TRUE 0.684 160.000 0.000 NA   NA
 7232613 7232614 RMA_1108 RMA_1109 msbA2   FALSE 0.171 264.000 0.000 NA   NA
 7232614 7232615 RMA_1109 RMA_1110   bcr2 FALSE 0.020 669.000 0.000 NA   NA
 7232615 7232616 RMA_1110 RMA_1111 bcr2   TRUE 0.695 74.000 0.020 NA N NA
 7232616 7232617 RMA_1111 RMA_1112   lolD TRUE 0.990 -7.000 0.620 1.000 N NA
 7232617 7232618 RMA_1112 RMA_1113 lolD   FALSE 0.334 212.000 0.009 1.000   NA
 7232618 7232619 RMA_1113 RMA_1114     TRUE 0.621 75.000 0.012 NA   NA
 7232619 7232620 RMA_1114 RMA_1115   ccmF TRUE 0.940 -7.000 0.028 NA N NA
 7232621 7232622 RMA_1116 RMA_1117     TRUE 0.911 -6.000 0.000 NA   NA
 7232622 7232623 RMA_1117 RMA_1118   ompB FALSE 0.173 263.000 0.000 NA   NA
 7232623 7232624 RMA_1118 RMA_1119 ompB spoT11 FALSE 0.128 305.000 0.000 1.000   NA
 7232624 7232625 RMA_1119 RMA_1120 spoT11   TRUE 0.623 69.000 0.000 1.000   NA
 7232625 7232626 RMA_1120 RMA_1121     FALSE 0.038 474.000 0.000 1.000 N NA
 7232626 7232627 RMA_1121 RMA_1122     TRUE 0.901 4.000 0.006 1.000   NA
 7232627 7232628 RMA_1122 RMA_1123   himA TRUE 0.671 133.000 0.005 1.000   NA
 7232630 7232631 RMA_1125 RMA_1126 htrB lpxK TRUE 0.880 -37.000 0.044 1.000 Y NA
 7232631 7232632 RMA_1126 RMA_1127 lpxK   TRUE 0.951 4.000 0.006 1.000 Y NA
 7232632 7232633 RMA_1127 RMA_1128     TRUE 0.886 10.000 0.000 NA   NA
 7232633 7232634 RMA_1128 RMA_1129     TRUE 0.761 25.000 0.000 NA   NA
 7232634 7232635 RMA_1129 RMA_1130     TRUE 0.670 105.000 0.000 NA   NA
 7232635 7232636 RMA_1130 RMA_1131   ligA FALSE 0.149 282.000 0.000 NA   NA
 7232636 7232637 RMA_1131 RMA_1132 ligA   TRUE 0.670 105.000 0.000 NA   NA
 7232637 7232638 RMA_1132 RMA_1133   tgt TRUE 0.640 59.000 0.000 NA   NA
 7232639 7232640 RMA_1134 RMA_1135     TRUE 0.907 6.000 0.000 NA   NA
 7232641 7232642 RMA_1136 RMA_1137     TRUE 0.782 -25.000 0.000 NA   NA
 7232642 7232643 RMA_1137 RMA_1138     TRUE 0.886 10.000 0.000 NA   NA
 7232645 7232646 RMA_1140 RMA_1141     TRUE 0.906 -7.000 0.000 NA   NA
 7232646 7232647 RMA_1141 RMA_1142     TRUE 0.656 51.000 0.000 NA   NA
 7232647 7232648 RMA_1142 RMA_1143     FALSE 0.164 266.000 0.000 NA   NA
 7232648 7232649 RMA_1143 RMA_1144     TRUE 0.933 25.000 0.199 NA   NA
 7232649 7232650 RMA_1144 RMA_1145   rnhA TRUE 0.890 -12.000 0.012 1.000 N NA
 7232650 7232651 RMA_1145 RMA_1146 rnhA   TRUE 0.928 0.000 0.012 NA   NA
 7232651 7232652 RMA_1146 RMA_RNA32   ssrA TRUE 0.696 157.000 0.000 NA   NA
 7232653 7232654 RMA_1147 RMA_1148   coaE TRUE 0.894 -6.000 0.006 NA   NA
 7232654 7232655 RMA_1148 RMA_1149 coaE dnaQ TRUE 0.961 -12.000 0.092 1.000 N NA
 7232655 7232656 RMA_1149 RMA_1150 dnaQ surf1 TRUE 0.643 105.000 0.010 NA   NA
 7232656 7232657 RMA_1150 RMA_1151 surf1   TRUE 0.725 56.000 0.023 NA   NA
 7232657 7232658 RMA_1151 RMA_1152   fabD FALSE 0.018 767.000 0.000 1.000 N NA
 7232658 7232659 RMA_1152 RMA_1153 fabD   TRUE 0.661 48.000 0.000 NA   NA
 7232659 7232660 RMA_1153 RMA_RNA33     FALSE 0.079 356.000 0.000 NA   NA
 7232661 7232662 RMA_1154 RMA_1155     TRUE 0.720 -33.000 0.000 NA   NA
 7232662 7232663 RMA_1155 RMA_1156     TRUE 0.865 -16.000 0.000 NA   NA
 7232663 7232664 RMA_1156 RMA_1157     TRUE 0.747 27.000 0.000 NA   NA
 7232664 7232665 RMA_1157 RMA_1158     TRUE 0.626 72.000 0.000 NA   NA
 7232665 7232666 RMA_1158 RMA_1159     TRUE 0.761 25.000 0.000 NA   NA
 7232667 7232668 RMA_1160 RMA_1161     TRUE 0.643 58.000 0.000 NA   NA
 7232669 7232670 RMA_1162 RMA_1163     TRUE 0.876 11.000 0.000 NA   NA
 7232670 7232671 RMA_1163 RMA_1164     TRUE 0.874 -15.000 0.000 NA   NA
 7232671 7232672 RMA_1164 RMA_1165   phbC FALSE 0.097 342.000 0.000 NA   NA
 7232674 7232675 RMA_1167 RMA_1168   tlyC FALSE 0.025 569.000 0.000 NA   NA
 7232675 7232676 RMA_1168 RMA_1169 tlyC   TRUE 0.979 5.000 0.222 NA   NA
 7232676 7232677 RMA_1169 RMA_1170     TRUE 0.904 -3.000 0.002 NA   NA
 7232677 7232678 RMA_1170 RMA_1171   lipA FALSE 0.041 455.000 0.000 1.000   NA
 7232678 7232679 RMA_1171 RMA_1172 lipA glyA TRUE 0.894 -7.000 0.009 1.000 N NA
 7232679 7232680 RMA_1172 RMA_1173 glyA   TRUE 0.910 117.000 0.182 NA   NA
 7232680 7232681 RMA_1173 RMA_1174   grxC2 TRUE 0.953 160.000 0.538 NA   NA
 7232683 7232684 RMA_1176 RMA_1177     FALSE 0.031 494.000 0.000 NA   NA
 7232686 7232687 RMA_1179 RMA_1180     TRUE 0.678 40.000 0.000 NA   NA
 7232687 7232688 RMA_1180 RMA_1181     FALSE 0.400 -64.000 0.000 NA   NA
 7232688 7232689 RMA_1181 RMA_1182     TRUE 0.719 144.000 0.000 NA   NA
 7232692 7232693 RMA_1185 RMA_1186 pgpA rplU FALSE 0.572 68.000 0.004 1.000 N NA
 7232693 7232694 RMA_1186 RMA_1187 rplU rpmA TRUE 0.985 25.000 0.667 0.029 Y NA
 7232694 7232695 RMA_1187 RMA_1188 rpmA lysC FALSE 0.177 262.000 0.000 1.000 N NA
 7232695 7232696 RMA_1188 RMA_1189 lysC   FALSE 0.163 266.000 0.000 1.000   NA
 7232696 7232697 RMA_1189 RMA_1190     FALSE 0.061 486.000 0.043 NA   NA
 7232698 7232699 RMA_1191 RMA_1192   proP5 TRUE 0.715 120.000 0.000 NA   NA
 7232699 7232700 RMA_1192 RMA_1193 proP5   TRUE 0.718 130.000 0.000 NA   NA
 7232700 7232701 RMA_1193 RMA_1194     TRUE 0.792 -22.000 0.005 NA   NA
 7232701 7232702 RMA_1194 RMA_1195     TRUE 0.910 -3.000 0.008 NA   NA
 7232702 7232703 RMA_1195 RMA_1196     TRUE 0.962 7.000 0.077 NA   NA
 7232703 7232704 RMA_1196 RMA_1197     TRUE 0.977 1.000 0.115 NA   NA
 7232705 7232706 RMA_1198 RMA_1199 trmE   FALSE 0.052 410.000 0.000 NA   NA
 7232707 7232708 RMA_1200 RMA_1201     FALSE 0.307 -148.000 0.000 NA   NA
 7232708 7232709 RMA_1201 RMA_1202     TRUE 0.915 -4.000 0.000 NA   NA
 7232710 7232711 RMA_1203 RMA_1204 recA fabG TRUE 0.709 -31.000 0.008 1.000 N NA
 7232711 7232712 RMA_1204 RMA_1205 fabG acpP TRUE 0.954 165.000 0.321 0.004 Y NA
 7232712 7232713 RMA_1205 RMA_1206 acpP fabF TRUE 0.928 36.000 0.106 1.000 Y NA
 7232713 7232714 RMA_1206 RMA_1207 fabF uup FALSE 0.146 283.000 0.000 1.000   NA
 7232714 7232715 RMA_1207 RMA_1208 uup   FALSE 0.599 81.000 0.007 NA   NA
 7232716 7232717 RMA_1209 RMA_1210   gmk TRUE 0.624 70.000 0.000 NA   NA
 7232717 7232718 RMA_1210 RMA_1211 gmk   TRUE 0.635 107.000 0.008 1.000   NA
 7232718 7232719 RMA_1211 RMA_1212   mreC FALSE 0.111 320.000 0.000 1.000   NA
 7232719 7232720 RMA_1212 RMA_1213 mreC mreB TRUE 0.994 3.000 0.689 1.000 N NA
 7232720 7232721 RMA_1213 RMA_1214 mreB   FALSE 0.329 211.000 0.005 1.000   NA
 7232721 7232722 RMA_1214 RMA_RNA34     TRUE 0.822 18.000 0.000 NA   NA
 7232722 7232723 RMA_RNA34 RMA_1215   pal FALSE 0.121 312.000 0.000 NA   NA
 7232723 7232724 RMA_1215 RMA_1216 pal fabH FALSE 0.039 466.000 0.000 1.000 N NA
 7232724 7232725 RMA_1216 RMA_1217 fabH rpmF TRUE 0.903 8.000 0.014 1.000 N NA
 7232726 7232727 RMA_1218 RMA_1219 smpA ftsY TRUE 0.663 155.000 0.005 1.000 N NA
 7232727 7232728 RMA_1219 RMA_1220 ftsY polA TRUE 0.621 163.000 0.005 1.000 N NA
 7232728 7232729 RMA_1220 RMA_1221 polA   TRUE 0.718 137.000 0.000 NA   NA
 7232729 7232730 RMA_1221 RMA_1222     FALSE 0.564 -49.000 0.000 NA   NA
 7232730 7232731 RMA_1222 RMA_1223     TRUE 0.704 116.000 0.000 NA   NA
 7232731 7232732 RMA_1223 RMA_1224     TRUE 0.628 74.000 0.000 NA   NA
 7232732 7232733 RMA_1224 RMA_1225     FALSE 0.145 284.000 0.000 NA   NA
 7232733 7232734 RMA_1225 RMA_1226     TRUE 0.855 -18.000 0.000 NA   NA
 7232734 7232735 RMA_1226 RMA_1227     FALSE 0.194 253.000 0.000 NA   NA
 7232736 7232737 RMA_1228 RMA_1229 dnaE udg TRUE 0.616 165.000 0.007 1.000 N NA
 7232738 7232739 RMA_1230 RMA_1231   ampG3 TRUE 0.817 -42.000 0.079 NA   NA
 7232739 7232740 RMA_1231 RMA_1232 ampG3 tatC TRUE 0.738 67.000 0.033 NA   NA
 7232740 7232741 RMA_1232 RMA_1233 tatC serS TRUE 0.921 -22.000 0.065 NA N NA
 7232741 7232742 RMA_1233 RMA_1234 serS virB4-2 FALSE 0.092 343.000 0.000 0.085 N NA
 7232742 7232743 RMA_1234 RMA_1235 virB4-2   TRUE 0.947 133.000 0.375 NA   NA
 7232743 7232744 RMA_1235 RMA_1236   terC TRUE 0.956 5.000 0.051 NA   NA
 7232744 7232745 RMA_1236 RMA_1237 terC   TRUE 0.785 38.000 0.037 0.051   NA
 7232745 7232746 RMA_1237 RMA_1238     TRUE 0.971 94.000 0.857 1.000   NA
 7232746 7232747 RMA_1238 RMA_1239     TRUE 0.918 4.000 0.000 NA   NA
 7232747 7232748 RMA_1239 RMA_1240     TRUE 0.826 -22.000 0.000 NA   NA
 7232748 7232749 RMA_1240 RMA_1241   nuoJ TRUE 0.747 27.000 0.000 NA   NA
 7232749 7232750 RMA_1241 RMA_1242 nuoJ nuoK TRUE 0.975 -31.000 0.484 0.005 Y NA
 7232750 7232751 RMA_1242 RMA_1243 nuoK nuoL1 TRUE 0.994 -3.000 0.451 0.014 Y NA
 7232751 7232752 RMA_1243 RMA_1244 nuoL1 nuoM TRUE 0.955 153.000 0.251 0.005 Y NA
 7232752 7232753 RMA_1244 RMA_1245 nuoM ccmA FALSE 0.066 373.000 0.000 1.000 N NA
 7232754 7232755 RMA_1246 RMA_1247 nuoI nuoH TRUE 0.950 180.000 0.500 0.014 Y NA
 7232755 7232756 RMA_1247 RMA_1248 nuoH nuoG TRUE 0.975 120.000 0.515 0.014 Y NA
 7232756 7232757 RMA_1248 RMA_1249 nuoG   FALSE 0.593 -54.000 0.021 NA   NA
 7232757 7232758 RMA_1249 RMA_1250   acnA TRUE 0.606 169.000 0.008 NA   NA
 7232758 7232759 RMA_1250 RMA_1251 acnA atpC FALSE 0.587 203.000 0.005 1.000 Y NA
 7232759 7232760 RMA_1251 RMA_1252 atpC atpD TRUE 0.983 40.000 0.837 0.007 Y NA
 7232760 7232761 RMA_1252 RMA_1253 atpD atpG TRUE 0.977 98.000 0.724 0.007 Y NA
 7232761 7232762 RMA_1253 RMA_1254 atpG atpA TRUE 0.986 127.000 0.846 0.007 Y NA
 7232762 7232763 RMA_1254 RMA_1255 atpA atpH TRUE 0.983 95.000 0.864 0.007 Y NA
 7232763 7232764 RMA_1255 RMA_1256 atpH lpdA1 TRUE 0.815 153.000 0.007 1.000 Y NA
 7232764 7232765 RMA_1256 RMA_1257 lpdA1   FALSE 0.298 226.000 0.000 NA   NA
 7232767 7232768 RMA_1259 RMA_1260     TRUE 0.702 115.000 0.000 NA   NA
 7232768 7232769 RMA_1260 RMA_1261   mrcA FALSE 0.058 393.000 0.000 NA   NA
 7232769 7232770 RMA_1261 RMA_1262 mrcA miaB TRUE 0.886 -7.000 0.005 1.000 N NA
 7232770 7232771 RMA_1262 RMA_1263 miaB   FALSE 0.029 527.000 0.000 NA   NA
 7232771 7232772 RMA_1263 RMA_1264     FALSE 0.416 -63.000 0.000 NA   NA
 7232772 7232773 RMA_1264 RMA_1265     FALSE 0.061 388.000 0.000 NA   NA
 7232773 7232774 RMA_1265 RMA_1266     FALSE 0.286 227.000 0.000 NA   NA
 7232774 7232775 RMA_1266 RMA_1267   kefB TRUE 0.834 -31.000 0.039 NA   NA
 7232775 7232776 RMA_1267 RMA_1268 kefB   TRUE 0.872 -12.000 0.008 NA   NA
 7232778 7232779 RMA_1270 RMA_1271     FALSE 0.015 881.000 0.000 NA   NA
 7232779 7232780 RMA_1271 RMA_1272     TRUE 0.610 174.000 0.000 NA   NA
 7232780 7232781 RMA_1272 RMA_1273     TRUE 0.720 -33.000 0.000 NA   NA
 7232781 7232782 RMA_1273 RMA_1274     FALSE 0.151 281.000 0.000 NA   NA
 7232782 7232783 RMA_1274 RMA_1275     TRUE 0.631 75.000 0.000 NA   NA
 7232783 7232784 RMA_1275 RMA_1276     TRUE 0.792 22.000 0.000 NA   NA
 7232784 7232785 RMA_1276 RMA_1277     FALSE 0.112 320.000 0.000 NA   NA
 7232785 7232786 RMA_1277 RMA_1278     TRUE 0.792 22.000 0.000 NA   NA
 7232786 7232787 RMA_1278 RMA_1279     TRUE 0.915 -4.000 0.000 NA   NA
 7232787 7232788 RMA_1279 RMA_1280     TRUE 0.717 132.000 0.000 NA   NA
 7232788 7232789 RMA_1280 RMA_1281     TRUE 0.899 -9.000 0.000 NA   NA
 7232789 7232790 RMA_1281 RMA_1282     TRUE 0.623 172.000 0.000 NA   NA
 7232791 7232792 RMA_RNA35 RMA_1283   infA TRUE 0.867 12.000 0.000 NA   NA
 7232792 7232793 RMA_1283 RMA_1284 infA maf TRUE 0.978 6.000 0.207 NA N NA
 7232794 7232795 RMA_1285 RMA_1286 dksA xerC TRUE 0.779 101.000 0.040 1.000 N NA
 7232796 7232797 RMA_1287 RMA_1288     FALSE 0.587 -46.000 0.000 NA   NA
 7232798 7232799 RMA_1289 RMA_1290 pldA   TRUE 0.715 151.000 0.000 NA   NA
 7232799 7232800 RMA_1290 RMA_1291     TRUE 0.665 46.000 0.000 NA   NA
 7232800 7232801 RMA_1291 RMA_1292     FALSE 0.469 -57.000 0.000 NA   NA
 7232801 7232802 RMA_1292 RMA_1293     TRUE 0.924 3.000 0.000 NA   NA
 7232802 7232803 RMA_1293 RMA_1294   ubiD TRUE 0.696 157.000 0.000 NA   NA
 7232803 7232804 RMA_1294 RMA_1295 ubiD surA TRUE 0.722 157.000 0.015 NA N NA
 7232804 7232805 RMA_1295 RMA_1296 surA ompA FALSE 0.497 190.000 0.000 1.000   NA
 7232805 7232806 RMA_1296 RMA_1297 ompA   FALSE 0.325 222.000 0.000 NA   NA
 7232806 7232807 RMA_1297 RMA_1298   ftsK FALSE 0.026 562.000 0.000 NA   NA
 7232807 7232808 RMA_1298 RMA_1299 ftsK   FALSE 0.206 250.000 0.000 NA   NA
 7232808 7232809 RMA_1299 RMA_1300     TRUE 0.646 84.000 0.000 NA   NA
 7232810 7232811 RMA_1301 RMA_1302 map   FALSE 0.194 253.000 0.000 NA   NA
 7232811 7232812 RMA_1302 RMA_1303     TRUE 0.815 19.000 0.000 NA   NA
 7232812 7232813 RMA_1303 RMA_1304     TRUE 0.833 16.000 0.000 NA   NA
 7232813 7232814 RMA_1304 RMA_1305   mraY2 TRUE 0.929 0.000 0.000 NA   NA
 7232814 7232815 RMA_1305 RMA_1306 mraY2   FALSE 0.421 -102.000 0.023 NA   NA
 7232816 7232817 RMA_1307 RMA_1308     FALSE 0.370 247.000 0.000 0.004 Y NA
 7232817 7232818 RMA_1308 RMA_1309   fdxA TRUE 0.677 260.000 0.545 1.000 N NA
 7232818 7232819 RMA_1309 RMA_1310 fdxA ccmC TRUE 0.928 5.000 0.018 1.000 N NA
 7232819 7232820 RMA_1310 RMA_1311 ccmC   TRUE 0.639 94.000 0.010 1.000 N NA
 7232820 7232821 RMA_1311 RMA_1312     TRUE 0.841 -25.000 0.023 1.000 N NA
 7232822 7232823 RMA_1313 RMA_1314 omp   TRUE 0.864 37.000 0.085 NA   NA
 7232823 7232824 RMA_1314 RMA_1315   znuC FALSE 0.600 180.000 0.016 NA   NA
 7232825 7232826 RMA_1316 RMA_1317     FALSE 0.019 693.000 0.000 NA   NA
 7232826 7232827 RMA_1317 RMA_1318     TRUE 0.642 -40.000 0.000 NA   NA
 7232827 7232828 RMA_1318 RMA_1319   uvrA FALSE 0.025 576.000 0.000 NA   NA
 7232829 7232830 RMA_1320 RMA_1321 ssb   TRUE 0.973 0.000 0.083 NA   NA
 7232831 7232832 RMA_1322 RMA_1323     TRUE 0.918 4.000 0.000 NA   NA
 7232832 7232833 RMA_1323 RMA_RNA36     FALSE 0.154 273.000 0.000 NA   NA
 7232834 7232835 RMA_1324 RMA_1325   htpG TRUE 0.686 138.000 0.008 NA   NA
 7232835 7232836 RMA_1325 RMA_1326 htpG hemA TRUE 0.686 131.000 0.008 1.000 N NA
 7232836 7232837 RMA_1326 RMA_1327 hemA   FALSE 0.018 730.000 0.000 NA   NA
 7232837 7232838 RMA_1327 RMA_1328   tig FALSE 0.021 638.000 0.000 NA   NA
 7232839 7232840 RMA_1329 RMA_1330 obgE gltA TRUE 0.905 3.000 0.002 1.000   NA
 7232840 7232841 RMA_1330 RMA_1331 gltA   TRUE 0.660 99.000 0.000 1.000   NA
 7232841 7232842 RMA_1331 RMA_1332     FALSE 0.126 306.000 0.000 1.000   NA
 7232843 7232844 RMA_1333 RMA_1334   hemK FALSE 0.022 1809.000 0.000 1.000 Y NA
 7232845 7232846 RMA_1335 RMA_1336   glyS TRUE 0.962 -3.000 0.013 NA Y NA
 7232846 7232847 RMA_1336 RMA_1337 glyS glyQ TRUE 0.980 -33.000 0.651 0.001 Y NA
 7232847 7232848 RMA_1337 RMA_1338 glyQ vapC3 TRUE 0.668 32.000 0.003 NA   NA
 7232848 7232849 RMA_1338 RMA_1339 vapC3   TRUE 0.976 -6.000 0.154 NA   NA
 7232849 7232850 RMA_1339 RMA_1340     TRUE 0.653 90.000 0.000 NA   NA
 7232850 7232851 RMA_1340 RMA_1341     TRUE 0.733 30.000 0.000 NA   NA
 7232851 7232852 RMA_1341 RMA_1342     TRUE 0.658 93.000 0.000 NA   NA
 7232852 7232853 RMA_1342 RMA_1343     FALSE 0.013 1111.000 0.000 NA   NA
 7232854 7232855 RMA_1344 RMA_1345   mutL TRUE 0.846 -15.000 0.004 NA   NA
 7232855 7232856 RMA_1345 RMA_1346 mutL rpmG FALSE 0.290 221.000 0.004 1.000 N NA
 7232856 7232857 RMA_1346 RMA_1347 rpmG rpsP TRUE 0.906 14.000 0.008 0.028 Y NA
 7232857 7232858 RMA_1347 RMA_RNA37 rpsP   FALSE 0.582 178.000 0.000 NA   NA
 7232858 7232859 RMA_RNA37 RMA_1348   ampD2 FALSE 0.509 188.000 0.000 NA   NA
 7232859 7232860 RMA_1348 RMA_1349 ampD2 lipB TRUE 0.878 -9.000 0.004 1.000 N NA
 7232860 7232861 RMA_1349 RMA_1350 lipB   TRUE 0.909 -3.000 0.007 NA   NA
 7232863 7232864 RMA_1352 RMA_1353     TRUE 0.631 63.000 0.000 NA   NA
 7232864 7232865 RMA_1353 RMA_1354     TRUE 0.792 22.000 0.000 NA   NA
 7232865 7232866 RMA_1354 RMA_1355     FALSE 0.355 215.000 0.000 NA   NA
 7232866 7232867 RMA_1355 RMA_1356     FALSE 0.028 548.000 0.000 NA   NA
 7232867 7232868 RMA_1356 RMA_1357     TRUE 0.761 -28.000 0.000 NA   NA
 7232868 7232869 RMA_1357 RMA_1358   dapE TRUE 0.918 4.000 0.000 NA   NA
 7232869 7232870 RMA_1358 RMA_RNA38 dapE   TRUE 0.684 38.000 0.000 NA   NA
 7232870 7232871 RMA_RNA38 RMA_1359   holC TRUE 0.725 31.000 0.000 NA   NA
 7232872 7232873 RMA_1360 RMA_1361     TRUE 0.685 109.000 0.000 NA   NA
 7232873 7232874 RMA_1361 RMA_1362   dinJ TRUE 0.662 100.000 0.000 NA   NA
 7232874 7232875 RMA_1362 RMA_1363 dinJ   TRUE 0.800 87.000 0.053 NA   NA
 7232876 7232877 RMA_1364 RMA_1365 phnP glnQ TRUE 0.935 4.000 0.019 1.000   NA
 7232877 7232878 RMA_1365 RMA_1366 glnQ   FALSE 0.552 252.000 0.250 NA   NA
 7232878 7232879 RMA_1366 RMA_1367     FALSE 0.260 238.000 0.000 NA   NA
 7232879 7232880 RMA_1367 RMA_1368     FALSE 0.061 388.000 0.000 NA   NA
 7232881 7232882 RMA_1369 RMA_1370   dnaX TRUE 0.972 17.000 0.411 NA   NA
 7232882 7232883 RMA_1370 RMA_RNA39 dnaX ffs TRUE 0.714 119.000 0.000 NA   NA
 7232883 7232884 RMA_RNA39 RMA_1371 ffs lolA TRUE 0.761 25.000 0.000 NA   NA
 7232885 7232886 RMA_1372 RMA_1373 pntA1 pntA2 TRUE 0.992 -12.000 0.829 0.002   NA
 7232888 7232889 RMA_1375 RMA_1376 sec59 dnaG FALSE 0.392 -61.000 0.008 1.000 N NA
 7232889 7232890 RMA_1376 RMA_1377 dnaG rpoD TRUE 0.922 45.000 0.299 1.000 N NA
 7232890 7232891 RMA_1377 RMA_1378 rpoD truA TRUE 0.616 96.000 0.006 1.000 N NA
 7232893 7232894 RMA_1380 RMA_1381     TRUE 0.942 72.000 0.556 NA   NA
 7232894 7232895 RMA_1381 RMA_1382     TRUE 0.996 1.000 1.000 NA   NA
 7232895 7232896 RMA_1382 RMA_1383     FALSE 0.132 294.000 0.000 NA   NA
 7232896 7232897 RMA_1383 RMA_1384   proP7 FALSE 0.055 404.000 0.000 NA   NA
 7232897 7232898 RMA_1384 RMA_1385 proP7 hemF TRUE 0.838 -22.000 0.014 1.000 N NA
 7232899 7232900 RMA_1386 RMA_1387     FALSE 0.013 1133.000 0.000 NA   NA
 7232900 7232901 RMA_1387 RMA_1388   hemH TRUE 0.960 0.000 0.043 NA   NA
 7232901 7232902 RMA_1388 RMA_1389 hemH hemE TRUE 0.906 -43.000 0.131 1.000 Y NA
 7231467 7231468 RMA_p01 RMA_p02     FALSE 0.201 251.000 0.000 NA   NA
 7231469 7231470 RMA_p03 RMA_p04   spoT22 TRUE 0.654 91.000 0.000 NA   NA
 7231473 7231474 RMA_p07 RMA_p08     FALSE 0.033 487.000 0.000 NA   NA
 7231474 7231475 RMA_p08 RMA_p09     TRUE 0.892 9.000 0.000 NA   NA
 7231476 7231477 RMA_p10 RMA_p11     FALSE 0.379 -67.000 0.000 NA   NA