MicrobesOnline Operon Predictions for Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 1996349 1996350 LI0003 LI0004   hly TRUE 0.813 18.000 0.000 NA   NA
 1996352 1996353 LI0006 LI0007   tlc FALSE 0.022 335.000 0.000 NA   NA
 1996354 1996355 LI0008 LI0009     TRUE 0.385 97.000 0.000 NA   NA
 1996355 1996356 LI0009 LI0010     TRUE 0.886 -112.000 0.000 NA   NA
 1996356 1996357 LI0010 LIt01     FALSE 0.015 426.000 0.000 NA   NA
 1996357 1996358 LIt01 LI0011   polB FALSE 0.096 187.000 0.000 NA   NA
 1996358 1996359 LI0011 LI0012 polB   TRUE 0.888 -40.000 0.000 NA   NA
 1996359 1996360 LI0012 LI0013     FALSE 0.008 1208.000 0.000 NA   NA
 1996360 1996361 LI0013 LI0014     TRUE 0.979 -3.000 0.003 1.000 N NA
 1996361 1996362 LI0014 LI0015   upp TRUE 0.686 37.000 0.000 1.000 N NA
 1996364 1996365 LI0017 LI0018 ubiE gltP FALSE 0.047 258.000 0.000 1.000 N NA
 1996365 1996366 LI0018 LI0019 gltP tagD FALSE 0.028 314.000 0.000 1.000   NA
 1996366 1996367 LI0019 LI0020 tagD trpS TRUE 0.701 36.000 0.000 1.000   NA
 1996367 1996368 LI0020 LI0021 trpS   TRUE 0.981 3.000 0.005 1.000   NA
 1996368 1996369 LI0021 LI0022   tyrS TRUE 0.978 3.000 0.003 1.000   NA
 1996369 1996370 LI0022 LI0023 tyrS ogt FALSE 0.145 161.000 0.000 1.000 N NA
 1996370 1996371 LI0023 LI0024 ogt gcpE TRUE 0.611 61.000 0.000 1.000 N NA
 1996371 1996372 LI0024 LI0025 gcpE ppsA TRUE 0.507 83.000 0.000 1.000 N NA
 1996372 1996373 LI0025 LI0026 ppsA birA FALSE 0.048 257.000 0.000 1.000 N NA
 1996373 1996374 LI0026 LI0027 birA fliM TRUE 0.552 76.000 0.000 1.000 N NA
 1996376 1996377 LI0029 LI0030     FALSE 0.118 170.000 0.000 NA   NA
 1996377 1996378 LI0030 LI0031     TRUE 0.432 89.000 0.000 NA   NA
 1996378 1996379 LI0031 LI0032     FALSE 0.035 279.000 0.000 NA   NA
 1996379 1996380 LI0032 LI0033   ostA FALSE 0.013 474.000 0.000 NA   NA
 1996382 1996383 LI0035 LI0036 fur rfaF FALSE 0.027 314.000 0.000 1.000 N NA
 1996383 1996384 LI0036 LI0037 rfaF   FALSE 0.025 338.000 0.000 1.000   NA
 1996385 1996386 LI0038 LI0039     FALSE 0.033 300.000 0.000 1.000   NA
 1996386 1996387 LI0039 LI0040     TRUE 0.688 33.000 0.000 NA   NA
 1996387 1996388 LI0040 LI0041     FALSE 0.026 311.000 0.000 NA   NA
 1996388 1996389 LI0041 LI0042     FALSE 0.050 250.000 0.000 NA   NA
 1996389 1996390 LI0042 LI0043     TRUE 0.553 72.000 0.000 NA   NA
 1996392 1996393 LI0045 LI0046     FALSE 0.010 755.000 0.000 NA   NA
 1996394 1996395 LIt02 LI0047   secF FALSE 0.042 261.000 0.000 NA   NA
 1996395 1996396 LI0047 LI0048 secF secD TRUE 1.000 3.000 0.370 0.002 Y NA
 1996396 1996397 LI0048 LI0049 secD yajC TRUE 0.807 151.000 0.044 NA Y NA
 1996397 1996398 LI0049 LI0050 yajC   FALSE 0.008 1046.000 0.000 NA   NA
 1996398 1996399 LI0050 LI0051   uvrD TRUE 0.627 52.000 0.000 NA   NA
 1996399 1996400 LI0051 LI0052 uvrD pfp TRUE 0.988 -34.000 0.015 1.000 N NA
 1996404 1996405 LI0056 LI0057     TRUE 1.000 -3.000 0.778 1.000 Y NA
 1996405 1996406 LI0057 LI0058     TRUE 1.000 -3.000 0.500 NA Y NA
 1996407 1996408 LI0059 LI0060   glpR FALSE 0.009 763.000 0.000 NA   NA
 1996409 1996410 LI0061 LI0062   ybeN FALSE 0.012 516.000 0.000 NA   NA
 1996411 1996412 LI0063 LI0064     FALSE 0.012 628.000 0.000 1.000   NA
 1996413 1996414 LI0065 LI0066   ftsK TRUE 0.995 4.000 0.053 1.000 N NA
 1996414 1996415 LI0066 LI0067 ftsK   TRUE 0.544 77.000 0.000 1.000 N NA
 1996416 1996417 LI0068 LI0069     FALSE 0.008 1548.000 0.000 NA   NA
 1996417 1996418 LI0069 LI0070     FALSE 0.259 115.000 0.000 NA   NA
 1996418 1996419 LI0070 LI0071     FALSE 0.208 129.000 0.000 NA   NA
 1996419 1996420 LI0071 LI0072     TRUE 0.447 88.000 0.000 NA   NA
 1996420 1996421 LI0072 LI0073     FALSE 0.063 218.000 0.000 NA   NA
 1996423 1996424 LI0075 LI0076 icc   TRUE 0.833 18.000 0.000 1.000   NA
 1996424 1996425 LI0076 LI0077   ugpB TRUE 0.984 133.000 0.357 0.035 Y NA
 1996425 1996426 LI0077 LI0078 ugpB ugpA TRUE 0.999 63.000 0.611 0.035 Y NA
 1996426 1996427 LI0078 LI0079 ugpA   TRUE 1.000 -3.000 0.816 0.035 Y NA
 1996430 1996431 LI0082 LI0083   kpsF TRUE 0.838 15.000 0.000 NA   NA
 1996433 1996434 LI0084 LI0085   dnaK FALSE 0.017 397.000 0.000 NA   NA
 1996434 1996435 LI0085 LI0086 dnaK   FALSE 0.009 670.000 0.000 NA N NA
 1996435 1996436 LI0086 LI0087   argD TRUE 0.899 3.000 0.000 NA N NA
 1996436 1996437 LI0087 LI0088 argD dut TRUE 0.982 -28.000 0.008 1.000 N NA
 1996438 1996439 LI0089 LI0090 folE   TRUE 0.807 20.000 0.000 1.000   NA
 1996439 1996440 LI0090 LI0091   eno TRUE 0.709 114.000 0.008 1.000 N NA
 1996442 1996443 LI0093 LI0094   pfk TRUE 0.890 6.000 0.000 NA   NA
 1996444 1996445 LI0095 LI0096     TRUE 0.561 70.000 0.000 NA   NA
 1996445 1996446 LI0096 LI0097   corA FALSE 0.009 853.000 0.000 NA   NA
 1996448 1996449 LI0099 LI0100 argC   TRUE 0.990 4.000 0.019 NA   NA
 1996449 1996450 LI0100 LI0101   dgkA FALSE 0.028 301.000 0.000 NA   NA
 1996450 1996451 LI0101 LI0102 dgkA polB TRUE 0.730 28.000 0.000 1.000 N NA
 1996452 1996453 LI0103 LI0104     TRUE 0.875 10.000 0.000 NA   NA
 1996453 1996454 LI0104 LI0105     FALSE 0.170 144.000 0.000 NA   NA
 1996455 1996456 LI0106 LI0107 ilv   TRUE 0.983 19.000 0.025 1.000   NA
 1996456 1996457 LI0107 LI0108   dapA FALSE 0.032 302.000 0.000 1.000   NA
 1996457 1996458 LI0108 LIt04 dapA   FALSE 0.028 305.000 0.000 NA   NA
 1996459 1996460 LI0109 LI0110   smf TRUE 0.988 5.000 0.014 1.000   NA
 1996460 1996461 LI0110 LI0111 smf   TRUE 0.967 67.000 0.037 1.000 Y NA
 1996462 1996463 LI0112 LI0113     FALSE 0.099 193.000 0.000 1.000   NA
 1996463 1996464 LI0113 LI0114   serS TRUE 0.429 95.000 0.000 1.000   NA
 1996465 1996466 LI0115 LI0116     TRUE 0.813 18.000 0.000 NA   NA
 1996466 1996467 LI0116 LI0117   cysG TRUE 0.587 72.000 0.000 1.000   NA
 1996467 1996468 LI0117 LI0118 cysG purN TRUE 0.951 29.000 0.012 1.000 N NA
 1996469 1996470 LI0119 LI0120 msrA   TRUE 0.997 -25.000 0.031 0.002 Y NA
 1996470 1996471 LI0120 LI0121   pepQ TRUE 0.677 45.000 0.000 1.000   NA
 1996474 1996475 LI0124 LI0125 cbpA   TRUE 0.998 19.000 0.326 NA   NA
 1996475 1996476 LI0125 LI0126   clpB TRUE 0.875 91.000 0.015 NA   NA
 1996477 1996478 LI0127 LI0128 glnQ glnP TRUE 1.000 -31.000 0.625 1.000 Y NA
 1996478 1996479 LI0128 LI0129 glnP   TRUE 0.999 51.000 0.792 0.034 Y NA
 1996480 1996481 LI0130 LI0131 hisJ folC TRUE 0.370 101.000 0.000 1.000 N NA
 1996481 1996482 LI0131 LI0132 folC selA TRUE 0.987 22.000 0.055 1.000 N NA
 1996482 1996483 LI0132 LI0133 selA   FALSE 0.118 170.000 0.000 NA   NA
 1996483 1996484 LI0133 LI0134     TRUE 0.990 91.000 0.364 NA   NA
 1996484 1996485 LI0134 LI0135     TRUE 0.999 6.000 0.364 NA   NA
 1996485 1996486 LI0135 LIt05     TRUE 0.580 64.000 0.000 NA   NA
 1996486 1996487 LIt05 LI0136     FALSE 0.008 1155.000 0.000 NA   NA
 1996488 1996489 LI0137 LI0138     FALSE 0.020 354.000 0.000 NA   NA
 1996489 1996490 LI0138 LI0139     TRUE 0.683 34.000 0.000 NA   NA
 1996490 1996491 LI0139 LI0140     FALSE 0.071 207.000 0.000 NA   NA
 1996492 1996493 LI0141 LIt06 nodB   FALSE 0.007 2885.000 0.000 NA   NA
 1996493 1996494 LIt06 LI0142     FALSE 0.011 584.000 0.000 NA   NA
 1996495 1996496 LI0143 LI0144     FALSE 0.041 263.000 0.000 NA   NA
 1996496 1996497 LI0144 LIt07     FALSE 0.027 307.000 0.000 NA   NA
 1996501 1996502 LI0148 LI0149 lon radC TRUE 0.983 38.000 0.074 1.000 N NA
 1996502 1996503 LI0149 LI0150 radC   TRUE 0.874 95.000 0.011 1.000 Y NA
 1996503 1996504 LI0150 LI0151     TRUE 0.954 21.000 0.008 NA   NA
 1996504 1996505 LI0151 LI0152   leuS TRUE 0.974 11.000 0.007 NA   NA
 1996505 1996506 LI0152 LI0153 leuS nusB TRUE 0.979 11.000 0.010 1.000 N NA
 1996506 1996507 LI0153 LI0154 nusB ribH TRUE 0.999 10.000 0.347 1.000 N NA
 1996507 1996508 LI0154 LI0155 ribH ribA TRUE 0.975 87.000 0.051 0.004 Y NA
 1996508 1996509 LI0155 LI0156 ribA ribE TRUE 0.995 -15.000 0.037 1.000 Y NA
 1996509 1996510 LI0156 LI0157 ribE ribD TRUE 1.000 4.000 0.456 1.000 Y NA
 1996510 1481658 LI0157 LI0158 ribD comEB TRUE 0.890 -34.000 0.000 NA   NA
 1481658 1996511 LI0158 LI0159 comEB glyA TRUE 0.550 73.000 0.000 NA   NA
 1996511 1996512 LI0159 LI0160 glyA fabF/fabB TRUE 0.948 69.000 0.025 1.000 N NA
 1996512 1996513 LI0160 LI0161 fabF/fabB fabG FALSE 0.027 420.000 0.000 1.000 Y NA
 1996513 1996514 LI0161 LI0162 fabG fabH TRUE 0.857 109.000 0.007 0.006 Y NA
 1996514 1996515 LI0162 LI0163 fabH plsX TRUE 0.935 82.000 0.008 0.006 Y NA
 1996515 1996516 LI0163 LI0164 plsX   TRUE 0.538 223.000 0.044 NA   NA
 1996516 1996517 LI0164 LI0165   mutY FALSE 0.283 112.000 0.000 NA   NA
 1996519 1996520 LIt08 LI0167     FALSE 0.110 176.000 0.000 NA   NA
 1996520 1996521 LI0167 LI0168     TRUE 0.468 88.000 0.000 1.000 N NA
 1996522 1996523 LI0169 LI0170 oppA relA TRUE 0.943 130.000 0.167 1.000 N NA
 1996524 1996525 LI0171 LI0172     FALSE 0.011 595.000 0.000 NA   NA
 1996526 1996527 LI0173 LI0174     TRUE 0.902 -10.000 0.000 NA   NA
 1996527 1996528 LI0174 LI0175     FALSE 0.021 341.000 0.000 NA   NA
 1996528 1996529 LI0175 LI0176     TRUE 0.418 91.000 0.000 NA   NA
 1996529 1996530 LI0176 LI0177     FALSE 0.010 630.000 0.000 NA   NA
 1996530 1996531 LI0177 LI0178     FALSE 0.139 158.000 0.000 NA   NA
 1996533 1996534 LI0180 LI0181     FALSE 0.065 214.000 0.000 NA   NA
 1996534 1996535 LI0181 LI0182     TRUE 0.894 -24.000 0.000 NA   NA
 1996535 1996536 LI0182 LI0183     TRUE 0.991 69.000 0.208 NA   NA
 1996536 1996537 LI0183 LI0184     TRUE 1.000 -16.000 0.667 NA   NA
 1996537 1996538 LI0184 LI0185     TRUE 0.972 70.000 0.068 NA   NA
 1996538 1996539 LI0185 LI0186     TRUE 0.996 4.000 0.068 NA   NA
 1996539 1996540 LI0186 LI0187     TRUE 0.997 15.000 0.179 NA   NA
 1996540 1996541 LI0187 LI0188   ftsH FALSE 0.011 622.000 0.000 NA   NA
 1996541 1996542 LI0188 LI0189 ftsH folP TRUE 0.999 12.000 0.325 1.000 N NA
 1996542 1996543 LI0189 LI0190 folP   TRUE 0.985 64.000 0.133 NA   NA
 1996543 1996544 LI0190 LI0191     TRUE 0.952 193.000 0.502 NA   NA
 1996544 1996545 LI0191 LI0192     TRUE 0.993 28.000 0.150 NA   NA
 1996545 1996546 LI0192 LI0193   galU TRUE 0.914 1.000 0.000 1.000 N NA
 1996546 1996547 LI0193 LI0194 galU priA TRUE 0.696 35.000 0.000 1.000 N NA
 1996547 1996548 LI0194 LI0195 priA   FALSE 0.010 1027.000 0.000 1.000   NA
 1996548 1996549 LI0195 LI0196     TRUE 0.920 -3.000 0.000 1.000   NA
 1996550 1996551 LI0197 LI0198     FALSE 0.225 125.000 0.000 NA   NA
 1996551 1996552 LI0198 LI0199     TRUE 0.985 21.000 0.048 1.000   NA
 1996552 1996553 LI0199 LI0200   purH TRUE 0.970 60.000 0.051 1.000   NA
 1996554 1996555 LI0201 LI0202   purA TRUE 0.633 253.000 0.096 NA   NA
 1996555 1996556 LI0202 LI0203 purA trmU FALSE 0.136 165.000 0.000 1.000 N NA
 1996556 1996557 LI0203 LI0204 trmU   TRUE 0.530 82.000 0.000 1.000   NA
 1996557 1996558 LI0204 LI0205   hemB TRUE 0.904 114.000 0.056 1.000   NA
 1996558 1996559 LI0205 LI0206 hemB   TRUE 0.996 -15.000 0.070 1.000   NA
 1996559 1996560 LI0206 LI0207   nirD TRUE 0.999 5.000 0.200 1.000   NA
 1996560 1996561 LI0207 LI0208 nirD   FALSE 0.131 163.000 0.000 NA   NA
 1996561 1996562 LI0208 LI0209     FALSE 0.038 270.000 0.000 NA   NA
 1996563 1996564 LI0210 LI0211 fliS fliD TRUE 0.894 32.000 0.000 0.006 Y NA
 1996565 1996566 LIt09 LI0212   thrS TRUE 0.604 57.000 0.000 NA   NA
 1996566 1996567 LI0212 LI0213 thrS   TRUE 0.979 68.000 0.060 1.000 Y NA
 1996567 1996568 LI0213 LI0214   rplT FALSE 0.032 370.000 0.000 1.000 Y NA
 1996568 1996569 LI0214 LI0215 rplT pheS TRUE 0.990 84.000 0.202 1.000 Y NA
 1996569 1996570 LI0215 LI0216 pheS pheT TRUE 0.999 40.000 0.574 0.002 Y NA
 1996570 1996571 LI0216 LI0217 pheT   TRUE 0.932 41.000 0.010 1.000 N NA
 1996571 1996572 LI0217 LI0218   rpe FALSE 0.237 215.000 0.003 1.000 N NA
 1996572 1996573 LI0218 LI0219 rpe tkt TRUE 0.721 63.000 0.000 1.000 Y NA
 1996573 1996574 LI0219 LI0220 tkt trmD FALSE 0.067 227.000 0.000 1.000   NA
 1996574 1996575 LI0220 LI0221 trmD rplS TRUE 0.998 36.000 0.567 1.000   NA
 1996575 1996576 LI0221 LI0222 rplS rplS TRUE 0.974 67.000 0.066 1.000 N NA
 1996576 1996577 LI0222 LI0223 rplS   TRUE 0.995 20.000 0.111 1.000 Y NA
 1996577 1996578 LI0223 LI0224     TRUE 0.998 -58.000 0.165 1.000   NA
 1996578 1996579 LI0224 LI0225   smpB TRUE 0.916 3.000 0.000 1.000   NA
 1996579 1996580 LI0225 LI0226 smpB yjjK TRUE 0.790 21.000 0.000 1.000   NA
 1996581 1996582 LI0227 LI0228 fabD glpX FALSE 0.240 125.000 0.000 1.000 N NA
 1996583 1996584 LI0229 LI0230 argS   TRUE 0.983 7.000 0.011 NA   NA
 1996584 1996585 LI0230 LI0231     TRUE 0.978 17.000 0.015 NA   NA
 1996585 1996586 LI0231 LI0232     TRUE 0.989 13.000 0.021 NA Y NA
 1996586 1996587 LI0232 LI0233     TRUE 0.985 16.000 0.024 NA   NA
 1996587 1996588 LI0233 LI0234     TRUE 0.996 5.000 0.077 NA   NA
 1996588 1996589 LI0234 LI0235     TRUE 1.000 1.000 0.684 NA N NA
 1996590 1996591 LI0236 LI0237 mutS   FALSE 0.015 455.000 0.000 1.000 N NA
 1996591 1996592 LI0237 LI0238   cca TRUE 0.806 120.000 0.023 1.000 N NA
 1996592 1996593 LI0238 LI0239 cca   TRUE 0.674 167.000 0.028 1.000 N NA
 1996594 1996595 LI0240 LI0241 folk uvrB FALSE 0.013 524.000 0.000 1.000 N NA
 1996595 1996596 LI0241 LI0242 uvrB lig TRUE 0.965 20.000 0.006 1.000 Y NA
 1996596 1996597 LI0242 LI0243 lig dapB TRUE 0.972 17.000 0.011 1.000 N NA
 1996597 1996598 LI0243 LI0244 dapB nadE TRUE 0.978 1.000 0.003 1.000 N NA
 1996599 1996600 LI0245 LI0246 hypB hypA TRUE 0.999 11.000 0.215 0.003   NA
 1996601 1996602 LI0247 LI0248     TRUE 0.542 75.000 0.000 NA   NA
 1996603 1996604 LI0249 LI0250 recN oppC TRUE 0.985 55.000 0.109 1.000 N NA
 1996604 1996605 LI0250 LI0251 oppC oppB TRUE 1.000 9.000 0.456 0.033 Y NA
 1996605 1996606 LI0251 LI0252 oppB   TRUE 0.854 155.000 0.088 NA   NA
 1996606 1996607 LI0252 LI0253     TRUE 0.999 13.000 0.343 NA   NA
 1996609 1996610 LI0255 LI0256     TRUE 0.907 2.000 0.000 NA   NA
 1996611 1996612 LI0257 LI0258 dnaE   TRUE 0.962 20.000 0.009 1.000 N NA
 1996615 1996616 LI0261 LI0262 gad   TRUE 0.990 55.000 0.128 1.000 Y NA
 1996617 1996618 LI0263 LI0264   rho FALSE 0.020 367.000 0.000 1.000 N NA
 1996619 1996620 LI0265 LI0266   iscU TRUE 1.000 -3.000 0.716 1.000 N NA
 1996620 1996621 LI0266 LI0267 iscU   FALSE 0.009 948.000 0.000 NA   NA
 1996621 1996622 LI0267 LI0268   ruvC FALSE 0.252 117.000 0.000 NA   NA
 1996622 1996623 LI0268 LI0269 ruvC yebC TRUE 0.993 72.000 0.277 1.000   NA
 1996623 1996624 LI0269 LI0270 yebC ygcA TRUE 0.951 49.000 0.018 NA   NA
 1996625 1996626 LI0271 LI0272     TRUE 0.860 12.000 0.000 NA   NA
 1996626 1996627 LI0272 LI0273     FALSE 0.037 273.000 0.000 NA   NA
 1996627 1996628 LI0273 LI0274     FALSE 0.268 371.000 0.017 0.039 Y NA
 1996628 1996629 LI0274 LI0275   cyoB TRUE 0.431 140.000 0.000 0.022 Y NA
 1996629 1996630 LI0275 LI0276 cyoB cyoA TRUE 1.000 33.000 0.939 0.039 Y NA
 1996632 1996633 LI0278 LI0279 porA pta TRUE 0.990 88.000 0.300 1.000   NA
 1996633 1996634 LI0279 LI0280 pta ackA TRUE 0.973 100.000 0.160 1.000   NA
 1996635 1996636 LI0281 LI0282 miaA kdtB TRUE 0.950 47.000 0.017 1.000 N NA
 1996636 1996637 LI0282 LI0283 kdtB   TRUE 0.999 -24.000 0.367 1.000 N NA
 1996637 1996638 LI0283 LI0284     TRUE 0.537 141.000 0.005 1.000   NA
 1996638 1996639 LI0284 LI0285     FALSE 0.220 126.000 0.000 NA   NA
 1996639 1996640 LI0285 LI0286     TRUE 0.324 105.000 0.000 NA   NA
 1996640 1996641 LI0286 LI0287   recD TRUE 0.988 14.000 0.036 NA   NA
 1996642 1996643 LIt10 LI0288     FALSE 0.011 616.000 0.000 NA   NA
 1996644 1996645 LI0289 LI0290     FALSE 0.074 204.000 0.000 NA   NA
 1996645 1996646 LI0290 LI0291     FALSE 0.008 1077.000 0.000 NA   NA
 1996648 1996649 LI0293 LI0294 fumB fumA TRUE 0.998 26.000 0.262 0.003 Y NA
 1996649 1996650 LI0294 LI0295 fumA   FALSE 0.040 265.000 0.000 NA   NA
 1996650 1996651 LI0295 LI0296   purM FALSE 0.015 441.000 0.000 NA   NA
 1996652 1996653 LI0297 LI0298     TRUE 0.755 22.000 0.000 NA   NA
 1996654 1996655 LI0299 LI0300 glyS glyQ TRUE 1.000 6.000 0.651 0.002 Y NA
 1996655 1996656 LI0300 LI0301 glyQ recO TRUE 0.962 56.000 0.036 1.000 N NA
 1996656 1996657 LI0301 LI0302 recO   TRUE 0.973 5.000 0.002 1.000   NA
 1996657 1996658 LI0302 LI0303   ppi TRUE 0.822 19.000 0.000 1.000   NA
 1996658 1996659 LI0303 LI0304 ppi   FALSE 0.250 170.000 0.000 0.013   NA
 1996659 1996660 LI0304 LI0305     TRUE 0.908 38.000 0.004 1.000   NA
 1996660 1996661 LI0305 LI0306     TRUE 0.495 82.000 0.000 NA   NA
 1996662 1996663 LI0307 LI0308 greA   TRUE 0.609 62.000 0.000 1.000 N NA
 1996663 1996664 LI0308 LI0309   yicC TRUE 0.727 105.000 0.006 NA   NA
 1996664 1996665 LI0309 LI0310 yicC gmk TRUE 0.833 253.000 0.276 NA   NA
 1996665 1996666 LI0310 LI0311 gmk pyrF TRUE 0.985 7.000 0.006 1.000 Y NA
 1996666 1996667 LI0311 LI0312 pyrF   TRUE 0.893 70.000 0.008 1.000   NA
 1996667 1996668 LI0312 LI0313   recJ TRUE 0.864 60.000 0.002 1.000   NA
 1996670 1996671 LI0315 LI0316     FALSE 0.099 185.000 0.000 NA   NA
 1996671 1996672 LI0316 LI0317     TRUE 0.637 57.000 0.000 1.000   NA
 1996673 1996674 LI0318 LI0319     TRUE 0.904 3.000 0.000 NA   NA
 1996675 1996676 LI0320 LI0321 cysG resC TRUE 0.997 -13.000 0.104 1.000 N NA
 1996676 1996677 LI0321 LI0322 resC hemA TRUE 0.997 -25.000 0.112 1.000 N NA
 1996677 1996678 LI0322 LI0323 hemA   FALSE 0.222 129.000 0.000 1.000 N NA
 1996678 1996679 LI0323 LI0324   thiE TRUE 0.581 70.000 0.000 1.000 N NA
 1996682 1996683 LI0327 LI0328     TRUE 0.649 44.000 0.000 NA   NA
 1996684 1996685 LI0329 LI0330 glgX   TRUE 0.998 19.000 0.281 1.000 Y NA
 1996685 1996686 LI0330 LI0331   amyA TRUE 1.000 3.000 0.429 1.000 Y NA
 1996686 1996687 LI0331 LI0332 amyA glgP TRUE 0.997 10.000 0.086 1.000 Y NA
 1996688 1996689 LI0333 LI0334 argB hslU TRUE 0.976 21.000 0.021 1.000 N NA
 1996689 1996690 LI0334 LI0335 hslU livF TRUE 0.669 85.000 0.000 0.026 N NA
 1996690 1996691 LI0335 LI0336 livF livG TRUE 0.997 53.000 0.320 0.026 Y NA
 1996691 1996692 LI0336 LI0337 livG livM TRUE 0.999 10.000 0.429 1.000 Y NA
 1996692 1996693 LI0337 LI0338 livM livH TRUE 1.000 -3.000 0.783 0.032 Y NA
 1996693 1996694 LI0338 LI0339 livH   TRUE 0.998 51.000 0.581 1.000 Y NA
 1996695 1996696 LI0340 LI0341     FALSE 0.040 265.000 0.000 NA   NA
 1996696 1996697 LI0341 LI0342   leuB FALSE 0.139 158.000 0.000 NA   NA
 1996697 1996698 LI0342 LI0343 leuB codA TRUE 0.888 93.000 0.020 NA   NA
 1996698 1996699 LI0343 LI0344 codA   FALSE 0.062 219.000 0.000 NA   NA
 1996699 1996700 LI0344 LI0345     FALSE 0.080 199.000 0.000 NA   NA
 1996701 1996702 LI0346 LI0347 htrA flgE FALSE 0.084 201.000 0.000 1.000 N NA
 1996702 1996703 LI0347 LI0348 flgE flgE FALSE 0.168 151.000 0.000 1.000 N NA
 1996704 1996705 LI0349 LI0350 purC fabI TRUE 0.948 41.000 0.014 1.000 N NA
 1996705 1996706 LI0350 LI0351 fabI mdh FALSE 0.115 180.000 0.000 1.000 N NA
 1996706 1996707 LI0351 LI0352 mdh   FALSE 0.088 198.000 0.000 1.000 N NA
 1996707 1996708 LI0352 LI0353   rplI FALSE 0.111 276.000 0.000 0.026 Y NA
 1996708 1996709 LI0353 LI0354 rplI recQ TRUE 0.940 62.000 0.017 1.000 N NA
 1996710 1996711 LI0355 LI0356     TRUE 0.664 50.000 0.000 1.000   NA
 1996711 1996712 LI0356 LI0357   pcm TRUE 0.911 4.000 0.000 1.000   NA
 1996715 1996716 LI0360 LI0361 nadC   TRUE 0.999 -3.000 0.198 0.006 Y NA
 1996716 1996717 LI0361 LI0362   nadB TRUE 0.997 49.000 0.210 0.006 Y NA
 1996718 1996719 LI0363 LI0364   gph TRUE 0.887 106.000 0.036 1.000   NA
 1996719 1996720 LI0364 LI0365 gph   FALSE 0.015 489.000 0.000 1.000   NA
 1996720 1996721 LI0365 LI0366   trxB TRUE 0.978 6.000 0.006 1.000   NA
 1996721 1996722 LI0366 LI0367 trxB trxA TRUE 0.982 -3.000 0.006 1.000   NA
 1996722 1996723 LI0367 LI0368 trxA ygjD TRUE 0.685 126.000 0.011 1.000   NA
 1996723 1996724 LI0368 LI0369 ygjD fbp TRUE 0.814 104.000 0.013 1.000 N NA
 1996724 1996725 LI0369 LI0370 fbp   TRUE 0.880 114.000 0.049 NA   NA
 1996725 1996726 LI0370 LI0371     TRUE 0.993 30.000 0.154 NA   NA
 1996726 1996727 LI0371 LI0372     TRUE 0.938 23.000 0.004 1.000   NA
 1996727 1996728 LI0372 LI0373   pgsA TRUE 0.870 12.000 0.000 1.000 N NA
 1996728 1996729 LI0373 LI0374 pgsA   TRUE 0.627 148.000 0.013 1.000 N NA
 1996729 1996730 LI0374 LI0375   pcm TRUE 0.983 81.000 0.143 1.000 N NA
 1996731 1996732 LI0376 LI0377   rpsB FALSE 0.058 249.000 0.000 1.000   NA
 1996732 1996733 LI0377 LI0378 rpsB tsf TRUE 0.999 26.000 0.748 1.000 Y NA
 1996733 1996734 LI0378 LI0379 tsf galE TRUE 0.359 102.000 0.000 1.000 N NA
 1996734 1996735 LI0379 LI0380 galE   TRUE 0.995 4.000 0.041 1.000 Y NA
 1996735 1996736 LI0380 LI0381   lgtF TRUE 0.929 7.000 0.000 NA Y NA
 1996736 1996737 LI0381 LI0382 lgtF pyrH TRUE 0.938 21.000 0.004 NA N NA
 1996737 1996738 LI0382 LI0383 pyrH rrf TRUE 1.000 4.000 0.626 1.000 N NA
 1996738 1996739 LI0383 LI0384 rrf yaeS TRUE 0.997 36.000 0.409 1.000 N NA
 1996739 1996740 LI0384 LI0385 yaeS cdsA TRUE 1.000 -3.000 0.400 1.000 Y NA
 1996740 1996741 LI0385 LI0386 cdsA dxr TRUE 0.996 63.000 0.372 1.000 Y NA
 1996741 1996742 LI0386 LI0387 dxr   TRUE 1.000 0.000 0.568 1.000 N NA
 1996742 1996743 LI0387 LI0388     TRUE 0.956 -3.000 0.000 0.029 N NA
 1996743 1996744 LI0388 LI0389     FALSE 0.010 906.000 0.000 1.000 N NA
 1996745 1996746 LIt11 LI0390   proS FALSE 0.090 191.000 0.000 NA   NA
 1996746 1996747 LI0390 LI0391 proS   FALSE 0.263 121.000 0.000 1.000   NA
 1996748 1996749 LI0392 LI0393 mreB mreC TRUE 0.992 114.000 0.689 1.000 N NA
 1996749 1996750 LI0393 LI0394 mreC   TRUE 0.991 -3.000 0.018 NA   NA
 1996750 1996751 LI0394 LI0395     TRUE 0.999 -16.000 0.246 NA   NA
 1996751 1996752 LI0395 LI0396   rodA TRUE 0.988 25.000 0.075 1.000 N NA
 1996752 1996753 LI0396 LI0397 rodA   TRUE 0.952 25.000 0.011 NA N NA
 1996753 1996754 LI0397 LI0398     TRUE 0.936 95.000 0.053 NA   NA
 1996754 1996755 LI0398 LI0399   atpF TRUE 0.999 18.000 0.569 0.011   NA
 1996755 1996756 LI0399 LI0400 atpF atpE TRUE 0.999 -3.000 0.132 0.011 Y NA
 1996756 1996757 LI0400 LI0401 atpE atpD TRUE 1.000 -10.000 0.864 0.011 Y NA
 1996757 1996758 LI0401 LI0402 atpD atpC TRUE 1.000 5.000 0.846 0.011 Y NA
 1996758 1996759 LI0402 LI0403 atpC atpB TRUE 1.000 24.000 0.724 0.011 Y NA
 1996759 1996760 LI0403 LI0404 atpB atpA TRUE 1.000 11.000 0.837 0.011 Y NA
 1996760 1996761 LI0404 LI0405 atpA xseA FALSE 0.203 136.000 0.000 1.000 N NA
 1996761 1996762 LI0405 LI0406 xseA   TRUE 0.978 25.000 0.032 1.000   NA
 1996762 1996763 LI0406 LI0407     FALSE 0.040 282.000 0.000 1.000   NA
 1996763 1996764 LI0407 LI0408   dsx TRUE 0.997 74.000 0.522 1.000 Y NA
 1996767 1996768 LI0410 LI0411 trpA trpB TRUE 0.999 11.000 0.146 0.002 Y NA
 1996768 1996769 LI0411 LI0412 trpB trpF TRUE 0.998 -10.000 0.077 0.003 Y NA
 1996769 1996770 LI0412 LI0413 trpF trpC_2 TRUE 0.990 -22.000 0.013 1.000 Y NA
 1996770 1996771 LI0413 LI0414 trpC_2 trpD TRUE 0.927 54.000 0.006 1.000 Y NA
 1996771 1996772 LI0414 LI0415 trpD   TRUE 0.948 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1996772 1996773 LI0415 LI0416     TRUE 0.993 3.000 0.028 1.000   NA
 1996773 1996774 LI0416 LI0417     TRUE 0.914 -10.000 0.000 1.000   NA
 1996774 1996775 LI0417 LI0418     TRUE 0.899 4.000 0.000 NA   NA
 1996778 1996779 LI0421 LI0422 bioF   TRUE 0.998 -3.000 0.128 NA   NA
 1996779 1996780 LI0422 LI0424   bioC TRUE 0.995 20.000 0.163 NA   NA
 1996780 1996781 LI0424 LI0425 bioC bioD TRUE 0.997 0.000 0.081 1.000   NA
 1996781 1996782 LI0425 LI0426 bioD bioA TRUE 0.998 4.000 0.051 0.004 Y NA
 1996783 1996784 LI0427 LIt13     FALSE 0.008 1042.000 0.000 NA   NA
 1996784 1996785 LIt13 LIt14     TRUE 0.899 4.000 0.000 NA   NA
 1996788 1996789 LI0430 LI0431   himA TRUE 0.943 75.000 0.026 1.000 N NA
 1996790 1996791 LI0432 LI0433   dsbD FALSE 0.042 267.000 0.000 1.000 N NA
 1996795 1996796 LI0436 LI0437     TRUE 0.956 -78.000 0.000 0.003   NA
 1996796 1996797 LI0437 LI0438     FALSE 0.125 251.000 0.000 0.003   NA
 1996798 1996799 LI0439 LI0440 hyaA hyaB TRUE 1.000 15.000 0.611 0.002 Y NA
 1996799 1996800 LI0440 LI0441 hyaB hyaC TRUE 0.991 110.000 0.355 0.038 Y NA
 1996800 1996801 LI0441 LI0442 hyaC hyaD TRUE 0.999 3.000 0.177 1.000 Y NA
 1996801 1996802 LI0442 LI0443 hyaD   FALSE 0.010 760.000 0.000 NA   NA
 1996802 1996803 LI0443 LI0444     TRUE 0.894 5.000 0.000 NA   NA
 1996804 1996805 LI0445 LI0446 dtd   TRUE 0.672 41.000 0.000 1.000 N NA
 1996807 1996808 LI0448 LI0449     TRUE 0.980 35.000 0.055 NA   NA
 1996808 1996809 LI0449 LI0450   purL TRUE 0.568 123.000 0.003 NA   NA
 1996810 1996811 LI0451 LI0452 pyrG kdsA TRUE 0.992 31.000 0.138 1.000 N NA
 1996811 1996812 LI0452 LI0453 kdsA   TRUE 0.995 -3.000 0.048 1.000   NA
 1996812 1996813 LI0453 LI0454     TRUE 0.981 75.000 0.119 NA   NA
 1996813 1996814 LI0454 LI0455     TRUE 0.924 100.000 0.051 NA   NA
 1996814 1996815 LI0455 LI0456     TRUE 1.000 0.000 0.543 NA   NA
 1996815 1996816 LI0456 LI0457   rpoN TRUE 0.843 146.000 0.059 1.000   NA
 1996816 1996817 LI0457 LI0458 rpoN   TRUE 0.998 35.000 0.632 NA N NA
 1996817 1996818 LI0458 LI0459     TRUE 0.916 35.000 0.006 NA   NA
 1996818 1996819 LI0459 LIt16     TRUE 0.509 80.000 0.000 NA   NA
 1996819 1996820 LIt16 LI0460     FALSE 0.026 310.000 0.000 NA   NA
 1996821 1996822 LI0461 LI0462   gltX FALSE 0.142 157.000 0.000 NA   NA
 1996822 1996823 LI0462 LI0463 gltX   TRUE 0.334 104.000 0.000 NA   NA
 1996823 1996824 LI0463 LI0464   pgk TRUE 0.620 54.000 0.000 NA   NA
 1996826 1996827 LI0466 LI0467 galE cynT TRUE 0.370 101.000 0.000 1.000 N NA
 1996828 1996829 LIt17 LI0468   rfbB FALSE 0.014 455.000 0.000 NA   NA
 1996829 1996830 LI0468 LI0469 rfbB   TRUE 0.912 -7.000 0.000 1.000 N NA
 1996830 1996831 LI0469 LI0470     FALSE 0.018 394.000 0.000 1.000 N NA
 1996831 1996832 LI0470 LI0471     TRUE 0.693 38.000 0.000 1.000   NA
 1996833 1996834 LI0472 LI0473     FALSE 0.008 1305.000 0.000 NA   NA
 1996834 1996835 LI0473 LI0474     FALSE 0.008 2096.000 0.000 1.000   NA
 1996835 1996836 LI0474 LI0475     FALSE 0.158 196.000 0.000 0.064   NA
 1996837 1996838 LI0476 LI0477 nrdA nrdB TRUE 0.991 141.000 0.564 0.002 Y NA
 1996840 1996841 LI0479 LI0480     TRUE 0.982 18.000 0.023 NA   NA
 1996841 1996842 LI0480 LI0481     TRUE 0.580 64.000 0.000 NA   NA
 1996842 1996843 LI0481 LI0482   motA FALSE 0.080 199.000 0.000 NA   NA
 1996843 1996844 LI0482 LI0483 motA motB TRUE 0.999 45.000 0.833 1.000 Y NA
 1996845 1996846 LI0484 LI0485     FALSE 0.031 291.000 0.000 NA   NA
 1996847 1996848 LI0486 LI0487 motA motB TRUE 0.993 107.000 0.571 1.000 Y NA
 1996848 1996849 LI0487 LI0488 motB accC FALSE 0.019 382.000 0.000 1.000 N NA
 1996849 1996850 LI0488 LI0489 accC   TRUE 0.993 13.000 0.015 0.002 Y NA
 1996850 1996851 LI0489 LI0490     TRUE 0.923 48.000 0.010 NA   NA
 1996851 1996852 LI0490 LI0491     TRUE 0.992 5.000 0.028 NA   NA
 1996852 1996853 LI0491 LI0492     TRUE 0.997 38.000 0.480 NA   NA
 1996854 1996855 LI0493 LI0494 glnS   TRUE 0.688 39.000 0.000 1.000   NA
 1996856 1996857 LI0495 LI0496     FALSE 0.023 314.000 0.000 NA N NA
 1996857 1996858 LI0496 LI0497   livH TRUE 0.995 81.000 0.424 NA Y NA
 1996858 1996859 LI0497 LI0498 livH livM TRUE 1.000 -3.000 0.771 0.031 Y NA
 1996859 1996860 LI0498 LI0499 livM livG TRUE 1.000 -3.000 0.514 1.000 Y NA
 1996860 1996861 LI0499 LI0500 livG livF TRUE 1.000 -7.000 0.919 0.025 Y NA
 1996861 1996862 LI0500 LI0501 livF ppa FALSE 0.041 269.000 0.000 1.000 N NA
 1996863 1996864 LI0502 LI0503 pabC   TRUE 0.995 -3.000 0.043 1.000   NA
 1996865 1996866 LI0504 LI0505 thiG thiH TRUE 0.997 50.000 0.277 0.006 Y NA
 1996866 1996867 LI0505 LI0506 thiH thiF TRUE 0.996 10.000 0.083 1.000   NA
 1996868 1996869 LI0507 LI0508     TRUE 0.447 88.000 0.000 NA   NA
 1996869 1996870 LI0508 LI0509     TRUE 0.389 120.000 0.000 0.074 N NA
 1996872 1996873 LI0511 LI0512     TRUE 0.604 57.000 0.000 NA   NA
 1996873 1996874 LI0512 LI0513     TRUE 0.985 59.000 0.086 1.000 Y NA
 1996875 1996876 LI0514 LI0515   ispB FALSE 0.019 375.000 0.000 1.000 N NA
 1996876 1996877 LI0515 LI0516 ispB purL TRUE 0.964 27.000 0.016 1.000 N NA
 1996878 1996879 LI0517 LI0518 rpoD dnaG TRUE 0.999 -10.000 0.299 1.000 N NA
 1996879 1996880 LI0518 LI0519 dnaG   TRUE 0.457 410.000 0.137 1.000   NA
 1996884 1996885 LI0523 LI0524     TRUE 0.998 9.000 0.182 NA   NA
 1996885 1996886 LI0524 LI0525     TRUE 0.885 8.000 0.000 NA   NA
 1996886 1996887 LI0525 LI0526   cheY TRUE 0.980 86.000 0.143 1.000 N NA
 1996887 1482026 LI0526 LI0527 cheY fliA TRUE 0.713 28.000 0.000 NA   NA
 1482026 1996888 LI0527 LI0528 fliA fleN TRUE 0.886 -97.000 0.000 NA   NA
 1996888 1996889 LI0528 LI0529 fleN flhF TRUE 0.994 43.000 0.241 1.000   NA
 1996889 1996890 LI0529 LI0530 flhF   TRUE 0.999 0.000 0.440 1.000   NA
 1996890 1996891 LI0530 LI0531   flhB TRUE 0.990 89.000 0.171 0.012 Y NA
 1996891 1996892 LI0531 LI0532 flhB fliR TRUE 0.997 53.000 0.353 1.000 Y NA
 1996893 1996894 LI0533 LI0534   nusA TRUE 1.000 -3.000 0.759 NA   NA
 1996894 1996895 LI0534 LI0535 nusA infB TRUE 0.885 231.000 0.342 1.000 N NA
 1996895 1996896 LI0535 LI0536 infB mgpa FALSE 0.039 284.000 0.000 1.000   NA
 1996897 1996898 LI0537 LI0538 SctR   TRUE 0.995 25.000 0.154 NA Y NA
 1996898 1996899 LI0538 LI0539     TRUE 0.650 43.000 0.000 NA   NA
 1996899 1996900 LI0539 LI0540   sctN TRUE 0.997 22.000 0.250 NA   NA
 1996900 1996901 LI0540 LI0541 sctN sctL TRUE 0.999 21.000 0.600 1.000 Y NA
 1996901 1996902 LI0541 LI0542 sctL   TRUE 1.000 -21.000 0.667 NA   NA
 1996902 1996903 LI0542 LI0543   nolT TRUE 0.909 0.000 0.000 NA   NA
 1996903 1996904 LI0543 LI0544 nolT   TRUE 0.861 14.000 0.000 1.000   NA
 1996904 1996905 LI0544 LI0545     FALSE 0.009 926.000 0.000 NA   NA
 1996906 1996907 LI0546 LI0547     FALSE 0.083 206.000 0.000 1.000   NA
 1996907 1996908 LI0547 LI0548   yscV TRUE 0.920 -3.000 0.000 1.000   NA
 1996908 1996909 LI0548 LI0549 yscV yscS TRUE 0.997 18.000 0.094 0.012 Y NA
 1996909 1996910 LI0549 LI0550 yscS yscT TRUE 0.993 48.000 0.129 0.063 Y NA
 1996910 1996911 LI0550 LI0551 yscT yscU TRUE 1.000 -3.000 0.548 0.063 Y NA
 5526205 5526206 LI_r01 LI_r02     TRUE 0.663 38.000 0.000 NA   NA
 5526206 1996912 LI_r02 LIt18     FALSE 0.197 133.000 0.000 NA   NA
 1996912 1996913 LIt18 LIt19     TRUE 0.561 70.000 0.000 NA   NA
 1996913 5526207 LIt19 LI_r03     TRUE 0.596 59.000 0.000 NA   NA
 1996914 1996915 LI0552 LI0553   lysA FALSE 0.020 362.000 0.000 1.000 N NA
 1996915 1996916 LI0553 LI0554 lysA   TRUE 0.725 26.000 0.000 NA   NA
 1996916 1996917 LI0554 LI0555     TRUE 0.831 195.000 0.143 NA   NA
 1996917 1996918 LI0555 LI0556     FALSE 0.103 182.000 0.000 NA   NA
 1996918 1996919 LI0556 LI0557   bacA FALSE 0.222 129.000 0.000 1.000 N NA
 1996921 1996922 LI0559 LI0560 rplM   TRUE 0.994 19.000 0.051 0.025 Y NA
 1996922 1996923 LI0560 LI0561     FALSE 0.122 179.000 0.000 1.000   NA
 1996923 1996924 LI0561 LI0562     FALSE 0.053 242.000 0.000 NA   NA
 1996925 1996926 LIt20 LI0563     FALSE 0.121 168.000 0.000 NA   NA
 1996927 1996928 LI0564 LI0565 pgpA   FALSE 0.267 114.000 0.000 NA   NA
 1996929 1996930 LI0566 LI0567 flgE   TRUE 0.952 84.000 0.041 NA Y NA
 1996930 1996931 LI0567 LI0568     TRUE 0.986 13.000 0.023 NA   NA
 1996931 1996932 LI0568 LI0569     TRUE 0.828 211.000 0.167 1.000   NA
 1996936 1996937 LI0573 LI0574     TRUE 0.999 10.000 0.324 1.000   NA
 1996937 1996938 LI0574 LI0575     FALSE 0.016 457.000 0.000 1.000   NA
 1996938 1996939 LI0575 LI0576   trmA FALSE 0.201 137.000 0.000 1.000 N NA
 1996939 1996940 LI0576 LI0577 trmA   TRUE 0.690 36.000 0.000 1.000 N NA
 1996941 1996942 LI0578 LI0579 purH mutT FALSE 0.072 216.000 0.000 1.000   NA
 1996943 1996944 LI0580 LI0581     TRUE 0.996 13.000 0.133 NA   NA
 1996944 1996945 LI0581 LI0582     TRUE 0.986 -18.000 0.013 NA   NA
 1996945 1996946 LI0582 LI0583     TRUE 0.979 -3.000 0.004 NA   NA
 1996947 1996948 LI0584 LI0585     TRUE 0.643 56.000 0.000 1.000   NA
 1996948 1996949 LI0585 LI0586     TRUE 0.993 0.000 0.035 NA N NA
 1996950 1996951 LI0587 LI0588   tatC FALSE 0.237 121.000 0.000 NA   NA
 1996951 1996952 LI0588 LI0589 tatC   TRUE 0.987 30.000 0.060 NA Y NA
 1996952 1996953 LI0589 LI0590   guaA FALSE 0.183 283.000 0.007 1.000 N NA
 1996953 1996954 LI0590 LI0591 guaA guaB TRUE 0.984 113.000 0.190 0.002 Y NA
 1996955 1996956 LI0592 LI0593 maa cls FALSE 0.088 201.000 0.000 1.000   NA
 1996957 1996958 LI0594 LI0595 rnb lpxK TRUE 0.965 24.000 0.014 1.000 N NA
 1996958 1996959 LI0595 LI0596 lpxK tpx FALSE 0.124 171.000 0.000 1.000 N NA
 1996961 1996962 LI0598 LI0599 zntA panF FALSE 0.062 289.000 0.000 0.062 N NA
 1996962 1996963 LI0599 LI0600 panF   TRUE 1.000 3.000 0.682 NA   NA
 1996964 1996965 LI0601 LI0602     TRUE 0.366 100.000 0.000 NA   NA
 1996965 1996966 LI0602 LI0603     FALSE 0.020 354.000 0.000 NA   NA
 1996966 1996967 LI0603 LI0604     TRUE 0.619 58.000 0.000 1.000 N NA
 1996968 1996969 LI0605 LI0606     FALSE 0.254 124.000 0.000 1.000   NA
 1996969 1996970 LI0606 LI0607     FALSE 0.013 596.000 0.000 1.000   NA
 1996970 1996971 LI0607 LI0608   cysS TRUE 0.585 132.000 0.006 1.000   NA
 1996971 1996972 LI0608 LI0609 cysS rpiB TRUE 0.747 101.000 0.006 1.000 N NA
 1996972 1996973 LI0609 LI0610 rpiB   TRUE 0.881 9.000 0.000 NA   NA
 1996973 1996974 LI0610 LI0611     TRUE 0.523 77.000 0.000 NA   NA
 1996974 1996975 LI0611 LI0612     TRUE 0.999 8.000 0.231 NA   NA
 1996975 1996976 LI0612 LI0613   sigB TRUE 0.979 20.000 0.022 1.000   NA
 1996977 1996978 LI0614 LI0615     FALSE 0.010 663.000 0.000 NA   NA
 1996978 1996979 LI0615 LI0616   radA TRUE 0.909 27.000 0.002 NA   NA
 1996979 1996980 LI0616 LI0617 radA yljA FALSE 0.225 125.000 0.000 NA   NA
 1996980 1996981 LI0617 LI0618 yljA   TRUE 1.000 -3.000 0.596 NA   NA
 1996981 1996982 LI0618 LI0619   aat TRUE 0.966 95.000 0.087 1.000 Y NA
 1996983 1996984 LI0620 LI0621 clr3   FALSE 0.106 175.000 0.000 NA N NA
 1996984 1996985 LI0621 LI0622     FALSE 0.164 156.000 0.000 1.000   NA
 1996985 1996986 LI0622 LI0623   rplU FALSE 0.017 442.000 0.000 1.000   NA
 1996987 1996988 LI0624 LI0625     TRUE 0.985 148.000 0.429 0.012 Y NA
 1996988 1996989 LI0625 LI0626     FALSE 0.230 127.000 0.000 1.000 N NA
 1996989 1996990 LI0626 LI0627   lpxC TRUE 0.695 126.000 0.012 1.000 N NA
 1996990 1996991 LI0627 LI0628 lpxC mutL TRUE 0.562 75.000 0.000 1.000 N NA
 1996992 1996993 LI0629 LI0630   secA TRUE 0.402 94.000 0.000 NA   NA
 1996993 1996994 LI0630 LI0631 secA hypE FALSE 0.178 146.000 0.000 1.000 N NA
 1996994 1996995 LI0631 LI0632 hypE   FALSE 0.289 154.000 0.000 0.030   NA
 1996995 1996996 LI0632 LI0633   flgM FALSE 0.050 258.000 0.000 1.000   NA
 1996996 1996997 LI0633 LI0634 flgM   TRUE 0.991 28.000 0.130 NA   NA
 1996999 1997000 LI0636 LI0637   mutM TRUE 0.589 68.000 0.000 1.000 N NA
 1997000 1997001 LI0637 LI0638 mutM   TRUE 0.576 75.000 0.000 1.000   NA
 1997001 1997002 LI0638 LIt21     FALSE 0.154 153.000 0.000 NA   NA
 1997002 1997003 LIt21 LI0639   fliP FALSE 0.016 408.000 0.000 NA   NA
 1997003 1997004 LI0639 LI0640 fliP   TRUE 0.999 -19.000 0.386 1.000   NA
 1997004 1997005 LI0640 LI0641   fliN TRUE 0.990 26.000 0.090 1.000   NA
 1997005 1997006 LI0641 LI0642 fliN fliL TRUE 0.997 13.000 0.062 0.003 Y NA
 1997006 1997007 LI0642 LI0643 fliL   TRUE 0.732 142.000 0.024 NA   NA
 1997007 1997008 LI0643 LI0644     TRUE 0.997 -3.000 0.084 NA   NA
 1997008 1997009 LI0644 LI0645   htpX FALSE 0.067 227.000 0.000 1.000   NA
 1997012 1997013 LI0648 LI0649 valS   FALSE 0.010 934.000 0.000 1.000   NA
 1997013 1997014 LI0649 LI0650     FALSE 0.021 874.000 0.000 0.027   NA
 1997014 1997015 LI0650 LI0651   nadh TRUE 0.333 109.000 0.000 1.000   NA
 1997016 1997017 LI0652 LI0653     TRUE 0.679 44.000 0.000 1.000   NA
 1997018 1997019 LI0654 LI0655 topA gloB TRUE 0.398 100.000 0.000 1.000   NA
 1997019 1997020 LI0655 LI0656 gloB argG TRUE 0.613 64.000 0.000 1.000   NA
 1997020 1997021 LI0656 LI0657 argG argH TRUE 0.991 88.000 0.278 1.000 Y NA
 1997021 1997022 LI0657 LI0658 argH trmU FALSE 0.128 174.000 0.000 1.000   NA
 1997022 1997023 LI0658 LI0659 trmU   FALSE 0.017 416.000 0.000 1.000   NA
 1997025 1997026 LI0661 LI0662 glmS   FALSE 0.101 184.000 0.000 NA   NA
 1997026 1997027 LI0662 LI0663     FALSE 0.007 2114.000 0.000 NA   NA
 1997027 1997028 LI0663 LI0664     FALSE 0.025 314.000 0.000 NA   NA
 1997029 1997030 LI0665 LI0666     FALSE 0.105 181.000 0.000 NA   NA
 1997030 1997031 LI0666 LI0667     FALSE 0.008 1650.000 0.000 NA   NA
 1997031 1997032 LI0667 LI0668     FALSE 0.040 265.000 0.000 NA   NA
 1997032 1997033 LI0668 LI0669     FALSE 0.067 213.000 0.000 NA   NA
 1997033 1997034 LI0669 LIt22     FALSE 0.007 2168.000 0.000 NA   NA
 1997035 1997036 LI0670 LI0671 ahcY serA FALSE 0.060 284.000 0.000 1.000 Y NA
 1997036 1997037 LI0671 LI0672 serA pcrA TRUE 0.715 31.000 0.000 1.000 N NA
 1997037 1997038 LI0672 LI0673 pcrA thiL TRUE 0.979 16.000 0.013 1.000 N NA
 1997040 1997041 LI0675 LI0676 hflK hflC TRUE 1.000 1.000 0.947 0.012 Y NA
 1997041 1997042 LI0676 LI0677 hflC   TRUE 0.903 -34.000 0.000 1.000   NA
 1997044 1997045 LI0679 LI0680     TRUE 0.846 66.000 0.002 1.000   NA
 1997046 1997047 LI0681 LI0682 kdtA ddlA TRUE 0.991 5.000 0.014 1.000 Y NA
 1997047 1997048 LI0682 LI0683 ddlA   TRUE 0.901 -43.000 0.000 1.000   NA
 1997048 1997049 LI0683 LI0684     FALSE 0.011 645.000 0.000 1.000   NA
 1997049 1997050 LI0684 LI0685   dnaJ FALSE 0.009 1578.000 0.000 1.000   NA
 1997050 1997051 LI0685 LI0686 dnaJ pepA FALSE 0.017 415.000 0.000 1.000 N NA
 1997051 1997052 LI0686 LI0687 pepA   TRUE 0.798 20.000 0.000 1.000 N NA
 1997053 1997054 LI0688 LI0689   grsT TRUE 0.909 0.000 0.000 NA   NA
 1997055 1997056 LI0690 LIt23     FALSE 0.023 325.000 0.000 NA   NA
 1997056 1997057 LIt23 LI0691   pal TRUE 0.611 56.000 0.000 NA   NA
 1997057 1997058 LI0691 LI0692 pal tolB TRUE 0.898 146.000 0.115 1.000 N NA
 1997058 1997059 LI0692 LI0693 tolB   FALSE 0.250 464.000 0.033 0.013 N NA
 1997059 1997060 LI0693 LI0694   exbD TRUE 0.956 101.000 0.074 0.071 N NA
 1997060 1997061 LI0694 LI0695 exbD tolQ TRUE 0.985 83.000 0.102 0.036 Y NA
 1997062 1997063 LI0696 LI0697 rubY rubA TRUE 0.994 14.000 0.027 0.008 Y NA
 1997063 1997064 LI0697 LI0698 rubA rfaF TRUE 0.353 104.000 0.000 1.000 N NA
 1997064 1997065 LI0698 LI0699 rfaF   TRUE 0.673 47.000 0.000 1.000   NA
 1997066 1997067 LI0700 LI0701   uvrC FALSE 0.110 186.000 0.000 1.000   NA
 1997067 1997068 LI0701 LI0702 uvrC maf TRUE 0.875 9.000 0.000 NA N NA
 1997070 1997071 LI0704 LI0705 asnS   TRUE 0.580 64.000 0.000 NA   NA
 1997071 1997072 LI0705 LI0706     TRUE 0.473 85.000 0.000 NA   NA
 1997072 1997073 LI0706 LI0707   hypF FALSE 0.018 399.000 0.000 1.000 N NA
 1997074 1997075 LI0708 LI0709   ribF TRUE 0.306 111.000 0.000 1.000 N NA
 1997075 1997076 LI0709 LI0710 ribF fliC TRUE 0.725 29.000 0.000 1.000 N NA
 1997079 1997080 LI0712 LI0713 pyrD pyrDII TRUE 1.000 -3.000 0.592 1.000 N NA
 1997081 1997082 LI0714 LI0715 argJ rluD FALSE 0.136 165.000 0.000 1.000 N NA
 1997082 1997083 LI0715 LI0716 rluD gln FALSE 0.217 130.000 0.000 1.000 N NA
 1997083 1997084 LI0716 LI0717 gln glnP TRUE 0.998 56.000 0.378 0.030 Y NA
 1997084 1997085 LI0717 LI0718 glnP glnQ TRUE 1.000 11.000 0.600 1.000 Y NA
 1997085 1997086 LI0718 LI0719 glnQ   TRUE 1.000 2.000 0.643 1.000 Y NA
 1997086 1997087 LI0719 LI0720   lepA TRUE 0.652 50.000 0.000 1.000 N NA
 1997088 1997089 LI0721 LI0722     FALSE 0.012 571.000 0.000 NA   NA
 1997089 1997090 LI0722 LI0723   mltA FALSE 0.188 137.000 0.000 NA   NA
 1997092 1997093 LI0725 LI0726 hisB metK TRUE 0.430 92.000 0.000 1.000 N NA
 1997094 1997095 LI0727 LI0728   lytB TRUE 0.890 6.000 0.000 NA   NA
 1997095 1997096 LI0728 LI0729 lytB cheV TRUE 0.991 65.000 0.208 1.000 N NA
 1997098 1997099 LI0731 LI0732 acpS hslV TRUE 0.736 27.000 0.000 1.000 N NA
 1997099 1997100 LI0732 LI0733 hslV   FALSE 0.041 271.000 0.000 1.000 N NA
 1997100 1997101 LI0733 LI0734     FALSE 0.138 159.000 0.000 NA   NA
 1997101 1997102 LI0734 LI0735   ychB TRUE 0.366 100.000 0.000 NA   NA
 1997102 1997103 LI0735 LIt25 ychB   TRUE 0.704 30.000 0.000 NA   NA
 1997103 1997104 LIt25 LI0736   prsA TRUE 0.875 10.000 0.000 NA   NA
 1997104 1997105 LI0736 LI0737 prsA   TRUE 0.979 44.000 0.056 1.000 N NA
 1997105 1997106 LI0737 LI0738     TRUE 0.997 76.000 0.496 0.046 Y NA
 1997106 1997107 LI0738 LI0739     FALSE 0.045 256.000 0.000 NA   NA
 1997107 1997108 LI0739 LI0740   flgF FALSE 0.158 150.000 0.000 NA   NA
 1997108 1997109 LI0740 LI0741 flgF flgG TRUE 0.999 15.000 0.377 0.003 Y NA
 1997109 1997110 LI0741 LI0742 flgG   TRUE 0.992 26.000 0.098 NA Y NA
 1997110 1997111 LI0742 LI0743   flgG TRUE 0.999 18.000 0.632 NA Y NA
 1997111 1997112 LI0743 LI0744 flgG flgI TRUE 0.998 46.000 0.394 0.020 Y NA
 1997112 1997113 LI0744 LI0745 flgI flgJ TRUE 0.998 5.000 0.167 NA   NA
 1997113 1997114 LI0745 LI0746 flgJ   FALSE 0.071 207.000 0.000 NA   NA
 1997114 1997115 LI0746 LI0747   flgK TRUE 0.999 0.000 0.226 0.005   NA
 1997115 1997116 LI0747 LI0748 flgK flgL TRUE 1.000 10.000 0.667 0.003   NA
 1997116 1997117 LI0748 LI0749 flgL   TRUE 0.436 94.000 0.000 1.000   NA
 1997117 1997118 LI0749 LI0750     FALSE 0.057 228.000 0.000 NA   NA
 1997119 1997120 LI0751 LI0752     TRUE 0.916 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1997120 1997121 LI0752 LI0753   glnP TRUE 0.500 107.000 0.000 0.029 N NA
 1997121 1997122 LI0753 LI0754 glnP glnH TRUE 0.967 123.000 0.141 0.036 Y NA
 1997122 1997123 LI0754 LI0755 glnH lytB FALSE 0.013 541.000 0.000 1.000 N NA
 1997123 1997124 LI0755 LI0756 lytB rnh FALSE 0.026 315.000 0.000 1.000 N NA
 1997124 1997125 LI0756 LI0757 rnh menA FALSE 0.118 176.000 0.000 1.000 N NA
 1997125 1997126 LI0757 LI0758 menA   TRUE 0.979 112.000 0.308 NA   NA
 1997126 1997127 LI0758 LI0759   menA TRUE 0.999 -3.000 0.308 NA   NA
 1997127 1997128 LI0759 LI0760 menA tmk TRUE 0.397 99.000 0.000 1.000 N NA
 1997128 1997129 LI0760 LI0761 tmk cbf1 TRUE 0.990 -15.000 0.018 1.000   NA
 1997130 1997131 LI0762 LI0763 surE fba TRUE 0.468 193.000 0.013 1.000   NA
 1997131 1997132 LI0763 LI0764 fba gapA TRUE 0.955 110.000 0.056 0.008 Y NA
 1997133 1997134 LI0765 LI0766   fmt TRUE 0.968 57.000 0.048 NA   NA
 1997134 1997135 LI0766 LI0767 fmt def TRUE 0.997 -3.000 0.033 0.046 Y NA
 1997137 1997138 LI0769 LI0770     TRUE 0.989 -9.000 0.014 NA   NA
 1997139 1997140 LI0771 LI0772 rne   TRUE 0.993 4.000 0.032 NA   NA
 1997142 1997143 LI0774 LI0775 trkA trkH TRUE 0.733 91.000 0.000 0.004 Y NA
 1997143 1997144 LI0775 LI0776 trkH psd TRUE 0.430 92.000 0.000 1.000 N NA
 1997144 1997145 LI0776 LI0777 psd   TRUE 0.997 62.000 0.466 1.000 Y NA
 1997147 1997148 LI0779 LI0780 cutA fruK TRUE 0.993 1.000 0.027 1.000 N NA
 1997148 1997149 LI0780 LI0781 fruK   FALSE 0.035 287.000 0.000 1.000 N NA
 1997149 1997150 LI0781 LI0782   thiD TRUE 0.798 20.000 0.000 1.000 N NA
 1997151 1997152 LI0783 LI0784   gyrA TRUE 0.652 54.000 0.000 1.000   NA
 1997152 1997153 LI0784 LI0785 gyrA gyrB TRUE 0.988 119.000 0.306 0.002 Y NA
 1997153 1997154 LI0785 LI0786 gyrB dnaN TRUE 0.992 33.000 0.114 1.000 Y NA
 1997154 1997155 LI0786 LI0787 dnaN dnaA TRUE 0.797 121.000 0.014 1.000 Y NA
 1997156 1997157 LI0788 LI0789   queA TRUE 0.705 33.000 0.000 1.000 N NA
 1997157 1997158 LI0789 LI0790 queA vorB FALSE 0.009 975.000 0.000 1.000 N NA
 1997158 1997159 LI0790 LI0791 vorB porB TRUE 1.000 0.000 0.822 0.003 Y NA
 1997159 1997160 LI0791 LI0792 porB porB TRUE 1.000 2.000 0.797 0.003 Y NA
 1997160 1997161 LI0792 LIt26 porB   FALSE 0.113 174.000 0.000 NA   NA
 1997161 1997162 LIt26 LI0793     FALSE 0.031 293.000 0.000 NA   NA
 1997162 1997163 LI0793 LI0794   clpP TRUE 0.967 157.000 0.351 1.000 Y NA
 1997163 1997164 LI0794 LI0795 clpP clpX TRUE 0.871 276.000 0.352 1.000 Y NA
 1997164 1997165 LI0795 LI0796 clpX lon TRUE 0.988 88.000 0.201 1.000 Y NA
 1997168 1997169 LI0799 LI0800     TRUE 0.994 49.000 0.270 NA   NA
 1997170 1997171 LI0801 LI0802 glmU   FALSE 0.010 973.000 0.000 1.000   NA
 1997171 1997172 LI0802 LI0803     TRUE 0.486 83.000 0.000 NA   NA
 1997173 1997174 LI0804 LI0805     TRUE 0.965 -7.000 0.000 0.002   NA
 1997174 1997175 LI0805 LI0806   menE TRUE 0.648 55.000 0.000 1.000   NA
 1997175 1997176 LI0806 LI0807 menE menB TRUE 0.979 99.000 0.193 1.000 N NA
 1997176 1997177 LI0807 LI0808 menB comA TRUE 0.989 10.000 0.027 NA N NA
 1997177 1997178 LI0808 LIt27 comA   FALSE 0.085 194.000 0.000 NA   NA
 1997178 1997179 LIt27 LI0809     TRUE 0.460 87.000 0.000 NA   NA
 1997181 1997182 LI0811 LI0812 pit   TRUE 0.905 -7.000 0.000 NA   NA
 1997183 1997184 LI0813 LI0814 rluD soj FALSE 0.074 210.000 0.000 1.000 N NA
 1997184 1997185 LI0814 LI0815 soj spo0J TRUE 0.998 80.000 0.827 1.000 N NA
 1997185 1997186 LI0815 LI0816 spo0J   TRUE 0.712 116.000 0.011 NA N NA
 1997188 1997189 LI0818 LI0819 pyrB pyrC TRUE 0.999 12.000 0.452 1.000 Y NA
 1997191 1997192 LI0821 LI0822 miaB   FALSE 0.150 155.000 0.000 NA   NA
 1997192 1997193 LI0822 LI0823   pepQ TRUE 0.678 35.000 0.000 NA   NA
 1997193 1997194 LI0823 LI0824 pepQ   TRUE 0.758 24.000 0.000 1.000 N NA
 1997194 1997195 LI0824 LI0825     TRUE 0.708 29.000 0.000 NA   NA
 1997199 1997200 LI0829 LI0830 potA potB TRUE 1.000 -13.000 0.789 1.000 Y NA
 1997200 1997201 LI0830 LI0831 potB potC TRUE 1.000 0.000 0.286 0.029 Y NA
 1997201 1997202 LI0831 LI0832 potC potD TRUE 0.983 58.000 0.047 0.029 Y NA
 1997203 1997204 LI0833 LI0834     TRUE 0.784 20.000 0.000 NA   NA
 1997204 1997205 LI0834 LI0835     TRUE 0.646 45.000 0.000 NA   NA
 1997206 1997207 LI0836 LI0837     FALSE 0.033 300.000 0.000 1.000   NA
 1997210 1997211 LI0839 LI0840 xthA   FALSE 0.024 320.000 0.000 NA   NA
 1997211 1997212 LI0840 LI0841     FALSE 0.012 578.000 0.000 NA   NA
 1997213 1997214 LIt29 LI0842   katE FALSE 0.011 612.000 0.000 NA   NA
 1997214 1997215 LI0842 LI0843 katE tsr FALSE 0.009 1059.000 0.000 1.000 N NA
 1997217 1997218 LI0845 LI0846     FALSE 0.112 185.000 0.000 1.000   NA
 1997218 1997219 LI0846 LI0847     FALSE 0.120 165.000 0.000 NA N NA
 1997220 1997221 LI0848 LI0849 gidA   FALSE 0.112 185.000 0.000 1.000   NA
 1997221 1997222 LI0849 LI0850     TRUE 0.659 52.000 0.000 1.000   NA
 1997223 1997224 LI0851 LI0852     TRUE 0.804 52.000 0.000 0.020   NA
 1997225 1997226 LI0853 LIt30     FALSE 0.008 1284.000 0.000 NA   NA
 1997226 1997227 LIt30 LI0854   fliI FALSE 0.014 451.000 0.000 NA   NA
 1997227 1997228 LI0854 LI0855 fliI   TRUE 0.994 25.000 0.138 NA Y NA
 1997228 1997229 LI0855 LI0856   fliG TRUE 0.996 47.000 0.308 NA Y NA
 1997229 1997230 LI0856 LI0857 fliG fliF TRUE 0.858 407.000 0.477 0.015 Y NA
 1997230 1997231 LI0857 LI0858 fliF fliE TRUE 0.982 113.000 0.180 0.015 Y NA
 1997231 1997232 LI0858 LI0859 fliE flgC TRUE 0.997 49.000 0.271 0.009 Y NA
 1997232 1997233 LI0859 LI0860 flgC flgB TRUE 0.999 3.000 0.092 0.009 Y NA
 1997233 1997234 LI0860 LI0861 flgB cbiO FALSE 0.035 289.000 0.000 1.000 N NA
 1997234 1997235 LI0861 LI0862 cbiO   TRUE 0.998 9.000 0.143 1.000 N NA
 1997235 1997236 LI0862 LI0863   cbiM TRUE 0.999 -10.000 0.100 0.008 Y NA
 1997236 1997237 LI0863 LI0864 cbiM   TRUE 0.998 -13.000 0.150 1.000   NA
 1997237 1997238 LI0864 LI0865   mviN FALSE 0.105 189.000 0.000 1.000   NA
 1997238 1997239 LI0865 LI0866 mviN   TRUE 0.645 86.000 0.000 0.059   NA
 1997239 1997240 LI0866 LI0867   murI FALSE 0.010 1002.000 0.000 1.000   NA
 1997240 1997241 LI0867 LI0868 murI rluB FALSE 0.036 285.000 0.000 1.000 N NA
 1997242 1997243 LI0869 LI0870     TRUE 0.990 -25.000 0.020 NA   NA
 1997243 1997244 LI0870 LI0871   htrB TRUE 0.998 4.000 0.194 NA   NA
 1997245 1997246 LI0872 LI0873     FALSE 0.185 138.000 0.000 NA   NA
 1997247 1997248 LI0874 LI0875     TRUE 0.960 39.000 0.011 0.005 N NA
 1997249 1997250 LI0876 LI0877   atoC TRUE 0.769 59.000 0.000 0.025 N NA
 1997250 1997251 LI0877 LI0878 atoC atoS TRUE 0.972 66.000 0.047 1.000 Y NA
 1997251 1997252 LI0878 LI0879 atoS pgi TRUE 0.991 2.000 0.018 1.000 N NA
 1997254 1997255 LI0881 LI0882     TRUE 1.000 -3.000 0.631 0.059   NA
 1997255 1997256 LI0882 LI0883     FALSE 0.068 223.000 0.000 1.000   NA
 1997258 1997259 LI0884 LI0885 selB   TRUE 0.444 109.000 0.000 1.000 Y NA
 1997259 1997260 LI0885 LI0886     TRUE 0.999 26.000 0.643 0.002 Y NA
 1997260 1997261 LI0886 LI0887     FALSE 0.057 228.000 0.000 NA   NA
 1997263 1997264 LI0889 LI0890     FALSE 0.017 378.000 0.000 NA   NA
 1997265 1997266 LI0891 LI0892   lnt TRUE 0.432 89.000 0.000 NA   NA
 1997266 1997267 LI0892 LI0893 lnt   TRUE 0.934 49.000 0.012 1.000 N NA
 1997267 1997268 LI0893 LI0894   himD FALSE 0.016 443.000 0.000 1.000 N NA
 1997268 1997269 LI0894 LI0895 himD dapF FALSE 0.024 328.000 0.000 1.000 N NA
 1997269 1997270 LI0895 LI0896 dapF dapA TRUE 0.962 47.000 0.017 1.000 Y NA
 1997270 1997271 LI0896 LI0897 dapA araJ FALSE 0.082 202.000 0.000 1.000 N NA
 1997271 1997272 LI0897 LI0898 araJ tatD FALSE 0.097 182.000 0.000 NA N NA
 1997274 1997275 LI0900 LI0901   dsr FALSE 0.065 214.000 0.000 NA   NA
 1997275 1997276 LI0901 LI0902 dsr   FALSE 0.022 346.000 0.000 1.000 N NA
 1997276 1997277 LI0902 LI0903     TRUE 0.998 33.000 0.500 NA   NA
 1997278 1997279 LI0904 LI0905 rpoB rpoB TRUE 0.999 76.000 0.851 0.002   NA
 1997279 1997280 LI0905 LI0906 rpoB hemL FALSE 0.025 338.000 0.000 1.000   NA
 1997280 1997281 LI0906 LI0907 hemL nirH TRUE 0.995 0.000 0.053 NA N NA
 10712376 1997283 LI_1200 LI0909   lgt TRUE 0.577 128.000 0.005 1.000 N NA
 1997283 1997284 LI0909 LI0910 lgt cmk FALSE 0.082 202.000 0.000 1.000 N NA
 1997284 1997285 LI0910 LI0911 cmk   FALSE 0.063 230.000 0.000 1.000   NA
 1997287 1997288 LI0913 LI0914 aspA dacC FALSE 0.099 193.000 0.000 1.000   NA
 1997289 1997290 LI0915 LI0916 livE dnaX TRUE 0.965 31.000 0.020 1.000 N NA
 1997290 1997291 LI0916 LI0917 dnaX   TRUE 0.998 19.000 0.411 NA   NA
 1997291 1997292 LI0917 LI0918   recR TRUE 0.997 65.000 0.604 NA   NA
 1997293 1997294 LI0919 LI0920     FALSE 0.142 165.000 0.000 1.000   NA
 1997295 1997296 LI0921 LI0922 purD purK TRUE 0.995 -13.000 0.044 1.000 Y NA
 1997296 1997297 LI0922 LI0923 purK lepB TRUE 0.611 61.000 0.000 1.000 N NA
 1997298 1997299 LI0924 LI0925 qacE qacE TRUE 1.000 31.000 0.869 0.058 Y NA
 1997299 1997300 LI0925 LI0926 qacE mdoB TRUE 0.670 42.000 0.000 1.000 N NA
 1997300 1997301 LI0926 LI0927 mdoB mviN TRUE 0.618 63.000 0.000 1.000   NA
 1997303 1997304 LI0929 LI0930   rplL FALSE 0.277 111.000 0.000 NA N NA
 1997304 1997305 LI0930 LI0931 rplL rplJ TRUE 0.999 48.000 0.884 0.023 Y NA
 1997305 1997306 LI0931 LI0932 rplJ rplA TRUE 0.971 161.000 0.302 0.034 Y NA
 1997306 1997307 LI0932 LI0933 rplA rplK TRUE 0.998 105.000 0.838 0.034 Y NA
 1997307 1997308 LI0933 LI0934 rplK nusG TRUE 0.997 80.000 0.681 1.000 N NA
 1997308 1997309 LI0934 LIt32 nusG   FALSE 0.035 279.000 0.000 NA   NA
 1997309 1997310 LIt32 LI0935   tufA FALSE 0.109 177.000 0.000 NA   NA
 1997310 1997311 LI0935 LIt33 tufA   FALSE 0.163 147.000 0.000 NA   NA
 1997311 1997312 LIt33 LIt34     TRUE 0.542 75.000 0.000 NA   NA
 1997312 1997313 LIt34 LIt35     TRUE 0.899 4.000 0.000 NA   NA
 1997313 1997314 LIt35 LI0936   pqqL FALSE 0.245 120.000 0.000 NA   NA
 1997316 1997317 LI0938 LI0939 purF carB TRUE 0.951 76.000 0.023 1.000 Y NA
 1997318 1997319 LI0940 LI0941 yqiE corC FALSE 0.056 248.000 0.000 1.000 N NA
 1997319 1997320 LI0941 LI0942 corC rpsL FALSE 0.126 170.000 0.000 1.000 N NA
 1997320 1997321 LI0942 LI0943 rpsL rpsG TRUE 0.992 138.000 0.620 0.007 Y NA
 1997321 1997322 LI0943 LI0944 rpsG fusA TRUE 0.999 16.000 0.579 1.000 Y NA
 1997324 1997325 LI0946 LI0947 gidA   FALSE 0.047 250.000 0.000 NA N NA
 1997326 1997327 LI0948 LI0949     FALSE 0.126 165.000 0.000 NA   NA
 1997327 1997328 LI0949 LI0950     TRUE 0.851 13.000 0.000 NA   NA
 1997328 1997329 LI0950 LI0951   asd FALSE 0.134 201.000 0.000 1.000 Y NA
 1997329 1997330 LI0951 LI0952 asd   FALSE 0.011 703.000 0.000 1.000   NA
 1997330 1997331 LI0952 LI0953   ccmC FALSE 0.240 127.000 0.000 1.000   NA
 1997331 1997332 LI0953 LI0954 ccmC   TRUE 0.999 48.000 0.501 0.002 Y NA
 1997332 1997333 LI0954 LI0955   ccmA/ccmB TRUE 0.993 45.000 0.196 1.000 N NA
 1997333 1997334 LI0955 LI0956 ccmA/ccmB ccmF TRUE 0.994 -37.000 0.050 1.000 N NA
 1997334 1997335 LI0956 LI0957 ccmF b2503 TRUE 0.820 139.000 0.013 0.005 Y NA
 1997335 1997336 LI0957 LI0958 b2503 yhdP TRUE 0.912 89.000 0.026 NA   NA
 1997337 1997338 LI0959 LI0960 rpsJ rplC TRUE 0.999 22.000 0.467 0.034 Y NA
 1997338 1997339 LI0960 LI0961 rplC rplD TRUE 0.999 16.000 0.361 0.023 Y NA
 1997339 1997340 LI0961 LI0962 rplD rplW TRUE 1.000 15.000 0.513 0.023 Y NA
 1997340 1997341 LI0962 LI0963 rplW rplB TRUE 1.000 3.000 0.849 0.030 Y NA
 1997341 1997342 LI0963 LI0964 rplB rpsS TRUE 1.000 9.000 0.820 0.034 Y NA
 1997342 1997343 LI0964 LI0965 rpsS rplV TRUE 1.000 13.000 0.769 0.034 Y NA
 1997343 1997344 LI0965 LI0966 rplV rpsC TRUE 1.000 4.000 0.719 0.034 Y NA
 1997344 1997345 LI0966 LI0967 rpsC rplP TRUE 1.000 0.000 0.828 0.034 Y NA
 1997345 10712377 LI0967 LI_1205 rplP   TRUE 1.000 0.000 0.802 0.023   NA
 10712377 1997346 LI_1205 LI0968   rpsQ TRUE 1.000 3.000 0.828 0.023   NA
 1997346 1997347 LI0968 LI0969 rpsQ rplN TRUE 1.000 16.000 0.791 0.034 Y NA
 1997347 1997348 LI0969 LI0970 rplN rplX TRUE 1.000 9.000 0.810 0.034 Y NA
 1997348 1997349 LI0970 LI0971 rplX rplE TRUE 1.000 10.000 0.758 0.023 Y NA
 1997349 1997350 LI0971 LI0972 rplE rpsH TRUE 0.744 232.000 0.059 0.023 Y NA
 1997350 1997351 LI0972 LI0973 rpsH rplF TRUE 1.000 8.000 0.808 0.023 Y NA
 1997351 1997352 LI0973 LI0974 rplF rplR TRUE 1.000 13.000 0.815 0.023 Y NA
 1997352 1997353 LI0974 LI0975 rplR rpsE TRUE 1.000 25.000 0.814 0.034 Y NA
 1997353 1997354 LI0975 LI0976 rpsE rplO TRUE 0.925 181.000 0.148 0.034 Y NA
 1997354 1997355 LI0976 LI0977 rplO secY TRUE 1.000 12.000 0.730 1.000 N NA
 1997355 1997356 LI0977 LI0978 secY map TRUE 0.997 4.000 0.087 1.000 N NA
 1997356 1997357 LI0978 LI0979 map rpsM TRUE 0.392 222.000 0.010 1.000 Y NA
 1997357 1997358 LI0979 LI0980 rpsM rpsK TRUE 0.999 57.000 0.810 0.023 Y NA
 1997358 1997359 LI0980 LI0981 rpsK rpsD TRUE 0.999 23.000 0.509 0.034 Y NA
 1997359 1997360 LI0981 LI0982 rpsD rpoA TRUE 0.999 13.000 0.549 1.000 N NA
 1997360 1997361 LI0982 LI0983 rpoA rplQ TRUE 1.000 -10.000 0.873 1.000 N NA
 1997361 1997362 LI0983 LI0984 rplQ xanB FALSE 0.033 295.000 0.000 1.000 N NA
 1997362 1997363 LI0984 LI0985 xanB vc0389 FALSE 0.033 293.000 0.000 1.000 N NA
 1997363 1997364 LI0985 LI0986 vc0389 hisS FALSE 0.034 290.000 0.000 1.000 N NA
 1997364 1997365 LI0986 LI0987 hisS aspS TRUE 0.996 28.000 0.161 0.059 Y NA
 1997365 1997366 LI0987 LI0988 aspS dppF TRUE 0.439 91.000 0.000 1.000 N NA
 1997366 1997367 LI0988 LI0989 dppF   FALSE 0.195 139.000 0.000 1.000 N NA
 1997367 1997368 LI0989 LI0990   carA TRUE 0.987 0.000 0.011 1.000 N NA
 1997368 1997369 LI0990 LI0991 carA   FALSE 0.120 180.000 0.000 1.000   NA
 1997371 1997372 LI0993 LI0994 acrA acrB TRUE 1.000 0.000 0.945 1.000 N NA
 1997372 1997373 LI0994 LI0995 acrB oprM TRUE 0.999 4.000 0.204 0.028 N NA
 1997373 1997374 LI0995 LI0996 oprM   FALSE 0.018 371.000 0.000 NA   NA
 1997374 1997375 LI0996 LI0997   purB TRUE 0.939 41.000 0.012 NA   NA
 1997375 1997376 LI0997 LI0998 purB pyrE TRUE 0.963 31.000 0.012 1.000 Y NA
 1997376 1997377 LI0998 LI0999 pyrE   FALSE 0.020 353.000 0.000 NA   NA
 1997377 1997378 LI0999 LI1000     TRUE 0.909 -3.000 0.000 NA   NA
 1997378 1997379 LI1000 LI1001   napC FALSE 0.011 613.000 0.000 NA   NA
 1997379 1997380 LI1001 LI1002 napC nrfA TRUE 0.900 -7.000 0.000 NA N NA
 1997381 1997382 LI1003 LI1004 lysC   TRUE 0.956 5.000 0.000 0.009   NA
 1997383 10712378 LI1005 LI_1210 truB   TRUE 0.996 31.000 0.211 1.000 Y NA
 10712378 1997384 LI_1210 LI1006   pnpA TRUE 0.930 206.000 0.335 1.000 Y NA
 1997385 1997386 LI1007 LI1008 gatB   TRUE 0.957 19.000 0.006 NA   NA
 1997386 1997387 LI1008 LI1009   yfjB FALSE 0.010 637.000 0.000 NA   NA
 1997388 1997389 LI1010 LI1011 gmhA hemC FALSE 0.023 344.000 0.000 1.000 N NA
 1997389 1997390 LI1011 LI1012 hemC lon TRUE 0.779 88.000 0.003 1.000 N NA
 1997392 1997393 LI1014 LI1015   gmpA TRUE 0.984 15.000 0.020 NA   NA
 1997394 1997395 LI1016 LI1017     TRUE 0.999 2.000 0.250 NA   NA
 1997395 1997396 LI1017 LI1018   rfaQ TRUE 0.994 59.000 0.300 NA   NA
 1997396 1997397 LI1018 LIt36 rfaQ   FALSE 0.131 163.000 0.000 NA   NA
 1997397 1997398 LIt36 LI1019   lpxA TRUE 0.658 39.000 0.000 NA   NA
 1997398 1997399 LI1019 LI1020 lpxA fabZ TRUE 0.992 0.000 0.019 1.000 N NA
 1997399 1997400 LI1020 LI1021 fabZ lpxD TRUE 0.998 10.000 0.212 1.000 N NA
 1997400 1997401 LI1021 LI1022 lpxD   TRUE 0.989 4.000 0.010 1.000 Y NA
 1997401 1997402 LI1022 LI1023   amiA TRUE 0.949 145.000 0.182 1.000 Y NA
 1997402 1997403 LI1023 LI1024 amiA   TRUE 0.597 143.000 0.005 1.000 Y NA
 1997403 1997404 LI1024 LI1025   lolD TRUE 0.997 -7.000 0.075 1.000 N NA
 1997404 1997405 LI1025 LI1026 lolD lolC TRUE 0.983 3.000 0.007 1.000 N NA
 1997405 1997406 LI1026 LI1027 lolC lysU TRUE 0.985 0.000 0.008 1.000 N NA
 1997407 1997408 LIt37 LI1028     FALSE 0.014 450.000 0.000 NA   NA
 1997408 1997409 LI1028 LI1029   pstC TRUE 0.999 53.000 0.615 0.034 Y NA
 1997409 1997410 LI1029 LI1030 pstC pstA TRUE 1.000 -3.000 0.432 0.028 Y NA
 1997410 1997411 LI1030 LI1031 pstA pstB TRUE 0.999 -9.000 0.108 0.067 Y NA
 1997412 1997413 LI1032 LI1033     FALSE 0.095 188.000 0.000 NA   NA
 1997413 1997414 LI1033 LI1034     FALSE 0.019 360.000 0.000 NA   NA
 1997414 1997415 LI1034 LI1035     FALSE 0.010 645.000 0.000 NA   NA
 1997415 1997416 LI1035 LI1036     FALSE 0.203 130.000 0.000 NA   NA
 1997416 1997417 LI1036 LI1037     FALSE 0.126 165.000 0.000 NA   NA
 1997417 1997418 LI1037 LI1038     FALSE 0.027 309.000 0.000 NA   NA
 1997418 1997419 LI1038 LI1039     FALSE 0.013 500.000 0.000 NA   NA
 1997419 1997420 LI1039 LI1040     FALSE 0.053 241.000 0.000 NA   NA
 1997420 1997421 LI1040 LI1041     FALSE 0.133 162.000 0.000 NA   NA
 1997421 1997422 LI1041 LI1042     FALSE 0.014 446.000 0.000 NA   NA
 1997422 1997423 LI1042 LI1043   hprA FALSE 0.018 364.000 0.000 NA   NA
 1997423 1997424 LI1043 LI1044 hprA   TRUE 0.495 82.000 0.000 NA   NA
 1997424 1997425 LI1044 LI1045   pqiB TRUE 0.994 3.000 0.044 NA   NA
 1997425 1997426 LI1045 LI1046 pqiB   TRUE 1.000 -3.000 0.854 NA Y NA
 1997426 1997427 LI1046 LI1047   ttg2B TRUE 1.000 8.000 0.875 NA Y NA
 1997427 1997428 LI1047 LI1048 ttg2B grpE FALSE 0.147 153.000 0.000 NA N NA
 1997429 1997430 LI1049 LI1050     FALSE 0.016 404.000 0.000 NA   NA
 1997430 1997431 LI1050 LI1051   ileS FALSE 0.048 260.000 0.000 1.000   NA
 1997431 1997432 LI1051 LI1052 ileS lsp TRUE 0.983 25.000 0.049 1.000 N NA
 1997432 1997433 LI1052 LI1053 lsp   FALSE 0.194 143.000 0.000 1.000   NA
 1997433 1997434 LI1053 LI1054   cheZ TRUE 0.355 105.000 0.000 1.000   NA
 1997434 1997435 LI1054 LIt38 cheZ   TRUE 0.683 34.000 0.000 NA   NA
 1997435 1997436 LIt38 LI1055   lpxB FALSE 0.037 273.000 0.000 NA   NA
 1997436 1997437 LI1055 LI1056 lpxB   FALSE 0.046 254.000 0.000 NA   NA
 1997437 1997438 LI1056 LI1057   atpA TRUE 0.671 36.000 0.000 NA   NA
 1997438 1997439 LI1057 LI1058 atpA atpC TRUE 0.993 60.000 0.119 0.010 Y NA
 1997439 1997440 LI1058 LI1059 atpC   TRUE 0.988 46.000 0.114 1.000   NA
 1997440 1997441 LI1059 LI1060     FALSE 0.182 147.000 0.000 1.000   NA
 1997441 1997442 LI1060 LI1061     TRUE 0.988 17.000 0.041 1.000   NA
 1997442 1997443 LI1061 LI1062   truA TRUE 0.995 24.000 0.184 1.000   NA
 1997443 1997444 LI1062 LI1063 truA   FALSE 0.048 252.000 0.000 NA   NA
 1997444 1997445 LI1063 LI1064   fdhF FALSE 0.039 268.000 0.000 NA   NA
 1997446 1997447 LI1065 LI1066 rfbD rfbB TRUE 1.000 -3.000 0.600 0.006 Y NA
 1997448 1997449 LI1067 LI1068     TRUE 0.985 64.000 0.133 NA   NA
 1997449 1997450 LI1068 LI1069   rnpA FALSE 0.011 616.000 0.000 NA   NA
 1997450 1997451 LI1069 LI1070 rnpA yidC TRUE 0.451 354.000 0.105 1.000   NA
 1997451 1997452 LI1070 LI1071 yidC jag TRUE 0.997 24.000 0.254 1.000   NA
 1997452 1997453 LI1071 LI1072 jag thdF TRUE 0.984 66.000 0.116 1.000   NA
 1997453 1997454 LI1072 LI1073 thdF rncS TRUE 0.986 4.000 0.004 0.028   NA
 1997454 1997455 LI1073 LI1074 rncS   TRUE 0.530 82.000 0.000 1.000   NA
 1997455 1997456 LI1074 LI1075   ncd2 TRUE 0.908 57.000 0.007 1.000   NA
 1997457 1997458 LI1076 LI1077 glk   FALSE 0.176 142.000 0.000 NA   NA
 1997459 1997460 LI1078 LI1079 HydH hydG TRUE 0.999 20.000 0.500 1.000 Y NA
 1997460 1997461 LI1079 LI1080 hydG   FALSE 0.197 133.000 0.000 NA   NA
 1997463 1997464 LI1082 LI1083 feoA feoB TRUE 0.972 128.000 0.267 1.000 Y NA
 1997465 1997466 LI1084 LI1085     TRUE 1.000 12.000 0.547 0.002 N NA
 1997466 1997467 LI1085 LI1086   glpA TRUE 1.000 -7.000 0.650 0.002 N NA
 1997467 1997468 LI1086 LI1087 glpA   FALSE 0.029 299.000 0.000 NA   NA
 1997468 1997469 LI1087 LI1088     TRUE 1.000 -3.000 1.000 NA   NA
 1997470 1997471 LI1089 LI1090     TRUE 0.618 63.000 0.000 1.000   NA
 1997471 1997472 LI1090 LI1091     TRUE 0.981 24.000 0.039 1.000   NA
 1997472 1997473 LI1091 LI1092     FALSE 0.105 189.000 0.000 1.000   NA
 1997473 1997474 LI1092 LI1093     TRUE 0.637 57.000 0.000 1.000   NA
 1997475 1997476 LI1094 LI1095   pykF TRUE 0.999 4.000 0.269 1.000   NA
 1997477 1997478 LI1096 LI1097 mraZ   TRUE 0.997 71.000 0.635 1.000   NA
 1997478 1997479 LI1097 LI1098   ftsI FALSE 0.023 506.000 0.000 1.000 Y NA
 1997479 1997480 LI1098 LI1099 ftsI murE TRUE 0.997 2.000 0.073 1.000 Y NA
 1997480 1997481 LI1099 LI1100 murE murF TRUE 0.999 -9.000 0.099 0.005 Y NA
 1997481 1997482 LI1100 LI1101 murF mraY TRUE 1.000 0.000 0.309 0.008 Y NA
 1997482 1997483 LI1101 LI1102 mraY murD TRUE 1.000 14.000 0.647 0.008 Y NA
 1997483 1997484 LI1102 LI1103 murD spoVE TRUE 0.999 -13.000 0.297 0.005 N NA
 1997484 1997485 LI1103 LI1104 spoVE murG TRUE 0.997 5.000 0.098 1.000 N NA
 1997485 1997486 LI1104 LI1105 murG murC TRUE 0.999 -3.000 0.270 1.000 Y NA
 1997486 1997487 LI1105 LI1106 murC   TRUE 0.995 32.000 0.108 0.008 Y NA
 1997487 1997488 LI1106 LI1107   ftsQ TRUE 0.994 -6.000 0.024 NA Y NA
 1997488 1997489 LI1107 LI1108 ftsQ ftsA TRUE 0.933 194.000 0.389 NA N NA
 1997489 1997490 LI1108 LI1109 ftsA ftsZ TRUE 0.998 52.000 0.460 1.000 Y NA
 1997490 1997491 LI1109 LI1110 ftsZ   TRUE 0.333 109.000 0.000 1.000   NA
 1997492 1997493 LI1111 LI1112     TRUE 0.989 6.000 0.016 1.000   NA
 1997493 1997494 LI1112 LI1113   argF TRUE 0.735 76.000 0.000 0.019   NA
 1997494 1997495 LI1113 LI1114 argF   FALSE 0.183 144.000 0.000 1.000 N NA
 1997495 1997496 LI1114 LI1115   flbD FALSE 0.032 296.000 0.000 1.000 N NA
 1997497 1997498 LI1116 LI1117 priS cheV FALSE 0.029 310.000 0.000 1.000 N NA
 1997498 1997499 LI1117 LI1118 cheV   TRUE 0.637 49.000 0.000 NA   NA
 1997500 1997501 LI1119 LI1120 gapB proC FALSE 0.025 323.000 0.000 1.000 N NA
 1997501 1997502 LI1120 LI1121 proC ndk TRUE 0.989 0.000 0.013 1.000 N NA
 1997502 1997503 LI1121 LI1122 ndk   TRUE 0.909 30.000 0.002 1.000   NA
 1997503 1997504 LI1122 LI1123   prc TRUE 0.711 306.000 0.210 1.000   NA
 1997504 1997505 LI1123 LI1124 prc nth TRUE 0.589 68.000 0.000 1.000 N NA
 1997506 1997507 LIt39 LIt40     FALSE 0.146 156.000 0.000 NA   NA
 1997509 1997510 LI1126 LI1127     TRUE 0.619 58.000 0.000 1.000 N NA
 1997510 1997511 LI1127 LI1128     TRUE 0.976 78.000 0.105 NA   NA
 1997511 1997512 LI1128 LI1129   glnQ FALSE 0.150 155.000 0.000 NA   NA
 1997512 1997513 LI1129 LI1130 glnQ   TRUE 0.834 17.000 0.000 1.000 N NA
 1997514 1997515 LI1131 LI1132 secG tpiA TRUE 0.922 96.000 0.044 1.000 N NA
 1997515 1997516 LI1132 LI1133 tpiA rimJ TRUE 0.798 20.000 0.000 1.000 N NA
 1997518 1997519 LI1135 LI1136 mreB   TRUE 0.981 3.000 0.006 NA   NA
 1997520 1997521 LI1137 LI1138 cheB   TRUE 0.972 24.000 0.020 1.000 N NA
 1997521 1997522 LI1138 LI1139   cheR TRUE 0.999 0.000 0.250 1.000 N NA
 1997522 1997523 LI1139 LI1140 cheR soj TRUE 0.992 16.000 0.057 1.000 N NA
 1997523 1997524 LI1140 LI1141 soj cheW TRUE 0.672 204.000 0.057 1.000 N NA
 1997524 1997525 LI1141 LI1142 cheW cheY TRUE 1.000 11.000 0.615 1.000 Y NA
 1997525 1997526 LI1142 LI1143 cheY cheA_1 TRUE 0.742 24.000 0.000 NA   NA
 1997526 1997527 LI1143 LI1144 cheA_1 cheA_2 FALSE 0.095 188.000 0.000 NA   NA
 1997527 5526208 LI1144 LI_r04 cheA_2   FALSE 0.030 297.000 0.000 NA   NA
 5526208 1997529 LI_r04 LIt41     TRUE 0.596 59.000 0.000 NA   NA
 1997529 1997530 LIt41 LIt42     TRUE 0.561 70.000 0.000 NA   NA
 1997530 5526209 LIt42 LI_r05     FALSE 0.197 133.000 0.000 NA   NA
 5526209 5526210 LI_r05 LI_r06     TRUE 0.663 38.000 0.000 NA   NA
 1997535 1997536 LI1150 LI1151     FALSE 0.034 361.000 0.000 1.000 Y NA
 1997536 1997537 LI1151 LI1152     TRUE 0.881 9.000 0.000 NA   NA
 1997537 1997538 LI1152 LI1153     FALSE 0.029 300.000 0.000 NA   NA
 1997539 1997540 LI1154 LI1155     FALSE 0.013 462.000 0.000 NA   NA
 1997540 1997541 LI1155 LI1156     FALSE 0.009 924.000 0.000 NA   NA
 1997541 1997542 LI1156 LI1157     FALSE 0.011 608.000 0.000 NA   NA
 1997542 1997543 LI1157 LI1158     TRUE 0.920 -3.000 0.000 1.000   NA
 1997543 1997544 LI1158 LI1159     TRUE 0.640 48.000 0.000 NA   NA
 1997544 1997545 LI1159 LI1160   YscC FALSE 0.008 1289.000 0.000 NA   NA
 1997545 1997546 LI1160 LI1161 YscC   TRUE 0.998 0.000 0.122 NA   NA
 1997546 1997547 LI1161 LI1162     FALSE 0.067 213.000 0.000 NA   NA
 1997547 1997548 LI1162 LI1163   YscJ TRUE 1.000 9.000 0.750 NA   NA
 1997548 1997549 LI1163 LI1164 YscJ YscL TRUE 0.948 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1997549 1997550 LI1164 LI1165 YscL   TRUE 0.891 -28.000 0.000 NA   NA
 1997550 1997551 LI1165 LI1166     TRUE 0.999 54.000 1.000 NA   NA
 1997551 1997552 LI1166 LI1167     TRUE 0.557 77.000 0.000 1.000   NA
 1997552 1997553 LI1167 LI1168   rsbW TRUE 0.996 14.000 0.108 NA Y NA
 1997553 1997554 LI1168 LI1169 rsbW   TRUE 0.985 50.000 0.108 NA   NA
 1997554 1997555 LI1169 LI1170   cheW FALSE 0.120 169.000 0.000 NA   NA
 1997557 1997558 LI1172 LI1173     TRUE 0.909 0.000 0.000 NA   NA
 1997558 1997559 LI1173 LI1174   mltC FALSE 0.024 321.000 0.000 NA   NA
 1997559 1997560 LI1174 LI1175 mltC   TRUE 0.604 57.000 0.000 NA   NA
 1997561 1997562 LI1176 LI1177     TRUE 0.916 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1997562 1997563 LI1177 LI1178     FALSE 0.025 338.000 0.000 1.000   NA
 1997563 1997564 LI1178 LI1179   cbiO TRUE 0.999 -22.000 0.500 1.000   NA
 1997564 1997565 LI1179 LI1180 cbiO bioY TRUE 0.999 -13.000 0.192 1.000   NA
 1997565 1997566 LI1180 LI1181 bioY alaS TRUE 0.693 38.000 0.000 1.000   NA
 1997566 1997567 LI1181 LI1182 alaS recA TRUE 0.982 32.000 0.054 1.000 N NA
 1997567 1997568 LI1182 LI1183 recA metG TRUE 0.370 101.000 0.000 1.000 N NA
 1997568 1997569 LI1183 LI1184 metG   TRUE 0.857 134.000 0.059 NA   NA
 1997572 1997573 LI1186 LI1187 ruvA ruvB TRUE 1.000 -27.000 0.549 0.004 Y NA
 1997573 1997574 LI1187 LI1188 ruvB thyA TRUE 0.966 17.000 0.007 1.000 N NA
 1997574 1996347 LI1188 LI0001 thyA dnaA FALSE 0.014 488.000 0.000 1.000 N NA
 1996191 1996192 LIA002 LIA003     TRUE 0.906 -6.000 0.000 NA   NA
 1996194 1996195 LIA005 LIA006     FALSE 0.012 521.000 0.000 NA   NA
 1996195 1996196 LIA006 LIA007     FALSE 0.018 365.000 0.000 NA   NA
 1996196 1996197 LIA007 LIA008   mvaK1 TRUE 0.630 51.000 0.000 NA   NA
 1996197 1996198 LIA008 LIA009 mvaK1   TRUE 0.994 28.000 0.176 1.000   NA
 1996198 1996199 LIA009 LIA010     TRUE 0.904 13.000 0.000 NA Y NA
 1996199 1996200 LIA010 LIA011     FALSE 0.033 286.000 0.000 NA   NA
 1996200 1996201 LIA011 LIA012     TRUE 0.963 21.000 0.012 NA   NA
 1996201 1996202 LIA012 LIA013     TRUE 0.946 33.000 0.012 NA   NA
 1996202 1996203 LIA013 LIA014     TRUE 0.549 197.000 0.012 0.015   NA
 1996203 1996204 LIA014 LIA015     TRUE 0.684 41.000 0.000 1.000   NA
 1996204 1996205 LIA015 LIA016     FALSE 0.079 208.000 0.000 1.000   NA
 1996205 1996206 LIA016 LIA017   bchE TRUE 0.917 -6.000 0.000 1.000   NA
 1996206 1996207 LIA017 LIA018 bchE   TRUE 0.678 35.000 0.000 NA   NA
 1996207 1996208 LIA018 LIA019   gmhA TRUE 0.890 6.000 0.000 NA   NA
 1996208 1996209 LIA019 LIA020 gmhA   TRUE 0.790 21.000 0.000 1.000   NA
 1996209 1996210 LIA020 LIA021     TRUE 0.616 55.000 0.000 NA   NA
 1996210 1996211 LIA021 LIA022     TRUE 0.997 3.000 0.081 NA   NA
 1996211 1996212 LIA022 LIA023   galE FALSE 0.044 258.000 0.000 NA   NA
 1996212 1996213 LIA023 LIA024 galE   TRUE 0.548 79.000 0.000 1.000   NA
 1996213 1996214 LIA024 LIA025     TRUE 0.425 90.000 0.000 NA   NA
 1996214 1996215 LIA025 LIA026     TRUE 0.998 -10.000 0.136 NA   NA
 1996215 1996216 LIA026 LIA027     FALSE 0.012 510.000 0.000 NA   NA
 1996217 1996218 LIA028 LIA029     FALSE 0.081 198.000 0.000 NA   NA
 1996218 1996190 LIA029 LIA001     FALSE 0.012 619.000 0.000 1.000 N NA
 1996222 1996223 LIB004 LIB005     FALSE 0.015 460.000 0.000 1.000   NA
 1996225 1996226 LIB007 LIB008 asnB   TRUE 0.849 16.000 0.000 1.000   NA
 1996226 1996227 LIB008 LIB009     TRUE 0.917 -6.000 0.000 1.000   NA
 1996227 1996228 LIB009 LIB010     TRUE 0.862 13.000 0.000 1.000 N NA
 1996228 1996229 LIB010 LIB011   pqqE TRUE 0.881 21.000 0.000 0.030   NA
 1996229 1996230 LIB011 LIB012 pqqE   TRUE 0.621 62.000 0.000 1.000   NA
 1996231 1996232 LIB013 LIB014     FALSE 0.136 160.000 0.000 NA   NA
 1996232 1996233 LIB014 LIB015     TRUE 0.902 88.000 0.009 0.014   NA
 1996233 1996234 LIB015 LIB016     TRUE 0.901 7.000 0.000 1.000   NA
 1996234 1996235 LIB016 LIB017     TRUE 0.945 7.000 0.000 0.030 N NA
 1996235 1996236 LIB017 LIB018     FALSE 0.145 208.000 0.000 0.030   NA
 1996237 1996238 LIB019 LIB020     FALSE 0.010 729.000 0.000 NA   NA
 1996239 1996240 LIB021 LIB022     FALSE 0.007 2032.000 0.000 NA   NA
 1996240 1996241 LIB022 LIB023     FALSE 0.016 405.000 0.000 NA   NA
 1996241 1996242 LIB023 LIB024   parA FALSE 0.011 642.000 0.000 1.000 N NA
 1996242 1996219 LIB024 LIB001 parA   FALSE 0.010 776.000 0.000 1.000 N NA
 1996243 1996244 LIC001 LIC002     FALSE 0.008 1047.000 0.000 NA   NA
 1996244 1996245 LIC002 LIC003   epsG FALSE 0.113 174.000 0.000 NA   NA
 1996245 1996246 LIC003 LIC004 epsG rfbC FALSE 0.091 243.000 0.000 1.000 Y NA
 1996246 1996247 LIC004 LIC005 rfbC   FALSE 0.156 184.000 0.000 NA Y NA
 1996247 1996248 LIC005 LIC006     FALSE 0.093 189.000 0.000 NA   NA
 1996248 1996249 LIC006 LIC007     FALSE 0.255 116.000 0.000 NA   NA
 1996249 1996250 LIC007 LIC008     FALSE 0.048 260.000 0.000 1.000   NA
 1996251 1996252 LIC009 LIC010     TRUE 0.867 11.000 0.000 NA   NA
 1996252 1996253 LIC010 LIC011   mvaK1 TRUE 1.000 0.000 0.714 1.000   NA
 1996253 1996254 LIC011 LIC012 mvaK1   TRUE 0.650 310.000 0.174 1.000   NA
 1996254 1996255 LIC012 LIC013     TRUE 0.999 -3.000 0.174 0.018   NA
 1996255 1996256 LIC013 LIC014   ugd FALSE 0.206 134.000 0.000 1.000 N NA
 1996256 1996257 LIC014 LIC015 ugd   TRUE 0.350 101.000 0.000 NA   NA
 1996257 1996258 LIC015 LIC016   tal TRUE 0.895 -22.000 0.000 NA   NA
 1996258 1996259 LIC016 LIC017 tal hisJ TRUE 0.953 85.000 0.054 NA N NA
 1996259 1996260 LIC017 LIC018 hisJ   TRUE 0.996 -18.000 0.062 NA N NA
 1996260 1996261 LIC018 LIC019     FALSE 0.091 190.000 0.000 NA   NA
 1996261 1996262 LIC019 LIC020     FALSE 0.024 320.000 0.000 NA   NA
 1996262 1996263 LIC020 LIC021     TRUE 0.892 -27.000 0.000 NA   NA
 1996263 1996264 LIC021 LIC022     FALSE 0.054 233.000 0.000 NA   NA
 1996264 1996265 LIC022 LIC023   galE FALSE 0.019 359.000 0.000 NA   NA
 1996265 1996266 LIC023 LIC024 galE   TRUE 0.995 46.000 0.222 NA Y NA
 1996266 1996267 LIC024 LIC025     FALSE 0.013 478.000 0.000 NA   NA
 1996267 1996268 LIC025 LIC026     TRUE 0.909 0.000 0.000 NA   NA
 1996269 1996270 LIC027 LIC028     FALSE 0.024 344.000 0.000 1.000   NA
 1996270 1996271 LIC028 LIC029     FALSE 0.012 556.000 0.000 NA   NA
 1996271 1996272 LIC029 LIC030     TRUE 0.377 99.000 0.000 NA   NA
 1996272 1996273 LIC030 LIC031     FALSE 0.021 342.000 0.000 NA   NA
 1996274 1996275 LIC032 LIC033     TRUE 0.633 50.000 0.000 NA   NA
 1996275 1996276 LIC033 LIC034     TRUE 0.999 -3.000 0.485 NA   NA
 1996276 1996277 LIC034 LIC035     FALSE 0.026 311.000 0.000 NA   NA
 1996277 1996278 LIC035 LIC036   slt TRUE 0.999 11.000 0.400 NA   NA
 1996279 1996280 LIC037 LIC038     FALSE 0.014 453.000 0.000 NA   NA
 1996281 1996282 LIC039 LIC040     FALSE 0.017 384.000 0.000 NA   NA
 1996282 1996283 LIC040 LIC041     FALSE 0.007 2559.000 0.000 NA   NA
 1996283 1996284 LIC041 LIC042     FALSE 0.058 227.000 0.000 NA   NA
 1996284 1996285 LIC042 LIC043     TRUE 0.382 98.000 0.000 NA   NA
 1996285 1996286 LIC043 LIC044     FALSE 0.048 252.000 0.000 NA   NA
 1996286 1996287 LIC044 LIC045     FALSE 0.267 114.000 0.000 NA   NA
 1996287 1996288 LIC045 LIC046     FALSE 0.008 1076.000 0.000 NA   NA
 1996288 1996289 LIC046 LIC047     FALSE 0.011 615.000 0.000 NA   NA
 1996289 1996290 LIC047 LIC048     FALSE 0.007 1894.000 0.000 NA   NA
 1996290 1996291 LIC048 LIC049     TRUE 0.719 27.000 0.000 NA   NA
 1996291 1996292 LIC049 LIC050     FALSE 0.009 970.000 0.000 NA   NA
 1996292 1996293 LIC050 LIC051     FALSE 0.011 619.000 0.000 NA   NA
 1996293 1996294 LIC051 LIC052     FALSE 0.090 191.000 0.000 NA   NA
 1996294 1996295 LIC052 LIC053     FALSE 0.013 468.000 0.000 NA   NA
 1996295 1996296 LIC053 LIC054     FALSE 0.014 447.000 0.000 NA   NA
 1996296 1996297 LIC054 LIC055     FALSE 0.012 537.000 0.000 NA   NA
 1996297 1996298 LIC055 LIC056     FALSE 0.031 293.000 0.000 NA   NA
 1996298 1996299 LIC056 LIC057     FALSE 0.008 1570.000 0.000 NA   NA
 1996299 1996300 LIC057 LIC058     FALSE 0.016 406.000 0.000 NA   NA
 1996300 1996301 LIC058 LIC059     FALSE 0.014 458.000 0.000 NA   NA
 1996301 1996302 LIC059 LIC060     FALSE 0.010 633.000 0.000 NA   NA
 1996302 1996303 LIC060 LIC061     FALSE 0.009 800.000 0.000 NA   NA
 1996303 1996304 LIC061 LIC062     FALSE 0.008 1661.000 0.000 NA   NA
 1996305 1996306 LIC063 LIC064 parA   TRUE 0.876 12.000 0.000 1.000   NA
 1996308 1996309 LIC066 LIC067     TRUE 0.986 96.000 0.295 NA   NA
 1996309 1996310 LIC067 LIC068     TRUE 0.904 3.000 0.000 NA   NA
 1996310 1996311 LIC068 LIC069     TRUE 0.994 23.000 0.147 NA   NA
 1996311 1996312 LIC069 LIC070     TRUE 0.973 78.000 0.088 NA   NA
 1996312 1996313 LIC070 LIC071     TRUE 0.935 263.000 0.714 NA   NA
 1996313 1996314 LIC071 LIC072     TRUE 1.000 2.000 0.579 NA   NA
 1996314 1996315 LIC072 LIC073     FALSE 0.047 253.000 0.000 NA   NA
 1996315 1996316 LIC073 LIC074     FALSE 0.025 313.000 0.000 NA   NA
 1996316 1996317 LIC074 LIC075     TRUE 0.916 121.000 0.095 NA   NA
 1996317 1996318 LIC075 LIC076     TRUE 0.992 64.000 0.238 NA   NA
 1996319 1996320 LIC077 LIC078     FALSE 0.023 328.000 0.000 NA   NA
 1996320 1996321 LIC078 LIC079     FALSE 0.036 277.000 0.000 NA   NA
 1996321 1996322 LIC079 LIC080     TRUE 0.466 86.000 0.000 NA   NA
 1996322 1996323 LIC080 LIC081   recQ FALSE 0.020 363.000 0.000 1.000 N NA
 1996324 1996325 LIC082 LIC083 gmd   FALSE 0.019 391.000 0.000 1.000   NA
 1996325 1996326 LIC083 LIC084     FALSE 0.142 157.000 0.000 NA   NA
 1996327 1996328 LIC085 LIC086     TRUE 0.909 -3.000 0.000 NA   NA
 1996329 1996330 LIC087 LIC088     FALSE 0.019 360.000 0.000 NA   NA
 1996330 1996331 LIC088 LIC089     TRUE 0.999 5.000 0.400 NA   NA
 1996333 1996334 LIC091 LIC092     FALSE 0.020 356.000 0.000 NA   NA
 1996335 1996336 LIC093 LIC094     FALSE 0.154 351.000 0.008 1.000 Y NA
 1996336 1996337 LIC094 LIC095     TRUE 0.996 -3.000 0.048 1.000 Y NA
 1996337 1996338 LIC095 LIC096     TRUE 0.900 -13.000 0.000 NA   NA
 1996338 1996339 LIC096 LIC097     FALSE 0.126 165.000 0.000 NA   NA
 1996339 1996340 LIC097 LIC098     FALSE 0.027 323.000 0.000 1.000   NA
 1996340 1996341 LIC098 LIC099     FALSE 0.009 998.000 0.000 NA   NA
 1996342 1996343 LIC100 LIC101     FALSE 0.146 156.000 0.000 NA   NA
 1996343 1996344 LIC101 LIC102   yhjA FALSE 0.011 766.000 0.000 1.000   NA
 1996345 1996346 LIC103 LIC104 pilJ   FALSE 0.009 1393.000 0.000 1.000   NA