MicrobesOnline Operon Predictions for Staphylococcus carnosus subsp. carnosus TM300

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
5566150	5566151	Sca_0001	Sca_0002	rpmH	rnpA	TRUE	0.556	152.000	0.787	1.000		NA
5566151	5566152	Sca_0002	Sca_0003	rnpA	trmE	FALSE	0.234	130.000	0.007	1.000		NA
5566152	5566153	Sca_0003	Sca_0004	trmE	gidA	TRUE	0.906	16.000	0.266	1.000		NA
5566153	5566154	Sca_0004	Sca_0005	gidA	gidB	TRUE	0.973	1.000	0.466	1.000	N	NA
5566154	5566155	Sca_0005	Sca_0006	gidB		TRUE	0.778	47.000	0.089	1.000	N	NA
5566155	5566156	Sca_0006	Sca_0007			FALSE	0.033	135.000	0.000	NA		NA
5566156	5566157	Sca_0007	Sca_0008			FALSE	0.242	15.000	0.000	NA		NA
5566157	5566158	Sca_0008	Sca_0009			FALSE	0.061	94.000	0.000	NA		NA
5566158	5566159	Sca_0009	Sca_0010			FALSE	0.004	320.000	0.000	NA		NA
5566160	5566161	Sca_0011	Sca_0012		metE	FALSE	0.111	179.000	0.011	NA		NA
5566161	5566162	Sca_0012	Sca_0013	metE	metH	TRUE	0.986	-3.000	0.030	1.000	Y	NA
5566162	5566163	Sca_0013	Sca_0014	metH	metC	TRUE	0.995	-46.000	0.162	1.000	Y	NA
5566164	5566165	Sca_0015	Sca_0016			FALSE	0.418	89.000	0.007	1.000	N	NA
5566165	5566166	Sca_0016	Sca_0017			TRUE	0.872	19.000	0.171	NA		NA
5566166	5566167	Sca_0017	Sca_0018			TRUE	0.932	0.000	0.064	NA		NA
5566170	5566171	Sca_0021	Sca_0022		argF	FALSE	0.030	202.000	0.000	1.000		NA
5566171	5566172	Sca_0022	Sca_0023	argF	pemK	FALSE	0.030	241.000	0.000	1.000	N	NA
5566172	5566173	Sca_0023	Sca_0024	pemK	pemI	TRUE	0.655	-6.000	0.000	NA		NA
5566174	5566175	Sca_0025	Sca_0026	nuc	rpsF	FALSE	0.101	141.000	0.000	1.000	N	NA
5566175	5566176	Sca_0026	Sca_0027	rpsF	ssb	TRUE	0.776	22.000	0.007	1.000	N	NA
5566176	5566177	Sca_0027	Sca_0028	ssb	rpsR	TRUE	0.601	57.000	0.007	1.000	N	NA
5566177	5566178	Sca_0028	Sca_0029	rpsR		FALSE	0.005	296.000	0.000	NA		NA
5566178	5566179	Sca_0029	Sca_0030			FALSE	0.006	287.000	0.000	NA		NA
5566179	5566180	Sca_0030	Sca_0031			FALSE	0.003	461.000	0.000	NA		NA
5566180	5566181	Sca_0031	Sca_0032		gpm3	FALSE	0.009	232.000	0.000	NA		NA
5566184	5566185	Sca_0035	Sca_0036			FALSE	0.088	74.000	0.000	NA		NA
5566187	5566188	Sca_0038	Sca_0039	ahpF	ahpC	TRUE	0.978	17.000	0.551	1.000	Y	NA
5566188	5566189	Sca_0039	Sca_0040	ahpC		FALSE	0.010	406.000	0.000	1.000	N	NA
5566191	5566192	Sca_0042	Sca_0043			FALSE	0.003	365.000	0.000	NA		NA
5566192	5566193	Sca_0043	Sca_0044			FALSE	0.044	118.000	0.000	NA		NA
5566193	5566194	Sca_0044	Sca_0045			FALSE	0.074	82.000	0.000	NA		NA
5566194	5566195	Sca_0045	Sca_0046			TRUE	0.693	108.000	0.857	NA		NA
5566196	5566197	Sca_0047	Sca_0048	xprT	pbuX	TRUE	0.973	2.000	0.037	1.000	Y	NA
5566197	5566198	Sca_0048	Sca_0049	pbuX	guaB	TRUE	0.973	34.000	1.000	1.000	Y	NA
5566198	5566199	Sca_0049	Sca_0050	guaB	guaA	TRUE	0.977	17.000	0.007	0.001	Y	NA
5566199	5566200	Sca_0050	Sca_0051	guaA		FALSE	0.007	265.000	0.000	NA		NA
5566200	5566201	Sca_0051	Sca_0052			FALSE	0.032	137.000	0.000	NA		NA
5566203	5566204	Sca_0054	Sca_0056			FALSE	0.006	287.000	0.000	NA		NA
5566206	5566207	Sca_0058	Sca_0059	cysH	cysJ	TRUE	0.504	164.000	0.011	0.001	N	NA
5566207	5566208	Sca_0059	Sca_0060	cysJ	cysI	TRUE	0.992	24.000	0.791	0.001	Y	NA
5566208	5566209	Sca_0060	Sca_0061	cysI	cysG	TRUE	0.843	25.000	0.047	1.000	N	NA
5566209	5566210	Sca_0061	Sca_0062	cysG		FALSE	0.052	160.000	0.000	1.000		NA
5566210	5566211	Sca_0062	Sca_0063		cysD	TRUE	0.786	19.000	0.021	1.000		NA
5566211	5566212	Sca_0063	Sca_0064	cysD	cysC	TRUE	0.986	6.000	0.101	0.002	Y	NA
5566212	5566213	Sca_0064	Sca_0065	cysC		FALSE	0.104	138.000	0.000	1.000	N	NA
5566215	5566216	Sca_0067	Sca_0068			FALSE	0.030	143.000	0.000	NA		NA
5566216	5566217	Sca_0068	Sca_0069		metE	FALSE	0.003	454.000	0.000	NA		NA
5566217	5566218	Sca_0069	Sca_0070	metE		FALSE	0.018	237.000	0.000	NA	N	NA
5566218	5566219	Sca_0070	Sca_0071			TRUE	0.677	-7.000	0.000	NA		NA
5566219	5566220	Sca_0071	Sca_0072			TRUE	0.981	-3.000	0.500	NA		NA
5566220	5566221	Sca_0072	Sca_0073			FALSE	0.268	17.000	0.000	NA		NA
5566221	5566222	Sca_0073	Sca_0074		gloA	FALSE	0.002	527.000	0.000	NA		NA
5566222	5566223	Sca_0074	Sca_0075	gloA		FALSE	0.256	22.000	0.000	NA		NA
5566224	5566225	Sca_0076	Sca_0077			FALSE	0.006	284.000	0.000	NA		NA
5566225	5566226	Sca_0077	Sca_0078			FALSE	0.367	3.000	0.000	NA		NA
5566226	5566227	Sca_0078	Sca_0079			FALSE	0.242	15.000	0.000	NA		NA
5566227	5566228	Sca_0079	Sca_0080			TRUE	0.609	-3.000	0.000	NA		NA
5566228	5566229	Sca_0080	Sca_0081			FALSE	0.003	387.000	0.000	NA		NA
5566230	5566231	Sca_0082	Sca_0083			FALSE	0.083	126.000	0.000	1.000		NA
5566231	5566232	Sca_0083	Sca_0084			FALSE	0.016	265.000	0.000	1.000		NA
5566232	5566233	Sca_0084	Sca_0085			FALSE	0.009	328.000	0.000	1.000		NA
5566233	5566234	Sca_0085	Sca_0086		cysM	FALSE	0.131	200.000	0.024	1.000		NA
5566234	5566235	Sca_0086	Sca_0087	cysM	metC	TRUE	0.981	43.000	0.690	0.022	Y	NA
5566235	5566236	Sca_0087	Sca_0088	metC		FALSE	0.054	158.000	0.000	1.000		NA
5566237	5566238	Sca_0089	Sca_0090			FALSE	0.332	4.000	0.000	NA		NA
5566238	5566239	Sca_0090	Sca_0091			TRUE	0.927	2.000	0.095	1.000		NA
5566239	5566240	Sca_0091	Sca_0092			FALSE	0.416	120.000	0.077	1.000		NA
5566246	5566247	Sca_0098	Sca_0099			FALSE	0.066	89.000	0.000	NA		NA
5566247	5566248	Sca_0099	Sca_0100			FALSE	0.131	93.000	0.000	1.000		NA
5566248	5566249	Sca_0100	Sca_0101			FALSE	0.037	127.000	0.000	NA		NA
5566249	5566250	Sca_0101	Sca_0102			FALSE	0.047	111.000	0.000	NA		NA
5566250	5566251	Sca_0102	Sca_0103			TRUE	0.986	-3.000	0.957	NA		NA
5566251	5566252	Sca_0103	Sca_0104		gltC	FALSE	0.137	220.000	0.106	NA		NA
5566253	5566254	Sca_0105	Sca_0106	gltB	gltD	TRUE	0.987	23.000	0.222	0.002	Y	NA
5566254	5566255	Sca_0106	tRNA-Sca_0001	gltD	tRNA-Ser(TGA)	FALSE	0.031	140.000	0.000	NA		NA
5566255	5566256	tRNA-Sca_0001	Sca_0107	tRNA-Ser(TGA)		FALSE	0.014	195.000	0.000	NA		NA
5566256	5566257	Sca_0107	Sca_0108			FALSE	0.023	160.000	0.000	NA		NA
5566257	5566258	Sca_0108	Sca_0109			TRUE	0.789	67.000	0.018	0.010		NA
5566258	5566259	Sca_0109	Sca_0110		treC	TRUE	0.587	136.000	0.650	1.000		NA
5566259	5566260	Sca_0110	Sca_0111	treC		TRUE	0.916	27.000	0.336	1.000	N	NA
5566260	5566261	Sca_0111	Sca_0113			TRUE	0.635	130.000	0.000	0.046	Y	NA
5566261	5566262	Sca_0113	Sca_0114			FALSE	0.233	14.000	0.000	NA		NA
5566266	5566267	Sca_0118	Sca_0119		dnaX	TRUE	0.593	81.000	0.103	1.000		NA
5566267	5566268	Sca_0119	Sca_0120	dnaX		FALSE	0.147	204.000	0.071	NA		NA
5566268	5566269	Sca_0120	Sca_0121		recR	TRUE	0.932	7.000	0.604	NA		NA
5566269	5566270	Sca_0121	Sca_16S_rRNA_A	recR	16SrRNA_A	FALSE	0.002	500.000	0.000	NA		NA
5566270	5566271	Sca_16S_rRNA_A	Sca_23S_rRNA_A	16SrRNA_A	23SrRNA_A	FALSE	0.008	243.000	0.000	NA		NA
5566271	5566272	Sca_23S_rRNA_A	Sca_5S_rRNA_A	23SrRNA_A	5S_rRNA_A	FALSE	0.098	71.000	0.000	NA		NA
5566272	5566273	Sca_5S_rRNA_A	Sca_0122	5S_rRNA_A		FALSE	0.058	98.000	0.000	NA		NA
5566273	5566274	Sca_0122	Sca_0123		tmk	TRUE	0.888	2.000	0.010	1.000	N	NA
5566274	5566275	Sca_0123	Sca_0124	tmk		FALSE	0.106	211.000	0.038	NA		NA
5566275	5566276	Sca_0124	Sca_0125		holB	FALSE	0.136	174.000	0.021	NA		NA
5566276	5566277	Sca_0125	Sca_0126	holB		TRUE	0.961	1.000	0.372	NA		NA
5566277	5566278	Sca_0126	Sca_0127			TRUE	0.863	15.000	0.183	NA		NA
5566278	5566279	Sca_0127	Sca_0128			TRUE	0.586	89.000	0.193	NA		NA
5566279	5566280	Sca_0128	Sca_0129			TRUE	0.983	-10.000	0.209	1.000		NA
5566280	5566281	Sca_0129	Sca_0130			TRUE	0.952	-3.000	0.041	1.000		NA
5566281	5566282	Sca_0130	Sca_0131		geh'	FALSE	0.041	178.000	0.000	1.000		NA
5566282	5566283	Sca_0131	Sca_0132	geh'	geh''	FALSE	0.010	225.000	0.000	NA		NA
5566283	5566284	Sca_0132	Sca_0133	geh''		FALSE	0.002	1181.000	0.000	NA		NA
5566284	5566285	Sca_0133	Sca_0134			FALSE	0.142	50.000	0.000	NA		NA
5566285	5566286	Sca_0134	Sca_0135			TRUE	0.715	-15.000	0.000	NA		NA
5566286	5566287	Sca_0135	Sca_0136			TRUE	0.609	-3.000	0.000	NA		NA
5566287	5566288	Sca_0136	Sca_0137			FALSE	0.029	147.000	0.000	NA		NA
5566288	5566289	Sca_0137	Sca_0138			FALSE	0.004	358.000	0.000	NA		NA
5566289	5566290	Sca_0138	Sca_0139			FALSE	0.256	10.000	0.000	NA		NA
5566290	5566291	Sca_0139	Sca_0140		metS	FALSE	0.007	269.000	0.000	NA		NA
5566291	5566292	Sca_0140	Sca_0141	metS		FALSE	0.231	208.000	0.221	NA	N	NA
5566292	5566293	Sca_0141	Sca_0142			FALSE	0.079	799.000	0.058	NA	Y	NA
5566293	5566294	Sca_0142	Sca_0143			TRUE	0.937	2.000	0.093	1.000	N	NA
5566294	5566295	Sca_0143	Sca_0144			FALSE	0.369	100.000	0.035	NA		NA
5566295	5566296	Sca_0144	Sca_0145			FALSE	0.028	460.000	0.046	NA		NA
5566296	5566297	Sca_0145	Sca_0146		purR	TRUE	0.867	17.000	0.062	1.000	N	NA
5566297	5566298	Sca_0146	Sca_0147	purR		TRUE	0.899	19.000	0.227	NA	N	NA
5566298	5566299	Sca_0147	Sca_0148		spoVG	TRUE	0.708	67.000	0.131	NA	N	NA
5566299	5566300	Sca_0148	Sca_0149	spoVG	gcaD	FALSE	0.222	249.000	0.003	1.000	Y	NA
5566300	5566301	Sca_0149	Sca_0150	gcaD	prs	TRUE	0.509	104.000	0.069	1.000	N	NA
5566301	5566302	Sca_0150	Sca_0151	prs	rplY	FALSE	0.089	258.000	0.027	1.000	N	NA
5566302	5566303	Sca_0151	Sca_0152	rplY	pth	FALSE	0.339	487.000	0.496	0.036	Y	NA
5566303	5566304	Sca_0152	Sca_0153	pth	mfd	TRUE	0.973	-3.000	0.137	1.000	N	NA
5566304	5566305	Sca_0153	Sca_0154	mfd		TRUE	0.966	-10.000	0.033	1.000		NA
5566305	5566306	Sca_0154	Sca_0155			TRUE	0.959	-3.000	0.058	1.000		NA
5566306	5566307	Sca_0155	Sca_0156			TRUE	0.915	2.000	0.054	1.000		NA
5566307	5566308	Sca_0156	Sca_0157			TRUE	0.903	2.000	0.000	0.026		NA
5566308	5566309	Sca_0157	Sca_0158			TRUE	0.845	15.000	0.053	1.000	N	NA
5566309	5566310	Sca_0158	Sca_0159			FALSE	0.439	135.000	0.134	1.000	N	NA
5566310	5566311	Sca_0159	Sca_0160			FALSE	0.097	252.000	0.031	1.000	N	NA
5566311	5566312	Sca_0160	Sca_0161		hpt	TRUE	0.958	3.000	0.067	0.063	N	NA
5566312	5566313	Sca_0161	Sca_0162	hpt	ftsH	TRUE	0.558	117.000	0.192	1.000	N	NA
5566313	5566314	Sca_0162	Sca_0163	ftsH	hsp33	TRUE	0.568	154.000	0.041	1.000	Y	NA
5566314	5566315	Sca_0163	Sca_0164	hsp33	cysK	FALSE	0.091	285.000	0.053	1.000	N	NA
5566315	5566316	Sca_0164	Sca_0165	cysK	folP	FALSE	0.231	142.000	0.005	1.000	N	NA
5566316	5566317	Sca_0165	Sca_0166	folP	folB	TRUE	0.986	-3.000	0.024	1.000	Y	NA
5566317	5566318	Sca_0166	Sca_0167	folB	folK	TRUE	0.993	-7.000	0.142	1.000	Y	NA
5566318	5566319	Sca_0167	Sca_0168	folK	dus1	TRUE	0.816	24.000	0.025	1.000	N	NA
5566319	5566320	Sca_0168	Sca_0169	dus1	lysS	TRUE	0.929	13.000	0.021	1.000	Y	NA
5566320	5566321	Sca_0169	Sca_5S_rRNA_B2	lysS	5S_rRNA_B2	FALSE	0.003	440.000	0.000	NA		NA
5566321	5566322	Sca_5S_rRNA_B2	tRNA-Sca_0002	5S_rRNA_B2	tRNA-Val_(TAC)	FALSE	0.251	11.000	0.000	NA		NA
5566322	5566323	tRNA-Sca_0002	tRNA-Sca_0003	tRNA-Val_(TAC)	tRNA-Thr_(TGT)	FALSE	0.267	8.000	0.000	NA		NA
5566323	5566324	tRNA-Sca_0003	tRNA-Sca_0004	tRNA-Thr_(TGT)	tRNA-Lys_(TTT)	FALSE	0.233	14.000	0.000	NA		NA
5566324	5566325	tRNA-Sca_0004	tRNA-Sca_0005	tRNA-Lys_(TTT)	tRNA-Gly_(GCC)	FALSE	0.266	18.000	0.000	NA		NA
5566325	5566326	tRNA-Sca_0005	tRNA-Sca_0006	tRNA-Gly_(GCC)	tRNA-Leu_(TAA)	FALSE	0.261	9.000	0.000	NA		NA
5566326	5566327	tRNA-Sca_0006	tRNA-Sca_0007	tRNA-Leu_(TAA)	tRNA-Arg_(ACG)	FALSE	0.243	12.000	0.000	NA		NA
5566327	5566328	tRNA-Sca_0007	tRNA-Sca_0008	tRNA-Arg_(ACG)	tRNA-Pro_(TGG)	FALSE	0.193	33.000	0.000	NA		NA
5566328	5566329	tRNA-Sca_0008	tRNA-Sca_0009	tRNA-Pro_(TGG)	tRNA-Ala_(TGC)	FALSE	0.255	23.000	0.000	NA		NA
5566329	5566330	tRNA-Sca_0009	Sca_16S_rRNA_B	tRNA-Ala_(TGC)	16S_rRNA_B	FALSE	0.039	124.000	0.000	NA		NA
5566330	5566331	Sca_16S_rRNA_B	Sca_23S_rRNA_B	16S_rRNA_B	23S_rRNA_B	FALSE	0.008	243.000	0.000	NA		NA
5566331	5566332	Sca_23S_rRNA_B	Sca_5S_rRNA_B	23S_rRNA_B	5S_rRNA_B	FALSE	0.098	71.000	0.000	NA		NA
5566333	5566334	Sca_0170	Sca_0171			FALSE	0.009	229.000	0.000	NA		NA
5566334	5566335	Sca_0171	Sca_0172			FALSE	0.424	15.000	0.000	1.000		NA
5566336	5566337	Sca_0173	Sca_0174	pdx1		TRUE	0.987	2.000	0.488	NA	Y	NA
5566338	5566339	Sca_0175	Sca_0176			FALSE	0.258	21.000	0.000	NA		NA
5566339	5566340	Sca_0176	Sca_0177		nupC	FALSE	0.020	171.000	0.000	NA		NA
5566341	5566342	Sca_0178	Sca_0179	ctsR		TRUE	0.931	19.000	0.681	NA		NA
5566342	5566343	Sca_0179	Sca_0180			TRUE	0.955	5.000	0.848	1.000		NA
5566343	5566344	Sca_0180	Sca_0181		clpC	TRUE	0.926	12.000	0.425	1.000	N	NA
5566344	5566345	Sca_0181	Sca_0182	clpC	radA	FALSE	0.467	263.000	0.062	0.013	Y	NA
5566345	5566346	Sca_0182	Sca_0183	radA		TRUE	0.761	31.000	0.056	NA		NA
5566346	5566347	Sca_0183	Sca_0184		gltX	FALSE	0.041	294.000	0.021	NA		NA
5566347	5566348	Sca_0184	Sca_0185	gltX	cysE	FALSE	0.055	291.000	0.008	1.000	N	NA
5566348	5566349	Sca_0185	Sca_0186	cysE	cysS	TRUE	0.988	-16.000	0.039	0.062	N	NA
5566349	5566350	Sca_0186	Sca_0187	cysS		TRUE	0.992	-7.000	0.129	0.002		NA
5566350	5566351	Sca_0187	Sca_0188		spoU	TRUE	0.984	0.000	0.150	0.005		NA
5566351	5566352	Sca_0188	Sca_0189	spoU		TRUE	0.882	4.000	0.109	NA		NA
5566352	5566353	Sca_0189	Sca_0190		sigH	TRUE	0.501	72.000	0.036	NA		NA
5566353	5566354	Sca_0190	Sca_0191	sigH	secE	FALSE	0.017	307.000	0.000	1.000	N	NA
5566354	5566355	Sca_0191	Sca_0192	secE	nusG	TRUE	0.950	21.000	0.843	1.000	N	NA
5566355	5566356	Sca_0192	Sca_0193	nusG	rplK	FALSE	0.459	183.000	0.681	1.000	N	NA
5566356	5566357	Sca_0193	Sca_0194	rplK	rplA	TRUE	0.777	206.000	0.838	0.031	Y	NA
5566357	5566358	Sca_0194	Sca_0195	rplA	rplJ	FALSE	0.417	340.000	0.302	0.031	Y	NA
5566358	5566359	Sca_0195	Sca_0196	rplJ	rplL	TRUE	0.984	41.000	0.884	0.023	Y	NA
5566359	5566360	Sca_0196	Sca_0197	rplL		FALSE	0.272	261.000	0.050	1.000	Y	NA
5566362	5566363	Sca_0199	Sca_0200	rpoB	rpoC	TRUE	0.866	182.000	0.851	0.002	Y	NA
5566363	5566364	Sca_0200	Sca_0201	rpoC		FALSE	0.017	183.000	0.000	NA		NA
5566364	5566365	Sca_0201	Sca_0202			TRUE	0.728	-24.000	0.000	NA		NA
5566365	5566366	Sca_0202	Sca_0203			FALSE	0.013	202.000	0.000	NA		NA
5566366	5566367	Sca_0203	Sca_0204		rpsL	TRUE	0.826	96.000	0.239	NA	Y	NA
5566367	5566368	Sca_0204	Sca_0205	rpsL	rpsG	TRUE	0.954	71.000	0.224	0.005	Y	NA
5566368	5566369	Sca_0205	Sca_0206	rpsG	fusA	TRUE	0.857	114.000	0.579	1.000	Y	NA
5566369	5566370	Sca_0206	Sca_0207	fusA	tufA	TRUE	0.823	190.000	0.400	0.001	Y	NA
5566374	5566375	Sca_0211	Sca_0212			TRUE	0.822	15.000	0.000	0.015		NA
5566375	5566376	Sca_0212	Sca_0213			FALSE	0.027	210.000	0.000	1.000		NA
5566376	5566377	Sca_0213	Sca_0214			FALSE	0.033	189.000	0.000	NA	N	NA
5566377	5566378	Sca_0214	Sca_0215		ilvE	FALSE	0.021	222.000	0.000	NA	N	NA
5566378	5566379	Sca_0215	Sca_0216	ilvE		FALSE	0.025	155.000	0.000	NA		NA
5566379	5566380	Sca_0216	Sca_0217			FALSE	0.030	144.000	0.000	NA		NA
5566380	5566381	Sca_0217	Sca_0218			TRUE	0.583	41.000	0.011	NA		NA
5566381	5566382	Sca_0218	Sca_0219			FALSE	0.255	23.000	0.000	NA		NA
5566383	5566384	Sca_0220	Sca_0221			TRUE	0.998	-7.000	0.255	0.003	Y	NA
5566385	5566386	Sca_0222	Sca_0223			FALSE	0.232	215.000	0.013	0.022		NA
5566386	5566387	Sca_0223	Sca_0224			TRUE	0.699	67.000	0.159	NA		NA
5566388	5566389	Sca_0225	Sca_0226			TRUE	0.726	2.000	0.000	1.000	N	NA
5566389	5566390	Sca_0226	Sca_0227		nagB	TRUE	0.893	92.000	0.600	1.000	Y	NA
5566391	5566392	Sca_0228	Sca_0229			TRUE	0.917	13.000	0.644	NA		NA
5566392	5566393	Sca_0229	Sca_0230			TRUE	0.762	17.000	0.026	NA		NA
5566393	5566394	Sca_0230	Sca_0231		proP	FALSE	0.005	489.000	0.000	1.000		NA
5566396	5566397	Sca_0233	Sca_0234	ung		TRUE	0.988	-7.000	0.800	NA		NA
5566397	5566398	Sca_0234	Sca_0235			FALSE	0.390	85.000	0.024	NA		NA
5566398	5566399	Sca_0235	Sca_0236			TRUE	0.502	67.000	0.021	NA		NA
5566399	5566400	Sca_0236	Sca_0237		apl	FALSE	0.012	303.000	0.000	1.000		NA
5566401	5566402	Sca_0238	Sca_0239			FALSE	0.015	190.000	0.000	NA		NA
5566402	5566403	Sca_0239	Sca_0240			TRUE	0.939	11.000	1.000	NA		NA
5566403	5566404	Sca_0240	Sca_0241			FALSE	0.002	1419.000	0.000	NA		NA
5566405	5566406	Sca_0242	Sca_0243	pta	lplA	TRUE	0.960	0.000	0.123	1.000	N	NA
5566406	5566407	Sca_0243	Sca_0244	lplA	mvaK1	FALSE	0.009	435.000	0.000	1.000	N	NA
5566407	5566408	Sca_0244	Sca_0245	mvaK1	mvaD	TRUE	0.988	7.000	0.281	0.003	Y	NA
5566408	5566409	Sca_0245	Sca_0246	mvaD	mvaK2	TRUE	0.997	-3.000	0.312	0.006	Y	NA
5566409	5566410	Sca_0246	Sca_0247	mvaK2		FALSE	0.098	211.000	0.030	NA		NA
5566412	5566413	Sca_0249	Sca_0250			FALSE	0.119	212.000	0.051	NA		NA
5566413	5566414	Sca_0250	Sca_0251			TRUE	0.677	43.000	0.025	1.000		NA
5566414	5566415	Sca_0251	Sca_0252			TRUE	0.515	69.000	0.028	NA		NA
5566417	5566418	Sca_0254	Sca_0255			FALSE	0.008	340.000	0.000	NA	N	NA
5566418	5566419	Sca_0255	Sca_0256			TRUE	0.967	-7.000	0.087	NA		NA
5566419	5566420	Sca_0256	Sca_0257			FALSE	0.002	487.000	0.000	NA		NA
5566420	5566421	Sca_0257	Sca_0258			FALSE	0.023	161.000	0.000	NA		NA
5566421	5566422	Sca_0258	Sca_0259		argS	TRUE	0.908	2.000	0.079	NA		NA
5566422	5566423	Sca_0259	Sca_0260	argS		FALSE	0.249	132.000	0.002	1.000	N	NA
5566423	5566424	Sca_0260	Sca_0261			TRUE	0.955	6.000	0.046	1.000	Y	NA
5566424	5566425	Sca_0261	Sca_0262			TRUE	0.742	80.000	0.412	1.000		NA
5566425	5566426	Sca_0262	Sca_0263			TRUE	0.989	-25.000	0.412	1.000		NA
5566426	5566427	Sca_0263	Sca_0264			FALSE	0.427	166.000	0.556	NA		NA
5566427	5566428	Sca_0264	Sca_0265			TRUE	0.597	122.000	0.571	NA		NA
5566429	5566430	Sca_0266	Sca_0267	sarA		FALSE	0.004	331.000	0.000	NA		NA
5566430	5566431	Sca_0267	Sca_0268			FALSE	0.383	120.000	0.091	NA		NA
5566433	5566434	Sca_0270	Sca_0271			TRUE	0.875	15.000	0.233	NA		NA
5566436	5566437	Sca_0273	Sca_0274			TRUE	0.991	-3.000	0.154	1.000	Y	NA
5566437	5566438	Sca_0274	Sca_0275			TRUE	0.995	-7.000	0.286	1.000	Y	NA
5566439	5566440	Sca_0276	Sca_0277			FALSE	0.057	154.000	0.000	1.000		NA
5566441	5566442	Sca_0278	Sca_0279			FALSE	0.266	18.000	0.000	NA		NA
5566442	5566443	Sca_0279	Sca_0280		maa	FALSE	0.076	81.000	0.000	NA		NA
5566444	5566445	Sca_0281	Sca_0282	tagA	thrS	FALSE	0.007	642.000	0.000	1.000	N	NA
5566445	5566446	Sca_0282	Sca_0283	thrS		FALSE	0.034	226.000	0.000	1.000	N	NA
5566446	5566447	Sca_0283	Sca_0284			FALSE	0.411	14.000	0.000	1.000		NA
5566448	5566449	Sca_0285	Sca_0286		tagH	FALSE	0.004	345.000	0.000	NA		NA
5566450	5566451	Sca_0287	Sca_0288	tagG	tagB	TRUE	0.910	82.000	0.138	0.091	Y	NA
5566451	5566452	Sca_0288	Sca_0289	tagB	tagX	TRUE	0.952	0.000	0.000	NA	Y	NA
5566452	5566453	Sca_0289	Sca_0290	tagX	tagD	FALSE	0.466	115.000	0.000	NA	Y	NA
5566455	5566456	Sca_0292	Sca_0293			FALSE	0.069	298.000	0.000	0.040	N	NA
5566456	5566457	Sca_0293	Sca_0294			FALSE	0.002	485.000	0.000	NA		NA
5566457	5566458	Sca_0294	Sca_0295		fhuC	FALSE	0.005	313.000	0.000	NA		NA
5566458	5566459	Sca_0295	Sca_0296	fhuC	fhuB	TRUE	0.963	11.000	0.179	1.000	Y	NA
5566459	5566460	Sca_0296	Sca_0297	fhuB	fhuG	TRUE	0.998	-3.000	0.857	0.031	Y	NA
5566460	5566461	Sca_0297	Sca_0298	fhuG		FALSE	0.043	119.000	0.000	NA		NA
5566461	5566462	Sca_0298	Sca_0299			FALSE	0.004	355.000	0.000	NA		NA
5566462	5566463	Sca_0299	Sca_0300			FALSE	0.143	225.000	0.135	NA		NA
5566465	5566466	Sca_0302	Sca_0303			TRUE	0.997	-13.000	0.958	1.000	Y	NA
5566466	5566467	Sca_0303	Sca_0304			TRUE	0.669	93.000	0.250	1.000	N	NA
5566467	5566468	Sca_0304	Sca_0305			TRUE	0.845	-10.000	0.000	1.000		NA
5566468	5566469	Sca_0305	Sca_0306			FALSE	0.003	394.000	0.000	NA		NA
5566469	5566470	Sca_0306	Sca_0307			TRUE	0.926	14.000	0.033	NA	Y	NA
5566471	5566472	Sca_0308	Sca_0309			FALSE	0.028	149.000	0.000	NA		NA
5566475	5566476	Sca_0312	Sca_0313			FALSE	0.002	485.000	0.000	NA		NA
5566476	5566477	Sca_0313	Sca_0314			FALSE	0.243	12.000	0.000	NA		NA
5566477	5566478	Sca_0314	Sca_0315			FALSE	0.165	42.000	0.000	NA		NA
5566478	5566479	Sca_0315	Sca_0316			TRUE	0.509	160.000	0.875	NA		NA
5566479	5566480	Sca_0316	Sca_0317			FALSE	0.065	208.000	0.002	NA		NA
5566480	5566481	Sca_0317	Sca_0318			TRUE	0.831	2.000	0.009	NA		NA
5566481	5566482	Sca_0318	Sca_0319			FALSE	0.009	230.000	0.000	NA		NA
5566482	5566483	Sca_0319	Sca_0320			FALSE	0.355	132.000	0.114	NA		NA
5566483	5566484	Sca_0320	Sca_0321			FALSE	0.294	175.000	0.159	NA	N	NA
5566484	5566485	Sca_0321	Sca_0322			TRUE	0.770	16.000	0.034	NA		NA
5566487	5566488	Sca_0324	Sca_0325			FALSE	0.086	75.000	0.000	NA		NA
5566488	5566489	Sca_0325	Sca_0326			FALSE	0.094	228.000	0.043	NA		NA
5566490	5566491	Sca_0327	Sca_0328			TRUE	0.732	18.000	0.017	NA		NA
5566491	5566492	Sca_0328	Sca_0329			TRUE	0.679	13.000	0.012	NA		NA
5566492	5566493	Sca_0329	Sca_0330		bacA	FALSE	0.018	180.000	0.000	NA		NA
5566494	5566495	Sca_0331	Sca_0332	cydD	cydC	TRUE	0.997	-3.000	0.222	0.006	Y	NA
5566497	5566498	Sca_0334	Sca_0335			FALSE	0.101	189.000	0.012	NA		NA
5566498	5566499	Sca_0335	Sca_0336			TRUE	0.652	31.000	0.012	NA		NA
5566499	5566500	Sca_0336	Sca_0337			TRUE	0.503	74.000	0.042	NA		NA
5566500	5566501	Sca_0337	Sca_0338		mdh	FALSE	0.107	172.000	0.005	NA		NA
5566501	5566502	Sca_0338	Sca_0339	mdh		FALSE	0.053	289.000	0.005	1.000	N	NA
5566504	5566505	Sca_0341	Sca_0342	norA		FALSE	0.008	335.000	0.000	NA	N	NA
5566505	5566506	Sca_0342	Sca_0343		ldh	TRUE	0.894	22.000	0.214	NA	N	NA
5566506	5566507	Sca_0343	Sca_0344	ldh		FALSE	0.005	298.000	0.000	NA		NA
5566507	5566508	Sca_0344	Sca_0345			FALSE	0.044	118.000	0.000	NA		NA
5566508	5566509	Sca_0345	Sca_0346			FALSE	0.442	127.000	0.004	0.063		NA
5566509	5566510	Sca_0346	Sca_0347		fruB	TRUE	0.989	-3.000	0.063	1.000	Y	NA
5566510	5566511	Sca_0347	Sca_0348	fruB	fruA	TRUE	0.983	7.000	0.889	1.000	Y	NA
5566511	5566512	Sca_0348	Sca_0349	fruA		FALSE	0.006	420.000	0.000	1.000		NA
5566512	5566513	Sca_0349	Sca_0350			FALSE	0.021	169.000	0.000	NA		NA
5566513	5566514	Sca_0350	Sca_0351			FALSE	0.082	77.000	0.000	NA		NA
5566514	5566515	Sca_0351	Sca_0352		saeR'	TRUE	0.984	-28.000	0.250	NA		NA
5566515	5566516	Sca_0352	Sca_0352a	saeR'	saeR''	TRUE	0.931	1.000	0.000	0.008		NA
5566516	5566517	Sca_0352a	Sca_0353	saeR''	saeS	TRUE	0.956	3.000	0.500	1.000		NA
5566518	5566519	Sca_0354	Sca_0355	scdA		FALSE	0.004	321.000	0.000	NA		NA
5566519	5566520	Sca_0355	Sca_0356			FALSE	0.022	229.000	0.000	1.000		NA
5566520	5566521	Sca_0356	Sca_0357			TRUE	0.497	104.000	0.143	NA		NA
5566521	5566522	Sca_0357	Sca_0358			FALSE	0.249	158.000	0.080	NA		NA
5566522	5566523	Sca_0358	Sca_0359			TRUE	0.986	-7.000	0.307	1.000	N	NA
5566523	5566524	Sca_0359	Sca_0360			TRUE	0.904	2.000	0.041	1.000		NA
5566525	5566526	Sca_0361	Sca_0362			TRUE	0.996	-10.000	0.027	0.019	Y	NA
5566526	5566527	Sca_0362	Sca_0363			TRUE	0.980	3.000	0.219	1.000	Y	NA
5566527	5566528	Sca_0363	Sca_0364			FALSE	0.117	281.000	0.000	1.000	Y	NA
5566528	5566529	Sca_0364	Sca_0365			TRUE	0.996	0.000	0.194	0.001	Y	NA
5566529	5566530	Sca_0365	Sca_0366			FALSE	0.007	642.000	0.000	1.000	N	NA
5566530	5566531	Sca_0366	Sca_0367			FALSE	0.015	269.000	0.000	1.000		NA
5566531	5566532	Sca_0367	Sca_0368		recQ	TRUE	0.760	13.000	0.022	1.000		NA
5566532	5566533	Sca_0368	Sca_0369	recQ	opuBA	FALSE	0.447	100.000	0.029	1.000	N	NA
5566533	5566534	Sca_0369	Sca_0370	opuBA	opuAC	TRUE	0.983	-3.000	0.382	1.000	N	NA
5566534	5566535	Sca_0370	Sca_0371	opuAC	hisC	FALSE	0.027	578.000	0.027	1.000	N	NA
5566535	5566536	Sca_0371	Sca_0372	hisC		FALSE	0.270	157.000	0.102	NA		NA
5566536	5566537	Sca_0372	Sca_0373			TRUE	0.729	-25.000	0.000	NA		NA
5566538	5566539	Sca_0374	Sca_0375			FALSE	0.415	229.000	0.000	0.001	Y	NA
5566539	5566540	Sca_0375	Sca_0376			FALSE	0.157	165.000	0.008	1.000		NA
5566540	5566541	Sca_0376	Sca_0377			TRUE	0.820	3.000	0.005	1.000		NA
5566542	5566543	Sca_0378	Sca_0379	nrdI	nrdE	TRUE	0.996	-19.000	0.533	NA	Y	NA
5566543	5566544	Sca_0379	Sca_0380	nrdE	nrdF	TRUE	0.930	139.000	0.875	0.001	Y	NA
5566544	5566545	Sca_0380	Sca_0381	nrdF	sstA	FALSE	0.021	284.000	0.000	1.000	N	NA
5566545	5566546	Sca_0381	Sca_0382	sstA	sstB	TRUE	0.999	-10.000	0.870	0.031	Y	NA
5566546	5566547	Sca_0382	Sca_0383	sstB	sstC	TRUE	0.996	-3.000	0.870	1.000	Y	NA
5566547	5566548	Sca_0383	Sca_0384	sstC	sstD	TRUE	0.771	88.000	0.031	1.000	Y	NA
5566549	5566550	Sca_0385	Sca_0386		murB	TRUE	0.738	13.000	0.014	1.000		NA
5566550	5566551	Sca_0386	Sca_0387	murB		FALSE	0.331	80.000	0.005	NA		NA
5566552	5566553	Sca_0388	Sca_0389			FALSE	0.291	139.000	0.069	NA		NA
5566553	5566554	Sca_0389	Sca_0390			FALSE	0.009	235.000	0.000	NA		NA
5566555	5566556	Sca_0391	Sca_0392	pepT		TRUE	0.831	14.000	0.127	NA		NA
5566556	5566557	Sca_0392	Sca_0393			TRUE	0.939	19.000	0.875	NA		NA
5566557	5566558	Sca_0393	Sca_0394			FALSE	0.013	205.000	0.000	NA		NA
5566561	5566562	Sca_0397	Sca_0398			TRUE	0.861	28.000	0.214	NA		NA
5566562	5566563	Sca_0398	Sca_0399			TRUE	0.972	-7.000	0.130	NA		NA
5566563	5566564	Sca_0399	Sca_0400			TRUE	0.577	72.000	0.080	NA		NA
5566564	5566565	Sca_0400	Sca_0401		secA	FALSE	0.038	392.000	0.041	NA	N	NA
5566565	5566566	Sca_0401	Sca_0401a	secA	prfB'	FALSE	0.020	172.000	0.000	NA		NA
5566566	5566567	Sca_0401a	Sca_0402	prfB'	prfB''	FALSE	0.157	44.000	0.000	NA		NA
5566567	5566568	Sca_0402	Sca_0404	prfB''		FALSE	0.011	311.000	0.000	1.000		NA
5566568	5566569	Sca_0404	Sca_0405			FALSE	0.033	194.000	0.000	1.000		NA
5566569	5566570	Sca_0405	Sca_0406			TRUE	0.843	7.000	0.093	NA		NA
5566570	5566571	Sca_0406	Sca_0407		uvrB	FALSE	0.023	349.000	0.007	NA		NA
5566571	5566572	Sca_0407	Sca_0408	uvrB	uvrA	TRUE	0.986	8.000	0.154	0.002	Y	NA
5566572	5566573	Sca_0408	Sca_0409	uvrA	hprK	FALSE	0.098	212.000	0.002	1.000	N	NA
5566573	5566574	Sca_0409	Sca_0410	hprK	lgt	TRUE	0.985	-3.000	0.494	1.000	N	NA
5566574	5566575	Sca_0410	Sca_0411	lgt		TRUE	0.810	15.000	0.045	1.000		NA
5566575	5566576	Sca_0411	Sca_0412			TRUE	0.887	21.000	0.169	1.000		NA
5566576	5566577	Sca_0412	Sca_0413		trxB	TRUE	0.543	110.000	0.183	1.000		NA
5566577	5566578	Sca_0413	Sca_0414	trxB		FALSE	0.266	139.000	0.050	NA		NA
5566578	5566579	Sca_0414	Sca_0415			TRUE	0.981	-13.000	0.214	NA		NA
5566579	5566580	Sca_0415	Sca_0416			TRUE	0.916	19.000	0.470	NA		NA
5566581	5566582	Sca_0417	Sca_0418			FALSE	0.007	392.000	0.000	NA	N	NA
5566582	5566583	Sca_0418	tRNA-Sca_0010		tRNA-Arg_(CCG)	FALSE	0.007	268.000	0.000	NA		NA
5566588	5566589	Sca_0423	Sca_0424		gapA	TRUE	0.707	66.000	0.076	1.000	N	NA
5566589	5566590	Sca_0424	Sca_0425	gapA	pgk	FALSE	0.380	264.000	0.006	0.008	Y	NA
5566590	5566591	Sca_0425	Sca_0426	pgk	tpiA	TRUE	0.932	43.000	0.141	1.000	Y	NA
5566591	5566592	Sca_0426	Sca_0427	tpiA	gpmI	TRUE	0.981	2.000	0.138	1.000	Y	NA
5566592	5566593	Sca_0427	Sca_0428	gpmI	eno	TRUE	0.815	96.000	0.136	1.000	Y	NA
5566593	5566594	Sca_0428	Sca_0429	eno		FALSE	0.088	188.000	0.005	NA		NA
5566594	5566595	Sca_0429	Sca_0430		secG	FALSE	0.300	91.000	0.007	NA		NA
5566595	5566596	Sca_0430	Sca_0431	secG	est	FALSE	0.443	91.000	0.032	1.000		NA
5566596	5566597	Sca_0431	Sca_0432	est	rnr	TRUE	0.757	39.000	0.060	1.000		NA
5566597	5566598	Sca_0432	Sca_0433	rnr	smpB	TRUE	0.832	76.000	0.143	0.025	N	NA
5566598	5566599	Sca_0433	NEW_REGION_507	smpB		FALSE	0.025	155.000	0.000	NA		NA
5566599	5566600	NEW_REGION_507	Sca_0434			FALSE	0.002	987.000	0.000	NA		NA
5566600	5566601	Sca_0434	Sca_0435			FALSE	0.028	148.000	0.000	NA		NA
5566603	5566604	Sca_0437	Sca_0438	csp		FALSE	0.051	107.000	0.000	NA		NA
5566605	5566606	Sca_0439	Sca_0440			FALSE	0.016	189.000	0.000	NA		NA
5566606	5566607	Sca_0440	Sca_0441			FALSE	0.048	110.000	0.000	NA		NA
5566608	5566609	Sca_0442	Sca_0443			TRUE	0.538	48.000	0.010	NA		NA
5566609	5566610	Sca_0443	Sca_0444			FALSE	0.010	220.000	0.000	NA		NA
5566610	5566611	Sca_0444	Sca_0445			FALSE	0.016	186.000	0.000	NA		NA
5566612	5566613	Sca_0446	Sca_0447			FALSE	0.255	23.000	0.000	NA		NA
5566614	5566615	Sca_0448	Sca_0449	aroD		TRUE	0.557	73.000	0.022	1.000	N	NA
5566617	5566618	Sca_0451	Sca_0452		gcdH	FALSE	0.398	157.000	0.170	1.000	N	NA
5566618	5566619	Sca_0452	Sca_0453	gcdH		FALSE	0.087	280.000	0.043	1.000	N	NA
5566619	5566620	Sca_0453	Sca_0454			TRUE	0.979	-3.000	0.443	NA		NA
5566620	5566621	Sca_0454	Sca_0455			FALSE	0.007	260.000	0.000	NA		NA
5566621	5566622	Sca_0455	Sca_0456			TRUE	0.996	-7.000	0.642	1.000	Y	NA
5566622	5566623	Sca_0456	Sca_0457			TRUE	0.923	34.000	0.085	NA	Y	NA
5566623	5566624	Sca_0457	Sca_0458			FALSE	0.007	373.000	0.000	NA	N	NA
5566624	5566625	Sca_0458	Sca_0459			TRUE	0.901	66.000	0.139	1.000	Y	NA
5566625	5566626	Sca_0459	Sca_0460		csdB	FALSE	0.386	203.000	0.606	1.000	N	NA
5566626	5566627	Sca_0460	Sca_0461	csdB		TRUE	0.987	-10.000	0.292	1.000	N	NA
5566627	5566628	Sca_0461	Sca_0462		sufB	FALSE	0.408	231.000	0.152	0.002	N	NA
5566629	5566630	Sca_0463	Sca_0464	int		FALSE	0.002	477.000	0.000	NA		NA
5566630	5566631	Sca_0464	Sca_0465			FALSE	0.004	342.000	0.000	NA		NA
5566631	5566632	Sca_0465	Sca_0466			FALSE	0.258	16.000	0.000	NA		NA
5566633	5566634	Sca_0467	Sca_0468			FALSE	0.289	6.000	0.000	NA		NA
5566635	5566636	Sca_0469	Sca_0470			FALSE	0.002	671.000	0.000	NA		NA
5566637	5566638	Sca_0471	Sca_0472			FALSE	0.005	306.000	0.000	NA		NA
5566638	5566639	Sca_0472	Sca_0473			TRUE	0.677	-7.000	0.000	NA		NA
5566639	5566640	Sca_0473	Sca_0474			TRUE	0.732	-43.000	0.000	NA		NA
5566640	5566641	Sca_0474	Sca_0475		ssb	TRUE	0.912	0.000	0.034	NA		NA
5566641	5566642	Sca_0475	Sca_0476	ssb		TRUE	0.924	12.000	0.500	1.000		NA
5566642	5566643	Sca_0476	Sca_0477			TRUE	0.967	1.000	0.500	NA		NA
5566643	5566644	Sca_0477	Sca_0478			TRUE	0.959	-3.000	0.105	NA		NA
5566644	5566645	Sca_0478	Sca_0479			TRUE	0.930	1.000	0.105	NA		NA
5566645	5566646	Sca_0479	Sca_0480			FALSE	0.323	166.000	0.000	1.000	Y	NA
5566646	5566647	Sca_0480	Sca_0481			TRUE	0.609	-3.000	0.000	NA		NA
5566647	5566648	Sca_0481	Sca_0482			FALSE	0.289	6.000	0.000	NA		NA
5566648	5566649	Sca_0482	Sca_0483			TRUE	0.472	1.000	0.000	NA		NA
5566649	5566650	Sca_0483	Sca_0484			TRUE	0.677	-7.000	0.000	NA		NA
5566650	5566651	Sca_0484	Sca_0485			FALSE	0.151	47.000	0.000	NA		NA
5566651	5566652	Sca_0485	Sca_0486		dut	FALSE	0.014	197.000	0.000	NA		NA
5566652	5566653	Sca_0486	Sca_0487	dut		FALSE	0.142	50.000	0.000	NA		NA
5566653	5566654	Sca_0487	Sca_0488			TRUE	0.472	1.000	0.000	NA		NA
5566654	5566655	Sca_0488	Sca_0489			FALSE	0.006	272.000	0.000	NA		NA
5566655	5566656	Sca_0489	Sca_0490			FALSE	0.002	524.000	0.000	NA		NA
5566656	5566657	Sca_0490	Sca_0491			FALSE	0.232	13.000	0.000	NA		NA
5566657	5566658	Sca_0491	Sca_0492			FALSE	0.002	804.000	0.000	NA		NA
5566658	5566659	Sca_0492	Sca_0493			TRUE	0.976	-3.000	0.333	NA		NA
5566659	5566660	Sca_0493	Sca_0494			TRUE	0.880	15.000	0.250	NA		NA
5566660	5566661	Sca_0494	Sca_0495			TRUE	0.974	-10.000	0.118	NA		NA
5566661	5566662	Sca_0495	Sca_0496			TRUE	0.838	25.000	0.118	NA		NA
5566662	5566663	Sca_0496	Sca_0497			TRUE	0.660	73.000	0.182	NA		NA
5566663	5566664	Sca_0497	Sca_0498			TRUE	0.989	-25.000	0.500	NA		NA
5566664	5566665	Sca_0498	Sca_0499			TRUE	0.973	-3.000	0.250	NA		NA
5566665	5566666	Sca_0499	Sca_0500			TRUE	0.971	-3.000	0.222	NA		NA
5566666	5566667	Sca_0500	Sca_0501			TRUE	0.877	42.000	0.615	NA		NA
5566667	5566668	Sca_0501	Sca_0502			TRUE	0.619	77.000	0.154	NA		NA
5566668	5566669	Sca_0502	Sca_0503			TRUE	0.832	48.000	0.400	NA		NA
5566669	5566670	Sca_0503	Sca_0504			TRUE	0.822	51.000	0.400	NA		NA
5566670	5566671	Sca_0504	Sca_0505			FALSE	0.233	14.000	0.000	NA		NA
5566671	5566672	Sca_0505	Sca_0506			FALSE	0.340	35.000	0.000	1.000		NA
5566672	5566673	Sca_0506	Sca_0507			TRUE	0.966	-3.000	0.154	NA		NA
5566673	5566674	Sca_0507	Sca_0508			TRUE	0.939	11.000	1.000	NA		NA
5566674	5566675	Sca_0508	Sca_0509			TRUE	0.677	-7.000	0.000	NA		NA
5566675	5566676	Sca_0509	Sca_0510			FALSE	0.306	5.000	0.000	NA		NA
5566676	5566677	Sca_0510	Sca_0511			FALSE	0.367	3.000	0.000	NA		NA
5566677	5566678	Sca_0511	Sca_0512			TRUE	0.935	5.000	0.500	NA		NA
5566678	5566679	Sca_0512	Sca_0513			TRUE	0.972	0.000	0.500	NA		NA
5566679	5566680	Sca_0513	Sca_0514			FALSE	0.172	39.000	0.000	NA		NA
5566680	5566681	Sca_0514	Sca_0515			TRUE	0.711	-13.000	0.000	NA		NA
5566681	5566682	Sca_0515	Sca_0516			FALSE	0.151	47.000	0.000	NA		NA
5566682	5566683	Sca_0516	Sca_0517			FALSE	0.128	59.000	0.000	NA		NA
5566683	5566684	Sca_0517	Sca_0518			TRUE	0.977	0.000	0.750	NA		NA
5566684	5566685	Sca_0518	Sca_0519			FALSE	0.002	694.000	0.000	NA		NA
5566685	5566686	Sca_0519	Sca_0520			TRUE	0.677	-7.000	0.000	NA		NA
5566686	5566687	Sca_0520	Sca_0521		glpQ	FALSE	0.079	80.000	0.000	NA		NA
5566687	5566688	Sca_0521	Sca_0522	glpQ		FALSE	0.002	788.000	0.000	NA		NA
5566688	5566689	Sca_0522	Sca_0523			FALSE	0.005	307.000	0.000	NA		NA
5566689	5566690	Sca_0523	Sca_0524			TRUE	0.730	42.000	0.085	NA		NA
5566690	5566691	Sca_0524	Sca_0525			FALSE	0.347	125.000	0.079	NA		NA
5566691	5566692	Sca_0525	Sca_0526			TRUE	0.889	12.000	0.303	NA		NA
5566692	5566693	Sca_0526	Sca_0527			TRUE	0.914	17.000	0.299	1.000		NA
5566693	5566694	Sca_0527	Sca_0528		lipA	FALSE	0.460	84.000	0.012	1.000	N	NA
5566694	5566695	Sca_0528	Sca_0529	lipA		FALSE	0.118	184.000	0.021	NA		NA
5566697	5566698	Sca_0531	Sca_0532			TRUE	0.907	5.000	0.237	NA		NA
5566698	5566699	Sca_0532	Sca_0533			TRUE	0.934	9.000	0.082	0.073	N	NA
5566699	5566700	Sca_0533	Sca_0534		dltA	FALSE	0.007	592.000	0.000	1.000	N	NA
5566700	5566701	Sca_0534	Sca_0535	dltA	dltB	TRUE	0.974	0.000	0.435	NA	N	NA
5566701	5566702	Sca_0535	Sca_0536	dltB	dltC	TRUE	0.906	23.000	0.387	NA		NA
5566702	5566703	Sca_0536	Sca_0537	dltC	dltD	TRUE	0.951	-3.000	0.064	NA		NA
5566703	5566704	Sca_0537	Sca_0538	dltD		FALSE	0.034	184.000	0.000	NA	N	NA
5566704	5566705	Sca_0538	Sca_0539			FALSE	0.063	177.000	0.000	1.000	N	NA
5566707	5566708	Sca_0541	Sca_0542			FALSE	0.053	105.000	0.000	NA		NA
5566710	5566711	Sca_0544	Sca_0545			TRUE	0.568	44.000	0.012	NA		NA
5566711	5566712	Sca_0545	Sca_0546			FALSE	0.005	304.000	0.000	NA		NA
5566712	5566713	Sca_0546	Sca_0547			TRUE	0.474	120.000	0.097	1.000	N	NA
5566713	5566714	Sca_0547	Sca_0548			FALSE	0.165	164.000	0.025	NA		NA
5566714	5566715	Sca_0548	Sca_0549			TRUE	0.755	31.000	0.052	NA		NA
5566716	5566717	Sca_0550	Sca_0551		mnhG	TRUE	0.744	137.000	0.364	NA	Y	NA
5566717	5566718	Sca_0551	Sca_0552	mnhG	mnhF	TRUE	0.996	-28.000	0.244	1.000	Y	NA
5566718	5566719	Sca_0552	Sca_0553	mnhF	mnhE	TRUE	0.996	0.000	0.829	0.066	Y	NA
5566719	5566720	Sca_0553	Sca_0554	mnhE	mnhD	TRUE	0.991	2.000	0.842	1.000	Y	NA
5566720	5566721	Sca_0554	Sca_0555	mnhD	mnhC	TRUE	0.998	-7.000	0.211	0.003	Y	NA
5566721	5566722	Sca_0555	Sca_0556	mnhC	mnhB	TRUE	0.987	0.000	0.195	NA	Y	NA
5566722	5566723	Sca_0556	Sca_0557	mnhB	mnhA	TRUE	0.947	44.000	0.439	NA	Y	NA
5566723	5566724	Sca_0557	Sca_0558	mnhA		FALSE	0.408	136.000	0.206	NA		NA
5566725	5566726	Sca_0559	Sca_0560			FALSE	0.055	102.000	0.000	NA		NA
5566726	5566727	Sca_0560	Sca_0561			FALSE	0.228	28.000	0.000	NA		NA
5566727	5566728	Sca_0561	Sca_0562			FALSE	0.088	152.000	0.000	1.000	N	NA
5566728	5566729	Sca_0562	Sca_0563			FALSE	0.101	243.000	0.027	1.000	N	NA
5566729	5566730	Sca_0563	Sca_0564		rocA	FALSE	0.142	253.000	0.000	1.000	Y	NA
5566730	5566731	Sca_0564	Sca_0565	rocA	rocD	FALSE	0.186	180.000	0.023	1.000	N	NA
5566731	5566732	Sca_0565	Sca_0566	rocD	gudB	TRUE	0.658	110.000	0.008	1.000	Y	NA
5566732	5566733	Sca_0566	Sca_0567	gudB		FALSE	0.021	233.000	0.000	1.000		NA
5566734	5566735	Sca_0568	Sca_0569	argH	argG	TRUE	0.995	-10.000	0.278	1.000	Y	NA
5566736	5566737	Sca_0570	Sca_0571	pgiA	orf1	FALSE	0.070	205.000	0.005	NA		NA
5566737	5566738	Sca_0571	Sca_0572	orf1	sipA	TRUE	0.824	13.000	0.115	NA		NA
5566738	5566739	Sca_0572	Sca_0573	sipA	sipB	TRUE	0.988	17.000	0.184	0.001	Y	NA
5566739	5566740	Sca_0573	Sca_0574	sipB	addB	FALSE	0.285	163.000	0.057	1.000	N	NA
5566740	5566741	Sca_0574	Sca_0575	addB	addA	TRUE	0.998	-3.000	0.408	0.003	Y	NA
5566741	5566742	Sca_0575	Sca_0576	addA		FALSE	0.268	174.000	0.075	1.000	N	NA
5566743	5566744	Sca_0577	Sca_0578		cdr	FALSE	0.042	121.000	0.000	NA		NA
5566744	5566745	Sca_0578	Sca_0579	cdr		FALSE	0.368	112.000	0.033	1.000		NA
5566746	5566747	Sca_0580	Sca_0581			FALSE	0.005	315.000	0.000	NA		NA
5566747	5566748	Sca_0581	Sca_0582		clpB	FALSE	0.049	197.000	0.000	1.000	N	NA
5566750	5566751	Sca_0584	Sca_0585	FabH	fab	TRUE	0.982	12.000	0.076	0.001	Y	NA
5566751	5566752	Sca_0585	Sca_0586	fab		FALSE	0.007	256.000	0.000	NA		NA
5566754	5566755	Sca_0588	Sca_0589	oppB	oppC	TRUE	0.992	0.000	0.062	0.029	Y	NA
5566755	5566756	Sca_0589	Sca_0590	oppC	oppD	TRUE	0.979	15.000	0.857	1.000	Y	NA
5566756	5566757	Sca_0590	Sca_0591	oppD	oppF	TRUE	0.998	-10.000	0.121	0.002	Y	NA
5566757	5566758	Sca_0591	Sca_0592	oppF	oppA	TRUE	0.951	15.000	0.091	1.000	Y	NA
5566758	5566759	Sca_0592	Sca_0593	oppA		FALSE	0.046	163.000	0.000	NA	N	NA
5566759	5566760	Sca_0593	Sca_0594		thiC'	FALSE	0.007	378.000	0.000	NA	N	NA
5566760	5566761	Sca_0594	Sca_0595	thiC'	thiC''	TRUE	0.988	-69.000	0.010	0.005		NA
5566763	5566764	Sca_0597	Sca_0598			FALSE	0.069	305.000	0.063	NA	N	NA
5566764	5566765	Sca_0598	Sca_0599		pepF	FALSE	0.012	289.000	0.000	NA	N	NA
5566766	5566767	Sca_0600	Sca_0601			FALSE	0.379	31.000	0.000	1.000		NA
5566767	5566768	Sca_0601	Sca_0602			FALSE	0.127	60.000	0.000	NA		NA
5566768	5566769	Sca_0602	Sca_0603			FALSE	0.003	415.000	0.000	NA		NA
5566769	5566770	Sca_0603	Sca_0604			TRUE	0.855	16.000	0.138	NA		NA
5566770	5566771	Sca_0604	Sca_0605			FALSE	0.467	103.000	0.063	1.000		NA
5566772	5566773	Sca_0606	Sca_0607			TRUE	0.898	17.000	0.283	NA		NA
5566773	5566774	Sca_0607	Sca_0608			TRUE	0.941	9.000	0.725	1.000		NA
5566774	5566775	Sca_0608	Sca_0609			TRUE	0.978	0.000	0.480	1.000	N	NA
5566775	5566776	Sca_0609	Sca_0610			TRUE	0.900	21.000	0.163	1.000	N	NA
5566776	5566777	Sca_0610	Sca_0611			TRUE	0.954	11.000	0.094	1.000	Y	NA
5566777	5566778	Sca_0611	Sca_0612		fabI	FALSE	0.118	213.000	0.016	1.000	N	NA
5566778	5566779	Sca_0612	Sca_0613	fabI		FALSE	0.010	418.000	0.000	1.000	N	NA
5566780	5566781	Sca_0614	Sca_0615			FALSE	0.008	253.000	0.000	NA		NA
5566782	5566783	Sca_0616	Sca_0617			TRUE	0.637	97.000	0.287	NA	N	NA
5566784	5566785	Sca_0618	Sca_0619			TRUE	0.986	-22.000	0.239	NA	N	NA
5566786	5566787	Sca_0621	Sca_0623	murE	prfC	FALSE	0.177	234.000	0.003	0.057	N	NA
5566787	5566788	Sca_0623	Sca_0624	prfC		FALSE	0.023	273.000	0.000	1.000	N	NA
5566788	5566789	Sca_0624	Sca_0625			FALSE	0.271	178.000	0.095	1.000	N	NA
5566789	5566790	Sca_0625	Sca_0626			TRUE	0.880	18.000	0.096	1.000	N	NA
5566790	5566791	Sca_0626	Sca_0627			FALSE	0.022	219.000	0.000	NA	N	NA
5566791	5566792	Sca_0627	Sca_0628			TRUE	0.794	30.000	0.051	NA	N	NA
5566793	5566794	Sca_0629	Sca_0630	hisIE	hisF	TRUE	0.998	-9.000	0.430	0.004	Y	NA
5566794	5566795	Sca_0630	Sca_0631	hisF	hisA	TRUE	0.993	-3.000	0.002	0.004	Y	NA
5566795	5566796	Sca_0631	Sca_0632	hisA	hisH	TRUE	0.995	-7.000	0.009	0.004	Y	NA
5566796	5566797	Sca_0632	Sca_0633	hisH	hisB	TRUE	0.996	-3.000	0.125	0.004	Y	NA
5566797	5566798	Sca_0633	Sca_0634	hisB	hisC	TRUE	0.996	-22.000	0.341	1.000	Y	NA
5566798	5566799	Sca_0634	Sca_0635	hisC	hisD	TRUE	0.984	-3.000	0.009	1.000	Y	NA
5566799	5566800	Sca_0635	Sca_0636	hisD	hisG	TRUE	0.996	-10.000	0.007	0.004	Y	NA
5566800	5566801	Sca_0636	Sca_0637	hisG	hisZ	TRUE	0.963	13.000	0.239	0.001		NA
5566801	5566802	Sca_0637	Sca_0638	hisZ		FALSE	0.042	176.000	0.000	1.000		NA
5566803	5566804	Sca_0639	Sca_0640			FALSE	0.007	389.000	0.000	1.000		NA
5566804	5566805	Sca_0640	Sca_0641			TRUE	0.930	33.000	0.059	0.001		NA
5566806	5566807	tRNA-Sca_0011	tRNA-Sca_0012	tRNA-Ser_(GCT)	tRNA-Asn_(GTT)	FALSE	0.426	2.000	0.000	NA		NA
5566807	5566808	tRNA-Sca_0012	Sca_0642	tRNA-Asn_(GTT)		FALSE	0.025	156.000	0.000	NA		NA
5566811	5566812	Sca_0645	Sca_0646			TRUE	0.879	7.000	0.167	NA		NA
5566813	5566814	Sca_0647	Sca_0648			FALSE	0.232	13.000	0.000	NA		NA
5566817	5566818	Sca_0651	Sca_0652	menF	menD	TRUE	0.993	-7.000	0.142	1.000	Y	NA
5566818	5566819	Sca_0652	Sca_0653	menD		TRUE	0.983	-7.000	0.355	NA		NA
5566819	5566820	Sca_0653	Sca_0654		menB	TRUE	0.980	-7.000	0.280	NA		NA
5566820	5566821	Sca_0654	Sca_0655	menB		FALSE	0.016	315.000	0.000	1.000	N	NA
5566822	5566823	Sca_0656	Sca_0657			FALSE	0.413	151.000	0.158	1.000	N	NA
5566825	5566826	Sca_0659	Sca_0661	bph		FALSE	0.006	465.000	0.000	1.000		NA
5566826	5566827	Sca_0661	Sca_0662			TRUE	0.599	106.000	0.364	NA		NA
5566827	5566828	Sca_0662	Sca_0663			TRUE	0.935	19.000	0.800	NA		NA
5566829	5566830	Sca_0664	Sca_0665			TRUE	0.829	64.000	0.333	1.000	N	NA
5566830	5566831	Sca_0665	Sca_0666			FALSE	0.060	151.000	0.000	1.000		NA
5566831	5566832	Sca_0666	Sca_0667		lacF	FALSE	0.012	303.000	0.000	1.000		NA
5566832	5566833	Sca_0667	Sca_0668	lacF	lacE	TRUE	0.943	13.000	0.000	0.009	Y	NA
5566833	5566834	Sca_0668	Sca_0669	lacE	lacG	TRUE	0.900	84.000	0.500	1.000	Y	NA
5566835	5566836	Sca_0670	Sca_0671	arsC	arsB	TRUE	0.554	16.000	0.000	1.000	N	NA
5566836	5566837	Sca_0671	Sca_0672	arsB	lacD	FALSE	0.104	138.000	0.000	1.000	N	NA
5566837	5566838	Sca_0672	Sca_0673	lacD	lacC	TRUE	0.991	-3.000	0.000	0.001	Y	NA
5566838	5566839	Sca_0673	Sca_0674	lacC	lacB	TRUE	0.959	0.000	0.000	1.000	Y	NA
5566839	5566840	Sca_0674	Sca_0675	lacB	lacA	TRUE	0.989	19.000	0.286	0.001	Y	NA
5566840	5566841	Sca_0675	Sca_0676	lacA	lacR	FALSE	0.250	192.000	0.000	1.000	Y	NA
5566841	5566842	Sca_0676	Sca_0677	lacR		FALSE	0.227	81.000	0.000	1.000	N	NA
5566842	5566843	Sca_0677	Sca_0678		qoxD	FALSE	0.439	128.000	0.102	1.000	N	NA
5566843	5566844	Sca_0678	Sca_0679	qoxD	qoxC	TRUE	0.996	-3.000	0.959	1.000	Y	NA
5566844	5566845	Sca_0679	Sca_0680	qoxC	qoxB	TRUE	0.998	-7.000	0.957	0.028	Y	NA
5566845	5566846	Sca_0680	Sca_0681	qoxB	qoxA	TRUE	0.996	0.000	0.489	0.005	Y	NA
5566846	5566847	Sca_0681	Sca_0682	qoxA		FALSE	0.005	300.000	0.000	NA		NA
5566848	5566849	Sca_0683	Sca_0684			FALSE	0.133	122.000	0.000	1.000	N	NA
5566851	5566852	Sca_0686	Sca_0687	purE	purK	TRUE	0.997	-13.000	0.008	0.001	Y	NA
5566852	5566853	Sca_0687	Sca_0688	purK	purC	TRUE	0.978	0.000	0.015	1.000	Y	NA
5566853	5566854	Sca_0688	Sca_0689	purC	purS	TRUE	0.992	0.000	0.460	1.000	Y	NA
5566854	5566855	Sca_0689	Sca_0690	purS	purQ	TRUE	0.997	0.000	0.656	0.002	Y	NA
5566855	5566856	Sca_0690	Sca_0691	purQ	purL	TRUE	0.998	-7.000	0.346	0.002	Y	NA
5566856	5566857	Sca_0691	Sca_0692	purL	purF	TRUE	0.995	-21.000	0.223	1.000	Y	NA
5566857	5566858	Sca_0692	Sca_0693	purF	purM	TRUE	0.975	5.000	0.248	1.000	Y	NA
5566858	5566859	Sca_0693	Sca_0694	purM	purN	TRUE	0.997	-3.000	0.238	0.003	Y	NA
5566859	5566860	Sca_0694	Sca_0695	purN	purH	TRUE	0.968	18.000	0.225	1.000	Y	NA
5566860	5566861	Sca_0695	Sca_0696	purH	purD	TRUE	0.966	25.000	0.238	1.000	Y	NA
5566862	5566863	Sca_0697	Sca_0698			FALSE	0.010	226.000	0.000	NA		NA
5566863	5566864	Sca_0698	Sca_0699			TRUE	0.987	-7.000	0.469	1.000		NA
5566864	5566865	Sca_0699	Sca_0700			TRUE	0.872	13.000	0.241	NA		NA
5566866	5566867	Sca_0701	Sca_0702			FALSE	0.346	117.000	0.050	NA		NA
5566867	5566868	Sca_0702	Sca_0703			TRUE	0.823	15.000	0.100	NA		NA
5566868	5566869	Sca_0703	Sca_0704		ptsH	FALSE	0.242	149.000	0.047	NA		NA
5566869	5566870	Sca_0704	Sca_0705	ptsH	ptsI	TRUE	0.989	2.000	0.054	0.010	Y	NA
5566872	5566873	Sca_0707	Sca_0708			TRUE	0.998	-3.000	0.778	0.028	Y	NA
5566873	5566874	Sca_0708	Sca_0709			TRUE	0.611	99.000	0.163	1.000	N	NA
5566875	5566876	Sca_0710	Sca_0711			TRUE	0.726	2.000	0.000	1.000	N	NA
5566878	5566879	Sca_0713	Sca_0714			TRUE	0.974	0.000	0.576	NA		NA
5566882	5566883	Sca_0718	Sca_0719		pdhA	FALSE	0.189	169.000	0.046	NA		NA
5566883	5566884	Sca_0719	Sca_0720	pdhA	pdhB	TRUE	0.994	4.000	0.484	0.001	Y	NA
5566884	5566885	Sca_0720	Sca_0721	pdhB	pdhC	TRUE	0.504	347.000	0.883	0.071	Y	NA
5566885	5566886	Sca_0721	Sca_0722	pdhC	pdhD	TRUE	0.987	4.000	0.948	1.000	Y	NA
5566886	5566887	Sca_0722	Sca_0723	pdhD		FALSE	0.327	135.000	0.096	NA		NA
5566887	5566888	Sca_0723	Sca_0724			FALSE	0.272	127.000	0.034	NA		NA
5566888	5566889	Sca_0724	Sca_0725		potA	TRUE	0.918	12.000	0.326	1.000	N	NA
5566889	5566890	Sca_0725	Sca_0726	potA	potB	TRUE	0.997	-16.000	0.928	1.000	Y	NA
5566890	5566891	Sca_0726	Sca_0727	potB	potC	TRUE	0.997	-3.000	0.492	0.029	Y	NA
5566891	5566892	Sca_0727	Sca_0728	potC	potD	TRUE	0.996	-3.000	0.253	0.029	Y	NA
5566892	5566893	Sca_0728	Sca_0729	potD		TRUE	0.786	31.000	0.089	NA		NA
5566893	5566894	Sca_0729	Sca_0730			FALSE	0.007	267.000	0.000	NA		NA
5566895	5566896	Sca_0731	Sca_0732			FALSE	0.116	206.000	0.041	NA		NA
5566900	5566901	Sca_0736	Sca_0737			TRUE	0.935	2.000	0.173	NA		NA
5566902	5566903	Sca_0738	Sca_0739			FALSE	0.008	244.000	0.000	NA		NA
5566903	5566904	Sca_0739	Sca_0740		pyc	FALSE	0.010	427.000	0.000	1.000	N	NA
5566906	5566907	Sca_0742	Sca_0743	ctaB		TRUE	0.738	26.000	0.027	NA		NA
5566907	5566908	Sca_0743	Sca_0744			FALSE	0.283	135.000	0.052	NA		NA
5566908	5566909	Sca_0744	Sca_0745			TRUE	0.897	21.000	0.301	NA		NA
5566913	5566914	Sca_0749	Sca_0750		coaD	TRUE	0.987	-7.000	0.367	1.000	N	NA
5566915	5566916	Sca_0751	Sca_0752			FALSE	0.457	17.000	0.000	1.000		NA
5566917	5566918	Sca_0753	Sca_0754		rpmF	TRUE	0.677	101.000	0.599	NA		NA
5566918	5566919	Sca_0754	Sca_0755	rpmF		FALSE	0.290	177.000	0.000	1.000	Y	NA
5566919	5566920	Sca_0755	Sca_0756		pheS	FALSE	0.136	325.000	0.006	1.000	Y	NA
5566920	5566921	Sca_0756	Sca_0757	pheS	pheT	TRUE	0.997	0.000	0.574	0.001	Y	NA
5566923	5566924	Sca_0759	Sca_0760			TRUE	0.828	10.000	0.091	NA		NA
5566924	5566925	Sca_0760	Sca_0761			FALSE	0.453	107.000	0.066	1.000		NA
5566925	5566926	Sca_0761	Sca_0762		mutS2	TRUE	0.957	10.000	0.114	1.000	Y	NA
5566926	5566927	Sca_0762	Sca_0763	mutS2	trxA	FALSE	0.252	134.000	0.018	1.000		NA
5566927	5566928	Sca_0763	Sca_0764	trxA	uvrC	FALSE	0.084	241.000	0.023	1.000		NA
5566928	5566929	Sca_0764	Sca_0765	uvrC	sdhC	FALSE	0.009	480.000	0.000	1.000	N	NA
5566929	5566930	Sca_0765	Sca_0766	sdhC	sdhA	TRUE	0.969	56.000	0.184	0.002	Y	NA
5566930	5566931	Sca_0766	Sca_0767	sdhA	sdhB	TRUE	0.996	0.000	0.231	0.002	Y	NA
5566931	5566932	Sca_0767	Sca_0768	sdhB		FALSE	0.055	188.000	0.000	1.000	N	NA
5566932	5566933	Sca_0768	Sca_0769			TRUE	0.554	16.000	0.000	1.000	N	NA
5566933	5566934	Sca_0769	Sca_0770		murI	FALSE	0.046	203.000	0.000	1.000	N	NA
5566934	5566935	Sca_0770	Sca_0771	murI		TRUE	0.833	16.000	0.034	1.000	N	NA
5566935	5566936	Sca_0771	Sca_0772			TRUE	0.955	-3.000	0.085	NA		NA
5566936	5566937	Sca_0772	Sca_0773			FALSE	0.169	40.000	0.000	NA		NA
5566938	5566939	Sca_0774	Sca_0775		glx	FALSE	0.024	159.000	0.000	NA		NA
5566940	5566941	Sca_0776	Sca_0777			FALSE	0.020	171.000	0.000	NA		NA
5566942	5566943	Sca_0778	Sca_0779			FALSE	0.036	129.000	0.000	NA		NA
5566944	5566945	Sca_0780	Sca_0781			FALSE	0.002	588.000	0.000	NA		NA
5566945	5566946	Sca_0781	Sca_0782			FALSE	0.268	17.000	0.000	NA		NA
5566946	5566947	Sca_0782	Sca_0783			FALSE	0.148	48.000	0.000	NA		NA
5566949	5566950	Sca_0784	Sca_0785			TRUE	0.939	56.000	0.500	0.003		NA
5566951	5566952	Sca_0786	Sca_0787			FALSE	0.004	355.000	0.000	NA		NA
5566955	5566956	Sca_0790	Sca_0791		mraZ	FALSE	0.210	144.000	0.025	NA		NA
5566956	5566957	Sca_0791	Sca_0792	mraZ	mraW	TRUE	0.921	15.000	0.635	NA		NA
5566957	5566958	Sca_0792	Sca_0793	mraW		TRUE	0.867	20.000	0.077	1.000	N	NA
5566958	5566959	Sca_0793	Sca_0794		pbpA	TRUE	0.990	-19.000	0.456	1.000	N	NA
5566959	5566960	Sca_0794	Sca_0795	pbpA	mraY	TRUE	0.748	99.000	0.038	1.000	Y	NA
5566960	5566961	Sca_0795	Sca_0796	mraY	murD	TRUE	0.993	4.000	0.647	0.009	Y	NA
5566961	5566962	Sca_0796	Sca_0797	murD	div1b	TRUE	0.914	15.000	0.008	NA	Y	NA
5566962	5566963	Sca_0797	Sca_0798	div1b	ftsA	TRUE	0.654	102.000	0.389	NA	N	NA
5566963	5566964	Sca_0798	Sca_0799	ftsA	ftsZ	TRUE	0.969	30.000	0.460	1.000	Y	NA
5566964	5566965	Sca_0799	Sca_0800	ftsZ		FALSE	0.112	230.000	0.082	NA		NA
5566965	5566966	Sca_0800	Sca_0801			FALSE	0.232	13.000	0.000	NA		NA
5566966	5566967	Sca_0801	Sca_0802			TRUE	0.609	-3.000	0.000	NA		NA
5566967	5566968	Sca_0802	Sca_0803			TRUE	0.892	13.000	0.370	NA		NA
5566968	5566969	Sca_0803	Sca_0804			FALSE	0.203	236.000	0.287	1.000		NA
5566969	5566970	Sca_0804	Sca_0805			TRUE	0.920	25.000	0.579	NA		NA
5566970	5566971	Sca_0805	Sca_0806		ileS	FALSE	0.057	267.000	0.012	NA	N	NA
5566971	5566972	Sca_0806	Sca_0807	ileS		FALSE	0.011	216.000	0.000	NA		NA
5566972	5566973	Sca_0807	Sca_0808			TRUE	0.735	-78.000	0.000	NA		NA
5566973	5566974	Sca_0808	Sca_0809			TRUE	0.912	9.000	0.429	NA		NA
5566974	5566975	Sca_0809	Sca_0810		lsp	TRUE	0.600	107.000	0.375	NA		NA
5566975	5566976	Sca_0810	Sca_0811	lsp	rluD	TRUE	0.781	16.000	0.008	1.000	N	NA
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5566988	5566989	Sca_0823	Sca_0824		capC	FALSE	0.026	152.000	0.000	NA		NA
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5567004	5567005	Sca_0839	Sca_0840		pknB	TRUE	0.995	-3.000	0.704	1.000	Y	NA
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5567053	5567054	Sca_0889	Sca_0890	hslU	codY	TRUE	0.846	33.000	0.131	1.000	N	NA
5567054	5567055	Sca_0890	Sca_0891	codY	rpsB	FALSE	0.142	184.000	0.006	1.000	N	NA
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5567056	5567057	Sca_0892	Sca_0893	tsf	pyrH	TRUE	0.568	135.000	0.416	1.000	N	NA
5567057	5567058	Sca_0893	Sca_0894	pyrH	frr	TRUE	0.945	18.000	0.626	1.000	N	NA
5567058	5567059	Sca_0894	Sca_0895	frr	uppS	FALSE	0.403	181.000	0.409	1.000	N	NA
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5567060	5567061	Sca_0896	Sca_0897	cdsA		FALSE	0.120	234.000	0.040	1.000	N	NA
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5567064	5567065	Sca_0900	Sca_0901		nusA	TRUE	0.932	22.000	0.759	NA		NA
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5567068	5567069	Sca_0904	Sca_0905	infB	set	FALSE	0.028	206.000	0.000	1.000		NA
5567069	5567070	Sca_0905	Sca_0906	set		FALSE	0.033	134.000	0.000	NA		NA
5567070	5567071	Sca_0906	Sca_0907		ugpQ'	FALSE	0.015	192.000	0.000	NA		NA
5567071	5567072	Sca_0907	Sca_0908	ugpQ'	ugpQ''	TRUE	0.492	106.000	0.000	0.003		NA
5567072	5567073	Sca_0908	Sca_0909	ugpQ''		FALSE	0.183	35.000	0.000	NA		NA
5567073	5567074	Sca_0909	Sca_0910		rbfA	FALSE	0.007	376.000	0.000	NA	N	NA
5567074	5567075	Sca_0910	Sca_0911	rbfA	truB	TRUE	0.650	149.000	0.111	1.000	Y	NA
5567075	5567076	Sca_0911	Sca_0912	truB	ribC	TRUE	0.922	16.000	0.308	1.000	N	NA
5567076	5567077	Sca_0912	Sca_0913	ribC	rpsO	FALSE	0.467	125.000	0.119	1.000	N	NA
5567077	5567078	Sca_0913	Sca_0914	rpsO	pnpA	TRUE	0.688	165.000	0.335	1.000	Y	NA
5567078	5567079	Sca_0914	Sca_0915	pnpA		FALSE	0.127	175.000	0.002	1.000		NA
5567079	5567080	Sca_0915	Sca_0916		ftsK	FALSE	0.073	260.000	0.026	1.000		NA
5567080	5567081	Sca_0916	Sca_0918	ftsK		TRUE	0.965	3.000	0.115	0.037	N	NA
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5567082	5567083	Sca_0919	Sca_0920			TRUE	0.995	-3.000	0.872	0.004		NA
5567083	5567084	Sca_0920	Sca_0921			TRUE	0.973	0.000	0.397	1.000		NA
5567084	5567085	Sca_0921	Sca_0922			FALSE	0.366	129.000	0.114	NA		NA
5567085	5567086	Sca_0922	Sca_0923			TRUE	0.867	22.000	0.163	NA		NA
5567086	5567087	Sca_0923	Sca_0924		pgsA	TRUE	0.697	31.000	0.009	1.000		NA
5567087	5567088	Sca_0924	Sca_0925	pgsA		FALSE	0.372	151.000	0.151	1.000		NA
5567088	5567089	Sca_0925	Sca_0926		recA	FALSE	0.250	172.000	0.083	1.000		NA
5567089	5567090	Sca_0926	Sca_0927	recA		FALSE	0.059	275.000	0.018	1.000		NA
5567094	5567095	Sca_0931	Sca_0932			FALSE	0.302	107.000	0.021	NA		NA
5567095	5567096	Sca_0932	Sca_0933			TRUE	0.999	-13.000	0.437	0.001	Y	NA
5567096	5567097	Sca_0933	Sca_0934			FALSE	0.014	201.000	0.000	NA		NA
5567097	5567098	Sca_0934	Sca_0935			FALSE	0.074	82.000	0.000	NA		NA
5567098	5567099	Sca_0935	Sca_0936		appA	FALSE	0.015	191.000	0.000	NA		NA
5567099	5567100	Sca_0936	Sca_0937	appA	appD'	FALSE	0.067	376.000	0.000	1.000	Y	NA
5567100	5567101	Sca_0937	Sca_0938	appD'	appF	TRUE	0.988	13.000	0.333	0.001	Y	NA
5567101	5567102	Sca_0938	Sca_0939	appF	appB	TRUE	0.988	-3.000	0.045	1.000	Y	NA
5567102	5567103	Sca_0939	Sca_0940	appB	appC	TRUE	0.978	13.000	0.159	0.028	Y	NA
5567103	5567104	Sca_0940	Sca_0941	appC		FALSE	0.076	162.000	0.000	1.000	N	NA
5567104	5567105	Sca_0941	Sca_0942			TRUE	0.918	0.000	0.041	NA		NA
5567105	5567106	Sca_0942	Sca_0943			TRUE	0.778	32.000	0.091	NA		NA
5567108	5567109	Sca_0945	Sca_0946	mutS	mutL	TRUE	0.986	14.000	0.220	0.001	Y	NA
5567109	5567110	Sca_0946	Sca_0947	mutL	glpP	TRUE	0.795	12.000	0.020	1.000	N	NA
5567110	5567111	Sca_0947	Sca_0948	glpP	glpF	FALSE	0.290	169.000	0.083	1.000	N	NA
5567111	5567112	Sca_0948	Sca_0949	glpF	glpK	FALSE	0.255	174.000	0.057	1.000	N	NA
5567112	5567113	Sca_0949	Sca_0950	glpK	glpD	TRUE	0.700	177.000	0.013	0.001	Y	NA
5567113	5567114	Sca_0950	Sca_0951	glpD		FALSE	0.147	190.000	0.029	NA	N	NA
5567114	5567115	Sca_0951	Sca_0952		miaA	TRUE	0.963	-13.000	0.025	NA	N	NA
5567115	5567116	Sca_0952	Sca_0953	miaA		TRUE	0.876	2.000	0.016	1.000		NA
5567118	5567119	Sca_0955	Sca_0956			TRUE	0.932	1.000	0.065	1.000		NA
5567120	5567121	Sca_0957	Sca_0958	glnA		TRUE	0.880	19.000	0.103	1.000	N	NA
5567121	5567122	Sca_0958	Sca_0959			FALSE	0.010	227.000	0.000	NA		NA
5567123	5567124	Sca_0960	Sca_0961			FALSE	0.038	125.000	0.000	NA		NA
5567126	5567127	Sca_0963	Sca_0964	nuc		FALSE	0.118	129.000	0.000	1.000	N	NA
5567128	5567129	Sca_0965	Sca_0966			FALSE	0.008	243.000	0.000	NA		NA
5567130	5567131	Sca_0967	Sca_0968			FALSE	0.058	98.000	0.000	NA		NA
5567133	5567134	Sca_0970	Sca_0971	hom	thrC	TRUE	0.946	6.000	0.021	1.000	Y	NA
5567134	5567135	Sca_0971	Sca_0972	thrC	thrB	TRUE	0.989	0.000	0.221	1.000	Y	NA
5567135	5567136	Sca_0972	Sca_0973	thrB		TRUE	0.584	56.000	0.013	1.000		NA
5567137	5567138	Sca_0974	Sca_0975			TRUE	0.631	118.000	0.667	NA		NA
5567138	5567139	Sca_0975	Sca_0976		rpmG	FALSE	0.016	313.000	0.000	1.000	N	NA
5567140	5567141	Sca_0977	Sca_0978	rpsN	guaC	FALSE	0.159	187.000	0.015	1.000	N	NA
5567141	5567142	Sca_0978	Sca_0979	guaC		TRUE	0.795	23.000	0.049	NA		NA
5567144	5567145	Sca_0981	Sca_0982			FALSE	0.414	134.000	0.200	NA		NA
5567145	5567146	Sca_0982	Sca_0983		tkt	FALSE	0.233	202.000	0.240	NA		NA
5567146	5567147	Sca_0983	Sca_0984	tkt		FALSE	0.035	189.000	0.000	1.000		NA
5567147	5567148	Sca_0984	Sca_0985			FALSE	0.006	290.000	0.000	NA		NA
5567148	5567149	Sca_0985	Sca_0986			FALSE	0.054	103.000	0.000	NA		NA
5567149	5567150	Sca_0986	Sca_0987			FALSE	0.061	94.000	0.000	NA		NA
5567150	5567151	Sca_0987	Sca_0988			TRUE	0.995	-3.000	0.669	NA	Y	NA
5567153	5567154	Sca_0990	Sca_0991	opuD	citB	FALSE	0.025	260.000	0.000	1.000	N	NA
5567154	5567155	Sca_0991	Sca_0992	citB		FALSE	0.294	120.000	0.015	1.000		NA
5567156	5567157	Sca_0993	Sca_0994			FALSE	0.074	207.000	0.008	NA		NA
5567158	5567159	Sca_0995	Sca_0996	parE	parC	TRUE	0.995	-3.000	0.019	0.002	Y	NA
5567159	5567160	Sca_0996	Sca_0997	parC		FALSE	0.019	292.000	0.000	1.000	N	NA
5567160	5567161	Sca_0997	Sca_0998		glcT	FALSE	0.253	180.000	0.119	1.000		NA
5567161	5567162	Sca_0998	Sca_0999	glcT	glcA	FALSE	0.088	123.000	0.000	1.000		NA
5567162	5567163	Sca_0999	Sca_1000	glcA	glcB	TRUE	0.730	131.000	0.000	0.001	Y	NA
5567163	5567164	Sca_1000	Sca_1001	glcB		FALSE	0.011	215.000	0.000	NA		NA
5567164	5567165	Sca_1001	Sca_1002		fmtC	FALSE	0.130	174.000	0.018	NA		NA
5567165	5567166	Sca_1002	Sca_1003	fmtC	cysD	FALSE	0.004	344.000	0.000	NA		NA
5567166	5567167	Sca_1003	Sca_1004	cysD	metA	TRUE	0.965	2.000	0.005	1.000	Y	NA
5567171	5567172	Sca_1008	Sca_1009			TRUE	0.975	-34.000	0.000	0.016		NA
5567174	5567175	Sca_1011	Sca_1012		trpE	FALSE	0.007	553.000	0.000	1.000	N	NA
5567175	5567176	Sca_1012	Sca_1013	trpE	trpG	TRUE	0.995	-3.000	0.021	0.001	Y	NA
5567176	5567177	Sca_1013	Sca_1014	trpG	trpD	TRUE	0.984	-55.000	0.000	1.000	Y	NA
5567177	5567178	Sca_1014	Sca_1015	trpD	trpC	TRUE	0.987	-7.000	0.005	1.000	Y	NA
5567178	5567179	Sca_1015	Sca_1016	trpC	trpF	TRUE	0.990	5.000	0.264	0.002	Y	NA
5567179	5567180	Sca_1016	Sca_1017	trpF	trpB	TRUE	0.998	-3.000	0.375	0.002	Y	NA
5567180	5567181	Sca_1017	Sca_1018	trpB	trpA	TRUE	0.998	-7.000	0.248	0.001	Y	NA
5567181	5567182	Sca_1018	Sca_1019	trpA	femA	FALSE	0.017	305.000	0.000	1.000	N	NA
5567182	5567183	Sca_1019	Sca_1020	femA	femB	TRUE	0.990	27.000	1.000	0.008	Y	NA
5567184	5567185	Sca_1021	Sca_1022		opp-2F	FALSE	0.002	1402.000	0.000	NA		NA
5567185	5567186	Sca_1022	Sca_1023	opp-2F	opp-2D	TRUE	0.991	-7.000	0.000	0.023	Y	NA
5567186	5567187	Sca_1023	Sca_1024	opp-2D	opp-2C	TRUE	0.995	-7.000	0.353	1.000	Y	NA
5567187	5567188	Sca_1024	Sca_1025	opp-2C	opp-2B	TRUE	0.997	-3.000	0.647	0.027	Y	NA
5567188	5567189	Sca_1025	Sca_1026	opp-2B		TRUE	0.824	33.000	0.182	NA		NA
5567189	5567190	Sca_1026	Sca_1027			TRUE	0.734	-52.000	0.000	NA		NA
5567190	5567191	Sca_1027	Sca_1028			FALSE	0.022	163.000	0.000	NA		NA
5567193	5567194	Sca_1030	Sca_1031		pstB	TRUE	0.987	0.000	0.182	NA	Y	NA
5567194	5567195	Sca_1031	Sca_1032	pstB	pstA	TRUE	0.967	51.000	0.125	0.002	Y	NA
5567195	5567196	Sca_1032	Sca_1033	pstA		TRUE	0.995	2.000	0.485	0.002	Y	NA
5567196	5567197	Sca_1033	Sca_1034			TRUE	0.673	133.000	0.077	1.000	Y	NA
5567197	5567198	Sca_1034	Sca_1035			FALSE	0.003	421.000	0.000	NA		NA
5567199	5567200	Sca_1036	Sca_1037		lysC	FALSE	0.005	522.000	0.000	1.000		NA
5567200	5567201	Sca_1037	Sca_1038	lysC	asd	TRUE	0.834	85.000	0.119	1.000	Y	NA
5567201	5567202	Sca_1038	Sca_1039	asd	dapA	TRUE	0.960	3.000	0.015	1.000	Y	NA
5567202	5567203	Sca_1039	Sca_1040	dapA	dapB	TRUE	0.978	0.000	0.014	1.000	Y	NA
5567203	5567204	Sca_1040	Sca_1041	dapB	dapD	TRUE	0.943	23.000	0.036	1.000	Y	NA
5567204	5567205	Sca_1041	Sca_1042	dapD		TRUE	0.599	117.000	0.372	1.000		NA
5567205	5567206	Sca_1042	Sca_1043		alr	TRUE	0.896	3.000	0.058	1.000		NA
5567206	5567207	Sca_1043	Sca_1044	alr	lysA	TRUE	0.885	2.000	0.008	1.000	N	NA
5567208	5567209	Sca_1045	Sca_1046	csp		FALSE	0.052	351.000	0.105	NA		NA
5567210	5567211	Sca_1047	Sca_1048			TRUE	0.815	16.000	0.067	NA		NA
5567211	5567212	Sca_1048	Sca_1049			TRUE	0.906	21.000	0.373	NA		NA
5567212	5567213	Sca_1049	Sca_1050			FALSE	0.074	129.000	0.000	NA	N	NA
5567214	5567215	Sca_1051	Sca_1052	brnQ		FALSE	0.113	273.000	0.136	NA	N	NA
5567215	5567216	Sca_1052	Sca_1053			TRUE	0.926	13.000	0.822	NA		NA
5567216	5567217	Sca_1053	Sca_1054			TRUE	0.556	91.000	0.156	NA		NA
5567217	5567218	Sca_1054	Sca_1055			TRUE	0.880	27.000	0.280	NA		NA
5567220	5567221	Sca_1057	Sca_1058	odhB	odhA	TRUE	0.977	12.000	0.667	1.000	Y	NA
5567221	5567222	Sca_1058	Sca_1059	odhA		FALSE	0.125	197.000	0.006	1.000	N	NA
5567222	5567223	Sca_1059	Sca_1060			TRUE	0.994	-3.000	0.438	1.000	Y	NA
5567223	5567224	Sca_1060	Sca_1061			FALSE	0.010	407.000	0.000	1.000	N	NA
5567224	5567225	Sca_1061	Sca_1062		murG	TRUE	0.912	1.000	0.016	1.000	N	NA
5567225	5567226	Sca_1062	Sca_1063	murG		TRUE	0.750	12.000	0.014	1.000		NA
5567226	5567227	Sca_1063	Sca_1064			TRUE	0.805	14.000	0.046	1.000		NA
5567227	5567228	Sca_1064	Sca_1065			FALSE	0.216	157.000	0.045	NA		NA
5567228	5567229	Sca_1065	Sca_1066		crr	TRUE	0.935	0.000	0.080	NA		NA
5567229	5567230	Sca_1066	Sca_1067	crr		TRUE	0.936	3.000	0.154	1.000	N	NA
5567230	5567231	Sca_1067	Sca_1068			TRUE	0.999	-7.000	0.615	0.002	Y	NA
5567231	5567232	Sca_1068	Sca_1069			TRUE	0.524	99.000	0.154	NA		NA
5567232	5567233	Sca_1069	Sca_1070		dfrA	TRUE	0.640	13.000	0.005	NA		NA
5567233	5567234	Sca_1070	Sca_1071	dfrA	thyA	TRUE	0.861	44.000	0.295	1.000	N	NA
5567234	5567235	Sca_1071	Sca_1072	thyA		FALSE	0.055	102.000	0.000	NA		NA
5567235	5567236	Sca_1072	Sca_1073			FALSE	0.070	85.000	0.000	NA		NA
5567237	5567238	Sca_1074	Sca_1075			TRUE	0.649	45.000	0.039	NA		NA
5567239	5567240	Sca_1076	Sca_1077			FALSE	0.444	21.000	0.000	1.000		NA
5567240	5567241	Sca_1077	Sca_1078			FALSE	0.060	151.000	0.000	1.000		NA
5567241	5567242	Sca_1078	Sca_1079			TRUE	0.647	26.000	0.004	NA		NA
5567242	5567243	Sca_1079	Sca_1080			FALSE	0.002	617.000	0.000	NA		NA
5567243	5567244	Sca_1080	Sca_1081			TRUE	0.913	13.000	0.579	NA		NA
5567244	5567245	Sca_1081	Sca_1082			TRUE	0.975	-7.000	0.165	NA		NA
5567246	5567247	Sca_1083	Sca_1084	recU	pbp2	TRUE	0.979	-3.000	0.319	1.000		NA
5567248	5567249	Sca_1085	Sca_1086		nth	TRUE	0.664	13.000	0.009	NA		NA
5567249	5567250	Sca_1086	Sca_1087	nth	dnaD	TRUE	0.978	1.000	0.075	NA	Y	NA
5567250	5567251	Sca_1087	Sca_1088	dnaD	asnS	TRUE	0.611	98.000	0.234	NA	N	NA
5567251	5567252	Sca_1088	Sca_1089	asnS		FALSE	0.253	158.000	0.030	1.000	N	NA
5567252	5567253	Sca_1089	Sca_1090		birA	TRUE	0.866	16.000	0.074	1.000	N	NA
5567253	5567254	Sca_1090	Sca_1091	birA	pap	TRUE	0.969	-13.000	0.023	1.000	N	NA
5567254	5567255	Sca_1091	Sca_1092	pap		TRUE	0.929	3.000	0.126	1.000	N	NA
5567255	5567256	Sca_1092	Sca_1093			TRUE	0.741	29.000	0.038	NA		NA
5567256	5567257	Sca_1093	Sca_1094			FALSE	0.216	127.000	0.013	NA		NA
5567257	5567258	Sca_1094	Sca_1095			TRUE	0.805	27.000	0.083	NA		NA
5567258	5567259	Sca_1095	Sca_1096			TRUE	0.877	5.000	0.127	NA		NA
5567259	5567260	Sca_1096	Sca_1097			TRUE	0.905	19.000	0.353	NA		NA
5567260	5567261	Sca_1097	Sca_1098		aroA	TRUE	0.815	5.000	0.007	1.000	N	NA
5567261	5567262	Sca_1098	Sca_1099	aroA	aroB	TRUE	0.948	10.000	0.051	1.000	Y	NA
5567262	5567263	Sca_1099	Sca_1100	aroB	aroC	TRUE	0.984	16.000	0.110	0.002	Y	NA
5567263	5567264	Sca_1100	Sca_1101	aroC	ndk	FALSE	0.086	224.000	0.002	1.000	N	NA
5567264	5567265	Sca_1101	Sca_1102	ndk	gerCC	TRUE	0.483	106.000	0.054	1.000	N	NA
5567265	5567266	Sca_1102	Sca_1103	gerCC	gerCB	TRUE	0.969	2.000	0.020	1.000	Y	NA
5567266	5567267	Sca_1103	Sca_1104	gerCB		TRUE	0.826	2.000	0.008	NA		NA
5567267	5567268	Sca_1104	Sca_1105		hup	FALSE	0.011	219.000	0.000	NA		NA
5567268	5567269	Sca_1105	Sca_1106	hup	gpsA	FALSE	0.213	171.000	0.025	1.000	N	NA
5567269	5567270	Sca_1106	Sca_1107	gpsA		TRUE	0.816	29.000	0.068	1.000		NA
5567270	5567271	Sca_1107	Sca_1108			FALSE	0.240	153.000	0.032	1.000		NA
5567271	5567272	Sca_1108	Sca_1109		cmk	FALSE	0.147	220.000	0.047	1.000	N	NA
5567274	5567275	Sca_1111	Sca_1112			FALSE	0.244	144.000	0.022	1.000		NA
5567275	5567276	Sca_1112	Sca_1113			FALSE	0.079	298.000	0.079	1.000		NA
5567276	5567277	Sca_1113	Sca_1114			TRUE	0.951	3.000	0.508	NA		NA
5567279	5567280	Sca_1116	Sca_1117		srrB	FALSE	0.007	270.000	0.000	NA		NA
5567280	5567281	Sca_1117	Sca_1118	srrB	srrA	TRUE	0.993	-19.000	0.056	1.000	Y	NA
5567281	5567282	Sca_1118	Sca_1119	srrA	rluB	FALSE	0.068	315.000	0.046	1.000	N	NA
5567282	5567283	Sca_1119	Sca_1120	rluB	scpB	TRUE	0.981	-7.000	0.224	NA	N	NA
5567283	5567284	Sca_1120	Sca_1121	scpB	scpA	TRUE	0.989	-16.000	0.570	NA		NA
5567286	5567287	Sca_1123	Sca_1124	xerD	fur	TRUE	0.823	23.000	0.029	1.000	N	NA
5567287	5567288	Sca_1124	Sca_1125	fur	nudF	FALSE	0.406	106.000	0.021	1.000	N	NA
5567293	5567294	Sca_1130	Sca_1131	zwf		FALSE	0.194	161.000	0.021	1.000		NA
5567295	5567296	Sca_1132	Sca_1133	gnd		TRUE	0.579	75.000	0.035	1.000	N	NA
5567298	5567299	Sca_1135	Sca_1136			TRUE	0.813	13.000	0.097	NA		NA
5567299	5567300	Sca_1136	Sca_1137		bmfBB	FALSE	0.429	98.000	0.058	NA		NA
5567300	5567301	Sca_1137	Sca_1138	bmfBB	bfmBAB	TRUE	0.990	19.000	0.882	0.067	Y	NA
5567301	5567302	Sca_1138	Sca_1139	bfmBAB	bfmBAA	TRUE	0.998	0.000	0.897	0.001	Y	NA
5567302	5567303	Sca_1139	Sca_1140	bfmBAA	bfmBC	TRUE	0.974	19.000	0.414	1.000	Y	NA
5567303	5567304	Sca_1140	Sca_1141	bfmBC	buk	TRUE	0.967	11.000	0.026	0.053	Y	NA
5567304	5567305	Sca_1141	Sca_1142	buk		FALSE	0.455	207.000	0.125	1.000	Y	NA
5567305	5567306	Sca_1142	Sca_1143		recN	TRUE	0.776	27.000	0.013	1.000	N	NA
5567306	5567307	Sca_1143	Sca_1144	recN	argR	TRUE	0.847	15.000	0.056	1.000	N	NA
5567307	5567308	Sca_1144	Sca_1145	argR		FALSE	0.030	242.000	0.000	1.000	N	NA
5567308	5567309	Sca_1145	Sca_1146			TRUE	0.977	-7.000	0.100	1.000	N	NA
5567309	5567310	Sca_1146	Sca_1147			TRUE	0.998	-7.000	0.412	0.001	Y	NA
5567310	5567311	Sca_1147	Sca_1148		nusB	TRUE	0.793	19.000	0.011	1.000	N	NA
5567311	5567312	Sca_1148	Sca_1149	nusB		TRUE	0.891	21.000	0.265	NA		NA
5567312	5567313	Sca_1149	Sca_1150		accC	TRUE	0.905	22.000	0.373	NA		NA
5567313	5567314	Sca_1150	Sca_1151	accC	accB	TRUE	0.989	3.000	0.086	0.002	Y	NA
5567314	5567315	Sca_1151	Sca_1152	accB	efp	FALSE	0.148	250.000	0.120	1.000	N	NA
5567315	5567316	Sca_1152	Sca_1153	efp		TRUE	0.883	28.000	0.160	1.000	N	NA
5567317	5567318	Sca_1154	Sca_1155			TRUE	0.920	32.000	1.000	NA		NA
5567321	5567322	Sca_1158	Sca_1159	gcvPB''	gcvPB'	TRUE	0.995	-24.000	0.316	0.018		NA
5567322	5567323	Sca_1159	Sca_1160	gcvPB'	gcvPA	TRUE	0.993	-7.000	0.316	0.018		NA
5567323	5567324	Sca_1160	Sca_1161	gcvPA	gcvT	TRUE	0.984	21.000	0.092	0.001	Y	NA
5567324	5567325	Sca_1161	Sca_1162	gcvT	aroK	FALSE	0.395	191.000	0.019	1.000	Y	NA
5567325	5567326	Sca_1162	Sca_1163	aroK		FALSE	0.002	863.000	0.000	NA		NA
5567326	5567327	Sca_1163	Sca_1164			TRUE	0.721	-19.000	0.000	NA		NA
5567327	5567328	Sca_1164	Sca_1165			TRUE	0.993	18.000	0.861	0.001	Y	NA
5567328	5567329	Sca_1165	Sca_1166			TRUE	0.991	-28.000	0.639	1.000		NA
5567329	5567330	Sca_1166	Sca_1167			TRUE	0.504	71.000	0.015	1.000		NA
5567330	5567331	Sca_1167	Sca_1168			TRUE	0.887	0.000	0.015	NA		NA
5567331	5567332	Sca_1168	Sca_1169		glcA	TRUE	0.902	0.000	0.024	NA		NA
5567332	5567333	Sca_1169	Sca_1170	glcA		TRUE	0.972	0.000	0.496	NA		NA
5567333	5567334	Sca_1170	Sca_1171			TRUE	0.969	-19.000	0.058	NA		NA
5567334	5567335	Sca_1171	Sca_1172			TRUE	0.744	17.000	0.006	1.000		NA
5567335	5567336	Sca_1172	Sca_1173		pbpF	FALSE	0.062	178.000	0.000	1.000	N	NA
5567336	5567337	Sca_1173	Sca_1174	pbpF	sod	FALSE	0.212	201.000	0.085	1.000	N	NA
5567337	5567338	Sca_1174	Sca_1175	sod	fur	FALSE	0.235	200.000	0.000	1.000	Y	NA
5567338	5567339	Sca_1175	Sca_1176	fur	mreB	TRUE	0.988	2.000	0.480	1.000	Y	NA
5567339	5567340	Sca_1176	Sca_1177	mreB	mreA	TRUE	0.987	0.000	0.148	1.000	Y	NA
5567340	5567341	Sca_1177	Sca_1178	mreA		FALSE	0.341	116.000	0.012	1.000	N	NA
5567341	5567342	Sca_1178	Sca_1179			TRUE	0.958	18.000	0.104	1.000	Y	NA
5567342	5567343	Sca_1179	Sca_1180			TRUE	0.798	24.000	0.032	1.000		NA
5567343	5567344	Sca_1180	Sca_1181			TRUE	0.974	-3.000	0.283	NA		NA
5567344	5567345	Sca_1181	Sca_1183		sigA	FALSE	0.390	149.000	0.239	NA		NA
5567345	5567346	Sca_1183	Sca_1184	sigA	dnaG	TRUE	0.653	92.000	0.209	1.000	N	NA
5567346	5567347	Sca_1184	Sca_1185	dnaG		FALSE	0.228	122.000	0.011	NA		NA
5567347	5567348	Sca_1185	Sca_1186			TRUE	0.916	13.000	0.621	NA		NA
5567350	5567351	Sca_1188	Sca_1189	recO	era	TRUE	0.852	26.000	0.108	1.000		NA
5567351	5567352	Sca_1189	Sca_1190	era	cdd	TRUE	0.964	-3.000	0.098	1.000		NA
5567352	5567353	Sca_1190	Sca_1191	cdd	dgk	TRUE	0.880	21.000	0.108	1.000	N	NA
5567353	5567354	Sca_1191	Sca_1192	dgk		TRUE	0.756	4.000	0.007	NA		NA
5567354	5567355	Sca_1192	Sca_1193		phoH	TRUE	0.925	6.000	0.457	NA		NA
5567355	5567356	Sca_1193	Sca_1194	phoH		FALSE	0.010	221.000	0.000	NA		NA
5567356	5567357	Sca_1194	Sca_1195			TRUE	0.783	14.000	0.055	NA		NA
5567357	5567358	Sca_1195	Sca_1196			TRUE	0.890	20.000	0.258	NA		NA
5567358	5567359	Sca_1196	Sca_1197		rpsU	FALSE	0.078	207.000	0.011	NA		NA
5567359	5567360	Sca_1197	Sca_1198	rpsU		FALSE	0.258	131.000	0.016	1.000		NA
5567360	5567361	Sca_1198	Sca_1199			TRUE	0.884	6.000	0.163	NA		NA
5567361	5567362	Sca_1199	Sca_1200			TRUE	0.942	2.000	0.227	NA		NA
5567362	5567363	Sca_1200	Sca_1201		dnaJ	TRUE	0.898	7.000	0.133	1.000	N	NA
5567363	5567364	Sca_1201	Sca_1202	dnaJ	dnaK	TRUE	0.791	179.000	0.196	0.002	Y	NA
5567364	5567365	Sca_1202	Sca_1203	dnaK	grpE	TRUE	0.968	53.000	0.224	0.007	Y	NA
5567365	5567366	Sca_1203	Sca_1204	grpE	hrcA	TRUE	0.906	28.000	0.286	1.000	N	NA
5567366	5567367	Sca_1204	Sca_1205	hrcA	hemN	TRUE	0.516	105.000	0.082	1.000	N	NA
5567367	5567368	Sca_1205	Sca_1206	hemN	lepA	TRUE	0.625	69.000	0.032	1.000	N	NA
5567370	5567371	Sca_1208	Sca_1209			FALSE	0.366	74.000	0.005	NA		NA
5567371	5567372	Sca_1209	Sca_1210			TRUE	0.649	15.000	0.004	NA		NA
5567372	5567373	Sca_1210	Sca_1211			TRUE	0.842	8.000	0.055	1.000		NA
5567373	5567374	Sca_1211	Sca_1212			TRUE	0.655	75.000	0.095	1.000	N	NA
5567374	5567375	Sca_1212	Sca_1213			TRUE	0.706	49.000	0.033	1.000	N	NA
5567375	5567376	Sca_1213	Sca_1214			TRUE	0.889	3.000	0.085	NA		NA
5567376	5567377	Sca_1214	Sca_1215			TRUE	0.941	1.000	0.149	NA		NA
5567377	5567378	Sca_1215	Sca_1216		nad	TRUE	0.995	-10.000	0.199	1.000	Y	NA
5567378	5567379	Sca_1216	Sca_1217	nad		TRUE	0.983	-49.000	0.150	NA	N	NA
5567379	5567380	Sca_1217	Sca_1218		aroE	TRUE	0.936	1.000	0.089	NA	N	NA
5567380	5567381	Sca_1218	Sca_1219	aroE		TRUE	0.915	10.000	0.336	1.000		NA
5567381	5567382	Sca_1219	Sca_1220			TRUE	0.968	1.000	0.555	NA		NA
5567382	5567383	Sca_1220	Sca_1221		mtn	TRUE	0.730	20.000	0.019	NA		NA
5567383	5567384	Sca_1221	Sca_1222	mtn	greA	FALSE	0.077	250.000	0.010	1.000	N	NA
5567384	5567385	Sca_1222	Sca_1223	greA	udk	TRUE	0.865	26.000	0.095	1.000	N	NA
5567385	5567386	Sca_1223	Sca_1224	udk		FALSE	0.287	174.000	0.100	1.000	N	NA
5567386	5567387	Sca_1224	Sca_1225			TRUE	0.985	14.000	0.156	0.001	Y	NA
5567387	5567388	Sca_1225	Sca_1226			TRUE	0.970	-3.000	0.142	1.000		NA
5567388	5567389	Sca_1226	Sca_1227			FALSE	0.005	293.000	0.000	NA		NA
5567389	5567390	Sca_1227	Sca_1228			TRUE	0.927	23.000	0.651	NA		NA
5567390	5567391	Sca_1228	Sca_1229			TRUE	0.951	3.000	0.537	NA		NA
5567391	5567392	Sca_1229	Sca_1230		alaS	TRUE	0.643	69.000	0.110	NA		NA
5567392	5567393	Sca_1230	Sca_1231	alaS		FALSE	0.017	307.000	0.000	1.000	N	NA
5567393	5567394	Sca_1231	Sca_1232			TRUE	0.933	4.000	0.281	1.000		NA
5567394	5567395	Sca_1232	Sca_1233			FALSE	0.397	108.000	0.038	1.000		NA
5567395	5567396	Sca_1233	Sca_1234		iscS	TRUE	0.915	3.000	0.072	1.000	N	NA
5567398	5567399	Sca_1236	Sca_1237			FALSE	0.106	69.000	0.000	NA		NA
5567399	5567400	Sca_1237	Sca_1238			FALSE	0.024	159.000	0.000	NA		NA
5567402	5567403	Sca_1240	Sca_1241		aspS	FALSE	0.032	384.000	0.008	1.000	N	NA
5567403	5567404	Sca_1241	Sca_1242	aspS	hisS	TRUE	0.986	4.000	0.161	0.052	Y	NA
5567404	5567405	Sca_1242	Sca_1243	hisS		FALSE	0.014	330.000	0.000	1.000	N	NA
5567405	5567406	Sca_1243	Sca_1244			TRUE	0.944	-3.000	0.010	1.000	N	NA
5567406	5567407	Sca_1244	Sca_1245		relA	TRUE	0.902	16.000	0.177	1.000	N	NA
5567407	5567408	Sca_1245	Sca_1246	relA	apt	FALSE	0.058	374.000	0.068	1.000	N	NA
5567408	5567409	Sca_1246	Sca_1247	apt		TRUE	0.888	20.000	0.128	1.000	N	NA
5567409	5567410	Sca_1247	Sca_1248		secDF	FALSE	0.256	135.000	0.007	1.000	N	NA
5567410	5567411	Sca_1248	Sca_1249	secDF		FALSE	0.076	453.000	0.005	NA	Y	NA
5567411	5567412	Sca_1249	Sca_1250		tgt	TRUE	0.900	14.000	0.325	NA	N	NA
5567412	5567413	Sca_1250	Sca_1251	tgt	queA	TRUE	0.990	16.000	0.360	0.001	Y	NA
5567413	5567414	Sca_1251	Sca_1252	queA	ruvB	TRUE	0.978	-10.000	0.069	1.000	N	NA
5567414	5567415	Sca_1252	Sca_1253	ruvB	ruvA	TRUE	0.990	25.000	0.549	0.002	Y	NA
5567415	5567416	Sca_1253	Sca_1254	ruvA		TRUE	0.721	13.000	0.009	1.000		NA
5567416	5567417	Sca_1254	Sca_1255		obg	TRUE	0.781	11.000	0.024	1.000		NA
5567417	5567418	Sca_1255	Sca_1256	obg	rpmA	TRUE	0.525	132.000	0.335	1.000		NA
5567418	5567419	Sca_1256	Sca_1257	rpmA		TRUE	0.958	12.000	0.203	NA	Y	NA
5567419	5567420	Sca_1257	Sca_1258a			TRUE	0.976	3.000	0.208	NA	Y	NA
5567420	5567421	Sca_1258a	Sca_1259			FALSE	0.299	124.000	0.008	1.000	N	NA
5567421	5567422	Sca_1259	Sca_1260			TRUE	0.997	0.000	0.550	0.003	Y	NA
5567422	5567423	Sca_1260	Sca_1261			FALSE	0.065	209.000	0.004	NA		NA
5567423	5567424	Sca_1261	Sca_1262			TRUE	0.728	91.000	0.750	NA		NA
5567426	5567427	Sca_1264	Sca_1265	radC		TRUE	0.815	13.000	0.056	1.000		NA
5567427	5567428	Sca_1265	Sca_1267		folC''	FALSE	0.292	194.000	0.278	1.000		NA
5567428	5567429	Sca_1267	Sca_1268	folC''	folC'	TRUE	0.846	32.000	0.000	0.001		NA
5567429	5567430	Sca_1268	Sca_1269	folC'	valS	TRUE	0.721	12.000	0.006	1.000		NA
5567431	5567432	Sca_1270	Sca_1271	tag	pcp	FALSE	0.430	38.000	0.000	1.000	N	NA
5567433	5567434	Sca_1272	Sca_1273		hemL	FALSE	0.229	148.000	0.039	NA		NA
5567434	5567435	Sca_1273	Sca_1274	hemL	hemB	TRUE	0.992	2.000	0.126	0.003	Y	NA
5567435	5567436	Sca_1274	Sca_1275	hemB	hemD	TRUE	0.995	-3.000	0.042	0.003	Y	NA
5567436	5567437	Sca_1275	Sca_1276	hemD	hemC	TRUE	0.971	27.000	0.020	0.003	Y	NA
5567437	5567438	Sca_1276	Sca_1277	hemC	hemX	TRUE	0.791	32.000	0.040	1.000	N	NA
5567438	5567439	Sca_1277	Sca_1278	hemX	hemA	TRUE	0.941	23.000	0.613	1.000	N	NA
5567439	5567440	Sca_1278	Sca_1279	hemA		FALSE	0.057	282.000	0.020	1.000		NA
5567440	5567441	Sca_1279	Sca_1280		clpX	FALSE	0.266	151.000	0.043	1.000		NA
5567441	5567442	Sca_1280	Sca_1281	clpX	tig	FALSE	0.309	371.000	0.033	0.002	Y	NA
5567442	5567443	Sca_1281	Sca_1282	tig		FALSE	0.137	165.000	0.012	NA		NA
5567443	5567444	Sca_1282	Sca_1283			TRUE	0.875	16.000	0.195	NA		NA
5567444	5567445	Sca_1283	Sca_1284		rplT	FALSE	0.183	148.000	0.004	1.000		NA
5567445	5567446	Sca_1284	Sca_1285	rplT	rpmI	TRUE	0.943	108.000	0.928	0.019	Y	NA
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5567447	5567448	Sca_1286	Sca_1287	infC	lysP	FALSE	0.090	221.000	0.004	1.000	N	NA
5567450	5567451	Sca_1289	Sca_1290	thrS	dnaI	FALSE	0.015	323.000	0.000	1.000	N	NA
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5567452	5567453	Sca_1291	Sca_1292	dnaB		TRUE	0.912	3.000	0.109	NA	N	NA
5567453	5567454	Sca_1292	Sca_1293		gapB	FALSE	0.163	154.000	0.004	NA	N	NA
5567454	5567455	Sca_1293	Sca_1295	gapB	coaE	FALSE	0.234	157.000	0.020	1.000	N	NA
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5567456	5567457	Sca_1296	Sca_1297	mutM	polA	TRUE	0.956	16.000	0.101	1.000	Y	NA
5567457	5567458	Sca_1297	Sca_1298	polA	phoR	FALSE	0.384	96.000	0.006	1.000	N	NA
5567458	5567459	Sca_1298	Sca_1299	phoR	phoP	TRUE	0.995	-3.000	0.159	0.054	Y	NA
5567459	5567460	Sca_1299	Sca_1300	phoP	icd	FALSE	0.060	180.000	0.000	1.000	N	NA
5567460	5567461	Sca_1300	Sca_1301	icd	citZ	TRUE	0.907	64.000	0.140	1.000	Y	NA
5567463	5567464	Sca_1303	Sca_1304	pykA	pfk	TRUE	0.980	32.000	0.261	0.007	Y	NA
5567464	5567465	Sca_1304	Sca_1305	pfk	accA	FALSE	0.069	318.000	0.047	1.000	N	NA
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5567467	5567468	Sca_1307	Sca_1308		dnaE	FALSE	0.143	256.000	0.127	1.000	N	NA
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5567469	5567470	Sca_1309	Sca_1310			TRUE	0.862	24.000	0.113	1.000		NA
5567476	5567477	Sca_1316	Sca_1317	ackA		TRUE	0.692	83.000	0.217	1.000	N	NA
5567477	5567478	Sca_1317	Sca_1318			TRUE	0.510	108.000	0.089	1.000	N	NA
5567478	5567479	Sca_1318	Sca_1319			FALSE	0.085	219.000	0.009	1.000		NA
5567479	5567480	Sca_1319	Sca_1320		thiI''	TRUE	0.631	34.000	0.016	NA		NA
5567480	5567481	Sca_1320	Sca_1321	thiI''	thiI'	TRUE	0.661	24.000	0.005	NA		NA
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5567485	5567486	Sca_1325	Sca_1326		rpsD	FALSE	0.044	250.000	0.005	NA		NA
5567488	5567489	Sca_1328	Sca_1329			FALSE	0.098	245.000	0.027	1.000	N	NA
5567489	5567490	Sca_1329	Sca_1330		serA	TRUE	0.993	-7.000	0.113	1.000	Y	NA
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5567497	5567498	Sca_1337	Sca_1338	fhs	acsA	FALSE	0.011	394.000	0.000	1.000	N	NA
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5567501	5567502	Sca_1342	Sca_1343	ccpA	ccpA	TRUE	0.736	-94.000	0.000	NA		NA
5567502	5567503	Sca_1343	Sca_1344	ccpA	aroA	FALSE	0.006	284.000	0.000	NA		NA
5567503	5567504	Sca_1344	Sca_1345	aroA		FALSE	0.007	260.000	0.000	NA		NA
5567504	5567505	Sca_1345	Sca_1346			FALSE	0.413	137.000	0.222	NA		NA
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5567508	5567509	Sca_1349	Sca_1350			TRUE	0.920	16.000	0.511	NA		NA
5567509	5567510	Sca_1350	Sca_1351			TRUE	0.673	96.000	0.500	NA		NA
5567510	5567511	Sca_1351	Sca_1352		pepA	TRUE	0.868	22.000	0.081	1.000	N	NA
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5567514	5567515	Sca_1355	Sca_1356			TRUE	0.846	14.000	0.154	NA		NA
5567515	5567516	Sca_1356	Sca_1357		dat	FALSE	0.004	637.000	0.000	NA	N	NA
5567516	5567517	Sca_1357	Sca_1358	dat	pepV	TRUE	0.969	5.000	0.143	1.000	Y	NA
5567517	5567518	Sca_1358	Sca_1359	pepV		FALSE	0.013	206.000	0.000	NA		NA
5567518	5567519	Sca_1359	Sca_1360			TRUE	0.886	19.000	0.233	NA		NA
5567519	5567520	Sca_1360	Sca_1361			TRUE	0.966	0.000	0.233	1.000		NA
5567522	5567523	Sca_1363	Sca_1364		leuS''	TRUE	0.681	21.000	0.007	NA		NA
5567523	5567524	Sca_1364	Sca_1365	leuS''	leuS'	TRUE	0.992	-82.000	0.021	0.001		NA
5567524	5567525	Sca_1365	Sca_1366	leuS'		FALSE	0.002	495.000	0.000	NA		NA
5567526	5567527	Sca_1367	Sca_1368			TRUE	0.937	5.000	0.408	1.000		NA
5567528	5567529	Sca_1369	Sca_1370	ldh		FALSE	0.031	193.000	0.000	NA	N	NA
5567531	5567532	Sca_1372	Sca_1373	ribH	ribA	TRUE	0.967	33.000	0.022	0.002	Y	NA
5567532	5567533	Sca_1373	Sca_1374	ribA	ribB	TRUE	0.939	10.000	0.026	1.000	Y	NA
5567533	5567534	Sca_1374	Sca_1375	ribB	ribD	TRUE	0.977	7.000	0.456	1.000	Y	NA
5567534	5567535	Sca_1375	Sca_1376	ribD		FALSE	0.003	406.000	0.000	NA		NA
5567535	5567536	Sca_1376	Sca_1377			FALSE	0.031	138.000	0.000	NA		NA
5567536	5567537	Sca_1377	Sca_1378			FALSE	0.004	320.000	0.000	NA		NA
5567539	5567540	Sca_1380	Sca_1381			FALSE	0.364	128.000	0.108	NA		NA
5567541	5567542	Sca_1382	Sca_1383			TRUE	0.513	71.000	0.034	NA		NA
5567542	5567543	Sca_1383	Sca_1384			TRUE	0.979	5.000	0.069	0.077	Y	NA
5567544	5567545	Sca_1385	Sca_1386			FALSE	0.251	11.000	0.000	NA		NA
5567546	5567547	Sca_1386a	Sca_1387	tnp'	tnp''	FALSE	0.111	67.000	0.000	NA		NA
5567548	5567549	Sca_1388	Sca_1389		metK	FALSE	0.439	92.000	0.054	NA		NA
5567551	5567552	Sca_1391	Sca_1392			TRUE	0.894	8.000	0.182	1.000		NA
5567554	5567555	Sca_1394	Sca_1395		menE	TRUE	0.871	4.000	0.029	1.000	N	NA
5567555	5567556	Sca_1395	Sca_1396	menE		FALSE	0.045	116.000	0.000	NA		NA
5567557	5567558	Sca_1397	Sca_1398			FALSE	0.007	268.000	0.000	NA		NA
5567559	5567560	tRNA-Sca_0014	tRNA-Sca_0015	tRNA-Ser_(GGA)	tRNA-Glu_(TTC)	FALSE	0.124	62.000	0.000	NA		NA
5567560	5567561	tRNA-Sca_0015	tRNA-Sca_0016	tRNA-Glu_(TTC)	tRNA-Asn_(GTT)	FALSE	0.426	2.000	0.000	NA		NA
5567561	5567562	tRNA-Sca_0016	tRNA-Sca_0017	tRNA-Asn_(GTT)	tRNA-Gly_(TCC)	FALSE	0.243	12.000	0.000	NA		NA
5567562	5567563	tRNA-Sca_0017	tRNA-Sca_0018	tRNA-Gly_(TCC)	tRNA-His_(GTG)	FALSE	0.243	12.000	0.000	NA		NA
5567563	5567564	tRNA-Sca_0018	tRNA-Sca_0019	tRNA-His_(GTG)	tRNA-Phe_(GAA)	FALSE	0.259	20.000	0.000	NA		NA
5567564	5567565	tRNA-Sca_0019	tRNA-Sca_0020	tRNA-Phe_(GAA)	tRNA-Asp_(GTC)	FALSE	0.232	13.000	0.000	NA		NA
5567565	5567566	tRNA-Sca_0020	tRNA-Sca_0021	tRNA-Asp_(GTC)	tRNA-Met_(CAT)	FALSE	0.268	17.000	0.000	NA		NA
5567566	5567567	tRNA-Sca_0021	Sca_1399	tRNA-Met_(CAT)		FALSE	0.003	398.000	0.000	NA		NA
5567567	5567568	Sca_1399	Sca_1400			FALSE	0.045	172.000	0.000	1.000		NA
5567568	5567569	Sca_1400	Sca_1401		nifS	TRUE	0.985	-13.000	0.243	1.000		NA
5567570	5567571	Sca_1402	Sca_1403	nadB	nadC	FALSE	0.391	181.000	0.005	1.000	Y	NA
5567571	5567572	Sca_1403	Sca_1404	nadC	nadA	TRUE	0.995	0.000	0.198	0.003	Y	NA
5567573	5567574	Sca_1405	Sca_1406		hemY	FALSE	0.010	220.000	0.000	NA		NA
5567574	5567575	Sca_1406	Sca_1407	hemY	hemH	TRUE	0.992	-7.000	0.069	1.000	Y	NA
5567575	5567576	Sca_1407	Sca_1408	hemH	hemE	TRUE	0.948	31.000	0.131	1.000	Y	NA
5567578	5567579	Sca_1410	Sca_1411	ecsB	ecsA	TRUE	0.962	-3.000	0.083	NA	N	NA
5567580	5567581	Sca_1412	Sca_1413	hit		FALSE	0.103	70.000	0.000	NA		NA
5567581	5567582	Sca_1413	Sca_1414			FALSE	0.009	230.000	0.000	NA		NA
5567582	5567583	Sca_1414	Sca_1415		prsA1	FALSE	0.128	208.000	0.056	NA		NA
5567584	5567585	Sca_1416	Sca_1417			TRUE	0.964	0.000	0.291	NA		NA
5567585	5567586	Sca_1417	Sca_1418			TRUE	0.966	0.000	0.330	NA		NA
5567586	5567587	Sca_1418	Sca_1419			FALSE	0.164	201.000	0.093	NA		NA
5567587	5567588	Sca_1419	Sca_1420			FALSE	0.389	158.000	0.321	NA		NA
5567588	5567589	Sca_1420	Sca_1421			FALSE	0.120	193.000	0.029	NA		NA
5567589	5567590	Sca_1421	Sca_1422			FALSE	0.010	401.000	0.000	1.000	N	NA
5567590	5567591	Sca_1422	Sca_1423			FALSE	0.261	149.000	0.021	1.000	N	NA
5567591	5567592	Sca_1423	Sca_1424			TRUE	0.991	6.000	0.536	0.009	Y	NA
5567594	5567595	Sca_1426	Sca_1427	citG		FALSE	0.115	174.000	0.009	NA		NA
5567595	5567596	Sca_1427	Sca_1428			FALSE	0.029	146.000	0.000	NA		NA
5567596	5567597	Sca_1428	Sca_1429			FALSE	0.091	247.000	0.021	1.000	N	NA
5567597	5567598	Sca_1429	Sca_1430			TRUE	0.878	7.000	0.077	1.000	N	NA
5567598	5567599	Sca_1430	Sca_1431		glnQ	TRUE	0.656	68.000	0.044	1.000	N	NA
5567599	5567600	Sca_1431	Sca_1432	glnQ		TRUE	0.994	-7.000	0.154	1.000	Y	NA
5567600	5567601	Sca_1432	Sca_1433			FALSE	0.284	146.000	0.077	NA		NA
5567601	5567602	Sca_1433	tRNA-Sca_0022		tRNA-Leu_(CAA)	FALSE	0.103	70.000	0.000	NA		NA
5567602	5567603	tRNA-Sca_0022	tRNA-Sca_0023	tRNA-Leu_(CAA)	tRNA-Gly_(TCC)	FALSE	0.276	7.000	0.000	NA		NA
5567603	5567604	tRNA-Sca_0023	tRNA-Sca_0024	tRNA-Gly_(TCC)	tRNA-Gly_(TCC)	FALSE	0.062	92.000	0.000	NA		NA
5567604	5567605	tRNA-Sca_0024	tRNA-Sca_0025	tRNA-Gly_(TCC)	tRNA-Cys_(GCA)	FALSE	0.261	9.000	0.000	NA		NA
5567605	5567606	tRNA-Sca_0025	tRNA-Sca_0026	tRNA-Cys_(GCA)	tRNA-Gln_(TTG)	FALSE	0.267	8.000	0.000	NA		NA
5567606	5567607	tRNA-Sca_0026	tRNA-Sca_0027	tRNA-Gln_(TTG)	tRNA-His_(GTG)	FALSE	0.232	13.000	0.000	NA		NA
5567607	5567608	tRNA-Sca_0027	tRNA-Sca_0028	tRNA-His_(GTG)	tRNA-Trp_(CCA)	FALSE	0.367	3.000	0.000	NA		NA
5567608	5567609	tRNA-Sca_0028	tRNA-Sca_0029	tRNA-Trp_(CCA)	tRNA-Tyr_(GTA)	FALSE	0.266	18.000	0.000	NA		NA
5567609	5567610	tRNA-Sca_0029	tRNA-Sca_0030	tRNA-Tyr_(GTA)	tRNA-Thr_(TGT)	FALSE	0.289	6.000	0.000	NA		NA
5567610	5567611	tRNA-Sca_0030	tRNA-Sca_0031	tRNA-Thr_(TGT)	tRNA-Phe_(GAA)	FALSE	0.276	7.000	0.000	NA		NA
5567611	5567612	tRNA-Sca_0031	tRNA-Sca_0032	tRNA-Phe_(GAA)	tRNA-Asp_(GTC)	FALSE	0.261	19.000	0.000	NA		NA
5567612	5567613	tRNA-Sca_0032	tRNA-Sca_0033	tRNA-Asp_(GTC)	tRNA-Met_(CAT)	FALSE	0.233	14.000	0.000	NA		NA
5567613	5567614	tRNA-Sca_0033	tRNA-Sca_0034	tRNA-Met_(CAT)	tRNA-Ser_(TGA)	FALSE	0.258	16.000	0.000	NA		NA
5567614	5567615	tRNA-Sca_0034	tRNA-Sca_0035	tRNA-Ser_(TGA)	tRNA-Met_(CAT)	FALSE	0.243	12.000	0.000	NA		NA
5567615	5567616	tRNA-Sca_0035	tRNA-Sca_0036	tRNA-Met_(CAT)	tRNA-Met_(CAT)	FALSE	0.223	29.000	0.000	NA		NA
5567616	5567617	tRNA-Sca_0036	tRNA-Sca_0037	tRNA-Met_(CAT)	tRNA-Ala_(TGC)	FALSE	0.210	31.000	0.000	NA		NA
5567617	5567618	tRNA-Sca_0037	tRNA-Sca_0038	tRNA-Ala_(TGC)	tRNA-Pro_(TGG)	FALSE	0.266	18.000	0.000	NA		NA
5567618	5567619	tRNA-Sca_0038	tRNA-Sca_0039	tRNA-Pro_(TGG)	tRNA-Arg_(ACG)	FALSE	0.243	12.000	0.000	NA		NA
5567619	5567620	tRNA-Sca_0039	tRNA-Sca_0040	tRNA-Arg_(ACG)	tRNA-Leu_(TAA)	FALSE	0.251	11.000	0.000	NA		NA
5567620	5567621	tRNA-Sca_0040	tRNA-Sca_0041	tRNA-Leu_(TAA)	tRNA-Gly_(GCC)	FALSE	0.261	9.000	0.000	NA		NA
5567621	5567622	tRNA-Sca_0041	tRNA-Sca_0042	tRNA-Gly_(GCC)	tRNA-Leu_(TAG)	FALSE	0.332	4.000	0.000	NA		NA
5567622	5567623	tRNA-Sca_0042	tRNA-Sca_0043	tRNA-Leu_(TAG)	tRNA-Lys_(TTT)	FALSE	0.261	9.000	0.000	NA		NA
5567623	5567624	tRNA-Sca_0043	tRNA-Sca_0044	tRNA-Lys_(TTT)	tRNA-Thr_(TGT)	FALSE	0.289	6.000	0.000	NA		NA
5567624	5567625	tRNA-Sca_0044	tRNA-Sca_0045	tRNA-Thr_(TGT)	tRNA-Val_(TAC)	FALSE	0.256	10.000	0.000	NA		NA
5567625	5567626	tRNA-Sca_0045	Sca_5S_rRNA_C	tRNA-Val_(TAC)	5S_rRNA_C	FALSE	0.232	13.000	0.000	NA		NA
5567626	5567627	Sca_5S_rRNA_C	Sca_23S_rRNA_C	5S_rRNA_C	23S_rRNA_C	FALSE	0.098	71.000	0.000	NA		NA
5567627	5567628	Sca_23S_rRNA_C	tRNA-Sca_0046	23S_rRNA_C	tRNA-Ala_(TGC)	FALSE	0.021	166.000	0.000	NA		NA
5567628	5567629	tRNA-Sca_0046	tRNA-Sca_0047	tRNA-Ala_(TGC)	tRNA-Ile_(GAT)	FALSE	0.258	21.000	0.000	NA		NA
5567629	5567630	tRNA-Sca_0047	Sca_16S_rRNA_C	tRNA-Ile_(GAT)	16S_rRNA_C	FALSE	0.062	92.000	0.000	NA		NA
5567630	5567631	Sca_16S_rRNA_C	Sca_1434	16S_rRNA_C	perR	FALSE	0.002	645.000	0.000	NA		NA
5567631	5567632	Sca_1434	Sca_1435	perR		TRUE	0.609	95.000	0.146	1.000	N	NA
5567632	5567633	Sca_1435	Sca_1436			TRUE	0.826	6.000	0.017	1.000	N	NA
5567634	5567635	Sca_1437	Sca_1438	gsaB		FALSE	0.427	110.000	0.102	NA		NA
5567636	5567637	Sca_1439	Sca_1440			FALSE	0.239	173.000	0.077	NA	N	NA
5567637	5567638	Sca_1440	Sca_1441			TRUE	0.545	64.000	0.011	NA	N	NA
5567640	5567641	Sca_1443	Sca_1444			TRUE	0.929	11.000	0.727	NA		NA
5567641	5567642	Sca_1444	Sca_1445			TRUE	0.879	17.000	0.186	NA		NA
5567642	5567643	Sca_1445	Sca_1446			TRUE	0.799	17.000	0.045	NA		NA
5567643	5567644	Sca_1446	Sca_1447			FALSE	0.119	181.000	0.004	1.000		NA
5567644	5567645	Sca_1447	Sca_1448			FALSE	0.034	193.000	0.000	1.000		NA
5567645	5567646	Sca_1448	Sca_1449			FALSE	0.038	125.000	0.000	NA		NA
5567648	5567649	Sca_1451	Sca_1452		ampS	TRUE	0.911	31.000	0.545	NA	N	NA
5567649	5567650	Sca_1452	Sca_1453	ampS		TRUE	0.769	39.000	0.125	NA		NA
5567651	5567652	Sca_1454	Sca_1455			FALSE	0.267	8.000	0.000	NA		NA
5567652	5567653	Sca_1455	Sca_1456			FALSE	0.330	119.000	0.045	NA		NA
5567653	5567654	Sca_1456	Sca_1457			FALSE	0.027	210.000	0.000	1.000		NA
5567655	5567656	Sca_1458	Sca_1459	vraR	vraS	TRUE	0.996	2.000	0.853	0.009	Y	NA
5567656	5567657	Sca_1459	Sca_1460	vraS		TRUE	0.983	-3.000	0.679	NA		NA
5567657	5567658	Sca_1460	Sca_1461			TRUE	0.827	16.000	0.086	NA		NA
5567658	5567659	Sca_1461	Sca_1462		map	FALSE	0.284	134.000	0.051	NA		NA
5567661	5567662	Sca_1464	Sca_1465			TRUE	0.986	-3.000	0.796	1.000		NA
5567666	5567667	Sca_1469	Sca_1470			TRUE	0.827	61.000	0.299	1.000	N	NA
5567667	5567668	Sca_1470	Sca_1471		gatB	FALSE	0.100	251.000	0.034	1.000	N	NA
5567668	5567669	Sca_1471	Sca_1472	gatB	gatA	TRUE	0.992	17.000	0.492	0.001	Y	NA
5567669	5567670	Sca_1472	Sca_1473	gatA	gatC	TRUE	0.997	0.000	0.643	0.001	Y	NA
5567672	5567673	Sca_1475	Sca_1476			FALSE	0.020	172.000	0.000	NA		NA
5567673	5567674	Sca_1476	Sca_1477		lig	TRUE	0.762	21.000	0.030	NA		NA
5567674	5567675	Sca_1477	Sca_1478	lig	pcrA	TRUE	0.986	4.000	0.103	0.015	Y	NA
5567675	5567676	Sca_1478	Sca_1479	pcrA	pcrB	TRUE	0.913	1.000	0.054	NA		NA
5567676	5567677	Sca_1479	Sca_1480	pcrB		FALSE	0.040	123.000	0.000	NA		NA
5567677	5567678	Sca_1480	Sca_1481			TRUE	0.717	-16.000	0.000	NA		NA
5567678	5567679	Sca_1481	Sca_1482		purB	FALSE	0.260	121.000	0.006	1.000		NA
5567679	5567680	Sca_1482	Sca_1483	purB		FALSE	0.012	211.000	0.000	NA		NA
5567680	5567681	Sca_1483	Sca_1484			TRUE	0.982	-10.000	0.258	NA		NA
5567681	5567682	Sca_1484	Sca_1485		nadE	TRUE	0.548	61.000	0.023	NA		NA
5567682	5567683	Sca_1485	Sca_1486	nadE		TRUE	0.993	2.000	0.194	0.003	Y	NA
5567684	5567685	Sca_1487	Sca_1488	nos		TRUE	0.910	34.000	0.022	1.000	Y	NA
5567685	5567686	Sca_1488	Sca_1489		drrC	FALSE	0.168	104.000	0.000	1.000	N	NA
5567687	5567688	Sca_1490	Sca_1491	aldH	ppaC	FALSE	0.240	243.000	0.008	1.000	Y	NA
5567688	5567689	Sca_1491	Sca_1492	ppaC		TRUE	0.529	76.000	0.020	1.000	N	NA
5567691	5567692	Sca_1494	Sca_1495			FALSE	0.276	7.000	0.000	NA		NA
5567692	5567693	Sca_1495	Sca_1496			FALSE	0.019	233.000	0.000	NA	N	NA
5567697	5567698	Sca_1500	Sca_1501			FALSE	0.133	317.000	0.545	NA		NA
5567698	5567699	Sca_1501	Sca_1502			FALSE	0.421	173.000	0.636	NA		NA
5567701	5567702	Sca_1504	Sca_1505			TRUE	0.982	-3.000	0.615	NA		NA
5567702	5567703	Sca_1505	Sca_1506			TRUE	0.907	15.000	0.462	NA		NA
5567703	5567704	Sca_1506	Sca_1507			TRUE	0.983	-3.000	0.625	NA		NA
5567704	5567705	Sca_1507	Sca_1508			TRUE	0.981	-3.000	0.292	1.000	N	NA
5567706	5567707	Sca_1509	Sca_1510			FALSE	0.049	109.000	0.000	NA		NA
5567707	5567708	Sca_1510	Sca_1511			TRUE	0.717	-16.000	0.000	NA		NA
5567709	5567710	Sca_1512	Sca_1513			FALSE	0.103	70.000	0.000	NA		NA
5567714	5567715	Sca_1517	Sca_1518			FALSE	0.042	121.000	0.000	NA		NA
5567715	5567716	Sca_1518	Sca_1519			FALSE	0.145	49.000	0.000	NA		NA
5567716	5567717	Sca_1519	Sca_1520			FALSE	0.076	81.000	0.000	NA		NA
5567717	5567718	Sca_1520	Sca_1521			TRUE	0.980	0.000	1.000	NA		NA
5567718	5567719	Sca_1521	Sca_1522			FALSE	0.041	122.000	0.000	NA		NA
5567719	5567720	Sca_1522	Sca_1523			TRUE	0.609	-3.000	0.000	NA		NA
5567720	5567721	Sca_1523	Sca_1524			FALSE	0.005	293.000	0.000	NA		NA
5567721	5567722	Sca_1524	Sca_1525			FALSE	0.228	28.000	0.000	NA		NA
5567724	5567725	Sca_1527	Sca_1528			TRUE	0.932	13.000	1.000	NA		NA
5567725	5567726	Sca_1528	Sca_1529			FALSE	0.015	194.000	0.000	NA		NA
5567726	5567727	Sca_1529	Sca_1530			FALSE	0.002	512.000	0.000	NA		NA
5567727	5567728	Sca_1530	Sca_1531			FALSE	0.232	13.000	0.000	NA		NA
5567728	5567729	Sca_1531	Sca_1532			FALSE	0.054	103.000	0.000	NA		NA
5567729	5567730	Sca_1532	Sca_1533			FALSE	0.426	2.000	0.000	NA		NA
5567730	5567731	Sca_1533	Sca_1534			FALSE	0.080	79.000	0.000	NA		NA
5567731	5567732	Sca_1534	Sca_1535			TRUE	0.472	1.000	0.000	NA		NA
5567732	5567733	Sca_1535	Sca_1536			FALSE	0.332	4.000	0.000	NA		NA
5567734	5567735	Sca_1537	Sca_1538			FALSE	0.223	29.000	0.000	NA		NA
5567735	5567736	Sca_1538	Sca_1539			FALSE	0.261	9.000	0.000	NA		NA
5567737	5567738	Sca_1540	Sca_1541	groEL	groES	TRUE	0.979	42.000	0.674	0.096	Y	NA
5567741	5567742	Sca_1544	Sca_1545		agrB	FALSE	0.004	891.000	0.000	1.000		NA
5567742	5567743	Sca_1545	Sca_1546	agrB	agrD	TRUE	0.885	9.000	0.225	NA		NA
5567743	5567744	Sca_1546	Sca_1547	agrD	agrC	TRUE	0.852	32.000	0.250	NA		NA
5567744	5567745	Sca_1547	Sca_1548	agrC	agrC''	FALSE	0.332	4.000	0.000	NA		NA
5567745	5567746	Sca_1548	Sca_1549	agrC''	agrA	TRUE	0.957	5.000	0.875	1.000		NA
5567748	5567749	Sca_1551	Sca_1552			TRUE	0.899	27.000	0.419	NA		NA
5567752	5567753	Sca_1555	Sca_1556	gcp		TRUE	0.963	-3.000	0.090	1.000		NA
5567753	5567754	Sca_1556	Sca_1557			TRUE	0.981	-24.000	0.127	1.000		NA
5567754	5567755	Sca_1557	Sca_1558			TRUE	0.859	-22.000	0.000	1.000		NA
5567756	5567757	Sca_1559	Sca_1560	ilvD	ilvB	TRUE	0.984	7.000	0.089	0.002	Y	NA
5567757	5567758	Sca_1560	Sca_1561	ilvB	ilvH	TRUE	0.997	-3.000	0.249	0.001	Y	NA
5567758	5567759	Sca_1561	Sca_1562	ilvH	ilvC	TRUE	0.964	57.000	0.130	0.002	Y	NA
5567759	5567760	Sca_1562	Sca_1563	ilvC	leuA	TRUE	0.953	26.000	0.103	1.000	Y	NA
5567760	5567761	Sca_1563	Sca_1564	leuA	leuB	TRUE	0.994	-3.000	0.011	0.002	Y	NA
5567761	5567762	Sca_1564	Sca_1565	leuB	leuC	TRUE	0.977	16.000	0.027	0.002	Y	NA
5567762	5567763	Sca_1565	Sca_1566	leuC	leuD	TRUE	0.998	-7.000	0.477	0.001	Y	NA
5567763	5567764	Sca_1566	Sca_1567	leuD	ilvA	TRUE	0.957	19.000	0.100	1.000	Y	NA
5567765	5567766	Sca_23S_rRNA_D	Sca_16S_rRNA_D	23S_rRNA_D	16S_rRNA_D	FALSE	0.008	243.000	0.000	NA		NA
5567766	5567767	Sca_16S_rRNA_D	tRNA-Sca_0048	16S_rRNA_D	tRNA-Gly_(TCC)	FALSE	0.038	126.000	0.000	NA		NA
5567767	5567768	tRNA-Sca_0048	tRNA-Sca_0049	tRNA-Gly_(TCC)	tRNA-Leu_(GAG)	FALSE	0.248	25.000	0.000	NA		NA
5567768	5567769	tRNA-Sca_0049	Sca_1568	tRNA-Leu_(GAG)		FALSE	0.005	303.000	0.000	NA		NA
5567769	5567770	Sca_1568	Sca_1569			TRUE	0.885	8.000	0.215	NA		NA
5567770	5567771	Sca_1569	Sca_1570		sigB	TRUE	0.733	109.000	0.049	1.000	Y	NA
5567771	5567772	Sca_1570	Sca_1571	sigB	rsbW	TRUE	0.993	-25.000	0.838	1.000	N	NA
5567772	5567773	Sca_1571	Sca_1572	rsbW	rsbV	TRUE	0.990	2.000	0.714	1.000	Y	NA
5567773	5567774	Sca_1572	Sca_1573	rsbV	rsbU	TRUE	0.910	76.000	0.440	1.000	Y	NA
5567774	5567775	Sca_1573	Sca_1574	rsbU		FALSE	0.078	344.000	0.000	1.000	Y	NA
5567775	5567776	Sca_1574	Sca_1575			TRUE	0.916	0.000	0.039	NA		NA
5567776	5567777	Sca_1575	Sca_1576		alr	TRUE	0.508	81.000	0.065	NA		NA
5567777	5567778	Sca_1576	Sca_1577	alr	acpS	TRUE	0.733	64.000	0.093	1.000	N	NA
5567778	5567779	Sca_1577	Sca_1578	acpS		TRUE	0.838	2.000	0.012	NA		NA
5567779	5567780	Sca_1578	Sca_1579			TRUE	0.881	5.000	0.137	NA		NA
5567780	5567781	Sca_1579	Sca_1580			TRUE	0.970	-7.000	0.118	NA		NA
5567781	5567782	Sca_1580	Sca_1581			FALSE	0.023	160.000	0.000	NA		NA
5567782	5567783	Sca_1581	Sca_1582		murF	FALSE	0.048	340.000	0.000	0.095	N	NA
5567783	5567784	Sca_1582	Sca_1583	murF	ddlA	TRUE	0.971	13.000	0.035	0.008	Y	NA
5567786	5567787	Sca_1585	Sca_1586	copA	copZ	TRUE	0.823	97.000	0.000	0.001	Y	NA
5567787	5567788	Sca_1586	Sca_1587	copZ		FALSE	0.424	15.000	0.000	1.000		NA
5567788	5567789	Sca_1587	Sca_1588			TRUE	0.759	12.000	0.036	NA		NA
5567790	5567791	Sca_1589	Sca_1590			TRUE	0.910	25.000	0.036	0.030		NA
5567792	5567793	Sca_1591	Sca_1592	paiA		FALSE	0.103	111.000	0.000	1.000		NA
5567793	5567794	Sca_1592	Sca_1593		thiE	TRUE	0.549	89.000	0.055	1.000	N	NA
5567794	5567795	Sca_1593	Sca_1594	thiE	thiM	TRUE	0.992	1.000	0.061	0.004	Y	NA
5567795	5567796	Sca_1594	Sca_1595	thiM	thiD	TRUE	0.996	-7.000	0.032	0.004	Y	NA
5567796	5567797	Sca_1595	Sca_1596	thiD	tenA	TRUE	0.985	-3.000	0.478	1.000	N	NA
5567797	5567798	Sca_1596	Sca_1596a	tenA	sceE''	FALSE	0.014	277.000	0.000	1.000		NA
5567798	5567799	Sca_1596a	Sca_1597	sceE''	sceE'	TRUE	0.735	-70.000	0.000	NA		NA
5567799	5567800	Sca_1597	Sca_1598	sceE'	sceA	FALSE	0.011	219.000	0.000	NA		NA
5567800	5567801	Sca_1598	Sca_1599	sceA	sceD	FALSE	0.170	213.000	0.000	0.003		NA
5567801	5567802	Sca_1599	Sca_1600	sceD	ssb	FALSE	0.005	531.000	0.000	1.000		NA
5567804	5567805	Sca_1602	Sca_1603	fabZ	murA	FALSE	0.170	205.000	0.044	1.000	N	NA
5567805	5567806	Sca_1603	Sca_1604	murA		TRUE	0.542	111.000	0.279	NA		NA
5567806	5567807	Sca_1604	Sca_1605		atpE	FALSE	0.150	181.000	0.039	NA		NA
5567807	5567808	Sca_1605	Sca_1606	atpE	atpD	TRUE	0.991	21.000	0.837	0.004	Y	NA
5567808	5567809	Sca_1606	Sca_1607	atpD	atpG	TRUE	0.991	23.000	0.724	0.004	Y	NA
5567809	5567810	Sca_1607	Sca_1608	atpG	atpA''	TRUE	0.987	36.000	0.846	0.004	Y	NA
5567810	5567811	Sca_1608	Sca_1609	atpA''	atpA'	TRUE	0.935	-10.000	0.006	NA		NA
5567811	5567812	Sca_1609	Sca_1610	atpA'	atpH	TRUE	0.935	24.000	0.864	NA		NA
5567812	5567813	Sca_1610	Sca_1611	atpH	atpF	TRUE	0.995	0.000	0.222	0.004	Y	NA
5567813	5567814	Sca_1611	Sca_1612	atpF	atpE	TRUE	0.870	116.000	0.077	0.004	Y	NA
5567814	5567815	Sca_1612	Sca_1613	atpE	atpB	TRUE	0.981	44.000	0.557	0.004	Y	NA
5567815	5567816	Sca_1613	Sca_1614	atpB	mnaA	FALSE	0.007	545.000	0.000	1.000	N	NA
5567816	5567817	Sca_1614	Sca_1615	mnaA	upp	FALSE	0.153	182.000	0.008	1.000	N	NA
5567817	5567818	Sca_1615	Sca_1616	upp	glyA	TRUE	0.847	25.000	0.051	1.000	N	NA
5567818	5567819	Sca_1616	Sca_1617	glyA		TRUE	0.848	26.000	0.145	NA		NA
5567819	5567820	Sca_1617	Sca_1618			FALSE	0.262	145.000	0.052	NA		NA
5567820	5567821	Sca_1618	Sca_1619			TRUE	0.956	-3.000	0.052	NA	N	NA
5567821	5567822	Sca_1619	Sca_1620			TRUE	0.770	92.000	0.072	NA	Y	NA
5567822	5567823	Sca_1620	Sca_1621		prfA	TRUE	0.956	8.000	0.084	1.000	Y	NA
5567823	5567824	Sca_1621	Sca_1622	prfA	tdk	TRUE	0.951	0.000	0.062	1.000	N	NA
5567824	5567825	Sca_1622	Sca_1623	tdk	rpmE	FALSE	0.309	136.000	0.028	1.000	N	NA
5567825	5567826	Sca_1623	Sca_1624	rpmE	rho	FALSE	0.369	132.000	0.049	1.000	N	NA
5567826	5567827	Sca_1624	Sca_1625	rho		FALSE	0.038	217.000	0.000	1.000	N	NA
5567827	5567828	Sca_1625	Sca_1626			TRUE	0.485	125.000	0.200	NA	N	NA
5567828	5567829	Sca_1626	Sca_1627		murA2	TRUE	0.636	65.000	0.046	NA	N	NA
5567829	5567830	Sca_1627	Sca_1628	murA2	fbaA	FALSE	0.008	528.000	0.000	1.000	N	NA
5567832	5567833	Sca_1630	Sca_1631	pyrG		FALSE	0.104	242.000	0.029	1.000	N	NA
5567833	5567834	Sca_1631	Sca_1632			FALSE	0.359	129.000	0.060	1.000		NA
5567834	5567835	Sca_1632	Sca_1633			FALSE	0.093	72.000	0.000	NA		NA
5567837	5567838	Sca_1635	Sca_1636			FALSE	0.034	133.000	0.000	NA		NA
5567840	5567841	Sca_1638	Sca_1639	fmhA''	fmhA'	FALSE	0.038	126.000	0.000	NA		NA
5567841	5567842	Sca_1639	Sca_1640	fmhA'	dra	FALSE	0.025	155.000	0.000	NA		NA
5567844	5567845	Sca_1642	Sca_1643			TRUE	0.725	-22.000	0.000	NA		NA
5567845	5567846	Sca_1643	Sca_1644		dps	FALSE	0.057	184.000	0.000	1.000	N	NA
5567846	5567847	Sca_1644	Sca_1645	dps		FALSE	0.024	358.000	0.009	NA		NA
5567847	5567848	Sca_1645	Sca_1646			FALSE	0.170	137.000	0.007	NA		NA
5567848	5567849	Sca_1646	Sca_1647			FALSE	0.035	131.000	0.000	NA		NA
5567849	5567850	Sca_1647	Sca_1648			TRUE	0.931	28.000	1.000	NA		NA
5567850	5567851	Sca_1648	Sca_1649			FALSE	0.007	557.000	0.000	1.000	N	NA
5567851	5567852	Sca_1649	Sca_1650			FALSE	0.022	276.000	0.000	1.000	N	NA
5567853	5567854	Sca_1651	Sca_1652	czrA	czrB	TRUE	0.889	24.000	0.139	1.000	N	NA
5567857	5567858	Sca_1655	Sca_1656			FALSE	0.014	199.000	0.000	NA		NA
5567858	5567859	Sca_1656	Sca_1657		glmS	FALSE	0.006	404.000	0.000	NA	N	NA
5567860	5567861	Sca_1658	Sca_1659	mtlA		TRUE	0.948	37.000	0.336	0.008	N	NA
5567861	5567862	Sca_1659	Sca_1660		mtlF	TRUE	0.953	7.000	0.098	0.008	N	NA
5567862	5567863	Sca_1660	Sca_1661	mtlF	mtlD	TRUE	0.984	0.000	0.062	1.000	Y	NA
5567863	5567864	Sca_1661	Sca_1662	mtlD		FALSE	0.105	110.000	0.000	1.000		NA
5567865	5567866	Sca_1663	Sca_1664	glmM		TRUE	0.833	30.000	0.150	NA		NA
5567866	5567867	Sca_1664	Sca_1665			TRUE	0.961	2.000	0.502	NA		NA
5567867	5567868	Sca_1665	tRNA-Sca_0050		tRNA-Lys_(TTT)	FALSE	0.016	189.000	0.000	NA		NA
5567868	5567869	tRNA-Sca_0050	tRNA-Sca_0051	tRNA-Lys_(TTT)	tRNA-Gln_(TTG)	FALSE	0.332	4.000	0.000	NA		NA
5567869	5567870	tRNA-Sca_0051	tRNA-Sca_0052	tRNA-Gln_(TTG)	tRNA-Tyr_(GTA)	FALSE	0.267	8.000	0.000	NA		NA
5567870	5567871	tRNA-Sca_0052	tRNA-Sca_0053	tRNA-Tyr_(GTA)	tRNA-Val_(TAC)	FALSE	0.252	24.000	0.000	NA		NA
5567871	5567872	tRNA-Sca_0053	tRNA-Sca_0054	tRNA-Val_(TAC)	tRNA-Glu_(TTC)	FALSE	0.251	11.000	0.000	NA		NA
5567872	5567873	tRNA-Sca_0054	tRNA-Sca_0055	tRNA-Glu_(TTC)	tRNA-Asn_(GTT)	FALSE	0.332	4.000	0.000	NA		NA
5567873	5567874	tRNA-Sca_0055	Sca_5S_rRNA_E	tRNA-Asn_(GTT)	5S_rRNA_E	FALSE	0.243	12.000	0.000	NA		NA
5567874	5567875	Sca_5S_rRNA_E	Sca_23S_rRNA_E	5S_rRNA_E	23S_rRNA_E	FALSE	0.098	71.000	0.000	NA		NA
5567875	5567876	Sca_23S_rRNA_E	tRNA-Sca_0056	23S_rRNA_E	tRNA-Ile_(GAT)	FALSE	0.024	159.000	0.000	NA		NA
5567876	5567877	tRNA-Sca_0056	Sca_16S_rRNA_E	tRNA-Ile_(GAT)	16S_rRNA_E	FALSE	0.057	99.000	0.000	NA		NA
5567877	5567878	Sca_16S_rRNA_E	Sca_1666	16S_rRNA_E		FALSE	0.003	437.000	0.000	NA		NA
5567878	5567879	Sca_1666	Sca_1667			FALSE	0.355	168.000	0.162	1.000	N	NA
5567879	5567880	Sca_1667	Sca_1668			TRUE	0.735	80.000	0.500	NA		NA
5567880	5567881	Sca_1668	Sca_1669			TRUE	0.719	102.000	0.875	NA		NA
5567881	5567882	Sca_1669	Sca_1670			TRUE	0.683	118.000	0.162	0.055		NA
5567882	5567883	Sca_1670	Sca_1671			TRUE	0.832	21.000	0.051	1.000		NA
5567883	5567884	Sca_1671	Sca_1672			FALSE	0.123	205.000	0.044	NA		NA
5567886	5567887	Sca_1674	Sca_1675			TRUE	0.696	-9.000	0.000	NA		NA
5567889	5567890	Sca_1677	Sca_1678			FALSE	0.016	260.000	0.000	1.000		NA
5567890	5567891	Sca_1678	Sca_1679			TRUE	0.996	-3.000	0.280	0.025	Y	NA
5567891	5567892	Sca_1679	Sca_1680		fecB	TRUE	0.974	15.000	0.500	1.000	Y	NA
5567892	5567893	Sca_1680	Sca_1681	fecB		FALSE	0.099	278.000	0.105	NA	N	NA
5567893	5567894	Sca_1681	Sca_1682			TRUE	0.948	3.000	0.368	NA	N	NA
5567894	5567895	Sca_1682	Sca_1683			TRUE	0.979	-3.000	0.429	NA		NA
5567897	5567898	Sca_1685	Sca_1686			TRUE	0.652	64.000	0.083	NA		NA
5567898	5567899	Sca_1686	Sca_1687			TRUE	0.828	12.000	0.107	NA		NA
5567899	5567900	Sca_1687	Sca_1688		opuD2	FALSE	0.398	166.000	0.455	NA		NA
5567900	5567901	Sca_1688	Sca_1689	opuD2		FALSE	0.235	166.000	0.032	1.000	N	NA
5567901	5567902	Sca_1689	Sca_1690			TRUE	0.928	13.000	0.079	0.014		NA
5567902	5567903	Sca_1690	Sca_1691			TRUE	0.502	73.000	0.039	NA		NA
5567903	5567904	Sca_1691	Sca_1692			FALSE	0.260	134.000	0.039	NA		NA
5567904	5567905	Sca_1692	Sca_1693			FALSE	0.016	188.000	0.000	NA		NA
5567905	5567906	Sca_1693	Sca_1694		ppdK	TRUE	0.676	50.000	0.065	NA		NA
5567907	5567908	Sca_1695	Sca_1696			FALSE	0.019	174.000	0.000	NA		NA
5567909	5567910	Sca_1697	Sca_1698			FALSE	0.144	87.000	0.000	1.000		NA
5567912	5567913	Sca_1700	Sca_1701			FALSE	0.161	202.000	0.051	1.000		NA
5567913	5567914	Sca_1701	Sca_1702		rpsI	FALSE	0.176	100.000	0.000	1.000	N	NA
5567914	5567915	Sca_1702	Sca_1703	rpsI	rplM	TRUE	0.967	20.000	0.006	0.017	Y	NA
5567915	5567916	Sca_1703	Sca_1704	rplM	truA	FALSE	0.379	215.000	0.052	1.000	Y	NA
5567916	5567917	Sca_1704	Sca_1705	truA		TRUE	0.920	5.000	0.170	1.000	N	NA
5567917	5567918	Sca_1705	Sca_1706			TRUE	0.961	20.000	0.139	1.000	Y	NA
5567918	5567919	Sca_1706	Sca_1707			TRUE	0.998	-3.000	0.713	0.020	Y	NA
5567919	5567920	Sca_1707	Sca_1708		rplQ	FALSE	0.062	359.000	0.074	1.000	N	NA
5567920	5567921	Sca_1708	Sca_1709	rplQ	rpoA	TRUE	0.951	23.000	0.873	1.000	N	NA
5567921	5567922	Sca_1709	Sca_1710	rpoA	rpsK	TRUE	0.716	86.000	0.308	1.000	N	NA
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5567923	5567924	Sca_1711	Sca_1712	rpsM	rpmJ	TRUE	0.913	23.000	0.023	0.017		NA
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5568095	5568096	Sca_1883	Sca_1884	mvaA	thiL	TRUE	0.960	7.000	0.098	1.000	Y	NA
5568097	5568098	Sca_1885	Sca_1886	mvaS		FALSE	0.038	218.000	0.000	1.000	N	NA
5568099	5568100	Sca_1887	Sca_1888	narT	nreC	FALSE	0.060	289.000	0.029	NA	N	NA
5568100	5568101	Sca_1888	Sca_1889	nreC	nreB	TRUE	0.991	18.000	0.800	0.009	Y	NA
5568101	5568102	Sca_1889	Sca_1890	nreB	nreA	TRUE	0.986	-22.000	0.333	NA		NA
5568102	5568103	Sca_1890	Sca_1891	nreA	narI	TRUE	0.828	16.000	0.088	NA		NA
5568103	5568104	Sca_1891	Sca_1892	narI	narJ	TRUE	0.985	14.000	0.206	0.002	Y	NA
5568104	5568105	Sca_1892	Sca_1893	narJ	narH	TRUE	0.999	-7.000	0.933	0.002	Y	NA
5568105	5568106	Sca_1893	Sca_1894	narH	narG	TRUE	0.989	14.000	0.429	0.001	Y	NA
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5568107	5568108	Sca_1895	Sca_1896	sirB	nirD	TRUE	0.972	-9.000	0.042	1.000	N	NA
5568108	5568109	Sca_1896	Sca_1897	nirD	nirB	TRUE	0.976	3.000	0.091	0.001	N	NA
5568109	5568110	Sca_1897	Sca_1898	nirB	sirA	TRUE	0.513	4.000	0.000	NA	N	NA
5568110	5568111	Sca_1898	Sca_1899	sirA	nirR	TRUE	0.472	1.000	0.000	NA		NA
5568111	5568112	Sca_1899	Sca_1900	nirR	nirC	TRUE	0.526	128.000	0.300	1.000		NA
5568112	5568113	Sca_1900	Sca_1901	nirC		FALSE	0.011	218.000	0.000	NA		NA
5568113	5568114	Sca_1901	Sca_1902			TRUE	0.622	110.000	0.500	NA		NA
5568114	5568115	Sca_1902	Sca_1903			FALSE	0.339	144.000	0.133	NA		NA
5568115	5568116	Sca_1903	Sca_1904			FALSE	0.039	124.000	0.000	NA		NA
5568116	5568117	Sca_1904	Sca_1905			TRUE	0.750	56.000	0.182	NA		NA
5568117	5568118	Sca_1905	Sca_1906			TRUE	0.978	-6.000	0.267	NA		NA
5568118	5568119	Sca_1906	Sca_1907			FALSE	0.143	233.000	0.000	NA	Y	NA
5568119	5568120	Sca_1907	Sca_1908			FALSE	0.025	209.000	0.000	NA	N	NA
5568120	5568121	Sca_1908	Sca_1909			TRUE	0.994	-3.000	0.481	1.000	Y	NA
5568121	5568122	Sca_1909	Sca_1910			TRUE	0.988	11.000	0.594	0.030	Y	NA
5568126	5568127	Sca_1914	Sca_1915			FALSE	0.197	172.000	0.034	1.000		NA
5568128	5568129	Sca_1916	Sca_1917			FALSE	0.046	113.000	0.000	NA		NA
5568129	5568130	Sca_1917	Sca_1918			FALSE	0.007	255.000	0.000	NA		NA
5568131	5568132	Sca_1919	Sca_1920			FALSE	0.048	166.000	0.000	1.000		NA
5568135	5568136	Sca_1923	Sca_1924	lytS	lytR	TRUE	0.999	-19.000	0.538	0.009	Y	NA
5568136	5568137	Sca_1924	Sca_1925	lytR	lrgA	FALSE	0.161	243.000	0.178	1.000		NA
5568137	5568138	Sca_1925	Sca_1926	lrgA	lrgB	TRUE	0.987	-3.000	0.869	1.000		NA
5568138	5568139	Sca_1926	Sca_1927	lrgB		FALSE	0.006	291.000	0.000	NA		NA
5568139	5568140	Sca_1927	Sca_1928			TRUE	0.932	19.000	0.714	NA		NA
5568140	5568141	Sca_1928	Sca_1929			TRUE	0.960	2.000	0.500	NA		NA
5568142	5568143	Sca_1930	Sca_1931		opuCD	TRUE	0.530	86.000	0.111	NA		NA
5568143	5568144	Sca_1931	Sca_1932	opuCD	opuCC	TRUE	0.985	0.000	0.190	0.024	N	NA
5568144	5568145	Sca_1932	Sca_1933	opuCC	opuCB	TRUE	0.956	19.000	0.200	0.024	N	NA
5568145	5568146	Sca_1933	Sca_1934	opuCB	opuCA	TRUE	0.994	0.000	0.200	0.069	Y	NA
5568146	5568147	Sca_1934	Sca_1935	opuCA		FALSE	0.002	740.000	0.000	NA		NA
5568148	5568149	Sca_1936	Sca_1937			FALSE	0.446	106.000	0.036	1.000	N	NA
5568150	5568151	Sca_1938	Sca_1939			FALSE	0.103	182.000	0.009	NA		NA
5568151	5568152	Sca_1939	Sca_1940			TRUE	0.962	-3.000	0.127	NA		NA
5568152	5568153	Sca_1940	Sca_1941			FALSE	0.314	123.000	0.045	NA		NA
5568153	5568154	Sca_1941	Sca_1942			FALSE	0.031	139.000	0.000	NA		NA
5568154	5568155	Sca_1942	Sca_1943			FALSE	0.014	197.000	0.000	NA		NA
5568156	5568157	Sca_1944	Sca_1945	ppx	ppk	FALSE	0.386	214.000	0.056	1.000	Y	NA
5568158	5568159	Sca_1946	Sca_1947	argE		FALSE	0.121	64.000	0.000	NA		NA
5568159	5568160	Sca_1947	Sca_1948		gntP	FALSE	0.086	75.000	0.000	NA		NA
5568160	5568161	Sca_1948	Sca_1949	gntP	gntK	TRUE	0.846	124.000	0.696	1.000	Y	NA
5568161	5568162	Sca_1949	Sca_1950	gntK	gntR	TRUE	0.938	27.000	0.680	1.000	N	NA
5568164	5568165	Sca_1952	Sca_1953		clpL	FALSE	0.019	175.000	0.000	NA		NA
5568165	5568166	Sca_1953	Sca_1954	clpL		FALSE	0.004	717.000	0.000	1.000		NA
5568168	5568169	Sca_1956	Sca_1957			TRUE	0.485	85.000	0.062	NA		NA
5568169	5568170	Sca_1957	Sca_1958			FALSE	0.026	152.000	0.000	NA		NA
5568170	5568171	Sca_1958	Sca_1959			FALSE	0.086	124.000	0.000	1.000		NA
5568171	5568172	Sca_1959	Sca_1960			FALSE	0.029	147.000	0.000	NA		NA
5568174	5568175	Sca_1962	Sca_1963			TRUE	0.977	-3.000	0.371	NA		NA
5568179	5568180	Sca_1968	Sca_1969	lacP		FALSE	0.013	349.000	0.000	1.000	N	NA
5568180	5568181	Sca_1969	Sca_1970			FALSE	0.336	62.000	0.000	1.000	N	NA
5568181	5568182	Sca_1970	Sca_1971			FALSE	0.076	162.000	0.000	1.000	N	NA
5568184	5568185	Sca_1973	Sca_1974			TRUE	0.999	-16.000	0.911	0.004	Y	NA
5568185	5568186	Sca_1974	Sca_1975		ddh	FALSE	0.362	52.000	0.000	1.000	N	NA
5568186	5568187	Sca_1975	Sca_1976	ddh		FALSE	0.248	193.000	0.000	1.000	Y	NA
5568187	5568188	Sca_1976	Sca_1977			TRUE	0.481	90.000	0.000	0.022		NA
5568188	5568189	Sca_1977	Sca_1978			FALSE	0.082	77.000	0.000	NA		NA
5568189	5568190	Sca_1978	Sca_1979			FALSE	0.145	177.000	0.029	NA		NA
5568190	5568191	Sca_1979	Sca_1980			TRUE	0.987	14.000	0.324	0.002	Y	NA
5568191	5568192	Sca_1980	Sca_1981			TRUE	0.833	48.000	0.304	NA	N	NA
5568192	5568193	Sca_1981	Sca_1982			FALSE	0.026	154.000	0.000	NA		NA
5568195	5568196	Sca_1984	Sca_1985	ccpA		FALSE	0.187	71.000	0.000	NA	N	NA
5568198	5568199	Sca_1987	Sca_1988	alzD		TRUE	0.990	2.000	0.915	NA	Y	NA
5568199	5568200	Sca_1988	Sca_1989			FALSE	0.006	399.000	0.000	NA	N	NA
5568202	5568203	Sca_1991	Sca_1992			TRUE	0.621	112.000	0.300	1.000	N	NA
5568203	5568204	Sca_1992	Sca_1993			TRUE	0.961	-3.000	0.070	1.000		NA
5568204	5568205	Sca_1993	Sca_1994			FALSE	0.011	307.000	0.000	1.000		NA
5568205	5568206	Sca_1994	Sca_1995			FALSE	0.119	128.000	0.000	1.000	N	NA
5568206	5568207	Sca_1995	Sca_1996			TRUE	0.994	-3.000	0.372	1.000	Y	NA
5568207	5568208	Sca_1996	Sca_1997			TRUE	0.985	-3.000	0.652	NA	N	NA
5568209	5568210	Sca_1998	Sca_1999			FALSE	0.009	236.000	0.000	NA		NA
5568211	5568212	Sca_2000	Sca_2001	adaB		FALSE	0.071	136.000	0.000	1.000		NA
5568218	5568219	Sca_2007	Sca_2008			FALSE	0.066	89.000	0.000	NA		NA
5568219	5568220	Sca_2008	Sca_2009			FALSE	0.024	158.000	0.000	NA		NA
5568222	5568223	Sca_2011	Sca_2012	drm	pdp	TRUE	0.870	39.000	0.280	1.000	N	NA
5568225	5568226	Sca_2014	Sca_2015			FALSE	0.040	123.000	0.000	NA		NA
5568226	5568227	Sca_2015	Sca_2016		pflA	FALSE	0.196	91.000	0.000	1.000	N	NA
5568227	5568228	Sca_2016	Sca_2017	pflA	pflB	TRUE	0.755	65.000	0.135	1.000	N	NA
5568228	5568229	Sca_2017	Sca_2018	pflB		FALSE	0.007	271.000	0.000	NA		NA
5568229	5568230	Sca_2018	Sca_2019			FALSE	0.002	1103.000	0.000	NA		NA
5568230	5568231	Sca_2019	Sca_2020			TRUE	0.909	9.000	0.392	NA		NA
5568231	5568232	Sca_2020	Sca_2021			FALSE	0.018	177.000	0.000	NA		NA
5568232	5568233	Sca_2021	Sca_2022			TRUE	0.703	7.000	0.007	NA		NA
5568233	5568234	Sca_2022	Sca_2023			FALSE	0.072	84.000	0.000	NA		NA
5568234	5568235	Sca_2023	Sca_2024			FALSE	0.049	109.000	0.000	NA		NA
5568235	5568236	Sca_2024	Sca_2025		gtaB	FALSE	0.093	149.000	0.000	1.000	N	NA
5568236	5568237	Sca_2025	Sca_2026	gtaB	capD	FALSE	0.068	374.000	0.000	1.000	Y	NA
5568237	5568238	Sca_2026	Sca_2027	capD		TRUE	0.492	120.000	0.000	1.000	Y	NA
5568239	5568240	Sca_2028	Sca_2029		feoB	TRUE	0.995	-7.000	0.308	1.000	Y	NA
5568240	5568241	Sca_2029	Sca_2030	feoB		TRUE	0.910	13.000	0.517	NA		NA
5568241	5568242	Sca_2030	Sca_2031			FALSE	0.013	205.000	0.000	NA		NA
5568242	5568243	Sca_2031	Sca_2032			TRUE	0.979	-10.000	0.172	NA		NA
5568244	5568245	Sca_2033	Sca_2034			FALSE	0.103	111.000	0.000	1.000		NA
5568247	5568248	Sca_2036	Sca_2037	xylB		FALSE	0.062	178.000	0.000	1.000	N	NA
5568248	5568249	Sca_2037	Sca_2038			TRUE	0.891	4.000	0.084	1.000		NA
5568249	5568250	Sca_2038	Sca_2039			TRUE	0.918	2.000	0.062	1.000		NA
5568250	5568251	Sca_2039	Sca_2040			TRUE	0.982	16.000	0.071	0.002	Y	NA
5568251	5568252	Sca_2040	Sca_2041			TRUE	0.697	0.000	0.000	NA	N	NA
5568252	5568253	Sca_2041	Sca_2042			TRUE	0.994	-10.000	0.184	NA	Y	NA
5568253	5568254	Sca_2042	Sca_2043			FALSE	0.002	567.000	0.000	NA		NA
5568256	5568257	Sca_2045	Sca_2046			FALSE	0.042	120.000	0.000	NA		NA
5568257	5568258	Sca_2046	Sca_2047			FALSE	0.038	177.000	0.000	NA	N	NA
5568258	5568259	Sca_2047	Sca_2048			TRUE	0.609	-3.000	0.000	NA		NA
5568259	5568260	Sca_2048	Sca_2049		arcC	FALSE	0.025	155.000	0.000	NA		NA
5568260	5568261	Sca_2049	Sca_2050	arcC		TRUE	0.988	-7.000	0.800	NA		NA
5568261	5568262	Sca_2050	Sca_2051			TRUE	0.961	-3.000	0.118	NA		NA
5568262	5568263	Sca_2051	Sca_2052		fdrA	TRUE	0.969	0.000	0.412	NA		NA
5568263	5568264	Sca_2052	Sca_2053	fdrA	allD	TRUE	0.965	16.000	0.200	1.000	Y	NA
5568264	5568265	Sca_2053	Sca_2054	allD	allD	TRUE	0.949	104.000	0.500	0.001	Y	NA
5568265	5568266	Sca_2054	Sca_2055	allD		TRUE	0.724	17.000	0.013	NA		NA
5568266	5568267	Sca_2055	Sca_2056			TRUE	0.795	26.000	0.059	NA		NA
5568268	5568269	Sca_2057	Sca_2058			FALSE	0.289	6.000	0.000	NA		NA
5568270	5568271	Sca_2059	Sca_2060	allB		TRUE	0.782	-3.000	0.000	1.000		NA
5568271	5568272	Sca_2060	Sca_2061			TRUE	0.845	-10.000	0.000	1.000		NA
5568273	5568274	Sca_2062	Sca_2063		amaB	FALSE	0.075	128.000	0.000	NA	N	NA
5568277	5568278	Sca_2066	Sca_2067			TRUE	0.770	77.000	0.667	NA		NA
5568278	5568279	Sca_2067	Sca_2068		nagA	FALSE	0.011	309.000	0.000	1.000		NA
5568279	5568280	Sca_2068	Sca_2069	nagA		FALSE	0.015	193.000	0.000	NA		NA
5568280	5568281	Sca_2069	Sca_2070			FALSE	0.080	79.000	0.000	NA		NA
5568281	5568282	Sca_2070	Sca_2071			FALSE	0.008	250.000	0.000	NA		NA
5568283	5568284	Sca_2072	Sca_2073	panB	panC	TRUE	0.998	-3.000	0.395	0.001	Y	NA
5568284	5568285	Sca_2073	Sca_2074	panC	panD	TRUE	0.995	-7.000	0.342	1.000	Y	NA
5568287	5568288	Sca_2076	Sca_2077		goxB	TRUE	0.860	4.000	0.037	1.000		NA
5568288	5568289	Sca_2077	Sca_2078	goxB		TRUE	0.981	-16.000	0.094	1.000	N	NA
5568289	5568290	Sca_2078	Sca_2079		thiG	TRUE	0.973	2.000	0.037	1.000	Y	NA
5568290	5568291	Sca_2079	Sca_2080	thiG		TRUE	0.992	-3.000	0.011	0.028	Y	NA
5568294	5568295	Sca_2083	Sca_2084		arcD	FALSE	0.013	281.000	0.000	NA	N	NA
5568295	5568296	Sca_2084	Sca_2085	arcD	arcA	FALSE	0.119	280.000	0.000	1.000	Y	NA
5568296	5568297	Sca_2085	Sca_2086	arcA	arcA	FALSE	0.169	427.000	0.000	0.001	Y	NA
5568297	5568298	Sca_2086	Sca_2087	arcA		FALSE	0.042	120.000	0.000	NA		NA
5568298	5568299	Sca_2087	Sca_2088		vraB	TRUE	0.929	1.000	0.101	NA		NA
5568299	5568300	Sca_2088	Sca_2089	vraB	vraA	TRUE	0.979	7.000	0.576	1.000	Y	NA
5568301	5568302	Sca_2090	Sca_2091			FALSE	0.049	109.000	0.000	NA		NA
5568302	5568303	Sca_2091	Sca_2092			FALSE	0.010	323.000	0.000	1.000		NA
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5568404	5568405	Sca_1292a	tRNA-Sca_0058		tRNA-Ser_(CGA)	FALSE	0.005	300.000	0.000	NA		NA
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5568482	5568483	Sca_2271	Sca_2272			FALSE	0.002	518.000	0.000	NA		NA
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5568486	5568487	Sca_2275	Sca_2276			FALSE	0.010	222.000	0.000	NA		NA
5568490	5568491	Sca_2279	Sca_2280	fabG5		FALSE	0.338	164.000	0.179	NA	N	NA
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5568494	5568495	Sca_2283	Sca_2284			FALSE	0.012	294.000	0.000	1.000		NA
5568499	5568500	Sca_2288	Sca_2289		mocA	FALSE	0.012	207.000	0.000	NA		NA
5568501	5568502	Sca_2290	Sca_2291			TRUE	0.609	-3.000	0.000	NA		NA
5568502	5568503	Sca_2291	Sca_2292			FALSE	0.011	218.000	0.000	NA		NA
5568503	5568504	Sca_2292	Sca_2293			FALSE	0.015	190.000	0.000	NA		NA
5568504	5568505	Sca_2293	Sca_2294			FALSE	0.135	55.000	0.000	NA		NA
5568506	5568507	Sca_2295	Sca_2296			FALSE	0.038	126.000	0.000	NA		NA
5568507	5568508	Sca_2296	Sca_2297			FALSE	0.145	49.000	0.000	NA		NA
5568510	5568511	Sca_2299	Sca_2300			FALSE	0.175	76.000	0.000	1.000		NA
5568512	5568513	Sca_2301	Sca_2302			FALSE	0.039	124.000	0.000	NA		NA
5568513	5568514	Sca_2302	Sca_2303			FALSE	0.013	206.000	0.000	NA		NA
5568515	5568516	Sca_2304	Sca_2305			FALSE	0.041	122.000	0.000	NA		NA
5568516	5568517	Sca_2305	Sca_2306			TRUE	0.985	-7.000	0.462	NA		NA
5568517	5568518	Sca_2306	Sca_2307			TRUE	0.520	0.000	0.000	NA		NA
5568520	5568521	Sca_2309	Sca_2310		opuD	FALSE	0.022	1023.000	0.000	0.065	N	NA
5568521	5568522	Sca_2310	Sca_2311	opuD		FALSE	0.007	260.000	0.000	NA		NA
5568522	5568523	Sca_2311	Sca_2312			TRUE	0.722	71.000	0.280	NA		NA
5568523	5568524	Sca_2312	Sca_2313			FALSE	0.003	434.000	0.000	NA		NA
5568527	5568528	Sca_2316	Sca_2317		srlD	FALSE	0.009	467.000	0.000	1.000	N	NA
5568528	5568529	Sca_2317	Sca_2318	srlD	srlM	TRUE	0.899	27.000	0.222	1.000	N	NA
5568529	5568530	Sca_2318	Sca_2319	srlM		TRUE	0.972	3.000	0.127	NA	Y	NA
5568530	5568531	Sca_2319	Sca_2320			TRUE	0.985	-16.000	0.239	NA	N	NA
5568531	5568532	Sca_2320	Sca_2321			TRUE	0.975	12.000	0.047	0.007	Y	NA
5568532	5568533	Sca_2321	Sca_2322			TRUE	0.912	45.000	0.000	0.007	Y	NA
5568534	5568535	Sca_2323	Sca_2324			TRUE	0.944	4.000	0.552	NA		NA
5568535	5568536	Sca_2324	Sca_2325			FALSE	0.009	236.000	0.000	NA		NA
5568536	5568537	Sca_2325	Sca_2326			FALSE	0.139	51.000	0.000	NA		NA
5568538	5568539	Sca_2327	Sca_2328			TRUE	0.520	0.000	0.000	NA		NA
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5568542	5568543	Sca_2331	Sca_2332			FALSE	0.278	46.000	0.000	NA	N	NA
5568544	5568545	Sca_2333	Sca_2334			FALSE	0.046	114.000	0.000	NA		NA
5568546	5568547	Sca_2335	Sca_2336	gutB	katA	FALSE	0.035	224.000	0.000	1.000	N	NA
5568547	5568548	Sca_2336	Sca_2337	katA		FALSE	0.106	69.000	0.000	NA		NA
5568550	5568551	Sca_2339	Sca_2340			FALSE	0.140	89.000	0.000	1.000		NA
5568552	5568553	Sca_2341	Sca_2342			TRUE	0.759	37.000	0.000	0.010		NA
5568555	5568556	Sca_2344	Sca_2345	capM		TRUE	0.971	1.000	0.023	NA	Y	NA
5568556	5568557	Sca_2345	Sca_2346			TRUE	0.990	-3.000	0.111	1.000	Y	NA
5568557	5568558	Sca_2346	Sca_2347			FALSE	0.306	5.000	0.000	NA		NA
5568558	5568559	Sca_2347	Sca_2348		capL	FALSE	0.426	2.000	0.000	NA		NA
5568559	5568560	Sca_2348	Sca_2349	capL	capI	TRUE	0.877	48.000	0.015	1.000	Y	NA
5568560	5568561	Sca_2349	Sca_2350	capI		TRUE	0.927	3.000	0.000	1.000	Y	NA
5568561	5568562	Sca_2350	Sca_2351			FALSE	0.444	16.000	0.000	1.000		NA
5568562	5568563	Sca_2351	Sca_2352			TRUE	0.677	-7.000	0.000	NA		NA
5568563	5568564	Sca_2352	Sca_2353		capD''	FALSE	0.248	25.000	0.000	NA		NA
5568564	5568565	Sca_2353	Sca_2354	capD''	capD'	FALSE	0.137	52.000	0.000	NA		NA
5568565	5568566	Sca_2354	Sca_2355	capD'	capC	FALSE	0.252	24.000	0.000	NA		NA
5568566	5568567	Sca_2355	Sca_2356	capC	capB	TRUE	0.794	0.000	0.000	1.000	N	NA
5568567	5568568	Sca_2356	Sca_2357	capB	capA	TRUE	0.885	19.000	0.115	1.000	N	NA
5568568	5568569	Sca_2357	Sca_2358	capA		FALSE	0.005	302.000	0.000	NA		NA
5568569	5568570	Sca_2358	Sca_2359			FALSE	0.009	238.000	0.000	NA		NA
5568570	5568571	Sca_2359	Sca_2360			FALSE	0.047	168.000	0.000	1.000		NA
5568571	5568572	Sca_2360	Sca_2361		citH	FALSE	0.137	120.000	0.000	1.000	N	NA
5568572	5568573	Sca_2361	Sca_2362	citH		FALSE	0.060	180.000	0.000	1.000	N	NA
5568574	5568575	Sca_2363	Sca_2364	gabD		TRUE	0.554	21.000	0.000	1.000	N	NA
5568575	5568576	Sca_2364	Sca_2365			FALSE	0.372	50.000	0.000	1.000	N	NA
5568577	5568578	Sca_2366	Sca_2367			FALSE	0.312	166.000	0.103	1.000	N	NA
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5568579	5568580	Sca_2368	Sca_2369		adc	FALSE	0.018	299.000	0.000	1.000	N	NA
5568580	5568581	Sca_2369	Sca_2370	adc		TRUE	0.857	15.000	0.077	1.000	N	NA
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5568585	5568586	Sca_2374	Sca_2375	gabD		FALSE	0.029	147.000	0.000	NA		NA
5568587	5568588	Sca_2376	Sca_2377		lytM	FALSE	0.003	428.000	0.000	NA		NA
5568588	5568589	Sca_2377	Sca_2378	lytM		FALSE	0.005	509.000	0.000	1.000		NA
5568593	5568594	Sca_2382	Sca_2383			FALSE	0.007	258.000	0.000	NA		NA
5568594	5568595	Sca_2383	Sca_2384			FALSE	0.200	71.000	0.000	1.000		NA
5568595	5568596	Sca_2384	Sca_2385			TRUE	0.503	5.000	0.000	1.000		NA
5568596	5568597	Sca_2385	Sca_2386			FALSE	0.034	132.000	0.000	NA		NA
5568597	5568598	Sca_2386	Sca_2387			FALSE	0.258	16.000	0.000	NA		NA
5568598	5568599	Sca_2387	Sca_2388			TRUE	0.574	147.000	0.000	0.065	Y	NA
5568599	5568600	Sca_2388	Sca_2389		nanA	TRUE	0.950	30.000	0.130	1.000	Y	NA
5568603	5568604	Sca_2392	Sca_2393		nagB	TRUE	0.946	23.000	0.043	1.000	Y	NA
5568604	5568605	Sca_2393	Sca_2394	nagB		FALSE	0.038	126.000	0.000	NA		NA
5568606	5568607	Sca_2395	Sca_2396		lip	FALSE	0.082	247.000	0.000	0.065		NA
5568607	5568608	Sca_2396	Sca_2397	lip		FALSE	0.004	321.000	0.000	NA		NA
5568609	5568610	Sca_2398	Sca_2399			TRUE	0.969	-16.000	0.059	NA		NA
5568613	5568614	Sca_2402	Sca_2403			FALSE	0.100	114.000	0.000	1.000		NA
5568614	5568615	Sca_2403	Sca_2404			FALSE	0.365	134.000	0.000	0.004		NA
5568615	5568616	Sca_2404	Sca_2405			FALSE	0.268	17.000	0.000	NA		NA
5568617	5568618	Sca_2406	Sca_2407	fadX	fadE	TRUE	0.966	30.000	0.046	0.055	Y	NA
5568618	5568619	Sca_2407	Sca_2408	fadE		TRUE	0.817	80.000	0.046	1.000	Y	NA
5568619	5568620	Sca_2408	Sca_2409			TRUE	0.879	45.000	0.012	1.000	Y	NA
5568620	5568621	Sca_2409	Sca_2410		fadA	TRUE	0.971	31.000	0.588	1.000	Y	NA
5568621	5568622	Sca_2410	Sca_2411	fadA		FALSE	0.079	129.000	0.000	1.000		NA
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5568624	5568625	Sca_2413	Sca_2414			TRUE	0.975	13.000	0.667	1.000	Y	NA
5568625	5568626	Sca_2414	Sca_2415			TRUE	0.999	-13.000	1.000	0.002	Y	NA
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5568627	5568628	Sca_2416	Sca_2417		gutB	FALSE	0.091	150.000	0.000	1.000	N	NA
5568630	5568631	Sca_2419	Sca_2420	rbsK	rbsD	TRUE	0.942	19.000	0.030	1.000	Y	NA
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5568633	5568634	Sca_2422	Sca_2423			FALSE	0.111	67.000	0.000	NA		NA
5568635	5568636	Sca_2424	Sca_2425			FALSE	0.008	244.000	0.000	NA		NA
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5568638	5568639	Sca_2427	Sca_2428			FALSE	0.005	496.000	0.000	1.000		NA
5568639	5568640	Sca_2428	Sca_2429			TRUE	0.722	42.000	0.043	1.000		NA
5568643	5568644	Sca_2432	Sca_2433			TRUE	0.720	113.000	0.800	1.000	N	NA
5568644	5568645	Sca_2433	Sca_2434			FALSE	0.039	214.000	0.000	1.000	N	NA
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5568647	5568648	Sca_2436	Sca_2437			FALSE	0.042	176.000	0.000	1.000		NA
5568650	5568651	Sca_2439	Sca_2440	pmi	fruA	TRUE	0.954	15.000	0.111	1.000	Y	NA
5568651	5568652	Sca_2440	Sca_2441	fruA		TRUE	0.828	79.000	0.111	0.008	N	NA
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5568653	5568654	Sca_2442	Sca_2443			FALSE	0.004	355.000	0.000	NA		NA
5568654	5568655	Sca_2443	Sca_2444			FALSE	0.021	230.000	0.000	1.000		NA
5568656	5568657	Sca_2445	Sca_2446	pbp4		FALSE	0.376	49.000	0.000	1.000	N	NA
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5568658	5568659	Sca_2447	Sca_2448			TRUE	0.847	11.000	0.091	NA	N	NA
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5568661	5568662	Sca_2450	Sca_2451			FALSE	0.002	574.000	0.000	NA		NA
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5568663	5568664	Sca_2452	Sca_2453			FALSE	0.075	327.000	0.176	NA		NA
5568664	5568665	Sca_2453	Sca_2454			TRUE	0.986	-3.000	0.890	NA		NA
5568665	5568666	Sca_2454	Sca_2455			TRUE	0.988	-10.000	0.575	NA		NA
5568666	5568667	Sca_2455	Sca_2456		vicR	TRUE	0.987	12.000	0.597	0.045	Y	NA
5568669	5568670	tRNA-Sca_0059	tRNA-Sca_0060	tRNA-Asp_(GTC)	tRNA-Glu_(TTC)	FALSE	0.289	6.000	0.000	NA		NA
5568672	5568673	Sca_2459	Sca_2460	purA	dnaC	FALSE	0.037	379.000	0.018	1.000	N	NA
5568673	5568674	Sca_2460	Sca_2461	dnaC	rplI	TRUE	0.801	35.000	0.064	1.000	N	NA
5568674	5568675	Sca_2461	Sca_2462	rplI		TRUE	0.942	-3.000	0.008	1.000	N	NA
5568675	5568676	Sca_2462	Sca_2463			TRUE	0.763	15.000	0.039	NA		NA
5568678	5568679	Sca_2465	Sca_2466	serS	hutH	FALSE	0.043	381.000	0.000	0.043	N	NA
5568680	5568681	Sca_2467	Sca_2468			FALSE	0.004	324.000	0.000	NA		NA
5568682	5568683	Sca_2469	Sca_2470	gyrA	gyrB	TRUE	0.978	47.000	0.306	0.002	Y	NA
5568683	5568684	Sca_2470	Sca_2471	gyrB	recF	TRUE	0.986	22.000	0.249	0.004	Y	NA
5568684	5568685	Sca_2471	Sca_2472	recF		TRUE	0.975	-3.000	0.209	1.000		NA
5568685	5568686	Sca_2472	Sca_2473		dnaN	FALSE	0.059	364.000	0.103	1.000		NA
5568686	5568687	Sca_2473	Sca_2474	dnaN	dnaA	FALSE	0.422	255.000	0.328	1.000	Y	NA