MicrobesOnline Operon Predictions for Rhodospirillum centenum SW

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5592637 5592638 RC1_0016 RC1_0017     FALSE 0.037 246.000 0.000 NA   NA
 5592638 5592639 RC1_0017 RC1_0018     TRUE 0.793 29.000 0.035 NA   NA
 5592641 5592642 RC1_0020 RC1_0021     TRUE 0.596 13.000 0.000 NA   NA
 5592645 5592646 RC1_0024 RC1_0025     FALSE 0.138 95.000 0.000 1.000   NA
 5592647 5592648 RC1_0026 RC1_0027     FALSE 0.248 63.000 0.000 1.000   NA
 5592649 5592650 RC1_0028 RC1_0029   gatB FALSE 0.087 146.000 0.000 1.000 N NA
 5592654 5592655 RC1_0033 RC1_0034     TRUE 0.644 10.000 0.000 NA   NA
 5592656 5592657 RC1_0035 RC1_0036   gin TRUE 0.999 -3.000 0.667 NA   NA
 5592657 5592658 RC1_0036 RC1_0037 gin   TRUE 0.996 -3.000 0.333 NA   NA
 5592658 5592659 RC1_0037 RC1_0038     TRUE 0.747 0.000 0.000 NA   NA
 5592660 5592661 RC1_0039 RC1_0040     FALSE 0.104 102.000 0.000 NA   NA
 5592661 5592662 RC1_0040 RC1_0041     TRUE 0.795 114.000 0.250 NA   NA
 5592662 5592663 RC1_0041 RC1_0042     FALSE 0.030 308.000 0.000 NA   NA
 5592663 5592664 RC1_0042 RC1_0043     TRUE 0.875 140.000 0.400 NA   NA
 5592664 5592665 RC1_0043 RC1_0044     FALSE 0.073 132.000 0.000 NA   NA
 5592665 5592666 RC1_0044 RC1_0045     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5592666 5592667 RC1_0045 RC1_0046     TRUE 0.890 117.000 0.400 NA   NA
 5592667 5592668 RC1_0046 RC1_0047     TRUE 0.999 12.000 1.000 NA   NA
 5592668 5592669 RC1_0047 RC1_0048     TRUE 0.999 -15.000 1.000 NA   NA
 5592669 5592670 RC1_0048 RC1_0049     TRUE 0.997 -3.000 0.400 NA   NA
 5592670 5592671 RC1_0049 RC1_0050     TRUE 0.997 15.000 0.667 NA   NA
 5592671 5592672 RC1_0050 RC1_0051     TRUE 0.997 -3.000 0.400 NA   NA
 5592672 5592673 RC1_0051 RC1_0052     TRUE 0.946 -3.000 0.027 NA   NA
 5592673 5592674 RC1_0052 RC1_0053     TRUE 0.946 -3.000 0.027 NA   NA
 5592675 5592676 RC1_0054 RC1_0055     FALSE 0.185 70.000 0.000 NA   NA
 5592677 5592678 RC1_0056 RC1_0057     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5592678 5592679 RC1_0057 RC1_0058     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5592679 5592680 RC1_0058 RC1_0059     TRUE 0.784 -7.000 0.000 NA   NA
 5592680 5592681 RC1_0059 RC1_0060     FALSE 0.026 390.000 0.000 NA   NA
 5592681 5592682 RC1_0060 RC1_0061     TRUE 0.960 5.000 0.000 0.002 Y NA
 5592682 5592683 RC1_0061 RC1_0062     TRUE 0.784 -7.000 0.000 NA   NA
 5592684 5592685 RC1_0063 RC1_0064     FALSE 0.106 101.000 0.000 NA   NA
 5592686 5592687 RC1_0065 RC1_0066 nu1   TRUE 0.999 -148.000 1.000 NA   NA
 5592687 5592688 RC1_0066 RC1_0067     TRUE 0.781 -12.000 0.000 NA   NA
 5592688 5592689 RC1_0067 RC1_0068     TRUE 0.783 0.000 0.000 1.000   NA
 5592689 5592690 RC1_0068 RC1_0069   u35 TRUE 0.989 7.000 0.267 NA   NA
 5592690 5592691 RC1_0069 RC1_0070 u35 amiB TRUE 0.715 4.000 0.000 NA   NA
 5592691 5592692 RC1_0070 RC1_0071 amiB   TRUE 0.596 13.000 0.000 NA   NA
 5592692 5592693 RC1_0071 RC1_0072     FALSE 0.335 37.000 0.000 NA   NA
 5592694 5592695 RC1_0073 RC1_0074     FALSE 0.205 65.000 0.000 NA   NA
 5592695 5592696 RC1_0074 RC1_0075     FALSE 0.343 36.000 0.000 NA   NA
 5592697 5592698 RC1_0076 RC1_0077     TRUE 0.715 4.000 0.000 NA   NA
 5592698 5592699 RC1_0077 RC1_0078     FALSE 0.276 49.000 0.000 NA   NA
 5592699 5592700 RC1_0078 RC1_0079     TRUE 0.561 15.000 0.000 NA   NA
 5592700 5592701 RC1_0079 RC1_0080     FALSE 0.044 210.000 0.000 NA   NA
 5592702 5592703 RC1_0081 RC1_0082     TRUE 0.993 -3.000 0.235 NA   NA
 5592703 5592704 RC1_0082 RC1_0083     FALSE 0.113 97.000 0.000 NA   NA
 5592705 5592706 RC1_0084 RC1_0085     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5592706 5592707 RC1_0085 RC1_0086     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5592707 5592708 RC1_0086 RC1_0087     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5592708 5592709 RC1_0087 RC1_0088     TRUE 0.949 36.000 0.222 NA   NA
 5592709 5592710 RC1_0088 RC1_0089     TRUE 0.747 0.000 0.000 NA   NA
 5592710 5592711 RC1_0089 RC1_0090     TRUE 0.699 5.000 0.000 NA   NA
 5592711 5592712 RC1_0090 RC1_0091     TRUE 0.715 4.000 0.000 NA   NA
 5592712 5592713 RC1_0091 RC1_0092     FALSE 0.427 27.000 0.000 NA   NA
 5592713 5592714 RC1_0092 RC1_0093     FALSE 0.032 286.000 0.000 NA   NA
 5592715 5592716 RC1_0094 RC1_0095     FALSE 0.459 23.000 0.000 NA   NA
 5592716 5592717 RC1_0095 RC1_0096     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5592717 5592718 RC1_0096 RC1_0097     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5592718 5592719 RC1_0097 RC1_0098     TRUE 0.974 -3.000 0.075 NA   NA
 5592719 5592720 RC1_0098 RC1_0099     TRUE 0.530 161.000 0.119 NA   NA
 5592720 5592721 RC1_0099 RC1_0100     TRUE 0.699 5.000 0.000 NA   NA
 5592721 5592722 RC1_0100 RC1_0101   moeA FALSE 0.021 954.000 0.000 NA   NA
 5592722 5592723 RC1_0101 RC1_0102 moeA moaC TRUE 0.994 -3.000 0.093 0.004 Y NA
 5592723 5592724 RC1_0102 RC1_0103 moaC trpC TRUE 0.976 5.000 0.113 1.000 N NA
 5592724 5592725 RC1_0103 RC1_0104 trpC trpD TRUE 0.998 -3.000 0.293 1.000 Y NA
 5592725 5592726 RC1_0104 RC1_0105 trpD trpG TRUE 0.936 39.000 0.070 1.000 Y NA
 5592727 5592728 RC1_0106 RC1_0107 hmrR   FALSE 0.067 489.000 0.009 1.000   NA
 5592728 5592729 RC1_0107 RC1_0108     TRUE 0.529 69.000 0.021 1.000   NA
 5592730 5592731 RC1_0109 RC1_0110 trpE   TRUE 0.845 7.000 0.006 1.000 N NA
 5592732 5592733 RC1_0111 RC1_0112   tpiA TRUE 0.777 -21.000 0.000 NA   NA
 5592733 5592734 RC1_0112 RC1_0113 tpiA secG TRUE 0.715 122.000 0.184 1.000 N NA
 5592734 5592735 RC1_0113 RC1_0114 secG pyrG TRUE 0.524 120.000 0.083 1.000 N NA
 5592735 5592736 RC1_0114 RC1_0115 pyrG kdsA TRUE 0.815 75.000 0.138 1.000 N NA
 5592736 5592737 RC1_0115 RC1_0116 kdsA   FALSE 0.347 45.000 0.000 1.000 N NA
 5592737 5592738 RC1_0116 RC1_0117   eno FALSE 0.072 172.000 0.000 1.000 N NA
 5592738 5592739 RC1_0117 RC1_0118 eno   FALSE 0.232 191.000 0.032 1.000 N NA
 5592739 5592740 RC1_0118 RC1_0119   pdhA TRUE 0.489 172.000 0.104 1.000 N NA
 5592740 5592741 RC1_0119 RC1_0120 pdhA pdhB TRUE 0.996 28.000 0.456 0.001 Y NA
 5592741 5592742 RC1_0120 RC1_0121 pdhB pdhC TRUE 0.988 28.000 0.254 1.000 Y NA
 5592742 5592743 RC1_0121 RC1_0122 pdhC pdhD TRUE 0.840 110.000 0.121 1.000 Y NA
 5592743 5592744 RC1_0122 RC1_0123 pdhD lipA FALSE 0.185 211.000 0.022 1.000 N NA
 5592744 5592745 RC1_0123 RC1_0124 lipA   TRUE 0.915 21.000 0.081 NA N NA
 5592746 5592747 RC1_0125 RC1_0126 cinA ispDF TRUE 0.951 5.000 0.061 NA   NA
 5592748 5592749 RC1_0127 RC1_0128   ntrB TRUE 0.977 0.000 0.094 1.000 N NA
 5592749 5592750 RC1_0128 RC1_0129 ntrB ntrC TRUE 0.998 2.000 0.297 0.083 Y NA
 5592750 5592751 RC1_0129 RC1_0130 ntrC ntrY TRUE 0.789 231.000 0.205 1.000 Y NA
 5592751 5592752 RC1_0130 RC1_0131 ntrY ntrX TRUE 0.999 5.000 0.533 1.000 Y NA
 5592752 5592753 RC1_0131 RC1_0132 ntrX trkA FALSE 0.229 70.000 0.000 1.000 N NA
 5592753 5592754 RC1_0132 RC1_0133 trkA   FALSE 0.313 52.000 0.000 1.000 N NA
 5592754 5592755 RC1_0133 RC1_0134     TRUE 0.971 5.000 0.083 0.076   NA
 5592755 5592756 RC1_0134 RC1_0135   hfq TRUE 0.561 79.000 0.043 1.000   NA
 5592756 5592757 RC1_0135 RC1_0136 hfq hflX TRUE 0.785 74.000 0.115 1.000   NA
 5592760 5592761 RC1_0139 RC1_0140 ydfG mazG FALSE 0.212 71.000 0.000 1.000   NA
 5592761 5592762 RC1_0140 RC1_0141 mazG cueR FALSE 0.064 180.000 0.000 1.000   NA
 5592763 5592764 RC1_0142 RC1_0143   gcdH FALSE 0.093 133.000 0.000 1.000 N NA
 5592764 5592765 RC1_0143 RC1_0144 gcdH frhB FALSE 0.085 150.000 0.000 1.000 N NA
 5592765 5592766 RC1_0144 RC1_0145 frhB   FALSE 0.098 122.000 0.000 1.000 N NA
 5592766 5592767 RC1_0145 RC1_0146     FALSE 0.213 63.000 0.000 NA   NA
 5592767 5592768 RC1_0146 RC1_0147     FALSE 0.445 25.000 0.000 NA   NA
 5592769 5592770 RC1_0148 RC1_0149     FALSE 0.082 117.000 0.000 NA   NA
 5592770 5592771 RC1_0149 RC1_0150     FALSE 0.032 386.000 0.000 1.000   NA
 5592774 5592775 RC1_0153 RC1_0154   rrmJ TRUE 0.797 163.000 0.316 NA N NA
 5592775 5592776 RC1_0154 RC1_0155 rrmJ guaB FALSE 0.101 216.000 0.006 NA N NA
 5592776 5592777 RC1_0155 RC1_0156 guaB   FALSE 0.318 149.000 0.039 1.000 N NA
 5592777 5592778 RC1_0156 RC1_0157     FALSE 0.076 140.000 0.000 NA N NA
 5592778 5592779 RC1_0157 RC1_0158     TRUE 0.997 0.000 0.250 NA Y NA
 5592779 5592780 RC1_0158 RC1_0159     FALSE 0.117 94.000 0.000 NA   NA
 5592780 5592781 RC1_0159 RC1_0160     TRUE 0.632 11.000 0.000 NA   NA
 5592783 5592784 RC1_0162 RC1_0163     FALSE 0.042 218.000 0.000 NA   NA
 5592786 5592787 RC1_0165 RC1_0166 zraR   TRUE 0.480 21.000 0.000 NA   NA
 5592788 5592789 RC1_0167 RC1_0168     TRUE 0.706 130.000 0.200 NA   NA
 5592791 5592792 RC1_0170 RC1_0171   expC FALSE 0.129 88.000 0.000 NA   NA
 5592792 5592793 RC1_0171 RC1_0172 expC manC TRUE 0.678 64.000 0.000 1.000 Y NA
 5592794 5592795 RC1_0173 RC1_0174 expG   FALSE 0.204 73.000 0.000 1.000   NA
 5592795 5592796 RC1_0174 RC1_0175     FALSE 0.089 112.000 0.000 NA   NA
 5592796 5592797 RC1_0175 RC1_0176     FALSE 0.097 106.000 0.000 NA   NA
 5592798 5592799 RC1_0177 RC1_0178     FALSE 0.074 131.000 0.000 NA   NA
 5592799 5592800 RC1_0178 RC1_0179   fliG TRUE 0.493 20.000 0.000 NA   NA
 5592800 5592801 RC1_0179 RC1_0180 fliG flhB TRUE 0.583 17.000 0.000 1.000   NA
 5592801 5592802 RC1_0180 RC1_0181 flhB fliP TRUE 0.874 -3.000 0.000 0.015   NA
 5592802 5592803 RC1_0181 RC1_0182 fliP fliN TRUE 0.989 -3.000 0.053 1.000 Y NA
 5592803 5592804 RC1_0182 RC1_0183 fliN fliH TRUE 0.972 49.000 0.400 NA   NA
 5592804 5592805 RC1_0183 RC1_0184 fliH fliF TRUE 0.956 0.000 0.053 NA   NA
 5592806 5592807 RC1_0185 RC1_0186 fliL fliM TRUE 0.998 8.000 0.323 0.004 Y NA
 5592807 5592808 RC1_0186 RC1_0187 fliM   TRUE 0.902 -19.000 0.008 NA   NA
 5592808 5592809 RC1_0187 RC1_0188   flaA TRUE 0.965 34.000 0.286 NA   NA
 5592810 5592811 RC1_0189 RC1_0190 flhB fliR TRUE 0.984 19.000 0.143 1.000 Y NA
 5592811 5592812 RC1_0190 RC1_0191 fliR flhA TRUE 0.995 9.000 0.222 1.000 Y NA
 5592814 5592815 RC1_0192 RC1_0194   fliQ TRUE 0.989 -3.000 0.158 NA   NA
 5592815 5592816 RC1_0194 RC1_0195 fliQ fliE TRUE 0.992 10.000 0.158 1.000 Y NA
 5592816 5592817 RC1_0195 RC1_0196 fliE flgC TRUE 0.983 20.000 0.115 0.006 Y NA
 5592817 5592818 RC1_0196 RC1_0197 flgC flgB TRUE 0.998 30.000 0.804 NA Y NA
 5592819 5592820 RC1_0198 RC1_0199 fliI   FALSE 0.030 524.000 0.000 1.000 N NA
 5592821 5592822 RC1_0200 RC1_0201     FALSE 0.157 78.000 0.000 NA   NA
 5592822 5592823 RC1_0201 RC1_0202     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5592823 5592824 RC1_0202 RC1_0203   flbT FALSE 0.259 52.000 0.000 NA   NA
 5592824 5592825 RC1_0203 RC1_0204 flbT flaF TRUE 0.916 13.000 0.000 NA Y NA
 5592825 5592826 RC1_0204 RC1_0205 flaF flaB FALSE 0.334 155.000 0.000 NA Y NA
 5592826 5592827 RC1_0205 RC1_0206 flaB   FALSE 0.049 231.000 0.000 1.000   NA
 5592827 5592828 RC1_0206 RC1_0207   cheL TRUE 0.699 5.000 0.000 NA   NA
 5592828 5592829 RC1_0207 RC1_0208 cheL flgI TRUE 0.747 0.000 0.000 NA   NA
 5592831 5592832 RC1_0210 RC1_0211 flgL flgK TRUE 0.998 3.000 0.286 0.007 Y NA
 5592832 5592833 RC1_0211 RC1_0212 flgK flgE TRUE 1.000 15.000 1.000 0.007 Y NA
 5592833 5592834 RC1_0212 RC1_0213 flgE motB FALSE 0.427 114.000 0.000 1.000 Y NA
 5592834 5592835 RC1_0213 RC1_0214 motB motA TRUE 0.986 4.000 0.062 1.000 Y NA
 5592835 5592836 RC1_0214 RC1_0215 motA   FALSE 0.299 52.000 0.000 1.000   NA
 5592837 5592838 RC1_0216 RC1_0217   flgF FALSE 0.229 59.000 0.000 NA   NA
 5592838 5592839 RC1_0217 RC1_0218 flgF flgG TRUE 0.975 35.000 0.140 0.002 Y NA
 5592839 5592840 RC1_0218 RC1_0219 flgG flgA TRUE 1.000 8.000 1.000 NA Y NA
 5592840 5592841 RC1_0219 RC1_0220 flgA flgH TRUE 0.988 32.000 0.286 NA Y NA
 5592841 5592842 RC1_0220 RC1_0221 flgH   TRUE 0.493 20.000 0.000 NA   NA
 5592842 5592843 RC1_0221 RC1_0222     FALSE 0.075 128.000 0.000 NA   NA
 5592844 5592845 RC1_0223 RC1_0224 flgD fliK TRUE 0.961 11.000 0.103 NA   NA
 5592846 5592847 RC1_0225 RC1_0226     FALSE 0.071 140.000 0.000 NA   NA
 5592848 5592849 RC1_0227 RC1_0228     FALSE 0.157 78.000 0.000 NA   NA
 5592849 5592850 RC1_0228 RC1_0229     FALSE 0.033 280.000 0.000 NA   NA
 5592850 5592851 RC1_0229 RC1_0230   glgX FALSE 0.066 150.000 0.000 NA   NA
 5592851 5592852 RC1_0230 RC1_0231 glgX   FALSE 0.121 92.000 0.000 NA   NA
 5592852 5592853 RC1_0231 RC1_0232     TRUE 0.995 -3.000 0.315 NA   NA
 5592853 5592854 RC1_0232 RC1_0233     FALSE 0.038 319.000 0.000 1.000 N NA
 5592856 5592857 RC1_0235 RC1_0236 ilvB   TRUE 0.849 27.000 0.048 1.000   NA
 5592857 5592858 RC1_0236 RC1_0237   butA FALSE 0.034 266.000 0.000 NA   NA
 5592858 5592859 RC1_0237 RC1_0238 butA cbbR2 FALSE 0.469 24.000 0.000 NA N NA
 5592860 5592861 RC1_0239 RC1_0240 rbcL ccbS2 TRUE 0.993 32.000 0.569 0.002 N NA
 5592861 5592862 RC1_0240 RC1_0241 ccbS2 cbbQ FALSE 0.144 92.000 0.000 1.000   NA
 5592862 5592863 RC1_0241 RC1_0242 cbbQ cbbO FALSE 0.367 33.000 0.000 NA   NA
 5592864 5592865 RC1_0243 RC1_0244     FALSE 0.225 60.000 0.000 NA   NA
 5592865 5592866 RC1_0244 RC1_0245     FALSE 0.148 82.000 0.000 NA   NA
 5592866 5592867 RC1_0245 RC1_0246   phoD FALSE 0.106 101.000 0.000 NA   NA
 5592867 5592868 RC1_0246 RC1_0247 phoD   FALSE 0.350 35.000 0.000 NA   NA
 5592869 5592870 RC1_0248 RC1_0249     TRUE 0.996 15.000 0.586 1.000   NA
 5592870 5592871 RC1_0249 RC1_0250     TRUE 0.991 -3.000 0.184 1.000   NA
 5592871 5592872 RC1_0250 RC1_0251     TRUE 0.999 2.000 0.720 0.037   NA
 5592872 5592873 RC1_0251 RC1_0252   cpdB FALSE 0.083 144.000 0.000 1.000   NA
 5592873 5592874 RC1_0252 RC1_0253 cpdB   TRUE 0.964 -3.000 0.000 NA Y NA
 5592877 5592878 RC1_0256 RC1_0257 uspA pac FALSE 0.217 70.000 0.000 1.000   NA
 5592878 5592879 RC1_0257 RC1_0258 pac   TRUE 0.734 2.000 0.000 NA   NA
 5592879 5592880 RC1_0258 RC1_0259     TRUE 0.761 0.000 0.000 NA N NA
 5592880 5592881 RC1_0259 RC1_0260     FALSE 0.073 147.000 0.000 NA N NA
 5592881 5592882 RC1_0260 RC1_0261     TRUE 0.964 -3.000 0.000 NA Y NA
 5592883 5592884 RC1_0262 RC1_0263     FALSE 0.069 144.000 0.000 NA   NA
 5592884 5592885 RC1_0263 RC1_0265   glpD FALSE 0.101 104.000 0.000 NA   NA
 5592887 5592888 RC1_0266 RC1_0267   glpK TRUE 0.638 71.000 0.000 1.000 Y NA
 5592891 5592892 RC1_0270 RC1_0271     FALSE 0.039 309.000 0.000 1.000 N NA
 5592893 5592894 RC1_0272 RC1_0273     TRUE 0.997 8.000 0.579 NA N NA
 5592895 5592896 RC1_0274 RC1_0275     TRUE 0.980 9.000 0.167 NA   NA
 5592896 5592897 RC1_0275 RC1_0276     FALSE 0.087 113.000 0.000 NA   NA
 5592898 5592899 RC1_0277 RC1_0278     FALSE 0.048 192.000 0.000 NA   NA
 5592901 5592902 RC1_0280 RC1_0281     TRUE 0.996 11.000 0.538 NA N NA
 5592903 5592904 RC1_0282 RC1_0283 bchJ bchE TRUE 0.992 13.000 0.368 1.000   NA
 5592905 5592906 RC1_0284 RC1_0286     TRUE 0.991 26.000 0.500 1.000   NA
 5592907 5592908 RC1_0285 RC1_0287     TRUE 1.000 9.000 0.886 0.056 Y NA
 5592908 5592909 RC1_0287 RC1_0288     FALSE 0.044 211.000 0.000 NA   NA
 5592911 5592912 RC1_0290 RC1_0291     TRUE 0.996 14.000 0.333 1.000 Y NA
 5592912 5592913 RC1_0291 RC1_0292     FALSE 0.038 241.000 0.000 NA   NA
 5592914 5592915 RC1_0293 RC1_0294   phy TRUE 0.848 32.000 0.060 1.000 N NA
 5592915 5592916 RC1_0294 RC1_0295 phy   FALSE 0.034 387.000 0.000 1.000 N NA
 5592918 5592919 RC1_0297 RC1_0298     FALSE 0.074 130.000 0.000 NA   NA
 5592919 5592920 RC1_0298 RC1_0299   acvB TRUE 0.632 11.000 0.000 NA   NA
 5592920 5592921 RC1_0299 RC1_0300 acvB mgtA FALSE 0.207 68.000 0.000 NA N NA
 5592921 5592922 RC1_0300 RC1_0301 mgtA rpFG FALSE 0.080 158.000 0.000 1.000 N NA
 5592923 5592924 RC1_0302 RC1_0303 yhhJ   TRUE 0.948 4.000 0.032 0.008   NA
 5592924 5592925 RC1_0303 RC1_0304     TRUE 0.976 -7.000 0.077 1.000   NA
 5592925 5592926 RC1_0304 RC1_0305   ttgR TRUE 0.825 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5592926 5592927 RC1_0305 RC1_0306 ttgR   FALSE 0.068 179.000 0.000 1.000 N NA
 5592927 5592928 RC1_0306 RC1_0307     TRUE 0.524 179.000 0.125 1.000   NA
 5592928 5592929 RC1_0307 RC1_0308     TRUE 0.997 -3.000 0.433 NA   NA
 5592930 5592931 RC1_0309 RC1_0310     FALSE 0.055 218.000 0.000 1.000 N NA
 5592931 5592932 RC1_0310 RC1_0311     FALSE 0.356 152.000 0.000 1.000 Y NA
 5592934 5592935 RC1_0313 RC1_0314 hmuU   FALSE 0.225 60.000 0.000 NA   NA
 5592935 5592936 RC1_0314 RC1_0315   fecE TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5592937 5592938 RC1_0316 RC1_0317     TRUE 0.790 -21.000 0.000 NA N NA
 5592938 5592939 RC1_0317 RC1_0318     TRUE 0.561 15.000 0.000 NA   NA
 5592939 5592940 RC1_0318 RC1_0319   nrdD FALSE 0.157 78.000 0.000 NA   NA
 5592941 5592942 RC1_0320 RC1_0321   cobQ FALSE 0.022 567.000 0.000 NA   NA
 5592942 5592943 RC1_0321 RC1_0322 cobQ cobD TRUE 0.871 49.000 0.016 0.008 Y NA
 5592943 5592944 RC1_0322 RC1_0323 cobD cobU TRUE 0.893 28.000 0.006 1.000 Y NA
 5592944 5592945 RC1_0323 RC1_0324 cobU   FALSE 0.126 101.000 0.000 1.000   NA
 5592946 5592947 RC1_0325 RC1_0326     TRUE 0.724 87.000 0.111 1.000 N NA
 5592948 5592949 RC1_0327 RC1_0329     FALSE 0.023 558.000 0.000 NA   NA
 5592950 5592951 RC1_0328 RC1_0330     TRUE 0.982 10.000 0.200 NA   NA
 5592951 5592952 RC1_0330 RC1_0331     TRUE 0.671 7.000 0.000 NA   NA
 5592952 5592953 RC1_0331 RC1_0332     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5592953 5592954 RC1_0332 RC1_0333   fepA TRUE 0.763 69.000 0.097 NA   NA
 5592956 5592957 RC1_0335 RC1_0336     FALSE 0.091 110.000 0.000 NA   NA
 5592957 5592958 RC1_0336 RC1_0337   cheA2 FALSE 0.205 65.000 0.000 NA   NA
 5592958 5592960 RC1_0337 RC1_0339 cheA2 cheY2 TRUE 0.966 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5592960 5592961 RC1_0339 RC1_0340 cheY2 cheR2 TRUE 0.966 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5592961 5592962 RC1_0340 RC1_0341 cheR2   TRUE 0.629 14.000 0.000 1.000   NA
 5592962 5592963 RC1_0341 RC1_0342   cheB2 TRUE 0.771 2.000 0.000 1.000   NA
 5592963 5592964 RC1_0342 RC1_0343 cheB2 cheW2 TRUE 0.993 26.000 0.316 0.023 Y NA
 5592964 5592965 RC1_0343 RC1_0344 cheW2 mcp2 TRUE 0.977 29.000 0.123 0.016 Y NA
 5592965 5592966 RC1_0344 RC1_0345 mcp2 hdpA TRUE 0.532 90.000 0.000 1.000 Y NA
 5592966 5592967 RC1_0345 RC1_0346 hdpA rsbT TRUE 0.726 3.000 0.000 NA   NA
 5592967 5592968 RC1_0346 RC1_0348 rsbT rsbS TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5592968 5592969 RC1_0348 RC1_0349 rsbS rsbR TRUE 0.988 4.000 0.082 NA Y NA
 5592969 5592970 RC1_0349 RC1_0350 rsbR   TRUE 0.812 33.000 0.000 NA Y NA
 5592970 5592971 RC1_0350 RC1_0351     TRUE 0.971 -22.000 0.000 0.035 Y NA
 5592971 5592972 RC1_0351 RC1_0352   cheZ FALSE 0.025 392.000 0.000 NA   NA
 5592972 5592973 RC1_0352 RC1_0353 cheZ cheY TRUE 0.644 10.000 0.000 NA   NA
 5592973 5592974 RC1_0353 RC1_0354 cheY   TRUE 0.966 -9.000 0.000 1.000 Y NA
 5592974 5592975 RC1_0354 RC1_0355   fixJ TRUE 0.667 66.000 0.000 1.000 Y NA
 5592976 5592977 RC1_0356 RC1_0357   prtD FALSE 0.062 159.000 0.000 NA   NA
 5592977 5592978 RC1_0357 RC1_0358 prtD   TRUE 0.877 -3.000 0.000 0.009   NA
 5592978 5592979 RC1_0358 RC1_0359     TRUE 0.857 146.000 0.375 NA   NA
 5592979 5592980 RC1_0359 RC1_0360     FALSE 0.069 144.000 0.000 NA   NA
 5592980 5592981 RC1_0360 RC1_0361   atpD FALSE 0.034 267.000 0.000 NA   NA
 5592981 5592982 RC1_0361 RC1_0362 atpD atpC TRUE 0.988 -3.000 0.029 0.007 Y NA
 5592982 5592983 RC1_0362 RC1_0363 atpC   TRUE 0.999 -3.000 0.671 NA   NA
 5592983 5592984 RC1_0363 RC1_0364     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5592984 5592985 RC1_0364 RC1_0365   atpB TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5592985 5592986 RC1_0365 RC1_0366 atpB atpE TRUE 0.999 7.000 0.818 0.007   NA
 5592986 5592987 RC1_0366 RC1_0367 atpE atpF TRUE 0.999 4.000 0.727 0.007   NA
 5592987 5592988 RC1_0367 RC1_0368 atpF atpA TRUE 1.000 -25.000 0.697 0.007 Y NA
 5592988 5592989 RC1_0368 RC1_0369 atpA atpG TRUE 0.999 -3.000 0.455 0.007 Y NA
 5592990 5592991 RC1_0370 RC1_0371     FALSE 0.032 289.000 0.000 NA   NA
 5592991 5592992 RC1_0371 RC1_0372   rrlA FALSE 0.032 288.000 0.000 NA   NA
 5592992 5592993 RC1_0372 RC1_0373 rrlA rrfA FALSE 0.044 209.000 0.000 NA   NA
 5592993 5592994 RC1_0373 RC1_0374 rrfA rrsA FALSE 0.079 119.000 0.000 NA   NA
 5592994 5592995 RC1_0374 RC1_0375 rrsA   FALSE 0.022 624.000 0.000 NA   NA
 5592995 5592996 RC1_0375 RC1_0376     FALSE 0.129 88.000 0.000 NA   NA
 5592996 5592997 RC1_0376 RC1_0377     FALSE 0.296 44.000 0.000 NA   NA
 5592997 5592998 RC1_0377 RC1_0378     FALSE 0.154 91.000 0.000 1.000 N NA
 5593000 5593001 RC1_0380 RC1_0381 ptr mccA FALSE 0.029 601.000 0.000 1.000 N NA
 5593001 5593002 RC1_0381 RC1_0382 mccA kefB FALSE 0.275 60.000 0.000 1.000 N NA
 5593002 5593003 RC1_0382 RC1_0383 kefB   FALSE 0.091 140.000 0.000 1.000 N NA
 5593003 5593004 RC1_0383 RC1_0384     FALSE 0.031 296.000 0.000 NA   NA
 5593004 5593005 RC1_0384 RC1_0385     FALSE 0.140 85.000 0.000 NA   NA
 5593007 5593008 RC1_0387 RC1_0388     FALSE 0.061 160.000 0.000 NA   NA
 5593012 5593013 RC1_0392 RC1_0393   alkB FALSE 0.090 127.000 0.000 1.000   NA
 5593013 5593014 RC1_0393 RC1_0394 alkB   TRUE 0.696 9.000 0.000 1.000   NA
 5593014 5593015 RC1_0394 RC1_0395   csgA TRUE 0.754 132.000 0.089 1.000 Y NA
 5593015 5593016 RC1_0395 RC1_0396 csgA   FALSE 0.076 165.000 0.000 1.000 N NA
 5593016 5593017 RC1_0396 RC1_0397     FALSE 0.065 186.000 0.000 1.000 N NA
 5593017 5593018 RC1_0397 RC1_0398     FALSE 0.069 170.000 0.000 1.000   NA
 5593019 5593020 RC1_0399 RC1_0400     FALSE 0.076 123.000 0.000 NA   NA
 5593021 5593022 RC1_0401 RC1_0402 ivd2   FALSE 0.089 129.000 0.000 1.000   NA
 5593022 5593023 RC1_0402 RC1_0403     FALSE 0.049 383.000 0.000 0.016   NA
 5593023 5593024 RC1_0403 RC1_0404   mgtE FALSE 0.181 367.000 0.000 1.000 Y NA
 5593024 5593025 RC1_0404 RC1_0405 mgtE dme TRUE 0.780 9.000 0.000 0.073 N NA
 5593025 5593026 RC1_0405 RC1_0406 dme   FALSE 0.029 331.000 0.000 NA   NA
 5593027 5593028 RC1_0407 RC1_0408 lipB   TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5593028 5593029 RC1_0408 RC1_0409     FALSE 0.054 176.000 0.000 NA   NA
 5593030 5593031 RC1_0410 RC1_0411     FALSE 0.090 111.000 0.000 NA   NA
 5593031 5593032 RC1_0411 RC1_0412   pccA TRUE 0.919 -55.000 0.011 1.000 N NA
 5593032 5593033 RC1_0412 RC1_0413 pccA   FALSE 0.051 183.000 0.000 NA   NA
 5593033 5593034 RC1_0413 RC1_0414     FALSE 0.367 33.000 0.000 NA   NA
 5593035 5593036 RC1_0415 RC1_0416 cioA cioB TRUE 0.733 60.000 0.000 0.055 Y NA
 5593037 5593038 RC1_0417 RC1_0418   pccB TRUE 0.796 38.000 0.000 1.000 Y NA
 5593038 5593039 RC1_0418 RC1_0419 pccB   FALSE 0.208 144.000 0.015 NA N NA
 5593039 5593040 RC1_0419 RC1_0420     TRUE 0.973 26.000 0.269 NA   NA
 5593042 5593043 RC1_0422 RC1_0423     TRUE 0.977 -3.000 0.083 NA N NA
 5593043 5593044 RC1_0423 RC1_0424     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5593048 5593049 RC1_0428 RC1_0429   degP TRUE 0.611 76.000 0.051 1.000 N NA
 5593049 5593050 RC1_0429 RC1_0430 degP   FALSE 0.195 68.000 0.000 NA   NA
 5593052 5593053 RC1_0432 RC1_0433 kdpE kdpD TRUE 0.991 -3.000 0.068 1.000 Y NA
 5593053 5593054 RC1_0433 RC1_0434 kdpD kdpC TRUE 0.548 56.000 0.014 1.000 N NA
 5593054 5593055 RC1_0434 RC1_0435 kdpC kdpB TRUE 1.000 12.000 0.877 0.001 Y NA
 5593055 5593056 RC1_0435 RC1_0436 kdpB kdpA TRUE 0.992 -3.000 0.059 0.001 Y NA
 5593056 5593057 RC1_0436 RC1_0437 kdpA   FALSE 0.096 107.000 0.000 NA   NA
 5593057 5593058 RC1_0437 RC1_0438   oxyR FALSE 0.132 87.000 0.000 NA   NA
 5593059 5593060 RC1_0439 RC1_0440 ahpC ahpD FALSE 0.469 165.000 0.095 1.000   NA
 5593061 5593062 RC1_0441 RC1_0442     FALSE 0.050 187.000 0.000 NA   NA
 5593063 5593064 RC1_0443 RC1_0444     FALSE 0.056 173.000 0.000 NA   NA
 5593065 5593066 RC1_0445 RC1_0446 proB   TRUE 0.636 94.000 0.087 1.000   NA
 5593066 5593067 RC1_0446 RC1_0447   rpmA TRUE 0.726 264.000 0.335 1.000   NA
 5593067 5593068 RC1_0447 RC1_0448 rpmA rplU TRUE 0.998 32.000 0.667 0.015 Y NA
 5593068 5593069 RC1_0448 RC1_0449 rplU   FALSE 0.041 271.000 0.000 1.000   NA
 5593069 5593070 RC1_0449 RC1_0450     TRUE 0.968 11.000 0.115 1.000   NA
 5593070 5593071 RC1_0450 RC1_0451   mobA FALSE 0.109 114.000 0.000 1.000 N NA
 5593071 5593072 RC1_0451 RC1_0452 mobA   TRUE 0.612 12.000 0.000 NA   NA
 5593073 5593074 RC1_0453 RC1_0454   napE FALSE 0.152 80.000 0.000 NA   NA
 5593074 5593075 RC1_0454 RC1_0455 napE napF TRUE 0.932 11.000 0.058 NA   NA
 5593075 5593076 RC1_0455 RC1_0456 napF napD TRUE 0.782 -10.000 0.000 NA   NA
 5593076 5593077 RC1_0456 RC1_0457 napD napA TRUE 0.950 -3.000 0.030 NA N NA
 5593077 5593078 RC1_0457 RC1_0458 napA napB TRUE 0.999 15.000 0.643 0.001 Y NA
 5593078 5593079 RC1_0458 RC1_0459 napB napC TRUE 0.999 -3.000 0.490 0.001 Y NA
 5593081 5593082 RC1_0461 RC1_0463 copA   FALSE 0.022 587.000 0.000 NA   NA
 5593083 5593084 RC1_0464 RC1_0465     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5593088 5593089 RC1_0469 RC1_0470     FALSE 0.072 138.000 0.000 NA   NA
 5593089 5593090 RC1_0470 RC1_0471     TRUE 0.677 68.000 0.062 NA   NA
 5593090 5593091 RC1_0471 RC1_0472     TRUE 0.597 175.000 0.143 0.054   NA
 5593091 5593092 RC1_0472 RC1_0473     FALSE 0.447 30.000 0.000 1.000   NA
 5593093 5593094 RC1_0474 RC1_0475     TRUE 0.995 -3.000 0.287 1.000   NA
 5593094 5593095 RC1_0475 RC1_0476     TRUE 1.000 0.000 0.713 1.000 Y NA
 5593095 5593096 RC1_0476 RC1_0477     FALSE 0.275 242.000 0.000 0.024 Y NA
 5593097 5593098 RC1_0478 RC1_0479 nifS nifU TRUE 0.997 18.000 0.716 1.000 N NA
 5593098 5593099 RC1_0479 RC1_0480 nifU   TRUE 0.777 106.000 0.210 NA   NA
 5593101 5593102 RC1_0482 RC1_0483 fdxB   FALSE 0.213 63.000 0.000 NA   NA
 5593102 5593103 RC1_0483 RC1_0484     TRUE 0.999 -165.000 1.000 NA   NA
 5593103 5593104 RC1_0484 RC1_0485     FALSE 0.122 91.000 0.000 NA   NA
 5593104 5593105 RC1_0485 RC1_0486     FALSE 0.021 1271.000 0.000 NA   NA
 5593105 5593106 RC1_0486 RC1_0487     FALSE 0.270 50.000 0.000 NA   NA
 5593106 5593107 RC1_0487 RC1_0488     TRUE 0.965 29.000 0.240 NA   NA
 5593107 5593108 RC1_0488 RC1_0489     TRUE 0.868 19.000 0.042 NA   NA
 5593108 5593109 RC1_0489 RC1_0490   sufS TRUE 0.926 0.000 0.017 1.000 N NA
 5593109 5593110 RC1_0490 RC1_0491 sufS sufD TRUE 0.986 5.000 0.193 1.000 N NA
 5593110 5593111 RC1_0491 RC1_0492 sufD sufC TRUE 0.998 14.000 0.482 1.000 Y NA
 5593111 5593112 RC1_0492 RC1_0493 sufC sufB TRUE 0.975 99.000 0.466 1.000 Y NA
 5593112 5593113 RC1_0493 RC1_0494 sufB   TRUE 0.885 29.000 0.078 NA N NA
 5593113 5593114 RC1_0494 RC1_0495     FALSE 0.040 245.000 0.000 NA N NA
 5593114 5593115 RC1_0495 RC1_0496     FALSE 0.073 135.000 0.000 NA   NA
 5593115 5593116 RC1_0496 RC1_0497     TRUE 0.950 29.000 0.182 NA   NA
 5593116 5593117 RC1_0497 RC1_0498     TRUE 0.988 -3.000 0.154 NA   NA
 5593118 5593119 RC1_0499 RC1_0500   chvl TRUE 0.999 5.000 0.750 NA   NA
 5593119 5593120 RC1_0500 RC1_0501 chvl   TRUE 0.988 -3.000 0.045 1.000 Y NA
 5593121 5593122 RC1_0502 RC1_0503 nhaP uspA FALSE 0.062 192.000 0.000 1.000 N NA
 5593122 5593123 RC1_0503 RC1_0504 uspA   TRUE 0.610 15.000 0.000 1.000   NA
 5593123 5593124 RC1_0504 RC1_0505     FALSE 0.023 496.000 0.000 NA   NA
 5593126 5593127 RC1_0507 RC1_0508 smc   FALSE 0.215 213.000 0.039 NA N NA
 5593127 5593128 RC1_0508 RC1_0509     TRUE 0.944 67.000 0.333 NA   NA
 5593129 5593130 RC1_0510 RC1_0511 mutY   TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5593130 5593131 RC1_0511 RC1_0512     FALSE 0.030 307.000 0.000 NA   NA
 5593131 5593132 RC1_0512 RC1_0513     FALSE 0.263 51.000 0.000 NA   NA
 5593133 5593134 RC1_0514 RC1_0515   glgB FALSE 0.035 259.000 0.000 NA   NA
 5593134 5593135 RC1_0515 RC1_0516 glgB treS TRUE 0.982 -3.000 0.009 0.005 Y NA
 5593137 5593138 RC1_0518 RC1_0519 wsp   FALSE 0.037 331.000 0.000 1.000 N NA
 5593142 5593143 RC1_0523 RC1_0524     FALSE 0.335 37.000 0.000 NA   NA
 5593143 5593144 RC1_0524 RC1_0525   phnM TRUE 0.985 -3.000 0.123 NA   NA
 5593145 5593146 RC1_0526 RC1_0527 galE rfbE TRUE 0.957 87.000 0.258 0.003 Y NA
 5593146 5593147 RC1_0527 RC1_0528 rfbE   TRUE 0.827 38.000 0.065 1.000 N NA
 5593147 5593148 RC1_0528 RC1_0529     TRUE 0.826 -7.000 0.000 1.000 N NA
 5593148 5593149 RC1_0529 RC1_0530     TRUE 0.682 6.000 0.000 NA   NA
 5593149 5593150 RC1_0530 RC1_0531     TRUE 0.990 4.000 0.250 NA   NA
 5593150 5593151 RC1_0531 RC1_0532     TRUE 0.996 -3.000 0.300 0.001   NA
 5593151 5593152 RC1_0532 RC1_0533     FALSE 0.132 98.000 0.000 1.000   NA
 5593153 5593154 RC1_0534 RC1_0535     FALSE 0.031 297.000 0.000 NA   NA
 5593154 5593155 RC1_0535 RC1_0536     FALSE 0.023 499.000 0.000 NA   NA
 5593155 5593156 RC1_0536 RC1_0537     FALSE 0.140 85.000 0.000 NA   NA
 5593156 5593157 RC1_0537 RC1_0538     FALSE 0.026 390.000 0.000 NA   NA
 5593158 5593159 RC1_0539 RC1_0540     FALSE 0.070 176.000 0.000 1.000 N NA
 5593161 5593162 RC1_0542 RC1_0543   phaR FALSE 0.025 406.000 0.000 NA   NA
 5593162 5593163 RC1_0543 RC1_0544 phaR   FALSE 0.032 281.000 0.000 NA   NA
 5593164 5593165 RC1_0545 RC1_0546     TRUE 0.995 6.000 0.424 NA   NA
 5593165 5593166 RC1_0546 RC1_0547     FALSE 0.047 196.000 0.000 NA   NA
 5593167 5593168 RC1_0548 RC1_0549     FALSE 0.288 71.000 0.000 0.037   NA
 5593168 5593169 RC1_0549 RC1_0550     TRUE 0.716 64.000 0.000 0.037 Y NA
 5593169 5593170 RC1_0550 RC1_0551   fadE36 TRUE 0.992 15.000 0.429 NA   NA
 5593170 5593171 RC1_0551 RC1_0552 fadE36   FALSE 0.033 276.000 0.000 NA   NA
 5593172 5593173 RC1_0553 RC1_0554     FALSE 0.096 107.000 0.000 NA   NA
 5593173 5593174 RC1_0554 RC1_0555   ctpA FALSE 0.101 104.000 0.000 NA   NA
 5593174 5593175 RC1_0555 RC1_0556 ctpA   TRUE 0.997 2.000 0.408 0.029 N NA
 5593176 5593177 RC1_0557 RC1_0558 rocD   TRUE 0.908 32.000 0.019 1.000 Y NA
 5593177 5593178 RC1_0558 RC1_0559   lrp FALSE 0.303 54.000 0.000 1.000 N NA
 5593180 5593181 RC1_0561 RC1_0562     FALSE 0.119 98.000 0.000 NA N NA
 5593181 5593182 RC1_0562 RC1_0563   xseB FALSE 0.385 59.000 0.003 NA N NA
 5593182 5593183 RC1_0563 RC1_0564 xseB ispA TRUE 0.887 24.000 0.062 1.000 N NA
 5593183 5593184 RC1_0564 RC1_0565 ispA dxs TRUE 0.869 45.000 0.020 1.000 Y NA
 5593185 5593186 RC1_0566 RC1_0567     FALSE 0.044 207.000 0.000 NA   NA
 5593186 5593187 RC1_0567 RC1_0568     FALSE 0.263 51.000 0.000 NA   NA
 5593190 5593191 RC1_0571 RC1_0573 pabB ilvE TRUE 0.996 -3.000 0.180 1.000 Y NA
 5593192 5593193 RC1_0572 RC1_0574   cstA TRUE 0.975 6.000 0.125 NA   NA
 5593193 5593194 RC1_0574 RC1_0575 cstA   FALSE 0.108 115.000 0.000 1.000 N NA
 5593194 5593195 RC1_0575 RC1_0576   aroC FALSE 0.309 53.000 0.000 1.000 N NA
 5593195 5593196 RC1_0576 RC1_0577 aroC fabI TRUE 0.664 33.000 0.011 1.000 N NA
 5593199 5593200 RC1_0580 RC1_0581     FALSE 0.057 171.000 0.000 NA   NA
 5593201 5593202 RC1_0582 RC1_0583   omp TRUE 0.984 106.000 1.000 1.000 N NA
 5593203 5593204 RC1_0584 RC1_0585 pdxH   TRUE 0.522 73.000 0.025 1.000 N NA
 5593204 5593205 RC1_0585 RC1_0586     FALSE 0.072 164.000 0.000 1.000   NA
 5593205 5593206 RC1_0586 RC1_0587     FALSE 0.085 115.000 0.000 NA   NA
 5593206 5593207 RC1_0587 RC1_0588     FALSE 0.051 184.000 0.000 NA   NA
 5593208 5593209 RC1_0589 RC1_0590 cobW zur FALSE 0.455 60.000 0.011 NA   NA
 5593210 5593211 RC1_0591 RC1_0592     TRUE 0.912 2.000 0.017 NA   NA
 5593211 5593212 RC1_0592 RC1_0593     TRUE 0.927 -3.000 0.013 1.000   NA
 5593212 5593213 RC1_0593 RC1_0594     TRUE 0.997 5.000 0.533 NA   NA
 5593213 5593214 RC1_0594 RC1_0595   panC FALSE 0.328 38.000 0.000 NA   NA
 5593215 5593216 RC1_0596 RC1_0597     FALSE 0.270 50.000 0.000 NA   NA
 5593216 5593217 RC1_0597 RC1_0598   gloA FALSE 0.079 119.000 0.000 NA   NA
 5593217 5593218 RC1_0598 RC1_0599 gloA   FALSE 0.029 317.000 0.000 NA   NA
 5593218 5593219 RC1_0599 RC1_0600     TRUE 0.612 12.000 0.000 NA   NA
 5593219 5593220 RC1_0600 RC1_0601   ligA FALSE 0.058 167.000 0.000 NA   NA
 5593220 5593221 RC1_0601 RC1_0602 ligA   FALSE 0.238 83.000 0.000 0.035   NA
 5593221 5593222 RC1_0602 RC1_0603   recN TRUE 0.500 24.000 0.000 1.000   NA
 5593222 5593223 RC1_0603 RC1_0604 recN   TRUE 0.842 59.000 0.117 1.000   NA
 5593223 5593224 RC1_0604 RC1_0605   lpxC FALSE 0.279 237.000 0.064 1.000   NA
 5593224 5593225 RC1_0605 RC1_0606 lpxC ftsZ FALSE 0.024 487.000 0.000 NA   NA
 5593225 5593226 RC1_0606 RC1_0607 ftsZ ftsA FALSE 0.091 110.000 0.000 NA   NA
 5593226 5593227 RC1_0607 RC1_0608 ftsA ftsQ TRUE 0.966 14.000 0.137 NA N NA
 5593227 5593228 RC1_0608 RC1_0609 ftsQ ddlB TRUE 0.999 -12.000 0.372 NA Y NA
 5593230 5593231 RC1_0610 RC1_0612 murB murC TRUE 0.994 0.000 0.108 0.005 Y NA
 5593231 5593232 RC1_0612 RC1_0613 murC murG TRUE 0.948 93.000 0.283 1.000 Y NA
 5593232 5593233 RC1_0613 RC1_0614 murG ftsW TRUE 0.985 -3.000 0.115 1.000 N NA
 5593233 5593234 RC1_0614 RC1_0615 ftsW murD TRUE 0.966 -3.000 0.035 0.004 N NA
 5593234 5593235 RC1_0615 RC1_0616 murD mraY TRUE 0.999 8.000 0.647 0.005 Y NA
 5593235 5593236 RC1_0616 RC1_0617 mraY murF TRUE 0.997 8.000 0.309 0.005 Y NA
 5593236 5593237 RC1_0617 RC1_0618 murF murE TRUE 0.999 14.000 0.569 0.003 Y NA
 5593237 5593238 RC1_0618 RC1_0619 murE ftsI TRUE 0.878 40.000 0.018 1.000 Y NA
 5593238 5593239 RC1_0619 RC1_0620 ftsI tonB TRUE 0.992 -3.000 0.222 NA   NA
 5593239 5593240 RC1_0620 RC1_0621 tonB mraW TRUE 0.901 -3.000 0.007 NA   NA
 5593240 5593241 RC1_0621 RC1_0622 mraW mraZ TRUE 0.999 -3.000 0.635 NA   NA
 5593241 5593242 RC1_0622 RC1_0623 mraZ   FALSE 0.021 1115.000 0.000 NA   NA
 5593242 5593243 RC1_0623 RC1_0624     TRUE 0.956 -3.000 0.035 1.000   NA
 5593243 5593244 RC1_0624 RC1_0625   hfaC TRUE 0.917 -3.000 0.009 1.000   NA
 5593244 5593245 RC1_0625 RC1_0626 hfaC djlA TRUE 0.659 12.000 0.000 1.000   NA
 5593246 5593247 RC1_0627 RC1_0628     FALSE 0.140 94.000 0.000 1.000   NA
 5593247 5593248 RC1_0628 RC1_0629     FALSE 0.095 119.000 0.000 1.000   NA
 5593248 5593249 RC1_0629 RC1_0630     FALSE 0.079 119.000 0.000 NA   NA
 5593249 5593250 RC1_0630 RC1_0631     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   NA
 5593253 5593254 RC1_0634 RC1_0635   trxB FALSE 0.203 401.000 0.065 1.000 N NA
 5593254 5593255 RC1_0635 RC1_0636 trxB   FALSE 0.113 97.000 0.000 NA   NA
 5593256 5593257 RC1_0637 RC1_0638 dsbD   FALSE 0.378 141.000 0.000 1.000 Y NA
 5593257 5593258 RC1_0638 RC1_0639     FALSE 0.118 105.000 0.000 1.000   NA
 5593259 5593260 RC1_0640 RC1_0641     FALSE 0.086 140.000 0.000 1.000   NA
 5593261 5593262 RC1_0642 RC1_0643 mtnN   FALSE 0.108 111.000 0.000 1.000   NA
 5593263 5593264 RC1_0644 RC1_0645     FALSE 0.074 129.000 0.000 NA   NA
 5593265 5593266 RC1_0646 RC1_0647   lig TRUE 0.996 25.000 0.751 NA N NA
 5593267 5593268 RC1_0648 RC1_0649     TRUE 0.507 19.000 0.000 NA   NA
 5593271 5593272 RC1_0652 RC1_0653     TRUE 0.698 85.000 0.100 NA   NA
 5593272 5593273 RC1_0653 RC1_0654     TRUE 0.971 -3.000 0.067 NA   NA
 5593273 5593274 RC1_0654 RC1_0655     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5593275 5593276 RC1_0656 RC1_0657     FALSE 0.055 183.000 0.000 NA N NA
 5593276 5593277 RC1_0657 RC1_0658     TRUE 0.982 12.000 0.083 NA Y NA
 5593277 5593278 RC1_0658 RC1_0659     FALSE 0.121 104.000 0.000 1.000   NA
 5593280 5593281 RC1_0661 RC1_0662   fecE TRUE 0.819 -33.000 0.000 1.000 N NA
 5593281 5593282 RC1_0662 RC1_0663 fecE hmuU TRUE 0.966 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5593282 5593283 RC1_0663 RC1_0664 hmuU   TRUE 0.966 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5593283 5593284 RC1_0664 RC1_0665   btuB TRUE 0.998 0.000 0.500 1.000 N NA
 5593285 5593286 RC1_0666 RC1_0667     FALSE 0.097 106.000 0.000 NA   NA
 5593288 5593289 RC1_0669 RC1_0670 phoU   FALSE 0.074 129.000 0.000 NA   NA
 5593289 5593290 RC1_0670 RC1_0671     FALSE 0.121 92.000 0.000 NA   NA
 5593291 5593292 RC1_0672 RC1_0673 fliG   FALSE 0.053 179.000 0.000 NA   NA
 5593292 5593293 RC1_0673 RC1_0674     FALSE 0.025 404.000 0.000 NA   NA
 5593293 5593294 RC1_0674 RC1_0675     TRUE 0.939 37.000 0.200 NA N NA
 5593294 5593295 RC1_0675 RC1_0676     FALSE 0.028 345.000 0.000 NA   NA
 5593295 5593296 RC1_0676 RC1_0677     TRUE 0.747 0.000 0.000 NA   NA
 5593296 5593297 RC1_0677 RC1_0678     FALSE 0.060 162.000 0.000 NA   NA
 5593298 5593299 RC1_0679 RC1_0680   tonB FALSE 0.040 230.000 0.000 NA   NA
 5593299 5593300 RC1_0680 RC1_0681 tonB exbB TRUE 0.602 27.000 0.000 0.015 N NA
 5593300 5593301 RC1_0681 RC1_0682 exbB exbD TRUE 0.994 3.000 0.118 0.048 Y NA
 5593301 5593302 RC1_0682 RC1_0683 exbD exbD1 TRUE 0.991 22.000 0.235 0.035 Y NA
 5593302 5593303 RC1_0683 RC1_0684 exbD1   FALSE 0.304 51.000 0.000 1.000   NA
 5593305 5593306 RC1_0686 RC1_0688     TRUE 1.000 -13.000 0.733 1.000 Y NA
 5593307 5593308 RC1_0687 RC1_0689     FALSE 0.233 58.000 0.000 NA   NA
 5593309 5593310 RC1_0690 RC1_0691     FALSE 0.079 119.000 0.000 NA   NA
 5593310 5593311 RC1_0691 RC1_0692     FALSE 0.076 123.000 0.000 NA   NA
 5593311 5593312 RC1_0692 RC1_0693   tuf FALSE 0.225 60.000 0.000 NA   NA
 5593312 5593313 RC1_0693 RC1_0694 tuf   FALSE 0.041 227.000 0.000 NA   NA
 5593313 5593314 RC1_0694 RC1_0695   secE FALSE 0.127 89.000 0.000 NA   NA
 5593314 5593315 RC1_0695 RC1_0696 secE nusG TRUE 0.999 4.000 0.843 1.000 N NA
 5593315 5593316 RC1_0696 RC1_0697 nusG rplK TRUE 0.961 117.000 0.681 1.000 N NA
 5593316 5593317 RC1_0697 RC1_0698 rplK rplA TRUE 1.000 5.000 0.838 0.020 Y NA
 5593317 5593318 RC1_0698 RC1_0699 rplA rplJ TRUE 0.814 333.000 0.302 1.000 Y NA
 5593318 5593319 RC1_0699 RC1_0700 rplJ rplL TRUE 0.998 46.000 0.884 1.000 Y NA
 5593319 5593320 RC1_0700 RC1_0701 rplL rpoB TRUE 0.524 351.000 0.223 1.000   NA
 5593320 5593321 RC1_0701 RC1_0702 rpoB rpoC TRUE 0.981 109.000 0.851 0.001   NA
 5593321 5593322 RC1_0702 RC1_0703 rpoC   FALSE 0.055 204.000 0.000 1.000   NA
 5593322 5593323 RC1_0703 RC1_0704     TRUE 0.999 -9.000 0.636 NA   NA
 5593325 5593326 RC1_0706 RC1_0707 rpsL rpsG TRUE 0.999 13.000 0.620 0.003 Y NA
 5593326 5593327 RC1_0707 RC1_0708 rpsG fusA TRUE 0.944 53.000 0.114 1.000 Y NA
 5593327 5593328 RC1_0708 RC1_0709 fusA tuf TRUE 0.945 56.000 0.102 0.001 Y NA
 5593328 5593329 RC1_0709 RC1_0710 tuf rpsJ TRUE 0.979 63.000 0.318 1.000 Y NA
 5593329 5593330 RC1_0710 RC1_0711 rpsJ rplC TRUE 0.980 62.000 0.307 0.020 Y NA
 5593330 5593331 RC1_0711 RC1_0712 rplC rplD TRUE 0.999 6.000 0.486 0.014 Y NA
 5593331 5593332 RC1_0712 RC1_0713 rplD rplW TRUE 0.999 -3.000 0.513 0.014 Y NA
 5593332 5593333 RC1_0713 RC1_0714 rplW rplB TRUE 1.000 11.000 0.849 0.018 Y NA
 5593333 5593334 RC1_0714 RC1_0715 rplB rpsS TRUE 0.999 12.000 0.820 0.020 Y NA
 5593334 5593335 RC1_0715 RC1_0716 rpsS rplV TRUE 0.994 2.000 0.119 0.020 Y NA
 5593335 5593336 RC1_0716 RC1_0717 rplV rpsC TRUE 0.994 0.000 0.109 0.020 Y NA
 5593336 5593337 RC1_0717 RC1_0718 rpsC rplP TRUE 0.998 39.000 0.828 0.020 Y NA
 5593337 5593338 RC1_0718 RC1_0719 rplP rpmC TRUE 1.000 -3.000 0.802 0.014 Y NA
 5593338 5593339 RC1_0719 RC1_0720 rpmC rpsQ TRUE 0.999 17.000 0.828 0.014 Y NA
 5593339 5593340 RC1_0720 RC1_0721 rpsQ rplN TRUE 0.999 19.000 0.791 0.020 Y NA
 5593340 5593341 RC1_0721 RC1_0722 rplN rplX TRUE 1.000 0.000 0.810 0.020 Y NA
 5593341 5593342 RC1_0722 RC1_0723 rplX rplE TRUE 0.999 9.000 0.758 0.014 Y NA
 5593342 5593343 RC1_0723 RC1_0724 rplE rpsN TRUE 0.995 18.000 0.309 0.014 Y NA
 5593343 5593344 RC1_0724 RC1_0725 rpsN rpsH TRUE 0.996 14.000 0.295 0.014 Y NA
 5593344 5593345 RC1_0725 RC1_0726 rpsH rplF TRUE 0.999 12.000 0.808 0.014 Y NA
 5593345 5593346 RC1_0726 RC1_0727 rplF rplR TRUE 0.999 12.000 0.815 0.014 Y NA
 5593346 5593347 RC1_0727 RC1_0728 rplR rpsE TRUE 0.999 13.000 0.814 0.020 Y NA
 5593347 5593348 RC1_0728 RC1_0729 rpsE rpmD TRUE 1.000 -3.000 0.789 0.020 Y NA
 5593348 5593349 RC1_0729 RC1_0730 rpmD rplO TRUE 0.998 34.000 0.653 0.003 Y NA
 5593349 5593350 RC1_0730 RC1_0731 rplO secY TRUE 0.885 422.000 0.730 1.000 N NA
 5593350 5593351 RC1_0731 RC1_0732 secY adk TRUE 0.943 -3.000 0.019 1.000 N NA
 5593351 5593352 RC1_0732 RC1_0733 adk rpsM FALSE 0.054 403.000 0.002 1.000 N NA
 5593352 5593353 RC1_0733 RC1_0734 rpsM rpsK TRUE 0.999 22.000 0.810 0.014 Y NA
 5593353 5593354 RC1_0734 RC1_0735 rpsK rpoA TRUE 0.827 134.000 0.308 1.000 N NA
 5593354 5593355 RC1_0735 RC1_0736 rpoA rplQ TRUE 0.969 154.000 0.873 1.000 N NA
 5593356 5593357 RC1_0737 RC1_0738     FALSE 0.121 92.000 0.000 NA   NA
 5593357 5593358 RC1_0738 RC1_0739     FALSE 0.427 27.000 0.000 NA   NA
 5593358 5593359 RC1_0739 RC1_0740     FALSE 0.022 654.000 0.000 NA   NA
 5593359 5593360 RC1_0740 RC1_0741     FALSE 0.057 170.000 0.000 NA   NA
 5593360 5593361 RC1_0741 RC1_0742     FALSE 0.279 48.000 0.000 NA   NA
 5593361 5593362 RC1_0742 RC1_0743     FALSE 0.154 79.000 0.000 NA   NA
 5593363 5593364 RC1_0744 RC1_0745 yghQ   FALSE 0.298 1286.000 0.129 1.000   NA
 5593364 5593365 RC1_0745 RC1_0746     TRUE 0.959 12.000 0.096 1.000 N NA
 5593365 5593366 RC1_0746 RC1_0747     FALSE 0.259 183.000 0.038 1.000 N NA
 5593366 5593367 RC1_0747 RC1_0748   bioF TRUE 0.987 4.000 0.191 1.000 N NA
 5593368 5593369 RC1_0749 RC1_0750     TRUE 0.662 8.000 0.000 NA   NA
 5593369 5593370 RC1_0750 RC1_0751     TRUE 0.999 -3.000 0.694 NA   NA
 5593370 5593371 RC1_0751 RC1_0752     TRUE 0.994 -3.000 0.250 1.000   NA
 5593371 5593372 RC1_0752 RC1_0753     TRUE 0.780 -13.000 0.000 NA   NA
 5593373 5593374 RC1_0754 RC1_0755     FALSE 0.183 130.000 0.007 1.000   NA
 5593374 5593375 RC1_0755 RC1_0756     TRUE 0.899 -3.000 0.005 1.000   NA
 5593375 5593376 RC1_0756 RC1_0757     TRUE 0.999 -3.000 0.631 0.051   NA
 5593376 5593377 RC1_0757 RC1_0758     FALSE 0.114 164.000 0.004 NA   NA
 5593377 5593378 RC1_0758 RC1_0759     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5593378 5593379 RC1_0759 RC1_0761     TRUE 0.971 -3.000 0.069 NA   NA
 5593382 5593383 RC1_0763 RC1_0764 rnz   TRUE 0.507 19.000 0.000 NA   NA
 5593384 5593385 RC1_0765 RC1_0766     FALSE 0.167 75.000 0.000 NA   NA
 5593385 5593386 RC1_0766 RC1_0767     FALSE 0.027 369.000 0.000 NA   NA
 5593386 5593387 RC1_0767 RC1_0768     FALSE 0.073 135.000 0.000 NA   NA
 5593387 5593388 RC1_0768 RC1_0769     TRUE 0.981 -3.000 0.097 NA N NA
 5593388 5593389 RC1_0769 RC1_0770     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5593389 5593390 RC1_0770 RC1_0771     FALSE 0.445 25.000 0.000 NA   NA
 5593390 5593391 RC1_0771 RC1_0772     TRUE 0.989 -3.000 0.167 NA   NA
 5593391 5593392 RC1_0772 RC1_0773     TRUE 0.995 -18.000 0.318 NA   NA
 5593392 5593393 RC1_0773 RC1_0774     TRUE 0.882 63.000 0.182 NA   NA
 5593393 5593394 RC1_0774 RC1_0775     TRUE 0.999 -9.000 0.625 NA   NA
 5593394 5593395 RC1_0775 RC1_0776     TRUE 0.931 10.000 0.000 NA Y NA
 5593395 5593396 RC1_0776 RC1_0777     TRUE 0.976 -3.000 0.080 NA   NA
 5593396 5593397 RC1_0777 RC1_0778     FALSE 0.072 137.000 0.000 NA   NA
 5593397 5593398 RC1_0778 RC1_0779     FALSE 0.069 144.000 0.000 NA   NA
 5593398 5593399 RC1_0779 RC1_0780   coxB FALSE 0.083 152.000 0.000 1.000 N NA
 5593399 5593400 RC1_0780 RC1_0781 coxB coxA TRUE 0.959 5.000 0.000 0.003 Y NA
 5593400 5593401 RC1_0781 RC1_0782 coxA   FALSE 0.068 146.000 0.000 NA   NA
 5593402 5593403 RC1_0783 RC1_0784     FALSE 0.024 461.000 0.000 NA   NA
 5593403 5593404 RC1_0784 RC1_0785     FALSE 0.079 119.000 0.000 NA   NA
 5593406 5593407 RC1_0787 RC1_0788   fleN TRUE 0.853 17.000 0.029 NA   NA
 5593407 5593408 RC1_0788 RC1_0789 fleN flhF TRUE 0.997 -3.000 0.382 1.000   NA
 5593408 5593409 RC1_0789 RC1_0790 flhF flhA TRUE 0.493 57.000 0.010 1.000   NA
 5593409 5593410 RC1_0790 RC1_0791 flhA flbD TRUE 0.937 50.000 0.226 1.000 N NA
 5593410 5593411 RC1_0791 RC1_0792 flbD motA FALSE 0.473 86.000 0.030 1.000 N NA
 5593411 5593412 RC1_0792 RC1_0793 motA fliN TRUE 0.927 6.000 0.020 0.011   NA
 5593412 5593413 RC1_0793 RC1_0794 fliN fliH TRUE 0.931 23.000 0.111 NA   NA
 5593413 5593414 RC1_0794 RC1_0795 fliH fliF FALSE 0.380 32.000 0.000 NA   NA
 5593414 5593415 RC1_0795 RC1_0796 fliF   FALSE 0.046 255.000 0.000 1.000 N NA
 5593415 5593416 RC1_0796 RC1_0797     TRUE 0.520 18.000 0.000 NA   NA
 5593416 5593417 RC1_0797 RC1_0798     FALSE 0.136 86.000 0.000 NA   NA
 5593418 5593419 RC1_0799 RC1_0800     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5593419 5593420 RC1_0800 RC1_0801     TRUE 0.998 -16.000 0.455 0.015   NA
 5593420 5593421 RC1_0801 RC1_0802   exbD2 TRUE 0.995 5.000 0.333 0.048   NA
 5593421 5593422 RC1_0802 RC1_0803 exbD2 tonB FALSE 0.458 29.000 0.000 1.000   NA
 5593422 5593423 RC1_0803 RC1_0804 tonB   TRUE 0.629 14.000 0.000 1.000   NA
 5593423 5593424 RC1_0804 RC1_0805     FALSE 0.037 301.000 0.000 1.000   NA
 5593425 5593426 RC1_0806 RC1_0807     FALSE 0.167 75.000 0.000 NA   NA
 5593428 5593429 RC1_0809 RC1_0810 msrA   FALSE 0.125 90.000 0.000 NA   NA
 5593429 5593430 RC1_0810 RC1_0811     FALSE 0.468 22.000 0.000 NA   NA
 5593431 5593432 RC1_0812 RC1_0813     FALSE 0.093 109.000 0.000 NA   NA
 5593432 5593433 RC1_0813 RC1_0814   czcA TRUE 0.650 11.000 0.000 NA N NA
 5593433 5593434 RC1_0814 RC1_0815 czcA   FALSE 0.249 54.000 0.000 NA   NA
 5593434 5593435 RC1_0815 RC1_0816   rfbB FALSE 0.043 213.000 0.000 NA   NA
 5593435 5593436 RC1_0816 RC1_0818 rfbB rfbA TRUE 0.973 -3.000 0.000 0.006 Y NA
 5593438 5593439 RC1_0819 RC1_0820     TRUE 0.990 -10.000 0.169 1.000 N NA
 5593439 5593440 RC1_0820 RC1_0821     FALSE 0.415 77.000 0.014 1.000 N NA
 5593440 5593441 RC1_0821 RC1_0822     TRUE 0.925 4.000 0.027 NA   NA
 5593441 5593442 RC1_0822 RC1_0823     TRUE 0.734 2.000 0.000 NA   NA
 5593442 5593443 RC1_0823 RC1_0824     TRUE 0.682 6.000 0.000 NA   NA
 5593443 5593444 RC1_0824 RC1_0825     FALSE 0.036 252.000 0.000 NA   NA
 5593446 5593447 RC1_0827 RC1_0828 rsaA   FALSE 0.033 280.000 0.000 NA   NA
 5593449 5593450 RC1_0830 RC1_0831     TRUE 0.774 -58.000 0.000 NA   NA
 5593451 5593452 RC1_0832 RC1_0833 ohrR   TRUE 0.882 39.000 0.103 1.000 N NA
 5593453 5593454 RC1_0834 RC1_0835     FALSE 0.038 242.000 0.000 NA   NA
 5593455 5593456 RC1_0836 RC1_0837 rho   FALSE 0.023 515.000 0.000 NA   NA
 5593457 5593458 RC1_0838 RC1_0839   azlC TRUE 0.507 19.000 0.000 NA   NA
 5593458 5593459 RC1_0839 RC1_0840 azlC   TRUE 0.994 -7.000 0.275 NA   NA
 5593465 5593466 RC1_0846 RC1_0847 ompA ompA FALSE 0.265 261.000 0.000 0.007 Y NA
 5593468 5593469 RC1_0849 RC1_0850     FALSE 0.109 99.000 0.000 NA   NA
 5593469 5593470 RC1_0850 RC1_0851     FALSE 0.034 270.000 0.000 NA   NA
 5593471 5593472 RC1_0852 RC1_0853     TRUE 0.581 14.000 0.000 NA   NA
 5593472 5593473 RC1_0853 RC1_0854     FALSE 0.040 230.000 0.000 NA   NA
 5593474 5593475 RC1_0855 RC1_0856     FALSE 0.245 55.000 0.000 NA   NA
 5593476 5593477 RC1_0857 RC1_0858 lrgB lrgA TRUE 0.998 -3.000 0.500 NA   NA
 5593477 5593478 RC1_0858 RC1_0859 lrgA   FALSE 0.136 86.000 0.000 NA   NA
 5593478 5593479 RC1_0859 RC1_0860     FALSE 0.036 251.000 0.000 NA   NA
 5593481 5593482 RC1_0862 RC1_0863     FALSE 0.023 488.000 0.000 NA   NA
 5593484 5593485 RC1_0865 RC1_0866     FALSE 0.077 122.000 0.000 NA   NA
 5593485 5593486 RC1_0866 RC1_0867     FALSE 0.437 26.000 0.000 NA   NA
 5593487 5593488 RC1_0868 RC1_0869 dbpA prfC FALSE 0.317 175.000 0.000 1.000 Y NA
 5593490 5593491 RC1_0871 RC1_0872     TRUE 0.480 21.000 0.000 NA   NA
 5593494 5593495 RC1_0874 RC1_0876     TRUE 0.999 -10.000 0.734 NA   NA
 5593495 5593496 RC1_0876 RC1_0877     TRUE 0.998 11.000 0.667 NA   NA
 5593497 5593498 RC1_0878 RC1_0879 fliL fliM TRUE 0.994 23.000 0.323 0.003 Y NA
 5593498 5593499 RC1_0879 RC1_0880 fliM   TRUE 0.947 -3.000 0.028 NA   NA
 5593499 5593500 RC1_0880 RC1_0881   flaA TRUE 0.997 -3.000 0.375 NA   NA
 5593500 5593501 RC1_0881 RC1_0882 flaA cheZ FALSE 0.180 80.000 0.000 1.000   NA
 5593501 5593502 RC1_0882 RC1_0883 cheZ   TRUE 0.561 15.000 0.000 NA   NA
 5593502 5593503 RC1_0883 RC1_0884   motB TRUE 0.988 -3.000 0.154 NA   NA
 5593503 5593504 RC1_0884 RC1_0885 motB   TRUE 0.987 0.000 0.154 1.000   NA
 5593505 5593506 RC1_0886 RC1_0887 fliP fliO TRUE 0.993 3.000 0.120 1.000 Y NA
 5593506 5593507 RC1_0887 RC1_0888 fliO   FALSE 0.270 50.000 0.000 NA   NA
 5593507 5593508 RC1_0888 RC1_0889   flhB TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5593509 5593510 RC1_0890 RC1_0891 flgB flgC TRUE 0.923 24.000 0.007 0.004 Y NA
 5593510 5593511 RC1_0891 RC1_0892 flgC fliE TRUE 0.937 33.000 0.056 1.000 Y NA
 5593511 5593512 RC1_0892 RC1_0893 fliE fliQ TRUE 0.977 17.000 0.083 1.000 Y NA
 5593512 5593513 RC1_0893 RC1_0894 fliQ fliR TRUE 0.991 14.000 0.150 0.004 Y NA
 5593513 5593514 RC1_0894 RC1_0895 fliR flhB TRUE 0.987 16.000 0.152 1.000 Y NA
 5593514 5593515 RC1_0895 RC1_0896 flhB cckA TRUE 0.973 32.000 0.303 1.000 N NA
 5593516 5593517 RC1_0897 RC1_0898     FALSE 0.243 288.000 0.000 0.015 Y NA
 5593518 5593519 RC1_0899 RC1_0900 recA alaS FALSE 0.203 314.000 0.054 1.000 N NA
 5593519 5593520 RC1_0900 RC1_0901 alaS   FALSE 0.047 239.000 0.000 1.000   NA
 5593520 5593521 RC1_0901 RC1_0902     FALSE 0.066 150.000 0.000 NA   NA
 5593521 5593522 RC1_0902 RC1_0903     TRUE 0.984 26.000 0.354 NA   NA
 5593522 5593523 RC1_0903 RC1_0904   cyaA FALSE 0.076 123.000 0.000 NA   NA
 5593523 5593524 RC1_0904 RC1_0905 cyaA   FALSE 0.181 71.000 0.000 NA   NA
 5593524 5593525 RC1_0905 RC1_0906   icd FALSE 0.074 130.000 0.000 NA   NA
 5593525 5593526 RC1_0906 RC1_0907 icd gcrA FALSE 0.036 255.000 0.000 NA   NA
 5593526 5593527 RC1_0907 RC1_0908 gcrA   FALSE 0.035 261.000 0.000 NA   NA
 5593527 5593528 RC1_0908 RC1_0909     FALSE 0.167 75.000 0.000 NA   NA
 5593528 5593529 RC1_0909 RC1_0910     TRUE 0.996 0.000 0.372 NA   NA
 5593530 5593531 RC1_0911 RC1_0913 icd   FALSE 0.061 161.000 0.000 NA   NA
 5593532 5593533 RC1_0914 RC1_0915     TRUE 0.942 11.000 0.000 0.051 Y NA
 5593536 5593537 RC1_0918 RC1_0919     FALSE 0.037 250.000 0.000 NA   NA
 5593540 5593541 RC1_0922 RC1_0923     FALSE 0.071 140.000 0.000 NA   NA
 5593541 5593542 RC1_0923 RC1_0924     TRUE 0.874 69.000 0.199 NA   NA
 5593542 5593543 RC1_0924 RC1_0925     TRUE 0.734 2.000 0.000 NA   NA
 5593546 5593547 RC1_0928 RC1_0929 accC accB TRUE 0.994 8.000 0.153 0.002 Y NA
 5593547 5593548 RC1_0929 RC1_0930 accB aroQ TRUE 0.812 32.000 0.042 1.000 N NA
 5593548 5593549 RC1_0930 RC1_0931 aroQ   FALSE 0.148 94.000 0.000 1.000 N NA
 5593549 5593550 RC1_0931 RC1_0932     FALSE 0.085 142.000 0.000 1.000   NA
 5593552 5593553 RC1_0934 RC1_0935     TRUE 1.000 5.000 0.948 0.003 Y NA
 5593553 5593554 RC1_0935 RC1_0936     TRUE 0.997 -3.000 0.381 1.000 N NA
 5593554 5593555 RC1_0936 RC1_0937     FALSE 0.038 290.000 0.000 1.000   NA
 5593556 5593557 RC1_0938 RC1_0939 trmU   FALSE 0.090 111.000 0.000 NA   NA
 5593559 5593560 RC1_0941 RC1_0942     FALSE 0.030 303.000 0.000 NA   NA
 5593560 5593561 RC1_0942 RC1_0943     TRUE 0.662 8.000 0.000 NA   NA
 5593561 5593562 RC1_0943 RC1_0944     TRUE 0.871 -31.000 0.000 0.013   NA
 5593562 5593563 RC1_0944 RC1_0945     FALSE 0.028 525.000 0.000 1.000   NA
 5593563 5593564 RC1_0945 RC1_0946     TRUE 0.992 0.000 0.250 NA   NA
 5593565 5593566 RC1_0948 RC1_0949     FALSE 0.079 119.000 0.000 NA   NA
 5593569 5593570 RC1_0952 RC1_0953 aroF xaa FALSE 0.150 93.000 0.000 1.000 N NA
 5593571 5593572 RC1_0954 RC1_0955 cheZ cheY TRUE 0.937 9.000 0.000 1.000 Y NA
 5593572 5593573 RC1_0955 RC1_0956 cheY   FALSE 0.033 276.000 0.000 NA   NA
 5593576 5593577 RC1_0959 RC1_0961     FALSE 0.225 60.000 0.000 NA   NA
 5593577 5593578 RC1_0961 RC1_0962     FALSE 0.163 76.000 0.000 NA   NA
 5593578 5593579 RC1_0962 RC1_0963   fkpA FALSE 0.120 108.000 0.000 1.000 N NA
 5593582 5593583 RC1_0966 RC1_0967     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5593583 5593584 RC1_0967 RC1_0968     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5593584 5593585 RC1_0968 RC1_0969     TRUE 0.815 -3.000 0.000 1.000   NA
 5593586 5593587 RC1_0970 RC1_0971     FALSE 0.136 86.000 0.000 NA   NA
 5593587 5593588 RC1_0971 RC1_0972   rsmC FALSE 0.127 129.000 0.000 0.067   NA
 5593588 5593589 RC1_0972 RC1_0973 rsmC   FALSE 0.083 116.000 0.000 NA   NA
 5593589 5593590 RC1_0973 RC1_0974     FALSE 0.062 158.000 0.000 NA   NA
 5593590 5593591 RC1_0974 RC1_0975   gltX FALSE 0.199 77.000 0.000 1.000 N NA
 5593591 5593592 RC1_0975 RC1_0976 gltX cysS FALSE 0.455 196.000 0.021 1.000 Y NA
 5593592 5593593 RC1_0976 RC1_0977 cysS   FALSE 0.384 97.000 0.021 1.000 N NA
 5593593 5593594 RC1_0977 RC1_0978     TRUE 0.716 28.000 0.012 1.000 N NA
 5593594 5593595 RC1_0978 RC1_0979     FALSE 0.125 90.000 0.000 NA   NA
 5593595 5593596 RC1_0979 RC1_0980   rpsD FALSE 0.037 250.000 0.000 NA   NA
 5593597 5593598 RC1_0981 RC1_0982     TRUE 0.596 13.000 0.000 NA   NA
 5593599 5593600 RC1_0983 RC1_0984     FALSE 0.245 55.000 0.000 NA   NA
 5593601 5593602 RC1_0985 RC1_0986 mtrF   FALSE 0.049 204.000 0.000 NA N NA
 5593602 5593603 RC1_0986 RC1_0987     TRUE 0.749 119.000 0.216 NA N NA
 5593603 5593604 RC1_0987 RC1_0988   purL TRUE 0.831 50.000 0.093 NA N NA
 5593604 5593605 RC1_0988 RC1_0989 purL purQ TRUE 0.999 -3.000 0.346 0.001 Y NA
 5593605 5593606 RC1_0989 RC1_0990 purQ   FALSE 0.072 172.000 0.000 1.000 N NA
 5593606 5593607 RC1_0990 RC1_0991     TRUE 0.993 -3.000 0.231 NA   NA
 5593607 5593608 RC1_0991 RC1_0992     TRUE 0.747 0.000 0.000 NA   NA
 5593608 5593609 RC1_0992 RC1_0993   yycF TRUE 0.994 -3.000 0.229 0.074   NA
 5593609 5593610 RC1_0993 RC1_0994 yycF   FALSE 0.072 136.000 0.000 NA   NA
 5593610 5593611 RC1_0994 RC1_0995   secF FALSE 0.063 155.000 0.000 NA   NA
 5593611 5593612 RC1_0995 RC1_0996 secF hemA FALSE 0.053 228.000 0.000 1.000 N NA
 5593612 5593613 RC1_0996 RC1_0997 hemA   TRUE 0.524 224.000 0.040 0.015 Y NA
 5593616 5593617 RC1_1000 RC1_1001     TRUE 0.999 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 5593617 5593618 RC1_1001 RC1_1002     FALSE 0.093 121.000 0.000 1.000   NA
 5593618 5593619 RC1_1002 RC1_1003     TRUE 0.777 -22.000 0.000 NA   NA
 5593624 5593625 RC1_1008 RC1_1009 motB   TRUE 1.000 -10.000 0.913 1.000 Y NA
 5593627 5593628 RC1_1011 RC1_1012 tatA   FALSE 0.059 192.000 0.000 1.000   NA
 5593628 5593629 RC1_1012 RC1_1013     FALSE 0.075 126.000 0.000 NA   NA
 5593629 5593630 RC1_1013 RC1_1014     FALSE 0.062 157.000 0.000 NA   NA
 5593630 5593631 RC1_1014 RC1_1015     FALSE 0.049 188.000 0.000 NA   NA
 5593631 5593632 RC1_1015 RC1_1016     FALSE 0.054 178.000 0.000 NA   NA
 5593632 5593633 RC1_1016 RC1_1017     TRUE 0.932 12.000 0.060 1.000   NA
 5593634 5593635 RC1_1018 RC1_1019     FALSE 0.085 115.000 0.000 NA   NA
 5593636 5593637 RC1_1020 RC1_1021     FALSE 0.205 65.000 0.000 NA   NA
 5593637 5593638 RC1_1021 RC1_1022   xth FALSE 0.228 68.000 0.000 1.000   NA
 5593638 5593639 RC1_1022 RC1_1023 xth   FALSE 0.297 73.000 0.003 NA   NA
 5593640 5593641 RC1_1024 RC1_1025 dgt argS FALSE 0.093 134.000 0.000 1.000 N NA
 5593641 5593642 RC1_1025 RC1_1026 argS tonB TRUE 0.875 13.000 0.027 NA   NA
 5593642 5593643 RC1_1026 RC1_1027 tonB   TRUE 0.964 -25.000 0.056 NA   NA
 5593643 5593644 RC1_1027 RC1_1028     TRUE 0.899 4.000 0.013 1.000   NA
 5593644 5593645 RC1_1028 RC1_1029   scpA TRUE 0.962 8.000 0.092 NA   NA
 5593645 5593646 RC1_1029 RC1_1030 scpA scpB TRUE 0.981 57.000 0.570 NA   NA
 5593646 5593647 RC1_1030 RC1_1031 scpB   FALSE 0.326 176.000 0.060 NA N NA
 5593647 5593648 RC1_1031 RC1_1032   tatB TRUE 0.791 73.000 0.016 0.008 Y NA
 5593648 5593649 RC1_1032 RC1_1033 tatB tatC TRUE 0.966 6.000 0.014 NA Y NA
 5593649 5593650 RC1_1033 RC1_1034 tatC serS FALSE 0.371 163.000 0.065 NA N NA
 5593650 5593651 RC1_1034 RC1_1035 serS surE TRUE 0.968 -7.000 0.058 1.000   NA
 5593651 5593652 RC1_1035 RC1_1036 surE pcm TRUE 0.988 -3.000 0.147 1.000   NA
 5593652 5593653 RC1_1036 RC1_1037 pcm   TRUE 0.967 6.000 0.089 1.000 N NA
 5593653 5593654 RC1_1037 RC1_1038     FALSE 0.044 208.000 0.000 NA   NA
 5593654 5593655 RC1_1038 RC1_1039     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5593657 5593658 RC1_1041 RC1_1042 yajC secD TRUE 0.799 46.000 0.003 NA Y NA
 5593659 5593660 RC1_1043 RC1_1044 y4aB   TRUE 0.984 20.000 0.315 1.000   NA
 5593660 5593661 RC1_1044 RC1_1045   sodA FALSE 0.057 209.000 0.000 1.000 N NA
 5593665 5593666 RC1_1049 RC1_1050 braC braC TRUE 0.495 113.000 0.000 0.002 Y NA
 5593666 5593667 RC1_1050 RC1_1051 braC pcs FALSE 0.128 104.000 0.000 1.000 N NA
 5593670 5593671 RC1_1054 RC1_1055   ssb FALSE 0.074 131.000 0.000 NA   NA
 5593671 5593672 RC1_1055 RC1_1056 ssb   TRUE 0.747 0.000 0.000 NA   NA
 5593674 5593675 RC1_1058 RC1_1059 norM gyrA FALSE 0.132 154.000 0.002 1.000 N NA
 5593675 5593676 RC1_1059 RC1_1060 gyrA coaD TRUE 0.761 21.000 0.012 1.000 N NA
 5593676 5593677 RC1_1060 RC1_1061 coaD   FALSE 0.072 139.000 0.000 NA   NA
 5593677 5593678 RC1_1061 RC1_1062     FALSE 0.026 379.000 0.000 NA   NA
 5593678 5593679 RC1_1062 RC1_1063     FALSE 0.037 244.000 0.000 NA   NA
 5593680 5593681 RC1_1064 RC1_1065   omp FALSE 0.217 70.000 0.000 1.000   NA
 5593682 5593683 RC1_1066 RC1_1069 msbA   TRUE 0.547 21.000 0.000 1.000 N NA
 5593684 5593685 RC1_1068 RC1_1070   coxI TRUE 0.734 2.000 0.000 NA   NA
 5593685 5593686 RC1_1070 RC1_1072 coxI coxE TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5593686 5593687 RC1_1072 RC1_1073 coxE coxD TRUE 0.999 -3.000 0.645 NA   NA
 5593687 5593688 RC1_1073 RC1_1074 coxD coxM TRUE 0.955 -3.000 0.033 1.000   NA
 5593688 5593689 RC1_1074 RC1_1075 coxM coxL TRUE 0.976 12.000 0.037 0.001 Y NA
 5593689 5593690 RC1_1075 RC1_1076 coxL coxS TRUE 0.970 156.000 0.512 0.001 Y NA
 5593690 5593691 RC1_1076 RC1_1077 coxS coxG FALSE 0.134 151.000 0.000 0.001   NA
 5593691 5593692 RC1_1077 RC1_1078 coxG   FALSE 0.075 157.000 0.000 1.000   NA
 5593693 5593694 RC1_1079 RC1_1080     FALSE 0.041 225.000 0.000 NA   NA
 5593696 5593697 RC1_1082 RC1_1083     FALSE 0.101 104.000 0.000 NA   NA
 5593697 5593698 RC1_1083 RC1_1084     FALSE 0.160 77.000 0.000 NA   NA
 5593698 5593699 RC1_1084 RC1_1085     TRUE 0.533 17.000 0.000 NA   NA
 5593701 5593702 RC1_1087 RC1_1089 ner   TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5593704 5593705 RC1_1090 RC1_1091     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5593705 5593706 RC1_1091 RC1_1092     TRUE 0.978 54.000 0.500 NA   NA
 5593706 5593707 RC1_1092 RC1_1093     TRUE 0.990 3.000 0.222 NA   NA
 5593707 5593708 RC1_1093 RC1_1094     TRUE 0.995 -3.000 0.308 NA   NA
 5593708 5593709 RC1_1094 RC1_1095     TRUE 0.726 3.000 0.000 NA   NA
 5593709 5593710 RC1_1095 RC1_1096     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5593710 5593711 RC1_1096 RC1_1097     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5593711 5593712 RC1_1097 RC1_1098     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5593712 5593713 RC1_1098 RC1_1099     FALSE 0.117 94.000 0.000 NA   NA
 5593713 5593714 RC1_1099 RC1_1100     FALSE 0.283 47.000 0.000 NA   NA
 5593714 5593715 RC1_1100 RC1_1101     TRUE 0.784 -7.000 0.000 NA   NA
 5593715 5593716 RC1_1101 RC1_1102     FALSE 0.109 99.000 0.000 NA   NA
 5593716 5593717 RC1_1102 RC1_1103   gemA FALSE 0.270 50.000 0.000 NA   NA
 5593717 5593718 RC1_1103 RC1_1104 gemA   TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5593718 5593719 RC1_1104 RC1_1105   mor TRUE 0.682 6.000 0.000 NA   NA
 5593719 5593720 RC1_1105 RC1_1106 mor   FALSE 0.074 131.000 0.000 NA   NA
 5593720 5593721 RC1_1106 RC1_1107     TRUE 0.596 13.000 0.000 NA   NA
 5593721 5593722 RC1_1107 RC1_1108     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5593722 5593723 RC1_1108 RC1_1109     TRUE 0.699 5.000 0.000 NA   NA
 5593723 5593724 RC1_1109 RC1_1110     TRUE 0.993 -3.000 0.250 NA   NA
 5593724 5593725 RC1_1110 RC1_1111     TRUE 0.581 14.000 0.000 NA   NA
 5593725 5593726 RC1_1111 RC1_1112     TRUE 0.996 -3.000 0.333 NA   NA
 5593726 5593727 RC1_1112 RC1_1113     TRUE 0.747 0.000 0.000 NA   NA
 5593727 5593728 RC1_1113 RC1_1114     TRUE 0.784 -7.000 0.000 NA   NA
 5593728 5593729 RC1_1114 RC1_1115     FALSE 0.032 289.000 0.000 NA   NA
 5593729 5593730 RC1_1115 RC1_1116     TRUE 0.998 0.000 0.500 NA   NA
 5593730 5593731 RC1_1116 RC1_1117     TRUE 0.973 13.000 0.160 NA   NA
 5593731 5593732 RC1_1117 RC1_1118     TRUE 0.612 12.000 0.000 NA   NA
 5593732 5593733 RC1_1118 RC1_1119     FALSE 0.427 27.000 0.000 NA   NA
 5593733 5593734 RC1_1119 RC1_1120     TRUE 0.747 0.000 0.000 NA   NA
 5593734 5593735 RC1_1120 RC1_1121     TRUE 0.715 4.000 0.000 NA   NA
 5593735 5593736 RC1_1121 RC1_1122     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5593736 5593737 RC1_1122 RC1_1123     TRUE 0.734 2.000 0.000 NA   NA
 5593737 5593738 RC1_1123 RC1_1124     TRUE 0.931 13.000 0.067 NA   NA
 5593738 5593739 RC1_1124 RC1_1125     TRUE 0.949 7.000 0.067 NA   NA
 5593741 5593742 RC1_1127 RC1_1128     TRUE 0.747 0.000 0.000 NA   NA
 5593742 5593743 RC1_1128 RC1_1129     TRUE 0.972 9.000 0.125 NA   NA
 5593743 5593744 RC1_1129 RC1_1130     TRUE 0.983 4.000 0.154 NA   NA
 5593744 5593745 RC1_1130 RC1_1131     TRUE 0.782 -10.000 0.000 NA   NA
 5593745 5593746 RC1_1131 RC1_1132     FALSE 0.027 357.000 0.000 NA   NA
 5593746 5593747 RC1_1132 RC1_1133     TRUE 0.983 -3.000 0.111 NA   NA
 5593747 5593748 RC1_1133 RC1_1134     TRUE 0.784 -7.000 0.000 NA   NA
 5593748 5593749 RC1_1134 RC1_1135     TRUE 0.784 -7.000 0.000 NA   NA
 5593749 5593750 RC1_1135 RC1_1136     TRUE 0.699 5.000 0.000 NA   NA
 5593750 5593751 RC1_1136 RC1_1137     TRUE 0.581 14.000 0.000 NA   NA
 5593751 5593752 RC1_1137 RC1_1138     FALSE 0.185 70.000 0.000 NA   NA
 5593752 5593753 RC1_1138 RC1_1139     FALSE 0.177 72.000 0.000 NA   NA
 5593753 5593754 RC1_1139 RC1_1140     FALSE 0.034 269.000 0.000 NA   NA
 5593755 5593756 RC1_1141 RC1_1142     FALSE 0.039 239.000 0.000 NA   NA
 5593756 5593757 RC1_1142 RC1_1143     TRUE 0.976 -7.000 0.080 NA   NA
 5593759 5593760 RC1_1145 RC1_1146   hisL FALSE 0.041 227.000 0.000 NA   NA
 5593760 5593761 RC1_1146 RC1_1147 hisL metC TRUE 0.974 -3.000 0.003 1.000 Y NA
 5593761 5593762 RC1_1147 RC1_1148 metC   TRUE 0.815 -3.000 0.000 1.000   NA
 5593762 5593763 RC1_1148 RC1_1149   sseA TRUE 0.991 -3.000 0.200 1.000   NA
 5593763 5593764 RC1_1149 RC1_1150 sseA alaS TRUE 0.987 7.000 0.222 1.000   NA
 5593764 5593765 RC1_1150 RC1_1151 alaS   FALSE 0.132 98.000 0.000 1.000   NA
 5593766 5593767 RC1_1152 RC1_1153     FALSE 0.209 64.000 0.000 NA   NA
 5593767 5593768 RC1_1153 RC1_1154     FALSE 0.029 330.000 0.000 NA   NA
 5593772 5593773 RC1_1158 RC1_1159 pcm   TRUE 0.947 33.000 0.200 NA N NA
 5593773 5593774 RC1_1159 RC1_1160     TRUE 0.908 3.000 0.016 NA N NA
 5593774 5593775 RC1_1160 RC1_1161     FALSE 0.405 125.000 0.061 NA   NA
 5593775 5593776 RC1_1161 RC1_1162   valS FALSE 0.331 116.000 0.033 NA   NA
 5593776 5593777 RC1_1162 RC1_1163 valS ilvD FALSE 0.119 171.000 0.002 1.000 N NA
 5593777 5593778 RC1_1163 RC1_1164 ilvD   FALSE 0.367 33.000 0.000 NA   NA
 5593778 5593779 RC1_1164 RC1_1165   mltB FALSE 0.276 135.000 0.027 NA   NA
 5593779 5593780 RC1_1165 RC1_1166 mltB rlpA TRUE 0.853 44.000 0.016 NA Y NA
 5593780 5593781 RC1_1166 RC1_1167 rlpA dacA TRUE 0.915 93.000 0.198 NA Y NA
 5593781 5593782 RC1_1167 RC1_1168 dacA holB FALSE 0.257 64.000 0.000 1.000 N NA
 5593782 5593783 RC1_1168 RC1_1169 holB metG TRUE 0.740 66.000 0.075 1.000 N NA
 5593783 5593784 RC1_1169 RC1_1170 metG   TRUE 0.991 0.000 0.221 NA N NA
 5593784 5593785 RC1_1170 RC1_1171     TRUE 0.979 5.000 0.139 NA   NA
 5593786 5593787 RC1_1172 RC1_1173   kaiC TRUE 0.679 70.000 0.000 0.098 Y NA
 5593787 5593788 RC1_1173 RC1_1174 kaiC   FALSE 0.034 375.000 0.000 1.000 N NA
 5593788 5593789 RC1_1174 RC1_1175     FALSE 0.116 95.000 0.000 NA   NA
 5593794 5593795 RC1_1180 RC1_1181     FALSE 0.118 109.000 0.000 1.000 N NA
 5593795 5593796 RC1_1181 RC1_1182     FALSE 0.092 137.000 0.000 1.000 N NA
 5593796 5593797 RC1_1182 RC1_1183     FALSE 0.211 74.000 0.000 1.000 N NA
 5593797 5593798 RC1_1183 RC1_1184   cirA FALSE 0.041 284.000 0.000 1.000 N NA
 5593798 5593799 RC1_1184 RC1_1185 cirA   FALSE 0.477 27.000 0.000 1.000   NA
 5593801 5593802 RC1_1187 RC1_1188     TRUE 0.996 26.000 0.750 NA   NA
 5593802 5593803 RC1_1188 RC1_1189   lexA FALSE 0.024 465.000 0.000 NA   NA
 5593805 5593806 RC1_1191 RC1_1192 gltX gltA TRUE 0.689 105.000 0.127 1.000 N NA
 5593807 5593808 RC1_1193 RC1_1194   lpxB FALSE 0.043 260.000 0.000 1.000   NA
 5593808 5593809 RC1_1194 RC1_1195 lpxB   TRUE 0.990 -3.000 0.173 NA   NA
 5593809 5593810 RC1_1195 RC1_1196   lpxA TRUE 0.997 6.000 0.552 NA   NA
 5593810 5593811 RC1_1196 RC1_1197 lpxA fabZ TRUE 0.989 8.000 0.264 1.000 N NA
 5593811 5593812 RC1_1197 RC1_1198 fabZ lpxD TRUE 0.992 -16.000 0.212 1.000 N NA
 5593812 5593813 RC1_1198 RC1_1199 lpxD ompH TRUE 0.983 6.000 0.060 1.000 Y NA
 5593813 5593814 RC1_1199 RC1_1200 ompH   TRUE 0.988 12.000 0.123 1.000 Y NA
 5593814 5593815 RC1_1200 RC1_1201     TRUE 0.986 25.000 0.204 1.000 Y NA
 5593815 5593816 RC1_1201 RC1_1202   dxr TRUE 0.994 21.000 0.568 1.000 N NA
 5593816 5593817 RC1_1202 RC1_1203 dxr cdsA TRUE 0.999 -9.000 0.372 1.000 Y NA
 5593817 5593818 RC1_1203 RC1_1204 cdsA uppS TRUE 0.999 -61.000 0.400 1.000 Y NA
 5593818 5593819 RC1_1204 RC1_1205 uppS frr TRUE 0.988 24.000 0.409 1.000 N NA
 5593819 5593820 RC1_1205 RC1_1206 frr pyrH TRUE 0.998 2.000 0.626 1.000 N NA
 5593820 5593821 RC1_1206 RC1_1207 pyrH tsf TRUE 0.942 86.000 0.416 1.000 N NA
 5593821 5593822 RC1_1207 RC1_1208 tsf rpsB TRUE 0.990 98.000 0.748 1.000 Y NA
 5593826 5593827 RC1_1212 RC1_1213 alkA alkA FALSE 0.078 120.000 0.000 NA   NA
 5593827 5593828 RC1_1213 RC1_1214 alkA lolD TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5593828 5593829 RC1_1214 RC1_1215 lolD   TRUE 0.998 8.000 0.620 1.000 N NA
 5593829 5593830 RC1_1215 RC1_1216   proS TRUE 0.485 124.000 0.076 1.000 N NA
 5593830 5593831 RC1_1216 RC1_1217 proS   FALSE 0.039 239.000 0.000 NA   NA
 5593831 5593832 RC1_1217 RC1_1218     FALSE 0.245 55.000 0.000 NA   NA
 5593832 5593833 RC1_1218 RC1_1219     FALSE 0.073 135.000 0.000 NA   NA
 5593835 5593836 RC1_1221 RC1_1222     TRUE 0.897 7.000 0.020 NA   NA
 5593836 5593837 RC1_1222 RC1_1223     TRUE 0.980 10.000 0.172 NA   NA
 5593837 5593838 RC1_1223 RC1_1224     TRUE 0.917 29.000 0.105 1.000   NA
 5593838 5593839 RC1_1224 RC1_1225     TRUE 0.953 11.000 0.080 1.000   NA
 5593839 5593840 RC1_1225 RC1_1226   birA TRUE 0.835 12.000 0.010 1.000 N NA
 5593840 5593841 RC1_1226 RC1_1227 birA nuoN TRUE 0.911 11.000 0.032 1.000 N NA
 5593841 5593842 RC1_1227 RC1_1228 nuoN nuoM TRUE 0.999 4.000 0.453 0.003 Y NA
 5593842 5593843 RC1_1228 RC1_1229 nuoM nuoL TRUE 0.993 19.000 0.251 0.003 Y NA
 5593843 5593844 RC1_1229 RC1_1230 nuoL nuoK TRUE 0.999 5.000 0.451 0.008 Y NA
 5593844 5593845 RC1_1230 RC1_1231 nuoK nuoJ TRUE 0.999 2.000 0.484 0.003 Y NA
 5593845 5593846 RC1_1231 RC1_1232 nuoJ nuoI TRUE 0.965 122.000 0.442 0.008 Y NA
 5593846 5593847 RC1_1232 RC1_1233 nuoI nuoH TRUE 0.985 87.000 0.500 0.008 Y NA
 5593847 5593848 RC1_1233 RC1_1234 nuoH nuoG TRUE 0.999 8.000 0.515 0.008 Y NA
 5593848 5593849 RC1_1234 RC1_1235 nuoG nuoF TRUE 0.973 96.000 0.395 0.008 Y NA
 5593849 5593850 RC1_1235 RC1_1236 nuoF nuoE TRUE 0.997 14.000 0.343 0.006 Y NA
 5593850 5593851 RC1_1236 RC1_1237 nuoE nuoD TRUE 0.999 -3.000 0.355 0.006 Y NA
 5593851 5593852 RC1_1237 RC1_1238 nuoD nuoC TRUE 0.999 8.000 0.483 0.008 Y NA
 5593852 5593853 RC1_1238 RC1_1239 nuoC nuoB TRUE 0.994 28.000 0.328 0.003 Y NA
 5593853 5593854 RC1_1239 RC1_1240 nuoB nuoA TRUE 0.999 -9.000 0.507 0.003 Y NA
 5593854 5593855 RC1_1240 RC1_1241 nuoA   FALSE 0.023 501.000 0.000 NA   NA
 5593855 5593856 RC1_1241 RC1_1242     FALSE 0.076 124.000 0.000 NA   NA
 5593856 5593857 RC1_1242 RC1_1243     FALSE 0.055 174.000 0.000 NA   NA
 5593857 5593858 RC1_1243 RC1_1244   hupA FALSE 0.059 164.000 0.000 NA   NA
 5593858 5593859 RC1_1244 RC1_1245 hupA lon FALSE 0.349 143.000 0.043 1.000 N NA
 5593861 5593862 RC1_1247 RC1_1248 clpX clpP TRUE 0.884 255.000 0.352 1.000 Y NA
 5593862 5593863 RC1_1248 RC1_1249 clpP tig TRUE 0.977 73.000 0.351 1.000 Y NA
 5593863 5593864 RC1_1249 RC1_1250 tig   FALSE 0.109 99.000 0.000 NA   NA
 5593864 5593865 RC1_1250 RC1_1251     FALSE 0.082 117.000 0.000 NA   NA
 5593865 5593866 RC1_1251 RC1_1252     FALSE 0.053 180.000 0.000 NA   NA
 5593866 5593867 RC1_1252 RC1_1253     FALSE 0.031 290.000 0.000 NA   NA
 5593867 5593868 RC1_1253 RC1_1254     FALSE 0.358 34.000 0.000 NA   NA
 5593868 5593869 RC1_1254 RC1_1255     TRUE 0.969 11.000 0.124 NA   NA
 5593869 5593870 RC1_1255 RC1_1256     FALSE 0.129 88.000 0.000 NA   NA
 5593871 5593872 RC1_1257 RC1_1258 glnB glnA TRUE 0.828 135.000 0.145 1.000 Y NA
 5593872 5593873 RC1_1258 RC1_1259 glnA   FALSE 0.063 156.000 0.000 NA   NA
 5593876 5593877 RC1_1262 RC1_1263 mfd   TRUE 0.830 41.000 0.078 NA   NA
 5593878 5593879 RC1_1264 RC1_1265   recG FALSE 0.473 104.000 0.000 1.000 Y NA
 5593881 5593882 RC1_1268 RC1_1269 bcsA   TRUE 0.754 4.000 0.000 1.000   NA
 5593882 5593883 RC1_1269 RC1_1270     FALSE 0.089 131.000 0.000 1.000   NA
 5593884 5593885 RC1_1271 RC1_1272 fliN   FALSE 0.045 206.000 0.000 NA   NA
 5593885 5593886 RC1_1272 RC1_1273   fixS FALSE 0.306 42.000 0.000 NA   NA
 5593886 5593887 RC1_1273 RC1_1274 fixS fixI TRUE 1.000 -3.000 0.713 NA Y NA
 5593887 5593888 RC1_1274 RC1_1275 fixI fixH TRUE 0.997 -3.000 0.206 NA Y NA
 5593888 5593889 RC1_1275 RC1_1276 fixH fixG FALSE 0.457 26.000 0.000 NA N NA
 5593889 5593890 RC1_1276 RC1_1277 fixG ccoP FALSE 0.257 224.000 0.000 1.000 Y NA
 5593890 5593891 RC1_1277 RC1_1278 ccoP ccoQ TRUE 0.993 8.000 0.300 0.003   NA
 5593891 5593892 RC1_1278 RC1_1279 ccoQ ccoO TRUE 0.992 10.000 0.300 0.003   NA
 5593892 5593893 RC1_1279 RC1_1280 ccoO ccoN TRUE 0.998 14.000 0.800 0.003 N NA
 5593896 5593897 RC1_1283 RC1_1284     FALSE 0.021 1219.000 0.000 NA   NA
 5593897 5593898 RC1_1284 RC1_1285     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5593898 5593899 RC1_1285 RC1_1286     TRUE 0.747 0.000 0.000 NA   NA
 5593899 5593900 RC1_1286 RC1_1287     FALSE 0.028 352.000 0.000 NA   NA
 5593900 5593901 RC1_1287 RC1_1288     FALSE 0.027 372.000 0.000 NA   NA
 5593901 5593902 RC1_1288 RC1_1289     TRUE 0.999 -10.000 1.000 NA   NA
 5593902 5593903 RC1_1289 RC1_1290     TRUE 0.974 62.000 0.500 NA   NA
 5593903 5593904 RC1_1290 RC1_1291     TRUE 0.998 -10.000 0.500 NA   NA
 5593904 5593905 RC1_1291 RC1_1292     TRUE 0.994 3.000 0.333 NA   NA
 5593905 5593906 RC1_1292 RC1_1293     TRUE 0.998 4.000 0.667 NA   NA
 5593906 5593907 RC1_1293 RC1_1294     FALSE 0.109 99.000 0.000 NA   NA
 5593907 5593908 RC1_1294 RC1_1295     FALSE 0.181 71.000 0.000 NA   NA
 5593908 5593909 RC1_1295 RC1_1297     FALSE 0.023 490.000 0.000 NA   NA
 5593910 5593911 RC1_1296 RC1_1298     FALSE 0.427 27.000 0.000 NA   NA
 5593912 5593913 RC1_1299 RC1_1300     TRUE 0.726 3.000 0.000 NA   NA
 5593913 5593914 RC1_1300 RC1_1301     TRUE 0.784 -7.000 0.000 NA   NA
 5593915 5593916 RC1_1302 RC1_1303   recJ FALSE 0.113 97.000 0.000 NA   NA
 5593916 5593917 RC1_1303 RC1_1304 recJ glpX TRUE 0.649 71.000 0.055 1.000 N NA
 5593917 5593918 RC1_1304 RC1_1305 glpX hom TRUE 0.718 89.000 0.112 1.000 N NA
 5593918 5593919 RC1_1305 RC1_1306 hom   TRUE 0.993 12.000 0.202 1.000 Y NA
 5593919 5593920 RC1_1306 RC1_1307     FALSE 0.125 90.000 0.000 NA   NA
 5593922 5593923 RC1_1309 RC1_1310     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5593923 5593924 RC1_1310 RC1_1311   argC FALSE 0.306 42.000 0.000 NA   NA
 5593924 5593925 RC1_1311 RC1_1312 argC   FALSE 0.313 52.000 0.000 1.000 N NA
 5593925 5593926 RC1_1312 RC1_1313   rpsI FALSE 0.125 105.000 0.000 1.000 N NA
 5593926 5593927 RC1_1313 RC1_1314 rpsI rplM TRUE 0.997 5.000 0.231 0.013 Y NA
 5593930 5593931 RC1_1317 RC1_1318     TRUE 0.608 29.000 0.006 NA   NA
 5593931 5593932 RC1_1318 RC1_1319     TRUE 0.881 -3.000 0.004 NA   NA
 5593933 5593934 RC1_1320 RC1_1321   cutA TRUE 0.796 -3.000 0.000 NA N NA
 5593935 5593936 RC1_1322 RC1_1323 lolB   FALSE 0.073 133.000 0.000 NA   NA
 5593937 5593938 RC1_1324 RC1_1325     FALSE 0.026 388.000 0.000 NA   NA
 5593938 5593939 RC1_1325 RC1_1326   ihfA TRUE 0.997 8.000 0.535 1.000   NA
 5593939 5593940 RC1_1326 RC1_1327 ihfA fabH TRUE 0.717 146.000 0.207 1.000 N NA
 5593940 5593941 RC1_1327 RC1_1328 fabH plsX TRUE 0.999 0.000 0.380 0.004 Y NA
 5593941 5593942 RC1_1328 RC1_1329 plsX rpmF TRUE 0.967 62.000 0.418 1.000 N NA
 5593942 5593943 RC1_1329 RC1_1330 rpmF   TRUE 0.956 102.000 0.599 NA   NA
 5593943 5593944 RC1_1330 RC1_1331     TRUE 0.955 6.000 0.071 NA   NA
 5593946 5593947 RC1_1333 RC1_1334 hppA fliL FALSE 0.041 268.000 0.000 1.000   NA
 5593947 5593948 RC1_1334 RC1_1335 fliL thiL FALSE 0.187 117.000 0.006 1.000   NA
 5593948 5593949 RC1_1335 RC1_1336 thiL nusB TRUE 0.962 31.000 0.225 1.000 N NA
 5593949 5593950 RC1_1336 RC1_1337 nusB ribH TRUE 0.985 23.000 0.347 1.000 N NA
 5593950 5593951 RC1_1337 RC1_1338 ribH ribAB TRUE 0.905 30.000 0.006 0.003 Y NA
 5593951 5593952 RC1_1338 RC1_1339 ribAB ribE TRUE 0.978 -3.000 0.007 1.000 Y NA
 5593952 5593953 RC1_1339 RC1_1340 ribE ribD TRUE 0.981 82.000 0.456 1.000 Y NA
 5593953 5593954 RC1_1340 RC1_1341 ribD   TRUE 0.988 11.000 0.277 NA N NA
 5593954 5593955 RC1_1341 RC1_1342   glyA TRUE 0.708 29.000 0.015 NA N NA
 5593955 5593956 RC1_1342 RC1_1343 glyA rpiB TRUE 0.863 35.000 0.077 1.000 N NA
 5593958 5593959 RC1_1345 RC1_1346   expG TRUE 0.493 20.000 0.000 NA   NA
 5593959 5593960 RC1_1346 RC1_1347 expG mmsB TRUE 0.570 68.000 0.027 1.000 N NA
 5593960 5593961 RC1_1347 RC1_1348 mmsB   TRUE 0.849 65.000 0.041 1.000 Y NA
 5593961 5593962 RC1_1348 RC1_1349     TRUE 0.874 83.000 0.096 1.000 Y NA
 5593963 5593964 RC1_1350 RC1_1351     TRUE 0.652 9.000 0.000 NA   NA
 5593964 5593965 RC1_1351 RC1_1352     TRUE 0.995 10.000 0.446 1.000   NA
 5593965 5593966 RC1_1352 RC1_1353   hemB FALSE 0.239 95.000 0.005 1.000   NA
 5593966 5593967 RC1_1353 RC1_1354 hemB   FALSE 0.022 705.000 0.000 NA   NA
 5593968 5593969 RC1_1355 RC1_1356     FALSE 0.358 34.000 0.000 NA   NA
 5593969 5593970 RC1_1356 RC1_1357   ldc FALSE 0.205 65.000 0.000 NA   NA
 5593971 5593972 RC1_1358 RC1_1360 betB acyII FALSE 0.429 32.000 0.000 1.000   NA
 5593974 5593975 RC1_1361 RC1_1362 motB   FALSE 0.046 200.000 0.000 NA   NA
 5593975 5593976 RC1_1362 RC1_1363     TRUE 0.943 -3.000 0.024 NA   NA
 5593976 5593977 RC1_1363 RC1_1364     FALSE 0.266 85.000 0.005 NA   NA
 5593977 5593978 RC1_1364 RC1_1365     FALSE 0.254 53.000 0.000 NA   NA
 5593978 5593979 RC1_1365 RC1_1366     FALSE 0.328 38.000 0.000 NA   NA
 5593979 5593980 RC1_1366 RC1_1367     FALSE 0.240 56.000 0.000 NA   NA
 5593980 5593981 RC1_1367 RC1_1368     FALSE 0.035 330.000 0.000 1.000   NA
 5593981 5593982 RC1_1368 RC1_1369     FALSE 0.073 133.000 0.000 NA   NA
 5593984 5593985 RC1_1371 RC1_1372 parE   FALSE 0.397 35.000 0.000 1.000   NA
 5593986 5593987 RC1_1373 RC1_1374     FALSE 0.148 82.000 0.000 NA   NA
 5593987 5593988 RC1_1374 RC1_1375     FALSE 0.117 94.000 0.000 NA   NA
 5593989 5593990 RC1_1376 RC1_1377     TRUE 0.901 5.000 0.018 NA   NA
 5593990 5593991 RC1_1377 RC1_1378   ostA FALSE 0.098 105.000 0.000 NA   NA
 5593991 5593992 RC1_1378 RC1_1379 ostA   FALSE 0.185 82.000 0.000 1.000 N NA
 5593992 5593993 RC1_1379 RC1_1380     FALSE 0.077 122.000 0.000 NA   NA
 5593993 5593994 RC1_1380 RC1_1381     FALSE 0.107 100.000 0.000 NA   NA
 5593995 5593996 RC1_1382 RC1_1383     TRUE 0.985 -3.000 0.123 NA   NA
 5593996 5593997 RC1_1383 RC1_1384     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5593998 5593999 RC1_1385 RC1_1386     TRUE 0.598 89.000 0.000 0.003 Y NA
 5593999 5594000 RC1_1386 RC1_1387   flgF FALSE 0.045 262.000 0.000 1.000 N NA
 5594000 5594001 RC1_1387 RC1_1388 flgF flgG TRUE 0.992 13.000 0.163 0.002 Y NA
 5594001 5594002 RC1_1388 RC1_1389 flgG flgA TRUE 0.958 33.000 0.235 NA   NA
 5594002 5594003 RC1_1389 RC1_1390 flgA flgH TRUE 0.612 12.000 0.000 NA   NA
 5594004 5594005 RC1_1391 RC1_1392 dksA fliX TRUE 0.490 133.000 0.086 NA   NA
 5594006 5594007 RC1_1393 RC1_1394 flgI cheL TRUE 0.958 0.000 0.056 NA   NA
 5594007 5594008 RC1_1394 RC1_1395 cheL   FALSE 0.104 102.000 0.000 NA   NA
 5594010 5594011 RC1_1397 RC1_1398 fliK flgD TRUE 0.520 18.000 0.000 NA   NA
 5594011 5594012 RC1_1398 RC1_1399 flgD   FALSE 0.077 122.000 0.000 NA   NA
 5594013 5594014 RC1_1400 RC1_1401   engA FALSE 0.167 75.000 0.000 NA   NA
 5594014 5594015 RC1_1401 RC1_1402 engA   TRUE 0.980 12.000 0.203 NA   NA
 5594015 5594016 RC1_1402 RC1_1403     TRUE 0.988 -3.000 0.154 NA   NA
 5594016 5594017 RC1_1403 RC1_1404     FALSE 0.255 112.000 0.016 NA   NA
 5594017 5594018 RC1_1404 RC1_1405     FALSE 0.099 121.000 0.000 1.000 N NA
 5594020 5594021 RC1_1407 RC1_1408 narL   FALSE 0.022 833.000 0.000 NA   NA
 5594021 5594022 RC1_1408 RC1_1409     FALSE 0.060 162.000 0.000 NA   NA
 5594022 5594023 RC1_1409 RC1_1410     FALSE 0.304 51.000 0.000 1.000   NA
 5594026 5594027 RC1_1413 RC1_1414 nagA   FALSE 0.067 174.000 0.000 1.000   NA
 5594028 5594029 RC1_1415 RC1_1416 hyfI hyfG TRUE 0.999 11.000 0.631 0.003 Y NA
 5594029 5594030 RC1_1416 RC1_1417 hyfG hyfF TRUE 1.000 0.000 0.659 0.008 Y NA
 5594030 5594031 RC1_1417 RC1_1418 hyfF hyfE TRUE 0.999 27.000 0.864 NA Y NA
 5594031 5594032 RC1_1418 RC1_1419 hyfE hyfC TRUE 0.999 9.000 0.679 NA Y NA
 5594032 5594033 RC1_1419 RC1_1420 hyfC hyfB TRUE 0.999 -3.000 0.398 1.000 Y NA
 5594035 5594036 RC1_1422 RC1_1423 aspG   FALSE 0.046 202.000 0.000 NA   NA
 5594036 5594037 RC1_1423 RC1_1424   cheYIII TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5594038 5594039 RC1_1425 RC1_1426     FALSE 0.057 170.000 0.000 NA   NA
 5594039 5594040 RC1_1426 RC1_1427     TRUE 0.699 5.000 0.000 NA   NA
 5594040 5594041 RC1_1427 RC1_1428     FALSE 0.053 189.000 0.000 NA N NA
 5594041 5594042 RC1_1428 RC1_1429     FALSE 0.243 59.000 0.000 NA N NA
 5594042 5594043 RC1_1429 RC1_1430     TRUE 0.985 -3.000 0.125 NA N NA
 5594044 5594045 RC1_1431 RC1_1432 pssA   TRUE 0.999 0.000 0.466 1.000 Y NA
 5594046 5594047 RC1_1433 RC1_1434     FALSE 0.064 153.000 0.000 NA   NA
 5594047 5594048 RC1_1434 RC1_1435     TRUE 0.956 116.000 0.667 NA   NA
 5594048 5594049 RC1_1435 RC1_1436     FALSE 0.296 44.000 0.000 NA   NA
 5594049 5594050 RC1_1436 RC1_1437   rbn TRUE 0.992 -3.000 0.222 NA   NA
 5594051 5594052 RC1_1438 RC1_1439 hrpB   FALSE 0.145 83.000 0.000 NA   NA
 5594052 5594053 RC1_1439 RC1_1440     FALSE 0.408 29.000 0.000 NA   NA
 5594053 5594054 RC1_1440 RC1_1441     TRUE 0.913 -3.000 0.011 NA   NA
 5594054 5594055 RC1_1441 RC1_1442   metN TRUE 0.983 5.000 0.059 NA Y NA
 5594055 5594056 RC1_1442 RC1_1443 metN   TRUE 0.989 -40.000 0.059 NA Y NA
 5594058 5594059 RC1_1444 RC1_1446     TRUE 0.989 -3.000 0.051 1.000 Y NA
 5594059 5594060 RC1_1446 RC1_1447     TRUE 0.999 3.000 0.702 NA Y NA
 5594061 5594062 RC1_1448 RC1_1449     TRUE 0.996 -7.000 0.316 1.000   NA
 5594064 5594065 RC1_1451 RC1_1452   puuC FALSE 0.098 117.000 0.000 1.000   NA
 5594065 5594066 RC1_1452 RC1_1453 puuC clpP FALSE 0.203 76.000 0.000 1.000 N NA
 5594066 5594067 RC1_1453 RC1_1455 clpP   FALSE 0.157 87.000 0.000 1.000   NA
 5594068 5594069 RC1_1454 RC1_1456   aguA FALSE 0.343 36.000 0.000 NA   NA
 5594069 5594070 RC1_1456 RC1_1457 aguA potI FALSE 0.156 531.000 0.000 1.000 Y NA
 5594070 5594071 RC1_1457 RC1_1458 potI potH TRUE 0.995 4.000 0.152 0.031 Y NA
 5594071 5594072 RC1_1458 RC1_1459 potH potG TRUE 0.991 11.000 0.152 1.000 Y NA
 5594072 5594073 RC1_1459 RC1_1460 potG potF TRUE 0.987 102.000 0.667 1.000 Y NA
 5594073 5594074 RC1_1460 RC1_1461 potF   FALSE 0.040 300.000 0.000 1.000 N NA
 5594074 5594075 RC1_1461 RC1_1462     TRUE 0.775 -36.000 0.000 NA   NA
 5594076 5594077 RC1_1463 RC1_1464     FALSE 0.309 53.000 0.000 1.000 N NA
 5594079 5594080 RC1_1466 RC1_1467 puuA   FALSE 0.148 82.000 0.000 NA   NA
 5594080 5594081 RC1_1467 RC1_1468     TRUE 0.715 4.000 0.000 NA   NA
 5594082 5594083 RC1_1469 RC1_1470     FALSE 0.121 104.000 0.000 1.000   NA
 5594084 5594085 RC1_1471 RC1_1472     TRUE 0.644 10.000 0.000 NA   NA
 5594085 5594086 RC1_1472 RC1_1473     FALSE 0.065 152.000 0.000 NA   NA
 5594086 5594087 RC1_1473 RC1_1474   capD FALSE 0.044 271.000 0.000 1.000 N NA
 5594087 5594088 RC1_1474 RC1_1475 capD   FALSE 0.074 145.000 0.000 NA N NA
 5594088 5594089 RC1_1475 RC1_1476     TRUE 0.986 13.000 0.119 NA Y NA
 5594090 5594091 RC1_1477 RC1_1478     TRUE 0.581 14.000 0.000 NA   NA
 5594093 5594094 RC1_1480 RC1_1481   parC FALSE 0.070 152.000 0.000 NA N NA
 5594094 5594095 RC1_1481 RC1_1482 parC recO TRUE 0.983 -3.000 0.020 1.000 Y NA
 5594097 5594098 RC1_1484 RC1_1485     FALSE 0.021 1118.000 0.000 NA   NA
 5594098 5594099 RC1_1485 RC1_1486     FALSE 0.157 78.000 0.000 NA   NA
 5594100 5594101 RC1_1487 RC1_1488     FALSE 0.116 95.000 0.000 NA   NA
 5594101 5594102 RC1_1488 RC1_1489     TRUE 0.671 7.000 0.000 NA   NA
 5594102 5594103 RC1_1489 RC1_1490     TRUE 0.507 19.000 0.000 NA   NA
 5594103 5594104 RC1_1490 RC1_1491     FALSE 0.201 66.000 0.000 NA   NA
 5594104 5594105 RC1_1491 RC1_1492     FALSE 0.028 342.000 0.000 NA   NA
 5594106 5594107 RC1_1493 RC1_1494 era rnc TRUE 0.984 -3.000 0.098 0.031   NA
 5594107 5594108 RC1_1494 RC1_1495 rnc lepB TRUE 0.971 -3.000 0.062 1.000 N NA
 5594108 5594109 RC1_1495 RC1_1496 lepB acpS FALSE 0.402 162.000 0.070 1.000 N NA
 5594109 5594110 RC1_1496 RC1_1497 acpS pdxJ TRUE 0.996 -3.000 0.326 1.000 N NA
 5594110 5594111 RC1_1497 RC1_1498 pdxJ   TRUE 0.963 -3.000 0.050 NA   NA
 5594111 5594112 RC1_1498 RC1_1499     TRUE 0.864 36.000 0.086 NA   NA
 5594112 5594113 RC1_1499 RC1_1500   rpoZ TRUE 0.923 119.000 0.291 1.000 Y NA
 5594113 5594114 RC1_1500 RC1_1501 rpoZ folK TRUE 0.551 86.000 0.049 1.000 N NA
 5594115 5594116 RC1_1502 RC1_1503     TRUE 0.985 6.000 0.204 NA   NA
 5594117 5594118 RC1_1504 RC1_1505   ssrA FALSE 0.119 93.000 0.000 NA   NA
 5594118 5594119 RC1_1505 RC1_1506 ssrA dapA TRUE 0.872 26.000 0.058 1.000 N NA
 5594120 5594121 RC1_1507 RC1_1508     FALSE 0.030 304.000 0.000 NA   NA
 5594122 5594123 RC1_1509 RC1_1510     FALSE 0.083 116.000 0.000 NA   NA
 5594123 5594124 RC1_1510 RC1_1511     FALSE 0.132 87.000 0.000 NA   NA
 5594126 5594127 RC1_1513 RC1_1514     TRUE 0.754 4.000 0.000 1.000   NA
 5594127 5594128 RC1_1514 RC1_1515     FALSE 0.024 431.000 0.000 NA   NA
 5594128 5594129 RC1_1515 RC1_1516   gatA FALSE 0.052 181.000 0.000 NA   NA
 5594129 5594130 RC1_1516 RC1_1517 gatA gatC TRUE 1.000 0.000 0.643 0.001 Y NA
 5594131 5594132 RC1_1518 RC1_1519     TRUE 0.938 -3.000 0.017 1.000   NA
 5594134 5594135 RC1_1521 RC1_1522     FALSE 0.135 100.000 0.000 1.000 N NA
 5594137 5594138 RC1_1524 RC1_1525 pyrB pyrC' TRUE 0.997 16.000 0.452 1.000 Y NA
 5594138 5594139 RC1_1525 RC1_1526 pyrC'   TRUE 0.892 37.000 0.108 1.000   NA
 5594139 5594140 RC1_1526 RC1_1527   dprA TRUE 0.636 83.000 0.070 1.000   NA
 5594140 5594141 RC1_1527 RC1_1528 dprA topA TRUE 0.980 42.000 0.238 1.000 Y NA
 5594141 5594142 RC1_1528 RC1_1529 topA rnr FALSE 0.362 140.000 0.045 1.000 N NA
 5594142 5594143 RC1_1529 RC1_1530 rnr   FALSE 0.140 150.000 0.003 1.000 N NA
 5594143 5594144 RC1_1530 RC1_1531   rpmG FALSE 0.108 191.000 0.003 1.000 N NA
 5594145 5594146 RC1_1532 RC1_1533   divK TRUE 0.994 39.000 0.461 0.023 Y NA
 5594149 5594150 RC1_1536 RC1_1537     TRUE 0.990 -13.000 0.167 1.000 N NA
 5594154 5594155 RC1_1541 RC1_1542 rnd   FALSE 0.082 117.000 0.000 NA   NA
 5594156 5594157 RC1_1543 RC1_1544   ppk TRUE 0.986 17.000 0.149 NA Y NA
 5594158 5594159 RC1_1545 RC1_1546 sixA   FALSE 0.127 89.000 0.000 NA   NA
 5594160 5594161 RC1_1547 RC1_1548     TRUE 0.985 24.000 0.362 NA   NA
 5594161 5594162 RC1_1548 RC1_1549     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5594162 5594163 RC1_1549 RC1_1550     TRUE 0.644 10.000 0.000 NA   NA
 5594164 5594165 RC1_1551 RC1_1552 purM purN TRUE 0.998 -12.000 0.230 0.002 Y NA
 5594165 5594166 RC1_1552 RC1_1553 purN   FALSE 0.074 129.000 0.000 NA   NA
 5594168 5594169 RC1_1555 RC1_1556   pmtA FALSE 0.061 186.000 0.000 1.000   NA
 5594170 5594171 RC1_1557 RC1_1558     FALSE 0.180 80.000 0.000 1.000   NA
 5594172 5594173 RC1_1559 RC1_1560   gmk TRUE 0.817 113.000 0.276 NA   NA
 5594174 5594175 RC1_1561 RC1_1562 ksgA pdxA TRUE 0.989 0.000 0.197 1.000 N NA
 5594175 5594176 RC1_1562 RC1_1563 pdxA   TRUE 0.998 -3.000 0.561 1.000 N NA
 5594176 5594177 RC1_1563 RC1_1564     FALSE 0.154 88.000 0.000 1.000   NA
 5594177 5594178 RC1_1564 RC1_1565     TRUE 0.998 6.000 0.631 0.045   NA
 5594179 5594180 RC1_1566 RC1_1567 pepA holC TRUE 0.805 110.000 0.230 1.000 N NA
 5594181 5594182 RC1_1568 RC1_1569   fabF TRUE 0.969 12.000 0.134 NA   NA
 5594182 5594183 RC1_1569 RC1_1570 fabF acpP TRUE 0.853 97.000 0.106 1.000 Y NA
 5594183 5594184 RC1_1570 RC1_1571 acpP fabG TRUE 0.923 174.000 0.321 0.004 Y NA
 5594184 5594185 RC1_1571 RC1_1572 fabG fabD TRUE 0.996 26.000 0.432 0.004 Y NA
 5594186 5594187 RC1_1573 RC1_1574 rpsF rpsR TRUE 0.999 -3.000 0.319 0.013 Y NA
 5594187 5594188 RC1_1574 RC1_1575 rpsR rplI TRUE 0.997 26.000 0.499 0.013 Y NA
 5594188 5594189 RC1_1575 RC1_1576 rplI cfa FALSE 0.052 229.000 0.000 1.000 N NA
 5594189 5594190 RC1_1576 RC1_1577 cfa dnaB FALSE 0.111 113.000 0.000 1.000 N NA
 5594190 5594191 RC1_1577 RC1_1578 dnaB alr TRUE 0.939 -7.000 0.017 1.000 N NA
 5594191 5594192 RC1_1578 RC1_1579 alr   FALSE 0.199 132.000 0.012 NA N NA
 5594192 5594193 RC1_1579 RC1_1580   mkl TRUE 0.996 -3.000 0.178 NA Y NA
 5594194 5594195 RC1_1581 RC1_1582     FALSE 0.190 69.000 0.000 NA   NA
 5594196 5594197 RC1_1583 RC1_1584 radA cvpA TRUE 0.970 5.000 0.094 1.000   NA
 5594197 5594198 RC1_1584 RC1_1585 cvpA purF TRUE 0.850 50.000 0.101 1.000   NA
 5594198 5594199 RC1_1585 RC1_1586 purF   TRUE 0.640 102.000 0.100 1.000 N NA
 5594204 5594205 RC1_1591 RC1_1592     FALSE 0.079 119.000 0.000 NA   NA
 5594205 5594206 RC1_1592 RC1_1593   gabD FALSE 0.071 174.000 0.000 1.000 N NA
 5594206 5594207 RC1_1593 RC1_1594 gabD glmU FALSE 0.072 173.000 0.000 1.000 N NA
 5594213 5594214 RC1_1600 RC1_1601     TRUE 0.952 -3.000 0.034 NA   NA
 5594215 5594216 RC1_1602 RC1_1603 cysQ   FALSE 0.072 139.000 0.000 NA   NA
 5594216 5594217 RC1_1603 RC1_1604     FALSE 0.150 81.000 0.000 NA   NA
 5594217 5594218 RC1_1604 RC1_1605     FALSE 0.073 133.000 0.000 NA   NA
 5594219 5594220 RC1_1606 RC1_1607 prfB ompW FALSE 0.038 329.000 0.000 1.000 N NA
 5594220 5594221 RC1_1607 RC1_1608 ompW mrcA FALSE 0.260 219.000 0.000 1.000 Y NA
 5594221 5594222 RC1_1608 RC1_1609 mrcA amiB TRUE 0.944 151.000 0.396 1.000 Y NA
 5594222 5594223 RC1_1609 RC1_1610 amiB   FALSE 0.023 488.000 0.000 NA   NA
 5594224 5594225 RC1_1611 RC1_1612 rne   FALSE 0.089 143.000 0.000 1.000 N NA
 5594226 5594227 RC1_1613 RC1_1614   fdx TRUE 0.901 7.000 0.018 1.000 N NA
 5594227 5594228 RC1_1614 RC1_1615 fdx   FALSE 0.188 124.000 0.007 1.000   NA
 5594230 5594231 RC1_1616 RC1_1618 nifS   TRUE 0.954 26.000 0.168 NA N NA
 5594231 5594232 RC1_1618 RC1_1619   cysE TRUE 0.933 33.000 0.154 NA N NA
 5594237 5594238 RC1_1624 RC1_1625 glnE   TRUE 0.983 -3.000 0.020 1.000 Y NA
 5594239 5594240 RC1_1626 RC1_1627     FALSE 0.079 119.000 0.000 NA   NA
 5594240 5594241 RC1_1627 RC1_1628     FALSE 0.075 128.000 0.000 NA   NA
 5594242 5594243 RC1_1629 RC1_1630     FALSE 0.338 39.000 0.000 NA N NA
 5594245 5594246 RC1_1632 RC1_1633     FALSE 0.072 137.000 0.000 NA   NA
 5594248 5594249 RC1_1635 RC1_1636     FALSE 0.038 242.000 0.000 NA   NA
 5594250 5594251 RC1_1637 RC1_1638     FALSE 0.328 38.000 0.000 NA   NA
 5594253 5594254 RC1_1640 RC1_1641 macB   TRUE 0.996 -3.000 0.163 NA Y NA
 5594254 5594255 RC1_1641 RC1_1642     TRUE 0.977 3.000 0.104 1.000 N NA
 5594255 5594256 RC1_1642 RC1_1643     FALSE 0.031 300.000 0.000 NA   NA
 5594256 5594257 RC1_1643 RC1_1644     FALSE 0.027 365.000 0.000 NA   NA
 5594257 5594258 RC1_1644 RC1_1645     TRUE 0.864 66.000 0.154 1.000   NA
 5594258 5594259 RC1_1645 RC1_1646   maf TRUE 0.972 11.000 0.133 NA N NA
 5594259 5594260 RC1_1646 RC1_1647 maf infA TRUE 0.975 16.000 0.207 NA N NA
 5594260 5594261 RC1_1647 RC1_1648 infA   TRUE 0.787 150.000 0.293 NA N NA
 5594261 5594262 RC1_1648 RC1_1649     TRUE 0.998 9.000 0.768 NA   NA
 5594262 5594263 RC1_1649 RC1_1650   hisD TRUE 0.976 11.000 0.157 NA   NA
 5594263 5594264 RC1_1650 RC1_1651 hisD hisG TRUE 0.998 -10.000 0.254 0.003 Y NA
 5594264 5594265 RC1_1651 RC1_1652 hisG   FALSE 0.061 160.000 0.000 NA   NA
 5594265 5594266 RC1_1652 RC1_1653   murA TRUE 0.852 61.000 0.138 NA   NA
 5594266 5594267 RC1_1653 RC1_1654 murA dcd FALSE 0.263 123.000 0.017 1.000 N NA
 5594267 5594268 RC1_1654 RC1_1655 dcd   FALSE 0.109 99.000 0.000 NA   NA
 5594274 5594275 RC1_1661 RC1_1663   rfaF TRUE 0.964 -3.000 0.000 NA Y NA
 5594276 5594277 RC1_1664 RC1_1665     FALSE 0.161 86.000 0.000 1.000   NA
 5594277 5594278 RC1_1665 RC1_1666     FALSE 0.068 147.000 0.000 NA   NA
 5594279 5594280 RC1_1667 RC1_1668 ppdK glyS FALSE 0.362 210.000 0.071 0.092 N NA
 5594280 5594281 RC1_1668 RC1_1669 glyS glyQ TRUE 0.999 3.000 0.651 0.001 Y NA
 5594281 5594282 RC1_1669 RC1_1670 glyQ   FALSE 0.048 192.000 0.000 NA   NA
 5594282 5594283 RC1_1670 RC1_1671     FALSE 0.062 158.000 0.000 NA   NA
 5594283 5594284 RC1_1671 RC1_1672   sohB FALSE 0.068 244.000 0.000 0.025   NA
 5594284 5594285 RC1_1672 RC1_1673 sohB   TRUE 0.783 16.000 0.009 1.000   NA
 5594285 5594286 RC1_1673 RC1_1674     TRUE 0.998 -3.000 0.525 1.000   NA
 5594287 5594288 RC1_1675 RC1_1676   ispB FALSE 0.350 35.000 0.000 NA   NA
 5594288 5594289 RC1_1676 RC1_1677 ispB   FALSE 0.066 150.000 0.000 NA   NA
 5594289 5594290 RC1_1677 RC1_1678     FALSE 0.055 175.000 0.000 NA   NA
 5594290 5594291 RC1_1678 RC1_1679     FALSE 0.026 383.000 0.000 NA   NA
 5594291 5594292 RC1_1679 RC1_1680     FALSE 0.052 181.000 0.000 NA   NA
 5594292 5594293 RC1_1680 RC1_1681     TRUE 0.812 -13.000 0.000 1.000   NA
 5594293 5594294 RC1_1681 RC1_1682     TRUE 0.764 3.000 0.000 1.000   NA
 5594294 5594295 RC1_1682 RC1_1683   pncA FALSE 0.080 150.000 0.000 1.000   NA
 5594296 5594297 RC1_1684 RC1_1685 guaD   TRUE 0.682 6.000 0.000 NA   NA
 5594298 5594299 RC1_1686 RC1_1687     TRUE 0.976 28.000 0.300 1.000   NA
 5594299 5594300 RC1_1687 RC1_1688   tetA FALSE 0.061 185.000 0.000 1.000   NA
 5594300 5594301 RC1_1688 RC1_1689 tetA   FALSE 0.048 206.000 0.000 NA N NA
 5594301 5594302 RC1_1689 RC1_1690     TRUE 0.999 -165.000 1.000 NA   NA
 5594303 5594304 RC1_1691 RC1_1692 clpA clpS TRUE 0.997 7.000 0.596 NA   NA
 5594304 5594305 RC1_1692 RC1_1693 clpS   FALSE 0.098 250.000 0.011 NA   NA
 5594306 5594307 RC1_1694 RC1_1695   dacA FALSE 0.023 774.000 0.000 NA N NA
 5594307 5594308 RC1_1695 RC1_1696 dacA   FALSE 0.152 80.000 0.000 NA   NA
 5594309 5594310 RC1_1697 RC1_1698 algC rkpK TRUE 0.757 18.000 0.007 1.000 N NA
 5594310 5594311 RC1_1698 RC1_1699 rkpK galU TRUE 0.976 72.000 0.333 1.000 Y NA
 5594311 5594312 RC1_1699 RC1_1700 galU   FALSE 0.080 149.000 0.000 1.000   NA
 5594312 5594313 RC1_1700 RC1_1701     TRUE 0.971 2.000 0.086 NA   NA
 5594314 5594315 RC1_1702 RC1_1703 aglA agmR FALSE 0.046 259.000 0.000 1.000 N NA
 5594315 5594316 RC1_1703 RC1_1704 agmR   FALSE 0.217 62.000 0.000 NA   NA
 5594319 5594320 RC1_1707 RC1_1708     TRUE 0.561 15.000 0.000 NA   NA
 5594320 5594321 RC1_1708 RC1_1709     TRUE 0.985 62.000 0.667 NA   NA
 5594321 5594322 RC1_1709 RC1_1710     FALSE 0.237 57.000 0.000 NA   NA
 5594325 5594326 RC1_1713 RC1_1714     FALSE 0.117 94.000 0.000 NA   NA
 5594326 5594327 RC1_1714 RC1_1715     TRUE 0.923 20.000 0.088 NA   NA
 5594327 5594328 RC1_1715 RC1_1716   wbpL FALSE 0.233 58.000 0.000 NA   NA
 5594328 5594329 RC1_1716 RC1_1717 wbpL   FALSE 0.031 454.000 0.000 1.000 N NA
 5594329 5594330 RC1_1717 RC1_1718   hss FALSE 0.086 148.000 0.000 1.000 N NA
 5594330 5594331 RC1_1718 RC1_1719 hss hisZ FALSE 0.045 264.000 0.000 1.000 N NA
 5594331 5594332 RC1_1719 RC1_1720 hisZ purA TRUE 0.839 76.000 0.161 1.000 N NA
 5594332 5594333 RC1_1720 RC1_1721 purA   FALSE 0.116 181.000 0.004 1.000   NA
 5594333 5594334 RC1_1721 RC1_1722     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   NA
 5594334 5594335 RC1_1722 RC1_1723     FALSE 0.270 50.000 0.000 NA   NA
 5594336 5594337 RC1_1724 RC1_1725 rpoH   FALSE 0.409 115.000 0.046 1.000 N NA
 5594338 5594339 RC1_1726 RC1_1727   ltaE FALSE 0.439 56.000 0.007 NA   NA
 5594339 5594340 RC1_1727 RC1_1728 ltaE   FALSE 0.289 45.000 0.000 NA   NA
 5594341 5594342 RC1_1729 RC1_1730     TRUE 0.545 16.000 0.000 NA   NA
 5594342 5594343 RC1_1730 RC1_1731     TRUE 0.962 198.000 1.000 NA   NA
 5594343 5594344 RC1_1731 RC1_1732     FALSE 0.028 348.000 0.000 NA   NA
 5594349 5594350 RC1_1737 RC1_1738     FALSE 0.069 145.000 0.000 NA   NA
 5594350 5594351 RC1_1738 RC1_1739     FALSE 0.059 165.000 0.000 NA   NA
 5594351 5594352 RC1_1739 RC1_1740     TRUE 0.983 137.000 0.743 NA Y NA
 5594352 5594353 RC1_1740 RC1_1741     TRUE 0.998 -3.000 0.314 NA Y NA
 5594354 5594355 RC1_1742 RC1_1743   fadJ FALSE 0.052 181.000 0.000 NA   NA
 5594355 5594356 RC1_1743 RC1_1744 fadJ fadA TRUE 0.953 22.000 0.045 1.000 Y NA
 5594356 5594357 RC1_1744 RC1_1745 fadA ybaN FALSE 0.033 278.000 0.000 NA   NA
 5594358 5594359 RC1_1746 RC1_1747 hexR glgB TRUE 0.599 17.000 0.000 1.000 N NA
 5594359 5594360 RC1_1747 RC1_1748 glgB malQ FALSE 0.384 167.000 0.000 0.004 Y NA
 5594360 5594361 RC1_1748 RC1_1749 malQ   TRUE 0.509 23.000 0.000 1.000   NA
 5594362 5594363 RC1_1750 RC1_1751   fliI TRUE 0.912 29.000 0.105 NA   NA
 5594364 5594365 RC1_1752 RC1_1753 ctrA   FALSE 0.202 69.000 0.000 NA N NA
 5594366 5594367 RC1_1754 RC1_1755 cheR cheB TRUE 0.993 -3.000 0.085 1.000 Y NA
 5594367 5594368 RC1_1755 RC1_1756 cheB cheY TRUE 0.992 23.000 0.268 0.022 Y NA
 5594368 5594369 RC1_1756 RC1_1757 cheY cheW TRUE 0.980 30.000 0.167 1.000 Y NA
 5594369 5594370 RC1_1757 RC1_1758 cheW cheAY TRUE 0.987 -3.000 0.024 0.019 Y NA
 5594370 5594371 RC1_1758 RC1_1759 cheAY   FALSE 0.360 207.000 0.085 NA   NA
 5594374 5594375 RC1_1762 RC1_1763 moaA   FALSE 0.354 44.000 0.000 1.000 N NA
 5594377 5594378 RC1_1765 RC1_1767 aspA   TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5594379 5594380 RC1_1766 RC1_1768     FALSE 0.060 163.000 0.000 NA   NA
 5594381 5594382 RC1_1769 RC1_1770     FALSE 0.150 81.000 0.000 NA   NA
 5594382 5594383 RC1_1770 RC1_1771   nfeD TRUE 0.996 13.000 0.313 NA Y NA
 5594384 5594385 RC1_1772 RC1_1773     FALSE 0.048 193.000 0.000 NA   NA
 5594385 5594386 RC1_1773 RC1_1774     FALSE 0.054 177.000 0.000 NA   NA
 5594392 5594393 RC1_1780 RC1_1781 torR putA FALSE 0.081 155.000 0.000 1.000 N NA
 5594395 5594396 RC1_1783 RC1_1784     FALSE 0.061 161.000 0.000 NA   NA
 5594396 5594397 RC1_1784 RC1_1785     FALSE 0.136 86.000 0.000 NA   NA
 5594397 5594398 RC1_1785 RC1_1786   serA FALSE 0.091 124.000 0.000 1.000   NA
 5594398 5594399 RC1_1786 RC1_1787 serA   FALSE 0.315 40.000 0.000 NA   NA
 5594401 5594402 RC1_1788 RC1_1790 serC   FALSE 0.047 195.000 0.000 NA   NA
 5594402 5594403 RC1_1790 RC1_1791     FALSE 0.054 176.000 0.000 NA   NA
 5594403 5594404 RC1_1791 RC1_1792     TRUE 0.677 11.000 0.000 1.000   NA
 5594404 5594405 RC1_1792 RC1_1793   thiD TRUE 0.815 -3.000 0.000 1.000   NA
 5594405 5594406 RC1_1793 RC1_1794 thiD glmM FALSE 0.293 105.000 0.014 1.000 N NA
 5594406 5594407 RC1_1794 RC1_1795 glmM folP TRUE 0.896 79.000 0.260 1.000 N NA
 5594407 5594408 RC1_1795 RC1_1796 folP ftsH TRUE 0.824 156.000 0.325 1.000 N NA
 5594408 5594409 RC1_1796 RC1_1797 ftsH tilS TRUE 0.748 104.000 0.145 0.091 N NA
 5594409 5594410 RC1_1797 RC1_1798 tilS   TRUE 0.979 -9.000 0.085 1.000   NA
 5594410 5594411 RC1_1798 RC1_1799   omp16 TRUE 0.624 186.000 0.199 1.000   NA
 5594411 5594412 RC1_1799 RC1_1800 omp16 tolB TRUE 0.931 151.000 0.592 1.000 N NA
 5594412 5594413 RC1_1800 RC1_1801 tolB tonB TRUE 0.892 0.000 0.010 NA   NA
 5594413 5594414 RC1_1801 RC1_1802 tonB exbD TRUE 0.754 43.000 0.049 NA   NA
 5594414 5594415 RC1_1802 RC1_1803 exbD tolQ TRUE 0.996 5.000 0.220 0.041 Y NA
 5594415 5594416 RC1_1803 RC1_1804 tolQ   TRUE 0.994 24.000 0.593 1.000   NA
 5594416 5594417 RC1_1804 RC1_1805   ruvB TRUE 0.978 -7.000 0.082 1.000   NA
 5594417 5594418 RC1_1805 RC1_1806 ruvB ruvA TRUE 0.999 -3.000 0.549 0.002 Y NA
 5594418 5594419 RC1_1806 RC1_1807 ruvA ruvC TRUE 0.979 92.000 0.451 0.006 Y NA
 5594419 5594420 RC1_1807 RC1_1808 ruvC   TRUE 0.831 19.000 0.027 NA   NA
 5594420 5594421 RC1_1808 RC1_1809     FALSE 0.282 143.000 0.031 NA   NA
 5594421 5594422 RC1_1809 RC1_1810     TRUE 0.715 4.000 0.000 NA   NA
 5594422 5594423 RC1_1810 RC1_1811     FALSE 0.031 296.000 0.000 NA   NA
 5594423 5594424 RC1_1811 RC1_1812     TRUE 0.715 4.000 0.000 NA   NA
 5594424 5594425 RC1_1812 RC1_1813     FALSE 0.093 109.000 0.000 NA   NA
 5594425 5594426 RC1_1813 RC1_1814     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5594426 5594427 RC1_1814 RC1_1815     TRUE 0.964 -3.000 0.000 NA Y NA
 5594430 5594431 RC1_1818 RC1_1819 gap   FALSE 0.122 91.000 0.000 NA   NA
 5594433 5594434 RC1_1821 RC1_1822   fbaB FALSE 0.093 109.000 0.000 NA   NA
 5594434 5594435 RC1_1822 RC1_1824 fbaB thiE FALSE 0.350 119.000 0.036 1.000 N NA
 5594438 5594439 RC1_1826 RC1_1827 motB   TRUE 0.996 4.000 0.432 NA   NA
 5594439 5594440 RC1_1827 RC1_1828     FALSE 0.062 157.000 0.000 NA   NA
 5594440 5594441 RC1_1828 RC1_1829   suhB FALSE 0.094 131.000 0.000 1.000 N NA
 5594441 5594442 RC1_1829 RC1_1830 suhB efp FALSE 0.201 284.000 0.047 1.000 N NA
 5594443 5594444 RC1_1831 RC1_1832 livH livM TRUE 0.999 5.000 0.406 0.030 Y NA
 5594444 5594445 RC1_1832 RC1_1833 livM livG TRUE 0.999 0.000 0.386 1.000 Y NA
 5594445 5594446 RC1_1833 RC1_1834 livG livF TRUE 1.000 -3.000 0.881 0.015 Y NA
 5594447 5594448 RC1_1835 RC1_1836     FALSE 0.040 291.000 0.000 1.000 N NA
 5594448 5594449 RC1_1836 RC1_1837     FALSE 0.091 140.000 0.000 1.000 N NA
 5594453 5594454 RC1_1841 RC1_1842     TRUE 0.964 -3.000 0.000 NA Y NA
 5594454 5594455 RC1_1842 RC1_1843   prpE FALSE 0.100 120.000 0.000 1.000 N NA
 5594457 5594458 RC1_1845 RC1_1846   bdhA FALSE 0.134 97.000 0.000 1.000   NA
 5594458 5594459 RC1_1846 RC1_1847 bdhA   FALSE 0.087 113.000 0.000 NA   NA
 5594461 5594462 RC1_1849 RC1_1850 purK purE TRUE 0.996 5.000 0.201 0.001 Y NA
 5594462 5594463 RC1_1850 RC1_1851 purE   FALSE 0.414 106.000 0.044 NA   NA
 5594464 5594465 RC1_1852 RC1_1853     TRUE 0.699 36.000 0.022 NA   NA
 5594465 5594466 RC1_1853 RC1_1854     FALSE 0.190 69.000 0.000 NA   NA
 5594467 5594468 RC1_1855 RC1_1856   ubiX FALSE 0.074 131.000 0.000 NA   NA
 5594470 5594471 RC1_1858 RC1_1859     FALSE 0.198 153.000 0.016 NA   NA
 5594472 5594473 RC1_1860 RC1_1861     FALSE 0.044 211.000 0.000 NA   NA
 5594474 5594475 RC1_1862 RC1_1863     FALSE 0.321 39.000 0.000 NA   NA
 5594475 5594476 RC1_1863 RC1_1864     FALSE 0.075 143.000 0.000 NA N NA
 5594476 5594477 RC1_1864 RC1_1865   fumC FALSE 0.133 90.000 0.000 NA N NA
 5594478 5594479 RC1_1866 RC1_1867     FALSE 0.057 171.000 0.000 NA   NA
 5594480 5594481 RC1_1868 RC1_1869     FALSE 0.107 100.000 0.000 NA   NA
 5594481 5594482 RC1_1869 RC1_1870     FALSE 0.082 117.000 0.000 NA   NA
 5594482 5594483 RC1_1870 RC1_1871     FALSE 0.358 34.000 0.000 NA   NA
 5594483 5594484 RC1_1871 RC1_1872     FALSE 0.064 154.000 0.000 NA   NA
 5594485 5594486 RC1_1873 RC1_1874 efp   FALSE 0.044 269.000 0.000 1.000 N NA
 5594486 5594487 RC1_1874 RC1_1875   dps FALSE 0.140 98.000 0.000 1.000 N NA
 5594487 5594488 RC1_1875 RC1_1876 dps dps FALSE 0.297 238.000 0.000 0.001 Y NA
 5594489 5594490 RC1_1877 RC1_1878     FALSE 0.083 116.000 0.000 NA   NA
 5594490 5594491 RC1_1878 RC1_1879     FALSE 0.057 197.000 0.000 1.000   NA
 5594491 5594492 RC1_1879 RC1_1880   aatA FALSE 0.150 735.000 0.000 1.000 Y NA
 5594492 5594493 RC1_1880 RC1_1881 aatA uvrB FALSE 0.030 489.000 0.000 1.000 N NA
 5594493 5594494 RC1_1881 RC1_1882 uvrB   TRUE 0.699 5.000 0.000 NA   NA
 5594497 5594498 RC1_1885 RC1_1886 uvrC pgsA TRUE 0.804 109.000 0.227 1.000 N NA
 5594498 5594499 RC1_1886 RC1_1887 pgsA   FALSE 0.058 167.000 0.000 NA   NA
 5594499 5594500 RC1_1887 RC1_1888   moaD FALSE 0.101 104.000 0.000 NA   NA
 5594500 5594501 RC1_1888 RC1_1889 moaD moaE TRUE 0.999 9.000 0.501 0.003 Y NA
 5594501 5594502 RC1_1889 RC1_1890 moaE pleC FALSE 0.135 100.000 0.000 1.000 N NA
 5594504 5594505 RC1_1892 RC1_1893 petP ompR TRUE 0.956 129.000 0.392 0.065 Y NA
 5594505 5594506 RC1_1893 RC1_1894 ompR   TRUE 0.999 12.000 0.592 1.000 Y NA
 5594507 5594508 RC1_1895 RC1_1896     TRUE 0.686 117.000 0.160 NA   NA
 5594508 5594509 RC1_1896 RC1_1897   ybaK FALSE 0.136 173.000 0.008 NA   NA
 5594509 5594510 RC1_1897 RC1_1898 ybaK proC TRUE 0.581 14.000 0.000 NA   NA
 5594510 5594511 RC1_1898 RC1_1899 proC   TRUE 0.906 83.000 0.308 NA   NA
 5594511 5594512 RC1_1899 RC1_1900     FALSE 0.250 328.000 0.080 NA   NA
 5594513 5594514 RC1_1901 RC1_1902 rfaD lgt TRUE 0.953 13.000 0.013 1.000 Y NA
 5594514 5594515 RC1_1902 RC1_1903 lgt   TRUE 0.990 -3.000 0.170 NA   NA
 5594515 5594516 RC1_1903 RC1_1904     FALSE 0.418 206.000 0.107 NA   NA
 5594516 5594517 RC1_1904 RC1_1906   prs FALSE 0.098 278.000 0.013 NA   NA
 5594519 5594520 RC1_1907 RC1_1908   pth TRUE 0.999 7.000 0.496 0.020 Y NA
 5594520 5594521 RC1_1908 RC1_1909 pth   FALSE 0.083 116.000 0.000 NA   NA
 5594521 5594522 RC1_1909 RC1_1910     TRUE 0.734 2.000 0.000 NA   NA
 5594522 5594523 RC1_1910 RC1_1911     FALSE 0.067 149.000 0.000 NA   NA
 5594525 5594526 RC1_1913 RC1_1914 proA nadD TRUE 0.990 -3.000 0.170 1.000 N NA
 5594526 5594527 RC1_1914 RC1_1915 nadD   TRUE 0.992 -10.000 0.221 NA   NA
 5594527 5594528 RC1_1915 RC1_1916     TRUE 0.968 35.000 0.307 NA   NA
 5594528 5594529 RC1_1916 RC1_1917     FALSE 0.068 146.000 0.000 NA   NA
 5594529 5594530 RC1_1917 RC1_1918     FALSE 0.045 205.000 0.000 NA   NA
 5594530 5594531 RC1_1918 RC1_1919   lpxB TRUE 0.715 4.000 0.000 NA   NA
 5594531 5594532 RC1_1919 RC1_1920 lpxB   TRUE 0.959 -3.000 0.040 1.000   NA
 5594532 5594533 RC1_1920 RC1_1921     TRUE 0.552 17.000 0.000 NA N NA
 5594533 5594534 RC1_1921 RC1_1922     FALSE 0.423 106.000 0.047 NA   NA
 5594536 5594537 RC1_1924 RC1_1925     TRUE 0.973 6.000 0.118 NA   NA
 5594537 5594538 RC1_1925 RC1_1926     TRUE 0.988 0.000 0.176 NA   NA
 5594538 5594539 RC1_1926 RC1_1927     TRUE 0.999 -3.000 0.750 NA   NA
 5594539 5594540 RC1_1927 RC1_1928     TRUE 0.903 37.000 0.125 NA   NA
 5594540 5594541 RC1_1928 RC1_1929     TRUE 0.585 140.000 0.125 NA   NA
 5594541 5594542 RC1_1929 RC1_1930   cas2 TRUE 0.990 21.000 0.433 NA   NA
 11430549 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3248.000 0.000 NA   NA
 11572912 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3248.000 0.000 NA   NA
 11715304 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3248.000 0.000 NA   NA
 11430550 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3284.000 0.000 NA   NA
 11572913 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3284.000 0.000 NA   NA
 11715305 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3284.000 0.000 NA   NA
 11430551 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3322.000 0.000 NA   NA
 11572914 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3322.000 0.000 NA   NA
 11715306 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3322.000 0.000 NA   NA
 11430552 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3358.000 0.000 NA   NA
 11572915 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3358.000 0.000 NA   NA
 11715307 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3358.000 0.000 NA   NA
 11430553 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3397.000 0.000 NA   NA
 11572916 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3397.000 0.000 NA   NA
 11715308 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3397.000 0.000 NA   NA
 11430554 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3433.000 0.000 NA   NA
 11572917 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3433.000 0.000 NA   NA
 11715309 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3433.000 0.000 NA   NA
 11430555 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3473.000 0.000 NA   NA
 11572918 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3473.000 0.000 NA   NA
 11715310 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3473.000 0.000 NA   NA
 11430556 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3509.000 0.000 NA   NA
 11572919 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3509.000 0.000 NA   NA
 11715311 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3509.000 0.000 NA   NA
 11430557 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3548.000 0.000 NA   NA
 11572920 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3548.000 0.000 NA   NA
 11715312 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3548.000 0.000 NA   NA
 11430558 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3584.000 0.000 NA   NA
 11572921 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3584.000 0.000 NA   NA
 11715313 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3584.000 0.000 NA   NA
 11430559 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3623.000 0.000 NA   NA
 11572922 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3623.000 0.000 NA   NA
 11715314 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3623.000 0.000 NA   NA
 11430560 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3659.000 0.000 NA   NA
 11572923 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3659.000 0.000 NA   NA
 11715315 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3659.000 0.000 NA   NA
 11430561 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3697.000 0.000 NA   NA
 11572924 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3697.000 0.000 NA   NA
 11715316 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3697.000 0.000 NA   NA
 11430562 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3733.000 0.000 NA   NA
 11572925 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3733.000 0.000 NA   NA
 11715317 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3733.000 0.000 NA   NA
 11430563 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3770.000 0.000 NA   NA
 11572926 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3770.000 0.000 NA   NA
 11715318 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3770.000 0.000 NA   NA
 11430564 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3806.000 0.000 NA   NA
 11572927 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3806.000 0.000 NA   NA
 11715319 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3806.000 0.000 NA   NA
 11430565 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3846.000 0.000 NA   NA
 11572928 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3846.000 0.000 NA   NA
 11715320 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3846.000 0.000 NA   NA
 11430566 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3882.000 0.000 NA   NA
 11572929 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3882.000 0.000 NA   NA
 11715321 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3882.000 0.000 NA   NA
 11430567 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3922.000 0.000 NA   NA
 11572930 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3922.000 0.000 NA   NA
 11715322 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3922.000 0.000 NA   NA
 11430568 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3958.000 0.000 NA   NA
 11572931 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3958.000 0.000 NA   NA
 11715323 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3958.000 0.000 NA   NA
 11430569 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3998.000 0.000 NA   NA
 11572932 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3998.000 0.000 NA   NA
 11715324 5594539   RC1_1927     FALSE NA 3998.000 0.000 NA   NA
 11430570 5594539   RC1_1927     FALSE NA 4034.000 0.000 NA   NA
 11572933 5594539   RC1_1927     FALSE NA 4034.000 0.000 NA   NA
 11715325 5594539   RC1_1927     FALSE NA 4034.000 0.000 NA   NA
 11430571 5594539   RC1_1927     FALSE NA 4071.000 0.000 NA   NA
 11572934 5594539   RC1_1927     FALSE NA 4071.000 0.000 NA   NA
 11715326 5594539   RC1_1927     FALSE NA 4071.000 0.000 NA   NA
 5594543 5594544 RC1_1931 RC1_1932     FALSE 0.034 268.000 0.000 NA   NA
 5594544 5594545 RC1_1932 RC1_1933     TRUE 0.501 93.000 0.000 NA Y NA
 5594545 5594546 RC1_1933 RC1_1934     TRUE 0.796 -3.000 0.000 NA N NA
 5594546 5594547 RC1_1934 RC1_1935     FALSE 0.061 160.000 0.000 NA   NA
 5594547 5594548 RC1_1935 RC1_1936   wrbA TRUE 0.901 78.000 0.286 NA   NA
 5594549 5594550 RC1_1937 RC1_1938     FALSE 0.080 127.000 0.000 NA N NA
 5594553 5594554 RC1_1941 RC1_1942     FALSE 0.069 144.000 0.000 NA   NA
 5594556 5594557 RC1_1944 RC1_1945     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5594557 5594558 RC1_1945 RC1_1946     FALSE 0.113 97.000 0.000 NA   NA
 5594558 5594559 RC1_1946 RC1_1947     TRUE 0.564 154.000 0.031 1.000 Y NA
 5594559 5594560 RC1_1947 RC1_1948   fadA TRUE 0.884 53.000 0.042 1.000 Y NA
 5594560 5594561 RC1_1948 RC1_1949 fadA   TRUE 0.859 144.000 0.353 1.000 N NA
 5594563 5594564 RC1_1951 RC1_1952   rbsK FALSE 0.046 259.000 0.000 1.000 N NA
 5594565 5594566 RC1_1953 RC1_1954 pepN   TRUE 0.774 -82.000 0.000 NA   NA
 5594567 5594568 RC1_1955 RC1_1956     FALSE 0.058 167.000 0.000 NA   NA
 5594568 5594569 RC1_1956 RC1_1957     FALSE 0.244 113.000 0.012 1.000   NA
 5594573 5594574 RC1_1961 RC1_1962     FALSE 0.045 204.000 0.000 NA   NA
 5594574 5594575 RC1_1962 RC1_1963     FALSE 0.302 43.000 0.000 NA   NA
 5594575 5594576 RC1_1963 RC1_1964   rodA FALSE 0.065 152.000 0.000 NA   NA
 5594576 5594577 RC1_1964 RC1_1965 rodA mrdA TRUE 0.981 -3.000 0.094 1.000 N NA
 5594577 5594578 RC1_1965 RC1_1966 mrdA mreD TRUE 0.985 5.000 0.169 1.000   NA
 5594578 5594579 RC1_1966 RC1_1967 mreD mreC TRUE 0.897 12.000 0.016 0.002   NA
 5594579 5594580 RC1_1967 RC1_1968 mreC mreB TRUE 0.977 87.000 0.689 1.000 N NA
 5594580 5594581 RC1_1968 RC1_1969 mreB leuA FALSE 0.066 361.000 0.005 1.000 N NA
 5594581 5594582 RC1_1969 RC1_1970 leuA   FALSE 0.071 140.000 0.000 NA   NA
 5594582 5594583 RC1_1970 RC1_1971     FALSE 0.051 183.000 0.000 NA   NA
 5594583 5594584 RC1_1971 RC1_1972     FALSE 0.177 72.000 0.000 NA   NA
 5594584 5594585 RC1_1972 RC1_1973   ilvC FALSE 0.043 215.000 0.000 NA   NA
 5594585 5594586 RC1_1973 RC1_1974 ilvC ilvH TRUE 0.557 179.000 0.026 0.001 Y NA
 5594586 5594587 RC1_1974 RC1_1975 ilvH ilvI TRUE 0.940 74.000 0.146 0.001 Y NA
 5594590 5594591 RC1_1978 RC1_1979   serB FALSE 0.163 76.000 0.000 NA   NA
 5594592 5594593 RC1_1980 RC1_1981 degP   TRUE 0.584 165.000 0.150 NA   NA
 5594593 5594594 RC1_1981 RC1_1982   hflC TRUE 0.858 128.000 0.348 NA   NA
 5594594 5594595 RC1_1982 RC1_1983 hflC hflK TRUE 1.000 12.000 0.947 0.009 Y NA
 5594596 5594597 RC1_1984 RC1_1985     FALSE 0.063 155.000 0.000 NA   NA
 5594598 5594599 RC1_1986 RC1_1987   cbs TRUE 0.964 47.000 0.133 0.013 Y NA
 5594599 5594600 RC1_1987 RC1_1988 cbs   FALSE 0.082 117.000 0.000 NA   NA
 5594600 5594601 RC1_1988 RC1_1989   folA FALSE 0.468 22.000 0.000 NA   NA
 5594601 5594602 RC1_1989 RC1_1990 folA   FALSE 0.058 193.000 0.000 1.000   NA
 5594602 5594603 RC1_1990 RC1_1991     FALSE 0.042 219.000 0.000 NA   NA
 5594603 5594604 RC1_1991 RC1_1992     FALSE 0.058 168.000 0.000 NA   NA
 5594604 5594605 RC1_1992 RC1_1993     FALSE 0.040 280.000 0.000 1.000   NA
 5594605 5594606 RC1_1993 RC1_1994     FALSE 0.077 122.000 0.000 NA   NA
 5594606 5594607 RC1_1994 RC1_1995     FALSE 0.310 41.000 0.000 NA   NA
 5594607 5594608 RC1_1995 RC1_1996     FALSE 0.064 153.000 0.000 NA   NA
 5594608 5594609 RC1_1996 RC1_1997     FALSE 0.060 162.000 0.000 NA   NA
 5594609 5594610 RC1_1997 RC1_1998     FALSE 0.367 33.000 0.000 NA   NA
 5594610 5594611 RC1_1998 RC1_1999     FALSE 0.042 224.000 0.000 NA   NA
 5594611 5594612 RC1_1999 RC1_2000     FALSE 0.468 22.000 0.000 NA   NA
 5594615 5594616 RC1_2003 RC1_2004 ssrA   FALSE 0.221 61.000 0.000 NA   NA
 5594616 5594617 RC1_2004 RC1_2005     TRUE 0.832 14.000 0.016 NA   NA
 5594618 5594619 RC1_2006 RC1_2007 rpoD dnaG TRUE 0.738 193.000 0.299 1.000 N NA
 5594619 5594620 RC1_2007 RC1_2008 dnaG   TRUE 0.516 194.000 0.137 1.000   NA
 5594620 5594621 RC1_2008 RC1_2009     FALSE 0.083 116.000 0.000 NA   NA
 5594624 5594625 RC1_2012 RC1_2013     FALSE 0.142 84.000 0.000 NA   NA
 5594625 5594626 RC1_2013 RC1_2014   carB FALSE 0.041 225.000 0.000 NA   NA
 5594626 5594627 RC1_2014 RC1_2015 carB greA TRUE 0.831 104.000 0.241 1.000 N NA
 5594627 5594628 RC1_2015 RC1_2016 greA chrA FALSE 0.096 126.000 0.000 1.000 N NA
 5594630 5594631 RC1_2018 RC1_2019     TRUE 0.742 108.000 0.182 NA   NA
 5594631 5594632 RC1_2019 RC1_2020     TRUE 0.958 40.000 0.286 NA   NA
 5594632 5594633 RC1_2020 RC1_2021   yjfL FALSE 0.249 54.000 0.000 NA   NA
 5594633 5594634 RC1_2021 RC1_2022 yjfL   TRUE 0.926 108.000 0.470 NA   NA
 5594634 5594635 RC1_2022 RC1_2023     TRUE 0.959 5.000 0.073 NA   NA
 5594637 5594638 RC1_2025 RC1_2026     FALSE 0.059 387.000 0.004 1.000   NA
 5594638 5594639 RC1_2026 RC1_2027     TRUE 0.619 54.000 0.023 1.000   NA
 5594639 5594640 RC1_2027 RC1_2028     TRUE 0.998 9.000 0.722 NA   NA
 5594640 5594641 RC1_2028 RC1_2029   cfa TRUE 0.780 107.000 0.213 NA   NA
 5594641 5594642 RC1_2029 RC1_2030 cfa   TRUE 0.773 73.000 0.111 NA N NA
 5594642 5594643 RC1_2030 RC1_2031     TRUE 0.994 3.000 0.323 NA   NA
 5594643 5594644 RC1_2031 RC1_2032   prmA FALSE 0.073 135.000 0.000 NA   NA
 5594644 5594645 RC1_2032 RC1_2033 prmA   FALSE 0.357 108.000 0.027 1.000 N NA
 5594646 5594647 RC1_2034 RC1_2035 pepF   FALSE 0.080 149.000 0.000 1.000   NA
 5594647 5594648 RC1_2035 RC1_2036     FALSE 0.078 152.000 0.000 1.000   NA
 5594650 5594651 RC1_2038 RC1_2039     FALSE 0.054 176.000 0.000 NA   NA
 5594653 5594654 RC1_2041 RC1_2042     TRUE 0.999 -3.000 0.667 NA   NA
 5594656 5594657 RC1_2044 RC1_2045     FALSE 0.427 27.000 0.000 NA   NA
 5594659 5594660 RC1_2047 RC1_2048 cstS2   FALSE 0.065 151.000 0.000 NA   NA
 5594660 5594661 RC1_2048 RC1_2049     FALSE 0.073 132.000 0.000 NA   NA
 5594661 5594662 RC1_2049 RC1_2050   metF TRUE 0.533 17.000 0.000 NA   NA
 5594662 5594663 RC1_2050 RC1_2051 metF   TRUE 0.990 -3.000 0.160 1.000 N NA
 5594664 5594665 RC1_2052 RC1_2053     TRUE 0.638 81.000 0.070 NA N NA
 5594665 5594666 RC1_2053 RC1_2054     FALSE 0.070 142.000 0.000 NA   NA
 5594666 5594667 RC1_2054 RC1_2055     FALSE 0.140 85.000 0.000 NA   NA
 5594667 5594668 RC1_2055 RC1_2056     TRUE 0.825 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5594668 5594669 RC1_2056 RC1_2057     TRUE 1.000 -3.000 0.752 1.000 Y NA
 5594669 5594670 RC1_2057 RC1_2058     TRUE 0.999 -3.000 0.671 0.086 N NA
 5594671 5594672 RC1_2059 RC1_2060     FALSE 0.073 147.000 0.000 NA N NA
 5594672 5594673 RC1_2060 RC1_2061     FALSE 0.039 236.000 0.000 NA   NA
 5594675 5594676 RC1_2063 RC1_2064     FALSE 0.021 1179.000 0.000 NA   NA
 5594677 5594678 RC1_2065 RC1_2066     FALSE 0.122 91.000 0.000 NA   NA
 5594679 5594680 RC1_2067 RC1_2068     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5594680 5594681 RC1_2068 RC1_2069   def TRUE 0.675 63.000 0.050 1.000   NA
 5594683 5594684 RC1_2071 RC1_2072   pntB FALSE 0.078 121.000 0.000 NA   NA
 5594684 5594685 RC1_2072 RC1_2073 pntB pntAB TRUE 0.844 19.000 0.014 0.001   NA
 5594685 5594686 RC1_2073 RC1_2074 pntAB pntAA TRUE 0.999 -3.000 0.829 0.001   NA
 5594686 5594687 RC1_2074 RC1_2075 pntAA   FALSE 0.029 332.000 0.000 NA   NA
 5594690 5594691 RC1_2078 RC1_2079 bchG bch2 TRUE 0.999 -3.000 0.640 NA   NA
 5594691 5594692 RC1_2079 RC1_2080 bch2 bchP TRUE 0.973 32.000 0.314 NA   NA
 5594692 5594693 RC1_2080 RC1_2081 bchP bchI FALSE 0.378 62.000 0.000 0.003 N NA
 5594693 5594694 RC1_2081 RC1_2082 bchI bchD TRUE 0.999 -3.000 0.465 0.001 Y NA
 5594694 5594695 RC1_2082 RC1_2083 bchD bchO TRUE 0.819 29.000 0.020 0.001 N NA
 5594695 5594696 RC1_2083 RC1_2084 bchO   FALSE 0.091 110.000 0.000 NA   NA
 5594696 5594697 RC1_2084 RC1_2085   crtI FALSE 0.052 181.000 0.000 NA   NA
 5594697 5594698 RC1_2085 RC1_2086 crtI crtB TRUE 0.996 -7.000 0.332 1.000 N NA
 5594698 5594699 RC1_2086 RC1_2087 crtB   FALSE 0.358 34.000 0.000 NA   NA
 5594699 5594700 RC1_2087 RC1_2088     FALSE 0.031 294.000 0.000 NA   NA
 5594701 5594702 RC1_2089 RC1_2090 crtC crtD FALSE 0.050 186.000 0.000 NA   NA
 5594703 5594704 RC1_2091 RC1_2092 crtE crtF TRUE 0.897 168.000 0.500 1.000   NA
 5594704 5594705 RC1_2092 RC1_2093 crtF bchC TRUE 0.968 91.000 0.627 1.000   NA
 5594705 5594706 RC1_2093 RC1_2094 bchC bchX TRUE 0.999 3.000 0.882 0.002 N NA
 5594706 5594707 RC1_2094 RC1_2095 bchX bchY TRUE 0.991 31.000 0.491 0.002   NA
 5594707 5594708 RC1_2095 RC1_2096 bchY bchZ TRUE 0.999 -6.000 0.632 0.002   NA
 5594708 5594709 RC1_2096 RC1_2097 bchZ pufB FALSE 0.247 187.000 0.038 1.000   NA
 5594709 5594710 RC1_2097 RC1_2098 pufB pufA TRUE 0.999 11.000 0.946 0.002   NA
 5594710 5594711 RC1_2098 RC1_2099 pufA pufL TRUE 0.976 118.000 0.829 0.002   NA
 5594711 5594712 RC1_2099 RC1_2100 pufL pufM TRUE 0.999 11.000 0.895 0.002   NA
 5594712 5594713 RC1_2100 RC1_2101 pufM pufC TRUE 0.999 -3.000 0.526 0.002   NA
 5594713 5594714 RC1_2101 RC1_2102 pufC c552 FALSE 0.044 562.000 0.000 0.008   NA
 5594715 5594716 RC1_2103 RC1_2104 hemA puhE TRUE 0.617 122.000 0.132 NA   NA
 5594716 5594717 RC1_2104 RC1_2105 puhE acsF TRUE 0.988 20.000 0.375 NA   NA
 5594717 5594718 RC1_2105 RC1_2106 acsF   TRUE 0.975 37.000 0.361 NA   NA
 5594718 5594719 RC1_2106 RC1_2107   puhC TRUE 0.998 -3.000 0.519 NA   NA
 5594719 5594720 RC1_2107 RC1_2108 puhC puhB TRUE 0.997 -3.000 0.455 NA   NA
 5594720 5594721 RC1_2108 RC1_2109 puhB puhA TRUE 0.999 -3.000 0.912 NA   NA
 5594721 5594722 RC1_2109 RC1_2110 puhA lhaA TRUE 0.972 26.000 0.265 NA   NA
 5594722 5594723 RC1_2110 RC1_2111 lhaA bchM TRUE 0.975 -3.000 0.077 NA   NA
 5594723 5594724 RC1_2111 RC1_2112 bchM chlL TRUE 0.994 0.000 0.274 0.003 N NA
 5594724 5594725 RC1_2112 RC1_2113 chlL bchH TRUE 0.997 -3.000 0.344 0.003 N NA
 5594725 5594726 RC1_2113 RC1_2114 bchH bchB TRUE 0.995 -25.000 0.278 0.003 N NA
 5594726 5594727 RC1_2114 RC1_2115 bchB bchN TRUE 0.999 5.000 0.591 0.001 Y NA
 5594727 5594728 RC1_2115 RC1_2116 bchN bchF TRUE 0.996 -3.000 0.311 0.001   NA
 5594729 5594730 RC1_2117 RC1_2118 aerR crtJ FALSE 0.044 250.000 0.000 1.000   NA
 5594730 5594731 RC1_2118 RC1_2119 crtJ treZ FALSE 0.091 125.000 0.000 1.000   NA
 5594733 5594734 RC1_2121 RC1_2122     FALSE 0.310 41.000 0.000 NA   NA
 5594734 5594735 RC1_2122 RC1_2123   rhrA FALSE 0.138 95.000 0.000 1.000   NA
 5594736 5594737 RC1_2124 RC1_2125 cstS3 cheB3 TRUE 0.972 -3.000 0.000 0.021 Y NA
 5594737 5594738 RC1_2125 RC1_2126 cheB3 cheA3 TRUE 0.998 -3.000 0.300 0.018 Y NA
 5594738 5594740 RC1_2126 RC1_2128 cheA3 mcp3 TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.018 Y NA
 5594740 5594741 RC1_2128 RC1_2129 mcp3 cheW3b TRUE 0.932 14.000 0.000 0.013 Y NA
 5594741 5594742 RC1_2129 RC1_2130 cheW3b cheR3 TRUE 0.993 -3.000 0.085 1.000 Y NA
 5594742 5594744 RC1_2130 RC1_2132 cheR3 cheW3a TRUE 0.997 -3.000 0.213 1.000 Y NA
 5594744 5594745 RC1_2132 RC1_2133 cheW3a cheY3 TRUE 0.867 24.000 0.000 1.000 Y NA
 5594745 5594746 RC1_2133 RC1_2134 cheY3   FALSE 0.034 267.000 0.000 NA   NA
 5594746 5594747 RC1_2134 RC1_2135   pyk FALSE 0.233 58.000 0.000 NA   NA
 5594747 5594748 RC1_2135 RC1_2136 pyk ttuD TRUE 0.575 83.000 0.000 1.000 Y NA
 5594748 5594749 RC1_2136 RC1_2137 ttuD   FALSE 0.350 35.000 0.000 NA   NA
 5594750 5594751 RC1_2138 RC1_2139     TRUE 0.904 71.000 0.254 NA   NA
 5594751 5594752 RC1_2139 RC1_2140     FALSE 0.074 131.000 0.000 NA   NA
 5594752 5594753 RC1_2140 RC1_2141     FALSE 0.032 282.000 0.000 NA   NA
 5594753 5594754 RC1_2141 RC1_2142     FALSE 0.104 102.000 0.000 NA   NA
 5594754 5594755 RC1_2142 RC1_2143     FALSE 0.189 72.000 0.000 NA N NA
 5594758 5594759 RC1_2146 RC1_2147     FALSE 0.205 65.000 0.000 NA   NA
 5594761 5594762 RC1_2148 RC1_2150 glcF   FALSE 0.173 73.000 0.000 NA   NA
 5594762 5594763 RC1_2150 RC1_2151   glcE TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5594763 5594764 RC1_2151 RC1_2152 glcE glcD TRUE 0.983 47.000 0.266 0.009 Y NA
 5594766 5594767 RC1_2153 RC1_2155 rpmJ   FALSE 0.132 87.000 0.000 NA   NA
 5594770 5594771 RC1_2158 RC1_2159 luxO   TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5594771 5594772 RC1_2159 RC1_2160     FALSE 0.074 129.000 0.000 NA   NA
 5594772 5594773 RC1_2160 RC1_2161   cspG FALSE 0.027 548.000 0.000 1.000   NA
 5594773 5594774 RC1_2161 RC1_2162 cspG ggt FALSE 0.031 453.000 0.000 1.000 N NA
 5594774 5594775 RC1_2162 RC1_2163 ggt   FALSE 0.048 236.000 0.000 1.000   NA
 5594775 5594776 RC1_2163 RC1_2164     TRUE 0.644 10.000 0.000 NA   NA
 5594777 5594778 RC1_2165 RC1_2166     TRUE 0.995 9.000 0.432 NA   NA
 5594778 5594779 RC1_2166 RC1_2167     FALSE 0.358 34.000 0.000 NA   NA
 5594779 5594780 RC1_2167 RC1_2168     FALSE 0.063 156.000 0.000 NA   NA
 5594780 5594781 RC1_2168 RC1_2169     FALSE 0.076 124.000 0.000 NA   NA
 5594781 5594782 RC1_2169 RC1_2170     FALSE 0.025 406.000 0.000 NA   NA
 5594782 5594783 RC1_2170 RC1_2171   ohr FALSE 0.042 220.000 0.000 NA   NA
 5594783 5594784 RC1_2171 RC1_2172 ohr kat FALSE 0.190 80.000 0.000 1.000 N NA
 5594785 5594786 RC1_2173 RC1_2174     FALSE 0.071 141.000 0.000 NA   NA
 5594787 5594788 RC1_2175 RC1_2176   fpr FALSE 0.042 220.000 0.000 NA   NA
 5594789 5594790 RC1_2177 RC1_2178 cysG   TRUE 0.984 11.000 0.224 NA   NA
 5594790 5594791 RC1_2178 RC1_2179   cysI TRUE 0.999 -3.000 0.919 NA   NA
 5594791 5594792 RC1_2179 RC1_2180 cysI   TRUE 0.995 -13.000 0.309 NA   NA
 5594792 5594793 RC1_2180 RC1_2181   cysH TRUE 0.987 -3.000 0.139 NA   NA
 5594793 5594794 RC1_2181 RC1_2182 cysH cysD TRUE 0.581 82.000 0.000 1.000 Y NA
 5594794 5594795 RC1_2182 RC1_2183 cysD cysNC TRUE 0.997 0.000 0.390 0.001 N NA
 5594795 5594796 RC1_2183 RC1_2184 cysNC   FALSE 0.057 170.000 0.000 NA   NA
 5594796 5594797 RC1_2184 RC1_2185   trk FALSE 0.063 155.000 0.000 NA   NA
 5594797 5594798 RC1_2185 RC1_2186 trk dcp FALSE 0.048 244.000 0.000 1.000 N NA
 5594798 5594799 RC1_2186 RC1_2187 dcp sucC FALSE 0.039 304.000 0.000 1.000 N NA
 5594799 5594800 RC1_2187 RC1_2188 sucC sucD TRUE 0.997 3.000 0.256 0.001 Y NA
 5594800 5594801 RC1_2188 RC1_2189 sucD   FALSE 0.035 262.000 0.000 NA   NA
 5594801 5594802 RC1_2189 RC1_2190     TRUE 0.999 8.000 0.848 NA   NA
 5594802 5594803 RC1_2190 RC1_2191     TRUE 0.990 61.000 0.808 NA   NA
 5594803 5594804 RC1_2191 RC1_2192   apbE TRUE 0.985 36.000 0.462 1.000 N NA
 5594805 5594806 RC1_2193 RC1_2194     FALSE 0.049 191.000 0.000 NA   NA
 5594806 5594807 RC1_2194 RC1_2195   ftsY FALSE 0.037 249.000 0.000 NA   NA
 5594807 5594808 RC1_2195 RC1_2196 ftsY   TRUE 0.954 0.000 0.042 1.000 N NA
 5594808 5594809 RC1_2196 RC1_2197   dapF TRUE 0.984 -3.000 0.109 1.000 N NA
 5594811 5594812 RC1_2199 RC1_2200     TRUE 0.983 -3.000 0.114 NA   NA
 5594812 5594813 RC1_2200 RC1_2201     FALSE 0.180 217.000 0.029 NA   NA
 5594813 5594814 RC1_2201 RC1_2202     FALSE 0.029 318.000 0.000 NA   NA
 5594814 5594815 RC1_2202 RC1_2203     FALSE 0.038 243.000 0.000 NA   NA
 5594816 5594817 RC1_2204 RC1_2205 ffh   TRUE 0.752 5.000 0.000 1.000 N NA
 5594817 5594818 RC1_2205 RC1_2206     TRUE 0.580 15.000 0.000 NA N NA
 5594818 5594819 RC1_2206 RC1_2207   rpsP TRUE 0.698 6.000 0.000 NA N NA
 5594819 5594820 RC1_2207 RC1_2208 rpsP rimM TRUE 0.949 127.000 0.342 0.012 Y NA
 5594820 5594821 RC1_2208 RC1_2209 rimM trmD TRUE 0.998 30.000 0.672 1.000 Y NA
 5594821 5594822 RC1_2209 RC1_2210 trmD rplS TRUE 0.999 7.000 0.567 1.000 Y NA
 5594823 5594824 RC1_2211 RC1_2212 oppA oppA TRUE 0.731 146.000 0.071 0.028 Y NA
 5594824 5594825 RC1_2212 RC1_2213 oppA oppA TRUE 0.876 77.000 0.071 0.028 Y NA
 5594825 5594826 RC1_2213 RC1_2214 oppA oppA TRUE 0.755 122.000 0.071 0.028 Y NA
 5594826 5594827 RC1_2214 RC1_2215 oppA oppA TRUE 0.921 56.000 0.071 0.028 Y NA
 5594829 5594830 RC1_2216 RC1_2218 modC modB TRUE 0.999 0.000 0.537 0.001 Y NA
 5594830 5594831 RC1_2218 RC1_2219 modB modA TRUE 0.996 47.000 0.627 0.001 Y NA
 5594831 5594832 RC1_2219 RC1_2220 modA   FALSE 0.074 131.000 0.000 NA   NA
 5594833 5594834 RC1_2221 RC1_2222   fdxA FALSE 0.263 51.000 0.000 NA   NA
 5594834 5594835 RC1_2222 RC1_2223 fdxA   FALSE 0.037 340.000 0.000 1.000 N NA
 5594835 5594836 RC1_2223 RC1_2224     FALSE 0.039 238.000 0.000 NA   NA
 5594836 5594837 RC1_2224 RC1_2225   rpoH FALSE 0.067 148.000 0.000 NA   NA
 5594838 5594839 RC1_2226 RC1_2227 cyaB   FALSE 0.410 47.000 0.000 0.097   NA
 5594840 5594841 RC1_2228 RC1_2229     TRUE 0.726 3.000 0.000 NA   NA
 5594842 5594843 RC1_2230 RC1_2231     FALSE 0.059 165.000 0.000 NA   NA
 5594843 5594844 RC1_2231 RC1_2232     FALSE 0.087 113.000 0.000 NA   NA
 5594844 5594845 RC1_2232 RC1_2233   nnrU TRUE 0.715 4.000 0.000 NA   NA
 5594846 5594847 RC1_2234 RC1_2236   pip TRUE 0.773 -270.000 0.000 NA   NA
 5594849 5594850 RC1_2237 RC1_2238     FALSE 0.104 102.000 0.000 NA   NA
 5594851 5594852 RC1_2239 RC1_2240   atpC FALSE 0.078 240.000 0.002 1.000   NA
 5594852 5594853 RC1_2240 RC1_2241 atpC atpD TRUE 0.995 79.000 0.837 0.005 Y NA
 5594853 5594854 RC1_2241 RC1_2242 atpD atpG TRUE 0.994 77.000 0.724 0.005 Y NA
 5594854 5594855 RC1_2242 RC1_2243 atpG atpA TRUE 0.998 51.000 0.846 0.005 Y NA
 5594855 5594856 RC1_2243 RC1_2244 atpA atpH TRUE 1.000 0.000 0.864 0.005 Y NA
 5594861 5594862 RC1_2249 RC1_2250     TRUE 0.944 -3.000 0.021 1.000   NA
 5594862 5594863 RC1_2250 RC1_2251     FALSE 0.074 130.000 0.000 NA   NA
 5594864 5594865 RC1_2252 RC1_2253 priA tyrR FALSE 0.132 98.000 0.000 1.000   NA
 5594865 5594866 RC1_2253 RC1_2254 tyrR   TRUE 0.778 -19.000 0.000 NA   NA
 5594867 5594868 RC1_2255 RC1_2256 talC   TRUE 0.571 54.000 0.018 NA   NA
 5594868 5594869 RC1_2256 RC1_2257   xerC TRUE 0.834 5.000 0.005 NA   NA
 5594869 5594870 RC1_2257 RC1_2258 xerC   FALSE 0.027 559.000 0.000 1.000   NA
 5594872 5594873 RC1_2260 RC1_2261     TRUE 0.774 -97.000 0.000 NA   NA
 5594874 5594875 RC1_2262 RC1_2263 rpFC sucB FALSE 0.055 214.000 0.000 1.000 N NA
 5594875 5594876 RC1_2263 RC1_2264 sucB sucA TRUE 0.996 51.000 0.667 1.000 Y NA
 5594877 5594878 RC1_2265 RC1_2266   cdd FALSE 0.148 94.000 0.000 1.000 N NA
 5594878 5594879 RC1_2266 RC1_2267 cdd deoC TRUE 0.941 15.000 0.009 1.000 Y NA
 5594880 5594881 RC1_2268 RC1_2269 treY   FALSE 0.111 109.000 0.000 1.000   NA
 5594881 5594882 RC1_2269 RC1_2270   glgX TRUE 0.999 -7.000 1.000 1.000   NA
 5594882 5594883 RC1_2270 RC1_2271 glgX   FALSE 0.197 75.000 0.000 1.000   NA
 5594883 5594884 RC1_2271 RC1_2272     FALSE 0.226 84.000 0.000 0.097   NA
 5594884 5594885 RC1_2272 RC1_2273   panD FALSE 0.262 60.000 0.000 1.000   NA
 5594885 5594886 RC1_2273 RC1_2274 panD deoA FALSE 0.078 162.000 0.000 1.000 N NA
 5594886 5594887 RC1_2274 RC1_2275 deoA   FALSE 0.063 181.000 0.000 1.000   NA
 5594887 5594888 RC1_2275 RC1_2276     FALSE 0.039 237.000 0.000 NA   NA
 5594888 5594889 RC1_2276 RC1_2277     FALSE 0.065 152.000 0.000 NA   NA
 5594889 5594890 RC1_2277 RC1_2278   tam FALSE 0.077 122.000 0.000 NA   NA
 5594890 5594891 RC1_2278 RC1_2279 tam merA FALSE 0.477 27.000 0.000 1.000   NA
 5594891 5594892 RC1_2279 RC1_2280 merA merA1 TRUE 0.987 16.000 0.320 NA   NA
 5594893 5594894 RC1_2281 RC1_2282 rpmH rnpA TRUE 0.999 6.000 0.787 1.000   NA
 5594894 5594895 RC1_2282 RC1_2283 rnpA   FALSE 0.297 393.000 0.105 1.000 N NA
 5594895 5594896 RC1_2283 RC1_2284   engB FALSE 0.476 164.000 0.082 0.041   NA
 5594897 5594898 RC1_2285 RC1_2286     TRUE 0.533 17.000 0.000 NA   NA
 5594898 5594899 RC1_2286 RC1_2287     FALSE 0.263 51.000 0.000 NA   NA
 5594901 5594902 RC1_2289 RC1_2290     TRUE 0.996 5.000 0.400 1.000   NA
 5594903 5594904 RC1_2291 RC1_2292   dapD FALSE 0.450 137.000 0.071 1.000   NA
 5594904 5594905 RC1_2292 RC1_2293 dapD dapE TRUE 0.992 6.000 0.109 0.002 Y NA
 5594905 5594906 RC1_2293 RC1_2294 dapE   TRUE 0.925 -3.000 0.015 NA   NA
 5594907 5594908 RC1_2295 RC1_2296 truA fmt TRUE 0.965 21.000 0.069 1.000 Y NA
 5594908 5594909 RC1_2296 RC1_2297 fmt   FALSE 0.350 35.000 0.000 NA   NA
 5594909 5594910 RC1_2297 RC1_2298   def FALSE 0.408 29.000 0.000 NA   NA
 5594910 5594911 RC1_2298 RC1_2299 def   TRUE 0.489 114.000 0.074 NA   NA
 5594911 5594912 RC1_2299 RC1_2300     FALSE 0.185 70.000 0.000 NA   NA
 5594912 5594913 RC1_2300 RC1_2301     TRUE 0.998 -10.000 0.500 NA   NA
 5594913 5594914 RC1_2301 RC1_2302     FALSE 0.332 45.000 0.000 1.000   NA
 5594916 5594917 RC1_2304 RC1_2305 recR   TRUE 0.930 152.000 0.604 NA   NA
 5594917 5594918 RC1_2305 RC1_2306   dnaX TRUE 0.996 4.000 0.411 NA   NA
 5594920 5594921 RC1_2308 RC1_2309     FALSE 0.306 42.000 0.000 NA   NA
 5594921 5594922 RC1_2309 RC1_2310     FALSE 0.143 132.000 0.000 0.003   NA
 5594923 5594924 RC1_2311 RC1_2312   rpmI TRUE 0.612 12.000 0.000 NA   NA
 5594924 5594925 RC1_2312 RC1_2313 rpmI rplT TRUE 1.000 14.000 0.928 0.011 Y NA
 5594927 5594928 RC1_2315 RC1_2316 pheS   FALSE 0.154 88.000 0.000 1.000   NA
 5594928 5594929 RC1_2316 RC1_2317     TRUE 0.997 -3.000 0.400 0.035   NA
 5594929 5594930 RC1_2317 RC1_2318   pheT FALSE 0.284 55.000 0.000 1.000   NA
 5594930 5594931 RC1_2318 RC1_2319 pheT   FALSE 0.057 208.000 0.000 1.000 N NA
 5594931 5594932 RC1_2319 RC1_2320     FALSE 0.151 89.000 0.000 1.000   NA
 5594932 5594933 RC1_2320 RC1_2321     FALSE 0.321 48.000 0.000 1.000   NA
 5594934 5594935 RC1_2322 RC1_2323     FALSE 0.069 170.000 0.000 1.000   NA
 5594935 5594936 RC1_2323 RC1_2324   gst FALSE 0.118 105.000 0.000 1.000   NA
 5594939 5594940 RC1_2327 RC1_2328     FALSE 0.055 174.000 0.000 NA   NA
 5594942 5594943 RC1_2330 RC1_2331 pepB   TRUE 0.689 114.000 0.130 0.028   NA
 5594943 5594944 RC1_2331 RC1_2332     TRUE 0.988 -3.000 0.150 NA   NA
 5594944 5594945 RC1_2332 RC1_2333   leuC FALSE 0.041 243.000 0.000 NA N NA
 5594946 5594947 RC1_2334 RC1_2335     FALSE 0.075 127.000 0.000 NA   NA
 5594949 5594950 RC1_2337 RC1_2338     FALSE 0.302 43.000 0.000 NA   NA
 5594951 5594952 RC1_2339 RC1_2340     FALSE 0.044 211.000 0.000 NA   NA
 5594952 5594953 RC1_2340 RC1_2341     TRUE 0.715 4.000 0.000 NA   NA
 5594953 5594954 RC1_2341 RC1_2342   ompA TRUE 0.928 15.000 0.071 NA   NA
 5594954 5594955 RC1_2342 RC1_2343 ompA   TRUE 0.998 -3.000 0.500 NA   NA
 5594956 5594957 RC1_2344 RC1_2345     FALSE 0.160 77.000 0.000 NA   NA
 5594957 5594958 RC1_2345 RC1_2346     FALSE 0.330 178.000 0.062 NA   NA
 5594959 5594960 RC1_2347 RC1_2348 htpX rsmB TRUE 0.554 105.000 0.075 1.000 N NA
 5594962 5594963 RC1_2350 RC1_2351 rpe   TRUE 0.908 12.000 0.042 NA   NA
 5594963 5594964 RC1_2351 RC1_2352   purH TRUE 0.952 6.000 0.068 NA   NA
 5594964 5594965 RC1_2352 RC1_2353 purH   FALSE 0.059 164.000 0.000 NA   NA
 5594965 5594966 RC1_2353 RC1_2354     FALSE 0.062 158.000 0.000 NA   NA
 5594966 5594967 RC1_2354 RC1_2355     FALSE 0.052 182.000 0.000 NA   NA
 5594968 5594969 RC1_2356 RC1_2357     TRUE 0.632 11.000 0.000 NA   NA
 5594969 5594970 RC1_2357 RC1_2358     TRUE 0.930 27.000 0.122 NA   NA
 5594971 5594972 RC1_2359 RC1_2360   clpP FALSE 0.098 105.000 0.000 NA   NA
 5594973 5594974 RC1_2361 RC1_2362 gpsA gcp TRUE 0.569 98.000 0.070 1.000 N NA
 5594975 5594976 RC1_2363 RC1_2364 hemC hemD TRUE 0.976 15.000 0.056 0.001 Y NA
 5594976 5594977 RC1_2364 RC1_2365 hemD   FALSE 0.258 61.000 0.000 1.000   NA
 5594977 5594978 RC1_2365 RC1_2366   hemY TRUE 0.815 -3.000 0.000 1.000   NA
 5594978 5594979 RC1_2366 RC1_2367 hemY cobD TRUE 0.570 18.000 0.000 1.000   NA
 5594980 5594981 RC1_2368 RC1_2369     TRUE 0.510 136.000 0.095 NA   NA
 5594981 5594982 RC1_2369 RC1_2370   cobS TRUE 0.832 8.000 0.007 NA N NA
 5594983 5594984 RC1_2371 RC1_2372 cobT   FALSE 0.024 477.000 0.000 NA   NA
 5594985 5594986 RC1_2373 RC1_2374   folE FALSE 0.339 44.000 0.000 1.000   NA
 5594986 5594987 RC1_2374 RC1_2375 folE apaG FALSE 0.108 251.000 0.013 NA N NA
 5594988 5594989 RC1_2376 RC1_2377     FALSE 0.095 108.000 0.000 NA   NA
 5594989 5594990 RC1_2377 RC1_2378     FALSE 0.026 378.000 0.000 NA   NA
 5594991 5594992 RC1_2379 RC1_2380     FALSE 0.022 657.000 0.000 NA   NA
 5594992 5594993 RC1_2380 RC1_2381     FALSE 0.022 676.000 0.000 NA   NA
 5594993 5594994 RC1_2381 RC1_2382     TRUE 0.807 -61.000 0.000 1.000   NA
 5594996 5594997 RC1_2384 RC1_2385     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5594998 5594999 RC1_2386 RC1_2387     FALSE 0.140 85.000 0.000 NA   NA
 5594999 5595000 RC1_2387 RC1_2388     TRUE 0.715 4.000 0.000 NA   NA
 5595000 5595001 RC1_2388 RC1_2389     FALSE 0.036 253.000 0.000 NA   NA
 5595001 5595002 RC1_2389 RC1_2390     FALSE 0.122 91.000 0.000 NA   NA
 5595003 5595004 RC1_2391 RC1_2392 phoD   TRUE 0.659 68.000 0.000 1.000 Y NA
 5595009 5595010 RC1_2397 RC1_2398     FALSE 0.043 214.000 0.000 NA   NA
 5595011 5595012 RC1_2399 RC1_2400     TRUE 0.972 -3.000 0.000 0.026 Y NA
 5595012 5595013 RC1_2400 RC1_2401     FALSE 0.056 213.000 0.000 1.000 N NA
 5595013 5595014 RC1_2401 RC1_2402     FALSE 0.078 121.000 0.000 NA   NA
 5595015 5595016 RC1_2403 RC1_2404 lepA   FALSE 0.053 180.000 0.000 NA   NA
 5595018 5595019 RC1_2406 RC1_2407     TRUE 0.493 20.000 0.000 NA   NA
 5595022 5595023 RC1_2410 RC1_2411     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5595025 5595026 RC1_2413 RC1_2414     TRUE 0.927 12.000 0.053 1.000   NA
 5595028 5595029 RC1_2416 RC1_2417     FALSE 0.224 71.000 0.000 1.000 N NA
 5595031 5595032 RC1_2419 RC1_2420   mgpS TRUE 0.994 -3.000 0.116 1.000 Y NA
 5595034 5595035 RC1_2422 RC1_2423     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5595035 5595036 RC1_2423 RC1_2424     FALSE 0.047 196.000 0.000 NA   NA
 5595037 5595038 RC1_2425 RC1_2426     FALSE 0.076 155.000 0.000 1.000   NA
 5595038 5595039 RC1_2426 RC1_2427     FALSE 0.041 225.000 0.000 NA   NA
 5595042 5595043 RC1_2430 RC1_2431 phaZ   FALSE 0.041 227.000 0.000 NA   NA
 5595044 5595045 RC1_2432 RC1_2433 recQ   TRUE 0.480 21.000 0.000 NA   NA
 5595045 5595046 RC1_2433 RC1_2434     FALSE 0.450 24.000 0.000 NA   NA
 5595047 5595048 RC1_2435 RC1_2436     FALSE 0.459 23.000 0.000 NA   NA
 5595048 5595049 RC1_2436 RC1_2437     FALSE 0.103 103.000 0.000 NA   NA
 5595050 5595051 RC1_2438 RC1_2439 macA macB TRUE 0.956 4.000 0.045 0.095 N NA
 5595051 5595052 RC1_2439 RC1_2440 macB   TRUE 0.996 -3.000 0.303 0.095 N NA
 5595054 5595055 RC1_2442 RC1_2443     FALSE 0.038 240.000 0.000 NA   NA
 5595055 5595056 RC1_2443 RC1_2444   uspA TRUE 0.825 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5595056 5595057 RC1_2444 RC1_2445 uspA   FALSE 0.037 340.000 0.000 1.000 N NA
 5595057 5595058 RC1_2445 RC1_2446   ppc FALSE 0.163 461.000 0.000 1.000 Y NA
 5595059 5595060 RC1_2447 RC1_2448   feoB TRUE 0.682 6.000 0.000 NA   NA
 5595060 5595061 RC1_2448 RC1_2449 feoB   TRUE 0.837 157.000 0.178 1.000 Y NA
 5595068 5595069 RC1_2456 RC1_2457     FALSE 0.296 44.000 0.000 NA   NA
 5595071 5595072 RC1_2459 RC1_2460 troA troB TRUE 1.000 9.000 0.898 1.000 Y NA
 5595072 5595073 RC1_2460 RC1_2461 troB troC TRUE 0.998 11.000 0.432 0.082 Y NA
 5595073 5595074 RC1_2461 RC1_2462 troC troD TRUE 0.999 -3.000 0.443 0.006 Y NA
 5595074 5595075 RC1_2462 RC1_2463 troD   FALSE 0.429 32.000 0.000 1.000   NA
 5595076 5595077 RC1_2464 RC1_2465     FALSE 0.132 87.000 0.000 NA   NA
 5595077 5595078 RC1_2465 RC1_2466     FALSE 0.044 208.000 0.000 NA   NA
 5595078 5595079 RC1_2466 RC1_2467     FALSE 0.058 167.000 0.000 NA   NA
 5595079 5595080 RC1_2467 RC1_2468     FALSE 0.067 148.000 0.000 NA   NA
 5595080 5595081 RC1_2468 RC1_2469     FALSE 0.027 373.000 0.000 NA   NA
 5595081 5595082 RC1_2469 RC1_2470     FALSE 0.070 142.000 0.000 NA   NA
 5595082 5595083 RC1_2470 RC1_2471     TRUE 0.612 12.000 0.000 NA   NA
 5595084 5595085 RC1_2472 RC1_2473     FALSE 0.103 103.000 0.000 NA   NA
 5595086 5595087 RC1_2474 RC1_2475   argF TRUE 0.967 -3.000 0.052 1.000 N NA
 5595087 5595088 RC1_2475 RC1_2476 argF argD TRUE 0.975 -3.000 0.004 1.000 Y NA
 5595090 5595091 RC1_2478 RC1_2479     FALSE 0.125 90.000 0.000 NA   NA
 5595092 5595093 RC1_2480 RC1_2481   barA FALSE 0.060 162.000 0.000 NA   NA
 5595093 5595094 RC1_2481 RC1_2482 barA   FALSE 0.072 231.000 0.000 0.094 N NA
 5595094 5595095 RC1_2482 RC1_2483   polA FALSE 0.120 108.000 0.000 1.000 N NA
 5595095 5595096 RC1_2483 RC1_2484 polA   FALSE 0.075 128.000 0.000 NA   NA
 5595097 5595098 RC1_2485 RC1_2486   ihfB FALSE 0.312 200.000 0.069 NA   NA
 5595098 5595099 RC1_2486 RC1_2487 ihfB rpsA TRUE 0.629 304.000 0.292 1.000 N NA
 5595099 5595100 RC1_2487 RC1_2488 rpsA cmk TRUE 0.633 282.000 0.281 1.000 N NA
 5595100 5595101 RC1_2488 RC1_2489 cmk   FALSE 0.212 71.000 0.000 1.000   NA
 5595101 5595102 RC1_2489 RC1_2490     TRUE 0.780 -13.000 0.000 NA   NA
 5595102 5595103 RC1_2490 RC1_2491     FALSE 0.315 40.000 0.000 NA   NA
 5595103 5595104 RC1_2491 RC1_2492   aroA FALSE 0.172 83.000 0.000 1.000   NA
 5595105 5595106 RC1_2493 RC1_2494     FALSE 0.055 174.000 0.000 NA   NA
 5595106 5595107 RC1_2494 RC1_2495     FALSE 0.034 265.000 0.000 NA   NA
 5595107 5595108 RC1_2495 RC1_2496     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5595110 5595111 RC1_2498 RC1_2499   lonD TRUE 0.993 -3.000 0.222 1.000   NA
 5595111 5595112 RC1_2499 RC1_2500 lonD   TRUE 0.825 72.000 0.148 NA   NA
 5595112 5595113 RC1_2500 RC1_2501     TRUE 0.887 9.000 0.020 NA   NA
 5595113 5595114 RC1_2501 RC1_2502     FALSE 0.054 178.000 0.000 NA   NA
 5595116 5595117 RC1_2504 RC1_2505     TRUE 0.999 12.000 0.833 0.001 Y NA
 5595117 5595118 RC1_2505 RC1_2506   kamA FALSE 0.113 112.000 0.000 1.000 N NA
 5595119 5595120 RC1_2507 RC1_2508   maiA FALSE 0.044 209.000 0.000 NA   NA
 5595120 5595121 RC1_2508 RC1_2509 maiA   TRUE 0.998 -3.000 0.495 1.000 N NA
 5595121 5595122 RC1_2509 RC1_2510   hmgA TRUE 0.992 13.000 0.195 1.000 Y NA
 5595124 5595125 RC1_2512 RC1_2513   pspF FALSE 0.078 121.000 0.000 NA   NA
 5595126 5595127 RC1_2514 RC1_2515   pspA TRUE 0.561 15.000 0.000 NA   NA
 5595127 5595128 RC1_2515 RC1_2516 pspA pspB TRUE 0.731 37.000 0.033 NA   NA
 5595128 5595129 RC1_2516 RC1_2517 pspB pspC TRUE 0.999 -3.000 0.913 NA   NA
 5595129 5595130 RC1_2517 RC1_2518 pspC   FALSE 0.398 30.000 0.000 NA   NA
 5595130 5595131 RC1_2518 RC1_2519   pspB FALSE 0.098 105.000 0.000 NA   NA
 5595132 5595133 RC1_2520 RC1_2521     FALSE 0.050 187.000 0.000 NA   NA
 5595136 5595137 RC1_2524 RC1_2525     FALSE 0.082 117.000 0.000 NA   NA
 5595140 5595141 RC1_2528 RC1_2529 hldE   TRUE 0.707 55.000 0.000 NA Y NA
 5595142 5595143 RC1_2530 RC1_2531     FALSE 0.113 97.000 0.000 NA   NA
 5595143 5595144 RC1_2531 RC1_2532   gst FALSE 0.060 162.000 0.000 NA   NA
 5595145 5595146 RC1_2533 RC1_2534 exoP   FALSE 0.039 237.000 0.000 NA   NA
 5595147 5595148 RC1_2535 RC1_2536 gumK   TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5595148 5595149 RC1_2536 RC1_2537     TRUE 0.972 -3.000 0.000 0.015 Y NA
 5595150 5595151 RC1_2538 RC1_2539     FALSE 0.064 154.000 0.000 NA   NA
 5595151 5595152 RC1_2539 RC1_2540     TRUE 0.993 67.000 0.594 0.081 Y NA
 5595153 5595154 RC1_2541 RC1_2542 regB regA TRUE 0.990 70.000 0.560 1.000 Y NA
 5595154 5595155 RC1_2542 RC1_2543 regA rfbP FALSE 0.029 640.000 0.000 1.000 N NA
 5595155 5595156 RC1_2543 RC1_2544 rfbP exoB TRUE 0.956 2.000 0.000 1.000 Y NA
 5595156 5595157 RC1_2544 RC1_2545 exoB   TRUE 0.581 14.000 0.000 NA   NA
 5595158 5595159 RC1_2546 RC1_2547     FALSE 0.306 42.000 0.000 NA   NA
 5595159 5595160 RC1_2547 RC1_2548     FALSE 0.177 72.000 0.000 NA   NA
 5595161 5595162 RC1_2549 RC1_2550     FALSE 0.042 223.000 0.000 NA   NA
 5595162 5595163 RC1_2550 RC1_2551   leuS TRUE 0.519 88.000 0.051 NA   NA
 5595163 5595164 RC1_2551 RC1_2552 leuS   TRUE 0.778 62.000 0.090 NA   NA
 5595164 5595165 RC1_2552 RC1_2553   holA TRUE 0.924 22.000 0.097 NA   NA
 5595166 5595167 RC1_2554 RC1_2555     TRUE 0.781 -12.000 0.000 NA   NA
 5595168 5595169 RC1_2556 RC1_2557 dnaK   TRUE 0.825 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5595169 5595170 RC1_2557 RC1_2558   fur FALSE 0.053 228.000 0.000 1.000 N NA
 5595170 5595171 RC1_2558 RC1_2559 fur   TRUE 0.632 11.000 0.000 NA   NA
 5595172 5595173 RC1_2560 RC1_2561   tgt FALSE 0.208 75.000 0.000 1.000 N NA
 5595173 5595174 RC1_2561 RC1_2562 tgt   FALSE 0.092 123.000 0.000 1.000   NA
 5595174 5595175 RC1_2562 RC1_2563     FALSE 0.107 100.000 0.000 NA   NA
 5595176 5595177 RC1_2564 RC1_2565     TRUE 0.989 -3.000 0.165 NA N NA
 5595179 5595180 RC1_2567 RC1_2568     FALSE 0.045 205.000 0.000 NA   NA
 5595180 5595181 RC1_2568 RC1_2569     FALSE 0.041 228.000 0.000 NA   NA
 5595183 5595184 RC1_2571 RC1_2572     FALSE 0.187 305.000 0.000 NA Y NA
 5595184 5595185 RC1_2572 RC1_2573     FALSE 0.048 193.000 0.000 NA   NA
 5595185 5595186 RC1_2573 RC1_2574     FALSE 0.104 102.000 0.000 NA   NA
 5595187 5595188 RC1_2575 RC1_2576     TRUE 0.993 -3.000 0.227 NA   NA
 5595188 5595189 RC1_2576 RC1_2577     TRUE 0.997 -10.000 0.391 NA   NA
 5595190 5595191 RC1_2578 RC1_2579     FALSE 0.468 22.000 0.000 NA   NA
 5595191 5595192 RC1_2579 RC1_2580     FALSE 0.087 113.000 0.000 NA   NA
 5595192 5595193 RC1_2580 RC1_2581     TRUE 0.977 -3.000 0.080 1.000   NA
 5595195 5595196 RC1_2583 RC1_2584     FALSE 0.065 151.000 0.000 NA   NA
 5595196 5595197 RC1_2584 RC1_2585   ompA FALSE 0.229 59.000 0.000 NA   NA
 5595197 5595198 RC1_2585 RC1_2586 ompA agmR FALSE 0.071 175.000 0.000 1.000 N NA
 5595198 5595199 RC1_2586 RC1_2587 agmR   TRUE 0.581 14.000 0.000 NA   NA
 5595199 5595200 RC1_2587 RC1_2588     FALSE 0.050 187.000 0.000 NA   NA
 5595202 5595203 RC1_2590 RC1_2591 metZ   FALSE 0.047 197.000 0.000 NA   NA
 5595203 5595204 RC1_2591 RC1_2592   glnD FALSE 0.049 188.000 0.000 NA   NA
 5595206 5595207 RC1_2594 RC1_2595 groS groL TRUE 0.741 58.000 0.000 0.081 Y NA
 5595208 5595209 RC1_2596 RC1_2597     FALSE 0.098 105.000 0.000 NA   NA
 5595209 5595210 RC1_2597 RC1_2598   greB FALSE 0.022 595.000 0.000 NA   NA
 5595211 5595212 RC1_2599 RC1_2600     FALSE 0.107 100.000 0.000 NA   NA
 5595212 5595213 RC1_2600 RC1_2601     FALSE 0.201 66.000 0.000 NA   NA
 5595213 5595214 RC1_2601 RC1_2602     FALSE 0.195 68.000 0.000 NA   NA
 5595214 5595215 RC1_2602 RC1_2603     TRUE 0.775 -31.000 0.000 NA   NA
 5595215 5595216 RC1_2603 RC1_2604     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5595216 5595217 RC1_2604 RC1_2605     FALSE 0.150 81.000 0.000 NA   NA
 5595218 5595219 RC1_2606 RC1_2607     TRUE 0.954 21.000 0.150 NA   NA
 5595219 5595220 RC1_2607 RC1_2608   mucR FALSE 0.024 424.000 0.000 NA   NA
 5595222 5595223 RC1_2610 RC1_2611 rimI   TRUE 0.992 -3.000 0.209 1.000   NA
 5595225 5595226 RC1_2613 RC1_2614     FALSE 0.074 160.000 0.000 1.000   NA
 5595226 5595227 RC1_2614 RC1_2615     FALSE 0.036 314.000 0.000 1.000   NA
 5595229 5595230 RC1_2617 RC1_2618     TRUE 0.870 23.000 0.058 NA   NA
 5595230 5595231 RC1_2618 RC1_2619     TRUE 0.996 16.000 0.632 NA   NA
 5595231 5595232 RC1_2619 RC1_2620   pcp FALSE 0.128 100.000 0.000 1.000   NA
 5595232 5595233 RC1_2620 RC1_2621 pcp   FALSE 0.098 105.000 0.000 NA   NA
 5595233 5595234 RC1_2621 RC1_2622     FALSE 0.358 34.000 0.000 NA   NA
 5595234 5595235 RC1_2622 RC1_2623   trpS FALSE 0.095 108.000 0.000 NA   NA
 5595235 5595236 RC1_2623 RC1_2624 trpS mviN TRUE 0.589 98.000 0.078 1.000   NA
 5595236 5595237 RC1_2624 RC1_2625 mviN   FALSE 0.025 419.000 0.000 NA   NA
 5595237 5595238 RC1_2625 RC1_2626   rrfB FALSE 0.276 49.000 0.000 NA   NA
 5595238 5595239 RC1_2626 RC1_2627 rrfB rrlB FALSE 0.079 119.000 0.000 NA   NA
 5595239 5595240 RC1_2627 RC1_2628 rrlB   FALSE 0.027 366.000 0.000 NA   NA
 5595240 5595241 RC1_2628 RC1_2629     FALSE 0.343 36.000 0.000 NA   NA
 5595241 5595242 RC1_2629 RC1_2630   rrsB FALSE 0.046 198.000 0.000 NA   NA
 5595243 5595244 RC1_2631 RC1_2632     FALSE 0.145 83.000 0.000 NA   NA
 5595247 5595248 RC1_2635 RC1_2636     FALSE 0.147 238.000 0.021 NA   NA
 5595248 5595249 RC1_2636 RC1_2637   prfA TRUE 0.996 6.000 0.229 1.000 Y NA
 5595250 5595251 RC1_2638 RC1_2639     TRUE 0.493 20.000 0.000 NA   NA
 5595252 5595253 RC1_2640 RC1_2641   ispG TRUE 0.780 -13.000 0.000 NA   NA
 5595253 5595254 RC1_2641 RC1_2642 ispG   TRUE 0.671 196.000 0.233 1.000   NA
 5595256 5595257 RC1_2644 RC1_2645 ptsI fabK FALSE 0.308 281.000 0.088 1.000   NA
 5595257 5595258 RC1_2645 RC1_2646 fabK lysC TRUE 0.518 71.000 0.023 1.000   NA
 5595259 5595260 RC1_2647 RC1_2648 ubiG   FALSE 0.257 64.000 0.000 1.000 N NA
 5595260 5595261 RC1_2648 RC1_2649     FALSE 0.166 87.000 0.000 1.000 N NA
 5595264 5595265 RC1_2651 RC1_2653   actP TRUE 0.572 158.000 0.138 NA   NA
 5595265 5595266 RC1_2653 RC1_2654 actP yjcH TRUE 0.999 0.000 0.826 NA   NA
 5595266 5595267 RC1_2654 RC1_2655 yjcH   FALSE 0.028 352.000 0.000 NA   NA
 5595267 5595268 RC1_2655 RC1_2656     FALSE 0.072 139.000 0.000 NA   NA
 5595269 5595270 RC1_2657 RC1_2658   prrA TRUE 0.871 -3.000 0.000 0.025   NA
 5595271 5595272 RC1_2659 RC1_2660   grxC FALSE 0.265 110.000 0.013 1.000   NA
 5595272 5595273 RC1_2660 RC1_2661 grxC comF FALSE 0.225 101.000 0.005 1.000   NA
 5595275 5595276 RC1_2663 RC1_2664     TRUE 0.961 -10.000 0.041 1.000 N NA
 5595276 5595277 RC1_2664 RC1_2665   argJ TRUE 0.858 5.000 0.005 1.000 N NA
 5595277 5595278 RC1_2665 RC1_2666 argJ   FALSE 0.285 249.000 0.070 1.000 N NA
 5595280 5595281 RC1_2668 RC1_2669     TRUE 0.747 0.000 0.000 NA   NA
 5595281 5595282 RC1_2669 RC1_2670   accA FALSE 0.339 44.000 0.000 1.000   NA
 5595282 5595283 RC1_2670 RC1_2671 accA   FALSE 0.070 142.000 0.000 NA   NA
 5595283 5595284 RC1_2671 RC1_2672     TRUE 0.985 -19.000 0.131 NA   NA
 5595284 5595285 RC1_2672 RC1_2673     FALSE 0.321 39.000 0.000 NA   NA
 5595285 5595286 RC1_2673 RC1_2674     FALSE 0.076 124.000 0.000 NA   NA
 5595286 5595287 RC1_2674 RC1_2675   aroB FALSE 0.248 187.000 0.040 NA N NA
 5595287 5595288 RC1_2675 RC1_2676 aroB aroK TRUE 0.996 -3.000 0.147 1.000 Y NA
 5595288 5595289 RC1_2676 RC1_2677 aroK   TRUE 0.699 5.000 0.000 NA   NA
 5595290 5595291 RC1_2678 RC1_2679     TRUE 0.997 -19.000 0.400 NA   NA
 5595291 5595292 RC1_2679 RC1_2680   xerD TRUE 0.842 6.000 0.007 NA   NA
 5595292 5595293 RC1_2680 RC1_2682 xerD   FALSE 0.275 74.000 0.000 0.034   NA
 5595294 5595295 RC1_2681 RC1_2683   tmk FALSE 0.055 214.000 0.000 1.000 N NA
 5595295 5595296 RC1_2683 RC1_2684 tmk   FALSE 0.087 137.000 0.000 1.000   NA
 5595296 5595297 RC1_2684 RC1_2685     FALSE 0.101 115.000 0.000 1.000   NA
 5595298 5595299 RC1_2686 RC1_2687 aceA   FALSE 0.033 278.000 0.000 NA   NA
 5595299 5595300 RC1_2687 RC1_2688   aceB FALSE 0.027 356.000 0.000 NA   NA
 5595301 5595302 RC1_2689 RC1_2690     FALSE 0.062 193.000 0.000 1.000 N NA
 5595302 5595303 RC1_2690 RC1_2691     FALSE 0.151 89.000 0.000 1.000   NA
 5595303 5595304 RC1_2691 RC1_2692   paaG FALSE 0.373 38.000 0.000 1.000   NA
 5595304 5595305 RC1_2692 RC1_2693 paaG   FALSE 0.073 133.000 0.000 NA   NA
 5595308 5595309 RC1_2696 RC1_2697     FALSE 0.060 197.000 0.000 1.000 N NA
 5595310 5595311 RC1_2698 RC1_2699 nfi   FALSE 0.035 257.000 0.000 NA   NA
 5595313 5595314 RC1_2701 RC1_2702 morB gdhA FALSE 0.090 142.000 0.000 1.000 N NA
 5595314 5595315 RC1_2702 RC1_2703 gdhA   TRUE 0.699 5.000 0.000 NA   NA
 5595317 5595318 RC1_2705 RC1_2706 lamB   FALSE 0.045 454.000 0.000 0.036 N NA
 5595319 5595320 RC1_2707 RC1_2708 hisJ artI TRUE 0.575 96.000 0.000 0.001 Y NA
 5595320 5595321 RC1_2708 RC1_2709 artI   TRUE 0.996 9.000 0.250 0.036 Y NA
 5595321 5595322 RC1_2709 RC1_2710     TRUE 0.999 11.000 0.625 0.007 Y NA
 5595323 5595324 RC1_2711 RC1_2712     FALSE 0.050 187.000 0.000 NA   NA
 5595324 5595325 RC1_2712 RC1_2713     FALSE 0.051 183.000 0.000 NA   NA
 5595326 5595327 RC1_2714 RC1_2715 ahcY divL FALSE 0.111 352.000 0.018 1.000 N NA
 5595327 5595328 RC1_2715 RC1_2716 divL   FALSE 0.075 128.000 0.000 NA   NA
 5595330 5595331 RC1_2718 RC1_2719     FALSE 0.140 85.000 0.000 NA   NA
 5595331 5595332 RC1_2719 RC1_2720     FALSE 0.321 39.000 0.000 NA   NA
 5595335 5595336 RC1_2723 RC1_2724     FALSE 0.125 90.000 0.000 NA   NA
 5595336 5595337 RC1_2724 RC1_2725     FALSE 0.185 70.000 0.000 NA   NA
 5595337 5595338 RC1_2725 RC1_2726     FALSE 0.075 128.000 0.000 NA   NA
 5595338 5595339 RC1_2726 RC1_2727     FALSE 0.093 109.000 0.000 NA   NA
 5595339 5595340 RC1_2727 RC1_2728   cvaB FALSE 0.064 153.000 0.000 NA   NA
 5595340 5595341 RC1_2728 RC1_2729 cvaB   FALSE 0.070 143.000 0.000 NA   NA
 5595341 5595342 RC1_2729 RC1_2730     FALSE 0.068 146.000 0.000 NA   NA
 5595342 5595343 RC1_2730 RC1_2731     FALSE 0.021 1363.000 0.000 NA   NA
 5595343 5595344 RC1_2731 RC1_2732     TRUE 0.999 -183.000 1.000 NA   NA
 5595346 5595347 RC1_2734 RC1_2735     FALSE 0.024 431.000 0.000 NA   NA
 5595347 5595348 RC1_2735 RC1_2736     FALSE 0.408 29.000 0.000 NA   NA
 5595350 5595351 RC1_2737 RC1_2739     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5595351 5595352 RC1_2739 RC1_2740     FALSE 0.125 90.000 0.000 NA   NA
 5595353 5595354 RC1_2741 RC1_2742     FALSE 0.145 86.000 0.000 NA N NA
 5595355 5595356 RC1_2743 RC1_2744 amtB   FALSE 0.045 203.000 0.000 NA   NA
 5595357 5595358 RC1_2745 RC1_2746 glgC glgA TRUE 0.996 13.000 0.307 1.000 Y NA
 5595358 5595359 RC1_2746 RC1_2747 glgA   FALSE 0.081 155.000 0.000 1.000 N NA
 5595361 5595362 RC1_2749 RC1_2750     TRUE 0.880 -3.000 0.004 NA   NA
 5595363 5595364 RC1_2751 RC1_2752     TRUE 0.652 9.000 0.000 NA   NA
 5595364 5595365 RC1_2752 RC1_2753     FALSE 0.109 99.000 0.000 NA   NA
 5595365 5595366 RC1_2753 RC1_2754     TRUE 0.775 -45.000 0.000 NA   NA
 5595366 5595367 RC1_2754 RC1_2755     FALSE 0.279 48.000 0.000 NA   NA
 5595367 5595368 RC1_2755 RC1_2756     FALSE 0.039 287.000 0.000 1.000   NA
 5595369 5595370 RC1_2757 RC1_2758     TRUE 0.715 4.000 0.000 NA   NA
 5595370 5595371 RC1_2758 RC1_2759     FALSE 0.121 92.000 0.000 NA   NA
 5595371 5595372 RC1_2759 RC1_2760   bla TRUE 0.710 9.000 0.000 1.000 N NA
 5595372 5595373 RC1_2760 RC1_2761 bla   FALSE 0.021 1242.000 0.000 NA   NA
 5595373 5595374 RC1_2761 RC1_2762     TRUE 0.507 19.000 0.000 NA   NA
 5595375 5595376 RC1_2763 RC1_2764     FALSE 0.116 95.000 0.000 NA   NA
 5595376 5595377 RC1_2764 RC1_2765     FALSE 0.041 228.000 0.000 NA   NA
 5595377 5595378 RC1_2765 RC1_2766   ppa FALSE 0.065 151.000 0.000 NA   NA
 5595378 5595379 RC1_2766 RC1_2767 ppa   FALSE 0.072 148.000 0.000 NA N NA
 5595380 5595381 RC1_2768 RC1_2769     FALSE 0.155 188.000 0.015 NA N NA
 5595382 5595383 RC1_2770 RC1_2771 nth acyII FALSE 0.113 108.000 0.000 1.000   NA
 5595386 5595387 RC1_2774 RC1_2775     FALSE 0.217 62.000 0.000 NA   NA
 5595388 5595389 RC1_2776 RC1_2777     FALSE 0.075 126.000 0.000 NA   NA
 5595389 5595390 RC1_2777 RC1_2778     TRUE 0.682 6.000 0.000 NA   NA
 5595392 5595393 RC1_2780 RC1_2781   cah FALSE 0.111 113.000 0.000 1.000 N NA
 5595393 5595394 RC1_2781 RC1_2782 cah ubiH FALSE 0.088 145.000 0.000 1.000 N NA
 5595395 5595396 RC1_2783 RC1_2784 glnZ dapC FALSE 0.164 454.000 0.000 1.000 Y NA
 5595396 5595397 RC1_2784 RC1_2785 dapC ftsK FALSE 0.049 242.000 0.000 1.000 N NA
 5595399 5595400 RC1_2787 RC1_2788 lolA   FALSE 0.282 86.000 0.005 1.000   NA
 5595400 5595401 RC1_2788 RC1_2789     FALSE 0.160 77.000 0.000 NA   NA
 5595401 5595402 RC1_2789 RC1_2790     FALSE 0.201 66.000 0.000 NA   NA
 5595402 5595403 RC1_2790 RC1_2791     FALSE 0.240 56.000 0.000 NA   NA
 5595403 5595404 RC1_2791 RC1_2792     FALSE 0.380 32.000 0.000 NA   NA
 5595405 5595406 RC1_2793 RC1_2794   rho FALSE 0.082 117.000 0.000 NA   NA
 5595406 5595407 RC1_2794 RC1_2795 rho ble FALSE 0.029 324.000 0.000 NA   NA
 5595407 5595408 RC1_2795 RC1_2796 ble   TRUE 0.632 11.000 0.000 NA   NA
 5595408 5595409 RC1_2796 RC1_2797   hemH TRUE 0.486 89.000 0.043 NA   NA
 5595409 5595410 RC1_2797 RC1_2798 hemH hemE TRUE 0.958 45.000 0.131 1.000 Y NA
 5595411 5595412 RC1_2799 RC1_2800     TRUE 0.883 49.000 0.135 NA   NA
 5595412 5595413 RC1_2800 RC1_2801   aroE TRUE 0.990 -3.000 0.169 NA N NA
 5595413 5595414 RC1_2801 RC1_2802 aroE coaE TRUE 0.800 53.000 0.078 1.000 N NA
 5595414 5595415 RC1_2802 RC1_2803 coaE dnaQ TRUE 0.976 0.000 0.092 1.000 N NA
 5595416 5595417 RC1_2804 RC1_2805     FALSE 0.309 53.000 0.000 1.000 N NA
 5595417 5595418 RC1_2805 RC1_2806     FALSE 0.101 119.000 0.000 1.000 N NA
 5595419 5595420 RC1_2807 RC1_2808     TRUE 0.957 -3.000 0.041 NA   NA
 5595420 5595421 RC1_2808 RC1_2809   trmE FALSE 0.392 63.000 0.006 NA   NA
 5595421 5595422 RC1_2809 RC1_2810 trmE gidA TRUE 0.938 56.000 0.266 1.000   NA
 5595422 5595423 RC1_2810 RC1_2811 gidA gidB TRUE 0.987 32.000 0.466 1.000 N NA
 5595423 5595424 RC1_2811 RC1_2812 gidB   TRUE 0.994 6.000 0.339 1.000 N NA
 5595424 5595425 RC1_2812 RC1_2813   parB TRUE 0.999 -7.000 0.827 1.000 N NA
 5595425 5595426 RC1_2813 RC1_2814 parB   FALSE 0.437 26.000 0.000 NA   NA
 5595427 5595428 RC1_2815 RC1_2816     FALSE 0.335 37.000 0.000 NA   NA
 5595429 5595430 RC1_2817 RC1_2818   rfaF TRUE 0.956 51.000 0.141 1.000 Y NA
 5595430 5595431 RC1_2818 RC1_2819 rfaF thrS FALSE 0.187 183.000 0.017 1.000 N NA
 5595431 5595432 RC1_2819 RC1_2820 thrS infC TRUE 0.735 274.000 0.186 1.000 Y NA
 5595433 5595434 RC1_2821 RC1_2822   pckA FALSE 0.037 248.000 0.000 NA   NA
 5595437 5595438 RC1_2825 RC1_2826 chvI chvG TRUE 0.998 43.000 0.829 1.000 Y NA
 5595438 5595439 RC1_2826 RC1_2827 chvG pleC FALSE 0.321 201.000 0.000 0.013 Y NA
 5595441 5595442 RC1_2829 RC1_2830 trpB trpA TRUE 0.999 -3.000 0.344 0.001 Y NA
 5595442 5595443 RC1_2830 RC1_2831 trpA   TRUE 0.699 5.000 0.000 NA   NA
 5595443 5595444 RC1_2831 RC1_2832     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   NA
 5595444 5595445 RC1_2832 RC1_2833   accD TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5595445 5595446 RC1_2833 RC1_2834 accD folC TRUE 0.994 8.000 0.383 1.000 N NA
 5595446 5595447 RC1_2834 RC1_2835 folC   FALSE 0.296 44.000 0.000 NA   NA
 5595449 5595450 RC1_2837 RC1_2838     TRUE 0.999 14.000 1.000 NA   NA
 5595452 5595453 RC1_2840 RC1_2841     TRUE 0.726 3.000 0.000 NA   NA
 5595455 5595456 RC1_2843 RC1_2844     FALSE 0.157 78.000 0.000 NA   NA
 5595456 5595457 RC1_2844 RC1_2845     FALSE 0.245 55.000 0.000 NA   NA
 5595457 5595458 RC1_2845 RC1_2846     FALSE 0.052 182.000 0.000 NA   NA
 5595459 5595460 RC1_2847 RC1_2848 cstS1   FALSE 0.051 220.000 0.000 1.000   NA
 5595460 5595461 RC1_2848 RC1_2849     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5595462 5595463 RC1_2850 RC1_2851     TRUE 0.813 7.000 0.000 0.005 N NA
 5595465 5595466 RC1_2853 RC1_2854   metE FALSE 0.023 507.000 0.000 NA   NA
 5595467 5595468 RC1_2856 RC1_2857     FALSE 0.040 233.000 0.000 NA   NA
 5595469 5595470 RC1_2858 RC1_2859 dnaK dnaJ TRUE 0.929 112.000 0.236 0.003 Y NA
 5595471 5595472 RC1_2860 RC1_2861     FALSE 0.033 279.000 0.000 NA   NA
 5595473 5595474 RC1_2862 RC1_2863   pyrD TRUE 0.982 -3.000 0.108 NA   NA
 5595476 5595477 RC1_2865 RC1_2866 pfpL   FALSE 0.032 288.000 0.000 NA   NA
 5595477 5595478 RC1_2866 RC1_2867   hprK FALSE 0.358 34.000 0.000 NA   NA
 5595478 5595479 RC1_2867 RC1_2868 hprK   TRUE 0.991 -3.000 0.194 NA   NA
 5595479 5595480 RC1_2868 RC1_2869     TRUE 0.990 -3.000 0.171 NA   NA
 5595480 5595481 RC1_2869 RC1_2870   ptsH TRUE 0.999 4.000 0.420 0.001 Y NA
 5595481 5595482 RC1_2870 RC1_2871 ptsH ptsI TRUE 0.994 -10.000 0.079 0.001 Y NA
 5595484 5595485 RC1_2874 RC1_2875     TRUE 0.985 9.000 0.220 NA   NA
 5595485 5595486 RC1_2875 RC1_2876   folD FALSE 0.278 108.000 0.017 NA   NA
 5595486 5595487 RC1_2876 RC1_2877 folD corA TRUE 0.550 76.000 0.036 1.000 N NA
 5595487 5595488 RC1_2877 RC1_2878 corA gshB FALSE 0.120 108.000 0.000 1.000 N NA
 5595488 5595489 RC1_2878 RC1_2879 gshB   FALSE 0.082 122.000 0.000 NA N NA
 5595489 5595490 RC1_2879 RC1_2880     TRUE 1.000 -3.000 0.806 NA Y NA
 5595490 5595491 RC1_2880 RC1_2881     TRUE 0.992 -25.000 0.179 0.001   NA
 5595491 5595492 RC1_2881 RC1_2882     TRUE 0.948 -7.000 0.029 NA   NA
 5595495 5595496 RC1_2885 RC1_2886   argG FALSE 0.036 345.000 0.000 1.000 N NA
 5595498 5595499 RC1_2887 RC1_2889     TRUE 0.632 11.000 0.000 NA   NA
 5595499 5595500 RC1_2889 RC1_2890     TRUE 0.612 12.000 0.000 NA   NA
 5595501 5595502 RC1_2891 RC1_2892     FALSE 0.154 79.000 0.000 NA   NA
 5595502 5595503 RC1_2892 RC1_2893   divJ FALSE 0.069 145.000 0.000 NA   NA
 5595509 5595510 RC1_2899 RC1_2900     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5595512 5595513 RC1_2902 RC1_2903   mutS FALSE 0.073 134.000 0.000 NA   NA
 5595513 5595514 RC1_2903 RC1_2904 mutS   FALSE 0.168 84.000 0.000 1.000   NA
 5595514 5595515 RC1_2904 RC1_2905   lolD FALSE 0.121 104.000 0.000 1.000   NA
 5595515 5595516 RC1_2905 RC1_2906 lolD   TRUE 0.999 -3.000 0.605 1.000 N NA
 5595516 5595517 RC1_2906 RC1_2907     TRUE 0.866 12.000 0.019 NA   NA
 5595517 5595518 RC1_2907 RC1_2908     TRUE 0.520 18.000 0.000 NA   NA
 5595518 5595519 RC1_2908 RC1_2909     FALSE 0.027 370.000 0.000 NA   NA
 5595519 5595520 RC1_2909 RC1_2910   nusA TRUE 0.996 22.000 0.759 NA   NA
 5595520 5595521 RC1_2910 RC1_2911 nusA   TRUE 0.929 44.000 0.075 NA Y NA
 5595521 5595522 RC1_2911 RC1_2912   infB TRUE 0.993 -3.000 0.223 NA N NA
 5595522 5595523 RC1_2912 RC1_2913 infB   FALSE 0.056 213.000 0.000 1.000 N NA
 5595525 5595526 RC1_2915 RC1_2916 rbfA truB TRUE 0.998 -10.000 0.318 1.000 Y NA
 5595526 5595527 RC1_2916 RC1_2917 truB rpsO TRUE 0.780 248.000 0.211 1.000 Y NA
 5595527 5595528 RC1_2917 RC1_2918 rpsO   FALSE 0.024 434.000 0.000 NA   NA
 5595528 5595529 RC1_2918 RC1_2919   pnp FALSE 0.078 120.000 0.000 NA   NA
 5595529 5595530 RC1_2919 RC1_2920 pnp   FALSE 0.171 86.000 0.000 1.000 N NA
 5595530 5595531 RC1_2920 RC1_2921   yefM FALSE 0.049 201.000 0.000 NA N NA
 5595531 5595532 RC1_2921 RC1_2922 yefM yoeB TRUE 0.493 20.000 0.000 NA   NA
 5595532 5595533 RC1_2922 RC1_2923 yoeB   FALSE 0.025 405.000 0.000 NA   NA
 5595533 5595534 RC1_2923 RC1_2924     FALSE 0.268 260.000 0.000 0.005 Y NA
 5595535 5595536 RC1_2925 RC1_2926     TRUE 0.981 112.000 1.000 NA   NA
 5595536 5595537 RC1_2926 RC1_2927     FALSE 0.223 69.000 0.000 1.000   NA
 5595537 5595538 RC1_2927 RC1_2928     FALSE 0.163 76.000 0.000 NA   NA
 5595538 5595539 RC1_2928 RC1_2929     TRUE 0.994 -3.000 0.254 NA   NA
 5595539 5595540 RC1_2929 RC1_2930     TRUE 0.999 -3.000 0.591 1.000 N NA
 5595540 5595541 RC1_2930 RC1_2931     TRUE 0.998 -12.000 0.489 1.000 N NA
 5595542 5595543 RC1_2932 RC1_2933   ribA TRUE 0.509 23.000 0.000 1.000   NA
 11430572 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 221.000 0.000 NA   NA
 11572935 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 221.000 0.000 NA   NA
 11715327 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 221.000 0.000 NA   NA
 11430573 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 257.000 0.000 NA   NA
 11572936 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 257.000 0.000 NA   NA
 11715328 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 257.000 0.000 NA   NA
 11430574 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 295.000 0.000 NA   NA
 11572937 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 295.000 0.000 NA   NA
 11715329 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 295.000 0.000 NA   NA
 11430575 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 331.000 0.000 NA   NA
 11572938 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 331.000 0.000 NA   NA
 11715330 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 331.000 0.000 NA   NA
 11430576 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 369.000 0.000 NA   NA
 11572939 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 369.000 0.000 NA   NA
 11715331 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 369.000 0.000 NA   NA
 11430577 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 405.000 0.000 NA   NA
 11572940 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 405.000 0.000 NA   NA
 11715332 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 405.000 0.000 NA   NA
 11430578 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 445.000 0.000 NA   NA
 11572941 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 445.000 0.000 NA   NA
 11715333 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 445.000 0.000 NA   NA
 11430579 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 481.000 0.000 NA   NA
 11572942 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 481.000 0.000 NA   NA
 11715334 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 481.000 0.000 NA   NA
 11430580 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 520.000 0.000 NA   NA
 11572943 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 520.000 0.000 NA   NA
 11715335 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 520.000 0.000 NA   NA
 11430581 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 556.000 0.000 NA   NA
 11572944 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 556.000 0.000 NA   NA
 11715336 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 556.000 0.000 NA   NA
 11430582 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 594.000 0.000 NA   NA
 11572945 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 594.000 0.000 NA   NA
 11715337 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 594.000 0.000 NA   NA
 11430583 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 630.000 0.000 NA   NA
 11572946 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 630.000 0.000 NA   NA
 11715338 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 630.000 0.000 NA   NA
 11430584 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 670.000 0.000 NA   NA
 11572947 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 670.000 0.000 NA   NA
 11715339 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 670.000 0.000 NA   NA
 11430585 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 706.000 0.000 NA   NA
 11572948 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 706.000 0.000 NA   NA
 11715340 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 706.000 0.000 NA   NA
 11430586 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 744.000 0.000 NA   NA
 11572949 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 744.000 0.000 NA   NA
 11715341 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 744.000 0.000 NA   NA
 11430587 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 780.000 0.000 NA   NA
 11572950 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 780.000 0.000 NA   NA
 11715342 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 780.000 0.000 NA   NA
 11430588 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 820.000 0.000 NA   NA
 11572951 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 820.000 0.000 NA   NA
 11715343 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 820.000 0.000 NA   NA
 11430589 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 856.000 0.000 NA   NA
 11572952 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 856.000 0.000 NA   NA
 11715344 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 856.000 0.000 NA   NA
 11430590 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 892.000 0.000 NA   NA
 11572953 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 892.000 0.000 NA   NA
 11715345 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 892.000 0.000 NA   NA
 11430591 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 928.000 0.000 NA   NA
 11572954 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 928.000 0.000 NA   NA
 11715346 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 928.000 0.000 NA   NA
 11430592 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 970.000 0.000 NA   NA
 11572955 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 970.000 0.000 NA   NA
 11715347 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 970.000 0.000 NA   NA
 11430593 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1006.000 0.000 NA   NA
 11572956 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1006.000 0.000 NA   NA
 11715348 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1006.000 0.000 NA   NA
 11430594 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1042.000 0.000 NA   NA
 11572957 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1042.000 0.000 NA   NA
 11715349 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1042.000 0.000 NA   NA
 11430595 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1078.000 0.000 NA   NA
 11572958 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1078.000 0.000 NA   NA
 11715350 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1078.000 0.000 NA   NA
 11430596 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1115.000 0.000 NA   NA
 11572959 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1115.000 0.000 NA   NA
 11715351 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1115.000 0.000 NA   NA
 11430597 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1151.000 0.000 NA   NA
 11572960 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1151.000 0.000 NA   NA
 11715352 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1151.000 0.000 NA   NA
 11430598 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1190.000 0.000 NA   NA
 11572961 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1190.000 0.000 NA   NA
 11715353 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1190.000 0.000 NA   NA
 11430599 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1226.000 0.000 NA   NA
 11572962 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1226.000 0.000 NA   NA
 11715354 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1226.000 0.000 NA   NA
 11430600 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1266.000 0.000 NA   NA
 11572963 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1266.000 0.000 NA   NA
 11715355 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1266.000 0.000 NA   NA
 11430601 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1302.000 0.000 NA   NA
 11572964 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1302.000 0.000 NA   NA
 11715356 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1302.000 0.000 NA   NA
 11430602 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1342.000 0.000 NA   NA
 11572965 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1342.000 0.000 NA   NA
 11715357 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1342.000 0.000 NA   NA
 11430603 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1378.000 0.000 NA   NA
 11572966 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1378.000 0.000 NA   NA
 11715358 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1378.000 0.000 NA   NA
 11430604 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1418.000 0.000 NA   NA
 11572967 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1418.000 0.000 NA   NA
 11715359 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1418.000 0.000 NA   NA
 11430605 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1454.000 0.000 NA   NA
 11572968 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1454.000 0.000 NA   NA
 11715360 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1454.000 0.000 NA   NA
 11430606 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1491.000 0.000 NA   NA
 11572969 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1491.000 0.000 NA   NA
 11715361 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1491.000 0.000 NA   NA
 11430607 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1527.000 0.000 NA   NA
 11572970 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1527.000 0.000 NA   NA
 11715362 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1527.000 0.000 NA   NA
 11430608 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1567.000 0.000 NA   NA
 11572971 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1567.000 0.000 NA   NA
 11715363 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1567.000 0.000 NA   NA
 11430609 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1603.000 0.000 NA   NA
 11572972 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1603.000 0.000 NA   NA
 11715364 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1603.000 0.000 NA   NA
 11430610 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1639.000 0.000 NA   NA
 11572973 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1639.000 0.000 NA   NA
 11715365 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1639.000 0.000 NA   NA
 11430611 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1675.000 0.000 NA   NA
 11572974 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1675.000 0.000 NA   NA
 11715366 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1675.000 0.000 NA   NA
 11430612 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1714.000 0.000 NA   NA
 11572975 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1714.000 0.000 NA   NA
 11715367 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1714.000 0.000 NA   NA
 11430613 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1750.000 0.000 NA   NA
 11572976 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1750.000 0.000 NA   NA
 11715368 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1750.000 0.000 NA   NA
 11430614 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1786.000 0.000 NA   NA
 11572977 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1786.000 0.000 NA   NA
 11715369 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1786.000 0.000 NA   NA
 11430615 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1822.000 0.000 NA   NA
 11572978 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1822.000 0.000 NA   NA
 11715370 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1822.000 0.000 NA   NA
 11430616 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1862.000 0.000 NA   NA
 11572979 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1862.000 0.000 NA   NA
 11715371 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1862.000 0.000 NA   NA
 11430617 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1898.000 0.000 NA   NA
 11572980 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1898.000 0.000 NA   NA
 11715372 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1898.000 0.000 NA   NA
 11430618 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1937.000 0.000 NA   NA
 11572981 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1937.000 0.000 NA   NA
 11715373 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1937.000 0.000 NA   NA
 11430619 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1973.000 0.000 NA   NA
 11572982 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1973.000 0.000 NA   NA
 11715374 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 1973.000 0.000 NA   NA
 11430620 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2012.000 0.000 NA   NA
 11572983 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2012.000 0.000 NA   NA
 11715375 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2012.000 0.000 NA   NA
 11430621 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2048.000 0.000 NA   NA
 11572984 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2048.000 0.000 NA   NA
 11715376 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2048.000 0.000 NA   NA
 11430622 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2091.000 0.000 NA   NA
 11572985 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2091.000 0.000 NA   NA
 11715377 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2091.000 0.000 NA   NA
 11430623 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2127.000 0.000 NA   NA
 11572986 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2127.000 0.000 NA   NA
 11715378 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2127.000 0.000 NA   NA
 11430624 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2169.000 0.000 NA   NA
 11572987 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2169.000 0.000 NA   NA
 11715379 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2169.000 0.000 NA   NA
 11430625 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2205.000 0.000 NA   NA
 11572988 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2205.000 0.000 NA   NA
 11715380 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2205.000 0.000 NA   NA
 11430626 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2241.000 0.000 NA   NA
 11572989 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2241.000 0.000 NA   NA
 11715381 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2241.000 0.000 NA   NA
 11430627 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2277.000 0.000 NA   NA
 11572990 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2277.000 0.000 NA   NA
 11715382 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2277.000 0.000 NA   NA
 11430628 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2313.000 0.000 NA   NA
 11572991 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2313.000 0.000 NA   NA
 11715383 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2313.000 0.000 NA   NA
 11430629 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2349.000 0.000 NA   NA
 11572992 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2349.000 0.000 NA   NA
 11715384 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2349.000 0.000 NA   NA
 11430630 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2389.000 0.000 NA   NA
 11572993 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2389.000 0.000 NA   NA
 11715385 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2389.000 0.000 NA   NA
 11430631 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2425.000 0.000 NA   NA
 11572994 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2425.000 0.000 NA   NA
 11715386 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2425.000 0.000 NA   NA
 11430632 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2464.000 0.000 NA   NA
 11572995 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2464.000 0.000 NA   NA
 11715387 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2464.000 0.000 NA   NA
 11430633 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2500.000 0.000 NA   NA
 11572996 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2500.000 0.000 NA   NA
 11715388 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2500.000 0.000 NA   NA
 11430634 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2536.000 0.000 NA   NA
 11572997 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2536.000 0.000 NA   NA
 11715389 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2536.000 0.000 NA   NA
 11430635 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2572.000 0.000 NA   NA
 11572998 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2572.000 0.000 NA   NA
 11715390 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2572.000 0.000 NA   NA
 11430636 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2609.000 0.000 NA   NA
 11572999 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2609.000 0.000 NA   NA
 11715391 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2609.000 0.000 NA   NA
 11430637 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2645.000 0.000 NA   NA
 11573000 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2645.000 0.000 NA   NA
 11715392 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2645.000 0.000 NA   NA
 11430638 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2686.000 0.000 NA   NA
 11573001 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2686.000 0.000 NA   NA
 11715393 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2686.000 0.000 NA   NA
 11430639 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2722.000 0.000 NA   NA
 11573002 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2722.000 0.000 NA   NA
 11715394 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2722.000 0.000 NA   NA
 11430640 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2758.000 0.000 NA   NA
 11573003 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2758.000 0.000 NA   NA
 11715395 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2758.000 0.000 NA   NA
 11430641 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2794.000 0.000 NA   NA
 11573004 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2794.000 0.000 NA   NA
 11715396 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2794.000 0.000 NA   NA
 11430642 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2830.000 0.000 NA   NA
 11573005 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2830.000 0.000 NA   NA
 11715397 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2830.000 0.000 NA   NA
 11430643 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2866.000 0.000 NA   NA
 11573006 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2866.000 0.000 NA   NA
 11715398 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2866.000 0.000 NA   NA
 11430644 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2903.000 0.000 NA   NA
 11573007 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2903.000 0.000 NA   NA
 11715399 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2903.000 0.000 NA   NA
 11430645 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2939.000 0.000 NA   NA
 11573008 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2939.000 0.000 NA   NA
 11715400 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2939.000 0.000 NA   NA
 11430646 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2979.000 0.000 NA   NA
 11573009 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2979.000 0.000 NA   NA
 11715401 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 2979.000 0.000 NA   NA
 11430647 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 3015.000 0.000 NA   NA
 11573010 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 3015.000 0.000 NA   NA
 11715402 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 3015.000 0.000 NA   NA
 11430648 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 3053.000 0.000 NA   NA
 11573011 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 3053.000 0.000 NA   NA
 11715403 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 3053.000 0.000 NA   NA
 11430649 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 3089.000 0.000 NA   NA
 11573012 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 3089.000 0.000 NA   NA
 11715404 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 3089.000 0.000 NA   NA
 11430650 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 3128.000 0.000 NA   NA
 11573013 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 3128.000 0.000 NA   NA
 11715405 5595543   RC1_2933   ribA FALSE NA 3128.000 0.000 NA   NA
 5595547 5595548 RC1_2937 RC1_2938     FALSE 0.440 82.000 0.024 NA   NA
 5595548 5595549 RC1_2938 RC1_2939     TRUE 0.493 20.000 0.000 NA   NA
 5595549 5595550 RC1_2939 RC1_2940     FALSE 0.090 111.000 0.000 NA   NA
 5595550 5595551 RC1_2940 RC1_2941   ugpQ FALSE 0.081 118.000 0.000 NA   NA
 5595551 5595552 RC1_2941 RC1_2942 ugpQ   FALSE 0.165 167.000 0.011 1.000   NA
 5595552 5595553 RC1_2942 RC1_2943     FALSE 0.063 156.000 0.000 NA   NA
 5595553 5595554 RC1_2943 RC1_2944     FALSE 0.033 280.000 0.000 NA   NA
 5595557 5595558 RC1_2947 RC1_2948     TRUE 0.997 -3.000 0.440 NA   NA
 5595559 5595560 RC1_2949 RC1_2950     FALSE 0.095 108.000 0.000 NA   NA
 5595560 5595561 RC1_2950 RC1_2951     FALSE 0.026 988.000 0.000 1.000   NA
 5595561 5595562 RC1_2951 RC1_2952     FALSE 0.073 171.000 0.000 1.000 N NA
 5595562 5595563 RC1_2952 RC1_2953     FALSE 0.061 161.000 0.000 NA   NA
 5595566 5595567 RC1_2956 RC1_2957 grpE hrcA TRUE 0.603 131.000 0.120 1.000 N NA
 5595568 5595569 RC1_2958 RC1_2959     TRUE 0.533 17.000 0.000 NA   NA
 5595569 5595570 RC1_2959 RC1_2960   rph FALSE 0.271 58.000 0.000 1.000   NA
 5595570 5595571 RC1_2960 RC1_2961 rph rdgB TRUE 0.994 -3.000 0.262 1.000 N NA
 5595571 5595572 RC1_2961 RC1_2962 rdgB   FALSE 0.024 476.000 0.000 NA   NA
 5595572 5595573 RC1_2962 RC1_2963     FALSE 0.109 99.000 0.000 NA   NA
 5595575 5595576 RC1_2965 RC1_2966     FALSE 0.136 86.000 0.000 NA   NA
 5595576 5595577 RC1_2966 RC1_2967     FALSE 0.249 54.000 0.000 NA   NA
 5595580 5595581 RC1_2970 RC1_2971   trmB FALSE 0.074 160.000 0.000 1.000   NA
 5595581 5595582 RC1_2971 RC1_2972 trmB metK TRUE 0.583 125.000 0.112 1.000   NA
 5595582 5595583 RC1_2972 RC1_2973 metK   FALSE 0.065 186.000 0.000 1.000 N NA
 5595583 5595584 RC1_2973 RC1_2974   lnt FALSE 0.111 113.000 0.000 1.000 N NA
 5595584 5595585 RC1_2974 RC1_2975 lnt   TRUE 0.992 -3.000 0.213 NA   NA
 5595585 5595586 RC1_2975 RC1_2976     TRUE 0.990 3.000 0.222 NA   NA
 5595586 5595587 RC1_2976 RC1_2977     TRUE 0.974 54.000 0.457 NA   NA
 5595587 5595588 RC1_2977 RC1_2978   miaB TRUE 0.993 -3.000 0.220 1.000 N NA
 5595588 5595589 RC1_2978 RC1_2979 miaB   FALSE 0.040 232.000 0.000 NA   NA
 5595590 5595591 RC1_2980 RC1_2981   chrR TRUE 0.992 60.000 0.898 NA N NA
 5595591 5595592 RC1_2981 RC1_2982 chrR   FALSE 0.087 118.000 0.000 NA N NA
 5595593 5595594 RC1_2983 RC1_2984   anr FALSE 0.027 374.000 0.000 NA   NA
 5595595 5595596 RC1_2985 RC1_2986     FALSE 0.468 22.000 0.000 NA   NA
 5595597 5595598 RC1_2987 RC1_2988     TRUE 0.999 -16.000 0.667 1.000   NA
 5595599 5595600 RC1_2989 RC1_2990 nadA nadB TRUE 0.988 27.000 0.210 0.002 Y NA
 5595600 5595601 RC1_2990 RC1_2991 nadB nadC TRUE 0.966 70.000 0.223 0.002 Y NA
 5595601 5595602 RC1_2991 RC1_2992 nadC   FALSE 0.038 291.000 0.000 1.000   NA
 5595604 5595605 RC1_2994 RC1_2995   arsC FALSE 0.305 45.000 0.000 NA N NA
 5595605 5595606 RC1_2995 RC1_2996 arsC acr3 TRUE 0.796 -3.000 0.000 NA N NA
 5595612 5595613 RC1_3002 RC1_3003   mltA TRUE 0.801 173.000 0.324 1.000   NA
 5595614 5595615 RC1_3004 RC1_3005 tonB   FALSE 0.065 151.000 0.000 NA   NA
 5595616 5595617 RC1_3006 RC1_3007 pleC   FALSE 0.049 242.000 0.000 1.000 N NA
 5595618 5595619 RC1_3008 RC1_3009   ldc FALSE 0.025 408.000 0.000 NA   NA
 5595620 5595621 RC1_3010 RC1_3011   ccmA FALSE 0.021 983.000 0.000 NA   NA
 5595621 5595622 RC1_3011 RC1_3012 ccmA ccmB TRUE 0.999 -3.000 0.503 0.002 Y NA
 5595622 5595623 RC1_3012 RC1_3013 ccmB   FALSE 0.034 288.000 0.000 NA N NA
 5595623 5595624 RC1_3013 RC1_3014     TRUE 0.792 -16.000 0.000 NA N NA
 5595624 5595625 RC1_3014 RC1_3015   ccmC FALSE 0.062 168.000 0.000 NA N NA
 5595625 5595626 RC1_3015 RC1_3016 ccmC ccmD TRUE 0.904 167.000 0.501 1.000 N NA
 5595626 5595627 RC1_3016 RC1_3017 ccmD ccmE TRUE 0.996 -3.000 0.344 1.000 N NA
 5595627 5595628 RC1_3017 RC1_3018 ccmE   FALSE 0.051 185.000 0.000 NA   NA
 5595628 5595629 RC1_3018 RC1_3019   ccmF TRUE 0.533 17.000 0.000 NA   NA
 5595629 5595630 RC1_3019 RC1_3020 ccmF   FALSE 0.437 26.000 0.000 NA   NA
 5595630 5595631 RC1_3020 RC1_3021   ccmG TRUE 0.951 9.000 0.000 0.002 Y NA
 5595631 5595632 RC1_3021 RC1_3022 ccmG ccmH TRUE 0.723 96.000 0.040 NA Y NA
 5595632 5595633 RC1_3022 RC1_3023 ccmH cycH TRUE 0.987 0.000 0.060 NA Y NA
 5595635 5595636 RC1_3025 RC1_3026   mdh FALSE 0.026 390.000 0.000 NA   NA
 5595636 5595637 RC1_3026 RC1_3027 mdh   FALSE 0.034 345.000 0.000 1.000   NA
 5595638 5595639 RC1_3028 RC1_3029 zitB yedI FALSE 0.024 427.000 0.000 NA   NA
 5595642 5595643 RC1_3032 RC1_3033     FALSE 0.036 251.000 0.000 NA   NA
 5595644 5595645 RC1_3034 RC1_3035     FALSE 0.040 232.000 0.000 NA   NA
 5595646 5595647 RC1_3036 RC1_3037     TRUE 0.989 -25.000 0.165 1.000   NA
 5595647 5595648 RC1_3037 RC1_3038     FALSE 0.277 90.000 0.006 1.000   NA
 5595649 5595650 RC1_3039 RC1_3040 mtnK   FALSE 0.075 128.000 0.000 NA   NA
 5595651 5595652 RC1_3041 RC1_3042 flgC coaBC FALSE 0.082 154.000 0.000 1.000 N NA
 5595652 5595653 RC1_3042 RC1_3043 coaBC dut TRUE 0.992 -3.000 0.201 1.000 N NA
 5595653 5595654 RC1_3043 RC1_3044 dut   FALSE 0.101 104.000 0.000 NA   NA
 5595654 5595655 RC1_3044 RC1_3045   stbB TRUE 0.747 0.000 0.000 NA   NA
 5595655 5595656 RC1_3045 RC1_3046 stbB   FALSE 0.053 179.000 0.000 NA   NA
 5595656 5595657 RC1_3046 RC1_3047   cysK TRUE 0.806 73.000 0.132 NA N NA
 5595657 5595658 RC1_3047 RC1_3048 cysK   FALSE 0.040 234.000 0.000 NA   NA
 5595660 5595661 RC1_3050 RC1_3051 moeB   TRUE 0.981 -7.000 0.098 NA   NA
 5595661 5595662 RC1_3051 RC1_3052   mutM FALSE 0.160 77.000 0.000 NA   NA
 5595662 5595663 RC1_3052 RC1_3053 mutM   TRUE 0.784 15.000 0.010 NA   NA
 5595663 5595664 RC1_3053 RC1_3054     TRUE 0.991 28.000 0.556 NA   NA
 5595664 5595665 RC1_3054 RC1_3055   rpsT FALSE 0.160 139.000 0.004 1.000 N NA
 5595673 5595674 RC1_3063 RC1_3064 dnaN recF TRUE 0.880 251.000 0.318 0.030 Y NA
 5595674 5595675 RC1_3064 RC1_3065 recF gyrB TRUE 0.976 56.000 0.249 0.072 Y NA
 5595675 5595676 RC1_3065 RC1_3066 gyrB   FALSE 0.034 271.000 0.000 NA   NA
 5595676 5595677 RC1_3066 RC1_3067     FALSE 0.023 523.000 0.000 NA   NA
 5595677 5595678 RC1_3067 RC1_3068     FALSE 0.138 99.000 0.000 1.000 N NA
 5595678 5595679 RC1_3068 RC1_3069   yagS TRUE 0.998 -3.000 0.231 0.036 Y NA
 5595679 5595680 RC1_3069 RC1_3070 yagS yagR TRUE 0.997 -3.000 0.192 0.001 Y NA
 5595681 5595682 RC1_3071 RC1_3072     FALSE 0.136 86.000 0.000 NA   NA
 5595682 5595683 RC1_3072 RC1_3073     FALSE 0.072 138.000 0.000 NA   NA
 5595683 5595684 RC1_3073 RC1_3074     FALSE 0.047 195.000 0.000 NA   NA
 5595684 5595685 RC1_3074 RC1_3075     FALSE 0.172 83.000 0.000 1.000   NA
 5595685 5595686 RC1_3075 RC1_3076     TRUE 0.996 5.000 0.462 NA   NA
 5595686 5595687 RC1_3076 RC1_3077     FALSE 0.031 300.000 0.000 NA   NA
 5595687 5595688 RC1_3077 RC1_3078   dnaJ TRUE 0.796 83.000 0.148 1.000   NA
 5595688 5595689 RC1_3078 RC1_3079 dnaJ   FALSE 0.244 64.000 0.000 1.000   NA
 5595690 5595691 RC1_3080 RC1_3081 bolA   FALSE 0.057 171.000 0.000 NA   NA
 5595692 5595693 RC1_3082 RC1_3083     FALSE 0.054 178.000 0.000 NA   NA
 5595693 5595694 RC1_3083 RC1_3084     TRUE 0.734 2.000 0.000 NA   NA
 5595694 5595695 RC1_3084 RC1_3085     FALSE 0.031 473.000 0.000 1.000 N NA
 5595695 5595696 RC1_3085 RC1_3086     FALSE 0.046 405.000 0.000 0.082 N NA
 5595696 5595697 RC1_3086 RC1_3087     TRUE 0.671 7.000 0.000 NA   NA
 5595698 5595699 RC1_3088 RC1_3089     TRUE 0.918 -3.000 0.012 NA   NA
 5595699 5595700 RC1_3089 RC1_3090     FALSE 0.221 125.000 0.015 NA   NA
 5595700 5595701 RC1_3090 RC1_3091     TRUE 0.667 33.000 0.012 1.000 N NA
 5595702 5595703 RC1_3092 RC1_3093     TRUE 0.779 -16.000 0.000 NA   NA
 5595704 5595705 RC1_3094 RC1_3095 pyrF trpF TRUE 0.933 0.000 0.020 1.000 N NA
 5595706 5595707 RC1_3096 RC1_3097   argK FALSE 0.078 120.000 0.000 NA   NA
 5595707 5595708 RC1_3097 RC1_3098 argK   FALSE 0.058 205.000 0.000 1.000 N NA
 5595708 5595709 RC1_3098 RC1_3099     FALSE 0.089 131.000 0.000 1.000   NA
 5595709 5595710 RC1_3099 RC1_3100   thiG FALSE 0.103 547.000 0.014 0.003   NA
 5595710 5595711 RC1_3100 RC1_3101 thiG thiS TRUE 0.929 59.000 0.104 1.000 Y NA
 5595711 5595712 RC1_3101 RC1_3102 thiS thiO TRUE 0.999 -3.000 0.625 1.000 N NA
 5595714 5595715 RC1_3104 RC1_3105     FALSE 0.185 70.000 0.000 NA   NA
 5595715 5595716 RC1_3105 RC1_3106     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5595716 5595717 RC1_3106 RC1_3107     TRUE 0.973 18.000 0.214 NA   NA
 5595717 5595718 RC1_3107 RC1_3108     TRUE 0.561 15.000 0.000 NA   NA
 5595718 5595719 RC1_3108 RC1_3109     TRUE 0.507 19.000 0.000 NA   NA
 5595719 5595720 RC1_3109 RC1_3110     FALSE 0.119 93.000 0.000 NA   NA
 5595720 5595721 RC1_3110 RC1_3111     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5595721 5595722 RC1_3111 RC1_3112     FALSE 0.046 201.000 0.000 NA   NA
 5595722 5595723 RC1_3112 RC1_3113     TRUE 0.995 0.000 0.333 NA   NA
 5595723 5595724 RC1_3113 RC1_3114     TRUE 0.998 -3.000 0.500 NA   NA
 5595724 5595725 RC1_3114 RC1_3115     TRUE 0.951 90.000 0.500 NA   NA
 5595725 5595726 RC1_3115 RC1_3116     TRUE 0.917 126.000 0.500 NA   NA
 5595726 5595727 RC1_3116 RC1_3117     FALSE 0.033 277.000 0.000 NA   NA
 5595727 5595728 RC1_3117 RC1_3118     TRUE 0.520 18.000 0.000 NA   NA
 5595728 5595729 RC1_3118 RC1_3119   bhbA FALSE 0.044 208.000 0.000 NA   NA
 5595730 5595731 RC1_3120 RC1_3121   upp FALSE 0.043 215.000 0.000 NA   NA
 5595731 5595732 RC1_3121 RC1_3122 upp   FALSE 0.122 91.000 0.000 NA   NA
 5595732 5595733 RC1_3122 RC1_3123   aapJ FALSE 0.029 318.000 0.000 NA   NA
 5595733 5595734 RC1_3123 RC1_3124 aapJ aapQ TRUE 0.965 14.000 0.022 0.024 Y NA
 5595734 5595735 RC1_3124 RC1_3125 aapQ aapM TRUE 0.985 2.000 0.037 0.006 Y NA
 5595735 5595736 RC1_3125 RC1_3126 aapM aapP TRUE 0.766 74.000 0.018 1.000 Y NA
 5595736 5595737 RC1_3126 RC1_3127 aapP   FALSE 0.024 442.000 0.000 NA   NA
 5595737 5595738 RC1_3127 RC1_3128     FALSE 0.163 76.000 0.000 NA   NA
 5595738 5595739 RC1_3128 RC1_3129     TRUE 0.999 -19.000 0.654 NA   NA
 5595741 5595742 RC1_3131 RC1_3132 ggt   FALSE 0.030 407.000 0.000 1.000   NA
 5595744 5595745 RC1_3134 RC1_3135   fucA TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5595745 5595746 RC1_3135 RC1_3136 fucA   FALSE 0.076 156.000 0.000 1.000   NA
 5595746 5595747 RC1_3136 RC1_3137     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5595748 5595749 RC1_3138 RC1_3139     TRUE 0.954 0.000 0.048 NA   NA
 5595750 5595751 RC1_3140 RC1_3141 rpmB   TRUE 0.818 20.000 0.025 NA   NA
 5595758 5595759 RC1_3147 RC1_3149     TRUE 0.999 -3.000 0.637 NA   NA
 5595759 5595760 RC1_3149 RC1_3150     FALSE 0.073 133.000 0.000 NA   NA
 5595760 5595761 RC1_3150 RC1_3151     TRUE 0.734 2.000 0.000 NA   NA
 5595761 5595762 RC1_3151 RC1_3152     FALSE 0.034 378.000 0.000 1.000 N NA
 5595762 5595763 RC1_3152 RC1_3153     TRUE 0.785 -6.000 0.000 NA   NA
 5595763 5595764 RC1_3153 RC1_3154     TRUE 0.785 -6.000 0.000 NA   NA
 5595766 5595767 RC1_3156 RC1_3157     TRUE 0.988 -19.000 0.154 NA   NA
 5595769 5595770 RC1_3159 RC1_3160 znuB znuC TRUE 0.996 58.000 0.755 0.071 Y NA
 5595771 5595772 RC1_3161 RC1_3162 znuA dapB FALSE 0.301 77.000 0.002 1.000 N NA
 5595776 5595777 RC1_3166 RC1_3167   ilvA FALSE 0.036 252.000 0.000 NA   NA
 5595777 5595778 RC1_3167 RC1_3168 ilvA   FALSE 0.096 111.000 0.000 NA N NA
 5595778 5595779 RC1_3168 RC1_3169     TRUE 0.637 119.000 0.135 NA N NA
 5595782 5595783 RC1_3172 RC1_3173 folB ccrM TRUE 0.547 53.000 0.012 1.000 N NA
 5595783 5595784 RC1_3173 RC1_3174 ccrM rnhB TRUE 0.569 180.000 0.048 1.000 Y NA
 5595784 5595785 RC1_3174 RC1_3175 rnhB   TRUE 0.825 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5595786 5595787 RC1_3176 RC1_3177 hemN   FALSE 0.056 200.000 0.000 1.000   NA
 5595788 5595789 RC1_3178 RC1_3179   ispE FALSE 0.375 40.000 0.000 1.000 N NA
 5595789 5595790 RC1_3179 RC1_3180 ispE   TRUE 0.553 144.000 0.107 1.000 N NA
 5595793 5595794 RC1_3183 RC1_3185   moaB TRUE 0.659 49.000 0.023 1.000 N NA
 5595795 5595796 RC1_3184 RC1_3186     TRUE 0.949 -3.000 0.031 NA   NA
 5595796 5595797 RC1_3186 RC1_3187     FALSE 0.391 31.000 0.000 NA   NA
 5595798 5595799 RC1_3188 RC1_3189   ftsE FALSE 0.083 116.000 0.000 NA   NA
 5595801 5595802 RC1_3191 RC1_3192     FALSE 0.051 183.000 0.000 NA   NA
 5595803 5595804 RC1_3193 RC1_3194 gltB   TRUE 0.631 12.000 0.000 NA N NA
 5595804 5595805 RC1_3194 RC1_3195   gltD FALSE 0.251 57.000 0.000 NA N NA
 5595808 5595809 RC1_3198 RC1_3199     FALSE 0.059 165.000 0.000 NA   NA
 5595809 5595810 RC1_3199 RC1_3200     FALSE 0.464 245.000 0.151 NA   NA
 5595810 5595811 RC1_3200 RC1_3201     TRUE 0.987 -3.000 0.144 NA   NA
 5595811 5595812 RC1_3201 RC1_3202     TRUE 0.998 -3.000 0.543 NA   NA
 5595812 5595813 RC1_3202 RC1_3203   rpoN FALSE 0.132 177.000 0.006 1.000   NA
 5595813 5595814 RC1_3203 RC1_3204 rpoN yfiA FALSE 0.126 196.000 0.010 NA N NA
 5595814 5595815 RC1_3204 RC1_3205 yfiA ptsN TRUE 0.957 61.000 0.353 NA N NA
 5595816 5595817 RC1_3206 RC1_3207   hspA TRUE 0.983 99.000 0.955 NA   NA
 5595819 5595820 RC1_3209 RC1_3210 fliN   FALSE 0.157 78.000 0.000 NA   NA
 5595821 5595822 RC1_3211 RC1_3212     FALSE 0.074 129.000 0.000 NA   NA
 5595822 5595823 RC1_3212 RC1_3213     TRUE 0.987 -9.000 0.143 NA   NA
 5595825 5595826 RC1_3215 RC1_3216 fhuA   TRUE 0.632 11.000 0.000 NA   NA
 5595826 5595827 RC1_3216 RC1_3217     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5595827 5595828 RC1_3217 RC1_3218     TRUE 0.999 -3.000 0.706 NA   NA
 5595828 5595829 RC1_3218 RC1_3219     FALSE 0.051 184.000 0.000 NA   NA
 5595829 5595830 RC1_3219 RC1_3220     TRUE 0.997 23.000 0.916 NA   NA
 5595830 5595831 RC1_3220 RC1_3221     TRUE 0.782 58.000 0.079 1.000   NA
 5595831 5595832 RC1_3221 RC1_3222     TRUE 0.995 15.000 0.567 NA   NA
 5595833 5595834 RC1_3223 RC1_3224   ppr FALSE 0.028 391.000 0.000 NA N NA
 5595834 5595835 RC1_3224 RC1_3225 ppr   FALSE 0.048 194.000 0.000 NA   NA
 5595836 5595837 RC1_3226 RC1_3227     TRUE 0.998 -3.000 0.581 NA N NA
 5595837 5595838 RC1_3227 RC1_3228     FALSE 0.073 147.000 0.000 NA N NA
 5595840 5595841 RC1_3230 RC1_3231 rluE   FALSE 0.154 79.000 0.000 NA   NA
 5595845 5595846 RC1_3235 RC1_3236 hutF hutU TRUE 0.877 11.000 0.016 1.000 N NA
 5595846 5595847 RC1_3236 RC1_3237 hutU hutG TRUE 0.980 -3.000 0.012 1.000 Y NA
 5595847 5595848 RC1_3237 RC1_3238 hutG hutH TRUE 0.979 -3.000 0.011 1.000 Y NA
 5595849 5595850 RC1_3239 RC1_3240 calB   FALSE 0.055 174.000 0.000 NA   NA
 5595850 5595851 RC1_3240 RC1_3241     FALSE 0.391 31.000 0.000 NA   NA
 5595853 5595854 RC1_3243 RC1_3244     FALSE 0.233 58.000 0.000 NA   NA
 5595854 5595855 RC1_3244 RC1_3245     FALSE 0.202 69.000 0.000 NA N NA
 5595855 5595856 RC1_3245 RC1_3246     FALSE 0.030 313.000 0.000 NA   NA
 5595856 5595857 RC1_3246 RC1_3247     FALSE 0.027 362.000 0.000 NA   NA
 5595857 5595858 RC1_3247 RC1_3248     FALSE 0.049 188.000 0.000 NA   NA
 5595858 5595859 RC1_3248 RC1_3249     TRUE 0.570 18.000 0.000 1.000   NA
 5595864 5595865 RC1_3254 RC1_3255     TRUE 0.962 -13.000 0.047 NA N NA
 5595866 5595867 RC1_3256 RC1_3257     FALSE 0.068 147.000 0.000 NA   NA
 5595867 5595868 RC1_3257 RC1_3258     FALSE 0.240 65.000 0.000 1.000   NA
 5595868 5595869 RC1_3258 RC1_3259     FALSE 0.076 124.000 0.000 NA   NA
 5595870 5595871 RC1_3260 RC1_3261 tme phoR FALSE 0.052 232.000 0.000 1.000 N NA
 5595871 5595872 RC1_3261 RC1_3262 phoR pstS FALSE 0.036 272.000 0.000 NA N NA
 5595872 5595873 RC1_3262 RC1_3263 pstS pstC TRUE 0.741 118.000 0.079 NA Y NA
 5595873 5595874 RC1_3263 RC1_3264 pstC pstA TRUE 0.999 -7.000 0.485 0.001 Y NA
 5595874 5595875 RC1_3264 RC1_3265 pstA pstB TRUE 0.998 6.000 0.402 0.001 Y NA
 5595875 5595876 RC1_3265 RC1_3266 pstB phoU TRUE 0.816 53.000 0.013 NA Y NA
 5595876 5595877 RC1_3266 RC1_3267 phoU phoB TRUE 0.500 42.000 0.005 NA N NA
 5595877 5595878 RC1_3267 RC1_3268 phoB ubiE FALSE 0.138 169.000 0.006 1.000 N NA
 5595878 5595879 RC1_3268 RC1_3269 ubiE ubiB FALSE 0.379 274.000 0.115 1.000   NA
 5595880 5595881 RC1_3270 RC1_3271     FALSE 0.132 87.000 0.000 NA   NA
 5595882 5595883 RC1_3272 RC1_3273     FALSE 0.039 235.000 0.000 NA   NA
 5595884 5595885 RC1_3274 RC1_3275     FALSE 0.053 179.000 0.000 NA   NA
 5595887 5595888 RC1_3277 RC1_3278   gst FALSE 0.060 163.000 0.000 NA   NA
 5595889 5595890 RC1_3279 RC1_3280     FALSE 0.433 44.000 0.000 0.047   NA
 5595890 5595891 RC1_3280 RC1_3281     FALSE 0.090 128.000 0.000 1.000   NA
 5595891 5595892 RC1_3281 RC1_3282   hlyD FALSE 0.074 161.000 0.000 1.000   NA
 5595892 5595893 RC1_3282 RC1_3283 hlyD   TRUE 0.985 80.000 0.810 1.000 N NA
 5595893 5595894 RC1_3283 RC1_3284     TRUE 0.998 12.000 0.839 1.000 N NA
 5595894 5595895 RC1_3284 RC1_3285     TRUE 0.999 5.000 0.820 0.081 N NA
 5595897 5595898 RC1_3287 RC1_3288     FALSE 0.048 194.000 0.000 NA   NA
 5595900 5595901 RC1_3290 RC1_3291     FALSE 0.151 89.000 0.000 1.000   NA
 5595902 5595903 RC1_3292 RC1_3293 hslU hslV TRUE 1.000 4.000 0.752 1.000 Y NA
 5595903 5595904 RC1_3293 RC1_3294 hslV   FALSE 0.167 119.000 0.004 1.000   NA
 5595905 5595906 RC1_3295 RC1_3296 hisB hisH TRUE 0.850 77.000 0.049 0.002 Y NA
 5595906 5595907 RC1_3296 RC1_3297 hisH   TRUE 0.830 28.000 0.042 1.000   NA
 5595907 5595908 RC1_3297 RC1_3298   hisA TRUE 0.902 -3.000 0.006 1.000   NA
 5595908 5595909 RC1_3298 RC1_3299 hisA hisF TRUE 0.999 -6.000 0.433 0.002 Y NA
 5595909 5595910 RC1_3299 RC1_3300 hisF hisE TRUE 0.752 180.000 0.105 0.002 Y NA
 5595910 5595911 RC1_3300 RC1_3301 hisE   TRUE 0.806 52.000 0.079 1.000 N NA
 5595911 5595912 RC1_3301 RC1_3302   lldP FALSE 0.185 82.000 0.000 1.000 N NA
 5595916 5595917 RC1_3306 RC1_3307     FALSE 0.067 149.000 0.000 NA   NA
 5595918 5595919 RC1_3308 RC1_3309 mtgA divJ FALSE 0.095 119.000 0.000 1.000   NA
 5595919 5595920 RC1_3309 RC1_3310 divJ   FALSE 0.036 251.000 0.000 NA   NA
 5595921 5595922 RC1_3311 RC1_3312     FALSE 0.197 67.000 0.000 NA   NA
 5595922 5595923 RC1_3312 RC1_3313     FALSE 0.033 280.000 0.000 NA   NA
 5595923 5595924 RC1_3313 RC1_3314     FALSE 0.031 302.000 0.000 NA   NA
 5595925 5595926 RC1_3315 RC1_3316     FALSE 0.087 113.000 0.000 NA   NA
 5595927 5595928 RC1_3317 RC1_3318     TRUE 0.999 -3.000 0.750 NA   NA
 5595928 5595929 RC1_3318 RC1_3319     TRUE 0.781 -12.000 0.000 NA   NA
 5595929 5595930 RC1_3319 RC1_3320     TRUE 0.726 3.000 0.000 NA   NA
 5595930 5595931 RC1_3320 RC1_3321     TRUE 0.998 -3.000 0.571 NA   NA
 5595931 5595932 RC1_3321 RC1_3322     TRUE 0.992 30.000 0.600 NA   NA
 5595933 5595934 RC1_3323 RC1_3324     FALSE 0.142 84.000 0.000 NA   NA
 5595936 5595937 RC1_3326 RC1_3327 aglA   FALSE 0.075 127.000 0.000 NA   NA
 5595937 5595938 RC1_3327 RC1_3328     FALSE 0.136 86.000 0.000 NA   NA
 5595939 5595940 RC1_3329 RC1_3330     FALSE 0.085 115.000 0.000 NA   NA
 5595940 5595941 RC1_3330 RC1_3331     FALSE 0.067 149.000 0.000 NA   NA
 5595941 5595942 RC1_3331 RC1_3332     FALSE 0.063 190.000 0.000 1.000 N NA
 11430651 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1150.000 0.000 NA   NA
 11573014 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1150.000 0.000 NA   NA
 11715406 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1150.000 0.000 NA   NA
 11430652 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1118.000 0.000 NA   NA
 11573015 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1118.000 0.000 NA   NA
 11715407 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1118.000 0.000 NA   NA
 11430653 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1089.000 0.000 NA   NA
 11573016 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1089.000 0.000 NA   NA
 11715408 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1089.000 0.000 NA   NA
 11430654 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1057.000 0.000 NA   NA
 11573017 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1057.000 0.000 NA   NA
 11715409 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1057.000 0.000 NA   NA
 11430655 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1028.000 0.000 NA   NA
 11573018 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1028.000 0.000 NA   NA
 11715410 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1028.000 0.000 NA   NA
 11430656 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 995.000 0.000 NA   NA
 11573019 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 995.000 0.000 NA   NA
 11715411 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 995.000 0.000 NA   NA
 11430657 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 966.000 0.000 NA   NA
 11573020 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 966.000 0.000 NA   NA
 11715412 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 966.000 0.000 NA   NA
 11430658 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 934.000 0.000 NA   NA
 11573021 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 934.000 0.000 NA   NA
 11715413 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 934.000 0.000 NA   NA
 11430659 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 905.000 0.000 NA   NA
 11573022 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 905.000 0.000 NA   NA
 11715414 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 905.000 0.000 NA   NA
 11430660 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 873.000 0.000 NA   NA
 11573023 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 873.000 0.000 NA   NA
 11715415 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 873.000 0.000 NA   NA
 11430661 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 844.000 0.000 NA   NA
 11573024 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 844.000 0.000 NA   NA
 11715416 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 844.000 0.000 NA   NA
 11430662 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 812.000 0.000 NA   NA
 11573025 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 812.000 0.000 NA   NA
 11715417 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 812.000 0.000 NA   NA
 11430663 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 783.000 0.000 NA   NA
 11573026 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 783.000 0.000 NA   NA
 11715418 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 783.000 0.000 NA   NA
 11430664 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 751.000 0.000 NA   NA
 11573027 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 751.000 0.000 NA   NA
 11715419 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 751.000 0.000 NA   NA
 11430665 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 722.000 0.000 NA   NA
 11573028 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 722.000 0.000 NA   NA
 11715420 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 722.000 0.000 NA   NA
 11430666 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 690.000 0.000 NA   NA
 11573029 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 690.000 0.000 NA   NA
 11715421 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 690.000 0.000 NA   NA
 11430667 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 661.000 0.000 NA   NA
 11573030 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 661.000 0.000 NA   NA
 11715422 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 661.000 0.000 NA   NA
 11430668 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 629.000 0.000 NA   NA
 11573031 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 629.000 0.000 NA   NA
 11715423 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 629.000 0.000 NA   NA
 11430669 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 600.000 0.000 NA   NA
 11573032 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 600.000 0.000 NA   NA
 11715424 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 600.000 0.000 NA   NA
 11430670 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 568.000 0.000 NA   NA
 11573033 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 568.000 0.000 NA   NA
 11715425 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 568.000 0.000 NA   NA
 11430671 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 539.000 0.000 NA   NA
 11573034 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 539.000 0.000 NA   NA
 11715426 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 539.000 0.000 NA   NA
 11430672 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 507.000 0.000 NA   NA
 11573035 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 507.000 0.000 NA   NA
 11715427 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 507.000 0.000 NA   NA
 11430673 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 478.000 0.000 NA   NA
 11573036 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 478.000 0.000 NA   NA
 11715428 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 478.000 0.000 NA   NA
 11430674 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 446.000 0.000 NA   NA
 11573037 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 446.000 0.000 NA   NA
 11715429 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 446.000 0.000 NA   NA
 11430675 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 417.000 0.000 NA   NA
 11573038 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 417.000 0.000 NA   NA
 11715430 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 417.000 0.000 NA   NA
 11430676 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 385.000 0.000 NA   NA
 11573039 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 385.000 0.000 NA   NA
 11715431 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 385.000 0.000 NA   NA
 11430677 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 356.000 0.000 NA   NA
 11573040 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 356.000 0.000 NA   NA
 11715432 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 356.000 0.000 NA   NA
 11430678 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 324.000 0.000 NA   NA
 11573041 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 324.000 0.000 NA   NA
 11715433 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 324.000 0.000 NA   NA
 11430679 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 295.000 0.000 NA   NA
 11573042 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 295.000 0.000 NA   NA
 11715434 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 295.000 0.000 NA   NA
 11430680 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 263.000 0.000 NA   NA
 11573043 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 263.000 0.000 NA   NA
 11715435 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 263.000 0.000 NA   NA
 11430681 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 234.000 0.000 NA   NA
 11573044 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 234.000 0.000 NA   NA
 11715436 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 234.000 0.000 NA   NA
 11430682 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 202.000 0.000 NA   NA
 11573045 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 202.000 0.000 NA   NA
 11715437 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 202.000 0.000 NA   NA
 11430683 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 173.000 0.000 NA   NA
 11573046 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 173.000 0.000 NA   NA
 11715438 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 173.000 0.000 NA   NA
 11430684 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 141.000 0.000 NA   NA
 11573047 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 141.000 0.000 NA   NA
 11715439 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 141.000 0.000 NA   NA
 11430685 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 112.000 0.000 NA   NA
 11573048 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 112.000 0.000 NA   NA
 11715440 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 112.000 0.000 NA   NA
 11430686 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 80.000 0.000 NA   NA
 11573049 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 80.000 0.000 NA   NA
 11715441 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 80.000 0.000 NA   NA
 11430687 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 51.000 0.000 NA   NA
 11573050 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 51.000 0.000 NA   NA
 11715442 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 51.000 0.000 NA   NA
 5595943 5595944 RC1_3333 RC1_3334 cas2 cas1 TRUE 0.979 0.000 0.109 NA   NA
 5595944 5595945 RC1_3334 RC1_3335 cas1   TRUE 0.788 3110.000 0.589 NA   NA
 11430688 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1317.000 0.000 NA   NA
 11573051 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1317.000 0.000 NA   NA
 11715443 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1317.000 0.000 NA   NA
 11430689 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1346.000 0.000 NA   NA
 11573052 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1346.000 0.000 NA   NA
 11715444 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1346.000 0.000 NA   NA
 11430690 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1390.000 0.000 NA   NA
 11573053 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1390.000 0.000 NA   NA
 11715445 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1390.000 0.000 NA   NA
 11430691 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1419.000 0.000 NA   NA
 11573054 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1419.000 0.000 NA   NA
 11715446 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1419.000 0.000 NA   NA
 11430692 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1451.000 0.000 NA   NA
 11573055 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1451.000 0.000 NA   NA
 11715447 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1451.000 0.000 NA   NA
 11430693 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1480.000 0.000 NA   NA
 11573056 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1480.000 0.000 NA   NA
 11715448 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1480.000 0.000 NA   NA
 11430694 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1512.000 0.000 NA   NA
 11573057 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1512.000 0.000 NA   NA
 11715449 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1512.000 0.000 NA   NA
 11430695 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1541.000 0.000 NA   NA
 11573058 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1541.000 0.000 NA   NA
 11715450 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1541.000 0.000 NA   NA
 11430696 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1573.000 0.000 NA   NA
 11573059 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1573.000 0.000 NA   NA
 11715451 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 1573.000 0.000 NA   NA
 11430697 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2116.000 0.000 NA   NA
 11573060 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2116.000 0.000 NA   NA
 11715452 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2116.000 0.000 NA   NA
 11430698 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2145.000 0.000 NA   NA
 11573061 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2145.000 0.000 NA   NA
 11715453 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2145.000 0.000 NA   NA
 11430699 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2177.000 0.000 NA   NA
 11573062 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2177.000 0.000 NA   NA
 11715454 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2177.000 0.000 NA   NA
 11430700 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2206.000 0.000 NA   NA
 11573063 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2206.000 0.000 NA   NA
 11715455 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2206.000 0.000 NA   NA
 11430701 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2238.000 0.000 NA   NA
 11573064 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2238.000 0.000 NA   NA
 11715456 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2238.000 0.000 NA   NA
 11430702 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2267.000 0.000 NA   NA
 11573065 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2267.000 0.000 NA   NA
 11715457 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2267.000 0.000 NA   NA
 11430703 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2299.000 0.000 NA   NA
 11573066 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2299.000 0.000 NA   NA
 11715458 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2299.000 0.000 NA   NA
 11430704 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2328.000 0.000 NA   NA
 11573067 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2328.000 0.000 NA   NA
 11715459 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2328.000 0.000 NA   NA
 11430705 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2360.000 0.000 NA   NA
 11573068 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2360.000 0.000 NA   NA
 11715460 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2360.000 0.000 NA   NA
 11430706 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2389.000 0.000 NA   NA
 11573069 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2389.000 0.000 NA   NA
 11715461 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2389.000 0.000 NA   NA
 11430707 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2421.000 0.000 NA   NA
 11573070 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2421.000 0.000 NA   NA
 11715462 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2421.000 0.000 NA   NA
 11430708 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2450.000 0.000 NA   NA
 11573071 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2450.000 0.000 NA   NA
 11715463 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2450.000 0.000 NA   NA
 11430709 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2482.000 0.000 NA   NA
 11573072 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2482.000 0.000 NA   NA
 11715464 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2482.000 0.000 NA   NA
 11430710 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2511.000 0.000 NA   NA
 11573073 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2511.000 0.000 NA   NA
 11715465 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2511.000 0.000 NA   NA
 11430711 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2543.000 0.000 NA   NA
 11573074 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2543.000 0.000 NA   NA
 11715466 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2543.000 0.000 NA   NA
 11430712 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2572.000 0.000 NA   NA
 11573075 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2572.000 0.000 NA   NA
 11715467 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2572.000 0.000 NA   NA
 11430713 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2604.000 0.000 NA   NA
 11573076 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2604.000 0.000 NA   NA
 11715468 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2604.000 0.000 NA   NA
 11430714 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2633.000 0.000 NA   NA
 11573077 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2633.000 0.000 NA   NA
 11715469 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2633.000 0.000 NA   NA
 11430715 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2665.000 0.000 NA   NA
 11573078 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2665.000 0.000 NA   NA
 11715470 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2665.000 0.000 NA   NA
 11430716 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2694.000 0.000 NA   NA
 11573079 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2694.000 0.000 NA   NA
 11715471 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2694.000 0.000 NA   NA
 11430717 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2726.000 0.000 NA   NA
 11573080 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2726.000 0.000 NA   NA
 11715472 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2726.000 0.000 NA   NA
 11430718 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2755.000 0.000 NA   NA
 11573081 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2755.000 0.000 NA   NA
 11715473 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2755.000 0.000 NA   NA
 11430719 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2787.000 0.000 NA   NA
 11573082 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2787.000 0.000 NA   NA
 11715474 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2787.000 0.000 NA   NA
 11430720 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2816.000 0.000 NA   NA
 11573083 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2816.000 0.000 NA   NA
 11715475 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2816.000 0.000 NA   NA
 11430721 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2848.000 0.000 NA   NA
 11573084 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2848.000 0.000 NA   NA
 11715476 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2848.000 0.000 NA   NA
 11430722 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2877.000 0.000 NA   NA
 11573085 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2877.000 0.000 NA   NA
 11715477 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2877.000 0.000 NA   NA
 11430723 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2909.000 0.000 NA   NA
 11573086 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2909.000 0.000 NA   NA
 11715478 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2909.000 0.000 NA   NA
 11430724 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2938.000 0.000 NA   NA
 11573087 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2938.000 0.000 NA   NA
 11715479 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2938.000 0.000 NA   NA
 11430725 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2970.000 0.000 NA   NA
 11573088 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2970.000 0.000 NA   NA
 11715480 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2970.000 0.000 NA   NA
 11430726 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2999.000 0.000 NA   NA
 11573089 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2999.000 0.000 NA   NA
 11715481 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 2999.000 0.000 NA   NA
 11430727 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3031.000 0.000 NA   NA
 11573090 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3031.000 0.000 NA   NA
 11715482 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3031.000 0.000 NA   NA
 11430728 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3060.000 0.000 NA   NA
 11573091 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3060.000 0.000 NA   NA
 11715483 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3060.000 0.000 NA   NA
 11430729 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3092.000 0.000 NA   NA
 11573092 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3092.000 0.000 NA   NA
 11715484 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3092.000 0.000 NA   NA
 11430730 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3121.000 0.000 NA   NA
 11573093 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3121.000 0.000 NA   NA
 11715485 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3121.000 0.000 NA   NA
 11430731 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3153.000 0.000 NA   NA
 11573094 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3153.000 0.000 NA   NA
 11715486 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3153.000 0.000 NA   NA
 11430732 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3182.000 0.000 NA   NA
 11573095 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3182.000 0.000 NA   NA
 11715487 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3182.000 0.000 NA   NA
 11430733 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3214.000 0.000 NA   NA
 11573096 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3214.000 0.000 NA   NA
 11715488 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3214.000 0.000 NA   NA
 11430734 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3243.000 0.000 NA   NA
 11573097 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3243.000 0.000 NA   NA
 11715489 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3243.000 0.000 NA   NA
 11430735 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3275.000 0.000 NA   NA
 11573098 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3275.000 0.000 NA   NA
 11715490 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3275.000 0.000 NA   NA
 11430736 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3304.000 0.000 NA   NA
 11573099 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3304.000 0.000 NA   NA
 11715491 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3304.000 0.000 NA   NA
 11430737 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3336.000 0.000 NA   NA
 11573100 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3336.000 0.000 NA   NA
 11715492 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3336.000 0.000 NA   NA
 11430738 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3365.000 0.000 NA   NA
 11573101 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3365.000 0.000 NA   NA
 11715493 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3365.000 0.000 NA   NA
 11430739 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3397.000 0.000 NA   NA
 11573102 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3397.000 0.000 NA   NA
 11715494 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3397.000 0.000 NA   NA
 11430740 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3426.000 0.000 NA   NA
 11573103 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3426.000 0.000 NA   NA
 11715495 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3426.000 0.000 NA   NA
 11430741 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3458.000 0.000 NA   NA
 11573104 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3458.000 0.000 NA   NA
 11715496 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3458.000 0.000 NA   NA
 11430742 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3487.000 0.000 NA   NA
 11573105 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3487.000 0.000 NA   NA
 11715497 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3487.000 0.000 NA   NA
 11430743 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3519.000 0.000 NA   NA
 11573106 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3519.000 0.000 NA   NA
 11715498 5595943   RC1_3333   cas2 FALSE NA 3519.000 0.000 NA   NA
 5595945 5595946 RC1_3335 RC1_3336     TRUE 0.994 -3.000 0.282 NA   NA
 5595946 5595947 RC1_3336 RC1_3337     TRUE 0.999 -3.000 0.780 NA   NA
 5595947 5595948 RC1_3337 RC1_3338     TRUE 0.994 -7.000 0.276 NA   NA
 5595948 5595949 RC1_3338 RC1_3339     TRUE 0.996 -7.000 0.336 NA   NA
 5595954 5595955 RC1_3344 RC1_3345 lrp   FALSE 0.096 107.000 0.000 NA   NA
 5595955 5595956 RC1_3345 RC1_3346   phhA FALSE 0.035 257.000 0.000 NA   NA
 5595956 5595957 RC1_3346 RC1_3347 phhA glmS FALSE 0.065 184.000 0.000 1.000 N NA
 5595957 5595958 RC1_3347 RC1_3348 glmS   FALSE 0.091 125.000 0.000 1.000   NA
 5595959 5595960 RC1_3349 RC1_3350     FALSE 0.116 151.000 0.000 0.075 N NA
 5595960 5595961 RC1_3350 RC1_3351     TRUE 0.993 -3.000 0.096 1.000 Y NA
 5595961 5595962 RC1_3351 RC1_3352     TRUE 0.998 -3.000 0.323 NA Y NA
 5595962 5595963 RC1_3352 RC1_3353     FALSE 0.066 161.000 0.000 NA N NA
 5595964 5595965 RC1_3354 RC1_3355     FALSE 0.312 50.000 0.000 1.000   NA
 5595966 5595967 RC1_3356 RC1_3357     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5595968 5595969 RC1_3358 RC1_3359     TRUE 0.480 21.000 0.000 NA   NA
 5595969 5595970 RC1_3359 RC1_3360   purC TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5595970 5595971 RC1_3360 RC1_3361 purC purS TRUE 0.980 85.000 0.460 1.000 Y NA
 5595971 5595972 RC1_3361 RC1_3362 purS   FALSE 0.306 42.000 0.000 NA   NA
 5595974 5595975 RC1_3364 RC1_3365 oppB oppC TRUE 0.991 117.000 0.870 0.022 Y NA
 5595975 5595976 RC1_3365 RC1_3366 oppC oppD TRUE 0.998 17.000 0.554 1.000 Y NA
 5595976 5595977 RC1_3366 RC1_3367 oppD traN TRUE 0.682 6.000 0.000 NA   NA
 5595977 5595978 RC1_3367 RC1_3368 traN oppF FALSE 0.075 125.000 0.000 NA   NA
 5595978 5595979 RC1_3368 RC1_3369 oppF   FALSE 0.073 132.000 0.000 NA   NA
 5595979 5595980 RC1_3369 RC1_3370     FALSE 0.058 168.000 0.000 NA   NA
 5595981 5595982 RC1_3371 RC1_3372     FALSE 0.129 88.000 0.000 NA   NA
 5595982 5595983 RC1_3372 RC1_3373   ecnAB FALSE 0.200 74.000 0.000 1.000   NA
 5595983 5595984 RC1_3373 RC1_3374 ecnAB   FALSE 0.038 240.000 0.000 NA   NA
 5595984 5595985 RC1_3374 RC1_3375     TRUE 0.596 13.000 0.000 NA   NA
 5595986 5595987 RC1_3376 RC1_3377     FALSE 0.045 204.000 0.000 NA   NA
 5595987 5595988 RC1_3377 RC1_3378     FALSE 0.270 50.000 0.000 NA   NA
 5595990 5595991 RC1_3380 RC1_3381   pgk FALSE 0.063 155.000 0.000 NA   NA
 5595991 5595992 RC1_3381 RC1_3382 pgk   FALSE 0.087 136.000 0.000 1.000   NA
 5595995 5595996 RC1_3385 RC1_3386 trpF nat TRUE 0.820 -21.000 0.000 1.000 N NA
 5595996 5595997 RC1_3386 RC1_3387 nat purB FALSE 0.293 56.000 0.000 1.000 N NA
 5595997 5595998 RC1_3387 RC1_3388 purB   FALSE 0.079 151.000 0.000 1.000   NA
 5595998 5595999 RC1_3388 RC1_3389     FALSE 0.123 103.000 0.000 1.000   NA
 5595999 5596000 RC1_3389 RC1_3390   map FALSE 0.029 640.000 0.000 1.000 N NA
 5596000 5596001 RC1_3390 RC1_3391 map   FALSE 0.074 145.000 0.000 NA N NA
 5596001 5596002 RC1_3391 RC1_3392   sfsA FALSE 0.074 131.000 0.000 NA   NA
 5596003 5596004 RC1_3393 RC1_3394     FALSE 0.039 237.000 0.000 NA   NA
 5596004 5596005 RC1_3394 RC1_3395     TRUE 0.782 -10.000 0.000 NA   NA
 5596006 5596007 RC1_3396 RC1_3397     TRUE 0.783 -9.000 0.000 NA   NA
 5596007 5596008 RC1_3397 RC1_3398     FALSE 0.083 116.000 0.000 NA   NA
 5596011 5596012 RC1_3401 RC1_3402   divJ FALSE 0.075 125.000 0.000 NA   NA
 5596013 5596014 RC1_3403 RC1_3404 suhB cycM FALSE 0.059 200.000 0.000 1.000 N NA
 5596015 5596016 RC1_3405 RC1_3406 kdsB   TRUE 0.956 11.000 0.083 1.000 N NA
 5596017 5596018 RC1_3407 RC1_3408     FALSE 0.031 295.000 0.000 NA   NA
 5596019 5596020 RC1_3409 RC1_3410     FALSE 0.061 160.000 0.000 NA   NA
 5596021 5596022 RC1_3411 RC1_3412     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5596022 5596023 RC1_3412 RC1_3413     TRUE 0.662 8.000 0.000 NA   NA
 5596023 5596024 RC1_3413 RC1_3414     TRUE 0.747 0.000 0.000 NA   NA
 5596024 5596025 RC1_3414 RC1_3415     TRUE 0.989 53.000 0.697 NA   NA
 5596026 5596027 RC1_3416 RC1_3417     TRUE 0.996 -45.000 0.346 NA   NA
 5596027 5596028 RC1_3417 RC1_3418     FALSE 0.233 58.000 0.000 NA   NA
 5596028 5596029 RC1_3418 RC1_3419     FALSE 0.106 101.000 0.000 NA   NA
 5596030 5596031 RC1_3420 RC1_3421 hemF   FALSE 0.404 104.000 0.033 1.000 N NA
 5596032 5596033 RC1_3422 RC1_3423 petA petB TRUE 0.916 32.000 0.013 0.001 Y NA
 5596033 5596034 RC1_3423 RC1_3424 petB petC TRUE 0.999 0.000 0.630 0.001 Y NA
 5596034 5596035 RC1_3424 RC1_3425 petC   FALSE 0.048 233.000 0.000 1.000   NA
 5596036 5596037 RC1_3426 RC1_3427     FALSE 0.079 131.000 0.000 NA N NA
 5596037 5596038 RC1_3427 RC1_3428   bfr TRUE 0.819 340.000 0.316 NA Y NA
 5596038 5596039 RC1_3428 RC1_3429 bfr   FALSE 0.103 103.000 0.000 NA   NA
 5596039 5596040 RC1_3429 RC1_3430     TRUE 0.910 6.000 0.027 NA   NA
 5596040 5596041 RC1_3430 RC1_3431   gloB FALSE 0.361 68.000 0.006 NA   NA
 5596041 5596042 RC1_3431 RC1_3432 gloB   FALSE 0.240 65.000 0.000 1.000   NA
 5596043 5596044 RC1_3433 RC1_3434     FALSE 0.051 184.000 0.000 NA   NA
 5596044 5596045 RC1_3434 RC1_3435     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5596045 5596046 RC1_3435 RC1_3436     FALSE 0.067 149.000 0.000 NA   NA
 5596047 5596048 RC1_3437 RC1_3438 gcvA   TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5596049 5596050 RC1_3439 RC1_3440     FALSE 0.064 154.000 0.000 NA   NA
 5596053 5596054 RC1_3443 RC1_3444     TRUE 0.739 55.000 0.045 0.031   NA
 5596054 5596055 RC1_3444 RC1_3445     TRUE 0.969 69.000 0.500 NA   NA
 5596055 5596056 RC1_3445 RC1_3446     TRUE 0.991 47.000 0.710 NA   NA
 5596059 5596060 RC1_3449 RC1_3450     FALSE 0.391 31.000 0.000 NA   NA
 5596060 5596061 RC1_3450 RC1_3451     TRUE 0.999 -3.000 0.791 NA   NA
 5596061 5596062 RC1_3451 RC1_3452   panE FALSE 0.249 54.000 0.000 NA   NA
 5596068 5596069 RC1_3458 RC1_3459     FALSE 0.030 304.000 0.000 NA   NA
 5596069 5596070 RC1_3459 RC1_3460   amiB FALSE 0.181 83.000 0.000 1.000 N NA
 5596070 5596071 RC1_3460 RC1_3461 amiB hly FALSE 0.147 161.000 0.008 NA   NA
 5596071 5596072 RC1_3461 RC1_3462 hly   TRUE 0.495 50.000 0.008 NA   NA
 5596075 5596076 RC1_3465 RC1_3466     FALSE 0.075 159.000 0.000 1.000   NA
 5596076 5596077 RC1_3466 RC1_3467     FALSE 0.209 64.000 0.000 NA   NA
 5596078 5596079 RC1_3468 RC1_3469     FALSE 0.263 51.000 0.000 NA   NA
 5596082 5596083 RC1_3472 RC1_3473     FALSE 0.074 131.000 0.000 NA   NA
 5596083 5596084 RC1_3473 RC1_3474     FALSE 0.087 113.000 0.000 NA   NA
 5596084 5596085 RC1_3474 RC1_3475     FALSE 0.050 187.000 0.000 NA   NA
 5596085 5596086 RC1_3475 RC1_3476     FALSE 0.197 67.000 0.000 NA   NA
 5596087 5596088 RC1_3477 RC1_3478 nrdA   FALSE 0.027 369.000 0.000 NA   NA
 5596088 5596089 RC1_3478 RC1_3479     TRUE 0.996 20.000 0.667 NA   NA
 5596089 5596090 RC1_3479 RC1_3480     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   NA
 5596090 5596091 RC1_3480 RC1_3481     TRUE 0.819 4.000 0.000 0.064   NA
 5596091 5596092 RC1_3481 RC1_3482     FALSE 0.021 981.000 0.000 NA   NA
 5596092 5596093 RC1_3482 RC1_3483     TRUE 0.824 37.000 0.068 NA   NA
 5596093 5596094 RC1_3483 RC1_3484     TRUE 0.964 -7.000 0.000 NA Y NA
 5596094 5596095 RC1_3484 RC1_3485     FALSE 0.146 336.000 0.038 NA   NA
 5596095 5596096 RC1_3485 RC1_3486     TRUE 0.776 -25.000 0.000 NA   NA
 5596096 5596097 RC1_3486 RC1_3487     FALSE 0.095 108.000 0.000 NA   NA
 5596097 5596098 RC1_3487 RC1_3488   cas1 TRUE 0.632 11.000 0.000 NA   NA
 5596098 5596099 RC1_3488 RC1_3489 cas1 cas2 TRUE 0.997 31.000 0.667 NA Y NA
 11430744 5596095   RC1_3485     FALSE NA 5670.000 0.000 NA   NA
 11573107 5596095   RC1_3485     FALSE NA 5670.000 0.000 NA   NA
 11715499 5596095   RC1_3485     FALSE NA 5670.000 0.000 NA   NA
 11430745 5596095   RC1_3485     FALSE NA 5706.000 0.000 NA   NA
 11573108 5596095   RC1_3485     FALSE NA 5706.000 0.000 NA   NA
 11715500 5596095   RC1_3485     FALSE NA 5706.000 0.000 NA   NA
 11430746 5596095   RC1_3485     FALSE NA 5745.000 0.000 NA   NA
 11573109 5596095   RC1_3485     FALSE NA 5745.000 0.000 NA   NA
 11715501 5596095   RC1_3485     FALSE NA 5745.000 0.000 NA   NA
 11430747 5596095   RC1_3485     FALSE NA 5781.000 0.000 NA   NA
 11573110 5596095   RC1_3485     FALSE NA 5781.000 0.000 NA   NA
 11715502 5596095   RC1_3485     FALSE NA 5781.000 0.000 NA   NA
 11430748 5596095   RC1_3485     FALSE NA 5820.000 0.000 NA   NA
 11573111 5596095   RC1_3485     FALSE NA 5820.000 0.000 NA   NA
 11715503 5596095   RC1_3485     FALSE NA 5820.000 0.000 NA   NA
 11430749 5596095   RC1_3485     FALSE NA 5856.000 0.000 NA   NA
 11573112 5596095   RC1_3485     FALSE NA 5856.000 0.000 NA   NA
 11715504 5596095   RC1_3485     FALSE NA 5856.000 0.000 NA   NA
 11430750 5596095   RC1_3485     FALSE NA 5897.000 0.000 NA   NA
 11573113 5596095   RC1_3485     FALSE NA 5897.000 0.000 NA   NA
 11715505 5596095   RC1_3485     FALSE NA 5897.000 0.000 NA   NA
 11430751 5596095   RC1_3485     FALSE NA 5933.000 0.000 NA   NA
 11573114 5596095   RC1_3485     FALSE NA 5933.000 0.000 NA   NA
 11715506 5596095   RC1_3485     FALSE NA 5933.000 0.000 NA   NA
 11430752 5596095   RC1_3485     FALSE NA 5977.000 0.000 NA   NA
 11573115 5596095   RC1_3485     FALSE NA 5977.000 0.000 NA   NA
 11715507 5596095   RC1_3485     FALSE NA 5977.000 0.000 NA   NA
 11430753 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6013.000 0.000 NA   NA
 11573116 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6013.000 0.000 NA   NA
 11715508 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6013.000 0.000 NA   NA
 11430754 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6054.000 0.000 NA   NA
 11573117 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6054.000 0.000 NA   NA
 11715509 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6054.000 0.000 NA   NA
 11430755 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6090.000 0.000 NA   NA
 11573118 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6090.000 0.000 NA   NA
 11715510 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6090.000 0.000 NA   NA
 11430756 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6128.000 0.000 NA   NA
 11573119 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6128.000 0.000 NA   NA
 11715511 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6128.000 0.000 NA   NA
 11430757 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6164.000 0.000 NA   NA
 11573120 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6164.000 0.000 NA   NA
 11715512 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6164.000 0.000 NA   NA
 11430758 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6204.000 0.000 NA   NA
 11573121 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6204.000 0.000 NA   NA
 11715513 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6204.000 0.000 NA   NA
 11430759 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6240.000 0.000 NA   NA
 11573122 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6240.000 0.000 NA   NA
 11715514 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6240.000 0.000 NA   NA
 11430760 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6282.000 0.000 NA   NA
 11573123 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6282.000 0.000 NA   NA
 11715515 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6282.000 0.000 NA   NA
 11430761 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6318.000 0.000 NA   NA
 11573124 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6318.000 0.000 NA   NA
 11715516 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6318.000 0.000 NA   NA
 11430762 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6358.000 0.000 NA   NA
 11573125 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6358.000 0.000 NA   NA
 11715517 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6358.000 0.000 NA   NA
 11430763 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6394.000 0.000 NA   NA
 11573126 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6394.000 0.000 NA   NA
 11715518 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6394.000 0.000 NA   NA
 11430764 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6434.000 0.000 NA   NA
 11573127 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6434.000 0.000 NA   NA
 11715519 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6434.000 0.000 NA   NA
 11430765 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6470.000 0.000 NA   NA
 11573128 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6470.000 0.000 NA   NA
 11715520 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6470.000 0.000 NA   NA
 11430766 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6508.000 0.000 NA   NA
 11573129 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6508.000 0.000 NA   NA
 11715521 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6508.000 0.000 NA   NA
 11430767 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6544.000 0.000 NA   NA
 11573130 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6544.000 0.000 NA   NA
 11715522 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6544.000 0.000 NA   NA
 11430768 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6583.000 0.000 NA   NA
 11573131 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6583.000 0.000 NA   NA
 11715523 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6583.000 0.000 NA   NA
 11430769 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6619.000 0.000 NA   NA
 11573132 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6619.000 0.000 NA   NA
 11715524 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6619.000 0.000 NA   NA
 11430770 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6657.000 0.000 NA   NA
 11573133 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6657.000 0.000 NA   NA
 11715525 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6657.000 0.000 NA   NA
 11430771 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6693.000 0.000 NA   NA
 11573134 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6693.000 0.000 NA   NA
 11715526 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6693.000 0.000 NA   NA
 11430772 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6731.000 0.000 NA   NA
 11573135 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6731.000 0.000 NA   NA
 11715527 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6731.000 0.000 NA   NA
 11430773 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6767.000 0.000 NA   NA
 11573136 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6767.000 0.000 NA   NA
 11715528 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6767.000 0.000 NA   NA
 11430774 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6805.000 0.000 NA   NA
 11573137 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6805.000 0.000 NA   NA
 11715529 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6805.000 0.000 NA   NA
 11430775 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6841.000 0.000 NA   NA
 11573138 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6841.000 0.000 NA   NA
 11715530 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6841.000 0.000 NA   NA
 11430776 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6880.000 0.000 NA   NA
 11573139 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6880.000 0.000 NA   NA
 11715531 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6880.000 0.000 NA   NA
 11430777 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6916.000 0.000 NA   NA
 11573140 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6916.000 0.000 NA   NA
 11715532 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6916.000 0.000 NA   NA
 11430778 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6956.000 0.000 NA   NA
 11573141 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6956.000 0.000 NA   NA
 11715533 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6956.000 0.000 NA   NA
 11430779 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6992.000 0.000 NA   NA
 11573142 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6992.000 0.000 NA   NA
 11715534 5596095   RC1_3485     FALSE NA 6992.000 0.000 NA   NA
 11430780 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7035.000 0.000 NA   NA
 11573143 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7035.000 0.000 NA   NA
 11715535 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7035.000 0.000 NA   NA
 11430781 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7071.000 0.000 NA   NA
 11573144 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7071.000 0.000 NA   NA
 11715536 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7071.000 0.000 NA   NA
 11430782 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7109.000 0.000 NA   NA
 11573145 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7109.000 0.000 NA   NA
 11715537 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7109.000 0.000 NA   NA
 11430783 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7145.000 0.000 NA   NA
 11573146 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7145.000 0.000 NA   NA
 11715538 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7145.000 0.000 NA   NA
 11430784 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7188.000 0.000 NA   NA
 11573147 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7188.000 0.000 NA   NA
 11715539 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7188.000 0.000 NA   NA
 11430785 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7224.000 0.000 NA   NA
 11573148 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7224.000 0.000 NA   NA
 11715540 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7224.000 0.000 NA   NA
 11430786 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7263.000 0.000 NA   NA
 11573149 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7263.000 0.000 NA   NA
 11715541 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7263.000 0.000 NA   NA
 11430787 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7299.000 0.000 NA   NA
 11573150 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7299.000 0.000 NA   NA
 11715542 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7299.000 0.000 NA   NA
 11430788 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7337.000 0.000 NA   NA
 11573151 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7337.000 0.000 NA   NA
 11715543 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7337.000 0.000 NA   NA
 11430789 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7373.000 0.000 NA   NA
 11573152 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7373.000 0.000 NA   NA
 11715544 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7373.000 0.000 NA   NA
 11430790 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7411.000 0.000 NA   NA
 11573153 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7411.000 0.000 NA   NA
 11715545 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7411.000 0.000 NA   NA
 11430791 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7447.000 0.000 NA   NA
 11573154 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7447.000 0.000 NA   NA
 11715546 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7447.000 0.000 NA   NA
 11430792 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7487.000 0.000 NA   NA
 11573155 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7487.000 0.000 NA   NA
 11715547 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7487.000 0.000 NA   NA
 11430793 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7523.000 0.000 NA   NA
 11573156 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7523.000 0.000 NA   NA
 11715548 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7523.000 0.000 NA   NA
 11430794 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7562.000 0.000 NA   NA
 11573157 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7562.000 0.000 NA   NA
 11715549 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7562.000 0.000 NA   NA
 11430795 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7598.000 0.000 NA   NA
 11573158 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7598.000 0.000 NA   NA
 11715550 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7598.000 0.000 NA   NA
 11430796 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7636.000 0.000 NA   NA
 11573159 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7636.000 0.000 NA   NA
 11715551 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7636.000 0.000 NA   NA
 11430797 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7672.000 0.000 NA   NA
 11573160 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7672.000 0.000 NA   NA
 11715552 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7672.000 0.000 NA   NA
 11430798 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7711.000 0.000 NA   NA
 11573161 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7711.000 0.000 NA   NA
 11715553 5596095   RC1_3485     FALSE NA 7711.000 0.000 NA   NA
 5596100 5596101 RC1_3490 RC1_3491     FALSE 0.059 166.000 0.000 NA   NA
 5596101 5596102 RC1_3491 RC1_3492     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5596102 5596103 RC1_3492 RC1_3493   ppcE FALSE 0.062 158.000 0.000 NA   NA
 5596103 5596104 RC1_3493 RC1_3494 ppcE   FALSE 0.074 129.000 0.000 NA   NA
 5596104 5596105 RC1_3494 RC1_3495     TRUE 0.996 15.000 0.600 NA   NA
 5596105 5596106 RC1_3495 RC1_3496   nrdF FALSE 0.113 97.000 0.000 NA   NA
 5596106 5596107 RC1_3496 RC1_3497 nrdF   FALSE 0.091 125.000 0.000 1.000   NA
 5596107 5596108 RC1_3497 RC1_3498     FALSE 0.050 186.000 0.000 NA   NA
 5596109 5596110 RC1_3499 RC1_3500   panB FALSE 0.101 115.000 0.000 1.000   NA
 5596111 5596112 RC1_3501 RC1_3502 minE minD TRUE 0.999 -3.000 0.618 NA Y NA
 5596112 5596113 RC1_3502 RC1_3503 minD minC TRUE 0.993 41.000 0.466 1.000 Y NA
 5596113 5596114 RC1_3503 RC1_3504 minC   FALSE 0.028 352.000 0.000 NA   NA
 5596117 5596118 RC1_3507 RC1_3508     TRUE 0.561 15.000 0.000 NA   NA
 5596118 5596119 RC1_3508 RC1_3509   atpI FALSE 0.039 237.000 0.000 NA   NA
 5596119 5596120 RC1_3509 RC1_3510 atpI atpB TRUE 0.991 -7.000 0.195 NA   NA
 5596120 5596121 RC1_3510 RC1_3511 atpB atpE TRUE 0.982 72.000 0.628 0.004   NA
 5596121 5596122 RC1_3511 RC1_3512 atpE   TRUE 0.675 278.000 0.278 0.004   NA
 5596122 5596123 RC1_3512 RC1_3513   atpF TRUE 1.000 0.000 0.863 0.004 Y NA
 5596124 5596125 RC1_3514 RC1_3515 glk otsA TRUE 0.994 -3.000 0.100 1.000 Y NA
 5596125 5596126 RC1_3515 RC1_3516 otsA bar FALSE 0.030 489.000 0.000 1.000 N NA
 5596126 5596127 RC1_3516 RC1_3517 bar   TRUE 0.825 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5596128 5596129 RC1_3518 RC1_3519     FALSE 0.035 262.000 0.000 NA   NA
 5596129 5596130 RC1_3519 RC1_3520     TRUE 0.480 21.000 0.000 NA   NA
 5596131 5596132 RC1_3521 RC1_3522   fadB1 TRUE 0.786 48.000 0.000 0.041 Y NA
 5596132 5596133 RC1_3522 RC1_3523 fadB1   FALSE 0.053 187.000 0.000 NA N NA
 5596133 5596134 RC1_3523 RC1_3524     TRUE 0.792 130.000 0.276 NA N NA
 5596134 5596135 RC1_3524 RC1_3525   bioH TRUE 0.843 35.000 0.069 1.000   NA
 5596136 5596137 RC1_3526 RC1_3527     TRUE 0.680 50.000 0.031 1.000 N NA
 5596137 5596138 RC1_3527 RC1_3528     TRUE 0.815 -3.000 0.000 1.000   NA
 5596139 5596140 RC1_3529 RC1_3530     TRUE 0.528 32.000 0.000 0.041   NA
 5596140 5596141 RC1_3530 RC1_3531     TRUE 0.938 12.000 0.000 0.041 Y NA
 5596141 5596142 RC1_3531 RC1_3532     TRUE 1.000 -3.000 0.600 0.041 Y NA
 5596142 5596143 RC1_3532 RC1_3533     TRUE 0.983 6.000 0.061 1.000 Y NA
 5596143 5596144 RC1_3533 RC1_3534     TRUE 0.999 0.000 0.544 1.000 Y NA
 5596144 5596145 RC1_3534 RC1_3535   fadD TRUE 0.722 55.000 0.000 1.000 Y NA
 5596146 5596147 RC1_3536 RC1_3537   fusA FALSE 0.043 275.000 0.000 1.000 N NA
 5596147 5596148 RC1_3537 RC1_3538 fusA rrsC FALSE 0.021 1144.000 0.000 NA   NA
 5596148 5596149 RC1_3538 RC1_3539 rrsC   FALSE 0.046 198.000 0.000 NA   NA
 5596149 5596150 RC1_3539 RC1_3540     FALSE 0.343 36.000 0.000 NA   NA
 5596150 5596151 RC1_3540 RC1_3541   rrlC FALSE 0.027 366.000 0.000 NA   NA
 5596152 5596153 RC1_3542 RC1_3543     TRUE 0.998 -3.000 0.471 1.000 N NA
 5596153 5596154 RC1_3543 RC1_3544   asnB TRUE 0.996 12.000 0.514 1.000 N NA
 5596159 5596160 RC1_3549 RC1_3550 oxyR   FALSE 0.172 83.000 0.000 1.000   NA
 5596162 5596163 RC1_3552 RC1_3553     TRUE 0.989 53.000 0.683 NA   NA
 5596163 5596164 RC1_3553 RC1_3554     TRUE 0.999 -3.000 0.761 NA   NA
 5596165 5596166 RC1_3555 RC1_3556     FALSE 0.038 243.000 0.000 NA   NA
 5596167 5596168 RC1_3557 RC1_3558   trxB TRUE 0.612 12.000 0.000 NA   NA
 5596169 5596170 RC1_3559 RC1_3560     FALSE 0.111 113.000 0.000 1.000 N NA
 5596170 5596171 RC1_3560 RC1_3561     FALSE 0.091 110.000 0.000 NA   NA
 5596171 5596172 RC1_3561 RC1_3562   ppsA FALSE 0.025 411.000 0.000 NA   NA
 5596172 5596173 RC1_3562 RC1_3563 ppsA   FALSE 0.047 239.000 0.000 1.000   NA
 5596173 5596174 RC1_3563 RC1_3564   dnaJ TRUE 0.982 -3.000 0.100 1.000   NA
 5596174 5596175 RC1_3564 RC1_3565 dnaJ trxC TRUE 0.786 40.000 0.000 1.000 Y NA
 5596176 5596177 RC1_3566 RC1_3567 omp   FALSE 0.380 32.000 0.000 NA   NA
 5596178 5596179 RC1_3568 RC1_3569 mhpR   FALSE 0.103 103.000 0.000 NA   NA
 5596180 5596181 RC1_3570 RC1_3571     FALSE 0.053 179.000 0.000 NA   NA
 5596182 5596183 RC1_3572 RC1_3573 pyrE pyrC TRUE 0.811 94.000 0.072 1.000 Y NA
 5596183 5596184 RC1_3573 RC1_3574 pyrC   TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5596191 5596192 RC1_3582 RC1_3583 ribF   FALSE 0.059 166.000 0.000 NA   NA
 5596192 5596193 RC1_3583 RC1_3584   stbB TRUE 0.507 19.000 0.000 NA   NA
 5596193 5596194 RC1_3584 RC1_3585 stbB ileS FALSE 0.040 229.000 0.000 NA   NA
 5596194 5596195 RC1_3585 RC1_3586 ileS lspA TRUE 0.825 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5596195 5596196 RC1_3586 RC1_3587 lspA   FALSE 0.289 45.000 0.000 NA   NA
 5596196 5596197 RC1_3587 RC1_3588     FALSE 0.058 167.000 0.000 NA   NA
 5596197 5596198 RC1_3588 RC1_3589     TRUE 0.999 -3.000 0.598 0.004   NA
 5596198 5596199 RC1_3589 RC1_3590     FALSE 0.201 66.000 0.000 NA   NA
 5596201 5596202 RC1_3592 RC1_3593 pgi   FALSE 0.083 116.000 0.000 NA   NA
 5596203 5596204 RC1_3594 RC1_3595     FALSE 0.261 63.000 0.000 1.000 N NA
 5596205 5596206 RC1_3596 RC1_3597     FALSE 0.197 75.000 0.000 1.000   NA
 5596206 5596207 RC1_3597 RC1_3598     TRUE 0.821 -19.000 0.000 1.000 N NA
 5596207 5596208 RC1_3598 RC1_3599     FALSE 0.119 93.000 0.000 NA   NA
 5596208 5596209 RC1_3599 RC1_3600     TRUE 0.999 11.000 0.857 NA   NA
 5596210 5596211 RC1_3601 RC1_3602 mutL   FALSE 0.130 99.000 0.000 1.000   NA
 5596211 5596212 RC1_3602 RC1_3603     TRUE 0.773 -187.000 0.000 NA   NA
 5596212 5596213 RC1_3603 RC1_3604   purD FALSE 0.025 411.000 0.000 NA   NA
 5596213 5596214 RC1_3604 RC1_3605 purD   FALSE 0.293 56.000 0.000 1.000 N NA
 5596215 5596216 RC1_3606 RC1_3607 phnA   FALSE 0.028 518.000 0.000 1.000   NA
 5596216 5596217 RC1_3607 RC1_3608     FALSE 0.299 52.000 0.000 1.000   NA
 5596217 5596218 RC1_3608 RC1_3609   xseA FALSE 0.089 130.000 0.000 1.000   NA
 5596218 5596219 RC1_3609 RC1_3610 xseA   FALSE 0.116 99.000 0.000 NA N NA
 5596220 5596221 RC1_3611 RC1_3612   htrB FALSE 0.113 97.000 0.000 NA   NA
 5596221 5596222 RC1_3612 RC1_3613 htrB lpxK TRUE 0.988 -16.000 0.044 1.000 Y NA
 5596222 5596223 RC1_3613 RC1_3614 lpxK kdtA TRUE 0.984 -3.000 0.022 1.000 Y NA
 5596224 5596225 RC1_3615 RC1_3616   omp TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5596225 5596226 RC1_3616 RC1_3617 omp   FALSE 0.091 110.000 0.000 NA   NA
 5596226 5596227 RC1_3617 RC1_3618     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5596228 5596229 RC1_3619 RC1_3620 pmbA   FALSE 0.125 90.000 0.000 NA   NA
 5596231 5596232 RC1_3622 RC1_3623 ubiD   FALSE 0.305 77.000 0.006 NA   NA
 5596235 5596236 RC1_3626 RC1_3627     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5596236 5596237 RC1_3627 RC1_3628   gshA TRUE 0.651 87.000 0.087 NA   NA
 5596239 5596240 RC1_3630 RC1_3631 ctaC ctaD TRUE 0.998 29.000 0.741 0.002 Y NA
 5596240 5596241 RC1_3631 RC1_3632 ctaD ctaB TRUE 0.748 109.000 0.153 0.030 N NA
 5596241 5596242 RC1_3632 RC1_3633 ctaB   TRUE 0.561 15.000 0.000 NA   NA
 5596242 5596243 RC1_3633 RC1_3634   ctaG TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5596243 5596244 RC1_3634 RC1_3635 ctaG coxC TRUE 0.998 -7.000 0.536 1.000 N NA
 5596244 5596245 RC1_3635 RC1_3636 coxC   TRUE 0.984 -22.000 0.122 NA   NA
 5596245 5596246 RC1_3636 RC1_3637     TRUE 0.996 -3.000 0.340 NA   NA
 5596247 5596248 RC1_3638 RC1_3639     TRUE 0.999 -13.000 1.000 NA   NA
 5596248 5596249 RC1_3639 RC1_3640     FALSE 0.037 244.000 0.000 NA   NA
 5596250 5596251 RC1_3641 RC1_3642   thrC TRUE 0.671 7.000 0.000 NA   NA
 5596251 5596252 RC1_3642 RC1_3643 thrC   TRUE 0.780 81.000 0.129 1.000   NA
 5596252 5596253 RC1_3643 RC1_3644   rimJ TRUE 0.997 18.000 0.674 1.000   NA
 5596256 5596257 RC1_3647 RC1_3648 rnhA thrB TRUE 0.983 -3.000 0.104 1.000   NA
 5596258 5596259 RC1_3649 RC1_3650   pspA FALSE 0.263 51.000 0.000 NA   NA
 5596259 5596260 RC1_3650 RC1_3651 pspA pspC TRUE 0.769 41.000 0.000 NA Y NA
 5596261 5596262 RC1_3652 RC1_3653     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5596262 5596263 RC1_3653 RC1_3654   ispH FALSE 0.221 61.000 0.000 NA   NA
 5596264 5596265 RC1_3655 RC1_3656   gcvT FALSE 0.024 449.000 0.000 NA   NA
 5596265 5596266 RC1_3656 RC1_3657 gcvT gcvH TRUE 0.900 121.000 0.202 0.001 Y NA
 5596266 5596267 RC1_3657 RC1_3658 gcvH gcvPA TRUE 0.994 0.000 0.130 1.000 Y NA
 5596267 5596268 RC1_3658 RC1_3659 gcvPA gcvPB TRUE 0.999 -3.000 0.316 0.000 Y NA
 5596268 5596269 RC1_3659 RC1_3661 gcvPB   FALSE 0.448 124.000 0.000 0.009 Y NA
 5596271 5596272 RC1_3662 RC1_3663     FALSE 0.098 117.000 0.000 1.000   NA
 5596272 5596273 RC1_3663 RC1_3664   mrpA FALSE 0.174 390.000 0.000 1.000 Y NA
 5596273 5596274 RC1_3664 RC1_3665 mrpA mrpB TRUE 0.998 -3.000 0.274 NA Y NA
 5596274 5596275 RC1_3665 RC1_3666 mrpB mrpC TRUE 0.997 4.000 0.278 NA Y NA
 5596275 5596276 RC1_3666 RC1_3667 mrpC mrpD TRUE 1.000 0.000 0.896 0.005 Y NA
 5596276 5596277 RC1_3667 RC1_3668 mrpD mrpE TRUE 1.000 -3.000 0.810 1.000 Y NA
 5596277 5596278 RC1_3668 RC1_3669 mrpE mrpF TRUE 1.000 -3.000 0.644 0.029 Y NA
 5596278 5596279 RC1_3669 RC1_3670 mrpF mrpG TRUE 0.999 -13.000 0.614 1.000 Y NA
 5596280 5596281 RC1_3671 RC1_3672 cspA   FALSE 0.283 47.000 0.000 NA   NA
 5596282 5596283 RC1_3673 RC1_3674 lcfA   FALSE 0.072 173.000 0.000 1.000 N NA
 5596284 5596285 RC1_3675 RC1_3676     TRUE 0.999 -165.000 1.000 NA   NA
 5596285 5596286 RC1_3676 RC1_3677     FALSE 0.190 69.000 0.000 NA   NA
 5596286 5596287 RC1_3677 RC1_3678     TRUE 0.875 32.000 0.081 NA   NA
 5596287 5596288 RC1_3678 RC1_3679   nifX TRUE 0.955 4.000 0.062 NA   NA
 5596288 5596289 RC1_3679 RC1_3680 nifX nifEN TRUE 0.978 -28.000 0.070 0.003   NA
 5596289 5596290 RC1_3680 RC1_3681 nifEN nifK TRUE 0.922 225.000 0.380 0.001 Y NA
 5596290 5596291 RC1_3681 RC1_3682 nifK nifD TRUE 0.998 43.000 0.902 0.001 Y NA
 5596291 5596292 RC1_3682 RC1_3683 nifD nifH TRUE 0.674 69.000 0.039 0.001 N NA
 5596292 5596293 RC1_3683 RC1_3684 nifH modC FALSE 0.030 304.000 0.000 NA   NA
 5596295 5596296 RC1_3686 RC1_3687 sir2 nifT TRUE 0.939 40.000 0.215 NA   NA
 5596296 5596297 RC1_3687 RC1_3688 nifT nifZ TRUE 0.997 -3.000 0.354 0.003   NA
 5596297 5596298 RC1_3688 RC1_3689 nifZ fdxN TRUE 0.541 57.000 0.015 1.000   NA
 5596298 5596299 RC1_3689 RC1_3690 fdxN nifB TRUE 0.813 38.000 0.061 1.000   NA
 5596299 5596300 RC1_3690 RC1_3691 nifB nifA FALSE 0.401 192.000 0.071 0.003   NA
 5596300 5596301 RC1_3691 RC1_3692 nifA   FALSE 0.046 201.000 0.000 NA   NA
 5596302 5596303 RC1_3693 RC1_3694 nifV nifW TRUE 0.995 -9.000 0.300 1.000   NA
 5596303 5596304 RC1_3694 RC1_3695 nifW fixA TRUE 0.987 4.000 0.189 1.000   NA
 5596304 5596305 RC1_3695 RC1_3696 fixA fixB TRUE 0.980 69.000 0.330 0.007 Y NA
 5596305 5596306 RC1_3696 RC1_3697 fixB fixC TRUE 0.999 11.000 0.491 0.007 Y NA
 5596306 5596307 RC1_3697 RC1_3698 fixC fixX TRUE 0.996 30.000 0.461 0.030 Y NA
 5596308 5596309 RC1_3699 RC1_3700   arsC FALSE 0.438 44.000 0.000 0.030   NA
 5596309 5596310 RC1_3700 RC1_3701 arsC   FALSE 0.068 147.000 0.000 NA   NA
 5596310 5596311 RC1_3701 RC1_3702     FALSE 0.061 161.000 0.000 NA   NA
 5596311 5596312 RC1_3702 RC1_3703   rrfD FALSE 0.276 49.000 0.000 NA   NA
 5596312 5596313 RC1_3703 RC1_3704 rrfD rrlD FALSE 0.079 119.000 0.000 NA   NA
 5596313 5596314 RC1_3704 RC1_3705 rrlD   FALSE 0.027 366.000 0.000 NA   NA
 5596314 5596315 RC1_3705 RC1_3706     FALSE 0.343 36.000 0.000 NA   NA
 5596315 5596316 RC1_3706 RC1_3707   rrsD FALSE 0.046 198.000 0.000 NA   NA
 5596317 5596318 RC1_3708 RC1_3709     FALSE 0.042 283.000 0.000 1.000 N NA
 5596318 5596319 RC1_3709 RC1_3710     TRUE 0.995 16.000 0.571 NA   NA
 5596319 5596320 RC1_3710 RC1_3711     TRUE 0.507 19.000 0.000 NA   NA
 5596320 5596321 RC1_3711 RC1_3712   hyuA FALSE 0.178 84.000 0.000 1.000 N NA
 5596321 5596322 RC1_3712 RC1_3713 hyuA huyB TRUE 0.999 5.000 0.636 0.000 Y NA
 5596322 5596323 RC1_3713 RC1_3714 huyB   TRUE 0.643 13.000 0.000 1.000   NA
 5596323 5596324 RC1_3714 RC1_3715     TRUE 0.713 7.000 0.000 1.000   NA
 5596324 5596325 RC1_3715 RC1_3716     TRUE 0.959 0.000 0.000 1.000 Y NA
 5596325 5596326 RC1_3716 RC1_3717   bluB FALSE 0.037 336.000 0.000 1.000 N NA
 5596327 5596328 RC1_3718 RC1_3719     TRUE 0.950 9.000 0.071 NA   NA
 5596328 5596329 RC1_3719 RC1_3720   atoE FALSE 0.106 112.000 0.000 1.000   NA
 5596332 5596333 RC1_3723 RC1_3725     FALSE 0.091 110.000 0.000 NA   NA
 5596335 5596336 RC1_3726 RC1_3727     TRUE 0.998 -13.000 0.464 0.070   NA
 5596336 5596337 RC1_3727 RC1_3728     TRUE 0.990 4.000 0.208 0.004   NA
 5596339 5596340 RC1_3730 RC1_3731 malF malG TRUE 0.999 12.000 0.723 0.020 Y NA
 5596340 5596341 RC1_3731 RC1_3732 malG malK TRUE 0.837 58.000 0.014 0.020 Y NA
 5596341 5596342 RC1_3732 RC1_3733 malK   FALSE 0.197 67.000 0.000 NA   NA
 5596342 5596343 RC1_3733 RC1_3734     FALSE 0.150 81.000 0.000 NA   NA
 5596343 5596344 RC1_3734 RC1_3735     FALSE 0.070 142.000 0.000 NA   NA
 5596346 5596347 RC1_3737 RC1_3738     FALSE 0.229 59.000 0.000 NA   NA
 5596347 5596348 RC1_3738 RC1_3739     TRUE 0.829 66.000 0.032 1.000 Y NA
 5596348 5596349 RC1_3739 RC1_3740     TRUE 0.999 -3.000 0.422 1.000 Y NA
 5596349 5596350 RC1_3740 RC1_3741     TRUE 1.000 -3.000 0.862 1.000 Y NA
 5596350 5596351 RC1_3741 RC1_3742   repA FALSE 0.085 150.000 0.000 1.000 N NA
 5596351 5596352 RC1_3742 RC1_3743 repA   TRUE 0.825 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5596353 5596354 RC1_3744 RC1_3745     FALSE 0.030 304.000 0.000 NA   NA
 5596354 5596355 RC1_3745 RC1_3746   adeS FALSE 0.039 306.000 0.000 1.000 N NA
 5596355 5596356 RC1_3746 RC1_3747 adeS adeR TRUE 0.999 11.000 0.826 1.000 Y NA
 5596357 5596358 RC1_3748 RC1_3749   acrB TRUE 0.965 21.000 0.182 1.000 N NA
 5596358 5596359 RC1_3749 RC1_3750 acrB   TRUE 0.822 5.000 0.000 0.020 N NA
 5596360 5596361 RC1_3751 RC1_3752     FALSE 0.114 96.000 0.000 NA   NA
 5596366 5596367 RC1_3757 RC1_3758   flgE FALSE 0.022 583.000 0.000 NA   NA
 5596367 5596368 RC1_3758 RC1_3759 flgE flaG FALSE 0.048 193.000 0.000 NA   NA
 5596370 5596371 RC1_3761 RC1_3762 flgK flgL TRUE 0.908 20.000 0.000 0.004 Y NA
 5596371 5596372 RC1_3762 RC1_3763 flgL lafA FALSE 0.465 122.000 0.000 0.001 Y NA
 5596372 5596373 RC1_3763 RC1_3764 lafA flaF TRUE 0.705 112.000 0.057 NA Y NA
 5596373 5596374 RC1_3764 RC1_3765 flaF flgF TRUE 0.699 5.000 0.000 NA   NA
 5596376 5596377 RC1_3767 RC1_3768   neuA TRUE 0.930 -3.000 0.013 1.000 N NA
 5596377 5596378 RC1_3768 RC1_3769 neuA   TRUE 0.804 22.000 0.020 1.000 N NA
 5596378 5596379 RC1_3769 RC1_3770     FALSE 0.408 51.000 0.000 0.040 N NA
 5596379 5596380 RC1_3770 RC1_3771   nans FALSE 0.178 260.000 0.032 1.000 N NA
 5596380 5596381 RC1_3771 RC1_3772 nans   FALSE 0.328 38.000 0.000 NA   NA
 5596381 5596382 RC1_3772 RC1_3773     FALSE 0.358 34.000 0.000 NA   NA
 5596382 5596383 RC1_3773 RC1_3775     TRUE 0.644 10.000 0.000 NA   NA
 5596386 5596387 RC1_3777 RC1_3778 rfbC   TRUE 0.997 0.000 0.457 NA   NA
 5596387 5596388 RC1_3778 RC1_3779   rfbG TRUE 0.984 -3.000 0.119 NA   NA
 5596388 5596389 RC1_3779 RC1_3780 rfbG rfbF TRUE 0.999 -3.000 0.624 1.000 Y NA
 5596390 5596391 RC1_3781 RC1_3782 asnB   FALSE 0.044 252.000 0.000 1.000   NA
 5596391 5596392 RC1_3782 RC1_3783     FALSE 0.039 281.000 0.000 1.000   NA
 5596394 5596395 RC1_3785 RC1_3786     FALSE 0.101 104.000 0.000 NA   NA
 5596395 5596396 RC1_3786 RC1_3787     TRUE 0.995 47.000 1.000 NA   NA
 5596396 5596397 RC1_3787 RC1_3788     TRUE 0.677 86.000 0.095 NA   NA
 5596397 5596398 RC1_3788 RC1_3789     FALSE 0.134 101.000 0.000 1.000 N NA
 5596399 5596400 RC1_3790 RC1_3791     FALSE 0.101 104.000 0.000 NA   NA
 5596400 5596401 RC1_3791 RC1_3792     TRUE 0.545 16.000 0.000 NA   NA
 5596401 5596402 RC1_3792 RC1_3793     TRUE 0.747 0.000 0.000 NA   NA
 5596402 5596403 RC1_3793 RC1_3794     TRUE 0.652 9.000 0.000 NA   NA
 5596403 5596404 RC1_3794 RC1_3795     TRUE 0.682 6.000 0.000 NA   NA
 5596404 5596405 RC1_3795 RC1_3796     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   NA
 5596405 5596406 RC1_3796 RC1_3797     FALSE 0.031 293.000 0.000 NA   NA
 5596407 5596408 RC1_3798 RC1_3800     FALSE 0.170 74.000 0.000 NA   NA
 5596409 5596410 RC1_3799 RC1_3801     FALSE 0.022 840.000 0.000 NA   NA
 5596411 5596412 RC1_3802 RC1_3803   divJ FALSE 0.068 179.000 0.000 1.000 N NA
 5596413 5596414 RC1_3804 RC1_3805 prpB prpC TRUE 0.991 29.000 0.502 1.000 N NA
 5596414 5596415 RC1_3805 RC1_3806 prpC prpD TRUE 0.972 20.000 0.216 1.000   NA
 5596415 5596416 RC1_3806 RC1_3807 prpD   TRUE 0.947 -3.000 0.029 NA   NA
 5596418 5596419 RC1_3809 RC1_3810     TRUE 0.726 3.000 0.000 NA   NA
 5596419 5596420 RC1_3810 RC1_3811     TRUE 0.563 82.000 0.000 NA Y NA
 5596420 5596421 RC1_3811 RC1_3812     TRUE 0.997 -3.000 0.375 NA N NA
 5596423 5596424 RC1_3814 RC1_3815     FALSE 0.054 177.000 0.000 NA   NA
 5596424 5596425 RC1_3815 RC1_3816     TRUE 0.979 89.000 0.763 NA   NA
 5596427 5596428 RC1_3818 RC1_3819     TRUE 0.999 2.000 0.667 1.000 Y NA
 5596428 5596429 RC1_3819 RC1_3820     TRUE 0.998 18.000 0.600 0.008 Y NA
 5596429 5596430 RC1_3820 RC1_3821     TRUE 0.998 -3.000 0.300 1.000 Y NA
 5596430 5596431 RC1_3821 RC1_3822     FALSE 0.289 54.000 0.000 1.000   NA
 5596432 5596433 RC1_3823 RC1_3824     FALSE 0.028 337.000 0.000 NA   NA
 5596433 5596434 RC1_3824 RC1_3825     FALSE 0.025 411.000 0.000 NA   NA
 5596434 5596435 RC1_3825 RC1_3826     TRUE 0.993 -3.000 0.230 NA   NA
 5596437 5596438 RC1_3828 RC1_3829 ccpA   FALSE 0.067 148.000 0.000 NA   NA
 5596438 5596439 RC1_3829 RC1_3830     TRUE 0.747 0.000 0.000 NA   NA
 5596439 5596440 RC1_3830 RC1_3831     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5596442 5596443 RC1_3833 RC1_3834 exbB exbD TRUE 0.984 7.000 0.054 0.027 Y NA
 5596443 5596444 RC1_3834 RC1_3835 exbD tonB TRUE 0.983 -3.000 0.089 0.069 N NA
 5596445 5596446 RC1_3836 RC1_3837     TRUE 0.978 0.000 0.105 NA   NA
 5596446 5596447 RC1_3837 RC1_3838     TRUE 0.994 11.000 0.442 NA   NA
 5596450 5596451 RC1_3841 RC1_3842   hemN FALSE 0.389 38.000 0.000 1.000 N NA
 5596451 5596452 RC1_3842 RC1_3843 hemN   TRUE 0.987 -3.000 0.135 NA N NA
 5596453 5596454 RC1_3844 RC1_3845     FALSE 0.125 90.000 0.000 NA   NA
 5596454 5596455 RC1_3845 RC1_3846     FALSE 0.134 97.000 0.000 1.000   NA
 5596456 5596457 RC1_3847 RC1_3848   nfrA FALSE 0.085 142.000 0.000 1.000   NA
 5596458 5596459 RC1_3849 RC1_3850     FALSE 0.056 172.000 0.000 NA   NA
 5596459 5596460 RC1_3850 RC1_3851     FALSE 0.060 197.000 0.000 1.000 N NA
 5596461 5596462 RC1_3852 RC1_3853     FALSE 0.091 115.000 0.000 NA N NA
 5596464 5596465 RC1_3855 RC1_3856     FALSE 0.032 380.000 0.000 1.000   NA
 5596465 5596466 RC1_3856 RC1_3857     TRUE 0.916 25.000 0.015 NA Y NA
 5596466 5596467 RC1_3857 RC1_3858   hmuS TRUE 0.928 45.000 0.077 NA Y NA
 5596467 5596468 RC1_3858 RC1_3859 hmuS hmuT TRUE 0.999 -3.000 0.384 1.000 Y NA
 5596468 5596469 RC1_3859 RC1_3860 hmuT hmuU TRUE 1.000 3.000 0.852 1.000 Y NA
 5596469 5596470 RC1_3860 RC1_3861 hmuU hmuV TRUE 0.998 -3.000 0.292 1.000 Y NA
 5596470 5596471 RC1_3861 RC1_3862 hmuV   FALSE 0.076 140.000 0.000 NA N NA
 5596471 5596472 RC1_3862 RC1_3863   aer FALSE 0.056 182.000 0.000 NA N NA
 5596472 5596473 RC1_3863 RC1_3864 aer sbp FALSE 0.034 380.000 0.000 1.000 N NA
 5596473 5596474 RC1_3864 RC1_3865 sbp cysT TRUE 0.569 152.000 0.097 0.001 N NA
 5596474 5596475 RC1_3865 RC1_3866 cysT cysW TRUE 1.000 -15.000 0.935 0.000 N NA
 5596475 5596476 RC1_3866 RC1_3867 cysW cysA TRUE 0.999 11.000 0.587 1.000 Y NA
 5596476 5596477 RC1_3867 RC1_3868 cysA   FALSE 0.066 150.000 0.000 NA   NA
 5596479 5596480 RC1_3870 RC1_3871     TRUE 0.776 3.000 0.000 1.000 N NA
 5596480 5596481 RC1_3871 RC1_3872     TRUE 0.966 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5596481 5596482 RC1_3872 RC1_3873     TRUE 0.966 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5596482 5596483 RC1_3873 RC1_3874   cobC FALSE 0.093 134.000 0.000 1.000 N NA
 5596483 5596484 RC1_3874 RC1_3875 cobC   FALSE 0.150 81.000 0.000 NA   NA
 5596486 5596487 RC1_3877 RC1_3878     TRUE 0.966 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5596487 5596488 RC1_3878 RC1_3879     TRUE 0.782 -10.000 0.000 NA   NA
 5596488 5596489 RC1_3879 RC1_3880     FALSE 0.201 66.000 0.000 NA   NA
 5596489 5596490 RC1_3880 RC1_3881     FALSE 0.296 44.000 0.000 NA   NA
 5596494 5596495 RC1_3885 RC1_3886   acrF TRUE 0.999 7.000 0.842 1.000 N NA
 5596496 5596497 RC1_3887 RC1_3888 gcd aer FALSE 0.051 234.000 0.000 1.000 N NA
 5596499 5596500 RC1_3890 RC1_3891 aer   FALSE 0.116 95.000 0.000 NA   NA
 5596501 5596502 RC1_3892 RC1_3893 fcuA   FALSE 0.343 36.000 0.000 NA   NA
 5596502 5596503 RC1_3893 RC1_3894     FALSE 0.398 30.000 0.000 NA   NA
 5596503 5596504 RC1_3894 RC1_3895     FALSE 0.042 217.000 0.000 NA   NA
 5596504 5596505 RC1_3895 RC1_3896     FALSE 0.075 128.000 0.000 NA   NA
 5596506 5596507 RC1_3897 RC1_3898   acrB FALSE 0.042 223.000 0.000 NA   NA
 5596507 5596508 RC1_3898 RC1_3899 acrB acrE TRUE 0.815 111.000 0.250 1.000 N NA
 5596510 5596511 RC1_3901 RC1_3902     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5596511 5596512 RC1_3902 RC1_3903     TRUE 0.949 -3.000 0.031 NA   NA
 5596513 5596514 RC1_3904 RC1_3905     FALSE 0.022 686.000 0.000 NA   NA
 5596514 5596515 RC1_3905 RC1_3906     FALSE 0.217 62.000 0.000 NA   NA
 5596516 5596517 RC1_3907 RC1_3908 nosX nosL TRUE 0.998 -13.000 0.464 NA N NA
 5596517 5596518 RC1_3908 RC1_3909 nosL nosY TRUE 0.998 0.000 0.519 NA   NA
 5596518 5596519 RC1_3909 RC1_3910 nosY nosF TRUE 0.998 -3.000 0.500 NA   NA
 5596519 5596520 RC1_3910 RC1_3911 nosF nosD TRUE 0.999 -3.000 0.963 1.000 N NA
 5596520 5596521 RC1_3911 RC1_3912 nosD nosZ TRUE 0.859 73.000 0.146 0.001 N NA
 5596521 5596522 RC1_3912 RC1_3913 nosZ nosR TRUE 0.646 53.000 0.018 0.069 N NA
 5596522 5596523 RC1_3913 RC1_3914 nosR   FALSE 0.229 59.000 0.000 NA   NA
 5596524 5596525 RC1_3915 RC1_3916     FALSE 0.043 214.000 0.000 NA   NA
 5596525 5596526 RC1_3916 RC1_3917     TRUE 0.983 9.000 0.204 NA   NA
 5596526 5596527 RC1_3917 RC1_3919     FALSE 0.029 358.000 0.000 NA N NA
 5596529 5596530 RC1_3920 RC1_3921     FALSE 0.113 112.000 0.000 1.000 N NA
 5596530 5596531 RC1_3921 RC1_3922     TRUE 0.691 17.000 0.000 0.030 N NA
 5596531 5596532 RC1_3922 RC1_3923     FALSE 0.062 193.000 0.000 1.000 N NA
 5596533 5596534 RC1_3924 RC1_3925 sqr   FALSE 0.029 335.000 0.000 NA   NA
 5596534 5596535 RC1_3925 RC1_3926     TRUE 0.866 76.000 0.212 NA   NA
 5596535 5596536 RC1_3926 RC1_3927   amn FALSE 0.171 86.000 0.000 1.000 N NA
 5596537 5596538 RC1_3928 RC1_3929     TRUE 0.775 -48.000 0.000 NA   NA
 5596540 5596541 RC1_3931 RC1_3932 pdxY   FALSE 0.093 109.000 0.000 NA   NA
 5596543 5596544 RC1_3934 RC1_3935     FALSE 0.468 22.000 0.000 NA   NA
 5596544 5596545 RC1_3935 RC1_3936     FALSE 0.072 139.000 0.000 NA   NA
 5596545 5596546 RC1_3936 RC1_3938     FALSE 0.059 166.000 0.000 NA   NA
 5596548 5596549 RC1_3939 RC1_3940 sdhC sdhD TRUE 0.995 15.000 0.291 0.000 Y NA
 5596549 5596550 RC1_3940 RC1_3941 sdhD sdhA TRUE 0.999 12.000 0.705 0.001 Y NA
 5596550 5596551 RC1_3941 RC1_3942 sdhA sdhB TRUE 0.979 143.000 0.604 0.001 Y NA
 5596552 5596553 RC1_3943 RC1_3944     FALSE 0.057 170.000 0.000 NA   NA
 5596553 5596554 RC1_3944 RC1_3945   ispZ TRUE 0.815 -3.000 0.000 1.000   NA
 5596555 5596556 RC1_3946 RC1_3947 typA   FALSE 0.277 201.000 0.000 1.000 Y NA
 5596556 5596557 RC1_3947 RC1_3948     FALSE 0.085 150.000 0.000 1.000 N NA
 5596557 5596558 RC1_3948 RC1_3949   phbB TRUE 0.766 79.000 0.027 1.000 Y NA
 5596558 5596559 RC1_3949 RC1_3950 phbB   FALSE 0.116 110.000 0.000 1.000 N NA
 5596559 5596560 RC1_3950 RC1_3951     FALSE 0.204 73.000 0.000 1.000   NA
 5596562 5596563 RC1_3953 RC1_3954     FALSE 0.056 172.000 0.000 NA   NA
 5596566 5596567 RC1_3957 RC1_3958     FALSE 0.310 41.000 0.000 NA   NA
 5596567 5596568 RC1_3958 RC1_3959     TRUE 0.747 0.000 0.000 NA   NA
 5596568 5596569 RC1_3959 RC1_3960     TRUE 0.747 0.000 0.000 NA   NA
 5596570 5596571 RC1_3961 RC1_3962 leuD leuB TRUE 0.928 72.000 0.114 0.001 Y NA
 5596571 5596572 RC1_3962 RC1_3963 leuB   TRUE 0.583 17.000 0.000 1.000   NA
 5596572 5596573 RC1_3963 RC1_3964     FALSE 0.276 49.000 0.000 NA   NA
 5596574 5596575 RC1_3965 RC1_3966     FALSE 0.045 263.000 0.000 1.000 N NA
 5596578 5596579 RC1_3969 RC1_3970   thiC FALSE 0.036 315.000 0.000 1.000   NA
 5596579 5596580 RC1_3970 RC1_3971 thiC   FALSE 0.106 101.000 0.000 NA   NA
 5596580 5596581 RC1_3971 RC1_3972   guaA FALSE 0.054 177.000 0.000 NA   NA
 5596581 5596582 RC1_3972 RC1_3973 guaA   FALSE 0.271 61.000 0.000 1.000 N NA
 5596583 5596584 RC1_3974 RC1_3975 linC ytfE FALSE 0.064 164.000 0.000 NA N NA
 5596586 5596587 RC1_3977 RC1_3978 nnrR nnrS FALSE 0.061 172.000 0.000 NA N NA
 5596587 5596588 RC1_3978 RC1_3979 nnrS   FALSE 0.140 85.000 0.000 NA   NA
 5596588 5596589 RC1_3979 RC1_3980     FALSE 0.283 47.000 0.000 NA   NA
 5596589 5596590 RC1_3980 RC1_3981     FALSE 0.033 401.000 0.000 1.000 N NA
 5596590 5596591 RC1_3981 RC1_3982     FALSE 0.054 177.000 0.000 NA   NA
 5596591 5596592 RC1_3982 RC1_3983     FALSE 0.132 87.000 0.000 NA   NA
 5596592 5596593 RC1_3983 RC1_3984     FALSE 0.328 38.000 0.000 NA   NA
 5596593 5596594 RC1_3984 RC1_3985     FALSE 0.296 44.000 0.000 NA   NA
 5596594 5596595 RC1_3985 RC1_3986     TRUE 0.737 1.000 0.000 NA   NA
 5596595 5596596 RC1_3986 RC1_3987     TRUE 0.942 10.000 0.065 NA   NA
 5596596 5596597 RC1_3987 RC1_3988   rfbF TRUE 0.951 15.000 0.017 1.000 Y NA
 5596597 5596598 RC1_3988 RC1_3989 rfbF   FALSE 0.055 204.000 0.000 1.000   NA
 5596601 5596602 RC1_3992 RC1_3993     TRUE 0.581 14.000 0.000 NA   NA
 5596602 5596603 RC1_3993 RC1_3994     FALSE 0.042 217.000 0.000 NA   NA
 5596604 5596605 RC1_3995 RC1_3996   rfbF TRUE 0.995 8.000 0.412 NA   NA
 5596605 5596606 RC1_3996 RC1_3997 rfbF   TRUE 0.989 -3.000 0.162 NA   NA
 5596606 5596607 RC1_3997 RC1_3998     FALSE 0.052 182.000 0.000 NA   NA
 5596608 5596609 RC1_3999 RC1_4000     FALSE 0.071 166.000 0.000 1.000   NA
 5596609 5596610 RC1_4000 RC1_4001     FALSE 0.122 139.000 0.000 0.068   NA
 5596612 5596613 RC1_4003 RC1_4004     FALSE 0.029 317.000 0.000 NA   NA
 5596613 5596614 RC1_4004 RC1_4006   exoP TRUE 0.598 86.000 0.000 0.068 Y NA
 5596616 5596617 RC1_4007 RC1_4008     TRUE 0.747 0.000 0.000 NA   NA
 5596617 5596618 RC1_4008 RC1_4009     FALSE 0.201 66.000 0.000 NA   NA
 5596618 5596619 RC1_4009 RC1_4010     TRUE 0.674 12.000 0.000 1.000 N NA
 5596619 5596620 RC1_4010 RC1_4011     TRUE 0.758 56.000 0.000 0.011 Y NA
 5596620 5596621 RC1_4011 RC1_4013     TRUE 0.779 -15.000 0.000 NA   NA
 5596624 5596625 RC1_4014 RC1_4016     TRUE 0.945 5.000 0.000 NA Y NA
 5596627 5596628 RC1_4018 RC1_4019     FALSE 0.243 86.000 0.000 0.005   NA
 5596629 5596630 RC1_4020 RC1_4021     FALSE 0.310 41.000 0.000 NA   NA
 5596630 5596631 RC1_4021 RC1_4022     FALSE 0.021 1003.000 0.000 NA   NA
 5596631 5596632 RC1_4022 RC1_4023     TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5596633 5596634 RC1_4024 RC1_4025     FALSE 0.072 136.000 0.000 NA   NA
 5596634 5596635 RC1_4025 RC1_4026   pimA FALSE 0.296 44.000 0.000 NA   NA
 5596635 5596636 RC1_4026 RC1_4027 pimA asnB TRUE 0.825 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5596636 5596637 RC1_4027 RC1_4028 asnB rfbB TRUE 0.654 65.000 0.044 1.000 N NA
 5596638 5596639 RC1_4029 RC1_4030 gmd fcl TRUE 0.993 -3.000 0.075 0.003 Y NA
 5596639 5596640 RC1_4030 RC1_4031 fcl   TRUE 0.784 -7.000 0.000 NA   NA
 5596640 5596641 RC1_4031 RC1_4032   exoB FALSE 0.142 84.000 0.000 NA   NA
 5596641 5596642 RC1_4032 RC1_4033 exoB   FALSE 0.168 84.000 0.000 1.000   NA
 5596643 5596644 RC1_4034 RC1_4035 ybgT cydB TRUE 0.948 39.000 0.230 NA   NA
 5596644 5596645 RC1_4035 RC1_4036 cydB   TRUE 1.000 6.000 0.953 0.029 Y NA
 5596646 5596647 RC1_4037 RC1_4039   cydC TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5596649 5596650 RC1_4041 RC1_4042   phoD TRUE 0.688 62.000 0.000 1.000 Y NA
 5596651 5596652 RC1_4043 RC1_4044     FALSE 0.163 76.000 0.000 NA   NA
 5596652 5596653 RC1_4044 RC1_4045   gpo TRUE 0.783 2.000 0.000 1.000 N NA
 5596654 5596655 RC1_4046 RC1_4047     FALSE 0.221 61.000 0.000 NA   NA
 5596657 5596658 RC1_4049 RC1_4050 nodT emrA TRUE 0.997 27.000 0.833 0.068 N NA
 5596658 5596659 RC1_4050 RC1_4051 emrA emrB TRUE 0.998 11.000 0.750 1.000   NA
 5596660 5596661 RC1_4052 RC1_4053     FALSE 0.078 121.000 0.000 NA   NA
 5596661 5596662 RC1_4053 RC1_4054   gltR FALSE 0.066 183.000 0.000 1.000 N NA
 5596662 5596663 RC1_4054 RC1_4055 gltR   TRUE 0.721 64.000 0.000 0.015 Y NA
 5596663 5596664 RC1_4055 RC1_4056     TRUE 0.972 -3.000 0.000 0.015 Y NA
 5596665 5596666 RC1_4057 RC1_4058 cckA fixJ TRUE 0.678 72.000 0.000 0.015 Y NA
 5596666 5596667 RC1_4058 RC1_4059 fixJ   FALSE 0.257 224.000 0.000 1.000 Y NA
 5596669 5596670 RC1_4061 RC1_4062 rbcL cbbS1 TRUE 0.982 32.000 0.333 0.001 N NA
 5596670 5596671 RC1_4062 RC1_4063 cbbS1 cbbE TRUE 0.824 -10.000 0.000 1.000 N NA
 5596671 5596672 RC1_4063 RC1_4064 cbbE cbbX TRUE 0.815 -3.000 0.000 1.000   NA
 5596672 5596673 RC1_4064 RC1_4065 cbbX cbbF FALSE 0.197 75.000 0.000 1.000   NA
 5596673 5596674 RC1_4065 RC1_4066 cbbF cbbP TRUE 0.797 23.000 0.011 0.006 N NA
 5596674 5596675 RC1_4066 RC1_4067 cbbP cbbT TRUE 0.577 56.000 0.017 1.000 N NA
 5596675 5596676 RC1_4067 RC1_4068 cbbT cbbA TRUE 0.615 75.000 0.000 1.000 Y NA
 5596676 5596677 RC1_4068 RC1_4069 cbbA cbbZ TRUE 0.610 15.000 0.000 1.000   NA
 5596677 5596678 RC1_4069 RC1_4070 cbbZ cbbY TRUE 0.529 32.000 0.000 0.039   NA
 5596679 5596680 RC1_4071 RC1_4072 purT rfbD FALSE 0.128 104.000 0.000 1.000 N NA
 5596680 5596681 RC1_4072 RC1_4073 rfbD rfbC TRUE 0.949 5.000 0.000 1.000 Y NA
 5596683 5596684 RC1_4075 RC1_4076     FALSE 0.436 139.000 0.000 0.006 Y NA
 5596686 5596687 RC1_4078 RC1_4079     FALSE 0.073 135.000 0.000 NA   NA
 5596689 5596690 RC1_4081 RC1_4082   metW FALSE 0.078 120.000 0.000 NA   NA
 5596690 5596691 RC1_4082 RC1_4083 metW metX TRUE 0.998 2.000 0.509 NA N NA
 5596692 5596693 RC1_4084 RC1_4085   hisC TRUE 0.668 111.000 0.037 1.000 Y NA
 5596693 5596694 RC1_4085 RC1_4086 hisC tyrA TRUE 0.949 5.000 0.000 1.000 Y NA
 5596695 5596696 RC1_4087 RC1_4088 rlpA   FALSE 0.190 69.000 0.000 NA   NA
 5596696 5596697 RC1_4088 RC1_4089     FALSE 0.060 163.000 0.000 NA   NA
 5596697 5596698 RC1_4089 RC1_4090     FALSE 0.074 130.000 0.000 NA   NA
 5596698 5596699 RC1_4090 RC1_4091     FALSE 0.098 105.000 0.000 NA   NA
 5596701 5596702 RC1_4093 RC1_4094     FALSE 0.034 387.000 0.000 1.000 N NA
 5596702 5596703 RC1_4094 RC1_4095     FALSE 0.048 248.000 0.000 1.000 N NA
 5596705 5596706 RC1_4097 RC1_4098     TRUE 0.997 -3.000 0.417 NA   NA
 5596708 5596709 RC1_4100 RC1_4101   lysA TRUE 0.754 51.000 0.062 NA   NA
 5596709 5596710 RC1_4101 RC1_4102 lysA   TRUE 0.747 0.000 0.000 NA   NA
 5596710 5596711 RC1_4102 RC1_4103   argH TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5596712 5596713 RC1_4104 RC1_4105 tlpA   FALSE 0.053 179.000 0.000 NA   NA
 5596713 5596714 RC1_4105 RC1_4106     FALSE 0.296 44.000 0.000 NA   NA
 5596715 5596716 RC1_4107 RC1_4108 hbd   TRUE 0.783 -3.000 0.000 NA   NA
 5596716 5596717 RC1_4108 RC1_4109   etfL TRUE 0.747 0.000 0.000 NA   NA
 5596717 5596718 RC1_4109 RC1_4110 etfL etfS TRUE 0.997 16.000 0.364 0.007 Y NA
 5596718 5596719 RC1_4110 RC1_4111 etfS   FALSE 0.077 346.000 0.008 1.000   NA
 5596719 5596720 RC1_4111 RC1_4112     TRUE 0.952 24.000 0.156 NA   NA
 5596722 5596723 RC1_4114 RC1_4115   gltX FALSE 0.072 139.000 0.000 NA   NA
 5596724 5596725 RC1_4116 RC1_4117     FALSE 0.070 143.000 0.000 NA   NA
 5596726 5596727 RC1_4118 RC1_4119     FALSE 0.270 50.000 0.000 NA   NA
 5596727 5596728 RC1_4119 RC1_4120   dsbB TRUE 0.988 -3.000 0.145 1.000 N NA
 5596728 5596729 RC1_4120 RC1_4121 dsbB   TRUE 0.960 61.000 0.385 NA   NA
 5596730 5596731 RC1_4122 RC1_4123     FALSE 0.039 235.000 0.000 NA   NA
 5596731 5596732 RC1_4123 RC1_4124     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA N NA
 5596732 5596733 RC1_4124 RC1_4125     FALSE 0.087 113.000 0.000 NA   NA
 5596733 5596734 RC1_4125 RC1_4126     TRUE 0.726 3.000 0.000 NA   NA
 5596734 5596735 RC1_4126 RC1_4127     FALSE 0.270 50.000 0.000 NA   NA
 5596735 5596736 RC1_4127 RC1_4128     FALSE 0.279 48.000 0.000 NA   NA
 5596736 5592632 RC1_4128 RC1_0011     FALSE 0.021 5926.000 0.000 NA   NA