MicrobesOnline Operon Predictions for Borrelia recurrentis A1

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5587957 5587958 BRE_1 BRE_2     FALSE 0.042 406.000 0.000 NA   NA
 5587958 5587959 BRE_2 BRE_3   vlp-a FALSE 0.043 932.000 0.000 NA   NA
 5587959 5587960 BRE_3 BRE_4 vlp-a vlp-d FALSE 0.080 3600.000 0.600 NA   NA
 5587960 5587961 BRE_4 BRE_5 vlp-d   FALSE 0.043 1388.000 0.000 NA   NA
 5587963 5587964 BRE_7 BRE_8     TRUE 0.796 -67.000 0.025 1.000 Y NA
 5587966 5587967 BRE_10 BRE_11 trsA   TRUE 0.850 -3.000 0.066 NA   NA
 5587967 5587968 BRE_11 BRE_12     FALSE 0.153 113.000 0.106 NA   NA
 5587969 5587970 BRE_13 BRE_14     TRUE 0.864 4.000 0.021 NA   NA
 5587970 5587971 BRE_14 BRE_15     TRUE 0.711 -7.000 0.015 NA   NA
 5587971 5587972 BRE_15 BRE_16     TRUE 0.851 4.000 0.015 NA   NA
 5587972 5587973 BRE_16 BRE_17   hisT TRUE 0.883 1.000 0.054 NA   NA
 5587973 5587974 BRE_17 BRE_18 hisT   TRUE 0.777 -7.000 0.040 NA   NA
 5587974 5587975 BRE_18 BRE_19   priA TRUE 0.703 -7.000 0.010 NA   NA
 5587976 5587977 BRE_20 BRE_21 udk glpE FALSE 0.402 -7.000 0.022 NA N NA
 5587979 5587980 BRE_23 BRE_24     TRUE 0.827 1.000 0.009 NA   NA
 5587980 5587981 BRE_24 BRE_25   pfpB TRUE 0.919 8.000 0.158 NA   NA
 5587981 5587982 BRE_25 BRE_26 pfpB queA FALSE 0.094 70.000 0.008 1.000 N NA
 5587982 5587983 BRE_26 BRE_27 queA ruvB TRUE 0.625 -16.000 0.069 1.000 N NA
 5587983 5587984 BRE_27 BRE_28 ruvB ruvA TRUE 0.944 53.000 0.549 0.010 Y NA
 5587984 5587985 BRE_28 BRE_29 ruvA   FALSE 0.155 83.000 0.002 NA   NA
 5587985 5587986 BRE_29 BRE_30   folD TRUE 0.826 1.000 0.010 NA   NA
 5587987 5587988 BRE_31 BRE_32     TRUE 0.952 8.000 0.600 NA   NA
 5587989 5587990 BRE_33 BRE_34   lepB-1 TRUE 0.707 -10.000 0.022 NA   NA
 5587990 5587991 BRE_34 BRE_35 lepB-1 lepB-2 TRUE 0.987 1.000 0.273 0.005   NA
 5587992 5587993 BRE_36 BRE_37   smpB TRUE 0.841 3.000 0.008 NA   NA
 5587994 5587995 BRE_38 BRE_39   parC TRUE 0.672 21.000 0.016 NA   NA
 5587995 5587996 BRE_39 BRE_40 parC parE TRUE 0.991 0.000 0.110 0.006 Y NA
 5587996 5587997 BRE_40 BRE_41 parE plsC TRUE 0.790 12.000 0.064 1.000 N NA
 5587997 5587998 BRE_41 BRE_42 plsC   TRUE 0.946 8.000 0.462 NA   NA
 5587998 5587999 BRE_42 BRE_43     FALSE 0.451 63.000 0.333 NA   NA
 5588001 5588002 BRE_45 BRE_46 phoU   TRUE 0.922 7.000 0.164 NA   NA
 5588002 5588003 BRE_46 BRE_47     TRUE 0.938 -3.000 0.900 NA   NA
 5588003 5588004 BRE_47 BRE_48     TRUE 0.794 28.000 0.310 NA   NA
 5588009 5588010 BRE_53 BRE_54     FALSE 0.478 45.000 0.035 NA   NA
 5588013 5588014 BRE_57 BRE_58   tpi TRUE 0.811 6.000 0.044 1.000 N NA
 5588014 5588015 BRE_58 BRE_59 tpi pgk TRUE 0.969 2.000 0.141 1.000 Y NA
 5588015 5588016 BRE_59 BRE_60 pgk gap TRUE 0.950 30.000 0.003 0.014 Y NA
 5588016 5588017 BRE_60 BRE_61 gap   FALSE 0.432 73.000 0.300 1.000   NA
 5588017 5588018 BRE_61 BRE_62   tlyC TRUE 0.846 -3.000 0.025 1.000   NA
 5588018 5588019 BRE_62 BRE_63 tlyC   TRUE 0.887 -3.000 0.222 NA   NA
 5588019 5588020 BRE_63 BRE_64   trxA FALSE 0.134 87.000 0.009 NA   NA
 5588022 5588023 BRE_66 BRE_67   fmt TRUE 0.664 28.000 0.015 1.000   NA
 5588023 5588024 BRE_67 BRE_68 fmt def TRUE 0.972 -3.000 0.026 0.096 Y NA
 5588024 5588025 BRE_68 BRE_69 def   TRUE 0.765 28.000 0.205 NA   NA
 5588025 5588026 BRE_69 BRE_70     TRUE 0.850 -3.000 0.066 NA   NA
 5588027 5588028 BRE_71 BRE_72     TRUE 0.946 14.000 0.818 1.000   NA
 5588028 5588029 BRE_72 BRE_73     TRUE 0.757 25.000 0.052 1.000   NA
 5588029 5588030 BRE_73 BRE_74     TRUE 0.683 28.000 0.052 NA   NA
 5588030 5588031 BRE_74 BRE_75     TRUE 0.945 0.000 0.643 NA   NA
 5588031 5588032 BRE_75 BRE_76     TRUE 0.929 -3.000 0.643 NA   NA
 5588032 5588033 BRE_76 BRE_77   prfB FALSE 0.533 34.000 0.005 NA   NA
 5588033 5588034 BRE_77 BRE_78 prfB   TRUE 0.615 -18.000 0.010 NA   NA
 5588034 5588035 BRE_78 BRE_79   ftsY FALSE 0.327 52.000 0.009 NA   NA
 5588035 5588036 BRE_79 BRE_80 ftsY   TRUE 0.769 -3.000 0.008 NA   NA
 5588036 5588037 BRE_80 BRE_81     TRUE 0.868 -13.000 0.529 NA   NA
 5588037 5588038 BRE_81 BRE_82     TRUE 0.900 1.000 0.529 NA N NA
 5588038 5588039 BRE_82 BRE_83     TRUE 0.857 -3.000 0.500 NA N NA
 5588040 5588041 BRE_84 BRE_85     TRUE 0.920 -7.000 1.000 NA   NA
 5588042 5588043 BRE_86 BRE_87 nifS   FALSE 0.048 146.000 0.053 1.000 N NA
 5588043 5588044 BRE_87 BRE_88     FALSE 0.311 -45.000 0.006 1.000 N NA
 5588045 5588046 BRE_89 BRE_90 ldh lepA FALSE 0.017 178.000 0.009 1.000 N NA
 5588046 5588047 BRE_90 BRE_91 lepA   FALSE 0.040 179.000 0.009 NA   NA
 5588047 5588048 BRE_91 BRE_92   atpK TRUE 0.588 37.000 0.050 NA   NA
 5588048 5588049 BRE_92 BRE_93 atpK atpI TRUE 0.977 20.000 0.848 0.011   NA
 5588049 5588050 BRE_93 BRE_94 atpI atpD TRUE 0.993 5.000 0.270 0.011 Y NA
 5588050 5588051 BRE_94 BRE_95 atpD atpB TRUE 0.995 3.000 0.903 0.011 Y NA
 5588051 5588052 BRE_95 BRE_96 atpB atpA TRUE 0.995 4.000 0.806 0.011 Y NA
 5588052 5588053 BRE_96 BRE_97 atpA   TRUE 0.946 11.000 0.633 NA   NA
 5588053 5588054 BRE_97 BRE_98   atpE TRUE 0.952 10.000 0.667 NA   NA
 5588054 5588055 BRE_98 BRE_99 atpE   FALSE 0.181 107.000 0.175 NA   NA
 5588055 5588056 BRE_99 BRE_100     TRUE 0.913 3.000 0.000 NA   NA
 5588056 5588057 BRE_100 BRE_101     TRUE 0.664 -52.000 0.000 NA   NA
 5588057 5588058 BRE_101 BRE_102   murI TRUE 0.824 -3.000 0.015 1.000   NA
 5588059 5588060 BRE_103 BRE_104 asnS   TRUE 0.614 28.000 0.021 NA   NA
 5588061 5588062 BRE_105 BRE_106   htrA FALSE 0.054 350.000 0.000 1.000   NA
 5588062 5588063 BRE_106 BRE_107 htrA map TRUE 0.718 41.000 0.010 0.047 N NA
 5588063 5588064 BRE_107 BRE_108 map   TRUE 0.935 5.000 0.000 1.000   NA
 5588064 5588065 BRE_108 BRE_109   nusB TRUE 0.823 -13.000 0.000 1.000   NA
 5588065 5588066 BRE_109 BRE_110 nusB   FALSE 0.502 19.000 0.016 1.000 N NA
 5588066 5588067 BRE_110 BRE_111   fadA FALSE 0.074 91.000 0.025 1.000 N NA
 5588069 5588070 BRE_113 BRE_114 dnaB rplI FALSE 0.474 19.000 0.009 1.000 N NA
 5588070 5588071 BRE_114 BRE_115 rplI rpsR TRUE 0.987 14.000 0.499 0.060 Y NA
 5588071 5588072 BRE_115 BRE_116 rpsR ssb TRUE 0.645 13.000 0.019 1.000 N NA
 5588072 5588073 BRE_116 BRE_117 ssb rpsF TRUE 0.658 12.000 0.018 1.000 N NA
 5588073 5588074 BRE_117 BRE_118 rpsF   FALSE 0.042 683.000 0.000 NA   NA
 5588076 5588077 BRE_120 BRE_121   cdsA FALSE 0.512 17.000 0.014 1.000 N NA
 5588077 5588078 BRE_121 BRE_122 cdsA uppS TRUE 0.794 -112.000 0.027 1.000 Y NA
 5588078 5588079 BRE_122 BRE_123 uppS frr TRUE 0.920 5.000 0.409 1.000 N NA
 5588079 5588080 BRE_123 BRE_124 frr tsf TRUE 0.789 38.000 0.021 1.000 Y NA
 5588080 5588081 BRE_124 BRE_125 tsf rpsB TRUE 0.952 22.000 0.748 1.000 Y NA
 5588081 5588082 BRE_125 BRE_126 rpsB maf FALSE 0.148 36.000 0.008 NA N NA
 5588082 5588083 BRE_126 BRE_127 maf   TRUE 0.676 -10.000 0.008 NA   NA
 5588083 5588084 BRE_127 BRE_128     TRUE 0.940 14.000 1.000 NA   NA
 5588084 5588085 BRE_128 BRE_129     FALSE 0.144 120.000 0.000 NA   NA
 5588085 5588086 BRE_129 BRE_130   rpsA TRUE 0.858 -7.000 0.000 1.000   NA
 5588086 5588087 BRE_130 BRE_131 rpsA cmk TRUE 0.897 8.000 0.281 1.000 N NA
 5588087 5588088 BRE_131 BRE_132 cmk   TRUE 0.620 -3.000 0.019 1.000 N NA
 5588088 5588089 BRE_132 BRE_133     TRUE 0.665 -28.000 0.060 NA   NA
 5588089 5588090 BRE_133 BRE_134     TRUE 0.899 11.000 0.000 NA   NA
 5588090 5588091 BRE_134 BRE_135   greA TRUE 0.899 11.000 0.000 NA   NA
 5588091 5588092 BRE_135 BRE_136 greA   TRUE 0.674 36.000 0.054 1.000   NA
 5588096 5588097 BRE_140 BRE_141     FALSE 0.061 216.000 0.000 NA   NA
 5588097 5588098 BRE_141 BRE_142   acrB TRUE 0.901 13.000 0.250 NA   NA
 5588098 5588099 BRE_142 BRE_143 acrB mtrC TRUE 0.964 4.000 1.000 NA   NA
 5588099 5588100 BRE_143 BRE_144 mtrC   FALSE 0.115 180.000 0.273 1.000   NA
 5588102 5588103 BRE_146 BRE_147 proX proW TRUE 0.969 37.000 1.000 0.028 Y NA
 5588103 5588104 BRE_147 BRE_148 proW proV TRUE 0.977 7.000 0.333 1.000 Y NA
 5588104 5588105 BRE_148 BRE_149 proV flaB FALSE 0.181 125.000 0.750 1.000 N NA
 5588105 5588106 BRE_149 BRE_150 flaB fliD FALSE 0.267 128.000 0.049 1.000 Y NA
 5588107 5588108 BRE_151 BRE_152 nagA nagB TRUE 0.995 0.000 0.500 0.003 Y NA
 5588109 5588110 BRE_153 BRE_154 sodA secA TRUE 0.677 16.000 0.046 1.000 N NA
 5588111 5588112 BRE_155 BRE_156     TRUE 0.871 22.000 0.529 NA   NA
 5588112 5588113 BRE_156 BRE_157     TRUE 0.917 4.000 0.000 NA   NA
 5588113 5588114 BRE_157 BRE_158   alr FALSE 0.196 94.000 0.000 NA   NA
 5588117 5588118 BRE_161 BRE_162     FALSE 0.339 76.000 0.273 NA   NA
 5588118 5588119 BRE_162 BRE_163     TRUE 0.739 25.000 0.035 1.000   NA
 5588119 5588120 BRE_163 BRE_164     FALSE 0.377 62.000 0.000 NA   NA
 5588124 5588125 BRE_168 BRE_169     TRUE 0.883 -51.000 0.048 0.035   NA
 5588125 5588126 BRE_169 BRE_170     TRUE 0.873 -18.000 0.778 NA   NA
 5588126 5588127 BRE_170 BRE_171     TRUE 0.889 -3.000 0.229 NA   NA
 5588127 5588128 BRE_171 BRE_172     TRUE 0.732 -37.000 0.257 NA   NA
 5588128 5588129 BRE_172 BRE_173     TRUE 0.851 -3.000 0.068 NA   NA
 5588129 5588130 BRE_173 BRE_174   moxR TRUE 0.957 8.000 0.764 NA   NA
 5588130 5588131 BRE_174 BRE_175 moxR gidB FALSE 0.254 70.000 0.009 1.000   NA
 5588131 5588132 BRE_175 BRE_176 gidB gidA TRUE 0.878 -3.000 0.466 1.000 N NA
 5588132 5588133 BRE_176 BRE_177 gidA thdF TRUE 0.730 -15.000 0.020 1.000   NA
 5588134 5588135 BRE_178 BRE_179   flgK TRUE 0.972 19.000 0.321 0.007   NA
 5588135 5588136 BRE_179 BRE_180 flgK flgL TRUE 0.994 4.000 0.186 0.004 Y NA
 5588136 5588137 BRE_180 BRE_181 flgL   TRUE 0.939 2.000 0.385 NA   NA
 5588137 5588138 BRE_181 BRE_182   csrA TRUE 0.898 3.000 0.064 NA   NA
 5588139 5588140 BRE_183 BRE_184     TRUE 0.596 -46.000 0.003 1.000   NA
 5588140 5588141 BRE_184 BRE_185     TRUE 0.879 -3.000 0.167 NA   NA
 5588141 5588142 BRE_185 BRE_186   rplT FALSE 0.047 166.000 0.002 NA   NA
 5588142 5588143 BRE_186 BRE_187 rplT rpmI TRUE 0.982 21.000 0.928 0.058 Y NA
 5588143 5588144 BRE_187 BRE_188 rpmI infC TRUE 0.948 23.000 0.652 1.000 Y NA
 5588145 5588146 BRE_189 BRE_190     TRUE 0.954 0.000 1.000 NA   NA
 5588147 5588148 BRE_191 BRE_192     FALSE 0.347 -3.000 0.012 NA N NA
 5588149 5588150 BRE_193 BRE_194 prfA   TRUE 0.961 11.000 0.081 1.000 Y NA
 5588150 5588151 BRE_194 BRE_195   spoT FALSE 0.540 -16.000 0.035 1.000 N NA
 5588151 5588152 BRE_195 BRE_196 spoT   TRUE 0.857 -10.000 0.333 NA   NA
 5588153 5588154 BRE_197 BRE_198 ddlA murE TRUE 0.989 5.000 0.033 0.016 Y NA
 5588155 5588156 BRE_199 BRE_200     FALSE 0.220 89.000 0.000 NA   NA
 5588156 5588157 BRE_200 BRE_201   hflK FALSE 0.110 125.000 0.022 1.000   NA
 5588157 5588158 BRE_201 BRE_202 hflK hflC TRUE 0.994 1.000 0.947 0.017 Y NA
 5588158 5588159 BRE_202 BRE_203 hflC   FALSE 0.042 425.000 0.000 NA   NA
 5588159 5588160 BRE_203 BRE_204     FALSE 0.068 201.000 0.000 NA   NA
 5588162 5588163 BRE_206 BRE_207 gtaB   TRUE 0.950 1.000 0.643 NA   NA
 5588163 5588164 BRE_207 BRE_208     TRUE 0.676 50.000 0.667 NA   NA
 5588164 5588165 BRE_208 BRE_209   lmp1 TRUE 0.955 -7.000 0.000 0.035   NA
 5588165 5588166 BRE_209 BRE_210 lmp1 mutL TRUE 0.893 -3.000 0.000 1.000   NA
 5588166 5588167 BRE_210 BRE_211 mutL   TRUE 0.662 21.000 0.011 NA   NA
 5588167 5588168 BRE_211 BRE_212     FALSE 0.458 56.000 0.000 NA   NA
 5588169 5588170 BRE_213 BRE_214   efp TRUE 0.588 -22.000 0.009 NA   NA
 5588171 5588172 BRE_215 BRE_216 pstS pstC FALSE 0.329 88.000 0.019 NA Y NA
 5588172 5588173 BRE_216 BRE_217 pstC pstA TRUE 0.990 -3.000 0.219 0.004 Y NA
 5588173 5588174 BRE_217 BRE_218 pstA pstB TRUE 0.995 4.000 0.428 0.004 Y NA
 5588175 5588176 BRE_219 BRE_220 gufA alaS TRUE 0.655 28.000 0.009 1.000   NA
 5588176 5588177 BRE_220 BRE_221 alaS fliG-1 TRUE 0.857 0.000 0.009 1.000   NA
 5588177 5588178 BRE_221 BRE_222 fliG-1 pgl FALSE 0.463 -25.000 0.032 1.000 N NA
 5588178 5588179 BRE_222 BRE_223 pgl   TRUE 0.718 17.000 0.014 NA   NA
 5588182 5588183 BRE_226 BRE_227     TRUE 0.840 13.000 0.040 NA   NA
 5588184 5588185 BRE_228 BRE_229 rpmE rho FALSE 0.227 58.000 0.049 1.000 N NA
 5588185 5588186 BRE_229 BRE_230 rho   FALSE 0.024 87.000 0.010 NA N NA
 5588186 5588187 BRE_230 BRE_231     TRUE 0.907 4.000 0.476 NA N NA
 5588187 5588188 BRE_231 BRE_232   rpsT TRUE 0.632 12.000 0.015 1.000 N NA
 5588188 5588189 BRE_232 BRE_233 rpsT   TRUE 0.845 4.000 0.009 NA   NA
 5588189 5588190 BRE_233 BRE_234     TRUE 0.816 11.000 0.009 NA   NA
 5588190 5588191 BRE_234 BRE_235     TRUE 0.684 25.000 0.007 1.000   NA
 5588193 5588194 BRE_237 BRE_238   dck FALSE 0.549 60.000 0.571 NA   NA
 5588195 5588196 BRE_239 BRE_240 glpF   FALSE 0.347 64.000 0.000 NA   NA
 5588196 5588197 BRE_240 BRE_241   glpT FALSE 0.129 128.000 0.000 NA   NA
 5588197 5588198 BRE_241 BRE_242 glpT glpQ FALSE 0.252 86.000 0.396 1.000 N NA
 5588198 5588199 BRE_242 BRE_243 glpQ   TRUE 0.698 33.000 0.000 NA   NA
 5588200 5588201 BRE_244 BRE_245     TRUE 0.774 -10.000 0.062 NA   NA
 5588201 5588202 BRE_245 BRE_246     TRUE 0.975 1.000 0.562 NA Y NA
 5588203 5588204 BRE_247 BRE_248   pepF FALSE 0.030 126.000 0.010 1.000 N NA
 5588204 5588205 BRE_248 BRE_249 pepF   TRUE 0.727 15.000 0.061 1.000 N NA
 5588205 5588206 BRE_249 BRE_250   dedA TRUE 0.879 11.000 0.061 NA   NA
 5588206 5588207 BRE_250 BRE_251 dedA   TRUE 0.815 19.000 0.000 NA   NA
 5588207 5588208 BRE_251 BRE_252   leuS FALSE 0.186 98.000 0.000 NA   NA
 5588208 5588209 BRE_252 BRE_253 leuS   TRUE 0.864 11.000 0.003 1.000   NA
 5588211 5588212 BRE_255 BRE_256   recJ1 TRUE 0.683 -19.000 0.006 1.000   NA
 5588212 5588213 BRE_256 BRE_257 recJ1   TRUE 0.680 0.000 0.018 1.000 N NA
 5588213 5588214 BRE_257 BRE_258   rpsU_1 TRUE 0.822 19.000 0.059 1.000   NA
 5588215 5588216 BRE_259 BRE_260 ftsK1   TRUE 0.855 15.000 0.000 NA   NA
 5588217 5588218 BRE_261 BRE_262     TRUE 0.913 3.000 0.000 NA   NA
 5588218 5588219 BRE_262 BRE_263   rpsU_2 TRUE 0.822 19.000 0.059 1.000   NA
 5588220 5588221 BRE_264 BRE_265 ftsK2 bacA TRUE 0.605 13.000 0.014 1.000 N NA
 5588221 5588222 BRE_265 BRE_266 bacA   TRUE 0.868 14.000 0.000 NA   NA
 5588222 5588223 BRE_266 BRE_267     TRUE 0.880 -19.000 1.000 NA   NA
 5588227 5588228 BRE_271 BRE_272 dnaK-1   TRUE 0.888 -3.000 0.225 NA   NA
 5588228 5588229 BRE_272 BRE_273     TRUE 0.904 21.000 1.000 NA   NA
 5588229 5588230 BRE_273 BRE_274     TRUE 0.837 24.000 0.391 NA   NA
 5588230 5588231 BRE_274 BRE_275     TRUE 0.913 3.000 0.000 NA   NA
 5588231 5588232 BRE_275 BRE_276   ylxH-1 TRUE 0.883 7.000 0.035 NA   NA
 5588232 5588233 BRE_276 BRE_277 ylxH-1 flhF TRUE 0.907 10.000 0.382 1.000 N NA
 5588233 5588234 BRE_277 BRE_278 flhF flhA TRUE 0.946 -10.000 0.440 1.000 Y NA
 5588234 5588235 BRE_278 BRE_279 flhA flhB TRUE 0.989 13.000 0.207 0.011 Y NA
 5588235 5588236 BRE_279 BRE_280 flhB fliR TRUE 0.959 -3.000 0.259 1.000 Y NA
 5588236 5588237 BRE_280 BRE_281 fliR fliQ TRUE 0.986 17.000 0.181 0.006 Y NA
 5588237 5588238 BRE_281 BRE_282 fliQ fliP TRUE 0.991 9.000 0.101 0.011 Y NA
 5588238 5588239 BRE_282 BRE_283 fliP fliZ TRUE 0.869 10.000 0.032 NA   NA
 5588239 5588240 BRE_283 BRE_284 fliZ fliN TRUE 0.777 -7.000 0.042 NA   NA
 5588240 5588241 BRE_284 BRE_285 fliN fliM TRUE 0.960 47.000 0.508 0.004 Y NA
 5588241 5588242 BRE_285 BRE_286 fliM fliL TRUE 0.981 20.000 0.067 0.004 Y NA
 5588242 5588243 BRE_286 BRE_287 fliL motB TRUE 0.874 44.000 0.615 1.000 Y NA
 5588243 5588244 BRE_287 BRE_288 motB motA TRUE 0.973 0.000 0.383 1.000 Y NA
 5588244 5588245 BRE_288 BRE_289 motA flbD TRUE 0.954 -3.000 0.301 NA Y NA
 5588245 5588246 BRE_289 BRE_290 flbD flgE TRUE 0.953 17.000 0.545 NA Y NA
 5588246 5588247 BRE_290 BRE_291 flgE flgD TRUE 0.972 5.000 0.298 NA Y NA
 5588247 5588248 BRE_291 BRE_292 flgD flbC TRUE 0.850 13.000 0.053 NA   NA
 5588248 5588249 BRE_292 BRE_293 flbC flbB TRUE 0.964 4.000 1.000 NA   NA
 5588249 5588250 BRE_293 BRE_294 flbB flbA TRUE 0.920 -7.000 1.000 NA   NA
 5588250 5588251 BRE_294 BRE_295 flbA fliI TRUE 0.918 -3.000 0.474 NA   NA
 5588251 5588252 BRE_295 BRE_296 fliI fliH TRUE 0.952 14.000 0.124 1.000 Y NA
 5588252 5588253 BRE_296 BRE_297 fliH fliG-2 TRUE 0.975 9.000 0.308 1.000 Y NA
 5588253 5588254 BRE_297 BRE_298 fliG-2 fliF TRUE 0.987 16.000 0.477 0.019 Y NA
 5588254 5588255 BRE_298 BRE_299 fliF fliE TRUE 0.985 14.000 0.164 0.019 Y NA
 5588255 5588256 BRE_299 BRE_300 fliE flgC TRUE 0.985 16.000 0.156 0.011 Y NA
 5588256 5588257 BRE_300 BRE_301 flgC flgB TRUE 0.986 23.000 0.804 0.011 Y NA
 5588257 5588258 BRE_301 BRE_302 flgB hslU FALSE 0.384 33.000 0.021 1.000 N NA
 5588258 5588259 BRE_302 BRE_303 hslU hslV TRUE 0.972 -3.000 0.752 1.000 Y NA
 5588259 5588260 BRE_303 BRE_304 hslV   TRUE 0.855 15.000 0.000 NA   NA
 5588260 5588261 BRE_304 BRE_305     TRUE 0.918 6.000 0.000 NA   NA
 5588261 5588262 BRE_305 BRE_306   ftsZ TRUE 0.874 1.000 0.002 1.000   NA
 5588262 5588263 BRE_306 BRE_307 ftsZ ftsA TRUE 0.945 21.000 0.460 1.000 Y NA
 5588263 5588264 BRE_307 BRE_308 ftsA divIB TRUE 0.871 0.000 0.389 NA N NA
 5588264 5588265 BRE_308 BRE_309 divIB ftsW FALSE 0.184 32.000 0.015 NA N NA
 5588265 5588266 BRE_309 BRE_310 ftsW mraY TRUE 0.949 11.000 0.018 0.015 N NA
 5588266 5588267 BRE_310 BRE_311 mraY murF TRUE 0.960 24.000 0.018 0.015 Y NA
 5588267 5588268 BRE_311 BRE_312 murF   TRUE 0.840 16.000 0.108 NA   NA
 5588268 5588269 BRE_312 BRE_313     TRUE 0.704 -7.000 0.009 NA   NA
 5588269 5588270 BRE_313 BRE_314     TRUE 0.704 -7.000 0.009 NA   NA
 5588270 5588271 BRE_314 BRE_315     TRUE 0.962 4.000 0.900 NA   NA
 5588271 5588272 BRE_315 BRE_316     TRUE 0.950 11.000 0.800 NA   NA
 5588272 5588273 BRE_316 BRE_317   recN TRUE 0.709 32.000 0.000 NA   NA
 5588273 5588274 BRE_317 BRE_318 recN   FALSE 0.362 27.000 0.031 NA N NA
 5588274 5588275 BRE_318 BRE_319   cheW-1 TRUE 0.561 -67.000 0.191 1.000 N NA
 5588275 5588276 BRE_319 BRE_320 cheW-1 ftsJ FALSE 0.444 41.000 0.188 NA N NA
 5588277 5588278 BRE_321 BRE_322 ispB   TRUE 0.893 -3.000 0.000 1.000   NA
 5588279 5588280 BRE_323 BRE_324     TRUE 0.945 1.000 0.529 NA   NA
 5588280 5588281 BRE_324 BRE_325   mglA-1 TRUE 0.920 -3.000 0.321 1.000   NA
 5588281 5588282 BRE_325 BRE_326 mglA-1 tpn38b TRUE 0.947 4.000 0.281 1.000   NA
 5588282 5588283 BRE_326 BRE_327 tpn38b   FALSE 0.042 400.000 0.000 NA   NA
 5588284 5588285 BRE_328 BRE_329     FALSE 0.196 94.000 0.000 NA   NA
 5588286 5588287 BRE_330 BRE_331     FALSE 0.513 64.000 0.643 NA   NA
 5588287 5588288 BRE_331 BRE_332     TRUE 0.882 15.000 0.000 1.000   NA
 5588289 5588290 BRE_333 BRE_334   oppA-2 FALSE 0.044 346.000 0.000 NA   NA
 5588290 5588291 BRE_334 BRE_335 oppA-2 oppB-1 FALSE 0.291 365.000 0.000 0.026 Y NA
 5588291 5588292 BRE_335 BRE_336 oppB-1 oppC-1 TRUE 0.937 -16.000 0.096 0.026   NA
 5588292 5588293 BRE_336 BRE_337 oppC-1 oppD TRUE 0.919 11.000 0.123 1.000   NA
 5588293 5588294 BRE_337 BRE_338 oppD oppF TRUE 0.987 1.000 0.138 0.003   NA
 5588297 5588298 BRE_341 BRE_342 rpsI rplM TRUE 0.991 11.000 0.601 0.054 Y NA
 5588298 5588299 BRE_342 BRE_343 rplM   FALSE 0.319 80.000 0.000 1.000   NA
 5588299 5588300 BRE_343 BRE_344   gatB TRUE 0.858 -7.000 0.000 1.000   NA
 5588300 5588301 BRE_344 BRE_345 gatB gatA TRUE 0.988 -10.000 0.492 0.004 Y NA
 5588301 5588302 BRE_345 BRE_346 gatA gatC TRUE 0.994 12.000 0.643 0.004 Y NA
 5588302 5588303 BRE_346 BRE_347 gatC uvrD TRUE 0.684 10.000 0.015 1.000 N NA
 5588303 5588304 BRE_347 BRE_348 uvrD   TRUE 0.956 -3.000 0.030 0.044   NA
 5588304 5588305 BRE_348 BRE_349     TRUE 0.917 12.000 0.173 1.000   NA
 5588306 5588307 BRE_350 BRE_351   pyk FALSE 0.025 114.000 0.023 NA N NA
 5588308 5588309 BRE_352 BRE_353 rpmB   TRUE 0.830 10.000 0.009 NA   NA
 5588311 5588312 BRE_355 BRE_356     TRUE 0.958 6.000 0.727 NA   NA
 5588312 5588313 BRE_356 BRE_357     TRUE 0.702 27.000 0.055 NA   NA
 5588313 5588314 BRE_357 BRE_358     FALSE 0.419 45.000 0.018 NA   NA
 5588314 5588315 BRE_358 BRE_359     TRUE 0.710 -7.000 0.006 NA   NA
 5588315 5588316 BRE_359 BRE_360   ctp TRUE 0.883 4.000 0.033 NA   NA
 5588317 5588318 BRE_361 BRE_362   ylxH-2 TRUE 0.947 4.000 0.444 NA   NA
 5588318 5588319 BRE_362 BRE_363 ylxH-2 lgt TRUE 0.700 11.000 0.021 1.000 N NA
 5588319 5588320 BRE_363 BRE_364 lgt   FALSE 0.057 58.000 0.013 NA N NA
 5588320 5588321 BRE_364 BRE_365   yscI FALSE 0.011 133.000 0.014 NA N NA
 5588321 5588322 BRE_365 BRE_366 yscI   TRUE 0.636 -49.000 0.027 1.000   NA
 5588323 5588324 BRE_367 BRE_368 gpsA   TRUE 0.768 24.000 0.000 NA   NA
 5588324 5588325 BRE_368 BRE_369   tyrS TRUE 0.804 -10.000 0.000 NA   NA
 5588325 5588326 BRE_369 BRE_370 tyrS glyS TRUE 0.960 5.000 0.023 1.000 Y NA
 5588326 5588327 BRE_370 BRE_371 glyS gltX TRUE 0.927 15.000 0.025 1.000 Y NA
 5588327 5588328 BRE_371 BRE_372 gltX   TRUE 0.568 -31.000 0.020 NA   NA
 5588329 5588330 BRE_373 BRE_374   pfs-1 TRUE 0.876 14.000 0.450 1.000 N NA
 5588330 5588331 BRE_374 BRE_375 pfs-1 metK TRUE 0.893 17.000 1.000 1.000 N NA
 5588331 5588332 BRE_375 BRE_376 metK   FALSE 0.363 -87.000 0.029 1.000 N NA
 5588333 5588334 BRE_377 BRE_378 pkcI mgtE TRUE 0.841 36.000 0.051 0.015 N NA
 5588334 5588335 BRE_378 BRE_379 mgtE   FALSE 0.436 55.000 0.300 1.000 N NA
 5588335 5588336 BRE_379 BRE_380   bmpA-1 FALSE 0.064 274.000 0.000 1.000   NA
 5588336 5588337 BRE_380 BRE_381 bmpA-1 bmpC TRUE 0.910 56.000 1.000 0.007   NA
 5588337 5588338 BRE_381 BRE_382 bmpC bmpA-2 FALSE 0.460 159.000 0.333 0.007   NA
 5588338 5588339 BRE_382 BRE_383 bmpA-2 bmpD TRUE 0.964 24.000 0.333 0.007   NA
 5588339 5588340 BRE_383 BRE_384 bmpD rpsG FALSE 0.267 64.000 0.009 1.000   NA
 5588340 5588341 BRE_384 BRE_385 rpsG rpsL TRUE 0.987 15.000 0.224 0.011 Y NA
 5588341 5588342 BRE_385 BRE_386 rpsL rpoC FALSE 0.167 63.000 0.035 1.000 N NA
 5588342 5588343 BRE_386 BRE_387 rpoC rpoB TRUE 0.994 15.000 0.851 0.003 Y NA
 5588343 5588344 BRE_387 BRE_388 rpoB rplL FALSE 0.197 86.000 0.223 1.000 N NA
 5588344 5588345 BRE_388 BRE_389 rplL rplJ TRUE 0.858 74.000 0.884 0.054 Y NA
 5588345 5588346 BRE_389 BRE_390 rplJ rplA TRUE 0.987 11.000 0.302 0.072 Y NA
 5588346 5588347 BRE_390 BRE_391 rplA rplK TRUE 0.991 0.000 0.838 0.072 Y NA
 5588347 5588348 BRE_391 BRE_392 rplK nusG FALSE 0.537 56.000 0.681 1.000 N NA
 5588348 5588349 BRE_392 BRE_393 nusG secE TRUE 0.960 11.000 0.843 1.000   NA
 5588349 5588350 BRE_393 BRE_394 secE   TRUE 0.714 31.000 0.000 NA   NA
 5588350 5588351 BRE_394 BRE_395   rpmG TRUE 0.899 11.000 0.000 NA   NA
 5588351 5588352 BRE_395 BRE_396 rpmG   TRUE 0.768 24.000 0.000 NA   NA
 5588352 5588353 BRE_396 BRE_397     FALSE 0.171 103.000 0.000 NA   NA
 5588353 5588354 BRE_397 BRE_398     TRUE 0.923 11.000 0.300 NA   NA
 5588355 5588356 BRE_399 BRE_400     TRUE 0.879 13.000 0.000 NA   NA
 5588356 5588357 BRE_400 BRE_401     FALSE 0.102 150.000 0.000 NA   NA
 5588359 5588360 BRE_403 BRE_404     TRUE 0.888 24.000 1.000 NA   NA
 5588361 5588362 BRE_405 BRE_406 manA fruA-1 FALSE 0.204 113.000 0.167 1.000   NA
 5588363 5588364 BRE_407 BRE_408   nucA TRUE 0.876 -3.000 0.155 NA   NA
 5588364 5588365 BRE_408 BRE_409 nucA   TRUE 0.876 -3.000 0.155 NA   NA
 5588366 5588367 BRE_410 BRE_411     TRUE 0.775 0.000 0.107 NA N NA
 5588368 5588369 BRE_412 BRE_413 cheR-2 cheB-1 TRUE 0.897 36.000 0.450 1.000 Y NA
 5588369 5588370 BRE_413 BRE_414 cheB-1 traB TRUE 0.792 24.000 0.073 1.000   NA
 5588370 5588371 BRE_414 BRE_415 traB adk TRUE 0.563 40.000 0.022 1.000   NA
 5588371 5588372 BRE_415 BRE_416 adk   FALSE 0.191 95.000 0.000 NA   NA
 5588373 5588374 BRE_417 BRE_418 rrp-1   TRUE 0.990 -3.000 0.429 0.011 Y NA
 5588374 5588375 BRE_418 BRE_419     FALSE 0.423 58.000 0.000 NA   NA
 5588375 5588376 BRE_419 BRE_420     TRUE 0.804 20.000 0.000 NA   NA
 5588376 5588377 BRE_420 BRE_421     FALSE 0.111 139.000 0.000 NA   NA
 5588378 5588379 BRE_422 BRE_423 hpt purA TRUE 0.950 10.000 0.008 1.000 Y NA
 5588379 5588380 BRE_423 BRE_424 purA purB TRUE 0.892 -15.000 0.038 1.000 Y NA
 5588383 5588384 BRE_427 BRE_428     FALSE 0.249 86.000 0.000 NA   NA
 5588384 5588385 BRE_428 BRE_429     FALSE 0.042 495.000 0.000 NA   NA
 5588388 5588389 BRE_432 BRE_433 pepQ   FALSE 0.081 173.000 0.000 NA   NA
 5588390 5588391 BRE_434 BRE_435 spo0J gyrA FALSE 0.025 137.000 0.009 1.000 N NA
 5588391 5588392 BRE_435 BRE_436 gyrA gyrB TRUE 0.991 -3.000 0.306 0.005 Y NA
 5588393 5588394 BRE_437 BRE_438 dnaA dnaN FALSE 0.177 264.000 0.328 1.000 Y NA
 5588394 5588395 BRE_438 BRE_439 dnaN recF TRUE 0.938 21.000 0.318 1.000 Y NA
 5588395 5588396 BRE_439 BRE_440 recF   TRUE 0.614 -19.000 0.004 NA   NA
 5588396 5588397 BRE_440 BRE_441   rpmH FALSE 0.104 95.000 0.010 NA   NA
 5588397 5588398 BRE_441 BRE_442 rpmH rnpA TRUE 0.888 -19.000 0.787 1.000   NA
 5588398 5588399 BRE_442 BRE_443 rnpA   TRUE 0.787 -3.000 0.105 1.000 N NA
 5588399 5588400 BRE_443 BRE_444   jag TRUE 0.911 -3.000 0.254 1.000   NA
 5588400 5588401 BRE_444 BRE_445 jag   FALSE 0.389 57.000 0.024 1.000   NA
 5588401 5588402 BRE_445 BRE_446   fba FALSE 0.210 139.000 0.025 1.000 Y NA
 5588402 5588403 BRE_446 BRE_447 fba   FALSE 0.025 232.000 0.000 NA N NA
 5588404 5588405 BRE_448 BRE_449 aspS napA_1 TRUE 0.704 4.000 0.007 1.000 N NA
 5588405 5588406 BRE_449 BRE_450 napA_1 ptsH-1 TRUE 0.942 -3.000 0.029 0.014 N NA
 5588406 5588407 BRE_450 BRE_451 ptsH-1   FALSE 0.540 15.000 0.033 NA N NA
 5588407 5588408 BRE_451 BRE_452   ntrA FALSE 0.462 -25.000 0.071 NA N NA
 5588408 5588409 BRE_452 BRE_453 ntrA   TRUE 0.810 3.000 0.050 1.000 N NA
 5588409 5588410 BRE_453 BRE_454     TRUE 0.976 -34.000 0.310 0.003 Y NA
 5588415 5588416 BRE_459 BRE_460     TRUE 0.737 -64.000 0.360 NA   NA
 5588416 5588417 BRE_460 BRE_461     FALSE 0.332 70.000 0.000 NA   NA
 5588417 5588418 BRE_461 BRE_462     FALSE 0.340 66.000 0.000 NA   NA
 5588420 5588421 BRE_464 BRE_465     TRUE 0.843 16.000 0.000 NA   NA
 5588421 5588422 BRE_465 BRE_466   dnaX FALSE 0.054 247.000 0.000 NA   NA
 5588422 5588423 BRE_466 BRE_467 dnaX   TRUE 0.943 3.000 0.411 NA   NA
 5588423 5588424 BRE_467 BRE_468   recR TRUE 0.955 4.000 0.604 NA   NA
 5588424 5588425 BRE_468 BRE_469 recR ndk FALSE 0.032 252.000 0.000 1.000 N NA
 5588425 5588426 BRE_469 BRE_470 ndk   TRUE 0.712 4.000 0.003 1.000 N NA
 5588426 5588427 BRE_470 BRE_471     FALSE 0.062 214.000 0.000 NA   NA
 5588427 5588428 BRE_471 BRE_472     TRUE 0.781 -3.000 0.018 NA   NA
 5588428 5588429 BRE_472 BRE_473     TRUE 0.773 -64.000 0.543 NA   NA
 5588429 5588430 BRE_473 BRE_474     TRUE 0.767 -3.000 0.011 NA   NA
 5588430 5588431 BRE_474 BRE_475     TRUE 0.834 2.000 0.011 NA   NA
 5588431 5588432 BRE_475 BRE_476   lsp TRUE 0.883 10.000 0.050 NA   NA
 5588432 5588433 BRE_476 BRE_477 lsp   TRUE 0.890 -3.000 0.237 NA   NA
 5588433 5588434 BRE_477 BRE_478     TRUE 0.781 15.000 0.024 NA   NA
 5588434 5588435 BRE_478 BRE_479   murA FALSE 0.291 59.000 0.024 NA   NA
 5588435 5588436 BRE_479 BRE_480 murA   FALSE 0.034 237.000 0.000 1.000 N NA
 5588438 5588439 BRE_482 BRE_483 tuf rpsJ TRUE 0.826 46.000 0.318 1.000 Y NA
 5588439 5588440 BRE_483 BRE_484 rpsJ rplC TRUE 0.952 34.000 0.307 0.069 Y NA
 5588440 5588441 BRE_484 BRE_485 rplC rplD TRUE 0.985 2.000 0.040 0.051 Y NA
 5588441 5588442 BRE_485 BRE_486 rplD rplW TRUE 0.934 22.000 0.307 1.000 Y NA
 5588442 5588443 BRE_486 BRE_487 rplW rplB TRUE 0.961 19.000 0.849 1.000 Y NA
 5588443 5588444 BRE_487 BRE_488 rplB rpsS TRUE 0.992 10.000 0.820 0.069 Y NA
 5588444 5588445 BRE_488 BRE_489 rpsS rplV TRUE 0.993 7.000 0.769 0.069 Y NA
 5588445 5588446 BRE_489 BRE_490 rplV rpsC TRUE 0.993 4.000 0.719 0.069 Y NA
 5588446 5588447 BRE_490 BRE_491 rpsC rplP TRUE 0.983 19.000 0.828 0.069 Y NA
 5588447 5588448 BRE_491 BRE_492 rplP rpmC TRUE 0.994 4.000 0.802 0.051 Y NA
 5588448 5588449 BRE_492 BRE_493 rpmC rpsQ TRUE 0.994 6.000 0.828 0.051 Y NA
 5588449 5588450 BRE_493 BRE_494 rpsQ rplN TRUE 0.936 48.000 0.791 0.069 Y NA
 5588450 5588451 BRE_494 BRE_495 rplN rplX TRUE 0.991 11.000 0.810 0.069 Y NA
 5588451 5588452 BRE_495 BRE_496 rplX rplE TRUE 0.994 4.000 0.758 0.051 Y NA
 5588452 5588453 BRE_496 BRE_497 rplE rpsN TRUE 0.986 15.000 0.496 0.051 Y NA
 5588453 5588454 BRE_497 BRE_498 rpsN rpsH TRUE 0.991 10.000 0.473 0.051 Y NA
 5588454 5588455 BRE_498 BRE_499 rpsH rplF TRUE 0.983 20.000 0.808 0.051 Y NA
 5588455 5588456 BRE_499 BRE_500 rplF rplR TRUE 0.986 18.000 0.815 0.051 Y NA
 5588456 5588457 BRE_500 BRE_501 rplR rpsE TRUE 0.990 12.000 0.814 0.069 Y NA
 5588457 5588458 BRE_501 BRE_502 rpsE rpmD TRUE 0.993 4.000 0.789 0.069 Y NA
 5588458 5588459 BRE_502 BRE_503 rpmD rplO TRUE 0.989 -7.000 0.653 0.009 Y NA
 5588459 5588460 BRE_503 BRE_504 rplO secY TRUE 0.911 13.000 0.730 1.000 N NA
 5588460 5588461 BRE_504 BRE_505 secY rpmJ TRUE 0.921 10.000 0.089 1.000   NA
 5588461 5588462 BRE_505 BRE_506 rpmJ rpsM TRUE 0.978 10.000 0.194 0.051   NA
 5588462 5588463 BRE_506 BRE_507 rpsM rpsK TRUE 0.973 31.000 0.810 0.051 Y NA
 5588463 5588464 BRE_507 BRE_508 rpsK rpoA TRUE 0.826 16.000 0.308 1.000 N NA
 5588464 5588465 BRE_508 BRE_509 rpoA rplQ TRUE 0.873 19.000 0.873 1.000 N NA
 5588465 5588466 BRE_509 BRE_510 rplQ   FALSE 0.221 75.000 0.009 1.000   NA
 5588466 5588467 BRE_510 BRE_511     TRUE 0.743 -31.000 0.245 NA   NA
 5588467 5588468 BRE_511 BRE_512   tlyA TRUE 0.631 -19.000 0.019 NA   NA
 5588470 5588471 BRE_514 BRE_515     TRUE 0.766 -3.000 0.009 NA   NA
 5588471 5588472 BRE_515 BRE_516     TRUE 0.947 6.000 0.429 NA   NA
 5588472 5588473 BRE_516 BRE_517     TRUE 0.806 19.000 0.095 NA   NA
 5588473 5588474 BRE_517 BRE_518   pheS TRUE 0.825 11.000 0.002 NA   NA
 5588474 5588475 BRE_518 BRE_519 pheS pheT TRUE 0.984 -7.000 0.046 0.003 Y NA
 5588475 5588476 BRE_519 BRE_520 pheT trxB FALSE 0.108 89.000 0.053 1.000 N NA
 5588477 5588478 BRE_521 BRE_522 yacO dnaJ-1 TRUE 0.680 2.000 0.014 1.000 N NA
 5588478 5588479 BRE_522 BRE_523 dnaJ-1 dnaK-2 TRUE 0.992 0.000 0.196 0.006 Y NA
 5588479 5588480 BRE_523 BRE_524 dnaK-2 grpE TRUE 0.944 44.000 0.224 0.013 Y NA
 5588481 5588482 BRE_525 BRE_526     FALSE 0.526 -13.000 0.025 1.000 N NA
 5588484 5588485 BRE_528 BRE_529     TRUE 0.672 -10.000 0.012 NA   NA
 5588486 5588487 BRE_530 BRE_531     TRUE 0.720 -19.000 0.063 NA   NA
 5588487 5588488 BRE_531 BRE_532     TRUE 0.941 3.000 0.375 NA   NA
 5588489 5588490 BRE_533 BRE_534 phnP exoA TRUE 0.848 12.000 0.015 1.000   NA
 5588490 5588491 BRE_534 BRE_535 exoA   TRUE 0.629 24.000 0.015 NA   NA
 5588491 5588492 BRE_535 BRE_536     TRUE 0.897 -3.000 0.290 NA   NA
 5588493 5588494 BRE_537 BRE_538     FALSE 0.405 59.000 0.000 NA   NA
 5588494 5588495 BRE_538 BRE_539     TRUE 0.913 8.000 0.000 NA   NA
 5588495 5588496 BRE_539 BRE_540     FALSE 0.204 92.000 0.000 NA   NA
 5588496 5588497 BRE_540 BRE_541     FALSE 0.523 49.000 0.000 NA   NA
 5588497 5588498 BRE_541 BRE_542     TRUE 0.711 -3.000 0.095 NA N NA
 5588498 5588499 BRE_542 BRE_543     FALSE 0.206 89.000 0.083 NA   NA
 5588499 5588500 BRE_543 BRE_544   fus-1 TRUE 0.826 13.000 0.029 NA   NA
 5588501 5588502 BRE_545 BRE_546     FALSE 0.080 203.000 0.222 NA   NA
 5588502 5588503 BRE_546 BRE_547     FALSE 0.168 104.000 0.000 NA   NA
 5588503 5588504 BRE_547 BRE_548     TRUE 0.660 55.000 0.778 NA   NA
 5588504 5588505 BRE_548 BRE_549   prs FALSE 0.113 158.000 0.222 NA   NA
 5588505 5588506 BRE_549 BRE_550 prs xylB TRUE 0.872 5.000 0.134 1.000 N NA
 5588507 5588508 BRE_551 BRE_552   coaE TRUE 0.815 0.000 0.008 NA   NA
 5588508 5588509 BRE_552 BRE_553 coaE polA TRUE 0.586 -21.000 0.068 1.000 N NA
 5588509 5588510 BRE_553 BRE_554 polA   TRUE 0.767 -3.000 0.009 NA   NA
 5588510 5588511 BRE_554 BRE_555   flaJ TRUE 0.803 -10.000 0.114 NA   NA
 5588511 5588512 BRE_555 BRE_556 flaJ cheY-1 TRUE 0.838 11.000 0.114 1.000 N NA
 5588515 5588516 BRE_559 BRE_560     TRUE 0.898 -13.000 1.000 NA   NA
 5588516 5588517 BRE_560 BRE_561     TRUE 0.961 -3.000 0.474 NA Y NA
 5588517 5588518 BRE_561 BRE_562   ptsH-2 FALSE 0.037 160.000 0.099 NA N NA
 5588518 5588519 BRE_562 BRE_563 ptsH-2 ptsI TRUE 0.990 1.000 0.099 0.014 Y NA
 5588519 5588520 BRE_563 BRE_564 ptsI crr TRUE 0.991 4.000 0.114 0.014 Y NA
 5588523 5588524 BRE_567 BRE_568     FALSE 0.177 124.000 0.300 NA   NA
 5588524 5588525 BRE_568 BRE_569     FALSE 0.062 215.000 0.000 NA   NA
 5588526 5588527 BRE_570 BRE_571 cheW-2   TRUE 0.935 6.000 0.273 NA   NA
 5588527 5588528 BRE_571 BRE_572   cheA-1 TRUE 0.829 24.000 0.333 NA   NA
 5588528 5588529 BRE_572 BRE_573 cheA-1 cheB-2 TRUE 0.915 62.000 0.692 0.012 Y NA
 5588529 5588530 BRE_573 BRE_574 cheB-2   TRUE 0.843 -21.000 0.562 NA   NA
 5588530 5588531 BRE_574 BRE_575   cheY-2 TRUE 0.767 37.000 0.500 NA   NA
 5588531 5588532 BRE_575 BRE_576 cheY-2   FALSE 0.341 43.000 0.035 1.000 N NA
 5588533 5588534 BRE_577 BRE_578   smbA TRUE 0.912 9.000 0.000 NA   NA
 5588535 5588536 BRE_579 BRE_580 lgtD   FALSE 0.289 62.000 0.310 NA N NA
 5588536 5588537 BRE_580 BRE_581     TRUE 0.872 -7.000 0.321 NA   NA
 5588537 5588538 BRE_581 BRE_582   pyrG FALSE 0.031 228.000 0.005 NA   NA
 5588538 5588539 BRE_582 BRE_583 pyrG   FALSE 0.229 63.000 0.003 NA   NA
 5588539 5588540 BRE_583 BRE_584   mcp-1 FALSE 0.208 109.000 0.300 NA   NA
 5588540 5588541 BRE_584 BRE_585 mcp-1 dnaE FALSE 0.099 124.000 0.010 1.000   NA
 5588541 5588542 BRE_585 BRE_586 dnaE   TRUE 0.845 12.000 0.009 1.000   NA
 5588542 5588543 BRE_586 BRE_587   recG TRUE 0.951 10.000 0.429 1.000   NA
 5588545 5588546 BRE_589 BRE_590   murD FALSE 0.385 25.000 0.010 1.000 N NA
 5588547 5588548 BRE_591 BRE_592 femA metG FALSE 0.520 22.000 0.024 1.000 N NA
 5588550 5588551 BRE_594 BRE_595 ksgA   FALSE 0.530 35.000 0.016 NA   NA
 5588552 5588553 BRE_596 BRE_597     TRUE 0.927 10.000 0.273 NA   NA
 5588554 5588555 BRE_598 BRE_599 argS   TRUE 0.708 -7.000 0.008 NA   NA
 5588555 5588556 BRE_599 BRE_600   mcp-2 TRUE 0.907 16.000 0.538 NA   NA
 5588559 5588560 BRE_603 BRE_604 cysS   TRUE 0.849 4.000 0.007 NA   NA
 5588560 5588561 BRE_604 BRE_605   glyA TRUE 0.790 -10.000 0.084 NA   NA
 5588561 5588562 BRE_605 BRE_606 glyA dnaJ TRUE 0.874 15.000 0.084 1.000   NA
 5588563 5588564 BRE_607 BRE_608   lctP FALSE 0.064 224.000 0.167 NA   NA
 5588565 5588566 BRE_609 BRE_610 dacA   FALSE 0.048 254.000 0.316 1.000 N NA
 5588566 5588567 BRE_610 BRE_611   pepD FALSE 0.047 179.000 0.000 1.000 N NA
 5588567 5588568 BRE_611 BRE_612 pepD   FALSE 0.173 102.000 0.000 NA   NA
 5588568 5588569 BRE_612 BRE_613     TRUE 0.815 19.000 0.000 NA   NA
 5588569 5588570 BRE_613 BRE_614     FALSE 0.423 58.000 0.000 NA   NA
 5588570 5588571 BRE_614 BRE_615     TRUE 0.918 6.000 0.000 NA   NA
 5588571 5588572 BRE_615 BRE_616   tig FALSE 0.523 49.000 0.000 NA   NA
 5588572 5588573 BRE_616 BRE_617 tig clpP-1 TRUE 0.972 0.000 0.351 1.000 Y NA
 5588573 5588574 BRE_617 BRE_618 clpP-1 clpX TRUE 0.935 23.000 0.352 1.000 Y NA
 5588574 5588575 BRE_618 BRE_619 clpX lon-2 TRUE 0.788 -55.000 0.015 1.000 Y NA
 5588576 5588577 BRE_620 BRE_621 rpsD   TRUE 0.815 19.000 0.000 NA   NA
 5588577 5588578 BRE_621 BRE_622     FALSE 0.458 56.000 0.000 NA   NA
 5588583 5588584 BRE_627 BRE_628   thiJ TRUE 0.834 17.000 0.000 NA   NA
 5588585 5588586 BRE_629 BRE_630 ackA mfd TRUE 0.643 11.000 0.009 1.000 N NA
 5588587 5588588 BRE_631 BRE_632     TRUE 0.676 -64.000 0.180 NA   NA
 5588588 5588589 BRE_632 BRE_633     FALSE 0.283 76.000 0.000 NA   NA
 5588594 5588595 BRE_638 BRE_639   recD FALSE 0.533 48.000 0.000 NA   NA
 5588595 5588596 BRE_639 BRE_640 recD recB TRUE 0.996 9.000 0.688 0.004 Y NA
 5588596 5588597 BRE_640 BRE_641 recB recC TRUE 0.996 7.000 0.542 0.004 Y NA
 5588597 5588598 BRE_641 BRE_642 recC   TRUE 0.698 5.000 0.011 1.000 N NA
 5588599 5588600 BRE_643 BRE_644 zwf nhaC-2 FALSE 0.018 925.000 0.000 NA N NA
 5588601 5588602 BRE_645 BRE_646 potD potC TRUE 0.987 12.000 0.131 0.023 Y NA
 5588602 5588603 BRE_646 BRE_647 potC potB TRUE 0.992 10.000 0.492 0.023 Y NA
 5588603 5588604 BRE_647 BRE_648 potB potA TRUE 0.995 6.000 0.928 0.023 Y NA
 5588604 5588605 BRE_648 BRE_649 potA   FALSE 0.196 87.000 0.021 1.000   NA
 5588606 5588607 BRE_650 BRE_651   ptsG TRUE 0.851 40.000 0.246 1.000 Y NA
 5588608 5588609 BRE_652 BRE_653   fur TRUE 0.784 13.000 0.184 NA N NA
 5588609 5588610 BRE_653 BRE_654 fur   FALSE 0.245 92.000 0.257 NA   NA
 5588611 5588612 BRE_655 BRE_656 groEL   FALSE 0.500 61.000 0.423 NA   NA
 5588612 5588613 BRE_656 BRE_657   yajC TRUE 0.730 16.000 0.013 NA   NA
 5588613 5588614 BRE_657 BRE_658 yajC secD FALSE 0.446 81.000 0.068 NA Y NA
 5588614 5588615 BRE_658 BRE_659 secD secF TRUE 0.984 -16.000 0.244 0.002 Y NA
 5588615 5588616 BRE_659 BRE_660 secF   TRUE 0.845 24.000 0.450 NA   NA
 5588621 5588622 BRE_665 BRE_666 lysS era FALSE 0.492 50.000 0.038 1.000   NA
 5588623 5588624 BRE_667 BRE_668     TRUE 0.937 13.000 0.727 NA   NA
 5588624 5588625 BRE_668 BRE_669     TRUE 0.807 -3.000 0.026 NA   NA
 5588627 5588628 BRE_671 BRE_672     TRUE 0.677 -37.000 0.105 NA   NA
 5588628 5588629 BRE_672 BRE_673     TRUE 0.741 -19.000 0.095 NA   NA
 5588629 5588630 BRE_673 BRE_674   flaA FALSE 0.371 77.000 0.391 NA   NA
 5588630 5588631 BRE_674 BRE_675 flaA cheA-2 FALSE 0.470 71.000 0.370 1.000   NA
 5588631 5588632 BRE_675 BRE_676 cheA-2 cheW-3 TRUE 0.993 6.000 0.436 0.021 Y NA
 5588632 5588633 BRE_676 BRE_677 cheW-3 cheX TRUE 0.966 12.000 0.436 NA Y NA
 5588633 5588634 BRE_677 BRE_678 cheX cheY3 FALSE 0.532 49.000 0.625 NA N NA
 5588635 5588636 BRE_679 BRE_680     TRUE 0.938 -3.000 0.889 NA   NA
 5588636 5588637 BRE_680 BRE_681     TRUE 0.840 -6.000 0.000 NA   NA
 5588637 5588638 BRE_681 BRE_682   gph TRUE 0.868 -3.000 0.000 NA   NA
 5588639 5588640 BRE_683 BRE_684 mglA rbsC-1 TRUE 0.956 4.000 0.438 1.000   NA
 5588640 5588641 BRE_684 BRE_685 rbsC-1 rbsC-2 TRUE 0.952 -28.000 0.720 0.022   NA
 5588641 5588642 BRE_685 BRE_686 rbsC-2 mcp-4 FALSE 0.190 168.000 0.032 0.090   NA
 5588642 5588643 BRE_686 BRE_687 mcp-4 mcp-5 TRUE 0.980 30.000 0.900 0.012 Y NA
 5588645 5588646 BRE_689 BRE_690     TRUE 0.883 -31.000 0.034 0.006 N NA
 5588646 5588647 BRE_690 BRE_691   mvaA TRUE 0.633 -10.000 0.053 1.000 N NA
 5588647 5588648 BRE_691 BRE_692 mvaA mvaD TRUE 0.961 2.000 0.048 1.000 Y NA
 5588648 5588649 BRE_692 BRE_693 mvaD   TRUE 0.979 -12.000 0.082 0.006 Y NA
 5588649 5588650 BRE_693 BRE_694   mvaK TRUE 0.992 1.000 0.109 0.006 Y NA
 5588651 5588652 BRE_695 BRE_696     TRUE 0.597 43.000 0.000 NA   NA
 5588653 5588654 BRE_697 BRE_698 napA_2 fus-2 FALSE 0.078 131.000 0.136 1.000 N NA
 5588654 5588655 BRE_698 BRE_699 fus-2 xylR-1 FALSE 0.022 277.000 0.000 NA N NA
 5588655 5588656 BRE_699 BRE_700 xylR-1 ffh FALSE 0.054 60.000 0.007 NA N NA
 5588656 5588657 BRE_700 BRE_701 ffh rpsP TRUE 0.865 -3.000 0.361 1.000 N NA
 5588657 5588658 BRE_701 BRE_702 rpsP   TRUE 0.949 10.000 0.385 1.000   NA
 5588658 5588659 BRE_702 BRE_703   rimM TRUE 0.951 4.000 0.324 1.000   NA
 5588659 5588660 BRE_703 BRE_704 rimM trmD TRUE 0.971 -3.000 0.672 1.000 Y NA
 5588660 5588661 BRE_704 BRE_705 trmD rplS TRUE 0.924 -25.000 0.567 1.000 Y NA
 5588661 5588662 BRE_705 BRE_706 rplS   FALSE 0.043 931.000 0.000 NA   NA
 5588662 5588663 BRE_706 BRE_707   kdtB TRUE 0.839 3.000 0.012 NA   NA
 5588663 5588664 BRE_707 BRE_708 kdtB rpmF FALSE 0.170 52.000 0.013 1.000 N NA
 5588664 5588665 BRE_708 BRE_709 rpmF   TRUE 0.701 2.000 0.017 1.000 N NA
 5588665 5588666 BRE_709 BRE_710   rnc TRUE 0.737 6.000 0.019 1.000 N NA
 5588668 5588669 BRE_712 BRE_713     TRUE 0.963 7.000 1.000 NA   NA
 5588669 5588670 BRE_713 BRE_714     FALSE 0.301 74.000 0.000 NA   NA
 5588670 5588671 BRE_714 BRE_715     TRUE 0.919 5.000 0.000 NA   NA
 5588671 5588672 BRE_715 BRE_716     FALSE 0.057 233.000 0.000 NA   NA
 5588672 5588673 BRE_716 BRE_717   dnaG TRUE 0.848 8.000 0.017 NA   NA
 5588673 5588674 BRE_717 BRE_718 dnaG rpoD TRUE 0.800 -7.000 0.299 1.000 N NA
 5588674 5588675 BRE_718 BRE_719 rpoD   TRUE 0.823 -3.000 0.036 NA   NA
 5588675 5588676 BRE_719 BRE_720     FALSE 0.042 395.000 0.000 NA   NA
 5588676 5588677 BRE_720 BRE_721   mreB-1 TRUE 0.836 13.000 0.014 1.000   NA
 5588677 5588678 BRE_721 BRE_722 mreB-1 mreC TRUE 0.935 3.000 0.689 1.000 N NA
 5588678 5588679 BRE_722 BRE_723 mreC   TRUE 0.766 -3.000 0.011 NA   NA
 5588679 5588680 BRE_723 BRE_724   pbp-2 TRUE 0.886 6.000 0.035 NA   NA
 5588680 5588681 BRE_724 BRE_725 pbp-2 mreB-2 TRUE 0.878 4.000 0.161 1.000 N NA
 5588681 5588682 BRE_725 BRE_726 mreB-2 thrZ FALSE 0.022 158.000 0.014 1.000 N NA
 5588682 5588683 BRE_726 BRE_727 thrZ   TRUE 0.672 2.000 0.010 1.000 N NA
 5588683 5588684 BRE_727 BRE_728     TRUE 0.602 -19.000 0.010 NA   NA
 5588686 5588687 BRE_730 BRE_731 ntpJ   TRUE 0.994 7.000 0.270 0.006 Y NA
 5588687 5588688 BRE_731 BRE_732   ylxH-3 TRUE 0.846 13.000 0.231 1.000 N NA
 5588688 5588689 BRE_732 BRE_733 ylxH-3 pfk TRUE 0.676 37.000 0.474 1.000 N NA
 5588690 5588691 BRE_734 BRE_735 nox gltP TRUE 0.895 13.000 0.085 1.000   NA
 5588691 5588692 BRE_735 BRE_736 gltP pgi TRUE 0.584 44.000 0.051 1.000   NA
 5588692 5588693 BRE_736 BRE_737 pgi   TRUE 0.731 37.000 0.200 1.000   NA
 5588693 5588694 BRE_737 BRE_738   pbp-3 TRUE 0.960 7.000 0.560 1.000   NA
 5588695 5588696 BRE_739 BRE_740     TRUE 0.770 -16.000 0.000 NA   NA
 5588700 5588701 BRE_744 BRE_745   valS TRUE 0.943 0.000 0.009 1.000 Y NA
 5588702 5588703 BRE_746 BRE_747   groES FALSE 0.071 196.000 0.000 NA   NA
 5588704 5588705 BRE_748 BRE_749     TRUE 0.682 23.000 0.023 NA   NA
 5588705 5588706 BRE_749 BRE_750     FALSE 0.168 129.000 0.318 NA   NA
 5588707 5588708 BRE_751 BRE_752     TRUE 0.908 10.000 0.000 NA   NA
 5588710 5588711 BRE_754 BRE_755 oppC-2 oppB-2 TRUE 0.985 0.000 0.600 0.022   NA
 5588711 5588712 BRE_755 BRE_756 oppB-2   TRUE 0.727 36.000 0.143 1.000   NA
 5588714 5588715 BRE_758 BRE_759     TRUE 0.692 -40.000 0.145 NA   NA
 5588715 5588716 BRE_759 BRE_760     TRUE 0.915 8.000 0.129 NA   NA
 5588716 5588717 BRE_760 BRE_761     TRUE 0.844 -3.000 0.061 NA   NA
 5588717 5588718 BRE_761 BRE_762     TRUE 0.731 22.000 0.016 1.000   NA
 5588718 5588719 BRE_762 BRE_763     FALSE 0.034 306.000 0.005 1.000   NA
 5588720 5588721 BRE_764 BRE_765 clpP-2   TRUE 0.560 -58.000 0.030 NA   NA
 5588721 5588722 BRE_765 BRE_766     FALSE 0.405 59.000 0.000 NA   NA
 5588723 5588724 BRE_767 BRE_768     TRUE 0.793 35.000 0.529 NA   NA
 5588726 5588727 BRE_770 BRE_771 rrp-2   TRUE 0.953 -7.000 0.432 1.000 Y NA
 5588727 5588728 BRE_771 BRE_772     TRUE 0.880 0.000 0.026 1.000   NA
 5588728 5588729 BRE_772 BRE_773     TRUE 0.794 18.000 0.023 1.000   NA
 5588729 5588730 BRE_773 BRE_774   murG TRUE 0.664 -31.000 0.026 1.000   NA
 5588730 5588731 BRE_774 BRE_775 murG pdxK FALSE 0.031 130.000 0.016 1.000 N NA
 5588731 5588732 BRE_775 BRE_776 pdxK gcp TRUE 0.576 -3.000 0.009 1.000 N NA
 5588732 5588733 BRE_776 BRE_777 gcp   TRUE 0.617 -31.000 0.013 1.000   NA
 5588733 5588734 BRE_777 BRE_778   rpoS FALSE 0.537 46.000 0.038 1.000   NA
 5588734 5588735 BRE_778 BRE_779 rpoS flgJ FALSE 0.165 112.000 0.136 NA   NA
 5588735 5588736 BRE_779 BRE_780 flgJ flgI TRUE 0.915 3.000 0.136 NA   NA
 5588736 5588737 BRE_780 BRE_781 flgI   FALSE 0.149 196.000 0.900 NA   NA
 5588737 5588738 BRE_781 BRE_782   flgG TRUE 0.849 -3.000 0.066 NA   NA
 5588738 5588739 BRE_782 BRE_783 flgG flhO TRUE 0.990 15.000 0.180 0.003 Y NA
 5588740 5588741 BRE_784 BRE_785   apt TRUE 0.849 5.000 0.011 NA   NA
 5588741 5588742 BRE_785 BRE_786 apt rplU FALSE 0.028 129.000 0.009 1.000 N NA
 5588742 5588743 BRE_786 BRE_787 rplU   TRUE 0.969 4.000 0.208 NA Y NA
 5588743 5588744 BRE_787 BRE_788   rpmA TRUE 0.911 -13.000 0.203 NA Y NA
 5588744 5588745 BRE_788 BRE_789 rpmA obg TRUE 0.654 50.000 0.335 1.000   NA
 5588745 5588746 BRE_789 BRE_790 obg nadD FALSE 0.198 92.000 0.045 1.000   NA
 5588746 5588747 BRE_790 BRE_791 nadD   FALSE 0.476 1.000 0.003 NA N NA
 5588747 5588748 BRE_791 BRE_792     FALSE 0.532 -34.000 0.014 NA   NA
 5588748 5588749 BRE_792 BRE_793     FALSE 0.100 99.000 0.009 NA   NA
 5588749 5588750 BRE_793 BRE_794     FALSE 0.323 71.000 0.000 NA   NA
 5588750 5588751 BRE_794 BRE_795   ctc TRUE 0.782 23.000 0.000 NA   NA
 5588751 5588752 BRE_795 BRE_796 ctc pth TRUE 0.991 6.000 0.496 0.070 Y NA
 5588752 5588753 BRE_796 BRE_797 pth   TRUE 0.905 -3.000 0.025 0.070 N NA
 5588753 5588754 BRE_797 BRE_798   ftsH TRUE 0.806 -3.000 0.145 1.000 N NA
 5588754 5588755 BRE_798 BRE_799 ftsH   TRUE 0.656 23.000 0.017 NA   NA
 5588755 5588756 BRE_799 BRE_800     TRUE 0.895 14.000 0.273 NA   NA
 5588756 5588757 BRE_800 BRE_801   tdk TRUE 0.708 6.000 0.006 1.000 N NA
 5588758 5588759 BRE_802 BRE_803   tmk FALSE 0.534 33.000 0.010 NA   NA
 5588760 5588761 BRE_804 BRE_805     FALSE 0.551 -52.000 0.025 NA   NA
 5588761 5588762 BRE_805 BRE_806     TRUE 0.874 33.000 0.123 1.000 Y NA
 5588764 5588765 BRE_808 BRE_809 mutS   TRUE 0.913 8.000 0.000 NA   NA
 5588765 5588766 BRE_809 BRE_810     FALSE 0.148 117.000 0.000 NA   NA
 5588766 5588767 BRE_810 BRE_811   nusA TRUE 0.844 -25.000 0.759 NA   NA
 5588767 5588768 BRE_811 BRE_812 nusA infB TRUE 0.746 -19.000 0.342 1.000 N NA
 5588768 5588769 BRE_812 BRE_813 infB rbfA TRUE 0.951 -10.000 0.530 1.000 Y NA
 5588769 5588770 BRE_813 BRE_814 rbfA truB TRUE 0.967 10.000 0.111 1.000 Y NA
 5588770 5588771 BRE_814 BRE_815 truB rpsO FALSE 0.108 222.000 0.013 1.000 Y NA
 5588771 5588772 BRE_815 BRE_816 rpsO pnpA TRUE 0.963 14.000 0.335 1.000 Y NA
 5588772 5588773 BRE_816 BRE_817 pnpA   TRUE 0.830 10.000 0.010 NA   NA
 5588773 5588774 BRE_817 BRE_818     TRUE 0.571 -25.000 0.016 NA   NA
 5588774 5588775 BRE_818 BRE_819     TRUE 0.925 -144.000 0.631 0.042   NA
 5588775 5588776 BRE_819 BRE_820   tgt TRUE 0.804 18.000 0.028 1.000   NA
 5588776 5588777 BRE_820 BRE_821 tgt mviN TRUE 0.796 -7.000 0.024 1.000   NA
 5588777 5588778 BRE_821 BRE_822 mviN   TRUE 0.830 -3.000 0.018 1.000   NA
 5588780 5588781 BRE_824 BRE_825 panF rluA TRUE 0.737 5.000 0.019 1.000 N NA
 5588781 5588782 BRE_825 BRE_826 rluA   TRUE 0.576 -31.000 0.021 NA   NA
 5588782 5588783 BRE_826 BRE_827   murC FALSE 0.494 -52.000 0.010 NA   NA
 5588783 5588784 BRE_827 BRE_828 murC   TRUE 0.812 12.000 0.018 NA   NA
 5588784 5588785 BRE_828 BRE_829     TRUE 0.800 -3.000 0.024 NA   NA
 5588785 5588786 BRE_829 BRE_830     TRUE 0.804 -10.000 0.000 NA   NA
 5588786 5588787 BRE_830 BRE_831   miaA TRUE 0.786 -13.000 0.000 NA   NA
 5588790 5588791 BRE_834 BRE_835     TRUE 0.901 -7.000 0.600 NA   NA
 5588791 5588792 BRE_835 BRE_836   nagE TRUE 0.643 46.000 0.333 NA   NA
 5588792 5588793 BRE_836 BRE_837 nagE hrpA FALSE 0.053 90.000 0.009 1.000 N NA
 5588793 5588794 BRE_837 BRE_838 hrpA topA TRUE 0.954 4.000 0.010 1.000 Y NA
 5588795 5588796 BRE_839 BRE_840 sbcD sbcC TRUE 0.859 -13.000 0.019 NA Y NA
 5588796 5588797 BRE_840 BRE_841 sbcC   TRUE 0.681 35.000 0.000 NA   NA
 5588797 5588798 BRE_841 BRE_842   cutC TRUE 0.584 44.000 0.000 NA   NA
 5588799 5588800 BRE_843 BRE_844   ileS TRUE 0.661 -12.000 0.014 NA   NA
 5588800 5588801 BRE_844 BRE_845 ileS clpC FALSE 0.441 -15.000 0.016 1.000 N NA
 5588801 5588802 BRE_845 BRE_846 clpC cpsG TRUE 0.792 17.000 0.231 1.000 N NA
 5588803 5588804 BRE_847 BRE_848 uvrB uvrA TRUE 0.977 28.000 0.154 0.003 Y NA
 5588804 5588805 BRE_848 BRE_849 uvrA   FALSE 0.176 -45.000 0.017 NA N NA
 5588806 5588807 BRE_850 BRE_851     TRUE 0.849 7.000 0.005 NA   NA
 5588808 5588809 BRE_852 BRE_853 arcA arcB TRUE 0.834 -36.000 0.034 1.000 Y NA
 5588809 5588810 BRE_853 BRE_854 arcB   TRUE 0.693 53.000 1.000 NA   NA
 5588810 5588811 BRE_854 BRE_855     TRUE 0.827 18.000 0.000 NA   NA
 5588811 5588812 BRE_855 BRE_856     FALSE 0.045 328.000 0.000 NA   NA
 5588814 5588815 BRE_1002 BRE_1003     FALSE 0.042 423.000 0.000 NA   NA
 5588816 5588817 BRE_1004 BRE_1005     FALSE 0.070 198.000 0.000 NA   NA
 5588817 5588818 BRE_1005 BRE_1006     FALSE 0.047 309.000 0.000 NA   NA
 5588818 5588819 BRE_1006 BRE_1007     FALSE 0.056 243.000 0.000 NA   NA
 5588819 5588820 BRE_1007 BRE_1008     FALSE 0.044 341.000 0.000 NA   NA
 5588820 5588821 BRE_1008 BRE_1009     FALSE 0.044 341.000 0.000 NA   NA
 5588821 5588822 BRE_1009 BRE_1010     FALSE 0.108 142.000 0.000 NA   NA
 5588822 5588823 BRE_1010 BRE_1011     FALSE 0.053 253.000 0.000 NA   NA
 5588823 5588824 BRE_1011 BRE_1012     FALSE 0.063 212.000 0.000 NA   NA
 5588826 5588827 BRE_1014 BRE_1015     FALSE 0.042 562.000 0.000 NA   NA
 5588827 5588828 BRE_1015 BRE_1016     FALSE 0.048 293.000 0.000 NA   NA
 5588829 5588830 BRE_1017 BRE_1018     FALSE 0.042 440.000 0.000 NA   NA
 5588830 5588831 BRE_1018 BRE_1019     FALSE 0.045 330.000 0.000 NA   NA
 5588831 5588832 BRE_1019 BRE_1020     FALSE 0.049 282.000 0.000 NA   NA
 5588833 5588834 BRE_1021 BRE_1022     FALSE 0.043 359.000 0.000 NA   NA
 5588834 5588835 BRE_1022 BRE_1023     FALSE 0.098 154.000 0.000 NA   NA
 5588835 5588836 BRE_1023 BRE_1024     FALSE 0.060 218.000 0.000 NA   NA
 5588836 5588837 BRE_1024 BRE_1025     FALSE 0.114 136.000 0.000 NA   NA
 5588837 5588838 BRE_1025 BRE_1026     TRUE 0.735 28.000 0.000 NA   NA
 5588838 5588839 BRE_1026 BRE_1027     TRUE 0.815 19.000 0.000 NA   NA
 5588839 5588840 BRE_1027 BRE_1028     FALSE 0.042 804.000 0.000 NA   NA
 5588840 5588841 BRE_1028 BRE_1029     FALSE 0.088 165.000 0.000 NA   NA
 5588841 5588842 BRE_1029 BRE_1030     FALSE 0.058 232.000 0.000 NA   NA
 5588842 5588843 BRE_1030 BRE_1031     FALSE 0.057 236.000 0.000 NA   NA
 5588843 5588844 BRE_1031 BRE_1032     FALSE 0.045 338.000 0.000 NA   NA
 5588844 5588845 BRE_1032 BRE_1033     TRUE 0.634 39.000 0.000 NA   NA
 5588845 5588846 BRE_1033 BRE_1034     FALSE 0.177 100.000 0.000 NA   NA
 5588846 5588847 BRE_1034 BRE_1035     FALSE 0.085 166.000 0.000 NA   NA
 5588847 5588848 BRE_1035 BRE_1036     FALSE 0.074 186.000 0.000 NA   NA
 5588848 5588849 BRE_1036 BRE_1037     TRUE 0.606 42.000 0.000 NA   NA
 5588849 5588850 BRE_1037 BRE_1038     FALSE 0.065 207.000 0.000 NA   NA
 5588852 5588853 BRE_1040 BRE_1041     FALSE 0.043 1129.000 0.000 NA   NA
 5588853 5588854 BRE_1041 BRE_1042     FALSE 0.073 189.000 0.000 NA   NA
 5588854 5588855 BRE_1042 BRE_1043     FALSE 0.102 150.000 0.000 NA   NA
 5588855 5588856 BRE_1043 BRE_1044     FALSE 0.046 319.000 0.000 NA   NA
 5588856 5588857 BRE_1044 BRE_1045   nrdF FALSE 0.045 337.000 0.000 NA   NA
 5588857 5588858 BRE_1045 BRE_1046 nrdF nrdE TRUE 0.965 45.000 0.400 0.002 Y NA
 5588858 5588859 BRE_1046 BRE_1047 nrdE nrdI TRUE 0.815 -76.000 0.000 NA Y NA
 5588859 5588860 BRE_1047 BRE_1048 nrdI   FALSE 0.495 76.000 0.000 NA Y NA
 5588861 5588862 BRE_1049 BRE_1050     FALSE 0.048 302.000 0.000 NA   NA
 5588863 5588864 BRE_1051 BRE_1052     FALSE 0.080 175.000 0.000 NA   NA
 5588864 5588865 BRE_1052 BRE_1053     TRUE 0.668 36.000 0.000 NA   NA
 5588865 5588866 BRE_1053 BRE_1054     FALSE 0.161 112.000 0.000 NA   NA
 5588866 5588867 BRE_1054 BRE_1055     TRUE 0.634 39.000 0.000 NA   NA
 5588867 5588868 BRE_1055 BRE_1056     TRUE 0.755 25.000 0.000 NA   NA
 5588868 5588869 BRE_1056 BRE_1057     TRUE 0.868 14.000 0.000 NA   NA
 5588869 5588870 BRE_1057 BRE_1058     TRUE 0.755 25.000 0.000 NA   NA
 5588870 5588871 BRE_1058 BRE_1059     TRUE 0.917 4.000 0.000 NA   NA
 5588871 5588872 BRE_1059 BRE_1060     TRUE 0.868 -3.000 0.000 NA   NA
 5588872 5588873 BRE_1060 BRE_1061     FALSE 0.553 46.000 0.000 NA   NA
 5588873 5588874 BRE_1061 BRE_1062     TRUE 0.698 33.000 0.000 NA   NA
 5588874 5588875 BRE_1062 BRE_1063     TRUE 0.868 -3.000 0.000 NA   NA
 5588875 5588876 BRE_1063 BRE_1064     TRUE 0.813 -9.000 0.000 NA   NA
 5588876 5588877 BRE_1064 BRE_1065     FALSE 0.182 99.000 0.000 NA   NA
 5588877 5588878 BRE_1065 BRE_1066     FALSE 0.423 58.000 0.000 NA   NA
 5588878 5588879 BRE_1066 BRE_1067     TRUE 0.892 -1.000 0.000 NA   NA
 5588879 5588880 BRE_1067 BRE_1068     FALSE 0.053 256.000 0.000 NA   NA
 5588881 5588882 BRE_1069 BRE_1070     FALSE 0.046 323.000 0.000 NA   NA
 5588882 5588883 BRE_1070 BRE_1071     FALSE 0.042 765.000 0.000 NA   NA
 5588883 5588884 BRE_1071 BRE_1072     FALSE 0.141 122.000 0.000 NA   NA
 5588884 5588885 BRE_1072 BRE_1073     FALSE 0.067 204.000 0.000 NA   NA
 5588885 5588886 BRE_1073 BRE_1074     FALSE 0.107 145.000 0.000 NA   NA
 5588887 5588888 BRE_1075 BRE_1076     FALSE 0.072 190.000 0.000 NA   NA
 5588888 5588889 BRE_1076 BRE_1077     FALSE 0.072 194.000 0.000 NA   NA
 5588889 5588890 BRE_1077 BRE_1078     FALSE 0.116 271.000 1.000 NA   NA
 5588891 5588892 BRE_1079 BRE_1080     FALSE 0.052 264.000 0.000 NA   NA
 5588892 5588893 BRE_1080 BRE_1081     FALSE 0.042 522.000 0.000 NA   NA
 5588894 5588895 BRE_1082 BRE_1083 bsr   FALSE 0.146 118.000 0.000 NA   NA
 5588895 5588896 BRE_1083 BRE_1084   pf49 FALSE 0.042 818.000 0.000 NA   NA
 5588896 5588897 BRE_1084 BRE_1085 pf49 pf32 FALSE 0.501 51.000 0.000 NA   NA
 5588897 5588898 BRE_1085 BRE_1086 pf32 ppap1 TRUE 0.731 -24.000 0.000 NA   NA
 5588898 5588899 BRE_1086 BRE_1087 ppap1 ppap2 TRUE 0.735 28.000 0.000 NA   NA
 5588899 5588900 BRE_1087 BRE_1088 ppap2   FALSE 0.042 482.000 0.000 NA   NA
 5588900 5588901 BRE_1088 BRE_1089     TRUE 0.868 -3.000 0.000 NA   NA
 5588901 5588902 BRE_1089 BRE_1090     FALSE 0.044 339.000 0.000 NA   NA
 5588902 5588903 BRE_1090 BRE_1091     TRUE 0.634 39.000 0.000 NA   NA
 5588903 5588904 BRE_1091 BRE_1092     TRUE 0.919 5.000 0.000 NA   NA
 5588904 5588905 BRE_1092 BRE_1093     TRUE 0.917 4.000 0.000 NA   NA
 5588906 5588907 BRE_1094 BRE_1095     FALSE 0.042 629.000 0.000 NA   NA
 5588907 5588908 BRE_1095 BRE_1096     FALSE 0.063 212.000 0.000 NA   NA
 5588908 5588909 BRE_1096 BRE_1097     FALSE 0.116 134.000 0.000 NA   NA
 5588909 5588910 BRE_1097 BRE_1098     FALSE 0.116 134.000 0.000 NA   NA
 5588910 5588911 BRE_1098 BRE_1099     FALSE 0.042 652.000 0.000 NA   NA
 5588911 5588912 BRE_1099 BRE_1100     FALSE 0.061 217.000 0.000 NA   NA
 5588912 5588913 BRE_1100 BRE_1101     FALSE 0.270 80.000 0.000 NA   NA
 5588913 5588914 BRE_1101 BRE_1102     FALSE 0.377 62.000 0.000 NA   NA
 5588914 5588915 BRE_1102 BRE_1103     FALSE 0.046 323.000 0.000 NA   NA
 5588915 5588916 BRE_1103 BRE_1104     FALSE 0.043 361.000 0.000 NA   NA
 5588916 5588917 BRE_1104 BRE_1105   pncA FALSE 0.177 100.000 0.000 NA   NA
 5588917 5588918 BRE_1105 BRE_1106 pncA   FALSE 0.065 208.000 0.000 NA   NA
 5588918 5588919 BRE_1106 BRE_1107     FALSE 0.082 170.000 0.000 NA   NA
 5588919 5588920 BRE_1107 BRE_1108   guaA FALSE 0.042 567.000 0.000 NA   NA
 5588920 5588921 BRE_1108 BRE_1109 guaA   TRUE 0.978 30.000 0.190 0.002 Y NA
 5588921 5588922 BRE_1109 BRE_1110     FALSE 0.051 276.000 0.000 NA   NA
 5588923 5588924 BRE_6001 BRE_6002     FALSE 0.050 279.000 0.000 NA   NA
 5588924 5588925 BRE_6002 BRE_6003   guaA TRUE 0.698 33.000 0.000 NA   NA
 5588925 5588926 BRE_6003 BRE_6004 guaA   FALSE 0.042 496.000 0.000 NA   NA
 5588926 5588927 BRE_6004 BRE_6005     FALSE 0.141 122.000 0.000 NA   NA
 5588927 5588928 BRE_6005 BRE_6006     TRUE 0.634 39.000 0.000 NA   NA
 5588931 5588932 BRE_6009 BRE_6010   malX FALSE 0.042 817.000 0.000 NA   NA
 5588932 5588933 BRE_6010 BRE_6011 malX acyP FALSE 0.170 83.000 0.000 1.000 N NA
 5588934 5588935 BRE_6012 BRE_6013   resT FALSE 0.458 56.000 0.000 NA   NA
 5588935 5588936 BRE_6013 BRE_6014 resT   FALSE 0.229 88.000 0.000 NA   NA
 5588937 5588938 BRE_6015 BRE_6016   ppap1 TRUE 0.782 23.000 0.000 NA   NA
 5588938 5588939 BRE_6016 BRE_6017 ppap1 pf32 TRUE 0.731 -24.000 0.000 NA   NA
 5588939 5588940 BRE_6017 BRE_6018 pf32 pf49 FALSE 0.458 56.000 0.000 NA   NA
 5588944 5588945 BRE_5001 BRE_5002 bdr_1   FALSE 0.049 280.000 0.000 NA   NA
 5588945 5588946 BRE_5002 BRE_5003     FALSE 0.049 288.000 0.000 NA   NA
 5588946 5588947 BRE_5003 BRE_5004     FALSE 0.045 338.000 0.000 NA   NA
 5588947 5588948 BRE_5004 BRE_5005     FALSE 0.042 563.000 0.000 NA   NA
 5588948 5588949 BRE_5005 BRE_5006     FALSE 0.043 875.000 0.000 NA   NA
 5588949 5588950 BRE_5006 BRE_5007     FALSE 0.042 384.000 0.000 NA   NA
 5588950 5588951 BRE_5007 BRE_5008     FALSE 0.069 199.000 0.000 NA   NA
 5588952 5588953 BRE_5009 BRE_5010   ppap1 TRUE 0.875 -16.000 0.750 NA   NA
 5588953 5588954 BRE_5010 BRE_5011 ppap1 pf32 TRUE 0.731 -24.000 0.000 NA   NA
 5588954 5588955 BRE_5011 BRE_5012 pf32 pf49 TRUE 0.782 23.000 0.000 NA   NA
 5588955 5588956 BRE_5012 BRE_5013 pf49   FALSE 0.049 281.000 0.000 NA   NA
 5588956 5588957 BRE_5013 BRE_5014     FALSE 0.043 991.000 0.000 NA   NA
 5588959 5588960 BRE_5016 BRE_5017     FALSE 0.047 309.000 0.000 NA   NA
 5588960 5588961 BRE_5017 BRE_5018   vlp-d_1 FALSE 0.074 188.000 0.000 NA   NA
 5588961 5588962 BRE_5018 BRE_5019 vlp-d_1   FALSE 0.047 318.000 0.000 NA   NA
 5588964 5588965 BRE_5021 BRE_5022     FALSE 0.079 176.000 0.000 NA   NA
 5588965 5588966 BRE_5022 BRE_5023   bdr_2 TRUE 0.868 14.000 0.000 NA   NA
 5588966 5588967 BRE_5023 BRE_5024 bdr_2   FALSE 0.042 596.000 0.000 NA   NA
 5588967 5588968 BRE_5024 BRE_5025   bdr_3 FALSE 0.042 790.000 0.000 NA   NA
 5588968 5588969 BRE_5025 BRE_5026 bdr_3   FALSE 0.043 378.000 0.000 NA   NA
 5588969 5588970 BRE_5026 BRE_5027   vsp_1 FALSE 0.046 320.000 0.000 NA   NA
 5588970 5588971 BRE_5027 BRE_5028 vsp_1   FALSE 0.042 422.000 0.000 NA   NA
 5588971 5588972 BRE_5028 BRE_5029   vlp-d_2 FALSE 0.092 160.000 0.000 NA   NA
 5588972 5588973 BRE_5029 BRE_5030 vlp-d_2 vsp_2 FALSE 0.063 278.000 0.000 1.000   NA
 5588974 5588975 BRE_4001 BRE_4002     TRUE 0.710 -28.000 0.000 NA   NA
 5588975 5588976 BRE_4002 BRE_4003   vlp_1 FALSE 0.043 1392.000 0.000 NA   NA
 5588976 5588977 BRE_4003 BRE_4004 vlp_1   FALSE 0.153 114.000 0.000 NA   NA
 5588977 5588978 BRE_4004 BRE_4005   bdr_1 FALSE 0.042 687.000 0.000 NA   NA
 5588978 5588979 BRE_4005 BRE_4006 bdr_1   TRUE 0.597 43.000 0.000 NA   NA
 5588979 5588980 BRE_4006 BRE_4007     TRUE 0.868 14.000 0.000 NA   NA
 5588981 5588982 BRE_4008 BRE_4009     FALSE 0.088 165.000 0.000 NA   NA
 5588982 5588983 BRE_4009 BRE_4010     FALSE 0.043 369.000 0.000 NA   NA
 5588984 5588985 BRE_4011 BRE_4012     FALSE 0.553 46.000 0.000 NA   NA
 5588985 5588986 BRE_4012 BRE_4013     FALSE 0.084 167.000 0.000 NA   NA
 5588989 5588990 BRE_4016 BRE_4017   ppap1 TRUE 0.724 29.000 0.000 NA   NA
 5588990 5588991 BRE_4017 BRE_4018 ppap1 pf32 TRUE 0.731 -24.000 0.000 NA   NA
 5588991 5588992 BRE_4018 BRE_4019 pf32 pf49 FALSE 0.439 57.000 0.000 NA   NA
 5588992 5588993 BRE_4019 BRE_4020 pf49   FALSE 0.042 440.000 0.000 NA   NA
 5588993 5588994 BRE_4020 BRE_4021     FALSE 0.088 165.000 0.000 NA   NA
 5588994 5588995 BRE_4021 BRE_4022     FALSE 0.553 46.000 0.000 NA   NA
 5588996 5588997 BRE_4023 BRE_4024     FALSE 0.045 328.000 0.000 NA   NA
 5588998 5588999 BRE_4025 BRE_4026     TRUE 0.899 11.000 0.000 NA   NA
 5588999 5589000 BRE_4026 BRE_4027   bdr_2 TRUE 0.584 44.000 0.000 NA   NA
 5589000 5589001 BRE_4027 BRE_4028 bdr_2   FALSE 0.104 149.000 0.000 NA   NA
 5589001 5589002 BRE_4028 BRE_4029     TRUE 0.634 39.000 0.000 NA   NA
 5589002 5589003 BRE_4029 BRE_4030   vsp FALSE 0.055 244.000 0.000 NA   NA
 5589003 5589004 BRE_4030 BRE_4031 vsp   FALSE 0.080 175.000 0.000 NA   NA
 5589004 5589005 BRE_4031 BRE_4032     TRUE 0.868 -3.000 0.000 NA   NA
 5589005 5589006 BRE_4032 BRE_4033   vlp_2 FALSE 0.150 115.000 0.000 NA   NA
 5589006 5589007 BRE_4033 BRE_4034 vlp_2   FALSE 0.043 1392.000 0.000 NA   NA
 5589008 5589009 BRE_3001 BRE_3002     FALSE 0.042 497.000 0.000 NA   NA
 5589010 5589011 BRE_3003 BRE_3004     FALSE 0.043 1824.000 0.000 NA   NA
 5589011 5589012 BRE_3004 BRE_3005   thy1 FALSE 0.059 223.000 0.000 NA   NA
 5589012 5589013 BRE_3005 BRE_3006 thy1   FALSE 0.056 239.000 0.000 NA   NA
 5589014 5589015 BRE_3007 BRE_3008     FALSE 0.042 548.000 0.000 NA   NA
 5589015 5589016 BRE_3008 BRE_3009     FALSE 0.121 131.000 0.000 NA   NA
 5589017 5589018 BRE_3010 BRE_3011   vlp-d_1 FALSE 0.048 301.000 0.000 NA   NA
 5589018 5589019 BRE_3011 BRE_3012 vlp-d_1 vlp-c FALSE 0.198 607.000 0.600 0.070   NA
 5589021 5589022 BRE_3014 BRE_3015   pf32 FALSE 0.301 74.000 0.000 NA   NA
 5589022 5589023 BRE_3015 BRE_3016 pf32 ppap1 TRUE 0.838 -24.000 0.600 NA   NA
 5589023 5589024 BRE_3016 BRE_3017 ppap1   FALSE 0.489 73.000 0.750 NA   NA
 5589025 5589026 BRE_3018 BRE_3019 vlp-a vsp_1 FALSE 0.052 631.000 0.000 1.000   NA
 5589026 5589027 BRE_3019 BRE_3020 vsp_1 vlp-d_2 FALSE 0.068 246.000 0.000 1.000   NA
 5589027 5589028 BRE_3020 BRE_3021 vlp-d_2 vsp_2 FALSE 0.055 349.000 0.000 1.000   NA
 5589028 5589029 BRE_3021 BRE_3022 vsp_2   FALSE 0.042 422.000 0.000 NA   NA
 5589029 5589030 BRE_3022 BRE_3023   vlp-d_3 FALSE 0.092 160.000 0.000 NA   NA
 5589030 5589031 BRE_3023 BRE_3024 vlp-d_3 vsp_3 FALSE 0.063 278.000 0.000 1.000   NA
 5589031 5589032 BRE_3024 BRE_3025 vsp_3   FALSE 0.042 533.000 0.000 NA   NA
 5589032 5589033 BRE_3025 BRE_3026     FALSE 0.066 205.000 0.000 NA   NA
 5589033 5589034 BRE_3026 BRE_3027     FALSE 0.100 153.000 0.000 NA   NA
 5589034 5589035 BRE_3027 BRE_3028     FALSE 0.064 211.000 0.000 NA   NA
 5589035 5589036 BRE_3028 BRE_3029     FALSE 0.043 377.000 0.000 NA   NA
 5589036 5589037 BRE_3029 BRE_3030     FALSE 0.043 365.000 0.000 NA   NA
 5589038 5589039 BRE_2001 BRE_2002   bdr_1 FALSE 0.042 429.000 0.000 NA   NA
 5589039 5589040 BRE_2002 BRE_2003 bdr_1   FALSE 0.042 445.000 0.000 NA   NA
 5589041 5589042 BRE_2004 BRE_2005   mlpA FALSE 0.042 653.000 0.000 NA   NA
 5589042 5589043 BRE_2005 BRE_2006 mlpA   FALSE 0.048 290.000 0.000 NA   NA
 5589043 5589044 BRE_2006 BRE_2007   ppap1_1 TRUE 0.917 4.000 0.000 NA   NA
 5589044 5589045 BRE_2007 BRE_2008 ppap1_1 pf32_1 TRUE 0.731 -24.000 0.000 NA   NA
 5589045 5589046 BRE_2008 BRE_2009 pf32_1 pf49_1 TRUE 0.621 40.000 0.000 NA   NA
 5589046 5589047 BRE_2009 BRE_2010 pf49_1 vsp_1 FALSE 0.042 704.000 0.000 NA   NA
 5589047 5589048 BRE_2010 BRE_2011 vsp_1   FALSE 0.046 326.000 0.000 NA   NA
 5589049 5589050 BRE_2012 BRE_2013   bdr_2 FALSE 0.042 391.000 0.000 NA   NA
 5589050 5589051 BRE_2013 BRE_2014 bdr_2   TRUE 0.879 13.000 0.000 NA   NA
 5589051 5589052 BRE_2014 BRE_2015     TRUE 0.868 -3.000 0.000 NA   NA
 5589053 5589054 BRE_2016 BRE_2017   bppC_1 FALSE 0.042 579.000 0.000 NA   NA
 5589055 5589056 BRE_2018 BRE_2019   pf49_2 FALSE 0.042 444.000 0.000 NA   NA
 5589056 5589057 BRE_2019 BRE_2020 pf49_2 pf32_2 TRUE 0.606 42.000 0.000 NA   NA
 5589057 5589058 BRE_2020 BRE_2021 pf32_2 ppap1_2 TRUE 0.731 -24.000 0.000 NA   NA
 5589058 5589059 BRE_2021 BRE_2022 ppap1_2 ppap2 TRUE 0.908 10.000 0.000 NA   NA
 5589060 5589061 BRE_2023 BRE_2024     FALSE 0.085 166.000 0.000 NA   NA
 5589061 5589062 BRE_2024 BRE_2025     TRUE 0.747 27.000 0.000 NA   NA
 5589063 5589064 BRE_2026 BRE_2027 bppC_2   FALSE 0.042 432.000 0.000 NA   NA
 5589064 5589065 BRE_2027 BRE_2028     FALSE 0.077 179.000 0.000 NA   NA
 5589066 5589067 BRE_2029 BRE_2030   bdr_3 TRUE 0.855 15.000 0.000 NA   NA
 5589067 5589068 BRE_2030 BRE_2031 bdr_3   FALSE 0.042 424.000 0.000 NA   NA
 5589068 5589069 BRE_2031 BRE_2032     FALSE 0.044 343.000 0.000 NA   NA
 5589070 5589071 BRE_2033 BRE_2034     FALSE 0.044 344.000 0.000 NA   NA
 5589071 5589072 BRE_2034 BRE_2035     TRUE 0.630 -455.000 0.000 NA   NA
 5589072 5589073 BRE_2035 BRE_2036   vlp-d_1 FALSE 0.048 301.000 0.000 NA   NA
 5589073 5589074 BRE_2036 BRE_2037 vlp-d_1 vlp-c FALSE 0.210 607.000 0.600 0.067   NA
 5589076 5589077 BRE_2039 BRE_2040   pf32_3 FALSE 0.301 74.000 0.000 NA   NA
 5589077 5589078 BRE_2040 BRE_2041 pf32_3 ppap1_3 TRUE 0.838 -24.000 0.600 NA   NA
 5589078 5589079 BRE_2041 BRE_2042 ppap1_3   FALSE 0.489 73.000 0.750 NA   NA
 5589080 5589081 BRE_2043 BRE_2044 vlp-a vsp_2 FALSE 0.052 631.000 0.000 1.000   NA
 5589081 5589082 BRE_2044 BRE_2045 vsp_2 vlp-d_2 FALSE 0.068 246.000 0.000 1.000   NA
 5589082 5589083 BRE_2045 BRE_2046 vlp-d_2 vsp_3 FALSE 0.058 318.000 0.000 1.000   NA
 5589083 5589084 BRE_2046 BRE_2047 vsp_3   FALSE 0.042 422.000 0.000 NA   NA
 5589084 5589085 BRE_2047 BRE_2048   vlp-d_3 FALSE 0.092 160.000 0.000 NA   NA
 5589085 5589086 BRE_2048 BRE_2049 vlp-d_3 vsp_4 FALSE 0.063 278.000 0.000 1.000   NA
 5589086 5589087 BRE_2049 BRE_2050 vsp_4   FALSE 0.042 533.000 0.000 NA   NA
 5589087 5589088 BRE_2050 BRE_2051     FALSE 0.066 205.000 0.000 NA   NA
 5589088 5589089 BRE_2051 BRE_2052     FALSE 0.100 153.000 0.000 NA   NA
 5589089 5589090 BRE_2052 BRE_2053     FALSE 0.064 211.000 0.000 NA   NA
 5589090 5589091 BRE_2053 BRE_2054     FALSE 0.043 377.000 0.000 NA   NA
 5589091 5589092 BRE_2054 BRE_2055     FALSE 0.043 365.000 0.000 NA   NA
 5589093 5589094 BRE_7001 BRE_7002 pf49 pf32 FALSE 0.361 63.000 0.000 NA   NA