MicrobesOnline Operon Predictions for Roseobacter denitrificans OCh 114

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 2023772 2023773 RD1_0003 RD1_0004     TRUE 0.734 77.000 0.438 NA   NA
 2023773 2023774 RD1_0004 RD1_0005   vanB TRUE 0.973 -3.000 0.565 NA   NA
 2023774 2023775 RD1_0005 RD1_0006 vanB   TRUE 0.951 12.000 0.543 NA   NA
 2023778 2023779 RD1_0009 RD1_0010 soxG soxA TRUE 0.984 -7.000 0.929 0.005   NA
 2023779 2023780 RD1_0010 RD1_0011 soxA soxD TRUE 0.988 -3.000 0.467 0.003   NA
 2023780 2023781 RD1_0011 RD1_0012 soxD soxB TRUE 0.994 13.000 0.875 0.003 Y NA
 2023782 2023783 RD1_0013 RD1_0014 opuAC opuAA TRUE 0.920 82.000 0.750 1.000 Y NA
 2023783 2023784 RD1_0014 RD1_0015 opuAA opuAB TRUE 0.978 0.000 0.350 1.000 N NA
 2023785 2023786 RD1_0016 RD1_0017 rluA   TRUE 0.718 31.000 0.109 1.000 N NA
 2023786 2023787 RD1_0017 RD1_0018     TRUE 0.876 30.000 0.117 1.000 Y NA
 2023787 2023788 RD1_0018 RD1_0019     TRUE 0.967 -3.000 0.117 1.000 Y NA
 2023788 2023789 RD1_0019 RD1_0020     TRUE 0.913 2.000 0.095 NA   NA
 2023789 2023790 RD1_0020 RD1_0021     TRUE 0.676 -31.000 0.143 NA   NA
 2023790 2023791 RD1_0021 RD1_0022     TRUE 0.959 -3.000 0.290 1.000 N NA
 2023793 2023794 RD1_0024 RD1_0025     FALSE 0.356 49.000 0.025 NA N NA
 2023795 2023796 RD1_0026 RD1_0027   rsbW TRUE 0.983 12.000 0.621 1.000 Y NA
 2023796 2023797 RD1_0027 RD1_0028 rsbW ggtA FALSE 0.036 263.000 0.103 1.000 N NA
 2023799 2023800 RD1_0030 RD1_0031     FALSE 0.422 71.000 0.090 NA   NA
 2023801 2023802 RD1_0032 RD1_0033 lolA ftsK FALSE 0.122 138.000 0.043 1.000 N NA
 2023802 2023803 RD1_0033 RD1_0034 ftsK   TRUE 0.932 6.000 0.157 1.000 N NA
 2023803 2023804 RD1_0034 RD1_0035     FALSE 0.371 109.000 0.110 1.000 N NA
 2023806 2023807 RD1_0037 RD1_0038   lonD TRUE 0.911 -3.000 0.148 NA   NA
 2023807 2023808 RD1_0038 RD1_0039 lonD trx TRUE 0.814 28.000 0.222 1.000   NA
 2023808 2023809 RD1_0039 RD1_0041 trx xth TRUE 0.623 55.000 0.117 1.000 N NA
 2023809 2023810 RD1_0041 RD1_0042 xth mtrA FALSE 0.070 261.000 0.070 0.051 N NA
 2023811 2023812 RD1_0043 RD1_0044 ribA   TRUE 0.894 -3.000 0.116 NA   NA
 2023813 2023814 RD1_0046 RD1_0047     FALSE 0.127 99.000 0.013 NA   NA
 2023815 2023816 RD1_0048 RD1_0049   leuS FALSE 0.165 114.000 0.051 NA   NA
 2023816 2023817 RD1_0049 RD1_0050 leuS   TRUE 0.663 -13.000 0.090 NA   NA
 2023817 2023818 RD1_0050 RD1_0052     TRUE 0.879 -3.000 0.097 NA   NA
 2023818 2023819 RD1_0052 RD1_0053     TRUE 0.581 19.000 0.015 1.000 N NA
 2023820 2023821 RD1_0054 RD1_0055     TRUE 0.802 -3.000 0.045 NA   NA
 2023821 2023822 RD1_0055 RD1_0056     FALSE 0.295 104.000 0.091 NA   NA
 2023822 2023823 RD1_0056 RD1_0057     FALSE 0.425 65.000 0.043 1.000 N NA
 2023823 2023824 RD1_0057 RD1_0058     TRUE 0.900 13.000 0.213 1.000 N NA
 2023824 2023825 RD1_0058 RD1_0059   mtgA FALSE 0.510 56.000 0.075 1.000   NA
 2023825 2023826 RD1_0059 RD1_0060 mtgA gltB FALSE 0.206 110.000 0.041 1.000   NA
 2023826 2023827 RD1_0060 RD1_0061 gltB   TRUE 0.815 -3.000 0.030 1.000   NA
 2023827 2023828 RD1_0061 RD1_0062     TRUE 0.983 -3.000 0.250 0.001   NA
 2023828 2023829 RD1_0062 RD1_0063   gltD FALSE 0.161 131.000 0.070 1.000   NA
 2023832 2023833 RD1_0067 RD1_0068     FALSE 0.001 412.000 0.000 NA   NA
 2023833 2023834 RD1_0068 RD1_0069     FALSE 0.090 55.000 0.000 NA   NA
 2023836 2023837 RD1_0071 RD1_0072     TRUE 0.987 4.000 0.286 0.001   NA
 2023837 2023838 RD1_0072 RD1_0073     TRUE 0.987 11.000 0.806 NA Y NA
 2023838 2023839 RD1_0073 RD1_0074   dld FALSE 0.280 126.000 0.021 NA Y NA
 2023840 2023841 RD1_0075 RD1_0076     TRUE 0.672 -42.000 0.160 NA   NA
 2023841 2023842 RD1_0076 RD1_0077   pqiB TRUE 0.954 -7.000 0.819 NA   NA
 2023842 2023843 RD1_0077 RD1_0078 pqiB   TRUE 0.949 1.000 0.185 NA   NA
 2023846 2023847 RD1_0081 RD1_0082     FALSE 0.255 13.000 0.000 NA   NA
 2023849 2023850 RD1_0084 RD1_0085     TRUE 0.940 2.000 0.102 1.000 N NA
 2023850 2023851 RD1_0085 RD1_0086     TRUE 0.942 -3.000 0.254 NA   NA
 2023854 2023855 RD1_0089 RD1_0090   dapE TRUE 0.839 38.000 0.097 1.000 Y NA
 2023856 2023857 RD1_0091 RD1_0093 panC panB TRUE 0.995 -3.000 0.395 0.001 Y NA
 2023858 2023859 RD1_0094 RD1_0095     FALSE 0.017 135.000 0.000 NA   NA
 2023861 2023862 RD1_0097 RD1_0098   linX TRUE 0.885 16.000 0.105 0.084   NA
 2023862 2023863 RD1_0098 RD1_0099 linX   TRUE 0.853 -3.000 0.039 1.000 N NA
 2023863 2023864 RD1_0099 RD1_0100     TRUE 0.814 2.000 0.018 NA N NA
 2023865 2023866 RD1_0101 RD1_0102 dxs pufC FALSE 0.066 222.000 0.139 1.000   NA
 2023866 2023867 RD1_0102 RD1_0103 pufC pufM TRUE 0.993 3.000 0.526 0.003   NA
 2023867 2023868 RD1_0103 RD1_0104 pufM pufL TRUE 0.996 2.000 0.895 0.003   NA
 2023870 2023871 RD1_0106 RD1_0107 pufA pufB TRUE 0.988 13.000 0.946 0.003   NA
 2023871 2023872 RD1_0107 RD1_0108 pufB pufQ FALSE 0.183 182.000 0.324 1.000   NA
 2023872 2023873 RD1_0108 RD1_0109 pufQ bchZ TRUE 0.946 18.000 0.231 0.003   NA
 2023873 2023874 RD1_0109 RD1_0110 bchZ bchY TRUE 0.904 89.000 0.632 0.003   NA
 2023874 2023875 RD1_0110 RD1_0111 bchY bchX FALSE 0.408 199.000 0.491 0.003   NA
 2023875 2023876 RD1_0111 RD1_0112 bchX bchC TRUE 0.994 -3.000 0.882 0.003 N NA
 2023876 2023877 RD1_0112 RD1_0113 bchC crtF FALSE 0.565 128.000 0.627 1.000   NA
 2023877 2023878 RD1_0113 RD1_0114 crtF crtE TRUE 0.942 14.000 0.500 1.000   NA
 2023879 2023880 RD1_0115 RD1_0116 crtD crtC TRUE 0.934 -150.000 0.434 0.001   NA
 2023880 2023881 RD1_0116 RD1_0117 crtC   FALSE 0.101 134.000 0.033 1.000   NA
 2023882 2023883 RD1_0118 RD1_0119 crtK crtB TRUE 0.662 24.000 0.050 1.000 N NA
 2023883 2023884 RD1_0119 RD1_0120 crtB ctrI TRUE 0.963 -3.000 0.332 1.000 N NA
 2023885 2023886 RD1_0121 RD1_0122 crtA bchI TRUE 0.902 -3.000 0.131 NA   NA
 2023886 2023887 RD1_0122 RD1_0123 bchI bchD TRUE 0.995 -3.000 0.465 0.002 Y NA
 2023887 2023888 RD1_0123 RD1_0124 bchD bchO TRUE 0.985 1.000 0.152 0.002 N NA
 2023889 2023890 RD1_0125 RD1_0126   cycA FALSE 0.005 204.000 0.000 NA   NA
 2023890 2023891 RD1_0126 RD1_0127 cycA hemA TRUE 0.747 74.000 0.348 1.000 N NA
 2023891 2023892 RD1_0127 RD1_0128 hemA puhE TRUE 0.818 -10.000 0.211 NA   NA
 2023892 2023893 RD1_0128 RD1_0129 puhE acsF TRUE 0.972 2.000 0.375 NA   NA
 2023893 2023894 RD1_0129 RD1_0130 acsF   TRUE 0.702 75.000 0.361 NA   NA
 2023894 2023895 RD1_0130 RD1_0131   puhC TRUE 0.904 21.000 0.481 NA   NA
 2023895 2023896 RD1_0131 RD1_0132 puhC puhB TRUE 0.969 6.000 0.515 NA   NA
 2023896 2023897 RD1_0132 RD1_0133 puhB puhA TRUE 0.836 88.000 0.912 NA   NA
 2023897 2023898 RD1_0133 RD1_0134 puhA lhaA TRUE 0.876 23.000 0.382 NA   NA
 2023898 2023899 RD1_0134 RD1_0135 lhaA bchM TRUE 0.890 -3.000 0.111 NA   NA
 2023899 2023900 RD1_0135 RD1_0136 bchM bchL TRUE 0.989 0.000 0.274 0.005 N NA
 2023900 2023901 RD1_0136 RD1_0137 bchL bchH TRUE 0.901 53.000 0.344 0.005   NA
 2023901 2023902 RD1_0137 RD1_0138 bchH bchB TRUE 0.944 -10.000 0.278 0.005   NA
 2023902 2023903 RD1_0138 RD1_0139 bchB bchN TRUE 0.996 -3.000 0.591 0.001 Y NA
 2023903 2023904 RD1_0139 RD1_0140 bchN bchF TRUE 0.985 -3.000 0.311 0.001   NA
 2023905 2023906 RD1_0142 RD1_0143 ppa ppsR TRUE 0.954 -3.000 0.286 1.000   NA
 2023906 2023907 RD1_0143 RD1_0144 ppsR bchG TRUE 0.654 55.000 0.160 1.000   NA
 2023907 2023908 RD1_0144 RD1_0145 bchG   TRUE 0.984 0.000 0.640 NA   NA
 2023908 2023909 RD1_0145 RD1_0146   bchP TRUE 0.953 5.000 0.314 NA   NA
 2023909 2023910 RD1_0146 RD1_0147 bchP idi TRUE 0.872 -3.000 0.050 1.000 N NA
 2023910 2023911 RD1_0147 RD1_0148 idi   FALSE 0.001 463.000 0.000 NA   NA
 2023911 2023912 RD1_0148 RD1_0149   flhA TRUE 0.950 3.000 0.209 NA   NA
 2023912 2023913 RD1_0149 RD1_0150 flhA fliR TRUE 0.986 -3.000 0.395 1.000 Y NA
 2023913 2023914 RD1_0150 RD1_0151 fliR flhB TRUE 0.994 -3.000 0.952 1.000 Y NA
 2023914 2023915 RD1_0151 RD1_0153 flhB   TRUE 0.954 -3.000 0.333 NA   NA
 2023916 2023917 RD1_0154 RD1_0155     FALSE 0.015 405.000 0.000 0.051   NA
 2023917 2023918 RD1_0155 RD1_0156     FALSE 0.107 97.000 0.000 1.000   NA
 2023919 2023920 RD1_0157 RD1_0158     TRUE 0.914 36.000 0.346 0.051   NA
 2023921 2023922 RD1_0159 RD1_0160 flaF   TRUE 0.723 71.000 0.105 NA Y NA
 2023922 2023923 RD1_0160 RD1_0161     FALSE 0.011 209.000 0.000 1.000   NA
 2023923 2023924 RD1_0161 RD1_0162   cheL TRUE 0.836 -7.000 0.200 NA   NA
 2023925 2023926 RD1_0163 RD1_0164   flgD TRUE 0.718 10.000 0.038 NA   NA
 2023927 2023928 RD1_0165 RD1_0167   potI TRUE 0.987 0.000 0.259 1.000 Y NA
 2023928 2023929 RD1_0167 RD1_0168 potI potH TRUE 0.995 -3.000 0.758 0.081 Y NA
 2023929 2023930 RD1_0168 RD1_0169 potH potG TRUE 0.948 38.000 0.545 1.000 Y NA
 2023930 2023931 RD1_0169 RD1_0170 potG potF TRUE 0.898 80.000 0.541 1.000 Y NA
 2023932 2023933 RD1_0171 RD1_0172     TRUE 0.719 78.000 0.326 1.000 N NA
 2023933 2023934 RD1_0172 RD1_0173     FALSE 0.011 238.000 0.000 1.000 N NA
 2023934 2023935 RD1_0173 RD1_0175     TRUE 0.747 120.000 0.541 NA Y NA
 2023935 2023936 RD1_0175 RD1_0178     TRUE 0.614 73.000 0.231 NA   NA
 2023936 2023937 RD1_0178 RD1_0179     TRUE 0.875 4.000 0.072 NA   NA
 2023937 2023938 RD1_0179 RD1_0180     FALSE 0.203 340.000 0.386 0.081 Y NA
 2023941 2023942 RD1_0183 RD1_0184 rnr   TRUE 0.673 6.000 0.015 NA   NA
 2023942 2023943 RD1_0184 RD1_0185   dapE TRUE 0.735 -3.000 0.025 NA   NA
 2023943 2023944 RD1_0185 RD1_0186 dapE   FALSE 0.217 68.000 0.020 NA   NA
 2023944 2023945 RD1_0186 RD1_0187     TRUE 0.805 10.000 0.074 NA   NA
 2023949 2023950 RD1_0191 RD1_0192     TRUE 0.791 0.000 0.002 1.000   NA
 2023950 2023951 RD1_0192 RD1_0193     FALSE 0.103 111.000 0.018 NA   NA
 2023954 2023955 RD1_0196 RD1_0197 serC serA TRUE 0.853 43.000 0.140 1.000 Y NA
 2023956 2023957 RD1_0198 RD1_0199 tdh kbl TRUE 0.971 9.000 0.547 1.000 N NA
 2023957 2023958 RD1_0199 RD1_0200 kbl   FALSE 0.433 95.000 0.095 1.000 N NA
 2023960 2023961 RD1_0202 RD1_0203 ubiB ubiE TRUE 0.939 1.000 0.115 1.000   NA
 2023962 2023963 RD1_0204 RD1_0205 mutM   FALSE 0.413 65.000 0.040 1.000 N NA
 2023963 2023964 RD1_0205 RD1_0206     FALSE 0.232 29.000 0.000 NA N NA
 2023964 2023965 RD1_0206 RD1_0207   rpsT FALSE 0.014 172.000 0.000 NA N NA
 2023965 2023966 RD1_0207 RD1_0208 rpsT dnaA FALSE 0.003 508.000 0.000 1.000 N NA
 2023966 2023967 RD1_0208 RD1_0209 dnaA dnaN FALSE 0.554 142.000 0.328 1.000 Y NA
 2023967 2023968 RD1_0209 RD1_0210 dnaN recF TRUE 0.886 58.000 0.318 1.000 Y NA
 2023968 2023969 RD1_0210 RD1_0211 recF   TRUE 0.790 -3.000 0.011 1.000 N NA
 2023969 2023970 RD1_0211 RD1_0212   gyrB FALSE 0.263 79.000 0.010 1.000 N NA
 2023971 2023972 RD1_0213 RD1_0214   ccdA FALSE 0.255 115.000 0.085 1.000   NA
 2023973 2023974 RD1_0215 RD1_0216     TRUE 0.988 2.000 0.748 1.000   NA
 2023975 2023976 RD1_0217 RD1_0218 idhA fba TRUE 0.978 4.000 0.500 1.000   NA
 2023976 2023977 RD1_0218 RD1_0219 fba   TRUE 0.986 -3.000 0.393 1.000 Y NA
 2023977 2023978 RD1_0219 RD1_0220     TRUE 0.985 5.000 0.357 1.000 Y NA
 2023978 2023979 RD1_0220 RD1_0221   iolD TRUE 0.920 24.000 0.500 1.000 N NA
 2023980 2023981 RD1_0222 RD1_0223     TRUE 0.880 19.000 0.294 1.000   NA
 2023981 2023982 RD1_0223 RD1_0224     TRUE 0.897 14.000 0.265 1.000   NA
 2023982 2023983 RD1_0224 RD1_0225     FALSE 0.147 133.000 0.091 NA   NA
 2023983 2023984 RD1_0225 RD1_0226   leuD FALSE 0.004 219.000 0.000 NA   NA
 2023984 2023985 RD1_0226 RD1_0227 leuD   FALSE 0.407 45.000 0.045 NA   NA
 2023985 2023986 RD1_0227 RD1_0228   leuB FALSE 0.539 73.000 0.159 NA   NA
 2023986 2023987 RD1_0228 RD1_0229 leuB   TRUE 0.718 112.000 0.345 NA Y NA
 2023989 1595721 RD1_0232 RD1_0233     FALSE 0.034 110.000 0.000 NA   NA
 1595721 2023990 RD1_0233 RD1_0234     FALSE 0.055 89.000 0.000 NA   NA
 2023990 2023991 RD1_0234 RD1_0235     TRUE 0.799 -3.000 0.044 NA   NA
 2023992 2023993 RD1_0236 RD1_0237     TRUE 0.632 8.000 0.014 NA   NA
 2023994 2023995 RD1_0238 RD1_0239     TRUE 0.896 21.000 0.344 1.000 N NA
 2023995 2023996 RD1_0239 RD1_0240     TRUE 0.921 64.000 0.656 NA Y NA
 2023996 2023997 RD1_0240 RD1_0241     TRUE 0.921 -19.000 0.688 NA N NA
 2023997 2023998 RD1_0241 RD1_0242     TRUE 0.951 0.000 0.192 NA   NA
 2023998 2023999 RD1_0242 RD1_0243     TRUE 0.828 5.000 0.054 NA   NA
 2023999 2024000 RD1_0243 RD1_0244     TRUE 0.958 -3.000 0.071 1.000 Y NA
 2024000 2024001 RD1_0244 RD1_0245     TRUE 0.802 13.000 0.087 1.000   NA
 2024001 2024002 RD1_0245 RD1_0246   iorA FALSE 0.011 210.000 0.000 1.000   NA
 2024002 2024003 RD1_0246 RD1_0247 iorA iorB TRUE 0.990 4.000 0.100 0.001 Y NA
 2024003 2024004 RD1_0247 RD1_0248 iorB araC FALSE 0.014 216.000 0.000 1.000 N NA
 2024004 2024005 RD1_0248 RD1_0249 araC   FALSE 0.464 127.000 0.000 0.008 Y NA
 2024005 2024006 RD1_0249 RD1_0250     FALSE 0.498 157.000 0.800 1.000 N NA
 2024008 2024009 RD1_0253 RD1_0254 flgB flgC TRUE 0.982 14.000 0.804 NA Y NA
 2024009 2024010 RD1_0254 RD1_0255 flgC fliE TRUE 0.912 54.000 0.095 0.002 Y NA
 2024010 2024011 RD1_0255 RD1_0256 fliE fliQ TRUE 0.990 2.000 0.404 1.000 Y NA
 2024011 2024012 RD1_0256 RD1_0257 fliQ flgF TRUE 0.995 3.000 0.905 1.000 Y NA
 2024012 2024013 RD1_0257 RD1_0258 flgF flgG TRUE 0.991 30.000 1.000 0.001 Y NA
 2024013 2024014 RD1_0258 RD1_0259 flgG flgA TRUE 0.985 -3.000 1.000 NA   NA
 2024014 2024015 RD1_0259 RD1_0260 flgA flgH TRUE 0.974 10.000 0.810 NA   NA
 2024015 2024016 RD1_0260 RD1_0261 flgH   TRUE 0.977 10.000 0.333 0.006   NA
 2024016 2024017 RD1_0261 RD1_0262     FALSE 0.081 62.000 0.000 NA   NA
 2024017 2024018 RD1_0262 RD1_0263     FALSE 0.042 103.000 0.000 NA   NA
 2024018 2024019 RD1_0263 RD1_0264     TRUE 0.860 29.000 0.115 0.050   NA
 2024020 2024021 RD1_0265 RD1_0266 fliP fliN TRUE 0.981 -3.000 0.704 1.000   NA
 2024021 2024022 RD1_0266 RD1_0267 fliN   TRUE 0.932 -7.000 0.556 NA   NA
 2024022 2024023 RD1_0267 RD1_0268   fliF TRUE 0.988 0.000 0.800 NA   NA
 2024024 2024025 RD1_0270 RD1_0271 fliL   TRUE 0.870 11.000 0.152 NA   NA
 2024025 2024026 RD1_0271 RD1_0272     TRUE 0.964 12.000 0.722 NA   NA
 2024026 2024027 RD1_0272 RD1_0273   motA TRUE 0.665 67.000 0.279 NA   NA
 2024027 2024028 RD1_0273 RD1_0274 motA   TRUE 0.956 -3.000 0.349 NA   NA
 2024028 2024029 RD1_0274 RD1_0275     FALSE 0.001 395.000 0.000 NA   NA
 2024029 2024030 RD1_0275 RD1_0276     FALSE 0.061 81.000 0.000 NA   NA
 2024031 2024032 RD1_0277 RD1_0278     TRUE 0.990 -3.000 0.625 1.000 Y NA
 2024032 2024033 RD1_0278 RD1_0279   potB TRUE 0.994 -3.000 0.625 0.080 Y NA
 2024033 2024034 RD1_0279 RD1_0280 potB potD TRUE 0.960 78.000 0.833 0.080 Y NA
 2024034 2024035 RD1_0280 RD1_0281 potD   TRUE 0.861 45.000 0.500 1.000   NA
 2024035 2024036 RD1_0281 RD1_0282     TRUE 0.941 -3.000 0.250 NA   NA
 2024036 2024037 RD1_0282 RD1_0283     TRUE 0.983 0.000 0.588 NA   NA
 2024037 2024038 RD1_0283 RD1_0284     TRUE 0.938 -3.000 0.235 NA   NA
 2024038 2024039 RD1_0284 RD1_0285     FALSE 0.456 69.000 0.088 NA N NA
 2024041 2024042 RD1_0287 RD1_0288     TRUE 0.989 -3.000 0.276 0.083 Y NA
 2024043 2024044 RD1_0289 RD1_0290   pmbA FALSE 0.515 31.000 0.054 NA   NA
 2024044 2024045 RD1_0290 RD1_0291 pmbA   TRUE 0.783 -13.000 0.182 NA   NA
 2024045 2024046 RD1_0291 RD1_0292     TRUE 0.959 10.000 0.515 NA   NA
 2024046 2024047 RD1_0292 RD1_0293     TRUE 0.919 7.000 0.198 NA   NA
 2024047 2024048 RD1_0293 RD1_0294   lpxK TRUE 0.849 -13.000 0.046 1.000 Y NA
 2024049 2024050 RD1_0295 RD1_0296 bdbD   TRUE 0.870 14.000 0.233 NA   NA
 2024052 2024053 RD1_0298 RD1_0300 ccrM rnhB TRUE 0.605 93.000 0.048 1.000 Y NA
 2024053 2024054 RD1_0300 RD1_0301 rnhB   FALSE 0.010 232.000 0.010 NA   NA
 2024055 2024056 RD1_0302 RD1_0303     TRUE 0.743 -28.000 0.205 NA   NA
 2024056 2024057 RD1_0303 RD1_0304   bphF FALSE 0.247 79.000 0.016 1.000   NA
 2024060 2024061 RD1_0307 RD1_0308   glpQ TRUE 0.954 -3.000 0.333 NA   NA
 2024061 2024062 RD1_0308 RD1_0309 glpQ   FALSE 0.167 196.000 0.400 NA   NA
 2024062 2024063 RD1_0309 RD1_0310     TRUE 0.664 37.000 0.143 NA   NA
 2024063 2024064 RD1_0310 RD1_0311     TRUE 0.903 5.000 0.124 NA   NA
 2024064 2024065 RD1_0311 RD1_0312   cynT FALSE 0.243 82.000 0.037 NA   NA
 2024066 2024067 RD1_0313 RD1_0314   pepA TRUE 0.573 64.000 0.159 NA   NA
 2024067 2024068 RD1_0314 RD1_0315 pepA   TRUE 0.962 -3.000 0.408 NA   NA
 2024069 2024070 RD1_0316 RD1_0317     FALSE 0.300 70.000 0.043 NA   NA
 2024070 2024071 RD1_0317 RD1_0318     FALSE 0.307 84.000 0.028 1.000 N NA
 2024072 2024073 RD1_0319 RD1_0320   fghA TRUE 0.633 70.000 0.200 1.000   NA
 2024073 2024074 RD1_0320 RD1_0321 fghA   TRUE 0.754 -3.000 0.029 NA   NA
 2024074 2024075 RD1_0321 RD1_0322     FALSE 0.401 21.000 0.015 NA   NA
 2024075 2024076 RD1_0322 RD1_0323     TRUE 0.895 -3.000 0.091 1.000   NA
 2024076 2024077 RD1_0323 RD1_0324     TRUE 0.969 -3.000 0.429 1.000   NA
 2024080 2024081 RD1_0327 RD1_0328 folC accD TRUE 0.968 -3.000 0.383 1.000 N NA
 2024081 2024082 RD1_0328 RD1_0329 accD   FALSE 0.250 59.000 0.020 NA   NA
 2024082 2024083 RD1_0329 RD1_0330     FALSE 0.332 10.000 0.000 NA   NA
 2024083 2024084 RD1_0330 RD1_0331     FALSE 0.332 10.000 0.000 NA   NA
 2024086 2024087 RD1_0333 RD1_0334 ctpA   TRUE 0.961 7.000 0.408 NA N NA
 2024087 2024088 RD1_0334 RD1_0335   gpmI TRUE 0.783 -15.000 0.170 NA N NA
 2024088 2024089 RD1_0335 RD1_0336 gpmI dnaE FALSE 0.547 75.000 0.003 0.045 N NA
 2024090 2024091 RD1_0338 RD1_0339     FALSE 0.001 910.000 0.000 NA   NA
 2024091 2024092 RD1_0339 RD1_0340     TRUE 0.857 -40.000 0.500 NA   NA
 2024092 2024093 RD1_0340 RD1_0341     FALSE 0.519 0.000 0.000 NA   NA
 2024093 2024094 RD1_0341 RD1_0342     FALSE 0.410 -3.000 0.000 NA   NA
 2024094 2024095 RD1_0342 RD1_0343     FALSE 0.410 -3.000 0.000 NA   NA
 2024095 2024096 RD1_0343 RD1_0344     FALSE 0.002 333.000 0.000 NA   NA
 2024096 2024097 RD1_0344 RD1_0345     TRUE 0.742 24.000 0.143 NA   NA
 2024097 2024098 RD1_0345 RD1_0346     FALSE 0.006 185.000 0.000 NA   NA
 2024098 2024099 RD1_0346 RD1_0348     FALSE 0.397 6.000 0.000 NA   NA
 2024099 2024100 RD1_0348 RD1_0349   polA FALSE 0.001 834.000 0.000 NA   NA
 2024101 2024102 RD1_0350 RD1_0352     FALSE 0.340 76.000 0.062 NA   NA
 2024103 2024104 RD1_0353 RD1_0354 moxR   TRUE 0.978 -3.000 0.697 NA   NA
 2024104 2024105 RD1_0354 RD1_0355     TRUE 0.982 -3.000 0.816 NA   NA
 2024105 2024106 RD1_0355 RD1_0356     TRUE 0.983 -3.000 0.876 NA   NA
 2024106 2024107 RD1_0356 RD1_0357     FALSE 0.047 157.000 0.031 NA   NA
 2024108 2024109 RD1_0358 RD1_0359   recQ FALSE 0.466 35.000 0.048 NA   NA
 2024109 2024110 RD1_0359 RD1_0360 recQ   FALSE 0.204 108.000 0.054 NA   NA
 2024111 2024112 RD1_0361 RD1_0362   mepA TRUE 0.858 -3.000 0.079 NA   NA
 2024112 2024113 RD1_0362 RD1_0364 mepA   TRUE 0.718 -27.000 0.175 NA   NA
 2024113 2024114 RD1_0364 RD1_0365     FALSE 0.458 70.000 0.105 NA   NA
 2024114 2024115 RD1_0365 RD1_0366     FALSE 0.004 334.000 0.005 NA   NA
 2024115 2024116 RD1_0366 RD1_0367     FALSE 0.216 74.000 0.005 1.000   NA
 2024116 2024117 RD1_0367 RD1_0368   kdsD TRUE 0.908 -3.000 0.108 1.000   NA
 2024117 2024118 RD1_0368 RD1_0369 kdsD   TRUE 0.893 6.000 0.122 NA   NA
 2024118 2024119 RD1_0369 RD1_0370     TRUE 0.852 4.000 0.055 NA   NA
 2024119 2024120 RD1_0370 RD1_0371     TRUE 0.981 1.000 0.543 NA   NA
 2024120 2024121 RD1_0371 RD1_0372     FALSE 0.007 247.000 0.005 NA   NA
 2024121 2024122 RD1_0372 RD1_0373   ptsN TRUE 0.817 41.000 0.353 NA N NA
 2024123 2024124 RD1_0374 RD1_0375 gtaB kdsB FALSE 0.087 214.000 0.016 1.000 Y NA
 2024124 2024125 RD1_0375 RD1_0376 kdsB cysQ TRUE 0.914 0.000 0.052 1.000 N NA
 2024125 2024126 RD1_0376 RD1_0377 cysQ alkB FALSE 0.003 336.000 0.000 NA N NA
 2024127 2024128 RD1_0378 RD1_0379 dnaK dnaJ TRUE 0.918 79.000 0.236 0.003 Y NA
 2024129 2024130 RD1_0380 RD1_0382   secA FALSE 0.129 34.000 0.000 NA   NA
 2024131 2024132 RD1_0383 RD1_0384   argJ TRUE 0.876 7.000 0.070 1.000 N NA
 2024132 2024133 RD1_0384 RD1_0385 argJ mutT TRUE 0.651 19.000 0.046 1.000   NA
 2024134 2024135 RD1_0386 RD1_0387 infB   TRUE 0.903 10.000 0.171 NA N NA
 2024135 2024136 RD1_0387 RD1_0388   nusA TRUE 0.937 23.000 0.323 NA Y NA
 2024136 2024137 RD1_0388 RD1_0389 nusA   TRUE 0.987 0.000 0.759 NA   NA
 2024137 2024138 RD1_0389 RD1_0390     FALSE 0.028 144.000 0.002 NA   NA
 2024138 2024139 RD1_0390 RD1_0391   pip TRUE 0.914 -3.000 0.119 1.000   NA
 2024141 2024142 RD1_0393 RD1_0395     TRUE 0.913 1.000 0.067 1.000   NA
 2024142 2024143 RD1_0395 RD1_0396   grxC TRUE 0.943 0.000 0.121 1.000   NA
 2024143 2024144 RD1_0396 RD1_0398 grxC comF FALSE 0.547 40.000 0.061 1.000   NA
 2024145 2024146 RD1_0400 RD1_0401   hemH FALSE 0.339 86.000 0.052 1.000   NA
 2024149 2024150 RD1_0404 RD1_0405   ccaA FALSE 0.440 126.000 0.409 NA   NA
 2024150 2024151 RD1_0405 RD1_0406 ccaA   FALSE 0.435 20.000 0.018 NA   NA
 2024151 2024152 RD1_0406 RD1_0407     FALSE 0.449 39.000 0.038 NA N NA
 2024152 2024153 RD1_0407 RD1_0408     TRUE 0.996 -3.000 0.704 0.007 Y NA
 2024153 2024154 RD1_0408 RD1_0409     FALSE 0.063 171.000 0.034 1.000 N NA
 2024154 2024155 RD1_0409 RD1_0410     TRUE 0.779 -21.000 0.163 1.000 N NA
 2024155 2024156 RD1_0410 RD1_0411   hslO TRUE 0.712 -7.000 0.046 1.000 N NA
 2024160 2024161 RD1_0415 RD1_0416   ilvA TRUE 0.745 9.000 0.011 1.000 N NA
 2024165 2024166 RD1_0420 RD1_0421 rbsK tme TRUE 0.968 0.000 0.231 1.000 N NA
 2024168 2024169 RD1_0424 RD1_0425 grpE hrcA TRUE 0.895 10.000 0.120 1.000 N NA
 2024170 2024171 RD1_0426 RD1_0427 rph   TRUE 0.838 -3.000 0.030 1.000 N NA
 2024171 2024172 RD1_0427 RD1_0428   hemN TRUE 0.879 -7.000 0.218 1.000 N NA
 2024173 2024174 RD1_0429 RD1_0430 parB parA TRUE 0.980 10.000 0.827 1.000 N NA
 2024174 2024175 RD1_0430 RD1_0431 parA gidB TRUE 0.914 -7.000 0.339 1.000 N NA
 2024175 2024176 RD1_0431 RD1_0432 gidB gidA TRUE 0.954 12.000 0.466 1.000 N NA
 2024176 2024177 RD1_0432 RD1_0433 gidA trmE TRUE 0.954 5.000 0.266 1.000   NA
 2024177 2024178 RD1_0433 RD1_0434 trmE rho TRUE 0.580 30.000 0.050 1.000   NA
 2024178 2024179 RD1_0434 RD1_0435 rho   FALSE 0.043 156.000 0.025 NA   NA
 2024180 2024181 RD1_0436 RD1_0437   maf FALSE 0.064 79.000 0.000 NA   NA
 2024181 2024182 RD1_0437 RD1_0438 maf aroE TRUE 0.939 -3.000 0.169 1.000 N NA
 2024182 2024183 RD1_0438 RD1_0439 aroE coaE TRUE 0.897 -3.000 0.078 1.000 N NA
 2024183 2024184 RD1_0439 RD1_0440 coaE dnaQ TRUE 0.792 -7.000 0.092 1.000 N NA
 2024185 2024186 RD1_0441 RD1_0443 secB fxsA FALSE 0.559 54.000 0.122 NA   NA
 2024187 2024188 RD1_0444 RD1_0446     FALSE 0.058 139.000 0.025 NA   NA
 2024189 2024190 RD1_0447 RD1_0448   hslU FALSE 0.431 39.000 0.015 1.000 N NA
 2024190 2024191 RD1_0448 RD1_0449 hslU   FALSE 0.159 92.000 0.018 NA   NA
 2024191 2024192 RD1_0449 RD1_0450   hslV FALSE 0.305 -48.000 0.020 NA   NA
 2024192 2024193 RD1_0450 RD1_0451 hslV trxA FALSE 0.118 113.000 0.009 1.000   NA
 2024193 2024194 RD1_0451 RD1_0452 trxA   TRUE 0.733 38.000 0.173 1.000   NA
 2024194 2024195 RD1_0452 RD1_0453     TRUE 0.992 -3.000 0.863 NA Y NA
 2024195 2024196 RD1_0453 RD1_0454     TRUE 0.847 -7.000 0.196 NA N NA
 2024196 2024197 RD1_0454 RD1_0455     TRUE 0.919 -15.000 0.642 NA   NA
 2024197 2024198 RD1_0455 RD1_0456     TRUE 0.807 -3.000 0.047 NA   NA
 2024198 2024199 RD1_0456 RD1_0457     FALSE 0.182 51.000 0.003 NA   NA
 2024199 1595932 RD1_0457 RD1_0459   regB FALSE 0.007 178.000 0.000 NA   NA
 2024200 2024201 RD1_0460 RD1_0461 senC regA TRUE 0.607 97.000 0.286 1.000   NA
 2024202 2024203 RD1_0463 RD1_0464   rfaI TRUE 0.817 -3.000 0.031 1.000   NA
 2024204 2024205 RD1_0465 RD1_0466 ahcY   FALSE 0.018 175.000 0.005 NA   NA
 2024206 2024207 RD1_0467 RD1_0468     TRUE 0.932 0.000 0.122 NA   NA
 2024207 2024208 RD1_0468 RD1_0469   gpsA TRUE 0.977 2.000 0.456 NA   NA
 2024208 2024209 RD1_0469 RD1_0470 gpsA gcp TRUE 0.890 -3.000 0.070 1.000 N NA
 2024210 2024211 RD1_0471 RD1_0472 hemD   TRUE 0.681 61.000 0.263 NA   NA
 2024211 2024212 RD1_0472 RD1_0473     TRUE 0.935 12.000 0.408 NA   NA
 2024214 2024215 RD1_0475 RD1_0476     TRUE 0.783 37.000 0.041 1.000 Y NA
 2024218 2024219 RD1_0479 RD1_0481     FALSE 0.002 272.000 0.000 NA   NA
 2024219 2024220 RD1_0481 RD1_0482     FALSE 0.559 36.000 0.083 NA   NA
 2024220 2024221 RD1_0482 RD1_0483     FALSE 0.004 217.000 0.000 NA   NA
 2024221 2024222 RD1_0483 RD1_0484   iolB TRUE 0.608 16.000 0.032 NA N NA
 2024222 2024223 RD1_0484 RD1_0486 iolB   TRUE 0.781 -3.000 0.019 1.000   NA
 2024223 2024224 RD1_0486 RD1_0487     TRUE 0.980 2.000 0.467 1.000   NA
 2024224 2024225 RD1_0487 RD1_0488     TRUE 0.884 63.000 0.400 NA Y NA
 2024226 2024227 RD1_0490 RD1_0491     FALSE 0.003 243.000 0.000 NA   NA
 2024228 2024229 RD1_0492 RD1_0493     FALSE 0.182 124.000 0.091 NA   NA
 2024229 2024230 RD1_0493 RD1_0494     FALSE 0.008 174.000 0.000 NA   NA
 2024230 2024231 RD1_0494 RD1_0495     TRUE 0.838 8.000 0.083 NA   NA
 2024236 2024237 RD1_0500 RD1_0501     TRUE 0.912 -48.000 0.875 NA   NA
 2024238 2024239 RD1_0502 RD1_0503     TRUE 0.979 0.000 0.476 NA   NA
 2024239 2024240 RD1_0503 RD1_0504     TRUE 0.965 -3.000 0.175 0.081   NA
 2024240 2024241 RD1_0504 RD1_0505   mmgC TRUE 0.989 -3.000 0.545 1.000 Y NA
 2024242 2024243 RD1_0506 RD1_0507     TRUE 0.961 -3.000 0.095 0.050 N NA
 2024244 2024245 RD1_0508 RD1_0509     TRUE 0.830 13.000 0.143 NA   NA
 2024245 2024246 RD1_0509 RD1_0510   pct TRUE 0.995 -3.000 0.750 0.081 Y NA
 2024248 2024249 RD1_0512 RD1_0513 betA   FALSE 0.044 179.000 0.053 NA   NA
 2024249 2024250 RD1_0513 RD1_0514   gutB TRUE 0.641 16.000 0.053 NA   NA
 2024252 2024253 RD1_0516 RD1_0517     FALSE 0.410 -3.000 0.000 NA   NA
 2024253 2024254 RD1_0517 RD1_0518     TRUE 0.994 4.000 0.421 0.078 Y NA
 2024254 2024255 RD1_0518 RD1_0519     TRUE 0.996 0.000 0.588 0.078 Y NA
 2024255 2024256 RD1_0519 RD1_0521     TRUE 0.945 56.000 0.412 0.078 Y NA
 2024256 2024257 RD1_0521 RD1_0522     FALSE 0.175 157.000 0.167 1.000   NA
 2024257 2024258 RD1_0522 RD1_0524     TRUE 0.796 19.000 0.167 NA   NA
 2024258 2024259 RD1_0524 RD1_0525     TRUE 0.969 -3.000 0.500 NA   NA
 2024259 2024260 RD1_0525 RD1_0526     TRUE 0.983 0.000 0.600 NA   NA
 2024260 2024261 RD1_0526 RD1_0527     FALSE 0.410 -3.000 0.000 NA   NA
 2024261 2024262 RD1_0527 RD1_0528     TRUE 0.901 -3.000 0.128 NA   NA
 2024262 2024263 RD1_0528 RD1_0529   moxR TRUE 0.961 11.000 0.609 NA   NA
 2024263 2024264 RD1_0529 RD1_0530 moxR napD TRUE 0.929 -3.000 0.200 NA   NA
 2024264 2024265 RD1_0530 RD1_0531 napD   FALSE 0.434 89.000 0.130 NA   NA
 2024265 2024266 RD1_0531 RD1_0532   coxG FALSE 0.022 163.000 0.000 1.000   NA
 2024266 2024267 RD1_0532 RD1_0533 coxG   TRUE 0.788 95.000 0.667 1.000   NA
 2024267 2024268 RD1_0533 RD1_0534     FALSE 0.548 61.000 0.133 NA   NA
 2024268 2024269 RD1_0534 RD1_0535     TRUE 0.685 35.000 0.133 NA N NA
 2024269 2024270 RD1_0535 RD1_0536   chrR TRUE 0.843 -3.000 0.053 NA N NA
 2024271 2024272 RD1_0537 RD1_0538     FALSE 0.153 69.000 0.000 1.000   NA
 2024274 2024275 RD1_0540 RD1_0541     TRUE 0.943 52.000 0.750 NA Y NA
 2024275 2024276 RD1_0541 RD1_0542     TRUE 0.997 0.000 0.826 0.078 Y NA
 2024276 2024277 RD1_0542 RD1_0543     TRUE 0.981 -7.000 0.783 1.000 Y NA
 2024277 2024278 RD1_0543 RD1_0544     TRUE 0.996 -3.000 0.783 0.034 Y NA
 2024280 2024281 RD1_0546 RD1_0547 fadD   TRUE 0.970 6.000 0.467 1.000   NA
 2024282 2024283 RD1_0548 RD1_0549 dxs ispA TRUE 0.973 10.000 0.265 1.000 Y NA
 2024283 2024284 RD1_0549 RD1_0550 ispA xseB TRUE 0.903 4.000 0.062 1.000 N NA
 2024284 2024285 RD1_0550 RD1_0551 xseB petR FALSE 0.253 76.000 0.005 1.000 N NA
 2024285 2024286 RD1_0551 RD1_0552 petR marR TRUE 0.992 -3.000 0.392 0.070 Y NA
 2024287 2024288 RD1_0553 RD1_0554 ilvE   FALSE 0.367 -40.000 0.029 NA   NA
 2024289 2024290 RD1_0555 RD1_0556   aroC FALSE 0.143 67.000 0.003 NA   NA
 2024291 2024292 RD1_0557 RD1_0558   thiP TRUE 0.956 -24.000 0.697 0.078 N NA
 2024293 2024294 RD1_0559 RD1_0560   ribH FALSE 0.003 248.000 0.000 NA   NA
 2024295 2024296 RD1_0561 RD1_0562     TRUE 0.725 43.000 0.163 1.000 N NA
 2024296 2024297 RD1_0562 RD1_0563   petA FALSE 0.044 207.000 0.047 1.000 N NA
 2024297 2024298 RD1_0563 RD1_0564 petA petB TRUE 0.970 13.000 0.069 0.001 Y NA
 2024298 2024299 RD1_0564 RD1_0565 petB petC TRUE 0.991 15.000 0.630 0.001 Y NA
 2024299 2024300 RD1_0565 RD1_0566 petC   FALSE 0.002 980.000 0.000 1.000 N NA
 2024302 2024303 RD1_0568 RD1_0569     TRUE 0.630 5.000 0.000 1.000   NA
 2024303 2024304 RD1_0569 RD1_0570     FALSE 0.056 87.000 0.000 NA   NA
 2024304 2024305 RD1_0570 RD1_0571     FALSE 0.072 69.000 0.000 NA   NA
 2024305 2024306 RD1_0571 RD1_0572     FALSE 0.364 8.000 0.000 NA   NA
 2024306 2024307 RD1_0572 RD1_0573     FALSE 0.090 55.000 0.000 NA   NA
 2024307 2024308 RD1_0573 RD1_0575     TRUE 0.716 0.000 0.000 1.000   NA
 2024308 2024309 RD1_0575 RD1_0576     FALSE 0.001 600.000 0.000 NA   NA
 2024310 2024311 RD1_0577 RD1_0578 flgI flgL TRUE 0.997 -3.000 0.950 0.004 Y NA
 2024311 2024312 RD1_0578 RD1_0580 flgL flgK TRUE 0.998 4.000 0.864 0.004 Y NA
 2024312 2024313 RD1_0580 RD1_0581 flgK flgE TRUE 0.984 45.000 0.955 0.004 Y NA
 2024313 2024314 RD1_0581 RD1_0583 flgE motB TRUE 0.913 101.000 0.905 1.000 Y NA
 2024314 2024315 RD1_0583 RD1_0584 motB   FALSE 0.017 181.000 0.008 NA   NA
 2024316 2024317 RD1_0585 RD1_0586 pncA pncB TRUE 0.729 -7.000 0.053 1.000 N NA
 2024317 2024318 RD1_0586 RD1_0587 pncB   FALSE 0.078 64.000 0.000 NA   NA
 2024318 2024319 RD1_0587 RD1_0589     FALSE 0.059 83.000 0.000 NA   NA
 2024319 2024320 RD1_0589 RD1_0590     FALSE 0.007 183.000 0.000 NA   NA
 2024320 2024321 RD1_0590 RD1_0591     FALSE 0.001 432.000 0.000 NA   NA
 2024322 2024323 RD1_0592 RD1_0593     TRUE 0.996 2.000 0.600 0.054 Y NA
 2024323 2024324 RD1_0593 RD1_0594     TRUE 0.996 -3.000 0.600 0.007 Y NA
 2024324 2024325 RD1_0594 RD1_0595     TRUE 0.851 66.000 0.667 1.000   NA
 2024325 2024326 RD1_0595 RD1_0596   msrA FALSE 0.092 130.000 0.020 1.000   NA
 2024326 2024327 RD1_0596 RD1_0597 msrA msrB TRUE 0.995 -3.000 0.404 0.001 Y NA
 2024328 2024329 RD1_0599 RD1_0600 gpo   TRUE 0.808 4.000 0.017 1.000   NA
 2024332 2024333 RD1_0603 RD1_0604 hup amn FALSE 0.222 138.000 0.132 1.000 N NA
 2024333 2024334 RD1_0604 RD1_0605 amn ade TRUE 0.958 -3.000 0.074 1.000 Y NA
 2024335 2024336 RD1_0606 RD1_0607     FALSE 0.001 377.000 0.000 NA   NA
 2024338 2024339 RD1_0609 RD1_0610     TRUE 0.668 -10.000 0.067 NA N NA
 2024339 2024340 RD1_0610 RD1_0611   acdA TRUE 0.673 106.000 0.200 NA Y NA
 2024340 2024341 RD1_0611 RD1_0612 acdA   TRUE 0.684 63.000 0.200 1.000 N NA
 2024341 2024342 RD1_0612 RD1_0613   caiD TRUE 0.957 -13.000 0.448 0.032 N NA
 2024342 2024343 RD1_0613 RD1_0614 caiD   TRUE 0.698 40.000 0.004 0.032 N NA
 2024344 2024345 RD1_0615 RD1_0616   leuC FALSE 0.002 262.000 0.000 NA   NA
 2024345 2024346 RD1_0616 RD1_0617 leuC   FALSE 0.106 45.000 0.000 NA   NA
 2024347 2024348 RD1_0618 RD1_0619     FALSE 0.209 72.000 0.020 NA   NA
 2024348 2024349 RD1_0619 RD1_0620     FALSE 0.021 157.000 0.002 NA   NA
 2024349 2024350 RD1_0620 RD1_0621     TRUE 0.881 16.000 0.307 NA   NA
 2024351 2024352 RD1_0622 RD1_0623     FALSE 0.268 100.000 0.067 NA   NA
 2024352 2024353 RD1_0623 RD1_0624     TRUE 0.830 13.000 0.143 NA   NA
 2024354 2024355 RD1_0625 RD1_0626 glcD glcE TRUE 0.954 52.000 0.266 0.001 Y NA
 2024355 2024356 RD1_0626 RD1_0627 glcE glcF TRUE 0.995 0.000 0.227 0.001 Y NA
 2024356 2024357 RD1_0627 RD1_0628 glcF   FALSE 0.462 91.000 0.100 1.000 N NA
 2024357 2024358 RD1_0628 RD1_0629   ibpA FALSE 0.043 212.000 0.075 NA N NA
 2024359 2024360 RD1_0630 RD1_0631     FALSE 0.410 -3.000 0.000 NA   NA
 2024366 2024367 RD1_0637 RD1_0638 pnp   FALSE 0.004 455.000 0.000 1.000 N NA
 2024367 2024368 RD1_0638 RD1_0639     TRUE 0.973 11.000 0.704 1.000 N NA
 2024368 2024369 RD1_0639 RD1_0641     FALSE 0.007 275.000 0.000 1.000 N NA
 2024369 2024370 RD1_0641 RD1_0642   rpsO FALSE 0.024 175.000 0.000 1.000 N NA
 2024370 2024371 RD1_0642 RD1_0643 rpsO   FALSE 0.009 171.000 0.000 NA   NA
 2024371 2024372 RD1_0643 RD1_0645     FALSE 0.001 722.000 0.000 NA   NA
 2024372 2024373 RD1_0645 RD1_0646     FALSE 0.014 145.000 0.000 NA   NA
 2024373 2024374 RD1_0646 RD1_0647   truB FALSE 0.038 131.000 0.003 NA   NA
 2024374 2024375 RD1_0647 RD1_0648 truB   FALSE 0.154 106.000 0.030 NA   NA
 2024375 2024376 RD1_0648 RD1_0649   rbfA TRUE 0.732 -3.000 0.024 NA   NA
 2024377 2024378 RD1_0650 RD1_0651 dapB   FALSE 0.135 91.000 0.011 NA   NA
 2024380 2024381 RD1_0653 RD1_0654     FALSE 0.395 66.000 0.071 NA   NA
 2024381 2024382 RD1_0654 RD1_0655   purH TRUE 0.638 20.000 0.068 NA   NA
 2024382 2024383 RD1_0655 RD1_0656 purH lspA TRUE 0.671 15.000 0.027 1.000 N NA
 2024383 2024384 RD1_0656 RD1_0657 lspA   TRUE 0.809 67.000 0.588 NA   NA
 2024384 2024385 RD1_0657 RD1_0658   pqqE FALSE 0.311 118.000 0.173 NA   NA
 2024385 2024386 RD1_0658 RD1_0659 pqqE   TRUE 0.994 0.000 0.598 0.004   NA
 2024387 2024388 RD1_0660 RD1_0661 ald deoC TRUE 0.850 28.000 0.277 1.000 N NA
 2024389 2024390 RD1_0662 RD1_0663 mutL   TRUE 0.761 -3.000 0.031 NA   NA
 2024390 2024391 RD1_0663 RD1_0664     FALSE 0.410 -3.000 0.000 NA   NA
 2024392 2024393 RD1_0665 RD1_0666 uxuA   TRUE 0.906 -3.000 0.105 1.000   NA
 2024393 2024394 RD1_0666 RD1_0667     TRUE 0.980 2.000 0.190 0.049   NA
 2024394 2024395 RD1_0667 RD1_0668     TRUE 0.976 -3.000 0.238 0.049   NA
 2024395 2024396 RD1_0668 RD1_0669   kdgK TRUE 0.945 -3.000 0.222 1.000   NA
 2024396 2024397 RD1_0669 RD1_0671 kdgK   TRUE 0.896 -3.000 0.120 NA   NA
 2024397 2024398 RD1_0671 RD1_0672   garR TRUE 0.943 1.000 0.160 NA   NA
 2024398 2024399 RD1_0672 RD1_0673 garR   TRUE 0.828 13.000 0.120 NA N NA
 2024399 2024400 RD1_0673 RD1_0674     TRUE 0.642 -13.000 0.080 NA   NA
 2024400 2024401 RD1_0674 RD1_0675   garD TRUE 0.973 -3.000 0.500 1.000   NA
 2024401 2024402 RD1_0675 RD1_0676 garD   TRUE 0.934 12.000 0.364 NA N NA
 2024402 2024403 RD1_0676 RD1_0677     TRUE 0.826 16.000 0.182 NA   NA
 2024403 2024404 RD1_0677 RD1_0678     TRUE 0.989 0.000 0.857 NA   NA
 2024404 2024405 RD1_0678 RD1_0679     FALSE 0.025 244.000 0.059 NA N NA
 2024405 2024406 RD1_0679 RD1_0680     FALSE 0.503 72.000 0.088 1.000 N NA
 2024407 2024408 RD1_0681 RD1_0682     FALSE 0.068 74.000 0.000 NA   NA
 2024409 2024410 RD1_0683 RD1_0684   glxR TRUE 0.972 -3.000 0.136 0.008 N NA
 2024411 2024412 RD1_0685 RD1_0686     TRUE 0.951 -3.000 0.086 0.079 N NA
 2024412 2024413 RD1_0686 RD1_0688     TRUE 0.836 34.000 0.086 0.032 N NA
 2024413 2024414 RD1_0688 RD1_0689     TRUE 0.994 1.000 0.750 0.079 N NA
 2024414 2024415 RD1_0689 RD1_0690     TRUE 0.961 2.000 0.062 0.079 N NA
 2024416 2024417 RD1_0691 RD1_0692 chrR rpoE TRUE 0.982 8.000 0.898 NA N NA
 2024418 2024419 RD1_0693 RD1_0694     TRUE 0.979 -3.000 0.722 NA   NA
 2024419 2024420 RD1_0694 RD1_0695     TRUE 0.882 0.000 0.058 NA   NA
 2024420 2024421 RD1_0695 RD1_0696     TRUE 0.934 10.000 0.323 NA   NA
 2024421 2024422 RD1_0696 RD1_0697     TRUE 0.960 0.000 0.240 NA   NA
 2024423 2024424 RD1_0698 RD1_0699   gst TRUE 0.932 -3.000 0.146 1.000 N NA
 2024424 2024425 RD1_0699 RD1_0700 gst   TRUE 0.894 11.000 0.139 1.000 N NA
 2024426 2024427 RD1_0701 RD1_0702     FALSE 0.054 91.000 0.000 NA   NA
 2024427 2024428 RD1_0702 RD1_0703     TRUE 0.879 38.000 0.474 1.000 N NA
 2024428 2024429 RD1_0703 RD1_0704     TRUE 0.828 102.000 0.421 1.000 Y NA
 2024431 2024432 RD1_0706 RD1_0708     TRUE 0.886 91.000 0.651 NA Y NA
 2024432 2024433 RD1_0708 RD1_0709     TRUE 0.639 133.000 0.464 NA Y NA
 2024433 2024434 RD1_0709 RD1_0710   paaK FALSE 0.342 163.000 0.479 1.000 N NA
 2024434 2024435 RD1_0710 RD1_0711 paaK   FALSE 0.073 131.000 0.027 NA   NA
 2024436 2024437 RD1_0715 RD1_0716     FALSE 0.460 -64.000 0.062 NA   NA
 2024439 2024440 RD1_0719 RD1_0720 dinB pyrF FALSE 0.005 343.000 0.000 1.000 N NA
 2024443 2024444 RD1_0723 RD1_0725     FALSE 0.075 129.000 0.008 1.000   NA
 2024444 2024445 RD1_0725 RD1_0726     TRUE 0.962 29.000 0.790 0.073   NA
 2024445 1596181 RD1_0726 RD1_0727   rrsA FALSE 0.001 830.000 0.000 NA   NA
 1596181 1596182 RD1_0727 RD1_0728 rrsA   FALSE 0.002 266.000 0.000 NA   NA
 1596182 1596183 RD1_0728 RD1_0729     FALSE 0.192 19.000 0.000 NA   NA
 1596183 1596184 RD1_0729 RD1_0730   rrlA FALSE 0.001 449.000 0.000 NA   NA
 1596184 1596185 RD1_0730 RD1_0731 rrlA rrfA FALSE 0.064 79.000 0.000 NA   NA
 1596185 2024446 RD1_0731 RD1_0732 rrfA   FALSE 0.205 17.000 0.000 NA   NA
 2024449 2024450 RD1_0735 RD1_0736     FALSE 0.410 -3.000 0.000 NA   NA
 2024450 2024451 RD1_0736 RD1_0737   ubiG FALSE 0.410 -3.000 0.000 NA   NA
 2024451 2024452 RD1_0737 RD1_0738 ubiG   FALSE 0.254 -37.000 0.006 NA   NA
 2024452 2024453 RD1_0738 RD1_0740     FALSE 0.001 495.000 0.000 NA   NA
 2024453 2024454 RD1_0740 RD1_0741     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA Y NA
 2024454 2024455 RD1_0741 RD1_0742     TRUE 0.906 61.000 0.500 NA Y NA
 2024455 2024456 RD1_0742 RD1_0743     TRUE 0.753 67.000 0.333 1.000 N NA
 2024456 2024457 RD1_0743 RD1_0744   dapA FALSE 0.463 -7.000 0.000 1.000 N NA
 2024458 2024459 RD1_0745 RD1_0746 yihV thiD FALSE 0.001 907.000 0.000 NA N NA
 2024459 2024460 RD1_0746 RD1_0747 thiD thiO TRUE 0.921 -3.000 0.117 1.000 N NA
 2024460 2024461 RD1_0747 RD1_0748 thiO thiS TRUE 0.866 -22.000 0.351 1.000 N NA
 2024461 2024462 RD1_0748 RD1_0749 thiS thiG TRUE 0.975 2.000 0.095 1.000 Y NA
 2024462 2024463 RD1_0749 RD1_0750 thiG thiE TRUE 0.986 -3.000 0.118 0.006 Y NA
 2024463 2024464 RD1_0750 RD1_0751 thiE thiF TRUE 0.964 -3.000 0.098 1.000 Y NA
 2024464 2024465 RD1_0751 RD1_0752 thiF   TRUE 0.811 11.000 0.074 NA N NA
 2024465 2024466 RD1_0752 RD1_0753   tenA TRUE 0.933 -3.000 0.189 NA N NA
 2024466 2024467 RD1_0753 RD1_0754 tenA   TRUE 0.891 9.000 0.100 1.000 N NA
 2024467 2024468 RD1_0754 RD1_0755   tenA TRUE 0.843 -3.000 0.033 1.000 N NA
 2024468 2024469 RD1_0755 RD1_0756 tenA   TRUE 0.861 -3.000 0.043 1.000 N NA
 2024470 2024471 RD1_0757 RD1_0758 arcD arcA FALSE 0.008 240.000 0.000 1.000   NA
 2024472 1596213 RD1_0759 RD1_0760   acr FALSE 0.055 89.000 0.000 NA   NA
 2024473 2024474 RD1_0763 RD1_0764     FALSE 0.001 391.000 0.000 NA   NA
 2024474 2024475 RD1_0764 RD1_0765     FALSE 0.060 82.000 0.000 NA   NA
 2024475 2024476 RD1_0765 RD1_0766     TRUE 0.967 0.000 0.250 1.000   NA
 2024476 2024477 RD1_0766 RD1_0767     FALSE 0.001 532.000 0.000 NA   NA
 2024477 2024478 RD1_0767 RD1_0768     FALSE 0.001 562.000 0.000 NA   NA
 2024478 2024479 RD1_0768 RD1_0769     FALSE 0.162 25.000 0.000 NA   NA
 2024479 2024480 RD1_0769 RD1_0770     TRUE 0.964 -3.000 0.435 NA   NA
 2024480 2024481 RD1_0770 RD1_0771     TRUE 0.923 16.000 0.426 1.000   NA
 2024481 2024482 RD1_0771 RD1_0772   groL FALSE 0.011 239.000 0.000 1.000 N NA
 2024482 2024483 RD1_0772 RD1_0773 groL groES TRUE 0.957 31.000 0.209 0.007 Y NA
 2024483 2024484 RD1_0773 RD1_0774 groES degP FALSE 0.032 278.000 0.000 1.000 Y NA
 2024484 2024485 RD1_0774 RD1_0775 degP htpX FALSE 0.039 474.000 0.000 0.026 Y NA
 2024485 2024486 RD1_0775 RD1_0776 htpX   FALSE 0.002 307.000 0.000 NA   NA
 2024486 2024487 RD1_0776 RD1_0777     FALSE 0.106 45.000 0.000 NA   NA
 2024487 2024488 RD1_0777 RD1_0778     FALSE 0.066 77.000 0.000 NA   NA
 2024488 2024489 RD1_0778 RD1_0779     FALSE 0.001 834.000 0.000 NA   NA
 2024490 2024491 RD1_0782 RD1_0783     FALSE 0.001 627.000 0.000 NA   NA
 2024491 2024492 RD1_0783 RD1_0784     FALSE 0.269 93.000 0.054 NA   NA
 2024492 2024493 RD1_0784 RD1_0785     TRUE 0.679 12.000 0.041 NA   NA
 2024493 2024494 RD1_0785 RD1_0786     TRUE 0.871 31.000 0.471 NA   NA
 2024494 2024495 RD1_0786 RD1_0787     TRUE 0.957 2.000 0.235 NA   NA
 2024495 2024496 RD1_0787 RD1_0788     TRUE 0.899 5.000 0.118 NA   NA
 2024496 2024497 RD1_0788 RD1_0789     FALSE 0.509 93.000 0.200 NA   NA
 2024497 2024498 RD1_0789 RD1_0790     TRUE 0.861 -3.000 0.067 NA N NA
 1596241 2024499 RD1_0791 RD1_0792     FALSE 0.121 37.000 0.000 NA   NA
 2024499 2024500 RD1_0792 RD1_0793   cydA FALSE 0.070 72.000 0.000 NA   NA
 2024500 2024501 RD1_0793 RD1_0794 cydA cydB TRUE 0.939 13.000 0.027 0.073 Y NA
 2024502 2024503 RD1_0795 RD1_0796     FALSE 0.410 -3.000 0.000 NA   NA
 2024503 2024504 RD1_0796 RD1_0797     FALSE 0.213 -7.000 0.000 NA   NA
 2024505 2024506 RD1_0798 RD1_0799     TRUE 0.955 -3.000 0.344 NA   NA
 2024506 2024507 RD1_0799 RD1_0800     TRUE 0.964 -3.000 0.365 1.000   NA
 2024507 2024508 RD1_0800 RD1_0801     TRUE 0.926 -10.000 0.623 NA   NA
 2024508 2024509 RD1_0801 RD1_0802   nifS TRUE 0.790 5.000 0.038 NA   NA
 2024509 2024510 RD1_0802 RD1_0803 nifS   FALSE 0.157 67.000 0.000 1.000   NA
 2024510 2024511 RD1_0803 RD1_0804   rpoD FALSE 0.029 148.000 0.000 1.000   NA
 2024511 2024512 RD1_0804 RD1_0805 rpoD   TRUE 0.883 0.000 0.038 1.000   NA
 2024512 2024513 RD1_0805 RD1_0806     FALSE 0.027 227.000 0.038 1.000   NA
 2024513 2024514 RD1_0806 RD1_0807     TRUE 0.584 -46.000 0.105 NA   NA
 2024514 2024515 RD1_0807 RD1_0808     FALSE 0.001 665.000 0.000 NA   NA
 2024517 2024518 RD1_0810 RD1_0811     FALSE 0.013 147.000 0.000 NA   NA
 2024519 2024520 RD1_0813 RD1_0814 dapF   TRUE 0.917 -3.000 0.109 1.000 N NA
 2024520 2024521 RD1_0814 RD1_0815     FALSE 0.015 223.000 0.004 1.000   NA
 2024521 2024522 RD1_0815 RD1_0816     FALSE 0.255 86.000 0.025 1.000   NA
 2024523 2024524 RD1_0817 RD1_0818     FALSE 0.020 171.000 0.000 1.000   NA
 2024524 2024525 RD1_0818 RD1_0819     TRUE 0.761 13.000 0.047 1.000 N NA
 2024527 2024528 RD1_0821 RD1_0823 pta   FALSE 0.464 46.000 0.065 NA   NA
 2024528 2024529 RD1_0823 RD1_0824     TRUE 0.631 20.000 0.065 NA   NA
 2024529 2024530 RD1_0824 RD1_0826   xsc FALSE 0.191 117.000 0.077 NA   NA
 2024530 2024531 RD1_0826 RD1_0828 xsc tauD TRUE 0.894 25.000 0.121 1.000 Y NA
 2024531 2024532 RD1_0828 RD1_0829 tauD tauX TRUE 0.938 28.000 0.259 0.001   NA
 2024532 2024533 RD1_0829 RD1_0830 tauX   TRUE 0.709 25.000 0.094 1.000   NA
 2024533 2024534 RD1_0830 RD1_0831   tauM TRUE 0.733 25.000 0.094 1.000 N NA
 2024534 2024535 RD1_0831 RD1_0832 tauM tauL TRUE 0.996 0.000 1.000 NA Y NA
 2024535 2024536 RD1_0832 RD1_0833 tauL tauK TRUE 0.933 64.000 0.769 NA Y NA
 2024537 2024538 RD1_0834 RD1_0836     FALSE 0.383 59.000 0.034 1.000   NA
 2024538 2024539 RD1_0836 RD1_0837     FALSE 0.410 -3.000 0.000 NA   NA
 2024541 2024542 RD1_0839 RD1_0840 gabT cpnE FALSE 0.239 55.000 0.000 1.000 N NA
 2024542 2024543 RD1_0840 RD1_0841 cpnE buk TRUE 0.911 6.000 0.000 1.000 Y NA
 2024543 2024544 RD1_0841 RD1_0842 buk ptb TRUE 0.959 -3.000 0.077 1.000 Y NA
 2024548 2024549 RD1_0846 RD1_0847     TRUE 0.991 0.000 0.500 NA Y NA
 2024549 2024550 RD1_0847 RD1_0848     TRUE 0.908 60.000 0.500 NA Y NA
 2024552 2024553 RD1_0850 RD1_0851     FALSE 0.051 94.000 0.000 NA   NA
 2024555 2024556 RD1_0854 RD1_0855     TRUE 0.894 93.000 0.714 NA Y NA
 2024556 2024557 RD1_0855 RD1_0856     TRUE 0.993 8.000 0.600 0.075 Y NA
 2024557 2024558 RD1_0856 RD1_0858     TRUE 0.990 -3.000 0.600 1.000 Y NA
 2024558 2024559 RD1_0858 RD1_0859     TRUE 0.996 4.000 0.667 0.033 Y NA
 2024559 2024560 RD1_0859 RD1_0861   hyuE TRUE 0.972 7.000 0.194 1.000 Y NA
 2024562 2024563 RD1_0864 RD1_0865     TRUE 0.916 85.000 0.833 NA Y NA
 2024563 2024564 RD1_0865 RD1_0866     TRUE 0.994 -3.000 0.909 1.000 Y NA
 2024564 2024565 RD1_0866 RD1_0867   rbsC TRUE 0.996 7.000 1.000 0.075 Y NA
 2024565 2024566 RD1_0867 RD1_0868 rbsC gnl TRUE 0.945 14.000 0.182 1.000 Y NA
 2024568 2024569 RD1_0870 RD1_0871   moxR FALSE 0.558 88.000 0.231 NA   NA
 2024569 2024570 RD1_0871 RD1_0873 moxR   TRUE 0.950 -3.000 0.308 NA   NA
 2024570 2024571 RD1_0873 RD1_0874     TRUE 0.985 -3.000 1.000 NA   NA
 2024571 2024572 RD1_0874 RD1_0875     TRUE 0.843 -7.000 0.211 NA   NA
 2024572 2024573 RD1_0875 RD1_0876     TRUE 0.943 -3.000 0.263 NA   NA
 2024573 2024574 RD1_0876 RD1_0877     FALSE 0.061 81.000 0.000 NA   NA
 2024574 2024575 RD1_0877 RD1_0878     FALSE 0.410 -3.000 0.000 NA   NA
 2024575 2024576 RD1_0878 RD1_0879     FALSE 0.009 171.000 0.000 NA   NA
 2024576 2024577 RD1_0879 RD1_0880     TRUE 0.960 12.000 0.667 NA   NA
 2024577 2024578 RD1_0880 RD1_0881     TRUE 0.696 69.000 0.333 NA   NA
 2024578 2024579 RD1_0881 RD1_0882     TRUE 0.647 34.000 0.120 NA   NA
 2024579 2024580 RD1_0882 RD1_0883     TRUE 0.974 -3.000 0.600 NA   NA
 2024584 2024585 RD1_0887 RD1_0888 flhA   TRUE 0.942 9.000 0.286 1.000   NA
 2024585 2024586 RD1_0888 RD1_0889     TRUE 0.869 36.000 0.455 1.000   NA
 2024586 2024587 RD1_0889 RD1_0890   moxF TRUE 0.630 126.000 0.385 0.072 N NA
 2024587 2024588 RD1_0890 RD1_0891 moxF cycB TRUE 0.810 109.000 0.571 0.072 N NA
 2024588 2024589 RD1_0891 RD1_0892 cycB   TRUE 0.897 -16.000 0.419 1.000 N NA
 2024589 2024590 RD1_0892 RD1_0893     TRUE 0.968 -3.000 0.488 NA   NA
 2024591 2024592 RD1_0894 RD1_0895     TRUE 0.935 -3.000 0.222 NA   NA
 2024592 2024593 RD1_0895 RD1_0896     TRUE 0.917 -16.000 0.667 NA   NA
 2024593 2024594 RD1_0896 RD1_0897     TRUE 0.960 0.000 0.238 NA   NA
 2024595 2024596 RD1_0898 RD1_0899     TRUE 0.961 13.000 0.793 NA   NA
 2024596 2024597 RD1_0899 RD1_0900     TRUE 0.785 32.000 0.259 NA   NA
 2024597 2024598 RD1_0900 RD1_0901     TRUE 0.928 18.000 0.571 NA   NA
 2024598 2024599 RD1_0901 RD1_0902     TRUE 0.694 -10.000 0.093 NA   NA
 2024599 2024600 RD1_0902 RD1_0903   ssuC TRUE 0.960 -16.000 0.628 NA Y NA
 2024600 2024601 RD1_0903 RD1_0904 ssuC   TRUE 0.992 -3.000 0.756 1.000 Y NA
 2024602 2024603 RD1_0905 RD1_0906     TRUE 0.982 3.000 0.620 NA   NA
 2024603 2024604 RD1_0906 RD1_0907     TRUE 0.980 5.000 0.713 NA   NA
 2024605 2024606 RD1_0908 RD1_0909     FALSE 0.544 119.000 0.500 NA   NA
 2024607 2024608 RD1_0910 RD1_0911     FALSE 0.132 98.000 0.014 NA   NA
 2024608 2024609 RD1_0911 RD1_0912     FALSE 0.385 29.000 0.021 NA   NA
 2024609 2024610 RD1_0912 RD1_0913     TRUE 0.864 -3.000 0.085 NA   NA
 2024610 2024611 RD1_0913 RD1_0914     TRUE 0.688 -3.000 0.015 NA   NA
 2024613 2024614 RD1_0916 RD1_0917     FALSE 0.006 196.000 0.000 NA   NA
 2024616 2024617 RD1_0919 RD1_0920     TRUE 0.982 0.000 0.011 0.007 Y NA
 2024617 2024618 RD1_0920 RD1_0921   troB TRUE 0.987 -3.000 0.432 1.000 Y NA
 2024618 2024619 RD1_0921 RD1_0922 troB   TRUE 0.994 -3.000 0.898 1.000 Y NA
 2024620 2024621 RD1_0923 RD1_0924   amt-2 FALSE 0.003 249.000 0.000 NA   NA
 2024621 2024622 RD1_0924 RD1_0925 amt-2 gntR FALSE 0.451 110.000 0.182 1.000 N NA
 2024623 2024624 RD1_0926 RD1_0927   gabD FALSE 0.037 108.000 0.000 NA   NA
 2024625 2024626 RD1_0928 RD1_0929   cln FALSE 0.271 126.000 0.143 1.000   NA
 2024626 2024627 RD1_0929 RD1_0930 cln   FALSE 0.138 150.000 0.125 NA   NA
 2024627 2024628 RD1_0930 RD1_0931     TRUE 0.943 11.000 0.411 NA   NA
 2024630 2024631 RD1_0933 RD1_0934 smpB mst FALSE 0.241 86.000 0.010 1.000 N NA
 2024631 2024632 RD1_0934 RD1_0935 mst tyrB TRUE 0.983 0.000 0.481 1.000 N NA
 2024633 2024634 RD1_0936 RD1_0937   glnB TRUE 0.810 28.000 0.191 1.000 N NA
 2024636 2024637 RD1_0939 RD1_0940     TRUE 0.941 15.000 0.553 NA N NA
 2024638 2024639 RD1_0941 RD1_0942     TRUE 0.980 -3.000 0.696 NA N NA
 2024639 2024640 RD1_0942 RD1_0943     TRUE 0.729 50.000 0.280 NA   NA
 2024640 2024641 RD1_0943 RD1_0944   pcd TRUE 0.866 -3.000 0.087 NA   NA
 2024641 2024642 RD1_0944 RD1_0945 pcd   TRUE 0.748 7.000 0.024 NA N NA
 2024644 2024645 RD1_0947 RD1_0948     TRUE 0.824 -3.000 0.035 1.000   NA
 2024646 2024647 RD1_0949 RD1_0950 map sfsA FALSE 0.469 54.000 0.080 NA   NA
 2024648 2024649 RD1_0951 RD1_0952     TRUE 0.881 -3.000 0.075 1.000   NA
 2024649 2024650 RD1_0952 RD1_0953     TRUE 0.821 -7.000 0.176 NA   NA
 2024650 2024651 RD1_0953 RD1_0954     TRUE 0.927 -3.000 0.194 NA   NA
 2024658 2024659 RD1_0961 RD1_0962     TRUE 0.818 3.000 0.032 NA   NA
 2024659 2024660 RD1_0962 RD1_0963   nth TRUE 0.792 -3.000 0.030 NA N NA
 2024661 2024662 RD1_0965 RD1_0966 ada   FALSE 0.447 15.000 0.011 NA   NA
 2024662 2024663 RD1_0966 RD1_0967     FALSE 0.315 -16.000 0.007 NA   NA
 2024663 2024664 RD1_0967 RD1_0968     FALSE 0.131 103.000 0.018 NA   NA
 2024669 2024670 RD1_0973 RD1_0974 dmsC   TRUE 0.984 0.000 0.548 1.000   NA
 2024670 2024671 RD1_0974 RD1_0975   phsA TRUE 0.826 86.000 0.306 1.000 Y NA
 2024673 2024674 RD1_0977 RD1_0978 xsc   TRUE 0.780 94.000 0.231 1.000 Y NA
 2024675 2024676 RD1_0979 RD1_0980 ppk2   FALSE 0.531 24.000 0.043 NA   NA
 2024678 2024679 RD1_0982 RD1_0983 tauA tauB TRUE 0.628 113.000 0.209 NA Y NA
 2024679 2024680 RD1_0983 RD1_0984 tauB tauC TRUE 0.992 -3.000 0.728 1.000 Y NA
 2024680 2024681 RD1_0984 RD1_0985 tauC   FALSE 0.376 -18.000 0.019 NA   NA
 2024681 2024682 RD1_0985 RD1_0986     TRUE 0.910 51.000 1.000 NA   NA
 2024682 2024683 RD1_0986 RD1_0987     FALSE 0.520 -22.000 0.057 NA   NA
 2024687 2024688 RD1_0992 RD1_0993     TRUE 0.684 75.000 0.250 1.000 N NA
 1596433 2024689 RD1_0994 RD1_0995     FALSE 0.071 70.000 0.000 NA   NA
 2024690 2024691 RD1_0996 RD1_0997     FALSE 0.421 56.000 0.065 NA   NA
 2024692 2024693 RD1_0998 RD1_0999 accA   FALSE 0.323 59.000 0.008 1.000 N NA
 2024696 2024697 RD1_1002 RD1_1003     TRUE 0.803 39.000 0.344 NA   NA
 2024697 2024698 RD1_1003 RD1_1004   dat TRUE 0.974 -3.000 0.233 0.076 N NA
 2024698 2024699 RD1_1004 RD1_1005 dat nodN TRUE 0.670 66.000 0.067 0.076 N NA
 2024703 2024704 RD1_1009 RD1_1010 rpmI rplT TRUE 0.994 13.000 0.928 0.013 Y NA
 2024704 2024705 RD1_1010 RD1_1011 rplT   FALSE 0.001 425.000 0.000 NA   NA
 2024705 2024706 RD1_1011 RD1_1012   pheS FALSE 0.011 192.000 0.002 NA   NA
 2024706 2024707 RD1_1012 RD1_1013 pheS pheT FALSE 0.291 455.000 0.574 0.001 Y NA
 2024707 2024708 RD1_1013 RD1_1014 pheT   FALSE 0.216 57.000 0.013 NA   NA
 2024708 2024709 RD1_1014 RD1_1015   mscL FALSE 0.022 170.000 0.008 NA   NA
 2024710 2024711 RD1_1016 RD1_1017     FALSE 0.410 -3.000 0.000 NA   NA
 2024712 2024713 RD1_1018 RD1_1019     TRUE 0.770 13.000 0.091 NA   NA
 2024713 2024714 RD1_1019 RD1_1020     TRUE 0.950 0.000 0.182 NA   NA
 2024714 2024715 RD1_1020 RD1_1021     TRUE 0.890 31.000 0.556 NA   NA
 2024715 2024716 RD1_1021 RD1_1023     FALSE 0.056 87.000 0.000 NA   NA
 2024716 2024717 RD1_1023 RD1_1024     FALSE 0.308 11.000 0.000 NA   NA
 2024717 2024718 RD1_1024 RD1_1025     TRUE 0.962 10.000 0.560 NA   NA
 2024718 2024719 RD1_1025 RD1_1026     TRUE 0.987 0.000 0.710 NA N NA
 2024719 2024720 RD1_1026 RD1_1027     TRUE 0.927 -3.000 0.194 NA   NA
 2024721 2024722 RD1_1028 RD1_1029     TRUE 0.985 -3.000 1.000 NA   NA
 2024723 2024724 RD1_1030 RD1_1031     FALSE 0.229 132.000 0.167 NA   NA
 2024724 2024725 RD1_1031 RD1_1032     TRUE 0.604 59.000 0.167 NA   NA
 2024727 2024728 RD1_1034 RD1_1035     TRUE 0.716 0.000 0.000 1.000   NA
 2024730 2024731 RD1_1037 RD1_1038     FALSE 0.183 87.000 0.022 NA   NA
 2024731 2024732 RD1_1038 RD1_1040     TRUE 0.637 64.000 0.179 1.000   NA
 2024732 2024733 RD1_1040 RD1_1041   qor TRUE 0.910 35.000 0.031 0.002 Y NA
 2024735 2024736 RD1_1043 RD1_1044     FALSE 0.050 136.000 0.016 NA   NA
 2024737 2024738 RD1_1045 RD1_1046 recR   TRUE 0.840 57.000 0.604 NA   NA
 2024738 2024739 RD1_1046 RD1_1047   dnaX TRUE 0.752 66.000 0.411 NA   NA
 2024739 2024740 RD1_1047 RD1_1048 dnaX idnD FALSE 0.019 190.000 0.000 1.000 N NA
 2024740 2024741 RD1_1048 RD1_1049 idnD   TRUE 0.922 13.000 0.300 1.000 N NA
 2024741 2024742 RD1_1049 RD1_1051     TRUE 0.990 3.000 0.500 NA Y NA
 2024742 2024743 RD1_1051 RD1_1052     TRUE 0.931 69.000 0.818 NA Y NA
 2024743 2024744 RD1_1052 RD1_1053     TRUE 0.949 17.000 0.636 1.000 N NA
 2024744 2024745 RD1_1053 RD1_1054     FALSE 0.049 190.000 0.043 1.000 N NA
 2024745 2024746 RD1_1054 RD1_1055   phnE TRUE 0.998 0.000 0.915 0.001 Y NA
 2024746 2024747 RD1_1055 RD1_1056 phnE phnC TRUE 0.996 -3.000 0.667 0.003 Y NA
 2024747 2024748 RD1_1056 RD1_1057 phnC phnD TRUE 0.967 68.000 0.667 0.003 Y NA
 2024749 2024750 RD1_1058 RD1_1059     FALSE 0.008 175.000 0.000 NA   NA
 2024750 2024751 RD1_1059 RD1_1060     TRUE 0.996 4.000 0.800 0.073 Y NA
 2024751 2024752 RD1_1060 RD1_1061   fbpC TRUE 0.957 -3.000 0.105 0.073 N NA
 2024752 2024753 RD1_1061 RD1_1062 fbpC   TRUE 0.903 1.000 0.067 NA N NA
 2024754 2024755 RD1_1064 RD1_1065   murA TRUE 0.655 5.000 0.009 NA   NA
 2024755 2024756 RD1_1065 RD1_1066 murA   TRUE 0.937 0.000 0.138 NA   NA
 2024756 2024757 RD1_1066 RD1_1068   hisD FALSE 0.545 46.000 0.096 NA   NA
 2024757 2024758 RD1_1068 RD1_1069 hisD   FALSE 0.542 70.000 0.157 NA   NA
 2024758 2024759 RD1_1069 RD1_1071   arsC TRUE 0.987 1.000 0.768 NA   NA
 2024761 2024762 RD1_1073 RD1_1074     FALSE 0.284 46.000 0.019 NA   NA
 2024762 2024763 RD1_1074 RD1_1075     TRUE 0.881 -10.000 0.364 NA   NA
 2024764 2024765 RD1_1076 RD1_1077     FALSE 0.466 75.000 0.115 NA   NA
 2024767 2024768 RD1_1079 RD1_1080     TRUE 0.988 0.000 0.303 0.005   NA
 2024769 2024770 RD1_1081 RD1_1082 lepA   FALSE 0.038 107.000 0.000 NA   NA
 2024770 2024771 RD1_1082 RD1_1083     FALSE 0.002 334.000 0.000 NA   NA
 2024771 2024772 RD1_1083 RD1_1084     FALSE 0.334 61.000 0.043 NA   NA
 2024773 2024774 RD1_1085 RD1_1087     FALSE 0.004 227.000 0.000 NA   NA
 2024774 2024775 RD1_1087 RD1_1088     TRUE 0.971 -3.000 0.538 NA   NA
 2024775 2024776 RD1_1088 RD1_1089     FALSE 0.172 23.000 0.000 NA   NA
 2024776 2024777 RD1_1089 RD1_1090     FALSE 0.132 -25.000 0.000 NA   NA
 2024777 2024778 RD1_1090 RD1_1092     TRUE 0.959 -3.000 0.328 1.000   NA
 2024778 2024779 RD1_1092 RD1_1093     TRUE 0.957 -3.000 0.276 1.000 N NA
 2024779 2024780 RD1_1093 RD1_1094     TRUE 0.994 -3.000 0.477 0.014 Y NA
 2024780 2024781 RD1_1094 RD1_1095     TRUE 0.975 -3.000 0.614 NA   NA
 2024782 2024783 RD1_1096 RD1_1097     FALSE 0.005 200.000 0.000 NA   NA
 2024784 2024785 RD1_1098 RD1_1099     FALSE 0.002 267.000 0.000 NA   NA
 2024785 2024786 RD1_1099 RD1_1100     TRUE 0.992 -3.000 0.929 0.073   NA
 2024786 2024787 RD1_1100 RD1_1101     TRUE 0.996 -3.000 0.821 0.073 Y NA
 2024787 2024788 RD1_1101 RD1_1102     TRUE 0.955 -7.000 0.741 1.000   NA
 2024790 2024791 RD1_1105 RD1_1106 rpe   FALSE 0.066 139.000 0.003 1.000 N NA
 2024791 2024792 RD1_1106 RD1_1107     FALSE 0.232 93.000 0.023 1.000   NA
 2024792 2024793 RD1_1107 RD1_1108   idnD FALSE 0.301 68.000 0.023 1.000   NA
 2024794 2024795 RD1_1109 RD1_1110 idnO   TRUE 0.573 49.000 0.118 NA   NA
 2024796 2024797 RD1_1111 RD1_1112     TRUE 0.868 2.000 0.051 NA   NA
 2024797 2024798 RD1_1112 RD1_1113     TRUE 0.883 34.000 0.567 NA   NA
 2024798 2024799 RD1_1113 RD1_1114     FALSE 0.373 94.000 0.079 1.000   NA
 2024799 2024800 RD1_1114 RD1_1115     TRUE 0.987 4.000 0.916 NA   NA
 2024800 2024801 RD1_1115 RD1_1116   adk-2 FALSE 0.412 57.000 0.063 NA   NA
 2024801 2024802 RD1_1116 RD1_1117 adk-2 acsA TRUE 0.943 5.000 0.179 1.000 N NA
 2024803 2024804 RD1_1118 RD1_1119   rarD FALSE 0.004 219.000 0.000 NA   NA
 2024806 2024807 RD1_1121 RD1_1122     FALSE 0.099 -172.000 0.000 NA   NA
 2024808 2024809 RD1_1123 RD1_1124     TRUE 0.996 -3.000 0.700 0.050 Y NA
 2024809 2024810 RD1_1124 RD1_1125   aggA TRUE 0.979 -3.000 0.600 1.000 N NA
 2024811 2024812 RD1_1126 RD1_1127     FALSE 0.188 105.000 0.043 NA   NA
 2024812 2024813 RD1_1127 RD1_1128     FALSE 0.100 108.000 0.013 NA   NA
 2024814 2024815 RD1_1129 RD1_1130 cysE   FALSE 0.490 3.000 0.000 NA   NA
 2024815 2024816 RD1_1130 RD1_1131     FALSE 0.243 81.000 0.036 NA   NA
 2024816 2024817 RD1_1131 RD1_1132     TRUE 0.900 5.000 0.119 NA   NA
 2024817 2024818 RD1_1132 RD1_1133   gst TRUE 0.961 -3.000 0.400 NA   NA
 2024821 2024822 RD1_1136 RD1_1137     FALSE 0.255 13.000 0.000 NA   NA
 2024823 2024824 RD1_1138 RD1_1140     FALSE 0.001 367.000 0.000 NA   NA
 2024825 2024826 RD1_1142 RD1_1143     FALSE 0.001 778.000 0.000 NA   NA
 2024826 2024827 RD1_1143 RD1_1144     TRUE 0.915 36.000 0.346 0.045   NA
 1596576 2024829 RD1_1148 RD1_1149     FALSE 0.074 67.000 0.000 NA   NA
 2024829 2024830 RD1_1149 RD1_1150   pqqE FALSE 0.210 64.000 0.015 NA   NA
 2024830 2024831 RD1_1150 RD1_1151 pqqE pqqD TRUE 0.986 -3.000 0.361 0.002   NA
 2024831 2024832 RD1_1151 RD1_1152 pqqD pqqC TRUE 0.991 2.000 0.404 0.002   NA
 2024832 2024833 RD1_1152 RD1_1153 pqqC pqqB TRUE 0.996 2.000 0.825 0.002   NA
 2024833 2024834 RD1_1153 RD1_1154 pqqB pqqA TRUE 0.880 25.000 0.073 0.002   NA
 2024834 2024835 RD1_1154 RD1_1155 pqqA prrA FALSE 0.532 98.000 0.200 1.000   NA
 2024835 2024836 RD1_1155 RD1_1156 prrA resE TRUE 0.986 5.000 0.393 1.000 Y NA
 2024838 2024839 RD1_1158 RD1_1159     TRUE 0.980 -3.000 0.635 1.000 N NA
 2024839 2024840 RD1_1159 RD1_1160   mclA FALSE 0.005 320.000 0.000 1.000 N NA
 2024841 2024842 RD1_1161 RD1_1162   mtkA TRUE 0.689 34.000 0.011 0.075 N NA
 2024842 2024843 RD1_1162 RD1_1163 mtkA mtkB TRUE 0.989 -3.000 0.140 0.001 Y NA
 2024843 2024844 RD1_1163 RD1_1164 mtkB gyaR TRUE 0.980 0.000 0.029 0.075 Y NA
 2024844 2024845 RD1_1164 RD1_1165 gyaR glyA TRUE 0.618 39.000 0.075 1.000 N NA
 2024845 2024846 RD1_1165 RD1_1166 glyA   FALSE 0.003 453.000 0.000 1.000   NA
 2024846 2024847 RD1_1166 RD1_1167     FALSE 0.002 298.000 0.000 NA   NA
 2024848 2024849 RD1_1168 RD1_1169 mcpA   FALSE 0.011 236.000 0.000 1.000 N NA
 2024851 2024852 RD1_1171 RD1_1172     FALSE 0.001 1916.000 0.000 NA   NA
 2024852 2024853 RD1_1172 RD1_1173     TRUE 0.941 -3.000 0.250 NA   NA
 2024853 2024854 RD1_1173 RD1_1174     TRUE 0.844 81.000 0.875 NA   NA
 2024854 2024855 RD1_1174 RD1_1175     TRUE 0.959 -3.000 0.375 NA   NA
 2024856 2024857 RD1_1176 RD1_1177 aspS   TRUE 0.721 38.000 0.007 1.000 Y NA
 2024859 2024860 RD1_1179 RD1_1180     TRUE 0.777 23.000 0.172 NA   NA
 2024861 2024862 RD1_1181 RD1_1182     TRUE 0.895 -3.000 0.075 1.000 N NA
 2024862 2024863 RD1_1182 RD1_1183     TRUE 0.577 15.000 0.022 NA N NA
 2024863 2024864 RD1_1183 RD1_1185   trpS FALSE 0.067 125.000 0.005 NA N NA
 2024866 2024867 RD1_1187 RD1_1188 mviN glnD TRUE 0.886 -3.000 0.081 1.000   NA
 2024867 2024868 RD1_1188 RD1_1189 glnD   FALSE 0.533 -19.000 0.043 NA N NA
 2024869 2024870 RD1_1190 RD1_1191     TRUE 0.931 -3.000 0.165 1.000   NA
 2024870 2024871 RD1_1191 RD1_1192   gshB FALSE 0.076 176.000 0.064 1.000 N NA
 2024872 2024873 RD1_1193 RD1_1194     TRUE 0.611 80.000 0.029 1.000 Y NA
 2024873 2024874 RD1_1194 RD1_1195     TRUE 0.631 60.000 0.134 1.000 N NA
 2024874 2024875 RD1_1195 RD1_1196   cobP TRUE 0.889 -3.000 0.069 1.000 N NA
 2024876 2024877 RD1_1197 RD1_1198 rpoH-1   TRUE 0.912 0.000 0.090 NA   NA
 2024877 2024878 RD1_1198 RD1_1200   coaBC FALSE 0.188 70.000 0.014 NA   NA
 2024878 2024879 RD1_1200 RD1_1201 coaBC dut TRUE 0.932 9.000 0.201 1.000 N NA
 2024879 2024880 RD1_1201 RD1_1202 dut moeB TRUE 0.884 0.000 0.027 1.000 N NA
 2024880 2024881 RD1_1202 RD1_1203 moeB dcp TRUE 0.660 61.000 0.163 1.000 N NA
 2024882 2024883 RD1_1204 RD1_1205   rodA TRUE 0.631 21.000 0.033 1.000 N NA
 2024883 2024884 RD1_1205 RD1_1206 rodA pbpA TRUE 0.909 -3.000 0.094 1.000 N NA
 2024884 2024885 RD1_1206 RD1_1207 pbpA mreD TRUE 0.831 32.000 0.351 NA   NA
 2024885 2024886 RD1_1207 RD1_1208 mreD mreC TRUE 0.770 -3.000 0.034 NA   NA
 2024886 2024887 RD1_1208 RD1_1209 mreC mreB TRUE 0.852 75.000 0.689 1.000 N NA
 2024887 2024888 RD1_1209 RD1_1210 mreB   FALSE 0.055 132.000 0.000 1.000 N NA
 2024888 2024889 RD1_1210 RD1_1211   leuA FALSE 0.245 133.000 0.003 1.000 Y NA
 2024890 2024891 RD1_1212 RD1_1213 csgA   TRUE 0.890 -3.000 0.085 1.000   NA
 2024893 2024894 RD1_1215 RD1_1216 nadE   FALSE 0.151 106.000 0.011 1.000   NA
 2024895 2024896 RD1_1217 RD1_1218     FALSE 0.185 20.000 0.000 NA   NA
 2024897 2024898 RD1_1219 RD1_1220 gltX   FALSE 0.277 76.000 0.011 1.000 N NA
 2024900 2024901 RD1_1222 RD1_1223 gcvT gcvH TRUE 0.972 18.000 0.202 0.005 Y NA
 2024901 2024902 RD1_1223 RD1_1225 gcvH gcvP TRUE 0.826 52.000 0.130 1.000 Y NA
 2024903 2024904 RD1_1226 RD1_1227     TRUE 0.989 -3.000 0.626 NA Y NA
 2024906 2024907 RD1_1229 RD1_1230 cspA   FALSE 0.001 380.000 0.000 NA   NA
 2024909 2024910 RD1_1232 RD1_1233 cspA   FALSE 0.023 122.000 0.000 NA   NA
 2024910 2024911 RD1_1233 RD1_1234     FALSE 0.004 228.000 0.000 NA   NA
 2024912 2024913 RD1_1235 RD1_1236     TRUE 0.879 11.000 0.167 NA   NA
 2024915 2024916 RD1_1238 RD1_1239     FALSE 0.410 -3.000 0.000 NA   NA
 2024916 2024917 RD1_1239 RD1_1240     FALSE 0.009 168.000 0.000 NA   NA
 2024917 2024918 RD1_1240 RD1_1242     TRUE 0.780 2.000 0.019 NA   NA
 2024918 2024919 RD1_1242 RD1_1243   nadD FALSE 0.335 37.000 0.003 1.000   NA
 2024919 2024920 RD1_1243 RD1_1244 nadD dacB FALSE 0.278 83.000 0.018 1.000 N NA
 2024922 2024923 RD1_1246 RD1_1247 lysS   FALSE 0.346 61.000 0.046 NA   NA
 2024926 2024927 RD1_1250 RD1_1251     TRUE 0.627 91.000 0.333 NA   NA
 2024927 2024928 RD1_1251 RD1_1252     FALSE 0.130 98.000 0.014 NA   NA
 2024928 2024929 RD1_1252 RD1_1253     FALSE 0.267 43.000 0.014 NA   NA
 2024929 2024930 RD1_1253 RD1_1254   uvrB FALSE 0.001 657.000 0.000 NA   NA
 2024934 2024935 RD1_1259 RD1_1260     FALSE 0.291 105.000 0.091 NA   NA
 2024937 2024938 RD1_1262 RD1_1263 cycM   FALSE 0.133 184.000 0.188 1.000 N NA
 2024938 2024939 RD1_1263 RD1_1264     TRUE 0.990 5.000 0.711 0.072   NA
 2024939 2024940 RD1_1264 RD1_1265     TRUE 0.993 4.000 0.882 0.072   NA
 2024940 2024941 RD1_1265 RD1_1266     TRUE 0.982 -3.000 0.744 1.000   NA
 2024945 2024946 RD1_1270 RD1_1271 ccoN ccoO TRUE 0.983 15.000 0.714 0.003 N NA
 2024946 2024947 RD1_1271 RD1_1272 ccoO ccoQ TRUE 0.960 13.000 0.229 0.003   NA
 2024947 2024948 RD1_1272 RD1_1273 ccoQ ccoP TRUE 0.980 -3.000 0.232 0.003   NA
 2024948 2024949 RD1_1273 RD1_1274 ccoP rdxB TRUE 0.829 108.000 0.203 0.020 Y NA
 2024949 2024950 RD1_1274 RD1_1275 rdxB rdxH TRUE 0.973 -3.000 0.506 NA N NA
 2024950 2024951 RD1_1275 RD1_1276 rdxH rdxI TRUE 0.973 -3.000 0.206 NA Y NA
 2024951 2024952 RD1_1276 RD1_1277 rdxI rdxS TRUE 0.991 -3.000 0.713 NA Y NA
 2024954 2024955 RD1_1279 RD1_1280 clpS rsmC FALSE 0.449 50.000 0.066 NA   NA
 2024955 2024956 RD1_1280 RD1_1281 rsmC   TRUE 0.756 25.000 0.109 1.000 N NA
 2024956 2024957 RD1_1281 RD1_1282   hemF FALSE 0.353 75.000 0.031 1.000 N NA
 2024959 1596709 RD1_1284 RD1_1285 hemE   FALSE 0.091 54.000 0.000 NA   NA
 1596709 2024960 RD1_1285 RD1_1286   dctP FALSE 0.011 156.000 0.000 NA   NA
 2024960 2024961 RD1_1286 RD1_1287 dctP   FALSE 0.086 58.000 0.000 NA   NA
 2024961 2024962 RD1_1287 RD1_1288   dctM TRUE 0.974 8.000 0.714 NA   NA
 2024962 2024963 RD1_1288 RD1_1289 dctM   FALSE 0.002 347.000 0.000 NA   NA
 2024964 2024965 RD1_1290 RD1_1291     FALSE 0.065 78.000 0.000 NA   NA
 2024965 2024966 RD1_1291 RD1_1292     FALSE 0.003 532.000 0.000 1.000 N NA
 2024966 2024967 RD1_1292 RD1_1293     TRUE 0.835 -3.000 0.029 1.000 N NA
 2024969 2024970 RD1_1295 RD1_1296     FALSE 0.127 -31.000 0.000 NA   NA
 2024970 2024971 RD1_1296 RD1_1297     FALSE 0.008 174.000 0.000 NA   NA
 2024973 2024974 RD1_1299 RD1_1300     FALSE 0.003 249.000 0.000 NA   NA
 2024974 2024975 RD1_1300 RD1_1301     TRUE 0.881 68.000 1.000 NA   NA
 2024977 2024978 RD1_1303 RD1_1304 nas rpmE FALSE 0.007 247.000 0.000 1.000   NA
 2024978 2024979 RD1_1304 RD1_1305 rpmE rplS TRUE 0.957 12.000 0.027 0.013 Y NA
 2024979 2024980 RD1_1305 RD1_1306 rplS   FALSE 0.002 271.000 0.000 NA   NA
 2024980 2024981 RD1_1306 RD1_1307   trmD FALSE 0.004 221.000 0.000 NA   NA
 2024981 2024982 RD1_1307 RD1_1308 trmD rimM TRUE 0.928 68.000 0.672 1.000 Y NA
 2024982 2024983 RD1_1308 RD1_1310 rimM   TRUE 0.599 -3.000 0.003 NA   NA
 2024983 2024984 RD1_1310 RD1_1311   rpsP FALSE 0.099 49.000 0.000 NA   NA
 2024984 2024985 RD1_1311 RD1_1312 rpsP   FALSE 0.555 41.000 0.050 1.000 N NA
 2024985 2024986 RD1_1312 RD1_1313     FALSE 0.419 94.000 0.112 NA N NA
 2024986 2024987 RD1_1313 RD1_1314     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA Y NA
 2024987 2024988 RD1_1314 RD1_1315     FALSE 0.471 24.000 0.002 1.000 N NA
 2024988 2024989 RD1_1315 RD1_1316     FALSE 0.005 214.000 0.000 NA   NA
 2024990 2024991 RD1_1317 RD1_1318     TRUE 0.969 -3.000 0.500 NA   NA
 2024993 2024994 RD1_1321 RD1_1322 atpI atpB TRUE 0.968 2.000 0.046 0.003   NA
 2024994 2024995 RD1_1322 RD1_1323 atpB atpE TRUE 0.940 56.000 0.628 0.003   NA
 2024995 2024996 RD1_1323 RD1_1324 atpE atpX TRUE 0.831 83.000 0.278 0.003   NA
 2024996 2024997 RD1_1324 RD1_1325 atpX atpF TRUE 0.997 6.000 0.863 0.003 Y NA
 2024999 2025000 RD1_1327 RD1_1328 smc   FALSE 0.243 33.000 0.003 NA   NA
 2025001 2025002 RD1_1329 RD1_1330   cobD TRUE 0.824 19.000 0.144 1.000 N NA
 2025002 2025003 RD1_1330 RD1_1331 cobD cobC TRUE 0.985 -3.000 0.344 0.009 N NA
 2025008 2025009 RD1_1337 RD1_1338 def def TRUE 0.995 -3.000 0.429 0.001 Y NA
 2025009 2025010 RD1_1338 RD1_1339 def fmt TRUE 0.927 19.000 0.023 0.020 Y NA
 2025010 2025011 RD1_1339 RD1_1340 fmt   TRUE 0.765 0.000 0.014 NA   NA
 2025012 2025013 RD1_1341 RD1_1342 acrD   TRUE 0.987 4.000 0.853 NA N NA
 2025013 2025014 RD1_1342 RD1_1343     FALSE 0.323 102.000 0.059 1.000 N NA
 2025014 2025015 RD1_1343 RD1_1344     TRUE 0.967 7.000 0.429 1.000 N NA
 2025015 2025016 RD1_1344 RD1_1345     TRUE 0.983 -3.000 0.714 1.000 N NA
 2025018 2025019 RD1_1347 RD1_1348     FALSE 0.110 156.000 0.065 1.000 N NA
 2025019 2025020 RD1_1348 RD1_1349     FALSE 0.406 50.000 0.050 NA   NA
 2025020 2025021 RD1_1349 RD1_1350     FALSE 0.414 29.000 0.027 NA   NA
 2025021 2025022 RD1_1350 RD1_1351   rnhA TRUE 0.780 3.000 0.022 NA   NA
 2025022 2025023 RD1_1351 RD1_1352 rnhA   TRUE 0.607 -7.000 0.025 1.000   NA
 2025023 2025024 RD1_1352 RD1_1353     TRUE 0.907 -3.000 0.140 NA   NA
 2025024 2025025 RD1_1353 RD1_1354     TRUE 0.600 35.000 0.097 NA   NA
 2025025 2025026 RD1_1354 RD1_1355   ispH FALSE 0.491 -22.000 0.029 1.000   NA
 2025026 2025027 RD1_1355 RD1_1356 ispH   FALSE 0.308 102.000 0.091 NA   NA
 2025028 2025029 RD1_1357 RD1_1358 folK rpoZ FALSE 0.400 77.000 0.049 1.000 N NA
 2025029 2025030 RD1_1358 RD1_1359 rpoZ spoT TRUE 0.912 38.000 0.291 1.000 Y NA
 2025030 2025031 RD1_1359 RD1_1360 spoT   FALSE 0.356 87.000 0.086 NA   NA
 2025031 2025032 RD1_1360 RD1_1362   pdxJ FALSE 0.501 31.000 0.050 NA   NA
 2025032 2025033 RD1_1362 RD1_1363 pdxJ rhtC TRUE 0.772 -3.000 0.006 1.000 N NA
 2025033 2025034 RD1_1363 RD1_1364 rhtC acpS TRUE 0.769 -3.000 0.005 1.000 N NA
 2025034 2025035 RD1_1364 RD1_1365 acpS lepB TRUE 0.591 42.000 0.070 1.000 N NA
 2025035 2025036 RD1_1365 RD1_1366 lepB rnc TRUE 0.882 -3.000 0.062 1.000 N NA
 2025036 2025037 RD1_1366 RD1_1367 rnc era TRUE 0.959 -3.000 0.098 0.038   NA
 2025037 2025038 RD1_1367 RD1_1368 era   TRUE 0.668 46.000 0.182 NA   NA
 2025038 2025039 RD1_1368 RD1_1369   recO TRUE 0.792 0.000 0.020 NA   NA
 2025040 2025041 RD1_1370 RD1_1371     TRUE 0.914 -3.000 0.154 NA   NA
 2025041 2025042 RD1_1371 RD1_1372   ibd2 FALSE 0.055 171.000 0.036 1.000   NA
 2025042 2025043 RD1_1372 RD1_1373 ibd2   FALSE 0.007 253.000 0.000 1.000   NA
 2025044 2025045 RD1_1374 RD1_1375     TRUE 0.794 92.000 0.750 NA   NA
 2025047 2025048 RD1_1377 RD1_1378 chvI chvG TRUE 0.961 44.000 0.829 1.000 Y NA
 2025048 2025049 RD1_1378 RD1_1379 chvG hprK TRUE 0.919 34.000 0.304 0.008   NA
 2025049 2025050 RD1_1379 RD1_1380 hprK   TRUE 0.832 -7.000 0.194 NA   NA
 2025050 2025051 RD1_1380 RD1_1382     TRUE 0.935 4.000 0.171 NA   NA
 2025051 2025052 RD1_1382 RD1_1383   ptsH TRUE 0.986 17.000 0.420 0.002 Y NA
 2025052 2025053 RD1_1383 RD1_1384 ptsH   TRUE 0.762 41.000 0.228 1.000   NA
 2025056 2025057 RD1_1387 RD1_1388 etfA etfB TRUE 0.996 0.000 0.452 0.020 Y NA
 2025057 2025058 RD1_1388 RD1_1389 etfB   FALSE 0.042 180.000 0.030 1.000   NA
 2025058 2025059 RD1_1389 RD1_1390     TRUE 0.904 7.000 0.156 NA   NA
 2025059 2025060 RD1_1390 RD1_1391     TRUE 0.769 32.000 0.231 NA   NA
 2025060 2025061 RD1_1391 RD1_1392     FALSE 0.243 57.000 0.018 NA   NA
 2025064 2025065 RD1_1395 RD1_1396   tufA FALSE 0.093 113.000 0.016 NA   NA
 2025067 2025068 RD1_1398 RD1_1399 rpsJ rplC TRUE 0.973 21.000 0.307 0.017 Y NA
 2025068 2025069 RD1_1399 RD1_1400 rplC rplD TRUE 0.994 -3.000 0.486 0.013 Y NA
 2025069 2025070 RD1_1400 RD1_1401 rplD rplW TRUE 0.989 -3.000 0.513 1.000 Y NA
 2025070 2025071 RD1_1401 RD1_1402 rplW   FALSE 0.007 270.000 0.000 1.000 N NA
 2025071 2025072 RD1_1402 RD1_1403     FALSE 0.014 187.000 0.000 1.000   NA
 2025074 2025075 RD1_1405 RD1_1406 rplB rpsS TRUE 0.997 4.000 0.820 0.017 Y NA
 2025075 2025076 RD1_1406 RD1_1407 rpsS rplV TRUE 0.985 -3.000 0.119 0.017 Y NA
 2025076 2025077 RD1_1407 RD1_1408 rplV rpsC TRUE 0.990 0.000 0.109 0.017 Y NA
 2025077 2025078 RD1_1408 RD1_1409 rpsC rplP TRUE 0.992 14.000 0.828 0.017 Y NA
 2025078 2025079 RD1_1409 RD1_1410 rplP   FALSE 0.002 325.000 0.000 NA   NA
 2025080 2025081 RD1_1411 RD1_1412     FALSE 0.012 152.000 0.000 NA   NA
 2025083 2025084 RD1_1415 RD1_1416 arcB arcA TRUE 0.967 9.000 0.174 1.000 Y NA
 2025084 2025085 RD1_1416 RD1_1417 arcA   FALSE 0.082 191.000 0.000 1.000 Y NA
 2025086 2025087 RD1_1418 RD1_1419   rpsQ TRUE 0.994 12.000 0.828 0.013 Y NA
 2025087 2025088 RD1_1419 RD1_1420 rpsQ rplN TRUE 0.967 70.000 0.791 0.017 Y NA
 2025088 2025089 RD1_1420 RD1_1421 rplN rplX TRUE 0.997 3.000 0.810 0.017 Y NA
 2025089 2025090 RD1_1421 RD1_1422 rplX rplE TRUE 0.990 -7.000 0.758 0.013 Y NA
 2025090 2025091 RD1_1422 RD1_1423 rplE rpsN TRUE 0.974 21.000 0.309 0.013 Y NA
 2025091 2025092 RD1_1423 RD1_1424 rpsN rpsH TRUE 0.983 13.000 0.295 0.013 Y NA
 2025092 2025093 RD1_1424 RD1_1425 rpsH rplF TRUE 0.995 11.000 0.808 0.013 Y NA
 2025093 2025094 RD1_1425 RD1_1426 rplF rplR TRUE 0.994 12.000 0.815 0.013 Y NA
 2025094 2025095 RD1_1426 RD1_1428 rplR rpsE TRUE 0.941 107.000 0.814 0.017 Y NA
 2025095 2025096 RD1_1428 RD1_1429 rpsE rpmD TRUE 0.993 13.000 0.789 0.017 Y NA
 2025096 2025097 RD1_1429 RD1_1430 rpmD   FALSE 0.032 137.000 0.002 NA   NA
 2025097 2025098 RD1_1430 RD1_1431   rplO FALSE 0.001 1153.000 0.000 NA   NA
 2025098 2025099 RD1_1431 RD1_1432 rplO secY TRUE 0.682 120.000 0.730 1.000 N NA
 2025099 2025100 RD1_1432 RD1_1433 secY adk TRUE 0.829 -3.000 0.026 1.000 N NA
 2025102 2025103 RD1_1435 RD1_1436 rpsM rpsK TRUE 0.991 16.000 0.810 0.013 Y NA
 2025103 2025104 RD1_1436 RD1_1437 rpsK rpoA TRUE 0.610 103.000 0.308 1.000 N NA
 2025104 2025105 RD1_1437 RD1_1438 rpoA rplQ TRUE 0.664 130.000 0.873 1.000 N NA
 2025105 2025106 RD1_1438 RD1_1439 rplQ   FALSE 0.018 223.000 0.002 1.000 N NA
 2025106 2025107 RD1_1439 RD1_1440   crcB FALSE 0.259 67.000 0.019 NA N NA
 2025107 2025108 RD1_1440 RD1_1441 crcB rluC TRUE 0.851 -3.000 0.059 NA N NA
 2025108 2025109 RD1_1441 RD1_1442 rluC   TRUE 0.978 0.000 0.389 1.000   NA
 2025109 2025110 RD1_1442 RD1_1443     TRUE 0.954 4.000 0.269 NA   NA
 2025110 2025111 RD1_1443 RD1_1444   bztA FALSE 0.038 199.000 0.048 NA N NA
 2025111 2025112 RD1_1444 RD1_1445 bztA bztB TRUE 0.649 134.000 0.202 0.071 Y NA
 2025112 2025113 RD1_1445 RD1_1446 bztB   TRUE 0.997 4.000 0.815 0.008 Y NA
 2025114 2025115 RD1_1447 RD1_1448     FALSE 0.004 217.000 0.000 NA   NA
 2025115 2025116 RD1_1448 RD1_1449     TRUE 0.938 4.000 0.183 NA   NA
 2025116 2025117 RD1_1449 RD1_1450     TRUE 0.826 -3.000 0.057 NA   NA
 2025117 2025118 RD1_1450 RD1_1452   argB FALSE 0.153 91.000 0.005 NA N NA
 2025118 2025119 RD1_1452 RD1_1453 argB   FALSE 0.565 30.000 0.046 1.000   NA
 2025119 2025120 RD1_1453 RD1_1454     TRUE 0.861 0.000 0.025 1.000   NA
 2025120 2025121 RD1_1454 RD1_1455   oxaA TRUE 0.812 -3.000 0.030 1.000   NA
 2025121 2025122 RD1_1455 RD1_1456 oxaA   FALSE 0.050 172.000 0.021 1.000 N NA
 2025122 2025123 RD1_1456 RD1_1457     FALSE 0.158 120.000 0.049 NA N NA
 2025123 2025124 RD1_1457 RD1_1458     FALSE 0.521 12.000 0.011 NA   NA
 2025124 2025125 RD1_1458 RD1_1459   rnpA TRUE 0.971 -3.000 0.540 NA   NA
 2025125 2025126 RD1_1459 RD1_1462 rnpA rpmH TRUE 0.941 25.000 0.787 1.000   NA
 2025127 2025128 RD1_1463 RD1_1464 merA merA TRUE 0.921 -58.000 0.320 0.001   NA
 2025128 2025129 RD1_1464 RD1_1465 merA regM TRUE 0.929 12.000 0.287 1.000 N NA
 2025129 1596880 RD1_1465 RD1_1466 regM   FALSE 0.024 121.000 0.000 NA   NA
 1596880 2025130 RD1_1466 RD1_1467     FALSE 0.014 144.000 0.000 NA   NA
 2025130 2025131 RD1_1467 RD1_1468     FALSE 0.001 1516.000 0.000 NA   NA
 2025133 2025134 RD1_1470 RD1_1471     FALSE 0.003 240.000 0.000 NA   NA
 2025134 2025135 RD1_1471 RD1_1472   gatM FALSE 0.004 235.000 0.000 NA   NA
 2025136 2025137 RD1_1474 RD1_1475   mcd TRUE 0.692 3.000 0.000 1.000   NA
 2025137 2025138 RD1_1475 RD1_1476 mcd   TRUE 0.854 -3.000 0.050 1.000   NA
 2025138 2025139 RD1_1476 RD1_1477     TRUE 0.995 0.000 0.900 NA Y NA
 2025139 2025140 RD1_1477 RD1_1478     TRUE 0.952 23.000 0.436 NA Y NA
 2025142 2025143 RD1_1480 RD1_1481   mtlK FALSE 0.002 309.000 0.000 NA   NA
 2025143 2025144 RD1_1481 RD1_1482 mtlK   FALSE 0.177 -12.000 0.000 NA   NA
 2025144 2025145 RD1_1482 RD1_1483     FALSE 0.129 34.000 0.000 NA   NA
 2025145 2025146 RD1_1483 RD1_1484     TRUE 0.983 13.000 0.373 0.070 Y NA
 2025146 2025147 RD1_1484 RD1_1485     TRUE 0.994 11.000 0.918 0.070 Y NA
 2025147 2025148 RD1_1485 RD1_1486     TRUE 0.781 120.000 0.306 0.070 Y NA
 2025148 2025149 RD1_1486 RD1_1487     FALSE 0.530 115.000 0.333 1.000 N NA
 2025149 2025150 RD1_1487 RD1_1488     FALSE 0.003 458.000 0.000 1.000 N NA
 2025150 2025151 RD1_1488 RD1_1489     TRUE 0.607 77.000 0.167 1.000 N NA
 2025152 2025153 RD1_1490 RD1_1491     TRUE 0.893 22.000 0.100 1.000 Y NA
 2025153 2025154 RD1_1491 RD1_1492     FALSE 0.046 100.000 0.000 NA   NA
 2025154 2025155 RD1_1492 RD1_1493     FALSE 0.109 43.000 0.000 NA   NA
 2025156 2025157 RD1_1494 RD1_1495 fmdA   FALSE 0.410 104.000 0.111 1.000 N NA
 2025157 2025158 RD1_1495 RD1_1496     TRUE 0.951 -3.000 0.258 1.000   NA
 2025158 2025159 RD1_1496 RD1_1497     TRUE 0.828 10.000 0.065 1.000   NA
 2025159 2025160 RD1_1497 RD1_1498     TRUE 0.979 -3.000 0.600 1.000 N NA
 2025161 2025162 RD1_1499 RD1_1500     TRUE 0.923 -3.000 0.120 1.000 N NA
 2025162 2025163 RD1_1500 RD1_1501     FALSE 0.560 44.000 0.060 1.000 N NA
 2025163 2025164 RD1_1501 RD1_1502     TRUE 0.963 31.000 0.667 1.000 Y NA
 2025164 2025165 RD1_1502 RD1_1503     TRUE 0.928 45.000 0.444 1.000 Y NA
 2025165 2025166 RD1_1503 RD1_1504     TRUE 0.994 2.000 0.667 1.000 Y NA
 2025166 2025167 RD1_1504 RD1_1505     TRUE 0.975 -3.000 0.057 0.070 Y NA
 2025168 2025169 RD1_1506 RD1_1507     TRUE 0.837 34.000 0.333 1.000   NA
 2025169 2025170 RD1_1507 RD1_1508   soxS TRUE 0.889 28.000 0.500 NA   NA
 2025171 2025172 RD1_1509 RD1_1510 ccdA soxW TRUE 0.910 16.000 0.417 NA   NA
 2025172 2025173 RD1_1510 RD1_1511 soxW soxX TRUE 0.607 120.000 0.667 NA   NA
 2025173 2025174 RD1_1511 RD1_1512 soxX soxY TRUE 0.882 49.000 0.741 NA   NA
 2025174 2025175 RD1_1512 RD1_1513 soxY soxZ TRUE 0.928 21.000 0.656 NA   NA
 2025175 2025176 RD1_1513 RD1_1514 soxZ soxA TRUE 0.934 26.000 0.812 NA   NA
 2025176 2025177 RD1_1514 RD1_1515 soxA soxB TRUE 0.797 98.000 0.735 1.000   NA
 2025177 2025178 RD1_1515 RD1_1516 soxB soxC TRUE 0.901 30.000 0.518 1.000   NA
 2025178 2025179 RD1_1516 RD1_1517 soxC soxD TRUE 0.897 -16.000 0.214 0.068   NA
 2025179 2025180 RD1_1517 RD1_1518 soxD soxE TRUE 0.992 5.000 0.316 0.014 Y NA
 2025180 2025181 RD1_1518 RD1_1519 soxE soxF TRUE 0.958 29.000 0.632 NA Y NA
 2025181 2025182 RD1_1519 RD1_1520 soxF   TRUE 0.677 81.000 0.357 NA   NA
 2025182 2025183 RD1_1520 RD1_1521     FALSE 0.285 110.000 0.107 NA   NA
 2025184 2025185 RD1_1522 RD1_1523     TRUE 0.972 3.000 0.346 1.000   NA
 2025185 2025186 RD1_1523 RD1_1524     FALSE 0.084 60.000 0.000 NA   NA
 2025187 2025188 RD1_1525 RD1_1526     TRUE 0.921 43.000 1.000 NA   NA
 2025188 2025189 RD1_1526 RD1_1527   nadC FALSE 0.154 65.000 0.004 NA   NA
 2025189 2025190 RD1_1527 RD1_1528 nadC   FALSE 0.490 24.000 0.005 1.000 N NA
 2025192 2025193 RD1_1531 RD1_1532 marR   FALSE 0.286 143.000 0.222 1.000 N NA
 2025193 2025194 RD1_1532 RD1_1533   mop TRUE 0.997 1.000 0.667 0.068 Y NA
 2025194 2025195 RD1_1533 RD1_1534 mop   TRUE 0.896 -7.000 0.355 NA   NA
 2025195 2025196 RD1_1534 RD1_1535     TRUE 0.936 5.000 0.214 NA   NA
 2025196 2025197 RD1_1535 RD1_1536     TRUE 0.774 -13.000 0.171 NA   NA
 2025197 2025198 RD1_1536 RD1_1537     TRUE 0.978 -3.000 0.680 NA   NA
 2025198 2025199 RD1_1537 RD1_1539     FALSE 0.001 460.000 0.000 NA   NA
 2025199 2025200 RD1_1539 RD1_1541     TRUE 0.888 74.000 0.500 NA Y NA
 2025200 2025201 RD1_1541 RD1_1542     TRUE 0.994 4.000 0.875 NA Y NA
 2025203 2025204 RD1_1545 RD1_1546   nosR FALSE 0.012 150.000 0.000 NA   NA
 2025204 2025205 RD1_1546 RD1_1547 nosR nosZ TRUE 0.736 19.000 0.070 1.000 N NA
 2025205 2025206 RD1_1547 RD1_1548 nosZ nosD TRUE 0.980 4.000 0.146 0.003 N NA
 2025206 2025207 RD1_1548 RD1_1549 nosD nosF TRUE 0.962 -10.000 0.963 1.000 N NA
 2025207 2025208 RD1_1549 RD1_1550 nosF nosY TRUE 0.969 -3.000 0.500 NA   NA
 2025208 2025209 RD1_1550 RD1_1551 nosY nosL TRUE 0.971 -3.000 0.519 NA   NA
 2025209 2025210 RD1_1551 RD1_1552 nosL nosX TRUE 0.867 -3.000 0.071 NA N NA
 2025212 2025213 RD1_1554 RD1_1556 hbaR   FALSE 0.375 -37.000 0.029 NA   NA
 2025214 2025215 RD1_1557 RD1_1558 norF norE TRUE 0.963 -3.000 0.071 0.002   NA
 2025215 2025216 RD1_1558 RD1_1559 norE norD TRUE 0.978 -3.000 0.164 0.002 N NA
 2025216 2025217 RD1_1559 RD1_1560 norD norQ TRUE 0.993 4.000 0.590 0.002   NA
 2025217 2025218 RD1_1560 RD1_1561 norQ norB TRUE 0.990 -3.000 0.529 0.002   NA
 2025218 2025219 RD1_1561 RD1_1562 norB norC TRUE 0.991 10.000 0.794 0.002   NA
 2025219 2025220 RD1_1562 RD1_1563 norC cycA TRUE 0.579 84.000 0.032 0.014   NA
 2025220 2025221 RD1_1563 RD1_1564 cycA nosR TRUE 0.885 24.000 0.333 1.000 N NA
 2025222 2025223 RD1_1565 RD1_1566 nirS nirE FALSE 0.444 112.000 0.214 1.000   NA
 2025223 2025224 RD1_1566 RD1_1567 nirE nirC TRUE 0.825 -7.000 0.143 1.000   NA
 2025224 2025225 RD1_1567 RD1_1568 nirC nirF TRUE 0.991 0.000 0.372 0.002   NA
 2025225 2025226 RD1_1568 RD1_1569 nirF nirD TRUE 0.862 11.000 0.140 NA   NA
 2025226 2025227 RD1_1569 RD1_1570 nirD nirG TRUE 0.935 -10.000 0.276 NA Y NA
 2025227 2025228 RD1_1570 RD1_1571 nirG nirH TRUE 0.980 -3.000 0.310 NA Y NA
 2025228 2025229 RD1_1571 RD1_1572 nirH nirJ TRUE 0.971 0.000 0.348 NA   NA
 2025229 2025230 RD1_1572 RD1_1573 nirJ nirN TRUE 0.889 -25.000 0.500 1.000   NA
 2025230 2025231 RD1_1573 RD1_1574 nirN cbiX FALSE 0.547 -43.000 0.062 1.000   NA
 2025231 2025232 RD1_1574 RD1_1575 cbiX   TRUE 0.936 -3.000 0.182 1.000   NA
 2025232 2025233 RD1_1575 RD1_1576   hemA TRUE 0.631 66.000 0.182 1.000   NA
 2025233 2025234 RD1_1576 RD1_1577 hemA   FALSE 0.002 275.000 0.000 NA   NA
 2025234 2025235 RD1_1577 RD1_1579     FALSE 0.005 206.000 0.000 NA   NA
 2025239 2025240 RD1_1583 RD1_1584     TRUE 0.628 115.000 0.632 NA   NA
 2025240 2025241 RD1_1584 RD1_1585     FALSE 0.001 597.000 0.000 NA   NA
 2025242 2025243 RD1_1586 RD1_1587   mexF FALSE 0.105 145.000 0.040 1.000 N NA
 2025243 2025244 RD1_1587 RD1_1588 mexF   TRUE 0.913 -46.000 0.720 1.000 N NA
 2025244 2025245 RD1_1588 RD1_1589     FALSE 0.276 86.000 0.050 NA   NA
 2025245 2025246 RD1_1589 RD1_1590   tlpA FALSE 0.050 96.000 0.000 NA   NA
 2025247 2025248 RD1_1591 RD1_1592 argH   FALSE 0.288 -18.000 0.005 NA   NA
 2025248 2025249 RD1_1592 RD1_1593     TRUE 0.959 6.000 0.400 NA   NA
 2025249 2025250 RD1_1593 RD1_1594     TRUE 0.909 2.000 0.091 NA   NA
 2025250 2025251 RD1_1594 RD1_1595   lysA FALSE 0.220 91.000 0.017 1.000   NA
 2025251 2025252 RD1_1595 RD1_1596 lysA   FALSE 0.470 43.000 0.062 NA   NA
 2025253 2025254 RD1_1597 RD1_1598     FALSE 0.031 113.000 0.000 NA   NA
 2025255 2025256 RD1_1599 RD1_1600 ftsE   TRUE 0.978 0.000 0.139 NA Y NA
 2025256 2025257 RD1_1600 RD1_1601     TRUE 0.966 0.000 0.267 NA N NA
 2025257 2025258 RD1_1601 RD1_1602     TRUE 0.770 -16.000 0.153 1.000   NA
 2025261 2025262 RD1_1605 RD1_1606     TRUE 0.635 -19.000 0.095 NA   NA
 2025262 2025263 RD1_1606 RD1_1607     TRUE 0.930 11.000 0.333 NA   NA
 2025263 2025264 RD1_1607 RD1_1608   sucB FALSE 0.001 570.000 0.000 NA   NA
 2025264 2025265 RD1_1608 RD1_1609 sucB sucA TRUE 0.993 4.000 0.667 1.000 Y NA
 2025265 2025266 RD1_1609 RD1_1610 sucA   TRUE 0.733 -3.000 0.006 1.000   NA
 2025266 2025267 RD1_1610 RD1_1611   sucD FALSE 0.025 203.000 0.016 1.000   NA
 2025267 2025268 RD1_1611 RD1_1612 sucD   FALSE 0.465 16.000 0.016 NA   NA
 2025268 2025269 RD1_1612 RD1_1613     TRUE 0.985 -3.000 1.000 NA   NA
 2025269 2025270 RD1_1613 RD1_1614     FALSE 0.019 129.000 0.000 NA   NA
 2025270 2025271 RD1_1614 RD1_1615   sucC FALSE 0.461 4.000 0.000 NA   NA
 2025276 2025277 RD1_1620 RD1_1621 citE   TRUE 0.939 5.000 0.223 NA   NA
 2025277 2025278 RD1_1621 RD1_1622     TRUE 0.852 17.000 0.243 NA   NA
 2025278 2025279 RD1_1622 RD1_1623     TRUE 0.971 0.000 0.347 NA   NA
 2025279 2025280 RD1_1623 RD1_1624     FALSE 0.331 72.000 0.053 NA   NA
 2025280 2025281 RD1_1624 RD1_1625     TRUE 0.814 56.000 0.500 NA   NA
 2025281 2025282 RD1_1625 RD1_1626   sdhC FALSE 0.050 155.000 0.032 NA   NA
 2025282 2025283 RD1_1626 RD1_1627 sdhC sdhD TRUE 0.989 11.000 0.291 0.001 Y NA
 2025283 2025284 RD1_1627 RD1_1628 sdhD sdhA TRUE 0.979 53.000 0.705 0.001 Y NA
 2025284 2025285 RD1_1628 RD1_1629 sdhA   FALSE 0.329 -40.000 0.022 NA   NA
 2025285 2025286 RD1_1629 RD1_1630   sdhB FALSE 0.392 26.000 0.019 NA   NA
 2025286 2025287 RD1_1630 RD1_1631 sdhB   TRUE 0.605 10.000 0.004 NA N NA
 2025287 2025288 RD1_1631 RD1_1632     TRUE 0.813 0.000 0.025 NA   NA
 2025288 2025289 RD1_1632 RD1_1633     FALSE 0.479 58.000 0.091 NA   NA
 2025290 2025291 RD1_1634 RD1_1635 deoD mutB FALSE 0.389 64.000 0.031 1.000 N NA
 2025292 2025293 RD1_1636 RD1_1637   ccrA FALSE 0.338 136.000 0.298 1.000   NA
 2025293 2025294 RD1_1637 RD1_1638 ccrA rhlR FALSE 0.004 369.000 0.000 1.000 N NA
 2025294 2025295 RD1_1638 RD1_1639 rhlR tral FALSE 0.416 116.000 0.200 1.000 N NA
 2025295 2025296 RD1_1639 RD1_1640 tral   FALSE 0.092 188.000 0.135 1.000   NA
 2025297 2025298 RD1_1641 RD1_1642     TRUE 0.982 3.000 0.632 NA   NA
 2025298 2025299 RD1_1642 RD1_1643     FALSE 0.348 72.000 0.039 1.000   NA
 2025299 2025300 RD1_1643 RD1_1644     TRUE 0.993 0.000 0.720 0.069   NA
 2025300 2025301 RD1_1644 RD1_1645     TRUE 0.939 5.000 0.184 1.000   NA
 2025301 2025302 RD1_1645 RD1_1647     TRUE 0.909 -21.000 0.586 1.000   NA
 2025302 2025303 RD1_1647 RD1_1648     FALSE 0.101 137.000 0.038 1.000   NA
 2025303 2025304 RD1_1648 RD1_1649     TRUE 0.980 -3.000 0.209 0.002   NA
 2025304 2025305 RD1_1649 RD1_1650     TRUE 0.774 47.000 0.061 1.000 Y NA
 2025305 2025306 RD1_1650 RD1_1652     FALSE 0.065 230.000 0.151 1.000   NA
 2025308 2025309 RD1_1654 RD1_1655 ilvE   FALSE 0.391 72.000 0.077 NA   NA
 2025311 2025312 RD1_1657 RD1_1658     FALSE 0.069 73.000 0.000 NA   NA
 2025312 2025313 RD1_1658 RD1_1659     FALSE 0.080 63.000 0.000 NA   NA
 2025315 2025316 RD1_1661 RD1_1662 kdsA   TRUE 0.834 2.000 0.036 NA   NA
 2025317 2025318 RD1_1663 RD1_1664     FALSE 0.009 480.000 0.085 NA   NA
 2025318 2025319 RD1_1664 RD1_1665     FALSE 0.061 173.000 0.071 NA   NA
 2025319 2025320 RD1_1665 RD1_1666     TRUE 0.961 0.000 0.250 NA   NA
 2025320 2025321 RD1_1666 RD1_1667     FALSE 0.120 -39.000 0.000 NA   NA
 2025322 2025323 RD1_1668 RD1_1669 opgH opgG TRUE 0.928 -3.000 0.169 NA N NA
 2025323 2025324 RD1_1669 RD1_1670 opgG opgC TRUE 0.987 0.000 0.769 NA   NA
 2025324 2025325 RD1_1670 RD1_1671 opgC   FALSE 0.099 49.000 0.000 NA   NA
 2025325 2025326 RD1_1671 RD1_1673     FALSE 0.014 186.000 0.000 1.000   NA
 2025326 2025327 RD1_1673 RD1_1674   alsS TRUE 0.930 -16.000 0.647 1.000 N NA
 2025327 2025328 RD1_1674 RD1_1675 alsS   FALSE 0.164 121.000 0.071 NA   NA
 2025329 2025330 RD1_1676 RD1_1677 argD argF TRUE 0.702 60.000 0.038 1.000 Y NA
 2025332 2025333 RD1_1679 RD1_1680   rpmB FALSE 0.272 74.000 0.008 1.000 N NA
 2025333 2025334 RD1_1680 RD1_1681 rpmB   FALSE 0.190 60.000 0.008 NA   NA
 2025334 2025335 RD1_1681 RD1_1682     TRUE 0.690 46.000 0.205 NA   NA
 2025337 2025338 RD1_1684 RD1_1685   infA TRUE 0.639 77.000 0.228 1.000   NA
 2025338 2025339 RD1_1685 RD1_1686 infA maf TRUE 0.949 4.000 0.207 NA N NA
 2025339 2025340 RD1_1686 RD1_1687 maf   TRUE 0.913 -3.000 0.133 NA N NA
 2025340 2025341 RD1_1687 RD1_1688     TRUE 0.928 -3.000 0.154 1.000   NA
 2025342 2025343 RD1_1689 RD1_1690     FALSE 0.317 -90.000 0.027 NA   NA
 2025343 2025344 RD1_1690 RD1_1691   rrf FALSE 0.419 25.000 0.022 NA   NA
 2025345 2025346 RD1_1692 RD1_1693     FALSE 0.054 90.000 0.000 NA   NA
 2025346 2025347 RD1_1693 RD1_1694   nnrS FALSE 0.510 25.000 0.041 NA   NA
 2025347 2025348 RD1_1694 RD1_1695 nnrS nnrU TRUE 0.870 -3.000 0.090 NA   NA
 2025348 2025349 RD1_1695 RD1_1696 nnrU hemN FALSE 0.004 223.000 0.000 NA   NA
 2025349 2025350 RD1_1696 RD1_1697 hemN bchE FALSE 0.041 258.000 0.000 0.012 N NA
 2025350 2025351 RD1_1697 RD1_1698 bchE   FALSE 0.051 237.000 0.000 1.000 Y NA
 2025352 2025353 RD1_1699 RD1_1700     FALSE 0.030 163.000 0.000 1.000 N NA
 2025354 2025355 RD1_1701 RD1_1702 soxB soxD TRUE 0.992 12.000 0.533 0.003 Y NA
 2025355 2025356 RD1_1702 RD1_1704 soxD soxA TRUE 0.994 -3.000 0.867 0.003   NA
 2025356 2025357 RD1_1704 RD1_1705 soxA soxG TRUE 0.972 14.000 0.444 0.004   NA
 2025358 2025359 RD1_1707 RD1_1708     TRUE 0.673 78.000 0.333 NA   NA
 2025360 2025361 RD1_1709 RD1_1710     FALSE 0.004 235.000 0.000 NA   NA
 2025361 2025362 RD1_1710 RD1_1711     FALSE 0.192 19.000 0.000 NA   NA
 2025363 2025364 RD1_1712 RD1_1713     FALSE 0.519 0.000 0.000 NA   NA
 2025364 2025365 RD1_1713 RD1_1714     FALSE 0.012 181.000 0.000 NA N NA
 2025365 2025366 RD1_1714 RD1_1715     FALSE 0.035 109.000 0.000 NA   NA
 2025366 2025367 RD1_1715 RD1_1716     TRUE 0.954 -3.000 0.333 NA   NA
 2025367 2025368 RD1_1716 RD1_1717     TRUE 0.799 63.000 0.167 NA Y NA
 2025368 2025369 RD1_1717 RD1_1718     FALSE 0.132 33.000 0.000 NA   NA
 2025370 2025371 RD1_1719 RD1_1720 hutC prsD FALSE 0.006 264.000 0.000 1.000   NA
 2025371 2025372 RD1_1720 RD1_1721 prsD   TRUE 0.966 -3.000 0.111 0.007   NA
 2025372 2025373 RD1_1721 RD1_1722     FALSE 0.007 178.000 0.000 NA   NA
 2025373 2025374 RD1_1722 RD1_1723     FALSE 0.101 -106.000 0.000 NA   NA
 2025374 2025375 RD1_1723 RD1_1724     TRUE 0.958 13.000 0.714 NA   NA
 2025376 2025377 RD1_1725 RD1_1726 nagA   TRUE 0.967 -3.000 0.369 1.000 N NA
 2025377 2025378 RD1_1726 RD1_1727     TRUE 0.979 -3.000 0.577 1.000 N NA
 2025378 2025379 RD1_1727 RD1_1728     TRUE 0.983 -3.000 0.704 1.000 N NA
 2025380 2025381 RD1_1729 RD1_1730     TRUE 0.930 80.000 0.456 0.069 Y NA
 2025381 2025382 RD1_1730 RD1_1731     TRUE 0.989 14.000 0.708 0.069 Y NA
 2025382 2025383 RD1_1731 RD1_1732     TRUE 0.968 -3.000 0.415 1.000   NA
 2025383 2025384 RD1_1732 RD1_1733     TRUE 0.971 -3.000 0.463 1.000   NA
 2025385 2025386 RD1_1734 RD1_1735     TRUE 0.904 -18.000 0.600 NA   NA
 2025388 2025389 RD1_1737 RD1_1738   bceA TRUE 0.990 -3.000 0.605 1.000 Y NA
 2025389 2025390 RD1_1738 RD1_1739 bceA   TRUE 0.904 14.000 0.336 NA   NA
 2025391 2025392 RD1_1741 RD1_1742 pcm   FALSE 0.523 82.000 0.121 1.000 N NA
 2025392 2025393 RD1_1742 RD1_1743     TRUE 0.857 73.000 0.852 NA   NA
 2025393 2025394 RD1_1743 RD1_1744     FALSE 0.126 137.000 0.083 NA   NA
 2025401 2025402 RD1_1751 RD1_1752     FALSE 0.378 55.000 0.049 NA   NA
 2025404 2025405 RD1_1754 RD1_1756 valS   FALSE 0.278 76.000 0.041 NA   NA
 2025405 2025406 RD1_1756 RD1_1757     TRUE 0.833 -3.000 0.061 NA   NA
 2025407 2025408 RD1_1758 RD1_1759     TRUE 0.855 -22.000 0.350 1.000   NA
 2025409 2025410 RD1_1761 RD1_1762   metF FALSE 0.470 61.000 0.051 1.000 N NA
 2025412 2025413 RD1_1764 RD1_1765     FALSE 0.034 162.000 0.021 NA   NA
 2025413 2025414 RD1_1765 RD1_1766     TRUE 0.772 -3.000 0.035 NA   NA
 2025414 2025415 RD1_1766 RD1_1767   cycH TRUE 0.846 -3.000 0.035 1.000 N NA
 2025418 2025419 RD1_1770 RD1_1771     FALSE 0.421 5.000 0.000 NA   NA
 2025419 2025420 RD1_1771 RD1_1772   sodB FALSE 0.082 111.000 0.009 NA   NA
 2025422 2025423 RD1_1774 RD1_1775     TRUE 0.694 73.000 0.290 1.000   NA
 2025423 2025424 RD1_1775 RD1_1776     FALSE 0.157 67.000 0.000 1.000   NA
 2025425 2025426 RD1_1777 RD1_1778     FALSE 0.350 77.000 0.067 NA   NA
 2025426 2025427 RD1_1778 RD1_1779     TRUE 0.984 -3.000 0.875 NA N NA
 2025428 2025429 RD1_1780 RD1_1781     TRUE 0.583 72.000 0.154 1.000   NA
 2025429 2025430 RD1_1781 RD1_1783     TRUE 0.701 53.000 0.203 1.000   NA
 2025432 2025433 RD1_1785 RD1_1786     FALSE 0.425 71.000 0.091 NA   NA
 2025433 2025434 RD1_1786 RD1_1787   gill FALSE 0.044 156.000 0.026 NA   NA
 2025434 2025435 RD1_1787 RD1_1788 gill soxB FALSE 0.051 318.000 0.066 1.000 Y NA
 2025435 2025436 RD1_1788 RD1_1789 soxB soxD TRUE 0.985 41.000 0.882 0.003 Y NA
 2025436 2025437 RD1_1789 RD1_1790 soxD soxA TRUE 0.994 -3.000 0.944 0.003   NA
 2025437 2025438 RD1_1790 RD1_1791 soxA soxG TRUE 0.985 -7.000 0.944 0.004   NA
 2025438 2025439 RD1_1791 RD1_1792 soxG   TRUE 0.865 33.000 0.471 NA   NA
 2025439 2025440 RD1_1792 RD1_1793   dnaG FALSE 0.141 85.000 0.010 NA   NA
 2025440 2025441 RD1_1793 RD1_1794 dnaG rpoD FALSE 0.445 123.000 0.299 1.000 N NA
 2025441 2025442 RD1_1794 RD1_1795 rpoD   FALSE 0.002 724.000 0.015 NA   NA
 2025442 2025443 RD1_1795 RD1_1796     FALSE 0.266 75.000 0.036 NA   NA
 2025443 2025444 RD1_1796 RD1_1797     FALSE 0.244 34.000 0.004 NA   NA
 2025444 2025445 RD1_1797 RD1_1798     FALSE 0.053 135.000 0.017 NA   NA
 2025445 2025446 RD1_1798 RD1_1799   ribD TRUE 0.950 -3.000 0.277 NA N NA
 2025446 2025447 RD1_1799 RD1_1800 ribD ribE TRUE 0.617 144.000 0.456 1.000 Y NA
 2025447 2025448 RD1_1800 RD1_1801 ribE ribB TRUE 0.590 71.000 0.006 1.000 Y NA
 2025448 2025449 RD1_1801 RD1_1803 ribB ribH TRUE 0.983 4.000 0.022 0.002 Y NA
 2025449 2025450 RD1_1803 RD1_1804 ribH nusB TRUE 0.834 42.000 0.347 1.000 N NA
 2025450 2025451 RD1_1804 RD1_1805 nusB   TRUE 0.729 4.000 0.015 NA   NA
 2025451 2025452 RD1_1805 RD1_1806     FALSE 0.142 125.000 0.065 NA   NA
 2025452 2025453 RD1_1806 RD1_1807     FALSE 0.002 292.000 0.000 NA   NA
 2025455 1597207 RD1_1809 RD1_1810     FALSE 0.107 44.000 0.000 NA   NA
 1597207 2025456 RD1_1810 RD1_1811     FALSE 0.049 97.000 0.000 NA   NA
 2025458 2025459 RD1_1813 RD1_1814 rluD rpoH FALSE 0.055 184.000 0.046 1.000 N NA
 2025462 2025463 RD1_1817 RD1_1818 dnlI   TRUE 0.981 -3.000 0.751 NA N NA
 2025463 2025464 RD1_1818 RD1_1819   pldB FALSE 0.487 39.000 0.047 NA N NA
 2025464 2025465 RD1_1819 RD1_1820 pldB   TRUE 0.654 69.000 0.033 1.000 Y NA
 2025466 2025467 RD1_1821 RD1_1822     TRUE 0.582 25.000 0.040 1.000   NA
 2025467 2025468 RD1_1822 RD1_1823   hslR TRUE 0.978 1.000 0.116 1.000 Y NA
 2025468 2025469 RD1_1823 RD1_1824 hslR fdxA FALSE 0.491 54.000 0.050 1.000 N NA
 2025469 2025470 RD1_1824 RD1_1825 fdxA   FALSE 0.007 274.000 0.000 1.000 N NA
 2025473 2025474 RD1_1828 RD1_1829 kefC   TRUE 0.815 23.000 0.159 1.000 N NA
 2025477 2025478 RD1_1831 RD1_1833     FALSE 0.001 1803.000 0.000 NA   NA
 2025482 2025483 RD1_1838 RD1_1839     TRUE 0.940 35.000 0.444 1.000 Y NA
 2025485 2025486 RD1_1841 RD1_1842     TRUE 0.980 -3.000 0.667 1.000   NA
 2025486 2025487 RD1_1842 RD1_1843     FALSE 0.023 122.000 0.000 NA   NA
 1597242 2025489 RD1_1846 RD1_1848     FALSE 0.078 64.000 0.000 NA   NA
 2025489 2025490 RD1_1848 RD1_1849     TRUE 0.816 -15.000 0.250 NA   NA
 2025491 2025492 RD1_1850 RD1_1851     FALSE 0.001 904.000 0.000 NA   NA
 2025492 2025493 RD1_1851 RD1_1852     TRUE 0.916 36.000 0.346 0.042   NA
 2025496 2025497 RD1_1856 RD1_1857     FALSE 0.413 33.000 0.032 NA   NA
 2025497 2025498 RD1_1857 RD1_1858     TRUE 0.901 -3.000 0.127 NA   NA
 2025498 2025499 RD1_1858 RD1_1859     TRUE 0.811 20.000 0.200 NA   NA
 2025501 2025502 RD1_1861 RD1_1862     TRUE 0.944 -3.000 0.032 1.000 Y NA
 2025502 2025503 RD1_1862 RD1_1863   nikC TRUE 0.950 -7.000 0.093 0.068 Y NA
 2025503 2025504 RD1_1863 RD1_1864 nikC   TRUE 0.955 -3.000 0.125 0.099   NA
 2025505 2025506 RD1_1865 RD1_1866     TRUE 0.971 -3.000 0.538 NA   NA
 2025506 2025507 RD1_1866 RD1_1867     TRUE 0.785 51.000 0.385 NA   NA
 2025508 2025509 RD1_1868 RD1_1869   mucS FALSE 0.006 301.000 0.000 1.000 N NA
 2025510 2025511 RD1_1870 RD1_1871     TRUE 0.980 3.000 0.556 NA   NA
 2025511 2025512 RD1_1871 RD1_1872   gloA TRUE 0.798 -6.000 0.128 NA   NA
 2025513 2025514 RD1_1873 RD1_1874   thyA FALSE 0.017 133.000 0.000 NA   NA
 2025514 2025515 RD1_1874 RD1_1875 thyA folA TRUE 0.967 4.000 0.295 1.000 N NA
 2025518 2025519 RD1_1878 RD1_1879     TRUE 0.833 -3.000 0.061 NA   NA
 2025519 2025520 RD1_1879 RD1_1880     TRUE 0.965 -3.000 0.450 NA   NA
 2025520 2025521 RD1_1880 RD1_1881     FALSE 0.253 82.000 0.040 NA   NA
 2025524 2025525 RD1_1884 RD1_1885     FALSE 0.020 255.000 0.065 NA   NA
 2025525 2025526 RD1_1885 RD1_1886     FALSE 0.012 153.000 0.000 NA   NA
 2025528 2025529 RD1_1888 RD1_1889 phaC   FALSE 0.238 141.000 0.222 NA   NA
 2025529 2025530 RD1_1889 RD1_1890     FALSE 0.429 46.000 0.052 NA   NA
 2025531 2025532 RD1_1891 RD1_1892     TRUE 0.976 19.000 0.706 1.000 Y NA
 2025532 2025533 RD1_1892 RD1_1893     TRUE 0.878 -15.000 0.329 1.000 N NA
 2025533 2025534 RD1_1893 RD1_1894     TRUE 0.965 4.000 0.278 1.000 N NA
 2025534 2025535 RD1_1894 RD1_1896   hisM TRUE 0.874 88.000 0.481 1.000 Y NA
 2025535 2025536 RD1_1896 RD1_1897 hisM   TRUE 0.976 57.000 1.000 0.067 Y NA
 2025536 2025537 RD1_1897 RD1_1898     TRUE 0.918 108.000 0.724 0.082 Y NA
 2025537 2025538 RD1_1898 RD1_1899     TRUE 0.971 28.000 0.774 1.000 Y NA
 2025538 2025539 RD1_1899 RD1_1900     FALSE 0.472 112.000 0.275 NA N NA
 2025539 2025540 RD1_1900 RD1_1901     TRUE 0.948 -3.000 0.294 NA   NA
 2025540 2025541 RD1_1901 RD1_1902     TRUE 0.865 39.000 0.536 NA   NA
 2025543 2025544 RD1_1904 RD1_1905     FALSE 0.046 129.000 0.007 NA   NA
 2025544 2025545 RD1_1905 RD1_1906   pyrG FALSE 0.005 205.000 0.000 NA   NA
 2025545 2025546 RD1_1906 RD1_1907 pyrG secG FALSE 0.086 178.000 0.083 1.000 N NA
 2025547 2025548 RD1_1908 RD1_1909 nthA nthB TRUE 0.994 -3.000 0.761 0.001   NA
 2025548 2025549 RD1_1909 RD1_1910 nthB   TRUE 0.970 -30.000 0.761 0.001   NA
 2025551 2025552 RD1_1912 RD1_1913 purA   TRUE 0.637 12.000 0.030 NA   NA
 2025555 2025556 RD1_1916 RD1_1917   sdaA TRUE 0.657 56.000 0.167 1.000   NA
 2025557 2025558 RD1_1918 RD1_1919 rpiA gor FALSE 0.226 96.000 0.014 1.000 N NA
 2025558 2025559 RD1_1919 RD1_1920 gor   FALSE 0.359 74.000 0.032 1.000 N NA
 2025559 2025560 RD1_1920 RD1_1921   hflC TRUE 0.998 0.000 0.947 0.006 Y NA
 2025560 2025561 RD1_1921 RD1_1922 hflC   TRUE 0.956 -3.000 0.348 NA   NA
 2025561 2025562 RD1_1922 RD1_1923   degP FALSE 0.159 149.000 0.150 NA   NA
 2025564 2025565 RD1_1925 RD1_1926 fdx   TRUE 0.984 0.000 0.647 NA   NA
 2025569 2025570 RD1_1931 RD1_1932   ftsY FALSE 0.225 15.000 0.000 NA   NA
 2025570 2025571 RD1_1932 RD1_1933 ftsY   FALSE 0.490 71.000 0.013 0.098   NA
 2025571 2025572 RD1_1933 RD1_1934   ispZ TRUE 0.849 10.000 0.082 1.000   NA
 2025573 2025574 RD1_1935 RD1_1937   gst FALSE 0.143 140.000 0.103 NA   NA
 2025574 2025575 RD1_1937 RD1_1938 gst   FALSE 0.154 -16.000 0.000 NA   NA
 2025578 2025579 RD1_1941 RD1_1942   trkH-1 FALSE 0.129 116.000 0.020 1.000   NA
 2025579 2025580 RD1_1942 RD1_1943 trkH-1 ilvB TRUE 0.975 2.000 0.333 1.000 N NA
 2025582 2025583 RD1_1945 RD1_1946 glyQ   TRUE 0.790 -3.000 0.041 NA   NA
 2025583 2025584 RD1_1946 RD1_1947   glyS TRUE 0.821 0.000 0.028 NA   NA
 2025584 2025585 RD1_1947 RD1_1948 glyS ppdK FALSE 0.488 93.000 0.030 0.097 N NA
 2025585 2025586 RD1_1948 RD1_1949 ppdK   FALSE 0.433 154.000 0.630 1.000   NA
 2025586 2025587 RD1_1949 RD1_1950   folB TRUE 0.811 94.000 0.750 1.000   NA
 2025587 2025588 RD1_1950 RD1_1951 folB folP FALSE 0.126 192.000 0.036 1.000 Y NA
 2025588 2025589 RD1_1951 RD1_1952 folP glmM TRUE 0.893 -7.000 0.260 1.000 N NA
 2025590 2025591 RD1_1953 RD1_1954   ilvC FALSE 0.227 75.000 0.007 1.000   NA
 2025592 2025593 RD1_1955 RD1_1956     TRUE 0.997 -3.000 0.964 0.017 Y NA
 2025593 2025594 RD1_1956 RD1_1957     FALSE 0.421 99.000 0.098 1.000 N NA
 2025595 2025596 RD1_1958 RD1_1959     FALSE 0.494 62.000 0.104 NA   NA
 2025596 2025597 RD1_1959 RD1_1960     FALSE 0.236 81.000 0.033 NA   NA
 2025599 2025600 RD1_1962 RD1_1963   carA FALSE 0.390 106.000 0.021 0.097 N NA
 2025601 2025602 RD1_1964 RD1_1965     FALSE 0.002 269.000 0.000 NA   NA
 2025603 2025604 RD1_1966 RD1_1967   ctaD FALSE 0.009 298.000 0.036 NA   NA
 2025605 2025606 RD1_1968 RD1_1969     FALSE 0.263 -25.000 0.000 1.000   NA
 1597363 1597364 RD1_1971 RD1_1972     FALSE 0.003 244.000 0.000 NA   NA
 1597364 2025608 RD1_1972 RD1_1973     FALSE 0.017 133.000 0.000 NA   NA
 2025608 2025609 RD1_1973 RD1_1974   lcfA FALSE 0.238 115.000 0.060 1.000 N NA
 2025610 2025611 RD1_1975 RD1_1976     FALSE 0.145 144.000 0.087 1.000   NA
 2025611 2025612 RD1_1976 RD1_1977     TRUE 0.987 -3.000 1.000 1.000   NA
 2025612 2025613 RD1_1977 RD1_1978     TRUE 0.992 -3.000 0.409 0.067 Y NA
 2025613 2025614 RD1_1978 RD1_1979     TRUE 0.973 14.000 0.227 0.067 Y NA
 2025614 2025615 RD1_1979 RD1_1980     FALSE 0.529 118.000 0.400 1.000   NA
 2025615 2025616 RD1_1980 RD1_1981   ttuD TRUE 0.682 54.000 0.188 1.000   NA
 2025616 2025617 RD1_1981 RD1_1982 ttuD   FALSE 0.183 100.000 0.004 1.000 N NA
 2025617 2025618 RD1_1982 RD1_1984     FALSE 0.209 44.000 0.004 NA   NA
 2025618 2025619 RD1_1984 RD1_1985     TRUE 0.908 -3.000 0.140 NA   NA
 2025619 2025620 RD1_1985 RD1_1986     FALSE 0.297 88.000 0.061 NA   NA
 2025620 2025621 RD1_1986 RD1_1987     TRUE 0.744 28.000 0.167 NA   NA
 2025621 2025622 RD1_1987 RD1_1989   telA TRUE 0.925 7.000 0.214 NA   NA
 2025622 2025623 RD1_1989 RD1_1990 telA   TRUE 0.732 34.000 0.198 NA   NA
 2025623 2025624 RD1_1990 RD1_1991     TRUE 0.889 3.000 0.074 NA   NA
 2025624 2025625 RD1_1991 RD1_1992     FALSE 0.047 142.000 0.017 NA   NA
 2025629 2025630 RD1_1996 RD1_1997     FALSE 0.132 33.000 0.000 NA   NA
 2025630 2025631 RD1_1997 RD1_1998     FALSE 0.003 515.000 0.000 1.000 N NA
 2025631 2025632 RD1_1998 RD1_1999     TRUE 0.741 -39.000 0.226 NA   NA
 2025632 2025633 RD1_1999 RD1_2000   gatA FALSE 0.339 43.000 0.027 NA   NA
 2025633 2025634 RD1_2000 RD1_2001 gatA gatC TRUE 0.998 0.000 0.643 0.001 Y NA
 2025634 2025635 RD1_2001 RD1_2002 gatC   FALSE 0.002 316.000 0.000 NA   NA
 2025635 2025636 RD1_2002 RD1_2003     FALSE 0.100 176.000 0.149 NA   NA
 2025637 2025638 RD1_2004 RD1_2005   phrR FALSE 0.015 481.000 0.000 1.000 Y NA
 2025638 2025639 RD1_2005 RD1_2006 phrR   TRUE 0.750 62.000 0.294 1.000 N NA
 2025639 2025640 RD1_2006 RD1_2007   atzB TRUE 0.931 -3.000 0.143 1.000 N NA
 2025642 2025643 RD1_2009 RD1_2010 mgtE   TRUE 0.828 -3.000 0.026 1.000 N NA
 2025643 2025644 RD1_2010 RD1_2012     FALSE 0.094 163.000 0.077 1.000   NA
 2025644 2025645 RD1_2012 RD1_2013     TRUE 0.810 -3.000 0.029 1.000   NA
 2025645 2025646 RD1_2013 RD1_2014   trkA TRUE 0.797 52.000 0.355 1.000   NA
 2025647 2025648 RD1_2015 RD1_2016     FALSE 0.071 70.000 0.000 NA   NA
 2025648 2025649 RD1_2016 RD1_2017     FALSE 0.283 12.000 0.000 NA   NA
 2025652 2025653 RD1_2020 RD1_2021   betI FALSE 0.346 75.000 0.041 1.000   NA
 2025653 2025654 RD1_2021 RD1_2022 betI betC-1 TRUE 0.929 -3.000 0.138 1.000 N NA
 2025654 2025655 RD1_2022 RD1_2023 betC-1 betB TRUE 0.625 40.000 0.081 1.000 N NA
 2025655 2025656 RD1_2023 RD1_2024 betB betA FALSE 0.165 256.000 0.634 1.000 N NA
 2025656 2025657 RD1_2024 RD1_2025 betA   FALSE 0.445 60.000 0.042 1.000 N NA
 2025658 2025659 RD1_2026 RD1_2027     TRUE 0.708 85.000 0.377 1.000   NA
 2025660 2025661 RD1_2028 RD1_2029 pccB   FALSE 0.174 109.000 0.044 NA   NA
 2025661 2025662 RD1_2029 RD1_2030     FALSE 0.515 80.000 0.161 NA   NA
 2025662 2025663 RD1_2030 RD1_2031     FALSE 0.002 314.000 0.000 NA   NA
 2025663 2025664 RD1_2031 RD1_2032   pccA FALSE 0.027 117.000 0.000 NA   NA
 2025666 2025667 RD1_2034 RD1_2035   mutA FALSE 0.506 -37.000 0.063 NA   NA
 2025667 2025668 RD1_2035 RD1_2036 mutA   TRUE 0.714 -3.000 0.021 NA   NA
 2025668 2025669 RD1_2036 RD1_2037     TRUE 0.892 -3.000 0.113 NA   NA
 2025669 2025670 RD1_2037 RD1_2039   djlA FALSE 0.555 52.000 0.073 1.000 N NA
 2025670 2025671 RD1_2039 RD1_2040 djlA   FALSE 0.122 102.000 0.015 NA   NA
 2025672 2025673 RD1_2041 RD1_2042   ppk TRUE 0.659 107.000 0.149 1.000 Y NA
 2025673 2025674 RD1_2042 RD1_2043 ppk   TRUE 0.807 -10.000 0.134 1.000 N NA
 2025674 2025675 RD1_2043 RD1_2044     TRUE 0.971 2.000 0.362 NA   NA
 2025676 2025677 RD1_2045 RD1_2046 proS   FALSE 0.144 88.000 0.012 NA   NA
 2025677 2025678 RD1_2046 RD1_2047     FALSE 0.281 53.000 0.023 NA   NA
 2025678 2025679 RD1_2047 RD1_2048   lolD TRUE 0.949 -7.000 0.620 1.000 N NA
 2025679 2025680 RD1_2048 RD1_2049 lolD   FALSE 0.379 47.000 0.011 1.000 N NA
 2025684 2025685 RD1_2053 RD1_2054     FALSE 0.236 14.000 0.000 NA   NA
 2025685 2025686 RD1_2054 RD1_2055     FALSE 0.001 360.000 0.000 NA   NA
 2025687 2025688 RD1_2056 RD1_2057   parE FALSE 0.410 -3.000 0.000 NA   NA
 2025688 2025689 RD1_2057 RD1_2058 parE   FALSE 0.410 -3.000 0.000 NA   NA
 2025689 2025690 RD1_2058 RD1_2059     FALSE 0.007 176.000 0.000 NA   NA
 2025692 2025693 RD1_2061 RD1_2062     FALSE 0.431 114.000 0.222 1.000   NA
 2025693 2025694 RD1_2062 RD1_2063     TRUE 0.801 17.000 0.122 1.000   NA
 2025694 2025695 RD1_2063 RD1_2064     FALSE 0.311 84.000 0.041 1.000   NA
 2025696 2025697 RD1_2065 RD1_2066     FALSE 0.006 190.000 0.000 NA   NA
 2025697 2025698 RD1_2066 RD1_2067     FALSE 0.119 38.000 0.000 NA   NA
 2025698 2025699 RD1_2067 RD1_2068     TRUE 0.942 -3.000 0.256 NA   NA
 2025699 2025700 RD1_2068 RD1_2069     TRUE 0.624 -24.000 0.100 NA   NA
 2025702 2025703 RD1_2071 RD1_2072     TRUE 0.865 -3.000 0.085 NA   NA
 2025703 2025704 RD1_2072 RD1_2073     TRUE 0.914 0.000 0.091 NA   NA
 2025704 2025705 RD1_2073 RD1_2074   ileS FALSE 0.012 206.000 0.005 NA   NA
 2025705 2025706 RD1_2074 RD1_2075 ileS ogt FALSE 0.267 72.000 0.005 1.000 N NA
 2025706 2025707 RD1_2075 RD1_2076 ogt   FALSE 0.053 92.000 0.000 NA   NA
 2025708 2025709 RD1_2077 RD1_2078 pcs xerC FALSE 0.335 74.000 0.025 1.000 N NA
 2025709 2025710 RD1_2078 RD1_2079 xerC   TRUE 0.874 -3.000 0.093 NA   NA
 2025710 2025711 RD1_2079 RD1_2080   tal FALSE 0.197 145.000 0.183 NA   NA
 2025712 2025713 RD1_2081 RD1_2082 priA   FALSE 0.129 92.000 0.009 NA   NA
 2025713 2025714 RD1_2082 RD1_2083     FALSE 0.412 30.000 0.028 NA   NA
 2025714 2025715 RD1_2083 RD1_2084   prmA TRUE 0.830 0.000 0.003 1.000 N NA
 2025715 2025716 RD1_2084 RD1_2085 prmA   FALSE 0.199 97.000 0.034 NA   NA
 2025718 2025719 RD1_2088 RD1_2089 ruvC ruvA TRUE 0.994 -3.000 0.451 0.007 Y NA
 2025719 2025720 RD1_2089 RD1_2090 ruvA ruvB TRUE 0.986 25.000 0.549 0.001 Y NA
 2025720 2025721 RD1_2090 RD1_2091 ruvB   FALSE 0.265 43.000 0.013 NA   NA
 2025721 2025722 RD1_2091 RD1_2092     TRUE 0.813 -3.000 0.049 NA   NA
 2025722 2025723 RD1_2092 RD1_2093   tolQ TRUE 0.752 99.000 0.593 1.000   NA
 2025723 2025724 RD1_2093 RD1_2095 tolQ   TRUE 0.989 4.000 0.220 0.080 Y NA
 2025724 2025725 RD1_2095 RD1_2096     TRUE 0.741 63.000 0.366 NA   NA
 2025725 2025726 RD1_2096 RD1_2097   tolB TRUE 0.847 -3.000 0.070 NA   NA
 2025726 2025727 RD1_2097 RD1_2098 tolB pal TRUE 0.794 90.000 0.592 1.000 N NA
 2025727 2025728 RD1_2098 RD1_2099 pal   TRUE 0.942 5.000 0.199 1.000   NA
 2025728 2025729 RD1_2099 RD1_2100     TRUE 0.877 7.000 0.085 1.000   NA
 2025729 2025730 RD1_2100 RD1_2101   ftsH TRUE 0.707 81.000 0.145 0.095 N NA
 2025730 2025731 RD1_2101 RD1_2103 ftsH   FALSE 0.004 505.000 0.008 1.000   NA
 2025731 2025732 RD1_2103 RD1_2104     FALSE 0.001 465.000 0.000 NA   NA
 2025732 2025733 RD1_2104 RD1_2105   folD TRUE 0.589 15.000 0.036 NA   NA
 2025734 2025735 RD1_2106 RD1_2107     TRUE 0.780 10.000 0.061 NA   NA
 2025735 2025736 RD1_2107 RD1_2108     TRUE 0.862 40.000 0.460 1.000   NA
 2025736 2025737 RD1_2108 RD1_2109     FALSE 0.437 57.000 0.048 1.000   NA
 2025739 2025740 RD1_2111 RD1_2112     TRUE 0.837 31.000 0.077 0.010   NA
 2025740 2025741 RD1_2112 RD1_2113     TRUE 0.859 -3.000 0.054 1.000   NA
 2025741 2025742 RD1_2113 RD1_2115     TRUE 0.981 -72.000 0.838 0.007 Y NA
 2025742 2025743 RD1_2115 RD1_2116     TRUE 0.974 31.000 0.968 1.000 Y NA
 2025743 2025744 RD1_2116 RD1_2117     TRUE 0.979 20.000 0.833 1.000 Y NA
 2025744 2025745 RD1_2117 RD1_2119     FALSE 0.002 287.000 0.000 NA   NA
 2025745 2025746 RD1_2119 RD1_2120     TRUE 0.815 5.000 0.048 NA   NA
 2025748 2025749 RD1_2122 RD1_2124     FALSE 0.072 164.000 0.074 NA   NA
 2025753 2025754 RD1_2128 RD1_2129 dxnH   TRUE 0.832 13.000 0.095 1.000 N NA
 2025754 2025755 RD1_2129 RD1_2130   dxnG TRUE 0.806 11.000 0.048 1.000 N NA
 2025755 2025756 RD1_2130 RD1_2131 dxnG topA FALSE 0.047 156.000 0.002 1.000 N NA
 2025756 2025757 RD1_2131 RD1_2132 topA dprA FALSE 0.146 261.000 0.238 1.000 Y NA
 2025757 2025758 RD1_2132 RD1_2133 dprA tldD FALSE 0.110 98.000 0.007 NA   NA
 2025759 2025760 RD1_2134 RD1_2135   ctaC FALSE 0.410 -3.000 0.000 NA   NA
 2025760 2025761 RD1_2135 RD1_2136 ctaC ctaB TRUE 0.718 62.000 0.064 0.046 N NA
 2025761 2025762 RD1_2136 RD1_2137 ctaB   TRUE 0.857 4.000 0.059 NA   NA
 2025762 2025763 RD1_2137 RD1_2138   ctaG TRUE 0.906 0.000 0.083 NA   NA
 2025763 2025764 RD1_2138 RD1_2139 ctaG ctaE TRUE 0.965 26.000 0.536 0.003 N NA
 2025764 2025765 RD1_2139 RD1_2140 ctaE surF FALSE 0.439 72.000 0.096 NA   NA
 2025765 2025766 RD1_2140 RD1_2141 surF thrC TRUE 0.778 6.000 0.040 NA   NA
 2025766 2025767 RD1_2141 RD1_2142 thrC mpp TRUE 0.939 3.000 0.129 1.000   NA
 2025767 2025768 RD1_2142 RD1_2143 mpp   TRUE 0.980 -3.000 0.674 1.000   NA
 2025768 2025769 RD1_2143 RD1_2144     FALSE 0.137 120.000 0.049 NA   NA
 2025769 2025770 RD1_2144 RD1_2145     FALSE 0.483 45.000 0.070 NA   NA
 2025770 2025771 RD1_2145 RD1_2147     FALSE 0.339 84.000 0.074 NA   NA
 2025772 2025773 RD1_2148 RD1_2149 apt   TRUE 0.587 15.000 0.006 1.000 N NA
 2025773 2025774 RD1_2149 RD1_2150     FALSE 0.569 18.000 0.010 1.000 N NA
 2025777 2025778 RD1_2153 RD1_2154     TRUE 0.730 43.000 0.237 NA   NA
 2025778 2025779 RD1_2154 RD1_2155     FALSE 0.011 156.000 0.000 NA   NA
 2025779 2025780 RD1_2155 RD1_2156     FALSE 0.223 72.000 0.023 NA   NA
 2025780 2025781 RD1_2156 RD1_2157     FALSE 0.006 258.000 0.003 NA   NA
 2025781 2025782 RD1_2157 RD1_2158   ptsP FALSE 0.571 46.000 0.069 1.000 N NA
 2025782 2025783 RD1_2158 RD1_2159 ptsP   FALSE 0.500 25.000 0.020 1.000   NA
 2025784 2025785 RD1_2160 RD1_2161   mcp FALSE 0.005 208.000 0.000 NA   NA
 2025785 2025786 RD1_2161 RD1_2162 mcp   FALSE 0.013 227.000 0.000 1.000 N NA
 2025786 2025787 RD1_2162 RD1_2163     TRUE 0.973 -10.000 0.731 0.029   NA
 2025787 2025788 RD1_2163 RD1_2164     TRUE 0.984 -3.000 0.823 1.000   NA
 2025788 2025789 RD1_2164 RD1_2165     TRUE 0.986 4.000 0.121 0.066 Y NA
 2025789 2025790 RD1_2165 RD1_2166     TRUE 0.886 27.000 0.150 NA Y NA
 2025790 2025791 RD1_2166 RD1_2167     FALSE 0.397 6.000 0.000 NA   NA
 2025791 2025792 RD1_2167 RD1_2168     FALSE 0.024 121.000 0.000 NA   NA
 2025792 2025793 RD1_2168 RD1_2169     FALSE 0.058 84.000 0.000 NA   NA
 2025795 2025796 RD1_2171 RD1_2172 gbd   TRUE 0.996 5.000 0.706 0.042 Y NA
 2025796 2025797 RD1_2172 RD1_2173   ipuC TRUE 0.973 4.000 0.361 1.000 N NA
 2025797 2025798 RD1_2173 RD1_2174 ipuC   TRUE 0.744 63.000 0.289 1.000 N NA
 2025798 2025799 RD1_2174 RD1_2175     TRUE 0.957 49.000 0.938 NA Y NA
 2025799 2025800 RD1_2175 RD1_2176     TRUE 0.958 -54.000 0.865 NA Y NA
 2025800 2025801 RD1_2176 RD1_2177     TRUE 0.917 0.000 0.081 NA N NA
 2025803 2025804 RD1_2179 RD1_2180 ggtA cobQ FALSE 0.113 117.000 0.003 1.000 N NA
 2025804 2025805 RD1_2180 RD1_2181 cobQ cobO TRUE 0.973 11.000 0.078 0.009 Y NA
 2025806 2025807 RD1_2182 RD1_2183     TRUE 0.992 8.000 0.481 0.066 Y NA
 2025807 2025808 RD1_2183 RD1_2184     TRUE 0.972 -13.000 0.696 1.000 Y NA
 2025808 2025809 RD1_2184 RD1_2185   dctP FALSE 0.105 109.000 0.000 1.000 N NA
 2025809 2025810 RD1_2185 RD1_2186 dctP   TRUE 0.962 35.000 0.818 NA Y NA
 2025810 2025811 RD1_2186 RD1_2187     TRUE 0.991 -3.000 0.769 NA Y NA
 2025811 2025812 RD1_2187 RD1_2188     TRUE 0.986 5.000 0.385 1.000 Y NA
 2025813 2025814 RD1_2189 RD1_2190     FALSE 0.190 161.000 0.049 0.063 N NA
 2025814 2025815 RD1_2190 RD1_2191     TRUE 0.962 16.000 0.972 NA   NA
 2025815 2025816 RD1_2191 RD1_2192   glo TRUE 0.775 18.000 0.137 NA   NA
 2025816 2025817 RD1_2192 RD1_2193 glo   FALSE 0.320 108.000 0.118 NA   NA
 2025817 2025818 RD1_2193 RD1_2194   oxyR FALSE 0.005 206.000 0.000 NA   NA
 2025820 2025821 RD1_2196 RD1_2198   panE TRUE 0.697 13.000 0.034 1.000   NA
 2025821 2025822 RD1_2198 RD1_2199 panE   FALSE 0.530 116.000 0.345 1.000 N NA
 2025822 2025823 RD1_2199 RD1_2200     TRUE 0.675 38.000 0.154 NA   NA
 2025823 2025824 RD1_2200 RD1_2201     TRUE 0.962 13.000 0.800 NA   NA
 2025824 2025825 RD1_2201 RD1_2202     TRUE 0.821 84.000 0.800 NA   NA
 2025827 1597585 RD1_2204 RD1_2206 icd   FALSE 0.012 149.000 0.000 NA   NA
 1597585 2025828 RD1_2206 RD1_2207     FALSE 0.461 4.000 0.000 NA   NA
 2025829 2025830 RD1_2208 RD1_2209     FALSE 0.223 120.000 0.067 1.000 N NA
 2025831 2025832 RD1_2210 RD1_2211     TRUE 0.751 -10.000 0.016 0.095   NA
 2025832 2025833 RD1_2211 RD1_2212   rbcS TRUE 0.989 0.000 0.797 1.000   NA
 2025833 2025834 RD1_2212 RD1_2213 rbcS   TRUE 0.833 111.000 0.676 NA Y NA
 2025835 2025836 RD1_2214 RD1_2215 frcR   FALSE 0.002 276.000 0.000 NA   NA
 2025841 2025842 RD1_2220 RD1_2221     FALSE 0.012 153.000 0.000 NA   NA
 2025842 2025843 RD1_2221 RD1_2222     TRUE 0.996 0.000 0.388 0.001 Y NA
 2025843 2025844 RD1_2222 RD1_2223     TRUE 0.989 0.000 0.333 1.000 Y NA
 2025844 2025845 RD1_2223 RD1_2224     TRUE 0.995 0.000 0.452 0.065 Y NA
 2025845 2025846 RD1_2224 RD1_2225     TRUE 0.886 51.000 0.097 0.065 Y NA
 2025846 2025847 RD1_2225 RD1_2226     TRUE 0.864 88.000 0.200 0.065 Y NA
 1597606 2025848 RD1_2227 RD1_2228     FALSE 0.022 124.000 0.000 NA   NA
 2025848 2025849 RD1_2228 RD1_2229     TRUE 0.809 26.000 0.250 NA   NA
 2025849 2025850 RD1_2229 RD1_2231     FALSE 0.003 249.000 0.000 NA   NA
 2025850 2025851 RD1_2231 RD1_2232     TRUE 0.860 53.000 0.571 1.000   NA
 2025851 2025852 RD1_2232 RD1_2233     FALSE 0.555 55.000 0.000 0.041   NA
 2025852 2025853 RD1_2233 RD1_2234     TRUE 0.981 -3.000 0.083 0.041 Y NA
 2025853 2025854 RD1_2234 RD1_2235     TRUE 0.959 16.000 0.049 0.001 Y NA
 2025858 2025859 RD1_2239 RD1_2240     FALSE 0.032 183.000 0.017 1.000   NA
 2025859 2025860 RD1_2240 RD1_2241     TRUE 0.982 -3.000 0.680 1.000 N NA
 2025860 2025861 RD1_2241 RD1_2242     TRUE 0.936 -10.000 0.627 1.000   NA
 2025861 2025862 RD1_2242 RD1_2243   acdA FALSE 0.230 80.000 0.013 1.000   NA
 2025862 2025863 RD1_2243 RD1_2244 acdA cheB FALSE 0.087 134.000 0.013 1.000 N NA
 2025863 2025864 RD1_2244 RD1_2245 cheB cheD TRUE 0.968 -3.000 0.121 1.000 Y NA
 2025865 1597625 RD1_2246 RD1_2247     FALSE 0.117 39.000 0.000 NA   NA
 1597625 1597626 RD1_2247 RD1_2248     FALSE 0.001 596.000 0.000 NA   NA
 1597626 2025866 RD1_2248 RD1_2249     FALSE 0.074 67.000 0.000 NA   NA
 2025868 2025869 RD1_2252 RD1_2253     TRUE 0.992 -3.000 0.230 0.002 Y NA
 2025869 2025870 RD1_2253 RD1_2254   rnd FALSE 0.358 89.000 0.049 1.000 N NA
 2025873 2025874 RD1_2257 RD1_2258   mtbC TRUE 0.830 42.000 0.436 NA   NA
 2025874 2025875 RD1_2258 RD1_2260 mtbC   FALSE 0.260 178.000 0.103 0.001   NA
 2025875 2025876 RD1_2260 RD1_2261     FALSE 0.136 173.000 0.205 NA   NA
 2025877 2025878 RD1_2262 RD1_2263 purC   TRUE 0.975 13.000 0.460 1.000 Y NA
 2025878 2025879 RD1_2263 RD1_2264     TRUE 0.998 0.000 0.656 0.001 Y NA
 2025879 2025880 RD1_2264 RD1_2265   dctB FALSE 0.320 95.000 0.043 1.000 N NA
 2025880 2025881 RD1_2265 RD1_2266 dctB dctD TRUE 0.997 4.000 0.964 0.094 Y NA
 2025881 2025882 RD1_2266 RD1_2267 dctD rne FALSE 0.003 469.000 0.000 1.000 N NA
 2025884 2025885 RD1_2269 RD1_2270 ccdA fda FALSE 0.084 134.000 0.010 1.000 N NA
 2025886 2025887 RD1_2271 RD1_2272     TRUE 0.964 -3.000 0.425 NA   NA
 2025887 2025888 RD1_2272 RD1_2273   fumC TRUE 0.767 -3.000 0.033 NA   NA
 2025889 2025890 RD1_2274 RD1_2275     FALSE 0.410 -3.000 0.000 NA   NA
 2025891 2025892 RD1_2277 RD1_2278     FALSE 0.475 92.000 0.165 NA   NA
 2025892 2025893 RD1_2278 RD1_2279     FALSE 0.089 124.000 0.029 NA   NA
 2025893 1597656 RD1_2279 RD1_2280     FALSE 0.042 103.000 0.000 NA   NA
 1597656 2025894 RD1_2280 RD1_2281     FALSE 0.011 156.000 0.000 NA   NA
 2025894 2025895 RD1_2281 RD1_2282     FALSE 0.083 61.000 0.000 NA   NA
 2025895 2025896 RD1_2282 RD1_2283     FALSE 0.077 65.000 0.000 NA   NA
 2025897 2025898 RD1_2284 RD1_2286     TRUE 0.955 4.000 0.280 NA   NA
 2025898 2025899 RD1_2286 RD1_2287     TRUE 0.923 -3.000 0.180 NA   NA
 2025899 2025900 RD1_2287 RD1_2288     TRUE 0.946 2.000 0.180 NA   NA
 2025900 2025901 RD1_2288 RD1_2290     TRUE 0.765 81.000 0.441 1.000 N NA
 2025903 2025904 RD1_2292 RD1_2293     FALSE 0.200 123.000 0.061 1.000 N NA
 2025904 2025905 RD1_2293 RD1_2295   phrB FALSE 0.363 68.000 0.029 1.000 N NA
 2025905 2025906 RD1_2295 RD1_2296 phrB cfa FALSE 0.361 80.000 0.041 1.000 N NA
 2025906 2025907 RD1_2296 RD1_2297 cfa trgA FALSE 0.453 126.000 0.435 NA   NA
 2025907 2025908 RD1_2297 RD1_2298 trgA trgB TRUE 0.775 17.000 0.132 NA   NA
 2025908 2025909 RD1_2298 RD1_2299 trgB cysB FALSE 0.328 112.000 0.114 1.000   NA
 2025909 2025910 RD1_2299 RD1_2300 cysB   TRUE 0.920 -3.000 0.114 1.000 N NA
 2025910 1597674 RD1_2300 RD1_2301     FALSE 0.080 63.000 0.000 NA   NA
 2025911 2025912 RD1_2302 RD1_2303     TRUE 0.619 -3.000 0.000 1.000   NA
 2025913 2025914 RD1_2304 RD1_2305 hmrR   FALSE 0.035 109.000 0.000 NA   NA
 2025914 2025915 RD1_2305 RD1_2306     TRUE 0.985 -3.000 1.000 NA   NA
 2025915 2025916 RD1_2306 RD1_2307     TRUE 0.771 39.000 0.286 NA   NA
 2025917 2025918 RD1_2308 RD1_2309     TRUE 0.958 12.000 0.545 1.000   NA
 2025919 2025920 RD1_2310 RD1_2311 ssuD   TRUE 0.910 0.000 0.061 1.000   NA
 2025920 2025921 RD1_2311 RD1_2312   ntaB TRUE 0.793 30.000 0.045 0.041   NA
 2025921 2025922 RD1_2312 RD1_2313 ntaB   TRUE 0.781 61.000 0.444 NA   NA
 2025922 2025923 RD1_2313 RD1_2314   dctM TRUE 0.995 1.000 0.867 NA Y NA
 2025923 2025924 RD1_2314 RD1_2315 dctM   TRUE 0.971 26.000 0.733 1.000 Y NA
 2025926 2025927 RD1_2318 RD1_2320 bglA   TRUE 0.957 14.000 0.632 1.000 N NA
 2025928 2025929 RD1_2321 RD1_2322   aglE FALSE 0.012 153.000 0.000 NA   NA
 2025929 2025930 RD1_2322 RD1_2323 aglE aglF TRUE 0.954 76.000 0.670 0.065 Y NA
 2025930 1597696 RD1_2323 RD1_2324 aglF aglG FALSE 0.461 4.000 0.000 NA   NA
 1597696 2025931 RD1_2324 RD1_2326 aglG aglA FALSE 0.225 15.000 0.000 NA   NA
 2025931 2025932 RD1_2326 RD1_2327 aglA aglK TRUE 0.969 27.000 0.697 1.000 Y NA
 2025932 2025933 RD1_2327 RD1_2328 aglK   FALSE 0.058 153.000 0.038 NA   NA
 2025933 2025934 RD1_2328 RD1_2329     FALSE 0.025 159.000 0.007 NA   NA
 2025934 2025935 RD1_2329 RD1_2330     TRUE 0.933 -3.000 0.212 NA   NA
 2025936 2025937 RD1_2331 RD1_2332 ntaB acsA FALSE 0.029 196.000 0.021 1.000   NA
 2025938 2025939 RD1_2333 RD1_2334     TRUE 0.940 71.000 0.955 NA Y NA
 2025939 2025940 RD1_2334 RD1_2335     TRUE 0.996 0.000 0.955 NA Y NA
 2025944 2025945 RD1_2339 RD1_2340     FALSE 0.129 34.000 0.000 NA   NA
 2025946 2025947 RD1_2341 RD1_2342     TRUE 0.918 -3.000 0.111 1.000 N NA
 2025947 2025948 RD1_2342 RD1_2343     TRUE 0.992 1.000 0.467 1.000 Y NA
 2025948 2025949 RD1_2343 RD1_2344     TRUE 0.986 7.000 0.538 NA Y NA
 2025949 2025950 RD1_2344 RD1_2345     FALSE 0.356 54.000 0.042 NA   NA
 2025950 2025951 RD1_2345 RD1_2346     TRUE 0.892 0.000 0.067 NA   NA
 2025951 2025952 RD1_2346 RD1_2347     TRUE 0.798 0.000 0.003 1.000   NA
 2025952 2025953 RD1_2347 RD1_2348     FALSE 0.004 222.000 0.000 NA   NA
 2025954 2025955 RD1_2349 RD1_2350     FALSE 0.142 30.000 0.000 NA   NA
 2025955 2025956 RD1_2350 RD1_2351     FALSE 0.064 79.000 0.000 NA   NA
 2025959 2025960 RD1_2354 RD1_2355 grxC   FALSE 0.317 52.000 0.030 NA   NA
 2025961 2025962 RD1_2356 RD1_2357     FALSE 0.002 282.000 0.000 NA   NA
 2025963 2025964 RD1_2358 RD1_2359     FALSE 0.086 115.000 0.000 1.000 N NA
 2025964 2025965 RD1_2359 RD1_2360   van FALSE 0.011 237.000 0.000 1.000 N NA
 2025965 2025966 RD1_2360 RD1_2362 van cdd FALSE 0.018 196.000 0.000 1.000 N NA
 2025966 2025967 RD1_2362 RD1_2363 cdd   TRUE 0.779 6.000 0.022 1.000   NA
 2025967 2025968 RD1_2363 RD1_2364     TRUE 0.940 5.000 0.188 1.000   NA
 2025968 2025969 RD1_2364 RD1_2367   potC TRUE 0.995 -3.000 0.688 0.065 Y NA
 2025969 2025970 RD1_2367 RD1_2368 potC potH TRUE 0.996 -3.000 0.917 0.065 Y NA
 2025970 2025971 RD1_2368 RD1_2369 potH   TRUE 0.943 72.000 0.500 0.065 Y NA
 2025971 2025972 RD1_2369 RD1_2370     FALSE 0.182 148.000 0.121 1.000 N NA
 2025974 2025975 RD1_2373 RD1_2376 apt   FALSE 0.001 928.000 0.000 NA   NA
 2025975 2025976 RD1_2376 RD1_2377   petF TRUE 0.961 -3.000 0.400 NA   NA
 2025976 2025977 RD1_2377 RD1_2378 petF sbp FALSE 0.459 60.000 0.060 1.000   NA
 2025977 2025978 RD1_2378 RD1_2379 sbp   TRUE 0.760 13.000 0.060 1.000   NA
 2025978 2025979 RD1_2379 RD1_2380     FALSE 0.004 276.000 0.000 NA N NA
 2025979 2025980 RD1_2380 RD1_2381   rbsC TRUE 0.936 26.000 0.355 NA Y NA
 2025980 2025981 RD1_2381 RD1_2382 rbsC   TRUE 0.997 -3.000 0.952 0.002 Y NA
 2025982 2025983 RD1_2383 RD1_2384     TRUE 0.905 -3.000 0.104 1.000   NA
 2025983 2025984 RD1_2384 RD1_2385     TRUE 0.817 4.000 0.009 1.000 N NA
 2025985 2025986 RD1_2386 RD1_2387   phnM FALSE 0.283 12.000 0.000 NA   NA
 2025986 2025987 RD1_2387 RD1_2388 phnM phnN FALSE 0.025 284.000 0.000 NA Y NA
 2025987 2025988 RD1_2388 RD1_2389 phnN phnL TRUE 0.964 -3.000 0.128 NA Y NA
 2025988 2025989 RD1_2389 RD1_2390 phnL phnK TRUE 0.997 4.000 0.859 0.028 Y NA
 2025989 2025990 RD1_2390 RD1_2391 phnK   TRUE 0.993 -3.000 0.883 1.000 Y NA
 2025990 2025991 RD1_2391 RD1_2392   phnI TRUE 0.993 -3.000 0.880 1.000 Y NA
 2025991 2025992 RD1_2392 RD1_2393 phnI phnH TRUE 0.998 2.000 0.960 0.003 Y NA
 2025992 2025993 RD1_2393 RD1_2394 phnH phnG TRUE 0.998 0.000 0.967 0.003 Y NA
 2025996 2025997 RD1_2397 RD1_2398 arsC gap TRUE 0.936 -3.000 0.158 1.000 N NA
 2025997 2025998 RD1_2398 RD1_2399 gap   TRUE 0.978 -3.000 0.689 NA   NA
 2025999 2026000 RD1_2400 RD1_2401   phnE FALSE 0.160 66.000 0.000 1.000   NA
 2026000 2026001 RD1_2401 RD1_2402 phnE   TRUE 0.968 65.000 0.568 0.001 Y NA
 2026001 2026002 RD1_2402 RD1_2403   phnC TRUE 0.947 95.000 0.589 0.003 Y NA
 2026002 2026003 RD1_2403 RD1_2404 phnC hydA FALSE 0.002 731.000 0.000 1.000 N NA
 2026003 2026004 RD1_2404 RD1_2405 hydA hyuE TRUE 0.915 -3.000 0.136 NA N NA
 2026004 2026005 RD1_2405 RD1_2406 hyuE gatA TRUE 0.952 2.000 0.182 NA N NA
 2026005 2026006 RD1_2406 RD1_2407 gatA   FALSE 0.334 121.000 0.154 1.000 N NA
 2026006 2026007 RD1_2407 RD1_2408     TRUE 0.993 -3.000 0.423 0.064 Y NA
 2026007 2026008 RD1_2408 RD1_2409   potA TRUE 0.990 -3.000 0.308 0.064 Y NA
 2026008 2026009 RD1_2409 RD1_2410 potA   TRUE 0.992 5.000 0.348 0.064 Y NA
 2026009 2026010 RD1_2410 RD1_2411     FALSE 0.257 145.000 0.200 1.000 N NA
 2026010 2026011 RD1_2411 RD1_2412     FALSE 0.004 441.000 0.000 1.000 N NA
 2026011 2026012 RD1_2412 RD1_2413     TRUE 0.981 -3.000 0.100 0.064 Y NA
 2026012 2026013 RD1_2413 RD1_2414     TRUE 0.925 -21.000 0.100 0.064 Y NA
 2026013 2026014 RD1_2414 RD1_2416     TRUE 0.945 48.000 0.333 0.064 Y NA
 2026014 2026015 RD1_2416 RD1_2417     FALSE 0.031 161.000 0.000 1.000 N NA
 2026016 2026017 RD1_2418 RD1_2419   rbsK TRUE 0.965 2.000 0.250 1.000   NA
 2026017 2026018 RD1_2419 RD1_2420 rbsK btpA FALSE 0.572 -9.000 0.024 1.000   NA
 2026018 2026019 RD1_2420 RD1_2421 btpA   TRUE 0.795 -3.000 0.024 1.000   NA
 2026019 2026020 RD1_2421 RD1_2422     TRUE 0.991 -3.000 0.250 0.006 Y NA
 2026020 2026021 RD1_2422 RD1_2423   hyuE TRUE 0.891 -3.000 0.095 NA N NA
 2026021 2026022 RD1_2423 RD1_2424 hyuE   TRUE 0.891 -3.000 0.095 NA N NA
 2026022 2026023 RD1_2424 RD1_2427     FALSE 0.139 170.000 0.133 1.000 N NA
 2026023 2026024 RD1_2427 RD1_2428     TRUE 0.963 42.000 0.467 0.064 Y NA
 2026024 2026025 RD1_2428 RD1_2429     TRUE 0.992 3.000 0.286 0.064 Y NA
 2026025 2026026 RD1_2429 RD1_2430     TRUE 0.998 0.000 1.000 0.064 Y NA
 2026026 2026027 RD1_2430 RD1_2431     TRUE 0.950 8.000 0.286 1.000 N NA
 2026027 2026028 RD1_2431 RD1_2432   pam TRUE 0.954 -3.000 0.286 1.000   NA
 2026029 2026030 RD1_2433 RD1_2434     TRUE 0.876 2.000 0.058 NA   NA
 2026032 2026033 RD1_2437 RD1_2438     FALSE 0.537 10.000 0.000 1.000   NA
 2026034 2026035 RD1_2439 RD1_2440   napA TRUE 0.932 19.000 0.545 1.000   NA
 2026035 2026036 RD1_2440 RD1_2441 napA narK TRUE 0.630 69.000 0.042 0.045   NA
 2026036 2026037 RD1_2441 RD1_2442 narK narG TRUE 0.732 63.000 0.271 1.000 N NA
 2026037 2026038 RD1_2442 RD1_2443 narG narH TRUE 0.995 -3.000 0.405 0.001 Y NA
 2026038 2026039 RD1_2443 RD1_2444 narH narJ TRUE 0.998 0.000 0.625 0.002 Y NA
 2026039 2026040 RD1_2444 RD1_2445 narJ narI TRUE 0.993 12.000 0.583 0.002 Y NA
 2026040 2026041 RD1_2445 RD1_2446 narI   TRUE 0.951 6.000 0.242 1.000 N NA
 2026041 2026042 RD1_2446 RD1_2447     FALSE 0.004 577.000 0.030 NA   NA
 2026042 2026043 RD1_2447 RD1_2448   moeA FALSE 0.485 29.000 0.042 NA   NA
 2026044 2026045 RD1_2449 RD1_2450 ilvB gdhA TRUE 0.941 -3.000 0.025 1.000 Y NA
 2026046 2026047 RD1_2451 RD1_2452 fixK   FALSE 0.233 40.000 0.000 1.000   NA
 2026047 2026048 RD1_2452 RD1_2453     FALSE 0.534 -49.000 0.000 0.094   NA
 2026048 2026049 RD1_2453 RD1_2454     FALSE 0.011 407.000 0.000 0.094   NA
 2026050 2026051 RD1_2455 RD1_2456     FALSE 0.002 288.000 0.000 NA   NA
 2026051 2026052 RD1_2456 RD1_2457     FALSE 0.002 287.000 0.000 NA   NA
 2026052 2026053 RD1_2457 RD1_2458     FALSE 0.046 100.000 0.000 NA   NA
 2026054 2026055 RD1_2459 RD1_2460     FALSE 0.001 486.000 0.000 NA   NA
 2026056 2026057 RD1_2461 RD1_2462     FALSE 0.002 637.000 0.000 1.000 N NA
 2026059 2026060 RD1_2464 RD1_2465 trkA trkH TRUE 0.985 0.000 0.017 0.003 Y NA
 2026062 2026063 RD1_2467 RD1_2468     FALSE 0.031 113.000 0.000 NA   NA
 2026066 2026067 RD1_2472 RD1_2473     TRUE 0.677 8.000 0.022 NA   NA
 2026068 2026069 RD1_2474 RD1_2475     FALSE 0.100 48.000 0.000 NA   NA
 2026070 2026071 RD1_2476 RD1_2477   pld FALSE 0.521 -16.000 0.047 NA   NA
 2026071 2026072 RD1_2477 RD1_2478 pld   FALSE 0.005 214.000 0.000 NA   NA
 2026072 2026073 RD1_2478 RD1_2479     TRUE 0.878 -3.000 0.096 NA   NA
 2026073 2026074 RD1_2479 RD1_2481     TRUE 0.924 -7.000 0.500 NA   NA
 2026074 2026075 RD1_2481 RD1_2482     TRUE 0.689 56.000 0.250 NA   NA
 2026075 1597842 RD1_2482 RD1_2483     FALSE 0.001 1419.000 0.000 NA   NA
 1597842 2026076 RD1_2483 RD1_2485     FALSE 0.028 116.000 0.000 NA   NA
 2026077 2026078 RD1_2486 RD1_2487   helD FALSE 0.056 88.000 0.000 NA   NA
 2026078 1597846 RD1_2487 RD1_2488 helD   FALSE 0.099 49.000 0.000 NA   NA
 1597846 2026079 RD1_2488 RD1_2490     FALSE 0.001 733.000 0.000 NA   NA
 2026079 2026080 RD1_2490 RD1_2491     TRUE 0.844 -7.000 0.000 0.001   NA
 2026084 2026085 RD1_2495 RD1_2496     FALSE 0.002 292.000 0.000 NA   NA
 2026086 2026087 RD1_2497 RD1_2498     FALSE 0.330 72.000 0.053 NA   NA
 2026087 2026088 RD1_2498 RD1_2499     FALSE 0.157 67.000 0.000 1.000   NA
 2026090 2026091 RD1_2501 RD1_2502     FALSE 0.187 55.000 0.000 1.000   NA
 2026091 2026092 RD1_2502 RD1_2504     FALSE 0.009 633.000 0.000 0.041   NA
 2026094 2026095 RD1_2506 RD1_2507   suhB FALSE 0.070 110.000 0.003 NA   NA
 2026096 2026097 RD1_2508 RD1_2509   putA TRUE 0.787 69.000 0.459 1.000   NA
 2026098 2026099 RD1_2510 RD1_2511 putR   FALSE 0.496 32.000 0.031 1.000   NA
 2026099 1597868 RD1_2511 RD1_2512     FALSE 0.010 160.000 0.000 NA   NA
 1597868 2026100 RD1_2512 RD1_2513   mcpA FALSE 0.003 237.000 0.000 NA   NA
 2026103 2026104 RD1_2516 RD1_2517 metG   FALSE 0.357 70.000 0.029 1.000 N NA
 2026104 2026105 RD1_2517 RD1_2518     FALSE 0.429 66.000 0.085 NA   NA
 2026105 2026106 RD1_2518 RD1_2519     FALSE 0.552 58.000 0.128 NA   NA
 2026107 2026108 RD1_2520 RD1_2521     FALSE 0.191 99.000 0.015 1.000   NA
 2026108 2026109 RD1_2521 RD1_2522     FALSE 0.320 24.000 0.000 1.000   NA
 2026109 2026110 RD1_2522 RD1_2523     TRUE 0.619 -3.000 0.000 1.000   NA
 2026110 2026111 RD1_2523 RD1_2524     FALSE 0.227 103.000 0.034 1.000   NA
 2026112 2026113 RD1_2525 RD1_2526     TRUE 0.693 78.000 0.362 NA   NA
 2026113 2026114 RD1_2526 RD1_2527   pleD FALSE 0.001 494.000 0.000 NA   NA
 2026115 2026116 RD1_2528 RD1_2529     TRUE 0.896 -3.000 0.118 NA   NA
 2026116 2026117 RD1_2529 RD1_2530     FALSE 0.307 96.000 0.051 1.000   NA
 2026117 2026118 RD1_2530 RD1_2531     FALSE 0.378 72.000 0.048 1.000   NA
 2026118 2026119 RD1_2531 RD1_2532     TRUE 0.938 -3.000 0.192 1.000   NA
 2026120 2026121 RD1_2533 RD1_2534 acrF acrE TRUE 0.984 5.000 0.714 1.000 N NA
 2026121 1597891 RD1_2534 RD1_2535 acrE   FALSE 0.001 596.000 0.000 NA   NA
 1597891 2026122 RD1_2535 RD1_2536   recJ FALSE 0.057 85.000 0.000 NA   NA
 2026122 2026123 RD1_2536 RD1_2537 recJ glpX TRUE 0.594 35.000 0.055 1.000 N NA
 2026123 2026124 RD1_2537 RD1_2538 glpX hom FALSE 0.498 85.000 0.112 1.000 N NA
 2026124 2026125 RD1_2538 RD1_2539 hom   FALSE 0.111 96.000 0.006 NA   NA
 2026127 2026128 RD1_2541 RD1_2542 serS   FALSE 0.169 90.000 0.003 1.000   NA
 2026129 2026130 RD1_2543 RD1_2544 yajC secD TRUE 0.831 34.000 0.099 NA Y NA
 2026130 2026131 RD1_2544 RD1_2545 secD secF TRUE 0.995 2.000 0.244 0.001 Y NA
 2026131 2026132 RD1_2545 RD1_2546 secF   TRUE 0.668 14.000 0.052 NA   NA
 2026132 2026133 RD1_2546 RD1_2547   ccmA FALSE 0.521 45.000 0.085 NA   NA
 2026133 2026134 RD1_2547 RD1_2548 ccmA ccmB TRUE 0.995 -3.000 0.503 0.003 Y NA
 2026134 2026135 RD1_2548 RD1_2549 ccmB ccmC TRUE 0.972 53.000 0.501 0.001 Y NA
 2026135 2026136 RD1_2549 RD1_2550 ccmC   TRUE 0.974 -3.000 0.501 1.000   NA
 2026136 2026137 RD1_2550 RD1_2551   cycY TRUE 0.793 -7.000 0.108 1.000   NA
 2026138 2026139 RD1_2552 RD1_2553 gltK   FALSE 0.315 178.000 0.615 1.000   NA
 2026139 2026140 RD1_2553 RD1_2554     FALSE 0.010 160.000 0.000 NA   NA
 2026140 2026141 RD1_2554 RD1_2555   acnA FALSE 0.002 292.000 0.000 NA   NA
 2026143 2026144 RD1_2557 RD1_2558   fliG FALSE 0.108 214.000 0.214 1.000 N NA
 2026144 2026145 RD1_2558 RD1_2559 fliG purB FALSE 0.004 538.000 0.003 1.000 N NA
 2026146 2026147 RD1_2560 RD1_2561   bioY TRUE 0.606 76.000 0.231 NA   NA
 2026147 2026148 RD1_2561 RD1_2562 bioY   FALSE 0.204 135.000 0.154 NA   NA
 2026151 2026152 RD1_2565 RD1_2566     FALSE 0.004 228.000 0.000 NA   NA
 2026153 2026154 RD1_2567 RD1_2568     FALSE 0.117 39.000 0.000 NA   NA
 2026155 2026156 RD1_2569 RD1_2570 glnA glnB TRUE 0.841 49.000 0.145 1.000 Y NA
 2026160 2026161 RD1_2578 RD1_2580     FALSE 0.501 85.000 0.133 1.000   NA
 2026161 2026162 RD1_2580 RD1_2581     TRUE 0.986 13.000 0.478 0.063 Y NA
 2026162 2026163 RD1_2581 RD1_2582   pobR FALSE 0.015 209.000 0.000 1.000 N NA
 2026166 2026167 RD1_2585 RD1_2586 pyrH frr TRUE 0.813 84.000 0.626 1.000 N NA
 2026167 2026168 RD1_2586 RD1_2587 frr uppS FALSE 0.306 164.000 0.409 1.000 N NA
 2026168 2026169 RD1_2587 RD1_2588 uppS   TRUE 0.984 7.000 0.400 1.000 Y NA
 2026169 2026170 RD1_2588 RD1_2590   dxr TRUE 0.982 8.000 0.372 1.000 Y NA
 2026170 2026171 RD1_2590 RD1_2591 dxr ecfE TRUE 0.962 12.000 0.568 1.000 N NA
 2026171 2026172 RD1_2591 RD1_2592 ecfE   FALSE 0.084 103.000 0.002 NA   NA
 2026172 2026173 RD1_2592 RD1_2593     FALSE 0.009 166.000 0.000 NA   NA
 2026173 2026174 RD1_2593 RD1_2594     TRUE 0.983 4.000 0.241 1.000 Y NA
 2026174 2026175 RD1_2594 RD1_2595   fabZ FALSE 0.497 81.000 0.102 1.000 N NA
 2026175 2026176 RD1_2595 RD1_2596 fabZ lpxA TRUE 0.964 4.000 0.264 1.000 N NA
 2026176 2026177 RD1_2596 RD1_2597 lpxA   TRUE 0.982 0.000 0.552 NA   NA
 2026177 2026178 RD1_2597 RD1_2598   lpxB TRUE 0.921 -3.000 0.173 NA   NA
 2026180 2026181 RD1_2600 RD1_2601   ctrA FALSE 0.534 100.000 0.213 1.000   NA
 2026181 2026182 RD1_2601 RD1_2602 ctrA ligA FALSE 0.114 128.000 0.022 1.000 N NA
 2026182 2026183 RD1_2602 RD1_2604 ligA recG TRUE 0.976 -3.000 0.029 0.010 Y NA
 2026184 2026185 RD1_2605 RD1_2606     FALSE 0.212 73.000 0.011 NA N NA
 2026187 2026188 RD1_2608 RD1_2609     TRUE 0.791 -3.000 0.022 1.000   NA
 2026188 2026189 RD1_2609 RD1_2610   gid FALSE 0.401 39.000 0.018 1.000   NA
 2026191 2026192 RD1_2612 RD1_2613 rspI rplM TRUE 0.993 3.000 0.231 0.011 Y NA
 2026193 2026194 RD1_2614 RD1_2615     TRUE 0.977 -3.000 0.667 NA   NA
 2026194 2026195 RD1_2615 RD1_2616     TRUE 0.919 -3.000 0.167 NA   NA
 2026196 2026197 RD1_2617 RD1_2618     FALSE 0.015 139.000 0.000 NA   NA
 2026198 2026199 RD1_2619 RD1_2620   lpxD TRUE 0.578 33.000 0.057 1.000   NA
 2026199 2026200 RD1_2620 RD1_2621 lpxD   TRUE 0.598 -13.000 0.029 1.000 N NA
 2026200 2026201 RD1_2621 RD1_2623     TRUE 0.974 7.000 0.212 1.000 Y NA
 2026204 2026205 RD1_2626 RD1_2627     TRUE 0.996 -3.000 0.775 0.063 Y NA
 2026205 2026206 RD1_2627 RD1_2628     FALSE 0.054 479.000 0.190 1.000 Y NA
 2026206 2026207 RD1_2628 RD1_2630     TRUE 0.995 -3.000 0.582 0.028 Y NA
 2026207 2026208 RD1_2630 RD1_2631     TRUE 0.840 77.000 0.333 NA Y NA
 2026209 2026210 RD1_2632 RD1_2633     FALSE 0.146 29.000 0.000 NA   NA
 2026214 2026215 RD1_2637 RD1_2638     TRUE 0.894 13.000 0.276 NA   NA
 2026215 2026216 RD1_2638 RD1_2639     TRUE 0.805 -3.000 0.027 1.000   NA
 2026216 2026217 RD1_2639 RD1_2640   mdeA TRUE 0.850 2.000 0.023 1.000   NA
 2026217 2026218 RD1_2640 RD1_2641 mdeA phoR FALSE 0.562 19.000 0.011 1.000 N NA
 2026218 2026219 RD1_2641 RD1_2642 phoR pstS FALSE 0.036 195.000 0.041 NA N NA
 2026219 2026220 RD1_2642 RD1_2643 pstS pstC TRUE 0.752 63.000 0.107 NA Y NA
 2026220 2026221 RD1_2643 RD1_2644 pstC pstA TRUE 0.995 -3.000 0.485 0.001 Y NA
 2026221 2026222 RD1_2644 RD1_2646 pstA pstB TRUE 0.989 13.000 0.402 0.001 Y NA
 2026222 2026223 RD1_2646 RD1_2647 pstB phoU TRUE 0.976 5.000 0.222 NA Y NA
 2026223 2026224 RD1_2647 RD1_2648 phoU phoB TRUE 0.887 6.000 0.096 NA N NA
 2026226 2026227 RD1_2650 RD1_2651   aroQ FALSE 0.022 178.000 0.000 1.000 N NA
 2026228 2026229 RD1_2652 RD1_2653 tsf rpsB TRUE 0.920 82.000 0.748 1.000 Y NA
 2026231 2026232 RD1_2655 RD1_2656     TRUE 0.912 -3.000 0.150 NA   NA
 2026234 2026235 RD1_2658 RD1_2659 proA proB TRUE 0.936 30.000 0.065 0.002 Y NA
 2026235 2026236 RD1_2659 RD1_2660 proB   TRUE 0.718 -12.000 0.087 1.000   NA
 2026236 2026237 RD1_2660 RD1_2661     FALSE 0.417 36.000 0.019 1.000   NA
 2026237 2026238 RD1_2661 RD1_2662     TRUE 0.966 3.000 0.241 1.000 N NA
 2026238 2026239 RD1_2662 RD1_2663   rpmA FALSE 0.003 622.000 0.004 1.000 N NA
 2026239 2026240 RD1_2663 RD1_2665 rpmA   TRUE 0.894 12.000 0.025 0.011   NA
 2026240 2026241 RD1_2665 RD1_2666     TRUE 0.848 12.000 0.140 NA   NA
 2026241 2026242 RD1_2666 RD1_2668     TRUE 0.975 4.000 0.500 NA   NA
 2026243 2026244 RD1_2670 RD1_2671     FALSE 0.002 293.000 0.000 NA   NA
 2026245 2026246 RD1_2672 RD1_2673     FALSE 0.039 259.000 0.000 1.000 Y NA
 2026246 2026247 RD1_2673 RD1_2674     TRUE 0.956 47.000 0.800 1.000 Y NA
 2026247 2026248 RD1_2674 RD1_2675     TRUE 0.972 0.000 0.067 1.000 Y NA
 2026248 2026249 RD1_2675 RD1_2676   bcp TRUE 0.587 -16.000 0.033 1.000 N NA
 2026252 2026253 RD1_2679 RD1_2681     TRUE 0.971 4.000 0.444 NA   NA
 2026253 2026254 RD1_2681 RD1_2682     TRUE 0.697 48.000 0.222 NA   NA
 2026255 2026256 RD1_2683 RD1_2684   glsA FALSE 0.001 387.000 0.000 NA   NA
 2026256 2026257 RD1_2684 RD1_2685 glsA   FALSE 0.007 244.000 0.000 1.000   NA
 2026257 2026258 RD1_2685 RD1_2686     TRUE 0.947 13.000 0.500 1.000   NA
 2026258 2026259 RD1_2686 RD1_2687   cyaA FALSE 0.324 -13.000 0.000 1.000   NA
 1598033 2026260 RD1_2688 RD1_2689   sufS FALSE 0.011 155.000 0.000 NA   NA
 2026260 2026261 RD1_2689 RD1_2690 sufS   TRUE 0.821 -7.000 0.176 NA   NA
 2026261 2026262 RD1_2690 RD1_2691     TRUE 0.973 12.000 0.964 NA   NA
 2026262 2026263 RD1_2691 RD1_2692   sufD TRUE 0.869 0.000 0.049 NA   NA
 2026263 2026264 RD1_2692 RD1_2694 sufD sufC TRUE 0.992 0.000 0.482 1.000 Y NA
 2026264 2026265 RD1_2694 RD1_2695 sufC   FALSE 0.149 72.000 0.005 NA   NA
 2026265 2026266 RD1_2695 RD1_2696   sufB FALSE 0.131 90.000 0.009 NA   NA
 2026266 2026267 RD1_2696 RD1_2698 sufB nifS TRUE 0.814 16.000 0.109 1.000 N NA
 2026267 2026268 RD1_2698 RD1_2700 nifS   TRUE 0.758 31.000 0.183 NA N NA
 2026269 2026270 RD1_2701 RD1_2702     TRUE 0.903 4.000 0.100 NA   NA
 2026270 2026271 RD1_2702 RD1_2703     TRUE 0.761 -7.000 0.112 NA   NA
 2026271 2026272 RD1_2703 RD1_2704   icd FALSE 0.209 105.000 0.031 1.000   NA
 2026274 2026275 RD1_2706 RD1_2707 qacE typA FALSE 0.154 112.000 0.012 1.000 N NA
 2026276 2026277 RD1_2708 RD1_2709   alaS TRUE 0.739 5.000 0.024 NA   NA
 2026277 2026278 RD1_2709 RD1_2710 alaS recA FALSE 0.223 147.000 0.054 0.091 N NA
 2026278 2026279 RD1_2710 RD1_2711 recA   FALSE 0.042 240.000 0.006 0.091 N NA
 2026279 2026280 RD1_2711 RD1_2712     FALSE 0.339 73.000 0.045 NA N NA
 2026280 2026281 RD1_2712 RD1_2713   guaB FALSE 0.502 31.000 0.039 NA N NA
 2026282 2026283 RD1_2715 RD1_2716     FALSE 0.087 149.000 0.043 1.000   NA
 2026283 1598058 RD1_2716 RD1_2717     FALSE 0.052 93.000 0.000 NA   NA
 1598058 2026284 RD1_2717 RD1_2718     FALSE 0.010 158.000 0.000 NA   NA
 2026285 2026286 RD1_2720 RD1_2721 pgi pgl TRUE 0.962 -3.000 0.089 1.000 Y NA
 2026286 2026287 RD1_2721 RD1_2722 pgl zwf TRUE 0.970 4.000 0.092 1.000 Y NA
 2026291 2026292 RD1_2727 RD1_2728 cxp   TRUE 0.942 3.000 0.117 1.000 N NA
 2026292 2026293 RD1_2728 RD1_2729   rrm2 FALSE 0.450 63.000 0.048 1.000 N NA
 2026296 2026297 RD1_2732 RD1_2733     TRUE 0.702 52.000 0.243 NA   NA
 2026297 2026298 RD1_2733 RD1_2734     TRUE 0.912 -3.000 0.131 NA N NA
 2026298 2026299 RD1_2734 RD1_2735     FALSE 0.353 82.000 0.077 NA   NA
 2026300 2026301 RD1_2736 RD1_2738   bdhA TRUE 0.771 76.000 0.452 1.000   NA
 2026301 2026302 RD1_2738 RD1_2740 bdhA   FALSE 0.192 19.000 0.000 NA   NA
 2026305 2026306 RD1_2743 RD1_2744     TRUE 0.795 -22.000 0.196 1.000 N NA
 2026306 2026307 RD1_2744 RD1_2745     FALSE 0.297 126.000 0.147 1.000 N NA
 2026308 2026309 RD1_2746 RD1_2747 mfd   FALSE 0.377 34.000 0.026 NA   NA
 2026310 2026311 RD1_2749 RD1_2750 hemB   FALSE 0.141 111.000 0.033 NA   NA
 2026313 2026314 RD1_2752 RD1_2753 acy   TRUE 0.835 1.000 0.015 1.000   NA
 2026315 2026316 RD1_2754 RD1_2755 hflX hfq TRUE 0.911 -3.000 0.115 1.000   NA
 2026316 2026317 RD1_2755 RD1_2756 hfq trkH-2 FALSE 0.350 129.000 0.252 1.000   NA
 2026317 2026318 RD1_2756 RD1_2757 trkH-2 trkA TRUE 0.986 5.000 0.089 0.002 Y NA
 2026319 2026320 RD1_2758 RD1_2759     FALSE 0.475 54.000 0.083 NA   NA
 2026321 2026322 RD1_2761 RD1_2762 ntrX ntrY TRUE 0.985 -7.000 0.533 0.057 Y NA
 2026322 2026323 RD1_2762 RD1_2763 ntrY ntrC TRUE 0.843 102.000 0.205 0.057 Y NA
 2026323 2026324 RD1_2763 RD1_2764 ntrC ntrB TRUE 0.978 13.000 0.297 0.090 Y NA
 2026324 2026325 RD1_2764 RD1_2765 ntrB   TRUE 0.908 -3.000 0.094 1.000 N NA
 2026326 2026327 RD1_2766 RD1_2767 ispD ispF TRUE 0.959 -10.000 0.419 1.000 Y NA
 2026327 2026328 RD1_2767 RD1_2768 ispF pgpA TRUE 0.929 -3.000 0.006 1.000 Y NA
 2026328 2026329 RD1_2768 RD1_2769 pgpA cinA TRUE 0.910 2.000 0.091 NA   NA
 2026332 2026333 RD1_2772 RD1_2773   lipA FALSE 0.153 69.000 0.000 1.000   NA
 2026333 2026334 RD1_2773 RD1_2774 lipA   FALSE 0.095 98.000 0.003 NA   NA
 2026334 2026335 RD1_2774 RD1_2775     FALSE 0.006 190.000 0.000 NA   NA
 2026338 2026339 RD1_2778 RD1_2779     FALSE 0.330 41.000 0.005 1.000   NA
 2026339 2026340 RD1_2779 RD1_2780     FALSE 0.546 134.000 0.381 0.091   NA
 2026340 2026341 RD1_2780 RD1_2781     TRUE 0.750 13.000 0.080 NA   NA
 2026341 2026342 RD1_2781 RD1_2782     TRUE 0.829 -3.000 0.059 NA   NA
 2026342 2026343 RD1_2782 RD1_2783     FALSE 0.325 78.000 0.059 NA   NA
 2026343 2026344 RD1_2783 RD1_2784   metA FALSE 0.153 92.000 0.016 NA   NA
 2026344 2026345 RD1_2784 RD1_2785 metA   TRUE 0.651 -16.000 0.056 1.000 N NA
 2026345 2026346 RD1_2785 RD1_2786     TRUE 0.835 49.000 0.444 1.000   NA
 2026346 2026347 RD1_2786 RD1_2787     TRUE 0.833 -40.000 0.356 1.000   NA
 2026348 2026349 RD1_2789 RD1_2790     TRUE 0.598 -15.000 0.067 NA   NA
 2026350 2026351 RD1_2791 RD1_2792   dksA TRUE 0.579 71.000 0.131 1.000 N NA
 2026352 2026353 RD1_2793 RD1_2794     FALSE 0.162 114.000 0.030 1.000   NA
 2026353 2026354 RD1_2794 RD1_2795     TRUE 0.961 -3.000 0.400 NA   NA
 2026354 2026355 RD1_2795 RD1_2796     FALSE 0.010 235.000 0.010 NA   NA
 2026355 2026356 RD1_2796 RD1_2797     FALSE 0.233 80.000 0.031 NA   NA
 2026357 2026358 RD1_2798 RD1_2799     TRUE 0.910 5.000 0.138 NA   NA
 2026358 2026359 RD1_2799 RD1_2801     FALSE 0.177 95.000 0.026 NA   NA
 2026359 2026360 RD1_2801 RD1_2802   glnE TRUE 0.830 -3.000 0.060 NA   NA
 2026361 2026362 RD1_2803 RD1_2804     TRUE 0.639 67.000 0.240 NA   NA
 2026362 2026363 RD1_2804 RD1_2805   ate TRUE 0.708 26.000 0.128 NA   NA
 2026364 2026365 RD1_2806 RD1_2807     TRUE 0.872 63.000 0.833 NA   NA
 2026365 2026366 RD1_2807 RD1_2809     FALSE 0.087 379.000 0.750 NA   NA
 2026367 2026368 RD1_2810 RD1_2811 degS degU TRUE 0.992 -3.000 0.312 0.013 Y NA
 2026368 2026369 RD1_2811 RD1_2812 degU ilvB FALSE 0.003 457.000 0.000 1.000 N NA
 2026369 2026370 RD1_2812 RD1_2813 ilvB ilvN FALSE 0.206 297.000 0.146 0.001 Y NA
 2026372 2026373 RD1_2815 RD1_2816     FALSE 0.437 106.000 0.160 1.000   NA
 2026373 2026374 RD1_2816 RD1_2817     TRUE 0.968 0.000 0.320 NA   NA
 2026375 2026376 RD1_2818 RD1_2819   prfB FALSE 0.113 96.000 0.006 NA   NA
 2026376 2026377 RD1_2819 RD1_2820 prfB mrcA FALSE 0.341 86.000 0.041 1.000 N NA
 2026377 2026378 RD1_2820 RD1_2821 mrcA amiC TRUE 0.845 93.000 0.396 1.000 Y NA
 2026378 2026379 RD1_2821 RD1_2822 amiC aspB FALSE 0.513 62.000 0.072 1.000 N NA
 2026380 2026381 RD1_2823 RD1_2824     TRUE 0.939 4.000 0.149 1.000   NA
 2026382 2026383 RD1_2825 RD1_2826 ispG   TRUE 0.674 57.000 0.233 NA   NA
 2026383 2026384 RD1_2826 RD1_2827   hemA FALSE 0.100 136.000 0.057 NA   NA
 2026385 2026386 RD1_2828 RD1_2829   dehH1 TRUE 0.953 0.000 0.156 1.000   NA
 1598163 2026387 RD1_2830 RD1_2831     FALSE 0.022 124.000 0.000 NA   NA
 2026387 2026388 RD1_2831 RD1_2832     FALSE 0.215 153.000 0.250 NA   NA
 2026388 1598166 RD1_2832 RD1_2833     FALSE 0.001 710.000 0.000 NA   NA
 1598166 2026389 RD1_2833 RD1_2834     FALSE 0.101 47.000 0.000 NA   NA
 2026389 2026390 RD1_2834 RD1_2835     FALSE 0.005 209.000 0.000 NA   NA
 2026391 2026392 RD1_2836 RD1_2837     FALSE 0.097 147.000 0.073 NA   NA
 2026393 2026394 RD1_2838 RD1_2839     FALSE 0.403 126.000 0.328 NA N NA
 2026394 2026395 RD1_2839 RD1_2840     TRUE 0.960 6.000 0.406 NA   NA
 2026395 2026396 RD1_2840 RD1_2841     TRUE 0.965 5.000 0.429 NA   NA
 2026396 2026397 RD1_2841 RD1_2842     FALSE 0.219 181.000 0.397 1.000   NA
 2026398 2026399 RD1_2843 RD1_2844     TRUE 0.831 88.000 0.377 NA Y NA
 2026399 2026400 RD1_2844 RD1_2845     TRUE 0.992 5.000 0.377 0.062 Y NA
 2026400 2026401 RD1_2845 RD1_2846     TRUE 0.979 13.000 0.558 1.000 Y NA
 2026401 2026402 RD1_2846 RD1_2847     TRUE 0.991 13.000 0.628 0.027 Y NA
 2026403 2026404 RD1_2848 RD1_2849     FALSE 0.156 89.000 0.000 1.000 N NA
 2026405 2026406 RD1_2850 RD1_2851 accB accC TRUE 0.982 12.000 0.153 0.001 Y NA
 2026406 2026407 RD1_2851 RD1_2852 accC aat TRUE 0.849 13.000 0.114 1.000 N NA
 2026408 2026409 RD1_2853 RD1_2854     TRUE 0.888 -3.000 0.108 NA   NA
 2026409 2026410 RD1_2854 RD1_2855     TRUE 0.924 6.000 0.199 NA   NA
 2026410 2026411 RD1_2855 RD1_2856     FALSE 0.269 82.000 0.033 NA N NA
 2026411 2026412 RD1_2856 RD1_2857   clpX FALSE 0.066 131.000 0.012 NA N NA
 2026412 2026413 RD1_2857 RD1_2858 clpX clpP TRUE 0.584 139.000 0.352 1.000 Y NA
 2026415 2026416 RD1_2860 RD1_2861 lacK   TRUE 0.955 5.000 0.239 1.000 N NA
 2026417 2026418 RD1_2862 RD1_2863     TRUE 0.924 99.000 0.560 0.062 Y NA
 2026418 2026419 RD1_2863 RD1_2864     TRUE 0.963 69.000 0.762 0.062 Y NA
 2026419 2026420 RD1_2864 RD1_2865   rafA TRUE 0.990 -3.000 0.579 1.000 Y NA
 2026420 2026421 RD1_2865 RD1_2866 rafA   FALSE 0.572 101.000 0.233 1.000 N NA
 2026421 2026422 RD1_2866 RD1_2867   dgoK TRUE 0.952 8.000 0.300 1.000 N NA
 2026422 2026423 RD1_2867 RD1_2868 dgoK dgoA TRUE 0.961 -3.000 0.084 1.000 Y NA
 2026423 2026424 RD1_2868 RD1_2869 dgoA bgaT FALSE 0.255 140.000 0.024 1.000 Y NA
 2026425 2026426 RD1_2870 RD1_2871 pgm malQ TRUE 0.971 -3.000 0.007 0.012 Y NA
 2026426 2026427 RD1_2871 RD1_2872 malQ glgX TRUE 0.993 -10.000 1.000 0.002 Y NA
 2026427 2026428 RD1_2872 RD1_2873 glgX   TRUE 0.972 10.000 0.250 1.000 Y NA
 2026428 2026429 RD1_2873 RD1_2874   glgC TRUE 0.975 2.000 0.094 1.000 Y NA
 2026429 2026430 RD1_2874 RD1_2875 glgC glgB TRUE 0.951 46.000 0.205 0.001 Y NA
 2026430 2026431 RD1_2875 RD1_2876 glgB glgP TRUE 0.946 14.000 0.189 1.000 Y NA
 2026431 2026432 RD1_2876 RD1_2877 glgP frk FALSE 0.538 92.000 0.016 1.000 Y NA
 2026432 2026433 RD1_2877 RD1_2878 frk eda TRUE 0.750 32.000 0.008 1.000 Y NA
 2026433 2026434 RD1_2878 RD1_2879 eda edd TRUE 0.972 16.000 0.523 1.000 Y NA
 2026434 2026435 RD1_2879 RD1_2880 edd gap TRUE 0.690 46.000 0.008 1.000 Y NA
 2026435 2026436 RD1_2880 RD1_2882 gap   FALSE 0.062 165.000 0.028 1.000 N NA
 2026436 2026437 RD1_2882 RD1_2883   glpK TRUE 0.778 -19.000 0.015 1.000 Y NA
 2026437 2026438 RD1_2883 RD1_2884 glpK glpD TRUE 0.946 17.000 0.019 0.001 Y NA
 2026440 2026441 RD1_2887 RD1_2888     TRUE 0.993 -3.000 0.800 0.005   NA
 2026441 2026442 RD1_2888 RD1_2889     FALSE 0.002 518.000 0.000 1.000   NA
 2026442 2026443 RD1_2889 RD1_2890     TRUE 0.741 82.000 0.129 1.000 Y NA
 2026443 2026444 RD1_2890 RD1_2891   srr TRUE 0.973 13.000 0.426 1.000 Y NA
 2026444 2026445 RD1_2891 RD1_2892 srr sgaA TRUE 0.989 11.000 0.393 0.017 Y NA
 2026446 2026447 RD1_2893 RD1_2894 iclR   TRUE 0.602 124.000 0.067 0.056 Y NA
 2026448 2026449 RD1_2895 RD1_2896 fdhI fdhB TRUE 0.938 80.000 0.349 0.002 Y NA
 2026449 2026450 RD1_2896 RD1_2897 fdhB fdhA TRUE 0.984 16.000 0.317 0.001 Y NA
 2026450 2026451 RD1_2897 RD1_2898 fdhA   TRUE 0.676 95.000 0.440 NA   NA
 2026451 2026452 RD1_2898 RD1_2899   torD TRUE 0.576 52.000 0.126 NA   NA
 2026452 2026453 RD1_2899 RD1_2900 torD   TRUE 0.949 -3.000 0.305 NA   NA
 2026453 2026454 RD1_2900 RD1_2901     TRUE 0.984 -3.000 0.901 NA   NA
 2026456 2026457 RD1_2903 RD1_2904     FALSE 0.519 0.000 0.000 NA   NA
 2026458 2026459 RD1_2905 RD1_2906     TRUE 0.976 0.000 0.429 NA   NA
 2026459 2026460 RD1_2906 RD1_2907     TRUE 0.985 -3.000 0.952 NA N NA
 2026460 2026461 RD1_2907 RD1_2908     TRUE 0.975 -3.000 0.625 NA   NA
 2026462 2026463 RD1_2909 RD1_2910     TRUE 0.901 -3.000 0.109 NA N NA
 2026463 2026464 RD1_2910 RD1_2911     TRUE 0.979 0.000 0.389 1.000 N NA
 2026465 2026466 RD1_2912 RD1_2913   modA FALSE 0.376 17.000 0.000 1.000   NA
 2026466 2026467 RD1_2913 RD1_2914 modA modB TRUE 0.995 9.000 0.627 0.001 Y NA
 2026467 2026468 RD1_2914 RD1_2915 modB modC TRUE 0.996 -3.000 0.537 0.001 Y NA
 2026469 2026470 RD1_2916 RD1_2917     FALSE 0.223 78.000 0.027 NA   NA
 2026470 2026471 RD1_2917 RD1_2918   adhE TRUE 0.942 33.000 0.500 0.064 N NA
 2026471 2026472 RD1_2918 RD1_2920 adhE   TRUE 0.726 62.000 0.286 1.000   NA
 2026472 2026473 RD1_2920 RD1_2921     TRUE 0.908 46.000 0.889 NA   NA
 2026473 2026474 RD1_2921 RD1_2922     TRUE 0.983 -3.000 0.889 NA   NA
 2026476 2026477 RD1_2925 RD1_2926 fabD pdhB TRUE 0.984 -3.000 0.419 0.064 N NA
 2026477 2026478 RD1_2926 RD1_2927 pdhB   FALSE 0.176 118.000 0.047 1.000   NA
 2026478 2026479 RD1_2927 RD1_2928     TRUE 0.598 86.000 0.222 1.000   NA
 2026479 2026480 RD1_2928 RD1_2929     FALSE 0.007 177.000 0.000 NA   NA
 2026481 2026482 RD1_2930 RD1_2931 opuAC opuAB TRUE 0.932 73.000 0.400 0.062 Y NA
 2026482 2026483 RD1_2931 RD1_2932 opuAB opuAA TRUE 0.976 11.000 0.167 0.090 Y NA
 2026484 2026485 RD1_2933 RD1_2934 uxuB uxaC TRUE 0.960 -3.000 0.082 1.000 Y NA
 2026485 2026486 RD1_2934 RD1_2935 uxaC   TRUE 0.715 53.000 0.033 1.000 Y NA
 2026486 2026487 RD1_2935 RD1_2936   ugpC TRUE 0.840 -55.000 0.016 0.062 Y NA
 2026487 2026488 RD1_2936 RD1_2937 ugpC ugpE TRUE 0.991 0.000 0.160 0.062 Y NA
 2026488 2026489 RD1_2937 RD1_2938 ugpE ugpA TRUE 0.998 0.000 0.840 0.062 Y NA
 2026489 2026490 RD1_2938 RD1_2939 ugpA upgB TRUE 0.961 74.000 0.760 0.062 Y NA
 2026490 2026491 RD1_2939 RD1_2940 upgB   FALSE 0.049 183.000 0.045 1.000   NA
 2026493 2026494 RD1_2943 RD1_2944     TRUE 0.915 -21.000 0.667 NA N NA
 2026494 2026495 RD1_2944 RD1_2945   tctD TRUE 0.972 -7.000 0.515 1.000 Y NA
 2026496 2026497 RD1_2946 RD1_2947     TRUE 0.825 73.000 0.690 NA   NA
 2026497 2026498 RD1_2947 RD1_2948     TRUE 0.988 2.000 0.844 NA   NA
 2026499 2026500 RD1_2949 RD1_2950   lon FALSE 0.013 147.000 0.000 NA   NA
 2026500 2026501 RD1_2950 RD1_2951 lon   FALSE 0.013 199.000 0.000 1.000   NA
 2026501 2026502 RD1_2951 RD1_2952   tgt FALSE 0.070 126.000 0.003 1.000   NA
 2026503 2026504 RD1_2953 RD1_2954     FALSE 0.054 91.000 0.000 NA   NA
 2026504 2026505 RD1_2954 RD1_2955     TRUE 0.937 15.000 0.565 NA   NA
 2026505 2026506 RD1_2955 RD1_2956   rimK FALSE 0.292 78.000 0.047 NA   NA
 2026506 2026507 RD1_2956 RD1_2957 rimK   FALSE 0.218 87.000 0.032 NA   NA
 2026507 2026508 RD1_2957 RD1_2959   maa FALSE 0.542 12.000 0.014 NA   NA
 2026508 2026509 RD1_2959 RD1_2960 maa hesB FALSE 0.417 24.000 0.020 NA   NA
 2026509 2026510 RD1_2960 RD1_2961 hesB tpiA FALSE 0.122 125.000 0.049 NA   NA
 2026510 2026511 RD1_2961 RD1_2962 tpiA cyp FALSE 0.332 53.000 0.005 1.000 N NA
 2026513 2026514 RD1_2964 RD1_2965 cysG   TRUE 0.964 0.000 0.282 NA   NA
 2026514 2026515 RD1_2965 RD1_2966   cysI TRUE 0.960 -7.000 0.919 NA   NA
 2026515 2026516 RD1_2966 RD1_2967 cysI cysH TRUE 0.702 -10.000 0.059 1.000 N NA
 2026516 2026517 RD1_2967 RD1_2968 cysH   TRUE 0.907 -3.000 0.139 NA   NA
 2026517 2026518 RD1_2968 RD1_2969   fpr FALSE 0.479 82.000 0.144 NA   NA
 2026518 2026519 RD1_2969 RD1_2970 fpr infC FALSE 0.015 238.000 0.002 1.000 N NA
 2026519 2026520 RD1_2970 RD1_2971 infC   FALSE 0.030 114.000 0.000 NA   NA
 2026521 2026522 RD1_2972 RD1_2973 coxM coxL TRUE 0.942 101.000 0.525 0.001 Y NA
 2026522 2026523 RD1_2973 RD1_2974 coxL coxS TRUE 0.934 105.000 0.512 0.001 Y NA
 2026523 2026524 RD1_2974 RD1_2975 coxS   FALSE 0.445 108.000 0.158 1.000 N NA
 2026524 2026525 RD1_2975 RD1_2976     TRUE 0.952 -3.000 0.289 NA N NA
 2026526 2026527 RD1_2977 RD1_2978     TRUE 0.705 4.000 0.011 NA   NA
 2026527 2026528 RD1_2978 RD1_2979     TRUE 0.745 -3.000 0.028 NA   NA
 2026529 2026530 RD1_2980 RD1_2981     TRUE 0.744 0.000 0.010 NA   NA
 2026534 2026535 RD1_2985 RD1_2986 coaD   FALSE 0.201 87.000 0.010 1.000   NA
 2026535 2026536 RD1_2986 RD1_2988     TRUE 0.695 61.000 0.229 1.000   NA
 2026536 2026537 RD1_2988 RD1_2989     FALSE 0.107 -55.000 0.000 NA   NA
 2026538 2026539 RD1_2990 RD1_2991 mmsA mmsB FALSE 0.287 146.000 0.019 0.001 N NA
 2026539 2026540 RD1_2991 RD1_2992 mmsB   FALSE 0.008 172.000 0.000 NA   NA
 2026543 2026544 RD1_2995 RD1_2996 lpdA   FALSE 0.206 120.000 0.070 1.000   NA
 2026544 2026545 RD1_2996 RD1_2997     FALSE 0.410 93.000 0.094 1.000   NA
 2026545 2026546 RD1_2997 RD1_2998   queA FALSE 0.174 104.000 0.017 1.000   NA
 2026546 2026547 RD1_2998 RD1_2999 queA   FALSE 0.534 11.000 0.008 NA   NA
 2026548 2026549 RD1_3000 RD1_3001 bcp   TRUE 0.945 -3.000 0.052 0.039   NA
 2026549 2026550 RD1_3001 RD1_3002     FALSE 0.095 168.000 0.086 1.000   NA
 2026550 2026551 RD1_3002 RD1_3003     TRUE 0.914 -10.000 0.484 NA N NA
 2026552 2026553 RD1_3004 RD1_3006   ppiB FALSE 0.001 364.000 0.000 NA   NA
 2026553 2026554 RD1_3006 RD1_3007 ppiB   TRUE 0.990 14.000 0.551 0.002 Y NA
 2026555 2026556 RD1_3008 RD1_3010 pgk   FALSE 0.013 228.000 0.002 1.000   NA
 2026556 2026557 RD1_3010 RD1_3011   pdhA FALSE 0.108 136.000 0.041 1.000   NA
 2026557 2026558 RD1_3011 RD1_3013 pdhA pdhB TRUE 0.996 4.000 0.456 0.001 Y NA
 2026558 2026559 RD1_3013 RD1_3014 pdhB pdhC TRUE 0.965 12.000 0.254 1.000 Y NA
 2026560 2026561 RD1_3015 RD1_3016 cysE   FALSE 0.322 103.000 0.100 NA   NA
 2026561 2026562 RD1_3016 RD1_3017     TRUE 0.989 0.000 0.871 NA   NA
 2026562 2026563 RD1_3017 RD1_3018     TRUE 0.984 -3.000 0.929 NA   NA
 2026563 2026564 RD1_3018 RD1_3019     TRUE 0.979 0.000 0.475 NA   NA
 2026564 2026565 RD1_3019 RD1_3020     TRUE 0.940 18.000 0.678 NA   NA
 2026565 2026566 RD1_3020 RD1_3022     TRUE 0.962 13.000 0.800 NA   NA
 2026566 2026567 RD1_3022 RD1_3023     TRUE 0.973 -3.000 0.578 NA   NA
 2026567 2026568 RD1_3023 RD1_3024     TRUE 0.830 59.000 0.577 NA   NA
 2026568 2026569 RD1_3024 RD1_3025     TRUE 0.820 29.000 0.299 NA   NA
 2026569 2026570 RD1_3025 RD1_3026     TRUE 0.948 -3.000 0.291 NA   NA
 2026570 2026571 RD1_3026 RD1_3027     TRUE 0.944 -3.000 0.267 NA   NA
 2026571 2026572 RD1_3027 RD1_3028     FALSE 0.358 159.000 0.600 NA   NA
 2026572 2026573 RD1_3028 RD1_3030     TRUE 0.804 68.000 0.578 NA   NA
 2026573 2026574 RD1_3030 RD1_3031     TRUE 0.903 34.000 0.688 NA   NA
 2026574 2026575 RD1_3031 RD1_3033     TRUE 0.765 -31.000 0.242 NA   NA
 2026575 2026576 RD1_3033 RD1_3034     FALSE 0.220 149.000 0.242 NA   NA
 2026576 2026577 RD1_3034 RD1_3035     FALSE 0.001 521.000 0.000 NA   NA
 2026577 2026578 RD1_3035 RD1_3036   fabF TRUE 0.936 0.000 0.134 NA   NA
 2026578 2026579 RD1_3036 RD1_3037 fabF   FALSE 0.302 91.000 0.032 1.000 N NA
 2026579 2026580 RD1_3037 RD1_3038   acpP FALSE 0.038 173.000 0.005 1.000 N NA
 2026580 2026581 RD1_3038 RD1_3039 acpP   FALSE 0.357 250.000 0.321 0.004 Y NA
 2026581 2026582 RD1_3039 RD1_3040   fabD TRUE 0.986 15.000 0.432 0.004 Y NA
 2026585 2026586 RD1_3043 RD1_3044 rpsF rpsR TRUE 0.970 27.000 0.319 0.011 Y NA
 2026586 2026587 RD1_3044 RD1_3045 rpsR rplI TRUE 0.991 11.000 0.499 0.011 Y NA
 2026590 2026591 RD1_3048 RD1_3049 apqZ tig FALSE 0.068 136.000 0.002 1.000 N NA
 2026591 2026592 RD1_3049 RD1_3050 tig   FALSE 0.011 236.000 0.000 1.000 N NA
 2026592 2026593 RD1_3050 RD1_3051     FALSE 0.001 659.000 0.000 NA   NA
 2026593 2026594 RD1_3051 RD1_3052   rrmJ FALSE 0.153 94.000 0.017 NA   NA
 2026594 2026595 RD1_3052 RD1_3053 rrmJ   TRUE 0.971 0.000 0.316 NA N NA
 2026596 2026597 RD1_3054 RD1_3056   metF TRUE 0.893 -9.000 0.391 NA   NA
 2026597 2026598 RD1_3056 RD1_3057 metF metH TRUE 0.831 19.000 0.179 1.000   NA
 2026598 2026599 RD1_3057 RD1_3058 metH cheY FALSE 0.002 511.000 0.000 1.000   NA
 2026599 2026600 RD1_3058 RD1_3059 cheY cheA TRUE 0.965 31.000 0.711 1.000 Y NA
 2026600 2026601 RD1_3059 RD1_3060 cheA cheW TRUE 0.989 -3.000 0.178 0.005 Y NA
 2026601 2026602 RD1_3060 RD1_3061 cheW cheR TRUE 0.980 0.000 0.125 1.000 Y NA
 2026602 2026603 RD1_3061 RD1_3062 cheR cheY TRUE 0.919 -9.000 0.141 1.000 Y NA
 2026603 2026604 RD1_3062 RD1_3063 cheY   FALSE 0.002 641.000 0.000 1.000 N NA
 2026605 2026606 RD1_3064 RD1_3065     FALSE 0.001 397.000 0.000 NA   NA
 2026606 2026607 RD1_3065 RD1_3066   frpC FALSE 0.029 115.000 0.000 NA   NA
 2026607 2026608 RD1_3066 RD1_3067 frpC   FALSE 0.002 321.000 0.000 NA   NA
 1598387 2026609 RD1_3068 RD1_3069     FALSE 0.074 67.000 0.000 NA   NA
 2026611 2026612 RD1_3071 RD1_3072     FALSE 0.332 10.000 0.000 NA   NA
 2026613 2026614 RD1_3073 RD1_3074     FALSE 0.145 -19.000 0.000 NA   NA
 2026614 2026615 RD1_3074 RD1_3075     FALSE 0.141 -21.000 0.000 NA   NA
 2026615 2026616 RD1_3075 RD1_3076     TRUE 0.911 -3.000 0.147 NA   NA
 2026616 2026617 RD1_3076 RD1_3077     TRUE 0.920 -3.000 0.168 NA   NA
 2026617 2026618 RD1_3077 RD1_3078   rbsC TRUE 0.994 -3.000 0.515 0.061 Y NA
 2026618 2026619 RD1_3078 RD1_3079 rbsC rbsA TRUE 0.982 15.000 0.794 1.000 Y NA
 2026619 2026620 RD1_3079 RD1_3080 rbsA   TRUE 0.912 50.000 0.446 NA Y NA
 2026620 2026621 RD1_3080 RD1_3082     TRUE 0.939 25.000 0.357 NA Y NA
 2026622 2026623 RD1_3083 RD1_3084     TRUE 0.819 14.000 0.147 NA   NA
 2026623 2026624 RD1_3084 RD1_3085   fixL FALSE 0.036 126.000 0.000 NA N NA
 2026624 2026625 RD1_3085 RD1_3086 fixL fixJ TRUE 0.979 -16.000 0.500 0.012 Y NA
 2026626 2026627 RD1_3087 RD1_3088 aroB aroK TRUE 0.930 -7.000 0.147 1.000 Y NA
 2026628 2026629 RD1_3089 RD1_3090     TRUE 0.924 -10.000 0.593 NA   NA
 2026629 2026630 RD1_3090 RD1_3091   xerD TRUE 0.845 0.000 0.038 NA   NA
 2026630 2026631 RD1_3091 RD1_3092 xerD   FALSE 0.066 159.000 0.025 1.000 N NA
 2026632 2026633 RD1_3093 RD1_3094     FALSE 0.175 106.000 0.039 NA   NA
 2026633 2026634 RD1_3094 RD1_3095     FALSE 0.069 73.000 0.000 NA   NA
 2026634 2026635 RD1_3095 RD1_3096     FALSE 0.002 333.000 0.000 NA   NA
 2026635 2026636 RD1_3096 RD1_3097     TRUE 0.929 47.000 0.539 NA Y NA
 2026636 2026637 RD1_3097 RD1_3098     TRUE 0.998 0.000 0.855 0.061 Y NA
 2026637 2026638 RD1_3098 RD1_3099     TRUE 0.980 14.000 0.661 1.000 Y NA
 2026638 2026639 RD1_3099 RD1_3100   hydA TRUE 0.802 24.000 0.149 1.000 N NA
 2026639 2026640 RD1_3100 RD1_3101 hydA   TRUE 0.777 26.000 0.137 1.000 N NA
 2026642 2026643 RD1_3103 RD1_3104     TRUE 0.975 0.000 0.085 0.011 N NA
 2026643 2026644 RD1_3104 RD1_3106     FALSE 0.107 44.000 0.000 NA   NA
 2026644 2026645 RD1_3106 RD1_3107     FALSE 0.002 267.000 0.000 NA   NA
 2026646 2026647 RD1_3108 RD1_3109   galM FALSE 0.064 79.000 0.000 NA   NA
 2026647 2026648 RD1_3109 RD1_3110 galM   FALSE 0.004 232.000 0.000 NA   NA
 2026652 2026653 RD1_3115 RD1_3116     TRUE 0.618 52.000 0.156 NA   NA
 2026654 2026655 RD1_3117 RD1_3118   pepA TRUE 0.948 6.000 0.230 1.000 N NA
 2026656 2026657 RD1_3119 RD1_3120     TRUE 0.989 -3.000 0.631 0.042   NA
 2026657 2026658 RD1_3120 RD1_3121   ost TRUE 0.927 -3.000 0.153 1.000   NA
 2026658 2026659 RD1_3121 RD1_3122 ost surA TRUE 0.930 8.000 0.181 1.000 N NA
 2026659 2026660 RD1_3122 RD1_3123 surA pdxA TRUE 0.862 -3.000 0.044 1.000 N NA
 2026660 2026661 RD1_3123 RD1_3124 pdxA ksgA FALSE 0.542 28.000 0.023 1.000 N NA
 2026662 2026663 RD1_3125 RD1_3126   hemK FALSE 0.014 224.000 0.021 NA   NA
 2026663 2026664 RD1_3126 RD1_3127 hemK prfA TRUE 0.950 15.000 0.229 1.000 Y NA
 2026666 2026667 RD1_3129 RD1_3130     TRUE 0.722 40.000 0.212 NA   NA
 2026667 2026668 RD1_3130 RD1_3131     TRUE 0.989 0.000 0.047 0.001 Y NA
 2026668 2026669 RD1_3131 RD1_3132     TRUE 0.931 4.000 0.124 1.000   NA
 2026670 2026671 RD1_3133 RD1_3134     FALSE 0.027 179.000 0.007 1.000   NA
 2026671 2026672 RD1_3134 RD1_3135     TRUE 0.943 -3.000 0.210 1.000   NA
 2026672 2026673 RD1_3135 RD1_3136     FALSE 0.333 45.000 0.028 NA   NA
 2026674 2026675 RD1_3137 RD1_3138   rhlE2 FALSE 0.287 64.000 0.015 1.000   NA
 2026676 2026677 RD1_3139 RD1_3140   fur FALSE 0.410 -3.000 0.000 NA   NA
 2026677 2026678 RD1_3140 RD1_3141 fur   FALSE 0.423 76.000 0.071 1.000   NA
 2026678 2026679 RD1_3141 RD1_3142   eno FALSE 0.294 65.000 0.018 1.000   NA
 2026679 2026680 RD1_3142 RD1_3143 eno   TRUE 0.754 -3.000 0.012 1.000   NA
 2026681 2026682 RD1_3144 RD1_3145     FALSE 0.063 108.000 0.000 NA N NA
 2026683 2026684 RD1_3146 RD1_3147 tyrS hadH FALSE 0.528 20.000 0.006 1.000 N NA
 2026684 2026685 RD1_3147 RD1_3148 hadH   TRUE 0.930 0.000 0.091 1.000   NA
 2026686 2026687 RD1_3149 RD1_3150     FALSE 0.359 67.000 0.038 1.000   NA
 2026687 2026688 RD1_3150 RD1_3151     TRUE 0.782 23.000 0.141 1.000   NA
 2026688 2026689 RD1_3151 RD1_3152     FALSE 0.075 66.000 0.000 NA   NA
 2026690 2026691 RD1_3153 RD1_3154     FALSE 0.170 231.000 0.599 NA   NA
 2026691 2026692 RD1_3154 RD1_3155   plsX TRUE 0.837 50.000 0.418 1.000 N NA
 2026692 2026693 RD1_3155 RD1_3156 plsX fabH TRUE 0.994 -3.000 0.380 0.003 Y NA
 2026693 2026694 RD1_3156 RD1_3157 fabH ihfA TRUE 0.695 62.000 0.207 1.000 N NA
 2026694 2026695 RD1_3157 RD1_3158 ihfA   TRUE 0.736 5.000 0.005 1.000   NA
 2026695 1598475 RD1_3158 RD1_3159     FALSE 0.087 57.000 0.000 NA   NA
 1598475 2026696 RD1_3159 RD1_3160     FALSE 0.073 68.000 0.000 NA   NA
 2026697 2026698 RD1_3161 RD1_3162     TRUE 0.818 63.000 0.570 NA   NA
 2026698 2026699 RD1_3162 RD1_3163   nagZ TRUE 0.749 16.000 0.103 NA   NA
 2026699 2026700 RD1_3163 RD1_3164 nagZ   TRUE 0.887 4.000 0.085 NA   NA
 2026700 2026701 RD1_3164 RD1_3165   argS FALSE 0.200 82.000 0.025 NA   NA
 2026701 2026702 RD1_3165 RD1_3166 argS   FALSE 0.050 95.000 0.000 NA   NA
 2026702 2026703 RD1_3166 RD1_3167     FALSE 0.078 64.000 0.000 NA   NA
 2026705 2026706 RD1_3169 RD1_3170     FALSE 0.519 77.000 0.154 NA   NA
 2026708 2026709 RD1_3172 RD1_3173     FALSE 0.004 231.000 0.000 NA   NA
 2026711 2026712 RD1_3175 RD1_3176     TRUE 0.844 -3.000 0.069 NA   NA
 2026712 2026713 RD1_3176 RD1_3177   cobK TRUE 0.862 -3.000 0.044 1.000 N NA
 2026715 2026716 RD1_3180 RD1_3181     FALSE 0.410 -3.000 0.000 NA   NA
 2026716 2026717 RD1_3181 RD1_3182     FALSE 0.410 -3.000 0.000 NA   NA
 2026717 2026718 RD1_3182 RD1_3183   cysS FALSE 0.015 263.000 0.021 1.000 N NA
 2026719 2026720 RD1_3184 RD1_3185   aspC FALSE 0.095 52.000 0.000 NA   NA
 2026722 2026723 RD1_3188 RD1_3189     FALSE 0.068 75.000 0.000 NA   NA
 2026724 2026725 RD1_3190 RD1_3191     FALSE 0.070 71.000 0.000 NA   NA
 2026725 2026726 RD1_3191 RD1_3192     TRUE 0.985 -3.000 1.000 NA   NA
 2026726 2026727 RD1_3192 RD1_3193   nrdJ FALSE 0.003 423.000 0.000 1.000   NA
 2026727 2026728 RD1_3193 RD1_3194 nrdJ   FALSE 0.002 347.000 0.000 NA   NA
 2026728 1598509 RD1_3194 RD1_3195     FALSE 0.004 218.000 0.000 NA   NA
 1598509 2026729 RD1_3195 RD1_3196     FALSE 0.109 43.000 0.000 NA   NA
 2026729 2026730 RD1_3196 RD1_3197     TRUE 0.752 -33.000 0.226 NA   NA
 2026730 2026731 RD1_3197 RD1_3198   pdxH FALSE 0.019 282.000 0.046 1.000 N NA
 2026732 2026733 RD1_3199 RD1_3200 fabI-2   TRUE 0.949 5.000 0.207 1.000 N NA
 2026733 2026734 RD1_3200 RD1_3201   gpt TRUE 0.861 6.000 0.048 1.000 N NA
 2026734 2026735 RD1_3201 RD1_3202 gpt aspC TRUE 0.745 19.000 0.076 1.000 N NA
 2026735 2026736 RD1_3202 RD1_3203 aspC   FALSE 0.364 84.000 0.060 1.000   NA
 2026736 2026737 RD1_3203 RD1_3205   trpE TRUE 0.895 7.000 0.106 1.000   NA
 2026737 2026738 RD1_3205 RD1_3206 trpE   TRUE 0.791 4.000 0.012 1.000   NA
 2026738 2026739 RD1_3206 RD1_3207     FALSE 0.009 235.000 0.000 1.000   NA
 2026741 2026742 RD1_3209 RD1_3210 trpG trpD TRUE 0.946 9.000 0.070 1.000 Y NA
 2026742 2026743 RD1_3210 RD1_3211 trpD ung TRUE 0.846 3.000 0.015 1.000 N NA
 2026743 2026744 RD1_3211 RD1_3213 ung trpC TRUE 0.875 -3.000 0.054 1.000 N NA
 2026744 2026745 RD1_3213 RD1_3214 trpC moaC TRUE 0.944 2.000 0.113 1.000 N NA
 2026745 2026746 RD1_3214 RD1_3215 moaC moaA TRUE 0.985 -3.000 0.093 0.003 Y NA
 2026746 2026747 RD1_3215 RD1_3216 moaA lexA TRUE 0.684 70.000 0.232 1.000 N NA
 2026749 2026750 RD1_3218 RD1_3219 gltX gltA FALSE 0.411 107.000 0.127 1.000 N NA
 2026750 2026751 RD1_3219 RD1_3220 gltA   FALSE 0.003 237.000 0.000 NA   NA
 2026752 2026753 RD1_3221 RD1_3222 paaB cycL TRUE 0.866 71.000 0.833 NA N NA
 2026753 2026754 RD1_3222 RD1_3223 cycL cycK TRUE 0.993 -3.000 0.963 NA Y NA
 2026754 2026755 RD1_3223 RD1_3224 cycK   TRUE 0.752 59.000 0.361 NA   NA
 2026755 2026756 RD1_3224 RD1_3225     TRUE 0.832 -9.000 0.222 NA   NA
 2026756 2026757 RD1_3225 RD1_3226   cycJ FALSE 0.071 137.000 0.016 1.000   NA
 2026757 2026758 RD1_3226 RD1_3227 cycJ argC TRUE 0.815 8.000 0.032 1.000 N NA
 2026758 2026759 RD1_3227 RD1_3228 argC murI FALSE 0.521 31.000 0.025 1.000 N NA
 2026759 2026760 RD1_3228 RD1_3229 murI   TRUE 0.764 25.000 0.025 0.063   NA
 2026760 2026761 RD1_3229 RD1_3230     TRUE 0.750 73.000 0.389 1.000   NA
 2026762 2026763 RD1_3231 RD1_3232   purL FALSE 0.006 285.000 0.000 1.000 N NA
 2026764 2026765 RD1_3233 RD1_3234     TRUE 0.865 49.000 0.645 NA   NA
 2026766 2026767 RD1_3235 RD1_3236 pyrC pyrE TRUE 0.771 53.000 0.072 1.000 Y NA
 2026767 2026768 RD1_3236 RD1_3237 pyrE dnaB FALSE 0.026 236.000 0.031 1.000 N NA
 2026768 2026769 RD1_3237 RD1_3238 dnaB   FALSE 0.002 282.000 0.000 NA   NA
 2026769 2026770 RD1_3238 RD1_3239     FALSE 0.039 106.000 0.000 NA   NA
 2026770 2026771 RD1_3239 RD1_3240   alr FALSE 0.138 31.000 0.000 NA   NA
 2026771 2026772 RD1_3240 RD1_3241 alr   TRUE 0.873 -3.000 0.077 NA N NA
 2026772 2026773 RD1_3241 RD1_3243     TRUE 0.970 -3.000 0.178 NA Y NA
 2026773 2026774 RD1_3243 RD1_3244     FALSE 0.020 181.000 0.014 NA   NA
 2026774 2026775 RD1_3244 RD1_3245   radA FALSE 0.024 153.000 0.002 NA   NA
 2026775 2026776 RD1_3245 RD1_3246 radA   TRUE 0.692 28.000 0.094 1.000   NA
 2026776 2026777 RD1_3246 RD1_3247     FALSE 0.077 187.000 0.101 1.000   NA
 2026777 2026778 RD1_3247 RD1_3248     FALSE 0.345 110.000 0.100 1.000 N NA
 2026778 2026779 RD1_3248 RD1_3249   surE FALSE 0.330 89.000 0.051 1.000   NA
 2026779 2026780 RD1_3249 RD1_3250 surE pcm TRUE 0.906 9.000 0.147 1.000   NA
 2026780 2026781 RD1_3250 RD1_3251 pcm lysM FALSE 0.432 74.000 0.057 1.000 N NA
 2026782 2026783 RD1_3252 RD1_3253   tatC TRUE 0.857 -3.000 0.078 NA   NA
 2026783 2026784 RD1_3253 RD1_3254 tatC tatB TRUE 0.988 -3.000 0.535 NA Y NA
 2026784 2026785 RD1_3254 RD1_3255 tatB   TRUE 0.994 4.000 0.353 0.006 Y NA
 2026786 2026787 RD1_3256 RD1_3257     TRUE 0.687 -13.000 0.100 NA   NA
 2026788 2026789 RD1_3258 RD1_3259     TRUE 0.957 -7.000 0.875 NA   NA
 2026789 2026790 RD1_3259 RD1_3260     TRUE 0.836 0.000 0.033 NA   NA
 2026790 2026791 RD1_3260 RD1_3261     FALSE 0.202 131.000 0.088 1.000 N NA
 2026792 2026793 RD1_3262 RD1_3263 prfC rhlE FALSE 0.095 181.000 0.000 1.000 Y NA
 2026794 2026795 RD1_3264 RD1_3265     FALSE 0.179 21.000 0.000 NA   NA
 2026795 2026796 RD1_3265 RD1_3266     TRUE 0.889 5.000 0.080 1.000   NA
 2026796 2026797 RD1_3266 RD1_3267     TRUE 0.738 19.000 0.071 1.000 N NA
 2026797 2026798 RD1_3267 RD1_3268   nuoN TRUE 0.863 34.000 0.372 1.000 N NA
 2026798 2026799 RD1_3268 RD1_3269 nuoN nuoM TRUE 0.990 13.000 0.453 0.002 Y NA
 2026799 2026800 RD1_3269 RD1_3270 nuoM nuoL TRUE 0.995 0.000 0.251 0.002 Y NA
 2026800 2026801 RD1_3270 RD1_3271 nuoL nuoK TRUE 0.819 132.000 0.451 0.006 Y NA
 2026801 2026802 RD1_3271 RD1_3272 nuoK   FALSE 0.299 47.000 0.023 NA   NA
 2026802 2026803 RD1_3272 RD1_3273   nuoJ FALSE 0.438 16.000 0.012 NA   NA
 2026803 2026804 RD1_3273 RD1_3274 nuoJ   TRUE 0.971 1.000 0.066 0.006   NA
 2026804 2026805 RD1_3274 RD1_3275   nuoI TRUE 0.950 -3.000 0.046 0.006   NA
 2026805 2026806 RD1_3275 RD1_3276 nuoI nuoH TRUE 0.996 2.000 0.500 0.006 Y NA
 2026806 2026807 RD1_3276 RD1_3277 nuoH   TRUE 0.813 7.000 0.060 NA   NA
 2026807 2026808 RD1_3277 RD1_3278   nuoG TRUE 0.844 -3.000 0.069 NA   NA
 2026808 2026809 RD1_3278 RD1_3279 nuoG   FALSE 0.447 42.000 0.051 NA   NA
 2026809 2026810 RD1_3279 RD1_3280     TRUE 0.908 29.000 0.636 NA   NA
 2026810 2026811 RD1_3280 RD1_3281     FALSE 0.490 -39.000 0.060 NA   NA
 2026811 2026812 RD1_3281 RD1_3282   nuoF FALSE 0.005 212.000 0.000 NA   NA
 2026812 2026813 RD1_3282 RD1_3283 nuoF   TRUE 0.699 13.000 0.056 NA   NA
 2026813 2026814 RD1_3283 RD1_3284     TRUE 0.664 28.000 0.105 NA   NA
 2026814 2026815 RD1_3284 RD1_3285   nuoE FALSE 0.275 30.000 0.005 NA   NA
 2026815 2026816 RD1_3285 RD1_3286 nuoE   FALSE 0.255 13.000 0.000 NA   NA
 2026816 2026817 RD1_3286 RD1_3287   nuoD FALSE 0.410 -3.000 0.000 NA   NA
 2026817 2026818 RD1_3287 RD1_3288 nuoD   TRUE 0.718 2.000 0.007 NA   NA
 2026818 2026819 RD1_3288 RD1_3289     FALSE 0.084 60.000 0.000 NA   NA
 2026819 2026820 RD1_3289 RD1_3290   nuoC TRUE 0.731 -3.000 0.006 1.000   NA
 2026820 2026821 RD1_3290 RD1_3291 nuoC nuoB TRUE 0.959 40.000 0.262 0.002 Y NA
 2026821 2026822 RD1_3291 RD1_3292 nuoB nuoA FALSE 0.298 319.000 0.396 0.002 Y NA
 2026824 2026825 RD1_3294 RD1_3295   mvaB TRUE 0.964 10.000 0.218 0.062 N NA
 2026825 2026826 RD1_3295 RD1_3296 mvaB gst TRUE 0.738 29.000 0.113 1.000 N NA
 2026826 2026827 RD1_3296 RD1_3297 gst mccA TRUE 0.885 -3.000 0.064 1.000 N NA
 2026827 2026828 RD1_3297 RD1_3298 mccA mccB TRUE 0.909 78.000 0.158 0.001 Y NA
 2026828 2026829 RD1_3298 RD1_3299 mccB   FALSE 0.245 47.000 0.012 NA   NA
 2026831 2026832 RD1_3301 RD1_3302 ivd   FALSE 0.037 189.000 0.021 1.000 N NA
 2026832 2026833 RD1_3302 RD1_3303   gph TRUE 0.889 48.000 0.679 1.000   NA
 2026834 2026835 RD1_3304 RD1_3305 glmU glmS TRUE 0.971 3.000 0.083 1.000 Y NA
 2026835 2026836 RD1_3305 RD1_3306 glmS   FALSE 0.026 228.000 0.036 1.000   NA
 2026836 2026837 RD1_3306 RD1_3307   moaA FALSE 0.275 94.000 0.038 1.000   NA
 2026837 2026838 RD1_3307 RD1_3308 moaA kdtA TRUE 0.965 9.000 0.444 1.000 N NA
 2026838 2026839 RD1_3308 RD1_3309 kdtA lpcC TRUE 0.983 0.000 0.164 1.000 Y NA
 2026840 2026841 RD1_3310 RD1_3311   argE FALSE 0.023 356.000 0.000 0.004   NA
 2026841 1598623 RD1_3311 RD1_3312 argE   FALSE 0.042 103.000 0.000 NA   NA
 2026842 2026843 RD1_3314 RD1_3315     FALSE 0.563 122.000 0.042 0.060 Y NA
 2026843 2026844 RD1_3315 RD1_3316     TRUE 0.976 -43.000 0.725 0.060 Y NA
 2026845 2026846 RD1_3317 RD1_3318   pntB FALSE 0.003 476.000 0.012 NA   NA
 2026846 2026847 RD1_3318 RD1_3319 pntB pntA TRUE 0.993 14.000 0.745 0.001 Y NA
 2026847 2026848 RD1_3319 RD1_3320 pntA   FALSE 0.201 126.000 0.071 1.000 N NA
 2026850 2026851 RD1_3322 RD1_3323     FALSE 0.115 -42.000 0.000 NA   NA
 2026853 2026854 RD1_3325 RD1_3326 glcB   FALSE 0.003 244.000 0.000 NA   NA
 2026855 2026856 RD1_3327 RD1_3328 pepN   TRUE 0.825 4.000 0.012 1.000 N NA
 2026856 2026857 RD1_3328 RD1_3329     TRUE 0.699 68.000 0.333 NA   NA
 2026859 2026860 RD1_3331 RD1_3332     TRUE 0.791 14.000 0.118 NA   NA
 2026860 2026861 RD1_3332 RD1_3333   gatB FALSE 0.040 127.000 0.002 NA   NA
 2026861 2026862 RD1_3333 RD1_3334 gatB   FALSE 0.002 266.000 0.000 NA   NA
 2026862 2026863 RD1_3334 RD1_3335     FALSE 0.001 430.000 0.000 NA   NA
 2026863 2026864 RD1_3335 RD1_3336     FALSE 0.318 120.000 0.194 NA   NA
 2026866 2026867 RD1_3338 RD1_3339 dnaJ cobS FALSE 0.295 123.000 0.148 1.000   NA
 2026867 2026868 RD1_3339 RD1_3340 cobS cobT TRUE 0.931 52.000 0.433 0.001   NA
 2026868 2026869 RD1_3340 RD1_3341 cobT   TRUE 0.641 47.000 0.107 1.000 N NA
 2026869 2026870 RD1_3341 RD1_3342     FALSE 0.542 76.000 0.168 NA   NA
 2026871 2026872 RD1_3343 RD1_3344   recN FALSE 0.536 68.000 0.013 0.087 N NA
 2026872 2026873 RD1_3344 RD1_3345 recN comL TRUE 0.657 -43.000 0.117 1.000   NA
 2026873 2026874 RD1_3345 RD1_3346 comL lpxC FALSE 0.065 178.000 0.064 1.000   NA
 2026874 2026875 RD1_3346 RD1_3348 lpxC ftsZ FALSE 0.088 204.000 0.134 1.000 N NA
 2026875 2026876 RD1_3348 RD1_3349 ftsZ ftsA FALSE 0.048 419.000 0.114 1.000 Y NA
 2026876 2026877 RD1_3349 RD1_3350 ftsA ftsQ TRUE 0.930 4.000 0.137 NA N NA
 2026877 2026878 RD1_3350 RD1_3351 ftsQ ddlB TRUE 0.884 60.000 0.372 NA Y NA
 2026878 2026879 RD1_3351 RD1_3352 ddlB murB TRUE 0.951 30.000 0.135 0.003 Y NA
 2026879 2026880 RD1_3352 RD1_3354 murB   TRUE 0.666 10.000 0.025 NA   NA
 2026880 2026881 RD1_3354 RD1_3355   murC FALSE 0.372 20.000 0.008 NA   NA
 2026881 2026882 RD1_3355 RD1_3357 murC   TRUE 0.981 -3.000 0.283 1.000 Y NA
 2026882 2026883 RD1_3357 RD1_3358   ftsW TRUE 0.967 12.000 0.647 1.000 N NA
 2026885 2026886 RD1_3360 RD1_3361   murD FALSE 0.078 64.000 0.000 NA   NA
 2026886 2026887 RD1_3361 RD1_3363 murD mraY TRUE 0.974 53.000 0.647 0.003 Y NA
 2026887 2026888 RD1_3363 RD1_3364 mraY murF TRUE 0.990 10.000 0.309 0.003 Y NA
 2026888 2026889 RD1_3364 RD1_3365 murF murE TRUE 0.996 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 2026889 2026890 RD1_3365 RD1_3366 murE   TRUE 0.897 19.000 0.091 1.000 Y NA
 2026890 2026891 RD1_3366 RD1_3367     FALSE 0.268 147.000 0.315 NA   NA
 2026891 2026892 RD1_3367 RD1_3368   mraW TRUE 0.911 0.000 0.089 NA   NA
 2026892 2026893 RD1_3368 RD1_3370 mraW   TRUE 0.980 4.000 0.635 NA   NA
 2026893 2026894 RD1_3370 RD1_3371     FALSE 0.001 652.000 0.000 NA   NA
 2026896 2026897 RD1_3373 RD1_3374     FALSE 0.109 114.000 0.007 1.000   NA
 2026898 2026899 RD1_3375 RD1_3376 lldD pyc FALSE 0.248 146.000 0.032 1.000 Y NA
 2026899 2026900 RD1_3376 RD1_3377 pyc   FALSE 0.035 167.000 0.007 1.000   NA
 2026900 1598683 RD1_3377 RD1_3378     FALSE 0.041 104.000 0.000 NA   NA
 1598683 1598684 RD1_3378 RD1_3379     FALSE 0.001 481.000 0.000 NA   NA
 1598684 2026901 RD1_3379 RD1_3380     FALSE 0.117 39.000 0.000 NA   NA
 2026902 2026903 RD1_3381 RD1_3382     FALSE 0.004 295.000 0.000 1.000   NA
 2026903 2026904 RD1_3382 RD1_3383     TRUE 0.893 0.000 0.068 NA   NA
 2026904 2026905 RD1_3383 RD1_3384   chaC TRUE 0.617 76.000 0.243 NA   NA
 2026907 2026908 RD1_3386 RD1_3387   tyrC TRUE 0.780 -3.000 0.038 NA   NA
 2026908 2026909 RD1_3387 RD1_3388 tyrC hisC TRUE 0.976 -3.000 0.198 1.000 Y NA
 2026910 2026911 RD1_3389 RD1_3390     FALSE 0.132 33.000 0.000 NA   NA
 2026912 2026913 RD1_3391 RD1_3392 rpsD tag FALSE 0.074 133.000 0.003 1.000 N NA
 2026914 2026915 RD1_3393 RD1_3394   phbA FALSE 0.433 116.000 0.271 NA N NA
 2026915 2026916 RD1_3394 RD1_3395 phbA phbB TRUE 0.731 112.000 0.319 1.000 Y NA
 2026919 2026920 RD1_3398 RD1_3399     FALSE 0.420 112.000 0.235 NA   NA
 2026920 2026921 RD1_3399 RD1_3400     TRUE 0.975 -3.000 0.525 1.000   NA
 2026923 2026924 RD1_3402 RD1_3403 ispE   TRUE 0.895 7.000 0.107 1.000   NA
 2026924 2026925 RD1_3403 RD1_3404     FALSE 0.142 146.000 0.091 1.000   NA
 2026926 2026927 RD1_3405 RD1_3406 greA   TRUE 0.638 15.000 0.048 NA   NA
 2026928 2026929 RD1_3407 RD1_3408 moeA mobB TRUE 0.993 -3.000 0.302 0.003 Y NA
 2026929 2026930 RD1_3408 RD1_3409 mobB mobA TRUE 0.976 -3.000 0.013 0.003 Y NA
 2026930 2026931 RD1_3409 RD1_3410 mobA fdhD TRUE 0.790 -3.000 0.011 1.000 N NA
 2026932 2026933 RD1_3411 RD1_3412     TRUE 0.968 -3.000 0.482 NA   NA
 2026934 2026935 RD1_3413 RD1_3414     FALSE 0.466 111.000 0.286 NA   NA
 2026935 2026936 RD1_3414 RD1_3415     FALSE 0.247 157.000 0.343 NA   NA
 2026936 2026937 RD1_3415 RD1_3416     TRUE 0.962 4.000 0.333 NA   NA
 2026937 2026938 RD1_3416 RD1_3417     TRUE 0.975 0.000 0.342 1.000   NA
 2026942 2026943 RD1_3421 RD1_3422     TRUE 0.984 4.000 0.325 NA Y NA
 2026943 2026944 RD1_3422 RD1_3423   moaB FALSE 0.297 95.000 0.035 1.000 N NA
 2026944 2026945 RD1_3423 RD1_3424 moaB   TRUE 0.887 2.000 0.032 1.000 N NA
 2026945 2026946 RD1_3424 RD1_3425   udgA TRUE 0.656 -7.000 0.027 1.000 N NA
 2026947 2026948 RD1_3427 RD1_3428 pyrB   TRUE 0.701 -3.000 0.018 NA   NA
 2026948 2026949 RD1_3428 RD1_3429   pyr TRUE 0.760 0.000 0.013 NA   NA
 2026949 2026950 RD1_3429 RD1_3430 pyr   TRUE 0.903 6.000 0.108 1.000   NA
 2026952 2026953 RD1_3432 RD1_3433     FALSE 0.293 56.000 0.028 NA   NA
 2026954 2026955 RD1_3434 RD1_3435     FALSE 0.153 116.000 0.021 1.000 N NA
 2026955 2026956 RD1_3435 RD1_3436   ggt TRUE 0.634 31.000 0.062 1.000 N NA
 2026956 2026957 RD1_3436 RD1_3437 ggt gyaR TRUE 0.688 30.000 0.086 1.000 N NA
 2026958 2026959 RD1_3438 RD1_3439     FALSE 0.032 173.000 0.026 NA   NA
 2026959 1598744 RD1_3439 RD1_3440     FALSE 0.045 101.000 0.000 NA   NA
 2026960 2026961 RD1_3441 RD1_3442     FALSE 0.008 172.000 0.000 NA   NA
 2026961 2026962 RD1_3442 RD1_3443     FALSE 0.001 612.000 0.000 NA   NA
 2026963 2026964 RD1_3444 RD1_3445 tnpA   FALSE 0.001 761.000 0.000 NA   NA
 2026964 2026965 RD1_3445 RD1_3446     TRUE 0.966 0.000 0.300 NA   NA
 2026966 2026967 RD1_3447 RD1_3448     TRUE 0.963 -3.000 0.415 NA   NA
 2026967 2026968 RD1_3448 RD1_3449     FALSE 0.007 178.000 0.000 NA   NA
 2026968 2026969 RD1_3449 RD1_3450     TRUE 0.917 36.000 0.346 0.037   NA
 2026969 2026970 RD1_3450 RD1_3451     FALSE 0.001 1598.000 0.000 NA   NA
 2026972 2026973 RD1_3456 RD1_3457     FALSE 0.123 298.000 0.333 0.037   NA
 2026973 2026974 RD1_3457 RD1_3458     FALSE 0.010 159.000 0.000 NA   NA
 2026975 2026976 RD1_3460 RD1_3461     FALSE 0.105 98.000 0.000 1.000   NA
 2026976 2026977 RD1_3461 RD1_3462     TRUE 0.975 -3.000 0.182 1.000 Y NA
 2026977 1598764 RD1_3462 RD1_3463     FALSE 0.001 1063.000 0.000 NA   NA
 2026978 2026979 RD1_3464 RD1_3465   dacC TRUE 0.825 21.000 0.231 NA   NA
 2026979 2026980 RD1_3465 RD1_3466 dacC tmk TRUE 0.912 -3.000 0.099 1.000 N NA
 2026980 2026981 RD1_3466 RD1_3467 tmk   TRUE 0.975 -3.000 0.254 0.085 N NA
 2026981 2026982 RD1_3467 RD1_3468     TRUE 0.774 34.000 0.046 NA Y NA
 2026982 2026983 RD1_3468 RD1_3469     TRUE 0.937 0.000 0.139 NA   NA
 2026983 2026984 RD1_3469 RD1_3470     FALSE 0.475 61.000 0.069 1.000   NA
 2026985 2026986 RD1_3471 RD1_3472   pepQ TRUE 0.969 -3.000 0.455 NA N NA
 2026986 2026987 RD1_3472 RD1_3473 pepQ   FALSE 0.234 288.000 0.636 1.000 Y NA
 2026988 2026989 RD1_3474 RD1_3475     TRUE 0.971 5.000 0.444 1.000   NA
 2026990 2026991 RD1_3476 RD1_3477 gph   FALSE 0.032 112.000 0.000 NA   NA
 2026991 2026992 RD1_3477 RD1_3478     TRUE 0.959 18.000 1.000 NA   NA
 2026992 2026993 RD1_3478 RD1_3479     FALSE 0.002 337.000 0.000 NA   NA
 2026993 2026994 RD1_3479 RD1_3480     TRUE 0.993 6.000 0.833 1.000 Y NA
 2026994 2026995 RD1_3480 RD1_3481     TRUE 0.987 13.000 0.909 1.000 Y NA
 2026995 2026996 RD1_3481 RD1_3482     TRUE 0.963 -3.000 0.417 NA   NA
 2026997 2026998 RD1_3483 RD1_3484     TRUE 0.943 -7.000 0.667 NA   NA
 2026999 2027000 RD1_3485 RD1_3487   arsR TRUE 0.900 50.000 0.880 NA   NA
 2027000 2027001 RD1_3487 RD1_3488 arsR   FALSE 0.016 136.000 0.000 NA   NA
 2027002 2027003 RD1_3489 RD1_3490   carB FALSE 0.164 98.000 0.006 1.000   NA
 2027003 2027004 RD1_3490 RD1_3491 carB   FALSE 0.012 153.000 0.000 NA   NA
 2027004 2027005 RD1_3491 RD1_3492   fabH FALSE 0.134 99.000 0.015 NA   NA
 2027008 2027009 RD1_3495 RD1_3496   csaA TRUE 0.913 -3.000 0.117 1.000   NA
 2027009 2027010 RD1_3496 RD1_3497 csaA proC TRUE 0.839 -7.000 0.163 1.000   NA
 2027010 2027011 RD1_3497 RD1_3499 proC   TRUE 0.777 41.000 0.308 NA   NA
 2027011 2027012 RD1_3499 RD1_3500     FALSE 0.014 331.000 0.080 NA   NA
 2027013 2027014 RD1_3501 RD1_3502 lgt   TRUE 0.933 -3.000 0.170 1.000   NA
 2027014 2027015 RD1_3502 RD1_3503     TRUE 0.887 -3.000 0.107 NA   NA
 2027017 2027018 RD1_3505 RD1_3506 trxB   FALSE 0.425 101.000 0.003 0.057 N NA
 2027019 2027020 RD1_3507 RD1_3508   hspH TRUE 0.985 5.000 0.955 NA   NA
 2027021 2027022 RD1_3510 RD1_3511 purE purK TRUE 0.978 -7.000 0.201 0.001 Y NA
 2027023 2027024 RD1_3512 RD1_3513     FALSE 0.347 68.000 0.057 NA   NA
 2027026 2027027 RD1_3515 RD1_3516   groL1 FALSE 0.011 213.000 0.000 1.000   NA
 2027027 2027028 RD1_3516 RD1_3517 groL1 groES TRUE 0.933 56.000 0.209 0.005 Y NA
 2027028 2027029 RD1_3517 RD1_3518 groES   FALSE 0.063 182.000 0.094 NA   NA
 2027030 2027031 RD1_3519 RD1_3520   ppaC FALSE 0.010 163.000 0.000 NA   NA
 2027031 2027032 RD1_3520 RD1_3521 ppaC   FALSE 0.286 89.000 0.025 1.000 N NA
 2027032 2027033 RD1_3521 RD1_3522     TRUE 0.758 90.000 0.216 0.061 N NA
 2027033 2027034 RD1_3522 RD1_3523   ribF FALSE 0.446 61.000 0.044 1.000 N NA
 2027034 2027035 RD1_3523 RD1_3524 ribF   TRUE 0.799 -3.000 0.044 NA   NA
 2027035 2027036 RD1_3524 RD1_3525   ltaE TRUE 0.906 0.000 0.082 NA   NA
 2027037 2027038 RD1_3526 RD1_3527     TRUE 0.964 -3.000 0.370 1.000   NA
 2027040 2027041 RD1_3529 RD1_3530     FALSE 0.001 883.000 0.000 NA   NA
 2027041 2027042 RD1_3530 RD1_3532   atpC FALSE 0.004 410.000 0.000 1.000 N NA
 2027042 2027043 RD1_3532 RD1_3533 atpC atpD TRUE 0.994 13.000 0.837 0.003 Y NA
 2027043 2027044 RD1_3533 RD1_3534 atpD atpG TRUE 0.990 20.000 0.724 0.003 Y NA
 2027044 2027045 RD1_3534 RD1_3535 atpG atpA TRUE 0.992 16.000 0.846 0.003 Y NA
 2027045 2027046 RD1_3535 RD1_3536 atpA atpH TRUE 0.998 1.000 0.864 0.003 Y NA
 2027046 2027047 RD1_3536 RD1_3537 atpH   FALSE 0.008 173.000 0.000 NA   NA
 2027047 2027048 RD1_3537 RD1_3538     FALSE 0.172 23.000 0.000 NA   NA
 2027049 2027050 RD1_3539 RD1_3540 gloB clpA FALSE 0.117 176.000 0.041 0.085   NA
 2027052 2027053 RD1_3542 RD1_3543   pucB FALSE 0.002 487.000 0.000 1.000   NA
 2027053 2027054 RD1_3543 RD1_3544 pucB pucA TRUE 0.987 13.000 0.800 0.002   NA
 2027054 2027055 RD1_3544 RD1_3545 pucA pucC TRUE 0.582 101.000 0.333 NA   NA
 2027055 2027056 RD1_3545 RD1_3546 pucC   TRUE 0.972 -3.000 0.556 NA   NA
 2027057 2027058 RD1_3547 RD1_3548   phaF TRUE 0.994 -3.000 0.937 1.000 Y NA
 2027058 2027059 RD1_3548 RD1_3549 phaF phaE TRUE 0.997 -3.000 0.937 0.041 Y NA
 2027059 2027060 RD1_3549 RD1_3550 phaE phaD TRUE 0.996 2.000 0.944 1.000 Y NA
 2027060 2027061 RD1_3550 RD1_3551 phaD phaC TRUE 0.997 -3.000 0.976 0.006 Y NA
 2027061 2027062 RD1_3551 RD1_3552 phaC phaA TRUE 0.998 2.000 0.881 0.006 Y NA
 2027064 2027065 RD1_3553 RD1_3555     TRUE 0.731 -3.000 0.024 NA   NA
 2027066 2027067 RD1_3556 RD1_3557 hisB hisH TRUE 0.986 3.000 0.049 0.003 Y NA
 2027068 2027069 RD1_3558 RD1_3559     FALSE 0.407 88.000 0.111 NA   NA
 2027070 2027071 RD1_3560 RD1_3561 hisA hisF TRUE 0.948 77.000 0.433 0.003 Y NA
 2027071 2027072 RD1_3561 RD1_3562 hisF hisE TRUE 0.986 -3.000 0.105 0.003 Y NA
 2027073 2027074 RD1_3563 RD1_3564     FALSE 0.005 210.000 0.000 NA   NA
 2027074 2027075 RD1_3564 RD1_3565     FALSE 0.264 28.000 0.002 NA   NA
 2027076 2027077 RD1_3567 RD1_3568     TRUE 0.843 16.000 0.167 1.000   NA
 2027077 2027078 RD1_3568 RD1_3569     TRUE 0.929 -3.000 0.158 1.000   NA
 2027078 2027079 RD1_3569 RD1_3570     TRUE 0.996 -3.000 0.816 0.059 Y NA
 2027079 2027080 RD1_3570 RD1_3571     TRUE 0.957 65.000 0.611 0.059 Y NA
 2027080 2027081 RD1_3571 RD1_3572     TRUE 0.846 48.000 0.188 0.059 N NA
 2027081 2027082 RD1_3572 RD1_3573   deoR TRUE 0.973 -3.000 0.455 1.000 N NA
 2027082 2027083 RD1_3573 RD1_3574 deoR   FALSE 0.010 162.000 0.000 NA   NA
 2027083 2027084 RD1_3574 RD1_3575     FALSE 0.062 80.000 0.000 NA   NA
 2027084 2027085 RD1_3575 RD1_3576     FALSE 0.225 15.000 0.000 NA   NA
 2027085 2027086 RD1_3576 RD1_3577     FALSE 0.001 561.000 0.000 NA   NA
 2027086 2027087 RD1_3577 RD1_3578     TRUE 0.681 118.000 0.750 1.000   NA
 2027088 2027089 RD1_3579 RD1_3580     FALSE 0.362 164.000 0.667 NA   NA
 2027089 2027090 RD1_3580 RD1_3582   mcpA FALSE 0.001 505.000 0.000 NA   NA
 2027090 2027091 RD1_3582 RD1_3583 mcpA   FALSE 0.003 457.000 0.000 1.000 N NA
 2027091 2027092 RD1_3583 RD1_3584   hyuA TRUE 0.582 88.000 0.188 1.000 N NA
 2027092 2027093 RD1_3584 RD1_3585 hyuA   TRUE 0.997 5.000 0.692 0.001 Y NA
 2027095 2027096 RD1_3587 RD1_3588     TRUE 0.995 0.000 0.333 0.026 Y NA
 2027096 2027097 RD1_3588 RD1_3589     TRUE 0.988 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 2027097 2027098 RD1_3589 RD1_3590     TRUE 0.981 4.000 0.057 0.058 Y NA
 2027098 2027099 RD1_3590 RD1_3591     TRUE 0.715 41.000 0.029 NA Y NA
 2027100 2027101 RD1_3592 RD1_3593     TRUE 0.880 -54.000 0.667 NA   NA
 2027101 2027102 RD1_3593 RD1_3594     FALSE 0.003 567.000 0.000 1.000 N NA
 2027102 2027103 RD1_3594 RD1_3595     TRUE 0.938 -16.000 0.310 0.010 N NA
 2027104 2027105 RD1_3596 RD1_3598     TRUE 0.875 72.000 0.367 1.000 Y NA
 2027105 2027106 RD1_3598 RD1_3599     TRUE 0.993 13.000 0.888 0.058 Y NA
 2027106 2027107 RD1_3599 RD1_3600     TRUE 0.963 12.000 0.639 1.000   NA
 2027107 2027108 RD1_3600 RD1_3601     TRUE 0.981 12.000 0.600 0.026   NA
 2027108 2027109 RD1_3601 RD1_3602   fmdA TRUE 0.874 25.000 0.312 1.000 N NA
 2027109 2027110 RD1_3602 RD1_3603 fmdA   FALSE 0.552 66.000 0.152 NA   NA
 2027112 2027113 RD1_3605 RD1_3606     TRUE 0.988 0.000 0.800 NA   NA
 2027114 2027115 RD1_3607 RD1_3608     TRUE 0.957 -13.000 0.500 NA Y NA
 2027115 2027116 RD1_3608 RD1_3609     TRUE 0.899 68.000 0.529 NA Y NA
 2027117 2027118 RD1_3610 RD1_3611 thiM thiDE TRUE 0.988 -3.000 0.146 0.004 Y NA
 2027118 2027119 RD1_3611 RD1_3612 thiDE thiD TRUE 0.988 -3.000 0.109 0.001 Y NA
 2027119 2027120 RD1_3612 RD1_3613 thiD tenA FALSE 0.380 54.000 0.018 1.000 N NA
 2027122 2027123 RD1_3615 RD1_3616     TRUE 0.778 22.000 0.133 1.000   NA
 2027123 2027124 RD1_3616 RD1_3617   xylB FALSE 0.315 81.000 0.038 1.000   NA
 2027124 2027125 RD1_3617 RD1_3618 xylB   TRUE 0.947 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 2027125 2027126 RD1_3618 RD1_3619     FALSE 0.024 336.000 0.000 1.000 Y NA
 2027126 2027127 RD1_3619 RD1_3620     TRUE 0.995 -3.000 0.667 0.058 Y NA
 2027127 2027128 RD1_3620 RD1_3621     TRUE 0.714 163.000 0.571 0.058 Y NA
 2027128 2027129 RD1_3621 RD1_3622     TRUE 0.835 110.000 0.286 0.058 Y NA
 2027129 2027130 RD1_3622 RD1_3623   xdh FALSE 0.411 21.000 0.000 1.000 N NA
 2027131 2027132 RD1_3624 RD1_3625 rpiB tpiA TRUE 0.987 -3.000 0.438 1.000 Y NA
 2027132 2027133 RD1_3625 RD1_3626 tpiA   TRUE 0.794 34.000 0.062 NA Y NA
 2027133 2027134 RD1_3626 RD1_3628     TRUE 0.983 0.000 0.222 NA Y NA
 2027134 2027135 RD1_3628 RD1_3629   xylB TRUE 0.966 -3.000 0.107 1.000 Y NA
 2027135 2027136 RD1_3629 RD1_3630 xylB   TRUE 0.751 -7.000 0.080 1.000   NA
 2027136 2027137 RD1_3630 RD1_3631   glpD TRUE 0.958 -3.000 0.318 1.000   NA
 2027137 2027138 RD1_3631 RD1_3632 glpD fucA TRUE 0.940 -3.000 0.176 1.000 N NA
 2027138 2027139 RD1_3632 RD1_3633 fucA serA TRUE 0.934 5.000 0.143 1.000 N NA
 2027139 2027140 RD1_3633 RD1_3634 serA   TRUE 0.935 -7.000 0.476 1.000 N NA
 2027140 2027141 RD1_3634 RD1_3635     TRUE 0.989 -3.000 0.550 1.000 Y NA
 2027141 2027142 RD1_3635 RD1_3636   ugpC TRUE 0.994 -3.000 0.846 0.006 N NA
 2027142 2027143 RD1_3636 RD1_3638 ugpC   TRUE 0.990 4.000 0.550 0.058 N NA
 2027143 2027144 RD1_3638 RD1_3639     TRUE 0.995 11.000 0.950 0.058 Y NA
 2027144 2027145 RD1_3639 RD1_3640     TRUE 0.905 117.000 0.783 0.058 Y NA
 2027145 2027146 RD1_3640 RD1_3641   eryD TRUE 0.876 31.000 0.391 1.000 N NA
 2027148 2027149 RD1_3643 RD1_3645 kynU   FALSE 0.009 250.000 0.000 1.000 N NA
 2027149 2027150 RD1_3645 RD1_3647     FALSE 0.523 74.000 0.150 NA   NA
 2027150 2027151 RD1_3647 RD1_3648     TRUE 0.930 21.000 0.667 NA   NA
 2027154 2027155 RD1_3651 RD1_3652 hmgA maiA TRUE 0.838 6.000 0.034 1.000 N NA
 2027155 2027156 RD1_3652 RD1_3653 maiA fahA TRUE 0.957 11.000 0.093 0.001 N NA
 2027156 2027157 RD1_3653 RD1_3654 fahA cybB FALSE 0.004 438.000 0.000 1.000 N NA
 2027158 2027159 RD1_3655 RD1_3656     FALSE 0.102 -85.000 0.000 NA   NA
 2027159 2027160 RD1_3656 RD1_3657   pabB FALSE 0.184 -10.000 0.000 NA   NA
 2027160 2027161 RD1_3657 RD1_3658 pabB   FALSE 0.321 30.000 0.012 NA   NA
 2027161 2027162 RD1_3658 RD1_3659   metH FALSE 0.001 365.000 0.000 NA   NA
 2027162 2027163 RD1_3659 RD1_3660 metH metH TRUE 0.979 -3.000 0.013 0.001 Y NA
 2027163 2027164 RD1_3660 RD1_3661 metH   FALSE 0.031 113.000 0.000 NA   NA
 2027166 2027167 RD1_3663 RD1_3664   dmsA FALSE 0.057 158.000 0.044 NA   NA
 2027171 2027172 RD1_3669 RD1_3670     FALSE 0.568 16.000 0.034 NA   NA
 2027172 2027173 RD1_3670 RD1_3671   grxC TRUE 0.798 32.000 0.022 0.004 N NA
 2027173 2027174 RD1_3671 RD1_3672 grxC   FALSE 0.317 52.000 0.030 NA   NA
 2027175 2027176 RD1_3673 RD1_3674     FALSE 0.008 260.000 0.000 1.000 N NA
 2027177 2027178 RD1_3675 RD1_3676   hutF FALSE 0.077 142.000 0.013 1.000 N NA
 2027179 2027180 RD1_3677 RD1_3678 hutI hutH TRUE 0.975 -3.000 0.192 0.033 N NA
 2027180 2027181 RD1_3678 RD1_3679 hutH hutG TRUE 0.956 -3.000 0.064 1.000 Y NA
 2027181 2027182 RD1_3679 RD1_3680 hutG   TRUE 0.921 -3.000 0.115 1.000 N NA
 2027182 2027183 RD1_3680 RD1_3681   acdA TRUE 0.985 -3.000 0.800 1.000 N NA
 2027183 2027184 RD1_3681 RD1_3682 acdA hutU TRUE 0.684 12.000 0.012 1.000 N NA
 2027184 2027185 RD1_3682 RD1_3683 hutU van FALSE 0.560 18.000 0.008 1.000 N NA
 2027185 2027186 RD1_3683 RD1_3684 van   FALSE 0.519 38.000 0.056 NA N NA
 2027189 2027190 RD1_3687 RD1_3688   sndH TRUE 0.977 -3.000 0.519 1.000 N NA
 2027190 2027191 RD1_3688 RD1_3690 sndH radC FALSE 0.004 386.000 0.000 1.000 N NA
 2027194 2027195 RD1_3693 RD1_3694 ilvD   FALSE 0.432 63.000 0.080 NA   NA
 2027195 2027196 RD1_3694 RD1_3695     FALSE 0.396 72.000 0.080 NA   NA
 2027196 2027197 RD1_3695 RD1_3696   htpG FALSE 0.015 212.000 0.000 1.000 N NA
 2027197 2027198 RD1_3696 RD1_3697 htpG   FALSE 0.050 95.000 0.000 NA   NA
 2027198 2027199 RD1_3697 RD1_3698     FALSE 0.005 208.000 0.000 NA   NA
 2027199 2027200 RD1_3698 RD1_3699     FALSE 0.018 175.000 0.000 1.000   NA
 2027202 2027203 RD1_3701 RD1_3702     FALSE 0.410 -3.000 0.000 NA   NA
 2027203 2027204 RD1_3702 RD1_3703     FALSE 0.004 317.000 0.000 1.000   NA
 2027204 2027205 RD1_3703 RD1_3704   xylB TRUE 0.859 5.000 0.050 1.000   NA
 2027205 2027206 RD1_3704 RD1_3705 xylB xylA TRUE 0.970 4.000 0.094 1.000 Y NA
 2027207 2027208 RD1_3706 RD1_3707     FALSE 0.013 146.000 0.000 NA   NA
 2027208 2027209 RD1_3707 RD1_3708     FALSE 0.054 90.000 0.000 NA   NA
 2027209 2027210 RD1_3708 RD1_3709     FALSE 0.123 36.000 0.000 NA   NA
 2027211 2027212 RD1_3710 RD1_3711     FALSE 0.410 -3.000 0.000 NA   NA
 2027214 2027215 RD1_3713 RD1_3714 mpgP   FALSE 0.183 172.000 0.302 NA   NA
 2027216 2027217 RD1_3715 RD1_3716 gtfA gnl FALSE 0.074 205.000 0.000 1.000 Y NA
 2027217 2027218 RD1_3716 RD1_3717 gnl   TRUE 0.847 -40.000 0.400 1.000   NA
 2027218 2027219 RD1_3717 RD1_3718     TRUE 0.921 -3.000 0.136 1.000   NA
 2027219 2027220 RD1_3718 RD1_3719     TRUE 0.994 0.000 0.318 0.058 Y NA
 2027220 2027221 RD1_3719 RD1_3720     TRUE 0.923 77.000 0.350 0.058 Y NA
 2027221 2027222 RD1_3720 RD1_3721   algS TRUE 0.970 30.000 0.417 0.058 Y NA
 2027222 2027223 RD1_3721 RD1_3722 algS   FALSE 0.471 98.000 0.125 1.000 N NA
 2027223 2027224 RD1_3722 RD1_3723     FALSE 0.001 613.000 0.000 NA   NA
 2027224 2027225 RD1_3723 RD1_3724     FALSE 0.003 255.000 0.000 NA   NA
 2027226 2027227 RD1_3725 RD1_3726     TRUE 0.997 0.000 0.571 0.005 Y NA
 2027227 2027228 RD1_3726 RD1_3728   lktD TRUE 0.652 131.000 0.143 0.040 Y NA
 2027228 2027229 RD1_3728 RD1_3730 lktD   FALSE 0.006 184.000 0.000 NA   NA
 2027229 2027230 RD1_3730 RD1_3731     FALSE 0.027 168.000 0.015 NA   NA
 2027230 2027231 RD1_3731 RD1_3732     FALSE 0.162 -15.000 0.000 NA   NA
 2027231 2027232 RD1_3732 RD1_3733     FALSE 0.119 38.000 0.000 NA   NA
 2027233 2027234 RD1_3734 RD1_3735     TRUE 0.944 6.000 0.286 NA   NA
 2027234 2027235 RD1_3735 RD1_3736     TRUE 0.975 4.000 0.500 NA   NA
 2027235 2027236 RD1_3736 RD1_3737   rbsK FALSE 0.003 379.000 0.000 1.000   NA
 2027236 2027237 RD1_3737 RD1_3738 rbsK fucU TRUE 0.980 1.000 0.134 1.000 Y NA
 2027237 2027238 RD1_3738 RD1_3739 fucU   TRUE 0.785 86.000 0.208 1.000 Y NA
 2027239 2027240 RD1_3740 RD1_3741     FALSE 0.001 412.000 0.000 NA   NA
 2027240 2027241 RD1_3741 RD1_3742     FALSE 0.001 515.000 0.000 NA   NA
 2027241 2027242 RD1_3742 RD1_3743     TRUE 0.965 36.000 0.425 0.058 Y NA
 2027243 2027244 RD1_3744 RD1_3746     FALSE 0.145 -19.000 0.000 NA   NA
 2027244 2027245 RD1_3746 RD1_3747     FALSE 0.214 16.000 0.000 NA   NA
 2027245 2027246 RD1_3747 RD1_3748     FALSE 0.109 43.000 0.000 NA   NA
 2027246 2027247 RD1_3748 RD1_3749     TRUE 0.778 45.000 0.333 NA   NA
 2027247 2027248 RD1_3749 RD1_3750     FALSE 0.012 154.000 0.000 NA   NA
 2027250 2027251 RD1_3752 RD1_3753     FALSE 0.095 52.000 0.000 NA   NA
 2027253 2027254 RD1_3755 RD1_3756     FALSE 0.530 69.000 0.000 0.037 N NA
 2027254 2027255 RD1_3756 RD1_3758     FALSE 0.053 92.000 0.000 NA   NA
 2027257 2027258 RD1_3760 RD1_3761 xylB   FALSE 0.123 36.000 0.000 NA   NA
 2027259 2027260 RD1_3762 RD1_3763     TRUE 0.956 8.000 0.364 1.000   NA
 2027261 2027262 RD1_3764 RD1_3765 rbsK xylA TRUE 0.776 -3.000 0.007 1.000 N NA
 2027262 2027263 RD1_3765 RD1_3766 xylA   FALSE 0.041 104.000 0.000 NA   NA
 2027263 2027264 RD1_3766 RD1_3767     FALSE 0.410 -3.000 0.000 NA   NA
 2027264 2027265 RD1_3767 RD1_3768     FALSE 0.009 166.000 0.000 NA   NA
 2027265 2027266 RD1_3768 RD1_3769     FALSE 0.004 217.000 0.000 NA   NA
 2027267 2027268 RD1_3770 RD1_3771     FALSE 0.042 701.000 0.286 NA Y NA
 2027268 2027269 RD1_3771 RD1_3772     TRUE 0.986 4.000 0.375 NA Y NA
 2027269 2027270 RD1_3772 RD1_3773   pcaC FALSE 0.337 131.000 0.250 1.000   NA
 2027270 2027271 RD1_3773 RD1_3774 pcaC pcaH TRUE 0.811 -3.000 0.029 1.000   NA
 2027271 2027272 RD1_3774 RD1_3775 pcaH pcaG TRUE 0.998 3.000 0.782 0.001 Y NA
 2027273 2027274 RD1_3776 RD1_3777 glk   FALSE 0.109 144.000 0.062 NA N NA
 2027274 2027275 RD1_3777 RD1_3778   hemA FALSE 0.452 56.000 0.062 NA N NA
 2027275 2027276 RD1_3778 RD1_3779 hemA   FALSE 0.115 -42.000 0.000 NA   NA
 2027276 2027277 RD1_3779 RD1_3780     FALSE 0.010 158.000 0.000 NA   NA
 2027277 2027278 RD1_3780 RD1_3781     TRUE 0.986 0.000 0.706 NA   NA
 2027278 2027279 RD1_3781 RD1_3782     FALSE 0.138 31.000 0.000 NA   NA
 2027279 2027280 RD1_3782 RD1_3783     FALSE 0.041 146.000 0.000 1.000 N NA
 2027280 2027281 RD1_3783 RD1_3784     TRUE 0.962 -3.000 0.088 1.000 Y NA
 2027281 2027282 RD1_3784 RD1_3785     TRUE 0.841 -3.000 0.066 NA   NA
 2027282 2027283 RD1_3785 RD1_3786   mmsB TRUE 0.907 24.000 0.538 NA   NA
 2027283 2027284 RD1_3786 RD1_3787 mmsB gntR FALSE 0.564 83.000 0.154 1.000 N NA
 2027284 2027285 RD1_3787 RD1_3788 gntR   TRUE 0.748 -27.000 0.167 1.000   NA
 2027285 2027286 RD1_3788 RD1_3789   leuB TRUE 0.947 -3.000 0.233 1.000   NA
 2027287 2027288 RD1_3790 RD1_3791     TRUE 0.964 -3.000 0.368 1.000   NA
 2027288 2027289 RD1_3791 RD1_3792   ureD FALSE 0.078 127.000 0.009 1.000   NA
 2027289 2027290 RD1_3792 RD1_3793 ureD ureA TRUE 0.994 4.000 0.664 0.002 N NA
 2027290 2027291 RD1_3793 RD1_3795 ureA ureB TRUE 0.995 10.000 0.595 0.001 Y NA
 2027291 2027292 RD1_3795 RD1_3797 ureB   FALSE 0.315 33.000 0.014 NA   NA
 2027292 2027293 RD1_3797 RD1_3798     TRUE 0.941 0.000 0.150 NA   NA
 2027293 2027294 RD1_3798 RD1_3800   ureC FALSE 0.001 478.000 0.000 NA   NA
 2027294 2027295 RD1_3800 RD1_3801 ureC   FALSE 0.410 -3.000 0.000 NA   NA
 2027295 2027296 RD1_3801 RD1_3803   ureE FALSE 0.020 128.000 0.000 NA   NA
 2027296 2027297 RD1_3803 RD1_3804 ureE ureF TRUE 0.967 -37.000 0.330 0.002 Y NA
 2027297 2027298 RD1_3804 RD1_3805 ureF ureG TRUE 0.993 -3.000 0.283 0.002 Y NA
 2027299 2027300 RD1_3806 RD1_3807 flhA   FALSE 0.564 53.000 0.080 1.000 N NA
 2027301 2027302 RD1_3808 RD1_3809 hisD gno TRUE 0.968 6.000 0.405 1.000 N NA
 2027302 2027303 RD1_3809 RD1_3810 gno gutB TRUE 0.984 -3.000 0.372 0.037 N NA
 2027303 2027304 RD1_3810 RD1_3811 gutB   TRUE 0.802 32.000 0.209 1.000 N NA
 2027304 2027305 RD1_3811 RD1_3812     TRUE 0.623 66.000 0.172 1.000   NA
 2027305 2027306 RD1_3812 RD1_3813   bcpC TRUE 0.989 -3.000 0.436 0.001   NA
 2027306 2027307 RD1_3813 RD1_3814 bcpC lldD TRUE 0.944 5.000 0.205 1.000   NA
 2027308 2027309 RD1_3815 RD1_3816 bluB cobF FALSE 0.318 61.000 0.009 1.000 N NA
 2027309 2027310 RD1_3816 RD1_3817 cobF cobA TRUE 0.956 9.000 0.106 1.000 Y NA
 2027310 2027311 RD1_3817 RD1_3818 cobA cobB TRUE 0.967 -3.000 0.115 1.000 Y NA
 2027311 2027312 RD1_3818 RD1_3819 cobB cobM TRUE 0.953 -7.000 0.065 0.008 Y NA
 2027312 2027313 RD1_3819 RD1_3820 cobM   TRUE 0.985 -3.000 0.397 0.008   NA
 2027313 2027314 RD1_3820 RD1_3821   cobl TRUE 0.969 -3.000 0.139 0.008   NA
 2027316 2027317 RD1_3823 RD1_3824 cobJ cobI TRUE 0.987 -3.000 0.138 0.008 Y NA
 2027317 2027318 RD1_3824 RD1_3825 cobI cobH TRUE 0.989 -3.000 0.191 0.008 Y NA
 2027318 2027319 RD1_3825 RD1_3826 cobH cobG TRUE 0.968 3.000 0.273 1.000 N NA
 2027319 2027320 RD1_3826 RD1_3827 cobG cobN TRUE 0.949 -3.000 0.245 1.000   NA
 2027320 2027321 RD1_3827 RD1_3828 cobN cobW TRUE 0.934 7.000 0.204 1.000   NA
 2027321 2027322 RD1_3828 RD1_3829 cobW   TRUE 0.843 -7.000 0.211 NA   NA
 2027324 2027325 RD1_3832 RD1_3833     TRUE 0.720 -3.000 0.022 NA   NA
 2027327 2027328 RD1_3835 RD1_3836     FALSE 0.397 6.000 0.000 NA   NA
 2027329 2027330 RD1_3837 RD1_3838     TRUE 0.811 -3.000 0.049 NA   NA
 2027330 2027331 RD1_3838 RD1_3839     TRUE 0.584 29.000 0.073 NA   NA
 2027335 2027336 RD1_3844 RD1_3845     FALSE 0.504 80.000 0.154 NA   NA
 2027336 2027337 RD1_3845 RD1_3846     FALSE 0.070 72.000 0.000 NA   NA
 2027338 2027339 RD1_3847 RD1_3848     FALSE 0.002 306.000 0.000 NA   NA
 2027339 2027340 RD1_3848 RD1_3849   asnO TRUE 0.990 0.000 0.875 1.000   NA
 2027340 2027341 RD1_3849 RD1_3850 asnO   FALSE 0.006 186.000 0.000 NA   NA
 2027341 2027342 RD1_3850 RD1_3851     FALSE 0.461 4.000 0.000 NA   NA
 2027342 2027343 RD1_3851 RD1_3852   spaT FALSE 0.001 479.000 0.000 NA   NA
 2027343 2027344 RD1_3852 RD1_3853 spaT   FALSE 0.419 119.000 0.222 1.000 N NA
 2027346 2027347 RD1_3855 RD1_3856     TRUE 0.979 2.000 0.500 NA   NA
 2027349 2027350 RD1_3858 RD1_3859     FALSE 0.056 88.000 0.000 NA   NA
 2027350 2027351 RD1_3859 RD1_3860     FALSE 0.095 52.000 0.000 NA   NA
 2027351 2027352 RD1_3860 RD1_3861     TRUE 0.837 12.000 0.083 1.000 N NA
 2027352 2027353 RD1_3861 RD1_3862     TRUE 0.978 2.000 0.125 1.000 Y NA
 2027353 2027354 RD1_3862 RD1_3863     TRUE 0.978 -54.000 0.812 0.057 Y NA
 2027354 2027355 RD1_3863 RD1_3864     TRUE 0.967 -7.000 0.438 1.000 Y NA
 2027355 2027356 RD1_3864 RD1_3865     TRUE 0.906 68.000 0.500 1.000 Y NA
 2027356 2027357 RD1_3865 RD1_3866     TRUE 0.893 68.000 0.429 1.000 Y NA
 2027358 2027359 RD1_3867 RD1_3868 lysR   TRUE 0.793 51.000 0.400 NA   NA
 2027361 2027362 RD1_3870 RD1_3871     FALSE 0.004 236.000 0.000 NA   NA
 2027363 2027364 RD1_3872 RD1_3873     TRUE 0.879 -3.000 0.083 NA N NA
 2027365 2027366 RD1_3874 RD1_3876     TRUE 0.950 11.000 0.483 NA   NA
 2027366 2027367 RD1_3876 RD1_3877     FALSE 0.546 -49.000 0.091 NA   NA
 2027368 2027369 RD1_3878 RD1_3879     TRUE 0.867 -3.000 0.087 NA   NA
 2027369 2027370 RD1_3879 RD1_3880     TRUE 0.985 -3.000 1.000 NA   NA
 2027370 2027371 RD1_3880 RD1_3881     TRUE 0.996 -3.000 0.800 0.057 Y NA
 2027371 2027372 RD1_3881 RD1_3882   y4oQ TRUE 0.997 0.000 0.800 0.057 Y NA
 2027372 2027373 RD1_3882 RD1_3883 y4oQ   TRUE 0.964 73.000 0.800 0.057 Y NA
 2027373 2027374 RD1_3883 RD1_3884     TRUE 0.967 66.000 0.800 0.057 Y NA
 2027374 2027375 RD1_3884 RD1_3886     TRUE 0.845 28.000 0.087 NA Y NA
 2027375 2027376 RD1_3886 RD1_3887     TRUE 0.641 30.000 0.087 NA N NA
 2027378 2027379 RD1_3889 RD1_3890     FALSE 0.011 156.000 0.000 NA   NA
 2027379 2027380 RD1_3890 RD1_3891     FALSE 0.547 -16.000 0.053 NA   NA
 2027382 2027383 RD1_3893 RD1_3894 ychF   FALSE 0.149 67.000 0.004 NA   NA
 2027384 2027385 RD1_3895 RD1_3896 trpA   FALSE 0.021 249.000 0.030 1.000 N NA
 2027387 2027388 RD1_3898 RD1_3900   pth TRUE 0.912 105.000 0.496 0.016 Y NA
 2027388 2027389 RD1_3900 RD1_3901 pth   TRUE 0.651 -3.000 0.010 NA   NA
 2027389 2027390 RD1_3901 RD1_3903   nylB TRUE 0.930 0.000 0.118 NA   NA
 2027390 2027391 RD1_3903 RD1_3904 nylB   TRUE 0.603 -13.000 0.064 NA   NA
 2027391 2027392 RD1_3904 RD1_3905     FALSE 0.004 217.000 0.000 NA   NA
 2027393 2027394 RD1_3906 RD1_3907 trpB trpF FALSE 0.197 485.000 0.375 0.001 Y NA
 2027394 2027395 RD1_3907 RD1_3908 trpF   FALSE 0.388 41.000 0.036 NA   NA
 2027395 2027396 RD1_3908 RD1_3910   ihfB TRUE 0.916 0.000 0.095 NA   NA
 2027396 2027397 RD1_3910 RD1_3911 ihfB rpsA FALSE 0.041 404.000 0.292 1.000 N NA
 2027397 2027398 RD1_3911 RD1_3912 rpsA   FALSE 0.002 279.000 0.000 NA   NA
 2027398 2027399 RD1_3912 RD1_3913     FALSE 0.148 67.000 0.004 NA   NA
 2027399 2027400 RD1_3913 RD1_3914   aroA TRUE 0.937 8.000 0.209 1.000 N NA
 2027400 2027401 RD1_3914 RD1_3915 aroA trmB FALSE 0.229 84.000 0.015 1.000   NA
 2027401 2027402 RD1_3915 RD1_3916 trmB metK FALSE 0.300 115.000 0.112 1.000   NA
 2027402 2027403 RD1_3916 RD1_3917 metK cutE TRUE 0.595 85.000 0.191 1.000 N NA
 2027403 2027404 RD1_3917 RD1_3918 cutE   TRUE 0.757 36.000 0.213 NA N NA
 2027404 2027405 RD1_3918 RD1_3919     TRUE 0.733 39.000 0.222 NA   NA
 2027405 2027406 RD1_3919 RD1_3920   phoH TRUE 0.850 37.000 0.457 NA   NA
 2027406 2027407 RD1_3920 RD1_3921 phoH miaB FALSE 0.461 113.000 0.220 1.000 N NA
 2027407 2027408 RD1_3921 RD1_3922 miaB   FALSE 0.043 145.000 0.000 1.000 N NA
 2027409 2027410 RD1_3923 RD1_3924 fabA fabB TRUE 0.945 32.000 0.451 1.000 Y NA
 2027410 2027411 RD1_3924 RD1_3925 fabB fabI TRUE 0.973 10.000 0.265 1.000 Y NA
 2027411 2027412 RD1_3925 RD1_3926 fabI   FALSE 0.005 199.000 0.000 NA   NA
 2027413 2027414 RD1_3927 RD1_3928   slyD FALSE 0.101 135.000 0.054 NA   NA
 2027415 2027416 RD1_3929 RD1_3930 deh   TRUE 0.936 0.000 0.135 NA   NA
 2027416 2027417 RD1_3930 RD1_3931     TRUE 0.951 -3.000 0.311 NA   NA
 2027417 2027418 RD1_3931 RD1_3932   pcaD TRUE 0.664 41.000 0.122 1.000   NA
 2027418 2027419 RD1_3932 RD1_3934 pcaD estC TRUE 0.878 -7.000 0.300 NA   NA
 2027419 2027420 RD1_3934 RD1_3935 estC pcaB TRUE 0.843 4.000 0.049 NA   NA
 2027420 2027421 RD1_3935 RD1_3936 pcaB tetA TRUE 0.891 -3.000 0.070 1.000 N NA
 2027421 2027422 RD1_3936 RD1_3937 tetA   TRUE 0.676 102.000 0.400 1.000 N NA
 2027422 2027423 RD1_3937 RD1_3939     TRUE 0.891 26.000 0.387 1.000 N NA
 2027424 2027425 RD1_3940 RD1_3941   metE TRUE 0.887 0.000 0.062 NA   NA
 2027425 2027426 RD1_3941 RD1_3942 metE   TRUE 0.672 46.000 0.188 NA   NA
 2027426 2027427 RD1_3942 RD1_3943     TRUE 0.832 37.000 0.400 NA   NA
 2027427 2027428 RD1_3943 RD1_3944     TRUE 0.969 -3.000 0.500 NA   NA
 2027428 2027429 RD1_3944 RD1_3945     TRUE 0.891 17.000 0.273 1.000 N NA
 2027429 2027430 RD1_3945 RD1_3946     TRUE 0.924 -3.000 0.182 NA   NA
 2027430 2027431 RD1_3946 RD1_3947     FALSE 0.236 14.000 0.000 NA   NA
 2027431 2027432 RD1_3947 RD1_3948   hisD FALSE 0.379 7.000 0.000 NA   NA
 2027432 2027433 RD1_3948 RD1_3949 hisD   TRUE 0.905 13.000 0.316 NA   NA
 2027433 2027434 RD1_3949 RD1_3950     TRUE 0.600 29.000 0.080 NA   NA
 2027434 2027435 RD1_3950 RD1_3951     TRUE 0.975 0.000 0.000 0.057 Y NA
 2027435 2027436 RD1_3951 RD1_3953     FALSE 0.443 125.000 0.000 0.057 Y NA
 2027436 2027437 RD1_3953 RD1_3954     TRUE 0.873 85.000 0.192 0.057 Y NA
 2027441 2027442 RD1_3958 RD1_3959     FALSE 0.107 104.000 0.011 NA   NA
 2027443 2027444 RD1_3960 RD1_3961     TRUE 0.888 -3.000 0.108 NA   NA
 2027445 2027446 RD1_3962 RD1_3963 dinF   TRUE 0.699 -10.000 0.082 NA N NA
 2027446 2027447 RD1_3963 RD1_3964     TRUE 0.992 -3.000 0.845 NA Y NA
 2027449 2027450 RD1_3966 RD1_3967   luxR TRUE 0.871 76.000 1.000 NA   NA
 2027451 2027452 RD1_3968 RD1_3969     TRUE 0.810 41.000 0.287 1.000 N NA
 2027452 2027453 RD1_3969 RD1_3970   fadE TRUE 0.612 126.000 0.046 0.003 Y NA
 2027453 2027454 RD1_3970 RD1_3971 fadE gst TRUE 0.674 42.000 0.114 1.000 N NA
 2027454 2027455 RD1_3971 RD1_3972 gst fadA TRUE 0.790 41.000 0.247 1.000 N NA
 2027455 2027456 RD1_3972 RD1_3973 fadA fadJ TRUE 0.954 33.000 0.562 1.000 Y NA
 2027456 2027457 RD1_3973 RD1_3974 fadJ   FALSE 0.047 243.000 0.000 1.000 Y NA
 2027457 2027458 RD1_3974 RD1_3975     TRUE 0.786 54.000 0.407 NA   NA
 2027459 2027460 RD1_3976 RD1_3978 upp deoB FALSE 0.513 25.000 0.012 1.000 N NA
 2027460 2027461 RD1_3978 RD1_3979 deoB deoA TRUE 0.991 0.000 0.875 1.000 N NA
 2027461 2027462 RD1_3979 RD1_3980 deoA cdd TRUE 0.986 2.000 0.242 1.000 Y NA
 2027462 2027463 RD1_3980 RD1_3981 cdd   FALSE 0.359 79.000 0.074 NA   NA
 2027463 2027464 RD1_3981 RD1_3982     TRUE 0.899 -3.000 0.125 NA   NA
 2027467 2027468 RD1_3987 RD1_3988 csbD   FALSE 0.004 215.000 0.000 NA   NA
 2027468 2027469 RD1_3988 RD1_3989   ppnK TRUE 0.860 0.000 0.015 1.000 N NA
 2027471 2027472 RD1_3992 RD1_3993 dctM   TRUE 0.977 10.000 0.390 NA Y NA
 2027472 2027473 RD1_3993 RD1_3994   dctP TRUE 0.762 78.000 0.171 NA Y NA
 2027473 2027474 RD1_3994 RD1_3995 dctP kdgF FALSE 0.002 274.000 0.000 NA   NA
 2027474 2027475 RD1_3995 RD1_3996 kdgF   FALSE 0.419 21.000 0.017 NA   NA
 2027476 2027477 RD1_3997 RD1_3998   frpC FALSE 0.006 259.000 0.000 1.000   NA
 2027477 2027478 RD1_3998 RD1_3999 frpC   FALSE 0.008 239.000 0.000 1.000   NA
 2027482 2027483 RD1_4005 RD1_4006 zur znuC TRUE 0.982 -3.000 0.309 1.000 Y NA
 2027483 2027484 RD1_4006 RD1_4007 znuC znuB TRUE 0.997 0.000 0.755 0.082 Y NA
 2027484 2027485 RD1_4007 RD1_4008 znuB   FALSE 0.005 208.000 0.000 NA   NA
 2027485 2027486 RD1_4008 RD1_4009     FALSE 0.102 120.000 0.030 NA   NA
 1599277 2027487 RD1_4010 RD1_4011     FALSE 0.074 67.000 0.000 NA   NA
 2027487 2027488 RD1_4011 RD1_4012   tuf FALSE 0.044 144.000 0.000 1.000 N NA
 2027488 2027489 RD1_4012 RD1_4013 tuf fusA TRUE 0.888 78.000 0.102 0.001 Y NA
 2027489 2027490 RD1_4013 RD1_4014 fusA rpsG TRUE 0.775 66.000 0.114 1.000 Y NA
 2027490 2027491 RD1_4014 RD1_4015 rpsG rpsL TRUE 0.992 13.000 0.620 0.002 Y NA
 2027491 2027492 RD1_4015 RD1_4016 rpsL   FALSE 0.003 362.000 0.000 1.000   NA
 2027494 2027495 RD1_4018 RD1_4019 rpoC rpoB FALSE 0.311 301.000 0.851 0.001   NA
 2027495 2027496 RD1_4019 RD1_4020 rpoB rplL FALSE 0.064 257.000 0.223 1.000   NA
 2027496 2027497 RD1_4020 RD1_4021 rplL rplJ TRUE 0.971 75.000 0.884 0.010 Y NA
 2027497 2027498 RD1_4021 RD1_4022 rplJ rplA FALSE 0.355 240.000 0.302 0.014 Y NA
 2027498 2027499 RD1_4022 RD1_4023 rplA rplK TRUE 0.998 2.000 0.838 0.014 Y NA
 2027499 2027500 RD1_4023 RD1_4024 rplK nusG TRUE 0.772 104.000 0.681 1.000 N NA
 2027500 2027501 RD1_4024 RD1_4025 nusG secE FALSE 0.481 164.000 0.843 1.000 N NA
 2027505 2027506 RD1_4029 RD1_4030     TRUE 0.974 9.000 0.750 NA   NA
 2027506 2027507 RD1_4030 RD1_4031     TRUE 0.991 -3.000 0.750 0.057 N NA
 2027507 2027508 RD1_4031 RD1_4033     TRUE 0.924 60.000 0.600 0.057 N NA
 2027508 2027509 RD1_4033 RD1_4034     FALSE 0.002 594.000 0.000 1.000   NA
 2027509 2027510 RD1_4034 RD1_4036     FALSE 0.002 275.000 0.000 NA   NA
 2027511 2027512 RD1_4037 RD1_4038 rpoE3   TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA Y NA
 2027513 2027514 RD1_4039 RD1_4040     FALSE 0.156 26.000 0.000 NA   NA
 2027514 2027515 RD1_4040 RD1_4041     FALSE 0.057 85.000 0.000 NA   NA
 2027515 2027516 RD1_4041 RD1_4042     FALSE 0.079 109.000 0.000 1.000   NA
 2027516 2027517 RD1_4042 RD1_4043     FALSE 0.001 401.000 0.000 NA   NA
 2027518 2027519 RD1_4044 RD1_4045     FALSE 0.001 908.000 0.000 NA   NA
 2027520 2027521 RD1_4046 RD1_4047     FALSE 0.519 0.000 0.000 NA   NA
 2027521 2027522 RD1_4047 RD1_4048     TRUE 0.692 3.000 0.000 1.000   NA
 2027522 2027523 RD1_4048 RD1_4050     FALSE 0.051 94.000 0.000 NA   NA
 2027523 2027524 RD1_4050 RD1_4051     FALSE 0.020 127.000 0.000 NA   NA
 2027525 2027526 RD1_4052 RD1_4053   hsdM FALSE 0.001 1451.000 0.000 NA   NA
 2027526 2027527 RD1_4053 RD1_4054 hsdM   TRUE 0.970 -3.000 0.134 1.000 Y NA
 2027527 2027528 RD1_4054 RD1_4055   hsdR TRUE 0.984 -3.000 0.060 0.001 Y NA
 2027528 2027529 RD1_4055 RD1_4056 hsdR   FALSE 0.002 262.000 0.000 NA   NA
 2027530 2027531 RD1_4057 RD1_4058     TRUE 0.881 12.000 0.200 NA   NA
 2027531 2027532 RD1_4058 RD1_4059   lon FALSE 0.007 1197.000 0.000 0.025   NA
 2027536 2027537 RD1_4063 RD1_4064 hisG hisZ TRUE 0.979 -3.000 0.239 1.000 Y NA
 2027537 2027538 RD1_4064 RD1_4065 hisZ hisS TRUE 0.974 -3.000 0.097 0.000 N NA
 2027541 2027542 RD1_4068 RD1_4069 xdhA xdhB TRUE 0.984 -3.000 0.043 0.000 Y NA
 2027542 2027543 RD1_4069 RD1_4070 xdhB xdhC TRUE 0.972 0.000 0.027 0.001 N NA
 2027543 2027544 RD1_4070 RD1_4071 xdhC   TRUE 0.959 -3.000 0.329 1.000   NA
 2027544 2027545 RD1_4071 RD1_4072     TRUE 0.820 42.000 0.346 1.000   NA
 2027545 2027546 RD1_4072 RD1_4073     TRUE 0.988 0.000 0.346 0.056   NA
 2027546 2027547 RD1_4073 RD1_4074     TRUE 0.793 54.000 0.364 1.000   NA
 2027547 2027548 RD1_4074 RD1_4075     FALSE 0.351 9.000 0.000 NA   NA
 2027548 2027549 RD1_4075 RD1_4076     FALSE 0.077 65.000 0.000 NA   NA
 2027550 2027551 RD1_4077 RD1_4078 gsh   TRUE 0.621 66.000 0.213 NA   NA
 2027552 2027553 RD1_4079 RD1_4080   ubiA FALSE 0.175 22.000 0.000 NA   NA
 2027553 2027554 RD1_4080 RD1_4081 ubiA   TRUE 0.714 61.000 0.054 0.039 N NA
 2027554 2027555 RD1_4081 RD1_4082     TRUE 0.914 35.000 0.800 NA   NA
 2027556 2027557 RD1_4083 RD1_4084   moaE FALSE 0.155 90.000 0.000 1.000 N NA
 2027557 2027558 RD1_4084 RD1_4085 moaE moaD TRUE 0.996 4.000 0.501 0.003 Y NA
 2027558 2027559 RD1_4085 RD1_4086 moaD pgsA TRUE 0.899 -3.000 0.082 1.000 N NA
 2027559 1599351 RD1_4086 RD1_4088 pgsA uvrC FALSE 0.044 102.000 0.000 NA   NA
 1599351 2027560 RD1_4088 RD1_4089 uvrC   FALSE 0.001 392.000 0.000 NA   NA
 2027560 2027561 RD1_4089 RD1_4090     TRUE 0.904 23.000 0.397 1.000 N NA
 2027561 2027562 RD1_4090 RD1_4091     FALSE 0.068 175.000 0.048 1.000 N NA
 2027562 2027563 RD1_4091 RD1_4092     FALSE 0.480 69.000 0.073 1.000 N NA
 2027563 2027564 RD1_4092 RD1_4093     TRUE 0.983 -3.000 0.411 0.081 N NA
 2027566 2027567 RD1_4095 RD1_4096     FALSE 0.503 11.000 0.005 NA   NA
 2027569 2027570 RD1_4098 RD1_4099     FALSE 0.464 126.000 0.125 0.054 N NA
 2027571 2027572 RD1_4100 RD1_4101     TRUE 0.821 117.000 0.786 NA Y NA
 2027572 2027573 RD1_4101 RD1_4102     TRUE 0.996 0.000 1.000 NA Y NA
 2027573 2027574 RD1_4102 RD1_4103   iclR TRUE 0.956 18.000 0.750 1.000 N NA
 2027575 2027576 RD1_4104 RD1_4105     TRUE 0.973 0.000 0.365 NA   NA
 2027576 2027577 RD1_4105 RD1_4106     TRUE 0.987 2.000 0.805 NA   NA
 2027577 2027578 RD1_4106 RD1_4107     FALSE 0.077 112.000 0.007 NA   NA
 2027578 2027579 RD1_4107 RD1_4108     FALSE 0.048 98.000 0.000 NA   NA
 2027579 2027580 RD1_4108 RD1_4109     FALSE 0.025 120.000 0.000 NA   NA
 2027580 2027581 RD1_4109 RD1_4110     TRUE 0.927 -3.000 0.195 NA   NA
 2027581 2027582 RD1_4110 RD1_4111     FALSE 0.354 96.000 0.098 NA   NA
 2027583 2027584 RD1_4112 RD1_4113     FALSE 0.235 104.000 0.028 1.000 N NA
 2027585 2027586 RD1_4114 RD1_4115     TRUE 0.973 -16.000 0.909 NA Y NA
 2027586 2027587 RD1_4115 RD1_4116     FALSE 0.359 81.000 0.079 NA   NA
 2027587 2027588 RD1_4116 RD1_4117     TRUE 0.989 0.000 0.854 NA   NA
 2027588 2027589 RD1_4117 RD1_4118     TRUE 0.997 -3.000 0.922 0.056 Y NA
 2027589 2027590 RD1_4118 RD1_4119     TRUE 0.996 -3.000 0.847 0.056 Y NA
 2027590 2027591 RD1_4119 RD1_4120   ugpC TRUE 0.998 0.000 0.865 0.006 Y NA
 2027591 2027592 RD1_4120 RD1_4122 ugpC   TRUE 0.788 98.000 0.087 0.056 Y NA
 2027592 2027593 RD1_4122 RD1_4123     FALSE 0.045 101.000 0.000 NA   NA
 2027594 2027595 RD1_4124 RD1_4125     FALSE 0.020 128.000 0.000 NA   NA
 2027595 2027596 RD1_4125 RD1_4127     FALSE 0.283 12.000 0.000 NA   NA
 2027600 2027601 RD1_4131 RD1_4132   potB TRUE 0.993 0.000 0.545 1.000 Y NA
 2027601 2027602 RD1_4132 RD1_4133 potB potI TRUE 0.997 4.000 0.833 0.056 Y NA
 2027602 2027603 RD1_4133 RD1_4134 potI   TRUE 0.976 18.000 0.333 0.056 Y NA
 2027603 2027604 RD1_4134 RD1_4135   aphA TRUE 0.593 67.000 0.167 NA N NA
 2027606 2027607 RD1_4137 RD1_4138     TRUE 0.977 3.000 0.500 NA   NA
 2027607 2027608 RD1_4138 RD1_4139     TRUE 0.874 -3.000 0.093 NA   NA
 2027608 2027609 RD1_4139 RD1_4140     FALSE 0.041 199.000 0.070 NA   NA
 2027609 2027610 RD1_4140 RD1_4141   tmd TRUE 0.575 107.000 0.300 1.000 N NA
 2027610 2027611 RD1_4141 RD1_4142 tmd tmd TRUE 0.579 81.000 0.000 0.000   NA
 2027611 2027612 RD1_4142 RD1_4143 tmd argE FALSE 0.444 13.000 0.000 1.000   NA
 2027613 2027614 RD1_4144 RD1_4145   nuo TRUE 0.936 22.000 0.750 NA   NA
 2027616 2027617 RD1_4147 RD1_4148 ampD   FALSE 0.053 122.000 0.000 1.000   NA
 2027620 2027621 RD1_4151 RD1_4152   allA TRUE 0.924 -3.000 0.123 1.000 N NA
 2027621 2027622 RD1_4152 RD1_4153 allA   TRUE 0.947 46.000 0.636 1.000 Y NA
 2027623 2027624 RD1_4154 RD1_4155     FALSE 0.003 245.000 0.000 NA   NA
 2027624 2027625 RD1_4155 RD1_4156     FALSE 0.379 7.000 0.000 NA   NA
 2027627 2027628 RD1_4158 RD1_4159     TRUE 0.780 14.000 0.000 0.058   NA
 2027628 2027629 RD1_4159 RD1_4160     FALSE 0.030 574.000 0.000 0.036 Y NA
 2027629 2027630 RD1_4160 RD1_4161     FALSE 0.011 552.000 0.000 0.036   NA
 2027630 2027631 RD1_4161 RD1_4162     FALSE 0.009 560.000 0.000 0.058   NA
 2027631 2027632 RD1_4162 RD1_4164   cysG FALSE 0.002 649.000 0.000 1.000   NA
 2027632 2027633 RD1_4164 RD1_4165 cysG   TRUE 0.969 -3.000 0.500 NA   NA
 2027633 2027634 RD1_4165 RD1_4166   nasA TRUE 0.644 -3.000 0.009 NA   NA
 2027634 2027635 RD1_4166 RD1_4167 nasA nirD TRUE 0.980 -3.000 0.294 0.054 N NA
 2027635 2027636 RD1_4167 RD1_4168 nirD nirB TRUE 0.992 -3.000 0.539 0.000 N NA
 2027636 2027637 RD1_4168 RD1_4169 nirB nasD TRUE 0.875 6.000 0.074 1.000   NA
 2027637 2027638 RD1_4169 RD1_4170 nasD nasE TRUE 0.985 6.000 0.549 0.082   NA
 2027638 2027639 RD1_4170 RD1_4172 nasE nasF TRUE 0.920 77.000 0.767 NA Y NA
 2027639 2027640 RD1_4172 RD1_4173 nasF nasS FALSE 0.033 258.000 0.000 NA Y NA
 2027640 2027641 RD1_4173 RD1_4174 nasS nasT TRUE 0.969 -3.000 0.466 NA N NA
 2027641 2027642 RD1_4174 RD1_4175 nasT   FALSE 0.001 397.000 0.000 NA   NA
 2027642 2027643 RD1_4175 RD1_4176     FALSE 0.086 58.000 0.000 NA   NA
 2027643 2027644 RD1_4176 RD1_4177     FALSE 0.072 69.000 0.000 NA   NA
 2027644 2027645 RD1_4177 RD1_4178     FALSE 0.072 69.000 0.000 NA   NA
 2027645 2027646 RD1_4178 RD1_4179     FALSE 0.410 -3.000 0.000 NA   NA
 2027646 2027647 RD1_4179 RD1_4180     TRUE 0.781 20.000 0.158 NA   NA
 2027650 2027651 RD1_4183 RD1_4184     FALSE 0.410 -3.000 0.000 NA   NA
 2027651 2027652 RD1_4184 RD1_4185     FALSE 0.117 -40.000 0.000 NA   NA
 2027652 2027653 RD1_4185 RD1_4186     FALSE 0.002 318.000 0.000 NA   NA
 2027653 2027654 RD1_4186 RD1_4187     TRUE 0.781 -13.000 0.182 NA   NA
 2027654 2027655 RD1_4187 RD1_4188   hmuS FALSE 0.003 259.000 0.000 NA   NA
 2027655 2027656 RD1_4188 RD1_4189 hmuS hmuT TRUE 0.985 -3.000 0.384 1.000 Y NA
 2027656 2027657 RD1_4189 RD1_4190 hmuT   TRUE 0.960 -79.000 0.852 1.000 Y NA
 2027657 2027658 RD1_4190 RD1_4191   hmuV TRUE 0.987 2.000 0.292 1.000 Y NA
 2027658 2027659 RD1_4191 RD1_4192 hmuV   FALSE 0.007 247.000 0.000 1.000   NA
 2027659 2027660 RD1_4192 RD1_4193   hugA FALSE 0.014 188.000 0.000 1.000   NA
 2027660 2027661 RD1_4193 RD1_4194 hugA pepN FALSE 0.091 104.000 0.000 1.000   NA
 2027661 2027662 RD1_4194 RD1_4195 pepN   FALSE 0.004 236.000 0.000 NA   NA
 2027662 2027663 RD1_4195 RD1_4196     TRUE 0.972 -3.000 0.548 NA   NA
 2027663 2027664 RD1_4196 RD1_4197     TRUE 0.980 -7.000 0.419 0.068 Y NA
 2027664 2027665 RD1_4197 RD1_4198     TRUE 0.988 -3.000 0.562 0.056   NA
 2027665 2027666 RD1_4198 RD1_4199     TRUE 0.981 -3.000 0.409 0.081   NA
 2027668 2027669 RD1_4201 RD1_4202     TRUE 0.957 -3.000 0.357 NA   NA
 2027671 2027672 RD1_4204 RD1_4205     FALSE 0.196 52.000 0.000 1.000   NA
 2027672 2027673 RD1_4205 RD1_4206     TRUE 0.719 -3.000 0.022 NA   NA
 2027673 2027674 RD1_4206 RD1_4207     FALSE 0.017 133.000 0.000 NA   NA
 2027677 2027678 RD1_4211 RD1_4212     FALSE 0.107 44.000 0.000 NA   NA
 2027679 2027680 RD1_4213 RD1_4214     FALSE 0.410 -3.000 0.000 NA   NA
 2027680 2027681 RD1_4214 RD1_4215     FALSE 0.001 504.000 0.000 NA   NA
 2027681 2027682 RD1_4215 RD1_4216     TRUE 0.985 0.000 0.667 NA   NA
 2027682 2027683 RD1_4216 RD1_4217     TRUE 0.744 16.000 0.100 NA   NA
 2027683 2027684 RD1_4217 RD1_4218     TRUE 0.910 26.000 0.600 NA   NA
 2027684 2027685 RD1_4218 RD1_4219     TRUE 0.966 6.000 0.105 0.003   NA
 2027685 2027686 RD1_4219 RD1_4220     TRUE 0.990 0.000 1.000 NA   NA
 2027686 2027687 RD1_4220 RD1_4221     TRUE 0.981 4.000 0.667 NA   NA
 2027687 2027688 RD1_4221 RD1_4222     TRUE 0.972 8.000 0.667 NA   NA
 2027688 2027689 RD1_4222 RD1_4223     FALSE 0.154 27.000 0.000 NA   NA
 2027689 2027690 RD1_4223 RD1_4224     TRUE 0.962 2.000 0.276 NA   NA
 2027690 2027691 RD1_4224 RD1_4225     TRUE 0.870 4.000 0.069 NA   NA
 2027691 2027692 RD1_4225 RD1_4226     TRUE 0.943 -7.000 0.667 NA   NA
 2027692 2027693 RD1_4226 RD1_4227     TRUE 0.937 -3.000 0.231 NA   NA
 2027693 2027694 RD1_4227 RD1_4228     TRUE 0.914 -3.000 0.154 NA   NA
 2027694 2027695 RD1_4228 RD1_4230     TRUE 0.990 0.000 1.000 NA   NA
 2027695 2027696 RD1_4230 RD1_4231     TRUE 0.889 -7.000 0.333 NA   NA
 2027696 2027697 RD1_4231 RD1_4232     TRUE 0.954 -3.000 0.333 NA   NA
 2027697 2027698 RD1_4232 RD1_4233   fdhB FALSE 0.001 484.000 0.000 NA   NA
 2027698 2027699 RD1_4233 RD1_4234 fdhB fdhA TRUE 0.993 4.000 0.571 0.001   NA
 2027699 2027700 RD1_4234 RD1_4235 fdhA fhs FALSE 0.568 28.000 0.042 1.000   NA
 2027700 2027701 RD1_4235 RD1_4236 fhs folD TRUE 0.673 114.000 0.194 0.003 N NA
 2027701 2027702 RD1_4236 RD1_4237 folD folD TRUE 0.988 0.000 0.036 0.001 Y NA
 2027705 2027706 RD1_4241 RD1_4242   mclA TRUE 0.901 -13.000 0.125 1.000 Y NA
 2027706 2027707 RD1_4242 RD1_4243 mclA narP FALSE 0.465 109.000 0.188 1.000 N NA
 2027708 2027709 RD1_4244 RD1_4245   mtkA TRUE 0.696 41.000 0.016 0.058 N NA
 2027709 2027710 RD1_4245 RD1_4246 mtkA mtkB TRUE 0.989 -3.000 0.140 0.001 Y NA
 2027710 2027711 RD1_4246 RD1_4247 mtkB gyaR TRUE 0.980 0.000 0.019 0.058 Y NA
 2027711 2027712 RD1_4247 RD1_4248 gyaR ppc TRUE 0.965 0.000 0.038 1.000 Y NA
 2027712 2027713 RD1_4248 RD1_4249 ppc glyA FALSE 0.544 35.000 0.038 1.000 N NA
 2027714 2027715 RD1_4250 RD1_4251 glnT   TRUE 0.828 106.000 0.493 1.000 Y NA
 2027715 2027716 RD1_4251 RD1_4252     TRUE 0.990 11.000 0.901 1.000 Y NA
 2027716 2027717 RD1_4252 RD1_4253     TRUE 0.995 0.000 0.786 1.000 Y NA
 2023596 2023597 RD1_A0002 RD1_A0003 gltS   FALSE 0.214 16.000 0.000 NA   NA
 2023597 2023598 RD1_A0003 RD1_A0004   opuD FALSE 0.170 -13.000 0.000 NA   NA
 2023598 2023599 RD1_A0004 RD1_A0005 opuD   FALSE 0.013 191.000 0.000 1.000   NA
 2023599 2023600 RD1_A0005 RD1_A0006     FALSE 0.008 175.000 0.000 NA   NA
 2023600 2023601 RD1_A0006 RD1_A0007   virB11 FALSE 0.001 381.000 0.000 NA   NA
 2023601 2023602 RD1_A0007 RD1_A0008 virB11   TRUE 0.915 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 2023602 2023603 RD1_A0008 RD1_A0009     TRUE 0.993 0.000 0.667 NA Y NA
 2023603 2023604 RD1_A0009 RD1_A0010     TRUE 0.993 0.000 0.667 NA Y NA
 2023604 2023605 RD1_A0010 RD1_A0011     TRUE 0.948 64.000 1.000 NA Y NA
 2023605 2023606 RD1_A0011 RD1_A0012     FALSE 0.461 4.000 0.000 NA   NA
 2023606 2023607 RD1_A0012 RD1_A0013     FALSE 0.490 3.000 0.000 NA   NA
 2023607 2023608 RD1_A0013 RD1_A0014   virB4 FALSE 0.402 131.000 0.400 NA   NA
 2023608 2023609 RD1_A0014 RD1_A0015 virB4   TRUE 0.983 -7.000 1.000 NA Y NA
 2023609 2023610 RD1_A0015 RD1_A0016     FALSE 0.490 3.000 0.000 NA   NA
 2023610 2023611 RD1_A0016 RD1_A0017     FALSE 0.177 -12.000 0.000 NA   NA
 2023611 2023612 RD1_A0017 RD1_A0018     FALSE 0.141 -21.000 0.000 NA   NA
 2023612 2023613 RD1_A0018 RD1_A0019     FALSE 0.001 1125.000 0.000 NA   NA
 2023614 2023615 RD1_A0021 RD1_A0023     TRUE 0.619 -3.000 0.000 1.000   NA
 2023615 2023616 RD1_A0023 RD1_A0024     FALSE 0.003 241.000 0.000 NA   NA
 2023616 2023617 RD1_A0024 RD1_A0025   vagC FALSE 0.067 76.000 0.000 NA   NA
 2023617 2023618 RD1_A0025 RD1_A0026 vagC   TRUE 0.823 -3.000 0.054 NA   NA
 2023622 2023623 RD1_A0031 RD1_A0032     TRUE 0.596 -3.000 0.003 NA   NA
 2023623 2023624 RD1_A0032 RD1_A0033     FALSE 0.001 410.000 0.000 NA   NA
 2023624 2023625 RD1_A0033 RD1_A0034     TRUE 0.920 7.000 0.200 NA   NA
 2023625 2023626 RD1_A0034 RD1_A0035     FALSE 0.011 155.000 0.000 NA   NA
 2023626 2023627 RD1_A0035 RD1_A0036     TRUE 0.848 -22.000 0.394 NA   NA
 2023627 2023628 RD1_A0036 RD1_A0037     TRUE 0.978 3.000 0.515 NA   NA
 2023629 2023630 RD1_A0038 RD1_A0039     FALSE 0.073 68.000 0.000 NA   NA
 2023630 2023631 RD1_A0039 RD1_A0040     FALSE 0.505 2.000 0.000 NA   NA
 2023631 2023632 RD1_A0040 RD1_A0041     FALSE 0.137 -22.000 0.000 NA   NA
 2023632 2023633 RD1_A0041 RD1_A0043     FALSE 0.410 -3.000 0.000 NA   NA
 2023633 2023634 RD1_A0043 RD1_A0044     FALSE 0.075 66.000 0.000 NA   NA
 2023634 2023635 RD1_A0044 RD1_A0045     FALSE 0.106 -58.000 0.000 NA   NA
 2023636 2023637 RD1_A0046 RD1_A0047     TRUE 0.997 -3.000 0.669 0.001 Y NA
 2023637 2023638 RD1_A0047 RD1_A0048     FALSE 0.388 16.000 0.000 1.000   NA
 2023639 2023640 RD1_A0049 RD1_A0050     FALSE 0.102 -85.000 0.000 NA   NA
 2023640 2023641 RD1_A0050 RD1_A0051   xerD FALSE 0.001 365.000 0.000 NA   NA
 2023641 2023642 RD1_A0051 RD1_A0052 xerD   FALSE 0.024 121.000 0.000 NA   NA
 2023643 2023644 RD1_A0053 RD1_A0054   frpC FALSE 0.001 1403.000 0.000 NA   NA
 2023644 2023645 RD1_A0054 RD1_A0055 frpC   FALSE 0.130 -28.000 0.000 NA   NA
 2023645 2023646 RD1_A0055 RD1_A0056     FALSE 0.006 186.000 0.000 NA   NA
 2023646 2023647 RD1_A0056 RD1_A0057     FALSE 0.027 117.000 0.000 NA   NA
 2023650 2023651 RD1_A0060 RD1_A0061     FALSE 0.048 98.000 0.000 NA   NA
 2023651 2023652 RD1_A0061 RD1_A0062     FALSE 0.012 149.000 0.000 NA   NA
 2023654 2023655 RD1_A0065 RD1_A0066   tnp FALSE 0.001 478.000 0.000 NA   NA
 2023655 2023656 RD1_A0066 RD1_A0067 tnp   FALSE 0.001 716.000 0.000 NA   NA
 2023657 2023658 RD1_A0068 RD1_A0069     FALSE 0.102 -88.000 0.000 NA   NA
 2023658 2023659 RD1_A0069 RD1_A0070     FALSE 0.018 131.000 0.000 NA   NA
 2023660 2023661 RD1_A0071 RD1_A0072     FALSE 0.006 255.000 0.000 1.000   NA
 2023661 2023662 RD1_A0072 RD1_A0073     FALSE 0.046 100.000 0.000 NA   NA
 2023662 2023663 RD1_A0073 RD1_A0074     FALSE 0.519 0.000 0.000 NA   NA
 2023664 2023665 RD1_A0075 RD1_A0076     FALSE 0.100 -127.000 0.000 NA   NA
 2023666 2023667 RD1_A0077 RD1_A0078   rpsC FALSE 0.014 144.000 0.000 NA   NA
 2023667 2023668 RD1_A0078 RD1_A0079 rpsC   FALSE 0.519 0.000 0.000 NA   NA
 2023668 2023669 RD1_A0079 RD1_A0080     FALSE 0.025 120.000 0.000 NA   NA
 2023670 2023671 RD1_A0081 RD1_A0082     FALSE 0.068 74.000 0.000 NA   NA
 2023672 2023673 RD1_A0083 RD1_A0084     FALSE 0.001 770.000 0.000 NA   NA
 2023674 2023675 RD1_A0085 RD1_A0086     FALSE 0.064 79.000 0.000 NA   NA
 2023675 2023676 RD1_A0086 RD1_A0087     FALSE 0.077 65.000 0.000 NA   NA
 2023676 2023677 RD1_A0087 RD1_A0088   iorA TRUE 0.998 2.000 0.920 0.001 Y NA
 2023677 2023678 RD1_A0088 RD1_A0089 iorA   FALSE 0.163 85.000 0.000 1.000 N NA
 2023678 2023679 RD1_A0089 RD1_A0090     FALSE 0.154 -16.000 0.000 NA   NA
 2023679 2023680 RD1_A0090 RD1_A0091   dps FALSE 0.084 60.000 0.000 NA   NA
 2023680 2023681 RD1_A0091 RD1_A0092 dps   FALSE 0.062 116.000 0.000 1.000   NA
 2023681 2023682 RD1_A0092 RD1_A0093     TRUE 0.692 -34.000 0.000 0.005   NA
 2023682 2023683 RD1_A0093 RD1_A0094     FALSE 0.157 67.000 0.000 1.000   NA
 2023683 2023684 RD1_A0094 RD1_A0096     TRUE 0.674 25.000 0.100 NA   NA
 2023684 2023685 RD1_A0096 RD1_A0097     FALSE 0.047 99.000 0.000 NA   NA
 2023685 2023686 RD1_A0097 RD1_A0098     TRUE 0.900 12.000 0.250 NA   NA
 2023689 2023690 RD1_A0101 RD1_A0104     FALSE 0.001 364.000 0.000 NA   NA
 2023690 2023691 RD1_A0104 RD1_A0105     FALSE 0.002 330.000 0.000 NA   NA
 2023691 2023692 RD1_A0105 RD1_A0106     FALSE 0.519 0.000 0.000 NA   NA
 2023692 2023693 RD1_A0106 RD1_A0107     FALSE 0.053 92.000 0.000 NA   NA
 2023694 2023695 RD1_A0108 RD1_A0109   virC1 TRUE 0.869 -13.000 0.357 NA   NA
 2023696 2023697 RD1_A0110 RD1_A0111   virD1 FALSE 0.002 266.000 0.000 NA   NA
 2023697 2023698 RD1_A0111 RD1_A0112 virD1 virD2 FALSE 0.005 201.000 0.000 NA   NA
 2023698 2023699 RD1_A0112 RD1_A0114 virD2   FALSE 0.332 10.000 0.000 NA   NA
 2023699 2023595 RD1_A0114 RD1_A0001     FALSE 0.001 1093.000 0.000 NA   NA
 2023700 2023701 RD1_B0001 RD1_B0002     FALSE 0.410 -3.000 0.000 NA   NA
 2023701 2023702 RD1_B0002 RD1_B0003     FALSE 0.332 10.000 0.000 NA   NA
 2023702 2023703 RD1_B0003 RD1_B0004     FALSE 0.003 261.000 0.000 NA   NA
 2023703 2023704 RD1_B0004 RD1_B0005     TRUE 0.950 -3.000 0.250 1.000   NA
 2023704 2023705 RD1_B0005 RD1_B0006     TRUE 0.982 0.000 0.156 1.000 Y NA
 2023706 2023707 RD1_B0007 RD1_B0008     FALSE 0.056 87.000 0.000 NA   NA
 2023708 2023709 RD1_B0009 RD1_B0010     TRUE 0.933 1.000 0.130 NA   NA
 2023709 2023710 RD1_B0010 RD1_B0011     FALSE 0.570 -7.000 0.035 NA   NA
 2023710 2023711 RD1_B0011 RD1_B0012     TRUE 0.773 -3.000 0.035 NA   NA
 2023711 2023712 RD1_B0012 RD1_B0013     FALSE 0.020 169.000 0.000 1.000   NA
 2023712 2023713 RD1_B0013 RD1_B0014     TRUE 0.915 -3.000 0.000 0.006   NA
 2023713 2023714 RD1_B0014 RD1_B0015     FALSE 0.006 262.000 0.000 1.000   NA
 2023715 2023716 RD1_B0016 RD1_B0017 noeK rfbA FALSE 0.558 12.000 0.000 1.000 N NA
 2023716 2023717 RD1_B0017 RD1_B0018 rfbA rfbD TRUE 0.980 13.000 0.179 0.002 Y NA
 2023717 2023718 RD1_B0018 RD1_B0019 rfbD rfbB TRUE 0.937 -81.000 0.147 0.002 Y NA
 2023718 2023719 RD1_B0019 RD1_B0020 rfbB rfbC TRUE 0.984 -3.000 0.337 1.000 Y NA
 2023719 2023720 RD1_B0020 RD1_B0021 rfbC   FALSE 0.038 151.000 0.000 1.000 N NA
 2023720 2023721 RD1_B0021 RD1_B0022     TRUE 0.856 21.000 0.222 1.000 N NA
 2023721 2023722 RD1_B0022 RD1_B0023   exeA TRUE 0.955 -3.000 0.259 1.000 N NA
 2023723 2023724 RD1_B0024 RD1_B0025     FALSE 0.007 251.000 0.000 1.000   NA
 2023724 2023725 RD1_B0025 RD1_B0026     FALSE 0.115 188.000 0.188 1.000   NA
 2023725 2023726 RD1_B0026 RD1_B0027     FALSE 0.122 -37.000 0.000 NA   NA
 2023726 2023727 RD1_B0027 RD1_B0028     FALSE 0.129 34.000 0.000 NA   NA
 2023728 2023729 RD1_B0029 RD1_B0030   sat FALSE 0.059 83.000 0.000 NA   NA
 2023730 2023731 RD1_B0031 RD1_B0032     FALSE 0.030 114.000 0.000 NA   NA
 2023731 2023732 RD1_B0032 RD1_B0033     TRUE 0.617 -364.000 0.000 0.008   NA
 2023733 2023734 RD1_B0034 RD1_B0035     FALSE 0.001 449.000 0.000 NA   NA
 2023734 2023735 RD1_B0035 RD1_B0036   xanB FALSE 0.002 297.000 0.000 NA   NA
 2023736 2023737 RD1_B0037 RD1_B0038     FALSE 0.001 699.000 0.000 NA   NA
 2023738 2023739 RD1_B0039 RD1_B0040   galE TRUE 0.918 5.000 0.000 1.000 Y NA
 2023740 2023741 RD1_B0041 RD1_B0042     FALSE 0.125 -34.000 0.000 NA   NA
 2023741 2023742 RD1_B0042 RD1_B0043     FALSE 0.059 83.000 0.000 NA   NA
 2023745 2023746 RD1_B0047 RD1_B0048   rep TRUE 0.666 127.000 0.889 1.000   NA
 2023747 2023748 RD1_B0049 RD1_B0050 repA   FALSE 0.014 143.000 0.000 NA   NA
 2023750 2023751 RD1_B0052 RD1_B0053     TRUE 0.692 -34.000 0.000 0.005   NA
 2023751 2023752 RD1_B0053 RD1_B0054     FALSE 0.001 363.000 0.000 NA   NA
 2023752 2023753 RD1_B0054 RD1_B0055     FALSE 0.001 619.000 0.000 NA   NA
 2023753 2023754 RD1_B0055 RD1_B0056     FALSE 0.022 124.000 0.000 NA   NA
 2023756 2023757 RD1_C0001 RD1_C0002   virD TRUE 0.954 21.000 1.000 NA   NA
 2023759 2023760 RD1_C0004 RD1_C0005     FALSE 0.002 278.000 0.000 NA   NA
 2023763 2023764 RD1_C0008 RD1_C0009     FALSE 0.127 -31.000 0.000 NA   NA
 2023764 2023765 RD1_C0009 RD1_C0010     FALSE 0.001 1007.000 0.000 NA   NA
 2023765 2023766 RD1_C0010 RD1_C0011     FALSE 0.057 85.000 0.000 NA   NA
 2023766 2023767 RD1_C0011 RD1_C0012     TRUE 0.897 -15.000 0.500 NA   NA
 2023768 2023769 RD1_C0013 RD1_C0014     FALSE 0.410 -3.000 0.000 NA   NA
 2023769 2023770 RD1_C0014 RD1_C0015     FALSE 0.064 79.000 0.000 NA   NA
 2023770 2023771 RD1_C0015 RD1_C0016   parA TRUE 0.670 -16.000 0.105 NA   NA
 2023771 2023756 RD1_C0016 RD1_C0001 parA   FALSE 0.001 1372.000 0.000 NA   NA
 2023590 2023591 RD1_D0002 RD1_D0003     FALSE 0.025 285.000 0.000 NA Y NA
 2023591 2023592 RD1_D0003 RD1_D0004     FALSE 0.099 -196.000 0.000 NA   NA