MicrobesOnline Operon Predictions for Nitratiruptor sp. SB155-2

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 3579499 3579500 NIS_0001 NIS_0002 dnaA dnaN TRUE 0.819 172.000 0.328 1.000 Y NA
 3579500 3579501 NIS_0002 NIS_0003 dnaN gyrB TRUE 0.842 69.000 0.114 1.000 Y NA
 3579501 3579502 NIS_0003 NIS_0004 gyrB   TRUE 0.804 1.000 0.003 1.000 N NA
 3579502 3579503 NIS_0004 NIS_0005     TRUE 0.668 -13.000 0.005 1.000   NA
 3579503 3579504 NIS_0005 NIS_0006     TRUE 0.602 -7.000 0.000 1.000   NA
 3579504 3579505 NIS_0006 NIS_0007     FALSE 0.164 92.000 0.000 1.000 N NA
 3579505 3579506 NIS_0007 NIS_0008     FALSE 0.252 244.000 0.000 1.000 Y NA
 3579508 3579509 NIS_0010 NIS_0011     TRUE 0.783 0.000 0.000 1.000 N NA
 3579509 3579510 NIS_0011 NIS_0012     FALSE 0.353 61.000 0.000 NA   NA
 3579510 3579511 NIS_0012 NIS_0013     TRUE 0.980 12.000 0.400 NA   NA
 3579511 3579512 NIS_0013 NIS_0014     TRUE 0.987 10.000 0.400 NA   NA
 3579512 3579513 NIS_0014 NIS_0015     FALSE 0.218 109.000 0.000 NA   NA
 3579513 3579514 NIS_0015 NIS_0016     FALSE 0.277 78.000 0.000 NA   NA
 3579515 3579516 NIS_0017 NIS_0018     FALSE 0.282 77.000 0.000 NA   NA
 3579516 3579517 NIS_0018 NIS_0019     TRUE 0.961 -3.000 0.556 1.000 N NA
 3579517 3579518 NIS_0019 NIS_0020     TRUE 0.974 -15.000 0.667 1.000 N NA
 3579519 3579520 NIS_0021 NIS_0022     TRUE 0.978 -10.000 0.600 NA   NA
 3579521 3579522 NIS_0023 NIS_0024     TRUE 0.985 -12.000 0.604 1.000 Y NA
 3579522 3579523 NIS_0024 NIS_0025     TRUE 0.993 11.000 0.887 NA   NA
 3579523 3579524 NIS_0025 NIS_0026   arsB FALSE 0.146 428.000 0.000 NA   NA
 3579524 3579525 NIS_0026 NIS_0027 arsB   FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3579525 3579526 NIS_0027 NIS_0028     TRUE 0.967 3.000 0.090 NA   NA
 3579526 3579527 NIS_0028 NIS_0029     TRUE 0.891 -3.000 0.077 NA   NA
 3579527 3579528 NIS_0029 NIS_0030     TRUE 0.865 -3.000 0.057 1.000   NA
 3579529 3579530 NIS_0031 NIS_0032 nhaA   FALSE 0.116 218.000 0.000 NA N NA
 3579530 3579531 NIS_0032 NIS_0033     FALSE 0.536 57.000 0.000 NA Y NA
 3579531 3579532 NIS_0033 NIS_0034     TRUE 0.963 9.000 0.000 0.031   NA
 3579532 3579533 NIS_0034 NIS_0035     TRUE 0.808 10.000 0.000 NA   NA
 3579533 3579534 NIS_0035 NIS_0036     FALSE 0.260 87.000 0.000 NA   NA
 3579536 3579537 NIS_0038 NIS_0039     TRUE 0.606 -19.000 0.000 NA   NA
 3579537 3579538 NIS_0039 NIS_0040     TRUE 0.828 9.000 0.000 NA   NA
 3579539 3579540 NIS_0041 NIS_0042     TRUE 0.808 10.000 0.000 NA   NA
 3579540 3579541 NIS_0042 NIS_0043   pckA FALSE 0.185 146.000 0.000 NA   NA
 3579541 3579542 NIS_0043 NIS_0044 pckA   FALSE 0.470 65.000 0.000 1.000 Y NA
 3579542 3579543 NIS_0044 NIS_0045   pcm FALSE 0.237 64.000 0.000 1.000 N NA
 3579543 3579544 NIS_0045 NIS_0046 pcm   TRUE 0.904 -3.000 0.099 1.000   NA
 3579544 3579545 NIS_0046 NIS_0047     TRUE 0.903 -10.000 0.071 1.000   NA
 3579547 3579548 NIS_0049 NIS_0050     FALSE 0.268 82.000 0.000 NA   NA
 3579548 3579549 NIS_0050 NIS_0051     TRUE 0.602 -7.000 0.000 1.000   NA
 3579549 3579550 NIS_0051 NIS_0052     FALSE 0.571 -49.000 0.000 NA   NA
 3579550 3579551 NIS_0052 NIS_0053   nrdA TRUE 0.633 -9.000 0.000 NA   NA
 3579551 3579552 NIS_0053 NIS_0054 nrdA   TRUE 0.944 0.000 0.012 1.000 Y NA
 3579554 3579555 NIS_0056 NIS_0057     FALSE 0.153 194.000 0.000 1.000   NA
 3579555 3579556 NIS_0057 NIS_0058     TRUE 0.903 -3.000 0.011 0.043   NA
 3579556 3579557 NIS_0058 NIS_0059   hisF TRUE 0.599 -3.000 0.003 1.000   NA
 3579558 3579559 NIS_0060 NIS_0061   ksgA FALSE 0.215 70.000 0.000 1.000 N NA
 3579559 3579560 NIS_0061 NIS_0062 ksgA   TRUE 0.774 -61.000 0.028 1.000   NA
 3579560 3579561 NIS_0062 NIS_0063     TRUE 0.980 9.000 0.222 1.000   NA
 3579561 3579562 NIS_0063 NIS_0064     TRUE 0.904 -3.000 0.167 1.000 N NA
 3579562 3579563 NIS_0064 NIS_0065     TRUE 0.830 -31.000 0.035 NA   NA
 3579563 3579564 NIS_0065 NIS_0066     TRUE 0.666 -7.000 0.003 NA   NA
 3579564 3579565 NIS_0066 NIS_0067     FALSE 0.125 136.000 0.000 1.000 N NA
 3579566 3579567 NIS_0068 NIS_0069     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3579567 3579568 NIS_0069 NIS_0070   dtd FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3579571 3579572 NIS_0073 NIS_0074     TRUE 0.918 -3.000 0.222 1.000 N NA
 3579572 3579573 NIS_0074 NIS_0075     TRUE 0.932 -3.000 0.093 1.000 Y NA
 3579573 3579574 NIS_0075 NIS_0076     TRUE 0.983 4.000 0.349 NA N NA
 3579574 3579575 NIS_0076 NIS_0077     TRUE 0.808 10.000 0.000 NA   NA
 3579575 3579576 NIS_0077 NIS_0078     FALSE 0.568 28.000 0.000 NA   NA
 3579576 3579577 NIS_0078 NIS_0079     FALSE 0.500 -7.000 0.000 1.000 N NA
 3579577 3579578 NIS_0079 NIS_0080     TRUE 0.758 11.000 0.000 1.000   NA
 3579578 3579579 NIS_0080 NIS_0081     TRUE 0.986 0.000 0.250 NA   NA
 3579579 3579580 NIS_0081 NIS_0082     TRUE 0.991 0.000 0.250 NA Y NA
 3579580 3579581 NIS_0082 NIS_0083     TRUE 0.993 2.000 0.667 NA   NA
 3579581 3579582 NIS_0083 NIS_0084     TRUE 0.996 2.000 1.000 NA   NA
 3579582 3579583 NIS_0084 NIS_0085     TRUE 0.774 11.000 0.000 NA   NA
 3579583 3579584 NIS_0085 NIS_0086     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3579584 3579585 NIS_0086 NIS_0087     FALSE 0.127 128.000 0.000 1.000 N NA
 3579585 3579586 NIS_0087 NIS_0088     TRUE 0.821 4.000 0.000 NA   NA
 3579586 3579587 NIS_0088 NIS_0089     TRUE 0.833 -3.000 0.038 NA   NA
 3579587 3579588 NIS_0089 NIS_0090     TRUE 0.596 -22.000 0.000 NA   NA
 3579588 3579589 NIS_0090 NIS_0091     TRUE 0.944 -19.000 0.222 NA   NA
 3579589 3579590 NIS_0091 NIS_0092     TRUE 0.857 0.000 0.000 NA   NA
 3579590 3579591 NIS_0092 NIS_0093     TRUE 0.830 2.000 0.000 NA   NA
 3579591 3579592 NIS_0093 NIS_0094   feoA TRUE 0.637 17.000 0.000 NA   NA
 3579592 3579593 NIS_0094 NIS_0095 feoA feoB TRUE 0.967 -12.000 0.229 1.000 Y NA
 3579594 3579595 NIS_0096 NIS_0097     FALSE 0.197 123.000 0.000 NA   NA
 3579595 3579596 NIS_0097 NIS_0098     TRUE 0.624 -7.000 0.000 NA   NA
 3579596 3579597 NIS_0098 NIS_0099   purM TRUE 0.606 -3.000 0.002 NA   NA
 3579598 3579599 NIS_0100 NIS_0101 speE   TRUE 0.677 -6.000 0.016 1.000 N NA
 3579599 3579600 NIS_0101 NIS_0102   dapF TRUE 0.694 -13.000 0.016 1.000 N NA
 3579600 3579601 NIS_0102 NIS_0103 dapF   TRUE 0.694 -6.000 0.010 1.000   NA
 3579602 3579603 NIS_0104 NIS_0105 prfA rpsT TRUE 0.913 13.000 0.029 1.000 Y NA
 3579604 3579605 NIS_0106 NIS_0107 glmM lspA TRUE 0.946 0.000 0.042 1.000 N NA
 3579605 3579606 NIS_0107 NIS_t01 lspA trnA_Val TRUE 0.616 20.000 0.000 NA   NA
 3579606 3579607 NIS_t01 NIS_0108 trnA_Val thrS FALSE 0.360 60.000 0.000 NA   NA
 3579607 3579608 NIS_0108 NIS_0109 thrS infC TRUE 0.914 -3.000 0.060 1.000 Y NA
 3579608 3579609 NIS_0109 NIS_0110 infC rpmI TRUE 0.928 97.000 0.652 1.000 Y NA
 3579609 3579610 NIS_0110 NIS_0111 rpmI rplT TRUE 0.990 79.000 0.928 0.029 Y NA
 3579611 3579612 NIS_0112 NIS_0113     TRUE 0.994 2.000 0.827 NA N NA
 3579612 3579613 NIS_0113 NIS_0114     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3579613 3579614 NIS_0114 NIS_0115     TRUE 0.634 -10.000 0.000 NA   NA
 3579614 3579615 NIS_0115 NIS_0116     TRUE 0.624 -7.000 0.000 NA   NA
 3579615 3579616 NIS_0116 NIS_0117     FALSE 0.147 400.000 0.000 NA   NA
 3579616 3579617 NIS_0117 NIS_0118     TRUE 0.938 151.000 1.000 1.000 Y NA
 3579617 3579618 NIS_0118 NIS_0119   sufE FALSE 0.152 314.000 0.000 NA   NA
 3579619 3579620 NIS_0120 NIS_0121     TRUE 0.808 10.000 0.000 NA   NA
 3579620 3579621 NIS_0121 NIS_0122     FALSE 0.156 264.000 0.000 NA   NA
 3579621 3579622 NIS_0122 NIS_0123     TRUE 0.845 0.000 0.000 1.000   NA
 3579622 3579623 NIS_0123 NIS_0124     FALSE 0.368 59.000 0.000 NA   NA
 3579624 3579625 NIS_0125 NIS_0126   ilvD TRUE 0.612 -10.000 0.000 1.000   NA
 3579626 3579627 NIS_t02 NIS_t03 trnB_Gly trnB_Leu FALSE 0.188 142.000 0.000 NA   NA
 3579627 3579628 NIS_t03 NIS_t04 trnB_Leu trnB_Cys TRUE 0.697 13.000 0.000 NA   NA
 3579628 3579629 NIS_t04 NIS_t05 trnB_Cys trnB_Ser1 TRUE 0.658 15.000 0.000 NA   NA
 3579629 3579630 NIS_t05 NIS_t06 trnB_Ser1 trnB_Ser2 FALSE 0.420 47.000 0.000 NA   NA
 3579630 3579631 NIS_t06 NIS_0127 trnB_Ser2   FALSE 0.173 173.000 0.000 NA   NA
 3579632 3579633 NIS_0128 NIS_0129     TRUE 0.881 1.000 0.005 NA   NA
 3579633 3579634 NIS_0129 NIS_0130   purT TRUE 0.623 -3.000 0.004 NA   NA
 3579634 3579635 NIS_0130 NIS_0131 purT   TRUE 0.596 -22.000 0.000 NA   NA
 3579635 3579636 NIS_0131 NIS_0132     TRUE 0.633 -9.000 0.000 NA   NA
 3579637 3579638 NIS_0133 NIS_0134     FALSE 0.305 71.000 0.000 NA   NA
 3579638 3579639 NIS_0134 NIS_0135     FALSE 0.188 142.000 0.000 NA   NA
 3579639 3579640 NIS_0135 NIS_0136     TRUE 0.748 93.000 0.000 0.024 Y NA
 3579640 3579641 NIS_0136 NIS_0137     FALSE 0.144 486.000 0.000 NA   NA
 3579642 3579643 NIS_0138 NIS_0139 rpsU   FALSE 0.397 52.000 0.000 NA   NA
 3579643 3579644 NIS_0139 NIS_0140     TRUE 0.970 -13.000 0.444 NA   NA
 3579645 3579646 NIS_0141 NIS_0142   tas FALSE 0.267 57.000 0.000 1.000 N NA
 3579646 3579647 NIS_0142 NIS_0143 tas   FALSE 0.110 178.000 0.000 1.000 N NA
 3579647 3579648 NIS_0143 NIS_0144     TRUE 0.981 4.000 0.333 1.000 N NA
 3579648 3579649 NIS_0144 NIS_0145     FALSE 0.461 40.000 0.000 NA   NA
 3579649 3579650 NIS_0145 NIS_0146     FALSE 0.160 238.000 0.000 NA   NA
 3579650 3579651 NIS_0146 NIS_0147     TRUE 0.821 4.000 0.000 NA   NA
 3579651 3579652 NIS_0147 NIS_0148     TRUE 0.983 -3.000 0.887 NA   NA
 3579652 3579653 NIS_0148 NIS_0149     TRUE 0.997 -7.000 0.962 0.075 Y NA
 3579653 3579654 NIS_0149 NIS_0150     FALSE 0.105 218.000 0.000 1.000 N NA
 3579654 3579655 NIS_0150 NIS_0151     FALSE 0.276 60.000 0.000 NA N NA
 3579655 3579656 NIS_0151 NIS_0152     TRUE 0.634 -10.000 0.000 NA   NA
 3579656 3579657 NIS_0152 NIS_0153     TRUE 0.658 15.000 0.000 NA   NA
 3579657 3579658 NIS_0153 NIS_0154     TRUE 0.602 -15.000 0.000 1.000   NA
 3579660 3579661 NIS_0156 NIS_0157 pyrG recJ TRUE 0.717 -3.000 0.026 1.000 N NA
 3579661 3579662 NIS_0157 NIS_0158 recJ   FALSE 0.281 88.000 0.002 NA   NA
 3579662 3579663 NIS_0158 NIS_0159     TRUE 0.828 9.000 0.000 NA   NA
 3579664 3579665 NIS_0160 NIS_0161     TRUE 0.746 19.000 0.000 1.000 Y NA
 3579668 3579669 NIS_0164 NIS_0165 tig clpP TRUE 0.969 -3.000 0.351 1.000 Y NA
 3579669 3579670 NIS_0165 NIS_0166 clpP def TRUE 0.740 -3.000 0.030 1.000 N NA
 3579670 3579671 NIS_0166 NIS_0167 def   TRUE 0.830 2.000 0.000 NA   NA
 3579673 3579674 NIS_0169 NIS_0170     FALSE 0.522 -16.000 0.000 NA N NA
 3579674 3579675 NIS_0170 NIS_0171   purN TRUE 0.645 -3.000 0.014 NA N NA
 3579676 3579677 NIS_0172 NIS_0173     FALSE 0.171 174.000 0.000 NA   NA
 3579678 3579679 NIS_0174 NIS_0175 thiG   FALSE 0.435 29.000 0.000 1.000 N NA
 3579679 3579680 NIS_0175 NIS_0176     FALSE 0.158 96.000 0.000 1.000 N NA
 3579681 3579682 NIS_0177 NIS_0178     FALSE 0.346 59.000 0.000 1.000   NA
 3579682 3579683 NIS_0178 NIS_0179     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3579683 3579684 NIS_0179 NIS_0180     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3579684 3579685 NIS_0180 NIS_0181     FALSE 0.184 148.000 0.000 NA   NA
 3579685 3579686 NIS_0181 NIS_0182     TRUE 0.610 -6.000 0.000 NA   NA
 3579686 3579687 NIS_0182 NIS_0183     TRUE 0.588 24.000 0.000 NA   NA
 3579687 3579688 NIS_0183 NIS_0184     TRUE 0.624 -7.000 0.000 NA   NA
 3579688 3579689 NIS_0184 NIS_0185     TRUE 0.808 10.000 0.000 NA   NA
 3579689 3579690 NIS_0185 NIS_0186     TRUE 0.633 -12.000 0.000 NA   NA
 3579690 3579691 NIS_0186 NIS_0187     TRUE 0.578 -31.000 0.000 NA   NA
 3579691 3579692 NIS_0187 NIS_0188     TRUE 0.979 -10.000 0.625 NA   NA
 3579692 3579693 NIS_0188 NIS_0189     TRUE 0.828 9.000 0.000 NA   NA
 3579693 3579694 NIS_0189 NIS_0190     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3579694 3579695 NIS_0190 NIS_0191     TRUE 0.808 10.000 0.000 NA   NA
 3579695 3579696 NIS_0191 NIS_0192     FALSE 0.451 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3579696 3579697 NIS_0192 NIS_0193     TRUE 0.793 10.000 0.000 1.000   NA
 3579697 3579698 NIS_0193 NIS_0194     TRUE 0.815 9.000 0.000 1.000   NA
 3579698 3579699 NIS_0194 NIS_0195     FALSE 0.554 -3.000 0.000 1.000   NA
 3579700 3579701 NIS_t07 NIS_t08 trnC_Pro trnC_His FALSE 0.537 32.000 0.000 NA   NA
 3579701 3579702 NIS_t08 NIS_t09 trnC_His trnC_Arg1 FALSE 0.368 59.000 0.000 NA   NA
 3579702 3579703 NIS_t09 NIS_t10 trnC_Arg1 trnC_Arg2 TRUE 0.601 22.000 0.000 NA   NA
 3579703 3579704 NIS_t10 NIS_t11 trnC_Arg2 trnC_Leu TRUE 0.831 7.000 0.000 NA   NA
 3579704 3579705 NIS_t11 NIS_0196 trnC_Leu   FALSE 0.154 281.000 0.000 NA   NA
 3579705 3579706 NIS_0196 NIS_0197     FALSE 0.446 43.000 0.000 NA   NA
 3579707 3579708 NIS_0198 NIS_0199   gph FALSE 0.554 -3.000 0.000 1.000   NA
 3579708 3579709 NIS_0199 NIS_0200 gph   FALSE 0.471 39.000 0.000 NA   NA
 3579709 3579710 NIS_0200 NIS_0201     TRUE 0.704 -3.000 0.013 NA   NA
 3579712 3579713 NIS_0203 NIS_0204     FALSE 0.507 35.000 0.000 NA   NA
 3579715 3579716 NIS_0206 NIS_0207     TRUE 0.817 6.000 0.000 1.000   NA
 3579718 3579719 NIS_0209 NIS_t12   trnD_Ala FALSE 0.209 115.000 0.000 NA   NA
 3579719 3579720 NIS_t12 NIS_0210 trnD_Ala dgkA FALSE 0.496 37.000 0.000 NA   NA
 3579720 3579721 NIS_0210 NIS_0211 dgkA   FALSE 0.451 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3579721 3579722 NIS_0211 NIS_0212   dnaG TRUE 0.807 -7.000 0.035 1.000 N NA
 3579723 3579724 NIS_0213 NIS_0214   rnhA TRUE 0.582 -22.000 0.008 1.000 N NA
 3579724 3579725 NIS_0214 NIS_0215 rnhA rnc FALSE 0.506 70.000 0.032 1.000 N NA
 3579725 3579726 NIS_0215 NIS_0216 rnc aroC TRUE 0.776 -7.000 0.030 1.000 N NA
 3579727 3579728 NIS_0217 NIS_0218   rnhB TRUE 0.758 11.000 0.000 1.000   NA
 3579729 3579730 NIS_0219 NIS_0220     TRUE 0.857 0.000 0.000 NA   NA
 3579732 3579733 NIS_0222 NIS_0223 rpsJ rplC TRUE 0.998 10.000 0.467 0.037 Y NA
 3579733 3579734 NIS_0223 NIS_0224 rplC rplD TRUE 0.992 -3.000 0.361 0.028 Y NA
 3579734 3579735 NIS_0224 NIS_0225 rplD rplW TRUE 0.994 2.000 0.513 1.000 Y NA
 3579735 3579736 NIS_0225 NIS_0226 rplW rplB TRUE 0.995 11.000 0.849 1.000 Y NA
 3579736 3579737 NIS_0226 NIS_0227 rplB rpsS TRUE 0.998 12.000 0.820 0.037 Y NA
 3579737 3579738 NIS_0227 NIS_0228 rpsS rplV TRUE 0.999 10.000 0.769 0.037 Y NA
 3579738 3579739 NIS_0228 NIS_0229 rplV rpsC TRUE 0.999 0.000 0.719 0.037 Y NA
 3579739 3579740 NIS_0229 NIS_0230 rpsC rplP TRUE 0.999 3.000 0.828 0.037 Y NA
 3579740 3579741 NIS_0230 NIS_0231 rplP rpmC TRUE 0.996 -13.000 0.802 0.028   NA
 3579741 3579742 NIS_0231 NIS_0232 rpmC rpsQ TRUE 0.999 0.000 0.828 0.028   NA
 3579742 3579743 NIS_0232 NIS_0233 rpsQ rplN TRUE 0.999 0.000 0.791 0.037 Y NA
 3579743 3579744 NIS_0233 NIS_0234 rplN rplX TRUE 0.999 0.000 0.810 0.037 Y NA
 3579744 3579745 NIS_0234 NIS_0235 rplX rplE TRUE 0.996 -3.000 0.758 0.028 Y NA
 3579745 3579746 NIS_0235 NIS_0236 rplE rpsN TRUE 0.999 0.000 0.496 0.028 Y NA
 3579746 3579747 NIS_0236 NIS_0237 rpsN rpsH TRUE 0.986 59.000 0.473 0.028 Y NA
 3579747 3579748 NIS_0237 NIS_0238 rpsH rplF TRUE 0.993 49.000 0.808 0.028 Y NA
 3579748 3579749 NIS_0238 NIS_0239 rplF rplR TRUE 0.999 11.000 0.815 0.028 Y NA
 3579749 3579750 NIS_0239 NIS_0240 rplR rpsE TRUE 0.999 10.000 0.814 0.037 Y NA
 3579750 3579751 NIS_0240 NIS_0241 rpsE rplO TRUE 0.996 4.000 0.148 0.037 Y NA
 3579751 3579752 NIS_0241 NIS_0242 rplO secY TRUE 0.993 0.000 0.730 1.000 N NA
 3579752 3579753 NIS_0242 NIS_0243 secY map TRUE 0.919 0.000 0.026 1.000 N NA
 3579753 3579754 NIS_0243 NIS_0244 map infA TRUE 0.975 1.000 0.051 1.000 Y NA
 3579754 3579755 NIS_0244 NIS_0245 infA rpmJ TRUE 0.602 159.000 0.104 1.000   NA
 3579755 3579756 NIS_0245 NIS_0246 rpmJ rpsM TRUE 0.995 4.000 0.194 0.028   NA
 3579756 3579757 NIS_0246 NIS_0247 rpsM rpsK TRUE 0.998 12.000 0.810 0.028 Y NA
 3579757 3579758 NIS_0247 NIS_0248 rpsK rpsD TRUE 0.987 56.000 0.509 0.037 Y NA
 3579758 3579759 NIS_0248 NIS_0249 rpsD rpoA TRUE 0.955 32.000 0.549 1.000 N NA
 3579759 3579760 NIS_0249 NIS_0250 rpoA rplQ TRUE 0.991 11.000 0.873 1.000 N NA
 3579760 3579761 NIS_0250 NIS_0251 rplQ   FALSE 0.205 100.000 0.006 1.000 N NA
 3579761 3579762 NIS_0251 NIS_0252     TRUE 0.975 1.000 0.107 1.000   NA
 3579762 3579763 NIS_0252 NIS_0253   murE TRUE 0.863 -3.000 0.057 1.000   NA
 3579763 3579764 NIS_0253 NIS_0254 murE   FALSE 0.249 100.000 0.010 NA N NA
 3579764 3579765 NIS_0254 NIS_0255   panD TRUE 0.848 3.000 0.012 NA N NA
 3579765 3579766 NIS_0255 NIS_0256 panD   TRUE 0.888 12.000 0.029 NA   NA
 3579766 3579767 NIS_0256 NIS_0257   ispA TRUE 0.869 1.000 0.003 NA   NA
 3579767 3579768 NIS_0257 NIS_0258 ispA   TRUE 0.983 4.000 0.375 1.000 N NA
 3579768 3579769 NIS_0258 NIS_0259     FALSE 0.215 99.000 0.000 1.000   NA
 3579769 3579770 NIS_0259 NIS_t13   trnE_Thr1 FALSE 0.429 45.000 0.000 NA   NA
 3579770 3579771 NIS_t13 NIS_t14 trnE_Thr1 trnE_Tyr FALSE 0.537 32.000 0.000 NA   NA
 3579771 3579772 NIS_t14 NIS_t15 trnE_Tyr trnE_Gly TRUE 0.830 6.000 0.000 NA   NA
 3579772 3579773 NIS_t15 NIS_t16 trnE_Gly trnE_Thr2 FALSE 0.255 88.000 0.000 NA   NA
 3579773 3579774 NIS_t16 NIS_0260 trnE_Thr2 tufA FALSE 0.255 88.000 0.000 NA   NA
 3579774 3579775 NIS_0260 NIS_0261 tufA rpmG TRUE 0.915 37.000 0.099 1.000 Y NA
 3579775 3579776 NIS_0261 NIS_t17 rpmG trnE_Trp FALSE 0.548 31.000 0.000 NA   NA
 3579776 3579777 NIS_t17 NIS_0262 trnE_Trp secE TRUE 0.637 17.000 0.000 NA   NA
 3579777 3579778 NIS_0262 NIS_0263 secE nusG TRUE 0.989 13.000 0.843 1.000   NA
 3579778 3579779 NIS_0263 NIS_0264 nusG rplK TRUE 0.973 21.000 0.681 1.000 N NA
 3579779 3579780 NIS_0264 NIS_0265 rplK rplA TRUE 0.993 56.000 0.838 0.037 Y NA
 3579780 3579781 NIS_0265 NIS_0266 rplA rplJ TRUE 0.968 76.000 0.302 0.037 Y NA
 3579781 3579782 NIS_0266 NIS_0267 rplJ rplL TRUE 0.997 21.000 0.884 0.028 Y NA
 3579782 3579783 NIS_0267 NIS_0268 rplL rpoB TRUE 0.723 119.000 0.223 1.000   NA
 3579783 3579784 NIS_0268 NIS_0269 rpoB rpoC TRUE 0.997 -22.000 0.851 0.003   NA
 3579784 3579785 NIS_0269 NIS_0270 rpoC rpsL TRUE 0.658 90.000 0.122 1.000 N NA
 3579785 3579786 NIS_0270 NIS_0271 rpsL rpsG TRUE 0.983 109.000 0.620 0.006 Y NA
 3579786 3579787 NIS_0271 NIS_0272 rpsG fusA TRUE 0.915 102.000 0.579 1.000 Y NA
 3579787 3579788 NIS_0272 NIS_t18 fusA trnF_Arg FALSE 0.155 274.000 0.000 NA   NA
 3579788 3579789 NIS_t18 NIS_0273 trnF_Arg cheB FALSE 0.223 104.000 0.000 NA   NA
 3579789 3579790 NIS_0273 NIS_0274 cheB   TRUE 0.590 -25.000 0.000 NA   NA
 3579790 3579791 NIS_0274 NIS_0275     TRUE 0.624 -7.000 0.000 NA   NA
 3579792 3579793 NIS_0276 NIS_0277     TRUE 0.977 3.000 0.000 0.017 Y NA
 3579796 3579797 NIS_0280 NIS_0281     FALSE 0.554 -3.000 0.000 1.000   NA
 3579797 3579798 NIS_0281 NIS_0282     TRUE 0.600 -21.000 0.000 NA   NA
 3579799 3579800 NIS_0283 NIS_0284     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3579801 3579802 NIS_0285 NIS_0286   nfo TRUE 0.747 -7.000 0.013 NA   NA
 3579802 3579803 NIS_0286 NIS_0287 nfo   TRUE 0.802 3.000 0.000 1.000   NA
 3579803 3579804 NIS_0287 NIS_0288   nuoA FALSE 0.462 135.000 0.041 1.000   NA
 3579804 3579805 NIS_0288 NIS_0289 nuoA nuoB TRUE 0.997 -18.000 0.571 0.006 Y NA
 3579805 3579806 NIS_0289 NIS_0290 nuoB nuoC TRUE 0.999 0.000 0.703 0.006 Y NA
 3579806 3579807 NIS_0290 NIS_0291 nuoC nuoD TRUE 0.999 10.000 0.650 0.014 Y NA
 3579807 3579808 NIS_0291 NIS_0292 nuoD   TRUE 0.996 14.000 0.650 0.014   NA
 3579808 3579809 NIS_0292 NIS_0293     TRUE 0.963 13.000 0.250 1.000   NA
 3579809 3579810 NIS_0293 NIS_0294     TRUE 0.994 10.000 0.259 0.032 N NA
 3579810 3579811 NIS_0294 NIS_0295   nuoG TRUE 0.993 -7.000 0.259 0.014 Y NA
 3579811 3579812 NIS_0295 NIS_0296 nuoG nuoH TRUE 0.995 2.000 0.065 0.014 Y NA
 3579812 3579813 NIS_0296 NIS_0297 nuoH nuoI TRUE 0.998 10.000 0.500 0.014 Y NA
 3579813 3579814 NIS_0297 NIS_0298 nuoI nuoJ TRUE 0.970 12.000 0.004 0.014 Y NA
 3579814 3579815 NIS_0298 NIS_0299 nuoJ nuoK TRUE 0.985 -3.000 0.071 0.006 Y NA
 3579815 3579816 NIS_0299 NIS_0300 nuoK nuoL TRUE 0.994 4.000 0.056 0.014 Y NA
 3579816 3579817 NIS_0300 NIS_0301 nuoL nuoM TRUE 0.992 12.000 0.056 0.003 Y NA
 3579817 3579818 NIS_0301 NIS_0302 nuoM nuoN TRUE 0.999 0.000 0.389 0.003 Y NA
 3579820 3579821 NIS_0304 NIS_t19 ubiA trnG_Arg FALSE 0.573 27.000 0.000 NA   NA
 3579822 3579823 NIS_0305 NIS_0306     TRUE 0.962 -3.000 0.429 NA   NA
 3579823 3579824 NIS_0306 NIS_0307     TRUE 0.948 -3.000 0.286 NA   NA
 3579825 3579826 NIS_0308 NIS_0309     FALSE 0.340 64.000 0.000 NA   NA
 3579826 3579827 NIS_0309 NIS_0310     TRUE 0.908 1.000 0.000 1.000 Y NA
 3579828 3579829 NIS_t20 NIS_0311 trnG_Phe murD FALSE 0.455 41.000 0.000 NA   NA
 3579829 3579830 NIS_0311 NIS_0312 murD mraY TRUE 0.999 0.000 0.647 0.006 Y NA
 3579831 3579832 NIS_0313 NIS_0314 fabG acpP TRUE 0.986 50.000 0.321 0.007 Y NA
 3579832 3579833 NIS_0314 NIS_0315 acpP fabF TRUE 0.776 75.000 0.066 1.000 Y NA
 3579833 3579834 NIS_0315 NIS_0316 fabF accA TRUE 0.967 3.000 0.046 1.000 Y NA
 3579835 3579836 NIS_0317 NIS_0318   argJ TRUE 0.669 33.000 0.015 NA   NA
 3579836 3579837 NIS_0318 NIS_0319 argJ rpmB FALSE 0.390 43.000 0.004 1.000 N NA
 3579838 3579839 NIS_0320 NIS_0321 rpe trpF TRUE 0.781 2.000 0.003 1.000 N NA
 3579839 3579840 NIS_0321 NIS_0322 trpF dnaQ TRUE 0.651 -7.000 0.011 1.000 N NA
 3579841 3579842 NIS_0323 NIS_0324     FALSE 0.462 -27.000 0.000 1.000 N NA
 3579842 3579843 NIS_0324 NIS_0325     FALSE 0.461 40.000 0.000 NA   NA
 3579843 3579844 NIS_0325 NIS_0326     TRUE 0.961 16.000 0.290 NA   NA
 3579844 3579845 NIS_0326 NIS_0327     FALSE 0.192 135.000 0.000 NA   NA
 3579845 3579846 NIS_0327 NIS_0328   ppk TRUE 0.911 0.000 0.015 1.000   NA
 3579849 3579850 NIS_0331 NIS_0332     TRUE 0.816 3.000 0.000 NA   NA
 3579850 3579851 NIS_0332 NIS_0333     FALSE 0.282 77.000 0.000 NA   NA
 3579851 3579852 NIS_0333 NIS_0334     TRUE 0.821 4.000 0.000 NA   NA
 3579852 3579853 NIS_0334 NIS_0335     FALSE 0.348 62.000 0.000 NA   NA
 3579853 3579854 NIS_0335 NIS_0336   priA TRUE 0.857 0.000 0.000 NA   NA
 3579854 3579855 NIS_0336 NIS_0337 priA ispG FALSE 0.489 33.000 0.006 1.000 N NA
 3579855 3579856 NIS_0337 NIS_0338 ispG dnaB TRUE 0.830 4.000 0.011 1.000 N NA
 3579856 3579857 NIS_0338 NIS_0339 dnaB   TRUE 0.936 0.000 0.023 NA   NA
 3579858 3579859 NIS_0340 NIS_0341 rbn glcD FALSE 0.350 260.000 0.031 1.000   NA
 3579859 3579860 NIS_0341 NIS_0342 glcD   TRUE 0.991 0.000 0.404 NA   NA
 3579861 3579862 NIS_0343 NIS_0344     TRUE 0.796 -37.000 0.042 1.000 N NA
 3579862 3579863 NIS_0344 NIS_0345     TRUE 0.943 2.000 0.036 1.000   NA
 3579864 3579865 NIS_0346 NIS_0347     TRUE 0.757 -10.000 0.016 1.000   NA
 3579865 3579866 NIS_0347 NIS_0348     FALSE 0.554 -3.000 0.000 1.000   NA
 3579866 3579867 NIS_0348 NIS_0349     TRUE 0.985 -7.000 0.616 1.000 Y NA
 3579867 3579868 NIS_0349 NIS_0350     TRUE 0.982 -16.000 0.509 1.000 Y NA
 3579868 3579869 NIS_0350 NIS_0351     FALSE 0.483 25.000 0.000 NA N NA
 3579870 3579871 NIS_0352 NIS_0353     TRUE 0.969 -7.000 0.434 NA   NA
 3579871 3579872 NIS_0353 NIS_0354     FALSE 0.151 330.000 0.000 NA   NA
 3579872 3579873 NIS_0354 NIS_0355     FALSE 0.446 43.000 0.000 NA   NA
 3579874 3579875 NIS_0356 NIS_0357     TRUE 0.987 0.000 0.304 1.000   NA
 3579875 3579876 NIS_0357 NIS_0358   gidB TRUE 0.747 -10.000 0.015 1.000   NA
 3579876 3579877 NIS_0358 NIS_0359 gidB ribA TRUE 0.891 0.000 0.017 1.000 N NA
 3579878 3579879 NIS_0360 NIS_0361 hemB   TRUE 0.622 33.000 0.020 1.000 N NA
 3579879 3579880 NIS_0361 NIS_0362     FALSE 0.554 -3.000 0.000 1.000   NA
 3579880 3579881 NIS_0362 NIS_0363     TRUE 0.774 11.000 0.000 NA   NA
 3579881 3579882 NIS_0363 NIS_0364   hemN TRUE 0.961 -3.000 0.419 NA   NA
 3579882 3579883 NIS_0364 NIS_0365 hemN   FALSE 0.554 -3.000 0.000 1.000   NA
 3579883 3579884 NIS_0365 NIS_0366     TRUE 0.858 -3.000 0.000 0.060   NA
 3579884 3579885 NIS_0366 NIS_0367     TRUE 0.729 3.000 0.000 1.000 N NA
 3579885 3579886 NIS_0367 NIS_0368     FALSE 0.280 54.000 0.000 1.000 N NA
 3579886 3579887 NIS_0368 NIS_0369     TRUE 0.718 10.000 0.000 1.000 N NA
 3579887 3579888 NIS_0369 NIS_0370   lgt TRUE 0.750 38.000 0.000 0.097 N NA
 3579889 3579890 NIS_0371 NIS_0372   ruvB TRUE 0.914 8.000 0.019 NA   NA
 3579890 3579891 NIS_0372 NIS_0373 ruvB panB TRUE 0.922 0.000 0.027 1.000 N NA
 3579893 3579894 NIS_0375 NIS_0376   pyrB TRUE 0.624 -7.000 0.009 1.000 N NA
 3579897 3579898 NIS_0379 NIS_0380 clpS clpA TRUE 0.993 0.000 0.596 NA   NA
 3579898 3579899 NIS_0380 NIS_0381 clpA aat TRUE 0.929 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 3579899 3579900 NIS_0381 NIS_0382 aat tal FALSE 0.508 32.000 0.006 1.000 N NA
 3579900 3579901 NIS_0382 NIS_0383 tal pilT TRUE 0.946 16.000 0.273 1.000 N NA
 3579901 3579902 NIS_0383 NIS_0384 pilT rplY FALSE 0.377 66.000 0.014 1.000 N NA
 3579902 3579903 NIS_0384 NIS_0385 rplY pth TRUE 0.998 0.000 0.496 0.043 Y NA
 3579903 3579904 NIS_0385 NIS_0386 pth   TRUE 0.673 46.000 0.031 1.000   NA
 3579904 3579905 NIS_0386 NIS_0387     TRUE 0.620 44.000 0.021 1.000   NA
 3579905 3579906 NIS_0387 NIS_0388     TRUE 0.631 -3.000 0.015 1.000 N NA
 3579906 3579907 NIS_0388 NIS_0389   pheA TRUE 0.907 0.000 0.021 1.000 N NA
 3579907 3579908 NIS_0389 NIS_0390 pheA hisC TRUE 0.882 -13.000 0.028 1.000 Y NA
 3579908 3579909 NIS_0390 NIS_0391 hisC dxs TRUE 0.599 -10.000 0.006 1.000 N NA
 3579911 3579912 NIS_0393 NIS_0394 metK   FALSE 0.416 59.000 0.006 1.000   NA
 3579912 3579913 NIS_0394 NIS_0395   ndk FALSE 0.330 105.000 0.015 1.000   NA
 3579913 3579914 NIS_0395 NIS_0396 ndk   TRUE 0.942 2.000 0.033 NA   NA
 3579914 3579915 NIS_0396 NIS_0397   rpmF TRUE 0.842 -13.000 0.032 NA   NA
 3579915 3579916 NIS_0397 NIS_0398 rpmF plsX TRUE 0.979 11.000 0.418 1.000 N NA
 3579916 3579917 NIS_0398 NIS_0399 plsX fabH TRUE 0.995 4.000 0.058 0.007 Y NA
 3579917 3579918 NIS_0399 NIS_r01 fabH rrnA_16S FALSE 0.154 279.000 0.000 NA   NA
 3579918 3579919 NIS_r01 NIS_t21 rrnA_16S trnG_Ile FALSE 0.173 173.000 0.000 NA   NA
 3579919 3579920 NIS_t21 NIS_t22 trnG_Ile trnG_Ala FALSE 0.242 93.000 0.000 NA   NA
 3579920 3579921 NIS_t22 NIS_r02 trnG_Ala rrnA_23S FALSE 0.170 176.000 0.000 NA   NA
 3579921 3579922 NIS_r02 NIS_r03 rrnA_23S rrnA_5S FALSE 0.202 118.000 0.000 NA   NA
 3579922 3579923 NIS_r03 NIS_0400 rrnA_5S   FALSE 0.151 315.000 0.000 NA   NA
 3579923 3579924 NIS_0400 NIS_0401     TRUE 0.967 -3.000 0.500 NA   NA
 3579924 3579925 NIS_0401 NIS_0402     TRUE 0.994 0.000 0.600 NA   NA
 3579925 3579926 NIS_0402 NIS_0403     TRUE 0.958 -7.000 0.300 NA   NA
 3579926 3579927 NIS_0403 NIS_0404     TRUE 0.970 0.000 0.065 NA   NA
 3579927 3579928 NIS_0404 NIS_0405     TRUE 0.818 -16.000 0.027 NA   NA
 3579931 3579932 NIS_0408 NIS_0409     TRUE 0.995 0.000 0.806 1.000   NA
 3579932 3579933 NIS_0409 NIS_0410     TRUE 0.839 61.000 0.194 1.000   NA
 3579933 3579934 NIS_0410 NIS_0411     TRUE 0.974 -21.000 0.375 1.000 Y NA
 3579934 3579935 NIS_0411 NIS_0412     FALSE 0.561 95.000 0.067 1.000 N NA
 3579935 3579936 NIS_0412 NIS_0413     TRUE 0.975 0.000 0.096 1.000   NA
 3579937 3579938 NIS_0414 NIS_0415 nadA nadC TRUE 0.991 -3.000 0.198 0.005 Y NA
 3579938 3579939 NIS_0415 NIS_0416 nadC   TRUE 0.604 -3.000 0.004 1.000   NA
 3579939 3579940 NIS_0416 NIS_0417     TRUE 0.729 -3.000 0.019 1.000   NA
 3579940 3579941 NIS_0417 NIS_0418     TRUE 0.766 40.000 0.022 1.000 Y NA
 3579941 3579942 NIS_0418 NIS_0419     TRUE 0.837 -25.000 0.035 NA   NA
 3579942 3579943 NIS_0419 NIS_0420   thrB TRUE 0.937 4.000 0.032 NA   NA
 3579943 3579944 NIS_0420 NIS_0421 thrB infB FALSE 0.100 268.000 0.000 1.000 N NA
 3579944 3579945 NIS_0421 NIS_0422 infB rbfA TRUE 0.991 11.000 0.530 1.000 Y NA
 3579945 3579946 NIS_0422 NIS_0423 rbfA   TRUE 0.818 -3.000 0.033 NA   NA
 3579946 3579947 NIS_0423 NIS_0424     TRUE 0.748 -6.000 0.016 NA   NA
 3579947 3579948 NIS_0424 NIS_0425   ubiE TRUE 0.801 -7.000 0.008 1.000 Y NA
 3579948 3579949 NIS_0425 NIS_0426 ubiE   FALSE 0.494 -16.000 0.000 1.000 N NA
 3579949 3579950 NIS_0426 NIS_0427   xseA FALSE 0.451 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3579951 3579952 NIS_0428 NIS_0429     FALSE 0.506 -13.000 0.000 1.000 N NA
 3579953 3579954 NIS_0430 NIS_0431 aroQ   TRUE 0.962 16.000 0.168 1.000 Y NA
 3579954 3579955 NIS_0431 NIS_0432   folK TRUE 0.931 1.000 0.033 1.000 N NA
 3579955 3579956 NIS_0432 NIS_0433 folK   FALSE 0.493 -3.000 0.003 1.000 N NA
 3579956 3579957 NIS_0433 NIS_0434   trmU TRUE 0.718 10.000 0.000 1.000 N NA
 3579957 3579958 NIS_0434 NIS_0435 trmU prsA FALSE 0.540 32.000 0.009 1.000 N NA
 3579958 3579959 NIS_0435 NIS_0436 prsA lepA TRUE 0.749 11.000 0.006 1.000 N NA
 3579959 3579960 NIS_0436 NIS_0437 lepA   TRUE 0.876 0.000 0.005 1.000   NA
 3579961 3579962 NIS_0438 NIS_0439     FALSE 0.224 103.000 0.000 NA   NA
 3579962 3579963 NIS_0439 NIS_0440     FALSE 0.179 132.000 0.000 1.000   NA
 3579963 3579964 NIS_0440 NIS_0441     FALSE 0.143 493.000 0.000 NA   NA
 3579965 3579966 NIS_0442 NIS_0443     TRUE 0.981 -10.000 0.667 NA   NA
 3579967 3579968 NIS_0444 NIS_0445     FALSE 0.186 145.000 0.000 NA   NA
 3579968 3579969 NIS_0445 NIS_0446     FALSE 0.174 142.000 0.000 1.000   NA
 3579969 3579970 NIS_0446 NIS_0447     FALSE 0.149 349.000 0.000 NA   NA
 3579970 3579971 NIS_0447 NIS_0448     FALSE 0.149 352.000 0.000 NA   NA
 3579971 3579972 NIS_0448 NIS_0449     FALSE 0.446 43.000 0.000 NA   NA
 3579972 3579973 NIS_0449 NIS_0450     TRUE 0.817 6.000 0.000 1.000   NA
 3579973 3579974 NIS_0450 NIS_0451     TRUE 0.624 -15.000 0.000 NA   NA
 3579974 3579975 NIS_0451 NIS_0452     TRUE 0.624 -7.000 0.000 NA   NA
 3579975 3579976 NIS_0452 NIS_0453     TRUE 0.853 -82.000 0.000 0.059   NA
 3579976 3579977 NIS_0453 NIS_0454     FALSE 0.562 -118.000 0.000 NA   NA
 3579977 3579978 NIS_0454 NIS_0455     TRUE 0.830 2.000 0.000 NA   NA
 3579978 3579979 NIS_0455 NIS_0456     FALSE 0.141 699.000 0.000 NA   NA
 3579979 3579980 NIS_0456 NIS_0457     FALSE 0.255 88.000 0.000 NA   NA
 3579981 3579982 NIS_0458 NIS_0459     FALSE 0.439 369.000 0.000 0.059   NA
 3579982 3579983 NIS_0459 NIS_0460     TRUE 0.830 2.000 0.000 NA   NA
 3579983 3579984 NIS_0460 NIS_0461     FALSE 0.148 391.000 0.000 NA   NA
 3579984 3579985 NIS_0461 NIS_0462     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3579985 3579986 NIS_0462 NIS_0463     TRUE 0.821 4.000 0.000 NA   NA
 3579986 3579987 NIS_0463 NIS_0464     TRUE 0.816 3.000 0.000 NA   NA
 3579987 3579988 NIS_0464 NIS_0465     TRUE 0.945 -13.000 0.000 0.001   NA
 3579988 3579989 NIS_0465 NIS_0466     FALSE 0.158 251.000 0.000 NA   NA
 3579989 3579990 NIS_0466 NIS_0467     FALSE 0.566 -61.000 0.000 NA   NA
 3579991 3579992 NIS_0468 NIS_0469     TRUE 0.634 -10.000 0.000 NA   NA
 3579992 3579993 NIS_0469 NIS_0470     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3579994 3579995 NIS_0471 NIS_0472     TRUE 0.734 12.000 0.000 NA   NA
 3579995 3579996 NIS_0472 NIS_0473     FALSE 0.164 213.000 0.000 NA   NA
 3579996 3579997 NIS_0473 NIS_0474     TRUE 0.808 10.000 0.000 NA   NA
 3579997 3579998 NIS_0474 NIS_0475     FALSE 0.415 48.000 0.000 NA   NA
 3579998 3579999 NIS_0475 NIS_0476     FALSE 0.180 157.000 0.000 NA   NA
 3579999 3580000 NIS_0476 NIS_0477     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580000 3580001 NIS_0477 NIS_0478     TRUE 0.857 0.000 0.000 NA   NA
 3580001 3580002 NIS_0478 NIS_0479     TRUE 0.658 15.000 0.000 NA   NA
 3580002 3580003 NIS_0479 NIS_0480     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580003 3580004 NIS_0480 NIS_0481     TRUE 0.857 0.000 0.000 NA   NA
 3580004 3580005 NIS_0481 NIS_0482     FALSE 0.142 619.000 0.000 NA   NA
 3580005 3580006 NIS_0482 NIS_0483     TRUE 0.624 -7.000 0.000 NA   NA
 3580007 3580008 NIS_t23 NIS_0484 trnH_Asn   FALSE 0.322 68.000 0.000 NA   NA
 3580008 3580009 NIS_0484 NIS_0485     FALSE 0.133 484.000 0.000 1.000   NA
 3580009 3580010 NIS_0485 NIS_0486   hemE TRUE 0.654 -3.000 0.017 1.000 N NA
 3580010 3580011 NIS_0486 NIS_0487 hemE   TRUE 0.890 10.000 0.016 NA   NA
 3580011 3580012 NIS_0487 NIS_0488     TRUE 0.778 -3.000 0.025 NA   NA
 3580012 3580013 NIS_0488 NIS_0489   gyrA TRUE 0.582 -13.000 0.005 1.000 N NA
 3580016 3580017 NIS_0492 NIS_0493   glnB TRUE 0.931 11.000 0.063 1.000 N NA
 3580018 3580019 NIS_0494 NIS_0495     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580019 3580020 NIS_0495 NIS_0496     TRUE 0.602 -7.000 0.000 1.000   NA
 3580020 3580021 NIS_0496 NIS_0497     TRUE 0.612 -10.000 0.000 1.000   NA
 3580021 3580022 NIS_0497 NIS_0498     TRUE 0.949 -31.000 0.159 1.000 Y NA
 3580022 3580023 NIS_0498 NIS_0499     TRUE 0.984 11.000 0.262 1.000 Y NA
 3580024 3580025 NIS_0500 NIS_0501     TRUE 0.979 2.000 0.190 1.000   NA
 3580025 3580026 NIS_0501 NIS_0502     TRUE 0.981 0.000 0.143 NA   NA
 3580026 3580027 NIS_0502 NIS_0503     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580029 3580030 NIS_0505 NIS_0506     TRUE 0.995 -3.000 0.800 0.004 N NA
 3580030 3580031 NIS_0506 NIS_0507     TRUE 0.808 10.000 0.000 NA   NA
 3580031 3580032 NIS_0507 NIS_0508   ugpQ TRUE 0.629 -13.000 0.000 NA   NA
 3580033 3580034 NIS_0509 NIS_0510 groEL groES TRUE 0.995 15.000 0.356 0.009 Y NA
 3580035 3580036 NIS_0511 NIS_0512     FALSE 0.322 68.000 0.000 NA   NA
 3580036 3580037 NIS_0512 NIS_0513     FALSE 0.260 87.000 0.000 NA   NA
 3580039 3580040 NIS_t24 NIS_0515 trnI_Met   FALSE 0.179 158.000 0.000 NA   NA
 3580041 3580042 NIS_t25 NIS_0516 trnI_Ser pyrF FALSE 0.560 29.000 0.000 NA   NA
 3580044 3580045 NIS_0518 NIS_0519     TRUE 0.629 -13.000 0.000 NA   NA
 3580045 3580046 NIS_0519 NIS_0520     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580046 3580047 NIS_0520 NIS_0521   acs FALSE 0.186 79.000 0.000 1.000 N NA
 3580047 3580048 NIS_0521 NIS_0522 acs   FALSE 0.500 -7.000 0.000 1.000 N NA
 3580048 3580049 NIS_0522 NIS_0523     TRUE 0.783 0.000 0.000 1.000 N NA
 3580049 3580050 NIS_0523 NIS_0524     TRUE 0.886 37.000 0.138 1.000   NA
 3580050 3580051 NIS_0524 NIS_0525     TRUE 0.981 -3.000 0.826 NA   NA
 3580051 3580052 NIS_0525 NIS_0526     TRUE 0.970 11.000 0.174 NA   NA
 3580052 3580053 NIS_0526 NIS_0527     FALSE 0.297 69.000 0.000 1.000   NA
 3580053 3580054 NIS_0527 NIS_0528     TRUE 0.707 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3580054 3580055 NIS_0528 NIS_0529     FALSE 0.479 -3.000 0.000 NA N NA
 3580056 3580057 NIS_0530 NIS_0531     TRUE 0.612 -10.000 0.000 1.000   NA
 3580057 3580058 NIS_0531 NIS_0532     TRUE 0.847 1.000 0.000 NA   NA
 3580058 3580059 NIS_0532 NIS_0533     FALSE 0.483 38.000 0.000 NA   NA
 3580060 3580061 NIS_0534 NIS_0535     FALSE 0.451 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3580061 3580062 NIS_0535 NIS_0536     TRUE 0.895 9.000 0.000 1.000 Y NA
 3580063 3580064 NIS_0537 NIS_0538     TRUE 0.848 1.000 0.009 1.000 N NA
 3580064 3580065 NIS_0538 NIS_0539     TRUE 0.610 -6.000 0.000 NA   NA
 3580065 3580066 NIS_0539 NIS_0540   fabZ TRUE 0.944 2.000 0.035 NA   NA
 3580066 3580067 NIS_0540 NIS_0541 fabZ lpxA TRUE 0.982 0.000 0.264 1.000 N NA
 3580067 3580068 NIS_0541 NIS_0542 lpxA clpX TRUE 0.903 9.000 0.027 1.000 N NA
 3580068 3580069 NIS_0542 NIS_0543 clpX mreB TRUE 0.912 10.000 0.034 1.000 N NA
 3580069 3580070 NIS_0543 NIS_0544 mreB   TRUE 0.975 -7.000 0.689 1.000 N NA
 3580070 3580071 NIS_0544 NIS_0545   carB FALSE 0.511 44.000 0.016 1.000 N NA
 3580071 3580072 NIS_0545 NIS_0546 carB   TRUE 0.699 -7.000 0.016 NA N NA
 3580073 3580074 NIS_0547 NIS_0548     FALSE 0.132 528.000 0.000 1.000   NA
 3580075 3580076 NIS_0549 NIS_0550 metH   TRUE 0.675 11.000 0.000 1.000 N NA
 3580076 3580077 NIS_0550 NIS_0551     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580077 3580078 NIS_0551 NIS_0552   btuR FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580078 3580079 NIS_0552 NIS_0553 btuR   TRUE 0.636 37.000 0.000 1.000 Y NA
 3580079 3580080 NIS_0553 NIS_0554     TRUE 0.970 -3.000 0.545 NA   NA
 3580080 3580081 NIS_0554 NIS_0555     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580081 3580082 NIS_0555 NIS_0556     FALSE 0.537 29.000 0.000 1.000   NA
 3580082 3580083 NIS_0556 NIS_0557   pepD FALSE 0.537 29.000 0.000 1.000   NA
 3580083 3580084 NIS_0557 NIS_0558 pepD   FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580086 3580087 NIS_0560 NIS_0561     FALSE 0.373 58.000 0.000 NA   NA
 3580087 3580088 NIS_0561 NIS_0562   fbaA TRUE 0.625 12.000 0.000 1.000 N NA
 3580089 3580090 NIS_0563 NIS_0564     TRUE 0.867 -30.000 0.052 NA   NA
 3580091 3580092 NIS_0565 NIS_0566   hisD TRUE 0.850 20.000 0.020 1.000 Y NA
 3580092 3580093 NIS_0566 NIS_0567 hisD   TRUE 0.770 1.000 0.000 1.000 N NA
 3580093 3580094 NIS_0567 NIS_0568     FALSE 0.511 -10.000 0.000 1.000 N NA
 3580094 3580095 NIS_0568 NIS_0569     TRUE 0.802 0.000 0.000 NA N NA
 3580095 3580096 NIS_0569 NIS_0570     FALSE 0.509 -19.000 0.000 NA N NA
 3580096 3580097 NIS_0570 NIS_0571     FALSE 0.098 287.000 0.000 1.000 N NA
 3580097 3580098 NIS_0571 NIS_0572     TRUE 0.982 0.000 0.243 NA N NA
 3580098 3580099 NIS_0572 NIS_0573     TRUE 0.987 12.000 0.784 NA N NA
 3580099 3580100 NIS_0573 NIS_0574     FALSE 0.319 64.000 0.000 1.000   NA
 3580100 3580101 NIS_0574 NIS_0575     TRUE 0.980 -7.000 0.667 NA   NA
 3580103 3580104 NIS_0577 NIS_0578     TRUE 0.873 -6.000 0.000 0.069   NA
 3580104 3580105 NIS_0578 NIS_0579     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580105 3580106 NIS_0579 NIS_0580     FALSE 0.171 174.000 0.000 NA   NA
 3580108 3580109 NIS_0582 NIS_0583 pstS   TRUE 0.595 23.000 0.000 NA   NA
 3580109 3580110 NIS_0583 NIS_0584   pstC FALSE 0.248 90.000 0.000 NA   NA
 3580110 3580111 NIS_0584 NIS_0585 pstC pstA TRUE 0.996 -3.000 0.537 0.004 Y NA
 3580111 3580112 NIS_0585 NIS_0586 pstA pstB TRUE 0.999 0.000 0.526 0.004 Y NA
 3580113 3580114 NIS_0587 NIS_0588     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580114 3580115 NIS_0588 NIS_0589     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580115 3580116 NIS_0589 NIS_0590     TRUE 0.606 -19.000 0.000 NA   NA
 3580116 3580117 NIS_0590 NIS_0591     FALSE 0.554 -3.000 0.000 1.000   NA
 3580117 3580118 NIS_0591 NIS_0592   pgpA FALSE 0.451 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3580118 3580119 NIS_0592 NIS_0593 pgpA   TRUE 0.945 8.000 0.052 1.000 N NA
 3580119 3580120 NIS_0593 NIS_0594     TRUE 0.708 -22.000 0.021 1.000 N NA
 3580120 3580121 NIS_0594 NIS_0595     TRUE 0.583 -3.000 0.010 1.000 N NA
 3580122 3580123 NIS_0596 NIS_0597 thiC mrp FALSE 0.223 272.000 0.021 1.000 N NA
 3580123 3580124 NIS_0597 NIS_0598 mrp   TRUE 0.838 52.000 0.000 0.005   NA
 3580125 3580126 NIS_0599 NIS_0600     TRUE 0.844 39.000 0.000 0.016   NA
 3580126 3580127 NIS_0600 NIS_0601   cheY TRUE 0.882 10.000 0.000 1.000 Y NA
 3580127 3580128 NIS_0601 NIS_0602 cheY   TRUE 0.996 9.000 0.091 0.014 Y NA
 3580128 3580129 NIS_0602 NIS_0603   cheW TRUE 0.992 10.000 0.045 0.016 Y NA
 3580129 3580130 NIS_0603 NIS_0604 cheW cheA TRUE 0.993 0.000 0.033 0.016 Y NA
 3580130 3580131 NIS_0604 NIS_0605 cheA   TRUE 0.882 5.000 0.009 NA   NA
 3580132 3580133 NIS_0606 NIS_0607 fliG fliM TRUE 0.778 111.000 0.005 0.009 Y NA
 3580133 3580134 NIS_0607 NIS_0608 fliM   TRUE 0.969 -7.000 0.010 0.003 Y NA
 3580134 3580135 NIS_0608 NIS_0609     TRUE 0.990 4.000 0.026 0.009 Y NA
 3580135 3580136 NIS_0609 NIS_0610   flgG TRUE 0.996 11.000 0.148 0.006 Y NA
 3580136 3580137 NIS_0610 NIS_0611 flgG   TRUE 0.740 188.000 0.319 NA   NA
 3580137 3580138 NIS_0611 NIS_0612     TRUE 0.874 18.000 0.043 NA   NA
 3580138 3580139 NIS_0612 NIS_0613   flgI TRUE 0.997 30.000 0.833 0.011 Y NA
 3580139 3580140 NIS_0613 NIS_0614 flgI   TRUE 0.992 9.000 0.625 NA   NA
 3580140 3580141 NIS_0614 NIS_0615   flhA TRUE 0.750 -3.000 0.020 NA   NA
 3580141 3580142 NIS_0615 NIS_0616 flhA   TRUE 0.980 -13.000 0.440 1.000 Y NA
 3580142 3580143 NIS_0616 NIS_0617     TRUE 0.945 -3.000 0.382 1.000 N NA
 3580143 3580144 NIS_0617 NIS_0618   fliA TRUE 0.809 -3.000 0.045 1.000 N NA
 3580144 3580145 NIS_0618 NIS_0619 fliA   TRUE 0.857 0.000 0.000 NA   NA
 3580145 3580146 NIS_0619 NIS_0620     TRUE 0.629 -13.000 0.000 NA   NA
 3580146 3580147 NIS_0620 NIS_0621     TRUE 0.845 0.000 0.000 1.000   NA
 3580147 3580148 NIS_0621 NIS_0622   flgC TRUE 0.996 3.000 0.804 1.000 Y NA
 3580148 3580149 NIS_0622 NIS_0623 flgC   TRUE 0.997 12.000 0.271 0.004 Y NA
 3580149 3580150 NIS_0623 NIS_0624   fliF TRUE 0.996 11.000 0.180 0.009 Y NA
 3580150 3580151 NIS_0624 NIS_0625 fliF   TRUE 0.775 -3.000 0.024 NA   NA
 3580151 3580152 NIS_0625 NIS_0626   fliI TRUE 0.985 -28.000 1.000 NA   NA
 3580152 3580153 NIS_0626 NIS_0627 fliI   TRUE 0.889 60.000 0.156 NA Y NA
 3580153 3580154 NIS_0627 NIS_0628     TRUE 0.987 2.000 0.188 NA Y NA
 3580154 3580155 NIS_0628 NIS_0629     TRUE 0.868 97.000 0.024 0.011 Y NA
 3580155 3580156 NIS_0629 NIS_0630     TRUE 0.992 9.000 0.024 0.003 Y NA
 3580156 3580157 NIS_0630 NIS_0631     TRUE 0.977 -7.000 0.600 NA   NA
 3580157 3580158 NIS_0631 NIS_0632   fliP TRUE 0.665 -3.000 0.008 NA   NA
 3580158 3580159 NIS_0632 NIS_0633 fliP fliQ TRUE 0.972 -3.000 0.032 0.012 Y NA
 3580159 3580160 NIS_0633 NIS_0634 fliQ fliR TRUE 0.987 -3.000 0.078 0.003 Y NA
 3580160 3580161 NIS_0634 NIS_0635 fliR flhB TRUE 0.991 4.000 0.353 1.000 Y NA
 3580162 3580163 NIS_0636 NIS_0637     TRUE 0.629 -13.000 0.000 NA   NA
 3580163 3580164 NIS_0637 NIS_0638     FALSE 0.570 -52.000 0.000 NA   NA
 3580164 3580165 NIS_0638 NIS_0639     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580166 3580167 NIS_0640 NIS_0641     TRUE 0.613 98.000 0.032 NA Y NA
 3580167 3580168 NIS_0641 NIS_0642     TRUE 0.987 11.000 0.298 NA Y NA
 3580168 3580169 NIS_0642 NIS_0643   fliS TRUE 0.984 13.000 0.025 0.003 Y NA
 3580170 3580171 NIS_0644 NIS_0645   flgK TRUE 0.996 56.000 0.833 0.001 Y NA
 3580171 3580172 NIS_0645 NIS_0646 flgK   TRUE 0.866 45.000 0.000 0.003   NA
 3580172 3580173 NIS_0646 NIS_0647   glmS TRUE 0.802 3.000 0.000 1.000   NA
 3580174 3580175 NIS_0648 NIS_0649     TRUE 0.915 0.000 0.016 1.000   NA
 3580175 3580176 NIS_0649 NIS_0650   pabA TRUE 0.584 -19.000 0.000 1.000   NA
 3580176 3580177 NIS_0650 NIS_0651 pabA   TRUE 0.987 0.000 0.263 NA   NA
 3580177 3580178 NIS_0651 NIS_0652     TRUE 0.606 120.000 0.083 NA   NA
 3580178 3580179 NIS_0652 NIS_0653     TRUE 0.998 12.000 0.371 0.001 Y NA
 3580179 3580180 NIS_0653 NIS_0654     TRUE 0.802 33.000 0.038 NA   NA
 3580180 3580181 NIS_0654 NIS_0655     FALSE 0.373 58.000 0.000 NA   NA
 3580181 3580182 NIS_0655 NIS_r04   rrnB_16S FALSE 0.154 285.000 0.000 NA   NA
 3580182 3580183 NIS_r04 NIS_t26 rrnB_16S trnJ_Ile FALSE 0.173 173.000 0.000 NA   NA
 3580183 3580184 NIS_t26 NIS_t27 trnJ_Ile trnJ_Ala FALSE 0.242 93.000 0.000 NA   NA
 3580184 3580185 NIS_t27 NIS_r05 trnJ_Ala rrnB_23S FALSE 0.169 178.000 0.000 NA   NA
 3580185 3580186 NIS_r05 NIS_r06 rrnB_23S rrnB_5S FALSE 0.202 118.000 0.000 NA   NA
 3580186 3580187 NIS_r06 NIS_0656 rrnB_5S   FALSE 0.176 166.000 0.000 NA   NA
 3580187 3580188 NIS_0656 NIS_0657   argH FALSE 0.518 37.000 0.003 1.000   NA
 3580190 3580191 NIS_0659 NIS_0660 pheS pheT TRUE 0.997 -3.000 0.574 0.001 Y NA
 3580191 3580192 NIS_0660 NIS_0661 pheT aroA TRUE 0.732 -3.000 0.028 1.000 N NA
 3580192 3580193 NIS_0661 NIS_0662 aroA ispH TRUE 0.794 -10.000 0.032 1.000 N NA
 3580193 3580194 NIS_0662 NIS_0663 ispH rpsA TRUE 0.871 32.000 0.118 1.000 N NA
 3580194 3580195 NIS_0663 NIS_0664 rpsA   TRUE 0.835 9.000 0.010 1.000 N NA
 3580195 3580196 NIS_0664 NIS_0665     FALSE 0.200 95.000 0.004 1.000 N NA
 3580196 3580197 NIS_0665 NIS_0666     TRUE 0.879 -3.000 0.098 1.000 N NA
 3580197 3580198 NIS_0666 NIS_0667     TRUE 0.925 10.000 0.029 NA   NA
 3580198 3580199 NIS_0667 NIS_0668     TRUE 0.984 -3.000 1.000 NA   NA
 3580199 3580200 NIS_0668 NIS_0669     TRUE 0.857 0.000 0.000 NA   NA
 3580200 3580201 NIS_0669 NIS_0670   efp FALSE 0.568 28.000 0.000 NA   NA
 3580201 3580202 NIS_0670 NIS_0671 efp   TRUE 0.816 2.000 0.000 1.000   NA
 3580202 3580203 NIS_0671 NIS_0672   thiJ FALSE 0.205 117.000 0.000 NA   NA
 3580204 3580205 NIS_0673 NIS_0674     FALSE 0.479 -3.000 0.000 NA N NA
 3580205 3580206 NIS_0674 NIS_0675     TRUE 0.578 -31.000 0.000 NA   NA
 3580211 3580212 NIS_0680 NIS_0681     FALSE 0.165 200.000 0.000 NA   NA
 3580212 3580213 NIS_0681 NIS_0682     FALSE 0.565 24.000 0.000 1.000   NA
 3580213 3580214 NIS_0682 NIS_0683     FALSE 0.196 76.000 0.000 1.000 N NA
 3580214 3580215 NIS_0683 NIS_0684     FALSE 0.492 61.000 0.000 1.000 Y NA
 3580215 3580216 NIS_0684 NIS_0685     TRUE 0.815 5.000 0.000 1.000   NA
 3580217 3580218 NIS_0686 NIS_0687     TRUE 0.896 -3.000 0.087 NA   NA
 3580218 3580219 NIS_0687 NIS_0688     FALSE 0.090 915.000 0.000 1.000 N NA
 3580219 3580220 NIS_0688 NIS_0689     TRUE 0.995 11.000 0.087 0.003 Y NA
 3580220 3580221 NIS_0689 NIS_0690     TRUE 0.979 13.000 0.014 0.003 Y NA
 3580222 3580223 NIS_0691 NIS_0692     TRUE 0.916 9.000 0.022 1.000   NA
 3580223 3580224 NIS_0692 NIS_0693     TRUE 0.847 1.000 0.000 NA   NA
 3580224 3580225 NIS_0693 NIS_0694     TRUE 0.828 9.000 0.000 NA   NA
 3580226 3580227 NIS_0695 NIS_0696     TRUE 0.793 -7.000 0.021 NA   NA
 3580227 3580228 NIS_0696 NIS_0697   pgsA TRUE 0.978 0.000 0.023 0.049 N NA
 3580228 3580229 NIS_0697 NIS_0698 pgsA   TRUE 0.952 0.000 0.017 1.000 Y NA
 3580229 3580230 NIS_0698 NIS_0699   dapA TRUE 0.981 0.000 0.238 1.000 N NA
 3580230 3580231 NIS_0699 NIS_0700 dapA   TRUE 0.984 0.000 0.217 1.000   NA
 3580231 3580232 NIS_0700 NIS_0701   pyrD TRUE 0.849 -3.000 0.048 1.000   NA
 3580234 3580235 NIS_0703 NIS_0704     FALSE 0.475 67.000 0.026 1.000 N NA
 3580235 3580236 NIS_0704 NIS_0705     TRUE 0.961 14.000 0.250 NA   NA
 3580236 3580237 NIS_0705 NIS_0706   trpB TRUE 0.896 8.000 0.013 NA   NA
 3580237 3580238 NIS_0706 NIS_0707 trpB apt TRUE 0.867 0.000 0.011 1.000 N NA
 3580238 3580239 NIS_0707 NIS_0708 apt rpiB FALSE 0.171 88.000 0.000 1.000 N NA
 3580239 3580240 NIS_0708 NIS_0709 rpiB   TRUE 0.948 2.000 0.042 1.000   NA
 3580240 3580241 NIS_0709 NIS_0710   lepB TRUE 0.972 -13.000 0.055 0.026   NA
 3580241 3580242 NIS_0710 NIS_0711 lepB folD TRUE 0.886 -3.000 0.117 1.000 N NA
 3580243 3580244 NIS_0712 NIS_0713   citE TRUE 0.911 -3.000 0.125 1.000   NA
 3580245 3580246 NIS_0714 NIS_0715     TRUE 0.997 -3.000 0.631 0.006 Y NA
 3580246 3580247 NIS_0715 NIS_0716     TRUE 0.995 10.000 0.097 0.013 Y NA
 3580247 3580248 NIS_0716 NIS_0717     TRUE 0.935 -7.000 0.064 NA Y NA
 3580248 3580249 NIS_0717 NIS_0718     TRUE 0.996 2.000 0.679 NA Y NA
 3580249 3580250 NIS_0718 NIS_0719     TRUE 0.948 -3.000 0.155 1.000 Y NA
 3580250 3580251 NIS_0719 NIS_0720     FALSE 0.122 144.000 0.000 1.000 N NA
 3580252 3580253 NIS_0721 NIS_0722 hemL   FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580253 3580254 NIS_0722 NIS_0723     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580255 3580256 NIS_0724 NIS_t28 rpoD trnK_Met FALSE 0.202 118.000 0.000 NA   NA
 3580256 3580257 NIS_t28 NIS_t29 trnK_Met trnK_Gln TRUE 0.832 8.000 0.000 NA   NA
 3580257 3580258 NIS_t29 NIS_0725 trnK_Gln   FALSE 0.471 39.000 0.000 NA   NA
 3580259 3580260 NIS_0726 NIS_0727 leuD leuB TRUE 0.983 38.000 0.089 0.003 Y NA
 3580260 3580261 NIS_0727 NIS_0728 leuB   TRUE 0.596 -16.000 0.000 1.000   NA
 3580261 3580262 NIS_0728 NIS_0729   purU TRUE 0.873 -3.000 0.064 1.000   NA
 3580262 3580263 NIS_0729 NIS_0730 purU   TRUE 0.917 0.000 0.025 1.000 N NA
 3580265 3580266 NIS_0732 NIS_0733 glyS   TRUE 0.841 0.000 0.006 1.000 N NA
 3580266 3580267 NIS_0733 NIS_0734   hemH FALSE 0.451 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3580267 3580268 NIS_0734 NIS_0735 hemH   TRUE 0.756 4.000 0.000 NA N NA
 3580268 3580269 NIS_0735 NIS_0736     FALSE 0.479 -3.000 0.000 NA N NA
 3580269 3580270 NIS_0736 NIS_0737     TRUE 0.595 23.000 0.000 NA   NA
 3580272 3580273 NIS_0738 NIS_0739     TRUE 0.835 12.000 0.015 NA   NA
 3580273 3580274 NIS_0739 NIS_0740     TRUE 0.857 0.000 0.000 NA   NA
 3580274 3580275 NIS_0740 NIS_0741     TRUE 0.774 11.000 0.000 NA   NA
 3580275 3580276 NIS_0741 NIS_0742     FALSE 0.141 716.000 0.000 NA   NA
 3580276 3580277 NIS_0742 NIS_0743     FALSE 0.322 68.000 0.000 NA   NA
 3580277 3580278 NIS_0743 NIS_0744     TRUE 0.994 0.000 0.158 0.055   NA
 3580278 3580279 NIS_0744 NIS_0745     FALSE 0.299 74.000 0.000 NA   NA
 3580279 3580280 NIS_0745 NIS_0746     TRUE 0.847 1.000 0.000 NA   NA
 3580280 3580281 NIS_0746 NIS_0747     FALSE 0.483 38.000 0.000 NA   NA
 3580281 3580282 NIS_0747 NIS_0748     FALSE 0.565 -64.000 0.000 NA   NA
 3580282 3580283 NIS_0748 NIS_0749     TRUE 0.857 0.000 0.000 NA   NA
 3580283 3580284 NIS_0749 NIS_0750     TRUE 0.991 9.000 0.564 1.000   NA
 3580285 3580286 NIS_t31 NIS_0751 trnM_Met   TRUE 0.830 2.000 0.000 NA   NA
 3580287 3580288 NIS_0752 NIS_0753     TRUE 0.805 -49.000 0.031 NA   NA
 3580288 3580289 NIS_0753 NIS_0754     TRUE 0.966 1.000 0.060 NA   NA
 3580289 3580290 NIS_0754 NIS_0755   ftsE TRUE 0.866 -7.000 0.044 1.000   NA
 3580290 3580291 NIS_0755 NIS_0756 ftsE ftsX TRUE 0.802 -13.000 0.024 1.000   NA
 3580291 3580292 NIS_0756 NIS_0757 ftsX   FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580292 3580293 NIS_0757 NIS_0758   pyrH FALSE 0.224 74.000 0.000 NA N NA
 3580293 3580294 NIS_0758 NIS_0759 pyrH   TRUE 0.762 -3.000 0.033 1.000 N NA
 3580294 3580295 NIS_0759 NIS_0760     TRUE 0.964 4.000 0.039 1.000 Y NA
 3580295 3580296 NIS_0760 NIS_0761   tyrS TRUE 0.937 9.000 0.045 1.000 N NA
 3580296 3580297 NIS_0761 NIS_0762 tyrS   TRUE 0.958 0.000 0.043 1.000   NA
 3580297 3580298 NIS_0762 NIS_0763     TRUE 0.850 27.000 0.050 1.000   NA
 3580299 3580300 NIS_0764 NIS_0765     TRUE 0.969 0.000 0.062 NA   NA
 3580300 3580301 NIS_0765 NIS_0766   ppa FALSE 0.235 97.000 0.000 NA   NA
 3580301 3580302 NIS_0766 NIS_0767 ppa   FALSE 0.402 51.000 0.000 NA   NA
 3580302 3580303 NIS_0767 NIS_0768     TRUE 0.633 -9.000 0.000 NA   NA
 3580303 3580304 NIS_0768 NIS_0769     TRUE 0.754 -13.000 0.016 1.000   NA
 3580304 3580305 NIS_0769 NIS_0770     TRUE 0.881 14.000 0.057 1.000 N NA
 3580305 3580306 NIS_0770 NIS_0771   aspS FALSE 0.553 -13.000 0.003 1.000 N NA
 3580307 3580308 NIS_0772 NIS_0773   recN TRUE 0.957 1.000 0.066 1.000 N NA
 3580308 3580309 NIS_0773 NIS_0774 recN   TRUE 0.765 -3.000 0.005 NA Y NA
 3580309 3580310 NIS_0774 NIS_0775     TRUE 0.774 20.000 0.028 NA N NA
 3580310 3580311 NIS_0775 NIS_0776     TRUE 0.952 -16.000 0.115 NA Y NA
 3580311 3580312 NIS_0776 NIS_0777     TRUE 0.752 -7.000 0.022 NA N NA
 3580312 3580313 NIS_0777 NIS_0778     TRUE 0.724 -3.000 0.018 1.000   NA
 3580313 3580314 NIS_0778 NIS_0779     TRUE 0.993 1.000 0.617 NA   NA
 3580314 3580315 NIS_0779 NIS_0780     TRUE 0.964 -3.000 0.459 NA   NA
 3580315 3580316 NIS_0780 NIS_0781     TRUE 0.840 -3.000 0.041 NA   NA
 3580316 3580317 NIS_0781 NIS_0782     TRUE 0.764 -28.000 0.023 1.000   NA
 3580317 3580318 NIS_0782 NIS_0783     FALSE 0.569 -54.000 0.000 NA   NA
 3580318 3580319 NIS_0783 NIS_0784     TRUE 0.634 -10.000 0.000 NA   NA
 3580320 3580321 NIS_0785 NIS_0786     TRUE 0.817 11.000 0.005 NA   NA
 3580322 3580323 NIS_0787 NIS_0788     TRUE 0.896 2.000 0.000 1.000 Y NA
 3580323 3580324 NIS_0788 NIS_0789     TRUE 0.845 0.000 0.000 1.000   NA
 3580325 3580326 NIS_0790 NIS_0791     FALSE 0.500 -7.000 0.000 1.000 N NA
 3580326 3580327 NIS_0791 NIS_0792     TRUE 0.980 11.000 0.429 1.000 N NA
 3580327 3580328 NIS_0792 NIS_0793     TRUE 0.715 12.000 0.000 1.000   NA
 3580328 3580329 NIS_0793 NIS_0794   metG TRUE 0.847 -3.000 0.046 1.000   NA
 3580329 3580330 NIS_0794 NIS_0795 metG   TRUE 0.914 10.000 0.024 NA   NA
 3580330 3580331 NIS_0795 NIS_0796   fbp TRUE 0.984 -10.000 0.778 NA   NA
 3580331 3580332 NIS_0796 NIS_0797 fbp   TRUE 0.969 2.000 0.139 1.000 N NA
 3580334 3580335 NIS_0799 NIS_0800     TRUE 0.887 -3.000 0.080 1.000   NA
 3580335 3580336 NIS_0800 NIS_0801     TRUE 0.893 -3.000 0.088 1.000   NA
 3580337 3580338 NIS_0802 NIS_0803     TRUE 0.857 0.000 0.000 NA   NA
 3580338 3580339 NIS_0803 NIS_0804     FALSE 0.218 109.000 0.000 NA   NA
 3580339 3580340 NIS_0804 NIS_0805     TRUE 0.969 2.000 0.094 1.000   NA
 3580340 3580341 NIS_0805 NIS_0806     TRUE 0.945 -7.000 0.094 1.000 Y NA
 3580341 3580342 NIS_0806 NIS_0807     FALSE 0.305 71.000 0.000 NA   NA
 3580342 3580343 NIS_0807 NIS_0808   tdcB TRUE 0.932 4.000 0.030 NA   NA
 3580343 3580344 NIS_0808 NIS_0809 tdcB   TRUE 0.900 0.000 0.009 NA   NA
 3580344 3580345 NIS_0809 NIS_0810   ilvI FALSE 0.560 40.000 0.008 NA   NA
 3580345 3580346 NIS_0810 NIS_0811 ilvI ilvH TRUE 0.998 3.000 0.249 0.001 Y NA
 3580346 3580347 NIS_0811 NIS_0812 ilvH lpxD TRUE 0.856 -10.000 0.052 1.000 N NA
 3580347 3580348 NIS_0812 NIS_0813 lpxD   FALSE 0.541 71.000 0.026 NA   NA
 3580349 3580350 NIS_0814 NIS_0815     FALSE 0.537 29.000 0.000 1.000   NA
 3580350 3580351 NIS_0815 NIS_0816     TRUE 0.982 2.000 0.102 1.000 Y NA
 3580351 3580352 NIS_0816 NIS_0817   speA TRUE 0.924 -7.000 0.055 1.000 Y NA
 3580352 3580353 NIS_0817 NIS_0818 speA hisS TRUE 0.904 0.000 0.021 1.000 N NA
 3580353 3580354 NIS_0818 NIS_0819 hisS tmk TRUE 0.874 2.000 0.018 1.000 N NA
 3580354 3580355 NIS_0819 NIS_0820 tmk coaD TRUE 0.932 1.000 0.034 1.000 N NA
 3580355 3580356 NIS_0820 NIS_0821 coaD ubiX TRUE 0.891 -7.000 0.032 1.000 Y NA
 3580357 3580358 NIS_0822 NIS_0823   minD TRUE 0.989 2.000 0.466 1.000   NA
 3580358 3580359 NIS_0823 NIS_0824 minD minE TRUE 0.983 -3.000 0.618 NA Y NA
 3580360 3580361 NIS_t32 NIS_t33 trnN_Gly trnN_Leu TRUE 0.816 3.000 0.000 NA   NA
 3580361 3580362 NIS_t33 NIS_0825 trnN_Leu hup FALSE 0.293 75.000 0.000 NA   NA
 3580363 3580364 NIS_0826 NIS_0827     FALSE 0.218 109.000 0.000 NA   NA
 3580364 3580365 NIS_0827 NIS_0828   acnB TRUE 0.808 10.000 0.000 NA   NA
 3580367 3580368 NIS_0830 NIS_0831 secA   TRUE 0.977 -7.000 0.201 0.089 N NA
 3580370 3580371 NIS_0833 NIS_0834     FALSE 0.368 97.000 0.016 NA   NA
 3580371 3580372 NIS_0834 NIS_0835   mdh TRUE 0.816 39.000 0.032 1.000 Y NA
 3580372 3580373 NIS_0835 NIS_0836 mdh   TRUE 0.992 0.000 0.286 1.000 Y NA
 3580373 3580374 NIS_0836 NIS_0837     TRUE 0.989 11.000 0.018 0.001 Y NA
 3580374 3580375 NIS_0837 NIS_0838   sucC TRUE 0.848 16.000 0.015 1.000 Y NA
 3580375 3580376 NIS_0838 NIS_0839 sucC sucD TRUE 0.998 0.000 0.169 0.001 Y NA
 3580376 3580377 NIS_0839 NIS_0840 sucD   TRUE 0.923 0.000 0.019 1.000   NA
 3580377 3580378 NIS_0840 NIS_0841     TRUE 0.925 2.000 0.027 1.000   NA
 3580378 3580379 NIS_0841 NIS_0842     TRUE 0.998 10.000 0.316 0.002 Y NA
 3580379 3580380 NIS_0842 NIS_0843     TRUE 0.999 11.000 0.771 0.002 Y NA
 3580380 3580381 NIS_0843 NIS_0844     TRUE 0.980 84.000 0.324 0.002 Y NA
 3580383 3580384 NIS_0846 NIS_0847 ubiD   TRUE 0.651 -34.000 0.015 NA N NA
 3580384 3580385 NIS_0847 NIS_0848     FALSE 0.476 -21.000 0.000 1.000 N NA
 3580385 3580386 NIS_0848 NIS_0849   trpD TRUE 0.841 0.000 0.006 1.000 N NA
 3580386 3580387 NIS_0849 NIS_0850 trpD   TRUE 0.612 -10.000 0.000 1.000   NA
 3580387 3580388 NIS_0850 NIS_0851     TRUE 0.611 -12.000 0.000 1.000   NA
 3580388 3580389 NIS_0851 NIS_0852     TRUE 0.596 -3.000 0.003 1.000   NA
 3580389 3580390 NIS_0852 NIS_0853   atpB FALSE 0.466 45.000 0.004 1.000   NA
 3580390 3580391 NIS_0853 NIS_0854 atpB   FALSE 0.161 230.000 0.009 1.000 N NA
 3580391 3580392 NIS_0854 NIS_0855     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580392 3580393 NIS_0855 NIS_0856     FALSE 0.388 55.000 0.000 NA   NA
 3580393 3580394 NIS_0856 NIS_0857     FALSE 0.571 -3.000 0.008 1.000 N NA
 3580394 3580395 NIS_0857 NIS_0858     TRUE 0.954 -7.000 0.000 0.005 Y NA
 3580395 3580396 NIS_0858 NIS_0859   gpsA FALSE 0.451 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3580396 3580397 NIS_0859 NIS_0860 gpsA   FALSE 0.528 -7.000 0.000 NA N NA
 3580397 3580398 NIS_0860 NIS_0861   proA TRUE 0.740 10.000 0.000 NA N NA
 3580398 3580399 NIS_0861 NIS_0862 proA   FALSE 0.554 -3.000 0.000 1.000   NA
 3580399 3580400 NIS_0862 NIS_0863     TRUE 0.857 0.000 0.000 NA   NA
 3580400 3580401 NIS_0863 NIS_0864     TRUE 0.618 -16.000 0.000 NA   NA
 3580401 3580402 NIS_0864 NIS_0865   phnA TRUE 0.675 11.000 0.000 1.000 N NA
 3580402 3580403 NIS_0865 NIS_0866 phnA   TRUE 0.742 -16.000 0.000 1.000 Y NA
 3580404 3580405 NIS_0867 NIS_0868     TRUE 0.821 4.000 0.000 NA   NA
 3580405 3580406 NIS_0868 NIS_0869     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580406 3580407 NIS_0869 NIS_0870   plsC TRUE 0.627 64.000 0.000 0.088 N NA
 3580407 3580408 NIS_0870 NIS_0871 plsC   TRUE 0.985 -16.000 0.846 NA   NA
 3580408 3580409 NIS_0871 NIS_0872     TRUE 0.867 17.000 0.038 NA   NA
 3580409 3580410 NIS_0872 NIS_0873     TRUE 0.997 -3.000 0.656 0.002 Y NA
 3580410 3580411 NIS_0873 NIS_0874   purC TRUE 0.975 -3.000 0.460 1.000 Y NA
 3580411 3580412 NIS_0874 NIS_0875 purC   TRUE 0.808 -3.000 0.045 1.000 N NA
 3580415 3580416 NIS_0878 NIS_0879 rpmH rnpA TRUE 0.978 -3.000 0.787 1.000   NA
 3580416 3580417 NIS_0879 NIS_0880 rnpA   TRUE 0.974 -6.000 0.540 NA   NA
 3580417 3580418 NIS_0880 NIS_0881     TRUE 0.989 4.000 0.461 NA   NA
 3580418 3580419 NIS_0881 NIS_0882     TRUE 0.876 -3.000 0.061 NA   NA
 3580419 3580420 NIS_0882 NIS_0883   trmE TRUE 0.878 -16.000 0.049 NA   NA
 3580420 3580421 NIS_0883 NIS_0884 trmE   TRUE 0.675 -10.000 0.005 1.000   NA
 3580421 3580422 NIS_0884 NIS_0885     TRUE 0.634 -10.000 0.000 NA   NA
 3580422 3580423 NIS_0885 NIS_0886   metE TRUE 0.644 -34.000 0.006 NA   NA
 3580423 3580424 NIS_0886 NIS_0887 metE   TRUE 0.623 38.000 0.000 1.000 Y NA
 3580424 3580425 NIS_0887 NIS_0888   htpX FALSE 0.124 139.000 0.000 1.000 N NA
 3580425 3580426 NIS_0888 NIS_0889 htpX   TRUE 0.697 13.000 0.000 NA   NA
 3580428 3580429 NIS_0891 NIS_0892     TRUE 0.996 -7.000 0.600 0.036 Y NA
 3580429 3580430 NIS_0892 NIS_0893     TRUE 0.975 -10.000 0.545 1.000   NA
 3580430 3580431 NIS_0893 NIS_0894     TRUE 0.637 17.000 0.000 NA   NA
 3580431 3580432 NIS_0894 NIS_0895     FALSE 0.353 61.000 0.000 NA   NA
 3580435 3580436 NIS_0898 NIS_0899     TRUE 0.732 -19.000 0.000 1.000 Y NA
 3580436 3580437 NIS_0899 NIS_0900     TRUE 0.590 -25.000 0.000 NA   NA
 3580437 3580438 NIS_0900 NIS_0901     TRUE 0.857 0.000 0.000 NA   NA
 3580438 3580439 NIS_0901 NIS_0902     FALSE 0.305 71.000 0.000 NA   NA
 3580439 3580440 NIS_0902 NIS_0903     TRUE 0.902 -7.000 0.105 1.000 N NA
 3580440 3580441 NIS_0903 NIS_0904     TRUE 0.707 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3580441 3580442 NIS_0904 NIS_0905     TRUE 0.857 0.000 0.000 NA   NA
 3580442 3580443 NIS_0905 NIS_0906     FALSE 0.198 121.000 0.000 NA   NA
 3580443 3580444 NIS_0906 NIS_0907     TRUE 0.857 0.000 0.000 NA   NA
 3580445 3580446 NIS_0908 NIS_0909     FALSE 0.151 329.000 0.000 NA   NA
 3580446 3580447 NIS_0909 NIS_0910     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580447 3580448 NIS_0910 NIS_0911     TRUE 0.978 -7.000 0.429 1.000 Y NA
 3580448 3580449 NIS_0911 NIS_0912     TRUE 0.983 10.000 0.429 1.000 N NA
 3580450 3580451 NIS_0913 NIS_0914     TRUE 0.963 -10.000 0.188 1.000 Y NA
 3580452 3580453 NIS_0915 NIS_0916     TRUE 0.952 14.000 0.000 0.017 Y NA
 3580453 3580454 NIS_0916 NIS_0917     TRUE 0.922 15.000 0.000 0.015   NA
 3580454 3580455 NIS_0917 NIS_0918     TRUE 0.972 -6.000 0.538 1.000   NA
 3580456 3580457 NIS_0919 NIS_0920   gpmA FALSE 0.312 51.000 0.000 NA N NA
 3580457 3580458 NIS_0920 NIS_0921 gpmA   TRUE 0.984 1.000 0.000 0.007 Y NA
 3580458 3580459 NIS_0921 NIS_0922     FALSE 0.375 52.000 0.000 1.000   NA
 3580459 3580460 NIS_0922 NIS_0923   ppsA TRUE 0.724 -10.000 0.011 1.000   NA
 3580460 3580461 NIS_0923 NIS_0924 ppsA   TRUE 0.718 10.000 0.000 1.000 N NA
 3580461 3580462 NIS_0924 NIS_0925   lipA TRUE 0.903 13.000 0.000 0.036 N NA
 3580462 3580463 NIS_0925 NIS_0926 lipA lipB TRUE 0.992 -16.000 0.319 0.036 Y NA
 3580463 3580464 NIS_0926 NIS_0927 lipB   TRUE 0.783 0.000 0.000 1.000 N NA
 3580464 3580465 NIS_0927 NIS_0928     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580465 3580466 NIS_0928 NIS_0929     TRUE 0.908 3.000 0.020 NA   NA
 3580466 3580467 NIS_0929 NIS_0930     TRUE 0.906 -3.000 0.097 NA   NA
 3580467 3580468 NIS_0930 NIS_0931     TRUE 0.902 0.000 0.020 1.000 N NA
 3580468 3580469 NIS_0931 NIS_0932     TRUE 0.905 -3.000 0.051 1.000 Y NA
 3580469 3580470 NIS_0932 NIS_0933     TRUE 0.959 -10.000 0.019 0.042 Y NA
 3580470 3580471 NIS_0933 NIS_0934     TRUE 0.997 -13.000 0.456 0.001 Y NA
 3580471 3580472 NIS_0934 NIS_0935     TRUE 0.776 -7.000 0.018 NA   NA
 3580472 3580473 NIS_0935 NIS_0936   glgB FALSE 0.436 44.000 0.000 NA   NA
 3580473 3580474 NIS_0936 NIS_0937 glgB   TRUE 0.887 -3.000 0.039 1.000 Y NA
 3580474 3580475 NIS_0937 NIS_0938     TRUE 0.808 77.000 0.097 1.000 Y NA
 3580475 3580476 NIS_0938 NIS_0939   galT TRUE 0.724 -16.000 0.021 1.000 N NA
 3580476 3580477 NIS_0939 NIS_0940 galT   TRUE 0.927 -12.000 0.117 1.000   NA
 3580477 3580478 NIS_0940 NIS_0941     TRUE 0.995 10.000 0.220 0.014   NA
 3580478 3580479 NIS_0941 NIS_0942     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580479 3580480 NIS_0942 NIS_0943     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580480 3580481 NIS_0943 NIS_0944     TRUE 0.821 4.000 0.000 NA   NA
 3580481 3580482 NIS_0944 NIS_0945     TRUE 0.762 -3.000 0.007 1.000 Y NA
 3580482 3580483 NIS_0945 NIS_0946   pgm TRUE 0.762 -3.000 0.007 1.000 Y NA
 3580483 3580484 NIS_0946 NIS_0947 pgm   TRUE 0.949 -3.000 0.010 0.014 Y NA
 3580485 3580486 NIS_0948 NIS_0949 purH   TRUE 0.857 0.000 0.000 NA   NA
 3580487 3580488 NIS_0950 NIS_0951     TRUE 0.965 -6.000 0.400 NA   NA
 3580491 3580492 NIS_0954 NIS_0955 htpG cbpA TRUE 0.802 100.000 0.000 0.003 Y NA
 3580492 3580493 NIS_0955 NIS_0956 cbpA   TRUE 0.942 -7.000 0.282 1.000 N NA
 3580495 3580496 NIS_0958 NIS_0959     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580496 3580497 NIS_0959 NIS_0960     TRUE 0.815 9.000 0.000 1.000   NA
 3580497 3580498 NIS_0960 NIS_0961     TRUE 0.970 -10.000 0.562 1.000 N NA
 3580498 3580499 NIS_0961 NIS_0962     TRUE 0.998 -10.000 0.800 0.003 Y NA
 3580499 3580500 NIS_0962 NIS_0963     TRUE 0.973 110.000 0.333 0.003 Y NA
 3580500 3580501 NIS_0963 NIS_0964     TRUE 1.000 0.000 0.900 0.003 Y NA
 3580501 3580502 NIS_0964 NIS_0965     TRUE 0.998 11.000 0.700 0.065 Y NA
 3580502 3580503 NIS_0965 NIS_0966     TRUE 0.994 2.000 0.545 1.000 Y NA
 3580503 3580504 NIS_0966 NIS_0967     TRUE 0.596 -16.000 0.000 1.000   NA
 3580504 3580505 NIS_0967 NIS_0968     TRUE 0.828 9.000 0.000 NA   NA
 3580505 3580506 NIS_0968 NIS_0969     TRUE 0.848 -3.000 0.043 NA   NA
 3580507 3580508 NIS_0970 NIS_0971     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580508 3580509 NIS_0971 NIS_0972     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580510 3580511 NIS_0973 NIS_0974     TRUE 0.906 10.000 0.021 NA   NA
 3580511 3580512 NIS_0974 NIS_0975     TRUE 0.995 0.000 0.463 NA Y NA
 3580512 3580513 NIS_0975 NIS_0976     TRUE 0.976 -10.000 0.342 NA Y NA
 3580513 3580514 NIS_0976 NIS_0977     TRUE 0.913 -3.000 0.058 1.000 Y NA
 3580514 3580515 NIS_0977 NIS_0978     TRUE 0.822 -6.000 0.042 1.000 N NA
 3580515 3580516 NIS_0978 NIS_0979     TRUE 0.846 -7.000 0.035 1.000   NA
 3580518 3580519 NIS_0981 NIS_0982     TRUE 0.783 0.000 0.000 1.000 N NA
 3580520 3580521 NIS_0983 NIS_0984     TRUE 0.997 10.000 0.214 0.004 Y NA
 3580521 3580522 NIS_0984 NIS_0985     TRUE 0.980 4.000 0.096 1.000 Y NA
 3580522 3580523 NIS_0985 NIS_0986     FALSE 0.393 53.000 0.000 NA   NA
 3580523 3580524 NIS_0986 NIS_0987     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580526 3580527 NIS_0989 NIS_0990     TRUE 0.842 -3.000 0.044 1.000   NA
 3580527 3580528 NIS_0990 NIS_0991     TRUE 0.941 -27.000 0.228 NA   NA
 3580528 3580529 NIS_0991 NIS_0992     TRUE 0.900 -15.000 0.064 NA   NA
 3580531 3580532 NIS_0994 NIS_0995     TRUE 0.985 9.000 0.286 NA   NA
 3580532 3580533 NIS_0995 NIS_0996   oppC FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580533 3580534 NIS_0996 NIS_0997 oppC   FALSE 0.541 -3.000 0.004 NA N NA
 3580535 3580536 NIS_0998 NIS_0999 argG rplI TRUE 0.578 -3.000 0.009 1.000 N NA
 3580536 3580537 NIS_0999 NIS_1000 rplI hslV TRUE 0.936 0.000 0.034 1.000 N NA
 3580537 3580538 NIS_1000 NIS_1001 hslV hslU TRUE 0.997 0.000 0.752 1.000 Y NA
 3580538 3580539 NIS_1001 NIS_1002 hslU era TRUE 0.954 9.000 0.051 1.000   NA
 3580539 3580540 NIS_1002 NIS_1003 era   TRUE 0.582 89.000 0.044 NA   NA
 3580540 3580541 NIS_1003 NIS_1004     TRUE 0.977 -3.000 0.692 NA   NA
 3580541 3580542 NIS_1004 NIS_1005     TRUE 0.964 -18.000 0.385 NA   NA
 3580542 3580543 NIS_1005 NIS_1006     TRUE 0.939 -3.000 0.250 1.000   NA
 3580543 3580544 NIS_1006 NIS_1007     TRUE 0.968 -19.000 0.458 NA   NA
 3580544 3580545 NIS_1007 NIS_1008     TRUE 0.952 -7.000 0.250 NA   NA
 3580545 3580546 NIS_1008 NIS_1009     TRUE 0.624 -7.000 0.000 NA   NA
 3580546 3580547 NIS_1009 NIS_1010     TRUE 0.958 13.000 0.188 NA   NA
 3580547 3580548 NIS_1010 NIS_1011     TRUE 0.987 -3.000 0.812 1.000 Y NA
 3580550 3580551 NIS_1013 NIS_1014 valS   FALSE 0.304 47.000 0.000 1.000 N NA
 3580551 3580552 NIS_1014 NIS_1015     TRUE 0.793 10.000 0.000 1.000   NA
 3580552 3580553 NIS_1015 NIS_1016   sufB FALSE 0.194 115.000 0.000 1.000   NA
 3580553 3580554 NIS_1016 NIS_1017 sufB sufC TRUE 0.976 -3.000 0.466 1.000 Y NA
 3580554 3580555 NIS_1017 NIS_1018 sufC sufD TRUE 0.994 0.000 0.482 1.000 Y NA
 3580555 3580556 NIS_1018 NIS_1019 sufD   TRUE 0.623 -3.000 0.004 NA   NA
 3580557 3580558 NIS_1020 NIS_1021 hemC   TRUE 0.847 0.000 0.007 1.000 N NA
 3580558 3580559 NIS_1021 NIS_1022     TRUE 0.721 -31.000 0.017 1.000   NA
 3580559 3580560 NIS_1022 NIS_1023   proS TRUE 0.930 0.000 0.022 1.000   NA
 3580560 3580561 NIS_1023 NIS_1024 proS hemA TRUE 0.982 2.000 0.040 0.046 N NA
 3580561 3580562 NIS_1024 NIS_1025 hemA   TRUE 0.977 0.000 0.051 1.000 Y NA
 3580562 3580563 NIS_1025 NIS_1026     TRUE 0.864 10.000 0.009 NA   NA
 3580563 3580564 NIS_1026 NIS_1027     FALSE 0.548 31.000 0.000 NA   NA
 3580564 3580565 NIS_1027 NIS_1028     TRUE 0.980 8.000 0.182 NA   NA
 3580565 3580566 NIS_1028 NIS_1029     TRUE 0.937 2.000 0.031 NA   NA
 3580566 3580567 NIS_1029 NIS_1030   bioA FALSE 0.545 -16.000 0.003 1.000 N NA
 3580568 3580569 NIS_1031 NIS_1032   ftsA TRUE 0.916 1.000 0.018 1.000   NA
 3580569 3580570 NIS_1032 NIS_1033 ftsA ftsZ TRUE 0.947 21.000 0.114 1.000 Y NA
 3580571 3580572 NIS_1034 NIS_1035     TRUE 0.921 3.000 0.025 NA   NA
 3580572 3580573 NIS_1035 NIS_1036   hemK TRUE 0.841 -16.000 0.033 NA   NA
 3580573 3580574 NIS_1036 NIS_1037 hemK   FALSE 0.506 -13.000 0.000 1.000 N NA
 3580575 3580576 NIS_1038 NIS_1039     FALSE 0.554 -3.000 0.000 1.000   NA
 3580577 3580578 NIS_1040 NIS_1041 thrC cutA FALSE 0.523 23.000 0.003 1.000 N NA
 3580578 3580579 NIS_1041 NIS_1042 cutA argB TRUE 0.799 1.000 0.003 1.000 N NA
 3580579 3580580 NIS_1042 NIS_1043 argB   TRUE 0.603 -37.000 0.012 1.000 N NA
 3580580 3580581 NIS_1043 NIS_1044     FALSE 0.508 117.000 0.024 1.000 Y NA
 3580581 3580582 NIS_1044 NIS_1045     FALSE 0.284 115.000 0.011 1.000   NA
 3580584 3580585 NIS_1047 NIS_1048     FALSE 0.539 -10.000 0.000 NA N NA
 3580585 3580586 NIS_1048 NIS_1049     FALSE 0.451 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3580586 3580587 NIS_1049 NIS_1050     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580588 3580589 NIS_1051 NIS_1052     TRUE 0.585 21.000 0.000 1.000   NA
 3580590 3580591 NIS_1053 NIS_1054     TRUE 0.861 -88.000 0.059 1.000   NA
 3580592 3580593 NIS_1055 NIS_1056     TRUE 0.853 4.000 0.006 1.000   NA
 3580593 3580594 NIS_1056 NIS_1057     TRUE 0.591 226.000 0.015 0.019 N NA
 3580594 3580595 NIS_1057 NIS_1058     TRUE 0.774 11.000 0.000 NA   NA
 3580598 3580599 NIS_1061 NIS_1062 thiS   TRUE 0.618 -16.000 0.000 NA   NA
 3580599 3580600 NIS_1062 NIS_1063     FALSE 0.446 43.000 0.000 NA   NA
 3580600 3580601 NIS_1063 NIS_1064     TRUE 0.758 -10.000 0.014 NA   NA
 3580601 3580602 NIS_1064 NIS_1065     TRUE 0.922 -7.000 0.178 1.000 N NA
 3580602 3580603 NIS_1065 NIS_1066     TRUE 0.584 -19.000 0.000 1.000   NA
 3580603 3580604 NIS_1066 NIS_1067     TRUE 0.606 -19.000 0.000 NA   NA
 3580604 3580605 NIS_1067 NIS_1068     TRUE 0.608 21.000 0.000 NA   NA
 3580605 3580606 NIS_1068 NIS_1069     TRUE 0.953 -3.000 0.333 NA   NA
 3580608 3580609 NIS_1071 NIS_1072   pncB FALSE 0.383 35.000 0.000 1.000 N NA
 3580611 3580612 NIS_1074 NIS_1075     TRUE 0.729 3.000 0.000 1.000 N NA
 3580612 3580613 NIS_1075 NIS_1076     TRUE 0.707 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3580614 3580615 NIS_1077 NIS_1078   fur TRUE 0.746 2.000 0.000 1.000 N NA
 3580616 3580617 NIS_1079 NIS_1080     TRUE 0.951 -13.000 0.237 NA   NA
 3580617 3580618 NIS_1080 NIS_1081     TRUE 0.874 -13.000 0.067 1.000 N NA
 3580618 3580619 NIS_1081 NIS_1082     TRUE 0.841 -3.000 0.063 1.000 N NA
 3580619 3580620 NIS_1082 NIS_1083   aroB TRUE 0.817 -6.000 0.041 1.000 N NA
 3580620 3580621 NIS_1083 NIS_1084 aroB   TRUE 0.665 49.000 0.031 1.000   NA
 3580622 3580623 NIS_1085 NIS_1086 tgt pdxJ FALSE 0.512 -3.000 0.004 1.000 N NA
 3580623 3580624 NIS_1086 NIS_1087 pdxJ pdxA TRUE 0.987 -22.000 0.048 0.001 Y NA
 3580625 3580626 NIS_1088 NIS_1089     TRUE 0.637 17.000 0.000 NA   NA
 3580626 3580627 NIS_1089 NIS_1090     TRUE 0.808 10.000 0.000 NA   NA
 3580627 3580628 NIS_1090 NIS_1091     FALSE 0.268 82.000 0.000 NA   NA
 3580628 3580629 NIS_1091 NIS_1092     TRUE 0.849 0.000 0.008 1.000 N NA
 3580629 3580630 NIS_1092 NIS_1093     FALSE 0.133 118.000 0.000 1.000 N NA
 3580630 3580631 NIS_1093 NIS_1094     TRUE 0.601 253.000 0.129 NA   NA
 3580631 3580632 NIS_1094 NIS_1095     FALSE 0.152 304.000 0.000 NA   NA
 3580632 3580633 NIS_1095 NIS_1096     TRUE 0.596 -22.000 0.000 NA   NA
 3580633 3580634 NIS_1096 NIS_1097   ddlA FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580634 3580635 NIS_1097 NIS_1098 ddlA ruvA TRUE 0.828 9.000 0.009 1.000 N NA
 3580636 3580637 NIS_1099 NIS_1100   mviN TRUE 0.845 32.000 0.000 0.046   NA
 3580637 3580638 NIS_1100 NIS_1101 mviN cysS TRUE 0.806 -16.000 0.027 1.000   NA
 3580638 3580639 NIS_1101 NIS_1102 cysS   TRUE 0.612 -3.000 0.013 1.000 N NA
 3580639 3580640 NIS_1102 NIS_1103   glmU FALSE 0.451 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3580640 3580641 NIS_1103 NIS_1104 glmU dfp TRUE 0.890 0.000 0.016 1.000 N NA
 3580641 3580642 NIS_1104 NIS_1105 dfp uppS TRUE 0.619 -7.000 0.009 1.000 N NA
 3580642 3580643 NIS_1105 NIS_1106 uppS   TRUE 0.651 -3.000 0.017 1.000 N NA
 3580643 3580644 NIS_1106 NIS_1107     TRUE 0.853 -7.000 0.039 1.000   NA
 3580644 3580645 NIS_1107 NIS_1108   truA TRUE 0.966 0.000 0.059 1.000   NA
 3580647 3580648 NIS_1110 NIS_1111     TRUE 0.971 -3.000 0.129 0.085   NA
 3580648 3580649 NIS_1111 NIS_1112     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580649 3580650 NIS_1112 NIS_1113     TRUE 0.925 -3.000 0.160 NA   NA
 3580651 3580652 NIS_1114 NIS_1115 allB   FALSE 0.539 -10.000 0.000 NA N NA
 3580652 3580653 NIS_1115 NIS_1116   dsbD TRUE 0.927 -3.000 0.074 NA Y NA
 3580654 3580655 NIS_1117 NIS_1118   msrA TRUE 0.746 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 3580656 3580657 NIS_1119 NIS_1120     FALSE 0.479 -3.000 0.000 NA N NA
 3580657 3580658 NIS_1120 NIS_1121   dnaK FALSE 0.140 112.000 0.000 1.000 N NA
 3580658 3580659 NIS_1121 NIS_1122 dnaK grpE TRUE 0.910 75.000 0.029 0.008 Y NA
 3580659 3580660 NIS_1122 NIS_1123 grpE   TRUE 0.927 11.000 0.038 NA   NA
 3580660 3580661 NIS_1123 NIS_1124   rpsO FALSE 0.164 215.000 0.000 NA   NA
 3580661 3580662 NIS_1124 NIS_1125 rpsO   FALSE 0.277 55.000 0.000 1.000 N NA
 3580663 3580664 NIS_1126 NIS_1127     TRUE 0.951 3.000 0.048 NA   NA
 3580665 3580666 NIS_1128 NIS_1129     FALSE 0.554 -3.000 0.000 1.000   NA
 3580666 3580667 NIS_1129 NIS_1130     TRUE 0.607 -13.000 0.000 1.000   NA
 3580667 3580668 NIS_1130 NIS_1131   ribF FALSE 0.510 -9.000 0.000 1.000 N NA
 3580668 3580669 NIS_1131 NIS_1132 ribF   TRUE 0.872 5.000 0.018 1.000 N NA
 3580669 3580670 NIS_1132 NIS_1133   ligA TRUE 0.679 -10.000 0.014 1.000 N NA
 3580670 3580671 NIS_1133 NIS_1134 ligA   FALSE 0.500 -7.000 0.000 1.000 N NA
 3580671 3580672 NIS_1134 NIS_1135     FALSE 0.500 -7.000 0.000 1.000 N NA
 3580672 3580673 NIS_1135 NIS_1136     FALSE 0.438 40.000 0.000 1.000   NA
 3580673 3580674 NIS_1136 NIS_1137     FALSE 0.554 -3.000 0.000 1.000   NA
 3580674 3580675 NIS_1137 NIS_1138     TRUE 0.859 -3.000 0.054 1.000   NA
 3580675 3580676 NIS_1138 NIS_1139     TRUE 0.866 -3.000 0.053 NA   NA
 3580676 3580677 NIS_1139 NIS_1140     TRUE 0.859 -3.000 0.050 NA   NA
 3580677 3580678 NIS_1140 NIS_1141     TRUE 0.822 -3.000 0.051 1.000 N NA
 3580681 3580682 NIS_1144 NIS_1145   tatC TRUE 0.983 -7.000 0.535 NA Y NA
 3580682 3580683 NIS_1145 NIS_1146 tatC queA TRUE 0.943 0.000 0.036 NA N NA
 3580683 3580684 NIS_1146 NIS_1147 queA   FALSE 0.294 56.000 0.000 NA N NA
 3580684 3580685 NIS_1147 NIS_1148   xthA FALSE 0.125 169.000 0.000 NA N NA
 3580685 3580686 NIS_1148 NIS_1149 xthA   FALSE 0.482 -19.000 0.000 1.000 N NA
 3580688 3580689 NIS_1151 NIS_1152     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580689 3580690 NIS_1152 NIS_1153     TRUE 0.821 4.000 0.000 NA   NA
 3580691 3580692 NIS_1154 NIS_1155     TRUE 0.634 -10.000 0.000 NA   NA
 3580692 3580693 NIS_1155 NIS_1156     FALSE 0.548 31.000 0.000 NA   NA
 3580693 3580694 NIS_1156 NIS_1157     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580694 3580695 NIS_1157 NIS_1158     TRUE 0.857 0.000 0.000 NA   NA
 3580695 3580696 NIS_1158 NIS_1159     FALSE 0.500 -7.000 0.000 1.000 N NA
 3580696 3580697 NIS_1159 NIS_1160     TRUE 0.793 10.000 0.000 1.000   NA
 3580697 3580698 NIS_1160 NIS_1161   ilvC TRUE 0.690 26.000 0.013 1.000   NA
 3580699 3580700 NIS_1162 NIS_1163     TRUE 0.580 -7.000 0.005 1.000 N NA
 3580700 3580701 NIS_1163 NIS_1164   rpsF FALSE 0.369 78.000 0.020 1.000 N NA
 3580701 3580702 NIS_1164 NIS_1165 rpsF ssb TRUE 0.798 -7.000 0.033 1.000 N NA
 3580702 3580703 NIS_1165 NIS_1166 ssb rpsR TRUE 0.835 14.000 0.034 1.000 N NA
 3580704 3580705 NIS_1167 NIS_1168     TRUE 0.857 0.000 0.000 NA   NA
 3580705 3580706 NIS_1168 NIS_1169   hisG TRUE 0.685 -10.000 0.006 1.000   NA
 3580706 3580707 NIS_1169 NIS_1170 hisG   TRUE 0.731 -6.000 0.023 1.000 N NA
 3580707 3580708 NIS_1170 NIS_1171     TRUE 0.792 -13.000 0.021 NA   NA
 3580708 3580709 NIS_1171 NIS_1172     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580709 3580710 NIS_1172 NIS_1173     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580711 3580712 NIS_1174 NIS_1175     TRUE 0.836 9.000 0.010 1.000 N NA
 3580712 3580713 NIS_1175 NIS_1176     TRUE 0.770 13.000 0.010 1.000   NA
 3580713 3580714 NIS_1176 NIS_1177     TRUE 0.912 3.000 0.023 1.000   NA
 3580714 3580715 NIS_1177 NIS_1178   glyA TRUE 0.932 4.000 0.044 1.000 N NA
 3580715 3580716 NIS_1178 NIS_1179 glyA   FALSE 0.271 81.000 0.000 NA   NA
 3580716 3580717 NIS_1179 NIS_1180   trpE TRUE 0.921 0.000 0.016 NA   NA
 3580717 3580718 NIS_1180 NIS_1181 trpE aroE TRUE 0.788 -3.000 0.011 1.000 Y NA
 3580719 3580720 NIS_1182 NIS_1183     FALSE 0.095 390.000 0.000 1.000 N NA
 3580720 3580721 NIS_1183 NIS_1184     FALSE 0.451 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3580721 3580722 NIS_1184 NIS_1185   recR FALSE 0.293 50.000 0.000 1.000 N NA
 3580724 3580725 NIS_1187 NIS_1188   polA FALSE 0.171 88.000 0.000 1.000 N NA
 3580727 3580728 NIS_1190 NIS_1191   uvrA FALSE 0.574 -10.000 0.002 NA N NA
 3580728 3580729 NIS_1191 NIS_1192 uvrA   TRUE 0.793 10.000 0.000 1.000   NA
 3580731 3580732 NIS_1194 NIS_1195     TRUE 0.928 1.000 0.021 NA   NA
 3580732 3580733 NIS_1195 NIS_1196     TRUE 0.783 14.000 0.013 NA   NA
 3580733 3580734 NIS_1196 NIS_1197     TRUE 0.707 -7.000 0.008 NA   NA
 3580734 3580735 NIS_1197 NIS_1198   accD TRUE 0.638 -13.000 0.010 1.000 N NA
 3580735 3580736 NIS_1198 NIS_1199 accD   TRUE 0.887 0.000 0.016 1.000 N NA
 3580736 3580737 NIS_1199 NIS_1200   gltD TRUE 0.961 0.000 0.070 1.000 N NA
 3580737 3580738 NIS_1200 NIS_1201 gltD gltB TRUE 0.998 2.000 0.188 0.001 Y NA
 3580740 3580741 NIS_1203 NIS_1204     TRUE 0.984 0.000 0.000 0.014 Y NA
 3580741 3580742 NIS_1204 NIS_1205     TRUE 0.746 19.000 0.000 1.000 Y NA
 3580742 3580743 NIS_1205 NIS_1206     FALSE 0.143 496.000 0.000 NA   NA
 3580743 3580744 NIS_1206 NIS_1207     FALSE 0.158 251.000 0.000 NA   NA
 3580744 3580745 NIS_1207 NIS_1208     TRUE 0.830 2.000 0.000 NA   NA
 3580745 3580746 NIS_1208 NIS_1209   pfs TRUE 0.807 -3.000 0.042 NA N NA
 3580746 3580747 NIS_1209 NIS_1210 pfs   FALSE 0.340 64.000 0.000 NA   NA
 3580747 3580748 NIS_1210 NIS_1211   fabD FALSE 0.214 111.000 0.000 NA   NA
 3580748 3580749 NIS_1211 NIS_1212 fabD slyD FALSE 0.231 78.000 0.004 1.000 N NA
 3580749 3580750 NIS_1212 NIS_1213 slyD   FALSE 0.250 82.000 0.000 1.000   NA
 3580750 3580751 NIS_1213 NIS_1214     TRUE 0.793 10.000 0.000 1.000   NA
 3580751 3580752 NIS_1214 NIS_1215     TRUE 0.921 67.000 0.702 1.000 N NA
 3580752 3580753 NIS_1215 NIS_1216     TRUE 0.888 45.000 0.213 NA   NA
 3580753 3580754 NIS_1216 NIS_1217     TRUE 0.962 -7.000 0.343 NA   NA
 3580754 3580755 NIS_1217 NIS_1218     TRUE 0.999 0.000 0.944 0.036   NA
 3580755 3580756 NIS_1218 NIS_1219   atpC TRUE 0.942 2.000 0.036 1.000   NA
 3580756 3580757 NIS_1219 NIS_1220 atpC atpD TRUE 0.998 30.000 0.837 0.005 Y NA
 3580757 3580758 NIS_1220 NIS_1221 atpD atpG TRUE 0.998 16.000 0.724 0.005 Y NA
 3580758 3580759 NIS_1221 NIS_1222 atpG atpA TRUE 0.999 10.000 0.846 0.005 Y NA
 3580759 3580760 NIS_1222 NIS_1223 atpA atpH TRUE 0.999 13.000 0.864 0.005 Y NA
 3580760 3580761 NIS_1223 NIS_1224 atpH   TRUE 0.998 0.000 0.132 0.005 Y NA
 3580761 3580762 NIS_1224 NIS_1225     TRUE 0.993 13.000 0.110 0.005 Y NA
 3580762 3580763 NIS_1225 NIS_1226     FALSE 0.537 71.000 0.037 1.000 N NA
 3580763 3580764 NIS_1226 NIS_1227     TRUE 0.981 -13.000 0.827 1.000 N NA
 3580764 3580765 NIS_1227 NIS_1228     TRUE 0.789 -3.000 0.040 1.000 N NA
 3580765 3580766 NIS_1228 NIS_1229   fmt TRUE 0.757 -19.000 0.029 1.000 N NA
 3580766 3580767 NIS_1229 NIS_1230 fmt   FALSE 0.554 -3.000 0.000 1.000   NA
 3580767 3580768 NIS_1230 NIS_1231   proB TRUE 0.602 -15.000 0.000 1.000   NA
 3580768 3580769 NIS_1231 NIS_1232 proB obg TRUE 0.983 -7.000 0.206 0.044   NA
 3580769 3580770 NIS_1232 NIS_1233 obg rpmA TRUE 0.829 88.000 0.335 1.000   NA
 3580770 3580771 NIS_1233 NIS_1234 rpmA rplU TRUE 0.998 13.000 0.667 0.023 Y NA
 3580771 3580772 NIS_1234 NIS_1235 rplU   TRUE 0.591 63.000 0.009 NA Y NA
 3580773 3580774 NIS_t34 NIS_t35 trnO_Gln trnO_Met TRUE 0.832 8.000 0.000 NA   NA
 3580774 3580775 NIS_t35 NIS_1236 trnO_Met   FALSE 0.228 100.000 0.000 NA   NA
 3580776 3580777 NIS_1237 NIS_1238 dapE   TRUE 0.596 -22.000 0.000 NA   NA
 3580777 3580778 NIS_1238 NIS_1239     TRUE 0.914 0.000 0.014 NA   NA
 3580780 3580781 NIS_1241 NIS_1242     FALSE 0.573 -22.000 0.000 1.000   NA
 3580783 3580784 NIS_1244 NIS_1245     FALSE 0.561 -1000.000 0.000 NA   NA
 3580784 3580785 NIS_1245 NIS_1246     TRUE 0.994 0.000 0.158 0.051   NA
 3580785 3580786 NIS_1246 NIS_1247     FALSE 0.132 590.000 0.000 1.000   NA
 3580786 3580787 NIS_1247 NIS_1248     TRUE 0.948 -22.000 0.133 1.000 Y NA
 3580787 3580788 NIS_1248 NIS_1249     TRUE 0.979 3.000 0.094 1.000 Y NA
 3580788 3580789 NIS_1249 NIS_1250     TRUE 0.832 -3.000 0.041 1.000   NA
 3580789 3580790 NIS_1250 NIS_1251     TRUE 0.925 1.000 0.020 NA   NA
 3580790 3580791 NIS_1251 NIS_1252     TRUE 0.722 -3.000 0.000 NA Y NA
 3580791 3580792 NIS_1252 NIS_1253     TRUE 0.707 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3580792 3580793 NIS_1253 NIS_1254     FALSE 0.552 -34.000 0.000 1.000   NA
 3580793 3580794 NIS_1254 NIS_1255     TRUE 0.853 -3.000 0.000 0.083   NA
 3580794 3580795 NIS_1255 NIS_1256     TRUE 0.941 -6.000 0.000 0.001   NA
 3580795 3580796 NIS_1256 NIS_1257     TRUE 0.707 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3580796 3580797 NIS_1257 NIS_1258     FALSE 0.500 -15.000 0.000 1.000 N NA
 3580797 3580798 NIS_1258 NIS_1259   wecB FALSE 0.482 -19.000 0.000 1.000 N NA
 3580798 3580799 NIS_1259 NIS_1260 wecB   TRUE 0.891 4.000 0.000 1.000 Y NA
 3580799 3580800 NIS_1260 NIS_1261     FALSE 0.455 25.000 0.000 1.000 N NA
 3580800 3580801 NIS_1261 NIS_1262     TRUE 0.753 -9.000 0.000 1.000 Y NA
 3580801 3580802 NIS_1262 NIS_1263     TRUE 0.634 -10.000 0.000 NA   NA
 3580802 3580803 NIS_1263 NIS_1264     TRUE 0.816 3.000 0.000 NA   NA
 3580803 3580804 NIS_1264 NIS_1265     TRUE 0.930 -3.000 0.182 NA   NA
 3580804 3580805 NIS_1265 NIS_1266   murC FALSE 0.554 -3.000 0.000 1.000   NA
 3580805 3580806 NIS_1266 NIS_1267 murC   TRUE 0.661 -3.000 0.007 NA   NA
 3580806 3580807 NIS_1267 NIS_1268     TRUE 0.592 -24.000 0.000 NA   NA
 3580807 3580808 NIS_1268 NIS_1269     TRUE 0.962 -25.000 0.400 NA   NA
 3580808 3580809 NIS_1269 NIS_1270     TRUE 0.611 -18.000 0.000 NA   NA
 3580809 3580810 NIS_1270 NIS_1271     TRUE 0.634 -10.000 0.000 NA   NA
 3580810 3580811 NIS_1271 NIS_1272     TRUE 0.939 -16.000 0.176 NA   NA
 3580811 3580812 NIS_1272 NIS_1273     FALSE 0.446 43.000 0.000 NA   NA
 3580812 3580813 NIS_1273 NIS_1274     TRUE 0.918 -3.000 0.146 1.000   NA
 3580813 3580814 NIS_1274 NIS_1275     TRUE 0.805 -3.000 0.032 1.000   NA
 3580814 3580815 NIS_1275 NIS_1276     TRUE 0.728 -3.000 0.019 1.000   NA
 3580817 3580818 NIS_1278 NIS_1279     TRUE 0.956 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 3580818 3580819 NIS_1279 NIS_1280   guaB FALSE 0.248 61.000 0.000 1.000 N NA
 3580819 3580820 NIS_1280 NIS_1281 guaB   TRUE 0.860 12.000 0.032 1.000 N NA
 3580820 3580821 NIS_1281 NIS_1282   ileS FALSE 0.468 85.000 0.008 1.000 Y NA
 3580822 3580823 NIS_1283 NIS_t36   trnP_Lys FALSE 0.245 92.000 0.000 NA   NA
 3580823 3580824 NIS_t36 NIS_t37 trnP_Lys trnP_Glu TRUE 0.830 6.000 0.000 NA   NA
 3580824 3580825 NIS_t37 NIS_t38 trnP_Glu trnP_Val TRUE 0.831 7.000 0.000 NA   NA
 3580825 3580826 NIS_t38 NIS_t39 trnP_Val trnP_Asp TRUE 0.821 4.000 0.000 NA   NA
 3580826 3580827 NIS_t39 NIS_1284 trnP_Asp   FALSE 0.211 114.000 0.000 NA   NA
 3580827 3580828 NIS_1284 NIS_1285     FALSE 0.497 193.000 0.057 NA   NA
 3580829 3580830 NIS_1286 NIS_1287     FALSE 0.459 -28.000 0.000 1.000 N NA
 3580831 3580832 NIS_1288 NIS_1289     TRUE 0.983 -22.000 0.625 1.000 Y NA
 3580832 3580833 NIS_1289 NIS_1290     TRUE 0.974 -12.000 0.500 NA   NA
 3580833 3580834 NIS_1290 NIS_1291     FALSE 0.360 60.000 0.000 NA   NA
 3580834 3580835 NIS_1291 NIS_1292     FALSE 0.537 32.000 0.000 NA   NA
 3580837 3580838 NIS_1294 NIS_1295     FALSE 0.151 217.000 0.000 1.000   NA
 3580838 3580839 NIS_1295 NIS_1296     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580839 3580840 NIS_1296 NIS_1297     TRUE 0.629 -13.000 0.000 NA   NA
 3580840 3580841 NIS_1297 NIS_1298     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580842 3580843 NIS_1299 NIS_1300     TRUE 0.951 -28.000 0.333 1.000   NA
 3580845 3580846 NIS_1302 NIS_1303     TRUE 0.999 5.000 0.350 0.002 Y NA
 3580846 3580847 NIS_1303 NIS_1304     TRUE 0.995 13.000 0.140 0.002 Y NA
 3580849 3580850 NIS_1306 NIS_1307     TRUE 0.957 -10.000 0.273 NA   NA
 3580850 3580851 NIS_1307 NIS_1308     FALSE 0.330 66.000 0.000 NA   NA
 3580852 3580853 NIS_1309 NIS_1310     TRUE 0.618 -16.000 0.000 NA   NA
 3580854 3580855 NIS_1311 NIS_1312   argC TRUE 0.890 11.000 0.021 NA   NA
 3580855 3580856 NIS_1312 NIS_1313 argC greA TRUE 0.594 -3.000 0.011 1.000 N NA
 3580857 3580858 NIS_1314 NIS_1315 lpxB   TRUE 0.952 4.000 0.027 1.000 Y NA
 3580858 3580859 NIS_1315 NIS_1316     TRUE 0.909 -3.000 0.117 1.000   NA
 3580859 3580860 NIS_1316 NIS_1317     FALSE 0.554 -3.000 0.000 1.000   NA
 3580860 3580861 NIS_1317 NIS_1318   surE FALSE 0.490 34.000 0.000 1.000   NA
 3580861 3580862 NIS_1318 NIS_1319 surE   TRUE 0.852 -3.000 0.051 1.000   NA
 3580862 3580863 NIS_1319 NIS_1320     FALSE 0.150 335.000 0.000 NA   NA
 3580864 3580865 NIS_1321 NIS_1322     FALSE 0.140 1092.000 0.000 NA   NA
 3580865 3580866 NIS_1322 NIS_1323     TRUE 0.808 10.000 0.000 NA   NA
 3580866 3580867 NIS_1323 NIS_1324     TRUE 0.624 -7.000 0.000 NA   NA
 3580867 3580868 NIS_1324 NIS_1325     TRUE 0.606 -19.000 0.000 NA   NA
 3580868 3580869 NIS_1325 NIS_1326     TRUE 0.629 -13.000 0.000 NA   NA
 3580869 3580870 NIS_1326 NIS_1327     FALSE 0.265 83.000 0.000 NA   NA
 3580870 3580871 NIS_1327 NIS_1328     FALSE 0.184 147.000 0.000 NA   NA
 3580871 3580872 NIS_1328 NIS_1329     FALSE 0.147 425.000 0.000 NA   NA
 3580872 3580873 NIS_1329 NIS_1330     FALSE 0.513 34.000 0.000 NA   NA
 3580873 3580874 NIS_1330 NIS_1331     TRUE 0.987 1.000 0.286 NA   NA
 3580874 3580875 NIS_1331 NIS_1332     FALSE 0.415 48.000 0.000 NA   NA
 3580875 3580876 NIS_1332 NIS_t40   trnQ_Leu FALSE 0.168 185.000 0.000 NA   NA
 3580876 3580877 NIS_t40 NIS_1333 trnQ_Leu pnp FALSE 0.145 460.000 0.000 NA   NA
 3580877 3580878 NIS_1333 NIS_1334 pnp   TRUE 0.781 11.000 0.002 1.000   NA
 3580878 3580879 NIS_1334 NIS_1335     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580879 3580880 NIS_1335 NIS_1336     TRUE 0.948 0.000 0.041 NA N NA
 3580880 3580881 NIS_1336 NIS_1337   purD FALSE 0.540 -13.000 0.002 1.000 N NA
 3580881 3580882 NIS_1337 NIS_1338 purD   FALSE 0.098 304.000 0.000 1.000 N NA
 3580882 3580883 NIS_1338 NIS_1339   guaA TRUE 0.846 0.000 0.007 1.000 N NA
 3580883 3580884 NIS_1339 NIS_1340 guaA   TRUE 0.763 10.000 0.004 1.000 N NA
 3580884 3580885 NIS_1340 NIS_1341     TRUE 0.864 1.000 0.012 1.000 N NA
 3580886 3580887 NIS_1342 NIS_1343   uvrC TRUE 0.769 -16.000 0.018 NA   NA
 3580887 3580888 NIS_1343 NIS_1344 uvrC   FALSE 0.271 81.000 0.000 NA   NA
 3580888 3580889 NIS_1344 NIS_1345     TRUE 0.857 0.000 0.000 NA   NA
 3580889 3580890 NIS_1345 NIS_1346     TRUE 0.715 12.000 0.000 1.000   NA
 3580890 3580891 NIS_1346 NIS_1347     TRUE 0.996 -3.000 0.636 0.012 Y NA
 3580892 3580893 NIS_1348 NIS_1349 lon   TRUE 0.914 14.000 0.062 NA   NA
 3580894 3580895 NIS_1350 NIS_1351 proC   FALSE 0.216 110.000 0.000 NA   NA
 3580895 3580896 NIS_1351 NIS_1352     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580896 3580897 NIS_1352 NIS_1353     TRUE 0.960 -3.000 0.400 NA   NA
 3580897 3580898 NIS_1353 NIS_1354     TRUE 0.967 -3.000 0.500 NA   NA
 3580898 3580899 NIS_1354 NIS_1355     TRUE 0.721 50.000 0.040 NA   NA
 3580900 3580901 NIS_1356 NIS_1357 recG   TRUE 0.889 -3.000 0.084 1.000   NA
 3580901 3580902 NIS_1357 NIS_1358     TRUE 0.863 42.000 0.130 1.000   NA
 3580902 3580903 NIS_1358 NIS_1359     FALSE 0.554 -3.000 0.000 1.000   NA
 3580903 3580904 NIS_1359 NIS_1360   nusB TRUE 0.584 -19.000 0.000 1.000   NA
 3580904 3580905 NIS_1360 NIS_1361 nusB ribE TRUE 0.948 0.000 0.045 1.000 N NA
 3580905 3580906 NIS_1361 NIS_1362 ribE   TRUE 0.847 1.000 0.000 NA   NA
 3580906 3580907 NIS_1362 NIS_1363     TRUE 0.981 -10.000 0.667 NA   NA
 3580907 3580908 NIS_1363 NIS_1364   kdsA TRUE 0.602 -7.000 0.000 1.000   NA
 3580908 3580909 NIS_1364 NIS_1365 kdsA   FALSE 0.554 -3.000 0.000 1.000   NA
 3580909 3580910 NIS_1365 NIS_1366     TRUE 0.816 2.000 0.000 1.000   NA
 3580910 3580911 NIS_1366 NIS_1367     TRUE 0.624 -7.000 0.000 NA   NA
 3580912 3580913 NIS_1368 NIS_1369     FALSE 0.554 -3.000 0.000 1.000   NA
 3580913 3580914 NIS_1369 NIS_1370   trpS TRUE 0.715 12.000 0.000 1.000   NA
 3580914 3580915 NIS_1370 NIS_1371 trpS   TRUE 0.596 -16.000 0.000 1.000   NA
 3580915 3580916 NIS_1371 NIS_1372     TRUE 0.963 -30.000 0.429 NA   NA
 3580916 3580917 NIS_1372 NIS_1373     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580917 3580918 NIS_1373 NIS_1374   crcB TRUE 0.695 -3.000 0.011 NA   NA
 3580918 3580919 NIS_1374 NIS_1375 crcB   TRUE 0.857 0.000 0.000 NA   NA
 3580919 3580920 NIS_1375 NIS_1376     TRUE 0.857 0.000 0.000 NA   NA
 3580920 3580921 NIS_1376 NIS_1377     TRUE 0.964 -27.000 0.432 NA   NA
 3580923 3580924 NIS_1379 NIS_1380 serS   TRUE 0.744 9.000 0.000 1.000 N NA
 3580924 3580925 NIS_1380 NIS_1381     TRUE 0.978 1.000 0.061 1.000 Y NA
 3580926 3580927 NIS_1382 NIS_1383     FALSE 0.415 48.000 0.000 NA   NA
 3580927 3580928 NIS_1383 NIS_1384     FALSE 0.486 -6.000 0.000 1.000 N NA
 3580928 3580929 NIS_1384 NIS_1385     TRUE 0.943 -16.000 0.093 1.000 Y NA
 3580929 3580930 NIS_1385 NIS_1386   gmd TRUE 0.998 0.000 0.222 0.003 Y NA
 3580930 3580931 NIS_1386 NIS_1387 gmd   FALSE 0.273 80.000 0.000 NA   NA
 3580931 3580932 NIS_1387 NIS_1388     FALSE 0.211 114.000 0.000 NA   NA
 3580933 3580934 NIS_1389 NIS_1390     TRUE 0.964 -19.000 0.400 NA   NA
 3580935 3580936 NIS_1391 NIS_1392     FALSE 0.141 762.000 0.000 NA   NA
 3580936 3580937 NIS_1392 NIS_1393     FALSE 0.175 168.000 0.000 NA   NA
 3580937 3580938 NIS_1393 NIS_1394     FALSE 0.262 85.000 0.000 NA   NA
 3580938 3580939 NIS_1394 NIS_1395     TRUE 0.947 -3.000 0.135 NA Y NA
 3580941 3580942 NIS_1397 NIS_1398     FALSE 0.558 25.000 0.000 1.000   NA
 3580942 3580943 NIS_1398 NIS_1399     TRUE 0.828 9.000 0.000 NA   NA
 3580943 3580944 NIS_1399 NIS_1400     TRUE 0.634 -10.000 0.000 NA   NA
 3580944 3580945 NIS_1400 NIS_1401     TRUE 0.606 -19.000 0.000 NA   NA
 3580945 3580946 NIS_1401 NIS_1402     TRUE 0.976 -10.000 0.357 1.000 Y NA
 3580946 3580947 NIS_1402 NIS_1403     TRUE 0.999 0.000 0.765 0.008   NA
 3580948 3580949 NIS_1404 NIS_1405     TRUE 0.722 -3.000 0.000 NA Y NA
 3580949 3580950 NIS_1405 NIS_1406     FALSE 0.407 50.000 0.000 NA   NA
 3580951 3580952 NIS_1407 NIS_1408 leuA   FALSE 0.501 139.000 0.073 1.000 N NA
 3580952 3580953 NIS_1408 NIS_1409     TRUE 0.804 3.000 0.007 1.000 N NA
 3580953 3580954 NIS_1409 NIS_1410     TRUE 0.801 -10.000 0.032 1.000 N NA
 3580954 3580955 NIS_1410 NIS_1411   hisA FALSE 0.570 -7.000 0.004 1.000 N NA
 3580955 3580956 NIS_1411 NIS_1412 hisA hisH TRUE 0.993 1.000 0.031 0.006 Y NA
 3580956 3580957 NIS_1412 NIS_1413 hisH   TRUE 0.943 -3.000 0.273 1.000   NA
 3580957 3580958 NIS_1413 NIS_1414     TRUE 0.908 -13.000 0.083 1.000   NA
 3580959 3580960 NIS_1415 NIS_1416     FALSE 0.554 -3.000 0.000 1.000   NA
 3580960 3580961 NIS_1416 NIS_1417     FALSE 0.556 -31.000 0.000 1.000   NA
 3580961 3580962 NIS_1417 NIS_1418     TRUE 0.984 -10.000 0.226 0.081   NA
 3580962 3580963 NIS_1418 NIS_1419     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3580963 3580964 NIS_1419 NIS_1420     TRUE 0.857 0.000 0.000 NA   NA
 3580964 3580965 NIS_1420 NIS_1421     TRUE 0.624 -7.000 0.000 NA   NA
 3580966 3580967 NIS_1422 NIS_1423     TRUE 0.820 -3.000 0.000 0.080 N NA
 3580967 3580968 NIS_1423 NIS_1424     TRUE 0.997 -31.000 1.000 0.035 Y NA
 3580968 3580969 NIS_1424 NIS_1425     TRUE 0.820 -3.000 0.000 0.080 N NA
 3580969 3580970 NIS_1425 NIS_1426     TRUE 0.972 -10.000 0.286 1.000 Y NA
 3580970 3580971 NIS_1426 NIS_1427   pyrC FALSE 0.511 -10.000 0.000 1.000 N NA
 3580971 3580972 NIS_1427 NIS_1428 pyrC   TRUE 0.707 -9.000 0.018 1.000 N NA
 3580972 3580973 NIS_1428 NIS_1429     TRUE 0.744 9.000 0.000 1.000 N NA
 3580973 3580974 NIS_1429 NIS_1430     TRUE 0.744 9.000 0.000 1.000 N NA
 3580975 3580976 NIS_1431 NIS_1432     FALSE 0.181 82.000 0.000 1.000 N NA
 3580976 3580977 NIS_1432 NIS_1433     TRUE 0.984 1.000 0.337 1.000 N NA
 3580977 3580978 NIS_1433 NIS_1434     FALSE 0.310 66.000 0.000 1.000   NA
 3580978 3580979 NIS_1434 NIS_1435     TRUE 0.966 10.000 0.097 1.000   NA
 3580979 3580980 NIS_1435 NIS_1436     TRUE 0.858 -3.000 0.000 0.060   NA
 3580981 3580982 NIS_1437 NIS_1438     FALSE 0.161 232.000 0.000 NA   NA
 3580982 3580983 NIS_1438 NIS_1439     TRUE 0.618 -16.000 0.000 NA   NA
 3580983 3580984 NIS_1439 NIS_1440     FALSE 0.554 -3.000 0.000 1.000   NA
 3580984 3580985 NIS_1440 NIS_1441     FALSE 0.554 -3.000 0.000 1.000   NA
 3580985 3580986 NIS_1441 NIS_1442     FALSE 0.500 -7.000 0.000 1.000 N NA
 3580986 3580987 NIS_1442 NIS_1443     TRUE 0.866 164.000 0.041 0.013 Y NA
 3580987 3580988 NIS_1443 NIS_1444     TRUE 0.856 -3.000 0.025 NA Y NA
 3580988 3580989 NIS_1444 NIS_1445     TRUE 0.824 -3.000 0.017 NA Y NA
 3580989 3580990 NIS_1445 NIS_1446     TRUE 0.746 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 3580990 3580991 NIS_1446 NIS_1447     TRUE 0.783 0.000 0.000 1.000 N NA
 3580991 3580992 NIS_1447 NIS_1448     TRUE 0.909 -6.000 0.142 1.000 N NA
 3580992 3580993 NIS_1448 NIS_1449     TRUE 0.986 -3.000 0.096 0.013 Y NA
 3580993 3580994 NIS_1449 NIS_1450     TRUE 0.955 10.000 0.093 1.000 N NA
 3580994 3580995 NIS_1450 NIS_1451     FALSE 0.194 131.000 0.000 NA   NA
 3580995 3580996 NIS_1451 NIS_1452     TRUE 0.993 3.000 0.713 NA   NA
 3580996 3580997 NIS_1452 NIS_1453     TRUE 0.705 -12.000 0.009 1.000   NA
 3580998 3580999 NIS_1454 NIS_1455   rho FALSE 0.244 107.000 0.002 NA   NA
 3580999 3581000 NIS_1455 NIS_1456 rho   TRUE 0.895 6.000 0.023 1.000 N NA
 3581000 3581001 NIS_1456 NIS_1457     FALSE 0.529 23.000 0.004 1.000 N NA
 3581002 3581003 NIS_1458 NIS_1459     TRUE 0.727 -3.000 0.018 1.000   NA
 3581003 3581004 NIS_1459 NIS_1460     FALSE 0.554 -3.000 0.000 1.000   NA
 3581004 3581005 NIS_1460 NIS_1461     FALSE 0.118 153.000 0.000 1.000 N NA
 3581005 3581006 NIS_1461 NIS_1462   folC TRUE 0.856 -27.000 0.007 0.099 N NA
 3581006 3581007 NIS_1462 NIS_1463 folC   TRUE 0.896 -3.000 0.084 NA   NA
 3581007 3581008 NIS_1463 NIS_1464   leuS TRUE 0.931 3.000 0.031 NA   NA
 3581008 3581009 NIS_1464 NIS_1465 leuS secF TRUE 0.849 0.000 0.008 1.000 N NA
 3581009 3581010 NIS_1465 NIS_1466 secF secD TRUE 0.999 2.000 0.436 0.001 Y NA
 3581010 3581011 NIS_1466 NIS_1467 secD   TRUE 0.976 4.000 0.068 NA Y NA
 3581012 3581013 NIS_1468 NIS_1469   cysK FALSE 0.451 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3581013 3581014 NIS_1469 NIS_1470 cysK   TRUE 0.914 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3581014 3581015 NIS_1470 NIS_1471     TRUE 0.847 -10.000 0.032 NA   NA
 3581017 3581018 NIS_1473 NIS_1474     TRUE 0.810 -3.000 0.046 1.000 N NA
 3581018 3581019 NIS_1474 NIS_1475     FALSE 0.535 -3.000 0.005 1.000 N NA
 3581019 3581020 NIS_1475 NIS_1476   smpB TRUE 0.733 -3.000 0.028 1.000 N NA
 3581020 3581021 NIS_1476 NIS_1477 smpB   TRUE 0.675 11.000 0.000 1.000 N NA
 3581021 3581022 NIS_1477 NIS_1478     FALSE 0.451 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3581022 3581023 NIS_1478 NIS_1479     FALSE 0.482 -19.000 0.000 1.000 N NA
 3581024 3581025 NIS_1480 NIS_1481     TRUE 0.634 -10.000 0.000 NA   NA
 3581025 3581026 NIS_1481 NIS_1482     TRUE 0.734 12.000 0.000 NA   NA
 3581026 3581027 NIS_1482 NIS_1483     TRUE 0.930 6.000 0.029 1.000   NA
 3581027 3581028 NIS_1483 NIS_1484     TRUE 0.821 -3.000 0.033 NA   NA
 3581030 3581031 NIS_1486 NIS_1487     TRUE 0.687 636.000 0.029 0.023   NA
 3581031 3581032 NIS_1487 NIS_1488     TRUE 0.832 8.000 0.000 NA   NA
 3581032 3581033 NIS_1488 NIS_1489   fabI FALSE 0.282 77.000 0.000 NA   NA
 3581033 3581034 NIS_1489 NIS_1490 fabI tpiA TRUE 0.990 0.000 0.071 0.039 N NA
 3581034 3581035 NIS_1490 NIS_1491 tpiA pgk TRUE 0.839 -3.000 0.022 1.000 Y NA
 3581035 3581036 NIS_1491 NIS_1492 pgk   TRUE 0.951 -19.000 0.002 0.006 Y NA
 3581038 3581039 NIS_1494 NIS_1495   argS TRUE 0.876 2.000 0.008 NA   NA
 3581039 3581040 NIS_1495 NIS_1496 argS   TRUE 0.614 34.000 0.020 1.000 N NA
 3581040 3581041 NIS_1496 NIS_1497   gmk FALSE 0.219 69.000 0.000 1.000 N NA
 3581041 3581042 NIS_1497 NIS_1498 gmk   TRUE 0.816 3.000 0.000 NA   NA
 3581044 3581045 NIS_1500 NIS_1501 rplS trmD TRUE 0.984 -10.000 0.567 1.000 Y NA
 3581045 3581046 NIS_1501 NIS_1502 trmD   TRUE 0.984 -3.000 0.672 1.000 Y NA
 3581046 3581047 NIS_1502 NIS_1503     TRUE 0.984 3.000 0.324 1.000   NA
 3581047 3581048 NIS_1503 NIS_1504   rpsP TRUE 0.987 2.000 0.385 1.000   NA
 3581048 3581049 NIS_1504 NIS_1505 rpsP ffh TRUE 0.841 71.000 0.361 1.000 N NA
 3581049 3581050 NIS_1505 NIS_1506 ffh   FALSE 0.329 75.000 0.013 1.000 N NA
 3581050 3581051 NIS_1506 NIS_1507     TRUE 0.598 34.000 0.007 NA   NA
 3581051 3581052 NIS_1507 NIS_1508   kdtA TRUE 0.689 -10.000 0.005 NA   NA
 3581052 3581053 NIS_1508 NIS_1509 kdtA   TRUE 0.912 28.000 0.122 NA   NA
 3581053 3581054 NIS_1509 NIS_1510     TRUE 0.987 2.000 0.342 NA   NA
 3581054 3581055 NIS_1510 NIS_1511   glyQ TRUE 0.871 -10.000 0.041 NA   NA
 3581055 3581056 NIS_1511 NIS_1512 glyQ   FALSE 0.451 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3581056 3581057 NIS_1512 NIS_1513     TRUE 0.734 12.000 0.000 NA   NA
 3581057 3581058 NIS_1513 NIS_1514   purE TRUE 0.646 -16.000 0.002 NA   NA
 3581058 3581059 NIS_1514 NIS_1515 purE   TRUE 0.808 10.000 0.000 NA   NA
 3581059 3581060 NIS_1515 NIS_1516     TRUE 0.634 -10.000 0.000 NA   NA
 3581060 3581061 NIS_1516 NIS_1517     TRUE 0.828 5.000 0.000 NA   NA
 3581065 3581066 NIS_1521 NIS_1522     FALSE 0.451 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3581066 3581067 NIS_1522 NIS_1523     FALSE 0.451 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3581067 3581068 NIS_1523 NIS_1524     FALSE 0.528 -7.000 0.000 NA N NA
 3581068 3581069 NIS_1524 NIS_1525     FALSE 0.522 -16.000 0.000 NA N NA
 3581069 3581070 NIS_1525 NIS_1526     FALSE 0.479 -3.000 0.000 NA N NA
 3581070 3581071 NIS_1526 NIS_1527     TRUE 0.734 12.000 0.000 NA   NA
 3581071 3581072 NIS_1527 NIS_1528   alaS TRUE 0.889 9.000 0.011 NA   NA
 3581072 3581073 NIS_1528 NIS_1529 alaS   FALSE 0.318 44.000 0.000 1.000 N NA
 3581074 3581075 NIS_1530 NIS_1531 ftsW murG TRUE 0.928 -15.000 0.200 1.000 N NA
 3581076 3581077 NIS_1532 NIS_1533   panC TRUE 0.718 10.000 0.000 1.000 N NA
 3581079 3581080 NIS_1535 NIS_1536   tsf FALSE 0.256 140.000 0.019 1.000 N NA
 3581080 3581081 NIS_1536 NIS_1537 tsf rpsB TRUE 0.997 0.000 0.748 1.000 Y NA
 3581081 3581082 NIS_1537 NIS_1538 rpsB   FALSE 0.134 165.000 0.003 1.000 N NA
 3581082 3581083 NIS_1538 NIS_1539     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3581083 3581084 NIS_1539 NIS_1540     TRUE 0.624 -7.000 0.000 NA   NA
 3581084 3581085 NIS_1540 NIS_1541     FALSE 0.451 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3581086 3581087 NIS_1542 NIS_1543 ilvE   TRUE 0.958 10.000 0.098 1.000 N NA
 3581087 3581088 NIS_1543 NIS_1544   hisI TRUE 0.645 33.000 0.022 1.000 N NA
 3581088 3581089 NIS_1544 NIS_1545 hisI   TRUE 0.810 0.000 0.002 1.000 N NA
 3581090 3581091 NIS_1546 NIS_1547   purF TRUE 0.910 10.000 0.024 1.000   NA
 3581091 3581092 NIS_1547 NIS_1548 purF dapB TRUE 0.893 2.000 0.022 1.000 N NA
 3581092 3581093 NIS_1548 NIS_1549 dapB trxB TRUE 0.899 -6.000 0.013 0.042 N NA
 3581093 3581094 NIS_1549 NIS_1550 trxB trxA FALSE 0.461 117.000 0.035 1.000   NA
 3581094 3581095 NIS_1550 NIS_1551 trxA   TRUE 0.578 62.000 0.027 1.000   NA
 3581095 3581096 NIS_1551 NIS_1552   fdhF TRUE 0.878 0.000 0.005 1.000   NA
 3581096 3581097 NIS_1552 NIS_1553 fdhF   FALSE 0.238 88.000 0.000 1.000   NA
 3581097 3581098 NIS_1553 NIS_1554     TRUE 0.955 -3.000 0.202 1.000 Y NA
 3581098 3581099 NIS_1554 NIS_1555     TRUE 0.961 11.000 0.098 NA   NA
 3581099 3581100 NIS_1555 NIS_1556     TRUE 0.985 -6.000 0.882 NA   NA
 3581100 3581101 NIS_1556 NIS_1557     TRUE 0.844 -7.000 0.033 NA   NA
 3581101 3581102 NIS_1557 NIS_1558     TRUE 0.795 25.000 0.031 1.000   NA
 3581102 3581103 NIS_1558 NIS_1559   rpmE TRUE 0.944 0.000 0.031 1.000   NA
 3581104 3581105 NIS_1560 NIS_1561     TRUE 0.995 0.000 0.500 NA Y NA
 3581106 3581107 NIS_1562 NIS_1563     TRUE 0.989 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 3581107 3581108 NIS_1563 NIS_1564     FALSE 0.554 -3.000 0.000 1.000   NA
 3581108 3581109 NIS_1564 NIS_1565     TRUE 0.602 -7.000 0.000 1.000   NA
 3581109 3581110 NIS_1565 NIS_1566     TRUE 0.845 0.000 0.000 1.000   NA
 3581110 3581111 NIS_1566 NIS_1567     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3581111 3581112 NIS_1567 NIS_1568     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3581112 3581113 NIS_1568 NIS_1569     TRUE 0.967 -3.000 0.500 NA   NA
 3581113 3581114 NIS_1569 NIS_1570     FALSE 0.145 469.000 0.000 NA   NA
 3581114 3581115 NIS_1570 NIS_1571     TRUE 0.984 -3.000 1.000 NA   NA
 3581115 3581116 NIS_1571 NIS_1572     TRUE 0.996 0.000 1.000 NA   NA
 3581116 3581117 NIS_1572 NIS_1573     TRUE 0.978 -3.000 0.750 NA   NA
 3581117 3581118 NIS_1573 NIS_1574     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3581118 3581119 NIS_1574 NIS_1575     TRUE 0.857 0.000 0.000 NA   NA
 3581119 3581120 NIS_1575 NIS_1576     TRUE 0.925 -55.000 0.174 NA   NA
 3581120 3581121 NIS_1576 NIS_1577     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3581123 3581124 NIS_1579 NIS_1580     TRUE 0.718 10.000 0.000 1.000 N NA
 3581124 3581125 NIS_1580 NIS_1581     TRUE 0.901 -3.000 0.139 NA N NA
 3581125 3581126 NIS_1581 NIS_1582   moaA TRUE 0.928 0.000 0.028 NA N NA
 3581126 3581127 NIS_1582 NIS_1583 moaA   FALSE 0.242 99.000 0.011 1.000 N NA
 3581127 3581128 NIS_1583 NIS_1584     TRUE 0.998 0.000 0.103 0.002 Y NA
 3581128 3581129 NIS_1584 NIS_1585     TRUE 0.996 10.000 0.093 0.002 Y NA
 3581129 3581130 NIS_1585 NIS_1586     TRUE 0.785 77.000 0.167 NA   NA
 3581130 3581131 NIS_1586 NIS_1587   gidA FALSE 0.231 158.000 0.006 NA   NA
 3581134 3581135 NIS_1590 NIS_1591     FALSE 0.397 52.000 0.000 NA   NA
 3581135 3581136 NIS_1591 NIS_1592     TRUE 0.996 0.000 0.643 NA Y NA
 3581136 3581137 NIS_1592 NIS_1593     TRUE 0.986 -12.000 0.625 1.000 Y NA
 3581137 3581138 NIS_1593 NIS_1594     TRUE 0.993 3.000 0.500 NA Y NA
 3581138 3581139 NIS_1594 NIS_1595     TRUE 0.740 10.000 0.000 NA N NA
 3581140 3581141 NIS_1596 NIS_1597     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3581141 3581142 NIS_1597 NIS_1598     TRUE 0.634 -10.000 0.000 NA   NA
 3581142 3581143 NIS_1598 NIS_1599     TRUE 0.618 -16.000 0.000 NA   NA
 3581143 3581144 NIS_1599 NIS_1600     TRUE 0.875 1.000 0.004 NA   NA
 3581144 3581145 NIS_1600 NIS_1601     TRUE 0.923 1.000 0.019 NA   NA
 3581145 3581146 NIS_1601 NIS_1602     FALSE 0.093 433.000 0.000 1.000 N NA
 3581146 3581147 NIS_1602 NIS_1603     TRUE 0.996 13.000 0.268 0.002 Y NA
 3581147 3581148 NIS_1603 NIS_1604     TRUE 0.997 11.000 0.160 0.002 Y NA
 3581148 3581149 NIS_1604 NIS_1605     TRUE 0.992 11.000 0.034 0.002 Y NA
 3581149 3581150 NIS_1605 NIS_1606     FALSE 0.559 149.000 0.077 1.000   NA
 3581150 3581151 NIS_1606 NIS_1607     TRUE 0.866 -3.000 0.058 1.000   NA
 3581151 3581152 NIS_1607 NIS_1608     FALSE 0.479 -3.000 0.000 NA N NA
 3581152 3581153 NIS_1608 NIS_1609   rpsI FALSE 0.331 46.000 0.000 NA N NA
 3581153 3581154 NIS_1609 NIS_1610 rpsI rplM TRUE 0.997 2.000 0.231 0.022 Y NA
 3581154 3581155 NIS_1610 NIS_1611 rplM   FALSE 0.312 70.000 0.000 NA   NA
 3581155 3581156 NIS_1611 NIS_1612     TRUE 0.950 -3.000 0.312 NA   NA
 3581156 3581157 NIS_1612 NIS_1613     FALSE 0.195 126.000 0.000 NA   NA
 3581157 3581158 NIS_1613 NIS_1614     TRUE 0.830 2.000 0.000 NA   NA
 3581158 3581159 NIS_1614 NIS_1615   ccoP TRUE 0.986 2.000 0.316 NA   NA
 3581159 3581160 NIS_1615 NIS_1616 ccoP ccoQ TRUE 0.996 0.000 0.143 0.002 N NA
 3581160 3581161 NIS_1616 NIS_1617 ccoQ ccoO TRUE 0.999 4.000 0.738 0.002 N NA
 3581161 3581162 NIS_1617 NIS_1618 ccoO ccoN TRUE 0.996 10.000 0.283 0.002 N NA
 3581162 3581163 NIS_1618 NIS_1619 ccoN   FALSE 0.488 119.000 0.062 1.000 N NA
 3581163 3581164 NIS_1619 NIS_1620     TRUE 0.990 -10.000 0.133 0.014 Y NA
 3581164 3581165 NIS_1620 NIS_1621     FALSE 0.483 21.000 0.000 1.000 N NA
 3581165 3581166 NIS_1621 NIS_1622     FALSE 0.182 153.000 0.000 NA   NA
 3581166 3581167 NIS_1622 NIS_1623   carA TRUE 0.857 0.000 0.000 NA   NA
 3581167 3581168 NIS_1623 NIS_1624 carA   TRUE 0.839 -3.000 0.041 NA   NA
 3581168 3581169 NIS_1624 NIS_1625   purA TRUE 0.842 10.000 0.004 NA   NA
 3581169 3581170 NIS_1625 NIS_1626 purA   TRUE 0.976 0.000 0.161 1.000 N NA
 3581170 3581171 NIS_1626 NIS_1627     TRUE 0.911 2.000 0.030 1.000 N NA
 3581171 3581172 NIS_1627 NIS_1628     FALSE 0.155 111.000 0.000 NA N NA
 3581172 3581173 NIS_1628 NIS_1629     FALSE 0.382 56.000 0.000 NA   NA
 3581173 3581174 NIS_1629 NIS_1630     TRUE 0.590 -3.000 0.003 1.000   NA
 3581176 3581177 NIS_1632 NIS_1633     TRUE 0.758 11.000 0.000 1.000   NA
 3581179 3581180 NIS_1635 NIS_1636     TRUE 0.994 2.000 0.501 1.000 Y NA
 3581181 3581182 NIS_1637 NIS_1638     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3581182 3581183 NIS_1638 NIS_1639     TRUE 0.964 -3.000 0.600 1.000 N NA
 3581184 3581185 NIS_1640 NIS_1641   gltX TRUE 0.690 -3.000 0.021 1.000 N NA
 3581186 3581187 NIS_1642 NIS_1643     TRUE 0.793 10.000 0.000 1.000   NA
 3581188 3581189 NIS_1644 NIS_1645 accC accB TRUE 0.997 1.000 0.071 0.002 Y NA
 3581191 3581192 NIS_1647 NIS_1648     FALSE 0.200 75.000 0.000 1.000 N NA
 3581192 3581193 NIS_1648 NIS_1649     FALSE 0.107 212.000 0.000 1.000 N NA
 3581193 3581194 NIS_1649 NIS_1650     TRUE 0.783 0.000 0.000 1.000 N NA
 3581195 3581196 NIS_1651 NIS_1652 topA   FALSE 0.554 -3.000 0.000 1.000   NA
 3581196 3581197 NIS_1652 NIS_1653   bioB FALSE 0.554 -3.000 0.000 1.000   NA
 3581197 3581198 NIS_1653 NIS_1654 bioB   TRUE 0.696 -7.000 0.017 1.000 N NA
 3581199 3581200 NIS_1655 NIS_1656     TRUE 0.980 -3.000 0.788 NA   NA
 3581200 3581201 NIS_1656 NIS_1657   eno TRUE 0.966 4.000 0.080 NA   NA
 3581201 3581202 NIS_1657 NIS_1658 eno recA TRUE 0.893 11.000 0.033 1.000 N NA
 3581203 3581204 NIS_1659 NIS_1660     TRUE 0.734 12.000 0.000 NA   NA
 3581204 3581205 NIS_1660 NIS_1661     FALSE 0.494 -16.000 0.000 1.000 N NA
 3581206 3581207 NIS_1662 NIS_1663 tpx   FALSE 0.341 125.000 0.004 1.000 Y NA
 3581207 3581208 NIS_1663 NIS_1664     TRUE 0.614 -3.000 0.003 NA   NA
 3581208 3581209 NIS_1664 NIS_1665     TRUE 0.624 -7.000 0.000 NA   NA
 3581209 3581210 NIS_1665 NIS_1666   ispC TRUE 0.618 -16.000 0.000 NA   NA
 3581210 3581211 NIS_1666 NIS_1667 ispC cdsA TRUE 0.955 -3.000 0.372 1.000   NA
 3581211 3581212 NIS_1667 NIS_1668 cdsA   TRUE 0.742 13.000 0.004 NA   NA
 3581213 3581214 NIS_1669 NIS_1670 leuC sfsA FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3581214 3581215 NIS_1670 NIS_1671 sfsA   TRUE 0.588 24.000 0.000 NA   NA
 3581215 3581216 NIS_1671 NIS_1672     TRUE 0.979 -10.000 0.800 1.000 N NA
 3581216 3581217 NIS_1672 NIS_1673     TRUE 0.948 -22.000 0.133 1.000 Y NA
 3581217 3581218 NIS_1673 NIS_1674     TRUE 0.982 -3.000 0.125 0.078 Y NA
 3581218 3581219 NIS_1674 NIS_t41   trnR_Pro FALSE 0.207 116.000 0.000 NA   NA
 3581219 3581220 NIS_t41 NIS_1675 trnR_Pro   FALSE 0.150 332.000 0.000 NA   NA
 3581220 3581221 NIS_1675 NIS_1676     FALSE 0.479 154.000 0.000 0.096   NA
 3581221 3581222 NIS_1676 NIS_1677     TRUE 0.857 0.000 0.000 NA   NA
 3581222 3581223 NIS_1677 NIS_1678     TRUE 0.697 13.000 0.000 NA   NA
 3581224 3581225 NIS_1679 NIS_1680     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3581225 3581226 NIS_1680 NIS_1681     TRUE 0.634 -10.000 0.000 NA   NA
 3581228 3581229 NIS_1683 NIS_1684     TRUE 0.774 11.000 0.000 NA   NA
 3581229 3581230 NIS_1684 NIS_1685     TRUE 0.629 18.000 0.000 NA   NA
 3581230 3581231 NIS_1685 NIS_1686     TRUE 0.616 20.000 0.000 NA   NA
 3581231 3581232 NIS_1686 NIS_1687     TRUE 0.601 22.000 0.000 NA   NA
 3581232 3581233 NIS_1687 NIS_1688     FALSE 0.388 55.000 0.000 NA   NA
 3581233 3581234 NIS_1688 NIS_1689     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3581234 3581235 NIS_1689 NIS_1690     FALSE 0.496 37.000 0.000 NA   NA
 3581235 3581236 NIS_1690 NIS_1691     FALSE 0.134 447.000 0.000 1.000   NA
 3581236 3581237 NIS_1691 NIS_1692     FALSE 0.142 594.000 0.000 NA   NA
 3581238 3581239 NIS_t42 NIS_1693 trnS_Thr   FALSE 0.248 90.000 0.000 NA   NA
 3581239 3581240 NIS_1693 NIS_1694     TRUE 0.978 12.000 0.372 NA   NA
 3581240 3581241 NIS_1694 NIS_1695     TRUE 0.981 13.000 0.516 NA   NA
 3581241 3581242 NIS_1695 NIS_1696     TRUE 0.905 23.000 0.087 NA   NA
 3581242 3581243 NIS_1696 NIS_1697     TRUE 0.989 2.000 0.414 NA   NA
 3581243 3581244 NIS_1697 NIS_1698     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3581244 3581245 NIS_1698 NIS_t43   trnT_Lys TRUE 0.734 12.000 0.000 NA   NA
 3581247 3581248 NIS_1700 NIS_1701     TRUE 0.634 -10.000 0.000 NA   NA
 3581249 3581250 NIS_1702 NIS_1703     FALSE 0.147 415.000 0.000 NA   NA
 3581250 3581251 NIS_1703 NIS_1704     TRUE 0.965 -10.000 0.000 0.001 Y NA
 3581251 3581252 NIS_1704 NIS_1705     FALSE 0.108 193.000 0.000 1.000 N NA
 3581252 3581253 NIS_1705 NIS_1706     TRUE 0.965 4.000 0.087 1.000   NA
 3581253 3581254 NIS_1706 NIS_1707     TRUE 0.894 -3.000 0.091 1.000   NA
 3581254 3581255 NIS_1707 NIS_1708   radC TRUE 0.783 0.000 0.000 1.000 N NA
 3581256 3581257 NIS_1709 NIS_1710 deaD   FALSE 0.483 38.000 0.000 NA   NA
 3581257 3581258 NIS_1710 NIS_1711     TRUE 0.618 -16.000 0.000 NA   NA
 3581260 3581261 NIS_1713 NIS_1714     TRUE 0.744 9.000 0.000 1.000 N NA
 3581261 3581262 NIS_1714 NIS_1715     TRUE 0.707 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3581262 3581263 NIS_1715 NIS_1716     FALSE 0.144 487.000 0.000 NA   NA
 3581263 3581264 NIS_1716 NIS_1717     TRUE 0.816 3.000 0.000 NA   NA
 3581265 3581266 NIS_1718 NIS_1719     FALSE 0.554 -3.000 0.000 1.000   NA
 3581266 3581267 NIS_1719 NIS_1720     TRUE 0.927 -3.000 0.267 1.000 N NA
 3581267 3581268 NIS_1720 NIS_1721     TRUE 0.965 3.000 0.133 1.000 N NA
 3581269 3581270 NIS_1722 NIS_1723     TRUE 0.746 2.000 0.000 1.000 N NA
 3581270 3581271 NIS_1723 NIS_1724     TRUE 0.883 8.000 0.011 1.000   NA
 3581271 3581272 NIS_1724 NIS_1725     TRUE 0.721 -13.000 0.011 1.000   NA
 3581272 3581273 NIS_1725 NIS_1726     TRUE 0.992 -3.000 0.667 0.095   NA
 3581273 3581274 NIS_1726 NIS_1727     TRUE 0.898 -3.000 0.000 0.004 N NA
 3581274 3581275 NIS_1727 NIS_1728     TRUE 0.847 1.000 0.000 NA   NA
 3581275 3581276 NIS_1728 NIS_1729     TRUE 0.808 10.000 0.000 NA   NA
 3581276 3581277 NIS_1729 NIS_1730     TRUE 0.847 1.000 0.000 NA   NA
 3581277 3581278 NIS_1730 NIS_1731     FALSE 0.179 158.000 0.000 NA   NA
 3581279 3581280 NIS_1732 NIS_1733     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3581282 3581283 NIS_1735 NIS_1736     TRUE 0.633 -9.000 0.000 NA   NA
 3581283 3581284 NIS_1736 NIS_1737     TRUE 0.847 1.000 0.000 NA   NA
 3581284 3581285 NIS_1737 NIS_1738     TRUE 0.847 1.000 0.000 NA   NA
 3581285 3581286 NIS_1738 NIS_1739     FALSE 0.287 76.000 0.000 NA   NA
 3581287 3581288 NIS_1740 NIS_1741     TRUE 0.962 -18.000 0.008 0.005 Y NA
 3581288 3581289 NIS_1741 NIS_1742     TRUE 0.808 10.000 0.000 NA   NA
 3581289 3581290 NIS_1742 NIS_1743     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3581291 3581292 NIS_1744 NIS_1745     TRUE 0.624 -7.000 0.000 NA   NA
 3581293 3581294 NIS_1746 NIS_1747     TRUE 0.671 14.000 0.000 NA   NA
 3581294 3581295 NIS_1747 NIS_1748     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3581295 3581296 NIS_1748 NIS_1749     FALSE 0.313 65.000 0.000 1.000   NA
 3581296 3581297 NIS_1749 NIS_1750     TRUE 0.953 -3.000 0.000 0.002 Y NA
 3581297 3581298 NIS_1750 NIS_1751     FALSE 0.510 -9.000 0.000 1.000 N NA
 3581299 3581300 NIS_1752 NIS_1753     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3581300 3581301 NIS_1753 NIS_1754     TRUE 0.982 -6.000 0.538 1.000 Y NA
 3581301 3581302 NIS_1754 NIS_1755     TRUE 0.845 0.000 0.000 1.000   NA
 3581302 3581303 NIS_1755 NIS_1756     FALSE 0.480 36.000 0.000 1.000   NA
 3581304 3581305 NIS_1757 NIS_1758     FALSE 0.451 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3581306 3581307 NIS_1759 NIS_1760     FALSE 0.479 -3.000 0.000 NA N NA
 3581307 3581308 NIS_1760 NIS_1761     TRUE 0.813 64.000 0.214 NA N NA
 3581309 3581310 NIS_1762 NIS_1763     TRUE 0.885 -7.000 0.000 0.047   NA
 3581310 3581311 NIS_1763 NIS_1764   upp FALSE 0.451 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3581311 3581312 NIS_1764 NIS_1765 upp   FALSE 0.554 -3.000 0.000 1.000   NA
 3581313 3581314 NIS_1766 NIS_1767     FALSE 0.545 -55.000 0.000 1.000   NA
 3581314 3581315 NIS_1767 NIS_1768     TRUE 0.919 -10.000 0.096 1.000   NA
 3581315 3581316 NIS_1768 NIS_1769     FALSE 0.448 39.000 0.000 1.000   NA
 3581316 3581317 NIS_1769 NIS_1770     TRUE 0.903 -18.000 0.076 NA   NA
 3581317 3581318 NIS_1770 NIS_1771   nrdD TRUE 0.918 -3.000 0.133 NA   NA
 3581318 3581319 NIS_1771 NIS_1772 nrdD   FALSE 0.200 75.000 0.000 1.000 N NA
 3581321 3581322 NIS_1774 NIS_1775     TRUE 0.821 4.000 0.000 NA   NA
 3581322 3581323 NIS_1775 NIS_1776     TRUE 0.873 -10.000 0.042 NA   NA
 3581324 3581325 NIS_1777 NIS_1778     TRUE 0.973 0.000 0.077 NA   NA
 3581326 3581327 NIS_1779 NIS_1780     TRUE 0.927 12.000 0.051 NA   NA
 3581327 3581328 NIS_1780 NIS_1781     TRUE 0.863 -3.000 0.051 NA   NA
 3581328 3581329 NIS_1781 NIS_1782     TRUE 0.907 -13.000 0.071 NA   NA
 3581329 3581330 NIS_1782 NIS_1783     TRUE 0.938 -3.000 0.333 1.000 N NA
 3581330 3581331 NIS_1783 NIS_1784     TRUE 0.952 11.000 0.000 0.027   NA
 3581331 3581332 NIS_1784 NIS_1785     TRUE 0.890 -3.000 0.000 0.020   NA
 3581332 3581333 NIS_1785 NIS_1786     TRUE 0.960 3.000 0.000 0.031   NA
 3581333 3581334 NIS_1786 NIS_1787     FALSE 0.554 -3.000 0.000 1.000   NA
 3581334 3581335 NIS_1787 NIS_1788     TRUE 0.855 -84.000 0.051 NA   NA
 3581335 3581336 NIS_1788 NIS_1789     TRUE 0.723 190.000 0.281 NA   NA
 3581336 3581337 NIS_1789 NIS_1790     FALSE 0.095 370.000 0.000 1.000 N NA
 3581337 3581338 NIS_1790 NIS_1791     TRUE 0.904 18.000 0.075 1.000   NA
 3581338 3581339 NIS_1791 NIS_1792     TRUE 0.614 241.000 0.151 1.000   NA
 3581339 3581340 NIS_1792 NIS_1793     TRUE 0.971 0.000 0.075 1.000   NA
 3581340 3581341 NIS_1793 NIS_1794     TRUE 0.947 105.000 0.188 0.002   NA
 3581341 3581342 NIS_1794 NIS_1795     FALSE 0.462 266.000 0.000 0.020 N NA
 3581342 3581343 NIS_1795 NIS_1796     TRUE 0.995 -37.000 0.500 0.001   NA
 3581343 3581344 NIS_1796 NIS_1797     TRUE 0.971 13.000 0.333 NA   NA
 3581345 3581346 NIS_1798 NIS_1799     FALSE 0.565 24.000 0.000 1.000   NA
 3581347 3581348 NIS_1800 NIS_1801     FALSE 0.231 90.000 0.000 1.000   NA
 3581348 3581349 NIS_1801 NIS_1802     TRUE 0.971 10.000 0.139 1.000   NA
 3581349 3581350 NIS_1802 NIS_1803     TRUE 0.909 -3.000 0.000 0.006   NA
 3581350 3581351 NIS_1803 NIS_1804   napF TRUE 0.973 2.000 0.000 0.006   NA
 3581351 3581352 NIS_1804 NIS_1805 napF   TRUE 0.997 0.000 0.174 0.006   NA
 3581352 3581353 NIS_1805 NIS_1806   napH TRUE 0.998 2.000 0.385 0.006 Y NA
 3581353 3581354 NIS_1806 NIS_1807 napH napG TRUE 0.997 -7.000 0.795 0.006   NA
 3581354 3581355 NIS_1807 NIS_1808 napG napA TRUE 0.991 19.000 0.270 0.006   NA
 3581357 3581358 NIS_1810 NIS_1811     FALSE 0.164 215.000 0.000 NA   NA
 3581358 3581359 NIS_1811 NIS_1812     TRUE 0.980 -7.000 0.667 NA   NA
 3581359 3581360 NIS_1812 NIS_1813     TRUE 0.976 15.000 0.500 NA   NA
 3581360 3581361 NIS_1813 NIS_1814     FALSE 0.317 69.000 0.000 NA   NA
 3581361 3581362 NIS_1814 NIS_1815     TRUE 0.887 -10.000 0.000 0.056   NA
 3581362 3581363 NIS_1815 NIS_1816     TRUE 0.931 101.000 1.000 NA   NA
 3581363 3581364 NIS_1816 NIS_1817     TRUE 0.904 -3.000 0.095 NA   NA
 3581364 3581365 NIS_1817 NIS_1818     TRUE 0.992 -3.000 0.583 0.031   NA
 3581365 3581366 NIS_1818 NIS_1819     TRUE 0.734 12.000 0.000 NA   NA
 3581366 3581367 NIS_1819 NIS_1820     TRUE 0.697 13.000 0.000 NA   NA
 3581368 3581369 NIS_1821 NIS_1822     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3581369 3581370 NIS_1822 NIS_1823     TRUE 0.808 10.000 0.000 NA   NA
 3581371 3581372 NIS_1824 NIS_1825     TRUE 0.982 11.000 0.364 NA   NA
 3581372 3581373 NIS_1825 NIS_1826     FALSE 0.576 -3.000 0.000 NA   NA
 3581373 3581374 NIS_1826 NIS_1827     TRUE 0.815 9.000 0.000 1.000   NA
 3581374 3581375 NIS_1827 NIS_1828     TRUE 0.954 16.000 0.250 1.000   NA
 3581375 3581376 NIS_1828 NIS_1829     TRUE 0.986 4.000 0.375 1.000   NA
 3581376 3581377 NIS_1829 NIS_1830     TRUE 0.994 4.000 0.750 NA   NA
 3581377 3581378 NIS_1830 NIS_1831     TRUE 0.978 19.000 0.625 NA   NA
 3581378 3581379 NIS_1831 NIS_1832     TRUE 0.992 0.000 0.500 NA   NA
 3581379 3581380 NIS_1832 NIS_1833     TRUE 0.806 74.000 0.200 1.000   NA
 3581380 3581381 NIS_1833 NIS_1834     TRUE 0.978 -10.000 0.400 1.000 Y NA
 3581381 3581382 NIS_1834 NIS_1835     TRUE 0.984 -3.000 1.000 NA   NA
 3581382 3581383 NIS_1835 NIS_1836     FALSE 0.159 249.000 0.000 NA   NA
 3581383 3581384 NIS_1836 NIS_r07   rrnC_5S FALSE 0.153 297.000 0.000 NA   NA
 3581384 3581385 NIS_r07 NIS_r08 rrnC_5S rrnC_23S FALSE 0.202 118.000 0.000 NA   NA
 3581385 3581386 NIS_r08 NIS_t44 rrnC_23S trnU_Ala FALSE 0.169 178.000 0.000 NA   NA
 3581386 3581387 NIS_t44 NIS_t45 trnU_Ala trnU_Ile FALSE 0.242 93.000 0.000 NA   NA
 3581387 3581388 NIS_t45 NIS_r09 trnU_Ile rrnC_16S FALSE 0.173 173.000 0.000 NA   NA
 3581389 3581390 NIS_1837 NIS_1838     TRUE 0.906 -7.000 0.072 NA   NA
 3581391 3581392 NIS_1839 NIS_1840     TRUE 0.633 -12.000 0.000 NA   NA
 3581393 3581394 NIS_1841 NIS_1842     FALSE 0.566 -28.000 0.007 1.000 N NA
 3581394 3581395 NIS_1842 NIS_1843   frr TRUE 0.605 -13.000 0.007 1.000 N NA
 3581395 3581396 NIS_1843 NIS_1844 frr   FALSE 0.101 254.000 0.000 1.000 N NA
 3581396 3581397 NIS_1844 NIS_1845     TRUE 0.832 8.000 0.000 NA   NA
 3581397 3581398 NIS_1845 NIS_1846     TRUE 0.797 -16.000 0.022 NA   NA
 3581398 3581399 NIS_1846 NIS_1847     TRUE 0.618 -16.000 0.000 NA   NA
 3581400 3581401 NIS_1848 NIS_1849   nfnB TRUE 0.758 11.000 0.000 1.000   NA
 3581401 3581402 NIS_1849 NIS_1850 nfnB   TRUE 0.624 -7.000 0.000 NA   NA
 3581402 3581403 NIS_1850 NIS_1851     TRUE 0.774 11.000 0.000 NA   NA
 3581405 3581406 NIS_1853 NIS_1854 dgt   TRUE 0.607 -13.000 0.000 1.000   NA
 3581407 3581408 NIS_1855 NIS_1856     FALSE 0.554 -3.000 0.000 1.000   NA