MicrobesOnline Operon Predictions for Rickettsia massiliae MTU5

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
7231480	7231481	RMA_0001	RMA_0002		trxA	FALSE	0.231	312.000	0.053	NA		NA
7231481	7231482	RMA_0002	RMA_0003	trxA	rfbE	TRUE	0.985	-22.000	0.778	1.000		NA
7231482	7231483	RMA_0003	RMA_0004	rfbE	rfbA	TRUE	0.993	1.000	0.304	1.000	Y	NA
7231483	7231484	RMA_0004	RMA_0005	rfbA	gltD	TRUE	0.972	-3.000	0.088	1.000	N	NA
7231485	7231486	RMA_0006	RMA_0007	lpxA	fabZ	TRUE	0.980	7.000	0.264	1.000	N	NA
7231486	7231487	RMA_0007	RMA_0008	fabZ	lpxD	TRUE	0.842	184.000	0.212	1.000	N	NA
7231489	7231490	RMA_0010	RMA_RNA01			FALSE	0.028	531.000	0.000	NA		NA
7231491	7231492	RMA_0011	RMA_0012			TRUE	0.719	127.000	0.000	NA		NA
7231492	7231493	RMA_0012	RMA_0013			TRUE	0.882	-13.000	0.000	NA		NA
7231493	7231494	RMA_0013	RMA_0014			TRUE	0.660	97.000	0.000	NA		NA
7231494	7231495	RMA_0014	RMA_0015			TRUE	0.929	0.000	0.000	NA		NA
7231495	7231496	RMA_0015	RMA_0016			TRUE	0.733	30.000	0.000	NA		NA
7231497	7231498	RMA_0017	RMA_0018		znuA	TRUE	0.873	-12.000	0.008	NA		NA
7231498	7231499	RMA_0018	RMA_0019	znuA	pcnB	TRUE	0.857	-24.000	0.023	1.000	N	NA
7231500	7231501	RMA_0020	RMA_RNA02	sca1		TRUE	0.685	109.000	0.000	NA		NA
7231501	7231502	RMA_RNA02	RMA_0021			FALSE	0.019	687.000	0.000	NA		NA
7231502	7231503	RMA_0021	RMA_0022			FALSE	0.065	373.000	0.000	NA		NA
7231503	7231504	RMA_0022	RMA_0023			TRUE	0.855	-18.000	0.000	NA		NA
7231504	7231505	RMA_0023	RMA_0024			FALSE	0.012	1424.000	0.000	NA		NA
7231506	7231507	RMA_0025	RMA_0026	atpF	atpX	TRUE	0.997	-3.000	0.863	0.013	Y	NA
7231507	7231508	RMA_0026	RMA_0027	atpX	atpE	TRUE	0.959	19.000	0.278	0.013		NA
7231508	7231509	RMA_0027	RMA_0028	atpE	atpB	TRUE	0.951	59.000	0.628	0.013		NA
7231509	7231510	RMA_0028	RMA_0029	atpB		TRUE	0.970	-13.000	0.195	NA		NA
7231510	7231511	RMA_0029	RMA_0030		dsbG	TRUE	0.947	6.000	0.043	NA		NA
7231513	7231514	RMA_0032	RMA_0033		recF	FALSE	0.049	417.000	0.000	1.000		NA
7231514	7231515	RMA_0033	RMA_0034	recF		TRUE	0.701	114.000	0.000	NA		NA
7231515	7231516	RMA_0034	RMA_0035			TRUE	0.684	38.000	0.000	NA		NA
7231516	7231517	RMA_0035	RMA_0036			TRUE	0.717	132.000	0.000	NA		NA
7231517	7231518	RMA_0036	RMA_0037			TRUE	0.924	3.000	0.000	NA		NA
7231518	7231519	RMA_0037	RMA_0038			TRUE	0.649	87.000	0.000	NA		NA
7231519	7231520	RMA_0038	RMA_0039			TRUE	0.895	-10.000	0.000	NA		NA
7231520	7231521	RMA_0039	RMA_0040			TRUE	0.659	50.000	0.000	NA		NA
7231521	7231522	RMA_0040	RMA_0041			TRUE	0.725	31.000	0.000	NA		NA
7231522	7231523	RMA_0041	RMA_0042			FALSE	0.236	243.000	0.000	NA		NA
7231523	7231524	RMA_0042	RMA_0043			TRUE	0.678	40.000	0.000	NA		NA
7231524	7231525	RMA_0043	RMA_0044			TRUE	0.643	82.000	0.000	NA		NA
7231525	7231526	RMA_0044	RMA_0045			TRUE	0.801	-24.000	0.000	NA		NA
7231526	7231527	RMA_0045	RMA_0046			FALSE	0.053	407.000	0.000	NA		NA
7231527	7231528	RMA_0046	RMA_0047			FALSE	0.036	476.000	0.000	NA		NA
7231531	7231532	RMA_0050	RMA_0051	cvpA		FALSE	0.277	229.000	0.000	NA		NA
7231532	7231533	RMA_0051	RMA_0052			TRUE	0.892	9.000	0.000	NA		NA
7231533	7231534	RMA_0052	RMA_0053			FALSE	0.014	983.000	0.000	NA		NA
7231534	7231535	RMA_0053	RMA_0054			FALSE	0.340	-91.000	0.000	NA		NA
7231535	7231536	RMA_0054	RMA_0055			TRUE	0.882	-13.000	0.000	NA		NA
7231537	7231538	RMA_0056	RMA_0057			TRUE	0.906	98.000	0.250	NA		NA
7231538	7231539	RMA_0057	RMA_0058			TRUE	0.676	-37.000	0.000	NA		NA
7231539	7231540	RMA_0058	RMA_0059			FALSE	0.016	804.000	0.000	NA		NA
7231540	7231541	RMA_0059	RMA_0060			TRUE	0.847	-19.000	0.000	NA		NA
7231541	7231542	RMA_0060	RMA_0061			FALSE	0.020	665.000	0.000	NA		NA
7231542	7231543	RMA_0061	RMA_0062			FALSE	0.464	196.000	0.000	NA		NA
7231545	7231546	RMA_0064	RMA_0065		gcp	FALSE	0.586	80.000	0.004	NA		NA
7231546	7231547	RMA_0065	RMA_0066	gcp	aco1	FALSE	0.492	183.000	0.005	1.000	N	NA
7231547	7231548	RMA_0066	RMA_0067	aco1		TRUE	0.719	143.000	0.000	NA		NA
7231549	7231550	RMA_0068	RMA_0069	rpsF	rpsR	TRUE	0.972	25.000	0.319	0.053	Y	NA
7231550	7231551	RMA_0069	RMA_0070	rpsR	rplI	TRUE	0.990	12.000	0.499	0.053	Y	NA
7231551	7231552	RMA_0070	RMA_0071	rplI	tilS	FALSE	0.105	294.000	0.002	0.086	N	NA
7231552	7231553	RMA_0071	RMA_0072	tilS	ftsH	TRUE	0.880	98.000	0.145	1.000	N	NA
7231553	7231554	RMA_0072	RMA_0073	ftsH		TRUE	0.822	18.000	0.000	NA		NA
7231554	7231555	RMA_0073	RMA_0074			FALSE	0.409	207.000	0.000	NA		NA
7231555	7231556	RMA_0074	RMA_0075		sdhB	FALSE	0.022	624.000	0.000	NA		NA
7231556	7231557	RMA_0075	RMA_0076	sdhB		TRUE	0.876	11.000	0.000	NA		NA
7231558	7231559	RMA_0077	RMA_0078		lgt	TRUE	0.779	-57.000	0.170	NA		NA
7231560	7231561	RMA_0079	RMA_0080		yidC	FALSE	0.486	185.000	0.008	1.000	N	NA
7231561	7231562	RMA_0080	RMA_0081	yidC	pgsA	TRUE	0.916	0.000	0.008	0.093	N	NA
7231562	7231563	RMA_0081	RMA_0082	pgsA		TRUE	0.813	14.000	0.005	1.000		NA
7231565	7231566	RMA_0084	RMA_0085			FALSE	0.355	215.000	0.000	NA		NA
7231566	7231567	RMA_0085	RMA_0086			TRUE	0.915	-4.000	0.000	NA		NA
7231569	7231570	RMA_0088	RMA_0089	tlc1	uhpC	TRUE	0.995	4.000	0.875	NA	N	NA
7231570	7231571	RMA_0089	RMA_0090	uhpC	ndk	TRUE	0.788	19.000	0.007	NA	N	NA
7231571	7231572	RMA_0090	RMA_0091	ndk	gidA	TRUE	0.903	4.000	0.007	1.000	N	NA
7231572	7231573	RMA_0091	RMA_0092	gidA	gidB	TRUE	0.975	-22.000	0.466	1.000	N	NA
7231573	7231574	RMA_0092	RMA_0093	gidB	soj	TRUE	0.988	-3.000	0.339	1.000	N	NA
7231574	7231575	RMA_0093	RMA_0094	soj		TRUE	0.992	-13.000	0.827	1.000	N	NA
7231575	7231576	RMA_0094	RMA_0095		abcT1	FALSE	0.148	262.000	0.006	1.000		NA
7231576	7231577	RMA_0095	RMA_0096	abcT1		TRUE	0.901	-9.000	0.013	NA		NA
7231577	7231578	RMA_0096	RMA_0097		kdsA	TRUE	0.699	33.000	0.011	NA		NA
7231578	7231579	RMA_0097	RMA_0098	kdsA		FALSE	0.157	270.000	0.000	NA		NA
7231579	7231580	RMA_0098	RMA_0099			FALSE	0.032	493.000	0.000	NA		NA
7231580	7231581	RMA_0099	RMA_0100			TRUE	0.847	-19.000	0.000	NA		NA
7231583	7231584	RMA_0102	RMA_0103	dgt	argS	TRUE	0.857	144.000	0.062	1.000	N	NA
7231584	7231585	RMA_0103	RMA_0104	argS		TRUE	0.670	155.000	0.008	NA		NA
7231585	7231586	RMA_0104	RMA_0105		parC	FALSE	0.447	191.000	0.007	NA		NA
7231588	7231589	RMA_0107	RMA_0108	dcd	secB	TRUE	0.738	34.000	0.015	1.000	N	NA
7231589	7231590	RMA_0108	RMA_0109	secB	czcR	FALSE	0.360	207.000	0.005	1.000	N	NA
7231590	7231591	RMA_0109	RMA_0110	czcR	queF	TRUE	0.951	4.000	0.038	1.000		NA
7231592	7231593	RMA_0111	RMA_0112		pntB	TRUE	0.791	49.000	0.047	NA		NA
7231593	7231594	RMA_0112	RMA_0113	pntB	ompW	TRUE	0.801	108.000	0.046	0.092	N	NA
7231595	7231596	RMA_0114	RMA_0115	sam	proP1	TRUE	0.979	-22.000	0.556	1.000		NA
7231596	7231597	RMA_0115	RMA_0116	proP1		TRUE	0.923	-3.000	0.000	NA		NA
7231597	7231598	RMA_0116	RMA_RNA03			TRUE	0.651	88.000	0.000	NA		NA
7231598	7231599	RMA_RNA03	RMA_0117		secG	FALSE	0.563	180.000	0.000	NA		NA
7231599	7231600	RMA_0117	RMA_0118	secG		FALSE	0.024	613.000	0.000	NA		NA
7231602	7231603	RMA_0120	RMA_0121	cysS	rpsB	TRUE	0.659	193.000	0.000	1.000	Y	NA
7231603	7231604	RMA_0121	RMA_0122	rpsB	tsf	TRUE	0.959	188.000	0.748	1.000	Y	NA
7231604	7231605	RMA_0122	RMA_0123	tsf		FALSE	0.025	569.000	0.000	NA		NA
7231605	7231606	RMA_0123	RMA_0124			TRUE	0.855	-18.000	0.000	NA		NA
7231607	7231608	RMA_0125	RMA_0126	kdtA		TRUE	0.814	-54.000	0.179	NA		NA
7231608	7231609	RMA_0126	RMA_0127		aatA	TRUE	0.857	148.000	0.062	NA		NA
7231609	7231610	RMA_0127	RMA_0128	aatA		TRUE	0.668	45.000	0.000	NA		NA
7231610	7231611	RMA_0128	RMA_0129			TRUE	0.906	-7.000	0.000	NA		NA
7231612	7231613	RMA_0130	RMA_0131		vacJ	TRUE	0.808	-37.000	0.049	1.000		NA
7231613	7231614	RMA_0131	RMA_0132	vacJ		FALSE	0.561	-103.000	0.070	NA	N	NA
7231614	7231615	RMA_0132	RMA_0133		prs	TRUE	0.834	178.000	0.133	NA	N	NA
7231615	7231616	RMA_0133	RMA_0134	prs	alr	TRUE	0.723	-69.000	0.200	1.000	N	NA
7231616	7231617	RMA_0134	RMA_0135	alr		TRUE	0.710	138.000	0.012	NA	N	NA
7231617	7231618	RMA_0135	RMA_0136		mkl	TRUE	0.922	70.000	0.178	NA	Y	NA
7231618	7231619	RMA_0136	RMA_0137	mkl		TRUE	0.963	2.000	0.050	NA		NA
7231620	7231621	RMA_0138	RMA_0139			TRUE	0.833	16.000	0.000	NA		NA
7231622	7231623	RMA_0140	RMA_0141	rpmB	rpmE	TRUE	0.942	-9.000	0.009	0.051	Y	NA
7231623	7231624	RMA_0141	RMA_RNA04	rpmE		FALSE	0.307	225.000	0.000	NA		NA
7231624	7231625	RMA_RNA04	RMA_0142		engB	TRUE	0.658	93.000	0.000	NA		NA
7231625	7231626	RMA_0142	RMA_0143	engB	argB	TRUE	0.686	-52.000	0.046	1.000		NA
7231626	7231627	RMA_0143	RMA_0144	argB	virB3	TRUE	0.829	13.000	0.004	NA	N	NA
7231627	7231628	RMA_0144	RMA_0145	virB3	virB4-1	TRUE	0.977	62.000	0.789	NA	Y	NA
7231628	7231629	RMA_0145	RMA_0146	virB4-1	virB6-1	TRUE	0.969	118.000	0.421	1.000	Y	NA
7231629	7231630	RMA_0146	RMA_0147	virB6-1	virB6-2	TRUE	0.992	-25.000	1.000	0.005	Y	NA
7231630	7231631	RMA_0147	RMA_0148	virB6-2	virB6-3	TRUE	0.997	7.000	1.000	0.005	Y	NA
7231631	7231632	RMA_0148	RMA_0149	virB6-3	virB6-4	TRUE	0.971	175.000	0.750	0.005	Y	NA
7231632	7231633	RMA_0149	RMA_0150	virB6-4		TRUE	0.701	156.000	0.000	NA		NA
7231633	7231634	RMA_0150	RMA_0151			FALSE	0.400	-64.000	0.000	NA		NA
7231634	7231635	RMA_0151	RMA_0152			FALSE	0.023	615.000	0.000	NA		NA
7231635	7231636	RMA_0152	RMA_0153			FALSE	0.379	-67.000	0.000	NA		NA
7231636	7231637	RMA_0153	RMA_0154			TRUE	0.625	68.000	0.000	NA		NA
7231637	7231638	RMA_0154	RMA_0155			TRUE	0.929	0.000	0.000	NA		NA
7231638	7231639	RMA_0155	RMA_0156			TRUE	0.918	4.000	0.000	NA		NA
7231639	7231640	RMA_0156	RMA_0157			FALSE	0.390	-66.000	0.000	NA		NA
7231640	7231641	RMA_0157	RMA_0158		trmD	FALSE	0.035	485.000	0.000	NA		NA
7231641	7231642	RMA_0158	RMA_0159	trmD	rplS	TRUE	0.980	27.000	0.567	1.000	Y	NA
7231644	7231645	RMA_0161	RMA_0162	secF	nuoF	TRUE	0.740	125.000	0.015	1.000	N	NA
7231645	7231646	RMA_0162	RMA_0163	nuoF	lepB	TRUE	0.625	181.000	0.021	1.000	N	NA
7231646	7231647	RMA_0163	RMA_0164	lepB	rnc	TRUE	0.921	0.000	0.010	1.000	N	NA
7231647	7231648	RMA_0164	RMA_0165	rnc	era	TRUE	0.944	-19.000	0.098	0.031		NA
7231648	7231649	RMA_0165	RMA_0166	era	ruvC	TRUE	0.657	112.000	0.007	1.000		NA
7231649	7231650	RMA_0166	RMA_0167	ruvC		TRUE	0.888	-7.000	0.006	1.000	N	NA
7231651	7231652	RMA_0168	RMA_0169			TRUE	0.975	-19.000	0.400	NA		NA
7231652	7231653	RMA_0169	RMA_0170			TRUE	0.972	5.000	0.118	NA		NA
7231653	7231654	RMA_0170	RMA_0171		mrp	TRUE	0.619	-54.000	0.025	NA	N	NA
7231655	7231656	RMA_0172	RMA_0173	hflK	hflC2	TRUE	0.984	93.000	0.947	0.021	Y	NA
7231656	7231657	RMA_0173	RMA_0174	hflC2	htrA	TRUE	0.945	23.000	0.084	0.021	Y	NA
7231657	7231658	RMA_0174	RMA_0175	htrA		TRUE	0.773	35.000	0.023	NA		NA
7231658	7231659	RMA_0175	RMA_0176		sdhC	TRUE	0.796	153.000	0.026	NA		NA
7231659	7231660	RMA_0176	RMA_0177	sdhC	sdhD	TRUE	0.960	150.000	0.291	0.003	Y	NA
7231660	7231661	RMA_0177	RMA_0178	sdhD	sdhA	TRUE	0.982	137.000	0.705	0.005	Y	NA
7231661	7231662	RMA_0178	RMA_0179	sdhA	yqiY	TRUE	0.622	103.000	0.006	1.000	N	NA
7231662	7231663	RMA_0179	RMA_0180	yqiY	rpsL	TRUE	0.758	70.000	0.044	1.000	N	NA
7231663	7231664	RMA_0180	RMA_0181	rpsL	rpsG	TRUE	0.900	27.000	0.029	0.010	Y	NA
7231664	7231665	RMA_0181	RMA_0182	rpsG	fusA	TRUE	0.978	10.000	0.114	1.000	Y	NA
7231665	7231666	RMA_0182	RMA_RNA05	fusA		TRUE	0.716	150.000	0.000	NA		NA
7231666	7231667	RMA_RNA05	RMA_0183		secE	TRUE	0.654	91.000	0.000	NA		NA
7231667	7231668	RMA_0183	RMA_0184	secE	nusG	TRUE	0.990	13.000	0.843	1.000	N	NA
7231668	7231669	RMA_0184	RMA_0185	nusG	rplK	TRUE	0.698	273.000	0.681	1.000	N	NA
7231669	7231670	RMA_0185	RMA_0186	rplK	rplA	TRUE	0.997	0.000	0.838	0.068	Y	NA
7231670	7231671	RMA_0186	RMA_0187	rplA	rplJ	TRUE	0.958	111.000	0.302	0.068	Y	NA
7231671	7231672	RMA_0187	RMA_0188	rplJ	rplL	TRUE	0.988	144.000	0.884	0.050	Y	NA
7231672	7231673	RMA_0188	RMA_0189	rplL	rpoB	FALSE	0.070	849.000	0.223	1.000		NA
7231673	7231674	RMA_0189	RMA_0190	rpoB	rpoC	TRUE	0.799	254.000	0.851	0.003		NA
7231676	7231677	RMA_0192	RMA_0193	pepA		TRUE	0.712	187.000	0.061	1.000	N	NA
7231677	7231678	RMA_0193	RMA_0194			TRUE	0.829	77.000	0.082	NA		NA
7231678	7231679	RMA_0194	RMA_0195		aspS	FALSE	0.584	77.000	0.005	NA		NA
7231680	7231681	RMA_0196	RMA_0197			FALSE	0.067	370.000	0.000	NA		NA
7231681	7231682	RMA_0197	RMA_0198		dapB	TRUE	0.660	35.000	0.006	NA		NA
7231682	7231683	RMA_0198	RMA_0199	dapB		TRUE	0.701	125.000	0.011	1.000		NA
7231683	7231684	RMA_0199	RMA_0200		yqiX	TRUE	0.972	-15.000	0.250	1.000		NA
7231684	7231685	RMA_0200	RMA_0201	yqiX	gatB	FALSE	0.590	170.000	0.005	1.000	N	NA
7231685	7231686	RMA_0201	RMA_0202	gatB	gatA	TRUE	0.995	0.000	0.492	0.004	Y	NA
7231686	7231687	RMA_0202	RMA_0203	gatA	gatC	TRUE	0.996	-3.000	0.643	0.004	Y	NA
7231687	7231688	RMA_0203	RMA_0204	gatC	frr	FALSE	0.030	767.000	0.002	1.000	Y	NA
7231688	7231689	RMA_0204	RMA_0205	frr	pyrH	TRUE	0.648	287.000	0.626	1.000	N	NA
7231689	7231690	RMA_0205	RMA_0206	pyrH	mnhE	TRUE	0.854	-15.000	0.008	1.000	N	NA
7231690	7231691	RMA_0206	RMA_0207	mnhE	emrB	TRUE	0.950	-22.000	0.171	0.088	N	NA
7231693	7231694	RMA_0209	RMA_RNA06			FALSE	0.035	485.000	0.000	NA		NA
7231694	7231695	RMA_RNA06	RMA_0210		omp1	TRUE	0.638	170.000	0.000	NA		NA
7231695	7231696	RMA_0210	RMA_0211	omp1		FALSE	0.442	239.000	0.016	1.000	Y	NA
7231697	7231698	RMA_0212	RMA_0213	nusB	rrmJ	TRUE	0.910	4.000	0.010	NA	N	NA
7231701	7231702	RMA_0216	RMA_0217			TRUE	0.917	0.000	0.008	NA		NA
7231704	7231705	RMA_0219	RMA_0220		acrF	FALSE	0.496	253.000	0.179	NA		NA
7231706	7231707	RMA_0221	RMA_0222	hupA	holB	TRUE	0.870	137.000	0.020	1.000	Y	NA
7231707	7231708	RMA_0222	RMA_0223	holB	ffh	FALSE	0.423	205.000	0.000	1.000	N	NA
7231709	7231710	RMA_0224	RMA_0225			TRUE	0.782	-25.000	0.000	NA		NA
7231710	7231711	RMA_0225	RMA_0226			TRUE	0.924	3.000	0.000	NA		NA
7231711	7231712	RMA_0226	RMA_0227			TRUE	0.740	28.000	0.000	NA		NA
7231712	7231713	RMA_0227	RMA_0228			TRUE	0.855	-18.000	0.000	NA		NA
7231713	7231714	RMA_0228	RMA_0229			TRUE	0.761	-28.000	0.000	NA		NA
7231714	7231715	RMA_0229	RMA_0230			TRUE	0.857	13.000	0.000	NA		NA
7231717	7231718	RMA_0232	RMA_0233			TRUE	0.708	34.000	0.000	NA		NA
7231718	7231719	RMA_0233	RMA_0234			TRUE	0.815	19.000	0.000	NA		NA
7231719	7231720	RMA_0234	RMA_0235		gltP	TRUE	0.692	111.000	0.000	NA		NA
7231720	7231721	RMA_0235	RMA_0236	gltP	cutA	TRUE	0.727	38.000	0.017	1.000	N	NA
7231721	7231722	RMA_0236	RMA_0237	cutA		TRUE	0.937	3.000	0.017	1.000	N	NA
7231722	7231723	RMA_0237	RMA_0238		sucB	TRUE	0.669	163.000	0.013	1.000	N	NA
7231723	7231724	RMA_0238	RMA_0239	sucB	sucA	TRUE	0.977	162.000	0.667	1.000	Y	NA
7231724	7231725	RMA_0239	RMA_0240	sucA		FALSE	0.187	255.000	0.000	NA		NA
7231725	7231726	RMA_0240	RMA_0241			TRUE	0.638	60.000	0.000	NA		NA
7231726	7231727	RMA_0241	RMA_0242		recN	TRUE	0.627	66.000	0.000	NA		NA
7231727	7231728	RMA_0242	RMA_0243	recN	comL	TRUE	0.973	-4.000	0.117	1.000		NA
7231728	7231729	RMA_0243	RMA_0244	comL		FALSE	0.074	360.000	0.000	NA		NA
7231729	7231730	RMA_0244	RMA_0245		dnaJ	TRUE	0.645	57.000	0.000	NA		NA
7231730	7231731	RMA_0245	RMA_0246	dnaJ	dnaK	TRUE	0.954	127.000	0.236	0.006	Y	NA
7231733	7231734	RMA_0248	RMA_0249			TRUE	0.642	-40.000	0.000	NA		NA
7231734	7231735	RMA_0249	RMA_0250			FALSE	0.013	1083.000	0.000	NA		NA
7231736	7231737	RMA_0251	RMA_0252		holA	TRUE	0.964	8.000	0.097	NA		NA
7231737	7231738	RMA_0252	RMA_0253	holA	coq7	TRUE	0.633	106.000	0.007	1.000	N	NA
7231738	7231739	RMA_0253	RMA_0254	coq7	coxC	FALSE	0.022	627.000	0.000	1.000	N	NA
7231739	7231740	RMA_0254	RMA_0255	coxC	virB2	TRUE	0.753	108.000	0.022	NA	N	NA
7231743	7231744	RMA_0258	RMA_0259			FALSE	0.353	-81.000	0.000	NA		NA
7231744	7231745	RMA_0259	RMA_0260		pbpC	TRUE	0.839	15.000	0.000	NA		NA
7231746	7231747	RMA_0261	RMA_0262			TRUE	0.923	-3.000	0.000	NA		NA
7231747	7231748	RMA_0262	RMA_0263			FALSE	0.046	431.000	0.000	NA		NA
7231748	7231749	RMA_0263	RMA_0264			FALSE	0.011	2022.000	0.000	NA		NA
7231749	7231750	RMA_0264	RMA_0265			TRUE	0.902	7.000	0.000	NA		NA
7231751	7231752	RMA_0266	RMA_0267	uspA	imp	TRUE	0.972	10.000	0.200	NA		NA
7231752	7231753	RMA_0267	RMA_0268	imp		TRUE	0.952	-46.000	0.778	NA		NA
7231753	7231754	RMA_0268	RMA_0269		fdxB	TRUE	0.966	4.000	0.068	NA		NA
7231754	7231755	RMA_0269	RMA_0270	fdxB	hscA	TRUE	0.835	62.000	0.091	1.000	N	NA
7231755	7231756	RMA_0270	RMA_0271	hscA	hscB	TRUE	0.994	-12.000	0.634	1.000	Y	NA
7231759	7231760	RMA_0274	RMA_0275	grxC1	atm1	TRUE	0.922	145.000	0.068	1.000	Y	NA
7231760	7231761	RMA_0275	RMA_0276	atm1	gyrA	FALSE	0.083	353.000	0.000	1.000	N	NA
7231761	7231762	RMA_0276	RMA_0277	gyrA		FALSE	0.015	874.000	0.000	NA		NA
7231762	7231763	RMA_0277	RMA_0278			FALSE	0.016	864.000	0.000	NA		NA
7231763	7231764	RMA_0278	RMA_0279		def	FALSE	0.042	447.000	0.000	NA		NA
7231764	7231765	RMA_0279	RMA_0280	def	fmt	TRUE	0.955	-3.000	0.008	0.077	Y	NA
7231765	7231766	RMA_0280	RMA_RNA07	fmt	rrl	FALSE	0.016	848.000	0.000	NA		NA
7231766	7231767	RMA_RNA07	RMA_RNA08	rrl	rrf	FALSE	0.206	250.000	0.000	NA		NA
7231767	7231768	RMA_RNA08	RMA_0286	rrf		TRUE	0.717	121.000	0.000	NA		NA
7231768	7231769	RMA_0286	RMA_0287			TRUE	0.876	11.000	0.000	NA		NA
7231769	7231770	RMA_0287	RMA_0288			FALSE	0.379	-67.000	0.000	NA		NA
7231771	7231772	RMA_0289	RMA_0290	n2B		FALSE	0.381	211.000	0.000	NA		NA
7231772	7231773	RMA_0290	RMA_0291			TRUE	0.896	8.000	0.000	NA		NA
7231774	7231775	RMA_0292	RMA_0293			TRUE	0.667	163.000	0.000	NA		NA
7231777	7231778	RMA_0295	RMA_0296		cydA	TRUE	0.956	152.000	0.500	NA		NA
7231778	7231779	RMA_0296	RMA_0297	cydA	cydB	TRUE	0.979	8.000	0.095	0.046	Y	NA
7231779	7231780	RMA_0297	RMA_0298	cydB		TRUE	0.720	130.000	0.000	NA	N	NA
7231780	7231781	RMA_0298	RMA_0299			TRUE	0.989	11.000	0.681	NA		NA
7231781	7231782	RMA_0299	RMA_0300		lgtF	TRUE	0.842	-16.000	0.007	NA		NA
7231782	7231783	RMA_0300	RMA_0301	lgtF	mpp	TRUE	0.950	2.000	0.025	NA		NA
7231783	7231784	RMA_0301	RMA_0302	mpp	purC	TRUE	0.697	154.000	0.011	1.000		NA
7231784	7231785	RMA_0302	RMA_0303	purC		FALSE	0.325	222.000	0.000	NA		NA
7231785	7231786	RMA_0303	RMA_0304		thrS	TRUE	0.609	51.000	0.006	NA		NA
7231786	7231787	RMA_0304	RMA_0305	thrS		FALSE	0.024	613.000	0.000	NA		NA
7231787	7231788	RMA_0305	RMA_0306			FALSE	0.015	883.000	0.000	NA		NA
7231788	7231789	RMA_0306	RMA_0307			FALSE	0.125	309.000	0.000	NA		NA
7231790	7231791	RMA_0308	RMA_0309			TRUE	0.924	3.000	0.000	NA		NA
7231791	7231792	RMA_0309	RMA_0310			TRUE	0.902	7.000	0.000	NA		NA
7231792	7231793	RMA_0310	RMA_0311			TRUE	0.718	137.000	0.000	NA		NA
7231794	7231795	RMA_0312	RMA_0313	tolC		TRUE	0.980	2.000	0.146	NA		NA
7231795	7231796	RMA_0313	RMA_0314			TRUE	0.705	195.000	0.073	NA		NA
7231796	7231797	RMA_0314	RMA_0315		parE	FALSE	0.426	210.000	0.016	NA		NA
7231797	7231798	RMA_0315	RMA_0316	parE	ctp	TRUE	0.937	0.000	0.015	1.000	N	NA
7231798	7231799	RMA_0316	RMA_0317	ctp	barA	FALSE	0.368	212.000	0.000	1.000	N	NA
7231799	7231800	RMA_0317	RMA_0318	barA		TRUE	0.875	51.000	0.143	1.000		NA
7231800	7231801	RMA_0318	RMA_0319			TRUE	0.984	13.000	0.583	NA		NA
7231801	7231802	RMA_0319	RMA_0320			TRUE	0.923	-10.000	0.022	NA		NA
7231802	7231803	RMA_0320	RMA_0321		rplM	FALSE	0.604	90.000	0.006	1.000		NA
7231803	7231804	RMA_0321	RMA_0322	rplM	rpsI	TRUE	0.987	7.000	0.231	0.046	Y	NA
7231804	7231805	RMA_0322	RMA_RNA09	rpsI		FALSE	0.217	248.000	0.000	NA		NA
7231805	7231806	RMA_RNA09	RMA_0323			FALSE	0.029	513.000	0.000	NA		NA
7231806	7231807	RMA_0323	RMA_0324			TRUE	0.624	69.000	0.000	NA		NA
7231807	7231808	RMA_0324	RMA_0325			FALSE	0.088	345.000	0.000	NA		NA
7231808	7231809	RMA_0325	RMA_0326			FALSE	0.038	469.000	0.000	NA		NA
7231810	7231811	RMA_0327	RMA_0328	nudH	pleD	TRUE	0.826	22.000	0.017	1.000	N	NA
7231812	7231813	RMA_0329	RMA_0330	efp	suhB	FALSE	0.277	266.000	0.047	1.000	N	NA
7231813	7231814	RMA_0330	RMA_0331	suhB		FALSE	0.586	60.000	0.005	NA		NA
7231814	7231815	RMA_0331	RMA_0332		psd	TRUE	0.921	7.000	0.018	NA		NA
7231815	7231816	RMA_0332	RMA_0333	psd	pssA	TRUE	0.972	149.000	0.466	0.006	Y	NA
7231816	7231817	RMA_0333	RMA_0334	pssA	emrA	TRUE	0.911	-6.000	0.013	0.061	N	NA
7231817	7231818	RMA_0334	RMA_0335	emrA		FALSE	0.105	325.000	0.000	NA		NA
7231819	7231820	RMA_0336	RMA_0337		bolA1	TRUE	0.893	-18.000	0.022	NA		NA
7231821	7231822	RMA_0338	RMA_0339		murC	FALSE	0.297	221.000	0.006	NA	N	NA
7231822	7231823	RMA_0339	RMA_0340	murC	murB	TRUE	0.977	10.000	0.108	0.012	Y	NA
7231823	7231824	RMA_0340	RMA_0341	murB	ddl	TRUE	0.658	243.000	0.135	0.012	Y	NA
7231824	7231825	RMA_0341	RMA_0342	ddl	ftsQ	TRUE	0.992	-6.000	0.372	NA	Y	NA
7231825	7231826	RMA_0342	RMA_0343	ftsQ	ftsA	TRUE	0.904	129.000	0.137	NA	N	NA
7231827	7231828	RMA_0344	RMA_0345		cycM	TRUE	0.874	-16.000	0.014	NA	N	NA
7231830	7231831	RMA_0347	RMA_0348	lpxC		FALSE	0.070	348.000	0.005	NA		NA
7231832	7231833	RMA_0349	RMA_0350	rne	coxW	FALSE	0.237	243.000	0.000	1.000	N	NA
7231833	7231834	RMA_0350	RMA_0351	coxW	rluA1	TRUE	0.940	4.000	0.022	1.000	N	NA
7231834	7231835	RMA_0351	RMA_0352	rluA1	pbpE	TRUE	0.939	107.000	0.412	1.000	N	NA
7231835	7231836	RMA_0352	RMA_0353	pbpE	xth1	TRUE	0.812	82.000	0.063	1.000	N	NA
7231836	7231837	RMA_0353	RMA_0354	xth1	pdhA	TRUE	0.817	23.000	0.018	1.000	N	NA
7231837	7231838	RMA_0354	RMA_0355	pdhA	pdhB	TRUE	0.966	161.000	0.456	0.002	Y	NA
7231840	7231841	RMA_0357	RMA_0358	hlpA	icd	TRUE	0.802	75.000	0.062	1.000	N	NA
7231841	7231842	RMA_0358	RMA_0359	icd		TRUE	0.840	106.000	0.069	1.000	N	NA
7231842	7231843	RMA_0359	RMA_0360		mnhB	TRUE	0.937	46.000	0.184	NA	Y	NA
7231843	7231844	RMA_0360	RMA_0361	mnhB	ccmB	TRUE	0.883	-13.000	0.000	NA	N	NA
7231844	7231845	RMA_0361	RMA_0362	ccmB		TRUE	0.636	77.000	0.000	NA		NA
7231845	7231846	RMA_0362	RMA_0363		petA	TRUE	0.986	22.000	0.875	NA		NA
7231846	7231847	RMA_0363	RMA_0364	petA	petB	TRUE	0.772	-49.000	0.021	0.003	Y	NA
7231847	7231848	RMA_0364	RMA_0365	petB		TRUE	0.667	118.000	0.005	1.000	N	NA
7231848	7231849	RMA_0365	RMA_0366		fbcH	FALSE	0.579	72.000	0.006	1.000	N	NA
7231849	7231850	RMA_0366	RMA_0367	fbcH		FALSE	0.137	291.000	0.000	NA		NA
7231850	7231851	RMA_0367	RMA_0368		hspC1	TRUE	0.958	21.000	0.286	NA		NA
7231852	7231853	RMA_0369	RMA_0370			TRUE	0.826	17.000	0.000	NA		NA
7231853	7231854	RMA_0370	RMA_0371			TRUE	0.801	-24.000	0.000	NA		NA
7231854	7231855	RMA_0371	RMA_0372		prfB	TRUE	0.886	10.000	0.000	NA		NA
7231856	7231857	RMA_0373	RMA_RNA10	lepA		TRUE	0.656	92.000	0.000	NA		NA
7231858	7231859	RMA_0374	RMA_0375			FALSE	0.038	471.000	0.000	NA		NA
7231859	7231860	RMA_0375	RMA_0376			FALSE	0.079	356.000	0.000	NA		NA
7231861	7231862	RMA_0377	RMA_0378			TRUE	0.674	42.000	0.000	NA		NA
7231862	7231863	RMA_0378	RMA_0379			TRUE	0.708	34.000	0.000	NA		NA
7231863	7231864	RMA_0379	RMA_0380			FALSE	0.021	662.000	0.000	NA		NA
7231864	7231865	RMA_0380	RMA_0381			TRUE	0.929	0.000	0.000	NA		NA
7231865	7231866	RMA_0381	RMA_0382			TRUE	0.715	151.000	0.000	NA		NA
7231866	7231867	RMA_0382	RMA_0383			FALSE	0.026	560.000	0.000	NA		NA
7231867	7231868	RMA_0383	RMA_0384			TRUE	0.826	-22.000	0.000	NA		NA
7231869	7231870	RMA_0385	RMA_0386			TRUE	0.876	11.000	0.000	NA		NA
7231870	7231871	RMA_0386	RMA_0387		rodA	FALSE	0.563	180.000	0.000	NA		NA
7231871	7231872	RMA_0387	RMA_0388	rodA	ptrB	FALSE	0.428	201.000	0.010	1.000	N	NA
7231872	7231873	RMA_0388	RMA_0389	ptrB	nuoL3	TRUE	0.932	176.000	0.538	1.000	N	NA
7231873	7231874	RMA_0389	RMA_0390	nuoL3	vapC1	TRUE	0.991	-4.000	0.556	NA		NA
7231874	7231875	RMA_0390	RMA_0391	vapC1	vapB1	TRUE	0.935	52.000	0.444	NA		NA
7231875	7231876	RMA_0391	RMA_0392	vapB1	nuoL2	TRUE	0.862	155.000	0.070	NA		NA
7231876	7231877	RMA_0392	RMA_0393	nuoL2	nuoN2	TRUE	0.890	84.000	0.067	0.008	Y	NA
7231877	7231878	RMA_0393	RMA_0394	nuoN2	mnhC	TRUE	0.993	-3.000	0.426	0.022	Y	NA
7231878	7231879	RMA_0394	RMA_0395	mnhC	virB9-1	TRUE	0.823	92.000	0.065	NA	N	NA
7231879	7231880	RMA_0395	RMA_0396	virB9-1	virB8-1	TRUE	0.989	-16.000	0.455	NA	Y	NA
7231881	7231882	RMA_0397	RMA_0398		virB8-2	TRUE	0.921	53.000	0.316	NA		NA
7231882	7231883	RMA_0398	RMA_0399	virB8-2	virB9-2	TRUE	0.982	-13.000	0.421	NA		NA
7231883	7231884	RMA_0399	RMA_0400	virB9-2	virB10	TRUE	0.897	184.000	0.421	NA		NA
7231884	7231885	RMA_0400	RMA_0401	virB10	virB11	TRUE	0.956	-42.000	0.452	1.000	Y	NA
7231885	7231886	RMA_0401	RMA_0402	virB11	virD4	TRUE	0.958	167.000	0.405	1.000	Y	NA
7231886	7231887	RMA_0402	RMA_0403	virD4	gppA	TRUE	0.945	10.000	0.054	1.000	N	NA
7231891	7231892	RMA_0407	RMA_0408			TRUE	0.966	-43.000	0.875	NA		NA
7231892	7231893	RMA_0408	RMA_0409		cysQ	TRUE	0.959	-3.000	0.048	NA		NA
7231894	7231895	RMA_0410	RMA_0411	mutS	lacA	TRUE	0.632	171.000	0.000	1.000	N	NA
7231896	7231897	RMA_0412	RMA_0413	nlpD1		TRUE	0.928	1.000	0.000	NA		NA
7231897	7231898	RMA_0413	RMA_0414			TRUE	0.661	99.000	0.000	NA		NA
7231898	7231899	RMA_0414	RMA_0415		thyX	FALSE	0.298	226.000	0.000	NA		NA
7231899	7231900	RMA_0415	RMA_0416	thyX	tolB	TRUE	0.646	75.000	0.014	1.000	N	NA
7231904	7231905	RMA_0420	RMA_0421	mnmA	atrC1	TRUE	0.731	126.000	0.014	1.000	N	NA
7231905	7231906	RMA_0421	RMA_0422	atrC1	hisS	FALSE	0.587	69.000	0.008	1.000	N	NA
7231906	7231907	RMA_0422	RMA_0423	hisS		FALSE	0.074	360.000	0.000	NA		NA
7231907	7231908	RMA_0423	RMA_0424			TRUE	0.635	61.000	0.000	NA		NA
7231908	7231909	RMA_0424	RMA_0425			FALSE	0.312	-123.000	0.000	NA		NA
7231910	7231911	RMA_0426	RMA_0427			FALSE	0.024	593.000	0.000	NA		NA
7231911	7231912	RMA_0427	RMA_0428			TRUE	0.642	-40.000	0.000	NA		NA
7231912	7231913	RMA_0428	RMA_0429			TRUE	0.857	13.000	0.000	NA		NA
7231913	7231914	RMA_0429	RMA_0430			FALSE	0.047	424.000	0.000	NA		NA
7231914	7231915	RMA_0430	RMA_0431			FALSE	0.032	490.000	0.000	NA		NA
7231916	7231917	RMA_0432	RMA_0433	tolQ	tolR	TRUE	0.982	0.000	0.059	0.030	Y	NA
7231917	7231918	RMA_0433	RMA_0434	tolR		TRUE	0.958	-22.000	0.240	NA		NA
7231918	7231919	RMA_0434	RMA_0435		spoT2	FALSE	0.014	1006.000	0.000	NA		NA
7231920	7231921	RMA_0436	RMA_0437	proP2		TRUE	0.931	134.000	0.273	0.076		NA
7231921	7231922	RMA_0437	RMA_0438		aprD	TRUE	0.862	182.000	0.267	0.011		NA
7231922	7231923	RMA_0438	RMA_0439	aprD	asd	TRUE	0.874	-13.000	0.011	1.000		NA
7231923	7231924	RMA_0439	RMA_0440	asd	pkcI	TRUE	0.895	-10.000	0.012	1.000	N	NA
7231924	7231925	RMA_0440	RMA_0441	pkcI		TRUE	0.695	133.000	0.010	NA		NA
7231926	7231927	RMA_0442	RMA_0443	hslV	hslU	TRUE	0.996	-3.000	0.752	1.000	Y	NA
7231927	7231928	RMA_0443	RMA_0444	hslU		FALSE	0.437	204.000	0.000	NA		NA
7231928	7231929	RMA_0444	RMA_0445			TRUE	0.847	-19.000	0.000	NA		NA
7231929	7231930	RMA_0445	RMA_0446			FALSE	0.547	-51.000	0.000	NA		NA
7231930	7231931	RMA_0446	RMA_0447			TRUE	0.719	143.000	0.000	NA		NA
7231931	7231932	RMA_0447	RMA_0448			TRUE	0.918	4.000	0.000	NA		NA
7231932	7231933	RMA_0448	RMA_0449			FALSE	0.024	611.000	0.000	NA		NA
7231933	7231934	RMA_0449	RMA_0450			TRUE	0.629	65.000	0.000	NA		NA
7231934	7231935	RMA_0450	RMA_0451			TRUE	0.902	7.000	0.000	NA		NA
7231935	7231936	RMA_0451	RMA_0452		lpxB	TRUE	0.857	13.000	0.000	NA		NA
7231938	7231939	RMA_0454	RMA_0455		cyaY	TRUE	0.699	116.000	0.012	NA		NA
7231939	7231940	RMA_0455	RMA_0456	cyaY		TRUE	0.686	138.000	0.008	NA		NA
7231940	7231941	RMA_0456	RMA_0457			FALSE	0.141	288.000	0.000	NA		NA
7231941	7231942	RMA_0457	RMA_0458			FALSE	0.578	-48.000	0.000	NA		NA
7231942	7231943	RMA_0458	RMA_0459			TRUE	0.635	61.000	0.000	NA		NA
7231943	7231944	RMA_0459	RMA_0460			TRUE	0.629	65.000	0.000	NA		NA
7231944	7231945	RMA_0460	RMA_0461			FALSE	0.030	509.000	0.000	NA		NA
7231946	7231947	RMA_0462	RMA_0463	gltX	topA	TRUE	0.644	109.000	0.007	1.000	N	NA
7231947	7231948	RMA_0463	RMA_0464	topA		TRUE	0.918	4.000	0.000	NA		NA
7231948	7231949	RMA_0464	RMA_0465			TRUE	0.761	-28.000	0.000	NA		NA
7231949	7231950	RMA_0465	RMA_0466			TRUE	0.915	-4.000	0.000	NA		NA
7231950	7231951	RMA_0466	RMA_0467			FALSE	0.547	-51.000	0.000	NA		NA
7231951	7231952	RMA_0467	RMA_0468		tdpX1	TRUE	0.719	129.000	0.000	NA		NA
7231952	7231953	RMA_0468	RMA_0469	tdpX1	hflC1	TRUE	0.792	76.000	0.014	1.000	Y	NA
7231953	7231954	RMA_0469	RMA_0470	hflC1		FALSE	0.067	370.000	0.000	1.000		NA
7231955	7231956	RMA_0471	RMA_0472			TRUE	0.700	156.000	0.000	1.000		NA
7231956	7231957	RMA_0472	RMA_0473			TRUE	0.646	86.000	0.000	1.000		NA
7231957	7231958	RMA_0473	RMA_0474		capD	TRUE	0.822	195.000	0.271	0.002		NA
7231958	7231959	RMA_0474	RMA_0475	capD	rffE	TRUE	0.974	-7.000	0.148	1.000		NA
7231959	7231960	RMA_0475	RMA_0476	rffE		TRUE	0.642	-40.000	0.000	NA		NA
7231960	7231961	RMA_0476	RMA_0477			TRUE	0.833	16.000	0.000	NA		NA
7231961	7231962	RMA_0477	RMA_0478			FALSE	0.050	416.000	0.000	NA		NA
7231963	7231964	RMA_0479	RMA_0480			TRUE	0.921	89.000	0.312	NA		NA
7231964	7231965	RMA_0480	RMA_0481			TRUE	0.975	4.000	0.129	NA		NA
7231967	7231968	RMA_0483	RMA_0484		rpsD	FALSE	0.011	1434.000	0.000	NA		NA
7231972	7231973	RMA_0488	RMA_0489	asmA	rimM	FALSE	0.109	322.000	0.000	NA	N	NA
7231974	7231975	RMA_0490	RMA_0491		xseB	TRUE	0.820	14.000	0.007	NA		NA
7231975	7231976	RMA_0491	RMA_0492	xseB		TRUE	0.684	38.000	0.000	NA		NA
7231976	7231977	RMA_0492	RMA_0493			TRUE	0.815	19.000	0.000	NA		NA
7231977	7231978	RMA_0493	RMA_0494			FALSE	0.504	189.000	0.000	NA		NA
7231978	7231979	RMA_0494	RMA_0495			TRUE	0.902	7.000	0.000	NA		NA
7231980	7231981	RMA_0496	RMA_0497	mpg		TRUE	0.918	4.000	0.000	NA		NA
7231981	7231982	RMA_0497	RMA_0498			TRUE	0.629	65.000	0.000	NA		NA
7231982	7231983	RMA_0498	RMA_0499		nuoE	TRUE	0.889	-7.000	0.007	NA		NA
7231983	7231984	RMA_0499	RMA_0500	nuoE		TRUE	0.635	61.000	0.000	NA		NA
7231984	7231985	RMA_0500	RMA_0501		nuoD	TRUE	0.718	138.000	0.000	NA		NA
7231985	7231986	RMA_0501	RMA_0502	nuoD	nuoC	TRUE	0.993	6.000	0.483	0.020	Y	NA
7231986	7231987	RMA_0502	RMA_0503	nuoC	nuoB	TRUE	0.981	-22.000	0.328	0.007	Y	NA
7231987	7231988	RMA_0503	RMA_0504	nuoB	nuoA	TRUE	0.993	5.000	0.507	0.007	Y	NA
7231988	7231989	RMA_0504	RMA_0505	nuoA	rfaL	TRUE	0.953	-3.000	0.031	NA	N	NA
7231989	7231990	RMA_0505	RMA_0506	rfaL		TRUE	0.969	1.000	0.066	NA		NA
7231991	7231992	RMA_0507	RMA_0508			FALSE	0.317	-115.000	0.000	NA		NA
7231992	7231993	RMA_0508	RMA_RNA11			FALSE	0.260	238.000	0.000	NA		NA
7231993	7231994	RMA_RNA11	RMA_0509		xerD	TRUE	0.792	22.000	0.000	NA		NA
7231994	7231995	RMA_0509	RMA_0510	xerD		FALSE	0.596	76.000	0.008	NA		NA
7231995	7231996	RMA_0510	RMA_0511			TRUE	0.958	111.000	0.571	NA		NA
7231998	7231999	RMA_0513	RMA_0514	lnt		FALSE	0.563	180.000	0.000	NA		NA
7231999	7232000	RMA_0514	RMA_0515		ampD1	TRUE	0.656	92.000	0.000	NA		NA
7232000	7232001	RMA_0515	RMA_0516	ampD1		FALSE	0.021	654.000	0.000	NA		NA
7232001	7232002	RMA_0516	RMA_0517			TRUE	0.929	0.000	0.000	NA		NA
7232002	7232003	RMA_0517	RMA_0518			FALSE	0.453	-58.000	0.000	NA		NA
7232003	7232004	RMA_0518	RMA_0519			FALSE	0.302	-174.000	0.000	NA		NA
7232004	7232005	RMA_0519	RMA_0520			TRUE	0.662	-39.000	0.000	NA		NA
7232005	7232006	RMA_0520	RMA_0521			TRUE	0.882	-13.000	0.000	NA		NA
7232007	7232008	RMA_0522	RMA_0523			TRUE	0.929	0.000	0.000	NA		NA
7232008	7232009	RMA_0523	RMA_0524		dsbB	TRUE	0.845	14.000	0.000	NA		NA
7232010	7232011	RMA_0525	RMA_0526	lysK		TRUE	0.776	130.000	0.021	1.000		NA
7232011	7232012	RMA_0526	RMA_0527		tme	TRUE	0.832	52.000	0.071	1.000		NA
7232012	7232013	RMA_0527	RMA_0528	tme		TRUE	0.736	29.000	0.000	NA		NA
7232013	7232014	RMA_0528	RMA_0529			TRUE	0.691	-36.000	0.000	NA		NA
7232015	7232016	RMA_0530	RMA_0531			TRUE	0.930	-34.000	0.286	NA		NA
7232018	7232019	RMA_0533	RMA_0534			TRUE	0.656	51.000	0.000	NA		NA
7232019	7232020	RMA_0534	RMA_0535			FALSE	0.359	-79.000	0.000	NA		NA
7232020	7232021	RMA_0535	RMA_0536		mdh	FALSE	0.090	344.000	0.000	NA		NA
7232025	7232026	RMA_0540	RMA_0541	tlc2	pyrG	FALSE	0.396	209.000	0.000	1.000	N	NA
7232026	7232027	RMA_0541	RMA_0542	pyrG	kdsB	TRUE	0.940	-3.000	0.019	1.000	N	NA
7232028	7232029	RMA_RNA12	RMA_RNA13			TRUE	0.833	16.000	0.000	NA		NA
7232031	7232032	RMA_0544	RMA_0545		folE	TRUE	0.966	-7.000	0.092	1.000		NA
7232032	7232033	RMA_0545	RMA_0546	folE	proS	TRUE	0.681	133.000	0.008	0.051	N	NA
7232033	7232034	RMA_0546	RMA_0547	proS		FALSE	0.421	205.000	0.000	1.000		NA
7232034	7232035	RMA_0547	RMA_0548			TRUE	0.753	59.000	0.034	NA		NA
7232035	7232036	RMA_0548	RMA_0549		ruvA	TRUE	0.820	-19.000	0.007	NA		NA
7232036	7232037	RMA_0549	RMA_0550	ruvA	ruvB	FALSE	0.167	1171.000	0.549	0.004	Y	NA
7232037	7232038	RMA_0550	RMA_0551	ruvB	msbA1	FALSE	0.491	-52.000	0.007	1.000	N	NA
7232038	7232039	RMA_0551	RMA_0552	msbA1	ampG4	FALSE	0.593	173.000	0.010	NA		NA
7232039	7232040	RMA_0552	RMA_0553	ampG4	dacF	TRUE	0.960	159.000	0.625	NA		NA
7232041	7232042	RMA_0554	RMA_0555	rlpA	osmY	TRUE	0.745	-40.000	0.029	NA		NA
7232042	7232043	RMA_0555	RMA_0556	osmY	ispZ	FALSE	0.464	202.000	0.014	NA		NA
7232043	7232044	RMA_0556	RMA_0557	ispZ		TRUE	0.836	25.000	0.027	1.000	N	NA
7232044	7232045	RMA_0557	RMA_0558			TRUE	0.993	1.000	0.629	NA		NA
7232045	7232046	RMA_0558	RMA_0559			TRUE	0.719	146.000	0.000	NA		NA
7232047	7232048	RMA_0560	RMA_0561		tlpA	TRUE	0.606	190.000	0.026	1.000	N	NA
7232048	7232049	RMA_0561	RMA_0562	tlpA	sppA1	TRUE	0.896	150.000	0.042	1.000	Y	NA
7232049	7232050	RMA_0562	RMA_0563	sppA1	dut	TRUE	0.914	2.000	0.008	1.000	N	NA
7232050	7232051	RMA_0563	RMA_0564	dut	mltE1	FALSE	0.336	211.000	0.006	1.000	N	NA
7232051	7232052	RMA_0564	RMA_0565	mltE1		TRUE	0.750	71.000	0.041	NA		NA
7232052	7232053	RMA_0565	RMA_0566		mccF	TRUE	0.887	204.000	0.571	NA		NA
7232056	7232057	RMA_0569	RMA_0570		coxA	FALSE	0.400	207.000	0.012	1.000		NA
7232057	7232058	RMA_0570	RMA_0571	coxA		TRUE	0.874	-15.000	0.000	NA		NA
7232058	7232059	RMA_0571	RMA_0572		coxB	FALSE	0.072	365.000	0.000	NA		NA
7232059	7232060	RMA_0572	RMA_0573	coxB		TRUE	0.815	19.000	0.000	NA		NA
7232061	7232062	RMA_0574	RMA_0575	nlpD2	lspA	TRUE	0.749	-55.000	0.031	0.028	Y	NA
7232062	7232063	RMA_0575	RMA_0576	lspA		TRUE	0.814	103.000	0.054	NA		NA
7232063	7232064	RMA_0576	RMA_0577		murD	FALSE	0.576	172.000	0.006	NA		NA
7232064	7232065	RMA_0577	RMA_0578	murD	ftsW	TRUE	0.933	118.000	0.297	0.009	N	NA
7232065	7232066	RMA_0578	RMA_0579	ftsW	murG	TRUE	0.993	-3.000	0.647	1.000	N	NA
7232066	7232067	RMA_0579	RMA_0580	murG		FALSE	0.055	399.000	0.000	NA		NA
7232067	7232068	RMA_0580	RMA_0581			FALSE	0.054	405.000	0.000	NA		NA
7232069	7232070	RMA_0582	RMA_0583			FALSE	0.367	212.000	0.000	NA		NA
7232070	7232071	RMA_0583	RMA_0584			TRUE	0.886	10.000	0.000	NA		NA
7232071	7232072	RMA_0584	RMA_0585			TRUE	0.867	12.000	0.000	NA		NA
7232072	7232073	RMA_0585	RMA_0586			FALSE	0.057	396.000	0.000	NA		NA
7232073	7232074	RMA_0586	RMA_0587			FALSE	0.535	-52.000	0.000	NA		NA
7232074	7232075	RMA_0587	RMA_0588			FALSE	0.432	-61.000	0.000	NA		NA
7232075	7232076	RMA_0588	RMA_0589			TRUE	0.924	3.000	0.000	NA		NA
7232076	7232077	RMA_0589	RMA_0590			FALSE	0.035	485.000	0.000	NA		NA
7232077	7232078	RMA_0590	RMA_0591			TRUE	0.857	13.000	0.000	NA		NA
7232078	7232079	RMA_0591	RMA_0592			FALSE	0.316	223.000	0.000	NA		NA
7232079	7232080	RMA_0592	RMA_0593			TRUE	0.974	-9.000	0.182	NA		NA
7232080	7232081	RMA_0593	RMA_0594			TRUE	0.769	-27.000	0.000	NA		NA
7232081	7232082	RMA_0594	RMA_0595			TRUE	0.857	13.000	0.000	NA		NA
7232083	7232084	RMA_0596	RMA_0597	dapF		TRUE	0.921	-25.000	0.109	1.000	N	NA
7232084	7232085	RMA_0597	RMA_0598		pheS	TRUE	0.764	82.000	0.007	1.000	Y	NA
7232085	7232086	RMA_0598	RMA_0599	pheS	pheT	TRUE	0.995	-3.000	0.574	0.002	Y	NA
7232086	7232087	RMA_0599	RMA_0600	pheT	dnaN	TRUE	0.918	5.000	0.015	1.000	N	NA
7232087	7232088	RMA_0600	RMA_0601	dnaN		FALSE	0.056	367.000	0.002	NA		NA
7232088	7232089	RMA_0601	RMA_0602		leuS	TRUE	0.842	129.000	0.051	NA		NA
7232090	7232091	RMA_0603	RMA_0604	rnd2		TRUE	0.736	151.000	0.015	1.000		NA
7232091	7232092	RMA_0604	RMA_0605		cdsA	TRUE	0.772	-25.000	0.011	1.000	N	NA
7232092	7232093	RMA_0605	RMA_0606	cdsA	uppS	TRUE	0.956	-40.000	0.400	1.000	Y	NA
7232093	7232094	RMA_0606	RMA_0607	uppS	envZ	TRUE	0.679	146.000	0.006	1.000	N	NA
7232094	7232095	RMA_0607	RMA_0608	envZ	ompR	TRUE	0.985	-25.000	0.592	1.000	Y	NA
7232096	7232097	RMA_0609	RMA_0610	ilvE	dapA	TRUE	0.904	168.000	0.087	1.000	Y	NA
7232097	7232098	RMA_0610	RMA_0611	dapA	smpB	TRUE	0.818	-21.000	0.008	1.000	N	NA
7232098	7232099	RMA_0611	RMA_0612	smpB	dsbA	TRUE	0.796	109.000	0.007	1.000	Y	NA
7232100	7232101	RMA_0613	RMA_0614	sucD	sucC	TRUE	0.924	178.000	0.256	0.002	Y	NA
7232101	7232102	RMA_0614	RMA_0615	sucC		TRUE	0.648	54.000	0.000	NA		NA
7232102	7232103	RMA_0615	RMA_0616			TRUE	0.676	-37.000	0.000	NA		NA
7232103	7232104	RMA_0616	RMA_0617			TRUE	0.605	-43.000	0.000	NA		NA
7232104	7232105	RMA_0617	RMA_0618			FALSE	0.017	775.000	0.000	NA		NA
7232105	7232106	RMA_0618	RMA_0619			TRUE	0.701	88.000	0.018	1.000		NA
7232106	7232107	RMA_0619	RMA_0620		rbfA	FALSE	0.012	1327.000	0.000	1.000		NA
7232107	7232108	RMA_0620	RMA_0621	rbfA		TRUE	0.903	4.000	0.007	NA		NA
7232109	7232110	RMA_0622	RMA_0623		recR	TRUE	0.677	139.000	0.006	NA		NA
7232111	7232112	RMA_0624	RMA_0625			FALSE	0.013	1039.000	0.000	NA		NA
7232112	7232113	RMA_0625	RMA_0626		ppnK	TRUE	0.635	61.000	0.000	NA		NA
7232114	7232115	RMA_0627	RMA_0628		gpsA	FALSE	0.304	249.000	0.029	1.000		NA
7232115	7232116	RMA_0628	RMA_0629	gpsA		FALSE	0.017	772.000	0.000	1.000		NA
7232116	7232117	RMA_0629	RMA_0630			TRUE	0.847	58.000	0.096	NA		NA
7232117	7232118	RMA_0630	RMA_0631		trxB1	FALSE	0.438	193.000	0.007	NA		NA
7232118	7232119	RMA_0631	RMA_0632	trxB1		FALSE	0.269	231.000	0.000	NA		NA
7232119	7232120	RMA_0632	RMA_0633		gabD	TRUE	0.675	162.000	0.000	NA		NA
7232120	7232121	RMA_0633	RMA_0634	gabD		TRUE	0.800	158.000	0.040	NA		NA
7232121	7232122	RMA_0634	RMA_0635		lgtD	TRUE	0.976	-7.000	0.182	NA		NA
7232122	7232123	RMA_0635	RMA_0636	lgtD	uvrD	FALSE	0.525	185.000	0.012	NA	N	NA
7232123	7232124	RMA_0636	RMA_0637	uvrD		FALSE	0.011	1463.000	0.000	NA		NA
7232126	7232127	RMA_0639	RMA_0640	lon1		FALSE	0.045	437.000	0.000	NA		NA
7232127	7232128	RMA_0640	RMA_0641			TRUE	0.627	73.000	0.000	NA		NA
7232129	7232130	RMA_0642	RMA_RNA14			FALSE	0.537	184.000	0.000	NA		NA
7232131	7232132	RMA_0643	RMA_0644	yhbH		TRUE	0.929	0.000	0.000	NA		NA
7232132	7232133	RMA_0644	RMA_0645			TRUE	0.801	-24.000	0.000	NA		NA
7232134	7232135	RMA_0646	RMA_0647	folD	trxB2	TRUE	0.800	147.000	0.026	1.000	N	NA
7232136	7232137	RMA_0648	RMA_0649	famC		FALSE	0.080	355.000	0.000	NA		NA
7232137	7232138	RMA_0649	RMA_0650			TRUE	0.626	67.000	0.000	NA		NA
7232138	7232139	RMA_0650	RMA_0651			FALSE	0.017	788.000	0.000	NA		NA
7232139	7232140	RMA_0651	RMA_0652			FALSE	0.014	961.000	0.000	NA		NA
7232140	7232141	RMA_0652	RMA_0653		nrdA	FALSE	0.084	349.000	0.000	NA		NA
7232141	7232142	RMA_0653	RMA_0654	nrdA		TRUE	0.896	8.000	0.000	NA		NA
7232142	7232143	RMA_0654	RMA_0655			TRUE	0.826	-22.000	0.000	NA		NA
7232143	7232144	RMA_0655	RMA_0656			FALSE	0.492	-55.000	0.000	NA		NA
7232144	7232145	RMA_0656	RMA_0657		nrdF	FALSE	0.206	250.000	0.000	NA		NA
7232145	7232146	RMA_0657	RMA_0658	nrdF		TRUE	0.852	117.000	0.065	NA		NA
7232146	7232147	RMA_0658	RMA_0659			FALSE	0.059	392.000	0.000	NA		NA
7232147	7232148	RMA_0659	RMA_0660			TRUE	0.803	21.000	0.000	NA		NA
7232148	7232149	RMA_0660	RMA_0661			FALSE	0.056	398.000	0.000	NA		NA
7232149	7232150	RMA_0661	RMA_0662			TRUE	0.624	69.000	0.000	NA		NA
7232151	7232152	RMA_0663	RMA_0664	miaA	exoC	FALSE	0.023	551.000	0.007	1.000	N	NA
7232152	7232153	RMA_0664	RMA_0665	exoC	abcT2	FALSE	0.599	171.000	0.009	1.000		NA
7232153	7232154	RMA_0665	RMA_0666	abcT2		TRUE	0.934	175.000	0.543	NA		NA
7232154	7232155	RMA_0666	RMA_0667			TRUE	0.914	-31.000	0.144	NA		NA
7232155	7232156	RMA_0667	RMA_0668		kpsF	TRUE	0.970	6.000	0.115	NA		NA
7232156	7232157	RMA_0668	RMA_0669	kpsF	pnp	FALSE	0.440	192.000	0.006	1.000	N	NA
7232157	7232158	RMA_0669	RMA_0670	pnp	rpsO	TRUE	0.967	139.000	0.335	1.000	Y	NA
7232158	7232159	RMA_0670	RMA_0671	rpsO	truB	TRUE	0.990	3.000	0.211	1.000	Y	NA
7232160	7232161	RMA_0672	RMA_0673	tlc4	sca4	FALSE	0.135	292.000	0.000	NA		NA
7232165	7232166	RMA_0677	RMA_0678		def2	FALSE	0.152	256.000	0.004	NA		NA
7232166	7232167	RMA_0678	RMA_0679	def2		FALSE	0.422	205.000	0.000	NA		NA
7232167	7232168	RMA_0679	RMA_0680			TRUE	0.680	108.000	0.000	NA		NA
7232169	7232170	RMA_0681	RMA_0682	addA		FALSE	0.311	224.000	0.000	NA		NA
7232170	7232171	RMA_0682	RMA_0683		ppdK	FALSE	0.227	247.000	0.000	NA		NA
7232172	7232173	RMA_RNA15	RMA_0684	rnpB		TRUE	0.714	119.000	0.000	NA		NA
7232175	7232176	RMA_0686	RMA_0687	bioY2	folC	FALSE	0.536	177.000	0.004	NA		NA
7232176	7232177	RMA_0687	RMA_0688	folC	sodB	TRUE	0.726	144.000	0.013	1.000	N	NA
7232177	7232178	RMA_0688	RMA_0689	sodB	rssA	TRUE	0.890	5.000	0.004	1.000		NA
7232178	7232179	RMA_0689	RMA_0690	rssA	birA	TRUE	0.765	109.000	0.024	1.000		NA
7232179	7232180	RMA_0690	RMA_0691	birA		FALSE	0.015	877.000	0.000	NA		NA
7232180	7232181	RMA_0691	RMA_0692			TRUE	0.707	155.000	0.000	NA		NA
7232181	7232182	RMA_0692	RMA_0693			FALSE	0.028	542.000	0.000	NA		NA
7232182	7232183	RMA_0693	RMA_0694			FALSE	0.094	343.000	0.000	NA		NA
7232183	7232184	RMA_0694	RMA_0695			TRUE	0.640	80.000	0.000	NA		NA
7232184	7232185	RMA_0695	RMA_0696			FALSE	0.020	674.000	0.000	NA		NA
7232185	7232186	RMA_0696	RMA_0697			TRUE	0.645	57.000	0.000	NA		NA
7232186	7232187	RMA_0697	RMA_0698			TRUE	0.718	122.000	0.000	NA		NA
7232187	7232188	RMA_0698	RMA_0699			TRUE	0.902	7.000	0.000	NA		NA
7232188	7232189	RMA_0699	RMA_0700			TRUE	0.970	-13.000	0.194	NA		NA
7232189	7232190	RMA_0700	RMA_0701		infC	TRUE	0.629	43.000	0.007	NA		NA
7232190	7232191	RMA_0701	RMA_0702	infC	pdhC	TRUE	0.674	146.000	0.005	1.000	N	NA
7232191	7232192	RMA_0702	RMA_0703	pdhC	prfA	TRUE	0.672	133.000	0.005	1.000	N	NA
7232192	7232193	RMA_0703	RMA_0704	prfA	recJ	FALSE	0.439	-55.000	0.005	1.000	N	NA
7232193	7232194	RMA_0704	RMA_0705	recJ		TRUE	0.616	46.000	0.005	1.000	N	NA
7232194	7232195	RMA_0705	RMA_0706		rho	FALSE	0.101	341.000	0.000	1.000	N	NA
7232195	7232196	RMA_0706	RMA_0707	rho	sppA2	TRUE	0.674	126.000	0.005	1.000	N	NA
7232196	7232197	RMA_0707	RMA_0708	sppA2	himD	TRUE	0.980	0.000	0.142	1.000	N	NA
7232197	7232198	RMA_0708	RMA_0709	himD		FALSE	0.014	936.000	0.000	NA		NA
7232198	7232199	RMA_0709	RMA_0710			TRUE	0.822	18.000	0.000	NA		NA
7232199	7232200	RMA_0710	RMA_0711			FALSE	0.076	358.000	0.000	NA		NA
7232200	7232201	RMA_0711	RMA_0712			TRUE	0.826	17.000	0.000	NA		NA
7232201	7232202	RMA_0712	RMA_0713			FALSE	0.011	1585.000	0.000	NA		NA
7232202	7232203	RMA_0713	RMA_0714			FALSE	0.348	216.000	0.000	NA		NA
7232203	7232204	RMA_0714	RMA_0715			TRUE	0.923	-3.000	0.000	NA		NA
7232204	7232205	RMA_0715	RMA_0716			FALSE	0.040	457.000	0.000	NA		NA
7232205	7232206	RMA_0716	RMA_0717		traE	TRUE	0.994	0.000	0.667	NA		NA
7232206	7232207	RMA_0717	RMA_0718	traE		TRUE	0.996	-3.000	1.000	NA		NA
7232207	7232208	RMA_0718	RMA_0719			TRUE	0.939	-61.000	1.000	NA		NA
7232208	7232209	RMA_0719	RMA_0720		traB	TRUE	0.985	25.000	1.000	NA		NA
7232209	7232210	RMA_0720	RMA_0721	traB	traV	TRUE	0.978	0.000	0.125	NA		NA
7232210	7232211	RMA_0721	RMA_0722	traV		TRUE	0.978	0.000	0.125	NA		NA
7232211	7232212	RMA_0722	RMA_0723			TRUE	0.651	88.000	0.000	NA		NA
7232212	7232213	RMA_0723	RMA_0724			TRUE	0.689	110.000	0.000	NA		NA
7232213	7232214	RMA_0724	RMA_0725			TRUE	0.703	-34.000	0.000	NA		NA
7232214	7232215	RMA_0725	RMA_0726		traU	FALSE	0.164	266.000	0.000	NA		NA
7232215	7232216	RMA_0726	RMA_0727	traU	trbC	TRUE	0.990	-15.000	0.800	NA		NA
7232216	7232217	RMA_0727	RMA_0728	trbC	traN	TRUE	0.970	-30.000	0.600	NA		NA
7232217	7232218	RMA_0728	RMA_0729	traN	traF	TRUE	0.703	-34.000	0.000	NA		NA
7232218	7232219	RMA_0729	RMA_0730	traF	traH	TRUE	0.839	15.000	0.000	NA		NA
7232219	7232220	RMA_0730	RMA_0731	traH	traG	TRUE	0.639	79.000	0.000	NA		NA
7232220	7232221	RMA_0731	RMA_0732	traG		TRUE	0.826	-22.000	0.000	NA		NA
7232221	7232222	RMA_0732	RMA_0733		traD_F	TRUE	0.990	-10.000	0.333	NA	Y	NA
7232223	7232224	RMA_0734	RMA_0735		traA_Ti	TRUE	0.919	44.000	0.286	NA		NA
7232225	7232226	RMA_0736	RMA_0737			FALSE	0.520	186.000	0.000	NA		NA
7232226	7232227	RMA_0737	RMA_0738			FALSE	0.587	-46.000	0.000	NA		NA
7232228	7232229	RMA_0739	RMA_0740			TRUE	0.895	-10.000	0.000	NA		NA
7232229	7232230	RMA_0740	RMA_0741			TRUE	0.915	-4.000	0.000	NA		NA
7232230	7232231	RMA_0741	RMA_0742			TRUE	0.629	65.000	0.000	NA		NA
7232231	7232232	RMA_0742	RMA_0743			TRUE	0.635	61.000	0.000	NA		NA
7232233	7232234	RMA_0744	RMA_0745			TRUE	0.678	40.000	0.000	NA		NA
7232234	7232235	RMA_0745	RMA_0746			TRUE	0.697	-34.000	0.000	0.059		NA
7232242	7232243	RMA_0753	RMA_0754	spoT6		TRUE	0.673	159.000	0.011	NA		NA
7232245	7232246	RMA_0756	RMA_RNA16			TRUE	0.718	140.000	0.000	NA		NA
7232247	7232248	RMA_0757	RMA_0758		cmk	TRUE	0.657	94.000	0.000	1.000		NA
7232248	7232249	RMA_0758	RMA_0759	cmk	rpsA	TRUE	0.933	148.000	0.281	1.000	N	NA
7232249	7232250	RMA_0759	RMA_0760	rpsA	clpP	TRUE	0.665	112.000	0.009	1.000	N	NA
7232250	7232251	RMA_0760	RMA_RNA17	clpP		TRUE	0.667	163.000	0.000	NA		NA
7232251	7232252	RMA_RNA17	RMA_0761			FALSE	0.182	259.000	0.000	NA		NA
7232252	7232253	RMA_0761	RMA_0762			FALSE	0.515	-54.000	0.000	NA		NA
7232255	7232256	RMA_0764	RMA_0765			FALSE	0.340	-91.000	0.000	NA		NA
7232256	7232257	RMA_0765	RMA_0766		fni	FALSE	0.030	510.000	0.000	NA		NA
7232258	7232259	RMA_0767	RMA_0768			TRUE	0.715	33.000	0.000	NA		NA
7232259	7232260	RMA_0768	RMA_0769			TRUE	0.720	-33.000	0.000	NA		NA
7232260	7232261	RMA_0769	RMA_0770			TRUE	0.640	59.000	0.000	NA		NA
7232261	7232262	RMA_0770	RMA_0771			TRUE	0.674	42.000	0.000	NA		NA
7232262	7232263	RMA_0771	RMA_0772			TRUE	0.717	121.000	0.000	NA		NA
7232265	7232266	RMA_RNA18	RMA_0774		glmU	FALSE	0.217	248.000	0.000	NA		NA
7232266	7232267	RMA_0774	RMA_0775	glmU		TRUE	0.910	-3.000	0.008	NA		NA
7232267	7232268	RMA_0775	RMA_0776		rpmJ	TRUE	0.747	46.000	0.024	NA		NA
7232269	7232270	RMA_0777	RMA_0778			TRUE	0.678	40.000	0.000	NA		NA
7232270	7232271	RMA_0778	RMA_0779		mltE2	TRUE	0.664	102.000	0.000	NA		NA
7232271	7232272	RMA_0779	RMA_0780	mltE2		TRUE	0.960	-16.000	0.146	NA		NA
7232272	7232273	RMA_0780	RMA_0781			FALSE	0.115	317.000	0.000	NA		NA
7232273	7232274	RMA_0781	RMA_0782			FALSE	0.049	419.000	0.000	NA		NA
7232274	7232275	RMA_0782	RMA_0783			TRUE	0.713	152.000	0.000	NA		NA
7232275	7232276	RMA_0783	RMA_0784			TRUE	0.647	55.000	0.000	NA		NA
7232276	7232277	RMA_0784	RMA_0785			FALSE	0.031	499.000	0.000	NA		NA
7232277	7232278	RMA_0785	RMA_0786		lpdA2	TRUE	0.690	156.000	0.012	1.000		NA
7232278	7232279	RMA_0786	RMA_0787	lpdA2		FALSE	0.182	248.000	0.004	1.000	N	NA
7232280	7232281	RMA_0788	RMA_0789	rnd		TRUE	0.935	1.000	0.015	NA		NA
7232282	7232283	RMA_0790	RMA_0791			FALSE	0.022	630.000	0.000	NA		NA
7232283	7232284	RMA_0791	RMA_0792			FALSE	0.051	415.000	0.000	NA		NA
7232284	7232285	RMA_0792	RMA_0793			FALSE	0.469	-57.000	0.000	NA		NA
7232285	7232286	RMA_0793	RMA_0794			TRUE	0.720	-33.000	0.000	NA		NA
7232286	7232287	RMA_0794	RMA_0795			TRUE	0.792	22.000	0.000	NA		NA
7232287	7232288	RMA_0795	RMA_0796			TRUE	0.777	23.000	0.000	NA		NA
7232288	7232289	RMA_0796	RMA_0797			TRUE	0.876	11.000	0.000	NA		NA
7232289	7232290	RMA_0797	RMA_0798		mccF2	TRUE	0.865	-16.000	0.000	NA		NA
7232290	7232291	RMA_0798	RMA_0799	mccF2	hemC	TRUE	0.905	-3.000	0.003	NA	N	NA
7232291	7232292	RMA_0799	RMA_0800	hemC		FALSE	0.243	240.000	0.000	NA		NA
7232292	7232293	RMA_0800	RMA_0801			TRUE	0.910	5.000	0.000	NA		NA
7232293	7232294	RMA_0801	RMA_0802			FALSE	0.100	341.000	0.000	NA		NA
7232295	7232296	RMA_RNA19	RMA_0803		trpS	TRUE	0.638	60.000	0.000	NA		NA
7232297	7232298	RMA_0804	RMA_0805	plsC		TRUE	0.849	53.000	0.092	NA	N	NA
7232298	7232299	RMA_0805	RMA_0806			FALSE	0.027	559.000	0.000	NA		NA
7232300	7232301	RMA_0807	RMA_0808			TRUE	0.725	31.000	0.000	NA		NA
7232301	7232302	RMA_0808	RMA_0809			TRUE	0.882	-13.000	0.000	NA		NA
7232302	7232303	RMA_0809	RMA_0810			TRUE	0.900	-22.000	0.045	NA		NA
7232303	7232304	RMA_0810	RMA_0811		lysE	FALSE	0.467	-73.000	0.026	1.000		NA
7232304	7232305	RMA_0811	RMA_0812	lysE	ampG1	FALSE	0.052	408.000	0.000	NA		NA
7232306	7232307	RMA_0813	RMA_0814			TRUE	0.697	112.000	0.000	NA		NA
7232307	7232308	RMA_0814	RMA_0815			FALSE	0.492	-55.000	0.000	NA		NA
7232308	7232309	RMA_0815	RMA_0816		tlc3	TRUE	0.656	51.000	0.000	NA		NA
7232309	7232310	RMA_0816	RMA_0817	tlc3		TRUE	0.983	20.000	0.778	NA		NA
7232310	7232311	RMA_0817	RMA_0818		ispB	TRUE	0.908	7.000	0.014	NA		NA
7232311	7232312	RMA_0818	RMA_RNA20	ispB		TRUE	0.777	23.000	0.000	NA		NA
7232313	7232314	RMA_RNA21	RMA_0819		pepP	TRUE	0.671	43.000	0.000	NA		NA
7232314	7232315	RMA_0819	RMA_0820	pepP	potE	TRUE	0.927	103.000	0.136	1.000	Y	NA
7232315	7232316	RMA_0820	RMA_0821	potE	iscA2	FALSE	0.013	1117.000	0.013	NA		NA
7232316	7232317	RMA_0821	RMA_0822	iscA2	iscU	TRUE	0.962	4.000	0.056	NA		NA
7232317	7232318	RMA_0822	RMA_0823	iscU	iscS	TRUE	0.952	146.000	0.448	1.000	N	NA
7232318	7232319	RMA_0823	RMA_0824	iscS	spl1	TRUE	0.885	103.000	0.052	0.002	Y	NA
7232319	7232320	RMA_0824	RMA_0825	spl1	iscR	TRUE	0.979	-3.000	0.168	1.000	N	NA
7232320	7232321	RMA_0825	RMA_0826	iscR		FALSE	0.041	453.000	0.000	NA		NA
7232321	7232322	RMA_0826	RMA_0827			TRUE	0.626	67.000	0.000	NA		NA
7232322	7232323	RMA_0827	RMA_0828			TRUE	0.725	31.000	0.000	NA		NA
7232323	7232324	RMA_0828	RMA_0829			TRUE	0.718	137.000	0.000	NA		NA
7232324	7232325	RMA_0829	RMA_0830			FALSE	0.012	1323.000	0.000	NA		NA
7232325	7232326	RMA_0830	RMA_0831			TRUE	0.715	151.000	0.000	NA		NA
7232326	7232327	RMA_0831	RMA_0832			FALSE	0.019	705.000	0.000	NA		NA
7232327	7232328	RMA_0832	RMA_0833			FALSE	0.012	1222.000	0.000	NA		NA
7232330	7232331	RMA_0835	RMA_0836		hemB	TRUE	0.701	95.000	0.017	NA		NA
7232334	7232335	RMA_0839	RMA_0840	ubiX	dnaB	FALSE	0.063	379.000	0.000	1.000	N	NA
7232336	7232337	RMA_0841	RMA_0842			TRUE	0.910	5.000	0.000	NA		NA
7232337	7232338	RMA_0842	RMA_0843			TRUE	0.701	114.000	0.000	NA		NA
7232338	7232339	RMA_0843	RMA_0844			FALSE	0.596	-45.000	0.000	NA		NA
7232340	7232341	RMA_0845	RMA_0846	rluA2		TRUE	0.866	22.000	0.034	NA		NA
7232341	7232342	RMA_0846	RMA_0847			TRUE	0.927	5.000	0.017	NA		NA
7232342	7232343	RMA_0847	RMA_0848		radA	TRUE	0.723	-28.000	0.005	1.000	N	NA
7232343	7232344	RMA_0848	RMA_0849	radA		TRUE	0.908	-3.000	0.007	NA		NA
7232344	7232345	RMA_0849	RMA_0850		recO	FALSE	0.603	58.000	0.008	NA		NA
7232345	7232346	RMA_0850	RMA_0851	recO		FALSE	0.048	420.000	0.000	1.000	N	NA
7232347	7232348	RMA_0852	RMA_0853		infB	FALSE	0.064	374.000	0.000	NA		NA
7232348	7232349	RMA_0853	RMA_0854	infB	nusA	TRUE	0.693	239.000	0.342	1.000	N	NA
7232349	7232350	RMA_0854	RMA_0855	nusA		TRUE	0.990	11.000	0.759	NA		NA
7232350	7232351	RMA_0855	RMA_0856			FALSE	0.090	344.000	0.000	NA		NA
7232352	7232353	RMA_0857	RMA_0858			TRUE	0.691	-36.000	0.000	NA		NA
7232354	7232355	RMA_0859	RMA_0860	tlyA	tyrS	TRUE	0.818	141.000	0.008	0.026	Y	NA
7232355	7232356	RMA_0860	RMA_0861	tyrS		TRUE	0.899	4.000	0.004	NA		NA
7232356	7232357	RMA_0861	RMA_0862			TRUE	0.989	3.000	0.400	NA		NA
7232357	7232358	RMA_0862	RMA_0863			FALSE	0.471	195.000	0.000	NA		NA
7232360	7232361	RMA_0865	RMA_0866			TRUE	0.642	-40.000	0.000	NA		NA
7232361	7232362	RMA_0866	RMA_0867			TRUE	0.625	68.000	0.000	NA		NA
7232364	7232365	RMA_0868	RMA_0869			FALSE	0.460	198.000	0.000	NA		NA
7232365	7232366	RMA_0869	RMA_0870			TRUE	0.629	65.000	0.000	NA		NA
7232366	7232367	RMA_0870	RMA_0871			FALSE	0.399	208.000	0.000	NA		NA
7232367	7232368	RMA_0871	RMA_0872			TRUE	0.717	121.000	0.000	NA		NA
7232368	7232369	RMA_0872	RMA_0873			FALSE	0.033	487.000	0.000	NA		NA
7232369	7232370	RMA_0873	RMA_0874			TRUE	0.741	-31.000	0.000	NA		NA
7232370	7232371	RMA_0874	RMA_0875			FALSE	0.012	1234.000	0.000	NA		NA
7232373	7232374	RMA_0877	RMA_0878			TRUE	0.719	142.000	0.000	NA		NA
7232374	7232375	RMA_0878	RMA_0879			FALSE	0.348	-85.000	0.000	NA		NA
7232375	7232376	RMA_0879	RMA_0880			TRUE	0.697	36.000	0.000	NA		NA
7232376	7232377	RMA_0880	RMA_0881			FALSE	0.416	-63.000	0.000	NA		NA
7232377	7232378	RMA_0881	RMA_0882		comF2	TRUE	0.701	156.000	0.000	NA		NA
7232378	7232379	RMA_0882	RMA_0883	comF2		TRUE	0.636	77.000	0.000	NA		NA
7232379	7232380	RMA_0883	RMA_0884			TRUE	0.662	47.000	0.000	NA		NA
7232380	7232381	RMA_0884	RMA_0885			TRUE	0.826	-22.000	0.000	NA		NA
7232381	7232382	RMA_0885	RMA_0886		ubiH	FALSE	0.033	487.000	0.000	NA		NA
7232382	7232383	RMA_0886	RMA_0887	ubiH		TRUE	0.878	-28.000	0.057	1.000	N	NA
7232384	7232385	RMA_0888	RMA_0889	ntrX		TRUE	0.741	-31.000	0.000	NA		NA
7232386	7232387	RMA_0890	RMA_0891		pbpA1	FALSE	0.022	632.000	0.000	NA		NA
7232387	7232388	RMA_0891	RMA_0892	pbpA1		TRUE	0.914	-25.000	0.091	NA		NA
7232388	7232389	RMA_0892	RMA_0893		pbpA2	FALSE	0.023	619.000	0.000	NA		NA
7232389	7232390	RMA_0893	RMA_0894	pbpA2	ftsL	FALSE	0.195	344.000	0.065	NA		NA
7232390	7232391	RMA_0894	RMA_0895	ftsL	mraW	TRUE	0.970	4.000	0.089	NA		NA
7232391	7232392	RMA_0895	RMA_0896	mraW	mraZ	TRUE	0.993	0.000	0.635	NA		NA
7232393	7232394	RMA_0897	RMA_0898			FALSE	0.416	-63.000	0.000	NA		NA
7232394	7232395	RMA_0898	RMA_0899		panF	FALSE	0.044	438.000	0.000	NA		NA
7232395	7232396	RMA_0899	RMA_0900	panF		TRUE	0.632	62.000	0.000	NA		NA
7232397	7232398	RMA_0901	RMA_0902	uvrC		FALSE	0.600	168.000	0.006	NA		NA
7232398	7232399	RMA_0902	RMA_0903			TRUE	0.682	186.000	0.048	NA		NA
7232399	7232400	RMA_0903	RMA_0904			FALSE	0.322	-109.000	0.000	NA		NA
7232400	7232401	RMA_0904	RMA_0905			FALSE	0.013	1031.000	0.000	NA		NA
7232401	7232402	RMA_0905	RMA_0906			FALSE	0.047	428.000	0.000	NA		NA
7232402	7232403	RMA_0906	RMA_0907			TRUE	0.826	-22.000	0.000	NA		NA
7232403	7232404	RMA_0907	RMA_RNA23			FALSE	0.014	961.000	0.000	NA		NA
7232404	7232405	RMA_RNA23	RMA_0908			TRUE	0.692	37.000	0.000	NA		NA
7232405	7232406	RMA_0908	RMA_0909			FALSE	0.110	321.000	0.000	NA		NA
7232406	7232407	RMA_0909	RMA_0910			FALSE	0.037	475.000	0.000	NA		NA
7232407	7232408	RMA_0910	RMA_0911			TRUE	0.740	28.000	0.000	NA		NA
7232408	7232409	RMA_0911	RMA_0912		secA	TRUE	0.928	1.000	0.000	NA		NA
7232411	7232412	RMA_0914	RMA_0915	acpS	rpoZ	TRUE	0.919	1.000	0.009	1.000	N	NA
7232412	7232413	RMA_0915	RMA_0916	rpoZ	murA	FALSE	0.588	66.000	0.008	1.000	N	NA
7232413	7232414	RMA_0916	RMA_0917	murA	gyrB	TRUE	0.634	160.000	0.004	1.000	N	NA
7232415	7232416	RMA_0918	RMA_RNA24			TRUE	0.707	155.000	0.000	NA		NA
7232416	7232417	RMA_RNA24	RMA_0919		mgtE	FALSE	0.164	266.000	0.000	NA		NA
7232417	7232418	RMA_0919	RMA_0920	mgtE		FALSE	0.016	846.000	0.000	NA		NA
7232419	7232420	RMA_0921	RMA_0922	proP9		FALSE	0.286	227.000	0.000	NA		NA
7232420	7232421	RMA_0922	RMA_0923			TRUE	0.619	-42.000	0.000	NA		NA
7232424	7232425	RMA_0925	RMA_0926	yajC	secD	TRUE	0.923	-16.000	0.009	NA	Y	NA
7232425	7232426	RMA_0926	RMA_0927	secD		TRUE	0.688	226.000	0.263	1.000		NA
7232426	7232427	RMA_0927	RMA_0928			TRUE	0.979	-7.000	0.250	NA		NA
7232427	7232428	RMA_0928	RMA_0929		ccmE	TRUE	0.629	-37.000	0.005	NA		NA
7232428	7232429	RMA_0929	RMA_0930	ccmE	ppa	TRUE	0.718	118.000	0.013	1.000	N	NA
7232429	7232430	RMA_0930	RMA_0931	ppa	mviN	FALSE	0.388	204.000	0.006	1.000		NA
7232430	7232431	RMA_0931	RMA_0932	mviN	traX	TRUE	0.821	-22.000	0.012	NA		NA
7232431	7232432	RMA_0932	RMA_0933	traX		TRUE	0.950	38.000	0.500	NA		NA
7232433	7232434	RMA_0934	RMA_0935	recG		FALSE	0.017	772.000	0.000	NA		NA
7232434	7232435	RMA_0935	RMA_0936			TRUE	0.710	118.000	0.000	NA		NA
7232436	7232437	RMA_0937	RMA_0938	scoA	scoB	TRUE	0.915	57.000	0.125	0.002	Y	NA
7232437	7232438	RMA_0938	RMA_0939	scoB		TRUE	0.665	46.000	0.000	NA		NA
7232438	7232439	RMA_0939	RMA_0940			TRUE	0.691	-36.000	0.000	NA		NA
7232440	7232441	RMA_0941	RMA_0942	rickA	mraY	TRUE	0.644	112.000	0.003	NA		NA
7232441	7232442	RMA_0942	RMA_0943	mraY	murF	TRUE	0.811	179.000	0.037	0.008	Y	NA
7232442	7232443	RMA_0943	RMA_0944	murF	murE	TRUE	0.746	204.000	0.051	0.005	Y	NA
7232443	7232444	RMA_0944	RMA_0945	murE	mfd	TRUE	0.677	132.000	0.007	0.096	N	NA
7232444	7232445	RMA_0945	RMA_0946	mfd		TRUE	0.917	-24.000	0.078	NA		NA
7232446	7232447	RMA_0947	RMA_0948	pspE	dnaA	TRUE	0.917	1.000	0.008	NA	N	NA
7232447	7232448	RMA_0948	RMA_0949	dnaA		FALSE	0.325	222.000	0.000	NA		NA
7232449	7232450	RMA_0950	RMA_0951			TRUE	0.833	16.000	0.000	NA		NA
7232452	7232453	RMA_0953	RMA_0954			TRUE	0.708	34.000	0.000	NA		NA
7232453	7232454	RMA_0954	RMA_0955			TRUE	0.640	80.000	0.000	NA		NA
7232454	7232455	RMA_0955	RMA_0956			FALSE	0.478	194.000	0.000	NA		NA
7232455	7232456	RMA_0956	RMA_0957			TRUE	0.662	-39.000	0.000	NA		NA
7232456	7232457	RMA_0957	RMA_0958		ychF	FALSE	0.103	328.000	0.000	NA		NA
7232457	7232458	RMA_0958	RMA_0959	ychF		FALSE	0.469	-57.000	0.000	NA		NA
7232458	7232459	RMA_0959	RMA_0960		pth	FALSE	0.043	446.000	0.000	NA		NA
7232459	7232460	RMA_0960	RMA_0961	pth	rplY	TRUE	0.653	316.000	0.496	0.052	Y	NA
7232460	7232461	RMA_0961	RMA_0962	rplY	nrdG	FALSE	0.014	755.000	0.002	1.000	N	NA
7232462	7232463	RMA_0963	RMA_0964	rpmI	rplT	TRUE	0.992	20.000	0.928	0.032	Y	NA
7232463	7232464	RMA_0964	RMA_0965	rplT	rpmH	FALSE	0.577	74.000	0.007	0.032		NA
7232464	7232465	RMA_0965	RMA_0966	rpmH	rnpA	TRUE	0.987	14.000	0.787	1.000		NA
7232466	7232467	RMA_0967	RMA_0968			FALSE	0.265	237.000	0.000	NA		NA
7232467	7232468	RMA_0968	RMA_0969			FALSE	0.017	770.000	0.000	NA		NA
7232468	7232469	RMA_0969	RMA_0970			FALSE	0.100	341.000	0.000	NA		NA
7232469	7232470	RMA_0970	RMA_0971		corA	FALSE	0.603	175.000	0.000	1.000	N	NA
7232472	7232473	RMA_0973	RMA_0974			FALSE	0.019	697.000	0.000	NA		NA
7232473	7232474	RMA_0974	RMA_RNA26		rrs	FALSE	0.026	567.000	0.000	NA		NA
7232474	7232475	RMA_RNA26	RMA_0975	rrs		FALSE	0.045	436.000	0.000	NA		NA
7232475	7232476	RMA_0975	RMA_0976			FALSE	0.097	342.000	0.000	NA		NA
7232476	7232477	RMA_0976	RMA_0977		ntrY	TRUE	0.658	93.000	0.000	NA		NA
7232477	7232478	RMA_0977	RMA_0978	ntrY	rpsU	FALSE	0.072	362.000	0.000	1.000		NA
7232479	7232480	RMA_0979	RMA_0980			FALSE	0.060	389.000	0.000	NA		NA
7232480	7232481	RMA_0980	RMA_0981			TRUE	0.899	-9.000	0.000	NA		NA
7232481	7232482	RMA_0981	RMA_0982		ileS	FALSE	0.582	178.000	0.000	NA		NA
7232482	7232483	RMA_0982	RMA_0983	ileS		TRUE	0.610	174.000	0.000	NA		NA
7232483	7232484	RMA_0983	RMA_0984			FALSE	0.564	-49.000	0.000	NA		NA
7232485	7232486	RMA_0985	RMA_0986	accC	pccB	TRUE	0.942	35.000	0.157	1.000	Y	NA
7232486	7232487	RMA_0986	RMA_0987	pccB		FALSE	0.070	367.000	0.000	1.000	N	NA
7232489	7232490	RMA_0989	RMA_0990	tfoX	znuB	FALSE	0.485	-60.000	0.016	NA		NA
7232491	7232492	RMA_0991	RMA_0992	ubiG	gltX	FALSE	0.307	217.000	0.008	1.000	N	NA
7232492	7232493	RMA_0992	RMA_0993	gltX		TRUE	0.915	-3.000	0.010	NA		NA
7232496	7232497	RMA_0996	RMA_0997	spoT12	groEL	FALSE	0.014	960.000	0.000	1.000		NA
7232497	7232498	RMA_0997	RMA_0998	groEL	groES	TRUE	0.980	0.000	0.050	0.094	Y	NA
7232498	7232499	RMA_0998	RMA_0999	groES		FALSE	0.040	461.000	0.000	NA		NA
7232499	7232500	RMA_0999	RMA_1000			FALSE	0.082	354.000	0.000	NA		NA
7232500	7232501	RMA_1000	RMA_1001			TRUE	0.642	-40.000	0.000	NA		NA
7232501	7232502	RMA_1001	RMA_1002			FALSE	0.273	230.000	0.000	NA		NA
7232502	7232503	RMA_1002	RMA_1003			TRUE	0.627	73.000	0.000	NA		NA
7232503	7232504	RMA_1003	RMA_1004			TRUE	0.656	92.000	0.000	NA		NA
7232504	7232505	RMA_1004	RMA_1005			TRUE	0.915	-4.000	0.000	NA		NA
7232505	7232506	RMA_1005	RMA_1006		rph	FALSE	0.020	668.000	0.000	NA		NA
7232507	7232508	RMA_1007	RMA_1008	grpE	perM	TRUE	0.877	20.000	0.034	NA		NA
7232508	7232509	RMA_1008	RMA_1009	perM		TRUE	0.987	4.000	0.362	NA		NA
7232509	7232510	RMA_1009	RMA_1010			TRUE	0.631	64.000	0.000	NA		NA
7232510	7232511	RMA_1010	RMA_1011			TRUE	0.801	-24.000	0.000	NA		NA
7232511	7232512	RMA_1011	RMA_1012			FALSE	0.087	347.000	0.000	NA		NA
7232513	7232514	RMA_1013	RMA_RNA27			FALSE	0.012	1190.000	0.000	NA		NA
7232514	7232515	RMA_RNA27	RMA_1014		rpsT	TRUE	0.636	77.000	0.000	NA		NA
7232515	7232516	RMA_1014	RMA_1015	rpsT	rplQ	TRUE	0.952	4.000	0.008	0.032	Y	NA
7232516	7232517	RMA_1015	RMA_1016	rplQ	rpoA	TRUE	0.992	11.000	0.873	1.000	N	NA
7232517	7232518	RMA_1016	RMA_1017	rpoA	rpsK	TRUE	0.965	19.000	0.308	1.000	N	NA
7232518	7232519	RMA_1017	RMA_1018	rpsK	rpsM	TRUE	0.990	22.000	0.810	0.032	Y	NA
7232519	7232520	RMA_1018	RMA_1019	rpsM	adk	TRUE	0.685	61.000	0.017	1.000	N	NA
7232520	7232521	RMA_1019	RMA_1020	adk	secY	TRUE	0.967	13.000	0.241	1.000	N	NA
7232521	7232522	RMA_1020	RMA_1021	secY	rplO	TRUE	0.993	4.000	0.730	1.000	N	NA
7232522	7232523	RMA_1021	RMA_1022	rplO	rpmD	TRUE	0.991	14.000	0.653	0.006	Y	NA
7232523	7232524	RMA_1022	RMA_1023	rpmD	rpsE	TRUE	0.988	24.000	0.789	0.043	Y	NA
7232524	7232525	RMA_1023	RMA_1024	rpsE	rplR	TRUE	0.996	-6.000	0.814	0.043	Y	NA
7232525	7232526	RMA_1024	RMA_1025	rplR	rplF	TRUE	0.992	16.000	0.815	0.032	Y	NA
7232526	7232527	RMA_1025	RMA_1026	rplF	rpsH	TRUE	0.995	10.000	0.808	0.032	Y	NA
7232527	7232528	RMA_1026	RMA_1027	rpsH	rpsN	TRUE	0.976	20.000	0.295	0.032	Y	NA
7232528	7232529	RMA_1027	RMA_1028	rpsN	rplE	TRUE	0.993	0.000	0.309	0.032	Y	NA
7232529	7232530	RMA_1028	RMA_1029	rplE	rplX	TRUE	0.980	-3.000	0.057	0.032	Y	NA
7232530	7232531	RMA_1029	RMA_1030	rplX	rplN	TRUE	0.984	1.000	0.071	0.043	Y	NA
7232531	7232532	RMA_1030	RMA_1031	rplN	rpsQ	TRUE	0.977	75.000	0.791	0.043	Y	NA
7232532	7232533	RMA_1031	RMA_1032	rpsQ	rpmC	TRUE	0.994	-16.000	0.828	0.032	Y	NA
7232533	7232534	RMA_1032	RMA_1033	rpmC	rplP	TRUE	0.996	-7.000	0.802	0.032	Y	NA
7232534	7232535	RMA_1033	RMA_1034	rplP	rpsC	TRUE	0.997	0.000	0.828	0.043	Y	NA
7232535	7232536	RMA_1034	RMA_1035	rpsC	rplV	TRUE	0.953	-25.000	0.109	0.043	Y	NA
7232536	7232537	RMA_1035	RMA_1036	rplV	rpsS	TRUE	0.986	3.000	0.119	0.043	Y	NA
7232537	7232538	RMA_1036	RMA_1037	rpsS	rplB	TRUE	0.991	19.000	0.820	0.043	Y	NA
7232538	7232539	RMA_1037	RMA_1038	rplB	rplW	TRUE	0.997	1.000	0.849	1.000	Y	NA
7232539	7232540	RMA_1038	RMA_1039	rplW	rplD	TRUE	0.943	-54.000	0.513	1.000	Y	NA
7232540	7232541	RMA_1039	RMA_1040	rplD	rplC	TRUE	0.967	107.000	0.486	0.032	Y	NA
7232541	7232542	RMA_1040	RMA_1041	rplC	rpsJ	TRUE	0.992	1.000	0.307	0.043	Y	NA
7232542	7232543	RMA_1041	RMA_1042	rpsJ	tuf	TRUE	0.762	247.000	0.318	1.000	Y	NA
7232543	7232544	RMA_1042	RMA_RNA28	tuf		TRUE	0.627	73.000	0.000	NA		NA
7232544	7232545	RMA_RNA28	RMA_RNA29			TRUE	0.631	171.000	0.000	NA		NA
7232546	7232547	RMA_1043	RMA_1044			TRUE	0.608	102.000	0.002	NA		NA
7232547	7232548	RMA_1044	RMA_1045		fumC	TRUE	0.909	-3.000	0.007	NA		NA
7232548	7232549	RMA_1045	RMA_1046	fumC		FALSE	0.583	69.000	0.007	NA	N	NA
7232549	7232550	RMA_1046	RMA_1047			TRUE	0.989	-6.000	0.500	NA		NA
7232550	7232551	RMA_1047	RMA_1048		ftsZ	FALSE	0.250	239.000	0.000	NA		NA
7232551	7232552	RMA_1048	RMA_1049	ftsZ		FALSE	0.139	289.000	0.000	NA		NA
7232552	7232553	RMA_1049	RMA_1050			FALSE	0.062	385.000	0.000	NA		NA
7232554	7232555	RMA_1051	RMA_1052		ampG2	FALSE	0.041	438.000	0.011	NA		NA
7232555	7232556	RMA_1052	RMA_1053	ampG2	rhlE	TRUE	0.616	173.000	0.000	NA		NA
7232556	7232557	RMA_1053	RMA_1054	rhlE	cspA	FALSE	0.061	503.000	0.000	1.000	Y	NA
7232558	7232559	RMA_1055	RMA_RNA30			TRUE	0.718	147.000	0.000	NA		NA
7232560	7232561	RMA_1056	RMA_1057	ksgA		FALSE	0.576	70.000	0.006	1.000		NA
7232561	7232562	RMA_1057	RMA_1058		ostA	TRUE	0.840	132.000	0.051	1.000		NA
7232563	7232564	RMA_1059	RMA_1060	xseA		TRUE	0.629	160.000	0.002	1.000		NA
7232564	7232565	RMA_1060	RMA_1061			FALSE	0.106	323.000	0.000	NA		NA
7232565	7232566	RMA_1061	RMA_1062			TRUE	0.647	86.000	0.000	NA		NA
7232566	7232567	RMA_1062	RMA_1063		xth2	TRUE	0.801	-24.000	0.000	NA		NA
7232567	7232568	RMA_1063	RMA_1064	xth2	engA	FALSE	0.074	357.000	0.000	0.019		NA
7232569	7232570	RMA_1065	RMA_1066			TRUE	0.692	37.000	0.000	NA		NA
7232570	7232571	RMA_1066	RMA_1067			FALSE	0.118	313.000	0.000	NA		NA
7232571	7232572	RMA_1067	RMA_1068		ubiB	FALSE	0.015	926.000	0.000	NA		NA
7232572	7232573	RMA_1068	RMA_1069	ubiB	ubiE	TRUE	0.893	148.000	0.115	1.000		NA
7232574	7232575	RMA_1070	RMA_1071	mutM		FALSE	0.400	-64.000	0.000	NA		NA
7232575	7232576	RMA_1071	RMA_1072			FALSE	0.123	311.000	0.000	NA		NA
7232576	7232577	RMA_1072	RMA_1073			TRUE	0.867	12.000	0.000	NA		NA
7232580	7232581	RMA_1076	RMA_1077			TRUE	0.717	134.000	0.000	NA		NA
7232581	7232582	RMA_1077	RMA_1078			TRUE	0.792	22.000	0.000	NA		NA
7232582	7232583	RMA_1078	RMA_1079			FALSE	0.469	-57.000	0.000	NA		NA
7232583	7232584	RMA_1079	RMA_1080		tatD	TRUE	0.725	31.000	0.000	NA		NA
7232584	7232585	RMA_1080	RMA_1081	tatD	metG	TRUE	0.896	53.000	0.221	NA	N	NA
7232585	7232586	RMA_1081	RMA_1082	metG	tmk	TRUE	0.908	-3.000	0.008	0.091	N	NA
7232589	7232590	RMA_1085	RMA_1086			FALSE	0.564	-49.000	0.000	NA		NA
7232590	7232591	RMA_1086	RMA_1087		valS	FALSE	0.070	367.000	0.000	NA		NA
7232591	7232592	RMA_1087	RMA_1088	valS		TRUE	0.695	-31.000	0.002	NA	N	NA
7232592	7232593	RMA_1088	RMA_1089			TRUE	0.977	53.000	0.750	NA	Y	NA
7232594	7232595	RMA_1090	RMA_1091			TRUE	0.915	-4.000	0.000	NA		NA
7232595	7232596	RMA_1091	RMA_1092			TRUE	0.865	-16.000	0.000	NA		NA
7232597	7232598	RMA_1093	RMA_1094			FALSE	0.286	227.000	0.000	NA		NA
7232598	7232599	RMA_1094	RMA_1095			FALSE	0.564	-49.000	0.000	NA		NA
7232599	7232600	RMA_1095	RMA_1096			TRUE	0.792	22.000	0.000	NA		NA
7232600	7232601	RMA_1096	RMA_1097			TRUE	0.718	122.000	0.000	NA		NA
7232602	7232603	RMA_1098	RMA_1099			TRUE	0.927	-1.000	0.000	NA		NA
7232603	7232604	RMA_1099	RMA_1100			FALSE	0.445	-60.000	0.000	NA		NA
7232604	7232605	RMA_1100	RMA_1101			TRUE	0.890	-12.000	0.000	NA		NA
7232606	7232607	RMA_1102	RMA_1103			TRUE	0.667	163.000	0.000	NA		NA
7232608	7232609	RMA_1104	RMA_1105	clpX	rimJ	TRUE	0.649	37.000	0.006	1.000	N	NA
7232609	7232610	RMA_1105	RMA_1106	rimJ	exsB	TRUE	0.606	166.000	0.005	NA		NA
7232610	7232611	RMA_1106	RMA_1107	exsB		TRUE	0.671	-33.000	0.004	NA		NA
7232612	7232613	RMA_RNA31	RMA_1108		msbA2	TRUE	0.684	160.000	0.000	NA		NA
7232613	7232614	RMA_1108	RMA_1109	msbA2		FALSE	0.171	264.000	0.000	NA		NA
7232614	7232615	RMA_1109	RMA_1110		bcr2	FALSE	0.020	669.000	0.000	NA		NA
7232615	7232616	RMA_1110	RMA_1111	bcr2		TRUE	0.695	74.000	0.020	NA	N	NA
7232616	7232617	RMA_1111	RMA_1112		lolD	TRUE	0.990	-7.000	0.620	1.000	N	NA
7232617	7232618	RMA_1112	RMA_1113	lolD		FALSE	0.334	212.000	0.009	1.000		NA
7232618	7232619	RMA_1113	RMA_1114			TRUE	0.621	75.000	0.012	NA		NA
7232619	7232620	RMA_1114	RMA_1115		ccmF	TRUE	0.940	-7.000	0.028	NA	N	NA
7232621	7232622	RMA_1116	RMA_1117			TRUE	0.911	-6.000	0.000	NA		NA
7232622	7232623	RMA_1117	RMA_1118		ompB	FALSE	0.173	263.000	0.000	NA		NA
7232623	7232624	RMA_1118	RMA_1119	ompB	spoT11	FALSE	0.128	305.000	0.000	1.000		NA
7232624	7232625	RMA_1119	RMA_1120	spoT11		TRUE	0.623	69.000	0.000	1.000		NA
7232625	7232626	RMA_1120	RMA_1121			FALSE	0.038	474.000	0.000	1.000	N	NA
7232626	7232627	RMA_1121	RMA_1122			TRUE	0.901	4.000	0.006	1.000		NA
7232627	7232628	RMA_1122	RMA_1123		himA	TRUE	0.671	133.000	0.005	1.000		NA
7232630	7232631	RMA_1125	RMA_1126	htrB	lpxK	TRUE	0.880	-37.000	0.044	1.000	Y	NA
7232631	7232632	RMA_1126	RMA_1127	lpxK		TRUE	0.951	4.000	0.006	1.000	Y	NA
7232632	7232633	RMA_1127	RMA_1128			TRUE	0.886	10.000	0.000	NA		NA
7232633	7232634	RMA_1128	RMA_1129			TRUE	0.761	25.000	0.000	NA		NA
7232634	7232635	RMA_1129	RMA_1130			TRUE	0.670	105.000	0.000	NA		NA
7232635	7232636	RMA_1130	RMA_1131		ligA	FALSE	0.149	282.000	0.000	NA		NA
7232636	7232637	RMA_1131	RMA_1132	ligA		TRUE	0.670	105.000	0.000	NA		NA
7232637	7232638	RMA_1132	RMA_1133		tgt	TRUE	0.640	59.000	0.000	NA		NA
7232639	7232640	RMA_1134	RMA_1135			TRUE	0.907	6.000	0.000	NA		NA
7232641	7232642	RMA_1136	RMA_1137			TRUE	0.782	-25.000	0.000	NA		NA
7232642	7232643	RMA_1137	RMA_1138			TRUE	0.886	10.000	0.000	NA		NA
7232645	7232646	RMA_1140	RMA_1141			TRUE	0.906	-7.000	0.000	NA		NA
7232646	7232647	RMA_1141	RMA_1142			TRUE	0.656	51.000	0.000	NA		NA
7232647	7232648	RMA_1142	RMA_1143			FALSE	0.164	266.000	0.000	NA		NA
7232648	7232649	RMA_1143	RMA_1144			TRUE	0.933	25.000	0.199	NA		NA
7232649	7232650	RMA_1144	RMA_1145		rnhA	TRUE	0.890	-12.000	0.012	1.000	N	NA
7232650	7232651	RMA_1145	RMA_1146	rnhA		TRUE	0.928	0.000	0.012	NA		NA
7232651	7232652	RMA_1146	RMA_RNA32		ssrA	TRUE	0.696	157.000	0.000	NA		NA
7232653	7232654	RMA_1147	RMA_1148		coaE	TRUE	0.894	-6.000	0.006	NA		NA
7232654	7232655	RMA_1148	RMA_1149	coaE	dnaQ	TRUE	0.961	-12.000	0.092	1.000	N	NA
7232655	7232656	RMA_1149	RMA_1150	dnaQ	surf1	TRUE	0.643	105.000	0.010	NA		NA
7232656	7232657	RMA_1150	RMA_1151	surf1		TRUE	0.725	56.000	0.023	NA		NA
7232657	7232658	RMA_1151	RMA_1152		fabD	FALSE	0.018	767.000	0.000	1.000	N	NA
7232658	7232659	RMA_1152	RMA_1153	fabD		TRUE	0.661	48.000	0.000	NA		NA
7232659	7232660	RMA_1153	RMA_RNA33			FALSE	0.079	356.000	0.000	NA		NA
7232661	7232662	RMA_1154	RMA_1155			TRUE	0.720	-33.000	0.000	NA		NA
7232662	7232663	RMA_1155	RMA_1156			TRUE	0.865	-16.000	0.000	NA		NA
7232663	7232664	RMA_1156	RMA_1157			TRUE	0.747	27.000	0.000	NA		NA
7232664	7232665	RMA_1157	RMA_1158			TRUE	0.626	72.000	0.000	NA		NA
7232665	7232666	RMA_1158	RMA_1159			TRUE	0.761	25.000	0.000	NA		NA
7232667	7232668	RMA_1160	RMA_1161			TRUE	0.643	58.000	0.000	NA		NA
7232669	7232670	RMA_1162	RMA_1163			TRUE	0.876	11.000	0.000	NA		NA
7232670	7232671	RMA_1163	RMA_1164			TRUE	0.874	-15.000	0.000	NA		NA
7232671	7232672	RMA_1164	RMA_1165		phbC	FALSE	0.097	342.000	0.000	NA		NA
7232674	7232675	RMA_1167	RMA_1168		tlyC	FALSE	0.025	569.000	0.000	NA		NA
7232675	7232676	RMA_1168	RMA_1169	tlyC		TRUE	0.979	5.000	0.222	NA		NA
7232676	7232677	RMA_1169	RMA_1170			TRUE	0.904	-3.000	0.002	NA		NA
7232677	7232678	RMA_1170	RMA_1171		lipA	FALSE	0.041	455.000	0.000	1.000		NA
7232678	7232679	RMA_1171	RMA_1172	lipA	glyA	TRUE	0.894	-7.000	0.009	1.000	N	NA
7232679	7232680	RMA_1172	RMA_1173	glyA		TRUE	0.910	117.000	0.182	NA		NA
7232680	7232681	RMA_1173	RMA_1174		grxC2	TRUE	0.953	160.000	0.538	NA		NA
7232683	7232684	RMA_1176	RMA_1177			FALSE	0.031	494.000	0.000	NA		NA
7232686	7232687	RMA_1179	RMA_1180			TRUE	0.678	40.000	0.000	NA		NA
7232687	7232688	RMA_1180	RMA_1181			FALSE	0.400	-64.000	0.000	NA		NA
7232688	7232689	RMA_1181	RMA_1182			TRUE	0.719	144.000	0.000	NA		NA
7232692	7232693	RMA_1185	RMA_1186	pgpA	rplU	FALSE	0.572	68.000	0.004	1.000	N	NA
7232693	7232694	RMA_1186	RMA_1187	rplU	rpmA	TRUE	0.985	25.000	0.667	0.029	Y	NA
7232694	7232695	RMA_1187	RMA_1188	rpmA	lysC	FALSE	0.177	262.000	0.000	1.000	N	NA
7232695	7232696	RMA_1188	RMA_1189	lysC		FALSE	0.163	266.000	0.000	1.000		NA
7232696	7232697	RMA_1189	RMA_1190			FALSE	0.061	486.000	0.043	NA		NA
7232698	7232699	RMA_1191	RMA_1192		proP5	TRUE	0.715	120.000	0.000	NA		NA
7232699	7232700	RMA_1192	RMA_1193	proP5		TRUE	0.718	130.000	0.000	NA		NA
7232700	7232701	RMA_1193	RMA_1194			TRUE	0.792	-22.000	0.005	NA		NA
7232701	7232702	RMA_1194	RMA_1195			TRUE	0.910	-3.000	0.008	NA		NA
7232702	7232703	RMA_1195	RMA_1196			TRUE	0.962	7.000	0.077	NA		NA
7232703	7232704	RMA_1196	RMA_1197			TRUE	0.977	1.000	0.115	NA		NA
7232705	7232706	RMA_1198	RMA_1199	trmE		FALSE	0.052	410.000	0.000	NA		NA
7232707	7232708	RMA_1200	RMA_1201			FALSE	0.307	-148.000	0.000	NA		NA
7232708	7232709	RMA_1201	RMA_1202			TRUE	0.915	-4.000	0.000	NA		NA
7232710	7232711	RMA_1203	RMA_1204	recA	fabG	TRUE	0.709	-31.000	0.008	1.000	N	NA
7232711	7232712	RMA_1204	RMA_1205	fabG	acpP	TRUE	0.954	165.000	0.321	0.004	Y	NA
7232712	7232713	RMA_1205	RMA_1206	acpP	fabF	TRUE	0.928	36.000	0.106	1.000	Y	NA
7232713	7232714	RMA_1206	RMA_1207	fabF	uup	FALSE	0.146	283.000	0.000	1.000		NA
7232714	7232715	RMA_1207	RMA_1208	uup		FALSE	0.599	81.000	0.007	NA		NA
7232716	7232717	RMA_1209	RMA_1210		gmk	TRUE	0.624	70.000	0.000	NA		NA
7232717	7232718	RMA_1210	RMA_1211	gmk		TRUE	0.635	107.000	0.008	1.000		NA
7232718	7232719	RMA_1211	RMA_1212		mreC	FALSE	0.111	320.000	0.000	1.000		NA
7232719	7232720	RMA_1212	RMA_1213	mreC	mreB	TRUE	0.994	3.000	0.689	1.000	N	NA
7232720	7232721	RMA_1213	RMA_1214	mreB		FALSE	0.329	211.000	0.005	1.000		NA
7232721	7232722	RMA_1214	RMA_RNA34			TRUE	0.822	18.000	0.000	NA		NA
7232722	7232723	RMA_RNA34	RMA_1215		pal	FALSE	0.121	312.000	0.000	NA		NA
7232723	7232724	RMA_1215	RMA_1216	pal	fabH	FALSE	0.039	466.000	0.000	1.000	N	NA
7232724	7232725	RMA_1216	RMA_1217	fabH	rpmF	TRUE	0.903	8.000	0.014	1.000	N	NA
7232726	7232727	RMA_1218	RMA_1219	smpA	ftsY	TRUE	0.663	155.000	0.005	1.000	N	NA
7232727	7232728	RMA_1219	RMA_1220	ftsY	polA	TRUE	0.621	163.000	0.005	1.000	N	NA
7232728	7232729	RMA_1220	RMA_1221	polA		TRUE	0.718	137.000	0.000	NA		NA
7232729	7232730	RMA_1221	RMA_1222			FALSE	0.564	-49.000	0.000	NA		NA
7232730	7232731	RMA_1222	RMA_1223			TRUE	0.704	116.000	0.000	NA		NA
7232731	7232732	RMA_1223	RMA_1224			TRUE	0.628	74.000	0.000	NA		NA
7232732	7232733	RMA_1224	RMA_1225			FALSE	0.145	284.000	0.000	NA		NA
7232733	7232734	RMA_1225	RMA_1226			TRUE	0.855	-18.000	0.000	NA		NA
7232734	7232735	RMA_1226	RMA_1227			FALSE	0.194	253.000	0.000	NA		NA
7232736	7232737	RMA_1228	RMA_1229	dnaE	udg	TRUE	0.616	165.000	0.007	1.000	N	NA
7232738	7232739	RMA_1230	RMA_1231		ampG3	TRUE	0.817	-42.000	0.079	NA		NA
7232739	7232740	RMA_1231	RMA_1232	ampG3	tatC	TRUE	0.738	67.000	0.033	NA		NA
7232740	7232741	RMA_1232	RMA_1233	tatC	serS	TRUE	0.921	-22.000	0.065	NA	N	NA
7232741	7232742	RMA_1233	RMA_1234	serS	virB4-2	FALSE	0.092	343.000	0.000	0.085	N	NA
7232742	7232743	RMA_1234	RMA_1235	virB4-2		TRUE	0.947	133.000	0.375	NA		NA
7232743	7232744	RMA_1235	RMA_1236		terC	TRUE	0.956	5.000	0.051	NA		NA
7232744	7232745	RMA_1236	RMA_1237	terC		TRUE	0.785	38.000	0.037	0.051		NA
7232745	7232746	RMA_1237	RMA_1238			TRUE	0.971	94.000	0.857	1.000		NA
7232746	7232747	RMA_1238	RMA_1239			TRUE	0.918	4.000	0.000	NA		NA
7232747	7232748	RMA_1239	RMA_1240			TRUE	0.826	-22.000	0.000	NA		NA
7232748	7232749	RMA_1240	RMA_1241		nuoJ	TRUE	0.747	27.000	0.000	NA		NA
7232749	7232750	RMA_1241	RMA_1242	nuoJ	nuoK	TRUE	0.975	-31.000	0.484	0.005	Y	NA
7232750	7232751	RMA_1242	RMA_1243	nuoK	nuoL1	TRUE	0.994	-3.000	0.451	0.014	Y	NA
7232751	7232752	RMA_1243	RMA_1244	nuoL1	nuoM	TRUE	0.955	153.000	0.251	0.005	Y	NA
7232752	7232753	RMA_1244	RMA_1245	nuoM	ccmA	FALSE	0.066	373.000	0.000	1.000	N	NA
7232754	7232755	RMA_1246	RMA_1247	nuoI	nuoH	TRUE	0.950	180.000	0.500	0.014	Y	NA
7232755	7232756	RMA_1247	RMA_1248	nuoH	nuoG	TRUE	0.975	120.000	0.515	0.014	Y	NA
7232756	7232757	RMA_1248	RMA_1249	nuoG		FALSE	0.593	-54.000	0.021	NA		NA
7232757	7232758	RMA_1249	RMA_1250		acnA	TRUE	0.606	169.000	0.008	NA		NA
7232758	7232759	RMA_1250	RMA_1251	acnA	atpC	FALSE	0.587	203.000	0.005	1.000	Y	NA
7232759	7232760	RMA_1251	RMA_1252	atpC	atpD	TRUE	0.983	40.000	0.837	0.007	Y	NA
7232760	7232761	RMA_1252	RMA_1253	atpD	atpG	TRUE	0.977	98.000	0.724	0.007	Y	NA
7232761	7232762	RMA_1253	RMA_1254	atpG	atpA	TRUE	0.986	127.000	0.846	0.007	Y	NA
7232762	7232763	RMA_1254	RMA_1255	atpA	atpH	TRUE	0.983	95.000	0.864	0.007	Y	NA
7232763	7232764	RMA_1255	RMA_1256	atpH	lpdA1	TRUE	0.815	153.000	0.007	1.000	Y	NA
7232764	7232765	RMA_1256	RMA_1257	lpdA1		FALSE	0.298	226.000	0.000	NA		NA
7232767	7232768	RMA_1259	RMA_1260			TRUE	0.702	115.000	0.000	NA		NA
7232768	7232769	RMA_1260	RMA_1261		mrcA	FALSE	0.058	393.000	0.000	NA		NA
7232769	7232770	RMA_1261	RMA_1262	mrcA	miaB	TRUE	0.886	-7.000	0.005	1.000	N	NA
7232770	7232771	RMA_1262	RMA_1263	miaB		FALSE	0.029	527.000	0.000	NA		NA
7232771	7232772	RMA_1263	RMA_1264			FALSE	0.416	-63.000	0.000	NA		NA
7232772	7232773	RMA_1264	RMA_1265			FALSE	0.061	388.000	0.000	NA		NA
7232773	7232774	RMA_1265	RMA_1266			FALSE	0.286	227.000	0.000	NA		NA
7232774	7232775	RMA_1266	RMA_1267		kefB	TRUE	0.834	-31.000	0.039	NA		NA
7232775	7232776	RMA_1267	RMA_1268	kefB		TRUE	0.872	-12.000	0.008	NA		NA
7232778	7232779	RMA_1270	RMA_1271			FALSE	0.015	881.000	0.000	NA		NA
7232779	7232780	RMA_1271	RMA_1272			TRUE	0.610	174.000	0.000	NA		NA
7232780	7232781	RMA_1272	RMA_1273			TRUE	0.720	-33.000	0.000	NA		NA
7232781	7232782	RMA_1273	RMA_1274			FALSE	0.151	281.000	0.000	NA		NA
7232782	7232783	RMA_1274	RMA_1275			TRUE	0.631	75.000	0.000	NA		NA
7232783	7232784	RMA_1275	RMA_1276			TRUE	0.792	22.000	0.000	NA		NA
7232784	7232785	RMA_1276	RMA_1277			FALSE	0.112	320.000	0.000	NA		NA
7232785	7232786	RMA_1277	RMA_1278			TRUE	0.792	22.000	0.000	NA		NA
7232786	7232787	RMA_1278	RMA_1279			TRUE	0.915	-4.000	0.000	NA		NA
7232787	7232788	RMA_1279	RMA_1280			TRUE	0.717	132.000	0.000	NA		NA
7232788	7232789	RMA_1280	RMA_1281			TRUE	0.899	-9.000	0.000	NA		NA
7232789	7232790	RMA_1281	RMA_1282			TRUE	0.623	172.000	0.000	NA		NA
7232791	7232792	RMA_RNA35	RMA_1283		infA	TRUE	0.867	12.000	0.000	NA		NA
7232792	7232793	RMA_1283	RMA_1284	infA	maf	TRUE	0.978	6.000	0.207	NA	N	NA
7232794	7232795	RMA_1285	RMA_1286	dksA	xerC	TRUE	0.779	101.000	0.040	1.000	N	NA
7232796	7232797	RMA_1287	RMA_1288			FALSE	0.587	-46.000	0.000	NA		NA
7232798	7232799	RMA_1289	RMA_1290	pldA		TRUE	0.715	151.000	0.000	NA		NA
7232799	7232800	RMA_1290	RMA_1291			TRUE	0.665	46.000	0.000	NA		NA
7232800	7232801	RMA_1291	RMA_1292			FALSE	0.469	-57.000	0.000	NA		NA
7232801	7232802	RMA_1292	RMA_1293			TRUE	0.924	3.000	0.000	NA		NA
7232802	7232803	RMA_1293	RMA_1294		ubiD	TRUE	0.696	157.000	0.000	NA		NA
7232803	7232804	RMA_1294	RMA_1295	ubiD	surA	TRUE	0.722	157.000	0.015	NA	N	NA
7232804	7232805	RMA_1295	RMA_1296	surA	ompA	FALSE	0.497	190.000	0.000	1.000		NA
7232805	7232806	RMA_1296	RMA_1297	ompA		FALSE	0.325	222.000	0.000	NA		NA
7232806	7232807	RMA_1297	RMA_1298		ftsK	FALSE	0.026	562.000	0.000	NA		NA
7232807	7232808	RMA_1298	RMA_1299	ftsK		FALSE	0.206	250.000	0.000	NA		NA
7232808	7232809	RMA_1299	RMA_1300			TRUE	0.646	84.000	0.000	NA		NA
7232810	7232811	RMA_1301	RMA_1302	map		FALSE	0.194	253.000	0.000	NA		NA
7232811	7232812	RMA_1302	RMA_1303			TRUE	0.815	19.000	0.000	NA		NA
7232812	7232813	RMA_1303	RMA_1304			TRUE	0.833	16.000	0.000	NA		NA
7232813	7232814	RMA_1304	RMA_1305		mraY2	TRUE	0.929	0.000	0.000	NA		NA
7232814	7232815	RMA_1305	RMA_1306	mraY2		FALSE	0.421	-102.000	0.023	NA		NA
7232816	7232817	RMA_1307	RMA_1308			FALSE	0.370	247.000	0.000	0.004	Y	NA
7232817	7232818	RMA_1308	RMA_1309		fdxA	TRUE	0.677	260.000	0.545	1.000	N	NA
7232818	7232819	RMA_1309	RMA_1310	fdxA	ccmC	TRUE	0.928	5.000	0.018	1.000	N	NA
7232819	7232820	RMA_1310	RMA_1311	ccmC		TRUE	0.639	94.000	0.010	1.000	N	NA
7232820	7232821	RMA_1311	RMA_1312			TRUE	0.841	-25.000	0.023	1.000	N	NA
7232822	7232823	RMA_1313	RMA_1314	omp		TRUE	0.864	37.000	0.085	NA		NA
7232823	7232824	RMA_1314	RMA_1315		znuC	FALSE	0.600	180.000	0.016	NA		NA
7232825	7232826	RMA_1316	RMA_1317			FALSE	0.019	693.000	0.000	NA		NA
7232826	7232827	RMA_1317	RMA_1318			TRUE	0.642	-40.000	0.000	NA		NA
7232827	7232828	RMA_1318	RMA_1319		uvrA	FALSE	0.025	576.000	0.000	NA		NA
7232829	7232830	RMA_1320	RMA_1321	ssb		TRUE	0.973	0.000	0.083	NA		NA
7232831	7232832	RMA_1322	RMA_1323			TRUE	0.918	4.000	0.000	NA		NA
7232832	7232833	RMA_1323	RMA_RNA36			FALSE	0.154	273.000	0.000	NA		NA
7232834	7232835	RMA_1324	RMA_1325		htpG	TRUE	0.686	138.000	0.008	NA		NA
7232835	7232836	RMA_1325	RMA_1326	htpG	hemA	TRUE	0.686	131.000	0.008	1.000	N	NA
7232836	7232837	RMA_1326	RMA_1327	hemA		FALSE	0.018	730.000	0.000	NA		NA
7232837	7232838	RMA_1327	RMA_1328		tig	FALSE	0.021	638.000	0.000	NA		NA
7232839	7232840	RMA_1329	RMA_1330	obgE	gltA	TRUE	0.905	3.000	0.002	1.000		NA
7232840	7232841	RMA_1330	RMA_1331	gltA		TRUE	0.660	99.000	0.000	1.000		NA
7232841	7232842	RMA_1331	RMA_1332			FALSE	0.126	306.000	0.000	1.000		NA
7232843	7232844	RMA_1333	RMA_1334		hemK	FALSE	0.022	1809.000	0.000	1.000	Y	NA
7232845	7232846	RMA_1335	RMA_1336		glyS	TRUE	0.962	-3.000	0.013	NA	Y	NA
7232846	7232847	RMA_1336	RMA_1337	glyS	glyQ	TRUE	0.980	-33.000	0.651	0.001	Y	NA
7232847	7232848	RMA_1337	RMA_1338	glyQ	vapC3	TRUE	0.668	32.000	0.003	NA		NA
7232848	7232849	RMA_1338	RMA_1339	vapC3		TRUE	0.976	-6.000	0.154	NA		NA
7232849	7232850	RMA_1339	RMA_1340			TRUE	0.653	90.000	0.000	NA		NA
7232850	7232851	RMA_1340	RMA_1341			TRUE	0.733	30.000	0.000	NA		NA
7232851	7232852	RMA_1341	RMA_1342			TRUE	0.658	93.000	0.000	NA		NA
7232852	7232853	RMA_1342	RMA_1343			FALSE	0.013	1111.000	0.000	NA		NA
7232854	7232855	RMA_1344	RMA_1345		mutL	TRUE	0.846	-15.000	0.004	NA		NA
7232855	7232856	RMA_1345	RMA_1346	mutL	rpmG	FALSE	0.290	221.000	0.004	1.000	N	NA
7232856	7232857	RMA_1346	RMA_1347	rpmG	rpsP	TRUE	0.906	14.000	0.008	0.028	Y	NA
7232857	7232858	RMA_1347	RMA_RNA37	rpsP		FALSE	0.582	178.000	0.000	NA		NA
7232858	7232859	RMA_RNA37	RMA_1348		ampD2	FALSE	0.509	188.000	0.000	NA		NA
7232859	7232860	RMA_1348	RMA_1349	ampD2	lipB	TRUE	0.878	-9.000	0.004	1.000	N	NA
7232860	7232861	RMA_1349	RMA_1350	lipB		TRUE	0.909	-3.000	0.007	NA		NA
7232863	7232864	RMA_1352	RMA_1353			TRUE	0.631	63.000	0.000	NA		NA
7232864	7232865	RMA_1353	RMA_1354			TRUE	0.792	22.000	0.000	NA		NA
7232865	7232866	RMA_1354	RMA_1355			FALSE	0.355	215.000	0.000	NA		NA
7232866	7232867	RMA_1355	RMA_1356			FALSE	0.028	548.000	0.000	NA		NA
7232867	7232868	RMA_1356	RMA_1357			TRUE	0.761	-28.000	0.000	NA		NA
7232868	7232869	RMA_1357	RMA_1358		dapE	TRUE	0.918	4.000	0.000	NA		NA
7232869	7232870	RMA_1358	RMA_RNA38	dapE		TRUE	0.684	38.000	0.000	NA		NA
7232870	7232871	RMA_RNA38	RMA_1359		holC	TRUE	0.725	31.000	0.000	NA		NA
7232872	7232873	RMA_1360	RMA_1361			TRUE	0.685	109.000	0.000	NA		NA
7232873	7232874	RMA_1361	RMA_1362		dinJ	TRUE	0.662	100.000	0.000	NA		NA
7232874	7232875	RMA_1362	RMA_1363	dinJ		TRUE	0.800	87.000	0.053	NA		NA
7232876	7232877	RMA_1364	RMA_1365	phnP	glnQ	TRUE	0.935	4.000	0.019	1.000		NA
7232877	7232878	RMA_1365	RMA_1366	glnQ		FALSE	0.552	252.000	0.250	NA		NA
7232878	7232879	RMA_1366	RMA_1367			FALSE	0.260	238.000	0.000	NA		NA
7232879	7232880	RMA_1367	RMA_1368			FALSE	0.061	388.000	0.000	NA		NA
7232881	7232882	RMA_1369	RMA_1370		dnaX	TRUE	0.972	17.000	0.411	NA		NA
7232882	7232883	RMA_1370	RMA_RNA39	dnaX	ffs	TRUE	0.714	119.000	0.000	NA		NA
7232883	7232884	RMA_RNA39	RMA_1371	ffs	lolA	TRUE	0.761	25.000	0.000	NA		NA
7232885	7232886	RMA_1372	RMA_1373	pntA1	pntA2	TRUE	0.992	-12.000	0.829	0.002		NA
7232888	7232889	RMA_1375	RMA_1376	sec59	dnaG	FALSE	0.392	-61.000	0.008	1.000	N	NA
7232889	7232890	RMA_1376	RMA_1377	dnaG	rpoD	TRUE	0.922	45.000	0.299	1.000	N	NA
7232890	7232891	RMA_1377	RMA_1378	rpoD	truA	TRUE	0.616	96.000	0.006	1.000	N	NA
7232893	7232894	RMA_1380	RMA_1381			TRUE	0.942	72.000	0.556	NA		NA
7232894	7232895	RMA_1381	RMA_1382			TRUE	0.996	1.000	1.000	NA		NA
7232895	7232896	RMA_1382	RMA_1383			FALSE	0.132	294.000	0.000	NA		NA
7232896	7232897	RMA_1383	RMA_1384		proP7	FALSE	0.055	404.000	0.000	NA		NA
7232897	7232898	RMA_1384	RMA_1385	proP7	hemF	TRUE	0.838	-22.000	0.014	1.000	N	NA
7232899	7232900	RMA_1386	RMA_1387			FALSE	0.013	1133.000	0.000	NA		NA
7232900	7232901	RMA_1387	RMA_1388		hemH	TRUE	0.960	0.000	0.043	NA		NA
7232901	7232902	RMA_1388	RMA_1389	hemH	hemE	TRUE	0.906	-43.000	0.131	1.000	Y	NA
7231467	7231468	RMA_p01	RMA_p02			FALSE	0.201	251.000	0.000	NA		NA
7231469	7231470	RMA_p03	RMA_p04		spoT22	TRUE	0.654	91.000	0.000	NA		NA
7231473	7231474	RMA_p07	RMA_p08			FALSE	0.033	487.000	0.000	NA		NA
7231474	7231475	RMA_p08	RMA_p09			TRUE	0.892	9.000	0.000	NA		NA
7231476	7231477	RMA_p10	RMA_p11			FALSE	0.379	-67.000	0.000	NA		NA