MicrobesOnline Operon Predictions for Shigella flexneri 5 str. 8401

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 2018878 2018879 SFV_0001 SFV_0002 thrA thrB TRUE 0.981 2.000 0.133 1.000 Y NA
 2018879 2018880 SFV_0002 SFV_0003 thrB thrC TRUE 0.989 1.000 0.233 1.000 Y NA
 2018880 2018881 SFV_0003 SFV_0004 thrC   FALSE 0.025 223.000 0.003 NA   NA
 2018882 1602980 SFV_0005 SFV_0006 yaaA yaaJ FALSE 0.216 70.000 0.000 NA   NA
 2018883 2018884 SFV_0007 SFV_0008 talB mog FALSE 0.242 112.000 0.042 1.000 N NA
 2018885 2018886 SFV_0009 SFV_0010 yaaH   FALSE 0.155 149.000 0.043 NA   NA
 2018886 2018887 SFV_0010 SFV_0011   yaaI TRUE 0.938 26.000 0.500 NA   NA
 2018888 2018889 SFV_0012 SFV_0013 dnaK dnaJ TRUE 0.928 89.000 0.236 0.004 Y NA
 2018889 2018890 SFV_0013 SFV_0014 dnaJ nhaA FALSE 0.003 843.000 0.022 1.000 N NA
 2018890 2018891 SFV_0014 SFV_0015 nhaA nhaR TRUE 0.732 66.000 0.292 1.000 N NA
 2018895 2018896 SFV_0019 SFV_0020 ribF ileS TRUE 0.677 91.000 0.254 1.000 N NA
 2018896 2018897 SFV_0020 SFV_0021 ileS lspA TRUE 0.836 0.000 0.045 1.000 N NA
 2018897 2018898 SFV_0021 SFV_0022 lspA slpA FALSE 0.507 87.000 0.154 1.000 N NA
 2018898 2018899 SFV_0022 SFV_0023 slpA lytB TRUE 0.988 2.000 0.626 1.000 N NA
 2018899 2018900 SFV_0023 SFV_0024 lytB yaaF FALSE 0.230 66.000 0.028 1.000 N NA
 2018900 2018901 SFV_0024 SFV_0025 yaaF dapB FALSE 0.059 167.000 0.003 1.000 N NA
 2018901 2018902 SFV_0025 SFV_0026 dapB carA FALSE 0.061 456.000 0.034 1.000 Y NA
 2018902 2018903 SFV_0026 SFV_0027 carA carB TRUE 0.989 18.000 0.345 0.001 Y NA
 2018903 2018904 SFV_0027 SFV_0028 carB caiF FALSE 0.106 157.000 0.000 NA   NA
 2018905 2018906 SFV_0029 SFV_0030 caiE caiD TRUE 0.665 -15.000 0.000 1.000   NA
 2018906 2018907 SFV_0030 SFV_0031 caiD caiC TRUE 0.939 21.000 0.000 0.023 Y NA
 2018907 2018908 SFV_0031 SFV_0032 caiC caiB TRUE 0.655 74.000 0.154 0.023 N NA
 2018908 2018909 SFV_0032 SFV_0033 caiB caiA TRUE 0.813 129.000 0.529 1.000 N NA
 2018909 2018910 SFV_0033 SFV_0034 caiA caiT TRUE 0.669 31.000 0.118 1.000 N NA
 2018911 1603010 SFV_0035 SFV_0036 fixA fixB TRUE 0.557 15.000 0.000 NA   NA
 1603010 2018912 SFV_0036 SFV_0037 fixB fixC FALSE 0.290 51.000 0.000 NA   NA
 2018912 2018913 SFV_0037 SFV_0038 fixC fixX TRUE 0.990 -3.000 0.167 0.058 Y NA
 2018913 2018914 SFV_0038 SFV_0039 fixX yaaU FALSE 0.255 59.000 0.000 1.000 N NA
 2018914 2018915 SFV_0039 SFV_0040 yaaU yabF FALSE 0.345 48.000 0.000 1.000   NA
 2018915 2018916 SFV_0040 SFV_0041 yabF kefC TRUE 0.982 -7.000 0.560 1.000   NA
 2018916 2018917 SFV_0041 SFV_0042 kefC folA FALSE 0.050 191.000 0.012 1.000 N NA
 2018918 2018919 SFV_0043 SFV_0044 apaH apaG TRUE 0.941 7.000 0.267 NA N NA
 2018919 2018920 SFV_0044 SFV_0045 apaG ksgA TRUE 0.841 3.000 0.078 NA N NA
 2018920 2018921 SFV_0045 SFV_0046 ksgA pdxA TRUE 0.952 -3.000 0.197 1.000 N NA
 2018921 2018922 SFV_0046 SFV_0047 pdxA surA TRUE 0.988 0.000 0.561 1.000 N NA
 2018922 2018923 SFV_0047 SFV_0048 surA imp TRUE 0.647 53.000 0.182 1.000 N NA
 2018925 2018926 SFV_0050 SFV_0051 yabO hepA TRUE 0.932 12.000 0.294 1.000 N NA
 2018926 2018927 SFV_0051 SFV_0052 hepA polB TRUE 0.606 165.000 0.098 1.000 Y NA
 2018927 2018928 SFV_0052 SFV_0053 polB araD FALSE 0.177 75.000 0.018 1.000 N NA
 2018928 2018929 SFV_0053 SFV_0054 araD araA FALSE 0.348 200.000 0.017 1.000 Y NA
 2018929 2018930 SFV_0054 SFV_0055 araA araB TRUE 0.841 11.000 0.138 1.000 N NA
 2018931 2018932 SFV_0056 SFV_0057 araC yabI FALSE 0.529 86.000 0.167 NA   NA
 2018933 2018934 SFV_0058 SFV_0059 yabJ yabK TRUE 0.981 -16.000 0.522 0.017 N NA
 2018934 2018935 SFV_0059 SFV_0060 yabK tbpA TRUE 0.984 -24.000 0.697 0.073 N NA
 2018935 2018936 SFV_0060 SFV_0061 tbpA yabN FALSE 0.201 164.000 0.010 0.073   NA
 2018937 2018938 SFV_0063 SFV_0064 leuD leuC TRUE 0.991 11.000 0.309 0.001 Y NA
 2018938 2018939 SFV_0064 SFV_0065 leuC leuB TRUE 0.994 3.000 0.275 0.001 Y NA
 2018939 2018940 SFV_0065 SFV_0066 leuB leuA TRUE 0.991 0.000 0.126 0.001 Y NA
 2018941 2018942 SFV_0067 SFV_0068 leuO ilvI FALSE 0.015 318.000 0.000 1.000 N NA
 2018942 2018943 SFV_0068 SFV_0069 ilvI ilvH TRUE 0.996 3.000 0.371 0.002 Y NA
 2018943 2018944 SFV_0069 SFV_0070 ilvH fruL TRUE 0.592 12.000 0.000 NA   NA
 2018944 2018945 SFV_0070 SFV_0071 fruL fruR FALSE 0.211 82.000 0.000 NA   NA
 2018947 2018948 SFV_0073 SFV_0074 insB yabB FALSE 0.005 559.000 0.000 NA   NA
 2018948 2018949 SFV_0074 SFV_0075 yabB yabC TRUE 0.988 2.000 0.635 NA   NA
 2018949 2018950 SFV_0075 SFV_0076 yabC ftsL TRUE 0.960 -3.000 0.227 1.000 N NA
 2018950 2018951 SFV_0076 SFV_0077 ftsL ftsI TRUE 0.790 16.000 0.124 1.000 N NA
 2018951 2018952 SFV_0077 SFV_0078 ftsI murE TRUE 0.954 -13.000 0.059 1.000 Y NA
 2018952 2018953 SFV_0078 SFV_0079 murE murF TRUE 0.998 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 2018953 2018954 SFV_0079 SFV_0080 murF mraY TRUE 0.994 -6.000 0.309 0.004 Y NA
 2018954 2018955 SFV_0080 SFV_0081 mraY murD TRUE 0.998 3.000 0.647 0.004 Y NA
 2018955 2018956 SFV_0081 SFV_0082 murD ftsW TRUE 0.984 0.000 0.297 0.003 N NA
 2018956 2018957 SFV_0082 SFV_0083 ftsW murG TRUE 0.990 -3.000 0.647 1.000 N NA
 2018957 2018958 SFV_0083 SFV_0084 murG murC TRUE 0.929 54.000 0.283 1.000 Y NA
 2018958 2018959 SFV_0084 SFV_0085 murC ddlB TRUE 0.986 -7.000 0.153 0.004 Y NA
 2018959 2018960 SFV_0085 SFV_0086 ddlB ftsQ TRUE 0.993 2.000 0.372 NA Y NA
 2018960 2018961 SFV_0086 SFV_0087 ftsQ ftsA TRUE 0.778 90.000 0.389 NA N NA
 2018961 2018962 SFV_0087 SFV_0088 ftsA ftsZ TRUE 0.952 61.000 0.460 1.000 Y NA
 2018962 2018963 SFV_0088 SFV_0089 ftsZ lpxC FALSE 0.453 101.000 0.134 1.000 N NA
 2018963 2018964 SFV_0089 SFV_0090 lpxC yacA FALSE 0.243 78.000 0.000 1.000   NA
 2018964 2018965 SFV_0090 SFV_0091 yacA secA FALSE 0.405 62.000 0.065 1.000   NA
 2018965 2018966 SFV_0091 SFV_0092 secA mutT TRUE 0.587 60.000 0.168 1.000 N NA
 2018967 2018968 SFV_0093 SFV_0094 yacG yacF TRUE 0.956 10.000 0.356 NA   NA
 2018968 2018969 SFV_0094 SFV_0095 yacF yacE TRUE 0.910 0.000 0.110 NA   NA
 2018971 1603072 SFV_0097 SFV_0098 hofC hofB TRUE 0.659 -10.000 0.000 NA   NA
 1603072 2018972 SFV_0098 SFV_0099 hofB ppdD TRUE 0.633 10.000 0.000 NA   NA
 2018972 2018973 SFV_0099 SFV_0100 ppdD nadC FALSE 0.032 203.000 0.015 NA N NA
 2018974 2018975 SFV_0101 SFV_0102 ampD ampE TRUE 0.991 -3.000 0.249 1.000 Y NA
 2018977 2018978 SFV_0104 SFV_0105 pdhR aceE FALSE 0.489 161.000 0.276 1.000 N NA
 2018978 2018979 SFV_0105 SFV_0106 aceE aceF TRUE 0.971 15.000 0.220 1.000 Y NA
 2018979 2018980 SFV_0106 SFV_0107 aceF lpdA FALSE 0.475 322.000 0.463 1.000 Y NA
 2018982 2018983 SFV_0109 SFV_0110 acnB yacL FALSE 0.293 127.000 0.068 NA   NA
 2018984 2018985 SFV_0111 SFV_0112 speD speE TRUE 0.959 16.000 0.162 1.000 Y NA
 2018985 2018986 SFV_0112 SFV_0114 speE yacC TRUE 0.753 106.000 0.354 NA   NA
 2018991 2018992 SFV_0118 SFV_0119 yadG yadH TRUE 0.998 -3.000 0.688 0.093 Y NA
 2018992 2018993 SFV_0119 SFV_0120 yadH yadE FALSE 0.004 609.000 0.000 1.000 N NA
 2018996 2018997 SFV_0123 SFV_0124 panC panB TRUE 0.992 12.000 0.395 0.001 Y NA
 2018997 2018998 SFV_0124 SFV_0125 panB   FALSE 0.156 113.000 0.002 1.000   NA
 2019000 2019001 SFV_0127 SFV_0128 folK pcnB TRUE 0.962 -3.000 0.234 1.000 N NA
 2019001 2019002 SFV_0128 SFV_0129 pcnB yadB TRUE 0.815 93.000 0.131 1.000 Y NA
 2019002 2019003 SFV_0129 SFV_0130 yadB dksA TRUE 0.667 67.000 0.231 1.000 N NA
 2019003 2019004 SFV_0130 SFV_0131 dksA sfsA FALSE 0.247 178.000 0.151 NA   NA
 2019004 2019005 SFV_0131 SFV_0133 sfsA yadP TRUE 0.634 15.000 0.045 NA   NA
 2019006 2019007 SFV_0132 SFV_0134 hrpB mrcB FALSE 0.204 196.000 0.158 1.000 N NA
 2019007 2019008 SFV_0134 SFV_0135 mrcB fhuA FALSE 0.019 298.000 0.000 1.000 N NA
 2019008 2019009 SFV_0135 SFV_0136 fhuA fhuC TRUE 0.973 9.000 0.156 1.000 Y NA
 2019009 2019010 SFV_0136 SFV_0137 fhuC fhuD TRUE 0.972 0.000 0.031 1.000 Y NA
 2019010 2019011 SFV_0137 SFV_0138 fhuD fhuB TRUE 0.971 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 2019013 2019014 SFV_0140 SFV_0141 yadQ yadR FALSE 0.220 82.000 0.031 NA   NA
 2019015 2019016 SFV_0142 SFV_0143 yadS yadT TRUE 0.772 38.000 0.213 NA   NA
 2019016 2019017 SFV_0143 SFV_0144 yadT pfs TRUE 0.706 -34.000 0.073 1.000 N NA
 2019018 2019019 SFV_0145 SFV_0146 dgt htrA FALSE 0.350 130.000 0.101 1.000 N NA
 2019019 1603121 SFV_0146 SFV_0147 htrA yaeG FALSE 0.108 155.000 0.000 NA   NA
 2019020 2019021 SFV_0148 SFV_0149 yaeH dapD FALSE 0.018 314.000 0.035 NA   NA
 2019021 2019022 SFV_0149 SFV_0150 dapD glnD TRUE 0.638 31.000 0.097 1.000 N NA
 2019022 2019023 SFV_0150 SFV_0151 glnD map TRUE 0.701 62.000 0.243 1.000 N NA
 2019024 2019025 SFV_0152 SFV_0153 rpsB tsf TRUE 0.757 258.000 0.748 1.000 Y NA
 2019025 2019026 SFV_0153 SFV_0154 tsf pyrH TRUE 0.685 147.000 0.416 1.000 N NA
 2019026 2019027 SFV_0154 SFV_0155 pyrH frr FALSE 0.352 292.000 0.626 1.000 N NA
 2019027 2019028 SFV_0155 SFV_0156 frr yaeM FALSE 0.221 92.000 0.032 1.000 N NA
 2019028 2019029 SFV_0156 SFV_0157 yaeM yaeS FALSE 0.407 189.000 0.025 1.000 Y NA
 2019029 2019030 SFV_0157 SFV_0158 yaeS cdsA TRUE 0.963 43.000 0.400 1.000 Y NA
 2019030 2019031 SFV_0158 SFV_0159 cdsA yaeL TRUE 0.761 12.000 0.080 1.000 N NA
 2019031 2019032 SFV_0159 SFV_0160 yaeL yaeT TRUE 0.946 30.000 0.204 1.000 Y NA
 2019032 2019033 SFV_0160 SFV_0161 yaeT hlpA TRUE 0.911 122.000 0.354 1.000 Y NA
 2019033 2019034 SFV_0161 SFV_0162 hlpA lpxD TRUE 0.985 40.000 0.814 1.000 Y NA
 2019034 2019035 SFV_0162 SFV_0163 lpxD fabZ TRUE 0.981 12.000 0.796 1.000 N NA
 2019035 2019036 SFV_0163 SFV_0164 fabZ lpxA TRUE 0.990 4.000 0.850 1.000 N NA
 2019036 2019037 SFV_0164 SFV_0165 lpxA lpxB TRUE 0.992 0.000 0.289 1.000 Y NA
 2019037 2019038 SFV_0165 SFV_0166 lpxB rnhB TRUE 0.950 -3.000 0.186 1.000 N NA
 2019038 2019039 SFV_0166 SFV_0167 rnhB dnaE TRUE 0.735 136.000 0.104 1.000 Y NA
 2019039 2019040 SFV_0167 SFV_0168 dnaE accA TRUE 0.809 13.000 0.122 1.000 N NA
 2019040 2019041 SFV_0168 SFV_0169 accA ldcC FALSE 0.148 99.000 0.010 1.000 N NA
 2019041 2019042 SFV_0169 SFV_0170 ldcC yaeR TRUE 0.773 57.000 0.039 NA Y NA
 2019042 1603145 SFV_0170 SFV_0171 yaeR mesJ FALSE 0.231 65.000 0.000 NA   NA
 2019043 2019044 SFV_0172 SFV_0173 yaeO yaeP TRUE 0.889 -13.000 0.179 NA   NA
 2019045 2019046 SFV_0174 SFV_0175 yaeQ yaeJ TRUE 0.797 -3.000 0.034 NA   NA
 2019046 2019047 SFV_0175 SFV_0176 yaeJ cutF TRUE 0.560 14.000 0.027 NA   NA
 2019048 2019049 SFV_0177 SFV_0178 yaeF proS FALSE 0.220 44.000 0.002 NA   NA
 2019049 2019050 SFV_0178 SFV_0179 proS yaeB FALSE 0.261 111.000 0.048 NA   NA
 2019050 2019051 SFV_0179 SFV_0180 yaeB rcsF TRUE 0.963 -3.000 0.247 NA   NA
 2019051 2019052 SFV_0180 SFV_0181 rcsF yaeC TRUE 0.816 118.000 0.500 NA   NA
 2019052 2019053 SFV_0181 SFV_0182 yaeC yaeE TRUE 0.976 40.000 0.411 0.060 Y NA
 2019053 2019054 SFV_0182 SFV_0183 yaeE abc TRUE 0.994 8.000 0.584 1.000 Y NA
 2019055 1603159 SFV_0184 SFV_0185 yaeD rrsH FALSE 0.010 364.000 0.000 NA   NA
 1603159 1603160 SFV_0185 SFV_0186 rrsH   FALSE 0.212 86.000 0.000 NA   NA
 1603160 1603161 SFV_0186 SFV_0187   rrlH FALSE 0.063 194.000 0.000 NA   NA
 1603161 1603162 SFV_0187 SFV_0188 rrlH rrfH FALSE 0.205 95.000 0.000 NA   NA
 1603162 1603163 SFV_0188 SFV_0189 rrfH   FALSE 0.279 53.000 0.000 NA   NA
 1603163 2019056 SFV_0189 SFV_0190   yafB FALSE 0.098 163.000 0.000 NA   NA
 2019057 2019058 SFV_0191 SFV_0192   yafC FALSE 0.298 50.000 0.000 1.000 N NA
 2019059 2019060 SFV_0193 SFV_0194 yafD yafE FALSE 0.335 78.000 0.066 NA   NA
 2019061 2019062 SFV_0195 SFV_0196 dniR gloB TRUE 0.671 72.000 0.233 1.000   NA
 2019065 1603174 SFV_0198 SFV_0200 dnaQ   FALSE 0.163 133.000 0.000 NA   NA
 2019066 2019067 SFV_0201 SFV_0202 safA   TRUE 0.986 11.000 1.000 NA   NA
 2019067 2019068 SFV_0202 SFV_0203   safB FALSE 0.108 155.000 0.000 NA   NA
 2019068 1603178 SFV_0203 SFV_0204 safB safC TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 1603178 2019069 SFV_0204 SFV_0205 safC   FALSE 0.184 120.000 0.000 NA   NA
 2019069 2019070 SFV_0205 SFV_0206   sat1 FALSE 0.200 195.000 0.154 NA   NA
 2019070 2019071 SFV_0206 SFV_0207 sat1 sat2 TRUE 0.868 -13.000 0.154 NA   NA
 2019072 2019073 SFV_0208 SFV_0209     TRUE 0.891 24.000 0.000 1.000 Y NA
 2019074 2019075 SFV_0210 SFV_0211     TRUE 0.644 -12.000 0.000 NA   NA
 2019075 2019076 SFV_0211 SFV_0212     TRUE 0.811 -3.000 0.000 1.000   NA
 2019076 2019077 SFV_0212 SFV_0213     FALSE 0.226 66.000 0.000 NA   NA
 2019077 2019078 SFV_0213 SFV_0214     FALSE 0.211 74.000 0.000 NA   NA
 2019078 2019079 SFV_0214 SFV_0215     FALSE 0.003 755.000 0.000 NA   NA
 2019079 2019080 SFV_0215 SFV_0216     TRUE 0.827 102.000 0.500 NA   NA
 2019081 2019082 SFV_0217 SFV_0218     FALSE 0.146 301.000 0.000 1.000 Y NA
 2019082 2019083 SFV_0218 SFV_0219     TRUE 0.716 -6.000 0.000 NA   NA
 2019083 2019084 SFV_0219 SFV_0220     TRUE 0.917 1.000 0.143 NA   NA
 2019084 2019085 SFV_0220 SFV_0221     TRUE 0.921 14.000 0.286 NA   NA
 2019085 2019086 SFV_0221 SFV_0222     TRUE 0.936 0.000 0.161 NA   NA
 2019086 2019087 SFV_0222 SFV_0223     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 2019087 2019088 SFV_0223 SFV_0224     TRUE 0.590 -22.000 0.000 NA   NA
 2019088 2019089 SFV_0224 SFV_0225     TRUE 0.984 1.000 0.500 NA   NA
 2019089 2019090 SFV_0225 SFV_0226     TRUE 0.970 0.000 0.286 NA   NA
 2019090 2019091 SFV_0226 SFV_0227     TRUE 0.992 0.000 0.750 NA   NA
 2019091 2019092 SFV_0227 SFV_0228     TRUE 0.986 3.000 0.600 NA   NA
 2019092 2019093 SFV_0228 SFV_0229     TRUE 0.951 10.000 0.333 NA   NA
 2019093 2019094 SFV_0229 SFV_0230     TRUE 0.930 1.000 0.167 NA   NA
 2019094 2019095 SFV_0230 SFV_0231     FALSE 0.177 126.000 0.000 NA   NA
 2019095 2019096 SFV_0231 SFV_0232     TRUE 0.814 0.000 0.000 1.000   NA
 2019097 2019098 SFV_0233 SFV_0234     TRUE 0.759 36.000 0.182 1.000   NA
 2019099 2019100 SFV_0235 SFV_0236   ymfR TRUE 0.813 12.000 0.120 NA   NA
 2019100 2019101 SFV_0236 SFV_0237 ymfR   TRUE 0.989 0.000 0.600 NA   NA
 2019101 2019102 SFV_0237 SFV_0238     TRUE 0.904 -22.000 0.222 NA   NA
 2019102 2019103 SFV_0238 SFV_0239     TRUE 0.848 15.000 0.174 NA   NA
 2019103 2019104 SFV_0239 SFV_0240     FALSE 0.497 50.000 0.087 NA   NA
 2019104 2019105 SFV_0240 SFV_0241     TRUE 0.969 3.000 0.333 NA   NA
 2019105 2019106 SFV_0241 SFV_0242     TRUE 0.861 -3.000 0.058 NA   NA
 2019106 2019107 SFV_0242 SFV_0243     TRUE 0.657 -25.000 0.047 NA   NA
 2019107 2019108 SFV_0243 SFV_0244     TRUE 0.986 -3.000 0.500 NA   NA
 2019108 2019109 SFV_0244 SFV_0245     FALSE 0.312 163.000 0.167 NA   NA
 2019109 2019110 SFV_0245 SFV_0246     TRUE 0.994 0.000 1.000 NA   NA
 2019110 2019111 SFV_0246 SFV_0247     TRUE 0.994 0.000 0.900 NA   NA
 2019111 2019112 SFV_0247 SFV_0248     FALSE 0.464 142.000 0.200 NA   NA
 2019112 2019113 SFV_0248 SFV_0249     TRUE 0.681 61.000 0.222 NA   NA
 2019113 2019114 SFV_0249 SFV_0250     TRUE 0.964 -3.000 0.250 NA   NA
 2019114 2019115 SFV_0250 SFV_0251     TRUE 0.869 0.000 0.062 NA   NA
 2019115 2019116 SFV_0251 SFV_0252     TRUE 0.994 0.000 1.000 NA   NA
 2019116 2019117 SFV_0252 SFV_0253     TRUE 0.798 -13.000 0.083 NA   NA
 2019117 2019118 SFV_0253 SFV_0254     TRUE 0.825 -9.000 0.083 NA   NA
 2019118 2019119 SFV_0254 SFV_0255     FALSE 0.005 563.000 0.000 NA   NA
 2019120 2019121 SFV_0256 SFV_0257 gtrV gtrB TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 2019121 2019122 SFV_0257 SFV_0258 gtrB gtra TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 2019122 2019123 SFV_0258 SFV_0259 gtra   FALSE 0.031 262.000 0.000 1.000   NA
 2019123 2019124 SFV_0259 SFV_0260     FALSE 0.003 1041.000 0.000 1.000   NA
 2019124 2019125 SFV_0260 SFV_0261     TRUE 0.750 2.000 0.000 NA   NA
 2019125 2019126 SFV_0261 SFV_0262     TRUE 0.634 -13.000 0.000 NA   NA
 2019126 2019127 SFV_0262 SFV_0263     FALSE 0.198 103.000 0.000 NA   NA
 2019127 2019128 SFV_0263 SFV_0264     FALSE 0.006 504.000 0.000 NA   NA
 2019128 2019129 SFV_0264 SFV_0265     TRUE 0.611 -16.000 0.000 NA   NA
 2019129 2019130 SFV_0265 SFV_0266     TRUE 0.981 -3.000 0.400 NA   NA
 2019130 2019131 SFV_0266 SFV_0267     FALSE 0.113 152.000 0.000 NA   NA
 2019133 2019134 SFV_0269 SFV_0270     FALSE 0.004 706.000 0.000 NA   NA
 2019134 2019135 SFV_0270 SFV_0271     FALSE 0.008 400.000 0.000 1.000 N NA
 2019136 2019137 SFV_0272 SFV_0273     TRUE 0.961 -10.000 0.364 NA   NA
 2019137 2019138 SFV_0273 SFV_0274     FALSE 0.003 1033.000 0.000 NA   NA
 2019138 2019139 SFV_0274 SFV_0275     TRUE 0.695 -7.000 0.000 NA   NA
 2019139 2019140 SFV_0275 SFV_0276     FALSE 0.021 287.000 0.000 NA   NA
 2019140 2019141 SFV_0276 SFV_0277     FALSE 0.091 182.000 0.000 1.000   NA
 2019141 2019142 SFV_0277 SFV_0278     FALSE 0.004 669.000 0.000 NA   NA
 2019142 2019143 SFV_0278 SFV_0279     TRUE 0.899 -16.000 0.200 NA   NA
 2019143 2019144 SFV_0279 SFV_0280     FALSE 0.146 148.000 0.000 1.000   NA
 2019144 2019145 SFV_0280 SFV_0281     FALSE 0.056 202.000 0.000 NA   NA
 2019145 2019146 SFV_0281 SFV_0282     FALSE 0.006 517.000 0.000 NA   NA
 2019146 2019147 SFV_0282 SFV_0283     TRUE 0.782 141.000 0.182 1.000 Y NA
 1603258 2019148 SFV_0284 SFV_0285   proA FALSE 0.191 115.000 0.000 NA   NA
 2019148 2019149 SFV_0285 SFV_0286 proA proB TRUE 0.964 12.000 0.026 0.001 Y NA
 2019149 2019150 SFV_0286 SFV_0287 proB insB FALSE 0.068 191.000 0.000 1.000 N NA
 2019151 2019152 SFV_0288 SFV_0289   phoE FALSE 0.200 101.000 0.000 NA   NA
 2019153 2019154 SFV_0290 SFV_0291 crl yafA FALSE 0.333 58.000 0.048 NA   NA
 2019154 2019155 SFV_0291 SFV_0292 yafA gpt FALSE 0.249 92.000 0.040 NA   NA
 1603268 2019157 SFV_0294 SFV_0295 prfH   FALSE 0.189 116.000 0.000 NA   NA
 2019157 2019158 SFV_0295 SFV_0296   yafP FALSE 0.044 219.000 0.000 NA   NA
 2019158 2019159 SFV_0296 SFV_0297 yafP yafO TRUE 0.633 10.000 0.000 NA   NA
 2019159 2019160 SFV_0297 SFV_0298 yafO yafN TRUE 0.982 3.000 0.500 NA   NA
 2019160 2019161 SFV_0298 SFV_0299 yafN dinP FALSE 0.246 52.000 0.000 NA N NA
 2019161 2019162 SFV_0299 SFV_0301 dinP mbhA FALSE 0.185 122.000 0.000 1.000 N NA
 2019164 2019165 SFV_0302 SFV_0303 yafM yafL FALSE 0.069 176.000 0.000 NA N NA
 2019167 2019168 SFV_0305 SFV_0306 yafJ gmhA FALSE 0.292 206.000 0.229 1.000   NA
 2019172 2019173 SFV_0310 SFV_0311     FALSE 0.066 192.000 0.000 NA   NA
 2019173 2019174 SFV_0311 SFV_0312     FALSE 0.099 162.000 0.000 NA   NA
 2019174 2019175 SFV_0312 SFV_0313     TRUE 0.704 22.000 0.095 NA   NA
 2019175 2019176 SFV_0313 SFV_0314     TRUE 0.695 23.000 0.095 NA   NA
 2019176 2019177 SFV_0314 SFV_0315   insB FALSE 0.003 1078.000 0.000 NA   NA
 2019178 2019179 SFV_0316 SFV_0317   ykgE FALSE 0.014 323.000 0.000 NA   NA
 2019179 2019180 SFV_0317 SFV_0318 ykgE ykgF TRUE 0.981 11.000 0.286 NA Y NA
 2019180 2019181 SFV_0318 SFV_0319 ykgF ykgG TRUE 0.977 -7.000 0.286 0.001   NA
 2019182 2019183 SFV_0320 SFV_0321   ykgH FALSE 0.210 76.000 0.000 NA   NA
 2019183 2019184 SFV_0321 SFV_0322 ykgH betA FALSE 0.046 214.000 0.000 NA   NA
 2019184 2019185 SFV_0322 SFV_0323 betA betB TRUE 0.974 14.000 0.634 1.000 N NA
 2019185 2019186 SFV_0323 SFV_0324 betB betI TRUE 0.957 14.000 0.459 1.000 N NA
 2019191 2019192 SFV_0329 SFV_0330 tauA tauB TRUE 0.937 13.000 0.047 1.000 Y NA
 2019192 2019193 SFV_0330 SFV_0331 tauB tauC TRUE 0.997 -3.000 0.728 1.000 Y NA
 2019193 2019194 SFV_0331 SFV_0332 tauC tauD TRUE 0.956 -3.000 0.214 1.000 N NA
 1603308 2019196 SFV_0334 SFV_0335 yaiU   FALSE 0.410 -825.000 0.000 NA   NA
 2019196 2019197 SFV_0335 SFV_0336     TRUE 0.891 24.000 0.000 1.000 Y NA
 2019197 2019198 SFV_0336 SFV_0337     FALSE 0.461 206.000 0.000 0.042 Y NA
 2019198 2019199 SFV_0337 SFV_0338   yaiV FALSE 0.005 590.000 0.000 NA   NA
 2019201 2019202 SFV_0340 SFV_0341 sbmA yaiW TRUE 0.624 13.000 0.000 1.000   NA
 2019206 2019207 SFV_0345 SFV_0346 yaiB phoA FALSE 0.209 101.000 0.032 NA   NA
 2019207 2019208 SFV_0346 SFV_0347 phoA psiF FALSE 0.209 101.000 0.032 NA   NA
 2019209 2019210 SFV_0348 SFV_0349     TRUE 0.972 0.000 0.000 1.000 Y NA
 2019213 2019214 SFV_0352 SFV_0353 yaiI aroL FALSE 0.049 183.000 0.007 NA   NA
 2019214 2019215 SFV_0353 SFV_0354 aroL yaiA FALSE 0.366 50.000 0.044 NA   NA
 2019215 2019216 SFV_0354 SFV_0355 yaiA aroM FALSE 0.027 258.000 0.000 NA   NA
 2019216 2019217 SFV_0355 SFV_0356 aroM yaiE FALSE 0.285 72.000 0.049 NA   NA
 2019217 2019218 SFV_0356 SFV_0357 yaiE   FALSE 0.051 209.000 0.000 NA   NA
 2019218 2019219 SFV_0357 SFV_0358     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 2019222 2019223 SFV_0361 SFV_0362 araJ sbcC FALSE 0.422 30.000 0.030 1.000 N NA
 2019223 2019224 SFV_0362 SFV_0363 sbcC sbcD TRUE 0.984 -3.000 0.021 0.001 Y NA
 2019225 2019226 SFV_0364 SFV_0365 phoB phoR TRUE 0.969 58.000 0.453 0.014 Y NA
 2019226 2019227 SFV_0365 SFV_0366 phoR brnQ FALSE 0.008 407.000 0.000 1.000 N NA
 2019227 2019228 SFV_0366 SFV_0367 brnQ proY TRUE 0.944 76.000 0.348 0.086 Y NA
 2019228 2019229 SFV_0367 SFV_0368 proY malZ FALSE 0.263 159.000 0.123 1.000 N NA
 2019230 2019231 SFV_0370 SFV_0371 queA tgt TRUE 0.969 55.000 0.360 0.001 Y NA
 2019231 2019232 SFV_0371 SFV_0372 tgt yajC TRUE 0.901 23.000 0.325 NA N NA
 2019232 2019233 SFV_0372 SFV_0373 yajC secD TRUE 0.882 28.000 0.045 NA Y NA
 2019233 2019234 SFV_0373 SFV_0374 secD secF TRUE 0.986 11.000 0.206 0.001 Y NA
 2019234 2019235 SFV_0374 SFV_0375 secF yajD FALSE 0.161 129.000 0.015 1.000   NA
 2019236 2019237 SFV_0376 SFV_0377 tsx yajI FALSE 0.018 298.000 0.000 NA   NA
 2019238 2019239 SFV_0378 SFV_0379 ybaD ribD TRUE 0.882 22.000 0.277 NA N NA
 2019239 2019240 SFV_0379 SFV_0380 ribD ribH TRUE 0.919 35.000 0.034 0.002 Y NA
 2019240 2019241 SFV_0380 SFV_0381 ribH nusB TRUE 0.925 20.000 0.347 1.000 N NA
 2019241 2019242 SFV_0381 SFV_0382 nusB thiL TRUE 0.640 78.000 0.225 1.000 N NA
 2019242 2019243 SFV_0382 SFV_0383 thiL pgpA TRUE 0.911 -13.000 0.206 1.000 N NA
 2019244 2019245 SFV_0384 SFV_0385 yajO dxs FALSE 0.202 55.000 0.009 1.000 N NA
 2019245 2019246 SFV_0385 SFV_0386 dxs ispA TRUE 0.907 25.000 0.060 1.000 Y NA
 2019246 2019247 SFV_0386 SFV_0387 ispA xseB TRUE 0.806 0.000 0.035 1.000 N NA
 2019249 2019250 SFV_0389 SFV_0390 thiJ apbA TRUE 0.812 -37.000 0.155 NA   NA
 2019252 2019253 SFV_0392 SFV_0393     TRUE 0.570 53.000 0.000 0.010   NA
 2019253 2019254 SFV_0393 SFV_0394   yajR FALSE 0.091 182.000 0.000 1.000   NA
 2019255 2019256 SFV_0395 SFV_0396     FALSE 0.107 237.000 0.000 0.010   NA
 2019257 2019258 SFV_0397 SFV_0398     FALSE 0.185 135.000 0.000 1.000   NA
 2019258 1603373 SFV_0398 SFV_0399   cyoE FALSE 0.155 137.000 0.000 NA   NA
 1603373 2019259 SFV_0399 SFV_0400 cyoE cyoD TRUE 0.592 12.000 0.000 NA   NA
 2019259 2019260 SFV_0400 SFV_0401 cyoD cyoC TRUE 0.997 0.000 0.485 0.055 Y NA
 2019260 1603376 SFV_0401 SFV_0402 cyoC cyoB FALSE 0.442 -76.000 0.000 NA   NA
 1603376 1603377 SFV_0402 SFV_0403 cyoB cyoA FALSE 0.484 22.000 0.000 NA   NA
 1603377 2019261 SFV_0403 SFV_0404 cyoA   FALSE 0.238 63.000 0.000 NA   NA
 2019261 2019262 SFV_0404 SFV_0405     TRUE 0.582 -24.000 0.000 NA   NA
 2019262 2019263 SFV_0405 SFV_0406     FALSE 0.506 20.000 0.000 NA   NA
 2019263 2019264 SFV_0406 SFV_0407     TRUE 0.969 -3.000 0.000 NA Y NA
 2019264 2019265 SFV_0407 SFV_0408   ampG FALSE 0.012 370.000 0.000 1.000   NA
 2019265 2019266 SFV_0408 SFV_0409 ampG yajG TRUE 0.790 44.000 0.256 NA   NA
 2019267 2019268 SFV_0410 SFV_0411 tig clpP TRUE 0.585 247.000 0.351 1.000 Y NA
 2019268 2019269 SFV_0411 SFV_0412 clpP clpX TRUE 0.908 126.000 0.352 1.000 Y NA
 2019269 2019270 SFV_0412 SFV_0413 clpX lon TRUE 0.721 188.000 0.201 0.089 Y NA
 2019270 2019271 SFV_0413 SFV_0414 lon hupB FALSE 0.042 209.000 0.000 NA N NA
 2019271 2019272 SFV_0414 SFV_0415 hupB ybaU FALSE 0.054 192.000 0.000 NA N NA
 2019272 2019273 SFV_0415 SFV_0416 ybaU ybaV FALSE 0.126 151.000 0.033 1.000 N NA
 2019273 2019274 SFV_0416 SFV_0417 ybaV ybaW FALSE 0.235 94.000 0.027 1.000   NA
 2019275 2019276 SFV_0418 SFV_0419 ybaX ybaE FALSE 0.234 65.000 0.019 1.000   NA
 2019277 2019278 SFV_0420 SFV_0421 cof ybaO FALSE 0.320 46.000 0.020 1.000   NA
 2019278 2019279 SFV_0421 SFV_0422 ybaO mdlA TRUE 0.764 30.000 0.179 1.000 N NA
 2019279 2019280 SFV_0422 SFV_0423 mdlA mdlB TRUE 0.998 -7.000 0.911 0.005 Y NA
 2019280 2019281 SFV_0423 SFV_0424 mdlB glnK FALSE 0.330 43.000 0.028 1.000 N NA
 2019281 2019282 SFV_0424 SFV_0425 glnK amtB TRUE 0.734 30.000 0.156 1.000 N NA
 2019284 2019285 SFV_0427 SFV_0428 ybaY   FALSE 0.208 93.000 0.000 NA   NA
 2019288 2019289 SFV_0431 SFV_0432 ylaB ylaC FALSE 0.104 158.000 0.000 NA   NA
 2019289 2019290 SFV_0432 SFV_0433 ylaC ylaD FALSE 0.439 77.000 0.101 1.000   NA
 2019290 2019291 SFV_0433 SFV_0434 ylaD ybaJ FALSE 0.007 416.000 0.000 NA   NA
 2019291 2019292 SFV_0434 SFV_0435 ybaJ acrB FALSE 0.005 546.000 0.000 NA   NA
 2019292 2019293 SFV_0435 SFV_0436 acrB acrA TRUE 0.939 23.000 0.458 1.000 N NA
 2019294 2019295 SFV_0437 SFV_0438 acrR aefA FALSE 0.174 128.000 0.000 1.000 N NA
 2019296 2019297 SFV_0439 SFV_0440 ybaM priC TRUE 0.959 14.000 0.474 NA   NA
 2019298 2019299 SFV_0441 SFV_0442 ybaN apt FALSE 0.143 153.000 0.043 NA   NA
 2019299 2019300 SFV_0442 SFV_0443 apt dnaX FALSE 0.330 129.000 0.088 1.000 N NA
 2019300 2019301 SFV_0443 SFV_0444 dnaX ybaB TRUE 0.852 53.000 0.411 NA   NA
 2019301 2019302 SFV_0444 SFV_0445 ybaB recR TRUE 0.989 0.000 0.604 NA   NA
 2019302 1603420 SFV_0445 SFV_0446 recR htpG FALSE 0.195 110.000 0.000 NA   NA
 1603420 2019303 SFV_0446 SFV_0447 htpG adk FALSE 0.078 181.000 0.000 NA   NA
 2019303 2019304 SFV_0447 SFV_0448 adk hemH FALSE 0.128 132.000 0.013 1.000 N NA
 2019307 2019308 SFV_0451 SFV_0452 ybaL fsr FALSE 0.079 238.000 0.000 0.085 N NA
 2019309 2019310 SFV_0454 SFV_0455 ybaK ybaP FALSE 0.046 204.000 0.022 NA   NA
 2019313 2019314 SFV_0458 SFV_0459 ybaS ybaT TRUE 0.964 3.000 0.028 1.000 Y NA
 2019314 2019315 SFV_0459 SFV_0460 ybaT ybbI FALSE 0.182 125.000 0.000 1.000 N NA
 2019316 2019317 SFV_0461 SFV_0462 ybbJ ybbK TRUE 0.986 9.000 0.313 NA Y NA
 2019318 2019319 SFV_0463 SFV_0464 ybbL ybbM TRUE 0.846 -13.000 0.127 NA   NA
 2019320 2019321 SFV_0465 SFV_0466 ybbN ybbO TRUE 0.728 25.000 0.118 1.000   NA
 2019321 1603441 SFV_0466 SFV_0468 ybbO tesA FALSE 0.417 29.000 0.000 NA   NA
 2019322 2019323 SFV_0467 SFV_0469 ybbA ybbP TRUE 0.996 -3.000 0.535 1.000 Y NA
 2019324 2019325 SFV_0470 SFV_0471 ybbB ybbS FALSE 0.165 69.000 0.012 NA   NA
 2019326 2019327 SFV_0472 SFV_0473 ybbT ybbU TRUE 0.878 78.000 0.625 1.000 N NA
 2019327 2019328 SFV_0473 SFV_0474 ybbU gcl FALSE 0.525 36.000 0.054 1.000   NA
 2019329 2019330 SFV_0475 SFV_0476 insB ylbA FALSE 0.042 223.000 0.000 NA   NA
 2019330 2019331 SFV_0476 SFV_0477 ylbA ylbB TRUE 0.734 11.000 0.059 NA   NA
 2019332 2019333 SFV_0478 SFV_0479 ylbF arcC TRUE 0.979 -3.000 0.375 NA   NA
 2019334 2019335 SFV_0480 SFV_0481 purK purE TRUE 0.991 -3.000 0.136 0.001 Y NA
 2019335 2019336 SFV_0481 SFV_0482 purE ybbF FALSE 0.181 118.000 0.016 1.000   NA
 2019336 2019337 SFV_0482 SFV_0483 ybbF ppiB TRUE 0.956 3.000 0.237 1.000   NA
 2019339 2019340 SFV_0485 SFV_0486 ybcI ybcJ FALSE 0.143 108.000 0.011 NA   NA
 2019340 2019341 SFV_0486 SFV_0487 ybcJ folD TRUE 0.704 -28.000 0.055 1.000   NA
 2019342 1603463 SFV_0488 SFV_0489 sfmA sfmC FALSE 0.008 405.000 0.000 NA   NA
 1603463 1603464 SFV_0489 SFV_0490 sfmC sfmD FALSE 0.404 31.000 0.000 NA   NA
 2019344 1603467 SFV_0492 SFV_0493   sfmH FALSE 0.003 1085.000 0.000 NA   NA
 1603467 2019345 SFV_0493 SFV_0494 sfmH sfmF TRUE 0.609 11.000 0.000 NA   NA
 2019346 2019347 SFV_0495 SFV_0496     TRUE 0.905 -42.000 0.000 1.000 Y NA
 2019347 2019348 SFV_0496 SFV_0497   fimZ FALSE 0.213 76.000 0.000 1.000 N NA
 2019349 2019350 SFV_0499 SFV_0500 envY ybcH FALSE 0.075 183.000 0.000 NA   NA
 2019350 1603475 SFV_0500 SFV_0501 ybcH nfrA TRUE 0.760 1.000 0.000 NA   NA
 1603475 2019351 SFV_0501 SFV_0502 nfrA nfrB TRUE 0.634 -13.000 0.000 NA   NA
 2019351 2019352 SFV_0502 SFV_0503 nfrB ybcZ FALSE 0.095 225.000 0.000 0.089 N NA
 2019352 2019353 SFV_0503 SFV_0504 ybcZ ylcA TRUE 0.997 -10.000 0.600 0.001 Y NA
 1603479 2019354 SFV_0505 SFV_0506 ylcB ylcC FALSE 0.462 24.000 0.000 NA   NA
 2019354 1603481 SFV_0506 SFV_0507 ylcC ylcD TRUE 0.544 16.000 0.000 NA   NA
 2019355 2019356 SFV_0508 SFV_0509     FALSE 0.254 236.000 0.000 1.000 Y NA
 2019358 2019359 SFV_0511 SFV_0512     TRUE 0.782 141.000 0.182 1.000 Y NA
 2019359 2019360 SFV_0512 SFV_0513     FALSE 0.023 1713.000 0.000 1.000 Y NA
 2019360 2019361 SFV_0513 SFV_0514     TRUE 0.905 -42.000 0.000 1.000 Y NA
 2019362 2019363 SFV_0515 SFV_0516 ybdE pheP FALSE 0.384 101.000 0.000 0.085 N NA
 2019364 2019365 SFV_0517 SFV_0518 ybdG nfnB FALSE 0.199 108.000 0.000 1.000 N NA
 2019365 2019366 SFV_0518 SFV_0519 nfnB ybdF FALSE 0.206 94.000 0.000 NA   NA
 2019366 2019367 SFV_0519 SFV_0520 ybdF ybdJ FALSE 0.231 65.000 0.000 NA   NA
 2019367 2019368 SFV_0520 SFV_0521 ybdJ ybdK FALSE 0.226 66.000 0.000 NA   NA
 2019370 2019371 SFV_0523 SFV_0524     FALSE 0.276 270.000 0.000 0.041 Y NA
 2019371 2019372 SFV_0524 SFV_0525     FALSE 0.254 236.000 0.000 1.000 Y NA
 2019372 2019373 SFV_0525 SFV_0526     FALSE 0.527 52.000 0.000 0.081   NA
 2019375 2019376 SFV_0528 SFV_0529 entD fepA TRUE 0.962 25.000 0.700 1.000 N NA
 2019377 2019378 SFV_0530 SFV_0531 fes ybdZ TRUE 0.967 3.000 0.320 NA   NA
 2019378 2019379 SFV_0531 SFV_0532 ybdZ entF TRUE 0.886 -3.000 0.080 NA   NA
 2019381 1603509 SFV_0534 SFV_0535 insB fepE FALSE 0.004 652.000 0.000 NA   NA
 2019382 2019383 SFV_0536 SFV_0537 fepC fepG TRUE 0.973 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 2019383 2019384 SFV_0537 SFV_0538 fepG fepD TRUE 0.981 -3.000 0.000 0.057 Y NA
 1603515 2019387 SFV_0541 SFV_0542 entC entE TRUE 0.633 10.000 0.000 NA   NA
 2019387 2019388 SFV_0542 SFV_0543 entE entB TRUE 0.992 14.000 0.667 1.000 Y NA
 2019388 2019389 SFV_0543 SFV_0544 entB entA TRUE 0.971 0.000 0.024 1.000 Y NA
 2019389 2019390 SFV_0544 SFV_0545 entA ybdB TRUE 0.970 3.000 0.065 NA Y NA
 2019390 2019391 SFV_0545 SFV_0546 ybdB cstA FALSE 0.341 181.000 0.222 NA N NA
 2019391 2019392 SFV_0546 SFV_0547 cstA ybdD FALSE 0.483 182.000 0.333 NA   NA
 2019395 2019396 SFV_0550 SFV_0551 ybdM   FALSE 0.376 28.000 0.000 NA N NA
 2019396 2019397 SFV_0551 SFV_0552     TRUE 0.879 27.000 0.000 1.000 Y NA
 2019397 2019398 SFV_0552 SFV_0553     FALSE 0.093 167.000 0.000 NA   NA
 2019398 2019399 SFV_0553 SFV_0554     FALSE 0.212 73.000 0.000 NA   NA
 2019400 2019401 SFV_0555 SFV_0556     TRUE 0.772 57.000 0.000 1.000 Y NA
 2019402 2019403 SFV_0557 SFV_0558 ybdO dsbG FALSE 0.091 210.000 0.067 1.000 N NA
 2019404 2019405 SFV_0559 SFV_0560 ahpC ahpF TRUE 0.712 245.000 0.551 1.000 Y NA
 2019408 2019409 SFV_0563 SFV_0564 rnk rna FALSE 0.031 229.000 0.018 1.000 N NA
 2019409 2019410 SFV_0564 SFV_0565 rna ybdS FALSE 0.189 96.000 0.024 1.000 N NA
 2019410 2019411 SFV_0565 SFV_0566 ybdS citG TRUE 0.692 51.000 0.194 1.000 N NA
 2019411 2019412 SFV_0566 SFV_0567 citG ybdU TRUE 0.986 -25.000 0.400 1.000 Y NA
 2019412 2019413 SFV_0567 SFV_0568 ybdU citF TRUE 0.717 4.000 0.000 1.000 N NA
 2019413 2019414 SFV_0568 SFV_0569 citF citE TRUE 0.823 -31.000 0.000 0.001 N NA
 2019414 2019415 SFV_0569 SFV_0570 citE citD TRUE 0.993 -3.000 0.537 0.001 N NA
 2019415 1603545 SFV_0570 SFV_0571 citD citC TRUE 0.557 15.000 0.000 NA   NA
 1603545 2019416 SFV_0571 SFV_0572 citC insB FALSE 0.051 209.000 0.000 NA   NA
 2019417 2019418 SFV_0573 SFV_0574   ybhA FALSE 0.188 134.000 0.000 1.000   NA
 2019419 2019420 SFV_0575 SFV_0576 modC modB TRUE 0.997 3.000 0.537 0.001 Y NA
 2019420 2019421 SFV_0576 SFV_0577 modB modA TRUE 0.998 0.000 0.627 0.001 Y NA
 2019421 2019422 SFV_0577 SFV_0578 modA   FALSE 0.173 167.000 0.072 NA   NA
 2019423 2019424 SFV_0579 SFV_0580 modE modF FALSE 0.390 68.000 0.009 0.088   NA
 2019424 2019425 SFV_0580 SFV_0581 modF galE FALSE 0.028 261.000 0.023 1.000   NA
 2019425 2019426 SFV_0581 SFV_0582 galE galT TRUE 0.895 10.000 0.053 0.001 N NA
 2019426 2019427 SFV_0582 SFV_0583 galT galK TRUE 0.984 4.000 0.370 0.001 N NA
 2019427 2019428 SFV_0583 SFV_0584 galK galM TRUE 0.985 -6.000 0.083 0.001 Y NA
 2019428 2019429 SFV_0584 SFV_0585 galM gpmA FALSE 0.328 203.000 0.009 1.000 Y NA
 2019431 2019432 SFV_0587 SFV_0588   ybgR FALSE 0.320 114.000 0.057 1.000   NA
 2019433 2019434 SFV_0589 SFV_0590 pnuC nadA TRUE 0.836 38.000 0.023 1.000 Y NA
 2019434 1603565 SFV_0590 SFV_0591 nadA   FALSE 0.030 249.000 0.000 NA   NA
 1603565 1603566 SFV_0591 SFV_0592     TRUE 0.713 4.000 0.000 NA   NA
 1603566 1603567 SFV_0592 SFV_0593     FALSE 0.156 136.000 0.000 NA   NA
 1603567 2019435 SFV_0593 SFV_0594   ybgF FALSE 0.095 165.000 0.000 NA   NA
 2019435 2019436 SFV_0594 SFV_0595 ybgF pal TRUE 0.823 10.000 0.088 1.000   NA
 2019436 2019437 SFV_0595 SFV_0596 pal tolB TRUE 0.939 35.000 0.592 1.000 N NA
 2019437 2019438 SFV_0596 SFV_0597 tolB tolA FALSE 0.204 133.000 0.051 NA N NA
 2019438 2019439 SFV_0597 SFV_0598 tolA tolR FALSE 0.438 65.000 0.114 NA N NA
 2019439 2019440 SFV_0598 SFV_0599 tolR tolQ TRUE 0.996 4.000 0.556 0.069 Y NA
 2019440 2019441 SFV_0599 SFV_0600 tolQ ybgC TRUE 0.983 6.000 0.593 1.000   NA
 2019441 2019442 SFV_0600 SFV_0601 ybgC ybgE FALSE 0.251 150.000 0.095 NA   NA
 2019442 2019443 SFV_0601 SFV_0602 ybgE cydB FALSE 0.353 128.000 0.100 NA   NA
 2019443 2019444 SFV_0602 SFV_0603 cydB cydA TRUE 0.947 16.000 0.000 0.054 Y NA
 2019444 2019445 SFV_0603 SFV_0604 cydA ybgG FALSE 0.003 850.000 0.000 1.000 N NA
 2019445 1603579 SFV_0604 SFV_0605 ybgG hrsA FALSE 0.526 18.000 0.000 NA   NA
 2019447 2019448 SFV_0607 SFV_0608 sucD sucC TRUE 0.999 0.000 0.806 0.001 Y NA
 2019448 2019449 SFV_0608 SFV_0609 sucC sucB TRUE 0.816 94.000 0.136 1.000 Y NA
 2019449 2019450 SFV_0609 SFV_0610 sucB sucA TRUE 0.992 15.000 0.667 1.000 Y NA
 2019450 2019451 SFV_0610 SFV_0611 sucA sdhB FALSE 0.183 301.000 0.067 1.000 Y NA
 2019451 2019452 SFV_0611 SFV_0612 sdhB sdhA TRUE 0.994 16.000 0.604 0.003 Y NA
 2019452 2019453 SFV_0612 SFV_0613 sdhA sdhD TRUE 0.998 0.000 0.705 0.003 Y NA
 2019453 2019454 SFV_0613 SFV_0614 sdhD sdhC TRUE 0.996 -6.000 0.453 0.001 Y NA
 2019455 2019456 SFV_0615 SFV_0616 gltA ybgD FALSE 0.009 390.000 0.000 1.000 N NA
 2019456 2019457 SFV_0616 SFV_0617 ybgD ybgQ TRUE 0.947 9.000 0.000 1.000 Y NA
 2019457 2019458 SFV_0617 SFV_0618 ybgQ ybgP TRUE 0.923 15.000 0.000 1.000 Y NA
 2019458 2019459 SFV_0618 SFV_0619 ybgP ybgO FALSE 0.015 333.000 0.000 1.000   NA
 2019459 1603594 SFV_0619 SFV_0620 ybgO abrB FALSE 0.113 152.000 0.000 NA   NA
 2019460 2019461 SFV_0621 SFV_0622 nei ybgL FALSE 0.452 36.000 0.037 1.000   NA
 2019461 1603597 SFV_0622 SFV_0623 ybgL ybgK TRUE 0.659 -10.000 0.000 NA   NA
 1603597 2019462 SFV_0623 SFV_0624 ybgK ybgJ TRUE 0.716 -6.000 0.000 NA   NA
 2019462 2019463 SFV_0624 SFV_0625 ybgJ ybgI TRUE 0.575 23.000 0.050 NA   NA
 2019465 2019466 SFV_0627 SFV_0628 phrB ybgA TRUE 0.743 -3.000 0.019 NA   NA
 2019468 2019469 SFV_0630 SFV_0631     TRUE 0.965 19.000 0.600 NA   NA
 2019469 2019470 SFV_0631 SFV_0632   insB FALSE 0.008 397.000 0.000 NA   NA
 2019473 1603610 SFV_0635 SFV_0636 kdpA kdpB FALSE 0.474 23.000 0.000 NA   NA
 1603610 2019474 SFV_0636 SFV_0637 kdpB kdpC TRUE 0.653 9.000 0.000 NA   NA
 2019474 1603612 SFV_0637 SFV_0638 kdpC kdpD FALSE 0.520 -40.000 0.000 NA   NA
 1603612 2019475 SFV_0638 SFV_0639 kdpD kdpE FALSE 0.213 72.000 0.000 NA   NA
 1603615 2019477 SFV_0641 SFV_0642 speF potE TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 2019478 2019479 SFV_0643 SFV_0644 pgm seqA TRUE 0.746 26.000 0.151 1.000 N NA
 2019480 2019481 SFV_0645 SFV_0646 ybfF ybfE TRUE 0.698 71.000 0.276 NA   NA
 2019481 2019482 SFV_0646 SFV_0647 ybfE fldA TRUE 0.945 23.000 0.473 1.000   NA
 2019482 2019483 SFV_0647 SFV_0648 fldA fur FALSE 0.074 290.000 0.156 1.000 N NA
 2019484 2019485 SFV_0649 SFV_0650 ybfN ybfM FALSE 0.517 19.000 0.000 NA   NA
 2019485 2019486 SFV_0650 SFV_0651 ybfM glnS FALSE 0.006 579.000 0.000 1.000   NA
 2019486 2019487 SFV_0651 SFV_0652 glnS nagE FALSE 0.036 203.000 0.006 1.000 N NA
 2019488 2019489 SFV_0653 SFV_0654 nagB nagA TRUE 0.979 60.000 0.557 0.001 Y NA
 2019489 2019490 SFV_0654 SFV_0655 nagA nagC TRUE 0.994 9.000 0.571 1.000 Y NA
 2019490 2019491 SFV_0655 SFV_0656 nagC nagD TRUE 0.847 48.000 0.070 1.000 Y NA
 2019491 2019492 SFV_0656 SFV_0657 nagD asnB FALSE 0.008 397.000 0.000 1.000 N NA
 2019492 1603632 SFV_0657 SFV_0658 asnB   FALSE 0.009 381.000 0.000 NA   NA
 1603632 1603633 SFV_0658 SFV_0659     TRUE 0.633 10.000 0.000 NA   NA
 1603633 1603634 SFV_0659 SFV_0660     FALSE 0.462 24.000 0.000 NA   NA
 1603634 1603635 SFV_0660 SFV_0661     FALSE 0.381 35.000 0.000 NA   NA
 1603635 1603636 SFV_0661 SFV_0662     TRUE 0.544 16.000 0.000 NA   NA
 1603636 1603637 SFV_0662 SFV_0663     FALSE 0.299 49.000 0.000 NA   NA
 1603637 1603638 SFV_0663 SFV_0664     FALSE 0.356 38.000 0.000 NA   NA
 2019494 2019495 SFV_0666 SFV_0667 yleA ybeZ FALSE 0.448 153.000 0.220 1.000 N NA
 2019495 2019496 SFV_0667 SFV_0668 ybeZ ybeY TRUE 0.984 -3.000 0.457 NA   NA
 2019496 2019497 SFV_0668 SFV_0669 ybeY ybeX FALSE 0.496 90.000 0.150 NA   NA
 2019497 2019498 SFV_0669 SFV_0670 ybeX lnt TRUE 0.949 25.000 0.557 1.000 N NA
 2019498 2019499 SFV_0670 SFV_0671 lnt ybeJ FALSE 0.008 397.000 0.000 1.000 N NA
 2019499 2019500 SFV_0671 SFV_0672 ybeJ gltJ TRUE 0.590 170.000 0.000 0.057 Y NA
 2019500 2019501 SFV_0672 SFV_0673 gltJ gltK TRUE 0.999 0.000 0.933 0.016 Y NA
 2019501 2019502 SFV_0673 SFV_0674 gltK gltL TRUE 0.994 0.000 0.379 1.000 Y NA
 2019502 2019503 SFV_0674 SFV_0675 gltL ybeK TRUE 0.539 118.000 0.195 NA N NA
 2019503 2019504 SFV_0675 SFV_0676 ybeK ybeW FALSE 0.179 84.000 0.000 NA N NA
 2019505 2019506 SFV_0677 SFV_0678 ybeV ybeU TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 2019508 2019509 SFV_0680 SFV_0681 ybeS ybeR TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 2019512 2019513 SFV_0684 SFV_0685 leuS rlpB TRUE 0.856 15.000 0.182 NA N NA
 2019513 2019514 SFV_0685 SFV_0686 rlpB holA TRUE 0.949 0.000 0.199 NA N NA
 2019514 2019515 SFV_0686 SFV_0687 holA ybeN TRUE 0.809 2.000 0.045 1.000 N NA
 2019515 2019516 SFV_0687 SFV_0688 ybeN phpB TRUE 0.596 24.000 0.057 1.000 N NA
 2019516 2019517 SFV_0688 SFV_0689 phpB ybeB FALSE 0.026 260.000 0.000 NA   NA
 2019517 2019518 SFV_0689 SFV_0690 ybeB ybeA TRUE 0.961 4.000 0.307 NA   NA
 2019518 2019519 SFV_0690 SFV_0691 ybeA mrdA FALSE 0.415 31.000 0.031 NA   NA
 2019519 2019520 SFV_0691 SFV_0692 mrdA mrdB TRUE 0.799 3.000 0.046 1.000 N NA
 2019520 2019521 SFV_0692 SFV_0693 mrdB rlpA TRUE 0.597 11.000 0.035 NA N NA
 2019521 2019522 SFV_0693 SFV_0694 rlpA dacA TRUE 0.945 67.000 0.475 NA Y NA
 2019522 2019523 SFV_0694 SFV_0695 dacA ybeD FALSE 0.348 111.000 0.081 NA   NA
 2019523 2019524 SFV_0695 SFV_0696 ybeD lipB TRUE 0.615 101.000 0.219 NA   NA
 2019524 2019525 SFV_0696 SFV_0697 lipB ybeF FALSE 0.027 259.000 0.000 1.000 N NA
 2019525 2019526 SFV_0697 SFV_0698 ybeF lipA FALSE 0.026 224.000 0.005 1.000 N NA
 2019527 2019528 SFV_0699 SFV_0700 ybeC ybeM TRUE 0.549 129.000 0.196 1.000   NA
 2019530 2019531 SFV_0702 SFV_0703 cspE crcA TRUE 0.762 91.000 0.333 1.000   NA
 1603679 2019533 SFV_0705 SFV_0706 citB   FALSE 0.009 377.000 0.000 NA   NA
 2019534 2019535 SFV_0707 SFV_0708     FALSE 0.471 62.000 0.000 0.080   NA
 2019535 2019536 SFV_0708 SFV_0709     TRUE 0.782 141.000 0.182 1.000 Y NA
 2019537 2019538 SFV_0710 SFV_0711     TRUE 0.985 12.000 1.000 NA   NA
 2019538 2019539 SFV_0711 SFV_0712     TRUE 0.991 4.000 1.000 NA   NA
 2019539 2019540 SFV_0712 SFV_0713     FALSE 0.004 638.000 0.000 NA   NA
 2019540 2019541 SFV_0713 SFV_0714     TRUE 0.994 0.000 1.000 NA   NA
 2019541 2019542 SFV_0714 SFV_0715     TRUE 0.665 -15.000 0.000 1.000   NA
 2019542 2019543 SFV_0715 SFV_0716     TRUE 0.891 24.000 0.000 1.000 Y NA
 2019543 2019544 SFV_0716 SFV_0717     FALSE 0.243 76.000 0.000 1.000   NA
 2019544 2019545 SFV_0717 SFV_0718     TRUE 0.974 -67.000 1.000 NA   NA
 2019546 2019547 SFV_0719 SFV_0720     FALSE 0.146 301.000 0.000 1.000 Y NA
 2019548 2019549 SFV_0721 SFV_0722     TRUE 0.665 -15.000 0.000 1.000   NA
 2019549 2019550 SFV_0722 SFV_0723     FALSE 0.381 35.000 0.000 NA   NA
 2019550 2019551 SFV_0723 SFV_0724     TRUE 0.901 20.000 0.000 NA Y NA
 2019551 2019552 SFV_0724 SFV_0725     TRUE 0.969 -3.000 0.000 NA Y NA
 2019552 2019553 SFV_0725 SFV_0726   ybcS FALSE 0.314 54.000 0.000 1.000   NA
 2019554 2019555 SFV_0727 SFV_0728     TRUE 0.782 141.000 0.182 1.000 Y NA
 1603703 1603704 SFV_0729 SFV_0730     TRUE 0.713 4.000 0.000 NA   NA
 1603704 1603705 SFV_0730 SFV_0731     TRUE 0.735 3.000 0.000 NA   NA
 1603705 1603706 SFV_0731 SFV_0732     TRUE 0.750 2.000 0.000 NA   NA
 1603706 2019556 SFV_0732 SFV_0733     FALSE 0.003 741.000 0.000 NA   NA
 2019556 2019557 SFV_0733 SFV_0734     TRUE 0.783 0.000 0.000 NA   NA
 2019557 2019558 SFV_0734 SFV_0735     FALSE 0.350 39.000 0.000 NA   NA
 2019558 2019559 SFV_0735 SFV_0736     FALSE 0.004 633.000 0.000 NA   NA
 2019559 2019560 SFV_0736 SFV_0737     FALSE 0.124 148.000 0.000 NA   NA
 2019560 1603712 SFV_0737 SFV_0738     FALSE 0.006 495.000 0.000 NA   NA
 1603712 2019561 SFV_0738 SFV_0739     FALSE 0.127 146.000 0.000 NA   NA
 2019561 2019562 SFV_0739 SFV_0740   ydaT FALSE 0.210 78.000 0.000 NA   NA
 2019562 2019563 SFV_0740 SFV_0741 ydaT   FALSE 0.199 102.000 0.000 NA   NA
 2019565 2019566 SFV_0743 SFV_0744     TRUE 0.905 -42.000 0.000 1.000 Y NA
 2019568 2019569 SFV_0746 SFV_0747     TRUE 0.782 141.000 0.182 1.000 Y NA
 2019573 2019574 SFV_0752 SFV_0753 ybhH ybhI FALSE 0.210 76.000 0.000 NA   NA
 2019574 2019575 SFV_0753 SFV_0754 ybhI ybhJ FALSE 0.439 183.000 0.300 1.000 N NA
 2019576 2019577 SFV_0755 SFV_0756 ybhC ybhB FALSE 0.113 152.000 0.000 NA   NA
 2019577 2019578 SFV_0756 SFV_0758 ybhB bioA FALSE 0.166 59.000 0.003 NA   NA
 2019579 2019580 SFV_0757 SFV_0759 bioB bioF TRUE 0.992 -3.000 0.168 0.002 Y NA
 2019580 2019581 SFV_0759 SFV_0760 bioF bioC TRUE 0.981 -13.000 0.133 0.002 Y NA
 2019581 2019582 SFV_0760 SFV_0761 bioC bioD TRUE 0.980 -7.000 0.054 0.002 Y NA
 2019582 2019583 SFV_0761 SFV_0762 bioD uvrB FALSE 0.012 579.000 0.000 0.086 N NA
 2019585 2019586 SFV_0764 SFV_0765 moaA moaB TRUE 0.961 22.000 0.108 0.003 Y NA
 2019586 2019587 SFV_0765 SFV_0766 moaB moaC TRUE 0.987 3.000 0.109 0.003 Y NA
 2019587 2019588 SFV_0766 SFV_0767 moaC moaD TRUE 0.988 -7.000 0.175 0.003 Y NA
 2019588 2019589 SFV_0767 SFV_0768 moaD moaE TRUE 0.997 2.000 0.501 0.003 Y NA
 2019589 2019590 SFV_0768 SFV_0769 moaE ybhL FALSE 0.145 137.000 0.025 NA   NA
 2019590 2019591 SFV_0769 SFV_0770 ybhL ybhM FALSE 0.062 205.000 0.037 NA   NA
 2019592 2019593 SFV_0771 SFV_0772 ybhN ybhO TRUE 0.880 0.000 0.071 NA   NA
 2019593 2019594 SFV_0772 SFV_0773 ybhO ybhP TRUE 0.976 -3.000 0.333 NA   NA
 1603749 2019596 SFV_0775 SFV_0776 ybhR ybhS TRUE 0.609 11.000 0.000 NA   NA
 2019596 2019597 SFV_0776 SFV_0777 ybhS ybhF TRUE 0.987 -7.000 0.547 0.086   NA
 2019597 2019598 SFV_0777 SFV_0778 ybhF   TRUE 0.982 -7.000 0.545 1.000   NA
 2019598 2019599 SFV_0778 SFV_0779   ybiH TRUE 0.953 3.000 0.236 1.000 N NA
 2019602 2019603 SFV_0781 SFV_0783 dinG ybiB FALSE 0.490 28.000 0.041 1.000 N NA
 2019603 2019604 SFV_0783 SFV_0784 ybiB ybiC FALSE 0.310 141.000 0.000 0.050 N NA
 2019605 2019606 SFV_0785 SFV_0786 ybiJ ybiI FALSE 0.024 265.000 0.027 NA   NA
 2019606 2019607 SFV_0786 SFV_0787 ybiI ybiX FALSE 0.244 74.000 0.000 1.000   NA
 2019607 1603762 SFV_0787 SFV_0789 ybiX   FALSE 0.335 42.000 0.000 NA   NA
 2019611 2019612 SFV_0792 SFV_0793 ybiO glnQ FALSE 0.005 542.000 0.000 1.000 N NA
 2019612 2019613 SFV_0793 SFV_0794 glnQ glnP TRUE 0.973 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 2019613 2019614 SFV_0794 SFV_0795 glnP glnH TRUE 0.751 139.000 0.051 0.068 Y NA
 2019614 2019615 SFV_0795 SFV_0796 glnH dps FALSE 0.008 404.000 0.000 1.000 N NA
 2019615 2019616 SFV_0796 SFV_0797 dps ybiF FALSE 0.126 176.000 0.044 1.000   NA
 2019619 2019620 SFV_0800 SFV_0801   ybiR TRUE 0.727 -3.000 0.014 1.000 N NA
 2019623 2019624 SFV_0804 SFV_0805 ybiU   FALSE 0.113 152.000 0.000 NA   NA
 2019624 2019625 SFV_0805 SFV_0806   ybiW FALSE 0.150 146.000 0.000 1.000   NA
 2019625 2019626 SFV_0806 SFV_0807 ybiW ybiY TRUE 0.975 6.000 0.316 0.003 N NA
 2019628 2019629 SFV_0809 SFV_0810 moeB moeA TRUE 0.983 24.000 0.323 0.003 Y NA
 2019630 2019631 SFV_0811 SFV_0812 ybiK   TRUE 0.755 20.000 0.104 1.000   NA
 2019631 2019632 SFV_0812 SFV_0813     TRUE 0.724 20.000 0.083 1.000   NA
 2019632 2019633 SFV_0813 SFV_0814     TRUE 0.995 18.000 0.803 0.056 Y NA
 2019633 1603789 SFV_0814 SFV_0815     FALSE 0.319 45.000 0.000 NA   NA
 1603789 2019634 SFV_0815 SFV_0816     FALSE 0.200 100.000 0.000 NA   NA
 2019634 2019635 SFV_0816 SFV_0817     TRUE 0.946 8.000 0.000 NA Y NA
 2019637 1603794 SFV_0819 SFV_0820   yliI FALSE 0.194 111.000 0.000 NA   NA
 1603796 2019639 SFV_0822 SFV_0823 dacC   FALSE 0.394 -1324.000 0.000 NA   NA
 2019639 2019640 SFV_0823 SFV_0824     TRUE 0.782 141.000 0.182 1.000 Y NA
 2019641 2019642 SFV_0825 SFV_0826 deoR ybjG TRUE 0.726 58.000 0.235 1.000   NA
 2019644 2019645 SFV_0828 SFV_0829 ybjH   FALSE 0.209 92.000 0.000 NA   NA
 2019645 2019646 SFV_0829 SFV_0830     TRUE 0.814 0.000 0.000 1.000   NA
 2019651 2019652 SFV_0835 SFV_0836 ybjC mdaA TRUE 0.863 -16.000 0.159 NA   NA
 2019652 2019653 SFV_0836 SFV_0837 mdaA rimK FALSE 0.249 61.000 0.000 1.000 N NA
 2019653 2019654 SFV_0837 SFV_0838 rimK ybjN FALSE 0.331 76.000 0.065 NA   NA
 2019654 2019655 SFV_0838 SFV_0839 ybjN potF FALSE 0.022 277.000 0.000 NA   NA
 2019655 1603814 SFV_0839 SFV_0840 potF potG TRUE 0.567 14.000 0.000 NA   NA
 1603814 2019656 SFV_0840 SFV_0841 potG potH TRUE 0.633 10.000 0.000 NA   NA
 2019656 2019657 SFV_0841 SFV_0842 potH potI TRUE 0.997 -3.000 0.528 0.056 Y NA
 2019657 2019658 SFV_0842 SFV_0843 potI ybjO TRUE 0.729 60.000 0.264 NA   NA
 2019658 2019659 SFV_0843 SFV_0844 ybjO ybjF TRUE 0.778 41.000 0.226 NA   NA
 2019660 2019661 SFV_0845 SFV_0846 artJ artM FALSE 0.337 292.000 0.143 0.068 Y NA
 2019661 2019662 SFV_0846 SFV_0847 artM artQ TRUE 0.998 0.000 0.714 0.015 Y NA
 2019662 2019663 SFV_0847 SFV_0848 artQ artI TRUE 0.990 7.000 0.260 0.056 Y NA
 2019663 2019664 SFV_0848 SFV_0849 artI artP TRUE 0.978 18.000 0.323 1.000 Y NA
 2019664 2019665 SFV_0849 SFV_0850 artP ybjP FALSE 0.093 218.000 0.081 NA   NA
 2019668 2019669 SFV_0853 SFV_0854     FALSE 0.048 211.000 0.000 NA   NA
 2019669 2019670 SFV_0854 SFV_0855     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 2019671 2019672 SFV_0856 SFV_0857   ybjT TRUE 0.838 63.000 0.022 0.003 Y NA
 2019672 2019673 SFV_0857 SFV_0858 ybjT ybjU TRUE 0.766 11.000 0.074 1.000 N NA
 2019673 2019674 SFV_0858 SFV_0859 ybjU poxB TRUE 0.857 37.000 0.041 1.000 Y NA
 2019674 2019675 SFV_0859 SFV_0860 poxB   FALSE 0.156 133.000 0.025 1.000 N NA
 2019675 2019676 SFV_0860 SFV_0861   ybjW TRUE 0.958 12.000 0.000 0.017 Y NA
 2019676 2019677 SFV_0861 SFV_0862 ybjW ybjE FALSE 0.155 144.000 0.000 1.000   NA
 2019677 2019678 SFV_0862 SFV_0863 ybjE aqpZ FALSE 0.008 409.000 0.025 1.000   NA
 2019678 2019679 SFV_0863 SFV_0864 aqpZ insB FALSE 0.289 52.000 0.000 1.000 N NA
 2019680 2019681 SFV_0865 SFV_0866   ybjD FALSE 0.013 329.000 0.000 NA   NA
 2019683 2019684 SFV_0868 SFV_0869     FALSE 0.426 -115.000 0.000 NA   NA
 2019684 1603844 SFV_0869 SFV_0870   ybjZ TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 2019686 2019687 SFV_0872 SFV_0873 yljA clpA TRUE 0.945 31.000 0.596 NA   NA
 1603848 2019688 SFV_0874 SFV_0875   infA FALSE 0.028 254.000 0.000 NA   NA
 2019688 2019689 SFV_0875 SFV_0876 infA aat FALSE 0.018 285.000 0.020 1.000 N NA
 2019689 2019690 SFV_0876 SFV_0877 aat cydC TRUE 0.849 42.000 0.049 1.000 Y NA
 2019690 2019691 SFV_0877 SFV_0878 cydC cydD TRUE 0.998 1.000 0.631 0.005 Y NA
 2019691 2019692 SFV_0878 SFV_0879 cydD trxB TRUE 0.710 123.000 0.049 1.000 Y NA
 2019693 2019694 SFV_0880 SFV_0881 lrp ftsK TRUE 0.693 135.000 0.345 1.000 N NA
 2019694 2019695 SFV_0881 SFV_0882 ftsK lolA TRUE 0.545 155.000 0.305 1.000 N NA
 2019695 2019696 SFV_0882 SFV_0883 lolA ycaJ TRUE 0.870 11.000 0.167 1.000 N NA
 2019696 2019697 SFV_0883 SFV_0884 ycaJ serS FALSE 0.522 91.000 0.078 0.085 N NA
 2019697 1603859 SFV_0884 SFV_0885 serS dmsA FALSE 0.032 240.000 0.000 NA   NA
 1603859 2019698 SFV_0885 SFV_0886 dmsA dmsB TRUE 0.609 11.000 0.000 NA   NA
 2019698 2019699 SFV_0886 SFV_0887 dmsB dmsC TRUE 0.973 2.000 0.333 1.000   NA
 2019701 2019702 SFV_0889 SFV_0890 ycaD   FALSE 0.016 313.000 0.000 1.000 N NA
 2019702 2019703 SFV_0890 SFV_0891     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 2019703 2019704 SFV_0891 SFV_0892     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 2019704 2019705 SFV_0892 SFV_0893     TRUE 0.682 6.000 0.000 NA   NA
 2019705 2019706 SFV_0893 SFV_0894     FALSE 0.195 131.000 0.000 1.000   NA
 2019706 2019707 SFV_0894 SFV_0895     TRUE 0.544 16.000 0.000 NA   NA
 2019709 2019710 SFV_0897 SFV_0898 insB ycaN TRUE 0.753 2.000 0.000 1.000 N NA
 2019711 2019712 SFV_0900 SFV_0901     TRUE 0.782 141.000 0.182 1.000 Y NA
 2019713 2019714 SFV_0902 SFV_0903 pflA pflB FALSE 0.149 192.000 0.092 1.000 N NA
 2019714 2019715 SFV_0903 SFV_0904 pflB focA TRUE 0.815 55.000 0.345 1.000 N NA
 2019715 2019716 SFV_0904 SFV_0905 focA ycaO FALSE 0.036 232.000 0.000 NA   NA
 1603880 2019717 SFV_0906 SFV_0907 ycaP serC FALSE 0.058 199.000 0.000 NA   NA
 2019717 2019718 SFV_0907 SFV_0908 serC aroA TRUE 0.728 71.000 0.033 1.000 Y NA
 2019718 2019719 SFV_0908 SFV_0909 aroA   FALSE 0.180 126.000 0.000 1.000 N NA
 2019719 2019720 SFV_0909 SFV_0910   ycaL FALSE 0.196 112.000 0.000 1.000 N NA
 2019720 2019721 SFV_0910 SFV_0911 ycaL cmk FALSE 0.054 173.000 0.004 1.000 N NA
 2019721 2019722 SFV_0911 SFV_0912 cmk rpsA TRUE 0.678 111.000 0.281 1.000 N NA
 2019722 2019723 SFV_0912 SFV_0913 rpsA himD FALSE 0.511 160.000 0.292 1.000 N NA
 2019723 2019724 SFV_0913 SFV_0914 himD ycaI FALSE 0.004 598.000 0.003 1.000   NA
 2019724 2019725 SFV_0914 SFV_0915 ycaI msbA FALSE 0.015 710.000 0.075 0.082   NA
 2019725 2019726 SFV_0915 SFV_0916 msbA ycaH TRUE 0.954 -3.000 0.205 1.000 N NA
 2019726 2019727 SFV_0916 SFV_0917 ycaH ycaQ FALSE 0.306 37.000 0.017 NA   NA
 2019727 2019728 SFV_0917 SFV_0918 ycaQ ycaR FALSE 0.234 52.000 0.016 NA   NA
 2019728 2019729 SFV_0918 SFV_0919 ycaR kdsB TRUE 0.967 -3.000 0.265 NA   NA
 2019729 2019730 SFV_0919 SFV_0920 kdsB   FALSE 0.098 154.000 0.023 NA   NA
 2019732 2019733 SFV_0922 SFV_0923 smtA mukF TRUE 0.973 -3.000 0.325 NA N NA
 2019733 2019734 SFV_0923 SFV_0924 mukF mukE TRUE 0.895 -46.000 0.036 NA Y NA
 2019734 2019735 SFV_0924 SFV_0925 mukE mukB TRUE 0.985 0.000 0.000 0.001 Y NA
 2019735 2019736 SFV_0925 SFV_0926 mukB   FALSE 0.131 145.000 0.000 1.000 N NA
 2019736 2019737 SFV_0926 SFV_0927   ycbB FALSE 0.062 208.000 0.000 1.000   NA
 2019737 2019738 SFV_0927 SFV_0928 ycbB ycbK FALSE 0.524 182.000 0.372 NA   NA
 2019738 2019739 SFV_0928 SFV_0929 ycbK ycbL TRUE 0.648 27.000 0.089 NA   NA
 2019740 2019741 SFV_0930 SFV_0931 aspC ompF FALSE 0.083 185.000 0.036 1.000 N NA
 2019741 2019742 SFV_0931 SFV_0932 ompF asnS FALSE 0.004 601.000 0.000 1.000 N NA
 2019742 2019743 SFV_0932 SFV_0933 asnS pncB FALSE 0.101 169.000 0.034 1.000 N NA
 2019745 2019746 SFV_0935 SFV_0936 ycbE ycbM TRUE 0.996 -3.000 0.472 1.000 Y NA
 2019746 2019747 SFV_0936 SFV_0937 ycbM   TRUE 0.576 -25.000 0.000 1.000 N NA
 2019747 2019748 SFV_0937 SFV_0938     TRUE 0.891 24.000 0.000 1.000 Y NA
 2019748 2019749 SFV_0938 SFV_0939   ycbN FALSE 0.022 283.000 0.000 1.000 N NA
 2019749 2019750 SFV_0939 SFV_0940 ycbN ycbO TRUE 0.977 -3.000 0.341 1.000 N NA
 2019750 2019751 SFV_0940 SFV_0941 ycbO ycbP TRUE 0.806 -49.000 0.169 1.000   NA
 2019751 2019752 SFV_0941 SFV_0942 ycbP   FALSE 0.438 -81.000 0.000 NA   NA
 2019753 2019754 SFV_0943 SFV_0944 insB   FALSE 0.020 289.000 0.000 1.000 N NA
 2019755 2019756 SFV_0945 SFV_0946 insB insB TRUE 0.616 37.000 0.000 0.078   NA
 2019757 2019758 SFV_0947 SFV_0948   ycbR FALSE 0.090 169.000 0.000 NA   NA
 2019758 2019759 SFV_0948 SFV_0949 ycbR ycbS TRUE 0.988 25.000 0.667 1.000 Y NA
 2019759 2019760 SFV_0949 SFV_0950 ycbS   TRUE 0.783 54.000 0.000 1.000 Y NA
 2019760 2019761 SFV_0950 SFV_0951     TRUE 0.807 98.000 0.000 0.007 Y NA
 2019761 2019762 SFV_0951 SFV_0952     TRUE 0.997 8.000 0.667 0.007 Y NA
 2019762 2019763 SFV_0952 SFV_0953   ycbF TRUE 0.987 -34.000 0.500 1.000 Y NA
 2019763 2019764 SFV_0953 SFV_0954 ycbF pyrD FALSE 0.197 111.000 0.000 1.000 N NA
 2019764 2019765 SFV_0954 SFV_0955 pyrD ycbW FALSE 0.287 138.000 0.081 NA   NA
 2019767 2019768 SFV_0957 SFV_0958 ycbY uup TRUE 0.750 12.000 0.061 1.000   NA
 2019768 2019769 SFV_0958 SFV_0959 uup pqiA FALSE 0.248 130.000 0.054 NA   NA
 2019769 2019770 SFV_0959 SFV_0960 pqiA pqiB TRUE 0.988 5.000 0.819 NA   NA
 2019770 2019771 SFV_0960 SFV_0961 pqiB ymbA TRUE 0.987 -3.000 0.531 NA   NA
 2019772 2019773 SFV_0962 SFV_0963 fabA   TRUE 0.719 69.000 0.290 1.000 N NA
 2019775 2019776 SFV_0965 SFV_0966 ompA sulA FALSE 0.011 356.000 0.000 1.000 N NA
 1603941 2019777 SFV_0967 SFV_0968     FALSE 0.407 -866.000 0.000 NA   NA
 2019777 2019778 SFV_0968 SFV_0969     TRUE 0.891 24.000 0.000 1.000 Y NA
 2019779 2019780 SFV_0970 SFV_0971   yccF TRUE 0.807 10.000 0.090 NA   NA
 2019782 2019783 SFV_0973 SFV_0974 mgsA   FALSE 0.307 87.000 0.055 NA   NA
 2019785 2019786 SFV_0976 SFV_0977 yccV   TRUE 0.838 7.000 0.094 NA   NA
 2019786 2019787 SFV_0977 SFV_0978   yccK FALSE 0.011 385.000 0.000 1.000   NA
 2019787 2019788 SFV_0978 SFV_0979 yccK yccA TRUE 0.706 34.000 0.140 1.000   NA
 2019788 1603954 SFV_0979 SFV_0980 yccA   FALSE 0.052 207.000 0.000 NA   NA
 2019789 2019790 SFV_0981 SFV_0982 hyaA hyaB TRUE 0.985 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 2019790 2019791 SFV_0982 SFV_0983 hyaB hyaC TRUE 0.986 19.000 0.355 0.053 Y NA
 2019791 2019792 SFV_0983 SFV_0984 hyaC hyaD TRUE 0.987 -3.000 0.177 1.000 Y NA
 2019792 2019793 SFV_0984 SFV_0985 hyaD hyaE TRUE 0.900 -3.000 0.096 NA   NA
 2019793 2019794 SFV_0985 SFV_0986 hyaE hyaF TRUE 0.992 -3.000 0.769 NA   NA
 2019794 2019795 SFV_0986 SFV_0987 hyaF appC FALSE 0.282 134.000 0.061 1.000   NA
 2019795 2019796 SFV_0987 SFV_0988 appC appB TRUE 0.977 12.000 0.158 0.053 Y NA
 2019796 2019797 SFV_0988 SFV_0989 appB appA FALSE 0.087 184.000 0.000 1.000   NA
 2019798 2019799 SFV_0990 SFV_0991 yccC yccY TRUE 0.979 20.000 1.000 1.000 N NA
 2019799 2019800 SFV_0991 SFV_0992 yccY yccZ TRUE 0.979 -24.000 0.750 1.000 N NA
 2019800 2019801 SFV_0992 SFV_0993 yccZ ymcA FALSE 0.448 25.000 0.000 NA   NA
 2019801 2019802 SFV_0993 SFV_0994 ymcA ymcB TRUE 0.866 0.000 0.060 NA   NA
 2019802 2019803 SFV_0994 SFV_0995 ymcB ymcC TRUE 0.989 -3.000 0.600 NA   NA
 2019803 2019804 SFV_0995 SFV_0996 ymcC ymcD FALSE 0.197 107.000 0.000 NA   NA
 2019804 2019805 SFV_0996 SFV_0997 ymcD cspH FALSE 0.007 424.000 0.000 NA   NA
 2019805 2019806 SFV_0997 SFV_0998 cspH   FALSE 0.032 241.000 0.000 NA   NA
 2019807 2019808 SFV_0999 SFV_1000 insB cspG FALSE 0.488 22.000 0.000 1.000 N NA
 2019808 2019809 SFV_1000 SFV_1001 cspG gnsA FALSE 0.008 394.000 0.000 NA   NA
 2019810 2019811 SFV_1002 SFV_1004 yccM torS FALSE 0.202 102.000 0.000 1.000 N NA
 2019814 2019815 SFV_1006 SFV_1007 torC torA TRUE 0.982 0.000 0.000 0.052 Y NA
 2019815 1603982 SFV_1007 SFV_1008 torA torD TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 2019818 2019819 SFV_1011 SFV_1012 yccD cbpA TRUE 0.987 0.000 0.512 NA   NA
 2019820 2019821 SFV_1013 SFV_1014 yccE agp FALSE 0.019 293.000 0.000 NA   NA
 2019822 2019823 SFV_1015 SFV_1016 yccJ wrbA TRUE 0.900 21.000 0.290 NA   NA
 2019825 2019826 SFV_1018 SFV_1019 ycdG   TRUE 0.957 21.000 0.533 1.000   NA
 2019826 2019827 SFV_1019 SFV_1020     TRUE 0.986 11.000 0.625 0.030   NA
 2019827 2019828 SFV_1020 SFV_1021     TRUE 0.936 10.000 0.256 1.000   NA
 2019828 2019829 SFV_1021 SFV_1022     TRUE 0.962 8.000 0.365 NA   NA
 2019829 2019830 SFV_1022 SFV_1023     TRUE 0.957 12.000 0.442 NA N NA
 2019830 2019831 SFV_1023 SFV_1024     TRUE 0.989 -3.000 0.621 NA N NA
 2019833 2019834 SFV_1026 SFV_1027     FALSE 0.223 114.000 0.000 1.000   NA
 2019835 2019836 SFV_1028 SFV_1029   ycdO TRUE 0.813 58.000 0.356 NA   NA
 2019836 2019837 SFV_1029 SFV_1030 ycdO ycdB TRUE 0.990 6.000 0.378 NA Y NA
 2019837 1604005 SFV_1030 SFV_1031 ycdB phoH FALSE 0.013 333.000 0.000 NA   NA
 2019838 2019839 SFV_1032 SFV_1033 ycdP ycdQ TRUE 0.981 2.000 0.462 NA   NA
 2019839 1604008 SFV_1033 SFV_1035 ycdQ ycdR TRUE 0.695 -7.000 0.000 NA   NA
 1604008 2019840 SFV_1035 SFV_1034 ycdR insB FALSE 0.392 -1487.000 0.000 NA   NA
 2019840 1604010 SFV_1034 SFV_1036 insB ycdS FALSE 0.003 1041.000 0.000 NA   NA
 2019841 2019842 SFV_1037 SFV_1038     FALSE 0.201 98.000 0.000 NA   NA
 2019843 2019844 SFV_1039 SFV_1040     TRUE 0.811 -3.000 0.000 1.000   NA
 2019845 2019846 SFV_1041 SFV_1042   ycdU FALSE 0.196 109.000 0.000 NA   NA
 1604018 2019847 SFV_1044 SFV_1045 ycdW ycdX FALSE 0.269 55.000 0.000 NA   NA
 2019847 2019848 SFV_1045 SFV_1046 ycdX ycdY TRUE 0.932 24.000 0.417 1.000   NA
 2019848 2019849 SFV_1046 SFV_1047 ycdY ycdZ TRUE 0.575 54.000 0.145 NA   NA
 1604022 2019850 SFV_1048 SFV_1049 csgG csgF FALSE 0.432 27.000 0.000 NA   NA
 2019850 2019851 SFV_1049 SFV_1050 csgF csgE TRUE 0.963 25.000 0.723 NA   NA
 2019851 2019852 SFV_1050 SFV_1051 csgE csgD TRUE 0.911 5.000 0.176 NA   NA
 2019853 1604027 SFV_1052 SFV_1053 csgB csgA FALSE 0.340 41.000 0.000 NA   NA
 1604027 2019854 SFV_1053 SFV_1054 csgA   FALSE 0.419 -475.000 0.000 NA   NA
 2019854 2019855 SFV_1054 SFV_1055     TRUE 0.610 141.000 0.000 1.000 Y NA
 2019855 2019856 SFV_1055 SFV_1056     FALSE 0.004 858.000 0.000 1.000   NA
 2019856 2019857 SFV_1056 SFV_1057     FALSE 0.202 95.000 0.028 NA   NA
 2019857 1604032 SFV_1057 SFV_1058   ymdC TRUE 0.695 -7.000 0.000 NA   NA
 2019859 2019860 SFV_1060 SFV_1061 mdoG mdoH TRUE 0.976 -7.000 0.469 1.000 N NA
 2019861 2019862 SFV_1062 SFV_1063     FALSE 0.223 114.000 0.000 1.000   NA
 2019864 2019865 SFV_1065 SFV_1066     FALSE 0.254 236.000 0.000 1.000 Y NA
 2019866 2019867 SFV_1067 SFV_1068     FALSE 0.146 301.000 0.000 1.000 Y NA
 2019867 2019868 SFV_1068 SFV_1069     FALSE 0.045 573.000 0.000 1.000 Y NA
 2019868 2019869 SFV_1069 SFV_1070     TRUE 0.905 -42.000 0.000 1.000 Y NA
 2019869 2019870 SFV_1070 SFV_1071     FALSE 0.010 396.000 0.000 1.000   NA
 2019870 2019871 SFV_1071 SFV_1072     FALSE 0.041 236.000 0.000 1.000   NA
 2019871 2019872 SFV_1072 SFV_1073     FALSE 0.470 -219.000 0.000 1.000   NA
 2019872 2019873 SFV_1073 SFV_1074     FALSE 0.025 288.000 0.000 1.000   NA
 2019873 2019874 SFV_1074 SFV_1075     TRUE 0.782 141.000 0.182 1.000 Y NA
 2019875 2019876 SFV_1076 SFV_1077   htrB FALSE 0.009 387.000 0.000 1.000 N NA
 2019878 2019879 SFV_1079 SFV_1080 yceI   TRUE 0.988 4.000 0.676 1.000   NA
 2019879 2019880 SFV_1080 SFV_1081   yceO FALSE 0.071 186.000 0.000 NA   NA
 2019880 2019881 SFV_1081 SFV_1082 yceO solA TRUE 0.891 21.000 0.269 NA   NA
 2019881 2019882 SFV_1082 SFV_1083 solA dinI FALSE 0.004 659.000 0.000 NA   NA
 2019882 2019883 SFV_1083 SFV_1084 dinI pyrC FALSE 0.217 74.000 0.031 NA   NA
 2019883 2019884 SFV_1084 SFV_1085 pyrC yceB FALSE 0.175 106.000 0.022 NA   NA
 2019884 2019885 SFV_1085 SFV_1086 yceB grxB FALSE 0.364 77.000 0.078 NA   NA
 2019885 2019886 SFV_1086 SFV_1087 grxB yceL FALSE 0.452 64.000 0.103 1.000 N NA
 2019887 2019888 SFV_1088 SFV_1089 rimJ yceH TRUE 0.820 11.000 0.116 NA   NA
 2019888 2019889 SFV_1089 SFV_1090 yceH mviM TRUE 0.889 2.000 0.103 NA   NA
 2019889 2019890 SFV_1090 SFV_1091 mviM mviN FALSE 0.099 167.000 0.022 1.000   NA
 2019891 2019892 SFV_1092 SFV_1093 flgN flgM TRUE 0.995 5.000 0.361 0.002 Y NA
 2019892 2019893 SFV_1093 SFV_1094 flgM flgA TRUE 0.912 76.000 0.330 NA Y NA
 2019894 1604070 SFV_1095 SFV_1096 flgB flgC TRUE 0.713 4.000 0.000 NA   NA
 1604070 2019895 SFV_1096 SFV_1097 flgC flgD TRUE 0.633 10.000 0.000 NA   NA
 2019895 2019896 SFV_1097 SFV_1098 flgD flgE TRUE 0.923 25.000 0.116 NA Y NA
 2019896 2019897 SFV_1098 SFV_1099 flgE flgF TRUE 0.991 20.000 0.476 0.003 Y NA
 2019897 2019898 SFV_1099 SFV_1100 flgF flgG TRUE 0.946 138.000 0.420 0.001 Y NA
 2019898 2019899 SFV_1100 SFV_1101 flgG flgH TRUE 0.963 44.000 0.268 0.004 Y NA
 2019899 2019900 SFV_1101 SFV_1102 flgH flgI TRUE 0.970 12.000 0.073 0.005 Y NA
 2019900 2019901 SFV_1102 SFV_1103 flgI flgJ TRUE 0.985 0.000 0.036 0.005 Y NA
 2019901 1604078 SFV_1103 SFV_1104 flgJ flgK FALSE 0.226 66.000 0.000 NA   NA
 1604078 2019902 SFV_1104 SFV_1105 flgK flgL TRUE 0.592 12.000 0.000 NA   NA
 2019906 2019907 SFV_1109 SFV_1110 yceD plsX FALSE 0.014 360.000 0.044 NA   NA
 2019907 2019908 SFV_1110 SFV_1111 plsX fabH TRUE 0.958 68.000 0.380 0.004 Y NA
 2019908 2019909 SFV_1111 SFV_1112 fabH fabD TRUE 0.978 16.000 0.182 0.004 Y NA
 2019909 2019910 SFV_1112 SFV_1113 fabD fabG TRUE 0.992 13.000 0.432 0.004 Y NA
 2019910 2019911 SFV_1113 SFV_1114 fabG acpP TRUE 0.769 211.000 0.321 0.004 Y NA
 2019911 2019912 SFV_1114 SFV_1115 acpP fabF TRUE 0.923 86.000 0.346 1.000 Y NA
 2019912 2019913 SFV_1115 SFV_1116 fabF pabC TRUE 0.546 120.000 0.187 1.000 N NA
 2019913 2019914 SFV_1116 SFV_1117 pabC yceG TRUE 0.941 3.000 0.204 NA   NA
 2019914 2019915 SFV_1117 SFV_1118 yceG tmk TRUE 0.920 -10.000 0.209 NA   NA
 2019915 2019916 SFV_1118 SFV_1119 tmk holB TRUE 0.956 -3.000 0.211 1.000 N NA
 2019916 2019917 SFV_1119 SFV_1120 holB ycfH TRUE 0.957 11.000 0.110 NA Y NA
 2019917 2019918 SFV_1120 SFV_1121 ycfH ptsG FALSE 0.008 295.000 0.004 NA N NA
 2019920 2019921 SFV_1123 SFV_1124 ycfF ycfL TRUE 0.811 3.000 0.051 NA   NA
 2019921 2019922 SFV_1124 SFV_1125 ycfL ycfM TRUE 0.962 15.000 0.516 NA   NA
 2019922 2019923 SFV_1125 SFV_1126 ycfM ycfN TRUE 0.842 40.000 0.310 NA   NA
 2019923 2019924 SFV_1126 SFV_1127 ycfN ycfO TRUE 0.642 23.000 0.069 1.000 N NA
 2019924 2019925 SFV_1127 SFV_1128 ycfO ycfP TRUE 0.687 23.000 0.091 NA   NA
 2019925 2019926 SFV_1128 SFV_1129 ycfP ndh FALSE 0.012 432.000 0.057 NA   NA
 2019926 2019927 SFV_1129 SFV_1130 ndh ycfJ FALSE 0.072 239.000 0.071 1.000   NA
 2019930 2019931 SFV_1133 SFV_1134 ycfS mfd FALSE 0.125 140.000 0.006 1.000   NA
 2019931 2019932 SFV_1134 SFV_1135 mfd ycfT FALSE 0.191 65.000 0.003 1.000   NA
 2019933 2019934 SFV_1136 SFV_1137 ycfU ycfV TRUE 0.937 8.000 0.175 0.066 N NA
 2019934 2019935 SFV_1137 SFV_1138 ycfV ycfW TRUE 0.953 0.000 0.125 0.066 N NA
 2019935 2019936 SFV_1138 SFV_1139 ycfW ycfX TRUE 0.828 29.000 0.225 1.000 N NA
 2019936 2019937 SFV_1139 SFV_1140 ycfX cobB TRUE 0.950 16.000 0.119 1.000 Y NA
 2019938 2019939 SFV_1141 SFV_1142 potD potC TRUE 0.981 -3.000 0.000 0.054 Y NA
 2019939 2019940 SFV_1142 SFV_1143 potC potB TRUE 0.995 -3.000 0.286 0.054 Y NA
 2019940 2019941 SFV_1143 SFV_1144 potB potA TRUE 0.995 -16.000 0.789 1.000 Y NA
 2019944 2019945 SFV_1147 SFV_1148     FALSE 0.004 621.000 0.000 NA   NA
 2019945 2019946 SFV_1148 SFV_1149     FALSE 0.003 874.000 0.000 NA   NA
 2019946 2019947 SFV_1149 SFV_1150     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 2019947 2019948 SFV_1150 SFV_1151     FALSE 0.005 564.000 0.000 NA   NA
 2019948 2019949 SFV_1151 SFV_1152     TRUE 0.633 10.000 0.000 NA   NA
 2019949 2019950 SFV_1152 SFV_1153     FALSE 0.235 64.000 0.000 NA   NA
 2019952 1604130 SFV_1155 SFV_1156     TRUE 0.535 17.000 0.000 NA   NA
 1604130 2019953 SFV_1156 SFV_1157     FALSE 0.269 55.000 0.000 NA   NA
 2019953 2019954 SFV_1157 SFV_1158     TRUE 0.859 2.000 0.071 NA   NA
 2019954 2019955 SFV_1158 SFV_1159     FALSE 0.013 332.000 0.000 NA   NA
 2019955 2019956 SFV_1159 SFV_1160     FALSE 0.004 677.000 0.000 NA   NA
 2019956 2019957 SFV_1160 SFV_1161     TRUE 0.963 -16.000 0.444 NA   NA
 2019957 2019958 SFV_1161 SFV_1162     TRUE 0.567 14.000 0.000 NA   NA
 2019959 2019960 SFV_1163 SFV_1164   phoQ FALSE 0.016 314.000 0.000 NA   NA
 2019960 2019961 SFV_1164 SFV_1165 phoQ phoP TRUE 0.998 0.000 0.940 1.000 Y NA
 2019961 2019962 SFV_1165 SFV_1166 phoP purB FALSE 0.065 169.000 0.011 1.000 N NA
 2019962 2019963 SFV_1166 SFV_1167 purB ycfC TRUE 0.861 4.000 0.093 NA   NA
 2019963 2019964 SFV_1167 SFV_1168 ycfC ycfB TRUE 0.734 36.000 0.180 NA   NA
 2019964 2019965 SFV_1168 SFV_1169 ycfB   TRUE 0.604 54.000 0.158 1.000 N NA
 2019965 2019966 SFV_1169 SFV_1170   ymfC TRUE 0.898 10.000 0.182 1.000 N NA
 2019969 2019970 SFV_1173 SFV_1174     FALSE 0.007 424.000 0.000 NA   NA
 2019971 2019972 SFV_1175 SFV_1176     TRUE 0.633 10.000 0.000 NA   NA
 2019974 2019975 SFV_1178 SFV_1179 minE minD TRUE 0.995 4.000 0.618 NA Y NA
 2019975 2019976 SFV_1179 SFV_1180 minD minC TRUE 0.982 24.000 0.466 1.000 Y NA
 2019976 2019977 SFV_1180 SFV_1181 minC   FALSE 0.003 740.000 0.000 1.000 N NA
 2019977 2019978 SFV_1181 SFV_1182     TRUE 0.905 -42.000 0.000 1.000 Y NA
 2019978 2019979 SFV_1182 SFV_1183     FALSE 0.010 364.000 0.000 NA   NA
 2019980 2019981 SFV_1184 SFV_1185     TRUE 0.811 -3.000 0.000 1.000   NA
 2019981 2019982 SFV_1185 SFV_1186   ycgL FALSE 0.011 358.000 0.000 NA   NA
 2019982 2019983 SFV_1186 SFV_1187 ycgL   FALSE 0.314 72.000 0.056 NA   NA
 2019983 2019984 SFV_1187 SFV_1188   ycgN FALSE 0.388 92.000 0.088 NA   NA
 2019985 2019986 SFV_1190 SFV_1191 umuD umuC TRUE 0.786 0.000 0.000 1.000 N NA
 2019987 2019988 SFV_1192 SFV_1193 dsbB nhaB TRUE 0.825 146.000 0.723 1.000 N NA
 2019991 2019992 SFV_1196 SFV_1197 dadA dadX TRUE 0.882 10.000 0.168 1.000 N NA
 2019993 2019994 SFV_1198 SFV_1199 ipaH   FALSE 0.004 727.000 0.000 NA   NA
 2019994 2019995 SFV_1199 SFV_1201     FALSE 0.385 95.000 0.103 NA N NA
 1604178 2019999 SFV_1204 SFV_1205 prrA modD TRUE 0.693 5.000 0.000 NA   NA
 2019999 2020000 SFV_1205 SFV_1206 modD   TRUE 0.973 0.000 0.034 1.000 Y NA
 2020000 2020001 SFV_1206 SFV_1207     TRUE 0.793 115.000 0.123 1.000 Y NA
 2020001 2020002 SFV_1207 SFV_1208     TRUE 0.998 -3.000 0.862 1.000 Y NA
 2020002 2020003 SFV_1208 SFV_1209     TRUE 0.995 0.000 0.422 1.000 Y NA
 2020005 2020006 SFV_1211 SFV_1212 treA ycgC FALSE 0.018 320.000 0.000 1.000   NA
 2020006 2020007 SFV_1212 SFV_1213 ycgC   FALSE 0.466 80.000 0.118 1.000   NA
 2020007 2020008 SFV_1213 SFV_1214     TRUE 0.987 11.000 0.226 0.001 Y NA
 2020010 2020011 SFV_1216 SFV_1217   ychF FALSE 0.003 844.000 0.000 1.000 N NA
 2020011 2020012 SFV_1217 SFV_1218 ychF pth TRUE 0.841 117.000 0.184 1.000 Y NA
 2020014 2020015 SFV_1220 SFV_1221 ychM prsA FALSE 0.112 152.000 0.027 1.000 N NA
 2020015 2020016 SFV_1221 SFV_1222 prsA ychB FALSE 0.300 85.000 0.053 1.000 N NA
 2020016 2020017 SFV_1222 SFV_1223 ychB hemM TRUE 0.935 0.000 0.157 1.000 N NA
 2020018 2020019 SFV_1224 SFV_1225 hemA prfA TRUE 0.797 42.000 0.171 0.043 N NA
 2020019 2020020 SFV_1225 SFV_1226 prfA hemK TRUE 0.994 0.000 0.229 0.043 Y NA
 2020020 2020021 SFV_1226 SFV_1227 hemK   TRUE 0.909 -3.000 0.109 NA   NA
 2020021 2020022 SFV_1227 SFV_1228   ychA TRUE 0.932 4.000 0.195 NA   NA
 2020022 2020023 SFV_1228 SFV_1229 ychA kdsA TRUE 0.617 36.000 0.089 1.000   NA
 2020024 2020025 SFV_1230 SFV_1231     FALSE 0.008 402.000 0.000 NA   NA
 2020025 2020026 SFV_1231 SFV_1232   chaA FALSE 0.009 378.000 0.000 NA   NA
 2020027 2020028 SFV_1233 SFV_1234 chaB chaC FALSE 0.383 137.000 0.140 NA   NA
 2020031 2020032 SFV_1237 SFV_1238 narL narX TRUE 0.996 -7.000 0.521 0.013 Y NA
 2020033 2020034 SFV_1239 SFV_1240 narK narG FALSE 0.009 393.000 0.000 1.000 N NA
 2020034 2020035 SFV_1240 SFV_1241 narG narH TRUE 0.997 -3.000 0.471 0.001 Y NA
 2020035 2020036 SFV_1241 SFV_1242 narH narJ TRUE 0.998 -3.000 0.588 0.003 Y NA
 2020036 2020037 SFV_1242 SFV_1243 narJ narI TRUE 0.998 0.000 0.500 0.003 Y NA
 1604218 2020038 SFV_1244 SFV_1245   purU FALSE 0.101 160.000 0.000 NA   NA
 2020038 2020039 SFV_1245 SFV_1246 purU ychJ TRUE 0.702 50.000 0.200 NA   NA
 2020040 2020041 SFV_1247 SFV_1248 ychK hnr FALSE 0.308 92.000 0.048 1.000   NA
 2020041 2020042 SFV_1248 SFV_1249 hnr galU FALSE 0.297 202.000 0.235 1.000 N NA
 2020045 2020046 SFV_1252 SFV_1253   adhE FALSE 0.199 108.000 0.000 1.000 N NA
 2020047 2020048 SFV_1254 SFV_1255 ychE oppA FALSE 0.003 738.000 0.000 NA N NA
 2020048 2020049 SFV_1255 SFV_1256 oppA oppB TRUE 0.880 86.000 0.151 0.053 Y NA
 2020049 2020050 SFV_1256 SFV_1257 oppB oppC TRUE 0.996 15.000 0.870 0.053 Y NA
 2020050 2020051 SFV_1257 SFV_1258 oppC oppD TRUE 0.991 12.000 0.554 1.000 Y NA
 2020051 2020052 SFV_1258 SFV_1259 oppD oppF TRUE 0.997 -3.000 0.420 0.002 Y NA
 2020053 2020054 SFV_1260 SFV_1261   cls TRUE 0.866 -43.000 0.231 NA   NA
 2020054 2020055 SFV_1261 SFV_1262 cls kch FALSE 0.007 455.000 0.000 1.000 N NA
 2020056 2020057 SFV_1263 SFV_1264     TRUE 0.782 141.000 0.182 1.000 Y NA
 2020060 2020061 SFV_1267 SFV_1268 yciA yciB FALSE 0.487 105.000 0.167 NA N NA
 2020061 2020062 SFV_1268 SFV_1269 yciB yciC TRUE 0.558 30.000 0.061 NA   NA
 2020064 2020065 SFV_1271 SFV_1272 yciE yciF TRUE 0.778 46.000 0.115 0.001   NA
 2020065 2020066 SFV_1272 SFV_1273 yciF yciG FALSE 0.212 86.000 0.000 NA   NA
 2020066 2020067 SFV_1273 SFV_1274 yciG trpA FALSE 0.014 324.000 0.000 NA   NA
 2020067 2020068 SFV_1274 SFV_1275 trpA trpB TRUE 0.999 0.000 0.947 0.001 Y NA
 2020068 2020069 SFV_1275 SFV_1276 trpB trpC TRUE 0.986 12.000 0.221 0.001 Y NA
 2020069 2020070 SFV_1276 SFV_1277 trpC trpD TRUE 0.991 1.000 0.293 1.000 Y NA
 2020070 2020071 SFV_1277 SFV_1278 trpD trpE TRUE 0.984 0.000 0.010 0.001 Y NA
 2020072 2020073 SFV_1279 SFV_1280 yciV yciO TRUE 0.905 -39.000 0.281 NA   NA
 2020073 2020074 SFV_1280 SFV_1281 yciO yciL TRUE 0.753 101.000 0.075 NA Y NA
 2020075 2020076 SFV_1282 SFV_1283 btuR yciK TRUE 0.843 -3.000 0.050 1.000 N NA
 2020077 2020078 SFV_1284 SFV_1285 sohB topA FALSE 0.003 625.000 0.006 1.000 N NA
 2020078 2020079 SFV_1285 SFV_1286 topA cysB FALSE 0.033 210.000 0.008 1.000 N NA
 2020079 2020080 SFV_1286 SFV_1287 cysB   FALSE 0.019 295.000 0.000 NA   NA
 2020080 2020081 SFV_1287 SFV_1288     TRUE 0.983 4.000 0.556 NA   NA
 2020081 2020082 SFV_1288 SFV_1289   acnA FALSE 0.010 373.000 0.000 NA   NA
 2020084 2020085 SFV_1291 SFV_1292 pgpB yciS FALSE 0.324 149.000 0.143 NA   NA
 2020085 2020086 SFV_1292 SFV_1293 yciS yciM TRUE 0.888 61.000 0.576 NA   NA
 2020086 2020087 SFV_1293 SFV_1294 yciM pyrF FALSE 0.179 193.000 0.125 1.000 N NA
 2020087 2020088 SFV_1294 SFV_1295 pyrF yciH TRUE 0.837 0.000 0.045 1.000 N NA
 2020089 2020090 SFV_1296 SFV_1297 osmB   FALSE 0.024 269.000 0.000 NA   NA
 2020090 2020091 SFV_1297 SFV_1298     FALSE 0.490 90.000 0.146 NA   NA
 2020091 1604273 SFV_1298 SFV_1299   yciR FALSE 0.124 148.000 0.000 NA   NA
 1604273 2020092 SFV_1299 SFV_1300 yciR rnb FALSE 0.036 234.000 0.000 NA   NA
 2020092 2020093 SFV_1300 SFV_1301 rnb yciW FALSE 0.435 68.000 0.105 NA   NA
 2020093 2020094 SFV_1301 SFV_1302 yciW fabI FALSE 0.206 144.000 0.057 NA   NA
 2020094 2020095 SFV_1302 SFV_1303 fabI ycjD FALSE 0.012 368.000 0.000 1.000   NA
 2020095 2020096 SFV_1303 SFV_1304 ycjD sapF FALSE 0.248 71.000 0.000 1.000   NA
 2020096 2020097 SFV_1304 SFV_1305 sapF sapD TRUE 0.998 2.000 0.684 0.015 Y NA
 2020097 2020098 SFV_1305 SFV_1306 sapD sapC TRUE 0.997 0.000 0.667 1.000 Y NA
 2020098 2020099 SFV_1306 SFV_1307 sapC sapB TRUE 0.989 -13.000 0.284 0.053 Y NA
 2020099 2020100 SFV_1307 SFV_1308 sapB sapA TRUE 0.979 -3.000 0.264 0.053 N NA
 2020100 2020101 SFV_1308 SFV_1309 sapA ymjA FALSE 0.016 313.000 0.000 NA   NA
 2020101 2020102 SFV_1309 SFV_1310 ymjA ycjJ FALSE 0.160 134.000 0.000 NA   NA
 2020102 2020103 SFV_1310 SFV_1311 ycjJ   FALSE 0.141 303.000 0.000 1.000 Y NA
 2020104 2020105 SFV_1312 SFV_1313 ycjL ycjC FALSE 0.082 197.000 0.046 NA   NA
 2020105 2020106 SFV_1313 SFV_1314 ycjC aldH FALSE 0.123 150.000 0.040 NA N NA
 2020106 2020107 SFV_1314 SFV_1315 aldH ordL TRUE 0.989 2.000 0.500 0.029 N NA
 2020107 2020108 SFV_1315 SFV_1316 ordL goaG TRUE 0.891 38.000 0.100 1.000 Y NA
 2020110 2020111 SFV_1318 SFV_1319 pspA pspB TRUE 0.925 54.000 0.739 NA   NA
 2020111 2020112 SFV_1319 SFV_1320 pspB pspC TRUE 0.994 0.000 0.913 NA   NA
 2020112 2020113 SFV_1320 SFV_1321 pspC pspD TRUE 0.937 -3.000 0.167 NA   NA
 2020113 2020114 SFV_1321 SFV_1322 pspD pspE TRUE 0.617 43.000 0.133 NA   NA
 2020114 1604297 SFV_1322 SFV_1323 pspE ycjM FALSE 0.072 185.000 0.000 NA   NA
 1604297 2020115 SFV_1323 SFV_1324 ycjM insB FALSE 0.401 -1105.000 0.000 NA   NA
 2020115 1604299 SFV_1324 SFV_1326 insB   FALSE 0.004 614.000 0.000 NA   NA
 1604299 2020116 SFV_1326 SFV_1327   ycjO FALSE 0.495 21.000 0.000 NA   NA
 2020116 2020117 SFV_1327 SFV_1328 ycjO ycjP TRUE 0.997 -13.000 0.805 0.053 Y NA
 2020117 2020118 SFV_1328 SFV_1329 ycjP ycjQ TRUE 0.799 31.000 0.205 1.000 N NA
 2020118 1604303 SFV_1329 SFV_1330 ycjQ   FALSE 0.526 18.000 0.000 NA   NA
 1604303 1604304 SFV_1330 SFV_1331   ycjS FALSE 0.223 67.000 0.000 NA   NA
 1604304 2020119 SFV_1331 SFV_1332 ycjS ycjT TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 2020119 2020120 SFV_1332 SFV_1333 ycjT ycjU TRUE 0.811 -3.000 0.000 1.000   NA
 2020120 2020121 SFV_1333 SFV_1334 ycjU ycjV TRUE 0.795 14.000 0.103 1.000   NA
 2020121 1604308 SFV_1334 SFV_1335 ycjV ompG FALSE 0.059 198.000 0.000 NA   NA
 2020123 2020124 SFV_1337 SFV_1338 ycjX ycjF TRUE 0.992 -3.000 0.791 NA   NA
 2020124 2020125 SFV_1338 SFV_1339 ycjF tyrR FALSE 0.321 148.000 0.137 NA   NA
 2020128 2020129 SFV_1342 SFV_1343 ycjI   FALSE 0.037 231.000 0.000 1.000 N NA
 2020129 2020130 SFV_1343 SFV_1344     FALSE 0.526 18.000 0.000 NA   NA
 2020132 2020133 SFV_1346 SFV_1347     TRUE 0.939 0.000 0.000 0.001   NA
 2020133 2020134 SFV_1347 SFV_1348     FALSE 0.005 620.000 0.000 1.000   NA
 2020134 2020135 SFV_1348 SFV_1349     TRUE 0.782 141.000 0.182 1.000 Y NA
 2020136 2020137 SFV_1350 SFV_1351     FALSE 0.146 301.000 0.000 1.000 Y NA
 2020138 2020139 SFV_1352 SFV_1353     TRUE 0.905 -42.000 0.000 1.000 Y NA
 2020140 2020141 SFV_1354 SFV_1355     TRUE 0.673 7.000 0.000 NA   NA
 2020141 2020142 SFV_1355 SFV_1356     FALSE 0.006 495.000 0.000 NA   NA
 2020142 2020143 SFV_1356 SFV_1357     FALSE 0.208 93.000 0.000 NA   NA
 2020143 2020144 SFV_1357 SFV_1358     FALSE 0.010 364.000 0.000 NA   NA
 2020144 2020145 SFV_1358 SFV_1359     TRUE 0.783 0.000 0.000 NA   NA
 2020147 2020148 SFV_1361 SFV_1362     TRUE 0.991 0.000 0.667 NA   NA
 2020148 2020149 SFV_1362 SFV_1363     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 2020149 1604337 SFV_1363 SFV_1364     FALSE 0.068 190.000 0.000 NA   NA
 1604337 1604338 SFV_1364 SFV_1365     TRUE 0.750 2.000 0.000 NA   NA
 1604338 1604339 SFV_1365 SFV_1366     TRUE 0.735 3.000 0.000 NA   NA
 1604339 1604340 SFV_1366 SFV_1367     TRUE 0.713 4.000 0.000 NA   NA
 1604340 2020150 SFV_1367 SFV_1368     FALSE 0.191 115.000 0.000 NA   NA
 2020152 2020153 SFV_1370 SFV_1371 insB   FALSE 0.341 208.000 0.000 1.000 Y NA
 2020153 2020154 SFV_1371 SFV_1372     FALSE 0.425 28.000 0.000 NA   NA
 2020154 2020155 SFV_1372 SFV_1373     FALSE 0.059 197.000 0.000 NA   NA
 2020155 2020156 SFV_1373 SFV_1374     FALSE 0.462 24.000 0.000 NA   NA
 2020156 2020157 SFV_1374 SFV_1375     FALSE 0.469 -49.000 0.000 NA   NA
 2020158 2020159 SFV_1376 SFV_1377 sitD sitC TRUE 0.998 -3.000 0.525 0.005 Y NA
 2020159 2020160 SFV_1377 SFV_1378 sitC sitB TRUE 0.948 171.000 0.857 0.081 Y NA
 2020160 2020161 SFV_1378 SFV_1379 sitB sitA TRUE 0.998 0.000 0.894 1.000 Y NA
 2020161 2020162 SFV_1379 SFV_1380 sitA   FALSE 0.008 451.000 0.000 1.000   NA
 2020162 2020163 SFV_1380 SFV_1381     TRUE 0.783 0.000 0.000 NA   NA
 2020164 2020165 SFV_1382 SFV_1383 insB   FALSE 0.112 391.000 0.000 0.075 Y NA
 2020165 2020166 SFV_1383 SFV_1384     TRUE 0.969 -3.000 0.000 NA Y NA
 2020166 2020167 SFV_1384 SFV_1385     TRUE 0.901 20.000 0.000 NA Y NA
 2020167 2020168 SFV_1385 SFV_1386     FALSE 0.026 259.000 0.000 NA   NA
 1604361 2020170 SFV_1388 SFV_1389 pphA   FALSE 0.413 -813.000 0.000 NA   NA
 2020170 2020171 SFV_1389 SFV_1390     TRUE 0.782 141.000 0.182 1.000 Y NA
 2020172 2020173 SFV_1391 SFV_1392     TRUE 0.924 21.000 0.353 NA   NA
 2020173 2020174 SFV_1392 SFV_1393   yebU FALSE 0.411 118.000 0.121 NA   NA
 2020174 2020175 SFV_1393 SFV_1394 yebU   TRUE 0.803 74.000 0.420 NA   NA
 2020175 2020176 SFV_1394 SFV_1395     FALSE 0.350 46.000 0.037 NA   NA
 2020176 2020177 SFV_1395 SFV_1396     TRUE 0.978 -37.000 0.840 NA   NA
 2020178 2020179 SFV_1397 SFV_1398   proQ TRUE 0.761 97.000 0.081 NA Y NA
 2020179 2020180 SFV_1398 SFV_1399 proQ prc TRUE 0.903 20.000 0.304 NA N NA
 2020180 2020181 SFV_1399 SFV_1400 prc htpX FALSE 0.192 192.000 0.042 0.021 N NA
 2020183 2020184 SFV_1402 SFV_1403     FALSE 0.005 541.000 0.000 NA   NA
 2020184 2020185 SFV_1403 SFV_1404     TRUE 0.837 75.000 0.500 NA   NA
 2020185 2020186 SFV_1404 SFV_1405   cspC FALSE 0.003 826.000 0.000 NA   NA
 2020186 2020187 SFV_1405 SFV_1406 cspC yebH FALSE 0.129 166.000 0.038 1.000   NA
 2020188 2020189 SFV_1407 SFV_1408   insB FALSE 0.043 220.000 0.000 NA   NA
 2020189 2020190 SFV_1408 SFV_1409 insB   FALSE 0.042 223.000 0.000 NA   NA
 2020190 2020191 SFV_1409 SFV_1410   manZ TRUE 0.925 55.000 0.755 NA   NA
 2020191 2020192 SFV_1410 SFV_1411 manZ manY TRUE 0.997 13.000 0.939 0.010 Y NA
 2020192 2020193 SFV_1411 SFV_1412 manY manX TRUE 0.836 63.000 0.000 0.010 Y NA
 2020195 2020196 SFV_1414 SFV_1415   sdaA TRUE 0.724 131.000 0.389 NA N NA
 2020196 2020197 SFV_1415 SFV_1416 sdaA yeaB FALSE 0.482 202.000 0.409 1.000   NA
 2020197 2020198 SFV_1416 SFV_1417 yeaB pabB TRUE 0.890 4.000 0.116 1.000   NA
 2020200 2020201 SFV_1419 SFV_1420     FALSE 0.011 356.000 0.000 NA   NA
 2020202 2020203 SFV_1421 SFV_1422   yeaZ FALSE 0.439 58.000 0.082 1.000 N NA
 2020203 2020204 SFV_1422 SFV_1423 yeaZ   FALSE 0.326 40.000 0.024 1.000 N NA
 2020204 2020205 SFV_1423 SFV_1424   fadD FALSE 0.293 172.000 0.169 1.000 N NA
 2020205 2020206 SFV_1424 SFV_1425 fadD rnd FALSE 0.446 70.000 0.115 1.000 N NA
 2020207 2020208 SFV_1426 SFV_1427 yeaX   TRUE 0.562 56.000 0.043 0.050   NA
 2020209 2020210 SFV_1428 SFV_1429     TRUE 0.782 141.000 0.182 1.000 Y NA
 2020211 2020212 SFV_1430 SFV_1431     FALSE 0.024 272.000 0.000 NA   NA
 2020213 2020214 SFV_1432 SFV_1433 insB yeaF FALSE 0.006 424.000 0.000 NA N NA
 2020214 2020215 SFV_1433 SFV_1434 yeaF   FALSE 0.340 90.000 0.067 NA   NA
 2020216 2020217 SFV_1435 SFV_1436 yeaD gapA TRUE 0.833 84.000 0.154 1.000 Y NA
 2020218 2020219 SFV_1437 SFV_1438 yeaA   TRUE 0.957 -3.000 0.216 NA   NA
 2020219 2020220 SFV_1438 SFV_1439     FALSE 0.010 370.000 0.000 NA   NA
 2020220 2020221 SFV_1439 SFV_1440     TRUE 0.854 27.000 0.250 1.000 N NA
 2020221 1604414 SFV_1440 SFV_1441   ydjJ FALSE 0.066 192.000 0.000 NA   NA
 1604414 2020222 SFV_1441 SFV_1442 ydjJ   FALSE 0.495 21.000 0.000 NA   NA
 2020222 2020223 SFV_1442 SFV_1443     TRUE 0.990 5.000 0.368 NA Y NA
 2020223 2020224 SFV_1443 SFV_1444     TRUE 0.931 10.000 0.269 NA N NA
 2020224 2020225 SFV_1444 SFV_1445     FALSE 0.440 173.000 0.269 1.000 N NA
 2020225 1604419 SFV_1445 SFV_1446   ydjE TRUE 0.578 13.000 0.000 NA   NA
 2020228 2020229 SFV_1449 SFV_1450 ydjB ansA TRUE 0.663 11.000 0.040 1.000 N NA
 2020229 2020230 SFV_1450 SFV_1451 ansA sppA FALSE 0.121 215.000 0.113 1.000 N NA
 2020231 2020232 SFV_1452 SFV_1453 ydjA selD FALSE 0.205 117.000 0.033 1.000 N NA
 2020232 2020233 SFV_1453 SFV_1454 selD topB FALSE 0.530 -52.000 0.041 1.000 N NA
 2020233 2020234 SFV_1454 SFV_1455 topB   FALSE 0.172 128.000 0.000 NA   NA
 2020234 2020235 SFV_1455 SFV_1456   insB FALSE 0.039 228.000 0.000 NA   NA
 1604434 2020240 SFV_1461 SFV_1462     FALSE 0.223 67.000 0.000 NA   NA
 2020240 1604436 SFV_1462 SFV_1463     TRUE 0.783 0.000 0.000 NA   NA
 1604436 2020241 SFV_1463 SFV_1464     TRUE 0.564 -27.000 0.000 NA   NA
 2020243 2020244 SFV_1466 SFV_1467   ynjA FALSE 0.280 55.000 0.032 NA   NA
 2020244 2020245 SFV_1467 SFV_1468 ynjA ydjZ TRUE 0.895 0.000 0.087 NA   NA
 2020245 2020246 SFV_1468 SFV_1469 ydjZ ydjY TRUE 0.832 18.000 0.174 NA   NA
 2020246 2020247 SFV_1469 SFV_1470 ydjY ydjX TRUE 0.838 5.000 0.083 NA   NA
 2020247 2020248 SFV_1470 SFV_1471 ydjX xthA FALSE 0.072 167.000 0.016 NA   NA
 1604445 2020249 SFV_1472 SFV_1473 cstC   TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 2020249 2020250 SFV_1473 SFV_1474     TRUE 0.943 -3.000 0.179 1.000 N NA
 2020250 1604448 SFV_1474 SFV_1475   astB TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 1604448 2020251 SFV_1475 SFV_1476 astB ydjS TRUE 0.695 -7.000 0.000 NA   NA
 2020251 2020252 SFV_1476 SFV_1477 ydjS spy FALSE 0.011 330.000 0.000 NA N NA
 2020252 2020253 SFV_1477 SFV_1478 spy   FALSE 0.147 140.000 0.028 NA   NA
 2020254 2020255 SFV_1479 SFV_1480   nadE FALSE 0.026 230.000 0.010 1.000 N NA
 2020256 2020257 SFV_1481 SFV_1482 osmE celA FALSE 0.022 299.000 0.000 1.000   NA
 2020257 2020258 SFV_1482 SFV_1483 celA celB TRUE 0.966 85.000 0.500 0.010 Y NA
 2020258 2020259 SFV_1483 SFV_1484 celB celC TRUE 0.995 -46.000 0.833 0.010 Y NA
 2020259 1604458 SFV_1484 SFV_1485 celC celD TRUE 0.609 11.000 0.000 NA   NA
 1604458 2020260 SFV_1485 SFV_1486 celD celF FALSE 0.198 105.000 0.000 NA   NA
 2020260 2020261 SFV_1486 SFV_1487 celF ydjC TRUE 0.973 13.000 0.429 0.016   NA
 2020263 1604463 SFV_1489 SFV_1490     FALSE 0.022 276.000 0.000 NA   NA
 1604464 2020264 SFV_1491 SFV_1493     FALSE 0.163 133.000 0.000 NA   NA
 2020264 2020265 SFV_1493 SFV_1494   yniC FALSE 0.175 163.000 0.068 NA   NA
 2020267 2020268 SFV_1496 SFV_1497     FALSE 0.197 106.000 0.000 NA   NA
 2020268 2020269 SFV_1497 SFV_1498   pfkB FALSE 0.200 101.000 0.000 NA   NA
 2020271 1604473 SFV_1500 SFV_1503     FALSE 0.245 61.000 0.000 NA   NA
 1604473 2020272 SFV_1503 SFV_1501   insB FALSE 0.397 -1132.000 0.000 NA   NA
 2020273 2020274 SFV_1502 SFV_1504   thrS FALSE 0.003 860.000 0.000 NA   NA
 2020274 2020275 SFV_1504 SFV_1505 thrS infC TRUE 0.847 112.000 0.186 1.000 Y NA
 2020275 2020276 SFV_1505 SFV_1506 infC rpmI TRUE 0.963 82.000 0.652 1.000 Y NA
 2020276 2020277 SFV_1506 SFV_1507 rpmI rplT TRUE 0.989 53.000 0.928 0.012 Y NA
 2020277 2020278 SFV_1507 SFV_1508 rplT pheM FALSE 0.174 127.000 0.000 NA   NA
 2020278 2020279 SFV_1508 SFV_1509 pheM pheS FALSE 0.069 189.000 0.000 NA   NA
 2020279 2020280 SFV_1509 SFV_1510 pheS pheT TRUE 0.995 15.000 0.574 0.001 Y NA
 2020280 2020281 SFV_1510 SFV_1511 pheT himA TRUE 0.931 5.000 0.208 1.000 N NA
 2020281 2020282 SFV_1511 SFV_1512 himA btuC FALSE 0.185 101.000 0.023 1.000 N NA
 2020282 2020283 SFV_1512 SFV_1513 btuC btuE FALSE 0.423 63.000 0.084 1.000 N NA
 2020283 2020284 SFV_1513 SFV_1514 btuE btuD TRUE 0.786 0.000 0.000 1.000 N NA
 2020284 2020285 SFV_1514 SFV_1515 btuD nlpC FALSE 0.178 78.000 0.000 NA N NA
 2020287 2020288 SFV_1517 SFV_1518     TRUE 0.642 10.000 0.031 NA   NA
 2020289 2020290 SFV_1519 SFV_1520 ydiE aroH FALSE 0.258 105.000 0.054 NA N NA
 2020290 2020291 SFV_1520 SFV_1521 aroH ydiA FALSE 0.346 157.000 0.165 1.000   NA
 2020293 2020294 SFV_1523 SFV_1524 ydiD ydiT FALSE 0.438 57.000 0.080 1.000 N NA
 2020294 2020295 SFV_1524 SFV_1525 ydiT ydiS TRUE 0.996 -3.000 0.400 0.050 Y NA
 2020295 2020296 SFV_1525 SFV_1526 ydiS ydiR TRUE 0.988 56.000 1.000 0.050 Y NA
 2020296 2020297 SFV_1526 SFV_1527 ydiR ydiQ TRUE 0.996 20.000 1.000 0.017 Y NA
 2020301 2020302 SFV_1531 SFV_1532     FALSE 0.006 519.000 0.000 1.000 N NA
 2020302 2020303 SFV_1532 SFV_1533     FALSE 0.015 334.000 0.000 1.000   NA
 2020303 2020304 SFV_1533 SFV_1534     TRUE 0.555 -28.000 0.000 NA   NA
 2020305 2020306 SFV_1535 SFV_1536 insB   FALSE 0.437 183.000 0.000 1.000 Y NA
 2020307 1604510 SFV_1537 SFV_1538     FALSE 0.003 1492.000 0.000 NA   NA
 1604510 1604511 SFV_1538 SFV_1539     FALSE 0.199 102.000 0.000 NA   NA
 1604511 1604512 SFV_1539 SFV_1540     FALSE 0.131 144.000 0.000 NA   NA
 1604512 2020308 SFV_1540 SFV_1541     TRUE 0.557 15.000 0.000 NA   NA
 2020308 2020309 SFV_1541 SFV_1542     FALSE 0.014 326.000 0.000 NA   NA
 2020309 2020310 SFV_1542 SFV_1543     FALSE 0.011 347.000 0.000 NA   NA
 2020310 2020311 SFV_1543 SFV_1544   relB FALSE 0.003 732.000 0.000 NA   NA
 2020311 2020312 SFV_1544 SFV_1545 relB   FALSE 0.108 327.000 0.000 NA Y NA
 2020312 2020313 SFV_1545 SFV_1546     TRUE 0.782 141.000 0.182 1.000 Y NA
 2020314 2020315 SFV_1547 SFV_1548   ydfI TRUE 0.687 89.000 0.250 1.000   NA
 2020316 2020317 SFV_1549 SFV_1550   ydfH FALSE 0.081 178.000 0.000 NA   NA
 2020317 2020318 SFV_1550 SFV_1551 ydfH ydfG FALSE 0.182 137.000 0.000 1.000   NA
 2020321 2020322 SFV_1554 SFV_1555 ydeI   FALSE 0.036 234.000 0.000 NA   NA
 2020322 2020323 SFV_1555 SFV_1556     FALSE 0.444 141.000 0.182 NA   NA
 2020324 2020325 SFV_1557 SFV_1558     FALSE 0.101 348.000 0.304 NA   NA
 1604532 2020327 SFV_1560 SFV_1561 speG   FALSE 0.381 35.000 0.000 NA   NA
 2020328 2020329 SFV_1562 SFV_1563   rspA FALSE 0.054 206.000 0.020 1.000   NA
 2020329 2020330 SFV_1563 SFV_1564 rspA   FALSE 0.213 77.000 0.000 1.000 N NA
 2020331 2020332 SFV_1565 SFV_1566     TRUE 0.548 -42.000 0.000 1.000   NA
 2020332 2020333 SFV_1566 SFV_1567   ydeW FALSE 0.024 289.000 0.000 1.000   NA
 2020334 2020335 SFV_1568 SFV_1569   ydeY TRUE 0.997 -6.000 0.818 1.000 Y NA
 2020335 2020336 SFV_1569 SFV_1570 ydeY ydeZ TRUE 0.998 0.000 0.788 0.052 Y NA
 2020336 1604543 SFV_1570 SFV_1571 ydeZ   TRUE 0.592 12.000 0.000 NA   NA
 1604543 2020337 SFV_1571 SFV_1572     FALSE 0.046 215.000 0.000 NA   NA
 2020337 2020338 SFV_1572 SFV_1573     TRUE 0.905 -42.000 0.000 1.000 Y NA
 2020338 2020339 SFV_1573 SFV_1574   yneB FALSE 0.452 25.000 0.000 1.000 N NA
 2020339 2020340 SFV_1574 SFV_1575 yneB   FALSE 0.510 24.000 0.000 1.000   NA
 2020340 2020341 SFV_1575 SFV_1576     FALSE 0.390 40.000 0.000 1.000   NA
 2020343 2020344 SFV_1578 SFV_1579     TRUE 0.578 13.000 0.000 NA   NA
 2020345 2020346 SFV_1580 SFV_1581 uxaB   FALSE 0.041 227.000 0.000 1.000 N NA
 2020346 2020347 SFV_1581 SFV_1582     FALSE 0.315 139.000 0.098 NA   NA
 2020347 2020348 SFV_1582 SFV_1583   yneH FALSE 0.459 29.000 0.037 NA   NA
 2020348 1604556 SFV_1583 SFV_1584 yneH   FALSE 0.210 76.000 0.000 NA   NA
 1604556 2020349 SFV_1584 SFV_1585     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 2020350 2020351 SFV_1586 SFV_1587 insB   FALSE 0.216 70.000 0.000 NA   NA
 2020351 2020352 SFV_1587 SFV_1588   ydeA FALSE 0.117 150.000 0.000 NA   NA
 2020354 2020355 SFV_1590 SFV_1591 marR marA TRUE 0.994 20.000 0.667 0.040 Y NA
 2020355 2020356 SFV_1591 SFV_1592 marA marB FALSE 0.398 32.000 0.000 NA   NA
 2020359 2020360 SFV_1595 SFV_1596     FALSE 0.444 141.000 0.182 NA   NA
 2020360 2020361 SFV_1596 SFV_1597     FALSE 0.033 239.000 0.000 NA   NA
 2020362 2020363 SFV_1598 SFV_1599     FALSE 0.431 74.000 0.000 0.073   NA
 2020363 2020364 SFV_1599 SFV_1600     FALSE 0.041 236.000 0.000 1.000   NA
 2020366 1604575 SFV_1601 SFV_1603     FALSE 0.187 118.000 0.000 NA   NA
 1604575 2020367 SFV_1603 SFV_1604     TRUE 0.609 11.000 0.000 NA   NA
 2020367 2020368 SFV_1604 SFV_1605     TRUE 0.973 2.000 0.333 1.000   NA
 2020368 1604578 SFV_1605 SFV_1606     FALSE 0.330 43.000 0.000 NA   NA
 1604578 2020369 SFV_1606 SFV_1607     FALSE 0.158 135.000 0.000 NA   NA
 2020370 2020371 SFV_1608 SFV_1609   mlc TRUE 0.788 125.000 0.455 1.000 N NA
 2020371 2020372 SFV_1609 SFV_1610 mlc ynfL TRUE 0.909 135.000 0.408 1.000 Y NA
 1604583 2020373 SFV_1611 SFV_1612 ynfM asr FALSE 0.008 397.000 0.000 NA   NA
 2020373 2020374 SFV_1612 SFV_1613 asr   FALSE 0.022 276.000 0.000 NA   NA
 2020375 2020376 SFV_1614 SFV_1615     TRUE 0.997 -13.000 0.869 0.076 Y NA
 2020378 2020379 SFV_1617 SFV_1618 pntB pntA TRUE 0.997 11.000 0.745 0.001 Y NA
 2020380 2020381 SFV_1619 SFV_1620     FALSE 0.210 186.000 0.143 NA   NA
 2020381 2020382 SFV_1620 SFV_1621   ydgB TRUE 0.663 37.000 0.140 1.000 N NA
 2020384 2020385 SFV_1623 SFV_1624 rstA   FALSE 0.049 225.000 0.000 1.000   NA
 2020385 2020386 SFV_1624 SFV_1625   rstB FALSE 0.194 179.000 0.000 0.087   NA
 2020386 2020387 SFV_1625 SFV_1626 rstB tus TRUE 0.619 76.000 0.200 1.000   NA
 2020388 2020389 SFV_1627 SFV_1628 fumC fumA TRUE 0.740 143.000 0.000 0.001 Y NA
 2020390 2020391 SFV_1629 SFV_1630 manA ydgA TRUE 0.895 101.000 0.778 NA   NA
 2020392 1604604 SFV_1631 SFV_1632 uidC uidB FALSE 0.350 39.000 0.000 NA   NA
 1604604 2020393 SFV_1632 SFV_1633 uidB uidA TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 2020393 2020394 SFV_1633 SFV_1634 uidA uidR FALSE 0.009 388.000 0.000 1.000 N NA
 2020394 1604607 SFV_1634 SFV_1636 uidR hdhA FALSE 0.038 229.000 0.000 NA   NA
 1604607 2020395 SFV_1636 SFV_1635 hdhA insB FALSE 0.414 -679.000 0.000 NA   NA
 2020395 2020396 SFV_1635 SFV_1637 insB malI FALSE 0.003 977.000 0.000 1.000 N NA
 2020397 2020398 SFV_1638 SFV_1639 malX malY TRUE 0.936 31.000 0.531 1.000 N NA
 2020398 2020399 SFV_1639 SFV_1640 malY add FALSE 0.448 104.000 0.132 1.000 N NA
 2020401 2020402 SFV_1642 SFV_1643     FALSE 0.446 86.000 0.120 NA   NA
 2020402 2020403 SFV_1643 SFV_1644     FALSE 0.494 77.000 0.148 NA   NA
 2020403 2020404 SFV_1644 SFV_1645     TRUE 0.998 0.000 0.564 0.049 Y NA
 2020404 2020405 SFV_1645 SFV_1646     TRUE 0.996 -7.000 0.537 0.017 Y NA
 2020405 2020406 SFV_1646 SFV_1647   ydgO TRUE 0.998 1.000 0.814 0.049 Y NA
 2020406 2020407 SFV_1647 SFV_1648 ydgO   TRUE 0.998 4.000 0.924 0.049 Y NA
 2020407 2020408 SFV_1648 SFV_1649   ydgQ TRUE 0.998 4.000 0.908 0.049 Y NA
 2020408 2020409 SFV_1649 SFV_1650 ydgQ nth TRUE 0.911 0.000 0.109 1.000 N NA
 2020409 2020410 SFV_1650 SFV_1651 nth ydgR FALSE 0.004 611.000 0.000 1.000 N NA
 2020410 2020411 SFV_1651 SFV_1652 ydgR gst TRUE 0.746 105.000 0.344 1.000 N NA
 2020412 2020413 SFV_1653 SFV_1654 pdxY tyrS FALSE 0.296 62.000 0.041 1.000 N NA
 2020413 2020414 SFV_1654 SFV_1655 tyrS pdxH FALSE 0.251 129.000 0.054 1.000 N NA
 2020414 2020415 SFV_1655 SFV_1656 pdxH ydhA FALSE 0.307 59.000 0.034 1.000   NA
 2020415 2020416 SFV_1656 SFV_1657 ydhA   TRUE 0.532 22.000 0.000 1.000   NA
 2020416 2020417 SFV_1657 SFV_1658     TRUE 0.891 24.000 0.000 1.000 Y NA
 2020417 2020418 SFV_1658 SFV_1659     FALSE 0.036 220.000 0.000 NA N NA
 2020421 2020422 SFV_1662 SFV_1663     TRUE 0.974 -6.000 0.412 NA   NA
 2020422 2020423 SFV_1663 SFV_1664     TRUE 0.783 0.000 0.000 NA   NA
 2020423 2020424 SFV_1664 SFV_1665     FALSE 0.087 172.000 0.000 NA   NA
 2020425 2020426 SFV_1666 SFV_1667 sodC   FALSE 0.258 81.000 0.033 1.000   NA
 2020426 2020427 SFV_1667 SFV_1669     FALSE 0.373 49.000 0.045 NA   NA
 2020428 2020429 SFV_1668 SFV_1670   nemA TRUE 0.881 37.000 0.362 1.000 N NA
 2020429 2020430 SFV_1670 SFV_1671 nemA gloA FALSE 0.314 81.000 0.057 1.000 N NA
 2020430 2020431 SFV_1671 SFV_1672 gloA rnt FALSE 0.453 103.000 0.136 1.000 N NA
 2020431 2020432 SFV_1672 SFV_1673 rnt lhr FALSE 0.396 132.000 0.000 0.013   NA
 2020432 2020433 SFV_1673 SFV_1674 lhr   FALSE 0.465 -55.000 0.030 NA   NA
 2020434 2020435 SFV_1675 SFV_1676   ydhD FALSE 0.004 611.000 0.000 NA N NA
 2020436 2020437 SFV_1677 SFV_1678 ydhO sodB FALSE 0.137 128.000 0.015 1.000 N NA
 2020441 2020442 SFV_1682 SFV_1683 ydhC cfa FALSE 0.020 291.000 0.000 1.000 N NA
 1604659 1604660 SFV_1687 SFV_1688     TRUE 0.693 5.000 0.000 NA   NA
 1604660 2020446 SFV_1688 SFV_1689     FALSE 0.196 108.000 0.000 NA   NA
 2020446 2020447 SFV_1689 SFV_1690     FALSE 0.177 126.000 0.000 NA   NA
 2020448 2020449 SFV_1691 SFV_1692   ydhU TRUE 0.724 52.000 0.222 NA   NA
 2020449 2020450 SFV_1692 SFV_1693 ydhU   TRUE 0.997 -3.000 0.444 0.049 Y NA
 2020450 2020451 SFV_1693 SFV_1694     TRUE 0.686 64.000 0.235 NA   NA
 2020451 2020452 SFV_1694 SFV_1695     TRUE 0.977 4.000 0.458 NA   NA
 2020452 2020453 SFV_1695 SFV_1696     TRUE 0.648 326.000 0.600 0.016 Y NA
 2020453 2020454 SFV_1696 SFV_1697     FALSE 0.006 457.000 0.000 NA   NA
 2020455 2020456 SFV_1698 SFV_1699 insB pykF FALSE 0.013 333.000 0.000 1.000 N NA
 2020456 2020457 SFV_1699 SFV_1700 pykF lpp FALSE 0.016 312.000 0.000 1.000 N NA
 2020458 2020459 SFV_1701 SFV_1702 ynhG ynhA FALSE 0.213 149.000 0.069 NA   NA
 2020459 2020460 SFV_1702 SFV_1703 ynhA   TRUE 0.875 13.000 0.183 NA   NA
 2020460 2020461 SFV_1703 SFV_1704   ynhC TRUE 0.951 -3.000 0.193 1.000 N NA
 2020461 2020462 SFV_1704 SFV_1705 ynhC ynhD TRUE 0.945 79.000 0.482 1.000 Y NA
 2020462 2020463 SFV_1705 SFV_1706 ynhD ynhE TRUE 0.991 10.000 0.466 1.000 Y NA
 2020463 2020464 SFV_1706 SFV_1707 ynhE ydiC TRUE 0.709 9.000 0.041 NA   NA
 2020464 2020465 SFV_1707 SFV_1708 ydiC   FALSE 0.005 548.000 0.000 NA   NA
 2020465 2020466 SFV_1708 SFV_1709     TRUE 0.535 19.000 0.032 NA   NA
 2020466 2020467 SFV_1709 SFV_1710   ydiJ TRUE 0.912 -3.000 0.129 NA N NA
 2020468 2020469 SFV_1711 SFV_1712     FALSE 0.008 401.000 0.000 NA   NA
 2020469 1604685 SFV_1712 SFV_1713     FALSE 0.200 100.000 0.000 NA   NA
 1604685 2020470 SFV_1713 SFV_1714   insB FALSE 0.406 -921.000 0.000 NA   NA
 2020470 2020471 SFV_1714 SFV_1715 insB   FALSE 0.004 712.000 0.000 1.000 N NA
 2020473 2020474 SFV_1717 SFV_1718 insB ydiB FALSE 0.436 27.000 0.000 1.000 N NA
 2020474 2020475 SFV_1718 SFV_1719 ydiB aroD TRUE 0.913 31.000 0.113 1.000 Y NA
 2020477 2020478 SFV_1721 SFV_1722     TRUE 0.735 3.000 0.000 NA   NA
 2020478 2020479 SFV_1722 SFV_1723     TRUE 0.942 52.000 0.600 0.046   NA
 2020479 1604696 SFV_1723 SFV_1724   yddA FALSE 0.020 291.000 0.000 NA   NA
 2020481 2020482 SFV_1726 SFV_1727 insB yddB FALSE 0.006 487.000 0.000 1.000 N NA
 2020482 1604700 SFV_1727 SFV_1728 yddB pqqL FALSE 0.261 57.000 0.000 NA   NA
 1604700 2020483 SFV_1728 SFV_1729 pqqL insB FALSE 0.389 -1749.000 0.000 NA   NA
 2020483 2020484 SFV_1729 SFV_1730 insB gadB FALSE 0.002 2172.000 0.000 1.000 N NA
 2020484 2020485 SFV_1730 SFV_1731 gadB xasA TRUE 0.640 156.000 0.103 1.000 Y NA
 2020485 2020486 SFV_1731 SFV_1732 xasA   FALSE 0.195 131.000 0.000 1.000   NA
 2020486 2020487 SFV_1732 SFV_1733     FALSE 0.011 377.000 0.000 1.000   NA
 2020487 2020488 SFV_1733 SFV_1734     FALSE 0.335 42.000 0.000 NA   NA
 2020488 2020489 SFV_1734 SFV_1735     FALSE 0.027 258.000 0.000 NA   NA
 2020489 2020490 SFV_1735 SFV_1736     FALSE 0.505 -55.000 0.000 1.000   NA
 2020490 2020491 SFV_1736 SFV_1737     TRUE 0.993 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 2020491 2020492 SFV_1737 SFV_1738     TRUE 0.990 -7.000 0.219 0.003 Y NA
 2020493 2020494 SFV_1739 SFV_1740 osmC insB FALSE 0.087 173.000 0.000 1.000 N NA
 2020495 2020496 SFV_1741 SFV_1742   sfcA FALSE 0.340 41.000 0.000 NA   NA
 2020496 1604715 SFV_1742 SFV_1743 sfcA adhP FALSE 0.198 104.000 0.000 NA   NA
 1604715 2020497 SFV_1743 SFV_1744 adhP yddM FALSE 0.220 68.000 0.000 NA   NA
 2020498 2020499 SFV_1745 SFV_1746 fdnI fdnH TRUE 0.994 -7.000 0.333 0.002 Y NA
 2020499 2020500 SFV_1746 SFV_1747 fdnH fdnG TRUE 0.992 13.000 0.429 0.002 Y NA
 2020503 2020504 SFV_1750 SFV_1751     FALSE 0.238 63.000 0.000 NA   NA
 2020504 2020505 SFV_1751 SFV_1752     FALSE 0.089 170.000 0.000 NA   NA
 2020505 2020506 SFV_1752 SFV_1753     FALSE 0.195 110.000 0.000 NA   NA
 2020508 2020509 SFV_1755 SFV_1756 insB narU FALSE 0.006 458.000 0.000 1.000 N NA
 2020509 2020510 SFV_1756 SFV_1757 narU narZ TRUE 0.859 82.000 0.556 1.000 N NA
 2020510 2020511 SFV_1757 SFV_1758 narZ narY TRUE 0.996 -3.000 0.833 0.001   NA
 2020511 2020512 SFV_1758 SFV_1759 narY   FALSE 0.427 35.000 0.000 1.000   NA
 2020512 2020513 SFV_1759 SFV_1760     FALSE 0.223 114.000 0.000 1.000   NA
 2020514 2020515 SFV_1761 SFV_1762   yncB FALSE 0.118 162.000 0.000 1.000   NA
 2020515 2020516 SFV_1762 SFV_1763 yncB   FALSE 0.196 130.000 0.000 1.000   NA
 2020516 2020517 SFV_1763 SFV_1764     TRUE 0.905 -42.000 0.000 1.000 Y NA
 1604737 2020518 SFV_1765 SFV_1766     FALSE 0.421 -364.000 0.000 NA   NA
 2020519 2020520 SFV_1767 SFV_1768     FALSE 0.212 86.000 0.000 NA   NA
 2020520 2020521 SFV_1768 SFV_1769     FALSE 0.004 617.000 0.000 NA   NA
 2020521 2020522 SFV_1769 SFV_1770     FALSE 0.059 210.000 0.000 1.000   NA
 2020522 2020523 SFV_1770 SFV_1771     TRUE 0.855 22.000 0.216 1.000 N NA
 2020523 1604744 SFV_1771 SFV_1772     TRUE 0.659 -10.000 0.000 NA   NA
 2020525 2020526 SFV_1774 SFV_1775     FALSE 0.005 592.000 0.000 NA   NA
 2020526 2020527 SFV_1775 SFV_1776   tehB FALSE 0.040 303.000 0.088 NA   NA
 2020527 2020528 SFV_1776 SFV_1777 tehB tehA TRUE 0.946 -3.000 0.175 1.000   NA
 2020530 2020531 SFV_1779 SFV_1780 rimL ydcH FALSE 0.226 63.000 0.026 NA   NA
 2020531 2020532 SFV_1780 SFV_1781 ydcH ydcG FALSE 0.140 140.000 0.026 NA   NA
 2020532 2020533 SFV_1781 SFV_1782 ydcG   FALSE 0.028 255.000 0.000 NA   NA
 2020537 2020538 SFV_1786 SFV_1787     TRUE 0.782 141.000 0.182 1.000 Y NA
 2020538 2020539 SFV_1787 SFV_1788   ydcA FALSE 0.005 596.000 0.000 NA   NA
 2020539 2020540 SFV_1788 SFV_1789 ydcA cybB FALSE 0.031 245.000 0.000 NA   NA
 2020542 2020543 SFV_1791 SFV_1792 aldA   FALSE 0.020 305.000 0.040 NA   NA
 2020547 2020548 SFV_1796 SFV_1797     TRUE 0.782 141.000 0.182 1.000 Y NA
 2020549 2020550 SFV_1799 SFV_1800     TRUE 0.544 16.000 0.000 NA   NA
 2020550 2020551 SFV_1800 SFV_1801     FALSE 0.490 173.000 0.179 0.002   NA
 2020551 2020552 SFV_1801 SFV_1802   ydbD FALSE 0.088 171.000 0.000 NA   NA
 2020554 2020555 SFV_1804 SFV_1805 hslJ ldhA FALSE 0.170 99.000 0.000 NA N NA
 2020556 2020557 SFV_1806 SFV_1807 ydbH ynbE TRUE 0.874 -3.000 0.068 NA   NA
 2020559 1604782 SFV_1809 SFV_1810 insB hslJ TRUE 0.750 2.000 0.000 NA   NA
 1604782 2020560 SFV_1810 SFV_1811 hslJ ydbK FALSE 0.006 537.000 0.000 NA   NA
 2020560 1604784 SFV_1811 SFV_1812 ydbK   FALSE 0.010 367.000 0.000 NA   NA
 1604784 2020561 SFV_1812 SFV_1813   ynaF FALSE 0.218 69.000 0.000 NA   NA
 2020561 2020562 SFV_1813 SFV_1814 ynaF ydaO FALSE 0.069 176.000 0.000 NA N NA
 2020563 2020564 SFV_1815 SFV_1816 dbpA   FALSE 0.006 478.000 0.000 1.000 N NA
 2020566 2020567 SFV_1818 SFV_1819 ydaL   FALSE 0.003 739.000 0.000 NA   NA
 2020567 2020568 SFV_1819 SFV_1820     TRUE 0.973 0.000 0.293 1.000   NA
 2020571 2020572 SFV_1823 SFV_1824   ogt FALSE 0.005 544.000 0.000 1.000 N NA
 2020572 2020573 SFV_1824 SFV_1825 ogt fnr FALSE 0.062 195.000 0.000 1.000 N NA
 2020573 2020574 SFV_1825 SFV_1826 fnr ydaA TRUE 0.921 152.000 0.619 1.000 Y NA
 2020575 2020576 SFV_1827 SFV_1828 ynaJ   FALSE 0.057 200.000 0.000 NA   NA
 2020576 2020577 SFV_1828 SFV_1829     FALSE 0.146 301.000 0.000 1.000 Y NA
 2020579 1604804 SFV_1831 SFV_1832   ycjZ FALSE 0.015 316.000 0.000 NA   NA
 2020580 2020581 SFV_1833 SFV_1834     TRUE 0.782 141.000 0.182 1.000 Y NA
 2020581 1604807 SFV_1834 SFV_1835   recE FALSE 0.324 44.000 0.000 NA   NA
 1604807 2020582 SFV_1835 SFV_1836 recE   TRUE 0.590 -22.000 0.000 NA   NA
 2020582 2020583 SFV_1836 SFV_1837     FALSE 0.379 84.000 0.083 NA   NA
 2020583 2020584 SFV_1837 SFV_1838     FALSE 0.012 340.000 0.000 NA   NA
 2020584 2020585 SFV_1838 SFV_1839     TRUE 0.782 141.000 0.182 1.000 Y NA
 2020585 2020586 SFV_1839 SFV_1840     FALSE 0.032 364.000 0.000 0.036   NA
 2020587 2020588 SFV_1841 SFV_1842     TRUE 0.977 13.000 0.704 NA   NA
 2020588 2020589 SFV_1842 SFV_1843     TRUE 0.986 4.000 0.613 1.000   NA
 2020590 2020591 SFV_1844 SFV_1845 holE   FALSE 0.083 333.000 0.222 1.000   NA
 2020591 2020592 SFV_1845 SFV_1846     TRUE 0.946 24.000 0.500 1.000   NA
 2020593 2020594 SFV_1847 SFV_1848 ptrB yebE FALSE 0.116 209.000 0.092 NA   NA
 2020594 2020595 SFV_1848 SFV_1849 yebE yebF FALSE 0.013 327.000 0.028 NA   NA
 2020595 1604822 SFV_1849 SFV_1850 yebF yebG FALSE 0.269 55.000 0.000 NA   NA
 2020597 2020598 SFV_1852 SFV_1853 eda edd TRUE 0.976 37.000 0.523 1.000 Y NA
 2020598 2020599 SFV_1853 SFV_1854 edd zwf FALSE 0.277 235.000 0.041 1.000 Y NA
 2020600 2020601 SFV_1855 SFV_1856 yebK pykA FALSE 0.297 128.000 0.071 1.000 N NA
 2020602 2020603 SFV_1857 SFV_1858 msbB yebA TRUE 0.915 66.000 0.299 1.000 Y NA
 2020603 2020604 SFV_1858 SFV_1860 yebA yebL TRUE 0.796 16.000 0.131 1.000 N NA
 2020605 2020606 SFV_1859 SFV_1861 yebM yebI TRUE 0.998 -3.000 0.755 0.078 Y NA
 2020607 2020608 SFV_1862 SFV_1863 ruvB ruvA TRUE 0.996 9.000 0.549 0.001 Y NA
 2020610 2020611 SFV_1865 SFV_1866 ruvC yebC TRUE 0.840 35.000 0.277 NA   NA
 2020611 2020612 SFV_1866 SFV_1867 yebC ntpA FALSE 0.447 29.000 0.035 NA   NA
 2020612 2020613 SFV_1867 SFV_1868 ntpA aspS FALSE 0.291 88.000 0.050 1.000 N NA
 1604841 2020614 SFV_1869 SFV_1870 yecD   FALSE 0.390 -1570.000 0.000 NA   NA
 2020614 2020615 SFV_1870 SFV_1871     FALSE 0.004 729.000 0.000 NA   NA
 2020615 2020616 SFV_1871 SFV_1872   ipaH_3 FALSE 0.004 599.000 0.000 NA   NA
 2020617 2020618 SFV_1873 SFV_1874     FALSE 0.271 64.000 0.000 1.000   NA
 2020618 2020619 SFV_1874 SFV_1875     FALSE 0.220 68.000 0.000 NA   NA
 2020619 2020620 SFV_1875 SFV_1876     TRUE 0.863 61.000 0.500 NA   NA
 2020620 2020621 SFV_1876 SFV_1877     FALSE 0.531 -36.000 0.000 NA   NA
 2020621 2020622 SFV_1877 SFV_1878     FALSE 0.451 -64.000 0.000 NA   NA
 2020622 1604851 SFV_1878 SFV_1879     TRUE 0.783 0.000 0.000 NA   NA
 1604851 2020623 SFV_1879 SFV_1880     TRUE 0.555 -28.000 0.000 NA   NA
 2020623 2020624 SFV_1880 SFV_1881     TRUE 0.653 9.000 0.000 NA   NA
 2020624 2020625 SFV_1881 SFV_1882     FALSE 0.251 59.000 0.000 NA   NA
 2020625 2020626 SFV_1882 SFV_1883     TRUE 0.986 11.000 1.000 NA   NA
 2020626 2020627 SFV_1883 SFV_1884     TRUE 0.994 -3.000 1.000 NA   NA
 2020627 2020628 SFV_1884 SFV_1885     FALSE 0.356 38.000 0.000 NA   NA
 2020628 2020629 SFV_1885 SFV_1886     TRUE 0.592 12.000 0.000 NA   NA
 1604860 1604861 SFV_1888 SFV_1889     TRUE 0.713 4.000 0.000 NA   NA
 1604861 1604862 SFV_1889 SFV_1890     TRUE 0.735 3.000 0.000 NA   NA
 1604862 1604863 SFV_1890 SFV_1891     TRUE 0.750 2.000 0.000 NA   NA
 1604863 2020631 SFV_1891 SFV_1892     FALSE 0.082 177.000 0.000 NA   NA
 2020631 2020632 SFV_1892 SFV_1893     FALSE 0.199 102.000 0.000 NA   NA
 2020632 2020633 SFV_1893 SFV_1894     TRUE 0.783 0.000 0.000 NA   NA
 2020634 2020635 SFV_1895 SFV_1896     TRUE 0.782 141.000 0.182 1.000 Y NA
 2020636 2020637 SFV_1897 SFV_1898     TRUE 0.972 0.000 0.000 1.000 Y NA
 2020637 2020638 SFV_1898 SFV_1899     FALSE 0.285 52.000 0.000 NA   NA
 2020638 2020639 SFV_1899 SFV_1900     FALSE 0.202 97.000 0.000 NA   NA
 2020639 2020640 SFV_1900 SFV_1901     FALSE 0.003 1156.000 0.000 NA   NA
 2020640 2020641 SFV_1901 SFV_1902     FALSE 0.002 1800.000 0.000 NA   NA
 2020641 2020642 SFV_1902 SFV_1903     FALSE 0.002 2343.000 0.000 NA   NA
 2020643 2020644 SFV_1904 SFV_1905   yecN TRUE 0.550 53.000 0.126 NA   NA
 2020644 2020645 SFV_1905 SFV_1906 yecN yecO TRUE 0.555 41.000 0.089 NA   NA
 2020645 2020646 SFV_1906 SFV_1907 yecO yecP TRUE 0.973 -3.000 0.315 NA   NA
 2020647 2020648 SFV_1908 SFV_1909     TRUE 0.891 24.000 0.000 1.000 Y NA
 2020649 2020650 SFV_1911 SFV_1912 yecK cutC FALSE 0.009 388.000 0.000 1.000 N NA
 2020650 2020651 SFV_1912 SFV_1913 cutC yecM TRUE 0.718 14.000 0.057 1.000   NA
 2020652 2020653 SFV_1914 SFV_1915 argS yecT FALSE 0.082 177.000 0.000 NA   NA
 2020654 2020655 SFV_1916 SFV_1917     FALSE 0.211 82.000 0.000 NA   NA
 2020655 2020656 SFV_1917 SFV_1918     TRUE 0.783 0.000 0.000 NA   NA
 2020656 2020657 SFV_1918 SFV_1919   flhE FALSE 0.326 52.000 0.000 1.000   NA
 2020657 1604892 SFV_1919 SFV_1920 flhE flhA TRUE 0.783 0.000 0.000 NA   NA
 1604892 2020658 SFV_1920 SFV_1921 flhA flhB FALSE 0.285 52.000 0.000 NA   NA
 2020658 2020659 SFV_1921 SFV_1922 flhB   FALSE 0.004 629.000 0.000 1.000 N NA
 2020659 2020660 SFV_1922 SFV_1923     FALSE 0.146 301.000 0.000 1.000 Y NA
 2020661 2020662 SFV_1924 SFV_1925     FALSE 0.038 229.000 0.000 NA   NA
 2020662 2020663 SFV_1925 SFV_1926     FALSE 0.444 141.000 0.182 NA   NA
 2020664 2020665 SFV_1927 SFV_1928 cheZ cheY TRUE 0.937 11.000 0.000 1.000 Y NA
 2020665 2020666 SFV_1928 SFV_1929 cheY cheB TRUE 0.953 15.000 0.000 0.010 Y NA
 2020666 2020667 SFV_1929 SFV_1930 cheB cheR TRUE 0.964 3.000 0.000 1.000 Y NA
 2020667 2020668 SFV_1930 SFV_1931 cheR tap TRUE 0.961 19.000 0.188 1.000 Y NA
 2020668 2020669 SFV_1931 SFV_1932 tap tar TRUE 0.960 46.000 0.235 0.001 Y NA
 2020669 2020670 SFV_1932 SFV_1933 tar cheW TRUE 0.738 145.000 0.043 0.003 Y NA
 2020670 2020671 SFV_1933 SFV_1934 cheW cheA TRUE 0.990 21.000 0.447 0.002 Y NA
 2020671 2020672 SFV_1934 SFV_1935 cheA motB TRUE 0.997 5.000 0.913 1.000 Y NA
 2020672 2020673 SFV_1935 SFV_1936 motB motA TRUE 0.995 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 2020673 2020674 SFV_1936 SFV_1937 motA flhC TRUE 0.768 127.000 0.408 1.000   NA
 1604910 2020675 SFV_1938 SFV_1939 flhD yecG FALSE 0.003 771.000 0.000 NA   NA
 1604912 2020676 SFV_1940 SFV_1941 otsA otsB TRUE 0.544 -31.000 0.000 NA   NA
 2020676 2020677 SFV_1941 SFV_1942 otsB araH FALSE 0.508 167.000 0.037 1.000 Y NA
 2020677 2020678 SFV_1942 SFV_1943 araH araG FALSE 0.110 643.000 0.451 0.002   NA
 2020678 2020679 SFV_1943 SFV_1944 araG araF TRUE 0.956 70.000 0.917 0.002   NA
 2020683 2020684 SFV_1948 SFV_1949   ftn FALSE 0.088 171.000 0.000 NA   NA
 2020687 1604925 SFV_1952 SFV_1953 yecA   FALSE 0.060 196.000 0.000 NA   NA
 1604925 1604926 SFV_1953 SFV_1954     TRUE 0.578 13.000 0.000 NA   NA
 1604926 1604927 SFV_1954 SFV_1955     FALSE 0.269 55.000 0.000 NA   NA
 1604927 2020688 SFV_1955 SFV_1956   pgsA FALSE 0.113 152.000 0.000 NA   NA
 2020688 2020689 SFV_1956 SFV_1957 pgsA uvrC TRUE 0.707 57.000 0.227 1.000 N NA
 2020689 2020690 SFV_1957 SFV_1958 uvrC uvrY TRUE 0.608 63.000 0.086 0.021 N NA
 2020692 2020693 SFV_1960 SFV_1961 sdiA yecC FALSE 0.082 230.000 0.071 1.000   NA
 2020693 2020694 SFV_1961 SFV_1962 yecC yecS TRUE 0.985 -3.000 0.150 1.000 Y NA
 2020694 2020695 SFV_1962 SFV_1963 yecS yedO TRUE 0.933 15.000 0.050 1.000 Y NA
 2020695 2020696 SFV_1963 SFV_1964 yedO fliY TRUE 0.939 105.000 0.469 1.000 Y NA
 2020696 2020697 SFV_1964 SFV_1965 fliY fliZ TRUE 0.713 88.000 0.280 1.000   NA
 2020697 2020698 SFV_1965 SFV_1966 fliZ fliA TRUE 0.585 46.000 0.108 1.000   NA
 2020698 2020699 SFV_1966 SFV_1967 fliA fliC FALSE 0.045 195.000 0.012 1.000 N NA
 2020700 2020701 SFV_1968 SFV_1969 fliD fliS TRUE 0.980 25.000 0.284 0.002 Y NA
 2020701 2020702 SFV_1969 SFV_1970 fliS fliT TRUE 0.976 0.000 0.324 1.000   NA
 2020702 2020703 SFV_1970 SFV_1971 fliT amyA FALSE 0.460 78.000 0.115 1.000   NA
 2020705 2020706 SFV_1973 SFV_1974 yedE yedF TRUE 0.993 -3.000 0.844 NA   NA
 2020706 1604947 SFV_1974 SFV_1975 yedF yedK FALSE 0.197 107.000 0.000 NA   NA
 2020709 2020710 SFV_1978 SFV_1979 ybcM emrE FALSE 0.004 730.000 0.000 1.000 N NA
 2020710 2020711 SFV_1979 SFV_1980 emrE fliE FALSE 0.080 180.000 0.000 1.000 N NA
 1604953 2020712 SFV_1981 SFV_1982 fliF fliG FALSE 0.231 65.000 0.000 NA   NA
 2020712 2020713 SFV_1982 SFV_1983 fliG fliH TRUE 0.975 -7.000 0.000 0.003 Y NA
 2020713 2020714 SFV_1983 SFV_1984 fliH fliI TRUE 0.984 0.000 0.000 0.003 Y NA
 2020714 1604957 SFV_1984 SFV_1985 fliI fliJ FALSE 0.517 19.000 0.000 NA   NA
 1604957 2020715 SFV_1985 SFV_1986 fliJ fliK TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 2020715 2020716 SFV_1986 SFV_1987 fliK fliL TRUE 0.797 105.000 0.119 1.000 Y NA
 2020716 2020717 SFV_1987 SFV_1988 fliL fliM TRUE 0.996 -40.000 0.957 0.001 Y NA
 2020717 2020718 SFV_1988 SFV_1989 fliM fliN TRUE 0.991 -3.000 0.137 0.001 Y NA
 2020718 2020719 SFV_1989 SFV_1990 fliN fliO TRUE 0.994 3.000 0.443 1.000 Y NA
 2020719 2020720 SFV_1990 SFV_1991 fliO fliP TRUE 0.989 0.000 0.203 1.000 Y NA
 2020720 2020721 SFV_1991 SFV_1992 fliP fliQ TRUE 0.997 10.000 0.827 0.006 Y NA
 2020721 2020722 SFV_1992 SFV_1993 fliQ fliR TRUE 0.971 9.000 0.000 0.002 Y NA
 2020722 2020723 SFV_1993 SFV_1994 fliR rcsA FALSE 0.021 285.000 0.000 1.000 N NA
 2020725 1604969 SFV_1996 SFV_1997     FALSE 0.018 298.000 0.000 NA   NA
 2020726 2020727 SFV_1998 SFV_1999   yedI FALSE 0.003 642.000 0.008 NA   NA
 2020729 2020730 SFV_2001 SFV_2002 vsr dcm TRUE 0.935 -19.000 0.000 1.000 Y NA
 2020730 2020731 SFV_2002 SFV_2003 dcm yedJ FALSE 0.224 113.000 0.000 1.000   NA
 2020731 2020732 SFV_2003 SFV_2004 yedJ   FALSE 0.015 337.000 0.000 1.000   NA
 2020732 2020733 SFV_2004 SFV_2005     TRUE 0.772 57.000 0.000 1.000 Y NA
 2020735 2020736 SFV_2007 SFV_2008     TRUE 0.905 -42.000 0.000 1.000 Y NA
 2020739 2020740 SFV_2011 SFV_2012 insB yedU FALSE 0.313 46.000 0.000 NA   NA
 2020741 2020742 SFV_2013 SFV_2014 yedV yedW TRUE 0.999 0.000 0.857 0.001 Y NA
 2020743 1604988 SFV_2015 SFV_2016     FALSE 0.196 109.000 0.000 NA   NA
 1604988 2020744 SFV_2016 SFV_2017     TRUE 0.760 1.000 0.000 NA   NA
 2020744 2020745 SFV_2017 SFV_2018     FALSE 0.032 258.000 0.000 1.000   NA
 2020747 2020748 SFV_2020 SFV_2021   ipaH_4 FALSE 0.018 316.000 0.000 1.000   NA
 2020749 2020750 SFV_2022 SFV_2023     FALSE 0.132 143.000 0.000 NA   NA
 2020750 2020751 SFV_2023 SFV_2024     TRUE 0.782 141.000 0.182 1.000 Y NA
 2020751 2020752 SFV_2024 SFV_2025     TRUE 0.759 57.000 0.000 NA Y NA
 2020752 2020753 SFV_2025 SFV_2026     FALSE 0.081 178.000 0.000 NA   NA
 2020753 2020754 SFV_2026 SFV_2027     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 2020754 2020755 SFV_2027 SFV_2028     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 2020755 2020756 SFV_2028 SFV_2029     FALSE 0.201 99.000 0.000 NA   NA
 2020756 1605002 SFV_2029 SFV_2030     FALSE 0.019 293.000 0.000 NA   NA
 1605002 1605003 SFV_2030 SFV_2031     TRUE 0.713 4.000 0.000 NA   NA
 1605003 1605004 SFV_2031 SFV_2032     TRUE 0.735 3.000 0.000 NA   NA
 1605004 1605005 SFV_2032 SFV_2033     TRUE 0.750 2.000 0.000 NA   NA
 1605005 1605006 SFV_2033 SFV_2034     FALSE 0.432 27.000 0.000 NA   NA
 1605006 2020757 SFV_2034 SFV_2035     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 2020757 2020758 SFV_2035 SFV_2036     TRUE 0.760 1.000 0.000 NA   NA
 2020758 2020759 SFV_2036 SFV_2037     TRUE 0.544 16.000 0.000 NA   NA
 2020759 2020760 SFV_2037 SFV_2038     FALSE 0.003 1255.000 0.000 NA   NA
 2020762 2020763 SFV_2040 SFV_2041   insB FALSE 0.395 39.000 0.000 1.000   NA
 2020764 2020765 SFV_2042 SFV_2043     FALSE 0.182 122.000 0.000 NA   NA
 2020766 1605018 SFV_2045 SFV_2046     FALSE 0.200 101.000 0.000 NA   NA
 1605018 2020767 SFV_2046 SFV_2047     FALSE 0.004 675.000 0.000 NA   NA
 2020768 2020769 SFV_2048 SFV_2049     FALSE 0.146 301.000 0.000 1.000 Y NA
 1605022 2020770 SFV_2050 SFV_2051     FALSE 0.410 -825.000 0.000 NA   NA
 2020770 2020771 SFV_2051 SFV_2052     TRUE 0.782 141.000 0.182 1.000 Y NA
 2020771 2020772 SFV_2052 SFV_2053   amn FALSE 0.011 352.000 0.000 1.000 N NA
 2020772 2020773 SFV_2053 SFV_2054 amn   FALSE 0.012 343.000 0.000 NA   NA
 1605027 2020774 SFV_2055 SFV_2056     FALSE 0.007 410.000 0.000 NA   NA
 2020774 2020775 SFV_2056 SFV_2057     TRUE 0.942 -9.000 0.120 0.001   NA
 2020776 2020777 SFV_2059 SFV_2060 cbl nac TRUE 0.911 102.000 0.222 0.046 Y NA
 2020778 2020779 SFV_2062 SFV_2063 erfK cobT FALSE 0.192 62.000 0.015 NA   NA
 2020779 2020780 SFV_2063 SFV_2064 cobT cobS TRUE 0.968 12.000 0.056 0.003 Y NA
 2020780 2020781 SFV_2064 SFV_2065 cobS cobU TRUE 0.971 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 2020781 2020782 SFV_2065 SFV_2066 cobU   FALSE 0.003 997.000 0.000 NA   NA
 2020783 2020784 SFV_2067 SFV_2068     FALSE 0.140 141.000 0.000 NA   NA
 2020787 2020788 SFV_2071 SFV_2072 yeeD yeeE TRUE 0.952 14.000 0.419 NA   NA
 2020788 2020789 SFV_2072 SFV_2073 yeeE yeeF FALSE 0.036 233.000 0.000 NA   NA
 2020789 2020790 SFV_2073 SFV_2074 yeeF yeeY FALSE 0.048 213.000 0.000 1.000 N NA
 2020790 2020791 SFV_2074 SFV_2075 yeeY   FALSE 0.259 46.000 0.015 1.000 N NA
 2020791 2020792 SFV_2075 SFV_2076     FALSE 0.211 83.000 0.000 NA   NA
 2020792 2020793 SFV_2076 SFV_2077   insB FALSE 0.484 22.000 0.000 NA   NA
 2020793 2020794 SFV_2077 SFV_2078 insB yefM FALSE 0.032 228.000 0.000 NA N NA
 2020795 2020796 SFV_2079 SFV_2080 hisG hisD TRUE 0.987 6.000 0.171 0.002 Y NA
 2020796 2020797 SFV_2080 SFV_2081 hisD hisC TRUE 0.995 -3.000 0.294 0.002 Y NA
 2020797 2020798 SFV_2081 SFV_2082 hisC hisB TRUE 0.996 0.000 0.341 0.002 Y NA
 2020798 2020799 SFV_2082 SFV_2083 hisB hisH TRUE 0.991 0.000 0.128 0.002 Y NA
 2020799 2020800 SFV_2083 SFV_2084 hisH hisA TRUE 0.983 0.000 0.010 0.002 Y NA
 2020800 2020801 SFV_2084 SFV_2085 hisA hisF TRUE 0.960 -18.000 0.003 0.002 Y NA
 2020801 2020802 SFV_2085 SFV_2086 hisF hisI TRUE 0.996 -6.000 0.430 0.002 Y NA
 2020803 1605060 SFV_2087 SFV_2088 wzzB ugd FALSE 0.195 110.000 0.000 NA   NA
 1605060 2020804 SFV_2088 SFV_2089 ugd gnd FALSE 0.029 250.000 0.000 NA   NA
 2020804 2020805 SFV_2089 SFV_2090 gnd   FALSE 0.003 1117.000 0.000 NA   NA
 2020805 2020806 SFV_2090 SFV_2091   rfc FALSE 0.003 1500.000 0.000 NA   NA
 2020806 2020807 SFV_2091 SFV_2092 rfc rfbG FALSE 0.506 20.000 0.000 NA   NA
 2020807 2020808 SFV_2092 SFV_2093 rfbG rfbF TRUE 0.830 -7.000 0.077 NA   NA
 2020808 2020809 SFV_2093 SFV_2094 rfbF rfbE FALSE 0.102 159.000 0.000 NA   NA
 2020809 2020810 SFV_2094 SFV_2095 rfbE rfbC TRUE 0.591 16.000 0.000 1.000   NA
 2020810 2020811 SFV_2095 SFV_2096 rfbC rfbA TRUE 0.983 5.000 0.211 1.000 Y NA
 2020811 2020812 SFV_2096 SFV_2097 rfbA rfbD TRUE 0.875 59.000 0.053 0.002 Y NA
 2020812 2020813 SFV_2097 SFV_2098 rfbD rfbB TRUE 0.989 0.000 0.084 0.002 Y NA
 2020813 2020814 SFV_2098 SFV_2099 rfbB galF FALSE 0.084 373.000 0.000 1.000 Y NA
 2020814 1605072 SFV_2099 SFV_2100 galF wcaM FALSE 0.084 175.000 0.000 NA   NA
 1605072 2020815 SFV_2100 SFV_2101 wcaM wcaL TRUE 0.609 11.000 0.000 NA   NA
 2020815 2020816 SFV_2101 SFV_2102 wcaL wcaK TRUE 0.955 -3.000 0.095 0.009   NA
 2020816 2020817 SFV_2102 SFV_2103 wcaK wzxC FALSE 0.195 180.000 0.095 1.000   NA
 2020817 2020818 SFV_2103 SFV_2104 wzxC wcaJ TRUE 0.967 2.000 0.304 NA   NA
 2020818 1605077 SFV_2104 SFV_2105 wcaJ cpsG FALSE 0.028 254.000 0.000 NA   NA
 1605077 2020819 SFV_2105 SFV_2106 cpsG cpsB FALSE 0.064 193.000 0.000 NA   NA
 2020819 2020820 SFV_2106 SFV_2107 cpsB wcaI TRUE 0.786 120.000 0.123 1.000 Y NA
 2020820 2020821 SFV_2107 SFV_2108 wcaI wcaH TRUE 0.909 -3.000 0.108 1.000 N NA
 2020821 2020822 SFV_2108 SFV_2109 wcaH wcaG TRUE 0.958 0.000 0.217 1.000 N NA
 2020822 2020823 SFV_2109 SFV_2110 wcaG gmd TRUE 0.979 3.000 0.000 0.007 Y NA
 2020823 2020824 SFV_2110 SFV_2111 gmd wcaF FALSE 0.455 26.000 0.022 1.000   NA
 2020824 2020825 SFV_2111 SFV_2112 wcaF   TRUE 0.544 16.000 0.000 NA   NA
 2020827 2020828 SFV_2114 SFV_2115 wcaE wcaD TRUE 0.936 14.000 0.333 NA   NA
 2020828 2020829 SFV_2115 SFV_2116 wcaD wcaC TRUE 0.950 -25.000 0.400 NA   NA
 2020829 2020830 SFV_2116 SFV_2117 wcaC wcaB TRUE 0.966 -3.000 0.259 1.000 N NA
 2020830 2020831 SFV_2117 SFV_2118 wcaB wcaA TRUE 0.954 3.000 0.259 NA N NA
 2020831 2020832 SFV_2118 SFV_2119 wcaA   TRUE 0.701 93.000 0.000 NA Y NA
 2020832 2020833 SFV_2119 SFV_2120   wzb TRUE 0.738 3.000 0.000 1.000 N NA
 2020833 2020834 SFV_2120 SFV_2121 wzb wza TRUE 0.951 6.000 0.286 1.000 N NA
 2020836 2020837 SFV_2123 SFV_2124 asmA dcd TRUE 0.586 22.000 0.057 NA N NA
 2020837 2020838 SFV_2124 SFV_2125 dcd udk TRUE 0.794 92.000 0.098 1.000 Y NA
 2020838 2020839 SFV_2125 SFV_2126 udk   FALSE 0.004 708.000 0.000 1.000   NA
 2020840 2020841 SFV_2127 SFV_2128     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 2020841 2020842 SFV_2128 SFV_2129     TRUE 0.984 -3.000 0.455 NA   NA
 2020845 2020846 SFV_2133 SFV_2134     TRUE 0.784 2.000 0.000 1.000   NA
 2020846 2020847 SFV_2134 SFV_2135   yegN TRUE 0.747 0.000 0.000 NA N NA
 2020847 2020848 SFV_2135 SFV_2136 yegN   FALSE 0.216 70.000 0.000 NA   NA
 2020848 2020849 SFV_2136 SFV_2137   yegO TRUE 0.853 1.000 0.062 NA   NA
 2020849 2020850 SFV_2137 SFV_2138 yegO yegB TRUE 0.799 107.000 0.438 1.000 N NA
 2020850 2020851 SFV_2138 SFV_2139 yegB baeS TRUE 0.924 -3.000 0.139 1.000 N NA
 2020851 2020852 SFV_2139 SFV_2140 baeS baeR TRUE 0.997 -3.000 0.591 1.000 Y NA
 2020852 2020853 SFV_2140 SFV_2141 baeR   FALSE 0.190 152.000 0.062 NA   NA
 2020853 2020854 SFV_2141 SFV_2142   yegQ TRUE 0.578 6.000 0.008 NA   NA
 2020857 1605118 SFV_2145 SFV_2146 gatR gatD FALSE 0.198 105.000 0.000 NA   NA
 1605118 2020858 SFV_2146 SFV_2147 gatD gatC FALSE 0.303 48.000 0.000 NA   NA
 2020858 2020859 SFV_2147 SFV_2148 gatC gatB TRUE 0.976 4.000 0.000 0.009 Y NA
 2020859 1605121 SFV_2148 SFV_2149 gatB gatA FALSE 0.404 31.000 0.000 NA   NA
 1605121 2020860 SFV_2149 SFV_2150 gatA gatZ TRUE 0.633 10.000 0.000 NA   NA
 2020860 2020861 SFV_2150 SFV_2151 gatZ gatY TRUE 0.930 29.000 0.000 0.001 Y NA
 2020861 2020862 SFV_2151 SFV_2152 gatY   FALSE 0.237 308.000 0.000 0.001 Y NA
 2020863 1605126 SFV_2153 SFV_2154 yegT   TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 1605126 2020864 SFV_2154 SFV_2155     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 2020865 2020866 SFV_2156 SFV_2157 yegW yegX FALSE 0.306 48.000 0.000 1.000 N NA
 2020866 2020867 SFV_2157 SFV_2158 yegX thiD FALSE 0.234 65.000 0.000 1.000 N NA
 2020867 2020868 SFV_2158 SFV_2159 thiD thiM TRUE 0.984 -3.000 0.037 0.004 Y NA
 2020868 2020869 SFV_2159 SFV_2160 thiM yohL FALSE 0.042 223.000 0.000 NA   NA
 2020870 2020871 SFV_2161 SFV_2162 yohM   FALSE 0.044 219.000 0.000 NA   NA
 2020872 2020873 SFV_2163 SFV_2164 yehA yehB TRUE 0.544 16.000 0.000 NA   NA
 2020873 2020874 SFV_2164 SFV_2165 yehB yehC TRUE 0.995 16.000 1.000 1.000 Y NA
 2020874 2020875 SFV_2165 SFV_2166 yehC insB FALSE 0.255 59.000 0.000 1.000 N NA
 2020877 2020878 SFV_2168 SFV_2169 yehD mrp FALSE 0.003 836.000 0.000 1.000 N NA
 2020879 1605143 SFV_2170 SFV_2171 metG molR_1 FALSE 0.140 141.000 0.000 NA   NA
 1605143 2020880 SFV_2171 SFV_2172 molR_1   FALSE 0.418 -557.000 0.000 NA   NA
 2020880 2020881 SFV_2172 SFV_2173     FALSE 0.444 141.000 0.182 NA   NA
 2020881 1605146 SFV_2173 SFV_2174   molR_2 FALSE 0.003 792.000 0.000 NA   NA
 1605146 2020882 SFV_2174 SFV_2175 molR_2   FALSE 0.404 -934.000 0.000 NA   NA
 2020882 2020883 SFV_2175 SFV_2176     TRUE 0.633 10.000 0.000 NA   NA
 2020885 2020886 SFV_2178 SFV_2179   yehR FALSE 0.484 22.000 0.000 NA   NA
 2020887 2020888 SFV_2180 SFV_2181 yehS yehT TRUE 0.746 -10.000 0.051 NA   NA
 2020888 2020889 SFV_2181 SFV_2182 yehT yehU TRUE 0.999 -3.000 0.877 0.012 Y NA
 2020890 2020891 SFV_2183 SFV_2184     FALSE 0.008 398.000 0.000 NA   NA
 2020893 2020894 SFV_2186 SFV_2187   ipaH_5 FALSE 0.018 316.000 0.000 1.000   NA
 2020895 2020896 SFV_2188 SFV_2189     FALSE 0.469 -49.000 0.000 NA   NA
 2020896 2020897 SFV_2189 SFV_2190     FALSE 0.096 164.000 0.000 NA   NA
 2020897 2020898 SFV_2190 SFV_2191     TRUE 0.735 3.000 0.000 NA   NA
 2020899 2020900 SFV_2192 SFV_2193 insB   FALSE 0.034 238.000 0.000 1.000 N NA
 2020901 2020902 SFV_2194 SFV_2196 insB   FALSE 0.039 228.000 0.000 NA   NA
 2020904 2020905 SFV_2197 SFV_2198     FALSE 0.444 141.000 0.182 NA   NA
 2020906 1605172 SFV_2199 SFV_2200   yehV FALSE 0.210 75.000 0.000 NA   NA
 1605172 2020907 SFV_2200 SFV_2201 yehV   FALSE 0.416 -579.000 0.000 NA   NA
 2020907 2020908 SFV_2201 SFV_2202     TRUE 0.814 0.000 0.000 1.000   NA
 2020908 2020909 SFV_2202 SFV_2203     FALSE 0.005 558.000 0.000 NA   NA
 2020910 2020911 SFV_2204 SFV_2205 yehW yehX TRUE 0.994 5.000 0.542 1.000 Y NA
 2020911 2020912 SFV_2205 SFV_2206 yehX yehY TRUE 0.993 -7.000 0.489 1.000 Y NA
 2020912 2020913 SFV_2206 SFV_2207 yehY yehZ TRUE 0.985 7.000 0.521 0.049 N NA
 2020913 2020914 SFV_2207 SFV_2208 yehZ bglX FALSE 0.073 252.000 0.099 1.000 N NA
 2020916 2020917 SFV_2210 SFV_2211 pbpG yohC FALSE 0.248 174.000 0.145 NA   NA
 1605185 2020919 SFV_2213 SFV_2214 yohF yohG FALSE 0.279 53.000 0.000 NA   NA
 2020919 2020920 SFV_2214 SFV_2215 yohG yohI FALSE 0.005 588.000 0.000 1.000 N NA
 2020921 2020922 SFV_2216 SFV_2217 yohJ yohK TRUE 0.978 -3.000 0.340 1.000   NA
 2020922 2020923 SFV_2217 SFV_2218 yohK cdd FALSE 0.531 130.000 0.198 1.000 N NA
 2020923 2020924 SFV_2218 SFV_2219 cdd sanA FALSE 0.156 150.000 0.045 NA   NA
 2020924 2020925 SFV_2219 SFV_2220 sanA   TRUE 0.691 3.000 0.019 NA   NA
 2020925 2020926 SFV_2220 SFV_2221     FALSE 0.071 195.000 0.036 NA   NA
 2020926 1605194 SFV_2221 SFV_2222   yeiA TRUE 0.716 -6.000 0.000 NA   NA
 2020927 2020928 SFV_2223 SFV_2224 mglC mglA TRUE 0.994 16.000 0.905 1.000 Y NA
 2020928 2020929 SFV_2224 SFV_2225 mglA mglB TRUE 0.880 97.000 0.250 NA Y NA
 2020929 2020930 SFV_2225 SFV_2226 mglB galS FALSE 0.018 280.000 0.000 NA N NA
 2020930 2020931 SFV_2226 SFV_2227 galS yeiB TRUE 0.748 142.000 0.500 NA   NA
 2020931 2020932 SFV_2227 SFV_2228 yeiB folE TRUE 0.973 17.000 0.719 NA   NA
 2020934 2020935 SFV_2230 SFV_2231 cirA lysP FALSE 0.020 292.000 0.000 1.000 N NA
 2020935 2020936 SFV_2231 SFV_2232 lysP yeiE FALSE 0.023 275.000 0.000 1.000 N NA
 2020937 2020938 SFV_2233 SFV_2234 yeiH nfo FALSE 0.253 74.000 0.040 NA   NA
 2020938 2020939 SFV_2234 SFV_2235 nfo yeiI TRUE 0.551 3.000 0.004 NA N NA
 2020940 2020941 SFV_2236 SFV_2237 yeiJ yeiK TRUE 0.746 100.000 0.056 1.000 Y NA
 2020943 2020944 SFV_2239 SFV_2240 yeiM yeiN FALSE 0.175 94.000 0.000 NA N NA
 2020944 2020945 SFV_2240 SFV_2241 yeiN yeiC FALSE 0.461 -12.000 0.008 NA N NA
 2020945 2020946 SFV_2241 SFV_2242 yeiC fruA FALSE 0.060 424.000 0.000 NA Y NA
 2020946 2020947 SFV_2242 SFV_2243 fruA fruK TRUE 0.989 17.000 0.562 1.000 Y NA
 2020947 2020948 SFV_2243 SFV_2244 fruK fruB TRUE 0.982 0.000 0.112 1.000 Y NA
 2020950 2020951 SFV_2246 SFV_2248 insB insA TRUE 0.917 27.000 0.000 0.069 Y NA
 2020952 2020953 SFV_2247 SFV_2249   yeiP FALSE 0.100 161.000 0.000 NA   NA
 2020953 2020954 SFV_2249 SFV_2250 yeiP yeiQ FALSE 0.047 214.000 0.000 1.000 N NA
 2020954 2020955 SFV_2250 SFV_2251 yeiQ yeiR FALSE 0.490 118.000 0.167 NA   NA
 2020955 2020956 SFV_2251 SFV_2252 yeiR   TRUE 0.959 3.000 0.275 NA   NA
 2020956 2020957 SFV_2252 SFV_2253   spr FALSE 0.006 412.000 0.000 NA N NA
 2020957 2020958 SFV_2253 SFV_2254 spr rtn FALSE 0.160 244.000 0.219 NA N NA
 2020958 2020959 SFV_2254 SFV_2255 rtn yejA TRUE 0.779 82.000 0.394 NA N NA
 2020959 2020960 SFV_2255 SFV_2256 yejA yejB TRUE 0.995 1.000 0.848 0.048   NA
 2020960 2020961 SFV_2256 SFV_2257 yejB yejE TRUE 0.995 0.000 0.833 0.048   NA
 2020961 2020962 SFV_2257 SFV_2258 yejE yejF TRUE 0.991 2.000 0.758 1.000   NA
 2020963 2020964 SFV_2259 SFV_2260 yejG bcr FALSE 0.013 333.000 0.000 NA   NA
 2020964 2020965 SFV_2260 SFV_2261 bcr rsuA FALSE 0.466 28.000 0.036 1.000 N NA
 2020966 2020967 SFV_2262 SFV_2263 yejH rplY FALSE 0.390 125.000 0.024 0.011 N NA
 2020969 2020970 SFV_2265 SFV_2266 yejL yejM TRUE 0.562 20.000 0.040 NA   NA
 2020970 1605239 SFV_2266 SFV_2267 yejM   FALSE 0.210 75.000 0.000 NA   NA
 2020973 2020974 SFV_2270 SFV_2271 ccmH dsbE TRUE 0.997 -3.000 0.578 1.000 Y NA
 2020974 2020975 SFV_2271 SFV_2272 dsbE ccmF TRUE 0.999 -3.000 0.804 0.002 Y NA
 2020975 2020976 SFV_2272 SFV_2273 ccmF ccmE TRUE 0.994 -3.000 0.211 0.002 Y NA
 2020976 2020977 SFV_2273 SFV_2274 ccmE ccmD TRUE 0.977 -3.000 0.344 1.000 N NA
 2020977 2020978 SFV_2274 SFV_2275 ccmD ccmC TRUE 0.986 -3.000 0.501 1.000 N NA
 2020978 2020979 SFV_2275 SFV_2276 ccmC ccmB TRUE 0.993 18.000 0.501 0.001 Y NA
 2020979 2020980 SFV_2276 SFV_2277 ccmB ccmA TRUE 0.998 -3.000 0.503 0.002 Y NA
 2020980 2020981 SFV_2277 SFV_2278 ccmA napC TRUE 0.647 13.000 0.043 1.000 N NA
 2020981 2020982 SFV_2278 SFV_2279 napC napB TRUE 0.995 10.000 0.490 0.003 Y NA
 2020982 2020983 SFV_2279 SFV_2280 napB napH TRUE 0.996 -3.000 0.316 0.003 Y NA
 2020983 2020984 SFV_2280 SFV_2281 napH napG TRUE 0.991 -13.000 0.795 0.003   NA
 2020984 2020985 SFV_2281 SFV_2282 napG napA TRUE 0.968 7.000 0.243 0.003   NA
 2020985 2020986 SFV_2282 SFV_2283 napA napD TRUE 0.996 -3.000 0.875 0.003 N NA
 1605257 2020988 SFV_2285 SFV_2286 yojH yojI FALSE 0.045 218.000 0.000 NA   NA
 2020988 2020989 SFV_2286 SFV_2287 yojI alkB FALSE 0.362 76.000 0.076 1.000 N NA
 2020989 2020990 SFV_2287 SFV_2288 alkB ada TRUE 0.906 0.000 0.015 0.012 N NA
 2020990 2020991 SFV_2288 SFV_2289 ada yojL FALSE 0.179 74.000 0.019 1.000 N NA
 2020991 2020992 SFV_2289 SFV_2290 yojL ompC FALSE 0.314 112.000 0.066 1.000 N NA
 2020993 2020994 SFV_2291 SFV_2292 yojN rcsB TRUE 0.989 17.000 0.558 1.000 Y NA
 2020995 2020996 SFV_2293 SFV_2294 rcsC   FALSE 0.023 275.000 0.000 NA   NA
 2020996 2020997 SFV_2294 SFV_2295     TRUE 0.693 5.000 0.000 NA   NA
 2020997 1605268 SFV_2295 SFV_2298   yfaSR FALSE 0.210 79.000 0.000 NA   NA
 1605268 2020998 SFV_2298 SFV_2296 yfaSR   FALSE 0.387 -3112.000 0.000 NA   NA
 2020998 2020999 SFV_2296 SFV_2297     TRUE 0.879 27.000 0.000 1.000 Y NA
 2020999 2021000 SFV_2297 SFV_2299     FALSE 0.002 2349.000 0.000 NA   NA
 2021000 2021001 SFV_2299 SFV_2300     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 2021001 2021002 SFV_2300 SFV_2301     FALSE 0.245 61.000 0.000 NA   NA
 2021002 2021003 SFV_2301 SFV_2302   gyrA FALSE 0.120 149.000 0.000 NA   NA
 2021005 2021006 SFV_2304 SFV_2305     TRUE 0.905 -42.000 0.000 1.000 Y NA
 2021006 2021007 SFV_2305 SFV_2307   nrdA FALSE 0.003 887.000 0.000 1.000 N NA
 2021007 2021008 SFV_2307 SFV_2308 nrdA nrdB TRUE 0.987 3.000 0.100 0.001 Y NA
 2021008 2021009 SFV_2308 SFV_2309 nrdB yfaE TRUE 0.805 0.000 0.034 1.000 N NA
 2021010 2021011 SFV_2310 SFV_2311 inaA glpQ FALSE 0.008 463.000 0.000 1.000   NA
 2021011 2021012 SFV_2311 SFV_2312 glpQ glpT TRUE 0.970 5.000 0.396 1.000 N NA
 2021013 2021014 SFV_2313 SFV_2314 glpA glpB TRUE 0.990 -10.000 0.650 0.001 N NA
 2021014 2021015 SFV_2314 SFV_2315 glpB glpC TRUE 0.993 -3.000 0.547 0.001 N NA
 2021015 2021016 SFV_2315 SFV_2316 glpC yfaD FALSE 0.064 193.000 0.000 NA   NA
 2021017 2021018 SFV_2317 SFV_2318     TRUE 0.951 13.000 0.400 NA   NA
 2021018 2021019 SFV_2318 SFV_2319     FALSE 0.211 82.000 0.000 NA   NA
 2021019 2021020 SFV_2319 SFV_2320     FALSE 0.179 87.000 0.005 1.000   NA
 2021023 2021024 SFV_2323 SFV_2324     TRUE 0.992 4.000 0.378 NA Y NA
 2021024 2021025 SFV_2324 SFV_2325     TRUE 0.989 0.000 0.220 NA Y NA
 2021025 2021026 SFV_2325 SFV_2326     TRUE 0.995 -3.000 0.447 1.000 Y NA
 2021026 2021027 SFV_2326 SFV_2327   arnT TRUE 0.792 0.000 0.031 1.000 N NA
 2021027 2021028 SFV_2327 SFV_2328 arnT   TRUE 0.959 -3.000 0.158 0.082 N NA
 2021028 2021029 SFV_2328 SFV_2329     TRUE 0.960 0.000 0.226 NA   NA
 1605302 2021030 SFV_2330 SFV_2331 pmrD menE FALSE 0.210 80.000 0.000 NA   NA
 2021030 2021031 SFV_2331 SFV_2332 menE menC TRUE 0.984 -3.000 0.283 0.001 N NA
 2021031 2021032 SFV_2332 SFV_2333 menC menB TRUE 0.957 36.000 0.171 0.001 Y NA
 2021032 2021033 SFV_2333 SFV_2334 menB yfbB TRUE 0.915 15.000 0.280 NA   NA
 2021033 2021034 SFV_2334 SFV_2335 yfbB menD TRUE 0.978 -3.000 0.355 NA   NA
 2021034 2021035 SFV_2335 SFV_2336 menD menF TRUE 0.962 -100.000 0.281 1.000 Y NA
 2021035 2021036 SFV_2336 SFV_2337 menF elaB FALSE 0.263 79.000 0.043 NA   NA
 2021036 2021037 SFV_2337 SFV_2338 elaB elaA FALSE 0.440 55.000 0.077 NA   NA
 2021040 2021041 SFV_2341 SFV_2342 insB yfbM FALSE 0.211 84.000 0.000 NA   NA
 2021042 2021043 SFV_2343 SFV_2344 nuoN nuoM TRUE 0.880 187.000 0.437 0.002 Y NA
 2021043 2021044 SFV_2344 SFV_2345 nuoM nuoL TRUE 0.951 164.000 0.713 0.002 Y NA
 2021044 2021045 SFV_2345 SFV_2346 nuoL nuoK TRUE 0.993 -3.000 0.211 0.006 Y NA
 2021045 2021046 SFV_2346 SFV_2347 nuoK nuoJ TRUE 0.995 -3.000 0.269 0.003 Y NA
 2021046 2021047 SFV_2347 SFV_2348 nuoJ nuoI TRUE 0.992 12.000 0.428 0.006 Y NA
 2021047 2021048 SFV_2348 SFV_2349 nuoI nuoH TRUE 0.991 15.000 0.423 0.006 Y NA
 2021048 2021049 SFV_2349 SFV_2350 nuoH nuoG TRUE 0.998 -3.000 0.664 0.006 Y NA
 2021049 2021050 SFV_2350 SFV_2351 nuoG nuoF TRUE 0.931 53.000 0.180 0.006 Y NA
 2021050 2021051 SFV_2351 SFV_2352 nuoF nuoE TRUE 0.993 -3.000 0.186 0.006 Y NA
 2021051 2021052 SFV_2352 SFV_2353 nuoE nuoC TRUE 0.996 3.000 0.407 0.006 Y NA
 2021052 2021053 SFV_2353 SFV_2354 nuoC nuoB TRUE 0.977 106.000 0.691 0.003 Y NA
 2021053 2021054 SFV_2354 SFV_2355 nuoB nuoA TRUE 0.990 16.000 0.377 0.003 Y NA
 2021054 2021055 SFV_2355 SFV_2356 nuoA lrhA FALSE 0.004 632.000 0.000 1.000 N NA
 2021056 2021057 SFV_2357 SFV_2358     FALSE 0.446 84.000 0.104 1.000   NA
 2021058 2021059 SFV_2359 SFV_2360 yfbS yfbT TRUE 0.540 162.000 0.308 1.000   NA
 2021059 2021060 SFV_2360 SFV_2361 yfbT   TRUE 0.954 11.000 0.375 NA   NA
 2021060 2021061 SFV_2361 SFV_2362     TRUE 0.634 83.000 0.221 NA   NA
 2021062 2021063 SFV_2363 SFV_2364 ackA pta TRUE 0.888 75.000 0.634 1.000   NA
 2021063 2021064 SFV_2364 SFV_2365 pta yfcC FALSE 0.044 232.000 0.000 1.000   NA
 2021065 2021066 SFV_2366 SFV_2367   yfcE TRUE 0.721 58.000 0.143 0.010   NA
 2021066 2021067 SFV_2367 SFV_2368 yfcE yfcF FALSE 0.471 56.000 0.092 NA   NA
 2021068 2021069 SFV_2369 SFV_2370 yfcG folX FALSE 0.205 57.000 0.012 1.000 N NA
 2021069 2021070 SFV_2370 SFV_2371 folX   TRUE 0.769 21.000 0.122 1.000   NA
 2021071 2021072 SFV_2372 SFV_2373 yfcI hisP FALSE 0.059 197.000 0.000 NA   NA
 2021072 2021073 SFV_2373 SFV_2374 hisP hisM TRUE 0.995 8.000 0.643 1.000 Y NA
 2021073 2021074 SFV_2374 SFV_2375 hisM hisQ TRUE 0.999 -3.000 0.900 0.013 Y NA
 2021074 2021075 SFV_2375 SFV_2376 hisQ hisJ TRUE 0.981 90.000 0.833 0.048 Y NA
 2021075 2021076 SFV_2376 SFV_2377 hisJ argT FALSE 0.416 221.000 0.000 0.012 Y NA
 2021076 2021077 SFV_2377 SFV_2378 argT   TRUE 0.625 -15.000 0.000 1.000 N NA
 2021077 2021078 SFV_2378 SFV_2379     TRUE 0.905 -42.000 0.000 1.000 Y NA
 2021078 2021079 SFV_2379 SFV_2380   ubiX FALSE 0.007 425.000 0.000 1.000 N NA
 2021079 2021080 SFV_2380 SFV_2381 ubiX purF FALSE 0.302 96.000 0.056 1.000 N NA
 2021080 2021081 SFV_2381 SFV_2382 purF cvpA TRUE 0.832 37.000 0.262 1.000   NA
 2021081 2021082 SFV_2382 SFV_2383 cvpA dedD FALSE 0.073 259.000 0.116 NA   NA
 2021082 2021083 SFV_2383 SFV_2384 dedD folC TRUE 0.923 -10.000 0.216 NA   NA
 2021083 2021084 SFV_2384 SFV_2385 folC accD TRUE 0.793 70.000 0.383 1.000 N NA
 2021084 2021085 SFV_2385 SFV_2386 accD dedA FALSE 0.091 156.000 0.020 NA   NA
 2021085 2021086 SFV_2386 SFV_2387 dedA truA FALSE 0.243 83.000 0.038 NA   NA
 2021086 2021087 SFV_2387 SFV_2388 truA usg TRUE 0.822 0.000 0.040 1.000 N NA
 2021087 2021088 SFV_2388 SFV_2389 usg pdxB TRUE 0.877 66.000 0.097 0.008 Y NA
 2021090 2021091 SFV_2391 SFV_2392   fabB FALSE 0.028 255.000 0.000 1.000 N NA
 2021093 2021094 SFV_2394 SFV_2395     TRUE 0.908 34.000 0.425 NA   NA
 2021094 2021095 SFV_2395 SFV_2396   yfcA TRUE 0.931 0.000 0.153 NA   NA
 2021095 2021096 SFV_2396 SFV_2397 yfcA mepA TRUE 0.563 66.000 0.160 1.000   NA
 2021096 2021097 SFV_2397 SFV_2398 mepA aroC TRUE 0.697 4.000 0.025 1.000 N NA
 2021097 2021098 SFV_2398 SFV_2400 aroC yfcB TRUE 0.579 35.000 0.081 1.000 N NA
 2021100 2021101 SFV_2401 SFV_2402 yfcO   FALSE 0.209 92.000 0.000 NA   NA
 2021101 2021102 SFV_2402 SFV_2403     TRUE 0.995 -3.000 0.286 0.006 Y NA
 2021102 2021103 SFV_2403 SFV_2404     TRUE 0.997 -3.000 0.571 1.000 Y NA
 2021103 2021104 SFV_2404 SFV_2405   yfcS TRUE 0.949 47.000 0.333 1.000 Y NA
 2021104 1605378 SFV_2405 SFV_2406 yfcS yfcU FALSE 0.506 20.000 0.000 NA   NA
 1605378 2021105 SFV_2406 SFV_2407 yfcU   FALSE 0.211 82.000 0.000 NA   NA
 2021105 2021106 SFV_2407 SFV_2408     FALSE 0.004 684.000 0.000 1.000 N NA
 2021106 2021107 SFV_2408 SFV_2409     FALSE 0.055 203.000 0.000 1.000 N NA
 2021107 2021108 SFV_2409 SFV_2410     TRUE 0.995 0.000 0.430 1.000 Y NA
 2021108 2021109 SFV_2410 SFV_2411     FALSE 0.135 180.000 0.061 NA   NA
 2021110 2021111 SFV_2412 SFV_2413 fadL   FALSE 0.010 366.000 0.000 NA   NA
 2021113 1605388 SFV_2415 SFV_2416 yfdC   FALSE 0.211 74.000 0.000 NA   NA
 1605388 2021114 SFV_2416 SFV_2417     FALSE 0.099 162.000 0.000 NA   NA
 2021115 2021116 SFV_2418 SFV_2419     FALSE 0.146 301.000 0.000 1.000 Y NA
 2021116 2021117 SFV_2419 SFV_2420     FALSE 0.025 270.000 0.000 1.000 N NA
 2021117 2021118 SFV_2420 SFV_2421     FALSE 0.294 51.000 0.000 1.000 N NA
 2021121 2021122 SFV_2424 SFV_2425   dsdA TRUE 0.740 18.000 0.083 1.000   NA
 2021123 2021124 SFV_2426 SFV_2427 emrY emrK TRUE 0.994 0.000 1.000 1.000   NA
 2021125 2021126 SFV_2428 SFV_2429 evgA evgS TRUE 0.974 5.000 0.000 0.009 Y NA
 2021127 2021128 SFV_2430 SFV_2431 yfdE   FALSE 0.427 35.000 0.000 1.000   NA
 2021128 2021129 SFV_2431 SFV_2432     FALSE 0.250 70.000 0.000 1.000   NA
 2021129 2021130 SFV_2432 SFV_2433     TRUE 0.557 54.000 0.134 1.000 N NA
 2021130 2021131 SFV_2433 SFV_2434     FALSE 0.006 513.000 0.000 NA   NA
 2021131 2021132 SFV_2434 SFV_2435     FALSE 0.004 649.000 0.000 NA   NA
 2021135 2021136 SFV_2438 SFV_2439     TRUE 0.995 15.000 0.744 0.011 Y NA
 2021136 2021137 SFV_2439 SFV_2440     TRUE 0.959 13.000 0.051 0.061 Y NA
 2021138 2021139 SFV_2441 SFV_2442     TRUE 0.985 25.000 0.571 1.000 Y NA
 2021139 1605415 SFV_2442 SFV_2443     TRUE 0.783 0.000 0.000 NA   NA
 1605415 2021140 SFV_2443 SFV_2444     TRUE 0.557 15.000 0.000 NA   NA
 2021140 2021141 SFV_2444 SFV_2445     TRUE 0.995 22.000 0.875 0.009 Y NA
 2021141 2021142 SFV_2445 SFV_2446   glk FALSE 0.395 219.000 0.091 1.000 Y NA
 2021143 2021144 SFV_2447 SFV_2448     FALSE 0.191 115.000 0.000 NA   NA
 2021147 1605424 SFV_2451 SFV_2452 yfeA   FALSE 0.051 208.000 0.000 NA   NA
 2021148 2021149 SFV_2453 SFV_2454 yfeC yfeD TRUE 0.916 2.000 0.000 0.005   NA
 1605428 1605429 SFV_2456 SFV_2457     FALSE 0.324 44.000 0.000 NA   NA
 1605429 1605430 SFV_2457 SFV_2458     TRUE 0.693 5.000 0.000 NA   NA
 1605430 2021151 SFV_2458 SFV_2459   flxA FALSE 0.022 276.000 0.000 NA   NA
 2021154 2021155 SFV_2462 SFV_2463 ypeB lig TRUE 0.700 2.000 0.017 NA   NA
 2021155 2021156 SFV_2463 SFV_2464 lig zipA FALSE 0.141 71.000 0.002 1.000 N NA
 2021157 2021158 SFV_2465 SFV_2466 cysZ cysK TRUE 0.555 185.000 0.122 1.000 Y NA
 2021158 2021159 SFV_2466 SFV_2467 cysK ptsH FALSE 0.007 384.000 0.019 1.000 N NA
 2021159 2021160 SFV_2467 SFV_2468 ptsH ptsI TRUE 0.885 45.000 0.000 0.009 Y NA
 2021160 2021161 SFV_2468 SFV_2469 ptsI crr TRUE 0.895 41.000 0.000 0.009 Y NA
 2021163 2021164 SFV_2471 SFV_2472 yfeK   FALSE 0.395 33.000 0.000 NA   NA
 2021164 2021165 SFV_2472 SFV_2473     TRUE 0.544 -31.000 0.000 NA   NA
 2021166 2021167 SFV_2474 SFV_2475 cysM cysA FALSE 0.349 56.000 0.049 1.000 N NA
 2021167 2021168 SFV_2475 SFV_2476 cysA cysW TRUE 0.976 -10.000 0.180 1.000 Y NA
 2021168 2021169 SFV_2476 SFV_2477 cysW cysU TRUE 0.994 0.000 0.583 0.001 N NA
 2021169 2021170 SFV_2477 SFV_2478 cysU cysP TRUE 0.992 0.000 0.479 0.001 N NA
 2021170 2021171 SFV_2478 SFV_2479 cysP ucpA FALSE 0.023 304.000 0.043 1.000 N NA
 2021171 2021172 SFV_2479 SFV_2480 ucpA yfeT FALSE 0.071 187.000 0.000 1.000 N NA
 2021173 2021174 SFV_2481 SFV_2482 yfeU   TRUE 0.916 4.000 0.158 1.000   NA
 2021175 2021176 SFV_2483 SFV_2484     TRUE 0.741 96.000 0.333 NA   NA
 2021176 2021177 SFV_2484 SFV_2485     TRUE 0.653 61.000 0.204 NA   NA
 2021177 2021178 SFV_2485 SFV_2486     TRUE 0.726 -19.000 0.059 NA   NA
 2021179 2021180 SFV_2487 SFV_2488 amiA hemF TRUE 0.698 4.000 0.025 1.000 N NA
 2021181 2021182 SFV_2489 SFV_2490 yfeG   TRUE 0.764 46.000 0.250 NA N NA
 2021182 2021183 SFV_2490 SFV_2491     TRUE 0.772 13.000 0.106 NA N NA
 2021184 2021185 SFV_2492 SFV_2493   insB FALSE 0.039 228.000 0.000 NA   NA
 2021185 2021186 SFV_2493 SFV_2494 insB   FALSE 0.003 834.000 0.000 NA   NA
 2021186 2021187 SFV_2494 SFV_2495     FALSE 0.104 158.000 0.000 NA   NA
 2021187 2021188 SFV_2495 SFV_2496     FALSE 0.474 23.000 0.000 NA   NA
 2021188 2021189 SFV_2496 SFV_2497     FALSE 0.006 465.000 0.000 NA   NA
 2021189 2021190 SFV_2497 SFV_2498     FALSE 0.016 312.000 0.000 NA   NA
 2021190 2021191 SFV_2498 SFV_2499     FALSE 0.067 252.000 0.077 1.000   NA
 2021191 2021192 SFV_2499 SFV_2500     FALSE 0.117 151.000 0.000 1.000 N NA
 2021193 2021194 SFV_2501 SFV_2502     FALSE 0.106 334.000 0.000 1.000 Y NA
 2021194 2021195 SFV_2502 SFV_2503     TRUE 0.905 -42.000 0.000 1.000 Y NA
 2021195 2021196 SFV_2503 SFV_2504     FALSE 0.004 593.000 0.000 NA N NA
 2021196 2021197 SFV_2504 SFV_2505     TRUE 0.923 -25.000 0.000 NA Y NA
 2021197 2021198 SFV_2505 SFV_2506     TRUE 0.929 13.000 0.000 1.000 Y NA
 2021198 2021199 SFV_2506 SFV_2507     FALSE 0.082 221.000 0.070 1.000 N NA
 2021200 2021201 SFV_2508 SFV_2509 talA tktB TRUE 0.991 20.000 0.739 1.000 Y NA
 2021202 2021203 SFV_2510 SFV_2511   yffH TRUE 0.708 126.000 0.333 NA   NA
 2021203 2021204 SFV_2511 SFV_2512 yffH yffG TRUE 0.543 68.000 0.167 1.000 N NA
 1605485 2021205 SFV_2513 SFV_2514 narQ acrD FALSE 0.056 202.000 0.000 NA   NA
 2021205 2021206 SFV_2514 SFV_2515 acrD yffB FALSE 0.006 539.000 0.000 1.000 N NA
 2021206 2021207 SFV_2515 SFV_2516 yffB dapE TRUE 0.959 4.000 0.292 1.000 N NA
 2021207 2021208 SFV_2516 SFV_2517 dapE   FALSE 0.404 28.000 0.025 NA   NA
 2021209 2021210 SFV_2518 SFV_2519 ypfH ypfI FALSE 0.244 74.000 0.000 1.000   NA
 2021210 2021211 SFV_2519 SFV_2520 ypfI   TRUE 0.604 15.000 0.029 1.000   NA
 2021211 2021212 SFV_2520 SFV_2521   purC FALSE 0.075 168.000 0.006 1.000   NA
 2021212 2021213 SFV_2521 SFV_2522 purC nlpB FALSE 0.039 213.000 0.019 1.000 N NA
 2021213 2021214 SFV_2522 SFV_2523 nlpB dapA TRUE 0.974 17.000 0.267 1.000 Y NA
 2021215 2021216 SFV_2524 SFV_2525 gcvR bcp TRUE 0.906 0.000 0.102 1.000 N NA
 2021216 2021217 SFV_2525 SFV_2526 bcp hyfA FALSE 0.029 253.000 0.000 1.000 N NA
 2021217 1605499 SFV_2526 SFV_2527 hyfA hyfB TRUE 0.783 0.000 0.000 NA   NA
 1605499 2021218 SFV_2527 SFV_2528 hyfB hyfC TRUE 0.609 11.000 0.000 NA   NA
 2021218 2021219 SFV_2528 SFV_2529 hyfC hyfD TRUE 0.963 44.000 0.412 1.000 Y NA
 2021219 2021220 SFV_2529 SFV_2530 hyfD hyfE TRUE 0.972 12.000 0.093 0.006 Y NA
 2021220 2021221 SFV_2530 SFV_2531 hyfE hyfF TRUE 0.998 5.000 0.864 0.006 Y NA
 2021221 1605504 SFV_2531 SFV_2532 hyfF hyfG TRUE 0.659 -10.000 0.000 NA   NA
 1605504 2021222 SFV_2532 SFV_2533 hyfG hyfH TRUE 0.633 10.000 0.000 NA   NA
 2021222 2021223 SFV_2533 SFV_2534 hyfH hyfI TRUE 0.990 -3.000 0.222 1.000 Y NA
 2021223 2021224 SFV_2534 SFV_2535 hyfI   TRUE 0.859 -70.000 0.250 NA   NA
 2021224 2021225 SFV_2535 SFV_2536   hyfR FALSE 0.203 96.000 0.000 NA   NA
 2021225 1605509 SFV_2536 SFV_2537 hyfR focB FALSE 0.484 22.000 0.000 NA   NA
 2021227 2021228 SFV_2539 SFV_2540     TRUE 0.893 21.000 0.259 1.000   NA
 2021229 2021230 SFV_2541 SFV_2542   uraA FALSE 0.380 50.000 0.048 1.000 N NA
 2021230 2021231 SFV_2542 SFV_2543 uraA upp TRUE 0.670 149.000 0.101 1.000 Y NA
 2021232 2021233 SFV_2544 SFV_2545 purM purN TRUE 0.994 0.000 0.230 0.002 Y NA
 2021233 2021234 SFV_2545 SFV_2546 purN ppk FALSE 0.070 172.000 0.017 1.000 N NA
 2021234 2021235 SFV_2546 SFV_2547 ppk ppx TRUE 0.945 77.000 0.486 1.000 Y NA
 2021236 2021237 SFV_2548 SFV_2549     TRUE 0.782 141.000 0.182 1.000 Y NA
 2021237 2021238 SFV_2549 SFV_2551     FALSE 0.003 1530.000 0.000 NA   NA
 2021238 2021239 SFV_2551 SFV_2552     FALSE 0.015 317.000 0.000 NA   NA
 2021239 2021240 SFV_2552 SFV_2553     TRUE 0.909 16.000 0.273 NA   NA
 2021241 2021242 SFV_2554 SFV_2555 guaA guaB TRUE 0.923 69.000 0.190 0.001 Y NA
 2021244 2021245 SFV_2557 SFV_2558     FALSE 0.297 34.000 0.009 NA   NA
 2021245 2021246 SFV_2558 SFV_2559     TRUE 0.589 118.000 0.203 1.000   NA
 2021246 2021247 SFV_2559 SFV_2560     TRUE 0.969 11.000 0.492 1.000   NA
 2021247 2021248 SFV_2560 SFV_2561   hisS TRUE 0.904 18.000 0.259 1.000   NA
 2021248 2021249 SFV_2561 SFV_2562 hisS gcpE TRUE 0.538 133.000 0.207 1.000 N NA
 2021249 2021250 SFV_2562 SFV_2563 gcpE yfgA TRUE 0.851 27.000 0.233 1.000   NA
 2021250 2021251 SFV_2563 SFV_2564 yfgA yfgB FALSE 0.022 285.000 0.020 1.000   NA
 2021251 2021252 SFV_2564 SFV_2565 yfgB ndk FALSE 0.361 150.000 0.156 1.000   NA
 2021252 2021253 SFV_2565 SFV_2566 ndk pbpC FALSE 0.081 150.000 0.008 1.000 N NA
 2021253 2021254 SFV_2566 SFV_2567 pbpC   TRUE 0.784 2.000 0.000 1.000   NA
 2021254 2021255 SFV_2567 SFV_2568     FALSE 0.201 179.000 0.000 0.067   NA
 2021256 2021257 SFV_2570 SFV_2571 sseB pepB TRUE 0.603 133.000 0.253 NA   NA
 2021257 2021258 SFV_2571 SFV_2572 pepB yfhJ TRUE 0.615 59.000 0.171 1.000   NA
 2021258 2021259 SFV_2572 SFV_2573 yfhJ fdx TRUE 0.977 12.000 0.625 1.000   NA
 2021259 2021260 SFV_2573 SFV_2574 fdx hscA TRUE 0.991 2.000 0.794 1.000 N NA
 2021260 2021261 SFV_2574 SFV_2575 hscA yfhE TRUE 0.991 17.000 0.634 1.000 Y NA
 2021261 2021262 SFV_2575 SFV_2576 yfhE yfhF TRUE 0.839 96.000 0.500 1.000   NA
 2021262 2021263 SFV_2576 SFV_2577 yfhF   TRUE 0.974 11.000 0.359 0.002   NA
 2021263 2021264 SFV_2577 SFV_2578   yfhO TRUE 0.925 28.000 0.448 1.000 N NA
 2021264 2021265 SFV_2578 SFV_2579 yfhO   TRUE 0.788 112.000 0.424 1.000 N NA
 2021265 2021266 SFV_2579 SFV_2580     FALSE 0.073 270.000 0.126 1.000 N NA
 2021267 2021268 SFV_2581 SFV_2582 suhB   FALSE 0.105 145.000 0.003 1.000   NA
 2021268 2021269 SFV_2582 SFV_2583   csiE FALSE 0.080 191.000 0.000 1.000   NA
 2021270 2021271 SFV_2584 SFV_2585 hcaT hcaR FALSE 0.120 160.000 0.000 1.000   NA
 2021272 2021273 SFV_2586 SFV_2587 hcaA1 hcaA2 TRUE 0.987 -3.000 0.333 0.001 N NA
 2021273 2021274 SFV_2587 SFV_2588 hcaA2 hcaC TRUE 0.944 0.000 0.083 0.045 N NA
 2021274 2021275 SFV_2588 SFV_2589 hcaC hcaB TRUE 0.945 -3.000 0.083 0.026 N NA
 2021275 2021276 SFV_2589 SFV_2590 hcaB hcaD TRUE 0.846 10.000 0.000 0.026   NA
 2021276 2021277 SFV_2590 SFV_2591 hcaD yphA FALSE 0.448 25.000 0.000 NA   NA
 2021278 2021279 SFV_2592 SFV_2593 yphB yphC TRUE 0.596 12.000 0.000 1.000 N NA
 2021279 2021280 SFV_2593 SFV_2594 yphC yphD FALSE 0.229 66.000 0.000 1.000 N NA
 2021280 2021281 SFV_2594 SFV_2595 yphD yphE TRUE 0.936 25.000 0.148 1.000 Y NA
 2021281 2021282 SFV_2595 SFV_2596 yphE yphF TRUE 0.942 23.000 0.161 NA Y NA
 2021282 1605569 SFV_2596 SFV_2597 yphF yphG FALSE 0.202 97.000 0.000 NA   NA
 2021286 2021287 SFV_2601 SFV_2602 glnB yfhA TRUE 0.542 61.000 0.146 1.000 N NA
 2021287 2021288 SFV_2602 SFV_2603 yfhA yfhG TRUE 0.662 -10.000 0.029 NA   NA
 2021288 2021289 SFV_2603 SFV_2604 yfhG yfhK FALSE 0.104 159.000 0.029 NA   NA
 2021289 2021290 SFV_2604 SFV_2605 yfhK purL FALSE 0.005 576.000 0.000 1.000 N NA
 2021292 2021293 SFV_2607 SFV_2608 yfhC yfhB FALSE 0.355 58.000 0.062 NA N NA
 2021297 2021298 SFV_2612 SFV_2613     FALSE 0.469 -49.000 0.000 NA   NA
 2021298 2021299 SFV_2613 SFV_2614     FALSE 0.462 24.000 0.000 NA   NA
 2021299 2021300 SFV_2614 SFV_2615     FALSE 0.462 24.000 0.000 NA   NA
 2021301 2021302 SFV_2616 SFV_2617     TRUE 0.891 24.000 0.000 1.000 Y NA
 2021303 2021304 SFV_2618 SFV_2619     TRUE 0.634 -13.000 0.000 NA   NA
 2021304 2021305 SFV_2619 SFV_2620     TRUE 0.884 11.000 0.182 NA   NA
 2021306 2021307 SFV_2621 SFV_2622     TRUE 0.782 141.000 0.182 1.000 Y NA
 2021308 2021309 SFV_2623 SFV_2624   insB FALSE 0.007 538.000 0.000 1.000   NA
 2021311 2021312 SFV_2626 SFV_2627 acpS pdxJ TRUE 0.975 0.000 0.326 1.000 N NA
 2021312 2021313 SFV_2627 SFV_2628 pdxJ recO TRUE 0.857 12.000 0.166 1.000 N NA
 2021313 2021314 SFV_2628 SFV_2629 recO era TRUE 0.818 12.000 0.109 1.000   NA
 2021314 2021315 SFV_2629 SFV_2630 era rnc TRUE 0.959 -3.000 0.127 0.037   NA
 2021315 2021316 SFV_2630 SFV_2631 rnc lepB FALSE 0.073 272.000 0.117 1.000   NA
 2021316 2021317 SFV_2631 SFV_2632 lepB lepA TRUE 0.873 16.000 0.187 1.000   NA
 2021317 2021318 SFV_2632 SFV_2633 lepA rseC FALSE 0.069 198.000 0.045 NA N NA
 2021318 2021319 SFV_2633 SFV_2634 rseC rseB TRUE 0.997 -3.000 0.609 NA Y NA
 2021319 2021320 SFV_2634 SFV_2635 rseB rseA TRUE 0.998 0.000 0.856 NA Y NA
 2021320 2021321 SFV_2635 SFV_2636 rseA rpoE TRUE 0.951 33.000 0.705 NA N NA
 2021329 2021330 SFV_2645 SFV_2646 trxC yfiP TRUE 0.720 18.000 0.084 NA   NA
 2021330 2021331 SFV_2646 SFV_2647 yfiP yfiQ TRUE 0.813 32.000 0.222 NA   NA
 2021331 2021332 SFV_2647 SFV_2648 yfiQ pssA TRUE 0.580 114.000 0.121 0.042 N NA
 2021332 2021333 SFV_2648 SFV_2649 pssA yfiM FALSE 0.525 46.000 0.089 NA   NA
 2021334 1605623 SFV_2650 SFV_2651 kgtP rrfG FALSE 0.014 324.000 0.000 NA   NA
 1605623 1605624 SFV_2651 SFV_2652 rrfG rrlG FALSE 0.205 95.000 0.000 NA   NA
 1605624 1605625 SFV_2652 SFV_2653 rrlG   FALSE 0.063 194.000 0.000 NA   NA
 1605625 1605626 SFV_2653 SFV_2654   rrsG FALSE 0.212 86.000 0.000 NA   NA
 2021335 2021336 SFV_2655 SFV_2656     TRUE 0.775 -31.000 0.000 0.067   NA
 2021338 2021339 SFV_2658 SFV_2659 sfhB yfiH TRUE 0.938 -3.000 0.168 NA   NA
 2021339 2021340 SFV_2659 SFV_2660 yfiH clpB FALSE 0.358 130.000 0.108 NA   NA
 2021341 2021342 SFV_2661 SFV_2662   ygdH FALSE 0.211 84.000 0.000 NA   NA
 2021342 2021343 SFV_2662 SFV_2663 ygdH yqcD FALSE 0.233 148.000 0.079 NA   NA
 2021344 2021345 SFV_2664 SFV_2665 syd   FALSE 0.004 622.000 0.000 NA   NA
 2021345 2021346 SFV_2665 SFV_2666   yqcB TRUE 0.987 0.000 0.518 NA   NA
 2021346 2021347 SFV_2666 SFV_2667 yqcB   TRUE 0.870 18.000 0.209 1.000 N NA
 2021347 2021348 SFV_2667 SFV_2668     FALSE 0.007 434.000 0.000 1.000 N NA
 2021348 2021349 SFV_2668 SFV_2669   ygcY TRUE 0.753 2.000 0.000 1.000 N NA
 2021349 2021350 SFV_2669 SFV_2670 ygcY ygcX TRUE 0.948 21.000 0.000 0.001 Y NA
 2021352 2021353 SFV_2672 SFV_2673 ygcA relA FALSE 0.496 48.000 0.082 1.000 N NA
 2021353 2021354 SFV_2673 SFV_2674 relA mazG FALSE 0.275 96.000 0.040 1.000   NA
 2021354 2021355 SFV_2674 SFV_2675 mazG pyrG FALSE 0.044 228.000 0.025 1.000   NA
 2021355 2021356 SFV_2675 SFV_2676 pyrG eno FALSE 0.346 88.000 0.068 1.000 N NA
 2021359 2021360 SFV_2679 SFV_2680 insB insB TRUE 0.622 37.000 0.000 0.067   NA
 2021361 2021362 SFV_2681 SFV_2682   ygcS TRUE 0.650 94.000 0.250 NA N NA
 2021362 2021363 SFV_2682 SFV_2683 ygcS ygcR TRUE 0.876 -22.000 0.182 1.000 N NA
 2021363 2021364 SFV_2683 SFV_2684 ygcR ygcQ TRUE 0.988 -3.000 0.102 0.015 Y NA
 1605657 2021365 SFV_2685 SFV_2686 ygcP   FALSE 0.046 214.000 0.000 NA   NA
 2021365 2021366 SFV_2686 SFV_2687     TRUE 0.707 -94.000 0.000 0.034   NA
 2021366 2021367 SFV_2687 SFV_2688     TRUE 0.782 141.000 0.182 1.000 Y NA
 2021368 2021369 SFV_2689 SFV_2690     FALSE 0.098 163.000 0.000 NA   NA
 2021369 2021370 SFV_2690 SFV_2691   ninB TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 2021372 2021373 SFV_2692 SFV_2694     FALSE 0.174 127.000 0.000 NA   NA
 2021373 2021374 SFV_2694 SFV_2695     FALSE 0.045 217.000 0.000 NA   NA
 2021374 2021375 SFV_2695 SFV_2696     TRUE 0.609 11.000 0.000 NA   NA
 2021375 2021376 SFV_2696 SFV_2697     TRUE 0.981 -3.000 0.000 0.073 Y NA
 2021376 2021377 SFV_2697 SFV_2698     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 2021377 2021378 SFV_2698 SFV_2699     FALSE 0.208 93.000 0.000 NA   NA
 2021378 1605672 SFV_2699 SFV_2700     FALSE 0.005 573.000 0.000 NA   NA
 1605672 1605673 SFV_2700 SFV_2701     TRUE 0.750 2.000 0.000 NA   NA
 1605673 1605674 SFV_2701 SFV_2702     TRUE 0.735 3.000 0.000 NA   NA
 1605674 1605675 SFV_2702 SFV_2703     TRUE 0.713 4.000 0.000 NA   NA
 1605675 2021379 SFV_2703 SFV_2704     FALSE 0.019 293.000 0.000 NA   NA
 2021379 2021380 SFV_2704 SFV_2705     FALSE 0.211 74.000 0.000 NA   NA
 2021380 2021381 SFV_2705 SFV_2706     FALSE 0.226 66.000 0.000 NA   NA
 2021381 2021382 SFV_2706 SFV_2707     TRUE 0.811 -3.000 0.000 1.000   NA
 2021383 2021384 SFV_2708 SFV_2709     TRUE 0.782 141.000 0.182 1.000 Y NA
 2021386 2021387 SFV_2711 SFV_2712     TRUE 0.814 0.000 0.000 1.000   NA
 2021388 2021389 SFV_2713 SFV_2714     FALSE 0.444 141.000 0.182 NA   NA
 2021389 2021390 SFV_2714 SFV_2715     FALSE 0.425 28.000 0.000 NA   NA
 2021390 2021391 SFV_2715 SFV_2716     TRUE 0.555 -28.000 0.000 NA   NA
 2021391 2021392 SFV_2716 SFV_2717     FALSE 0.073 184.000 0.000 NA   NA
 2021392 2021393 SFV_2717 SFV_2718     TRUE 0.621 53.000 0.000 0.001   NA
 2021393 2021394 SFV_2718 SFV_2719     TRUE 0.887 -10.000 0.150 1.000   NA
 2021394 2021395 SFV_2719 SFV_2720     FALSE 0.409 37.000 0.000 1.000   NA
 2021395 2021396 SFV_2720 SFV_2721     FALSE 0.256 58.000 0.000 NA   NA
 2021396 2021397 SFV_2721 SFV_2722     FALSE 0.285 52.000 0.000 NA   NA
 2021397 2021398 SFV_2722 SFV_2723     TRUE 0.592 12.000 0.000 NA   NA
 2021398 2021399 SFV_2723 SFV_2724     TRUE 0.778 10.000 0.071 NA   NA
 2021399 2021400 SFV_2724 SFV_2725     TRUE 0.994 -3.000 1.000 NA   NA
 2021400 2021401 SFV_2725 SFV_2726     TRUE 0.986 11.000 1.000 NA   NA
 2021401 2021402 SFV_2726 SFV_2727     FALSE 0.251 59.000 0.000 NA   NA
 2021402 2021403 SFV_2727 SFV_2728     TRUE 0.653 9.000 0.000 NA   NA
 2021403 1605701 SFV_2728 SFV_2729     TRUE 0.555 -28.000 0.000 NA   NA
 1605701 2021404 SFV_2729 SFV_2730     TRUE 0.783 0.000 0.000 NA   NA
 2021404 2021405 SFV_2730 SFV_2731     FALSE 0.451 -64.000 0.000 NA   NA
 2021405 2021406 SFV_2731 SFV_2732     FALSE 0.531 -36.000 0.000 NA   NA
 2021406 2021407 SFV_2732 SFV_2733     TRUE 0.863 61.000 0.500 NA   NA
 2021407 2021408 SFV_2733 SFV_2734     FALSE 0.220 68.000 0.000 NA   NA
 2021408 2021409 SFV_2734 SFV_2735     FALSE 0.271 64.000 0.000 1.000   NA
 2021409 2021410 SFV_2735 SFV_2736     FALSE 0.469 -49.000 0.000 NA   NA
 2021411 2021412 SFV_2737 SFV_2738 ipaH_7 ygcO FALSE 0.007 484.000 0.000 1.000   NA
 2021412 2021413 SFV_2738 SFV_2739 ygcO ygcN TRUE 0.933 -45.000 0.026 0.045 Y NA
 2021413 2021414 SFV_2739 SFV_2740 ygcN ygcM FALSE 0.165 78.000 0.014 1.000 N NA
 2021415 2021416 SFV_2741 SFV_2742 cysJ cysI TRUE 0.999 0.000 0.791 0.001 Y NA
 2021416 2021417 SFV_2742 SFV_2743 cysI cysH FALSE 0.439 74.000 0.116 1.000 N NA
 2021417 2021418 SFV_2743 SFV_2744 cysH   FALSE 0.002 652.000 0.003 NA   NA
 2021420 2021421 SFV_2746 SFV_2747 cysD cysN TRUE 0.993 2.000 0.574 0.001 N NA
 2021421 2021422 SFV_2747 SFV_2748 cysN cysC TRUE 0.994 0.000 0.340 1.000 Y NA
 2021422 2021423 SFV_2748 SFV_2749 cysC ygbE TRUE 0.699 50.000 0.198 NA   NA
 2021423 2021424 SFV_2749 SFV_2750 ygbE   FALSE 0.062 194.000 0.028 NA   NA
 2021424 2021425 SFV_2750 SFV_2751   ygbP TRUE 0.848 19.000 0.185 1.000 N NA
 2021425 2021426 SFV_2751 SFV_2752 ygbP ygbB TRUE 0.995 0.000 0.419 1.000 Y NA
 2021426 2021427 SFV_2752 SFV_2753 ygbB ygbO TRUE 0.945 -3.000 0.173 1.000   NA
 2021427 2021428 SFV_2753 SFV_2754 ygbO surE TRUE 0.862 -64.000 0.235 1.000   NA
 2021428 2021429 SFV_2754 SFV_2755 surE pcm TRUE 0.971 -6.000 0.353 1.000   NA
 2021429 2021430 SFV_2755 SFV_2756 pcm nlpD FALSE 0.154 140.000 0.030 1.000 N NA
 2021430 2021431 SFV_2756 SFV_2757 nlpD rpoS FALSE 0.521 63.000 0.142 1.000 N NA
 2021433 2021434 SFV_2759 SFV_2760   yclC TRUE 0.970 0.000 0.000 NA Y NA
 2021437 2021438 SFV_2763 SFV_2764     FALSE 0.108 155.000 0.000 NA   NA
 2021440 2021441 SFV_2766 SFV_2767     FALSE 0.022 282.000 0.000 1.000 N NA
 1605741 2021443 SFV_2769 SFV_2770 pphB mutS FALSE 0.197 106.000 0.000 NA   NA
 2021445 2021446 SFV_2772 SFV_2773 fhlA hypE FALSE 0.178 74.000 0.019 1.000 N NA
 2021446 2021447 SFV_2773 SFV_2774 hypE hypD TRUE 0.961 39.000 0.353 1.000 Y NA
 2021447 2021448 SFV_2774 SFV_2775 hypD hypC TRUE 0.968 0.000 0.021 NA Y NA
 2021448 2021449 SFV_2775 SFV_2776 hypC hypB TRUE 0.971 -9.000 0.139 NA Y NA
 2021449 2021450 SFV_2776 SFV_2777 hypB hypA TRUE 0.980 4.000 0.306 0.002   NA
 2021451 2021452 SFV_2778 SFV_2779 hycA hycB FALSE 0.180 125.000 0.000 NA   NA
 2021452 2021453 SFV_2779 SFV_2780 hycB hycC TRUE 0.646 169.000 0.154 1.000 Y NA
 2021453 2021454 SFV_2780 SFV_2781 hycC hycD TRUE 0.993 3.000 0.382 1.000 Y NA
 2021454 2021455 SFV_2781 SFV_2782 hycD hycE TRUE 0.970 18.000 0.235 1.000 Y NA
 2021455 2021456 SFV_2782 SFV_2783 hycE hycF TRUE 0.977 10.000 0.200 1.000 Y NA
 2021456 2021457 SFV_2783 SFV_2784 hycF hycG TRUE 0.982 0.000 0.111 1.000 Y NA
 2021457 2021458 SFV_2784 SFV_2785 hycG hycH TRUE 0.933 -3.000 0.156 NA   NA
 2021458 2021459 SFV_2785 SFV_2786 hycH hycI TRUE 0.908 26.000 0.360 NA   NA
 2021459 2021460 SFV_2786 SFV_2787 hycI   FALSE 0.416 25.000 0.022 NA   NA
 2021460 2021461 SFV_2787 SFV_2788     FALSE 0.006 480.000 0.000 NA   NA
 2021462 2021463 SFV_2789 SFV_2790 ascB ascF TRUE 0.992 9.000 0.485 1.000 Y NA
 2021464 2021465 SFV_2791 SFV_2792 ascG hydN TRUE 0.587 149.000 0.316 1.000 N NA
 2021465 2021466 SFV_2792 SFV_2793 hydN hypF FALSE 0.091 153.000 0.018 1.000 N NA
 2021467 2021468 SFV_2794 SFV_2795 ygbD   TRUE 0.916 -3.000 0.000 0.045   NA
 2021470 2021471 SFV_2797 SFV_2798 gutQ srlR TRUE 0.982 -7.000 0.562 1.000 N NA
 2021471 2021472 SFV_2798 SFV_2799 srlR gutM TRUE 0.860 67.000 0.183 NA Y NA
 2021472 2021473 SFV_2799 SFV_2800 gutM srlD TRUE 0.559 105.000 0.197 NA N NA
 2021473 2021474 SFV_2800 SFV_2801 srlD srlB TRUE 0.760 4.000 0.040 1.000 N NA
 2021474 1605774 SFV_2801 SFV_2802 srlB srlE TRUE 0.609 11.000 0.000 NA   NA
 1605774 2021475 SFV_2802 SFV_2803 srlE srlA TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 2021476 2021477 SFV_2804 SFV_2805 mltB ygaD FALSE 0.124 145.000 0.026 NA   NA
 2021477 2021478 SFV_2805 SFV_2806 ygaD recA FALSE 0.373 80.000 0.082 NA   NA
 2021478 2021479 SFV_2806 SFV_2807 recA oraA FALSE 0.246 243.000 0.296 1.000   NA
 2021479 2021480 SFV_2807 SFV_2808 oraA alaS FALSE 0.352 128.000 0.085 1.000   NA
 2021480 2021481 SFV_2808 SFV_2809 alaS csrA FALSE 0.029 235.000 0.020 1.000 N NA
 2021481 1605782 SFV_2809 SFV_2810 csrA   FALSE 0.015 316.000 0.000 NA   NA
 1605782 1605783 SFV_2810 SFV_2811     TRUE 0.713 4.000 0.000 NA   NA
 1605783 1605784 SFV_2811 SFV_2812     FALSE 0.231 65.000 0.000 NA   NA
 1605784 1605785 SFV_2812 SFV_2813     FALSE 0.231 65.000 0.000 NA   NA
 1605785 2021482 SFV_2813 SFV_2814   yqaB FALSE 0.124 148.000 0.000 NA   NA
 2021482 2021483 SFV_2814 SFV_2815 yqaB   TRUE 0.871 -3.000 0.067 NA   NA
 2021483 2021484 SFV_2815 SFV_2816   gshA FALSE 0.351 73.000 0.071 NA   NA
 2021484 2021485 SFV_2816 SFV_2817 gshA ygaG FALSE 0.241 150.000 0.087 1.000 N NA
 2021486 1605791 SFV_2818 SFV_2819 emrB emrA TRUE 0.535 17.000 0.000 NA   NA
 1605791 2021487 SFV_2819 SFV_2820 emrA emrR FALSE 0.174 127.000 0.000 NA   NA
 2021487 2021488 SFV_2820 SFV_2821 emrR ygaH FALSE 0.334 91.000 0.065 NA   NA
 2021488 2021489 SFV_2821 SFV_2822 ygaH   TRUE 0.988 -10.000 0.915 NA   NA
 2021489 2021490 SFV_2822 SFV_2823     FALSE 0.018 344.000 0.060 NA N NA
 2021490 2021491 SFV_2823 SFV_2824   proX FALSE 0.230 231.000 0.174 0.047 N NA
 2021491 2021492 SFV_2824 SFV_2825 proX proW TRUE 0.982 58.000 0.695 0.047 Y NA
 2021492 2021493 SFV_2825 SFV_2826 proW proV TRUE 0.997 -7.000 0.630 0.079 Y NA
 2021493 2021494 SFV_2826 SFV_2827 proV nrdF FALSE 0.112 154.000 0.000 1.000 N NA
 2021494 2021495 SFV_2827 SFV_2828 nrdF nrdE TRUE 0.970 10.000 0.000 0.001 Y NA
 2021495 2021496 SFV_2828 SFV_2829 nrdE nrdI TRUE 0.920 -27.000 0.000 NA Y NA
 2021496 2021497 SFV_2829 SFV_2830 nrdI nrdH TRUE 0.729 -3.000 0.026 NA N NA
 2021497 2021498 SFV_2830 SFV_2831 nrdH ygaM FALSE 0.032 240.000 0.000 NA   NA
 2021502 2021503 SFV_2835 SFV_2836 ygaP   TRUE 0.778 10.000 0.083 NA N NA
 2021504 2021505 SFV_2837 SFV_2838   ygaU FALSE 0.239 84.000 0.027 1.000   NA
 2021506 2021507 SFV_2839 SFV_2840 ygaE gabP TRUE 0.964 21.000 0.625 1.000 N NA
 2021507 2021508 SFV_2840 SFV_2841 gabP gabT FALSE 0.356 238.000 0.121 1.000 Y NA
 2021508 1605814 SFV_2841 SFV_2842 gabT gabD FALSE 0.381 35.000 0.000 NA   NA
 1605814 2021509 SFV_2842 SFV_2843 gabD ygaF FALSE 0.474 23.000 0.000 NA   NA
 2021509 2021510 SFV_2843 SFV_2844 ygaF   FALSE 0.506 20.000 0.000 NA   NA
 2021510 2021511 SFV_2844 SFV_2845     FALSE 0.037 231.000 0.000 NA   NA
 2021512 2021513 SFV_2847 SFV_2848     TRUE 0.811 -3.000 0.000 1.000   NA
 2021513 2021514 SFV_2848 SFV_2849   insB FALSE 0.397 119.000 0.000 0.066   NA
 2021516 2021517 SFV_2851 SFV_2852 intA smpB FALSE 0.003 782.000 0.000 1.000 N NA
 2021519 2021520 SFV_2854 SFV_2855 smpA recN FALSE 0.170 149.000 0.049 1.000 N NA
 2021520 2021521 SFV_2855 SFV_2856 recN yfjB TRUE 0.540 86.000 0.170 1.000 N NA
 2021523 2021524 SFV_2858 SFV_2859 yfjD   TRUE 0.851 45.000 0.349 NA   NA
 2021525 2021526 SFV_2860 SFV_2861 ffh rpsP TRUE 0.773 77.000 0.361 1.000 N NA
 2021526 2021527 SFV_2861 SFV_2862 rpsP yfjA TRUE 0.987 19.000 0.342 0.011 Y NA
 2021527 2021528 SFV_2862 SFV_2863 yfjA trmD TRUE 0.986 31.000 0.672 1.000 Y NA
 2021528 2021529 SFV_2863 SFV_2864 trmD rplS TRUE 0.976 42.000 0.567 1.000 Y NA
 2021530 2021531 SFV_2865 SFV_2866 yfiB yfiN TRUE 0.956 16.000 0.475 1.000 N NA
 2021531 2021532 SFV_2866 SFV_2867 yfiN   FALSE 0.079 180.000 0.000 NA   NA
 2021532 2021533 SFV_2867 SFV_2868     TRUE 0.976 -7.000 0.475 NA   NA
 2021533 2021534 SFV_2868 SFV_2869   yfiL FALSE 0.327 150.000 0.148 NA   NA
 2021535 2021536 SFV_2870 SFV_2871 aroF tyrA TRUE 0.937 11.000 0.000 1.000 Y NA
 2021537 2021538 SFV_2872 SFV_2873 pheA yfiA FALSE 0.017 250.000 0.015 NA N NA
 2021539 2021540 SFV_2874 SFV_2875   sdaC FALSE 0.005 564.000 0.000 1.000 N NA
 2021540 2021541 SFV_2875 SFV_2876 sdaC sdaB TRUE 0.767 58.000 0.000 1.000 Y NA
 2021541 2021542 SFV_2876 SFV_2877 sdaB exo FALSE 0.499 21.000 0.000 1.000 N NA
 2021543 2021544 SFV_2878 SFV_2879 fucO fucA TRUE 0.584 28.000 0.066 1.000 N NA
 2021545 2021546 SFV_2880 SFV_2881 fucP fucI TRUE 0.908 33.000 0.104 1.000 Y NA
 2021546 1605854 SFV_2881 SFV_2882 fucI fucK FALSE 0.196 109.000 0.000 NA   NA
 1605854 2021547 SFV_2882 SFV_2883 fucK fucU TRUE 0.750 2.000 0.000 NA   NA
 2021547 2021548 SFV_2883 SFV_2884 fucU fucR TRUE 0.929 58.000 0.308 1.000 Y NA
 2021549 2021550 SFV_2885 SFV_2886 ygdE ygdD TRUE 0.890 -7.000 0.144 NA   NA
 2021550 2021551 SFV_2886 SFV_2887 ygdD gcvA TRUE 0.705 19.000 0.081 NA   NA
 2021551 2021552 SFV_2887 SFV_2888 gcvA   FALSE 0.011 351.000 0.000 NA   NA
 2021553 2021554 SFV_2889 SFV_2890   ygdK TRUE 0.966 0.000 0.122 0.001   NA
 2021555 2021556 SFV_2891 SFV_2892 ygdL mltA FALSE 0.023 239.000 0.009 1.000 N NA
 1605865 1605866 SFV_2893 SFV_2894     FALSE 0.390 34.000 0.000 NA   NA
 2021559 2021560 SFV_2897 SFV_2898 recD recB TRUE 0.998 0.000 0.688 0.001 Y NA
 2021560 2021561 SFV_2898 SFV_2899 recB ptr TRUE 0.850 -7.000 0.092 1.000 N NA
 2021561 2021562 SFV_2899 SFV_2900 ptr recC FALSE 0.183 176.000 0.092 1.000 N NA
 2021562 2021563 SFV_2900 SFV_2901 recC ppdC TRUE 0.720 13.000 0.076 NA N NA
 2021563 2021564 SFV_2901 SFV_2902 ppdC ygdB TRUE 0.973 -15.000 0.538 NA   NA
 2021564 2021565 SFV_2902 SFV_2903 ygdB ppdB TRUE 0.979 -3.000 0.373 NA   NA
 2021565 1605876 SFV_2903 SFV_2904 ppdB ppdA TRUE 0.675 -9.000 0.000 NA   NA
 1605876 2021566 SFV_2904 SFV_2905 ppdA thyA FALSE 0.073 184.000 0.000 NA   NA
 2021566 2021567 SFV_2905 SFV_2906 thyA lgt TRUE 0.894 7.000 0.164 1.000 N NA
 2021567 2021568 SFV_2906 SFV_2907 lgt ptsP FALSE 0.049 211.000 0.000 1.000 N NA
 2021568 2021569 SFV_2907 SFV_2908 ptsP ygdP FALSE 0.475 13.000 0.008 1.000 N NA
 2021570 2021571 SFV_2909 SFV_2910 mutH   FALSE 0.305 69.000 0.052 1.000 N NA
 2021571 2021572 SFV_2910 SFV_2911     TRUE 0.740 138.000 0.429 NA   NA
 2021572 2021573 SFV_2911 SFV_2912     FALSE 0.245 108.000 0.043 NA   NA
 2021574 2021575 SFV_2913 SFV_2914 ygeD aas TRUE 0.633 38.000 0.124 NA   NA
 2021579 2021580 SFV_2918 SFV_2919 ygeA araE TRUE 0.548 10.000 0.011 1.000 N NA
 2021580 2021581 SFV_2919 SFV_2920 araE kduD FALSE 0.072 186.000 0.000 1.000 N NA
 2021581 2021582 SFV_2920 SFV_2921 kduD kduI TRUE 0.854 30.000 0.269 1.000 N NA
 2021582 2021583 SFV_2921 SFV_2922 kduI yqeF FALSE 0.021 287.000 0.000 1.000 N NA
 1605895 2021584 SFV_2923 SFV_2924     FALSE 0.003 936.000 0.000 NA   NA
 2021584 2021585 SFV_2924 SFV_2925     TRUE 0.811 -3.000 0.000 1.000   NA
 2021586 1605899 SFV_2926 SFV_2927     FALSE 0.066 192.000 0.000 NA   NA
 1605899 2021587 SFV_2927 SFV_2928     FALSE 0.210 79.000 0.000 NA   NA
 2021587 2021588 SFV_2928 SFV_2929     FALSE 0.390 34.000 0.000 NA   NA
 2021589 2021590 SFV_2930 SFV_2931 insB   FALSE 0.015 323.000 0.000 1.000 N NA
 2021590 2021591 SFV_2931 SFV_2932   ygeT TRUE 0.995 11.000 0.500 0.001 Y NA
 2021591 2021592 SFV_2932 SFV_2933 ygeT   TRUE 0.998 -3.000 0.667 0.044 Y NA
 2021594 2021595 SFV_2935 SFV_2936 insB ygfU FALSE 0.014 325.000 0.000 1.000 N NA
 2021595 2021596 SFV_2936 SFV_2937 ygfU   FALSE 0.030 250.000 0.000 1.000 N NA
 2021597 1605911 SFV_2938 SFV_2939 lysS prfB TRUE 0.633 10.000 0.000 NA   NA
 1605911 2021598 SFV_2939 SFV_2940 prfB recJ FALSE 0.210 91.000 0.000 NA   NA
 2021598 2021599 SFV_2940 SFV_2941 recJ dsbC FALSE 0.245 147.000 0.082 1.000 N NA
 2021599 2021600 SFV_2941 SFV_2942 dsbC xerD TRUE 0.640 25.000 0.079 1.000 N NA
 2021602 2021603 SFV_2944 SFV_2945   ygfY TRUE 0.731 -19.000 0.061 NA   NA
 2021605 2021606 SFV_2947 SFV_2948     FALSE 0.234 164.000 0.113 NA   NA
 1605922 2021608 SFV_2950 SFV_2951 ygfF gcvP FALSE 0.025 267.000 0.000 NA   NA
 2021608 2021609 SFV_2951 SFV_2952 gcvP gcvH TRUE 0.873 119.000 0.249 1.000 Y NA
 2021609 2021610 SFV_2952 SFV_2953 gcvH gcvT TRUE 0.984 24.000 0.317 0.001 Y NA
 2021610 2021611 SFV_2953 SFV_2954 gcvT visC FALSE 0.004 448.000 0.004 1.000 N NA
 2021611 2021612 SFV_2954 SFV_2955 visC ubiH TRUE 0.990 23.000 0.474 0.001 Y NA
 2021612 2021613 SFV_2955 SFV_2956 ubiH pepP TRUE 0.773 -3.000 0.026 1.000 N NA
 2021613 2021614 SFV_2956 SFV_2957 pepP ygfB FALSE 0.477 26.000 0.036 NA   NA
 2021615 2021616 SFV_2958 SFV_2959 ygfE ygfA FALSE 0.020 300.000 0.034 NA   NA
 2021617 2021618 SFV_2960 SFV_2961 serA rpiA FALSE 0.028 256.000 0.029 1.000 N NA
 2021619 2021620 SFV_2962 SFV_2963 iciA sbm FALSE 0.055 204.000 0.000 1.000 N NA
 2021620 2021621 SFV_2963 SFV_2964 sbm ygfD TRUE 0.968 -7.000 0.366 1.000 N NA
 2021621 2021622 SFV_2964 SFV_2965 ygfD ygfG TRUE 0.544 11.000 0.015 1.000 N NA
 2021622 2021623 SFV_2965 SFV_2966 ygfG ygfH TRUE 0.809 24.000 0.085 0.018 N NA
 2021624 2021625 SFV_2967 SFV_2968   yggE FALSE 0.108 167.000 0.037 NA   NA
 2021625 2021626 SFV_2968 SFV_2969 yggE yggA FALSE 0.313 126.000 0.075 NA   NA
 2021626 2021627 SFV_2969 SFV_2970 yggA yggB FALSE 0.127 181.000 0.049 1.000   NA
 2021627 2021628 SFV_2970 SFV_2971 yggB fba FALSE 0.082 191.000 0.038 1.000 N NA
 2021628 2021629 SFV_2971 SFV_2972 fba pgk FALSE 0.492 215.000 0.056 0.005 Y NA
 2021629 2021630 SFV_2972 SFV_2973 pgk epd TRUE 0.901 50.000 0.070 0.005 Y NA
 2021631 2021632 SFV_2974 SFV_2975     TRUE 0.707 23.000 0.103 NA   NA
 2021632 2021633 SFV_2975 SFV_2976     TRUE 0.988 1.000 0.605 NA   NA
 2021633 2021634 SFV_2976 SFV_2977     TRUE 0.760 1.000 0.000 NA   NA
 2021634 2021635 SFV_2977 SFV_2978     TRUE 0.818 -12.000 0.093 NA   NA
 2021635 2021636 SFV_2978 SFV_2979     TRUE 0.676 138.000 0.214 0.013   NA
 2021637 2021638 SFV_2980 SFV_2981 yggC yggD TRUE 0.988 -3.000 0.588 NA N NA
 2021638 2021639 SFV_2981 SFV_2982 yggD yggF TRUE 0.951 22.000 0.545 NA N NA
 2021639 2021640 SFV_2982 SFV_2983 yggF   TRUE 0.986 -3.000 0.500 1.000 N NA
 2021640 2021641 SFV_2983 SFV_2984   insB TRUE 0.753 2.000 0.000 1.000 N NA
 2021642 2021643 SFV_2985 SFV_2986     FALSE 0.025 264.000 0.000 NA   NA
 2021646 2021647 SFV_2989 SFV_2990 speB   FALSE 0.156 136.000 0.000 NA   NA
 2021647 2021648 SFV_2990 SFV_2991   insB FALSE 0.438 26.000 0.000 NA   NA
 2021650 2021651 SFV_2993 SFV_2994 speA yqgB FALSE 0.211 87.000 0.000 NA   NA
 2021651 2021652 SFV_2994 SFV_2995 yqgB yqgD FALSE 0.013 333.000 0.000 NA   NA
 2021653 2021654 SFV_2996 SFV_2997 metK galP FALSE 0.007 435.000 0.000 1.000 N NA
 2021654 2021655 SFV_2997 SFV_2998 galP sprT FALSE 0.291 77.000 0.042 1.000   NA
 2021655 2021656 SFV_2998 SFV_2999 sprT endA TRUE 0.625 95.000 0.210 1.000   NA
 2021656 2021657 SFV_2999 SFV_3000 endA yggJ TRUE 0.604 80.000 0.201 NA   NA
 2021657 2021658 SFV_3000 SFV_3001 yggJ gshB TRUE 0.858 13.000 0.173 NA   NA
 2021658 2021659 SFV_3001 SFV_3002 gshB yqgE TRUE 0.608 37.000 0.120 NA N NA
 2021659 2021660 SFV_3002 SFV_3003 yqgE yqgF TRUE 0.965 0.000 0.263 NA N NA
 2021662 2021663 SFV_3005 SFV_3006 yggS yggT TRUE 0.856 18.000 0.189 NA   NA
 2021663 2021664 SFV_3006 SFV_3007 yggT yggU TRUE 0.785 -15.000 0.081 NA   NA
 2021664 2021665 SFV_3007 SFV_3008 yggU yggV TRUE 0.598 8.000 0.016 NA   NA
 2021665 2021666 SFV_3008 SFV_3009 yggV yggW TRUE 0.936 -7.000 0.218 1.000 N NA
 2021666 2021667 SFV_3009 SFV_3010 yggW   FALSE 0.019 314.000 0.000 1.000   NA
 2021667 2021668 SFV_3010 SFV_3011     TRUE 0.795 17.000 0.000 0.011   NA
 2021668 2021669 SFV_3011 SFV_3012     TRUE 0.939 45.000 0.286 NA Y NA
 2021669 2021670 SFV_3012 SFV_3013     TRUE 0.992 0.000 0.286 NA Y NA
 2021671 2021672 SFV_3014 SFV_3015 yggM ansB FALSE 0.089 153.000 0.018 NA   NA
 2021672 2021673 SFV_3015 SFV_3016 ansB yggN FALSE 0.080 176.000 0.027 NA   NA
 2021673 2021674 SFV_3016 SFV_3017 yggN yggL FALSE 0.225 187.000 0.155 NA   NA
 2021674 2021675 SFV_3017 SFV_3018 yggL yggH TRUE 0.899 0.000 0.092 NA   NA
 2021678 2021679 SFV_3020 SFV_3022 yggX mltC FALSE 0.480 62.000 0.128 NA N NA
 2021679 2021680 SFV_3022 SFV_3023 mltC nupG FALSE 0.090 202.000 0.056 NA   NA
 2021682 1605998 SFV_3025 SFV_3026 yqgA   FALSE 0.197 106.000 0.000 NA   NA
 1605998 2021683 SFV_3026 SFV_3027     FALSE 0.004 600.000 0.000 NA   NA
 2021686 2021687 SFV_3030 SFV_3031 yghK glcB FALSE 0.096 355.000 0.000 1.000 Y NA
 2021687 2021688 SFV_3031 SFV_3032 glcB glcG TRUE 0.594 22.000 0.052 NA   NA
 2021688 1606005 SFV_3032 SFV_3033 glcG glcF TRUE 0.693 5.000 0.000 NA   NA
 1606005 1606006 SFV_3033 SFV_3034 glcF glcD TRUE 0.783 0.000 0.000 NA   NA
 2021690 2021691 SFV_3036 SFV_3037     TRUE 0.539 -33.000 0.000 NA   NA
 2021691 2021692 SFV_3037 SFV_3038     FALSE 0.051 209.000 0.000 NA   NA
 1606012 2021694 SFV_3040 SFV_3041 pitB gsp FALSE 0.019 294.000 0.000 NA   NA
 2021696 2021697 SFV_3043 SFV_3044 hybG hybF FALSE 0.160 134.000 0.000 NA   NA
 2021697 2021698 SFV_3044 SFV_3045 hybF hybE TRUE 0.790 -7.000 0.055 NA   NA
 2021698 2021699 SFV_3045 SFV_3046 hybE hybD TRUE 0.954 -7.000 0.291 NA   NA
 2021699 2021700 SFV_3046 SFV_3047 hybD hybC TRUE 0.998 0.000 0.828 1.000 Y NA
 2021700 2021701 SFV_3047 SFV_3048 hybC hybB TRUE 0.969 -3.000 0.000 NA Y NA
 2021701 2021702 SFV_3048 SFV_3049 hybB hybA TRUE 0.945 -10.000 0.000 NA Y NA
 2021702 2021703 SFV_3049 SFV_3050 hybA   TRUE 0.997 3.000 0.615 0.014 Y NA
 2021703 2021704 SFV_3050 SFV_3051     FALSE 0.065 243.000 0.077 NA   NA
 2021704 2021705 SFV_3051 SFV_3052   yghYX FALSE 0.149 119.000 0.017 NA   NA
 2021709 2021710 SFV_3056 SFV_3057 exbD exbB TRUE 0.997 7.000 0.810 0.056 Y NA
 2021711 2021712 SFV_3058 SFV_3059 metC yghB FALSE 0.515 140.000 0.212 NA   NA
 2021713 2021714 SFV_3060 SFV_3062 yqhD yqhE TRUE 0.601 105.000 0.200 1.000   NA
 2021714 2021715 SFV_3062 SFV_3063 yqhE yqhG FALSE 0.057 200.000 0.000 NA   NA
 2021715 2021716 SFV_3063 SFV_3064 yqhG yqhH FALSE 0.290 51.000 0.000 NA   NA
 1606037 2021717 SFV_3065 SFV_3066 ygiRQ sufI FALSE 0.194 111.000 0.000 NA   NA
 2021717 2021718 SFV_3066 SFV_3067 sufI plsC FALSE 0.505 75.000 0.154 1.000 N NA
 2021718 2021719 SFV_3067 SFV_3068 plsC parC FALSE 0.048 234.000 0.043 1.000 N NA
 2021719 2021720 SFV_3068 SFV_3069 parC   FALSE 0.039 546.000 0.005 NA Y NA
 2021720 2021721 SFV_3069 SFV_3070   ygiW FALSE 0.384 53.000 0.053 NA   NA
 2021722 2021723 SFV_3071 SFV_3072 qseB qseC TRUE 0.996 -3.000 0.526 1.000 Y NA
 2021723 2021724 SFV_3072 SFV_3073 qseC mdaB FALSE 0.005 697.000 0.035 1.000   NA
 2021724 2021725 SFV_3073 SFV_3074 mdaB ygiN TRUE 0.675 31.000 0.025 0.025   NA
 2021726 2021727 SFV_3075 SFV_3076 parE yqiA TRUE 0.819 29.000 0.217 NA   NA
 2021727 2021728 SFV_3076 SFV_3077 yqiA icc TRUE 0.983 0.000 0.427 NA   NA
 2021728 2021729 SFV_3077 SFV_3078 icc yqiB TRUE 0.929 25.000 0.433 NA   NA
 2021729 2021730 SFV_3078 SFV_3079 yqiB yqiE TRUE 0.981 1.000 0.443 NA   NA
 2021731 2021732 SFV_3080 SFV_3081 tolC ygiB TRUE 0.719 148.000 0.480 NA   NA
 2021732 2021733 SFV_3081 SFV_3082 ygiB ygiC TRUE 0.984 6.000 0.632 NA   NA
 2021737 2021738 SFV_3086 SFV_3087     FALSE 0.027 256.000 0.000 NA   NA
 2021738 2021739 SFV_3087 SFV_3088     TRUE 0.905 -42.000 0.000 1.000 Y NA
 2021741 1606063 SFV_3090 SFV_3091 insB   FALSE 0.390 34.000 0.000 NA   NA
 2021742 2021743 SFV_3092 SFV_3093   glnE FALSE 0.497 48.000 0.083 1.000 N NA
 2021743 2021744 SFV_3093 SFV_3094 glnE ygiF TRUE 0.602 -64.000 0.053 1.000   NA
 2021745 2021746 SFV_3095 SFV_3096 ygiM cca FALSE 0.431 64.000 0.106 NA N NA
 2021747 2021748 SFV_3097 SFV_3098 bacA ygiG FALSE 0.462 91.000 0.128 1.000 N NA
 2021751 2021752 SFV_3101 SFV_3102 ttdA ttdB TRUE 0.993 28.000 0.667 0.000 Y NA
 2021752 2021753 SFV_3102 SFV_3103 ttdB ygjE FALSE 0.342 48.000 0.037 1.000 N NA
 2021755 2021756 SFV_3105 SFV_3106 rpsU dnaG FALSE 0.319 111.000 0.067 1.000 N NA
 2021756 2021757 SFV_3106 SFV_3107 dnaG rpoD FALSE 0.385 195.000 0.299 1.000 N NA
 2021757 2021758 SFV_3107 SFV_3108 rpoD   FALSE 0.155 138.000 0.000 1.000 N NA
 2021762 2021763 SFV_3116 SFV_3117 ebgR ebgA FALSE 0.210 184.000 0.136 1.000 N NA
 2021763 2021764 SFV_3117 SFV_3118 ebgA ebgC TRUE 0.998 -3.000 0.682 0.000 Y NA
 2021764 2021765 SFV_3118 SFV_3119 ebgC ygjI TRUE 0.825 63.000 0.412 1.000 N NA
 2021765 1606092 SFV_3119 SFV_3120 ygjI ygjJ FALSE 0.160 134.000 0.000 NA   NA
 1606092 1606093 SFV_3120 SFV_3121 ygjJ ygjK TRUE 0.535 17.000 0.000 NA   NA
 1606093 2021766 SFV_3121 SFV_3122 ygjK ygjL FALSE 0.040 226.000 0.000 NA   NA
 2021767 2021768 SFV_3123 SFV_3124 ygjM ygjN TRUE 0.979 -3.000 0.375 NA   NA
 2021768 2021769 SFV_3124 SFV_3126 ygjN ygjO FALSE 0.021 285.000 0.000 NA   NA
 2021770 2021771 SFV_3125 SFV_3127   ygjQ FALSE 0.177 77.000 0.019 NA   NA
 2021771 2021772 SFV_3127 SFV_3128 ygjQ ygjR FALSE 0.177 79.000 0.019 NA   NA
 2021772 2021773 SFV_3128 SFV_3129 ygjR ygjT FALSE 0.029 271.000 0.000 1.000   NA
 2021773 2021774 SFV_3129 SFV_3130 ygjT ygjU FALSE 0.005 596.000 0.000 1.000 N NA
 2021775 2021776 SFV_3131 SFV_3132 ygjV uxaA FALSE 0.458 83.000 0.126 NA   NA
 2021776 2021777 SFV_3132 SFV_3133 uxaA uxaC TRUE 0.947 15.000 0.092 1.000 Y NA
 2021779 2021780 SFV_3135 SFV_3136   tsaC TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 2021781 2021782 SFV_3137 SFV_3138 insB exuR FALSE 0.199 108.000 0.000 1.000 N NA
 2021782 2021783 SFV_3138 SFV_3139 exuR yqjA FALSE 0.012 345.000 0.000 NA   NA
 2021783 2021784 SFV_3139 SFV_3140 yqjA yqjB TRUE 0.981 4.000 0.529 NA   NA
 2021784 2021785 SFV_3140 SFV_3141 yqjB yqjC TRUE 0.815 147.000 0.684 NA   NA
 2021785 2021786 SFV_3141 SFV_3142 yqjC yqjD TRUE 0.963 -42.000 0.609 NA   NA
 2021786 2021787 SFV_3142 SFV_3143 yqjD yqjE TRUE 0.935 3.000 0.185 NA   NA
 2021787 2021788 SFV_3143 SFV_3144 yqjE   TRUE 0.910 -10.000 0.185 NA   NA
 2021788 2021789 SFV_3144 SFV_3145   yqjF FALSE 0.508 96.000 0.161 NA   NA
 2021789 2021790 SFV_3145 SFV_3146 yqjF yqjG FALSE 0.216 70.000 0.000 NA   NA
 2021790 2021791 SFV_3146 SFV_3147 yqjG yhaH FALSE 0.028 272.000 0.000 1.000   NA
 2021793 2021794 SFV_3149 SFV_3150 yhaK yhaL FALSE 0.356 23.000 0.005 NA   NA
 2021795 2021796 SFV_3151 SFV_3152 yhaNM yhaO TRUE 0.744 28.000 0.157 NA   NA
 2021796 2021797 SFV_3152 SFV_3153 yhaO yhaP FALSE 0.105 338.000 0.000 1.000 Y NA
 2021797 2021798 SFV_3153 SFV_3154 yhaP yhaR FALSE 0.478 72.000 0.150 NA N NA
 2021798 2021799 SFV_3154 SFV_3155 yhaR tdcE FALSE 0.419 -49.000 0.000 NA N NA
 2021799 2021800 SFV_3155 SFV_3156 tdcE tdcD TRUE 0.957 34.000 0.286 1.000 Y NA
 2021800 2021801 SFV_3156 SFV_3157 tdcD tdcC TRUE 0.929 14.000 0.308 1.000 N NA
 2021801 2021802 SFV_3157 SFV_3158 tdcC tdcB TRUE 0.900 22.000 0.029 1.000 Y NA
 2021802 2021803 SFV_3158 SFV_3159 tdcB tdcA FALSE 0.186 99.000 0.023 1.000 N NA
 2021804 2021805 SFV_3160 SFV_3161 tdcR yhaB FALSE 0.027 256.000 0.000 NA   NA
 2021805 2021806 SFV_3161 SFV_3162 yhaB yhaC FALSE 0.484 22.000 0.000 NA   NA
 2021806 2021807 SFV_3162 SFV_3163 yhaC   FALSE 0.003 1073.000 0.000 NA   NA
 2021808 2021809 SFV_3164 SFV_3165 yhaD yhaE TRUE 0.818 16.000 0.152 1.000 N NA
 2021809 2021810 SFV_3165 SFV_3166 yhaE yhaF TRUE 0.902 36.000 0.424 1.000 N NA
 2021810 2021811 SFV_3166 SFV_3167 yhaF yhaU FALSE 0.366 241.000 0.143 1.000 Y NA
 2021811 2021812 SFV_3167 SFV_3168 yhaU insB TRUE 0.753 2.000 0.000 1.000 N NA
 2021813 1606142 SFV_3169 SFV_3170   yraH FALSE 0.120 149.000 0.000 NA   NA
 1606142 2021814 SFV_3170 SFV_3171 yraH yraI FALSE 0.210 80.000 0.000 NA   NA
 2021814 1606144 SFV_3171 SFV_3172 yraI yraJ FALSE 0.417 29.000 0.000 NA   NA
 2021815 2021816 SFV_3173 SFV_3174     TRUE 0.891 24.000 0.000 1.000 Y NA
 2021819 2021820 SFV_3177 SFV_3178 yraM yraN TRUE 0.827 -42.000 0.172 1.000   NA
 2021820 2021821 SFV_3178 SFV_3179 yraN yraO TRUE 0.846 20.000 0.187 1.000 N NA
 2021821 2021822 SFV_3179 SFV_3180 yraO yraP TRUE 0.978 10.000 0.613 NA   NA
 2021823 2021824 SFV_3181 SFV_3182 yraQ yraR FALSE 0.275 73.000 0.045 NA   NA
 2021828 2021829 SFV_3186 SFV_3187 yhbS yhbT TRUE 0.962 -6.000 0.295 1.000   NA
 2021830 2021831 SFV_3188 SFV_3189 yhbU yhbV TRUE 0.998 9.000 0.948 0.003 Y NA
 2021831 2021832 SFV_3189 SFV_3190 yhbV yhbW FALSE 0.205 114.000 0.041 NA N NA
 2021833 2021834 SFV_3191 SFV_3192 mtr deaD FALSE 0.078 154.000 0.009 1.000 N NA
 2021834 2021835 SFV_3192 SFV_3193 deaD yhbM FALSE 0.301 114.000 0.053 1.000   NA
 2021835 2021836 SFV_3193 SFV_3194 yhbM pnp FALSE 0.357 109.000 0.071 1.000   NA
 2021836 2021837 SFV_3194 SFV_3195 pnp rpsO TRUE 0.573 247.000 0.335 1.000 Y NA
 2021837 2021838 SFV_3195 SFV_3196 rpsO truB TRUE 0.779 149.000 0.211 1.000 Y NA
 2021838 2021839 SFV_3196 SFV_3197 truB rbfA TRUE 0.993 0.000 0.318 1.000 Y NA
 2021839 2021840 SFV_3197 SFV_3198 rbfA infB TRUE 0.888 164.000 0.530 1.000 Y NA
 2021840 2021841 SFV_3198 SFV_3199 infB nusA TRUE 0.906 25.000 0.342 1.000 N NA
 2021841 2021842 SFV_3199 SFV_3200 nusA yhbC TRUE 0.962 28.000 0.759 NA   NA
 2021842 1606173 SFV_3200 SFV_3201 yhbC   FALSE 0.052 207.000 0.000 NA   NA
 1606175 1606176 SFV_3203 SFV_3204 yhbX   FALSE 0.007 441.000 0.000 NA   NA
 1606176 2021844 SFV_3204 SFV_3205   secG TRUE 0.557 15.000 0.000 NA   NA
 2021844 2021845 SFV_3205 SFV_3206 secG mrsA FALSE 0.031 227.000 0.016 1.000 N NA
 2021845 2021846 SFV_3206 SFV_3207 mrsA folP TRUE 0.948 -7.000 0.260 1.000 N NA
 2021846 2021847 SFV_3207 SFV_3208 folP hflB TRUE 0.744 90.000 0.325 1.000 N NA
 2021847 2021848 SFV_3208 SFV_3209 hflB ftsJ FALSE 0.486 100.000 0.152 1.000 N NA
 2021852 2021853 SFV_3213 SFV_3214 yhbZ yhbE FALSE 0.527 16.000 0.015 1.000   NA
 2021853 2021854 SFV_3214 SFV_3215 yhbE rpmA FALSE 0.176 127.000 0.019 1.000   NA
 2021854 2021855 SFV_3215 SFV_3216 rpmA rplU TRUE 0.994 21.000 0.667 0.011 Y NA
 2021856 2021857 SFV_3217 SFV_3218 ispB nlp FALSE 0.033 227.000 0.000 NA N NA
 2021858 2021859 SFV_3219 SFV_3220 murA yrbA TRUE 0.731 55.000 0.258 NA N NA
 2021859 2021860 SFV_3220 SFV_3221 yrbA yrbB TRUE 0.713 145.000 0.453 NA   NA
 2021860 2021861 SFV_3221 SFV_3222 yrbB yrbC TRUE 0.883 -96.000 0.308 NA   NA
 2021861 2021862 SFV_3222 SFV_3223 yrbC yrbD TRUE 0.851 19.000 0.188 NA   NA
 2021862 2021863 SFV_3223 SFV_3224 yrbD yrbE TRUE 0.981 5.000 0.562 NA   NA
 2021863 2021864 SFV_3224 SFV_3225 yrbE yrbF TRUE 0.993 8.000 0.530 NA Y NA
 2021865 2021866 SFV_3226 SFV_3227 yrbG yrbH TRUE 0.939 -7.000 0.226 1.000 N NA
 2021866 2021867 SFV_3227 SFV_3228 yrbH yrbI TRUE 0.963 21.000 0.598 1.000   NA
 2021867 2021868 SFV_3228 SFV_3229 yrbI yrbK TRUE 0.989 -3.000 0.617 NA   NA
 2021868 2021869 SFV_3229 SFV_3230 yrbK yhbN TRUE 0.936 -52.000 0.459 NA   NA
 2021869 2021870 SFV_3230 SFV_3231 yhbN yhbG TRUE 0.978 7.000 0.543 NA   NA
 2021870 2021871 SFV_3231 SFV_3232 yhbG rpoN TRUE 0.660 48.000 0.163 1.000   NA
 2021871 2021872 SFV_3232 SFV_3233 rpoN yhbH TRUE 0.970 23.000 0.820 NA N NA
 2021872 2021873 SFV_3233 SFV_3234 yhbH ptsN TRUE 0.876 118.000 0.728 NA N NA
 2021873 2021874 SFV_3234 SFV_3235 ptsN yhbJ TRUE 0.705 46.000 0.186 NA   NA
 2021874 2021875 SFV_3235 SFV_3236 yhbJ ptsO TRUE 0.948 -3.000 0.182 NA   NA
 2021875 2021876 SFV_3236 SFV_3237 ptsO yrbL FALSE 0.030 213.000 0.007 NA   NA
 1606210 2021877 SFV_3238 SFV_3239 mtgA yhbL TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 2021877 2021878 SFV_3239 SFV_3240 yhbL arcB FALSE 0.031 230.000 0.000 NA N NA
 2021878 2021879 SFV_3240 SFV_3241 arcB yhcC FALSE 0.447 96.000 0.113 1.000   NA
 2021880 2021881 SFV_3242 SFV_3243 gltB gltD TRUE 0.975 13.000 0.096 0.000 Y NA
 2021881 2021882 SFV_3243 SFV_3244 gltD   FALSE 0.003 737.000 0.000 1.000 N NA
 2021882 2021883 SFV_3244 SFV_3245     TRUE 0.782 141.000 0.182 1.000 Y NA
 2021884 2021885 SFV_3246 SFV_3247 yhcH yhcI TRUE 0.969 -3.000 0.000 NA Y NA
 2021885 2021886 SFV_3247 SFV_3248 yhcI yhcJ TRUE 0.971 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 2021886 2021887 SFV_3248 SFV_3249 yhcJ nanT TRUE 0.806 48.000 0.000 1.000 Y NA
 2021887 2021888 SFV_3249 SFV_3250 nanT nanA TRUE 0.718 110.000 0.318 1.000 N NA
 2021888 2021889 SFV_3250 SFV_3251 nanA yhcK FALSE 0.185 122.000 0.000 1.000 N NA
 2021889 2021890 SFV_3251 SFV_3252 yhcK   FALSE 0.022 279.000 0.000 NA   NA
 2021891 2021892 SFV_3253 SFV_3254 insB yhcL FALSE 0.180 126.000 0.000 1.000 N NA
 2021893 2021894 SFV_3255 SFV_3256 sspB sspA TRUE 0.988 6.000 0.831 NA   NA
 2021894 2021895 SFV_3256 SFV_3257 sspA rpsI FALSE 0.006 395.000 0.014 1.000 N NA
 2021895 2021896 SFV_3257 SFV_3258 rpsI rplM TRUE 0.994 16.000 0.601 0.010 Y NA
 2021896 2021897 SFV_3258 SFV_3259 rplM yhcM FALSE 0.027 219.000 0.003 NA   NA
 2021898 2021899 SFV_3260 SFV_3261 yhcB degQ FALSE 0.320 154.000 0.154 NA   NA
 2021899 2021900 SFV_3261 SFV_3262 degQ degS TRUE 0.937 90.000 0.262 0.002 Y NA
 2021902 2021903 SFV_3264 SFV_3265 argR yhcN FALSE 0.016 314.000 0.000 NA   NA
 2021904 2021905 SFV_3266 SFV_3267 yhcO yhcP FALSE 0.206 92.000 0.027 NA   NA
 2021905 2021906 SFV_3267 SFV_3268 yhcP yhcQ TRUE 0.984 6.000 0.667 NA   NA
 2021906 2021907 SFV_3268 SFV_3269 yhcQ yhcR TRUE 0.838 8.000 0.100 NA   NA
 2021909 2021910 SFV_3271 SFV_3272 tldD yhdRP FALSE 0.153 156.000 0.050 NA   NA
 2021910 2021911 SFV_3272 SFV_3273 yhdRP cafA TRUE 0.727 68.000 0.296 NA   NA
 2021911 2021912 SFV_3273 SFV_3274 cafA yhdE TRUE 0.965 -10.000 0.417 NA N NA
 2021912 2021913 SFV_3274 SFV_3275 yhdE mreD TRUE 0.911 9.000 0.206 NA N NA
 2021913 2021914 SFV_3275 SFV_3276 mreD mreC TRUE 0.998 0.000 0.550 0.002 Y NA
 2021914 2021915 SFV_3276 SFV_3277 mreC mreB TRUE 0.901 66.000 0.689 1.000 N NA
 2021915 2021916 SFV_3277 SFV_3278 mreB yhdA FALSE 0.017 305.000 0.000 1.000 N NA
 2021917 2021918 SFV_3279 SFV_3280 yhdH accB FALSE 0.003 978.000 0.000 1.000 N NA
 2021918 2021919 SFV_3280 SFV_3281 accB accC TRUE 0.990 11.000 0.275 0.000 Y NA
 2021919 2021920 SFV_3281 SFV_3282 accC yhdT FALSE 0.395 109.000 0.103 NA   NA
 2021920 2021921 SFV_3282 SFV_3283 yhdT panF TRUE 0.983 -10.000 0.682 NA   NA
 2021921 2021922 SFV_3283 SFV_3284 panF prmA TRUE 0.656 12.000 0.041 1.000 N NA
 2021922 2021923 SFV_3284 SFV_3285 prmA yhdG FALSE 0.124 329.000 0.042 1.000 Y NA
 2021923 2021924 SFV_3285 SFV_3286 yhdG fis TRUE 0.760 26.000 0.161 1.000 N NA
 2021924 2021925 SFV_3286 SFV_3287 fis yhdJ TRUE 0.703 86.000 0.016 1.000 Y NA
 2021927 2021928 SFV_3289 SFV_3290   yhdW FALSE 0.417 29.000 0.000 NA   NA
 2021928 1606263 SFV_3290 SFV_3291 yhdW yhdX FALSE 0.295 50.000 0.000 NA   NA
 1606263 2021929 SFV_3291 SFV_3292 yhdX yhdY TRUE 0.633 10.000 0.000 NA   NA
 2021929 2021930 SFV_3292 SFV_3293 yhdY yhdZ TRUE 0.995 8.000 0.734 1.000 Y NA
 1606266 1606267 SFV_3294 SFV_3295 rrfF   FALSE 0.340 41.000 0.000 NA   NA
 1606267 1606268 SFV_3295 SFV_3296   rrfD TRUE 0.578 13.000 0.000 NA   NA
 1606268 1606269 SFV_3296 SFV_3297 rrfD rrlD FALSE 0.205 95.000 0.000 NA   NA
 1606269 1606270 SFV_3297 SFV_3298 rrlD   FALSE 0.063 194.000 0.000 NA   NA
 1606270 1606271 SFV_3298 SFV_3299   rrsD FALSE 0.212 86.000 0.000 NA   NA
 2021932 2021933 SFV_3301 SFV_3302 yrdB aroE TRUE 0.824 -3.000 0.043 NA   NA
 2021933 2021934 SFV_3302 SFV_3303 aroE yrdC TRUE 0.828 5.000 0.087 NA N NA
 2021934 2021935 SFV_3303 SFV_3304 yrdC smg FALSE 0.004 531.000 0.011 NA   NA
 2021935 2021936 SFV_3304 SFV_3305 smg smf TRUE 0.796 -28.000 0.124 NA   NA
 2021937 2021938 SFV_3306 SFV_3307 def fmt TRUE 0.960 15.000 0.058 0.015 Y NA
 2021938 2021939 SFV_3307 SFV_3308 fmt sun TRUE 0.968 25.000 0.305 1.000 Y NA
 2021939 2021940 SFV_3308 SFV_3309 sun trkA TRUE 0.742 22.000 0.122 1.000 N NA
 2021940 2021941 SFV_3309 SFV_3310 trkA   FALSE 0.079 181.000 0.000 1.000 N NA
 2021941 2021942 SFV_3310 SFV_3311     TRUE 0.969 -3.000 0.000 NA Y NA
 2021942 2021943 SFV_3311 SFV_3312     TRUE 0.901 20.000 0.000 NA Y NA
 2021944 2021945 SFV_3313 SFV_3314   rplQ FALSE 0.089 170.000 0.000 NA   NA
 2021945 2021946 SFV_3314 SFV_3315 rplQ rpoA TRUE 0.956 41.000 0.873 1.000 N NA
 2021946 2021947 SFV_3315 SFV_3316 rpoA rpsD TRUE 0.946 26.000 0.549 1.000 N NA
 2021947 2021948 SFV_3316 SFV_3317 rpsD rpsK TRUE 0.986 34.000 0.509 0.013 Y NA
 2021948 2021949 SFV_3317 SFV_3318 rpsK rpsM TRUE 0.995 17.000 0.810 0.010 Y NA
 2021949 2021950 SFV_3318 SFV_3319 rpsM rpmJ TRUE 0.767 147.000 0.086 0.010 Y NA
 2021950 2021951 SFV_3319 SFV_3320 rpmJ prlA FALSE 0.437 32.000 0.036 1.000 N NA
 2021951 2021952 SFV_3320 SFV_3321 prlA rplO TRUE 0.985 8.000 0.730 1.000 N NA
 2021952 2021953 SFV_3321 SFV_3322 rplO rpmD TRUE 0.998 4.000 0.653 0.001 Y NA
 2021953 2021954 SFV_3322 SFV_3323 rpmD rpsE TRUE 0.998 4.000 0.789 0.013 Y NA
 2021954 2021955 SFV_3323 SFV_3324 rpsE rplR TRUE 0.996 15.000 0.814 0.013 Y NA
 2021955 2021956 SFV_3324 SFV_3325 rplR rplF TRUE 0.997 10.000 0.815 0.010 Y NA
 2021956 2021957 SFV_3325 SFV_3326 rplF rpsH TRUE 0.996 13.000 0.808 0.010 Y NA
 2021957 2021958 SFV_3326 SFV_3327 rpsH rpsN TRUE 0.984 34.000 0.473 0.010 Y NA
 2021958 2021959 SFV_3327 SFV_3328 rpsN rplE TRUE 0.992 15.000 0.496 0.010 Y NA
 2021959 2021960 SFV_3328 SFV_3329 rplE rplX TRUE 0.996 15.000 0.758 0.010 Y NA
 2021960 2021961 SFV_3329 SFV_3330 rplX rplN TRUE 0.997 11.000 0.810 0.013 Y NA
 2021961 2021962 SFV_3330 SFV_3331 rplN rpsQ TRUE 0.950 165.000 0.791 0.013 Y NA
 2021962 2021963 SFV_3331 SFV_3332 rpsQ rpmC TRUE 0.999 0.000 0.828 0.010 Y NA
 2021963 2021964 SFV_3332 SFV_3333 rpmC rplP TRUE 0.999 0.000 0.802 0.010 Y NA
 2021964 2021965 SFV_3333 SFV_3334 rplP rpsC TRUE 0.996 13.000 0.828 0.013 Y NA
 2021965 2021966 SFV_3334 SFV_3335 rpsC rplV TRUE 0.995 18.000 0.719 0.013 Y NA
 2021966 2021967 SFV_3335 SFV_3336 rplV rplB FALSE 0.235 310.000 0.000 0.001 Y NA
 2021967 2021968 SFV_3336 SFV_3337 rplB rplW TRUE 0.996 18.000 0.849 0.013 Y NA
 2021968 2021969 SFV_3337 SFV_3338 rplW rplD TRUE 0.997 -3.000 0.513 0.010 Y NA
 2021969 2021970 SFV_3338 SFV_3339 rplD rplC TRUE 0.994 11.000 0.486 0.010 Y NA
 2021970 2021971 SFV_3339 SFV_3340 rplC rpsJ TRUE 0.975 33.000 0.307 0.013 Y NA
 2021973 2021974 SFV_3342 SFV_3343 bfr yheA TRUE 0.712 73.000 0.033 NA Y NA
 2021974 2021975 SFV_3343 SFV_3344 yheA tufA FALSE 0.036 183.000 0.007 NA N NA
 2021975 2021976 SFV_3344 SFV_3345 tufA fusA TRUE 0.962 71.000 0.400 0.001 Y NA
 2021976 2021977 SFV_3345 SFV_3346 fusA rpsG TRUE 0.984 28.000 0.579 1.000 Y NA
 2021977 2021978 SFV_3346 SFV_3347 rpsG rpsL TRUE 0.975 97.000 0.620 0.002 Y NA
 2021978 2021979 SFV_3347 SFV_3348 rpsL yheL FALSE 0.248 126.000 0.058 NA N NA
 2021979 2021980 SFV_3348 SFV_3349 yheL yheM TRUE 0.996 8.000 0.804 NA Y NA
 2021980 2021981 SFV_3349 SFV_3350 yheM yheN TRUE 0.998 0.000 0.790 NA Y NA
 2021981 2021982 SFV_3350 SFV_3351 yheN yheO TRUE 0.959 0.000 0.220 NA   NA
 2021982 2021983 SFV_3351 SFV_3352 yheO fkpA FALSE 0.508 167.000 0.310 NA   NA
 2021985 2021986 SFV_3354 SFV_3355 slyD   TRUE 0.772 95.000 0.370 NA   NA
 2021986 2021987 SFV_3355 SFV_3356   kefB TRUE 0.961 10.000 0.400 NA   NA
 2021987 2021988 SFV_3356 SFV_3357 kefB yheR TRUE 0.934 64.000 0.927 1.000   NA
 2021989 2021990 SFV_3358 SFV_3359 yheS yheT TRUE 0.732 0.000 0.016 NA   NA
 2021990 2021991 SFV_3359 SFV_3360 yheT yheU TRUE 0.885 -33.000 0.222 NA   NA
 2021991 2021992 SFV_3360 SFV_3361 yheU prkB TRUE 0.785 54.000 0.303 NA   NA
 2021994 2021995 SFV_3363 SFV_3364 crp yhfK TRUE 0.562 51.000 0.111 1.000   NA
 2021996 2021997 SFV_3365 SFV_3366 argD pabA TRUE 0.790 86.000 0.088 1.000 Y NA
 2021997 2021998 SFV_3366 SFV_3367 pabA fic FALSE 0.307 32.000 0.008 1.000 N NA
 2021998 2021999 SFV_3367 SFV_3368 fic yhfG TRUE 0.659 -10.000 0.000 NA   NA
 2021999 2022000 SFV_3368 SFV_3369 yhfG ppiA TRUE 0.761 105.000 0.364 NA   NA
 2022001 2022002 SFV_3370 SFV_3371 yhfC nirB FALSE 0.026 262.000 0.000 1.000 N NA
 2022002 2022003 SFV_3371 SFV_3372 nirB nirD TRUE 0.996 -3.000 0.829 0.000 N NA
 2022003 2022004 SFV_3372 SFV_3373 nirD nirC TRUE 0.881 126.000 0.283 1.000 Y NA
 2022004 2022005 SFV_3373 SFV_3374 nirC cysG FALSE 0.521 19.000 0.000 1.000 N NA
 2022005 2022006 SFV_3374 SFV_3375 cysG yhfL FALSE 0.030 247.000 0.000 NA   NA
 2022006 1606348 SFV_3375 SFV_3376 yhfL yhfM FALSE 0.031 244.000 0.000 NA   NA
 1606348 2022007 SFV_3376 SFV_3377 yhfM yhfN TRUE 0.783 0.000 0.000 NA   NA
 2022007 2022008 SFV_3377 SFV_3378 yhfN yhfP TRUE 0.910 50.000 0.600 NA N NA
 2022008 2022009 SFV_3378 SFV_3379 yhfP yhfQ TRUE 0.988 -3.000 0.200 NA Y NA
 2022009 2022010 SFV_3379 SFV_3380 yhfQ yhfR TRUE 0.831 34.000 0.267 NA N NA
 2022011 2022012 SFV_3381 SFV_3382 yhfS yhfT TRUE 0.883 12.000 0.185 NA   NA
 2022012 2022013 SFV_3382 SFV_3383 yhfT yhfU TRUE 0.982 12.000 0.828 NA   NA
 2022013 2022014 SFV_3383 SFV_3384 yhfU yhfV TRUE 0.931 -28.000 0.312 1.000   NA
 2022014 2022015 SFV_3384 SFV_3385 yhfV yhfW TRUE 0.908 -3.000 0.094 1.000   NA
 2022015 2022016 SFV_3385 SFV_3386 yhfW yhfX TRUE 0.988 1.000 0.625 NA N NA
 2022016 2022017 SFV_3386 SFV_3387 yhfX yhfY TRUE 0.653 84.000 0.233 NA   NA
 2022017 2022018 SFV_3387 SFV_3388 yhfY yhfZ TRUE 0.969 -25.000 0.562 NA   NA
 2022018 2022019 SFV_3388 SFV_3389 yhfZ trpS FALSE 0.008 327.000 0.004 NA   NA
 2022019 2022020 SFV_3389 SFV_3390 trpS gph TRUE 0.882 -7.000 0.118 1.000   NA
 2022020 2022021 SFV_3390 SFV_3391 gph rpe TRUE 0.883 -7.000 0.120 1.000   NA
 2022021 2022022 SFV_3391 SFV_3392 rpe dam TRUE 0.584 18.000 0.040 1.000 N NA
 2022022 2022023 SFV_3392 SFV_3393 dam damX TRUE 0.634 107.000 0.234 NA   NA
 2022023 2022024 SFV_3393 SFV_3394 damX aroB FALSE 0.185 92.000 0.022 NA   NA
 2022024 2022025 SFV_3394 SFV_3395 aroB aroK TRUE 0.900 57.000 0.208 1.000 Y NA
 2022025 2022026 SFV_3395 SFV_3396 aroK hofQ FALSE 0.077 401.000 0.319 1.000 N NA
 2022026 2022027 SFV_3396 SFV_3397 hofQ yrfA TRUE 0.612 -88.000 0.072 NA   NA
 2022027 2022028 SFV_3397 SFV_3398 yrfA yrfB TRUE 0.969 -10.000 0.444 NA   NA
 2022028 2022029 SFV_3398 SFV_3399 yrfB yrfC TRUE 0.950 -16.000 0.348 NA   NA
 2022029 2022030 SFV_3399 SFV_3400 yrfC yrfD TRUE 0.993 0.000 0.870 NA   NA
 2022033 2022034 SFV_3403 SFV_3404 yrfF yrfG FALSE 0.506 65.000 0.122 1.000   NA
 2022034 2022035 SFV_3404 SFV_3405 yrfG yrfH TRUE 0.736 -22.000 0.056 1.000   NA
 2022035 2022036 SFV_3405 SFV_3406 yrfH yrfI TRUE 0.735 25.000 0.140 1.000 N NA
 2022039 2022040 SFV_3409 SFV_3410 envZ ompR TRUE 0.997 -3.000 0.584 1.000 Y NA
 2022041 2022042 SFV_3411 SFV_3412 greB yhgF TRUE 0.804 97.000 0.123 1.000 Y NA
 2022042 2022043 SFV_3412 SFV_3413 yhgF feoA FALSE 0.007 438.000 0.000 1.000 N NA
 2022043 2022044 SFV_3413 SFV_3414 feoA feoB TRUE 0.960 17.000 0.177 1.000 Y NA
 2022044 2022045 SFV_3414 SFV_3415 feoB yhgG TRUE 0.972 -9.000 0.455 NA   NA
 2022045 2022046 SFV_3415 SFV_3416 yhgG yhgA FALSE 0.055 203.000 0.000 NA   NA
 2022046 2022047 SFV_3416 SFV_3417 yhgA   FALSE 0.210 76.000 0.000 NA   NA
 2022047 2022048 SFV_3417 SFV_3418     TRUE 0.891 24.000 0.000 1.000 Y NA
 2022048 2022049 SFV_3418 SFV_3419     FALSE 0.009 359.000 0.000 NA N NA
 2022051 2022052 SFV_3421 SFV_3422 yhgH yhgI FALSE 0.420 59.000 0.066 1.000   NA
 2022052 2022053 SFV_3422 SFV_3423 yhgI gntT FALSE 0.013 361.000 0.000 1.000   NA
 2022054 2022055 SFV_3424 SFV_3425 malQ malP TRUE 0.979 10.000 0.137 0.014 Y NA
 2022057 2022058 SFV_3427 SFV_3428 yhgKJ rtcB TRUE 0.846 4.000 0.081 NA   NA
 2022060 2022061 SFV_3430 SFV_3431 glpR glpG TRUE 0.870 17.000 0.190 1.000   NA
 2022061 2022062 SFV_3431 SFV_3432 glpG glpE TRUE 0.794 102.000 0.405 1.000   NA
 2022064 2022065 SFV_3434 SFV_3435 yzgL   FALSE 0.184 120.000 0.000 NA   NA
 2022065 2022066 SFV_3435 SFV_3436     TRUE 0.567 14.000 0.000 NA   NA
 2022066 2022067 SFV_3436 SFV_3437   glgP FALSE 0.200 100.000 0.000 NA   NA
 2022067 2022068 SFV_3437 SFV_3438 glgP glgA TRUE 0.968 19.000 0.228 1.000 Y NA
 2022068 2022069 SFV_3438 SFV_3439 glgA glgC TRUE 0.993 0.000 0.307 1.000 Y NA
 2022069 2022070 SFV_3439 SFV_3440 glgC glgX TRUE 0.969 18.000 0.228 1.000 Y NA
 2022070 2022071 SFV_3440 SFV_3441 glgX glgB TRUE 0.983 -3.000 0.020 0.003 Y NA
 2022071 2022072 SFV_3441 SFV_3442 glgB asd FALSE 0.024 273.000 0.000 1.000 N NA
 1606416 2022074 SFV_3444 SFV_3445 gntU gntK TRUE 0.713 4.000 0.000 NA   NA
 2022074 2022075 SFV_3445 SFV_3446 gntK gntR FALSE 0.153 139.000 0.000 1.000 N NA
 2022075 2022076 SFV_3446 SFV_3447 gntR yhhW FALSE 0.022 281.000 0.000 NA   NA
 2022076 2022077 SFV_3447 SFV_3448 yhhW yhhX TRUE 0.760 123.000 0.400 NA   NA
 2022081 1606425 SFV_3452 SFV_3453 ugpQ ugpC TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 1606425 2022082 SFV_3453 SFV_3454 ugpC ugpE FALSE 0.527 -37.000 0.000 NA   NA
 2022082 2022083 SFV_3454 SFV_3455 ugpE ugpA TRUE 0.995 -3.000 0.306 0.044 Y NA
 2022083 2022084 SFV_3455 SFV_3456 ugpA ugpB TRUE 0.978 98.000 0.793 0.044 Y NA
 2022084 2022085 SFV_3456 SFV_3457 ugpB livF FALSE 0.008 397.000 0.000 1.000 N NA
 2022085 2022086 SFV_3457 SFV_3458 livF livG TRUE 0.999 2.000 0.967 0.013 Y NA
 2022086 2022087 SFV_3458 SFV_3459 livG livM TRUE 0.997 -3.000 0.574 1.000 Y NA
 2022087 2022088 SFV_3459 SFV_3460 livM livH TRUE 0.973 66.000 0.574 0.044 Y NA
 2022088 2022089 SFV_3460 SFV_3461 livH livK TRUE 0.875 81.000 0.217 1.000 Y NA
 2022091 2022092 SFV_3463 SFV_3464 livJ rpoH FALSE 0.024 271.000 0.000 1.000 N NA
 2022092 2022093 SFV_3464 SFV_3465 rpoH ftsX FALSE 0.047 246.000 0.051 1.000 N NA
 2022093 2022094 SFV_3465 SFV_3466 ftsX ftsE TRUE 0.973 -7.000 0.121 1.000 Y NA
 2022094 1606439 SFV_3466 SFV_3467 ftsE ftsY TRUE 0.735 3.000 0.000 NA   NA
 2022095 2022096 SFV_3468 SFV_3469 yhhF yhhL TRUE 0.781 -10.000 0.063 NA   NA
 2022098 2022099 SFV_3471 SFV_3472 yhhN zntA TRUE 0.823 74.000 0.325 0.065   NA
 2022101 2022102 SFV_3474 SFV_3475 yhhQ   FALSE 0.337 73.000 0.066 NA   NA
 2022104 2022105 SFV_3477 SFV_3478 yhhT yhhU TRUE 0.779 55.000 0.300 NA   NA
 2022105 2022106 SFV_3478 SFV_3479 yhhU nikA FALSE 0.197 111.000 0.000 1.000 N NA
 2022106 2022107 SFV_3479 SFV_3480 nikA nikB TRUE 0.999 0.000 0.833 0.054 Y NA
 2022107 2022108 SFV_3480 SFV_3481 nikB nikC TRUE 0.998 -3.000 0.629 0.001 Y NA
 2022108 2022109 SFV_3481 SFV_3482 nikC nikD TRUE 0.995 0.000 0.409 1.000 Y NA
 2022109 2022110 SFV_3482 SFV_3483 nikD nikE TRUE 0.995 -3.000 0.290 0.068 Y NA
 2022110 2022111 SFV_3483 SFV_3484 nikE yhhG TRUE 0.695 6.000 0.031 1.000 N NA
 2022112 2022113 SFV_3485 SFV_3486 hicB yhhJ FALSE 0.016 331.000 0.000 1.000   NA
 2022113 2022114 SFV_3486 SFV_3487 yhhJ yhiH TRUE 0.992 0.000 0.500 0.004   NA
 2022114 2022115 SFV_3487 SFV_3488 yhiH yhiI TRUE 0.926 -3.000 0.049 0.075   NA
 2022115 2022116 SFV_3488 SFV_3489 yhiI yhiJ FALSE 0.010 366.000 0.000 NA   NA
 2022116 2022117 SFV_3489 SFV_3490 yhiJ yhiL FALSE 0.026 262.000 0.000 NA   NA
 2022121 2022122 SFV_3494 SFV_3495     FALSE 0.151 139.000 0.000 NA   NA
 2022123 2022124 SFV_3496 SFV_3497     TRUE 0.905 -42.000 0.000 1.000 Y NA
 2022125 2022126 SFV_3498 SFV_3499     FALSE 0.195 131.000 0.000 1.000   NA
 2022126 2022127 SFV_3499 SFV_3500     FALSE 0.003 1160.000 0.000 NA   NA
 2022134 1606480 SFV_3507 SFV_3508 uspA yhiP FALSE 0.012 342.000 0.000 NA   NA
 2022135 2022136 SFV_3509 SFV_3510 yhiQ prlC TRUE 0.836 8.000 0.098 NA   NA
 2022137 2022138 SFV_3511 SFV_3512 yhiR gor FALSE 0.442 72.000 0.100 1.000   NA
 2022138 2022139 SFV_3512 SFV_3513 gor arsR FALSE 0.003 880.000 0.000 1.000 N NA
 2022139 2022140 SFV_3513 SFV_3514 arsR arsB FALSE 0.278 54.000 0.000 1.000 N NA
 2022140 2022141 SFV_3514 SFV_3515 arsB arsC TRUE 0.929 13.000 0.000 1.000 Y NA
 2022143 2022144 SFV_3517 SFV_3518 insB   FALSE 0.496 25.000 0.000 1.000   NA
 2022144 2022145 SFV_3518 SFV_3519     FALSE 0.005 581.000 0.000 NA   NA
 2022145 2022146 SFV_3519 SFV_3520   slp FALSE 0.211 82.000 0.000 NA   NA
 2022146 2022147 SFV_3520 SFV_3521 slp yhiF FALSE 0.108 156.000 0.000 1.000 N NA
 1606494 2022148 SFV_3522 SFV_3523 yhiD hdeB FALSE 0.235 64.000 0.000 NA   NA
 2022148 2022149 SFV_3523 SFV_3524 hdeB hdeA FALSE 0.189 116.000 0.000 NA   NA
 2022150 2022151 SFV_3525 SFV_3526 hdeD yhiE FALSE 0.003 799.000 0.000 NA   NA
 2022151 1606499 SFV_3526 SFV_3527 yhiE yhiU FALSE 0.012 339.000 0.000 NA   NA
 2022153 2022154 SFV_3529 SFV_3530     TRUE 0.997 -3.000 0.571 1.000 Y NA
 2022155 2022156 SFV_3531 SFV_3532 cspA yiaG FALSE 0.175 281.000 0.000 1.000 Y NA
 2022158 2022159 SFV_3534 SFV_3535 yiaE yiaD FALSE 0.201 104.000 0.000 1.000 N NA
 2022161 2022162 SFV_3537 SFV_3539 yiaC tag TRUE 0.811 -3.000 0.028 1.000   NA
 2022163 2022164 SFV_3538 SFV_3540 yhjY yhjX FALSE 0.039 229.000 0.000 1.000 N NA
 2022164 2022165 SFV_3540 SFV_3541 yhjX yhjW FALSE 0.040 324.000 0.000 0.065   NA
 2022165 1606514 SFV_3541 SFV_3542 yhjW   FALSE 0.209 92.000 0.000 NA   NA
 1606514 2022166 SFV_3542 SFV_3543   dppA FALSE 0.003 745.000 0.000 NA   NA
 2022166 2022167 SFV_3543 SFV_3544 dppA dppB FALSE 0.265 308.000 0.087 0.044 Y NA
 2022167 1606517 SFV_3544 SFV_3545 dppB dppC TRUE 0.633 10.000 0.000 NA   NA
 1606517 2022168 SFV_3545 SFV_3546 dppC dppD TRUE 0.609 11.000 0.000 NA   NA
 2022168 2022169 SFV_3546 SFV_3547 dppD dppF TRUE 0.998 -3.000 0.500 0.002 Y NA
 2022170 2022171 SFV_3548 SFV_3549 yhjV yhjU FALSE 0.002 1573.000 0.000 NA   NA
 2022171 2022172 SFV_3549 SFV_3550 yhjU yhjT TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 2022172 1606523 SFV_3550 SFV_3552 yhjT yhjS TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 2022173 2022174 SFV_3551 SFV_3553 insB yhjR FALSE 0.003 785.000 0.000 NA   NA
 2022174 2022175 SFV_3553 SFV_3554 yhjR yhjQ TRUE 0.962 12.000 0.464 NA   NA
 2022175 1606527 SFV_3554 SFV_3555 yhjQ yhjO TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 1606527 2022176 SFV_3555 SFV_3556 yhjO yhjN FALSE 0.127 146.000 0.000 NA   NA
 2022176 2022177 SFV_3556 SFV_3557 yhjN yhjM TRUE 0.714 7.000 0.000 1.000   NA
 2022177 1606530 SFV_3557 SFV_3558 yhjM yhjL FALSE 0.477 -46.000 0.000 NA   NA
 1606530 2022178 SFV_3558 SFV_3559 yhjL yhjK FALSE 0.191 115.000 0.000 NA   NA
 2022178 2022179 SFV_3559 SFV_3560 yhjK dctA FALSE 0.454 185.000 0.229 0.074 N NA
 2022179 2022180 SFV_3560 SFV_3561 dctA yhjJ FALSE 0.106 221.000 0.088 1.000   NA
 2022182 2022183 SFV_3563 SFV_3564 yhjH yhjG FALSE 0.183 70.000 0.000 NA N NA
 2022184 2022185 SFV_3565 SFV_3566 yhjE yhjD FALSE 0.009 411.000 0.000 1.000   NA
 2022185 2022186 SFV_3566 SFV_3567 yhjD yhjC TRUE 0.551 49.000 0.098 1.000   NA
 2022188 2022189 SFV_3569 SFV_3570   treF FALSE 0.177 127.000 0.000 1.000 N NA
 2022189 2022190 SFV_3570 SFV_3571 treF   FALSE 0.048 211.000 0.000 NA   NA
 2022193 2022194 SFV_3574 SFV_3575 yiiQ tpiA FALSE 0.299 108.000 0.058 NA   NA
 2022195 2022196 SFV_3576 SFV_3577 cdh sbp FALSE 0.441 -85.000 0.000 1.000 N NA
 2022196 2022197 SFV_3577 SFV_3578 sbp pfkA FALSE 0.022 320.000 0.049 1.000 N NA
 2022197 2022198 SFV_3578 SFV_3579 pfkA yiiP FALSE 0.220 121.000 0.040 1.000 N NA
 2022198 2022199 SFV_3579 SFV_3580 yiiP yiiO TRUE 0.562 148.000 0.031 NA Y NA
 2022200 2022201 SFV_3581 SFV_3582 cpxR cpxA TRUE 0.998 -3.000 0.791 1.000 Y NA
 2022203 2022204 SFV_3584 SFV_3585     TRUE 0.891 24.000 0.000 1.000 Y NA
 2022205 2022206 SFV_3586 SFV_3587 kdgT sodA FALSE 0.032 259.000 0.000 1.000   NA
 2022207 2022208 SFV_3589 SFV_3590 rhaR rhaS TRUE 0.985 -37.000 0.800 0.018   NA
 2022209 2022210 SFV_3591 SFV_3592 rhaB rhaA TRUE 0.994 -3.000 0.387 1.000 Y NA
 2022210 2022211 SFV_3592 SFV_3593 rhaA rhaD FALSE 0.172 425.000 0.247 1.000 Y NA
 2022211 2022212 SFV_3593 SFV_3594 rhaD yiiL TRUE 0.830 10.000 0.112 NA   NA
 2022212 2022213 SFV_3594 SFV_3595 yiiL frvA FALSE 0.018 301.000 0.000 NA   NA
 2022213 2022214 SFV_3595 SFV_3596 frvA frvB TRUE 0.963 11.000 0.000 0.008 Y NA
 2022214 2022215 SFV_3596 SFV_3597 frvB frvX TRUE 0.995 -10.000 0.667 NA Y NA
 2022215 2022216 SFV_3597 SFV_3598 frvX frvR TRUE 0.981 0.000 0.400 NA   NA
 2022216 2022217 SFV_3598 SFV_3599 frvR insB FALSE 0.047 228.000 0.000 1.000   NA
 2022219 2022220 SFV_3601 SFV_3602 fdoG fdoH TRUE 0.997 13.000 0.833 0.001 Y NA
 2022220 2022221 SFV_3602 SFV_3603 fdoH fdoI TRUE 0.999 -3.000 0.944 0.001 Y NA
 2022221 2022222 SFV_3603 SFV_3604 fdoI fdhE TRUE 0.941 -3.000 0.182 NA N NA
 2022223 2022224 SFV_3605 SFV_3606 yiiF yiiE FALSE 0.045 218.000 0.000 NA   NA
 2022224 2022225 SFV_3606 SFV_3607 yiiE   FALSE 0.006 535.000 0.000 NA   NA
 2022225 2022226 SFV_3607 SFV_3608     TRUE 0.599 -19.000 0.000 NA   NA
 2022226 2022227 SFV_3608 SFV_3609     TRUE 0.659 -10.000 0.000 NA   NA
 2022229 2022230 SFV_3611 SFV_3612 yiiD yihZ FALSE 0.499 45.000 0.065 1.000   NA
 2022230 2022231 SFV_3612 SFV_3613 yihZ rbn TRUE 0.888 -3.000 0.069 1.000   NA
 2022231 2022232 SFV_3613 SFV_3614 rbn yihX TRUE 0.754 -6.000 0.000 1.000   NA
 2022232 2022233 SFV_3614 SFV_3615 yihX yihW FALSE 0.233 99.000 0.000 1.000   NA
 2022233 2022234 SFV_3615 SFV_3616 yihW yihV TRUE 0.859 34.000 0.000 1.000 Y NA
 2022235 2022236 SFV_3617 SFV_3618 yihU yihT TRUE 0.868 24.000 0.250 1.000 N NA
 2022236 2022237 SFV_3618 SFV_3619 yihT yihS TRUE 0.928 17.000 0.051 1.000 Y NA
 2022237 2022238 SFV_3619 SFV_3620 yihS yihR TRUE 0.690 114.000 0.026 1.000 Y NA
 2022238 2022239 SFV_3620 SFV_3621 yihR yihQ FALSE 0.514 199.000 0.000 0.003 Y NA
 2022239 2022240 SFV_3621 SFV_3622 yihQ yihP TRUE 0.813 46.000 0.000 1.000 Y NA
 2022240 2022241 SFV_3622 SFV_3623 yihP yihO TRUE 0.962 43.000 0.250 0.003 Y NA
 2022241 2022242 SFV_3623 SFV_3624 yihO   TRUE 0.975 -21.000 0.625 NA   NA
 2022243 2022244 SFV_3625 SFV_3626 insB yihN FALSE 0.034 223.000 0.000 NA N NA
 2022244 2022245 SFV_3626 SFV_3627 yihN yihM TRUE 0.906 102.000 0.833 NA   NA
 2022245 2022246 SFV_3627 SFV_3628 yihM yihL TRUE 0.986 8.000 0.800 NA   NA
 2022249 2022250 SFV_3631 SFV_3632 glnA glnL FALSE 0.131 173.000 0.053 1.000 N NA
 2022250 2022251 SFV_3632 SFV_3633 glnL glnG TRUE 0.994 12.000 0.587 0.056 Y NA
 2022252 2022253 SFV_3634 SFV_3635 hemN yihI FALSE 0.168 189.000 0.107 NA   NA
 1606611 2022257 SFV_3640 SFV_3639 yihF insB FALSE 0.395 -1263.000 0.000 NA   NA
 2022257 2022258 SFV_3639 SFV_3641 insB dsbA FALSE 0.003 1098.000 0.000 1.000   NA
 2022258 2022259 SFV_3641 SFV_3642 dsbA yihE TRUE 0.764 17.000 0.111 NA   NA
 2022259 2022260 SFV_3642 SFV_3643 yihE yihD FALSE 0.249 155.000 0.106 NA   NA
 2022261 2022262 SFV_3644 SFV_3645 mobA mobB TRUE 0.971 -18.000 0.064 0.003 Y NA
 1606618 1606619 SFV_3646 SFV_3647 rrfA rrlA FALSE 0.205 95.000 0.000 NA   NA
 1606619 1606620 SFV_3647 SFV_3648 rrlA   FALSE 0.063 194.000 0.000 NA   NA
 1606620 1606621 SFV_3648 SFV_3649   rrsA FALSE 0.212 86.000 0.000 NA   NA
 1606621 2022263 SFV_3649 SFV_3650 rrsA hemG FALSE 0.009 378.000 0.000 NA   NA
 2022263 2022264 SFV_3650 SFV_3651 hemG trkH TRUE 0.961 12.000 0.455 1.000 N NA
 2022264 2022265 SFV_3651 SFV_3652 trkH yigZ TRUE 0.770 39.000 0.202 1.000   NA
 2022265 2022266 SFV_3652 SFV_3653 yigZ pepQ TRUE 0.926 -3.000 0.127 1.000   NA
 2022267 2022268 SFV_3654 SFV_3655 fadB fadA TRUE 0.994 10.000 0.607 1.000 Y NA
 2022269 2022270 SFV_3656 SFV_3657 ubiB yigC TRUE 0.948 13.000 0.090 NA Y NA
 2022272 2022273 SFV_3659 SFV_3660 tatD yigU TRUE 0.581 42.000 0.121 NA N NA
 2022273 2022274 SFV_3660 SFV_3661 yigU   TRUE 0.991 3.000 0.333 NA Y NA
 2022274 2022275 SFV_3661 SFV_3662     TRUE 0.990 4.000 0.188 0.003 Y NA
 2022275 2022276 SFV_3662 SFV_3663   yigR FALSE 0.423 37.000 0.032 1.000   NA
 2022276 2022277 SFV_3663 SFV_3664 yigR yigP TRUE 0.984 -3.000 0.432 1.000   NA
 2022277 2022278 SFV_3664 SFV_3665 yigP ubiE TRUE 0.837 14.000 0.145 1.000   NA
 2022278 2022279 SFV_3665 SFV_3666 ubiE yigN FALSE 0.271 95.000 0.047 NA   NA
 2022279 2022280 SFV_3666 SFV_3667 yigN udp FALSE 0.174 141.000 0.041 NA   NA
 2022284 2022285 SFV_3671 SFV_3672 yigM yigL FALSE 0.365 76.000 0.067 1.000   NA
 2022285 2022286 SFV_3672 SFV_3673 yigL pldB TRUE 0.949 -55.000 0.524 1.000   NA
 2022288 2022289 SFV_3675 SFV_3676 yigJ recQ FALSE 0.295 64.000 0.043 1.000 N NA
 2022289 2022290 SFV_3676 SFV_3677 recQ pldA FALSE 0.253 133.000 0.057 1.000 N NA
 2022291 2022292 SFV_3678 SFV_3679 yigI rarD FALSE 0.510 52.000 0.099 NA   NA
 2022292 2022293 SFV_3679 SFV_3680 rarD yigG FALSE 0.173 59.000 0.006 NA   NA
 2022293 2022294 SFV_3680 SFV_3681 yigG yigF TRUE 0.881 14.000 0.200 NA   NA
 2022299 2022300 SFV_3686 SFV_3687 uvrD yigB FALSE 0.486 84.000 0.128 1.000   NA
 2022300 2022301 SFV_3687 SFV_3688 yigB xerC TRUE 0.980 0.000 0.367 1.000   NA
 2022301 2022302 SFV_3688 SFV_3689 xerC yigA TRUE 0.991 -3.000 0.714 NA   NA
 2022302 2022303 SFV_3689 SFV_3690 yigA dapF TRUE 0.941 -3.000 0.175 NA   NA
 2022303 2022304 SFV_3690 SFV_3691 dapF yifL FALSE 0.276 37.000 0.021 NA N NA
 2022305 2022306 SFV_3692 SFV_3693     FALSE 0.484 22.000 0.000 NA   NA
 2022306 2022307 SFV_3693 SFV_3694     FALSE 0.012 344.000 0.000 NA   NA
 2022307 2022308 SFV_3694 SFV_3695   cyaY FALSE 0.303 48.000 0.000 NA   NA
 2022310 2022311 SFV_3697 SFV_3698 hemC hemD TRUE 0.994 -3.000 0.205 0.001 Y NA
 2022311 2022312 SFV_3698 SFV_3699 hemD hemX TRUE 0.988 22.000 0.600 1.000 Y NA
 2022312 2022313 SFV_3699 SFV_3700 hemX hemY TRUE 0.980 3.000 0.144 1.000 Y NA
 2022313 2022314 SFV_3700 SFV_3701 hemY   FALSE 0.003 862.000 0.000 1.000 N NA
 2022314 2022315 SFV_3701 SFV_3702     TRUE 0.891 24.000 0.000 1.000 Y NA
 2022316 1606676 SFV_3703 SFV_3704 aslB   FALSE 0.126 147.000 0.000 NA   NA
 1606676 1606677 SFV_3704 SFV_3705     FALSE 0.330 43.000 0.000 NA   NA
 1606677 1606678 SFV_3705 SFV_3706     FALSE 0.495 21.000 0.000 NA   NA
 1606678 1606679 SFV_3706 SFV_3707     FALSE 0.251 59.000 0.000 NA   NA
 1606679 2022317 SFV_3707 SFV_3708   yifK FALSE 0.198 103.000 0.000 NA   NA
 2022317 2022318 SFV_3708 SFV_3709 yifK wecG FALSE 0.068 191.000 0.000 1.000 N NA
 2022318 2022319 SFV_3709 SFV_3710 wecG wecF TRUE 0.906 3.000 0.126 1.000   NA
 2022319 2022320 SFV_3710 SFV_3711 wecF yifM TRUE 0.991 -3.000 0.684 1.000   NA
 2022320 2022321 SFV_3711 SFV_3712 yifM wzxE TRUE 0.990 -3.000 0.605 1.000   NA
 2022321 2022322 SFV_3712 SFV_3713 wzxE wecE TRUE 0.954 2.000 0.218 1.000   NA
 2022322 2022323 SFV_3713 SFV_3714 wecE wecD TRUE 0.947 5.000 0.248 1.000   NA
 2022323 2022324 SFV_3714 SFV_3715 wecD rffH TRUE 0.850 -22.000 0.145 1.000   NA
 2022324 2022325 SFV_3715 SFV_3716 rffH rffG TRUE 0.995 19.000 0.739 0.002 Y NA
 2022325 2022326 SFV_3716 SFV_3717 rffG wecC TRUE 0.992 0.000 0.273 1.000 Y NA
 2022326 2022327 SFV_3717 SFV_3718 wecC wecB TRUE 0.994 -3.000 0.348 1.000 Y NA
 2022327 2022328 SFV_3718 SFV_3719 wecB wzzE TRUE 0.984 56.000 0.677 0.004 Y NA
 2022328 2022329 SFV_3719 SFV_3720 wzzE rfe TRUE 0.996 12.000 0.735 0.004 Y NA
 2022329 2022330 SFV_3720 SFV_3721 rfe   TRUE 0.592 12.000 0.000 NA   NA
 2022330 2022331 SFV_3721 SFV_3722   rho TRUE 0.633 10.000 0.000 NA   NA
 2022331 2022332 SFV_3722 SFV_3723 rho trxA FALSE 0.064 255.000 0.087 1.000 N NA
 2022333 2022334 SFV_3724 SFV_3725 rhlB gppA TRUE 0.737 134.000 0.406 1.000 N NA
 2022339 2022340 SFV_3730 SFV_3731 ilvA ilvD TRUE 0.977 3.000 0.106 1.000 Y NA
 2022340 2022341 SFV_3731 SFV_3732 ilvD ilvE TRUE 0.797 65.000 0.075 1.000 Y NA
 2022341 2022342 SFV_3732 SFV_3733 ilvE ilvM TRUE 0.866 20.000 0.205 1.000   NA
 2022342 2022343 SFV_3733 SFV_3734 ilvM ilvG TRUE 0.997 -3.000 0.943 0.001   NA
 1606710 1606711 SFV_3738 SFV_3739     TRUE 0.653 9.000 0.000 NA   NA
 1606711 1606712 SFV_3739 SFV_3740   rrfC FALSE 0.279 53.000 0.000 NA   NA
 1606712 1606713 SFV_3740 SFV_3741 rrfC rrlC FALSE 0.205 95.000 0.000 NA   NA
 1606713 1606714 SFV_3741 SFV_3742 rrlC   FALSE 0.063 194.000 0.000 NA   NA
 1606714 1606715 SFV_3742 SFV_3743   rrsC FALSE 0.212 86.000 0.000 NA   NA
 2022347 2022348 SFV_3744 SFV_3745 yieP yieO TRUE 0.565 47.000 0.100 1.000   NA
 2022349 2022350 SFV_3746 SFV_3747 rbsR rbsK TRUE 0.964 13.000 0.500 1.000 N NA
 2022350 1606720 SFV_3747 SFV_3748 rbsK rbsB FALSE 0.194 111.000 0.000 NA   NA
 1606720 2022351 SFV_3748 SFV_3749 rbsB rbsC FALSE 0.404 31.000 0.000 NA   NA
 2022351 1606722 SFV_3749 SFV_3751 rbsC rbsA TRUE 0.693 5.000 0.000 NA   NA
 1606722 2022352 SFV_3751 SFV_3750 rbsA insB FALSE 0.402 -1104.000 0.000 NA   NA
 2022352 2022353 SFV_3750 SFV_3752 insB rbsD FALSE 0.004 609.000 0.000 1.000 N NA
 2022353 2022354 SFV_3752 SFV_3753 rbsD kup FALSE 0.094 167.000 0.000 1.000 N NA
 2022354 2022355 SFV_3753 SFV_3754 kup   FALSE 0.106 158.000 0.000 1.000 N NA
 2022355 2022356 SFV_3754 SFV_3755   glmS FALSE 0.201 103.000 0.000 1.000 N NA
 2022356 2022357 SFV_3755 SFV_3756 glmS glmU TRUE 0.563 162.000 0.055 1.000 Y NA
 2022357 2022358 SFV_3756 SFV_3757 glmU atpC FALSE 0.022 352.000 0.067 1.000 N NA
 2022358 2022359 SFV_3757 SFV_3758 atpC atpD TRUE 0.995 21.000 0.837 0.002 Y NA
 2022359 2022360 SFV_3758 SFV_3759 atpD atpG TRUE 0.993 27.000 0.724 0.002 Y NA
 2022360 2022361 SFV_3759 SFV_3760 atpG atpA TRUE 0.989 51.000 0.846 0.002 Y NA
 2022361 2022362 SFV_3760 SFV_3761 atpA atpH TRUE 0.997 13.000 0.864 0.002 Y NA
 2022362 2022363 SFV_3761 SFV_3762 atpH atpF TRUE 0.985 15.000 0.242 0.002 Y NA
 2022363 2022364 SFV_3762 SFV_3763 atpF atpE TRUE 0.981 62.000 0.666 0.002 Y NA
 2022364 2022365 SFV_3763 SFV_3764 atpE atpB TRUE 0.983 47.000 0.557 0.003 Y NA
 2022365 2022366 SFV_3764 SFV_3765 atpB atpI TRUE 0.991 9.000 0.291 0.003 Y NA
 2022366 2022367 SFV_3765 SFV_3766 atpI gidB FALSE 0.003 617.000 0.005 1.000 N NA
 2022367 2022368 SFV_3766 SFV_3767 gidB gidA TRUE 0.843 64.000 0.466 1.000 N NA
 2022368 2022369 SFV_3767 SFV_3768 gidA mioC FALSE 0.006 460.000 0.000 1.000 N NA
 2022369 2022370 SFV_3768 SFV_3769 mioC asnC FALSE 0.525 90.000 0.165 1.000 N NA
 2022372 2022373 SFV_3771 SFV_3772 yieM yieN TRUE 0.976 -6.000 0.443 NA   NA
 2022374 2022375 SFV_3773 SFV_3774   lpfA FALSE 0.020 292.000 0.000 1.000 N NA
 2022376 2022377 SFV_3775 SFV_3776     TRUE 0.905 -42.000 0.000 1.000 Y NA
 2022378 2022379 SFV_3777 SFV_3778 lpfC   TRUE 0.937 11.000 0.000 1.000 Y NA
 2022379 2022380 SFV_3778 SFV_3779   pstS FALSE 0.030 248.000 0.000 1.000 N NA
 2022380 2022381 SFV_3779 SFV_3780 pstS pstC TRUE 0.898 87.000 0.145 0.001 Y NA
 2022381 2022382 SFV_3780 SFV_3781 pstC pstA TRUE 0.998 0.000 0.537 0.001 Y NA
 2022382 2022383 SFV_3781 SFV_3782 pstA pstB TRUE 0.971 92.000 0.526 0.001 Y NA
 2022383 2022384 SFV_3782 SFV_3783 pstB phoU TRUE 0.979 15.000 0.317 NA Y NA
 2022384 2022385 SFV_3783 SFV_3784 phoU bglG FALSE 0.021 287.000 0.000 NA   NA
 2022385 2022386 SFV_3784 SFV_3785 bglG bglF FALSE 0.407 197.000 0.312 1.000   NA
 2022386 2022387 SFV_3785 SFV_3786 bglF bglB TRUE 0.989 19.000 0.562 1.000 Y NA
 2022387 2022388 SFV_3786 SFV_3787 bglB yieC TRUE 0.927 86.000 0.364 1.000 Y NA
 2022388 2022389 SFV_3787 SFV_3788 yieC yieL TRUE 0.672 102.000 0.267 1.000 N NA
 2022389 2022390 SFV_3788 SFV_3789 yieL yieK TRUE 0.869 2.000 0.080 1.000 N NA
 2022391 2022392 SFV_3790 SFV_3791 yieJ   FALSE 0.084 175.000 0.000 NA   NA
 2022392 2022393 SFV_3791 SFV_3792     TRUE 0.582 -24.000 0.000 NA   NA
 2022393 2022394 SFV_3792 SFV_3793     FALSE 0.506 20.000 0.000 NA   NA
 2022394 2022395 SFV_3793 SFV_3794     TRUE 0.969 -3.000 0.000 NA Y NA
 2022395 2022396 SFV_3794 SFV_3795   yieI FALSE 0.091 168.000 0.000 NA   NA
 2022396 2022397 SFV_3795 SFV_3796 yieI yieH FALSE 0.223 67.000 0.000 NA   NA
 2022399 2022400 SFV_3798 SFV_3799 yieF yieE TRUE 0.662 22.000 0.074 NA   NA
 2022401 2022402 SFV_3800 SFV_3801     TRUE 0.782 141.000 0.182 1.000 Y NA
 2022403 2022404 SFV_3802 SFV_3803   yidY TRUE 0.856 68.000 0.526 1.000 N NA
 2022404 2022405 SFV_3803 SFV_3804 yidY tnaB FALSE 0.168 132.000 0.000 1.000 N NA
 2022405 2022406 SFV_3804 SFV_3805 tnaB tnaA TRUE 0.832 91.000 0.154 1.000 Y NA
 2022406 2022407 SFV_3805 SFV_3806 tnaA thdF FALSE 0.007 537.000 0.000 1.000   NA
 2022407 2022408 SFV_3806 SFV_3807 thdF yidC TRUE 0.632 106.000 0.221 1.000   NA
 2022408 2022409 SFV_3807 SFV_3808 yidC rnpA FALSE 0.061 275.000 0.105 1.000 N NA
 2022409 2022410 SFV_3808 SFV_3809 rnpA rpmH TRUE 0.939 50.000 0.787 1.000   NA
 2022411 2022412 SFV_3810 SFV_3811 dnaA dnaN TRUE 0.989 5.000 0.328 1.000 Y NA
 2022412 2022413 SFV_3811 SFV_3812 dnaN recF TRUE 0.993 0.000 0.318 1.000 Y NA
 2022413 2022414 SFV_3812 SFV_3813 recF gyrB TRUE 0.973 29.000 0.249 0.003 Y NA
 2022414 2022415 SFV_3813 SFV_3814 gyrB yidB FALSE 0.032 240.000 0.000 NA   NA
 2022415 2022416 SFV_3814 SFV_3815 yidB yidA FALSE 0.192 114.000 0.000 NA   NA
 1606789 2022418 SFV_3817 SFV_3818 yidW dgoK TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 2022418 1606791 SFV_3818 SFV_3819 dgoK dgoA TRUE 0.611 -16.000 0.000 NA   NA
 1606791 2022419 SFV_3819 SFV_3820 dgoA dgoT FALSE 0.208 93.000 0.000 NA   NA
 2022423 2022424 SFV_3824 SFV_3825 ibpA ibpB TRUE 0.768 112.000 0.099 NA Y NA
 2022424 2022425 SFV_3825 SFV_3826 ibpB yidE FALSE 0.060 196.000 0.000 NA   NA
 2022427 1606801 SFV_3828 SFV_3829 glvC glvG TRUE 0.783 0.000 0.000 NA   NA
 2022429 2022430 SFV_3831 SFV_3832 yidK yidJ TRUE 0.825 35.000 0.235 1.000   NA
 2022432 2022433 SFV_3834 SFV_3835 yidH yidG TRUE 0.979 -10.000 0.571 NA   NA
 2022433 2022434 SFV_3835 SFV_3836 yidG yidF TRUE 0.982 -3.000 0.429 NA   NA
 2022436 2022437 SFV_3838 SFV_3839 ilvB ilvN TRUE 0.993 4.000 0.649 0.001   NA
 2022437 2022438 SFV_3839 SFV_3840 ilvN uhpA FALSE 0.465 75.000 0.118 1.000   NA
 2022438 2022439 SFV_3840 SFV_3841 uhpA uhpB TRUE 0.983 -3.000 0.000 0.010 Y NA
 2022439 2022440 SFV_3841 SFV_3842 uhpB uhpC TRUE 0.844 7.000 0.000 0.064 N NA
 2022440 2022441 SFV_3842 SFV_3843 uhpC uhpT TRUE 0.735 138.000 0.000 0.043 Y NA
 2022443 2022444 SFV_3845 SFV_3846 yicO yicN FALSE 0.279 53.000 0.000 NA   NA
 2022444 2022445 SFV_3846 SFV_3847 yicN nepI FALSE 0.278 211.000 0.250 NA   NA
 2022445 2022446 SFV_3847 SFV_3848 nepI   FALSE 0.005 589.000 0.000 1.000 N NA
 2022446 2022447 SFV_3848 SFV_3849     TRUE 0.782 141.000 0.182 1.000 Y NA
 2022448 2022449 SFV_3850 SFV_3851 iutA iucD TRUE 0.809 3.000 0.050 1.000 N NA
 2022449 2022450 SFV_3851 SFV_3852 iucD iucC TRUE 0.995 -3.000 0.417 1.000 Y NA
 2022450 2022451 SFV_3852 SFV_3853 iucC iucB TRUE 0.967 0.000 0.250 1.000   NA
 2022451 2022452 SFV_3853 SFV_3854 iucB iucA TRUE 0.989 1.000 0.609 1.000   NA
 2022455 2022456 SFV_3857 SFV_3858 insB   FALSE 0.034 2472.000 0.000 0.061 Y NA
 2022456 2022457 SFV_3858 SFV_3859     TRUE 0.905 -42.000 0.000 1.000 Y NA
 2022457 2022458 SFV_3859 SFV_3860     TRUE 0.927 -25.000 0.000 1.000 Y NA
 2022458 2022459 SFV_3860 SFV_3861     TRUE 0.905 -42.000 0.000 1.000 Y NA
 2022459 2022460 SFV_3861 SFV_3862     FALSE 0.030 770.000 0.000 1.000 Y NA
 2022460 2022461 SFV_3862 SFV_3863     FALSE 0.254 236.000 0.000 1.000 Y NA
 2022463 2022464 SFV_3865 SFV_3866     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 2022464 2022465 SFV_3866 SFV_3867     TRUE 0.555 -28.000 0.000 NA   NA
 2022466 2022467 SFV_3868 SFV_3869 shiB shiA FALSE 0.006 515.000 0.000 NA   NA
 2022467 2022468 SFV_3869 SFV_3870 shiA intC FALSE 0.009 412.000 0.000 1.000   NA
 2022468 1606843 SFV_3870 SFV_3871 intC   FALSE 0.017 304.000 0.000 NA   NA
 1606844 2022469 SFV_3872 SFV_3873 yicJ yicI FALSE 0.198 103.000 0.000 NA   NA
 2022470 2022471 SFV_3874 SFV_3875 yicH yicE TRUE 0.638 121.000 0.257 NA   NA
 2022473 2022474 SFV_3877 SFV_3878 recG spoU TRUE 0.821 6.000 0.076 1.000 N NA
 2022474 2022475 SFV_3878 SFV_3879 spoU spoT TRUE 0.841 7.000 0.095 1.000 N NA
 2022475 2022476 SFV_3879 SFV_3880 spoT rpoZ TRUE 0.975 19.000 0.291 1.000 Y NA
 2022476 2022477 SFV_3880 SFV_3881 rpoZ gmk TRUE 0.867 55.000 0.471 1.000 N NA
 2022478 2022479 SFV_3882 SFV_3883   yicF FALSE 0.425 -145.000 0.000 NA   NA
 2022480 2022481 SFV_3884 SFV_3885 yicG dinD FALSE 0.020 291.000 0.000 NA   NA
 2022481 2022482 SFV_3885 SFV_3886 dinD yicC FALSE 0.049 210.000 0.000 NA   NA
 2022483 2022484 SFV_3887 SFV_3888 rph pyrE FALSE 0.202 66.000 0.022 1.000 N NA
 2022485 2022486 SFV_3889 SFV_3890 ttk dut FALSE 0.308 107.000 0.060 1.000 N NA
 2022486 2022487 SFV_3890 SFV_3891 dut dfp TRUE 0.896 -19.000 0.201 1.000 N NA
 2022488 2022489 SFV_3892 SFV_3893 radC rpmG FALSE 0.006 474.000 0.000 1.000 N NA
 2022489 2022490 SFV_3893 SFV_3894 rpmG mutM FALSE 0.223 98.000 0.034 1.000 N NA
 2022491 2022492 SFV_3895 SFV_3896 kdtB kdtA TRUE 0.627 8.000 0.020 1.000 N NA
 2022492 2022493 SFV_3896 SFV_3897 kdtA   FALSE 0.381 35.000 0.000 NA   NA
 2022494 2022495 SFV_3898 SFV_3899 insB waaQ FALSE 0.009 394.000 0.000 1.000 N NA
 2022495 2022496 SFV_3899 SFV_3900 waaQ waaG TRUE 0.979 -3.000 0.079 1.000 Y NA
 2022496 2022497 SFV_3900 SFV_3901 waaG waaP TRUE 0.734 -7.000 0.000 1.000   NA
 2022497 2022498 SFV_3901 SFV_3902 waaP waaL FALSE 0.374 43.000 0.000 1.000   NA
 2022498 2022499 SFV_3902 SFV_3903 waaL waaY FALSE 0.486 26.000 0.000 1.000   NA
 2022499 2022500 SFV_3903 SFV_3904 waaY waaJ TRUE 0.921 25.000 0.375 1.000   NA
 2022500 2022501 SFV_3904 SFV_3905 waaJ waaD TRUE 0.988 9.000 0.333 1.000 Y NA
 2022502 2022503 SFV_3906 SFV_3907 waaI waaC TRUE 0.971 -3.000 0.036 NA Y NA
 2022503 2022504 SFV_3907 SFV_3908 waaC waaF TRUE 0.991 4.000 0.205 0.001 Y NA
 2022504 2022505 SFV_3908 SFV_3909 waaF rfaD TRUE 0.969 10.000 0.146 1.000 Y NA
 2022506 2022507 SFV_3910 SFV_3911 htrL kbl FALSE 0.023 275.000 0.000 NA   NA
 2022507 2022508 SFV_3911 SFV_3912 kbl tdh TRUE 0.975 10.000 0.547 1.000 N NA
 2022508 2022509 SFV_3912 SFV_3913 tdh yibD FALSE 0.026 242.000 0.000 NA N NA
 2022509 2022510 SFV_3913 SFV_3914 yibD insB FALSE 0.025 245.000 0.000 NA N NA
 2022511 2022512 SFV_3915 SFV_3916 yibQ yibP FALSE 0.323 139.000 0.088 1.000   NA
 2022512 2022513 SFV_3916 SFV_3917 yibP yibO TRUE 0.883 10.000 0.170 1.000 N NA
 2022513 2022514 SFV_3917 SFV_3918 yibO insB FALSE 0.163 134.000 0.000 1.000 N NA
 2022515 2022516 SFV_3919 SFV_3920   yibN FALSE 0.425 28.000 0.000 NA   NA
 2022516 2022517 SFV_3920 SFV_3921 yibN grxC FALSE 0.161 142.000 0.048 NA N NA
 2022517 2022518 SFV_3921 SFV_3922 grxC secB FALSE 0.278 63.000 0.038 1.000 N NA
 2022518 2022519 SFV_3922 SFV_3923 secB gpsA TRUE 0.956 0.000 0.206 1.000 N NA
 2022519 2022520 SFV_3923 SFV_3924 gpsA cysE TRUE 0.809 80.000 0.429 1.000 N NA
 2022521 2022522 SFV_3925 SFV_3926 yibK lldD FALSE 0.052 196.000 0.020 1.000 N NA
 2022522 2022523 SFV_3926 SFV_3927 lldD lldR TRUE 0.973 -3.000 0.309 1.000 N NA
 2022523 2022524 SFV_3927 SFV_3928 lldR lldP TRUE 0.979 -15.000 0.652 1.000 N NA
 2022524 2022525 SFV_3928 SFV_3929 lldP   FALSE 0.010 368.000 0.000 1.000 N NA
 2022525 2022526 SFV_3929 SFV_3930     FALSE 0.026 458.000 0.000 0.001   NA
 2022526 2022527 SFV_3930 SFV_3931     FALSE 0.324 44.000 0.000 NA   NA
 2022527 2022528 SFV_3931 SFV_3932   insB FALSE 0.009 391.000 0.000 NA   NA
 2022532 2022533 SFV_3936 SFV_3937 mtlR mtlD TRUE 0.959 0.000 0.230 NA N NA
 2022533 2022534 SFV_3937 SFV_3938 mtlD mtlA TRUE 0.966 -79.000 0.292 1.000 Y NA
 2022535 2022536 SFV_3939 SFV_3940 yibI yibH TRUE 0.984 3.000 0.556 NA   NA
 2022536 2022537 SFV_3940 SFV_3941 yibH yibF FALSE 0.379 71.000 0.081 1.000 N NA
 2022537 2022538 SFV_3941 SFV_3942 yibF selA FALSE 0.240 98.000 0.040 1.000 N NA
 2022538 2022539 SFV_3942 SFV_3943 selA selB TRUE 0.994 -3.000 0.569 0.000 N NA
 2022539 2022540 SFV_3943 SFV_3944 selB yiaY FALSE 0.053 190.000 0.015 1.000 N NA
 2022540 2022541 SFV_3944 SFV_3945 yiaY aldB TRUE 0.624 165.000 0.032 0.038 Y NA
 2022543 2022544 SFV_3947 SFV_3948 yiaW yiaV TRUE 0.682 6.000 0.000 NA   NA
 2022545 2022546 SFV_3949 SFV_3950     FALSE 0.052 207.000 0.000 NA   NA
 2022547 2022548 SFV_3951 SFV_3952 insB yiaT FALSE 0.004 538.000 0.000 NA N NA
 2022549 2022550 SFV_3953 SFV_3954     TRUE 0.985 11.000 0.833 1.000   NA
 2022552 2022553 SFV_3956 SFV_3957 sgbE sgbU TRUE 0.984 -6.000 0.200 1.000 Y NA
 2022553 2022554 SFV_3957 SFV_3958 sgbU sgbH TRUE 0.981 -40.000 0.360 1.000 Y NA
 2022554 2022555 SFV_3958 SFV_3959 sgbH lyxK TRUE 0.998 -3.000 0.900 1.000 Y NA
 2022555 2022556 SFV_3959 SFV_3960 lyxK yiaO TRUE 0.960 4.000 0.000 1.000 Y NA
 2022556 2022557 SFV_3960 SFV_3961 yiaO yiaN TRUE 0.929 13.000 0.000 1.000 Y NA
 2022557 2022558 SFV_3961 SFV_3962 yiaN yiaM TRUE 0.991 3.000 0.864 NA   NA
 2022558 2022559 SFV_3962 SFV_3963 yiaM insB FALSE 0.411 30.000 0.000 NA   NA
 2022562 2022563 SFV_3966 SFV_3967 yiaJ yiaI TRUE 0.781 102.000 0.400 1.000 N NA
 2022564 2022565 SFV_3968 SFV_3969 avtA malS FALSE 0.387 73.000 0.085 1.000 N NA
 1606943 1606944 SFV_3971 SFV_3972 xylR xylH FALSE 0.210 78.000 0.000 NA   NA
 1606944 2022567 SFV_3972 SFV_3973 xylH xylG TRUE 0.590 -22.000 0.000 NA   NA
 2022567 2022568 SFV_3973 SFV_3974 xylG xylF TRUE 0.948 78.000 0.518 NA Y NA
 1606947 2022569 SFV_3975 SFV_3976 xylA xylB FALSE 0.213 72.000 0.000 NA   NA
 2022569 2022570 SFV_3976 SFV_3977 xylB yiaB FALSE 0.257 169.000 0.143 NA   NA
 2022570 2022571 SFV_3977 SFV_3978 yiaB yiaA FALSE 0.329 46.000 0.032 NA   NA
 2022573 2022574 SFV_3980 SFV_3981   glyQ FALSE 0.148 95.000 0.010 NA   NA
 2022574 2022575 SFV_3981 SFV_3982 glyQ glyS TRUE 0.997 10.000 0.651 0.000 Y NA
 2022577 2022578 SFV_3984 SFV_3985     FALSE 0.148 140.000 0.000 NA   NA
 2022578 2022579 SFV_3985 SFV_3986   yhiV FALSE 0.496 25.000 0.000 1.000   NA
 2022580 2022581 SFV_3987 SFV_3988 yhiW yhiX FALSE 0.143 368.000 0.000 0.006 Y NA
 2022581 2022582 SFV_3988 SFV_3989 yhiX gadA FALSE 0.010 370.000 0.000 1.000 N NA
 2022582 2022583 SFV_3989 SFV_3990 gadA yhjA FALSE 0.049 211.000 0.000 1.000 N NA
 2022583 2022584 SFV_3990 SFV_3991 yhjA insB FALSE 0.255 59.000 0.000 1.000 N NA
 2022585 2022586 SFV_3992 SFV_3993   yiiS FALSE 0.034 237.000 0.000 NA   NA
 2022586 2022587 SFV_3993 SFV_3994 yiiS yiiT FALSE 0.432 27.000 0.000 NA   NA
 2022588 2022589 SFV_3995 SFV_3996 fpr glpX FALSE 0.428 97.000 0.117 1.000 N NA
 2022589 2022590 SFV_3996 SFV_3997 glpX glpK FALSE 0.035 230.000 0.025 1.000 N NA
 2022590 2022591 SFV_3997 SFV_3998 glpK glpF FALSE 0.013 286.000 0.004 1.000 N NA
 2022593 2022594 SFV_4000 SFV_4001 menG menA TRUE 0.824 93.000 0.158 NA Y NA
 2022594 2022595 SFV_4001 SFV_4002 menA hslU FALSE 0.307 67.000 0.051 1.000 N NA
 2022595 2022596 SFV_4002 SFV_4003 hslU hslV TRUE 0.995 10.000 0.752 1.000 Y NA
 2022596 2022597 SFV_4003 SFV_4004 hslV ftsN FALSE 0.446 93.000 0.122 1.000 N NA
 2022597 2022598 SFV_4004 SFV_4005 ftsN cytR TRUE 0.645 92.000 0.245 NA N NA
 2022598 2022599 SFV_4005 SFV_4006 cytR priA FALSE 0.114 116.000 0.013 NA N NA
 2022599 2022600 SFV_4006 SFV_4007 priA yiiX FALSE 0.006 476.000 0.000 NA   NA
 2022600 2022601 SFV_4007 SFV_4008 yiiX metJ FALSE 0.073 184.000 0.000 NA   NA
 2022602 2022603 SFV_4009 SFV_4010 metB metL TRUE 0.994 3.000 0.428 1.000 Y NA
 2022603 2022604 SFV_4010 SFV_4011 metL metF FALSE 0.092 349.000 0.017 1.000 Y NA
 2022604 2022605 SFV_4011 SFV_4012 metF katG FALSE 0.009 329.000 0.010 1.000 N NA
 2022605 2022606 SFV_4012 SFV_4013 katG yijE FALSE 0.226 61.000 0.012 1.000   NA
 2022607 1606987 SFV_4014 SFV_4015 yijF gldA FALSE 0.023 275.000 0.000 NA   NA
 1606987 1606988 SFV_4015 SFV_4016 gldA talC TRUE 0.609 11.000 0.000 NA   NA
 1606988 1606989 SFV_4016 SFV_4017 talC ptsA TRUE 0.592 12.000 0.000 NA   NA
 2022608 2022609 SFV_4018 SFV_4019 frwC frwB TRUE 0.990 15.000 0.400 0.008 Y NA
 2022609 2022610 SFV_4019 SFV_4020 frwB pflD TRUE 0.780 51.000 0.280 1.000 N NA
 2022610 2022611 SFV_4020 SFV_4021 pflD pflC TRUE 0.956 -34.000 0.312 0.002 N NA
 2022611 2022612 SFV_4021 SFV_4022 pflC frwD TRUE 0.922 2.000 0.156 1.000 N NA
 2022613 2022614 SFV_4023 SFV_4024 yijO yijP FALSE 0.328 149.000 0.130 1.000   NA
 2022614 2022615 SFV_4024 SFV_4025 yijP ppc FALSE 0.090 183.000 0.000 1.000   NA
 2022615 2022616 SFV_4025 SFV_4026 ppc argE FALSE 0.018 352.000 0.053 1.000 N NA
 2022617 2022618 SFV_4027 SFV_4028 argC argB TRUE 0.972 -25.000 0.097 0.002 Y NA
 2022618 2022619 SFV_4028 SFV_4029 argB argH TRUE 0.742 61.000 0.017 1.000 Y NA
 2022619 2022620 SFV_4029 SFV_4030 argH   FALSE 0.074 184.000 0.000 1.000 N NA
 2022620 2022621 SFV_4030 SFV_4031     FALSE 0.008 408.000 0.000 1.000 N NA
 2022621 1607004 SFV_4031 SFV_4032     FALSE 0.223 67.000 0.000 NA   NA
 1607004 2022622 SFV_4032 SFV_4033   insB FALSE 0.399 -1118.000 0.000 NA   NA
 2022622 2022623 SFV_4033 SFV_4034 insB oxyR FALSE 0.003 1196.000 0.000 1.000 N NA
 2022625 2022626 SFV_4036 SFV_4037 yijC yijD TRUE 0.952 0.000 0.194 NA   NA
 2022628 2022629 SFV_4039 SFV_4040 btuB murI FALSE 0.440 -55.000 0.025 1.000 N NA
 2022629 1607013 SFV_4040 SFV_4041 murI rrsB FALSE 0.009 374.000 0.000 NA   NA
 1607013 1607014 SFV_4041 SFV_4042 rrsB   FALSE 0.212 86.000 0.000 NA   NA
 1607014 1607015 SFV_4042 SFV_4043   rrlB FALSE 0.063 194.000 0.000 NA   NA
 1607015 1607016 SFV_4043 SFV_4044 rrlB rrfB FALSE 0.205 95.000 0.000 NA   NA
 1607016 2022630 SFV_4044 SFV_4045 rrfB murB FALSE 0.174 127.000 0.000 NA   NA
 2022630 2022631 SFV_4045 SFV_4046 murB birA TRUE 0.956 -3.000 0.211 1.000 N NA
 1607020 1607021 SFV_4048 SFV_4049     TRUE 0.653 9.000 0.000 NA   NA
 1607021 1607022 SFV_4049 SFV_4050     FALSE 0.188 117.000 0.000 NA   NA
 1607022 1607023 SFV_4050 SFV_4051     TRUE 0.673 7.000 0.000 NA   NA
 1607023 2022633 SFV_4051 SFV_4052   tufB FALSE 0.191 115.000 0.000 NA   NA
 2022633 2022634 SFV_4052 SFV_4053 tufB secE FALSE 0.026 230.000 0.009 1.000 N NA
 2022634 2022635 SFV_4053 SFV_4054 secE nusG TRUE 0.992 2.000 0.843 1.000 N NA
 2022635 2022636 SFV_4054 SFV_4055 nusG rplK TRUE 0.777 159.000 0.681 1.000 N NA
 2022636 2022637 SFV_4055 SFV_4056 rplK rplA TRUE 0.998 4.000 0.838 0.013 Y NA
 2022637 2022638 SFV_4056 SFV_4057 rplA rplJ FALSE 0.296 413.000 0.302 0.013 Y NA
 2022638 2022639 SFV_4057 SFV_4058 rplJ rplL TRUE 0.984 67.000 0.884 0.010 Y NA
 2022639 2022640 SFV_4058 SFV_4059 rplL rpoB FALSE 0.096 320.000 0.223 1.000   NA
 2022640 2022641 SFV_4059 SFV_4060 rpoB rpoC TRUE 0.952 77.000 0.851 0.001   NA
 2022642 2022643 SFV_4061 SFV_4063 thiH thiG TRUE 0.995 -3.000 0.277 0.003 Y NA
 2022643 2022644 SFV_4063 SFV_4062 thiG thiS TRUE 0.977 2.000 0.087 1.000 Y NA
 2022644 2022645 SFV_4062 SFV_4064 thiS thiF TRUE 0.992 -16.000 0.548 1.000 Y NA
 2022645 2022646 SFV_4064 SFV_4065 thiF thiE TRUE 0.985 -7.000 0.242 1.000 Y NA
 2022646 2022647 SFV_4065 SFV_4066 thiE thiC TRUE 0.987 0.000 0.063 0.003 Y NA
 2022647 2022648 SFV_4066 SFV_4067 thiC yjaE FALSE 0.036 234.000 0.000 1.000 N NA
 2022649 2022650 SFV_4068 SFV_4069 yjaD hemE FALSE 0.403 40.000 0.040 1.000 N NA
 2022650 2022651 SFV_4069 SFV_4070 hemE nfi FALSE 0.107 157.000 0.028 1.000 N NA
 2022651 2022652 SFV_4070 SFV_4071 nfi yjaG TRUE 0.536 43.000 0.086 NA   NA
 2022652 2022653 SFV_4071 SFV_4072 yjaG hupA FALSE 0.484 187.000 0.355 NA   NA
 2022653 2022654 SFV_4072 SFV_4073 hupA yjaH TRUE 0.783 73.000 0.375 NA   NA
 2022656 2022657 SFV_4075 SFV_4076 hydH hydG TRUE 0.997 -3.000 0.500 0.066 Y NA
 2022658 2022659 SFV_4077 SFV_4078 purD purH TRUE 0.977 12.000 0.238 1.000 Y NA
 1607051 1607052 SFV_4079 SFV_4080 rrsE   FALSE 0.212 86.000 0.000 NA   NA
 1607052 1607053 SFV_4080 SFV_4081   rrlE FALSE 0.063 194.000 0.000 NA   NA
 1607053 1607054 SFV_4081 SFV_4082 rrlE rrfE FALSE 0.205 95.000 0.000 NA   NA
 2022661 1607057 SFV_4084 SFV_4085 metA aceB FALSE 0.024 269.000 0.000 NA   NA
 1607057 2022662 SFV_4085 SFV_4086 aceB aceA FALSE 0.411 30.000 0.000 NA   NA
 2022662 1607059 SFV_4086 SFV_4087 aceA aceK FALSE 0.073 184.000 0.000 NA   NA
 1607060 2022663 SFV_4088 SFV_4089 arp iclR FALSE 0.015 317.000 0.000 NA   NA
 2022664 2022665 SFV_4090 SFV_4091 metH yjbB FALSE 0.028 220.000 0.006 1.000 N NA
 2022666 2022667 SFV_4092 SFV_4093 pepE sorE FALSE 0.080 382.000 0.000 1.000 Y NA
 2022667 2022668 SFV_4093 SFV_4094 sorE sorM TRUE 0.782 52.000 0.286 1.000 N NA
 2022668 2022669 SFV_4094 SFV_4095 sorM sorA TRUE 0.990 11.000 0.333 0.010 Y NA
 2022669 2022670 SFV_4095 SFV_4096 sorA sorB TRUE 0.960 66.000 0.400 0.010 Y NA
 2022670 2022671 SFV_4096 SFV_4097 sorB sorF TRUE 0.992 0.000 0.167 0.008 Y NA
 2022671 2022672 SFV_4097 SFV_4098 sorF sorD TRUE 0.799 10.000 0.083 1.000 N NA
 2022672 2022673 SFV_4098 SFV_4099 sorD   FALSE 0.404 70.000 0.091 1.000 N NA
 2022675 2022676 SFV_4101 SFV_4102 yjbD   TRUE 0.572 -25.000 0.000 NA   NA
 2022676 2022677 SFV_4102 SFV_4103     FALSE 0.308 55.000 0.000 1.000   NA
 2022677 2022678 SFV_4103 SFV_4104     FALSE 0.510 24.000 0.000 1.000   NA
 2022679 2022680 SFV_4105 SFV_4106 yjdH yjdG TRUE 0.987 -3.000 0.086 0.054 Y NA
 2022680 2022681 SFV_4106 SFV_4107 yjdG dcuB FALSE 0.006 572.000 0.000 1.000   NA
 2022681 2022682 SFV_4107 SFV_4108 dcuB fumB FALSE 0.243 78.000 0.000 1.000   NA
 2022682 2022683 SFV_4108 SFV_4109 fumB yjdF FALSE 0.181 123.000 0.000 NA   NA
 2022684 2022685 SFV_4110 SFV_4111 melB melA TRUE 0.860 115.000 0.214 1.000 Y NA
 2022686 2022687 SFV_4112 SFV_4113 melR adiA FALSE 0.059 199.000 0.000 1.000 N NA
 2022687 2022688 SFV_4113 SFV_4114 adiA adiY FALSE 0.014 325.000 0.000 1.000 N NA
 2022688 2022689 SFV_4114 SFV_4115 adiY yjdE FALSE 0.436 137.000 0.167 1.000 N NA
 2022689 2022690 SFV_4115 SFV_4116 yjdE yjdB FALSE 0.128 155.000 0.000 1.000   NA
 2022690 2022691 SFV_4116 SFV_4117 yjdB basR TRUE 0.909 -3.000 0.095 1.000   NA
 2022691 2022692 SFV_4117 SFV_4118 basR basS TRUE 0.978 10.000 0.143 0.072 Y NA
 2022693 2022694 SFV_4119 SFV_4120 proP yjcZ FALSE 0.025 264.000 0.000 NA   NA
 2022694 2022695 SFV_4120 SFV_4121 yjcZ yjdA TRUE 0.993 -3.000 0.857 NA   NA
 2022696 2022697 SFV_4122 SFV_4123 phnA phnB FALSE 0.078 158.000 0.013 NA   NA
 2022697 2022698 SFV_4123 SFV_4124 phnB phnC FALSE 0.288 133.000 0.074 NA   NA
 2022698 2022699 SFV_4124 SFV_4125 phnC phnD TRUE 0.985 25.000 0.337 0.000 Y NA
 2022699 2022700 SFV_4125 SFV_4126 phnD phnE TRUE 0.814 52.000 0.330 NA   NA
 2022702 2022703 SFV_4128 SFV_4129   yjcR FALSE 0.438 26.000 0.000 NA   NA
 2022703 2022704 SFV_4129 SFV_4130 yjcR yjcQ TRUE 0.994 0.000 1.000 NA   NA
 2022704 2022705 SFV_4130 SFV_4131 yjcQ yjcP TRUE 0.990 -3.000 0.625 NA   NA
 2022705 1607104 SFV_4131 SFV_4132 yjcP fdhF FALSE 0.059 198.000 0.000 NA   NA
 1607104 2022706 SFV_4132 SFV_4133 fdhF yjcO FALSE 0.206 94.000 0.000 NA   NA
 2022707 2022708 SFV_4134 SFV_4135 gltP nrfG FALSE 0.012 342.000 0.000 1.000 N NA
 2022708 2022709 SFV_4135 SFV_4136 nrfG nrfF TRUE 0.995 -3.000 0.464 NA Y NA
 2022709 2022710 SFV_4136 SFV_4137 nrfF nrfE TRUE 0.983 -7.000 0.214 NA Y NA
 2022710 2022711 SFV_4137 SFV_4138 nrfE nrfD TRUE 0.733 134.000 0.400 1.000 N NA
 2022711 2022712 SFV_4138 SFV_4139 nrfD nrfC TRUE 0.996 -3.000 0.927 0.001 N NA
 2022712 2022713 SFV_4139 SFV_4140 nrfC nrfB TRUE 0.948 -3.000 0.049 0.001   NA
 2022713 2022714 SFV_4140 SFV_4141 nrfB nrfA TRUE 0.755 45.000 0.083 0.001   NA
 2022715 2022716 SFV_4142 SFV_4143 acs yjcH FALSE 0.179 200.000 0.147 NA   NA
 2022716 2022717 SFV_4143 SFV_4144 yjcH yjcG TRUE 0.888 108.000 0.733 NA   NA
 2022720 2022721 SFV_4147 SFV_4148 yjcE yjcD FALSE 0.317 151.000 0.130 1.000   NA
 2022721 2022722 SFV_4148 SFV_4149 yjcD soxR FALSE 0.004 706.000 0.000 1.000   NA
 2022725 2022726 SFV_4152 SFV_4153 yjcB insB FALSE 0.025 264.000 0.000 NA   NA
 2022729 2022730 SFV_4156 SFV_4157 yjbR yjbQ TRUE 0.664 4.000 0.018 NA   NA
 2022730 2022731 SFV_4157 SFV_4158 yjbQ aphA FALSE 0.138 111.000 0.009 NA   NA
 2022731 2022732 SFV_4158 SFV_4159 aphA tyrB FALSE 0.003 869.000 0.026 1.000   NA
 2022732 2022733 SFV_4159 SFV_4160 tyrB alr FALSE 0.122 253.000 0.181 1.000 N NA
 2022733 2022734 SFV_4160 SFV_4161 alr dnaB TRUE 0.802 53.000 0.317 1.000 N NA
 2022736 2022737 SFV_4163 SFV_4164 yjbO yjbN FALSE 0.442 -76.000 0.000 NA   NA
 2022737 2022738 SFV_4164 SFV_4165 yjbN yjbM FALSE 0.011 357.000 0.000 NA   NA
 2022738 2022739 SFV_4165 SFV_4166 yjbM yjbL TRUE 0.675 -9.000 0.000 NA   NA
 2022741 2022742 SFV_4168 SFV_4169 yjbJ dinF FALSE 0.164 116.000 0.021 NA   NA
 2022742 2022743 SFV_4169 SFV_4170 dinF lexA TRUE 0.544 19.000 0.033 1.000 N NA
 2022743 2022744 SFV_4170 SFV_4171 lexA dgkA FALSE 0.456 110.000 0.141 1.000 N NA
 2022746 2022747 SFV_4173 SFV_4174 ubiA ubiC TRUE 0.975 13.000 0.248 NA Y NA
 2022747 2022748 SFV_4174 SFV_4175 ubiC insB FALSE 0.266 47.000 0.000 NA N NA
 2022750 2022751 SFV_4177 SFV_4178 malM lamB FALSE 0.330 152.000 0.143 1.000   NA
 2022751 2022752 SFV_4178 SFV_4179 lamB malK TRUE 0.864 72.000 0.111 0.051 Y NA
 2022753 2022754 SFV_4180 SFV_4181 malE malF TRUE 0.753 62.000 0.000 1.000 Y NA
 2022754 2022755 SFV_4181 SFV_4182 malF malG TRUE 0.996 15.000 0.814 0.042 Y NA
 2022755 1607155 SFV_4182 SFV_4183 malG xylE FALSE 0.010 372.000 0.000 NA   NA
 2022756 2022757 SFV_4184 SFV_4185 yjbA yjbH FALSE 0.005 595.000 0.000 NA   NA
 2022757 2022758 SFV_4185 SFV_4186 yjbH yjbG FALSE 0.443 116.000 0.140 NA   NA
 2022758 2022759 SFV_4186 SFV_4187 yjbG yjbF TRUE 0.994 -3.000 1.000 NA   NA
 2022759 2022760 SFV_4187 SFV_4188 yjbF pgi FALSE 0.003 818.000 0.000 NA   NA
 2022762 2022763 SFV_4190 SFV_4191     TRUE 0.901 20.000 0.000 NA Y NA
 2022763 2022764 SFV_4191 SFV_4192     TRUE 0.969 -3.000 0.000 NA Y NA
 2022765 2022766 SFV_4193 SFV_4194     TRUE 0.905 -42.000 0.000 1.000 Y NA
 2022768 2022769 SFV_4196 SFV_4197 yjiH yjiG TRUE 0.932 -3.000 0.019 0.001   NA
 2022769 2022770 SFV_4197 SFV_4198 yjiG iadA TRUE 0.623 13.000 0.028 1.000   NA
 2022770 2022771 SFV_4198 SFV_4199 iadA yjiE FALSE 0.266 65.000 0.037 1.000 N NA
 2022774 2022775 SFV_4202 SFV_4203 uxuR uxuB FALSE 0.026 263.000 0.000 1.000 N NA
 2022775 2022776 SFV_4203 SFV_4204 uxuB uxuA TRUE 0.772 81.000 0.070 1.000 Y NA
 2022778 2022779 SFV_4206 SFV_4207 fimH fimG TRUE 0.986 20.000 0.833 0.005   NA
 2022779 2022780 SFV_4207 SFV_4208 fimG fimF TRUE 0.958 13.000 0.000 0.005 Y NA
 2022780 2022781 SFV_4208 SFV_4209 fimF fimD TRUE 0.943 10.000 0.000 1.000 Y NA
 2022781 2022782 SFV_4209 SFV_4210 fimD fimC TRUE 0.970 67.000 0.750 1.000 Y NA
 2022782 1607183 SFV_4210 SFV_4212 fimC fimI FALSE 0.197 106.000 0.000 NA   NA
 2022784 2022785 SFV_4213 SFV_4214 fimA fimE FALSE 0.007 481.000 0.000 1.000   NA
 2022785 2022786 SFV_4214 SFV_4215 fimE fimB FALSE 0.014 637.000 0.000 0.009   NA
 2022787 2022788 SFV_4216 SFV_4217 yjhA yjhT FALSE 0.434 -88.000 0.000 NA   NA
 2022788 2022789 SFV_4217 SFV_4218 yjhT yjhS FALSE 0.231 65.000 0.000 NA   NA
 2022791 2022792 SFV_4220 SFV_4221     FALSE 0.356 38.000 0.000 NA   NA
 2022794 2022795 SFV_4223 SFV_4224     FALSE 0.450 69.000 0.000 0.060   NA
 2022798 1607200 SFV_4227 SFV_4228     FALSE 0.058 199.000 0.000 NA   NA
 2022799 2022800 SFV_4229 SFV_4230 yjgB yjgR FALSE 0.145 129.000 0.007 1.000   NA
 2022801 2022802 SFV_4231 SFV_4232 yjgQ yjgP TRUE 0.994 0.000 0.631 0.062   NA
 2022803 2022804 SFV_4233 SFV_4234 pepA holC TRUE 0.781 134.000 0.494 1.000 N NA
 2022804 2022805 SFV_4234 SFV_4235 holC valS TRUE 0.898 0.000 0.089 1.000 N NA
 2022812 2022813 SFV_4242 SFV_4243   yjgK FALSE 0.181 123.000 0.000 NA   NA
 2022813 2022814 SFV_4243 SFV_4244 yjgK yjgJ FALSE 0.108 145.000 0.000 NA N NA
 2022815 2022816 SFV_4245 SFV_4246 yjgI yjgH FALSE 0.262 48.000 0.000 NA N NA
 2022816 2022817 SFV_4246 SFV_4247 yjgH pyrB FALSE 0.006 419.000 0.000 NA N NA
 2022817 2022818 SFV_4247 SFV_4248 pyrB pyrI TRUE 0.984 13.000 0.197 0.000 Y NA
 2022818 2022819 SFV_4248 SFV_4249 pyrI yjgF FALSE 0.358 73.000 0.084 NA N NA
 2022821 2022822 SFV_4251 SFV_4252 treR treC FALSE 0.003 1443.000 0.000 1.000 N NA
 2022822 2022823 SFV_4252 SFV_4253 treC nrdD FALSE 0.009 394.000 0.000 1.000 N NA
 2022823 2022824 SFV_4253 SFV_4254 nrdD nrdG TRUE 0.669 158.000 0.464 1.000 N NA
 2022825 2022826 SFV_4255 SFV_4256 cybC pmbA FALSE 0.075 183.000 0.028 NA   NA
 2022830 2022831 SFV_4260 SFV_4261   yjfF FALSE 0.050 210.000 0.000 1.000 N NA
 2022831 2022832 SFV_4261 SFV_4262 yjfF ytfT TRUE 0.997 -13.000 0.865 0.042 Y NA
 2022832 2022833 SFV_4262 SFV_4263 ytfT ytfR TRUE 0.989 14.000 0.506 1.000 Y NA
 2022833 1607236 SFV_4263 SFV_4264 ytfR ytfQ FALSE 0.148 140.000 0.000 NA   NA
 2022835 2022836 SFV_4266 SFV_4267 ytfP ytfN TRUE 0.920 3.000 0.167 NA   NA
 2022836 2022837 SFV_4267 SFV_4268 ytfN ytfM TRUE 0.989 -3.000 0.575 NA   NA
 2022838 2022839 SFV_4269 SFV_4270 msrA ytfL FALSE 0.019 323.000 0.042 NA   NA
 2022839 2022840 SFV_4270 SFV_4271 ytfL ytfJ FALSE 0.005 593.000 0.000 NA   NA
 2022841 2022842 SFV_4272 SFV_4273 ytfI cysQ FALSE 0.047 212.000 0.000 NA   NA
 2022845 2022846 SFV_4275 SFV_4277 ytfG ytfF TRUE 0.694 100.000 0.021 1.000 Y NA
 2022846 2022847 SFV_4277 SFV_4278 ytfF ytfE FALSE 0.452 108.000 0.150 NA N NA
 2022848 2022849 SFV_4279 SFV_4280 cycA fklB FALSE 0.017 309.000 0.000 1.000 N NA
 2022852 2022853 SFV_4283 SFV_4284     FALSE 0.108 145.000 0.000 NA N NA
 2022856 2022857 SFV_4287 SFV_4288 cadB   FALSE 0.346 40.000 0.000 NA   NA
 1607262 2022859 SFV_4290 SFV_4291   yjdC FALSE 0.197 107.000 0.000 NA   NA
 2022859 2022860 SFV_4291 SFV_4292 yjdC dsbD TRUE 0.795 37.000 0.217 1.000   NA
 2022860 2022861 SFV_4292 SFV_4293 dsbD cutA TRUE 0.775 -24.000 0.092 1.000 N NA
 2022861 2022862 SFV_4293 SFV_4294 cutA dcuA FALSE 0.159 116.000 0.005 1.000   NA
 2022862 2022863 SFV_4294 SFV_4295 dcuA aspA FALSE 0.177 118.000 0.015 1.000   NA
 2022866 2022867 SFV_4298 SFV_4299 mopB mopA TRUE 0.986 44.000 0.631 0.005 Y NA
 2022867 2022868 SFV_4299 SFV_4300 mopA yjeI FALSE 0.247 138.000 0.062 NA   NA
 2022869 2022870 SFV_4301 SFV_4302 yjeJ   FALSE 0.432 27.000 0.000 NA   NA
 2022873 2022874 SFV_4305 SFV_4306 efp   FALSE 0.016 288.000 0.003 1.000   NA
 2022874 2022875 SFV_4306 SFV_4307   sugE TRUE 0.647 26.000 0.074 1.000   NA
 2022876 2022877 SFV_4308 SFV_4309 blc ampC FALSE 0.193 89.000 0.022 1.000 N NA
 2022877 2022878 SFV_4309 SFV_4310 ampC frdD FALSE 0.385 30.000 0.022 1.000 N NA
 2022878 2022879 SFV_4310 SFV_4311 frdD frdC TRUE 0.997 11.000 0.787 0.002 Y NA
 2022879 2022880 SFV_4311 SFV_4312 frdC frdB TRUE 0.994 11.000 0.454 0.002 Y NA
 2022880 2022881 SFV_4312 SFV_4313 frdB frdA TRUE 0.996 -7.000 0.470 0.002 Y NA
 2022882 1607287 SFV_4314 SFV_4315 yjeA yjeM FALSE 0.044 219.000 0.000 NA   NA
 2022883 2022884 SFV_4316 SFV_4317 yjeP psd TRUE 0.775 22.000 0.148 1.000 N NA
 2022884 2022885 SFV_4317 SFV_4318 psd yjeQ FALSE 0.415 97.000 0.095 1.000   NA
 2022886 1607292 SFV_4319 SFV_4320 yjeR   FALSE 0.048 211.000 0.000 NA   NA
 1607292 1607293 SFV_4320 SFV_4321     FALSE 0.104 158.000 0.000 NA   NA
 1607293 1607294 SFV_4321 SFV_4322     FALSE 0.372 36.000 0.000 NA   NA
 1607294 1607295 SFV_4322 SFV_4323     FALSE 0.372 36.000 0.000 NA   NA
 2022888 2022889 SFV_4324 SFV_4326 yjeF yjeE TRUE 0.788 -28.000 0.118 NA   NA
 2022889 2022890 SFV_4326 SFV_4327 yjeE amiB TRUE 0.749 19.000 0.109 NA   NA
 2022890 2022891 SFV_4327 SFV_4328 amiB mutL TRUE 0.810 10.000 0.092 1.000 N NA
 2022891 2022892 SFV_4328 SFV_4329 mutL miaA TRUE 0.829 38.000 0.188 0.065 N NA
 2022892 2022893 SFV_4329 SFV_4330 miaA hfq TRUE 0.858 86.000 0.531 1.000   NA
 2022893 2022894 SFV_4330 SFV_4331 hfq hflX FALSE 0.359 145.000 0.141 1.000   NA
 2022894 2022895 SFV_4331 SFV_4332 hflX hflK TRUE 0.710 86.000 0.184 0.062   NA
 2022895 2022896 SFV_4332 SFV_4333 hflK hflC TRUE 0.998 3.000 0.947 0.010 Y NA
 2022896 2022897 SFV_4333 SFV_4334 hflC yjeT TRUE 0.763 82.000 0.348 NA   NA
 2022897 2022898 SFV_4334 SFV_4335 yjeT purA FALSE 0.274 104.000 0.051 NA   NA
 2022898 2022899 SFV_4335 SFV_4336 purA yjeB FALSE 0.028 205.000 0.010 NA N NA
 2022899 2022900 SFV_4336 SFV_4337 yjeB vacB TRUE 0.838 39.000 0.038 NA Y NA
 2022900 2022901 SFV_4337 SFV_4338 vacB yjfH FALSE 0.376 180.000 0.147 0.013 N NA
 2022903 2022904 SFV_4340 SFV_4341 insB yjfM FALSE 0.025 266.000 0.000 NA   NA
 2022904 1607314 SFV_4341 SFV_4342 yjfM yjfC TRUE 0.735 3.000 0.000 NA   NA
 1607314 2022905 SFV_4342 SFV_4343 yjfC aidB FALSE 0.211 84.000 0.000 NA   NA
 2022906 2022907 SFV_4344 SFV_4345 yjfN yjfO TRUE 0.773 149.000 0.588 NA   NA
 2022909 2022910 SFV_4347 SFV_4348 yjfQ yjfR FALSE 0.228 108.000 0.000 1.000   NA
 2022911 2022912 SFV_4349 SFV_4350 sgaT sgaB FALSE 0.300 175.000 0.059 0.010   NA
 2022912 2022913 SFV_4350 SFV_4351 sgaB ptxA TRUE 0.978 10.000 0.115 0.008 Y NA
 2022913 2022914 SFV_4351 SFV_4352 ptxA sgaH TRUE 0.982 14.000 0.328 1.000 Y NA
 2022914 2022915 SFV_4352 SFV_4353 sgaH sgaU TRUE 0.981 10.000 0.250 1.000 Y NA
 2022915 2022916 SFV_4353 SFV_4354 sgaU sgaE TRUE 0.989 0.000 0.200 1.000 Y NA
 2022918 2022919 SFV_4356 SFV_4357 rpsF rpsR FALSE 0.467 326.000 0.319 0.010 Y NA
 2022919 2022920 SFV_4357 SFV_4358 rpsR rplI TRUE 0.981 42.000 0.499 0.010 Y NA
 2022920 2022921 SFV_4358 SFV_4359 rplI   FALSE 0.004 698.000 0.000 1.000 N NA
 2022921 2022922 SFV_4359 SFV_4360     TRUE 0.772 57.000 0.000 1.000 Y NA
 2022923 2022924 SFV_4361 SFV_4362     TRUE 0.782 141.000 0.182 1.000 Y NA
 2022926 2022927 SFV_4364 SFV_4365 yjiW   FALSE 0.043 221.000 0.000 NA   NA
 2022927 2022928 SFV_4365 SFV_4366     TRUE 0.966 0.000 0.239 1.000   NA
 2022928 2022929 SFV_4366 SFV_4367     TRUE 0.974 46.000 0.564 1.000 Y NA
 2022929 2022930 SFV_4367 SFV_4368     FALSE 0.158 135.000 0.000 NA   NA
 2022931 2022932 SFV_4369 SFV_4370 insB   FALSE 0.151 139.000 0.000 NA   NA
 2022933 2022934 SFV_4371 SFV_4372 yjiA yjiX TRUE 0.905 11.000 0.212 NA   NA
 2022934 2022935 SFV_4372 SFV_4373 yjiX yjiY TRUE 0.899 50.000 0.531 NA   NA
 2022935 2022936 SFV_4373 SFV_4374 yjiY hpaC FALSE 0.011 378.000 0.000 1.000   NA
 2022936 1607347 SFV_4374 SFV_4375 hpaC hpaB FALSE 0.526 18.000 0.000 NA   NA
 1607347 2022937 SFV_4375 SFV_4376 hpaB   FALSE 0.029 253.000 0.000 NA   NA
 2022937 2022938 SFV_4376 SFV_4377   hpaA FALSE 0.346 108.000 0.067 1.000   NA
 2022938 2022939 SFV_4377 SFV_4378 hpaA hpaX TRUE 0.820 10.000 0.100 1.000 N NA
 2022939 2022940 SFV_4378 SFV_4379 hpaX hpaI TRUE 0.915 22.000 0.053 1.000 Y NA
 2022940 2022941 SFV_4379 SFV_4380 hpaI hpaH FALSE 0.502 235.000 0.439 0.004 N NA
 2022941 2022942 SFV_4380 SFV_4381 hpaH hpaF TRUE 0.712 68.000 0.282 1.000 N NA
 2022942 2022943 SFV_4381 SFV_4382 hpaF hpaD TRUE 0.953 10.000 0.330 1.000   NA
 2022943 2022944 SFV_4382 SFV_4383 hpaD hpaE TRUE 0.977 2.000 0.378 1.000   NA
 2022944 2022945 SFV_4383 SFV_4384 hpaE hpaG TRUE 0.991 -3.000 0.510 0.037 N NA
 2022946 2022947 SFV_4385 SFV_4386 hpcR tsr FALSE 0.368 119.000 0.095 1.000 N NA
 2022948 2022949 SFV_4387 SFV_4388 yjiZ yjjM FALSE 0.033 434.000 0.182 1.000 N NA
 2022951 2022952 SFV_4390 SFV_4391 mdoB yjjA FALSE 0.013 331.000 0.000 NA   NA
 2022952 2022953 SFV_4391 SFV_4392 yjjA dnaC TRUE 0.856 46.000 0.368 NA   NA
 2022953 2022954 SFV_4392 SFV_4393 dnaC dnaT TRUE 0.990 3.000 0.778 NA   NA
 2022954 2022955 SFV_4393 SFV_4394 dnaT yjjB FALSE 0.268 95.000 0.046 NA   NA
 2022955 2022956 SFV_4394 SFV_4395 yjjB yjjP TRUE 0.985 -9.000 0.704 NA   NA
 2022956 2022957 SFV_4395 SFV_4396 yjjP   FALSE 0.006 525.000 0.000 NA   NA
 2022958 2022959 SFV_4397 SFV_4398 insB yjjQ TRUE 0.753 2.000 0.000 1.000 N NA
 2022959 2022960 SFV_4398 SFV_4399 yjjQ bglJ TRUE 0.995 -42.000 0.889 0.017 Y NA
 1607374 1607375 SFV_4402 SFV_4403     FALSE 0.381 35.000 0.000 NA   NA
 1607375 1607376 SFV_4403 SFV_4404     FALSE 0.417 29.000 0.000 NA   NA
 1607376 2022963 SFV_4404 SFV_4405   yjjT FALSE 0.022 277.000 0.000 NA   NA
 2022964 2022965 SFV_4406 SFV_4407 holD rimI TRUE 0.800 -31.000 0.121 1.000   NA
 2022965 2022966 SFV_4407 SFV_4408 rimI yjjG TRUE 0.554 15.000 0.018 1.000   NA
 2022966 2022967 SFV_4408 SFV_4409 yjjG prfC FALSE 0.195 91.000 0.012 1.000   NA
 2022967 2022968 SFV_4409 SFV_4410 prfC osmY FALSE 0.009 393.000 0.000 NA   NA
 2022968 2022969 SFV_4410 SFV_4411 osmY yjjU FALSE 0.007 410.000 0.000 NA   NA
 2022969 2022970 SFV_4411 SFV_4412 yjjU yjjV TRUE 0.859 -3.000 0.057 NA   NA
 2022971 2022972 SFV_4413 SFV_4414 yjjW yjjI TRUE 0.979 -28.000 0.810 NA   NA
 2022973 2022974 SFV_4415 SFV_4416 deoC deoA TRUE 0.881 127.000 0.286 1.000 Y NA
 2022974 2022975 SFV_4416 SFV_4417 deoA deoB TRUE 0.850 52.000 0.398 1.000 N NA
 2022975 2022976 SFV_4417 SFV_4418 deoB deoD TRUE 0.842 57.000 0.414 1.000 N NA
 2022977 1607392 SFV_4419 SFV_4420   lplA FALSE 0.398 32.000 0.000 NA   NA
 1607392 2022978 SFV_4420 SFV_4421 lplA smp FALSE 0.425 28.000 0.000 NA   NA
 2022979 2022980 SFV_4422 SFV_4423 serB sms FALSE 0.281 49.000 0.024 1.000 N NA
 2022980 2022981 SFV_4423 SFV_4424 sms nadR FALSE 0.456 21.000 0.021 1.000 N NA
 2022983 2022984 SFV_4426 SFV_4427 slt trpR TRUE 0.534 90.000 0.167 1.000 N NA
 2022988 2022989 SFV_4431 SFV_4432 creA creB TRUE 0.622 13.000 0.038 NA   NA
 2022989 2022990 SFV_4432 SFV_4433 creB creC TRUE 0.998 0.000 0.776 1.000 Y NA
 2022990 2022991 SFV_4433 SFV_4434 creC creD TRUE 0.766 58.000 0.311 NA N NA
 2022993 2018878 SFV_4436 SFV_0001 lasT thrA FALSE 0.011 360.000 0.000 1.000 N NA